PeakID (cmd=annotatePeaks.pl S07_S7_SEACR.relaxed.bed hg38 -annStats S07_S7_SEACR.relaxed.log) Chr Start End Strand Peak Score Focus Ratio/Region Size Annotation Detailed Annotation Distance to TSS Nearest PromoterID Entrez ID Nearest Unigene Nearest Refseq Nearest Ensembl Gene Name Gene Alias Gene Description Gene Type chrY 11293599 11293794 141 - chrY:11293673-11293750 NA NA NA NA NA chrX-153 99804355 99804514 155 - chrX:99804355-99804502 NA NA NA NA NA chrX-152 99793053 99793401 223 - chrX:99793250-99793312 NA NA NA NA NA chrX-151 99312120 99312417 197 - chrX:99312120-99312267 NA NA NA NA NA chrX-150 99249025 99249298 168 - chrX:99249146-99249201 NA NA NA NA NA chrX-149 99221914 99222117 185 - chrX:99221917-99222066 NA NA NA NA NA chrX-148 99022553 99022897 212 - chrX:99022730-99022876 NA NA NA NA NA chrX-147 98845308 98845562 219 - chrX:98845395-98845544 NA NA NA NA NA chrX-146 98729987 98730239 131 - chrX:98730084-98730106 NA NA NA NA NA chrX-145 98487488 98487718 181 - chrX:98487517-98487659 NA NA NA NA NA chrX-144 98408615 98408781 151 - chrX:98408628-98408762 NA NA NA NA NA chrX-143 98282532 98282748 138 - chrX:98282644-98282743 NA NA NA NA NA chrX-142 97976612 97976781 121 - chrX:97976622-97976714 NA NA NA NA NA chrX-141 97613234 97613540 196 - chrX:97613392-97613454 NA NA NA NA NA chrX-140 97003064 97003316 126 - chrX:97003086-97003149 NA NA NA NA NA chrX-139 96989667 96990130 366 - chrX:96989822-96990129 NA NA NA NA NA chrX-138 96966505 96966711 149 - chrX:96966572-96966659 NA NA NA NA NA chrX-137 96325543 96325984 256 - chrX:96325821-96325914 NA NA NA NA NA chrX-136 95493063 95493237 133 - chrX:95493128-95493208 NA NA NA NA NA chrX-135 94582742 94582984 180 - chrX:94582796-94582906 NA NA NA NA NA chrX-134 94386902 94387089 146 - chrX:94386940-94387042 NA NA NA NA NA chrX-133 94161767 94162187 248 - chrX:94162035-94162063 NA NA NA NA NA chrX-132 93557595 93558020 209 - chrX:93557855-93557892 NA NA NA NA NA chrX-131 92237832 92237999 163 - chrX:92237844-92237999 NA NA NA NA NA chrX-130 88512382 88512762 250 - chrX:88512616-88512684 NA NA NA NA NA chrX-129 88109040 88109446 208 - chrX:88109241-88109254 NA NA NA NA NA chrX-128 88047661 88047817 119 - chrX:88047716-88047816 NA NA NA NA NA chrX-127 88021832 88022010 162 - chrX:88021843-88021984 NA NA NA NA NA chrX-126 87669893 87670081 128 - chrX:87670029-87670059 NA NA NA NA NA chrX-125 87380737 87380988 208 - chrX:87380752-87380889 NA NA NA NA NA chrX-124 86941666 86942161 221 - chrX:86941772-86941803 NA NA NA NA NA chrX-123 86487350 86487558 154 - chrX:86487372-86487488 NA NA NA NA NA chrX-122 85788388 85788610 153 - chrX:85788461-85788549 NA NA NA NA NA chrX-121 85691726 85691969 140 - chrX:85691877-85691890 NA NA NA NA NA chrX-120 85634467 85634810 163 - chrX:85634591-85634602 NA NA NA NA NA chrX-119 85351001 85351193 178 - chrX:85351035-85351185 NA NA NA NA NA chrX-118 84864295 84864475 160 - chrX:84864320-84864465 NA NA NA NA NA chrX-117 84658503 84658774 199 - chrX:84658597-84658760 NA NA NA NA NA chrX-116 84272566 84272851 142 - chrX:84272723-84272736 NA NA NA NA NA chrX-115 84193332 84193584 189 - chrX:84193373-84193477 NA NA NA NA NA chrX-5 8314905 8315050 131 - chrX:8314906-8315030 NA NA NA NA NA chrX-114 82493723 82493962 147 - chrX:82493817-82493874 NA NA NA NA NA chrX-113 81381255 81381660 236 - chrX:81381390-81381423 NA NA NA NA NA chrX-112 80866561 80866714 141 - chrX:80866561-80866678 NA NA NA NA NA chrX-111 80793195 80793592 219 - chrX:80793359-80793386 NA NA NA NA NA chrX-110 80729837 80730073 117 - chrX:80729983-80730008 NA NA NA NA NA chrX-109 80695434 80695727 203 - chrX:80695482-80695640 NA NA NA NA NA chrX-108 80110573 80110791 181 - chrX:80110591-80110716 NA NA NA NA NA chrX-107 79864947 79865384 245 - chrX:79865222-79865358 NA NA NA NA NA chrX-106 79542645 79542824 149 - chrX:79542675-79542794 NA NA NA NA NA chrX-105 79405001 79405269 174 - chrX:79405082-79405209 NA NA NA NA NA chrX-104 79182247 79182479 190 - chrX:79182266-79182435 NA NA NA NA NA chrX-103 78822806 78823210 248 - chrX:78822876-78823046 NA NA NA NA NA chrX-4 7845690 7845923 177 - chrX:7845768-7845911 NA NA NA NA NA chrX-102 77917077 77917446 212 - chrX:77917197-77917332 NA NA NA NA NA chrX-101 77139819 77140268 279 - chrX:77139923-77139966 NA NA NA NA NA chrX-100 76807617 76808003 183 - chrX:76807855-76807870 NA NA NA NA NA chrX-99 76632795 76633171 301 - chrX:76633002-76633153 NA NA NA NA NA chrX-98 76042343 76042552 174 - chrX:76042360-76042508 NA NA NA NA NA chrX-97 75070366 75070548 165 - chrX:75070380-75070525 NA NA NA NA NA chrX-96 74701890 74702097 157 - chrX:74701944-74702055 NA NA NA NA NA chrX-95 74643507 74643885 208 - chrX:74643614-74643737 NA NA NA NA NA chrX-94 74414726 74414912 145 - chrX:74414787-74414850 NA NA NA NA NA chrX-93 74336403 74336602 161 - chrX:74336445-74336572 NA NA NA NA NA chrX-92 74250432 74250733 163 - chrX:74250581-74250675 NA NA NA NA NA chrX-91 74157586 74157901 234 - chrX:74157793-74157865 NA NA NA NA NA chrX-90 74079495 74079763 189 - chrX:74079510-74079652 NA NA NA NA NA chrX-89 74014644 74015197 295 - chrX:74014902-74014939 NA NA NA NA NA chrX-88 73274767 73275133 203 - chrX:73274984-73275078 NA NA NA NA NA chrX-87 73222869 73223250 255 - chrX:73222886-73223078 NA NA NA NA NA chrX-86 72203964 72204119 151 - chrX:72203964-72204113 NA NA NA NA NA chrX-85 72154193 72154342 123 - chrX:72154197-72154307 NA NA NA NA NA chrX-84 72088647 72089162 291 - chrX:72088735-72088788 NA NA NA NA NA chrX-83 71477278 71477454 149 - chrX:71477309-71477429 NA NA NA NA NA chrX-82 71469124 71469639 285 - chrX:71469224-71469344 NA NA NA NA NA chrX-81 71323769 71324373 326 - chrX:71323876-71324140 NA NA NA NA NA chrX-80 69084233 69084556 209 - chrX:69084396-69084548 NA NA NA NA NA chrX-79 68971306 68971640 167 - chrX:68971439-68971456 NA NA NA NA NA chrX-78 67731757 67732122 290 - chrX:67731920-67732060 NA NA NA NA NA chrX-77 67086580 67086828 153 - chrX:67086627-67086637 NA NA NA NA NA chrX-76 67013688 67013961 160 - chrX:67013789-67013842 NA NA NA NA NA chrX-75 66006673 66007134 236 - chrX:66006743-66006863 NA NA NA NA NA chrX-74 65082119 65082304 156 - chrX:65082149-65082277 NA NA NA NA NA chrX-73 65043040 65043328 212 - chrX:65043114-65043288 NA NA NA NA NA chrX-72 64935227 64935529 247 - chrX:64935292-64935429 NA NA NA NA NA chrX-71 64932779 64932978 153 - chrX:64932815-64932927 NA NA NA NA NA chrX-70 64872723 64872885 153 - chrX:64872734-64872880 NA NA NA NA NA chrX-69 64392312 64392684 224 - chrX:64392414-64392564 NA NA NA NA NA chrX-68 64161803 64162327 352 - chrX:64162271-64162303 NA NA NA NA NA chrX-67 63997804 63998006 151 - chrX:63997857-63997956 NA NA NA NA NA chrX-66 63590896 63591318 332 - chrX:63590945-63591097 NA NA NA NA NA chrX-65 63514598 63514870 142 - chrX:63514731-63514746 NA NA NA NA NA chrX-3 6191602 6191853 162 - chrX:6191657-6191747 NA NA NA NA NA chrX-2 5970171 5970401 170 - chrX:5970229-5970340 NA NA NA NA NA chrX 5906495 5906893 295 - chrX:5906584-5906783 NA NA NA NA NA chrX-64 58125566 58125827 152 - chrX:58125691-58125726 NA NA NA NA NA chrX-63 57658417 57658579 157 - chrX:57658421-57658568 NA NA NA NA NA chrX-62 57600211 57600469 155 - chrX:57600316-57600370 NA NA NA NA NA chrX-61 57023002 57023186 153 - chrX:57023038-57023165 NA NA NA NA NA chrX-60 57014911 57015172 227 - chrX:57014996-57015155 NA NA NA NA NA chrX-59 56258340 56258642 269 - chrX:56258381-56258584 NA NA NA NA NA chrX-58 56087999 56088168 158 - chrX:56088006-56088149 NA NA NA NA NA chrX-57 56042324 56042475 132 - chrX:56042373-56042467 NA NA NA NA NA chrX-56 55854779 55854986 162 - chrX:55854840-55854949 NA NA NA NA NA chrX-55 55576665 55576897 154 - chrX:55576742-55576817 NA NA NA NA NA chrX-54 55550520 55550787 176 - chrX:55550581-55550636 NA NA NA NA NA chrX-53 54689241 54689474 129 - chrX:54689324-54689328 NA NA NA NA NA chrX-52 54677128 54677408 222 - chrX:54677284-54677399 NA NA NA NA NA chrX-51 54253586 54253737 145 - chrX:54253591-54253729 NA NA NA NA NA chrX-50 52876051 52876315 191 - chrX:52876117-52876228 NA NA NA NA NA chrX-49 51856389 51856592 155 - chrX:51856411-51856492 NA NA NA NA NA chrX-48 50724660 50724926 178 - chrX:50724684-50724806 NA NA NA NA NA chrX-47 50715121 50715538 329 - chrX:50715124-50715409 NA NA NA NA NA chrX-46 50582072 50582460 263 - chrX:50582407-50582440 NA NA NA NA NA chrX-45 49925368 49925606 192 - chrX:49925368-49925537 NA NA NA NA NA chrX-44 48847375 48847640 152 - chrX:48847486-48847526 NA NA NA NA NA chrX-43 47873023 47873257 173 - chrX:47873073-47873174 NA NA NA NA NA chrX-42 47407132 47407372 173 - chrX:47407161-47407286 NA NA NA NA NA chrX-41 46849951 46850246 235 - chrX:46850093-46850227 NA NA NA NA NA chrX-40 46387662 46387828 149 - chrX:46387695-46387819 NA NA NA NA NA chrX-39 46365318 46365487 157 - chrX:46365325-46365476 NA NA NA NA NA chrX-38 46028941 46029464 289 - chrX:46029203-46029244 NA NA NA NA NA chrX-37 45218833 45219131 198 - chrX:45218842-45218990 NA NA NA NA NA chrX-36 45052230 45052439 132 - chrX:45052267-45052342 NA NA NA NA NA chrX-35 44691910 44692092 159 - chrX:44691927-44692057 NA NA NA NA NA chrX-34 44570823 44571182 232 - chrX:44571014-44571087 NA NA NA NA NA chrX-33 44170490 44170695 136 - chrX:44170564-44170636 NA NA NA NA NA chrX-32 44125148 44125373 178 - chrX:44125175-44125316 NA NA NA NA NA chrX-31 44069137 44069415 190 - chrX:44069147-44069293 NA NA NA NA NA chrX-30 43460357 43460551 145 - chrX:43460382-43460454 NA NA NA NA NA chrX-29 42583435 42583659 151 - chrX:42583514-42583598 NA NA NA NA NA chrX-28 42379501 42379764 142 - chrX:42379648-42379656 NA NA NA NA NA chrX-27 41946192 41946501 208 - chrX:41946280-41946374 NA NA NA NA NA chrX-26 40921712 40921900 156 - chrX:40921742-40921867 NA NA NA NA NA chrX-25 39717231 39717494 185 - chrX:39717249-39717386 NA NA NA NA NA chrX-24 38354575 38355135 304 - chrX:38354729-38354953 NA NA NA NA NA chrX-23 35833385 35833658 154 - chrX:35833499-35833529 NA NA NA NA NA chrX-22 35467490 35467699 123 - chrX:35467572-35467611 NA NA NA NA NA chrX-21 33803079 33803412 208 - chrX:33803094-33803232 NA NA NA NA NA chrX-20 31771688 31771944 151 - chrX:31771808-31771869 NA NA NA NA NA chrX-19 30939974 30940236 164 - chrX:30940070-30940134 NA NA NA NA NA chrX-18 25826134 25826435 153 - chrX:25826284-25826291 NA NA NA NA NA chrX-17 22938487 22938694 157 - chrX:22938543-22938647 NA NA NA NA NA chrX-16 22698704 22698973 170 - chrX:22698767-22698802 NA NA NA NA NA chrX-15 22491220 22491497 219 - chrX:22491243-22491369 NA NA NA NA NA chrX-14 21908302 21908456 123 - chrX:21908355-21908416 NA NA NA NA NA chrX-13 21861140 21861803 335 - chrX:21861577-21861673 NA NA NA NA NA chrX-12 20972334 20972487 131 - chrX:20972340-20972427 NA NA NA NA NA chrX-11 19413203 19413565 196 - chrX:19413271-19413350 NA NA NA NA NA chrX-10 18051522 18051806 151 - chrX:18051657-18051677 NA NA NA NA NA chrX-210 155513903 155514129 157 - chrX:155513966-155514048 NA NA NA NA NA chrX-209 155265016 155265176 159 - chrX:155265016-155265173 NA NA NA NA NA chrX-208 155120543 155120831 233 - chrX:155120676-155120815 NA NA NA NA NA chrX-207 154819275 154819445 159 - chrX:154819292-154819429 NA NA NA NA NA chrX-206 154692991 154693137 132 - chrX:154693030-154693134 NA NA NA NA NA chrX-205 154600281 154600523 174 - chrX:154600369-154600495 NA NA NA NA NA chrX-204 153663462 153663613 121 - chrX:153663544-153663605 NA NA NA NA NA chrX-203 152388942 152389109 112 - chrX:152389020-152389100 NA NA NA NA NA chrX-202 150851890 150852159 185 - chrX:150851946-150852089 NA NA NA NA NA chrX-9 15045470 15045654 131 - chrX:15045485-15045582 NA NA NA NA NA chrX-8 15039359 15039657 202 - chrX:15039377-15039522 NA NA NA NA NA chrX-201 149890387 149890646 148 - chrX:149890506-149890551 NA NA NA NA NA chrX-200 149825657 149825814 151 - chrX:149825666-149825814 NA NA NA NA NA chrX-199 149197588 149197908 190 - chrX:149197760-149197862 NA NA NA NA NA chrX-198 146707313 146707586 155 - chrX:146707419-146707462 NA NA NA NA NA chrX-197 145279850 145280021 150 - chrX:145279869-145279996 NA NA NA NA NA chrX-196 144921191 144921372 177 - chrX:144921192-144921367 NA NA NA NA NA chrX-195 143783945 143784238 152 - chrX:143784080-143784094 NA NA NA NA NA chrX-194 143505803 143506022 155 - chrX:143505878-143505980 NA NA NA NA NA chrX-193 141988124 141988588 285 - chrX:141988239-141988281 NA NA NA NA NA chrX-192 141325611 141325757 119 - chrX:141325657-141325722 NA NA NA NA NA chrX-191 140972477 140972641 140 - chrX:140972549-140972641 NA NA NA NA NA chrX-7 14016385 14016674 201 - chrX:14016430-14016587 NA NA NA NA NA chrX-190 139893563 139893851 163 - chrX:139893672-139893694 NA NA NA NA NA chrX-189 139137253 139137535 150 - chrX:139137384-139137401 NA NA NA NA NA chrX-188 138160833 138161105 169 - chrX:138160948-138161008 NA NA NA NA NA chrX-187 134661629 134661898 150 - chrX:134661751-134661785 NA NA NA NA NA chrX-186 134454995 134455598 343 - chrX:134455286-134455400 NA NA NA NA NA chrX-185 133843821 133844352 297 - chrX:133844068-133844144 NA NA NA NA NA chrX-184 133581903 133582152 140 - chrX:133582004-133582039 NA NA NA NA NA chrX-183 132902242 132902455 164 - chrX:132902287-132902404 NA NA NA NA NA chrX-6 13154195 13154456 134 - chrX:13154338-13154361 NA NA NA NA NA chrX-182 129823871 129824097 162 - chrX:129823928-129824019 NA NA NA NA NA chrX-181 128771262 128771742 254 - chrX:128771312-128771453 NA NA NA NA NA chrX-180 126431604 126432069 246 - chrX:126431637-126431757 NA NA NA NA NA chrX-179 126176701 126176936 159 - chrX:126176762-126176830 NA NA NA NA NA chrX-178 126026326 126026803 247 - chrX:126026609-126026679 NA NA NA NA NA chrX-177 120342706 120343195 323 - chrX:120342912-120343049 NA NA NA NA NA chrX-176 120103793 120104024 162 - chrX:120103876-120103962 NA NA NA NA NA chrX-175 118083833 118084133 197 - chrX:118083980-118084118 NA NA NA NA NA chrX-174 116445474 116445620 144 - chrX:116445478-116445620 NA NA NA NA NA chrX-173 115155953 115156431 270 - chrX:115156014-115156180 NA NA NA NA NA chrX-172 114785420 114785613 162 - chrX:114785464-114785608 NA NA NA NA NA chrX-171 114361003 114361163 156 - chrX:114361007-114361159 NA NA NA NA NA chrX-170 114172417 114172880 267 - chrX:114172698-114172867 NA NA NA NA NA chrX-169 110724931 110725227 206 - chrX:110724970-110725131 NA NA NA NA NA chrX-168 107614156 107614498 190 - chrX:107614338-107614361 NA NA NA NA NA chrX-167 107141258 107141543 199 - chrX:107141271-107141427 NA NA NA NA NA chrX-166 105618636 105619101 255 - chrX:105618685-105618836 NA NA NA NA NA chrX-165 104509740 104510057 165 - chrX:104509782-104509850 NA NA NA NA NA chrX-164 103533029 103533192 160 - chrX:103533034-103533188 NA NA NA NA NA chrX-163 102965989 102966252 129 - chrX:102966159-102966221 NA NA NA NA NA chrX-162 102599398 102599692 211 - chrX:102599413-102599575 NA NA NA NA NA chrX-161 102593805 102594041 144 - chrX:102593899-102593950 NA NA NA NA NA chrX-160 101686650 101686931 209 - chrX:101686784-101686890 NA NA NA NA NA chrX-159 101495406 101495621 128 - chrX:101495464-101495476 NA NA NA NA NA chrX-158 101371547 101371849 161 - chrX:101371678-101371703 NA NA NA NA NA chrX-157 101157929 101158089 150 - chrX:101157930-101158075 NA NA NA NA NA chrX-156 101018164 101018399 122 - chrX:101018292-101018316 NA NA NA NA NA chrX-155 100422235 100422459 157 - chrX:100422284-100422383 NA NA NA NA NA chrX-154 100369714 100369886 157 - chrX:100369729-100369871 NA NA NA NA NA chrUn_KI270757v1 65689 65900 140 - chrUn_KI270757v1:65724-65811 NA NA NA NA NA chr9-382 99948987 99949285 159 - chr9:99949120-99949134 NA NA NA NA NA chr9-381 99921895 99922197 206 - chr9:99922038-99922196 NA NA NA NA NA chr9-380 99871427 99871595 128 - chr9:99871487-99871595 NA NA NA NA NA chr9-379 99582247 99582435 146 - chr9:99582303-99582428 NA NA NA NA NA chr9-378 99557477 99557644 124 - chr9:99557529-99557619 NA NA NA NA NA chr9-377 99234056 99234277 124 - chr9:99234115-99234161 NA NA NA NA NA chr9-376 99144915 99145117 119 - chr9:99144952-99145011 NA NA NA NA NA chr9-375 97991098 97991511 249 - chr9:97991256-97991501 NA NA NA NA NA chr9-374 97851010 97851304 218 - chr9:97851118-97851298 NA NA NA NA NA chr9-373 97832617 97832861 190 - chr9:97832705-97832824 NA NA NA NA NA chr9-372 97333592 97334007 299 - chr9:97333612-97333768 NA NA NA NA NA chr9-371 97035645 97035810 159 - chr9:97035654-97035810 NA NA NA NA NA chr9-370 96770492 96770731 158 - chr9:96770572-96770648 NA NA NA NA NA chr9-369 96733738 96734018 182 - chr9:96733780-96733892 NA NA NA NA NA chr9-32 9668349 9668789 233 - chr9:9668398-9668503 NA NA NA NA NA chr9-31 9654427 9654847 256 - chr9:9654620-9654741 NA NA NA NA NA chr9-30 9643512 9643823 182 - chr9:9643632-9643676 NA NA NA NA NA chr9-368 95986325 95986770 264 - chr9:95986461-95986499 NA NA NA NA NA chr9-367 95924064 95924366 206 - chr9:95924175-95924300 NA NA NA NA NA chr9-366 95870951 95871434 282 - chr9:95871294-95871386 NA NA NA NA NA chr9-365 95853651 95853969 165 - chr9:95853818-95853823 NA NA NA NA NA chr9-364 95679873 95680102 150 - chr9:95679931-95679981 NA NA NA NA NA chr9-363 95244760 95245326 306 - chr9:95244771-95244947 NA NA NA NA NA chr9-362 94766784 94767032 150 - chr9:94766884-94766938 NA NA NA NA NA chr9-29 9470977 9471378 195 - chr9:9471071-9471116 NA NA NA NA NA chr9-361 93705940 93706098 156 - chr9:93705944-93706096 NA NA NA NA NA chr9-360 93702534 93702818 193 - chr9:93702663-93702803 NA NA NA NA NA chr9-359 93522363 93522546 149 - chr9:93522400-93522518 NA NA NA NA NA chr9-358 92494454 92494650 149 - chr9:92494497-92494595 NA NA NA NA NA chr9-357 92488319 92488602 156 - chr9:92488430-92488467 NA NA NA NA NA chr9-356 92474653 92474929 168 - chr9:92474757-92474813 NA NA NA NA NA chr9-355 92446597 92446805 152 - chr9:92446651-92446745 NA NA NA NA NA chr9-354 91397534 91397748 193 - chr9:91397561-91397712 NA NA NA NA NA chr9-353 91316858 91317003 121 - chr9:91316878-91316951 NA NA NA NA NA chr9-352 90674643 90675010 229 - chr9:90674843-90674996 NA NA NA NA NA chr9-351 90544868 90545187 207 - chr9:90544969-90545053 NA NA NA NA NA chr9-350 90396470 90396686 158 - chr9:90396538-90396633 NA NA NA NA NA chr9-349 90336152 90336528 213 - chr9:90336231-90336323 NA NA NA NA NA chr9-348 90275763 90276035 161 - chr9:90275871-90275918 NA NA NA NA NA chr9-347 90145347 90145543 159 - chr9:90145387-90145512 NA NA NA NA NA chr9-346 90132580 90133080 243 - chr9:90132939-90133027 NA NA NA NA NA chr9-345 89761013 89761223 152 - chr9:89761058-89761094 NA NA NA NA NA chr9-344 89401404 89401563 151 - chr9:89401412-89401555 NA NA NA NA NA chr9-343 89397539 89397744 124 - chr9:89397584-89397645 NA NA NA NA NA chr9-342 89340989 89341210 141 - chr9:89341082-89341156 NA NA NA NA NA chr9-341 89081274 89081511 164 - chr9:89081350-89081444 NA NA NA NA NA chr9-340 89070220 89070374 148 - chr9:89070222-89070367 NA NA NA NA NA chr9-339 89066304 89066546 137 - chr9:89066408-89066439 NA NA NA NA NA chr9-338 89016472 89016621 124 - chr9:89016530-89016604 NA NA NA NA NA chr9-337 88927966 88928269 181 - chr9:88928101-88928117 NA NA NA NA NA chr9-336 88849698 88849866 145 - chr9:88849721-88849843 NA NA NA NA NA chr9-335 88511216 88511454 179 - chr9:88511288-88511445 NA NA NA NA NA chr9-334 87996857 87997163 204 - chr9:87997003-87997083 NA NA NA NA NA chr9-333 87975403 87975759 199 - chr9:87975612-87975628 NA NA NA NA NA chr9-332 87778070 87778261 149 - chr9:87778112-87778219 NA NA NA NA NA chr9-331 87774829 87775004 168 - chr9:87774836-87774990 NA NA NA NA NA chr9-330 87404815 87405022 181 - chr9:87404822-87404958 NA NA NA NA NA chr9-329 87355685 87356024 203 - chr9:87355768-87355782 NA NA NA NA NA chr9-328 87181748 87181967 171 - chr9:87181791-87181909 NA NA NA NA NA chr9-327 87139988 87140178 162 - chr9:87140011-87140140 NA NA NA NA NA chr9-326 87087221 87087430 161 - chr9:87087253-87087390 NA NA NA NA NA chr9-325 87000352 87000574 149 - chr9:87000406-87000499 NA NA NA NA NA chr9-324 86976335 86976796 255 - chr9:86976598-86976750 NA NA NA NA NA chr9-323 86883605 86883835 140 - chr9:86883685-86883740 NA NA NA NA NA chr9-322 86866725 86866958 159 - chr9:86866781-86866875 NA NA NA NA NA chr9-321 86562134 86562369 163 - chr9:86562214-86562301 NA NA NA NA NA chr9-320 86462499 86462865 263 - chr9:86462558-86462674 NA NA NA NA NA chr9-319 86441923 86442268 174 - chr9:86442121-86442151 NA NA NA NA NA chr9-318 85660305 85660581 156 - chr9:85660429-85660469 NA NA NA NA NA chr9-317 85611249 85611445 131 - chr9:85611350-85611398 NA NA NA NA NA chr9-316 85547123 85547515 264 - chr9:85547275-85547399 NA NA NA NA NA chr9-315 85541641 85541848 156 - chr9:85541686-85541794 NA NA NA NA NA chr9-314 84777218 84777743 259 - chr9:84777567-84777643 NA NA NA NA NA chr9-313 84204992 84205316 193 - chr9:84205075-84205129 NA NA NA NA NA chr9-312 84175685 84175899 177 - chr9:84175746-84175874 NA NA NA NA NA chr9-311 83378866 83379243 288 - chr9:83378887-83379018 NA NA NA NA NA chr9-310 83307134 83307435 169 - chr9:83307257-83307285 NA NA NA NA NA chr9-309 83263192 83263612 187 - chr9:83263251-83263292 NA NA NA NA NA chr9-308 83183568 83183728 133 - chr9:83183581-83183673 NA NA NA NA NA chr9-307 83022201 83022493 152 - chr9:83022340-83022351 NA NA NA NA NA chr9-306 82827513 82827715 157 - chr9:82827597-82827664 NA NA NA NA NA chr9-305 82717648 82718142 274 - chr9:82717906-82717998 NA NA NA NA NA chr9-304 82566926 82567127 167 - chr9:82566965-82567115 NA NA NA NA NA chr9-303 82256764 82257009 218 - chr9:82256771-82256972 NA NA NA NA NA chr9-28 8223809 8224037 149 - chr9:8223893-8223968 NA NA NA NA NA chr9-302 81999543 81999683 125 - chr9:81999585-81999680 NA NA NA NA NA chr9-301 81777156 81777486 308 - chr9:81777216-81777483 NA NA NA NA NA chr9-300 81685013 81685157 120 - chr9:81685051-81685140 NA NA NA NA NA chr9-299 81423413 81423668 140 - chr9:81423527-81423551 NA NA NA NA NA chr9-298 81370640 81370944 154 - chr9:81370790-81370794 NA NA NA NA NA chr9-297 81362075 81362444 251 - chr9:81362299-81362379 NA NA NA NA NA chr9-296 81052049 81052481 281 - chr9:81052141-81052212 NA NA NA NA NA chr9-295 81008682 81008986 201 - chr9:81008818-81008949 NA NA NA NA NA chr9-294 80933559 80933993 236 - chr9:80933783-80933920 NA NA NA NA NA chr9-293 80632514 80632701 159 - chr9:80632541-80632671 NA NA NA NA NA chr9-27 8034987 8035325 218 - chr9:8035139-8035269 NA NA NA NA NA chr9-292 80159595 80159796 137 - chr9:80159661-80159766 NA NA NA NA NA chr9-291 79577249 79577400 121 - chr9:79577251-79577356 NA NA NA NA NA chr9-290 79321914 79322361 231 - chr9:79322201-79322287 NA NA NA NA NA chr9-289 79302457 79302857 204 - chr9:79302563-79302616 NA NA NA NA NA chr9-288 79203991 79204208 193 - chr9:79204022-79204167 NA NA NA NA NA chr9-287 78983348 78983618 182 - chr9:78983390-78983528 NA NA NA NA NA chr9-286 78884766 78884934 154 - chr9:78884777-78884924 NA NA NA NA NA chr9-285 78646423 78646639 167 - chr9:78646496-78646638 NA NA NA NA NA chr9-284 78616219 78616503 198 - chr9:78616335-78616432 NA NA NA NA NA chr9-283 78384996 78385389 310 - chr9:78385199-78385366 NA NA NA NA NA chr9-282 78121627 78121797 151 - chr9:78121646-78121778 NA NA NA NA NA chr9-281 77930357 77930609 172 - chr9:77930465-77930510 NA NA NA NA NA chr9-280 77902242 77902623 207 - chr9:77902392-77902401 NA NA NA NA NA chr9-279 77667771 77667970 153 - chr9:77667906-77667967 NA NA NA NA NA chr9-278 77575612 77575910 237 - chr9:77575721-77575873 NA NA NA NA NA chr9-277 77313706 77313862 153 - chr9:77313713-77313861 NA NA NA NA NA chr9-276 77274729 77274937 149 - chr9:77274779-77274868 NA NA NA NA NA chr9-275 77246588 77247104 302 - chr9:77246898-77247093 NA NA NA NA NA chr9-274 77077496 77077714 158 - chr9:77077550-77077642 NA NA NA NA NA chr9-273 76640317 76640631 167 - chr9:76640440-76640472 NA NA NA NA NA chr9-272 76540820 76541091 225 - chr9:76540901-76541034 NA NA NA NA NA chr9-271 76423626 76423905 155 - chr9:76423748-76423780 NA NA NA NA NA chr9-270 76076406 76076614 153 - chr9:76076457-76076557 NA NA NA NA NA chr9-26 7583981 7584213 192 - chr9:7584083-7584195 NA NA NA NA NA chr9-269 75642719 75642899 151 - chr9:75642751-75642876 NA NA NA NA NA chr9-268 75374625 75374815 138 - chr9:75374685-75374767 NA NA NA NA NA chr9-267 75229724 75230109 312 - chr9:75229739-75229905 NA NA NA NA NA chr9-266 75224374 75224708 170 - chr9:75224504-75224527 NA NA NA NA NA chr9-265 75072118 75072413 149 - chr9:75072266-75072275 NA NA NA NA NA chr9-264 74760818 74761066 175 - chr9:74760911-74761003 NA NA NA NA NA chr9-263 74687740 74687990 149 - chr9:74687843-74687890 NA NA NA NA NA chr9-262 74652046 74652499 204 - chr9:74652191-74652198 NA NA NA NA NA chr9-261 74570559 74570797 138 - chr9:74570661-74570701 NA NA NA NA NA chr9-260 74561579 74561929 189 - chr9:74561674-74561735 NA NA NA NA NA chr9-259 74516487 74516755 159 - chr9:74516488-74516592 NA NA NA NA NA chr9-258 74311620 74312033 239 - chr9:74311874-74312019 NA NA NA NA NA chr9-257 74281432 74281620 166 - chr9:74281466-74281604 NA NA NA NA NA chr9-25 7427363 7427826 322 - chr9:7427441-7427561 NA NA NA NA NA chr9-256 73571943 73572158 150 - chr9:73572010-73572094 NA NA NA NA NA chr9-255 73441503 73441767 170 - chr9:73441596-73441671 NA NA NA NA NA chr9-254 73148051 73148646 260 - chr9:73148168-73148202 NA NA NA NA NA chr9-253 72948853 72949167 223 - chr9:72948887-72948962 NA NA NA NA NA chr9-252 72558605 72558807 144 - chr9:72558680-72558783 NA NA NA NA NA chr9-251 72325046 72325563 346 - chr9:72325184-72325326 NA NA NA NA NA chr9-250 72229609 72229786 154 - chr9:72229630-72229759 NA NA NA NA NA chr9-249 70918719 70919155 268 - chr9:70918822-70919006 NA NA NA NA NA chr9-248 70670678 70670995 249 - chr9:70670846-70670977 NA NA NA NA NA chr9-247 70544917 70545188 157 - chr9:70545027-70545072 NA NA NA NA NA chr9-24 6948015 6948192 162 - chr9:6948030-6948177 NA NA NA NA NA chr9-246 69311843 69312165 204 - chr9:69311991-69312107 NA NA NA NA NA chr9-245 69179854 69180385 246 - chr9:69180007-69180034 NA NA NA NA NA chr9-244 69038879 69039070 161 - chr9:69038901-69039036 NA NA NA NA NA chr9-243 68903186 68903437 153 - chr9:68903252-68903356 NA NA NA NA NA chr9-242 68763554 68764011 291 - chr9:68763570-68763715 NA NA NA NA NA chr9-241 68734266 68734639 212 - chr9:68734484-68734592 NA NA NA NA NA chr9-240 68670905 68671106 136 - chr9:68670955-68671011 NA NA NA NA NA chr9-239 68491117 68491473 237 - chr9:68491336-68491404 NA NA NA NA NA chr9-23 6809254 6809541 193 - chr9:6809273-6809419 NA NA NA NA NA chr9-6 672033 672410 223 - chr9:672168-672314 NA NA NA NA NA chr9-22 6682976 6683380 191 - chr9:6683233-6683255 NA NA NA NA NA chr9-21 6518245 6518815 332 - chr9:6518413-6518437 NA NA NA NA NA chr9-5 571697 571904 161 - chr9:571744-571860 NA NA NA NA NA chr9-20 5501312 5501479 115 - chr9:5501362-5501451 NA NA NA NA NA chr9-19 4986332 4986471 113 - chr9:4986352-4986452 NA NA NA NA NA chr9-4 494957 495106 135 - chr9:494966-495094 NA NA NA NA NA chr9-18 4849642 4849858 195 - chr9:4849659-4849812 NA NA NA NA NA chr9-17 4526742 4526974 151 - chr9:4526843-4526903 NA NA NA NA NA chr9-238 43185472 43185727 167 - chr9:43185536-43185627 NA NA NA NA NA chr9-16 4275882 4276067 152 - chr9:4275925-4276054 NA NA NA NA NA chr9-15 3985529 3985724 154 - chr9:3985576-3985695 NA NA NA NA NA chr9-237 39036325 39036796 299 - chr9:39036643-39036762 NA NA NA NA NA chr9-236 38239282 38239541 225 - chr9:38239294-38239451 NA NA NA NA NA chr9-235 38133733 38133912 158 - chr9:38133751-38133885 NA NA NA NA NA chr9-234 37771326 37771494 151 - chr9:37771342-37771475 NA NA NA NA NA chr9-233 37758075 37758466 253 - chr9:37758305-37758374 NA NA NA NA NA chr9-232 37688916 37689314 273 - chr9:37689006-37689119 NA NA NA NA NA chr9-231 37684286 37684585 164 - chr9:37684403-37684441 NA NA NA NA NA chr9-14 3763823 3764023 164 - chr9:3763855-3763979 NA NA NA NA NA chr9-230 37633440 37633825 182 - chr9:37633515-37633558 NA NA NA NA NA chr9-229 37312171 37312471 136 - chr9:37312349-37312403 NA NA NA NA NA chr9-228 37266717 37266945 162 - chr9:37266787-37266887 NA NA NA NA NA chr9-227 37257053 37257234 144 - chr9:37257066-37257185 NA NA NA NA NA chr9-226 37180880 37181072 147 - chr9:37180923-37181023 NA NA NA NA NA chr9-225 37163796 37164016 196 - chr9:37163822-37163970 NA NA NA NA NA chr9-224 37140244 37140427 148 - chr9:37140279-37140392 NA NA NA NA NA chr9-223 36826251 36826417 160 - chr9:36826254-36826411 NA NA NA NA NA chr9-222 36815630 36815894 161 - chr9:36815832-36815835 NA NA NA NA NA chr9-221 36420065 36420271 137 - chr9:36420154-36420212 NA NA NA NA NA chr9-220 36251108 36251442 214 - chr9:36251116-36251270 NA NA NA NA NA chr9-219 36217906 36218109 178 - chr9:36217945-36218091 NA NA NA NA NA chr9-218 36190066 36190236 152 - chr9:36190079-36190208 NA NA NA NA NA chr9-217 36092046 36092264 160 - chr9:36092110-36092209 NA NA NA NA NA chr9-216 36074209 36074673 307 - chr9:36074492-36074579 NA NA NA NA NA chr9-215 36067082 36067435 173 - chr9:36067192-36067294 NA NA NA NA NA chr9-214 35996859 35997034 148 - chr9:35996890-35997009 NA NA NA NA NA chr9-213 35990868 35991391 308 - chr9:35991157-35991160 NA NA NA NA NA chr9-212 35984314 35984607 134 - chr9:35984457-35984489 NA NA NA NA NA chr9-211 35945082 35945396 184 - chr9:35945229-35945300 NA NA NA NA NA chr9-210 35902940 35903119 123 - chr9:35902972-35903051 NA NA NA NA NA chr9-209 35901154 35901531 301 - chr9:35901327-35901476 NA NA NA NA NA chr9-208 35553116 35553390 160 - chr9:35553260-35553291 NA NA NA NA NA chr9-207 35548563 35548834 154 - chr9:35548680-35548717 NA NA NA NA NA chr9-206 35495216 35495430 145 - chr9:35495281-35495353 NA NA NA NA NA chr9-205 35473647 35473993 192 - chr9:35473849-35473863 NA NA NA NA NA chr9-204 35465822 35466016 162 - chr9:35465838-35465976 NA NA NA NA NA chr9-203 35360676 35360981 245 - chr9:35360843-35360968 NA NA NA NA NA chr9-202 35284859 35285258 215 - chr9:35285093-35285174 NA NA NA NA NA chr9-201 35242971 35243326 168 - chr9:35243114-35243117 NA NA NA NA NA chr9-200 34969787 34969969 157 - chr9:34969810-34969940 NA NA NA NA NA chr9-199 34924307 34924689 185 - chr9:34924468-34924479 NA NA NA NA NA chr9-198 34623201 34623474 227 - chr9:34623228-34623363 NA NA NA NA NA chr9-197 34518494 34518885 193 - chr9:34518598-34518640 NA NA NA NA NA chr9-196 34325087 34325326 140 - chr9:34325192-34325230 NA NA NA NA NA chr9-195 34287417 34287858 261 - chr9:34287544-34287572 NA NA NA NA NA chr9-194 34217814 34218065 142 - chr9:34217931-34217950 NA NA NA NA NA chr9-193 34192869 34193050 158 - chr9:34192896-34193029 NA NA NA NA NA chr9-192 34144682 34144944 184 - chr9:34144815-34144935 NA NA NA NA NA chr9-191 34096869 34097241 200 - chr9:34097069-34097125 NA NA NA NA NA chr9-190 34076349 34076701 272 - chr9:34076523-34076668 NA NA NA NA NA chr9-189 34068055 34068521 280 - chr9:34068178-34068209 NA NA NA NA NA chr9-188 33997676 33997849 118 - chr9:33997787-33997822 NA NA NA NA NA chr9-187 33986593 33986747 152 - chr9:33986593-33986744 NA NA NA NA NA chr9-186 33943750 33944204 231 - chr9:33944035-33944059 NA NA NA NA NA chr9-185 33871367 33871588 186 - chr9:33871460-33871576 NA NA NA NA NA chr9-184 33826961 33827160 139 - chr9:33827083-33827131 NA NA NA NA NA chr9-183 33422115 33422302 161 - chr9:33422140-33422274 NA NA NA NA NA chr9-182 33318255 33318499 180 - chr9:33318292-33318440 NA NA NA NA NA chr9-181 33174127 33174483 209 - chr9:33174329-33174337 NA NA NA NA NA chr9-180 33048527 33048880 155 - chr9:33048589-33048645 NA NA NA NA NA chr9-179 33004873 33005420 266 - chr9:33005107-33005271 NA NA NA NA NA chr9-178 32781881 32782066 119 - chr9:32782017-32782035 NA NA NA NA NA chr9-177 32763711 32763871 147 - chr9:32763724-32763858 NA NA NA NA NA chr9-176 32691960 32692414 272 - chr9:32692266-32692294 NA NA NA NA NA chr9-175 32596890 32597615 381 - chr9:32596927-32597128 NA NA NA NA NA chr9-174 32271943 32272144 140 - chr9:32272003-32272081 NA NA NA NA NA chr9-173 32014575 32014713 117 - chr9:32014638-32014713 NA NA NA NA NA chr9-172 31913155 31913482 207 - chr9:31913197-31913344 NA NA NA NA NA chr9-171 31866132 31866398 153 - chr9:31866256-31866307 NA NA NA NA NA chr9-170 31650699 31651020 198 - chr9:31650860-31650973 NA NA NA NA NA chr9-169 31598279 31598442 144 - chr9:31598298-31598423 NA NA NA NA NA chr9-168 31491073 31491386 175 - chr9:31491241-31491253 NA NA NA NA NA chr9-3 314773 314988 164 - chr9:314838-314965 NA NA NA NA NA chr9-167 31421090 31421246 144 - chr9:31421102-31421234 NA NA NA NA NA chr9-166 31280837 31281170 314 - chr9:31280845-31281121 NA NA NA NA NA chr9-165 31277436 31277841 204 - chr9:31277689-31277744 NA NA NA NA NA chr9-164 31243239 31243407 159 - chr9:31243251-31243404 NA NA NA NA NA chr9-163 31183425 31183665 148 - chr9:31183521-31183575 NA NA NA NA NA chr9-162 31043177 31043476 237 - chr9:31043208-31043352 NA NA NA NA NA chr9-161 31037204 31037607 185 - chr9:31037353-31037358 NA NA NA NA NA chr9-160 31020931 31021581 414 - chr9:31021206-31021531 NA NA NA NA NA chr9-13 3096346 3096565 168 - chr9:3096402-3096524 NA NA NA NA NA chr9-159 30900849 30901207 283 - chr9:30901058-30901199 NA NA NA NA NA chr9-158 30893447 30893595 119 - chr9:30893451-30893513 NA NA NA NA NA chr9-157 30870290 30870437 126 - chr9:30870313-30870397 NA NA NA NA NA chr9-156 30867655 30867960 236 - chr9:30867713-30867863 NA NA NA NA NA chr9-155 30794642 30794895 208 - chr9:30794675-30794826 NA NA NA NA NA chr9-12 3071738 3072066 186 - chr9:3071811-3071873 NA NA NA NA NA chr9-154 30642369 30642609 185 - chr9:30642434-30642559 NA NA NA NA NA chr9-153 30636590 30636809 162 - chr9:30636642-30636742 NA NA NA NA NA chr9-152 30602332 30602494 129 - chr9:30602347-30602425 NA NA NA NA NA chr9-151 30578017 30578174 129 - chr9:30578062-30578135 NA NA NA NA NA chr9-150 30476689 30476965 148 - chr9:30476814-30476831 NA NA NA NA NA chr9-149 30472831 30472989 151 - chr9:30472842-30472979 NA NA NA NA NA chr9-148 30195717 30195859 118 - chr9:30195760-30195830 NA NA NA NA NA chr9-2 301492 301763 203 - chr9:301541-301710 NA NA NA NA NA chr9-147 30124321 30124618 189 - chr9:30124338-30124473 NA NA NA NA NA chr9-146 30053844 30054281 278 - chr9:30054004-30054124 NA NA NA NA NA chr9-145 30044803 30045180 194 - chr9:30045023-30045071 NA NA NA NA NA chr9-144 30036173 30036545 206 - chr9:30036332-30036345 NA NA NA NA NA chr9-143 29909276 29909842 233 - chr9:29909600-29909642 NA NA NA NA NA chr9-142 29730905 29731356 226 - chr9:29731169-29731209 NA NA NA NA NA chr9-141 29644855 29645108 205 - chr9:29644857-29645013 NA NA NA NA NA chr9-140 29606148 29606329 132 - chr9:29606180-29606246 NA NA NA NA NA chr9-139 29524291 29524465 134 - chr9:29524317-29524371 NA NA NA NA NA chr9-138 29438161 29438426 192 - chr9:29438218-29438321 NA NA NA NA NA chr9-137 29310114 29310260 123 - chr9:29310136-29310213 NA NA NA NA NA chr9-136 29251559 29251752 169 - chr9:29251580-29251722 NA NA NA NA NA chr9-135 29146638 29147098 214 - chr9:29146779-29146796 NA NA NA NA NA chr9-134 29142722 29143037 176 - chr9:29142849-29142874 NA NA NA NA NA chr9-133 29122373 29122624 153 - chr9:29122476-29122536 NA NA NA NA NA chr9-132 29104653 29104868 169 - chr9:29104697-29104821 NA NA NA NA NA chr9-131 29087345 29087796 272 - chr9:29087624-29087667 NA NA NA NA NA chr9-130 29062509 29063049 250 - chr9:29062901-29062962 NA NA NA NA NA chr9-129 28976048 28976657 293 - chr9:28976076-28976190 NA NA NA NA NA chr9-128 28934610 28934903 194 - chr9:28934639-28934769 NA NA NA NA NA chr9-127 28863959 28864355 206 - chr9:28864206-28864252 NA NA NA NA NA chr9-126 28792372 28792761 195 - chr9:28792506-28792537 NA NA NA NA NA chr9-125 28716374 28716750 211 - chr9:28716435-28716533 NA NA NA NA NA chr9-124 28671978 28672247 205 - chr9:28672051-28672224 NA NA NA NA NA chr9-123 28609958 28610126 150 - chr9:28609976-28610108 NA NA NA NA NA chr9-122 28599270 28599538 144 - chr9:28599378-28599406 NA NA NA NA NA chr9-121 28571986 28572202 125 - chr9:28572050-28572057 NA NA NA NA NA chr9-120 28467932 28468116 157 - chr9:28467989-28468104 NA NA NA NA NA chr9-119 28423803 28424123 189 - chr9:28423943-28424010 NA NA NA NA NA chr9-118 28319181 28319354 141 - chr9:28319219-28319334 NA NA NA NA NA chr9-117 28267141 28267561 193 - chr9:28267276-28267288 NA NA NA NA NA chr9-116 28185737 28186003 134 - chr9:28185852-28185884 NA NA NA NA NA chr9-115 28074308 28074563 175 - chr9:28074420-28074499 NA NA NA NA NA chr9-114 28053768 28054113 182 - chr9:28053961-28054010 NA NA NA NA NA chr9-113 27943681 27943952 170 - chr9:27943738-27943829 NA NA NA NA NA chr9-112 27901083 27901375 158 - chr9:27901232-27901261 NA NA NA NA NA chr9-111 27888060 27888274 176 - chr9:27888098-27888236 NA NA NA NA NA chr9-110 27747710 27748044 218 - chr9:27747728-27747888 NA NA NA NA NA chr9-109 27684709 27685075 179 - chr9:27684924-27684944 NA NA NA NA NA chr9-108 27682323 27682798 257 - chr9:27682445-27682593 NA NA NA NA NA chr9-107 27680287 27680591 202 - chr9:27680334-27680440 NA NA NA NA NA chr9-106 27579576 27579877 153 - chr9:27579720-27579721 NA NA NA NA NA chr9-105 27463035 27463240 146 - chr9:27463095-27463183 NA NA NA NA NA chr9-104 27461972 27462263 203 - chr9:27462080-27462239 NA NA NA NA NA chr9-103 27461111 27461449 183 - chr9:27461262-27461286 NA NA NA NA NA chr9-102 27459400 27459796 273 - chr9:27459578-27459728 NA NA NA NA NA chr9-101 27417450 27417711 171 - chr9:27417543-27417627 NA NA NA NA NA chr9-100 27356224 27356510 202 - chr9:27356282-27356422 NA NA NA NA NA chr9-99 27189024 27189293 158 - chr9:27189130-27189172 NA NA NA NA NA chr9-98 27101486 27101665 142 - chr9:27101510-27101602 NA NA NA NA NA chr9-97 27060216 27060389 129 - chr9:27060256-27060316 NA NA NA NA NA chr9-11 2704385 2704646 232 - chr9:2704411-2704585 NA NA NA NA NA chr9-96 27030937 27031192 167 - chr9:27031052-27031088 NA NA NA NA NA chr9-95 27011987 27012142 139 - chr9:27011987-27012094 NA NA NA NA NA chr9-94 26991290 26991642 211 - chr9:26991493-26991625 NA NA NA NA NA chr9-93 26980756 26981095 294 - chr9:26980803-26981054 NA NA NA NA NA chr9-92 26949620 26949884 235 - chr9:26949707-26949884 NA NA NA NA NA chr9-91 26936615 26936890 188 - chr9:26936738-26936821 NA NA NA NA NA chr9-90 26881636 26881803 141 - chr9:26881639-26881767 NA NA NA NA NA chr9-89 26840585 26840874 222 - chr9:26840722-26840842 NA NA NA NA NA chr9-88 26639609 26639795 173 - chr9:26639646-26639794 NA NA NA NA NA chr9 262497 262753 136 - chr9:262605-262627 NA NA NA NA NA chr9-87 26130167 26130451 155 - chr9:26130284-26130298 NA NA NA NA NA chr9-86 26021054 26021312 190 - chr9:26021067-26021223 NA NA NA NA NA chr9-85 26016541 26016983 230 - chr9:26016701-26016745 NA NA NA NA NA chr9-84 26002791 26003055 167 - chr9:26002832-26002890 NA NA NA NA NA chr9-83 25943684 25943873 114 - chr9:25943775-25943830 NA NA NA NA NA chr9-82 25881746 25882036 152 - chr9:25881885-25881900 NA NA NA NA NA chr9-81 25704052 25704250 158 - chr9:25704100-25704214 NA NA NA NA NA chr9-80 25582332 25582696 226 - chr9:25582522-25582584 NA NA NA NA NA chr9-79 25487911 25488323 234 - chr9:25488077-25488222 NA NA NA NA NA chr9-78 25119407 25119679 193 - chr9:25119534-25119624 NA NA NA NA NA chr9-77 24866837 24867022 133 - chr9:24866907-24866979 NA NA NA NA NA chr9-76 24704686 24705195 367 - chr9:24704730-24704857 NA NA NA NA NA chr9-75 24623434 24623667 162 - chr9:24623519-24623603 NA NA NA NA NA chr9-74 24622877 24623308 197 - chr9:24623160-24623172 NA NA NA NA NA chr9-73 24540321 24540632 158 - chr9:24540477-24540485 NA NA NA NA NA chr9-72 24461858 24462149 173 - chr9:24461948-24462017 NA NA NA NA NA chr9-71 24430388 24430654 240 - chr9:24430392-24430580 NA NA NA NA NA chr9-70 24422012 24422212 142 - chr9:24422074-24422162 NA NA NA NA NA chr9-69 23857102 23857265 158 - chr9:23857106-23857254 NA NA NA NA NA chr9-68 23527534 23527748 172 - chr9:23527569-23527692 NA NA NA NA NA chr9-67 23218882 23219228 226 - chr9:23218892-23219058 NA NA NA NA NA chr9-66 23081096 23081352 160 - chr9:23081184-23081240 NA NA NA NA NA chr9-65 23054633 23054831 154 - chr9:23054675-23054786 NA NA NA NA NA chr9-64 22689098 22689277 155 - chr9:22689124-22689254 NA NA NA NA NA chr9-63 21983653 21984228 359 - chr9:21983987-21984071 NA NA NA NA NA chr9-62 21700616 21700766 130 - chr9:21700616-21700706 NA NA NA NA NA chr9-61 21590698 21590889 115 - chr9:21590740-21590745 NA NA NA NA NA chr9-60 21573252 21573448 177 - chr9:21573267-21573427 NA NA NA NA NA chr9-59 21484512 21484845 161 - chr9:21484660-21484661 NA NA NA NA NA chr9-10 2116932 2117107 161 - chr9:2116949-2117099 NA NA NA NA NA chr9-58 19497364 19497647 151 - chr9:19497497-19497517 NA NA NA NA NA chr9-57 19193308 19193753 252 - chr9:19193476-19193510 NA NA NA NA NA chr9-56 18913281 18913603 213 - chr9:18913416-18913507 NA NA NA NA NA chr9-55 18906314 18906553 144 - chr9:18906403-18906455 NA NA NA NA NA chr9-54 17617600 17617780 130 - chr9:17617690-17617750 NA NA NA NA NA chr9-53 16794950 16795183 165 - chr9:16795078-16795145 NA NA NA NA NA chr9-52 16702007 16702188 155 - chr9:16702043-16702167 NA NA NA NA NA chr9-51 16632956 16633104 147 - chr9:16632959-16633104 NA NA NA NA NA chr9-50 16427681 16428070 201 - chr9:16427908-16427960 NA NA NA NA NA chr9-49 16172150 16172330 165 - chr9:16172159-16172312 NA NA NA NA NA chr9-9 1611975 1612191 142 - chr9:1612050-1612119 NA NA NA NA NA chr9-48 15940923 15941361 248 - chr9:15941198-15941351 NA NA NA NA NA chr9-47 15938861 15939355 260 - chr9:15938911-15939029 NA NA NA NA NA chr9-46 15174914 15175103 127 - chr9:15174959-15175007 NA NA NA NA NA chr9-45 14763374 14763811 218 - chr9:14763451-14763521 NA NA NA NA NA chr9-44 14334803 14335154 242 - chr9:14335004-14335091 NA NA NA NA NA chr9-43 14284442 14284885 309 - chr9:14284577-14284868 NA NA NA NA NA chr9-8 1417576 1417769 163 - chr9:1417618-1417766 NA NA NA NA NA chr9-42 14101859 14102041 141 - chr9:14101904-14102008 NA NA NA NA NA chr9-7 1379392 1379653 220 - chr9:1379395-1379552 NA NA NA NA NA chr9-519 137573782 137574435 367 - chr9:137573944-137574087 NA NA NA NA NA chr9-518 137001240 137001719 275 - chr9:137001478-137001532 NA NA NA NA NA chr9-41 13680698 13680997 204 - chr9:13680769-13680854 NA NA NA NA NA chr9-517 135942852 135943228 283 - chr9:135942939-135943181 NA NA NA NA NA chr9-516 135866491 135866745 188 - chr9:135866563-135866619 NA NA NA NA NA chr9-40 13576236 13576431 140 - chr9:13576261-13576361 NA NA NA NA NA chr9-515 135328020 135328173 149 - chr9:135328025-135328172 NA NA NA NA NA chr9-514 134923904 134924350 220 - chr9:134923986-134924052 NA NA NA NA NA chr9-513 134915314 134915580 161 - chr9:134915439-134915485 NA NA NA NA NA chr9-512 133189783 133190120 246 - chr9:133189827-133189935 NA NA NA NA NA chr9-511 132924283 132924612 220 - chr9:132924314-132924464 NA NA NA NA NA chr9-510 132841944 132842221 151 - chr9:132842063-132842081 NA NA NA NA NA chr9-509 132836703 132836888 158 - chr9:132836730-132836861 NA NA NA NA NA chr9-508 132379392 132379568 162 - chr9:132379409-132379564 NA NA NA NA NA chr9-507 132375469 132375637 149 - chr9:132375486-132375617 NA NA NA NA NA chr9-506 132218870 132219064 145 - chr9:132218927-132219031 NA NA NA NA NA chr9-505 132012454 132012671 153 - chr9:132012528-132012627 NA NA NA NA NA chr9-504 131972148 131972319 116 - chr9:131972218-131972294 NA NA NA NA NA chr9-503 131941498 131941721 138 - chr9:131941573-131941631 NA NA NA NA NA chr9-502 131938096 131938371 148 - chr9:131938223-131938244 NA NA NA NA NA chr9-501 131836584 131837155 272 - chr9:131836981-131837052 NA NA NA NA NA chr9-500 131648402 131648688 150 - chr9:131648538-131648552 NA NA NA NA NA chr9-499 131524124 131524418 149 - chr9:131524268-131524271 NA NA NA NA NA chr9-498 131194619 131195063 237 - chr9:131194810-131194824 NA NA NA NA NA chr9-497 131193713 131194011 206 - chr9:131193851-131194011 NA NA NA NA NA chr9-496 131186744 131187073 194 - chr9:131186933-131187046 NA NA NA NA NA chr9-495 131182057 131182352 154 - chr9:131182201-131182217 NA NA NA NA NA chr9-494 131135615 131135925 186 - chr9:131135722-131135767 NA NA NA NA NA chr9-493 131044491 131044828 202 - chr9:131044686-131044723 NA NA NA NA NA chr9-492 130870061 130870317 121 - chr9:130870227-130870244 NA NA NA NA NA chr9-491 130581263 130581656 281 - chr9:130581475-130581594 NA NA NA NA NA chr9-490 130352179 130352659 217 - chr9:130352505-130352522 NA NA NA NA NA chr9-489 130351074 130351307 194 - chr9:130351125-130351274 NA NA NA NA NA chr9-488 130233173 130233548 186 - chr9:130233332-130233344 NA NA NA NA NA chr9-487 130088333 130088601 194 - chr9:130088438-130088595 NA NA NA NA NA chr9-486 130015140 130015438 198 - chr9:130015288-130015316 NA NA NA NA NA chr9-39 12916852 12917035 115 - chr9:12916891-12916909 NA NA NA NA NA chr9-485 128734664 128734913 133 - chr9:128734740-128734777 NA NA NA NA NA chr9-484 128601291 128601530 146 - chr9:128601382-128601436 NA NA NA NA NA chr9-483 128512415 128512841 263 - chr9:128512537-128512596 NA NA NA NA NA chr9-482 128324730 128325158 201 - chr9:128325004-128325025 NA NA NA NA NA chr9-38 12783866 12784190 178 - chr9:12783882-12783979 NA NA NA NA NA chr9-481 127330010 127330339 266 - chr9:127330192-127330332 NA NA NA NA NA chr9-480 125618047 125618554 365 - chr9:125618165-125618517 NA NA NA NA NA chr9-479 125579762 125580132 193 - chr9:125579867-125580009 NA NA NA NA NA chr9-478 125366115 125366372 152 - chr9:125366229-125366306 NA NA NA NA NA chr9-477 125260124 125260294 142 - chr9:125260144-125260262 NA NA NA NA NA chr9-476 124897608 124898068 271 - chr9:124897814-124897913 NA NA NA NA NA chr9-475 124527183 124527500 155 - chr9:124527255-124527293 NA NA NA NA NA chr9-474 124164298 124164656 252 - chr9:124164358-124164458 NA NA NA NA NA chr9-473 123948295 123948480 157 - chr9:123948305-123948416 NA NA NA NA NA chr9-472 122280022 122280437 203 - chr9:122280283-122280323 NA NA NA NA NA chr9-37 12184718 12185014 146 - chr9:12184881-12184890 NA NA NA NA NA chr9-471 121199813 121200042 195 - chr9:121199891-121200030 NA NA NA NA NA chr9-470 120871566 120871833 153 - chr9:120871682-120871723 NA NA NA NA NA chr9-469 120614350 120614500 126 - chr9:120614386-120614482 NA NA NA NA NA chr9-468 120291371 120291522 146 - chr9:120291375-120291515 NA NA NA NA NA chr9-467 119196017 119196243 150 - chr9:119196091-119196166 NA NA NA NA NA chr9-466 117862287 117862594 205 - chr9:117862355-117862475 NA NA NA NA NA chr9-465 117435205 117435507 194 - chr9:117435238-117435378 NA NA NA NA NA chr9-464 116847575 116847859 144 - chr9:116847693-116847708 NA NA NA NA NA chr9-463 116131020 116131234 145 - chr9:116131088-116131161 NA NA NA NA NA chr9-462 115732202 115732692 322 - chr9:115732312-115732408 NA NA NA NA NA chr9-461 115665593 115665764 167 - chr9:115665599-115665764 NA NA NA NA NA chr9-460 115463347 115463500 122 - chr9:115463403-115463463 NA NA NA NA NA chr9-459 115285090 115285506 234 - chr9:115285377-115285382 NA NA NA NA NA chr9-36 11491194 11491343 143 - chr9:11491196-11491336 NA NA NA NA NA chr9-35 11478024 11478310 157 - chr9:11478150-11478175 NA NA NA NA NA chr9-458 114726766 114726969 141 - chr9:114726846-114726916 NA NA NA NA NA chr9-457 114401525 114401743 180 - chr9:114401546-114401671 NA NA NA NA NA chr9-456 113634678 113634845 139 - chr9:113634713-113634831 NA NA NA NA NA chr9-455 113223115 113223302 141 - chr9:113223162-113223258 NA NA NA NA NA chr9-454 113051026 113051288 160 - chr9:113051136-113051202 NA NA NA NA NA chr9-453 112624034 112624588 246 - chr9:112624174-112624196 NA NA NA NA NA chr9-452 112458918 112459194 198 - chr9:112458954-112459095 NA NA NA NA NA chr9-451 111994311 111994573 172 - chr9:111994425-111994531 NA NA NA NA NA chr9-450 111936825 111937246 261 - chr9:111937167-111937177 NA NA NA NA NA chr9-449 111870784 111871247 221 - chr9:111870957-111870996 NA NA NA NA NA chr9-448 111708736 111708977 214 - chr9:111708778-111708938 NA NA NA NA NA chr9-447 111533821 111534102 206 - chr9:111533896-111533952 NA NA NA NA NA chr9-446 111467733 111467936 127 - chr9:111467779-111467845 NA NA NA NA NA chr9-445 111089488 111089702 155 - chr9:111089565-111089652 NA NA NA NA NA chr9-444 111073878 111074100 148 - chr9:111073951-111074024 NA NA NA NA NA chr9-443 110821440 110821806 193 - chr9:110821500-110821649 NA NA NA NA NA chr9-442 110749079 110749293 161 - chr9:110749118-110749233 NA NA NA NA NA chr9-441 110523848 110524013 161 - chr9:110523851-110524010 NA NA NA NA NA chr9-440 110135436 110135703 141 - chr9:110135565-110135583 NA NA NA NA NA chr9-439 110130206 110130398 154 - chr9:110130241-110130354 NA NA NA NA NA chr9-438 110118686 110118914 140 - chr9:110118804-110118886 NA NA NA NA NA chr9-437 109399182 109399650 246 - chr9:109399499-109399608 NA NA NA NA NA chr9-436 109264118 109264506 235 - chr9:109264330-109264471 NA NA NA NA NA chr9-435 109146793 109146940 144 - chr9:109146802-109146940 NA NA NA NA NA chr9-434 109143653 109143905 179 - chr9:109143703-109143832 NA NA NA NA NA chr9-433 109042123 109042282 154 - chr9:109042123-109042267 NA NA NA NA NA chr9-432 108965042 108965215 163 - chr9:108965048-108965197 NA NA NA NA NA chr9-431 108489880 108490262 224 - chr9:108490086-108490128 NA NA NA NA NA chr9-430 108459615 108459891 235 - chr9:108459711-108459864 NA NA NA NA NA chr9-429 108457239 108457509 237 - chr9:108457260-108457431 NA NA NA NA NA chr9-428 108117888 108118067 141 - chr9:108117926-108118029 NA NA NA NA NA chr9-427 108064422 108064671 174 - chr9:108064445-108064570 NA NA NA NA NA chr9-426 107958151 107958443 170 - chr9:107958336-107958401 NA NA NA NA NA chr9-425 107933676 107934038 207 - chr9:107933893-107933914 NA NA NA NA NA chr9-424 107543462 107543715 152 - chr9:107543521-107543593 NA NA NA NA NA chr9-423 107460202 107460559 213 - chr9:107460363-107460508 NA NA NA NA NA chr9-422 107373998 107374200 183 - chr9:107374009-107374165 NA NA NA NA NA chr9-421 107351547 107351934 186 - chr9:107351708-107351713 NA NA NA NA NA chr9-420 107239134 107239567 247 - chr9:107239413-107239567 NA NA NA NA NA chr9-419 107121912 107122314 322 - chr9:107121934-107122096 NA NA NA NA NA chr9-418 106926797 106927008 144 - chr9:106926878-106926948 NA NA NA NA NA chr9-417 106442482 106442727 115 - chr9:106442508-106442545 NA NA NA NA NA chr9-416 106386677 106386886 132 - chr9:106386788-106386826 NA NA NA NA NA chr9-415 105882860 105883048 140 - chr9:105882944-105883018 NA NA NA NA NA chr9-34 10542947 10543104 156 - chr9:10542950-10543104 NA NA NA NA NA chr9-414 105387073 105387337 163 - chr9:105387185-105387258 NA NA NA NA NA chr9-413 105349515 105349706 176 - chr9:105349527-105349685 NA NA NA NA NA chr9-412 105272239 105272665 195 - chr9:105272516-105272526 NA NA NA NA NA chr9-411 105153716 105153912 132 - chr9:105153807-105153902 NA NA NA NA NA chr9-410 104572291 104572801 374 - chr9:104572385-104572664 NA NA NA NA NA chr9-409 104561781 104562122 160 - chr9:104562024-104562065 NA NA NA NA NA chr9-408 104543252 104543410 154 - chr9:104543258-104543407 NA NA NA NA NA chr9-407 104279577 104279940 223 - chr9:104279749-104279902 NA NA NA NA NA chr9-406 104167840 104167990 148 - chr9:104167843-104167990 NA NA NA NA NA chr9-405 104069022 104069417 316 - chr9:104069087-104069245 NA NA NA NA NA chr9-404 104022237 104022452 134 - chr9:104022332-104022399 NA NA NA NA NA chr9-403 103796155 103796310 116 - chr9:103796256-103796302 NA NA NA NA NA chr9-402 103720868 103721048 161 - chr9:103720887-103721029 NA NA NA NA NA chr9-401 103465424 103465653 164 - chr9:103465484-103465578 NA NA NA NA NA chr9-400 103381039 103381275 120 - chr9:103381147-103381155 NA NA NA NA NA chr9-399 103255975 103256128 149 - chr9:103255977-103256123 NA NA NA NA NA chr9-398 103072451 103072833 275 - chr9:103072495-103072600 NA NA NA NA NA chr9-397 103025618 103025941 258 - chr9:103025713-103025891 NA NA NA NA NA chr9-396 102513531 102514206 424 - chr9:102513809-102513873 NA NA NA NA NA chr9-33 10231738 10232207 225 - chr9:10231818-10231881 NA NA NA NA NA chr9-395 102287578 102288028 245 - chr9:102287835-102287901 NA NA NA NA NA chr9-394 101676498 101676840 244 - chr9:101676620-101676719 NA NA NA NA NA chr9-393 101663592 101663879 151 - chr9:101663722-101663740 NA NA NA NA NA chr9-392 101485463 101485703 195 - chr9:101485488-101485618 NA NA NA NA NA chr9-391 101388954 101389383 253 - chr9:101389230-101389257 NA NA NA NA NA chr9-390 100927852 100928303 251 - chr9:100927910-100928061 NA NA NA NA NA chr9-389 100860969 100861353 189 - chr9:100861209-100861248 NA NA NA NA NA chr9-388 100570234 100570511 170 - chr9:100570341-100570404 NA NA NA NA NA chr9-387 100549333 100549663 179 - chr9:100549479-100549502 NA NA NA NA NA chr9-386 100481232 100481531 199 - chr9:100481262-100481411 NA NA NA NA NA chr9-385 100424060 100424300 173 - chr9:100424154-100424287 NA NA NA NA NA chr9-384 100108630 100108819 137 - chr9:100108727-100108760 NA NA NA NA NA chr9-383 100010162 100010350 152 - chr9:100010210-100010338 NA NA NA NA NA chr8-598 99962853 99963062 156 - chr8:99962890-99963001 NA NA NA NA NA chr8-597 99660333 99660557 199 - chr8:99660366-99660515 NA NA NA NA NA chr8-596 99600198 99600473 165 - chr8:99600300-99600359 NA NA NA NA NA chr8-595 99466302 99466549 171 - chr8:99466400-99466484 NA NA NA NA NA chr8-594 99436094 99436395 147 - chr8:99436324-99436394 NA NA NA NA NA chr8-593 99251090 99251397 164 - chr8:99251199-99251237 NA NA NA NA NA chr8-592 98881810 98882001 172 - chr8:98881830-98881984 NA NA NA NA NA chr8-591 98750585 98750910 192 - chr8:98750785-98750852 NA NA NA NA NA chr8-590 98691367 98691766 259 - chr8:98691549-98691710 NA NA NA NA NA chr8-589 98668055 98668250 165 - chr8:98668079-98668208 NA NA NA NA NA chr8-588 98645763 98646051 151 - chr8:98645902-98645918 NA NA NA NA NA chr8-587 98609237 98609452 139 - chr8:98609325-98609400 NA NA NA NA NA chr8-586 98409664 98409978 291 - chr8:98409689-98409959 NA NA NA NA NA chr8-585 98345318 98345579 203 - chr8:98345403-98345524 NA NA NA NA NA chr8-584 98195124 98195395 188 - chr8:98195248-98195394 NA NA NA NA NA chr8-583 97886647 97887069 248 - chr8:97886882-97887017 NA NA NA NA NA chr8-15 9754146 9754318 120 - chr8:9754175-9754269 NA NA NA NA NA chr8-582 96877935 96878126 157 - chr8:96877949-96878082 NA NA NA NA NA chr8-581 96632642 96632836 143 - chr8:96632671-96632774 NA NA NA NA NA chr8-580 96337889 96338190 215 - chr8:96337980-96338152 NA NA NA NA NA chr8-579 96273731 96273965 161 - chr8:96273798-96273880 NA NA NA NA NA chr8-14 9601553 9601717 121 - chr8:9601606-9601679 NA NA NA NA NA chr8-578 95889142 95889429 154 - chr8:95889271-95889288 NA NA NA NA NA chr8-577 95851291 95851459 160 - chr8:95851306-95851450 NA NA NA NA NA chr8-576 95774997 95775289 200 - chr8:95775077-95775173 NA NA NA NA NA chr8-575 95616250 95616710 308 - chr8:95616426-95616606 NA NA NA NA NA chr8-574 95565042 95565209 152 - chr8:95565050-95565180 NA NA NA NA NA chr8-573 95045727 95046015 196 - chr8:95045861-95045944 NA NA NA NA NA chr8-572 95016175 95016501 262 - chr8:95016177-95016323 NA NA NA NA NA chr8-571 94977868 94978224 268 - chr8:94977901-94978026 NA NA NA NA NA chr8-570 94947723 94948006 188 - chr8:94947734-94947869 NA NA NA NA NA chr8-569 94946803 94947094 219 - chr8:94946841-94946954 NA NA NA NA NA chr8-568 94843780 94843967 161 - chr8:94843802-94843939 NA NA NA NA NA chr8-567 94507470 94507814 190 - chr8:94507665-94507742 NA NA NA NA NA chr8-566 94502986 94503201 158 - chr8:94503046-94503142 NA NA NA NA NA chr8-565 93565063 93565224 157 - chr8:93565067-93565216 NA NA NA NA NA chr8-564 93146268 93146768 215 - chr8:93146383-93146398 NA NA NA NA NA chr8-563 92976001 92976316 190 - chr8:92976167-92976273 NA NA NA NA NA chr8-562 92922818 92923000 173 - chr8:92922827-92922982 NA NA NA NA NA chr8-13 9281252 9281476 123 - chr8:9281393-9281455 NA NA NA NA NA chr8-561 92622897 92623118 162 - chr8:92622938-92623050 NA NA NA NA NA chr8-560 92466987 92467176 120 - chr8:92467104-92467131 NA NA NA NA NA chr8-559 92340629 92340956 209 - chr8:92340788-92340938 NA NA NA NA NA chr8-558 92225769 92226128 197 - chr8:92225829-92225915 NA NA NA NA NA chr8-557 92132520 92132707 164 - chr8:92132549-92132696 NA NA NA NA NA chr8-556 92099256 92099413 135 - chr8:92099264-92099384 NA NA NA NA NA chr8-555 92077102 92077338 182 - chr8:92077212-92077286 NA NA NA NA NA chr8-12 9203187 9203629 274 - chr8:9203257-9203447 NA NA NA NA NA chr8-554 92010382 92010666 226 - chr8:92010474-92010599 NA NA NA NA NA chr8-553 91883843 91884354 328 - chr8:91883937-91884184 NA NA NA NA NA chr8-552 91855948 91856312 187 - chr8:91856031-91856088 NA NA NA NA NA chr8-551 91759729 91760048 165 - chr8:91759882-91759892 NA NA NA NA NA chr8-550 91659743 91659914 152 - chr8:91659764-91659899 NA NA NA NA NA chr8-549 91536056 91536320 156 - chr8:91536166-91536213 NA NA NA NA NA chr8-548 91353249 91353509 186 - chr8:91353299-91353448 NA NA NA NA NA chr8-547 91290176 91290413 161 - chr8:91290249-91290331 NA NA NA NA NA chr8-546 91277288 91277537 144 - chr8:91277394-91277434 NA NA NA NA NA chr8-545 91207284 91207680 326 - chr8:91207363-91207654 NA NA NA NA NA chr8-544 91118866 91119125 153 - chr8:91118976-91119021 NA NA NA NA NA chr8-543 90975994 90976584 312 - chr8:90976290-90976315 NA NA NA NA NA chr8-542 90358640 90358890 143 - chr8:90358735-90358777 NA NA NA NA NA chr8-541 90213440 90213877 201 - chr8:90213725-90213739 NA NA NA NA NA chr8-540 90123282 90123696 197 - chr8:90123546-90123573 NA NA NA NA NA chr8-539 89991751 89992181 210 - chr8:89991843-89991897 NA NA NA NA NA chr8-11 8989933 8990103 164 - chr8:8989933-8990094 NA NA NA NA NA chr8-538 89868031 89868299 188 - chr8:89868067-89868197 NA NA NA NA NA chr8-537 89688279 89688479 147 - chr8:89688328-89688418 NA NA NA NA NA chr8-536 89652388 89652566 126 - chr8:89652461-89652556 NA NA NA NA NA chr8-535 89651577 89651903 184 - chr8:89651647-89651725 NA NA NA NA NA chr8-534 89610534 89610791 150 - chr8:89610641-89610684 NA NA NA NA NA chr8-533 89601607 89601897 160 - chr8:89601731-89601755 NA NA NA NA NA chr8-532 89517191 89517436 198 - chr8:89517242-89517397 NA NA NA NA NA chr8-531 89357687 89358017 188 - chr8:89357803-89357862 NA NA NA NA NA chr8-530 89232323 89232714 190 - chr8:89232444-89232473 NA NA NA NA NA chr8-529 89199825 89200217 203 - chr8:89199924-89199983 NA NA NA NA NA chr8-528 89188398 89188795 235 - chr8:89188617-89188747 NA NA NA NA NA chr8-527 89028284 89028464 137 - chr8:89028303-89028373 NA NA NA NA NA chr8-526 88991452 88991786 169 - chr8:88991638-88991663 NA NA NA NA NA chr8-525 88979637 88979855 163 - chr8:88979672-88979790 NA NA NA NA NA chr8-524 88965604 88965843 135 - chr8:88965736-88965753 NA NA NA NA NA chr8-523 88955408 88955875 222 - chr8:88955716-88955756 NA NA NA NA NA chr8-522 88926834 88927020 114 - chr8:88926976-88926983 NA NA NA NA NA chr8-521 88909676 88909828 147 - chr8:88909676-88909813 NA NA NA NA NA chr8-520 88874570 88874840 151 - chr8:88874690-88874725 NA NA NA NA NA chr8-519 88807168 88807397 153 - chr8:88807200-88807233 NA NA NA NA NA chr8-518 88710961 88711589 414 - chr8:88711052-88711129 NA NA NA NA NA chr8-517 88707920 88708203 145 - chr8:88708042-88708057 NA NA NA NA NA chr8-516 88698502 88698755 185 - chr8:88698600-88698747 NA NA NA NA NA chr8-515 88639696 88639987 152 - chr8:88639838-88639854 NA NA NA NA NA chr8-514 88519073 88519334 161 - chr8:88519167-88519231 NA NA NA NA NA chr8-513 88489347 88489655 191 - chr8:88489348-88489480 NA NA NA NA NA chr8-512 88431756 88432101 197 - chr8:88431955-88431980 NA NA NA NA NA chr8-511 88397853 88398187 192 - chr8:88397975-88398005 NA NA NA NA NA chr8-510 88372721 88373161 333 - chr8:88372971-88373124 NA NA NA NA NA chr8-509 88331910 88332234 178 - chr8:88332087-88332192 NA NA NA NA NA chr8-508 88273827 88273966 134 - chr8:88273832-88273961 NA NA NA NA NA chr8-507 88243554 88243787 157 - chr8:88243614-88243703 NA NA NA NA NA chr8-506 88205707 88205856 145 - chr8:88205715-88205854 NA NA NA NA NA chr8-505 88095712 88095907 146 - chr8:88095766-88095868 NA NA NA NA NA chr8-504 88094817 88095029 176 - chr8:88094873-88095003 NA NA NA NA NA chr8-503 88040744 88040995 203 - chr8:88040772-88040907 NA NA NA NA NA chr8-502 87984183 87984424 141 - chr8:87984279-87984322 NA NA NA NA NA chr8-501 87969857 87970309 184 - chr8:87970221-87970233 NA NA NA NA NA chr8-500 87942494 87942837 148 - chr8:87942571-87942583 NA NA NA NA NA chr8-499 87923383 87923571 166 - chr8:87923423-87923558 NA NA NA NA NA chr8-498 87898402 87898854 286 - chr8:87898715-87898814 NA NA NA NA NA chr8-497 87820235 87820473 185 - chr8:87820295-87820434 NA NA NA NA NA chr8-496 87815229 87815512 174 - chr8:87815324-87815396 NA NA NA NA NA chr8-495 87773378 87773773 225 - chr8:87773453-87773464 NA NA NA NA NA chr8-494 87698482 87698710 135 - chr8:87698611-87698635 NA NA NA NA NA chr8-493 87658116 87658819 456 - chr8:87658368-87658568 NA NA NA NA NA chr8-492 87635369 87635735 224 - chr8:87635476-87635535 NA NA NA NA NA chr8-491 87533483 87533797 169 - chr8:87533633-87533662 NA NA NA NA NA chr8-490 87369197 87369385 150 - chr8:87369240-87369357 NA NA NA NA NA chr8-489 87309618 87309820 143 - chr8:87309652-87309711 NA NA NA NA NA chr8-488 87233642 87233905 153 - chr8:87233745-87233781 NA NA NA NA NA chr8-487 87152456 87152656 147 - chr8:87152511-87152604 NA NA NA NA NA chr8-10 8710897 8711195 180 - chr8:8711048-8711143 NA NA NA NA NA chr8-486 86991323 86991531 149 - chr8:86991390-86991476 NA NA NA NA NA chr8-485 86972547 86972804 148 - chr8:86972657-86972697 NA NA NA NA NA chr8-484 86807799 86807993 112 - chr8:86807844-86807857 NA NA NA NA NA chr8-483 86802922 86803113 122 - chr8:86802964-86802990 NA NA NA NA NA chr8-482 86764854 86765142 212 - chr8:86764879-86765053 NA NA NA NA NA chr8-481 86755293 86755686 162 - chr8:86755541-86755573 NA NA NA NA NA chr8-480 86612400 86612787 185 - chr8:86612455-86612539 NA NA NA NA NA chr8-479 86569160 86569317 138 - chr8:86569182-86569304 NA NA NA NA NA chr8-478 86426228 86426450 192 - chr8:86426267-86426399 NA NA NA NA NA chr8-477 86392707 86393021 190 - chr8:86392759-86392861 NA NA NA NA NA chr8-476 86374515 86374709 147 - chr8:86374556-86374650 NA NA NA NA NA chr8-475 86361545 86361764 154 - chr8:86361613-86361705 NA NA NA NA NA chr8-474 86153746 86154542 358 - chr8:86154384-86154442 NA NA NA NA NA chr8-473 86131173 86131396 173 - chr8:86131242-86131384 NA NA NA NA NA chr8-472 86122001 86122280 159 - chr8:86122075-86122174 NA NA NA NA NA chr8-471 86109311 86109541 161 - chr8:86109392-86109478 NA NA NA NA NA chr8-470 86101754 86102058 245 - chr8:86101911-86102050 NA NA NA NA NA chr8-469 85993696 85993972 230 - chr8:85993831-85993969 NA NA NA NA NA chr8-468 85964840 85965001 150 - chr8:85964842-85964970 NA NA NA NA NA chr8-467 85956010 85956299 154 - chr8:85956149-85956172 NA NA NA NA NA chr8-466 85625047 85625311 169 - chr8:85625164-85625227 NA NA NA NA NA chr8-465 85555386 85555655 154 - chr8:85555507-85555543 NA NA NA NA NA chr8-464 85520401 85520559 157 - chr8:85520402-85520558 NA NA NA NA NA chr8-463 85473430 85473721 159 - chr8:85473558-85473581 NA NA NA NA NA chr8-462 85351911 85352059 112 - chr8:85351948-85351988 NA NA NA NA NA chr8-461 85313264 85313452 147 - chr8:85313315-85313416 NA NA NA NA NA chr8-460 85302518 85302921 194 - chr8:85302640-85302671 NA NA NA NA NA chr8-459 85284483 85284836 211 - chr8:85284653-85284793 NA NA NA NA NA chr8-458 85186782 85186974 160 - chr8:85186811-85186936 NA NA NA NA NA chr8-457 85140925 85141130 150 - chr8:85140989-85141093 NA NA NA NA NA chr8-456 85140407 85140571 142 - chr8:85140424-85140539 NA NA NA NA NA chr8-455 85117237 85117677 192 - chr8:85117556-85117571 NA NA NA NA NA chr8-454 85096047 85096374 216 - chr8:85096240-85096317 NA NA NA NA NA chr8-453 85011815 85012219 192 - chr8:85012044-85012130 NA NA NA NA NA chr8-452 84837603 84837988 264 - chr8:84837617-84837752 NA NA NA NA NA chr8-451 84830340 84830666 251 - chr8:84830429-84830530 NA NA NA NA NA chr8-450 84770667 84770831 136 - chr8:84770670-84770750 NA NA NA NA NA chr8-449 84758796 84759207 208 - chr8:84758904-84759057 NA NA NA NA NA chr8-448 84629113 84629462 261 - chr8:84629179-84629330 NA NA NA NA NA chr8-447 84622142 84622404 224 - chr8:84622202-84622350 NA NA NA NA NA chr8-446 84415581 84415817 150 - chr8:84415661-84415728 NA NA NA NA NA chr8-445 84390745 84391131 217 - chr8:84390884-84390947 NA NA NA NA NA chr8-444 84305133 84305623 345 - chr8:84305236-84305457 NA NA NA NA NA chr8-443 84220115 84220446 168 - chr8:84220266-84220277 NA NA NA NA NA chr8-442 84153753 84153975 155 - chr8:84153806-84153903 NA NA NA NA NA chr8-441 84100083 84100356 157 - chr8:84100224-84100290 NA NA NA NA NA chr8-440 84065272 84065596 196 - chr8:84065427-84065522 NA NA NA NA NA chr8-439 83988450 83988624 162 - chr8:83988459-83988606 NA NA NA NA NA chr8-438 83935527 83935739 163 - chr8:83935529-83935594 NA NA NA NA NA chr8-437 83893278 83893461 152 - chr8:83893323-83893437 NA NA NA NA NA chr8-436 83816487 83816911 339 - chr8:83816497-83816676 NA NA NA NA NA chr8-435 83801305 83801711 234 - chr8:83801456-83801497 NA NA NA NA NA chr8-434 83754716 83755097 213 - chr8:83754949-83755059 NA NA NA NA NA chr8-433 83689773 83690021 127 - chr8:83689798-83689852 NA NA NA NA NA chr8-432 83572606 83572771 116 - chr8:83572626-83572664 NA NA NA NA NA chr8-431 83556308 83556480 133 - chr8:83556321-83556389 NA NA NA NA NA chr8-430 83399877 83400437 232 - chr8:83400205-83400268 NA NA NA NA NA chr8-429 83310810 83311195 225 - chr8:83311048-83311191 NA NA NA NA NA chr8-428 83288833 83289131 204 - chr8:83288974-83289131 NA NA NA NA NA chr8-427 83260803 83261050 136 - chr8:83260897-83260908 NA NA NA NA NA chr8-426 83260497 83260732 121 - chr8:83260627-83260650 NA NA NA NA NA chr8-425 83217519 83217839 203 - chr8:83217688-83217748 NA NA NA NA NA chr8-424 82965727 82965937 153 - chr8:82965776-82965876 NA NA NA NA NA chr8-423 82928359 82928821 230 - chr8:82928521-82928554 NA NA NA NA NA chr8-422 82926670 82926839 147 - chr8:82926696-82926819 NA NA NA NA NA chr8-421 82868115 82868273 142 - chr8:82868143-82868263 NA NA NA NA NA chr8-420 82859695 82859858 159 - chr8:82859705-82859856 NA NA NA NA NA chr8-419 82855416 82855773 216 - chr8:82855480-82855647 NA NA NA NA NA chr8-418 82771689 82771903 134 - chr8:82771757-82771817 NA NA NA NA NA chr8-417 82712323 82712618 249 - chr8:82712450-82712607 NA NA NA NA NA chr8-416 82633092 82633461 263 - chr8:82633094-82633145 NA NA NA NA NA chr8-415 82470199 82470433 154 - chr8:82470277-82470352 NA NA NA NA NA chr8-414 82445658 82446456 370 - chr8:82446305-82446312 NA NA NA NA NA chr8-413 82275623 82275954 205 - chr8:82275751-82275893 NA NA NA NA NA chr8-412 82235322 82235506 168 - chr8:82235328-82235470 NA NA NA NA NA chr8-411 82185263 82185770 305 - chr8:82185306-82185603 NA NA NA NA NA chr8-410 82151083 82151496 188 - chr8:82151226-82151230 NA NA NA NA NA chr8-409 81948805 81948978 167 - chr8:81948807-81948964 NA NA NA NA NA chr8-408 81868254 81868604 201 - chr8:81868446-81868541 NA NA NA NA NA chr8-407 81677920 81678109 150 - chr8:81677959-81678070 NA NA NA NA NA chr8-406 81568428 81568892 364 - chr8:81568499-81568744 NA NA NA NA NA chr8-405 81529184 81529487 162 - chr8:81529307-81529337 NA NA NA NA NA chr8-404 81476841 81477123 171 - chr8:81476976-81477060 NA NA NA NA NA chr8-403 81456462 81456750 212 - chr8:81456518-81456692 NA NA NA NA NA chr8-402 81267856 81268345 308 - chr8:81267887-81268012 NA NA NA NA NA chr8-401 81252224 81252448 142 - chr8:81252295-81252344 NA NA NA NA NA chr8-400 81237655 81237817 148 - chr8:81237676-81237817 NA NA NA NA NA chr8-399 81219299 81219585 196 - chr8:81219368-81219519 NA NA NA NA NA chr8-398 81133603 81133785 152 - chr8:81133627-81133752 NA NA NA NA NA chr8-397 81132086 81132336 129 - chr8:81132219-81132239 NA NA NA NA NA chr8-396 80994079 80994215 116 - chr8:80994091-80994179 NA NA NA NA NA chr8-395 80985430 80985660 144 - chr8:80985509-80985610 NA NA NA NA NA chr8-394 80808521 80808748 198 - chr8:80808572-80808712 NA NA NA NA NA chr8-393 80790290 80790652 250 - chr8:80790356-80790448 NA NA NA NA NA chr8-392 80677031 80677235 165 - chr8:80677062-80677192 NA NA NA NA NA chr8-391 80609639 80609798 115 - chr8:80609648-80609741 NA NA NA NA NA chr8-390 80520669 80521011 196 - chr8:80520859-80520934 NA NA NA NA NA chr8-389 80482686 80483080 215 - chr8:80482793-80482848 NA NA NA NA NA chr8-388 80387520 80387701 150 - chr8:80387553-80387674 NA NA NA NA NA chr8-387 80307552 80307766 181 - chr8:80307583-80307729 NA NA NA NA NA chr8-386 79996365 79996582 157 - chr8:79996431-79996534 NA NA NA NA NA chr8-385 79935630 79936096 342 - chr8:79935868-79936029 NA NA NA NA NA chr8-384 79893657 79894015 271 - chr8:79893716-79893880 NA NA NA NA NA chr8-383 79892878 79893206 169 - chr8:79893055-79893056 NA NA NA NA NA chr8-382 79891449 79891741 231 - chr8:79891464-79891588 NA NA NA NA NA chr8-381 79863034 79863505 253 - chr8:79863296-79863440 NA NA NA NA NA chr8-380 79761625 79762008 206 - chr8:79761794-79761827 NA NA NA NA NA chr8-379 79469324 79469582 136 - chr8:79469446-79469460 NA NA NA NA NA chr8-378 79395256 79395552 183 - chr8:79395297-79395403 NA NA NA NA NA chr8-377 79370524 79370791 147 - chr8:79370636-79370667 NA NA NA NA NA chr8-376 79270297 79270708 248 - chr8:79270382-79270389 NA NA NA NA NA chr8-375 79240942 79241405 352 - chr8:79240961-79241132 NA NA NA NA NA chr8-374 78819450 78819645 116 - chr8:78819544-78819596 NA NA NA NA NA chr8-373 78731647 78731838 140 - chr8:78731678-78731777 NA NA NA NA NA chr8-372 78711017 78711263 149 - chr8:78711126-78711172 NA NA NA NA NA chr8-371 78675339 78675616 159 - chr8:78675443-78675470 NA NA NA NA NA chr8-370 78662306 78662548 179 - chr8:78662397-78662499 NA NA NA NA NA chr8-369 78657604 78657782 137 - chr8:78657644-78657739 NA NA NA NA NA chr8-368 78633681 78634188 255 - chr8:78633899-78633919 NA NA NA NA NA chr8-367 78564611 78564895 255 - chr8:78564684-78564881 NA NA NA NA NA chr8-366 78491014 78491326 182 - chr8:78491155-78491195 NA NA NA NA NA chr8-365 78483306 78483498 153 - chr8:78483338-78483445 NA NA NA NA NA chr8-364 78465069 78465349 143 - chr8:78465217-78465234 NA NA NA NA NA chr8-363 78388997 78389264 143 - chr8:78389127-78389152 NA NA NA NA NA chr8-362 78234311 78234595 183 - chr8:78234423-78234477 NA NA NA NA NA chr8-361 78166138 78166406 238 - chr8:78166149-78166327 NA NA NA NA NA chr8-360 78141480 78141782 144 - chr8:78141680-78141740 NA NA NA NA NA chr8-359 78100526 78100812 247 - chr8:78100641-78100810 NA NA NA NA NA chr8-358 78089498 78089660 116 - chr8:78089526-78089578 NA NA NA NA NA chr8-357 78085644 78085847 183 - chr8:78085688-78085831 NA NA NA NA NA chr8-356 77946824 77946978 146 - chr8:77946836-77946978 NA NA NA NA NA chr8-355 77936797 77937248 234 - chr8:77936918-77936983 NA NA NA NA NA chr8-354 77454169 77454375 150 - chr8:77454237-77454325 NA NA NA NA NA chr8-353 77442855 77443190 249 - chr8:77442896-77443014 NA NA NA NA NA chr8-352 77408947 77409122 152 - chr8:77408970-77409099 NA NA NA NA NA chr8-351 77325389 77325813 205 - chr8:77325517-77325522 NA NA NA NA NA chr8-350 77311348 77311575 150 - chr8:77311409-77311490 NA NA NA NA NA chr8-349 77309540 77310081 285 - chr8:77309772-77309882 NA NA NA NA NA chr8-348 77147871 77148053 155 - chr8:77147899-77148028 NA NA NA NA NA chr8-347 77065419 77065613 155 - chr8:77065466-77065590 NA NA NA NA NA chr8-346 76892271 76892574 201 - chr8:76892422-76892570 NA NA NA NA NA chr8-345 76883580 76883877 161 - chr8:76883702-76883721 NA NA NA NA NA chr8-344 76839924 76840348 390 - chr8:76839924-76840246 NA NA NA NA NA chr8-343 76445019 76445256 140 - chr8:76445128-76445165 NA NA NA NA NA chr8-342 76417037 76417276 139 - chr8:76417154-76417210 NA NA NA NA NA chr8-341 76358110 76358455 282 - chr8:76358121-76358288 NA NA NA NA NA chr8-340 76231929 76232087 138 - chr8:76231945-76232065 NA NA NA NA NA chr8-339 76189458 76189649 165 - chr8:76189478-76189620 NA NA NA NA NA chr8-338 76120399 76120900 297 - chr8:76120530-76120550 NA NA NA NA NA chr8-337 76047564 76047795 176 - chr8:76047587-76047676 NA NA NA NA NA chr8-336 75880775 75881074 158 - chr8:75880888-75880919 NA NA NA NA NA chr8-335 75738428 75738612 147 - chr8:75738465-75738575 NA NA NA NA NA chr8-334 75515011 75515271 187 - chr8:75515070-75515170 NA NA NA NA NA chr8-333 75462549 75462887 278 - chr8:75462618-75462845 NA NA NA NA NA chr8-332 75265694 75265854 159 - chr8:75265697-75265854 NA NA NA NA NA chr8-331 75034164 75034404 157 - chr8:75034251-75034323 NA NA NA NA NA chr8-330 74581938 74582256 188 - chr8:74582092-74582215 NA NA NA NA NA chr8-329 74434706 74434910 152 - chr8:74434735-74434861 NA NA NA NA NA chr8-328 74392155 74392532 302 - chr8:74392157-74392309 NA NA NA NA NA chr8-327 74349692 74350089 294 - chr8:74349879-74350029 NA NA NA NA NA chr8-326 73875408 73875669 225 - chr8:73875500-73875653 NA NA NA NA NA chr8-325 73828782 73828946 145 - chr8:73828807-73828939 NA NA NA NA NA chr8-324 73502372 73502763 228 - chr8:73502499-73502542 NA NA NA NA NA chr8-323 73416081 73416635 277 - chr8:73416187-73416259 NA NA NA NA NA chr8-322 73299927 73300094 161 - chr8:73299927-73300076 NA NA NA NA NA chr8-321 73023177 73023324 117 - chr8:73023200-73023257 NA NA NA NA NA chr8-320 71968374 71968714 167 - chr8:71968556-71968559 NA NA NA NA NA chr8-319 71917144 71917304 147 - chr8:71917156-71917289 NA NA NA NA NA chr8-318 71891961 71892258 154 - chr8:71892100-71892113 NA NA NA NA NA chr8-317 71812956 71813122 155 - chr8:71812964-71813105 NA NA NA NA NA chr8-316 71695524 71695788 142 - chr8:71695664-71695702 NA NA NA NA NA chr8-315 71480688 71480864 164 - chr8:71480695-71480842 NA NA NA NA NA chr8-314 71260229 71260516 187 - chr8:71260379-71260516 NA NA NA NA NA chr8-313 71238904 71239088 135 - chr8:71238937-71239031 NA NA NA NA NA chr8-312 71215325 71215510 167 - chr8:71215343-71215484 NA NA NA NA NA chr8-311 71104063 71104236 157 - chr8:71104075-71104218 NA NA NA NA NA chr8-310 71078296 71078819 355 - chr8:71078425-71078660 NA NA NA NA NA chr8-309 71070229 71070540 229 - chr8:71070270-71070376 NA NA NA NA NA chr8-308 70906985 70907193 188 - chr8:70907005-70907183 NA NA NA NA NA chr8-307 70595074 70595315 161 - chr8:70595147-70595221 NA NA NA NA NA chr8-306 70438205 70438360 112 - chr8:70438218-70438257 NA NA NA NA NA chr8-305 70296420 70296617 193 - chr8:70296426-70296617 NA NA NA NA NA chr8-304 70182538 70182822 189 - chr8:70182612-70182685 NA NA NA NA NA chr8-303 69914393 69914895 349 - chr8:69914501-69914652 NA NA NA NA NA chr8-302 69752527 69752716 139 - chr8:69752569-69752662 NA NA NA NA NA chr8-301 69461955 69462119 150 - chr8:69461955-69462098 NA NA NA NA NA chr8-300 69218419 69218625 146 - chr8:69218503-69218577 NA NA NA NA NA chr8-299 69107928 69108498 290 - chr8:69108004-69108154 NA NA NA NA NA chr8-298 68901031 68901224 157 - chr8:68901068-68901190 NA NA NA NA NA chr8-297 68646525 68646900 206 - chr8:68646761-68646820 NA NA NA NA NA chr8-296 68232968 68233228 145 - chr8:68233079-68233111 NA NA NA NA NA chr8-295 68068190 68068534 190 - chr8:68068378-68068397 NA NA NA NA NA chr8-294 67847516 67847890 193 - chr8:67847686-67847687 NA NA NA NA NA chr8-293 67662223 67662394 163 - chr8:67662225-67662372 NA NA NA NA NA chr8-292 67599052 67599440 210 - chr8:67599126-67599210 NA NA NA NA NA chr8-291 67577598 67578058 262 - chr8:67577766-67577929 NA NA NA NA NA chr8-290 67491524 67491730 150 - chr8:67491586-67491677 NA NA NA NA NA chr8-289 67458688 67458928 139 - chr8:67458781-67458823 NA NA NA NA NA chr8-288 67334730 67334966 136 - chr8:67334832-67334870 NA NA NA NA NA chr8-287 67260688 67261012 161 - chr8:67260823-67260835 NA NA NA NA NA chr8-286 67089412 67089563 139 - chr8:67089418-67089551 NA NA NA NA NA chr8-285 66938708 66938901 150 - chr8:66938752-66938860 NA NA NA NA NA chr8-284 66890882 66891163 201 - chr8:66890901-66891062 NA NA NA NA NA chr8-283 66853494 66853860 200 - chr8:66853710-66853794 NA NA NA NA NA chr8-282 66820018 66820185 147 - chr8:66820021-66820131 NA NA NA NA NA chr8-281 66814534 66814827 268 - chr8:66814534-66814752 NA NA NA NA NA chr8-280 66725617 66725834 131 - chr8:66725674-66725690 NA NA NA NA NA chr8-279 66648162 66648591 215 - chr8:66648444-66648525 NA NA NA NA NA chr8-278 66583541 66583746 155 - chr8:66583595-66583698 NA NA NA NA NA chr8-277 66494517 66494897 186 - chr8:66494754-66494789 NA NA NA NA NA chr8-276 66468239 66468477 146 - chr8:66468375-66468475 NA NA NA NA NA chr8-275 66222600 66222789 180 - chr8:66222613-66222782 NA NA NA NA NA chr8-274 66203625 66203876 164 - chr8:66203711-66203787 NA NA NA NA NA chr8-273 65793796 65794079 155 - chr8:65793926-65793952 NA NA NA NA NA chr8-272 65786198 65786504 204 - chr8:65786351-65786504 NA NA NA NA NA chr8-271 65751270 65751625 212 - chr8:65751481-65751618 NA NA NA NA NA chr8-270 65686048 65686540 246 - chr8:65686160-65686227 NA NA NA NA NA chr8-269 65471035 65471330 237 - chr8:65471185-65471306 NA NA NA NA NA chr8-268 65186148 65186340 149 - chr8:65186187-65186295 NA NA NA NA NA chr8-267 64897345 64897515 155 - chr8:64897364-64897502 NA NA NA NA NA chr8-266 64794826 64795225 309 - chr8:64794887-64795077 NA NA NA NA NA chr8-265 64665327 64665522 141 - chr8:64665387-64665480 NA NA NA NA NA chr8-264 64583322 64583539 145 - chr8:64583472-64583506 NA NA NA NA NA chr8-263 64429316 64429624 157 - chr8:64429465-64429469 NA NA NA NA NA chr8-262 64339053 64339355 155 - chr8:64339186-64339201 NA NA NA NA NA chr8-261 64143942 64144171 159 - chr8:64144010-64144097 NA NA NA NA NA chr8-260 64047181 64047371 164 - chr8:64047210-64047351 NA NA NA NA NA chr8-259 63372769 63373157 195 - chr8:63372880-63372923 NA NA NA NA NA chr8-258 63218614 63218796 158 - chr8:63218634-63218770 NA NA NA NA NA chr8-257 63182856 63183212 239 - chr8:63182928-63182989 NA NA NA NA NA chr8-256 63100379 63100684 130 - chr8:63100620-63100641 NA NA NA NA NA chr8-255 63091099 63091312 154 - chr8:63091162-63091261 NA NA NA NA NA chr8-254 62820999 62821319 158 - chr8:62821135-62821144 NA NA NA NA NA chr8-253 62679879 62680048 141 - chr8:62679888-62679982 NA NA NA NA NA chr8-252 62602566 62602827 188 - chr8:62602672-62602820 NA NA NA NA NA chr8-251 62336082 62336264 152 - chr8:62336110-62336230 NA NA NA NA NA chr8-250 62154601 62154745 118 - chr8:62154619-62154685 NA NA NA NA NA chr8-249 61869174 61869657 243 - chr8:61869504-61869597 NA NA NA NA NA chr8-248 61705038 61705482 232 - chr8:61705106-61705198 NA NA NA NA NA chr8-247 61685402 61685560 143 - chr8:61685423-61685557 NA NA NA NA NA chr8-246 61531836 61532214 157 - chr8:61531911-61531920 NA NA NA NA NA chr8-245 61491309 61491651 197 - chr8:61491370-61491464 NA NA NA NA NA chr8-244 61320612 61320918 224 - chr8:61320776-61320877 NA NA NA NA NA chr8-243 61306325 61306503 164 - chr8:61306345-61306492 NA NA NA NA NA chr8-242 61223966 61224433 306 - chr8:61224047-61224232 NA NA NA NA NA chr8-241 60862377 60862773 322 - chr8:60862469-60862643 NA NA NA NA NA chr8-240 60834293 60834542 161 - chr8:60834371-60834449 NA NA NA NA NA chr8-239 60314881 60315075 146 - chr8:60314937-60315043 NA NA NA NA NA chr8-238 60291580 60292059 267 - chr8:60291798-60291850 NA NA NA NA NA chr8-237 60245972 60246328 231 - chr8:60246053-60246115 NA NA NA NA NA chr8-236 60195004 60195306 198 - chr8:60195148-60195282 NA NA NA NA NA chr8-235 60176119 60176776 340 - chr8:60176180-60176228 NA NA NA NA NA chr8-234 60019074 60019603 350 - chr8:60019083-60019473 NA NA NA NA NA chr8-233 59802282 59802624 203 - chr8:59802460-59802563 NA NA NA NA NA chr8-232 59595020 59595642 265 - chr8:59595482-59595495 NA NA NA NA NA chr8-231 59337839 59338175 182 - chr8:59337931-59337990 NA NA NA NA NA chr8-230 59310930 59311164 161 - chr8:59311003-59311091 NA NA NA NA NA chr8-229 59088148 59088451 252 - chr8:59088150-59088302 NA NA NA NA NA chr8-228 58886722 58886965 135 - chr8:58886817-58886831 NA NA NA NA NA chr8-227 58630904 58631076 149 - chr8:58630927-58631053 NA NA NA NA NA chr8-226 58613870 58614031 120 - chr8:58613953-58614011 NA NA NA NA NA chr8-225 58611964 58612297 227 - chr8:58612111-58612273 NA NA NA NA NA chr8-224 58607516 58607900 228 - chr8:58607800-58607808 NA NA NA NA NA chr8-9 5843945 5844255 215 - chr8:5844028-5844136 NA NA NA NA NA chr8-223 58399265 58399510 150 - chr8:58399361-58399417 NA NA NA NA NA chr8-222 58203079 58203231 113 - chr8:58203087-58203130 NA NA NA NA NA chr8-221 58130707 58130933 130 - chr8:58130781-58130826 NA NA NA NA NA chr8-220 57985597 57985841 190 - chr8:57985672-57985829 NA NA NA NA NA chr8-219 57850232 57850541 178 - chr8:57850359-57850408 NA NA NA NA NA chr8-218 57820031 57820203 143 - chr8:57820060-57820174 NA NA NA NA NA chr8-217 57743782 57744091 165 - chr8:57743910-57743939 NA NA NA NA NA chr8-216 57713241 57713415 159 - chr8:57713267-57713396 NA NA NA NA NA chr8-215 56709134 56709318 142 - chr8:56709179-56709282 NA NA NA NA NA chr8-214 56611713 56612007 242 - chr8:56611857-56612001 NA NA NA NA NA chr8-213 56487369 56487688 299 - chr8:56487387-56487664 NA NA NA NA NA chr8-212 56479753 56479990 115 - chr8:56479879-56479933 NA NA NA NA NA chr8-211 56269006 56269391 212 - chr8:56269127-56269192 NA NA NA NA NA chr8-210 56259005 56259328 189 - chr8:56259177-56259213 NA NA NA NA NA chr8-209 55969374 55969697 261 - chr8:55969543-55969680 NA NA NA NA NA chr8-208 55956481 55956784 245 - chr8:55956641-55956777 NA NA NA NA NA chr8-207 55837134 55837497 249 - chr8:55837200-55837287 NA NA NA NA NA chr8-206 55817368 55817636 153 - chr8:55817482-55817519 NA NA NA NA NA chr8-205 55377823 55378067 186 - chr8:55377917-55378027 NA NA NA NA NA chr8-204 55228451 55228612 131 - chr8:55228527-55228605 NA NA NA NA NA chr8-203 55146933 55147177 140 - chr8:55147039-55147074 NA NA NA NA NA chr8-202 55042588 55042800 154 - chr8:55042647-55042744 NA NA NA NA NA chr8-201 54730168 54730365 143 - chr8:54730230-54730315 NA NA NA NA NA chr8-200 54543648 54544137 287 - chr8:54543994-54544007 NA NA NA NA NA chr8-199 54509689 54509915 204 - chr8:54509722-54509915 NA NA NA NA NA chr8-198 54152036 54152330 148 - chr8:54152235-54152310 NA NA NA NA NA chr8-197 54138860 54139165 201 - chr8:54138967-54139116 NA NA NA NA NA chr8-196 53853136 53853526 240 - chr8:53853207-53853218 NA NA NA NA NA chr8-195 53567254 53567529 151 - chr8:53567378-53567405 NA NA NA NA NA chr8-194 53116527 53116839 155 - chr8:53116691-53116696 NA NA NA NA NA chr8-193 52999538 52999774 192 - chr8:52999602-52999772 NA NA NA NA NA chr8-192 52796460 52796811 157 - chr8:52796530-52796590 NA NA NA NA NA chr8-191 52788208 52788387 139 - chr8:52788302-52788374 NA NA NA NA NA chr8-190 52780165 52780427 226 - chr8:52780273-52780427 NA NA NA NA NA chr8-189 52722556 52722744 128 - chr8:52722648-52722700 NA NA NA NA NA chr8-188 52448108 52448302 163 - chr8:52448113-52448258 NA NA NA NA NA chr8-187 52386677 52387045 210 - chr8:52386762-52386833 NA NA NA NA NA chr8-186 52274939 52275145 156 - chr8:52274996-52275109 NA NA NA NA NA chr8-185 52146149 52146376 180 - chr8:52146202-52146332 NA NA NA NA NA chr8-184 52135764 52135930 135 - chr8:52135775-52135857 NA NA NA NA NA chr8-183 52133694 52134160 242 - chr8:52133784-52133869 NA NA NA NA NA chr8-182 51927785 51928259 257 - chr8:51927788-51927935 NA NA NA NA NA chr8-181 51490282 51490519 150 - chr8:51490363-51490429 NA NA NA NA NA chr8-180 51261234 51261745 295 - chr8:51261245-51261432 NA NA NA NA NA chr8-179 51051349 51051537 168 - chr8:51051397-51051531 NA NA NA NA NA chr8-178 51014696 51014973 219 - chr8:51014745-51014848 NA NA NA NA NA chr8-177 50863440 50863667 147 - chr8:50863610-50863632 NA NA NA NA NA chr8-176 50835498 50835662 158 - chr8:50835508-50835654 NA NA NA NA NA chr8-175 50707285 50707491 133 - chr8:50707351-50707427 NA NA NA NA NA chr8-174 50654235 50654542 201 - chr8:50654235-50654385 NA NA NA NA NA chr8-173 50647448 50647780 162 - chr8:50647488-50647545 NA NA NA NA NA chr8-172 50458948 50459188 170 - chr8:50459006-50459094 NA NA NA NA NA chr8-171 50443150 50443629 225 - chr8:50443458-50443483 NA NA NA NA NA chr8-170 50226318 50226473 152 - chr8:50226327-50226473 NA NA NA NA NA chr8-8 5022573 5022827 249 - chr8:5022588-5022827 NA NA NA NA NA chr8-169 50110646 50110878 170 - chr8:50110699-50110798 NA NA NA NA NA chr8-168 49920184 49920588 227 - chr8:49920415-49920496 NA NA NA NA NA chr8-167 49631531 49631781 158 - chr8:49631593-49631674 NA NA NA NA NA chr8-166 49174052 49174227 149 - chr8:49174074-49174199 NA NA NA NA NA chr8-165 49171483 49171693 162 - chr8:49171516-49171641 NA NA NA NA NA chr8-164 49075401 49075698 135 - chr8:49075490-49075544 NA NA NA NA NA chr8-163 48779831 48780030 142 - chr8:48779832-48779945 NA NA NA NA NA chr8-162 48618651 48619126 268 - chr8:48618676-48618828 NA NA NA NA NA chr8-161 48590292 48590654 237 - chr8:48590388-48590471 NA NA NA NA NA chr8-160 48404210 48404385 154 - chr8:48404233-48404368 NA NA NA NA NA chr8-159 48265678 48265856 170 - chr8:48265690-48265850 NA NA NA NA NA chr8-158 47932355 47932718 227 - chr8:47932452-47932611 NA NA NA NA NA chr8-157 47767178 47767378 136 - chr8:47767247-47767324 NA NA NA NA NA chr8-156 47701718 47701915 117 - chr8:47701821-47701881 NA NA NA NA NA chr8-155 47592508 47592725 182 - chr8:47592541-47592686 NA NA NA NA NA chr8-154 47585652 47585937 167 - chr8:47585763-47585805 NA NA NA NA NA chr8-153 47528445 47528893 272 - chr8:47528565-47528605 NA NA NA NA NA chr8-152 47468913 47469318 191 - chr8:47469023-47469052 NA NA NA NA NA chr8-151 47454965 47455296 208 - chr8:47455014-47455136 NA NA NA NA NA chr8-7 4734673 4734992 181 - chr8:4734842-4734916 NA NA NA NA NA chr8-150 47028139 47028445 157 - chr8:47028294-47028299 NA NA NA NA NA chr8-149 46990800 46991422 305 - chr8:46990831-46990955 NA NA NA NA NA chr8-148 46824437 46824857 225 - chr8:46824524-46824608 NA NA NA NA NA chr8-6 4503185 4503402 156 - chr8:4503256-4503346 NA NA NA NA NA chr8-5 4488936 4489086 146 - chr8:4488941-4489085 NA NA NA NA NA chr8-147 43620649 43620851 112 - chr8:43620759-43620801 NA NA NA NA NA chr8-146 43472193 43472401 133 - chr8:43472250-43472317 NA NA NA NA NA chr8-145 43281763 43282189 251 - chr8:43282010-43282050 NA NA NA NA NA chr8-4 4294830 4295021 161 - chr8:4294848-4294994 NA NA NA NA NA chr8-144 42822115 42822562 260 - chr8:42822324-42822476 NA NA NA NA NA chr8-143 42820084 42820258 152 - chr8:42820115-42820254 NA NA NA NA NA chr8-142 42814223 42814447 159 - chr8:42814292-42814390 NA NA NA NA NA chr8-141 42189074 42189326 163 - chr8:42189141-42189226 NA NA NA NA NA chr8-140 42013868 42014047 170 - chr8:42013873-42014025 NA NA NA NA NA chr8-139 41406146 41406550 266 - chr8:41406340-41406440 NA NA NA NA NA chr8-138 41268255 41268590 283 - chr8:41268304-41268483 NA NA NA NA NA chr8-137 41046435 41046623 175 - chr8:41046474-41046623 NA NA NA NA NA chr8-136 41006743 41007048 152 - chr8:41006910-41006923 NA NA NA NA NA chr8-135 40558115 40558411 246 - chr8:40558161-40558307 NA NA NA NA NA chr8-134 38754912 38755394 407 - chr8:38755003-38755351 NA NA NA NA NA chr8-133 38577357 38577705 195 - chr8:38577489-38577510 NA NA NA NA NA chr8-132 38415486 38416025 279 - chr8:38415838-38415949 NA NA NA NA NA chr8-131 38357170 38357450 240 - chr8:38357195-38357355 NA NA NA NA NA chr8-130 38291183 38291407 154 - chr8:38291267-38291344 NA NA NA NA NA chr8-129 38201080 38201231 125 - chr8:38201110-38201183 NA NA NA NA NA chr8-128 38174573 38174973 297 - chr8:38174603-38174724 NA NA NA NA NA chr8-127 37204388 37204685 210 - chr8:37204391-37204556 NA NA NA NA NA chr8-126 37117089 37117295 155 - chr8:37117136-37117242 NA NA NA NA NA chr8-125 37034006 37034241 181 - chr8:37034044-37034155 NA NA NA NA NA chr8-124 36998882 36999047 130 - chr8:36998892-36998962 NA NA NA NA NA chr8-123 36715643 36715844 137 - chr8:36715691-36715772 NA NA NA NA NA chr8-122 36271669 36271873 128 - chr8:36271740-36271830 NA NA NA NA NA chr8-121 35961497 35961723 175 - chr8:35961540-35961656 NA NA NA NA NA chr8-120 35160061 35160530 242 - chr8:35160360-35160447 NA NA NA NA NA chr8-119 34879185 34879557 268 - chr8:34879233-34879341 NA NA NA NA NA chr8-118 34510764 34511031 152 - chr8:34510887-34510920 NA NA NA NA NA chr8-3 3449259 3449512 242 - chr8:3449272-3449502 NA NA NA NA NA chr8-117 34211614 34212396 390 - chr8:34212226-34212377 NA NA NA NA NA chr8-116 33864104 33864843 479 - chr8:33864114-33864591 NA NA NA NA NA chr8-115 33827891 33828259 244 - chr8:33827911-33828097 NA NA NA NA NA chr8-114 33779919 33780148 164 - chr8:33779972-33780059 NA NA NA NA NA chr8-2 3342042 3342357 171 - chr8:3342062-3342161 NA NA NA NA NA chr8-113 33291038 33291232 154 - chr8:33291088-33291212 NA NA NA NA NA chr8 3325124 3325396 154 - chr8:3325237-3325268 NA NA NA NA NA chr8-112 33132890 33133144 194 - chr8:33132927-33133091 NA NA NA NA NA chr8-111 32720945 32721276 211 - chr8:32721034-32721185 NA NA NA NA NA chr8-110 32704446 32704614 134 - chr8:32704475-32704570 NA NA NA NA NA chr8-109 32649899 32650153 193 - chr8:32650004-32650114 NA NA NA NA NA chr8-108 32454038 32454206 154 - chr8:32454056-32454194 NA NA NA NA NA chr8-107 32308773 32309037 150 - chr8:32308895-32308927 NA NA NA NA NA chr8-106 32267347 32267563 176 - chr8:32267375-32267531 NA NA NA NA NA chr8-105 32115397 32115662 187 - chr8:32115440-32115588 NA NA NA NA NA chr8-104 31149015 31149335 243 - chr8:31149074-31149249 NA NA NA NA NA chr8-103 31075731 31075975 168 - chr8:31075829-31075910 NA NA NA NA NA chr8-102 30853233 30853488 153 - chr8:30853333-30853385 NA NA NA NA NA chr8-101 30842522 30842811 127 - chr8:30842655-30842671 NA NA NA NA NA chr8-100 30681664 30682126 222 - chr8:30681954-30681986 NA NA NA NA NA chr8-99 30510487 30510659 151 - chr8:30510511-30510644 NA NA NA NA NA chr8-98 30204533 30204752 175 - chr8:30204555-30204708 NA NA NA NA NA chr8-97 30145896 30146094 158 - chr8:30145943-30146068 NA NA NA NA NA chr8-96 29666504 29666783 169 - chr8:29666565-29666575 NA NA NA NA NA chr8-95 29205660 29205921 162 - chr8:29205767-29205826 NA NA NA NA NA chr8-94 29139923 29140474 425 - chr8:29140072-29140245 NA NA NA NA NA chr8-93 29018053 29018345 158 - chr8:29018191-29018219 NA NA NA NA NA chr8-92 28647996 28648247 190 - chr8:28648086-28648231 NA NA NA NA NA chr8-91 28641246 28641506 154 - chr8:28641341-28641378 NA NA NA NA NA chr8-90 28561838 28562125 154 - chr8:28561979-28562008 NA NA NA NA NA chr8-89 28512966 28513242 143 - chr8:28513096-28513103 NA NA NA NA NA chr8-88 28456592 28457007 257 - chr8:28456704-28456757 NA NA NA NA NA chr8-87 28362943 28363093 123 - chr8:28362945-28363014 NA NA NA NA NA chr8-86 28236498 28236757 223 - chr8:28236581-28236732 NA NA NA NA NA chr8-85 28152406 28152855 291 - chr8:28152634-28152846 NA NA NA NA NA chr8-84 28139150 28139364 193 - chr8:28139150-28139301 NA NA NA NA NA chr8-83 28105487 28105944 209 - chr8:28105779-28105784 NA NA NA NA NA chr8-82 28081730 28082160 193 - chr8:28082012-28082013 NA NA NA NA NA chr8-81 28018004 28018200 143 - chr8:28018059-28018151 NA NA NA NA NA chr8-80 27933051 27933489 238 - chr8:27933329-27933445 NA NA NA NA NA chr8-79 27684913 27685152 131 - chr8:27684983-27685025 NA NA NA NA NA chr8-78 27196131 27196517 244 - chr8:27196377-27196427 NA NA NA NA NA chr8-77 27071452 27071686 192 - chr8:27071518-27071626 NA NA NA NA NA chr8-76 27020076 27020640 319 - chr8:27020370-27020493 NA NA NA NA NA chr8-75 26941911 26942120 168 - chr8:26941962-26942084 NA NA NA NA NA chr8-74 26556376 26556596 129 - chr8:26556468-26556507 NA NA NA NA NA chr8-73 26188549 26189123 377 - chr8:26188572-26188760 NA NA NA NA NA chr8-72 26103780 26104152 221 - chr8:26103849-26103960 NA NA NA NA NA chr8-71 25836711 25837070 239 - chr8:25836771-25836950 NA NA NA NA NA chr8-70 25508106 25508428 209 - chr8:25508246-25508369 NA NA NA NA NA chr8-69 25351728 25351918 148 - chr8:25351784-25351883 NA NA NA NA NA chr8-68 25349967 25350422 271 - chr8:25350101-25350280 NA NA NA NA NA chr8-67 24983529 24983758 141 - chr8:24983643-24983683 NA NA NA NA NA chr8-66 24665776 24665989 171 - chr8:24665784-24665930 NA NA NA NA NA chr8-65 24619233 24619551 156 - chr8:24619402-24619403 NA NA NA NA NA chr8-64 24183987 24184258 153 - chr8:24184103-24184139 NA NA NA NA NA chr8-63 23952044 23952321 172 - chr8:23952157-23952220 NA NA NA NA NA chr8-62 23946465 23946631 139 - chr8:23946536-23946626 NA NA NA NA NA chr8-61 23868930 23869186 143 - chr8:23869085-23869157 NA NA NA NA NA chr8-60 23831997 23832242 121 - chr8:23832102-23832146 NA NA NA NA NA chr8-59 23589396 23589629 157 - chr8:23589476-23589555 NA NA NA NA NA chr8-58 23140875 23141039 146 - chr8:23140899-23141033 NA NA NA NA NA chr8-57 23052249 23052661 278 - chr8:23052315-23052391 NA NA NA NA NA chr8-56 22948822 22948992 155 - chr8:22948837-22948977 NA NA NA NA NA chr8-55 22608700 22608974 230 - chr8:22608755-22608897 NA NA NA NA NA chr8-54 21889176 21889364 169 - chr8:21889204-21889335 NA NA NA NA NA chr8-53 21377916 21378073 124 - chr8:21377964-21378070 NA NA NA NA NA chr8-52 20455228 20455528 241 - chr8:20455371-20455511 NA NA NA NA NA chr8-51 20152557 20152705 122 - chr8:20152557-20152627 NA NA NA NA NA chr8-50 19583206 19583360 133 - chr8:19583265-19583356 NA NA NA NA NA chr8-49 19401582 19401930 189 - chr8:19401724-19401737 NA NA NA NA NA chr8-48 19346845 19347008 149 - chr8:19346863-19346996 NA NA NA NA NA chr8-47 19261274 19261450 123 - chr8:19261383-19261419 NA NA NA NA NA chr8-46 18680988 18681172 171 - chr8:18680988-18681133 NA NA NA NA NA chr8-45 18675407 18675554 145 - chr8:18675407-18675548 NA NA NA NA NA chr8-44 18114039 18114218 175 - chr8:18114044-18114216 NA NA NA NA NA chr8-43 18099649 18100044 183 - chr8:18099751-18099777 NA NA NA NA NA chr8-42 17913392 17913671 248 - chr8:17913485-17913671 NA NA NA NA NA chr8-41 17557188 17557504 189 - chr8:17557319-17557337 NA NA NA NA NA chr8-40 17061965 17062434 255 - chr8:17062066-17062214 NA NA NA NA NA chr8-39 16933008 16933177 155 - chr8:16933008-16933156 NA NA NA NA NA chr8-38 16931704 16931964 151 - chr8:16931809-16931853 NA NA NA NA NA chr8-37 16899467 16899701 123 - chr8:16899588-16899610 NA NA NA NA NA chr8-36 16746721 16746885 140 - chr8:16746753-16746845 NA NA NA NA NA chr8-35 16742043 16742211 152 - chr8:16742065-16742198 NA NA NA NA NA chr8-34 16576333 16576568 165 - chr8:16576421-16576534 NA NA NA NA NA chr8-33 16379036 16379269 182 - chr8:16379073-16379190 NA NA NA NA NA chr8-32 16109405 16109603 155 - chr8:16109440-16109556 NA NA NA NA NA chr8-31 15766759 15767263 357 - chr8:15766807-15766918 NA NA NA NA NA chr8-30 15288463 15288710 175 - chr8:15288559-15288650 NA NA NA NA NA chr8-29 14721370 14721926 392 - chr8:14721732-14721921 NA NA NA NA NA chr8-1141 144412269 144412506 175 - chr8:144412359-144412458 NA NA NA NA NA chr8-1140 144403862 144404023 151 - chr8:144403873-144404004 NA NA NA NA NA chr8-1139 144225083 144225335 177 - chr8:144225190-144225276 NA NA NA NA NA chr8-1138 144031325 144031742 267 - chr8:144031649-144031679 NA NA NA NA NA chr8-1137 143911012 143911235 179 - chr8:143911041-143911198 NA NA NA NA NA chr8-1136 143348639 143348828 144 - chr8:143348730-143348806 NA NA NA NA NA chr8-1135 143335904 143336119 195 - chr8:143335915-143336070 NA NA NA NA NA chr8-1134 143174831 143175106 131 - chr8:143174994-143175053 NA NA NA NA NA chr8-1133 143006374 143006711 190 - chr8:143006505-143006556 NA NA NA NA NA chr8-1132 142528578 142528734 153 - chr8:142528579-142528730 NA NA NA NA NA chr8-1131 142471198 142471477 153 - chr8:142471319-142471341 NA NA NA NA NA chr8-1130 141919022 141919234 136 - chr8:141919072-141919106 NA NA NA NA NA chr8-1129 141823221 141823741 331 - chr8:141823329-141823390 NA NA NA NA NA chr8-1128 141295985 141296149 127 - chr8:141295992-141296052 NA NA NA NA NA chr8-1127 141278710 141278909 159 - chr8:141278722-141278855 NA NA NA NA NA chr8-28 14101186 14101637 240 - chr8:14101457-14101608 NA NA NA NA NA chr8-1126 141013372 141013641 148 - chr8:141013494-141013522 NA NA NA NA NA chr8-1125 140879190 140879378 149 - chr8:140879227-140879335 NA NA NA NA NA chr8-1124 140866898 140867125 145 - chr8:140866974-140867031 NA NA NA NA NA chr8-1123 140711685 140711917 120 - chr8:140711818-140711847 NA NA NA NA NA chr8-1122 140658903 140659178 146 - chr8:140659032-140659049 NA NA NA NA NA chr8-1121 140650586 140650896 176 - chr8:140650706-140650734 NA NA NA NA NA chr8-1120 140531040 140531235 146 - chr8:140531081-140531182 NA NA NA NA NA chr8-1119 140420858 140421225 218 - chr8:140420986-140421017 NA NA NA NA NA chr8-1118 140244401 140244574 119 - chr8:140244469-140244527 NA NA NA NA NA chr8-1117 140231747 140232074 164 - chr8:140231918-140231927 NA NA NA NA NA chr8-1116 140177391 140177658 172 - chr8:140177473-140177537 NA NA NA NA NA chr8-1115 140166574 140166852 175 - chr8:140166659-140166713 NA NA NA NA NA chr8-1114 139685012 139685186 118 - chr8:139685102-139685147 NA NA NA NA NA chr8-1113 139571594 139571906 163 - chr8:139571755-139571770 NA NA NA NA NA chr8-1112 139524519 139524765 122 - chr8:139524635-139524695 NA NA NA NA NA chr8-1111 139439463 139439676 118 - chr8:139439540-139439572 NA NA NA NA NA chr8-1110 139307304 139307472 164 - chr8:139307315-139307471 NA NA NA NA NA chr8-1109 139274945 139275235 178 - chr8:139275023-139275106 NA NA NA NA NA chr8-1108 139138171 139138421 169 - chr8:139138204-139138316 NA NA NA NA NA chr8-1107 139046542 139046768 155 - chr8:139046619-139046700 NA NA NA NA NA chr8-1106 138942852 138943039 155 - chr8:138942886-138943011 NA NA NA NA NA chr8-1105 138816562 138816843 179 - chr8:138816694-138816801 NA NA NA NA NA chr8-1104 138798461 138798711 152 - chr8:138798558-138798611 NA NA NA NA NA chr8-1103 138678176 138678462 240 - chr8:138678253-138678401 NA NA NA NA NA chr8-1102 138414641 138414879 167 - chr8:138414726-138414815 NA NA NA NA NA chr8-1101 138355583 138356009 210 - chr8:138355839-138355873 NA NA NA NA NA chr8-1100 138244199 138244426 165 - chr8:138244273-138244388 NA NA NA NA NA chr8-1099 138201504 138201720 157 - chr8:138201551-138201655 NA NA NA NA NA chr8-1098 138165089 138165482 307 - chr8:138165188-138165452 NA NA NA NA NA chr8-1097 138105988 138106203 165 - chr8:138106044-138106165 NA NA NA NA NA chr8-1096 138060629 138060814 154 - chr8:138060666-138060786 NA NA NA NA NA chr8-1095 138009171 138009377 141 - chr8:138009243-138009326 NA NA NA NA NA chr8-1094 137985435 137985692 157 - chr8:137985543-137985596 NA NA NA NA NA chr8-1093 137857611 137857866 155 - chr8:137857712-137857768 NA NA NA NA NA chr8-1092 137850658 137851057 232 - chr8:137850882-137850936 NA NA NA NA NA chr8-1091 137804274 137804779 260 - chr8:137804419-137804420 NA NA NA NA NA chr8-1090 137726647 137727084 259 - chr8:137726937-137726962 NA NA NA NA NA chr8-1089 137717624 137717836 159 - chr8:137717679-137717787 NA NA NA NA NA chr8-1088 137637750 137638135 202 - chr8:137637843-137637907 NA NA NA NA NA chr8-1087 137596473 137596655 150 - chr8:137596505-137596623 NA NA NA NA NA chr8-27 13753285 13753576 211 - chr8:13753357-13753408 NA NA NA NA NA chr8-1086 137272854 137273195 259 - chr8:137272966-137273173 NA NA NA NA NA chr8-1085 137209931 137210105 149 - chr8:137209957-137210082 NA NA NA NA NA chr8-1084 137179551 137179880 269 - chr8:137179649-137179818 NA NA NA NA NA chr8-1083 137149000 137149271 155 - chr8:137149118-137149159 NA NA NA NA NA chr8-1082 137138857 137139073 182 - chr8:137138859-137139024 NA NA NA NA NA chr8-1081 137133414 137134008 283 - chr8:137133511-137133650 NA NA NA NA NA chr8-1080 137123087 137123315 145 - chr8:137123242-137123268 NA NA NA NA NA chr8-1079 137059485 137059667 146 - chr8:137059501-137059621 NA NA NA NA NA chr8-1078 137046752 137046987 182 - chr8:137046792-137046917 NA NA NA NA NA chr8-1077 136952583 136952819 180 - chr8:136952637-136952789 NA NA NA NA NA chr8-1076 136922546 136922796 145 - chr8:136922657-136922694 NA NA NA NA NA chr8-1075 136918630 136918809 134 - chr8:136918719-136918786 NA NA NA NA NA chr8-1074 136860006 136860325 159 - chr8:136860037-136860116 NA NA NA NA NA chr8-1073 136743591 136743944 252 - chr8:136743650-136743803 NA NA NA NA NA chr8-1072 136676284 136676525 170 - chr8:136676375-136676464 NA NA NA NA NA chr8-1071 136659137 136659557 222 - chr8:136659216-136659229 NA NA NA NA NA chr8-1070 136610874 136611201 198 - chr8:136611036-136611046 NA NA NA NA NA chr8-1069 136567605 136567850 150 - chr8:136567699-136567753 NA NA NA NA NA chr8-1068 136556733 136556998 159 - chr8:136556826-136556866 NA NA NA NA NA chr8-26 13651218 13651382 139 - chr8:13651243-13651357 NA NA NA NA NA chr8-1067 136503634 136503984 222 - chr8:136503878-136503914 NA NA NA NA NA chr8-1066 136452786 136453075 148 - chr8:136452926-136452932 NA NA NA NA NA chr8-1065 136341626 136341908 206 - chr8:136341806-136341860 NA NA NA NA NA chr8-1064 136298363 136298550 159 - chr8:136298400-136298540 NA NA NA NA NA chr8-1063 136118815 136119116 174 - chr8:136118964-136119000 NA NA NA NA NA chr8-1062 136077841 136078042 153 - chr8:136077909-136077966 NA NA NA NA NA chr8-1061 136050409 136050567 132 - chr8:136050435-136050515 NA NA NA NA NA chr8-1060 135995889 135996198 188 - chr8:135995988-135996033 NA NA NA NA NA chr8-1059 135938280 135938611 185 - chr8:135938471-135938555 NA NA NA NA NA chr8-1058 135798973 135799184 145 - chr8:135799033-135799115 NA NA NA NA NA chr8-1057 135745779 135746033 200 - chr8:135745819-135745992 NA NA NA NA NA chr8-1056 135598065 135598323 223 - chr8:135598109-135598262 NA NA NA NA NA chr8-1055 135541541 135541810 217 - chr8:135541645-135541802 NA NA NA NA NA chr8-1054 135373404 135373692 160 - chr8:135373529-135373558 NA NA NA NA NA chr8-1053 135353771 135354097 181 - chr8:135353864-135353926 NA NA NA NA NA chr8-1052 135291793 135292056 157 - chr8:135291901-135291951 NA NA NA NA NA chr8-1051 135150086 135150302 127 - chr8:135150153-135150202 NA NA NA NA NA chr8-1050 135056665 135057071 228 - chr8:135056675-135056814 NA NA NA NA NA chr8-1049 134936201 134936500 170 - chr8:134936349-134936409 NA NA NA NA NA chr8-25 13482723 13482927 182 - chr8:13482728-13482871 NA NA NA NA NA chr8-1048 134818258 134818552 189 - chr8:134818357-134818458 NA NA NA NA NA chr8-1047 134799945 134800177 207 - chr8:134800013-134800170 NA NA NA NA NA chr8-1046 134767861 134768194 262 - chr8:134768033-134768184 NA NA NA NA NA chr8-24 13476212 13476437 158 - chr8:13476273-13476367 NA NA NA NA NA chr8-1045 134710644 134710876 176 - chr8:134710723-134710871 NA NA NA NA NA chr8-1044 134647738 134647899 137 - chr8:134647779-134647868 NA NA NA NA NA chr8-1043 134572302 134572679 211 - chr8:134572526-134572542 NA NA NA NA NA chr8-1042 134560130 134560454 220 - chr8:134560194-134560362 NA NA NA NA NA chr8-1041 134399009 134399262 176 - chr8:134399117-134399216 NA NA NA NA NA chr8-1040 134397677 134397855 124 - chr8:134397748-134397835 NA NA NA NA NA chr8-1039 134342134 134342349 153 - chr8:134342220-134342299 NA NA NA NA NA chr8-1038 134254755 134255083 186 - chr8:134254967-134255082 NA NA NA NA NA chr8-1037 134169575 134169951 264 - chr8:134169649-134169763 NA NA NA NA NA chr8-1036 134123410 134123751 204 - chr8:134123429-134123555 NA NA NA NA NA chr8-1035 134080013 134080380 227 - chr8:134080187-134080287 NA NA NA NA NA chr8-1034 134018352 134018668 148 - chr8:134018593-134018628 NA NA NA NA NA chr8-1033 133997233 133997707 223 - chr8:133997399-133997413 NA NA NA NA NA chr8-1032 133973140 133973298 112 - chr8:133973165-133973254 NA NA NA NA NA chr8-1031 133945545 133945837 154 - chr8:133945692-133945717 NA NA NA NA NA chr8-1030 133896537 133896749 115 - chr8:133896600-133896635 NA NA NA NA NA chr8-1029 133860686 133860897 159 - chr8:133860720-133860816 NA NA NA NA NA chr8-1028 133827367 133827683 209 - chr8:133827539-133827604 NA NA NA NA NA chr8-1027 133752714 133752981 167 - chr8:133752809-133752871 NA NA NA NA NA chr8-1026 133740094 133740532 246 - chr8:133740233-133740255 NA NA NA NA NA chr8-1025 133717972 133718220 162 - chr8:133718056-133718130 NA NA NA NA NA chr8-1024 133650133 133650381 166 - chr8:133650225-133650305 NA NA NA NA NA chr8-1023 133583220 133583383 157 - chr8:133583228-133583382 NA NA NA NA NA chr8-1022 133519689 133520011 260 - chr8:133519867-133520007 NA NA NA NA NA chr8-1021 133254907 133255108 161 - chr8:133254921-133255043 NA NA NA NA NA chr8-1020 133229154 133229342 154 - chr8:133229187-133229306 NA NA NA NA NA chr8-1019 133215847 133216165 247 - chr8:133215936-133216041 NA NA NA NA NA chr8-1018 133185474 133185966 314 - chr8:133185664-133185794 NA NA NA NA NA chr8-1017 133175329 133175517 141 - chr8:133175354-133175459 NA NA NA NA NA chr8-1016 133147959 133148185 168 - chr8:133147991-133148114 NA NA NA NA NA chr8-1015 132733387 132733806 235 - chr8:132733460-132733557 NA NA NA NA NA chr8-1014 132637981 132638231 156 - chr8:132638071-132638129 NA NA NA NA NA chr8-1013 132609862 132610073 172 - chr8:132609884-132610000 NA NA NA NA NA chr8-1012 132548242 132548543 159 - chr8:132548386-132548402 NA NA NA NA NA chr8-1011 132478332 132478692 220 - chr8:132478358-132478508 NA NA NA NA NA chr8-1010 132433072 132433264 164 - chr8:132433085-132433235 NA NA NA NA NA chr8-1009 132103689 132104156 185 - chr8:132104081-132104094 NA NA NA NA NA chr8-1008 132072646 132072782 114 - chr8:132072675-132072778 NA NA NA NA NA chr8-1007 132011954 132012133 171 - chr8:132011964-132012129 NA NA NA NA NA chr8-1006 131996141 131996343 155 - chr8:131996194-131996299 NA NA NA NA NA chr8-1005 131948017 131948408 234 - chr8:131948243-131948389 NA NA NA NA NA chr8-1004 131939489 131939909 220 - chr8:131939769-131939807 NA NA NA NA NA chr8-1003 131888132 131888289 133 - chr8:131888147-131888247 NA NA NA NA NA chr8-1002 131716532 131717019 309 - chr8:131716669-131716889 NA NA NA NA NA chr8-1001 131704723 131704963 175 - chr8:131704780-131704878 NA NA NA NA NA chr8-1000 131667490 131667761 165 - chr8:131667614-131667691 NA NA NA NA NA chr8-999 131648118 131648367 178 - chr8:131648189-131648296 NA NA NA NA NA chr8-998 131461704 131462052 246 - chr8:131461857-131462052 NA NA NA NA NA chr8-997 131440784 131440958 148 - chr8:131440801-131440914 NA NA NA NA NA chr8-996 131405527 131405705 155 - chr8:131405556-131405685 NA NA NA NA NA chr8-995 131347532 131347712 158 - chr8:131347564-131347710 NA NA NA NA NA chr8-994 131296050 131296240 176 - chr8:131296063-131296211 NA NA NA NA NA chr8-993 131283103 131283494 212 - chr8:131283365-131283481 NA NA NA NA NA chr8-992 131241504 131241740 149 - chr8:131241593-131241657 NA NA NA NA NA chr8-991 131170040 131170412 244 - chr8:131170274-131170337 NA NA NA NA NA chr8-990 131139040 131139733 354 - chr8:131139172-131139464 NA NA NA NA NA chr8-989 131129188 131129509 228 - chr8:131129304-131129462 NA NA NA NA NA chr8-988 131078127 131078575 216 - chr8:131078304-131078340 NA NA NA NA NA chr8-987 131045332 131045691 244 - chr8:131045391-131045464 NA NA NA NA NA chr8-986 130995752 130995929 138 - chr8:130995823-130995906 NA NA NA NA NA chr8-985 130955161 130955651 308 - chr8:130955493-130955544 NA NA NA NA NA chr8-984 130939362 130939785 220 - chr8:130939497-130939542 NA NA NA NA NA chr8-983 130850075 130850300 191 - chr8:130850116-130850280 NA NA NA NA NA chr8-982 130847481 130847783 190 - chr8:130847635-130847692 NA NA NA NA NA chr8-981 130831791 130832038 148 - chr8:130831890-130831939 NA NA NA NA NA chr8-980 130656453 130656690 151 - chr8:130656541-130656605 NA NA NA NA NA chr8-979 130650400 130650764 203 - chr8:130650615-130650677 NA NA NA NA NA chr8-978 130621919 130622355 212 - chr8:130622192-130622229 NA NA NA NA NA chr8-977 130562738 130563123 227 - chr8:130562756-130562904 NA NA NA NA NA chr8-976 130545167 130545586 247 - chr8:130545394-130545458 NA NA NA NA NA chr8-975 130484602 130485002 186 - chr8:130484734-130484747 NA NA NA NA NA chr8-974 130434427 130434782 213 - chr8:130434558-130434618 NA NA NA NA NA chr8-973 130335966 130336233 167 - chr8:130336071-130336143 NA NA NA NA NA chr8-972 130318768 130319134 211 - chr8:130318953-130318967 NA NA NA NA NA chr8-971 130280397 130280538 121 - chr8:130280447-130280533 NA NA NA NA NA chr8-970 130251808 130251957 140 - chr8:130251821-130251956 NA NA NA NA NA chr8-969 130242348 130242521 152 - chr8:130242372-130242506 NA NA NA NA NA chr8-968 130238618 130239124 236 - chr8:130238963-130238971 NA NA NA NA NA chr8-967 130105130 130105432 222 - chr8:130105247-130105411 NA NA NA NA NA chr8-966 130092031 130092348 195 - chr8:130092079-130092189 NA NA NA NA NA chr8-965 130082249 130082578 250 - chr8:130082279-130082401 NA NA NA NA NA chr8-964 129992245 129992707 252 - chr8:129992402-129992549 NA NA NA NA NA chr8-963 129941097 129941347 184 - chr8:129941114-129941183 NA NA NA NA NA chr8-962 129871654 129871928 140 - chr8:129871796-129871810 NA NA NA NA NA chr8-961 129783183 129783479 180 - chr8:129783231-129783265 NA NA NA NA NA chr8-960 129593850 129594160 247 - chr8:129593956-129594077 NA NA NA NA NA chr8-959 129576362 129576566 150 - chr8:129576418-129576516 NA NA NA NA NA chr8-958 129573200 129573517 170 - chr8:129573357-129573375 NA NA NA NA NA chr8-957 129537030 129537230 134 - chr8:129537125-129537226 NA NA NA NA NA chr8-956 129505437 129505712 149 - chr8:129505563-129505586 NA NA NA NA NA chr8-955 129473732 129473919 172 - chr8:129473737-129473879 NA NA NA NA NA chr8-954 129439334 129439628 198 - chr8:129439479-129439619 NA NA NA NA NA chr8-953 129361983 129362258 267 - chr8:129361993-129362251 NA NA NA NA NA chr8-952 129218291 129218695 216 - chr8:129218520-129218539 NA NA NA NA NA chr8-951 129210387 129210557 128 - chr8:129210429-129210515 NA NA NA NA NA chr8-950 129202463 129202949 248 - chr8:129202800-129202909 NA NA NA NA NA chr8-949 129200776 129201242 286 - chr8:129200895-129201047 NA NA NA NA NA chr8-948 129183374 129183551 153 - chr8:129183396-129183526 NA NA NA NA NA chr8-947 129057966 129058170 147 - chr8:129058025-129058114 NA NA NA NA NA chr8-946 129043923 129044100 153 - chr8:129043927-129044066 NA NA NA NA NA chr8-945 129039657 129039935 175 - chr8:129039725-129039819 NA NA NA NA NA chr8-944 129035689 129035967 173 - chr8:129035782-129035856 NA NA NA NA NA chr8-23 12903127 12903541 233 - chr8:12903178-12903304 NA NA NA NA NA chr8-943 128975844 128976288 302 - chr8:128975915-128976004 NA NA NA NA NA chr8-942 128444355 128444626 224 - chr8:128444363-128444501 NA NA NA NA NA chr8-941 128414798 128415071 144 - chr8:128414937-128414947 NA NA NA NA NA chr8-940 128362473 128362668 151 - chr8:128362527-128362629 NA NA NA NA NA chr8-939 128319964 128320139 160 - chr8:128319971-128320120 NA NA NA NA NA chr8-938 128295255 128295519 127 - chr8:128295346-128295359 NA NA NA NA NA chr8-937 128214400 128214581 164 - chr8:128214427-128214569 NA NA NA NA NA chr8-936 128183192 128183397 131 - chr8:128183199-128183242 NA NA NA NA NA chr8-935 128136695 128136966 139 - chr8:128136832-128136844 NA NA NA NA NA chr8-934 128052902 128053259 200 - chr8:128053067-128053118 NA NA NA NA NA chr8-933 127928725 127928879 149 - chr8:127928728-127928870 NA NA NA NA NA chr8-932 127893001 127893307 199 - chr8:127893184-127893238 NA NA NA NA NA chr8-931 127797844 127798299 218 - chr8:127798119-127798138 NA NA NA NA NA chr8-930 127763413 127763722 236 - chr8:127763494-127763665 NA NA NA NA NA chr8-929 127721726 127722132 205 - chr8:127721851-127721893 NA NA NA NA NA chr8-928 127546397 127546671 205 - chr8:127546567-127546634 NA NA NA NA NA chr8-927 127222096 127222425 180 - chr8:127222147-127222227 NA NA NA NA NA chr8-926 127188127 127188552 269 - chr8:127188176-127188426 NA NA NA NA NA chr8-925 127114623 127115156 320 - chr8:127114792-127115063 NA NA NA NA NA chr8-924 127060663 127061079 204 - chr8:127060825-127060842 NA NA NA NA NA chr8-923 127023668 127023846 174 - chr8:127023669-127023841 NA NA NA NA NA chr8-922 126929376 126929527 148 - chr8:126929384-126929526 NA NA NA NA NA chr8-921 126905345 126905606 154 - chr8:126905458-126905502 NA NA NA NA NA chr8-920 126898273 126898582 157 - chr8:126898433-126898434 NA NA NA NA NA chr8-919 126780403 126780713 194 - chr8:126780578-126780598 NA NA NA NA NA chr8-918 126770141 126770480 261 - chr8:126770227-126770372 NA NA NA NA NA chr8-917 126564951 126565239 192 - chr8:126564959-126565099 NA NA NA NA NA chr8-916 126560374 126560560 147 - chr8:126560449-126560539 NA NA NA NA NA chr8-915 126543851 126544036 115 - chr8:126543891-126543951 NA NA NA NA NA chr8-914 126357513 126357820 152 - chr8:126357660-126357661 NA NA NA NA NA chr8-913 126340288 126340517 163 - chr8:126340354-126340451 NA NA NA NA NA chr8-912 126334975 126335386 215 - chr8:126335096-126335257 NA NA NA NA NA chr8-911 126230478 126230824 225 - chr8:126230593-126230773 NA NA NA NA NA chr8-910 126209650 126209860 164 - chr8:126209684-126209790 NA NA NA NA NA chr8-909 126198763 126198994 123 - chr8:126198847-126198874 NA NA NA NA NA chr8-908 126159630 126159859 150 - chr8:126159706-126159774 NA NA NA NA NA chr8-907 126124378 126124764 218 - chr8:126124617-126124747 NA NA NA NA NA chr8-906 126089499 126089682 121 - chr8:126089647-126089663 NA NA NA NA NA chr8-905 126048000 126048336 215 - chr8:126048187-126048248 NA NA NA NA NA chr8-904 126030377 126030624 173 - chr8:126030395-126030522 NA NA NA NA NA chr8-903 126006159 126006324 130 - chr8:126006202-126006293 NA NA NA NA NA chr8-902 125968889 125969110 158 - chr8:125968962-125969052 NA NA NA NA NA chr8-901 125956631 125956844 187 - chr8:125956660-125956824 NA NA NA NA NA chr8-900 125867529 125867778 193 - chr8:125867598-125867748 NA NA NA NA NA chr8-899 125714962 125715270 237 - chr8:125715143-125715238 NA NA NA NA NA chr8-898 125675638 125675893 223 - chr8:125675638-125675797 NA NA NA NA NA chr8-897 125619930 125620447 241 - chr8:125620065-125620085 NA NA NA NA NA chr8-896 125565132 125565653 293 - chr8:125565293-125565384 NA NA NA NA NA chr8-895 125393744 125394078 188 - chr8:125393866-125393884 NA NA NA NA NA chr8-894 125295968 125296173 163 - chr8:125296023-125296157 NA NA NA NA NA chr8-893 125269069 125269228 151 - chr8:125269080-125269226 NA NA NA NA NA chr8-892 125246847 125247166 210 - chr8:125246985-125246995 NA NA NA NA NA chr8-891 125029753 125030287 330 - chr8:125029968-125030104 NA NA NA NA NA chr8-890 124980345 124980532 142 - chr8:124980386-124980485 NA NA NA NA NA chr8-889 124940015 124940256 137 - chr8:124940139-124940162 NA NA NA NA NA chr8-888 124747834 124747987 146 - chr8:124747839-124747979 NA NA NA NA NA chr8-887 124744144 124744530 272 - chr8:124744221-124744333 NA NA NA NA NA chr8-886 124592506 124592673 133 - chr8:124592524-124592631 NA NA NA NA NA chr8-885 124582834 124583038 165 - chr8:124582835-124582923 NA NA NA NA NA chr8-884 124542933 124543256 201 - chr8:124542989-124543129 NA NA NA NA NA chr8-883 124423798 124423987 161 - chr8:124423842-124423967 NA NA NA NA NA chr8-882 124330873 124331118 143 - chr8:124330966-124330998 NA NA NA NA NA chr8-881 124305651 124306153 279 - chr8:124305996-124306119 NA NA NA NA NA chr8-880 124150929 124151110 154 - chr8:124150960-124151091 NA NA NA NA NA chr8-879 124116057 124116329 232 - chr8:124116058-124116210 NA NA NA NA NA chr8-878 124098042 124098269 175 - chr8:124098087-124098236 NA NA NA NA NA chr8-877 123992754 123992989 153 - chr8:123992834-123992903 NA NA NA NA NA chr8-876 123988756 123989005 193 - chr8:123988870-123988951 NA NA NA NA NA chr8-875 123885719 123886196 312 - chr8:123885818-123885899 NA NA NA NA NA chr8-874 123787420 123787605 165 - chr8:123787446-123787588 NA NA NA NA NA chr8-873 123705493 123705960 243 - chr8:123705751-123705902 NA NA NA NA NA chr8-872 123666550 123666947 227 - chr8:123666762-123666861 NA NA NA NA NA chr8-871 123554241 123554464 160 - chr8:123554282-123554390 NA NA NA NA NA chr8-870 123373387 123373624 117 - chr8:123373418-123373450 NA NA NA NA NA chr8-869 123345103 123345297 164 - chr8:123345118-123345267 NA NA NA NA NA chr8-868 123335742 123336270 315 - chr8:123335973-123336066 NA NA NA NA NA chr8-867 123305628 123305961 190 - chr8:123305736-123305879 NA NA NA NA NA chr8-866 123277900 123278074 158 - chr8:123277916-123278058 NA NA NA NA NA chr8-865 123189301 123189564 214 - chr8:123189344-123189460 NA NA NA NA NA chr8-864 123118260 123118612 222 - chr8:123118375-123118532 NA NA NA NA NA chr8-863 122968420 122968673 185 - chr8:122968520-122968671 NA NA NA NA NA chr8-862 122933907 122934301 193 - chr8:122934154-122934192 NA NA NA NA NA chr8-861 122923235 122923586 294 - chr8:122923406-122923586 NA NA NA NA NA chr8-860 122852763 122852973 158 - chr8:122852837-122852932 NA NA NA NA NA chr8-859 122778202 122778479 185 - chr8:122778334-122778407 NA NA NA NA NA chr8-858 122706207 122706432 175 - chr8:122706211-122706359 NA NA NA NA NA chr8-857 122522953 122523239 153 - chr8:122523086-122523106 NA NA NA NA NA chr8-856 122461507 122461668 160 - chr8:122461508-122461667 NA NA NA NA NA chr8-855 122398453 122398631 166 - chr8:122398460-122398620 NA NA NA NA NA chr8-854 122376815 122377100 192 - chr8:122376851-122376893 NA NA NA NA NA chr8-853 122367891 122368066 115 - chr8:122367913-122367930 NA NA NA NA NA chr8-852 122334104 122334362 138 - chr8:122334168-122334174 NA NA NA NA NA chr8-851 122269874 122270140 190 - chr8:122269988-122270140 NA NA NA NA NA chr8-850 122237099 122237287 124 - chr8:122237134-122237165 NA NA NA NA NA chr8-849 122196267 122196477 140 - chr8:122196335-122196406 NA NA NA NA NA chr8-848 122190989 122191363 232 - chr8:122191177-122191338 NA NA NA NA NA chr8-847 122133375 122133557 152 - chr8:122133408-122133533 NA NA NA NA NA chr8-846 122076453 122076602 116 - chr8:122076476-122076549 NA NA NA NA NA chr8-845 122050245 122050421 157 - chr8:122050266-122050403 NA NA NA NA NA chr8-844 122040882 122041192 247 - chr8:122040909-122041030 NA NA NA NA NA chr8-843 122028307 122028564 152 - chr8:122028407-122028453 NA NA NA NA NA chr8-842 122013677 122013889 138 - chr8:122013733-122013779 NA NA NA NA NA chr8-841 121995041 121995203 139 - chr8:121995042-121995169 NA NA NA NA NA chr8-840 121962919 121963224 179 - chr8:121963077-121963114 NA NA NA NA NA chr8-839 121876085 121876353 183 - chr8:121876242-121876283 NA NA NA NA NA chr8-838 121867417 121867575 129 - chr8:121867420-121867494 NA NA NA NA NA chr8-837 121840458 121840621 156 - chr8:121840470-121840612 NA NA NA NA NA chr8-836 121797320 121797696 264 - chr8:121797371-121797538 NA NA NA NA NA chr8-835 121793029 121793330 165 - chr8:121793159-121793191 NA NA NA NA NA chr8-834 121779298 121779781 250 - chr8:121779616-121779718 NA NA NA NA NA chr8-833 121671817 121672139 254 - chr8:121671947-121672065 NA NA NA NA NA chr8-832 121667912 121668152 155 - chr8:121668001-121668075 NA NA NA NA NA chr8-831 121466637 121466888 220 - chr8:121466728-121466887 NA NA NA NA NA chr8-830 121449492 121449760 188 - chr8:121449557-121449705 NA NA NA NA NA chr8-829 121341549 121341855 268 - chr8:121341598-121341847 NA NA NA NA NA chr8-828 121312537 121312834 248 - chr8:121312635-121312785 NA NA NA NA NA chr8-827 121289305 121289492 174 - chr8:121289310-121289463 NA NA NA NA NA chr8-826 121261997 121262416 200 - chr8:121262272-121262309 NA NA NA NA NA chr8-825 121228699 121229063 202 - chr8:121228916-121229011 NA NA NA NA NA chr8-824 121218078 121218337 193 - chr8:121218080-121218239 NA NA NA NA NA chr8-823 121200479 121200763 161 - chr8:121200582-121200630 NA NA NA NA NA chr8-822 121147976 121148232 159 - chr8:121148083-121148155 NA NA NA NA NA chr8-821 121082703 121082926 164 - chr8:121082740-121082856 NA NA NA NA NA chr8-820 121076208 121076650 252 - chr8:121076347-121076400 NA NA NA NA NA chr8-819 120999314 120999864 266 - chr8:120999712-120999719 NA NA NA NA NA chr8-818 120877849 120878059 113 - chr8:120877864-120877921 NA NA NA NA NA chr8-817 120844931 120845296 211 - chr8:120845122-120845236 NA NA NA NA NA chr8-816 120827407 120827898 229 - chr8:120827545-120827661 NA NA NA NA NA chr8-815 120715885 120716356 208 - chr8:120716213-120716216 NA NA NA NA NA chr8-814 120696046 120696373 193 - chr8:120696224-120696327 NA NA NA NA NA chr8-813 120535968 120536276 156 - chr8:120536126-120536127 NA NA NA NA NA chr8-812 120470894 120471228 234 - chr8:120471005-120471075 NA NA NA NA NA chr8-811 120464358 120464769 208 - chr8:120464407-120464489 NA NA NA NA NA chr8-810 120455084 120455574 235 - chr8:120455428-120455497 NA NA NA NA NA chr8-809 120408818 120409040 160 - chr8:120408904-120408990 NA NA NA NA NA chr8-808 120347602 120348029 242 - chr8:120347888-120347974 NA NA NA NA NA chr8-807 120063354 120063749 244 - chr8:120063464-120063516 NA NA NA NA NA chr8-806 119996550 119996915 235 - chr8:119996660-119996775 NA NA NA NA NA chr8-805 119968699 119968982 147 - chr8:119968833-119968845 NA NA NA NA NA chr8-804 119944281 119944443 160 - chr8:119944281-119944437 NA NA NA NA NA chr8-803 119877621 119877824 191 - chr8:119877622-119877790 NA NA NA NA NA chr8-802 119614932 119615138 129 - chr8:119615025-119615093 NA NA NA NA NA chr8-801 119608968 119609489 283 - chr8:119608993-119609116 NA NA NA NA NA chr8-800 119583845 119584099 180 - chr8:119583873-119584002 NA NA NA NA NA chr8-799 119386636 119386918 162 - chr8:119386753-119386792 NA NA NA NA NA chr8-798 119338241 119338423 151 - chr8:119338265-119338378 NA NA NA NA NA chr8-797 119322206 119322385 145 - chr8:119322236-119322349 NA NA NA NA NA chr8-796 119190219 119190514 180 - chr8:119190283-119190369 NA NA NA NA NA chr8-795 119144861 119145209 223 - chr8:119145064-119145209 NA NA NA NA NA chr8-794 119099653 119099842 145 - chr8:119099765-119099832 NA NA NA NA NA chr8-793 119079355 119079583 141 - chr8:119079466-119079508 NA NA NA NA NA chr8-792 119065135 119065973 422 - chr8:119065559-119065820 NA NA NA NA NA chr8-791 119037472 119037621 146 - chr8:119037473-119037613 NA NA NA NA NA chr8-790 119003734 119004142 268 - chr8:119003855-119004011 NA NA NA NA NA chr8-789 118971129 118971473 201 - chr8:118971212-118971281 NA NA NA NA NA chr8-788 118926145 118926442 173 - chr8:118926255-118926311 NA NA NA NA NA chr8-787 118878677 118878824 126 - chr8:118878690-118878774 NA NA NA NA NA chr8-786 118813877 118814142 144 - chr8:118813994-118814013 NA NA NA NA NA chr8-785 118812980 118813316 170 - chr8:118813167-118813192 NA NA NA NA NA chr8-784 118772560 118772774 129 - chr8:118772611-118772621 NA NA NA NA NA chr8-783 118771551 118771785 174 - chr8:118771618-118771759 NA NA NA NA NA chr8-782 118757234 118757485 148 - chr8:118757328-118757382 NA NA NA NA NA chr8-781 118691432 118691716 167 - chr8:118691563-118691606 NA NA NA NA NA chr8-780 118686247 118686403 124 - chr8:118686278-118686386 NA NA NA NA NA chr8-779 118639894 118640438 237 - chr8:118640059-118640060 NA NA NA NA NA chr8-778 118603742 118604007 152 - chr8:118603856-118603896 NA NA NA NA NA chr8-777 118602033 118602452 312 - chr8:118602170-118602360 NA NA NA NA NA chr8-776 118600813 118601096 172 - chr8:118600900-118600937 NA NA NA NA NA chr8-775 118471895 118472094 177 - chr8:118471912-118472045 NA NA NA NA NA chr8-774 118423763 118424011 160 - chr8:118423833-118423914 NA NA NA NA NA chr8-773 118391004 118391475 246 - chr8:118391258-118391403 NA NA NA NA NA chr8-772 118343601 118343929 281 - chr8:118343619-118343826 NA NA NA NA NA chr8-771 118341400 118341704 154 - chr8:118341526-118341542 NA NA NA NA NA chr8-770 118340193 118340429 163 - chr8:118340286-118340366 NA NA NA NA NA chr8-769 118301645 118301907 155 - chr8:118301742-118301795 NA NA NA NA NA chr8-768 118261742 118261914 119 - chr8:118261747-118261837 NA NA NA NA NA chr8-767 118185254 118185446 172 - chr8:118185284-118185431 NA NA NA NA NA chr8-766 118174755 118174935 150 - chr8:118174796-118174899 NA NA NA NA NA chr8-765 118112266 118112453 150 - chr8:118112303-118112416 NA NA NA NA NA chr8-764 118093673 118093988 194 - chr8:118093806-118093891 NA NA NA NA NA chr8-763 118091996 118092207 148 - chr8:118092059-118092144 NA NA NA NA NA chr8-762 118066933 118067138 175 - chr8:118066973-118067122 NA NA NA NA NA chr8-761 117985857 117986037 154 - chr8:117985883-117986011 NA NA NA NA NA chr8-760 117981647 117982001 224 - chr8:117981779-117981926 NA NA NA NA NA chr8-759 117940761 117941198 381 - chr8:117940795-117941148 NA NA NA NA NA chr8-758 117608161 117608398 161 - chr8:117608247-117608316 NA NA NA NA NA chr8-757 117595886 117596078 156 - chr8:117595910-117596036 NA NA NA NA NA chr8-756 117415429 117415617 140 - chr8:117415491-117415582 NA NA NA NA NA chr8-755 117313841 117314375 288 - chr8:117313888-117314224 NA NA NA NA NA chr8-754 117292796 117293001 140 - chr8:117292822-117292917 NA NA NA NA NA chr8-753 117275892 117276201 209 - chr8:117275924-117276042 NA NA NA NA NA chr8-752 117249538 117250065 292 - chr8:117249654-117249718 NA NA NA NA NA chr8-751 117160582 117161062 270 - chr8:117160757-117160782 NA NA NA NA NA chr8-750 117046831 117047119 164 - chr8:117046954-117046993 NA NA NA NA NA chr8-749 116966585 116966778 163 - chr8:116966613-116966747 NA NA NA NA NA chr8-748 116762787 116763041 234 - chr8:116762790-116762987 NA NA NA NA NA chr8-747 116648948 116649260 192 - chr8:116649091-116649223 NA NA NA NA NA chr8-746 116560417 116560714 170 - chr8:116560522-116560576 NA NA NA NA NA chr8-745 116497537 116497804 159 - chr8:116497637-116497692 NA NA NA NA NA chr8-744 116476507 116476898 206 - chr8:116476538-116476636 NA NA NA NA NA chr8-743 116265961 116266244 159 - chr8:116266095-116266140 NA NA NA NA NA chr8-742 116250814 116251226 333 - chr8:116250860-116251035 NA NA NA NA NA chr8-741 116100166 116100749 366 - chr8:116100561-116100621 NA NA NA NA NA chr8-740 116040194 116040364 165 - chr8:116040197-116040352 NA NA NA NA NA chr8-739 115922569 115922789 156 - chr8:115922641-115922724 NA NA NA NA NA chr8-738 115894323 115894477 128 - chr8:115894401-115894477 NA NA NA NA NA chr8-737 115858389 115858670 154 - chr8:115858514-115858542 NA NA NA NA NA chr8-736 115621107 115621293 140 - chr8:115621167-115621275 NA NA NA NA NA chr8-735 115468617 115469142 310 - chr8:115468963-115469115 NA NA NA NA NA chr8-22 11540626 11540963 166 - chr8:11540763-11540775 NA NA NA NA NA chr8-734 115157974 115158365 179 - chr8:115158152-115158225 NA NA NA NA NA chr8-733 115076725 115076979 151 - chr8:115076827-115076874 NA NA NA NA NA chr8-732 115040696 115040927 121 - chr8:115040832-115040869 NA NA NA NA NA chr8-731 114989431 114989735 178 - chr8:114989567-114989614 NA NA NA NA NA chr8-21 11489618 11489854 176 - chr8:11489679-11489825 NA NA NA NA NA chr8-730 114819955 114820108 120 - chr8:114819997-114820051 NA NA NA NA NA chr8-729 114807190 114807400 136 - chr8:114807234-114807311 NA NA NA NA NA chr8-728 114772613 114772807 152 - chr8:114772645-114772745 NA NA NA NA NA chr8-727 114667412 114667600 174 - chr8:114667414-114667580 NA NA NA NA NA chr8-726 114601958 114602240 202 - chr8:114601983-114602145 NA NA NA NA NA chr8-725 114559039 114559292 219 - chr8:114559039-114559190 NA NA NA NA NA chr8-724 114314986 114315229 166 - chr8:114315057-114315149 NA NA NA NA NA chr8-723 114291496 114292056 287 - chr8:114291614-114291792 NA NA NA NA NA chr8-722 114146722 114147007 141 - chr8:114146875-114146881 NA NA NA NA NA chr8-721 113824017 113824323 167 - chr8:113824152-113824182 NA NA NA NA NA chr8-720 113737763 113738045 172 - chr8:113737883-113737955 NA NA NA NA NA chr8-719 113737582 113737732 116 - chr8:113737582-113737681 NA NA NA NA NA chr8-718 113718408 113718731 167 - chr8:113718585-113718617 NA NA NA NA NA chr8-717 113669076 113669288 146 - chr8:113669150-113669226 NA NA NA NA NA chr8-716 113134567 113134955 221 - chr8:113134798-113134820 NA NA NA NA NA chr8-715 113040524 113040795 148 - chr8:113040680-113040699 NA NA NA NA NA chr8-20 11268120 11268448 166 - chr8:11268254-11268272 NA NA NA NA NA chr8-714 112652795 112653176 225 - chr8:112652812-112652959 NA NA NA NA NA chr8-713 112617380 112617724 211 - chr8:112617437-112617553 NA NA NA NA NA chr8-712 112281177 112281352 155 - chr8:112281195-112281331 NA NA NA NA NA chr8-711 112126682 112126839 155 - chr8:112126688-112126839 NA NA NA NA NA chr8-710 112061185 112061441 192 - chr8:112061293-112061399 NA NA NA NA NA chr8-709 112046921 112047705 389 - chr8:112047557-112047705 NA NA NA NA NA chr8-708 111875197 111875361 137 - chr8:111875212-111875328 NA NA NA NA NA chr8-707 111731530 111732143 370 - chr8:111731859-111732024 NA NA NA NA NA chr8-706 111578990 111579288 154 - chr8:111579133-111579142 NA NA NA NA NA chr8-705 111505162 111505365 161 - chr8:111505208-111505325 NA NA NA NA NA chr8-704 111445047 111445533 317 - chr8:111445287-111445444 NA NA NA NA NA chr8-703 111233704 111233947 165 - chr8:111233794-111233893 NA NA NA NA NA chr8-702 111221060 111221606 278 - chr8:111221438-111221459 NA NA NA NA NA chr8-701 111190170 111190404 163 - chr8:111190235-111190330 NA NA NA NA NA chr8-700 111103004 111103204 161 - chr8:111103053-111103170 NA NA NA NA NA chr8-699 111072022 111072260 146 - chr8:111072090-111072120 NA NA NA NA NA chr8-698 110977052 110977268 174 - chr8:110977092-110977245 NA NA NA NA NA chr8-697 110871464 110871679 185 - chr8:110871528-110871666 NA NA NA NA NA chr8-696 110864353 110864781 260 - chr8:110864448-110864624 NA NA NA NA NA chr8-695 110461127 110461297 119 - chr8:110461254-110461284 NA NA NA NA NA chr8-694 110438113 110438273 118 - chr8:110438115-110438211 NA NA NA NA NA chr8-693 110339328 110339623 205 - chr8:110339472-110339560 NA NA NA NA NA chr8-692 110241680 110241980 192 - chr8:110241842-110241980 NA NA NA NA NA chr8-691 110217154 110217302 128 - chr8:110217167-110217285 NA NA NA NA NA chr8-690 109970719 109971029 177 - chr8:109970753-109970916 NA NA NA NA NA chr8-689 109819244 109819488 129 - chr8:109819355-109819365 NA NA NA NA NA chr8-688 109816532 109816898 219 - chr8:109816545-109816653 NA NA NA NA NA chr8-687 109754473 109754650 128 - chr8:109754523-109754615 NA NA NA NA NA chr8-686 109670706 109671087 208 - chr8:109670939-109671034 NA NA NA NA NA chr8-685 109489009 109489459 315 - chr8:109489314-109489409 NA NA NA NA NA chr8-684 109363231 109364045 380 - chr8:109363518-109363666 NA NA NA NA NA chr8-683 109322236 109322466 165 - chr8:109322296-109322391 NA NA NA NA NA chr8-682 108938759 108938966 158 - chr8:108938803-108938907 NA NA NA NA NA chr8-681 108827176 108827342 151 - chr8:108827195-108827335 NA NA NA NA NA chr8-680 108637413 108637686 157 - chr8:108637528-108637568 NA NA NA NA NA chr8-679 108522219 108522493 141 - chr8:108522348-108522358 NA NA NA NA NA chr8-678 108102678 108102946 142 - chr8:108102795-108102802 NA NA NA NA NA chr8-677 107568272 107568483 164 - chr8:107568313-107568433 NA NA NA NA NA chr8-676 107529464 107529761 287 - chr8:107529488-107529758 NA NA NA NA NA chr8-675 107330639 107330906 151 - chr8:107330757-107330791 NA NA NA NA NA chr8-674 107310704 107310974 153 - chr8:107310817-107310849 NA NA NA NA NA chr8-673 107089464 107089642 123 - chr8:107089571-107089613 NA NA NA NA NA chr8-672 107076891 107077176 203 - chr8:107076892-107077054 NA NA NA NA NA chr8-671 106997769 106998092 170 - chr8:106997912-106997919 NA NA NA NA NA chr8-19 10697766 10698028 166 - chr8:10697874-10697956 NA NA NA NA NA chr8-670 106767044 106767363 151 - chr8:106767162-106767170 NA NA NA NA NA chr8-669 106607795 106607983 156 - chr8:106607839-106607975 NA NA NA NA NA chr8-668 106458002 106458221 130 - chr8:106458105-106458139 NA NA NA NA NA chr8-667 106432923 106433200 234 - chr8:106433026-106433187 NA NA NA NA NA chr8-666 106375030 106375340 257 - chr8:106375058-106375209 NA NA NA NA NA chr8-665 106253588 106253846 139 - chr8:106253692-106253697 NA NA NA NA NA chr8-664 106146496 106146693 194 - chr8:106146501-106146693 NA NA NA NA NA chr8-663 106079403 106079851 302 - chr8:106079685-106079804 NA NA NA NA NA chr8-662 105890229 105890474 185 - chr8:105890329-105890434 NA NA NA NA NA chr8-661 105569894 105570089 148 - chr8:105569942-105570044 NA NA NA NA NA chr8-660 105546413 105546733 240 - chr8:105546447-105546561 NA NA NA NA NA chr8-18 10544518 10544807 186 - chr8:10544662-10544786 NA NA NA NA NA chr8-659 105437201 105438027 442 - chr8:105437569-105437611 NA NA NA NA NA chr8-658 105392910 105393145 197 - chr8:105392969-105393090 NA NA NA NA NA chr8-657 105344911 105345229 154 - chr8:105344933-105345005 NA NA NA NA NA chr8-656 105127751 105128384 354 - chr8:105128011-105128163 NA NA NA NA NA chr8-655 105023488 105023777 149 - chr8:105023630-105023638 NA NA NA NA NA chr8-654 105017442 105018111 343 - chr8:105017812-105017873 NA NA NA NA NA chr8-653 104967953 104968241 158 - chr8:104968100-104968145 NA NA NA NA NA chr8-652 104771145 104771433 156 - chr8:104771285-104771305 NA NA NA NA NA chr8-651 104604497 104604709 164 - chr8:104604547-104604665 NA NA NA NA NA chr8-650 104441523 104442156 332 - chr8:104442004-104442130 NA NA NA NA NA chr8-649 104413386 104413653 213 - chr8:104413409-104413595 NA NA NA NA NA chr8-648 104357548 104357785 159 - chr8:104357610-104357699 NA NA NA NA NA chr8-647 104235753 104235941 182 - chr8:104235762-104235941 NA NA NA NA NA chr8-646 104175510 104175772 149 - chr8:104175615-104175630 NA NA NA NA NA chr8-645 104095423 104095621 138 - chr8:104095454-104095503 NA NA NA NA NA chr8-644 104043840 104044025 171 - chr8:104043852-104044010 NA NA NA NA NA chr8-643 103859897 103860104 153 - chr8:103859950-103860048 NA NA NA NA NA chr8-642 103811805 103812134 243 - chr8:103811985-103812095 NA NA NA NA NA chr8-641 103804867 103805435 293 - chr8:103805262-103805419 NA NA NA NA NA chr8-640 103783054 103783241 112 - chr8:103783091-103783147 NA NA NA NA NA chr8-639 103749837 103750138 153 - chr8:103749985-103749990 NA NA NA NA NA chr8-638 103741754 103742095 164 - chr8:103741895-103741900 NA NA NA NA NA chr8-637 103591665 103591868 169 - chr8:103591736-103591837 NA NA NA NA NA chr8-636 103518640 103518997 217 - chr8:103518741-103518779 NA NA NA NA NA chr8-635 103508926 103509200 151 - chr8:103509053-103509079 NA NA NA NA NA chr8-634 103441050 103441357 181 - chr8:103441157-103441193 NA NA NA NA NA chr8-633 103085120 103085506 281 - chr8:103085351-103085464 NA NA NA NA NA chr8-632 103079778 103080179 265 - chr8:103079863-103079941 NA NA NA NA NA chr8-631 103052794 103053183 234 - chr8:103053051-103053082 NA NA NA NA NA chr8-630 102973228 102973483 190 - chr8:102973280-102973392 NA NA NA NA NA chr8-629 102968627 102968897 196 - chr8:102968734-102968893 NA NA NA NA NA chr8-628 102954597 102954823 155 - chr8:102954673-102954762 NA NA NA NA NA chr8-627 102953595 102954047 253 - chr8:102953882-102953982 NA NA NA NA NA chr8-626 102951651 102952037 336 - chr8:102951726-102952037 NA NA NA NA NA chr8-625 102933591 102933886 163 - chr8:102933710-102933728 NA NA NA NA NA chr8-624 102889815 102890429 401 - chr8:102890155-102890393 NA NA NA NA NA chr8-623 102432884 102433178 206 - chr8:102432884-102433046 NA NA NA NA NA chr8-17 10234564 10235108 306 - chr8:10234787-10234942 NA NA NA NA NA chr8-622 102344002 102344191 158 - chr8:102344037-102344168 NA NA NA NA NA chr8-621 102316237 102316388 144 - chr8:102316237-102316367 NA NA NA NA NA chr8-620 102198690 102198910 119 - chr8:102198813-102198853 NA NA NA NA NA chr8-16 10213104 10213274 154 - chr8:10213112-10213258 NA NA NA NA NA chr8-619 101982230 101982388 155 - chr8:101982237-101982386 NA NA NA NA NA chr8-618 101654241 101654584 207 - chr8:101654426-101654546 NA NA NA NA NA chr8-617 101625383 101625671 155 - chr8:101625523-101625552 NA NA NA NA NA chr8-616 101584091 101584253 152 - chr8:101584107-101584246 NA NA NA NA NA chr8-615 101572874 101573142 167 - chr8:101572993-101573050 NA NA NA NA NA chr8-614 101375703 101376198 223 - chr8:101375849-101375863 NA NA NA NA NA chr8-613 101312718 101312967 181 - chr8:101312768-101312863 NA NA NA NA NA chr8-612 101034728 101035007 222 - chr8:101034734-101034842 NA NA NA NA NA chr8-611 100997786 100997995 158 - chr8:100997833-100997942 NA NA NA NA NA chr8-610 100925909 100926062 115 - chr8:100925995-100926048 NA NA NA NA NA chr8-609 100838446 100838686 211 - chr8:100838470-100838623 NA NA NA NA NA chr8-608 100568777 100569188 215 - chr8:100569026-100569098 NA NA NA NA NA chr8-607 100558096 100558352 168 - chr8:100558192-100558268 NA NA NA NA NA chr8-606 100528961 100529230 139 - chr8:100529027-100529101 NA NA NA NA NA chr8-605 100395501 100395968 323 - chr8:100395669-100395727 NA NA NA NA NA chr8-604 100300683 100301071 225 - chr8:100300920-100300999 NA NA NA NA NA chr8-603 100286597 100286851 125 - chr8:100286742-100286754 NA NA NA NA NA chr8-602 100285584 100285894 198 - chr8:100285606-100285737 NA NA NA NA NA chr8-601 100179441 100179616 145 - chr8:100179458-100179588 NA NA NA NA NA chr8-600 100077018 100077244 122 - chr8:100077136-100077168 NA NA NA NA NA chr8-599 100020103 100020393 192 - chr8:100020253-100020321 NA NA NA NA NA chr7-666 99907313 99907508 180 - chr7:99907322-99907472 NA NA NA NA NA chr7-92 9979547 9979765 112 - chr7:9979652-9979657 NA NA NA NA NA chr7-665 98943851 98944045 137 - chr7:98943916-98944004 NA NA NA NA NA chr7-664 98910563 98910762 133 - chr7:98910637-98910712 NA NA NA NA NA chr7-663 98518189 98518363 153 - chr7:98518214-98518350 NA NA NA NA NA chr7-91 9848875 9849501 264 - chr7:9849346-9849360 NA NA NA NA NA chr7-662 98469389 98469588 146 - chr7:98469438-98469533 NA NA NA NA NA chr7-661 98394289 98394449 124 - chr7:98394297-98394403 NA NA NA NA NA chr7-90 9828679 9828998 231 - chr7:9828717-9828828 NA NA NA NA NA chr7-89 9780792 9781002 115 - chr7:9780907-9780947 NA NA NA NA NA chr7-660 97623820 97624091 141 - chr7:97623945-97623951 NA NA NA NA NA chr7-659 97550167 97550404 164 - chr7:97550184-97550219 NA NA NA NA NA chr7-658 97067816 97067962 112 - chr7:97067851-97067946 NA NA NA NA NA chr7-657 96985208 96985560 195 - chr7:96985409-96985491 NA NA NA NA NA chr7-656 96931085 96931284 167 - chr7:96931090-96931241 NA NA NA NA NA chr7-655 96907855 96908230 295 - chr7:96908063-96908198 NA NA NA NA NA chr7-654 96904889 96905063 162 - chr7:96904901-96905051 NA NA NA NA NA chr7-653 96614230 96614544 177 - chr7:96614377-96614427 NA NA NA NA NA chr7-652 96577007 96577465 295 - chr7:96577175-96577420 NA NA NA NA NA chr7-88 9623135 9623430 168 - chr7:9623256-9623291 NA NA NA NA NA chr7-651 96109462 96109659 164 - chr7:96109511-96109634 NA NA NA NA NA chr7-650 96105869 96106113 134 - chr7:96105985-96106015 NA NA NA NA NA chr7-649 96105065 96105293 153 - chr7:96105166-96105231 NA NA NA NA NA chr7-648 96074153 96074326 150 - chr7:96074180-96074305 NA NA NA NA NA chr7-647 96057857 96058048 154 - chr7:96057894-96058011 NA NA NA NA NA chr7-646 96037363 96037609 151 - chr7:96037453-96037525 NA NA NA NA NA chr7-645 95860676 95861006 256 - chr7:95860710-95860852 NA NA NA NA NA chr7-644 95636244 95636539 180 - chr7:95636411-95636528 NA NA NA NA NA chr7-643 95431483 95431785 245 - chr7:95431628-95431772 NA NA NA NA NA chr7-642 95399476 95399635 155 - chr7:95399478-95399630 NA NA NA NA NA chr7-641 95300253 95300578 219 - chr7:95300407-95300573 NA NA NA NA NA chr7-640 95242303 95242549 193 - chr7:95242398-95242517 NA NA NA NA NA chr7-639 95209975 95210243 187 - chr7:95209990-95210129 NA NA NA NA NA chr7-638 95195330 95195637 160 - chr7:95195485-95195494 NA NA NA NA NA chr7-637 94992007 94992311 166 - chr7:94992072-94992169 NA NA NA NA NA chr7-636 94626358 94626817 333 - chr7:94626547-94626817 NA NA NA NA NA chr7-635 94606669 94606865 159 - chr7:94606700-94606825 NA NA NA NA NA chr7-634 94588401 94588952 340 - chr7:94588646-94588758 NA NA NA NA NA chr7-633 94330767 94331045 153 - chr7:94330890-94330916 NA NA NA NA NA chr7-632 94129027 94129178 131 - chr7:94129027-94129148 NA NA NA NA NA chr7-631 93909148 93909500 187 - chr7:93909353-93909355 NA NA NA NA NA chr7-630 93894471 93894649 154 - chr7:93894509-93894632 NA NA NA NA NA chr7-629 93873496 93873946 219 - chr7:93873673-93873801 NA NA NA NA NA chr7-628 93726531 93726802 127 - chr7:93726598-93726653 NA NA NA NA NA chr7-627 93522803 93523163 178 - chr7:93522925-93522951 NA NA NA NA NA chr7-626 93497412 93497833 251 - chr7:93497428-93497594 NA NA NA NA NA chr7-625 93492470 93492776 156 - chr7:93492628-93492642 NA NA NA NA NA chr7-624 93384616 93384859 144 - chr7:93384720-93384770 NA NA NA NA NA chr7-623 93290020 93290483 260 - chr7:93290184-93290270 NA NA NA NA NA chr7-622 93286716 93286915 162 - chr7:93286747-93286875 NA NA NA NA NA chr7-621 93268212 93268458 124 - chr7:93268300-93268319 NA NA NA NA NA chr7-620 93243221 93243381 152 - chr7:93243222-93243370 NA NA NA NA NA chr7-619 93136264 93136499 182 - chr7:93136302-93136416 NA NA NA NA NA chr7-618 93037630 93037922 198 - chr7:93037669-93037820 NA NA NA NA NA chr7-617 92857167 92857375 169 - chr7:92857218-92857360 NA NA NA NA NA chr7-616 92718202 92718535 300 - chr7:92718241-92718514 NA NA NA NA NA chr7-615 92520981 92521272 177 - chr7:92521101-92521161 NA NA NA NA NA chr7-614 92362460 92362741 206 - chr7:92362583-92362690 NA NA NA NA NA chr7-613 92292534 92293015 231 - chr7:92292676-92292782 NA NA NA NA NA chr7-612 92141513 92141840 267 - chr7:92141625-92141798 NA NA NA NA NA chr7-611 92050398 92050642 139 - chr7:92050510-92050551 NA NA NA NA NA chr7-610 92014546 92014877 203 - chr7:92014726-92014853 NA NA NA NA NA chr7-609 91896112 91896258 119 - chr7:91896166-91896231 NA NA NA NA NA chr7-608 91726619 91726873 159 - chr7:91726702-91726772 NA NA NA NA NA chr7-607 91658971 91659222 151 - chr7:91659073-91659126 NA NA NA NA NA chr7-606 91543897 91544407 234 - chr7:91544013-91544051 NA NA NA NA NA chr7-605 91505661 91505877 157 - chr7:91505700-91505808 NA NA NA NA NA chr7-604 91375260 91375629 164 - chr7:91375371-91375377 NA NA NA NA NA chr7-603 91359688 91359856 151 - chr7:91359710-91359849 NA NA NA NA NA chr7-602 91305852 91306292 237 - chr7:91306031-91306077 NA NA NA NA NA chr7-601 90797195 90797377 148 - chr7:90797278-90797358 NA NA NA NA NA chr7-600 90785927 90786371 242 - chr7:90785957-90786083 NA NA NA NA NA chr7-599 90496069 90496271 137 - chr7:90496124-90496201 NA NA NA NA NA chr7-598 90480921 90481183 195 - chr7:90480997-90481134 NA NA NA NA NA chr7-597 90280890 90281053 131 - chr7:90280898-90280973 NA NA NA NA NA chr7-596 89998996 89999154 134 - chr7:89999021-89999132 NA NA NA NA NA chr7-595 89829213 89829392 158 - chr7:89829233-89829369 NA NA NA NA NA chr7-594 89707339 89707485 141 - chr7:89707340-89707478 NA NA NA NA NA chr7-87 8965623 8965915 208 - chr7:8965696-8965862 NA NA NA NA NA chr7-593 89576749 89577184 232 - chr7:89577019-89577115 NA NA NA NA NA chr7-592 89007157 89007392 205 - chr7:89007205-89007350 NA NA NA NA NA chr7-591 89006675 89007000 209 - chr7:89006782-89006933 NA NA NA NA NA chr7-590 88867218 88867571 177 - chr7:88867380-88867388 NA NA NA NA NA chr7-589 88717219 88717413 142 - chr7:88717279-88717365 NA NA NA NA NA chr7-588 88576372 88576626 215 - chr7:88576387-88576575 NA NA NA NA NA chr7-587 88094566 88094870 215 - chr7:88094646-88094763 NA NA NA NA NA chr7-586 87838194 87838468 192 - chr7:87838316-87838406 NA NA NA NA NA chr7-585 87780697 87781030 256 - chr7:87780732-87780932 NA NA NA NA NA chr7-584 87627002 87627207 168 - chr7:87627022-87627116 NA NA NA NA NA chr7-86 8761447 8761797 219 - chr7:8761610-8761776 NA NA NA NA NA chr7-583 87354820 87355050 160 - chr7:87354900-87355000 NA NA NA NA NA chr7-582 87183724 87184012 151 - chr7:87183861-87183875 NA NA NA NA NA chr7-581 87136883 87137382 235 - chr7:87137184-87137192 NA NA NA NA NA chr7-580 86943004 86943362 194 - chr7:86943210-86943219 NA NA NA NA NA chr7-579 86815245 86815456 159 - chr7:86815297-86815404 NA NA NA NA NA chr7-85 8663638 8663881 144 - chr7:8663739-8663786 NA NA NA NA NA chr7-578 86314921 86315095 149 - chr7:86314944-86315069 NA NA NA NA NA chr7-577 86098771 86099194 333 - chr7:86098774-86098927 NA NA NA NA NA chr7-576 85814691 85814877 147 - chr7:85814730-85814838 NA NA NA NA NA chr7-84 8562233 8562502 131 - chr7:8562379-8562441 NA NA NA NA NA chr7-575 85606303 85606517 190 - chr7:85606319-85606477 NA NA NA NA NA chr7-574 85358236 85358629 199 - chr7:85358511-85358613 NA NA NA NA NA chr7-573 85263153 85263452 155 - chr7:85263298-85263310 NA NA NA NA NA chr7-572 85217474 85217692 175 - chr7:85217545-85217663 NA NA NA NA NA chr7-571 85065555 85065823 153 - chr7:85065676-85065711 NA NA NA NA NA chr7-570 84950394 84951015 340 - chr7:84950530-84950873 NA NA NA NA NA chr7-569 84852267 84852410 122 - chr7:84852292-84852391 NA NA NA NA NA chr7-83 8474145 8474579 221 - chr7:8474300-8474337 NA NA NA NA NA chr7-568 83917254 83917453 148 - chr7:83917306-83917404 NA NA NA NA NA chr7-567 83479951 83480207 157 - chr7:83480046-83480100 NA NA NA NA NA chr7-566 83318281 83318783 254 - chr7:83318505-83318523 NA NA NA NA NA chr7-565 83229663 83229987 292 - chr7:83229723-83229969 NA NA NA NA NA chr7-564 83217110 83217276 134 - chr7:83217121-83217202 NA NA NA NA NA chr7-563 83013873 83014362 232 - chr7:83013960-83014018 NA NA NA NA NA chr7-562 82970980 82971212 193 - chr7:82971061-82971194 NA NA NA NA NA chr7-561 82836628 82836803 121 - chr7:82836703-82836797 NA NA NA NA NA chr7-560 82623296 82623713 192 - chr7:82623411-82623433 NA NA NA NA NA chr7-559 82156602 82156835 172 - chr7:82156689-82156772 NA NA NA NA NA chr7-558 82086561 82086851 190 - chr7:82086561-82086701 NA NA NA NA NA chr7-557 81982589 81982753 148 - chr7:81982603-81982736 NA NA NA NA NA chr7-556 81921489 81921836 193 - chr7:81921591-81921683 NA NA NA NA NA chr7-555 81739170 81739377 142 - chr7:81739263-81739326 NA NA NA NA NA chr7-554 81700819 81701196 201 - chr7:81701036-81701102 NA NA NA NA NA chr7-553 81619753 81620012 164 - chr7:81619846-81619916 NA NA NA NA NA chr7-552 81516884 81517210 276 - chr7:81516931-81517107 NA NA NA NA NA chr7-551 81513396 81513568 155 - chr7:81513399-81513544 NA NA NA NA NA chr7-550 81504782 81504986 188 - chr7:81504796-81504952 NA NA NA NA NA chr7-549 80806104 80806419 160 - chr7:80806253-80806261 NA NA NA NA NA chr7-548 80803578 80803804 159 - chr7:80803641-80803729 NA NA NA NA NA chr7-547 80372037 80372325 152 - chr7:80372169-80372187 NA NA NA NA NA chr7-546 80298422 80298691 189 - chr7:80298461-80298610 NA NA NA NA NA chr7-545 80270467 80270647 153 - chr7:80270492-80270616 NA NA NA NA NA chr7-544 80247848 80248143 189 - chr7:80247978-80248049 NA NA NA NA NA chr7-543 80123780 80124137 315 - chr7:80123825-80124119 NA NA NA NA NA chr7-82 7993738 7994013 198 - chr7:7993964-7994008 NA NA NA NA NA chr7-542 79880388 79880601 196 - chr7:79880421-79880583 NA NA NA NA NA chr7-541 79836927 79837303 200 - chr7:79837088-79837097 NA NA NA NA NA chr7-540 79749075 79749308 188 - chr7:79749119-79749261 NA NA NA NA NA chr7-81 7964439 7964731 206 - chr7:7964537-7964700 NA NA NA NA NA chr7-539 79569407 79569821 227 - chr7:79569665-79569776 NA NA NA NA NA chr7-538 79563784 79564038 182 - chr7:79563836-79563982 NA NA NA NA NA chr7-537 79501125 79501356 127 - chr7:79501203-79501239 NA NA NA NA NA chr7-536 79286999 79287149 118 - chr7:79287035-79287089 NA NA NA NA NA chr7-535 79210844 79211188 164 - chr7:79211044-79211048 NA NA NA NA NA chr7-534 79182954 79183247 239 - chr7:79183082-79183230 NA NA NA NA NA chr7-533 79033709 79034000 159 - chr7:79033785-79033878 NA NA NA NA NA chr7-532 79027265 79027517 163 - chr7:79027358-79027436 NA NA NA NA NA chr7-531 79004186 79004398 134 - chr7:79004239-79004270 NA NA NA NA NA chr7-530 78852638 78852891 151 - chr7:78852647-78852747 NA NA NA NA NA chr7-529 78744435 78744862 261 - chr7:78744667-78744845 NA NA NA NA NA chr7-528 78664224 78664738 307 - chr7:78664551-78664591 NA NA NA NA NA chr7-527 78521361 78521556 151 - chr7:78521402-78521506 NA NA NA NA NA chr7-526 78328811 78328980 130 - chr7:78328885-78328937 NA NA NA NA NA chr7-525 78259257 78259770 264 - chr7:78259354-78259445 NA NA NA NA NA chr7-524 78208648 78208841 155 - chr7:78208688-78208804 NA NA NA NA NA chr7-523 78207078 78207473 189 - chr7:78207325-78207349 NA NA NA NA NA chr7-522 77827919 77828187 232 - chr7:77827973-77828133 NA NA NA NA NA chr7-521 77824825 77825145 173 - chr7:77824926-77824975 NA NA NA NA NA chr7-520 77685862 77686069 143 - chr7:77685926-77686005 NA NA NA NA NA chr7-519 77587732 77588075 209 - chr7:77587910-77588029 NA NA NA NA NA chr7-518 77311622 77311918 168 - chr7:77311758-77311794 NA NA NA NA NA chr7-517 77275138 77275557 193 - chr7:77275266-77275282 NA NA NA NA NA chr7-80 7697608 7697753 119 - chr7:7697644-7697711 NA NA NA NA NA chr7-3 766029 766225 169 - chr7:766055-766199 NA NA NA NA NA chr7-516 76204876 76205150 159 - chr7:76205001-76205040 NA NA NA NA NA chr7-515 76156288 76156456 167 - chr7:76156291-76156456 NA NA NA NA NA chr7-79 7604208 7604584 269 - chr7:7604339-7604488 NA NA NA NA NA chr7-514 76031873 76032227 204 - chr7:76031941-76032035 NA NA NA NA NA chr7-78 7598383 7598686 181 - chr7:7598539-7598632 NA NA NA NA NA chr7-513 75665631 75665915 165 - chr7:75665740-75665791 NA NA NA NA NA chr7-77 7553801 7554207 199 - chr7:7553947-7553948 NA NA NA NA NA chr7-76 7524660 7524950 181 - chr7:7524757-7524835 NA NA NA NA NA chr7-75 7519444 7519625 118 - chr7:7519569-7519593 NA NA NA NA NA chr7-74 7487906 7488318 270 - chr7:7488152-7488228 NA NA NA NA NA chr7-512 74655407 74655702 229 - chr7:74655415-74655520 NA NA NA NA NA chr7-73 7439648 7439946 211 - chr7:7439717-7439850 NA NA NA NA NA chr7-72 7416480 7416883 307 - chr7:7416499-7416633 NA NA NA NA NA chr7-511 74146855 74147043 118 - chr7:74146881-74146951 NA NA NA NA NA chr7-510 74141160 74141376 151 - chr7:74141221-74141303 NA NA NA NA NA chr7-71 7410515 7410697 137 - chr7:7410575-7410682 NA NA NA NA NA chr7-70 7382640 7382791 125 - chr7:7382668-7382780 NA NA NA NA NA chr7-69 7367281 7367572 206 - chr7:7367339-7367433 NA NA NA NA NA chr7-509 73552106 73552613 268 - chr7:73552418-73552520 NA NA NA NA NA chr7-68 7354267 7354643 237 - chr7:7354362-7354416 NA NA NA NA NA chr7-508 73423191 73423395 149 - chr7:73423227-73423302 NA NA NA NA NA chr7-67 7311942 7312121 160 - chr7:7311957-7312094 NA NA NA NA NA chr7-507 72284494 72284693 157 - chr7:72284548-72284657 NA NA NA NA NA chr7-506 72171788 72172475 363 - chr7:72172139-72172284 NA NA NA NA NA chr7-505 71779372 71779620 158 - chr7:71779457-71779520 NA NA NA NA NA chr7-504 71697212 71697542 184 - chr7:71697388-71697411 NA NA NA NA NA chr7-503 71592232 71592532 162 - chr7:71592372-71592395 NA NA NA NA NA chr7-502 71566892 71567233 162 - chr7:71567105-71567122 NA NA NA NA NA chr7-66 7097167 7097430 256 - chr7:7097185-7097427 NA NA NA NA NA chr7-501 70910396 70910595 156 - chr7:70910425-70910545 NA NA NA NA NA chr7-500 70905896 70906190 172 - chr7:70905924-70906035 NA NA NA NA NA chr7-499 70810810 70811086 167 - chr7:70810938-70810985 NA NA NA NA NA chr7-498 70752929 70753293 199 - chr7:70752948-70753052 NA NA NA NA NA chr7-497 70678217 70678483 154 - chr7:70678331-70678372 NA NA NA NA NA chr7-496 70521040 70521282 161 - chr7:70521121-70521201 NA NA NA NA NA chr7-495 70424413 70424624 132 - chr7:70424526-70424562 NA NA NA NA NA chr7-494 70395516 70395791 146 - chr7:70395641-70395660 NA NA NA NA NA chr7-493 70388752 70389129 184 - chr7:70388965-70388976 NA NA NA NA NA chr7-492 70148908 70149128 150 - chr7:70148982-70149066 NA NA NA NA NA chr7-491 70054992 70055191 151 - chr7:70055036-70055135 NA NA NA NA NA chr7-490 69906302 69906519 150 - chr7:69906369-69906452 NA NA NA NA NA chr7-489 69896242 69896663 240 - chr7:69896349-69896445 NA NA NA NA NA chr7-488 69830497 69830685 147 - chr7:69830540-69830645 NA NA NA NA NA chr7-487 68711253 68711450 152 - chr7:68711298-68711405 NA NA NA NA NA chr7-486 68696674 68697040 214 - chr7:68696764-68696902 NA NA NA NA NA chr7-485 68449771 68450042 119 - chr7:68449845-68449851 NA NA NA NA NA chr7-484 68321499 68321767 169 - chr7:68321634-68321686 NA NA NA NA NA chr7-483 67724813 67725340 333 - chr7:67724817-67724978 NA NA NA NA NA chr7-482 67389804 67390234 368 - chr7:67389877-67390194 NA NA NA NA NA chr7-481 66623533 66623702 140 - chr7:66623558-66623671 NA NA NA NA NA chr7-480 66484209 66484445 148 - chr7:66484270-66484303 NA NA NA NA NA chr7-479 66275547 66275799 188 - chr7:66275637-66275793 NA NA NA NA NA chr7-65 6599465 6599764 163 - chr7:6599542-6599583 NA NA NA NA NA chr7-478 65937923 65938308 211 - chr7:65938146-65938232 NA NA NA NA NA chr7-64 6587481 6587786 211 - chr7:6587635-6587722 NA NA NA NA NA chr7-477 65303519 65303855 195 - chr7:65303698-65303790 NA NA NA NA NA chr7-476 64943686 64943991 167 - chr7:64943823-64943851 NA NA NA NA NA chr7-475 64644271 64644555 194 - chr7:64644297-64644446 NA NA NA NA NA chr7-63 6417254 6417466 138 - chr7:6417301-6417398 NA NA NA NA NA chr7-62 6406267 6406505 169 - chr7:6406356-6406446 NA NA NA NA NA chr7-61 6381209 6381779 253 - chr7:6381622-6381654 NA NA NA NA NA chr7-60 6366058 6366254 152 - chr7:6366107-6366220 NA NA NA NA NA chr7-59 6311823 6312117 189 - chr7:6311897-6311949 NA NA NA NA NA chr7-474 62959762 62960059 209 - chr7:62959886-62960051 NA NA NA NA NA chr7-473 62954608 62954944 273 - chr7:62954720-62954867 NA NA NA NA NA chr7-472 62799430 62799596 129 - chr7:62799530-62799585 NA NA NA NA NA chr7-471 62702925 62703314 189 - chr7:62703168-62703200 NA NA NA NA NA chr7-58 6257122 6257292 120 - chr7:6257132-6257222 NA NA NA NA NA chr7-57 6054269 6054460 184 - chr7:6054284-6054454 NA NA NA NA NA chr7-56 6026397 6026757 218 - chr7:6026511-6026559 NA NA NA NA NA chr7-55 5829890 5830101 177 - chr7:5829937-5830097 NA NA NA NA NA chr7-54 5766829 5767306 266 - chr7:5766961-5767173 NA NA NA NA NA chr7-470 56711256 56711461 128 - chr7:56711385-56711410 NA NA NA NA NA chr7-469 56242052 56242211 124 - chr7:56242101-56242204 NA NA NA NA NA chr7-468 55992587 55992867 175 - chr7:55992683-55992744 NA NA NA NA NA chr7-467 55843175 55843406 144 - chr7:55843255-55843305 NA NA NA NA NA chr7-466 55540897 55541208 143 - chr7:55540933-55540974 NA NA NA NA NA chr7-465 55407249 55407543 201 - chr7:55407324-55407414 NA NA NA NA NA chr7-464 55246011 55246305 188 - chr7:55246165-55246223 NA NA NA NA NA chr7-463 55159939 55160376 287 - chr7:55160203-55160283 NA NA NA NA NA chr7-462 55022424 55022606 159 - chr7:55022467-55022593 NA NA NA NA NA chr7-461 54846694 54846867 159 - chr7:54846710-54846862 NA NA NA NA NA chr7-460 54756931 54757152 129 - chr7:54757043-54757100 NA NA NA NA NA chr7-459 54273677 54274099 271 - chr7:54273775-54273842 NA NA NA NA NA chr7-53 5417834 5418162 201 - chr7:5418031-5418080 NA NA NA NA NA chr7-52 5400256 5400620 217 - chr7:5400325-5400426 NA NA NA NA NA chr7-458 53966926 53967133 132 - chr7:53966983-53967020 NA NA NA NA NA chr7-457 53838700 53838868 149 - chr7:53838744-53838855 NA NA NA NA NA chr7-456 53754665 53754955 184 - chr7:53754797-53754928 NA NA NA NA NA chr7-455 53740208 53740439 160 - chr7:53740278-53740366 NA NA NA NA NA chr7-454 53556865 53557106 172 - chr7:53556947-53556981 NA NA NA NA NA chr7-453 53461681 53461846 158 - chr7:53461691-53461845 NA NA NA NA NA chr7-51 5337269 5337427 136 - chr7:5337309-5337401 NA NA NA NA NA chr7-452 53205864 53206073 138 - chr7:53205910-53205952 NA NA NA NA NA chr7-451 52998263 52998526 193 - chr7:52998303-52998398 NA NA NA NA NA chr7-450 52975636 52975781 115 - chr7:52975688-52975762 NA NA NA NA NA chr7-449 52872459 52872793 183 - chr7:52872651-52872702 NA NA NA NA NA chr7-448 52805419 52805840 333 - chr7:52805477-52805634 NA NA NA NA NA chr7-447 52754645 52755136 322 - chr7:52754828-52755111 NA NA NA NA NA chr7-446 52729042 52729407 213 - chr7:52729230-52729273 NA NA NA NA NA chr7-445 52676123 52676368 145 - chr7:52676226-52676274 NA NA NA NA NA chr7-444 52675276 52675497 163 - chr7:52675340-52675442 NA NA NA NA NA chr7-443 52623266 52623544 196 - chr7:52623369-52623524 NA NA NA NA NA chr7-442 52406755 52406985 162 - chr7:52406783-52406897 NA NA NA NA NA chr7-441 52351962 52352199 133 - chr7:52352065-52352093 NA NA NA NA NA chr7-440 52187336 52187510 150 - chr7:52187357-52187480 NA NA NA NA NA chr7-50 5218461 5218761 176 - chr7:5218571-5218609 NA NA NA NA NA chr7-439 52089701 52090180 296 - chr7:52089890-52089966 NA NA NA NA NA chr7-49 5207349 5207604 221 - chr7:5207408-5207561 NA NA NA NA NA chr7-438 52072143 52072461 258 - chr7:52072154-52072292 NA NA NA NA NA chr7-48 5198162 5198474 257 - chr7:5198172-5198319 NA NA NA NA NA chr7-437 51886463 51886753 161 - chr7:51886542-51886599 NA NA NA NA NA chr7-436 51850378 51850612 184 - chr7:51850379-51850464 NA NA NA NA NA chr7-435 51817569 51817854 156 - chr7:51817702-51817727 NA NA NA NA NA chr7-434 51790202 51790436 133 - chr7:51790311-51790351 NA NA NA NA NA chr7-433 51713794 51714276 219 - chr7:51713901-51713935 NA NA NA NA NA chr7-432 51587301 51587486 163 - chr7:51587319-51587456 NA NA NA NA NA chr7-431 50991466 50991848 212 - chr7:50991526-50991641 NA NA NA NA NA chr7-430 50789668 50789824 121 - chr7:50789722-50789773 NA NA NA NA NA chr7-429 50649455 50649884 242 - chr7:50649615-50649643 NA NA NA NA NA chr7-428 50469320 50469514 166 - chr7:50469328-50469476 NA NA NA NA NA chr7-427 50186304 50186555 229 - chr7:50186313-50186531 NA NA NA NA NA chr7-426 50084223 50084515 167 - chr7:50084417-50084460 NA NA NA NA NA chr7-425 50069827 50070215 217 - chr7:50069864-50069977 NA NA NA NA NA chr7-424 49962855 49963207 205 - chr7:49963049-49963053 NA NA NA NA NA chr7-423 49919643 49919858 186 - chr7:49919704-49919845 NA NA NA NA NA chr7-422 49875014 49875183 163 - chr7:49875032-49875183 NA NA NA NA NA chr7-421 49843212 49843461 167 - chr7:49843283-49843376 NA NA NA NA NA chr7-47 4939125 4939373 197 - chr7:4939193-4939356 NA NA NA NA NA chr7-420 49370187 49370356 155 - chr7:49370207-49370345 NA NA NA NA NA chr7-419 49235745 49235969 144 - chr7:49235821-49235881 NA NA NA NA NA chr7-418 49035139 49035353 158 - chr7:49035185-49035292 NA NA NA NA NA chr7-46 4901465 4901756 254 - chr7:4901521-4901701 NA NA NA NA NA chr7-417 48896656 48896905 149 - chr7:48896756-48896805 NA NA NA NA NA chr7-416 48579441 48579767 183 - chr7:48579602-48579633 NA NA NA NA NA chr7-415 48567852 48568107 194 - chr7:48567905-48568071 NA NA NA NA NA chr7-414 48389292 48389520 165 - chr7:48389359-48389445 NA NA NA NA NA chr7-413 48304815 48305082 152 - chr7:48304926-48304965 NA NA NA NA NA chr7-412 48267007 48267348 230 - chr7:48267028-48267192 NA NA NA NA NA chr7-411 48261939 48262114 167 - chr7:48261939-48262102 NA NA NA NA NA chr7-410 48138767 48138941 143 - chr7:48138811-48138936 NA NA NA NA NA chr7-409 47958193 47958412 157 - chr7:47958259-47958352 NA NA NA NA NA chr7-408 47820338 47820784 285 - chr7:47820377-47820562 NA NA NA NA NA chr7-407 47811293 47811582 205 - chr7:47811344-47811507 NA NA NA NA NA chr7-406 47732360 47732825 364 - chr7:47732382-47732566 NA NA NA NA NA chr7-405 47718850 47719080 158 - chr7:47718860-47718982 NA NA NA NA NA chr7-404 47717358 47717623 151 - chr7:47717468-47717507 NA NA NA NA NA chr7-45 4736720 4736908 159 - chr7:4736749-4736879 NA NA NA NA NA chr7-403 47207055 47207325 196 - chr7:47207203-47207288 NA NA NA NA NA chr7-402 47154911 47155074 123 - chr7:47154924-47155027 NA NA NA NA NA chr7-401 47138886 47139196 210 - chr7:47138922-47139082 NA NA NA NA NA chr7-400 47094174 47094415 146 - chr7:47094271-47094321 NA NA NA NA NA chr7-399 47061390 47061727 177 - chr7:47061607-47061681 NA NA NA NA NA chr7-44 4671343 4671644 150 - chr7:4671486-4671489 NA NA NA NA NA chr7-43 4661676 4662124 244 - chr7:4661769-4661898 NA NA NA NA NA chr7-42 4655604 4655974 228 - chr7:4655817-4655974 NA NA NA NA NA chr7-398 46557037 46557628 252 - chr7:46557164-46557183 NA NA NA NA NA chr7-397 46553361 46553988 308 - chr7:46553839-46553888 NA NA NA NA NA chr7-396 46470740 46471004 171 - chr7:46470823-46470891 NA NA NA NA NA chr7-395 46391834 46392159 194 - chr7:46392007-46392049 NA NA NA NA NA chr7-394 46329921 46330117 160 - chr7:46329931-46330073 NA NA NA NA NA chr7-393 46300448 46300812 256 - chr7:46300508-46300710 NA NA NA NA NA chr7-392 46186022 46186287 157 - chr7:46186128-46186178 NA NA NA NA NA chr7-391 46126009 46126191 152 - chr7:46126042-46126167 NA NA NA NA NA chr7-390 46061463 46061884 312 - chr7:46061567-46061802 NA NA NA NA NA chr7-389 46024048 46024232 152 - chr7:46024060-46024190 NA NA NA NA NA chr7-388 45995251 45995689 262 - chr7:45995453-45995627 NA NA NA NA NA chr7-387 45638109 45638410 255 - chr7:45638159-45638322 NA NA NA NA NA chr7-386 45622809 45623117 170 - chr7:45622939-45622963 NA NA NA NA NA chr7-385 45603899 45604093 168 - chr7:45603915-45604047 NA NA NA NA NA chr7-384 45599973 45600274 156 - chr7:45600141-45600175 NA NA NA NA NA chr7-383 45530168 45530456 162 - chr7:45530310-45530338 NA NA NA NA NA chr7-382 45477125 45477304 148 - chr7:45477158-45477274 NA NA NA NA NA chr7-381 45370515 45370719 177 - chr7:45370522-45370682 NA NA NA NA NA chr7-380 45127012 45127318 167 - chr7:45127164-45127205 NA NA NA NA NA chr7-379 44938521 44938719 156 - chr7:44938570-44938691 NA NA NA NA NA chr7-378 44794613 44795062 317 - chr7:44794810-44795061 NA NA NA NA NA chr7-377 44713833 44714084 187 - chr7:44713905-44714060 NA NA NA NA NA chr7-376 44707084 44707341 181 - chr7:44707183-44707311 NA NA NA NA NA chr7-375 44659450 44659941 287 - chr7:44659684-44659797 NA NA NA NA NA chr7-374 44524108 44524316 188 - chr7:44524160-44524312 NA NA NA NA NA chr7-373 44404763 44405114 239 - chr7:44404961-44405045 NA NA NA NA NA chr7-372 44317335 44317656 225 - chr7:44317415-44317592 NA NA NA NA NA chr7-371 44287580 44287764 155 - chr7:44287607-44287731 NA NA NA NA NA chr7-370 44168261 44168472 162 - chr7:44168312-44168424 NA NA NA NA NA chr7-369 44126450 44126808 216 - chr7:44126529-44126619 NA NA NA NA NA chr7-368 43801994 43802295 193 - chr7:43802101-43802169 NA NA NA NA NA chr7-367 43790697 43791076 243 - chr7:43790901-43790929 NA NA NA NA NA chr7-366 43754926 43755195 224 - chr7:43754961-43755145 NA NA NA NA NA chr7-365 43752531 43752696 151 - chr7:43752541-43752674 NA NA NA NA NA chr7-41 4371936 4372145 175 - chr7:4371976-4372123 NA NA NA NA NA chr7-2 436995 437379 206 - chr7:437157-437274 NA NA NA NA NA chr7-364 43592130 43592507 205 - chr7:43592363-43592457 NA NA NA NA NA chr7-363 43536290 43536581 129 - chr7:43536296-43536344 NA NA NA NA NA chr7-362 43469831 43470134 158 - chr7:43469981-43469999 NA NA NA NA NA chr7-361 43253073 43253313 213 - chr7:43253097-43253256 NA NA NA NA NA chr7-360 43186337 43186748 259 - chr7:43186575-43186639 NA NA NA NA NA chr7-359 43045313 43045633 198 - chr7:43045466-43045603 NA NA NA NA NA chr7-358 42999649 42999976 223 - chr7:42999845-42999918 NA NA NA NA NA chr7-357 42936050 42936224 141 - chr7:42936061-42936147 NA NA NA NA NA chr7-356 42840815 42841062 145 - chr7:42840892-42840910 NA NA NA NA NA chr7-355 42560208 42560502 138 - chr7:42560399-42560416 NA NA NA NA NA chr7-354 42474825 42474980 149 - chr7:42474833-42474975 NA NA NA NA NA chr7-353 42467742 42468060 166 - chr7:42467892-42467907 NA NA NA NA NA chr7-352 42447117 42447299 154 - chr7:42447157-42447277 NA NA NA NA NA chr7-351 42417422 42417785 239 - chr7:42417485-42417539 NA NA NA NA NA chr7-350 42371571 42372022 266 - chr7:42371652-42371720 NA NA NA NA NA chr7-349 42352564 42352950 286 - chr7:42352684-42352860 NA NA NA NA NA chr7-348 42284612 42284850 158 - chr7:42284698-42284816 NA NA NA NA NA chr7-347 42182408 42182621 137 - chr7:42182489-42182555 NA NA NA NA NA chr7-346 41819956 41820228 173 - chr7:41820032-41820105 NA NA NA NA NA chr7-345 41807567 41807723 133 - chr7:41807616-41807703 NA NA NA NA NA chr7-344 41721148 41721401 165 - chr7:41721250-41721341 NA NA NA NA NA chr7-343 41698836 41699205 249 - chr7:41698945-41699035 NA NA NA NA NA chr7-342 41685610 41686218 333 - chr7:41685841-41685921 NA NA NA NA NA chr7-341 41484060 41484258 145 - chr7:41484135-41484216 NA NA NA NA NA chr7-340 41328056 41328241 114 - chr7:41328173-41328193 NA NA NA NA NA chr7-339 41281355 41281572 150 - chr7:41281420-41281501 NA NA NA NA NA chr7-338 40865355 40865528 163 - chr7:40865363-40865514 NA NA NA NA NA chr7-337 40853793 40854084 201 - chr7:40853861-40854017 NA NA NA NA NA chr7-336 40611614 40611988 242 - chr7:40611836-40611943 NA NA NA NA NA chr7-335 40600959 40601116 135 - chr7:40600967-40601091 NA NA NA NA NA chr7-334 40375421 40375591 164 - chr7:40375433-40375585 NA NA NA NA NA chr7-333 40354171 40354666 306 - chr7:40354269-40354508 NA NA NA NA NA chr7-332 40256728 40256984 228 - chr7:40256793-40256965 NA NA NA NA NA chr7-331 40224930 40225305 208 - chr7:40225156-40225256 NA NA NA NA NA chr7-330 40119450 40119705 148 - chr7:40119611-40119625 NA NA NA NA NA chr7-329 40040676 40041039 191 - chr7:40040855-40040947 NA NA NA NA NA chr7-328 39886686 39887116 208 - chr7:39887017-39887114 NA NA NA NA NA chr7-327 39676544 39677018 290 - chr7:39676814-39676877 NA NA NA NA NA chr7-326 39633875 39634027 117 - chr7:39633976-39634023 NA NA NA NA NA chr7-325 39588162 39588339 146 - chr7:39588191-39588307 NA NA NA NA NA chr7-324 39576516 39576700 160 - chr7:39576520-39576668 NA NA NA NA NA chr7-323 39558077 39558289 166 - chr7:39558139-39558251 NA NA NA NA NA chr7-322 39540602 39540906 164 - chr7:39540731-39540744 NA NA NA NA NA chr7-321 39520479 39520642 151 - chr7:39520509-39520636 NA NA NA NA NA chr7-40 3950102 3950267 125 - chr7:3950112-3950212 NA NA NA NA NA chr7-320 39332026 39332413 270 - chr7:39332081-39332172 NA NA NA NA NA chr7-319 39089839 39090081 163 - chr7:39089910-39089998 NA NA NA NA NA chr7-318 39003901 39004267 282 - chr7:39004055-39004218 NA NA NA NA NA chr7-317 38976907 38977195 135 - chr7:38977084-38977090 NA NA NA NA NA chr7-316 38814994 38815403 262 - chr7:38815253-38815312 NA NA NA NA NA chr7-315 38789074 38789388 163 - chr7:38789224-38789235 NA NA NA NA NA chr7-314 38768282 38768473 130 - chr7:38768413-38768447 NA NA NA NA NA chr7-313 38751568 38751750 127 - chr7:38751663-38751715 NA NA NA NA NA chr7-312 38748053 38748306 135 - chr7:38748167-38748186 NA NA NA NA NA chr7-311 38669427 38669637 157 - chr7:38669492-38669590 NA NA NA NA NA chr7-310 38651468 38651860 181 - chr7:38651648-38651655 NA NA NA NA NA chr7-309 38639462 38639822 203 - chr7:38639587-38639601 NA NA NA NA NA chr7-308 38625565 38625803 134 - chr7:38625697-38625755 NA NA NA NA NA chr7-39 3857137 3857385 176 - chr7:3857190-3857330 NA NA NA NA NA chr7-307 38541841 38542132 198 - chr7:38541910-38541991 NA NA NA NA NA chr7-306 38539428 38539582 139 - chr7:38539473-38539582 NA NA NA NA NA chr7-305 38462774 38463088 160 - chr7:38462912-38462926 NA NA NA NA NA chr7-304 38314876 38315084 164 - chr7:38314924-38315048 NA NA NA NA NA chr7-303 38305804 38306069 146 - chr7:38305917-38305947 NA NA NA NA NA chr7-302 38287089 38287688 445 - chr7:38287221-38287498 NA NA NA NA NA chr7-38 3825343 3825655 174 - chr7:3825513-3825533 NA NA NA NA NA chr7-301 38113093 38113336 187 - chr7:38113107-38113266 NA NA NA NA NA chr7-300 37981707 37982090 207 - chr7:37981919-37982038 NA NA NA NA NA chr7-37 3792834 3793148 167 - chr7:3792981-3793001 NA NA NA NA NA chr7-299 37789039 37789422 225 - chr7:37789236-37789382 NA NA NA NA NA chr7-298 37763333 37763539 162 - chr7:37763383-37763507 NA NA NA NA NA chr7-297 37731633 37731955 179 - chr7:37731776-37731812 NA NA NA NA NA chr7-296 37201095 37201594 271 - chr7:37201349-37201379 NA NA NA NA NA chr7-295 37012367 37012610 149 - chr7:37012463-37012520 NA NA NA NA NA chr7-294 36914288 36914495 172 - chr7:36914337-36914488 NA NA NA NA NA chr7-36 3689265 3689707 210 - chr7:3689549-3689579 NA NA NA NA NA chr7-293 36790567 36790951 215 - chr7:36790789-36790888 NA NA NA NA NA chr7-292 36781293 36781451 154 - chr7:36781298-36781450 NA NA NA NA NA chr7-291 36692988 36693181 167 - chr7:36693018-36693163 NA NA NA NA NA chr7-290 36585162 36585465 198 - chr7:36585170-36585319 NA NA NA NA NA chr7-289 36491586 36491727 133 - chr7:36491604-36491724 NA NA NA NA NA chr7-35 3647300 3647619 218 - chr7:3647495-3647565 NA NA NA NA NA chr7-288 36463701 36463906 141 - chr7:36463779-36463870 NA NA NA NA NA chr7-34 3639890 3640121 155 - chr7:3639963-3640039 NA NA NA NA NA chr7-287 36213349 36213650 172 - chr7:36213468-36213501 NA NA NA NA NA chr7-286 35999752 35999929 155 - chr7:35999762-35999901 NA NA NA NA NA chr7-285 35722730 35722978 181 - chr7:35722754-35722825 NA NA NA NA NA chr7-284 35675653 35676046 252 - chr7:35675890-35675928 NA NA NA NA NA chr7-33 3562901 3563062 115 - chr7:3562909-3563001 NA NA NA NA NA chr7-283 35625612 35625936 170 - chr7:35625763-35625776 NA NA NA NA NA chr7-282 35546609 35546887 146 - chr7:35546737-35546747 NA NA NA NA NA chr7-32 3545660 3546054 210 - chr7:3545883-3545948 NA NA NA NA NA chr7-281 35426894 35427212 215 - chr7:35427033-35427181 NA NA NA NA NA chr7-280 35397755 35398317 364 - chr7:35397925-35398063 NA NA NA NA NA chr7-279 35247254 35247498 154 - chr7:35247345-35247410 NA NA NA NA NA chr7-31 3491565 3491887 204 - chr7:3491658-3491803 NA NA NA NA NA chr7-278 34889709 34890056 166 - chr7:34889956-34889968 NA NA NA NA NA chr7-277 34846232 34846386 146 - chr7:34846242-34846382 NA NA NA NA NA chr7-30 3484165 3484423 119 - chr7:3484248-3484256 NA NA NA NA NA chr7-276 34702094 34702391 218 - chr7:34702141-34702248 NA NA NA NA NA chr7-275 34622003 34622316 158 - chr7:34622144-34622154 NA NA NA NA NA chr7-274 34603469 34604110 328 - chr7:34603839-34603996 NA NA NA NA NA chr7-273 34523510 34523737 127 - chr7:34523536-34523600 NA NA NA NA NA chr7-29 3425680 3425918 147 - chr7:3425773-3425831 NA NA NA NA NA chr7-272 34251039 34251273 155 - chr7:34251116-34251190 NA NA NA NA NA chr7-271 34194507 34194929 254 - chr7:34194611-34194729 NA NA NA NA NA chr7-270 34045491 34045873 195 - chr7:34045709-34045748 NA NA NA NA NA chr7-269 33839477 33839909 248 - chr7:33839666-33839724 NA NA NA NA NA chr7-268 33725649 33725943 159 - chr7:33725781-33725802 NA NA NA NA NA chr7-267 33720309 33720630 213 - chr7:33720454-33720613 NA NA NA NA NA chr7-266 33647399 33647612 114 - chr7:33647566-33647569 NA NA NA NA NA chr7-265 33587705 33588157 228 - chr7:33588111-33588126 NA NA NA NA NA chr7-264 33578998 33579295 192 - chr7:33579139-33579262 NA NA NA NA NA chr7-28 3352340 3352591 135 - chr7:3352456-3352475 NA NA NA NA NA chr7-263 33506492 33506742 203 - chr7:33506619-33506735 NA NA NA NA NA chr7-262 33386963 33387189 146 - chr7:33387059-33387117 NA NA NA NA NA chr7-27 3335514 3335721 133 - chr7:3335620-3335663 NA NA NA NA NA chr7-261 33289790 33290115 273 - chr7:33289938-33290107 NA NA NA NA NA chr7-260 33207948 33208269 204 - chr7:33208147-33208193 NA NA NA NA NA chr7-26 3320233 3320502 162 - chr7:3320339-3320393 NA NA NA NA NA chr7-259 33174325 33174645 218 - chr7:33174355-33174522 NA NA NA NA NA chr7-258 33154699 33155076 153 - chr7:33154937-33154961 NA NA NA NA NA chr7-257 33144397 33144595 160 - chr7:33144435-33144557 NA NA NA NA NA chr7-256 33104543 33104808 181 - chr7:33104638-33104746 NA NA NA NA NA chr7-255 33014737 33014928 155 - chr7:33014772-33014890 NA NA NA NA NA chr7-25 3288588 3288758 128 - chr7:3288597-3288704 NA NA NA NA NA chr7-254 32808744 32808995 123 - chr7:32808885-32808893 NA NA NA NA NA chr7 326724 327259 233 - chr7:327177-327259 NA NA NA NA NA chr7-253 32153322 32153624 146 - chr7:32153393-32153427 NA NA NA NA NA chr7-252 32141521 32141791 232 - chr7:32141528-32141684 NA NA NA NA NA chr7-251 32029645 32029823 160 - chr7:32029665-32029816 NA NA NA NA NA chr7-24 3194867 3195312 217 - chr7:3195004-3195163 NA NA NA NA NA chr7-250 31907151 31907363 153 - chr7:31907212-31907308 NA NA NA NA NA chr7-249 31780958 31781206 136 - chr7:31781049-31781106 NA NA NA NA NA chr7-248 31658880 31659187 165 - chr7:31659025-31659051 NA NA NA NA NA chr7-23 3150097 3150417 209 - chr7:3150248-3150326 NA NA NA NA NA chr7-22 3136109 3136539 338 - chr7:3136237-3136391 NA NA NA NA NA chr7-247 31350407 31350585 158 - chr7:31350429-31350569 NA NA NA NA NA chr7-246 31330082 31330420 224 - chr7:31330198-31330268 NA NA NA NA NA chr7-245 31313275 31313776 251 - chr7:31313413-31313568 NA NA NA NA NA chr7-244 31305178 31305535 177 - chr7:31305242-31305297 NA NA NA NA NA chr7-243 31276198 31276716 287 - chr7:31276376-31276379 NA NA NA NA NA chr7-21 3114654 3115153 381 - chr7:3114685-3115020 NA NA NA NA NA chr7-242 30865409 30865748 179 - chr7:30865575-30865591 NA NA NA NA NA chr7-241 30605000 30605303 255 - chr7:30605056-30605215 NA NA NA NA NA chr7-240 30592087 30592359 146 - chr7:30592203-30592228 NA NA NA NA NA chr7-239 30428728 30428947 147 - chr7:30428802-30428879 NA NA NA NA NA chr7-238 30310589 30310787 131 - chr7:30310636-30310710 NA NA NA NA NA chr7-237 30263515 30264006 258 - chr7:30263857-30263901 NA NA NA NA NA chr7-236 30250567 30250740 156 - chr7:30250586-30250724 NA NA NA NA NA chr7-235 30248300 30248503 143 - chr7:30248383-30248496 NA NA NA NA NA chr7-234 30041220 30041370 128 - chr7:30041253-30041337 NA NA NA NA NA chr7-233 29927488 29927812 175 - chr7:29927662-29927687 NA NA NA NA NA chr7-232 29863710 29863970 197 - chr7:29863744-29863815 NA NA NA NA NA chr7-231 29804381 29804803 224 - chr7:29804608-29804663 NA NA NA NA NA chr7-230 29748625 29749162 269 - chr7:29749007-29749142 NA NA NA NA NA chr7-229 29610437 29610683 125 - chr7:29610472-29610519 NA NA NA NA NA chr7-228 29555789 29556071 161 - chr7:29555916-29555953 NA NA NA NA NA chr7-20 2955545 2955908 224 - chr7:2955576-2955715 NA NA NA NA NA chr7-227 29439595 29439889 162 - chr7:29439764-29439831 NA NA NA NA NA chr7-226 29422480 29422723 159 - chr7:29422565-29422641 NA NA NA NA NA chr7-225 29234374 29234584 170 - chr7:29234408-29234532 NA NA NA NA NA chr7-224 29008499 29009135 290 - chr7:29009001-29009105 NA NA NA NA NA chr7-223 29008054 29008234 165 - chr7:29008059-29008199 NA NA NA NA NA chr7-222 29003879 29004115 146 - chr7:29003967-29004021 NA NA NA NA NA chr7-221 28972710 28973207 368 - chr7:28972929-28973123 NA NA NA NA NA chr7-220 28900487 28900820 202 - chr7:28900587-28900627 NA NA NA NA NA chr7-219 28795113 28795265 118 - chr7:28795150-28795200 NA NA NA NA NA chr7-218 28777502 28777712 143 - chr7:28777572-28777651 NA NA NA NA NA chr7-217 28582747 28582984 140 - chr7:28582883-28582902 NA NA NA NA NA chr7-216 28552679 28552963 158 - chr7:28552818-28552863 NA NA NA NA NA chr7-215 28543082 28543253 134 - chr7:28543085-28543148 NA NA NA NA NA chr7-214 28450892 28451171 155 - chr7:28451023-28451061 NA NA NA NA NA chr7-213 28418666 28418901 113 - chr7:28418806-28418815 NA NA NA NA NA chr7-212 28332875 28333130 156 - chr7:28332974-28333031 NA NA NA NA NA chr7-211 28239520 28239724 169 - chr7:28239542-28239663 NA NA NA NA NA chr7-210 28199945 28200289 257 - chr7:28200008-28200190 NA NA NA NA NA chr7-209 28164238 28164508 173 - chr7:28164415-28164451 NA NA NA NA NA chr7-19 2791818 2792325 299 - chr7:2792018-2792101 NA NA NA NA NA chr7-208 27839411 27839830 199 - chr7:27839678-27839704 NA NA NA NA NA chr7-207 27745949 27746108 120 - chr7:27746059-27746101 NA NA NA NA NA chr7-206 27707409 27707715 190 - chr7:27707491-27707582 NA NA NA NA NA chr7-18 2715623 2715821 166 - chr7:2715651-2715781 NA NA NA NA NA chr7-205 27027023 27027340 216 - chr7:27027139-27027199 NA NA NA NA NA chr7-204 26882111 26882265 114 - chr7:26882128-26882222 NA NA NA NA NA chr7-203 26815442 26815609 118 - chr7:26815445-26815537 NA NA NA NA NA chr7-202 26517369 26517851 332 - chr7:26517428-26517519 NA NA NA NA NA chr7-201 26500596 26500819 132 - chr7:26500683-26500726 NA NA NA NA NA chr7-200 26436550 26437016 249 - chr7:26436659-26436745 NA NA NA NA NA chr7-199 26321106 26321304 154 - chr7:26321145-26321250 NA NA NA NA NA chr7-198 26291538 26291695 153 - chr7:26291544-26291695 NA NA NA NA NA chr7-197 26240088 26240316 144 - chr7:26240182-26240252 NA NA NA NA NA chr7-196 26232774 26233176 272 - chr7:26232913-26233064 NA NA NA NA NA chr7-195 26094060 26094268 156 - chr7:26094114-26094220 NA NA NA NA NA chr7-194 25907188 25907423 174 - chr7:25907249-25907362 NA NA NA NA NA chr7-193 25808512 25808697 149 - chr7:25808526-25808650 NA NA NA NA NA chr7-192 25677513 25677729 117 - chr7:25677607-25677620 NA NA NA NA NA chr7-191 24958820 24959039 155 - chr7:24958890-24958978 NA NA NA NA NA chr7-190 24574489 24574800 147 - chr7:24574654-24574719 NA NA NA NA NA chr7-189 24422648 24422828 149 - chr7:24422663-24422789 NA NA NA NA NA chr7-188 24360760 24361117 208 - chr7:24360845-24360994 NA NA NA NA NA chr7-187 24225139 24225463 214 - chr7:24225229-24225354 NA NA NA NA NA chr7-17 2381103 2381321 142 - chr7:2381168-2381272 NA NA NA NA NA chr7-186 23691283 23691515 164 - chr7:23691319-23691431 NA NA NA NA NA chr7-16 2364310 2364627 280 - chr7:2364345-2364586 NA NA NA NA NA chr7-15 2353492 2353907 245 - chr7:2353719-2353773 NA NA NA NA NA chr7-185 23504603 23504995 218 - chr7:23504773-23504904 NA NA NA NA NA chr7-184 23385746 23386240 297 - chr7:23386077-23386097 NA NA NA NA NA chr7-183 23122092 23122248 144 - chr7:23122114-23122241 NA NA NA NA NA chr7-14 2306930 2307257 261 - chr7:2307018-2307156 NA NA NA NA NA chr7-182 23024845 23025009 160 - chr7:23024848-23025003 NA NA NA NA NA chr7-181 22829500 22829698 144 - chr7:22829568-22829651 NA NA NA NA NA chr7-180 22824679 22824903 147 - chr7:22824757-22824828 NA NA NA NA NA chr7-179 22810592 22810824 159 - chr7:22810665-22810751 NA NA NA NA NA chr7-178 22766734 22766929 169 - chr7:22766773-22766929 NA NA NA NA NA chr7-13 2272429 2272769 201 - chr7:2272609-2272722 NA NA NA NA NA chr7-177 22429772 22429963 175 - chr7:22429776-22429943 NA NA NA NA NA chr7-176 22347520 22347714 144 - chr7:22347560-22347659 NA NA NA NA NA chr7-175 22328693 22329149 250 - chr7:22328784-22328931 NA NA NA NA NA chr7-174 22164612 22164958 184 - chr7:22164822-22164867 NA NA NA NA NA chr7-12 2186427 2186598 152 - chr7:2186442-2186577 NA NA NA NA NA chr7-173 21599276 21599584 163 - chr7:21599415-21599427 NA NA NA NA NA chr7-172 21531112 21531444 208 - chr7:21531202-21531348 NA NA NA NA NA chr7-171 21301924 21302077 131 - chr7:21301926-21302046 NA NA NA NA NA chr7-170 21289469 21289820 212 - chr7:21289678-21289716 NA NA NA NA NA chr7-169 21023635 21023838 151 - chr7:21023687-21023786 NA NA NA NA NA chr7-11 2060607 2060847 158 - chr7:2060695-2060768 NA NA NA NA NA chr7-10 2037886 2038133 168 - chr7:2037967-2038055 NA NA NA NA NA chr7-9 2019703 2019896 118 - chr7:2019805-2019875 NA NA NA NA NA chr7-168 20135962 20136251 233 - chr7:20135962-20136083 NA NA NA NA NA chr7-167 20082074 20082246 148 - chr7:20082105-20082236 NA NA NA NA NA chr7-166 19999449 19999632 165 - chr7:19999456-19999592 NA NA NA NA NA chr7-165 19911793 19912002 125 - chr7:19911903-19911931 NA NA NA NA NA chr7-164 19759712 19760004 202 - chr7:19759713-19759870 NA NA NA NA NA chr7-163 19401355 19401637 200 - chr7:19401400-19401559 NA NA NA NA NA chr7-162 19391245 19391471 150 - chr7:19391332-19391417 NA NA NA NA NA chr7-161 19222463 19222693 147 - chr7:19222550-19222612 NA NA NA NA NA chr7-160 19127429 19127588 133 - chr7:19127483-19127576 NA NA NA NA NA chr7-159 19125622 19126121 262 - chr7:19125655-19125782 NA NA NA NA NA chr7-158 18944149 18944568 212 - chr7:18944219-18944301 NA NA NA NA NA chr7-157 18587842 18588020 164 - chr7:18587864-18588010 NA NA NA NA NA chr7-156 18500258 18500397 123 - chr7:18500301-18500392 NA NA NA NA NA chr7-155 18430589 18430929 176 - chr7:18430739-18430758 NA NA NA NA NA chr7-154 18311270 18311462 150 - chr7:18311316-18311422 NA NA NA NA NA chr7-153 18164338 18164669 181 - chr7:18164449-18164497 NA NA NA NA NA chr7-152 18139769 18140040 160 - chr7:18139868-18139923 NA NA NA NA NA chr7-151 17983716 17983915 121 - chr7:17983763-17983775 NA NA NA NA NA chr7-150 17981393 17981631 168 - chr7:17981441-17981574 NA NA NA NA NA chr7-149 17966102 17966719 410 - chr7:17966130-17966465 NA NA NA NA NA chr7-148 17953567 17953825 120 - chr7:17953726-17953729 NA NA NA NA NA chr7-147 17919874 17920161 230 - chr7:17920013-17920145 NA NA NA NA NA chr7-146 17614719 17614915 122 - chr7:17614794-17614843 NA NA NA NA NA chr7-145 17539635 17539907 179 - chr7:17539751-17539860 NA NA NA NA NA chr7-144 17485154 17485474 205 - chr7:17485317-17485383 NA NA NA NA NA chr7-143 17380425 17380613 131 - chr7:17380504-17380600 NA NA NA NA NA chr7-142 17241566 17241738 138 - chr7:17241620-17241714 NA NA NA NA NA chr7-141 17028991 17029260 161 - chr7:17029115-17029160 NA NA NA NA NA chr7-140 16888080 16888352 154 - chr7:16888226-16888248 NA NA NA NA NA chr7-139 16779177 16779443 157 - chr7:16779291-16779344 NA NA NA NA NA chr7-138 16724272 16724592 172 - chr7:16724441-16724486 NA NA NA NA NA chr7-137 16611435 16611668 163 - chr7:16611503-16611594 NA NA NA NA NA chr7-136 16606610 16606818 188 - chr7:16606648-16606796 NA NA NA NA NA chr7-135 16553193 16553507 192 - chr7:16553351-16553403 NA NA NA NA NA chr7-134 16543863 16544078 138 - chr7:16543932-16543997 NA NA NA NA NA chr7-133 16197128 16197294 151 - chr7:16197140-16197273 NA NA NA NA NA chr7-132 16192926 16193272 219 - chr7:16193195-16193216 NA NA NA NA NA chr7-833 158963438 158963923 232 - chr7:158963740-158963768 NA NA NA NA NA chr7-832 158784472 158784911 229 - chr7:158784522-158784621 NA NA NA NA NA chr7-131 15665285 15665706 200 - chr7:15665338-15665401 NA NA NA NA NA chr7-130 15615030 15615393 178 - chr7:15615119-15615160 NA NA NA NA NA chr7-831 155855301 155855532 160 - chr7:155855382-155855466 NA NA NA NA NA chr7-129 15437842 15438066 168 - chr7:15437910-15438016 NA NA NA NA NA chr7-128 15337624 15337873 157 - chr7:15337711-15337771 NA NA NA NA NA chr7-127 15291214 15291531 215 - chr7:15291292-15291456 NA NA NA NA NA chr7-126 15255056 15255259 163 - chr7:15255099-15255225 NA NA NA NA NA chr7-125 15244162 15244644 260 - chr7:15244383-15244532 NA NA NA NA NA chr7-124 15231981 15232250 170 - chr7:15232074-15232148 NA NA NA NA NA chr7-830 152159395 152159609 131 - chr7:152159465-152159500 NA NA NA NA NA chr7-829 152106842 152107034 162 - chr7:152106871-152107002 NA NA NA NA NA chr7-123 15128959 15129361 234 - chr7:15129126-15129276 NA NA NA NA NA chr7-828 150648558 150648811 161 - chr7:150648645-150648709 NA NA NA NA NA chr7-827 149482907 149483670 531 - chr7:149482907-149483322 NA NA NA NA NA chr7-826 148089014 148089384 211 - chr7:148089187-148089232 NA NA NA NA NA chr7-122 14788456 14788853 317 - chr7:14788696-14788853 NA NA NA NA NA chr7-121 14711887 14712168 161 - chr7:14712012-14712058 NA NA NA NA NA chr7-825 146256703 146256940 149 - chr7:146256780-146256830 NA NA NA NA NA chr7-824 145727278 145727493 194 - chr7:145727321-145727473 NA NA NA NA NA chr7-823 145203147 145203731 315 - chr7:145203456-145203542 NA NA NA NA NA chr7-822 144485027 144485176 135 - chr7:144485065-144485174 NA NA NA NA NA chr7-120 14414295 14414620 266 - chr7:14414461-14414609 NA NA NA NA NA chr7-821 143124398 143124576 149 - chr7:143124431-143124555 NA NA NA NA NA chr7-8 1428413 1428592 170 - chr7:1428436-1428590 NA NA NA NA NA chr7-820 141625392 141625797 247 - chr7:141625496-141625531 NA NA NA NA NA chr7-819 141008779 141008960 151 - chr7:141008811-141008931 NA NA NA NA NA chr7-818 140884504 140884827 170 - chr7:140884669-140884680 NA NA NA NA NA chr7-817 140748911 140749213 163 - chr7:140749042-140749070 NA NA NA NA NA chr7-816 140385383 140385623 164 - chr7:140385383-140385509 NA NA NA NA NA chr7-815 140232122 140232337 195 - chr7:140232127-140232282 NA NA NA NA NA chr7-119 13945142 13945316 124 - chr7:13945158-13945249 NA NA NA NA NA chr7-814 139266639 139266942 170 - chr7:139266796-139266857 NA NA NA NA NA chr7-813 139143522 139143780 216 - chr7:139143532-139143664 NA NA NA NA NA chr7-812 138901739 138901911 141 - chr7:138901796-138901893 NA NA NA NA NA chr7-811 138896834 138897053 188 - chr7:138896917-138897043 NA NA NA NA NA chr7-810 138390267 138390483 155 - chr7:138390327-138390420 NA NA NA NA NA chr7-809 138092777 138092979 157 - chr7:138092816-138092922 NA NA NA NA NA chr7-808 137623088 137623367 159 - chr7:137623218-137623252 NA NA NA NA NA chr7-807 137496493 137496681 159 - chr7:137496522-137496652 NA NA NA NA NA chr7-806 137486222 137486463 211 - chr7:137486253-137486404 NA NA NA NA NA chr7-805 137249226 137249554 166 - chr7:137249389-137249394 NA NA NA NA NA chr7-118 13721795 13722152 191 - chr7:13721801-13721906 NA NA NA NA NA chr7-804 137013787 137013957 154 - chr7:137013806-137013952 NA NA NA NA NA chr7-803 136936117 136936325 169 - chr7:136936144-136936280 NA NA NA NA NA chr7-802 136741752 136741900 116 - chr7:136741767-136741867 NA NA NA NA NA chr7-117 13662743 13662896 133 - chr7:13662766-13662889 NA NA NA NA NA chr7-116 13582390 13582714 142 - chr7:13582617-13582622 NA NA NA NA NA chr7-801 135199031 135199340 205 - chr7:135199061-135199214 NA NA NA NA NA chr7-800 135099148 135099317 150 - chr7:135099159-135099294 NA NA NA NA NA chr7-115 13500300 13500491 164 - chr7:13500321-13500452 NA NA NA NA NA chr7-799 134870997 134871291 162 - chr7:134871130-134871161 NA NA NA NA NA chr7-798 134370449 134370696 139 - chr7:134370545-134370564 NA NA NA NA NA chr7-114 13411809 13412038 150 - chr7:13411880-13411955 NA NA NA NA NA chr7-797 133778974 133779143 125 - chr7:133779092-133779136 NA NA NA NA NA chr7-796 133578050 133578411 246 - chr7:133578329-133578378 NA NA NA NA NA chr7-795 133447669 133447834 157 - chr7:133447681-133447834 NA NA NA NA NA chr7-113 13279913 13280342 241 - chr7:13280126-13280273 NA NA NA NA NA chr7-794 132603308 132603490 145 - chr7:132603343-132603449 NA NA NA NA NA chr7-793 132532723 132533174 299 - chr7:132532849-132533072 NA NA NA NA NA chr7-792 132250503 132250726 155 - chr7:132250569-132250657 NA NA NA NA NA chr7-791 131453796 131454128 210 - chr7:131454092-131454093 NA NA NA NA NA chr7-790 131296243 131296594 177 - chr7:131296371-131296405 NA NA NA NA NA chr7-789 130830587 130830932 262 - chr7:130830758-130830893 NA NA NA NA NA chr7-788 130245991 130246173 155 - chr7:130246022-130246154 NA NA NA NA NA chr7-787 130091950 130092251 228 - chr7:130091978-130092088 NA NA NA NA NA chr7-786 130042012 130042228 149 - chr7:130042059-130042151 NA NA NA NA NA chr7-785 129946740 129946986 153 - chr7:129946784-129946846 NA NA NA NA NA chr7-112 12966068 12966472 302 - chr7:12966094-12966218 NA NA NA NA NA chr7-784 129571671 129572086 274 - chr7:129571934-129572006 NA NA NA NA NA chr7-783 128324239 128324395 145 - chr7:128324254-128324386 NA NA NA NA NA chr7-782 128105853 128106065 179 - chr7:128105909-128106054 NA NA NA NA NA chr7-781 128089241 128089519 173 - chr7:128089362-128089446 NA NA NA NA NA chr7-780 127938011 127938320 157 - chr7:127938153-127938160 NA NA NA NA NA chr7-779 126755922 126756105 145 - chr7:126755970-126756072 NA NA NA NA NA chr7-111 12642389 12642619 196 - chr7:12642389-12642517 NA NA NA NA NA chr7-778 126373375 126373720 269 - chr7:126373402-126373546 NA NA NA NA NA chr7-110 12585908 12586267 196 - chr7:12586112-12586186 NA NA NA NA NA chr7-777 125391291 125391490 147 - chr7:125391346-125391444 NA NA NA NA NA chr7-7 1252919 1253318 197 - chr7:1253163-1253200 NA NA NA NA NA chr7-776 125054094 125054391 157 - chr7:125054234-125054251 NA NA NA NA NA chr7-775 124456345 124456588 193 - chr7:124456353-124456521 NA NA NA NA NA chr7-774 124370169 124370323 124 - chr7:124370214-124370323 NA NA NA NA NA chr7-109 12382136 12382404 151 - chr7:12382259-12382290 NA NA NA NA NA chr7-773 123736225 123736443 167 - chr7:123736279-123736376 NA NA NA NA NA chr7-772 123714008 123714152 128 - chr7:123714034-123714130 NA NA NA NA NA chr7-108 12369416 12369717 158 - chr7:12369574-12369604 NA NA NA NA NA chr7-771 123662989 123663656 407 - chr7:123663096-123663467 NA NA NA NA NA chr7-770 123495989 123496208 160 - chr7:123496050-123496150 NA NA NA NA NA chr7-107 12349216 12349674 200 - chr7:12349314-12349408 NA NA NA NA NA chr7-106 12306851 12307068 124 - chr7:12306992-12306999 NA NA NA NA NA chr7-769 121953135 121953327 160 - chr7:121953135-121953279 NA NA NA NA NA chr7-768 121846819 121847117 158 - chr7:121846961-121846978 NA NA NA NA NA chr7-767 121299778 121300026 203 - chr7:121299793-121299921 NA NA NA NA NA chr7-105 12088217 12088429 134 - chr7:12088332-12088427 NA NA NA NA NA chr7-104 12080829 12081103 192 - chr7:12080952-12081103 NA NA NA NA NA chr7-766 120321591 120321814 149 - chr7:120321663-120321739 NA NA NA NA NA chr7-765 120136733 120136912 128 - chr7:120136777-120136847 NA NA NA NA NA chr7-764 120103811 120104091 155 - chr7:120103933-120103960 NA NA NA NA NA chr7-763 120027706 120028006 208 - chr7:120027770-120027932 NA NA NA NA NA chr7-762 119811237 119811405 154 - chr7:119811258-119811405 NA NA NA NA NA chr7-761 119785526 119785925 183 - chr7:119785644-119785660 NA NA NA NA NA chr7-760 119778797 119779091 158 - chr7:119778927-119778952 NA NA NA NA NA chr7-759 119547710 119548055 217 - chr7:119547720-119547868 NA NA NA NA NA chr7-6 1194958 1195216 162 - chr7:1195068-1195127 NA NA NA NA NA chr7-758 119278187 119278445 215 - chr7:119278268-119278397 NA NA NA NA NA chr7-757 119137158 119137450 207 - chr7:119137301-119137394 NA NA NA NA NA chr7-756 118844585 118845289 332 - chr7:118845013-118845029 NA NA NA NA NA chr7-103 11864316 11864596 164 - chr7:11864418-11864452 NA NA NA NA NA chr7-755 118092825 118093123 202 - chr7:118092929-118093083 NA NA NA NA NA chr7-754 118040161 118040625 273 - chr7:118040443-118040616 NA NA NA NA NA chr7-753 117937847 117938187 201 - chr7:117937860-117937985 NA NA NA NA NA chr7-752 117773018 117773240 163 - chr7:117773067-117773161 NA NA NA NA NA chr7-751 117511075 117511245 155 - chr7:117511104-117511237 NA NA NA NA NA chr7-750 116690333 116690537 168 - chr7:116690397-116690515 NA NA NA NA NA chr7-749 116632735 116633044 178 - chr7:116632856-116632893 NA NA NA NA NA chr7-748 116520017 116520341 193 - chr7:116520207-116520222 NA NA NA NA NA chr7-5 1164059 1164360 164 - chr7:1164204-1164227 NA NA NA NA NA chr7-747 116390021 116390613 338 - chr7:116390150-116390171 NA NA NA NA NA chr7-746 116207672 116208005 223 - chr7:116207699-116207729 NA NA NA NA NA chr7-745 116003139 116003446 268 - chr7:116003220-116003428 NA NA NA NA NA chr7-102 11577138 11577352 154 - chr7:11577180-11577283 NA NA NA NA NA chr7-101 11576635 11576809 126 - chr7:11576677-11576779 NA NA NA NA NA chr7-744 115678649 115678950 157 - chr7:115678803-115678811 NA NA NA NA NA chr7-743 115399802 115400292 250 - chr7:115399811-115399941 NA NA NA NA NA chr7-742 115222297 115222516 128 - chr7:115222417-115222483 NA NA NA NA NA chr7-741 115159007 115159251 120 - chr7:115159145-115159155 NA NA NA NA NA chr7-4 1150511 1150832 240 - chr7:1150684-1150797 NA NA NA NA NA chr7-740 115065039 115065291 151 - chr7:115065139-115065188 NA NA NA NA NA chr7-739 114758917 114759155 154 - chr7:114759006-114759081 NA NA NA NA NA chr7-100 11466635 11466789 135 - chr7:11466637-11466734 NA NA NA NA NA chr7-738 114409672 114410047 223 - chr7:114409771-114409789 NA NA NA NA NA chr7-737 114269422 114269658 210 - chr7:114269486-114269651 NA NA NA NA NA chr7-736 114173797 114174001 155 - chr7:114173890-114173974 NA NA NA NA NA chr7-735 114115983 114116212 141 - chr7:114116057-114116096 NA NA NA NA NA chr7-734 113815549 113815861 204 - chr7:113815709-113815857 NA NA NA NA NA chr7-733 113775044 113775251 142 - chr7:113775109-113775186 NA NA NA NA NA chr7-732 113737034 113737201 112 - chr7:113737110-113737188 NA NA NA NA NA chr7-731 113606406 113606724 169 - chr7:113606568-113606601 NA NA NA NA NA chr7-730 113530667 113531117 255 - chr7:113530948-113531094 NA NA NA NA NA chr7-729 113292473 113292614 124 - chr7:113292514-113292604 NA NA NA NA NA chr7-99 11325500 11325678 146 - chr7:11325528-11325644 NA NA NA NA NA chr7-728 113254118 113254348 146 - chr7:113254193-113254246 NA NA NA NA NA chr7-727 113234017 113234359 206 - chr7:113234217-113234355 NA NA NA NA NA chr7-726 113225277 113225602 163 - chr7:113225396-113225478 NA NA NA NA NA chr7-725 112993195 112993612 244 - chr7:112993383-112993469 NA NA NA NA NA chr7-724 112936103 112936391 188 - chr7:112936175-112936313 NA NA NA NA NA chr7-723 112826923 112827128 152 - chr7:112826977-112827077 NA NA NA NA NA chr7-722 112793271 112793465 159 - chr7:112793289-112793396 NA NA NA NA NA chr7-98 11173692 11174005 139 - chr7:11173905-11173909 NA NA NA NA NA chr7-721 111476473 111476820 169 - chr7:111476710-111476760 NA NA NA NA NA chr7-97 11141225 11141534 194 - chr7:11141386-11141442 NA NA NA NA NA chr7-720 111089230 111089421 152 - chr7:111089273-111089384 NA NA NA NA NA chr7-719 111052457 111052626 159 - chr7:111052472-111052626 NA NA NA NA NA chr7-718 110997947 110998289 207 - chr7:110998080-110998153 NA NA NA NA NA chr7-717 110964123 110964413 159 - chr7:110964256-110964283 NA NA NA NA NA chr7-96 11090008 11090565 286 - chr7:11090380-11090532 NA NA NA NA NA chr7-716 110811604 110812000 192 - chr7:110811744-110811764 NA NA NA NA NA chr7-715 110794822 110795178 280 - chr7:110794883-110795100 NA NA NA NA NA chr7-714 110782755 110782995 136 - chr7:110782893-110782908 NA NA NA NA NA chr7-713 110772436 110772768 176 - chr7:110772622-110772672 NA NA NA NA NA chr7-95 11045745 11046218 284 - chr7:11045868-11045897 NA NA NA NA NA chr7-712 110337330 110337742 231 - chr7:110337395-110337503 NA NA NA NA NA chr7-711 110120332 110120496 157 - chr7:110120344-110120487 NA NA NA NA NA chr7-710 109957525 109957684 155 - chr7:109957526-109957673 NA NA NA NA NA chr7-709 109925808 109926075 157 - chr7:109925835-109925937 NA NA NA NA NA chr7-708 109807735 109807931 131 - chr7:109807764-109807848 NA NA NA NA NA chr7-707 109678320 109678610 192 - chr7:109678346-109678476 NA NA NA NA NA chr7-706 109479520 109479764 172 - chr7:109479591-109479690 NA NA NA NA NA chr7-705 109404516 109404688 123 - chr7:109404559-109404636 NA NA NA NA NA chr7-704 108144451 108144774 181 - chr7:108144595-108144636 NA NA NA NA NA chr7-703 108046615 108046917 200 - chr7:108046684-108046833 NA NA NA NA NA chr7-702 107939961 107940103 134 - chr7:107939969-107940099 NA NA NA NA NA chr7-701 107899056 107899209 146 - chr7:107899063-107899202 NA NA NA NA NA chr7-700 107755127 107755384 220 - chr7:107755127-107755273 NA NA NA NA NA chr7-699 107676585 107677053 225 - chr7:107676742-107676767 NA NA NA NA NA chr7-698 107618168 107618366 125 - chr7:107618274-107618359 NA NA NA NA NA chr7-697 107593402 107593708 193 - chr7:107593569-107593622 NA NA NA NA NA chr7-696 107303818 107304139 198 - chr7:107303879-107303962 NA NA NA NA NA chr7-695 106564449 106564802 193 - chr7:106564589-106564602 NA NA NA NA NA chr7-694 106091299 106091586 154 - chr7:106091430-106091449 NA NA NA NA NA chr7-693 105794427 105794595 154 - chr7:105794440-105794587 NA NA NA NA NA chr7-692 105701671 105702087 230 - chr7:105701908-105702003 NA NA NA NA NA chr7-691 105699781 105699933 116 - chr7:105699799-105699897 NA NA NA NA NA chr7-690 104784257 104784569 156 - chr7:104784414-104784415 NA NA NA NA NA chr7-689 104663751 104664014 195 - chr7:104663775-104663936 NA NA NA NA NA chr7-688 104511819 104512467 358 - chr7:104512029-104512137 NA NA NA NA NA chr7-687 104220724 104221056 220 - chr7:104220892-104221056 NA NA NA NA NA chr7-686 104194285 104194438 122 - chr7:104194311-104194371 NA NA NA NA NA chr7-685 104014362 104014665 187 - chr7:104014514-104014567 NA NA NA NA NA chr7-684 103496351 103496744 223 - chr7:103496439-103496533 NA NA NA NA NA chr7-683 103472286 103472613 163 - chr7:103472434-103472441 NA NA NA NA NA chr7-682 103339568 103339938 275 - chr7:103339723-103339873 NA NA NA NA NA chr7-681 102923872 102924205 193 - chr7:102923928-102924023 NA NA NA NA NA chr7-680 102237422 102237705 151 - chr7:102237562-102237589 NA NA NA NA NA chr7-679 102022407 102022657 157 - chr7:102022496-102022556 NA NA NA NA NA chr7-678 101814907 101815070 150 - chr7:101814914-101815054 NA NA NA NA NA chr7-677 101790985 101791194 136 - chr7:101791150-101791167 NA NA NA NA NA chr7-676 101571069 101571266 131 - chr7:101571146-101571222 NA NA NA NA NA chr7-675 101330278 101330623 233 - chr7:101330353-101330437 NA NA NA NA NA chr7-674 101312042 101312468 349 - chr7:101312149-101312466 NA NA NA NA NA chr7-673 100957306 100957531 161 - chr7:100957363-100957453 NA NA NA NA NA chr7-94 10073983 10074173 137 - chr7:10074022-10074092 NA NA NA NA NA chr7-672 100710681 100710836 150 - chr7:100710691-100710831 NA NA NA NA NA chr7-671 100512695 100512978 149 - chr7:100512829-100512844 NA NA NA NA NA chr7-670 100458844 100459056 172 - chr7:100458874-100458996 NA NA NA NA NA chr7-669 100421377 100421620 151 - chr7:100421467-100421527 NA NA NA NA NA chr7-668 100394648 100395159 258 - chr7:100394731-100394813 NA NA NA NA NA chr7-667 100141882 100142274 229 - chr7:100141933-100142055 NA NA NA NA NA chr7-93 10009455 10009864 167 - chr7:10009817-10009862 NA NA NA NA NA chr6-469 99924091 99924284 145 - chr6:99924145-99924239 NA NA NA NA NA chr6-468 99763681 99763906 119 - chr6:99763808-99763842 NA NA NA NA NA chr6-467 99606567 99606785 157 - chr6:99606630-99606728 NA NA NA NA NA chr6-466 99038396 99038688 206 - chr6:99038454-99038617 NA NA NA NA NA chr6-465 98970617 98970808 167 - chr6:98970652-98970806 NA NA NA NA NA chr6-464 98592644 98593062 216 - chr6:98592855-98592878 NA NA NA NA NA chr6-463 98279313 98279529 125 - chr6:98279380-98279390 NA NA NA NA NA chr6-462 98100399 98100547 132 - chr6:98100401-98100524 NA NA NA NA NA chr6-461 97092988 97093233 148 - chr6:97093085-97093136 NA NA NA NA NA chr6-460 96696749 96697146 270 - chr6:96696930-96697128 NA NA NA NA NA chr6-459 96660116 96660309 177 - chr6:96660119-96660288 NA NA NA NA NA chr6-458 96205158 96205418 197 - chr6:96205263-96205376 NA NA NA NA NA chr6-457 96156371 96156816 212 - chr6:96156653-96156681 NA NA NA NA NA chr6-456 96067077 96067429 208 - chr6:96067244-96067331 NA NA NA NA NA chr6-455 96037915 96038177 227 - chr6:96037981-96038138 NA NA NA NA NA chr6-454 95448846 95449129 157 - chr6:95448966-95449000 NA NA NA NA NA chr6-453 95224499 95224834 197 - chr6:95224679-95224780 NA NA NA NA NA chr6-452 94844351 94844712 231 - chr6:94844411-94844577 NA NA NA NA NA chr6-451 94830482 94830659 115 - chr6:94830557-94830623 NA NA NA NA NA chr6-450 94823102 94823428 234 - chr6:94823144-94823236 NA NA NA NA NA chr6-449 94628260 94628561 251 - chr6:94628397-94628548 NA NA NA NA NA chr6-448 94504142 94504550 200 - chr6:94504397-94504403 NA NA NA NA NA chr6-447 94418733 94419212 257 - chr6:94418984-94419144 NA NA NA NA NA chr6-446 94244811 94244995 144 - chr6:94244903-94244981 NA NA NA NA NA chr6-445 94187796 94188042 160 - chr6:94187892-94187961 NA NA NA NA NA chr6-444 93863980 93864345 200 - chr6:93864199-93864207 NA NA NA NA NA chr6-443 93392392 93392932 344 - chr6:93392452-93392601 NA NA NA NA NA chr6-442 93302286 93302662 227 - chr6:93302496-93302635 NA NA NA NA NA chr6-441 92709379 92709761 268 - chr6:92709470-92709558 NA NA NA NA NA chr6-440 92532826 92533052 126 - chr6:92532959-92533035 NA NA NA NA NA chr6-439 92445666 92445953 241 - chr6:92445667-92445816 NA NA NA NA NA chr6-438 91077668 91078010 249 - chr6:91077719-91077833 NA NA NA NA NA chr6-20 9079332 9079536 147 - chr6:9079391-9079480 NA NA NA NA NA chr6-19 9030707 9030979 146 - chr6:9030837-9030855 NA NA NA NA NA chr6-437 89801236 89801478 151 - chr6:89801329-89801388 NA NA NA NA NA chr6-436 89366586 89366753 119 - chr6:89366648-89366743 NA NA NA NA NA chr6-435 89141473 89141719 155 - chr6:89141560-89141626 NA NA NA NA NA chr6-434 89122727 89122921 152 - chr6:89122751-89122870 NA NA NA NA NA chr6-433 88998455 88998620 160 - chr6:88998461-88998611 NA NA NA NA NA chr6-432 88720183 88720420 152 - chr6:88720258-88720330 NA NA NA NA NA chr6-431 88628920 88629220 153 - chr6:88629074-88629087 NA NA NA NA NA chr6-430 88456358 88456726 265 - chr6:88456400-88456501 NA NA NA NA NA chr6-429 88091066 88091325 149 - chr6:88091174-88091214 NA NA NA NA NA chr6-428 88070136 88070695 252 - chr6:88070309-88070321 NA NA NA NA NA chr6-427 87603288 87603673 240 - chr6:87603393-87603448 NA NA NA NA NA chr6-426 87427786 87427957 155 - chr6:87427808-87427953 NA NA NA NA NA chr6-425 87138189 87138552 173 - chr6:87138463-87138541 NA NA NA NA NA chr6-424 86210650 86210832 147 - chr6:86210685-86210797 NA NA NA NA NA chr6-423 86009623 86009767 126 - chr6:86009670-86009760 NA NA NA NA NA chr6-422 85911522 85911815 154 - chr6:85911660-85911674 NA NA NA NA NA chr6-421 85629733 85629998 139 - chr6:85629859-85629872 NA NA NA NA NA chr6-420 85120048 85120263 167 - chr6:85120096-85120215 NA NA NA NA NA chr6-419 84551449 84551726 184 - chr6:84551588-84551656 NA NA NA NA NA chr6-18 8415139 8415414 158 - chr6:8415255-8415295 NA NA NA NA NA chr6-418 84006797 84007003 133 - chr6:84006868-84006926 NA NA NA NA NA chr6-417 83996356 83996802 224 - chr6:83996658-83996735 NA NA NA NA NA chr6-416 83610172 83610395 136 - chr6:83610249-83610288 NA NA NA NA NA chr6-415 83514568 83514811 147 - chr6:83514653-83514693 NA NA NA NA NA chr6-414 82740820 82741089 185 - chr6:82740878-82740992 NA NA NA NA NA chr6-413 82422314 82422626 157 - chr6:82422459-82422466 NA NA NA NA NA chr6-412 82082301 82082554 148 - chr6:82082408-82082450 NA NA NA NA NA chr6-411 82002839 82003177 221 - chr6:82003030-82003097 NA NA NA NA NA chr6-17 8184638 8184785 123 - chr6:8184710-8184785 NA NA NA NA NA chr6-410 81512804 81513042 138 - chr6:81512921-81512976 NA NA NA NA NA chr6-409 81311312 81311653 205 - chr6:81311544-81311565 NA NA NA NA NA chr6-408 80599917 80600101 170 - chr6:80599938-80600101 NA NA NA NA NA chr6-407 80505279 80505443 160 - chr6:80505285-80505443 NA NA NA NA NA chr6-406 80449104 80449326 158 - chr6:80449170-80449266 NA NA NA NA NA chr6-405 80393293 80393594 139 - chr6:80393430-80393488 NA NA NA NA NA chr6-404 80013875 80014025 130 - chr6:80013895-80014015 NA NA NA NA NA chr6-403 79838767 79839052 174 - chr6:79838876-79838937 NA NA NA NA NA chr6-402 79032095 79032310 199 - chr6:79032139-79032308 NA NA NA NA NA chr6-401 78999752 78999990 145 - chr6:78999856-78999919 NA NA NA NA NA chr6-400 78995422 78996058 337 - chr6:78995661-78995716 NA NA NA NA NA chr6-399 78729534 78729794 229 - chr6:78729544-78729711 NA NA NA NA NA chr6-398 78715929 78716298 279 - chr6:78715992-78716154 NA NA NA NA NA chr6-16 7855247 7855664 188 - chr6:7855384-7855389 NA NA NA NA NA chr6-397 77988186 77988430 175 - chr6:77988261-77988364 NA NA NA NA NA chr6-396 77532680 77532933 168 - chr6:77532785-77532855 NA NA NA NA NA chr6-395 77342951 77343184 154 - chr6:77343030-77343105 NA NA NA NA NA chr6-394 77143765 77144006 134 - chr6:77143872-77143899 NA NA NA NA NA chr6-393 75843945 75844248 171 - chr6:75844073-75844108 NA NA NA NA NA chr6-392 75706119 75706569 213 - chr6:75706258-75706283 NA NA NA NA NA chr6-15 7565467 7565628 128 - chr6:7565504-7565603 NA NA NA NA NA chr6-391 75531687 75532088 231 - chr6:75531927-75531953 NA NA NA NA NA chr6-390 75485033 75485357 191 - chr6:75485112-75485197 NA NA NA NA NA chr6-389 75465383 75465640 156 - chr6:75465474-75465519 NA NA NA NA NA chr6-388 75418477 75418698 179 - chr6:75418523-75418681 NA NA NA NA NA chr6-387 75369835 75370246 235 - chr6:75370059-75370094 NA NA NA NA NA chr6-386 75335629 75335800 137 - chr6:75335685-75335754 NA NA NA NA NA chr6-385 75310699 75311013 159 - chr6:75310852-75310857 NA NA NA NA NA chr6-384 75127286 75127483 168 - chr6:75127320-75127464 NA NA NA NA NA chr6-383 74924999 74925215 176 - chr6:74925026-74925149 NA NA NA NA NA chr6-382 74748703 74749013 204 - chr6:74748861-74749012 NA NA NA NA NA chr6-381 74549614 74549785 151 - chr6:74549620-74549758 NA NA NA NA NA chr6-380 74444633 74444883 229 - chr6:74444654-74444862 NA NA NA NA NA chr6-379 74127351 74127768 211 - chr6:74127560-74127568 NA NA NA NA NA chr6-378 73925778 73926094 187 - chr6:73925995-73926009 NA NA NA NA NA chr6-377 73849676 73850089 224 - chr6:73849819-73849870 NA NA NA NA NA chr6-376 73585556 73585817 148 - chr6:73585665-73585702 NA NA NA NA NA chr6-375 73478277 73478731 205 - chr6:73478575-73478580 NA NA NA NA NA chr6-374 72937333 72937715 229 - chr6:72937562-72937680 NA NA NA NA NA chr6-373 72666033 72666386 193 - chr6:72666172-72666184 NA NA NA NA NA chr6-372 72637441 72637607 152 - chr6:72637454-72637591 NA NA NA NA NA chr6-371 72362783 72363236 287 - chr6:72362998-72363202 NA NA NA NA NA chr6-370 72226621 72227038 302 - chr6:72226659-72226769 NA NA NA NA NA chr6-369 72039319 72039477 149 - chr6:72039330-72039469 NA NA NA NA NA chr6-368 71978796 71979340 319 - chr6:71979191-71979200 NA NA NA NA NA chr6-367 71707758 71707958 149 - chr6:71707805-71707899 NA NA NA NA NA chr6-366 71510262 71510589 192 - chr6:71510323-71510417 NA NA NA NA NA chr6-365 71509715 71510025 157 - chr6:71509870-71509873 NA NA NA NA NA chr6-364 71049893 71050252 175 - chr6:71049916-71049999 NA NA NA NA NA chr6-363 70516899 70517144 160 - chr6:70516968-70517051 NA NA NA NA NA chr6-362 70326618 70326939 183 - chr6:70326748-70326785 NA NA NA NA NA chr6-361 70196606 70196761 133 - chr6:70196623-70196712 NA NA NA NA NA chr6-360 70081181 70081406 152 - chr6:70081252-70081332 NA NA NA NA NA chr6-359 69850018 69850362 260 - chr6:69850234-69850344 NA NA NA NA NA chr6-358 69731433 69731673 151 - chr6:69731528-69731587 NA NA NA NA NA chr6-357 69548846 69549037 177 - chr6:69548874-69549023 NA NA NA NA NA chr6-356 69458537 69458744 151 - chr6:69458591-69458687 NA NA NA NA NA chr6-355 69396908 69397128 120 - chr6:69397042-69397096 NA NA NA NA NA chr6-354 69396237 69396706 395 - chr6:69396455-69396702 NA NA NA NA NA chr6-353 69081018 69081540 274 - chr6:69081367-69081494 NA NA NA NA NA chr6-352 69054124 69054674 331 - chr6:69054391-69054465 NA NA NA NA NA chr6-351 68932440 68932870 195 - chr6:68932718-68932721 NA NA NA NA NA chr6-350 68826918 68827129 149 - chr6:68826972-68827063 NA NA NA NA NA chr6-349 68751795 68752046 172 - chr6:68751842-68751903 NA NA NA NA NA chr6-348 68671958 68672222 145 - chr6:68672115-68672122 NA NA NA NA NA chr6-14 6860924 6861166 189 - chr6:6860977-6861113 NA NA NA NA NA chr6-347 68466005 68466421 190 - chr6:68466139-68466149 NA NA NA NA NA chr6-346 68460828 68461041 181 - chr6:68460830-68460995 NA NA NA NA NA chr6-345 68079937 68080217 160 - chr6:68080053-68080089 NA NA NA NA NA chr6-344 67984367 67984824 365 - chr6:67984433-67984719 NA NA NA NA NA chr6-343 67453954 67454502 235 - chr6:67454354-67454429 NA NA NA NA NA chr6-342 67329857 67330040 155 - chr6:67329883-67330008 NA NA NA NA NA chr6-341 67266997 67267241 197 - chr6:67267053-67267212 NA NA NA NA NA chr6-340 67247396 67247679 236 - chr6:67247423-67247565 NA NA NA NA NA chr6-339 67131552 67131860 200 - chr6:67131714-67131809 NA NA NA NA NA chr6-338 67105472 67105709 177 - chr6:67105519-67105666 NA NA NA NA NA chr6-337 67064592 67064978 188 - chr6:67064592-67064681 NA NA NA NA NA chr6-336 67008791 67009058 138 - chr6:67008921-67008931 NA NA NA NA NA chr6-335 66912680 66912836 150 - chr6:66912685-66912832 NA NA NA NA NA chr6-334 66866012 66866331 217 - chr6:66866082-66866165 NA NA NA NA NA chr6-333 66649186 66649378 155 - chr6:66649189-66649270 NA NA NA NA NA chr6-332 66483819 66484117 182 - chr6:66483891-66483979 NA NA NA NA NA chr6-331 66189785 66189979 124 - chr6:66189823-66189893 NA NA NA NA NA chr6-330 66116346 66116588 153 - chr6:66116437-66116500 NA NA NA NA NA chr6-329 66008094 66008484 265 - chr6:66008325-66008412 NA NA NA NA NA chr6-328 65718516 65718992 298 - chr6:65718642-65718710 NA NA NA NA NA chr6-327 65612726 65612940 153 - chr6:65612846-65612877 NA NA NA NA NA chr6-326 65502584 65502932 249 - chr6:65502785-65502884 NA NA NA NA NA chr6-325 65216241 65216613 243 - chr6:65216281-65216306 NA NA NA NA NA chr6-324 65159797 65160049 138 - chr6:65159914-65159941 NA NA NA NA NA chr6-323 65157406 65157587 131 - chr6:65157494-65157556 NA NA NA NA NA chr6-322 65149640 65149907 163 - chr6:65149734-65149798 NA NA NA NA NA chr6-321 65109977 65110187 151 - chr6:65110042-65110140 NA NA NA NA NA chr6-320 65055003 65055272 157 - chr6:65055123-65055164 NA NA NA NA NA chr6-319 65017772 65018401 326 - chr6:65018120-65018135 NA NA NA NA NA chr6-318 64857645 64857942 203 - chr6:64857797-64857877 NA NA NA NA NA chr6-317 64676709 64677029 183 - chr6:64676838-64676888 NA NA NA NA NA chr6-316 64386484 64386639 151 - chr6:64386492-64386637 NA NA NA NA NA chr6-315 64384137 64384391 151 - chr6:64384244-64384296 NA NA NA NA NA chr6-314 64322256 64322533 234 - chr6:64322296-64322444 NA NA NA NA NA chr6-313 64309076 64309368 196 - chr6:64309078-64309225 NA NA NA NA NA chr6-312 64177244 64177520 160 - chr6:64177355-64177394 NA NA NA NA NA chr6-311 63777122 63777306 151 - chr6:63777149-63777270 NA NA NA NA NA chr6-310 63512271 63512545 164 - chr6:63512369-63512411 NA NA NA NA NA chr6-309 63335035 63335444 203 - chr6:63335278-63335312 NA NA NA NA NA chr6-308 63218402 63218583 117 - chr6:63218486-63218559 NA NA NA NA NA chr6-307 63125856 63126165 235 - chr6:63125982-63126069 NA NA NA NA NA chr6-306 63029967 63030225 144 - chr6:63030067-63030104 NA NA NA NA NA chr6-305 62985709 62985903 153 - chr6:62985816-62985895 NA NA NA NA NA chr6-304 62955145 62955317 146 - chr6:62955171-62955291 NA NA NA NA NA chr6-303 62941605 62942148 339 - chr6:62941746-62942131 NA NA NA NA NA chr6-302 62929657 62929854 160 - chr6:62929692-62929813 NA NA NA NA NA chr6-301 62849549 62849704 151 - chr6:62849550-62849693 NA NA NA NA NA chr6-300 62781179 62781496 217 - chr6:62781209-62781256 NA NA NA NA NA chr6-299 62722334 62722632 251 - chr6:62722465-62722622 NA NA NA NA NA chr6-298 62190108 62190365 175 - chr6:62190240-62190308 NA NA NA NA NA chr6-297 62144192 62144590 215 - chr6:62144300-62144510 NA NA NA NA NA chr6-296 62141053 62141358 158 - chr6:62141197-62141205 NA NA NA NA NA chr6-295 61974079 61974508 214 - chr6:61974312-61974329 NA NA NA NA NA chr6-294 61918674 61918944 183 - chr6:61918705-61918829 NA NA NA NA NA chr6-293 61887203 61887410 142 - chr6:61887250-61887336 NA NA NA NA NA chr6-292 61734408 61734692 158 - chr6:61734427-61734488 NA NA NA NA NA chr6-291 61718607 61719052 198 - chr6:61718734-61718745 NA NA NA NA NA chr6-290 61703956 61704317 145 - chr6:61704035-61704072 NA NA NA NA NA chr6-289 61513826 61514104 204 - chr6:61513930-61514097 NA NA NA NA NA chr6-288 61225182 61225427 189 - chr6:61225214-61225375 NA NA NA NA NA chr6-287 60681571 60681954 197 - chr6:60681784-60681822 NA NA NA NA NA chr6-13 5754752 5755131 216 - chr6:5754890-5754918 NA NA NA NA NA chr6-286 57189825 57190040 164 - chr6:57189848-57189975 NA NA NA NA NA chr6-285 57179037 57179339 198 - chr6:57179067-57179213 NA NA NA NA NA chr6-284 57124426 57124863 253 - chr6:57124522-57124716 NA NA NA NA NA chr6-283 57106997 57107265 132 - chr6:57107103-57107114 NA NA NA NA NA chr6-282 56965705 56965879 130 - chr6:56965714-56965822 NA NA NA NA NA chr6-281 56789226 56789540 174 - chr6:56789414-56789518 NA NA NA NA NA chr6-280 56635565 56635891 213 - chr6:56635754-56635836 NA NA NA NA NA chr6-279 56477939 56478191 170 - chr6:56478010-56478087 NA NA NA NA NA chr6-278 56413084 56413238 138 - chr6:56413084-56413214 NA NA NA NA NA chr6-12 5633651 5633848 158 - chr6:5633684-5633806 NA NA NA NA NA chr6-277 56237341 56237695 201 - chr6:56237420-56237505 NA NA NA NA NA chr6-276 56193749 56193916 147 - chr6:56193779-56193916 NA NA NA NA NA chr6-275 56055041 56055288 203 - chr6:56055070-56055214 NA NA NA NA NA chr6-274 55962838 55963177 208 - chr6:55962901-55963012 NA NA NA NA NA chr6-273 55962357 55962520 141 - chr6:55962377-55962497 NA NA NA NA NA chr6-272 55878530 55878720 149 - chr6:55878560-55878628 NA NA NA NA NA chr6-271 55798476 55798698 147 - chr6:55798551-55798623 NA NA NA NA NA chr6-270 55783492 55783701 158 - chr6:55783547-55783658 NA NA NA NA NA chr6-269 55772587 55772762 158 - chr6:55772614-55772750 NA NA NA NA NA chr6-268 55757485 55757636 145 - chr6:55757490-55757623 NA NA NA NA NA chr6-267 55663143 55663372 144 - chr6:55663212-55663255 NA NA NA NA NA chr6-266 55601022 55601555 245 - chr6:55601108-55601166 NA NA NA NA NA chr6-265 55554879 55555065 156 - chr6:55554915-55555047 NA NA NA NA NA chr6-264 55538860 55539073 169 - chr6:55538922-55539019 NA NA NA NA NA chr6-263 55530936 55531193 155 - chr6:55531039-55531093 NA NA NA NA NA chr6-262 55457198 55457593 223 - chr6:55457343-55457498 NA NA NA NA NA chr6-261 55415475 55415724 172 - chr6:55415508-55415625 NA NA NA NA NA chr6-260 55324769 55325012 149 - chr6:55324862-55324916 NA NA NA NA NA chr6-259 55274555 55275012 296 - chr6:55274731-55274736 NA NA NA NA NA chr6-258 55219081 55219370 152 - chr6:55219228-55219253 NA NA NA NA NA chr6-257 55146279 55146486 115 - chr6:55146401-55146454 NA NA NA NA NA chr6-256 55141591 55141787 136 - chr6:55141621-55141667 NA NA NA NA NA chr6-255 54887890 54888052 145 - chr6:54887913-54888047 NA NA NA NA NA chr6-254 54608449 54608690 214 - chr6:54608451-54608611 NA NA NA NA NA chr6-253 54347398 54347740 182 - chr6:54347608-54347680 NA NA NA NA NA chr6-252 54211269 54211685 334 - chr6:54211419-54211589 NA NA NA NA NA chr6-251 54148860 54149077 132 - chr6:54148941-54148972 NA NA NA NA NA chr6-250 53833536 53833866 165 - chr6:53833579-53833640 NA NA NA NA NA chr6-249 53739476 53739826 298 - chr6:53739582-53739801 NA NA NA NA NA chr6-248 53685156 53685489 213 - chr6:53685156-53685309 NA NA NA NA NA chr6-247 53639542 53639822 150 - chr6:53639672-53639692 NA NA NA NA NA chr6-246 53631860 53632107 161 - chr6:53631861-53631979 NA NA NA NA NA chr6-245 53594596 53594973 204 - chr6:53594697-53594746 NA NA NA NA NA chr6-244 53372773 53373119 177 - chr6:53373005-53373076 NA NA NA NA NA chr6-243 53357298 53357490 156 - chr6:53357332-53357450 NA NA NA NA NA chr6-242 53342074 53342257 127 - chr6:53342105-53342151 NA NA NA NA NA chr6-241 53283515 53283840 215 - chr6:53283515-53283675 NA NA NA NA NA chr6-240 53180938 53181250 241 - chr6:53180976-53181113 NA NA NA NA NA chr6-11 5310893 5311184 199 - chr6:5310933-5311086 NA NA NA NA NA chr6-239 52911103 52911299 129 - chr6:52911234-52911264 NA NA NA NA NA chr6-238 52899576 52899755 133 - chr6:52899578-52899688 NA NA NA NA NA chr6-237 52722869 52723160 193 - chr6:52722969-52723113 NA NA NA NA NA chr6-236 52720460 52720722 155 - chr6:52720563-52720607 NA NA NA NA NA chr6-235 52692407 52692668 142 - chr6:52692492-52692532 NA NA NA NA NA chr6-234 52627053 52627198 139 - chr6:52627069-52627197 NA NA NA NA NA chr6-233 52487700 52488062 238 - chr6:52487902-52487963 NA NA NA NA NA chr6-232 52377233 52377598 178 - chr6:52377298-52377310 NA NA NA NA NA chr6-231 52069708 52070070 218 - chr6:52069820-52069966 NA NA NA NA NA chr6-230 51971833 51972205 247 - chr6:51972036-51972119 NA NA NA NA NA chr6-229 51782100 51782302 158 - chr6:51782126-51782249 NA NA NA NA NA chr6-228 51708400 51708626 182 - chr6:51708415-51708575 NA NA NA NA NA chr6-227 51621167 51621337 146 - chr6:51621203-51621319 NA NA NA NA NA chr6-10 5149972 5150184 131 - chr6:5150023-5150088 NA NA NA NA NA chr6-226 51447813 51448305 232 - chr6:51447916-51447966 NA NA NA NA NA chr6-225 51049193 51049434 158 - chr6:51049264-51049327 NA NA NA NA NA chr6-224 50998412 50998924 415 - chr6:50998699-50998922 NA NA NA NA NA chr6-223 50799017 50799309 181 - chr6:50799109-50799160 NA NA NA NA NA chr6-222 50564149 50564414 155 - chr6:50564281-50564348 NA NA NA NA NA chr6-221 50512248 50512430 139 - chr6:50512298-50512351 NA NA NA NA NA chr6-220 50461401 50461603 165 - chr6:50461414-50461554 NA NA NA NA NA chr6-219 50362575 50362754 112 - chr6:50362720-50362726 NA NA NA NA NA chr6-218 50311068 50311412 278 - chr6:50311160-50311306 NA NA NA NA NA chr6-217 50307458 50307655 151 - chr6:50307502-50307608 NA NA NA NA NA chr6-216 49869809 49870035 179 - chr6:49869906-49869991 NA NA NA NA NA chr6-215 49869127 49869309 122 - chr6:49869137-49869229 NA NA NA NA NA chr6-214 49867317 49867623 155 - chr6:49867471-49867478 NA NA NA NA NA chr6-213 49835157 49835418 152 - chr6:49835263-49835303 NA NA NA NA NA chr6-212 49583112 49583349 172 - chr6:49583133-49583262 NA NA NA NA NA chr6-211 49540780 49540956 125 - chr6:49540849-49540914 NA NA NA NA NA chr6-210 49500586 49500819 156 - chr6:49500660-49500736 NA NA NA NA NA chr6-209 49355495 49355688 151 - chr6:49355543-49355649 NA NA NA NA NA chr6-208 49216273 49216480 162 - chr6:49216337-49216473 NA NA NA NA NA chr6-207 49052951 49053097 117 - chr6:49052982-49053041 NA NA NA NA NA chr6-206 48488186 48488361 151 - chr6:48488217-48488351 NA NA NA NA NA chr6-205 48258367 48258662 178 - chr6:48258422-48258514 NA NA NA NA NA chr6-204 47850932 47851259 188 - chr6:47851122-47851222 NA NA NA NA NA chr6-203 47822474 47822773 163 - chr6:47822603-47822698 NA NA NA NA NA chr6-202 47728456 47728693 153 - chr6:47728542-47728613 NA NA NA NA NA chr6-201 47698872 47699049 148 - chr6:47698900-47699018 NA NA NA NA NA chr6-9 4766348 4766588 164 - chr6:4766470-4766535 NA NA NA NA NA chr6-200 47594556 47594770 135 - chr6:47594656-47594700 NA NA NA NA NA chr6-199 47280199 47280437 152 - chr6:47280284-47280349 NA NA NA NA NA chr6-198 47129933 47130568 359 - chr6:47130057-47130398 NA NA NA NA NA chr6-197 46727354 46727610 147 - chr6:46727461-46727500 NA NA NA NA NA chr6-196 46715735 46715944 145 - chr6:46715778-46715838 NA NA NA NA NA chr6-195 46363587 46364016 231 - chr6:46363686-46363818 NA NA NA NA NA chr6-194 46349300 46349460 155 - chr6:46349308-46349453 NA NA NA NA NA chr6-193 46022383 46022753 234 - chr6:46022413-46022579 NA NA NA NA NA chr6-192 46022029 46022202 148 - chr6:46022054-46022177 NA NA NA NA NA chr6-191 45959881 45960167 158 - chr6:45960017-45960055 NA NA NA NA NA chr6-190 45949475 45949670 136 - chr6:45949520-45949604 NA NA NA NA NA chr6-189 45916156 45916472 168 - chr6:45916274-45916309 NA NA NA NA NA chr6-188 45772252 45772500 153 - chr6:45772347-45772405 NA NA NA NA NA chr6-8 4569360 4569833 310 - chr6:4569396-4569463 NA NA NA NA NA chr6-187 45588548 45588718 163 - chr6:45588559-45588713 NA NA NA NA NA chr6-186 45541869 45542323 208 - chr6:45541920-45541981 NA NA NA NA NA chr6-185 45526608 45526962 197 - chr6:45526727-45526786 NA NA NA NA NA chr6-184 45426739 45427355 292 - chr6:45427204-45427237 NA NA NA NA NA chr6-183 45268181 45268442 202 - chr6:45268292-45268409 NA NA NA NA NA chr6-182 45021765 45022031 152 - chr6:45021895-45021934 NA NA NA NA NA chr6-181 45004616 45004848 158 - chr6:45004692-45004775 NA NA NA NA NA chr6-180 44970301 44970474 154 - chr6:44970344-44970467 NA NA NA NA NA chr6-179 44825852 44826143 163 - chr6:44826028-44826127 NA NA NA NA NA chr6-178 44686190 44686354 130 - chr6:44686286-44686348 NA NA NA NA NA chr6-177 44596694 44596944 153 - chr6:44596793-44596848 NA NA NA NA NA chr6-176 44383632 44383849 150 - chr6:44383697-44383778 NA NA NA NA NA chr6-175 43926405 43926598 137 - chr6:43926487-43926555 NA NA NA NA NA chr6-174 43898818 43899106 155 - chr6:43898965-43899001 NA NA NA NA NA chr6-173 43808974 43809297 219 - chr6:43809098-43809265 NA NA NA NA NA chr6-172 43548023 43548324 216 - chr6:43548176-43548273 NA NA NA NA NA chr6-171 43460875 43461267 265 - chr6:43461114-43461196 NA NA NA NA NA chr6-170 43208671 43208957 154 - chr6:43208805-43208827 NA NA NA NA NA chr6-169 43150158 43150330 141 - chr6:43150231-43150320 NA NA NA NA NA chr6-168 42785995 42786399 213 - chr6:42786256-42786274 NA NA NA NA NA chr6-167 42628319 42628556 163 - chr6:42628404-42628504 NA NA NA NA NA chr6-166 42610041 42610316 142 - chr6:42610179-42610193 NA NA NA NA NA chr6-165 42487838 42488039 160 - chr6:42487859-42487988 NA NA NA NA NA chr6-164 42471904 42472084 125 - chr6:42471961-42472033 NA NA NA NA NA chr6-163 42143745 42144164 285 - chr6:42143797-42144035 NA NA NA NA NA chr6-162 42086444 42086750 233 - chr6:42086482-42086607 NA NA NA NA NA chr6-161 42055262 42055536 178 - chr6:42055268-42055395 NA NA NA NA NA chr6-160 41884376 41884594 115 - chr6:41884423-41884463 NA NA NA NA NA chr6-159 41738394 41739271 576 - chr6:41738642-41738981 NA NA NA NA NA chr6-158 41415712 41415907 132 - chr6:41415772-41415838 NA NA NA NA NA chr6-157 41401896 41402307 311 - chr6:41402122-41402233 NA NA NA NA NA chr6-156 41309582 41309757 144 - chr6:41309592-41309684 NA NA NA NA NA chr6-155 41301341 41301602 147 - chr6:41301446-41301469 NA NA NA NA NA chr6-154 41133807 41134071 174 - chr6:41133908-41133980 NA NA NA NA NA chr6-153 41071731 41071985 160 - chr6:41071818-41071877 NA NA NA NA NA chr6-152 40988691 40988980 239 - chr6:40988821-40988970 NA NA NA NA NA chr6-151 40759459 40759694 186 - chr6:40759480-40759568 NA NA NA NA NA chr6-150 40615443 40615690 145 - chr6:40615594-40615688 NA NA NA NA NA chr6-149 40567648 40567938 214 - chr6:40567692-40567754 NA NA NA NA NA chr6-148 40366707 40366914 138 - chr6:40366840-40366877 NA NA NA NA NA chr6-147 40108242 40108487 153 - chr6:40108310-40108417 NA NA NA NA NA chr6-146 39693634 39694085 257 - chr6:39693878-39694025 NA NA NA NA NA chr6-145 39650692 39650928 149 - chr6:39650799-39650851 NA NA NA NA NA chr6-144 39595279 39595678 220 - chr6:39595314-39595427 NA NA NA NA NA chr6-7 3958843 3959316 239 - chr6:3958995-3959013 NA NA NA NA NA chr6-143 39206853 39207108 119 - chr6:39206943-39206949 NA NA NA NA NA chr6-142 39202147 39202317 143 - chr6:39202164-39202285 NA NA NA NA NA chr6-141 39067424 39067593 163 - chr6:39067433-39067584 NA NA NA NA NA chr6-140 38883764 38883978 179 - chr6:38883863-38883972 NA NA NA NA NA chr6-139 38735779 38735946 159 - chr6:38735779-38735934 NA NA NA NA NA chr6-6 3868243 3868541 227 - chr6:3868300-3868433 NA NA NA NA NA chr6-138 38625662 38625900 122 - chr6:38625758-38625822 NA NA NA NA NA chr6-137 38602643 38602924 232 - chr6:38602660-38602859 NA NA NA NA NA chr6-136 38591439 38591823 242 - chr6:38591677-38591729 NA NA NA NA NA chr6-135 38591194 38591407 119 - chr6:38591293-38591323 NA NA NA NA NA chr6-134 38546392 38546699 202 - chr6:38546472-38546544 NA NA NA NA NA chr6-133 38491460 38491851 191 - chr6:38491696-38491723 NA NA NA NA NA chr6-132 38432362 38432610 155 - chr6:38432455-38432517 NA NA NA NA NA chr6-131 38409865 38410022 136 - chr6:38409911-38410005 NA NA NA NA NA chr6-130 38391242 38391464 182 - chr6:38391300-38391460 NA NA NA NA NA chr6-129 38216421 38216694 171 - chr6:38216513-38216572 NA NA NA NA NA chr6-128 38081177 38081418 177 - chr6:38081231-38081334 NA NA NA NA NA chr6-127 38036761 38036966 185 - chr6:38036769-38036914 NA NA NA NA NA chr6-126 37994179 37994440 145 - chr6:37994273-37994280 NA NA NA NA NA chr6-125 37992030 37992333 200 - chr6:37992046-37992194 NA NA NA NA NA chr6-124 37836943 37837154 156 - chr6:37836998-37837099 NA NA NA NA NA chr6-123 37824623 37824928 203 - chr6:37824733-37824885 NA NA NA NA NA chr6-122 37649267 37649514 164 - chr6:37649354-37649439 NA NA NA NA NA chr6-121 37589268 37589489 194 - chr6:37589294-37589460 NA NA NA NA NA chr6-120 37518878 37519112 204 - chr6:37518915-37519059 NA NA NA NA NA chr6-119 37497225 37497443 125 - chr6:37497292-37497298 NA NA NA NA NA chr6-118 37437858 37438345 318 - chr6:37438052-37438256 NA NA NA NA NA chr6-117 37421075 37421732 382 - chr6:37421131-37421649 NA NA NA NA NA chr6-116 37366336 37366737 303 - chr6:37366378-37366627 NA NA NA NA NA chr6-115 37052700 37052918 170 - chr6:37052740-37052854 NA NA NA NA NA chr6-114 36831920 36832241 194 - chr6:36832091-36832136 NA NA NA NA NA chr6-113 36791011 36791348 219 - chr6:36791185-36791345 NA NA NA NA NA chr6-112 36516271 36516486 174 - chr6:36516338-36516458 NA NA NA NA NA chr6-111 36485041 36485213 140 - chr6:36485065-36485177 NA NA NA NA NA chr6-110 36110416 36110592 160 - chr6:36110439-36110591 NA NA NA NA NA chr6-109 36067676 36068012 148 - chr6:36067748-36067802 NA NA NA NA NA chr6-108 35979779 35980004 130 - chr6:35979886-35979933 NA NA NA NA NA chr6-107 35877952 35878220 226 - chr6:35878021-35878163 NA NA NA NA NA chr6-106 35874927 35875134 169 - chr6:35874942-35875092 NA NA NA NA NA chr6-105 35872459 35872940 322 - chr6:35872551-35872664 NA NA NA NA NA chr6-104 35864556 35864789 163 - chr6:35864621-35864709 NA NA NA NA NA chr6-103 35857606 35857907 157 - chr6:35857741-35857758 NA NA NA NA NA chr6-102 35831525 35831719 160 - chr6:35831539-35831675 NA NA NA NA NA chr6-101 35811770 35812118 253 - chr6:35811905-35811968 NA NA NA NA NA chr6-100 35703297 35703589 152 - chr6:35703444-35703493 NA NA NA NA NA chr6-99 35669034 35669418 241 - chr6:35669089-35669231 NA NA NA NA NA chr6-98 35660450 35660746 259 - chr6:35660472-35660657 NA NA NA NA NA chr6-97 35656085 35656394 197 - chr6:35656241-35656370 NA NA NA NA NA chr6-96 35651666 35651873 131 - chr6:35651722-35651757 NA NA NA NA NA chr6-95 35630680 35631151 218 - chr6:35630825-35630844 NA NA NA NA NA chr6-94 35628469 35628665 134 - chr6:35628571-35628623 NA NA NA NA NA chr6-93 35602389 35602601 140 - chr6:35602450-35602507 NA NA NA NA NA chr6-92 35563418 35563598 173 - chr6:35563419-35563588 NA NA NA NA NA chr6-91 35549260 35549496 166 - chr6:35549332-35549427 NA NA NA NA NA chr6-90 35368469 35368669 155 - chr6:35368509-35368614 NA NA NA NA NA chr6-89 35211868 35212121 159 - chr6:35211956-35212024 NA NA NA NA NA chr6-88 35154070 35154405 181 - chr6:35154242-35154306 NA NA NA NA NA chr6-87 35127100 35127572 222 - chr6:35127348-35127395 NA NA NA NA NA chr6-86 35048391 35048631 136 - chr6:35048498-35048534 NA NA NA NA NA chr6-85 34814490 34814772 145 - chr6:34814623-34814633 NA NA NA NA NA chr6-84 34467153 34467484 180 - chr6:34467338-34467350 NA NA NA NA NA chr6-83 34442629 34442937 184 - chr6:34442779-34442865 NA NA NA NA NA chr6-82 34340028 34340295 164 - chr6:34340145-34340199 NA NA NA NA NA chr6-81 34294061 34294349 161 - chr6:34294186-34294218 NA NA NA NA NA chr6-80 33798802 33799113 163 - chr6:33798949-33798963 NA NA NA NA NA chr6-79 33637329 33637593 155 - chr6:33637432-33637472 NA NA NA NA NA chr6-78 28402162 28402462 250 - chr6:28402206-28402356 NA NA NA NA NA chr6-77 28288044 28288291 143 - chr6:28288149-28288189 NA NA NA NA NA chr6-76 28265187 28265522 234 - chr6:28265371-28265514 NA NA NA NA NA chr6-75 27843171 27843397 118 - chr6:27843273-27843302 NA NA NA NA NA chr6-5 2758396 2758663 151 - chr6:2758504-2758543 NA NA NA NA NA chr6-74 27584289 27584538 174 - chr6:27584404-27584483 NA NA NA NA NA chr6-73 27386604 27386951 186 - chr6:27386800-27386860 NA NA NA NA NA chr6-72 27351736 27352242 236 - chr6:27351864-27351901 NA NA NA NA NA chr6-71 27006493 27006630 128 - chr6:27006520-27006630 NA NA NA NA NA chr6-70 26661825 26662047 154 - chr6:26661887-26661976 NA NA NA NA NA chr6-69 25694841 25695084 192 - chr6:25694993-25695083 NA NA NA NA NA chr6-68 25623627 25623796 130 - chr6:25623646-25623717 NA NA NA NA NA chr6-67 25189088 25189441 235 - chr6:25189294-25189327 NA NA NA NA NA chr6-66 24875085 24875332 159 - chr6:24875163-24875239 NA NA NA NA NA chr6-65 24835700 24835967 155 - chr6:24835810-24835851 NA NA NA NA NA chr6-64 24649705 24649945 219 - chr6:24649726-24649903 NA NA NA NA NA chr6-63 24008209 24008396 158 - chr6:24008231-24008353 NA NA NA NA NA chr6-4 2355950 2356355 217 - chr6:2356048-2356122 NA NA NA NA NA chr6-62 23379703 23379969 196 - chr6:23379805-23379915 NA NA NA NA NA chr6-61 22722103 22722315 131 - chr6:22722198-22722262 NA NA NA NA NA chr6-60 22708109 22708596 237 - chr6:22708176-22708209 NA NA NA NA NA chr6-59 22698136 22698454 164 - chr6:22698289-22698298 NA NA NA NA NA chr6-58 22651777 22652114 204 - chr6:22651915-22651939 NA NA NA NA NA chr6-57 22408637 22408812 151 - chr6:22408655-22408785 NA NA NA NA NA chr6-56 22295633 22295912 175 - chr6:22295719-22295772 NA NA NA NA NA chr6-55 21978337 21978689 170 - chr6:21978447-21978471 NA NA NA NA NA chr6-54 21179212 21179617 232 - chr6:21179471-21179487 NA NA NA NA NA chr6-53 21148716 21148899 160 - chr6:21148751-21148882 NA NA NA NA NA chr6-52 20728677 20728903 181 - chr6:20728796-20728887 NA NA NA NA NA chr6-51 20473852 20474048 156 - chr6:20473972-20474048 NA NA NA NA NA chr6-50 20406249 20406756 235 - chr6:20406365-20406406 NA NA NA NA NA chr6-49 20379466 20379742 162 - chr6:20379624-20379650 NA NA NA NA NA chr6-48 20215333 20215511 124 - chr6:20215347-20215377 NA NA NA NA NA chr6-47 19985236 19985642 240 - chr6:19985474-19985631 NA NA NA NA NA chr6-46 18951899 18952300 288 - chr6:18952124-18952243 NA NA NA NA NA chr6-45 18824633 18824879 165 - chr6:18824751-18824872 NA NA NA NA NA chr6-44 18801220 18801408 172 - chr6:18801244-18801396 NA NA NA NA NA chr6-43 18732049 18732416 308 - chr6:18732059-18732259 NA NA NA NA NA chr6-42 18469441 18469705 131 - chr6:18469472-18469521 NA NA NA NA NA chr6-41 18136481 18136640 119 - chr6:18136492-18136591 NA NA NA NA NA chr6-40 17834397 17834748 202 - chr6:17834584-17834675 NA NA NA NA NA chr6-39 17067087 17067314 150 - chr6:17067158-17067225 NA NA NA NA NA chr6-765 170604649 170604856 160 - chr6:170604693-170604803 NA NA NA NA NA chr6-764 169521562 169521842 172 - chr6:169521660-169521714 NA NA NA NA NA chr6-763 169070619 169071100 273 - chr6:169070771-169070780 NA NA NA NA NA chr6-762 169070128 169070438 188 - chr6:169070194-169070321 NA NA NA NA NA chr6-761 168997312 168997729 218 - chr6:168997401-168997475 NA NA NA NA NA chr6-760 168708667 168708853 170 - chr6:168708675-168708821 NA NA NA NA NA chr6-38 16864152 16864379 180 - chr6:16864239-16864352 NA NA NA NA NA chr6-759 168462021 168462191 142 - chr6:168462048-168462161 NA NA NA NA NA chr6-758 168186082 168186311 167 - chr6:168186154-168186254 NA NA NA NA NA chr6-757 168144607 168144791 151 - chr6:168144640-168144758 NA NA NA NA NA chr6-756 167959508 167959804 181 - chr6:167959650-167959743 NA NA NA NA NA chr6-755 167833306 167833486 163 - chr6:167833339-167833477 NA NA NA NA NA chr6-754 167040880 167041131 128 - chr6:167040919-167040966 NA NA NA NA NA chr6-753 166709631 166709964 187 - chr6:166709816-166709896 NA NA NA NA NA chr6-752 166645015 166645242 153 - chr6:166645095-166645171 NA NA NA NA NA chr6-751 166096124 166096323 158 - chr6:166096161-166096274 NA NA NA NA NA chr6-750 165937643 165938162 331 - chr6:165937821-165938081 NA NA NA NA NA chr6-749 165637413 165637782 212 - chr6:165637590-165637665 NA NA NA NA NA chr6-37 16563460 16563621 142 - chr6:16563473-16563599 NA NA NA NA NA chr6-748 165489949 165490368 206 - chr6:165490215-165490261 NA NA NA NA NA chr6-747 165448987 165449137 145 - chr6:165448996-165449134 NA NA NA NA NA chr6-746 165021761 165022075 249 - chr6:165021858-165021977 NA NA NA NA NA chr6-745 164636684 164636983 212 - chr6:164636819-164636920 NA NA NA NA NA chr6-744 164453383 164453740 205 - chr6:164453569-164453656 NA NA NA NA NA chr6-743 164381615 164382025 224 - chr6:164381875-164381876 NA NA NA NA NA chr6-742 164306375 164306541 162 - chr6:164306375-164306535 NA NA NA NA NA chr6-741 164224941 164225244 225 - chr6:164225095-164225204 NA NA NA NA NA chr6-740 164199956 164200155 145 - chr6:164199987-164200055 NA NA NA NA NA chr6-739 164116972 164117235 206 - chr6:164116999-164117118 NA NA NA NA NA chr6-738 163973061 163973402 204 - chr6:163973250-163973369 NA NA NA NA NA chr6-737 163781697 163782219 244 - chr6:163781795-163781851 NA NA NA NA NA chr6-736 163618401 163618678 170 - chr6:163618472-163618553 NA NA NA NA NA chr6-735 163230942 163231145 126 - chr6:163231035-163231076 NA NA NA NA NA chr6-734 163104590 163105084 349 - chr6:163104725-163104919 NA NA NA NA NA chr6-733 162857823 162858096 140 - chr6:162857967-162857985 NA NA NA NA NA chr6-732 162730483 162730790 153 - chr6:162730672-162730706 NA NA NA NA NA chr6-731 162703356 162703659 169 - chr6:162703509-162703563 NA NA NA NA NA chr6-730 162454329 162454630 168 - chr6:162454450-162454491 NA NA NA NA NA chr6-729 162359693 162360057 230 - chr6:162359761-162359924 NA NA NA NA NA chr6-728 161825295 161825606 204 - chr6:161825430-161825513 NA NA NA NA NA chr6-727 161575250 161575661 211 - chr6:161575450-161575461 NA NA NA NA NA chr6-726 160743974 160744198 158 - chr6:160744013-160744138 NA NA NA NA NA chr6-725 160379590 160379931 233 - chr6:160379749-160379914 NA NA NA NA NA chr6-724 160226164 160226640 252 - chr6:160226428-160226496 NA NA NA NA NA chr6-723 160112661 160112849 168 - chr6:160112683-160112833 NA NA NA NA NA chr6-722 159780712 159780884 151 - chr6:159780735-159780864 NA NA NA NA NA chr6-721 159764738 159765102 232 - chr6:159764863-159764956 NA NA NA NA NA chr6-720 159737933 159738174 117 - chr6:159738068-159738072 NA NA NA NA NA chr6-719 159410870 159411113 164 - chr6:159410939-159411014 NA NA NA NA NA chr6-718 158694669 158694875 156 - chr6:158694726-158694839 NA NA NA NA NA chr6-717 158186588 158186911 211 - chr6:158186605-158186760 NA NA NA NA NA chr6-716 157864577 157865020 230 - chr6:157864686-157864743 NA NA NA NA NA chr6-715 157666566 157667083 232 - chr6:157666923-157666943 NA NA NA NA NA chr6-714 157632725 157632965 206 - chr6:157632788-157632926 NA NA NA NA NA chr6-713 157484273 157484612 263 - chr6:157484447-157484585 NA NA NA NA NA chr6-712 157326760 157327095 178 - chr6:157326839-157326899 NA NA NA NA NA chr6-711 157320130 157320435 207 - chr6:157320257-157320395 NA NA NA NA NA chr6-710 156903410 156903607 149 - chr6:156903476-156903568 NA NA NA NA NA chr6-709 156432784 156433002 133 - chr6:156432935-156432950 NA NA NA NA NA chr6-708 156414201 156414514 160 - chr6:156414353-156414359 NA NA NA NA NA chr6-707 156331344 156331484 124 - chr6:156331345-156331461 NA NA NA NA NA chr6-706 156283009 156283239 190 - chr6:156283035-156283171 NA NA NA NA NA chr6-705 155877261 155877589 167 - chr6:155877509-155877539 NA NA NA NA NA chr6-704 155600810 155601008 183 - chr6:155600815-155600968 NA NA NA NA NA chr6-703 155598729 155599057 196 - chr6:155598918-155598998 NA NA NA NA NA chr6-702 155312482 155312747 162 - chr6:155312580-155312634 NA NA NA NA NA chr6-701 155081417 155081650 176 - chr6:155081496-155081637 NA NA NA NA NA chr6-700 154949129 154949459 193 - chr6:154949310-154949410 NA NA NA NA NA chr6-3 1549464 1549608 119 - chr6:1549484-1549553 NA NA NA NA NA chr6-699 154914136 154914496 275 - chr6:154914226-154914421 NA NA NA NA NA chr6-698 154339639 154340119 228 - chr6:154339973-154340031 NA NA NA NA NA chr6-697 154107462 154107689 179 - chr6:154107505-154107660 NA NA NA NA NA chr6-696 154067824 154068035 154 - chr6:154067875-154067975 NA NA NA NA NA chr6-695 153881345 153881502 137 - chr6:153881354-153881460 NA NA NA NA NA chr6-694 153651127 153651477 220 - chr6:153651240-153651395 NA NA NA NA NA chr6-693 152947067 152947361 159 - chr6:152947191-152947204 NA NA NA NA NA chr6-692 152929806 152929972 151 - chr6:152929815-152929954 NA NA NA NA NA chr6-691 152535602 152535772 148 - chr6:152535624-152535750 NA NA NA NA NA chr6-690 152468687 152469038 215 - chr6:152468862-152468928 NA NA NA NA NA chr6-689 152456531 152456715 140 - chr6:152456563-152456665 NA NA NA NA NA chr6-688 151637927 151638209 178 - chr6:151638010-151638063 NA NA NA NA NA chr6-687 151255575 151255843 179 - chr6:151255642-151255728 NA NA NA NA NA chr6-686 151114034 151114304 212 - chr6:151114099-151114260 NA NA NA NA NA chr6-685 151099266 151099476 133 - chr6:151099389-151099422 NA NA NA NA NA chr6-36 15033773 15033959 150 - chr6:15033809-15033923 NA NA NA NA NA chr6-684 150169466 150169674 187 - chr6:150169469-150169617 NA NA NA NA NA chr6-683 150153450 150153697 159 - chr6:150153533-150153599 NA NA NA NA NA chr6-682 149622100 149622359 184 - chr6:149622160-149622254 NA NA NA NA NA chr6-681 149425647 149425957 171 - chr6:149425790-149425826 NA NA NA NA NA chr6-680 149214879 149215102 204 - chr6:149214915-149215081 NA NA NA NA NA chr6-679 148974864 148975136 152 - chr6:148974984-148975016 NA NA NA NA NA chr6-678 148829671 148830038 179 - chr6:148829835-148829838 NA NA NA NA NA chr6-677 148828805 148829126 233 - chr6:148828809-148828996 NA NA NA NA NA chr6-676 148796026 148796274 159 - chr6:148796119-148796187 NA NA NA NA NA chr6-675 148385960 148386237 153 - chr6:148386078-148386110 NA NA NA NA NA chr6-674 148104161 148104400 117 - chr6:148104239-148104256 NA NA NA NA NA chr6-673 147715352 147715526 149 - chr6:147715382-147715511 NA NA NA NA NA chr6-672 147564976 147565376 271 - chr6:147565048-147565133 NA NA NA NA NA chr6-671 147493509 147493792 201 - chr6:147493643-147493736 NA NA NA NA NA chr6-670 147446996 147447454 211 - chr6:147447121-147447146 NA NA NA NA NA chr6-669 147381579 147381790 135 - chr6:147381629-147381701 NA NA NA NA NA chr6-668 147186718 147187216 239 - chr6:147186773-147186849 NA NA NA NA NA chr6-667 146931839 146932041 161 - chr6:146931889-146932018 NA NA NA NA NA chr6-666 146787676 146787986 200 - chr6:146787696-146787841 NA NA NA NA NA chr6-35 14655242 14655463 158 - chr6:14655305-14655400 NA NA NA NA NA chr6-665 146423558 146423881 224 - chr6:146423592-146423652 NA NA NA NA NA chr6-664 146196911 146197187 144 - chr6:146197019-146197043 NA NA NA NA NA chr6-663 146088070 146088242 144 - chr6:146088098-146088214 NA NA NA NA NA chr6-662 146047453 146048447 518 - chr6:146047562-146048154 NA NA NA NA NA chr6-661 145989273 145989548 187 - chr6:145989362-145989505 NA NA NA NA NA chr6-660 145807374 145807614 179 - chr6:145807401-145807536 NA NA NA NA NA chr6-659 145768696 145768882 175 - chr6:145768716-145768869 NA NA NA NA NA chr6-658 145447077 145447393 155 - chr6:145447257-145447270 NA NA NA NA NA chr6-657 145137246 145137512 149 - chr6:145137365-145137399 NA NA NA NA NA chr6-656 145111917 145112259 171 - chr6:145112117-145112146 NA NA NA NA NA chr6-655 144905460 144905742 150 - chr6:144905584-144905606 NA NA NA NA NA chr6-654 144794265 144794545 176 - chr6:144794360-144794423 NA NA NA NA NA chr6-653 144126864 144127056 155 - chr6:144126905-144127021 NA NA NA NA NA chr6-652 144034135 144034613 208 - chr6:144034151-144034224 NA NA NA NA NA chr6-651 143901979 143902673 402 - chr6:143902319-143902349 NA NA NA NA NA chr6-650 143890497 143890871 189 - chr6:143890744-143890810 NA NA NA NA NA chr6-649 143385707 143385917 122 - chr6:143385709-143385787 NA NA NA NA NA chr6-648 143383628 143383825 154 - chr6:143383668-143383776 NA NA NA NA NA chr6-647 143145521 143145732 171 - chr6:143145583-143145703 NA NA NA NA NA chr6-646 143023090 143023330 205 - chr6:143023195-143023330 NA NA NA NA NA chr6-645 142689196 142689440 151 - chr6:142689288-142689345 NA NA NA NA NA chr6-644 142677571 142677856 193 - chr6:142677657-142677804 NA NA NA NA NA chr6-643 142487656 142487938 145 - chr6:142487797-142487803 NA NA NA NA NA chr6-642 142383900 142384278 188 - chr6:142384122-142384152 NA NA NA NA NA chr6-641 142363506 142363713 138 - chr6:142363565-142363639 NA NA NA NA NA chr6-640 142361823 142361999 130 - chr6:142361849-142361943 NA NA NA NA NA chr6-639 142355861 142356284 242 - chr6:142356130-142356147 NA NA NA NA NA chr6-638 141870750 141870976 170 - chr6:141870750-141870892 NA NA NA NA NA chr6-637 141808175 141808418 119 - chr6:141808309-141808314 NA NA NA NA NA chr6-636 141753754 141753958 142 - chr6:141753854-141753915 NA NA NA NA NA chr6-635 141544031 141544306 160 - chr6:141544161-141544221 NA NA NA NA NA chr6-634 141539617 141540057 288 - chr6:141539880-141539976 NA NA NA NA NA chr6-633 141348187 141348515 184 - chr6:141348267-141348338 NA NA NA NA NA chr6-632 141334476 141334820 262 - chr6:141334510-141334642 NA NA NA NA NA chr6-34 14083363 14083651 158 - chr6:14083491-14083520 NA NA NA NA NA chr6-33 14061675 14061955 169 - chr6:14061774-14061838 NA NA NA NA NA chr6-631 140550102 140550423 176 - chr6:140550233-140550250 NA NA NA NA NA chr6-630 140277792 140277958 150 - chr6:140277792-140277934 NA NA NA NA NA chr6-629 140063725 140064124 191 - chr6:140063768-140063833 NA NA NA NA NA chr6-628 140042758 140042939 158 - chr6:140042789-140042920 NA NA NA NA NA chr6-627 139922788 139922980 121 - chr6:139922931-139922945 NA NA NA NA NA chr6-626 139400221 139400771 300 - chr6:139400426-139400431 NA NA NA NA NA chr6-625 139294519 139295010 233 - chr6:139294625-139294676 NA NA NA NA NA chr6-624 139290878 139291120 162 - chr6:139290930-139291026 NA NA NA NA NA chr6-623 139184145 139184505 288 - chr6:139184317-139184461 NA NA NA NA NA chr6-622 138925996 138926207 124 - chr6:138926131-138926144 NA NA NA NA NA chr6-621 138685357 138685953 291 - chr6:138685554-138685646 NA NA NA NA NA chr6-620 138486222 138486560 174 - chr6:138486411-138486446 NA NA NA NA NA chr6-619 138457348 138457534 161 - chr6:138457380-138457523 NA NA NA NA NA chr6-618 138443078 138443352 156 - chr6:138443196-138443234 NA NA NA NA NA chr6-617 138174779 138175081 155 - chr6:138174930-138174936 NA NA NA NA NA chr6-616 137948768 137949063 195 - chr6:137948818-137948963 NA NA NA NA NA chr6-615 137712767 137713003 120 - chr6:137712897-137712915 NA NA NA NA NA chr6-614 137509126 137509282 112 - chr6:137509173-137509263 NA NA NA NA NA chr6-613 136602754 136603163 201 - chr6:136602994-136603019 NA NA NA NA NA chr6-612 136049876 136050124 198 - chr6:136049948-136050046 NA NA NA NA NA chr6-32 13604774 13605367 299 - chr6:13604867-13605019 NA NA NA NA NA chr6-611 136017809 136018305 262 - chr6:136018085-136018230 NA NA NA NA NA chr6-610 135845228 135845513 153 - chr6:135845374-135845388 NA NA NA NA NA chr6-609 135502312 135502578 144 - chr6:135502445-135502462 NA NA NA NA NA chr6-608 135401741 135402019 163 - chr6:135401850-135401901 NA NA NA NA NA chr6-607 135263884 135264194 160 - chr6:135264018-135264036 NA NA NA NA NA chr6-606 135178714 135179028 202 - chr6:135178752-135178867 NA NA NA NA NA chr6-605 135029319 135029663 232 - chr6:135029397-135029483 NA NA NA NA NA chr6-604 134543319 134543618 234 - chr6:134543450-134543586 NA NA NA NA NA chr6-603 134056036 134056493 210 - chr6:134056173-134056191 NA NA NA NA NA chr6-602 133907071 133907389 262 - chr6:133907237-133907388 NA NA NA NA NA chr6-601 133716945 133717405 304 - chr6:133717237-133717317 NA NA NA NA NA chr6-600 133716440 133716741 183 - chr6:133716539-133716585 NA NA NA NA NA chr6-599 133716238 133716394 146 - chr6:133716248-133716384 NA NA NA NA NA chr6-598 133411942 133412094 145 - chr6:133411943-133412075 NA NA NA NA NA chr6-597 133378202 133378488 163 - chr6:133378320-133378355 NA NA NA NA NA chr6-596 133096266 133096477 154 - chr6:133096322-133096418 NA NA NA NA NA chr6-595 133046059 133046446 159 - chr6:133046232-133046277 NA NA NA NA NA chr6-594 133016473 133016653 145 - chr6:133016504-133016616 NA NA NA NA NA chr6-593 132894675 132894959 244 - chr6:132894788-132894952 NA NA NA NA NA chr6-592 132748656 132749046 246 - chr6:132748752-132748806 NA NA NA NA NA chr6-591 132325732 132325916 180 - chr6:132325744-132325916 NA NA NA NA NA chr6-590 132299522 132299832 170 - chr6:132299670-132299696 NA NA NA NA NA chr6-589 132290453 132290650 157 - chr6:132290507-132290617 NA NA NA NA NA chr6-588 131682848 131683028 152 - chr6:131682876-131683000 NA NA NA NA NA chr6-587 131493827 131493990 123 - chr6:131493848-131493951 NA NA NA NA NA chr6-586 131335073 131335487 240 - chr6:131335202-131335223 NA NA NA NA NA chr6-31 13127299 13127663 230 - chr6:13127579-13127602 NA NA NA NA NA chr6-585 131110169 131110611 273 - chr6:131110196-131110504 NA NA NA NA NA chr6-30 13103866 13104291 251 - chr6:13103995-13104027 NA NA NA NA NA chr6-584 130824623 130825176 250 - chr6:130825035-130825075 NA NA NA NA NA chr6-583 130780803 130781059 168 - chr6:130780901-130780991 NA NA NA NA NA chr6-582 130654285 130654583 157 - chr6:130654424-130654441 NA NA NA NA NA chr6-581 130598474 130598678 162 - chr6:130598544-130598650 NA NA NA NA NA chr6-580 130575635 130575963 206 - chr6:130575715-130575860 NA NA NA NA NA chr6-579 130549859 130550102 143 - chr6:130549965-130550014 NA NA NA NA NA chr6-578 130159007 130159157 149 - chr6:130159007-130159154 NA NA NA NA NA chr6-577 130142688 130142957 154 - chr6:130142809-130142845 NA NA NA NA NA chr6-576 130097138 130097469 202 - chr6:130097171-130097292 NA NA NA NA NA chr6-575 129805376 129805610 130 - chr6:129805460-129805466 NA NA NA NA NA chr6-2 1298012 1298203 159 - chr6:1298034-1298166 NA NA NA NA NA chr6-574 129737736 129738042 214 - chr6:129737775-129737988 NA NA NA NA NA chr6-573 129690111 129690361 150 - chr6:129690215-129690269 NA NA NA NA NA chr6-572 129476252 129476462 160 - chr6:129476275-129476410 NA NA NA NA NA chr6-571 129463373 129463612 157 - chr6:129463447-129463526 NA NA NA NA NA chr6-570 129381295 129381466 143 - chr6:129381317-129381435 NA NA NA NA NA chr6-569 129162218 129162529 175 - chr6:129162296-129162364 NA NA NA NA NA chr6-568 128958296 128958585 154 - chr6:128958441-128958470 NA NA NA NA NA chr6-567 128848991 128849202 157 - chr6:128849049-128849150 NA NA NA NA NA chr6-566 128748478 128748858 272 - chr6:128748551-128748629 NA NA NA NA NA chr6-29 12853922 12854178 222 - chr6:12853975-12854129 NA NA NA NA NA chr6-565 127560463 127560665 185 - chr6:127560469-127560626 NA NA NA NA NA chr6-564 127388292 127388501 158 - chr6:127388346-127388456 NA NA NA NA NA chr6-563 127221113 127221617 264 - chr6:127221320-127221476 NA NA NA NA NA chr6-562 127028973 127029196 168 - chr6:127029040-127029150 NA NA NA NA NA chr6-561 126769636 126769961 205 - chr6:126769803-126769815 NA NA NA NA NA chr6-560 125886784 125887412 262 - chr6:125887266-125887278 NA NA NA NA NA chr6-559 125414348 125414682 232 - chr6:125414500-125414681 NA NA NA NA NA chr6-558 125048103 125048651 391 - chr6:125048121-125048578 NA NA NA NA NA chr6-557 125009467 125009644 157 - chr6:125009481-125009621 NA NA NA NA NA chr6-556 124933585 124933804 159 - chr6:124933648-124933750 NA NA NA NA NA chr6-555 124847421 124847586 132 - chr6:124847446-124847512 NA NA NA NA NA chr6-554 124783283 124783581 159 - chr6:124783413-124783424 NA NA NA NA NA chr6-553 124579856 124580087 158 - chr6:124579921-124579998 NA NA NA NA NA chr6-552 124504831 124505216 231 - chr6:124504877-124505031 NA NA NA NA NA chr6-551 124451158 124451450 125 - chr6:124451378-124451389 NA NA NA NA NA chr6-550 124393925 124394585 337 - chr6:124393937-124394078 NA NA NA NA NA chr6-549 124194744 124194997 195 - chr6:124194773-124194939 NA NA NA NA NA chr6-548 124154606 124154792 149 - chr6:124154631-124154749 NA NA NA NA NA chr6-547 124143441 124143704 152 - chr6:124143560-124143597 NA NA NA NA NA chr6-546 124056432 124056647 120 - chr6:124056471-124056524 NA NA NA NA NA chr6-545 123756277 123756520 199 - chr6:123756369-123756500 NA NA NA NA NA chr6-544 123722986 123723210 181 - chr6:123722991-123723148 NA NA NA NA NA chr6-543 123461278 123461582 196 - chr6:123461437-123461576 NA NA NA NA NA chr6-542 123226546 123226734 160 - chr6:123226550-123226654 NA NA NA NA NA chr6 1231795 1232164 223 - chr6:1232003-1232153 NA NA NA NA NA chr6-541 122765171 122765657 333 - chr6:122765532-122765608 NA NA NA NA NA chr6-540 122619228 122619440 134 - chr6:122619311-122619372 NA NA NA NA NA chr6-539 122488975 122489222 152 - chr6:122489071-122489129 NA NA NA NA NA chr6-538 122440601 122440800 164 - chr6:122440628-122440767 NA NA NA NA NA chr6-537 122371102 122371464 241 - chr6:122371188-122371273 NA NA NA NA NA chr6-536 121958735 121959025 176 - chr6:121958818-121958874 NA NA NA NA NA chr6-535 121512704 121512914 158 - chr6:121512800-121512884 NA NA NA NA NA chr6-534 120886662 120886908 192 - chr6:120886743-120886908 NA NA NA NA NA chr6-533 120482900 120483087 164 - chr6:120482920-120483058 NA NA NA NA NA chr6-532 120432358 120432545 131 - chr6:120432410-120432487 NA NA NA NA NA chr6-531 120247960 120248145 167 - chr6:120247976-120248123 NA NA NA NA NA chr6-530 119809328 119809688 186 - chr6:119809432-119809479 NA NA NA NA NA chr6-529 119559207 119559344 132 - chr6:119559212-119559339 NA NA NA NA NA chr6-528 119435452 119435761 211 - chr6:119435492-119435654 NA NA NA NA NA chr6-527 119260487 119260665 130 - chr6:119260535-119260641 NA NA NA NA NA chr6-28 11923463 11923709 189 - chr6:11923626-11923701 NA NA NA NA NA chr6-526 118899394 118899573 159 - chr6:118899422-118899571 NA NA NA NA NA chr6-525 118696341 118696685 191 - chr6:118696472-118696488 NA NA NA NA NA chr6-524 118265905 118266146 195 - chr6:118265939-118266094 NA NA NA NA NA chr6-523 117733368 117733614 150 - chr6:117733467-117733524 NA NA NA NA NA chr6-522 117720164 117720388 152 - chr6:117720260-117720328 NA NA NA NA NA chr6-521 117213608 117213783 160 - chr6:117213630-117213782 NA NA NA NA NA chr6-520 117139894 117140139 166 - chr6:117139988-117140090 NA NA NA NA NA chr6-519 116546544 116546862 194 - chr6:116546708-116546758 NA NA NA NA NA chr6-518 116312545 116312719 121 - chr6:116312612-116312694 NA NA NA NA NA chr6-27 11580904 11581190 219 - chr6:11581097-11581186 NA NA NA NA NA chr6-517 115506521 115506849 224 - chr6:115506541-115506703 NA NA NA NA NA chr6-516 114602804 114603238 208 - chr6:114602904-114602949 NA NA NA NA NA chr6-515 113960912 113961427 328 - chr6:113960991-113961024 NA NA NA NA NA chr6-514 113818417 113818686 154 - chr6:113818532-113818571 NA NA NA NA NA chr6-513 113242155 113242331 148 - chr6:113242159-113242293 NA NA NA NA NA chr6-512 112929672 112929837 145 - chr6:112929697-112929827 NA NA NA NA NA chr6-511 112639524 112639783 133 - chr6:112639636-112639650 NA NA NA NA NA chr6-26 11223631 11223983 189 - chr6:11223822-11223834 NA NA NA NA NA chr6-510 112193877 112194087 167 - chr6:112193926-112194047 NA NA NA NA NA chr6-509 112151165 112151605 252 - chr6:112151241-112151399 NA NA NA NA NA chr6-508 111521360 111521594 150 - chr6:111521442-111521509 NA NA NA NA NA chr6-507 111420433 111420661 174 - chr6:111420478-111420589 NA NA NA NA NA chr6-506 111404975 111405333 195 - chr6:111405170-111405226 NA NA NA NA NA chr6-505 111377896 111378308 188 - chr6:111378163-111378170 NA NA NA NA NA chr6-504 111074027 111074448 267 - chr6:111074273-111074383 NA NA NA NA NA chr6-503 110871846 110872187 205 - chr6:110871951-110871989 NA NA NA NA NA chr6-502 110619970 110620196 172 - chr6:110620044-110620152 NA NA NA NA NA chr6-25 11001104 11001274 151 - chr6:11001129-11001267 NA NA NA NA NA chr6-501 109625919 109626177 146 - chr6:109626035-109626067 NA NA NA NA NA chr6-24 10950040 10950331 176 - chr6:10950160-10950226 NA NA NA NA NA chr6-500 109317059 109317303 164 - chr6:109317148-109317241 NA NA NA NA NA chr6-499 109038404 109038636 136 - chr6:109038476-109038492 NA NA NA NA NA chr6-23 10842594 10842754 118 - chr6:10842623-10842657 NA NA NA NA NA chr6-498 108302908 108303422 359 - chr6:108302996-108303298 NA NA NA NA NA chr6-22 10823976 10824210 173 - chr6:10824055-10824158 NA NA NA NA NA chr6-497 107881405 107881613 154 - chr6:107881463-107881561 NA NA NA NA NA chr6-496 107375328 107375508 174 - chr6:107375328-107375490 NA NA NA NA NA chr6-495 107145715 107146017 250 - chr6:107145822-107145968 NA NA NA NA NA chr6-494 106606165 106606489 252 - chr6:106606343-106606470 NA NA NA NA NA chr6-493 106220631 106221214 288 - chr6:106221068-106221128 NA NA NA NA NA chr6-21 10568389 10568720 175 - chr6:10568551-10568567 NA NA NA NA NA chr6-492 105215992 105216241 122 - chr6:105216107-105216108 NA NA NA NA NA chr6-491 105213454 105213745 157 - chr6:105213584-105213603 NA NA NA NA NA chr6-490 104829748 104829949 151 - chr6:104829756-104829807 NA NA NA NA NA chr6-489 104634900 104635069 154 - chr6:104634902-104635026 NA NA NA NA NA chr6-488 104238195 104238508 179 - chr6:104238353-104238386 NA NA NA NA NA chr6-487 104157631 104157782 149 - chr6:104157633-104157781 NA NA NA NA NA chr6-486 104099775 104100053 154 - chr6:104099823-104099891 NA NA NA NA NA chr6-485 104059491 104059770 167 - chr6:104059613-104059663 NA NA NA NA NA chr6-484 103892205 103892408 155 - chr6:103892269-103892368 NA NA NA NA NA chr6-483 103465283 103465449 156 - chr6:103465295-103465443 NA NA NA NA NA chr6-482 103403371 103403673 203 - chr6:103403518-103403670 NA NA NA NA NA chr6-481 103188655 103188990 170 - chr6:103188835-103188855 NA NA NA NA NA chr6-480 101566045 101566247 123 - chr6:101566149-101566218 NA NA NA NA NA chr6-479 101195252 101195555 246 - chr6:101195340-101195472 NA NA NA NA NA chr6-478 101124104 101124253 142 - chr6:101124116-101124244 NA NA NA NA NA chr6-477 101103017 101103240 127 - chr6:101103091-101103133 NA NA NA NA NA chr6-476 100596905 100597194 161 - chr6:100597021-100597060 NA NA NA NA NA chr6-475 100587266 100587532 153 - chr6:100587385-100587422 NA NA NA NA NA chr6-474 100552004 100552312 194 - chr6:100552024-100552151 NA NA NA NA NA chr6-473 100536675 100536859 122 - chr6:100536807-100536832 NA NA NA NA NA chr6-472 100490255 100490697 252 - chr6:100490396-100490409 NA NA NA NA NA chr6-471 100434149 100434417 170 - chr6:100434345-100434368 NA NA NA NA NA chr6-470 100099261 100099475 160 - chr6:100099321-100099433 NA NA NA NA NA chr5_GL339449v2_alt 970538 970832 227 - chr5_GL339449v2_alt:970697-970790 NA NA NA NA NA chr5-755 99552412 99552721 207 - chr5:99552425-99552581 NA NA NA NA NA chr5-754 99259500 99259666 151 - chr5:99259516-99259653 NA NA NA NA NA chr5-753 99076408 99076586 143 - chr5:99076443-99076551 NA NA NA NA NA chr5-752 98752192 98752381 176 - chr5:98752231-98752381 NA NA NA NA NA chr5-751 98599473 98599744 147 - chr5:98599597-98599620 NA NA NA NA NA chr5-750 98322047 98322327 237 - chr5:98322127-98322278 NA NA NA NA NA chr5-749 98009313 98009707 195 - chr5:98009549-98009582 NA NA NA NA NA chr5-748 97932667 97932915 139 - chr5:97932824-97932830 NA NA NA NA NA chr5-747 97859568 97859963 221 - chr5:97859709-97859723 NA NA NA NA NA chr5-746 97833653 97833882 121 - chr5:97833781-97833814 NA NA NA NA NA chr5-745 97802029 97802192 153 - chr5:97802040-97802188 NA NA NA NA NA chr5-744 97728508 97728722 122 - chr5:97728577-97728584 NA NA NA NA NA chr5-743 97714086 97714277 151 - chr5:97714128-97714241 NA NA NA NA NA chr5-742 97561638 97561821 164 - chr5:97561650-97561788 NA NA NA NA NA chr5-741 97560850 97561045 155 - chr5:97560962-97561037 NA NA NA NA NA chr5-59 9751972 9752482 323 - chr5:9752337-9752384 NA NA NA NA NA chr5-740 97414836 97415004 160 - chr5:97414842-97414998 NA NA NA NA NA chr5-739 97077182 97077332 112 - chr5:97077211-97077304 NA NA NA NA NA chr5-738 97029195 97029431 168 - chr5:97029265-97029364 NA NA NA NA NA chr5-737 97018496 97019014 297 - chr5:97018775-97018926 NA NA NA NA NA chr5-736 96833196 96833481 218 - chr5:96833239-96833360 NA NA NA NA NA chr5-735 96779931 96780326 192 - chr5:96780022-96780054 NA NA NA NA NA chr5-734 96675470 96675704 177 - chr5:96675481-96675624 NA NA NA NA NA chr5-733 96575417 96575565 129 - chr5:96575474-96575565 NA NA NA NA NA chr5-732 96485895 96486290 289 - chr5:96486027-96486104 NA NA NA NA NA chr5-731 96268454 96268780 208 - chr5:96268458-96268607 NA NA NA NA NA chr5-730 96142592 96142808 149 - chr5:96142675-96142738 NA NA NA NA NA chr5-729 95515933 95516195 163 - chr5:95516036-95516098 NA NA NA NA NA chr5-728 95491179 95491431 219 - chr5:95491192-95491388 NA NA NA NA NA chr5-727 95376130 95376510 239 - chr5:95376189-95376337 NA NA NA NA NA chr5-726 94969592 94969876 196 - chr5:94969702-94969854 NA NA NA NA NA chr5-725 94875918 94876117 156 - chr5:94875969-94876078 NA NA NA NA NA chr5-58 9485123 9485295 139 - chr5:9485190-9485279 NA NA NA NA NA chr5-724 94416285 94416474 115 - chr5:94416385-94416452 NA NA NA NA NA chr5-723 94304439 94304719 165 - chr5:94304573-94304642 NA NA NA NA NA chr5-722 94174201 94174458 167 - chr5:94174292-94174370 NA NA NA NA NA chr5-721 94153984 94154215 118 - chr5:94154118-94154144 NA NA NA NA NA chr5-720 93992104 93992345 159 - chr5:93992172-93992256 NA NA NA NA NA chr5-719 93968788 93969004 194 - chr5:93968847-93968997 NA NA NA NA NA chr5-718 93831940 93832223 163 - chr5:93832059-93832101 NA NA NA NA NA chr5-717 93701301 93701495 165 - chr5:93701331-93701468 NA NA NA NA NA chr5-716 93624898 93625166 158 - chr5:93624993-93625026 NA NA NA NA NA chr5-715 93610602 93610969 189 - chr5:93610727-93610849 NA NA NA NA NA chr5-714 93436720 93437027 155 - chr5:93436862-93436868 NA NA NA NA NA chr5-57 9333989 9334150 139 - chr5:9334031-9334131 NA NA NA NA NA chr5-3 931230 931398 127 - chr5:931268-931351 NA NA NA NA NA chr5-713 93123123 93123431 156 - chr5:93123321-93123371 NA NA NA NA NA chr5-712 93053515 93053704 176 - chr5:93053519-93053669 NA NA NA NA NA chr5-711 93005036 93005458 329 - chr5:93005095-93005358 NA NA NA NA NA chr5-710 92883071 92883298 155 - chr5:92883129-92883219 NA NA NA NA NA chr5-709 92857864 92858188 162 - chr5:92857972-92857999 NA NA NA NA NA chr5-708 92747746 92748097 214 - chr5:92747960-92748024 NA NA NA NA NA chr5-707 92603213 92603560 268 - chr5:92603262-92603466 NA NA NA NA NA chr5-706 92536836 92536995 148 - chr5:92536840-92536970 NA NA NA NA NA chr5-705 92531542 92531825 163 - chr5:92531606-92531709 NA NA NA NA NA chr5-704 92518283 92518606 168 - chr5:92518406-92518435 NA NA NA NA NA chr5-703 92333817 92334166 197 - chr5:92334014-92334104 NA NA NA NA NA chr5-702 92261075 92261572 305 - chr5:92261413-92261528 NA NA NA NA NA chr5-701 92203005 92203387 184 - chr5:92203101-92203138 NA NA NA NA NA chr5-700 92136212 92136412 141 - chr5:92136311-92136373 NA NA NA NA NA chr5-699 92069210 92069483 237 - chr5:92069210-92069375 NA NA NA NA NA chr5-56 9203468 9203645 159 - chr5:9203474-9203621 NA NA NA NA NA chr5-698 91943599 91943781 151 - chr5:91943629-91943748 NA NA NA NA NA chr5-697 91888661 91888833 156 - chr5:91888679-91888827 NA NA NA NA NA chr5-696 91828358 91828586 168 - chr5:91828410-91828522 NA NA NA NA NA chr5-695 91807556 91808003 274 - chr5:91807865-91807898 NA NA NA NA NA chr5-694 91659385 91659657 152 - chr5:91659501-91659535 NA NA NA NA NA chr5-693 91104135 91104608 265 - chr5:91104135-91104296 NA NA NA NA NA chr5-692 90988269 90988711 315 - chr5:90988401-90988619 NA NA NA NA NA chr5-691 90960698 90960850 138 - chr5:90960723-90960833 NA NA NA NA NA chr5-690 90629552 90629913 198 - chr5:90629611-90629698 NA NA NA NA NA chr5-689 90555973 90556184 148 - chr5:90556042-90556124 NA NA NA NA NA chr5-688 90487914 90488275 215 - chr5:90488092-90488193 NA NA NA NA NA chr5-687 90426563 90426779 149 - chr5:90426634-90426720 NA NA NA NA NA chr5-686 89766326 89766499 161 - chr5:89766326-89766481 NA NA NA NA NA chr5-685 89729270 89729454 147 - chr5:89729300-89729403 NA NA NA NA NA chr5-684 89707613 89707917 211 - chr5:89707676-89707816 NA NA NA NA NA chr5-683 89517438 89517831 272 - chr5:89517530-89517652 NA NA NA NA NA chr5-682 89393766 89393947 128 - chr5:89393865-89393917 NA NA NA NA NA chr5-681 89333940 89334130 144 - chr5:89334000-89334112 NA NA NA NA NA chr5-680 89269185 89269543 162 - chr5:89269467-89269519 NA NA NA NA NA chr5-55 8886761 8887032 163 - chr5:8886897-8886938 NA NA NA NA NA chr5-679 88868737 88868932 159 - chr5:88868784-88868918 NA NA NA NA NA chr5-678 88849748 88849947 175 - chr5:88849765-88849909 NA NA NA NA NA chr5-677 88643231 88643566 212 - chr5:88643276-88643439 NA NA NA NA NA chr5-676 88540465 88540742 148 - chr5:88540566-88540599 NA NA NA NA NA chr5-675 88339176 88339353 165 - chr5:88339198-88339339 NA NA NA NA NA chr5-674 88184563 88184862 240 - chr5:88184571-88184693 NA NA NA NA NA chr5-673 87968699 87968905 146 - chr5:87968759-87968845 NA NA NA NA NA chr5-672 87674377 87674634 127 - chr5:87674529-87674548 NA NA NA NA NA chr5-671 87546444 87546648 142 - chr5:87546512-87546589 NA NA NA NA NA chr5-670 87528076 87528316 218 - chr5:87528117-87528291 NA NA NA NA NA chr5-669 87524573 87524742 150 - chr5:87524588-87524715 NA NA NA NA NA chr5-668 87385675 87385917 119 - chr5:87385779-87385795 NA NA NA NA NA chr5-667 87239202 87239379 164 - chr5:87239207-87239350 NA NA NA NA NA chr5-666 87191146 87191452 196 - chr5:87191198-87191313 NA NA NA NA NA chr5-54 8689745 8689937 158 - chr5:8689778-8689901 NA NA NA NA NA chr5-665 86559178 86559656 278 - chr5:86559460-86559638 NA NA NA NA NA chr5-664 86428874 86429132 154 - chr5:86428974-86429026 NA NA NA NA NA chr5-663 86400693 86401232 282 - chr5:86400986-86400998 NA NA NA NA NA chr5-662 86191316 86191724 209 - chr5:86191456-86191521 NA NA NA NA NA chr5-661 86166374 86167283 496 - chr5:86166563-86166697 NA NA NA NA NA chr5-53 8610745 8611024 193 - chr5:8610816-8610966 NA NA NA NA NA chr5-660 85869482 85869780 197 - chr5:85869635-85869705 NA NA NA NA NA chr5-659 85783786 85784011 172 - chr5:85783883-85783949 NA NA NA NA NA chr5-52 8572191 8572389 154 - chr5:8572237-8572346 NA NA NA NA NA chr5-658 85673269 85673501 155 - chr5:85673339-85673410 NA NA NA NA NA chr5-657 85615431 85615677 184 - chr5:85615516-85615669 NA NA NA NA NA chr5-656 85369005 85369302 253 - chr5:85369009-85369178 NA NA NA NA NA chr5-655 85331943 85332206 145 - chr5:85332079-85332097 NA NA NA NA NA chr5-654 85322052 85322391 164 - chr5:85322311-85322384 NA NA NA NA NA chr5-653 85297004 85297152 130 - chr5:85297022-85297116 NA NA NA NA NA chr5-652 84883709 84884001 138 - chr5:84883926-84883987 NA NA NA NA NA chr5-651 84444739 84445064 160 - chr5:84444886-84444890 NA NA NA NA NA chr5-650 84283402 84283679 205 - chr5:84283509-84283570 NA NA NA NA NA chr5-649 83994376 83994805 227 - chr5:83994637-83994763 NA NA NA NA NA chr5-648 83730969 83731385 273 - chr5:83730983-83731177 NA NA NA NA NA chr5-647 83649221 83649409 159 - chr5:83649263-83649406 NA NA NA NA NA chr5-646 83539280 83539484 136 - chr5:83539336-83539392 NA NA NA NA NA chr5-645 83477316 83477592 212 - chr5:83477430-83477553 NA NA NA NA NA chr5-51 8335895 8336279 245 - chr5:8335983-8336038 NA NA NA NA NA chr5-644 83227888 83228145 166 - chr5:83227923-83228026 NA NA NA NA NA chr5-643 83205990 83206137 146 - chr5:83205993-83206137 NA NA NA NA NA chr5-50 8311919 8312168 154 - chr5:8312016-8312144 NA NA NA NA NA chr5-642 83066352 83066583 164 - chr5:83066429-83066521 NA NA NA NA NA chr5-641 83059335 83059593 144 - chr5:83059407-83059458 NA NA NA NA NA chr5-640 82902316 82902473 126 - chr5:82902399-82902468 NA NA NA NA NA chr5-639 82682802 82683038 158 - chr5:82682884-82682968 NA NA NA NA NA chr5-638 82608459 82608618 157 - chr5:82608462-82608618 NA NA NA NA NA chr5-637 82480256 82480616 236 - chr5:82480277-82480451 NA NA NA NA NA chr5-636 82182220 82182380 136 - chr5:82182247-82182362 NA NA NA NA NA chr5-635 82076358 82076648 162 - chr5:82076476-82076515 NA NA NA NA NA chr5-634 82056627 82057017 218 - chr5:82056843-82056933 NA NA NA NA NA chr5-633 81779363 81779612 146 - chr5:81779462-81779507 NA NA NA NA NA chr5-632 81639652 81639938 164 - chr5:81639804-81639831 NA NA NA NA NA chr5-631 81608507 81608730 143 - chr5:81608627-81608670 NA NA NA NA NA chr5-49 8155594 8155868 147 - chr5:8155721-8155741 NA NA NA NA NA chr5-48 8130565 8131016 259 - chr5:8130688-8130851 NA NA NA NA NA chr5-47 8109831 8109993 138 - chr5:8109855-8109969 NA NA NA NA NA chr5-630 81011797 81012147 181 - chr5:81011840-81011982 NA NA NA NA NA chr5-629 80870215 80870440 166 - chr5:80870275-80870383 NA NA NA NA NA chr5-628 80655959 80656260 166 - chr5:80656056-80656106 NA NA NA NA NA chr5-627 80632968 80633182 112 - chr5:80633081-80633102 NA NA NA NA NA chr5-626 80324231 80324464 146 - chr5:80324252-80324318 NA NA NA NA NA chr5-46 8020439 8020692 157 - chr5:8020537-8020600 NA NA NA NA NA chr5-625 80027494 80027716 167 - chr5:80027529-80027651 NA NA NA NA NA chr5-45 7979718 7979987 171 - chr5:7979821-7979899 NA NA NA NA NA chr5-44 7954998 7955356 309 - chr5:7955054-7955321 NA NA NA NA NA chr5-624 79035370 79035657 169 - chr5:79035409-79035519 NA NA NA NA NA chr5-623 78991273 78991575 169 - chr5:78991335-78991426 NA NA NA NA NA chr5-622 78790766 78790994 208 - chr5:78790809-78790977 NA NA NA NA NA chr5-621 78655738 78656115 217 - chr5:78655890-78656027 NA NA NA NA NA chr5-620 78167996 78168157 158 - chr5:78168004-78168156 NA NA NA NA NA chr5-619 77956469 77956770 175 - chr5:77956569-77956681 NA NA NA NA NA chr5-618 77944662 77944839 153 - chr5:77944692-77944818 NA NA NA NA NA chr5-617 77888430 77888780 175 - chr5:77888557-77888581 NA NA NA NA NA chr5-616 77652802 77653072 216 - chr5:77652828-77652962 NA NA NA NA NA chr5-615 77599830 77600153 236 - chr5:77600015-77600115 NA NA NA NA NA chr5-614 76997663 76997987 194 - chr5:76997833-76997937 NA NA NA NA NA chr5-613 76925599 76925843 160 - chr5:76925679-76925757 NA NA NA NA NA chr5-612 76916765 76917226 234 - chr5:76916824-76916915 NA NA NA NA NA chr5-611 76598337 76598664 211 - chr5:76598509-76598576 NA NA NA NA NA chr5-610 76597309 76597659 171 - chr5:76597462-76597467 NA NA NA NA NA chr5-609 76530482 76530757 236 - chr5:76530505-76530663 NA NA NA NA NA chr5-608 76521355 76521700 180 - chr5:76521483-76521634 NA NA NA NA NA chr5-607 76278914 76279218 148 - chr5:76279138-76279208 NA NA NA NA NA chr5-606 76259247 76259644 228 - chr5:76259403-76259559 NA NA NA NA NA chr5-605 76178018 76178323 179 - chr5:76178161-76178231 NA NA NA NA NA chr5-604 76050552 76050701 148 - chr5:76050555-76050701 NA NA NA NA NA chr5-603 76046354 76046579 175 - chr5:76046370-76046512 NA NA NA NA NA chr5-602 76013563 76013858 150 - chr5:76013704-76013711 NA NA NA NA NA chr5-601 76001570 76001841 155 - chr5:76001690-76001727 NA NA NA NA NA chr5-600 75951258 75951611 179 - chr5:75951431-75951435 NA NA NA NA NA chr5-43 7590861 7591111 197 - chr5:7590938-7591070 NA NA NA NA NA chr5-42 7585965 7586121 126 - chr5:7586007-7586073 NA NA NA NA NA chr5-599 75590183 75590427 151 - chr5:75590278-75590338 NA NA NA NA NA chr5-41 7558126 7558401 153 - chr5:7558232-7558271 NA NA NA NA NA chr5-598 75571986 75572341 217 - chr5:75572187-75572329 NA NA NA NA NA chr5-597 75524644 75525086 235 - chr5:75524859-75525040 NA NA NA NA NA chr5-40 7548464 7548803 201 - chr5:7548567-7548717 NA NA NA NA NA chr5-596 75483558 75483999 214 - chr5:75483689-75483724 NA NA NA NA NA chr5-595 75427210 75427527 191 - chr5:75427310-75427388 NA NA NA NA NA chr5-594 75384586 75384891 189 - chr5:75384727-75384858 NA NA NA NA NA chr5-593 75382268 75382487 179 - chr5:75382373-75382472 NA NA NA NA NA chr5-592 75330521 75330723 141 - chr5:75330636-75330689 NA NA NA NA NA chr5-591 75281359 75281989 318 - chr5:75281631-75281834 NA NA NA NA NA chr5-590 75190746 75190890 137 - chr5:75190747-75190880 NA NA NA NA NA chr5-589 74912475 74912627 118 - chr5:74912554-74912604 NA NA NA NA NA chr5-588 74545290 74545642 215 - chr5:74545356-74545363 NA NA NA NA NA chr5-587 74531435 74531830 197 - chr5:74531603-74531611 NA NA NA NA NA chr5-586 74519758 74520122 230 - chr5:74520034-74520059 NA NA NA NA NA chr5-585 74471349 74471539 136 - chr5:74471394-74471467 NA NA NA NA NA chr5-39 7441972 7442283 254 - chr5:7442133-7442273 NA NA NA NA NA chr5-584 74417171 74417653 231 - chr5:74417488-74417534 NA NA NA NA NA chr5-38 7436906 7437105 136 - chr5:7436978-7437060 NA NA NA NA NA chr5-583 73925711 73925904 151 - chr5:73925755-73925863 NA NA NA NA NA chr5-582 73916670 73916852 127 - chr5:73916773-73916821 NA NA NA NA NA chr5-581 73747422 73747588 155 - chr5:73747429-73747575 NA NA NA NA NA chr5-37 7374182 7374637 285 - chr5:7374317-7374517 NA NA NA NA NA chr5-580 73554262 73554435 159 - chr5:73554282-73554424 NA NA NA NA NA chr5-579 73493951 73494118 145 - chr5:73493951-73494052 NA NA NA NA NA chr5-578 73278822 73279135 259 - chr5:73278881-73279032 NA NA NA NA NA chr5-577 73203323 73203693 266 - chr5:73203525-73203638 NA NA NA NA NA chr5-576 73074455 73075095 331 - chr5:73074534-73074689 NA NA NA NA NA chr5-575 72825704 72826018 162 - chr5:72825852-72825858 NA NA NA NA NA chr5-574 72421971 72422178 148 - chr5:72422076-72422142 NA NA NA NA NA chr5-573 72302712 72302980 156 - chr5:72302839-72302874 NA NA NA NA NA chr5-572 72111003 72111304 244 - chr5:72111042-72111172 NA NA NA NA NA chr5-571 72060441 72060596 149 - chr5:72060444-72060584 NA NA NA NA NA chr5-570 72059881 72060250 180 - chr5:72060092-72060105 NA NA NA NA NA chr5-569 71894625 71894826 152 - chr5:71894666-71894773 NA NA NA NA NA chr5-568 69124342 69124504 150 - chr5:69124342-69124486 NA NA NA NA NA chr5-567 69054451 69054746 184 - chr5:69054477-69054527 NA NA NA NA NA chr5-566 68828774 68829027 133 - chr5:68828882-68828883 NA NA NA NA NA chr5-565 68682531 68682724 156 - chr5:68682576-68682703 NA NA NA NA NA chr5-564 68665941 68666233 149 - chr5:68666082-68666089 NA NA NA NA NA chr5-563 68489283 68489553 151 - chr5:68489400-68489430 NA NA NA NA NA chr5-562 68342796 68342970 133 - chr5:68342842-68342893 NA NA NA NA NA chr5-561 68326275 68326427 119 - chr5:68326342-68326411 NA NA NA NA NA chr5-560 68319873 68320158 152 - chr5:68320010-68320027 NA NA NA NA NA chr5-559 68307635 68307993 185 - chr5:68307668-68307750 NA NA NA NA NA chr5-558 68132120 68132443 214 - chr5:68132251-68132419 NA NA NA NA NA chr5-557 68070645 68070994 273 - chr5:68070645-68070766 NA NA NA NA NA chr5-556 67969162 67969508 213 - chr5:67969238-67969369 NA NA NA NA NA chr5-555 67952077 67952379 167 - chr5:67952236-67952292 NA NA NA NA NA chr5-554 67948113 67948309 167 - chr5:67948136-67948277 NA NA NA NA NA chr5-553 67572786 67572950 141 - chr5:67572850-67572945 NA NA NA NA NA chr5-552 67406022 67406184 142 - chr5:67406047-67406174 NA NA NA NA NA chr5-551 67371806 67372159 183 - chr5:67371880-67371941 NA NA NA NA NA chr5-550 67300844 67301095 118 - chr5:67300927-67300937 NA NA NA NA NA chr5-549 67273337 67273692 261 - chr5:67273603-67273684 NA NA NA NA NA chr5-548 67252802 67253277 282 - chr5:67253115-67253144 NA NA NA NA NA chr5-547 67248996 67249264 216 - chr5:67249045-67249157 NA NA NA NA NA chr5-546 67176431 67176698 215 - chr5:67176585-67176697 NA NA NA NA NA chr5-545 67030097 67030349 184 - chr5:67030201-67030299 NA NA NA NA NA chr5-544 66927104 66927457 192 - chr5:66927306-66927379 NA NA NA NA NA chr5-36 6690555 6690734 146 - chr5:6690585-6690695 NA NA NA NA NA chr5-543 66733598 66733815 165 - chr5:66733662-66733769 NA NA NA NA NA chr5-542 66593463 66593770 159 - chr5:66593621-66593642 NA NA NA NA NA chr5-541 66546314 66547053 405 - chr5:66546532-66546619 NA NA NA NA NA chr5-540 66461815 66462049 149 - chr5:66461892-66461960 NA NA NA NA NA chr5-539 66441513 66441723 112 - chr5:66441660-66441723 NA NA NA NA NA chr5-538 66335452 66335664 174 - chr5:66335508-66335635 NA NA NA NA NA chr5-537 66216267 66216468 151 - chr5:66216319-66216445 NA NA NA NA NA chr5-35 6611523 6611770 147 - chr5:6611621-6611669 NA NA NA NA NA chr5-536 66075396 66075729 199 - chr5:66075424-66075542 NA NA NA NA NA chr5-535 65838712 65838944 175 - chr5:65838717-65838861 NA NA NA NA NA chr5-534 65807206 65807577 262 - chr5:65807419-65807520 NA NA NA NA NA chr5-533 65725468 65725703 146 - chr5:65725541-65725606 NA NA NA NA NA chr5-532 65684107 65684431 257 - chr5:65684188-65684335 NA NA NA NA NA chr5-531 65595784 65595971 137 - chr5:65595827-65595907 NA NA NA NA NA chr5-530 65547852 65548105 161 - chr5:65547939-65548003 NA NA NA NA NA chr5-529 65523113 65523327 169 - chr5:65523170-65523288 NA NA NA NA NA chr5-528 65382184 65382444 189 - chr5:65382231-65382325 NA NA NA NA NA chr5-527 65332577 65332931 205 - chr5:65332767-65332864 NA NA NA NA NA chr5-526 65155088 65155293 113 - chr5:65155199-65155239 NA NA NA NA NA chr5-525 64855893 64856253 290 - chr5:64855925-64856075 NA NA NA NA NA chr5-524 64823933 64824217 151 - chr5:64824062-64824082 NA NA NA NA NA chr5-523 64776340 64776552 120 - chr5:64776391-64776465 NA NA NA NA NA chr5-522 64540096 64540432 208 - chr5:64540141-64540285 NA NA NA NA NA chr5-521 64531793 64531954 128 - chr5:64531793-64531855 NA NA NA NA NA chr5-520 64184866 64185246 222 - chr5:64184930-64184979 NA NA NA NA NA chr5-519 64086300 64086616 202 - chr5:64086471-64086616 NA NA NA NA NA chr5-518 63840509 63840669 146 - chr5:63840529-63840667 NA NA NA NA NA chr5-517 63791170 63791553 192 - chr5:63791406-63791452 NA NA NA NA NA chr5-516 63790571 63790762 115 - chr5:63790668-63790728 NA NA NA NA NA chr5-515 63574339 63574487 147 - chr5:63574340-63574486 NA NA NA NA NA chr5-514 63370394 63370689 149 - chr5:63370544-63370551 NA NA NA NA NA chr5-513 63173397 63173578 126 - chr5:63173432-63173513 NA NA NA NA NA chr5-512 63131258 63131836 261 - chr5:63131544-63131546 NA NA NA NA NA chr5-511 63109272 63109686 249 - chr5:63109395-63109437 NA NA NA NA NA chr5-510 62917478 62917651 168 - chr5:62917479-62917644 NA NA NA NA NA chr5-509 62857732 62858098 202 - chr5:62857938-62857955 NA NA NA NA NA chr5-508 62792168 62792366 177 - chr5:62792227-62792364 NA NA NA NA NA chr5-507 62685113 62685405 161 - chr5:62685184-62685221 NA NA NA NA NA chr5-506 62573621 62573997 341 - chr5:62573651-62573922 NA NA NA NA NA chr5-505 62377545 62377869 218 - chr5:62377664-62377829 NA NA NA NA NA chr5-504 61848774 61848934 140 - chr5:61848830-61848930 NA NA NA NA NA chr5-503 61766292 61766729 295 - chr5:61766415-61766620 NA NA NA NA NA chr5-502 61576360 61576737 245 - chr5:61576374-61576553 NA NA NA NA NA chr5-501 61441557 61441906 222 - chr5:61441762-61441818 NA NA NA NA NA chr5-500 61285664 61285849 155 - chr5:61285690-61285817 NA NA NA NA NA chr5-499 61246754 61247084 234 - chr5:61246834-61247020 NA NA NA NA NA chr5-498 61208096 61208254 154 - chr5:61208096-61208242 NA NA NA NA NA chr5-497 61106378 61106564 134 - chr5:61106389-61106430 NA NA NA NA NA chr5-496 61009251 61009552 167 - chr5:61009391-61009421 NA NA NA NA NA chr5-495 60991153 60991367 147 - chr5:60991220-60991300 NA NA NA NA NA chr5-494 60885486 60885726 165 - chr5:60885579-60885660 NA NA NA NA NA chr5-493 60219876 60220063 163 - chr5:60219897-60220033 NA NA NA NA NA chr5-492 60143039 60143459 340 - chr5:60143073-60143356 NA NA NA NA NA chr5-491 60054901 60055303 328 - chr5:60054949-60055177 NA NA NA NA NA chr5-490 59936502 59936952 325 - chr5:59936789-59936908 NA NA NA NA NA chr5-489 59901456 59901651 126 - chr5:59901503-59901538 NA NA NA NA NA chr5-488 59526202 59526423 184 - chr5:59526251-59526392 NA NA NA NA NA chr5-487 59512733 59512928 139 - chr5:59512817-59512886 NA NA NA NA NA chr5-486 59198556 59198761 164 - chr5:59198600-59198726 NA NA NA NA NA chr5-485 59088630 59088874 139 - chr5:59088719-59088761 NA NA NA NA NA chr5-484 59083101 59083257 130 - chr5:59083114-59083192 NA NA NA NA NA chr5-483 58975604 58975852 144 - chr5:58975715-58975754 NA NA NA NA NA chr5-482 58878248 58878390 114 - chr5:58878288-58878368 NA NA NA NA NA chr5-481 58710792 58710984 120 - chr5:58710873-58710957 NA NA NA NA NA chr5-480 58619060 58619241 151 - chr5:58619088-58619207 NA NA NA NA NA chr5-479 58532880 58533241 202 - chr5:58533081-58533166 NA NA NA NA NA chr5-478 58392684 58392937 221 - chr5:58392756-58392925 NA NA NA NA NA chr5-477 58368338 58368538 158 - chr5:58368370-58368491 NA NA NA NA NA chr5-476 58366710 58366970 144 - chr5:58366854-58366910 NA NA NA NA NA chr5-475 58270971 58271310 280 - chr5:58270998-58271235 NA NA NA NA NA chr5-474 58125601 58125743 115 - chr5:58125658-58125719 NA NA NA NA NA chr5-473 58016254 58016609 230 - chr5:58016477-58016533 NA NA NA NA NA chr5-472 57855387 57855651 151 - chr5:57855497-57855532 NA NA NA NA NA chr5-471 57764210 57764472 147 - chr5:57764323-57764356 NA NA NA NA NA chr5-470 57746046 57746380 203 - chr5:57746093-57746207 NA NA NA NA NA chr5-469 57373847 57373995 136 - chr5:57373855-57373985 NA NA NA NA NA chr5-468 57138042 57138496 298 - chr5:57138093-57138217 NA NA NA NA NA chr5-467 56850615 56850887 162 - chr5:56850734-56850795 NA NA NA NA NA chr5-466 56830443 56830785 150 - chr5:56830686-56830740 NA NA NA NA NA chr5-465 56822261 56822444 151 - chr5:56822285-56822408 NA NA NA NA NA chr5-464 56758865 56759097 161 - chr5:56758940-56759034 NA NA NA NA NA chr5-463 56583119 56583412 187 - chr5:56583266-56583388 NA NA NA NA NA chr5-34 5627071 5627570 251 - chr5:5627117-5627221 NA NA NA NA NA chr5-462 56253068 56253337 146 - chr5:56253189-56253213 NA NA NA NA NA chr5-33 5624553 5624763 118 - chr5:5624602-5624674 NA NA NA NA NA chr5-461 56148223 56148514 154 - chr5:56148365-56148387 NA NA NA NA NA chr5-460 56093347 56093531 134 - chr5:56093441-56093503 NA NA NA NA NA chr5-459 56063070 56063272 153 - chr5:56063126-56063237 NA NA NA NA NA chr5-32 5599046 5599197 115 - chr5:5599091-5599134 NA NA NA NA NA chr5-458 55895771 55895965 125 - chr5:55895796-55895874 NA NA NA NA NA chr5-457 55569449 55569728 177 - chr5:55569552-55569628 NA NA NA NA NA chr5-456 55437926 55438081 147 - chr5:55437930-55438065 NA NA NA NA NA chr5-455 55432847 55433262 228 - chr5:55432989-55432996 NA NA NA NA NA chr5-454 55409781 55410336 248 - chr5:55409901-55409942 NA NA NA NA NA chr5-453 55262516 55262754 146 - chr5:55262602-55262659 NA NA NA NA NA chr5-452 54792307 54792718 215 - chr5:54792552-54792611 NA NA NA NA NA chr5-451 54659518 54659915 247 - chr5:54659732-54659893 NA NA NA NA NA chr5-450 54558594 54558941 279 - chr5:54558598-54558741 NA NA NA NA NA chr5-449 54415754 54415980 148 - chr5:54415834-54415906 NA NA NA NA NA chr5-448 54240918 54241197 148 - chr5:54241055-54241069 NA NA NA NA NA chr5-447 54108998 54109316 199 - chr5:54109171-54109254 NA NA NA NA NA chr5-446 54053363 54053682 220 - chr5:54053542-54053623 NA NA NA NA NA chr5-445 54025632 54025884 147 - chr5:54025779-54025863 NA NA NA NA NA chr5-444 54002790 54003271 339 - chr5:54002843-54002951 NA NA NA NA NA chr5-443 53970985 53971176 161 - chr5:53971025-53971166 NA NA NA NA NA chr5-442 53955489 53955881 230 - chr5:53955614-53955763 NA NA NA NA NA chr5-441 53534636 53534897 207 - chr5:53534739-53534871 NA NA NA NA NA chr5-440 53363256 53363571 157 - chr5:53363421-53363427 NA NA NA NA NA chr5-439 53330261 53330465 168 - chr5:53330301-53330431 NA NA NA NA NA chr5-31 5328930 5329176 158 - chr5:5329006-5329064 NA NA NA NA NA chr5-438 53107078 53107426 198 - chr5:53107272-53107298 NA NA NA NA NA chr5-437 53104392 53104729 186 - chr5:53104581-53104597 NA NA NA NA NA chr5-436 53096530 53096874 278 - chr5:53096573-53096719 NA NA NA NA NA chr5-435 53047727 53048141 190 - chr5:53047870-53048005 NA NA NA NA NA chr5-434 52870084 52870327 159 - chr5:52870165-52870237 NA NA NA NA NA chr5-433 52843940 52844086 145 - chr5:52843943-52844086 NA NA NA NA NA chr5-30 5260523 5260759 118 - chr5:5260653-5260665 NA NA NA NA NA chr5-29 5244185 5244617 217 - chr5:5244370-5244379 NA NA NA NA NA chr5-432 52276194 52276441 158 - chr5:52276280-52276346 NA NA NA NA NA chr5-431 52130604 52130785 151 - chr5:52130632-52130754 NA NA NA NA NA chr5-430 52053535 52053685 124 - chr5:52053551-52053623 NA NA NA NA NA chr5-429 52026028 52026484 253 - chr5:52026249-52026317 NA NA NA NA NA chr5-428 51982956 51983157 119 - chr5:51983060-51983119 NA NA NA NA NA chr5-427 51966757 51966919 124 - chr5:51966759-51966864 NA NA NA NA NA chr5-426 51838157 51838368 153 - chr5:51838215-51838310 NA NA NA NA NA chr5-425 51777333 51777516 149 - chr5:51777383-51777490 NA NA NA NA NA chr5-424 51684147 51684352 129 - chr5:51684283-51684306 NA NA NA NA NA chr5-423 51526199 51526605 201 - chr5:51526455-51526456 NA NA NA NA NA chr5-422 51153986 51154368 180 - chr5:51154026-51154085 NA NA NA NA NA chr5-421 51149959 51150262 187 - chr5:51150023-51150113 NA NA NA NA NA chr5-420 51144061 51144405 216 - chr5:51144195-51144223 NA NA NA NA NA chr5-28 5102536 5102872 180 - chr5:5102607-5102709 NA NA NA NA NA chr5-419 50961737 50962021 153 - chr5:50961872-50961898 NA NA NA NA NA chr5-418 50887499 50887730 194 - chr5:50887527-50887675 NA NA NA NA NA chr5-417 50791126 50791420 228 - chr5:50791158-50791337 NA NA NA NA NA chr5-416 50263901 50264131 168 - chr5:50263981-50264105 NA NA NA NA NA chr5-2 499820 499993 153 - chr5:499831-499974 NA NA NA NA NA chr5-27 4996719 4996881 149 - chr5:4996733-4996870 NA NA NA NA NA chr5-26 4971669 4971978 159 - chr5:4971799-4971818 NA NA NA NA NA chr5-25 4951447 4951671 137 - chr5:4951557-4951595 NA NA NA NA NA chr5-24 4934320 4934543 152 - chr5:4934387-4934470 NA NA NA NA NA chr5-23 4881663 4881877 192 - chr5:4881711-4881859 NA NA NA NA NA chr5-22 4690847 4691266 194 - chr5:4691115-4691127 NA NA NA NA NA chr5-415 46383045 46383390 231 - chr5:46383128-46383214 NA NA NA NA NA chr5 463144 463574 199 - chr5:463289-463300 NA NA NA NA NA chr5-414 46103137 46103556 226 - chr5:46103232-46103314 NA NA NA NA NA chr5-413 46010688 46010938 164 - chr5:46010776-46010856 NA NA NA NA NA chr5-412 45898139 45898311 139 - chr5:45898164-45898274 NA NA NA NA NA chr5-411 45865875 45866262 192 - chr5:45866034-45866049 NA NA NA NA NA chr5-410 45793166 45793353 117 - chr5:45793257-45793325 NA NA NA NA NA chr5-409 45665534 45665936 235 - chr5:45665603-45665686 NA NA NA NA NA chr5-21 4510535 4510828 255 - chr5:4510558-4510737 NA NA NA NA NA chr5-20 4510173 4510425 154 - chr5:4510261-4510322 NA NA NA NA NA chr5-408 44832874 44833199 157 - chr5:44833055-44833128 NA NA NA NA NA chr5-407 44818970 44819144 142 - chr5:44819017-44819143 NA NA NA NA NA chr5-19 4479223 4479401 157 - chr5:4479258-4479387 NA NA NA NA NA chr5-406 44765325 44765812 292 - chr5:44765508-44765593 NA NA NA NA NA chr5-18 4475109 4475274 154 - chr5:4475116-4475255 NA NA NA NA NA chr5-405 44486697 44487032 235 - chr5:44486778-44486963 NA NA NA NA NA chr5-404 44472096 44472313 112 - chr5:44472131-44472173 NA NA NA NA NA chr5-403 44052233 44052564 206 - chr5:44052323-44052488 NA NA NA NA NA chr5-17 4358633 4358784 118 - chr5:4358721-4358773 NA NA NA NA NA chr5-402 43572959 43573307 230 - chr5:43573035-43573105 NA NA NA NA NA chr5-401 43528630 43528879 167 - chr5:43528706-43528791 NA NA NA NA NA chr5-400 43479346 43479584 199 - chr5:43479347-43479469 NA NA NA NA NA chr5-399 43348245 43348390 140 - chr5:43348260-43348390 NA NA NA NA NA chr5-398 43339987 43340159 142 - chr5:43340029-43340135 NA NA NA NA NA chr5-397 43080874 43081127 148 - chr5:43080979-43081022 NA NA NA NA NA chr5-396 42799298 42799572 193 - chr5:42799334-42799446 NA NA NA NA NA chr5-395 42769755 42769931 150 - chr5:42769773-42769901 NA NA NA NA NA chr5-394 42441156 42441448 184 - chr5:42441260-42441338 NA NA NA NA NA chr5-393 42244833 42245015 152 - chr5:42244862-42244983 NA NA NA NA NA chr5-392 42232607 42233221 423 - chr5:42232609-42232954 NA NA NA NA NA chr5-391 42192062 42192221 146 - chr5:42192076-42192210 NA NA NA NA NA chr5-390 41962903 41963300 237 - chr5:41963131-41963174 NA NA NA NA NA chr5-389 41910076 41910471 254 - chr5:41910262-41910411 NA NA NA NA NA chr5-388 41882335 41882735 326 - chr5:41882394-41882631 NA NA NA NA NA chr5-387 41795722 41796093 163 - chr5:41795942-41795965 NA NA NA NA NA chr5-386 41578304 41578628 257 - chr5:41578477-41578614 NA NA NA NA NA chr5-385 41564073 41564469 238 - chr5:41564073-41564232 NA NA NA NA NA chr5-384 41512338 41512656 262 - chr5:41512380-41512530 NA NA NA NA NA chr5-383 41441404 41441868 226 - chr5:41441711-41441768 NA NA NA NA NA chr5-382 41401976 41402377 184 - chr5:41402037-41402082 NA NA NA NA NA chr5-381 41326376 41326605 154 - chr5:41326459-41326534 NA NA NA NA NA chr5-380 41312131 41312673 244 - chr5:41312263-41312292 NA NA NA NA NA chr5-379 41279371 41279687 200 - chr5:41279483-41279625 NA NA NA NA NA chr5-378 41123010 41123197 166 - chr5:41123041-41123181 NA NA NA NA NA chr5-377 41098279 41098535 164 - chr5:41098365-41098440 NA NA NA NA NA chr5-376 41085225 41085437 151 - chr5:41085287-41085378 NA NA NA NA NA chr5-375 41068243 41068576 194 - chr5:41068414-41068453 NA NA NA NA NA chr5-374 40965147 40965358 167 - chr5:40965159-40965304 NA NA NA NA NA chr5-373 40844187 40844458 184 - chr5:40844264-40844366 NA NA NA NA NA chr5-372 40754466 40754779 262 - chr5:40754519-40754679 NA NA NA NA NA chr5-371 40683563 40683807 146 - chr5:40683653-40683705 NA NA NA NA NA chr5-370 40631390 40631694 155 - chr5:40631543-40631547 NA NA NA NA NA chr5-369 40457877 40458064 130 - chr5:40457919-40457977 NA NA NA NA NA chr5-368 40352505 40352808 161 - chr5:40352648-40352668 NA NA NA NA NA chr5-367 40322748 40322999 159 - chr5:40322844-40322909 NA NA NA NA NA chr5-366 40134153 40134318 149 - chr5:40134190-40134307 NA NA NA NA NA chr5-365 40122616 40122800 148 - chr5:40122648-40122756 NA NA NA NA NA chr5-364 40056744 40057011 206 - chr5:40056891-40056993 NA NA NA NA NA chr5-363 40020682 40021087 266 - chr5:40020755-40020962 NA NA NA NA NA chr5-362 39878651 39878868 172 - chr5:39878687-39878818 NA NA NA NA NA chr5-361 39689551 39689784 164 - chr5:39689615-39689705 NA NA NA NA NA chr5-360 39494168 39494382 131 - chr5:39494319-39494333 NA NA NA NA NA chr5-359 39491280 39491447 149 - chr5:39491332-39491446 NA NA NA NA NA chr5-358 39408412 39408611 152 - chr5:39408463-39408572 NA NA NA NA NA chr5-357 39378899 39379078 112 - chr5:39378926-39378931 NA NA NA NA NA chr5-356 39289561 39289739 164 - chr5:39289589-39289725 NA NA NA NA NA chr5-355 39040975 39041211 112 - chr5:39041167-39041202 NA NA NA NA NA chr5-354 38947589 38947896 201 - chr5:38947723-38947871 NA NA NA NA NA chr5-353 38934495 38934765 188 - chr5:38934525-38934672 NA NA NA NA NA chr5-352 38901286 38901599 252 - chr5:38901447-38901588 NA NA NA NA NA chr5-351 38696325 38696637 180 - chr5:38696429-38696491 NA NA NA NA NA chr5-350 38687025 38687171 144 - chr5:38687030-38687170 NA NA NA NA NA chr5-349 38510160 38510326 138 - chr5:38510164-38510264 NA NA NA NA NA chr5-348 38437315 38437561 164 - chr5:38437392-38437469 NA NA NA NA NA chr5-347 38164558 38164791 131 - chr5:38164669-38164707 NA NA NA NA NA chr5-346 37976773 37977170 200 - chr5:37976981-37976995 NA NA NA NA NA chr5-345 37774154 37774436 193 - chr5:37774159-37774305 NA NA NA NA NA chr5-344 37598487 37598784 176 - chr5:37598651-37598749 NA NA NA NA NA chr5-343 37535405 37535731 256 - chr5:37535613-37535729 NA NA NA NA NA chr5-342 37513471 37513651 116 - chr5:37513506-37513529 NA NA NA NA NA chr5-341 37421827 37422040 161 - chr5:37421847-37421972 NA NA NA NA NA chr5-16 3734294 3734531 197 - chr5:3734334-3734491 NA NA NA NA NA chr5-340 37245850 37246053 136 - chr5:37245939-37245997 NA NA NA NA NA chr5-339 37162537 37162686 146 - chr5:37162537-37162677 NA NA NA NA NA chr5-338 37076989 37077262 163 - chr5:37077093-37077149 NA NA NA NA NA chr5-337 37011026 37011198 142 - chr5:37011058-37011185 NA NA NA NA NA chr5-336 37008245 37008606 173 - chr5:37008474-37008500 NA NA NA NA NA chr5-335 36987954 36988152 179 - chr5:36987959-36988105 NA NA NA NA NA chr5-334 36961407 36961579 160 - chr5:36961427-36961571 NA NA NA NA NA chr5-333 36949635 36949810 167 - chr5:36949648-36949799 NA NA NA NA NA chr5-332 36847968 36848150 151 - chr5:36847997-36848118 NA NA NA NA NA chr5-15 3682347 3682612 199 - chr5:3682394-3682560 NA NA NA NA NA chr5-331 36639837 36640330 223 - chr5:36640182-36640210 NA NA NA NA NA chr5-330 36626937 36627266 169 - chr5:36627106-36627196 NA NA NA NA NA chr5-329 36619754 36620052 154 - chr5:36619897-36619906 NA NA NA NA NA chr5-328 36603578 36603836 132 - chr5:36603690-36603759 NA NA NA NA NA chr5-327 36555610 36555808 130 - chr5:36555652-36555688 NA NA NA NA NA chr5-326 36534678 36535121 231 - chr5:36534786-36534833 NA NA NA NA NA chr5-325 36477102 36477383 145 - chr5:36477226-36477241 NA NA NA NA NA chr5-324 36388947 36389138 166 - chr5:36388970-36389112 NA NA NA NA NA chr5-323 36328366 36328627 153 - chr5:36328477-36328525 NA NA NA NA NA chr5-322 36320451 36320681 172 - chr5:36320537-36320680 NA NA NA NA NA chr5-321 36238656 36238968 154 - chr5:36238794-36238800 NA NA NA NA NA chr5-320 36233085 36233408 180 - chr5:36233215-36233239 NA NA NA NA NA chr5-319 36192124 36192377 151 - chr5:36192224-36192271 NA NA NA NA NA chr5-318 36190852 36191043 140 - chr5:36190899-36190984 NA NA NA NA NA chr5-317 36092946 36093099 140 - chr5:36092965-36093098 NA NA NA NA NA chr5-316 35990726 35991379 295 - chr5:35991222-35991297 NA NA NA NA NA chr5-315 35936532 35936927 229 - chr5:35936808-35936821 NA NA NA NA NA chr5-14 3589123 3589293 150 - chr5:3589141-3589269 NA NA NA NA NA chr5-314 35812638 35812898 136 - chr5:35812696-35812734 NA NA NA NA NA chr5-313 35702499 35702692 148 - chr5:35702555-35702669 NA NA NA NA NA chr5-312 35684332 35684648 211 - chr5:35684456-35684532 NA NA NA NA NA chr5-311 35625991 35626441 224 - chr5:35626012-35626123 NA NA NA NA NA chr5-310 35615105 35615359 189 - chr5:35615118-35615268 NA NA NA NA NA chr5-309 35555822 35556058 131 - chr5:35555940-35555979 NA NA NA NA NA chr5-13 3550721 3550940 176 - chr5:3550783-3550935 NA NA NA NA NA chr5-308 35485612 35486122 268 - chr5:35485656-35485781 NA NA NA NA NA chr5-307 35383392 35383605 142 - chr5:35383459-35383526 NA NA NA NA NA chr5-306 35046877 35047093 170 - chr5:35046920-35047041 NA NA NA NA NA chr5-305 35032332 35032540 160 - chr5:35032386-35032495 NA NA NA NA NA chr5-304 35011010 35011268 180 - chr5:35011116-35011204 NA NA NA NA NA chr5-303 34999654 35000206 306 - chr5:34999928-35000007 NA NA NA NA NA chr5-302 34928821 34929131 174 - chr5:34928909-34928971 NA NA NA NA NA chr5-301 34813884 34814082 170 - chr5:34813906-34814062 NA NA NA NA NA chr5-300 34804575 34804844 190 - chr5:34804636-34804756 NA NA NA NA NA chr5-299 34736863 34737160 197 - chr5:34736869-34737013 NA NA NA NA NA chr5-298 34558149 34558330 171 - chr5:34558173-34558324 NA NA NA NA NA chr5-297 34556697 34556910 160 - chr5:34556754-34556850 NA NA NA NA NA chr5-296 33716077 33716402 293 - chr5:33716110-33716372 NA NA NA NA NA chr5-295 33634134 33634496 248 - chr5:33634338-33634358 NA NA NA NA NA chr5-294 33525417 33525931 314 - chr5:33525725-33525847 NA NA NA NA NA chr5-293 33295735 33296146 307 - chr5:33295743-33296053 NA NA NA NA NA chr5-292 33281282 33281533 127 - chr5:33281376-33281394 NA NA NA NA NA chr5-291 33195132 33195431 250 - chr5:33195169-33195321 NA NA NA NA NA chr5-290 33047284 33047463 133 - chr5:33047303-33047413 NA NA NA NA NA chr5-289 33012865 33013134 158 - chr5:33012963-33012997 NA NA NA NA NA chr5-288 32874929 32875206 178 - chr5:32875006-32875096 NA NA NA NA NA chr5-287 32849219 32849396 154 - chr5:32849258-32849381 NA NA NA NA NA chr5-286 32812323 32812580 152 - chr5:32812426-32812471 NA NA NA NA NA chr5-285 32665597 32665741 133 - chr5:32665624-32665735 NA NA NA NA NA chr5-284 32618057 32618391 250 - chr5:32618103-32618311 NA NA NA NA NA chr5-283 32610694 32611083 243 - chr5:32610883-32611023 NA NA NA NA NA chr5-282 32583370 32583554 178 - chr5:32583373-32583548 NA NA NA NA NA chr5-281 32577843 32578110 145 - chr5:32577977-32577994 NA NA NA NA NA chr5-280 32575229 32575485 203 - chr5:32575260-32575357 NA NA NA NA NA chr5-279 32386704 32386874 160 - chr5:32386712-32386860 NA NA NA NA NA chr5-278 32243711 32243868 152 - chr5:32243716-32243863 NA NA NA NA NA chr5-277 31841872 31842100 155 - chr5:31841952-31842041 NA NA NA NA NA chr5-276 31827594 31827934 175 - chr5:31827781-31827813 NA NA NA NA NA chr5-275 31806469 31806980 238 - chr5:31806617-31806781 NA NA NA NA NA chr5-274 31746791 31747128 235 - chr5:31746846-31746932 NA NA NA NA NA chr5-273 31601964 31602251 245 - chr5:31602030-31602191 NA NA NA NA NA chr5-272 31549399 31549547 112 - chr5:31549443-31549527 NA NA NA NA NA chr5-271 31445792 31446109 215 - chr5:31445793-31445957 NA NA NA NA NA chr5-270 31421482 31421676 136 - chr5:31421520-31421578 NA NA NA NA NA chr5-269 31414851 31415114 185 - chr5:31414959-31415051 NA NA NA NA NA chr5-268 31291491 31291680 130 - chr5:31291537-31291595 NA NA NA NA NA chr5-267 31200777 31201051 150 - chr5:31200864-31200933 NA NA NA NA NA chr5-266 31015148 31015543 318 - chr5:31015208-31015372 NA NA NA NA NA chr5-265 30955496 30955707 181 - chr5:30955528-30955681 NA NA NA NA NA chr5-12 3087617 3088092 295 - chr5:3087653-3087840 NA NA NA NA NA chr5-264 30611601 30611832 125 - chr5:30611679-30611712 NA NA NA NA NA chr5-263 30579415 30579774 221 - chr5:30579578-30579730 NA NA NA NA NA chr5-262 30530081 30530334 181 - chr5:30530181-30530318 NA NA NA NA NA chr5-261 30343983 30344656 382 - chr5:30343988-30344139 NA NA NA NA NA chr5-260 30291613 30291825 161 - chr5:30291668-30291776 NA NA NA NA NA chr5-259 30209185 30209450 215 - chr5:30209186-30209351 NA NA NA NA NA chr5-11 3012093 3012501 208 - chr5:3012231-3012270 NA NA NA NA NA chr5-258 30086166 30086343 154 - chr5:30086185-30086318 NA NA NA NA NA chr5-257 30028369 30028830 220 - chr5:30028729-30028827 NA NA NA NA NA chr5-256 29675279 29675650 235 - chr5:29675393-29675449 NA NA NA NA NA chr5-255 29630630 29630893 177 - chr5:29630816-29630857 NA NA NA NA NA chr5-254 29596526 29596811 150 - chr5:29596657-29596668 NA NA NA NA NA chr5-253 29579355 29579581 182 - chr5:29579409-29579557 NA NA NA NA NA chr5-252 29464554 29464799 147 - chr5:29464740-29464745 NA NA NA NA NA chr5-251 29459690 29460131 245 - chr5:29459838-29459839 NA NA NA NA NA chr5-250 29354941 29355294 195 - chr5:29355091-29355132 NA NA NA NA NA chr5-249 28879766 28880151 312 - chr5:28879846-28880012 NA NA NA NA NA chr5-248 28719460 28719748 153 - chr5:28719601-28719616 NA NA NA NA NA chr5-247 28666668 28666983 171 - chr5:28666772-28666819 NA NA NA NA NA chr5-246 28529188 28529505 243 - chr5:28529225-28529357 NA NA NA NA NA chr5-245 28468984 28469160 136 - chr5:28469014-28469115 NA NA NA NA NA chr5-244 28437345 28437548 163 - chr5:28437383-28437507 NA NA NA NA NA chr5-243 28410473 28410865 232 - chr5:28410540-28410692 NA NA NA NA NA chr5-242 28361758 28362001 213 - chr5:28361829-28361982 NA NA NA NA NA chr5-241 28334811 28335332 227 - chr5:28334935-28334953 NA NA NA NA NA chr5-240 28285711 28285861 136 - chr5:28285719-28285827 NA NA NA NA NA chr5-239 28195142 28195456 204 - chr5:28195245-28195394 NA NA NA NA NA chr5-238 28168418 28168610 149 - chr5:28168465-28168575 NA NA NA NA NA chr5-237 28158870 28159249 313 - chr5:28158945-28159126 NA NA NA NA NA chr5-236 28089394 28089694 158 - chr5:28089526-28089547 NA NA NA NA NA chr5-235 28007054 28007432 195 - chr5:28007285-28007345 NA NA NA NA NA chr5-234 27942451 27942692 163 - chr5:27942539-27942619 NA NA NA NA NA chr5-233 27924419 27925032 341 - chr5:27924626-27924789 NA NA NA NA NA chr5-232 27894802 27895059 184 - chr5:27894897-27894997 NA NA NA NA NA chr5-231 27882644 27882805 153 - chr5:27882651-27882795 NA NA NA NA NA chr5-230 27843671 27843914 135 - chr5:27843786-27843820 NA NA NA NA NA chr5-229 27733158 27733384 133 - chr5:27733266-27733321 NA NA NA NA NA chr5-228 27713579 27713868 244 - chr5:27713601-27713755 NA NA NA NA NA chr5-227 27711563 27711754 166 - chr5:27711586-27711702 NA NA NA NA NA chr5-226 27709670 27709845 137 - chr5:27709722-27709814 NA NA NA NA NA chr5-225 27660901 27661070 142 - chr5:27660935-27661057 NA NA NA NA NA chr5-224 27610339 27610534 150 - chr5:27610382-27610485 NA NA NA NA NA chr5-223 27578300 27578862 265 - chr5:27578305-27578397 NA NA NA NA NA chr5-222 27468913 27469291 239 - chr5:27469000-27469048 NA NA NA NA NA chr5-10 2746522 2746720 168 - chr5:2746562-2746695 NA NA NA NA NA chr5-9 2738148 2738431 134 - chr5:2738328-2738344 NA NA NA NA NA chr5-221 27268885 27269145 155 - chr5:27269008-27269076 NA NA NA NA NA chr5-220 26933760 26933977 165 - chr5:26933796-26933917 NA NA NA NA NA chr5-219 26878857 26879289 238 - chr5:26878979-26879120 NA NA NA NA NA chr5-218 26782234 26782572 222 - chr5:26782310-26782328 NA NA NA NA NA chr5-217 26746374 26746733 246 - chr5:26746412-26746689 NA NA NA NA NA chr5-8 2666718 2667010 180 - chr5:2666862-2666946 NA NA NA NA NA chr5-216 26638871 26639289 247 - chr5:26639140-26639167 NA NA NA NA NA chr5-215 26626512 26626852 203 - chr5:26626708-26626833 NA NA NA NA NA chr5-7 2658898 2659136 147 - chr5:2659031-2659066 NA NA NA NA NA chr5-214 26582988 26583433 247 - chr5:26583228-26583376 NA NA NA NA NA chr5-213 26535349 26535745 212 - chr5:26535437-26535557 NA NA NA NA NA chr5-212 26499701 26500013 163 - chr5:26499853-26499870 NA NA NA NA NA chr5-211 25968378 25968732 204 - chr5:25968587-25968700 NA NA NA NA NA chr5-210 25927999 25928193 160 - chr5:25928101-25928193 NA NA NA NA NA chr5-209 25906155 25906429 153 - chr5:25906266-25906303 NA NA NA NA NA chr5-208 25879057 25879224 144 - chr5:25879065-25879171 NA NA NA NA NA chr5-207 25737694 25738009 196 - chr5:25737866-25737890 NA NA NA NA NA chr5-206 25714981 25715175 158 - chr5:25714982-25715068 NA NA NA NA NA chr5-205 25639312 25639640 224 - chr5:25639436-25639602 NA NA NA NA NA chr5-204 25487443 25487686 153 - chr5:25487527-25487593 NA NA NA NA NA chr5-203 25433301 25433609 190 - chr5:25433430-25433579 NA NA NA NA NA chr5-202 25298166 25298452 226 - chr5:25298287-25298404 NA NA NA NA NA chr5-201 25290965 25291352 227 - chr5:25291009-25291074 NA NA NA NA NA chr5-200 25266308 25266721 225 - chr5:25266403-25266472 NA NA NA NA NA chr5-199 25235452 25235652 170 - chr5:25235465-25235575 NA NA NA NA NA chr5-198 25183525 25183700 152 - chr5:25183556-25183681 NA NA NA NA NA chr5-197 25106700 25106923 120 - chr5:25106836-25106886 NA NA NA NA NA chr5-196 25029635 25029836 159 - chr5:25029693-25029802 NA NA NA NA NA chr5-195 25005908 25006271 222 - chr5:25006023-25006078 NA NA NA NA NA chr5-194 24998715 24998874 113 - chr5:24998757-24998804 NA NA NA NA NA chr5-193 24952109 24952365 171 - chr5:24952219-24952330 NA NA NA NA NA chr5-6 2488073 2488407 148 - chr5:2488107-2488145 NA NA NA NA NA chr5-192 24845798 24845983 153 - chr5:24845828-24845950 NA NA NA NA NA chr5-191 24535191 24535501 157 - chr5:24535340-24535346 NA NA NA NA NA chr5-190 24471455 24471615 132 - chr5:24471484-24471589 NA NA NA NA NA chr5-189 24429490 24429764 188 - chr5:24429606-24429693 NA NA NA NA NA chr5-188 24159339 24159973 280 - chr5:24159616-24159768 NA NA NA NA NA chr5-187 24084415 24084693 129 - chr5:24084601-24084618 NA NA NA NA NA chr5-186 24063857 24064158 251 - chr5:24063878-24064050 NA NA NA NA NA chr5-185 24002513 24002700 166 - chr5:24002532-24002675 NA NA NA NA NA chr5-184 23948062 23948240 147 - chr5:23948103-23948229 NA NA NA NA NA chr5-183 23920714 23920984 143 - chr5:23920827-23920850 NA NA NA NA NA chr5-182 23916112 23916374 157 - chr5:23916220-23916275 NA NA NA NA NA chr5-181 23845213 23845463 178 - chr5:23845233-23845365 NA NA NA NA NA chr5-180 23753617 23753780 148 - chr5:23753632-23753765 NA NA NA NA NA chr5-179 23670823 23671020 139 - chr5:23670882-23670964 NA NA NA NA NA chr5-178 23622754 23622978 134 - chr5:23622855-23622898 NA NA NA NA NA chr5-177 23584552 23584747 149 - chr5:23584596-23584697 NA NA NA NA NA chr5-176 23469881 23470098 159 - chr5:23469937-23470036 NA NA NA NA NA chr5-175 23454846 23455165 164 - chr5:23455007-23455013 NA NA NA NA NA chr5-174 23403930 23404342 201 - chr5:23404047-23404087 NA NA NA NA NA chr5-5 2334810 2335079 165 - chr5:2334904-2334959 NA NA NA NA NA chr5-173 23332550 23332716 136 - chr5:23332630-23332706 NA NA NA NA NA chr5-172 23313875 23314141 140 - chr5:23314023-23314026 NA NA NA NA NA chr5-171 23080712 23080997 223 - chr5:23080746-23080921 NA NA NA NA NA chr5-170 22965357 22965580 120 - chr5:22965486-22965529 NA NA NA NA NA chr5-169 22849854 22850008 118 - chr5:22849962-22850008 NA NA NA NA NA chr5-168 22827096 22827275 155 - chr5:22827118-22827250 NA NA NA NA NA chr5-167 22521327 22521589 138 - chr5:22521450-22521463 NA NA NA NA NA chr5-166 22503283 22503609 183 - chr5:22503470-22503554 NA NA NA NA NA chr5-165 22350436 22350705 143 - chr5:22350562-22350579 NA NA NA NA NA chr5-164 22251508 22251692 156 - chr5:22251541-22251674 NA NA NA NA NA chr5-163 22240141 22240433 246 - chr5:22240146-22240300 NA NA NA NA NA chr5-162 21714171 21714520 270 - chr5:21714348-21714490 NA NA NA NA NA chr5-161 21596237 21596511 153 - chr5:21596361-21596391 NA NA NA NA NA chr5-160 21122771 21123015 170 - chr5:21122867-21122952 NA NA NA NA NA chr5-159 21045303 21045650 283 - chr5:21045462-21045617 NA NA NA NA NA chr5-158 20582961 20583127 145 - chr5:20582992-20583126 NA NA NA NA NA chr5-157 20574497 20574652 117 - chr5:20574516-20574614 NA NA NA NA NA chr5-156 20512216 20512627 306 - chr5:20512252-20512384 NA NA NA NA NA chr5-155 20490054 20490216 143 - chr5:20490073-20490197 NA NA NA NA NA chr5-154 20383198 20383559 219 - chr5:20383327-20383475 NA NA NA NA NA chr5-153 20367748 20367970 141 - chr5:20367838-20367907 NA NA NA NA NA chr5-152 20363814 20364098 234 - chr5:20363854-20363988 NA NA NA NA NA chr5-151 20185244 20185566 188 - chr5:20185359-20185394 NA NA NA NA NA chr5-150 20155675 20156024 206 - chr5:20155825-20155972 NA NA NA NA NA chr5-149 20071251 20071559 222 - chr5:20071478-20071555 NA NA NA NA NA chr5-148 19985340 19985661 200 - chr5:19985507-19985563 NA NA NA NA NA chr5-147 19932054 19932341 243 - chr5:19932111-19932323 NA NA NA NA NA chr5-146 19886918 19887197 154 - chr5:19887035-19887068 NA NA NA NA NA chr5-145 19746975 19747181 168 - chr5:19747025-19747149 NA NA NA NA NA chr5-144 19518920 19519164 153 - chr5:19519013-19519074 NA NA NA NA NA chr5-143 19475411 19475640 156 - chr5:19475484-19475567 NA NA NA NA NA chr5-142 19456722 19456907 114 - chr5:19456740-19456794 NA NA NA NA NA chr5-141 19443502 19443791 253 - chr5:19443589-19443770 NA NA NA NA NA chr5-140 19159826 19160161 219 - chr5:19159882-19159925 NA NA NA NA NA chr5-139 19099439 19099814 238 - chr5:19099596-19099717 NA NA NA NA NA chr5-138 18903555 18903957 222 - chr5:18903763-18903895 NA NA NA NA NA chr5-137 18898303 18898525 137 - chr5:18898378-18898435 NA NA NA NA NA chr5-136 18870414 18870676 126 - chr5:18870589-18870647 NA NA NA NA NA chr5-135 18791563 18791827 150 - chr5:18791675-18791712 NA NA NA NA NA chr5-134 18777236 18777923 378 - chr5:18777759-18777910 NA NA NA NA NA chr5-133 18696092 18696398 230 - chr5:18696097-18696294 NA NA NA NA NA chr5-132 18612009 18612308 163 - chr5:18612159-18612179 NA NA NA NA NA chr5-131 18602931 18603152 147 - chr5:18603007-18603079 NA NA NA NA NA chr5-130 18592164 18592383 179 - chr5:18592192-18592351 NA NA NA NA NA chr5-129 18544050 18544353 251 - chr5:18544142-18544321 NA NA NA NA NA chr5-128 18425898 18426110 129 - chr5:18425957-18426015 NA NA NA NA NA chr5-127 18395726 18395973 194 - chr5:18395759-18395880 NA NA NA NA NA chr5-126 18318093 18318408 176 - chr5:18318260-18318325 NA NA NA NA NA chr5-125 18117733 18117995 156 - chr5:18117841-18117893 NA NA NA NA NA chr5-1198 180189239 180189679 281 - chr5:180189409-180189542 NA NA NA NA NA chr5-124 18015615 18015908 141 - chr5:18015721-18015733 NA NA NA NA NA chr5-1197 179371567 179371808 193 - chr5:179371605-179371774 NA NA NA NA NA chr5-1196 178619730 178620142 261 - chr5:178619945-178620119 NA NA NA NA NA chr5-123 17799667 17799932 161 - chr5:17799792-17799870 NA NA NA NA NA chr5-1195 177183378 177183620 142 - chr5:177183558-177183560 NA NA NA NA NA chr5-1194 177170393 177170904 236 - chr5:177170752-177170797 NA NA NA NA NA chr5-1193 177030480 177030814 251 - chr5:177030645-177030772 NA NA NA NA NA chr5-1192 176930324 176930561 140 - chr5:176930455-176930481 NA NA NA NA NA chr5-1191 176761415 176761675 168 - chr5:176761476-176761521 NA NA NA NA NA chr5-1190 176445956 176446469 256 - chr5:176446313-176446412 NA NA NA NA NA chr5-1189 175805993 175806156 156 - chr5:175806002-175806153 NA NA NA NA NA chr5-1188 175776375 175776759 305 - chr5:175776588-175776735 NA NA NA NA NA chr5-1187 175654295 175654545 163 - chr5:175654396-175654486 NA NA NA NA NA chr5-1186 175553467 175553760 171 - chr5:175553576-175553612 NA NA NA NA NA chr5-1185 175042613 175043294 342 - chr5:175042673-175042796 NA NA NA NA NA chr5-1184 174781458 174781665 123 - chr5:174781590-174781605 NA NA NA NA NA chr5-1183 174710429 174710697 191 - chr5:174710537-174710624 NA NA NA NA NA chr5-1182 174642817 174643126 238 - chr5:174642872-174643047 NA NA NA NA NA chr5-1181 174243883 174244192 180 - chr5:174244034-174244179 NA NA NA NA NA chr5-1180 174081991 174082311 260 - chr5:174082163-174082303 NA NA NA NA NA chr5-1179 174053347 174053689 266 - chr5:174053547-174053675 NA NA NA NA NA chr5-1178 174042453 174042780 245 - chr5:174042553-174042734 NA NA NA NA NA chr5-1177 174039204 174039387 149 - chr5:174039242-174039361 NA NA NA NA NA chr5-1176 173627439 173627626 167 - chr5:173627465-173627609 NA NA NA NA NA chr5-1175 172922043 172922263 163 - chr5:172922072-172922192 NA NA NA NA NA chr5-1174 172640297 172640486 184 - chr5:172640305-172640479 NA NA NA NA NA chr5-122 17251937 17252238 253 - chr5:17252039-17252196 NA NA NA NA NA chr5-1173 172360688 172360985 207 - chr5:172360688-172360850 NA NA NA NA NA chr5-1172 172223016 172223300 158 - chr5:172223154-172223180 NA NA NA NA NA chr5-1171 172193065 172193376 164 - chr5:172193219-172193243 NA NA NA NA NA chr5-1170 172163419 172163659 146 - chr5:172163505-172163549 NA NA NA NA NA chr5-121 17126999 17127205 131 - chr5:17127076-17127134 NA NA NA NA NA chr5-1169 171229115 171229326 174 - chr5:171229154-171229290 NA NA NA NA NA chr5-1168 171212862 171213013 149 - chr5:171212863-171213008 NA NA NA NA NA chr5-1167 171036509 171036771 184 - chr5:171036557-171036702 NA NA NA NA NA chr5-1166 171034911 171035417 268 - chr5:171035117-171035222 NA NA NA NA NA chr5-120 17094568 17094875 159 - chr5:17094717-17094729 NA NA NA NA NA chr5-1165 170684602 170684846 191 - chr5:170684659-170684801 NA NA NA NA NA chr5-1164 170028930 170029156 180 - chr5:170028990-170029117 NA NA NA NA NA chr5-1163 169818881 169819261 194 - chr5:169818981-169819032 NA NA NA NA NA chr5-1162 169313628 169313962 166 - chr5:169313833-169313868 NA NA NA NA NA chr5-1161 169279729 169279914 124 - chr5:169279804-169279881 NA NA NA NA NA chr5-1160 169179433 169179687 168 - chr5:169179531-169179607 NA NA NA NA NA chr5-1159 168788532 168789024 356 - chr5:168788595-168788903 NA NA NA NA NA chr5-4 1685665 1685895 174 - chr5:1685763-1685825 NA NA NA NA NA chr5-119 16850387 16850721 152 - chr5:16850616-16850633 NA NA NA NA NA chr5-1158 168310926 168311377 192 - chr5:168311264-168311276 NA NA NA NA NA chr5-118 16814110 16814420 230 - chr5:16814127-16814214 NA NA NA NA NA chr5-1157 167983410 167983786 152 - chr5:167983619-167983659 NA NA NA NA NA chr5-117 16772873 16773176 195 - chr5:16772964-16773034 NA NA NA NA NA chr5-1156 167628003 167628162 149 - chr5:167628013-167628152 NA NA NA NA NA chr5-1155 167521833 167522193 202 - chr5:167522036-167522125 NA NA NA NA NA chr5-1154 167510134 167510392 204 - chr5:167510171-167510304 NA NA NA NA NA chr5-1153 167447034 167447234 133 - chr5:167447102-167447169 NA NA NA NA NA chr5-1152 167416022 167416356 208 - chr5:167416022-167416167 NA NA NA NA NA chr5-1151 167318701 167318966 157 - chr5:167318802-167318844 NA NA NA NA NA chr5-1150 167248545 167248986 231 - chr5:167248837-167248940 NA NA NA NA NA chr5-1149 166738252 166738732 258 - chr5:166738582-166738729 NA NA NA NA NA chr5-1148 166620952 166621261 215 - chr5:166621007-166621111 NA NA NA NA NA chr5-1147 165849967 165850138 155 - chr5:165849981-165850118 NA NA NA NA NA chr5-1146 165807759 165807993 133 - chr5:165807860-165807892 NA NA NA NA NA chr5-1145 165536430 165536716 163 - chr5:165536589-165536611 NA NA NA NA NA chr5-1144 165099066 165099359 267 - chr5:165099144-165099359 NA NA NA NA NA chr5-1143 165089734 165090225 313 - chr5:165090047-165090055 NA NA NA NA NA chr5-1142 165085002 165085270 222 - chr5:165085025-165085155 NA NA NA NA NA chr5-1141 165026998 165027210 133 - chr5:165027099-165027142 NA NA NA NA NA chr5-1140 165015693 165015950 130 - chr5:165015831-165015845 NA NA NA NA NA chr5-1139 164973753 164973943 166 - chr5:164973787-164973941 NA NA NA NA NA chr5-1138 164957309 164957803 278 - chr5:164957509-164957665 NA NA NA NA NA chr5-1137 164900319 164900657 211 - chr5:164900491-164900620 NA NA NA NA NA chr5-1136 164815040 164815284 125 - chr5:164815123-164815147 NA NA NA NA NA chr5-1135 164472504 164472736 162 - chr5:164472570-164472664 NA NA NA NA NA chr5-1134 164471841 164472050 121 - chr5:164471961-164472026 NA NA NA NA NA chr5-1133 164166864 164167189 168 - chr5:164166928-164166992 NA NA NA NA NA chr5-1132 164106384 164106593 157 - chr5:164106432-164106533 NA NA NA NA NA chr5-1131 164027776 164028120 192 - chr5:164027969-164028050 NA NA NA NA NA chr5-1130 163881070 163881280 138 - chr5:163881144-163881246 NA NA NA NA NA chr5-1129 163878264 163878630 260 - chr5:163878271-163878319 NA NA NA NA NA chr5-1128 163843275 163843577 168 - chr5:163843444-163843513 NA NA NA NA NA chr5-1127 163652667 163652993 218 - chr5:163652812-163652976 NA NA NA NA NA chr5-1126 163297351 163297524 149 - chr5:163297375-163297500 NA NA NA NA NA chr5-1125 163128401 163128603 143 - chr5:163128464-163128546 NA NA NA NA NA chr5-116 16298419 16298615 149 - chr5:16298467-16298570 NA NA NA NA NA chr5-1124 162201397 162202053 397 - chr5:162201454-162201870 NA NA NA NA NA chr5-1123 161881214 161881392 177 - chr5:161881215-161881391 NA NA NA NA NA chr5-1122 161806939 161807167 209 - chr5:161806994-161807166 NA NA NA NA NA chr5-1121 161729736 161730210 340 - chr5:161729982-161730132 NA NA NA NA NA chr5-1120 161379101 161379404 152 - chr5:161379265-161379274 NA NA NA NA NA chr5-1119 161367681 161368085 227 - chr5:161367722-161367840 NA NA NA NA NA chr5-1118 161229350 161229647 150 - chr5:161229501-161229502 NA NA NA NA NA chr5-1117 161228227 161228521 167 - chr5:161228408-161228421 NA NA NA NA NA chr5-1116 161179896 161180132 155 - chr5:161179971-161180048 NA NA NA NA NA chr5-1115 161136023 161136307 188 - chr5:161136150-161136273 NA NA NA NA NA chr5-1114 160839770 160840134 225 - chr5:160839977-160840029 NA NA NA NA NA chr5-1113 160801040 160801249 148 - chr5:160801107-160801200 NA NA NA NA NA chr5-1112 160743427 160743613 154 - chr5:160743473-160743588 NA NA NA NA NA chr5-1111 160519273 160519715 341 - chr5:160519313-160519608 NA NA NA NA NA chr5-1110 160423284 160423597 193 - chr5:160423356-160423453 NA NA NA NA NA chr5-115 16023685 16023868 123 - chr5:16023688-16023781 NA NA NA NA NA chr5-1109 160042150 160042446 188 - chr5:160042300-160042359 NA NA NA NA NA chr5-1108 159919250 159919613 173 - chr5:159919296-159919351 NA NA NA NA NA chr5-1107 159268885 159269115 202 - chr5:159268938-159269084 NA NA NA NA NA chr5-1106 159246800 159247096 152 - chr5:159246953-159246970 NA NA NA NA NA chr5-1105 159043472 159043643 147 - chr5:159043500-159043627 NA NA NA NA NA chr5-1104 159035662 159035977 166 - chr5:159035805-159035816 NA NA NA NA NA chr5-1103 159031495 159031955 234 - chr5:159031645-159031691 NA NA NA NA NA chr5-1102 158685742 158685920 161 - chr5:158685771-158685909 NA NA NA NA NA chr5-1101 158299825 158300113 163 - chr5:158299949-158299986 NA NA NA NA NA chr5-1100 158221360 158221933 275 - chr5:158221372-158221492 NA NA NA NA NA chr5-1099 158111364 158111898 285 - chr5:158111741-158111859 NA NA NA NA NA chr5-1098 157766063 157766251 153 - chr5:157766095-157766210 NA NA NA NA NA chr5-1097 157497237 157497445 153 - chr5:157497298-157497393 NA NA NA NA NA chr5-1096 157415204 157415390 158 - chr5:157415234-157415363 NA NA NA NA NA chr5-1095 157383679 157383992 159 - chr5:157383838-157383848 NA NA NA NA NA chr5-1094 156889358 156889523 143 - chr5:156889409-156889508 NA NA NA NA NA chr5-114 15656026 15656440 196 - chr5:15656291-15656316 NA NA NA NA NA chr5-1093 156367182 156367489 154 - chr5:156367327-156367332 NA NA NA NA NA chr5-113 15626737 15627156 210 - chr5:15626846-15626894 NA NA NA NA NA chr5-1092 156184525 156184684 112 - chr5:156184580-156184653 NA NA NA NA NA chr5-1091 156173576 156173872 204 - chr5:156173653-156173750 NA NA NA NA NA chr5-1090 155961063 155961316 152 - chr5:155961166-155961216 NA NA NA NA NA chr5-1089 155960025 155960185 116 - chr5:155960031-155960122 NA NA NA NA NA chr5-1088 155797747 155797925 161 - chr5:155797770-155797911 NA NA NA NA NA chr5-1087 155779511 155779721 161 - chr5:155779526-155779655 NA NA NA NA NA chr5-112 15555623 15555767 136 - chr5:15555634-15555766 NA NA NA NA NA chr5-1086 155525392 155525674 237 - chr5:155525403-155525550 NA NA NA NA NA chr5-111 15543627 15543865 148 - chr5:15543714-15543769 NA NA NA NA NA chr5-1085 155358727 155359044 209 - chr5:155358889-155359044 NA NA NA NA NA chr5-1084 155025932 155026417 259 - chr5:155026176-155026322 NA NA NA NA NA chr5-1083 154906581 154906906 211 - chr5:154906734-154906870 NA NA NA NA NA chr5-1082 154754481 154754759 176 - chr5:154754572-154754697 NA NA NA NA NA chr5-1081 154696603 154696782 152 - chr5:154696637-154696769 NA NA NA NA NA chr5-110 15453374 15453641 202 - chr5:15453541-15453627 NA NA NA NA NA chr5-1080 154494298 154494669 206 - chr5:154494493-154494519 NA NA NA NA NA chr5-1079 154006477 154006699 146 - chr5:154006589-154006641 NA NA NA NA NA chr5-1078 153765547 153765742 148 - chr5:153765594-153765695 NA NA NA NA NA chr5-1077 153431994 153432195 151 - chr5:153432044-153432145 NA NA NA NA NA chr5-1076 153230480 153230753 199 - chr5:153230591-153230753 NA NA NA NA NA chr5-109 15321417 15321780 201 - chr5:15321497-15321645 NA NA NA NA NA chr5-1075 152749138 152749383 158 - chr5:152749235-152749301 NA NA NA NA NA chr5-1074 152535717 152536006 206 - chr5:152535846-152535904 NA NA NA NA NA chr5-1073 152336826 152336999 165 - chr5:152336838-152336999 NA NA NA NA NA chr5-1072 152187773 152187964 155 - chr5:152187810-152187930 NA NA NA NA NA chr5-1071 152054464 152054686 127 - chr5:152054559-152054591 NA NA NA NA NA chr5-1070 151810391 151810776 209 - chr5:151810612-151810690 NA NA NA NA NA chr5-1069 151582475 151582659 152 - chr5:151582498-151582609 NA NA NA NA NA chr5-108 15147228 15147586 200 - chr5:15147440-15147458 NA NA NA NA NA chr5-1068 151462095 151462375 155 - chr5:151462228-151462254 NA NA NA NA NA chr5-1067 151282388 151282562 156 - chr5:151282408-151282548 NA NA NA NA NA chr5-1066 151098815 151099304 295 - chr5:151098868-151099066 NA NA NA NA NA chr5-1065 150694454 150694790 165 - chr5:150694521-150694567 NA NA NA NA NA chr5-1064 150426157 150426371 140 - chr5:150426237-150426309 NA NA NA NA NA chr5-107 15039351 15039689 212 - chr5:15039518-15039667 NA NA NA NA NA chr5-1063 150075833 150076185 178 - chr5:150075933-150075974 NA NA NA NA NA chr5-1062 150046287 150046876 299 - chr5:150046616-150046664 NA NA NA NA NA chr5-1061 150011800 150012002 177 - chr5:150011808-150011935 NA NA NA NA NA chr5-1060 150011552 150011742 145 - chr5:150011568-150011639 NA NA NA NA NA chr5-106 14991653 14991930 169 - chr5:14991769-14991826 NA NA NA NA NA chr5-1059 149879914 149880111 184 - chr5:149879927-149880085 NA NA NA NA NA chr5-1058 149734763 149734940 117 - chr5:149734836-149734906 NA NA NA NA NA chr5-1057 149656559 149656954 261 - chr5:149656638-149656710 NA NA NA NA NA chr5-1056 149494880 149495133 153 - chr5:149494974-149495030 NA NA NA NA NA chr5-1055 149135243 149135493 178 - chr5:149135292-149135434 NA NA NA NA NA chr5-1054 149046661 149047055 283 - chr5:149046766-149046967 NA NA NA NA NA chr5-1053 149002030 149002454 199 - chr5:149002159-149002181 NA NA NA NA NA chr5-1052 148819606 148819871 151 - chr5:148819720-148819757 NA NA NA NA NA chr5-1051 148808066 148808327 142 - chr5:148808196-148808230 NA NA NA NA NA chr5-1050 148730112 148730335 159 - chr5:148730168-148730267 NA NA NA NA NA chr5-1049 148666634 148666845 147 - chr5:148666697-148666779 NA NA NA NA NA chr5-1048 148639640 148639809 163 - chr5:148639644-148639799 NA NA NA NA NA chr5-1047 148380027 148380230 170 - chr5:148380049-148380175 NA NA NA NA NA chr5-1046 148354952 148355272 270 - chr5:148355064-148355234 NA NA NA NA NA chr5-105 14826057 14826222 152 - chr5:14826068-14826208 NA NA NA NA NA chr5-1045 148244065 148244374 160 - chr5:148244213-148244223 NA NA NA NA NA chr5-1044 148083633 148083830 154 - chr5:148083675-148083785 NA NA NA NA NA chr5-1043 148077297 148077599 251 - chr5:148077365-148077514 NA NA NA NA NA chr5-1042 147984093 147984358 178 - chr5:147984199-147984309 NA NA NA NA NA chr5-1041 147983344 147983809 235 - chr5:147983654-147983739 NA NA NA NA NA chr5-1040 147949135 147949557 220 - chr5:147949283-147949328 NA NA NA NA NA chr5-1039 147933752 147934139 201 - chr5:147933874-147933900 NA NA NA NA NA chr5-1038 147774844 147775040 140 - chr5:147774868-147774920 NA NA NA NA NA chr5-1037 147286383 147286578 154 - chr5:147286416-147286533 NA NA NA NA NA chr5-1036 147125857 147126027 161 - chr5:147125857-147126000 NA NA NA NA NA chr5-1035 147026677 147026881 148 - chr5:147026736-147026831 NA NA NA NA NA chr5-1034 146976725 146976960 161 - chr5:146976793-146976874 NA NA NA NA NA chr5-104 14691004 14691262 150 - chr5:14691106-14691151 NA NA NA NA NA chr5-1033 146808462 146808647 139 - chr5:146808494-146808573 NA NA NA NA NA chr5-1032 146689403 146689899 234 - chr5:146689750-146689794 NA NA NA NA NA chr5-1031 146517747 146517943 136 - chr5:146517810-146517889 NA NA NA NA NA chr5-1030 145732885 145733337 211 - chr5:145733020-145733043 NA NA NA NA NA chr5-1029 145723125 145723570 289 - chr5:145723259-145723470 NA NA NA NA NA chr5-1028 145658182 145658495 209 - chr5:145658234-145658371 NA NA NA NA NA chr5-1027 145230970 145231215 148 - chr5:145231065-145231114 NA NA NA NA NA chr5-103 14512667 14512830 155 - chr5:14512678-14512828 NA NA NA NA NA chr5-1026 145091932 145092172 167 - chr5:145092016-145092121 NA NA NA NA NA chr5-1025 145028778 145029084 196 - chr5:145028863-145029004 NA NA NA NA NA chr5-1024 145024857 145025108 151 - chr5:145024950-145025000 NA NA NA NA NA chr5-1023 145020463 145020900 234 - chr5:145020699-145020810 NA NA NA NA NA chr5-1022 144870144 144870366 161 - chr5:144870209-144870313 NA NA NA NA NA chr5-102 14478120 14478336 127 - chr5:14478253-14478269 NA NA NA NA NA chr5-1021 144763431 144763687 152 - chr5:144763538-144763589 NA NA NA NA NA chr5-1020 144620078 144620368 242 - chr5:144620213-144620359 NA NA NA NA NA chr5-1019 144618977 144619253 147 - chr5:144619106-144619124 NA NA NA NA NA chr5-1018 144584845 144585049 140 - chr5:144584862-144584970 NA NA NA NA NA chr5-1017 144545534 144545717 166 - chr5:144545545-144545688 NA NA NA NA NA chr5-1016 144493714 144493943 213 - chr5:144493719-144493924 NA NA NA NA NA chr5-101 14442931 14443451 262 - chr5:14442962-14443069 NA NA NA NA NA chr5-100 14430490 14430685 180 - chr5:14430498-14430648 NA NA NA NA NA chr5-1015 144284359 144284529 148 - chr5:144284359-144284496 NA NA NA NA NA chr5-1014 144179334 144179667 204 - chr5:144179589-144179601 NA NA NA NA NA chr5-1013 144027120 144027451 165 - chr5:144027303-144027319 NA NA NA NA NA chr5-1012 143929981 143930411 340 - chr5:143930100-143930260 NA NA NA NA NA chr5-1011 143836854 143837272 194 - chr5:143837123-143837138 NA NA NA NA NA chr5-1010 143597090 143597248 151 - chr5:143597093-143597230 NA NA NA NA NA chr5-1009 143572966 143573345 231 - chr5:143573001-143573158 NA NA NA NA NA chr5-1008 142842875 142843070 149 - chr5:142842920-142843022 NA NA NA NA NA chr5-1007 142322504 142323002 263 - chr5:142322637-142322664 NA NA NA NA NA chr5-1006 142301297 142301625 151 - chr5:142301330-142301376 NA NA NA NA NA chr5-99 14186889 14187093 145 - chr5:14186906-14187013 NA NA NA NA NA chr5-1005 141740609 141740865 173 - chr5:141740678-141740754 NA NA NA NA NA chr5-98 14136305 14136631 207 - chr5:14136472-14136536 NA NA NA NA NA chr5-1004 141285009 141285313 165 - chr5:141285139-141285156 NA NA NA NA NA chr5-1003 141252282 141252471 141 - chr5:141252338-141252439 NA NA NA NA NA chr5-1002 141056167 141056435 198 - chr5:141056263-141056378 NA NA NA NA NA chr5-97 14096638 14097024 252 - chr5:14096877-14096957 NA NA NA NA NA chr5-1001 140914164 140914457 158 - chr5:140914303-140914324 NA NA NA NA NA chr5-1000 140798051 140798443 213 - chr5:140798179-140798227 NA NA NA NA NA chr5-999 140468700 140468867 148 - chr5:140468717-140468844 NA NA NA NA NA chr5-998 140466838 140467139 156 - chr5:140466991-140466998 NA NA NA NA NA chr5-997 140438470 140438894 318 - chr5:140438744-140438872 NA NA NA NA NA chr5-996 140355284 140355538 151 - chr5:140355385-140355434 NA NA NA NA NA chr5-96 14030646 14030880 156 - chr5:14030716-14030786 NA NA NA NA NA chr5-995 140203201 140203423 154 - chr5:140203275-140203358 NA NA NA NA NA chr5-95 13955320 13955613 155 - chr5:13955460-13955476 NA NA NA NA NA chr5-994 139232859 139233127 154 - chr5:139232971-139233068 NA NA NA NA NA chr5-993 139168620 139168831 158 - chr5:139168663-139168773 NA NA NA NA NA chr5-94 13898582 13898792 135 - chr5:13898664-13898731 NA NA NA NA NA chr5-992 138378936 138379179 185 - chr5:138379022-138379177 NA NA NA NA NA chr5-93 13810641 13810955 290 - chr5:13810705-13810951 NA NA NA NA NA chr5-991 138013542 138013759 197 - chr5:138013600-138013757 NA NA NA NA NA chr5-990 137822188 137822384 152 - chr5:137822230-137822336 NA NA NA NA NA chr5-92 13780786 13781037 155 - chr5:13780966-13780983 NA NA NA NA NA chr5-989 137651453 137651785 173 - chr5:137651589-137651607 NA NA NA NA NA chr5-988 137495661 137495966 245 - chr5:137495795-137495943 NA NA NA NA NA chr5-91 13731355 13731529 171 - chr5:13731363-13731528 NA NA NA NA NA chr5-987 136919681 136919864 131 - chr5:136919719-136919824 NA NA NA NA NA chr5-986 136887494 136887657 151 - chr5:136887513-136887640 NA NA NA NA NA chr5-985 136747076 136747543 333 - chr5:136747127-136747230 NA NA NA NA NA chr5-984 136583624 136584006 193 - chr5:136583848-136583887 NA NA NA NA NA chr5-983 136504940 136505099 157 - chr5:136504946-136505099 NA NA NA NA NA chr5-982 136159092 136159356 152 - chr5:136159196-136159240 NA NA NA NA NA chr5-90 13591092 13591478 234 - chr5:13591120-13591306 NA NA NA NA NA chr5-981 135640065 135640252 125 - chr5:135640169-135640211 NA NA NA NA NA chr5-89 13472031 13472255 203 - chr5:13472060-13472221 NA NA NA NA NA chr5-980 134670356 134670514 150 - chr5:134670366-134670507 NA NA NA NA NA chr5-88 13463853 13464249 295 - chr5:13464141-13464234 NA NA NA NA NA chr5-979 134539615 134539870 158 - chr5:134539694-134539764 NA NA NA NA NA chr5-978 134479950 134480106 142 - chr5:134479960-134480084 NA NA NA NA NA chr5-977 134428992 134429214 163 - chr5:134429051-134429155 NA NA NA NA NA chr5-976 134418464 134418985 279 - chr5:134418646-134418804 NA NA NA NA NA chr5-975 134223521 134223688 127 - chr5:134223631-134223678 NA NA NA NA NA chr5-974 133973658 133973939 152 - chr5:133973791-133973812 NA NA NA NA NA chr5-973 133687988 133688243 135 - chr5:133688101-133688109 NA NA NA NA NA chr5-972 133544642 133544991 167 - chr5:133544786-133544790 NA NA NA NA NA chr5-971 133359226 133359607 177 - chr5:133359284-133359359 NA NA NA NA NA chr5-970 133065313 133065695 210 - chr5:133065543-133065639 NA NA NA NA NA chr5-969 132988235 132988472 148 - chr5:132988315-132988418 NA NA NA NA NA chr5-968 132967612 132967961 269 - chr5:132967726-132967955 NA NA NA NA NA chr5-967 132955996 132956463 263 - chr5:132956052-132956213 NA NA NA NA NA chr5-966 132883220 132883642 323 - chr5:132883288-132883441 NA NA NA NA NA chr5-965 132594606 132594778 136 - chr5:132594654-132594766 NA NA NA NA NA chr5-964 131920380 131920543 129 - chr5:131920381-131920443 NA NA NA NA NA chr5-963 131654495 131654803 192 - chr5:131654676-131654712 NA NA NA NA NA chr5-962 131452438 131452598 120 - chr5:131452442-131452486 NA NA NA NA NA chr5-961 131162671 131162825 113 - chr5:131162719-131162798 NA NA NA NA NA chr5-960 130825383 130825563 159 - chr5:130825407-130825548 NA NA NA NA NA chr5-959 130783024 130783256 203 - chr5:130783102-130783247 NA NA NA NA NA chr5-958 130659974 130660220 145 - chr5:130660072-130660113 NA NA NA NA NA chr5-957 130193245 130193574 190 - chr5:130193424-130193515 NA NA NA NA NA chr5-956 130162142 130162481 235 - chr5:130162324-130162416 NA NA NA NA NA chr5-955 130022660 130022850 160 - chr5:130022690-130022820 NA NA NA NA NA chr5-87 13000032 13000198 127 - chr5:13000119-13000183 NA NA NA NA NA chr5-954 129971016 129971316 156 - chr5:129971154-129971160 NA NA NA NA NA chr5-953 129963349 129963781 223 - chr5:129963591-129963638 NA NA NA NA NA chr5-952 129887563 129887683 119 - chr5:129887564-129887682 NA NA NA NA NA chr5-951 129881483 129881887 291 - chr5:129881506-129881800 NA NA NA NA NA chr5-950 129661088 129661603 296 - chr5:129661167-129661459 NA NA NA NA NA chr5-949 129649148 129649449 154 - chr5:129649293-129649298 NA NA NA NA NA chr5-948 129645202 129645355 152 - chr5:129645203-129645354 NA NA NA NA NA chr5-947 129176160 129176518 171 - chr5:129176324-129176336 NA NA NA NA NA chr5-946 128683675 128683916 190 - chr5:128683747-128683916 NA NA NA NA NA chr5-945 128576668 128576829 143 - chr5:128576688-128576815 NA NA NA NA NA chr5-944 128363804 128364000 160 - chr5:128363826-128363957 NA NA NA NA NA chr5-943 128348632 128348986 232 - chr5:128348714-128348784 NA NA NA NA NA chr5-942 128108025 128108265 169 - chr5:128108084-128108188 NA NA NA NA NA chr5-941 127893723 127893973 143 - chr5:127893872-127893887 NA NA NA NA NA chr5-940 127785314 127785722 256 - chr5:127785407-127785675 NA NA NA NA NA chr5-86 12771740 12772107 236 - chr5:12771827-12771888 NA NA NA NA NA chr5-85 12762305 12762611 162 - chr5:12762440-12762449 NA NA NA NA NA chr5-939 127117999 127118311 212 - chr5:127118120-127118249 NA NA NA NA NA chr5-938 127098180 127098446 156 - chr5:127098290-127098336 NA NA NA NA NA chr5-937 127048533 127048843 254 - chr5:127048535-127048679 NA NA NA NA NA chr5-936 126871515 126871707 153 - chr5:126871552-126871667 NA NA NA NA NA chr5-935 126778725 126778971 182 - chr5:126778817-126778921 NA NA NA NA NA chr5-84 12651588 12652021 246 - chr5:12651670-12651739 NA NA NA NA NA chr5-934 126505899 126506101 172 - chr5:126505933-126506073 NA NA NA NA NA chr5-933 126412752 126413004 151 - chr5:126412853-126412903 NA NA NA NA NA chr5-83 12615844 12616007 116 - chr5:12615907-12615992 NA NA NA NA NA chr5-932 126146084 126146426 214 - chr5:126146199-126146349 NA NA NA NA NA chr5-931 126053140 126053563 210 - chr5:126053250-126053396 NA NA NA NA NA chr5-930 126016928 126017193 184 - chr5:126016992-126017078 NA NA NA NA NA chr5-929 125983606 125983844 159 - chr5:125983695-125983785 NA NA NA NA NA chr5-928 125899408 125900068 383 - chr5:125899739-125899745 NA NA NA NA NA chr5-927 125782287 125782531 191 - chr5:125782360-125782518 NA NA NA NA NA chr5-926 125634219 125634519 239 - chr5:125634296-125634413 NA NA NA NA NA chr5-925 125551296 125551522 150 - chr5:125551374-125551450 NA NA NA NA NA chr5-924 125251135 125251328 140 - chr5:125251180-125251271 NA NA NA NA NA chr5-923 125214722 125214951 175 - chr5:125214730-125214874 NA NA NA NA NA chr5-922 125190341 125190648 168 - chr5:125190438-125190488 NA NA NA NA NA chr5-921 125080159 125080357 141 - chr5:125080212-125080298 NA NA NA NA NA chr5-920 125065425 125065650 153 - chr5:125065473-125065566 NA NA NA NA NA chr5-919 124989565 124989840 142 - chr5:124989642-124989679 NA NA NA NA NA chr5-918 124804949 124805246 170 - chr5:124805089-124805145 NA NA NA NA NA chr5-917 124614441 124614762 258 - chr5:124614451-124614593 NA NA NA NA NA chr5-916 124131049 124131262 113 - chr5:124131167-124131198 NA NA NA NA NA chr5-915 124113049 124113278 137 - chr5:124113125-124113178 NA NA NA NA NA chr5-914 124074058 124074275 156 - chr5:124074109-124074207 NA NA NA NA NA chr5-913 124059660 124060101 345 - chr5:124059842-124059995 NA NA NA NA NA chr5-912 123995895 123996142 159 - chr5:123995962-123996012 NA NA NA NA NA chr5-911 123911670 123911884 120 - chr5:123911777-123911816 NA NA NA NA NA chr5-910 123869408 123869588 164 - chr5:123869417-123869558 NA NA NA NA NA chr5-82 12369004 12369161 121 - chr5:12369047-12369139 NA NA NA NA NA chr5-909 123564212 123564356 124 - chr5:123564235-123564349 NA NA NA NA NA chr5-908 123472643 123472967 194 - chr5:123472761-123472813 NA NA NA NA NA chr5-907 123357980 123358175 143 - chr5:123358024-123358119 NA NA NA NA NA chr5-906 122989094 122989873 360 - chr5:122989387-122989391 NA NA NA NA NA chr5-905 122902358 122902669 171 - chr5:122902478-122902519 NA NA NA NA NA chr5-904 122780162 122780407 145 - chr5:122780263-122780309 NA NA NA NA NA chr5-81 12220482 12220699 140 - chr5:12220565-12220634 NA NA NA NA NA chr5-903 122118994 122119278 145 - chr5:122119148-122119169 NA NA NA NA NA chr5-902 122116542 122116731 160 - chr5:122116565-122116690 NA NA NA NA NA chr5-901 121927180 121927415 173 - chr5:121927265-121927399 NA NA NA NA NA chr5-900 121791204 121791497 168 - chr5:121791319-121791352 NA NA NA NA NA chr5-899 121547001 121547246 134 - chr5:121547134-121547146 NA NA NA NA NA chr5-898 121484166 121484413 165 - chr5:121484232-121484323 NA NA NA NA NA chr5-80 12145416 12145647 201 - chr5:12145432-12145573 NA NA NA NA NA chr5-79 12143938 12144121 154 - chr5:12143964-12144086 NA NA NA NA NA chr5-78 12140816 12141109 242 - chr5:12140962-12141102 NA NA NA NA NA chr5-897 121302438 121302622 152 - chr5:121302490-121302600 NA NA NA NA NA chr5-896 121004865 121005053 151 - chr5:121004901-121005014 NA NA NA NA NA chr5-895 120866847 120867037 152 - chr5:120866918-120866994 NA NA NA NA NA chr5-894 120724186 120724456 162 - chr5:120724303-120724345 NA NA NA NA NA chr5-893 120627730 120627890 135 - chr5:120627799-120627887 NA NA NA NA NA chr5-892 120549855 120550142 168 - chr5:120549968-120550011 NA NA NA NA NA chr5-891 120534700 120534997 199 - chr5:120534808-120534904 NA NA NA NA NA chr5-890 120515490 120515982 377 - chr5:120515523-120515670 NA NA NA NA NA chr5-77 12044831 12045161 212 - chr5:12045008-12045161 NA NA NA NA NA chr5-889 120305612 120305867 193 - chr5:120305698-120305817 NA NA NA NA NA chr5-888 120288330 120288598 142 - chr5:120288455-120288470 NA NA NA NA NA chr5-887 120277994 120278330 218 - chr5:120278065-120278224 NA NA NA NA NA chr5-886 120197356 120197653 248 - chr5:120197406-120197556 NA NA NA NA NA chr5-885 120086061 120086596 261 - chr5:120086095-120086202 NA NA NA NA NA chr5-884 119947524 119947685 154 - chr5:119947529-119947677 NA NA NA NA NA chr5-883 119933233 119933437 118 - chr5:119933351-119933367 NA NA NA NA NA chr5-882 119922106 119922556 274 - chr5:119922410-119922444 NA NA NA NA NA chr5-881 119485632 119485898 145 - chr5:119485791-119485796 NA NA NA NA NA chr5-76 11934992 11935171 172 - chr5:11934992-11935150 NA NA NA NA NA chr5-880 119073376 119073868 241 - chr5:119073677-119073717 NA NA NA NA NA chr5-75 11897146 11897441 237 - chr5:11897284-11897423 NA NA NA NA NA chr5-879 118242472 118242920 285 - chr5:118242788-118242878 NA NA NA NA NA chr5-878 118026903 118027139 148 - chr5:118026995-118027053 NA NA NA NA NA chr5-877 117550037 117550383 288 - chr5:117550102-117550274 NA NA NA NA NA chr5-74 11751053 11751417 221 - chr5:11751116-11751234 NA NA NA NA NA chr5-876 117419319 117419804 334 - chr5:117419652-117419744 NA NA NA NA NA chr5-875 117288286 117288516 156 - chr5:117288364-117288450 NA NA NA NA NA chr5-874 117183403 117183733 185 - chr5:117183592-117183676 NA NA NA NA NA chr5-873 117100113 117100279 160 - chr5:117100120-117100268 NA NA NA NA NA chr5-872 117042466 117042750 152 - chr5:117042588-117042613 NA NA NA NA NA chr5-871 116925661 116925895 113 - chr5:116925728-116925747 NA NA NA NA NA chr5-73 11690286 11690454 152 - chr5:11690286-11690430 NA NA NA NA NA chr5-870 116822676 116822948 170 - chr5:116822780-116822847 NA NA NA NA NA chr5-869 116796334 116796559 171 - chr5:116796384-116796528 NA NA NA NA NA chr5-868 116674555 116674750 139 - chr5:116674603-116674690 NA NA NA NA NA chr5-867 116535770 116536164 204 - chr5:116536019-116536092 NA NA NA NA NA chr5-72 11631389 11631720 175 - chr5:11631531-11631536 NA NA NA NA NA chr5-866 116311671 116311817 142 - chr5:116311675-116311813 NA NA NA NA NA chr5-71 11596842 11597183 215 - chr5:11596913-11597065 NA NA NA NA NA chr5-70 11557148 11557392 140 - chr5:11557244-11557284 NA NA NA NA NA chr5-865 115373357 115373516 154 - chr5:115373368-115373514 NA NA NA NA NA chr5-69 11522872 11523121 209 - chr5:11522878-11523007 NA NA NA NA NA chr5-864 115098761 115099009 120 - chr5:115098847-115098860 NA NA NA NA NA chr5-863 115096505 115096713 193 - chr5:115096517-115096680 NA NA NA NA NA chr5-862 114936089 114936384 149 - chr5:114936240-114936248 NA NA NA NA NA chr5-861 114652365 114652671 232 - chr5:114652581-114652668 NA NA NA NA NA chr5-860 114558420 114558739 182 - chr5:114558565-114558606 NA NA NA NA NA chr5-859 114416822 114416976 118 - chr5:114416829-114416929 NA NA NA NA NA chr5-68 11440937 11441095 145 - chr5:11440944-11441070 NA NA NA NA NA chr5-858 114340825 114341020 135 - chr5:114340923-114340979 NA NA NA NA NA chr5-857 114309012 114309254 151 - chr5:114309107-114309165 NA NA NA NA NA chr5-856 114227096 114227403 167 - chr5:114227238-114227267 NA NA NA NA NA chr5-855 114066165 114066852 363 - chr5:114066530-114066610 NA NA NA NA NA chr5-854 114032180 114032483 218 - chr5:114032220-114032384 NA NA NA NA NA chr5-853 113702747 113703017 131 - chr5:113702865-113702901 NA NA NA NA NA chr5-67 11364618 11364768 130 - chr5:11364676-11364767 NA NA NA NA NA chr5-852 113594140 113594461 212 - chr5:113594173-113594314 NA NA NA NA NA chr5-851 113506107 113506622 337 - chr5:113506188-113506474 NA NA NA NA NA chr5-850 113399128 113399455 252 - chr5:113399161-113399296 NA NA NA NA NA chr5-849 113349212 113349688 282 - chr5:113349364-113349549 NA NA NA NA NA chr5-848 113334999 113335183 162 - chr5:113335018-113335155 NA NA NA NA NA chr5-847 113327586 113327757 157 - chr5:113327605-113327755 NA NA NA NA NA chr5-846 113185202 113185384 152 - chr5:113185226-113185351 NA NA NA NA NA chr5-845 113020342 113020613 150 - chr5:113020467-113020500 NA NA NA NA NA chr5-844 112945768 112945997 205 - chr5:112945840-112945997 NA NA NA NA NA chr5-843 112826630 112826937 199 - chr5:112826791-112826814 NA NA NA NA NA chr5-842 112601228 112601457 158 - chr5:112601335-112601368 NA NA NA NA NA chr5-66 11257411 11257724 199 - chr5:11257555-11257670 NA NA NA NA NA chr5-841 112404106 112404438 227 - chr5:112404116-112404263 NA NA NA NA NA chr5-840 112285878 112286241 325 - chr5:112285932-112286238 NA NA NA NA NA chr5-839 112285233 112285476 134 - chr5:112285349-112285381 NA NA NA NA NA chr5-838 112069065 112069347 133 - chr5:112069180-112069215 NA NA NA NA NA chr5-837 112025293 112025507 159 - chr5:112025438-112025487 NA NA NA NA NA chr5-836 111907158 111907544 192 - chr5:111907262-111907305 NA NA NA NA NA chr5-835 111539208 111539459 154 - chr5:111539297-111539358 NA NA NA NA NA chr5-834 111527662 111527929 172 - chr5:111527753-111527826 NA NA NA NA NA chr5-833 111515458 111515629 141 - chr5:111515458-111515584 NA NA NA NA NA chr5-832 111492344 111492512 157 - chr5:111492363-111492505 NA NA NA NA NA chr5-831 111477832 111477979 124 - chr5:111477871-111477949 NA NA NA NA NA chr5-830 111452475 111452782 258 - chr5:111452476-111452636 NA NA NA NA NA chr5-829 111312954 111313363 202 - chr5:111313051-111313101 NA NA NA NA NA chr5-828 111182773 111182965 153 - chr5:111182806-111182914 NA NA NA NA NA chr5-827 111168151 111168444 148 - chr5:111168299-111168305 NA NA NA NA NA chr5-826 111037447 111037639 144 - chr5:111037505-111037611 NA NA NA NA NA chr5-825 111008424 111008910 262 - chr5:111008622-111008673 NA NA NA NA NA chr5-824 110982917 110983108 153 - chr5:110982957-110983071 NA NA NA NA NA chr5-65 11068978 11069177 155 - chr5:11069090-11069167 NA NA NA NA NA chr5-823 110588916 110589357 244 - chr5:110589165-110589186 NA NA NA NA NA chr5-822 110564981 110565602 348 - chr5:110565017-110565280 NA NA NA NA NA chr5-821 110502468 110502720 151 - chr5:110502567-110502615 NA NA NA NA NA chr5-820 110455199 110455493 152 - chr5:110455345-110455353 NA NA NA NA NA chr5-819 110224454 110224885 270 - chr5:110224477-110224655 NA NA NA NA NA chr5-818 110164401 110164671 145 - chr5:110164519-110164532 NA NA NA NA NA chr5-817 110157396 110157597 167 - chr5:110157440-110157568 NA NA NA NA NA chr5-816 109989729 109990002 197 - chr5:109989740-109989899 NA NA NA NA NA chr5-815 109963038 109963225 163 - chr5:109963044-109963192 NA NA NA NA NA chr5-814 109894162 109894469 249 - chr5:109894267-109894400 NA NA NA NA NA chr5-813 109748579 109749022 251 - chr5:109748733-109748811 NA NA NA NA NA chr5-812 109517404 109517618 158 - chr5:109517472-109517568 NA NA NA NA NA chr5-811 109221762 109222061 156 - chr5:109221907-109221919 NA NA NA NA NA chr5-810 109184023 109184192 143 - chr5:109184053-109184183 NA NA NA NA NA chr5-809 108878251 108878402 130 - chr5:108878310-108878400 NA NA NA NA NA chr5-808 108767145 108767785 433 - chr5:108767150-108767364 NA NA NA NA NA chr5-807 108523547 108523887 177 - chr5:108523685-108523695 NA NA NA NA NA chr5-806 108333185 108333457 162 - chr5:108333294-108333345 NA NA NA NA NA chr5-805 108308218 108308751 281 - chr5:108308513-108308668 NA NA NA NA NA chr5-804 108286542 108286740 165 - chr5:108286573-108286703 NA NA NA NA NA chr5-803 108223133 108223427 194 - chr5:108223133-108223277 NA NA NA NA NA chr5-802 107739785 107740001 151 - chr5:107739851-107739938 NA NA NA NA NA chr5-801 107626417 107626666 159 - chr5:107626515-107626580 NA NA NA NA NA chr5-800 107619894 107620074 116 - chr5:107619979-107620052 NA NA NA NA NA chr5-799 107544209 107544469 131 - chr5:107544345-107544354 NA NA NA NA NA chr5-798 107525996 107526252 160 - chr5:107526120-107526170 NA NA NA NA NA chr5-797 107252418 107252688 160 - chr5:107252506-107252567 NA NA NA NA NA chr5-796 107187948 107188211 161 - chr5:107188054-107188098 NA NA NA NA NA chr5-795 106965110 106965397 202 - chr5:106965229-106965389 NA NA NA NA NA chr5-794 106862434 106862632 146 - chr5:106862487-106862582 NA NA NA NA NA chr5-793 106675263 106675422 155 - chr5:106675263-106675416 NA NA NA NA NA chr5-792 106581428 106581681 147 - chr5:106581570-106581593 NA NA NA NA NA chr5-791 106449284 106449527 149 - chr5:106449388-106449438 NA NA NA NA NA chr5-790 106332584 106332936 254 - chr5:106332689-106332852 NA NA NA NA NA chr5-789 106252282 106252603 206 - chr5:106252497-106252551 NA NA NA NA NA chr5-64 10617192 10617365 133 - chr5:10617300-10617353 NA NA NA NA NA chr5-788 106125169 106125372 138 - chr5:106125210-106125295 NA NA NA NA NA chr5-787 105898485 105898954 212 - chr5:105898687-105898811 NA NA NA NA NA chr5-786 105785726 105786041 165 - chr5:105785876-105785891 NA NA NA NA NA chr5-63 10570945 10571196 146 - chr5:10571026-10571043 NA NA NA NA NA chr5-785 105654251 105654407 150 - chr5:105654255-105654402 NA NA NA NA NA chr5-784 105545302 105545475 139 - chr5:105545343-105545455 NA NA NA NA NA chr5-783 105535808 105536213 212 - chr5:105535881-105535960 NA NA NA NA NA chr5-782 105535322 105535617 189 - chr5:105535416-105535487 NA NA NA NA NA chr5-781 105505355 105505631 153 - chr5:105505478-105505508 NA NA NA NA NA chr5-780 105128121 105128367 155 - chr5:105128202-105128256 NA NA NA NA NA chr5-779 104655551 104655862 243 - chr5:104655596-104655805 NA NA NA NA NA chr5-778 104628486 104628703 135 - chr5:104628554-104628593 NA NA NA NA NA chr5-777 104559948 104560314 246 - chr5:104560007-104560072 NA NA NA NA NA chr5-776 104494158 104494582 268 - chr5:104494428-104494528 NA NA NA NA NA chr5-775 103788006 103788174 157 - chr5:103788013-103788161 NA NA NA NA NA chr5-774 103344975 103345179 123 - chr5:103345018-103345022 NA NA NA NA NA chr5-62 10334105 10334347 165 - chr5:10334192-10334275 NA NA NA NA NA chr5-773 102681543 102682520 479 - chr5:102681991-102681997 NA NA NA NA NA chr5-772 102285711 102286057 211 - chr5:102285870-102285952 NA NA NA NA NA chr5-771 102158349 102158519 153 - chr5:102158354-102158496 NA NA NA NA NA chr5-770 102043759 102043926 140 - chr5:102043794-102043915 NA NA NA NA NA chr5-769 101941394 101941680 242 - chr5:101941394-101941548 NA NA NA NA NA chr5-768 101744780 101745130 220 - chr5:101744942-101745097 NA NA NA NA NA chr5-61 10171321 10171534 202 - chr5:10171333-10171513 NA NA NA NA NA chr5-767 101396807 101397332 247 - chr5:101397137-101397158 NA NA NA NA NA chr5-766 101327006 101327249 169 - chr5:101327180-101327225 NA NA NA NA NA chr5-765 101220277 101220447 131 - chr5:101220297-101220370 NA NA NA NA NA chr5-764 101175874 101176081 189 - chr5:101175924-101176077 NA NA NA NA NA chr5-763 101135263 101135550 180 - chr5:101135353-101135409 NA NA NA NA NA chr5-762 100847285 100847644 239 - chr5:100847397-100847520 NA NA NA NA NA chr5-761 100844876 100845186 158 - chr5:100845016-100845028 NA NA NA NA NA chr5-760 100539584 100539914 218 - chr5:100539679-100539788 NA NA NA NA NA chr5-759 100494758 100495158 238 - chr5:100494951-100495119 NA NA NA NA NA chr5-758 100318818 100319132 237 - chr5:100319044-100319127 NA NA NA NA NA chr5-757 100297276 100297425 115 - chr5:100297338-100297385 NA NA NA NA NA chr5-756 100263941 100264221 185 - chr5:100263960-100264088 NA NA NA NA NA chr5-60 10019043 10019360 206 - chr5:10019146-10019224 NA NA NA NA NA chr4-669 99997836 99998187 222 - chr4:99998035-99998098 NA NA NA NA NA chr4-668 99706180 99706537 260 - chr4:99706431-99706517 NA NA NA NA NA chr4-667 99678856 99679084 161 - chr4:99678925-99679018 NA NA NA NA NA chr4-666 99657124 99657344 151 - chr4:99657186-99657261 NA NA NA NA NA chr4-665 99566371 99566647 204 - chr4:99566437-99566605 NA NA NA NA NA chr4-664 99484118 99484414 203 - chr4:99484127-99484251 NA NA NA NA NA chr4-663 99404028 99404785 362 - chr4:99404269-99404542 NA NA NA NA NA chr4-662 99379275 99379565 149 - chr4:99379420-99379432 NA NA NA NA NA chr4-661 99345670 99345922 136 - chr4:99345816-99345821 NA NA NA NA NA chr4-660 99338167 99338369 149 - chr4:99338222-99338317 NA NA NA NA NA chr4-659 98501497 98501979 334 - chr4:98501529-98501773 NA NA NA NA NA chr4-658 98226417 98226720 162 - chr4:98226557-98226577 NA NA NA NA NA chr4-657 98150784 98151021 172 - chr4:98150863-98150963 NA NA NA NA NA chr4-656 98146838 98147095 148 - chr4:98146950-98146992 NA NA NA NA NA chr4-655 98024964 98025221 153 - chr4:98025066-98025113 NA NA NA NA NA chr4-654 98001091 98001251 139 - chr4:98001135-98001232 NA NA NA NA NA chr4-653 97978696 97979035 172 - chr4:97978891-97978924 NA NA NA NA NA chr4-652 97331058 97331378 177 - chr4:97331225-97331247 NA NA NA NA NA chr4-651 97318753 97318969 194 - chr4:97318763-97318946 NA NA NA NA NA chr4-650 96852305 96852559 138 - chr4:96852426-96852453 NA NA NA NA NA chr4-649 96701424 96701708 150 - chr4:96701558-96701572 NA NA NA NA NA chr4-648 96290528 96290743 147 - chr4:96290580-96290667 NA NA NA NA NA chr4-647 96203330 96203736 242 - chr4:96203346-96203476 NA NA NA NA NA chr4-646 96169568 96169774 169 - chr4:96169577-96169723 NA NA NA NA NA chr4-645 96065577 96065780 143 - chr4:96065608-96065662 NA NA NA NA NA chr4-644 96054000 96054339 257 - chr4:96054030-96054153 NA NA NA NA NA chr4-643 96008316 96008595 183 - chr4:96008466-96008526 NA NA NA NA NA chr4-642 95902657 95902871 142 - chr4:95902730-95902801 NA NA NA NA NA chr4-641 95703949 95704292 183 - chr4:95704035-95704087 NA NA NA NA NA chr4-640 95401865 95402095 154 - chr4:95401927-95401991 NA NA NA NA NA chr4-639 95184171 95184421 165 - chr4:95184256-95184336 NA NA NA NA NA chr4-638 95008619 95009060 217 - chr4:95008896-95008942 NA NA NA NA NA chr4-637 94860756 94860936 151 - chr4:94860786-94860909 NA NA NA NA NA chr4-636 94538358 94538707 289 - chr4:94538402-94538639 NA NA NA NA NA chr4-635 94220653 94220861 145 - chr4:94220724-94220802 NA NA NA NA NA chr4-634 93339243 93339606 342 - chr4:93339289-93339589 NA NA NA NA NA chr4-633 93130819 93131092 157 - chr4:93130944-93130994 NA NA NA NA NA chr4-632 93029834 93030181 261 - chr4:93029876-93029985 NA NA NA NA NA chr4-631 92836870 92837111 143 - chr4:92836946-92837002 NA NA NA NA NA chr4-630 92810899 92811194 179 - chr4:92810986-92811052 NA NA NA NA NA chr4-629 92763208 92763354 128 - chr4:92763224-92763343 NA NA NA NA NA chr4-628 92730066 92730664 524 - chr4:92730123-92730545 NA NA NA NA NA chr4-627 92654328 92654718 213 - chr4:92654624-92654668 NA NA NA NA NA chr4-626 92505582 92505782 170 - chr4:92505604-92505736 NA NA NA NA NA chr4-625 92474390 92474628 175 - chr4:92474448-92474555 NA NA NA NA NA chr4-624 92391348 92391671 182 - chr4:92391408-92391485 NA NA NA NA NA chr4-623 92337983 92338288 215 - chr4:92338096-92338286 NA NA NA NA NA chr4-622 92336307 92336569 169 - chr4:92336396-92336474 NA NA NA NA NA chr4-621 92322073 92322267 153 - chr4:92322114-92322226 NA NA NA NA NA chr4-620 92267653 92268154 223 - chr4:92268020-92268054 NA NA NA NA NA chr4-619 92150658 92150938 156 - chr4:92150776-92150802 NA NA NA NA NA chr4-618 91854848 91854998 129 - chr4:91854909-91854996 NA NA NA NA NA chr4-617 91727969 91728128 149 - chr4:91727978-91728116 NA NA NA NA NA chr4-616 91607304 91607776 284 - chr4:91607440-91607469 NA NA NA NA NA chr4-615 91451159 91451439 146 - chr4:91451267-91451292 NA NA NA NA NA chr4-614 91214904 91215059 147 - chr4:91214905-91215037 NA NA NA NA NA chr4-613 91077240 91077694 215 - chr4:91077375-91077403 NA NA NA NA NA chr4-612 90831739 90831958 157 - chr4:90831761-90831816 NA NA NA NA NA chr4-611 90793861 90794251 224 - chr4:90793978-90794119 NA NA NA NA NA chr4-610 90696960 90697136 160 - chr4:90696960-90697088 NA NA NA NA NA chr4-609 90541450 90541738 179 - chr4:90541580-90541619 NA NA NA NA NA chr4-608 90532552 90532709 123 - chr4:90532558-90532661 NA NA NA NA NA chr4-607 90283849 90284184 203 - chr4:90283871-90283997 NA NA NA NA NA chr4-606 90105053 90105220 155 - chr4:90105054-90105203 NA NA NA NA NA chr4-605 89886856 89887053 151 - chr4:89886906-89887015 NA NA NA NA NA chr4-604 89842339 89842512 152 - chr4:89842344-89842459 NA NA NA NA NA chr4-603 89774050 89774385 204 - chr4:89774108-89774220 NA NA NA NA NA chr4-602 89509058 89509306 153 - chr4:89509129-89509199 NA NA NA NA NA chr4-601 88999353 88999515 146 - chr4:88999374-88999509 NA NA NA NA NA chr4-600 88934264 88934476 148 - chr4:88934330-88934416 NA NA NA NA NA chr4-599 88854150 88854629 281 - chr4:88854498-88854506 NA NA NA NA NA chr4-598 88793962 88794171 155 - chr4:88794025-88794135 NA NA NA NA NA chr4-597 88671945 88672367 273 - chr4:88672097-88672226 NA NA NA NA NA chr4-596 88653998 88654184 143 - chr4:88654031-88654136 NA NA NA NA NA chr4-595 88404326 88404662 174 - chr4:88404489-88404502 NA NA NA NA NA chr4-594 88356687 88356958 141 - chr4:88356823-88356831 NA NA NA NA NA chr4-593 88109387 88109680 182 - chr4:88109485-88109543 NA NA NA NA NA chr4-592 87824809 87825163 294 - chr4:87824958-87825132 NA NA NA NA NA chr4-591 87808386 87808836 319 - chr4:87808453-87808673 NA NA NA NA NA chr4-590 87633718 87633895 142 - chr4:87633746-87633846 NA NA NA NA NA chr4-589 87618389 87618588 157 - chr4:87618431-87618546 NA NA NA NA NA chr4-588 87435896 87436301 289 - chr4:87436026-87436192 NA NA NA NA NA chr4-587 87304201 87304511 214 - chr4:87304339-87304436 NA NA NA NA NA chr4-586 87138446 87138802 231 - chr4:87138619-87138773 NA NA NA NA NA chr4-585 87056100 87056502 254 - chr4:87056340-87056400 NA NA NA NA NA chr4-584 86917716 86917879 161 - chr4:86917716-86917876 NA NA NA NA NA chr4-583 86753677 86754019 204 - chr4:86753789-86753829 NA NA NA NA NA chr4-582 86679120 86679392 168 - chr4:86679238-86679316 NA NA NA NA NA chr4-581 86608924 86609296 156 - chr4:86609188-86609236 NA NA NA NA NA chr4-580 86542056 86542293 149 - chr4:86542145-86542207 NA NA NA NA NA chr4-579 86080046 86080275 161 - chr4:86080124-86080227 NA NA NA NA NA chr4-578 85767286 85767563 161 - chr4:85767411-85767450 NA NA NA NA NA chr4-577 85753831 85753994 122 - chr4:85753843-85753895 NA NA NA NA NA chr4-576 85295436 85295723 170 - chr4:85295581-85295620 NA NA NA NA NA chr4-575 85091683 85091907 138 - chr4:85091782-85091840 NA NA NA NA NA chr4-574 84928212 84928409 175 - chr4:84928233-84928385 NA NA NA NA NA chr4-573 84909228 84909532 164 - chr4:84909358-84909372 NA NA NA NA NA chr4-572 84826744 84826929 154 - chr4:84826774-84826896 NA NA NA NA NA chr4-571 84792309 84792466 151 - chr4:84792311-84792459 NA NA NA NA NA chr4-570 84783453 84783725 233 - chr4:84783555-84783710 NA NA NA NA NA chr4-569 84661760 84661932 153 - chr4:84661771-84661909 NA NA NA NA NA chr4-568 84475850 84476066 177 - chr4:84475904-84476043 NA NA NA NA NA chr4-567 84469441 84469634 161 - chr4:84469463-84469597 NA NA NA NA NA chr4-9 8443993 8444257 174 - chr4:8444037-8444144 NA NA NA NA NA chr4-566 84409947 84410258 219 - chr4:84410059-84410232 NA NA NA NA NA chr4-565 84064029 84064339 206 - chr4:84064096-84064250 NA NA NA NA NA chr4-564 83886623 83886930 130 - chr4:83886704-83886705 NA NA NA NA NA chr4-563 83683901 83684117 155 - chr4:83683956-83684053 NA NA NA NA NA chr4-562 83647567 83647735 153 - chr4:83647574-83647716 NA NA NA NA NA chr4-561 83635856 83636089 148 - chr4:83635942-83636006 NA NA NA NA NA chr4-560 83621932 83622285 171 - chr4:83622086-83622089 NA NA NA NA NA chr4-559 83593369 83593610 157 - chr4:83593439-83593519 NA NA NA NA NA chr4-558 83573627 83573926 193 - chr4:83573649-83573778 NA NA NA NA NA chr4-557 83572457 83572690 165 - chr4:83572554-83572684 NA NA NA NA NA chr4-556 83206765 83207210 208 - chr4:83206904-83206924 NA NA NA NA NA chr4-555 82948880 82949379 279 - chr4:82949230-82949261 NA NA NA NA NA chr4-554 82884454 82884601 112 - chr4:82884486-82884528 NA NA NA NA NA chr4-553 82768348 82768760 245 - chr4:82768601-82768756 NA NA NA NA NA chr4-552 82696183 82696386 164 - chr4:82696212-82696342 NA NA NA NA NA chr4-551 82535435 82535606 162 - chr4:82535441-82535591 NA NA NA NA NA chr4-550 82451458 82451645 154 - chr4:82451497-82451615 NA NA NA NA NA chr4-549 82294594 82294885 145 - chr4:82294746-82294751 NA NA NA NA NA chr4-548 82132460 82132761 187 - chr4:82132465-82132595 NA NA NA NA NA chr4-547 81847334 81847528 135 - chr4:81847461-81847503 NA NA NA NA NA chr4-546 81703276 81703508 152 - chr4:81703372-81703436 NA NA NA NA NA chr4-545 81693486 81693752 172 - chr4:81693572-81693654 NA NA NA NA NA chr4-544 81636576 81636808 157 - chr4:81636648-81636727 NA NA NA NA NA chr4-543 81624390 81624573 140 - chr4:81624469-81624548 NA NA NA NA NA chr4-542 81529068 81529262 153 - chr4:81529104-81529211 NA NA NA NA NA chr4-541 81461298 81461583 153 - chr4:81461502-81461571 NA NA NA NA NA chr4-540 81430915 81431144 162 - chr4:81430970-81431071 NA NA NA NA NA chr4-539 81394951 81395201 148 - chr4:81395086-81395165 NA NA NA NA NA chr4-538 81111878 81112036 150 - chr4:81111888-81112032 NA NA NA NA NA chr4-537 80864160 80864461 221 - chr4:80864203-80864315 NA NA NA NA NA chr4-536 80632006 80632233 181 - chr4:80632042-80632167 NA NA NA NA NA chr4-535 80492722 80493142 280 - chr4:80492844-80492964 NA NA NA NA NA chr4-534 80278186 80278585 196 - chr4:80278269-80278322 NA NA NA NA NA chr4-533 80258681 80259120 230 - chr4:80258787-80258847 NA NA NA NA NA chr4-532 79955496 79955687 132 - chr4:79955573-79955637 NA NA NA NA NA chr4-531 79921241 79921480 166 - chr4:79921306-79921391 NA NA NA NA NA chr4-530 79796461 79796696 152 - chr4:79796538-79796601 NA NA NA NA NA chr4-529 79328124 79328303 156 - chr4:79328175-79328294 NA NA NA NA NA chr4-528 78988388 78988655 209 - chr4:78988446-78988539 NA NA NA NA NA chr4-527 78786958 78787156 176 - chr4:78786962-78787125 NA NA NA NA NA chr4-526 78325297 78325530 165 - chr4:78325353-78325438 NA NA NA NA NA chr4-525 78141123 78141504 235 - chr4:78141333-78141390 NA NA NA NA NA chr4-524 77948786 77949345 332 - chr4:77949030-77949152 NA NA NA NA NA chr4-523 77934320 77934584 149 - chr4:77934334-77934394 NA NA NA NA NA chr4-522 77649624 77649900 171 - chr4:77649746-77649829 NA NA NA NA NA chr4-521 77600482 77600738 153 - chr4:77600582-77600629 NA NA NA NA NA chr4-520 77483967 77484355 224 - chr4:77484011-77484131 NA NA NA NA NA chr4-519 77429507 77429816 164 - chr4:77429654-77429675 NA NA NA NA NA chr4-518 77191697 77191928 153 - chr4:77191766-77191832 NA NA NA NA NA chr4-517 77109414 77109623 165 - chr4:77109438-77109569 NA NA NA NA NA chr4-8 7709385 7709735 251 - chr4:7709435-7709538 NA NA NA NA NA chr4-516 76941214 76941461 134 - chr4:76941323-76941340 NA NA NA NA NA chr4-515 76882772 76882959 165 - chr4:76882785-76882919 NA NA NA NA NA chr4-514 76663482 76663667 160 - chr4:76663505-76663638 NA NA NA NA NA chr4-513 76605736 76605920 141 - chr4:76605772-76605853 NA NA NA NA NA chr4-512 76492169 76492365 163 - chr4:76492212-76492352 NA NA NA NA NA chr4-511 76227627 76228219 264 - chr4:76227776-76227789 NA NA NA NA NA chr4-510 76216351 76216509 157 - chr4:76216352-76216508 NA NA NA NA NA chr4-509 76121556 76121714 133 - chr4:76121563-76121680 NA NA NA NA NA chr4-508 75993238 75993445 187 - chr4:75993252-75993399 NA NA NA NA NA chr4-507 75975683 75975871 129 - chr4:75975780-75975831 NA NA NA NA NA chr4-506 75847687 75847996 160 - chr4:75847833-75847840 NA NA NA NA NA chr4-505 75697523 75698071 266 - chr4:75697581-75697677 NA NA NA NA NA chr4-504 75684009 75684481 223 - chr4:75684118-75684162 NA NA NA NA NA chr4-503 75477960 75478316 219 - chr4:75478167-75478214 NA NA NA NA NA chr4-502 75408718 75409177 290 - chr4:75408900-75409034 NA NA NA NA NA chr4-501 75188096 75188696 313 - chr4:75188358-75188417 NA NA NA NA NA chr4-500 74804671 74804888 164 - chr4:74804728-74804837 NA NA NA NA NA chr4-499 74744416 74744697 148 - chr4:74744553-74744572 NA NA NA NA NA chr4-498 74601651 74601922 154 - chr4:74601756-74601799 NA NA NA NA NA chr4-497 74534580 74534811 158 - chr4:74534637-74534730 NA NA NA NA NA chr4-496 74490151 74490438 201 - chr4:74490257-74490415 NA NA NA NA NA chr4-495 74237433 74237653 175 - chr4:74237471-74237594 NA NA NA NA NA chr4-494 74068673 74068955 154 - chr4:74068808-74068841 NA NA NA NA NA chr4-493 73988964 73989131 118 - chr4:73989003-73989077 NA NA NA NA NA chr4-492 73803996 73804197 121 - chr4:73804030-73804066 NA NA NA NA NA chr4-491 73784695 73784914 158 - chr4:73784760-73784855 NA NA NA NA NA chr4-490 73703576 73703745 161 - chr4:73703587-73703744 NA NA NA NA NA chr4-489 73507936 73508462 310 - chr4:73508168-73508254 NA NA NA NA NA chr4-488 73346478 73346926 263 - chr4:73346788-73346829 NA NA NA NA NA chr4-487 73248470 73248788 198 - chr4:73248630-73248688 NA NA NA NA NA chr4-486 73186551 73186799 214 - chr4:73186573-73186719 NA NA NA NA NA chr4-485 73121298 73121456 146 - chr4:73121310-73121444 NA NA NA NA NA chr4-484 73116373 73116610 156 - chr4:73116448-73116526 NA NA NA NA NA chr4-483 73109354 73109533 156 - chr4:73109370-73109496 NA NA NA NA NA chr4-482 72942873 72943095 185 - chr4:72942920-72943078 NA NA NA NA NA chr4-481 72912129 72912355 154 - chr4:72912205-72912291 NA NA NA NA NA chr4-480 72876470 72876648 157 - chr4:72876483-72876611 NA NA NA NA NA chr4-479 72571689 72572125 303 - chr4:72571703-72572009 NA NA NA NA NA chr4-478 72535130 72535316 118 - chr4:72535211-72535252 NA NA NA NA NA chr4-477 72514608 72514967 299 - chr4:72514788-72514967 NA NA NA NA NA chr4-476 72402009 72402414 184 - chr4:72402281-72402290 NA NA NA NA NA chr4-475 72379830 72380313 326 - chr4:72380163-72380244 NA NA NA NA NA chr4-474 72188087 72188276 161 - chr4:72188112-72188242 NA NA NA NA NA chr4-473 72041002 72041300 162 - chr4:72041140-72041165 NA NA NA NA NA chr4-472 71984767 71984908 114 - chr4:71984767-71984827 NA NA NA NA NA chr4-471 71928060 71928342 177 - chr4:71928216-71928339 NA NA NA NA NA chr4-470 71912690 71912970 242 - chr4:71912753-71912919 NA NA NA NA NA chr4-469 71854874 71855184 209 - chr4:71855009-71855136 NA NA NA NA NA chr4-468 71652963 71653136 148 - chr4:71652986-71653107 NA NA NA NA NA chr4-467 71559252 71559495 171 - chr4:71559351-71559477 NA NA NA NA NA chr4-466 71546300 71546627 181 - chr4:71546476-71546541 NA NA NA NA NA chr4-465 71398392 71398557 130 - chr4:71398461-71398539 NA NA NA NA NA chr4-464 71342350 71342641 154 - chr4:71342496-71342522 NA NA NA NA NA chr4-463 71186905 71187065 120 - chr4:71186922-71187022 NA NA NA NA NA chr4-462 71120325 71120548 155 - chr4:71120399-71120483 NA NA NA NA NA chr4-461 70832447 70832600 145 - chr4:70832449-70832580 NA NA NA NA NA chr4-460 70676611 70676787 119 - chr4:70676640-70676668 NA NA NA NA NA chr4-459 70344647 70344991 288 - chr4:70344673-70344875 NA NA NA NA NA chr4-458 70274794 70275127 219 - chr4:70274940-70275102 NA NA NA NA NA chr4-457 70253993 70254180 141 - chr4:70254022-70254100 NA NA NA NA NA chr4-456 69881215 69881394 157 - chr4:69881247-69881377 NA NA NA NA NA chr4-455 69631247 69631556 190 - chr4:69631418-69631541 NA NA NA NA NA chr4-454 68253942 68254287 222 - chr4:68254134-68254201 NA NA NA NA NA chr4-453 68099229 68099459 148 - chr4:68099295-68099369 NA NA NA NA NA chr4-452 68022327 68022801 246 - chr4:68022407-68022499 NA NA NA NA NA chr4-451 67995473 67995659 120 - chr4:67995562-67995639 NA NA NA NA NA chr4-450 67964839 67965162 188 - chr4:67964888-67964984 NA NA NA NA NA chr4-449 67849674 67849846 135 - chr4:67849690-67849767 NA NA NA NA NA chr4-448 67747101 67747534 285 - chr4:67747383-67747453 NA NA NA NA NA chr4-447 67725528 67725898 295 - chr4:67725751-67725896 NA NA NA NA NA chr4-446 67449003 67449457 264 - chr4:67449301-67449321 NA NA NA NA NA chr4-445 67361851 67362067 152 - chr4:67361908-67361998 NA NA NA NA NA chr4-444 67350108 67350423 162 - chr4:67350262-67350272 NA NA NA NA NA chr4-443 67343884 67344163 158 - chr4:67343974-67343980 NA NA NA NA NA chr4-442 67326997 67327316 260 - chr4:67327025-67327167 NA NA NA NA NA chr4-441 67244874 67245018 130 - chr4:67244882-67244984 NA NA NA NA NA chr4-440 67089283 67089474 154 - chr4:67089338-67089473 NA NA NA NA NA chr4-439 66839615 66839791 168 - chr4:66839616-66839768 NA NA NA NA NA chr4-438 66722078 66722400 180 - chr4:66722222-66722262 NA NA NA NA NA chr4-437 66638994 66639458 317 - chr4:66638994-66639288 NA NA NA NA NA chr4-436 66429892 66430122 177 - chr4:66429959-66430076 NA NA NA NA NA chr4-435 66374584 66375213 359 - chr4:66375062-66375118 NA NA NA NA NA chr4-434 66001815 66002102 202 - chr4:66002024-66002079 NA NA NA NA NA chr4-433 65942906 65943239 262 - chr4:65942954-65943122 NA NA NA NA NA chr4-432 65686952 65687334 242 - chr4:65687182-65687239 NA NA NA NA NA chr4-431 65504798 65505162 192 - chr4:65504912-65504961 NA NA NA NA NA chr4-430 65404223 65404610 205 - chr4:65404444-65404506 NA NA NA NA NA chr4-429 65319638 65319844 159 - chr4:65319680-65319787 NA NA NA NA NA chr4-428 65154518 65154898 193 - chr4:65154729-65154759 NA NA NA NA NA chr4-427 65041824 65042062 178 - chr4:65041871-65041976 NA NA NA NA NA chr4-426 64918703 64918904 142 - chr4:64918738-64918833 NA NA NA NA NA chr4-425 64882166 64882366 182 - chr4:64882204-64882350 NA NA NA NA NA chr4-424 64757713 64757928 150 - chr4:64757778-64757863 NA NA NA NA NA chr4-423 64643366 64643650 152 - chr4:64643496-64643514 NA NA NA NA NA chr4-422 64520719 64521203 302 - chr4:64521046-64521169 NA NA NA NA NA chr4-421 64456355 64456642 159 - chr4:64456484-64456516 NA NA NA NA NA chr4-420 64380697 64380936 143 - chr4:64380795-64380844 NA NA NA NA NA chr4-419 64229304 64229489 150 - chr4:64229347-64229458 NA NA NA NA NA chr4-418 64031776 64032162 319 - chr4:64031899-64032084 NA NA NA NA NA chr4-417 63995342 63995565 158 - chr4:63995403-63995492 NA NA NA NA NA chr4-416 63899590 63899822 181 - chr4:63899601-63899751 NA NA NA NA NA chr4-415 63860554 63860854 255 - chr4:63860659-63860824 NA NA NA NA NA chr4-414 63827406 63827907 285 - chr4:63827627-63827732 NA NA NA NA NA chr4-413 63794986 63795151 154 - chr4:63794995-63795136 NA NA NA NA NA chr4-412 63603409 63603659 139 - chr4:63603549-63603606 NA NA NA NA NA chr4-411 63549107 63549308 143 - chr4:63549147-63549199 NA NA NA NA NA chr4-410 63420651 63420931 196 - chr4:63420731-63420885 NA NA NA NA NA chr4-409 63009233 63009520 156 - chr4:63009360-63009387 NA NA NA NA NA chr4-408 62898969 62899174 129 - chr4:62899015-62899083 NA NA NA NA NA chr4-407 62885545 62885687 122 - chr4:62885603-62885685 NA NA NA NA NA chr4-406 62706479 62706688 151 - chr4:62706529-62706626 NA NA NA NA NA chr4-405 62692187 62692362 150 - chr4:62692212-62692337 NA NA NA NA NA chr4-404 62623369 62623602 155 - chr4:62623453-62623536 NA NA NA NA NA chr4-403 62498898 62499275 245 - chr4:62499041-62499194 NA NA NA NA NA chr4-402 62429023 62429382 217 - chr4:62429154-62429176 NA NA NA NA NA chr4-401 62318574 62318875 210 - chr4:62318589-62318746 NA NA NA NA NA chr4-400 62271091 62271462 212 - chr4:62271306-62271415 NA NA NA NA NA chr4-399 62251973 62252190 164 - chr4:62252013-62252111 NA NA NA NA NA chr4-398 62075796 62076060 154 - chr4:62075886-62075931 NA NA NA NA NA chr4-397 62057031 62057310 174 - chr4:62057086-62057180 NA NA NA NA NA chr4-396 62045616 62045916 156 - chr4:62045756-62045770 NA NA NA NA NA chr4-395 62001580 62001831 167 - chr4:62001659-62001737 NA NA NA NA NA chr4-394 61991499 61991867 240 - chr4:61991642-61991818 NA NA NA NA NA chr4-393 61905737 61906124 229 - chr4:61905800-61905959 NA NA NA NA NA chr4-392 61878493 61878777 162 - chr4:61878623-61878671 NA NA NA NA NA chr4-391 61656058 61656305 155 - chr4:61656146-61656205 NA NA NA NA NA chr4-390 61640834 61641112 154 - chr4:61640958-61640988 NA NA NA NA NA chr4-389 61608010 61608417 281 - chr4:61608181-61608381 NA NA NA NA NA chr4-388 61586796 61587018 160 - chr4:61586866-61586960 NA NA NA NA NA chr4-387 61568721 61568914 156 - chr4:61568760-61568881 NA NA NA NA NA chr4-386 61286608 61286878 199 - chr4:61286608-61286665 NA NA NA NA NA chr4-385 61248441 61248793 244 - chr4:61248635-61248748 NA NA NA NA NA chr4-384 61216710 61216984 136 - chr4:61216853-61216856 NA NA NA NA NA chr4-383 61198852 61199026 152 - chr4:61198906-61199014 NA NA NA NA NA chr4-382 61173636 61173849 174 - chr4:61173662-61173784 NA NA NA NA NA chr4-381 61125286 61125518 161 - chr4:61125340-61125437 NA NA NA NA NA chr4-380 61095210 61095456 158 - chr4:61095284-61095340 NA NA NA NA NA chr4-379 61058515 61058685 117 - chr4:61058541-61058578 NA NA NA NA NA chr4-378 60961098 60961392 150 - chr4:60961246-60961256 NA NA NA NA NA chr4-377 60960396 60960717 246 - chr4:60960427-60960554 NA NA NA NA NA chr4-376 60949655 60949831 155 - chr4:60949678-60949811 NA NA NA NA NA chr4-375 60944174 60944341 154 - chr4:60944193-60944331 NA NA NA NA NA chr4-374 60915005 60915182 147 - chr4:60915038-60915158 NA NA NA NA NA chr4-373 60898467 60898758 246 - chr4:60898498-60898654 NA NA NA NA NA chr4-372 60810265 60810657 257 - chr4:60810480-60810562 NA NA NA NA NA chr4-371 60794656 60795085 239 - chr4:60794803-60794809 NA NA NA NA NA chr4-370 60766236 60766635 220 - chr4:60766586-60766592 NA NA NA NA NA chr4-369 60718661 60718878 137 - chr4:60718745-60718800 NA NA NA NA NA chr4-368 60657657 60658116 239 - chr4:60657891-60657908 NA NA NA NA NA chr4-367 60592641 60592920 253 - chr4:60592647-60592884 NA NA NA NA NA chr4-366 60477584 60478076 403 - chr4:60477617-60477875 NA NA NA NA NA chr4-365 60363164 60363421 163 - chr4:60363256-60363326 NA NA NA NA NA chr4-364 60184359 60185008 310 - chr4:60184829-60184885 NA NA NA NA NA chr4-363 60117778 60118095 161 - chr4:60117938-60117941 NA NA NA NA NA chr4-362 59972353 59972516 123 - chr4:59972393-59972496 NA NA NA NA NA chr4-361 59909558 59909786 149 - chr4:59909639-59909711 NA NA NA NA NA chr4-360 59908907 59909154 152 - chr4:59909006-59909067 NA NA NA NA NA chr4-359 59837169 59837341 160 - chr4:59837169-59837323 NA NA NA NA NA chr4-358 59810299 59810546 159 - chr4:59810383-59810456 NA NA NA NA NA chr4-357 59629830 59629977 139 - chr4:59629833-59629968 NA NA NA NA NA chr4-356 59495858 59496056 166 - chr4:59495879-59496029 NA NA NA NA NA chr4-355 59348140 59348345 134 - chr4:59348177-59348257 NA NA NA NA NA chr4-354 59307150 59307454 161 - chr4:59307301-59307315 NA NA NA NA NA chr4-353 59219398 59219575 137 - chr4:59219417-59219493 NA NA NA NA NA chr4-352 59041073 59041340 154 - chr4:59041193-59041241 NA NA NA NA NA chr4-351 58984442 58984740 204 - chr4:58984575-58984732 NA NA NA NA NA chr4-350 58505416 58505600 166 - chr4:58505434-58505591 NA NA NA NA NA chr4-349 58474608 58474880 152 - chr4:58474727-58474758 NA NA NA NA NA chr4-348 58452287 58452533 168 - chr4:58452309-58452427 NA NA NA NA NA chr4-347 58397557 58397897 232 - chr4:58397584-58397627 NA NA NA NA NA chr4-346 58256402 58256715 191 - chr4:58256566-58256614 NA NA NA NA NA chr4-345 58164363 58164595 149 - chr4:58164445-58164510 NA NA NA NA NA chr4-344 58114244 58114425 136 - chr4:58114271-58114344 NA NA NA NA NA chr4-343 57991450 57991777 172 - chr4:57991681-57991774 NA NA NA NA NA chr4-342 57986594 57986905 224 - chr4:57986601-57986738 NA NA NA NA NA chr4-341 57926225 57926513 167 - chr4:57926355-57926410 NA NA NA NA NA chr4-340 57904375 57904543 166 - chr4:57904378-57904543 NA NA NA NA NA chr4-339 57503436 57503729 156 - chr4:57503583-57503612 NA NA NA NA NA chr4-338 57264612 57264806 152 - chr4:57264652-57264763 NA NA NA NA NA chr4-337 57226772 57226948 152 - chr4:57226807-57226947 NA NA NA NA NA chr4-336 57156728 57156919 153 - chr4:57156738-57156867 NA NA NA NA NA chr4-335 56893735 56894043 161 - chr4:56893886-56893904 NA NA NA NA NA chr4-334 56633126 56633479 186 - chr4:56633325-56633328 NA NA NA NA NA chr4-333 56627944 56628145 142 - chr4:56627955-56627990 NA NA NA NA NA chr4-332 56600578 56600856 144 - chr4:56600722-56600727 NA NA NA NA NA chr4-331 56457949 56458354 292 - chr4:56458029-56458175 NA NA NA NA NA chr4-330 56269620 56269911 149 - chr4:56269766-56269771 NA NA NA NA NA chr4-329 56267608 56267805 185 - chr4:56267608-56267769 NA NA NA NA NA chr4-328 56266225 56266503 179 - chr4:56266330-56266407 NA NA NA NA NA chr4-327 55981671 55981894 116 - chr4:55981730-55981763 NA NA NA NA NA chr4-326 55896111 55896506 268 - chr4:55896340-55896495 NA NA NA NA NA chr4-325 55603136 55603436 170 - chr4:55603352-55603373 NA NA NA NA NA chr4-324 55602122 55602757 317 - chr4:55602605-55602740 NA NA NA NA NA chr4-323 55596611 55596934 198 - chr4:55596721-55596779 NA NA NA NA NA chr4-322 55570137 55570487 197 - chr4:55570186-55570335 NA NA NA NA NA chr4-321 55523148 55523523 227 - chr4:55523298-55523439 NA NA NA NA NA chr4-320 55509884 55510107 183 - chr4:55509956-55510083 NA NA NA NA NA chr4-319 55498118 55498451 200 - chr4:55498230-55498276 NA NA NA NA NA chr4-318 55291082 55291259 143 - chr4:55291112-55291223 NA NA NA NA NA chr4-317 55251055 55251364 160 - chr4:55251215-55251237 NA NA NA NA NA chr4-316 55176413 55176876 285 - chr4:55176522-55176560 NA NA NA NA NA chr4-315 55146433 55146677 158 - chr4:55146527-55146607 NA NA NA NA NA chr4-314 55099969 55100233 158 - chr4:55100072-55100121 NA NA NA NA NA chr4-313 55082870 55083033 147 - chr4:55082888-55083021 NA NA NA NA NA chr4-312 55070857 55071315 296 - chr4:55071144-55071238 NA NA NA NA NA chr4-311 55054036 55054368 222 - chr4:55054119-55054204 NA NA NA NA NA chr4-310 55029465 55029717 144 - chr4:55029549-55029597 NA NA NA NA NA chr4-309 54751404 54751764 220 - chr4:54751559-54751709 NA NA NA NA NA chr4-308 54733466 54733742 193 - chr4:54733585-54733736 NA NA NA NA NA chr4-307 54715122 54715268 118 - chr4:54715122-54715184 NA NA NA NA NA chr4-306 54586116 54586664 338 - chr4:54586323-54586589 NA NA NA NA NA chr4-305 54414294 54414513 150 - chr4:54414333-54414384 NA NA NA NA NA chr4-304 54411777 54412506 298 - chr4:54412235-54412272 NA NA NA NA NA chr4-303 54348818 54348958 139 - chr4:54348821-54348958 NA NA NA NA NA chr4-302 54220303 54220565 186 - chr4:54220459-54220529 NA NA NA NA NA chr4-301 54220080 54220243 150 - chr4:54220093-54220230 NA NA NA NA NA chr4-300 54161505 54161879 259 - chr4:54161572-54161668 NA NA NA NA NA chr4-299 54081142 54081302 140 - chr4:54081169-54081299 NA NA NA NA NA chr4-298 54079773 54079944 125 - chr4:54079836-54079932 NA NA NA NA NA chr4-297 54034234 54034436 193 - chr4:54034239-54034419 NA NA NA NA NA chr4-296 54029900 54030118 153 - chr4:54029968-54030059 NA NA NA NA NA chr4-295 53955880 53956223 174 - chr4:53956070-53956096 NA NA NA NA NA chr4-294 53861169 53861418 143 - chr4:53861263-53861306 NA NA NA NA NA chr4-293 53854097 53854281 129 - chr4:53854108-53854204 NA NA NA NA NA chr4-292 53750038 53750448 260 - chr4:53750086-53750094 NA NA NA NA NA chr4-291 53724244 53724601 165 - chr4:53724380-53724381 NA NA NA NA NA chr4-290 53692354 53692638 148 - chr4:53692452-53692483 NA NA NA NA NA chr4-7 5355117 5355445 212 - chr4:5355282-5355436 NA NA NA NA NA chr4-289 53534298 53534820 272 - chr4:53534338-53534465 NA NA NA NA NA chr4-288 53089839 53090365 306 - chr4:53090112-53090269 NA NA NA NA NA chr4-287 52865679 52866360 375 - chr4:52866094-52866276 NA NA NA NA NA chr4-286 52758551 52758825 207 - chr4:52758578-52758678 NA NA NA NA NA chr4-285 52397556 52397741 166 - chr4:52397579-52397727 NA NA NA NA NA chr4-284 52164679 52164854 129 - chr4:52164699-52164756 NA NA NA NA NA chr4-283 52158687 52158912 152 - chr4:52158780-52158849 NA NA NA NA NA chr4-282 51959113 51959498 230 - chr4:51959380-51959399 NA NA NA NA NA chr4-281 51918737 51919032 193 - chr4:51918823-51918922 NA NA NA NA NA chr4-280 51903850 51904028 122 - chr4:51903916-51904010 NA NA NA NA NA chr4-279 51848215 51848387 159 - chr4:51848221-51848360 NA NA NA NA NA chr4-278 49056998 49057524 245 - chr4:49057101-49057154 NA NA NA NA NA chr4-277 48987588 48987885 151 - chr4:48987726-48987735 NA NA NA NA NA chr4-276 48707204 48707484 153 - chr4:48707330-48707355 NA NA NA NA NA chr4-275 48672899 48673046 118 - chr4:48672974-48673040 NA NA NA NA NA chr4-274 48591284 48591584 247 - chr4:48591434-48591575 NA NA NA NA NA chr4-273 48568032 48568419 227 - chr4:48568284-48568345 NA NA NA NA NA chr4-272 48566313 48566504 117 - chr4:48566457-48566465 NA NA NA NA NA chr4-271 48387796 48388183 189 - chr4:48387808-48387898 NA NA NA NA NA chr4-270 48327276 48327547 215 - chr4:48327373-48327476 NA NA NA NA NA chr4-269 48270433 48270974 263 - chr4:48270620-48270707 NA NA NA NA NA chr4-6 4799992 4800171 156 - chr4:4800019-4800156 NA NA NA NA NA chr4-268 47899362 47899615 167 - chr4:47899466-47899538 NA NA NA NA NA chr4-267 47891698 47891991 135 - chr4:47891768-47891824 NA NA NA NA NA chr4-266 47831958 47832129 157 - chr4:47831970-47832111 NA NA NA NA NA chr4-265 47741976 47742189 193 - chr4:47741984-47742137 NA NA NA NA NA chr4-264 47662173 47662492 203 - chr4:47662236-47662322 NA NA NA NA NA chr4-263 47641160 47641336 136 - chr4:47641201-47641257 NA NA NA NA NA chr4-262 47538947 47539191 166 - chr4:47539031-47539116 NA NA NA NA NA chr4-261 47536143 47536480 222 - chr4:47536320-47536396 NA NA NA NA NA chr4-260 47504995 47505372 173 - chr4:47505073-47505105 NA NA NA NA NA chr4-259 47499747 47500138 197 - chr4:47499923-47499935 NA NA NA NA NA chr4-258 47445947 47446286 187 - chr4:47445995-47446082 NA NA NA NA NA chr4-257 47400006 47400223 194 - chr4:47400071-47400219 NA NA NA NA NA chr4-256 47305445 47305808 273 - chr4:47305453-47305632 NA NA NA NA NA chr4-255 47304515 47304843 216 - chr4:47304588-47304748 NA NA NA NA NA chr4-254 47208603 47208865 133 - chr4:47208702-47208721 NA NA NA NA NA chr4-253 47085915 47086254 168 - chr4:47086070-47086075 NA NA NA NA NA chr4-252 46904843 46905114 176 - chr4:46904952-46905026 NA NA NA NA NA chr4-251 46902059 46902557 222 - chr4:46902191-46902209 NA NA NA NA NA chr4-250 46853451 46853698 119 - chr4:46853547-46853554 NA NA NA NA NA chr4-249 46827876 46828061 142 - chr4:46827997-46828053 NA NA NA NA NA chr4-248 46688487 46688751 186 - chr4:46688556-46688655 NA NA NA NA NA chr4-247 46668697 46669087 229 - chr4:46668747-46668906 NA NA NA NA NA chr4-246 46573939 46574159 148 - chr4:46574004-46574073 NA NA NA NA NA chr4-245 46547013 46547363 231 - chr4:46547128-46547287 NA NA NA NA NA chr4-244 46531475 46531617 124 - chr4:46531521-46531613 NA NA NA NA NA chr4-243 46396003 46396147 135 - chr4:46396016-46396140 NA NA NA NA NA chr4-242 46381675 46382017 193 - chr4:46381720-46381816 NA NA NA NA NA chr4-241 46369682 46369929 153 - chr4:46369776-46369835 NA NA NA NA NA chr4-240 46233708 46233927 149 - chr4:46233794-46233865 NA NA NA NA NA chr4-239 46167396 46167908 303 - chr4:46167727-46167788 NA NA NA NA NA chr4-238 46113761 46113943 175 - chr4:46113782-46113943 NA NA NA NA NA chr4-237 46101173 46101490 207 - chr4:46101334-46101486 NA NA NA NA NA chr4-236 46067665 46067926 144 - chr4:46067785-46067815 NA NA NA NA NA chr4-235 45788071 45788249 140 - chr4:45788108-45788209 NA NA NA NA NA chr4-234 45708219 45708424 138 - chr4:45708264-45708346 NA NA NA NA NA chr4-233 45573173 45573327 144 - chr4:45573185-45573309 NA NA NA NA NA chr4-232 45460610 45461106 237 - chr4:45460909-45460927 NA NA NA NA NA chr4-231 45317924 45318227 236 - chr4:45317946-45318070 NA NA NA NA NA chr4-230 45313031 45313253 176 - chr4:45313031-45313184 NA NA NA NA NA chr4-229 45204003 45204182 154 - chr4:45204024-45204149 NA NA NA NA NA chr4-228 44859939 44860158 157 - chr4:44859993-44860092 NA NA NA NA NA chr4-227 44680676 44680974 248 - chr4:44680718-44680866 NA NA NA NA NA chr4-226 44536323 44536632 212 - chr4:44536470-44536560 NA NA NA NA NA chr4-225 44425272 44425461 162 - chr4:44425294-44425402 NA NA NA NA NA chr4-224 44214416 44214719 158 - chr4:44214557-44214570 NA NA NA NA NA chr4-223 44166238 44166851 341 - chr4:44166480-44166519 NA NA NA NA NA chr4-222 43565538 43565790 177 - chr4:43565609-43565713 NA NA NA NA NA chr4-221 43322614 43323178 304 - chr4:43322786-43322903 NA NA NA NA NA chr4-220 43285428 43285592 153 - chr4:43285437-43285580 NA NA NA NA NA chr4-219 43198049 43198333 189 - chr4:43198168-43198250 NA NA NA NA NA chr4-218 43067048 43067338 155 - chr4:43067180-43067197 NA NA NA NA NA chr4-217 42872022 42872332 172 - chr4:42872150-42872174 NA NA NA NA NA chr4-5 4278696 4278904 164 - chr4:4278744-4278820 NA NA NA NA NA chr4-216 42575243 42575494 143 - chr4:42575346-42575376 NA NA NA NA NA chr4-215 42437077 42437262 174 - chr4:42437086-42437238 NA NA NA NA NA chr4-214 42395054 42395207 143 - chr4:42395080-42395203 NA NA NA NA NA chr4-213 42210643 42211066 310 - chr4:42210757-42211046 NA NA NA NA NA chr4-212 42059207 42059424 134 - chr4:42059299-42059359 NA NA NA NA NA chr4-211 41979333 41979582 155 - chr4:41979366-41979474 NA NA NA NA NA chr4-210 41677569 41677922 231 - chr4:41677703-41677824 NA NA NA NA NA chr4-209 41656095 41656355 160 - chr4:41656241-41656278 NA NA NA NA NA chr4-208 41599426 41599896 266 - chr4:41599702-41599866 NA NA NA NA NA chr4-207 41446393 41446656 128 - chr4:41446456-41446485 NA NA NA NA NA chr4-206 41299737 41299933 119 - chr4:41299840-41299869 NA NA NA NA NA chr4-205 41255333 41255621 243 - chr4:41255357-41255510 NA NA NA NA NA chr4-204 41008975 41009432 229 - chr4:41009221-41009240 NA NA NA NA NA chr4-203 41005931 41006097 157 - chr4:41005935-41006078 NA NA NA NA NA chr4-202 40949822 40950214 216 - chr4:40949854-40949966 NA NA NA NA NA chr4-201 40815369 40815675 202 - chr4:40815533-40815601 NA NA NA NA NA chr4-200 40670313 40670792 236 - chr4:40670556-40670569 NA NA NA NA NA chr4-199 40337555 40337879 189 - chr4:40337681-40337726 NA NA NA NA NA chr4-198 40263435 40263902 238 - chr4:40263743-40263831 NA NA NA NA NA chr4-197 40211582 40211784 148 - chr4:40211724-40211774 NA NA NA NA NA chr4-196 39989633 39990128 329 - chr4:39989931-39989969 NA NA NA NA NA chr4-195 39940101 39940474 244 - chr4:39940110-39940285 NA NA NA NA NA chr4-194 39893114 39893382 161 - chr4:39893225-39893277 NA NA NA NA NA chr4-193 39684706 39684860 132 - chr4:39684737-39684858 NA NA NA NA NA chr4-192 39557891 39558173 167 - chr4:39557976-39557998 NA NA NA NA NA chr4-191 39410731 39410971 138 - chr4:39410871-39410888 NA NA NA NA NA chr4-190 39410158 39410430 185 - chr4:39410229-39410311 NA NA NA NA NA chr4-189 39354541 39354726 152 - chr4:39354578-39354701 NA NA NA NA NA chr4-188 39280824 39281270 190 - chr4:39281128-39281147 NA NA NA NA NA chr4-187 39213537 39213724 133 - chr4:39213625-39213687 NA NA NA NA NA chr4-186 39187531 39187713 143 - chr4:39187567-39187668 NA NA NA NA NA chr4-185 39050769 39051205 243 - chr4:39050803-39050925 NA NA NA NA NA chr4-184 39003285 39003459 168 - chr4:39003303-39003459 NA NA NA NA NA chr4-183 38873538 38873930 183 - chr4:38873677-38873686 NA NA NA NA NA chr4-182 38690875 38691140 161 - chr4:38691004-38691113 NA NA NA NA NA chr4-181 38536893 38537206 166 - chr4:38537032-38537043 NA NA NA NA NA chr4-180 38405652 38405863 115 - chr4:38405765-38405801 NA NA NA NA NA chr4-179 38340167 38340344 147 - chr4:38340193-38340280 NA NA NA NA NA chr4-178 38292757 38292924 141 - chr4:38292771-38292892 NA NA NA NA NA chr4-177 38283819 38284061 148 - chr4:38283885-38283953 NA NA NA NA NA chr4-176 38277800 38278051 158 - chr4:38277879-38277951 NA NA NA NA NA chr4-175 38224077 38224260 154 - chr4:38224088-38224222 NA NA NA NA NA chr4-174 38142778 38142976 144 - chr4:38142826-38142879 NA NA NA NA NA chr4-173 38004085 38004247 156 - chr4:38004098-38004242 NA NA NA NA NA chr4-172 37995978 37996254 146 - chr4:37996109-37996126 NA NA NA NA NA chr4-171 37985829 37986039 157 - chr4:37985850-37985970 NA NA NA NA NA chr4-170 37971254 37971478 146 - chr4:37971331-37971398 NA NA NA NA NA chr4-169 37860141 37860382 158 - chr4:37860223-37860297 NA NA NA NA NA chr4-168 37627804 37627985 159 - chr4:37627806-37627954 NA NA NA NA NA chr4-167 37383445 37383760 211 - chr4:37383561-37383662 NA NA NA NA NA chr4-166 37289623 37289891 166 - chr4:37289743-37289798 NA NA NA NA NA chr4-165 37126083 37126402 169 - chr4:37126217-37126244 NA NA NA NA NA chr4-164 37051636 37051876 143 - chr4:37051733-37051779 NA NA NA NA NA chr4-163 36992636 36992891 139 - chr4:36992733-36992737 NA NA NA NA NA chr4-162 36919657 36919988 172 - chr4:36919781-36919813 NA NA NA NA NA chr4-161 36709967 36710233 236 - chr4:36709987-36710163 NA NA NA NA NA chr4 366577 367050 221 - chr4:366935-367030 NA NA NA NA NA chr4-160 36676937 36677223 191 - chr4:36677071-36677179 NA NA NA NA NA chr4-159 36558226 36558410 150 - chr4:36558262-36558380 NA NA NA NA NA chr4-158 36540373 36540636 224 - chr4:36540385-36540543 NA NA NA NA NA chr4-157 36506610 36506899 148 - chr4:36506744-36506767 NA NA NA NA NA chr4-156 36399091 36399316 138 - chr4:36399156-36399218 NA NA NA NA NA chr4-155 36353556 36353730 151 - chr4:36353578-36353705 NA NA NA NA NA chr4-154 36146555 36146800 140 - chr4:36146608-36146669 NA NA NA NA NA chr4-153 36144711 36144918 168 - chr4:36144745-36144869 NA NA NA NA NA chr4-152 36138724 36139019 167 - chr4:36138821-36138924 NA NA NA NA NA chr4-151 36026845 36027116 143 - chr4:36026985-36026994 NA NA NA NA NA chr4-150 35938841 35939078 205 - chr4:35938904-35939045 NA NA NA NA NA chr4-149 35552738 35552854 115 - chr4:35552741-35552854 NA NA NA NA NA chr4-148 35542496 35542858 192 - chr4:35542672-35542691 NA NA NA NA NA chr4-147 35476136 35476440 220 - chr4:35476247-35476392 NA NA NA NA NA chr4-146 35334258 35334804 325 - chr4:35334508-35334641 NA NA NA NA NA chr4-145 35314105 35314589 285 - chr4:35314272-35314374 NA NA NA NA NA chr4-144 35312328 35312718 207 - chr4:35312542-35312597 NA NA NA NA NA chr4-143 35269186 35269342 141 - chr4:35269188-35269301 NA NA NA NA NA chr4-142 35195099 35195364 188 - chr4:35195218-35195364 NA NA NA NA NA chr4-141 35184941 35185152 166 - chr4:35184978-35185091 NA NA NA NA NA chr4-140 35149330 35149500 163 - chr4:35149332-35149481 NA NA NA NA NA chr4-139 35075016 35075192 141 - chr4:35075061-35075162 NA NA NA NA NA chr4-138 35073398 35073730 284 - chr4:35073542-35073730 NA NA NA NA NA chr4-137 35009060 35009349 219 - chr4:35009188-35009299 NA NA NA NA NA chr4-136 35001145 35001364 140 - chr4:35001160-35001253 NA NA NA NA NA chr4-135 34949486 34949875 227 - chr4:34949728-34949753 NA NA NA NA NA chr4-134 34908057 34908253 167 - chr4:34908092-34908236 NA NA NA NA NA chr4-133 34503076 34503263 123 - chr4:34503082-34503170 NA NA NA NA NA chr4-132 34500151 34500461 166 - chr4:34500289-34500314 NA NA NA NA NA chr4-131 34473430 34473799 220 - chr4:34473504-34473617 NA NA NA NA NA chr4-130 34412499 34412738 147 - chr4:34412603-34412655 NA NA NA NA NA chr4-129 34402031 34402196 116 - chr4:34402105-34402145 NA NA NA NA NA chr4-128 34400401 34400573 165 - chr4:34400421-34400572 NA NA NA NA NA chr4-127 34272031 34272278 161 - chr4:34272118-34272194 NA NA NA NA NA chr4-126 34086778 34087102 205 - chr4:34086953-34086959 NA NA NA NA NA chr4-125 33952460 33952696 148 - chr4:33952543-33952598 NA NA NA NA NA chr4-124 33933112 33933448 200 - chr4:33933296-33933408 NA NA NA NA NA chr4-123 33926001 33926356 234 - chr4:33926308-33926328 NA NA NA NA NA chr4-122 33916712 33917013 227 - chr4:33916816-33916981 NA NA NA NA NA chr4-121 33791941 33792263 204 - chr4:33791961-33792096 NA NA NA NA NA chr4-120 33781472 33781754 193 - chr4:33781508-33781636 NA NA NA NA NA chr4-119 33751599 33752296 408 - chr4:33751671-33751744 NA NA NA NA NA chr4-118 33712835 33713078 222 - chr4:33712836-33713016 NA NA NA NA NA chr4-117 33673109 33673278 146 - chr4:33673154-33673254 NA NA NA NA NA chr4-116 33643311 33643459 121 - chr4:33643341-33643408 NA NA NA NA NA chr4-115 33617714 33618044 201 - chr4:33617755-33617871 NA NA NA NA NA chr4-114 33614315 33614583 151 - chr4:33614442-33614471 NA NA NA NA NA chr4-113 33580946 33581103 136 - chr4:33580957-33581077 NA NA NA NA NA chr4-112 33546437 33546751 207 - chr4:33546608-33546676 NA NA NA NA NA chr4-111 33461346 33461748 236 - chr4:33461584-33461737 NA NA NA NA NA chr4-110 33441927 33442106 140 - chr4:33442041-33442103 NA NA NA NA NA chr4-109 33418956 33419370 260 - chr4:33419154-33419368 NA NA NA NA NA chr4-108 33394372 33394813 227 - chr4:33394430-33394521 NA NA NA NA NA chr4-107 33374006 33374453 232 - chr4:33374197-33374278 NA NA NA NA NA chr4-106 33354120 33354469 181 - chr4:33354282-33354289 NA NA NA NA NA chr4-105 33331073 33331308 138 - chr4:33331138-33331195 NA NA NA NA NA chr4-104 33269981 33270154 162 - chr4:33270008-33270151 NA NA NA NA NA chr4-103 33206293 33206549 148 - chr4:33206406-33206451 NA NA NA NA NA chr4-102 33177370 33177564 168 - chr4:33177384-33177539 NA NA NA NA NA chr4-101 32887632 32887973 206 - chr4:32887807-32887918 NA NA NA NA NA chr4-100 32857758 32858137 257 - chr4:32857984-32858067 NA NA NA NA NA chr4-99 32848064 32848562 294 - chr4:32848091-32848223 NA NA NA NA NA chr4-98 32597441 32597701 188 - chr4:32597447-32597491 NA NA NA NA NA chr4-97 32587568 32587752 141 - chr4:32587623-32587733 NA NA NA NA NA chr4-96 32585797 32586121 217 - chr4:32585972-32586027 NA NA NA NA NA chr4-95 32549339 32549640 203 - chr4:32549388-32549542 NA NA NA NA NA chr4-94 32458714 32459049 275 - chr4:32458832-32458987 NA NA NA NA NA chr4-93 32438984 32439375 237 - chr4:32439209-32439369 NA NA NA NA NA chr4-92 32107738 32107915 147 - chr4:32107766-32107884 NA NA NA NA NA chr4-91 32065230 32065431 143 - chr4:32065300-32065379 NA NA NA NA NA chr4-90 31971063 31971504 255 - chr4:31971078-31971219 NA NA NA NA NA chr4-89 31968320 31968795 314 - chr4:31968377-31968426 NA NA NA NA NA chr4-88 31959273 31959561 162 - chr4:31959377-31959424 NA NA NA NA NA chr4-87 31949911 31950298 214 - chr4:31950025-31950062 NA NA NA NA NA chr4-86 31908486 31908942 254 - chr4:31908656-31908660 NA NA NA NA NA chr4-85 31815734 31815894 120 - chr4:31815791-31815891 NA NA NA NA NA chr4-84 31805729 31805937 164 - chr4:31805733-31805873 NA NA NA NA NA chr4-83 31797969 31798379 321 - chr4:31798034-31798242 NA NA NA NA NA chr4-82 31690920 31691088 129 - chr4:31691036-31691087 NA NA NA NA NA chr4-81 31662932 31663149 142 - chr4:31663003-31663072 NA NA NA NA NA chr4-80 31560309 31560580 140 - chr4:31560428-31560443 NA NA NA NA NA chr4-79 31445686 31445892 117 - chr4:31445811-31445821 NA NA NA NA NA chr4-78 31274744 31275064 285 - chr4:31274746-31274996 NA NA NA NA NA chr4-77 31222334 31222925 391 - chr4:31222516-31222689 NA NA NA NA NA chr4-76 31206356 31206585 150 - chr4:31206436-31206508 NA NA NA NA NA chr4-75 31149238 31149386 124 - chr4:31149279-31149355 NA NA NA NA NA chr4-74 30969448 30969698 168 - chr4:30969530-30969616 NA NA NA NA NA chr4-73 30902941 30903153 157 - chr4:30903006-30903103 NA NA NA NA NA chr4-72 30876382 30876682 166 - chr4:30876518-30876549 NA NA NA NA NA chr4-71 30874425 30874858 206 - chr4:30874709-30874748 NA NA NA NA NA chr4-70 30862204 30862382 120 - chr4:30862255-30862310 NA NA NA NA NA chr4-69 30845404 30845898 229 - chr4:30845735-30845765 NA NA NA NA NA chr4-68 30837521 30837803 176 - chr4:30837571-30837688 NA NA NA NA NA chr4-67 30793515 30793703 149 - chr4:30793586-30793680 NA NA NA NA NA chr4-66 30705970 30706197 157 - chr4:30706038-30706126 NA NA NA NA NA chr4-65 30684660 30684891 148 - chr4:30684675-30684774 NA NA NA NA NA chr4-64 30671296 30671603 289 - chr4:30671301-30671554 NA NA NA NA NA chr4-63 30643820 30644128 156 - chr4:30643983-30643998 NA NA NA NA NA chr4-62 30638461 30638713 155 - chr4:30638540-30638607 NA NA NA NA NA chr4-61 30636949 30637408 182 - chr4:30637344-30637367 NA NA NA NA NA chr4-60 30563313 30563450 123 - chr4:30563324-30563440 NA NA NA NA NA chr4-59 30446099 30446294 129 - chr4:30446146-30446187 NA NA NA NA NA chr4-58 30435385 30435906 266 - chr4:30435709-30435748 NA NA NA NA NA chr4-57 30417503 30417829 196 - chr4:30417679-30417722 NA NA NA NA NA chr4-56 30416540 30416914 238 - chr4:30416733-30416903 NA NA NA NA NA chr4-55 30409986 30410194 199 - chr4:30409996-30410177 NA NA NA NA NA chr4-54 30386932 30387286 216 - chr4:30387127-30387274 NA NA NA NA NA chr4-53 30294501 30295103 344 - chr4:30294679-30294791 NA NA NA NA NA chr4-4 3007854 3008010 142 - chr4:3007862-3007997 NA NA NA NA NA chr4-52 29398123 29398401 149 - chr4:29398248-29398270 NA NA NA NA NA chr4-51 29257323 29257553 162 - chr4:29257389-29257484 NA NA NA NA NA chr4-50 29154230 29154611 239 - chr4:29154321-29154367 NA NA NA NA NA chr4-49 28293294 28293557 216 - chr4:28293309-28293446 NA NA NA NA NA chr4-48 28089447 28089641 147 - chr4:28089500-28089606 NA NA NA NA NA chr4-47 27943243 27943480 210 - chr4:27943258-27943414 NA NA NA NA NA chr4-46 27863890 27864122 169 - chr4:27863941-27864035 NA NA NA NA NA chr4-45 26905846 26906031 118 - chr4:26905871-26905943 NA NA NA NA NA chr4-44 26622310 26623130 454 - chr4:26622956-26623011 NA NA NA NA NA chr4-43 26323866 26324115 219 - chr4:26323905-26324064 NA NA NA NA NA chr4-3 2528469 2528668 158 - chr4:2528521-2528649 NA NA NA NA NA chr4-42 24675616 24676209 351 - chr4:24675804-24675862 NA NA NA NA NA chr4-41 23837434 23837914 249 - chr4:23837750-23837853 NA NA NA NA NA chr4-40 23082478 23082761 144 - chr4:23082632-23082652 NA NA NA NA NA chr4-39 22917807 22918262 340 - chr4:22917950-22918203 NA NA NA NA NA chr4-38 22244903 22245169 206 - chr4:22245015-22245135 NA NA NA NA NA chr4-2 2191316 2191489 149 - chr4:2191362-2191476 NA NA NA NA NA chr4-37 21348350 21348596 219 - chr4:21348389-21348593 NA NA NA NA NA chr4-36 20550791 20550951 156 - chr4:20550793-20550946 NA NA NA NA NA chr4-35 20550400 20550625 143 - chr4:20550472-20550523 NA NA NA NA NA chr4-34 20310537 20310735 116 - chr4:20310631-20310677 NA NA NA NA NA chr4-33 20308522 20308923 319 - chr4:20308557-20308712 NA NA NA NA NA chr4-32 20201893 20202097 117 - chr4:20201952-20201996 NA NA NA NA NA chr4-31 20042389 20042686 203 - chr4:20042439-20042595 NA NA NA NA NA chr4-30 20007637 20007944 180 - chr4:20007811-20007911 NA NA NA NA NA chr4-29 19231740 19232168 310 - chr4:19231870-19232121 NA NA NA NA NA chr4-28 19169517 19169922 190 - chr4:19169745-19169760 NA NA NA NA NA chr4-27 19088928 19089401 362 - chr4:19089163-19089303 NA NA NA NA NA chr4-1008 188989648 188989859 160 - chr4:188989699-188989808 NA NA NA NA NA chr4-1007 187741257 187741523 171 - chr4:187741388-187741500 NA NA NA NA NA chr4-1006 187299705 187300022 188 - chr4:187299758-187299855 NA NA NA NA NA chr4-1005 187249078 187249309 148 - chr4:187249167-187249238 NA NA NA NA NA chr4-1004 186867741 186867900 149 - chr4:186867755-186867892 NA NA NA NA NA chr4-1003 185444627 185444913 242 - chr4:185444656-185444810 NA NA NA NA NA chr4-1002 185289943 185290161 164 - chr4:185289944-185290081 NA NA NA NA NA chr4-1001 184905042 184905549 314 - chr4:184905235-184905356 NA NA NA NA NA chr4-1000 184675505 184675864 242 - chr4:184675596-184675695 NA NA NA NA NA chr4-26 18413943 18414352 243 - chr4:18414086-18414140 NA NA NA NA NA chr4-999 183824363 183824534 149 - chr4:183824371-183824505 NA NA NA NA NA chr4-998 183549993 183550234 181 - chr4:183550063-183550194 NA NA NA NA NA chr4-997 183060122 183060420 254 - chr4:183060221-183060387 NA NA NA NA NA chr4-996 182948929 182949255 222 - chr4:182949022-182949129 NA NA NA NA NA chr4-995 181983192 181983627 216 - chr4:181983327-181983366 NA NA NA NA NA chr4-994 181869204 181869393 144 - chr4:181869246-181869342 NA NA NA NA NA chr4-993 181690643 181690900 162 - chr4:181690734-181690797 NA NA NA NA NA chr4-992 181345238 181345599 224 - chr4:181345336-181345384 NA NA NA NA NA chr4-991 181341898 181342092 177 - chr4:181341925-181342080 NA NA NA NA NA chr4-25 18127956 18128107 117 - chr4:18127979-18128051 NA NA NA NA NA chr4-990 180977569 180977769 116 - chr4:180977615-180977666 NA NA NA NA NA chr4-989 180765104 180765644 234 - chr4:180765226-180765246 NA NA NA NA NA chr4-988 180290035 180290259 170 - chr4:180290102-180290245 NA NA NA NA NA chr4-987 180087696 180087997 153 - chr4:180087846-180087853 NA NA NA NA NA chr4-986 180056315 180056493 146 - chr4:180056345-180056460 NA NA NA NA NA chr4-985 179781558 179781798 153 - chr4:179781662-179781745 NA NA NA NA NA chr4-984 179770690 179770960 134 - chr4:179770784-179770803 NA NA NA NA NA chr4-983 179633827 179634125 157 - chr4:179633966-179633983 NA NA NA NA NA chr4-982 179272773 179273084 243 - chr4:179272958-179273065 NA NA NA NA NA chr4-981 177897399 177897628 164 - chr4:177897454-177897558 NA NA NA NA NA chr4-980 177833843 177834129 271 - chr4:177833845-177834086 NA NA NA NA NA chr4-979 177366179 177366537 191 - chr4:177366364-177366406 NA NA NA NA NA chr4-978 177226590 177226821 160 - chr4:177226655-177226738 NA NA NA NA NA chr4-977 177123648 177123940 143 - chr4:177123775-177123780 NA NA NA NA NA chr4-976 176730453 176730764 162 - chr4:176730596-176730603 NA NA NA NA NA chr4-975 176661409 176661676 199 - chr4:176661424-176661589 NA NA NA NA NA chr4-974 176522975 176523224 195 - chr4:176522979-176523145 NA NA NA NA NA chr4-973 176242328 176242505 146 - chr4:176242359-176242474 NA NA NA NA NA chr4-972 176049180 176049342 154 - chr4:176049187-176049332 NA NA NA NA NA chr4-971 175183362 175183689 173 - chr4:175183365-175183461 NA NA NA NA NA chr4-970 174652319 174652674 225 - chr4:174652376-174652536 NA NA NA NA NA chr4-969 174267735 174267861 113 - chr4:174267770-174267857 NA NA NA NA NA chr4-968 174263333 174263741 253 - chr4:174263398-174263406 NA NA NA NA NA chr4-967 173401587 173401921 169 - chr4:173401764-173401780 NA NA NA NA NA chr4-966 173394496 173394811 249 - chr4:173394664-173394796 NA NA NA NA NA chr4-965 172800843 172801131 152 - chr4:172800944-172801028 NA NA NA NA NA chr4-964 172021697 172021969 154 - chr4:172021814-172021849 NA NA NA NA NA chr4-963 171871334 171871808 332 - chr4:171871386-171871621 NA NA NA NA NA chr4-962 171515939 171516408 343 - chr4:171516034-171516125 NA NA NA NA NA chr4-961 171463228 171463413 157 - chr4:171463255-171463398 NA NA NA NA NA chr4-960 171262262 171262432 113 - chr4:171262287-171262359 NA NA NA NA NA chr4-959 171251331 171251692 209 - chr4:171251579-171251588 NA NA NA NA NA chr4-958 171128899 171129188 218 - chr4:171128933-171129009 NA NA NA NA NA chr4-957 170950683 170951074 235 - chr4:170950851-170951008 NA NA NA NA NA chr4-956 170828095 170828335 114 - chr4:170828245-170828257 NA NA NA NA NA chr4-955 170418654 170419115 270 - chr4:170418969-170418986 NA NA NA NA NA chr4-954 170270420 170270742 172 - chr4:170270570-170270592 NA NA NA NA NA chr4-953 170010679 170010863 155 - chr4:170010683-170010784 NA NA NA NA NA chr4-952 169648510 169648848 184 - chr4:169648644-169648654 NA NA NA NA NA chr4-24 16905467 16905626 151 - chr4:16905479-16905626 NA NA NA NA NA chr4-951 168983740 168983879 130 - chr4:168983765-168983878 NA NA NA NA NA chr4-950 168747898 168748245 173 - chr4:168748018-168748044 NA NA NA NA NA chr4-949 168652569 168652762 125 - chr4:168652617-168652654 NA NA NA NA NA chr4-948 168365754 168365923 128 - chr4:168365785-168365862 NA NA NA NA NA chr4-947 168191646 168191812 157 - chr4:168191655-168191803 NA NA NA NA NA chr4-946 167746355 167746632 131 - chr4:167746367-167746419 NA NA NA NA NA chr4-945 167736324 167736539 119 - chr4:167736431-167736465 NA NA NA NA NA chr4-944 167561987 167562282 283 - chr4:167562001-167562278 NA NA NA NA NA chr4-23 16728742 16729052 156 - chr4:16728899-16728904 NA NA NA NA NA chr4-943 166818493 166818880 207 - chr4:166818567-166818647 NA NA NA NA NA chr4-942 166014858 166015075 161 - chr4:166014885-166014961 NA NA NA NA NA chr4-941 165768125 165768314 137 - chr4:165768183-165768265 NA NA NA NA NA chr4-940 165287361 165287575 140 - chr4:165287430-165287491 NA NA NA NA NA chr4-939 165182356 165182503 143 - chr4:165182359-165182500 NA NA NA NA NA chr4-938 165152663 165152929 159 - chr4:165152774-165152824 NA NA NA NA NA chr4-937 163693533 163693747 165 - chr4:163693574-163693694 NA NA NA NA NA chr4-936 162876624 162876879 150 - chr4:162876739-162876779 NA NA NA NA NA chr4-935 162258230 162258401 153 - chr4:162258254-162258398 NA NA NA NA NA chr4-934 161935554 161935774 137 - chr4:161935619-161935682 NA NA NA NA NA chr4-933 161630036 161630403 308 - chr4:161630116-161630306 NA NA NA NA NA chr4-932 161595770 161596219 328 - chr4:161596075-161596190 NA NA NA NA NA chr4-931 161085883 161086186 155 - chr4:161086033-161086042 NA NA NA NA NA chr4-930 160680743 160681119 226 - chr4:160680887-160681038 NA NA NA NA NA chr4-929 160133757 160134161 237 - chr4:160133806-160133935 NA NA NA NA NA chr4-928 159856792 159856991 162 - chr4:159856819-159856949 NA NA NA NA NA chr4-927 158872976 158873848 419 - chr4:158873011-158873103 NA NA NA NA NA chr4-926 158558689 158558983 243 - chr4:158558832-158558978 NA NA NA NA NA chr4-925 158021120 158021388 154 - chr4:158021177-158021196 NA NA NA NA NA chr4-924 157971269 157971486 157 - chr4:157971319-157971406 NA NA NA NA NA chr4-923 157960200 157960449 202 - chr4:157960319-157960427 NA NA NA NA NA chr4-922 157850417 157850720 190 - chr4:157850565-157850677 NA NA NA NA NA chr4-921 157616371 157616543 166 - chr4:157616383-157616540 NA NA NA NA NA chr4-920 157490123 157490512 214 - chr4:157490359-157490463 NA NA NA NA NA chr4-919 157070270 157070529 183 - chr4:157070377-157070515 NA NA NA NA NA chr4-918 157024049 157024249 152 - chr4:157024101-157024203 NA NA NA NA NA chr4-917 156850420 156850911 290 - chr4:156850633-156850734 NA NA NA NA NA chr4-916 156501604 156501942 218 - chr4:156501858-156501889 NA NA NA NA NA chr4-22 15611274 15611856 388 - chr4:15611321-15611585 NA NA NA NA NA chr4-915 155170944 155171244 161 - chr4:155171076-155171091 NA NA NA NA NA chr4-914 154634929 154635526 278 - chr4:154635370-154635451 NA NA NA NA NA chr4-913 154556494 154556795 161 - chr4:154556633-154556653 NA NA NA NA NA chr4-912 154518348 154518639 150 - chr4:154518493-154518500 NA NA NA NA NA chr4-911 154328153 154328819 332 - chr4:154328506-154328523 NA NA NA NA NA chr4-910 154197078 154197230 136 - chr4:154197080-154197207 NA NA NA NA NA chr4-909 153453693 153454008 183 - chr4:153453859-153453944 NA NA NA NA NA chr4-908 153125176 153125417 187 - chr4:153125192-153125352 NA NA NA NA NA chr4-907 153076295 153076474 156 - chr4:153076330-153076457 NA NA NA NA NA chr4-906 153009334 153009567 126 - chr4:153009453-153009466 NA NA NA NA NA chr4-905 152270071 152270263 170 - chr4:152270081-152270217 NA NA NA NA NA chr4-904 152090547 152090853 187 - chr4:152090580-152090691 NA NA NA NA NA chr4-903 152010961 152011153 166 - chr4:152010977-152011122 NA NA NA NA NA chr4-902 151848905 151849355 250 - chr4:151849097-151849247 NA NA NA NA NA chr4-901 151740435 151740741 179 - chr4:151740576-151740621 NA NA NA NA NA chr4-900 151623043 151623295 140 - chr4:151623049-151623130 NA NA NA NA NA chr4-899 150937668 150937907 152 - chr4:150937759-150937822 NA NA NA NA NA chr4-898 150497335 150497514 153 - chr4:150497367-150497491 NA NA NA NA NA chr4-897 150491609 150491941 213 - chr4:150491635-150491772 NA NA NA NA NA chr4-896 150076962 150077190 139 - chr4:150077056-150077111 NA NA NA NA NA chr4-895 149523180 149523512 222 - chr4:149523238-149523376 NA NA NA NA NA chr4-894 148714577 148715011 233 - chr4:148714865-148714894 NA NA NA NA NA chr4-21 14870064 14870473 256 - chr4:14870409-14870416 NA NA NA NA NA chr4-893 148676661 148676856 156 - chr4:148676698-148676813 NA NA NA NA NA chr4-892 148569429 148569600 121 - chr4:148569531-148569576 NA NA NA NA NA chr4-891 148561072 148561369 250 - chr4:148561128-148561284 NA NA NA NA NA chr4-890 148541553 148541768 160 - chr4:148541627-148541751 NA NA NA NA NA chr4-889 148471461 148471607 118 - chr4:148471462-148471524 NA NA NA NA NA chr4-888 148347306 148347524 151 - chr4:148347371-148347453 NA NA NA NA NA chr4-887 148298460 148298638 142 - chr4:148298494-148298564 NA NA NA NA NA chr4-886 147938899 147939415 261 - chr4:147939154-147939160 NA NA NA NA NA chr4-885 147344980 147345299 200 - chr4:147345074-147345130 NA NA NA NA NA chr4-884 146660621 146660794 166 - chr4:146660627-146660779 NA NA NA NA NA chr4-883 146523195 146523574 165 - chr4:146523486-146523514 NA NA NA NA NA chr4-882 146183566 146183774 167 - chr4:146183607-146183733 NA NA NA NA NA chr4-881 145559626 145559910 168 - chr4:145559746-145559796 NA NA NA NA NA chr4-880 144903914 144904288 171 - chr4:144904137-144904173 NA NA NA NA NA chr4-879 144323715 144323962 154 - chr4:144323808-144323869 NA NA NA NA NA chr4-878 143726188 143726476 214 - chr4:143726208-143726294 NA NA NA NA NA chr4-877 143308319 143308673 220 - chr4:143308343-143308484 NA NA NA NA NA chr4-876 143210916 143211223 148 - chr4:143211023-143211032 NA NA NA NA NA chr4-875 142978590 142978973 197 - chr4:142978684-142978741 NA NA NA NA NA chr4-874 142832004 142832208 120 - chr4:142832077-142832102 NA NA NA NA NA chr4-873 142502684 142503060 202 - chr4:142502780-142502847 NA NA NA NA NA chr4-872 142484040 142484275 143 - chr4:142484182-142484208 NA NA NA NA NA chr4-871 142410509 142411001 219 - chr4:142410658-142410666 NA NA NA NA NA chr4-870 142217006 142217278 204 - chr4:142217013-142217183 NA NA NA NA NA chr4-20 14214213 14214572 204 - chr4:14214409-14214499 NA NA NA NA NA chr4-869 142063252 142063471 166 - chr4:142063293-142063412 NA NA NA NA NA chr4-868 141316083 141316270 163 - chr4:141316109-141316260 NA NA NA NA NA chr4-19 14119089 14119385 169 - chr4:14119176-14119238 NA NA NA NA NA chr4-867 141103307 141103461 113 - chr4:141103420-141103451 NA NA NA NA NA chr4-866 141028512 141028763 147 - chr4:141028608-141028643 NA NA NA NA NA chr4-865 140974655 140974915 146 - chr4:140974768-140974799 NA NA NA NA NA chr4-864 140961697 140961979 167 - chr4:140961803-140961846 NA NA NA NA NA chr4-863 140724829 140725035 131 - chr4:140724949-140725007 NA NA NA NA NA chr4-862 139940943 139941151 124 - chr4:139940999-139941053 NA NA NA NA NA chr4-861 139724652 139725030 184 - chr4:139724868-139724880 NA NA NA NA NA chr4-860 139548697 139548911 160 - chr4:139548757-139548869 NA NA NA NA NA chr4-859 139461785 139461932 137 - chr4:139461792-139461924 NA NA NA NA NA chr4-858 139416227 139416439 126 - chr4:139416287-139416301 NA NA NA NA NA chr4-857 139334148 139334470 200 - chr4:139334197-139334336 NA NA NA NA NA chr4-18 13933105 13933418 190 - chr4:13933244-13933303 NA NA NA NA NA chr4-856 138609111 138609259 145 - chr4:138609112-138609251 NA NA NA NA NA chr4-855 138443715 138444054 205 - chr4:138443835-138443973 NA NA NA NA NA chr4-17 13817174 13817538 207 - chr4:13817304-13817327 NA NA NA NA NA chr4-854 138109699 138109914 146 - chr4:138109784-138109853 NA NA NA NA NA chr4-853 137543957 137544372 241 - chr4:137544218-137544372 NA NA NA NA NA chr4-852 137228306 137228472 149 - chr4:137228323-137228455 NA NA NA NA NA chr4-851 136445933 136446224 146 - chr4:136446074-136446077 NA NA NA NA NA chr4-850 136223554 136223718 154 - chr4:136223559-136223708 NA NA NA NA NA chr4-849 136086274 136086555 133 - chr4:136086450-136086509 NA NA NA NA NA chr4-848 135951113 135951321 145 - chr4:135951169-135951244 NA NA NA NA NA chr4-847 135117775 135118010 123 - chr4:135117815-135117862 NA NA NA NA NA chr4-16 13463859 13464084 181 - chr4:13463905-13464064 NA NA NA NA NA chr4-846 133914789 133915137 176 - chr4:133914929-133914949 NA NA NA NA NA chr4-15 13382089 13382459 228 - chr4:13382139-13382296 NA NA NA NA NA chr4-845 133807677 133808082 184 - chr4:133807976-133808017 NA NA NA NA NA chr4-844 133522881 133523046 163 - chr4:133522886-133523045 NA NA NA NA NA chr4-843 133394420 133394910 300 - chr4:133394764-133394797 NA NA NA NA NA chr4-842 132927714 132928174 233 - chr4:132927853-132927886 NA NA NA NA NA chr4-841 132580769 132580963 117 - chr4:132580912-132580919 NA NA NA NA NA chr4-840 132067932 132068106 152 - chr4:132067956-132068088 NA NA NA NA NA chr4-839 130797907 130798218 173 - chr4:130798037-130798076 NA NA NA NA NA chr4-838 130582185 130582539 262 - chr4:130582274-130582441 NA NA NA NA NA chr4-837 130548356 130548531 157 - chr4:130548368-130548516 NA NA NA NA NA chr4-836 130237779 130237943 143 - chr4:130237832-130237938 NA NA NA NA NA chr4-835 129786126 129786658 282 - chr4:129786189-129786269 NA NA NA NA NA chr4-834 129644837 129645077 180 - chr4:129644909-129645059 NA NA NA NA NA chr4-833 129416684 129416846 150 - chr4:129416696-129416834 NA NA NA NA NA chr4-832 129250900 129251062 138 - chr4:129250957-129251047 NA NA NA NA NA chr4-831 129101191 129101503 170 - chr4:129101364-129101423 NA NA NA NA NA chr4-830 128990094 128990411 227 - chr4:128990210-128990334 NA NA NA NA NA chr4-829 128395212 128395672 224 - chr4:128395523-128395586 NA NA NA NA NA chr4-828 127216659 127216890 186 - chr4:127216711-127216858 NA NA NA NA NA chr4-827 127098698 127098983 157 - chr4:127098808-127098846 NA NA NA NA NA chr4-826 126615465 126615674 148 - chr4:126615501-126615563 NA NA NA NA NA chr4-825 125774146 125774357 139 - chr4:125774208-125774280 NA NA NA NA NA chr4-824 125700543 125700747 151 - chr4:125700601-125700704 NA NA NA NA NA chr4-823 125603327 125603807 248 - chr4:125603572-125603704 NA NA NA NA NA chr4-822 125323247 125323532 239 - chr4:125323267-125323473 NA NA NA NA NA chr4-821 125168873 125169127 147 - chr4:125168981-125169022 NA NA NA NA NA chr4-820 125098107 125098357 151 - chr4:125098206-125098258 NA NA NA NA NA chr4-819 124986207 124986390 148 - chr4:124986253-124986377 NA NA NA NA NA chr4-818 124786726 124787061 281 - chr4:124786749-124786922 NA NA NA NA NA chr4-817 124737568 124737784 158 - chr4:124737632-124737729 NA NA NA NA NA chr4-816 124694372 124694759 208 - chr4:124694623-124694724 NA NA NA NA NA chr4-815 124497697 124497879 158 - chr4:124497714-124497841 NA NA NA NA NA chr4-814 124195103 124195422 183 - chr4:124195217-124195275 NA NA NA NA NA chr4-813 124092187 124092469 225 - chr4:124092203-124092330 NA NA NA NA NA chr4-812 123340662 123340985 165 - chr4:123340856-123340899 NA NA NA NA NA chr4-811 123064311 123064547 137 - chr4:123064414-123064450 NA NA NA NA NA chr4-810 122976414 122976569 150 - chr4:122976419-122976564 NA NA NA NA NA chr4-809 122736082 122736269 161 - chr4:122736134-122736256 NA NA NA NA NA chr4-808 122728395 122728633 175 - chr4:122728419-122728509 NA NA NA NA NA chr4-807 122676240 122676529 147 - chr4:122676382-122676387 NA NA NA NA NA chr4-14 12231624 12231786 155 - chr4:12231628-12231773 NA NA NA NA NA chr4-806 122313608 122313800 159 - chr4:122313631-122313763 NA NA NA NA NA chr4-805 122250237 122250485 148 - chr4:122250339-122250386 NA NA NA NA NA chr4-804 122129215 122129398 148 - chr4:122129252-122129364 NA NA NA NA NA chr4-803 122083280 122083516 155 - chr4:122083365-122083437 NA NA NA NA NA chr4-802 121824307 121824493 155 - chr4:121824344-121824465 NA NA NA NA NA chr4-801 121637633 121637953 253 - chr4:121637822-121637947 NA NA NA NA NA chr4-800 121612081 121612315 161 - chr4:121612132-121612231 NA NA NA NA NA chr4-799 121430938 121431198 156 - chr4:121431052-121431099 NA NA NA NA NA chr4-798 121140706 121141005 165 - chr4:121140870-121140931 NA NA NA NA NA chr4-797 120936984 120937189 149 - chr4:120937041-120937135 NA NA NA NA NA chr4-796 120133243 120133475 156 - chr4:120133317-120133395 NA NA NA NA NA chr4-795 119935046 119935284 149 - chr4:119935145-119935197 NA NA NA NA NA chr4-794 119892137 119892610 290 - chr4:119892146-119892340 NA NA NA NA NA chr4-793 119650668 119650828 130 - chr4:119650715-119650785 NA NA NA NA NA chr4-13 11907712 11907877 149 - chr4:11907736-11907877 NA NA NA NA NA chr4-792 118708914 118709082 124 - chr4:118708922-118709020 NA NA NA NA NA chr4-791 118363070 118363477 326 - chr4:118363078-118363242 NA NA NA NA NA chr4-12 11829353 11829779 225 - chr4:11829628-11829726 NA NA NA NA NA chr4-790 117881495 117881698 153 - chr4:117881535-117881643 NA NA NA NA NA chr4-789 117880070 117880245 138 - chr4:117880161-117880225 NA NA NA NA NA chr4-788 117859361 117859526 163 - chr4:117859361-117859520 NA NA NA NA NA chr4-787 117807821 117808202 216 - chr4:117807880-117807984 NA NA NA NA NA chr4-786 117567303 117567586 154 - chr4:117567439-117567471 NA NA NA NA NA chr4-785 117397102 117397238 135 - chr4:117397103-117397237 NA NA NA NA NA chr4-784 117173352 117173505 119 - chr4:117173417-117173468 NA NA NA NA NA chr4-783 116760701 116760871 152 - chr4:116760709-116760848 NA NA NA NA NA chr4-782 116756988 116757454 316 - chr4:116757316-116757393 NA NA NA NA NA chr4-781 116721150 116721575 321 - chr4:116721222-116721532 NA NA NA NA NA chr4-780 116617861 116618075 162 - chr4:116617918-116618033 NA NA NA NA NA chr4-779 116220060 116220381 163 - chr4:116220162-116220195 NA NA NA NA NA chr4-778 116199613 116199929 202 - chr4:116199654-116199812 NA NA NA NA NA chr4-777 116153908 116154175 202 - chr4:116153971-116154043 NA NA NA NA NA chr4-776 116032067 116032365 176 - chr4:116032210-116032285 NA NA NA NA NA chr4-775 115794601 115794986 218 - chr4:115794755-115794793 NA NA NA NA NA chr4-774 115693945 115694190 149 - chr4:115694036-115694084 NA NA NA NA NA chr4-773 115681478 115681813 225 - chr4:115681630-115681724 NA NA NA NA NA chr4-772 115670949 115671224 233 - chr4:115671003-115671152 NA NA NA NA NA chr4-771 115378900 115379155 145 - chr4:115379010-115379045 NA NA NA NA NA chr4-770 115287035 115287229 180 - chr4:115287056-115287229 NA NA NA NA NA chr4-769 114898761 114899055 156 - chr4:114898905-114898920 NA NA NA NA NA chr4-768 114782339 114782637 295 - chr4:114782343-114782636 NA NA NA NA NA chr4-767 114625320 114625505 155 - chr4:114625346-114625473 NA NA NA NA NA chr4-766 114484789 114485194 279 - chr4:114484859-114484956 NA NA NA NA NA chr4-765 114456156 114456510 285 - chr4:114456202-114456349 NA NA NA NA NA chr4-764 114319340 114319633 173 - chr4:114319442-114319479 NA NA NA NA NA chr4-763 114039415 114039634 156 - chr4:114039473-114039569 NA NA NA NA NA chr4-762 113892761 113893186 257 - chr4:113893001-113893127 NA NA NA NA NA chr4-761 113665609 113666040 288 - chr4:113665776-113665909 NA NA NA NA NA chr4-760 113627353 113627660 150 - chr4:113627524-113627531 NA NA NA NA NA chr4-759 113448531 113448695 160 - chr4:113448532-113448684 NA NA NA NA NA chr4-758 113220749 113221027 167 - chr4:113220845-113220886 NA NA NA NA NA chr4-757 113157071 113157533 223 - chr4:113157346-113157366 NA NA NA NA NA chr4-756 113031037 113031593 302 - chr4:113031186-113031358 NA NA NA NA NA chr4-755 112932551 112932984 248 - chr4:112932690-112932697 NA NA NA NA NA chr4-754 112887326 112887651 205 - chr4:112887346-112887481 NA NA NA NA NA chr4-753 112559980 112560251 153 - chr4:112560100-112560137 NA NA NA NA NA chr4-11 11242098 11242267 144 - chr4:11242145-11242239 NA NA NA NA NA chr4-752 112277170 112277372 163 - chr4:112277211-112277334 NA NA NA NA NA chr4-751 112238855 112239149 175 - chr4:112238922-112239004 NA NA NA NA NA chr4-750 112217385 112217631 145 - chr4:112217498-112217536 NA NA NA NA NA chr4-749 112186689 112187498 350 - chr4:112186839-112187033 NA NA NA NA NA chr4-748 112172846 112173276 258 - chr4:112172934-112173062 NA NA NA NA NA chr4-747 112151975 112152174 187 - chr4:112151975-112152138 NA NA NA NA NA chr4-746 111929422 111929709 241 - chr4:111929490-111929639 NA NA NA NA NA chr4-745 111750192 111750664 281 - chr4:111750332-111750371 NA NA NA NA NA chr4-744 111738062 111738344 162 - chr4:111738205-111738270 NA NA NA NA NA chr4-743 111666718 111667079 189 - chr4:111666914-111666919 NA NA NA NA NA chr4-742 111664315 111664622 159 - chr4:111664462-111664472 NA NA NA NA NA chr4-741 111620693 111620981 197 - chr4:111620760-111620842 NA NA NA NA NA chr4-740 111536023 111536243 143 - chr4:111536090-111536161 NA NA NA NA NA chr4-739 111120728 111120896 157 - chr4:111120747-111120889 NA NA NA NA NA chr4-738 110949984 110950476 372 - chr4:110950297-110950437 NA NA NA NA NA chr4-737 110930898 110931053 127 - chr4:110930922-110930993 NA NA NA NA NA chr4-736 110863161 110863378 193 - chr4:110863199-110863344 NA NA NA NA NA chr4-735 110823371 110823687 185 - chr4:110823540-110823632 NA NA NA NA NA chr4-734 110801811 110802038 185 - chr4:110801903-110802021 NA NA NA NA NA chr4-733 110721472 110721691 154 - chr4:110721543-110721629 NA NA NA NA NA chr4-732 110704449 110704682 181 - chr4:110704512-110704667 NA NA NA NA NA chr4-731 110666795 110667068 169 - chr4:110666899-110666964 NA NA NA NA NA chr4-730 110612010 110612338 177 - chr4:110612181-110612227 NA NA NA NA NA chr4-729 110247164 110247430 144 - chr4:110247287-110247310 NA NA NA NA NA chr4-728 110183852 110184158 213 - chr4:110183939-110184053 NA NA NA NA NA chr4-727 110121213 110121699 266 - chr4:110121419-110121575 NA NA NA NA NA chr4-726 109986965 109987185 156 - chr4:109987040-109987143 NA NA NA NA NA chr4-725 109984818 109985247 250 - chr4:109984830-109984910 NA NA NA NA NA chr4-724 109902503 109902916 187 - chr4:109902577-109902651 NA NA NA NA NA chr4-723 109516450 109516625 163 - chr4:109516463-109516620 NA NA NA NA NA chr4-722 109380354 109380695 212 - chr4:109380547-109380694 NA NA NA NA NA chr4-721 109298926 109299191 118 - chr4:109299044-109299073 NA NA NA NA NA chr4-720 109215006 109215408 192 - chr4:109215265-109215282 NA NA NA NA NA chr4-719 109067968 109068279 266 - chr4:109067984-109068160 NA NA NA NA NA chr4-718 109047306 109047608 156 - chr4:109047456-109047464 NA NA NA NA NA chr4-717 108992079 108992394 178 - chr4:108992193-108992211 NA NA NA NA NA chr4-716 108747286 108747568 164 - chr4:108747356-108747432 NA NA NA NA NA chr4-715 108685152 108685399 154 - chr4:108685249-108685314 NA NA NA NA NA chr4-714 108670836 108671014 140 - chr4:108670850-108670928 NA NA NA NA NA chr4-713 108624490 108624783 220 - chr4:108624511-108624606 NA NA NA NA NA chr4-712 108342547 108342840 248 - chr4:108342653-108342811 NA NA NA NA NA chr4-711 107462146 107462413 145 - chr4:107462262-107462279 NA NA NA NA NA chr4-710 107399500 107399717 162 - chr4:107399553-107399658 NA NA NA NA NA chr4-709 107170920 107171062 112 - chr4:107170924-107170976 NA NA NA NA NA chr4-708 106708779 106709065 165 - chr4:106708896-106708931 NA NA NA NA NA chr4-707 106642708 106642991 153 - chr4:106642832-106642858 NA NA NA NA NA chr4-706 106387077 106387491 216 - chr4:106387197-106387254 NA NA NA NA NA chr4-705 106249280 106249557 142 - chr4:106249415-106249422 NA NA NA NA NA chr4-704 106245328 106245753 198 - chr4:106245608-106245632 NA NA NA NA NA chr4-703 106198420 106198585 152 - chr4:106198439-106198575 NA NA NA NA NA chr4-702 105987134 105987534 338 - chr4:105987186-105987494 NA NA NA NA NA chr4-701 105815973 105816471 340 - chr4:105816176-105816340 NA NA NA NA NA chr4-700 105670715 105671096 194 - chr4:105670792-105670854 NA NA NA NA NA chr4-699 105549521 105549696 148 - chr4:105549551-105549675 NA NA NA NA NA chr4-698 105238841 105239023 159 - chr4:105238871-105239014 NA NA NA NA NA chr4-697 104950521 104950953 202 - chr4:104950665-104950680 NA NA NA NA NA chr4-696 104877910 104878189 147 - chr4:104878036-104878054 NA NA NA NA NA chr4-695 104701221 104701407 161 - chr4:104701253-104701378 NA NA NA NA NA chr4-694 104418725 104418943 188 - chr4:104418755-104418913 NA NA NA NA NA chr4-693 104332136 104332339 172 - chr4:104332177-104332328 NA NA NA NA NA chr4-692 104245621 104245815 148 - chr4:104245680-104245795 NA NA NA NA NA chr4-691 104119327 104119713 265 - chr4:104119560-104119656 NA NA NA NA NA chr4-690 103680589 103680755 118 - chr4:103680612-103680706 NA NA NA NA NA chr4-689 103152997 103153239 114 - chr4:103153091-103153141 NA NA NA NA NA chr4-688 103021863 103022048 157 - chr4:103021866-103022009 NA NA NA NA NA chr4-687 102678868 102679023 131 - chr4:102678885-102678968 NA NA NA NA NA chr4-686 102497449 102497737 194 - chr4:102497587-102497731 NA NA NA NA NA chr4-685 102439947 102440222 217 - chr4:102440116-102440217 NA NA NA NA NA chr4-684 102435257 102435756 212 - chr4:102435370-102435382 NA NA NA NA NA chr4-683 102388789 102389105 157 - chr4:102388954-102388958 NA NA NA NA NA chr4-682 102339144 102339463 197 - chr4:102339274-102339357 NA NA NA NA NA chr4-681 102167772 102168128 179 - chr4:102167966-102167985 NA NA NA NA NA chr4-680 101944099 101944423 208 - chr4:101944194-101944347 NA NA NA NA NA chr4-679 101806175 101806635 354 - chr4:101806365-101806571 NA NA NA NA NA chr4-678 101787781 101788082 251 - chr4:101787834-101787985 NA NA NA NA NA chr4-677 101586086 101586360 149 - chr4:101586203-101586231 NA NA NA NA NA chr4-676 101480780 101481063 167 - chr4:101480860-101480929 NA NA NA NA NA chr4-675 101277763 101278021 154 - chr4:101277866-101277915 NA NA NA NA NA chr4-674 101144851 101145129 164 - chr4:101144943-101145004 NA NA NA NA NA chr4-673 101083983 101084149 144 - chr4:101083985-101084085 NA NA NA NA NA chr4-672 101081550 101081845 179 - chr4:101081590-101081691 NA NA NA NA NA chr4-671 100984255 100984636 302 - chr4:100984462-100984606 NA NA NA NA NA chr4-10 10041365 10041687 212 - chr4:10041489-10041646 NA NA NA NA NA chr4-670 100176495 100176742 201 - chr4:100176503-100176681 NA NA NA NA NA chr3-589 99908619 99908826 169 - chr3:99908659-99908792 NA NA NA NA NA chr3-588 99867251 99867593 174 - chr3:99867406-99867410 NA NA NA NA NA chr3-587 99718817 99719101 145 - chr3:99719047-99719101 NA NA NA NA NA chr3-586 99690097 99690334 147 - chr3:99690187-99690244 NA NA NA NA NA chr3-585 99615093 99615478 228 - chr3:99615170-99615338 NA NA NA NA NA chr3-584 99582404 99582771 198 - chr3:99582473-99582552 NA NA NA NA NA chr3-583 99556832 99557194 250 - chr3:99556962-99557106 NA NA NA NA NA chr3-582 99527966 99528153 158 - chr3:99527989-99528112 NA NA NA NA NA chr3-581 99480375 99480770 194 - chr3:99480484-99480505 NA NA NA NA NA chr3-580 99470538 99470944 177 - chr3:99470619-99470641 NA NA NA NA NA chr3-579 99449937 99450224 193 - chr3:99450043-99450189 NA NA NA NA NA chr3-578 99420160 99420357 155 - chr3:99420211-99420333 NA NA NA NA NA chr3-577 99400889 99401095 137 - chr3:99400990-99401042 NA NA NA NA NA chr3-576 99388002 99388608 311 - chr3:99388286-99388291 NA NA NA NA NA chr3-575 99218820 99219015 128 - chr3:99218898-99218970 NA NA NA NA NA chr3-574 98996952 98997132 165 - chr3:98996953-98997110 NA NA NA NA NA chr3-573 98979851 98980215 334 - chr3:98979866-98980155 NA NA NA NA NA chr3-572 98881456 98881869 208 - chr3:98881619-98881643 NA NA NA NA NA chr3-571 98393158 98393377 153 - chr3:98393274-98393336 NA NA NA NA NA chr3-570 98347453 98347707 149 - chr3:98347581-98347648 NA NA NA NA NA chr3-569 98332463 98332740 204 - chr3:98332586-98332692 NA NA NA NA NA chr3-568 98266646 98266798 142 - chr3:98266648-98266770 NA NA NA NA NA chr3-567 98012674 98013320 398 - chr3:98012883-98012958 NA NA NA NA NA chr3-48 9797758 9798071 165 - chr3:9797894-9797899 NA NA NA NA NA chr3-566 97958637 97958874 182 - chr3:97958679-97958793 NA NA NA NA NA chr3-565 97919117 97919387 217 - chr3:97919135-97919264 NA NA NA NA NA chr3-564 97867428 97867786 263 - chr3:97867641-97867750 NA NA NA NA NA chr3-563 97753388 97753663 142 - chr3:97753517-97753528 NA NA NA NA NA chr3-562 97529453 97529740 197 - chr3:97529505-97529657 NA NA NA NA NA chr3-561 97399585 97399855 147 - chr3:97399736-97399746 NA NA NA NA NA chr3-560 97359025 97359366 211 - chr3:97359192-97359338 NA NA NA NA NA chr3-559 97260144 97260406 144 - chr3:97260266-97260290 NA NA NA NA NA chr3-558 97218355 97218710 293 - chr3:97218384-97218553 NA NA NA NA NA chr3-557 97195996 97196188 160 - chr3:97196030-97196160 NA NA NA NA NA chr3-556 97097093 97097411 182 - chr3:97097266-97097355 NA NA NA NA NA chr3-555 96818668 96818808 126 - chr3:96818685-96818783 NA NA NA NA NA chr3-554 96817544 96817824 178 - chr3:96817690-96817810 NA NA NA NA NA chr3-553 96781199 96781503 207 - chr3:96781273-96781349 NA NA NA NA NA chr3-552 96768865 96769073 116 - chr3:96768931-96768968 NA NA NA NA NA chr3-551 96690610 96690903 197 - chr3:96690701-96690850 NA NA NA NA NA chr3-550 96587541 96588004 261 - chr3:96587697-96587710 NA NA NA NA NA chr3-549 96348494 96348714 167 - chr3:96348535-96348637 NA NA NA NA NA chr3-548 96339592 96339920 212 - chr3:96339693-96339847 NA NA NA NA NA chr3-547 96310581 96310840 155 - chr3:96310635-96310738 NA NA NA NA NA chr3-546 96208470 96208640 148 - chr3:96208496-96208626 NA NA NA NA NA chr3-545 96054139 96054386 158 - chr3:96054238-96054302 NA NA NA NA NA chr3-544 95969531 95969774 161 - chr3:95969574-95969694 NA NA NA NA NA chr3-543 95958077 95958379 200 - chr3:95958143-95958259 NA NA NA NA NA chr3-542 95902285 95902681 244 - chr3:95902349-95902517 NA NA NA NA NA chr3-541 95842568 95842983 247 - chr3:95842687-95842717 NA NA NA NA NA chr3-540 95832461 95833020 354 - chr3:95832601-95832940 NA NA NA NA NA chr3-539 95786161 95786881 466 - chr3:95786218-95786367 NA NA NA NA NA chr3-538 95697951 95698363 236 - chr3:95698190-95698313 NA NA NA NA NA chr3-537 95639726 95640092 180 - chr3:95639814-95639874 NA NA NA NA NA chr3-536 95607197 95607417 162 - chr3:95607265-95607364 NA NA NA NA NA chr3-535 95580792 95580978 170 - chr3:95580830-95580973 NA NA NA NA NA chr3-534 95573636 95573838 133 - chr3:95573698-95573755 NA NA NA NA NA chr3-533 95217368 95217544 144 - chr3:95217452-95217538 NA NA NA NA NA chr3-532 95200297 95200611 261 - chr3:95200444-95200605 NA NA NA NA NA chr3-531 95152732 95152885 129 - chr3:95152783-95152864 NA NA NA NA NA chr3-530 95075953 95076139 141 - chr3:95075984-95076035 NA NA NA NA NA chr3-529 95030043 95030263 170 - chr3:95030083-95030193 NA NA NA NA NA chr3-528 94951257 94951477 139 - chr3:94951309-94951338 NA NA NA NA NA chr3-527 94924407 94924667 149 - chr3:94924519-94924558 NA NA NA NA NA chr3-526 94917317 94917593 174 - chr3:94917418-94917482 NA NA NA NA NA chr3-525 94772338 94772620 164 - chr3:94772466-94772507 NA NA NA NA NA chr3-524 94678724 94678931 140 - chr3:94678766-94678814 NA NA NA NA NA chr3-47 9459044 9459209 130 - chr3:9459113-9459173 NA NA NA NA NA chr3-46 9455803 9456180 331 - chr3:9455821-9456078 NA NA NA NA NA chr3-523 94458711 94458890 148 - chr3:94458760-94458868 NA NA NA NA NA chr3-522 94356136 94356488 243 - chr3:94356207-94356303 NA NA NA NA NA chr3-521 94338917 94339092 137 - chr3:94339023-94339088 NA NA NA NA NA chr3-520 94291296 94291678 331 - chr3:94291316-94291565 NA NA NA NA NA chr3-519 94219420 94219720 204 - chr3:94219557-94219713 NA NA NA NA NA chr3-518 94192103 94192634 228 - chr3:94192389-94192404 NA NA NA NA NA chr3-45 9357012 9357259 146 - chr3:9357115-9357162 NA NA NA NA NA chr3-517 90144314 90144585 161 - chr3:90144416-90144459 NA NA NA NA NA chr3-516 90026025 90026568 290 - chr3:90026230-90026291 NA NA NA NA NA chr3-515 90024051 90024237 125 - chr3:90024092-90024136 NA NA NA NA NA chr3-514 89878181 89878521 194 - chr3:89878231-89878327 NA NA NA NA NA chr3-513 89785852 89786025 171 - chr3:89785853-89786020 NA NA NA NA NA chr3-512 89669279 89669438 150 - chr3:89669298-89669430 NA NA NA NA NA chr3-511 89632970 89633210 164 - chr3:89633050-89633136 NA NA NA NA NA chr3-44 8953649 8953872 137 - chr3:8953733-8953792 NA NA NA NA NA chr3-510 89414105 89414323 174 - chr3:89414175-89414292 NA NA NA NA NA chr3-509 89334123 89334405 239 - chr3:89334135-89334288 NA NA NA NA NA chr3-508 89324116 89324353 153 - chr3:89324210-89324289 NA NA NA NA NA chr3-507 89317870 89318163 160 - chr3:89318020-89318064 NA NA NA NA NA chr3-506 89283545 89283808 162 - chr3:89283638-89283691 NA NA NA NA NA chr3-505 89223126 89223339 165 - chr3:89223188-89223319 NA NA NA NA NA chr3-504 89198958 89199167 159 - chr3:89199055-89199114 NA NA NA NA NA chr3-503 89190427 89190693 180 - chr3:89190499-89190600 NA NA NA NA NA chr3-502 89084779 89084975 157 - chr3:89084832-89084943 NA NA NA NA NA chr3-501 89008715 89008867 144 - chr3:89008727-89008861 NA NA NA NA NA chr3-500 88920355 88920635 144 - chr3:88920479-88920493 NA NA NA NA NA chr3-499 88885203 88885524 174 - chr3:88885390-88885397 NA NA NA NA NA chr3-498 88786302 88786766 307 - chr3:88786371-88786525 NA NA NA NA NA chr3-497 88672556 88672834 155 - chr3:88672669-88672706 NA NA NA NA NA chr3-496 88663958 88664141 156 - chr3:88664026-88664128 NA NA NA NA NA chr3-495 88659074 88659554 312 - chr3:88659257-88659405 NA NA NA NA NA chr3-494 88486522 88486748 150 - chr3:88486592-88486669 NA NA NA NA NA chr3-493 88424394 88424657 160 - chr3:88424509-88424560 NA NA NA NA NA chr3-492 88369490 88369798 213 - chr3:88369552-88369637 NA NA NA NA NA chr3-491 88306422 88306669 213 - chr3:88306477-88306622 NA NA NA NA NA chr3-490 88257504 88257999 285 - chr3:88257650-88257661 NA NA NA NA NA chr3-489 88238058 88238386 322 - chr3:88238059-88238378 NA NA NA NA NA chr3-488 88221574 88221828 201 - chr3:88221673-88221798 NA NA NA NA NA chr3-43 8815066 8815278 161 - chr3:8815124-8815241 NA NA NA NA NA chr3-487 88133642 88134030 300 - chr3:88133642-88133806 NA NA NA NA NA chr3-486 88072879 88073073 149 - chr3:88072892-88073012 NA NA NA NA NA chr3-485 87974443 87974700 149 - chr3:87974524-87974619 NA NA NA NA NA chr3-484 87962247 87962631 255 - chr3:87962334-87962418 NA NA NA NA NA chr3-483 87953477 87953739 167 - chr3:87953578-87953657 NA NA NA NA NA chr3-482 87893600 87894037 208 - chr3:87893905-87893948 NA NA NA NA NA chr3-481 87717480 87717792 207 - chr3:87717636-87717789 NA NA NA NA NA chr3-480 87631911 87632134 162 - chr3:87631976-87632075 NA NA NA NA NA chr3-479 87570019 87570292 173 - chr3:87570111-87570176 NA NA NA NA NA chr3-478 87569334 87569608 191 - chr3:87569395-87569484 NA NA NA NA NA chr3-477 87306761 87307046 201 - chr3:87306855-87307014 NA NA NA NA NA chr3-476 87287332 87287537 159 - chr3:87287375-87287485 NA NA NA NA NA chr3-475 87099352 87099488 129 - chr3:87099352-87099467 NA NA NA NA NA chr3-474 87073579 87073936 194 - chr3:87073788-87073865 NA NA NA NA NA chr3-473 87056213 87056481 182 - chr3:87056257-87056396 NA NA NA NA NA chr3-472 87001271 87001516 138 - chr3:87001368-87001404 NA NA NA NA NA chr3-471 86744883 86745082 162 - chr3:86744912-86745041 NA NA NA NA NA chr3-470 86352620 86352768 138 - chr3:86352620-86352738 NA NA NA NA NA chr3-469 86217375 86217687 164 - chr3:86217518-86217529 NA NA NA NA NA chr3-468 85713739 85713900 120 - chr3:85713741-85713781 NA NA NA NA NA chr3-467 85601425 85601856 233 - chr3:85601622-85601656 NA NA NA NA NA chr3-466 85499563 85499762 193 - chr3:85499563-85499744 NA NA NA NA NA chr3-465 85499169 85499466 159 - chr3:85499306-85499326 NA NA NA NA NA chr3-464 85376749 85377095 258 - chr3:85376941-85377059 NA NA NA NA NA chr3-463 85320376 85320610 156 - chr3:85320460-85320544 NA NA NA NA NA chr3-462 85236739 85237017 157 - chr3:85236858-85236895 NA NA NA NA NA chr3-461 85223143 85223598 246 - chr3:85223326-85223337 NA NA NA NA NA chr3-460 85131152 85131441 197 - chr3:85131246-85131397 NA NA NA NA NA chr3-459 85124903 85125130 185 - chr3:85124966-85125130 NA NA NA NA NA chr3-458 85064870 85065067 161 - chr3:85064888-85065022 NA NA NA NA NA chr3-457 85013488 85013695 187 - chr3:85013488-85013665 NA NA NA NA NA chr3-456 84904757 84904986 165 - chr3:84904805-84904890 NA NA NA NA NA chr3-455 84451663 84451837 144 - chr3:84451691-84451806 NA NA NA NA NA chr3-454 84333995 84334288 197 - chr3:84334097-84334246 NA NA NA NA NA chr3-453 84163103 84163310 128 - chr3:84163170-84163225 NA NA NA NA NA chr3-452 83801161 83801514 310 - chr3:83801192-83801465 NA NA NA NA NA chr3-451 83629366 83629655 153 - chr3:83629508-83629531 NA NA NA NA NA chr3-450 83627779 83628183 224 - chr3:83628033-83628040 NA NA NA NA NA chr3-449 83620306 83620550 144 - chr3:83620393-83620424 NA NA NA NA NA chr3-448 83598604 83598815 180 - chr3:83598620-83598754 NA NA NA NA NA chr3-447 83597495 83597785 187 - chr3:83597641-83597768 NA NA NA NA NA chr3-446 83578300 83578498 185 - chr3:83578316-83578475 NA NA NA NA NA chr3-445 83020033 83020362 215 - chr3:83020048-83020206 NA NA NA NA NA chr3-444 82980157 82980486 180 - chr3:82980354-82980433 NA NA NA NA NA chr3-443 82889323 82889591 124 - chr3:82889369-82889398 NA NA NA NA NA chr3-442 82544250 82544603 288 - chr3:82544253-82544411 NA NA NA NA NA chr3-441 82430361 82430636 150 - chr3:82430493-82430525 NA NA NA NA NA chr3-440 81694922 81695081 141 - chr3:81694946-81695075 NA NA NA NA NA chr3-439 81655043 81655229 161 - chr3:81655079-81655226 NA NA NA NA NA chr3-438 81635976 81636247 183 - chr3:81636068-81636161 NA NA NA NA NA chr3-42 8140437 8140644 155 - chr3:8140491-8140593 NA NA NA NA NA chr3-437 81262895 81263179 223 - chr3:81262904-81263092 NA NA NA NA NA chr3-436 80875198 80875589 304 - chr3:80875304-80875540 NA NA NA NA NA chr3-435 80680428 80680702 148 - chr3:80680538-80680592 NA NA NA NA NA chr3-434 80633446 80633811 215 - chr3:80633462-80633594 NA NA NA NA NA chr3-41 8013856 8014193 301 - chr3:8013895-8014163 NA NA NA NA NA chr3-433 80108439 80108610 157 - chr3:80108451-80108601 NA NA NA NA NA chr3-432 80034599 80034905 181 - chr3:80034706-80034744 NA NA NA NA NA chr3-431 80001291 80001455 144 - chr3:80001317-80001451 NA NA NA NA NA chr3-430 79889668 79889938 158 - chr3:79889780-79889826 NA NA NA NA NA chr3-429 79822020 79822450 186 - chr3:79822344-79822408 NA NA NA NA NA chr3-428 79637701 79637913 178 - chr3:79637750-79637909 NA NA NA NA NA chr3-427 79298561 79298942 288 - chr3:79298734-79298889 NA NA NA NA NA chr3-426 79185260 79185418 143 - chr3:79185267-79185399 NA NA NA NA NA chr3-425 79035304 79035685 262 - chr3:79035517-79035613 NA NA NA NA NA chr3-424 78964887 78965176 135 - chr3:78964929-78964987 NA NA NA NA NA chr3-423 78537123 78537528 305 - chr3:78537358-78537524 NA NA NA NA NA chr3-422 78532078 78532257 122 - chr3:78532109-78532148 NA NA NA NA NA chr3-421 78495310 78495609 155 - chr3:78495471-78495554 NA NA NA NA NA chr3-420 78435715 78436051 183 - chr3:78435923-78436008 NA NA NA NA NA chr3-419 78412264 78412601 266 - chr3:78412356-78412512 NA NA NA NA NA chr3-418 78401864 78402175 264 - chr3:78401927-78402097 NA NA NA NA NA chr3-40 7824558 7824819 145 - chr3:7824668-7824704 NA NA NA NA NA chr3-417 78020108 78020259 119 - chr3:78020169-78020224 NA NA NA NA NA chr3-416 77856679 77856898 166 - chr3:77856724-77856841 NA NA NA NA NA chr3-415 77521631 77521921 150 - chr3:77521775-77521789 NA NA NA NA NA chr3-414 77432756 77433062 191 - chr3:77432795-77432909 NA NA NA NA NA chr3-413 77350055 77350427 224 - chr3:77350136-77350145 NA NA NA NA NA chr3-412 77166344 77166497 124 - chr3:77166397-77166480 NA NA NA NA NA chr3-8 770392 770695 203 - chr3:770498-770651 NA NA NA NA NA chr3-411 76672131 76672447 159 - chr3:76672289-76672292 NA NA NA NA NA chr3-410 76658649 76658946 148 - chr3:76658801-76658803 NA NA NA NA NA chr3-409 76515408 76515714 256 - chr3:76515446-76515658 NA NA NA NA NA chr3-408 76439360 76439577 173 - chr3:76439434-76439548 NA NA NA NA NA chr3-407 76054512 76054782 147 - chr3:76054625-76054654 NA NA NA NA NA chr3-406 76051193 76051458 189 - chr3:76051204-76051355 NA NA NA NA NA chr3-405 75132466 75132644 177 - chr3:75132466-75132641 NA NA NA NA NA chr3-404 75035743 75035896 149 - chr3:75035747-75035892 NA NA NA NA NA chr3-403 74883626 74883850 147 - chr3:74883699-74883765 NA NA NA NA NA chr3-402 74772713 74772883 141 - chr3:74772776-74772859 NA NA NA NA NA chr3-401 74653825 74654109 188 - chr3:74653975-74654040 NA NA NA NA NA chr3-400 74547497 74548315 436 - chr3:74547517-74547908 NA NA NA NA NA chr3-39 7434296 7434702 255 - chr3:7434533-7434594 NA NA NA NA NA chr3-399 74247474 74247822 193 - chr3:74247609-74247627 NA NA NA NA NA chr3-398 74004121 74004335 128 - chr3:74004179-74004235 NA NA NA NA NA chr3-397 73957930 73958243 199 - chr3:73957956-73958085 NA NA NA NA NA chr3-396 73830702 73831080 228 - chr3:73830807-73830960 NA NA NA NA NA chr3-395 73785903 73786093 139 - chr3:73785940-73786035 NA NA NA NA NA chr3-394 73324052 73324311 171 - chr3:73324128-73324199 NA NA NA NA NA chr3-393 73043327 73043762 204 - chr3:73043446-73043475 NA NA NA NA NA chr3-392 72578042 72578499 209 - chr3:72578363-72578397 NA NA NA NA NA chr3-391 72531407 72531681 146 - chr3:72531527-72531537 NA NA NA NA NA chr3-390 72302823 72303179 169 - chr3:72302972-72302973 NA NA NA NA NA chr3-38 7216693 7217119 228 - chr3:7216951-7217080 NA NA NA NA NA chr3-389 72094542 72094954 299 - chr3:72094665-72094738 NA NA NA NA NA chr3-388 71810905 71811339 268 - chr3:71811193-71811234 NA NA NA NA NA chr3-387 71701806 71702080 148 - chr3:71701855-71701940 NA NA NA NA NA chr3-386 71677967 71678227 133 - chr3:71678092-71678099 NA NA NA NA NA chr3-385 71429391 71429671 130 - chr3:71429582-71429603 NA NA NA NA NA chr3-384 71283817 71284013 158 - chr3:71283863-71283979 NA NA NA NA NA chr3-383 70832755 70832974 153 - chr3:70832823-70832909 NA NA NA NA NA chr3-382 70719544 70719879 217 - chr3:70719636-70719709 NA NA NA NA NA chr3-381 70272743 70273110 210 - chr3:70272896-70273037 NA NA NA NA NA chr3-7 702633 702790 113 - chr3:702639-702727 NA NA NA NA NA chr3-380 70174674 70175134 267 - chr3:70174827-70174861 NA NA NA NA NA chr3-379 69947865 69948095 178 - chr3:69947933-69948085 NA NA NA NA NA chr3-378 69761079 69761594 302 - chr3:69761277-69761351 NA NA NA NA NA chr3-377 69562295 69562601 171 - chr3:69562519-69562524 NA NA NA NA NA chr3-376 69361970 69362219 165 - chr3:69362044-69362130 NA NA NA NA NA chr3-375 69356553 69356724 113 - chr3:69356630-69356704 NA NA NA NA NA chr3-374 69306597 69306834 167 - chr3:69306677-69306784 NA NA NA NA NA chr3-373 69151576 69151967 313 - chr3:69151712-69151869 NA NA NA NA NA chr3-372 68795981 68796630 394 - chr3:68796340-68796427 NA NA NA NA NA chr3-371 68600254 68600449 138 - chr3:68600284-68600338 NA NA NA NA NA chr3-370 68363176 68363482 178 - chr3:68363266-68363302 NA NA NA NA NA chr3-369 68203840 68204308 311 - chr3:68203995-68204150 NA NA NA NA NA chr3-368 67790884 67791365 249 - chr3:67791177-67791234 NA NA NA NA NA chr3-367 67579242 67579407 147 - chr3:67579274-67579396 NA NA NA NA NA chr3-366 67369332 67369667 278 - chr3:67369479-67369655 NA NA NA NA NA chr3-365 67112528 67112723 151 - chr3:67112555-67112618 NA NA NA NA NA chr3-364 66871026 66871198 157 - chr3:66871053-66871189 NA NA NA NA NA chr3-363 66678951 66679113 152 - chr3:66678964-66679109 NA NA NA NA NA chr3-362 65729610 65729931 157 - chr3:65729840-65729899 NA NA NA NA NA chr3-361 65693320 65693570 184 - chr3:65693372-65693497 NA NA NA NA NA chr3-360 65526859 65527127 147 - chr3:65526978-65527005 NA NA NA NA NA chr3-359 65451785 65452263 236 - chr3:65451909-65451962 NA NA NA NA NA chr3-358 64787211 64787387 160 - chr3:64787229-64787375 NA NA NA NA NA chr3-357 64728630 64728925 159 - chr3:64728774-64728793 NA NA NA NA NA chr3-356 64646755 64646926 158 - chr3:64646780-64646912 NA NA NA NA NA chr3-355 64573424 64573613 145 - chr3:64573465-64573563 NA NA NA NA NA chr3-354 64466431 64466831 221 - chr3:64466440-64466567 NA NA NA NA NA chr3-353 64247588 64247897 163 - chr3:64247743-64247769 NA NA NA NA NA chr3-352 64090320 64090704 193 - chr3:64090405-64090460 NA NA NA NA NA chr3-37 6405246 6405803 321 - chr3:6405404-6405411 NA NA NA NA NA chr3-351 63861918 63862214 248 - chr3:63861999-63862151 NA NA NA NA NA chr3-350 63856924 63857359 241 - chr3:63857044-63857128 NA NA NA NA NA chr3-36 6334159 6334535 203 - chr3:6334382-6334387 NA NA NA NA NA chr3-349 63320459 63320636 154 - chr3:63320474-63320597 NA NA NA NA NA chr3-348 63124143 63124602 213 - chr3:63124449-63124476 NA NA NA NA NA chr3-347 63102403 63102625 145 - chr3:63102483-63102554 NA NA NA NA NA chr3-346 62665653 62665904 202 - chr3:62665677-62665805 NA NA NA NA NA chr3-345 62523764 62523949 162 - chr3:62523771-62523918 NA NA NA NA NA chr3-344 62499040 62499221 125 - chr3:62499122-62499219 NA NA NA NA NA chr3-343 62408355 62408523 145 - chr3:62408384-62408512 NA NA NA NA NA chr3-342 62403145 62403319 153 - chr3:62403166-62403298 NA NA NA NA NA chr3-341 62301386 62301618 162 - chr3:62301453-62301542 NA NA NA NA NA chr3-340 62226591 62226871 236 - chr3:62226700-62226852 NA NA NA NA NA chr3-339 61758763 61759104 265 - chr3:61758780-61758910 NA NA NA NA NA chr3-338 61350849 61351089 164 - chr3:61350921-61351042 NA NA NA NA NA chr3-337 60737075 60737363 163 - chr3:60737198-60737237 NA NA NA NA NA chr3-336 60627865 60628060 120 - chr3:60627946-60627988 NA NA NA NA NA chr3-335 60620653 60620927 139 - chr3:60620758-60620777 NA NA NA NA NA chr3-334 60374067 60374353 182 - chr3:60374099-60374215 NA NA NA NA NA chr3-333 60287675 60287842 155 - chr3:60287692-60287841 NA NA NA NA NA chr3-332 60198331 60198486 137 - chr3:60198336-60198464 NA NA NA NA NA chr3-331 60146631 60146832 186 - chr3:60146636-60146792 NA NA NA NA NA chr3-35 5972765 5973015 146 - chr3:5972877-5972927 NA NA NA NA NA chr3-330 59728125 59728299 162 - chr3:59728136-59728285 NA NA NA NA NA chr3-329 58945253 58945491 157 - chr3:58945339-58945420 NA NA NA NA NA chr3-328 58911727 58912029 202 - chr3:58911760-58911912 NA NA NA NA NA chr3-327 58428044 58428330 234 - chr3:58428170-58428300 NA NA NA NA NA chr3-326 58307906 58308255 240 - chr3:58308169-58308223 NA NA NA NA NA chr3-325 58246169 58246580 240 - chr3:58246176-58246245 NA NA NA NA NA chr3-324 57898392 57898821 210 - chr3:57898487-57898540 NA NA NA NA NA chr3-323 57803398 57803683 244 - chr3:57803409-57803571 NA NA NA NA NA chr3-322 57745758 57746072 298 - chr3:57745780-57746059 NA NA NA NA NA chr3-321 57733239 57733473 211 - chr3:57733308-57733473 NA NA NA NA NA chr3-320 57620360 57620618 164 - chr3:57620475-57620566 NA NA NA NA NA chr3-34 5757142 5757608 204 - chr3:5757479-5757552 NA NA NA NA NA chr3-319 57540719 57540924 166 - chr3:57540772-57540892 NA NA NA NA NA chr3-318 57486054 57486430 214 - chr3:57486158-57486239 NA NA NA NA NA chr3-33 5745067 5745318 167 - chr3:5745223-5745240 NA NA NA NA NA chr3-317 57421346 57421555 141 - chr3:57421409-57421477 NA NA NA NA NA chr3-316 57366756 57367348 445 - chr3:57366888-57367332 NA NA NA NA NA chr3-315 57254453 57254892 206 - chr3:57254576-57254604 NA NA NA NA NA chr3-32 5655340 5655583 127 - chr3:5655346-5655415 NA NA NA NA NA chr3-314 56342786 56343012 166 - chr3:56342826-56342942 NA NA NA NA NA chr3-31 5627859 5628028 140 - chr3:5627887-5627997 NA NA NA NA NA chr3-313 56099000 56099260 191 - chr3:56099095-56099243 NA NA NA NA NA chr3-312 55518366 55518527 153 - chr3:55518376-55518525 NA NA NA NA NA chr3-311 55473648 55473815 131 - chr3:55473692-55473795 NA NA NA NA NA chr3-310 55411012 55411286 139 - chr3:55411154-55411165 NA NA NA NA NA chr3-309 55399734 55399943 152 - chr3:55399791-55399886 NA NA NA NA NA chr3-308 55268204 55268641 231 - chr3:55268487-55268589 NA NA NA NA NA chr3-307 55127671 55127909 159 - chr3:55127752-55127834 NA NA NA NA NA chr3-306 55056004 55056187 151 - chr3:55056046-55056160 NA NA NA NA NA chr3-305 53915364 53915594 191 - chr3:53915380-53915509 NA NA NA NA NA chr3-304 53484257 53484802 253 - chr3:53484370-53484412 NA NA NA NA NA chr3-303 53435390 53435644 152 - chr3:53435484-53435538 NA NA NA NA NA chr3-302 53401977 53402194 150 - chr3:53402046-53402128 NA NA NA NA NA chr3-30 5338778 5338960 164 - chr3:5338786-5338941 NA NA NA NA NA chr3-301 53173109 53173263 133 - chr3:53173135-53173226 NA NA NA NA NA chr3-300 53100662 53100921 158 - chr3:53100761-53100816 NA NA NA NA NA chr3-299 53071705 53071987 180 - chr3:53071844-53071959 NA NA NA NA NA chr3-298 52773133 52773431 170 - chr3:52773237-52773291 NA NA NA NA NA chr3-297 52259082 52259298 157 - chr3:52259146-52259249 NA NA NA NA NA chr3-296 52199460 52199763 173 - chr3:52199601-52199642 NA NA NA NA NA chr3-295 51846649 51846863 171 - chr3:51846735-51846820 NA NA NA NA NA chr3-294 51811223 51811391 153 - chr3:51811236-51811372 NA NA NA NA NA chr3-293 51759655 51759927 168 - chr3:51759748-51759801 NA NA NA NA NA chr3-292 51636344 51636650 192 - chr3:51636502-51636520 NA NA NA NA NA chr3-291 51590664 51591011 245 - chr3:51590682-51590867 NA NA NA NA NA chr3-290 51463021 51463378 176 - chr3:51463233-51463259 NA NA NA NA NA chr3-29 5141608 5141853 153 - chr3:5141704-5141772 NA NA NA NA NA chr3-289 51416610 51416775 151 - chr3:51416618-51416749 NA NA NA NA NA chr3-288 51378950 51379230 138 - chr3:51379157-51379218 NA NA NA NA NA chr3-287 51209968 51210436 263 - chr3:51210154-51210193 NA NA NA NA NA chr3-286 51046791 51047033 136 - chr3:51046798-51046881 NA NA NA NA NA chr3-28 5085541 5085706 155 - chr3:5085542-5085692 NA NA NA NA NA chr3-285 50813806 50814224 200 - chr3:50814094-50814146 NA NA NA NA NA chr3-27 5071117 5071497 203 - chr3:5071275-5071282 NA NA NA NA NA chr3-284 50505618 50506136 262 - chr3:50505772-50505906 NA NA NA NA NA chr3-283 50056650 50056999 192 - chr3:50056687-50056782 NA NA NA NA NA chr3-26 4989127 4989294 156 - chr3:4989141-4989289 NA NA NA NA NA chr3-282 49556060 49556246 168 - chr3:49556074-49556220 NA NA NA NA NA chr3-281 49513140 49513344 157 - chr3:49513178-49513294 NA NA NA NA NA chr3-280 49511276 49511453 167 - chr3:49511287-49511434 NA NA NA NA NA chr3-279 49471495 49471728 140 - chr3:49471591-49471641 NA NA NA NA NA chr3-278 49443669 49443907 175 - chr3:49443680-49443818 NA NA NA NA NA chr3-277 49106561 49106939 202 - chr3:49106619-49106704 NA NA NA NA NA chr3-276 49038951 49039294 167 - chr3:49039003-49039056 NA NA NA NA NA chr3-275 49030344 49030503 152 - chr3:49030353-49030500 NA NA NA NA NA chr3-274 49006522 49006757 129 - chr3:49006553-49006629 NA NA NA NA NA chr3-273 48979667 48979849 161 - chr3:48979676-48979804 NA NA NA NA NA chr3-272 48795859 48796232 253 - chr3:48796063-48796154 NA NA NA NA NA chr3-25 4860414 4860682 191 - chr3:4860469-4860561 NA NA NA NA NA chr3-271 48433198 48433695 228 - chr3:48433541-48433574 NA NA NA NA NA chr3-270 48269908 48270175 151 - chr3:48270090-48270092 NA NA NA NA NA chr3-269 48123622 48123778 119 - chr3:48123702-48123747 NA NA NA NA NA chr3-268 48068909 48069121 160 - chr3:48068978-48069103 NA NA NA NA NA chr3-267 48059599 48059926 174 - chr3:48059786-48059841 NA NA NA NA NA chr3-266 47946774 47946969 125 - chr3:47946823-47946857 NA NA NA NA NA chr3-265 47929795 47930156 216 - chr3:47929844-47929963 NA NA NA NA NA chr3-264 47635796 47635947 149 - chr3:47635798-47635946 NA NA NA NA NA chr3-263 47632990 47633279 188 - chr3:47633053-47633159 NA NA NA NA NA chr3-262 47615431 47615621 161 - chr3:47615460-47615592 NA NA NA NA NA chr3-24 4735352 4735604 141 - chr3:4735413-4735468 NA NA NA NA NA chr3-261 47343305 47343485 169 - chr3:47343319-47343480 NA NA NA NA NA chr3-260 47207848 47208153 255 - chr3:47207860-47208015 NA NA NA NA NA chr3-259 47020012 47020377 224 - chr3:47020085-47020202 NA NA NA NA NA chr3-258 46955010 46955268 199 - chr3:46955052-46955175 NA NA NA NA NA chr3-257 46919250 46919660 267 - chr3:46919328-46919387 NA NA NA NA NA chr3-256 46385133 46385346 153 - chr3:46385187-46385283 NA NA NA NA NA chr3-255 46199787 46200274 257 - chr3:46200125-46200260 NA NA NA NA NA chr3-23 4587999 4588320 177 - chr3:4588147-4588178 NA NA NA NA NA chr3-254 45576462 45576759 163 - chr3:45576532-45576593 NA NA NA NA NA chr3-253 45409342 45409599 185 - chr3:45409397-45409493 NA NA NA NA NA chr3-252 45274597 45274819 153 - chr3:45274666-45274750 NA NA NA NA NA chr3-6 451653 451843 151 - chr3:451684-451800 NA NA NA NA NA chr3-251 45057390 45057616 145 - chr3:45057531-45057565 NA NA NA NA NA chr3-250 44854645 44854958 162 - chr3:44854797-44854809 NA NA NA NA NA chr3-22 4462077 4462396 162 - chr3:4462240-4462251 NA NA NA NA NA chr3-249 44392174 44392364 172 - chr3:44392184-44392342 NA NA NA NA NA chr3-248 44283341 44283537 176 - chr3:44283387-44283530 NA NA NA NA NA chr3-247 43988380 43988661 195 - chr3:43988522-43988603 NA NA NA NA NA chr3-246 43920697 43920980 175 - chr3:43920792-43920846 NA NA NA NA NA chr3-245 43920232 43920451 157 - chr3:43920293-43920387 NA NA NA NA NA chr3-244 43816428 43816664 163 - chr3:43816486-43816561 NA NA NA NA NA chr3-243 43719137 43719587 251 - chr3:43719289-43719294 NA NA NA NA NA chr3-242 43610111 43610457 242 - chr3:43610295-43610393 NA NA NA NA NA chr3-241 43445338 43445567 160 - chr3:43445404-43445492 NA NA NA NA NA chr3-240 43409917 43410504 290 - chr3:43410226-43410231 NA NA NA NA NA chr3-21 4331502 4331748 191 - chr3:4331595-4331712 NA NA NA NA NA chr3-239 42946223 42946548 157 - chr3:42946367-42946368 NA NA NA NA NA chr3-238 42687879 42688644 404 - chr3:42688116-42688221 NA NA NA NA NA chr3-237 42624341 42624748 233 - chr3:42624560-42624706 NA NA NA NA NA chr3-236 42610651 42610946 181 - chr3:42610666-42610815 NA NA NA NA NA chr3-235 42463626 42463985 211 - chr3:42463629-42463724 NA NA NA NA NA chr3-234 42449750 42450048 203 - chr3:42449965-42450013 NA NA NA NA NA chr3-233 42365870 42366063 156 - chr3:42365913-42366038 NA NA NA NA NA chr3-232 42347024 42347220 138 - chr3:42347064-42347153 NA NA NA NA NA chr3-231 42336449 42336679 122 - chr3:42336513-42336549 NA NA NA NA NA chr3-230 42037018 42037261 149 - chr3:42037130-42037176 NA NA NA NA NA chr3-229 41693073 41693251 116 - chr3:41693142-41693203 NA NA NA NA NA chr3-20 4145449 4145628 128 - chr3:4145536-4145595 NA NA NA NA NA chr3-228 41405422 41405864 261 - chr3:41405578-41405597 NA NA NA NA NA chr3-227 41355800 41356019 150 - chr3:41355887-41355986 NA NA NA NA NA chr3-226 41173432 41173676 151 - chr3:41173510-41173583 NA NA NA NA NA chr3-225 41063185 41063506 306 - chr3:41063205-41063501 NA NA NA NA NA chr3-224 40739025 40739410 179 - chr3:40739271-40739284 NA NA NA NA NA chr3-223 40522041 40522429 296 - chr3:40522306-40522418 NA NA NA NA NA chr3-222 40521430 40521595 132 - chr3:40521471-40521578 NA NA NA NA NA chr3-221 40317947 40318084 119 - chr3:40317962-40318045 NA NA NA NA NA chr3-220 39698963 39699130 144 - chr3:39698982-39699099 NA NA NA NA NA chr3-219 39622658 39622965 255 - chr3:39622805-39622956 NA NA NA NA NA chr3-218 39425043 39425208 150 - chr3:39425060-39425197 NA NA NA NA NA chr3-217 39026938 39027200 169 - chr3:39027032-39027109 NA NA NA NA NA chr3-216 38968537 38968858 156 - chr3:38968562-38968623 NA NA NA NA NA chr3-215 38797390 38797657 218 - chr3:38797390-38797510 NA NA NA NA NA chr3-214 38671002 38671520 215 - chr3:38671436-38671479 NA NA NA NA NA chr3-213 38235543 38235832 167 - chr3:38235682-38235744 NA NA NA NA NA chr3-212 38221461 38221658 151 - chr3:38221511-38221614 NA NA NA NA NA chr3-211 38218307 38218593 159 - chr3:38218408-38218453 NA NA NA NA NA chr3-210 37938000 37938300 159 - chr3:37938151-37938179 NA NA NA NA NA chr3-209 37900207 37900564 162 - chr3:37900286-37900311 NA NA NA NA NA chr3-208 37847124 37847383 211 - chr3:37847124-37847311 NA NA NA NA NA chr3-207 37797043 37797466 209 - chr3:37797157-37797202 NA NA NA NA NA chr3-206 37699655 37699868 144 - chr3:37699726-37699800 NA NA NA NA NA chr3-205 37646206 37646369 153 - chr3:37646220-37646368 NA NA NA NA NA chr3-204 37623944 37624164 121 - chr3:37624065-37624109 NA NA NA NA NA chr3-203 37604369 37604670 251 - chr3:37604471-37604622 NA NA NA NA NA chr3-202 37530064 37530323 170 - chr3:37530159-37530246 NA NA NA NA NA chr3-201 37345134 37345362 160 - chr3:37345191-37345272 NA NA NA NA NA chr3-200 37174122 37174315 152 - chr3:37174147-37174266 NA NA NA NA NA chr3-199 37138443 37138877 254 - chr3:37138639-37138803 NA NA NA NA NA chr3-198 37125377 37125538 121 - chr3:37125408-37125509 NA NA NA NA NA chr3-197 37117084 37117367 160 - chr3:37117208-37117246 NA NA NA NA NA chr3-196 37099194 37099451 175 - chr3:37099224-37099343 NA NA NA NA NA chr3-195 37011583 37011717 132 - chr3:37011583-37011711 NA NA NA NA NA chr3-194 36812859 36813125 118 - chr3:36813060-36813104 NA NA NA NA NA chr3-193 36566587 36566793 166 - chr3:36566647-36566793 NA NA NA NA NA chr3-192 35933390 35933725 301 - chr3:35933428-35933693 NA NA NA NA NA chr3-191 35781887 35782201 156 - chr3:35782029-35782035 NA NA NA NA NA chr3-190 35116488 35116909 218 - chr3:35116777-35116845 NA NA NA NA NA chr3-189 35039563 35039816 145 - chr3:35039665-35039705 NA NA NA NA NA chr3-188 35033626 35033764 116 - chr3:35033652-35033725 NA NA NA NA NA chr3-187 34847512 34847971 243 - chr3:34847574-34847709 NA NA NA NA NA chr3-19 3465879 3466170 152 - chr3:3466018-3466031 NA NA NA NA NA chr3-186 34625842 34626130 151 - chr3:34625981-34626002 NA NA NA NA NA chr3-185 34581645 34581922 224 - chr3:34581680-34581833 NA NA NA NA NA chr3-18 3416776 3417000 151 - chr3:3416820-3416874 NA NA NA NA NA chr3-184 33990656 33991060 201 - chr3:33990748-33990764 NA NA NA NA NA chr3-183 33884259 33884605 182 - chr3:33884457-33884509 NA NA NA NA NA chr3-182 33801489 33801690 133 - chr3:33801625-33801656 NA NA NA NA NA chr3-181 33738488 33738757 233 - chr3:33738592-33738755 NA NA NA NA NA chr3-180 33655943 33656582 358 - chr3:33656175-33656254 NA NA NA NA NA chr3-179 33414470 33414652 149 - chr3:33414505-33414620 NA NA NA NA NA chr3-178 33352555 33352857 155 - chr3:33352699-33352704 NA NA NA NA NA chr3-177 32962793 32962951 120 - chr3:32962848-32962949 NA NA NA NA NA chr3-176 32736084 32736564 297 - chr3:32736241-32736368 NA NA NA NA NA chr3-175 32702605 32702874 145 - chr3:32702719-32702736 NA NA NA NA NA chr3-174 32326698 32326961 159 - chr3:32326805-32326863 NA NA NA NA NA chr3-173 32311792 32312034 156 - chr3:32311868-32311943 NA NA NA NA NA chr3-172 32095571 32095741 153 - chr3:32095586-32095723 NA NA NA NA NA chr3-17 3195218 3195500 203 - chr3:3195264-3195355 NA NA NA NA NA chr3-171 31951690 31951963 177 - chr3:31951761-31951890 NA NA NA NA NA chr3-170 31854465 31854798 230 - chr3:31854650-31854736 NA NA NA NA NA chr3-169 31824930 31825108 168 - chr3:31824947-31825095 NA NA NA NA NA chr3-168 31642689 31642913 149 - chr3:31642758-31642826 NA NA NA NA NA chr3-167 31565527 31565689 134 - chr3:31565529-31565648 NA NA NA NA NA chr3-166 31552153 31552411 158 - chr3:31552223-31552251 NA NA NA NA NA chr3-165 31499756 31500629 494 - chr3:31499931-31500010 NA NA NA NA NA chr3-164 31308258 31308699 291 - chr3:31308371-31308475 NA NA NA NA NA chr3-163 31290544 31290852 233 - chr3:31290689-31290812 NA NA NA NA NA chr3-162 31138097 31138513 184 - chr3:31138415-31138453 NA NA NA NA NA chr3-161 30964684 30965116 267 - chr3:30964765-30964935 NA NA NA NA NA chr3-160 30642360 30642669 184 - chr3:30642468-30642510 NA NA NA NA NA chr3-159 30627050 30627257 113 - chr3:30627096-30627139 NA NA NA NA NA chr3-158 30590492 30590706 113 - chr3:30590615-30590616 NA NA NA NA NA chr3-157 30503600 30503757 127 - chr3:30503690-30503757 NA NA NA NA NA chr3-156 30359954 30360117 145 - chr3:30359955-30360065 NA NA NA NA NA chr3-155 30057185 30057470 151 - chr3:30057317-30057335 NA NA NA NA NA chr3-5 300073 300224 128 - chr3:300140-300222 NA NA NA NA NA chr3-154 29989623 29989956 251 - chr3:29989740-29989827 NA NA NA NA NA chr3-4 299363 299642 155 - chr3:299479-299514 NA NA NA NA NA chr3-153 29893545 29893699 115 - chr3:29893601-29893694 NA NA NA NA NA chr3-152 29454926 29455186 160 - chr3:29455036-29455091 NA NA NA NA NA chr3-151 29169061 29169288 144 - chr3:29169138-29169193 NA NA NA NA NA chr3-150 29128725 29129120 203 - chr3:29128805-29128912 NA NA NA NA NA chr3-149 28934697 28934935 157 - chr3:28934780-28934858 NA NA NA NA NA chr3-148 28722201 28722445 186 - chr3:28722244-28722401 NA NA NA NA NA chr3-147 28604143 28604334 145 - chr3:28604185-28604280 NA NA NA NA NA chr3-146 28511805 28512093 240 - chr3:28511890-28512034 NA NA NA NA NA chr3-145 28362992 28363379 188 - chr3:28363231-28363260 NA NA NA NA NA chr3-144 28339314 28339549 122 - chr3:28339403-28339424 NA NA NA NA NA chr3-143 28326588 28327023 246 - chr3:28326721-28326806 NA NA NA NA NA chr3-142 28321360 28321676 198 - chr3:28321443-28321582 NA NA NA NA NA chr3-141 28298152 28298425 233 - chr3:28298271-28298424 NA NA NA NA NA chr3-140 27851471 27851701 148 - chr3:27851559-27851631 NA NA NA NA NA chr3-139 27672884 27673424 333 - chr3:27672915-27673289 NA NA NA NA NA chr3-138 27539992 27540145 148 - chr3:27539997-27540140 NA NA NA NA NA chr3-137 27537860 27538178 175 - chr3:27537976-27537981 NA NA NA NA NA chr3-136 27445337 27445635 145 - chr3:27445500-27445502 NA NA NA NA NA chr3-16 2738708 2738881 152 - chr3:2738715-2738853 NA NA NA NA NA chr3-135 27201258 27201465 154 - chr3:27201307-27201410 NA NA NA NA NA chr3-134 27194819 27195011 120 - chr3:27194947-27194967 NA NA NA NA NA chr3-133 27162880 27163126 186 - chr3:27162914-27163014 NA NA NA NA NA chr3-132 27072833 27073420 255 - chr3:27073323-27073374 NA NA NA NA NA chr3-15 2705430 2705563 129 - chr3:2705434-2705557 NA NA NA NA NA chr3-131 26694268 26694558 150 - chr3:26694409-26694420 NA NA NA NA NA chr3-3 264851 265366 279 - chr3:265058-265072 NA NA NA NA NA chr3-130 26460074 26460413 211 - chr3:26460099-26460246 NA NA NA NA NA chr3-129 25891729 25891907 116 - chr3:25891818-25891899 NA NA NA NA NA chr3-128 25597332 25597611 125 - chr3:25597523-25597571 NA NA NA NA NA chr3-14 2526845 2527128 225 - chr3:2526895-2527004 NA NA NA NA NA chr3-127 24972956 24973253 172 - chr3:24973076-24973118 NA NA NA NA NA chr3-126 24967070 24967400 240 - chr3:24967270-24967365 NA NA NA NA NA chr3-125 24891681 24891971 146 - chr3:24891830-24891837 NA NA NA NA NA chr3-124 24891267 24891519 177 - chr3:24891333-24891426 NA NA NA NA NA chr3-123 24877897 24878184 149 - chr3:24878028-24878040 NA NA NA NA NA chr3-122 24773556 24773745 169 - chr3:24773584-24773729 NA NA NA NA NA chr3-121 24762768 24763039 155 - chr3:24762900-24762931 NA NA NA NA NA chr3-120 24364692 24364855 129 - chr3:24364728-24364825 NA NA NA NA NA chr3-119 23564647 23564805 154 - chr3:23564650-23564796 NA NA NA NA NA chr3-118 23516978 23517225 142 - chr3:23517080-23517114 NA NA NA NA NA chr3-2 233299 233598 155 - chr3:233448-233461 NA NA NA NA NA chr3-117 23336472 23336674 160 - chr3:23336518-23336634 NA NA NA NA NA chr3-116 22868664 22868994 268 - chr3:22868699-22868843 NA NA NA NA NA chr3-115 22835391 22835736 165 - chr3:22835535-22835538 NA NA NA NA NA chr3-114 22612845 22613191 289 - chr3:22612894-22613118 NA NA NA NA NA chr3-113 22592308 22592519 152 - chr3:22592369-22592461 NA NA NA NA NA chr3-112 22475180 22475442 163 - chr3:22475283-22475351 NA NA NA NA NA chr3-111 22225029 22225266 162 - chr3:22225108-22225199 NA NA NA NA NA chr3-110 22087293 22087688 244 - chr3:22087522-22087576 NA NA NA NA NA chr3-109 22026469 22026813 259 - chr3:22026560-22026740 NA NA NA NA NA chr3-108 21749856 21750278 332 - chr3:21750054-21750206 NA NA NA NA NA chr3-107 21733236 21733474 162 - chr3:21733308-21733390 NA NA NA NA NA chr3-106 21534782 21535094 160 - chr3:21534782-21534866 NA NA NA NA NA chr3-105 21522145 21522298 128 - chr3:21522195-21522273 NA NA NA NA NA chr3-104 21484036 21484184 120 - chr3:21484068-21484174 NA NA NA NA NA chr3-103 21068748 21069090 187 - chr3:21068921-21068944 NA NA NA NA NA chr3-102 21062270 21062472 126 - chr3:21062338-21062380 NA NA NA NA NA chr3-101 21029146 21029406 177 - chr3:21029217-21029299 NA NA NA NA NA chr3-100 20824176 20824428 157 - chr3:20824269-20824332 NA NA NA NA NA chr3-99 20751570 20751936 187 - chr3:20751742-20751743 NA NA NA NA NA chr3-98 20706972 20707140 126 - chr3:20706981-20707086 NA NA NA NA NA chr3-97 20587310 20587697 269 - chr3:20587396-20587457 NA NA NA NA NA chr3-96 19793864 19794325 267 - chr3:19793898-19794051 NA NA NA NA NA chr3-95 19793342 19793718 214 - chr3:19793569-19793589 NA NA NA NA NA chr3-1170 197898047 197898342 154 - chr3:197898210-197898245 NA NA NA NA NA chr3-1169 197882981 197883216 159 - chr3:197883065-197883144 NA NA NA NA NA chr3-1168 197844992 197845403 192 - chr3:197845107-197845132 NA NA NA NA NA chr3-1167 197826467 197826657 154 - chr3:197826501-197826620 NA NA NA NA NA chr3-1166 197788734 197789038 210 - chr3:197788816-197788979 NA NA NA NA NA chr3-1165 197294964 197295420 263 - chr3:197295183-197295392 NA NA NA NA NA chr3-1164 197213367 197213610 140 - chr3:197213468-197213503 NA NA NA NA NA chr3-1163 197172392 197172538 112 - chr3:197172434-197172529 NA NA NA NA NA chr3-1162 197117553 197117795 184 - chr3:197117631-197117747 NA NA NA NA NA chr3-1161 197101792 197102119 209 - chr3:197101820-197101970 NA NA NA NA NA chr3-13 1969521 1969788 158 - chr3:1969633-1969685 NA NA NA NA NA chr3-1160 196937753 196937920 142 - chr3:196937782-196937903 NA NA NA NA NA chr3-1159 196875162 196875480 265 - chr3:196875312-196875471 NA NA NA NA NA chr3-1158 196686793 196686963 161 - chr3:196686808-196686957 NA NA NA NA NA chr3-1157 196186602 196186921 235 - chr3:196186796-196186892 NA NA NA NA NA chr3-1156 196181985 196182172 154 - chr3:196182054-196182157 NA NA NA NA NA chr3-1155 195540202 195540559 144 - chr3:195540485-195540486 NA NA NA NA NA chr3-1154 195400587 195400765 148 - chr3:195400616-195400733 NA NA NA NA NA chr3-1153 195392745 195392966 148 - chr3:195392820-195392894 NA NA NA NA NA chr3-94 19521839 19522139 146 - chr3:19522060-19522129 NA NA NA NA NA chr3-1152 194673652 194673844 162 - chr3:194673670-194673808 NA NA NA NA NA chr3-1151 194291938 194292107 134 - chr3:194291955-194292063 NA NA NA NA NA chr3-1150 193919155 193919461 168 - chr3:193919290-193919317 NA NA NA NA NA chr3-1149 193775467 193775628 136 - chr3:193775512-193775613 NA NA NA NA NA chr3-1148 193557289 193557532 171 - chr3:193557381-193557470 NA NA NA NA NA chr3-1147 193501761 193502015 152 - chr3:193501853-193501908 NA NA NA NA NA chr3-1146 193389407 193389883 227 - chr3:193389707-193389773 NA NA NA NA NA chr3-1145 193170553 193170984 382 - chr3:193170553-193170837 NA NA NA NA NA chr3-1144 192987139 192987338 163 - chr3:192987173-192987316 NA NA NA NA NA chr3-1143 192936970 192937310 253 - chr3:192937063-192937286 NA NA NA NA NA chr3-1142 192886727 192886977 201 - chr3:192886728-192886831 NA NA NA NA NA chr3-1141 192498673 192498974 157 - chr3:192498818-192498832 NA NA NA NA NA chr3-1140 192357608 192357805 155 - chr3:192357650-192357763 NA NA NA NA NA chr3-1139 192212425 192212720 150 - chr3:192212570-192212575 NA NA NA NA NA chr3-1138 192201005 192201233 142 - chr3:192201092-192201149 NA NA NA NA NA chr3-1137 192192464 192192739 226 - chr3:192192473-192192601 NA NA NA NA NA chr3-1136 191785152 191785315 160 - chr3:191785157-191785313 NA NA NA NA NA chr3-1135 191764421 191764694 207 - chr3:191764492-191764666 NA NA NA NA NA chr3-1134 191636050 191636286 174 - chr3:191636058-191636197 NA NA NA NA NA chr3-1133 191439319 191439480 118 - chr3:191439444-191439478 NA NA NA NA NA chr3-1132 191426254 191426463 143 - chr3:191426319-191426395 NA NA NA NA NA chr3-1131 191280278 191280487 162 - chr3:191280326-191280440 NA NA NA NA NA chr3-93 19105870 19106105 162 - chr3:19105960-19106092 NA NA NA NA NA chr3-92 19095380 19095684 154 - chr3:19095514-19095526 NA NA NA NA NA chr3-1130 190814145 190814380 148 - chr3:190814226-190814290 NA NA NA NA NA chr3-1129 190407009 190407345 194 - chr3:190407190-190407313 NA NA NA NA NA chr3-1128 190276031 190276365 203 - chr3:190276192-190276249 NA NA NA NA NA chr3-1127 190272178 190272523 202 - chr3:190272359-190272381 NA NA NA NA NA chr3-1126 190189815 190190121 168 - chr3:190189961-190189987 NA NA NA NA NA chr3-1125 190053974 190054441 334 - chr3:190054291-190054400 NA NA NA NA NA chr3-1124 190042580 190042849 118 - chr3:190042711-190042721 NA NA NA NA NA chr3-1123 190009629 190010080 256 - chr3:190009919-190010035 NA NA NA NA NA chr3-1122 189806823 189807118 164 - chr3:189806973-189807001 NA NA NA NA NA chr3-1121 189669483 189669671 152 - chr3:189669527-189669639 NA NA NA NA NA chr3-1120 189545380 189545889 312 - chr3:189545533-189545859 NA NA NA NA NA chr3-1119 189514001 189514284 239 - chr3:189514017-189514168 NA NA NA NA NA chr3-1118 189503915 189504340 207 - chr3:189504082-189504173 NA NA NA NA NA chr3-1117 189369915 189370248 170 - chr3:189370080-189370086 NA NA NA NA NA chr3-1116 189293906 189294178 232 - chr3:189293907-189294059 NA NA NA NA NA chr3-1115 189291766 189291992 163 - chr3:189291793-189291911 NA NA NA NA NA chr3-1114 189252847 189253068 126 - chr3:189252908-189252956 NA NA NA NA NA chr3-1113 189233851 189234205 287 - chr3:189233853-189234006 NA NA NA NA NA chr3-1112 188996245 188996640 194 - chr3:188996491-188996524 NA NA NA NA NA chr3-1111 188799675 188800089 211 - chr3:188799798-188799846 NA NA NA NA NA chr3-1110 188672789 188673083 154 - chr3:188672925-188672935 NA NA NA NA NA chr3-91 18862103 18862255 112 - chr3:18862152-18862244 NA NA NA NA NA chr3-1109 188603112 188603308 154 - chr3:188603138-188603258 NA NA NA NA NA chr3-1108 188540659 188540962 161 - chr3:188540788-188540878 NA NA NA NA NA chr3-1107 188099545 188099825 199 - chr3:188099622-188099699 NA NA NA NA NA chr3-1106 187966323 187966494 161 - chr3:187966333-187966484 NA NA NA NA NA chr3-1105 187779230 187779389 131 - chr3:187779239-187779314 NA NA NA NA NA chr3-1104 187674572 187674826 151 - chr3:187674671-187674721 NA NA NA NA NA chr3-1103 187666687 187666898 189 - chr3:187666706-187666870 NA NA NA NA NA chr3-1102 187584852 187585148 210 - chr3:187584920-187585026 NA NA NA NA NA chr3-1101 187545771 187546027 141 - chr3:187545884-187545908 NA NA NA NA NA chr3-1100 187452182 187452441 158 - chr3:187452294-187452362 NA NA NA NA NA chr3-1099 187084146 187084485 213 - chr3:187084200-187084323 NA NA NA NA NA chr3-1098 186898318 186898731 205 - chr3:186898583-186898637 NA NA NA NA NA chr3-1097 186724168 186724362 178 - chr3:186724197-186724343 NA NA NA NA NA chr3-1096 186636072 186636754 339 - chr3:186636590-186636597 NA NA NA NA NA chr3-1095 186525854 186526116 160 - chr3:186525980-186526026 NA NA NA NA NA chr3-1094 186482258 186482662 293 - chr3:186482349-186482541 NA NA NA NA NA chr3-90 18636986 18637136 146 - chr3:18636986-18637124 NA NA NA NA NA chr3-1093 186336630 186336967 179 - chr3:186336706-186336768 NA NA NA NA NA chr3-1092 186141700 186141973 149 - chr3:186141829-186141859 NA NA NA NA NA chr3-1091 185997733 185997970 165 - chr3:185997797-185997882 NA NA NA NA NA chr3-1090 185984990 185985246 166 - chr3:185985036-185985097 NA NA NA NA NA chr3-1089 185965905 185966205 155 - chr3:185966048-185966059 NA NA NA NA NA chr3-1088 185798528 185798703 161 - chr3:185798533-185798671 NA NA NA NA NA chr3-1087 185757703 185757964 226 - chr3:185757757-185757913 NA NA NA NA NA chr3-1086 185664027 185664345 187 - chr3:185664076-185664173 NA NA NA NA NA chr3-1085 185304158 185304337 155 - chr3:185304186-185304321 NA NA NA NA NA chr3-1084 185151687 185152005 183 - chr3:185151876-185151967 NA NA NA NA NA chr3-1083 185142727 185143048 195 - chr3:185142900-185143016 NA NA NA NA NA chr3-1082 184563496 184563801 162 - chr3:184563609-184563643 NA NA NA NA NA chr3-1081 184345954 184346274 278 - chr3:184345992-184346224 NA NA NA NA NA chr3-1080 183657724 183657919 137 - chr3:183657812-183657876 NA NA NA NA NA chr3-1079 183600586 183600745 138 - chr3:183600617-183600744 NA NA NA NA NA chr3-1078 183559852 183560096 124 - chr3:183559944-183559962 NA NA NA NA NA chr3-1077 183497320 183497609 158 - chr3:183497452-183497480 NA NA NA NA NA chr3-12 1833747 1834231 240 - chr3:1833933-1833958 NA NA NA NA NA chr3-1076 183390336 183390676 201 - chr3:183390519-183390552 NA NA NA NA NA chr3-1075 183280933 183281086 151 - chr3:183280935-183281084 NA NA NA NA NA chr3-1074 183231476 183231813 172 - chr3:183231599-183231627 NA NA NA NA NA chr3-89 18314065 18314289 142 - chr3:18314171-18314219 NA NA NA NA NA chr3-1073 183102086 183102440 179 - chr3:183102327-183102397 NA NA NA NA NA chr3-1072 183043880 183044201 211 - chr3:183043965-183044041 NA NA NA NA NA chr3-1071 182795056 182795640 294 - chr3:182795118-182795236 NA NA NA NA NA chr3-1070 182662959 182663325 224 - chr3:182663170-182663185 NA NA NA NA NA chr3-1069 182610456 182610655 172 - chr3:182610499-182610636 NA NA NA NA NA chr3-1068 182551851 182552153 224 - chr3:182552002-182552070 NA NA NA NA NA chr3-1067 182455984 182456492 374 - chr3:182456018-182456405 NA NA NA NA NA chr3-1066 182277208 182277638 203 - chr3:182277349-182277354 NA NA NA NA NA chr3-1065 182266855 182267081 147 - chr3:182266946-182267008 NA NA NA NA NA chr3-1064 181862585 181862909 168 - chr3:181862733-181862737 NA NA NA NA NA chr3-1063 181835239 181835480 138 - chr3:181835349-181835391 NA NA NA NA NA chr3-1062 181551395 181551692 179 - chr3:181551535-181551585 NA NA NA NA NA chr3-1061 181431562 181431775 150 - chr3:181431625-181431712 NA NA NA NA NA chr3-1060 181266874 181267144 148 - chr3:181267010-181267029 NA NA NA NA NA chr3-1059 181047908 181048170 143 - chr3:181048030-181048057 NA NA NA NA NA chr3-1058 181022991 181023513 355 - chr3:181023088-181023206 NA NA NA NA NA chr3-88 18089206 18089402 166 - chr3:18089234-18089371 NA NA NA NA NA chr3-1057 180697098 180697446 218 - chr3:180697166-180697307 NA NA NA NA NA chr3-1056 180649810 180650049 187 - chr3:180649855-180649938 NA NA NA NA NA chr3-1055 180612586 180612931 197 - chr3:180612748-180612790 NA NA NA NA NA chr3-1054 180575643 180575817 120 - chr3:180575663-180575695 NA NA NA NA NA chr3-87 18037963 18038146 147 - chr3:18037998-18038108 NA NA NA NA NA chr3-1053 180303521 180303842 199 - chr3:180303598-180303630 NA NA NA NA NA chr3-1052 180195687 180196255 286 - chr3:180195968-180196125 NA NA NA NA NA chr3-1051 180122614 180123020 240 - chr3:180122639-180122796 NA NA NA NA NA chr3-1050 180092071 180092237 130 - chr3:180092110-180092207 NA NA NA NA NA chr3-1049 180076993 180077227 141 - chr3:180077082-180077126 NA NA NA NA NA chr3-1048 179968887 179969515 366 - chr3:179969131-179969217 NA NA NA NA NA chr3-1047 179966476 179966662 158 - chr3:179966516-179966640 NA NA NA NA NA chr3-1046 179617634 179617907 150 - chr3:179617767-179617789 NA NA NA NA NA chr3-1045 179613835 179614025 149 - chr3:179613862-179613977 NA NA NA NA NA chr3-1044 179549148 179549407 158 - chr3:179549243-179549303 NA NA NA NA NA chr3-1043 179267606 179267763 145 - chr3:179267614-179267753 NA NA NA NA NA chr3-1042 179028767 179028968 141 - chr3:179028821-179028896 NA NA NA NA NA chr3-1041 179018744 179018981 168 - chr3:179018803-179018907 NA NA NA NA NA chr3-1040 179017559 179017809 125 - chr3:179017664-179017674 NA NA NA NA NA chr3-1039 178745115 178745255 115 - chr3:178745122-178745221 NA NA NA NA NA chr3-1038 178719791 178720081 232 - chr3:178719810-178720013 NA NA NA NA NA chr3-1037 178612056 178612248 180 - chr3:178612079-178612235 NA NA NA NA NA chr3-86 17856094 17856302 148 - chr3:17856156-17856246 NA NA NA NA NA chr3-1036 178537600 178537876 183 - chr3:178537729-178537855 NA NA NA NA NA chr3-1035 178311053 178311291 165 - chr3:178311126-178311218 NA NA NA NA NA chr3-1034 178245800 178246047 174 - chr3:178245863-178245954 NA NA NA NA NA chr3-1033 177995431 177995697 172 - chr3:177995519-177995591 NA NA NA NA NA chr3-1032 177785406 177785702 186 - chr3:177785443-177785594 NA NA NA NA NA chr3-1031 177384537 177384840 193 - chr3:177384583-177384698 NA NA NA NA NA chr3-85 17722040 17722263 134 - chr3:17722111-17722138 NA NA NA NA NA chr3-1030 177197973 177198160 119 - chr3:177198127-177198135 NA NA NA NA NA chr3-1029 177152722 177153017 161 - chr3:177152860-177152891 NA NA NA NA NA chr3-1028 177101529 177101830 155 - chr3:177101673-177101680 NA NA NA NA NA chr3-1027 176901897 176902084 159 - chr3:176901925-176902056 NA NA NA NA NA chr3-84 17631513 17631697 167 - chr3:17631548-17631689 NA NA NA NA NA chr3-1026 176152699 176152926 211 - chr3:176152699-176152878 NA NA NA NA NA chr3-1025 175883597 175884015 195 - chr3:175883858-175883868 NA NA NA NA NA chr3-1024 175544322 175544594 226 - chr3:175544325-175544459 NA NA NA NA NA chr3-1023 175480001 175480255 182 - chr3:175480088-175480234 NA NA NA NA NA chr3-1022 175352611 175352945 191 - chr3:175352664-175352757 NA NA NA NA NA chr3-1021 175289221 175289381 146 - chr3:175289229-175289355 NA NA NA NA NA chr3-1020 175281136 175281306 137 - chr3:175281183-175281254 NA NA NA NA NA chr3-1019 175212172 175212397 131 - chr3:175212247-175212265 NA NA NA NA NA chr3-1018 175168076 175168464 211 - chr3:175168307-175168314 NA NA NA NA NA chr3-83 17483666 17483868 143 - chr3:17483686-17483731 NA NA NA NA NA chr3-82 17475899 17476065 119 - chr3:17475934-17476012 NA NA NA NA NA chr3-1017 174677579 174677924 190 - chr3:174677674-174677739 NA NA NA NA NA chr3-1016 174356816 174357141 180 - chr3:174357007-174357019 NA NA NA NA NA chr3-1015 174120780 174121006 113 - chr3:174120837-174120865 NA NA NA NA NA chr3-1014 174033219 174033612 268 - chr3:174033267-174033333 NA NA NA NA NA chr3-1013 173950087 173950233 120 - chr3:173950115-173950222 NA NA NA NA NA chr3-81 17386751 17387084 151 - chr3:17386843-17386857 NA NA NA NA NA chr3-80 17385849 17386190 175 - chr3:17386012-17386018 NA NA NA NA NA chr3-1012 173855412 173855663 151 - chr3:173855518-173855566 NA NA NA NA NA chr3-1011 173542210 173542385 167 - chr3:173542233-173542384 NA NA NA NA NA chr3-79 17352593 17352811 139 - chr3:17352672-17352732 NA NA NA NA NA chr3-1010 173049001 173049429 180 - chr3:173049091-173049170 NA NA NA NA NA chr3-1009 172922299 172922671 198 - chr3:172922528-172922607 NA NA NA NA NA chr3-1008 172732090 172732269 144 - chr3:172732129-172732236 NA NA NA NA NA chr3-1007 172652382 172652617 183 - chr3:172652404-172652561 NA NA NA NA NA chr3-1006 172501784 172501955 148 - chr3:172501796-172501910 NA NA NA NA NA chr3-1005 171842196 171842450 178 - chr3:171842288-171842382 NA NA NA NA NA chr3-1004 171768076 171768397 169 - chr3:171768190-171768226 NA NA NA NA NA chr3-1003 171759435 171759628 157 - chr3:171759477-171759604 NA NA NA NA NA chr3-1002 171716361 171716528 146 - chr3:171716362-171716466 NA NA NA NA NA chr3-78 17130550 17130692 131 - chr3:17130554-17130667 NA NA NA NA NA chr3-1001 171140836 171141262 247 - chr3:171140955-171141113 NA NA NA NA NA chr3-77 17110411 17110966 247 - chr3:17110525-17110561 NA NA NA NA NA chr3-1000 171057212 171057578 271 - chr3:171057355-171057436 NA NA NA NA NA chr3 170753 171145 186 - chr3:171034-171089 NA NA NA NA NA chr3-999 170810620 170810792 113 - chr3:170810700-170810775 NA NA NA NA NA chr3-998 170785767 170786013 138 - chr3:170785862-170785879 NA NA NA NA NA chr3-997 170703725 170703900 143 - chr3:170703763-170703880 NA NA NA NA NA chr3-996 170679127 170679342 191 - chr3:170679191-170679334 NA NA NA NA NA chr3-995 170552647 170552835 121 - chr3:170552686-170552712 NA NA NA NA NA chr3-994 170501541 170501820 121 - chr3:170501611-170501618 NA NA NA NA NA chr3-993 170458480 170458808 176 - chr3:170458642-170458661 NA NA NA NA NA chr3-992 170456374 170456910 265 - chr3:170456409-170456521 NA NA NA NA NA chr3-76 16972901 16973149 155 - chr3:16973000-16973068 NA NA NA NA NA chr3-991 169144573 169144776 157 - chr3:169144615-169144722 NA NA NA NA NA chr3-990 168823699 168823915 159 - chr3:168823774-168823867 NA NA NA NA NA chr3-75 16831240 16831406 118 - chr3:16831261-16831304 NA NA NA NA NA chr3-989 168213864 168214049 159 - chr3:168213880-168214018 NA NA NA NA NA chr3-988 167898467 167898746 235 - chr3:167898560-167898707 NA NA NA NA NA chr3-987 167650116 167650491 203 - chr3:167650342-167650427 NA NA NA NA NA chr3-74 16728760 16729039 236 - chr3:16728842-16728992 NA NA NA NA NA chr3-986 167157175 167157564 204 - chr3:167157254-167157395 NA NA NA NA NA chr3-985 167117839 167118183 208 - chr3:167117877-167118017 NA NA NA NA NA chr3-984 167101389 167101645 144 - chr3:167101502-167101535 NA NA NA NA NA chr3-983 167052074 167052241 166 - chr3:167052077-167052241 NA NA NA NA NA chr3-73 16636664 16636980 174 - chr3:16636840-16636855 NA NA NA NA NA chr3-72 16635456 16635668 148 - chr3:16635518-16635600 NA NA NA NA NA chr3-982 166297143 166297288 125 - chr3:166297146-166297231 NA NA NA NA NA chr3-981 166150370 166150798 218 - chr3:166150664-166150777 NA NA NA NA NA chr3-980 165859542 165859938 203 - chr3:165859649-165859702 NA NA NA NA NA chr3-979 165186283 165186684 252 - chr3:165186371-165186413 NA NA NA NA NA chr3-978 165119682 165120069 285 - chr3:165119748-165119895 NA NA NA NA NA chr3-977 165106521 165106832 256 - chr3:165106532-165106678 NA NA NA NA NA chr3-976 164876922 164877217 163 - chr3:164877041-164877138 NA NA NA NA NA chr3-975 164806714 164806866 148 - chr3:164806720-164806866 NA NA NA NA NA chr3-974 164763549 164763769 172 - chr3:164763644-164763720 NA NA NA NA NA chr3-973 164195630 164195846 159 - chr3:164195705-164195798 NA NA NA NA NA chr3-71 16407199 16407520 227 - chr3:16407213-16407386 NA NA NA NA NA chr3-972 163899205 163899460 180 - chr3:163899292-163899391 NA NA NA NA NA chr3-971 163659220 163659373 151 - chr3:163659223-163659373 NA NA NA NA NA chr3-970 163507141 163507515 225 - chr3:163507362-163507402 NA NA NA NA NA chr3-969 163453728 163454113 212 - chr3:163453815-163453897 NA NA NA NA NA chr3-968 162952569 162953021 206 - chr3:162952721-162952728 NA NA NA NA NA chr3-70 16283129 16283475 219 - chr3:16283227-16283290 NA NA NA NA NA chr3-967 162791618 162791790 116 - chr3:162791734-162791764 NA NA NA NA NA chr3-69 16274402 16274813 249 - chr3:16274464-16274601 NA NA NA NA NA chr3-966 162298386 162298707 170 - chr3:162298521-162298548 NA NA NA NA NA chr3-68 16225382 16225841 366 - chr3:16225484-16225664 NA NA NA NA NA chr3-965 162167158 162167799 330 - chr3:162167468-162167523 NA NA NA NA NA chr3-11 1620936 1621119 116 - chr3:1620983-1621012 NA NA NA NA NA chr3-964 161557723 161558108 267 - chr3:161557947-161558043 NA NA NA NA NA chr3-963 161168272 161168740 258 - chr3:161168365-161168512 NA NA NA NA NA chr3-962 160861722 160862014 182 - chr3:160861862-160861964 NA NA NA NA NA chr3-961 160769734 160770011 179 - chr3:160769848-160769945 NA NA NA NA NA chr3-960 160676641 160676806 122 - chr3:160676681-160676757 NA NA NA NA NA chr3-959 160670521 160670864 258 - chr3:160670616-160670784 NA NA NA NA NA chr3-67 16056095 16056497 244 - chr3:16056208-16056268 NA NA NA NA NA chr3-958 160238096 160238325 147 - chr3:160238250-160238279 NA NA NA NA NA chr3-957 159671839 159672134 169 - chr3:159671903-159671977 NA NA NA NA NA chr3-956 158945637 158945838 148 - chr3:158945690-158945785 NA NA NA NA NA chr3-955 158733646 158733886 129 - chr3:158733783-158733788 NA NA NA NA NA chr3-66 15856869 15857287 206 - chr3:15857161-15857261 NA NA NA NA NA chr3-954 157392607 157392925 166 - chr3:157392759-157392773 NA NA NA NA NA chr3-953 156901708 156902153 269 - chr3:156901917-156902098 NA NA NA NA NA chr3-952 156668454 156668806 208 - chr3:156668655-156668776 NA NA NA NA NA chr3-951 156613630 156613975 185 - chr3:156613709-156613778 NA NA NA NA NA chr3-950 156320210 156320434 171 - chr3:156320215-156320357 NA NA NA NA NA chr3-949 155976101 155976419 182 - chr3:155976265-155976297 NA NA NA NA NA chr3-948 155563300 155563589 155 - chr3:155563432-155563451 NA NA NA NA NA chr3-947 155489056 155489284 199 - chr3:155489127-155489268 NA NA NA NA NA chr3-946 155475923 155476147 164 - chr3:155475975-155476071 NA NA NA NA NA chr3-945 155242529 155242711 168 - chr3:155242537-155242694 NA NA NA NA NA chr3-944 154919746 154920051 246 - chr3:154919770-154919922 NA NA NA NA NA chr3-943 154533187 154533406 157 - chr3:154533277-154533358 NA NA NA NA NA chr3-942 154402390 154402597 123 - chr3:154402502-154402569 NA NA NA NA NA chr3-941 154291763 154291930 127 - chr3:154291769-154291873 NA NA NA NA NA chr3-940 153844709 153844884 169 - chr3:153844709-153844875 NA NA NA NA NA chr3-939 153836321 153836966 384 - chr3:153836634-153836874 NA NA NA NA NA chr3-938 153741686 153742114 258 - chr3:153741906-153742042 NA NA NA NA NA chr3-937 153464314 153464626 162 - chr3:153464476-153464500 NA NA NA NA NA chr3-936 153270749 153270959 139 - chr3:153270792-153270832 NA NA NA NA NA chr3-935 152246240 152246415 157 - chr3:152246240-152246361 NA NA NA NA NA chr3-934 152170239 152170511 144 - chr3:152170389-152170427 NA NA NA NA NA chr3-933 151908631 151908892 157 - chr3:151908734-151908786 NA NA NA NA NA chr3-932 151335380 151335708 180 - chr3:151335548-151335570 NA NA NA NA NA chr3-931 151322400 151322837 348 - chr3:151322405-151322706 NA NA NA NA NA chr3-930 151106698 151107070 223 - chr3:151106975-151106985 NA NA NA NA NA chr3-929 150954683 150955166 267 - chr3:150955005-150955164 NA NA NA NA NA chr3-928 150829428 150830206 374 - chr3:150829938-150829988 NA NA NA NA NA chr3-927 150729318 150729515 149 - chr3:150729359-150729453 NA NA NA NA NA chr3-926 150696788 150697019 139 - chr3:150696868-150696921 NA NA NA NA NA chr3-925 150532316 150532573 153 - chr3:150532422-150532473 NA NA NA NA NA chr3-924 150486603 150486835 159 - chr3:150486668-150486758 NA NA NA NA NA chr3-923 150281016 150281323 202 - chr3:150281107-150281190 NA NA NA NA NA chr3-922 150229663 150229954 148 - chr3:150229808-150229812 NA NA NA NA NA chr3-65 14954531 14954695 151 - chr3:14954540-14954674 NA NA NA NA NA chr3-921 149267998 149268367 283 - chr3:149268060-149268233 NA NA NA NA NA chr3-920 148576190 148576445 165 - chr3:148576298-148576364 NA NA NA NA NA chr3-919 148550135 148550383 115 - chr3:148550182-148550207 NA NA NA NA NA chr3-918 148195786 148196084 159 - chr3:148195925-148195945 NA NA NA NA NA chr3-917 148021917 148022198 237 - chr3:148022044-148022193 NA NA NA NA NA chr3-916 147665109 147665387 175 - chr3:147665230-147665324 NA NA NA NA NA chr3-915 147590914 147591131 163 - chr3:147590984-147591109 NA NA NA NA NA chr3-914 147541455 147541652 163 - chr3:147541491-147541622 NA NA NA NA NA chr3-913 147088928 147089161 158 - chr3:147089001-147089085 NA NA NA NA NA chr3-912 146277677 146277991 172 - chr3:146277701-146277790 NA NA NA NA NA chr3-911 146180116 146180269 151 - chr3:146180117-146180265 NA NA NA NA NA chr3-910 145914789 145914949 147 - chr3:145914797-145914926 NA NA NA NA NA chr3-909 145584631 145584924 164 - chr3:145584792-145584811 NA NA NA NA NA chr3-908 145385527 145385854 202 - chr3:145385581-145385587 NA NA NA NA NA chr3-907 144796699 144797196 264 - chr3:144796980-144796987 NA NA NA NA NA chr3-906 144690253 144690623 264 - chr3:144690359-144690411 NA NA NA NA NA chr3-905 144649723 144650008 151 - chr3:144649821-144649856 NA NA NA NA NA chr3-904 144556564 144556835 157 - chr3:144556637-144556639 NA NA NA NA NA chr3-903 144555812 144556071 148 - chr3:144555931-144555964 NA NA NA NA NA chr3-902 144398133 144398489 279 - chr3:144398338-144398476 NA NA NA NA NA chr3-901 144334954 144335295 218 - chr3:144335061-144335140 NA NA NA NA NA chr3-64 14415790 14415963 161 - chr3:14415802-14415957 NA NA NA NA NA chr3-900 143998948 143999098 148 - chr3:143998949-143999094 NA NA NA NA NA chr3-899 143907034 143907299 167 - chr3:143907140-143907205 NA NA NA NA NA chr3-898 143226141 143226432 218 - chr3:143226311-143226383 NA NA NA NA NA chr3-897 143215912 143216170 154 - chr3:143216022-143216069 NA NA NA NA NA chr3-896 143183940 143184115 138 - chr3:143184011-143184075 NA NA NA NA NA chr3-10 1429659 1429847 171 - chr3:1429675-1429828 NA NA NA NA NA chr3-895 142919368 142919576 194 - chr3:142919368-142919534 NA NA NA NA NA chr3-894 142901596 142901821 127 - chr3:142901712-142901732 NA NA NA NA NA chr3-893 142542307 142542500 162 - chr3:142542332-142542466 NA NA NA NA NA chr3-892 142536465 142537026 331 - chr3:142536626-142536689 NA NA NA NA NA chr3-891 142384335 142384668 207 - chr3:142384446-142384512 NA NA NA NA NA chr3-890 142365232 142365505 147 - chr3:142365360-142365380 NA NA NA NA NA chr3-889 142243920 142244254 274 - chr3:142243948-142244102 NA NA NA NA NA chr3-888 141352001 141352410 196 - chr3:141352263-141352315 NA NA NA NA NA chr3-63 14127208 14127450 181 - chr3:14127303-14127406 NA NA NA NA NA chr3-887 141178186 141178379 160 - chr3:141178215-141178347 NA NA NA NA NA chr3-886 141028484 141028756 162 - chr3:141028591-141028640 NA NA NA NA NA chr3-885 140932043 140932511 301 - chr3:140932246-140932362 NA NA NA NA NA chr3-884 140744279 140744838 355 - chr3:140744539-140744662 NA NA NA NA NA chr3-883 140635679 140635878 146 - chr3:140635724-140635821 NA NA NA NA NA chr3-882 139858015 139858354 201 - chr3:139858132-139858174 NA NA NA NA NA chr3-881 139709581 139709741 125 - chr3:139709635-139709690 NA NA NA NA NA chr3-880 139457783 139457966 171 - chr3:139457795-139457942 NA NA NA NA NA chr3-879 139412632 139413159 291 - chr3:139412692-139412865 NA NA NA NA NA chr3-878 139393777 139394164 208 - chr3:139393844-139393929 NA NA NA NA NA chr3-877 138831104 138831409 210 - chr3:138831245-138831406 NA NA NA NA NA chr3-62 13860343 13860693 172 - chr3:13860436-13860519 NA NA NA NA NA chr3-876 138331001 138331216 152 - chr3:138331058-138331141 NA NA NA NA NA chr3-875 138024324 138024480 114 - chr3:138024334-138024422 NA NA NA NA NA chr3-61 13750930 13751359 248 - chr3:13751241-13751324 NA NA NA NA NA chr3-874 137331184 137331349 152 - chr3:137331193-137331334 NA NA NA NA NA chr3-873 137164749 137165096 250 - chr3:137164796-137164899 NA NA NA NA NA chr3-872 137087401 137087601 141 - chr3:137087455-137087532 NA NA NA NA NA chr3-871 136672594 136672770 163 - chr3:136672615-136672761 NA NA NA NA NA chr3-870 136650042 136650262 187 - chr3:136650055-136650219 NA NA NA NA NA chr3-869 136385057 136385282 126 - chr3:136385074-136385142 NA NA NA NA NA chr3-868 135491203 135491722 326 - chr3:135491298-135491480 NA NA NA NA NA chr3-867 135099120 135099400 153 - chr3:135099223-135099261 NA NA NA NA NA chr3-866 134988518 134988768 230 - chr3:134988541-134988731 NA NA NA NA NA chr3-865 134727106 134727264 150 - chr3:134727117-134727262 NA NA NA NA NA chr3-864 134222291 134222575 196 - chr3:134222314-134222466 NA NA NA NA NA chr3-863 133794430 133794605 143 - chr3:133794474-133794577 NA NA NA NA NA chr3-862 133679221 133679385 149 - chr3:133679230-133679367 NA NA NA NA NA chr3-861 133598640 133598820 150 - chr3:133598710-133598810 NA NA NA NA NA chr3-860 133578780 133579026 152 - chr3:133578874-133578932 NA NA NA NA NA chr3-859 133345352 133345574 165 - chr3:133345406-133345511 NA NA NA NA NA chr3-858 133135610 133135923 245 - chr3:133135687-133135898 NA NA NA NA NA chr3-857 133050560 133050771 151 - chr3:133050617-133050705 NA NA NA NA NA chr3-856 132907822 132908290 285 - chr3:132908169-132908189 NA NA NA NA NA chr3-855 132863865 132864041 130 - chr3:132863918-132864009 NA NA NA NA NA chr3-854 132711770 132711960 153 - chr3:132711804-132711917 NA NA NA NA NA chr3-853 132655398 132655586 151 - chr3:132655437-132655553 NA NA NA NA NA chr3-852 132629580 132629914 253 - chr3:132629629-132629769 NA NA NA NA NA chr3-851 132628484 132628831 248 - chr3:132628618-132628668 NA NA NA NA NA chr3-850 132261517 132261842 205 - chr3:132261644-132261789 NA NA NA NA NA chr3-849 132248361 132248704 211 - chr3:132248377-132248514 NA NA NA NA NA chr3-848 132168000 132168525 295 - chr3:132168379-132168460 NA NA NA NA NA chr3-847 132018075 132018259 139 - chr3:132018209-132018258 NA NA NA NA NA chr3-846 132005220 132005359 132 - chr3:132005223-132005350 NA NA NA NA NA chr3-845 131936677 131936879 153 - chr3:131936733-131936844 NA NA NA NA NA chr3-844 131689006 131689175 132 - chr3:131689115-131689173 NA NA NA NA NA chr3-843 131666292 131666493 121 - chr3:131666341-131666351 NA NA NA NA NA chr3-842 131394303 131394563 179 - chr3:131394354-131394467 NA NA NA NA NA chr3-841 131299945 131300204 145 - chr3:131300061-131300091 NA NA NA NA NA chr3-840 131030838 131031156 237 - chr3:131030884-131031005 NA NA NA NA NA chr3-839 131030351 131030800 243 - chr3:131030489-131030645 NA NA NA NA NA chr3-838 131008860 131009143 205 - chr3:131008946-131009112 NA NA NA NA NA chr3-837 130661453 130661765 190 - chr3:130661607-130661659 NA NA NA NA NA chr3-836 130614939 130615233 175 - chr3:130614990-130615080 NA NA NA NA NA chr3-835 129891914 129892129 147 - chr3:129891994-129892067 NA NA NA NA NA chr3-834 129890537 129890901 261 - chr3:129890646-129890800 NA NA NA NA NA chr3-833 129735667 129735926 167 - chr3:129735760-129735836 NA NA NA NA NA chr3-832 129694100 129694454 217 - chr3:129694199-129694241 NA NA NA NA NA chr3-831 129668035 129668525 250 - chr3:129668080-129668180 NA NA NA NA NA chr3-830 129429367 129429648 179 - chr3:129429479-129429566 NA NA NA NA NA chr3-829 129045469 129045796 228 - chr3:129045556-129045691 NA NA NA NA NA chr3-828 128904048 128904246 154 - chr3:128904087-128904192 NA NA NA NA NA chr3-827 128268489 128268789 178 - chr3:128268563-128268643 NA NA NA NA NA chr3-826 128239188 128239460 176 - chr3:128239266-128239355 NA NA NA NA NA chr3-825 128139670 128139979 167 - chr3:128139760-128139811 NA NA NA NA NA chr3-824 128040685 128040953 166 - chr3:128040769-128040842 NA NA NA NA NA chr3-823 127824461 127824751 155 - chr3:127824604-127824620 NA NA NA NA NA chr3-822 127768853 127769135 235 - chr3:127768994-127769135 NA NA NA NA NA chr3-821 127522629 127522921 171 - chr3:127522767-127522834 NA NA NA NA NA chr3-820 126606997 126607168 162 - chr3:126607006-126607159 NA NA NA NA NA chr3-819 126603737 126603930 169 - chr3:126603756-126603896 NA NA NA NA NA chr3-818 126458811 126458961 118 - chr3:126458815-126458917 NA NA NA NA NA chr3-817 126442729 126442983 220 - chr3:126442729-126442881 NA NA NA NA NA chr3-816 126408825 126409203 196 - chr3:126409050-126409107 NA NA NA NA NA chr3-815 126319137 126319327 128 - chr3:126319235-126319283 NA NA NA NA NA chr3-814 126302247 126302483 147 - chr3:126302337-126302396 NA NA NA NA NA chr3-60 12609257 12609440 159 - chr3:12609295-12609423 NA NA NA NA NA chr3-813 126081209 126081442 178 - chr3:126081240-126081339 NA NA NA NA NA chr3-812 126017861 126018239 238 - chr3:126018030-126018198 NA NA NA NA NA chr3-811 126007589 126007764 171 - chr3:126007594-126007762 NA NA NA NA NA chr3-810 125585125 125585458 190 - chr3:125585315-125585409 NA NA NA NA NA chr3-809 125575879 125576173 163 - chr3:125576023-125576068 NA NA NA NA NA chr3-808 125483115 125483417 202 - chr3:125483233-125483385 NA NA NA NA NA chr3-807 125367658 125367972 170 - chr3:125367658-125367756 NA NA NA NA NA chr3-806 125323970 125324120 118 - chr3:125323981-125324083 NA NA NA NA NA chr3-805 125265088 125265383 172 - chr3:125265209-125265259 NA NA NA NA NA chr3-804 125113443 125113785 224 - chr3:125113451-125113616 NA NA NA NA NA chr3-803 124920650 124920865 178 - chr3:124920686-124920836 NA NA NA NA NA chr3-802 124620071 124620226 149 - chr3:124620080-124620226 NA NA NA NA NA chr3-801 124618900 124619071 133 - chr3:124618962-124619045 NA NA NA NA NA chr3-59 12458646 12458865 122 - chr3:12458757-12458796 NA NA NA NA NA chr3-800 124505386 124505694 258 - chr3:124505427-124505585 NA NA NA NA NA chr3-799 124487697 124487948 125 - chr3:124487826-124487828 NA NA NA NA NA chr3-798 124461364 124461768 233 - chr3:124461369-124461447 NA NA NA NA NA chr3-797 124311796 124312326 327 - chr3:124311821-124312041 NA NA NA NA NA chr3-796 124248795 124249114 296 - chr3:124248814-124249089 NA NA NA NA NA chr3-795 124100681 124101115 310 - chr3:124100686-124100994 NA NA NA NA NA chr3-794 123943955 123944274 216 - chr3:123944120-123944202 NA NA NA NA NA chr3-793 123917356 123917665 253 - chr3:123917376-123917537 NA NA NA NA NA chr3-792 123826740 123827081 216 - chr3:123826849-123826948 NA NA NA NA NA chr3-791 123672483 123672643 156 - chr3:123672483-123672637 NA NA NA NA NA chr3-790 123467142 123467359 126 - chr3:123467209-123467256 NA NA NA NA NA chr3-789 123234901 123235356 216 - chr3:123235066-123235080 NA NA NA NA NA chr3-788 123168878 123169052 149 - chr3:123168904-123169029 NA NA NA NA NA chr3-787 122842144 122842456 255 - chr3:122842156-122842297 NA NA NA NA NA chr3-786 122769268 122769470 144 - chr3:122769328-122769413 NA NA NA NA NA chr3-785 122715159 122715440 143 - chr3:122715274-122715348 NA NA NA NA NA chr3-784 122538083 122538551 215 - chr3:122538403-122538432 NA NA NA NA NA chr3-783 122481010 122481357 207 - chr3:122481228-122481256 NA NA NA NA NA chr3-782 122041042 122041226 133 - chr3:122041123-122041190 NA NA NA NA NA chr3-781 122027699 122028169 367 - chr3:122027970-122028156 NA NA NA NA NA chr3-780 121999710 121999988 165 - chr3:121999831-121999891 NA NA NA NA NA chr3-779 121952154 121952845 361 - chr3:121952253-121952437 NA NA NA NA NA chr3-778 121832857 121833106 140 - chr3:121832962-121832995 NA NA NA NA NA chr3-777 121727510 121727920 360 - chr3:121727538-121727826 NA NA NA NA NA chr3-776 121701832 121702189 292 - chr3:121701887-121702119 NA NA NA NA NA chr3-775 121651374 121651853 286 - chr3:121651564-121651654 NA NA NA NA NA chr3-774 121648137 121648499 185 - chr3:121648395-121648445 NA NA NA NA NA chr3-773 121614325 121614929 294 - chr3:121614571-121614587 NA NA NA NA NA chr3-772 121576931 121577134 189 - chr3:121576971-121577133 NA NA NA NA NA chr3-771 121504760 121505175 257 - chr3:121504778-121504947 NA NA NA NA NA chr3-770 121261094 121261389 247 - chr3:121261198-121261369 NA NA NA NA NA chr3-58 12124255 12124405 122 - chr3:12124337-12124404 NA NA NA NA NA chr3-769 121083098 121083270 155 - chr3:121083116-121083255 NA NA NA NA NA chr3-768 121044436 121044688 154 - chr3:121044476-121044561 NA NA NA NA NA chr3-767 120809614 120809775 153 - chr3:120809621-120809765 NA NA NA NA NA chr3-766 120773319 120773566 142 - chr3:120773429-120773453 NA NA NA NA NA chr3-765 120741085 120741287 164 - chr3:120741121-120741245 NA NA NA NA NA chr3-764 120327464 120327819 180 - chr3:120327591-120327741 NA NA NA NA NA chr3-763 120303340 120303638 199 - chr3:120303428-120303493 NA NA NA NA NA chr3-762 120283817 120283970 123 - chr3:120283835-120283898 NA NA NA NA NA chr3-761 120073834 120074218 231 - chr3:120073961-120074139 NA NA NA NA NA chr3-760 119970804 119970978 120 - chr3:119970820-119970913 NA NA NA NA NA chr3-759 119928636 119929107 229 - chr3:119928936-119928981 NA NA NA NA NA chr3-758 119894699 119895099 295 - chr3:119894773-119895017 NA NA NA NA NA chr3-757 119857654 119857987 245 - chr3:119857828-119857942 NA NA NA NA NA chr3-756 119683657 119683951 164 - chr3:119683837-119683846 NA NA NA NA NA chr3-755 119486511 119486766 155 - chr3:119486606-119486656 NA NA NA NA NA chr3-754 119484545 119484730 163 - chr3:119484545-119484697 NA NA NA NA NA chr3-753 119368148 119368338 174 - chr3:119368180-119368330 NA NA NA NA NA chr3-752 119367051 119367475 260 - chr3:119367247-119367286 NA NA NA NA NA chr3-751 119265706 119265915 162 - chr3:119265739-119265861 NA NA NA NA NA chr3-750 119077598 119077975 260 - chr3:119077657-119077839 NA NA NA NA NA chr3-749 119008871 119009172 198 - chr3:119009022-119009165 NA NA NA NA NA chr3-748 118950829 118951053 159 - chr3:118950942-118951012 NA NA NA NA NA chr3-747 118797030 118797239 159 - chr3:118797072-118797173 NA NA NA NA NA chr3-746 118499451 118499822 301 - chr3:118499622-118499783 NA NA NA NA NA chr3-745 118353039 118353244 128 - chr3:118353150-118353184 NA NA NA NA NA chr3-744 118268662 118268845 163 - chr3:118268669-118268822 NA NA NA NA NA chr3-743 118228701 118228936 149 - chr3:118228799-118228856 NA NA NA NA NA chr3-9 1176959 1177378 227 - chr3:1177019-1177120 NA NA NA NA NA chr3-742 117595955 117596234 243 - chr3:117596059-117596230 NA NA NA NA NA chr3-741 117577876 117578183 232 - chr3:117578021-117578143 NA NA NA NA NA chr3-740 117323396 117323855 196 - chr3:117323738-117323750 NA NA NA NA NA chr3-739 117162800 117163088 211 - chr3:117162999-117163072 NA NA NA NA NA chr3-738 117035854 117036059 177 - chr3:117035884-117036032 NA NA NA NA NA chr3-737 116658943 116659388 248 - chr3:116658992-116659096 NA NA NA NA NA chr3-736 116642587 116643090 227 - chr3:116642851-116642878 NA NA NA NA NA chr3-735 116582195 116582540 174 - chr3:116582269-116582302 NA NA NA NA NA chr3-734 115941804 115942230 244 - chr3:115941927-115942077 NA NA NA NA NA chr3-733 115851915 115852094 136 - chr3:115852002-115852052 NA NA NA NA NA chr3-732 115848019 115848309 150 - chr3:115848157-115848165 NA NA NA NA NA chr3-731 115700206 115700558 176 - chr3:115700244-115700313 NA NA NA NA NA chr3-730 115643914 115644301 215 - chr3:115644124-115644156 NA NA NA NA NA chr3-729 115628941 115629235 151 - chr3:115629088-115629094 NA NA NA NA NA chr3-728 115569850 115570139 146 - chr3:115569994-115569998 NA NA NA NA NA chr3-727 115551822 115552203 229 - chr3:115551903-115552056 NA NA NA NA NA chr3-726 115196870 115197077 195 - chr3:115196891-115197062 NA NA NA NA NA chr3-725 115141630 115142006 308 - chr3:115141665-115141837 NA NA NA NA NA chr3-724 115052912 115053314 257 - chr3:115053131-115053206 NA NA NA NA NA chr3-723 114958246 114958484 148 - chr3:114958334-114958393 NA NA NA NA NA chr3-722 114899603 114899787 152 - chr3:114899641-114899758 NA NA NA NA NA chr3-721 114888301 114888789 283 - chr3:114888632-114888647 NA NA NA NA NA chr3-720 114585624 114585797 146 - chr3:114585645-114585767 NA NA NA NA NA chr3-57 11457693 11457994 200 - chr3:11457817-11457939 NA NA NA NA NA chr3-719 114559223 114560261 592 - chr3:114559779-114560154 NA NA NA NA NA chr3-56 11454178 11454464 227 - chr3:11454216-11454325 NA NA NA NA NA chr3-718 114445503 114445797 152 - chr3:114445639-114445652 NA NA NA NA NA chr3-717 114443985 114444160 165 - chr3:114443991-114444136 NA NA NA NA NA chr3-716 114326692 114326884 152 - chr3:114326740-114326848 NA NA NA NA NA chr3-715 114308990 114309180 174 - chr3:114308998-114309160 NA NA NA NA NA chr3-714 114287537 114287901 226 - chr3:114287581-114287738 NA NA NA NA NA chr3-713 114048319 114048591 239 - chr3:114048329-114048502 NA NA NA NA NA chr3-712 114009433 114009669 157 - chr3:114009516-114009592 NA NA NA NA NA chr3-711 113727507 113727851 276 - chr3:113727515-113727655 NA NA NA NA NA chr3-710 113726831 113727010 166 - chr3:113726870-113727010 NA NA NA NA NA chr3-709 113692516 113692783 208 - chr3:113692549-113692672 NA NA NA NA NA chr3-55 11351733 11351952 151 - chr3:11351798-11351878 NA NA NA NA NA chr3-54 11342528 11342791 127 - chr3:11342657-11342684 NA NA NA NA NA chr3-708 113176318 113176618 157 - chr3:113176461-113176475 NA NA NA NA NA chr3-707 113053638 113053909 203 - chr3:113053738-113053907 NA NA NA NA NA chr3-706 112877333 112877666 272 - chr3:112877374-112877524 NA NA NA NA NA chr3-705 112805949 112806196 144 - chr3:112806024-112806079 NA NA NA NA NA chr3-704 112765277 112765671 320 - chr3:112765313-112765578 NA NA NA NA NA chr3-703 112721033 112721237 155 - chr3:112721086-112721196 NA NA NA NA NA chr3-702 112468132 112468399 228 - chr3:112468134-112468286 NA NA NA NA NA chr3-53 11237192 11237459 221 - chr3:11237203-11237343 NA NA NA NA NA chr3-701 112353417 112353604 148 - chr3:112353461-112353575 NA NA NA NA NA chr3-700 111990779 111990926 146 - chr3:111990779-111990923 NA NA NA NA NA chr3-699 111932597 111933133 308 - chr3:111932747-111932772 NA NA NA NA NA chr3-698 111766533 111766850 178 - chr3:111766721-111766809 NA NA NA NA NA chr3-697 111761327 111761651 165 - chr3:111761493-111761506 NA NA NA NA NA chr3-696 111440954 111441095 114 - chr3:111440959-111441019 NA NA NA NA NA chr3-695 111433413 111433575 125 - chr3:111433513-111433564 NA NA NA NA NA chr3-694 111201108 111201310 129 - chr3:111201159-111201226 NA NA NA NA NA chr3-693 111121482 111121727 151 - chr3:111121578-111121634 NA NA NA NA NA chr3-692 111073127 111073409 172 - chr3:111073245-111073315 NA NA NA NA NA chr3-52 11105293 11105711 304 - chr3:11105574-11105650 NA NA NA NA NA chr3-691 110957851 110958181 188 - chr3:110957912-110957995 NA NA NA NA NA chr3-690 110954649 110955087 201 - chr3:110954923-110954924 NA NA NA NA NA chr3-689 110728198 110728480 198 - chr3:110728245-110728401 NA NA NA NA NA chr3-688 110709533 110709921 205 - chr3:110709773-110709852 NA NA NA NA NA chr3-687 110588477 110588702 158 - chr3:110588552-110588639 NA NA NA NA NA chr3-686 110528353 110528696 219 - chr3:110528402-110528559 NA NA NA NA NA chr3-685 110390507 110390754 129 - chr3:110390599-110390623 NA NA NA NA NA chr3-684 110229929 110230141 120 - chr3:110230006-110230070 NA NA NA NA NA chr3-683 110132835 110133035 116 - chr3:110132967-110132975 NA NA NA NA NA chr3-682 110121476 110121767 138 - chr3:110121647-110121650 NA NA NA NA NA chr3-681 109768473 109768650 168 - chr3:109768474-109768624 NA NA NA NA NA chr3-680 109753959 109754168 164 - chr3:109754000-109754121 NA NA NA NA NA chr3-679 109714708 109715472 304 - chr3:109714850-109714853 NA NA NA NA NA chr3-678 109623097 109623275 135 - chr3:109623142-109623233 NA NA NA NA NA chr3-677 109476008 109476187 167 - chr3:109476038-109476184 NA NA NA NA NA chr3-676 109361455 109361629 134 - chr3:109361501-109361615 NA NA NA NA NA chr3-675 109345007 109345315 164 - chr3:109345075-109345167 NA NA NA NA NA chr3-674 109322219 109322432 152 - chr3:109322253-109322317 NA NA NA NA NA chr3-673 109032118 109032308 158 - chr3:109032150-109032276 NA NA NA NA NA chr3-672 108581689 108581875 120 - chr3:108581823-108581843 NA NA NA NA NA chr3-671 108486660 108487106 235 - chr3:108487002-108487018 NA NA NA NA NA chr3-51 10839089 10839247 114 - chr3:10839110-10839157 NA NA NA NA NA chr3-670 108078687 108079075 266 - chr3:108078923-108079010 NA NA NA NA NA chr3-669 108058763 108058987 149 - chr3:108058840-108058913 NA NA NA NA NA chr3-668 107928353 107928683 221 - chr3:107928500-107928650 NA NA NA NA NA chr3-667 107920003 107920265 147 - chr3:107920123-107920160 NA NA NA NA NA chr3-666 107881609 107881948 217 - chr3:107881752-107881780 NA NA NA NA NA chr3-665 107732294 107732751 259 - chr3:107732437-107732443 NA NA NA NA NA chr3-664 107691350 107691538 132 - chr3:107691399-107691468 NA NA NA NA NA chr3-663 107644250 107644556 251 - chr3:107644381-107644522 NA NA NA NA NA chr3-662 107537838 107538103 158 - chr3:107537895-107537971 NA NA NA NA NA chr3-661 107528867 107529071 164 - chr3:107528879-107528975 NA NA NA NA NA chr3-660 107437195 107437415 159 - chr3:107437228-107437340 NA NA NA NA NA chr3-659 107344037 107344441 207 - chr3:107344285-107344346 NA NA NA NA NA chr3-658 107192844 107193011 155 - chr3:107192862-107193011 NA NA NA NA NA chr3-657 107124545 107124858 192 - chr3:107124706-107124757 NA NA NA NA NA chr3-656 107120630 107120835 124 - chr3:107120657-107120727 NA NA NA NA NA chr3-655 107084758 107084989 148 - chr3:107084805-107084888 NA NA NA NA NA chr3-654 107049932 107050300 266 - chr3:107050006-107050177 NA NA NA NA NA chr3-653 106863576 106863794 179 - chr3:106863647-106863771 NA NA NA NA NA chr3-652 106619924 106620251 265 - chr3:106619928-106620073 NA NA NA NA NA chr3-651 106570887 106571116 136 - chr3:106570988-106571039 NA NA NA NA NA chr3-650 106477687 106478077 190 - chr3:106477805-106477836 NA NA NA NA NA chr3-649 106322624 106322883 197 - chr3:106322696-106322862 NA NA NA NA NA chr3-648 106037352 106037578 135 - chr3:106037401-106037466 NA NA NA NA NA chr3-647 105881140 105881368 157 - chr3:105881213-105881298 NA NA NA NA NA chr3-646 105800002 105800302 213 - chr3:105800193-105800232 NA NA NA NA NA chr3-645 105563235 105563433 161 - chr3:105563266-105563384 NA NA NA NA NA chr3-644 105479446 105479654 162 - chr3:105479484-105479592 NA NA NA NA NA chr3-643 105458382 105458736 259 - chr3:105458485-105458554 NA NA NA NA NA chr3-642 105422763 105423139 168 - chr3:105422867-105422879 NA NA NA NA NA chr3-641 105265736 105265961 152 - chr3:105265801-105265884 NA NA NA NA NA chr3-640 105213716 105213947 170 - chr3:105213784-105213862 NA NA NA NA NA chr3-639 105015594 105015776 149 - chr3:105015627-105015743 NA NA NA NA NA chr3-638 105007050 105007307 147 - chr3:105007166-105007200 NA NA NA NA NA chr3-637 104908736 104909038 163 - chr3:104908879-104908907 NA NA NA NA NA chr3-636 104842477 104842659 153 - chr3:104842496-104842625 NA NA NA NA NA chr3-635 104751790 104751931 119 - chr3:104751855-104751930 NA NA NA NA NA chr3-634 104713369 104713620 141 - chr3:104713471-104713506 NA NA NA NA NA chr3-633 104645043 104645289 168 - chr3:104645114-104645197 NA NA NA NA NA chr3-632 104569625 104569922 162 - chr3:104569778-104569796 NA NA NA NA NA chr3-631 104518734 104519042 166 - chr3:104518854-104518889 NA NA NA NA NA chr3-630 104470785 104471029 167 - chr3:104470882-104470962 NA NA NA NA NA chr3-629 104233304 104233648 172 - chr3:104233491-104233506 NA NA NA NA NA chr3-628 104167485 104167705 176 - chr3:104167502-104167656 NA NA NA NA NA chr3-627 104117363 104117625 225 - chr3:104117472-104117624 NA NA NA NA NA chr3-626 103912302 103912584 162 - chr3:103912424-103912465 NA NA NA NA NA chr3-625 103870172 103870323 123 - chr3:103870186-103870253 NA NA NA NA NA chr3-624 103867201 103867597 246 - chr3:103867409-103867580 NA NA NA NA NA chr3-623 103532170 103532404 184 - chr3:103532209-103532368 NA NA NA NA NA chr3-622 103500688 103501046 170 - chr3:103500816-103500828 NA NA NA NA NA chr3-621 103432463 103432695 199 - chr3:103432478-103432626 NA NA NA NA NA chr3-620 103321101 103321630 273 - chr3:103321316-103321461 NA NA NA NA NA chr3-619 103310092 103310270 150 - chr3:103310116-103310240 NA NA NA NA NA chr3-618 103287086 103287325 159 - chr3:103287164-103287241 NA NA NA NA NA chr3-617 103216313 103216735 198 - chr3:103216403-103216444 NA NA NA NA NA chr3-616 103176510 103176790 200 - chr3:103176531-103176691 NA NA NA NA NA chr3-615 102984996 102985253 150 - chr3:102985105-102985147 NA NA NA NA NA chr3-50 10277950 10278193 162 - chr3:10278042-10278134 NA NA NA NA NA chr3-614 102636004 102636529 294 - chr3:102636205-102636283 NA NA NA NA NA chr3-613 102488614 102488904 186 - chr3:102488640-102488774 NA NA NA NA NA chr3-612 102405585 102405850 159 - chr3:102405673-102405708 NA NA NA NA NA chr3-611 102116715 102117440 377 - chr3:102116969-102117045 NA NA NA NA NA chr3-610 102017349 102017517 158 - chr3:102017356-102017501 NA NA NA NA NA chr3-609 102007166 102007466 153 - chr3:102007316-102007325 NA NA NA NA NA chr3-608 101960438 101960868 206 - chr3:101960448-101960537 NA NA NA NA NA chr3-607 101857386 101857620 153 - chr3:101857473-101857551 NA NA NA NA NA chr3-606 101838538 101838849 201 - chr3:101838540-101838686 NA NA NA NA NA chr3-605 101683442 101683738 196 - chr3:101683454-101683594 NA NA NA NA NA chr3-604 101562235 101562628 239 - chr3:101562235-101562397 NA NA NA NA NA chr3-603 101529711 101529910 162 - chr3:101529753-101529883 NA NA NA NA NA chr3-602 101523592 101523896 158 - chr3:101523592-101523677 NA NA NA NA NA chr3-601 101459437 101459610 124 - chr3:101459540-101459588 NA NA NA NA NA chr3-600 101434063 101434351 203 - chr3:101434147-101434264 NA NA NA NA NA chr3-599 101417828 101418279 278 - chr3:101417981-101418096 NA NA NA NA NA chr3-598 101388877 101389080 148 - chr3:101388913-101388987 NA NA NA NA NA chr3-597 101378916 101379079 155 - chr3:101378918-101379068 NA NA NA NA NA chr3-596 101242577 101242788 143 - chr3:101242657-101242726 NA NA NA NA NA chr3-595 101211650 101211990 164 - chr3:101211708-101211755 NA NA NA NA NA chr3-594 100932283 100932518 170 - chr3:100932334-100932446 NA NA NA NA NA chr3-49 10082973 10083179 168 - chr3:10083019-10083145 NA NA NA NA NA chr3-593 100796998 100797494 264 - chr3:100797405-100797490 NA NA NA NA NA chr3-592 100749340 100749767 197 - chr3:100749607-100749611 NA NA NA NA NA chr3-591 100419358 100419687 203 - chr3:100419485-100419626 NA NA NA NA NA chr3-590 100308890 100309168 177 - chr3:100308982-100309049 NA NA NA NA NA chr2-804 99901078 99901578 268 - chr2:99901207-99901281 NA NA NA NA NA chr2-803 99823480 99823757 177 - chr2:99823590-99823662 NA NA NA NA NA chr2-802 99802844 99803318 260 - chr2:99803035-99803102 NA NA NA NA NA chr2-801 99750586 99750915 217 - chr2:99750656-99750817 NA NA NA NA NA chr2-800 99717357 99717508 149 - chr2:99717362-99717507 NA NA NA NA NA chr2-799 99651924 99652111 160 - chr2:99651968-99652091 NA NA NA NA NA chr2-798 99594763 99594950 136 - chr2:99594854-99594919 NA NA NA NA NA chr2-36 9945967 9946197 164 - chr2:9946037-9946133 NA NA NA NA NA chr2-797 99452222 99452749 312 - chr2:99452258-99452373 NA NA NA NA NA chr2-35 9943268 9943820 279 - chr2:9943635-9943788 NA NA NA NA NA chr2-796 99425082 99425374 151 - chr2:99425225-99425237 NA NA NA NA NA chr2-795 99423309 99423485 157 - chr2:99423326-99423465 NA NA NA NA NA chr2-794 99267435 99267612 135 - chr2:99267465-99267564 NA NA NA NA NA chr2-793 99119255 99119419 141 - chr2:99119269-99119364 NA NA NA NA NA chr2-34 9911553 9911881 193 - chr2:9911602-9911703 NA NA NA NA NA chr2-792 99021143 99021309 127 - chr2:99021242-99021300 NA NA NA NA NA chr2-791 98916274 98916509 151 - chr2:98916352-98916422 NA NA NA NA NA chr2-33 9886692 9886878 129 - chr2:9886720-9886763 NA NA NA NA NA chr2-790 98727853 98728003 136 - chr2:98727857-98727984 NA NA NA NA NA chr2-789 98617289 98617728 289 - chr2:98617441-98617579 NA NA NA NA NA chr2-788 98557228 98557599 240 - chr2:98557385-98557490 NA NA NA NA NA chr2-787 98407883 98408446 320 - chr2:98408134-98408248 NA NA NA NA NA chr2-786 98214265 98214547 153 - chr2:98214399-98214428 NA NA NA NA NA chr2-785 98135004 98135298 196 - chr2:98135147-98135290 NA NA NA NA NA chr2-784 97975406 97975569 160 - chr2:97975406-97975560 NA NA NA NA NA chr2-783 97881836 97882135 178 - chr2:97881944-97881988 NA NA NA NA NA chr2-782 97745006 97745263 157 - chr2:97745106-97745163 NA NA NA NA NA chr2-781 97703761 97703929 138 - chr2:97703777-97703871 NA NA NA NA NA chr2-32 9702193 9702540 215 - chr2:9702377-9702408 NA NA NA NA NA chr2-780 96742914 96743247 202 - chr2:96743104-96743234 NA NA NA NA NA chr2-779 96611264 96611686 254 - chr2:96611503-96611673 NA NA NA NA NA chr2-778 96473762 96474019 197 - chr2:96473800-96473915 NA NA NA NA NA chr2-777 96415669 96416009 207 - chr2:96415682-96415816 NA NA NA NA NA chr2-776 96406862 96407086 156 - chr2:96406932-96407022 NA NA NA NA NA chr2-775 96340820 96340998 137 - chr2:96340861-96340957 NA NA NA NA NA chr2-31 9633036 9633366 214 - chr2:9633188-9633344 NA NA NA NA NA chr2-774 96312720 96313081 211 - chr2:96312774-96312883 NA NA NA NA NA chr2-773 96270060 96270339 216 - chr2:96270161-96270295 NA NA NA NA NA chr2-772 96132304 96132628 210 - chr2:96132309-96132462 NA NA NA NA NA chr2-30 9568737 9569011 209 - chr2:9568770-9568882 NA NA NA NA NA chr2-771 95566674 95566854 144 - chr2:95566712-95566822 NA NA NA NA NA chr2-770 95152762 95153068 170 - chr2:95152909-95152954 NA NA NA NA NA chr2-769 94967325 94967495 114 - chr2:94967344-94967365 NA NA NA NA NA chr2-29 9336861 9337230 193 - chr2:9337063-9337067 NA NA NA NA NA chr2-28 9335776 9336016 139 - chr2:9335863-9335908 NA NA NA NA NA chr2-27 9221932 9222234 259 - chr2:9222049-9222222 NA NA NA NA NA chr2-26 9205023 9205259 161 - chr2:9205096-9205180 NA NA NA NA NA chr2-768 91411813 91412247 223 - chr2:91411888-91411968 NA NA NA NA NA chr2-25 9102380 9102912 238 - chr2:9102509-9102653 NA NA NA NA NA chr2-767 89802324 89802523 125 - chr2:89802364-89802432 NA NA NA NA NA chr2-766 88923621 88923926 255 - chr2:88923662-88923817 NA NA NA NA NA chr2-765 88912955 88913086 112 - chr2:88913010-88913084 NA NA NA NA NA chr2-764 88690137 88690654 204 - chr2:88690218-88690225 NA NA NA NA NA chr2-763 88510624 88510817 151 - chr2:88510665-88510773 NA NA NA NA NA chr2-762 88414768 88415002 155 - chr2:88414859-88414948 NA NA NA NA NA chr2-761 88356062 88356817 409 - chr2:88356086-88356215 NA NA NA NA NA chr2-760 88289443 88289596 151 - chr2:88289443-88289590 NA NA NA NA NA chr2-759 88108967 88109361 206 - chr2:88109186-88109235 NA NA NA NA NA chr2-24 8749075 8749460 207 - chr2:8749227-8749230 NA NA NA NA NA chr2-758 86693802 86693988 138 - chr2:86693884-86693957 NA NA NA NA NA chr2-757 86535787 86535953 154 - chr2:86535788-86535936 NA NA NA NA NA chr2-756 86531912 86532105 147 - chr2:86531960-86532063 NA NA NA NA NA chr2-755 86448752 86449025 233 - chr2:86448804-86448957 NA NA NA NA NA chr2-754 86388475 86388788 153 - chr2:86388483-86388556 NA NA NA NA NA chr2-753 86279964 86280263 215 - chr2:86279979-86280026 NA NA NA NA NA chr2-752 85940048 85940213 152 - chr2:85940065-85940202 NA NA NA NA NA chr2-751 85925790 85926109 171 - chr2:85925910-85925947 NA NA NA NA NA chr2-750 85866146 85866326 166 - chr2:85866146-85866305 NA NA NA NA NA chr2-749 85834492 85834685 159 - chr2:85834516-85834631 NA NA NA NA NA chr2-748 85321745 85321924 125 - chr2:85321847-85321894 NA NA NA NA NA chr2-747 85242078 85242309 159 - chr2:85242132-85242201 NA NA NA NA NA chr2-746 85103942 85104400 267 - chr2:85104136-85104215 NA NA NA NA NA chr2-745 85093284 85093499 147 - chr2:85093350-85093427 NA NA NA NA NA chr2-744 84933968 84934315 139 - chr2:84934045-84934080 NA NA NA NA NA chr2-743 84716184 84716790 278 - chr2:84716318-84716345 NA NA NA NA NA chr2-742 84588866 84589091 125 - chr2:84589001-84589061 NA NA NA NA NA chr2-23 8449854 8450017 159 - chr2:8449854-8450011 NA NA NA NA NA chr2-741 84312803 84313139 278 - chr2:84312905-84313067 NA NA NA NA NA chr2-740 83831763 83831951 145 - chr2:83831808-83831912 NA NA NA NA NA chr2-739 83745697 83746022 179 - chr2:83745875-83745940 NA NA NA NA NA chr2-738 83706309 83706571 191 - chr2:83706416-83706518 NA NA NA NA NA chr2-737 83588291 83588451 157 - chr2:83588293-83588446 NA NA NA NA NA chr2-736 83581442 83582033 254 - chr2:83581495-83581536 NA NA NA NA NA chr2-735 83508263 83508486 160 - chr2:83508322-83508415 NA NA NA NA NA chr2-734 83334240 83334437 121 - chr2:83334366-83334386 NA NA NA NA NA chr2-733 83209348 83209700 227 - chr2:83209447-83209562 NA NA NA NA NA chr2-732 83199706 83200085 210 - chr2:83199775-83199866 NA NA NA NA NA chr2-731 83004754 83004941 120 - chr2:83004903-83004915 NA NA NA NA NA chr2-730 82864759 82864936 156 - chr2:82864792-82864921 NA NA NA NA NA chr2-729 82797975 82798314 242 - chr2:82798141-82798278 NA NA NA NA NA chr2-728 82792576 82792758 150 - chr2:82792600-82792710 NA NA NA NA NA chr2-727 82777370 82777498 118 - chr2:82777392-82777490 NA NA NA NA NA chr2-726 82666343 82666817 216 - chr2:82666478-82666565 NA NA NA NA NA chr2-725 82424103 82424304 152 - chr2:82424146-82424252 NA NA NA NA NA chr2-724 82404128 82404384 143 - chr2:82404245-82404279 NA NA NA NA NA chr2-723 82226839 82227091 165 - chr2:82226924-82227003 NA NA NA NA NA chr2-722 82207423 82207768 223 - chr2:82207499-82207661 NA NA NA NA NA chr2-721 82189129 82189411 229 - chr2:82189153-82189300 NA NA NA NA NA chr2-720 82124498 82124717 154 - chr2:82124591-82124666 NA NA NA NA NA chr2-719 82045218 82045455 185 - chr2:82045261-82045420 NA NA NA NA NA chr2-718 81962690 81962902 158 - chr2:81962722-81962837 NA NA NA NA NA chr2-717 81958481 81958638 117 - chr2:81958522-81958579 NA NA NA NA NA chr2-716 81938718 81938998 192 - chr2:81938744-81938892 NA NA NA NA NA chr2-22 8155341 8155553 128 - chr2:8155400-8155419 NA NA NA NA NA chr2-715 81159796 81159999 167 - chr2:81159813-81159953 NA NA NA NA NA chr2-714 80972564 80972743 141 - chr2:80972630-80972716 NA NA NA NA NA chr2-713 80693128 80693421 174 - chr2:80693267-80693342 NA NA NA NA NA chr2-712 80572831 80573146 157 - chr2:80572993-80572996 NA NA NA NA NA chr2-711 80477045 80477325 209 - chr2:80477144-80477259 NA NA NA NA NA chr2-710 79996836 79997071 141 - chr2:79996939-79996995 NA NA NA NA NA chr2-709 79356124 79356304 149 - chr2:79356159-79356275 NA NA NA NA NA chr2-708 79278397 79278586 142 - chr2:79278454-79278544 NA NA NA NA NA chr2-707 79048127 79048464 297 - chr2:79048216-79048433 NA NA NA NA NA chr2-706 78981089 78981337 167 - chr2:78981174-78981258 NA NA NA NA NA chr2-705 78953891 78954463 244 - chr2:78954361-78954419 NA NA NA NA NA chr2-704 78522684 78522876 160 - chr2:78522708-78522840 NA NA NA NA NA chr2-703 78499777 78500146 184 - chr2:78499850-78499905 NA NA NA NA NA chr2-702 78374715 78375048 194 - chr2:78374890-78374927 NA NA NA NA NA chr2-701 78312577 78312774 134 - chr2:78312649-78312729 NA NA NA NA NA chr2-700 78305076 78305555 342 - chr2:78305347-78305485 NA NA NA NA NA chr2-699 78282928 78283365 199 - chr2:78283215-78283225 NA NA NA NA NA chr2-698 78277086 78277396 167 - chr2:78277221-78277237 NA NA NA NA NA chr2-697 78228526 78228891 233 - chr2:78228578-78228745 NA NA NA NA NA chr2-696 78217021 78217217 164 - chr2:78217030-78217178 NA NA NA NA NA chr2-695 78075541 78075769 185 - chr2:78075570-78075698 NA NA NA NA NA chr2-694 78017759 78017930 147 - chr2:78017781-78017902 NA NA NA NA NA chr2-693 78003523 78003703 162 - chr2:78003533-78003686 NA NA NA NA NA chr2-692 77987055 77987339 221 - chr2:77987224-77987319 NA NA NA NA NA chr2-691 77895742 77896165 249 - chr2:77895827-77895942 NA NA NA NA NA chr2-21 7785820 7786098 172 - chr2:7785928-7785993 NA NA NA NA NA chr2-690 77653915 77654175 180 - chr2:77653930-77653965 NA NA NA NA NA chr2-689 77445672 77446019 205 - chr2:77445872-77445993 NA NA NA NA NA chr2-688 77326604 77326811 152 - chr2:77326701-77326777 NA NA NA NA NA chr2-687 77217472 77217836 214 - chr2:77217591-77217624 NA NA NA NA NA chr2-686 77189499 77189791 243 - chr2:77189642-77189787 NA NA NA NA NA chr2-685 77046867 77047164 178 - chr2:77047003-77047082 NA NA NA NA NA chr2-20 7680752 7680932 144 - chr2:7680804-7680876 NA NA NA NA NA chr2-684 76741506 76741796 155 - chr2:76741695-76741757 NA NA NA NA NA chr2-683 76717384 76717655 170 - chr2:76717473-76717530 NA NA NA NA NA chr2-682 76712145 76712455 170 - chr2:76712215-76712280 NA NA NA NA NA chr2-681 76589697 76589955 150 - chr2:76589808-76589853 NA NA NA NA NA chr2-680 76512064 76512262 133 - chr2:76512108-76512155 NA NA NA NA NA chr2-679 76435039 76435333 253 - chr2:76435143-76435314 NA NA NA NA NA chr2-678 76419695 76419958 151 - chr2:76419855-76419870 NA NA NA NA NA chr2-677 75870227 75870421 143 - chr2:75870275-75870351 NA NA NA NA NA chr2-676 75849410 75849763 172 - chr2:75849662-75849715 NA NA NA NA NA chr2-675 75823620 75824010 280 - chr2:75823669-75823778 NA NA NA NA NA chr2-674 75776508 75776692 180 - chr2:75776516-75776690 NA NA NA NA NA chr2-673 75776083 75776291 142 - chr2:75776117-75776161 NA NA NA NA NA chr2-672 75717446 75717623 163 - chr2:75717467-75717623 NA NA NA NA NA chr2-671 75620615 75620798 157 - chr2:75620642-75620747 NA NA NA NA NA chr2-670 75595537 75595938 173 - chr2:75595859-75595898 NA NA NA NA NA chr2-669 75574083 75574375 243 - chr2:75574215-75574360 NA NA NA NA NA chr2-668 75440832 75440996 158 - chr2:75440832-75440987 NA NA NA NA NA chr2-667 75418553 75418882 271 - chr2:75418589-75418744 NA NA NA NA NA chr2-666 75405152 75405369 147 - chr2:75405220-75405298 NA NA NA NA NA chr2-665 75314175 75314481 155 - chr2:75314282-75314308 NA NA NA NA NA chr2-664 75219932 75220185 137 - chr2:75220040-75220065 NA NA NA NA NA chr2-663 75174835 75175102 187 - chr2:75174878-75175025 NA NA NA NA NA chr2-662 75036018 75036511 259 - chr2:75036303-75036343 NA NA NA NA NA chr2-661 75024265 75024478 190 - chr2:75024326-75024474 NA NA NA NA NA chr2-660 74771547 74771902 253 - chr2:74771721-74771830 NA NA NA NA NA chr2-659 74680532 74680929 211 - chr2:74680765-74680837 NA NA NA NA NA chr2-658 74626977 74627155 132 - chr2:74627055-74627125 NA NA NA NA NA chr2-657 74468307 74468596 230 - chr2:74468436-74468572 NA NA NA NA NA chr2-656 74405352 74405740 185 - chr2:74405629-74405685 NA NA NA NA NA chr2-655 74174380 74174619 127 - chr2:74174502-74174527 NA NA NA NA NA chr2-654 74137266 74137541 150 - chr2:74137383-74137412 NA NA NA NA NA chr2-653 74058642 74059082 222 - chr2:74058858-74058971 NA NA NA NA NA chr2-652 74048619 74048829 163 - chr2:74048680-74048789 NA NA NA NA NA chr2-651 74027631 74027803 131 - chr2:74027676-74027770 NA NA NA NA NA chr2-650 73928545 73928836 177 - chr2:73928593-73928689 NA NA NA NA NA chr2-649 73588821 73589083 140 - chr2:73588953-73588966 NA NA NA NA NA chr2-648 73439161 73439387 114 - chr2:73439219-73439248 NA NA NA NA NA chr2-647 73332530 73332809 236 - chr2:73332575-73332725 NA NA NA NA NA chr2-646 73297738 73297965 151 - chr2:73297826-73297895 NA NA NA NA NA chr2-645 73184141 73184940 422 - chr2:73184456-73184883 NA NA NA NA NA chr2-644 72872475 72872729 178 - chr2:72872551-72872653 NA NA NA NA NA chr2-643 72820563 72820856 252 - chr2:72820597-72820767 NA NA NA NA NA chr2-642 72579794 72579965 163 - chr2:72579818-72579965 NA NA NA NA NA chr2-641 72567505 72567677 137 - chr2:72567529-72567620 NA NA NA NA NA chr2-640 72341486 72341654 131 - chr2:72341597-72341654 NA NA NA NA NA chr2-639 72304630 72305344 334 - chr2:72305070-72305084 NA NA NA NA NA chr2-638 72293560 72293778 155 - chr2:72293607-72293707 NA NA NA NA NA chr2-637 72130209 72130366 117 - chr2:72130240-72130337 NA NA NA NA NA chr2-636 72123577 72123776 171 - chr2:72123621-72123756 NA NA NA NA NA chr2-635 72045368 72045644 146 - chr2:72045497-72045512 NA NA NA NA NA chr2-634 71818838 71819183 276 - chr2:71818953-71819091 NA NA NA NA NA chr2-633 71762451 71762925 226 - chr2:71762774-71762805 NA NA NA NA NA chr2-632 71549519 71549672 136 - chr2:71549520-71549622 NA NA NA NA NA chr2-631 71375706 71375882 124 - chr2:71375740-71375794 NA NA NA NA NA chr2-630 71311710 71311930 168 - chr2:71311770-71311882 NA NA NA NA NA chr2-19 7125285 7125823 313 - chr2:7125425-7125553 NA NA NA NA NA chr2-629 70934305 70934482 123 - chr2:70934323-70934419 NA NA NA NA NA chr2-628 70698725 70699064 181 - chr2:70698835-70698882 NA NA NA NA NA chr2-627 70602533 70602693 156 - chr2:70602545-70602693 NA NA NA NA NA chr2-626 70576019 70576244 160 - chr2:70576084-70576179 NA NA NA NA NA chr2-625 70354555 70354854 158 - chr2:70354745-70354811 NA NA NA NA NA chr2-624 70313406 70313784 262 - chr2:70313486-70313690 NA NA NA NA NA chr2-623 70290574 70290820 183 - chr2:70290575-70290726 NA NA NA NA NA chr2-622 70198585 70198853 218 - chr2:70198636-70198796 NA NA NA NA NA chr2-621 70179154 70179406 203 - chr2:70179279-70179384 NA NA NA NA NA chr2-620 70075539 70075890 185 - chr2:70075737-70075740 NA NA NA NA NA chr2-619 69834044 69834228 171 - chr2:69834069-69834221 NA NA NA NA NA chr2-618 69758660 69759116 204 - chr2:69758964-69758968 NA NA NA NA NA chr2-617 69753574 69753840 167 - chr2:69753664-69753727 NA NA NA NA NA chr2-616 69734898 69735084 136 - chr2:69734920-69735020 NA NA NA NA NA chr2-615 69730509 69730821 206 - chr2:69730647-69730731 NA NA NA NA NA chr2-614 69532865 69533038 121 - chr2:69532887-69532971 NA NA NA NA NA chr2-18 6927886 6928132 143 - chr2:6927988-6928027 NA NA NA NA NA chr2-613 69256982 69257148 153 - chr2:69256994-69257133 NA NA NA NA NA chr2-612 69130658 69131051 229 - chr2:69130876-69130995 NA NA NA NA NA chr2-611 69110881 69111567 386 - chr2:69111111-69111271 NA NA NA NA NA chr2-610 69103606 69103937 282 - chr2:69103616-69103810 NA NA NA NA NA chr2-609 69031856 69032005 139 - chr2:69031881-69032000 NA NA NA NA NA chr2-608 69011078 69011420 195 - chr2:69011139-69011230 NA NA NA NA NA chr2-607 68959440 68959828 248 - chr2:68959664-68959730 NA NA NA NA NA chr2-606 68883614 68883829 181 - chr2:68883657-68883821 NA NA NA NA NA chr2-605 68837403 68838025 391 - chr2:68837403-68837561 NA NA NA NA NA chr2-604 68781573 68781779 130 - chr2:68781582-68781674 NA NA NA NA NA chr2-603 68761224 68761744 245 - chr2:68761291-68761349 NA NA NA NA NA chr2-602 68760069 68760223 150 - chr2:68760070-68760213 NA NA NA NA NA chr2-601 68693222 68693378 147 - chr2:68693225-68693357 NA NA NA NA NA chr2-600 68541433 68541769 291 - chr2:68541516-68541717 NA NA NA NA NA chr2-599 68485769 68486245 331 - chr2:68485901-68486202 NA NA NA NA NA chr2-598 68483403 68483624 147 - chr2:68483473-68483548 NA NA NA NA NA chr2-597 68473389 68473784 227 - chr2:68473506-68473649 NA NA NA NA NA chr2-596 68458099 68458401 205 - chr2:68458167-68458246 NA NA NA NA NA chr2-595 68444097 68444531 286 - chr2:68444385-68444453 NA NA NA NA NA chr2-594 68375998 68376151 118 - chr2:68376023-68376071 NA NA NA NA NA chr2-593 68288786 68289205 246 - chr2:68288906-68288926 NA NA NA NA NA chr2-592 68257469 68257740 200 - chr2:68257513-68257615 NA NA NA NA NA chr2-591 68218169 68218442 153 - chr2:68218290-68218324 NA NA NA NA NA chr2-590 68210561 68210756 127 - chr2:68210621-68210672 NA NA NA NA NA chr2-589 67964875 67965084 149 - chr2:67964945-67965029 NA NA NA NA NA chr2-588 67928348 67928499 124 - chr2:67928386-67928456 NA NA NA NA NA chr2-587 67690852 67691053 154 - chr2:67690900-67691008 NA NA NA NA NA chr2-586 67641229 67641473 119 - chr2:67641335-67641349 NA NA NA NA NA chr2-585 67553367 67553809 246 - chr2:67553425-67553573 NA NA NA NA NA chr2-584 67442678 67442867 145 - chr2:67442704-67442787 NA NA NA NA NA chr2-583 67299516 67299791 186 - chr2:67299543-67299671 NA NA NA NA NA chr2-582 67172738 67173048 154 - chr2:67172866-67172942 NA NA NA NA NA chr2-581 67066642 67066959 246 - chr2:67066686-67066790 NA NA NA NA NA chr2-580 66987183 66987391 118 - chr2:66987283-66987356 NA NA NA NA NA chr2-579 66908075 66908432 191 - chr2:66908157-66908217 NA NA NA NA NA chr2-578 66891893 66892123 160 - chr2:66891973-66892058 NA NA NA NA NA chr2-17 6686043 6686288 182 - chr2:6686052-6686198 NA NA NA NA NA chr2-577 66810246 66810474 169 - chr2:66810277-66810401 NA NA NA NA NA chr2-576 66800976 66801266 184 - chr2:66801070-66801136 NA NA NA NA NA chr2-575 66710281 66710635 183 - chr2:66710449-66710458 NA NA NA NA NA chr2-574 66268731 66269028 199 - chr2:66268835-66268985 NA NA NA NA NA chr2-573 66265234 66265502 185 - chr2:66265339-66265430 NA NA NA NA NA chr2-16 6622003 6622167 149 - chr2:6622022-6622154 NA NA NA NA NA chr2-572 66086622 66086824 158 - chr2:66086662-66086772 NA NA NA NA NA chr2-571 66010109 66010326 198 - chr2:66010137-66010297 NA NA NA NA NA chr2-570 65900559 65900838 193 - chr2:65900617-65900767 NA NA NA NA NA chr2-569 65856932 65857198 168 - chr2:65857028-65857099 NA NA NA NA NA chr2-568 65822727 65823026 205 - chr2:65822765-65822820 NA NA NA NA NA chr2-567 65806888 65807110 131 - chr2:65806951-65807005 NA NA NA NA NA chr2-566 65728590 65728759 160 - chr2:65728595-65728742 NA NA NA NA NA chr2-565 65708561 65708958 286 - chr2:65708643-65708789 NA NA NA NA NA chr2-564 65637264 65637419 114 - chr2:65637324-65637416 NA NA NA NA NA chr2-563 65187198 65187486 169 - chr2:65187311-65187355 NA NA NA NA NA chr2-562 65172276 65172457 167 - chr2:65172281-65172420 NA NA NA NA NA chr2-561 65105023 65105261 130 - chr2:65105109-65105142 NA NA NA NA NA chr2-560 65097542 65097778 199 - chr2:65097584-65097709 NA NA NA NA NA chr2-559 64756968 64757479 382 - chr2:64757123-64757363 NA NA NA NA NA chr2-15 6474596 6475129 323 - chr2:6474742-6474791 NA NA NA NA NA chr2-558 64684046 64684309 147 - chr2:64684153-64684175 NA NA NA NA NA chr2-557 64651892 64652177 204 - chr2:64651973-64652138 NA NA NA NA NA chr2-556 64591055 64591663 303 - chr2:64591240-64591385 NA NA NA NA NA chr2-555 64356612 64356868 240 - chr2:64356622-64356830 NA NA NA NA NA chr2-554 64340425 64340648 158 - chr2:64340488-64340579 NA NA NA NA NA chr2-553 64160560 64160919 169 - chr2:64160706-64160707 NA NA NA NA NA chr2-552 64151895 64152043 131 - chr2:64151905-64152002 NA NA NA NA NA chr2-551 64122923 64123106 115 - chr2:64122961-64122978 NA NA NA NA NA chr2-550 63999368 63999574 159 - chr2:63999395-63999517 NA NA NA NA NA chr2-549 63844077 63844520 236 - chr2:63844299-63844309 NA NA NA NA NA chr2-548 63835062 63835389 195 - chr2:63835080-63835200 NA NA NA NA NA chr2-547 63580660 63580807 137 - chr2:63580660-63580792 NA NA NA NA NA chr2-546 63575084 63575261 169 - chr2:63575104-63575259 NA NA NA NA NA chr2-545 63483771 63483995 155 - chr2:63483832-63483922 NA NA NA NA NA chr2-544 63404867 63405155 167 - chr2:63405026-63405053 NA NA NA NA NA chr2-543 63384884 63385149 153 - chr2:63384991-63385027 NA NA NA NA NA chr2-542 63249903 63250349 241 - chr2:63250042-63250058 NA NA NA NA NA chr2-541 63043387 63043658 148 - chr2:63043462-63043480 NA NA NA NA NA chr2-540 62893022 62893243 140 - chr2:62893100-62893188 NA NA NA NA NA chr2-539 62825666 62825860 146 - chr2:62825708-62825800 NA NA NA NA NA chr2-538 62778104 62778518 289 - chr2:62778295-62778494 NA NA NA NA NA chr2-537 62759377 62759560 169 - chr2:62759396-62759558 NA NA NA NA NA chr2-536 62705179 62705325 142 - chr2:62705191-62705325 NA NA NA NA NA chr2-535 62514207 62514516 165 - chr2:62514360-62514373 NA NA NA NA NA chr2-534 62482069 62482424 175 - chr2:62482252-62482337 NA NA NA NA NA chr2-533 62439457 62439880 239 - chr2:62439568-62439715 NA NA NA NA NA chr2-532 62346028 62346601 304 - chr2:62346065-62346213 NA NA NA NA NA chr2-531 62173716 62174022 195 - chr2:62173866-62174009 NA NA NA NA NA chr2-530 61817525 61817823 148 - chr2:61817655-61817663 NA NA NA NA NA chr2-529 61790345 61790562 151 - chr2:61790414-61790502 NA NA NA NA NA chr2-528 61710938 61711161 134 - chr2:61711025-61711071 NA NA NA NA NA chr2-527 61697938 61698130 160 - chr2:61697970-61698114 NA NA NA NA NA chr2-526 61602022 61602336 193 - chr2:61602148-61602205 NA NA NA NA NA chr2-525 61576261 61576458 144 - chr2:61576312-61576404 NA NA NA NA NA chr2-524 61343228 61343485 151 - chr2:61343330-61343377 NA NA NA NA NA chr2-523 61202180 61202357 151 - chr2:61202203-61202325 NA NA NA NA NA chr2-522 61175523 61175908 253 - chr2:61175661-61175848 NA NA NA NA NA chr2-521 61113584 61114097 290 - chr2:61113845-61113893 NA NA NA NA NA chr2-520 61099252 61099564 180 - chr2:61099307-61099421 NA NA NA NA NA chr2-519 61074525 61074829 186 - chr2:61074777-61074778 NA NA NA NA NA chr2-518 60983341 60983508 150 - chr2:60983359-60983493 NA NA NA NA NA chr2-517 60976021 60976445 172 - chr2:60976111-60976157 NA NA NA NA NA chr2-516 60963296 60963495 153 - chr2:60963346-60963451 NA NA NA NA NA chr2-515 60954463 60954719 149 - chr2:60954564-60954599 NA NA NA NA NA chr2-514 60948674 60948822 118 - chr2:60948750-60948808 NA NA NA NA NA chr2-513 60946185 60946523 153 - chr2:60946441-60946480 NA NA NA NA NA chr2-512 60773725 60773980 190 - chr2:60773811-60773957 NA NA NA NA NA chr2-511 60765776 60766042 112 - chr2:60765993-60766014 NA NA NA NA NA chr2-14 6061380 6061662 199 - chr2:6061499-6061651 NA NA NA NA NA chr2-13 6015401 6015565 143 - chr2:6015463-6015564 NA NA NA NA NA chr2-510 59914129 59914366 189 - chr2:59914129-59914294 NA NA NA NA NA chr2-12 5990829 5991005 151 - chr2:5990846-5990964 NA NA NA NA NA chr2-509 59878790 59878990 158 - chr2:59878823-59878930 NA NA NA NA NA chr2-508 59669629 59669898 160 - chr2:59669726-59669783 NA NA NA NA NA chr2-507 59533580 59533765 161 - chr2:59533613-59533752 NA NA NA NA NA chr2-506 59458905 59459274 297 - chr2:59458925-59459176 NA NA NA NA NA chr2-505 59397030 59397366 244 - chr2:59397048-59397246 NA NA NA NA NA chr2-504 59341980 59342202 190 - chr2:59342021-59342195 NA NA NA NA NA chr2-503 59304967 59305161 155 - chr2:59305030-59305134 NA NA NA NA NA chr2-502 59229172 59229342 148 - chr2:59229203-59229340 NA NA NA NA NA chr2-501 58984554 58985020 205 - chr2:58984701-58984702 NA NA NA NA NA chr2-500 58881164 58881896 351 - chr2:58881741-58881757 NA NA NA NA NA chr2-499 58549908 58550066 118 - chr2:58549955-58550053 NA NA NA NA NA chr2-498 58522462 58522754 156 - chr2:58522602-58522626 NA NA NA NA NA chr2-497 58519330 58519614 190 - chr2:58519471-58519614 NA NA NA NA NA chr2-496 58433573 58433930 256 - chr2:58433621-58433723 NA NA NA NA NA chr2-495 58412837 58413163 166 - chr2:58412855-58412932 NA NA NA NA NA chr2-494 58405296 58405622 156 - chr2:58405469-58405540 NA NA NA NA NA chr2-493 58239088 58239279 152 - chr2:58239126-58239238 NA NA NA NA NA chr2-492 58232814 58233181 188 - chr2:58232953-58233099 NA NA NA NA NA chr2-491 58002149 58002321 115 - chr2:58002230-58002312 NA NA NA NA NA chr2-490 57751238 57751496 183 - chr2:57751304-57751403 NA NA NA NA NA chr2-489 57737327 57737668 217 - chr2:57737463-57737618 NA NA NA NA NA chr2-488 57674154 57674449 155 - chr2:57674299-57674319 NA NA NA NA NA chr2-487 57666134 57666359 165 - chr2:57666190-57666291 NA NA NA NA NA chr2-486 57558483 57558663 154 - chr2:57558500-57558619 NA NA NA NA NA chr2-485 57540804 57540975 144 - chr2:57540809-57540904 NA NA NA NA NA chr2-484 57475505 57475730 205 - chr2:57475555-57475725 NA NA NA NA NA chr2-483 57414796 57414955 150 - chr2:57414804-57414944 NA NA NA NA NA chr2-482 57401990 57402229 203 - chr2:57402051-57402182 NA NA NA NA NA chr2-481 57330615 57330999 319 - chr2:57330677-57330928 NA NA NA NA NA chr2-480 57298122 57298343 163 - chr2:57298136-57298263 NA NA NA NA NA chr2-11 5729554 5729721 143 - chr2:5729584-5729715 NA NA NA NA NA chr2-479 57246422 57246662 154 - chr2:57246510-57246580 NA NA NA NA NA chr2-478 57207654 57207875 153 - chr2:57207685-57207733 NA NA NA NA NA chr2-477 57150122 57150389 209 - chr2:57150122-57150262 NA NA NA NA NA chr2-476 57059988 57060388 192 - chr2:57060089-57060246 NA NA NA NA NA chr2-475 57053926 57054378 248 - chr2:57054158-57054304 NA NA NA NA NA chr2-474 56925530 56925825 222 - chr2:56925693-56925797 NA NA NA NA NA chr2-473 56840747 56840979 151 - chr2:56840826-56840897 NA NA NA NA NA chr2-472 56666441 56666884 196 - chr2:56666674-56666697 NA NA NA NA NA chr2-471 56501693 56502203 267 - chr2:56501956-56502000 NA NA NA NA NA chr2-470 56346160 56346437 218 - chr2:56346217-56346377 NA NA NA NA NA chr2-469 56246897 56247319 374 - chr2:56246897-56247175 NA NA NA NA NA chr2-468 56224468 56225036 304 - chr2:56224849-56225014 NA NA NA NA NA chr2-467 56203614 56204235 367 - chr2:56203904-56203971 NA NA NA NA NA chr2-466 56037817 56038039 178 - chr2:56037830-56037986 NA NA NA NA NA chr2-465 55876654 55876913 115 - chr2:55876775-55876818 NA NA NA NA NA chr2-464 55785839 55786077 153 - chr2:55785943-55786030 NA NA NA NA NA chr2-463 55603915 55604698 389 - chr2:55604544-55604639 NA NA NA NA NA chr2-462 55589045 55589217 153 - chr2:55589076-55589204 NA NA NA NA NA chr2-461 55574154 55574426 192 - chr2:55574197-55574349 NA NA NA NA NA chr2-460 55540041 55540323 156 - chr2:55540145-55540184 NA NA NA NA NA chr2-459 55522219 55522387 156 - chr2:55522248-55522380 NA NA NA NA NA chr2-458 55492788 55493040 147 - chr2:55492897-55492937 NA NA NA NA NA chr2-457 55403361 55403858 337 - chr2:55403363-55403750 NA NA NA NA NA chr2-456 55297957 55298257 240 - chr2:55298112-55298257 NA NA NA NA NA chr2-455 55291503 55291696 182 - chr2:55291536-55291696 NA NA NA NA NA chr2-454 55166530 55166927 271 - chr2:55166597-55166683 NA NA NA NA NA chr2-453 55153661 55153969 215 - chr2:55153767-55153834 NA NA NA NA NA chr2-452 55095359 55095654 183 - chr2:55095493-55095553 NA NA NA NA NA chr2-451 55017892 55018084 147 - chr2:55017945-55018043 NA NA NA NA NA chr2-450 55004869 55005166 159 - chr2:55005016-55005046 NA NA NA NA NA chr2-449 54994312 54994538 129 - chr2:54994387-54994397 NA NA NA NA NA chr2-448 54935147 54935441 242 - chr2:54935200-54935338 NA NA NA NA NA chr2-447 54661004 54661239 151 - chr2:54661130-54661239 NA NA NA NA NA chr2-446 54583883 54584395 258 - chr2:54583921-54584033 NA NA NA NA NA chr2-445 54454146 54454453 175 - chr2:54454284-54454324 NA NA NA NA NA chr2-444 54426959 54427169 175 - chr2:54426964-54427119 NA NA NA NA NA chr2-443 54225782 54226187 236 - chr2:54225883-54225984 NA NA NA NA NA chr2-442 54171292 54171639 203 - chr2:54171443-54171509 NA NA NA NA NA chr2-441 54138391 54138598 124 - chr2:54138546-54138551 NA NA NA NA NA chr2-10 5386402 5386702 202 - chr2:5386535-5386674 NA NA NA NA NA chr2-440 53595803 53596302 357 - chr2:53595970-53596283 NA NA NA NA NA chr2-439 53452513 53452785 202 - chr2:53452540-53452707 NA NA NA NA NA chr2-438 53278238 53278520 148 - chr2:53278366-53278374 NA NA NA NA NA chr2-437 53252988 53253267 146 - chr2:53253123-53253138 NA NA NA NA NA chr2-436 52971624 52971782 153 - chr2:52971631-52971778 NA NA NA NA NA chr2-435 52904017 52904216 145 - chr2:52904072-52904164 NA NA NA NA NA chr2-434 52811204 52811348 139 - chr2:52811211-52811340 NA NA NA NA NA chr2-433 52724023 52724328 192 - chr2:52724119-52724181 NA NA NA NA NA chr2-432 52706526 52706754 143 - chr2:52706606-52706659 NA NA NA NA NA chr2-431 52639325 52639520 126 - chr2:52639394-52639451 NA NA NA NA NA chr2-430 52624370 52624772 186 - chr2:52624480-52624503 NA NA NA NA NA chr2-429 52612889 52613113 148 - chr2:52612965-52613037 NA NA NA NA NA chr2-428 52382738 52383019 178 - chr2:52382841-52382916 NA NA NA NA NA chr2-427 52361965 52362180 127 - chr2:52362053-52362092 NA NA NA NA NA chr2-426 52227092 52227855 362 - chr2:52227547-52227687 NA NA NA NA NA chr2-425 52202927 52203187 151 - chr2:52203036-52203078 NA NA NA NA NA chr2-424 52188655 52189127 279 - chr2:52188786-52188810 NA NA NA NA NA chr2-423 51831350 51831535 159 - chr2:51831363-51831509 NA NA NA NA NA chr2-422 51673589 51674188 286 - chr2:51673654-51673751 NA NA NA NA NA chr2-421 51507585 51507922 280 - chr2:51507629-51507839 NA NA NA NA NA chr2-420 51337336 51337560 210 - chr2:51337353-51337552 NA NA NA NA NA chr2-419 51258275 51258558 168 - chr2:51258410-51258453 NA NA NA NA NA chr2-418 51237038 51237310 143 - chr2:51237177-51237201 NA NA NA NA NA chr2-417 51105001 51105298 250 - chr2:51105058-51105256 NA NA NA NA NA chr2-416 51021517 51021760 185 - chr2:51021519-51021674 NA NA NA NA NA chr2-415 50814770 50815016 167 - chr2:50814834-50814933 NA NA NA NA NA chr2-414 50662415 50662800 241 - chr2:50662440-50662609 NA NA NA NA NA chr2-413 50607285 50607540 161 - chr2:50607375-50607438 NA NA NA NA NA chr2-412 50486584 50486879 154 - chr2:50486723-50486734 NA NA NA NA NA chr2-411 50441816 50442631 445 - chr2:50442308-50442610 NA NA NA NA NA chr2-410 50278889 50279084 132 - chr2:50278930-50278977 NA NA NA NA NA chr2-409 50110550 50110859 205 - chr2:50110691-50110829 NA NA NA NA NA chr2-408 49943685 49943941 220 - chr2:49943695-49943843 NA NA NA NA NA chr2-407 49903660 49903925 225 - chr2:49903681-49903826 NA NA NA NA NA chr2-406 49814297 49814446 148 - chr2:49814298-49814445 NA NA NA NA NA chr2-405 49792582 49792818 182 - chr2:49792662-49792777 NA NA NA NA NA chr2-404 49713268 49713640 176 - chr2:49713486-49713488 NA NA NA NA NA chr2-403 49626414 49626618 147 - chr2:49626497-49626574 NA NA NA NA NA chr2-402 49503839 49504102 158 - chr2:49503867-49503934 NA NA NA NA NA chr2-401 49499662 49499909 152 - chr2:49499777-49499824 NA NA NA NA NA chr2-400 49473880 49474109 168 - chr2:49473941-49474048 NA NA NA NA NA chr2-399 49201491 49201920 282 - chr2:49201521-49201683 NA NA NA NA NA chr2-398 49025488 49026058 351 - chr2:49025790-49025823 NA NA NA NA NA chr2-397 48820445 48820736 170 - chr2:48820582-48820647 NA NA NA NA NA chr2-396 48803563 48803887 204 - chr2:48803589-48803733 NA NA NA NA NA chr2-395 48633857 48634047 169 - chr2:48633884-48634011 NA NA NA NA NA chr2-394 48330856 48331059 138 - chr2:48330929-48331010 NA NA NA NA NA chr2-393 48324490 48324782 172 - chr2:48324628-48324698 NA NA NA NA NA chr2-392 48198965 48199414 235 - chr2:48199031-48199126 NA NA NA NA NA chr2-391 47894236 47894677 315 - chr2:47894509-47894572 NA NA NA NA NA chr2-390 47702330 47702580 155 - chr2:47702438-47702511 NA NA NA NA NA chr2-389 47638926 47639075 139 - chr2:47638941-47639075 NA NA NA NA NA chr2-388 47458286 47458489 129 - chr2:47458442-47458456 NA NA NA NA NA chr2-387 47404314 47404553 125 - chr2:47404444-47404471 NA NA NA NA NA chr2-386 47313136 47313336 149 - chr2:47313187-47313285 NA NA NA NA NA chr2-385 47172418 47172622 152 - chr2:47172496-47172583 NA NA NA NA NA chr2-384 47111845 47112077 148 - chr2:47111897-47111977 NA NA NA NA NA chr2-383 47038938 47039172 205 - chr2:47038980-47039169 NA NA NA NA NA chr2-382 46955162 46955393 207 - chr2:46955223-46955382 NA NA NA NA NA chr2-381 46907670 46907937 135 - chr2:46907780-46907794 NA NA NA NA NA chr2-380 46872651 46873121 214 - chr2:46872955-46872961 NA NA NA NA NA chr2-379 46800073 46800264 151 - chr2:46800114-46800226 NA NA NA NA NA chr2-378 46702748 46702946 159 - chr2:46702763-46702895 NA NA NA NA NA chr2-377 46538814 46539132 229 - chr2:46538870-46538977 NA NA NA NA NA chr2-376 46515994 46516300 183 - chr2:46516079-46516158 NA NA NA NA NA chr2-375 46365366 46365861 387 - chr2:46365467-46365696 NA NA NA NA NA chr2-374 46318351 46318840 325 - chr2:46318408-46318651 NA NA NA NA NA chr2-373 46140953 46141236 172 - chr2:46141068-46141127 NA NA NA NA NA chr2-372 46010608 46010861 159 - chr2:46010703-46010769 NA NA NA NA NA chr2-371 45955876 45956061 123 - chr2:45955964-45956056 NA NA NA NA NA chr2-370 45902221 45902447 151 - chr2:45902286-45902367 NA NA NA NA NA chr2-369 45824143 45824387 210 - chr2:45824197-45824339 NA NA NA NA NA chr2-9 4575857 4576280 233 - chr2:4576037-4576175 NA NA NA NA NA chr2-368 45759240 45759541 169 - chr2:45759369-45759420 NA NA NA NA NA chr2-367 45589469 45589715 192 - chr2:45589504-45589669 NA NA NA NA NA chr2-366 45252684 45252941 125 - chr2:45252788-45252795 NA NA NA NA NA chr2-365 45245121 45245268 140 - chr2:45245122-45245258 NA NA NA NA NA chr2-364 44711469 44711803 314 - chr2:44711474-44711778 NA NA NA NA NA chr2-363 44660440 44660720 144 - chr2:44660552-44660572 NA NA NA NA NA chr2-362 44569033 44569340 192 - chr2:44569104-44569248 NA NA NA NA NA chr2-361 44534646 44534919 181 - chr2:44534701-44534853 NA NA NA NA NA chr2-360 44519270 44519428 133 - chr2:44519325-44519418 NA NA NA NA NA chr2-359 44274492 44274882 210 - chr2:44274718-44274725 NA NA NA NA NA chr2-358 44248441 44248705 173 - chr2:44248554-44248658 NA NA NA NA NA chr2-357 44222513 44222707 146 - chr2:44222559-44222658 NA NA NA NA NA chr2-356 44219232 44219409 134 - chr2:44219245-44219293 NA NA NA NA NA chr2-355 44091833 44092083 152 - chr2:44091941-44091990 NA NA NA NA NA chr2-354 44064527 44064698 148 - chr2:44064550-44064675 NA NA NA NA NA chr2-353 44026415 44026639 131 - chr2:44026528-44026556 NA NA NA NA NA chr2-352 43990303 43990601 280 - chr2:43990315-43990559 NA NA NA NA NA chr2-351 43978662 43978962 202 - chr2:43978662-43978815 NA NA NA NA NA chr2-350 43941970 43942290 175 - chr2:43942067-43942121 NA NA NA NA NA chr2-349 43711007 43711316 183 - chr2:43711169-43711208 NA NA NA NA NA chr2-348 43569120 43569336 151 - chr2:43569177-43569267 NA NA NA NA NA chr2-347 43522105 43522366 152 - chr2:43522215-43522259 NA NA NA NA NA chr2-346 43451132 43451299 148 - chr2:43451151-43451280 NA NA NA NA NA chr2-345 43428016 43428421 235 - chr2:43428039-43428189 NA NA NA NA NA chr2-344 43354681 43354950 138 - chr2:43354763-43354850 NA NA NA NA NA chr2-8 4331128 4331402 208 - chr2:4331209-4331285 NA NA NA NA NA chr2-343 42725747 42726062 195 - chr2:42725777-42725897 NA NA NA NA NA chr2-342 42654469 42654671 129 - chr2:42654574-42654614 NA NA NA NA NA chr2-341 42632409 42632608 182 - chr2:42632409-42632557 NA NA NA NA NA chr2-340 42604363 42604621 184 - chr2:42604433-42604545 NA NA NA NA NA chr2-339 42157402 42157629 159 - chr2:42157473-42157567 NA NA NA NA NA chr2-338 41992404 41992738 274 - chr2:41992566-41992729 NA NA NA NA NA chr2-337 41950328 41950575 163 - chr2:41950410-41950490 NA NA NA NA NA chr2-336 41899568 41899761 166 - chr2:41899597-41899738 NA NA NA NA NA chr2-335 41838533 41838757 121 - chr2:41838596-41838634 NA NA NA NA NA chr2-334 41816986 41817153 161 - chr2:41816991-41817140 NA NA NA NA NA chr2-333 41785635 41785995 263 - chr2:41785743-41785920 NA NA NA NA NA chr2-332 41751439 41751613 155 - chr2:41751463-41751604 NA NA NA NA NA chr2-331 41733710 41733854 124 - chr2:41733736-41733850 NA NA NA NA NA chr2-330 41549184 41549482 158 - chr2:41549328-41549344 NA NA NA NA NA chr2-329 41530736 41530985 213 - chr2:41530779-41530920 NA NA NA NA NA chr2-328 41495098 41495411 256 - chr2:41495260-41495402 NA NA NA NA NA chr2-327 41479466 41479636 154 - chr2:41479472-41479615 NA NA NA NA NA chr2-326 41451886 41452145 177 - chr2:41451968-41452063 NA NA NA NA NA chr2-325 41445425 41445663 173 - chr2:41445480-41445593 NA NA NA NA NA chr2-324 41337335 41337640 193 - chr2:41337469-41337572 NA NA NA NA NA chr2-323 41287045 41287335 245 - chr2:41287171-41287326 NA NA NA NA NA chr2-322 41178151 41178445 157 - chr2:41178292-41178310 NA NA NA NA NA chr2-321 41159972 41160329 297 - chr2:41160030-41160265 NA NA NA NA NA chr2-320 40867321 40867620 181 - chr2:40867321-40867443 NA NA NA NA NA chr2-7 4064452 4064646 139 - chr2:4064510-4064597 NA NA NA NA NA chr2-319 40494965 40495534 318 - chr2:40495379-40495463 NA NA NA NA NA chr2-318 40473629 40473876 155 - chr2:40473716-40473774 NA NA NA NA NA chr2-317 40384148 40384315 121 - chr2:40384270-40384307 NA NA NA NA NA chr2-316 40332995 40333249 163 - chr2:40333083-40333152 NA NA NA NA NA chr2-315 40312909 40313423 288 - chr2:40313094-40313334 NA NA NA NA NA chr2-314 40292937 40293096 147 - chr2:40292959-40293082 NA NA NA NA NA chr2-313 40260010 40260248 147 - chr2:40260100-40260155 NA NA NA NA NA chr2-312 40230090 40230302 170 - chr2:40230126-40230248 NA NA NA NA NA chr2-311 40206134 40206294 149 - chr2:40206149-40206285 NA NA NA NA NA chr2-310 40018926 40019276 211 - chr2:40019049-40019210 NA NA NA NA NA chr2-309 39846593 39846791 187 - chr2:39846599-39846770 NA NA NA NA NA chr2-308 39740003 39740234 135 - chr2:39740081-39740102 NA NA NA NA NA chr2-307 39598611 39598906 191 - chr2:39598767-39598906 NA NA NA NA NA chr2-306 39460723 39460959 153 - chr2:39460806-39460876 NA NA NA NA NA chr2-305 39338484 39338684 181 - chr2:39338541-39338684 NA NA NA NA NA chr2-304 39319925 39320203 186 - chr2:39320047-39320126 NA NA NA NA NA chr2-303 39316954 39317239 160 - chr2:39317067-39317108 NA NA NA NA NA chr2-302 39293724 39293933 150 - chr2:39293783-39293874 NA NA NA NA NA chr2-301 39286701 39286897 140 - chr2:39286753-39286839 NA NA NA NA NA chr2-300 39281457 39281639 152 - chr2:39281481-39281597 NA NA NA NA NA chr2-299 39257354 39257587 152 - chr2:39257436-39257508 NA NA NA NA NA chr2-298 39142365 39142927 271 - chr2:39142793-39142871 NA NA NA NA NA chr2-297 39102761 39103401 311 - chr2:39103312-39103383 NA NA NA NA NA chr2-296 39035548 39035941 303 - chr2:39035646-39035867 NA NA NA NA NA chr2-295 39023036 39023257 144 - chr2:39023107-39023177 NA NA NA NA NA chr2-294 39021158 39021369 167 - chr2:39021202-39021347 NA NA NA NA NA chr2-293 39004942 39005111 149 - chr2:39004952-39005086 NA NA NA NA NA chr2-292 38746486 38746701 152 - chr2:38746548-38746636 NA NA NA NA NA chr2-291 38525383 38525740 264 - chr2:38525400-38525563 NA NA NA NA NA chr2-290 38327590 38327770 157 - chr2:38327614-38327749 NA NA NA NA NA chr2-289 38286463 38287017 342 - chr2:38286747-38286841 NA NA NA NA NA chr2-288 38285152 38285497 170 - chr2:38285297-38285307 NA NA NA NA NA chr2-287 38227089 38227229 136 - chr2:38227089-38227223 NA NA NA NA NA chr2-286 38184514 38184734 176 - chr2:38184524-38184678 NA NA NA NA NA chr2-285 38180152 38180442 156 - chr2:38180284-38180307 NA NA NA NA NA chr2-284 38101556 38101893 226 - chr2:38101695-38101838 NA NA NA NA NA chr2-283 38010917 38011191 157 - chr2:38011038-38011076 NA NA NA NA NA chr2-282 37786489 37786680 158 - chr2:37786536-37786654 NA NA NA NA NA chr2-281 37675224 37675464 140 - chr2:37675278-37675341 NA NA NA NA NA chr2-280 37548830 37549038 181 - chr2:37548899-37549032 NA NA NA NA NA chr2-279 37379266 37379541 171 - chr2:37379400-37379497 NA NA NA NA NA chr2-278 37348999 37349291 150 - chr2:37349139-37349145 NA NA NA NA NA chr2-277 37316574 37316887 206 - chr2:37316622-37316724 NA NA NA NA NA chr2-276 37056220 37056629 241 - chr2:37056424-37056581 NA NA NA NA NA chr2-275 37045723 37046097 222 - chr2:37045916-37046062 NA NA NA NA NA chr2-274 36916703 36916889 148 - chr2:36916742-36916853 NA NA NA NA NA chr2-273 36912564 36912994 241 - chr2:36912833-36912853 NA NA NA NA NA chr2-272 36863459 36863631 156 - chr2:36863480-36863604 NA NA NA NA NA chr2-271 36863028 36863359 185 - chr2:36863157-36863228 NA NA NA NA NA chr2-270 36517801 36518207 359 - chr2:36517833-36518130 NA NA NA NA NA chr2-269 36508441 36508732 175 - chr2:36508569-36508622 NA NA NA NA NA chr2-268 36492954 36493236 152 - chr2:36493078-36493103 NA NA NA NA NA chr2-267 36421372 36421764 298 - chr2:36421618-36421746 NA NA NA NA NA chr2-266 36027932 36028285 185 - chr2:36028048-36028091 NA NA NA NA NA chr2-265 35907446 35907737 224 - chr2:35907646-35907736 NA NA NA NA NA chr2-264 35712505 35712758 153 - chr2:35712562-35712572 NA NA NA NA NA chr2-263 35679169 35679447 158 - chr2:35679299-35679347 NA NA NA NA NA chr2-262 35668038 35668220 159 - chr2:35668048-35668171 NA NA NA NA NA chr2-261 35654071 35654247 136 - chr2:35654107-35654205 NA NA NA NA NA chr2-260 35555339 35555878 450 - chr2:35555401-35555777 NA NA NA NA NA chr2-259 35515310 35515478 155 - chr2:35515339-35515473 NA NA NA NA NA chr2-258 35411911 35412138 163 - chr2:35411985-35412079 NA NA NA NA NA chr2-257 35374757 35375055 212 - chr2:35374815-35374913 NA NA NA NA NA chr2-256 35298831 35299066 155 - chr2:35298909-35298985 NA NA NA NA NA chr2-255 35065471 35065849 314 - chr2:35065483-35065759 NA NA NA NA NA chr2-254 34962201 34962427 115 - chr2:34962338-34962368 NA NA NA NA NA chr2-253 34888440 34888701 185 - chr2:34888489-34888636 NA NA NA NA NA chr2-252 34744369 34744552 141 - chr2:34744389-34744499 NA NA NA NA NA chr2-251 34733869 34734110 149 - chr2:34733993-34734034 NA NA NA NA NA chr2-250 34609631 34610199 304 - chr2:34609921-34609948 NA NA NA NA NA chr2-249 34403333 34403485 120 - chr2:34403426-34403482 NA NA NA NA NA chr2-248 34374011 34374617 278 - chr2:34374157-34374198 NA NA NA NA NA chr2-247 34360024 34360360 199 - chr2:34360139-34360179 NA NA NA NA NA chr2-246 34090242 34090496 157 - chr2:34090333-34090396 NA NA NA NA NA chr2-245 34054072 34054417 276 - chr2:34054184-34054322 NA NA NA NA NA chr2-244 33934507 33934939 249 - chr2:33934781-33934898 NA NA NA NA NA chr2-243 33934262 33934461 160 - chr2:33934302-33934424 NA NA NA NA NA chr2-242 33678086 33678274 145 - chr2:33678139-33678236 NA NA NA NA NA chr2-241 33544536 33544823 150 - chr2:33544675-33544690 NA NA NA NA NA chr2-240 33436442 33436730 216 - chr2:33436499-33436628 NA NA NA NA NA chr2-239 33094947 33095135 152 - chr2:33094986-33095105 NA NA NA NA NA chr2-238 33079608 33079896 199 - chr2:33079642-33079754 NA NA NA NA NA chr2-237 33051076 33051249 141 - chr2:33051086-33051173 NA NA NA NA NA chr2-236 32851709 32852086 194 - chr2:32851925-32851969 NA NA NA NA NA chr2-235 32782111 32782788 408 - chr2:32782321-32782584 NA NA NA NA NA chr2-234 32683815 32684105 157 - chr2:32683950-32683973 NA NA NA NA NA chr2-233 32667039 32667240 167 - chr2:32667061-32667182 NA NA NA NA NA chr2-232 32635960 32636189 155 - chr2:32636032-32636114 NA NA NA NA NA chr2-231 32481037 32481220 136 - chr2:32481075-32481140 NA NA NA NA NA chr2-230 32379862 32380060 116 - chr2:32379965-32380020 NA NA NA NA NA chr2-229 32329068 32329357 192 - chr2:32329151-32329239 NA NA NA NA NA chr2-228 32196748 32197075 170 - chr2:32196912-32196932 NA NA NA NA NA chr2-227 32123603 32123784 172 - chr2:32123606-32123760 NA NA NA NA NA chr2-226 32060481 32060809 204 - chr2:32060647-32060706 NA NA NA NA NA chr2-225 32003401 32003651 184 - chr2:32003462-32003575 NA NA NA NA NA chr2-224 31920973 31921437 311 - chr2:31921032-31921096 NA NA NA NA NA chr2-223 31917912 31918070 149 - chr2:31917921-31918061 NA NA NA NA NA chr2-222 31759130 31759300 145 - chr2:31759158-31759253 NA NA NA NA NA chr2-221 31703248 31703524 202 - chr2:31703296-31703398 NA NA NA NA NA chr2-220 31658791 31659077 195 - chr2:31658796-31658943 NA NA NA NA NA chr2-219 31229420 31229604 160 - chr2:31229420-31229568 NA NA NA NA NA chr2-6 3121348 3121745 195 - chr2:3121453-3121469 NA NA NA NA NA chr2-218 31207524 31207766 147 - chr2:31207623-31207679 NA NA NA NA NA chr2-217 30982924 30983087 151 - chr2:30982930-30983072 NA NA NA NA NA chr2-216 30674253 30674665 220 - chr2:30674512-30674607 NA NA NA NA NA chr2-215 30655553 30655776 185 - chr2:30655583-30655722 NA NA NA NA NA chr2-214 30598523 30598731 149 - chr2:30598581-30598670 NA NA NA NA NA chr2-2 305478 305704 145 - chr2:305549-305618 NA NA NA NA NA chr2-213 30463167 30463688 325 - chr2:30463347-30463484 NA NA NA NA NA chr2-212 30365832 30366041 152 - chr2:30365947-30366013 NA NA NA NA NA chr2-211 30303380 30303766 308 - chr2:30303516-30303668 NA NA NA NA NA chr2-210 30231463 30232046 317 - chr2:30231585-30231757 NA NA NA NA NA chr2-209 30160247 30160448 128 - chr2:30160324-30160383 NA NA NA NA NA chr2-208 29715807 29716071 184 - chr2:29715850-29715994 NA NA NA NA NA chr2-5 2969296 2969477 160 - chr2:2969311-2969444 NA NA NA NA NA chr2-207 29549311 29549507 176 - chr2:29549355-29549491 NA NA NA NA NA chr2-206 29380694 29380918 146 - chr2:29380790-29380849 NA NA NA NA NA chr2-205 29368357 29368768 243 - chr2:29368367-29368521 NA NA NA NA NA chr2-204 29160344 29160589 167 - chr2:29160436-29160518 NA NA NA NA NA chr2-203 29066289 29066526 178 - chr2:29066292-29066439 NA NA NA NA NA chr2-202 28936321 28936669 178 - chr2:28936473-28936490 NA NA NA NA NA chr2-201 28920280 28920720 288 - chr2:28920478-28920650 NA NA NA NA NA chr2-200 28788451 28788735 168 - chr2:28788528-28788638 NA NA NA NA NA chr2-199 28769487 28769820 221 - chr2:28769678-28769783 NA NA NA NA NA chr2-198 28657929 28658322 278 - chr2:28658084-28658287 NA NA NA NA NA chr2-197 28521696 28521924 172 - chr2:28521748-28521860 NA NA NA NA NA chr2-196 28518128 28518364 139 - chr2:28518293-28518301 NA NA NA NA NA chr2-4 2835451 2835627 159 - chr2:2835458-2835590 NA NA NA NA NA chr2-195 28317144 28317466 200 - chr2:28317285-28317291 NA NA NA NA NA chr2-194 28312003 28312509 252 - chr2:28312210-28312316 NA NA NA NA NA chr2-193 28275510 28275882 206 - chr2:28275659-28275682 NA NA NA NA NA chr2-192 28141196 28141529 171 - chr2:28141381-28141413 NA NA NA NA NA chr2-191 28114860 28115089 153 - chr2:28114942-28115025 NA NA NA NA NA chr2-190 28091387 28091819 316 - chr2:28091548-28091772 NA NA NA NA NA chr2-189 27981108 27981416 226 - chr2:27981228-27981290 NA NA NA NA NA chr2-188 27913604 27913797 148 - chr2:27913633-27913720 NA NA NA NA NA chr2-187 27899178 27899332 149 - chr2:27899178-27899317 NA NA NA NA NA chr2-186 27876121 27876288 138 - chr2:27876123-27876203 NA NA NA NA NA chr2-185 27721970 27722167 158 - chr2:27722020-27722150 NA NA NA NA NA chr2-184 27651509 27651763 154 - chr2:27651604-27651654 NA NA NA NA NA chr2-183 27640719 27641107 266 - chr2:27640963-27641046 NA NA NA NA NA chr2-182 27616862 27617049 180 - chr2:27616870-27617044 NA NA NA NA NA chr2-181 27529971 27530241 190 - chr2:27530008-27530158 NA NA NA NA NA chr2-180 27382269 27382539 151 - chr2:27382379-27382402 NA NA NA NA NA chr2-179 27337585 27337986 216 - chr2:27337758-27337795 NA NA NA NA NA chr2-178 27252985 27253176 162 - chr2:27253022-27253151 NA NA NA NA NA chr2-177 26887425 26887670 157 - chr2:26887525-26887588 NA NA NA NA NA chr2-176 26514560 26515178 334 - chr2:26514850-26514897 NA NA NA NA NA chr2-175 26416062 26416364 206 - chr2:26416082-26416230 NA NA NA NA NA chr2-174 26414104 26414380 167 - chr2:26414209-26414263 NA NA NA NA NA chr2-173 26381261 26381704 235 - chr2:26381325-26381463 NA NA NA NA NA chr2-172 26375191 26375620 219 - chr2:26375247-26375333 NA NA NA NA NA chr2-171 26292004 26292272 157 - chr2:26292111-26292159 NA NA NA NA NA chr2-170 26114715 26115112 192 - chr2:26114951-26114969 NA NA NA NA NA chr2-169 26079688 26079894 172 - chr2:26079732-26079887 NA NA NA NA NA chr2-168 26074134 26074371 155 - chr2:26074211-26074279 NA NA NA NA NA chr2-167 25984193 25984436 161 - chr2:25984291-25984362 NA NA NA NA NA chr2-166 25897672 25897997 217 - chr2:25897725-25897888 NA NA NA NA NA chr2-165 25735753 25735897 112 - chr2:25735824-25735872 NA NA NA NA NA chr2-164 25615204 25615489 150 - chr2:25615340-25615356 NA NA NA NA NA chr2-163 25548453 25548645 141 - chr2:25548480-25548582 NA NA NA NA NA chr2-162 25439834 25439980 142 - chr2:25439834-25439974 NA NA NA NA NA chr2-161 25437508 25437698 157 - chr2:25437537-25437657 NA NA NA NA NA chr2-160 25386974 25387489 331 - chr2:25387262-25387357 NA NA NA NA NA chr2-159 25075161 25075331 148 - chr2:25075197-25075316 NA NA NA NA NA chr2-158 24916777 24917043 172 - chr2:24916860-24916927 NA NA NA NA NA chr2-157 24759544 24759861 243 - chr2:24759564-24759659 NA NA NA NA NA chr2-156 24479054 24479340 167 - chr2:24479180-24479235 NA NA NA NA NA chr2-155 24467043 24467236 147 - chr2:24467077-24467184 NA NA NA NA NA chr2-154 24389808 24390141 180 - chr2:24390036-24390106 NA NA NA NA NA chr2-153 24368856 24369272 246 - chr2:24368893-24369066 NA NA NA NA NA chr2-152 24201928 24202122 167 - chr2:24201957-24202091 NA NA NA NA NA chr2-151 24178841 24179043 171 - chr2:24178874-24179013 NA NA NA NA NA chr2-1729 241673782 241674023 160 - chr2:241673859-241673934 NA NA NA NA NA chr2-1728 241303723 241303974 147 - chr2:241303829-241303871 NA NA NA NA NA chr2-1727 241291856 241292072 153 - chr2:241291911-241292005 NA NA NA NA NA chr2-1726 241158719 241158997 206 - chr2:241158906-241158968 NA NA NA NA NA chr2-150 24094479 24094729 161 - chr2:24094553-24094610 NA NA NA NA NA chr2-1725 240267819 240268010 149 - chr2:240267861-240267968 NA NA NA NA NA chr2-1724 240163612 240163769 127 - chr2:240163627-240163694 NA NA NA NA NA chr2-1723 240055591 240055770 159 - chr2:240055615-240055752 NA NA NA NA NA chr2-1722 240031937 240032108 164 - chr2:240031939-240032089 NA NA NA NA NA chr2-1721 240024099 240024295 143 - chr2:240024150-240024241 NA NA NA NA NA chr2-1720 240014836 240014989 147 - chr2:240014845-240014989 NA NA NA NA NA chr2-1719 239849358 239849633 255 - chr2:239849414-239849629 NA NA NA NA NA chr2-149 23951122 23951418 222 - chr2:23951256-23951374 NA NA NA NA NA chr2-148 23916670 23916892 158 - chr2:23916732-23916827 NA NA NA NA NA chr2-1718 239109664 239110059 236 - chr2:239109677-239109827 NA NA NA NA NA chr2-1717 238377941 238378223 154 - chr2:238378066-238378089 NA NA NA NA NA chr2-147 23827472 23828012 258 - chr2:23827682-23827694 NA NA NA NA NA chr2-1716 238260416 238260617 143 - chr2:238260483-238260577 NA NA NA NA NA chr2-1715 238195325 238195479 139 - chr2:238195326-238195457 NA NA NA NA NA chr2-1714 238090673 238090848 148 - chr2:238090699-238090819 NA NA NA NA NA chr2-1713 238032172 238032749 384 - chr2:238032262-238032350 NA NA NA NA NA chr2-1712 237949039 237949200 130 - chr2:237949050-237949159 NA NA NA NA NA chr2-1711 237634894 237635065 156 - chr2:237634913-237635058 NA NA NA NA NA chr2-146 23725773 23725992 152 - chr2:23725836-23725925 NA NA NA NA NA chr2-1710 237173860 237174179 196 - chr2:237173967-237174024 NA NA NA NA NA chr2-1709 237061212 237061552 201 - chr2:237061261-237061368 NA NA NA NA NA chr2-1708 236493441 236493783 323 - chr2:236493466-236493751 NA NA NA NA NA chr2-1707 236347827 236348078 171 - chr2:236347911-236348000 NA NA NA NA NA chr2-1706 235860333 235860624 161 - chr2:235860452-235860495 NA NA NA NA NA chr2-1705 235808814 235808981 157 - chr2:235808820-235808963 NA NA NA NA NA chr2-1704 235787200 235787556 227 - chr2:235787339-235787447 NA NA NA NA NA chr2-1703 235530028 235530277 190 - chr2:235530059-235530162 NA NA NA NA NA chr2-1702 235055102 235055264 129 - chr2:235055199-235055262 NA NA NA NA NA chr2-1701 234796590 234796750 135 - chr2:234796622-234796707 NA NA NA NA NA chr2-1700 233301494 233301686 156 - chr2:233301536-233301653 NA NA NA NA NA chr2-1699 232975238 232975573 247 - chr2:232975291-232975400 NA NA NA NA NA chr2-1698 232915032 232915189 112 - chr2:232915095-232915180 NA NA NA NA NA chr2-145 23288225 23288559 192 - chr2:23288419-23288521 NA NA NA NA NA chr2-1697 232780650 232780906 178 - chr2:232780712-232780796 NA NA NA NA NA chr2-1696 232623991 232624170 152 - chr2:232624010-232624139 NA NA NA NA NA chr2-1695 232604669 232604967 278 - chr2:232604670-232604938 NA NA NA NA NA chr2-1694 232176403 232176562 132 - chr2:232176484-232176562 NA NA NA NA NA chr2-1693 232004449 232004618 121 - chr2:232004483-232004580 NA NA NA NA NA chr2-1692 231865347 231865804 221 - chr2:231865473-231865513 NA NA NA NA NA chr2-1691 231863551 231863735 154 - chr2:231863586-231863715 NA NA NA NA NA chr2-1690 231728716 231729445 349 - chr2:231729280-231729325 NA NA NA NA NA chr2-1689 231553370 231553614 134 - chr2:231553474-231553501 NA NA NA NA NA chr2-1688 231410899 231411104 151 - chr2:231410953-231411050 NA NA NA NA NA chr2-1687 231009946 231010253 159 - chr2:231010112-231010197 NA NA NA NA NA chr2-1686 230533268 230533657 229 - chr2:230533432-230533581 NA NA NA NA NA chr2-1685 230458153 230458321 147 - chr2:230458174-230458300 NA NA NA NA NA chr2-1684 230380850 230381140 224 - chr2:230380914-230381006 NA NA NA NA NA chr2-1683 230366001 230366151 118 - chr2:230366037-230366139 NA NA NA NA NA chr2-144 23033458 23033829 297 - chr2:23033504-23033653 NA NA NA NA NA chr2-1682 230095639 230095840 138 - chr2:230095732-230095792 NA NA NA NA NA chr2-1681 229302601 229302899 194 - chr2:229302629-229302771 NA NA NA NA NA chr2-1680 228998621 228998771 115 - chr2:228998670-228998715 NA NA NA NA NA chr2-1679 228950459 228950884 238 - chr2:228950466-228950607 NA NA NA NA NA chr2-1678 228803333 228803813 369 - chr2:228803476-228803623 NA NA NA NA NA chr2-1677 228555149 228555304 151 - chr2:228555150-228555294 NA NA NA NA NA chr2-1676 228525105 228525545 194 - chr2:228525183-228525215 NA NA NA NA NA chr2-1675 228381364 228381520 144 - chr2:228381376-228381514 NA NA NA NA NA chr2-1674 228329522 228329819 175 - chr2:228329621-228329735 NA NA NA NA NA chr2-1673 228285275 228285448 152 - chr2:228285292-228285402 NA NA NA NA NA chr2-1672 228222863 228223078 161 - chr2:228222914-228223018 NA NA NA NA NA chr2-1671 228128591 228128768 120 - chr2:228128612-228128693 NA NA NA NA NA chr2-143 22812033 22812189 120 - chr2:22812089-22812163 NA NA NA NA NA chr2-1670 227818398 227818601 123 - chr2:227818481-227818527 NA NA NA NA NA chr2-142 22762588 22762950 190 - chr2:22762714-22762755 NA NA NA NA NA chr2-1669 227354791 227354995 151 - chr2:227354847-227354948 NA NA NA NA NA chr2-1668 227158104 227158341 170 - chr2:227158169-227158273 NA NA NA NA NA chr2-1667 226837055 226837253 113 - chr2:226837149-226837186 NA NA NA NA NA chr2-1666 226725681 226725930 175 - chr2:226725773-226725865 NA NA NA NA NA chr2-1665 226705198 226705478 233 - chr2:226705266-226705405 NA NA NA NA NA chr2-141 22660121 22660341 153 - chr2:22660193-22660284 NA NA NA NA NA chr2-1664 226557857 226558045 142 - chr2:226557903-226557999 NA NA NA NA NA chr2-1663 226485692 226485868 142 - chr2:226485710-226485826 NA NA NA NA NA chr2-1662 226423073 226423373 154 - chr2:226423220-226423229 NA NA NA NA NA chr2-1661 226412573 226412763 150 - chr2:226412608-226412713 NA NA NA NA NA chr2-140 22627630 22628179 247 - chr2:22628027-22628067 NA NA NA NA NA chr2-1660 225970490 225970767 150 - chr2:225970611-225970637 NA NA NA NA NA chr2-1659 225784994 225785213 212 - chr2:225784999-225785197 NA NA NA NA NA chr2-1658 225584769 225585190 204 - chr2:225584796-225584878 NA NA NA NA NA chr2-1657 225226179 225226391 149 - chr2:225226244-225226332 NA NA NA NA NA chr2-139 22499183 22499386 152 - chr2:22499236-22499339 NA NA NA NA NA chr2-1656 224982855 224983039 158 - chr2:224982879-224983012 NA NA NA NA NA chr2-1655 224913289 224913680 236 - chr2:224913604-224913605 NA NA NA NA NA chr2-1654 224576240 224576523 181 - chr2:224576266-224576396 NA NA NA NA NA chr2-1653 224548561 224548836 147 - chr2:224548689-224548708 NA NA NA NA NA chr2-1652 224496957 224497173 123 - chr2:224497066-224497112 NA NA NA NA NA chr2-1651 224167095 224167272 129 - chr2:224167114-224167166 NA NA NA NA NA chr2-1650 223993181 223993385 177 - chr2:223993220-223993364 NA NA NA NA NA chr2-1649 223602662 223602931 207 - chr2:223602722-223602865 NA NA NA NA NA chr2-1648 223576625 223576793 128 - chr2:223576654-223576731 NA NA NA NA NA chr2-1647 223541848 223542317 263 - chr2:223542154-223542311 NA NA NA NA NA chr2-1646 223525824 223526302 237 - chr2:223526145-223526221 NA NA NA NA NA chr2-1645 223478212 223478594 236 - chr2:223478423-223478586 NA NA NA NA NA chr2-1644 222875314 222875588 158 - chr2:222875448-222875481 NA NA NA NA NA chr2-1643 222453776 222454067 157 - chr2:222453915-222453943 NA NA NA NA NA chr2-1642 222410296 222410453 123 - chr2:222410336-222410442 NA NA NA NA NA chr2-1641 222409560 222409872 206 - chr2:222409709-222409862 NA NA NA NA NA chr2-1640 222394740 222395003 139 - chr2:222394832-222394863 NA NA NA NA NA chr2-1639 222337609 222337974 214 - chr2:222337728-222337807 NA NA NA NA NA chr2-138 22209679 22210052 200 - chr2:22209756-22209831 NA NA NA NA NA chr2-1638 222073525 222073816 177 - chr2:222073688-222073800 NA NA NA NA NA chr2-1637 222022120 222022293 116 - chr2:222022197-222022276 NA NA NA NA NA chr2-1636 221965364 221965602 146 - chr2:221965447-221965492 NA NA NA NA NA chr2-1635 221462331 221462592 170 - chr2:221462382-221462481 NA NA NA NA NA chr2-1634 221328010 221328203 143 - chr2:221328066-221328165 NA NA NA NA NA chr2-1633 221195143 221195375 174 - chr2:221195183-221195281 NA NA NA NA NA chr2-1632 220835056 220835328 156 - chr2:220835178-220835224 NA NA NA NA NA chr2-1631 220455600 220455950 218 - chr2:220455888-220455896 NA NA NA NA NA chr2-1630 220420548 220420741 158 - chr2:220420565-220420697 NA NA NA NA NA chr2-1629 220242335 220242499 152 - chr2:220242369-220242498 NA NA NA NA NA chr2-137 22024055 22024370 181 - chr2:22024093-22024183 NA NA NA NA NA chr2-1628 220065755 220066064 235 - chr2:220065921-220066036 NA NA NA NA NA chr2-1627 220026581 220026896 179 - chr2:220026748-220026822 NA NA NA NA NA chr2-1626 219952209 219952457 164 - chr2:219952303-219952378 NA NA NA NA NA chr2-1625 219476167 219476325 154 - chr2:219476172-219476324 NA NA NA NA NA chr2-1624 219211110 219211260 140 - chr2:219211110-219211245 NA NA NA NA NA chr2-1623 218914964 218915206 139 - chr2:218915070-218915109 NA NA NA NA NA chr2-1622 218899084 218899475 321 - chr2:218899138-218899373 NA NA NA NA NA chr2-1621 218810859 218811188 254 - chr2:218811039-218811143 NA NA NA NA NA chr2-1620 218776446 218776701 159 - chr2:218776552-218776610 NA NA NA NA NA chr2-1619 218442741 218442887 143 - chr2:218442741-218442878 NA NA NA NA NA chr2-1618 218433481 218433648 163 - chr2:218433487-218433648 NA NA NA NA NA chr2-1617 218221160 218221422 158 - chr2:218221161-218221267 NA NA NA NA NA chr2-136 21814611 21815056 197 - chr2:21814906-21814917 NA NA NA NA NA chr2-1616 217726909 217727069 148 - chr2:217726909-217727033 NA NA NA NA NA chr2-1615 217696925 217697223 203 - chr2:217697128-217697182 NA NA NA NA NA chr2-1614 217308285 217308783 238 - chr2:217308586-217308605 NA NA NA NA NA chr2-1613 217285111 217285336 179 - chr2:217285139-217285295 NA NA NA NA NA chr2-1612 217146029 217146521 231 - chr2:217146373-217146405 NA NA NA NA NA chr2-1611 217061305 217061474 165 - chr2:217061305-217061462 NA NA NA NA NA chr2-1610 217058086 217058342 164 - chr2:217058160-217058241 NA NA NA NA NA chr2-1609 217024465 217024779 278 - chr2:217024490-217024750 NA NA NA NA NA chr2-1608 216984351 216984522 120 - chr2:216984375-216984417 NA NA NA NA NA chr2-1607 216960624 216960887 183 - chr2:216960716-216960813 NA NA NA NA NA chr2-1606 216609014 216609430 232 - chr2:216609094-216609194 NA NA NA NA NA chr2-1605 216522239 216522546 258 - chr2:216522240-216522401 NA NA NA NA NA chr2-1604 216428158 216428455 203 - chr2:216428301-216428451 NA NA NA NA NA chr2-1603 216403741 216403978 166 - chr2:216403810-216403932 NA NA NA NA NA chr2-135 21634285 21634504 177 - chr2:21634327-21634483 NA NA NA NA NA chr2-134 21633625 21633846 156 - chr2:21633696-21633784 NA NA NA NA NA chr2-133 21615051 21615295 177 - chr2:21615126-21615244 NA NA NA NA NA chr2-1602 215887899 215888383 274 - chr2:215888046-215888160 NA NA NA NA NA chr2-1601 215884234 215884385 150 - chr2:215884235-215884383 NA NA NA NA NA chr2-1600 215435078 215435283 155 - chr2:215435129-215435235 NA NA NA NA NA chr2-1599 215335877 215336257 219 - chr2:215335979-215336159 NA NA NA NA NA chr2-1598 215153303 215153580 159 - chr2:215153409-215153456 NA NA NA NA NA chr2-1597 215078242 215078648 236 - chr2:215078376-215078527 NA NA NA NA NA chr2-1596 214643930 214644138 154 - chr2:214643988-214644086 NA NA NA NA NA chr2-1595 214488583 214489020 241 - chr2:214488783-214488963 NA NA NA NA NA chr2-1594 214451469 214451622 138 - chr2:214451512-214451621 NA NA NA NA NA chr2-1593 214243128 214243408 161 - chr2:214243251-214243291 NA NA NA NA NA chr2-1592 214042330 214042551 156 - chr2:214042391-214042478 NA NA NA NA NA chr2-1591 213882794 213883308 262 - chr2:213883106-213883176 NA NA NA NA NA chr2-1590 213737992 213738194 160 - chr2:213738020-213738124 NA NA NA NA NA chr2-1589 213261181 213261392 146 - chr2:213261249-213261333 NA NA NA NA NA chr2-1588 212971283 212971654 241 - chr2:212971501-212971568 NA NA NA NA NA chr2-1587 212739654 212739943 255 - chr2:212739708-212739895 NA NA NA NA NA chr2-1586 212631750 212632110 206 - chr2:212631948-212632044 NA NA NA NA NA chr2-1585 212503833 212504159 171 - chr2:212504092-212504097 NA NA NA NA NA chr2-1584 212462533 212462753 176 - chr2:212462613-212462727 NA NA NA NA NA chr2-1583 212434584 212434847 182 - chr2:212434597-212434732 NA NA NA NA NA chr2-132 21237491 21237716 161 - chr2:21237567-21237658 NA NA NA NA NA chr2-1582 212038829 212039078 144 - chr2:212038922-212038949 NA NA NA NA NA chr2-1581 211722886 211723103 151 - chr2:211722954-211723041 NA NA NA NA NA chr2-1580 211719364 211719676 276 - chr2:211719393-211719597 NA NA NA NA NA chr2-131 21152095 21152273 166 - chr2:21152113-21152273 NA NA NA NA NA chr2-1579 211384820 211385071 149 - chr2:211384924-211384970 NA NA NA NA NA chr2-1578 211278601 211278874 170 - chr2:211278660-211278749 NA NA NA NA NA chr2-1577 211246118 211246271 117 - chr2:211246121-211246166 NA NA NA NA NA chr2-1576 211159674 211159952 159 - chr2:211159789-211159825 NA NA NA NA NA chr2-1575 211127502 211127940 279 - chr2:211127787-211127844 NA NA NA NA NA chr2-1574 211073128 211073498 224 - chr2:211073341-211073492 NA NA NA NA NA chr2-1573 211009229 211009711 337 - chr2:211009289-211009396 NA NA NA NA NA chr2-1572 210876870 210877153 240 - chr2:210876975-210877129 NA NA NA NA NA chr2-1571 210643248 210643713 250 - chr2:210643453-210643598 NA NA NA NA NA chr2-1570 210596082 210596552 286 - chr2:210596136-210596244 NA NA NA NA NA chr2-1569 210313752 210313927 168 - chr2:210313753-210313907 NA NA NA NA NA chr2-1568 210096060 210096428 203 - chr2:210096263-210096339 NA NA NA NA NA chr2-1567 210076135 210076608 232 - chr2:210076216-210076287 NA NA NA NA NA chr2-1566 209886879 209887148 144 - chr2:209886999-209887013 NA NA NA NA NA chr2-1565 209847012 209847330 169 - chr2:209847130-209847160 NA NA NA NA NA chr2-1564 209831808 209831983 155 - chr2:209831818-209831958 NA NA NA NA NA chr2-1563 209426901 209427078 153 - chr2:209426926-209427056 NA NA NA NA NA chr2-1562 209345351 209345542 134 - chr2:209345412-209345493 NA NA NA NA NA chr2-1561 209091045 209091223 114 - chr2:209091103-209091185 NA NA NA NA NA chr2-1560 208942511 208942718 145 - chr2:208942549-208942608 NA NA NA NA NA chr2-1559 208808175 208808466 163 - chr2:208808303-208808338 NA NA NA NA NA chr2-1558 208653329 208653523 162 - chr2:208653396-208653494 NA NA NA NA NA chr2-1557 208243934 208244353 373 - chr2:208243994-208244344 NA NA NA NA NA chr2-130 20805822 20806229 243 - chr2:20805931-20806146 NA NA NA NA NA chr2-1556 208014809 208014998 160 - chr2:208014860-208014980 NA NA NA NA NA chr2-129 20793386 20793541 130 - chr2:20793411-20793516 NA NA NA NA NA chr2-1555 207543059 207543233 160 - chr2:207543062-207543215 NA NA NA NA NA chr2-1554 207442497 207442723 158 - chr2:207442571-207442658 NA NA NA NA NA chr2-1553 207337337 207337576 177 - chr2:207337398-207337544 NA NA NA NA NA chr2-1552 206751755 206751977 178 - chr2:206751762-206751918 NA NA NA NA NA chr2-1551 206684918 206685106 141 - chr2:206684973-206685075 NA NA NA NA NA chr2-1550 206667792 206668068 233 - chr2:206667865-206668012 NA NA NA NA NA chr2-1549 206651423 206651699 176 - chr2:206651552-206651633 NA NA NA NA NA chr2-1548 206220213 206220479 184 - chr2:206220316-206220379 NA NA NA NA NA chr2-1547 206124056 206124354 279 - chr2:206124106-206124347 NA NA NA NA NA chr2-1546 205607951 205608279 224 - chr2:205608013-205608091 NA NA NA NA NA chr2-1545 205582736 205583070 198 - chr2:205582792-205582894 NA NA NA NA NA chr2-1544 205522297 205522706 227 - chr2:205522354-205522490 NA NA NA NA NA chr2-1543 205081391 205081554 149 - chr2:205081399-205081537 NA NA NA NA NA chr2-1542 204987414 204987607 168 - chr2:204987447-204987586 NA NA NA NA NA chr2-1541 204807878 204808076 116 - chr2:204807914-204807971 NA NA NA NA NA chr2-1540 204737403 204737785 270 - chr2:204737478-204737661 NA NA NA NA NA chr2-1539 204566207 204566459 136 - chr2:204566334-204566365 NA NA NA NA NA chr2-1538 204451774 204452146 224 - chr2:204451790-204451940 NA NA NA NA NA chr2-1537 204426071 204426355 210 - chr2:204426140-204426271 NA NA NA NA NA chr2-1536 204400813 204401084 162 - chr2:204400879-204400900 NA NA NA NA NA chr2-1535 204350435 204350816 326 - chr2:204350535-204350751 NA NA NA NA NA chr2-1534 204180151 204180948 341 - chr2:204180295-204180442 NA NA NA NA NA chr2-1533 204031711 204031906 130 - chr2:204031820-204031863 NA NA NA NA NA chr2-1532 203998607 203998919 230 - chr2:203998650-203998759 NA NA NA NA NA chr2-1531 203726090 203726506 374 - chr2:203726103-203726494 NA NA NA NA NA chr2-1530 203578617 203578901 174 - chr2:203578738-203578813 NA NA NA NA NA chr2-1529 203533846 203534207 191 - chr2:203534064-203534133 NA NA NA NA NA chr2-128 20352677 20352929 137 - chr2:20352824-20352830 NA NA NA NA NA chr2-1528 203352724 203353154 239 - chr2:203352882-203352897 NA NA NA NA NA chr2-1527 203219536 203219742 173 - chr2:203219560-203219691 NA NA NA NA NA chr2-1526 202989906 202990254 257 - chr2:202990101-202990215 NA NA NA NA NA chr2-1525 202985508 202985685 142 - chr2:202985573-202985665 NA NA NA NA NA chr2-1524 202945498 202945761 162 - chr2:202945593-202945648 NA NA NA NA NA chr2-1523 202936956 202937209 191 - chr2:202936972-202937132 NA NA NA NA NA chr2-1522 202900269 202900524 218 - chr2:202900380-202900524 NA NA NA NA NA chr2-1521 202749936 202750181 161 - chr2:202750018-202750093 NA NA NA NA NA chr2-1520 202554521 202554749 172 - chr2:202554598-202554694 NA NA NA NA NA chr2-1519 202459917 202460113 190 - chr2:202459924-202460102 NA NA NA NA NA chr2-1518 202323897 202324165 230 - chr2:202323953-202324107 NA NA NA NA NA chr2-1517 202185454 202185813 271 - chr2:202185599-202185694 NA NA NA NA NA chr2-1516 201995333 201995574 172 - chr2:201995392-201995485 NA NA NA NA NA chr2-1515 201634328 201634582 189 - chr2:201634390-201634449 NA NA NA NA NA chr2-1514 201599620 201599907 147 - chr2:201599754-201599764 NA NA NA NA NA chr2-1513 201509087 201509360 171 - chr2:201509178-201509236 NA NA NA NA NA chr2-1512 201475006 201475498 269 - chr2:201475170-201475293 NA NA NA NA NA chr2-1511 201415779 201415968 145 - chr2:201415831-201415928 NA NA NA NA NA chr2-1510 201241654 201242111 238 - chr2:201241968-201242065 NA NA NA NA NA chr2-1509 201130920 201131175 187 - chr2:201131018-201131140 NA NA NA NA NA chr2-1508 200939108 200939406 228 - chr2:200939203-200939291 NA NA NA NA NA chr2-1507 200837697 200838174 242 - chr2:200838022-200838119 NA NA NA NA NA chr2-1506 200815818 200816197 269 - chr2:200815989-200816196 NA NA NA NA NA chr2-1505 200798841 200799245 227 - chr2:200798995-200799022 NA NA NA NA NA chr2-1504 200676691 200676852 149 - chr2:200676709-200676852 NA NA NA NA NA chr2-1503 200516417 200516752 244 - chr2:200516610-200516712 NA NA NA NA NA chr2-1502 200194008 200194519 351 - chr2:200194370-200194460 NA NA NA NA NA chr2-1501 200000166 200000320 122 - chr2:200000166-200000272 NA NA NA NA NA chr2-1500 199995071 199995552 210 - chr2:199995200-199995210 NA NA NA NA NA chr2-1499 199869086 199869385 218 - chr2:199869223-199869279 NA NA NA NA NA chr2-127 19945346 19945972 325 - chr2:19945802-19945865 NA NA NA NA NA chr2 199328 199657 219 - chr2:199426-199590 NA NA NA NA NA chr2-1498 198960740 198960954 134 - chr2:198960852-198960890 NA NA NA NA NA chr2-1497 198900071 198900294 133 - chr2:198900207-198900227 NA NA NA NA NA chr2-1496 198794437 198794795 260 - chr2:198794595-198794776 NA NA NA NA NA chr2-1495 198618039 198618223 144 - chr2:198618126-198618190 NA NA NA NA NA chr2-1494 198389918 198390216 196 - chr2:198389938-198390073 NA NA NA NA NA chr2-1493 198361875 198362100 163 - chr2:198361915-198362027 NA NA NA NA NA chr2-1492 198050585 198050862 147 - chr2:198050718-198050738 NA NA NA NA NA chr2-1491 197612934 197613369 224 - chr2:197613067-197613119 NA NA NA NA NA chr2-1490 197506443 197506787 281 - chr2:197506628-197506783 NA NA NA NA NA chr2-1489 197497703 197498302 386 - chr2:197498138-197498200 NA NA NA NA NA chr2-1488 197405298 197405658 228 - chr2:197405331-197405446 NA NA NA NA NA chr2-1487 197301391 197301686 161 - chr2:197301524-197301550 NA NA NA NA NA chr2-1486 197124435 197124649 159 - chr2:197124470-197124584 NA NA NA NA NA chr2-1485 196937707 196938034 213 - chr2:196937815-196937971 NA NA NA NA NA chr2-1484 196878470 196878783 233 - chr2:196878520-196878593 NA NA NA NA NA chr2-1483 196822097 196822416 166 - chr2:196822266-196822271 NA NA NA NA NA chr2-1482 196777428 196777714 221 - chr2:196777428-196777519 NA NA NA NA NA chr2-1481 196623988 196624380 182 - chr2:196624051-196624128 NA NA NA NA NA chr2-1480 196534038 196534371 207 - chr2:196534156-196534300 NA NA NA NA NA chr2-1479 196450058 196450382 196 - chr2:196450244-196450339 NA NA NA NA NA chr2-1478 196338766 196338939 160 - chr2:196338783-196338934 NA NA NA NA NA chr2-1477 196188854 196189066 135 - chr2:196188935-196188997 NA NA NA NA NA chr2-1476 196131789 196132357 291 - chr2:196131924-196132009 NA NA NA NA NA chr2-1475 195965379 195965549 135 - chr2:195965404-195965509 NA NA NA NA NA chr2-1474 195723013 195723315 185 - chr2:195723151-195723310 NA NA NA NA NA chr2-126 19537857 19538114 203 - chr2:19537918-19538013 NA NA NA NA NA chr2-1473 195274093 195274591 354 - chr2:195274132-195274504 NA NA NA NA NA chr2-1472 195131019 195131370 179 - chr2:195131171-195131176 NA NA NA NA NA chr2-125 19511475 19511885 270 - chr2:19511591-19511733 NA NA NA NA NA chr2-1471 195079954 195080130 123 - chr2:195079975-195080061 NA NA NA NA NA chr2-124 19456658 19457050 231 - chr2:19456772-19456795 NA NA NA NA NA chr2-1470 194513084 194513300 126 - chr2:194513152-194513199 NA NA NA NA NA chr2-1469 194499791 194500016 203 - chr2:194499839-194499998 NA NA NA NA NA chr2-1468 194387674 194387875 156 - chr2:194387705-194387771 NA NA NA NA NA chr2-1467 194287347 194287677 205 - chr2:194287366-194287499 NA NA NA NA NA chr2-1466 194111046 194111427 225 - chr2:194111097-194111244 NA NA NA NA NA chr2-1465 194059362 194059735 213 - chr2:194059412-194059520 NA NA NA NA NA chr2-1464 193968008 193968301 153 - chr2:193968124-193968149 NA NA NA NA NA chr2-1463 193952521 193952761 137 - chr2:193952616-193952654 NA NA NA NA NA chr2-1462 193555628 193555866 148 - chr2:193555724-193555788 NA NA NA NA NA chr2-1461 193551491 193551820 162 - chr2:193551636-193551642 NA NA NA NA NA chr2-1460 193548496 193548985 351 - chr2:193548645-193548927 NA NA NA NA NA chr2-1459 193469247 193469561 266 - chr2:193469248-193469418 NA NA NA NA NA chr2-1458 193359939 193360165 132 - chr2:193359939-193360024 NA NA NA NA NA chr2-1457 193275668 193275848 159 - chr2:193275693-193275835 NA NA NA NA NA chr2-1456 193247047 193247227 158 - chr2:193247079-193247210 NA NA NA NA NA chr2-1455 193043884 193044147 206 - chr2:193043991-193044115 NA NA NA NA NA chr2-1454 192664422 192664787 294 - chr2:192664450-192664602 NA NA NA NA NA chr2-123 19252656 19253072 230 - chr2:19252920-19252977 NA NA NA NA NA chr2-1453 192501477 192501818 209 - chr2:192501583-192501726 NA NA NA NA NA chr2-1452 192403555 192403739 116 - chr2:192403594-192403613 NA NA NA NA NA chr2-1451 192012266 192012675 241 - chr2:192012373-192012584 NA NA NA NA NA chr2-1450 191879710 191879909 152 - chr2:191879759-191879866 NA NA NA NA NA chr2-1449 191793067 191793535 234 - chr2:191793386-191793471 NA NA NA NA NA chr2-1448 191767888 191768155 166 - chr2:191767986-191768048 NA NA NA NA NA chr2-1447 191721434 191721739 159 - chr2:191721586-191721596 NA NA NA NA NA chr2-1446 191690029 191690394 206 - chr2:191690231-191690321 NA NA NA NA NA chr2-1445 191620810 191620979 155 - chr2:191620830-191620977 NA NA NA NA NA chr2-1444 191325220 191325505 191 - chr2:191325264-191325408 NA NA NA NA NA chr2-1443 190858998 190859195 146 - chr2:190859043-190859141 NA NA NA NA NA chr2-1442 190636726 190637053 164 - chr2:190636889-190636890 NA NA NA NA NA chr2-1441 190599136 190599472 177 - chr2:190599319-190599325 NA NA NA NA NA chr2-1440 190510556 190510843 244 - chr2:190510599-190510757 NA NA NA NA NA chr2-1439 190480897 190481329 337 - chr2:190481168-190481322 NA NA NA NA NA chr2-1438 190333378 190333626 149 - chr2:190333475-190333523 NA NA NA NA NA chr2-1437 190278374 190278657 185 - chr2:190278580-190278613 NA NA NA NA NA chr2-1436 189989976 189990812 420 - chr2:189990052-189990167 NA NA NA NA NA chr2-1435 189962531 189962704 124 - chr2:189962600-189962695 NA NA NA NA NA chr2-1434 189824680 189824836 151 - chr2:189824683-189824830 NA NA NA NA NA chr2-122 18966479 18966790 160 - chr2:18966638-18966643 NA NA NA NA NA chr2-1433 189398078 189398309 173 - chr2:189398129-189398237 NA NA NA NA NA chr2-1432 189379812 189380075 163 - chr2:189379908-189379973 NA NA NA NA NA chr2-121 18932327 18932589 147 - chr2:18932442-18932474 NA NA NA NA NA chr2-120 18931288 18931723 278 - chr2:18931576-18931676 NA NA NA NA NA chr2-1431 189291250 189291483 147 - chr2:189291348-189291402 NA NA NA NA NA chr2-1430 189143246 189143499 168 - chr2:189143317-189143407 NA NA NA NA NA chr2-1429 188986149 188986335 117 - chr2:188986164-188986239 NA NA NA NA NA chr2-1428 188774564 188774741 124 - chr2:188774571-188774596 NA NA NA NA NA chr2-1427 188258741 188258975 152 - chr2:188258815-188258889 NA NA NA NA NA chr2-1426 188161587 188162034 203 - chr2:188161729-188161739 NA NA NA NA NA chr2-1425 187948621 187948800 116 - chr2:187948699-187948767 NA NA NA NA NA chr2-119 18788363 18788533 160 - chr2:18788367-18788520 NA NA NA NA NA chr2-1424 187633529 187633874 276 - chr2:187633626-187633819 NA NA NA NA NA chr2-1423 187579202 187579387 137 - chr2:187579304-187579366 NA NA NA NA NA chr2-1422 187577082 187577268 144 - chr2:187577170-187577249 NA NA NA NA NA chr2-1421 187322812 187323129 175 - chr2:187322858-187322939 NA NA NA NA NA chr2-1420 187114784 187115290 267 - chr2:187115139-187115283 NA NA NA NA NA chr2-1419 186932259 186932443 168 - chr2:186932262-186932422 NA NA NA NA NA chr2-1418 186878532 186878765 127 - chr2:186878620-186878623 NA NA NA NA NA chr2-1417 186531674 186531829 127 - chr2:186531698-186531769 NA NA NA NA NA chr2-1416 186139479 186139660 156 - chr2:186139494-186139630 NA NA NA NA NA chr2-118 18599514 18599760 146 - chr2:18599610-18599652 NA NA NA NA NA chr2-117 18581295 18581642 186 - chr2:18581380-18581443 NA NA NA NA NA chr2-1415 185640609 185640834 202 - chr2:185640618-185640804 NA NA NA NA NA chr2-1414 185560234 185560699 194 - chr2:185560404-185560407 NA NA NA NA NA chr2-1413 185390260 185390784 220 - chr2:185390347-185390417 NA NA NA NA NA chr2-116 18505137 18505486 266 - chr2:18505330-18505458 NA NA NA NA NA chr2-1412 185034075 185034429 212 - chr2:185034224-185034301 NA NA NA NA NA chr2-1411 185010052 185010606 240 - chr2:185010464-185010488 NA NA NA NA NA chr2-1410 184881958 184882163 163 - chr2:184881996-184882138 NA NA NA NA NA chr2-1409 184489440 184489608 161 - chr2:184489440-184489587 NA NA NA NA NA chr2-115 18441859 18442225 218 - chr2:18441899-18442023 NA NA NA NA NA chr2-1408 184272368 184272555 136 - chr2:184272428-184272522 NA NA NA NA NA chr2-1407 184038889 184039118 143 - chr2:184038989-184039039 NA NA NA NA NA chr2-1406 183966823 183967045 180 - chr2:183966860-183966993 NA NA NA NA NA chr2-1405 183738252 183738423 165 - chr2:183738252-183738414 NA NA NA NA NA chr2-1404 183506674 183506884 131 - chr2:183506742-183506791 NA NA NA NA NA chr2-114 18344580 18344876 213 - chr2:18344825-18344872 NA NA NA NA NA chr2-1403 183246587 183246865 171 - chr2:183246712-183246773 NA NA NA NA NA chr2-1402 183147961 183148169 165 - chr2:183148020-183148158 NA NA NA NA NA chr2-1401 182926171 182926327 150 - chr2:182926175-182926320 NA NA NA NA NA chr2-1400 182906485 182906884 234 - chr2:182906631-182906784 NA NA NA NA NA chr2-1399 182868791 182869262 227 - chr2:182868940-182868975 NA NA NA NA NA chr2-1398 182800357 182800820 272 - chr2:182800486-182800634 NA NA NA NA NA chr2-1397 182616386 182616562 171 - chr2:182616397-182616558 NA NA NA NA NA chr2-1396 182549803 182550104 171 - chr2:182549875-182549946 NA NA NA NA NA chr2-113 18254239 18254502 158 - chr2:18254352-18254401 NA NA NA NA NA chr2-1395 182074314 182074464 149 - chr2:182074316-182074463 NA NA NA NA NA chr2-1394 181995707 181996075 205 - chr2:181995910-181995932 NA NA NA NA NA chr2-1393 181977608 181977845 163 - chr2:181977678-181977769 NA NA NA NA NA chr2-1392 181897568 181898027 340 - chr2:181897754-181897856 NA NA NA NA NA chr2-1391 181771009 181771351 183 - chr2:181771194-181771244 NA NA NA NA NA chr2-1390 181613294 181613476 156 - chr2:181613324-181613458 NA NA NA NA NA chr2-1389 181401193 181401447 146 - chr2:181401306-181401328 NA NA NA NA NA chr2-1388 181316036 181316425 219 - chr2:181316223-181316357 NA NA NA NA NA chr2-1387 181291040 181291277 189 - chr2:181291083-181291248 NA NA NA NA NA chr2-1386 180924424 180924658 124 - chr2:180924526-180924544 NA NA NA NA NA chr2-1385 180876432 180876589 143 - chr2:180876456-180876580 NA NA NA NA NA chr2-1384 180842677 180842984 197 - chr2:180842732-180842874 NA NA NA NA NA chr2-1383 180809011 180809247 187 - chr2:180809096-180809216 NA NA NA NA NA chr2-1382 180671718 180672012 179 - chr2:180671824-180671879 NA NA NA NA NA chr2-1381 180500868 180501118 163 - chr2:180500954-180501029 NA NA NA NA NA chr2-1380 179990241 179990478 146 - chr2:179990322-179990382 NA NA NA NA NA chr2-1379 179623852 179624034 157 - chr2:179623874-179624003 NA NA NA NA NA chr2-1378 179609727 179610293 319 - chr2:179610064-179610091 NA NA NA NA NA chr2-1377 179383759 179383975 163 - chr2:179383801-179383905 NA NA NA NA NA chr2-1376 179271898 179272175 165 - chr2:179272011-179272065 NA NA NA NA NA chr2-112 17899654 17899871 123 - chr2:17899714-17899760 NA NA NA NA NA chr2-1375 178991409 178991635 186 - chr2:178991483-178991612 NA NA NA NA NA chr2-1374 178689464 178689749 213 - chr2:178689466-178689642 NA NA NA NA NA chr2-1373 178676424 178677273 523 - chr2:178676616-178677126 NA NA NA NA NA chr2-1372 178562642 178562846 151 - chr2:178562693-178562792 NA NA NA NA NA chr2-1371 178456482 178456675 166 - chr2:178456515-178456651 NA NA NA NA NA chr2-111 17842088 17842353 127 - chr2:17842223-17842281 NA NA NA NA NA chr2-1370 178368429 178368634 163 - chr2:178368490-178368632 NA NA NA NA NA chr2-1369 178323820 178324038 129 - chr2:178323889-178323939 NA NA NA NA NA chr2-1368 178158697 178159020 187 - chr2:178158826-178158870 NA NA NA NA NA chr2-1367 178153230 178153586 218 - chr2:178153338-178153388 NA NA NA NA NA chr2-1366 178118271 178118496 164 - chr2:178118316-178118403 NA NA NA NA NA chr2-1365 178018622 178019082 357 - chr2:178018698-178018849 NA NA NA NA NA chr2-110 17799069 17799242 146 - chr2:17799070-17799202 NA NA NA NA NA chr2-1364 177891538 177891769 136 - chr2:177891614-177891683 NA NA NA NA NA chr2-1363 177791436 177791796 157 - chr2:177791692-177791699 NA NA NA NA NA chr2-1362 177662380 177662611 153 - chr2:177662451-177662519 NA NA NA NA NA chr2-1361 177661176 177661346 154 - chr2:177661186-177661327 NA NA NA NA NA chr2-1360 177616459 177616690 174 - chr2:177616532-177616665 NA NA NA NA NA chr2-1359 177530417 177530662 165 - chr2:177530469-177530594 NA NA NA NA NA chr2-109 17700439 17700629 125 - chr2:17700588-17700606 NA NA NA NA NA chr2-1358 176735476 176735930 253 - chr2:176735691-176735757 NA NA NA NA NA chr2-1357 176479774 176479933 149 - chr2:176479781-176479917 NA NA NA NA NA chr2-1356 176034464 176034647 150 - chr2:176034491-176034611 NA NA NA NA NA chr2-1355 175799494 175799795 267 - chr2:175799529-175799779 NA NA NA NA NA chr2-1354 175667544 175668347 466 - chr2:175668180-175668339 NA NA NA NA NA chr2-1353 175558390 175558817 272 - chr2:175558745-175558762 NA NA NA NA NA chr2-108 17542107 17542467 197 - chr2:17542336-17542373 NA NA NA NA NA chr2-1352 175336938 175337098 157 - chr2:175336938-175337089 NA NA NA NA NA chr2-1351 175034170 175034455 227 - chr2:175034300-175034433 NA NA NA NA NA chr2-1350 174931434 174931651 152 - chr2:174931503-174931594 NA NA NA NA NA chr2-1349 174912936 174913314 286 - chr2:174913006-174913283 NA NA NA NA NA chr2-1348 174872144 174872519 184 - chr2:174872347-174872352 NA NA NA NA NA chr2-1347 174763460 174763675 157 - chr2:174763514-174763609 NA NA NA NA NA chr2-1346 174620050 174620270 148 - chr2:174620114-174620194 NA NA NA NA NA chr2-107 17428424 17428818 210 - chr2:17428507-17428571 NA NA NA NA NA chr2-1345 173974638 173974874 184 - chr2:173974659-173974817 NA NA NA NA NA chr2-106 17381702 17381875 168 - chr2:17381702-17381860 NA NA NA NA NA chr2-1344 173655342 173655504 156 - chr2:173655342-173655495 NA NA NA NA NA chr2-1343 173552234 173552415 150 - chr2:173552267-173552388 NA NA NA NA NA chr2-1342 173379428 173379592 153 - chr2:173379447-173379585 NA NA NA NA NA chr2-1341 173246089 173246349 225 - chr2:173246112-173246267 NA NA NA NA NA chr2-1340 173155127 173155349 171 - chr2:173155186-173155302 NA NA NA NA NA chr2-1339 173032719 173032906 167 - chr2:173032779-173032906 NA NA NA NA NA chr2-1338 172986097 172986370 144 - chr2:172986220-172986229 NA NA NA NA NA chr2-1337 172931596 172931815 155 - chr2:172931682-172931762 NA NA NA NA NA chr2-1336 172915546 172916155 338 - chr2:172915891-172916001 NA NA NA NA NA chr2-1335 172868653 172868939 200 - chr2:172868756-172868913 NA NA NA NA NA chr2-1334 172725320 172725492 162 - chr2:172725340-172725482 NA NA NA NA NA chr2-1333 172662786 172663280 328 - chr2:172662915-172663029 NA NA NA NA NA chr2-105 17260372 17260565 165 - chr2:17260374-17260524 NA NA NA NA NA chr2-1332 172469978 172470190 142 - chr2:172470096-172470144 NA NA NA NA NA chr2-1331 172425249 172425720 366 - chr2:172425365-172425521 NA NA NA NA NA chr2-1330 172262233 172262467 177 - chr2:172262316-172262462 NA NA NA NA NA chr2-104 17199726 17199991 159 - chr2:17199838-17199888 NA NA NA NA NA chr2-1329 171929735 171929917 147 - chr2:171929769-171929881 NA NA NA NA NA chr2-103 17188180 17188517 164 - chr2:17188406-17188450 NA NA NA NA NA chr2-1328 171800431 171800604 150 - chr2:171800448-171800578 NA NA NA NA NA chr2-1327 171488362 171488731 182 - chr2:171488489-171488514 NA NA NA NA NA chr2-1326 171392230 171392496 196 - chr2:171392360-171392456 NA NA NA NA NA chr2-1325 171235718 171236058 176 - chr2:171235879-171235888 NA NA NA NA NA chr2-1324 171124017 171124332 239 - chr2:171124042-171124154 NA NA NA NA NA chr2-1323 171030407 171030668 127 - chr2:171030555-171030562 NA NA NA NA NA chr2-102 17099119 17099349 143 - chr2:17099203-17099256 NA NA NA NA NA chr2-1322 170876026 170876336 210 - chr2:170876130-170876290 NA NA NA NA NA chr2-101 17087040 17087580 236 - chr2:17087186-17087197 NA NA NA NA NA chr2-1321 170386876 170387121 151 - chr2:170386972-170387031 NA NA NA NA NA chr2-1320 170319980 170320123 113 - chr2:170320070-170320123 NA NA NA NA NA chr2-1319 170207167 170207368 147 - chr2:170207229-170207318 NA NA NA NA NA chr2-1318 170147090 170147347 154 - chr2:170147189-170147242 NA NA NA NA NA chr2-1317 169981573 169981845 179 - chr2:169981638-169981696 NA NA NA NA NA chr2-1316 169951682 169951877 158 - chr2:169951727-169951856 NA NA NA NA NA chr2-1315 169933236 169933446 154 - chr2:169933291-169933388 NA NA NA NA NA chr2-100 16973680 16974105 206 - chr2:16973765-16973819 NA NA NA NA NA chr2-1314 169655013 169655334 230 - chr2:169655069-169655173 NA NA NA NA NA chr2-1313 169606800 169607177 205 - chr2:169606958-169606977 NA NA NA NA NA chr2-1312 169557878 169558129 159 - chr2:169557980-169558057 NA NA NA NA NA chr2-1311 169554477 169554929 189 - chr2:169554773-169554780 NA NA NA NA NA chr2-1310 169553814 169554065 157 - chr2:169553909-169553973 NA NA NA NA NA chr2-1309 169533667 169534059 213 - chr2:169533773-169533920 NA NA NA NA NA chr2-1308 169232794 169232955 141 - chr2:169232802-169232911 NA NA NA NA NA chr2-1307 169088927 169089108 126 - chr2:169088949-169088987 NA NA NA NA NA chr2-1306 168951022 168951301 154 - chr2:168951148-168951178 NA NA NA NA NA chr2-1305 168822594 168822876 157 - chr2:168822705-168822744 NA NA NA NA NA chr2-1304 168597998 168598238 157 - chr2:168598087-168598158 NA NA NA NA NA chr2-1303 168514202 168514516 209 - chr2:168514226-168514385 NA NA NA NA NA chr2-1302 168364725 168365007 175 - chr2:168364914-168364918 NA NA NA NA NA chr2-1301 168238474 168238956 393 - chr2:168238537-168238854 NA NA NA NA NA chr2-99 16813131 16813458 216 - chr2:16813193-16813371 NA NA NA NA NA chr2-1300 168088140 168088378 165 - chr2:168088208-168088295 NA NA NA NA NA chr2-1299 167691191 167691681 313 - chr2:167691305-167691378 NA NA NA NA NA chr2-1298 167403512 167403732 149 - chr2:167403567-167403653 NA NA NA NA NA chr2-1297 167396658 167396942 204 - chr2:167396697-167396861 NA NA NA NA NA chr2-1296 167205843 167206124 240 - chr2:167205843-167206001 NA NA NA NA NA chr2-1295 167181619 167182121 327 - chr2:167181621-167181901 NA NA NA NA NA chr2-98 16716906 16717364 210 - chr2:16717066-16717072 NA NA NA NA NA chr2-1294 167141243 167141455 154 - chr2:167141305-167141399 NA NA NA NA NA chr2-1293 167046321 167046511 156 - chr2:167046366-167046499 NA NA NA NA NA chr2-1292 166839295 166839477 158 - chr2:166839319-166839453 NA NA NA NA NA chr2-1291 166838705 166838967 139 - chr2:166838813-166838842 NA NA NA NA NA chr2-1290 166601519 166601770 155 - chr2:166601623-166601678 NA NA NA NA NA chr2-1289 166542949 166543123 133 - chr2:166542994-166543084 NA NA NA NA NA chr2-1288 166406401 166406679 151 - chr2:166406548-166406562 NA NA NA NA NA chr2-1287 166281211 166281462 167 - chr2:166281292-166281372 NA NA NA NA NA chr2-1286 166260345 166260613 155 - chr2:166260486-166260514 NA NA NA NA NA chr2-1285 166241518 166241873 215 - chr2:166241708-166241833 NA NA NA NA NA chr2-1284 166047409 166047887 254 - chr2:166047693-166047759 NA NA NA NA NA chr2-1283 165816721 165816962 142 - chr2:165816770-165816838 NA NA NA NA NA chr2-1282 165723282 165723466 173 - chr2:165723300-165723451 NA NA NA NA NA chr2-1281 165699507 165699712 158 - chr2:165699538-165699657 NA NA NA NA NA chr2-1280 165498187 165498476 151 - chr2:165498325-165498338 NA NA NA NA NA chr2-97 16534955 16535136 121 - chr2:16535036-16535118 NA NA NA NA NA chr2-1279 164845306 164845522 156 - chr2:164845328-164845443 NA NA NA NA NA chr2-1278 164654461 164654617 118 - chr2:164654473-164654566 NA NA NA NA NA chr2-1277 164566670 164567097 250 - chr2:164566930-164567059 NA NA NA NA NA chr2-1276 164537368 164537738 181 - chr2:164537395-164537468 NA NA NA NA NA chr2-96 16451247 16451421 117 - chr2:16451250-16451337 NA NA NA NA NA chr2-1275 164474767 164475197 337 - chr2:164474807-164474958 NA NA NA NA NA chr2-1274 164433892 164434055 151 - chr2:164433906-164434044 NA NA NA NA NA chr2-1273 164352724 164352984 192 - chr2:164352747-164352905 NA NA NA NA NA chr2-1272 164328981 164329219 138 - chr2:164329096-164329149 NA NA NA NA NA chr2-95 16425279 16425517 144 - chr2:16425374-16425425 NA NA NA NA NA chr2-1271 164231909 164232197 168 - chr2:164232040-164232099 NA NA NA NA NA chr2-1270 163996650 163996809 136 - chr2:163996707-163996803 NA NA NA NA NA chr2-1269 163858941 163859147 149 - chr2:163859022-163859083 NA NA NA NA NA chr2-1268 163690806 163691144 195 - chr2:163690930-163690963 NA NA NA NA NA chr2-1267 163659152 163659530 297 - chr2:163659229-163659517 NA NA NA NA NA chr2-1266 163645453 163645799 269 - chr2:163645510-163645682 NA NA NA NA NA chr2-1265 163463352 163463709 180 - chr2:163463525-163463530 NA NA NA NA NA chr2-1264 163298531 163298754 167 - chr2:163298602-163298728 NA NA NA NA NA chr2-1263 162957725 162957954 166 - chr2:162957787-162957889 NA NA NA NA NA chr2-1262 162831508 162831745 161 - chr2:162831574-162831664 NA NA NA NA NA chr2-1261 162677891 162678213 212 - chr2:162677983-162678140 NA NA NA NA NA chr2-1260 162487755 162488116 221 - chr2:162487803-162487954 NA NA NA NA NA chr2-1259 162147126 162147432 166 - chr2:162147257-162147274 NA NA NA NA NA chr2-1258 162096051 162096540 294 - chr2:162096318-162096331 NA NA NA NA NA chr2-1257 161438765 161439066 153 - chr2:161438915-161438922 NA NA NA NA NA chr2-1256 161205998 161206229 150 - chr2:161206078-161206146 NA NA NA NA NA chr2-1255 161039278 161039752 258 - chr2:161039465-161039557 NA NA NA NA NA chr2-1254 160880066 160880305 208 - chr2:160880153-160880299 NA NA NA NA NA chr2-1253 160806383 160806812 202 - chr2:160806658-160806681 NA NA NA NA NA chr2-1252 160742725 160742938 145 - chr2:160742783-160742850 NA NA NA NA NA chr2-1251 160437884 160438172 242 - chr2:160437938-160438088 NA NA NA NA NA chr2-1250 160188584 160188780 176 - chr2:160188585-160188721 NA NA NA NA NA chr2-1249 160054771 160055309 256 - chr2:160054933-160054936 NA NA NA NA NA chr2-1248 159885064 159885320 154 - chr2:159885168-159885222 NA NA NA NA NA chr2-1247 159560566 159560889 287 - chr2:159560612-159560858 NA NA NA NA NA chr2-1246 159459206 159459361 130 - chr2:159459215-159459304 NA NA NA NA NA chr2-1245 159348468 159348685 143 - chr2:159348592-159348615 NA NA NA NA NA chr2-1244 159036172 159036492 215 - chr2:159036208-159036249 NA NA NA NA NA chr2-94 15903453 15903758 162 - chr2:15903592-15903628 NA NA NA NA NA chr2-1243 158536043 158536242 169 - chr2:158536088-158536242 NA NA NA NA NA chr2-1242 158446810 158447075 152 - chr2:158446923-158446962 NA NA NA NA NA chr2-1241 158430752 158430971 193 - chr2:158430784-158430925 NA NA NA NA NA chr2-1240 158365619 158365943 249 - chr2:158365762-158365902 NA NA NA NA NA chr2-1239 158000155 158000379 145 - chr2:158000292-158000329 NA NA NA NA NA chr2-1238 157946352 157946592 166 - chr2:157946426-157946518 NA NA NA NA NA chr2-1237 157874280 157874534 160 - chr2:157874378-157874442 NA NA NA NA NA chr2-1236 157796424 157796585 142 - chr2:157796459-157796574 NA NA NA NA NA chr2-1235 157361707 157361895 164 - chr2:157361733-157361885 NA NA NA NA NA chr2-1234 157283305 157283589 254 - chr2:157283360-157283554 NA NA NA NA NA chr2-1233 157180490 157180661 126 - chr2:157180497-157180597 NA NA NA NA NA chr2-1232 156719772 156719950 155 - chr2:156719779-156719919 NA NA NA NA NA chr2-1231 156670498 156670762 154 - chr2:156670596-156670646 NA NA NA NA NA chr2-1230 156556148 156556451 164 - chr2:156556299-156556336 NA NA NA NA NA chr2-1229 156437562 156437905 205 - chr2:156437739-156437845 NA NA NA NA NA chr2-93 15641491 15641718 166 - chr2:15641557-15641660 NA NA NA NA NA chr2-1228 156272732 156273157 303 - chr2:156272813-156272953 NA NA NA NA NA chr2-1227 156214892 156215502 357 - chr2:156215169-156215297 NA NA NA NA NA chr2-1226 155909892 155910194 154 - chr2:155910035-155910036 NA NA NA NA NA chr2-1225 155890129 155890355 202 - chr2:155890182-155890336 NA NA NA NA NA chr2-92 15542807 15543040 200 - chr2:15542810-15542947 NA NA NA NA NA chr2-1224 155228893 155229056 133 - chr2:155228919-155228992 NA NA NA NA NA chr2-91 15520878 15521278 332 - chr2:15520929-15521176 NA NA NA NA NA chr2-90 15511674 15511952 193 - chr2:15511737-15511823 NA NA NA NA NA chr2-89 15509095 15509589 342 - chr2:15509265-15509473 NA NA NA NA NA chr2-1223 154921689 154921885 121 - chr2:154921792-154921824 NA NA NA NA NA chr2-1222 154865733 154866154 276 - chr2:154865790-154865941 NA NA NA NA NA chr2-1221 154755647 154756287 351 - chr2:154755970-154756015 NA NA NA NA NA chr2-88 15465287 15465465 170 - chr2:15465307-15465461 NA NA NA NA NA chr2-1220 154643333 154643627 146 - chr2:154643333-154643405 NA NA NA NA NA chr2-1219 154413032 154413238 191 - chr2:154413077-154413238 NA NA NA NA NA chr2-1218 154341124 154341299 135 - chr2:154341163-154341252 NA NA NA NA NA chr2-1217 154330855 154331092 177 - chr2:154330857-154331003 NA NA NA NA NA chr2-87 15431720 15432177 343 - chr2:15431808-15432163 NA NA NA NA NA chr2-1216 154091490 154091758 156 - chr2:154091584-154091637 NA NA NA NA NA chr2-1215 153995515 153995890 173 - chr2:153995627-153995643 NA NA NA NA NA chr2-1214 153988161 153988501 193 - chr2:153988365-153988390 NA NA NA NA NA chr2-1213 153822314 153822681 263 - chr2:153822387-153822515 NA NA NA NA NA chr2-86 15379486 15379720 170 - chr2:15379540-15379636 NA NA NA NA NA chr2-1212 153691715 153691853 126 - chr2:153691733-153691853 NA NA NA NA NA chr2-85 15341247 15341540 195 - chr2:15341330-15341437 NA NA NA NA NA chr2-1211 153211533 153211882 200 - chr2:153211584-153211684 NA NA NA NA NA chr2-1210 153063581 153063875 196 - chr2:153063619-153063747 NA NA NA NA NA chr2-1209 153022404 153022617 189 - chr2:153022419-153022575 NA NA NA NA NA chr2-1208 152927161 152927340 171 - chr2:152927164-152927319 NA NA NA NA NA chr2-1207 152594500 152594696 126 - chr2:152594638-152594660 NA NA NA NA NA chr2-1206 152568496 152568743 162 - chr2:152568587-152568661 NA NA NA NA NA chr2-1205 152490847 152491040 163 - chr2:152490889-152491034 NA NA NA NA NA chr2-1204 152400631 152400841 169 - chr2:152400677-152400810 NA NA NA NA NA chr2-1203 152343902 152344121 156 - chr2:152343971-152344070 NA NA NA NA NA chr2-1202 152305827 152306016 118 - chr2:152305836-152305914 NA NA NA NA NA chr2-1201 152292136 152292316 154 - chr2:152292162-152292290 NA NA NA NA NA chr2-1200 151981955 151982263 198 - chr2:151982042-151982107 NA NA NA NA NA chr2-1199 151932343 151932814 239 - chr2:151932527-151932558 NA NA NA NA NA chr2-1198 151666306 151666504 127 - chr2:151666341-151666415 NA NA NA NA NA chr2-1197 151535845 151536140 122 - chr2:151535910-151535913 NA NA NA NA NA chr2-1196 151491473 151491675 154 - chr2:151491527-151491639 NA NA NA NA NA chr2-84 15101382 15101536 137 - chr2:15101392-15101505 NA NA NA NA NA chr2-1195 151010547 151010798 155 - chr2:151010628-151010672 NA NA NA NA NA chr2-1194 150826948 150827367 217 - chr2:150827224-150827266 NA NA NA NA NA chr2-1193 150658433 150658823 178 - chr2:150658487-150658505 NA NA NA NA NA chr2-83 15064831 15065017 139 - chr2:15064869-15064952 NA NA NA NA NA chr2-1192 150605296 150605528 164 - chr2:150605374-150605480 NA NA NA NA NA chr2-1191 150148422 150149171 400 - chr2:150148619-150148746 NA NA NA NA NA chr2-1190 150100922 150101297 276 - chr2:150100929-150101014 NA NA NA NA NA chr2-1189 150076861 150077139 179 - chr2:150076965-150077050 NA NA NA NA NA chr2-1188 150062966 150063413 213 - chr2:150063261-150063301 NA NA NA NA NA chr2-1187 149955256 149955656 267 - chr2:149955381-149955507 NA NA NA NA NA chr2-1186 149697984 149698191 155 - chr2:149698029-149698125 NA NA NA NA NA chr2-1185 149659561 149659849 247 - chr2:149659562-149659728 NA NA NA NA NA chr2-1184 149570099 149570415 171 - chr2:149570246-149570258 NA NA NA NA NA chr2-1183 149443709 149444141 230 - chr2:149443767-149443867 NA NA NA NA NA chr2-1182 149395582 149395788 150 - chr2:149395615-149395686 NA NA NA NA NA chr2-1181 149334661 149335113 245 - chr2:149334868-149334906 NA NA NA NA NA chr2-1180 149026672 149026923 166 - chr2:149026749-149026822 NA NA NA NA NA chr2-1179 148899154 148899384 161 - chr2:148899209-148899308 NA NA NA NA NA chr2-1178 148630046 148630296 186 - chr2:148630058-148630212 NA NA NA NA NA chr2-1177 148585301 148585656 187 - chr2:148585471-148585492 NA NA NA NA NA chr2-1176 148492112 148492669 367 - chr2:148492312-148492626 NA NA NA NA NA chr2-1175 148339481 148339707 141 - chr2:148339590-148339670 NA NA NA NA NA chr2-1174 148247914 148248186 152 - chr2:148248032-148248062 NA NA NA NA NA chr2-1173 148198234 148198464 168 - chr2:148198318-148198413 NA NA NA NA NA chr2-82 14818196 14818383 156 - chr2:14818231-14818354 NA NA NA NA NA chr2-1172 148012867 148013221 194 - chr2:148013075-148013081 NA NA NA NA NA chr2-1171 147979060 147979222 151 - chr2:147979061-147979206 NA NA NA NA NA chr2-1170 147890443 147890704 177 - chr2:147890545-147890656 NA NA NA NA NA chr2-1169 147840447 147840644 112 - chr2:147840552-147840599 NA NA NA NA NA chr2-1168 147737669 147737838 141 - chr2:147737706-147737828 NA NA NA NA NA chr2-1167 147722350 147722641 136 - chr2:147722579-147722634 NA NA NA NA NA chr2-1166 147555152 147555325 148 - chr2:147555179-147555304 NA NA NA NA NA chr2-81 14740146 14740680 212 - chr2:14740586-14740594 NA NA NA NA NA chr2-1165 147373589 147373843 138 - chr2:147373692-147373706 NA NA NA NA NA chr2-1164 147284609 147284908 187 - chr2:147284721-147284796 NA NA NA NA NA chr2-1163 146995497 146995661 153 - chr2:146995514-146995653 NA NA NA NA NA chr2-80 14683153 14683421 176 - chr2:14683193-14683303 NA NA NA NA NA chr2-1162 146582613 146582769 152 - chr2:146582619-146582769 NA NA NA NA NA chr2-1161 146565772 146566028 129 - chr2:146565899-146565901 NA NA NA NA NA chr2-1160 146534507 146534846 236 - chr2:146534694-146534785 NA NA NA NA NA chr2-1159 146352065 146352281 154 - chr2:146352131-146352227 NA NA NA NA NA chr2-1158 146094248 146094417 140 - chr2:146094275-146094387 NA NA NA NA NA chr2-1157 146037710 146038033 190 - chr2:146037875-146037964 NA NA NA NA NA chr2-1156 145824916 145825098 156 - chr2:145824946-145825074 NA NA NA NA NA chr2-1155 145751634 145752115 233 - chr2:145751965-145752033 NA NA NA NA NA chr2-1154 145226654 145226893 153 - chr2:145226739-145226805 NA NA NA NA NA chr2-1153 145043144 145043678 375 - chr2:145043207-145043397 NA NA NA NA NA chr2-1152 144857398 144857599 131 - chr2:144857472-144857531 NA NA NA NA NA chr2-1151 144850809 144850973 120 - chr2:144850887-144850946 NA NA NA NA NA chr2-1150 144437565 144438046 416 - chr2:144437596-144437892 NA NA NA NA NA chr2-1149 144260898 144261141 165 - chr2:144260992-144261071 NA NA NA NA NA chr2-79 14425836 14426158 265 - chr2:14425964-14426115 NA NA NA NA NA chr2-1148 144237282 144237554 203 - chr2:144237321-144237386 NA NA NA NA NA chr2-1147 143938821 143939296 259 - chr2:143938885-143939036 NA NA NA NA NA chr2-78 14387070 14387334 165 - chr2:14387179-14387240 NA NA NA NA NA chr2-1146 143672554 143672842 161 - chr2:143672671-143672710 NA NA NA NA NA chr2-1145 143621560 143621832 161 - chr2:143621687-143621753 NA NA NA NA NA chr2-1144 142958372 142958852 224 - chr2:142958681-142958702 NA NA NA NA NA chr2-1143 142917062 142917268 152 - chr2:142917120-142917216 NA NA NA NA NA chr2-1142 142743726 142744005 166 - chr2:142743846-142743906 NA NA NA NA NA chr2-1141 142628591 142628750 150 - chr2:142628604-142628743 NA NA NA NA NA chr2-1140 141936396 141936576 141 - chr2:141936423-141936531 NA NA NA NA NA chr2-1139 141842538 141842752 156 - chr2:141842600-141842696 NA NA NA NA NA chr2-77 14174984 14175257 192 - chr2:14174985-14175136 NA NA NA NA NA chr2-1138 141608302 141608508 162 - chr2:141608354-141608468 NA NA NA NA NA chr2-1137 141087676 141087974 168 - chr2:141087776-141087829 NA NA NA NA NA chr2-76 14071912 14072077 149 - chr2:14071934-14072073 NA NA NA NA NA chr2-1136 140607998 140608175 148 - chr2:140608028-140608148 NA NA NA NA NA chr2-75 14050019 14050185 153 - chr2:14050030-14050171 NA NA NA NA NA chr2-1135 140495477 140495864 156 - chr2:140495791-140495799 NA NA NA NA NA chr2-1134 140177784 140177968 147 - chr2:140177823-140177932 NA NA NA NA NA chr2-1133 140004062 140004666 295 - chr2:140004398-140004411 NA NA NA NA NA chr2-1132 139970697 139970893 146 - chr2:139970745-139970839 NA NA NA NA NA chr2-1131 139725522 139725724 160 - chr2:139725574-139725687 NA NA NA NA NA chr2-1130 139630998 139631446 264 - chr2:139631296-139631319 NA NA NA NA NA chr2-1129 139336910 139337220 170 - chr2:139337016-139337063 NA NA NA NA NA chr2-1128 139253906 139254182 165 - chr2:139254018-139254073 NA NA NA NA NA chr2-1127 139190312 139190790 319 - chr2:139190461-139190626 NA NA NA NA NA chr2-74 13913040 13913393 251 - chr2:13913258-13913369 NA NA NA NA NA chr2-1126 138810202 138810436 131 - chr2:138810288-138810299 NA NA NA NA NA chr2-1125 138807836 138808364 302 - chr2:138808200-138808207 NA NA NA NA NA chr2-1124 138772703 138773009 192 - chr2:138772748-138772883 NA NA NA NA NA chr2-1123 138525367 138525643 144 - chr2:138525509-138525516 NA NA NA NA NA chr2-1122 138491087 138491469 247 - chr2:138491127-138491262 NA NA NA NA NA chr2-1121 138384144 138384317 150 - chr2:138384171-138384302 NA NA NA NA NA chr2-1120 138252672 138252847 140 - chr2:138252697-138252807 NA NA NA NA NA chr2-1119 138113317 138113479 114 - chr2:138113370-138113460 NA NA NA NA NA chr2-1118 138079223 138079501 202 - chr2:138079334-138079498 NA NA NA NA NA chr2-1117 137982436 137982597 134 - chr2:137982444-137982532 NA NA NA NA NA chr2-1116 137528733 137529207 264 - chr2:137528851-137529005 NA NA NA NA NA chr2-1115 137293849 137294164 156 - chr2:137293997-137294006 NA NA NA NA NA chr2-1114 137266487 137266828 201 - chr2:137266602-137266733 NA NA NA NA NA chr2-1113 137220038 137220271 139 - chr2:137220170-137220196 NA NA NA NA NA chr2-1112 137069311 137069772 276 - chr2:137069433-137069461 NA NA NA NA NA chr2-1111 136809329 136809576 227 - chr2:136809349-136809536 NA NA NA NA NA chr2-73 13664124 13664387 146 - chr2:13664253-13664294 NA NA NA NA NA chr2-1110 136513372 136513548 166 - chr2:136513372-136513533 NA NA NA NA NA chr2-72 13645187 13645467 241 - chr2:13645206-13645369 NA NA NA NA NA chr2-1109 136195153 136195469 173 - chr2:136195256-136195284 NA NA NA NA NA chr2-1108 135774939 135775353 198 - chr2:135775079-135775099 NA NA NA NA NA chr2-1107 135753735 135753971 164 - chr2:135753811-135753907 NA NA NA NA NA chr2-1106 135631773 135632277 268 - chr2:135631861-135632011 NA NA NA NA NA chr2-1105 135629567 135629883 176 - chr2:135629700-135629729 NA NA NA NA NA chr2-1104 135332309 135332751 276 - chr2:135332422-135332479 NA NA NA NA NA chr2-1103 134939901 134940137 128 - chr2:134939947-134940021 NA NA NA NA NA chr2-1102 134922327 134922757 256 - chr2:134922482-134922558 NA NA NA NA NA chr2-71 13487281 13487639 211 - chr2:13487397-13487430 NA NA NA NA NA chr2-1101 134762519 134762863 148 - chr2:134762583-134762601 NA NA NA NA NA chr2-70 13471008 13471213 161 - chr2:13471047-13471159 NA NA NA NA NA chr2-1100 134334947 134335227 191 - chr2:134335090-134335165 NA NA NA NA NA chr2-1099 134330462 134330754 140 - chr2:134330462-134330526 NA NA NA NA NA chr2-1098 134101123 134101408 202 - chr2:134101238-134101341 NA NA NA NA NA chr2-1097 134036108 134036370 140 - chr2:134036218-134036224 NA NA NA NA NA chr2-1096 133813615 133813773 116 - chr2:133813623-133813718 NA NA NA NA NA chr2-1095 133795823 133795992 114 - chr2:133795843-133795867 NA NA NA NA NA chr2-1094 133682774 133682957 129 - chr2:133682878-133682928 NA NA NA NA NA chr2-1093 133644378 133644599 146 - chr2:133644456-133644530 NA NA NA NA NA chr2-69 13354314 13354489 158 - chr2:13354323-13354468 NA NA NA NA NA chr2-68 13345413 13345888 210 - chr2:13345560-13345564 NA NA NA NA NA chr2-1092 133433002 133433161 151 - chr2:133433016-133433156 NA NA NA NA NA chr2-1091 133419909 133420173 218 - chr2:133420027-133420153 NA NA NA NA NA chr2-1090 133413895 133414043 140 - chr2:133413895-133414031 NA NA NA NA NA chr2-1089 133395416 133395718 246 - chr2:133395579-133395713 NA NA NA NA NA chr2-1088 133380407 133380667 145 - chr2:133380522-133380552 NA NA NA NA NA chr2-67 13333361 13333636 166 - chr2:13333461-13333509 NA NA NA NA NA chr2-1087 133313613 133313811 124 - chr2:133313745-133313766 NA NA NA NA NA chr2-1086 133303489 133303894 195 - chr2:133303617-133303643 NA NA NA NA NA chr2-1085 133292004 133292175 158 - chr2:133292004-133292136 NA NA NA NA NA chr2-1084 133272544 133272817 166 - chr2:133272633-133272701 NA NA NA NA NA chr2-1083 133023311 133023567 127 - chr2:133023469-133023496 NA NA NA NA NA chr2-1082 132986060 132986211 137 - chr2:132986081-132986211 NA NA NA NA NA chr2-1081 132894353 132894666 207 - chr2:132894436-132894600 NA NA NA NA NA chr2-1080 132768273 132768463 172 - chr2:132768290-132768426 NA NA NA NA NA chr2-1079 132685524 132685767 150 - chr2:132685611-132685662 NA NA NA NA NA chr2-1078 132487878 132488173 173 - chr2:132488028-132488107 NA NA NA NA NA chr2-1077 132397582 132397867 158 - chr2:132397711-132397744 NA NA NA NA NA chr2-1076 131071120 131071446 281 - chr2:131071186-131071443 NA NA NA NA NA chr2-66 13080646 13080988 204 - chr2:13080800-13080858 NA NA NA NA NA chr2-1075 130780259 130780560 187 - chr2:130780403-130780533 NA NA NA NA NA chr2-65 13059755 13060081 222 - chr2:13059755-13059925 NA NA NA NA NA chr2-1074 130366504 130366782 153 - chr2:130366675-130366680 NA NA NA NA NA chr2-1073 130321304 130321697 199 - chr2:130321541-130321578 NA NA NA NA NA chr2-1072 129443933 129444168 167 - chr2:129444005-129444108 NA NA NA NA NA chr2-1071 129209547 129209928 184 - chr2:129209777-129209797 NA NA NA NA NA chr2-64 12915477 12915640 146 - chr2:12915495-12915625 NA NA NA NA NA chr2-1070 129146338 129146776 267 - chr2:129146351-129146533 NA NA NA NA NA chr2-1069 129140156 129140510 204 - chr2:129140196-129140305 NA NA NA NA NA chr2-1068 129024300 129024467 142 - chr2:129024323-129024441 NA NA NA NA NA chr2-1067 128979558 128979746 156 - chr2:128979602-128979720 NA NA NA NA NA chr2-63 12893284 12893437 128 - chr2:12893308-12893386 NA NA NA NA NA chr2-1066 128758078 128758388 163 - chr2:128758187-128758222 NA NA NA NA NA chr2-1065 128703688 128704063 232 - chr2:128703891-128703985 NA NA NA NA NA chr2-62 12862404 12863024 268 - chr2:12862526-12862554 NA NA NA NA NA chr2-1064 128621330 128621560 150 - chr2:128621407-128621474 NA NA NA NA NA chr2-1063 128533454 128533899 245 - chr2:128533741-128533873 NA NA NA NA NA chr2-1062 128298118 128298312 153 - chr2:128298156-128298265 NA NA NA NA NA chr2-1061 128157229 128157728 286 - chr2:128157379-128157389 NA NA NA NA NA chr2-1060 128098839 128099097 154 - chr2:128098944-128098993 NA NA NA NA NA chr2-1059 127931094 127931452 183 - chr2:127931279-127931282 NA NA NA NA NA chr2-1058 127920413 127920685 172 - chr2:127920509-127920577 NA NA NA NA NA chr2-1057 127853521 127853807 158 - chr2:127853655-127853691 NA NA NA NA NA chr2-1056 127845714 127845893 149 - chr2:127845750-127845866 NA NA NA NA NA chr2-61 12760281 12760436 148 - chr2:12760286-12760425 NA NA NA NA NA chr2-1055 127515343 127515628 193 - chr2:127515396-127515563 NA NA NA NA NA chr2-60 12751233 12751433 178 - chr2:12751243-12751387 NA NA NA NA NA chr2-1054 127508691 127508831 116 - chr2:127508715-127508807 NA NA NA NA NA chr2-1053 127502949 127503153 142 - chr2:127503011-127503091 NA NA NA NA NA chr2-1052 127086648 127087115 342 - chr2:127086765-127086986 NA NA NA NA NA chr2-1051 126548531 126548802 143 - chr2:126548657-126548673 NA NA NA NA NA chr2-1050 126540402 126540541 131 - chr2:126540411-126540526 NA NA NA NA NA chr2-1049 126505868 126506201 168 - chr2:126506044-126506058 NA NA NA NA NA chr2-1048 126411356 126411633 182 - chr2:126411469-126411574 NA NA NA NA NA chr2-1047 126353730 126354040 231 - chr2:126353811-126353962 NA NA NA NA NA chr2-1046 126324143 126324670 320 - chr2:126324477-126324555 NA NA NA NA NA chr2-1045 126295645 126295816 166 - chr2:126295660-126295816 NA NA NA NA NA chr2-1044 126207577 126207988 240 - chr2:126207834-126207860 NA NA NA NA NA chr2-1043 126176154 126176428 208 - chr2:126176182-126176286 NA NA NA NA NA chr2-1042 126082724 126083162 207 - chr2:126083000-126083021 NA NA NA NA NA chr2-1041 126021889 126022105 142 - chr2:126022015-126022057 NA NA NA NA NA chr2-1040 125989889 125990038 131 - chr2:125989922-125990017 NA NA NA NA NA chr2-59 12563407 12563597 151 - chr2:12563442-12563556 NA NA NA NA NA chr2-1039 125628717 125628876 157 - chr2:125628718-125628871 NA NA NA NA NA chr2-1038 125388127 125388425 124 - chr2:125388352-125388353 NA NA NA NA NA chr2-58 12530009 12530345 172 - chr2:12530119-12530157 NA NA NA NA NA chr2-1037 125151898 125152078 153 - chr2:125151927-125152055 NA NA NA NA NA chr2-1036 125113571 125113829 151 - chr2:125113678-125113722 NA NA NA NA NA chr2-1035 125112265 125112730 303 - chr2:125112350-125112414 NA NA NA NA NA chr2-1034 125031831 125032091 154 - chr2:125031929-125031969 NA NA NA NA NA chr2-1033 124821137 124821500 209 - chr2:124821346-124821456 NA NA NA NA NA chr2-1032 124592596 124592947 175 - chr2:124592858-124592945 NA NA NA NA NA chr2-1031 124528694 124529098 231 - chr2:124528822-124528835 NA NA NA NA NA chr2-1030 124379205 124379398 171 - chr2:124379235-124379380 NA NA NA NA NA chr2-1029 124272656 124272861 165 - chr2:124272708-124272827 NA NA NA NA NA chr2-1028 124200685 124200986 146 - chr2:124200863-124200877 NA NA NA NA NA chr2-1027 124176445 124176809 208 - chr2:124176578-124176607 NA NA NA NA NA chr2-1026 124167891 124168301 252 - chr2:124168050-124168223 NA NA NA NA NA chr2-1025 123984958 123985335 242 - chr2:123985045-123985104 NA NA NA NA NA chr2-1024 123904774 123905111 310 - chr2:123904813-123905090 NA NA NA NA NA chr2-57 12381141 12381515 298 - chr2:12381316-12381462 NA NA NA NA NA chr2-56 12374896 12375165 159 - chr2:12375015-12375073 NA NA NA NA NA chr2-1023 123623851 123623998 145 - chr2:123623857-123623998 NA NA NA NA NA chr2-1022 123578649 123578794 133 - chr2:123578666-123578793 NA NA NA NA NA chr2-1021 123402450 123402623 151 - chr2:123402474-123402605 NA NA NA NA NA chr2-1020 123365089 123365354 151 - chr2:123365203-123365240 NA NA NA NA NA chr2-1019 123253127 123253606 272 - chr2:123253401-123253523 NA NA NA NA NA chr2-1018 123153169 123153448 177 - chr2:123153265-123153334 NA NA NA NA NA chr2-1017 123133021 123133369 194 - chr2:123133065-123133160 NA NA NA NA NA chr2-1016 122851213 122851876 394 - chr2:122851444-122851531 NA NA NA NA NA chr2-1015 122832450 122832842 206 - chr2:122832586-122832606 NA NA NA NA NA chr2-1014 122778464 122778739 141 - chr2:122778590-122778601 NA NA NA NA NA chr2-1013 122769262 122769695 275 - chr2:122769290-122769445 NA NA NA NA NA chr2-1012 122625525 122625960 246 - chr2:122625667-122625677 NA NA NA NA NA chr2-1011 122581448 122581685 144 - chr2:122581535-122581580 NA NA NA NA NA chr2-1010 122489262 122489459 152 - chr2:122489312-122489424 NA NA NA NA NA chr2-1009 122464660 122465008 207 - chr2:122464885-122464909 NA NA NA NA NA chr2-1008 122422722 122422869 123 - chr2:122422728-122422803 NA NA NA NA NA chr2-1007 122353473 122353854 163 - chr2:122353774-122353802 NA NA NA NA NA chr2-1006 121975578 121975878 163 - chr2:121975707-121975725 NA NA NA NA NA chr2-55 12190773 12191279 234 - chr2:12190913-12190941 NA NA NA NA NA chr2-1005 121691645 121691799 152 - chr2:121691646-121691794 NA NA NA NA NA chr2-1004 121624214 121624417 153 - chr2:121624262-121624366 NA NA NA NA NA chr2-1003 121573889 121574378 282 - chr2:121574096-121574171 NA NA NA NA NA chr2-1002 121553569 121553830 141 - chr2:121553685-121553710 NA NA NA NA NA chr2-1001 121511935 121512155 150 - chr2:121512001-121512083 NA NA NA NA NA chr2-1000 121510521 121511326 374 - chr2:121510851-121510973 NA NA NA NA NA chr2-999 121381034 121381278 184 - chr2:121381062-121381216 NA NA NA NA NA chr2-54 12123408 12123856 262 - chr2:12123485-12123654 NA NA NA NA NA chr2-998 121159507 121159744 207 - chr2:121159521-121159713 NA NA NA NA NA chr2-997 120877558 120877736 161 - chr2:120877582-120877733 NA NA NA NA NA chr2-996 120537420 120537769 210 - chr2:120537594-120537700 NA NA NA NA NA chr2-995 120484521 120484719 132 - chr2:120484599-120484677 NA NA NA NA NA chr2-994 120407578 120407838 154 - chr2:120407693-120407750 NA NA NA NA NA chr2-993 120021309 120021663 177 - chr2:120021460-120021473 NA NA NA NA NA chr2-992 119987144 119987435 221 - chr2:119987175-119987287 NA NA NA NA NA chr2-991 119968840 119969055 169 - chr2:119968890-119969017 NA NA NA NA NA chr2-990 119787637 119788113 225 - chr2:119787963-119787970 NA NA NA NA NA chr2-989 119771378 119771652 232 - chr2:119771378-119771526 NA NA NA NA NA chr2-988 119705983 119706387 277 - chr2:119706058-119706156 NA NA NA NA NA chr2-53 11966370 11966527 156 - chr2:11966371-11966525 NA NA NA NA NA chr2-987 119654373 119654586 122 - chr2:119654430-119654478 NA NA NA NA NA chr2-986 119548530 119548719 170 - chr2:119548569-119548710 NA NA NA NA NA chr2-985 119445973 119446165 155 - chr2:119446004-119446125 NA NA NA NA NA chr2-52 11936982 11937361 197 - chr2:11937080-11937137 NA NA NA NA NA chr2-984 119332300 119332595 162 - chr2:119332426-119332448 NA NA NA NA NA chr2-983 119328479 119328739 166 - chr2:119328580-119328659 NA NA NA NA NA chr2-982 119297180 119297388 201 - chr2:119297180-119297367 NA NA NA NA NA chr2-981 119237608 119237905 157 - chr2:119237745-119237759 NA NA NA NA NA chr2-980 118793641 118793805 160 - chr2:118793647-118793799 NA NA NA NA NA chr2-979 118613987 118614139 140 - chr2:118614019-118614137 NA NA NA NA NA chr2-978 118598766 118599102 205 - chr2:118598951-118598998 NA NA NA NA NA chr2-977 118513623 118513804 171 - chr2:118513627-118513778 NA NA NA NA NA chr2-976 118207746 118207972 156 - chr2:118207821-118207912 NA NA NA NA NA chr2-975 118156874 118157243 216 - chr2:118156895-118157024 NA NA NA NA NA chr2-974 118053651 118053937 165 - chr2:118053728-118053794 NA NA NA NA NA chr2-973 118015563 118015793 168 - chr2:118015633-118015735 NA NA NA NA NA chr2-972 118010397 118010549 140 - chr2:118010411-118010545 NA NA NA NA NA chr2-971 117832223 117832710 347 - chr2:117832397-117832587 NA NA NA NA NA chr2-970 117668424 117668701 236 - chr2:117668424-117668578 NA NA NA NA NA chr2-969 117439427 117439729 249 - chr2:117439568-117439720 NA NA NA NA NA chr2-968 117410219 117410462 128 - chr2:117410337-117410353 NA NA NA NA NA chr2-967 117167221 117167474 219 - chr2:117167256-117167407 NA NA NA NA NA chr2-966 117041079 117041320 146 - chr2:117041172-117041224 NA NA NA NA NA chr2-965 116564662 116564845 135 - chr2:116564693-116564763 NA NA NA NA NA chr2-964 116528111 116528373 191 - chr2:116528226-116528324 NA NA NA NA NA chr2-963 116495511 116495791 186 - chr2:116495578-116495717 NA NA NA NA NA chr2-962 116388428 116388766 195 - chr2:116388538-116388557 NA NA NA NA NA chr2-961 116384912 116385165 136 - chr2:116385012-116385014 NA NA NA NA NA chr2-960 116349441 116349818 225 - chr2:116349546-116349572 NA NA NA NA NA chr2-959 116316101 116316350 202 - chr2:116316202-116316330 NA NA NA NA NA chr2-958 116175512 116175986 234 - chr2:116175684-116175691 NA NA NA NA NA chr2-957 116107874 116108153 245 - chr2:116107901-116108078 NA NA NA NA NA chr2-956 115819390 115819582 157 - chr2:115819421-115819545 NA NA NA NA NA chr2-955 115694291 115694765 349 - chr2:115694392-115694592 NA NA NA NA NA chr2-954 115648464 115648685 184 - chr2:115648517-115648656 NA NA NA NA NA chr2-953 115619503 115619913 262 - chr2:115619635-115619733 NA NA NA NA NA chr2-952 115518260 115518672 213 - chr2:115518530-115518564 NA NA NA NA NA chr2-951 115461777 115462331 289 - chr2:115462089-115462160 NA NA NA NA NA chr2-950 115325698 115326190 329 - chr2:115326045-115326119 NA NA NA NA NA chr2-949 115267021 115267228 160 - chr2:115267065-115267175 NA NA NA NA NA chr2-51 11524454 11524902 202 - chr2:11524596-11524604 NA NA NA NA NA chr2-948 115132315 115132838 220 - chr2:115132459-115132461 NA NA NA NA NA chr2-947 115109640 115109902 125 - chr2:115109801-115109813 NA NA NA NA NA chr2-946 115064734 115065009 143 - chr2:115064878-115064883 NA NA NA NA NA chr2-945 115032984 115033217 140 - chr2:115033074-115033118 NA NA NA NA NA chr2-944 114974591 114974877 210 - chr2:114974595-114974765 NA NA NA NA NA chr2-943 114955721 114956131 239 - chr2:114955981-114956120 NA NA NA NA NA chr2-942 114816706 114816955 147 - chr2:114816810-114816857 NA NA NA NA NA chr2-941 114774852 114775085 127 - chr2:114774983-114775029 NA NA NA NA NA chr2-940 114747848 114748119 196 - chr2:114747901-114748000 NA NA NA NA NA chr2-939 114743584 114743799 177 - chr2:114743611-114743739 NA NA NA NA NA chr2-50 11469655 11469801 122 - chr2:11469668-11469778 NA NA NA NA NA chr2-938 114611786 114612082 158 - chr2:114611922-114611940 NA NA NA NA NA chr2-937 114537930 114538232 156 - chr2:114538070-114538083 NA NA NA NA NA chr2-936 114444321 114444647 203 - chr2:114444344-114444474 NA NA NA NA NA chr2-935 114435579 114435747 151 - chr2:114435602-114435733 NA NA NA NA NA chr2-934 114429540 114429836 249 - chr2:114429644-114429799 NA NA NA NA NA chr2-933 114326606 114327009 316 - chr2:114326637-114326779 NA NA NA NA NA chr2-932 114291479 114291689 152 - chr2:114291547-114291636 NA NA NA NA NA chr2-931 114254001 114254317 268 - chr2:114254110-114254282 NA NA NA NA NA chr2-930 114196177 114196521 206 - chr2:114196285-114196323 NA NA NA NA NA chr2-929 114180004 114180264 162 - chr2:114180122-114180235 NA NA NA NA NA chr2-928 114123252 114123455 146 - chr2:114123307-114123397 NA NA NA NA NA chr2-927 113977577 113977983 242 - chr2:113977688-113977848 NA NA NA NA NA chr2-926 113874204 113874502 153 - chr2:113874349-113874357 NA NA NA NA NA chr2-925 113734330 113734505 142 - chr2:113734357-113734469 NA NA NA NA NA chr2-924 113404720 113404913 172 - chr2:113404729-113404886 NA NA NA NA NA chr2-49 11294270 11294714 270 - chr2:11294350-11294412 NA NA NA NA NA chr2-923 112932724 112932946 197 - chr2:112932744-112932891 NA NA NA NA NA chr2-922 112902697 112902881 129 - chr2:112902790-112902845 NA NA NA NA NA chr2-921 112902363 112902558 147 - chr2:112902409-112902509 NA NA NA NA NA chr2-920 112873952 112874262 202 - chr2:112873991-112874139 NA NA NA NA NA chr2-3 1126535 1126790 129 - chr2:1126670-1126682 NA NA NA NA NA chr2-48 11257098 11257369 153 - chr2:11257208-11257247 NA NA NA NA NA chr2-919 112560537 112561083 224 - chr2:112560655-112560659 NA NA NA NA NA chr2-918 112536163 112536669 220 - chr2:112536516-112536517 NA NA NA NA NA chr2-47 11253234 11253449 175 - chr2:11253298-11253421 NA NA NA NA NA chr2-917 112463355 112463603 173 - chr2:112463498-112463562 NA NA NA NA NA chr2-916 112300971 112301200 156 - chr2:112301037-112301113 NA NA NA NA NA chr2-46 11213148 11213328 152 - chr2:11213184-11213304 NA NA NA NA NA chr2-915 111982295 111982555 160 - chr2:111982391-111982447 NA NA NA NA NA chr2-45 11194521 11194678 119 - chr2:11194530-11194582 NA NA NA NA NA chr2-914 111922458 111922724 159 - chr2:111922649-111922659 NA NA NA NA NA chr2-44 11181680 11181970 198 - chr2:11181817-11181968 NA NA NA NA NA chr2-913 111700428 111700745 225 - chr2:111700438-111700489 NA NA NA NA NA chr2-912 111195147 111195467 171 - chr2:111195334-111195337 NA NA NA NA NA chr2-911 111085241 111085429 144 - chr2:111085320-111085376 NA NA NA NA NA chr2-910 111074292 111074547 188 - chr2:111074488-111074542 NA NA NA NA NA chr2-909 111042067 111042232 142 - chr2:111042070-111042199 NA NA NA NA NA chr2-908 111003873 111004259 229 - chr2:111004003-111004048 NA NA NA NA NA chr2-907 110960373 110960698 231 - chr2:110960539-110960640 NA NA NA NA NA chr2-906 110953696 110953985 216 - chr2:110953805-110953984 NA NA NA NA NA chr2-905 110821591 110821778 149 - chr2:110821627-110821739 NA NA NA NA NA chr2-904 110764377 110764581 154 - chr2:110764434-110764541 NA NA NA NA NA chr2-903 110657000 110657302 157 - chr2:110657153-110657173 NA NA NA NA NA chr2-902 110648364 110648535 123 - chr2:110648431-110648530 NA NA NA NA NA chr2-43 11026614 11026867 205 - chr2:11026712-11026844 NA NA NA NA NA chr2-901 110215765 110216066 201 - chr2:110215914-110216064 NA NA NA NA NA chr2-42 11009100 11009328 180 - chr2:11009110-11009261 NA NA NA NA NA chr2-900 109628646 109629043 212 - chr2:109628814-109628824 NA NA NA NA NA chr2-899 109610162 109610698 308 - chr2:109610383-109610456 NA NA NA NA NA chr2-898 109588990 109589528 447 - chr2:109589050-109589445 NA NA NA NA NA chr2-897 109577947 109578092 128 - chr2:109577956-109578050 NA NA NA NA NA chr2-896 109537779 109538003 181 - chr2:109537798-109537948 NA NA NA NA NA chr2-895 109467053 109467248 171 - chr2:109467083-109467206 NA NA NA NA NA chr2-894 109243840 109244149 157 - chr2:109243994-109244001 NA NA NA NA NA chr2-41 10915387 10915868 265 - chr2:10915512-10915552 NA NA NA NA NA chr2-893 109068949 109069251 122 - chr2:109068999-109069006 NA NA NA NA NA chr2-40 10868592 10868781 162 - chr2:10868623-10868762 NA NA NA NA NA chr2-892 108642557 108642837 157 - chr2:108642676-108642706 NA NA NA NA NA chr2-891 108592743 108592954 146 - chr2:108592808-108592889 NA NA NA NA NA chr2-890 108589311 108589638 209 - chr2:108589399-108589549 NA NA NA NA NA chr2-889 108424141 108424440 156 - chr2:108424288-108424299 NA NA NA NA NA chr2-888 108367457 108367851 236 - chr2:108367707-108367739 NA NA NA NA NA chr2-887 108170127 108170554 321 - chr2:108170197-108170554 NA NA NA NA NA chr2-886 108120723 108121099 208 - chr2:108120941-108121001 NA NA NA NA NA chr2-885 108109604 108110100 333 - chr2:108109945-108110026 NA NA NA NA NA chr2-884 108006534 108006882 210 - chr2:108006730-108006871 NA NA NA NA NA chr2-883 107600359 107600622 140 - chr2:107600476-107600487 NA NA NA NA NA chr2-882 106950702 106951096 274 - chr2:106950732-106950796 NA NA NA NA NA chr2-881 106927467 106927738 149 - chr2:106927587-106927615 NA NA NA NA NA chr2-880 106902575 106903008 235 - chr2:106902784-106902896 NA NA NA NA NA chr2-879 106889367 106889538 151 - chr2:106889395-106889536 NA NA NA NA NA chr2-878 106791231 106791499 165 - chr2:106791352-106791432 NA NA NA NA NA chr2-877 106724144 106724408 152 - chr2:106724260-106724298 NA NA NA NA NA chr2-876 106643294 106643537 193 - chr2:106643324-106643477 NA NA NA NA NA chr2-875 106353720 106353938 150 - chr2:106353795-106353884 NA NA NA NA NA chr2-874 106326811 106327022 164 - chr2:106326854-106326973 NA NA NA NA NA chr2-873 106177498 106177659 143 - chr2:106177514-106177640 NA NA NA NA NA chr2-872 106165515 106165948 301 - chr2:106165799-106165838 NA NA NA NA NA chr2-871 106157381 106157790 231 - chr2:106157498-106157665 NA NA NA NA NA chr2-39 10614877 10615153 154 - chr2:10614976-10615009 NA NA NA NA NA chr2-870 106032603 106033293 334 - chr2:106032610-106032755 NA NA NA NA NA chr2-869 106003632 106003909 231 - chr2:106003698-106003837 NA NA NA NA NA chr2-868 105967837 105968239 204 - chr2:105967947-105967997 NA NA NA NA NA chr2-867 105964935 105965152 201 - chr2:105964969-105965138 NA NA NA NA NA chr2-866 105945896 105946056 147 - chr2:105945915-105946046 NA NA NA NA NA chr2-865 105920883 105921075 136 - chr2:105921039-105921069 NA NA NA NA NA chr2-864 105864962 105865134 170 - chr2:105864965-105865134 NA NA NA NA NA chr2-863 105851530 105851728 156 - chr2:105851571-105851684 NA NA NA NA NA chr2-862 105844950 105845183 152 - chr2:105845017-105845095 NA NA NA NA NA chr2-861 105749860 105750020 131 - chr2:105749865-105749979 NA NA NA NA NA chr2-860 105681668 105682048 205 - chr2:105681885-105681957 NA NA NA NA NA chr2-859 105419635 105419908 201 - chr2:105419736-105419901 NA NA NA NA NA chr2-858 105353876 105354087 169 - chr2:105353936-105354060 NA NA NA NA NA chr2-857 105341171 105341333 148 - chr2:105341183-105341318 NA NA NA NA NA chr2-856 105302210 105302753 286 - chr2:105302562-105302687 NA NA NA NA NA chr2-855 105161469 105161852 201 - chr2:105161682-105161718 NA NA NA NA NA chr2-854 105122754 105122965 155 - chr2:105122803-105122895 NA NA NA NA NA chr2-853 105091308 105091509 152 - chr2:105091364-105091474 NA NA NA NA NA chr2-852 105072810 105073177 313 - chr2:105072940-105073145 NA NA NA NA NA chr2-851 105002755 105003086 177 - chr2:105002899-105002912 NA NA NA NA NA chr2-850 104748118 104748334 151 - chr2:104748181-104748272 NA NA NA NA NA chr2-849 104737305 104737490 132 - chr2:104737434-104737475 NA NA NA NA NA chr2-848 104724318 104724627 178 - chr2:104724427-104724485 NA NA NA NA NA chr2-847 104509490 104509782 180 - chr2:104509609-104509684 NA NA NA NA NA chr2-846 104498103 104498614 257 - chr2:104498287-104498325 NA NA NA NA NA chr2-845 104452556 104453062 292 - chr2:104452895-104452946 NA NA NA NA NA chr2-844 104432700 104432978 155 - chr2:104432815-104432851 NA NA NA NA NA chr2-843 104377192 104377791 267 - chr2:104377348-104377371 NA NA NA NA NA chr2-842 104288720 104289174 250 - chr2:104288865-104289013 NA NA NA NA NA chr2-841 104120000 104120212 153 - chr2:104120058-104120158 NA NA NA NA NA chr2-840 103993192 103993355 156 - chr2:103993199-103993348 NA NA NA NA NA chr2-839 103979826 103980061 150 - chr2:103979911-103979976 NA NA NA NA NA chr2-838 103742077 103742386 209 - chr2:103742089-103742248 NA NA NA NA NA chr2-837 103484352 103484791 222 - chr2:103484429-103484547 NA NA NA NA NA chr2-836 103403678 103403995 171 - chr2:103403814-103403829 NA NA NA NA NA chr2-835 103284762 103285082 162 - chr2:103284798-103284863 NA NA NA NA NA chr2-834 103156581 103156748 141 - chr2:103156621-103156729 NA NA NA NA NA chr2-833 103105503 103105700 169 - chr2:103105525-103105669 NA NA NA NA NA chr2-832 103051731 103051912 125 - chr2:103051755-103051840 NA NA NA NA NA chr2-831 102673049 102673405 247 - chr2:102673115-102673305 NA NA NA NA NA chr2-830 102543191 102543432 153 - chr2:102543282-102543350 NA NA NA NA NA chr2-829 102538821 102539147 162 - chr2:102538988-102538989 NA NA NA NA NA chr2-828 102479338 102479507 151 - chr2:102479354-102479488 NA NA NA NA NA chr2-827 102416403 102416674 154 - chr2:102416518-102416553 NA NA NA NA NA chr2-826 102407555 102407782 176 - chr2:102407607-102407733 NA NA NA NA NA chr2-825 102337471 102337638 147 - chr2:102337493-102337619 NA NA NA NA NA chr2-824 102320950 102321189 140 - chr2:102321031-102321081 NA NA NA NA NA chr2-823 102304235 102304535 242 - chr2:102304276-102304402 NA NA NA NA NA chr2-822 102222264 102222433 144 - chr2:102222286-102222402 NA NA NA NA NA chr2-821 102191145 102191380 151 - chr2:102191231-102191299 NA NA NA NA NA chr2-820 102167988 102168178 148 - chr2:102168040-102168141 NA NA NA NA NA chr2-819 102130432 102130688 150 - chr2:102130540-102130583 NA NA NA NA NA chr2-818 102108283 102108520 163 - chr2:102108350-102108432 NA NA NA NA NA chr2-817 102088712 102089081 281 - chr2:102088882-102088987 NA NA NA NA NA chr2-816 101956957 101957274 181 - chr2:101957017-101957100 NA NA NA NA NA chr2-815 101844811 101845010 144 - chr2:101844860-101844952 NA NA NA NA NA chr2-814 101755428 101755639 133 - chr2:101755500-101755594 NA NA NA NA NA chr2-813 101698395 101698686 154 - chr2:101698535-101698555 NA NA NA NA NA chr2-812 101682760 101683123 229 - chr2:101682804-101682809 NA NA NA NA NA chr2-811 101185821 101186017 156 - chr2:101185868-101185991 NA NA NA NA NA chr2-38 10114949 10115205 143 - chr2:10115064-10115096 NA NA NA NA NA chr2-37 10109838 10110099 154 - chr2:10109935-10109990 NA NA NA NA NA chr2-810 100949248 100949411 141 - chr2:100949265-100949379 NA NA NA NA NA chr2-809 100899636 100899794 137 - chr2:100899699-100899794 NA NA NA NA NA chr2-808 100634484 100634677 122 - chr2:100634524-100634544 NA NA NA NA NA chr2-807 100619460 100619750 145 - chr2:100619606-100619607 NA NA NA NA NA chr2-806 100515977 100516311 245 - chr2:100516038-100516166 NA NA NA NA NA chr2-805 100209929 100210118 158 - chr2:100209956-100210079 NA NA NA NA NA chr22_KI270736v1_random 180801 181064 179 - chr22_KI270736v1_random:180924-181061 NA NA NA NA NA chr22_KI270733v1_random 151466 151634 137 - chr22_KI270733v1_random:151485-151597 NA NA NA NA NA chr22-260 50657986 50658232 144 - chr22:50658126-50658206 NA NA NA NA NA chr22-259 50387337 50387498 157 - chr22:50387345-50387496 NA NA NA NA NA chr22-258 50127846 50128143 166 - chr22:50127965-50128006 NA NA NA NA NA chr22-257 49894361 49894584 157 - chr22:49894411-49894510 NA NA NA NA NA chr22-256 49655065 49655326 180 - chr22:49655151-49655255 NA NA NA NA NA chr22-255 48772000 48772190 178 - chr22:48772035-48772189 NA NA NA NA NA chr22-254 48695516 48695669 137 - chr22:48695533-48695655 NA NA NA NA NA chr22-253 48105214 48105618 339 - chr22:48105282-48105491 NA NA NA NA NA chr22-252 48029132 48029389 113 - chr22:48029205-48029246 NA NA NA NA NA chr22-251 47723593 47723778 133 - chr22:47723629-47723736 NA NA NA NA NA chr22-250 47670685 47670860 142 - chr22:47670728-47670832 NA NA NA NA NA chr22-249 47345638 47345885 200 - chr22:47345727-47345859 NA NA NA NA NA chr22-248 47236769 47237054 201 - chr22:47236772-47236931 NA NA NA NA NA chr22-247 47001487 47001672 165 - chr22:47001512-47001667 NA NA NA NA NA chr22-246 46941236 46941407 159 - chr22:46941246-46941394 NA NA NA NA NA chr22-245 46879653 46879801 117 - chr22:46879686-46879741 NA NA NA NA NA chr22-244 46742902 46743225 179 - chr22:46743050-46743083 NA NA NA NA NA chr22-243 46733277 46733638 220 - chr22:46733385-46733431 NA NA NA NA NA chr22-242 46331085 46331292 172 - chr22:46331136-46331265 NA NA NA NA NA chr22-241 46172955 46173226 169 - chr22:46173021-46173100 NA NA NA NA NA chr22-240 46039631 46039879 190 - chr22:46039661-46039822 NA NA NA NA NA chr22-239 45900634 45900889 223 - chr22:45900665-45900872 NA NA NA NA NA chr22-238 45677103 45677361 223 - chr22:45677155-45677308 NA NA NA NA NA chr22-237 45420474 45420655 160 - chr22:45420517-45420635 NA NA NA NA NA chr22-236 45368237 45368477 153 - chr22:45368322-45368382 NA NA NA NA NA chr22-235 45110899 45111146 165 - chr22:45110993-45111070 NA NA NA NA NA chr22-234 44880033 44880212 172 - chr22:44880033-44880191 NA NA NA NA NA chr22-233 44627686 44627933 221 - chr22:44627741-44627910 NA NA NA NA NA chr22-232 44396526 44396807 167 - chr22:44396636-44396685 NA NA NA NA NA chr22-231 43864121 43864341 167 - chr22:43864195-43864330 NA NA NA NA NA chr22-230 43855014 43855222 155 - chr22:43855069-43855170 NA NA NA NA NA chr22-229 43767838 43768141 159 - chr22:43767974-43767997 NA NA NA NA NA chr22-228 43488255 43488663 238 - chr22:43488439-43488592 NA NA NA NA NA chr22-227 43379306 43379588 155 - chr22:43379429-43379453 NA NA NA NA NA chr22-226 42940442 42940713 181 - chr22:42940558-42940636 NA NA NA NA NA chr22-225 42889548 42890130 381 - chr22:42889548-42889866 NA NA NA NA NA chr22-224 42836650 42837071 277 - chr22:42836906-42836983 NA NA NA NA NA chr22-223 42806574 42807127 352 - chr22:42806971-42807024 NA NA NA NA NA chr22-222 42742396 42742569 136 - chr22:42742495-42742557 NA NA NA NA NA chr22-221 42671943 42672268 174 - chr22:42672070-42672105 NA NA NA NA NA chr22-220 42660768 42661120 223 - chr22:42660769-42660927 NA NA NA NA NA chr22-219 42352693 42353026 230 - chr22:42352844-42352923 NA NA NA NA NA chr22-218 41898743 41899282 239 - chr22:41898897-41898909 NA NA NA NA NA chr22-217 41772204 41772531 191 - chr22:41772363-41772460 NA NA NA NA NA chr22-216 41524797 41525232 265 - chr22:41524799-41524928 NA NA NA NA NA chr22-215 41489225 41489529 158 - chr22:41489369-41489382 NA NA NA NA NA chr22-214 41287395 41287821 256 - chr22:41287449-41287620 NA NA NA NA NA chr22-213 41078691 41078999 247 - chr22:41078836-41078980 NA NA NA NA NA chr22-212 41003143 41003308 155 - chr22:41003153-41003298 NA NA NA NA NA chr22-211 40580757 40580949 157 - chr22:40580771-40580901 NA NA NA NA NA chr22-210 40541376 40541602 203 - chr22:40541390-40541547 NA NA NA NA NA chr22-209 40337764 40337975 126 - chr22:40337819-40337830 NA NA NA NA NA chr22-208 40312511 40312670 155 - chr22:40312514-40312667 NA NA NA NA NA chr22-207 40308614 40308974 180 - chr22:40308797-40308800 NA NA NA NA NA chr22-206 40214762 40215188 210 - chr22:40215043-40215066 NA NA NA NA NA chr22-205 40205053 40205231 122 - chr22:40205128-40205213 NA NA NA NA NA chr22-204 39972214 39972456 159 - chr22:39972295-39972369 NA NA NA NA NA chr22-203 39934114 39934390 184 - chr22:39934192-39934270 NA NA NA NA NA chr22-202 39881259 39881411 124 - chr22:39881288-39881356 NA NA NA NA NA chr22-201 39880320 39880669 197 - chr22:39880459-39880603 NA NA NA NA NA chr22-200 39287059 39287219 128 - chr22:39287139-39287211 NA NA NA NA NA chr22-199 38855411 38855572 120 - chr22:38855516-38855563 NA NA NA NA NA chr22-198 38801195 38801825 271 - chr22:38801429-38801455 NA NA NA NA NA chr22-197 38704719 38704986 148 - chr22:38704838-38704867 NA NA NA NA NA chr22-196 38648506 38648927 216 - chr22:38648643-38648688 NA NA NA NA NA chr22-195 38547929 38548227 163 - chr22:38548070-38548104 NA NA NA NA NA chr22-194 38334394 38335055 393 - chr22:38334641-38334651 NA NA NA NA NA chr22-193 38320342 38320562 152 - chr22:38320410-38320494 NA NA NA NA NA chr22-192 37943756 37943982 162 - chr22:37943812-37943918 NA NA NA NA NA chr22-191 37622145 37622416 158 - chr22:37622268-37622308 NA NA NA NA NA chr22-190 36703513 36703762 220 - chr22:36703600-36703762 NA NA NA NA NA chr22-189 36284107 36284461 213 - chr22:36284267-36284374 NA NA NA NA NA chr22-188 36108685 36109062 345 - chr22:36108699-36109021 NA NA NA NA NA chr22-187 36097139 36097366 142 - chr22:36097221-36097275 NA NA NA NA NA chr22-186 35547549 35547959 218 - chr22:35547687-35547740 NA NA NA NA NA chr22-185 35502636 35502867 131 - chr22:35502783-35502861 NA NA NA NA NA chr22-184 35322317 35322570 229 - chr22:35322319-35322500 NA NA NA NA NA chr22-183 35306463 35306893 216 - chr22:35306675-35306784 NA NA NA NA NA chr22-182 35274525 35274813 200 - chr22:35274649-35274805 NA NA NA NA NA chr22-181 35184294 35184490 130 - chr22:35184376-35184456 NA NA NA NA NA chr22-180 35171011 35171325 245 - chr22:35171092-35171199 NA NA NA NA NA chr22-179 35132425 35132602 164 - chr22:35132448-35132594 NA NA NA NA NA chr22-178 35112487 35112824 223 - chr22:35112527-35112697 NA NA NA NA NA chr22-177 35099826 35099983 130 - chr22:35099849-35099925 NA NA NA NA NA chr22-176 35069376 35069663 177 - chr22:35069500-35069560 NA NA NA NA NA chr22-175 35054597 35054888 154 - chr22:35054710-35054739 NA NA NA NA NA chr22-174 35053663 35053910 161 - chr22:35053755-35053827 NA NA NA NA NA chr22-173 35008987 35009172 157 - chr22:35009009-35009141 NA NA NA NA NA chr22-172 34998002 34998205 167 - chr22:34998038-34998169 NA NA NA NA NA chr22-171 34947236 34947464 159 - chr22:34947297-34947379 NA NA NA NA NA chr22-170 34814313 34814524 170 - chr22:34814336-34814474 NA NA NA NA NA chr22-169 34767504 34767941 235 - chr22:34767784-34767793 NA NA NA NA NA chr22-168 34764981 34765285 194 - chr22:34765120-34765233 NA NA NA NA NA chr22-167 34720169 34720334 128 - chr22:34720215-34720315 NA NA NA NA NA chr22-166 34688475 34688831 201 - chr22:34688700-34688712 NA NA NA NA NA chr22-165 34441321 34441529 167 - chr22:34441349-34441462 NA NA NA NA NA chr22-164 34304468 34304781 186 - chr22:34304613-34304690 NA NA NA NA NA chr22-163 33574972 33575166 142 - chr22:33575008-33575046 NA NA NA NA NA chr22-162 33560066 33560352 141 - chr22:33560245-33560275 NA NA NA NA NA chr22-161 33524186 33524355 153 - chr22:33524204-33524343 NA NA NA NA NA chr22-160 33112556 33112909 201 - chr22:33112714-33112839 NA NA NA NA NA chr22-159 33005433 33006009 277 - chr22:33005776-33005814 NA NA NA NA NA chr22-158 32981092 32981320 162 - chr22:32981172-32981301 NA NA NA NA NA chr22-157 32888011 32888519 287 - chr22:32888167-32888168 NA NA NA NA NA chr22-156 32876933 32877231 148 - chr22:32876965-32877022 NA NA NA NA NA chr22-155 32653491 32653668 169 - chr22:32653507-32653660 NA NA NA NA NA chr22-154 32592659 32592817 122 - chr22:32592698-32592748 NA NA NA NA NA chr22-153 32476850 32477028 146 - chr22:32476872-32476976 NA NA NA NA NA chr22-152 32440884 32441217 286 - chr22:32440926-32441118 NA NA NA NA NA chr22-151 32431492 32431722 195 - chr22:32431586-32431711 NA NA NA NA NA chr22-150 32378242 32378591 189 - chr22:32378416-32378438 NA NA NA NA NA chr22-149 32168152 32168336 127 - chr22:32168221-32168303 NA NA NA NA NA chr22-148 32150268 32150727 328 - chr22:32150301-32150400 NA NA NA NA NA chr22-147 32103314 32103594 166 - chr22:32103444-32103553 NA NA NA NA NA chr22-146 31856492 31856916 287 - chr22:31856763-31856846 NA NA NA NA NA chr22-145 31595623 31595839 165 - chr22:31595662-31595782 NA NA NA NA NA chr22-144 31588913 31589164 141 - chr22:31589069-31589077 NA NA NA NA NA chr22-143 31520534 31520804 162 - chr22:31520642-31520696 NA NA NA NA NA chr22-142 31477634 31477807 134 - chr22:31477711-31477787 NA NA NA NA NA chr22-141 31291301 31291709 256 - chr22:31291553-31291622 NA NA NA NA NA chr22-140 31148608 31149040 227 - chr22:31148941-31148942 NA NA NA NA NA chr22-139 31113655 31114071 191 - chr22:31113922-31113930 NA NA NA NA NA chr22-138 31020609 31020801 181 - chr22:31020609-31020768 NA NA NA NA NA chr22-137 30894449 30894699 213 - chr22:30894449-30894588 NA NA NA NA NA chr22-136 30762857 30763121 150 - chr22:30762969-30763006 NA NA NA NA NA chr22-135 30739626 30739849 147 - chr22:30739702-30739773 NA NA NA NA NA chr22-134 30705842 30706034 153 - chr22:30705880-30705993 NA NA NA NA NA chr22-133 30504658 30505008 210 - chr22:30504775-30504822 NA NA NA NA NA chr22-132 30381689 30382021 261 - chr22:30381873-30381992 NA NA NA NA NA chr22-131 30154636 30154889 158 - chr22:30154733-30154795 NA NA NA NA NA chr22-130 30073296 30073516 156 - chr22:30073361-30073443 NA NA NA NA NA chr22-129 30068219 30068497 184 - chr22:30068219-30068356 NA NA NA NA NA chr22-128 30043042 30043261 166 - chr22:30043090-30043198 NA NA NA NA NA chr22-127 29735837 29736204 292 - chr22:29736031-29736173 NA NA NA NA NA chr22-126 29681898 29682117 161 - chr22:29681965-29682097 NA NA NA NA NA chr22-125 29549319 29549673 284 - chr22:29549480-29549624 NA NA NA NA NA chr22-124 29243871 29244248 237 - chr22:29244027-29244189 NA NA NA NA NA chr22-123 29110093 29110392 200 - chr22:29110126-29110260 NA NA NA NA NA chr22-122 28701739 28701953 161 - chr22:28701788-28701892 NA NA NA NA NA chr22-121 28635675 28635906 170 - chr22:28635687-28635840 NA NA NA NA NA chr22-120 28604133 28604368 133 - chr22:28604271-28604284 NA NA NA NA NA chr22-119 28603113 28603569 268 - chr22:28603425-28603443 NA NA NA NA NA chr22-118 28599331 28599532 136 - chr22:28599442-28599490 NA NA NA NA NA chr22-117 28523032 28523711 347 - chr22:28523136-28523268 NA NA NA NA NA chr22-116 28506053 28506284 144 - chr22:28506124-28506165 NA NA NA NA NA chr22-115 28498536 28498803 179 - chr22:28498647-28498758 NA NA NA NA NA chr22-114 28496612 28497334 374 - chr22:28496771-28496779 NA NA NA NA NA chr22-113 28435147 28435325 124 - chr22:28435159-28435256 NA NA NA NA NA chr22-112 28420352 28420549 117 - chr22:28420396-28420451 NA NA NA NA NA chr22-111 28382849 28383209 220 - chr22:28382908-28383058 NA NA NA NA NA chr22-110 28358154 28358421 177 - chr22:28358222-28358320 NA NA NA NA NA chr22-109 28319046 28319367 222 - chr22:28319281-28319336 NA NA NA NA NA chr22-108 28310960 28311209 146 - chr22:28311061-28311102 NA NA NA NA NA chr22-107 28260253 28260484 151 - chr22:28260351-28260413 NA NA NA NA NA chr22-106 28252242 28252602 248 - chr22:28252484-28252555 NA NA NA NA NA chr22-105 28231775 28232153 284 - chr22:28231877-28232139 NA NA NA NA NA chr22-104 28229008 28229344 265 - chr22:28229081-28229204 NA NA NA NA NA chr22-103 28226525 28227176 306 - chr22:28226745-28226896 NA NA NA NA NA chr22-102 28219728 28219928 113 - chr22:28219828-28219867 NA NA NA NA NA chr22-101 28201132 28201479 207 - chr22:28201314-28201423 NA NA NA NA NA chr22-100 28186311 28186539 154 - chr22:28186379-28186462 NA NA NA NA NA chr22-99 28176555 28176724 148 - chr22:28176564-28176697 NA NA NA NA NA chr22-98 28083115 28083489 256 - chr22:28083339-28083434 NA NA NA NA NA chr22-97 28071819 28072184 235 - chr22:28071845-28071988 NA NA NA NA NA chr22-96 28031287 28031791 262 - chr22:28031411-28031485 NA NA NA NA NA chr22-95 27975232 27975772 364 - chr22:27975241-27975528 NA NA NA NA NA chr22-94 27854249 27854682 217 - chr22:27854544-27854653 NA NA NA NA NA chr22-93 27789166 27789599 231 - chr22:27789398-27789412 NA NA NA NA NA chr22-92 27766557 27766719 149 - chr22:27766564-27766694 NA NA NA NA NA chr22-91 27762541 27762704 152 - chr22:27762550-27762692 NA NA NA NA NA chr22-90 27725607 27725879 133 - chr22:27725760-27725768 NA NA NA NA NA chr22-89 27652620 27652911 157 - chr22:27652805-27652806 NA NA NA NA NA chr22-88 27617392 27617611 176 - chr22:27617453-27617604 NA NA NA NA NA chr22-87 27158921 27159158 158 - chr22:27158997-27159073 NA NA NA NA NA chr22-86 27123699 27123872 144 - chr22:27123726-27123839 NA NA NA NA NA chr22-85 27066609 27066809 118 - chr22:27066653-27066708 NA NA NA NA NA chr22-84 27049157 27049423 181 - chr22:27049263-27049377 NA NA NA NA NA chr22-83 27035579 27035740 151 - chr22:27035603-27035737 NA NA NA NA NA chr22-82 27024191 27025257 559 - chr22:27024453-27024516 NA NA NA NA NA chr22-81 26982696 26983028 257 - chr22:26982913-26983020 NA NA NA NA NA chr22-80 26953896 26954198 255 - chr22:26953977-26954138 NA NA NA NA NA chr22-79 26923885 26924099 147 - chr22:26923954-26924033 NA NA NA NA NA chr22-78 26909837 26910081 159 - chr22:26909920-26909995 NA NA NA NA NA chr22-77 26891016 26891192 112 - chr22:26891016-26891096 NA NA NA NA NA chr22-76 26725798 26726160 328 - chr22:26725888-26726154 NA NA NA NA NA chr22-75 26703565 26703842 189 - chr22:26703570-26703715 NA NA NA NA NA chr22-74 26678100 26678289 170 - chr22:26678109-26678241 NA NA NA NA NA chr22-73 26640849 26641020 149 - chr22:26640865-26640995 NA NA NA NA NA chr22-72 26507923 26508219 164 - chr22:26508057-26508088 NA NA NA NA NA chr22-71 26287564 26287859 116 - chr22:26287607-26287612 NA NA NA NA NA chr22-70 26230071 26230314 139 - chr22:26230159-26230202 NA NA NA NA NA chr22-69 26079120 26079416 194 - chr22:26079267-26079404 NA NA NA NA NA chr22-68 26060036 26060384 174 - chr22:26060214-26060218 NA NA NA NA NA chr22-67 26000097 26000518 207 - chr22:26000365-26000399 NA NA NA NA NA chr22-66 25961863 25962016 151 - chr22:25961867-25962014 NA NA NA NA NA chr22-65 25884264 25884435 146 - chr22:25884288-25884384 NA NA NA NA NA chr22-64 25863743 25863907 114 - chr22:25863753-25863842 NA NA NA NA NA chr22-63 25719933 25720158 160 - chr22:25719993-25720083 NA NA NA NA NA chr22-62 25710567 25710763 162 - chr22:25710603-25710730 NA NA NA NA NA chr22-61 25652124 25652292 152 - chr22:25652132-25652260 NA NA NA NA NA chr22-60 25630530 25630754 144 - chr22:25630592-25630696 NA NA NA NA NA chr22-59 25578215 25578673 210 - chr22:25578521-25578541 NA NA NA NA NA chr22-58 25512953 25513462 235 - chr22:25513095-25513122 NA NA NA NA NA chr22-57 25510181 25510441 159 - chr22:25510295-25510366 NA NA NA NA NA chr22-56 25489738 25490219 228 - chr22:25489999-25490048 NA NA NA NA NA chr22-55 25449602 25449870 157 - chr22:25449705-25449755 NA NA NA NA NA chr22-54 25356628 25356796 137 - chr22:25356685-25356778 NA NA NA NA NA chr22-53 25212838 25213061 179 - chr22:25212923-25213014 NA NA NA NA NA chr22-52 25205777 25205941 139 - chr22:25205840-25205929 NA NA NA NA NA chr22-51 25163909 25164287 190 - chr22:25164132-25164138 NA NA NA NA NA chr22-50 25102123 25102357 168 - chr22:25102185-25102320 NA NA NA NA NA chr22-49 24915619 24915803 129 - chr22:24915710-24915766 NA NA NA NA NA chr22-48 24908244 24908635 198 - chr22:24908450-24908468 NA NA NA NA NA chr22-47 24901186 24901426 198 - chr22:24901258-24901399 NA NA NA NA NA chr22-46 24864563 24864948 251 - chr22:24864789-24864890 NA NA NA NA NA chr22-45 24741826 24742187 207 - chr22:24741886-24741986 NA NA NA NA NA chr22-44 24718074 24718329 157 - chr22:24718176-24718233 NA NA NA NA NA chr22-43 24464434 24464834 202 - chr22:24464686-24464744 NA NA NA NA NA chr22-42 24301372 24301663 214 - chr22:24301521-24301622 NA NA NA NA NA chr22-41 24022361 24022732 275 - chr22:24022445-24022596 NA NA NA NA NA chr22-40 23610193 23610418 159 - chr22:23610257-23610348 NA NA NA NA NA chr22-39 23201728 23201970 136 - chr22:23201741-23201824 NA NA NA NA NA chr22-38 22957974 22958261 195 - chr22:22958108-22958257 NA NA NA NA NA chr22-37 22329112 22329559 253 - chr22:22329223-22329261 NA NA NA NA NA chr22-36 22220504 22220696 127 - chr22:22220515-22220604 NA NA NA NA NA chr22-35 22049400 22049638 116 - chr22:22049539-22049550 NA NA NA NA NA chr22-34 21987171 21987547 195 - chr22:21987374-21987410 NA NA NA NA NA chr22-33 21927123 21927295 160 - chr22:21927145-21927288 NA NA NA NA NA chr22-32 21914300 21914887 432 - chr22:21914461-21914611 NA NA NA NA NA chr22-31 21780076 21780227 118 - chr22:21780101-21780153 NA NA NA NA NA chr22-30 21774819 21775274 296 - chr22:21774901-21775172 NA NA NA NA NA chr22-29 21724066 21724228 139 - chr22:21724099-21724210 NA NA NA NA NA chr22-28 21603194 21603679 243 - chr22:21603200-21603283 NA NA NA NA NA chr22-27 20909446 20909852 200 - chr22:20909677-20909696 NA NA NA NA NA chr22-26 20905047 20905261 178 - chr22:20905088-20905235 NA NA NA NA NA chr22-25 20852872 20853183 198 - chr22:20853008-20853155 NA NA NA NA NA chr22-24 20824107 20824259 151 - chr22:20824109-20824259 NA NA NA NA NA chr22-23 20768220 20768448 148 - chr22:20768306-20768380 NA NA NA NA NA chr22-22 20659706 20660051 189 - chr22:20659808-20659854 NA NA NA NA NA chr22-21 20492016 20492432 238 - chr22:20492255-20492404 NA NA NA NA NA chr22-20 20491707 20491908 158 - chr22:20491736-20491858 NA NA NA NA NA chr22-19 20469415 20469716 159 - chr22:20469561-20469576 NA NA NA NA NA chr22-18 20237780 20237977 138 - chr22:20237810-20237860 NA NA NA NA NA chr22-17 20098145 20098439 151 - chr22:20098291-20098302 NA NA NA NA NA chr22-16 20000039 20000209 149 - chr22:20000078-20000197 NA NA NA NA NA chr22-15 19943928 19944147 137 - chr22:19943978-19944001 NA NA NA NA NA chr22-14 19924350 19924682 250 - chr22:19924399-19924534 NA NA NA NA NA chr22-13 19842051 19842329 206 - chr22:19842114-19842284 NA NA NA NA NA chr22-12 19675058 19675440 192 - chr22:19675238-19675278 NA NA NA NA NA chr22-11 19672469 19672743 180 - chr22:19672537-19672615 NA NA NA NA NA chr22-10 19639991 19640263 172 - chr22:19640082-19640145 NA NA NA NA NA chr22-9 19363478 19363706 158 - chr22:19363551-19363642 NA NA NA NA NA chr22-8 19326739 19327157 190 - chr22:19327006-19327007 NA NA NA NA NA chr22-7 19305132 19305375 144 - chr22:19305240-19305294 NA NA NA NA NA chr22-6 19254856 19255159 187 - chr22:19255006-19255060 NA NA NA NA NA chr22-5 18155001 18155214 136 - chr22:18155038-18155117 NA NA NA NA NA chr22-4 17870086 17870320 159 - chr22:17870169-17870249 NA NA NA NA NA chr22-3 17472889 17473255 211 - chr22:17473046-17473101 NA NA NA NA NA chr22-2 17126730 17127134 254 - chr22:17127064-17127076 NA NA NA NA NA chr22 17064614 17064773 133 - chr22:17064652-17064772 NA NA NA NA NA chr21_GL383578v2_alt 26968 27209 153 - chr21_GL383578v2_alt:27050-27118 NA NA NA NA NA chr21 5313198 5313531 322 - chr21:5313199-5313500 NA NA NA NA NA chr21-180 46520618 46520897 149 - chr21:46520751-46520773 NA NA NA NA NA chr21-179 44039851 44040039 126 - chr21:44039912-44039975 NA NA NA NA NA chr21-178 43598430 43598832 234 - chr21:43598680-43598705 NA NA NA NA NA chr21-177 43309739 43309972 172 - chr21:43309770-43309896 NA NA NA NA NA chr21-176 42165915 42166221 177 - chr21:42166070-42166105 NA NA NA NA NA chr21-175 41815757 41815919 129 - chr21:41815856-41815919 NA NA NA NA NA chr21-174 39264101 39264387 208 - chr21:39264186-39264355 NA NA NA NA NA chr21-173 38703917 38704219 168 - chr21:38704056-38704072 NA NA NA NA NA chr21-172 38608842 38609064 112 - chr21:38608962-38608974 NA NA NA NA NA chr21-171 38280337 38280608 158 - chr21:38280448-38280491 NA NA NA NA NA chr21-170 37307862 37308189 162 - chr21:37307997-37308009 NA NA NA NA NA chr21-169 37079146 37079449 197 - chr21:37079209-37079353 NA NA NA NA NA chr21-168 36586853 36587111 226 - chr21:36586932-36587094 NA NA NA NA NA chr21-167 35686642 35687054 271 - chr21:35686893-35686968 NA NA NA NA NA chr21-166 35435831 35436014 155 - chr21:35435869-35435991 NA NA NA NA NA chr21-165 35247796 35248080 183 - chr21:35247925-35248035 NA NA NA NA NA chr21-164 34627806 34628008 163 - chr21:34627837-34627965 NA NA NA NA NA chr21-163 34624343 34624557 169 - chr21:34624444-34624540 NA NA NA NA NA chr21-162 34286727 34286908 171 - chr21:34286745-34286896 NA NA NA NA NA chr21-161 34226068 34226257 172 - chr21:34226115-34226255 NA NA NA NA NA chr21-160 34221824 34221976 132 - chr21:34221860-34221952 NA NA NA NA NA chr21-159 33942500 33942718 145 - chr21:33942573-33942645 NA NA NA NA NA chr21-158 33704546 33704697 149 - chr21:33704546-33704694 NA NA NA NA NA chr21-157 33636023 33636483 291 - chr21:33636106-33636263 NA NA NA NA NA chr21-156 33514429 33514634 159 - chr21:33514484-33514606 NA NA NA NA NA chr21-155 33286942 33287246 244 - chr21:33286952-33287086 NA NA NA NA NA chr21-154 32891320 32891477 139 - chr21:32891349-32891452 NA NA NA NA NA chr21-153 32413618 32413900 188 - chr21:32413725-32413897 NA NA NA NA NA chr21-152 32401950 32402219 225 - chr21:32401984-32402121 NA NA NA NA NA chr21-151 32316688 32317044 222 - chr21:32316715-32316870 NA NA NA NA NA chr21-150 32303558 32303900 277 - chr21:32303669-32303816 NA NA NA NA NA chr21-149 32078367 32078551 156 - chr21:32078403-32078527 NA NA NA NA NA chr21-148 32007424 32007665 120 - chr21:32007509-32007526 NA NA NA NA NA chr21-147 31938296 31938586 197 - chr21:31938428-31938571 NA NA NA NA NA chr21-146 31757786 31758053 151 - chr21:31757880-31757926 NA NA NA NA NA chr21-145 31711337 31711569 161 - chr21:31711486-31711537 NA NA NA NA NA chr21-144 31450030 31450259 154 - chr21:31450105-31450184 NA NA NA NA NA chr21-143 31319843 31320099 159 - chr21:31319953-31320083 NA NA NA NA NA chr21-142 31287008 31287366 204 - chr21:31287054-31287158 NA NA NA NA NA chr21-141 31258720 31259371 285 - chr21:31258870-31258897 NA NA NA NA NA chr21-140 31213077 31213271 141 - chr21:31213116-31213211 NA NA NA NA NA chr21-139 31131121 31131294 122 - chr21:31131183-31131265 NA NA NA NA NA chr21-138 31129043 31129219 158 - chr21:31129067-31129204 NA NA NA NA NA chr21-137 31072745 31072909 122 - chr21:31072801-31072895 NA NA NA NA NA chr21-136 31008058 31008281 165 - chr21:31008110-31008211 NA NA NA NA NA chr21-135 30830538 30830858 202 - chr21:30830685-30830828 NA NA NA NA NA chr21-134 30719977 30720234 173 - chr21:30720006-30720137 NA NA NA NA NA chr21-133 30685066 30685440 228 - chr21:30685141-30685296 NA NA NA NA NA chr21-132 30682162 30682445 207 - chr21:30682249-30682341 NA NA NA NA NA chr21-131 30598860 30599178 210 - chr21:30598860-30599016 NA NA NA NA NA chr21-130 30574960 30575323 201 - chr21:30575126-30575246 NA NA NA NA NA chr21-129 30535552 30536133 304 - chr21:30535877-30536015 NA NA NA NA NA chr21-128 30437998 30438293 178 - chr21:30438099-30438144 NA NA NA NA NA chr21-127 30404376 30404573 147 - chr21:30404420-30404520 NA NA NA NA NA chr21-126 30301040 30301415 162 - chr21:30301310-30301316 NA NA NA NA NA chr21-125 30226170 30226470 161 - chr21:30226304-30226321 NA NA NA NA NA chr21-124 30151641 30151932 153 - chr21:30151782-30151800 NA NA NA NA NA chr21-123 30015412 30015729 173 - chr21:30015530-30015631 NA NA NA NA NA chr21-122 29999000 29999288 164 - chr21:29999145-29999157 NA NA NA NA NA chr21-121 29986303 29986554 115 - chr21:29986430-29986477 NA NA NA NA NA chr21-120 29915591 29915782 143 - chr21:29915627-29915728 NA NA NA NA NA chr21-119 29795665 29795995 268 - chr21:29795703-29795847 NA NA NA NA NA chr21-118 29793554 29793953 268 - chr21:29793697-29793850 NA NA NA NA NA chr21-117 29749750 29749952 113 - chr21:29749854-29749893 NA NA NA NA NA chr21-116 29637646 29637877 153 - chr21:29637724-29637799 NA NA NA NA NA chr21-115 29597920 29598113 155 - chr21:29597955-29598069 NA NA NA NA NA chr21-114 29560815 29561112 256 - chr21:29560880-29561054 NA NA NA NA NA chr21-113 29441967 29442154 119 - chr21:29442006-29442091 NA NA NA NA NA chr21-112 29347306 29347872 237 - chr21:29347358-29347394 NA NA NA NA NA chr21-111 29259522 29259734 135 - chr21:29259533-29259624 NA NA NA NA NA chr21-110 29251615 29251813 146 - chr21:29251668-29251763 NA NA NA NA NA chr21-109 29249708 29249985 148 - chr21:29249837-29249856 NA NA NA NA NA chr21-108 29165528 29165865 173 - chr21:29165766-29165849 NA NA NA NA NA chr21-107 29091024 29091196 144 - chr21:29091056-29091170 NA NA NA NA NA chr21-106 29060337 29060664 170 - chr21:29060527-29060573 NA NA NA NA NA chr21-105 28910395 28910743 172 - chr21:28910584-28910593 NA NA NA NA NA chr21-104 28815730 28815905 130 - chr21:28815736-28815838 NA NA NA NA NA chr21-103 28805769 28805943 131 - chr21:28805850-28805919 NA NA NA NA NA chr21-102 28754908 28755169 158 - chr21:28755007-28755058 NA NA NA NA NA chr21-101 28602571 28602847 138 - chr21:28602737-28602765 NA NA NA NA NA chr21-100 28567754 28568036 239 - chr21:28567864-28568017 NA NA NA NA NA chr21-99 28486038 28486471 294 - chr21:28486086-28486204 NA NA NA NA NA chr21-98 28449627 28449917 153 - chr21:28449822-28449896 NA NA NA NA NA chr21-97 28412748 28413134 286 - chr21:28412888-28413079 NA NA NA NA NA chr21-96 28348585 28348908 155 - chr21:28348651-28348689 NA NA NA NA NA chr21-95 28327445 28327789 176 - chr21:28327681-28327757 NA NA NA NA NA chr21-94 28299279 28299443 161 - chr21:28299279-28299434 NA NA NA NA NA chr21-93 28088002 28088384 226 - chr21:28088096-28088152 NA NA NA NA NA chr21-92 27801960 27802165 179 - chr21:27801969-27802105 NA NA NA NA NA chr21-91 27745351 27745936 291 - chr21:27745401-27745513 NA NA NA NA NA chr21-90 27684038 27684314 200 - chr21:27684114-27684276 NA NA NA NA NA chr21-89 27525819 27526042 162 - chr21:27525894-27525988 NA NA NA NA NA chr21-88 27499309 27499595 153 - chr21:27499440-27499466 NA NA NA NA NA chr21-87 27451938 27452180 190 - chr21:27452015-27452179 NA NA NA NA NA chr21-86 27444189 27444454 144 - chr21:27444322-27444339 NA NA NA NA NA chr21-85 27406521 27406783 138 - chr21:27406636-27406641 NA NA NA NA NA chr21-84 27365741 27366102 266 - chr21:27365756-27365918 NA NA NA NA NA chr21-83 27315912 27316313 252 - chr21:27316007-27316233 NA NA NA NA NA chr21-82 27295018 27295233 148 - chr21:27295087-27295170 NA NA NA NA NA chr21-81 27237880 27238157 193 - chr21:27238002-27238153 NA NA NA NA NA chr21-80 27226726 27226949 152 - chr21:27226800-27226884 NA NA NA NA NA chr21-79 27217770 27218277 258 - chr21:27217832-27217927 NA NA NA NA NA chr21-78 27198132 27199041 376 - chr21:27198810-27198912 NA NA NA NA NA chr21-77 27181007 27181277 141 - chr21:27181141-27181158 NA NA NA NA NA chr21-76 27120784 27121073 189 - chr21:27120923-27121062 NA NA NA NA NA chr21-75 26981185 26981366 151 - chr21:26981218-26981342 NA NA NA NA NA chr21-74 26892753 26893117 238 - chr21:26892832-26892897 NA NA NA NA NA chr21-73 26641060 26641349 151 - chr21:26641190-26641195 NA NA NA NA NA chr21-72 26454732 26454951 135 - chr21:26454784-26454803 NA NA NA NA NA chr21-71 26384903 26385433 316 - chr21:26384919-26385055 NA NA NA NA NA chr21-70 26347084 26347335 156 - chr21:26347190-26347262 NA NA NA NA NA chr21-69 26016537 26016790 222 - chr21:26016545-26016705 NA NA NA NA NA chr21-68 25823693 25824092 263 - chr21:25823785-25824054 NA NA NA NA NA chr21-67 25812124 25812409 222 - chr21:25812124-25812220 NA NA NA NA NA chr21-66 25590779 25591012 138 - chr21:25590896-25590928 NA NA NA NA NA chr21-65 25540572 25540881 203 - chr21:25540582-25540732 NA NA NA NA NA chr21-64 25368740 25369145 205 - chr21:25368836-25368893 NA NA NA NA NA chr21-63 25326203 25326456 218 - chr21:25326292-25326440 NA NA NA NA NA chr21-62 25186562 25186882 245 - chr21:25186612-25186777 NA NA NA NA NA chr21-61 25106348 25106685 224 - chr21:25106366-25106499 NA NA NA NA NA chr21-60 25070011 25070316 223 - chr21:25070111-25070293 NA NA NA NA NA chr21-59 24903720 24903891 151 - chr21:24903735-24903846 NA NA NA NA NA chr21-58 24613987 24614216 167 - chr21:24614035-24614126 NA NA NA NA NA chr21-57 24100080 24100334 137 - chr21:24100193-24100209 NA NA NA NA NA chr21-56 23862243 23862450 154 - chr21:23862294-23862393 NA NA NA NA NA chr21-55 23684875 23685126 196 - chr21:23684901-23685013 NA NA NA NA NA chr21-54 23597568 23598017 273 - chr21:23597799-23597951 NA NA NA NA NA chr21-53 23356690 23357101 207 - chr21:23356790-23356845 NA NA NA NA NA chr21-52 23261505 23261711 172 - chr21:23261515-23261665 NA NA NA NA NA chr21-51 23219696 23220105 325 - chr21:23219753-23219910 NA NA NA NA NA chr21-50 23148560 23148819 143 - chr21:23148675-23148701 NA NA NA NA NA chr21-49 23105511 23105698 153 - chr21:23105547-23105665 NA NA NA NA NA chr21-48 22917222 22917403 151 - chr21:22917259-22917387 NA NA NA NA NA chr21-47 22660528 22660893 253 - chr21:22660657-22660815 NA NA NA NA NA chr21-46 22531617 22531771 150 - chr21:22531617-22531759 NA NA NA NA NA chr21-45 22512554 22512837 197 - chr21:22512573-22512727 NA NA NA NA NA chr21-44 22511760 22511934 156 - chr21:22511778-22511916 NA NA NA NA NA chr21-43 22389148 22389395 158 - chr21:22389236-22389304 NA NA NA NA NA chr21-42 22019890 22020139 145 - chr21:22019954-22019964 NA NA NA NA NA chr21-41 21814440 21814609 136 - chr21:21814487-21814604 NA NA NA NA NA chr21-40 21203587 21203889 203 - chr21:21203659-21203736 NA NA NA NA NA chr21-39 20787156 20787307 150 - chr21:20787157-20787306 NA NA NA NA NA chr21-38 20253003 20253366 242 - chr21:20253087-20253171 NA NA NA NA NA chr21-37 19859258 19859598 167 - chr21:19859425-19859487 NA NA NA NA NA chr21-36 19726882 19727050 156 - chr21:19726896-19727028 NA NA NA NA NA chr21-35 19720139 19720311 150 - chr21:19720160-19720287 NA NA NA NA NA chr21-34 19568063 19568396 276 - chr21:19568222-19568390 NA NA NA NA NA chr21-33 19547920 19548271 214 - chr21:19547945-19548078 NA NA NA NA NA chr21-32 19526960 19527151 149 - chr21:19526998-19527107 NA NA NA NA NA chr21-31 19416726 19416924 117 - chr21:19416773-19416826 NA NA NA NA NA chr21-30 19393789 19394083 133 - chr21:19393983-19393988 NA NA NA NA NA chr21-29 19210527 19210750 197 - chr21:19210543-19210688 NA NA NA NA NA chr21-28 19202697 19203081 236 - chr21:19202933-19202977 NA NA NA NA NA chr21-27 19113940 19114162 157 - chr21:19114015-19114117 NA NA NA NA NA chr21-26 19112575 19112755 131 - chr21:19112608-19112674 NA NA NA NA NA chr21-25 18883854 18884223 275 - chr21:18883884-18884097 NA NA NA NA NA chr21-24 18677874 18678124 149 - chr21:18677978-18678029 NA NA NA NA NA chr21-23 18622294 18622481 146 - chr21:18622332-18622434 NA NA NA NA NA chr21-22 18254425 18254838 222 - chr21:18254627-18254661 NA NA NA NA NA chr21-21 17841600 17841982 193 - chr21:17841645-17841721 NA NA NA NA NA chr21-20 17783145 17783393 180 - chr21:17783180-17783326 NA NA NA NA NA chr21-19 17537326 17537497 154 - chr21:17537343-17537480 NA NA NA NA NA chr21-18 17372625 17372792 114 - chr21:17372693-17372769 NA NA NA NA NA chr21-17 16651362 16651696 268 - chr21:16651432-16651568 NA NA NA NA NA chr21-16 16594293 16594462 158 - chr21:16594294-16594431 NA NA NA NA NA chr21-15 16446027 16446210 149 - chr21:16446065-16446184 NA NA NA NA NA chr21-14 15987379 15987550 147 - chr21:15987407-15987528 NA NA NA NA NA chr21-13 15687288 15687495 140 - chr21:15687337-15687419 NA NA NA NA NA chr21-12 15418358 15418658 157 - chr21:15418505-15418517 NA NA NA NA NA chr21-11 15331490 15331707 159 - chr21:15331553-15331659 NA NA NA NA NA chr21-10 15295892 15296344 265 - chr21:15296187-15296211 NA NA NA NA NA chr21-9 15273174 15273636 225 - chr21:15273486-15273522 NA NA NA NA NA chr21-8 15088245 15088650 193 - chr21:15088499-15088522 NA NA NA NA NA chr21-7 14992522 14992735 126 - chr21:14992604-14992638 NA NA NA NA NA chr21-6 14820424 14820668 123 - chr21:14820550-14820557 NA NA NA NA NA chr21-5 14787709 14788033 245 - chr21:14787734-14787846 NA NA NA NA NA chr21-4 14344038 14344516 309 - chr21:14344198-14344367 NA NA NA NA NA chr21-3 14219560 14219758 154 - chr21:14219600-14219706 NA NA NA NA NA chr21-2 14109721 14109912 128 - chr21:14109762-14109838 NA NA NA NA NA chr20-40 9941452 9941610 138 - chr20:9941478-9941602 NA NA NA NA NA chr20-39 9911312 9911547 158 - chr20:9911395-9911473 NA NA NA NA NA chr20-6 983774 984049 158 - chr20:983903-983938 NA NA NA NA NA chr20-38 9277026 9277456 216 - chr20:9277307-9277315 NA NA NA NA NA chr20-37 9240397 9240711 205 - chr20:9240549-9240688 NA NA NA NA NA chr20-36 9202055 9202314 132 - chr20:9202170-9202181 NA NA NA NA NA chr20-35 9161273 9161524 142 - chr20:9161372-9161410 NA NA NA NA NA chr20-5 893750 893994 164 - chr20:893828-893913 NA NA NA NA NA chr20-34 8930521 8930873 210 - chr20:8930618-8930678 NA NA NA NA NA chr20-33 8720370 8720639 159 - chr20:8720473-8720515 NA NA NA NA NA chr20-32 8571559 8571769 148 - chr20:8571657-8571725 NA NA NA NA NA chr20-31 7773446 7774191 462 - chr20:7773823-7773848 NA NA NA NA NA chr20-30 7673052 7673245 147 - chr20:7673101-7673205 NA NA NA NA NA chr20-29 7602033 7602325 166 - chr20:7602176-7602233 NA NA NA NA NA chr20-4 745763 745926 125 - chr20:745859-745917 NA NA NA NA NA chr20-28 7396677 7396855 130 - chr20:7396753-7396821 NA NA NA NA NA chr20-27 7138523 7138780 188 - chr20:7138530-7138680 NA NA NA NA NA chr20-26 7069474 7069767 197 - chr20:7069610-7069751 NA NA NA NA NA chr20-25 6767020 6767205 170 - chr20:6767055-6767200 NA NA NA NA NA chr20-24 6762093 6762436 323 - chr20:6762121-6762434 NA NA NA NA NA chr20-344 63841466 63841994 328 - chr20:63841580-63841622 NA NA NA NA NA chr20-343 63591120 63591476 203 - chr20:63591319-63591415 NA NA NA NA NA chr20-342 63544677 63544927 152 - chr20:63544773-63544828 NA NA NA NA NA chr20-341 63532745 63533035 198 - chr20:63532939-63532994 NA NA NA NA NA chr20-340 63212361 63212728 242 - chr20:63212491-63212644 NA NA NA NA NA chr20-339 63203229 63203467 151 - chr20:63203303-63203354 NA NA NA NA NA chr20-338 62969982 62970314 272 - chr20:62970009-62970251 NA NA NA NA NA chr20-337 62444325 62444521 151 - chr20:62444361-62444422 NA NA NA NA NA chr20-336 62418673 62418968 152 - chr20:62418819-62418831 NA NA NA NA NA chr20-23 6238036 6238238 148 - chr20:6238093-6238190 NA NA NA NA NA chr20-22 6193196 6193613 198 - chr20:6193465-6193494 NA NA NA NA NA chr20-335 61780987 61781255 153 - chr20:61781105-61781146 NA NA NA NA NA chr20-334 61486370 61486672 169 - chr20:61486525-61486550 NA NA NA NA NA chr20-333 61197580 61197756 166 - chr20:61197587-61197748 NA NA NA NA NA chr20-21 6063055 6063419 326 - chr20:6063090-6063397 NA NA NA NA NA chr20-332 60045624 60046257 408 - chr20:60045876-60046086 NA NA NA NA NA chr20-331 59816437 59816813 214 - chr20:59816483-59816593 NA NA NA NA NA chr20-330 59741077 59741376 155 - chr20:59741227-59741244 NA NA NA NA NA chr20-329 59698957 59699261 147 - chr20:59699090-59699092 NA NA NA NA NA chr20-328 59688221 59688480 147 - chr20:59688318-59688338 NA NA NA NA NA chr20-327 59597181 59597353 161 - chr20:59597213-59597352 NA NA NA NA NA chr20-326 59512967 59513154 127 - chr20:59513010-59513107 NA NA NA NA NA chr20-325 59486976 59487443 261 - chr20:59487168-59487326 NA NA NA NA NA chr20-324 59345597 59346254 309 - chr20:59345753-59345912 NA NA NA NA NA chr20-323 59274858 59275307 207 - chr20:59274978-59275004 NA NA NA NA NA chr20-322 59258511 59259062 374 - chr20:59258590-59259034 NA NA NA NA NA chr20-321 58990636 58990831 169 - chr20:58990647-58990803 NA NA NA NA NA chr20-320 58322716 58323069 250 - chr20:58322933-58322977 NA NA NA NA NA chr20-319 58081708 58081878 148 - chr20:58081730-58081834 NA NA NA NA NA chr20-318 57966686 57967018 194 - chr20:57966756-57966881 NA NA NA NA NA chr20-317 57919838 57920113 155 - chr20:57919959-57919995 NA NA NA NA NA chr20-316 57718282 57718761 270 - chr20:57718471-57718512 NA NA NA NA NA chr20-315 57640278 57640553 149 - chr20:57640404-57640427 NA NA NA NA NA chr20-314 57631013 57631280 163 - chr20:57631105-57631152 NA NA NA NA NA chr20-313 57623059 57623327 192 - chr20:57623174-57623319 NA NA NA NA NA chr20-312 57567228 57567453 152 - chr20:57567301-57567380 NA NA NA NA NA chr20-311 57214065 57214665 315 - chr20:57214374-57214428 NA NA NA NA NA chr20-310 57199815 57200109 175 - chr20:57199938-57199992 NA NA NA NA NA chr20-309 57052374 57052618 199 - chr20:57052465-57052596 NA NA NA NA NA chr20-308 56999069 56999373 181 - chr20:56999128-56999218 NA NA NA NA NA chr20-307 56964040 56964498 228 - chr20:56964222-56964244 NA NA NA NA NA chr20-306 56615875 56616082 157 - chr20:56615921-56616024 NA NA NA NA NA chr20-305 56561014 56561170 113 - chr20:56561075-56561163 NA NA NA NA NA chr20-304 56546691 56547069 253 - chr20:56546902-56546987 NA NA NA NA NA chr20-303 56497386 56497872 266 - chr20:56497684-56497808 NA NA NA NA NA chr20-302 56431559 56431886 239 - chr20:56431637-56431778 NA NA NA NA NA chr20-301 56245138 56245358 119 - chr20:56245221-56245248 NA NA NA NA NA chr20-300 56102885 56103247 215 - chr20:56102978-56102992 NA NA NA NA NA chr20-299 56067442 56067680 173 - chr20:56067529-56067626 NA NA NA NA NA chr20-298 55957875 55958040 157 - chr20:55957886-55958039 NA NA NA NA NA chr20-297 55799851 55800138 248 - chr20:55799958-55800128 NA NA NA NA NA chr20-296 55788700 55788851 141 - chr20:55788720-55788841 NA NA NA NA NA chr20-295 55773421 55773735 172 - chr20:55773567-55773668 NA NA NA NA NA chr20-294 55685760 55686255 305 - chr20:55685976-55686078 NA NA NA NA NA chr20-293 55625775 55625964 145 - chr20:55625791-55625864 NA NA NA NA NA chr20-292 55584799 55584938 112 - chr20:55584858-55584916 NA NA NA NA NA chr20-291 55530467 55530877 235 - chr20:55530598-55530614 NA NA NA NA NA chr20-290 55267973 55268214 148 - chr20:55268068-55268125 NA NA NA NA NA chr20-289 55218839 55219096 139 - chr20:55218943-55218950 NA NA NA NA NA chr20-288 55145597 55145758 133 - chr20:55145638-55145756 NA NA NA NA NA chr20-287 55047804 55048089 158 - chr20:55047913-55047953 NA NA NA NA NA chr20-286 54846988 54847156 141 - chr20:54847020-54847139 NA NA NA NA NA chr20-285 54823540 54823845 181 - chr20:54823622-54823700 NA NA NA NA NA chr20-284 54663158 54663491 215 - chr20:54663259-54663339 NA NA NA NA NA chr20-283 54477633 54478140 255 - chr20:54477642-54477771 NA NA NA NA NA chr20-282 54368350 54368600 143 - chr20:54368452-54368483 NA NA NA NA NA chr20-281 54367817 54367991 152 - chr20:54367842-54367975 NA NA NA NA NA chr20-280 54344697 54345159 309 - chr20:54344999-54345152 NA NA NA NA NA chr20-279 54144021 54144342 201 - chr20:54144022-54144163 NA NA NA NA NA chr20-278 53928935 53929222 239 - chr20:53928978-53929193 NA NA NA NA NA chr20-277 53756361 53756512 127 - chr20:53756383-53756498 NA NA NA NA NA chr20-276 53683855 53684613 352 - chr20:53684316-53684317 NA NA NA NA NA chr20-275 53576424 53576603 112 - chr20:53576563-53576572 NA NA NA NA NA chr20-274 53569018 53569468 206 - chr20:53569308-53569316 NA NA NA NA NA chr20-273 53503001 53503222 149 - chr20:53503077-53503158 NA NA NA NA NA chr20-272 53500396 53500658 150 - chr20:53500552-53500568 NA NA NA NA NA chr20-271 53494845 53495109 209 - chr20:53494877-53495008 NA NA NA NA NA chr20-270 53395234 53395493 156 - chr20:53395338-53395392 NA NA NA NA NA chr20-269 53361479 53361680 161 - chr20:53361503-53361632 NA NA NA NA NA chr20-268 53300166 53300500 243 - chr20:53300335-53300448 NA NA NA NA NA chr20-267 53071596 53071829 160 - chr20:53071683-53071763 NA NA NA NA NA chr20-266 52779934 52780268 214 - chr20:52780188-52780215 NA NA NA NA NA chr20-265 52379192 52379652 315 - chr20:52379238-52379309 NA NA NA NA NA chr20-264 52325806 52326330 318 - chr20:52326031-52326123 NA NA NA NA NA chr20-263 52168603 52168889 198 - chr20:52168606-52168760 NA NA NA NA NA chr20-262 51977293 51977574 158 - chr20:51977414-51977450 NA NA NA NA NA chr20-261 51735799 51736048 156 - chr20:51735890-51735954 NA NA NA NA NA chr20-260 51707009 51707224 173 - chr20:51707047-51707180 NA NA NA NA NA chr20-259 51582093 51582297 153 - chr20:51582108-51582228 NA NA NA NA NA chr20-258 51484786 51484966 144 - chr20:51484842-51484940 NA NA NA NA NA chr20-257 51452877 51453160 201 - chr20:51453004-51453056 NA NA NA NA NA chr20-256 51388571 51388988 271 - chr20:51388726-51388831 NA NA NA NA NA chr20-255 51294482 51294909 355 - chr20:51294499-51294818 NA NA NA NA NA chr20-254 51200908 51201125 129 - chr20:51200968-51201023 NA NA NA NA NA chr20-253 50965107 50965467 196 - chr20:50965197-50965266 NA NA NA NA NA chr20-252 50949886 50950138 159 - chr20:50949973-50950042 NA NA NA NA NA chr20-251 50843492 50843974 280 - chr20:50843760-50843805 NA NA NA NA NA chr20-250 50740698 50741099 201 - chr20:50740907-50740930 NA NA NA NA NA chr20-249 50678747 50678946 153 - chr20:50678799-50678912 NA NA NA NA NA chr20-248 50635337 50635653 229 - chr20:50635442-50635497 NA NA NA NA NA chr20-247 50575329 50575742 296 - chr20:50575449-50575638 NA NA NA NA NA chr20-246 50524098 50524559 211 - chr20:50524389-50524391 NA NA NA NA NA chr20-245 50510080 50510244 128 - chr20:50510162-50510231 NA NA NA NA NA chr20-244 50427666 50427823 115 - chr20:50427700-50427794 NA NA NA NA NA chr20-243 50208756 50209160 305 - chr20:50208879-50209073 NA NA NA NA NA chr20-242 50205857 50206064 192 - chr20:50205871-50206033 NA NA NA NA NA chr20-241 49975778 49976055 237 - chr20:49975782-49975939 NA NA NA NA NA chr20-240 49933598 49933982 189 - chr20:49933828-49933857 NA NA NA NA NA chr20-239 49903957 49904126 156 - chr20:49903970-49904113 NA NA NA NA NA chr20-238 49846308 49846491 171 - chr20:49846341-49846488 NA NA NA NA NA chr20-237 49696222 49696879 472 - chr20:49696238-49696678 NA NA NA NA NA chr20-236 49565286 49565565 242 - chr20:49565385-49565553 NA NA NA NA NA chr20-235 49558996 49559436 293 - chr20:49559287-49559361 NA NA NA NA NA chr20-234 49553155 49553443 152 - chr20:49553338-49553401 NA NA NA NA NA chr20-20 4950578 4950852 202 - chr20:4950610-4950668 NA NA NA NA NA chr20-233 49497112 49497505 257 - chr20:49497344-49497417 NA NA NA NA NA chr20-232 49399077 49399399 177 - chr20:49399208-49399226 NA NA NA NA NA chr20-231 49302722 49302872 142 - chr20:49302726-49302862 NA NA NA NA NA chr20-230 49266365 49266677 153 - chr20:49266533-49266536 NA NA NA NA NA chr20-229 49231511 49231701 159 - chr20:49231554-49231694 NA NA NA NA NA chr20-228 49075369 49076191 482 - chr20:49075851-49076159 NA NA NA NA NA chr20-227 49057473 49057658 147 - chr20:49057505-49057617 NA NA NA NA NA chr20-226 48852946 48853261 169 - chr20:48853038-48853100 NA NA NA NA NA chr20-225 48819469 48819696 133 - chr20:48819603-48819682 NA NA NA NA NA chr20-224 48480008 48480426 236 - chr20:48480128-48480273 NA NA NA NA NA chr20-223 48362608 48362931 212 - chr20:48362635-48362778 NA NA NA NA NA chr20-222 48104527 48105021 261 - chr20:48104870-48105008 NA NA NA NA NA chr20-221 47734396 47734786 236 - chr20:47734544-47734786 NA NA NA NA NA chr20-220 47548052 47548279 166 - chr20:47548092-47548176 NA NA NA NA NA chr20-219 47468227 47468456 136 - chr20:47468282-47468344 NA NA NA NA NA chr20-218 47368415 47368574 148 - chr20:47368426-47368563 NA NA NA NA NA chr20-217 47272516 47272757 150 - chr20:47272605-47272665 NA NA NA NA NA chr20-216 47095924 47096294 223 - chr20:47096058-47096082 NA NA NA NA NA chr20-215 46983925 46984203 190 - chr20:46984035-46984159 NA NA NA NA NA chr20-214 46924757 46925040 157 - chr20:46924845-46924895 NA NA NA NA NA chr20-213 46796590 46796765 157 - chr20:46796602-46796744 NA NA NA NA NA chr20-212 46781922 46782155 212 - chr20:46781983-46782154 NA NA NA NA NA chr20-211 46134746 46134974 165 - chr20:46134807-46134907 NA NA NA NA NA chr20-210 45923249 45923417 129 - chr20:45923260-45923322 NA NA NA NA NA chr20-209 45886007 45886267 166 - chr20:45886111-45886178 NA NA NA NA NA chr20-208 45836520 45836918 232 - chr20:45836558-45836707 NA NA NA NA NA chr20-207 45751146 45751337 142 - chr20:45751198-45751294 NA NA NA NA NA chr20-206 45677028 45677377 212 - chr20:45677140-45677190 NA NA NA NA NA chr20-205 45620909 45621123 145 - chr20:45620988-45621059 NA NA NA NA NA chr20-204 45530259 45530705 325 - chr20:45530422-45530692 NA NA NA NA NA chr20-203 45323652 45324168 333 - chr20:45323744-45323803 NA NA NA NA NA chr20-202 45231145 45231459 173 - chr20:45231260-45231305 NA NA NA NA NA chr20-201 44919495 44919820 199 - chr20:44919546-44919682 NA NA NA NA NA chr20-200 44820164 44820368 176 - chr20:44820202-44820364 NA NA NA NA NA chr20-199 44321472 44321767 118 - chr20:44321710-44321712 NA NA NA NA NA chr20-198 44302816 44303022 156 - chr20:44302879-44302998 NA NA NA NA NA chr20-197 44289546 44289811 150 - chr20:44289655-44289693 NA NA NA NA NA chr20-196 44164006 44164402 234 - chr20:44164126-44164156 NA NA NA NA NA chr20-195 43613143 43613332 118 - chr20:43613238-43613309 NA NA NA NA NA chr20-194 43555124 43555548 332 - chr20:43555169-43555317 NA NA NA NA NA chr20-193 43485152 43485344 158 - chr20:43485192-43485313 NA NA NA NA NA chr20-192 43227720 43227973 152 - chr20:43227805-43227864 NA NA NA NA NA chr20-191 42829576 42829800 129 - chr20:42829647-42829693 NA NA NA NA NA chr20-190 42777469 42777694 136 - chr20:42777532-42777553 NA NA NA NA NA chr20-189 42603517 42603697 113 - chr20:42603561-42603584 NA NA NA NA NA chr20-188 42098840 42099118 257 - chr20:42098903-42099118 NA NA NA NA NA chr20-187 41942969 41943134 148 - chr20:41942988-41943118 NA NA NA NA NA chr20-186 41833547 41833830 172 - chr20:41833678-41833759 NA NA NA NA NA chr20-185 41819603 41819943 179 - chr20:41819722-41819761 NA NA NA NA NA chr20-184 41813324 41813690 190 - chr20:41813543-41813600 NA NA NA NA NA chr20-19 4177529 4177689 153 - chr20:4177539-4177688 NA NA NA NA NA chr20-183 41759192 41759371 148 - chr20:41759236-41759322 NA NA NA NA NA chr20-182 41755637 41755830 142 - chr20:41755644-41755684 NA NA NA NA NA chr20-181 41517788 41517947 128 - chr20:41517851-41517917 NA NA NA NA NA chr20-180 41442624 41442878 166 - chr20:41442725-41442816 NA NA NA NA NA chr20-179 41108678 41108961 155 - chr20:41108807-41108835 NA NA NA NA NA chr20-178 41031123 41031351 158 - chr20:41031192-41031279 NA NA NA NA NA chr20-177 40974723 40975086 233 - chr20:40974857-40974958 NA NA NA NA NA chr20-176 40915071 40915255 160 - chr20:40915103-40915235 NA NA NA NA NA chr20-175 40861832 40862103 189 - chr20:40861948-40862096 NA NA NA NA NA chr20-174 40455184 40455459 163 - chr20:40455290-40455335 NA NA NA NA NA chr20-173 40371347 40371767 200 - chr20:40371600-40371613 NA NA NA NA NA chr20-172 40235983 40236235 164 - chr20:40236063-40236131 NA NA NA NA NA chr20-171 39820247 39820506 154 - chr20:39820340-39820395 NA NA NA NA NA chr20-170 39772465 39772613 130 - chr20:39772492-39772613 NA NA NA NA NA chr20-169 39765866 39766200 162 - chr20:39766055-39766062 NA NA NA NA NA chr20-168 39639769 39640062 165 - chr20:39639905-39639938 NA NA NA NA NA chr20-167 39575830 39576057 147 - chr20:39575908-39575976 NA NA NA NA NA chr20-166 39550726 39550999 142 - chr20:39550866-39550886 NA NA NA NA NA chr20-165 39519767 39519985 156 - chr20:39519836-39519937 NA NA NA NA NA chr20-164 39377377 39377910 402 - chr20:39377487-39377627 NA NA NA NA NA chr20-18 3920379 3920673 170 - chr20:3920459-3920523 NA NA NA NA NA chr20-163 39065852 39066059 140 - chr20:39065939-39066002 NA NA NA NA NA chr20-162 38868883 38869128 209 - chr20:38868913-38869089 NA NA NA NA NA chr20-161 38814714 38815001 236 - chr20:38814725-38814870 NA NA NA NA NA chr20-160 38235803 38236142 217 - chr20:38235841-38235978 NA NA NA NA NA chr20-159 38115778 38115937 142 - chr20:38115787-38115904 NA NA NA NA NA chr20-158 37915016 37915311 181 - chr20:37915131-37915199 NA NA NA NA NA chr20-157 37800396 37800706 156 - chr20:37800617-37800686 NA NA NA NA NA chr20-156 37791129 37791390 157 - chr20:37791229-37791278 NA NA NA NA NA chr20-155 37288130 37288351 125 - chr20:37288271-37288348 NA NA NA NA NA chr20-154 37145118 37145362 149 - chr20:37145219-37145270 NA NA NA NA NA chr20-153 37013447 37013831 182 - chr20:37013679-37013687 NA NA NA NA NA chr20-152 36923223 36923439 150 - chr20:36923285-36923371 NA NA NA NA NA chr20-151 36721917 36722221 192 - chr20:36721937-36722063 NA NA NA NA NA chr20-150 36701047 36701421 197 - chr20:36701252-36701300 NA NA NA NA NA chr20-149 36458577 36458879 160 - chr20:36458717-36458733 NA NA NA NA NA chr20-148 36408156 36408589 222 - chr20:36408171-36408324 NA NA NA NA NA chr20-147 36097968 36098362 198 - chr20:36098062-36098115 NA NA NA NA NA chr20-146 36070400 36070925 259 - chr20:36070513-36070639 NA NA NA NA NA chr20-145 35905954 35906153 129 - chr20:35905975-35905985 NA NA NA NA NA chr20-17 3580958 3581292 257 - chr20:3581124-3581280 NA NA NA NA NA chr20-144 35746684 35747034 326 - chr20:35746698-35747005 NA NA NA NA NA chr20-143 35571679 35571876 157 - chr20:35571739-35571846 NA NA NA NA NA chr20-142 35485458 35485771 206 - chr20:35485462-35485599 NA NA NA NA NA chr20-141 35243244 35243405 146 - chr20:35243257-35243389 NA NA NA NA NA chr20-140 34875853 34876116 158 - chr20:34875950-34876004 NA NA NA NA NA chr20-139 34873779 34874181 236 - chr20:34873847-34874000 NA NA NA NA NA chr20-138 34768657 34768865 181 - chr20:34768708-34768836 NA NA NA NA NA chr20-137 34721261 34721409 130 - chr20:34721315-34721409 NA NA NA NA NA chr20-136 34678338 34678569 159 - chr20:34678422-34678503 NA NA NA NA NA chr20-135 34461776 34462077 218 - chr20:34462002-34462054 NA NA NA NA NA chr20-134 34440422 34440842 280 - chr20:34440502-34440582 NA NA NA NA NA chr20-133 34396594 34396998 185 - chr20:34396703-34396724 NA NA NA NA NA chr20-132 34392411 34393035 324 - chr20:34392653-34392804 NA NA NA NA NA chr20-131 33707648 33707905 214 - chr20:33707648-33707776 NA NA NA NA NA chr20-130 33615000 33615306 205 - chr20:33615148-33615299 NA NA NA NA NA chr20-129 33549503 33549683 151 - chr20:33549540-33549658 NA NA NA NA NA chr20-128 33256025 33256516 270 - chr20:33256309-33256421 NA NA NA NA NA chr20-16 3321216 3321567 199 - chr20:3321405-3321489 NA NA NA NA NA chr20-127 32954148 32954443 197 - chr20:32954189-32954337 NA NA NA NA NA chr20-15 3295075 3295383 236 - chr20:3295144-3295344 NA NA NA NA NA chr20-126 32933857 32934237 241 - chr20:32934083-32934167 NA NA NA NA NA chr20-125 32856363 32856554 165 - chr20:32856401-32856534 NA NA NA NA NA chr20-124 32714569 32714761 171 - chr20:32714582-32714724 NA NA NA NA NA chr20-123 32610353 32610610 155 - chr20:32610429-32610495 NA NA NA NA NA chr20-122 32600695 32601072 302 - chr20:32600920-32601072 NA NA NA NA NA chr20-121 32433888 32434050 154 - chr20:32433889-32434039 NA NA NA NA NA chr20-120 32318625 32318822 146 - chr20:32318671-32318761 NA NA NA NA NA chr20-119 32316224 32316590 214 - chr20:32316382-32316535 NA NA NA NA NA chr20-118 32129752 32130257 241 - chr20:32130005-32130038 NA NA NA NA NA chr20-117 32037145 32037347 170 - chr20:32037170-32037276 NA NA NA NA NA chr20-116 31940579 31940848 151 - chr20:31940699-31940731 NA NA NA NA NA chr20-115 31807331 31807488 149 - chr20:31807348-31807481 NA NA NA NA NA chr20-114 31694606 31695078 242 - chr20:31694668-31694738 NA NA NA NA NA chr20-113 31615444 31615771 253 - chr20:31615632-31615754 NA NA NA NA NA chr20-112 31502337 31502773 280 - chr20:31502427-31502485 NA NA NA NA NA chr20-111 31457019 31457424 242 - chr20:31457128-31457153 NA NA NA NA NA chr20-110 31328814 31329010 142 - chr20:31328844-31328959 NA NA NA NA NA chr20-109 31251116 31251474 185 - chr20:31251319-31251366 NA NA NA NA NA chr20-108 31054261 31054440 143 - chr20:31054291-31054415 NA NA NA NA NA chr20-14 2826367 2826633 164 - chr20:2826451-2826522 NA NA NA NA NA chr20-13 2727748 2727924 151 - chr20:2727775-2727900 NA NA NA NA NA chr20-3 258147 258369 188 - chr20:258211-258350 NA NA NA NA NA chr20-107 25232830 25233192 164 - chr20:25232926-25232943 NA NA NA NA NA chr20-106 25027835 25028058 112 - chr20:25027912-25027930 NA NA NA NA NA chr20-12 2484829 2485137 278 - chr20:2484891-2485109 NA NA NA NA NA chr20-105 24734774 24735049 165 - chr20:24734878-24734927 NA NA NA NA NA chr20-104 24630474 24630644 158 - chr20:24630477-24630611 NA NA NA NA NA chr20-103 24460560 24460783 169 - chr20:24460690-24460751 NA NA NA NA NA chr20-102 24249519 24249826 220 - chr20:24249645-24249817 NA NA NA NA NA chr20-101 24047031 24047229 140 - chr20:24047081-24047167 NA NA NA NA NA chr20-100 23928028 23928605 257 - chr20:23928126-23928174 NA NA NA NA NA chr20-99 23626510 23626726 177 - chr20:23626568-23626725 NA NA NA NA NA chr20-98 22946891 22947301 207 - chr20:22946925-22946984 NA NA NA NA NA chr20-97 22310747 22310982 174 - chr20:22310816-22310937 NA NA NA NA NA chr20-96 22302599 22302793 140 - chr20:22302656-22302745 NA NA NA NA NA chr20-95 22284388 22284854 210 - chr20:22284482-22284517 NA NA NA NA NA chr20-94 22246341 22246620 168 - chr20:22246442-22246489 NA NA NA NA NA chr20-93 22216393 22216625 114 - chr20:22216394-22216449 NA NA NA NA NA chr20-92 21977217 21977492 197 - chr20:21977220-21977378 NA NA NA NA NA chr20-91 21818112 21818426 200 - chr20:21818250-21818311 NA NA NA NA NA chr20-90 21784661 21784903 127 - chr20:21784792-21784820 NA NA NA NA NA chr20-89 20581039 20581410 225 - chr20:20581050-20581202 NA NA NA NA NA chr20-88 20574652 20574962 166 - chr20:20574785-20574796 NA NA NA NA NA chr20-87 20541731 20541885 147 - chr20:20541738-20541878 NA NA NA NA NA chr20-86 20471037 20471258 166 - chr20:20471044-20471179 NA NA NA NA NA chr20-85 20181419 20181621 157 - chr20:20181467-20181582 NA NA NA NA NA chr20-84 20085482 20085776 148 - chr20:20085630-20085634 NA NA NA NA NA chr20-83 19659329 19659739 247 - chr20:19659526-19659555 NA NA NA NA NA chr20-82 18857686 18857876 141 - chr20:18857815-18857867 NA NA NA NA NA chr20-81 18410139 18410384 150 - chr20:18410238-18410291 NA NA NA NA NA chr20-80 18096131 18096571 276 - chr20:18096270-18096357 NA NA NA NA NA chr20-79 18068742 18068899 141 - chr20:18068754-18068887 NA NA NA NA NA chr20-78 17989667 17989936 150 - chr20:17989752-17989800 NA NA NA NA NA chr20-77 17969750 17970165 204 - chr20:17969993-17970018 NA NA NA NA NA chr20-76 17720595 17721071 278 - chr20:17720745-17720777 NA NA NA NA NA chr20-11 1751792 1752088 181 - chr20:1751845-1751924 NA NA NA NA NA chr20-75 17360839 17361006 138 - chr20:17360862-17360974 NA NA NA NA NA chr20-74 17129751 17129963 167 - chr20:17129801-17129928 NA NA NA NA NA chr20-73 17017009 17017178 144 - chr20:17017030-17017151 NA NA NA NA NA chr20-72 17001789 17001983 142 - chr20:17001819-17001935 NA NA NA NA NA chr20-71 16966140 16966486 183 - chr20:16966297-16966335 NA NA NA NA NA chr20-70 16939354 16939557 162 - chr20:16939395-16939516 NA NA NA NA NA chr20-10 1679779 1680071 191 - chr20:1679872-1679954 NA NA NA NA NA chr20-69 16732561 16732799 144 - chr20:16732651-16732703 NA NA NA NA NA chr20-68 16626383 16626598 153 - chr20:16626421-16626524 NA NA NA NA NA chr20-67 16444428 16444710 186 - chr20:16444446-16444575 NA NA NA NA NA chr20-9 1621101 1621365 143 - chr20:1621228-1621247 NA NA NA NA NA chr20-8 1552239 1552625 307 - chr20:1552334-1552483 NA NA NA NA NA chr20-66 14744337 14744538 149 - chr20:14744385-14744484 NA NA NA NA NA chr20-2 144732 144989 161 - chr20:144829-144895 NA NA NA NA NA chr20-65 14432981 14433357 234 - chr20:14433190-14433353 NA NA NA NA NA chr20-64 14421261 14421502 158 - chr20:14421339-14421409 NA NA NA NA NA chr20-63 14411442 14411669 191 - chr20:14411447-14411571 NA NA NA NA NA chr20-62 14369989 14370167 120 - chr20:14369993-14370034 NA NA NA NA NA chr20-61 14055153 14055331 157 - chr20:14055172-14055309 NA NA NA NA NA chr20-60 13932074 13932251 134 - chr20:13932105-13932202 NA NA NA NA NA chr20-59 13720439 13720705 152 - chr20:13720561-13720595 NA NA NA NA NA chr20-58 13569132 13569405 231 - chr20:13569132-13569279 NA NA NA NA NA chr20-57 13544809 13545061 177 - chr20:13544844-13544966 NA NA NA NA NA chr20-56 13470385 13470655 176 - chr20:13470519-13470538 NA NA NA NA NA chr20-55 13244554 13244916 179 - chr20:13244759-13244777 NA NA NA NA NA chr20-54 13197257 13197475 114 - chr20:13197307-13197344 NA NA NA NA NA chr20-53 12527263 12527552 157 - chr20:12527423-12527476 NA NA NA NA NA chr20-52 12284490 12284661 158 - chr20:12284491-12284642 NA NA NA NA NA chr20-51 12224048 12224428 222 - chr20:12224111-12224254 NA NA NA NA NA chr20-50 12020973 12021324 187 - chr20:12021057-12021120 NA NA NA NA NA chr20-49 11989196 11989417 192 - chr20:11989249-11989400 NA NA NA NA NA chr20-48 11970772 11970910 115 - chr20:11970774-11970845 NA NA NA NA NA chr20-7 1178396 1178680 149 - chr20:1178537-1178548 NA NA NA NA NA chr20-47 11263172 11263427 198 - chr20:11263245-11263329 NA NA NA NA NA chr20-46 11064856 11065070 139 - chr20:11064953-11065006 NA NA NA NA NA chr20-45 10983173 10983407 159 - chr20:10983252-10983334 NA NA NA NA NA chr20-44 10888536 10888790 141 - chr20:10888673-10888689 NA NA NA NA NA chr20-43 10601107 10601417 223 - chr20:10601204-10601350 NA NA NA NA NA chr20 104668 104841 140 - chr20:104708-104822 NA NA NA NA NA chr20-42 10346210 10346578 150 - chr20:10346430-10346471 NA NA NA NA NA chr20-41 10157524 10157820 154 - chr20:10157665-10157676 NA NA NA NA NA chr1-497 99982510 99982673 151 - chr1:99982527-99982671 NA NA NA NA NA chr1-496 99932707 99933069 222 - chr1:99932861-99932936 NA NA NA NA NA chr1-495 99687843 99688078 149 - chr1:99687931-99687996 NA NA NA NA NA chr1-494 99379914 99380220 155 - chr1:99380065-99380069 NA NA NA NA NA chr1-493 99330805 99331077 174 - chr1:99330873-99330964 NA NA NA NA NA chr1-492 99282963 99283337 307 - chr1:99283018-99283191 NA NA NA NA NA chr1-491 98900025 98900516 224 - chr1:98900167-98900187 NA NA NA NA NA chr1-490 98676514 98676800 196 - chr1:98676544-98676695 NA NA NA NA NA chr1-489 98440749 98441060 167 - chr1:98440896-98440917 NA NA NA NA NA chr1-488 98183190 98183481 215 - chr1:98183292-98183457 NA NA NA NA NA chr1-487 97979438 97979809 255 - chr1:97979473-97979641 NA NA NA NA NA chr1-486 97925860 97926150 152 - chr1:97925988-97926007 NA NA NA NA NA chr1-485 97871331 97871525 164 - chr1:97871373-97871501 NA NA NA NA NA chr1-484 97852221 97852459 156 - chr1:97852281-97852366 NA NA NA NA NA chr1-483 97764698 97764939 135 - chr1:97764793-97764811 NA NA NA NA NA chr1-482 97758747 97758990 173 - chr1:97758826-97758938 NA NA NA NA NA chr1-481 97582158 97582539 245 - chr1:97582170-97582316 NA NA NA NA NA chr1-480 97552141 97552454 165 - chr1:97552267-97552295 NA NA NA NA NA chr1-479 97503834 97504126 176 - chr1:97503901-97504019 NA NA NA NA NA chr1-478 97397636 97397797 149 - chr1:97397654-97397779 NA NA NA NA NA chr1-477 97341633 97342002 221 - chr1:97341734-97341760 NA NA NA NA NA chr1-476 97078868 97079141 159 - chr1:97078893-97078977 NA NA NA NA NA chr1-11 9707450 9707627 152 - chr1:9707476-9707604 NA NA NA NA NA chr1-475 96729354 96729647 152 - chr1:96729487-96729502 NA NA NA NA NA chr1-474 96675676 96675943 165 - chr1:96675764-96675834 NA NA NA NA NA chr1-473 96352706 96353103 185 - chr1:96352919-96352924 NA NA NA NA NA chr1-472 96254430 96254757 211 - chr1:96254433-96254586 NA NA NA NA NA chr1-471 96229777 96230209 227 - chr1:96229928-96229977 NA NA NA NA NA chr1-470 96008318 96008532 142 - chr1:96008376-96008453 NA NA NA NA NA chr1-469 95998883 95999067 172 - chr1:95998895-95999061 NA NA NA NA NA chr1-468 95894501 95894675 151 - chr1:95894531-95894666 NA NA NA NA NA chr1-467 95334392 95334591 121 - chr1:95334446-95334465 NA NA NA NA NA chr1-466 95249618 95250060 242 - chr1:95249882-95249892 NA NA NA NA NA chr1-465 95068309 95068540 179 - chr1:95068319-95068472 NA NA NA NA NA chr1-464 95035353 95035586 146 - chr1:95035441-95035501 NA NA NA NA NA chr1-463 94495212 94495605 229 - chr1:94495252-94495399 NA NA NA NA NA chr1-10 9444194 9444465 233 - chr1:9444245-9444402 NA NA NA NA NA chr1-462 94411884 94412161 157 - chr1:94412002-94412037 NA NA NA NA NA chr1-461 94307468 94307890 225 - chr1:94307589-94307625 NA NA NA NA NA chr1-460 94183825 94184110 159 - chr1:94183939-94183978 NA NA NA NA NA chr1-459 94059335 94059556 144 - chr1:94059404-94059475 NA NA NA NA NA chr1-458 93935943 93936284 227 - chr1:93935945-93936115 NA NA NA NA NA chr1-457 93707277 93707677 322 - chr1:93707374-93707540 NA NA NA NA NA chr1-456 93679578 93680107 375 - chr1:93679598-93679758 NA NA NA NA NA chr1-455 93631012 93631416 327 - chr1:93631243-93631416 NA NA NA NA NA chr1-454 93545649 93545846 138 - chr1:93545700-93545783 NA NA NA NA NA chr1-453 93461744 93461947 116 - chr1:93461843-93461884 NA NA NA NA NA chr1-452 93331518 93331682 156 - chr1:93331521-93331673 NA NA NA NA NA chr1-451 93293372 93293753 211 - chr1:93293597-93293693 NA NA NA NA NA chr1-450 93158592 93159134 284 - chr1:93158972-93159042 NA NA NA NA NA chr1-449 92927163 92927502 273 - chr1:92927166-92927310 NA NA NA NA NA chr1-448 92904223 92904455 113 - chr1:92904304-92904317 NA NA NA NA NA chr1-447 92820406 92820593 115 - chr1:92820558-92820561 NA NA NA NA NA chr1-446 92638650 92638944 159 - chr1:92638789-92638811 NA NA NA NA NA chr1-445 92572791 92573105 154 - chr1:92572998-92573039 NA NA NA NA NA chr1-444 92354489 92354674 171 - chr1:92354515-92354666 NA NA NA NA NA chr1-443 92343641 92343846 171 - chr1:92343699-92343824 NA NA NA NA NA chr1-442 92251265 92251551 200 - chr1:92251381-92251538 NA NA NA NA NA chr1-441 91227513 91227762 205 - chr1:91227543-91227690 NA NA NA NA NA chr1-440 91198719 91198877 114 - chr1:91198733-91198773 NA NA NA NA NA chr1-439 90846180 90846359 155 - chr1:90846210-90846338 NA NA NA NA NA chr1-438 90814881 90815052 119 - chr1:90814995-90815031 NA NA NA NA NA chr1-437 90657811 90658202 177 - chr1:90658021-90658091 NA NA NA NA NA chr1-436 90602319 90602586 154 - chr1:90602428-90602465 NA NA NA NA NA chr1-9 9027638 9028469 512 - chr1:9027990-9028081 NA NA NA NA NA chr1-435 89177011 89177488 282 - chr1:89177244-89177312 NA NA NA NA NA chr1-434 89115152 89115417 152 - chr1:89115263-89115303 NA NA NA NA NA chr1-8 8903672 8903980 163 - chr1:8903795-8903824 NA NA NA NA NA chr1-433 88988194 88988407 162 - chr1:88988245-88988356 NA NA NA NA NA chr1-432 88968684 88968975 247 - chr1:88968758-88968917 NA NA NA NA NA chr1-431 88571626 88571868 121 - chr1:88571713-88571730 NA NA NA NA NA chr1-430 88483098 88483287 155 - chr1:88483099-88483237 NA NA NA NA NA chr1-429 88450312 88450536 186 - chr1:88450367-88450534 NA NA NA NA NA chr1-428 88449547 88449839 220 - chr1:88449635-88449775 NA NA NA NA NA chr1-427 88228230 88228489 154 - chr1:88228337-88228388 NA NA NA NA NA chr1-426 88147016 88147362 205 - chr1:88147210-88147327 NA NA NA NA NA chr1-425 87814901 87815437 252 - chr1:87815002-87815103 NA NA NA NA NA chr1-424 87540987 87541306 234 - chr1:87541154-87541262 NA NA NA NA NA chr1-423 87469091 87469464 215 - chr1:87469317-87469340 NA NA NA NA NA chr1-422 87399716 87400012 184 - chr1:87399780-87399908 NA NA NA NA NA chr1-421 87372303 87372516 188 - chr1:87372315-87372465 NA NA NA NA NA chr1-420 87293034 87293305 165 - chr1:87293147-87293213 NA NA NA NA NA chr1-419 87088809 87089243 237 - chr1:87088846-87088966 NA NA NA NA NA chr1-7 8707902 8708544 314 - chr1:8708036-8708119 NA NA NA NA NA chr1-418 86998793 86999067 144 - chr1:86998931-86998941 NA NA NA NA NA chr1-6 8683118 8683283 153 - chr1:8683132-8683272 NA NA NA NA NA chr1-417 86652118 86652382 191 - chr1:86652119-86652273 NA NA NA NA NA chr1-416 86647102 86647348 131 - chr1:86647199-86647224 NA NA NA NA NA chr1-415 86635505 86635732 151 - chr1:86635577-86635654 NA NA NA NA NA chr1-414 86556195 86556502 203 - chr1:86556344-86556495 NA NA NA NA NA chr1-413 86037273 86037454 151 - chr1:86037307-86037426 NA NA NA NA NA chr1-412 86023434 86023698 166 - chr1:86023434-86023551 NA NA NA NA NA chr1-411 85668650 85669342 437 - chr1:85668817-85669288 NA NA NA NA NA chr1-410 85591780 85591993 150 - chr1:85591843-85591930 NA NA NA NA NA chr1-409 85151305 85151456 149 - chr1:85151306-85151454 NA NA NA NA NA chr1-408 85133739 85134041 161 - chr1:85133886-85133903 NA NA NA NA NA chr1-407 85032752 85032947 145 - chr1:85032786-85032889 NA NA NA NA NA chr1-406 84851625 84851864 119 - chr1:84851783-84851842 NA NA NA NA NA chr1-405 84796879 84797105 127 - chr1:84796998-84797016 NA NA NA NA NA chr1-404 84717966 84718237 193 - chr1:84718042-84718196 NA NA NA NA NA chr1-403 84706022 84706221 153 - chr1:84706074-84706178 NA NA NA NA NA chr1-402 84682349 84682668 240 - chr1:84682380-84682493 NA NA NA NA NA chr1-401 84676359 84676600 155 - chr1:84676459-84676542 NA NA NA NA NA chr1-400 84635077 84635284 147 - chr1:84635119-84635188 NA NA NA NA NA chr1-399 84515723 84515963 186 - chr1:84515829-84515937 NA NA NA NA NA chr1-398 84502446 84502599 121 - chr1:84502460-84502517 NA NA NA NA NA chr1-397 84471098 84471450 188 - chr1:84471330-84471436 NA NA NA NA NA chr1-396 84315368 84315590 160 - chr1:84315391-84315450 NA NA NA NA NA chr1-395 84048474 84048639 159 - chr1:84048482-84048637 NA NA NA NA NA chr1-394 83957859 83958128 203 - chr1:83957951-83958114 NA NA NA NA NA chr1-393 83880377 83880824 340 - chr1:83880400-83880549 NA NA NA NA NA chr1-392 83618978 83619194 152 - chr1:83619078-83619148 NA NA NA NA NA chr1-391 82881566 82881802 153 - chr1:82881645-82881711 NA NA NA NA NA chr1-390 82477459 82478054 341 - chr1:82477813-82477850 NA NA NA NA NA chr1-389 82053115 82053439 188 - chr1:82053265-82053310 NA NA NA NA NA chr1-388 82028397 82028741 261 - chr1:82028436-82028570 NA NA NA NA NA chr1-387 81986082 81986333 156 - chr1:81986180-81986244 NA NA NA NA NA chr1-386 81978101 81978515 250 - chr1:81978169-81978263 NA NA NA NA NA chr1-385 81733064 81733388 170 - chr1:81733241-81733280 NA NA NA NA NA chr1-384 81547586 81547843 182 - chr1:81547685-81547722 NA NA NA NA NA chr1-383 81530186 81530513 204 - chr1:81530369-81530469 NA NA NA NA NA chr1-382 81495977 81496284 284 - chr1:81495989-81496240 NA NA NA NA NA chr1-381 81384051 81384281 149 - chr1:81384114-81384191 NA NA NA NA NA chr1-380 81018655 81018818 153 - chr1:81018670-81018818 NA NA NA NA NA chr1-379 80847644 80847812 148 - chr1:80847663-80847790 NA NA NA NA NA chr1-378 80448888 80449112 136 - chr1:80448954-80449013 NA NA NA NA NA chr1-377 80388695 80388879 147 - chr1:80388718-80388835 NA NA NA NA NA chr1-376 80314744 80315148 221 - chr1:80314813-80314957 NA NA NA NA NA chr1-375 80286221 80286458 142 - chr1:80286290-80286311 NA NA NA NA NA chr1-374 80272059 80272399 250 - chr1:80272223-80272346 NA NA NA NA NA chr1-373 80254424 80254733 200 - chr1:80254581-80254720 NA NA NA NA NA chr1-372 80214579 80214741 157 - chr1:80214590-80214737 NA NA NA NA NA chr1-371 79773657 79774022 208 - chr1:79773864-79773890 NA NA NA NA NA chr1-370 79706492 79706685 149 - chr1:79706532-79706659 NA NA NA NA NA chr1-369 79611233 79611406 158 - chr1:79611250-79611392 NA NA NA NA NA chr1-368 79455610 79455833 128 - chr1:79455699-79455726 NA NA NA NA NA chr1-367 78982757 78983047 152 - chr1:78982898-78982915 NA NA NA NA NA chr1-366 78905332 78905813 244 - chr1:78905533-78905558 NA NA NA NA NA chr1-365 78660497 78660773 147 - chr1:78660626-78660644 NA NA NA NA NA chr1-364 78596002 78596454 205 - chr1:78596153-78596159 NA NA NA NA NA chr1-363 78504726 78505101 232 - chr1:78504831-78505031 NA NA NA NA NA chr1-362 78475169 78475415 173 - chr1:78475266-78475390 NA NA NA NA NA chr1-361 77815066 77815298 146 - chr1:77815162-77815217 NA NA NA NA NA chr1-360 77537912 77538437 301 - chr1:77538127-77538195 NA NA NA NA NA chr1-359 77435893 77436170 232 - chr1:77435906-77436061 NA NA NA NA NA chr1-358 77210549 77210893 187 - chr1:77210679-77210727 NA NA NA NA NA chr1-357 77138246 77138418 146 - chr1:77138268-77138401 NA NA NA NA NA chr1-356 77128211 77128593 222 - chr1:77128431-77128553 NA NA NA NA NA chr1-355 77094307 77094509 157 - chr1:77094347-77094454 NA NA NA NA NA chr1-354 76962244 76962605 217 - chr1:76962431-76962547 NA NA NA NA NA chr1-353 76871196 76871632 232 - chr1:76871404-76871430 NA NA NA NA NA chr1-352 76856279 76856677 224 - chr1:76856361-76856457 NA NA NA NA NA chr1-351 76741991 76742346 246 - chr1:76742126-76742289 NA NA NA NA NA chr1-350 76645107 76645436 280 - chr1:76645129-76645333 NA NA NA NA NA chr1-349 76400738 76400928 131 - chr1:76400835-76400888 NA NA NA NA NA chr1-348 76351252 76351462 124 - chr1:76351315-76351330 NA NA NA NA NA chr1-347 76215805 76216100 156 - chr1:76215936-76215957 NA NA NA NA NA chr1-346 76211935 76212135 129 - chr1:76211978-76212050 NA NA NA NA NA chr1-345 76196674 76196946 158 - chr1:76196789-76196834 NA NA NA NA NA chr1-344 76061617 76061916 255 - chr1:76061665-76061898 NA NA NA NA NA chr1-343 76019417 76019695 174 - chr1:76019483-76019605 NA NA NA NA NA chr1-342 75915682 75915874 185 - chr1:75915703-75915874 NA NA NA NA NA chr1-341 75740976 75741159 148 - chr1:75741014-75741130 NA NA NA NA NA chr1-340 75732641 75733002 197 - chr1:75732853-75732934 NA NA NA NA NA chr1-339 75599724 75600292 299 - chr1:75599973-75600013 NA NA NA NA NA chr1-338 75569458 75569716 178 - chr1:75569491-75569629 NA NA NA NA NA chr1-337 75309760 75310071 165 - chr1:75309895-75309903 NA NA NA NA NA chr1-336 75306140 75306341 145 - chr1:75306199-75306291 NA NA NA NA NA chr1-335 75292828 75293030 177 - chr1:75292848-75292995 NA NA NA NA NA chr1-334 75047559 75047995 256 - chr1:75047701-75047739 NA NA NA NA NA chr1-333 74363549 74363873 186 - chr1:74363672-74363705 NA NA NA NA NA chr1-332 74342717 74342932 170 - chr1:74342760-74342840 NA NA NA NA NA chr1-331 74337782 74337938 148 - chr1:74337792-74337931 NA NA NA NA NA chr1-330 74190444 74190798 267 - chr1:74190679-74190772 NA NA NA NA NA chr1-5 7401130 7401376 167 - chr1:7401205-7401289 NA NA NA NA NA chr1-329 73964608 73964858 166 - chr1:73964706-73964781 NA NA NA NA NA chr1-328 73783229 73783401 166 - chr1:73783230-73783385 NA NA NA NA NA chr1-327 73483363 73483677 218 - chr1:73483527-73483615 NA NA NA NA NA chr1-326 73350470 73350767 170 - chr1:73350618-73350682 NA NA NA NA NA chr1-325 73287592 73287759 159 - chr1:73287596-73287749 NA NA NA NA NA chr1-324 73184301 73184477 154 - chr1:73184324-73184457 NA NA NA NA NA chr1-323 72682200 72682355 115 - chr1:72682200-72682295 NA NA NA NA NA chr1-322 71954473 71954828 158 - chr1:71954524-71954558 NA NA NA NA NA chr1-321 71566815 71567099 145 - chr1:71566952-71566959 NA NA NA NA NA chr1-4 7150003 7150291 198 - chr1:7150117-7150270 NA NA NA NA NA chr1-320 71428791 71429086 165 - chr1:71428913-71428940 NA NA NA NA NA chr1-319 71403022 71403408 208 - chr1:71403144-71403187 NA NA NA NA NA chr1-318 71389535 71389799 166 - chr1:71389613-71389691 NA NA NA NA NA chr1-317 70917940 70918468 318 - chr1:70917940-70918153 NA NA NA NA NA chr1-316 70909182 70909376 160 - chr1:70909228-70909348 NA NA NA NA NA chr1-315 70871686 70871903 150 - chr1:70871753-70871836 NA NA NA NA NA chr1-314 70830736 70830955 119 - chr1:70830806-70830840 NA NA NA NA NA chr1-313 70423134 70423550 192 - chr1:70423402-70423414 NA NA NA NA NA chr1-312 70296972 70297181 145 - chr1:70297047-70297139 NA NA NA NA NA chr1-311 70143888 70144226 227 - chr1:70144071-70144151 NA NA NA NA NA chr1-310 70119387 70119670 175 - chr1:70119509-70119569 NA NA NA NA NA chr1-309 70030919 70031307 208 - chr1:70031037-70031075 NA NA NA NA NA chr1-308 70010489 70010928 189 - chr1:70010613-70010677 NA NA NA NA NA chr1-307 69828710 69829022 196 - chr1:69828728-69828866 NA NA NA NA NA chr1-306 69753863 69754176 162 - chr1:69754008-69754022 NA NA NA NA NA chr1-305 69721090 69721517 185 - chr1:69721142-69721180 NA NA NA NA NA chr1-304 69520089 69520499 345 - chr1:69520102-69520443 NA NA NA NA NA chr1-303 69498538 69498970 307 - chr1:69498746-69498803 NA NA NA NA NA chr1-302 69388752 69388936 152 - chr1:69388788-69388906 NA NA NA NA NA chr1-301 69085609 69085809 197 - chr1:69085609-69085800 NA NA NA NA NA chr1-300 68977735 68977900 159 - chr1:68977739-68977890 NA NA NA NA NA chr1-299 68846642 68846847 160 - chr1:68846686-68846800 NA NA NA NA NA chr1-298 68704852 68705084 146 - chr1:68704986-68705022 NA NA NA NA NA chr1-297 68545940 68546176 153 - chr1:68546017-68546090 NA NA NA NA NA chr1-296 68422365 68422653 138 - chr1:68422497-68422560 NA NA NA NA NA chr1-295 68181854 68182137 237 - chr1:68181988-68182133 NA NA NA NA NA chr1-294 67925814 67926112 212 - chr1:67925904-67926073 NA NA NA NA NA chr1-293 67925569 67925742 119 - chr1:67925642-67925726 NA NA NA NA NA chr1-292 67917912 67918375 435 - chr1:67917912-67918368 NA NA NA NA NA chr1-291 67737947 67738225 183 - chr1:67738069-67738184 NA NA NA NA NA chr1-290 67517582 67517750 156 - chr1:67517592-67517734 NA NA NA NA NA chr1-289 67328025 67328212 153 - chr1:67328079-67328188 NA NA NA NA NA chr1-288 67108624 67109160 307 - chr1:67108809-67108843 NA NA NA NA NA chr1-287 67016847 67017232 239 - chr1:67016966-67017132 NA NA NA NA NA chr1-286 66395694 66396083 285 - chr1:66395950-66396055 NA NA NA NA NA chr1-285 66376577 66376898 227 - chr1:66376605-66376771 NA NA NA NA NA chr1-284 65851795 65852191 201 - chr1:65851876-65851939 NA NA NA NA NA chr1-283 65805475 65805811 230 - chr1:65805475-65805652 NA NA NA NA NA chr1-282 65404583 65404866 242 - chr1:65404593-65404753 NA NA NA NA NA chr1-281 65372889 65373093 152 - chr1:65372924-65373050 NA NA NA NA NA chr1-280 65263305 65263463 145 - chr1:65263306-65263444 NA NA NA NA NA chr1-279 65251201 65251674 273 - chr1:65251469-65251624 NA NA NA NA NA chr1-278 65161425 65161657 133 - chr1:65161510-65161530 NA NA NA NA NA chr1-277 64582644 64582931 177 - chr1:64582782-64582818 NA NA NA NA NA chr1-276 64330963 64331177 157 - chr1:64331038-64331129 NA NA NA NA NA chr1-3 6421391 6421598 122 - chr1:6421542-6421546 NA NA NA NA NA chr1-275 63859260 63859589 162 - chr1:63859490-63859548 NA NA NA NA NA chr1-274 63784233 63784585 173 - chr1:63784372-63784386 NA NA NA NA NA chr1-273 63615769 63615942 121 - chr1:63615822-63615917 NA NA NA NA NA chr1-272 63475348 63475762 194 - chr1:63475490-63475503 NA NA NA NA NA chr1-271 63247507 63247710 186 - chr1:63247551-63247703 NA NA NA NA NA chr1-270 63176875 63177153 147 - chr1:63177010-63177024 NA NA NA NA NA chr1-269 62949013 62949282 162 - chr1:62949116-62949167 NA NA NA NA NA chr1-268 62856057 62856220 149 - chr1:62856069-62856205 NA NA NA NA NA chr1-267 62747262 62747524 225 - chr1:62747344-62747495 NA NA NA NA NA chr1-266 62471817 62472033 161 - chr1:62471844-62471995 NA NA NA NA NA chr1-265 62286577 62286799 123 - chr1:62286695-62286738 NA NA NA NA NA chr1-264 62148259 62148524 153 - chr1:62148381-62148417 NA NA NA NA NA chr1-263 61454362 61454584 145 - chr1:61454442-61454509 NA NA NA NA NA chr1-262 61403363 61403690 211 - chr1:61403389-61403529 NA NA NA NA NA chr1-261 61320551 61320792 156 - chr1:61320630-61320704 NA NA NA NA NA chr1-260 61272204 61272623 234 - chr1:61272469-61272598 NA NA NA NA NA chr1-259 61257899 61258410 326 - chr1:61258041-61258139 NA NA NA NA NA chr1-258 61214408 61214701 190 - chr1:61214425-61214555 NA NA NA NA NA chr1-257 60989112 60989404 172 - chr1:60989260-60989298 NA NA NA NA NA chr1-256 60987766 60988016 135 - chr1:60987889-60987917 NA NA NA NA NA chr1-255 60854779 60855000 158 - chr1:60854841-60854935 NA NA NA NA NA chr1-254 60737849 60738033 173 - chr1:60737867-60738018 NA NA NA NA NA chr1-253 60417167 60417452 185 - chr1:60417292-60417336 NA NA NA NA NA chr1-252 60311997 60312338 216 - chr1:60312042-60312053 NA NA NA NA NA chr1-251 59876891 59877156 154 - chr1:59877001-59877043 NA NA NA NA NA chr1-250 59593558 59593780 169 - chr1:59593631-59593737 NA NA NA NA NA chr1-249 59531567 59531967 228 - chr1:59531643-59531747 NA NA NA NA NA chr1-248 59127492 59127717 161 - chr1:59127546-59127633 NA NA NA NA NA chr1-247 59096755 59097039 186 - chr1:59096975-59097002 NA NA NA NA NA chr1-246 58788144 58788398 208 - chr1:58788267-58788383 NA NA NA NA NA chr1-245 58723563 58723755 153 - chr1:58723609-58723730 NA NA NA NA NA chr1-244 58544802 58545120 172 - chr1:58544900-58544950 NA NA NA NA NA chr1-243 58509690 58509886 149 - chr1:58509735-58509835 NA NA NA NA NA chr1-242 58198763 58199258 241 - chr1:58199094-58199155 NA NA NA NA NA chr1-241 58124031 58124364 203 - chr1:58124226-58124364 NA NA NA NA NA chr1-240 58120750 58121079 173 - chr1:58120921-58120953 NA NA NA NA NA chr1-239 57930960 57931368 217 - chr1:57931017-57931110 NA NA NA NA NA chr1-238 57465651 57465935 240 - chr1:57465725-57465877 NA NA NA NA NA chr1-237 57442960 57443451 344 - chr1:57443093-57443276 NA NA NA NA NA chr1-236 57329125 57329655 407 - chr1:57329177-57329338 NA NA NA NA NA chr1-235 57208974 57209240 143 - chr1:57209096-57209115 NA NA NA NA NA chr1-234 56990758 56991202 185 - chr1:56991104-56991117 NA NA NA NA NA chr1-233 56558790 56559273 213 - chr1:56559165-56559213 NA NA NA NA NA chr1-232 56556143 56556399 178 - chr1:56556226-56556331 NA NA NA NA NA chr1-231 56439508 56439715 165 - chr1:56439545-56439663 NA NA NA NA NA chr1-230 56341096 56341304 119 - chr1:56341205-56341255 NA NA NA NA NA chr1-229 56266564 56266878 241 - chr1:56266713-56266843 NA NA NA NA NA chr1-228 56265889 56266173 157 - chr1:56266004-56266040 NA NA NA NA NA chr1-227 55805818 55806054 212 - chr1:55805819-55805983 NA NA NA NA NA chr1-226 55674644 55674854 197 - chr1:55674651-55674822 NA NA NA NA NA chr1-225 55502926 55503247 165 - chr1:55503040-55503070 NA NA NA NA NA chr1-224 55456949 55457210 253 - chr1:55456956-55457200 NA NA NA NA NA chr1-223 55419879 55420074 164 - chr1:55419962-55420064 NA NA NA NA NA chr1-222 55257411 55257605 153 - chr1:55257460-55257580 NA NA NA NA NA chr1-221 55078425 55078625 129 - chr1:55078458-55078535 NA NA NA NA NA chr1-220 54977883 54978418 388 - chr1:54977928-54978209 NA NA NA NA NA chr1-219 54129226 54129387 151 - chr1:54129235-54129375 NA NA NA NA NA chr1-218 54063743 54063912 117 - chr1:54063781-54063872 NA NA NA NA NA chr1-217 53912382 53912601 159 - chr1:53912446-53912549 NA NA NA NA NA chr1-216 53451024 53451260 141 - chr1:53451107-53451159 NA NA NA NA NA chr1-215 53337587 53337849 157 - chr1:53337688-53337736 NA NA NA NA NA chr1-214 53281452 53281644 156 - chr1:53281476-53281602 NA NA NA NA NA chr1-213 53264620 53264969 166 - chr1:53264873-53264926 NA NA NA NA NA chr1-212 53014014 53014296 188 - chr1:53014138-53014217 NA NA NA NA NA chr1-211 52906137 52906462 307 - chr1:52906158-52906450 NA NA NA NA NA chr1-210 52650134 52650327 137 - chr1:52650180-52650247 NA NA NA NA NA chr1-209 52488304 52488497 122 - chr1:52488386-52488448 NA NA NA NA NA chr1-208 52487161 52487460 198 - chr1:52487303-52487441 NA NA NA NA NA chr1-207 52332872 52333115 150 - chr1:52332961-52333014 NA NA NA NA NA chr1-206 52211975 52212127 151 - chr1:52211975-52212124 NA NA NA NA NA chr1-205 52208865 52209056 125 - chr1:52208937-52208993 NA NA NA NA NA chr1-204 51810611 51810934 186 - chr1:51810782-51810814 NA NA NA NA NA chr1-203 51774235 51774484 155 - chr1:51774335-51774402 NA NA NA NA NA chr1-202 51513294 51513471 135 - chr1:51513386-51513454 NA NA NA NA NA chr1-201 51494921 51495209 200 - chr1:51495029-51495131 NA NA NA NA NA chr1-200 51444438 51444695 163 - chr1:51444530-51444646 NA NA NA NA NA chr1-199 51382042 51382215 140 - chr1:51382049-51382169 NA NA NA NA NA chr1-198 51272740 51272921 176 - chr1:51272741-51272914 NA NA NA NA NA chr1-197 50958434 50958892 232 - chr1:50958713-50958772 NA NA NA NA NA chr1-196 50842915 50843091 165 - chr1:50842919-50843062 NA NA NA NA NA chr1-195 50489427 50489685 149 - chr1:50489539-50489582 NA NA NA NA NA chr1-194 50388200 50388446 152 - chr1:50388284-50388347 NA NA NA NA NA chr1-193 50319077 50319237 116 - chr1:50319098-50319192 NA NA NA NA NA chr1-192 50209381 50209714 163 - chr1:50209517-50209527 NA NA NA NA NA chr1-191 50196272 50196512 158 - chr1:50196360-50196442 NA NA NA NA NA chr1-190 50165880 50166194 199 - chr1:50166031-50166122 NA NA NA NA NA chr1-189 50143826 50144022 162 - chr1:50143833-50143978 NA NA NA NA NA chr1-188 49560947 49561165 187 - chr1:49560971-49561096 NA NA NA NA NA chr1-187 49294521 49294934 193 - chr1:49294623-49294655 NA NA NA NA NA chr1-186 49092855 49093358 222 - chr1:49092875-49092921 NA NA NA NA NA chr1-185 48909224 48909607 200 - chr1:48909454-48909506 NA NA NA NA NA chr1-184 48878194 48878519 250 - chr1:48878246-48878398 NA NA NA NA NA chr1-183 48843918 48844111 150 - chr1:48843962-48844070 NA NA NA NA NA chr1-182 48805233 48805511 150 - chr1:48805362-48805385 NA NA NA NA NA chr1-181 48643073 48643269 165 - chr1:48643096-48643234 NA NA NA NA NA chr1-180 48418159 48418410 127 - chr1:48418241-48418293 NA NA NA NA NA chr1-179 48087029 48087518 223 - chr1:48087373-48087408 NA NA NA NA NA chr1-178 48010664 48010920 151 - chr1:48010768-48010813 NA NA NA NA NA chr1-177 46860675 46860981 248 - chr1:46860685-46860827 NA NA NA NA NA chr1-176 46817726 46818142 291 - chr1:46817829-46818006 NA NA NA NA NA chr1-175 46714777 46715135 212 - chr1:46714868-46714879 NA NA NA NA NA chr1-174 46339465 46339651 129 - chr1:46339498-46339546 NA NA NA NA NA chr1-173 46136555 46137271 428 - chr1:46136843-46136983 NA NA NA NA NA chr1-172 45988547 45988788 181 - chr1:45988592-45988743 NA NA NA NA NA chr1-171 45952235 45952473 166 - chr1:45952285-45952390 NA NA NA NA NA chr1-170 45906429 45906642 166 - chr1:45906474-45906594 NA NA NA NA NA chr1-169 45760051 45760421 213 - chr1:45760268-45760294 NA NA NA NA NA chr1-168 45661852 45662114 218 - chr1:45661885-45662081 NA NA NA NA NA chr1-167 45551179 45551504 269 - chr1:45551216-45551373 NA NA NA NA NA chr1-166 45503735 45503960 150 - chr1:45503812-45503889 NA NA NA NA NA chr1-165 45480984 45481163 123 - chr1:45481014-45481055 NA NA NA NA NA chr1-164 45471171 45471368 176 - chr1:45471195-45471353 NA NA NA NA NA chr1-163 45430819 45430973 116 - chr1:45430875-45430972 NA NA NA NA NA chr1-162 45219208 45219626 263 - chr1:45219480-45219548 NA NA NA NA NA chr1-161 45004173 45004459 149 - chr1:45004321-45004331 NA NA NA NA NA chr1-160 44401006 44401279 169 - chr1:44401120-44401195 NA NA NA NA NA chr1-159 43815173 43815348 157 - chr1:43815187-43815328 NA NA NA NA NA chr1-158 43730048 43730217 113 - chr1:43730069-43730154 NA NA NA NA NA chr1-157 43636272 43636545 182 - chr1:43636303-43636424 NA NA NA NA NA chr1-156 43493595 43493762 150 - chr1:43493612-43493745 NA NA NA NA NA chr1-2 4333577 4333825 159 - chr1:4333670-4333744 NA NA NA NA NA chr1-155 43083775 43084079 156 - chr1:43083927-43083933 NA NA NA NA NA chr1-154 42983066 42983319 189 - chr1:42983122-42983251 NA NA NA NA NA chr1-153 42856110 42856390 154 - chr1:42856231-42856254 NA NA NA NA NA chr1-152 42795855 42796087 174 - chr1:42795877-42796011 NA NA NA NA NA chr1-151 42607901 42608089 158 - chr1:42607913-42608050 NA NA NA NA NA chr1-150 42435976 42436329 200 - chr1:42436021-42436122 NA NA NA NA NA chr1-149 42268634 42268922 165 - chr1:42268771-42268806 NA NA NA NA NA chr1-148 42257952 42258132 147 - chr1:42257989-42258107 NA NA NA NA NA chr1-147 42202695 42202885 174 - chr1:42202720-42202862 NA NA NA NA NA chr1-146 42156205 42156414 183 - chr1:42156208-42156378 NA NA NA NA NA chr1-145 42126388 42126967 287 - chr1:42126819-42126943 NA NA NA NA NA chr1-144 41999092 41999371 192 - chr1:41999167-41999260 NA NA NA NA NA chr1-143 41993998 41994266 190 - chr1:41994124-41994212 NA NA NA NA NA chr1-142 41636344 41636489 116 - chr1:41636345-41636446 NA NA NA NA NA chr1-141 41310035 41310357 174 - chr1:41310123-41310179 NA NA NA NA NA chr1-140 41171242 41171754 264 - chr1:41171335-41171475 NA NA NA NA NA chr1-139 41119607 41119918 259 - chr1:41119607-41119762 NA NA NA NA NA chr1-138 41088738 41088962 167 - chr1:41088803-41088921 NA NA NA NA NA chr1-137 40969550 40969709 146 - chr1:40969554-40969678 NA NA NA NA NA chr1-136 40948041 40948491 254 - chr1:40948071-40948227 NA NA NA NA NA chr1-135 40876443 40876627 143 - chr1:40876464-40876576 NA NA NA NA NA chr1-134 40862724 40863063 250 - chr1:40862761-40862870 NA NA NA NA NA chr1-133 40618382 40618735 227 - chr1:40618400-40618564 NA NA NA NA NA chr1-132 40562361 40562519 137 - chr1:40562367-40562462 NA NA NA NA NA chr1-131 40467302 40467534 196 - chr1:40467309-40467487 NA NA NA NA NA chr1-130 40406042 40406244 157 - chr1:40406065-40406188 NA NA NA NA NA chr1-129 40363976 40364475 283 - chr1:40364129-40364291 NA NA NA NA NA chr1-128 40297687 40298467 390 - chr1:40297782-40298150 NA NA NA NA NA chr1-127 40058789 40059109 201 - chr1:40058964-40059018 NA NA NA NA NA chr1-126 40034992 40035374 244 - chr1:40035199-40035374 NA NA NA NA NA chr1-125 39969383 39969764 217 - chr1:39969611-39969728 NA NA NA NA NA chr1-124 39708879 39709032 119 - chr1:39708961-39709012 NA NA NA NA NA chr1-123 39535084 39535296 160 - chr1:39535144-39535248 NA NA NA NA NA chr1-122 39347814 39348010 165 - chr1:39347841-39347971 NA NA NA NA NA chr1-121 39327596 39327838 171 - chr1:39327657-39327747 NA NA NA NA NA chr1-120 39060639 39060994 277 - chr1:39060691-39060864 NA NA NA NA NA chr1-119 39003873 39004169 182 - chr1:39004013-39004068 NA NA NA NA NA chr1-118 38797491 38797657 155 - chr1:38797507-38797656 NA NA NA NA NA chr1-117 38516273 38516502 157 - chr1:38516348-38516436 NA NA NA NA NA chr1-116 38422317 38423095 387 - chr1:38422803-38423037 NA NA NA NA NA chr1-115 38349069 38349473 190 - chr1:38349125-38349208 NA NA NA NA NA chr1-114 38016942 38017355 211 - chr1:38017199-38017247 NA NA NA NA NA chr1-113 37760997 37761245 128 - chr1:37761136-37761163 NA NA NA NA NA chr1-112 37746418 37746882 232 - chr1:37746518-37746584 NA NA NA NA NA chr1-111 37609184 37609470 229 - chr1:37609310-37609425 NA NA NA NA NA chr1-110 37501081 37501253 139 - chr1:37501123-37501238 NA NA NA NA NA chr1-109 37316244 37316667 221 - chr1:37316296-37316390 NA NA NA NA NA chr1-108 36581168 36581401 180 - chr1:36581212-36581330 NA NA NA NA NA chr1-107 36144401 36144975 268 - chr1:36144481-36144596 NA NA NA NA NA chr1-106 35954207 35954418 130 - chr1:35954311-35954383 NA NA NA NA NA chr1-105 35899924 35900314 275 - chr1:35900115-35900253 NA NA NA NA NA chr1-104 35860934 35861112 143 - chr1:35860997-35861091 NA NA NA NA NA chr1-103 35768055 35768416 237 - chr1:35768136-35768206 NA NA NA NA NA chr1-102 35414319 35414590 188 - chr1:35414440-35414537 NA NA NA NA NA chr1-101 34966510 34966653 140 - chr1:34966517-34966652 NA NA NA NA NA chr1-100 34299278 34299539 171 - chr1:34299400-34299513 NA NA NA NA NA chr1-99 33713121 33713493 191 - chr1:33713341-33713390 NA NA NA NA NA chr1-98 33233759 33234086 168 - chr1:33233940-33233971 NA NA NA NA NA chr1-97 33077010 33077197 174 - chr1:33077030-33077178 NA NA NA NA NA chr1-96 32957060 32957357 167 - chr1:32957148-32957206 NA NA NA NA NA chr1-95 32820530 32820747 118 - chr1:32820657-32820704 NA NA NA NA NA chr1-94 32747170 32747423 222 - chr1:32747173-32747378 NA NA NA NA NA chr1-93 32724027 32724232 180 - chr1:32724070-32724200 NA NA NA NA NA chr1-92 32598313 32598567 156 - chr1:32598416-32598479 NA NA NA NA NA chr1-91 32387749 32388145 217 - chr1:32387975-32388060 NA NA NA NA NA chr1-90 32043619 32043859 127 - chr1:32043730-32043745 NA NA NA NA NA chr1 3191271 3191705 272 - chr1:3191557-3191605 NA NA NA NA NA chr1-89 31797709 31797926 152 - chr1:31797774-31797861 NA NA NA NA NA chr1-88 31255950 31256261 181 - chr1:31256105-31256117 NA NA NA NA NA chr1-87 30854110 30854330 137 - chr1:30854273-30854287 NA NA NA NA NA chr1-86 30565820 30566083 146 - chr1:30565941-30565974 NA NA NA NA NA chr1-85 29337064 29337277 158 - chr1:29337103-29337214 NA NA NA NA NA chr1-84 28868330 28868485 136 - chr1:28868373-28868478 NA NA NA NA NA chr1-83 28738847 28739256 213 - chr1:28738946-28738986 NA NA NA NA NA chr1-82 28696644 28696806 146 - chr1:28696660-28696790 NA NA NA NA NA chr1-81 28628667 28629183 349 - chr1:28628780-28628989 NA NA NA NA NA chr1-80 28493809 28494119 168 - chr1:28494002-28494099 NA NA NA NA NA chr1-79 28416944 28417234 138 - chr1:28417125-28417140 NA NA NA NA NA chr1-78 28301098 28301270 161 - chr1:28301114-28301253 NA NA NA NA NA chr1-77 27904834 27905193 150 - chr1:27904967-27905007 NA NA NA NA NA chr1-76 27779181 27779367 158 - chr1:27779209-27779339 NA NA NA NA NA chr1-75 27058995 27059326 255 - chr1:27059167-27059298 NA NA NA NA NA chr1-74 26946218 26946551 242 - chr1:26946486-26946546 NA NA NA NA NA chr1-73 26875696 26875981 155 - chr1:26875824-26875847 NA NA NA NA NA chr1-72 26782022 26782361 199 - chr1:26782218-26782249 NA NA NA NA NA chr1-71 26489184 26489505 200 - chr1:26489406-26489447 NA NA NA NA NA chr1-70 26453513 26453778 157 - chr1:26453632-26453692 NA NA NA NA NA chr1-69 26414423 26414789 194 - chr1:26414571-26414605 NA NA NA NA NA chr1-68 26196593 26197033 288 - chr1:26196757-26196905 NA NA NA NA NA chr1-67 26177752 26178138 232 - chr1:26177866-26177964 NA NA NA NA NA chr1-66 25686201 25686394 152 - chr1:25686212-25686338 NA NA NA NA NA chr1-65 25661411 25661611 151 - chr1:25661456-25661560 NA NA NA NA NA chr1-64 25434288 25434588 204 - chr1:25434324-25434480 NA NA NA NA NA chr1-63 25213502 25213773 163 - chr1:25213605-25213655 NA NA NA NA NA chr1-1175 248628681 248628900 145 - chr1:248628738-248628792 NA NA NA NA NA chr1-1174 247938134 247938517 215 - chr1:247938274-247938335 NA NA NA NA NA chr1-1173 247914344 247914606 232 - chr1:247914434-247914606 NA NA NA NA NA chr1-1172 247681612 247682039 296 - chr1:247681683-247681788 NA NA NA NA NA chr1-1171 247544588 247544943 186 - chr1:247544697-247544744 NA NA NA NA NA chr1-1170 247494683 247495024 201 - chr1:247494725-247494835 NA NA NA NA NA chr1-1169 247122015 247122328 274 - chr1:247122112-247122308 NA NA NA NA NA chr1-1168 246887112 246887492 317 - chr1:246887131-246887407 NA NA NA NA NA chr1-1167 246445129 246445313 150 - chr1:246445165-246445280 NA NA NA NA NA chr1-1166 246408364 246408647 163 - chr1:246408428-246408499 NA NA NA NA NA chr1-1165 246321456 246321672 160 - chr1:246321508-246321608 NA NA NA NA NA chr1-1164 245969140 245969537 192 - chr1:245969178-245969223 NA NA NA NA NA chr1-62 24527655 24527848 155 - chr1:24527689-24527808 NA NA NA NA NA chr1-1163 244600895 244601175 168 - chr1:244600999-244601047 NA NA NA NA NA chr1-1162 244415723 244415890 144 - chr1:244415735-244415845 NA NA NA NA NA chr1-61 24423522 24423858 233 - chr1:24423541-24423713 NA NA NA NA NA chr1-1161 244169125 244169429 148 - chr1:244169347-244169405 NA NA NA NA NA chr1-1160 244059957 244060134 142 - chr1:244060008-244060107 NA NA NA NA NA chr1-1159 242840282 242840568 193 - chr1:242840412-242840491 NA NA NA NA NA chr1-1158 242426789 242426943 151 - chr1:242426798-242426943 NA NA NA NA NA chr1-1157 242179196 242179386 168 - chr1:242179210-242179360 NA NA NA NA NA chr1-1156 242034204 242034554 208 - chr1:242034452-242034465 NA NA NA NA NA chr1-1155 241946937 241947338 200 - chr1:241947064-241947100 NA NA NA NA NA chr1-1154 241905953 241906185 161 - chr1:241906016-241906110 NA NA NA NA NA chr1-1153 241871186 241871447 151 - chr1:241871299-241871343 NA NA NA NA NA chr1-1152 241543044 241543352 233 - chr1:241543172-241543255 NA NA NA NA NA chr1-1151 241480952 241481180 155 - chr1:241481033-241481123 NA NA NA NA NA chr1-1150 241214619 241215037 198 - chr1:241214721-241214758 NA NA NA NA NA chr1-60 24114755 24114929 166 - chr1:24114766-24114927 NA NA NA NA NA chr1-1149 240442260 240442413 135 - chr1:240442266-240442371 NA NA NA NA NA chr1-59 24004407 24004599 144 - chr1:24004461-24004554 NA NA NA NA NA chr1-1148 240040948 240041362 237 - chr1:240041212-240041359 NA NA NA NA NA chr1-1147 239993029 239993542 230 - chr1:239993160-239993183 NA NA NA NA NA chr1-1146 239852156 239852464 225 - chr1:239852235-239852373 NA NA NA NA NA chr1-58 23963833 23964016 172 - chr1:23963850-23964008 NA NA NA NA NA chr1-1145 239382072 239382375 164 - chr1:239382207-239382228 NA NA NA NA NA chr1-1144 239326615 239327099 323 - chr1:239326704-239326794 NA NA NA NA NA chr1-57 23918886 23919454 249 - chr1:23919051-23919058 NA NA NA NA NA chr1-56 23880220 23880725 291 - chr1:23880517-23880534 NA NA NA NA NA chr1-1143 238718164 238718362 149 - chr1:238718308-238718359 NA NA NA NA NA chr1-1142 238520499 238521030 315 - chr1:238520573-238520720 NA NA NA NA NA chr1-1141 238246133 238246548 233 - chr1:238246199-238246308 NA NA NA NA NA chr1-1140 238001930 238002232 162 - chr1:238002071-238002094 NA NA NA NA NA chr1-1139 237697394 237697615 168 - chr1:237697425-237697518 NA NA NA NA NA chr1-1138 237598557 237598777 142 - chr1:237598637-237598700 NA NA NA NA NA chr1-1137 237404946 237405191 137 - chr1:237405026-237405069 NA NA NA NA NA chr1-1136 237330839 237331172 181 - chr1:237331021-237331071 NA NA NA NA NA chr1-1135 237218132 237218459 213 - chr1:237218262-237218420 NA NA NA NA NA chr1-1134 236796817 236797202 211 - chr1:236796865-236796962 NA NA NA NA NA chr1-1133 236787915 236788081 121 - chr1:236787935-236787986 NA NA NA NA NA chr1-1132 236772095 236772325 146 - chr1:236772163-236772209 NA NA NA NA NA chr1-1131 236233437 236233777 223 - chr1:236233616-236233691 NA NA NA NA NA chr1-1130 235949458 235949891 201 - chr1:235949655-235949740 NA NA NA NA NA chr1-1129 235789333 235789603 144 - chr1:235789467-235789488 NA NA NA NA NA chr1-1128 235686040 235686307 230 - chr1:235686047-235686210 NA NA NA NA NA chr1-1127 235524313 235524596 157 - chr1:235524433-235524467 NA NA NA NA NA chr1-1126 235258650 235259014 191 - chr1:235258729-235258794 NA NA NA NA NA chr1-1125 235224896 235225116 125 - chr1:235225021-235225036 NA NA NA NA NA chr1-1124 235064830 235065094 156 - chr1:235064938-235064986 NA NA NA NA NA chr1-1123 234684410 234684696 207 - chr1:234684507-234684626 NA NA NA NA NA chr1-1122 234496271 234496623 206 - chr1:234496325-234496431 NA NA NA NA NA chr1-1121 234332657 234332938 167 - chr1:234332777-234332827 NA NA NA NA NA chr1-1120 234157907 234158431 234 - chr1:234158069-234158077 NA NA NA NA NA chr1-1119 234093667 234093941 155 - chr1:234093788-234093823 NA NA NA NA NA chr1-1118 233985977 233986210 143 - chr1:233986059-233986116 NA NA NA NA NA chr1-1117 233703651 233703896 143 - chr1:233703755-233703798 NA NA NA NA NA chr1-1116 233676098 233676336 174 - chr1:233676176-233676279 NA NA NA NA NA chr1-1115 233668243 233668580 285 - chr1:233668345-233668553 NA NA NA NA NA chr1-1114 233610178 233610377 153 - chr1:233610246-233610342 NA NA NA NA NA chr1-1113 233260765 233260952 116 - chr1:233260836-233260881 NA NA NA NA NA chr1-1112 232752474 232752716 117 - chr1:232752618-232752629 NA NA NA NA NA chr1-1111 232723484 232723658 158 - chr1:232723497-232723647 NA NA NA NA NA chr1-1110 232408417 232408605 154 - chr1:232408439-232408565 NA NA NA NA NA chr1-1109 232282117 232282496 196 - chr1:232282218-232282272 NA NA NA NA NA chr1-55 23188141 23188341 159 - chr1:23188174-23188296 NA NA NA NA NA chr1-1108 231769955 231770104 143 - chr1:231769955-231770086 NA NA NA NA NA chr1-1107 231130751 231130914 128 - chr1:231130791-231130855 NA NA NA NA NA chr1-54 23108331 23108567 161 - chr1:23108398-23108476 NA NA NA NA NA chr1-1106 230953670 230953969 229 - chr1:230953685-230953774 NA NA NA NA NA chr1-1105 230625085 230625233 132 - chr1:230625098-230625198 NA NA NA NA NA chr1-1104 229703934 229704099 146 - chr1:229703955-229704081 NA NA NA NA NA chr1-53 22949635 22949901 154 - chr1:22949745-22949788 NA NA NA NA NA chr1-1103 229348685 229348935 138 - chr1:229348844-229348863 NA NA NA NA NA chr1-1102 229289420 229289770 286 - chr1:229289575-229289733 NA NA NA NA NA chr1-1101 229243286 229243511 148 - chr1:229243369-229243446 NA NA NA NA NA chr1-1100 229234728 229235157 276 - chr1:229234893-229234942 NA NA NA NA NA chr1-1099 228518139 228518302 153 - chr1:228518157-228518296 NA NA NA NA NA chr1-1098 228301918 228302153 187 - chr1:228301941-228302104 NA NA NA NA NA chr1-1097 228133680 228133948 154 - chr1:228133774-228133866 NA NA NA NA NA chr1-1096 227174676 227174843 117 - chr1:227174754-227174807 NA NA NA NA NA chr1-1095 227153299 227153587 163 - chr1:227153414-227153457 NA NA NA NA NA chr1-1094 227005401 227005856 250 - chr1:227005630-227005678 NA NA NA NA NA chr1-1093 226904962 226905138 149 - chr1:226904993-226905119 NA NA NA NA NA chr1-1092 226796139 226796441 157 - chr1:226796277-226796282 NA NA NA NA NA chr1-1091 226496076 226496331 189 - chr1:226496164-226496320 NA NA NA NA NA chr1-52 22621192 22621359 136 - chr1:22621211-22621322 NA NA NA NA NA chr1-1090 226070882 226071042 159 - chr1:226070883-226071041 NA NA NA NA NA chr1-1089 226019553 226020071 369 - chr1:226019776-226019959 NA NA NA NA NA chr1-1088 225959950 225960412 262 - chr1:225959998-225960160 NA NA NA NA NA chr1-1087 225531990 225532334 211 - chr1:225532014-225532171 NA NA NA NA NA chr1-1086 225508745 225509067 172 - chr1:225508930-225508954 NA NA NA NA NA chr1-1085 225345386 225345598 160 - chr1:225345432-225345534 NA NA NA NA NA chr1-1084 225229932 225230167 130 - chr1:225230017-225230052 NA NA NA NA NA chr1-1083 224961430 224961922 272 - chr1:224961628-224961658 NA NA NA NA NA chr1-1082 224807430 224807722 164 - chr1:224807550-224807578 NA NA NA NA NA chr1-1081 224698147 224698421 237 - chr1:224698190-224698353 NA NA NA NA NA chr1-1080 224348341 224348544 158 - chr1:224348388-224348500 NA NA NA NA NA chr1-1079 224248078 224248270 158 - chr1:224248103-224248218 NA NA NA NA NA chr1-1078 223174737 223175148 221 - chr1:223175003-223175110 NA NA NA NA NA chr1-1077 222744854 222745116 150 - chr1:222744966-222745004 NA NA NA NA NA chr1-1076 222586048 222586378 168 - chr1:222586208-222586215 NA NA NA NA NA chr1-1075 222573303 222573472 131 - chr1:222573377-222573432 NA NA NA NA NA chr1-1074 222033951 222034419 386 - chr1:222034019-222034364 NA NA NA NA NA chr1-1073 222026771 222027009 135 - chr1:222026852-222026862 NA NA NA NA NA chr1-1072 221651061 221651377 267 - chr1:221651082-221651251 NA NA NA NA NA chr1-1071 221620107 221620444 170 - chr1:221620355-221620380 NA NA NA NA NA chr1-1070 221590683 221590844 147 - chr1:221590698-221590832 NA NA NA NA NA chr1-1069 221565880 221566150 235 - chr1:221565980-221566145 NA NA NA NA NA chr1-1068 221559895 221560301 197 - chr1:221560034-221560057 NA NA NA NA NA chr1-1067 221322767 221323036 166 - chr1:221322876-221322936 NA NA NA NA NA chr1-1066 220841850 220842182 144 - chr1:220841946-220841948 NA NA NA NA NA chr1-1065 220671995 220672251 161 - chr1:220672083-220672142 NA NA NA NA NA chr1-1064 220365789 220366101 182 - chr1:220365900-220365933 NA NA NA NA NA chr1-1063 220287919 220288265 203 - chr1:220288058-220288120 NA NA NA NA NA chr1-1062 220087249 220087555 216 - chr1:220087249-220087420 NA NA NA NA NA chr1-1061 219465784 219465998 144 - chr1:219465838-219465896 NA NA NA NA NA chr1-1060 219180110 219180389 159 - chr1:219180230-219180241 NA NA NA NA NA chr1-1059 218960291 218960828 351 - chr1:218960498-218960687 NA NA NA NA NA chr1-1058 218522057 218522443 205 - chr1:218522268-218522322 NA NA NA NA NA chr1-1057 218430803 218431323 344 - chr1:218430903-218431178 NA NA NA NA NA chr1-1056 218270068 218270347 231 - chr1:218270200-218270341 NA NA NA NA NA chr1-51 21824635 21824942 257 - chr1:21824690-21824847 NA NA NA NA NA chr1-1055 218208729 218208937 123 - chr1:218208792-218208818 NA NA NA NA NA chr1-1054 217937699 217938247 450 - chr1:217937945-217938223 NA NA NA NA NA chr1-50 21779682 21779992 158 - chr1:21779814-21779830 NA NA NA NA NA chr1-1053 217754203 217754549 223 - chr1:217754317-217754408 NA NA NA NA NA chr1-1052 217727637 217727843 195 - chr1:217727668-217727842 NA NA NA NA NA chr1-1051 217484575 217484722 142 - chr1:217484576-217484715 NA NA NA NA NA chr1-1050 217225554 217225885 270 - chr1:217225720-217225876 NA NA NA NA NA chr1-1049 216613537 216613742 130 - chr1:216613548-216613606 NA NA NA NA NA chr1-1048 216352841 216353064 140 - chr1:216352931-216352995 NA NA NA NA NA chr1-1047 216268849 216269012 149 - chr1:216268868-216269010 NA NA NA NA NA chr1-1046 216214427 216214780 173 - chr1:216214575-216214584 NA NA NA NA NA chr1-1045 216103387 216103614 204 - chr1:216103420-216103578 NA NA NA NA NA chr1-1044 215706120 215706282 150 - chr1:215706137-215706280 NA NA NA NA NA chr1-1043 215693831 215694058 147 - chr1:215693914-215693984 NA NA NA NA NA chr1-1042 215468130 215468380 178 - chr1:215468220-215468362 NA NA NA NA NA chr1-1041 215151934 215152187 158 - chr1:215152026-215152086 NA NA NA NA NA chr1-1040 215072142 215072810 397 - chr1:215072211-215072305 NA NA NA NA NA chr1-1039 215052078 215052335 145 - chr1:215052185-215052213 NA NA NA NA NA chr1-1038 215046712 215046963 159 - chr1:215046796-215046867 NA NA NA NA NA chr1-1037 214905523 214905770 185 - chr1:214905667-214905728 NA NA NA NA NA chr1-1036 214514073 214514228 145 - chr1:214514086-214514226 NA NA NA NA NA chr1-1035 214363222 214363519 170 - chr1:214363327-214363381 NA NA NA NA NA chr1-1034 214347467 214347728 150 - chr1:214347572-214347605 NA NA NA NA NA chr1-1033 214205410 214205608 125 - chr1:214205456-214205481 NA NA NA NA NA chr1-1032 214199086 214199351 177 - chr1:214199163-214199241 NA NA NA NA NA chr1-1031 214086463 214086760 178 - chr1:214086573-214086623 NA NA NA NA NA chr1-1030 213837924 213838270 280 - chr1:213838116-213838264 NA NA NA NA NA chr1-1029 213738966 213739142 161 - chr1:213738975-213739115 NA NA NA NA NA chr1-1028 213697891 213698074 154 - chr1:213697917-213698039 NA NA NA NA NA chr1-1027 213522533 213522873 222 - chr1:213522639-213522731 NA NA NA NA NA chr1-1026 213503820 213504100 140 - chr1:213503962-213503964 NA NA NA NA NA chr1-1025 213436468 213436752 159 - chr1:213436585-213436611 NA NA NA NA NA chr1-1024 213365527 213365818 157 - chr1:213365657-213365682 NA NA NA NA NA chr1-1023 213288596 213288999 231 - chr1:213288654-213288799 NA NA NA NA NA chr1-1022 213255564 213255925 284 - chr1:213255577-213255720 NA NA NA NA NA chr1-1021 212873834 212874042 156 - chr1:212873876-212873985 NA NA NA NA NA chr1-1020 212787521 212787746 141 - chr1:212787615-212787667 NA NA NA NA NA chr1-1019 212770481 212771055 315 - chr1:212770910-212770937 NA NA NA NA NA chr1-1018 212614602 212614827 172 - chr1:212614669-212614782 NA NA NA NA NA chr1-1017 212532318 212532756 228 - chr1:212532608-212532706 NA NA NA NA NA chr1-1016 212482943 212483172 154 - chr1:212483001-212483063 NA NA NA NA NA chr1-1015 212340559 212340811 218 - chr1:212340658-212340808 NA NA NA NA NA chr1-1014 212296073 212296263 131 - chr1:212296142-212296224 NA NA NA NA NA chr1-1013 212009330 212009609 153 - chr1:212009507-212009597 NA NA NA NA NA chr1-1012 211882961 211883224 220 - chr1:211883033-211883167 NA NA NA NA NA chr1-1011 211854093 211854623 391 - chr1:211854175-211854370 NA NA NA NA NA chr1-1010 211818308 211818798 247 - chr1:211818654-211818761 NA NA NA NA NA chr1-1009 211591825 211592112 150 - chr1:211591986-211591987 NA NA NA NA NA chr1-1008 211438964 211439328 288 - chr1:211438971-211439114 NA NA NA NA NA chr1-1007 211409762 211410092 149 - chr1:211409849-211409864 NA NA NA NA NA chr1-1006 210920383 210920587 166 - chr1:210920434-210920575 NA NA NA NA NA chr1-1005 210876503 210876680 134 - chr1:210876535-210876583 NA NA NA NA NA chr1-1004 210793003 210793396 273 - chr1:210793061-210793152 NA NA NA NA NA chr1-1003 210728344 210728781 335 - chr1:210728610-210728761 NA NA NA NA NA chr1-1002 210656127 210656440 275 - chr1:210656180-210656436 NA NA NA NA NA chr1-1001 210569574 210569869 199 - chr1:210569718-210569869 NA NA NA NA NA chr1-1000 210262964 210263590 338 - chr1:210263297-210263392 NA NA NA NA NA chr1-999 210155266 210155684 289 - chr1:210155399-210155557 NA NA NA NA NA chr1-998 209775836 209776151 188 - chr1:209775990-209776078 NA NA NA NA NA chr1-997 209634198 209634352 126 - chr1:209634212-209634282 NA NA NA NA NA chr1-996 209408070 209408596 251 - chr1:209408396-209408423 NA NA NA NA NA chr1-995 209170460 209170749 226 - chr1:209170627-209170727 NA NA NA NA NA chr1-994 209080672 209080948 167 - chr1:209080805-209080851 NA NA NA NA NA chr1-993 208965718 208966037 186 - chr1:208965755-208965856 NA NA NA NA NA chr1-992 208936731 208937073 289 - chr1:208936890-208937073 NA NA NA NA NA chr1-991 208854337 208854668 221 - chr1:208854423-208854589 NA NA NA NA NA chr1-990 208830508 208830678 165 - chr1:208830514-208830675 NA NA NA NA NA chr1-989 208777556 208777811 151 - chr1:208777650-208777702 NA NA NA NA NA chr1-988 208770053 208770386 170 - chr1:208770214-208770222 NA NA NA NA NA chr1-987 208489714 208489929 119 - chr1:208489754-208489825 NA NA NA NA NA chr1-986 208465150 208465575 250 - chr1:208465417-208465553 NA NA NA NA NA chr1-985 208329352 208329611 183 - chr1:208329393-208329465 NA NA NA NA NA chr1-984 208176801 208177130 229 - chr1:208176927-208177082 NA NA NA NA NA chr1-983 208129752 208130099 190 - chr1:208129935-208129955 NA NA NA NA NA chr1-982 208124826 208125113 221 - chr1:208124904-208125009 NA NA NA NA NA chr1-981 208097826 208098045 163 - chr1:208097886-208097991 NA NA NA NA NA chr1-980 208094941 208095161 166 - chr1:208094988-208095093 NA NA NA NA NA chr1-979 207749652 207749846 163 - chr1:207749698-207749816 NA NA NA NA NA chr1-978 207588890 207589203 247 - chr1:207588937-207589099 NA NA NA NA NA chr1-49 20738949 20739323 215 - chr1:20738968-20739094 NA NA NA NA NA chr1-977 207336233 207336497 228 - chr1:207336271-207336481 NA NA NA NA NA chr1-976 207269199 207269680 217 - chr1:207269535-207269560 NA NA NA NA NA chr1-975 207242120 207242392 197 - chr1:207242262-207242309 NA NA NA NA NA chr1-974 207238532 207238934 224 - chr1:207238545-207238680 NA NA NA NA NA chr1-973 207189291 207189704 190 - chr1:207189440-207189444 NA NA NA NA NA chr1-48 20711186 20711829 323 - chr1:20711470-20711491 NA NA NA NA NA chr1-972 207105804 207105957 129 - chr1:207105840-207105957 NA NA NA NA NA chr1-971 207034728 207034898 154 - chr1:207034746-207034886 NA NA NA NA NA chr1-970 206888353 206888798 223 - chr1:206888645-206888716 NA NA NA NA NA chr1-969 206882298 206882681 218 - chr1:206882526-206882543 NA NA NA NA NA chr1-968 206842105 206842358 174 - chr1:206842149-206842209 NA NA NA NA NA chr1-967 206807699 206807966 138 - chr1:206807808-206807827 NA NA NA NA NA chr1-966 206805295 206805573 153 - chr1:206805328-206805402 NA NA NA NA NA chr1-965 206431227 206431391 155 - chr1:206431250-206431387 NA NA NA NA NA chr1-964 206150721 206150918 173 - chr1:206150727-206150852 NA NA NA NA NA chr1-963 206147491 206147786 217 - chr1:206147535-206147640 NA NA NA NA NA chr1-962 206020225 206020444 169 - chr1:206020238-206020382 NA NA NA NA NA chr1-961 205937280 205937792 274 - chr1:205937310-205937450 NA NA NA NA NA chr1-960 205613780 205614271 244 - chr1:205613960-205614142 NA NA NA NA NA chr1-959 205609033 205609323 202 - chr1:205609285-205609317 NA NA NA NA NA chr1-958 205497349 205497660 169 - chr1:205497494-205497524 NA NA NA NA NA chr1-957 205114973 205115193 146 - chr1:205115051-205115127 NA NA NA NA NA chr1-956 205077447 205077750 214 - chr1:205077466-205077626 NA NA NA NA NA chr1-955 204756518 204756826 202 - chr1:204756578-204756727 NA NA NA NA NA chr1-954 204684730 204685035 210 - chr1:204684847-204684951 NA NA NA NA NA chr1-953 204415234 204415440 179 - chr1:204415251-204415393 NA NA NA NA NA chr1-952 204250908 204251345 209 - chr1:204251202-204251249 NA NA NA NA NA chr1-951 204226334 204226640 204 - chr1:204226399-204226552 NA NA NA NA NA chr1-950 204032527 204032766 199 - chr1:204032538-204032717 NA NA NA NA NA chr1-949 203960923 203961188 249 - chr1:203960946-203961163 NA NA NA NA NA chr1-948 203884103 203884690 285 - chr1:203884148-203884250 NA NA NA NA NA chr1-947 203866913 203867089 151 - chr1:203866934-203867062 NA NA NA NA NA chr1-946 203829776 203830010 159 - chr1:203829845-203829932 NA NA NA NA NA chr1-945 203088586 203088948 226 - chr1:203088738-203088896 NA NA NA NA NA chr1-944 202808254 202808750 281 - chr1:202808426-202808449 NA NA NA NA NA chr1-943 202757161 202757334 162 - chr1:202757176-202757331 NA NA NA NA NA chr1-942 202745885 202746214 178 - chr1:202745996-202746043 NA NA NA NA NA chr1-941 202582129 202582396 131 - chr1:202582273-202582276 NA NA NA NA NA chr1-940 202124776 202124995 196 - chr1:202124845-202124995 NA NA NA NA NA chr1-47 20199845 20200109 150 - chr1:20199955-20199987 NA NA NA NA NA chr1-46 20197373 20197766 312 - chr1:20197589-20197739 NA NA NA NA NA chr1-939 201627043 201627260 135 - chr1:201627077-201627171 NA NA NA NA NA chr1-938 201065413 201065622 156 - chr1:201065474-201065585 NA NA NA NA NA chr1-937 200987253 200987430 162 - chr1:200987294-200987426 NA NA NA NA NA chr1-936 200968552 200968780 153 - chr1:200968623-200968703 NA NA NA NA NA chr1-935 200885466 200885767 205 - chr1:200885558-200885715 NA NA NA NA NA chr1-934 200661423 200661696 151 - chr1:200661441-200661531 NA NA NA NA NA chr1-933 200565348 200565526 158 - chr1:200565352-200565498 NA NA NA NA NA chr1-932 200556007 200556247 145 - chr1:200556102-200556152 NA NA NA NA NA chr1-931 200309493 200309803 184 - chr1:200309659-200309757 NA NA NA NA NA chr1-930 200151886 200152198 180 - chr1:200151970-200152032 NA NA NA NA NA chr1-929 200131178 200131456 190 - chr1:200131295-200131441 NA NA NA NA NA chr1-928 199901636 199901837 185 - chr1:199901644-199901817 NA NA NA NA NA chr1-927 199645295 199645652 213 - chr1:199645349-199645490 NA NA NA NA NA chr1-926 199229225 199229477 155 - chr1:199229306-199229372 NA NA NA NA NA chr1-925 198805088 198805463 220 - chr1:198805293-198805333 NA NA NA NA NA chr1-924 198295289 198295809 383 - chr1:198295345-198295454 NA NA NA NA NA chr1-923 198287938 198288134 145 - chr1:198287991-198288087 NA NA NA NA NA chr1-922 198256879 198257169 223 - chr1:198256969-198257058 NA NA NA NA NA chr1-921 198196394 198196549 154 - chr1:198196394-198196546 NA NA NA NA NA chr1-920 197418865 197419217 227 - chr1:197419156-197419175 NA NA NA NA NA chr1-919 197392650 197393029 205 - chr1:197392883-197392973 NA NA NA NA NA chr1-918 197310306 197310469 142 - chr1:197310349-197310459 NA NA NA NA NA chr1-917 197188850 197189196 164 - chr1:197189109-197189168 NA NA NA NA NA chr1-916 196725195 196725546 167 - chr1:196725333-196725339 NA NA NA NA NA chr1-915 196585832 196586018 135 - chr1:196585855-196585911 NA NA NA NA NA chr1-914 196506279 196506713 249 - chr1:196506574-196506583 NA NA NA NA NA chr1-913 196380842 196381064 161 - chr1:196380915-196381009 NA NA NA NA NA chr1-912 196317893 196318204 175 - chr1:196318037-196318072 NA NA NA NA NA chr1-911 196276386 196276695 246 - chr1:196276565-196276690 NA NA NA NA NA chr1-910 196254039 196254190 150 - chr1:196254039-196254187 NA NA NA NA NA chr1-909 196215829 196216011 156 - chr1:196215837-196215976 NA NA NA NA NA chr1-908 195812456 195812766 272 - chr1:195812505-195812758 NA NA NA NA NA chr1-907 195745709 195746412 488 - chr1:195746038-195746130 NA NA NA NA NA chr1-906 195727915 195728128 163 - chr1:195727960-195728068 NA NA NA NA NA chr1-905 195622350 195622670 166 - chr1:195622490-195622509 NA NA NA NA NA chr1-904 195425737 195425900 142 - chr1:195425746-195425846 NA NA NA NA NA chr1-45 19533755 19534010 155 - chr1:19533857-19533914 NA NA NA NA NA chr1-903 195157511 195157675 134 - chr1:195157527-195157638 NA NA NA NA NA chr1-902 195001890 195002041 125 - chr1:195001966-195002040 NA NA NA NA NA chr1-901 194980563 194980882 217 - chr1:194980694-194980838 NA NA NA NA NA chr1-900 194963740 194963910 144 - chr1:194963762-194963893 NA NA NA NA NA chr1-899 194804772 194805006 143 - chr1:194804903-194804945 NA NA NA NA NA chr1-898 194265339 194265499 134 - chr1:194265371-194265453 NA NA NA NA NA chr1-897 194234379 194234574 121 - chr1:194234417-194234428 NA NA NA NA NA chr1-896 193904006 193904274 193 - chr1:193904115-193904216 NA NA NA NA NA chr1-895 193687060 193687282 139 - chr1:193687197-193687226 NA NA NA NA NA chr1-894 193601676 193601984 188 - chr1:193601794-193601860 NA NA NA NA NA chr1-893 192574083 192574543 276 - chr1:192574270-192574342 NA NA NA NA NA chr1-892 192527913 192528174 223 - chr1:192527987-192528134 NA NA NA NA NA chr1-891 192507878 192508245 250 - chr1:192507977-192508135 NA NA NA NA NA chr1-890 192367285 192367504 155 - chr1:192367348-192367438 NA NA NA NA NA chr1-889 192133815 192134036 125 - chr1:192133961-192133965 NA NA NA NA NA chr1-888 191811697 191811943 151 - chr1:191811793-191811850 NA NA NA NA NA chr1-887 191251826 191252089 186 - chr1:191251891-191251988 NA NA NA NA NA chr1-44 19123599 19123911 222 - chr1:19123715-19123834 NA NA NA NA NA chr1-886 191148080 191148367 205 - chr1:191148093-191148147 NA NA NA NA NA chr1-43 19107613 19107810 179 - chr1:19107636-19107779 NA NA NA NA NA chr1-885 190943370 190943726 201 - chr1:190943441-190943529 NA NA NA NA NA chr1-884 190863126 190863484 180 - chr1:190863294-190863301 NA NA NA NA NA chr1-883 190703954 190704127 142 - chr1:190703964-190704044 NA NA NA NA NA chr1-882 190249711 190250134 225 - chr1:190249855-190249909 NA NA NA NA NA chr1-881 190159795 190160022 189 - chr1:190159812-190159982 NA NA NA NA NA chr1-880 190143566 190143812 154 - chr1:190143648-190143715 NA NA NA NA NA chr1-879 190092517 190092859 166 - chr1:190092704-190092705 NA NA NA NA NA chr1-878 190048875 190049059 146 - chr1:190048932-190049059 NA NA NA NA NA chr1-877 189992842 189993456 299 - chr1:189993182-189993333 NA NA NA NA NA chr1-876 189836738 189837197 255 - chr1:189836959-189837135 NA NA NA NA NA chr1-875 189797676 189798122 238 - chr1:189797765-189797899 NA NA NA NA NA chr1-874 189464954 189465232 152 - chr1:189465080-189465106 NA NA NA NA NA chr1-873 189451803 189452095 182 - chr1:189451849-189451953 NA NA NA NA NA chr1-872 189276700 189276887 142 - chr1:189276747-189276846 NA NA NA NA NA chr1-871 189143133 189143357 174 - chr1:189143180-189143329 NA NA NA NA NA chr1-870 189097537 189097992 358 - chr1:189097803-189097967 NA NA NA NA NA chr1-869 188989205 188989393 147 - chr1:188989249-188989358 NA NA NA NA NA chr1-868 188979878 188980225 236 - chr1:188980073-188980156 NA NA NA NA NA chr1-867 188791017 188791174 122 - chr1:188791122-188791174 NA NA NA NA NA chr1-866 188738717 188738955 137 - chr1:188738848-188738869 NA NA NA NA NA chr1-865 188725957 188726140 123 - chr1:188726018-188726111 NA NA NA NA NA chr1-864 188583295 188583528 201 - chr1:188583299-188583440 NA NA NA NA NA chr1-863 188526857 188527134 264 - chr1:188526877-188527115 NA NA NA NA NA chr1-862 188393709 188394034 211 - chr1:188393879-188394033 NA NA NA NA NA chr1-861 188274748 188274944 148 - chr1:188274800-188274898 NA NA NA NA NA chr1-860 188044626 188044823 169 - chr1:188044636-188044787 NA NA NA NA NA chr1-859 187810407 187810660 159 - chr1:187810511-187810571 NA NA NA NA NA chr1-858 187687545 187687698 141 - chr1:187687553-187687678 NA NA NA NA NA chr1-857 187524848 187525056 153 - chr1:187524907-187525003 NA NA NA NA NA chr1-856 187501701 187501945 135 - chr1:187501790-187501796 NA NA NA NA NA chr1-855 187259924 187260144 183 - chr1:187259995-187260124 NA NA NA NA NA chr1-854 187184137 187184402 134 - chr1:187184255-187184277 NA NA NA NA NA chr1-853 187075203 187075600 278 - chr1:187075303-187075443 NA NA NA NA NA chr1-852 186959445 186959677 139 - chr1:186959544-186959596 NA NA NA NA NA chr1-851 186471045 186471477 248 - chr1:186471325-186471341 NA NA NA NA NA chr1-850 186368932 186369370 247 - chr1:186369099-186369253 NA NA NA NA NA chr1-849 186319935 186320253 266 - chr1:186319938-186320103 NA NA NA NA NA chr1-848 186245421 186245839 205 - chr1:186245512-186245565 NA NA NA NA NA chr1-847 186058815 186058983 120 - chr1:186058837-186058883 NA NA NA NA NA chr1-846 185808860 185809073 158 - chr1:185808935-185809028 NA NA NA NA NA chr1-845 185601753 185602081 168 - chr1:185601913-185601921 NA NA NA NA NA chr1-42 18536523 18536872 214 - chr1:18536676-18536746 NA NA NA NA NA chr1-844 185341286 185341465 144 - chr1:185341317-185341428 NA NA NA NA NA chr1-843 185302620 185302902 208 - chr1:185302648-185302805 NA NA NA NA NA chr1-842 185206576 185206743 118 - chr1:185206689-185206726 NA NA NA NA NA chr1-841 185134680 185135017 277 - chr1:185134725-185134882 NA NA NA NA NA chr1-840 184971543 184971717 149 - chr1:184971571-184971698 NA NA NA NA NA chr1-839 184791785 184791947 148 - chr1:184791827-184791947 NA NA NA NA NA chr1-838 184660451 184660625 141 - chr1:184660467-184660558 NA NA NA NA NA chr1-837 184582302 184582562 201 - chr1:184582397-184582521 NA NA NA NA NA chr1-836 184314991 184315442 263 - chr1:184315263-184315422 NA NA NA NA NA chr1-835 183912914 183913071 117 - chr1:183912950-183913047 NA NA NA NA NA chr1-834 183450708 183450997 198 - chr1:183450749-183450859 NA NA NA NA NA chr1-833 182964764 182965215 209 - chr1:182964884-182964912 NA NA NA NA NA chr1-832 182676940 182677427 348 - chr1:182677010-182677368 NA NA NA NA NA chr1-831 182567578 182568080 246 - chr1:182567760-182567817 NA NA NA NA NA chr1-830 182565531 182565760 154 - chr1:182565613-182565699 NA NA NA NA NA chr1-829 182487769 182488160 191 - chr1:182488013-182488048 NA NA NA NA NA chr1-828 182437823 182437996 123 - chr1:182437835-182437927 NA NA NA NA NA chr1-827 182402986 182403272 153 - chr1:182403117-182403135 NA NA NA NA NA chr1-826 182143292 182143583 244 - chr1:182143405-182143555 NA NA NA NA NA chr1-825 182117778 182118025 159 - chr1:182117890-182117949 NA NA NA NA NA chr1-824 181970317 181970565 158 - chr1:181970413-181970478 NA NA NA NA NA chr1-823 181868837 181868996 158 - chr1:181868840-181868996 NA NA NA NA NA chr1-822 181748815 181748999 171 - chr1:181748854-181748999 NA NA NA NA NA chr1-821 181615157 181615667 297 - chr1:181615512-181615555 NA NA NA NA NA chr1-820 180765209 180765586 254 - chr1:180765372-180765527 NA NA NA NA NA chr1-819 180745916 180746121 160 - chr1:180745955-180746073 NA NA NA NA NA chr1-818 180550567 180550796 173 - chr1:180550641-180550749 NA NA NA NA NA chr1-817 180394477 180394814 174 - chr1:180394518-180394590 NA NA NA NA NA chr1-816 180360139 180360644 210 - chr1:180360238-180360251 NA NA NA NA NA chr1-815 180068949 180069328 289 - chr1:180069077-180069314 NA NA NA NA NA chr1-814 179943791 179944135 198 - chr1:179943975-179944008 NA NA NA NA NA chr1-813 179881856 179882126 154 - chr1:179881976-179882012 NA NA NA NA NA chr1-812 179756313 179756608 162 - chr1:179756452-179756478 NA NA NA NA NA chr1-811 179665855 179666063 152 - chr1:179665909-179666006 NA NA NA NA NA chr1-810 179057511 179057794 147 - chr1:179057645-179057654 NA NA NA NA NA chr1-809 178924399 178924785 256 - chr1:178924529-178924691 NA NA NA NA NA chr1-808 178829780 178830240 246 - chr1:178829932-178830012 NA NA NA NA NA chr1-807 178824942 178825145 158 - chr1:178824979-178825084 NA NA NA NA NA chr1-806 178738799 178739102 160 - chr1:178738948-178738962 NA NA NA NA NA chr1-805 178718817 178719006 144 - chr1:178718866-178718969 NA NA NA NA NA chr1-804 178506692 178507180 334 - chr1:178506726-178506983 NA NA NA NA NA chr1-803 178309548 178310030 253 - chr1:178309627-178309704 NA NA NA NA NA chr1-41 17816881 17817243 259 - chr1:17817088-17817192 NA NA NA NA NA chr1-802 177787626 177787921 233 - chr1:177787772-177787901 NA NA NA NA NA chr1-801 177318839 177319192 215 - chr1:177318942-177318984 NA NA NA NA NA chr1-40 17689972 17690206 204 - chr1:17689977-17690126 NA NA NA NA NA chr1-800 176601366 176602008 271 - chr1:176601523-176601530 NA NA NA NA NA chr1-799 176582847 176583018 144 - chr1:176582882-176582995 NA NA NA NA NA chr1-798 176533391 176533616 154 - chr1:176533466-176533553 NA NA NA NA NA chr1-797 176071412 176071763 200 - chr1:176071483-176071572 NA NA NA NA NA chr1-796 176031923 176032168 125 - chr1:176032065-176032092 NA NA NA NA NA chr1-39 17585871 17586456 384 - chr1:17585934-17586186 NA NA NA NA NA chr1-38 17548179 17548580 217 - chr1:17548289-17548345 NA NA NA NA NA chr1-795 175445746 175446010 125 - chr1:175445905-175445911 NA NA NA NA NA chr1-794 175006163 175006383 181 - chr1:175006197-175006334 NA NA NA NA NA chr1-793 174878615 174878931 160 - chr1:174878783-174878799 NA NA NA NA NA chr1-792 174869796 174869952 131 - chr1:174869867-174869950 NA NA NA NA NA chr1-791 174829341 174829692 177 - chr1:174829540-174829568 NA NA NA NA NA chr1-790 174559302 174559540 144 - chr1:174559400-174559448 NA NA NA NA NA chr1-789 174508609 174508810 158 - chr1:174508646-174508755 NA NA NA NA NA chr1-788 174357617 174357805 162 - chr1:174357635-174357775 NA NA NA NA NA chr1-787 174276190 174276557 211 - chr1:174276393-174276495 NA NA NA NA NA chr1-786 174246761 174247025 157 - chr1:174246876-174246934 NA NA NA NA NA chr1-785 174073403 174073575 143 - chr1:174073436-174073554 NA NA NA NA NA chr1-784 173967513 173967742 128 - chr1:173967641-173967671 NA NA NA NA NA chr1-783 173846222 173846546 203 - chr1:173846395-173846529 NA NA NA NA NA chr1-782 173735518 173735831 256 - chr1:173735689-173735831 NA NA NA NA NA chr1-781 173734246 173734609 244 - chr1:173734252-173734436 NA NA NA NA NA chr1-37 17364963 17365434 340 - chr1:17365066-17365247 NA NA NA NA NA chr1-780 173518227 173518493 159 - chr1:173518346-173518392 NA NA NA NA NA chr1-779 173478574 173478929 196 - chr1:173478794-173478892 NA NA NA NA NA chr1-778 173246689 173247052 359 - chr1:173246692-173247048 NA NA NA NA NA chr1-777 173215782 173216006 168 - chr1:173215856-173215959 NA NA NA NA NA chr1-776 173028320 173028674 191 - chr1:173028401-173028551 NA NA NA NA NA chr1-775 172778597 172778842 170 - chr1:172778666-172778764 NA NA NA NA NA chr1-774 172287318 172287589 233 - chr1:172287357-172287514 NA NA NA NA NA chr1-773 172277078 172277228 143 - chr1:172277086-172277215 NA NA NA NA NA chr1-772 172112537 172112815 144 - chr1:172112683-172112687 NA NA NA NA NA chr1-771 172072025 172072190 156 - chr1:172072038-172072183 NA NA NA NA NA chr1-770 170886571 170886835 153 - chr1:170886680-170886720 NA NA NA NA NA chr1-769 170699285 170699494 127 - chr1:170699389-170699423 NA NA NA NA NA chr1-768 170446048 170446242 156 - chr1:170446092-170446207 NA NA NA NA NA chr1-767 170264785 170264976 163 - chr1:170264785-170264934 NA NA NA NA NA chr1-766 170256391 170256699 204 - chr1:170256427-170256579 NA NA NA NA NA chr1-765 170195689 170196035 183 - chr1:170195864-170195896 NA NA NA NA NA chr1-764 170166923 170167264 235 - chr1:170167054-170167236 NA NA NA NA NA chr1-763 170078651 170078826 167 - chr1:170078664-170078815 NA NA NA NA NA chr1-762 169957319 169957554 119 - chr1:169957367-169957404 NA NA NA NA NA chr1-761 169377632 169377944 289 - chr1:169377651-169377913 NA NA NA NA NA chr1-760 169312746 169312891 121 - chr1:169312809-169312882 NA NA NA NA NA chr1-759 169228781 169229099 190 - chr1:169228890-169228933 NA NA NA NA NA chr1-758 168499022 168499224 141 - chr1:168499087-168499171 NA NA NA NA NA chr1-757 168336213 168336388 173 - chr1:168336216-168336388 NA NA NA NA NA chr1-756 168139498 168139861 225 - chr1:168139686-168139823 NA NA NA NA NA chr1-755 167938408 167938683 176 - chr1:167938523-167938616 NA NA NA NA NA chr1-754 167799879 167800275 231 - chr1:167800122-167800149 NA NA NA NA NA chr1-753 167739358 167739656 155 - chr1:167739499-167739509 NA NA NA NA NA chr1-752 167676334 167676559 152 - chr1:167676407-167676486 NA NA NA NA NA chr1-751 167656938 167657277 221 - chr1:167656950-167657112 NA NA NA NA NA chr1-750 167558199 167558399 136 - chr1:167558199-167558303 NA NA NA NA NA chr1-749 167349197 167349395 157 - chr1:167349224-167349347 NA NA NA NA NA chr1-748 166933976 166934126 132 - chr1:166934002-166934125 NA NA NA NA NA chr1-747 166933694 166933907 135 - chr1:166933702-166933798 NA NA NA NA NA chr1-746 166930238 166930456 182 - chr1:166930252-166930376 NA NA NA NA NA chr1-745 166904747 166904967 153 - chr1:166904810-166904898 NA NA NA NA NA chr1-744 166867782 166868040 224 - chr1:166867783-166867940 NA NA NA NA NA chr1-743 166865265 166865434 146 - chr1:166865288-166865411 NA NA NA NA NA chr1-742 166687360 166687632 210 - chr1:166687412-166687565 NA NA NA NA NA chr1-741 166453798 166453988 154 - chr1:166453838-166453954 NA NA NA NA NA chr1-740 166430395 166430691 143 - chr1:166430615-166430672 NA NA NA NA NA chr1-739 166230932 166231110 139 - chr1:166230953-166231014 NA NA NA NA NA chr1-738 164695798 164695991 175 - chr1:164695816-164695973 NA NA NA NA NA chr1-737 164643547 164643909 188 - chr1:164643611-164643680 NA NA NA NA NA chr1-736 164518128 164518278 124 - chr1:164518166-164518277 NA NA NA NA NA chr1-36 16440026 16440602 276 - chr1:16440130-16440186 NA NA NA NA NA chr1-735 164296785 164297084 154 - chr1:164296932-164296943 NA NA NA NA NA chr1-734 163941803 163942226 202 - chr1:163942051-163942059 NA NA NA NA NA chr1-733 163353241 163353599 239 - chr1:163353458-163353529 NA NA NA NA NA chr1-732 163148427 163148785 212 - chr1:163148635-163148774 NA NA NA NA NA chr1-731 163061747 163062065 144 - chr1:163061810-163061867 NA NA NA NA NA chr1-730 162835810 162836056 136 - chr1:162835838-162835905 NA NA NA NA NA chr1-729 162743130 162743560 300 - chr1:162743236-162743535 NA NA NA NA NA chr1-728 162601008 162601386 259 - chr1:162601144-162601222 NA NA NA NA NA chr1-727 162527021 162527254 152 - chr1:162527113-162527195 NA NA NA NA NA chr1-726 162457091 162457322 193 - chr1:162457094-162457268 NA NA NA NA NA chr1-725 162354130 162354330 174 - chr1:162354166-162354288 NA NA NA NA NA chr1-724 162238919 162239337 180 - chr1:162238955-162239016 NA NA NA NA NA chr1-723 162057805 162057976 169 - chr1:162057811-162057976 NA NA NA NA NA chr1-722 161788454 161788921 238 - chr1:161788523-161788612 NA NA NA NA NA chr1-721 161780087 161780404 214 - chr1:161780241-161780403 NA NA NA NA NA chr1-720 161495013 161495203 122 - chr1:161495039-161495114 NA NA NA NA NA chr1-719 161313385 161313644 156 - chr1:161313468-161313531 NA NA NA NA NA chr1-718 161225744 161225912 129 - chr1:161225853-161225908 NA NA NA NA NA chr1-717 161147638 161147925 214 - chr1:161147768-161147836 NA NA NA NA NA chr1-716 160988060 160988554 329 - chr1:160988133-160988446 NA NA NA NA NA chr1-715 160734260 160734571 196 - chr1:160734492-160734538 NA NA NA NA NA chr1-714 160650927 160651104 159 - chr1:160650939-160651083 NA NA NA NA NA chr1-713 160569769 160570156 213 - chr1:160569856-160569982 NA NA NA NA NA chr1-712 160230067 160230359 206 - chr1:160230211-160230305 NA NA NA NA NA chr1-711 160118885 160119126 130 - chr1:160118978-160118979 NA NA NA NA NA chr1-710 159851635 159851869 205 - chr1:159851722-159851869 NA NA NA NA NA chr1-709 159430750 159431006 154 - chr1:159430822-159430844 NA NA NA NA NA chr1-35 15935626 15935927 163 - chr1:15935773-15935807 NA NA NA NA NA chr1-708 159255366 159255693 196 - chr1:159255546-159255660 NA NA NA NA NA chr1-707 159065984 159066274 233 - chr1:159066069-159066188 NA NA NA NA NA chr1-706 159063093 159063497 294 - chr1:159063333-159063452 NA NA NA NA NA chr1-705 158988358 158988518 155 - chr1:158988369-158988514 NA NA NA NA NA chr1-704 158969199 158969618 245 - chr1:158969338-158969496 NA NA NA NA NA chr1-34 15884375 15884702 259 - chr1:15884380-15884503 NA NA NA NA NA chr1-703 158740899 158741135 152 - chr1:158740933-158741026 NA NA NA NA NA chr1-702 158434397 158434762 213 - chr1:158434607-158434639 NA NA NA NA NA chr1-701 158384937 158385110 149 - chr1:158384959-158385082 NA NA NA NA NA chr1-700 158256725 158257275 244 - chr1:158257118-158257143 NA NA NA NA NA chr1-699 158244494 158244786 235 - chr1:158244580-158244701 NA NA NA NA NA chr1-698 158183738 158184245 218 - chr1:158183877-158183881 NA NA NA NA NA chr1-697 158127325 158127519 152 - chr1:158127371-158127485 NA NA NA NA NA chr1-696 157552379 157552544 143 - chr1:157552379-157552511 NA NA NA NA NA chr1-695 157395782 157396231 312 - chr1:157395865-157396155 NA NA NA NA NA chr1-694 157250869 157251044 128 - chr1:157250951-157250985 NA NA NA NA NA chr1-693 157109564 157109720 151 - chr1:157109564-157109705 NA NA NA NA NA chr1-692 157108643 157108899 156 - chr1:157108791-157108823 NA NA NA NA NA chr1-691 157024673 157024971 153 - chr1:157024800-157024817 NA NA NA NA NA chr1-690 156530685 156531345 330 - chr1:156531005-156531010 NA NA NA NA NA chr1-33 15651282 15651483 144 - chr1:15651301-15651407 NA NA NA NA NA chr1-689 156305248 156305527 152 - chr1:156305381-156305403 NA NA NA NA NA chr1-688 155603492 155604014 270 - chr1:155603502-155603641 NA NA NA NA NA chr1-687 155436151 155436330 145 - chr1:155436207-155436307 NA NA NA NA NA chr1-686 155046867 155047379 246 - chr1:155046961-155047027 NA NA NA NA NA chr1-685 154911383 154911635 210 - chr1:154911402-154911528 NA NA NA NA NA chr1-684 154688593 154688893 159 - chr1:154688729-154688742 NA NA NA NA NA chr1-683 154666417 154666593 168 - chr1:154666422-154666586 NA NA NA NA NA chr1-682 154640876 154641031 151 - chr1:154640886-154641030 NA NA NA NA NA chr1-681 154519144 154519369 185 - chr1:154519170-154519301 NA NA NA NA NA chr1-680 154137769 154138143 195 - chr1:154137892-154137960 NA NA NA NA NA chr1-679 153328145 153328298 149 - chr1:153328145-153328292 NA NA NA NA NA chr1-678 153233537 153233756 180 - chr1:153233604-153233731 NA NA NA NA NA chr1-32 15319273 15319604 215 - chr1:15319416-15319573 NA NA NA NA NA chr1-677 153157392 153157641 214 - chr1:153157485-153157635 NA NA NA NA NA chr1-676 152822186 152822676 308 - chr1:152822265-152822408 NA NA NA NA NA chr1-675 152435855 152436143 155 - chr1:152435986-152436006 NA NA NA NA NA chr1-674 152240096 152240329 137 - chr1:152240162-152240208 NA NA NA NA NA chr1-673 152208570 152208721 148 - chr1:152208575-152208719 NA NA NA NA NA chr1-672 151896879 151897090 156 - chr1:151896930-151897033 NA NA NA NA NA chr1-671 151844398 151844716 231 - chr1:151844409-151844591 NA NA NA NA NA chr1-670 151262037 151262198 140 - chr1:151262079-151262177 NA NA NA NA NA chr1-669 151189433 151189711 158 - chr1:151189561-151189607 NA NA NA NA NA chr1-668 151156239 151156494 186 - chr1:151156294-151156397 NA NA NA NA NA chr1-667 151108404 151108601 146 - chr1:151108447-151108534 NA NA NA NA NA chr1-666 150988704 150988982 148 - chr1:150988837-150988858 NA NA NA NA NA chr1-665 150731561 150731854 152 - chr1:150731713-150731735 NA NA NA NA NA chr1-664 150660289 150660541 152 - chr1:150660389-150660441 NA NA NA NA NA chr1-663 150470757 150470951 157 - chr1:150470770-150470902 NA NA NA NA NA chr1-662 150103411 150103582 156 - chr1:150103450-150103576 NA NA NA NA NA chr1-661 150069906 150070170 204 - chr1:150070038-150070146 NA NA NA NA NA chr1-660 150051367 150051744 165 - chr1:150051403-150051434 NA NA NA NA NA chr1-31 14889338 14889600 226 - chr1:14889404-14889558 NA NA NA NA NA chr1-659 147849494 147849890 265 - chr1:147849497-147849840 NA NA NA NA NA chr1-658 147588837 147589074 163 - chr1:147588933-147589011 NA NA NA NA NA chr1-657 147567137 147567408 156 - chr1:147567244-147567289 NA NA NA NA NA chr1-656 147452446 147452927 317 - chr1:147452533-147452609 NA NA NA NA NA chr1-655 147450920 147451312 214 - chr1:147451063-147451064 NA NA NA NA NA chr1-654 147366440 147366828 255 - chr1:147366663-147366721 NA NA NA NA NA chr1-653 147081865 147082098 206 - chr1:147081885-147082037 NA NA NA NA NA chr1-652 147062655 147063042 226 - chr1:147062896-147063041 NA NA NA NA NA chr1-30 14662891 14663247 213 - chr1:14662987-14663048 NA NA NA NA NA chr1-29 14652238 14652456 156 - chr1:14652279-14652352 NA NA NA NA NA chr1-28 14650122 14650368 139 - chr1:14650241-14650267 NA NA NA NA NA chr1-651 145784766 145784944 169 - chr1:145784779-145784943 NA NA NA NA NA chr1-650 145745066 145745458 317 - chr1:145745103-145745307 NA NA NA NA NA chr1-27 14313044 14313282 186 - chr1:14313066-14313183 NA NA NA NA NA chr1-26 14254020 14254220 166 - chr1:14254026-14254124 NA NA NA NA NA chr1-25 13783849 13784101 166 - chr1:13783952-13784049 NA NA NA NA NA chr1-24 13753278 13753555 179 - chr1:13753333-13753477 NA NA NA NA NA chr1-23 13720344 13720577 211 - chr1:13720351-13720551 NA NA NA NA NA chr1-22 13703681 13703982 270 - chr1:13703744-13703967 NA NA NA NA NA chr1-21 13604756 13605153 186 - chr1:13604857-13604887 NA NA NA NA NA chr1-20 12767693 12768043 183 - chr1:12767864-12767878 NA NA NA NA NA chr1-19 12286643 12287358 316 - chr1:12286846-12286890 NA NA NA NA NA chr1-649 120133548 120134312 394 - chr1:120133638-120133727 NA NA NA NA NA chr1-648 119870486 119870694 188 - chr1:119870522-119870670 NA NA NA NA NA chr1-647 119752235 119752943 332 - chr1:119752639-119752803 NA NA NA NA NA chr1-646 119685921 119686218 171 - chr1:119686129-119686181 NA NA NA NA NA chr1-645 119662882 119663208 222 - chr1:119662999-119663146 NA NA NA NA NA chr1-644 119541407 119541678 203 - chr1:119541435-119541604 NA NA NA NA NA chr1-643 119528121 119528525 163 - chr1:119528170-119528188 NA NA NA NA NA chr1-642 119144277 119144518 132 - chr1:119144412-119144422 NA NA NA NA NA chr1-641 119090797 119091043 153 - chr1:119090890-119090950 NA NA NA NA NA chr1-640 118891021 118891181 153 - chr1:118891022-118891171 NA NA NA NA NA chr1-639 118811345 118811542 152 - chr1:118811386-118811489 NA NA NA NA NA chr1-638 118730281 118730478 179 - chr1:118730282-118730452 NA NA NA NA NA chr1-637 118412941 118413400 259 - chr1:118413236-118413246 NA NA NA NA NA chr1-636 118360081 118360247 142 - chr1:118360102-118360196 NA NA NA NA NA chr1-635 118249182 118249443 168 - chr1:118249273-118249349 NA NA NA NA NA chr1-634 118055969 118056421 289 - chr1:118056106-118056206 NA NA NA NA NA chr1-633 117956970 117957194 116 - chr1:117957018-117957080 NA NA NA NA NA chr1-632 117728480 117728790 204 - chr1:117728510-117728661 NA NA NA NA NA chr1-631 117633438 117633595 117 - chr1:117633470-117633567 NA NA NA NA NA chr1-630 117530618 117530829 164 - chr1:117530677-117530788 NA NA NA NA NA chr1-629 117320236 117320600 187 - chr1:117320315-117320374 NA NA NA NA NA chr1-628 117272833 117273011 128 - chr1:117272870-117272935 NA NA NA NA NA chr1-627 117193793 117194338 296 - chr1:117193994-117194232 NA NA NA NA NA chr1-626 116997468 116997745 181 - chr1:116997553-116997627 NA NA NA NA NA chr1-625 116688803 116688960 122 - chr1:116688803-116688855 NA NA NA NA NA chr1-624 116494727 116495008 160 - chr1:116494857-116494905 NA NA NA NA NA chr1-623 116435219 116435556 201 - chr1:116435387-116435440 NA NA NA NA NA chr1-622 116308390 116308739 223 - chr1:116308563-116308707 NA NA NA NA NA chr1-621 116291498 116291724 157 - chr1:116291567-116291655 NA NA NA NA NA chr1-620 116177040 116177400 228 - chr1:116177165-116177231 NA NA NA NA NA chr1-619 116145015 116145336 176 - chr1:116145107-116145163 NA NA NA NA NA chr1-618 115960551 115960929 227 - chr1:115960792-115960823 NA NA NA NA NA chr1-617 115938316 115938517 162 - chr1:115938351-115938470 NA NA NA NA NA chr1-616 115930878 115931198 264 - chr1:115931038-115931194 NA NA NA NA NA chr1-615 115905069 115905278 146 - chr1:115905114-115905179 NA NA NA NA NA chr1-614 115832350 115832767 235 - chr1:115832501-115832678 NA NA NA NA NA chr1-613 115819096 115819384 158 - chr1:115819216-115819249 NA NA NA NA NA chr1-612 115807416 115807696 239 - chr1:115807461-115807618 NA NA NA NA NA chr1-611 115770328 115770546 181 - chr1:115770381-115770517 NA NA NA NA NA chr1-610 115620652 115621068 256 - chr1:115620774-115620832 NA NA NA NA NA chr1-609 115478472 115478793 246 - chr1:115478582-115478788 NA NA NA NA NA chr1-608 115341508 115341708 176 - chr1:115341548-115341692 NA NA NA NA NA chr1-607 115277417 115277728 222 - chr1:115277428-115277600 NA NA NA NA NA chr1-606 115252902 115253083 170 - chr1:115252918-115253066 NA NA NA NA NA chr1-605 114978159 114978633 312 - chr1:114978238-114978305 NA NA NA NA NA chr1-604 114739645 114740014 200 - chr1:114739670-114739773 NA NA NA NA NA chr1-603 114651956 114652541 317 - chr1:114652377-114652528 NA NA NA NA NA chr1-602 114526093 114526367 155 - chr1:114526208-114526240 NA NA NA NA NA chr1-601 114464083 114464478 238 - chr1:114464092-114464247 NA NA NA NA NA chr1-600 114426085 114426309 184 - chr1:114426108-114426235 NA NA NA NA NA chr1-599 114349333 114349627 238 - chr1:114349425-114349563 NA NA NA NA NA chr1-598 114315880 114316311 247 - chr1:114315881-114316037 NA NA NA NA NA chr1-597 114142193 114142355 144 - chr1:114142211-114142337 NA NA NA NA NA chr1-596 114077193 114077445 153 - chr1:114077298-114077349 NA NA NA NA NA chr1-595 113998813 113999123 204 - chr1:113998966-113999117 NA NA NA NA NA chr1-594 113859646 113859915 160 - chr1:113859763-113859822 NA NA NA NA NA chr1-593 113822091 113822314 123 - chr1:113822137-113822187 NA NA NA NA NA chr1-592 113703102 113703276 139 - chr1:113703175-113703260 NA NA NA NA NA chr1-591 113695008 113695280 160 - chr1:113695114-113695165 NA NA NA NA NA chr1-590 113674970 113675277 215 - chr1:113675050-113675179 NA NA NA NA NA chr1-589 113595364 113595551 131 - chr1:113595446-113595508 NA NA NA NA NA chr1-588 113538579 113538745 151 - chr1:113538592-113538726 NA NA NA NA NA chr1-587 113512122 113512395 143 - chr1:113512256-113512273 NA NA NA NA NA chr1-586 113374536 113374804 187 - chr1:113374598-113374685 NA NA NA NA NA chr1-585 113291239 113291443 181 - chr1:113291260-113291416 NA NA NA NA NA chr1-584 113235145 113235376 134 - chr1:113235228-113235272 NA NA NA NA NA chr1-583 113174789 113175111 171 - chr1:113174952-113174966 NA NA NA NA NA chr1-582 112983150 112983564 203 - chr1:112983422-112983475 NA NA NA NA NA chr1-581 112976947 112977222 158 - chr1:112977050-112977098 NA NA NA NA NA chr1-580 112964325 112964632 175 - chr1:112964478-112964542 NA NA NA NA NA chr1-579 112963165 112963385 156 - chr1:112963219-112963316 NA NA NA NA NA chr1-578 112820072 112820277 150 - chr1:112820115-112820216 NA NA NA NA NA chr1-577 112344879 112345161 163 - chr1:112345020-112345053 NA NA NA NA NA chr1-576 112341568 112341753 131 - chr1:112341618-112341697 NA NA NA NA NA chr1-575 112254408 112254608 156 - chr1:112254458-112254567 NA NA NA NA NA chr1-574 112233685 112233944 157 - chr1:112233783-112233834 NA NA NA NA NA chr1-18 11221252 11221422 130 - chr1:11221281-11221360 NA NA NA NA NA chr1-17 11197846 11198006 149 - chr1:11197856-11197993 NA NA NA NA NA chr1-573 111864495 111864659 137 - chr1:111864508-111864625 NA NA NA NA NA chr1-572 111862994 111863199 115 - chr1:111863110-111863161 NA NA NA NA NA chr1-16 11178269 11178623 162 - chr1:11178443-11178509 NA NA NA NA NA chr1-571 111589448 111589672 157 - chr1:111589511-111589603 NA NA NA NA NA chr1-570 111531085 111531712 257 - chr1:111531573-111531578 NA NA NA NA NA chr1-569 111464328 111464604 166 - chr1:111464436-111464490 NA NA NA NA NA chr1-568 111450359 111450701 241 - chr1:111450556-111450648 NA NA NA NA NA chr1-567 111079818 111080051 143 - chr1:111079892-111079929 NA NA NA NA NA chr1-566 111002525 111002937 231 - chr1:111002684-111002861 NA NA NA NA NA chr1-15 11094756 11094968 148 - chr1:11094822-11094905 NA NA NA NA NA chr1-565 110873136 110873583 282 - chr1:110873214-110873487 NA NA NA NA NA chr1-564 110767724 110767992 153 - chr1:110767831-110767861 NA NA NA NA NA chr1-563 110761478 110761973 304 - chr1:110761819-110761857 NA NA NA NA NA chr1-562 110578958 110579220 165 - chr1:110579057-110579127 NA NA NA NA NA chr1-561 110358859 110359259 258 - chr1:110358944-110359146 NA NA NA NA NA chr1-560 110334546 110334698 112 - chr1:110334564-110334647 NA NA NA NA NA chr1-559 109953167 109953407 160 - chr1:109953254-109953341 NA NA NA NA NA chr1-558 109940188 109940402 189 - chr1:109940194-109940339 NA NA NA NA NA chr1-557 109908384 109908648 159 - chr1:109908485-109908535 NA NA NA NA NA chr1-556 109878225 109878491 188 - chr1:109878322-109878451 NA NA NA NA NA chr1-555 109877493 109877910 294 - chr1:109877550-109877655 NA NA NA NA NA chr1-554 109810022 109810295 165 - chr1:109810112-109810178 NA NA NA NA NA chr1-553 109621522 109621731 147 - chr1:109621610-109621682 NA NA NA NA NA chr1-552 109479902 109480222 209 - chr1:109480058-109480203 NA NA NA NA NA chr1-551 109443199 109443917 452 - chr1:109443275-109443815 NA NA NA NA NA chr1-550 109375086 109375304 152 - chr1:109375141-109375216 NA NA NA NA NA chr1-549 109120824 109121088 150 - chr1:109120942-109120976 NA NA NA NA NA chr1-548 109005747 109006041 157 - chr1:109005891-109005918 NA NA NA NA NA chr1-547 108946584 108946875 183 - chr1:108946638-108946767 NA NA NA NA NA chr1-546 108554522 108554814 208 - chr1:108554618-108554695 NA NA NA NA NA chr1-14 10816483 10816852 220 - chr1:10816522-10816648 NA NA NA NA NA chr1-545 108034764 108035039 182 - chr1:108034877-108034950 NA NA NA NA NA chr1-544 107986493 107986691 177 - chr1:107986504-107986650 NA NA NA NA NA chr1-543 107956879 107957083 159 - chr1:107956918-107957035 NA NA NA NA NA chr1-542 107538466 107538685 181 - chr1:107538536-107538641 NA NA NA NA NA chr1-541 107463131 107463419 162 - chr1:107463256-107463355 NA NA NA NA NA chr1-540 107082602 107082888 206 - chr1:107082693-107082859 NA NA NA NA NA chr1-539 106608298 106608686 239 - chr1:106608416-106608475 NA NA NA NA NA chr1-538 106507849 106508418 297 - chr1:106508262-106508415 NA NA NA NA NA chr1-537 106353211 106353643 196 - chr1:106353353-106353360 NA NA NA NA NA chr1-536 106323600 106323786 157 - chr1:106323649-106323774 NA NA NA NA NA chr1-535 106211219 106211513 251 - chr1:106211325-106211490 NA NA NA NA NA chr1-534 106090611 106090932 168 - chr1:106090783-106090817 NA NA NA NA NA chr1-533 106080785 106081027 121 - chr1:106080929-106080952 NA NA NA NA NA chr1-532 105425863 105426021 125 - chr1:105425960-105426020 NA NA NA NA NA chr1-531 105418718 105419028 191 - chr1:105418816-105418867 NA NA NA NA NA chr1-530 105177120 105177370 152 - chr1:105177226-105177288 NA NA NA NA NA chr1-529 105167275 105167552 219 - chr1:105167415-105167535 NA NA NA NA NA chr1-528 104742364 104742542 151 - chr1:104742394-104742521 NA NA NA NA NA chr1-527 104652442 104652653 184 - chr1:104652523-104652653 NA NA NA NA NA chr1-526 104647235 104647437 159 - chr1:104647296-104647403 NA NA NA NA NA chr1-13 10462668 10462918 152 - chr1:10462760-10462817 NA NA NA NA NA chr1-525 104445282 104445676 286 - chr1:104445307-104445377 NA NA NA NA NA chr1-524 104404913 104405129 146 - chr1:104404990-104405073 NA NA NA NA NA chr1-523 104133941 104134226 152 - chr1:104134074-104134093 NA NA NA NA NA chr1-522 104059127 104059281 141 - chr1:104059155-104059270 NA NA NA NA NA chr1-521 104034250 104034525 194 - chr1:104034371-104034524 NA NA NA NA NA chr1-520 104032334 104032531 164 - chr1:104032376-104032516 NA NA NA NA NA chr1-519 103943750 103943930 141 - chr1:103943775-103943838 NA NA NA NA NA chr1-518 103798263 103798434 158 - chr1:103798270-103798406 NA NA NA NA NA chr1-517 103439467 103439744 235 - chr1:103439531-103439682 NA NA NA NA NA chr1-516 103334209 103334691 226 - chr1:103334546-103334597 NA NA NA NA NA chr1-515 103090445 103090781 178 - chr1:103090543-103090593 NA NA NA NA NA chr1-514 103035536 103035697 144 - chr1:103035558-103035690 NA NA NA NA NA chr1-513 102948373 102948632 164 - chr1:102948460-102948533 NA NA NA NA NA chr1-512 102896918 102897153 196 - chr1:102896931-102897062 NA NA NA NA NA chr1-12 10233271 10233447 157 - chr1:10233294-10233430 NA NA NA NA NA chr1-511 102297777 102298122 190 - chr1:102297860-102297931 NA NA NA NA NA chr1-510 102166044 102166369 207 - chr1:102166091-102166239 NA NA NA NA NA chr1-509 102039926 102040366 217 - chr1:102040057-102040097 NA NA NA NA NA chr1-508 101927123 101927647 268 - chr1:101927207-101927374 NA NA NA NA NA chr1-507 101693392 101693737 193 - chr1:101693587-101693646 NA NA NA NA NA chr1-506 101667276 101667443 162 - chr1:101667291-101667443 NA NA NA NA NA chr1-505 101370188 101370490 160 - chr1:101370320-101370343 NA NA NA NA NA chr1-504 101019840 101020127 154 - chr1:101019967-101019991 NA NA NA NA NA chr1-503 100922523 100922975 207 - chr1:100922672-100922682 NA NA NA NA NA chr1-502 100805247 100805533 215 - chr1:100805340-100805413 NA NA NA NA NA chr1-501 100608971 100609310 183 - chr1:100609025-100609103 NA NA NA NA NA chr1-500 100586207 100586363 136 - chr1:100586237-100586363 NA NA NA NA NA chr1-499 100482715 100482901 153 - chr1:100482748-100482868 NA NA NA NA NA chr1-498 100013867 100014111 150 - chr1:100013955-100014014 NA NA NA NA NA chr19-6 8313954 8314132 118 - chr19:8313982-8314008 NA NA NA NA NA chr19-5 6642480 6642799 157 - chr19:6642612-6642622 NA NA NA NA NA chr19-4 6441156 6441396 180 - chr19:6441241-6441386 NA NA NA NA NA chr19-141 57968461 57968811 179 - chr19:57968622-57968660 NA NA NA NA NA chr19-140 57676775 57677024 215 - chr19:57676817-57676964 NA NA NA NA NA chr19-139 57465714 57465895 155 - chr19:57465736-57465861 NA NA NA NA NA chr19-138 57147755 57148052 207 - chr19:57147814-57147976 NA NA NA NA NA chr19-137 56077071 56077287 154 - chr19:56077139-56077228 NA NA NA NA NA chr19-3 5607112 5607546 199 - chr19:5607400-5607417 NA NA NA NA NA chr19-136 55931587 55931752 151 - chr19:55931600-55931744 NA NA NA NA NA chr19-135 55849461 55849736 153 - chr19:55849577-55849602 NA NA NA NA NA chr19-134 55830647 55830815 140 - chr19:55830677-55830791 NA NA NA NA NA chr19-133 55428052 55428343 158 - chr19:55428195-55428230 NA NA NA NA NA chr19-132 53624276 53624624 217 - chr19:53624297-53624438 NA NA NA NA NA chr19-131 52872426 52872606 166 - chr19:52872454-52872599 NA NA NA NA NA chr19-130 52153591 52154038 240 - chr19:52153779-52153793 NA NA NA NA NA chr19-129 52120375 52120706 160 - chr19:52120609-52120661 NA NA NA NA NA chr19-128 52041677 52041852 155 - chr19:52041694-52041839 NA NA NA NA NA chr19-127 51639204 51639464 171 - chr19:51639285-51639359 NA NA NA NA NA chr19-126 51497326 51497630 254 - chr19:51497395-51497549 NA NA NA NA NA chr19-125 50652792 50652978 162 - chr19:50652815-50652965 NA NA NA NA NA chr19-124 50439997 50440310 165 - chr19:50440151-50440165 NA NA NA NA NA chr19-123 49301152 49301326 139 - chr19:49301190-49301297 NA NA NA NA NA chr19-122 48737561 48737778 128 - chr19:48737700-48737714 NA NA NA NA NA chr19-121 48526462 48526647 157 - chr19:48526483-48526605 NA NA NA NA NA chr19-120 48313485 48313717 181 - chr19:48313584-48313663 NA NA NA NA NA chr19-119 48052638 48052941 225 - chr19:48052745-48052921 NA NA NA NA NA chr19-118 47870329 47870509 160 - chr19:47870355-47870505 NA NA NA NA NA chr19-117 47650938 47651224 142 - chr19:47651085-47651086 NA NA NA NA NA chr19-116 47186704 47187120 240 - chr19:47186810-47186996 NA NA NA NA NA chr19-115 46266045 46266226 151 - chr19:46266073-46266195 NA NA NA NA NA chr19-114 45823703 45823917 124 - chr19:45823817-45823896 NA NA NA NA NA chr19-113 45738530 45738820 174 - chr19:45738674-45738718 NA NA NA NA NA chr19-2 4548925 4549181 170 - chr19:4549013-4549099 NA NA NA NA NA chr19-112 45483026 45483225 136 - chr19:45483076-45483136 NA NA NA NA NA chr19-111 45121857 45122150 181 - chr19:45121975-45122100 NA NA NA NA NA chr19-110 44835305 44835601 192 - chr19:44835400-44835540 NA NA NA NA NA chr19-109 44339932 44340084 151 - chr19:44339933-44340083 NA NA NA NA NA chr19-108 44302014 44302227 155 - chr19:44302059-44302151 NA NA NA NA NA chr19-107 44198185 44198477 190 - chr19:44198279-44198418 NA NA NA NA NA chr19-106 44163075 44163306 122 - chr19:44163152-44163181 NA NA NA NA NA chr19-105 43978245 43978553 245 - chr19:43978400-43978536 NA NA NA NA NA chr19-104 43862079 43862266 171 - chr19:43862099-43862238 NA NA NA NA NA chr19-103 43564238 43564545 239 - chr19:43564329-43564523 NA NA NA NA NA chr19-102 43537674 43538534 340 - chr19:43537689-43537755 NA NA NA NA NA chr19-101 43473072 43473296 132 - chr19:43473154-43473199 NA NA NA NA NA chr19-100 42624056 42624363 162 - chr19:42624151-42624193 NA NA NA NA NA chr19-99 42497067 42497407 178 - chr19:42497175-42497218 NA NA NA NA NA chr19-98 42181114 42181492 302 - chr19:42181300-42181450 NA NA NA NA NA chr19-97 41937656 41937979 250 - chr19:41937801-41937942 NA NA NA NA NA chr19-96 41818782 41818990 156 - chr19:41818834-41818938 NA NA NA NA NA chr19-95 41310798 41311143 225 - chr19:41310803-41310968 NA NA NA NA NA chr19-94 40755146 40755555 228 - chr19:40755381-40755482 NA NA NA NA NA chr19-93 40699799 40699993 165 - chr19:40699828-40699964 NA NA NA NA NA chr19-92 40228362 40228609 181 - chr19:40228383-40228531 NA NA NA NA NA chr19-91 39952583 39952931 190 - chr19:39952773-39952789 NA NA NA NA NA chr19-90 39868137 39868425 190 - chr19:39868279-39868415 NA NA NA NA NA chr19-89 39765508 39765820 212 - chr19:39765583-39765745 NA NA NA NA NA chr19-88 39276458 39276699 163 - chr19:39276524-39276615 NA NA NA NA NA chr19-87 39075645 39075808 158 - chr19:39075655-39075803 NA NA NA NA NA chr19-86 38891293 38891605 193 - chr19:38891444-38891550 NA NA NA NA NA chr19-85 38721432 38721679 193 - chr19:38721469-38721591 NA NA NA NA NA chr19-84 38302160 38302558 227 - chr19:38302325-38302375 NA NA NA NA NA chr19-83 38250318 38250715 269 - chr19:38250325-38250459 NA NA NA NA NA chr19-82 38203835 38204147 190 - chr19:38203936-38203983 NA NA NA NA NA chr19-81 37998603 37998842 153 - chr19:37998695-37998768 NA NA NA NA NA chr19-80 37924424 37924730 162 - chr19:37924562-37924583 NA NA NA NA NA chr19-79 37509198 37509374 158 - chr19:37509212-37509348 NA NA NA NA NA chr19-78 37401938 37402112 157 - chr19:37401954-37402093 NA NA NA NA NA chr19-77 36657838 36658106 156 - chr19:36657838-36657938 NA NA NA NA NA chr19-76 36153149 36153536 244 - chr19:36153159-36153301 NA NA NA NA NA chr19-75 35800622 35801141 274 - chr19:35800713-35800819 NA NA NA NA NA chr19-74 35556500 35556720 151 - chr19:35556573-35556659 NA NA NA NA NA chr19-73 35177960 35178199 172 - chr19:35178025-35178128 NA NA NA NA NA chr19-72 35125291 35125463 122 - chr19:35125339-35125436 NA NA NA NA NA chr19-71 35047012 35047324 157 - chr19:35047173-35047181 NA NA NA NA NA chr19-70 33646115 33646359 156 - chr19:33646207-33646279 NA NA NA NA NA chr19-69 32913170 32913405 147 - chr19:32913257-32913315 NA NA NA NA NA chr19-68 32474270 32474534 159 - chr19:32474383-32474433 NA NA NA NA NA chr19-67 32405054 32405393 166 - chr19:32405211-32405212 NA NA NA NA NA chr19-66 32209443 32209698 153 - chr19:32209547-32209597 NA NA NA NA NA chr19-65 31881705 31881990 244 - chr19:31881756-31881918 NA NA NA NA NA chr19-64 31870711 31871277 333 - chr19:31870928-31871036 NA NA NA NA NA chr19-63 31768838 31769052 133 - chr19:31768861-31768942 NA NA NA NA NA chr19-62 31738076 31738244 162 - chr19:31738082-31738232 NA NA NA NA NA chr19-61 31559031 31559205 154 - chr19:31559047-31559183 NA NA NA NA NA chr19-60 31514274 31514497 131 - chr19:31514344-31514394 NA NA NA NA NA chr19-59 31406159 31406319 117 - chr19:31406166-31406258 NA NA NA NA NA chr19-58 31316834 31317092 167 - chr19:31316925-31317001 NA NA NA NA NA chr19-57 30979160 30979358 160 - chr19:30979200-30979324 NA NA NA NA NA chr19-56 30820998 30821265 158 - chr19:30821105-30821155 NA NA NA NA NA chr19-55 30652094 30652314 169 - chr19:30652197-30652314 NA NA NA NA NA chr19-54 30401318 30401632 167 - chr19:30401479-30401513 NA NA NA NA NA chr19-53 30359958 30360257 175 - chr19:30360081-30360131 NA NA NA NA NA chr19-52 30267295 30267476 142 - chr19:30267412-30267476 NA NA NA NA NA chr19-51 30215955 30216111 155 - chr19:30215955-30216108 NA NA NA NA NA chr19-50 30134382 30134592 176 - chr19:30134419-30134564 NA NA NA NA NA chr19-49 30029071 30029364 191 - chr19:30029102-30029242 NA NA NA NA NA chr19-48 29996507 29996754 154 - chr19:29996658-29996671 NA NA NA NA NA chr19-47 29940573 29940743 144 - chr19:29940645-29940740 NA NA NA NA NA chr19-46 29834283 29834642 218 - chr19:29834292-29834435 NA NA NA NA NA chr19-45 29648263 29648473 129 - chr19:29648370-29648405 NA NA NA NA NA chr19-44 29523771 29524035 199 - chr19:29523880-29523992 NA NA NA NA NA chr19-43 29523086 29523340 123 - chr19:29523239-29523250 NA NA NA NA NA chr19-42 29414051 29414378 260 - chr19:29414101-29414277 NA NA NA NA NA chr19-41 29369594 29370045 271 - chr19:29369717-29369761 NA NA NA NA NA chr19-40 29234711 29234925 158 - chr19:29234771-29234871 NA NA NA NA NA chr19-39 29224021 29224245 172 - chr19:29224049-29224195 NA NA NA NA NA chr19-38 29078364 29078658 194 - chr19:29078501-29078632 NA NA NA NA NA chr19-37 29002936 29003268 253 - chr19:29002949-29003057 NA NA NA NA NA chr19-36 28827148 28827323 139 - chr19:28827175-28827269 NA NA NA NA NA chr19-35 28781057 28781301 150 - chr19:28781151-28781207 NA NA NA NA NA chr19-34 28771926 28772357 281 - chr19:28772015-28772085 NA NA NA NA NA chr19-33 28628269 28628530 152 - chr19:28628380-28628422 NA NA NA NA NA chr19-32 28483808 28484247 350 - chr19:28483835-28484007 NA NA NA NA NA chr19-31 28457559 28457801 168 - chr19:28457640-28457741 NA NA NA NA NA chr19-30 28440623 28441040 206 - chr19:28440692-28440808 NA NA NA NA NA chr19-29 28298832 28299044 152 - chr19:28298879-28298958 NA NA NA NA NA chr19-28 28247111 28247401 208 - chr19:28247123-28247284 NA NA NA NA NA chr19-27 28122735 28122951 159 - chr19:28122800-28122898 NA NA NA NA NA chr19-26 27916850 27917187 213 - chr19:27916956-27917107 NA NA NA NA NA chr19-25 27859577 27860192 289 - chr19:27859920-27859981 NA NA NA NA NA chr19-24 27803577 27803842 188 - chr19:27803740-27803808 NA NA NA NA NA chr19-23 27792017 27792535 287 - chr19:27792197-27792202 NA NA NA NA NA chr19-22 27758589 27758778 157 - chr19:27758627-27758749 NA NA NA NA NA chr19-21 27721756 27722298 344 - chr19:27721926-27722044 NA NA NA NA NA chr19-20 27666610 27667128 352 - chr19:27666625-27666939 NA NA NA NA NA chr19-19 27651745 27652009 222 - chr19:27651748-27651889 NA NA NA NA NA chr19-18 27606756 27606941 159 - chr19:27606786-27606917 NA NA NA NA NA chr19-17 27360396 27360561 156 - chr19:27360404-27360542 NA NA NA NA NA chr19 2704583 2704770 173 - chr19:2704600-2704745 NA NA NA NA NA chr19-16 21452970 21453163 169 - chr19:21452993-21453137 NA NA NA NA NA chr19-15 19086539 19086717 139 - chr19:19086604-19086665 NA NA NA NA NA chr19-14 18121035 18121321 199 - chr19:18121131-18121186 NA NA NA NA NA chr19-13 17975296 17975586 226 - chr19:17975323-17975448 NA NA NA NA NA chr19-12 15583167 15583420 161 - chr19:15583258-15583326 NA NA NA NA NA chr19-11 14116299 14116504 139 - chr19:14116359-14116465 NA NA NA NA NA chr19-10 12734678 12734918 195 - chr19:12734739-12734905 NA NA NA NA NA chr19-9 12110011 12110279 146 - chr19:12110127-12110145 NA NA NA NA NA chr19-8 11006073 11006423 220 - chr19:11006262-11006411 NA NA NA NA NA chr19-7 10163577 10163809 158 - chr19:10163652-10163737 NA NA NA NA NA chr18-129 9928304 9928618 154 - chr18:9928457-9928469 NA NA NA NA NA chr18-128 9801324 9801936 318 - chr18:9801665-9801801 NA NA NA NA NA chr18-127 9725702 9725921 138 - chr18:9725827-9725862 NA NA NA NA NA chr18-126 9598601 9599013 301 - chr18:9598746-9598919 NA NA NA NA NA chr18-125 9551986 9552222 232 - chr18:9551986-9552216 NA NA NA NA NA chr18-124 9518360 9518536 126 - chr18:9518384-9518485 NA NA NA NA NA chr18-123 9501787 9502016 142 - chr18:9501862-9501905 NA NA NA NA NA chr18-122 9342740 9342966 162 - chr18:9342820-9342910 NA NA NA NA NA chr18-121 9336685 9336910 152 - chr18:9336762-9336839 NA NA NA NA NA chr18-120 9329137 9329512 191 - chr18:9329277-9329306 NA NA NA NA NA chr18-119 9315779 9315975 160 - chr18:9315811-9315931 NA NA NA NA NA chr18-118 9235048 9235374 274 - chr18:9235184-9235354 NA NA NA NA NA chr18-6 921740 921907 155 - chr18:921745-921881 NA NA NA NA NA chr18-117 9212184 9212581 260 - chr18:9212334-9212470 NA NA NA NA NA chr18-116 9190458 9190808 266 - chr18:9190458-9190682 NA NA NA NA NA chr18-115 9150414 9150740 178 - chr18:9150504-9150563 NA NA NA NA NA chr18-114 9145098 9145296 146 - chr18:9145152-9145248 NA NA NA NA NA chr18-113 9124766 9125026 149 - chr18:9124878-9124917 NA NA NA NA NA chr18-112 8853439 8853818 275 - chr18:8853558-8853744 NA NA NA NA NA chr18-111 8768308 8768666 149 - chr18:8768532-8768576 NA NA NA NA NA chr18-110 8583038 8583450 225 - chr18:8583291-8583377 NA NA NA NA NA chr18-109 8295906 8296279 182 - chr18:8296173-8296189 NA NA NA NA NA chr18-108 8259589 8259856 163 - chr18:8259697-8259773 NA NA NA NA NA chr18-107 8211735 8211987 157 - chr18:8211821-8211874 NA NA NA NA NA chr18-106 8185824 8185983 123 - chr18:8185912-8185973 NA NA NA NA NA chr18-105 8087791 8088006 139 - chr18:8087873-8087942 NA NA NA NA NA chr18-104 8019918 8020223 179 - chr18:8019997-8020003 NA NA NA NA NA chr18-374 80113813 80114124 154 - chr18:80113974-80113975 NA NA NA NA NA chr18-5 795202 795413 165 - chr18:795228-795327 NA NA NA NA NA chr18-373 79336183 79336369 149 - chr18:79336222-79336336 NA NA NA NA NA chr18-103 7901566 7901853 237 - chr18:7901658-7901795 NA NA NA NA NA chr18-102 7835686 7836030 246 - chr18:7835838-7835959 NA NA NA NA NA chr18-372 78303922 78304372 224 - chr18:78304078-78304111 NA NA NA NA NA chr18-371 78217008 78217440 248 - chr18:78217056-78217212 NA NA NA NA NA chr18-370 77701632 77701763 119 - chr18:77701633-77701728 NA NA NA NA NA chr18-101 7760768 7761000 148 - chr18:7760852-7760916 NA NA NA NA NA chr18-369 77318252 77318488 149 - chr18:77318340-77318403 NA NA NA NA NA chr18-368 77228470 77228708 179 - chr18:77228495-77228632 NA NA NA NA NA chr18-367 77059207 77059421 169 - chr18:77059245-77059362 NA NA NA NA NA chr18-366 76927615 76927863 155 - chr18:76927714-76927782 NA NA NA NA NA chr18-100 7683717 7684016 269 - chr18:7683727-7683981 NA NA NA NA NA chr18-365 76769524 76769670 118 - chr18:76769528-76769632 NA NA NA NA NA chr18-364 76638965 76639193 186 - chr18:76639001-76639166 NA NA NA NA NA chr18-363 76481490 76481660 146 - chr18:76481508-76481633 NA NA NA NA NA chr18-99 7645496 7645843 171 - chr18:7645631-7645642 NA NA NA NA NA chr18-98 7628062 7628331 119 - chr18:7628283-7628327 NA NA NA NA NA chr18-362 76154421 76154793 249 - chr18:76154447-76154651 NA NA NA NA NA chr18-361 76008167 76008463 145 - chr18:76008288-76008297 NA NA NA NA NA chr18-360 75714641 75714935 150 - chr18:75714783-75714790 NA NA NA NA NA chr18-359 75697728 75698061 252 - chr18:75697959-75698049 NA NA NA NA NA chr18-358 74758926 74759129 152 - chr18:74758980-74759084 NA NA NA NA NA chr18-357 74636961 74637384 282 - chr18:74637036-74637111 NA NA NA NA NA chr18-97 7425761 7425946 129 - chr18:7425775-7425869 NA NA NA NA NA chr18-356 74047055 74047280 172 - chr18:74047118-74047232 NA NA NA NA NA chr18-96 7387854 7388110 152 - chr18:7387953-7387996 NA NA NA NA NA chr18-355 73144988 73145304 186 - chr18:73145145-73145266 NA NA NA NA NA chr18-354 73067682 73067888 152 - chr18:73067756-73067844 NA NA NA NA NA chr18-353 72822342 72822555 147 - chr18:72822404-72822487 NA NA NA NA NA chr18-352 72757671 72757945 192 - chr18:72757749-72757836 NA NA NA NA NA chr18-351 71990320 71990662 220 - chr18:71990446-71990532 NA NA NA NA NA chr18-350 71868444 71868617 153 - chr18:71868469-71868612 NA NA NA NA NA chr18-349 71729408 71729765 231 - chr18:71729595-71729763 NA NA NA NA NA chr18-348 71351331 71351470 117 - chr18:71351344-71351417 NA NA NA NA NA chr18-347 71339167 71339408 156 - chr18:71339236-71339315 NA NA NA NA NA chr18-346 71289412 71289695 164 - chr18:71289541-71289581 NA NA NA NA NA chr18-95 7120034 7120278 171 - chr18:7120061-7120182 NA NA NA NA NA chr18-345 71198107 71198289 151 - chr18:71198142-71198260 NA NA NA NA NA chr18-344 70593784 70593989 158 - chr18:70593827-70593940 NA NA NA NA NA chr18-343 70441145 70441380 191 - chr18:70441199-70441368 NA NA NA NA NA chr18-342 70382471 70382721 205 - chr18:70382496-70382636 NA NA NA NA NA chr18-341 70133047 70133390 169 - chr18:70133245-70133264 NA NA NA NA NA chr18-340 70117641 70117990 286 - chr18:70117768-70117928 NA NA NA NA NA chr18-94 6989863 6990149 196 - chr18:6989967-6990118 NA NA NA NA NA chr18-93 6989112 6989300 164 - chr18:6989112-6989264 NA NA NA NA NA chr18-339 69801232 69801457 164 - chr18:69801267-69801383 NA NA NA NA NA chr18-338 69669366 69669623 173 - chr18:69669470-69669549 NA NA NA NA NA chr18-337 69325859 69326053 151 - chr18:69325906-69326012 NA NA NA NA NA chr18-92 6913429 6913621 144 - chr18:6913485-6913577 NA NA NA NA NA chr18-336 69014133 69014359 164 - chr18:69014190-69014287 NA NA NA NA NA chr18-91 6897084 6897375 207 - chr18:6897189-6897354 NA NA NA NA NA chr18-335 68954936 68955142 161 - chr18:68954982-68955099 NA NA NA NA NA chr18-334 68919168 68919535 217 - chr18:68919282-68919313 NA NA NA NA NA chr18-333 68778176 68778406 136 - chr18:68778260-68778307 NA NA NA NA NA chr18-332 68755882 68756220 155 - chr18:68755997-68756003 NA NA NA NA NA chr18-331 68695035 68695299 161 - chr18:68695156-68695205 NA NA NA NA NA chr18-330 68564209 68564409 158 - chr18:68564253-68564371 NA NA NA NA NA chr18-90 6842741 6842909 156 - chr18:6842755-6842898 NA NA NA NA NA chr18-329 68247546 68247955 264 - chr18:68247752-68247917 NA NA NA NA NA chr18-328 68187079 68187457 288 - chr18:68187109-68187352 NA NA NA NA NA chr18-327 68102921 68103183 152 - chr18:68103025-68103061 NA NA NA NA NA chr18-326 68015349 68015853 315 - chr18:68015710-68015750 NA NA NA NA NA chr18-325 67908944 67909244 244 - chr18:67909094-67909235 NA NA NA NA NA chr18-324 67828894 67829216 205 - chr18:67829008-67829049 NA NA NA NA NA chr18-323 67781585 67781974 263 - chr18:67781909-67781947 NA NA NA NA NA chr18-89 6747699 6747854 116 - chr18:6747772-6747810 NA NA NA NA NA chr18-4 673797 674144 169 - chr18:673993-674002 NA NA NA NA NA chr18-322 67281830 67282019 142 - chr18:67281835-67281888 NA NA NA NA NA chr18-321 67107542 67107797 135 - chr18:67107631-67107635 NA NA NA NA NA chr18-88 6671600 6672494 497 - chr18:6671600-6672072 NA NA NA NA NA chr18-320 66596443 66596742 247 - chr18:66596559-66596722 NA NA NA NA NA chr18-319 66541805 66542294 189 - chr18:66541849-66541866 NA NA NA NA NA chr18-318 66491471 66491798 167 - chr18:66491649-66491666 NA NA NA NA NA chr18-317 66214141 66214443 161 - chr18:66214288-66214305 NA NA NA NA NA chr18-316 65998450 65998690 156 - chr18:65998550-65998614 NA NA NA NA NA chr18-315 65987111 65987330 148 - chr18:65987192-65987264 NA NA NA NA NA chr18-314 65687623 65687865 163 - chr18:65687718-65687794 NA NA NA NA NA chr18-313 65598550 65598850 181 - chr18:65598625-65598709 NA NA NA NA NA chr18-312 65482542 65482703 150 - chr18:65482551-65482679 NA NA NA NA NA chr18-3 654553 654736 136 - chr18:654620-654729 NA NA NA NA NA chr18-311 65306421 65306707 154 - chr18:65306557-65306570 NA NA NA NA NA chr18-310 65302049 65302501 256 - chr18:65302184-65302342 NA NA NA NA NA chr18-309 64944396 64945026 501 - chr18:64944537-64944972 NA NA NA NA NA chr18-308 64875290 64875560 187 - chr18:64875399-64875529 NA NA NA NA NA chr18-87 6487375 6487667 170 - chr18:6487458-6487467 NA NA NA NA NA chr18-307 64656980 64657191 141 - chr18:64657074-64657133 NA NA NA NA NA chr18-306 64630677 64631024 249 - chr18:64630771-64630924 NA NA NA NA NA chr18-305 64502996 64503321 171 - chr18:64503183-64503233 NA NA NA NA NA chr18-304 64284178 64284514 237 - chr18:64284276-64284366 NA NA NA NA NA chr18-303 64188871 64189158 211 - chr18:64188887-64189060 NA NA NA NA NA chr18-302 64115447 64115916 220 - chr18:64115747-64115769 NA NA NA NA NA chr18-86 6395631 6396005 191 - chr18:6395896-6395986 NA NA NA NA NA chr18-301 63531388 63531724 192 - chr18:63531500-63531620 NA NA NA NA NA chr18-300 63354732 63354924 142 - chr18:63354774-63354870 NA NA NA NA NA chr18-85 6323463 6323679 162 - chr18:6323499-6323616 NA NA NA NA NA chr18-84 6278606 6278857 166 - chr18:6278681-6278752 NA NA NA NA NA chr18-299 62769839 62770011 138 - chr18:62769899-62769990 NA NA NA NA NA chr18-298 62609958 62610227 197 - chr18:62610047-62610208 NA NA NA NA NA chr18-297 62599575 62599743 162 - chr18:62599589-62599739 NA NA NA NA NA chr18-296 62575945 62576282 275 - chr18:62576038-62576282 NA NA NA NA NA chr18-295 62501841 62502068 144 - chr18:62501922-62501984 NA NA NA NA NA chr18-294 62395673 62395832 147 - chr18:62395685-62395820 NA NA NA NA NA chr18-293 62201906 62202144 164 - chr18:62201996-62202095 NA NA NA NA NA chr18-83 6217974 6218304 199 - chr18:6218163-6218289 NA NA NA NA NA chr18-82 6200294 6200516 154 - chr18:6200367-6200458 NA NA NA NA NA chr18-292 61723388 61723616 175 - chr18:61723431-61723543 NA NA NA NA NA chr18-291 61537356 61537706 184 - chr18:61537522-61537540 NA NA NA NA NA chr18-81 6150243 6150475 161 - chr18:6150321-6150418 NA NA NA NA NA chr18-290 61455804 61455977 145 - chr18:61455817-61455906 NA NA NA NA NA chr18-289 61150985 61151184 195 - chr18:61150997-61151184 NA NA NA NA NA chr18-288 61016585 61017187 252 - chr18:61016726-61016727 NA NA NA NA NA chr18-80 6091930 6092277 279 - chr18:6091996-6092205 NA NA NA NA NA chr18-287 60717879 60718048 128 - chr18:60717937-60718041 NA NA NA NA NA chr18-286 60672709 60673137 272 - chr18:60672803-60672857 NA NA NA NA NA chr18-285 60537130 60537405 219 - chr18:60537130-60537237 NA NA NA NA NA chr18-284 60448243 60448470 173 - chr18:60448294-60448410 NA NA NA NA NA chr18-79 5983011 5983203 158 - chr18:5983040-5983159 NA NA NA NA NA chr18-283 59363844 59364060 169 - chr18:59363923-59364029 NA NA NA NA NA chr18-78 5927395 5927705 272 - chr18:5927443-5927687 NA NA NA NA NA chr18-282 59106108 59106554 349 - chr18:59106386-59106541 NA NA NA NA NA chr18-281 59051425 59051745 188 - chr18:59051598-59051695 NA NA NA NA NA chr18-280 58245884 58246044 146 - chr18:58245901-58246040 NA NA NA NA NA chr18-279 57964857 57965206 193 - chr18:57965062-57965119 NA NA NA NA NA chr18-278 57962049 57962276 152 - chr18:57962126-57962205 NA NA NA NA NA chr18-77 5792358 5792653 252 - chr18:5792469-5792644 NA NA NA NA NA chr18-76 5776097 5776507 192 - chr18:5776353-5776365 NA NA NA NA NA chr18-277 57615807 57616048 146 - chr18:57615902-57615953 NA NA NA NA NA chr18-75 5722768 5722974 154 - chr18:5722825-5722920 NA NA NA NA NA chr18-276 57193595 57193856 166 - chr18:57193682-57193745 NA NA NA NA NA chr18-275 56751374 56751724 164 - chr18:56751428-56751472 NA NA NA NA NA chr18-274 56502910 56503188 210 - chr18:56503006-56503080 NA NA NA NA NA chr18-273 56396861 56397139 139 - chr18:56396988-56396994 NA NA NA NA NA chr18-74 5631393 5631699 246 - chr18:5631565-5631695 NA NA NA NA NA chr18-272 56186092 56186268 148 - chr18:56186119-56186238 NA NA NA NA NA chr18-271 55456700 55457008 190 - chr18:55456859-55456916 NA NA NA NA NA chr18-73 5525178 5525464 167 - chr18:5525297-5525345 NA NA NA NA NA chr18-270 54677878 54678198 172 - chr18:54678050-54678098 NA NA NA NA NA chr18-269 54559037 54559276 156 - chr18:54559128-54559209 NA NA NA NA NA chr18-72 5443272 5443546 239 - chr18:5443272-5443441 NA NA NA NA NA chr18-71 5442230 5442433 158 - chr18:5442274-5442386 NA NA NA NA NA chr18-268 54281293 54281691 220 - chr18:54281382-54281513 NA NA NA NA NA chr18-70 5420832 5421200 296 - chr18:5421039-5421191 NA NA NA NA NA chr18-267 53092619 53092946 266 - chr18:53092795-53092939 NA NA NA NA NA chr18-266 52981440 52981682 169 - chr18:52981613-52981659 NA NA NA NA NA chr18-69 5217374 5217740 204 - chr18:5217518-5217542 NA NA NA NA NA chr18-265 52131264 52131771 294 - chr18:52131387-52131513 NA NA NA NA NA chr18-68 5159979 5160332 247 - chr18:5160047-5160157 NA NA NA NA NA chr18-264 51226878 51227083 155 - chr18:51226931-51227039 NA NA NA NA NA chr18-263 51188019 51188430 208 - chr18:51188210-51188221 NA NA NA NA NA chr18-67 5107804 5107995 142 - chr18:5107865-5107970 NA NA NA NA NA chr18-262 51032719 51033078 193 - chr18:51032863-51032868 NA NA NA NA NA chr18-66 5066479 5066846 205 - chr18:5066699-5066800 NA NA NA NA NA chr18-65 4910481 4910665 128 - chr18:4910579-4910630 NA NA NA NA NA chr18-64 4906714 4906984 178 - chr18:4906838-4906908 NA NA NA NA NA chr18-63 4874190 4874362 157 - chr18:4874225-4874357 NA NA NA NA NA chr18-62 4854276 4854525 128 - chr18:4854359-4854385 NA NA NA NA NA chr18-261 47911665 47912186 314 - chr18:47911889-47912029 NA NA NA NA NA chr18-61 4775231 4775389 134 - chr18:4775294-4775380 NA NA NA NA NA chr18-260 47691517 47691729 142 - chr18:47691569-47691676 NA NA NA NA NA chr18-60 4751338 4751816 192 - chr18:4751736-4751754 NA NA NA NA NA chr18-259 46717478 46717691 135 - chr18:46717550-46717601 NA NA NA NA NA chr18-258 46690028 46690413 241 - chr18:46690163-46690332 NA NA NA NA NA chr18-257 46633768 46633937 152 - chr18:46633783-46633919 NA NA NA NA NA chr18-59 4653957 4654120 117 - chr18:4653971-4654065 NA NA NA NA NA chr18-256 46285614 46285891 156 - chr18:46285733-46285766 NA NA NA NA NA chr18-255 45918467 45918672 173 - chr18:45918513-45918647 NA NA NA NA NA chr18-254 45171229 45171500 162 - chr18:45171346-45171386 NA NA NA NA NA chr18-58 4500786 4500994 158 - chr18:4500852-4500976 NA NA NA NA NA chr18-57 4487168 4487451 117 - chr18:4487296-4487307 NA NA NA NA NA chr18-2 447470 447880 327 - chr18:447536-447697 NA NA NA NA NA chr18-253 44599313 44599795 285 - chr18:44599646-44599728 NA NA NA NA NA chr18-56 4443279 4443605 235 - chr18:4443462-4443515 NA NA NA NA NA chr18-252 43831755 43832024 148 - chr18:43831880-43831905 NA NA NA NA NA chr18-251 43657713 43657928 165 - chr18:43657749-43657871 NA NA NA NA NA chr18-55 4347248 4347686 238 - chr18:4347522-4347583 NA NA NA NA NA chr18-250 42818401 42818690 172 - chr18:42818478-42818553 NA NA NA NA NA chr18-249 42783654 42783944 161 - chr18:42783773-42783810 NA NA NA NA NA chr18-54 4275826 4275970 116 - chr18:4275830-4275932 NA NA NA NA NA chr18-248 42708747 42708924 149 - chr18:42708758-42708893 NA NA NA NA NA chr18-247 42090920 42091241 213 - chr18:42090990-42091149 NA NA NA NA NA chr18-246 41535459 41535771 168 - chr18:41535594-41535609 NA NA NA NA NA chr18-245 41314730 41314942 190 - chr18:41314752-41314898 NA NA NA NA NA chr18-244 41253184 41253493 220 - chr18:41253405-41253470 NA NA NA NA NA chr18-243 41176006 41176426 257 - chr18:41176159-41176386 NA NA NA NA NA chr18-53 4087082 4087331 155 - chr18:4087184-4087241 NA NA NA NA NA chr18-242 40581754 40581997 156 - chr18:40581845-40581918 NA NA NA NA NA chr18-241 39935346 39935543 145 - chr18:39935398-39935491 NA NA NA NA NA chr18-52 3954348 3954605 172 - chr18:3954426-3954506 NA NA NA NA NA chr18-240 39365091 39365439 201 - chr18:39365280-39365376 NA NA NA NA NA chr18-239 38908391 38908698 143 - chr18:38908580-38908641 NA NA NA NA NA chr18-51 3868654 3869051 231 - chr18:3868790-3868873 NA NA NA NA NA chr18-238 38646289 38646492 141 - chr18:38646345-38646427 NA NA NA NA NA chr18-237 38631541 38631738 153 - chr18:38631573-38631688 NA NA NA NA NA chr18-236 38582216 38582422 160 - chr18:38582259-38582370 NA NA NA NA NA chr18-235 38413103 38413326 187 - chr18:38413112-38413281 NA NA NA NA NA chr18-234 38264759 38264926 117 - chr18:38264869-38264906 NA NA NA NA NA chr18-233 38246972 38247613 289 - chr18:38247396-38247405 NA NA NA NA NA chr18-232 37589303 37589539 200 - chr18:37589391-37589529 NA NA NA NA NA chr18-50 3746297 3746599 185 - chr18:3746528-3746539 NA NA NA NA NA chr18-231 36922518 36922867 295 - chr18:36922528-36922860 NA NA NA NA NA chr18-230 36660861 36661264 235 - chr18:36661059-36661210 NA NA NA NA NA chr18-229 35681666 35681891 177 - chr18:35681707-35681860 NA NA NA NA NA chr18-228 35130427 35130746 171 - chr18:35130574-35130596 NA NA NA NA NA chr18-227 34410200 34410370 160 - chr18:34410208-34410359 NA NA NA NA NA chr18-226 34111021 34111273 150 - chr18:34111122-34111169 NA NA NA NA NA chr18-49 3384648 3384932 159 - chr18:3384775-3384808 NA NA NA NA NA chr18-225 33834287 33834610 164 - chr18:33834398-33834427 NA NA NA NA NA chr18-224 33428798 33428959 142 - chr18:33428803-33428933 NA NA NA NA NA chr18-223 33115387 33115636 142 - chr18:33115470-33115517 NA NA NA NA NA chr18-222 33101714 33102030 166 - chr18:33101872-33101896 NA NA NA NA NA chr18-221 33019743 33019940 196 - chr18:33019743-33019937 NA NA NA NA NA chr18-48 3278410 3278665 135 - chr18:3278538-3278549 NA NA NA NA NA chr18-47 3275997 3276199 160 - chr18:3276034-3276147 NA NA NA NA NA chr18-46 3274777 3274990 116 - chr18:3274876-3274897 NA NA NA NA NA chr18-45 3266488 3266902 222 - chr18:3266558-3266645 NA NA NA NA NA chr18-44 3244248 3244421 149 - chr18:3244279-3244416 NA NA NA NA NA chr18-43 3196836 3197104 225 - chr18:3196955-3197099 NA NA NA NA NA chr18-220 31900903 31901072 143 - chr18:31900937-31901050 NA NA NA NA NA chr18-42 3171046 3171212 142 - chr18:3171091-3171185 NA NA NA NA NA chr18-41 3144832 3145177 176 - chr18:3144953-3144984 NA NA NA NA NA chr18-219 31272094 31272571 234 - chr18:31272365-31272384 NA NA NA NA NA chr18-40 3122789 3122959 154 - chr18:3122800-3122933 NA NA NA NA NA chr18-218 30539928 30540170 144 - chr18:30540018-30540068 NA NA NA NA NA chr18-39 3025809 3026197 207 - chr18:3025918-3025980 NA NA NA NA NA chr18-217 30171809 30172131 192 - chr18:30171967-30172057 NA NA NA NA NA chr18-216 30157777 30158001 153 - chr18:30157821-30157876 NA NA NA NA NA chr18-38 2922313 2922612 204 - chr18:2922415-2922527 NA NA NA NA NA chr18-37 2920249 2920469 170 - chr18:2920339-2920439 NA NA NA NA NA chr18-215 29045091 29045552 293 - chr18:29045200-29045266 NA NA NA NA NA chr18-214 28980638 28980925 146 - chr18:28980777-28980783 NA NA NA NA NA chr18-213 28254938 28255110 143 - chr18:28254963-28255073 NA NA NA NA NA chr18-212 28036904 28037088 160 - chr18:28036940-28037070 NA NA NA NA NA chr18-211 27891574 27891726 119 - chr18:27891595-27891648 NA NA NA NA NA chr18-210 27818505 27818802 177 - chr18:27818557-27818638 NA NA NA NA NA chr18-209 27803997 27804250 166 - chr18:27804084-27804163 NA NA NA NA NA chr18-36 2699798 2700000 179 - chr18:2699813-2699961 NA NA NA NA NA chr18-208 26443269 26443606 227 - chr18:26443456-26443499 NA NA NA NA NA chr18-35 2617857 2618089 134 - chr18:2617952-2617985 NA NA NA NA NA chr18-34 2603424 2603996 305 - chr18:2603813-2603961 NA NA NA NA NA chr18-33 2578695 2579014 158 - chr18:2578704-2578777 NA NA NA NA NA chr18-32 2540991 2541447 203 - chr18:2541114-2541129 NA NA NA NA NA chr18-207 25287050 25287371 241 - chr18:25287139-25287307 NA NA NA NA NA chr18-31 2486993 2487541 315 - chr18:2487240-2487303 NA NA NA NA NA chr18-30 2442201 2442422 145 - chr18:2442277-2442346 NA NA NA NA NA chr18-206 24306829 24307065 156 - chr18:24306911-24306993 NA NA NA NA NA chr18-205 24283321 24283632 163 - chr18:24283530-24283606 NA NA NA NA NA chr18-204 24259182 24259429 154 - chr18:24259269-24259324 NA NA NA NA NA chr18-29 2355746 2355956 140 - chr18:2355858-2355907 NA NA NA NA NA chr18-203 23494511 23494730 147 - chr18:23494580-23494652 NA NA NA NA NA chr18-28 2325981 2326262 151 - chr18:2326109-2326128 NA NA NA NA NA chr18-202 23076156 23076339 139 - chr18:23076214-23076323 NA NA NA NA NA chr18-201 22981349 22981633 152 - chr18:22981484-22981507 NA NA NA NA NA chr18-200 22969499 22969831 171 - chr18:22969642-22969661 NA NA NA NA NA chr18-199 22940650 22940951 253 - chr18:22940787-22940944 NA NA NA NA NA chr18-198 22750900 22751077 172 - chr18:22750915-22751077 NA NA NA NA NA chr18-197 22495007 22495337 276 - chr18:22495169-22495337 NA NA NA NA NA chr18-196 22448831 22449064 132 - chr18:22448966-22448980 NA NA NA NA NA chr18-195 22425052 22425414 204 - chr18:22425283-22425408 NA NA NA NA NA chr18-27 2239925 2240248 153 - chr18:2239979-2240020 NA NA NA NA NA chr18-26 2237308 2237549 197 - chr18:2237318-2237437 NA NA NA NA NA chr18-194 22355268 22355502 185 - chr18:22355404-22355491 NA NA NA NA NA chr18-193 22225542 22225789 182 - chr18:22225579-22225710 NA NA NA NA NA chr18-192 21573862 21574182 259 - chr18:21573957-21574094 NA NA NA NA NA chr18-191 21492446 21492685 155 - chr18:21492529-21492599 NA NA NA NA NA chr18-190 21246083 21246256 149 - chr18:21246103-21246230 NA NA NA NA NA chr18-25 2119745 2119902 121 - chr18:2119772-2119821 NA NA NA NA NA chr18-189 21182620 21183053 211 - chr18:21182758-21182789 NA NA NA NA NA chr18-24 2110977 2111398 209 - chr18:2111087-2111135 NA NA NA NA NA chr18-188 21107413 21107753 196 - chr18:21107527-21107554 NA NA NA NA NA chr18-187 21066552 21066746 157 - chr18:21066591-21066710 NA NA NA NA NA chr18-186 21064984 21065279 244 - chr18:21065055-21065197 NA NA NA NA NA chr18-185 21059132 21059541 225 - chr18:21059337-21059470 NA NA NA NA NA chr18-23 2105651 2106099 207 - chr18:2105931-2105936 NA NA NA NA NA chr18-184 21045595 21045762 151 - chr18:21045607-21045750 NA NA NA NA NA chr18-183 21002403 21002655 153 - chr18:21002506-21002558 NA NA NA NA NA chr18-22 1824720 1824902 164 - chr18:1824746-1824900 NA NA NA NA NA chr18 180131 180460 269 - chr18:180278-180427 NA NA NA NA NA chr18-21 1802611 1802764 151 - chr18:1802615-1802763 NA NA NA NA NA chr18-20 1773110 1773544 200 - chr18:1773388-1773398 NA NA NA NA NA chr18-19 1697080 1697400 253 - chr18:1697138-1697283 NA NA NA NA NA chr18-18 1684935 1685181 146 - chr18:1685037-1685085 NA NA NA NA NA chr18-17 1680877 1681155 230 - chr18:1680919-1681053 NA NA NA NA NA chr18-16 1651123 1651533 223 - chr18:1651292-1651412 NA NA NA NA NA chr18-15 1613187 1613600 317 - chr18:1613233-1613404 NA NA NA NA NA chr18-14 1507321 1507518 153 - chr18:1507367-1507475 NA NA NA NA NA chr18-13 1464072 1464230 143 - chr18:1464081-1464203 NA NA NA NA NA chr18-12 1433330 1433685 227 - chr18:1433419-1433479 NA NA NA NA NA chr18-11 1416086 1416324 149 - chr18:1416171-1416227 NA NA NA NA NA chr18-182 14119545 14120054 313 - chr18:14119888-14119961 NA NA NA NA NA chr18-181 14077621 14077856 233 - chr18:14077621-14077853 NA NA NA NA NA chr18-180 13928773 13928951 149 - chr18:13928794-13928918 NA NA NA NA NA chr18-179 13874455 13874646 149 - chr18:13874489-13874600 NA NA NA NA NA chr18-178 13806778 13807284 254 - chr18:13807011-13807104 NA NA NA NA NA chr18-177 13781368 13781654 242 - chr18:13781484-13781638 NA NA NA NA NA chr18-176 13718298 13718449 127 - chr18:13718326-13718405 NA NA NA NA NA chr18-175 13699479 13699929 221 - chr18:13699791-13699866 NA NA NA NA NA chr18-174 13638729 13638937 148 - chr18:13638792-13638883 NA NA NA NA NA chr18-173 13614066 13614443 268 - chr18:13614112-13614162 NA NA NA NA NA chr18-172 13534744 13535091 185 - chr18:13534935-13534987 NA NA NA NA NA chr18-171 13521801 13522060 173 - chr18:13521857-13521959 NA NA NA NA NA chr18-170 13475238 13475561 137 - chr18:13475503-13475533 NA NA NA NA NA chr18-169 13463827 13464186 196 - chr18:13464039-13464112 NA NA NA NA NA chr18-168 13435827 13436177 241 - chr18:13436020-13436110 NA NA NA NA NA chr18-167 13404943 13405126 150 - chr18:13404980-13405095 NA NA NA NA NA chr18-166 13332777 13333111 191 - chr18:13332890-13332953 NA NA NA NA NA chr18-165 13312561 13312736 171 - chr18:13312563-13312728 NA NA NA NA NA chr18-164 13294850 13295466 309 - chr18:13294976-13295110 NA NA NA NA NA chr18-163 13213777 13214004 165 - chr18:13213823-13213934 NA NA NA NA NA chr18-162 13084356 13084782 244 - chr18:13084527-13084578 NA NA NA NA NA chr18-161 13067373 13067798 264 - chr18:13067694-13067717 NA NA NA NA NA chr18-160 12954521 12954786 156 - chr18:12954614-12954669 NA NA NA NA NA chr18-159 12938447 12938778 222 - chr18:12938540-12938637 NA NA NA NA NA chr18-158 12802571 12802747 120 - chr18:12802650-12802737 NA NA NA NA NA chr18-157 12793603 12793912 151 - chr18:12793812-12793856 NA NA NA NA NA chr18-156 12792770 12793201 243 - chr18:12792770-12792919 NA NA NA NA NA chr18-155 12773944 12774117 162 - chr18:12773957-12774110 NA NA NA NA NA chr18-154 12760615 12761123 246 - chr18:12760709-12760777 NA NA NA NA NA chr18-153 12706388 12706787 221 - chr18:12706603-12706672 NA NA NA NA NA chr18-152 12568143 12568620 351 - chr18:12568280-12568495 NA NA NA NA NA chr18-151 12542778 12542942 159 - chr18:12542793-12542942 NA NA NA NA NA chr18-150 12510498 12510735 170 - chr18:12510565-12510668 NA NA NA NA NA chr18-149 12508989 12509508 325 - chr18:12509092-12509132 NA NA NA NA NA chr18-148 12466531 12467068 298 - chr18:12466740-12466846 NA NA NA NA NA chr18-147 12457254 12457560 254 - chr18:12457410-12457560 NA NA NA NA NA chr18-146 12291578 12291827 156 - chr18:12291681-12291754 NA NA NA NA NA chr18-145 12240019 12240549 242 - chr18:12240365-12240409 NA NA NA NA NA chr18-144 11958697 11958992 157 - chr18:11958904-11958992 NA NA NA NA NA chr18-143 11936638 11936928 151 - chr18:11936777-11936789 NA NA NA NA NA chr18-10 1184447 1184616 144 - chr18:1184462-1184571 NA NA NA NA NA chr18-142 11842983 11843150 151 - chr18:11842985-11843127 NA NA NA NA NA chr18-9 1175571 1175832 138 - chr18:1175680-1175681 NA NA NA NA NA chr18-141 11419636 11419787 112 - chr18:11419694-11419786 NA NA NA NA NA chr18-8 1139590 1139988 274 - chr18:1139638-1139891 NA NA NA NA NA chr18-140 11317379 11317733 194 - chr18:11317577-11317649 NA NA NA NA NA chr18-139 11144989 11145348 188 - chr18:11145059-11145123 NA NA NA NA NA chr18-138 11103991 11104363 218 - chr18:11104206-11104347 NA NA NA NA NA chr18-7 1110297 1110519 153 - chr18:1110366-1110450 NA NA NA NA NA chr18-137 11089525 11089940 201 - chr18:11089627-11089721 NA NA NA NA NA chr18-136 10836746 10836903 140 - chr18:10836769-10836898 NA NA NA NA NA chr18-135 10820952 10821153 156 - chr18:10820993-10821100 NA NA NA NA NA chr18-134 10527343 10527629 192 - chr18:10527343-10527488 NA NA NA NA NA chr18-133 10328399 10328674 162 - chr18:10328514-10328562 NA NA NA NA NA chr18-132 10309105 10309399 155 - chr18:10309243-10309258 NA NA NA NA NA chr18-131 10281885 10282137 163 - chr18:10281984-10282053 NA NA NA NA NA chr18-130 10129081 10129291 175 - chr18:10129094-10129245 NA NA NA NA NA chr17_KI270730v1_random 83750 84147 292 - chr17_KI270730v1_random:83870-84081 NA NA NA NA NA chr17_KI270729v1_random 49695 49973 196 - chr17_KI270729v1_random:49755-49910 NA NA NA NA NA chr17_GL000205v2_random 652 1518 378 - chr17_GL000205v2_random:951-1041 NA NA NA NA NA chr17-19 9584213 9584540 209 - chr17:9584361-9584482 NA NA NA NA NA chr17-18 9535982 9536349 206 - chr17:9536199-9536216 NA NA NA NA NA chr17-17 9258443 9259008 325 - chr17:9258458-9258620 NA NA NA NA NA chr17-16 8581587 8581822 156 - chr17:8581708-8581764 NA NA NA NA NA chr17-15 8401781 8402068 246 - chr17:8401798-8401962 NA NA NA NA NA chr17-468 83198328 83198629 163 - chr17:83198386-83198480 NA NA NA NA NA chr17-467 83179952 83180228 167 - chr17:83180065-83180127 NA NA NA NA NA chr17-466 82776283 82776729 295 - chr17:82776458-82776590 NA NA NA NA NA chr17-465 82073109 82073253 118 - chr17:82073141-82073246 NA NA NA NA NA chr17-464 81979779 81980018 159 - chr17:81979864-81979948 NA NA NA NA NA chr17-463 81267127 81267357 178 - chr17:81267187-81267339 NA NA NA NA NA chr17-462 81225761 81225976 169 - chr17:81225797-81225910 NA NA NA NA NA chr17-461 80539249 80539536 181 - chr17:80539385-80539490 NA NA NA NA NA chr17-460 80188112 80188336 176 - chr17:80188126-80188278 NA NA NA NA NA chr17-459 80184778 80184949 115 - chr17:80184859-80184943 NA NA NA NA NA chr17-458 80162943 80163225 157 - chr17:80163072-80163102 NA NA NA NA NA chr17-457 79807804 79808101 169 - chr17:79807914-79807964 NA NA NA NA NA chr17-14 7973345 7973853 238 - chr17:7973503-7973527 NA NA NA NA NA chr17-456 79516329 79516477 144 - chr17:79516329-79516465 NA NA NA NA NA chr17-455 79499439 79499633 160 - chr17:79499471-79499595 NA NA NA NA NA chr17-454 79286736 79286913 149 - chr17:79286767-79286891 NA NA NA NA NA chr17-453 78949534 78949767 151 - chr17:78949616-78949685 NA NA NA NA NA chr17-452 78454430 78454800 236 - chr17:78454555-78454724 NA NA NA NA NA chr17-451 78449214 78449745 236 - chr17:78449353-78449363 NA NA NA NA NA chr17-13 7835900 7836329 244 - chr17:7836057-7836268 NA NA NA NA NA chr17-450 77380532 77380988 286 - chr17:77380695-77380877 NA NA NA NA NA chr17-449 77081268 77081431 150 - chr17:77081280-77081416 NA NA NA NA NA chr17-448 76936991 76937209 154 - chr17:76937049-76937142 NA NA NA NA NA chr17-447 76864812 76865018 180 - chr17:76864815-76864943 NA NA NA NA NA chr17-446 76829711 76830041 178 - chr17:76829877-76829896 NA NA NA NA NA chr17-445 76694358 76694607 162 - chr17:76694407-76694501 NA NA NA NA NA chr17-444 76504161 76504379 176 - chr17:76504179-76504334 NA NA NA NA NA chr17-443 76426908 76427301 236 - chr17:76427019-76427121 NA NA NA NA NA chr17-442 76201464 76201649 130 - chr17:76201557-76201613 NA NA NA NA NA chr17-441 75967958 75968269 161 - chr17:75968092-75968111 NA NA NA NA NA chr17-440 75945771 75946091 186 - chr17:75945853-75945931 NA NA NA NA NA chr17-439 75865970 75866393 221 - chr17:75866204-75866255 NA NA NA NA NA chr17-438 75676872 75677269 230 - chr17:75676905-75677039 NA NA NA NA NA chr17-437 75545301 75545570 134 - chr17:75545378-75545406 NA NA NA NA NA chr17-436 75385738 75386113 199 - chr17:75385966-75386041 NA NA NA NA NA chr17-435 75352477 75352773 152 - chr17:75352617-75352627 NA NA NA NA NA chr17-434 75347089 75347401 219 - chr17:75347248-75347341 NA NA NA NA NA chr17-433 75166554 75166892 214 - chr17:75166667-75166819 NA NA NA NA NA chr17-432 75145956 75146185 126 - chr17:75146071-75146106 NA NA NA NA NA chr17-431 74873466 74873857 199 - chr17:74873582-74873627 NA NA NA NA NA chr17-430 74658444 74658700 169 - chr17:74658508-74658567 NA NA NA NA NA chr17-429 74625307 74625558 153 - chr17:74625401-74625458 NA NA NA NA NA chr17-12 7434052 7434268 163 - chr17:7434093-7434209 NA NA NA NA NA chr17-428 74277898 74278105 146 - chr17:74277949-74278039 NA NA NA NA NA chr17-427 74001266 74001638 232 - chr17:74001394-74001492 NA NA NA NA NA chr17-426 73926764 73927003 150 - chr17:73926858-73926924 NA NA NA NA NA chr17-425 73848435 73848736 134 - chr17:73848480-73848508 NA NA NA NA NA chr17-424 73844802 73845053 171 - chr17:73844874-73844957 NA NA NA NA NA chr17-423 73761990 73762380 251 - chr17:73762138-73762259 NA NA NA NA NA chr17-422 73668036 73668225 150 - chr17:73668065-73668181 NA NA NA NA NA chr17-421 73414761 73415107 218 - chr17:73414763-73414917 NA NA NA NA NA chr17-420 73376405 73376830 258 - chr17:73376645-73376809 NA NA NA NA NA chr17-419 73348456 73348693 185 - chr17:73348504-73348663 NA NA NA NA NA chr17-418 73220559 73220743 134 - chr17:73220652-73220717 NA NA NA NA NA chr17-417 73094251 73094421 152 - chr17:73094272-73094409 NA NA NA NA NA chr17-416 72994023 72994313 166 - chr17:72994155-72994193 NA NA NA NA NA chr17-415 72992245 72992667 258 - chr17:72992384-72992405 NA NA NA NA NA chr17-414 72976191 72976401 153 - chr17:72976250-72976348 NA NA NA NA NA chr17-413 72963614 72963919 163 - chr17:72963762-72963780 NA NA NA NA NA chr17-412 72962908 72963335 196 - chr17:72963033-72963051 NA NA NA NA NA chr17-411 72820956 72821382 298 - chr17:72821148-72821286 NA NA NA NA NA chr17-410 72736498 72736897 262 - chr17:72736579-72736729 NA NA NA NA NA chr17-409 72715374 72715635 141 - chr17:72715480-72715508 NA NA NA NA NA chr17-408 72672980 72673297 177 - chr17:72673082-72673138 NA NA NA NA NA chr17-407 72587121 72587290 161 - chr17:72587134-72587279 NA NA NA NA NA chr17-406 72509818 72510084 192 - chr17:72509818-72509973 NA NA NA NA NA chr17-405 72296462 72296812 254 - chr17:72296509-72296618 NA NA NA NA NA chr17-404 72229837 72230153 213 - chr17:72229980-72230130 NA NA NA NA NA chr17-403 72128704 72129054 173 - chr17:72128905-72128925 NA NA NA NA NA chr17-402 71948963 71949117 149 - chr17:71948976-71949116 NA NA NA NA NA chr17-401 71914150 71914367 175 - chr17:71914180-71914301 NA NA NA NA NA chr17-400 71891947 71892228 234 - chr17:71892051-71892191 NA NA NA NA NA chr17-399 71492584 71493094 284 - chr17:71492619-71492790 NA NA NA NA NA chr17-398 71337082 71337366 199 - chr17:71337117-71337262 NA NA NA NA NA chr17-397 71326328 71326687 246 - chr17:71326529-71326668 NA NA NA NA NA chr17-396 71313560 71313729 155 - chr17:71313571-71313709 NA NA NA NA NA chr17-395 71243121 71243277 127 - chr17:71243160-71243268 NA NA NA NA NA chr17-394 71219417 71219665 175 - chr17:71219504-71219599 NA NA NA NA NA chr17-393 71015941 71016119 121 - chr17:71015970-71016048 NA NA NA NA NA chr17-392 70806476 70806646 151 - chr17:70806479-70806619 NA NA NA NA NA chr17-391 70687897 70688089 149 - chr17:70687926-70688039 NA NA NA NA NA chr17-390 70649492 70649729 156 - chr17:70649577-70649650 NA NA NA NA NA chr17-11 7055750 7055998 161 - chr17:7055813-7055899 NA NA NA NA NA chr17-389 70284727 70285089 218 - chr17:70284831-70284977 NA NA NA NA NA chr17-388 70269684 70269891 186 - chr17:70269700-70269844 NA NA NA NA NA chr17-387 70262091 70262436 177 - chr17:70262189-70262303 NA NA NA NA NA chr17-386 70155265 70155463 157 - chr17:70155302-70155414 NA NA NA NA NA chr17-385 70082897 70083261 253 - chr17:70083162-70083227 NA NA NA NA NA chr17-384 70067776 70067958 171 - chr17:70067782-70067937 NA NA NA NA NA chr17-383 70038029 70038371 185 - chr17:70038199-70038240 NA NA NA NA NA chr17-10 6993781 6994065 186 - chr17:6993928-6993992 NA NA NA NA NA chr17-382 69749271 69749420 143 - chr17:69749273-69749406 NA NA NA NA NA chr17-381 69691013 69691186 152 - chr17:69691041-69691179 NA NA NA NA NA chr17-380 69544599 69545010 303 - chr17:69544643-69544774 NA NA NA NA NA chr17-379 69208065 69208228 158 - chr17:69208066-69208214 NA NA NA NA NA chr17-378 69207323 69207532 138 - chr17:69207398-69207463 NA NA NA NA NA chr17-377 69161547 69161877 188 - chr17:69161617-69161752 NA NA NA NA NA chr17-376 68976668 68976934 155 - chr17:68976780-68976825 NA NA NA NA NA chr17-375 68954695 68955274 263 - chr17:68955084-68955104 NA NA NA NA NA chr17-374 68855056 68855400 185 - chr17:68855160-68855312 NA NA NA NA NA chr17-373 68607038 68607260 150 - chr17:68607120-68607193 NA NA NA NA NA chr17-372 68452184 68452726 222 - chr17:68452639-68452676 NA NA NA NA NA chr17-371 67975953 67976307 239 - chr17:67976106-67976268 NA NA NA NA NA chr17-9 6785065 6785230 120 - chr17:6785168-6785214 NA NA NA NA NA chr17-370 67777282 67777580 154 - chr17:67777426-67777436 NA NA NA NA NA chr17-369 67771781 67772152 171 - chr17:67771821-67771892 NA NA NA NA NA chr17-368 67738278 67738461 153 - chr17:67738297-67738409 NA NA NA NA NA chr17-367 67714910 67715293 323 - chr17:67714934-67715215 NA NA NA NA NA chr17-366 67690360 67690509 147 - chr17:67690360-67690503 NA NA NA NA NA chr17-365 67681140 67681524 225 - chr17:67681350-67681467 NA NA NA NA NA chr17-364 67607516 67607711 144 - chr17:67607575-67607676 NA NA NA NA NA chr17-363 67507003 67507200 118 - chr17:67507142-67507151 NA NA NA NA NA chr17-362 67179092 67179363 144 - chr17:67179217-67179235 NA NA NA NA NA chr17-361 67139939 67140197 203 - chr17:67140020-67140155 NA NA NA NA NA chr17-360 67129880 67130099 168 - chr17:67129917-67130041 NA NA NA NA NA chr17-359 66733488 66733651 158 - chr17:66733491-66733639 NA NA NA NA NA chr17-358 66689793 66689948 133 - chr17:66689834-66689923 NA NA NA NA NA chr17-357 66672109 66672272 146 - chr17:66672118-66672251 NA NA NA NA NA chr17-356 66666146 66666561 234 - chr17:66666171-66666302 NA NA NA NA NA chr17-355 66462095 66462246 117 - chr17:66462143-66462243 NA NA NA NA NA chr17-354 66347506 66347757 163 - chr17:66347596-66347673 NA NA NA NA NA chr17-353 66126923 66127173 151 - chr17:66127020-66127073 NA NA NA NA NA chr17-352 66120688 66120967 159 - chr17:66120688-66120894 NA NA NA NA NA chr17-351 66117236 66117396 150 - chr17:66117237-66117382 NA NA NA NA NA chr17-350 65793054 65793324 154 - chr17:65793102-65793141 NA NA NA NA NA chr17-349 65717353 65717659 161 - chr17:65717486-65717490 NA NA NA NA NA chr17-348 65675309 65675574 163 - chr17:65675414-65675478 NA NA NA NA NA chr17-347 65426695 65427102 295 - chr17:65426724-65426963 NA NA NA NA NA chr17-346 65391824 65392056 131 - chr17:65391909-65391923 NA NA NA NA NA chr17-345 65264759 65264979 141 - chr17:65264836-65264899 NA NA NA NA NA chr17-344 65245183 65245343 138 - chr17:65245199-65245318 NA NA NA NA NA chr17-343 65117054 65117278 149 - chr17:65117128-65117201 NA NA NA NA NA chr17-342 65115339 65115503 158 - chr17:65115351-65115500 NA NA NA NA NA chr17-341 65041096 65041338 140 - chr17:65041152-65041170 NA NA NA NA NA chr17-340 65023739 65024074 161 - chr17:65023877-65023882 NA NA NA NA NA chr17-339 64679052 64679503 344 - chr17:64679231-64679361 NA NA NA NA NA chr17-338 64514595 64514827 147 - chr17:64514637-64514685 NA NA NA NA NA chr17-337 64503963 64504209 178 - chr17:64503974-64504118 NA NA NA NA NA chr17-336 64462416 64462635 127 - chr17:64462519-64462565 NA NA NA NA NA chr17-335 64276199 64276511 200 - chr17:64276213-64276350 NA NA NA NA NA chr17-334 64142780 64142935 138 - chr17:64142789-64142893 NA NA NA NA NA chr17-333 64051996 64052200 152 - chr17:64052053-64052158 NA NA NA NA NA chr17-332 64003368 64003565 131 - chr17:64003392-64003415 NA NA NA NA NA chr17-331 63845115 63845501 185 - chr17:63845401-63845439 NA NA NA NA NA chr17-330 63815560 63816083 340 - chr17:63815638-63815848 NA NA NA NA NA chr17-329 63775390 63775545 135 - chr17:63775425-63775520 NA NA NA NA NA chr17-328 63764171 63764308 125 - chr17:63764175-63764294 NA NA NA NA NA chr17-327 63718457 63718848 380 - chr17:63718464-63718844 NA NA NA NA NA chr17-326 63418664 63419074 273 - chr17:63418745-63418825 NA NA NA NA NA chr17-325 63210602 63211079 269 - chr17:63210684-63210820 NA NA NA NA NA chr17-324 63159431 63159702 249 - chr17:63159444-63159649 NA NA NA NA NA chr17-323 63078211 63078486 179 - chr17:63078263-63078302 NA NA NA NA NA chr17-322 63075589 63075869 186 - chr17:63075671-63075751 NA NA NA NA NA chr17-321 62988793 62989327 322 - chr17:62988931-62989303 NA NA NA NA NA chr17-320 62726410 62726984 307 - chr17:62726825-62726974 NA NA NA NA NA chr17-319 62578758 62578989 147 - chr17:62578840-62578901 NA NA NA NA NA chr17-318 62391066 62391342 167 - chr17:62391193-62391242 NA NA NA NA NA chr17-317 62369767 62370074 177 - chr17:62369920-62369990 NA NA NA NA NA chr17-316 62299906 62300153 157 - chr17:62299969-62300039 NA NA NA NA NA chr17-315 62119522 62119931 255 - chr17:62119667-62119812 NA NA NA NA NA chr17-314 62113716 62114015 167 - chr17:62113878-62113898 NA NA NA NA NA chr17-313 62108760 62109053 245 - chr17:62108764-62108913 NA NA NA NA NA chr17-312 62044636 62045004 220 - chr17:62044638-62044783 NA NA NA NA NA chr17-311 62027936 62028670 491 - chr17:62028227-62028652 NA NA NA NA NA chr17-310 61998077 61998422 185 - chr17:61998239-61998266 NA NA NA NA NA chr17-309 61987943 61988207 225 - chr17:61988003-61988150 NA NA NA NA NA chr17-308 61938246 61938453 167 - chr17:61938273-61938387 NA NA NA NA NA chr17-307 61895109 61895599 270 - chr17:61895296-61895319 NA NA NA NA NA chr17-306 61886969 61887205 158 - chr17:61887046-61887125 NA NA NA NA NA chr17-305 61803890 61804235 214 - chr17:61803934-61804046 NA NA NA NA NA chr17-304 61786530 61786955 239 - chr17:61786629-61786684 NA NA NA NA NA chr17-303 61765084 61765293 174 - chr17:61765123-61765260 NA NA NA NA NA chr17-302 61705529 61705799 148 - chr17:61705646-61705667 NA NA NA NA NA chr17-301 61682117 61682413 251 - chr17:61682128-61682289 NA NA NA NA NA chr17-300 61655439 61655713 147 - chr17:61655574-61655601 NA NA NA NA NA chr17-299 61639095 61639366 195 - chr17:61639158-61639315 NA NA NA NA NA chr17-298 61629262 61629446 148 - chr17:61629292-61629407 NA NA NA NA NA chr17-297 61612905 61613056 145 - chr17:61612905-61613038 NA NA NA NA NA chr17-296 61596786 61597252 257 - chr17:61597157-61597225 NA NA NA NA NA chr17-295 61532825 61533048 148 - chr17:61532901-61532975 NA NA NA NA NA chr17-294 61501339 61501533 149 - chr17:61501385-61501490 NA NA NA NA NA chr17-293 61498706 61498879 158 - chr17:61498717-61498856 NA NA NA NA NA chr17-292 61446429 61447273 361 - chr17:61446908-61447061 NA NA NA NA NA chr17-291 61407962 61408237 212 - chr17:61408005-61408134 NA NA NA NA NA chr17-290 61233282 61233519 137 - chr17:61233385-61233425 NA NA NA NA NA chr17-289 61227876 61228616 398 - chr17:61228360-61228494 NA NA NA NA NA chr17-288 61227064 61227456 226 - chr17:61227102-61227253 NA NA NA NA NA chr17-287 61102607 61102803 130 - chr17:61102735-61102768 NA NA NA NA NA chr17-286 61054842 61055075 202 - chr17:61054921-61055068 NA NA NA NA NA chr17-285 61050583 61050834 145 - chr17:61050659-61050668 NA NA NA NA NA chr17-284 61011454 61011741 160 - chr17:61011572-61011596 NA NA NA NA NA chr17-283 60972212 60972430 181 - chr17:60972229-60972353 NA NA NA NA NA chr17-282 60939138 60939474 183 - chr17:60939285-60939309 NA NA NA NA NA chr17-281 60914128 60914672 290 - chr17:60914491-60914654 NA NA NA NA NA chr17-280 60828555 60828790 124 - chr17:60828687-60828721 NA NA NA NA NA chr17-279 60777222 60777409 155 - chr17:60777264-60777397 NA NA NA NA NA chr17-278 60729813 60730256 345 - chr17:60729856-60730152 NA NA NA NA NA chr17-277 60719755 60720024 170 - chr17:60719799-60719851 NA NA NA NA NA chr17-276 60630407 60630648 160 - chr17:60630513-60630617 NA NA NA NA NA chr17-275 60611729 60612007 166 - chr17:60611851-60611900 NA NA NA NA NA chr17-274 60606218 60606429 142 - chr17:60606315-60606374 NA NA NA NA NA chr17-273 60511219 60511652 196 - chr17:60511282-60511328 NA NA NA NA NA chr17-272 60502122 60502394 156 - chr17:60502231-60502264 NA NA NA NA NA chr17-271 60494913 60495365 218 - chr17:60495192-60495221 NA NA NA NA NA chr17-270 60323222 60323557 179 - chr17:60323352-60323388 NA NA NA NA NA chr17-269 60315562 60315828 164 - chr17:60315659-60315716 NA NA NA NA NA chr17-268 60314173 60314343 157 - chr17:60314176-60314325 NA NA NA NA NA chr17-267 60312159 60312396 126 - chr17:60312291-60312327 NA NA NA NA NA chr17-266 60298957 60299212 152 - chr17:60299033-60299080 NA NA NA NA NA chr17-265 60274823 60275044 134 - chr17:60274895-60274972 NA NA NA NA NA chr17-264 60261140 60261430 172 - chr17:60261258-60261312 NA NA NA NA NA chr17-263 60257779 60257935 122 - chr17:60257823-60257928 NA NA NA NA NA chr17-2 601591 601792 159 - chr17:601628-601740 NA NA NA NA NA chr17-262 60059334 60059605 216 - chr17:60059337-60059489 NA NA NA NA NA chr17-261 60051015 60051366 201 - chr17:60051219-60051305 NA NA NA NA NA chr17-260 60038436 60038808 196 - chr17:60038651-60038717 NA NA NA NA NA chr17-259 59877359 59877537 168 - chr17:59877367-59877523 NA NA NA NA NA chr17-258 59861381 59861832 313 - chr17:59861549-59861705 NA NA NA NA NA chr17-257 59840464 59840737 208 - chr17:59840581-59840698 NA NA NA NA NA chr17-256 59804899 59805258 176 - chr17:59805030-59805049 NA NA NA NA NA chr17-255 59796595 59796962 221 - chr17:59796773-59796880 NA NA NA NA NA chr17-254 59784276 59784481 136 - chr17:59784354-59784430 NA NA NA NA NA chr17-253 59740403 59740631 135 - chr17:59740516-59740548 NA NA NA NA NA chr17-252 59448182 59448433 203 - chr17:59448229-59448383 NA NA NA NA NA chr17-251 59386176 59386511 288 - chr17:59386214-59386408 NA NA NA NA NA chr17-250 59358013 59358320 242 - chr17:59358196-59358314 NA NA NA NA NA chr17-249 59356476 59356707 139 - chr17:59356580-59356621 NA NA NA NA NA chr17-248 59341997 59342286 210 - chr17:59342137-59342189 NA NA NA NA NA chr17-247 59311269 59311541 161 - chr17:59311398-59311475 NA NA NA NA NA chr17-246 59269684 59269997 182 - chr17:59269804-59269844 NA NA NA NA NA chr17-245 59254217 59254530 205 - chr17:59254378-59254528 NA NA NA NA NA chr17-244 59240883 59241199 176 - chr17:59240913-59241019 NA NA NA NA NA chr17-243 59116440 59116750 132 - chr17:59116601-59116644 NA NA NA NA NA chr17-242 59098871 59099313 362 - chr17:59098905-59099107 NA NA NA NA NA chr17-241 59070298 59070571 159 - chr17:59070408-59070455 NA NA NA NA NA chr17-240 59067295 59067558 142 - chr17:59067456-59067457 NA NA NA NA NA chr17-239 58939479 58939661 131 - chr17:58939502-58939554 NA NA NA NA NA chr17-238 58933280 58933652 244 - chr17:58933461-58933630 NA NA NA NA NA chr17-237 58914767 58914986 150 - chr17:58914834-58914916 NA NA NA NA NA chr17-236 58884618 58885029 188 - chr17:58884926-58884976 NA NA NA NA NA chr17-235 58873012 58873196 168 - chr17:58873024-58873172 NA NA NA NA NA chr17-234 58842222 58842621 255 - chr17:58842476-58842620 NA NA NA NA NA chr17-233 58797244 58797394 128 - chr17:58797310-58797394 NA NA NA NA NA chr17-232 58795094 58795492 196 - chr17:58795194-58795342 NA NA NA NA NA chr17-231 58752893 58753159 157 - chr17:58753000-58753046 NA NA NA NA NA chr17-230 58717169 58717361 125 - chr17:58717210-58717281 NA NA NA NA NA chr17-229 58681577 58681879 160 - chr17:58681701-58681728 NA NA NA NA NA chr17-228 58646948 58647127 158 - chr17:58646957-58647100 NA NA NA NA NA chr17-227 58581701 58581928 149 - chr17:58581775-58581848 NA NA NA NA NA chr17-226 58489606 58489810 135 - chr17:58489675-58489763 NA NA NA NA NA chr17 584518 584845 262 - chr17:584685-584831 NA NA NA NA NA chr17-225 58316668 58316893 168 - chr17:58316705-58316826 NA NA NA NA NA chr17-224 58156437 58156736 176 - chr17:58156550-58156593 NA NA NA NA NA chr17-223 58140104 58140525 212 - chr17:58140363-58140392 NA NA NA NA NA chr17-222 58133976 58134251 207 - chr17:58134092-58134207 NA NA NA NA NA chr17-221 58041869 58042159 201 - chr17:58041931-58042016 NA NA NA NA NA chr17-220 58020046 58020288 189 - chr17:58020143-58020257 NA NA NA NA NA chr17-219 57948769 57949071 159 - chr17:57948924-57948934 NA NA NA NA NA chr17-218 57932782 57933035 153 - chr17:57932875-57932921 NA NA NA NA NA chr17-217 57928238 57928385 136 - chr17:57928239-57928354 NA NA NA NA NA chr17-216 57854300 57854598 155 - chr17:57854452-57854473 NA NA NA NA NA chr17-215 57798199 57798360 124 - chr17:57798200-57798250 NA NA NA NA NA chr17-214 57783793 57783996 118 - chr17:57783889-57783933 NA NA NA NA NA chr17-213 57634600 57634882 194 - chr17:57634683-57634833 NA NA NA NA NA chr17-212 57494375 57494672 201 - chr17:57494492-57494645 NA NA NA NA NA chr17-211 57283212 57283367 149 - chr17:57283226-57283363 NA NA NA NA NA chr17-210 57263648 57263914 200 - chr17:57263676-57263843 NA NA NA NA NA chr17-209 57142208 57142473 153 - chr17:57142314-57142349 NA NA NA NA NA chr17-208 56571048 56571207 136 - chr17:56571056-56571154 NA NA NA NA NA chr17-207 56410586 56410845 219 - chr17:56410590-56410787 NA NA NA NA NA chr17-206 56332888 56333175 154 - chr17:56333035-56333049 NA NA NA NA NA chr17-205 56299453 56299678 152 - chr17:56299525-56299603 NA NA NA NA NA chr17-204 56069302 56069570 159 - chr17:56069425-56069457 NA NA NA NA NA chr17-203 56017967 56018171 158 - chr17:56018018-56018135 NA NA NA NA NA chr17-202 55860502 55860855 221 - chr17:55860686-55860841 NA NA NA NA NA chr17-201 55796555 55796985 223 - chr17:55796652-55796723 NA NA NA NA NA chr17-200 55769009 55769305 202 - chr17:55769127-55769223 NA NA NA NA NA chr17-199 55661705 55661923 167 - chr17:55661750-55661860 NA NA NA NA NA chr17-198 55329132 55329320 156 - chr17:55329174-55329293 NA NA NA NA NA chr17-197 55194382 55194582 156 - chr17:55194408-55194529 NA NA NA NA NA chr17-196 55146100 55146344 142 - chr17:55146192-55146222 NA NA NA NA NA chr17-195 55070490 55070783 193 - chr17:55070628-55070759 NA NA NA NA NA chr17-194 55027580 55027913 312 - chr17:55027639-55027911 NA NA NA NA NA chr17-193 54920939 54921165 156 - chr17:54921019-54921100 NA NA NA NA NA chr17-192 54671829 54672327 267 - chr17:54672144-54672303 NA NA NA NA NA chr17-191 54634668 54634875 163 - chr17:54634720-54634835 NA NA NA NA NA chr17-190 54606759 54607036 155 - chr17:54606891-54606919 NA NA NA NA NA chr17-189 54574221 54574411 161 - chr17:54574234-54574374 NA NA NA NA NA chr17-188 54566709 54567166 220 - chr17:54566898-54566919 NA NA NA NA NA chr17-187 54507063 54507618 368 - chr17:54507246-54507321 NA NA NA NA NA chr17-186 54408595 54409025 220 - chr17:54408861-54408927 NA NA NA NA NA chr17-185 54139503 54139697 138 - chr17:54139601-54139662 NA NA NA NA NA chr17-184 54066227 54066783 264 - chr17:54066257-54066360 NA NA NA NA NA chr17-183 54047923 54048361 258 - chr17:54048056-54048087 NA NA NA NA NA chr17-182 53951934 53952382 254 - chr17:53952122-53952279 NA NA NA NA NA chr17-181 53830089 53830426 213 - chr17:53830172-53830323 NA NA NA NA NA chr17-180 53802706 53803124 229 - chr17:53802843-53802856 NA NA NA NA NA chr17-8 5362737 5362917 153 - chr17:5362754-5362885 NA NA NA NA NA chr17-179 53626321 53626600 169 - chr17:53626382-53626392 NA NA NA NA NA chr17-178 53622928 53623210 181 - chr17:53623023-53623106 NA NA NA NA NA chr17-177 53603474 53603661 164 - chr17:53603504-53603652 NA NA NA NA NA chr17-176 53177908 53178235 171 - chr17:53178055-53178061 NA NA NA NA NA chr17-175 53118027 53118649 328 - chr17:53118357-53118373 NA NA NA NA NA chr17-174 52951386 52951711 187 - chr17:52951440-52951531 NA NA NA NA NA chr17-173 52468541 52468840 179 - chr17:52468596-52468715 NA NA NA NA NA chr17-172 52451563 52452029 233 - chr17:52451873-52451950 NA NA NA NA NA chr17-171 52276713 52277017 198 - chr17:52276734-52276879 NA NA NA NA NA chr17-170 52250683 52250935 144 - chr17:52250807-52250859 NA NA NA NA NA chr17-169 52173442 52173702 226 - chr17:52173536-52173698 NA NA NA NA NA chr17-168 52039725 52040107 226 - chr17:52040003-52040012 NA NA NA NA NA chr17-167 51909015 51909195 155 - chr17:51909060-51909176 NA NA NA NA NA chr17-166 51874811 51874990 149 - chr17:51874832-51874942 NA NA NA NA NA chr17-165 51434746 51435140 229 - chr17:51434795-51434896 NA NA NA NA NA chr17-164 51193803 51194146 173 - chr17:51194058-51194097 NA NA NA NA NA chr17-163 51042664 51042931 142 - chr17:51042809-51042816 NA NA NA NA NA chr17-162 50991127 50991404 206 - chr17:50991140-50991304 NA NA NA NA NA chr17-161 50843129 50843593 318 - chr17:50843287-50843532 NA NA NA NA NA chr17-160 50248098 50248326 161 - chr17:50248163-50248258 NA NA NA NA NA chr17-159 50031879 50032095 181 - chr17:50031924-50032065 NA NA NA NA NA chr17-158 49803187 49803365 126 - chr17:49803262-49803362 NA NA NA NA NA chr17-157 49759238 49759419 113 - chr17:49759325-49759389 NA NA NA NA NA chr17-156 49674459 49674882 217 - chr17:49674767-49674783 NA NA NA NA NA chr17-155 49479443 49479685 199 - chr17:49479526-49479639 NA NA NA NA NA chr17-154 49118335 49118767 287 - chr17:49118421-49118635 NA NA NA NA NA chr17-153 48980232 48980379 136 - chr17:48980242-48980356 NA NA NA NA NA chr17-152 48390004 48390209 152 - chr17:48390064-48390170 NA NA NA NA NA chr17-151 48388434 48389198 523 - chr17:48388648-48389191 NA NA NA NA NA chr17-150 48359095 48359732 297 - chr17:48359197-48359269 NA NA NA NA NA chr17-149 48021421 48021594 122 - chr17:48021428-48021521 NA NA NA NA NA chr17-148 47667047 47667281 207 - chr17:47667079-47667232 NA NA NA NA NA chr17-147 47137801 47138159 240 - chr17:47137956-47138144 NA NA NA NA NA chr17-146 45054205 45054655 358 - chr17:45054303-45054615 NA NA NA NA NA chr17-145 45044172 45044526 162 - chr17:45044282-45044293 NA NA NA NA NA chr17-144 45028264 45028760 376 - chr17:45028294-45028460 NA NA NA NA NA chr17-143 44744908 44745092 151 - chr17:44744935-44745047 NA NA NA NA NA chr17-142 44617661 44617818 155 - chr17:44617661-44617815 NA NA NA NA NA chr17-141 44472281 44472466 120 - chr17:44472360-44472429 NA NA NA NA NA chr17-140 44349375 44349593 163 - chr17:44349440-44349543 NA NA NA NA NA chr17-139 44316314 44317005 293 - chr17:44316524-44316611 NA NA NA NA NA chr17-138 44254115 44254306 169 - chr17:44254129-44254280 NA NA NA NA NA chr17-137 44153014 44153331 166 - chr17:44153162-44153188 NA NA NA NA NA chr17-136 43961830 43962022 162 - chr17:43961866-43962013 NA NA NA NA NA chr17-135 43493351 43493552 147 - chr17:43493405-43493498 NA NA NA NA NA chr17-134 43330590 43330877 165 - chr17:43330720-43330759 NA NA NA NA NA chr17-133 43307093 43307309 168 - chr17:43307131-43307256 NA NA NA NA NA chr17-132 43036295 43036774 229 - chr17:43036338-43036442 NA NA NA NA NA chr17-131 42982247 42982804 252 - chr17:42982378-42982412 NA NA NA NA NA chr17-130 42889923 42890397 264 - chr17:42890237-42890396 NA NA NA NA NA chr17-129 42281125 42281456 196 - chr17:42281202-42281205 NA NA NA NA NA chr17-128 42263469 42263971 268 - chr17:42263726-42263877 NA NA NA NA NA chr17-127 42245869 42246219 195 - chr17:42246082-42246163 NA NA NA NA NA chr17-126 42244432 42244580 134 - chr17:42244435-42244541 NA NA NA NA NA chr17-125 41950069 41950319 180 - chr17:41950163-41950297 NA NA NA NA NA chr17-124 41514319 41514484 123 - chr17:41514413-41514452 NA NA NA NA NA chr17-123 40545321 40545509 152 - chr17:40545327-40545458 NA NA NA NA NA chr17-122 40146768 40146959 133 - chr17:40146770-40146873 NA NA NA NA NA chr17-121 40000817 40001014 154 - chr17:40000863-40000977 NA NA NA NA NA chr17-120 39880233 39880453 122 - chr17:39880248-39880321 NA NA NA NA NA chr17-119 39848499 39848804 215 - chr17:39848529-39848656 NA NA NA NA NA chr17-118 39712455 39712687 178 - chr17:39712477-39712617 NA NA NA NA NA chr17-117 39497973 39498212 156 - chr17:39498055-39498127 NA NA NA NA NA chr17-116 39479160 39479566 252 - chr17:39479388-39479449 NA NA NA NA NA chr17-115 39311900 39312061 152 - chr17:39311911-39312045 NA NA NA NA NA chr17-114 39300853 39301198 195 - chr17:39300959-39301079 NA NA NA NA NA chr17-113 39268391 39268798 321 - chr17:39268627-39268776 NA NA NA NA NA chr17-112 39254975 39255182 152 - chr17:39255024-39255124 NA NA NA NA NA chr17-111 39226081 39226373 167 - chr17:39226130-39226210 NA NA NA NA NA chr17-110 39199612 39199886 216 - chr17:39199698-39199885 NA NA NA NA NA chr17-109 39032541 39032899 239 - chr17:39032592-39032729 NA NA NA NA NA chr17-7 3815230 3815573 225 - chr17:3815332-3815498 NA NA NA NA NA chr17-108 35705279 35705494 146 - chr17:35705356-35705441 NA NA NA NA NA chr17-107 35477433 35477630 154 - chr17:35477473-35477581 NA NA NA NA NA chr17-106 34837207 34837394 141 - chr17:34837237-34837340 NA NA NA NA NA chr17-105 34780785 34780938 122 - chr17:34780877-34780937 NA NA NA NA NA chr17-104 34668416 34668644 180 - chr17:34668496-34668612 NA NA NA NA NA chr17-103 34590670 34590912 154 - chr17:34590761-34590830 NA NA NA NA NA chr17-102 34104260 34104722 253 - chr17:34104446-34104563 NA NA NA NA NA chr17-101 34079919 34080197 168 - chr17:34079991-34080068 NA NA NA NA NA chr17-100 33849973 33850240 159 - chr17:33850032-33850034 NA NA NA NA NA chr17-99 33758055 33758297 149 - chr17:33758146-33758203 NA NA NA NA NA chr17-98 33610698 33610933 177 - chr17:33610740-33610843 NA NA NA NA NA chr17-97 33543496 33543693 112 - chr17:33543531-33543583 NA NA NA NA NA chr17-96 33475100 33475397 169 - chr17:33475137-33475209 NA NA NA NA NA chr17-95 33440914 33441233 221 - chr17:33441158-33441208 NA NA NA NA NA chr17-94 33396136 33396307 145 - chr17:33396164-33396282 NA NA NA NA NA chr17-93 33129161 33129452 203 - chr17:33129303-33129391 NA NA NA NA NA chr17-92 32737439 32737776 173 - chr17:32737619-32737620 NA NA NA NA NA chr17-91 32672153 32672610 217 - chr17:32672273-32672310 NA NA NA NA NA chr17-90 32660895 32661065 133 - chr17:32660914-32660992 NA NA NA NA NA chr17-89 32507083 32507309 171 - chr17:32507142-32507256 NA NA NA NA NA chr17-88 32365776 32365997 152 - chr17:32365842-32365922 NA NA NA NA NA chr17-87 32170236 32170430 152 - chr17:32170276-32170384 NA NA NA NA NA chr17-86 31683450 31683657 164 - chr17:31683523-31683629 NA NA NA NA NA chr17-85 31521396 31521704 280 - chr17:31521424-31521648 NA NA NA NA NA chr17-84 31453514 31453759 151 - chr17:31453604-31453663 NA NA NA NA NA chr17-83 31373224 31373529 161 - chr17:31373370-31373386 NA NA NA NA NA chr17-82 31066843 31067157 172 - chr17:31067001-31067047 NA NA NA NA NA chr17-81 30855760 30856189 249 - chr17:30855936-30856007 NA NA NA NA NA chr17-80 30785955 30786275 190 - chr17:30786082-30786139 NA NA NA NA NA chr17-79 30449231 30449453 163 - chr17:30449305-30449424 NA NA NA NA NA chr17-78 30249522 30249839 215 - chr17:30249522-30249686 NA NA NA NA NA chr17-77 30123137 30123467 216 - chr17:30123179-30123317 NA NA NA NA NA chr17-76 30054686 30054990 230 - chr17:30054785-30054966 NA NA NA NA NA chr17-75 30044625 30044805 165 - chr17:30044635-30044780 NA NA NA NA NA chr17-74 29975629 29976045 192 - chr17:29975904-29975923 NA NA NA NA NA chr17-73 29826730 29827106 259 - chr17:29826886-29827067 NA NA NA NA NA chr17-72 29746595 29746932 172 - chr17:29746788-29746823 NA NA NA NA NA chr17-71 29713945 29714227 211 - chr17:29713985-29714094 NA NA NA NA NA chr17-70 29324989 29325341 219 - chr17:29324996-29325145 NA NA NA NA NA chr17-69 29301382 29301675 193 - chr17:29301417-29301560 NA NA NA NA NA chr17-68 29252988 29253189 144 - chr17:29253069-29253144 NA NA NA NA NA chr17-67 29071016 29071261 157 - chr17:29071104-29071173 NA NA NA NA NA chr17-66 28965592 28965848 179 - chr17:28965705-28965843 NA NA NA NA NA chr17-65 28800559 28800765 166 - chr17:28800592-28800711 NA NA NA NA NA chr17-64 28695100 28695284 176 - chr17:28695100-28695272 NA NA NA NA NA chr17-63 28639609 28639853 179 - chr17:28639633-28639750 NA NA NA NA NA chr17-62 28570088 28570261 153 - chr17:28570109-28570252 NA NA NA NA NA chr17-61 28402165 28402447 141 - chr17:28402312-28402318 NA NA NA NA NA chr17-60 28159017 28159263 172 - chr17:28159047-28159167 NA NA NA NA NA chr17-59 27302860 27303297 221 - chr17:27302974-27303030 NA NA NA NA NA chr17-6 2695079 2695366 142 - chr17:2695248-2695269 NA NA NA NA NA chr17-58 26794579 26794889 185 - chr17:26794726-26794775 NA NA NA NA NA chr17-57 26704311 26704774 358 - chr17:26704454-26704602 NA NA NA NA NA chr17-56 26684099 26684342 163 - chr17:26684174-26684252 NA NA NA NA NA chr17-5 2433479 2433703 148 - chr17:2433555-2433627 NA NA NA NA NA chr17-55 22684915 22685092 142 - chr17:22684952-22685061 NA NA NA NA NA chr17-54 22615745 22616042 205 - chr17:22615773-22615932 NA NA NA NA NA chr17-53 21120604 21120880 163 - chr17:21120731-21120774 NA NA NA NA NA chr17-52 20164705 20164868 155 - chr17:20164717-20164868 NA NA NA NA NA chr17-51 20118984 20119189 183 - chr17:20118999-20119138 NA NA NA NA NA chr17-50 20053312 20053629 164 - chr17:20053461-20053474 NA NA NA NA NA chr17-49 19934443 19934724 153 - chr17:19934571-19934596 NA NA NA NA NA chr17-48 19534935 19535120 161 - chr17:19534945-19535089 NA NA NA NA NA chr17-47 19332458 19332865 277 - chr17:19332716-19332799 NA NA NA NA NA chr17-46 19261260 19261459 115 - chr17:19261381-19261454 NA NA NA NA NA chr17-4 1834888 1835118 174 - chr17:1834888-1835034 NA NA NA NA NA chr17-45 18310523 18310713 160 - chr17:18310549-18310681 NA NA NA NA NA chr17-3 1809039 1809336 247 - chr17:1809084-1809231 NA NA NA NA NA chr17-44 17890439 17890639 118 - chr17:17890487-17890540 NA NA NA NA NA chr17-43 17612406 17612622 156 - chr17:17612454-17612556 NA NA NA NA NA chr17-42 17262768 17263026 149 - chr17:17262863-17262910 NA NA NA NA NA chr17-41 16138496 16139157 400 - chr17:16138845-16138940 NA NA NA NA NA chr17-40 16061061 16061303 212 - chr17:16061070-16061222 NA NA NA NA NA chr17-39 15978637 15978951 193 - chr17:15978666-15978784 NA NA NA NA NA chr17-38 15974121 15974295 165 - chr17:15974131-15974278 NA NA NA NA NA chr17-37 15480302 15480693 184 - chr17:15480538-15480544 NA NA NA NA NA chr17-36 14950912 14951176 196 - chr17:14950916-14951076 NA NA NA NA NA chr17-35 14815144 14815554 242 - chr17:14815341-14815355 NA NA NA NA NA chr17-34 14688327 14688787 244 - chr17:14688474-14688610 NA NA NA NA NA chr17-33 14571276 14571581 179 - chr17:14571465-14571581 NA NA NA NA NA chr17-32 13942759 13943041 162 - chr17:13942879-13942921 NA NA NA NA NA chr17-31 13821144 13821594 307 - chr17:13821429-13821522 NA NA NA NA NA chr17-30 13714255 13714456 184 - chr17:13714276-13714426 NA NA NA NA NA chr17-29 13650175 13650521 236 - chr17:13650190-13650371 NA NA NA NA NA chr17-28 13461665 13461810 143 - chr17:13461668-13461810 NA NA NA NA NA chr17-27 13330710 13330889 125 - chr17:13330752-13330811 NA NA NA NA NA chr17-26 12131144 12131686 303 - chr17:12131349-12131430 NA NA NA NA NA chr17-25 12061402 12061774 208 - chr17:12061436-12061545 NA NA NA NA NA chr17-24 10546059 10546211 120 - chr17:10546099-10546203 NA NA NA NA NA chr17-23 10489893 10490134 155 - chr17:10489987-10490052 NA NA NA NA NA chr17-22 10479259 10479426 155 - chr17:10479273-10479415 NA NA NA NA NA chr17-21 10429088 10429529 256 - chr17:10429212-10429222 NA NA NA NA NA chr17-20 10135824 10136100 161 - chr17:10135923-10135977 NA NA NA NA NA chr16-39 9821112 9821714 347 - chr16:9821290-9821305 NA NA NA NA NA chr16-38 9525167 9525482 208 - chr16:9525317-9525461 NA NA NA NA NA chr16-37 9479093 9479332 188 - chr16:9479128-9479273 NA NA NA NA NA chr16-36 9089693 9089863 140 - chr16:9089743-9089843 NA NA NA NA NA chr16-293 89332059 89332875 482 - chr16:89332557-89332572 NA NA NA NA NA chr16-292 89026711 89027003 165 - chr16:89026828-89026856 NA NA NA NA NA chr16-291 88498448 88498752 291 - chr16:88498477-88498742 NA NA NA NA NA chr16-290 87972316 87972543 152 - chr16:87972441-87972493 NA NA NA NA NA chr16-289 87732327 87732775 277 - chr16:87732337-87732467 NA NA NA NA NA chr16-288 87659468 87660024 251 - chr16:87659601-87659633 NA NA NA NA NA chr16-287 87121798 87122157 323 - chr16:87121834-87122121 NA NA NA NA NA chr16-286 87115143 87115302 137 - chr16:87115151-87115273 NA NA NA NA NA chr16-285 86947798 86948072 150 - chr16:86947930-86947952 NA NA NA NA NA chr16-35 8692441 8692839 207 - chr16:8692500-8692582 NA NA NA NA NA chr16-284 86793770 86794211 224 - chr16:86793926-86794087 NA NA NA NA NA chr16-283 86660023 86660319 250 - chr16:86660056-86660214 NA NA NA NA NA chr16-282 86426964 86427137 151 - chr16:86426996-86427120 NA NA NA NA NA chr16-281 86292688 86292932 152 - chr16:86292784-86292842 NA NA NA NA NA chr16-280 86289362 86289617 123 - chr16:86289511-86289519 NA NA NA NA NA chr16-279 86142022 86142240 151 - chr16:86142093-86142181 NA NA NA NA NA chr16-278 86012913 86013168 198 - chr16:86013051-86013135 NA NA NA NA NA chr16-277 85852422 85852656 140 - chr16:85852442-85852535 NA NA NA NA NA chr16-276 85793946 85794284 207 - chr16:85794012-85794099 NA NA NA NA NA chr16-275 85220141 85220530 196 - chr16:85220332-85220333 NA NA NA NA NA chr16-274 85174667 85175115 246 - chr16:85174831-85174837 NA NA NA NA NA chr16-273 85083484 85083778 160 - chr16:85083616-85083643 NA NA NA NA NA chr16-272 84851581 84851935 237 - chr16:84851792-84851865 NA NA NA NA NA chr16-34 8471725 8471912 138 - chr16:8471797-8471882 NA NA NA NA NA chr16-271 84646392 84646961 292 - chr16:84646449-84646609 NA NA NA NA NA chr16-270 84476019 84476336 186 - chr16:84476196-84476297 NA NA NA NA NA chr16-33 8432281 8432543 128 - chr16:8432402-8432432 NA NA NA NA NA chr16-32 8405103 8405395 155 - chr16:8405257-8405292 NA NA NA NA NA chr16-269 83842256 83842572 256 - chr16:83842256-83842392 NA NA NA NA NA chr16-268 83753674 83753929 193 - chr16:83753682-83753844 NA NA NA NA NA chr16-267 83586020 83586388 295 - chr16:83586067-83586216 NA NA NA NA NA chr16-31 8330839 8331088 167 - chr16:8330903-8330997 NA NA NA NA NA chr16-266 83088891 83089682 327 - chr16:83089037-83089045 NA NA NA NA NA chr16-265 83049122 83049295 151 - chr16:83049134-83049268 NA NA NA NA NA chr16-30 8287387 8287691 167 - chr16:8287532-8287558 NA NA NA NA NA chr16-29 8286462 8286852 199 - chr16:8286690-8286704 NA NA NA NA NA chr16-264 82770674 82770878 185 - chr16:82770688-82770835 NA NA NA NA NA chr16-28 8269863 8270183 201 - chr16:8269983-8270056 NA NA NA NA NA chr16-27 8267863 8268177 220 - chr16:8268033-8268121 NA NA NA NA NA chr16-263 82661657 82661894 210 - chr16:82661735-82661891 NA NA NA NA NA chr16-262 82619487 82619658 139 - chr16:82619521-82619627 NA NA NA NA NA chr16-261 82314600 82315391 377 - chr16:82314858-82314899 NA NA NA NA NA chr16-260 82195513 82195767 176 - chr16:82195577-82195661 NA NA NA NA NA chr16-259 82128463 82128626 153 - chr16:82128476-82128624 NA NA NA NA NA chr16-258 82058447 82058687 149 - chr16:82058537-82058594 NA NA NA NA NA chr16-257 82055878 82056244 228 - chr16:82056100-82056148 NA NA NA NA NA chr16-256 81735492 81735804 160 - chr16:81735646-81735656 NA NA NA NA NA chr16-255 81506239 81506401 147 - chr16:81506256-81506390 NA NA NA NA NA chr16-254 81492180 81492317 130 - chr16:81492185-81492301 NA NA NA NA NA chr16-253 81386365 81386853 299 - chr16:81386596-81386777 NA NA NA NA NA chr16-252 80712876 80713208 212 - chr16:80712877-80713029 NA NA NA NA NA chr16-26 8054589 8054879 150 - chr16:8054727-8054735 NA NA NA NA NA chr16-251 80436070 80436374 247 - chr16:80436225-80436366 NA NA NA NA NA chr16-250 80404933 80405278 247 - chr16:80405070-80405268 NA NA NA NA NA chr16-249 80383543 80383768 155 - chr16:80383623-80383718 NA NA NA NA NA chr16-248 80289609 80290051 196 - chr16:80289715-80289735 NA NA NA NA NA chr16-247 80149519 80149773 128 - chr16:80149652-80149677 NA NA NA NA NA chr16-246 79995423 79995636 171 - chr16:79995479-79995601 NA NA NA NA NA chr16-245 79986256 79986450 156 - chr16:79986298-79986414 NA NA NA NA NA chr16-25 7993906 7994101 150 - chr16:7993952-7994058 NA NA NA NA NA chr16-244 79825524 79825960 294 - chr16:79825582-79825691 NA NA NA NA NA chr16-243 79514635 79514927 214 - chr16:79514720-79514895 NA NA NA NA NA chr16-242 79005541 79005855 194 - chr16:79005700-79005815 NA NA NA NA NA chr16-241 78799272 78799853 356 - chr16:78799503-78799631 NA NA NA NA NA chr16-240 78795223 78795531 170 - chr16:78795361-78795393 NA NA NA NA NA chr16-239 78656355 78656621 167 - chr16:78656442-78656516 NA NA NA NA NA chr16-238 78570345 78570523 150 - chr16:78570373-78570495 NA NA NA NA NA chr16-237 78569786 78570229 290 - chr16:78570057-78570135 NA NA NA NA NA chr16-236 78370373 78370619 180 - chr16:78370475-78370571 NA NA NA NA NA chr16-235 78113515 78113792 158 - chr16:78113628-78113661 NA NA NA NA NA chr16-234 78030183 78030418 145 - chr16:78030291-78030337 NA NA NA NA NA chr16-233 77881885 77882043 131 - chr16:77881890-77882005 NA NA NA NA NA chr16-232 77630284 77630452 164 - chr16:77630287-77630449 NA NA NA NA NA chr16-231 77624897 77625124 215 - chr16:77624915-77625115 NA NA NA NA NA chr16-230 77414522 77414797 149 - chr16:77414644-77414667 NA NA NA NA NA chr16-229 77176819 77177152 279 - chr16:77176851-77177022 NA NA NA NA NA chr16-24 7708691 7708976 182 - chr16:7708779-7708843 NA NA NA NA NA chr16-228 76905045 76905285 169 - chr16:76905103-76905167 NA NA NA NA NA chr16-227 76646325 76646637 208 - chr16:76646326-76646482 NA NA NA NA NA chr16-226 76556884 76557080 137 - chr16:76556952-76557039 NA NA NA NA NA chr16-23 7591659 7591824 116 - chr16:7591722-7591803 NA NA NA NA NA chr16-225 75842113 75842325 123 - chr16:75842216-75842264 NA NA NA NA NA chr16-224 75748569 75748823 159 - chr16:75748660-75748720 NA NA NA NA NA chr16-223 75511844 75512147 162 - chr16:75511982-75512000 NA NA NA NA NA chr16-222 75060239 75060397 141 - chr16:75060272-75060388 NA NA NA NA NA chr16-221 74862749 74862920 160 - chr16:74862772-74862915 NA NA NA NA NA chr16-220 74501451 74501821 222 - chr16:74501639-74501753 NA NA NA NA NA chr16-219 74298652 74299194 295 - chr16:74298661-74298762 NA NA NA NA NA chr16-218 74186015 74186209 144 - chr16:74186049-74186127 NA NA NA NA NA chr16-217 74126560 74126830 152 - chr16:74126698-74126722 NA NA NA NA NA chr16-216 73957536 73957912 218 - chr16:73957639-73957644 NA NA NA NA NA chr16-215 73663018 73663274 143 - chr16:73663115-73663129 NA NA NA NA NA chr16-214 73617960 73618673 399 - chr16:73618031-73618528 NA NA NA NA NA chr16-22 7354006 7354311 199 - chr16:7354158-7354297 NA NA NA NA NA chr16-213 73509034 73509375 176 - chr16:73509242-73509296 NA NA NA NA NA chr16-212 73286117 73286489 214 - chr16:73286246-73286273 NA NA NA NA NA chr16-211 73285573 73285898 207 - chr16:73285666-73285730 NA NA NA NA NA chr16-210 73258230 73258413 118 - chr16:73258271-73258300 NA NA NA NA NA chr16-209 72996557 72996836 237 - chr16:72996563-72996776 NA NA NA NA NA chr16-21 7298718 7298967 138 - chr16:7298843-7298884 NA NA NA NA NA chr16-208 72726603 72726936 192 - chr16:72726648-72726747 NA NA NA NA NA chr16-207 72438712 72438961 191 - chr16:72438748-72438859 NA NA NA NA NA chr16-206 72380295 72380546 143 - chr16:72380306-72380395 NA NA NA NA NA chr16-205 72273280 72273524 158 - chr16:72273353-72273412 NA NA NA NA NA chr16-204 72234596 72234802 186 - chr16:72234618-72234764 NA NA NA NA NA chr16-203 72014657 72014910 192 - chr16:72014694-72014801 NA NA NA NA NA chr16-202 71909682 71909968 190 - chr16:71909796-71909938 NA NA NA NA NA chr16-201 71641651 71642048 188 - chr16:71641912-71641943 NA NA NA NA NA chr16-200 71617032 71617224 147 - chr16:71617079-71617183 NA NA NA NA NA chr16-199 71591105 71591881 346 - chr16:71591391-71591593 NA NA NA NA NA chr16-198 71338801 71338976 155 - chr16:71338825-71338964 NA NA NA NA NA chr16-20 7093000 7093325 171 - chr16:7093224-7093310 NA NA NA NA NA chr16-197 70655310 70655665 221 - chr16:70655411-70655565 NA NA NA NA NA chr16-196 70651811 70651961 136 - chr16:70651815-70651923 NA NA NA NA NA chr16-195 70425125 70425517 261 - chr16:70425219-70425278 NA NA NA NA NA chr16-194 70404730 70405264 283 - chr16:70404751-70404898 NA NA NA NA NA chr16-193 69870013 69870273 144 - chr16:69870140-69870179 NA NA NA NA NA chr16-192 69797039 69797261 167 - chr16:69797056-69797187 NA NA NA NA NA chr16-191 69620413 69620591 173 - chr16:69620425-69620588 NA NA NA NA NA chr16-190 69553446 69553774 164 - chr16:69553624-69553638 NA NA NA NA NA chr16-189 69512980 69513223 140 - chr16:69513065-69513111 NA NA NA NA NA chr16-188 69467685 69467979 158 - chr16:69467824-69467849 NA NA NA NA NA chr16-187 69226346 69226654 162 - chr16:69226493-69226510 NA NA NA NA NA chr16-186 68752809 68753027 154 - chr16:68752881-68752967 NA NA NA NA NA chr16-185 68436687 68436952 163 - chr16:68436803-68436857 NA NA NA NA NA chr16-184 68352420 68352840 242 - chr16:68352563-68352592 NA NA NA NA NA chr16-183 68096466 68096775 202 - chr16:68096550-68096622 NA NA NA NA NA chr16-182 67851179 67851506 196 - chr16:67851298-67851369 NA NA NA NA NA chr16-181 67584469 67584650 166 - chr16:67584514-67584650 NA NA NA NA NA chr16-180 67569040 67569199 153 - chr16:67569044-67569185 NA NA NA NA NA chr16-179 67477128 67477559 306 - chr16:67477156-67477442 NA NA NA NA NA chr16-178 67357518 67357941 242 - chr16:67357721-67357817 NA NA NA NA NA chr16-177 67352070 67352422 195 - chr16:67352148-67352234 NA NA NA NA NA chr16-176 67115099 67115365 218 - chr16:67115105-67115299 NA NA NA NA NA chr16-19 6705743 6706012 172 - chr16:6705896-6705943 NA NA NA NA NA chr16-175 66817895 66818190 189 - chr16:66817994-66818078 NA NA NA NA NA chr16-174 66768533 66768724 122 - chr16:66768560-66768571 NA NA NA NA NA chr16-173 66673933 66674283 243 - chr16:66673933-66674232 NA NA NA NA NA chr16-172 66532921 66533078 153 - chr16:66532931-66533076 NA NA NA NA NA chr16-171 66458708 66459448 315 - chr16:66458849-66458873 NA NA NA NA NA chr16-18 6636864 6637154 222 - chr16:6636871-6636964 NA NA NA NA NA chr16-170 66027192 66027556 241 - chr16:66027407-66027479 NA NA NA NA NA chr16-169 65931333 65931632 249 - chr16:65931356-65931505 NA NA NA NA NA chr16-17 6547348 6547641 224 - chr16:6547396-6547530 NA NA NA NA NA chr16-168 65472286 65472516 151 - chr16:65472383-65472446 NA NA NA NA NA chr16-167 65300731 65300990 165 - chr16:65300818-65300882 NA NA NA NA NA chr16-166 65042445 65042656 170 - chr16:65042462-65042603 NA NA NA NA NA chr16-165 64771853 64772183 168 - chr16:64772013-64772017 NA NA NA NA NA chr16-164 64654038 64654216 153 - chr16:64654038-64654141 NA NA NA NA NA chr16-163 64638838 64639175 186 - chr16:64638901-64638980 NA NA NA NA NA chr16-162 64635770 64636007 144 - chr16:64635910-64635927 NA NA NA NA NA chr16-16 6462120 6462317 162 - chr16:6462149-6462270 NA NA NA NA NA chr16-15 6442944 6443268 240 - chr16:6443194-6443266 NA NA NA NA NA chr16-161 64407546 64407742 154 - chr16:64407581-64407651 NA NA NA NA NA chr16-160 63972228 63972520 148 - chr16:63972372-63972448 NA NA NA NA NA chr16-159 63939159 63939344 115 - chr16:63939219-63939269 NA NA NA NA NA chr16-158 63867291 63867602 165 - chr16:63867307-63867359 NA NA NA NA NA chr16-157 63793231 63793520 152 - chr16:63793370-63793387 NA NA NA NA NA chr16-156 63157559 63157807 162 - chr16:63157642-63157715 NA NA NA NA NA chr16-155 63083235 63083556 263 - chr16:63083313-63083460 NA NA NA NA NA chr16-154 63063212 63063412 149 - chr16:63063267-63063363 NA NA NA NA NA chr16-153 62953325 62953546 156 - chr16:62953386-62953473 NA NA NA NA NA chr16-152 62890935 62891146 149 - chr16:62890995-62891080 NA NA NA NA NA chr16-151 62189573 62189845 148 - chr16:62189701-62189729 NA NA NA NA NA chr16-150 62092384 62092839 274 - chr16:62092589-62092670 NA NA NA NA NA chr16-149 62024836 62025060 144 - chr16:62024931-62025010 NA NA NA NA NA chr16-148 61989077 61989243 128 - chr16:61989080-61989132 NA NA NA NA NA chr16-147 61505941 61506222 193 - chr16:61506022-61506120 NA NA NA NA NA chr16-146 61262129 61262408 155 - chr16:61262264-61262357 NA NA NA NA NA chr16-145 61029294 61029456 131 - chr16:61029357-61029441 NA NA NA NA NA chr16-144 60970164 60970488 169 - chr16:60970215-60970281 NA NA NA NA NA chr16-143 60914175 60914369 141 - chr16:60914233-60914326 NA NA NA NA NA chr16-142 60892655 60892838 168 - chr16:60892668-60892822 NA NA NA NA NA chr16-141 60855925 60856219 254 - chr16:60856042-60856216 NA NA NA NA NA chr16-140 60557845 60558006 129 - chr16:60557908-60557973 NA NA NA NA NA chr16-139 60416995 60417166 132 - chr16:60416995-60417049 NA NA NA NA NA chr16-138 60396258 60396534 163 - chr16:60396377-60396424 NA NA NA NA NA chr16-137 60353076 60353484 232 - chr16:60353113-60353257 NA NA NA NA NA chr16-136 59983169 59983746 311 - chr16:59983237-59983318 NA NA NA NA NA chr16-135 59478006 59478235 183 - chr16:59478088-59478207 NA NA NA NA NA chr16-134 58741253 58741795 327 - chr16:58741523-58741746 NA NA NA NA NA chr16-133 58589615 58589832 185 - chr16:58589669-58589811 NA NA NA NA NA chr16-132 58567786 58567992 161 - chr16:58567843-58567953 NA NA NA NA NA chr16-131 58149637 58150189 256 - chr16:58149677-58149702 NA NA NA NA NA chr16-130 57782973 57783149 154 - chr16:57782989-57783115 NA NA NA NA NA chr16-129 57307175 57307538 239 - chr16:57307383-57307456 NA NA NA NA NA chr16-128 57183316 57183507 155 - chr16:57183349-57183465 NA NA NA NA NA chr16-14 5714410 5714652 149 - chr16:5714501-5714558 NA NA NA NA NA chr16-127 57056306 57056472 132 - chr16:57056340-57056455 NA NA NA NA NA chr16-126 56588110 56588348 152 - chr16:56588197-56588264 NA NA NA NA NA chr16-125 56552336 56552525 165 - chr16:56552358-56552497 NA NA NA NA NA chr16-124 56176788 56176976 169 - chr16:56176798-56176929 NA NA NA NA NA chr16-123 55609522 55609798 149 - chr16:55609687-55609699 NA NA NA NA NA chr16-122 55579768 55579955 165 - chr16:55579785-55579923 NA NA NA NA NA chr16-121 55283683 55283982 242 - chr16:55283695-55283835 NA NA NA NA NA chr16-120 55167713 55167994 146 - chr16:55167852-55167861 NA NA NA NA NA chr16-119 54749683 54749937 225 - chr16:54749699-54749866 NA NA NA NA NA chr16-118 54608676 54609117 244 - chr16:54608951-54609076 NA NA NA NA NA chr16-117 54521340 54521579 136 - chr16:54521431-54521452 NA NA NA NA NA chr16-116 54353345 54353636 183 - chr16:54353455-54353532 NA NA NA NA NA chr16-115 54292165 54292368 156 - chr16:54292210-54292320 NA NA NA NA NA chr16-114 53877065 53877333 144 - chr16:53877184-53877221 NA NA NA NA NA chr16-113 53703160 53703380 155 - chr16:53703216-53703297 NA NA NA NA NA chr16-13 5362903 5363435 382 - chr16:5363075-5363382 NA NA NA NA NA chr16-112 53441704 53441976 165 - chr16:53441726-53441855 NA NA NA NA NA chr16-111 53338867 53339029 157 - chr16:53338876-53339026 NA NA NA NA NA chr16-110 53292365 53292669 200 - chr16:53292486-53292575 NA NA NA NA NA chr16-109 53215225 53215825 342 - chr16:53215379-53215515 NA NA NA NA NA chr16-108 53061106 53061307 189 - chr16:53061106-53061271 NA NA NA NA NA chr16-107 52803181 52803406 127 - chr16:52803317-52803327 NA NA NA NA NA chr16-106 52641167 52641400 184 - chr16:52641212-52641343 NA NA NA NA NA chr16-105 52345631 52345892 228 - chr16:52345660-52345822 NA NA NA NA NA chr16-104 52315568 52315826 181 - chr16:52315673-52315805 NA NA NA NA NA chr16-103 52212357 52212662 256 - chr16:52212483-52212641 NA NA NA NA NA chr16-102 52149881 52150138 141 - chr16:52149959-52150003 NA NA NA NA NA chr16-101 50925680 50926038 279 - chr16:50925917-50926038 NA NA NA NA NA chr16-100 50752135 50752346 167 - chr16:50752171-50752286 NA NA NA NA NA chr16-99 50378745 50378922 145 - chr16:50378833-50378918 NA NA NA NA NA chr16-98 50160938 50161169 171 - chr16:50160988-50161089 NA NA NA NA NA chr16-12 4999767 4999977 161 - chr16:4999825-4999946 NA NA NA NA NA chr16-97 49967925 49968524 326 - chr16:49968190-49968235 NA NA NA NA NA chr16-96 49739901 49740204 170 - chr16:49740055-49740113 NA NA NA NA NA chr16-95 49457295 49457570 161 - chr16:49457393-49457448 NA NA NA NA NA chr16-94 49421945 49422308 293 - chr16:49421960-49422128 NA NA NA NA NA chr16-93 49324262 49324540 164 - chr16:49324369-49324476 NA NA NA NA NA chr16-11 4898554 4899137 286 - chr16:4898715-4898772 NA NA NA NA NA chr16-92 48801848 48802094 154 - chr16:48801942-48802006 NA NA NA NA NA chr16-91 48788967 48789288 252 - chr16:48789068-48789235 NA NA NA NA NA chr16-90 48670445 48670822 283 - chr16:48670482-48670614 NA NA NA NA NA chr16-89 47746041 47746276 133 - chr16:47746073-47746139 NA NA NA NA NA chr16-88 47260836 47261094 207 - chr16:47260845-47261022 NA NA NA NA NA chr16-87 46767352 46767689 227 - chr16:46767612-46767654 NA NA NA NA NA chr16-10 4074728 4075115 247 - chr16:4074818-4074875 NA NA NA NA NA chr16-9 4035463 4035643 144 - chr16:4035499-4035615 NA NA NA NA NA chr16-8 3924701 3925060 292 - chr16:3924729-3924887 NA NA NA NA NA chr16-7 3737603 3737972 247 - chr16:3737757-3737914 NA NA NA NA NA chr16-86 36036112 36036408 230 - chr16:36036276-36036374 NA NA NA NA NA chr16-6 3557708 3558081 199 - chr16:3557764-3557848 NA NA NA NA NA chr16-85 35332014 35332174 116 - chr16:35332055-35332149 NA NA NA NA NA chr16-84 35196239 35196501 166 - chr16:35196342-35196419 NA NA NA NA NA chr16-5 3406668 3406886 158 - chr16:3406734-3406838 NA NA NA NA NA chr16-83 31860682 31860885 160 - chr16:31860727-31860843 NA NA NA NA NA chr16-4 3080928 3081094 160 - chr16:3080940-3081088 NA NA NA NA NA chr16-82 30781282 30781645 210 - chr16:30781494-30781589 NA NA NA NA NA chr16-81 30388799 30389187 193 - chr16:30388922-30388956 NA NA NA NA NA chr16-80 29981048 29981451 228 - chr16:29981127-29981195 NA NA NA NA NA chr16-79 27996970 27997260 190 - chr16:27997103-27997226 NA NA NA NA NA chr16-78 25514623 25515081 291 - chr16:25514772-25514878 NA NA NA NA NA chr16-77 25341720 25341974 141 - chr16:25341840-25341875 NA NA NA NA NA chr16-3 2508562 2508998 366 - chr16:2508772-2508998 NA NA NA NA NA chr16-76 24908743 24909051 186 - chr16:24908855-24908909 NA NA NA NA NA chr16-2 2479178 2479564 208 - chr16:2479396-2479485 NA NA NA NA NA chr16-75 24685203 24685687 216 - chr16:24685548-24685573 NA NA NA NA NA chr16-74 24474452 24474809 170 - chr16:24474507-24474556 NA NA NA NA NA chr16-73 24428331 24428506 159 - chr16:24428354-24428504 NA NA NA NA NA chr16-72 24242604 24242751 128 - chr16:24242655-24242748 NA NA NA NA NA chr16-71 24212911 24213423 238 - chr16:24213279-24213337 NA NA NA NA NA chr16-70 24150431 24150742 213 - chr16:24150578-24150742 NA NA NA NA NA chr16-69 23774031 23774391 219 - chr16:23774060-23774194 NA NA NA NA NA chr16-68 23230397 23230629 142 - chr16:23230509-23230550 NA NA NA NA NA chr16-67 23084961 23085243 190 - chr16:23084997-23085141 NA NA NA NA NA chr16-66 21957748 21958140 251 - chr16:21957955-21958023 NA NA NA NA NA chr16-65 21002958 21003329 207 - chr16:21003172-21003265 NA NA NA NA NA chr16-64 20992177 20992427 214 - chr16:20992188-20992330 NA NA NA NA NA chr16-63 19942374 19942658 171 - chr16:19942472-19942522 NA NA NA NA NA chr16-62 19827126 19827514 232 - chr16:19827356-19827506 NA NA NA NA NA chr16 1841745 1842029 172 - chr16:1841799-1841975 NA NA NA NA NA chr16-61 17633655 17633956 253 - chr16:17633742-17633899 NA NA NA NA NA chr16-60 17034462 17034644 156 - chr16:17034486-17034614 NA NA NA NA NA chr16-59 14212359 14212584 210 - chr16:14212366-14212546 NA NA NA NA NA chr16-58 14112635 14112984 213 - chr16:14112789-14112796 NA NA NA NA NA chr16-57 14037394 14037728 240 - chr16:14037656-14037708 NA NA NA NA NA chr16-56 13930563 13930767 201 - chr16:13930565-13930760 NA NA NA NA NA chr16-55 13727587 13727747 127 - chr16:13727597-13727658 NA NA NA NA NA chr16-54 13617554 13617769 174 - chr16:13617621-13617741 NA NA NA NA NA chr16-53 13601107 13601398 237 - chr16:13601212-13601341 NA NA NA NA NA chr16-52 13463238 13463570 206 - chr16:13463288-13463406 NA NA NA NA NA chr16-51 13426920 13427232 180 - chr16:13427017-13427131 NA NA NA NA NA chr16-50 13275958 13276251 210 - chr16:13276038-13276162 NA NA NA NA NA chr16-49 13100646 13100890 174 - chr16:13100690-13100829 NA NA NA NA NA chr16-48 13080481 13080666 133 - chr16:13080513-13080574 NA NA NA NA NA chr16-47 12004864 12005327 244 - chr16:12005171-12005284 NA NA NA NA NA chr16-46 11813987 11814198 129 - chr16:11814071-11814159 NA NA NA NA NA chr16-45 11007573 11008259 295 - chr16:11008108-11008156 NA NA NA NA NA chr16-44 10826643 10827028 194 - chr16:10826832-10826837 NA NA NA NA NA chr16-43 10795675 10795992 191 - chr16:10795705-10795818 NA NA NA NA NA chr16-42 10544300 10544844 314 - chr16:10544694-10544696 NA NA NA NA NA chr16-41 10447266 10447500 169 - chr16:10447325-10447423 NA NA NA NA NA chr16-40 10160965 10161252 167 - chr16:10161081-10161124 NA NA NA NA NA chr15_GL383555v2_alt 198237 198789 339 - chr15_GL383555v2_alt:198448-198572 NA NA NA NA NA chr15-427 99489928 99490580 358 - chr15:99490279-99490281 NA NA NA NA NA chr15-426 99400316 99400543 162 - chr15:99400374-99400464 NA NA NA NA NA chr15-425 99329019 99329183 150 - chr15:99329031-99329165 NA NA NA NA NA chr15-424 99214030 99214318 204 - chr15:99214124-99214286 NA NA NA NA NA chr15-423 98927789 98928186 370 - chr15:98927789-98928105 NA NA NA NA NA chr15-422 98870562 98870733 157 - chr15:98870596-98870725 NA NA NA NA NA chr15-421 98706723 98706961 135 - chr15:98706811-98706828 NA NA NA NA NA chr15-420 98666769 98666974 158 - chr15:98666826-98666932 NA NA NA NA NA chr15-419 98391748 98392176 250 - chr15:98392012-98392173 NA NA NA NA NA chr15-418 98306569 98306776 149 - chr15:98306628-98306720 NA NA NA NA NA chr15-417 98242723 98242961 138 - chr15:98242831-98242865 NA NA NA NA NA chr15-416 98077630 98077856 137 - chr15:98077748-98077791 NA NA NA NA NA chr15-415 98072822 98073298 256 - chr15:98073146-98073286 NA NA NA NA NA chr15-414 97827686 97827966 188 - chr15:97827790-97827898 NA NA NA NA NA chr15-413 97753961 97754166 179 - chr15:97753997-97754145 NA NA NA NA NA chr15-412 97309572 97309871 220 - chr15:97309633-97309765 NA NA NA NA NA chr15-411 97143042 97143581 283 - chr15:97143306-97143329 NA NA NA NA NA chr15-410 96953739 96954059 179 - chr15:96953772-96953864 NA NA NA NA NA chr15-409 96888031 96888481 205 - chr15:96888172-96888184 NA NA NA NA NA chr15-408 96663126 96663396 144 - chr15:96663238-96663242 NA NA NA NA NA chr15-407 96630083 96630291 126 - chr15:96630176-96630231 NA NA NA NA NA chr15-406 96561643 96561911 171 - chr15:96561730-96561794 NA NA NA NA NA chr15-405 96541480 96541697 151 - chr15:96541550-96541633 NA NA NA NA NA chr15-404 96385093 96385304 149 - chr15:96385157-96385243 NA NA NA NA NA chr15-403 96298421 96298726 234 - chr15:96298586-96298702 NA NA NA NA NA chr15-402 96195190 96195450 224 - chr15:96195270-96195422 NA NA NA NA NA chr15-401 96086731 96087068 196 - chr15:96086920-96086951 NA NA NA NA NA chr15-400 96026779 96027093 250 - chr15:96026794-96026931 NA NA NA NA NA chr15-399 95986413 95986779 210 - chr15:95986623-95986731 NA NA NA NA NA chr15-398 95767565 95767756 155 - chr15:95767595-95767717 NA NA NA NA NA chr15-397 95350721 95351152 291 - chr15:95350848-95351130 NA NA NA NA NA chr15-396 95294364 95294579 149 - chr15:95294434-95294515 NA NA NA NA NA chr15-395 95084942 95085214 192 - chr15:95084951-95085103 NA NA NA NA NA chr15-394 95069634 95069906 153 - chr15:95069741-95069781 NA NA NA NA NA chr15-393 94819940 94820163 174 - chr15:94819989-94820114 NA NA NA NA NA chr15-392 94769972 94770181 139 - chr15:94770034-94770095 NA NA NA NA NA chr15-391 94560307 94560550 122 - chr15:94560464-94560501 NA NA NA NA NA chr15-390 94205212 94205662 210 - chr15:94205488-94205494 NA NA NA NA NA chr15-389 94116226 94116504 158 - chr15:94116371-94116434 NA NA NA NA NA chr15-388 93948177 93948519 204 - chr15:93948303-93948438 NA NA NA NA NA chr15-387 93842996 93843419 219 - chr15:93843220-93843337 NA NA NA NA NA chr15-386 93802483 93803009 231 - chr15:93802815-93802899 NA NA NA NA NA chr15-385 93751333 93751943 347 - chr15:93751669-93751703 NA NA NA NA NA chr15-384 92947011 92947305 151 - chr15:92947157-92947168 NA NA NA NA NA chr15-383 92785196 92785435 208 - chr15:92785241-92785387 NA NA NA NA NA chr15-382 92754643 92754896 144 - chr15:92754750-92754786 NA NA NA NA NA chr15-381 92680321 92680655 254 - chr15:92680412-92680597 NA NA NA NA NA chr15-380 92547942 92548261 179 - chr15:92548078-92548113 NA NA NA NA NA chr15-379 92505465 92505840 208 - chr15:92505597-92505603 NA NA NA NA NA chr15-378 92382403 92382649 142 - chr15:92382521-92382552 NA NA NA NA NA chr15-377 92089300 92089769 249 - chr15:92089339-92089478 NA NA NA NA NA chr15-376 91714746 91714935 177 - chr15:91714763-91714934 NA NA NA NA NA chr15-375 91702728 91702998 199 - chr15:91702765-91702859 NA NA NA NA NA chr15-374 91534270 91534521 188 - chr15:91534359-91534471 NA NA NA NA NA chr15-373 91499557 91499802 149 - chr15:91499654-91499708 NA NA NA NA NA chr15-372 91477162 91477451 251 - chr15:91477171-91477346 NA NA NA NA NA chr15-371 90980087 90980336 179 - chr15:90980187-90980281 NA NA NA NA NA chr15-370 90723424 90723825 194 - chr15:90723673-90723702 NA NA NA NA NA chr15-369 90551267 90551422 150 - chr15:90551282-90551422 NA NA NA NA NA chr15-368 90422603 90422861 147 - chr15:90422716-90422754 NA NA NA NA NA chr15-367 90335036 90335249 119 - chr15:90335150-90335195 NA NA NA NA NA chr15-366 90203926 90204201 158 - chr15:90204043-90204084 NA NA NA NA NA chr15-365 89511008 89511224 157 - chr15:89511065-89511161 NA NA NA NA NA chr15-364 89441378 89441634 159 - chr15:89441473-89441533 NA NA NA NA NA chr15-363 89240237 89240544 162 - chr15:89240404-89240410 NA NA NA NA NA chr15-362 89163159 89163518 210 - chr15:89163426-89163428 NA NA NA NA NA chr15-361 89111464 89111713 130 - chr15:89111561-89111583 NA NA NA NA NA chr15-360 88647970 88648257 197 - chr15:88647984-88648129 NA NA NA NA NA chr15-359 88634814 88635148 172 - chr15:88634986-88634991 NA NA NA NA NA chr15-358 88297327 88297574 159 - chr15:88297417-88297487 NA NA NA NA NA chr15-357 88191384 88191702 164 - chr15:88191552-88191576 NA NA NA NA NA chr15-356 87713944 87714381 314 - chr15:87714111-87714294 NA NA NA NA NA chr15-355 87224551 87224799 149 - chr15:87224642-87224696 NA NA NA NA NA chr15-354 87038270 87038559 245 - chr15:87038272-87038429 NA NA NA NA NA chr15-353 86971902 86972092 172 - chr15:86971915-86972064 NA NA NA NA NA chr15-352 86824436 86824793 252 - chr15:86824552-86824594 NA NA NA NA NA chr15-351 86790032 86790308 146 - chr15:86790160-86790174 NA NA NA NA NA chr15-350 86742676 86742836 138 - chr15:86742692-86742811 NA NA NA NA NA chr15-349 86653741 86653955 173 - chr15:86653779-86653908 NA NA NA NA NA chr15-348 86444226 86444644 307 - chr15:86444306-86444595 NA NA NA NA NA chr15-347 86263096 86263619 302 - chr15:86263317-86263398 NA NA NA NA NA chr15-346 86113843 86114314 327 - chr15:86114052-86114249 NA NA NA NA NA chr15-345 85986889 85987155 152 - chr15:85987002-85987039 NA NA NA NA NA chr15-344 85681414 85681561 129 - chr15:85681421-85681541 NA NA NA NA NA chr15-343 85626208 85626415 143 - chr15:85626260-85626345 NA NA NA NA NA chr15-342 85597338 85597643 160 - chr15:85597488-85597508 NA NA NA NA NA chr15-341 85463073 85463636 342 - chr15:85463524-85463530 NA NA NA NA NA chr15-340 85455418 85455631 150 - chr15:85455559-85455607 NA NA NA NA NA chr15-339 85452653 85452846 171 - chr15:85452687-85452830 NA NA NA NA NA chr15-338 85406455 85406688 136 - chr15:85406541-85406587 NA NA NA NA NA chr15-337 85322964 85323113 146 - chr15:85322967-85323110 NA NA NA NA NA chr15-336 83911072 83911301 203 - chr15:83911096-83911247 NA NA NA NA NA chr15-335 83699982 83700305 239 - chr15:83700019-83700127 NA NA NA NA NA chr15-334 83638956 83639162 190 - chr15:83638959-83639117 NA NA NA NA NA chr15-333 83300974 83301333 202 - chr15:83301174-83301262 NA NA NA NA NA chr15-332 83077231 83077483 166 - chr15:83077385-83077464 NA NA NA NA NA chr15-331 83058133 83058350 167 - chr15:83058169-83058293 NA NA NA NA NA chr15-330 83051322 83051630 233 - chr15:83051332-83051425 NA NA NA NA NA chr15-329 82891088 82891298 193 - chr15:82891089-82891249 NA NA NA NA NA chr15-328 82831611 82831831 149 - chr15:82831698-82831768 NA NA NA NA NA chr15-327 82232432 82232642 170 - chr15:82232440-82232538 NA NA NA NA NA chr15-326 82162585 82162890 167 - chr15:82162725-82162756 NA NA NA NA NA chr15-325 82137325 82137491 155 - chr15:82137348-82137481 NA NA NA NA NA chr15-324 81693328 81693707 207 - chr15:81693444-81693507 NA NA NA NA NA chr15-323 81688228 81688562 281 - chr15:81688255-81688496 NA NA NA NA NA chr15-322 81408357 81408748 235 - chr15:81408415-81408537 NA NA NA NA NA chr15-321 80916717 80917068 159 - chr15:80916755-80916799 NA NA NA NA NA chr15-320 80781378 80781788 205 - chr15:80781620-80781657 NA NA NA NA NA chr15-319 80755984 80756219 160 - chr15:80756051-80756128 NA NA NA NA NA chr15-318 80516851 80517008 126 - chr15:80516874-80516961 NA NA NA NA NA chr15-317 80410699 80410990 158 - chr15:80410828-80410849 NA NA NA NA NA chr15-316 80274966 80275253 143 - chr15:80275112-80275113 NA NA NA NA NA chr15-315 80247982 80248146 153 - chr15:80247998-80248145 NA NA NA NA NA chr15-314 80227658 80228011 222 - chr15:80227853-80228008 NA NA NA NA NA chr15-313 80207089 80207563 295 - chr15:80207094-80207303 NA NA NA NA NA chr15-312 80143375 80143657 144 - chr15:80143517-80143527 NA NA NA NA NA chr15-311 80058414 80058653 176 - chr15:80058501-80058602 NA NA NA NA NA chr15-310 79723134 79723297 153 - chr15:79723134-79723282 NA NA NA NA NA chr15-309 79444048 79444334 146 - chr15:79444189-79444196 NA NA NA NA NA chr15-308 79403574 79403846 164 - chr15:79403684-79403739 NA NA NA NA NA chr15-307 79021587 79021810 153 - chr15:79021665-79021738 NA NA NA NA NA chr15-306 78939982 78940197 195 - chr15:78939983-78940138 NA NA NA NA NA chr15-305 78888317 78888502 178 - chr15:78888318-78888482 NA NA NA NA NA chr15-304 78868557 78868733 174 - chr15:78868557-78868730 NA NA NA NA NA chr15-303 78575715 78575947 200 - chr15:78575743-78575907 NA NA NA NA NA chr15-302 78559670 78559958 198 - chr15:78559740-78559893 NA NA NA NA NA chr15-301 78469973 78470158 176 - chr15:78469988-78470152 NA NA NA NA NA chr15-300 77772606 77772862 170 - chr15:77772606-77772733 NA NA NA NA NA chr15-299 77272312 77272629 254 - chr15:77272321-77272458 NA NA NA NA NA chr15-298 77253655 77253812 149 - chr15:77253656-77253790 NA NA NA NA NA chr15-297 77194172 77194499 285 - chr15:77194214-77194478 NA NA NA NA NA chr15-296 77186406 77186571 159 - chr15:77186408-77186564 NA NA NA NA NA chr15-295 77145727 77145909 143 - chr15:77145810-77145892 NA NA NA NA NA chr15-294 77126772 77127298 347 - chr15:77126796-77126945 NA NA NA NA NA chr15-293 76938721 76938990 160 - chr15:76938825-76938871 NA NA NA NA NA chr15-292 76932846 76933131 121 - chr15:76932910-76932917 NA NA NA NA NA chr15-291 76803678 76804112 204 - chr15:76803963-76803992 NA NA NA NA NA chr15-290 76641962 76642140 149 - chr15:76641964-76642057 NA NA NA NA NA chr15-289 76544588 76544841 174 - chr15:76544679-76544808 NA NA NA NA NA chr15-288 76519516 76519696 126 - chr15:76519628-76519671 NA NA NA NA NA chr15-287 76468660 76469229 250 - chr15:76468773-76468807 NA NA NA NA NA chr15-286 76305392 76305694 172 - chr15:76305587-76305694 NA NA NA NA NA chr15-285 76137388 76137807 249 - chr15:76137501-76137665 NA NA NA NA NA chr15-284 76030613 76031126 270 - chr15:76030855-76030881 NA NA NA NA NA chr15-283 75510392 75510624 176 - chr15:75510441-75510589 NA NA NA NA NA chr15-282 75476196 75476924 362 - chr15:75476708-75476864 NA NA NA NA NA chr15-281 75382849 75383140 168 - chr15:75382992-75383057 NA NA NA NA NA chr15-280 74973811 74974078 176 - chr15:74973906-74973995 NA NA NA NA NA chr15-279 74565028 74565216 151 - chr15:74565067-74565183 NA NA NA NA NA chr15-278 74418173 74418461 141 - chr15:74418328-74418330 NA NA NA NA NA chr15-277 73615769 73615985 160 - chr15:73615847-73615940 NA NA NA NA NA chr15-276 73399927 73400136 131 - chr15:73399965-73400038 NA NA NA NA NA chr15-275 73116702 73117013 149 - chr15:73116832-73116835 NA NA NA NA NA chr15-274 73085551 73085779 197 - chr15:73085620-73085767 NA NA NA NA NA chr15-273 72750076 72750346 153 - chr15:72750192-72750227 NA NA NA NA NA chr15-272 72602326 72602614 159 - chr15:72602447-72602481 NA NA NA NA NA chr15-271 72208087 72208252 139 - chr15:72208115-72208230 NA NA NA NA NA chr15-270 72173057 72173581 237 - chr15:72173202-72173223 NA NA NA NA NA chr15-269 72159864 72160134 203 - chr15:72159985-72160094 NA NA NA NA NA chr15-268 72066601 72066952 255 - chr15:72066747-72066881 NA NA NA NA NA chr15-267 71712882 71713170 198 - chr15:71712948-71713101 NA NA NA NA NA chr15-266 71684727 71685016 176 - chr15:71684813-71684849 NA NA NA NA NA chr15-265 71570140 71570300 152 - chr15:71570152-71570300 NA NA NA NA NA chr15-264 71499527 71499802 173 - chr15:71499647-71499711 NA NA NA NA NA chr15-263 71348460 71348623 144 - chr15:71348498-71348604 NA NA NA NA NA chr15-262 71222700 71223122 252 - chr15:71222746-71222913 NA NA NA NA NA chr15-261 71112697 71112967 156 - chr15:71112819-71112857 NA NA NA NA NA chr15-260 71076915 71077288 194 - chr15:71077095-71077121 NA NA NA NA NA chr15-259 71060719 71060982 170 - chr15:71060824-71060895 NA NA NA NA NA chr15-258 70938942 70939129 153 - chr15:70938972-70939087 NA NA NA NA NA chr15-257 70925673 70926021 219 - chr15:70925859-70925862 NA NA NA NA NA chr15-256 70806344 70806634 146 - chr15:70806494-70806502 NA NA NA NA NA chr15-255 70454391 70454699 162 - chr15:70454541-70454555 NA NA NA NA NA chr15-254 70248879 70249211 156 - chr15:70249118-70249161 NA NA NA NA NA chr15-253 69935960 69936288 211 - chr15:69936112-69936113 NA NA NA NA NA chr15-252 69784668 69784919 157 - chr15:69784756-69784813 NA NA NA NA NA chr15-251 69653413 69653596 129 - chr15:69653486-69653580 NA NA NA NA NA chr15-250 69516199 69516416 154 - chr15:69516276-69516360 NA NA NA NA NA chr15-249 69382153 69382427 152 - chr15:69382263-69382299 NA NA NA NA NA chr15-248 69208000 69208155 127 - chr15:69208033-69208104 NA NA NA NA NA chr15-247 69164318 69164762 388 - chr15:69164318-69164594 NA NA NA NA NA chr15-246 69163017 69163197 162 - chr15:69163017-69163170 NA NA NA NA NA chr15-245 69062290 69062652 194 - chr15:69062496-69062590 NA NA NA NA NA chr15-244 69019571 69019840 152 - chr15:69019682-69019720 NA NA NA NA NA chr15-243 68950537 68950888 213 - chr15:68950537-68950681 NA NA NA NA NA chr15-242 68932855 68933047 138 - chr15:68932929-68933040 NA NA NA NA NA chr15-241 68873426 68873662 162 - chr15:68873494-68873585 NA NA NA NA NA chr15-240 68866088 68866347 226 - chr15:68866094-68866254 NA NA NA NA NA chr15-239 68865661 68865918 221 - chr15:68865728-68865877 NA NA NA NA NA chr15-238 68826000 68826208 153 - chr15:68826054-68826151 NA NA NA NA NA chr15-237 68565072 68565300 173 - chr15:68565115-68565221 NA NA NA NA NA chr15-236 68559084 68559297 179 - chr15:68559119-68559281 NA NA NA NA NA chr15-235 68468076 68468348 154 - chr15:68468194-68468230 NA NA NA NA NA chr15-234 68376449 68376643 155 - chr15:68376450-68376585 NA NA NA NA NA chr15-233 68165448 68165733 238 - chr15:68165552-68165704 NA NA NA NA NA chr15-232 68077734 68078002 194 - chr15:68077779-68077936 NA NA NA NA NA chr15-231 67853783 67854229 266 - chr15:67853948-67854019 NA NA NA NA NA chr15-230 67800344 67800537 130 - chr15:67800391-67800442 NA NA NA NA NA chr15-229 67768674 67768830 152 - chr15:67768679-67768829 NA NA NA NA NA chr15-228 67713209 67713533 154 - chr15:67713259-67713303 NA NA NA NA NA chr15-227 67683800 67684053 152 - chr15:67683905-67683954 NA NA NA NA NA chr15-226 67642070 67642254 140 - chr15:67642122-67642226 NA NA NA NA NA chr15-225 67603544 67603817 136 - chr15:67603657-67603668 NA NA NA NA NA chr15-224 67538053 67538289 143 - chr15:67538124-67538185 NA NA NA NA NA chr15-223 67533113 67533262 143 - chr15:67533113-67533253 NA NA NA NA NA chr15-222 67510578 67510889 162 - chr15:67510727-67510740 NA NA NA NA NA chr15-221 67490170 67490596 235 - chr15:67490400-67490504 NA NA NA NA NA chr15-220 67480251 67480575 266 - chr15:67480377-67480551 NA NA NA NA NA chr15-219 67430092 67430428 193 - chr15:67430278-67430371 NA NA NA NA NA chr15-218 67395992 67396290 208 - chr15:67396066-67396229 NA NA NA NA NA chr15-217 67363789 67363972 145 - chr15:67363837-67363954 NA NA NA NA NA chr15-216 67348640 67348940 200 - chr15:67348788-67348936 NA NA NA NA NA chr15-215 67291639 67291821 143 - chr15:67291639-67291704 NA NA NA NA NA chr15-214 67251159 67251409 122 - chr15:67251301-67251309 NA NA NA NA NA chr15-213 67204847 67205256 219 - chr15:67204923-67205009 NA NA NA NA NA chr15-212 67044547 67044747 151 - chr15:67044582-67044691 NA NA NA NA NA chr15-211 66962960 66963245 180 - chr15:66963090-66963190 NA NA NA NA NA chr15-210 66914283 66914528 157 - chr15:66914387-66914448 NA NA NA NA NA chr15-209 66741129 66741337 154 - chr15:66741181-66741284 NA NA NA NA NA chr15-208 66739627 66740013 329 - chr15:66739795-66740010 NA NA NA NA NA chr15-207 66360127 66360711 357 - chr15:66360278-66360446 NA NA NA NA NA chr15-206 65880350 65880559 159 - chr15:65880396-65880501 NA NA NA NA NA chr15-205 65804687 65804935 195 - chr15:65804721-65804844 NA NA NA NA NA chr15-204 65760597 65760942 196 - chr15:65760732-65760765 NA NA NA NA NA chr15-203 65753890 65754201 174 - chr15:65754016-65754055 NA NA NA NA NA chr15-202 65709230 65709462 145 - chr15:65709309-65709371 NA NA NA NA NA chr15-201 65475960 65476285 189 - chr15:65476078-65476113 NA NA NA NA NA chr15-200 65456199 65456373 138 - chr15:65456236-65456356 NA NA NA NA NA chr15-199 65441087 65441307 161 - chr15:65441126-65441238 NA NA NA NA NA chr15-198 65409343 65409737 206 - chr15:65409443-65409488 NA NA NA NA NA chr15-197 65373344 65373564 167 - chr15:65373397-65373511 NA NA NA NA NA chr15-196 65244674 65244991 281 - chr15:65244690-65244899 NA NA NA NA NA chr15-195 65062678 65063051 215 - chr15:65062728-65062839 NA NA NA NA NA chr15-194 65027542 65027840 152 - chr15:65027688-65027694 NA NA NA NA NA chr15-193 64628108 64628273 136 - chr15:64628138-64628216 NA NA NA NA NA chr15-192 64544976 64545185 176 - chr15:64544983-64545139 NA NA NA NA NA chr15-191 64463990 64464268 156 - chr15:64464120-64464150 NA NA NA NA NA chr15-190 64447151 64447407 146 - chr15:64447267-64447300 NA NA NA NA NA chr15-189 64420567 64420901 235 - chr15:64420738-64420838 NA NA NA NA NA chr15-188 64398688 64398880 150 - chr15:64398732-64398842 NA NA NA NA NA chr15-187 64071245 64071459 185 - chr15:64071256-64071394 NA NA NA NA NA chr15-186 63985245 63985701 253 - chr15:63985406-63985477 NA NA NA NA NA chr15-185 63974800 63975064 161 - chr15:63974895-63974945 NA NA NA NA NA chr15-184 63910446 63910858 195 - chr15:63910563-63910591 NA NA NA NA NA chr15-183 63898469 63898771 157 - chr15:63898618-63898634 NA NA NA NA NA chr15-182 63838839 63839040 151 - chr15:63838885-63838988 NA NA NA NA NA chr15-181 63603083 63603290 158 - chr15:63603126-63603229 NA NA NA NA NA chr15-180 63595558 63595766 144 - chr15:63595608-63595695 NA NA NA NA NA chr15-179 63362787 63363055 166 - chr15:63362896-63362967 NA NA NA NA NA chr15-178 63272373 63272793 205 - chr15:63272644-63272690 NA NA NA NA NA chr15-177 63244734 63244896 120 - chr15:63244792-63244886 NA NA NA NA NA chr15-176 63215320 63215618 165 - chr15:63215375-63215465 NA NA NA NA NA chr15-175 63074648 63074825 126 - chr15:63074661-63074755 NA NA NA NA NA chr15-174 63017768 63018090 268 - chr15:63017914-63018074 NA NA NA NA NA chr15-173 62964094 62964402 167 - chr15:62964247-62964267 NA NA NA NA NA chr15-172 62843335 62843543 183 - chr15:62843362-62843495 NA NA NA NA NA chr15-171 62820972 62821451 360 - chr15:62820983-62821116 NA NA NA NA NA chr15-170 62792226 62792536 234 - chr15:62792235-62792431 NA NA NA NA NA chr15-169 62765151 62765331 158 - chr15:62765170-62765317 NA NA NA NA NA chr15-168 62700951 62701174 179 - chr15:62701010-62701167 NA NA NA NA NA chr15-167 62402438 62402622 139 - chr15:62402555-62402613 NA NA NA NA NA chr15-166 62381579 62381955 253 - chr15:62381630-62381799 NA NA NA NA NA chr15-165 62119225 62119449 146 - chr15:62119279-62119359 NA NA NA NA NA chr15-164 61968922 61969260 186 - chr15:61968996-61969069 NA NA NA NA NA chr15-163 61935725 61936099 200 - chr15:61935948-61936023 NA NA NA NA NA chr15-162 61755017 61755204 178 - chr15:61755018-61755191 NA NA NA NA NA chr15-161 61732439 61732830 236 - chr15:61732665-61732761 NA NA NA NA NA chr15-160 61689983 61690178 143 - chr15:61690029-61690114 NA NA NA NA NA chr15-159 61660998 61661302 162 - chr15:61661110-61661145 NA NA NA NA NA chr15-158 61603842 61604274 243 - chr15:61604113-61604116 NA NA NA NA NA chr15-157 61455706 61455968 173 - chr15:61455827-61455895 NA NA NA NA NA chr15-156 61332564 61332959 253 - chr15:61332606-61332753 NA NA NA NA NA chr15-155 61326444 61326719 201 - chr15:61326476-61326640 NA NA NA NA NA chr15-154 61185645 61185899 188 - chr15:61185731-61185886 NA NA NA NA NA chr15-153 61130597 61130823 159 - chr15:61130659-61130746 NA NA NA NA NA chr15-152 61046837 61047084 171 - chr15:61046881-61046992 NA NA NA NA NA chr15-151 60924549 60924916 216 - chr15:60924614-60924722 NA NA NA NA NA chr15-150 60856570 60856818 164 - chr15:60856650-60856732 NA NA NA NA NA chr15-149 60829524 60829789 161 - chr15:60829646-60829694 NA NA NA NA NA chr15-148 60822291 60822576 197 - chr15:60822323-60822476 NA NA NA NA NA chr15-147 60804659 60804992 158 - chr15:60804899-60804947 NA NA NA NA NA chr15-146 60800878 60801335 253 - chr15:60801002-60801153 NA NA NA NA NA chr15-145 60769822 60770051 160 - chr15:60769905-60770010 NA NA NA NA NA chr15-144 60713160 60713391 165 - chr15:60713218-60713321 NA NA NA NA NA chr15-143 60506838 60507048 157 - chr15:60506995-60507046 NA NA NA NA NA chr15-142 60406494 60406668 151 - chr15:60406509-60406641 NA NA NA NA NA chr15-141 60359659 60359893 154 - chr15:60359736-60359807 NA NA NA NA NA chr15-140 60296820 60297300 228 - chr15:60296915-60297017 NA NA NA NA NA chr15-139 60202354 60202812 256 - chr15:60202661-60202762 NA NA NA NA NA chr15-138 60047432 60047761 209 - chr15:60047525-60047674 NA NA NA NA NA chr15-137 60041133 60041456 253 - chr15:60041143-60041256 NA NA NA NA NA chr15-136 59905128 59905731 372 - chr15:59905322-59905609 NA NA NA NA NA chr15-135 59820419 59820752 211 - chr15:59820553-59820703 NA NA NA NA NA chr15-134 59815324 59815558 204 - chr15:59815384-59815543 NA NA NA NA NA chr15-133 59776527 59777229 334 - chr15:59777083-59777084 NA NA NA NA NA chr15-132 59655475 59655655 140 - chr15:59655547-59655607 NA NA NA NA NA chr15-131 59578900 59579148 157 - chr15:59578988-59579042 NA NA NA NA NA chr15-130 59546304 59546723 335 - chr15:59546304-59546471 NA NA NA NA NA chr15-129 59433305 59433560 155 - chr15:59433413-59433476 NA NA NA NA NA chr15-128 59333517 59333755 171 - chr15:59333578-59333685 NA NA NA NA NA chr15-127 59187453 59187733 151 - chr15:59187585-59187600 NA NA NA NA NA chr15-126 59085289 59085558 157 - chr15:59085395-59085434 NA NA NA NA NA chr15-125 59047784 59048109 207 - chr15:59047850-59047998 NA NA NA NA NA chr15-124 58908551 58908875 199 - chr15:58908649-58908696 NA NA NA NA NA chr15-123 58488530 58488901 299 - chr15:58488745-58488900 NA NA NA NA NA chr15-122 58486355 58486711 172 - chr15:58486433-58486474 NA NA NA NA NA chr15-121 58441925 58442396 262 - chr15:58442116-58442178 NA NA NA NA NA chr15-120 58412185 58412368 151 - chr15:58412217-58412336 NA NA NA NA NA chr15-119 58404853 58405350 259 - chr15:58404873-58405013 NA NA NA NA NA chr15-118 58090833 58091041 137 - chr15:58090888-58090962 NA NA NA NA NA chr15-117 58035736 58036055 219 - chr15:58035815-58035913 NA NA NA NA NA chr15-116 57964648 57964831 159 - chr15:57964662-57964773 NA NA NA NA NA chr15-115 57957516 57957753 133 - chr15:57957608-57957625 NA NA NA NA NA chr15-114 57883018 57883315 211 - chr15:57883063-57883147 NA NA NA NA NA chr15-113 57822916 57823277 225 - chr15:57823062-57823219 NA NA NA NA NA chr15-112 57764429 57764896 261 - chr15:57764728-57764886 NA NA NA NA NA chr15-111 57676666 57676840 145 - chr15:57676701-57676814 NA NA NA NA NA chr15-110 57495851 57496100 167 - chr15:57495943-57496023 NA NA NA NA NA chr15-109 57455284 57455566 150 - chr15:57455412-57455432 NA NA NA NA NA chr15-108 57284596 57284945 198 - chr15:57284724-57284748 NA NA NA NA NA chr15-107 57274617 57274890 152 - chr15:57274732-57274766 NA NA NA NA NA chr15-106 57206161 57206461 247 - chr15:57206168-57206309 NA NA NA NA NA chr15-105 57074732 57075066 275 - chr15:57074785-57074942 NA NA NA NA NA chr15-104 57005969 57006255 134 - chr15:57006070-57006128 NA NA NA NA NA chr15-103 56986211 56986393 112 - chr15:56986257-56986311 NA NA NA NA NA chr15-102 56882268 56882628 212 - chr15:56882476-56882600 NA NA NA NA NA chr15-101 56866003 56866278 156 - chr15:56866118-56866151 NA NA NA NA NA chr15-100 56833777 56834391 353 - chr15:56833904-56834063 NA NA NA NA NA chr15-99 56486846 56487188 175 - chr15:56486913-56486971 NA NA NA NA NA chr15-98 56449501 56449665 147 - chr15:56449520-56449649 NA NA NA NA NA chr15-97 56429304 56429604 231 - chr15:56429387-56429480 NA NA NA NA NA chr15-96 56374636 56374859 145 - chr15:56374720-56374784 NA NA NA NA NA chr15-95 56130851 56131049 159 - chr15:56130892-56131011 NA NA NA NA NA chr15-94 55482365 55482695 250 - chr15:55482393-55482511 NA NA NA NA NA chr15-93 55381592 55382097 298 - chr15:55381724-55381740 NA NA NA NA NA chr15-92 55238932 55239147 162 - chr15:55238995-55239099 NA NA NA NA NA chr15-91 55085346 55085740 316 - chr15:55085529-55085689 NA NA NA NA NA chr15-90 55035368 55035622 227 - chr15:55035401-55035574 NA NA NA NA NA chr15-89 54736512 54736766 177 - chr15:54736615-54736702 NA NA NA NA NA chr15-88 54574214 54574438 169 - chr15:54574235-54574315 NA NA NA NA NA chr15-87 53079782 53080043 151 - chr15:53079886-53079930 NA NA NA NA NA chr15-86 52555484 52555639 151 - chr15:52555484-52555633 NA NA NA NA NA chr15-85 51991301 51991561 136 - chr15:51991431-51991449 NA NA NA NA NA chr15-84 51785964 51786122 127 - chr15:51785967-51786077 NA NA NA NA NA chr15-83 51723700 51723889 157 - chr15:51723784-51723877 NA NA NA NA NA chr15-82 51719468 51719704 153 - chr15:51719632-51719671 NA NA NA NA NA chr15-81 51619157 51619407 164 - chr15:51619254-51619343 NA NA NA NA NA chr15-80 51432918 51433096 168 - chr15:51432946-51433094 NA NA NA NA NA chr15-79 50922335 50922660 171 - chr15:50922453-50922488 NA NA NA NA NA chr15-78 50582356 50582638 237 - chr15:50582417-50582564 NA NA NA NA NA chr15-77 50055507 50055710 150 - chr15:50055564-50055659 NA NA NA NA NA chr15-76 49687684 49687891 140 - chr15:49687765-49687831 NA NA NA NA NA chr15-75 49201664 49201961 169 - chr15:49201785-49201819 NA NA NA NA NA chr15-74 49131390 49131625 205 - chr15:49131419-49131564 NA NA NA NA NA chr15-73 49016659 49017004 243 - chr15:49016770-49016962 NA NA NA NA NA chr15-72 48775894 48776074 122 - chr15:48775929-48775970 NA NA NA NA NA chr15-71 47943023 47943255 160 - chr15:47943098-47943129 NA NA NA NA NA chr15-70 47913722 47913926 160 - chr15:47913742-47913870 NA NA NA NA NA chr15-69 47502807 47503108 244 - chr15:47502809-47502941 NA NA NA NA NA chr15-68 46129153 46129544 191 - chr15:46129404-46129446 NA NA NA NA NA chr15-67 46035878 46036244 216 - chr15:46035922-46036063 NA NA NA NA NA chr15-66 45680126 45680441 165 - chr15:45680229-45680319 NA NA NA NA NA chr15-65 45405280 45405706 332 - chr15:45405417-45405698 NA NA NA NA NA chr15-64 44263541 44263734 156 - chr15:44263580-44263701 NA NA NA NA NA chr15-63 44028615 44028931 204 - chr15:44028723-44028811 NA NA NA NA NA chr15-62 43422330 43422790 253 - chr15:43422389-43422509 NA NA NA NA NA chr15-61 43381612 43381789 150 - chr15:43381640-43381764 NA NA NA NA NA chr15-60 43181770 43182102 163 - chr15:43181959-43181973 NA NA NA NA NA chr15-59 43144330 43145042 280 - chr15:43144782-43144890 NA NA NA NA NA chr15-58 43029925 43030073 136 - chr15:43029940-43030070 NA NA NA NA NA chr15-57 42752227 42752449 147 - chr15:42752312-42752379 NA NA NA NA NA chr15-56 42552546 42552709 158 - chr15:42552557-42552707 NA NA NA NA NA chr15-55 42522463 42522652 114 - chr15:42522506-42522561 NA NA NA NA NA chr15-54 42030589 42030851 155 - chr15:42030698-42030745 NA NA NA NA NA chr15-53 42017805 42017976 163 - chr15:42017819-42017966 NA NA NA NA NA chr15-52 41924364 41924571 123 - chr15:41924421-41924433 NA NA NA NA NA chr15-51 41378019 41378341 225 - chr15:41378065-41378142 NA NA NA NA NA chr15-50 41193485 41193683 166 - chr15:41193513-41193649 NA NA NA NA NA chr15-49 41122640 41122881 185 - chr15:41122692-41122817 NA NA NA NA NA chr15-48 40510016 40510215 164 - chr15:40510044-40510166 NA NA NA NA NA chr15-47 39678347 39678552 156 - chr15:39678392-39678495 NA NA NA NA NA chr15-46 39615595 39615914 264 - chr15:39615602-39615756 NA NA NA NA NA chr15-45 39323037 39323322 205 - chr15:39323130-39323175 NA NA NA NA NA chr15-44 39107352 39107630 136 - chr15:39107543-39107608 NA NA NA NA NA chr15-43 39077007 39077311 155 - chr15:39077146-39077157 NA NA NA NA NA chr15-42 38854079 38854391 171 - chr15:38854222-38854254 NA NA NA NA NA chr15-41 38242137 38242311 148 - chr15:38242169-38242288 NA NA NA NA NA chr15-40 38224155 38224396 124 - chr15:38224287-38224309 NA NA NA NA NA chr15-39 38216256 38216470 129 - chr15:38216322-38216347 NA NA NA NA NA chr15-38 38210296 38210601 241 - chr15:38210452-38210583 NA NA NA NA NA chr15-37 38075444 38075743 155 - chr15:38075572-38075591 NA NA NA NA NA chr15-36 37784515 37784765 156 - chr15:37784529-37784638 NA NA NA NA NA chr15-35 37437593 37437960 251 - chr15:37437823-37437919 NA NA NA NA NA chr15-34 37393124 37393384 162 - chr15:37393224-37393290 NA NA NA NA NA chr15-33 37014152 37014451 146 - chr15:37014318-37014324 NA NA NA NA NA chr15-32 36971158 36971331 127 - chr15:36971279-36971314 NA NA NA NA NA chr15-31 36485057 36485695 284 - chr15:36485541-36485594 NA NA NA NA NA chr15-30 36412249 36412503 181 - chr15:36412348-36412443 NA NA NA NA NA chr15-29 36404342 36404659 181 - chr15:36404498-36404533 NA NA NA NA NA chr15-28 33749302 33749965 306 - chr15:33749549-33749553 NA NA NA NA NA chr15-27 33310083 33310288 169 - chr15:33310105-33310245 NA NA NA NA NA chr15-26 33278076 33278356 132 - chr15:33278194-33278199 NA NA NA NA NA chr15-25 33266391 33266839 311 - chr15:33266444-33266713 NA NA NA NA NA chr15-24 27778400 27778708 164 - chr15:27778554-27778569 NA NA NA NA NA chr15-23 27470806 27470945 113 - chr15:27470819-27470893 NA NA NA NA NA chr15-22 27382660 27382937 167 - chr15:27382732-27382808 NA NA NA NA NA chr15-21 27259888 27260266 297 - chr15:27259957-27260161 NA NA NA NA NA chr15-20 27259176 27259370 171 - chr15:27259204-27259357 NA NA NA NA NA chr15-19 26946256 26946675 201 - chr15:26946539-26946587 NA NA NA NA NA chr15-18 26759708 26759998 158 - chr15:26759839-26759864 NA NA NA NA NA chr15-17 26315105 26315299 151 - chr15:26315133-26315226 NA NA NA NA NA chr15-16 26285723 26285915 152 - chr15:26285753-26285870 NA NA NA NA NA chr15-15 26120903 26121228 192 - chr15:26120956-26121055 NA NA NA NA NA chr15-14 26102023 26102187 150 - chr15:26102035-26102178 NA NA NA NA NA chr15-13 25917575 25917735 154 - chr15:25917588-25917730 NA NA NA NA NA chr15-12 25697648 25697908 226 - chr15:25697654-25697812 NA NA NA NA NA chr15-11 25685287 25685520 165 - chr15:25685361-25685464 NA NA NA NA NA chr15-10 25557600 25557836 215 - chr15:25557619-25557792 NA NA NA NA NA chr15-9 25372748 25373091 254 - chr15:25372935-25373049 NA NA NA NA NA chr15-8 24975871 24976125 156 - chr15:24975969-24976027 NA NA NA NA NA chr15-7 24970939 24971296 177 - chr15:24971155-24971188 NA NA NA NA NA chr15-6 24913863 24914093 145 - chr15:24913964-24914016 NA NA NA NA NA chr15-5 24756302 24756461 155 - chr15:24756308-24756461 NA NA NA NA NA chr15-4 23818501 23818742 156 - chr15:23818590-23818665 NA NA NA NA NA chr15-3 23788108 23788372 133 - chr15:23788227-23788235 NA NA NA NA NA chr15-2 23595474 23595667 167 - chr15:23595502-23595645 NA NA NA NA NA chr15 23462881 23463206 187 - chr15:23462982-23462994 NA NA NA NA NA chr15-433 101648496 101648826 228 - chr15:101648627-101648782 NA NA NA NA NA chr15-432 101275461 101275947 250 - chr15:101275771-101275859 NA NA NA NA NA chr15-431 101206834 101207094 229 - chr15:101206910-101207077 NA NA NA NA NA chr15-430 100773331 100773544 153 - chr15:100773394-100773490 NA NA NA NA NA chr15-429 100409537 100409755 155 - chr15:100409560-100409672 NA NA NA NA NA chr15-428 100096636 100096859 149 - chr15:100096714-100096716 NA NA NA NA NA chr14-761 97998059 97998212 116 - chr14:97998091-97998133 NA NA NA NA NA chr14-760 97156855 97157065 150 - chr14:97156918-97157011 NA NA NA NA NA chr14-759 97095378 97095553 129 - chr14:97095431-97095521 NA NA NA NA NA chr14-758 96968849 96969086 175 - chr14:96968916-96969060 NA NA NA NA NA chr14-757 96570902 96571231 168 - chr14:96571061-96571066 NA NA NA NA NA chr14-756 95825809 95826027 153 - chr14:95825879-95825972 NA NA NA NA NA chr14-755 92716525 92716728 124 - chr14:92716668-92716681 NA NA NA NA NA chr14-754 92349799 92350122 163 - chr14:92349921-92349943 NA NA NA NA NA chr14-753 91443889 91444195 208 - chr14:91443889-91444048 NA NA NA NA NA chr14-752 90861505 90861770 175 - chr14:90861621-90861693 NA NA NA NA NA chr14-751 90482074 90482349 165 - chr14:90482174-90482219 NA NA NA NA NA chr14-750 89905997 89906171 146 - chr14:89906026-89906145 NA NA NA NA NA chr14-749 89145540 89145839 171 - chr14:89145659-89145693 NA NA NA NA NA chr14-748 89092629 89093083 210 - chr14:89092804-89092815 NA NA NA NA NA chr14-747 88886127 88886328 140 - chr14:88886179-88886249 NA NA NA NA NA chr14-746 88805038 88805220 146 - chr14:88805068-88805181 NA NA NA NA NA chr14-745 88779137 88779433 214 - chr14:88779148-88779198 NA NA NA NA NA chr14-744 88749088 88749264 148 - chr14:88749116-88749236 NA NA NA NA NA chr14-743 88735574 88735857 196 - chr14:88735575-88735727 NA NA NA NA NA chr14-742 88619244 88619521 168 - chr14:88619353-88619412 NA NA NA NA NA chr14-741 88605191 88605488 200 - chr14:88605327-88605469 NA NA NA NA NA chr14-740 88596982 88597175 151 - chr14:88597026-88597137 NA NA NA NA NA chr14-739 88419874 88420250 203 - chr14:88420095-88420101 NA NA NA NA NA chr14-738 88384118 88384356 151 - chr14:88384201-88384261 NA NA NA NA NA chr14-737 88251788 88252042 180 - chr14:88251845-88251934 NA NA NA NA NA chr14-736 88240844 88241124 156 - chr14:88240892-88240986 NA NA NA NA NA chr14-735 88086156 88086375 191 - chr14:88086225-88086360 NA NA NA NA NA chr14-734 88049010 88049269 146 - chr14:88049117-88049144 NA NA NA NA NA chr14-733 87990150 87990300 128 - chr14:87990179-87990263 NA NA NA NA NA chr14-732 87839547 87839792 154 - chr14:87839645-87839715 NA NA NA NA NA chr14-731 87790939 87791219 178 - chr14:87790968-87791085 NA NA NA NA NA chr14-730 87781924 87782145 181 - chr14:87782030-87782138 NA NA NA NA NA chr14-729 87671911 87672177 224 - chr14:87671922-87672073 NA NA NA NA NA chr14-728 87629860 87630197 169 - chr14:87630031-87630038 NA NA NA NA NA chr14-727 87528568 87528779 160 - chr14:87528614-87528718 NA NA NA NA NA chr14-726 87473208 87473450 154 - chr14:87473340-87473450 NA NA NA NA NA chr14-725 87374915 87375341 195 - chr14:87375193-87375204 NA NA NA NA NA chr14-724 87113129 87113352 156 - chr14:87113197-87113287 NA NA NA NA NA chr14-723 86939941 86940216 183 - chr14:86940043-86940105 NA NA NA NA NA chr14-722 86872124 86872307 137 - chr14:86872246-86872299 NA NA NA NA NA chr14-721 86700976 86701480 240 - chr14:86701050-86701118 NA NA NA NA NA chr14-720 86503753 86504043 153 - chr14:86503896-86503909 NA NA NA NA NA chr14-719 85947106 85947489 188 - chr14:85947172-85947332 NA NA NA NA NA chr14-718 85901052 85901480 338 - chr14:85901060-85901349 NA NA NA NA NA chr14-717 85726029 85726244 140 - chr14:85726102-85726168 NA NA NA NA NA chr14-716 85441701 85442007 239 - chr14:85441748-85441853 NA NA NA NA NA chr14-715 85065360 85065839 231 - chr14:85065613-85065711 NA NA NA NA NA chr14-714 84996599 84996872 223 - chr14:84996661-84996784 NA NA NA NA NA chr14-713 84967808 84968112 252 - chr14:84967950-84968098 NA NA NA NA NA chr14-712 84926502 84926705 131 - chr14:84926563-84926658 NA NA NA NA NA chr14-711 84858945 84859143 180 - chr14:84858971-84859129 NA NA NA NA NA chr14-710 84774087 84774598 295 - chr14:84774161-84774348 NA NA NA NA NA chr14-709 84734588 84734755 153 - chr14:84734598-84734744 NA NA NA NA NA chr14-708 84691713 84692011 231 - chr14:84691757-84691877 NA NA NA NA NA chr14-707 84681652 84681866 137 - chr14:84681713-84681757 NA NA NA NA NA chr14-706 84662713 84663073 222 - chr14:84662908-84663061 NA NA NA NA NA chr14-705 84560841 84561118 212 - chr14:84560851-84560943 NA NA NA NA NA chr14-704 84441251 84441459 176 - chr14:84441298-84441458 NA NA NA NA NA chr14-703 83913680 83914047 210 - chr14:83913806-83913828 NA NA NA NA NA chr14-702 83907690 83907853 153 - chr14:83907692-83907840 NA NA NA NA NA chr14-701 83871249 83871402 135 - chr14:83871282-83871381 NA NA NA NA NA chr14-700 83773914 83774278 207 - chr14:83773983-83774077 NA NA NA NA NA chr14-699 83748017 83748347 219 - chr14:83748073-83748126 NA NA NA NA NA chr14-698 83701302 83701533 149 - chr14:83701385-83701453 NA NA NA NA NA chr14-697 83673098 83673261 151 - chr14:83673099-83673244 NA NA NA NA NA chr14-696 83432068 83432272 162 - chr14:83432166-83432258 NA NA NA NA NA chr14-695 83364905 83365110 145 - chr14:83364954-83365028 NA NA NA NA NA chr14-694 82983860 82984199 183 - chr14:82983994-82984032 NA NA NA NA NA chr14-693 82777326 82777484 147 - chr14:82777345-82777477 NA NA NA NA NA chr14-692 82725627 82725908 150 - chr14:82725761-82725783 NA NA NA NA NA chr14-691 82558269 82558709 203 - chr14:82558296-82558367 NA NA NA NA NA chr14-690 82500154 82500524 227 - chr14:82500249-82500357 NA NA NA NA NA chr14-689 82369746 82370007 230 - chr14:82369839-82370007 NA NA NA NA NA chr14-688 82288357 82288525 149 - chr14:82288377-82288508 NA NA NA NA NA chr14-687 82158207 82158480 180 - chr14:82158345-82158477 NA NA NA NA NA chr14-686 82153255 82153682 264 - chr14:82153358-82153399 NA NA NA NA NA chr14-685 82019269 82019478 151 - chr14:82019327-82019420 NA NA NA NA NA chr14-684 81842963 81843366 225 - chr14:81842994-81843068 NA NA NA NA NA chr14-683 81598871 81599193 239 - chr14:81598910-81599022 NA NA NA NA NA chr14-682 81397989 81398348 182 - chr14:81398179-81398195 NA NA NA NA NA chr14-681 81316085 81316369 212 - chr14:81316171-81316347 NA NA NA NA NA chr14-680 81301861 81302097 148 - chr14:81301951-81302010 NA NA NA NA NA chr14-679 81174015 81174244 161 - chr14:81174099-81174184 NA NA NA NA NA chr14-678 81073499 81073920 257 - chr14:81073588-81073763 NA NA NA NA NA chr14-677 80960294 80960475 169 - chr14:80960312-80960475 NA NA NA NA NA chr14-676 80940762 80941010 140 - chr14:80940853-80940868 NA NA NA NA NA chr14-675 80869747 80869994 148 - chr14:80869863-80869929 NA NA NA NA NA chr14-674 80862372 80862598 113 - chr14:80862447-80862466 NA NA NA NA NA chr14-673 80805736 80805912 146 - chr14:80805752-80805875 NA NA NA NA NA chr14-672 80797616 80797801 157 - chr14:80797656-80797799 NA NA NA NA NA chr14-671 80412531 80412836 169 - chr14:80412691-80412712 NA NA NA NA NA chr14-670 80301252 80301411 149 - chr14:80301254-80301397 NA NA NA NA NA chr14-669 79985527 79985768 154 - chr14:79985609-79985671 NA NA NA NA NA chr14-668 79916786 79917020 176 - chr14:79916821-79916968 NA NA NA NA NA chr14-667 79904415 79904802 187 - chr14:79904666-79904753 NA NA NA NA NA chr14-666 79893211 79893396 153 - chr14:79893246-79893370 NA NA NA NA NA chr14-665 79818923 79819100 133 - chr14:79818983-79819064 NA NA NA NA NA chr14-664 79590718 79590882 159 - chr14:79590720-79590869 NA NA NA NA NA chr14-663 78957701 78957908 155 - chr14:78957766-78957882 NA NA NA NA NA chr14-662 78296837 78297306 353 - chr14:78297101-78297264 NA NA NA NA NA chr14-661 78148232 78148528 175 - chr14:78148369-78148415 NA NA NA NA NA chr14-660 78002625 78002847 154 - chr14:78002679-78002772 NA NA NA NA NA chr14-659 77419998 77420313 157 - chr14:77420163-77420169 NA NA NA NA NA chr14-658 77417774 77417920 114 - chr14:77417853-77417903 NA NA NA NA NA chr14-657 77366674 77366843 117 - chr14:77366730-77366799 NA NA NA NA NA chr14-656 77356218 77356382 152 - chr14:77356232-77356371 NA NA NA NA NA chr14-655 77105644 77105995 241 - chr14:77105733-77105867 NA NA NA NA NA chr14-654 76972529 76972691 149 - chr14:76972530-76972653 NA NA NA NA NA chr14-653 76930922 76931374 265 - chr14:76931016-76931173 NA NA NA NA NA chr14-652 76890442 76891015 264 - chr14:76890814-76890849 NA NA NA NA NA chr14-651 76865640 76866045 216 - chr14:76865856-76865910 NA NA NA NA NA chr14-650 76829967 76830150 163 - chr14:76829986-76830139 NA NA NA NA NA chr14-649 76818688 76818862 135 - chr14:76818727-76818825 NA NA NA NA NA chr14-648 76682040 76682254 121 - chr14:76682081-76682135 NA NA NA NA NA chr14-647 76642648 76642988 215 - chr14:76642752-76642821 NA NA NA NA NA chr14-646 76400905 76401431 273 - chr14:76401142-76401146 NA NA NA NA NA chr14-645 76285596 76285830 167 - chr14:76285656-76285749 NA NA NA NA NA chr14-644 75950197 75950498 165 - chr14:75950253-75950322 NA NA NA NA NA chr14-643 75879078 75879264 154 - chr14:75879120-75879237 NA NA NA NA NA chr14-642 75861672 75861931 195 - chr14:75861793-75861860 NA NA NA NA NA chr14-641 75671132 75671585 303 - chr14:75671272-75671500 NA NA NA NA NA chr14-640 75665334 75665482 112 - chr14:75665387-75665480 NA NA NA NA NA chr14-639 75509974 75510143 129 - chr14:75510076-75510134 NA NA NA NA NA chr14-638 75370871 75371041 137 - chr14:75370958-75371035 NA NA NA NA NA chr14-637 75345707 75346030 179 - chr14:75345856-75345896 NA NA NA NA NA chr14-636 75214383 75214608 128 - chr14:75214526-75214534 NA NA NA NA NA chr14-635 75059212 75059441 153 - chr14:75059291-75059371 NA NA NA NA NA chr14-634 74880995 74881385 232 - chr14:74881041-74881194 NA NA NA NA NA chr14-633 74846041 74846349 167 - chr14:74846172-74846204 NA NA NA NA NA chr14-632 74703155 74703495 225 - chr14:74703206-74703348 NA NA NA NA NA chr14-631 74642912 74643123 147 - chr14:74642974-74643055 NA NA NA NA NA chr14-630 74453645 74453861 136 - chr14:74453758-74453797 NA NA NA NA NA chr14-629 74223915 74224397 284 - chr14:74224200-74224385 NA NA NA NA NA chr14-628 74146319 74146598 163 - chr14:74146358-74146463 NA NA NA NA NA chr14-627 74103037 74103203 126 - chr14:74103037-74103083 NA NA NA NA NA chr14-626 74072994 74073571 263 - chr14:74073417-74073475 NA NA NA NA NA chr14-625 74053180 74053546 239 - chr14:74053370-74053443 NA NA NA NA NA chr14-624 74047204 74047454 171 - chr14:74047270-74047349 NA NA NA NA NA chr14-623 74044285 74044535 143 - chr14:74044392-74044428 NA NA NA NA NA chr14-622 74019494 74019649 145 - chr14:74019499-74019629 NA NA NA NA NA chr14-621 74007618 74007820 154 - chr14:74007661-74007774 NA NA NA NA NA chr14-620 74003616 74004103 370 - chr14:74003934-74004099 NA NA NA NA NA chr14-619 73995581 73995859 171 - chr14:73995708-73995762 NA NA NA NA NA chr14-618 73994429 73994869 271 - chr14:73994574-73994688 NA NA NA NA NA chr14-617 73954316 73954585 149 - chr14:73954440-73954467 NA NA NA NA NA chr14-616 73923557 73923874 176 - chr14:73923652-73923796 NA NA NA NA NA chr14-615 73910170 73910727 328 - chr14:73910277-73910581 NA NA NA NA NA chr14-614 73812109 73812384 155 - chr14:73812227-73812260 NA NA NA NA NA chr14-613 73774925 73775119 151 - chr14:73775004-73775069 NA NA NA NA NA chr14-612 73734868 73735239 168 - chr14:73735153-73735200 NA NA NA NA NA chr14-611 73701604 73701909 164 - chr14:73701755-73701788 NA NA NA NA NA chr14-610 73612180 73612392 161 - chr14:73612233-73612345 NA NA NA NA NA chr14-609 73381387 73381621 184 - chr14:73381390-73381474 NA NA NA NA NA chr14-608 73341781 73341989 194 - chr14:73341791-73341957 NA NA NA NA NA chr14-607 73300940 73301122 123 - chr14:73300959-73301043 NA NA NA NA NA chr14-606 73234546 73234935 257 - chr14:73234625-73234697 NA NA NA NA NA chr14-605 72988500 72988789 170 - chr14:72988605-72988663 NA NA NA NA NA chr14-604 72972177 72972872 343 - chr14:72972549-72972560 NA NA NA NA NA chr14-603 72945052 72945221 148 - chr14:72945076-72945206 NA NA NA NA NA chr14-602 72887513 72887935 277 - chr14:72887595-72887664 NA NA NA NA NA chr14-601 72843471 72843851 238 - chr14:72843529-72843667 NA NA NA NA NA chr14-600 72840348 72840658 172 - chr14:72840538-72840624 NA NA NA NA NA chr14-599 72801733 72801954 197 - chr14:72801768-72801917 NA NA NA NA NA chr14-598 72795318 72795787 327 - chr14:72795334-72795515 NA NA NA NA NA chr14-597 72636307 72636555 147 - chr14:72636400-72636450 NA NA NA NA NA chr14-596 72571101 72571324 153 - chr14:72571172-72571256 NA NA NA NA NA chr14-595 72533365 72533591 193 - chr14:72533426-72533572 NA NA NA NA NA chr14-594 72490979 72491145 128 - chr14:72491017-72491107 NA NA NA NA NA chr14-593 72424876 72425081 167 - chr14:72424916-72425064 NA NA NA NA NA chr14-592 72177798 72178012 177 - chr14:72177829-72177932 NA NA NA NA NA chr14-591 72164932 72165139 165 - chr14:72164983-72165115 NA NA NA NA NA chr14-590 72127959 72128150 168 - chr14:72127992-72128132 NA NA NA NA NA chr14-589 72084924 72085111 162 - chr14:72084949-72085086 NA NA NA NA NA chr14-588 72073749 72073967 145 - chr14:72073828-72073897 NA NA NA NA NA chr14-587 71919249 71919429 157 - chr14:71919318-71919429 NA NA NA NA NA chr14-586 71888800 71889221 229 - chr14:71888805-71888938 NA NA NA NA NA chr14-585 71883218 71883396 123 - chr14:71883219-71883314 NA NA NA NA NA chr14-584 71818759 71818941 123 - chr14:71818827-71818900 NA NA NA NA NA chr14-583 71796709 71796919 162 - chr14:71796765-71796875 NA NA NA NA NA chr14-582 71762450 71762626 152 - chr14:71762456-71762596 NA NA NA NA NA chr14-581 71757254 71757440 152 - chr14:71757284-71757404 NA NA NA NA NA chr14-580 71672513 71672893 218 - chr14:71672735-71672819 NA NA NA NA NA chr14-579 71607983 71608402 357 - chr14:71608071-71608353 NA NA NA NA NA chr14-578 71576688 71576859 142 - chr14:71576717-71576830 NA NA NA NA NA chr14-577 71499689 71499870 156 - chr14:71499716-71499846 NA NA NA NA NA chr14-576 71485680 71486197 261 - chr14:71485880-71486013 NA NA NA NA NA chr14-575 71426692 71427070 298 - chr14:71426747-71427019 NA NA NA NA NA chr14-574 71313559 71314181 264 - chr14:71314027-71314043 NA NA NA NA NA chr14-573 71152887 71153318 200 - chr14:71153026-71153041 NA NA NA NA NA chr14-572 71045130 71045536 195 - chr14:71045275-71045292 NA NA NA NA NA chr14-571 71015859 71016256 255 - chr14:71016032-71016176 NA NA NA NA NA chr14-570 71010917 71011119 154 - chr14:71010967-71011075 NA NA NA NA NA chr14-569 70983782 70984079 196 - chr14:70983794-70983927 NA NA NA NA NA chr14-568 70892446 70892884 302 - chr14:70892610-70892855 NA NA NA NA NA chr14-567 70873072 70873436 194 - chr14:70873130-70873210 NA NA NA NA NA chr14-566 70828729 70829071 246 - chr14:70828845-70828899 NA NA NA NA NA chr14-565 70811536 70811738 148 - chr14:70811578-70811678 NA NA NA NA NA chr14-564 70795965 70796204 183 - chr14:70796021-70796176 NA NA NA NA NA chr14-563 70748630 70748784 152 - chr14:70748631-70748782 NA NA NA NA NA chr14-562 70660785 70661228 267 - chr14:70660947-70660968 NA NA NA NA NA chr14-561 70618223 70618390 158 - chr14:70618226-70618369 NA NA NA NA NA chr14-560 70592601 70592813 165 - chr14:70592639-70592748 NA NA NA NA NA chr14-559 70462200 70462466 231 - chr14:70462214-70462375 NA NA NA NA NA chr14-558 70401041 70401415 202 - chr14:70401266-70401274 NA NA NA NA NA chr14-557 70351361 70351772 257 - chr14:70351465-70351612 NA NA NA NA NA chr14-556 70322536 70322878 179 - chr14:70322693-70322703 NA NA NA NA NA chr14-555 70286445 70286604 117 - chr14:70286545-70286591 NA NA NA NA NA chr14-554 70151200 70151408 169 - chr14:70151235-70151367 NA NA NA NA NA chr14-553 70144895 70145288 235 - chr14:70144947-70145077 NA NA NA NA NA chr14-552 70055291 70055727 281 - chr14:70055453-70055586 NA NA NA NA NA chr14-551 70022782 70023104 230 - chr14:70022833-70022930 NA NA NA NA NA chr14-550 69891123 69891356 151 - chr14:69891173-69891258 NA NA NA NA NA chr14-549 69876822 69877169 251 - chr14:69876870-69876977 NA NA NA NA NA chr14-548 69749932 69750143 150 - chr14:69749995-69750086 NA NA NA NA NA chr14-547 69672296 69672719 276 - chr14:69672559-69672630 NA NA NA NA NA chr14-546 69567356 69567702 200 - chr14:69567455-69567531 NA NA NA NA NA chr14-545 69534914 69535082 114 - chr14:69534994-69535080 NA NA NA NA NA chr14-544 69441361 69441586 165 - chr14:69441371-69441511 NA NA NA NA NA chr14-543 69196914 69197252 229 - chr14:69197053-69197203 NA NA NA NA NA chr14-542 69170374 69170609 133 - chr14:69170388-69170463 NA NA NA NA NA chr14-541 69163115 69163387 165 - chr14:69163222-69163280 NA NA NA NA NA chr14-540 69125259 69125423 152 - chr14:69125275-69125413 NA NA NA NA NA chr14-539 69082087 69082305 193 - chr14:69082149-69082292 NA NA NA NA NA chr14-538 69057166 69057434 165 - chr14:69057221-69057307 NA NA NA NA NA chr14-537 68960833 68961044 154 - chr14:68960890-68960987 NA NA NA NA NA chr14-536 68807784 68808063 148 - chr14:68807916-68807933 NA NA NA NA NA chr14-535 68724342 68724508 156 - chr14:68724348-68724490 NA NA NA NA NA chr14-534 68530480 68530652 144 - chr14:68530510-68530625 NA NA NA NA NA chr14-533 68492436 68492608 159 - chr14:68492453-68492597 NA NA NA NA NA chr14-532 68439969 68440175 158 - chr14:68440033-68440135 NA NA NA NA NA chr14-531 68406930 68407132 132 - chr14:68407040-68407082 NA NA NA NA NA chr14-530 68385509 68385759 165 - chr14:68385590-68385672 NA NA NA NA NA chr14-529 68360864 68361161 144 - chr14:68361014-68361021 NA NA NA NA NA chr14-528 68336206 68336513 151 - chr14:68336362-68336374 NA NA NA NA NA chr14-527 68321675 68321872 154 - chr14:68321728-68321834 NA NA NA NA NA chr14-526 68224194 68224530 173 - chr14:68224381-68224415 NA NA NA NA NA chr14-525 68204558 68204795 145 - chr14:68204659-68204721 NA NA NA NA NA chr14-524 68063790 68063938 122 - chr14:68063804-68063913 NA NA NA NA NA chr14-523 68022555 68022932 194 - chr14:68022634-68022697 NA NA NA NA NA chr14-522 67992958 67993118 125 - chr14:67993039-67993094 NA NA NA NA NA chr14-521 67944545 67944954 256 - chr14:67944616-67944676 NA NA NA NA NA chr14-520 67900002 67900265 154 - chr14:67900111-67900148 NA NA NA NA NA chr14-519 67866240 67866462 142 - chr14:67866300-67866342 NA NA NA NA NA chr14-518 67835077 67835241 145 - chr14:67835093-67835216 NA NA NA NA NA chr14-517 67830024 67830245 148 - chr14:67830101-67830180 NA NA NA NA NA chr14-516 67828641 67828852 184 - chr14:67828667-67828797 NA NA NA NA NA chr14-515 67801547 67801741 172 - chr14:67801567-67801715 NA NA NA NA NA chr14-514 67791474 67791662 174 - chr14:67791498-67791644 NA NA NA NA NA chr14-513 67738434 67738818 314 - chr14:67738513-67738781 NA NA NA NA NA chr14-512 67732660 67732936 149 - chr14:67732785-67732808 NA NA NA NA NA chr14-511 67677951 67678138 118 - chr14:67678010-67678049 NA NA NA NA NA chr14-510 67665972 67666356 291 - chr14:67666044-67666149 NA NA NA NA NA chr14-509 67644440 67644831 255 - chr14:67644682-67644748 NA NA NA NA NA chr14-508 67457188 67457832 442 - chr14:67457260-67457714 NA NA NA NA NA chr14-507 67376368 67376603 160 - chr14:67376444-67376530 NA NA NA NA NA chr14-506 67299110 67299272 142 - chr14:67299135-67299262 NA NA NA NA NA chr14-505 67297642 67298242 352 - chr14:67297785-67298087 NA NA NA NA NA chr14-504 67292505 67292811 150 - chr14:67292543-67292596 NA NA NA NA NA chr14-503 67291218 67291651 318 - chr14:67291417-67291595 NA NA NA NA NA chr14-502 67249835 67250197 153 - chr14:67249926-67249929 NA NA NA NA NA chr14-501 67211023 67211321 202 - chr14:67211147-67211239 NA NA NA NA NA chr14-500 67181587 67182223 325 - chr14:67181929-67181974 NA NA NA NA NA chr14-499 67132067 67132294 169 - chr14:67132118-67132222 NA NA NA NA NA chr14-498 67003459 67004002 271 - chr14:67003855-67003971 NA NA NA NA NA chr14-497 66998115 66998473 212 - chr14:66998305-66998415 NA NA NA NA NA chr14-496 66914550 66914840 154 - chr14:66914684-66914700 NA NA NA NA NA chr14-495 66909800 66910072 161 - chr14:66909918-66909975 NA NA NA NA NA chr14-494 66809170 66809357 174 - chr14:66809203-66809351 NA NA NA NA NA chr14-493 66787501 66787801 157 - chr14:66787652-66787662 NA NA NA NA NA chr14-492 66778520 66778873 267 - chr14:66778547-66778669 NA NA NA NA NA chr14-491 66750410 66750564 146 - chr14:66750422-66750564 NA NA NA NA NA chr14-490 66679867 66680127 139 - chr14:66679984-66680004 NA NA NA NA NA chr14-489 66665193 66665363 127 - chr14:66665218-66665284 NA NA NA NA NA chr14-488 66493631 66494079 219 - chr14:66493945-66493987 NA NA NA NA NA chr14-487 66398439 66398800 293 - chr14:66398559-66398716 NA NA NA NA NA chr14-486 66199701 66199855 126 - chr14:66199715-66199785 NA NA NA NA NA chr14-485 66197564 66197816 192 - chr14:66197660-66197774 NA NA NA NA NA chr14-484 66182876 66183051 165 - chr14:66182889-66183034 NA NA NA NA NA chr14-483 65989515 65989820 158 - chr14:65989649-65989666 NA NA NA NA NA chr14-482 65732229 65732747 252 - chr14:65732519-65732536 NA NA NA NA NA chr14-481 65637344 65637716 298 - chr14:65637368-65637573 NA NA NA NA NA chr14-480 65613789 65614331 301 - chr14:65614150-65614163 NA NA NA NA NA chr14-479 65601300 65601535 152 - chr14:65601371-65601446 NA NA NA NA NA chr14-478 65590940 65591366 268 - chr14:65591208-65591263 NA NA NA NA NA chr14-477 65493123 65493274 143 - chr14:65493133-65493272 NA NA NA NA NA chr14-476 65479036 65479236 187 - chr14:65479068-65479229 NA NA NA NA NA chr14-475 65382476 65382701 172 - chr14:65382527-65382644 NA NA NA NA NA chr14-474 65371771 65372282 244 - chr14:65372107-65372111 NA NA NA NA NA chr14-473 65237310 65237653 199 - chr14:65237374-65237469 NA NA NA NA NA chr14-472 65121190 65121905 415 - chr14:65121489-65121772 NA NA NA NA NA chr14-471 65082513 65082764 157 - chr14:65082577-65082655 NA NA NA NA NA chr14-470 65052464 65053301 404 - chr14:65052638-65052653 NA NA NA NA NA chr14-469 64919096 64919224 123 - chr14:64919101-64919214 NA NA NA NA NA chr14-468 64893123 64893297 150 - chr14:64893125-64893263 NA NA NA NA NA chr14-467 64690583 64691070 281 - chr14:64690724-64690734 NA NA NA NA NA chr14-466 64593343 64593551 173 - chr14:64593354-64593504 NA NA NA NA NA chr14-465 64525191 64525366 168 - chr14:64525197-64525351 NA NA NA NA NA chr14-464 64524426 64524726 259 - chr14:64524440-64524695 NA NA NA NA NA chr14-463 64276073 64276352 154 - chr14:64276200-64276228 NA NA NA NA NA chr14-462 64249155 64249445 151 - chr14:64249295-64249298 NA NA NA NA NA chr14-461 64190482 64190824 196 - chr14:64190676-64190774 NA NA NA NA NA chr14-460 64173704 64174301 323 - chr14:64173906-64174206 NA NA NA NA NA chr14-459 63895873 63896038 134 - chr14:63895940-63896012 NA NA NA NA NA chr14-458 63888853 63889136 199 - chr14:63888911-63889000 NA NA NA NA NA chr14-457 63773584 63773871 153 - chr14:63773716-63773736 NA NA NA NA NA chr14-456 63763800 63764021 158 - chr14:63763833-63763943 NA NA NA NA NA chr14-455 63705767 63705933 136 - chr14:63705799-63705875 NA NA NA NA NA chr14-454 63449773 63450277 253 - chr14:63449944-63449986 NA NA NA NA NA chr14-453 63364825 63365321 229 - chr14:63364959-63364980 NA NA NA NA NA chr14-452 63290962 63291259 151 - chr14:63291119-63291135 NA NA NA NA NA chr14-451 63285885 63286175 209 - chr14:63285906-63285974 NA NA NA NA NA chr14-450 63276079 63276477 221 - chr14:63276341-63276451 NA NA NA NA NA chr14-449 63186524 63186829 157 - chr14:63186676-63186695 NA NA NA NA NA chr14-448 63088862 63089043 155 - chr14:63088885-63089011 NA NA NA NA NA chr14-447 63042730 63042995 152 - chr14:63042848-63042885 NA NA NA NA NA chr14-446 62986725 62986928 151 - chr14:62986776-62986874 NA NA NA NA NA chr14-445 62928227 62928525 248 - chr14:62928375-62928524 NA NA NA NA NA chr14-444 62910999 62911165 154 - chr14:62911001-62911131 NA NA NA NA NA chr14-443 62625198 62625360 120 - chr14:62625225-62625324 NA NA NA NA NA chr14-442 62599489 62599834 167 - chr14:62599705-62599732 NA NA NA NA NA chr14-441 62568414 62568618 121 - chr14:62568467-62568520 NA NA NA NA NA chr14-440 62461567 62461847 158 - chr14:62461688-62461723 NA NA NA NA NA chr14-439 62416040 62416302 182 - chr14:62416154-62416276 NA NA NA NA NA chr14-438 62265793 62266091 207 - chr14:62265860-62265988 NA NA NA NA NA chr14-437 62155414 62155761 175 - chr14:62155564-62155578 NA NA NA NA NA chr14-436 62127108 62127401 187 - chr14:62127151-62127266 NA NA NA NA NA chr14-435 62093380 62093667 159 - chr14:62093504-62093537 NA NA NA NA NA chr14-434 62075708 62076305 264 - chr14:62075823-62075863 NA NA NA NA NA chr14-433 62043822 62043994 145 - chr14:62043843-62043964 NA NA NA NA NA chr14-432 62026624 62026837 190 - chr14:62026636-62026792 NA NA NA NA NA chr14-431 62021749 62022056 168 - chr14:62021919-62021980 NA NA NA NA NA chr14-430 61911715 61912419 367 - chr14:61912081-61912377 NA NA NA NA NA chr14-429 61874007 61874241 127 - chr14:61874136-61874178 NA NA NA NA NA chr14-428 61674105 61674463 182 - chr14:61674149-61674221 NA NA NA NA NA chr14-427 61617760 61618007 150 - chr14:61617838-61617897 NA NA NA NA NA chr14-426 61582926 61583182 144 - chr14:61583043-61583080 NA NA NA NA NA chr14-425 61530053 61530385 168 - chr14:61530243-61530273 NA NA NA NA NA chr14-424 61480188 61480376 113 - chr14:61480219-61480279 NA NA NA NA NA chr14-423 61448948 61449273 177 - chr14:61449094-61449121 NA NA NA NA NA chr14-422 61371236 61371549 150 - chr14:61371337-61371355 NA NA NA NA NA chr14-421 61296941 61297191 188 - chr14:61297012-61297169 NA NA NA NA NA chr14-420 61281949 61282275 243 - chr14:61282124-61282238 NA NA NA NA NA chr14-419 61054788 61054976 159 - chr14:61054829-61054971 NA NA NA NA NA chr14-418 61020049 61020344 161 - chr14:61020191-61020214 NA NA NA NA NA chr14-417 60973228 60973614 260 - chr14:60973292-60973364 NA NA NA NA NA chr14-416 60946190 60946440 200 - chr14:60946218-60946346 NA NA NA NA NA chr14-415 60931675 60932553 410 - chr14:60931919-60931981 NA NA NA NA NA chr14-414 60820083 60820594 224 - chr14:60820106-60820175 NA NA NA NA NA chr14-413 60782239 60782447 153 - chr14:60782298-60782394 NA NA NA NA NA chr14-412 60775453 60775787 166 - chr14:60775637-60775651 NA NA NA NA NA chr14-411 60639518 60639686 152 - chr14:60639520-60639663 NA NA NA NA NA chr14-410 60638317 60638725 243 - chr14:60638533-60638662 NA NA NA NA NA chr14-409 60617486 60617810 164 - chr14:60617711-60617759 NA NA NA NA NA chr14-408 60389860 60390094 150 - chr14:60389947-60390016 NA NA NA NA NA chr14-407 60343784 60344120 220 - chr14:60343801-60343963 NA NA NA NA NA chr14-406 60275905 60276288 181 - chr14:60276015-60276040 NA NA NA NA NA chr14-405 60161391 60161565 136 - chr14:60161413-60161495 NA NA NA NA NA chr14-404 60053583 60053750 131 - chr14:60053637-60053723 NA NA NA NA NA chr14-403 59999865 60000074 152 - chr14:59999906-60000009 NA NA NA NA NA chr14-402 59985104 59985469 203 - chr14:59985232-59985257 NA NA NA NA NA chr14-401 59941458 59941704 148 - chr14:59941560-59941608 NA NA NA NA NA chr14-400 59788970 59789564 516 - chr14:59789061-59789497 NA NA NA NA NA chr14-399 59738419 59738580 133 - chr14:59738455-59738574 NA NA NA NA NA chr14-398 59501273 59501414 124 - chr14:59501273-59501363 NA NA NA NA NA chr14-397 59471594 59472119 357 - chr14:59471749-59472052 NA NA NA NA NA chr14-396 59442536 59442727 170 - chr14:59442565-59442710 NA NA NA NA NA chr14-395 59423438 59424206 479 - chr14:59423514-59424001 NA NA NA NA NA chr14-394 59373733 59374025 165 - chr14:59373856-59373890 NA NA NA NA NA chr14-393 59290395 59290597 152 - chr14:59290459-59290554 NA NA NA NA NA chr14-392 59263940 59264233 173 - chr14:59264086-59264135 NA NA NA NA NA chr14-391 59248413 59248745 191 - chr14:59248602-59248700 NA NA NA NA NA chr14-390 59210418 59210899 252 - chr14:59210576-59210730 NA NA NA NA NA chr14-389 59194942 59195309 185 - chr14:59195058-59195094 NA NA NA NA NA chr14-388 59161352 59161695 223 - chr14:59161504-59161667 NA NA NA NA NA chr14-387 59120878 59121130 159 - chr14:59120974-59121043 NA NA NA NA NA chr14-386 59054224 59054494 176 - chr14:59054346-59054414 NA NA NA NA NA chr14-385 58854653 58854954 202 - chr14:58854801-58854953 NA NA NA NA NA chr14-384 58821639 58821797 148 - chr14:58821640-58821783 NA NA NA NA NA chr14-383 58777034 58777511 212 - chr14:58777359-58777366 NA NA NA NA NA chr14-382 58715038 58715209 148 - chr14:58715039-58715175 NA NA NA NA NA chr14-381 58672714 58672898 153 - chr14:58672746-58672869 NA NA NA NA NA chr14-380 58659412 58659692 141 - chr14:58659545-58659550 NA NA NA NA NA chr14-379 58629293 58629456 151 - chr14:58629299-58629441 NA NA NA NA NA chr14-378 58543728 58544007 161 - chr14:58543852-58543892 NA NA NA NA NA chr14-377 58522954 58523287 204 - chr14:58523142-58523189 NA NA NA NA NA chr14-376 58518937 58519215 200 - chr14:58519054-58519186 NA NA NA NA NA chr14-375 58438879 58439400 276 - chr14:58439138-58439162 NA NA NA NA NA chr14-374 58142173 58142453 183 - chr14:58142256-58142349 NA NA NA NA NA chr14-373 58039744 58039959 143 - chr14:58039816-58039887 NA NA NA NA NA chr14-372 57976640 57976950 209 - chr14:57976694-57976859 NA NA NA NA NA chr14-371 57881561 57881787 138 - chr14:57881571-57881660 NA NA NA NA NA chr14-370 57845490 57845707 134 - chr14:57845564-57845606 NA NA NA NA NA chr14-369 57712884 57713220 213 - chr14:57712938-57713155 NA NA NA NA NA chr14-368 57655840 57656104 175 - chr14:57655893-57655997 NA NA NA NA NA chr14-367 57577534 57577710 155 - chr14:57577560-57577699 NA NA NA NA NA chr14-366 57236682 57236947 175 - chr14:57236762-57236852 NA NA NA NA NA chr14-365 56934876 56935049 138 - chr14:56934950-56935018 NA NA NA NA NA chr14-364 56884788 56885019 159 - chr14:56884861-56884949 NA NA NA NA NA chr14-363 56722831 56723043 161 - chr14:56722881-56722990 NA NA NA NA NA chr14-362 56707409 56707715 257 - chr14:56707506-56707665 NA NA NA NA NA chr14-361 56656157 56656456 152 - chr14:56656303-56656307 NA NA NA NA NA chr14-360 56497729 56497906 145 - chr14:56497738-56497867 NA NA NA NA NA chr14-359 56423131 56423414 219 - chr14:56423159-56423332 NA NA NA NA NA chr14-358 56354601 56354818 157 - chr14:56354691-56354773 NA NA NA NA NA chr14-357 56288460 56288636 167 - chr14:56288477-56288626 NA NA NA NA NA chr14-356 56180065 56180397 203 - chr14:56180247-56180264 NA NA NA NA NA chr14-355 56135436 56135724 154 - chr14:56135575-56135600 NA NA NA NA NA chr14-354 56011775 56012033 183 - chr14:56011788-56011927 NA NA NA NA NA chr14-353 56001175 56001362 147 - chr14:56001209-56001319 NA NA NA NA NA chr14-352 55768347 55768594 117 - chr14:55768421-55768436 NA NA NA NA NA chr14-351 55710290 55710569 157 - chr14:55710415-55710453 NA NA NA NA NA chr14-350 55607459 55607765 135 - chr14:55607498-55607528 NA NA NA NA NA chr14-349 55554031 55554262 178 - chr14:55554082-55554205 NA NA NA NA NA chr14-348 55432070 55432390 182 - chr14:55432190-55432243 NA NA NA NA NA chr14-347 55423644 55423898 151 - chr14:55423759-55423806 NA NA NA NA NA chr14-346 55340370 55340617 168 - chr14:55340433-55340530 NA NA NA NA NA chr14-345 55295144 55295381 180 - chr14:55295212-55295346 NA NA NA NA NA chr14-344 55222834 55223080 184 - chr14:55222856-55223009 NA NA NA NA NA chr14-343 55203258 55203646 221 - chr14:55203351-55203376 NA NA NA NA NA chr14-342 55165733 55165938 171 - chr14:55165733-55165887 NA NA NA NA NA chr14-341 55148531 55148778 181 - chr14:55148572-55148711 NA NA NA NA NA chr14-340 55102550 55102901 242 - chr14:55102616-55102706 NA NA NA NA NA chr14-339 55019773 55019925 148 - chr14:55019775-55019917 NA NA NA NA NA chr14-338 54946065 54946367 257 - chr14:54946178-54946345 NA NA NA NA NA chr14-337 54919946 54920409 239 - chr14:54920195-54920235 NA NA NA NA NA chr14-336 54791344 54791597 154 - chr14:54791441-54791497 NA NA NA NA NA chr14-335 54673996 54674222 139 - chr14:54674070-54674109 NA NA NA NA NA chr14-334 54654794 54655082 200 - chr14:54654794-54654950 NA NA NA NA NA chr14-333 54600720 54601134 287 - chr14:54600778-54600869 NA NA NA NA NA chr14-332 54599847 54600377 334 - chr14:54600018-54600099 NA NA NA NA NA chr14-331 54570396 54570651 148 - chr14:54570531-54570558 NA NA NA NA NA chr14-330 54536796 54537011 181 - chr14:54536840-54536953 NA NA NA NA NA chr14-329 54511795 54511952 155 - chr14:54511801-54511952 NA NA NA NA NA chr14-328 54478463 54478709 147 - chr14:54478596-54478629 NA NA NA NA NA chr14-327 54433007 54433254 147 - chr14:54433107-54433154 NA NA NA NA NA chr14-326 54426351 54426538 144 - chr14:54426448-54426506 NA NA NA NA NA chr14-325 54416616 54416811 153 - chr14:54416656-54416768 NA NA NA NA NA chr14-324 54278711 54278892 153 - chr14:54278739-54278864 NA NA NA NA NA chr14-323 54216272 54216658 267 - chr14:54216332-54216421 NA NA NA NA NA chr14-322 54177554 54177941 309 - chr14:54177650-54177876 NA NA NA NA NA chr14-321 54106328 54106688 227 - chr14:54106405-54106443 NA NA NA NA NA chr14-320 53923538 53923824 159 - chr14:53923685-53923707 NA NA NA NA NA chr14-319 53844773 53845003 186 - chr14:53844834-53844993 NA NA NA NA NA chr14-318 53777561 53777813 149 - chr14:53777673-53777728 NA NA NA NA NA chr14-317 53724761 53725201 264 - chr14:53724865-53724917 NA NA NA NA NA chr14-316 53644406 53644623 130 - chr14:53644461-53644520 NA NA NA NA NA chr14-315 53588546 53588812 164 - chr14:53588628-53588700 NA NA NA NA NA chr14-314 53522453 53522701 163 - chr14:53522538-53522616 NA NA NA NA NA chr14-313 53291887 53292174 161 - chr14:53292001-53292024 NA NA NA NA NA chr14-312 53249703 53250080 238 - chr14:53249792-53249841 NA NA NA NA NA chr14-311 53192744 53192939 175 - chr14:53192752-53192913 NA NA NA NA NA chr14-310 53136088 53136441 273 - chr14:53136328-53136441 NA NA NA NA NA chr14-309 53090784 53091059 139 - chr14:53090963-53091034 NA NA NA NA NA chr14-308 53078937 53079532 372 - chr14:53079205-53079245 NA NA NA NA NA chr14-307 53072900 53073079 142 - chr14:53072949-53073066 NA NA NA NA NA chr14-306 53010264 53010463 154 - chr14:53010305-53010416 NA NA NA NA NA chr14-305 52960795 52961137 208 - chr14:52960975-52961026 NA NA NA NA NA chr14-304 52953224 52953511 135 - chr14:52953364-52953400 NA NA NA NA NA chr14-303 52927316 52927573 230 - chr14:52927333-52927526 NA NA NA NA NA chr14-302 52883218 52883392 166 - chr14:52883220-52883372 NA NA NA NA NA chr14-301 52758530 52758808 192 - chr14:52758553-52758702 NA NA NA NA NA chr14-300 52668838 52669036 167 - chr14:52668869-52669005 NA NA NA NA NA chr14-299 52602310 52602702 195 - chr14:52602378-52602549 NA NA NA NA NA chr14-298 52562909 52563416 287 - chr14:52563072-52563082 NA NA NA NA NA chr14-297 52557205 52557574 189 - chr14:52557328-52557336 NA NA NA NA NA chr14-296 52451653 52451881 149 - chr14:52451731-52451800 NA NA NA NA NA chr14-295 52390485 52390791 181 - chr14:52390631-52390708 NA NA NA NA NA chr14-294 52270125 52270555 236 - chr14:52270395-52270399 NA NA NA NA NA chr14-293 52184754 52184944 143 - chr14:52184788-52184871 NA NA NA NA NA chr14-292 52088812 52089111 249 - chr14:52088812-52088961 NA NA NA NA NA chr14-291 52082582 52082913 211 - chr14:52082681-52082775 NA NA NA NA NA chr14-290 52054408 52054761 215 - chr14:52054682-52054691 NA NA NA NA NA chr14-289 52023637 52023934 186 - chr14:52023680-52023789 NA NA NA NA NA chr14-288 52013728 52013968 190 - chr14:52013738-52013898 NA NA NA NA NA chr14-287 51914849 51915193 209 - chr14:51915029-51915148 NA NA NA NA NA chr14-286 51910604 51910874 132 - chr14:51910756-51910764 NA NA NA NA NA chr14-285 51864811 51865157 222 - chr14:51864905-51864978 NA NA NA NA NA chr14-284 51789332 51789521 125 - chr14:51789474-51789496 NA NA NA NA NA chr14-283 51571804 51572027 203 - chr14:51571840-51572015 NA NA NA NA NA chr14-282 51548618 51548868 146 - chr14:51548717-51548754 NA NA NA NA NA chr14-281 51547100 51547364 150 - chr14:51547143-51547236 NA NA NA NA NA chr14-280 51375788 51376001 183 - chr14:51375848-51375986 NA NA NA NA NA chr14-279 51350823 51351033 160 - chr14:51350874-51350985 NA NA NA NA NA chr14-278 51301257 51301441 135 - chr14:51301301-51301382 NA NA NA NA NA chr14-277 51293058 51293240 149 - chr14:51293097-51293219 NA NA NA NA NA chr14-276 51244026 51244432 289 - chr14:51244249-51244405 NA NA NA NA NA chr14-275 51230384 51230621 174 - chr14:51230473-51230571 NA NA NA NA NA chr14-274 51218443 51218601 155 - chr14:51218446-51218598 NA NA NA NA NA chr14-273 51092152 51092403 170 - chr14:51092251-51092331 NA NA NA NA NA chr14-272 51040140 51040413 160 - chr14:51040251-51040299 NA NA NA NA NA chr14-271 50994959 50995222 229 - chr14:50995051-50995217 NA NA NA NA NA chr14-270 50980008 50980286 192 - chr14:50980125-50980274 NA NA NA NA NA chr14-269 50908325 50908706 229 - chr14:50908387-50908540 NA NA NA NA NA chr14-268 50842351 50842645 154 - chr14:50842495-50842513 NA NA NA NA NA chr14-267 50817041 50817304 151 - chr14:50817155-50817193 NA NA NA NA NA chr14-266 50788137 50788319 136 - chr14:50788164-50788235 NA NA NA NA NA chr14-265 50730713 50730924 163 - chr14:50730756-50730866 NA NA NA NA NA chr14-264 50646023 50646387 324 - chr14:50646064-50646368 NA NA NA NA NA chr14-263 50626087 50626571 402 - chr14:50626152-50626503 NA NA NA NA NA chr14-262 50575792 50575947 145 - chr14:50575793-50575918 NA NA NA NA NA chr14-261 50560495 50560930 210 - chr14:50560676-50560683 NA NA NA NA NA chr14-260 50494687 50494849 138 - chr14:50494692-50494782 NA NA NA NA NA chr14-259 50445050 50445349 166 - chr14:50445173-50445211 NA NA NA NA NA chr14-258 50301423 50301826 215 - chr14:50301434-50301555 NA NA NA NA NA chr14-257 50294753 50295157 209 - chr14:50295032-50295109 NA NA NA NA NA chr14-256 50292741 50293011 244 - chr14:50292782-50292974 NA NA NA NA NA chr14-255 50216989 50217219 143 - chr14:50217076-50217132 NA NA NA NA NA chr14-254 50207229 50207491 155 - chr14:50207334-50207380 NA NA NA NA NA chr14-253 50201122 50201289 132 - chr14:50201167-50201274 NA NA NA NA NA chr14-252 50137112 50137550 280 - chr14:50137406-50137460 NA NA NA NA NA chr14-251 50125866 50126096 185 - chr14:50125900-50126029 NA NA NA NA NA chr14-250 49940040 49940357 256 - chr14:49940201-49940335 NA NA NA NA NA chr14-249 49838031 49838211 159 - chr14:49838060-49838194 NA NA NA NA NA chr14-248 49823420 49823680 150 - chr14:49823533-49823576 NA NA NA NA NA chr14-247 49705548 49705756 129 - chr14:49705705-49705722 NA NA NA NA NA chr14-246 49616139 49616355 194 - chr14:49616140-49616290 NA NA NA NA NA chr14-245 49604842 49605074 163 - chr14:49604914-49605011 NA NA NA NA NA chr14-244 49561617 49561865 186 - chr14:49561670-49561825 NA NA NA NA NA chr14-243 49551206 49551458 146 - chr14:49551350-49551371 NA NA NA NA NA chr14-242 49525979 49526178 153 - chr14:49526027-49526136 NA NA NA NA NA chr14-241 49468193 49468380 146 - chr14:49468232-49468338 NA NA NA NA NA chr14-240 49451978 49452245 152 - chr14:49452091-49452129 NA NA NA NA NA chr14-239 49252590 49252884 159 - chr14:49252725-49252749 NA NA NA NA NA chr14-238 49153145 49153611 239 - chr14:49153428-49153496 NA NA NA NA NA chr14-237 48880477 48880878 210 - chr14:48880576-48880641 NA NA NA NA NA chr14-236 48815035 48815333 208 - chr14:48815221-48815291 NA NA NA NA NA chr14-235 48791581 48791907 209 - chr14:48791758-48791857 NA NA NA NA NA chr14-234 48789805 48790104 163 - chr14:48789957-48789976 NA NA NA NA NA chr14-233 48769137 48769527 228 - chr14:48769365-48769497 NA NA NA NA NA chr14-232 48680723 48680899 118 - chr14:48680735-48680818 NA NA NA NA NA chr14-231 48635399 48635606 147 - chr14:48635462-48635552 NA NA NA NA NA chr14-230 48600389 48600806 333 - chr14:48600389-48600554 NA NA NA NA NA chr14-229 48443469 48443794 276 - chr14:48443502-48443713 NA NA NA NA NA chr14-228 48375095 48375461 216 - chr14:48375256-48375397 NA NA NA NA NA chr14-227 48351923 48352093 133 - chr14:48351948-48352032 NA NA NA NA NA chr14-226 48222239 48222560 209 - chr14:48222361-48222514 NA NA NA NA NA chr14-225 48163562 48163714 114 - chr14:48163591-48163686 NA NA NA NA NA chr14-224 48159026 48159445 245 - chr14:48159155-48159181 NA NA NA NA NA chr14-223 48048564 48048795 150 - chr14:48048648-48048720 NA NA NA NA NA chr14-222 48034388 48034567 148 - chr14:48034417-48034535 NA NA NA NA NA chr14-221 47773408 47773782 209 - chr14:47773550-47773581 NA NA NA NA NA chr14-220 47728704 47728890 139 - chr14:47728738-47728799 NA NA NA NA NA chr14-219 47576491 47576703 148 - chr14:47576556-47576641 NA NA NA NA NA chr14-218 47541752 47542008 134 - chr14:47541882-47541902 NA NA NA NA NA chr14-217 47205672 47205942 156 - chr14:47205679-47205778 NA NA NA NA NA chr14-216 47008256 47008541 148 - chr14:47008386-47008391 NA NA NA NA NA chr14-215 46990435 46990618 151 - chr14:46990505-46990603 NA NA NA NA NA chr14-214 46950328 46950512 156 - chr14:46950346-46950479 NA NA NA NA NA chr14-213 46792980 46793391 237 - chr14:46793197-46793347 NA NA NA NA NA chr14-212 46762931 46763358 199 - chr14:46763222-46763256 NA NA NA NA NA chr14-211 46472083 46472489 252 - chr14:46472094-46472269 NA NA NA NA NA chr14-210 46363987 46364258 149 - chr14:46364109-46364136 NA NA NA NA NA chr14-209 46357601 46357860 156 - chr14:46357688-46357749 NA NA NA NA NA chr14-208 46340875 46341148 150 - chr14:46340998-46341025 NA NA NA NA NA chr14-207 46238398 46238703 219 - chr14:46238598-46238645 NA NA NA NA NA chr14-206 46204860 46205085 209 - chr14:46204892-46205069 NA NA NA NA NA chr14-205 46145291 46145644 221 - chr14:46145418-46145458 NA NA NA NA NA chr14-204 46085157 46085460 143 - chr14:46085295-46085358 NA NA NA NA NA chr14-203 46002851 46003138 236 - chr14:46002856-46002990 NA NA NA NA NA chr14-202 45959057 45959362 270 - chr14:45959082-45959322 NA NA NA NA NA chr14-201 45850095 45850698 357 - chr14:45850188-45850351 NA NA NA NA NA chr14-200 45736799 45737043 193 - chr14:45736837-45736966 NA NA NA NA NA chr14-199 45685545 45685761 176 - chr14:45685556-45685652 NA NA NA NA NA chr14-198 45645356 45645609 151 - chr14:45645445-45645481 NA NA NA NA NA chr14-197 45510004 45510290 217 - chr14:45510142-45510221 NA NA NA NA NA chr14-196 45446060 45446259 154 - chr14:45446107-45446215 NA NA NA NA NA chr14-195 45319995 45320278 170 - chr14:45320121-45320191 NA NA NA NA NA chr14-194 45274829 45275022 144 - chr14:45274880-45274977 NA NA NA NA NA chr14-193 45243567 45243792 154 - chr14:45243634-45243713 NA NA NA NA NA chr14-192 45173955 45174275 208 - chr14:45174042-45174144 NA NA NA NA NA chr14-191 45125191 45125444 158 - chr14:45125297-45125371 NA NA NA NA NA chr14-190 45059541 45059735 165 - chr14:45059558-45059700 NA NA NA NA NA chr14-189 45056231 45056501 152 - chr14:45056322-45056354 NA NA NA NA NA chr14-188 44994645 44994944 168 - chr14:44994754-44994802 NA NA NA NA NA chr14-187 44833324 44833557 159 - chr14:44833372-44833470 NA NA NA NA NA chr14-186 44808435 44808859 225 - chr14:44808578-44808580 NA NA NA NA NA chr14-185 44774032 44774262 157 - chr14:44774083-44774178 NA NA NA NA NA chr14-184 44619509 44619789 153 - chr14:44619631-44619662 NA NA NA NA NA chr14-183 44469980 44470215 155 - chr14:44470058-44470134 NA NA NA NA NA chr14-182 44435721 44436181 262 - chr14:44435757-44435873 NA NA NA NA NA chr14-181 44400615 44400880 152 - chr14:44400722-44400755 NA NA NA NA NA chr14-180 43955567 43955891 243 - chr14:43955726-43955849 NA NA NA NA NA chr14-179 43946883 43947115 130 - chr14:43947019-43947030 NA NA NA NA NA chr14-178 43855259 43855465 135 - chr14:43855314-43855386 NA NA NA NA NA chr14-177 43832755 43832968 136 - chr14:43832818-43832884 NA NA NA NA NA chr14-176 43767110 43767353 164 - chr14:43767195-43767277 NA NA NA NA NA chr14-175 43758391 43758779 195 - chr14:43758631-43758644 NA NA NA NA NA chr14-174 43725066 43725317 219 - chr14:43725129-43725284 NA NA NA NA NA chr14-173 43661548 43661803 130 - chr14:43661621-43661652 NA NA NA NA NA chr14-172 43617488 43617700 133 - chr14:43617541-43617608 NA NA NA NA NA chr14-171 43580485 43580816 190 - chr14:43580554-43580639 NA NA NA NA NA chr14-170 43507776 43508055 158 - chr14:43507897-43507934 NA NA NA NA NA chr14-169 43500955 43501266 164 - chr14:43501074-43501105 NA NA NA NA NA chr14-168 43413433 43413748 196 - chr14:43413600-43413725 NA NA NA NA NA chr14-167 43379639 43379953 195 - chr14:43379804-43379926 NA NA NA NA NA chr14-166 43364577 43364951 268 - chr14:43364627-43364733 NA NA NA NA NA chr14-165 43297004 43297271 170 - chr14:43297097-43297172 NA NA NA NA NA chr14-164 43294414 43294817 213 - chr14:43294593-43294605 NA NA NA NA NA chr14-163 43234677 43235075 251 - chr14:43234821-43234978 NA NA NA NA NA chr14-162 43181322 43181791 405 - chr14:43181423-43181700 NA NA NA NA NA chr14-161 43174432 43174703 200 - chr14:43174485-43174596 NA NA NA NA NA chr14-160 43149678 43150168 296 - chr14:43149924-43150078 NA NA NA NA NA chr14-159 43137248 43137757 249 - chr14:43137438-43137462 NA NA NA NA NA chr14-158 43123436 43123834 228 - chr14:43123617-43123686 NA NA NA NA NA chr14-157 42936074 42936328 157 - chr14:42936168-42936233 NA NA NA NA NA chr14-156 42933648 42933812 157 - chr14:42933649-42933792 NA NA NA NA NA chr14-155 42872582 42872748 151 - chr14:42872607-42872738 NA NA NA NA NA chr14-154 42813685 42813940 133 - chr14:42813795-42813812 NA NA NA NA NA chr14-153 42812377 42812589 154 - chr14:42812427-42812527 NA NA NA NA NA chr14-152 41623493 41623698 157 - chr14:41623540-41623648 NA NA NA NA NA chr14-151 41439889 41440323 210 - chr14:41440179-41440231 NA NA NA NA NA chr14-150 40959681 40959982 201 - chr14:40959814-40959965 NA NA NA NA NA chr14-149 40937296 40937641 201 - chr14:40937414-40937445 NA NA NA NA NA chr14-148 40906899 40907043 123 - chr14:40906960-40907041 NA NA NA NA NA chr14-147 40905191 40905372 161 - chr14:40905191-40905342 NA NA NA NA NA chr14-146 40768270 40768407 129 - chr14:40768292-40768406 NA NA NA NA NA chr14-145 40660850 40661054 132 - chr14:40660902-40660942 NA NA NA NA NA chr14-144 40237422 40237611 178 - chr14:40237435-40237604 NA NA NA NA NA chr14-143 40219647 40219910 133 - chr14:40219759-40219771 NA NA NA NA NA chr14-142 40211741 40212259 230 - chr14:40211890-40211896 NA NA NA NA NA chr14-141 39720951 39721249 246 - chr14:39721076-39721218 NA NA NA NA NA chr14-140 39462411 39462582 115 - chr14:39462431-39462508 NA NA NA NA NA chr14-139 39276888 39277171 237 - chr14:39276914-39277083 NA NA NA NA NA chr14-138 39202091 39202394 186 - chr14:39202244-39202295 NA NA NA NA NA chr14-137 39045538 39045870 242 - chr14:39045622-39045768 NA NA NA NA NA chr14-136 38781435 38781724 197 - chr14:38781518-38781669 NA NA NA NA NA chr14-135 38701693 38702084 205 - chr14:38701900-38701940 NA NA NA NA NA chr14-134 38464246 38464718 294 - chr14:38464564-38464610 NA NA NA NA NA chr14-133 38018472 38018760 133 - chr14:38018483-38018533 NA NA NA NA NA chr14-132 37943145 37943473 259 - chr14:37943205-37943386 NA NA NA NA NA chr14-131 37831473 37831898 260 - chr14:37831670-37831797 NA NA NA NA NA chr14-130 37731446 37731655 155 - chr14:37731504-37731603 NA NA NA NA NA chr14-129 37380675 37380824 113 - chr14:37380675-37380770 NA NA NA NA NA chr14-128 37138928 37139150 161 - chr14:37138991-37139093 NA NA NA NA NA chr14-127 36983102 36983474 206 - chr14:36983175-36983212 NA NA NA NA NA chr14-126 36570667 36570954 246 - chr14:36570691-36570855 NA NA NA NA NA chr14-125 36564433 36564638 148 - chr14:36564492-36564582 NA NA NA NA NA chr14-124 36529379 36529678 220 - chr14:36529489-36529551 NA NA NA NA NA chr14-123 36309208 36309565 217 - chr14:36309391-36309472 NA NA NA NA NA chr14-122 35915613 35915843 155 - chr14:35915687-35915766 NA NA NA NA NA chr14-121 35650279 35650434 153 - chr14:35650280-35650432 NA NA NA NA NA chr14-120 35493161 35493444 117 - chr14:35493213-35493221 NA NA NA NA NA chr14-119 35469639 35469952 161 - chr14:35469793-35469801 NA NA NA NA NA chr14-118 35080679 35080967 156 - chr14:35080805-35080832 NA NA NA NA NA chr14-117 34999241 34999529 151 - chr14:34999374-34999384 NA NA NA NA NA chr14-116 34988610 34988972 210 - chr14:34988729-34988754 NA NA NA NA NA chr14-115 34318390 34318588 135 - chr14:34318462-34318543 NA NA NA NA NA chr14-114 34258986 34259250 202 - chr14:34259031-34259154 NA NA NA NA NA chr14-113 34020626 34021086 268 - chr14:34020869-34021003 NA NA NA NA NA chr14-112 33690447 33690672 124 - chr14:33690562-33690599 NA NA NA NA NA chr14-111 33575128 33575300 156 - chr14:33575152-33575288 NA NA NA NA NA chr14-110 33414277 33414554 157 - chr14:33414416-33414472 NA NA NA NA NA chr14-109 33394995 33395159 150 - chr14:33395014-33395155 NA NA NA NA NA chr14-108 33393716 33394107 200 - chr14:33393827-33393876 NA NA NA NA NA chr14-107 33237019 33237286 187 - chr14:33237061-33237208 NA NA NA NA NA chr14-106 33219257 33219495 153 - chr14:33219338-33219402 NA NA NA NA NA chr14-105 33213240 33213525 177 - chr14:33213343-33213407 NA NA NA NA NA chr14-104 33138962 33139263 152 - chr14:33139113-33139118 NA NA NA NA NA chr14-103 33105389 33105691 195 - chr14:33105521-33105523 NA NA NA NA NA chr14-102 33085064 33085233 151 - chr14:33085070-33085209 NA NA NA NA NA chr14-101 32982628 32982794 129 - chr14:32982730-32982785 NA NA NA NA NA chr14-100 32976137 32976341 170 - chr14:32976172-32976325 NA NA NA NA NA chr14-99 32960095 32960386 207 - chr14:32960171-32960336 NA NA NA NA NA chr14-98 32942198 32942511 187 - chr14:32942384-32942428 NA NA NA NA NA chr14-97 32878997 32879241 166 - chr14:32879059-32879150 NA NA NA NA NA chr14-96 32650638 32650831 149 - chr14:32650671-32650798 NA NA NA NA NA chr14-95 32500735 32500917 151 - chr14:32500754-32500880 NA NA NA NA NA chr14-94 32401072 32401264 179 - chr14:32401085-32401238 NA NA NA NA NA chr14-93 32215280 32215456 124 - chr14:32215349-32215438 NA NA NA NA NA chr14-92 32192300 32192582 135 - chr14:32192465-32192471 NA NA NA NA NA chr14-91 31827045 31827203 155 - chr14:31827050-31827201 NA NA NA NA NA chr14-90 31692884 31693064 148 - chr14:31692900-31693032 NA NA NA NA NA chr14-89 31607806 31608233 219 - chr14:31607930-31607983 NA NA NA NA NA chr14-88 31393619 31393801 124 - chr14:31393655-31393732 NA NA NA NA NA chr14-87 31388728 31389083 191 - chr14:31388762-31388871 NA NA NA NA NA chr14-86 31210887 31211237 237 - chr14:31210960-31211104 NA NA NA NA NA chr14-85 31037586 31037991 236 - chr14:31037645-31037740 NA NA NA NA NA chr14-84 30965039 30965244 146 - chr14:30965070-30965129 NA NA NA NA NA chr14-83 30958687 30959006 289 - chr14:30958695-30958969 NA NA NA NA NA chr14-82 30920265 30920438 117 - chr14:30920341-30920422 NA NA NA NA NA chr14-81 30903350 30903871 298 - chr14:30903507-30903516 NA NA NA NA NA chr14-80 30707487 30707820 197 - chr14:30707617-30707672 NA NA NA NA NA chr14-79 30622948 30623240 165 - chr14:30623067-30623109 NA NA NA NA NA chr14-78 30289933 30290204 156 - chr14:30290061-30290115 NA NA NA NA NA chr14-77 30224896 30225136 172 - chr14:30224979-30225098 NA NA NA NA NA chr14-76 29941741 29942079 173 - chr14:29941908-29941915 NA NA NA NA NA chr14-75 29852413 29852574 119 - chr14:29852473-29852571 NA NA NA NA NA chr14-74 29709294 29709483 149 - chr14:29709334-29709443 NA NA NA NA NA chr14-73 29571624 29572182 277 - chr14:29571887-29571892 NA NA NA NA NA chr14-72 28928411 28928687 198 - chr14:28928472-28928575 NA NA NA NA NA chr14-71 28863147 28863387 182 - chr14:28863201-28863321 NA NA NA NA NA chr14-70 28715764 28716074 170 - chr14:28715882-28715982 NA NA NA NA NA chr14-69 28713832 28713999 122 - chr14:28713855-28713910 NA NA NA NA NA chr14-68 28643418 28643676 182 - chr14:28643524-28643668 NA NA NA NA NA chr14-67 28457498 28457891 277 - chr14:28457586-28457805 NA NA NA NA NA chr14-66 28093091 28093304 138 - chr14:28093172-28093241 NA NA NA NA NA chr14-65 27934938 27935201 149 - chr14:27935036-27935079 NA NA NA NA NA chr14-64 27902507 27902818 152 - chr14:27902650-27902651 NA NA NA NA NA chr14-63 27222174 27222338 156 - chr14:27222186-27222338 NA NA NA NA NA chr14-62 26962763 26963059 173 - chr14:26962921-26962934 NA NA NA NA NA chr14-61 26687646 26687886 164 - chr14:26687740-26687819 NA NA NA NA NA chr14-60 26679399 26679629 128 - chr14:26679483-26679491 NA NA NA NA NA chr14-59 26626418 26627140 312 - chr14:26626770-26626919 NA NA NA NA NA chr14-58 26572131 26572451 191 - chr14:26572303-26572408 NA NA NA NA NA chr14-57 26515133 26515345 168 - chr14:26515145-26515285 NA NA NA NA NA chr14-56 26379575 26379797 188 - chr14:26379614-26379785 NA NA NA NA NA chr14-55 26240227 26240587 255 - chr14:26240432-26240532 NA NA NA NA NA chr14-54 26068493 26068766 185 - chr14:26068584-26068636 NA NA NA NA NA chr14-53 25831852 25832003 148 - chr14:25831853-25831999 NA NA NA NA NA chr14-52 25705698 25705916 188 - chr14:25705734-25705907 NA NA NA NA NA chr14-51 25675791 25676149 199 - chr14:25675972-25676034 NA NA NA NA NA chr14-50 25647199 25647513 255 - chr14:25647214-25647366 NA NA NA NA NA chr14-49 25488531 25488958 239 - chr14:25488697-25488726 NA NA NA NA NA chr14-48 25262976 25263285 190 - chr14:25263065-25263139 NA NA NA NA NA chr14-47 25200879 25201116 155 - chr14:25200956-25201030 NA NA NA NA NA chr14-46 25133418 25133855 219 - chr14:25133552-25133595 NA NA NA NA NA chr14-45 24949691 24949895 143 - chr14:24949744-24949830 NA NA NA NA NA chr14-44 24869057 24869349 148 - chr14:24869266-24869272 NA NA NA NA NA chr14-43 24857182 24857509 171 - chr14:24857390-24857483 NA NA NA NA NA chr14-42 24457989 24458690 276 - chr14:24458582-24458601 NA NA NA NA NA chr14-41 24149299 24149595 168 - chr14:24149415-24149461 NA NA NA NA NA chr14-40 24106613 24106919 172 - chr14:24106753-24106788 NA NA NA NA NA chr14-39 23927245 23927404 156 - chr14:23927246-23927400 NA NA NA NA NA chr14-38 23888738 23889189 248 - chr14:23889021-23889177 NA NA NA NA NA chr14-37 23886347 23886704 189 - chr14:23886487-23886592 NA NA NA NA NA chr14-36 23554214 23554492 154 - chr14:23554332-23554356 NA NA NA NA NA chr14-35 23255867 23256148 242 - chr14:23255913-23256077 NA NA NA NA NA chr14-34 22996324 22996571 149 - chr14:22996423-22996475 NA NA NA NA NA chr14-33 22909263 22909440 152 - chr14:22909283-22909405 NA NA NA NA NA chr14-32 22698265 22698531 179 - chr14:22698460-22698498 NA NA NA NA NA chr14-31 22524373 22524580 162 - chr14:22524421-22524541 NA NA NA NA NA chr14-30 22320611 22320771 150 - chr14:22320622-22320763 NA NA NA NA NA chr14-29 22308274 22308467 145 - chr14:22308314-22308415 NA NA NA NA NA chr14-28 22098332 22098589 146 - chr14:22098438-22098468 NA NA NA NA NA chr14-27 22087637 22087907 165 - chr14:22087756-22087809 NA NA NA NA NA chr14-26 21985362 21985636 216 - chr14:21985512-21985612 NA NA NA NA NA chr14-25 21954888 21955290 277 - chr14:21954949-21955037 NA NA NA NA NA chr14-24 21723554 21724091 262 - chr14:21723941-21724040 NA NA NA NA NA chr14-23 21610837 21611204 213 - chr14:21610907-21611008 NA NA NA NA NA chr14-22 21458394 21458670 196 - chr14:21458399-21458555 NA NA NA NA NA chr14-21 21366616 21366891 157 - chr14:21366742-21366789 NA NA NA NA NA chr14-20 21338076 21338523 228 - chr14:21338371-21338456 NA NA NA NA NA chr14-19 21330284 21330709 196 - chr14:21330403-21330425 NA NA NA NA NA chr14-18 21223111 21223391 153 - chr14:21223242-21223266 NA NA NA NA NA chr14-17 21064731 21064979 149 - chr14:21064834-21064888 NA NA NA NA NA chr14-16 20991876 20992080 112 - chr14:20991964-20991980 NA NA NA NA NA chr14-15 20989334 20989494 126 - chr14:20989418-20989485 NA NA NA NA NA chr14-14 20876317 20876592 151 - chr14:20876457-20876500 NA NA NA NA NA chr14-13 20838143 20838760 401 - chr14:20838431-20838443 NA NA NA NA NA chr14-12 20820713 20820914 142 - chr14:20820772-20820861 NA NA NA NA NA chr14-11 20794773 20794984 186 - chr14:20794834-20794977 NA NA NA NA NA chr14-10 20535793 20536058 148 - chr14:20535906-20535939 NA NA NA NA NA chr14-9 20455899 20456071 154 - chr14:20455917-20456053 NA NA NA NA NA chr14-8 20339151 20339523 179 - chr14:20339294-20339305 NA NA NA NA NA chr14-7 20213755 20214056 156 - chr14:20213912-20213917 NA NA NA NA NA chr14-6 20175742 20175919 154 - chr14:20175767-20175897 NA NA NA NA NA chr14-5 20049466 20049771 155 - chr14:20049612-20049619 NA NA NA NA NA chr14-4 20047126 20047380 159 - chr14:20047216-20047275 NA NA NA NA NA chr14-3 19931328 19931598 164 - chr14:19931459-19931524 NA NA NA NA NA chr14-2 19924856 19925218 221 - chr14:19924961-19925005 NA NA NA NA NA chr14 19884871 19885055 159 - chr14:19884888-19885026 NA NA NA NA NA chr14-771 104406937 104407166 184 - chr14:104407008-104407134 NA NA NA NA NA chr14-770 104035047 104035440 215 - chr14:104035278-104035368 NA NA NA NA NA chr14-769 103679477 103679656 119 - chr14:103679521-103679588 NA NA NA NA NA chr14-768 103457169 103457561 186 - chr14:103457469-103457543 NA NA NA NA NA chr14-767 103415810 103415983 153 - chr14:103415830-103415963 NA NA NA NA NA chr14-766 103393528 103393905 249 - chr14:103393620-103393705 NA NA NA NA NA chr14-765 103208283 103208555 183 - chr14:103208372-103208466 NA NA NA NA NA chr14-764 103085656 103086051 215 - chr14:103085822-103085843 NA NA NA NA NA chr14-763 102703146 102703335 146 - chr14:102703191-102703296 NA NA NA NA NA chr14-762 100384589 100384799 189 - chr14:100384636-100384783 NA NA NA NA NA chr13-279 99868148 99868549 318 - chr13:99868276-99868428 NA NA NA NA NA chr13-278 99112950 99113185 178 - chr13:99112999-99113112 NA NA NA NA NA chr13-277 98934108 98934460 219 - chr13:98934301-98934315 NA NA NA NA NA chr13-276 98659570 98659946 205 - chr13:98659789-98659799 NA NA NA NA NA chr13-275 98364150 98364282 114 - chr13:98364151-98364256 NA NA NA NA NA chr13-274 98170214 98170424 118 - chr13:98170335-98170390 NA NA NA NA NA chr13-273 98012740 98013193 253 - chr13:98013027-98013180 NA NA NA NA NA chr13-272 98012189 98012442 149 - chr13:98012294-98012340 NA NA NA NA NA chr13-271 97757537 97757806 115 - chr13:97757736-97757742 NA NA NA NA NA chr13-270 97565383 97565580 146 - chr13:97565428-97565526 NA NA NA NA NA chr13-269 97403971 97404298 189 - chr13:97404051-97404131 NA NA NA NA NA chr13-268 96761212 96761410 152 - chr13:96761265-96761378 NA NA NA NA NA chr13-267 96192857 96193193 318 - chr13:96192857-96193166 NA NA NA NA NA chr13-266 95574505 95574911 258 - chr13:95574549-95574711 NA NA NA NA NA chr13-265 94992512 94992742 141 - chr13:94992587-94992646 NA NA NA NA NA chr13-264 94942150 94942563 371 - chr13:94942154-94942441 NA NA NA NA NA chr13-263 94818728 94819028 202 - chr13:94818749-94818902 NA NA NA NA NA chr13-262 94520404 94520742 205 - chr13:94520451-94520566 NA NA NA NA NA chr13-261 94512067 94512507 403 - chr13:94512115-94512467 NA NA NA NA NA chr13-260 94405439 94405859 236 - chr13:94405649-94405701 NA NA NA NA NA chr13-259 94306871 94307069 116 - chr13:94306982-94307045 NA NA NA NA NA chr13-258 94281433 94281697 214 - chr13:94281545-94281678 NA NA NA NA NA chr13-257 94051681 94051904 129 - chr13:94051745-94051795 NA NA NA NA NA chr13-256 93854300 93854586 200 - chr13:93854346-93854503 NA NA NA NA NA chr13-255 93629963 93630273 218 - chr13:93630207-93630241 NA NA NA NA NA chr13-254 93550523 93550743 187 - chr13:93550533-93550664 NA NA NA NA NA chr13-253 93500465 93500731 140 - chr13:93500581-93500600 NA NA NA NA NA chr13-252 93240774 93241294 276 - chr13:93240982-93241032 NA NA NA NA NA chr13-251 93178667 93179012 197 - chr13:93178725-93178819 NA NA NA NA NA chr13-250 93066429 93066744 203 - chr13:93066447-93066585 NA NA NA NA NA chr13-249 92979088 92979498 194 - chr13:92979204-92979232 NA NA NA NA NA chr13-248 92947332 92947595 167 - chr13:92947454-92947512 NA NA NA NA NA chr13-247 92927521 92927764 165 - chr13:92927599-92927686 NA NA NA NA NA chr13-246 92904487 92904807 263 - chr13:92904555-92904704 NA NA NA NA NA chr13-245 92539611 92539958 201 - chr13:92539807-92539837 NA NA NA NA NA chr13-244 92459211 92459452 151 - chr13:92459292-92459344 NA NA NA NA NA chr13-243 92244366 92244730 179 - chr13:92244527-92244533 NA NA NA NA NA chr13-242 92179286 92179462 157 - chr13:92179317-92179449 NA NA NA NA NA chr13-241 92020149 92020637 318 - chr13:92020224-92020277 NA NA NA NA NA chr13-240 91637661 91638109 348 - chr13:91637926-91638074 NA NA NA NA NA chr13-239 90293923 90294295 190 - chr13:90294132-90294167 NA NA NA NA NA chr13-238 90263786 90263982 159 - chr13:90263821-90263944 NA NA NA NA NA chr13-237 89375030 89375302 154 - chr13:89375142-89375181 NA NA NA NA NA chr13-236 89204407 89204681 152 - chr13:89204537-89204563 NA NA NA NA NA chr13-235 89136868 89137149 208 - chr13:89136935-89137073 NA NA NA NA NA chr13-234 88841337 88841607 148 - chr13:88841460-88841487 NA NA NA NA NA chr13-233 88760195 88760375 145 - chr13:88760234-88760348 NA NA NA NA NA chr13-232 87855858 87856012 114 - chr13:87855888-87855922 NA NA NA NA NA chr13-231 87768042 87768285 149 - chr13:87768049-87768189 NA NA NA NA NA chr13-230 87713648 87713992 217 - chr13:87713707-87713729 NA NA NA NA NA chr13-229 87518208 87518488 241 - chr13:87518208-87518371 NA NA NA NA NA chr13-228 87077867 87078261 232 - chr13:87078067-87078218 NA NA NA NA NA chr13-227 86752776 86753086 173 - chr13:86752909-86752947 NA NA NA NA NA chr13-226 86415943 86416144 183 - chr13:86415965-86416112 NA NA NA NA NA chr13-225 86327185 86327391 160 - chr13:86327204-86327323 NA NA NA NA NA chr13-224 86164039 86164238 155 - chr13:86164077-86164191 NA NA NA NA NA chr13-223 86072546 86072710 141 - chr13:86072565-86072685 NA NA NA NA NA chr13-222 85783479 85783781 161 - chr13:85783640-85783650 NA NA NA NA NA chr13-221 85625168 85625319 137 - chr13:85625172-85625302 NA NA NA NA NA chr13-220 85096432 85096612 126 - chr13:85096492-85096591 NA NA NA NA NA chr13-219 85070570 85071336 406 - chr13:85070888-85070892 NA NA NA NA NA chr13-218 84706058 84706226 135 - chr13:84706060-84706129 NA NA NA NA NA chr13-217 84704602 84704936 182 - chr13:84704728-84704858 NA NA NA NA NA chr13-216 83800293 83800713 250 - chr13:83800567-83800595 NA NA NA NA NA chr13-215 83766937 83767122 140 - chr13:83766978-83767069 NA NA NA NA NA chr13-214 83765264 83765459 177 - chr13:83765300-83765450 NA NA NA NA NA chr13-213 83196209 83196509 169 - chr13:83196340-83196378 NA NA NA NA NA chr13-212 83194170 83194447 153 - chr13:83194291-83194317 NA NA NA NA NA chr13-211 82274468 82274902 246 - chr13:82274730-82274882 NA NA NA NA NA chr13-210 82176698 82176858 157 - chr13:82176704-82176855 NA NA NA NA NA chr13-209 82153033 82153426 190 - chr13:82153172-82153191 NA NA NA NA NA chr13-208 81312131 81312263 123 - chr13:81312137-81312248 NA NA NA NA NA chr13-207 80941868 80942255 272 - chr13:80941937-80942048 NA NA NA NA NA chr13-206 80297800 80298337 363 - chr13:80297944-80298174 NA NA NA NA NA chr13-205 80271482 80271860 240 - chr13:80271570-80271622 NA NA NA NA NA chr13-204 80258820 80259256 340 - chr13:80258944-80259092 NA NA NA NA NA chr13-203 78952997 78953193 165 - chr13:78953055-78953158 NA NA NA NA NA chr13-202 78902809 78903136 177 - chr13:78902975-78903018 NA NA NA NA NA chr13-201 78879805 78880112 171 - chr13:78879870-78879967 NA NA NA NA NA chr13-200 78829693 78829859 126 - chr13:78829721-78829767 NA NA NA NA NA chr13-199 78198030 78198346 240 - chr13:78198200-78198317 NA NA NA NA NA chr13-198 78182702 78183098 194 - chr13:78182814-78182851 NA NA NA NA NA chr13-197 77596902 77597323 219 - chr13:77597024-77597193 NA NA NA NA NA chr13-196 77186656 77186977 207 - chr13:77186822-77186967 NA NA NA NA NA chr13-195 77126702 77126859 131 - chr13:77126730-77126809 NA NA NA NA NA chr13-194 76958749 76958969 176 - chr13:76958789-76958943 NA NA NA NA NA chr13-193 76740507 76741071 398 - chr13:76740849-76740993 NA NA NA NA NA chr13-192 76628790 76629260 272 - chr13:76628820-76628978 NA NA NA NA NA chr13-191 76551717 76552158 239 - chr13:76551890-76551898 NA NA NA NA NA chr13-190 76511367 76511653 142 - chr13:76511479-76511493 NA NA NA NA NA chr13-189 76015213 76015498 171 - chr13:76015353-76015436 NA NA NA NA NA chr13-188 75988649 75988895 130 - chr13:75988743-75988768 NA NA NA NA NA chr13-187 75639023 75639287 206 - chr13:75639052-75639171 NA NA NA NA NA chr13-186 75314486 75314801 246 - chr13:75314651-75314780 NA NA NA NA NA chr13-185 75138655 75139003 193 - chr13:75138785-75138798 NA NA NA NA NA chr13-184 74850549 74850998 179 - chr13:74850599-74850618 NA NA NA NA NA chr13-183 74417292 74417574 158 - chr13:74417410-74417438 NA NA NA NA NA chr13-182 74143458 74143827 217 - chr13:74143651-74143792 NA NA NA NA NA chr13-181 73869164 73869350 141 - chr13:73869235-73869326 NA NA NA NA NA chr13-180 73768507 73768720 149 - chr13:73768572-73768658 NA NA NA NA NA chr13-179 73206266 73206663 237 - chr13:73206566-73206573 NA NA NA NA NA chr13-178 72722979 72723173 146 - chr13:72723013-72723118 NA NA NA NA NA chr13-177 72549698 72550029 212 - chr13:72549853-72549928 NA NA NA NA NA chr13-176 72307059 72307441 222 - chr13:72307223-72307289 NA NA NA NA NA chr13-175 72047498 72047947 237 - chr13:72047610-72047741 NA NA NA NA NA chr13-174 72046299 72046565 163 - chr13:72046413-72046484 NA NA NA NA NA chr13-173 71923667 71924000 198 - chr13:71923835-71923931 NA NA NA NA NA chr13-172 71859716 71860059 259 - chr13:71859758-71859891 NA NA NA NA NA chr13-171 71319570 71319864 164 - chr13:71319705-71319804 NA NA NA NA NA chr13-170 70917652 70917974 200 - chr13:70917746-70917885 NA NA NA NA NA chr13-169 70854423 70854610 131 - chr13:70854463-70854522 NA NA NA NA NA chr13-168 70619024 70619731 334 - chr13:70619185-70619328 NA NA NA NA NA chr13-167 70176401 70176749 236 - chr13:70176566-70176743 NA NA NA NA NA chr13-166 69408103 69408278 150 - chr13:69408131-69408259 NA NA NA NA NA chr13-165 69313156 69313345 134 - chr13:69313217-69313302 NA NA NA NA NA chr13-164 68715489 68715652 139 - chr13:68715538-68715629 NA NA NA NA NA chr13-163 68267764 68268113 296 - chr13:68267840-68268030 NA NA NA NA NA chr13-162 68147297 68147593 163 - chr13:68147400-68147445 NA NA NA NA NA chr13-161 67932767 67932967 136 - chr13:67932817-67932896 NA NA NA NA NA chr13-160 67458377 67458578 154 - chr13:67458428-67458539 NA NA NA NA NA chr13-159 67033642 67033879 159 - chr13:67033744-67033864 NA NA NA NA NA chr13-158 65955074 65955245 143 - chr13:65955105-65955223 NA NA NA NA NA chr13-157 65899227 65899497 147 - chr13:65899353-65899380 NA NA NA NA NA chr13-156 65631899 65632127 169 - chr13:65631960-65632072 NA NA NA NA NA chr13-155 65555368 65555703 202 - chr13:65555474-65555515 NA NA NA NA NA chr13-154 65238846 65239054 156 - chr13:65238896-65239001 NA NA NA NA NA chr13-153 65038999 65039356 183 - chr13:65039096-65039130 NA NA NA NA NA chr13-152 64437001 64437162 136 - chr13:64437002-64437088 NA NA NA NA NA chr13-151 63947495 63947760 201 - chr13:63947544-63947666 NA NA NA NA NA chr13-150 63595531 63595717 134 - chr13:63595619-63595683 NA NA NA NA NA chr13-149 62843492 62843661 155 - chr13:62843520-62843654 NA NA NA NA NA chr13-148 62694012 62694416 269 - chr13:62694089-62694165 NA NA NA NA NA chr13-147 62509730 62509873 131 - chr13:62509736-62509861 NA NA NA NA NA chr13-146 62418761 62419006 156 - chr13:62418858-62418933 NA NA NA NA NA chr13-145 62410600 62410881 143 - chr13:62410746-62410747 NA NA NA NA NA chr13-144 62265756 62266008 228 - chr13:62265777-62265993 NA NA NA NA NA chr13-143 61848251 61848565 162 - chr13:61848389-61848406 NA NA NA NA NA chr13-142 61633356 61633780 242 - chr13:61633430-61633581 NA NA NA NA NA chr13-141 61292973 61293397 252 - chr13:61293245-61293275 NA NA NA NA NA chr13-140 60870816 60871274 232 - chr13:60870964-60870984 NA NA NA NA NA chr13-139 60808789 60809034 148 - chr13:60808881-60808933 NA NA NA NA NA chr13-138 59715841 59716050 193 - chr13:59715847-59716008 NA NA NA NA NA chr13-137 59697775 59698043 137 - chr13:59697906-59697912 NA NA NA NA NA chr13-136 59624728 59625026 162 - chr13:59624863-59624888 NA NA NA NA NA chr13-135 58978695 58978935 178 - chr13:58978757-58978873 NA NA NA NA NA chr13-134 58835548 58835770 174 - chr13:58835620-58835770 NA NA NA NA NA chr13-133 58567533 58567714 129 - chr13:58567655-58567697 NA NA NA NA NA chr13-132 58410894 58411306 211 - chr13:58410983-58411049 NA NA NA NA NA chr13-131 58382788 58382987 160 - chr13:58382839-58382954 NA NA NA NA NA chr13-130 58004047 58004262 194 - chr13:58004106-58004258 NA NA NA NA NA chr13-129 57768746 57768978 160 - chr13:57768811-57768892 NA NA NA NA NA chr13-128 57337012 57337294 183 - chr13:57337055-57337122 NA NA NA NA NA chr13-127 56667309 56667842 291 - chr13:56667354-56667473 NA NA NA NA NA chr13-126 56649641 56649820 149 - chr13:56649674-56649796 NA NA NA NA NA chr13-125 56035946 56036125 135 - chr13:56035957-56036070 NA NA NA NA NA chr13-124 55884603 55884793 154 - chr13:55884631-55884753 NA NA NA NA NA chr13-123 55493432 55493617 152 - chr13:55493473-55493600 NA NA NA NA NA chr13-122 55399212 55399420 138 - chr13:55399268-55399343 NA NA NA NA NA chr13-121 55268632 55268792 136 - chr13:55268681-55268769 NA NA NA NA NA chr13-120 55032747 55033397 364 - chr13:55033053-55033121 NA NA NA NA NA chr13-119 55010624 55010888 158 - chr13:55010722-55010777 NA NA NA NA NA chr13-118 54913125 54913425 194 - chr13:54913179-54913215 NA NA NA NA NA chr13-117 54866394 54866602 140 - chr13:54866468-54866537 NA NA NA NA NA chr13-116 54648027 54648184 145 - chr13:54648032-54648171 NA NA NA NA NA chr13-115 54517694 54518018 238 - chr13:54517724-54517790 NA NA NA NA NA chr13-114 54259690 54259870 177 - chr13:54259699-54259870 NA NA NA NA NA chr13-113 54142517 54142767 155 - chr13:54142609-54142666 NA NA NA NA NA chr13-112 54034383 54034594 178 - chr13:54034444-54034575 NA NA NA NA NA chr13-111 53928494 53928763 234 - chr13:53928595-53928759 NA NA NA NA NA chr13-110 53642151 53642475 170 - chr13:53642307-53642322 NA NA NA NA NA chr13-109 53483833 53483979 122 - chr13:53483849-53483959 NA NA NA NA NA chr13-108 53220777 53221335 298 - chr13:53220855-53220939 NA NA NA NA NA chr13-107 53181046 53181260 151 - chr13:53181111-53181198 NA NA NA NA NA chr13-106 52963833 52964285 260 - chr13:52963934-52963973 NA NA NA NA NA chr13-105 52826749 52826986 192 - chr13:52826760-52826924 NA NA NA NA NA chr13-104 52360091 52360268 140 - chr13:52360132-52360239 NA NA NA NA NA chr13-103 52139300 52139707 252 - chr13:52139328-52139451 NA NA NA NA NA chr13-102 51550872 51551212 187 - chr13:51551075-51551084 NA NA NA NA NA chr13-101 51107284 51107454 149 - chr13:51107296-51107415 NA NA NA NA NA chr13-100 51032934 51033156 162 - chr13:51033008-51033103 NA NA NA NA NA chr13-99 50849613 50849903 190 - chr13:50849714-50849854 NA NA NA NA NA chr13-98 50231195 50231423 163 - chr13:50231261-50231395 NA NA NA NA NA chr13-97 49774696 49775138 206 - chr13:49774988-49775014 NA NA NA NA NA chr13-96 49487651 49487894 121 - chr13:49487777-49487780 NA NA NA NA NA chr13-95 49462441 49462840 201 - chr13:49462643-49462650 NA NA NA NA NA chr13-94 49459938 49460173 183 - chr13:49459977-49460134 NA NA NA NA NA chr13-93 49437429 49437721 152 - chr13:49437559-49437561 NA NA NA NA NA chr13-92 49024612 49024812 144 - chr13:49024662-49024744 NA NA NA NA NA chr13-91 48894752 48895077 233 - chr13:48894804-48894905 NA NA NA NA NA chr13-90 48717508 48717706 113 - chr13:48717578-48717591 NA NA NA NA NA chr13-89 48536967 48537193 127 - chr13:48537088-48537105 NA NA NA NA NA chr13-88 48350085 48350378 246 - chr13:48350137-48350289 NA NA NA NA NA chr13-87 48347120 48347459 223 - chr13:48347286-48347348 NA NA NA NA NA chr13-86 48342445 48342716 184 - chr13:48342570-48342597 NA NA NA NA NA chr13-85 48325810 48326066 190 - chr13:48325869-48326026 NA NA NA NA NA chr13-84 47937715 47937892 153 - chr13:47937743-47937870 NA NA NA NA NA chr13-83 46393337 46393607 227 - chr13:46393348-46393489 NA NA NA NA NA chr13-82 46347285 46347541 149 - chr13:46347393-46347436 NA NA NA NA NA chr13-81 46131759 46132028 160 - chr13:46131861-46131905 NA NA NA NA NA chr13-80 45767045 45767257 150 - chr13:45767118-45767217 NA NA NA NA NA chr13-79 45284672 45285078 223 - chr13:45284929-45285029 NA NA NA NA NA chr13-78 45252571 45252767 156 - chr13:45252610-45252725 NA NA NA NA NA chr13-77 45052877 45053188 260 - chr13:45052985-45053143 NA NA NA NA NA chr13-76 44732858 44733039 173 - chr13:44732880-44733038 NA NA NA NA NA chr13-75 44342385 44342560 131 - chr13:44342411-44342507 NA NA NA NA NA chr13-74 43768245 43768570 212 - chr13:43768415-43768483 NA NA NA NA NA chr13-73 43684535 43684798 157 - chr13:43684652-43684714 NA NA NA NA NA chr13-72 43319253 43319476 189 - chr13:43319253-43319425 NA NA NA NA NA chr13-71 43314742 43315014 154 - chr13:43314858-43314892 NA NA NA NA NA chr13-70 42880001 42880204 185 - chr13:42880003-42880154 NA NA NA NA NA chr13-69 42196453 42196728 155 - chr13:42196583-42196678 NA NA NA NA NA chr13-68 42179937 42180198 184 - chr13:42179998-42180089 NA NA NA NA NA chr13-67 42079687 42079988 155 - chr13:42079825-42079838 NA NA NA NA NA chr13-66 41800101 41800525 280 - chr13:41800287-41800402 NA NA NA NA NA chr13-65 41397537 41397857 204 - chr13:41397610-41397770 NA NA NA NA NA chr13-64 41258992 41259292 227 - chr13:41259129-41259251 NA NA NA NA NA chr13-63 39898566 39899013 224 - chr13:39898835-39898912 NA NA NA NA NA chr13-62 39677386 39677623 148 - chr13:39677515-39677614 NA NA NA NA NA chr13-61 39518346 39518555 149 - chr13:39518404-39518491 NA NA NA NA NA chr13-60 39456982 39457161 147 - chr13:39457008-39457126 NA NA NA NA NA chr13-59 39011666 39011958 158 - chr13:39011808-39011840 NA NA NA NA NA chr13-58 37902640 37903017 236 - chr13:37902726-37902848 NA NA NA NA NA chr13-57 37867694 37867885 154 - chr13:37867789-37867869 NA NA NA NA NA chr13-56 36817450 36817759 165 - chr13:36817600-36817627 NA NA NA NA NA chr13-55 36229488 36229634 123 - chr13:36229488-36229565 NA NA NA NA NA chr13-54 36153816 36154044 141 - chr13:36153900-36153951 NA NA NA NA NA chr13-53 35964639 35964868 177 - chr13:35964656-35964807 NA NA NA NA NA chr13-52 35791016 35791195 149 - chr13:35791050-35791173 NA NA NA NA NA chr13-51 35432339 35432762 249 - chr13:35432496-35432658 NA NA NA NA NA chr13-50 35313618 35313945 209 - chr13:35313715-35313865 NA NA NA NA NA chr13-49 35148743 35148933 171 - chr13:35148760-35148913 NA NA NA NA NA chr13-48 34644265 34644679 211 - chr13:34644415-34644445 NA NA NA NA NA chr13-47 34131501 34131771 147 - chr13:34131638-34131676 NA NA NA NA NA chr13-46 33597204 33597379 159 - chr13:33597216-33597361 NA NA NA NA NA chr13-45 33267630 33268034 240 - chr13:33267761-33267919 NA NA NA NA NA chr13-44 32723522 32723765 163 - chr13:32723605-32723691 NA NA NA NA NA chr13-43 32709362 32709571 147 - chr13:32709431-32709523 NA NA NA NA NA chr13-42 32429139 32429314 156 - chr13:32429154-32429272 NA NA NA NA NA chr13-41 32298498 32298644 116 - chr13:32298552-32298608 NA NA NA NA NA chr13-40 31568136 31568608 233 - chr13:31568207-31568285 NA NA NA NA NA chr13-39 31332512 31332806 156 - chr13:31332646-31332660 NA NA NA NA NA chr13-38 31181710 31181922 175 - chr13:31181753-31181888 NA NA NA NA NA chr13-37 30224520 30224841 173 - chr13:30224648-30224683 NA NA NA NA NA chr13-36 30029211 30029380 128 - chr13:30029219-30029273 NA NA NA NA NA chr13-35 29893385 29893557 117 - chr13:29893402-29893483 NA NA NA NA NA chr13-34 29278909 29279062 137 - chr13:29278915-29279020 NA NA NA NA NA chr13-33 29241102 29241316 194 - chr13:29241104-29241258 NA NA NA NA NA chr13-32 28827224 28827584 210 - chr13:28827436-28827465 NA NA NA NA NA chr13-31 28685630 28685882 153 - chr13:28685729-28685783 NA NA NA NA NA chr13-30 28457553 28457722 152 - chr13:28457562-28457701 NA NA NA NA NA chr13-29 28066786 28066981 129 - chr13:28066835-28066881 NA NA NA NA NA chr13-28 27578501 27578818 159 - chr13:27578689-27578720 NA NA NA NA NA chr13-27 27575832 27576257 232 - chr13:27575989-27575992 NA NA NA NA NA chr13-26 27505762 27506059 147 - chr13:27505966-27506038 NA NA NA NA NA chr13-25 26639123 26639301 150 - chr13:26639150-26639271 NA NA NA NA NA chr13-24 26501874 26502110 153 - chr13:26501960-26502033 NA NA NA NA NA chr13-23 25472738 25473000 225 - chr13:25472789-25472940 NA NA NA NA NA chr13-22 25156203 25156442 191 - chr13:25156273-25156440 NA NA NA NA NA chr13-21 25039454 25039726 231 - chr13:25039553-25039702 NA NA NA NA NA chr13-20 24515899 24516405 271 - chr13:24516238-24516302 NA NA NA NA NA chr13-19 24261732 24261995 155 - chr13:24261837-24261881 NA NA NA NA NA chr13-18 24114226 24114417 148 - chr13:24114276-24114388 NA NA NA NA NA chr13-17 23829883 23830066 113 - chr13:23829917-23829965 NA NA NA NA NA chr13-16 23819680 23820006 206 - chr13:23819693-23819839 NA NA NA NA NA chr13-15 23600291 23600546 149 - chr13:23600398-23600442 NA NA NA NA NA chr13-14 23279245 23279544 222 - chr13:23279313-23279381 NA NA NA NA NA chr13-13 23020731 23020990 159 - chr13:23020881-23020990 NA NA NA NA NA chr13-12 22424436 22424598 145 - chr13:22424441-22424575 NA NA NA NA NA chr13-11 22400204 22400446 151 - chr13:22400295-22400355 NA NA NA NA NA chr13-10 22152443 22152639 135 - chr13:22152518-22152585 NA NA NA NA NA chr13-9 21587242 21587734 346 - chr13:21587321-21587594 NA NA NA NA NA chr13-8 21099964 21100121 123 - chr13:21099999-21100105 NA NA NA NA NA chr13-7 20964206 20964574 279 - chr13:20964234-20964363 NA NA NA NA NA chr13-6 20843324 20843554 139 - chr13:20843426-20843485 NA NA NA NA NA chr13-5 20051910 20052174 139 - chr13:20051953-20052008 NA NA NA NA NA chr13-4 20006524 20006847 208 - chr13:20006657-20006685 NA NA NA NA NA chr13-3 19777579 19777783 170 - chr13:19777609-19777762 NA NA NA NA NA chr13-2 19174639 19174918 159 - chr13:19174755-19174790 NA NA NA NA NA chr13 18951063 18951390 267 - chr13:18951152-18951299 NA NA NA NA NA chr13-315 113977495 113977927 287 - chr13:113977604-113977764 NA NA NA NA NA chr13-314 113868461 113868631 132 - chr13:113868527-113868607 NA NA NA NA NA chr13-313 113763845 113764007 148 - chr13:113763869-113763989 NA NA NA NA NA chr13-312 113507512 113507779 150 - chr13:113507632-113507668 NA NA NA NA NA chr13-311 112785337 112785676 172 - chr13:112785531-112785563 NA NA NA NA NA chr13-310 112564477 112564650 129 - chr13:112564495-112564593 NA NA NA NA NA chr13-309 112516007 112516255 167 - chr13:112516116-112516188 NA NA NA NA NA chr13-308 112041008 112041311 177 - chr13:112041265-112041297 NA NA NA NA NA chr13-307 111483582 111483773 132 - chr13:111483663-111483725 NA NA NA NA NA chr13-306 110104013 110104177 142 - chr13:110104041-110104158 NA NA NA NA NA chr13-305 109545771 109545962 149 - chr13:109545820-109545910 NA NA NA NA NA chr13-304 109449437 109449723 175 - chr13:109449620-109449649 NA NA NA NA NA chr13-303 109198624 109199135 222 - chr13:109198743-109198757 NA NA NA NA NA chr13-302 109173164 109173639 228 - chr13:109173345-109173359 NA NA NA NA NA chr13-301 108291823 108292017 147 - chr13:108291850-108291960 NA NA NA NA NA chr13-300 107949009 107949204 169 - chr13:107949029-107949166 NA NA NA NA NA chr13-299 107705536 107705734 140 - chr13:107705583-107705654 NA NA NA NA NA chr13-298 106348510 106348727 126 - chr13:106348643-106348657 NA NA NA NA NA chr13-297 106138839 106139424 239 - chr13:106139373-106139379 NA NA NA NA NA chr13-296 106130388 106130691 134 - chr13:106130612-106130632 NA NA NA NA NA chr13-295 104759184 104759605 208 - chr13:104759457-104759512 NA NA NA NA NA chr13-294 104315604 104315797 146 - chr13:104315679-104315764 NA NA NA NA NA chr13-293 104302411 104302778 191 - chr13:104302636-104302700 NA NA NA NA NA chr13-292 104201483 104201961 222 - chr13:104201806-104201839 NA NA NA NA NA chr13-291 103923284 103923444 137 - chr13:103923307-103923421 NA NA NA NA NA chr13-290 103710760 103711117 225 - chr13:103710780-103710929 NA NA NA NA NA chr13-289 103455617 103455870 158 - chr13:103455714-103455779 NA NA NA NA NA chr13-288 103432809 103433027 195 - chr13:103432834-103432983 NA NA NA NA NA chr13-287 102813289 102813595 237 - chr13:102813474-102813584 NA NA NA NA NA chr13-286 102038358 102038567 134 - chr13:102038438-102038502 NA NA NA NA NA chr13-285 102005911 102006182 169 - chr13:102006027-102006087 NA NA NA NA NA chr13-284 101764487 101764755 173 - chr13:101764534-101764636 NA NA NA NA NA chr13-283 101325531 101325937 192 - chr13:101325651-101325676 NA NA NA NA NA chr13-282 100783143 100783662 300 - chr13:100783167-100783275 NA NA NA NA NA chr13-281 100570396 100570656 212 - chr13:100570454-100570642 NA NA NA NA NA chr13-280 100506772 100507117 140 - chr13:100506845-100506846 NA NA NA NA NA chr12-77 9993043 9993207 149 - chr12:9993044-9993185 NA NA NA NA NA chr12-76 9972226 9972474 160 - chr12:9972314-9972386 NA NA NA NA NA chr12-540 99334726 99334981 155 - chr12:99334799-99334861 NA NA NA NA NA chr12-539 99248480 99248649 158 - chr12:99248505-99248645 NA NA NA NA NA chr12-75 9916049 9916312 154 - chr12:9916143-9916196 NA NA NA NA NA chr12-538 99042698 99042954 174 - chr12:99042804-99042920 NA NA NA NA NA chr12-5 987386 987685 205 - chr12:987430-987588 NA NA NA NA NA chr12-537 98647900 98648116 168 - chr12:98647958-98648088 NA NA NA NA NA chr12-536 98193183 98193464 169 - chr12:98193217-98193330 NA NA NA NA NA chr12-4 977001 977495 327 - chr12:977143-977383 NA NA NA NA NA chr12-535 97632250 97632670 345 - chr12:97632251-97632558 NA NA NA NA NA chr12-74 9756999 9757279 166 - chr12:9757163-9757265 NA NA NA NA NA chr12-73 9754371 9754791 377 - chr12:9754432-9754723 NA NA NA NA NA chr12-534 97530045 97530398 217 - chr12:97530183-97530332 NA NA NA NA NA chr12-533 97432804 97433069 176 - chr12:97432932-97433000 NA NA NA NA NA chr12-532 97142345 97142812 263 - chr12:97142570-97142650 NA NA NA NA NA chr12-72 9669358 9669575 136 - chr12:9669461-9669505 NA NA NA NA NA chr12-71 9618726 9619010 196 - chr12:9618858-9619010 NA NA NA NA NA chr12-531 96107529 96107931 218 - chr12:96107764-96107849 NA NA NA NA NA chr12-70 9602836 9603137 171 - chr12:9603008-9603028 NA NA NA NA NA chr12-530 95270266 95270638 291 - chr12:95270347-95270557 NA NA NA NA NA chr12-529 94935194 94935582 259 - chr12:94935428-94935471 NA NA NA NA NA chr12-69 9364263 9364581 256 - chr12:9364445-9364579 NA NA NA NA NA chr12-528 93594100 93594363 237 - chr12:93594117-93594320 NA NA NA NA NA chr12-527 93536160 93536325 134 - chr12:93536253-93536325 NA NA NA NA NA chr12-526 93403293 93403471 163 - chr12:93403298-93403451 NA NA NA NA NA chr12-525 93319555 93319741 168 - chr12:93319572-93319721 NA NA NA NA NA chr12-68 9239030 9239200 127 - chr12:9239098-9239139 NA NA NA NA NA chr12-67 9204676 9204978 186 - chr12:9204851-9204931 NA NA NA NA NA chr12-524 92028467 92028724 141 - chr12:92028597-92028615 NA NA NA NA NA chr12-523 91862375 91862712 206 - chr12:91862422-91862539 NA NA NA NA NA chr12-522 90757793 90758048 231 - chr12:90757832-90758015 NA NA NA NA NA chr12-521 90388463 90388676 153 - chr12:90388527-90388618 NA NA NA NA NA chr12-520 89068160 89068559 241 - chr12:89068369-89068531 NA NA NA NA NA chr12-519 88408141 88408481 238 - chr12:88408201-88408295 NA NA NA NA NA chr12-518 88289887 88290257 248 - chr12:88289967-88290051 NA NA NA NA NA chr12-517 88160033 88160243 138 - chr12:88160043-88160124 NA NA NA NA NA chr12-66 8768456 8768662 142 - chr12:8768512-8768594 NA NA NA NA NA chr12-516 87234306 87234578 193 - chr12:87234403-87234508 NA NA NA NA NA chr12-515 86817341 86817547 189 - chr12:86817361-86817516 NA NA NA NA NA chr12-65 8651353 8651518 160 - chr12:8651366-8651517 NA NA NA NA NA chr12-514 85996622 85996935 201 - chr12:85996775-85996920 NA NA NA NA NA chr12-513 85953634 85953782 119 - chr12:85953677-85953738 NA NA NA NA NA chr12-64 8503410 8503589 138 - chr12:8503441-8503543 NA NA NA NA NA chr12-512 84922991 84923450 237 - chr12:84923217-84923236 NA NA NA NA NA chr12-511 84370290 84370484 169 - chr12:84370331-84370467 NA NA NA NA NA chr12-510 84219681 84220102 245 - chr12:84219801-84219898 NA NA NA NA NA chr12-509 84133554 84133764 143 - chr12:84133587-84133629 NA NA NA NA NA chr12-508 83390601 83391083 214 - chr12:83390687-83390724 NA NA NA NA NA chr12-507 83125759 83126080 174 - chr12:83125846-83125903 NA NA NA NA NA chr12-506 82960867 82961075 155 - chr12:82960931-82961044 NA NA NA NA NA chr12-505 82164320 82164854 273 - chr12:82164577-82164591 NA NA NA NA NA chr12-504 81991283 81991600 183 - chr12:81991404-81991520 NA NA NA NA NA chr12-503 81770309 81770668 220 - chr12:81770420-81770473 NA NA NA NA NA chr12-502 81750925 81751094 143 - chr12:81750967-81751076 NA NA NA NA NA chr12-501 81733809 81733978 130 - chr12:81733828-81733880 NA NA NA NA NA chr12-500 81432858 81433185 156 - chr12:81433052-81433060 NA NA NA NA NA chr12-499 81257935 81258399 313 - chr12:81258072-81258271 NA NA NA NA NA chr12-498 80854687 80855017 196 - chr12:80854804-80854849 NA NA NA NA NA chr12-497 80492038 80492381 184 - chr12:80492235-80492241 NA NA NA NA NA chr12-496 80237597 80237835 118 - chr12:80237747-80237775 NA NA NA NA NA chr12-495 80226628 80226817 157 - chr12:80226661-80226787 NA NA NA NA NA chr12-494 80159785 80160169 270 - chr12:80159863-80160037 NA NA NA NA NA chr12-493 79785140 79785470 171 - chr12:79785275-79785299 NA NA NA NA NA chr12-492 79781330 79781622 254 - chr12:79781372-79781598 NA NA NA NA NA chr12-491 79546294 79546953 268 - chr12:79546419-79546429 NA NA NA NA NA chr12-490 79531954 79532125 161 - chr12:79531954-79532095 NA NA NA NA NA chr12-489 79384066 79384337 155 - chr12:79384172-79384216 NA NA NA NA NA chr12-63 7919306 7919513 136 - chr12:7919407-7919457 NA NA NA NA NA chr12-488 79174428 79174858 230 - chr12:79174522-79174605 NA NA NA NA NA chr12-487 78067533 78067740 157 - chr12:78067577-78067687 NA NA NA NA NA chr12-486 77710293 77710494 190 - chr12:77710302-77710470 NA NA NA NA NA chr12-485 77394120 77394558 262 - chr12:77394364-77394416 NA NA NA NA NA chr12-62 7733077 7733213 114 - chr12:7733089-7733186 NA NA NA NA NA chr12-484 77316219 77316445 128 - chr12:77316314-77316341 NA NA NA NA NA chr12-61 7727744 7728178 260 - chr12:7727871-7727910 NA NA NA NA NA chr12-60 7726404 7726644 125 - chr12:7726485-7726512 NA NA NA NA NA chr12-59 7722275 7722495 161 - chr12:7722328-7722424 NA NA NA NA NA chr12-3 769757 769978 166 - chr12:769772-769903 NA NA NA NA NA chr12-483 76771953 76772230 230 - chr12:76772094-76772230 NA NA NA NA NA chr12-482 76602057 76602271 154 - chr12:76602124-76602225 NA NA NA NA NA chr12-481 76454543 76454883 284 - chr12:76454583-76454755 NA NA NA NA NA chr12-480 76067563 76067853 204 - chr12:76067681-76067842 NA NA NA NA NA chr12-479 75930669 75930878 149 - chr12:75930721-75930802 NA NA NA NA NA chr12-478 75727667 75727843 148 - chr12:75727683-75727809 NA NA NA NA NA chr12-477 75576554 75577002 260 - chr12:75576767-75576933 NA NA NA NA NA chr12-476 75326677 75326843 155 - chr12:75326684-75326824 NA NA NA NA NA chr12-475 75284757 75284985 159 - chr12:75284820-75284913 NA NA NA NA NA chr12-58 7512476 7512675 164 - chr12:7512515-7512648 NA NA NA NA NA chr12-474 74739067 74739349 237 - chr12:74739180-74739327 NA NA NA NA NA chr12-473 74691754 74691961 157 - chr12:74691814-74691931 NA NA NA NA NA chr12-57 7455699 7455958 153 - chr12:7455797-7455848 NA NA NA NA NA chr12-472 73566960 73567214 137 - chr12:73567077-73567097 NA NA NA NA NA chr12-471 73175132 73175765 292 - chr12:73175534-73175546 NA NA NA NA NA chr12-470 72966440 72966702 147 - chr12:72966555-72966587 NA NA NA NA NA chr12-469 72889083 72889497 186 - chr12:72889142-72889181 NA NA NA NA NA chr12-468 72617147 72617434 165 - chr12:72617291-72617323 NA NA NA NA NA chr12-467 71768171 71768355 147 - chr12:71768203-71768308 NA NA NA NA NA chr12-466 71680481 71680646 150 - chr12:71680512-71680632 NA NA NA NA NA chr12-465 71622662 71622982 190 - chr12:71622814-71622939 NA NA NA NA NA chr12-464 70881735 70881994 171 - chr12:70881842-70881944 NA NA NA NA NA chr12-463 70724879 70725249 299 - chr12:70724978-70725234 NA NA NA NA NA chr12-462 70652610 70652927 169 - chr12:70652778-70652789 NA NA NA NA NA chr12-461 70518057 70518246 152 - chr12:70518098-70518217 NA NA NA NA NA chr12-56 7042362 7042892 272 - chr12:7042633-7042656 NA NA NA NA NA chr12-460 70381542 70382158 335 - chr12:70381713-70381817 NA NA NA NA NA chr12-55 7015046 7015200 140 - chr12:7015059-7015192 NA NA NA NA NA chr12-459 70122147 70122318 117 - chr12:70122225-70122312 NA NA NA NA NA chr12-458 69922496 69922697 169 - chr12:69922496-69922649 NA NA NA NA NA chr12-54 6978409 6978650 163 - chr12:6978475-6978548 NA NA NA NA NA chr12-457 69734187 69734361 160 - chr12:69734201-69734347 NA NA NA NA NA chr12-456 69621220 69621483 156 - chr12:69621327-69621376 NA NA NA NA NA chr12-455 68822255 68822424 113 - chr12:68822279-68822352 NA NA NA NA NA chr12-454 68174206 68174832 316 - chr12:68174532-68174554 NA NA NA NA NA chr12-453 68026936 68027157 165 - chr12:68026997-68027111 NA NA NA NA NA chr12-452 67986781 67986927 115 - chr12:67986796-67986849 NA NA NA NA NA chr12-451 67928573 67928916 219 - chr12:67928677-67928834 NA NA NA NA NA chr12-53 6787133 6787519 341 - chr12:6787136-6787445 NA NA NA NA NA chr12-450 67798652 67799065 199 - chr12:67798916-67798951 NA NA NA NA NA chr12-449 66779099 66779382 156 - chr12:66779231-66779265 NA NA NA NA NA chr12-52 6661687 6661891 113 - chr12:6661759-6661762 NA NA NA NA NA chr12-448 66466373 66466537 162 - chr12:66466373-66466534 NA NA NA NA NA chr12-447 66409572 66409766 146 - chr12:66409633-66409744 NA NA NA NA NA chr12-446 66236462 66236954 269 - chr12:66236629-66236703 NA NA NA NA NA chr12-445 66038211 66038474 144 - chr12:66038310-66038315 NA NA NA NA NA chr12-444 65954448 65954858 345 - chr12:65954517-65954801 NA NA NA NA NA chr12-443 65868927 65869112 112 - chr12:65868928-65869003 NA NA NA NA NA chr12-442 65807882 65808129 115 - chr12:65807972-65807976 NA NA NA NA NA chr12-441 65803052 65803394 216 - chr12:65803103-65803256 NA NA NA NA NA chr12-440 65560443 65560621 152 - chr12:65560468-65560593 NA NA NA NA NA chr12-439 65386206 65386484 150 - chr12:65386338-65386358 NA NA NA NA NA chr12-438 65306027 65306555 254 - chr12:65306390-65306414 NA NA NA NA NA chr12-437 65305496 65305799 155 - chr12:65305632-65305645 NA NA NA NA NA chr12-436 65283214 65283429 121 - chr12:65283294-65283328 NA NA NA NA NA chr12-435 65209419 65209669 151 - chr12:65209528-65209575 NA NA NA NA NA chr12-434 65050946 65051247 241 - chr12:65050963-65051101 NA NA NA NA NA chr12-433 64948039 64948212 153 - chr12:64948053-64948180 NA NA NA NA NA chr12-432 64731446 64731601 143 - chr12:64731460-64731593 NA NA NA NA NA chr12-431 64644966 64645671 289 - chr12:64645119-64645275 NA NA NA NA NA chr12-430 64411163 64411382 151 - chr12:64411228-64411308 NA NA NA NA NA chr12-429 64218784 64219188 229 - chr12:64219092-64219155 NA NA NA NA NA chr12-428 64216745 64217178 255 - chr12:64216873-64216900 NA NA NA NA NA chr12-51 6403765 6403958 145 - chr12:6403797-6403878 NA NA NA NA NA chr12-427 64004237 64004496 151 - chr12:64004343-64004384 NA NA NA NA NA chr12-426 63914590 63914814 130 - chr12:63914734-63914745 NA NA NA NA NA chr12-50 6330965 6331307 280 - chr12:6331124-6331280 NA NA NA NA NA chr12-425 63262400 63262554 134 - chr12:63262423-63262547 NA NA NA NA NA chr12-424 63158813 63159244 227 - chr12:63159098-63159202 NA NA NA NA NA chr12-423 62997116 62997458 208 - chr12:62997157-62997298 NA NA NA NA NA chr12-422 62912137 62912409 168 - chr12:62912184-62912191 NA NA NA NA NA chr12-49 6266896 6267190 184 - chr12:6267019-6267066 NA NA NA NA NA chr12-421 62597698 62597910 160 - chr12:62597749-62597856 NA NA NA NA NA chr12-420 62373977 62374222 131 - chr12:62374118-62374162 NA NA NA NA NA chr12-419 62267032 62267291 132 - chr12:62267127-62267148 NA NA NA NA NA chr12-418 62229827 62230062 151 - chr12:62229915-62229986 NA NA NA NA NA chr12-417 62005985 62006266 159 - chr12:62006162-62006254 NA NA NA NA NA chr12-416 61970653 61970977 236 - chr12:61970698-61970803 NA NA NA NA NA chr12-415 61829883 61830038 148 - chr12:61829888-61830027 NA NA NA NA NA chr12-414 61599547 61599936 225 - chr12:61599741-61599884 NA NA NA NA NA chr12-413 61039420 61039713 195 - chr12:61039567-61039713 NA NA NA NA NA chr12-412 60878520 60878821 167 - chr12:60878674-60878697 NA NA NA NA NA chr12-411 60598238 60598431 146 - chr12:60598295-60598389 NA NA NA NA NA chr12-410 60544015 60544320 209 - chr12:60544072-60544234 NA NA NA NA NA chr12-409 59675729 59675902 162 - chr12:59675736-59675883 NA NA NA NA NA chr12-408 59619667 59619824 116 - chr12:59619770-59619814 NA NA NA NA NA chr12-407 59581236 59581393 156 - chr12:59581237-59581392 NA NA NA NA NA chr12-406 59362091 59362509 206 - chr12:59362250-59362403 NA NA NA NA NA chr12-405 59076154 59076391 144 - chr12:59076277-59076313 NA NA NA NA NA chr12-48 5899561 5899793 203 - chr12:5899580-5899725 NA NA NA NA NA chr12-47 5891784 5892150 286 - chr12:5891843-5892089 NA NA NA NA NA chr12-404 58880695 58881192 292 - chr12:58880858-58880903 NA NA NA NA NA chr12-403 58743952 58744413 260 - chr12:58744105-58744116 NA NA NA NA NA chr12-46 5865379 5865568 144 - chr12:5865421-5865517 NA NA NA NA NA chr12-402 58630795 58631240 198 - chr12:58630872-58630908 NA NA NA NA NA chr12-401 58531841 58532210 176 - chr12:58531986-58531993 NA NA NA NA NA chr12-400 58481658 58481893 159 - chr12:58481735-58481819 NA NA NA NA NA chr12-399 58449694 58449981 151 - chr12:58449831-58449847 NA NA NA NA NA chr12-398 58366479 58366641 138 - chr12:58366499-58366625 NA NA NA NA NA chr12-397 58271133 58271370 154 - chr12:58271212-58271285 NA NA NA NA NA chr12-396 58243843 58244206 220 - chr12:58244007-58244161 NA NA NA NA NA chr12-395 57135310 57135490 164 - chr12:57135310-57135466 NA NA NA NA NA chr12-394 57105776 57106109 167 - chr12:57105942-57105943 NA NA NA NA NA chr12-393 56552070 56552342 163 - chr12:56552185-56552236 NA NA NA NA NA chr12-392 55909050 55909189 115 - chr12:55909054-55909125 NA NA NA NA NA chr12-391 55907116 55907356 155 - chr12:55907213-55907277 NA NA NA NA NA chr12-390 55670785 55671178 203 - chr12:55671008-55671054 NA NA NA NA NA chr12-389 55499396 55499599 149 - chr12:55499450-55499545 NA NA NA NA NA chr12-45 5538557 5539108 283 - chr12:5538780-5538918 NA NA NA NA NA chr12-388 55343212 55343583 225 - chr12:55343354-55343506 NA NA NA NA NA chr12-44 5529802 5529984 157 - chr12:5529824-5529953 NA NA NA NA NA chr12-387 55249469 55249713 172 - chr12:55249568-55249695 NA NA NA NA NA chr12-386 55051266 55051546 238 - chr12:55051320-55051474 NA NA NA NA NA chr12-385 54882686 54883126 245 - chr12:54882715-54882848 NA NA NA NA NA chr12-384 54720683 54720966 141 - chr12:54720851-54720876 NA NA NA NA NA chr12-383 54684813 54685240 195 - chr12:54684851-54684911 NA NA NA NA NA chr12-382 53704637 53704835 151 - chr12:53704689-53704801 NA NA NA NA NA chr12-381 53605976 53606183 181 - chr12:53605977-53606149 NA NA NA NA NA chr12-380 53576821 53577084 205 - chr12:53576853-53576974 NA NA NA NA NA chr12-379 53565644 53566107 232 - chr12:53565969-53566064 NA NA NA NA NA chr12-378 53518466 53518759 151 - chr12:53518606-53518613 NA NA NA NA NA chr12-43 5346710 5347202 378 - chr12:5347042-5347192 NA NA NA NA NA chr12-377 53428252 53428562 228 - chr12:53428256-53428441 NA NA NA NA NA chr12-376 53363879 53364250 216 - chr12:53364109-53364131 NA NA NA NA NA chr12-375 53201628 53201950 178 - chr12:53201690-53201765 NA NA NA NA NA chr12-374 53162550 53162731 136 - chr12:53162635-53162706 NA NA NA NA NA chr12-373 53096130 53096440 213 - chr12:53096316-53096352 NA NA NA NA NA chr12-372 52871377 52871596 194 - chr12:52871400-52871567 NA NA NA NA NA chr12-42 5264107 5264475 338 - chr12:5264169-5264461 NA NA NA NA NA chr12-41 5206571 5206866 169 - chr12:5206687-5206720 NA NA NA NA NA chr12-371 51791282 51791633 173 - chr12:51791466-51791467 NA NA NA NA NA chr12-40 5178967 5179303 201 - chr12:5179130-5179224 NA NA NA NA NA chr12-370 51758337 51759002 387 - chr12:51758468-51758562 NA NA NA NA NA chr12-39 5170688 5170906 157 - chr12:5170735-5170838 NA NA NA NA NA chr12-369 51635643 51635975 173 - chr12:51635793-51635798 NA NA NA NA NA chr12-368 51247330 51247619 152 - chr12:51247468-51247484 NA NA NA NA NA chr12-367 51145664 51145977 189 - chr12:51145773-51145823 NA NA NA NA NA chr12-366 51118843 51119076 148 - chr12:51118928-51118991 NA NA NA NA NA chr12-365 51116226 51116614 168 - chr12:51116290-51116316 NA NA NA NA NA chr12-364 50931354 50931672 213 - chr12:50931459-50931636 NA NA NA NA NA chr12-363 50685762 50686130 222 - chr12:50685863-50686012 NA NA NA NA NA chr12-362 50362797 50363134 227 - chr12:50362962-50363134 NA NA NA NA NA chr12-361 49769945 49770164 168 - chr12:49770004-49770129 NA NA NA NA NA chr12-360 49732385 49732721 175 - chr12:49732542-49732552 NA NA NA NA NA chr12-359 49479824 49480115 175 - chr12:49479933-49479985 NA NA NA NA NA chr12-358 49318398 49318704 161 - chr12:49318519-49318547 NA NA NA NA NA chr12-357 49292619 49293064 301 - chr12:49292641-49292676 NA NA NA NA NA chr12-356 48948690 48948916 196 - chr12:48948735-48948916 NA NA NA NA NA chr12-38 4891240 4891527 132 - chr12:4891330-4891357 NA NA NA NA NA chr12-355 48895511 48895821 165 - chr12:48895693-48895750 NA NA NA NA NA chr12-354 48883025 48883339 200 - chr12:48883051-48883181 NA NA NA NA NA chr12-353 48677190 48677420 170 - chr12:48677262-48677384 NA NA NA NA NA chr12-352 48591688 48592028 177 - chr12:48591857-48591868 NA NA NA NA NA chr12-351 48456285 48456530 158 - chr12:48456432-48456473 NA NA NA NA NA chr12-37 4839096 4839383 229 - chr12:4839132-4839281 NA NA NA NA NA chr12-350 48374910 48375190 164 - chr12:48375038-48375098 NA NA NA NA NA chr12-349 48301566 48301962 275 - chr12:48301665-48301830 NA NA NA NA NA chr12-348 48280551 48280848 242 - chr12:48280698-48280839 NA NA NA NA NA chr12-347 48163507 48163751 145 - chr12:48163606-48163652 NA NA NA NA NA chr12-346 48095048 48095243 186 - chr12:48095052-48095220 NA NA NA NA NA chr12-345 48091735 48092033 157 - chr12:48091869-48091878 NA NA NA NA NA chr12-344 47665435 47665698 167 - chr12:47665529-47665598 NA NA NA NA NA chr12-343 47636072 47636246 158 - chr12:47636090-47636240 NA NA NA NA NA chr12-36 4757408 4757597 153 - chr12:4757434-4757541 NA NA NA NA NA chr12-342 47166923 47167323 233 - chr12:47167094-47167164 NA NA NA NA NA chr12-341 47047071 47047392 191 - chr12:47047243-47047346 NA NA NA NA NA chr12-340 47020051 47020349 169 - chr12:47020144-47020202 NA NA NA NA NA chr12-339 47013930 47014355 241 - chr12:47014012-47014161 NA NA NA NA NA chr12-338 46977957 46978290 247 - chr12:46978057-46978132 NA NA NA NA NA chr12-337 46836606 46836763 126 - chr12:46836675-46836739 NA NA NA NA NA chr12-336 46786312 46786492 133 - chr12:46786360-46786413 NA NA NA NA NA chr12-35 4655265 4655460 146 - chr12:4655314-4655411 NA NA NA NA NA chr12-34 4616019 4616385 258 - chr12:4616142-4616293 NA NA NA NA NA chr12-335 46121861 46122122 158 - chr12:46121978-46122026 NA NA NA NA NA chr12-334 45840334 45840666 135 - chr12:45840393-45840400 NA NA NA NA NA chr12-333 45616613 45616857 200 - chr12:45616630-45616759 NA NA NA NA NA chr12-332 45539242 45539775 289 - chr12:45539442-45539609 NA NA NA NA NA chr12-331 45520761 45520914 125 - chr12:45520770-45520839 NA NA NA NA NA chr12-330 45498747 45498993 132 - chr12:45498895-45498896 NA NA NA NA NA chr12-329 45245454 45245630 150 - chr12:45245480-45245604 NA NA NA NA NA chr12-328 45037749 45037900 139 - chr12:45037750-45037883 NA NA NA NA NA chr12-327 44995779 44995926 114 - chr12:44995874-44995922 NA NA NA NA NA chr12-326 44877465 44877829 229 - chr12:44877702-44877745 NA NA NA NA NA chr12-325 44863992 44864196 156 - chr12:44864022-44864139 NA NA NA NA NA chr12-324 44735640 44735800 118 - chr12:44735706-44735740 NA NA NA NA NA chr12-323 44735020 44735265 146 - chr12:44735117-44735162 NA NA NA NA NA chr12-33 4465509 4465901 228 - chr12:4465750-4465891 NA NA NA NA NA chr12-322 44641169 44641576 215 - chr12:44641444-44641500 NA NA NA NA NA chr12-321 44612521 44612751 150 - chr12:44612587-44612664 NA NA NA NA NA chr12-320 44600284 44600562 214 - chr12:44600289-44600375 NA NA NA NA NA chr12-32 4442150 4442333 165 - chr12:4442157-4442313 NA NA NA NA NA chr12-31 4424525 4424723 164 - chr12:4424547-4424665 NA NA NA NA NA chr12-319 43763511 43763797 238 - chr12:43763540-43763682 NA NA NA NA NA chr12-318 43728412 43728678 175 - chr12:43728495-43728571 NA NA NA NA NA chr12-317 43627657 43628166 308 - chr12:43627765-43628046 NA NA NA NA NA chr12-316 43612725 43613105 232 - chr12:43612951-43612996 NA NA NA NA NA chr12-315 43477283 43477566 160 - chr12:43477410-43477451 NA NA NA NA NA chr12-30 4338693 4338938 160 - chr12:4338776-4338852 NA NA NA NA NA chr12-314 43370180 43370430 168 - chr12:43370230-43370332 NA NA NA NA NA chr12-313 43000943 43001110 160 - chr12:43000964-43001110 NA NA NA NA NA chr12-312 42843850 42844075 153 - chr12:42843922-42844003 NA NA NA NA NA chr12-311 42591076 42591259 120 - chr12:42591203-42591228 NA NA NA NA NA chr12-310 42380859 42381097 126 - chr12:42380981-42380990 NA NA NA NA NA chr12-309 42266425 42266588 141 - chr12:42266441-42266554 NA NA NA NA NA chr12-308 42108573 42108790 126 - chr12:42108635-42108641 NA NA NA NA NA chr12-29 4159331 4159580 149 - chr12:4159433-4159481 NA NA NA NA NA chr12-307 41575933 41576142 154 - chr12:41575986-41576086 NA NA NA NA NA chr12-306 41443950 41444195 162 - chr12:41444027-41444109 NA NA NA NA NA chr12-305 41414139 41414391 145 - chr12:41414244-41414280 NA NA NA NA NA chr12-304 41412707 41412919 192 - chr12:41412729-41412903 NA NA NA NA NA chr12-303 41147675 41148014 187 - chr12:41147857-41147877 NA NA NA NA NA chr12-302 41052874 41053214 185 - chr12:41052967-41053007 NA NA NA NA NA chr12-28 4094670 4094883 147 - chr12:4094741-4094827 NA NA NA NA NA chr12-301 40605562 40605969 242 - chr12:40605825-40605933 NA NA NA NA NA chr12-300 40558050 40558199 118 - chr12:40558142-40558198 NA NA NA NA NA chr12-299 40515726 40515932 154 - chr12:40515783-40515890 NA NA NA NA NA chr12-298 40271490 40271978 312 - chr12:40271603-40271759 NA NA NA NA NA chr12-297 40167685 40167874 147 - chr12:40167729-40167836 NA NA NA NA NA chr12-296 40096706 40097299 352 - chr12:40097004-40097172 NA NA NA NA NA chr12-295 39958175 39958742 349 - chr12:39958439-39958472 NA NA NA NA NA chr12-294 39894000 39894274 148 - chr12:39894005-39894074 NA NA NA NA NA chr12-293 39813291 39813525 143 - chr12:39813408-39813447 NA NA NA NA NA chr12-292 39769833 39770304 302 - chr12:39769886-39770077 NA NA NA NA NA chr12-291 39752206 39752393 121 - chr12:39752206-39752294 NA NA NA NA NA chr12-27 3973940 3974287 201 - chr12:3974020-3974108 NA NA NA NA NA chr12-290 39541898 39542130 151 - chr12:39541981-39542050 NA NA NA NA NA chr12-289 39398701 39399032 210 - chr12:39398872-39398936 NA NA NA NA NA chr12-288 39389736 39389969 158 - chr12:39389809-39389890 NA NA NA NA NA chr12-287 39345423 39345589 114 - chr12:39345549-39345574 NA NA NA NA NA chr12-286 39323570 39323745 165 - chr12:39323571-39323717 NA NA NA NA NA chr12-285 39323145 39323478 191 - chr12:39323274-39323310 NA NA NA NA NA chr12-284 39124450 39124720 148 - chr12:39124551-39124556 NA NA NA NA NA chr12-283 39044955 39045604 384 - chr12:39045106-39045111 NA NA NA NA NA chr12-282 38776675 38776982 215 - chr12:38776738-38776832 NA NA NA NA NA chr12-281 38753089 38753284 153 - chr12:38753152-38753284 NA NA NA NA NA chr12-280 38738272 38738491 135 - chr12:38738384-38738421 NA NA NA NA NA chr12-279 38733068 38733420 170 - chr12:38733200-38733213 NA NA NA NA NA chr12-278 38687183 38687347 153 - chr12:38687186-38687332 NA NA NA NA NA chr12-277 38683122 38683292 120 - chr12:38683226-38683269 NA NA NA NA NA chr12-276 38449988 38450256 228 - chr12:38450045-38450193 NA NA NA NA NA chr12-275 38420397 38420779 278 - chr12:38420509-38420735 NA NA NA NA NA chr12-274 38388106 38388317 134 - chr12:38388190-38388254 NA NA NA NA NA chr12-273 38368925 38369227 220 - chr12:38369029-38369189 NA NA NA NA NA chr12-272 38056658 38056846 153 - chr12:38056691-38056810 NA NA NA NA NA chr12-271 37793153 37793360 147 - chr12:37793214-37793302 NA NA NA NA NA chr12-26 3773254 3773655 255 - chr12:3773387-3773529 NA NA NA NA NA chr12-270 37295812 37296127 187 - chr12:37295850-37295954 NA NA NA NA NA chr12-25 3550018 3550374 214 - chr12:3550176-3550319 NA NA NA NA NA chr12-269 34631622 34631860 152 - chr12:34631717-34631792 NA NA NA NA NA chr12-268 34591953 34592181 145 - chr12:34592069-34592164 NA NA NA NA NA chr12-267 34553623 34553953 171 - chr12:34553748-34553777 NA NA NA NA NA chr12-266 34538961 34539258 186 - chr12:34539104-34539211 NA NA NA NA NA chr12-265 33914461 33914613 141 - chr12:33914476-33914595 NA NA NA NA NA chr12-24 3387408 3387611 179 - chr12:3387414-3387581 NA NA NA NA NA chr12-264 33527288 33527646 195 - chr12:33527430-33527441 NA NA NA NA NA chr12-263 33170724 33170899 157 - chr12:33170739-33170887 NA NA NA NA NA chr12-262 33068708 33068939 142 - chr12:33068797-33068850 NA NA NA NA NA chr12-261 32794808 32795166 189 - chr12:32794968-32794979 NA NA NA NA NA chr12-260 32644720 32645135 324 - chr12:32644957-32645099 NA NA NA NA NA chr12-259 32542597 32543003 316 - chr12:32542678-32542895 NA NA NA NA NA chr12-258 32519746 32519935 157 - chr12:32519790-32519909 NA NA NA NA NA chr12-257 32452208 32452439 147 - chr12:32452306-32452362 NA NA NA NA NA chr12-256 32367232 32367457 150 - chr12:32367312-32367378 NA NA NA NA NA chr12-2 323022 323181 149 - chr12:323023-323167 NA NA NA NA NA chr12-255 31998016 31998192 159 - chr12:31998033-31998175 NA NA NA NA NA chr12-254 31980554 31980718 138 - chr12:31980597-31980683 NA NA NA NA NA chr12-253 31961785 31961964 155 - chr12:31961821-31961964 NA NA NA NA NA chr12-252 31769390 31769605 140 - chr12:31769485-31769570 NA NA NA NA NA chr12-23 3165091 3165321 153 - chr12:3165158-3165239 NA NA NA NA NA chr12-251 31584868 31585055 164 - chr12:31584885-31585029 NA NA NA NA NA chr12-250 31439335 31439764 201 - chr12:31439467-31439488 NA NA NA NA NA chr12-249 31392707 31392967 149 - chr12:31392826-31392860 NA NA NA NA NA chr12-248 31362198 31362674 302 - chr12:31362504-31362566 NA NA NA NA NA chr12-247 30820986 30821457 272 - chr12:30821308-30821356 NA NA NA NA NA chr12-246 30808767 30809054 163 - chr12:30808873-30808917 NA NA NA NA NA chr12-245 30805473 30805808 254 - chr12:30805473-30805619 NA NA NA NA NA chr12-244 30740664 30740956 169 - chr12:30740853-30740866 NA NA NA NA NA chr12-243 30658278 30658550 146 - chr12:30658404-30658424 NA NA NA NA NA chr12-242 30556457 30556861 287 - chr12:30556511-30556618 NA NA NA NA NA chr12-241 30540402 30540626 152 - chr12:30540475-30540556 NA NA NA NA NA chr12-240 30220197 30220468 176 - chr12:30220280-30220349 NA NA NA NA NA chr12-239 30103612 30103834 174 - chr12:30103679-30103824 NA NA NA NA NA chr12-238 30090670 30090855 154 - chr12:30090689-30090818 NA NA NA NA NA chr12-237 29974327 29974473 145 - chr12:29974327-29974470 NA NA NA NA NA chr12-236 29893074 29893483 227 - chr12:29893321-29893357 NA NA NA NA NA chr12-235 29799324 29799659 153 - chr12:29799449-29799511 NA NA NA NA NA chr12-234 29775268 29775441 168 - chr12:29775277-29775435 NA NA NA NA NA chr12-22 2971855 2972492 407 - chr12:2972343-2972391 NA NA NA NA NA chr12-233 29713842 29714161 270 - chr12:29713986-29714158 NA NA NA NA NA chr12-232 29693447 29693656 191 - chr12:29693454-29693636 NA NA NA NA NA chr12-231 29451392 29451633 193 - chr12:29451426-29451595 NA NA NA NA NA chr12-230 29359651 29359878 155 - chr12:29359705-29359797 NA NA NA NA NA chr12-229 29306616 29306796 149 - chr12:29306667-29306775 NA NA NA NA NA chr12-228 28999087 28999267 118 - chr12:28999123-28999192 NA NA NA NA NA chr12-227 28579481 28579645 156 - chr12:28579489-28579641 NA NA NA NA NA chr12-226 28425843 28426240 245 - chr12:28425979-28426148 NA NA NA NA NA chr12-225 28421516 28421801 190 - chr12:28421599-28421682 NA NA NA NA NA chr12-224 28110595 28110890 246 - chr12:28110727-28110875 NA NA NA NA NA chr12-223 27887447 27887719 203 - chr12:27887632-27887697 NA NA NA NA NA chr12-222 27749949 27750190 140 - chr12:27750050-27750089 NA NA NA NA NA chr12-221 27425463 27425615 145 - chr12:27425472-27425612 NA NA NA NA NA chr12-220 27309585 27309853 184 - chr12:27309623-27309765 NA NA NA NA NA chr12-219 27284506 27284895 172 - chr12:27284511-27284572 NA NA NA NA NA chr12 272449 272951 272 - chr12:272754-272911 NA NA NA NA NA chr12-218 27153422 27153733 199 - chr12:27153469-27153491 NA NA NA NA NA chr12-21 2709328 2709508 133 - chr12:2709401-2709474 NA NA NA NA NA chr12-217 27037812 27038107 155 - chr12:27037948-27037959 NA NA NA NA NA chr12-216 26952326 26952571 189 - chr12:26952336-26952413 NA NA NA NA NA chr12-215 26929757 26930314 251 - chr12:26930034-26930113 NA NA NA NA NA chr12-214 26812598 26812989 311 - chr12:26812767-26812918 NA NA NA NA NA chr12-213 26458735 26458943 168 - chr12:26458789-26458910 NA NA NA NA NA chr12-20 2644890 2645049 133 - chr12:2644898-2644987 NA NA NA NA NA chr12-212 26420563 26421019 318 - chr12:26420885-26420973 NA NA NA NA NA chr12-211 26406944 26407286 214 - chr12:26407033-26407183 NA NA NA NA NA chr12-210 26264306 26264582 150 - chr12:26264434-26264457 NA NA NA NA NA chr12-19 2622138 2622396 155 - chr12:2622252-2622315 NA NA NA NA NA chr12-209 26181411 26181583 160 - chr12:26181424-26181573 NA NA NA NA NA chr12-208 26157419 26157593 150 - chr12:26157439-26157567 NA NA NA NA NA chr12-207 26058327 26058719 167 - chr12:26058629-26058648 NA NA NA NA NA chr12-206 26053423 26053731 170 - chr12:26053499-26053562 NA NA NA NA NA chr12-205 25767712 25768011 255 - chr12:25767720-25767887 NA NA NA NA NA chr12-204 25503826 25504013 163 - chr12:25503844-25503977 NA NA NA NA NA chr12-203 25451753 25452023 161 - chr12:25451846-25451906 NA NA NA NA NA chr12-202 25450675 25451191 352 - chr12:25450737-25450823 NA NA NA NA NA chr12-18 2527162 2527353 152 - chr12:2527261-2527344 NA NA NA NA NA chr12-201 25252772 25253015 171 - chr12:25252869-25252993 NA NA NA NA NA chr12-200 25223600 25223839 146 - chr12:25223691-25223745 NA NA NA NA NA chr12-199 25216922 25217103 137 - chr12:25216953-25217033 NA NA NA NA NA chr12-198 25192341 25192496 121 - chr12:25192372-25192425 NA NA NA NA NA chr12-197 25147441 25147679 167 - chr12:25147508-25147606 NA NA NA NA NA chr12-196 25070353 25070694 221 - chr12:25070545-25070610 NA NA NA NA NA chr12-195 25066498 25066956 342 - chr12:25066559-25066730 NA NA NA NA NA chr12-194 24950588 24951145 298 - chr12:24950632-24951087 NA NA NA NA NA chr12-193 24913744 24913992 176 - chr12:24913876-24913950 NA NA NA NA NA chr12-192 24859944 24860344 259 - chr12:24860137-24860307 NA NA NA NA NA chr12-191 24657125 24657581 283 - chr12:24657235-24657282 NA NA NA NA NA chr12-190 24449715 24450122 235 - chr12:24449801-24449950 NA NA NA NA NA chr12-189 24413641 24413999 218 - chr12:24413827-24413975 NA NA NA NA NA chr12-188 24341075 24341451 267 - chr12:24341123-24341220 NA NA NA NA NA chr12-187 24218798 24218979 143 - chr12:24218828-24218937 NA NA NA NA NA chr12-186 24122339 24122487 146 - chr12:24122341-24122486 NA NA NA NA NA chr12-185 24062265 24062585 226 - chr12:24062320-24062453 NA NA NA NA NA chr12-184 23929351 23929550 153 - chr12:23929399-23929508 NA NA NA NA NA chr12-17 2384444 2384807 198 - chr12:2384589-2384602 NA NA NA NA NA chr12-183 23782337 23782719 241 - chr12:23782568-23782623 NA NA NA NA NA chr12-182 23596656 23596900 165 - chr12:23596730-23596811 NA NA NA NA NA chr12-181 23262005 23262198 145 - chr12:23262057-23262152 NA NA NA NA NA chr12-180 22897952 22898098 128 - chr12:22897966-22898085 NA NA NA NA NA chr12-179 22869911 22870092 166 - chr12:22869924-22870076 NA NA NA NA NA chr12-178 22491971 22492123 117 - chr12:22492068-22492119 NA NA NA NA NA chr12-177 22469579 22469897 167 - chr12:22469700-22469731 NA NA NA NA NA chr12-176 22456278 22456511 165 - chr12:22456294-22456425 NA NA NA NA NA chr12-16 2243650 2243958 204 - chr12:2243684-2243836 NA NA NA NA NA chr12-175 22294797 22295121 254 - chr12:22294984-22295098 NA NA NA NA NA chr12-174 21782364 21782606 149 - chr12:21782461-21782521 NA NA NA NA NA chr12-173 21617383 21617548 147 - chr12:21617399-21617529 NA NA NA NA NA chr12-172 21473224 21473495 235 - chr12:21473320-21473489 NA NA NA NA NA chr12-171 21459792 21460071 177 - chr12:21459857-21459991 NA NA NA NA NA chr12-170 20971260 20971498 164 - chr12:20971348-20971431 NA NA NA NA NA chr12-15 2077810 2078048 137 - chr12:2077903-2077943 NA NA NA NA NA chr12-169 20577691 20578129 267 - chr12:20577781-20577844 NA NA NA NA NA chr12-168 20557982 20558155 164 - chr12:20557992-20558138 NA NA NA NA NA chr12-167 20528942 20529224 153 - chr12:20529078-20529109 NA NA NA NA NA chr12-166 20214843 20215133 204 - chr12:20215004-20215036 NA NA NA NA NA chr12-165 20118879 20119036 146 - chr12:20118908-20119032 NA NA NA NA NA chr12-164 19969967 19970183 177 - chr12:19970019-19970170 NA NA NA NA NA chr12-14 1994862 1995037 123 - chr12:1994934-1995025 NA NA NA NA NA chr12-163 19761925 19762174 184 - chr12:19761925-19761979 NA NA NA NA NA chr12-162 18855780 18855985 171 - chr12:18855798-18855943 NA NA NA NA NA chr12-161 18816009 18816271 152 - chr12:18816115-18816159 NA NA NA NA NA chr12-160 18691368 18691602 128 - chr12:18691508-18691513 NA NA NA NA NA chr12-159 18658399 18658608 128 - chr12:18658544-18658559 NA NA NA NA NA chr12-158 18615722 18615937 159 - chr12:18615842-18615889 NA NA NA NA NA chr12-157 18614224 18614409 113 - chr12:18614260-18614319 NA NA NA NA NA chr12-156 18612992 18613214 116 - chr12:18613114-18613140 NA NA NA NA NA chr12-155 18496260 18496509 156 - chr12:18496347-18496413 NA NA NA NA NA chr12-154 18290014 18290318 172 - chr12:18290016-18290122 NA NA NA NA NA chr12-153 18257396 18257669 193 - chr12:18257524-18257613 NA NA NA NA NA chr12-152 18230671 18231034 221 - chr12:18230686-18230836 NA NA NA NA NA chr12-151 17851426 17851784 192 - chr12:17851628-17851636 NA NA NA NA NA chr12-150 17785282 17785568 211 - chr12:17785371-17785432 NA NA NA NA NA chr12-149 17748785 17749040 169 - chr12:17748839-17748938 NA NA NA NA NA chr12-148 17716556 17716908 221 - chr12:17716735-17716873 NA NA NA NA NA chr12-13 1766645 1766964 164 - chr12:1766800-1766809 NA NA NA NA NA chr12-147 17546237 17546652 264 - chr12:17546412-17546513 NA NA NA NA NA chr12-146 17490169 17490493 230 - chr12:17490339-17490437 NA NA NA NA NA chr12-145 17460528 17460813 245 - chr12:17460533-17460698 NA NA NA NA NA chr12-144 17291825 17292111 146 - chr12:17291967-17291972 NA NA NA NA NA chr12-143 17038009 17038235 207 - chr12:17038028-17038197 NA NA NA NA NA chr12-142 16954862 16955076 149 - chr12:16954907-16955001 NA NA NA NA NA chr12-141 16695541 16695953 207 - chr12:16695767-16695790 NA NA NA NA NA chr12-140 15530755 15530966 131 - chr12:15530869-15530903 NA NA NA NA NA chr12-12 1546802 1546951 113 - chr12:1546886-1546939 NA NA NA NA NA chr12-139 15430138 15430413 139 - chr12:15430276-15430281 NA NA NA NA NA chr12-138 15362793 15362978 147 - chr12:15362849-15362949 NA NA NA NA NA chr12-137 15295631 15296150 290 - chr12:15295646-15295773 NA NA NA NA NA chr12-136 15154923 15155276 140 - chr12:15155065-15155124 NA NA NA NA NA chr12-11 1506593 1507001 324 - chr12:1506662-1506818 NA NA NA NA NA chr12-135 15023989 15024389 232 - chr12:15024157-15024221 NA NA NA NA NA chr12-134 14921069 14921382 219 - chr12:14921079-14921223 NA NA NA NA NA chr12-133 14794263 14794551 164 - chr12:14794355-14794411 NA NA NA NA NA chr12-132 14570205 14570702 280 - chr12:14570388-14570468 NA NA NA NA NA chr12-131 14459992 14460305 186 - chr12:14460076-14460092 NA NA NA NA NA chr12-130 14411894 14412078 154 - chr12:14411914-14412043 NA NA NA NA NA chr12-129 14264891 14265148 120 - chr12:14265054-14265063 NA NA NA NA NA chr12-10 1418234 1418526 166 - chr12:1418362-1418401 NA NA NA NA NA chr12-128 13897500 13897973 233 - chr12:13897580-13897653 NA NA NA NA NA chr12-9 1385707 1385892 140 - chr12:1385761-1385865 NA NA NA NA NA chr12-8 1382179 1382467 189 - chr12:1382319-1382450 NA NA NA NA NA chr12-127 13782215 13782498 203 - chr12:13782238-13782401 NA NA NA NA NA chr12-126 13760932 13761229 166 - chr12:13761075-13761104 NA NA NA NA NA chr12-125 13678642 13678922 170 - chr12:13678759-13678826 NA NA NA NA NA chr12-7 1365368 1365632 159 - chr12:1365480-1365541 NA NA NA NA NA chr12-6 1357399 1357698 238 - chr12:1357519-1357635 NA NA NA NA NA chr12-124 13546069 13546236 157 - chr12:13546080-13546232 NA NA NA NA NA chr12-123 13512314 13512521 158 - chr12:13512331-13512456 NA NA NA NA NA chr12-122 13389391 13389694 257 - chr12:13389394-13389628 NA NA NA NA NA chr12-121 13328242 13328917 377 - chr12:13328294-13328801 NA NA NA NA NA chr12-659 132689740 132689955 148 - chr12:132689799-132689884 NA NA NA NA NA chr12-658 132097637 132097804 143 - chr12:132097676-132097771 NA NA NA NA NA chr12-657 131869899 131870272 292 - chr12:131869950-131870176 NA NA NA NA NA chr12-656 131670811 131671070 136 - chr12:131670843-131670891 NA NA NA NA NA chr12-655 131609469 131609785 207 - chr12:131609624-131609628 NA NA NA NA NA chr12-654 131606163 131606533 223 - chr12:131606188-131606325 NA NA NA NA NA chr12-653 131538525 131538746 154 - chr12:131538598-131538691 NA NA NA NA NA chr12-652 130988600 130988756 117 - chr12:130988607-130988653 NA NA NA NA NA chr12-651 130938517 130938874 204 - chr12:130938624-130938698 NA NA NA NA NA chr12-120 13070948 13071131 119 - chr12:13070988-13071019 NA NA NA NA NA chr12-650 130593876 130594066 154 - chr12:130593919-130594055 NA NA NA NA NA chr12-649 130157220 130157512 210 - chr12:130157308-130157354 NA NA NA NA NA chr12-119 12996064 12996323 225 - chr12:12996093-12996250 NA NA NA NA NA chr12-648 129783667 129783986 205 - chr12:129783758-129783906 NA NA NA NA NA chr12-118 12956959 12957135 169 - chr12:12956963-12957118 NA NA NA NA NA chr12-117 12933640 12933865 150 - chr12:12933717-12933794 NA NA NA NA NA chr12-647 129298326 129298601 236 - chr12:129298330-129298488 NA NA NA NA NA chr12-646 128914969 128915195 153 - chr12:128915028-128915115 NA NA NA NA NA chr12-116 12890501 12890842 219 - chr12:12890545-12890681 NA NA NA NA NA chr12-645 128277964 128278255 155 - chr12:128278096-128278117 NA NA NA NA NA chr12-644 128208933 128209127 149 - chr12:128208977-128209080 NA NA NA NA NA chr12-115 12789693 12789945 165 - chr12:12789792-12789882 NA NA NA NA NA chr12-643 127873421 127873765 193 - chr12:127873622-127873714 NA NA NA NA NA chr12-114 12778316 12778498 142 - chr12:12778352-12778450 NA NA NA NA NA chr12-113 12727906 12728124 142 - chr12:12727988-12728051 NA NA NA NA NA chr12-642 127264929 127265202 137 - chr12:127265082-127265100 NA NA NA NA NA chr12-641 127215042 127215441 233 - chr12:127215074-127215208 NA NA NA NA NA chr12-640 127004209 127004479 178 - chr12:127004339-127004463 NA NA NA NA NA chr12-639 126956959 126957133 151 - chr12:126956986-126957112 NA NA NA NA NA chr12-638 126932969 126933326 225 - chr12:126933123-126933178 NA NA NA NA NA chr12-637 126880717 126881007 173 - chr12:126880851-126880924 NA NA NA NA NA chr12-636 126865690 126866075 191 - chr12:126865776-126865827 NA NA NA NA NA chr12-112 12686400 12686577 147 - chr12:12686438-12686563 NA NA NA NA NA chr12-635 126811194 126811359 163 - chr12:126811196-126811355 NA NA NA NA NA chr12-111 12652595 12652785 156 - chr12:12652623-12652748 NA NA NA NA NA chr12-634 126487799 126488063 169 - chr12:126487934-126487988 NA NA NA NA NA chr12-110 12646800 12647156 214 - chr12:12646888-12647031 NA NA NA NA NA chr12-109 12623774 12624150 203 - chr12:12623989-12624061 NA NA NA NA NA chr12-633 126079049 126079333 183 - chr12:126079170-126079201 NA NA NA NA NA chr12-632 125904576 125904877 251 - chr12:125904632-125904783 NA NA NA NA NA chr12-631 125794570 125795001 231 - chr12:125794852-125794965 NA NA NA NA NA chr12-630 125519428 125520148 364 - chr12:125519770-125519785 NA NA NA NA NA chr12-629 125363171 125363524 175 - chr12:125363307-125363325 NA NA NA NA NA chr12-108 12523310 12523539 151 - chr12:12523389-12523463 NA NA NA NA NA chr12-628 125142735 125143186 273 - chr12:125142848-125142878 NA NA NA NA NA chr12-627 124919943 124920339 194 - chr12:124920180-124920207 NA NA NA NA NA chr12-626 124817846 124818201 194 - chr12:124817923-124817998 NA NA NA NA NA chr12-625 124728682 124728860 112 - chr12:124728773-124728852 NA NA NA NA NA chr12-624 124596838 124597181 276 - chr12:124596850-124597004 NA NA NA NA NA chr12-623 124537353 124537893 279 - chr12:124537398-124537524 NA NA NA NA NA chr12-622 124233214 124233510 158 - chr12:124233348-124233364 NA NA NA NA NA chr12-107 12381049 12381660 360 - chr12:12381114-12381417 NA NA NA NA NA chr12-621 123730521 123730691 155 - chr12:123730540-123730684 NA NA NA NA NA chr12-620 123690822 123691150 269 - chr12:123690872-123691023 NA NA NA NA NA chr12-619 123304635 123304878 122 - chr12:123304726-123304742 NA NA NA NA NA chr12-106 12306748 12307058 138 - chr12:12306768-12306810 NA NA NA NA NA chr12-618 122639877 122640096 149 - chr12:122639949-122640030 NA NA NA NA NA chr12-617 122567802 122568129 260 - chr12:122567983-122568119 NA NA NA NA NA chr12-616 122379542 122379699 116 - chr12:122379551-122379642 NA NA NA NA NA chr12-615 122291540 122291935 244 - chr12:122291819-122291848 NA NA NA NA NA chr12-105 12223191 12223633 291 - chr12:12223474-12223548 NA NA NA NA NA chr12-614 121907385 121907523 122 - chr12:121907401-121907507 NA NA NA NA NA chr12-104 12178376 12178611 164 - chr12:12178458-12178562 NA NA NA NA NA chr12-613 121235385 121235660 197 - chr12:121235429-121235587 NA NA NA NA NA chr12-612 121164248 121164525 141 - chr12:121164342-121164368 NA NA NA NA NA chr12-611 120843948 120844170 127 - chr12:120844029-120844047 NA NA NA NA NA chr12-610 120393756 120393905 116 - chr12:120393837-120393887 NA NA NA NA NA chr12-103 12031730 12032109 197 - chr12:12031959-12032021 NA NA NA NA NA chr12-609 120124632 120125011 310 - chr12:120124827-120124999 NA NA NA NA NA chr12-608 120059986 120060246 168 - chr12:120060105-120060208 NA NA NA NA NA chr12-607 120030630 120030829 163 - chr12:120030660-120030805 NA NA NA NA NA chr12-606 119872536 119872769 164 - chr12:119872612-119872714 NA NA NA NA NA chr12-102 11985238 11985396 156 - chr12:11985244-11985396 NA NA NA NA NA chr12-101 11975707 11975930 166 - chr12:11975759-11975863 NA NA NA NA NA chr12-605 119632220 119632370 149 - chr12:119632221-119632368 NA NA NA NA NA chr12-604 119468768 119468940 149 - chr12:119468790-119468915 NA NA NA NA NA chr12-603 118810349 118810638 183 - chr12:118810389-118810519 NA NA NA NA NA chr12-100 11875225 11875376 133 - chr12:11875226-11875350 NA NA NA NA NA chr12-602 118704964 118705155 155 - chr12:118705007-118705133 NA NA NA NA NA chr12-601 118594087 118594249 150 - chr12:118594101-118594238 NA NA NA NA NA chr12-99 11851735 11851945 200 - chr12:11851736-11851917 NA NA NA NA NA chr12-98 11833647 11833974 162 - chr12:11833766-11833786 NA NA NA NA NA chr12-600 118190582 118191034 194 - chr12:118190940-118191005 NA NA NA NA NA chr12-599 118161845 118162029 163 - chr12:118161878-118162014 NA NA NA NA NA chr12-598 118016688 118016968 194 - chr12:118016743-118016894 NA NA NA NA NA chr12-597 117895083 117895356 153 - chr12:117895189-117895229 NA NA NA NA NA chr12-97 11770659 11771308 301 - chr12:11771154-11771254 NA NA NA NA NA chr12-596 117639984 117640175 143 - chr12:117640062-117640142 NA NA NA NA NA chr12-96 11735914 11736094 128 - chr12:11736034-11736076 NA NA NA NA NA chr12-595 117355756 117356207 263 - chr12:117356040-117356058 NA NA NA NA NA chr12-594 116493525 116493772 167 - chr12:116493605-116493692 NA NA NA NA NA chr12-593 116460532 116460707 166 - chr12:116460545-116460706 NA NA NA NA NA chr12-592 116046383 116046603 172 - chr12:116046415-116046563 NA NA NA NA NA chr12-591 116018180 116018350 144 - chr12:116018181-116018273 NA NA NA NA NA chr12-95 11598219 11598486 147 - chr12:11598335-11598364 NA NA NA NA NA chr12-590 115980689 115980981 159 - chr12:115980823-115980850 NA NA NA NA NA chr12-589 115968706 115969088 248 - chr12:115968804-115968936 NA NA NA NA NA chr12-588 115856063 115856250 167 - chr12:115856070-115856204 NA NA NA NA NA chr12-587 115848269 115848505 132 - chr12:115848357-115848393 NA NA NA NA NA chr12-586 115821512 115821740 142 - chr12:115821600-115821655 NA NA NA NA NA chr12-585 115790530 115791114 373 - chr12:115790628-115790677 NA NA NA NA NA chr12-94 11576293 11576480 156 - chr12:11576328-11576451 NA NA NA NA NA chr12-584 115130578 115130851 243 - chr12:115130613-115130841 NA NA NA NA NA chr12-93 11490342 11490542 132 - chr12:11490428-11490526 NA NA NA NA NA chr12-583 114654632 114654815 154 - chr12:114654663-114654787 NA NA NA NA NA chr12-582 114220504 114220704 153 - chr12:114220545-114220654 NA NA NA NA NA chr12-581 113909540 113909891 197 - chr12:113909737-113909823 NA NA NA NA NA chr12-580 113339743 113339960 194 - chr12:113339754-113339931 NA NA NA NA NA chr12-579 113298175 113298454 220 - chr12:113298298-113298427 NA NA NA NA NA chr12-578 112914812 112915070 145 - chr12:112914985-112914987 NA NA NA NA NA chr12-577 112436385 112436692 201 - chr12:112436414-112436562 NA NA NA NA NA chr12-576 112343218 112343399 153 - chr12:112343234-112343365 NA NA NA NA NA chr12-575 112272894 112273388 252 - chr12:112273000-112273078 NA NA NA NA NA chr12-574 112235386 112235775 208 - chr12:112235589-112235638 NA NA NA NA NA chr12-573 111980137 111980428 227 - chr12:111980225-111980324 NA NA NA NA NA chr12-572 111412537 111412724 156 - chr12:111412552-111412685 NA NA NA NA NA chr12-571 111282815 111283009 149 - chr12:111282858-111282917 NA NA NA NA NA chr12-570 111209892 111210119 153 - chr12:111209957-111210027 NA NA NA NA NA chr12-569 110917256 110917422 147 - chr12:110917290-110917399 NA NA NA NA NA chr12-568 110914650 110914876 159 - chr12:110914728-110914824 NA NA NA NA NA chr12-567 110239233 110239497 182 - chr12:110239304-110239393 NA NA NA NA NA chr12-566 110218099 110218344 207 - chr12:110218141-110218314 NA NA NA NA NA chr12-565 109490161 109490488 183 - chr12:109490330-109490394 NA NA NA NA NA chr12-564 108764022 108764202 150 - chr12:108764102-108764192 NA NA NA NA NA chr12-563 108637017 108637397 232 - chr12:108637163-108637321 NA NA NA NA NA chr12-562 108215743 108216245 330 - chr12:108215826-108215895 NA NA NA NA NA chr12-92 10760565 10760874 164 - chr12:10760704-10760726 NA NA NA NA NA chr12-561 107568836 107569058 183 - chr12:107568849-107568967 NA NA NA NA NA chr12-560 107364268 107364593 236 - chr12:107364309-107364474 NA NA NA NA NA chr12-91 10661563 10661852 155 - chr12:10661643-10661691 NA NA NA NA NA chr12-559 106439373 106439576 157 - chr12:106439430-106439552 NA NA NA NA NA chr12-558 106373303 106373452 143 - chr12:106373307-106373447 NA NA NA NA NA chr12-557 106194840 106195142 160 - chr12:106194989-106195014 NA NA NA NA NA chr12-90 10522162 10522367 151 - chr12:10522218-10522292 NA NA NA NA NA chr12-556 105124918 105125311 242 - chr12:105125151-105125201 NA NA NA NA NA chr12-89 10510525 10510675 123 - chr12:10510606-10510675 NA NA NA NA NA chr12-555 105002676 105002899 144 - chr12:105002749-105002817 NA NA NA NA NA chr12-554 104991945 104992101 142 - chr12:104991966-104992101 NA NA NA NA NA chr12-553 104823507 104823765 161 - chr12:104823607-104823674 NA NA NA NA NA chr12-552 104651925 104652277 230 - chr12:104651931-104652097 NA NA NA NA NA chr12-88 10401945 10402403 261 - chr12:10402126-10402198 NA NA NA NA NA chr12-87 10340954 10341349 280 - chr12:10341179-10341289 NA NA NA NA NA chr12-86 10316486 10316675 115 - chr12:10316536-10316614 NA NA NA NA NA chr12-551 102846089 102846333 159 - chr12:102846172-102846244 NA NA NA NA NA chr12-550 102835914 102836083 149 - chr12:102835942-102836067 NA NA NA NA NA chr12-85 10273042 10273212 165 - chr12:10273049-10273211 NA NA NA NA NA chr12-84 10225976 10226495 271 - chr12:10226282-10226429 NA NA NA NA NA chr12-549 102166066 102166526 199 - chr12:102166195-102166199 NA NA NA NA NA chr12-548 101990643 101990872 146 - chr12:101990736-101990794 NA NA NA NA NA chr12-83 10175847 10176108 151 - chr12:10175967-10176003 NA NA NA NA NA chr12-547 101714823 101715210 280 - chr12:101715041-101715202 NA NA NA NA NA chr12-546 101601313 101601849 230 - chr12:101601457-101601534 NA NA NA NA NA chr12-82 10118539 10118845 158 - chr12:10118686-10118695 NA NA NA NA NA chr12-81 10095327 10095576 155 - chr12:10095425-10095484 NA NA NA NA NA chr12-80 10086839 10087519 351 - chr12:10087082-10087380 NA NA NA NA NA chr12-545 100723895 100724065 156 - chr12:100723907-100724047 NA NA NA NA NA chr12-544 100687590 100687894 224 - chr12:100687658-100687808 NA NA NA NA NA chr12-79 10052818 10053078 190 - chr12:10052848-10053003 NA NA NA NA NA chr12-543 100508575 100508991 202 - chr12:100508773-100508868 NA NA NA NA NA chr12-78 10049279 10049826 232 - chr12:10049424-10049426 NA NA NA NA NA chr12-542 100374481 100374884 211 - chr12:100374735-100374816 NA NA NA NA NA chr12-541 100105461 100105836 217 - chr12:100105691-100105822 NA NA NA NA NA chr11-506 99924862 99925124 161 - chr11:99924963-99925023 NA NA NA NA NA chr11-505 99714347 99714791 211 - chr11:99714470-99714503 NA NA NA NA NA chr11-504 99629706 99629881 147 - chr11:99629733-99629851 NA NA NA NA NA chr11-503 99570997 99571421 266 - chr11:99571102-99571157 NA NA NA NA NA chr11-502 99510867 99511086 141 - chr11:99510933-99511002 NA NA NA NA NA chr11-501 99509797 99509980 150 - chr11:99509835-99509957 NA NA NA NA NA chr11-31 9920583 9920899 257 - chr11:9920606-9920745 NA NA NA NA NA chr11-30 9888471 9888734 151 - chr11:9888537-9888551 NA NA NA NA NA chr11-500 98812104 98812582 219 - chr11:98812425-98812447 NA NA NA NA NA chr11-499 98792657 98792866 131 - chr11:98792767-98792804 NA NA NA NA NA chr11-498 98597657 98597931 142 - chr11:98597796-98597813 NA NA NA NA NA chr11-497 98538632 98539103 241 - chr11:98538808-98538946 NA NA NA NA NA chr11-496 98482552 98482818 187 - chr11:98482669-98482734 NA NA NA NA NA chr11-495 98429530 98429749 142 - chr11:98429597-98429652 NA NA NA NA NA chr11-29 9830973 9831123 148 - chr11:9830973-9831120 NA NA NA NA NA chr11-494 98252386 98252754 236 - chr11:98252604-98252665 NA NA NA NA NA chr11-493 98026062 98026267 153 - chr11:98026119-98026225 NA NA NA NA NA chr11-492 97994860 97995230 292 - chr11:97994864-97995004 NA NA NA NA NA chr11-491 97942026 97942309 161 - chr11:97942076-97942176 NA NA NA NA NA chr11-490 97936794 97937072 173 - chr11:97936877-97936923 NA NA NA NA NA chr11-489 97708201 97708511 204 - chr11:97708201-97708352 NA NA NA NA NA chr11-488 97654165 97654542 208 - chr11:97654372-97654392 NA NA NA NA NA chr11-487 97592678 97592913 162 - chr11:97592749-97592839 NA NA NA NA NA chr11-486 97443501 97444144 286 - chr11:97443793-97443809 NA NA NA NA NA chr11-485 97433353 97433868 353 - chr11:97433415-97433506 NA NA NA NA NA chr11-484 97405479 97405711 142 - chr11:97405574-97405631 NA NA NA NA NA chr11-28 9725919 9726101 143 - chr11:9725957-9726060 NA NA NA NA NA chr11-483 97240550 97240858 158 - chr11:97240674-97240695 NA NA NA NA NA chr11-27 9722736 9722981 207 - chr11:9722739-9722873 NA NA NA NA NA chr11-482 97086011 97086269 186 - chr11:97086099-97086249 NA NA NA NA NA chr11-481 97015459 97016098 269 - chr11:97015965-97016000 NA NA NA NA NA chr11-480 96715234 96715640 325 - chr11:96715245-96715622 NA NA NA NA NA chr11-479 96594324 96594497 160 - chr11:96594342-96594494 NA NA NA NA NA chr11-478 96388722 96389190 223 - chr11:96389007-96389025 NA NA NA NA NA chr11-477 96191855 96192144 213 - chr11:96191900-96192006 NA NA NA NA NA chr11-476 96068964 96069257 242 - chr11:96069115-96069256 NA NA NA NA NA chr11-475 96027267 96027436 163 - chr11:96027269-96027429 NA NA NA NA NA chr11-474 95479679 95480183 246 - chr11:95479987-95480059 NA NA NA NA NA chr11-473 95399956 95400224 190 - chr11:95399964-95400115 NA NA NA NA NA chr11-472 94967710 94967911 162 - chr11:94967742-94967862 NA NA NA NA NA chr11-471 94770990 94771241 187 - chr11:94771040-94771149 NA NA NA NA NA chr11-470 94698434 94698634 133 - chr11:94698496-94698557 NA NA NA NA NA chr11-469 94603951 94604183 158 - chr11:94604023-94604108 NA NA NA NA NA chr11-468 94143174 94143395 175 - chr11:94143207-94143323 NA NA NA NA NA chr11-467 94117477 94117802 191 - chr11:94117667-94117696 NA NA NA NA NA chr11-466 93881808 93881962 150 - chr11:93881814-93881962 NA NA NA NA NA chr11-465 93747195 93747614 195 - chr11:93747462-93747476 NA NA NA NA NA chr11-464 93678126 93678353 173 - chr11:93678171-93678281 NA NA NA NA NA chr11-463 93369506 93369662 122 - chr11:93369600-93369654 NA NA NA NA NA chr11-26 9334185 9334326 140 - chr11:9334188-9334326 NA NA NA NA NA chr11-462 93134479 93134829 230 - chr11:93134553-93134686 NA NA NA NA NA chr11-461 93131750 93132606 452 - chr11:93132228-93132239 NA NA NA NA NA chr11-460 93068703 93068924 164 - chr11:93068862-93068918 NA NA NA NA NA chr11-459 93062744 93063083 212 - chr11:93062810-93062921 NA NA NA NA NA chr11-458 92988518 92988774 160 - chr11:92988688-92988722 NA NA NA NA NA chr11-25 9272286 9272507 151 - chr11:9272355-9272435 NA NA NA NA NA chr11-457 92703366 92703659 149 - chr11:92703407-92703484 NA NA NA NA NA chr11-456 92685386 92685742 190 - chr11:92685391-92685498 NA NA NA NA NA chr11-455 92600178 92600386 157 - chr11:92600238-92600353 NA NA NA NA NA chr11-454 92117710 92117926 155 - chr11:92117773-92117869 NA NA NA NA NA chr11-453 92056117 92056382 158 - chr11:92056246-92056286 NA NA NA NA NA chr11-452 91999065 91999226 127 - chr11:91999109-91999168 NA NA NA NA NA chr11-451 91973695 91973943 153 - chr11:91973812-91973859 NA NA NA NA NA chr11-450 91965527 91965892 307 - chr11:91965565-91965843 NA NA NA NA NA chr11-24 9196063 9196321 154 - chr11:9196161-9196214 NA NA NA NA NA chr11-449 91956608 91956763 120 - chr11:91956659-91956760 NA NA NA NA NA chr11-448 91678654 91678907 153 - chr11:91678768-91678814 NA NA NA NA NA chr11-447 91271148 91271375 151 - chr11:91271224-91271299 NA NA NA NA NA chr11-446 91161539 91161799 161 - chr11:91161650-91161724 NA NA NA NA NA chr11-445 90869386 90869762 202 - chr11:90869520-90869549 NA NA NA NA NA chr11-444 90795288 90795480 151 - chr11:90795321-90795435 NA NA NA NA NA chr11-443 90671961 90672394 204 - chr11:90672084-90672112 NA NA NA NA NA chr11-442 90505659 90505958 152 - chr11:90505784-90505800 NA NA NA NA NA chr11-441 90440073 90440517 362 - chr11:90440227-90440425 NA NA NA NA NA chr11-440 90237558 90237754 150 - chr11:90237602-90237707 NA NA NA NA NA chr11-439 89149774 89149935 151 - chr11:89149782-89149928 NA NA NA NA NA chr11-438 88548424 88548935 256 - chr11:88548625-88548713 NA NA NA NA NA chr11-437 88466385 88466572 124 - chr11:88466422-88466457 NA NA NA NA NA chr11-436 88423070 88423277 130 - chr11:88423105-88423179 NA NA NA NA NA chr11-435 88314164 88314523 221 - chr11:88314331-88314483 NA NA NA NA NA chr11-434 88199171 88199324 112 - chr11:88199232-88199323 NA NA NA NA NA chr11-433 88137442 88137760 157 - chr11:88137565-88137580 NA NA NA NA NA chr11-23 8786947 8787260 192 - chr11:8786984-8787097 NA NA NA NA NA chr11-22 8769823 8770135 174 - chr11:8769982-8770039 NA NA NA NA NA chr11-432 87610780 87610961 150 - chr11:87610806-87610920 NA NA NA NA NA chr11-431 87581164 87581453 185 - chr11:87581245-87581378 NA NA NA NA NA chr11-430 87220193 87220443 156 - chr11:87220247-87220329 NA NA NA NA NA chr11-429 87214545 87214772 155 - chr11:87214625-87214704 NA NA NA NA NA chr11-428 87206456 87206894 269 - chr11:87206521-87206678 NA NA NA NA NA chr11-427 86883653 86883984 162 - chr11:86883794-86883801 NA NA NA NA NA chr11-426 86617504 86617754 158 - chr11:86617601-86617627 NA NA NA NA NA chr11-425 86454243 86454691 287 - chr11:86454340-86454520 NA NA NA NA NA chr11-424 86204355 86204608 182 - chr11:86204460-86204585 NA NA NA NA NA chr11-423 86041772 86042069 253 - chr11:86041843-86042008 NA NA NA NA NA chr11-422 86041275 86041511 148 - chr11:86041357-86041420 NA NA NA NA NA chr11-421 85988913 85989120 157 - chr11:85988953-85989065 NA NA NA NA NA chr11-420 85657419 85657731 160 - chr11:85657592-85657621 NA NA NA NA NA chr11-419 85551047 85551386 194 - chr11:85551092-85551191 NA NA NA NA NA chr11-418 85530467 85530651 131 - chr11:85530531-85530620 NA NA NA NA NA chr11-417 85391961 85392218 213 - chr11:85391981-85392106 NA NA NA NA NA chr11-416 85342517 85342742 142 - chr11:85342582-85342650 NA NA NA NA NA chr11-21 8528607 8528785 161 - chr11:8528636-8528774 NA NA NA NA NA chr11-415 85235920 85236557 372 - chr11:85236295-85236305 NA NA NA NA NA chr11-414 85228224 85228423 164 - chr11:85228266-85228402 NA NA NA NA NA chr11-413 85109655 85109945 162 - chr11:85109799-85109825 NA NA NA NA NA chr11-412 85075127 85075503 237 - chr11:85075352-85075407 NA NA NA NA NA chr11-411 85047743 85048037 182 - chr11:85047877-85047936 NA NA NA NA NA chr11-410 85038945 85039099 114 - chr11:85038945-85039039 NA NA NA NA NA chr11-409 84692508 84692940 233 - chr11:84692637-84692662 NA NA NA NA NA chr11-408 84535310 84535506 164 - chr11:84535333-84535456 NA NA NA NA NA chr11-407 84390248 84390498 169 - chr11:84390335-84390420 NA NA NA NA NA chr11-406 84247289 84247648 208 - chr11:84247365-84247536 NA NA NA NA NA chr11-405 84237112 84237306 185 - chr11:84237138-84237305 NA NA NA NA NA chr11-404 84172724 84173063 264 - chr11:84172743-84172876 NA NA NA NA NA chr11-403 84116718 84117079 292 - chr11:84116914-84117068 NA NA NA NA NA chr11-402 83876203 83876415 138 - chr11:83876270-83876327 NA NA NA NA NA chr11-401 83707468 83707724 115 - chr11:83707645-83707655 NA NA NA NA NA chr11-20 8370637 8370946 256 - chr11:8370664-8370814 NA NA NA NA NA chr11-400 83622778 83623109 199 - chr11:83622962-83623003 NA NA NA NA NA chr11-399 83458768 83459082 139 - chr11:83458922-83458940 NA NA NA NA NA chr11-398 83178931 83179113 156 - chr11:83178967-83179092 NA NA NA NA NA chr11-397 82973398 82973600 154 - chr11:82973462-82973560 NA NA NA NA NA chr11-396 82888103 82888430 167 - chr11:82888245-82888332 NA NA NA NA NA chr11-395 82850107 82850693 314 - chr11:82850398-82850546 NA NA NA NA NA chr11-394 82656669 82656857 146 - chr11:82656669-82656731 NA NA NA NA NA chr11-393 82357000 82357271 151 - chr11:82357118-82357150 NA NA NA NA NA chr11-392 82354558 82355049 297 - chr11:82354607-82354707 NA NA NA NA NA chr11-391 82350257 82350492 163 - chr11:82350303-82350407 NA NA NA NA NA chr11-390 82223281 82223763 229 - chr11:82223341-82223363 NA NA NA NA NA chr11-389 82139527 82139873 190 - chr11:82139593-82139672 NA NA NA NA NA chr11-388 82083144 82083486 268 - chr11:82083188-82083352 NA NA NA NA NA chr11-387 82065195 82065384 135 - chr11:82065244-82065320 NA NA NA NA NA chr11-386 82062566 82062771 119 - chr11:82062632-82062675 NA NA NA NA NA chr11-385 81646330 81646560 144 - chr11:81646417-81646476 NA NA NA NA NA chr11-384 81559787 81560215 227 - chr11:81559860-81559950 NA NA NA NA NA chr11-383 81467453 81467818 244 - chr11:81467646-81467733 NA NA NA NA NA chr11-382 81305513 81305748 157 - chr11:81305593-81305671 NA NA NA NA NA chr11-381 81202875 81203203 158 - chr11:81203061-81203065 NA NA NA NA NA chr11-380 81145860 81146101 137 - chr11:81145862-81145946 NA NA NA NA NA chr11-379 81010841 81011107 150 - chr11:81010957-81010991 NA NA NA NA NA chr11-378 80859457 80859669 144 - chr11:80859539-80859608 NA NA NA NA NA chr11-377 80846565 80846843 160 - chr11:80846687-80846733 NA NA NA NA NA chr11-376 80732412 80732709 252 - chr11:80732457-80732619 NA NA NA NA NA chr11-375 80729671 80729947 275 - chr11:80729674-80729947 NA NA NA NA NA chr11-374 80436082 80436328 162 - chr11:80436169-80436250 NA NA NA NA NA chr11-373 80247620 80247771 141 - chr11:80247628-80247749 NA NA NA NA NA chr11-372 80226868 80227488 265 - chr11:80227320-80227363 NA NA NA NA NA chr11-371 80134740 80135005 191 - chr11:80134744-80134896 NA NA NA NA NA chr11-370 79343309 79343529 164 - chr11:79343393-79343529 NA NA NA NA NA chr11-369 79330604 79330889 160 - chr11:79330717-79330753 NA NA NA NA NA chr11-368 79003010 79003279 189 - chr11:79003111-79003260 NA NA NA NA NA chr11-367 78848680 78848880 182 - chr11:78848723-78848869 NA NA NA NA NA chr11-366 78520077 78520474 190 - chr11:78520314-78520327 NA NA NA NA NA chr11-365 78454055 78454223 158 - chr11:78454065-78454213 NA NA NA NA NA chr11-364 78343376 78343644 155 - chr11:78343487-78343527 NA NA NA NA NA chr11-363 78300034 78300389 222 - chr11:78300229-78300234 NA NA NA NA NA chr11-362 78218462 78218747 192 - chr11:78218559-78218662 NA NA NA NA NA chr11-361 78114191 78114369 118 - chr11:78114220-78114247 NA NA NA NA NA chr11-360 77631218 77631431 115 - chr11:77631278-77631314 NA NA NA NA NA chr11-359 76420969 76421439 212 - chr11:76421123-76421129 NA NA NA NA NA chr11-358 76384655 76384899 161 - chr11:76384744-76384828 NA NA NA NA NA chr11-357 76379405 76379594 167 - chr11:76379409-76379563 NA NA NA NA NA chr11-356 76307947 76308160 198 - chr11:76307974-76308142 NA NA NA NA NA chr11-355 75986782 75987110 158 - chr11:75986971-75986978 NA NA NA NA NA chr11-354 75903551 75903827 176 - chr11:75903642-75903709 NA NA NA NA NA chr11-353 75761979 75762353 237 - chr11:75762155-75762294 NA NA NA NA NA chr11-352 75624264 75624659 313 - chr11:75624266-75624417 NA NA NA NA NA chr11-351 75513727 75513904 152 - chr11:75513747-75513869 NA NA NA NA NA chr11-350 75104215 75104421 157 - chr11:75104222-75104288 NA NA NA NA NA chr11-349 75052898 75053442 248 - chr11:75053159-75053193 NA NA NA NA NA chr11-348 75033392 75033758 203 - chr11:75033445-75033540 NA NA NA NA NA chr11-347 74897331 74897689 183 - chr11:74897515-74897532 NA NA NA NA NA chr11-346 74631200 74631372 139 - chr11:74631277-74631361 NA NA NA NA NA chr11-345 74561324 74561485 159 - chr11:74561327-74561485 NA NA NA NA NA chr11-344 74411167 74411607 218 - chr11:74411216-74411323 NA NA NA NA NA chr11-343 74395633 74395993 191 - chr11:74395846-74395912 NA NA NA NA NA chr11-342 74308125 74308303 170 - chr11:74308139-74308298 NA NA NA NA NA chr11-341 74280661 74280824 159 - chr11:74280671-74280823 NA NA NA NA NA chr11-340 74226984 74227313 160 - chr11:74227041-74227088 NA NA NA NA NA chr11-339 73933028 73933235 161 - chr11:73933068-73933177 NA NA NA NA NA chr11-338 73905907 73906187 163 - chr11:73906026-73906071 NA NA NA NA NA chr11-337 73829417 73829736 207 - chr11:73829571-73829722 NA NA NA NA NA chr11-336 73809566 73809716 149 - chr11:73809567-73809715 NA NA NA NA NA chr11-335 73806555 73806770 171 - chr11:73806559-73806706 NA NA NA NA NA chr11-334 73728489 73728935 223 - chr11:73728566-73728639 NA NA NA NA NA chr11-333 73517611 73517829 178 - chr11:73517641-73517769 NA NA NA NA NA chr11-332 73138064 73138456 184 - chr11:73138308-73138320 NA NA NA NA NA chr11-331 72700513 72700747 138 - chr11:72700625-72700659 NA NA NA NA NA chr11-330 72690141 72690433 192 - chr11:72690141-72690283 NA NA NA NA NA chr11-329 72618997 72619452 307 - chr11:72619094-72619367 NA NA NA NA NA chr11-328 72603370 72603618 175 - chr11:72603459-72603577 NA NA NA NA NA chr11-327 72504205 72504628 218 - chr11:72504504-72504611 NA NA NA NA NA chr11-326 72443541 72443710 114 - chr11:72443560-72443637 NA NA NA NA NA chr11-325 72417908 72418096 138 - chr11:72417969-72418068 NA NA NA NA NA chr11-324 72302148 72302422 143 - chr11:72302267-72302285 NA NA NA NA NA chr11-323 71063550 71063808 190 - chr11:71063560-71063711 NA NA NA NA NA chr11-322 70917767 70917970 157 - chr11:70917789-70917912 NA NA NA NA NA chr11-321 70625449 70625903 274 - chr11:70625707-70625762 NA NA NA NA NA chr11-19 7062084 7062247 158 - chr11:7062090-7062238 NA NA NA NA NA chr11-320 70515443 70515835 216 - chr11:70515519-70515609 NA NA NA NA NA chr11-319 70257016 70257248 160 - chr11:70257084-70257168 NA NA NA NA NA chr11-318 69589135 69589463 246 - chr11:69589290-69589372 NA NA NA NA NA chr11-317 68910837 68911169 169 - chr11:68911000-68911006 NA NA NA NA NA chr11-316 68821428 68821835 208 - chr11:68821549-68821597 NA NA NA NA NA chr11-315 68727083 68727645 340 - chr11:68727239-68727249 NA NA NA NA NA chr11-314 68669207 68669655 279 - chr11:68669380-68669417 NA NA NA NA NA chr11-313 68399747 68400000 151 - chr11:68399845-68399896 NA NA NA NA NA chr11-312 68333025 68333269 177 - chr11:68333111-68333240 NA NA NA NA NA chr11-18 6786089 6786386 151 - chr11:6786237-6786241 NA NA NA NA NA chr11-311 66520959 66521258 189 - chr11:66520982-66521116 NA NA NA NA NA chr11-310 66482745 66482998 174 - chr11:66482817-66482905 NA NA NA NA NA chr11-309 66400436 66400645 147 - chr11:66400508-66400588 NA NA NA NA NA chr11-308 66222334 66222591 180 - chr11:66222435-66222526 NA NA NA NA NA chr11-307 66216535 66216863 172 - chr11:66216645-66216684 NA NA NA NA NA chr11-306 66198871 66199066 173 - chr11:66198919-66199057 NA NA NA NA NA chr11-305 66173916 66174236 256 - chr11:66173930-66174072 NA NA NA NA NA chr11-304 65951611 65951827 128 - chr11:65951689-65951719 NA NA NA NA NA chr11-303 65737641 65737884 169 - chr11:65737705-65737790 NA NA NA NA NA chr11-302 65194602 65194747 133 - chr11:65194606-65194731 NA NA NA NA NA chr11-301 64364169 64364671 271 - chr11:64364377-64364394 NA NA NA NA NA chr11-17 6388219 6388662 246 - chr11:6388368-6388489 NA NA NA NA NA chr11-16 6378036 6378410 221 - chr11:6378251-6378288 NA NA NA NA NA chr11-300 63713762 63714090 236 - chr11:63713807-63713904 NA NA NA NA NA chr11-299 63658647 63658963 170 - chr11:63658858-63658955 NA NA NA NA NA chr11-15 6360280 6360521 167 - chr11:6360349-6360437 NA NA NA NA NA chr11-298 63268039 63268347 307 - chr11:63268040-63268345 NA NA NA NA NA chr11-297 63217347 63217709 189 - chr11:63217505-63217506 NA NA NA NA NA chr11-296 63130694 63130985 192 - chr11:63130775-63130877 NA NA NA NA NA chr11-295 63101199 63101606 206 - chr11:63101348-63101361 NA NA NA NA NA chr11-294 62778560 62778910 159 - chr11:62778811-62778839 NA NA NA NA NA chr11-293 62251086 62251264 120 - chr11:62251112-62251142 NA NA NA NA NA chr11-292 61850825 61851023 162 - chr11:61850848-61850992 NA NA NA NA NA chr11-291 61623706 61624056 253 - chr11:61623747-61623847 NA NA NA NA NA chr11-290 60990776 60990983 162 - chr11:60990827-60990950 NA NA NA NA NA chr11-289 60638585 60639116 259 - chr11:60638824-60638899 NA NA NA NA NA chr11-14 6059450 6059807 203 - chr11:6059570-6059636 NA NA NA NA NA chr11-13 6015061 6015235 155 - chr11:6015077-6015210 NA NA NA NA NA chr11-288 59579295 59579427 116 - chr11:59579303-59579411 NA NA NA NA NA chr11-287 59335844 59336179 253 - chr11:59336036-59336152 NA NA NA NA NA chr11-286 59329005 59329200 154 - chr11:59329034-59329153 NA NA NA NA NA chr11-285 59022942 59023293 279 - chr11:59023134-59023281 NA NA NA NA NA chr11-284 58895512 58895783 155 - chr11:58895632-58895675 NA NA NA NA NA chr11-12 5873070 5873419 285 - chr11:5873251-5873408 NA NA NA NA NA chr11-283 58538971 58539383 222 - chr11:58539051-58539138 NA NA NA NA NA chr11-11 5849889 5850163 142 - chr11:5850045-5850079 NA NA NA NA NA chr11-282 58433060 58433306 119 - chr11:58433202-58433209 NA NA NA NA NA chr11-281 58373268 58373600 235 - chr11:58373344-58373461 NA NA NA NA NA chr11-280 58059839 58060072 212 - chr11:58059854-58060024 NA NA NA NA NA chr11-279 57924116 57924359 136 - chr11:57924207-57924244 NA NA NA NA NA chr11-278 57780717 57780903 146 - chr11:57780749-57780856 NA NA NA NA NA chr11-277 57562897 57563215 163 - chr11:57563052-57563060 NA NA NA NA NA chr11-276 57516859 57516998 116 - chr11:57516859-57516929 NA NA NA NA NA chr11-275 57304430 57304613 176 - chr11:57304447-57304611 NA NA NA NA NA chr11-274 57273056 57273572 290 - chr11:57273280-57273345 NA NA NA NA NA chr11-273 56878486 56878790 186 - chr11:56878528-56878634 NA NA NA NA NA chr11-272 56514922 56515572 316 - chr11:56515252-56515265 NA NA NA NA NA chr11-10 5639869 5640119 130 - chr11:5639985-5639997 NA NA NA NA NA chr11-271 56140351 56140519 114 - chr11:56140384-56140423 NA NA NA NA NA chr11-270 55739733 55740292 244 - chr11:55739889-55739898 NA NA NA NA NA chr11-9 5566766 5567069 196 - chr11:5566915-5566983 NA NA NA NA NA chr11-269 55560648 55560882 173 - chr11:55560715-55560824 NA NA NA NA NA chr11-8 5544223 5544476 142 - chr11:5544337-5544371 NA NA NA NA NA chr11-268 55250043 55250320 160 - chr11:55250152-55250199 NA NA NA NA NA chr11-267 55113458 55113758 178 - chr11:55113490-55113607 NA NA NA NA NA chr11-266 54919765 54919964 177 - chr11:54919789-54919946 NA NA NA NA NA chr11-7 5178313 5178630 181 - chr11:5178476-5178548 NA NA NA NA NA chr11-6 5136210 5136659 254 - chr11:5136352-5136358 NA NA NA NA NA chr11-5 5103762 5104012 149 - chr11:5103855-5103912 NA NA NA NA NA chr11-265 50518343 50518677 238 - chr11:50518367-50518557 NA NA NA NA NA chr11-264 50502296 50502469 165 - chr11:50502304-50502453 NA NA NA NA NA chr11-263 50497210 50497520 237 - chr11:50497329-50497470 NA NA NA NA NA chr11-4 4980863 4981110 213 - chr11:4980871-4981016 NA NA NA NA NA chr11-262 48184801 48185154 216 - chr11:48184984-48185040 NA NA NA NA NA chr11-261 47490852 47491210 221 - chr11:47491044-47491094 NA NA NA NA NA chr11-260 47310759 47311128 223 - chr11:47310868-47310908 NA NA NA NA NA chr11-259 47240909 47241149 137 - chr11:47241042-47241061 NA NA NA NA NA chr11-258 47094569 47094805 174 - chr11:47094653-47094787 NA NA NA NA NA chr11-257 46980253 46980580 190 - chr11:46980377-46980417 NA NA NA NA NA chr11-256 46818144 46818448 215 - chr11:46818268-46818429 NA NA NA NA NA chr11-255 46490469 46490648 122 - chr11:46490532-46490603 NA NA NA NA NA chr11-254 46393395 46393706 157 - chr11:46393552-46393558 NA NA NA NA NA chr11-253 46074349 46074902 289 - chr11:46074425-46074582 NA NA NA NA NA chr11-252 46063155 46063370 157 - chr11:46063217-46063314 NA NA NA NA NA chr11-251 45800272 45800612 246 - chr11:45800464-45800567 NA NA NA NA NA chr11-250 45493677 45494101 271 - chr11:45493942-45494004 NA NA NA NA NA chr11-249 45451652 45451841 130 - chr11:45451697-45451754 NA NA NA NA NA chr11-248 45312270 45312647 181 - chr11:45312555-45312629 NA NA NA NA NA chr11-247 45167909 45168197 164 - chr11:45168015-45168064 NA NA NA NA NA chr11-246 45029213 45029396 166 - chr11:45029228-45029375 NA NA NA NA NA chr11-245 44739690 44740006 183 - chr11:44739815-44739869 NA NA NA NA NA chr11-244 44736102 44736309 151 - chr11:44736158-44736253 NA NA NA NA NA chr11-243 44677012 44677184 154 - chr11:44677029-44677164 NA NA NA NA NA chr11-242 44576699 44576957 166 - chr11:44576786-44576855 NA NA NA NA NA chr11-241 44431151 44431547 201 - chr11:44431415-44431461 NA NA NA NA NA chr11-240 44287907 44288050 138 - chr11:44287914-44288049 NA NA NA NA NA chr11-239 44131170 44131396 160 - chr11:44131247-44131352 NA NA NA NA NA chr11-3 4391356 4391842 270 - chr11:4391650-4391665 NA NA NA NA NA chr11-238 43844918 43845472 280 - chr11:43845191-43845334 NA NA NA NA NA chr11-237 43676944 43677263 307 - chr11:43676956-43677257 NA NA NA NA NA chr11-236 43392602 43392863 159 - chr11:43392728-43392809 NA NA NA NA NA chr11-235 43253092 43253284 122 - chr11:43253151-43253238 NA NA NA NA NA chr11-234 43122753 43122933 171 - chr11:43122778-43122931 NA NA NA NA NA chr11-233 42463098 42463384 174 - chr11:42463227-42463306 NA NA NA NA NA chr11-232 42171236 42171413 157 - chr11:42171278-42171404 NA NA NA NA NA chr11-231 42073109 42073278 146 - chr11:42073137-42073265 NA NA NA NA NA chr11-230 42035461 42035790 211 - chr11:42035625-42035777 NA NA NA NA NA chr11-229 41856624 41856888 154 - chr11:41856735-41856780 NA NA NA NA NA chr11-228 41524088 41524363 139 - chr11:41524228-41524235 NA NA NA NA NA chr11-227 41417941 41418103 154 - chr11:41417943-41418092 NA NA NA NA NA chr11-226 41416443 41416693 162 - chr11:41416503-41416633 NA NA NA NA NA chr11-225 41365438 41365593 133 - chr11:41365451-41365573 NA NA NA NA NA chr11-224 41258420 41258568 130 - chr11:41258472-41258567 NA NA NA NA NA chr11-223 41110694 41110974 150 - chr11:41110802-41110833 NA NA NA NA NA chr11-222 41016205 41016595 270 - chr11:41016267-41016553 NA NA NA NA NA chr11-221 41004061 41004334 135 - chr11:41004155-41004174 NA NA NA NA NA chr11-220 40950647 40950859 158 - chr11:40950693-40950789 NA NA NA NA NA chr11-219 40781637 40781837 117 - chr11:40781745-40781804 NA NA NA NA NA chr11-218 40696376 40696533 135 - chr11:40696398-40696511 NA NA NA NA NA chr11-217 40651570 40651751 163 - chr11:40651571-40651725 NA NA NA NA NA chr11-216 40316141 40316431 198 - chr11:40316279-40316431 NA NA NA NA NA chr11-215 40313255 40313489 113 - chr11:40313298-40313308 NA NA NA NA NA chr11-214 40246156 40246457 192 - chr11:40246302-40246422 NA NA NA NA NA chr11-213 40167519 40167701 170 - chr11:40167540-40167686 NA NA NA NA NA chr11-212 39977267 39977464 148 - chr11:39977318-39977416 NA NA NA NA NA chr11-211 39925231 39925518 193 - chr11:39925349-39925495 NA NA NA NA NA chr11-210 39486673 39486866 154 - chr11:39486711-39486825 NA NA NA NA NA chr11-209 39188011 39188341 191 - chr11:39188094-39188174 NA NA NA NA NA chr11-208 39167452 39167642 121 - chr11:39167536-39167603 NA NA NA NA NA chr11-207 39025816 39026149 173 - chr11:39025966-39025969 NA NA NA NA NA chr11-206 38893740 38894239 250 - chr11:38893859-38893925 NA NA NA NA NA chr11-205 38293738 38293975 152 - chr11:38293825-38293891 NA NA NA NA NA chr11-204 38090568 38090724 153 - chr11:38090577-38090724 NA NA NA NA NA chr11-203 37954281 37954630 197 - chr11:37954413-37954548 NA NA NA NA NA chr11-202 37898531 37899053 235 - chr11:37898690-37898695 NA NA NA NA NA chr11-201 37670045 37670329 176 - chr11:37670175-37670297 NA NA NA NA NA chr11-200 37598026 37598266 166 - chr11:37598091-37598174 NA NA NA NA NA chr11-199 37363857 37364262 187 - chr11:37364157-37364191 NA NA NA NA NA chr11-198 37265741 37265913 153 - chr11:37265757-37265888 NA NA NA NA NA chr11-197 37256686 37256899 154 - chr11:37256745-37256840 NA NA NA NA NA chr11-2 3710969 3711236 151 - chr11:3711089-3711122 NA NA NA NA NA chr11-196 37012307 37012674 217 - chr11:37012341-37012492 NA NA NA NA NA chr11-195 36847769 36848044 168 - chr11:36847875-36847935 NA NA NA NA NA chr11-194 36811959 36812235 163 - chr11:36812092-36812132 NA NA NA NA NA chr11-193 36751703 36751858 154 - chr11:36751704-36751856 NA NA NA NA NA chr11-192 36689870 36690131 222 - chr11:36689871-36690015 NA NA NA NA NA chr11-191 36650179 36650688 255 - chr11:36650232-36650322 NA NA NA NA NA chr11 364965 365355 270 - chr11:365149-365267 NA NA NA NA NA chr11-190 36332465 36332617 140 - chr11:36332469-36332601 NA NA NA NA NA chr11-189 36085181 36085471 167 - chr11:36085290-36085320 NA NA NA NA NA chr11-188 36053547 36053869 210 - chr11:36053605-36053759 NA NA NA NA NA chr11-187 35968301 35968726 247 - chr11:35968529-35968687 NA NA NA NA NA chr11-186 35881516 35881761 136 - chr11:35881609-35881644 NA NA NA NA NA chr11-185 35879159 35879541 207 - chr11:35879290-35879316 NA NA NA NA NA chr11-184 35674317 35674614 200 - chr11:35674461-35674611 NA NA NA NA NA chr11-183 35476196 35476621 315 - chr11:35476223-35476345 NA NA NA NA NA chr11-182 35402133 35402306 161 - chr11:35402138-35402293 NA NA NA NA NA chr11-181 35116970 35117228 125 - chr11:35117131-35117151 NA NA NA NA NA chr11-180 35040794 35041054 142 - chr11:35040903-35040918 NA NA NA NA NA chr11-179 34928626 34929223 342 - chr11:34928926-34928977 NA NA NA NA NA chr11-178 34909152 34909458 160 - chr11:34909293-34909302 NA NA NA NA NA chr11-177 34805723 34805899 151 - chr11:34805757-34805892 NA NA NA NA NA chr11-176 34581848 34582232 154 - chr11:34581930-34581969 NA NA NA NA NA chr11-175 34297055 34297228 141 - chr11:34297077-34297191 NA NA NA NA NA chr11-174 33902882 33903086 149 - chr11:33902937-33903031 NA NA NA NA NA chr11-173 33866049 33866260 133 - chr11:33866161-33866199 NA NA NA NA NA chr11-172 33771987 33772385 192 - chr11:33772099-33772132 NA NA NA NA NA chr11-171 33615600 33615777 141 - chr11:33615645-33615759 NA NA NA NA NA chr11-170 33425048 33425385 203 - chr11:33425074-33425197 NA NA NA NA NA chr11-169 33358478 33358759 155 - chr11:33358605-33358635 NA NA NA NA NA chr11-168 33290303 33290553 148 - chr11:33290308-33290405 NA NA NA NA NA chr11-167 32955872 32956153 170 - chr11:32956026-32956063 NA NA NA NA NA chr11-166 32954011 32954582 401 - chr11:32954228-32954511 NA NA NA NA NA chr11-165 32928217 32928608 249 - chr11:32928441-32928507 NA NA NA NA NA chr11-164 32567198 32567580 198 - chr11:32567318-32567364 NA NA NA NA NA chr11-163 32532667 32532952 160 - chr11:32532770-32532816 NA NA NA NA NA chr11-162 32475305 32475685 202 - chr11:32475482-32475595 NA NA NA NA NA chr11-161 32349602 32349957 298 - chr11:32349626-32349810 NA NA NA NA NA chr11-160 32293722 32293881 143 - chr11:32293746-32293869 NA NA NA NA NA chr11-159 32193137 32193380 128 - chr11:32193247-32193255 NA NA NA NA NA chr11-158 31968866 31969126 232 - chr11:31968939-31969115 NA NA NA NA NA chr11-157 31776434 31776605 147 - chr11:31776458-31776581 NA NA NA NA NA chr11-156 31605610 31605774 138 - chr11:31605647-31605772 NA NA NA NA NA chr11-155 31204037 31204187 143 - chr11:31204047-31204186 NA NA NA NA NA chr11-154 30825200 30825553 214 - chr11:30825400-30825536 NA NA NA NA NA chr11-153 30611730 30611982 154 - chr11:30611810-30611875 NA NA NA NA NA chr11-152 30399726 30399928 125 - chr11:30399825-30399895 NA NA NA NA NA chr11-151 29670853 29671320 304 - chr11:29671162-29671230 NA NA NA NA NA chr11-150 29588294 29588741 309 - chr11:29588592-29588683 NA NA NA NA NA chr11-149 29401669 29401879 135 - chr11:29401778-29401821 NA NA NA NA NA chr11-148 29346108 29346368 155 - chr11:29346218-29346245 NA NA NA NA NA chr11-147 29344988 29345280 146 - chr11:29345029-29345102 NA NA NA NA NA chr11-146 28871001 28871571 255 - chr11:28871146-28871171 NA NA NA NA NA chr11-145 28806933 28807083 117 - chr11:28806956-28807030 NA NA NA NA NA chr11-144 28591501 28591724 130 - chr11:28591604-28591636 NA NA NA NA NA chr11-143 28556221 28556423 131 - chr11:28556276-28556344 NA NA NA NA NA chr11-142 28509269 28509510 216 - chr11:28509288-28509454 NA NA NA NA NA chr11-141 28215296 28215528 145 - chr11:28215362-28215399 NA NA NA NA NA chr11-140 28072095 28072449 209 - chr11:28072279-28072382 NA NA NA NA NA chr11-139 27766801 27767112 240 - chr11:27766831-27766959 NA NA NA NA NA chr11-138 27694308 27694524 201 - chr11:27694317-27694488 NA NA NA NA NA chr11-137 27370055 27370396 284 - chr11:27370078-27370271 NA NA NA NA NA chr11-136 26807945 26808232 158 - chr11:26808078-26808105 NA NA NA NA NA chr11-135 26764846 26765018 145 - chr11:26764861-26764985 NA NA NA NA NA chr11-134 26621226 26621416 151 - chr11:26621263-26621373 NA NA NA NA NA chr11-133 26601563 26601847 166 - chr11:26601701-26601739 NA NA NA NA NA chr11-132 26562701 26563002 187 - chr11:26562737-26562849 NA NA NA NA NA chr11-131 26499567 26499963 324 - chr11:26499604-26499821 NA NA NA NA NA chr11-130 26459899 26460102 185 - chr11:26459905-26460054 NA NA NA NA NA chr11-129 26248276 26248451 138 - chr11:26248345-26248430 NA NA NA NA NA chr11-128 25402991 25403189 163 - chr11:25403038-25403160 NA NA NA NA NA chr11-127 25156513 25156669 130 - chr11:25156513-25156630 NA NA NA NA NA chr11-126 24935797 24935993 140 - chr11:24935853-24935937 NA NA NA NA NA chr11-125 24684357 24684612 141 - chr11:24684471-24684555 NA NA NA NA NA chr11-124 24637113 24637318 173 - chr11:24637137-24637294 NA NA NA NA NA chr11-123 24441175 24441449 164 - chr11:24441249-24441267 NA NA NA NA NA chr11-122 24118215 24118410 135 - chr11:24118263-24118326 NA NA NA NA NA chr11-121 24003227 24003512 154 - chr11:24003360-24003382 NA NA NA NA NA chr11-120 23946637 23946850 140 - chr11:23946684-23946764 NA NA NA NA NA chr11-119 23863146 23863373 138 - chr11:23863163-23863248 NA NA NA NA NA chr11-118 23676632 23676959 240 - chr11:23676777-23676901 NA NA NA NA NA chr11-117 23417595 23418024 200 - chr11:23417742-23417754 NA NA NA NA NA chr11-116 23344501 23344798 242 - chr11:23344577-23344709 NA NA NA NA NA chr11-115 23272123 23272428 204 - chr11:23272282-23272356 NA NA NA NA NA chr11-114 23227440 23227599 123 - chr11:23227487-23227538 NA NA NA NA NA chr11-113 23190786 23191111 165 - chr11:23190914-23190935 NA NA NA NA NA chr11-112 23098131 23098320 142 - chr11:23098184-23098285 NA NA NA NA NA chr11-111 22873061 22873246 161 - chr11:22873111-22873235 NA NA NA NA NA chr11-110 22847370 22847781 187 - chr11:22847632-22847633 NA NA NA NA NA chr11-109 22817773 22817996 150 - chr11:22817846-22817923 NA NA NA NA NA chr11-108 22800824 22801003 155 - chr11:22800850-22800980 NA NA NA NA NA chr11-107 22681094 22681388 190 - chr11:22681220-22681358 NA NA NA NA NA chr11-106 22616832 22617382 333 - chr11:22617017-22617222 NA NA NA NA NA chr11-105 22521434 22521846 208 - chr11:22521691-22521748 NA NA NA NA NA chr11-104 22378854 22379149 151 - chr11:22378983-22379007 NA NA NA NA NA chr11-103 22299510 22299688 155 - chr11:22299535-22299669 NA NA NA NA NA chr11-102 21968643 21968912 154 - chr11:21968768-21968802 NA NA NA NA NA chr11-101 21913840 21914287 260 - chr11:21914016-21914061 NA NA NA NA NA chr11-100 21766817 21767047 147 - chr11:21766907-21766978 NA NA NA NA NA chr11-99 21636551 21636896 237 - chr11:21636601-21636759 NA NA NA NA NA chr11-98 21363946 21364287 275 - chr11:21364078-21364221 NA NA NA NA NA chr11-97 21181392 21181618 153 - chr11:21181464-21181543 NA NA NA NA NA chr11-96 20527695 20528072 240 - chr11:20527908-20527973 NA NA NA NA NA chr11-95 20491393 20491812 258 - chr11:20491664-20491706 NA NA NA NA NA chr11-94 20407645 20408024 259 - chr11:20407855-20407949 NA NA NA NA NA chr11-93 20371050 20371416 210 - chr11:20371265-20371358 NA NA NA NA NA chr11-92 20008697 20009148 254 - chr11:20008992-20009002 NA NA NA NA NA chr11-91 19662575 19662990 301 - chr11:19662777-19662920 NA NA NA NA NA chr11-90 19511249 19511559 152 - chr11:19511373-19511384 NA NA NA NA NA chr11-89 19303544 19304036 274 - chr11:19303612-19303715 NA NA NA NA NA chr11-88 19277740 19278011 230 - chr11:19277741-19277889 NA NA NA NA NA chr11-87 19249502 19249671 164 - chr11:19249509-19249670 NA NA NA NA NA chr11-86 19055081 19055433 217 - chr11:19055166-19055273 NA NA NA NA NA chr11-85 18641281 18641538 167 - chr11:18641347-18641433 NA NA NA NA NA chr11-84 18563149 18563425 159 - chr11:18563252-18563301 NA NA NA NA NA chr11-83 18501464 18501751 162 - chr11:18501611-18501637 NA NA NA NA NA chr11-82 18495145 18495633 276 - chr11:18495288-18495455 NA NA NA NA NA chr11-81 18407753 18407942 153 - chr11:18407787-18407902 NA NA NA NA NA chr11-80 18249998 18250231 191 - chr11:18250046-18250216 NA NA NA NA NA chr11-79 18033304 18033865 328 - chr11:18033715-18033721 NA NA NA NA NA chr11-78 17503793 17504081 164 - chr11:17503893-17503945 NA NA NA NA NA chr11-77 17355104 17355471 273 - chr11:17355217-17355443 NA NA NA NA NA chr11-76 17307299 17307804 324 - chr11:17307456-17307790 NA NA NA NA NA chr11-75 17292009 17292284 155 - chr11:17292133-17292172 NA NA NA NA NA chr11-74 17087718 17087983 228 - chr11:17087825-17087979 NA NA NA NA NA chr11-73 16674789 16675104 211 - chr11:16674829-16674968 NA NA NA NA NA chr11-72 16620732 16621028 166 - chr11:16620926-16621026 NA NA NA NA NA chr11-71 16457360 16457834 275 - chr11:16457657-16457690 NA NA NA NA NA chr11-70 16235200 16235431 162 - chr11:16235270-16235362 NA NA NA NA NA chr11-69 15914102 15914234 114 - chr11:15914131-15914209 NA NA NA NA NA chr11-68 15866032 15866355 215 - chr11:15866156-15866317 NA NA NA NA NA chr11-67 14957381 14957551 113 - chr11:14957504-14957527 NA NA NA NA NA chr11-66 14915991 14916194 170 - chr11:14916037-14916187 NA NA NA NA NA chr11-65 14776027 14776267 136 - chr11:14776151-14776173 NA NA NA NA NA chr11-64 14659830 14660072 178 - chr11:14659861-14660015 NA NA NA NA NA chr11-63 14547164 14547379 142 - chr11:14547241-14547314 NA NA NA NA NA chr11-62 14400018 14400168 145 - chr11:14400019-14400154 NA NA NA NA NA chr11-61 14296286 14296561 147 - chr11:14296429-14296463 NA NA NA NA NA chr11-60 14274143 14274354 167 - chr11:14274145-14274290 NA NA NA NA NA chr11-59 14272286 14272658 296 - chr11:14272458-14272630 NA NA NA NA NA chr11-58 13911351 13911569 158 - chr11:13911403-13911531 NA NA NA NA NA chr11-57 13713910 13714192 234 - chr11:13714050-13714190 NA NA NA NA NA chr11-56 13607115 13607332 112 - chr11:13607194-13607214 NA NA NA NA NA chr11-679 133855688 133856055 207 - chr11:133855886-133855971 NA NA NA NA NA chr11-678 133654797 133655087 151 - chr11:133654924-133654942 NA NA NA NA NA chr11-55 13359473 13359828 198 - chr11:13359601-13359713 NA NA NA NA NA chr11-677 132940063 132940218 149 - chr11:132940071-132940213 NA NA NA NA NA chr11-54 13244515 13244925 208 - chr11:13244605-13244667 NA NA NA NA NA chr11-676 132398203 132398471 192 - chr11:132398218-132398372 NA NA NA NA NA chr11-675 132206417 132207053 360 - chr11:132206912-132206942 NA NA NA NA NA chr11-53 13204022 13204278 166 - chr11:13204142-13204203 NA NA NA NA NA chr11-674 130883321 130883555 137 - chr11:130883405-130883432 NA NA NA NA NA chr11-673 130799102 130799333 158 - chr11:130799175-130799260 NA NA NA NA NA chr11-672 130740546 130740716 157 - chr11:130740547-130740697 NA NA NA NA NA chr11-671 130491787 130492242 240 - chr11:130492023-130492069 NA NA NA NA NA chr11-670 130326592 130326771 145 - chr11:130326627-130326739 NA NA NA NA NA chr11-669 130151382 130151682 218 - chr11:130151416-130151470 NA NA NA NA NA chr11-52 12919215 12919403 151 - chr11:12919253-12919368 NA NA NA NA NA chr11-668 129067033 129067196 148 - chr11:129067050-129067182 NA NA NA NA NA chr11-667 128034515 128034763 148 - chr11:128034608-128034649 NA NA NA NA NA chr11-666 127812924 127813114 162 - chr11:127812945-127813072 NA NA NA NA NA chr11-665 127744457 127744898 228 - chr11:127744702-127744749 NA NA NA NA NA chr11-664 127632313 127632525 157 - chr11:127632404-127632488 NA NA NA NA NA chr11-51 12762611 12762987 195 - chr11:12762700-12762760 NA NA NA NA NA chr11-663 127585781 127585997 163 - chr11:127585832-127585943 NA NA NA NA NA chr11-662 127559134 127559307 153 - chr11:127559161-127559301 NA NA NA NA NA chr11-661 127197583 127197907 166 - chr11:127197741-127197749 NA NA NA NA NA chr11-660 126801398 126801626 132 - chr11:126801465-126801472 NA NA NA NA NA chr11-659 125877938 125878262 222 - chr11:125878051-125878222 NA NA NA NA NA chr11-50 12577049 12577275 178 - chr11:12577121-12577275 NA NA NA NA NA chr11-658 125421294 125421566 196 - chr11:125421347-125421444 NA NA NA NA NA chr11-49 12500437 12500822 199 - chr11:12500483-12500566 NA NA NA NA NA chr11-657 124978601 124978854 231 - chr11:124978641-124978841 NA NA NA NA NA chr11-656 124284294 124284755 253 - chr11:124284506-124284555 NA NA NA NA NA chr11-655 124030627 124030985 222 - chr11:124030835-124030885 NA NA NA NA NA chr11-654 123936151 123936439 155 - chr11:123936228-123936278 NA NA NA NA NA chr11-653 123807705 123807921 150 - chr11:123807768-123807849 NA NA NA NA NA chr11-48 12355249 12355428 153 - chr11:12355275-12355402 NA NA NA NA NA chr11-652 123408051 123408392 205 - chr11:123408148-123408207 NA NA NA NA NA chr11-651 122948403 122948762 219 - chr11:122948477-122948589 NA NA NA NA NA chr11-650 122562989 122563411 192 - chr11:122563262-122563267 NA NA NA NA NA chr11-649 122395306 122395610 260 - chr11:122395362-122395534 NA NA NA NA NA chr11-648 122157430 122157734 297 - chr11:122157434-122157717 NA NA NA NA NA chr11-647 122149959 122150095 118 - chr11:122149980-122150062 NA NA NA NA NA chr11-646 122047382 122047594 123 - chr11:122047453-122047496 NA NA NA NA NA chr11-645 121957948 121958268 206 - chr11:121958049-121958198 NA NA NA NA NA chr11-47 12191860 12192057 150 - chr11:12191953-12192033 NA NA NA NA NA chr11-644 121836954 121837324 259 - chr11:121837213-121837287 NA NA NA NA NA chr11-643 121603179 121603671 296 - chr11:121603222-121603420 NA NA NA NA NA chr11-46 12129112 12129494 240 - chr11:12129307-12129476 NA NA NA NA NA chr11-642 121135258 121135440 172 - chr11:121135274-121135433 NA NA NA NA NA chr11-641 121089417 121089812 233 - chr11:121089636-121089788 NA NA NA NA NA chr11-640 121033418 121033694 168 - chr11:121033472-121033559 NA NA NA NA NA chr11-45 12041858 12042110 172 - chr11:12041923-12042000 NA NA NA NA NA chr11-639 120415364 120415673 249 - chr11:120415373-120415511 NA NA NA NA NA chr11-638 120355335 120355592 172 - chr11:120355442-120355551 NA NA NA NA NA chr11-44 12034049 12034352 259 - chr11:12034050-12034221 NA NA NA NA NA chr11-637 120268715 120269070 236 - chr11:120268944-120269006 NA NA NA NA NA chr11-636 119223414 119223726 212 - chr11:119223447-119223492 NA NA NA NA NA chr11-635 119065254 119065518 159 - chr11:119065389-119065428 NA NA NA NA NA chr11-634 118550657 118550857 163 - chr11:118550704-118550825 NA NA NA NA NA chr11-633 118360660 118360944 204 - chr11:118360675-118360719 NA NA NA NA NA chr11-43 11803434 11803583 129 - chr11:11803444-11803533 NA NA NA NA NA chr11-632 117455614 117455894 144 - chr11:117455742-117455754 NA NA NA NA NA chr11-631 117259466 117259764 183 - chr11:117259614-117259715 NA NA NA NA NA chr11-630 117081279 117081451 159 - chr11:117081281-117081414 NA NA NA NA NA chr11-629 116663354 116663719 176 - chr11:116663574-116663592 NA NA NA NA NA chr11-628 116662554 116662768 158 - chr11:116662599-116662706 NA NA NA NA NA chr11-627 116426600 116427040 288 - chr11:116426862-116426943 NA NA NA NA NA chr11-626 116375820 116375999 154 - chr11:116375846-116375976 NA NA NA NA NA chr11-625 116018752 116018905 143 - chr11:116018765-116018903 NA NA NA NA NA chr11-624 115928492 115929122 301 - chr11:115928978-115929107 NA NA NA NA NA chr11-623 115908979 115909261 153 - chr11:115909125-115909166 NA NA NA NA NA chr11-622 115874870 115875073 165 - chr11:115874924-115875043 NA NA NA NA NA chr11-621 115779515 115779990 246 - chr11:115779770-115779858 NA NA NA NA NA chr11-620 115674844 115675193 197 - chr11:115675055-115675159 NA NA NA NA NA chr11-619 115507360 115507663 199 - chr11:115507516-115507663 NA NA NA NA NA chr11-42 11508562 11508720 125 - chr11:11508606-11508709 NA NA NA NA NA chr11-41 11501926 11502196 132 - chr11:11501974-11502037 NA NA NA NA NA chr11-618 114795936 114796290 213 - chr11:114796043-114796081 NA NA NA NA NA chr11-617 114647830 114648502 296 - chr11:114647922-114648027 NA NA NA NA NA chr11-616 114586873 114587144 215 - chr11:114586875-114587062 NA NA NA NA NA chr11-615 114502830 114503017 170 - chr11:114502839-114502984 NA NA NA NA NA chr11-614 114481325 114481664 276 - chr11:114481341-114481491 NA NA NA NA NA chr11-613 114340975 114341139 121 - chr11:114341072-114341123 NA NA NA NA NA chr11-612 114221258 114221583 241 - chr11:114221301-114221417 NA NA NA NA NA chr11-611 114178757 114179117 180 - chr11:114178968-114178999 NA NA NA NA NA chr11-610 114160874 114161090 158 - chr11:114160931-114161030 NA NA NA NA NA chr11-609 114048477 114048870 234 - chr11:114048671-114048672 NA NA NA NA NA chr11-608 114026573 114026764 119 - chr11:114026666-114026734 NA NA NA NA NA chr11-607 114006904 114007154 161 - chr11:114007001-114007069 NA NA NA NA NA chr11-606 113971044 113971208 154 - chr11:113971044-113971193 NA NA NA NA NA chr11-605 113938958 113939262 158 - chr11:113939116-113939140 NA NA NA NA NA chr11-604 113803576 113803834 145 - chr11:113803690-113803723 NA NA NA NA NA chr11-603 113481956 113482127 162 - chr11:113481975-113482123 NA NA NA NA NA chr11-602 113415411 113415733 165 - chr11:113415569-113415578 NA NA NA NA NA chr11-601 113170384 113170681 151 - chr11:113170535-113170545 NA NA NA NA NA chr11-600 113054423 113054578 129 - chr11:113054466-113054543 NA NA NA NA NA chr11-599 112708583 112708889 163 - chr11:112708724-112708742 NA NA NA NA NA chr11-598 112705457 112705683 169 - chr11:112705530-112705658 NA NA NA NA NA chr11-597 112456164 112456321 153 - chr11:112456174-112456319 NA NA NA NA NA chr11-596 112345592 112345776 158 - chr11:112345614-112345748 NA NA NA NA NA chr11-595 112252937 112253458 250 - chr11:112253072-112253119 NA NA NA NA NA chr11-594 112212273 112212566 207 - chr11:112212357-112212521 NA NA NA NA NA chr11-593 112149154 112149707 312 - chr11:112149386-112149428 NA NA NA NA NA chr11-592 112110716 112110983 162 - chr11:112110824-112110884 NA NA NA NA NA chr11-591 112064860 112065204 246 - chr11:112064906-112065002 NA NA NA NA NA chr11-40 11202642 11202856 168 - chr11:11202689-11202812 NA NA NA NA NA chr11-590 111995827 111996179 261 - chr11:111995883-111996030 NA NA NA NA NA chr11-589 111989215 111989856 399 - chr11:111989476-111989594 NA NA NA NA NA chr11-39 11193921 11194420 316 - chr11:11194032-11194093 NA NA NA NA NA chr11-588 111925142 111925510 297 - chr11:111925249-111925404 NA NA NA NA NA chr11-587 111918498 111919079 323 - chr11:111918599-111918678 NA NA NA NA NA chr11-586 111830506 111830729 149 - chr11:111830542-111830636 NA NA NA NA NA chr11-585 111710647 111710933 154 - chr11:111710755-111710799 NA NA NA NA NA chr11-38 11168320 11168853 302 - chr11:11168514-11168548 NA NA NA NA NA chr11-584 111654012 111654226 175 - chr11:111654099-111654211 NA NA NA NA NA chr11-583 111643149 111643546 198 - chr11:111643397-111643416 NA NA NA NA NA chr11-582 111534620 111534784 142 - chr11:111534627-111534725 NA NA NA NA NA chr11-581 111528459 111528730 154 - chr11:111528570-111528610 NA NA NA NA NA chr11-580 111386412 111386664 157 - chr11:111386512-111386579 NA NA NA NA NA chr11-579 111208958 111209122 141 - chr11:111208975-111209110 NA NA NA NA NA chr11-578 110954071 110954281 144 - chr11:110954135-110954211 NA NA NA NA NA chr11-37 11076204 11076533 186 - chr11:11076357-11076410 NA NA NA NA NA chr11-577 110669080 110669381 219 - chr11:110669131-110669237 NA NA NA NA NA chr11-576 110544434 110544613 156 - chr11:110544457-110544590 NA NA NA NA NA chr11-575 110512453 110512749 160 - chr11:110512588-110512611 NA NA NA NA NA chr11-574 110083081 110083578 308 - chr11:110083333-110083336 NA NA NA NA NA chr11-573 109960002 109960492 295 - chr11:109960126-109960155 NA NA NA NA NA chr11-572 109703094 109703255 139 - chr11:109703122-109703245 NA NA NA NA NA chr11-571 109675420 109675647 180 - chr11:109675427-109675580 NA NA NA NA NA chr11-570 109546894 109547098 152 - chr11:109546950-109547048 NA NA NA NA NA chr11-569 109258050 109258332 196 - chr11:109258051-109258204 NA NA NA NA NA chr11-36 10905533 10905841 262 - chr11:10905538-10905713 NA NA NA NA NA chr11-568 108987983 108988193 132 - chr11:108988028-108988121 NA NA NA NA NA chr11-567 108896589 108896781 170 - chr11:108896629-108896768 NA NA NA NA NA chr11-35 10869385 10869568 151 - chr11:10869427-10869541 NA NA NA NA NA chr11-566 108610391 108610587 141 - chr11:108610534-108610576 NA NA NA NA NA chr11-565 108436172 108436593 326 - chr11:108436175-108436311 NA NA NA NA NA chr11-564 108331912 108332062 126 - chr11:108331939-108332053 NA NA NA NA NA chr11-563 108021049 108021476 294 - chr11:108021321-108021468 NA NA NA NA NA chr11-562 107923994 107924244 148 - chr11:107924078-107924106 NA NA NA NA NA chr11-34 10759877 10760089 126 - chr11:10759935-10759947 NA NA NA NA NA chr11-561 107506470 107506664 130 - chr11:107506520-107506572 NA NA NA NA NA chr11-560 107292451 107292728 195 - chr11:107292565-107292719 NA NA NA NA NA chr11-559 107224276 107224446 155 - chr11:107224288-107224425 NA NA NA NA NA chr11-558 107200973 107201267 149 - chr11:107201116-107201121 NA NA NA NA NA chr11-557 107113068 107113391 217 - chr11:107113244-107113320 NA NA NA NA NA chr11-556 106926114 106926416 218 - chr11:106926186-106926362 NA NA NA NA NA chr11-555 106782381 106782571 153 - chr11:106782418-106782534 NA NA NA NA NA chr11-554 106664171 106664420 182 - chr11:106664188-106664253 NA NA NA NA NA chr11-553 106406363 106406589 122 - chr11:106406424-106406476 NA NA NA NA NA chr11-552 106091875 106092159 188 - chr11:106091887-106092027 NA NA NA NA NA chr11-551 105952865 105953245 203 - chr11:105953111-105953206 NA NA NA NA NA chr11-550 105919888 105920098 130 - chr11:105919969-105920059 NA NA NA NA NA chr11-549 105758955 105759396 221 - chr11:105759086-105759132 NA NA NA NA NA chr11-548 105694838 105695082 169 - chr11:105694915-105695008 NA NA NA NA NA chr11-547 105616194 105616545 207 - chr11:105616218-105616341 NA NA NA NA NA chr11-546 105457552 105457867 189 - chr11:105457678-105457741 NA NA NA NA NA chr11-545 105426313 105426524 153 - chr11:105426373-105426470 NA NA NA NA NA chr11-544 105235700 105235957 154 - chr11:105235792-105235832 NA NA NA NA NA chr11-543 104982660 104982951 214 - chr11:104982841-104982926 NA NA NA NA NA chr11-542 104728843 104729137 155 - chr11:104728988-104729001 NA NA NA NA NA chr11-541 104702045 104702202 127 - chr11:104702058-104702138 NA NA NA NA NA chr11-540 104537991 104538468 244 - chr11:104538335-104538449 NA NA NA NA NA chr11-539 104534462 104534739 157 - chr11:104534625-104534722 NA NA NA NA NA chr11-538 104509957 104510107 114 - chr11:104509979-104510075 NA NA NA NA NA chr11-537 104465515 104465677 153 - chr11:104465525-104465670 NA NA NA NA NA chr11-536 104187364 104187615 165 - chr11:104187454-104187545 NA NA NA NA NA chr11-535 104030504 104030778 178 - chr11:104030630-104030697 NA NA NA NA NA chr11-534 103910347 103910621 162 - chr11:103910458-103910507 NA NA NA NA NA chr11-533 103904728 103904967 149 - chr11:103904840-103904888 NA NA NA NA NA chr11-532 103354258 103354504 122 - chr11:103354404-103354424 NA NA NA NA NA chr11-531 103223947 103224215 146 - chr11:103224067-103224092 NA NA NA NA NA chr11-530 103220353 103220820 273 - chr11:103220560-103220736 NA NA NA NA NA chr11-529 103181843 103182220 239 - chr11:103181943-103182006 NA NA NA NA NA chr11-528 103146063 103146464 194 - chr11:103146170-103146207 NA NA NA NA NA chr11-527 103097794 103098038 174 - chr11:103097873-103097986 NA NA NA NA NA chr11-526 103096779 103096980 187 - chr11:103096790-103096949 NA NA NA NA NA chr11-525 103021579 103021892 178 - chr11:103021762-103021853 NA NA NA NA NA chr11-524 102981512 102981813 153 - chr11:102981624-102981634 NA NA NA NA NA chr11-523 102714559 102714750 165 - chr11:102714598-102714750 NA NA NA NA NA chr11-33 10260261 10260545 198 - chr11:10260263-10260418 NA NA NA NA NA chr11-522 102465923 102466344 205 - chr11:102466047-102466082 NA NA NA NA NA chr11-521 102003277 102003555 164 - chr11:102003367-102003429 NA NA NA NA NA chr11-520 101941362 101941508 117 - chr11:101941440-101941499 NA NA NA NA NA chr11-519 101940634 101941030 238 - chr11:101940854-101940996 NA NA NA NA NA chr11-518 101939984 101940332 210 - chr11:101940034-101940175 NA NA NA NA NA chr11-517 101823704 101823894 169 - chr11:101823743-101823882 NA NA NA NA NA chr11-516 101645213 101645403 165 - chr11:101645233-101645368 NA NA NA NA NA chr11-515 101602660 101602805 132 - chr11:101602693-101602802 NA NA NA NA NA chr11-514 101588139 101588471 166 - chr11:101588332-101588359 NA NA NA NA NA chr11-513 101525117 101525660 215 - chr11:101525460-101525511 NA NA NA NA NA chr11-512 101288844 101289069 129 - chr11:101288972-101288989 NA NA NA NA NA chr11-511 100612610 100612788 137 - chr11:100612617-100612679 NA NA NA NA NA chr11-510 100445504 100445673 155 - chr11:100445524-100445671 NA NA NA NA NA chr11-509 100379558 100379929 225 - chr11:100379558-100379710 NA NA NA NA NA chr11-508 100160596 100161047 265 - chr11:100160738-100160773 NA NA NA NA NA chr11-32 10012828 10013020 160 - chr11:10012844-10012988 NA NA NA NA NA chr11-507 100113733 100113985 183 - chr11:100113825-100113962 NA NA NA NA NA chr10-753 99468845 99469120 169 - chr10:99468915-99468996 NA NA NA NA NA chr10-752 99189969 99190182 175 - chr10:99189981-99190137 NA NA NA NA NA chr10-751 99187120 99187360 163 - chr10:99187192-99187273 NA NA NA NA NA chr10-750 98752231 98752566 219 - chr10:98752339-98752500 NA NA NA NA NA chr10-749 98671695 98671991 197 - chr10:98671800-98671950 NA NA NA NA NA chr10-748 98563640 98563953 160 - chr10:98563794-98563802 NA NA NA NA NA chr10-747 98530814 98531247 243 - chr10:98531090-98531100 NA NA NA NA NA chr10-746 98483610 98483872 190 - chr10:98483681-98483835 NA NA NA NA NA chr10-745 98471641 98471818 150 - chr10:98471672-98471793 NA NA NA NA NA chr10-32 9841677 9842171 254 - chr10:9841855-9841989 NA NA NA NA NA chr10-31 9806181 9806345 155 - chr10:9806208-9806345 NA NA NA NA NA chr10-744 97985183 97985363 142 - chr10:97985204-97985291 NA NA NA NA NA chr10-743 97843525 97843685 147 - chr10:97843539-97843674 NA NA NA NA NA chr10-742 96962402 96962803 252 - chr10:96962628-96962788 NA NA NA NA NA chr10-741 96708823 96709130 152 - chr10:96708964-96708968 NA NA NA NA NA chr10-740 96593552 96593975 259 - chr10:96593826-96593866 NA NA NA NA NA chr10-739 96497901 96498074 116 - chr10:96497976-96498053 NA NA NA NA NA chr10-738 96437263 96437547 190 - chr10:96437392-96437523 NA NA NA NA NA chr10-737 96295726 96296017 247 - chr10:96295858-96296017 NA NA NA NA NA chr10-30 9625353 9625683 271 - chr10:9625433-9625586 NA NA NA NA NA chr10-736 96176780 96177071 226 - chr10:96176868-96176964 NA NA NA NA NA chr10-735 95967411 95967643 143 - chr10:95967490-95967549 NA NA NA NA NA chr10-734 95869390 95869628 153 - chr10:95869483-95869559 NA NA NA NA NA chr10-733 95760017 95760363 215 - chr10:95760170-95760325 NA NA NA NA NA chr10-732 95667080 95667303 169 - chr10:95667128-95667237 NA NA NA NA NA chr10-731 95575316 95575527 174 - chr10:95575375-95575501 NA NA NA NA NA chr10-730 95566905 95567098 161 - chr10:95566937-95567066 NA NA NA NA NA chr10-729 95512617 95513201 350 - chr10:95512854-95512893 NA NA NA NA NA chr10-728 95484661 95485054 228 - chr10:95484893-95485016 NA NA NA NA NA chr10-727 94924719 94924942 155 - chr10:94924784-94924868 NA NA NA NA NA chr10-726 94547453 94547618 117 - chr10:94547525-94547618 NA NA NA NA NA chr10-725 94530544 94530840 192 - chr10:94530647-94530787 NA NA NA NA NA chr10-724 94515807 94516048 150 - chr10:94515895-94515951 NA NA NA NA NA chr10-723 94228540 94228711 118 - chr10:94228553-94228638 NA NA NA NA NA chr10-722 93832072 93832518 253 - chr10:93832087-93832236 NA NA NA NA NA chr10-721 93823585 93823781 142 - chr10:93823631-93823711 NA NA NA NA NA chr10-720 92980674 92980988 156 - chr10:92980842-92980850 NA NA NA NA NA chr10-719 92731542 92731696 137 - chr10:92731577-92731680 NA NA NA NA NA chr10-718 92701251 92701704 234 - chr10:92701501-92701547 NA NA NA NA NA chr10-717 92596612 92597102 254 - chr10:92596751-92596759 NA NA NA NA NA chr10-716 92543337 92543638 205 - chr10:92543343-92543500 NA NA NA NA NA chr10-715 92219802 92219992 157 - chr10:92219867-92219971 NA NA NA NA NA chr10-714 92045183 92045345 155 - chr10:92045194-92045340 NA NA NA NA NA chr10-713 92006641 92006909 198 - chr10:92006687-92006850 NA NA NA NA NA chr10-712 91987564 91987873 171 - chr10:91987657-91987759 NA NA NA NA NA chr10-711 91695117 91695480 173 - chr10:91695336-91695352 NA NA NA NA NA chr10-710 91491194 91491362 152 - chr10:91491202-91491342 NA NA NA NA NA chr10-709 91349089 91349274 119 - chr10:91349167-91349244 NA NA NA NA NA chr10-708 91258853 91259030 137 - chr10:91258944-91259001 NA NA NA NA NA chr10-707 91064015 91064323 181 - chr10:91064154-91064202 NA NA NA NA NA chr10-706 91007628 91007776 132 - chr10:91007640-91007764 NA NA NA NA NA chr10-705 90967389 90967567 139 - chr10:90967412-90967520 NA NA NA NA NA chr10-704 90834610 90834956 232 - chr10:90834679-90834752 NA NA NA NA NA chr10-703 90728252 90728414 137 - chr10:90728294-90728394 NA NA NA NA NA chr10-702 90720936 90721102 154 - chr10:90720936-90721084 NA NA NA NA NA chr10-701 90686645 90686940 160 - chr10:90686772-90686789 NA NA NA NA NA chr10-700 90630235 90630427 137 - chr10:90630283-90630358 NA NA NA NA NA chr10-699 90542198 90542457 195 - chr10:90542198-90542361 NA NA NA NA NA chr10-698 90481467 90481792 217 - chr10:90481611-90481756 NA NA NA NA NA chr10-697 90405643 90405796 135 - chr10:90405670-90405769 NA NA NA NA NA chr10-29 9040356 9040645 158 - chr10:9040473-9040507 NA NA NA NA NA chr10-696 90341077 90341240 147 - chr10:90341092-90341222 NA NA NA NA NA chr10-695 90187100 90187294 155 - chr10:90187138-90187253 NA NA NA NA NA chr10-694 90052356 90052835 260 - chr10:90052451-90052537 NA NA NA NA NA chr10-693 90044600 90044793 147 - chr10:90044682-90044765 NA NA NA NA NA chr10-692 89996120 89996492 232 - chr10:89996187-89996349 NA NA NA NA NA chr10-691 89966782 89967049 159 - chr10:89966880-89966936 NA NA NA NA NA chr10-690 89459303 89459638 239 - chr10:89459357-89459458 NA NA NA NA NA chr10-689 89421472 89422371 402 - chr10:89422073-89422077 NA NA NA NA NA chr10-688 89250867 89251560 299 - chr10:89251122-89251160 NA NA NA NA NA chr10-687 89227070 89227345 157 - chr10:89227214-89227240 NA NA NA NA NA chr10-686 89222076 89222474 216 - chr10:89222154-89222240 NA NA NA NA NA chr10-685 89220476 89220775 180 - chr10:89220617-89220667 NA NA NA NA NA chr10-684 89169452 89169823 213 - chr10:89169667-89169801 NA NA NA NA NA chr10-683 89135428 89135734 166 - chr10:89135559-89135576 NA NA NA NA NA chr10-682 89081781 89081972 171 - chr10:89081811-89081972 NA NA NA NA NA chr10-681 89015004 89015275 153 - chr10:89015071-89015165 NA NA NA NA NA chr10-680 89007352 89007632 174 - chr10:89007444-89007498 NA NA NA NA NA chr10-679 88743079 88743320 157 - chr10:88743159-88743228 NA NA NA NA NA chr10-678 88530776 88530972 144 - chr10:88530822-88530917 NA NA NA NA NA chr10-677 88526781 88526997 160 - chr10:88526839-88526945 NA NA NA NA NA chr10-676 88386418 88386926 216 - chr10:88386771-88386773 NA NA NA NA NA chr10-675 88367518 88367856 239 - chr10:88367549-88367693 NA NA NA NA NA chr10-28 8814199 8814500 272 - chr10:8814261-8814475 NA NA NA NA NA chr10-674 88105684 88106077 196 - chr10:88105689-88105784 NA NA NA NA NA chr10-673 87896579 87896727 117 - chr10:87896632-87896707 NA NA NA NA NA chr10-27 8779421 8779596 143 - chr10:8779461-8779568 NA NA NA NA NA chr10-672 87732503 87732972 237 - chr10:87732565-87732655 NA NA NA NA NA chr10-26 8772896 8773148 181 - chr10:8772913-8773050 NA NA NA NA NA chr10-671 87655908 87656255 212 - chr10:87656009-87656052 NA NA NA NA NA chr10-25 8744041 8744193 133 - chr10:8744096-8744192 NA NA NA NA NA chr10-24 8731285 8731715 200 - chr10:8731317-8731386 NA NA NA NA NA chr10-670 86933469 86933916 359 - chr10:86933675-86933858 NA NA NA NA NA chr10-669 86834323 86834542 144 - chr10:86834392-86834464 NA NA NA NA NA chr10-668 86796614 86796812 172 - chr10:86796631-86796790 NA NA NA NA NA chr10-667 86765942 86766115 162 - chr10:86765946-86766090 NA NA NA NA NA chr10-666 86669748 86669905 129 - chr10:86669778-86669893 NA NA NA NA NA chr10-665 86540620 86541043 263 - chr10:86540892-86540939 NA NA NA NA NA chr10-664 86433769 86434292 265 - chr10:86434142-86434263 NA NA NA NA NA chr10-663 86378300 86378517 169 - chr10:86378342-86378457 NA NA NA NA NA chr10-662 86291823 86292141 181 - chr10:86291951-86291986 NA NA NA NA NA chr10-23 8588490 8588872 170 - chr10:8588494-8588556 NA NA NA NA NA chr10-661 85187620 85187911 193 - chr10:85187630-85187774 NA NA NA NA NA chr10-660 84735049 84735268 159 - chr10:84735179-84735243 NA NA NA NA NA chr10-659 84557648 84558176 377 - chr10:84558029-84558134 NA NA NA NA NA chr10-658 84383865 84384017 115 - chr10:84383920-84384016 NA NA NA NA NA chr10-657 84332659 84333063 172 - chr10:84333005-84333061 NA NA NA NA NA chr10-656 84288814 84289133 232 - chr10:84288906-84289034 NA NA NA NA NA chr10-655 84036880 84037254 222 - chr10:84037036-84037054 NA NA NA NA NA chr10-654 84031182 84031534 220 - chr10:84031339-84031358 NA NA NA NA NA chr10-653 83995204 83995472 186 - chr10:83995218-83995363 NA NA NA NA NA chr10-652 83831076 83831346 155 - chr10:83831177-83831224 NA NA NA NA NA chr10-651 83647256 83647678 224 - chr10:83647348-83647427 NA NA NA NA NA chr10-650 83499771 83499932 152 - chr10:83499773-83499907 NA NA NA NA NA chr10-649 83406346 83406732 204 - chr10:83406553-83406582 NA NA NA NA NA chr10-22 8327288 8327442 133 - chr10:8327347-8327440 NA NA NA NA NA chr10-648 82967941 82968370 230 - chr10:82968244-82968355 NA NA NA NA NA chr10-647 82828846 82829094 120 - chr10:82828994-82829006 NA NA NA NA NA chr10-646 82805805 82806415 413 - chr10:82805935-82806351 NA NA NA NA NA chr10-645 82681403 82681829 172 - chr10:82681469-82681481 NA NA NA NA NA chr10-644 82572670 82573032 177 - chr10:82572865-82572867 NA NA NA NA NA chr10-643 82508549 82508814 219 - chr10:82508553-82508754 NA NA NA NA NA chr10-642 82503173 82503381 152 - chr10:82503223-82503313 NA NA NA NA NA chr10-641 82281562 82282194 451 - chr10:82281964-82282125 NA NA NA NA NA chr10-640 82270920 82271342 202 - chr10:82271180-82271202 NA NA NA NA NA chr10-639 82187819 82188016 135 - chr10:82187890-82187972 NA NA NA NA NA chr10-21 8194862 8195178 270 - chr10:8194916-8195148 NA NA NA NA NA chr10-638 81785836 81786233 214 - chr10:81785891-81785986 NA NA NA NA NA chr10-637 81694848 81695191 162 - chr10:81694905-81694948 NA NA NA NA NA chr10-636 81638654 81638866 133 - chr10:81638713-81638777 NA NA NA NA NA chr10-635 81514866 81515181 178 - chr10:81515022-81515051 NA NA NA NA NA chr10-634 81404576 81404917 181 - chr10:81404756-81404797 NA NA NA NA NA chr10-633 81326289 81326790 305 - chr10:81326430-81326637 NA NA NA NA NA chr10-632 81275531 81275720 142 - chr10:81275610-81275689 NA NA NA NA NA chr10-631 81273802 81274099 149 - chr10:81273952-81273955 NA NA NA NA NA chr10-630 81027143 81027471 220 - chr10:81027171-81027355 NA NA NA NA NA chr10-629 80936251 80936556 215 - chr10:80936359-80936529 NA NA NA NA NA chr10-628 80918179 80918749 288 - chr10:80918602-80918749 NA NA NA NA NA chr10-627 80681449 80681640 120 - chr10:80681472-80681545 NA NA NA NA NA chr10-626 80630781 80631012 165 - chr10:80630863-80630978 NA NA NA NA NA chr10-625 80616222 80616672 274 - chr10:80616473-80616646 NA NA NA NA NA chr10-624 80379174 80379378 153 - chr10:80379201-80379252 NA NA NA NA NA chr10-20 7967353 7967511 149 - chr10:7967360-7967501 NA NA NA NA NA chr10-623 79564932 79565216 242 - chr10:79564933-79565091 NA NA NA NA NA chr10-19 7950120 7950403 157 - chr10:7950240-7950274 NA NA NA NA NA chr10-622 79470740 79471213 241 - chr10:79471012-79471061 NA NA NA NA NA chr10-621 78945283 78945548 158 - chr10:78945384-78945429 NA NA NA NA NA chr10-18 7873316 7873509 134 - chr10:7873403-7873464 NA NA NA NA NA chr10-620 78527233 78527421 181 - chr10:78527241-78527408 NA NA NA NA NA chr10-619 78256134 78256650 319 - chr10:78256412-78256615 NA NA NA NA NA chr10-618 78234691 78235070 231 - chr10:78234729-78234867 NA NA NA NA NA chr10-617 77647940 77648262 142 - chr10:77648200-77648252 NA NA NA NA NA chr10-616 77572603 77573046 278 - chr10:77572798-77572896 NA NA NA NA NA chr10-615 77272593 77272781 151 - chr10:77272678-77272768 NA NA NA NA NA chr10-614 77215563 77215877 208 - chr10:77215673-77215828 NA NA NA NA NA chr10-613 76972594 76972934 190 - chr10:76972768-76972832 NA NA NA NA NA chr10-612 76901904 76902266 273 - chr10:76902017-76902189 NA NA NA NA NA chr10-611 76868537 76868810 232 - chr10:76868651-76868801 NA NA NA NA NA chr10-610 76790967 76791384 241 - chr10:76791219-76791246 NA NA NA NA NA chr10-609 76758268 76758544 156 - chr10:76758395-76758438 NA NA NA NA NA chr10-608 76630373 76630688 157 - chr10:76630533-76630611 NA NA NA NA NA chr10-607 76597037 76597352 225 - chr10:76597141-76597321 NA NA NA NA NA chr10-17 7654952 7655264 202 - chr10:7654952-7655099 NA NA NA NA NA chr10-606 76533399 76533626 187 - chr10:76533431-76533570 NA NA NA NA NA chr10-605 76470973 76471199 172 - chr10:76471034-76471179 NA NA NA NA NA chr10-604 76442983 76443231 159 - chr10:76443076-76443144 NA NA NA NA NA chr10-603 76362403 76362651 145 - chr10:76362520-76362555 NA NA NA NA NA chr10-16 7613276 7613574 225 - chr10:7613356-7613494 NA NA NA NA NA chr10-602 76093223 76093401 135 - chr10:76093238-76093344 NA NA NA NA NA chr10-601 75838215 75838503 159 - chr10:75838322-75838363 NA NA NA NA NA chr10-600 75632043 75632287 164 - chr10:75632127-75632209 NA NA NA NA NA chr10-599 75432487 75432743 161 - chr10:75432571-75432626 NA NA NA NA NA chr10-15 7512934 7513111 125 - chr10:7512966-7513049 NA NA NA NA NA chr10-598 75007449 75007759 161 - chr10:75007602-75007618 NA NA NA NA NA chr10-597 74682047 74682198 135 - chr10:74682062-74682165 NA NA NA NA NA chr10-596 74648174 74648574 271 - chr10:74648323-74648424 NA NA NA NA NA chr10-595 74638368 74638563 165 - chr10:74638412-74638540 NA NA NA NA NA chr10-594 74506431 74506810 247 - chr10:74506659-74506726 NA NA NA NA NA chr10-593 74436420 74436864 209 - chr10:74436557-74436580 NA NA NA NA NA chr10-592 74411334 74411586 149 - chr10:74411436-74411481 NA NA NA NA NA chr10-591 74143672 74143888 170 - chr10:74143735-74143876 NA NA NA NA NA chr10-590 74116722 74116991 192 - chr10:74116829-74116929 NA NA NA NA NA chr10-589 74039504 74039695 162 - chr10:74039525-74039662 NA NA NA NA NA chr10-588 73961506 73961793 149 - chr10:73961643-73961653 NA NA NA NA NA chr10-587 73939947 73940303 202 - chr10:73939997-73940097 NA NA NA NA NA chr10-586 73860564 73860820 188 - chr10:73860651-73860790 NA NA NA NA NA chr10-585 73812899 73813217 214 - chr10:73813048-73813210 NA NA NA NA NA chr10-584 73774521 73774869 215 - chr10:73774522-73774670 NA NA NA NA NA chr10-583 73751764 73752205 341 - chr10:73751939-73752200 NA NA NA NA NA chr10-582 73651284 73651603 202 - chr10:73651454-73651592 NA NA NA NA NA chr10-581 73640171 73640550 208 - chr10:73640383-73640461 NA NA NA NA NA chr10-580 73437051 73437393 239 - chr10:73437109-73437200 NA NA NA NA NA chr10-579 73338187 73338377 163 - chr10:73338218-73338352 NA NA NA NA NA chr10-578 73189421 73189584 133 - chr10:73189461-73189534 NA NA NA NA NA chr10-577 73088114 73088784 323 - chr10:73088239-73088326 NA NA NA NA NA chr10-576 73039172 73039435 162 - chr10:73039277-73039342 NA NA NA NA NA chr10-575 72876531 72876837 206 - chr10:72876582-72876738 NA NA NA NA NA chr10-574 72715924 72716216 193 - chr10:72715925-72716068 NA NA NA NA NA chr10-573 72599151 72599362 174 - chr10:72599197-72599297 NA NA NA NA NA chr10-572 72473416 72473707 268 - chr10:72473433-72473681 NA NA NA NA NA chr10-571 72429956 72430187 198 - chr10:72430015-72430147 NA NA NA NA NA chr10-570 72378722 72378994 158 - chr10:72378834-72378876 NA NA NA NA NA chr10-569 72307981 72308182 177 - chr10:72308009-72308174 NA NA NA NA NA chr10-568 72120258 72120406 144 - chr10:72120270-72120406 NA NA NA NA NA chr10-567 72056489 72056931 277 - chr10:72056744-72056911 NA NA NA NA NA chr10-566 72014374 72014667 211 - chr10:72014508-72014611 NA NA NA NA NA chr10-565 71836733 71836888 153 - chr10:71836737-71836887 NA NA NA NA NA chr10-564 71508425 71508710 160 - chr10:71508528-71508574 NA NA NA NA NA chr10-14 7126553 7126844 165 - chr10:7126658-7126676 NA NA NA NA NA chr10-563 71259814 71260194 264 - chr10:71260047-71260185 NA NA NA NA NA chr10-562 71082476 71082807 215 - chr10:71082536-71082693 NA NA NA NA NA chr10-13 7070839 7071281 258 - chr10:7071086-7071252 NA NA NA NA NA chr10-561 70487347 70487717 200 - chr10:70487517-70487520 NA NA NA NA NA chr10-560 70475186 70475426 124 - chr10:70475268-70475293 NA NA NA NA NA chr10-559 70221822 70222079 117 - chr10:70221904-70221910 NA NA NA NA NA chr10-558 70211638 70212181 313 - chr10:70211724-70211800 NA NA NA NA NA chr10-557 70085598 70085853 136 - chr10:70085724-70085748 NA NA NA NA NA chr10-556 70067886 70068055 142 - chr10:70067933-70068038 NA NA NA NA NA chr10-555 69968935 69969107 114 - chr10:69969051-69969078 NA NA NA NA NA chr10-554 69839426 69839716 220 - chr10:69839496-69839674 NA NA NA NA NA chr10-553 69818084 69818269 133 - chr10:69818122-69818210 NA NA NA NA NA chr10-552 69729880 69730130 153 - chr10:69729974-69730016 NA NA NA NA NA chr10-551 69584593 69584876 182 - chr10:69584715-69584748 NA NA NA NA NA chr10-550 69306950 69307309 242 - chr10:69307065-69307191 NA NA NA NA NA chr10-549 69104575 69104756 139 - chr10:69104604-69104722 NA NA NA NA NA chr10-548 69101441 69101717 149 - chr10:69101560-69101574 NA NA NA NA NA chr10-547 69092111 69092468 217 - chr10:69092151-69092278 NA NA NA NA NA chr10-546 69063248 69063550 179 - chr10:69063362-69063409 NA NA NA NA NA chr10-545 68966220 68966788 336 - chr10:68966630-68966750 NA NA NA NA NA chr10-544 68942759 68943170 308 - chr10:68942906-68943107 NA NA NA NA NA chr10-543 68912154 68912441 144 - chr10:68912275-68912287 NA NA NA NA NA chr10-542 68744683 68744987 225 - chr10:68744726-68744836 NA NA NA NA NA chr10-12 6858375 6858546 140 - chr10:6858427-6858505 NA NA NA NA NA chr10-541 68538197 68538394 149 - chr10:68538236-68538328 NA NA NA NA NA chr10-540 68432785 68432932 123 - chr10:68432836-68432911 NA NA NA NA NA chr10-539 68376533 68376708 142 - chr10:68376568-68376676 NA NA NA NA NA chr10-538 68251362 68251659 201 - chr10:68251490-68251643 NA NA NA NA NA chr10-537 68230678 68230960 162 - chr10:68230776-68230816 NA NA NA NA NA chr10-11 6811148 6811491 196 - chr10:6811331-6811362 NA NA NA NA NA chr10-536 68088914 68089169 145 - chr10:68089014-68089039 NA NA NA NA NA chr10-535 68072824 68073182 220 - chr10:68072854-68072990 NA NA NA NA NA chr10-534 68048957 68049168 192 - chr10:68048988-68049142 NA NA NA NA NA chr10-533 68035337 68035572 214 - chr10:68035390-68035562 NA NA NA NA NA chr10-532 68009324 68009634 141 - chr10:68009532-68009543 NA NA NA NA NA chr10-531 68006755 68006938 147 - chr10:68006792-68006904 NA NA NA NA NA chr10-530 67405102 67405316 132 - chr10:67405194-67405254 NA NA NA NA NA chr10-529 67281662 67282504 599 - chr10:67281689-67282412 NA NA NA NA NA chr10-528 67215397 67215823 229 - chr10:67215548-67215551 NA NA NA NA NA chr10-527 67001610 67001795 174 - chr10:67001643-67001795 NA NA NA NA NA chr10-526 66869226 66869462 130 - chr10:66869349-66869390 NA NA NA NA NA chr10-525 66855008 66855496 264 - chr10:66855100-66855222 NA NA NA NA NA chr10-524 66839535 66839790 148 - chr10:66839641-66839681 NA NA NA NA NA chr10-523 66741134 66741588 247 - chr10:66741207-66741314 NA NA NA NA NA chr10-522 66652412 66652824 207 - chr10:66652517-66652569 NA NA NA NA NA chr10-521 66532976 66533240 153 - chr10:66533085-66533128 NA NA NA NA NA chr10-520 66352409 66352632 178 - chr10:66352544-66352632 NA NA NA NA NA chr10-519 66307810 66308112 198 - chr10:66307962-66308104 NA NA NA NA NA chr10-518 66296138 66296319 131 - chr10:66296218-66296284 NA NA NA NA NA chr10-517 66273915 66274198 169 - chr10:66274021-66274080 NA NA NA NA NA chr10-516 66034157 66034443 158 - chr10:66034341-66034343 NA NA NA NA NA chr10-515 65765547 65766058 259 - chr10:65765685-65765749 NA NA NA NA NA chr10-514 65684055 65684267 148 - chr10:65684117-65684202 NA NA NA NA NA chr10-10 6565108 6565340 148 - chr10:6565190-6565255 NA NA NA NA NA chr10-513 65648094 65648427 213 - chr10:65648201-65648281 NA NA NA NA NA chr10-512 65560182 65560503 160 - chr10:65560317-65560329 NA NA NA NA NA chr10-511 65191249 65191450 143 - chr10:65191407-65191442 NA NA NA NA NA chr10-510 65161917 65162239 191 - chr10:65161947-65162108 NA NA NA NA NA chr10-509 64974380 64974545 149 - chr10:64974392-64974527 NA NA NA NA NA chr10-508 64774307 64774513 186 - chr10:64774332-64774508 NA NA NA NA NA chr10-507 64717745 64717978 207 - chr10:64717778-64717933 NA NA NA NA NA chr10-506 64654845 64655210 258 - chr10:64654975-64655141 NA NA NA NA NA chr10-505 64633189 64633359 135 - chr10:64633230-64633325 NA NA NA NA NA chr10-504 64523073 64523407 170 - chr10:64523258-64523285 NA NA NA NA NA chr10-503 64453500 64453888 247 - chr10:64453594-64453653 NA NA NA NA NA chr10-502 64413430 64413615 125 - chr10:64413501-64413577 NA NA NA NA NA chr10-501 64312860 64313249 212 - chr10:64313026-64313050 NA NA NA NA NA chr10-500 64225241 64225408 158 - chr10:64225251-64225401 NA NA NA NA NA chr10-499 64197580 64197847 156 - chr10:64197695-64197744 NA NA NA NA NA chr10-9 6395750 6396266 232 - chr10:6396039-6396187 NA NA NA NA NA chr10-498 63790588 63790994 253 - chr10:63790758-63790903 NA NA NA NA NA chr10-497 63708116 63708440 193 - chr10:63708277-63708324 NA NA NA NA NA chr10-496 63637352 63637615 199 - chr10:63637447-63637613 NA NA NA NA NA chr10-495 63577668 63577866 153 - chr10:63577719-63577824 NA NA NA NA NA chr10-8 6338056 6338256 147 - chr10:6338119-6338208 NA NA NA NA NA chr10-494 63169234 63169436 125 - chr10:63169279-63169295 NA NA NA NA NA chr10-7 6300364 6300544 128 - chr10:6300394-6300481 NA NA NA NA NA chr10-493 62942263 62942657 198 - chr10:62942487-62942517 NA NA NA NA NA chr10-492 62909139 62909567 244 - chr10:62909393-62909429 NA NA NA NA NA chr10-491 62873400 62873726 218 - chr10:62873489-62873653 NA NA NA NA NA chr10-490 62851148 62851346 154 - chr10:62851278-62851345 NA NA NA NA NA chr10-489 62759006 62759316 188 - chr10:62759169-62759276 NA NA NA NA NA chr10-488 62654346 62654635 153 - chr10:62654472-62654494 NA NA NA NA NA chr10-487 62507258 62507557 191 - chr10:62507300-62507416 NA NA NA NA NA chr10-486 62489617 62490141 239 - chr10:62490001-62490054 NA NA NA NA NA chr10-485 62357390 62357827 267 - chr10:62357682-62357718 NA NA NA NA NA chr10-484 62334068 62334291 119 - chr10:62334166-62334233 NA NA NA NA NA chr10-483 62315383 62315691 227 - chr10:62315454-62315620 NA NA NA NA NA chr10-482 62281891 62282089 182 - chr10:62281933-62282086 NA NA NA NA NA chr10-481 62257557 62257701 114 - chr10:62257575-62257674 NA NA NA NA NA chr10-480 62042411 62042562 139 - chr10:62042429-62042562 NA NA NA NA NA chr10-479 61893674 61893903 144 - chr10:61893763-61893820 NA NA NA NA NA chr10-478 61726931 61727215 150 - chr10:61727065-61727081 NA NA NA NA NA chr10-477 61631361 61631745 251 - chr10:61631445-61631514 NA NA NA NA NA chr10-476 61560630 61560822 152 - chr10:61560672-61560786 NA NA NA NA NA chr10-475 61375435 61375790 199 - chr10:61375568-61375588 NA NA NA NA NA chr10-474 61308211 61308407 176 - chr10:61308247-61308383 NA NA NA NA NA chr10-473 61221145 61221351 140 - chr10:61221194-61221251 NA NA NA NA NA chr10-472 60691713 60692113 206 - chr10:60691839-60691885 NA NA NA NA NA chr10-471 60525380 60525562 144 - chr10:60525440-60525535 NA NA NA NA NA chr10-470 60517131 60517434 139 - chr10:60517377-60517426 NA NA NA NA NA chr10-469 60503506 60503842 166 - chr10:60503688-60503696 NA NA NA NA NA chr10-468 60391085 60391280 156 - chr10:60391132-60391245 NA NA NA NA NA chr10-467 60383867 60384024 130 - chr10:60383903-60383979 NA NA NA NA NA chr10-466 60284966 60285164 152 - chr10:60285008-60285116 NA NA NA NA NA chr10-465 60270197 60270412 193 - chr10:60270248-60270397 NA NA NA NA NA chr10-464 60262538 60262832 155 - chr10:60262683-60262705 NA NA NA NA NA chr10-463 60144454 60144715 158 - chr10:60144549-60144608 NA NA NA NA NA chr10-462 60086281 60086443 133 - chr10:60086353-60086428 NA NA NA NA NA chr10-461 60081692 60081892 155 - chr10:60081739-60081851 NA NA NA NA NA chr10-460 59945628 59945860 174 - chr10:59945687-59945832 NA NA NA NA NA chr10-459 59736841 59737061 165 - chr10:59736924-59737020 NA NA NA NA NA chr10-458 59645466 59645793 175 - chr10:59645525-59645601 NA NA NA NA NA chr10-457 59521599 59521876 244 - chr10:59521689-59521867 NA NA NA NA NA chr10-456 59489463 59489753 145 - chr10:59489610-59489612 NA NA NA NA NA chr10-455 59225721 59225950 166 - chr10:59225779-59225877 NA NA NA NA NA chr10-454 59123765 59123999 150 - chr10:59123847-59123914 NA NA NA NA NA chr10-453 59006225 59006458 157 - chr10:59006307-59006385 NA NA NA NA NA chr10-452 58971590 58971837 136 - chr10:58971605-58971678 NA NA NA NA NA chr10-451 58842815 58843296 390 - chr10:58842867-58843253 NA NA NA NA NA chr10-450 58400732 58400978 216 - chr10:58400803-58400959 NA NA NA NA NA chr10-449 58309696 58309953 153 - chr10:58309812-58309855 NA NA NA NA NA chr10-448 58309209 58309441 174 - chr10:58309214-58309359 NA NA NA NA NA chr10-447 58289788 58290130 171 - chr10:58289947-58289953 NA NA NA NA NA chr10-446 58214175 58214443 164 - chr10:58214291-58214345 NA NA NA NA NA chr10-445 58200789 58201307 308 - chr10:58201077-58201299 NA NA NA NA NA chr10-444 58145938 58146190 166 - chr10:58145982-58146083 NA NA NA NA NA chr10-6 5809654 5810015 254 - chr10:5809819-5809889 NA NA NA NA NA chr10-443 58045800 58046213 266 - chr10:58045883-58045938 NA NA NA NA NA chr10-442 57939855 57940110 177 - chr10:57939875-57939916 NA NA NA NA NA chr10-441 57866354 57866531 130 - chr10:57866392-57866445 NA NA NA NA NA chr10-440 57824113 57824267 150 - chr10:57824119-57824267 NA NA NA NA NA chr10-439 57462090 57462591 279 - chr10:57462209-57462332 NA NA NA NA NA chr10-438 57438000 57438290 148 - chr10:57438130-57438197 NA NA NA NA NA chr10-437 57287521 57287952 241 - chr10:57287669-57287678 NA NA NA NA NA chr10-436 56993223 56993524 181 - chr10:56993329-56993376 NA NA NA NA NA chr10-435 56944640 56944971 129 - chr10:56944688-56944692 NA NA NA NA NA chr10-434 56920047 56920336 208 - chr10:56920190-56920286 NA NA NA NA NA chr10-433 56890885 56891513 365 - chr10:56891234-56891509 NA NA NA NA NA chr10-432 56877887 56878097 119 - chr10:56877946-56877990 NA NA NA NA NA chr10-431 56863473 56863690 164 - chr10:56863524-56863633 NA NA NA NA NA chr10-430 56804292 56804519 172 - chr10:56804360-56804490 NA NA NA NA NA chr10-5 5679883 5680099 174 - chr10:5679965-5680077 NA NA NA NA NA chr10-429 56745446 56745620 159 - chr10:56745459-56745604 NA NA NA NA NA chr10-428 56663652 56664270 287 - chr10:56663807-56663809 NA NA NA NA NA chr10-427 56590705 56591027 210 - chr10:56590713-56590863 NA NA NA NA NA chr10-426 56567757 56568094 217 - chr10:56567839-56567996 NA NA NA NA NA chr10-425 56464698 56464855 154 - chr10:56464707-56464855 NA NA NA NA NA chr10-424 56393142 56393513 248 - chr10:56393232-56393324 NA NA NA NA NA chr10-423 56362164 56362592 258 - chr10:56362387-56362560 NA NA NA NA NA chr10-422 56327823 56328173 216 - chr10:56327837-56327979 NA NA NA NA NA chr10-421 56277145 56277479 159 - chr10:56277347-56277358 NA NA NA NA NA chr10-420 56253984 56254234 151 - chr10:56254093-56254155 NA NA NA NA NA chr10-419 56130940 56131217 184 - chr10:56131065-56131140 NA NA NA NA NA chr10-418 56122312 56122794 368 - chr10:56122424-56122676 NA NA NA NA NA chr10-417 56107257 56107445 140 - chr10:56107309-56107405 NA NA NA NA NA chr10-416 56082044 56082436 265 - chr10:56082113-56082193 NA NA NA NA NA chr10-415 56045580 56045804 155 - chr10:56045659-56045740 NA NA NA NA NA chr10-414 55924225 55924705 249 - chr10:55924586-55924642 NA NA NA NA NA chr10-413 55894693 55894981 200 - chr10:55894752-55894835 NA NA NA NA NA chr10-412 55698228 55698464 144 - chr10:55698332-55698396 NA NA NA NA NA chr10-411 55657891 55658165 155 - chr10:55658015-55658056 NA NA NA NA NA chr10-410 55571662 55571945 151 - chr10:55571780-55571806 NA NA NA NA NA chr10-409 55566863 55567083 134 - chr10:55566922-55566943 NA NA NA NA NA chr10-408 55396407 55396564 128 - chr10:55396433-55396503 NA NA NA NA NA chr10-407 55349703 55350103 240 - chr10:55349754-55349860 NA NA NA NA NA chr10-406 55279636 55279859 117 - chr10:55279700-55279713 NA NA NA NA NA chr10-405 55203867 55204045 140 - chr10:55203883-55203996 NA NA NA NA NA chr10-404 55177708 55177967 243 - chr10:55177710-55177921 NA NA NA NA NA chr10-403 55085262 55085619 185 - chr10:55085350-55085405 NA NA NA NA NA chr10-402 54983231 54983381 132 - chr10:54983269-54983365 NA NA NA NA NA chr10-401 54914739 54915169 211 - chr10:54914826-54914884 NA NA NA NA NA chr10-400 54832980 54833226 175 - chr10:54833060-54833173 NA NA NA NA NA chr10-399 54820100 54820341 155 - chr10:54820189-54820261 NA NA NA NA NA chr10-398 54789855 54790025 150 - chr10:54789870-54789995 NA NA NA NA NA chr10-397 54560876 54561087 151 - chr10:54560933-54561021 NA NA NA NA NA chr10-396 54490928 54491216 155 - chr10:54491067-54491095 NA NA NA NA NA chr10-4 5445586 5445762 150 - chr10:5445614-5445737 NA NA NA NA NA chr10-395 54403974 54404269 249 - chr10:54404008-54404165 NA NA NA NA NA chr10-394 54330636 54330829 153 - chr10:54330672-54330781 NA NA NA NA NA chr10-393 54319024 54319363 208 - chr10:54319077-54319193 NA NA NA NA NA chr10-392 54148571 54148765 146 - chr10:54148687-54148751 NA NA NA NA NA chr10-391 54126916 54127084 146 - chr10:54126936-54127061 NA NA NA NA NA chr10-390 54020892 54021184 151 - chr10:54021035-54021044 NA NA NA NA NA chr10-389 53900343 53900518 149 - chr10:53900369-53900492 NA NA NA NA NA chr10-388 53861464 53861680 140 - chr10:53861571-53861666 NA NA NA NA NA chr10-387 53827663 53827883 175 - chr10:53827730-53827882 NA NA NA NA NA chr10-386 53799152 53799370 162 - chr10:53799210-53799315 NA NA NA NA NA chr10-385 53779788 53779944 142 - chr10:53779795-53779930 NA NA NA NA NA chr10-384 53751810 53752117 245 - chr10:53751860-53752057 NA NA NA NA NA chr10-383 53536856 53537178 177 - chr10:53537025-53537081 NA NA NA NA NA chr10-382 53513810 53514066 163 - chr10:53513922-53514011 NA NA NA NA NA chr10-381 53507358 53507605 159 - chr10:53507445-53507525 NA NA NA NA NA chr10-380 53463718 53463904 170 - chr10:53463726-53463864 NA NA NA NA NA chr10-379 53459017 53459227 167 - chr10:53459064-53459192 NA NA NA NA NA chr10-378 53268994 53269180 149 - chr10:53269029-53269142 NA NA NA NA NA chr10-377 53127364 53127762 227 - chr10:53127611-53127629 NA NA NA NA NA chr10-376 53106013 53106333 159 - chr10:53106191-53106206 NA NA NA NA NA chr10-375 53008236 53008630 197 - chr10:53008341-53008387 NA NA NA NA NA chr10-374 52981301 52981630 192 - chr10:52981353-52981442 NA NA NA NA NA chr10-373 52795068 52795231 146 - chr10:52795073-52795208 NA NA NA NA NA chr10-372 52653344 52653874 289 - chr10:52653486-52653517 NA NA NA NA NA chr10-371 52382864 52383156 180 - chr10:52382981-52383054 NA NA NA NA NA chr10-370 52319259 52319616 284 - chr10:52319324-52319539 NA NA NA NA NA chr10-369 52289483 52289946 394 - chr10:52289619-52289875 NA NA NA NA NA chr10-368 52280066 52280688 330 - chr10:52280341-52280397 NA NA NA NA NA chr10-367 52153301 52153458 136 - chr10:52153306-52153400 NA NA NA NA NA chr10-366 52129810 52130208 178 - chr10:52130058-52130126 NA NA NA NA NA chr10-365 52107443 52107830 219 - chr10:52107647-52107734 NA NA NA NA NA chr10-364 52039886 52040132 141 - chr10:52039999-52040031 NA NA NA NA NA chr10-363 52003114 52003404 150 - chr10:52003262-52003280 NA NA NA NA NA chr10-362 51951663 51951871 131 - chr10:51951720-51951754 NA NA NA NA NA chr10-361 51935094 51935445 174 - chr10:51935297-51935320 NA NA NA NA NA chr10-360 51925736 51926019 136 - chr10:51925754-51925816 NA NA NA NA NA chr10-359 51791854 51792118 158 - chr10:51791972-51792036 NA NA NA NA NA chr10-358 51586064 51586440 226 - chr10:51586116-51586259 NA NA NA NA NA chr10-357 51577055 51577303 153 - chr10:51577151-51577215 NA NA NA NA NA chr10-356 51560289 51560652 260 - chr10:51560379-51560527 NA NA NA NA NA chr10-355 51551091 51551559 233 - chr10:51551309-51551465 NA NA NA NA NA chr10-354 51344890 51345129 153 - chr10:51344972-51345035 NA NA NA NA NA chr10-353 51123007 51123287 173 - chr10:51123140-51123232 NA NA NA NA NA chr10-352 50977404 50977870 223 - chr10:50977457-50977532 NA NA NA NA NA chr10-351 50973226 50973508 150 - chr10:50973366-50973380 NA NA NA NA NA chr10-350 50895430 50895667 154 - chr10:50895517-50895586 NA NA NA NA NA chr10-349 50884690 50884834 132 - chr10:50884720-50884828 NA NA NA NA NA chr10-348 50833598 50833750 147 - chr10:50833599-50833737 NA NA NA NA NA chr10-347 50820894 50821183 161 - chr10:50821030-50821071 NA NA NA NA NA chr10-346 50799103 50799309 172 - chr10:50799103-50799207 NA NA NA NA NA chr10-345 50648691 50649433 460 - chr10:50649114-50649433 NA NA NA NA NA chr10-344 50644878 50645137 157 - chr10:50644968-50645029 NA NA NA NA NA chr10-343 50521494 50521810 263 - chr10:50521501-50521665 NA NA NA NA NA chr10-342 50447835 50448192 293 - chr10:50447837-50448004 NA NA NA NA NA chr10-341 50418734 50418920 149 - chr10:50418765-50418880 NA NA NA NA NA chr10-340 50391684 50391912 113 - chr10:50391737-50391766 NA NA NA NA NA chr10-339 50389341 50389801 284 - chr10:50389547-50389656 NA NA NA NA NA chr10-338 50300264 50300490 168 - chr10:50300312-50300412 NA NA NA NA NA chr10-337 50241731 50242146 307 - chr10:50242054-50242145 NA NA NA NA NA chr10-336 49764422 49764680 149 - chr10:49764538-49764573 NA NA NA NA NA chr10-335 49729199 49729432 149 - chr10:49729283-49729348 NA NA NA NA NA chr10-334 49636624 49636791 135 - chr10:49636640-49636751 NA NA NA NA NA chr10-333 49434332 49434560 176 - chr10:49434410-49434521 NA NA NA NA NA chr10-332 49040224 49040429 133 - chr10:49040280-49040325 NA NA NA NA NA chr10-331 48641021 48641186 132 - chr10:48641104-48641170 NA NA NA NA NA chr10-330 48623178 48623408 178 - chr10:48623242-48623380 NA NA NA NA NA chr10-329 48502636 48502882 116 - chr10:48502730-48502734 NA NA NA NA NA chr10-328 48327898 48328220 264 - chr10:48327995-48328143 NA NA NA NA NA chr10-327 47266917 47267271 191 - chr10:47266952-47267044 NA NA NA NA NA chr10-326 47249554 47249826 150 - chr10:47249668-47249688 NA NA NA NA NA chr10-325 47182003 47182140 113 - chr10:47182045-47182125 NA NA NA NA NA chr10-324 46532338 46532643 225 - chr10:46532397-46532541 NA NA NA NA NA chr10-323 46305130 46305353 176 - chr10:46305167-46305286 NA NA NA NA NA chr10-322 46035995 46036336 280 - chr10:46036081-46036239 NA NA NA NA NA chr10-321 45659328 45659819 353 - chr10:45659400-45659663 NA NA NA NA NA chr10-320 45631636 45631847 137 - chr10:45631716-45631785 NA NA NA NA NA chr10-319 44971128 44971370 153 - chr10:44971219-44971282 NA NA NA NA NA chr10-318 44676968 44677375 355 - chr10:44677033-44677349 NA NA NA NA NA chr10-317 44636498 44636779 200 - chr10:44636515-44636666 NA NA NA NA NA chr10-316 44549945 44550382 331 - chr10:44549956-44550234 NA NA NA NA NA chr10-3 4449795 4450152 265 - chr10:4449875-4450036 NA NA NA NA NA chr10-315 44423334 44423691 237 - chr10:44423466-44423643 NA NA NA NA NA chr10-314 44279380 44279645 170 - chr10:44279455-44279540 NA NA NA NA NA chr10-313 44097116 44097367 160 - chr10:44097207-44097276 NA NA NA NA NA chr10-312 44040775 44041039 132 - chr10:44040909-44040911 NA NA NA NA NA chr10-311 44027730 44028213 305 - chr10:44028064-44028113 NA NA NA NA NA chr10-310 44019128 44019449 180 - chr10:44019301-44019372 NA NA NA NA NA chr10-309 43808994 43809141 125 - chr10:43809003-43809117 NA NA NA NA NA chr10-308 43775125 43775451 239 - chr10:43775172-43775284 NA NA NA NA NA chr10-307 43617508 43617801 162 - chr10:43617649-43617675 NA NA NA NA NA chr10-306 43350799 43351076 196 - chr10:43350858-43350951 NA NA NA NA NA chr10-305 43015544 43015776 191 - chr10:43015565-43015695 NA NA NA NA NA chr10-304 42663408 42663767 223 - chr10:42663648-42663654 NA NA NA NA NA chr10-303 42660573 42660795 138 - chr10:42660646-42660689 NA NA NA NA NA chr10-302 42628220 42628421 119 - chr10:42628321-42628377 NA NA NA NA NA chr10-301 42553592 42553798 170 - chr10:42553639-42553784 NA NA NA NA NA chr10-300 42319855 42320040 139 - chr10:42319910-42320012 NA NA NA NA NA chr10-2 4210984 4211394 283 - chr10:4211055-4211155 NA NA NA NA NA chr10-299 41913091 41913530 211 - chr10:41913365-41913384 NA NA NA NA NA chr10-298 41898800 41899330 316 - chr10:41898877-41898990 NA NA NA NA NA chr10-297 41822474 41822626 141 - chr10:41822499-41822622 NA NA NA NA NA chr10-296 41812543 41812814 221 - chr10:41812558-41812694 NA NA NA NA NA chr10-295 41732078 41732247 153 - chr10:41732098-41732243 NA NA NA NA NA chr10-294 39286211 39286401 145 - chr10:39286252-39286348 NA NA NA NA NA chr10-293 39016235 39016773 224 - chr10:39016438-39016440 NA NA NA NA NA chr10-292 37796911 37797172 127 - chr10:37797029-37797058 NA NA NA NA NA chr10-291 37657401 37657606 154 - chr10:37657453-37657557 NA NA NA NA NA chr10-290 36723282 36723607 201 - chr10:36723434-36723573 NA NA NA NA NA chr10-289 36706890 36707351 287 - chr10:36707200-36707245 NA NA NA NA NA chr10-288 36667022 36667559 273 - chr10:36667294-36667311 NA NA NA NA NA chr10-287 36652116 36652289 119 - chr10:36652226-36652263 NA NA NA NA NA chr10-286 36638480 36638758 188 - chr10:36638638-36638702 NA NA NA NA NA chr10-285 36567038 36567248 167 - chr10:36567085-36567207 NA NA NA NA NA chr10-284 36368458 36368713 164 - chr10:36368513-36368604 NA NA NA NA NA chr10-283 36125397 36125647 124 - chr10:36125497-36125508 NA NA NA NA NA chr10-282 35787948 35788168 130 - chr10:35788082-35788166 NA NA NA NA NA chr10-281 35562160 35562393 156 - chr10:35562233-35562314 NA NA NA NA NA chr10-280 35495233 35495449 116 - chr10:35495299-35495332 NA NA NA NA NA chr10-279 35441961 35442306 243 - chr10:35442077-35442226 NA NA NA NA NA chr10-278 35262366 35262524 154 - chr10:35262367-35262519 NA NA NA NA NA chr10-277 35241871 35242172 161 - chr10:35242009-35242031 NA NA NA NA NA chr10-276 35181247 35181702 225 - chr10:35181317-35181392 NA NA NA NA NA chr10-275 35032874 35033137 179 - chr10:35032918-35033055 NA NA NA NA NA chr10-274 34607800 34607963 151 - chr10:34607818-34607954 NA NA NA NA NA chr10-273 34517288 34517598 167 - chr10:34517422-34517437 NA NA NA NA NA chr10-272 34496585 34496801 151 - chr10:34496643-34496722 NA NA NA NA NA chr10-271 34413432 34413683 161 - chr10:34413529-34413607 NA NA NA NA NA chr10-270 34287758 34287987 150 - chr10:34287829-34287904 NA NA NA NA NA chr10-269 34272856 34273192 214 - chr10:34272865-34273018 NA NA NA NA NA chr10-268 34228021 34228295 138 - chr10:34228160-34228165 NA NA NA NA NA chr10-267 34151961 34152467 346 - chr10:34152033-34152350 NA NA NA NA NA chr10-266 34106686 34106866 152 - chr10:34106714-34106838 NA NA NA NA NA chr10-265 34064438 34064730 156 - chr10:34064582-34064598 NA NA NA NA NA chr10-264 34050118 34050358 169 - chr10:34050165-34050275 NA NA NA NA NA chr10-263 33708194 33708491 252 - chr10:33708238-33708444 NA NA NA NA NA chr10-262 33611179 33611458 139 - chr10:33611382-33611451 NA NA NA NA NA chr10-261 33585653 33585814 154 - chr10:33585663-33585813 NA NA NA NA NA chr10-260 33552368 33552800 254 - chr10:33552432-33552597 NA NA NA NA NA chr10-259 33545798 33545951 142 - chr10:33545803-33545928 NA NA NA NA NA chr10-258 33545411 33545687 144 - chr10:33545555-33545561 NA NA NA NA NA chr10-257 33430002 33430160 120 - chr10:33430011-33430112 NA NA NA NA NA chr10-256 33416275 33416537 157 - chr10:33416366-33416425 NA NA NA NA NA chr10-255 33383750 33384060 241 - chr10:33383776-33383905 NA NA NA NA NA chr10-254 33219703 33220117 259 - chr10:33219852-33220002 NA NA NA NA NA chr10-253 33129973 33130385 215 - chr10:33130205-33130258 NA NA NA NA NA chr10-252 32949382 32949826 198 - chr10:32949683-32949690 NA NA NA NA NA chr10-251 32894224 32894445 134 - chr10:32894349-32894377 NA NA NA NA NA chr10-250 32827222 32827456 155 - chr10:32827315-32827405 NA NA NA NA NA chr10-249 32782489 32782742 136 - chr10:32782618-32782649 NA NA NA NA NA chr10-248 32770559 32770954 213 - chr10:32770649-32770726 NA NA NA NA NA chr10-247 32544737 32544967 191 - chr10:32544778-32544929 NA NA NA NA NA chr10-246 32524651 32525040 244 - chr10:32524693-32524911 NA NA NA NA NA chr10-245 32435350 32435633 155 - chr10:32435484-32435517 NA NA NA NA NA chr10-244 32308094 32308521 246 - chr10:32308373-32308440 NA NA NA NA NA chr10-243 32198667 32198901 206 - chr10:32198690-32198863 NA NA NA NA NA chr10-242 32157764 32158049 180 - chr10:32157898-32157916 NA NA NA NA NA chr10-241 32029195 32029480 150 - chr10:32029342-32029369 NA NA NA NA NA chr10-240 31948251 31948431 154 - chr10:31948281-31948407 NA NA NA NA NA chr10-239 31900848 31901051 176 - chr10:31900875-31901024 NA NA NA NA NA chr10-238 31867467 31867684 147 - chr10:31867534-31867608 NA NA NA NA NA chr10-237 31796456 31796679 129 - chr10:31796512-31796566 NA NA NA NA NA chr10-236 31726091 31726387 196 - chr10:31726221-31726367 NA NA NA NA NA chr10-235 31505678 31506057 210 - chr10:31505811-31505816 NA NA NA NA NA chr10-234 31482677 31482968 229 - chr10:31482799-31482936 NA NA NA NA NA chr10-233 31480371 31480864 244 - chr10:31480470-31480528 NA NA NA NA NA chr10-232 31404899 31405123 150 - chr10:31404969-31405041 NA NA NA NA NA chr10-231 31340516 31340950 214 - chr10:31340567-31340615 NA NA NA NA NA chr10-230 31303168 31303380 156 - chr10:31303222-31303320 NA NA NA NA NA chr10-229 31177658 31177825 161 - chr10:31177666-31177824 NA NA NA NA NA chr10-228 31172269 31172562 129 - chr10:31172507-31172546 NA NA NA NA NA chr10-227 30885824 30886118 162 - chr10:30885961-30885996 NA NA NA NA NA chr10-226 30870312 30870688 234 - chr10:30870389-30870416 NA NA NA NA NA chr10-225 30826635 30826855 159 - chr10:30826698-30826798 NA NA NA NA NA chr10-224 30740969 30741290 205 - chr10:30741092-30741188 NA NA NA NA NA chr10-223 30504169 30504359 154 - chr10:30504209-30504325 NA NA NA NA NA chr10-222 30167035 30167306 137 - chr10:30167165-30167170 NA NA NA NA NA chr10-221 30119369 30119674 169 - chr10:30119501-30119530 NA NA NA NA NA chr10-220 30001133 30001528 249 - chr10:30001389-30001437 NA NA NA NA NA chr10-219 29846139 29846403 157 - chr10:29846236-29846291 NA NA NA NA NA chr10-218 29808094 29808396 248 - chr10:29808250-29808393 NA NA NA NA NA chr10-217 29692040 29692346 196 - chr10:29692192-29692257 NA NA NA NA NA chr10-216 29641119 29641263 115 - chr10:29641157-29641252 NA NA NA NA NA chr10-215 29595095 29595400 178 - chr10:29595250-29595329 NA NA NA NA NA chr10-214 29537680 29537985 176 - chr10:29537797-29537820 NA NA NA NA NA chr10-213 29349357 29349597 160 - chr10:29349432-29349507 NA NA NA NA NA chr10-212 29312942 29313147 148 - chr10:29313085-29313133 NA NA NA NA NA chr10-211 29203887 29204166 179 - chr10:29203964-29204093 NA NA NA NA NA chr10-210 29010383 29010800 277 - chr10:29010583-29010690 NA NA NA NA NA chr10-209 28942520 28942827 175 - chr10:28942664-28942701 NA NA NA NA NA chr10-208 28939496 28940021 311 - chr10:28939640-28939674 NA NA NA NA NA chr10-207 28613732 28613913 157 - chr10:28613735-28613880 NA NA NA NA NA chr10-206 28596111 28596437 209 - chr10:28596187-28596238 NA NA NA NA NA chr10-205 28512213 28512548 220 - chr10:28512356-28512447 NA NA NA NA NA chr10-204 28124042 28124275 158 - chr10:28124091-28124187 NA NA NA NA NA chr10-203 27933397 27933905 257 - chr10:27933656-27933706 NA NA NA NA NA chr10-202 27913188 27913413 183 - chr10:27913252-27913382 NA NA NA NA NA chr10-201 27832665 27832909 127 - chr10:27832793-27832814 NA NA NA NA NA chr10-200 27765593 27766013 262 - chr10:27765882-27765957 NA NA NA NA NA chr10-199 27752583 27752844 151 - chr10:27752687-27752731 NA NA NA NA NA chr10-198 27692691 27692978 146 - chr10:27692836-27692845 NA NA NA NA NA chr10-197 27691424 27691734 257 - chr10:27691575-27691726 NA NA NA NA NA chr10-196 27663231 27663389 120 - chr10:27663236-27663285 NA NA NA NA NA chr10-195 27561498 27561742 126 - chr10:27561627-27561646 NA NA NA NA NA chr10-194 27542093 27542361 207 - chr10:27542095-27542182 NA NA NA NA NA chr10-193 27155587 27155765 113 - chr10:27155610-27155679 NA NA NA NA NA chr10-192 26806677 26806880 156 - chr10:26806716-26806817 NA NA NA NA NA chr10-191 26484715 26484934 169 - chr10:26484775-26484904 NA NA NA NA NA chr10-190 26168028 26168293 157 - chr10:26168148-26168191 NA NA NA NA NA chr10-189 26083908 26084285 202 - chr10:26083961-26084049 NA NA NA NA NA chr10-188 26029357 26029626 186 - chr10:26029478-26029562 NA NA NA NA NA chr10-187 26022042 26022279 198 - chr10:26022127-26022263 NA NA NA NA NA chr10-186 25998418 25998621 148 - chr10:25998468-25998556 NA NA NA NA NA chr10-185 25935503 25935822 183 - chr10:25935663-25935734 NA NA NA NA NA chr10-184 25905075 25905529 254 - chr10:25905240-25905259 NA NA NA NA NA chr10-183 25885148 25885443 157 - chr10:25885290-25885307 NA NA NA NA NA chr10-182 25882421 25882611 112 - chr10:25882426-25882499 NA NA NA NA NA chr10-181 25840247 25840630 307 - chr10:25840251-25840520 NA NA NA NA NA chr10-180 25798752 25798943 159 - chr10:25798769-25798881 NA NA NA NA NA chr10-179 25758982 25759214 162 - chr10:25759065-25759170 NA NA NA NA NA chr10-178 25644071 25644377 190 - chr10:25644164-25644215 NA NA NA NA NA chr10-177 25484201 25484587 186 - chr10:25484477-25484563 NA NA NA NA NA chr10-176 25459436 25459665 116 - chr10:25459515-25459535 NA NA NA NA NA chr10-175 25455132 25455410 196 - chr10:25455252-25455404 NA NA NA NA NA chr10-174 25406272 25406640 218 - chr10:25406482-25406580 NA NA NA NA NA chr10-173 25306667 25306932 119 - chr10:25306755-25306801 NA NA NA NA NA chr10-172 25121266 25121582 261 - chr10:25121426-25121577 NA NA NA NA NA chr10-171 24999983 25000233 155 - chr10:25000065-25000112 NA NA NA NA NA chr10-170 24961324 24961521 129 - chr10:24961354-24961377 NA NA NA NA NA chr10-169 24892624 24893010 191 - chr10:24892867-24892899 NA NA NA NA NA chr10-168 24878142 24878354 124 - chr10:24878236-24878269 NA NA NA NA NA chr10-167 24867974 24868269 156 - chr10:24868129-24868138 NA NA NA NA NA chr10-166 24785254 24785718 324 - chr10:24785506-24785656 NA NA NA NA NA chr10-165 24781936 24782193 163 - chr10:24782034-24782101 NA NA NA NA NA chr10-164 24533608 24534008 261 - chr10:24533666-24533773 NA NA NA NA NA chr10-163 24495621 24495836 148 - chr10:24495693-24495779 NA NA NA NA NA chr10-162 23948747 23948967 154 - chr10:23948817-23948903 NA NA NA NA NA chr10-161 23807472 23807782 220 - chr10:23807706-23807764 NA NA NA NA NA chr10-160 23622861 23623103 147 - chr10:23622954-23623007 NA NA NA NA NA chr10-159 23520179 23520514 208 - chr10:23520291-23520357 NA NA NA NA NA chr10-158 23267551 23267966 213 - chr10:23267661-23267718 NA NA NA NA NA chr10-157 23037087 23037920 585 - chr10:23037267-23037711 NA NA NA NA NA chr10-156 22875015 22875253 162 - chr10:22875102-22875199 NA NA NA NA NA chr10-155 22465058 22465262 157 - chr10:22465111-22465227 NA NA NA NA NA chr10-154 22430883 22431088 125 - chr10:22431039-22431046 NA NA NA NA NA chr10-153 22387276 22387603 182 - chr10:22387445-22387506 NA NA NA NA NA chr10-152 22353634 22353897 152 - chr10:22353751-22353789 NA NA NA NA NA chr10-151 22224894 22225409 259 - chr10:22224894-22225025 NA NA NA NA NA chr10-150 22192134 22192402 139 - chr10:22192280-22192283 NA NA NA NA NA chr10-149 22117702 22117866 132 - chr10:22117726-22117794 NA NA NA NA NA chr10-148 21940330 21940549 133 - chr10:21940439-21940509 NA NA NA NA NA chr10-147 21920935 21921430 314 - chr10:21921036-21921089 NA NA NA NA NA chr10-146 21917547 21917821 144 - chr10:21917664-21917693 NA NA NA NA NA chr10-145 21720808 21720996 149 - chr10:21720847-21720957 NA NA NA NA NA chr10-144 21715350 21715772 214 - chr10:21715618-21715671 NA NA NA NA NA chr10-143 21644405 21644679 172 - chr10:21644445-21644546 NA NA NA NA NA chr10-142 21583348 21583537 137 - chr10:21583390-21583501 NA NA NA NA NA chr10-141 21218251 21218421 135 - chr10:21218338-21218412 NA NA NA NA NA chr10-140 21065215 21065477 225 - chr10:21065271-21065422 NA NA NA NA NA chr10-139 20956920 20957066 142 - chr10:20956921-20957055 NA NA NA NA NA chr10-138 20909665 20909969 192 - chr10:20909725-20909753 NA NA NA NA NA chr10-137 20840915 20841194 129 - chr10:20841127-20841168 NA NA NA NA NA chr10-136 20825156 20825450 201 - chr10:20825166-20825323 NA NA NA NA NA chr10-135 20715965 20716419 202 - chr10:20716302-20716337 NA NA NA NA NA chr10-134 20676590 20676792 163 - chr10:20676643-20676760 NA NA NA NA NA chr10-133 20510668 20511034 302 - chr10:20510781-20510955 NA NA NA NA NA chr10-132 20386679 20387116 329 - chr10:20386689-20386802 NA NA NA NA NA chr10-131 20252536 20252853 182 - chr10:20252565-20252665 NA NA NA NA NA chr10-130 20157983 20158187 116 - chr10:20158033-20158080 NA NA NA NA NA chr10-129 20141190 20141355 152 - chr10:20141197-20141339 NA NA NA NA NA chr10-128 20082274 20082754 274 - chr10:20082440-20082468 NA NA NA NA NA chr10-127 20070853 20071326 228 - chr10:20071119-20071123 NA NA NA NA NA chr10-126 20033494 20033700 174 - chr10:20033510-20033668 NA NA NA NA NA chr10 2002623 2002942 192 - chr10:2002666-2002773 NA NA NA NA NA chr10-125 19648125 19648479 255 - chr10:19648326-19648431 NA NA NA NA NA chr10-124 19592202 19592489 154 - chr10:19592333-19592352 NA NA NA NA NA chr10-123 19551771 19551987 168 - chr10:19551897-19551978 NA NA NA NA NA chr10-122 19494527 19494938 326 - chr10:19494577-19494733 NA NA NA NA NA chr10-121 19437060 19437260 118 - chr10:19437204-19437209 NA NA NA NA NA chr10-120 19301897 19302167 149 - chr10:19302018-19302046 NA NA NA NA NA chr10-119 19234337 19234665 186 - chr10:19234497-19234559 NA NA NA NA NA chr10-118 19198809 19199283 251 - chr10:19199119-19199227 NA NA NA NA NA chr10-117 19186003 19186191 157 - chr10:19186032-19186159 NA NA NA NA NA chr10-116 19180015 19180415 241 - chr10:19180179-19180266 NA NA NA NA NA chr10-115 19084837 19085239 234 - chr10:19085006-19085156 NA NA NA NA NA chr10-114 18948093 18948491 284 - chr10:18948134-18948231 NA NA NA NA NA chr10-113 18914249 18914569 160 - chr10:18914389-18914399 NA NA NA NA NA chr10-112 18801442 18801733 160 - chr10:18801592-18801631 NA NA NA NA NA chr10-111 18738780 18739122 283 - chr10:18738797-18739042 NA NA NA NA NA chr10-110 18636599 18636921 137 - chr10:18636858-18636884 NA NA NA NA NA chr10-109 18326165 18326668 351 - chr10:18326399-18326548 NA NA NA NA NA chr10-108 18096498 18096788 206 - chr10:18096616-18096770 NA NA NA NA NA chr10-107 17928204 17928420 178 - chr10:17928228-17928375 NA NA NA NA NA chr10-106 17880737 17880989 192 - chr10:17880815-17880965 NA NA NA NA NA chr10-105 17859813 17860236 244 - chr10:17860044-17860201 NA NA NA NA NA chr10-104 17790817 17791145 270 - chr10:17790834-17791005 NA NA NA NA NA chr10-103 17694329 17694657 153 - chr10:17694404-17694432 NA NA NA NA NA chr10-102 17501224 17501394 157 - chr10:17501232-17501371 NA NA NA NA NA chr10-101 17348906 17349214 158 - chr10:17349059-17349070 NA NA NA NA NA chr10-100 17313026 17313194 130 - chr10:17313110-17313179 NA NA NA NA NA chr10-99 17277608 17277894 163 - chr10:17277723-17277755 NA NA NA NA NA chr10-98 17134294 17134514 133 - chr10:17134413-17134443 NA NA NA NA NA chr10-97 17128538 17129000 238 - chr10:17128799-17128850 NA NA NA NA NA chr10-96 17118011 17118253 140 - chr10:17118091-17118140 NA NA NA NA NA chr10-95 17101378 17101554 141 - chr10:17101401-17101513 NA NA NA NA NA chr10-94 17079653 17079960 182 - chr10:17079694-17079793 NA NA NA NA NA chr10-93 17057119 17057428 162 - chr10:17057282-17057289 NA NA NA NA NA chr10-92 17048829 17049231 190 - chr10:17048897-17048947 NA NA NA NA NA chr10-91 16991039 16991273 163 - chr10:16991109-16991200 NA NA NA NA NA chr10-90 16986554 16986754 141 - chr10:16986617-16986703 NA NA NA NA NA chr10-89 16721811 16722037 148 - chr10:16721882-16721963 NA NA NA NA NA chr10-88 16534264 16534522 172 - chr10:16534338-16534412 NA NA NA NA NA chr10-87 16473563 16473870 162 - chr10:16473728-16473735 NA NA NA NA NA chr10-86 16435140 16435412 149 - chr10:16435286-16435335 NA NA NA NA NA chr10-85 16386446 16386800 286 - chr10:16386617-16386767 NA NA NA NA NA chr10-84 16363158 16363467 202 - chr10:16363312-16363360 NA NA NA NA NA chr10-83 16106228 16106386 156 - chr10:16106228-16106380 NA NA NA NA NA chr10-82 15949555 15949758 127 - chr10:15949654-15949728 NA NA NA NA NA chr10-81 15925543 15925742 137 - chr10:15925637-15925696 NA NA NA NA NA chr10-80 15802969 15803231 156 - chr10:15803081-15803128 NA NA NA NA NA chr10-79 15802312 15802543 180 - chr10:15802321-15802471 NA NA NA NA NA chr10-78 15662987 15663548 357 - chr10:15663331-15663351 NA NA NA NA NA chr10-77 15613676 15613938 159 - chr10:15613781-15613839 NA NA NA NA NA chr10-76 15560931 15561109 169 - chr10:15560958-15561109 NA NA NA NA NA chr10-75 15430877 15431202 167 - chr10:15430977-15431015 NA NA NA NA NA chr10-74 15414773 15414903 126 - chr10:15414773-15414891 NA NA NA NA NA chr10-73 15228010 15228271 157 - chr10:15228108-15228155 NA NA NA NA NA chr10-72 15030528 15030831 160 - chr10:15030665-15030685 NA NA NA NA NA chr10-71 14955254 14955446 134 - chr10:14955296-14955380 NA NA NA NA NA chr10-70 14876444 14876597 140 - chr10:14876465-14876588 NA NA NA NA NA chr10-69 14716212 14716522 240 - chr10:14716378-14716500 NA NA NA NA NA chr10-68 14503153 14503726 265 - chr10:14503295-14503335 NA NA NA NA NA chr10-67 14485123 14485358 177 - chr10:14485173-14485234 NA NA NA NA NA chr10-66 14313184 14313527 243 - chr10:14313241-14313341 NA NA NA NA NA chr10-65 14249399 14249575 152 - chr10:14249423-14249551 NA NA NA NA NA chr10-64 14210616 14210824 166 - chr10:14210686-14210796 NA NA NA NA NA chr10-63 14096581 14096890 151 - chr10:14096611-14096668 NA NA NA NA NA chr10-62 13960970 13961236 173 - chr10:13961097-13961148 NA NA NA NA NA chr10-61 13939793 13940092 173 - chr10:13939904-13939936 NA NA NA NA NA chr10-60 13740356 13740602 150 - chr10:13740453-13740508 NA NA NA NA NA chr10-59 13707368 13707567 158 - chr10:13707417-13707542 NA NA NA NA NA chr10-58 13649067 13649232 156 - chr10:13649094-13649232 NA NA NA NA NA chr10-57 13559048 13559233 126 - chr10:13559092-13559144 NA NA NA NA NA chr10-56 13533966 13534171 191 - chr10:13533974-13534145 NA NA NA NA NA chr10-55 13505405 13505973 303 - chr10:13505791-13505898 NA NA NA NA NA chr10-54 13445142 13445428 162 - chr10:13445272-13445316 NA NA NA NA NA chr10-53 13382570 13382802 175 - chr10:13382627-13382745 NA NA NA NA NA chr10-929 133564340 133564613 167 - chr10:133564410-133564489 NA NA NA NA NA chr10-928 132661390 132661666 140 - chr10:132661519-132661591 NA NA NA NA NA chr10-927 132594127 132594385 196 - chr10:132594211-132594376 NA NA NA NA NA chr10-926 132513809 132514047 149 - chr10:132513898-132513958 NA NA NA NA NA chr10-52 13249706 13249933 139 - chr10:13249838-13249867 NA NA NA NA NA chr10-925 131770273 131770527 196 - chr10:131770401-131770504 NA NA NA NA NA chr10-924 131453682 131453869 166 - chr10:131453711-131453852 NA NA NA NA NA chr10-51 13140688 13141096 222 - chr10:13140689-13140818 NA NA NA NA NA chr10-923 131092309 131092495 134 - chr10:131092372-131092465 NA NA NA NA NA chr10-50 13089058 13089276 133 - chr10:13089131-13089167 NA NA NA NA NA chr10-922 130621535 130621949 324 - chr10:130621543-130621822 NA NA NA NA NA chr10-921 130445217 130445475 154 - chr10:130445327-130445383 NA NA NA NA NA chr10-920 129509849 129510020 136 - chr10:129509876-129509969 NA NA NA NA NA chr10-919 129431326 129431605 127 - chr10:129431414-129431421 NA NA NA NA NA chr10-918 129339899 129340059 143 - chr10:129339941-129340050 NA NA NA NA NA chr10-917 129159796 129160202 232 - chr10:129160042-129160097 NA NA NA NA NA chr10-916 129122225 129122607 228 - chr10:129122229-129122378 NA NA NA NA NA chr10-915 128267660 128267852 154 - chr10:128267694-128267806 NA NA NA NA NA chr10-49 12801736 12802013 199 - chr10:12801858-12801957 NA NA NA NA NA chr10-914 128007254 128007469 153 - chr10:128007294-128007363 NA NA NA NA NA chr10-48 12749055 12749295 158 - chr10:12749132-12749203 NA NA NA NA NA chr10-913 126798445 126798831 288 - chr10:126798572-126798664 NA NA NA NA NA chr10-912 126632493 126632744 207 - chr10:126632524-126632674 NA NA NA NA NA chr10-911 126304384 126304668 155 - chr10:126304515-126304543 NA NA NA NA NA chr10-910 125935933 125936294 199 - chr10:125936014-125936162 NA NA NA NA NA chr10-909 125860361 125860543 157 - chr10:125860381-125860508 NA NA NA NA NA chr10-908 125846651 125846962 160 - chr10:125846784-125846802 NA NA NA NA NA chr10-907 125821369 125821613 185 - chr10:125821464-125821572 NA NA NA NA NA chr10-906 125769842 125770116 149 - chr10:125769965-125769995 NA NA NA NA NA chr10-905 125676182 125676490 172 - chr10:125676304-125676347 NA NA NA NA NA chr10-904 125557390 125557684 200 - chr10:125557390-125557543 NA NA NA NA NA chr10-903 125252980 125253257 161 - chr10:125253086-125253136 NA NA NA NA NA chr10-902 125199379 125199710 253 - chr10:125199382-125199482 NA NA NA NA NA chr10-901 125132402 125132818 187 - chr10:125132683-125132693 NA NA NA NA NA chr10-900 124960100 124960336 147 - chr10:124960191-124960251 NA NA NA NA NA chr10-899 124647056 124647400 196 - chr10:124647184-124647212 NA NA NA NA NA chr10-898 124632974 124633475 235 - chr10:124633323-124633375 NA NA NA NA NA chr10-897 124063609 124064007 315 - chr10:124063710-124063859 NA NA NA NA NA chr10-896 124030692 124031027 231 - chr10:124030829-124030989 NA NA NA NA NA chr10-895 123652942 123653200 153 - chr10:123653054-123653109 NA NA NA NA NA chr10-47 12352325 12352639 158 - chr10:12352457-12352471 NA NA NA NA NA chr10-894 123367237 123367532 176 - chr10:123367364-123367417 NA NA NA NA NA chr10-46 12324474 12324676 181 - chr10:12324484-12324633 NA NA NA NA NA chr10-893 122936498 122936724 151 - chr10:122936567-122936646 NA NA NA NA NA chr10-892 122932649 122932854 153 - chr10:122932701-122932802 NA NA NA NA NA chr10-891 122895925 122896220 179 - chr10:122896075-122896121 NA NA NA NA NA chr10-890 122669416 122669673 170 - chr10:122669525-122669597 NA NA NA NA NA chr10-889 122442058 122442248 151 - chr10:122442094-122442203 NA NA NA NA NA chr10-888 122410004 122410201 152 - chr10:122410043-122410153 NA NA NA NA NA chr10-887 122002189 122002557 174 - chr10:122002325-122002372 NA NA NA NA NA chr10-886 121940321 121940467 116 - chr10:121940381-121940437 NA NA NA NA NA chr10-45 12185653 12185950 162 - chr10:12185736-12185789 NA NA NA NA NA chr10-44 12164501 12164883 230 - chr10:12164626-12164704 NA NA NA NA NA chr10-885 121633290 121633729 259 - chr10:121633559-121633728 NA NA NA NA NA chr10-884 121590219 121590423 149 - chr10:121590280-121590371 NA NA NA NA NA chr10-883 121486176 121486361 147 - chr10:121486218-121486331 NA NA NA NA NA chr10-882 121455364 121455535 151 - chr10:121455368-121455509 NA NA NA NA NA chr10-881 121401125 121401440 154 - chr10:121401298-121401303 NA NA NA NA NA chr10-880 121395702 121395970 130 - chr10:121395851-121395854 NA NA NA NA NA chr10-879 121265431 121265696 173 - chr10:121265535-121265610 NA NA NA NA NA chr10-878 120541336 120541517 149 - chr10:120541370-120541486 NA NA NA NA NA chr10-877 120530412 120530560 140 - chr10:120530422-120530553 NA NA NA NA NA chr10-876 120466076 120466374 252 - chr10:120466125-120466285 NA NA NA NA NA chr10-875 120271779 120272114 217 - chr10:120271911-120272069 NA NA NA NA NA chr10-43 12018928 12019310 234 - chr10:12018941-12019101 NA NA NA NA NA chr10-874 119979533 119979744 150 - chr10:119979600-119979686 NA NA NA NA NA chr10-873 119930253 119930423 157 - chr10:119930262-119930402 NA NA NA NA NA chr10-872 119830614 119830849 112 - chr10:119830791-119830834 NA NA NA NA NA chr10-42 11963528 11963940 207 - chr10:11963645-11963691 NA NA NA NA NA chr10-871 119578476 119578755 216 - chr10:119578509-119578632 NA NA NA NA NA chr10-870 119530273 119530646 301 - chr10:119530409-119530566 NA NA NA NA NA chr10-869 119099478 119099807 180 - chr10:119099607-119099648 NA NA NA NA NA chr10-868 119065410 119065646 201 - chr10:119065505-119065641 NA NA NA NA NA chr10-867 119048927 119049122 156 - chr10:119048956-119049078 NA NA NA NA NA chr10-866 118928653 118928866 164 - chr10:118928713-118928825 NA NA NA NA NA chr10-865 118762852 118763140 200 - chr10:118762980-118763132 NA NA NA NA NA chr10-864 118487211 118487438 158 - chr10:118487282-118487373 NA NA NA NA NA chr10-863 118393299 118393667 275 - chr10:118393528-118393642 NA NA NA NA NA chr10-862 118324156 118324672 250 - chr10:118324515-118324565 NA NA NA NA NA chr10-861 118321136 118321658 376 - chr10:118321213-118321513 NA NA NA NA NA chr10-41 11818768 11819000 150 - chr10:11818846-11818910 NA NA NA NA NA chr10-860 118104783 118105012 193 - chr10:118104856-118104977 NA NA NA NA NA chr10-859 117857487 117857683 162 - chr10:117857518-117857663 NA NA NA NA NA chr10-858 117767328 117767664 191 - chr10:117767393-117767479 NA NA NA NA NA chr10-857 117340479 117340878 233 - chr10:117340513-117340663 NA NA NA NA NA chr10-856 116985138 116985620 221 - chr10:116985460-116985492 NA NA NA NA NA chr10-855 116829942 116830204 182 - chr10:116830038-116830156 NA NA NA NA NA chr10-854 116736134 116736478 199 - chr10:116736273-116736321 NA NA NA NA NA chr10-853 116638955 116639187 178 - chr10:116639021-116639157 NA NA NA NA NA chr10-852 116339776 116340047 166 - chr10:116339880-116339940 NA NA NA NA NA chr10-851 115988909 115989087 154 - chr10:115988945-115989087 NA NA NA NA NA chr10-850 115787531 115787923 197 - chr10:115787765-115787806 NA NA NA NA NA chr10-849 115696759 115697140 254 - chr10:115696978-115697057 NA NA NA NA NA chr10-848 115620907 115621194 200 - chr10:115620960-115621039 NA NA NA NA NA chr10-847 115610652 115610978 270 - chr10:115610654-115610814 NA NA NA NA NA chr10-846 115507098 115507410 166 - chr10:115507254-115507347 NA NA NA NA NA chr10-845 115445195 115445429 209 - chr10:115445197-115445358 NA NA NA NA NA chr10-844 115330705 115331030 171 - chr10:115330858-115330874 NA NA NA NA NA chr10-843 115045328 115045512 149 - chr10:115045373-115045482 NA NA NA NA NA chr10-40 11503492 11503757 209 - chr10:11503550-11503647 NA NA NA NA NA chr10-842 115027395 115027748 252 - chr10:115027444-115027543 NA NA NA NA NA chr10-841 114975707 114976111 343 - chr10:114975739-114976099 NA NA NA NA NA chr10-840 114957813 114958071 125 - chr10:114957960-114957966 NA NA NA NA NA chr10-839 114951042 114951281 176 - chr10:114951115-114951165 NA NA NA NA NA chr10-838 114671820 114672114 161 - chr10:114671954-114671984 NA NA NA NA NA chr10-837 113915299 113915500 151 - chr10:113915345-113915448 NA NA NA NA NA chr10-836 113575771 113576240 367 - chr10:113575897-113576060 NA NA NA NA NA chr10-835 113468971 113469307 272 - chr10:113469044-113469188 NA NA NA NA NA chr10-834 113350212 113350434 112 - chr10:113350341-113350362 NA NA NA NA NA chr10-833 113214592 113215086 236 - chr10:113214958-113215065 NA NA NA NA NA chr10-832 113108625 113108922 248 - chr10:113108635-113108795 NA NA NA NA NA chr10-831 112700775 112701082 187 - chr10:112700825-112700927 NA NA NA NA NA chr10-830 112603698 112604209 300 - chr10:112603921-112604084 NA NA NA NA NA chr10-829 112314313 112314766 301 - chr10:112314438-112314584 NA NA NA NA NA chr10-828 111824305 111824602 153 - chr10:111824446-111824479 NA NA NA NA NA chr10-827 111767234 111767704 263 - chr10:111767510-111767567 NA NA NA NA NA chr10-826 111747023 111747352 194 - chr10:111747191-111747251 NA NA NA NA NA chr10-825 111718775 111718941 131 - chr10:111718815-111718916 NA NA NA NA NA chr10-824 111423402 111423622 174 - chr10:111423423-111423574 NA NA NA NA NA chr10-823 110968648 110968851 199 - chr10:110968648-110968845 NA NA NA NA NA chr10-822 110900831 110900999 129 - chr10:110900850-110900920 NA NA NA NA NA chr10-821 110790863 110791135 167 - chr10:110790984-110791038 NA NA NA NA NA chr10-820 110576197 110576418 152 - chr10:110576261-110576339 NA NA NA NA NA chr10-819 110146258 110146624 244 - chr10:110146470-110146547 NA NA NA NA NA chr10-818 110125394 110125622 184 - chr10:110125428-110125558 NA NA NA NA NA chr10-817 109870939 109871276 204 - chr10:109871046-109871091 NA NA NA NA NA chr10-39 10986283 10986579 179 - chr10:10986344-10986434 NA NA NA NA NA chr10-816 109844239 109844454 132 - chr10:109844302-109844361 NA NA NA NA NA chr10-38 10983279 10983750 235 - chr10:10983359-10983436 NA NA NA NA NA chr10-815 109543489 109543689 162 - chr10:109543534-109543677 NA NA NA NA NA chr10-814 109376664 109376850 146 - chr10:109376664-109376790 NA NA NA NA NA chr10-813 109365126 109365482 299 - chr10:109365273-109365458 NA NA NA NA NA chr10-812 109354319 109354469 149 - chr10:109354320-109354468 NA NA NA NA NA chr10-37 10929340 10929607 136 - chr10:10929409-10929445 NA NA NA NA NA chr10-811 109037434 109037597 128 - chr10:109037481-109037586 NA NA NA NA NA chr10-810 109015221 109015545 179 - chr10:109015358-109015396 NA NA NA NA NA chr10-809 108925378 108925540 150 - chr10:108925388-108925527 NA NA NA NA NA chr10-808 108908457 108908855 204 - chr10:108908569-108908620 NA NA NA NA NA chr10-807 108763362 108763686 166 - chr10:108763521-108763530 NA NA NA NA NA chr10-806 108668458 108668806 193 - chr10:108668674-108668773 NA NA NA NA NA chr10-805 108570450 108570799 259 - chr10:108570650-108570764 NA NA NA NA NA chr10-804 108532031 108532329 188 - chr10:108532167-108532244 NA NA NA NA NA chr10-803 108308189 108308405 139 - chr10:108308280-108308356 NA NA NA NA NA chr10-802 108226230 108226515 229 - chr10:108226279-108226445 NA NA NA NA NA chr10-801 108143870 108144056 129 - chr10:108143900-108143945 NA NA NA NA NA chr10-800 108142294 108142599 256 - chr10:108142397-108142555 NA NA NA NA NA chr10-799 107890918 107891155 132 - chr10:107890987-107891032 NA NA NA NA NA chr10-798 107668279 107668594 180 - chr10:107668388-107668446 NA NA NA NA NA chr10-797 107446687 107446902 157 - chr10:107446765-107446854 NA NA NA NA NA chr10-796 107055213 107055503 197 - chr10:107055409-107055500 NA NA NA NA NA chr10-795 106611437 106611824 204 - chr10:106611652-106611705 NA NA NA NA NA chr10-794 106488641 106489000 225 - chr10:106488694-106488852 NA NA NA NA NA chr10-793 106449871 106450162 178 - chr10:106450014-106450064 NA NA NA NA NA chr10-792 106408978 106409325 227 - chr10:106409044-106409211 NA NA NA NA NA chr10-791 106248050 106248360 252 - chr10:106248206-106248351 NA NA NA NA NA chr10-790 105935958 105936133 166 - chr10:105935958-105936106 NA NA NA NA NA chr10-789 105866008 105866172 160 - chr10:105866013-105866165 NA NA NA NA NA chr10-788 105526324 105526502 124 - chr10:105526336-105526427 NA NA NA NA NA chr10-787 105507094 105507302 141 - chr10:105507151-105507215 NA NA NA NA NA chr10-786 105327763 105328067 172 - chr10:105327915-105327975 NA NA NA NA NA chr10-785 104376529 104376749 146 - chr10:104376583-104376665 NA NA NA NA NA chr10-784 104286200 104286390 150 - chr10:104286241-104286352 NA NA NA NA NA chr10-783 103889395 103889564 162 - chr10:103889395-103889543 NA NA NA NA NA chr10-782 103840607 103840872 148 - chr10:103840734-103840775 NA NA NA NA NA chr10-781 103777300 103777607 256 - chr10:103777300-103777463 NA NA NA NA NA chr10-780 103587312 103587463 119 - chr10:103587398-103587458 NA NA NA NA NA chr10-779 103316658 103316908 184 - chr10:103316745-103316896 NA NA NA NA NA chr10-778 103045379 103045817 192 - chr10:103045389-103045458 NA NA NA NA NA chr10-777 102915382 102915853 424 - chr10:102915385-102915815 NA NA NA NA NA chr10-776 102807220 102807508 234 - chr10:102807382-102807508 NA NA NA NA NA chr10-775 102265576 102265900 209 - chr10:102265593-102265736 NA NA NA NA NA chr10-774 102225283 102225556 132 - chr10:102225410-102225434 NA NA NA NA NA chr10-773 102223232 102223479 215 - chr10:102223234-102223385 NA NA NA NA NA chr10-772 102196698 102197009 180 - chr10:102196824-102196868 NA NA NA NA NA chr10-771 102049529 102050043 235 - chr10:102049914-102049915 NA NA NA NA NA chr10-36 10201890 10202105 163 - chr10:10201936-10202050 NA NA NA NA NA chr10-770 101904429 101904695 145 - chr10:101904542-101904570 NA NA NA NA NA chr10-769 101896946 101897339 241 - chr10:101897158-101897323 NA NA NA NA NA chr10-768 101684787 101684986 120 - chr10:101684831-101684837 NA NA NA NA NA chr10-767 101678984 101679228 179 - chr10:101679029-101679153 NA NA NA NA NA chr10-766 101642571 101642924 216 - chr10:101642572-101642698 NA NA NA NA NA chr10-35 10150971 10151375 168 - chr10:10151282-10151332 NA NA NA NA NA chr10-765 101508064 101508313 134 - chr10:101508175-101508190 NA NA NA NA NA chr10-764 101364411 101364971 248 - chr10:101364497-101364553 NA NA NA NA NA chr10-763 101257184 101257618 303 - chr10:101257438-101257479 NA NA NA NA NA chr10-762 101231954 101232262 192 - chr10:101231982-101232102 NA NA NA NA NA chr10-761 100924702 100925026 170 - chr10:100924824-100924856 NA NA NA NA NA chr10-760 100834124 100835088 462 - chr10:100834280-100834385 NA NA NA NA NA chr10-759 100815356 100815653 219 - chr10:100815435-100815577 NA NA NA NA NA chr10-758 100426520 100426868 222 - chr10:100426689-100426801 NA NA NA NA NA chr10-34 10041993 10042291 220 - chr10:10042013-10042184 NA NA NA NA NA chr10-757 100394934 100395108 146 - chr10:100394970-100395084 NA NA NA NA NA chr10-33 10037020 10037171 129 - chr10:10037084-10037170 NA NA NA NA NA chr10-756 100209790 100209938 118 - chr10:100209861-100209919 NA NA NA NA NA chr10-755 100088539 100088750 149 - chr10:100088597-100088686 NA NA NA NA NA chr10-754 100037923 100038535 337 - chr10:100038314-100038474 NA NA NA NA NA 1363.67 chr17_KI270729v1_random 27663 27887 + 9.33333 NA NA (GAATG)n|Satellite|Satellite NA NA 940 chr4 49657458 49657816 + 6.66667 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 670995 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 1484.33 chrUn_KI270466v1 401 1219 + 5.33333 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 593.334 chr11 106904143 106904328 + 4.66667 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 114241 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 817.334 chr4 47471607 47472069 + 4.66667 NA Intergenic Intergenic -8108 NM_001329668 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 828.333 chr7 31914161 31914533 + 4.33333 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 156060 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 778.666 chrUn_KI270438v1 104526 104967 + 4.33333 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 697.999 chr9 27809925 27810258 + 4.33333 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -236225 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 691.333 chr13 93176941 93177289 + 4.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -49692 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 862 chr4 49709696 49710136 + 4.33333 NA Intergenic SAR|Satellite|Satellite 723274 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 732.666 chr3 105851917 105852241 + 4.33333 NA intron (NR_135807, intron 3 of 20) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 15512 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 682.333 chr5 18682985 18683193 + 4.33333 NA Intergenic Intergenic 875815 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 876.001 chr14 62037436 62037782 + 4 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) MER46C|DNA|TcMar-Tigger -79748 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 578 chr5 44620909 44621060 + 4 NA Intergenic Intergenic -110702 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 586-3 chr7 65001735 65001974 + 4 NA intron (NM_001007253, intron 1 of 1) MER21C|LTR|ERVL 4833 NM_001007253 2086 Hs.250693 NM_001007253 ENSG00000213462 ERV3-1 ERV-R|ERV3|ERVR|HERV-R|HERVR|envR endogenous retrovirus group 3 member 1, envelope protein-coding 703.667 chr5 55384049 55384389 + 4 NA intron (NM_015360, intron 18 of 26) L1M4b|LINE|L1 76230 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 555.666 chr14 74038979 74039249 + 4 NA intron (NM_025057, intron 4 of 11) intron (NM_025057, intron 4 of 11) 19765 NM_025057 80127 Hs.644621 NM_025057 ENSG00000119636 BBOF1 C14orf45|CCDC176 basal body orientation factor 1 protein-coding 534.333-2 chrUn_KI270336v1 462 668 + 4 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 618 chr14 70709319 70709517 + 4 NA intron (NR_125769, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 10720 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 598 chr4 49120778 49121176 + 3.66667 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 134335 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 673-2 chr1 164079298 164079694 + 3.66667 NA Intergenic Intergenic -479864 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 541.334 chr4 135734886 135735152 + 3.66667 NA Intergenic Intergenic 153074 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 639.333 chr14 67816827 67817229 + 3.66667 NA promoter-TSS (NM_015346) promoter-TSS (NM_015346) -438 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 563.333 chr1 79708843 79709145 + 3.66667 NA Intergenic Intergenic -702264 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 452.334-2 chr4 38739011 38739159 + 3.66667 NA Intergenic Intergenic 43905 NM_030956 81793 Hs.120551 NM_030956 ENSG00000174123 TLR10 CD290 toll like receptor 10 protein-coding 625.334 chr2 114058238 114058483 + 3.66667 NA Intergenic Intergenic -78376 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 579.001 chr2 63124578 63124755 + 3.66667 NA intron (NR_148704, intron 18 of 18) intron (NR_148704, intron 18 of 18) -5124 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 811.667 chr8 121569927 121570459 + 3.66667 NA Intergenic Intergenic -69153 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 951.668 chr10 34801258 34801555 + 3.66667 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 13890 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 556-3 chr2 86607411 86607625 + 3.66667 NA intron (NM_005667, intron 3 of 3) intron (NM_005667, intron 3 of 3) 16347 NM_005667 7844 Hs.469199 NM_005667 ENSG00000239305 RNF103 HKF-1|KF-1|KF1|ZFP-103|ZFP103 ring finger protein 103 protein-coding 561.667-2 chr18 3195084 3195349 + 3.66667 NA intron (NM_019856, intron 2 of 36) intron (NM_019856, intron 2 of 36) 24752 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 699.334 chr1 40082182 40082405 + 3.66667 NA intron (NM_001363695, intron 5 of 7) intron (NM_001363695, intron 5 of 7) 14959 NM_001363695 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 676.667 chr6 79509827 79510187 + 3.66667 NA intron (NM_001122769, intron 3 of 7) L1MD2|LINE|L1 27423 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 657.333 chr10 43645267 43645579 + 3.66667 NA promoter-TSS (NR_047558) promoter-TSS (NR_047558) -519 NR_047558 414208 Hs.608956 NR_047558 ENSG00000230565 ZNF32-AS2 ZNF32OS2|b402L1.7 ZNF32 antisense RNA 2 ncRNA 792.999 chr16 7080299 7080778 + 3.66667 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -252307 NM_145892 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 662 chr3 183652674 183652968 + 3.66667 NA intron (NM_001349426, intron 2 of 6) intron (NM_001349426, intron 2 of 6) 17198 NM_001349416 54800 Hs.407709 NM_017644 ENSG00000114796 KLHL24 DRE1|EBSSH|KRIP6 kelch like family member 24 protein-coding 787.334 chr12 115859908 115860295 + 3.66667 NA Intergenic Intergenic 288553 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 482 chr10 107625815 107626059 + 3.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 443356 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 565.667-2 chr7 131155608 131155875 + 3.66667 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) MIR3|SINE|MIR 45647 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 555-3 chr2 44072846 44073123 + 3.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -76995 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 636.667 chr8 127256669 127257017 + 3.66667 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 12206 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 868.666 chr5 16673286 16673821 + 3.66667 NA intron (NM_012334, intron 36 of 40) intron (NM_012334, intron 36 of 40) -56495 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 1331.67 chrUn_GL000216v2 4 839 + 3.66667 NA NA (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 605.667-2 chr6 120475012 120475220 + 3.66667 NA Intergenic Intergenic 459937 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 634.001 chr17 32877546 32877813 + 3.66667 NA promoter-TSS (NM_001303279) promoter-TSS (NM_001303279) -555 NM_001303280 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 965.668 chr3 182746857 182747241 + 3.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -46455 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 847 chr5 75712417 75712711 + 3.66667 NA promoter-TSS (NM_152408) promoter-TSS (NM_152408) -109 NM_152408 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 497.666 chr13 83939690 83939960 + 3.66667 NA Intergenic Intergenic -57351 NM_001281503 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 653 chr10 45478875 45479252 + 3.66667 NA intron (NM_001282866, intron 3 of 7) L1MA4A|LINE|L1 -25942 NR_120674 102724323 Hs.559151 NR_120674 ENSG00000231964 LOC102724323 - uncharacterized LOC102724323 ncRNA 511.333 chr18 13020451 13020751 + 3.33333 NA intron (NM_032142, intron 9 of 44) L1MB2|LINE|L1 29239 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 531.999-3 chr5 55344138 55344383 + 3.33333 NA intron (NM_015360, intron 8 of 26) intron (NM_015360, intron 8 of 26) 36271 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 815.001 chr2 166901358 166901781 + 3.33333 NA intron (NM_152381, intron 1 of 10) intron (NM_152381, intron 1 of 10) 13082 NM_001079810 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 690.666 chr6 131799471 131799815 + 3.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 7471 NR_039610 100616455 NR_039610 ENSG00000266807 MIR548H5 - microRNA 548h-5 ncRNA 462-11 chr19 46885206 46885470 + 3.33333 NA intron (NM_004491, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 24341 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 414-9 chr3 188994731 188994912 + 3.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -47182 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 537 chr5 68472712 68472998 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 180278 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 569.666 chrX 47130969 47131142 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 14155 NM_019056 54539 Hs.521969 NM_019056 ENSG00000147123 NDUFB11 CI-ESSS|ESSS|MC1DN30|NP17.3|Np15|P17.3 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B11 protein-coding 487.666-2 chr1 102532902 102533178 + 3.33333 NA Intergenic (TATCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -535806 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 695 chr6 52475371 52475884 + 3.33333 NA intron (NR_033327, intron 6 of 9) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 54619 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 503.666-3 chr4 104072129 104072293 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic -352226 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 491.666-2 chr14 50403806 50403961 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic -6585 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 520.666-2 chr16 50769090 50769296 + 3.33333 NA intron (NM_015247, intron 7 of 19) L1ME1|LINE|L1 26888 NR_130462 100422972 NR_130462 ENSG00000264947 MIR3181 - microRNA 3181 ncRNA 570.667 chr17 29385718 29386100 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic -4753 NR_039749 100616122 NR_039749 ENSG00000284162 MIR4523 - microRNA 4523 ncRNA 640.999 chr10 75353802 75354056 + 3.33333 NA intron (NR_038226, intron 2 of 3) intron (NR_038226, intron 2 of 3) -47599 NR_024421 100131213 Hs.534598 NR_024421 ENSG00000237149 ZNF503-AS2 C10orf41|NCRNA00245 ZNF503 antisense RNA 2 ncRNA 505.333-8 chr9 90648470 90648628 + 3.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5725 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 488.666-3 chr21 26394338 26394557 + 3.33333 NA intron (NR_135516, intron 1 of 3) intron (NR_135516, intron 1 of 3) 812 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 446.667-10 chr8 5554453 5554690 + 3.33333 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR -559657 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 543.333 chr10 25001143 25001380 + 3.33333 NA intron (NM_145010, intron 1 of 5) L1MEc|LINE|L1 14897 NM_145010 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 511.333-3 chr2 60019978 60020180 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 362957 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 628.333 chr14 19951862 19952265 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 16455 NM_001004063 79544 Hs.554584 NM_001004063 ENSG00000155249 OR4K1 OR14-19 olfactory receptor family 4 subfamily K member 1 protein-coding 563-3 chr2 172723570 172723922 + 3.33333 NA non-coding (NR_026995, exon 4 of 4) non-coding (NR_026995, exon 4 of 4) -12099 NM_007023 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 685.333 chr10 37793533 37793784 + 3.33333 NA TTS (NR_051997) TTS (NR_051997) 1517 NR_051997 100419868 Hs.741719 NR_051997 ZNF33BP1 - zinc finger protein 33B pseudogene 1 pseudo 499.333-8 chr4 133226051 133226207 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 76835 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 504.333-5 chrUn_KI270438v1 103973 104248 + 3.33333 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 524.333-4 chr5 115809465 115809640 + 3.33333 NA intron (NR_136618, intron 4 of 6) intron (NR_136618, intron 4 of 6) 7105 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 568 chr6 48923362 48923760 + 3.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 539692 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 622.666 chr3 41432650 41432852 + 3.33333 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) intron (NR_136342, intron 32 of 34) 233246 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 532.334 chr1 191960943 191961179 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic -197401 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 552.333-2 chr6 38751812 38752193 + 3.33333 NA intron (NM_001371, intron 8 of 91) MIRb|SINE|MIR 36691 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 522.666 chr2 220567189 220567381 + 3.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -660720 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 557.666 chr15 64509464 64509678 + 3.33333 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 10151 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 505.333-3 chr11 38453638 38453937 + 3.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 192569 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 362-18 chr3 109733066 109733258 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 130334 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 499-5 chr8 87230958 87231158 + 3.33333 NA intron (NM_173538, intron 5 of 10) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 364643 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 513.333 chr8 129499825 129499987 + 3.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 -15764 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 529.333-5 chr3 117385294 117385580 + 3.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 305488 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 360.666-7 chr15 96325074 96325306 + 3.33333 NA promoter-TSS (NM_001145155) promoter-TSS (NM_001145155) -856 NM_001145155 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 572 chr10 21691215 21691619 + 3.33333 NA intron (NM_004641, intron 14 of 23) intron (NM_004641, intron 14 of 23) 157245 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 742.667 chr2 122719665 122720005 + 3.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 353646 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 613.667-2 chr9 20928777 20929078 + 3.33333 NA intron (NM_017794, intron 28 of 45) intron (NM_017794, intron 28 of 45) 102713 NM_001321903 401494 Hs.716678 NM_001010915 ENSG00000188921 HACD4 PTPLAD2 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 protein-coding 476.333 chr12 19258198 19258546 + 3.33333 NA intron (NM_001256787, intron 4 of 25) intron (NM_001256787, intron 4 of 25) 53047 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 538.667 chr4 154687764 154688017 + 3.33333 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -52951 NM_001301645 9227 Hs.658427 NM_004744 ENSG00000121207 LRAT LCA14 lecithin retinol acyltransferase protein-coding 520.667 chr1 77234062 77234360 + 3.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -14781 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 589 chr13 55167602 55167932 + 3.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -6687 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 720.333 chr6 38982264 38982924 + 3.33333 NA intron (NM_001371, intron 85 of 91) intron (NM_001371, intron 85 of 91) -29487 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 497.666-2 chr2 188701576 188701782 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 88444 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 615.666 chr16 48891569 48891847 + 3.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -281528 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 659.666 chr18 73699394 73699712 + 3.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 374612 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 545.999 chr10 66405893 66406073 + 3.33333 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) intron (NM_001127384, intron 11 of 17) -520053 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 566.667-2 chr18 55412844 55413059 + 3.33333 NA intron (NM_001348217, intron 4 of 18) intron (NM_001348217, intron 4 of 18) -8956 NM_001243232 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 590 chr6 56750939 56751334 + 3.33333 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 92529 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 509-5 chr8 119047469 119047623 + 3.33333 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) intron (NM_001324095, intron 3 of 7) -19701 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 634.666 chr4 126137794 126138022 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 630649 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 546.667-2 chr7 50791566 50791848 + 3.33333 NA intron (NM_001001555, intron 1 of 16) intron (NM_001001555, intron 1 of 16) 1167 NM_001350816 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 506.333-2 chr16 63973632 63973908 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 1148293 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 723.999 chr20 33188809 33189128 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic -4637 NR_026760 317716 Hs.434194 NM_173859 ENSG00000183566 BPIFA4P BASE BPI fold containing family A member 4, pseudogene pseudo 618.666 chr10 121237505 121237784 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 293670 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 576.666-3 chr9 94234648 94234858 + 3.33333 NA intron (NR_160773, intron 1 of 2) ERVL-E-int|LTR|ERVL -24513 NM_003448 169841 Hs.387623 NM_003448 ENSG00000175787 ZNF169 - zinc finger protein 169 protein-coding 569.667-2 chr5 10350036 10350491 + 3.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -3432 NM_005885 10299 Hs.432862 NM_005885 ENSG00000145495 MARCH6 DOA10|MARCH-VI|RNF176|TEB4 membrane associated ring-CH-type finger 6 protein-coding 760.999 chr18 56080754 56081147 + 3.33333 NA intron (NR_148972, intron 3 of 8) intron (NR_148972, intron 3 of 8) 38672 NR_146511 102724698 NR_146510 ENSG00000267057 LINC01905 - long intergenic non-protein coding RNA 1905 ncRNA 494.333-5 chr7 50386339 50386657 + 3.33333 NA intron (NM_001220768, intron 4 of 4) intron (NM_001220768, intron 4 of 4) 63852 NM_001042762 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 255-22 chr11 113095903 113096020 + 3.33333 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) MIRb|SINE|MIR -132501 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 650.666 chr15 91064260 91064716 + 3.33333 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -35100 NM_001323031 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 596.667 chr16 72809311 72809624 + 3.33333 NA intron (NM_001164766, intron 6 of 8) intron (NM_001164766, intron 6 of 8) -144497 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 666.666-2 chr8 126367188 126367619 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 41908 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 689.666 chr5 126477737 126478121 + 3.33333 NA intron (NR_146196, intron 6 of 14) intron (NR_146196, intron 6 of 14) 12779 NM_001146322 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 593.333-3 chr4 8827209 8827574 + 3.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 44448 NM_018942 3166 Hs.104134 NM_018942 ENSG00000215612 HMX1 H6|NKX5-3 H6 family homeobox 1 protein-coding 499-2 chr2 102520888 102521159 + 3.33333 NA intron (NM_001011552, intron 9 of 11) intron (NM_001011552, intron 9 of 11) 47797 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 608.666 chr14 73651331 73651548 + 3.33333 NA intron (NM_031427, intron 1 of 7) L1M5|LINE|L1 6453 NM_031427 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 367.667-6 chr15 27281640 27281801 + 3.33333 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) L1MD2|LINE|L1 -120401 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 544.999 chr12 86201203 86201448 + 3.33333 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) L1ME2|LINE|L1 55066 NM_001351289 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 492.333-4 chr5 30629821 30630049 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic -563751 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 527.666 chr18 22733658 22733934 + 3.33333 NA intron (NR_110782, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 53041 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 785.333 chr16 5998953 5999252 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic -19922 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 531.333-4 chr8 133172933 133173268 + 3.33333 NA Intergenic Ricksha_b|DNA|MULE-MuDR -17939 NM_080838 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 535.334-2 chr12 7435359 7435649 + 3.33333 NA intron (NM_001297650, intron 2 of 19) L1ME3F|LINE|L1 8681 NM_174941 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 320-43 chr7 53433743 53433932 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 378094 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 830.333 chr14 20307507 20307844 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic -1724 NM_138376 91875 Hs.98553 NM_138376 ENSG00000136319 TTC5 Strap tetratricopeptide repeat domain 5 protein-coding 863.334 chr4 125724836 125725226 + 3.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 217772 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 680 chr4 65257371 65257710 + 3.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -253040 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 548.333-2 chr14 28285611 28285933 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 479547 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 659.332 chr9 105363910 105364230 + 3.33333 NA intron (NM_001330731, intron 9 of 15) intron (NM_001330731, intron 9 of 15) -83964 NM_001287191 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 755.333 chr10 23616738 23617192 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic -77762 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 512.333 chr10 61087335 61087669 + 3.33333 NA Intergenic Intergenic 71227 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 626.666-2 chr22 26924835 26925236 + 3.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 21743 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 413.334 chr10 104458266 104458499 + 3.33333 NA Intergenic MamRep1894|DNA|hAT 21893 NR_120624 101927523 Hs.407539 NR_120624 ENSG00000225768 LINC02620 - long intergenic non-protein coding RNA 2620 ncRNA 640.666 chr14 89047855 89048075 + 3.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 223314 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 850.001 chr2 100374468 100374939 + 3.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 42965 NM_004854 9486 Hs.516370 NM_004854 ENSG00000115526 CHST10 HNK-1ST|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 10 protein-coding 592.333-2 chr2 62990067 62990409 + 3.33333 NA intron (NM_001354213, intron 17 of 24) intron (NM_001354213, intron 17 of 24) 57473 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 593.333-5 chr5 39291606 39292008 + 3.33333 NA intron (NM_001737, intron 9 of 10) L1MEg|LINE|L1 -21158 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 840.666 chr1 69008503 69008942 + 3.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -47176 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 468.667-6 chr9 19357112 19357340 + 3.33333 NA intron (NR_073201, intron 26 of 31) intron (NR_073201, intron 26 of 31) 23010 NM_001010 6194 Hs.408073 NM_001010 ENSG00000137154 RPS6 S6 ribosomal protein S6 protein-coding 446-3 chr10 74529117 74529386 + 3 NA promoter-TSS (NR_120673) promoter-TSS (NR_120673) 73 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 621 chrX 96503372 96503656 + 3 NA Intergenic Intergenic -165612 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 429-3 chr12 47006491 47006763 + 3 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -72976 NM_001281429 91523 Hs.560100 NM_138371 ENSG00000179715 PCED1B FAM113B PC-esterase domain containing 1B protein-coding 643 chr19 56731142 56731643 + 3 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -33930 NR_110744 101929059 Hs.607132 NR_110744 ENSG00000286125 ZIM2-AS1 ZIM2as ZIM2 antisense RNA 1 ncRNA 606-2 chr7 41939005 41939354 + 3 NA Intergenic Intergenic -236089 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 394-16 chr7 31258570 31258778 + 3 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 82052 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 441.333-8 chr8 52324840 52324997 + 3 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) intron (NR_148195, intron 2 of 3) -70426 NM_001352849 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 434-7 chr6 126679718 126679907 + 3 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 195181 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 379-10 chr3 141277844 141278066 + 3 NA intron (NM_001282728, intron 3 of 6) intron (NM_001282728, intron 3 of 6) 46130 NM_152282 92370 Hs.657887 NM_152282 ENSG00000155893 PXYLP1 ACPL2|HEL124|XYLP 2-phosphoxylose phosphatase 1 protein-coding 435.333-9 chr8 143283983 143284242 + 3 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -2412 NR_120683 100507316 Hs.446671 NR_120682 ENSG00000253716 MINCR LINC01604 MYC-induced long non-coding RNA ncRNA 759.333 chr8 87962857 87963482 + 3 NA Intergenic Intergenic -89154 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 488-4 chr3 157639073 157639238 + 3 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 95811 NM_001099777 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 452.334-3 chr7 54397860 54398110 + 3 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 67288 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 797 chr5 19938840 19939247 + 3 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 49157 NM_001349560 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 385.667-4 chr14 63188011 63188281 + 3 NA Intergenic Intergenic -16297 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 687.333 chr5 57230865 57231284 + 3 NA intron (NM_001203246, intron 3 of 10) intron (NM_001203246, intron 3 of 10) 17000 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 491.334-2 chr3 47730154 47730450 + 3 NA intron (NM_003074, intron 5 of 27) AluJo|SINE|Alu 51591 NM_003074 6599 Hs.476179 NM_003074 ENSG00000173473 SMARCC1 BAF155|CRACC1|Rsc8|SRG3|SWI3 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 1 protein-coding 513.666 chr4 58483640 58483910 + 3 NA Intergenic Intergenic 52553 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 523.333-4 chr22 24746713 24747030 + 3 NA intron (NM_001008496, intron 12 of 20) L1MA2|LINE|L1 -17630 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 538-5 chr7 129761770 129762091 + 3 NA Intergenic Intergenic 8562 NR_029614 406958 NR_029614 ENSG00000207990 MIR182 MIRN182|miRNA182|mir-182 microRNA 182 ncRNA 556-4 chr2 196565046 196565409 + 3 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) intron (NM_001348768, intron 1 of 28) 27756 NM_020760 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 468.334-3 chr6 146308589 146308832 + 3 NA intron (NM_001278065, intron 4 of 9) L1ME4a|LINE|L1 -235123 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 372-6 chr14 60085797 60085984 + 3 NA Intergenic Intergenic -6021 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 445.333-9 chr8 121130142 121130390 + 3 NA Intergenic Intergenic -318220 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 646.334-3 chr3 112006496 112007063 + 3 NA intron (NM_001008272, intron 3 of 4) intron (NM_001008272, intron 3 of 4) 7619 NM_001008273 29114 Hs.169330 NM_013259 ENSG00000144834 TAGLN3 NP22|NP24|NP25 transgelin 3 protein-coding 595 chr16 68728746 68729113 + 3 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -8363 NM_004360 999 Hs.461086 NM_004360 ENSG00000039068 CDH1 Arc-1|BCDS1|CD324|CDHE|ECAD|LCAM|UVO cadherin 1 protein-coding 585 chr7 54485857 54486322 + 3 NA Intergenic Intergenic -56236 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 524.667-5 chr9 77545120 77545355 + 3 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) intron (NM_004297, intron 1 of 6) 97588 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 335-8 chr15 46323964 46324202 + 3 NA Intergenic Intergenic 618888 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 520.667-4 chr8 142919329 142919651 + 3 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1647 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 346.333-31 chr8 117720849 117721050 + 3 NA Intergenic Intergenic 199964 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 453-3 chr1 205122431 205122616 + 3 NA promoter-TSS (NM_005057) promoter-TSS (NM_005057) -545 NM_001193272 5929 Hs.519230 NM_005057 ENSG00000117222 RBBP5 RBQ3|SWD1 RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 457 chr11 19877893 19878171 + 3 NA intron (NM_182964, intron 4 of 37) intron (NM_182964, intron 4 of 37) -117949 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 524-2 chr2 121643756 121643971 + 3 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) MER5B|DNA|hAT-Charlie 5599 NM_015282 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 499.333 chr10 18709390 18709760 + 3 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 50144 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 538-4 chr5 116937673 116938088 + 3 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -175671 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 518.667-4 chr6 106495492 106495781 + 3 NA intron (NM_001371242, intron 2 of 21) intron (NM_001371242, intron 2 of 21) -16219 NM_001624 202 Hs.724262 NM_001624 ENSG00000112297 CRYBG1 AIM1|ST4 crystallin beta-gamma domain containing 1 protein-coding 486.333-4 chr18 1248909 1249241 + 3 NA Intergenic Intergenic 110554 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 474.333-5 chr8 110445849 110446167 + 3 NA Intergenic Intergenic -470237 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 543.334 chr2 66761731 66762122 + 3 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -58699 NR_110265 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 621.666 chr3 55253631 55253915 + 3 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 75601 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 567.333-2 chr7 33361910 33362285 + 3 NA intron (NM_198428, intron 16 of 22) L1ME1|LINE|L1 232533 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 548 chr16 52285691 52286026 + 3 NA Intergenic L2a|LINE|L2 27294 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 505-3 chr8 135971785 135972076 + 3 NA Intergenic Intergenic 514474 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 793 chr5 17022580 17023074 + 3 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -86539 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 378.667-19 chr5 124291772 124291929 + 3 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 146670 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 504-6 chr22 24754913 24755279 + 3 NA intron (NM_001008496, intron 6 of 20) intron (NM_001008496, intron 6 of 20) -9405 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 532.667-2 chr2 61826421 61826767 + 3 NA exon (NM_001201543, exon 7 of 7) exon (NM_001201543, exon 7 of 7) 27466 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 612-3 chr6 127549332 127549668 + 3 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -27674 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 671.999 chr3 142913291 142913704 + 3 NA Intergenic Intergenic -13178 NR_038455 100507389 Hs.38715 NR_038455 ENSG00000243818 LOC100507389 - uncharacterized LOC100507389 ncRNA 902.334 chr4 64542547 64542969 + 3 NA Intergenic Intergenic -133298 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 216.667-110 chr9 28658880 28659030 + 3 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) L1MC4|LINE|L1 60350 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 603-2 chr8 80568258 80568759 + 3 NA Intergenic Intergenic 82282 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 486-11 chr7 39030299 39030470 + 3 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 -16817 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 599 chr10 53917091 53917444 + 3 NA intron (NM_001354411, intron 26 of 34) intron (NM_001354411, intron 26 of 34) -568963 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 471-3 chr15 64399545 64399810 + 3 NA intron (NM_001321924, intron 4 of 12) AluSx1|SINE|Alu 11841 NM_016213 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 455-12 chrX 101093153 101093310 + 3 NA intron (NM_021637, intron 1 of 1) intron (NM_021637, intron 1 of 1) -4951 NM_001318521 2491 Hs.348920 NM_006733 ENSG00000102384 CENPI CENP-I|FSHPRH1|LRPR1 centromere protein I protein-coding 392.333-3 chr18 34338761 34339052 + 3 NA Intergenic Penelope1_Vert|LINE|Penelope -115355 NM_003787 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 703.334-2 chr5 61856407 61856712 + 3 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -120861 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 528.334 chr3 11312919 11313223 + 3 NA intron (NM_001144912, intron 5 of 16) intron (NM_001144912, intron 5 of 16) 40674 NM_001349237 10533 Hs.38032 NM_006395 ENSG00000197548 ATG7 APG7-LIKE|APG7L|GSA7 autophagy related 7 protein-coding 820.666 chr4 52675101 52675607 + 3 NA Intergenic Intergenic 15948 NR_125363 643783 Hs.631514 NR_125363 ENSG00000248866 USP46-AS1 - USP46 antisense RNA 1 ncRNA 562.333 chr17 59648261 59648608 + 3 NA intron (NM_001288653, intron 4 of 31) intron (NM_001288653, intron 4 of 31) 28539 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 313-14 chr14 85814124 85814324 + 3 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -120454 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 674.667 chr9 37392990 37393592 + 3 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -29405 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 603.334-2 chr8 86456953 86457375 + 3 NA intron (NM_007013, intron 21 of 24) intron (NM_007013, intron 21 of 24) 51522 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 466-2 chr1 235703107 235703292 + 3 NA intron (NM_000081, intron 44 of 52) intron (NM_000081, intron 44 of 52) -52445 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 630.333 chr10 43853613 43854018 + 3 NA Intergenic Intergenic -5596 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 543.667 chr12 597767 597979 + 3 NA intron (NM_016533, intron 1 of 3) intron (NM_016533, intron 1 of 3) -11387 NR_134624 105369595 Hs.504422 NR_134624 LOC105369595 - uncharacterized LOC105369595 ncRNA 485-2 chr14 50104114 50104310 + 3 NA intron (NR_131171, intron 1 of 8) intron (NR_131171, intron 1 of 8) 831 NR_131171 196913 Hs.406934 NM_001014830 LINC01599 C14orf183 long intergenic non-protein coding RNA 1599 ncRNA 680.333 chr7 25040848 25041348 + 3 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -60920 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 366.667-3 chr13 95113167 95113331 + 3 NA intron (NM_001105515, intron 20 of 20) intron (NM_001105515, intron 20 of 20) -97095 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 445-7 chr3 7415019 7415283 + 3 NA exon (NM_181874, exon 5 of 11) exon (NM_181874, exon 5 of 11) 120133 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 504-4 chr15 72592737 72593095 + 3 NA 3' UTR (NM_005744, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_005744, exon 14 of 14) 5699 NR_030359 693215 NR_030359 ENSG00000283798 MIR630 MIRN630|hsa-mir-630 microRNA 630 ncRNA 1099 chr22 26967704 26968568 + 3 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 64844 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 604.666 chr9 34913306 34913792 + 3 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 -17785 NM_001309427 100129969 Hs.571602 NM_001309426 ENSG00000187791 FAM205C FAM205CP family with sequence similarity 205 member C protein-coding 407-2 chr1 115118305 115118478 + 3 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -28888 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 518-2 chr18 3716125 3716362 + 3 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 112506 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 655 chr2 21695676 21695995 + 3 NA intron (NR_038837, intron 2 of 2) intron (NR_038837, intron 2 of 2) 14817 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 441-2 chr2 40654702 40654901 + 3 NA Intergenic Intergenic -142366 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 519.666 chr12 118948907 118949268 + 3 NA Intergenic Intergenic -32454 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 622.334 chr14 66810159 66810570 + 3 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) intron (NM_001024218, intron 3 of 21) 302957 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 481-2 chr10 2206218 2206500 + 3 NA Intergenic Intergenic 108715 NR_038884 399708 Hs.521270 NR_038884 LINC00701 - long intergenic non-protein coding RNA 701 ncRNA 325.333-36 chr5 43216973 43217167 + 3 NA intron (NR_072980, intron 1 of 3) L1MB8|LINE|L1 24218 NR_072980 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 479.333-5 chr2 44182036 44182299 + 3 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) intron (NM_177969, intron 1 of 4) 13292 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 475 chr10 90505670 90505942 + 3 NA intron (NR_110657, intron 2 of 6) L1ME2|LINE|L1 34999 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 523-3 chr5 36317570 36318005 + 3 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -15885 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 524-3 chr2 156550525 156550997 + 3 NA intron (NM_000408, intron 8 of 16) intron (NM_000408, intron 8 of 16) 114382 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 664.333-2 chr6 35156674 35157277 + 3 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -15565 NM_001261821 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 417-14 chr9 27563071 27563258 + 3 NA intron (NM_001256054, intron 3 of 10) intron (NM_001256054, intron 3 of 10) 10317 NM_018325 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 483.667-2 chr2 162387235 162387442 + 3 NA intron (NM_033272, intron 12 of 15) intron (NM_033272, intron 12 of 15) 42970 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 470.667-2 chr14 60156248 60156543 + 3 NA intron (NM_001322280, intron 1 of 6) intron (NM_001322280, intron 1 of 6) 9003 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 574.667 chr18 7671158 7671444 + 3 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 103985 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 349-10 chr22 26174310 26174508 + 3 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 4935 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 491.667-2 chr20 23613003 23613248 + 3 NA Intergenic Intergenic -7152 NM_001008693 128822 Hs.698020 NM_001008693 ENSG00000173335 CST9 CLM|CTES7A cystatin 9 protein-coding 576.333-2 chr8 127053115 127053441 + 3 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26596 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 242-55 chr4 127685727 127685887 + 3 NA intron (NM_015693, intron 7 of 15) intron (NM_015693, intron 7 of 15) -44593 NM_001318467 83447 Hs.149030 NM_031291 ENSG00000151475 SLC25A31 AAC4|ANT 4|ANT4|SFEC35kDa solute carrier family 25 member 31 protein-coding 770.999 chr14 86782945 86783287 + 3 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -122662 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 632-2 chr3 63378599 63378887 + 3 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) L1MDa|LINE|L1 -64569 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 463-3 chr3 28223914 28224217 + 3 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -17554 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 421-2 chr10 117741487 117741779 + 3 NA Intergenic Intergenic -196565 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 564.667-2 chr9 102530104 102530406 + 3 NA intron (NR_103830, intron 1 of 4) intron (NR_103830, intron 1 of 4) 10618 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 508-4 chr3 73550840 73551084 + 3 NA intron (NR_121660, intron 1 of 1) intron (NR_121660, intron 1 of 1) 10618 NM_001303140 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 548-2 chr16 57188234 57188551 + 3 NA intron (NM_001305163, intron 1 of 14) intron (NM_001305163, intron 1 of 14) 2063 NM_001305163 89970 Hs.460885 NM_133368 ENSG00000159579 RSPRY1 SEMDFA ring finger and SPRY domain containing 1 protein-coding 521 chr1 42285072 42285254 + 3 NA intron (NM_001198850, intron 2 of 12) L1PA11|LINE|L1 49792 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 575 chr10 44286521 44286958 + 3 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -6011 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 504.667-2 chr21 38147232 38147519 + 3 NA intron (NR_026839, intron 2 of 2) intron (NR_026839, intron 2 of 2) 25924 NR_026838 84677 Hs.733345 NM_032589 ENSG00000198054 DSCR8 C21orf65|CT25.1a|CT25.1b|MMA-1|MMA-1a|MMA-1b|MMA1|MTAG2 Down syndrome critical region 8 ncRNA 615.667 chr4 56583563 56583880 + 3 NA intron (NM_001256475, intron 5 of 8) intron (NM_001256475, intron 5 of 8) 53115 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 522-3 chr2 68197684 68197980 + 3 NA intron (NM_000945, intron 2 of 5) L1MD|LINE|L1 39944 NM_001329917 56902 Hs.262858 NM_020143 ENSG00000115946 PNO1 KHRBP1|RRP20 partner of NOB1 homolog protein-coding 529.666-2 chr19 33453232 33453557 + 3 NA intron (NM_001166056, intron 7 of 12) intron (NM_001166056, intron 7 of 12) 68397 NM_000285 5184 Hs.36473 NM_000285 ENSG00000124299 PEPD PROLIDASE peptidase D protein-coding 433.333-7 chr4 49118810 49119013 + 3 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 132269 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 466-3 chr11 6008679 6008900 + 3 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5597 NM_001005179 120793 Hs.553571 NM_001005179 ENSG00000183389 OR56A4 OR11-49 olfactory receptor family 56 subfamily A member 4 protein-coding 448.333-7 chr5 58561137 58561353 + 3 NA Intergenic Intergenic -3002 NR_109904 101928600 Hs.694699 NR_109904 ENSG00000250127 LINC02108 - long intergenic non-protein coding RNA 2108 ncRNA 434.667-2 chr14 60066765 60067043 + 3 NA Intergenic Intergenic -25007 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 559 chr10 76662120 76662565 + 3 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -225702 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 633.334 chr14 67161766 67162160 + 3 NA intron (NM_001024218, intron 18 of 21) intron (NM_001024218, intron 18 of 21) -27477 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 450-3 chr3 165819454 165819736 + 3 NA intron (NR_137635, intron 1 of 2) intron (NR_137635, intron 1 of 2) 17828 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 488-2 chr2 45131322 45131608 + 3 NA Intergenic Intergenic -122013 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 776.666 chr3 190460865 190461362 + 3 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -11237 NM_207316 131920 Hs.335321 NM_207316 ENSG00000198398 TMEM207 UNQ846 transmembrane protein 207 protein-coding 501.333 chr1 89739293 89739481 + 3 NA Intergenic Intergenic -81645 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 648-2 chr2 184628588 184628935 + 3 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 30232 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 567-2 chr17 11855304 11855645 + 3 NA intron (NM_001372, intron 50 of 68) LTR24C|LTR|ERV1 -27428 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 547.333-3 chr5 97671154 97671359 + 3 NA TTS (NR_105028) TTS (NR_105028) 166560 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 329-14 chr2 217507305 217507574 + 3 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) L1MC4|LINE|L1 224706 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 182.333-112 chr4 43176067 43176158 + 3 NA Intergenic Intergenic 282846 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 497.667-2 chr21 23000860 23001039 + 3 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -78335 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 745.667 chr5 143001001 143001483 + 3 NA intron (NR_146198, intron 11 of 22) L1ME2z|LINE|L1 -132332 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 437.333-9 chr3 122144869 122145096 + 3 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -38686 NM_000388 846 Hs.435615 NM_000388 ENSG00000036828 CASR CAR|EIG8|FHH|FIH|GPRC2A|HHC|HHC1|HYPOC1|NSHPT|PCAR1|hCasR calcium sensing receptor protein-coding 423-5 chr2 166001928 166002201 + 3 NA intron (NR_148667, intron 24 of 28) intron (NR_148667, intron 24 of 28) 44646 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 497-2 chr6 44959133 44959481 + 3 NA intron (NM_181356, intron 9 of 12) L1MEd|LINE|L1 238463 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 1690 chr10 38527956 38529722 + 3 NA Intergenic Intergenic 100693 NR_024497 399744 Hs.497951 NM_001013665 LINC00999 - long intergenic non-protein coding RNA 999 ncRNA 410-15 chr4 71247966 71248212 + 3 NA intron (NM_001098484, intron 2 of 25) intron (NM_001098484, intron 2 of 25) 60803 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 320.333-24 chr5 43488721 43488843 + 3 NA intron (NM_198566, intron 11 of 12) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger -4917 NM_022483 64417 Hs.732093 NM_022483 ENSG00000151881 TMEM267 C5orf28 transmembrane protein 267 protein-coding 699.333 chr6 48054139 48054454 + 3 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) intron (NM_207499, intron 1 of 2) 14393 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 493.667-2 chr22 27365274 27365538 + 3 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 54755 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 663.334 chr1 161205867 161206266 + 3 NA intron (NM_001166159, intron 2 of 12) MIR|SINE|MIR 3919 NM_001166159 4720 Hs.173611 NM_004550 ENSG00000158864 NDUFS2 CI-49|MC1DN6 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2 protein-coding 513.334-3 chr2 56281786 56282135 + 3 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) L1ME2|LINE|L1 -96190 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 576.333 chr4 34142102 34142436 + 3 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL -102376 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 439.667-3 chr2 167402427 167402597 + 3 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 215140 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 688 chr5 26077420 26077715 + 3 NA Intergenic Intergenic 886614 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 645.666 chr11 132077426 132077918 + 3 NA intron (NR_147849, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 166854 NR_147854 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 555-2 chr10 43763402 43763712 + 3 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 15268 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 455-6 chr4 77882998 77883230 + 3 NA intron (NM_020236, intron 2 of 8) intron (NM_020236, intron 2 of 8) 20284 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 394.333-14 chr3 47482372 47482628 + 3 NA Intergenic Intergenic -6559 NM_001320044 22937 Hs.531789 NM_012235 ENSG00000114650 SCAP - SREBF chaperone protein-coding 443.333-4 chr13 105011791 105011975 + 3 NA Intergenic Intergenic -453984 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 477-3 chr5 15755775 15756026 + 3 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -140898 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 486 chr1 85667778 85668139 + 3 NA intron (NM_017953, intron 8 of 9) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 40475 NM_001170670 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 522.333 chr1 108694269 108694661 + 3 NA intron (NM_001349758, intron 2 of 7) intron (NM_001349758, intron 2 of 7) 2155 NM_001349759 55119 Hs.342307 NM_018061 ENSG00000134186 PRPF38B NET1 pre-mRNA processing factor 38B protein-coding 833.667 chr8 125269766 125270144 + 3 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -160403 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 605.333-3 chr5 65324332 65324606 + 3 NA intron (NR_135689, intron 9 of 25) L1ME1|LINE|L1 157451 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 471.667-3 chr8 80067685 80067864 + 3 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) intron (NM_001025253, intron 1 of 7) 13056 NM_001025252 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 484 chr15 90259833 90260111 + 3 NA TTS (NR_104604) TTS (NR_104604) -5691 NR_028052 51335 Hs.135471 NM_016645 ENSG00000182768 NGRN DSC92 neugrin, neurite outgrowth associated protein-coding 387-17 chr8 79013140 79013360 + 3 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 175721 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 387.667-5 chr14 28878066 28878358 + 3 NA Intergenic Intergenic -92425 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 453-6 chr14 70684947 70685236 + 3 NA Intergenic Intergenic -13607 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 514.333 chr2 67174268 67174458 + 3 NA intron (NR_038844, intron 3 of 7) MER113|DNA|hAT-Charlie -39045 NR_110568 101927661 Hs.580508 NR_110568 ENSG00000235885 LOC101927661 - uncharacterized LOC101927661 ncRNA 825.667 chr3 89825257 89826034 + 3 NA Intergenic Intergenic 718024 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 495 chr10 118533210 118533458 + 3 NA Intergenic Intergenic 62314 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 494.333-3 chr5 131649642 131650045 + 3 NA intron (NM_133372, intron 16 of 17) L1MB4|LINE|L1 -14614 NM_001164390 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 516.667-6 chr9 81509824 81510058 + 3 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 179594 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 327.334-2 chr16 59884827 59885072 + 3 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 29596 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 583 chr4 69448052 69448396 + 3 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 47681 NM_001297615 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 450.334 chr11 100435464 100435630 + 3 NA Intergenic Intergenic -251741 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 539.667 chr1 45357637 45357965 + 3 NA intron (NM_007170, intron 4 of 10) AluSp|SINE|Alu -17331 NM_001293192 4595 Hs.271353 NM_012222 ENSG00000132781 MUTYH MYH mutY DNA glycosylase protein-coding 749-2 chr1 236577331 236578206 + 3 NA intron (NM_018072, intron 20 of 44) AluSp|SINE|Alu 26748 NM_018072 55127 Hs.708114 NM_018072 ENSG00000119285 HEATR1 BAP28|UTP10 HEAT repeat containing 1 protein-coding 650 chr10 55448819 55449299 + 3 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -149983 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 362-12 chr2 62372655 62372842 + 3 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 133447 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 515 chr10 51148806 51149030 + 3 NA intron (NM_006258, intron 1 of 17) intron (NM_006258, intron 1 of 17) 74431 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 563-4 chr5 114459332 114459600 + 3 NA intron (NR_130785, intron 11 of 12) intron (NR_130785, intron 11 of 12) 25955 NR_103458 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 646.667 chr2 132725001 132725338 + 3 NA intron (NM_207481, intron 17 of 17) intron (NM_207481, intron 17 of 17) -53643 NM_001077427 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 287.667-39 chr8 108759200 108759368 + 3 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) L1ME4b|LINE|L1 28310 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 486.333-7 chrX 70984357 70984562 + 3 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -53363 NM_032803 84889 Hs.175220 NM_032803 ENSG00000165349 SLC7A3 ATRC3|CAT-3|CAT3 solute carrier family 7 member 3 protein-coding 593.333 chr12 40910734 40911016 + 3 NA intron (NM_001256064, intron 3 of 15) intron (NM_001256064, intron 3 of 15) 2518 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 453.667 chr2 151645816 151646113 + 3 NA intron (NM_001271208, intron 55 of 182) intron (NM_001271208, intron 55 of 182) 88512 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 439.667-9 chr8 128213262 128213536 + 3 NA Intergenic Intergenic 63283 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 245-33 chr2 48151613 48151776 + 3 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -162988 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 529.333-4 chr2 188795589 188795987 + 3 NA Intergenic Intergenic -5665 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 508 chr1 216334257 216334564 + 3 NA intron (NM_206933, intron 4 of 71) L1M4|LINE|L1 88986 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 469.667-2 chr4 139075924 139076230 + 3 NA intron (NM_001371336, intron 4 of 8) intron (NM_001371336, intron 4 of 8) 8147 NM_001276458 1998 Hs.634040 NM_006874 ENSG00000109381 ELF2 EU32|NERF|NERF-1A|NERF-1B|NERF-1a,b|NERF-2 E74 like ETS transcription factor 2 protein-coding 551.667-2 chr5 111101322 111101611 + 3 NA intron (NM_139281, intron 5 of 22) intron (NM_139281, intron 5 of 22) 9294 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 498.666 chr14 71650091 71650491 + 3 NA intron (NM_001354286, intron 8 of 24) intron (NM_001354286, intron 8 of 24) 63993 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 478.333-3 chr3 6532397 6532825 + 3 NA Intergenic Intergenic 272838 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 787.666 chr8 49695994 49696443 + 3 NA Intergenic Intergenic -184038 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 624 chr4 73495667 73496159 + 3 NA intron (NM_001133, intron 9 of 14) intron (NM_001133, intron 9 of 14) -12890 NR_046377 728040 Hs.640574 NR_046377 ENSG00000250436 LINC02499 - long intergenic non-protein coding RNA 2499 ncRNA 456 chr14 49490841 49491081 + 3 NA Intergenic Intergenic 95419 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 530.333-2 chr14 65515585 65515851 + 3 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 44616 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 526.667 chr22 30798687 30798992 + 3 NA intron (NM_001282740, intron 1 of 12) AluSx|SINE|Alu -23677 NM_001282741 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 440.666-6 chr18 70538117 70538352 + 3 NA Intergenic Intergenic 112720 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 505-4 chr8 138660041 138660339 + 3 NA intron (NM_152888, intron 44 of 64) LTR33|LTR|ERVL -162460 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 569.333 chr11 79574108 79574575 + 3 NA Intergenic Intergenic -133311 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 457-2 chr15 68167330 68167531 + 3 NA intron (NM_016166, intron 8 of 13) intron (NM_016166, intron 8 of 13) 38680 NR_104583 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 489.666-2 chr8 129627189 129627427 + 3 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -52290 NR_130920 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 431-13 chr5 163911890 163912169 + 3 NA Intergenic Intergenic 406410 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 557.667-2 chr3 101078354 101078960 + 3 NA Intergenic Intergenic -85167 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 394-18 chr8 65676179 65676329 + 3 NA intron (NM_001145838, intron 1 of 5) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 6381 NM_001145838 9650 Hs.584788 NM_014637 ENSG00000066855 MTFR1 CHPPR|FAM54A2 mitochondrial fission regulator 1 protein-coding 461-2 chr11 63570278 63570502 + 3 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -7011 NM_017878 54979 Hs.272805 NM_017878 ENSG00000133328 PLAAT2 HRASLS2|PLA1/2-2|PLAAT-2 phospholipase A and acyltransferase 2 protein-coding 433-2 chr1 218847197 218847452 + 3 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 71187 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 433 chr1 97818815 97818990 + 3 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) intron (NM_000110, intron 3 of 22) 21981 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 552.667 chr18 2668405 2668871 + 3 NA intron (NM_015295, intron 3 of 47) L2a|LINE|L2 12751 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 596-3 chr8 76534144 76534801 + 3 NA Intergenic Intergenic 127818 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 498.333 chr10 30204088 30204257 + 3 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7680 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 393-3 chr15 97921397 97921696 + 3 NA Intergenic Intergenic -39157 NM_183376 91947 Hs.6093 NM_183376 ENSG00000140450 ARRDC4 - arrestin domain containing 4 protein-coding 396.334-2 chr15 32946912 32947163 + 3 NA intron (NM_001277313, intron 9 of 20) L1M5|LINE|L1 121137 NM_001103184 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 486-3 chr11 88311046 88311305 + 3 NA intron (NM_001814, intron 3 of 6) intron (NM_001814, intron 3 of 6) 26561 NM_001114173 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 454-4 chr13 101718044 101718340 + 3 NA 3' UTR (NM_001321947, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001321947, exon 6 of 6) 198453 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 526.333 chr8 76385347 76385642 + 3 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21160 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 459.666 chr1 8399014 8399180 + 3 NA intron (NM_001042681, intron 12 of 22) L1ME3Cz|LINE|L1 24735 NM_001042682 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 665.333 chr6 65284839 65285178 + 3 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -16410 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 438-7 chr2 233154705 233154889 + 3 NA intron (NM_001017915, intron 9 of 26).2 PABL_A|LTR|ERV1 94455 NM_001017915 3635 Hs.262886 NM_005541 ENSG00000168918 INPP5D SHIP|SHIP-1|SHIP1|SIP-145|hp51CN|p150Ship inositol polyphosphate-5-phosphatase D protein-coding 308.334 chr1 181474797 181474986 + 3 NA Intergenic Intergenic -8626 NM_001205293 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 434.666-2 chr10 43143339 43143620 + 3 NA intron (NM_018590, intron 1 of 7) intron (NM_018590, intron 1 of 7) 5034 NM_018590 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 492.333-2 chr10 74447685 74447915 + 3 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) MIR|SINE|MIR 81524 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 402.667-4 chr20 9479806 9480014 + 3 NA 3' UTR (NM_001172646, exon 38 of 38) 3' UTR (NM_001172646, exon 38 of 38) -34448 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 450.333-3 chr15 87822877 87823124 + 3 NA Intergenic Intergenic 123268 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 502.333 chr2 117093753 117094031 + 3 NA Intergenic Intergenic -720799 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 461.333-4 chr8 129590544 129590726 + 3 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR -15617 NR_130920 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 533.667-2 chr3 193433368 193433590 + 3 NA intron (NM_032279, intron 25 of 29) intron (NM_032279, intron 25 of 29) -54726 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 555 chr1 187870491 187870712 + 3 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 426973 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 652 chr4 61173950 61174262 + 3 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -27124 NM_001371343 517-5 chr4 55550197 55550487 + 3 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3433 NM_004898 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 361.667-4 chr16 62156630 62156864 + 3 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -120309 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 456.333-10 chr7 49984914 49985127 + 3 NA intron (NM_001159878, intron 6 of 7) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 108226 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 634.333-3 chr22 29077573 29077927 + 3 NA intron (NM_001039570, intron 1 of 8) intron (NM_001039570, intron 1 of 8) 4715 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 593.667 chr5 33737482 33737862 + 3 NA intron (NM_001324512, intron 3 of 21) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 154318 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 584 chr17 70205511 70205752 + 3 NA Intergenic UCON26|Unknown|Unknown 36096 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 476-2 chr11 37081190 37081422 + 3 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -483027 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 452.666-2 chr2 110655355 110655648 + 3 NA intron (NM_001278616, intron 15 of 23) intron (NM_001278616, intron 15 of 23) 2748 NR_132975 106635550 NR_132975 SNORD132 - small nucleolar RNA, C/D box 132 snoRNA 450.333-5 chr2 80388132 80388383 + 3 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) MIR3|SINE|MIR 74878 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 456-3 chr4 97187106 97187375 + 3 NA Intergenic Intergenic -179686 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 500-2 chr11 94226598 94226791 + 3 NA Intergenic Intergenic -78943 NM_001199206 390243 Hs.553758 NM_001080486 ENSG00000183560 IZUMO1R FOLR4|Folbp3|JUNO IZUMO1 receptor, JUNO protein-coding 528.667-2 chr14 66264205 66264410 + 3 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -222064 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 626 chr20 39281231 39281552 + 3 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -56643 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 453-10 chr5 129023664 129023958 + 3 NA intron (NM_001017372, intron 6 of 9) MER2|DNA|TcMar-Tigger 58323 NM_001017372 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 378-16 chr2 186581378 186581627 + 3 NA Intergenic Intergenic -8554 NM_002210 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 284-15 chr14 32063181 32063338 + 3 NA Intergenic Intergenic 13440 NR_027263 84837 Hs.496755 NM_032751 ARHGAP5-AS1 C14orf128 ARHGAP5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 286-46 chr4 102823587 102823833 + 2.66667 NA intron (NM_181893, intron 1 of 6) intron (NM_181893, intron 1 of 6) 2150 NM_001300795 7323 Hs.518773 NM_003340 ENSG00000109332 UBE2D3 E2(17)KB3|UBC4/5|UBCH5C ubiquitin conjugating enzyme E2 D3 protein-coding 417.001 chr4 42048579 42048740 + 2.66667 NA intron (NM_006345, intron 8 of 17) intron (NM_006345, intron 8 of 17) 58129 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 378-2 chr1 208804767 208804962 + 2.66667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 76176 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 517.334-3 chr17 73267996 73268234 + 2.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -6235 NM_001129885 642843 Hs.534707 NM_001129885 ENSG00000187959 CPSF4L - cleavage and polyadenylation specific factor 4 like protein-coding 407.334-2 chr17 62183705 62183941 + 2.66667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 91832 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 462.001 chr8 59162992 59163224 + 2.66667 NA Intergenic (AACCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 43898 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 393.667 chr10 43402220 43402452 + 2.66667 NA intron (NM_001098204, intron 1 of 3) L1MEj|LINE|L1 -4990 NM_001098207 3185 Hs.808 NM_004966 ENSG00000169813 HNRNPF HNRPF|OK/SW-cl.23|mcs94-1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F protein-coding 732 chr8 99295968 99296345 + 2.66667 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 240574 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 450.001-2 chr4 88960894 88961183 + 2.66667 NA intron (NM_014883, intron 4 of 23) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 96147 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 482.667 chr15 99694825 99695030 + 2.66667 NA intron (NM_001352615, intron 10 of 12) L1MC3|LINE|L1 38510 NM_001284417 145748 Hs.562568 NM_152449 ENSG00000183060 LYSMD4 - LysM domain containing 4 protein-coding 404.667-11 chrX 131093267 131093539 + 2.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 10968 NM_001330651 158763 Hs.22905 NM_144967 ENSG00000147256 ARHGAP36 - Rho GTPase activating protein 36 protein-coding 566 chr3 95190097 95190368 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 251969 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 419.334-8 chr5 12595489 12595786 + 2.66667 NA intron (NR_033383, intron 1 of 3) intron (NR_033383, intron 1 of 3) 20780 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 411.667-4 chr2 63788078 63788241 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -52805 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 813.333 chr16 11719809 11720336 + 2.66667 NA intron (NM_001303447, intron 5 of 12) intron (NM_001303447, intron 5 of 12) 22785 NM_001324025 51061 Hs.313847 NM_015914 ENSG00000153066 TXNDC11 EFP1 thioredoxin domain containing 11 protein-coding 552.333 chr20 31250051 31250334 + 2.66667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -7472 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 415-9 chr5 41939368 41939669 + 2.66667 NA exon (NM_012176, exon 6 of 7) exon (NM_012176, exon 6 of 7) 14237 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 297.333-47 chr6 128956426 128956575 + 2.66667 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 73359 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 420 chr1 166024379 166024669 + 2.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 116603 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 390.667-4 chr20 51857938 51858171 + 2.66667 NA intron (NR_110016, intron 1 of 2) L1MB5|LINE|L1 4859 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 615.666-2 chr2 123015715 123016127 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 57560 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 393.667-8 chr3 18640385 18640579 + 2.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -194890 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 451.667-4 chr2 43925207 43925406 + 2.66667 NA intron (NM_133259, intron 26 of 37) L1MB3|LINE|L1 70683 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 446.333 chr11 93969672 93969976 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -51530 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 415-10 chr5 162869543 162869738 + 2.66667 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -567931 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 408-6 chr4 55444391 55444579 + 2.66667 NA intron (NM_004898, intron 19 of 22) intron (NM_004898, intron 19 of 22) 48528 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 554.667-2 chr8 85121583 85121870 + 2.66667 NA intron (NM_033402, intron 6 of 18) L1ME2z|LINE|L1 14488 NM_033402 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 410.667 chr1 71073737 71073898 + 2.66667 NA intron (NM_203350, intron 4 of 9) intron (NM_203350, intron 4 of 9) -6101 NR_029707 406962 NR_029707 ENSG00000207721 MIR186 MIRN186|miR-186 microRNA 186 ncRNA 356.334 chr10 86931379 86931579 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -24280 NM_001330120 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 415.001 chr14 28162203 28162452 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -489106 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 434 chr14 66514223 66514478 + 2.66667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 6943 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 517.667-2 chr20 59907336 59907656 + 2.66667 NA intron (NM_014258, intron 14 of 44) intron (NM_014258, intron 14 of 44) 26141 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 372.666-12 chr8 114429164 114429507 + 2.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -992396 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 362-19 chr4 40389237 40389450 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 54010 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 385-12 chr5 60647313 60647503 + 2.66667 NA exon (NM_018369, exon 3 of 11) exon (NM_018369, exon 3 of 11) 52758 NM_018369 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 364.334-2 chr18 38871780 38872030 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 750270 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 501.334 chr10 85281539 85281897 + 2.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -82780 NR_120667 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 484-5 chr6 37495507 37495773 + 2.66667 NA intron (NM_138493, intron 1 of 3) intron (NM_138493, intron 1 of 3) 4253 NM_138493 154467 Hs.284207 NM_138493 ENSG00000198937 CCDC167 C6orf129|HSPC265 coiled-coil domain containing 167 protein-coding 413.667-6 chr3 103937363 103937538 + 2.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -413334 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 424-19 chrX 113605292 113605597 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 332774 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 529.334 chr1 105974901 105975352 + 2.66667 NA intron (NR_146609, intron 5 of 5) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 53127 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 389-9 chr6 72770211 72770455 + 2.66667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 139838 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 555.999 chr1 64958719 64959075 + 2.66667 NA intron (NM_001321853, intron 2 of 26) intron (NM_001321853, intron 2 of 26) 7652 NM_001321857 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 440.667-3 chr14 103868073 103868297 + 2.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 20464 NR_038436 145216 Hs.578091 NR_038436 ENSG00000258735 LINC00637 - long intergenic non-protein coding RNA 637 ncRNA 441.001 chr3 180306240 180306545 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -107781 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 387-12 chr3 88142705 88143069 + 2.66667 NA 3' UTR (NM_001350134, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001350134, exon 9 of 9) 6979 NM_001195308 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 386.333-11 chr4 32470918 32471161 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 120001 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 444-4 chr20 12032045 12032233 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 114246 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 421.334 chr1 242702519 242702759 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -177942 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 503.334 chr3 15602064 15602410 + 2.66667 NA promoter-TSS (NM_001284416) promoter-TSS (NM_001284416) 268 NM_001281725 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 515.334-3 chr6 57218535 57218832 + 2.66667 NA intron (NR_103822, intron 1 of 3) AluSx3|SINE|Alu 2778 NM_001278668 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 377.667 chr1 189247831 189248004 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 1228093 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 409.334-2 chr7 94541042 94541197 + 2.66667 NA intron (NM_001363428, intron 10 of 17) intron (NM_001363428, intron 10 of 17) 31310 NM_022900 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 592.001 chr14 46839366 46839751 + 2.66667 NA TTS (NM_182830) TTS (NM_182830) -187777 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 313.334-8 chr9 36904647 36904822 + 2.66667 NA intron (NR_103999, intron 6 of 8) intron (NR_103999, intron 6 of 8) -11203 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 445.667-4 chr3 4476132 4476334 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -8951 NM_001164675 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 366.667-7 chr2 28295463 28295617 + 2.66667 NA intron (NM_199193, intron 11 of 13) AluSq|SINE|Alu 14919 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 423.333-3 chr12 48458858 48459091 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -13691 NM_012404 23519 Hs.532658 NM_012404 ENSG00000139223 ANP32D PP32R2 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member D protein-coding 449.334-2 chr20 57555607 57555863 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -5375 NM_002591 5105 Hs.1872 NM_002591 ENSG00000124253 PCK1 PCKDC|PEPCK-C|PEPCK1|PEPCKC phosphoenolpyruvate carboxykinase 1 protein-coding 615.333 chr10 67962462 67962945 + 2.66667 NA intron (NM_001278185, intron 16 of 23) intron (NM_001278185, intron 16 of 23) 48180 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 407.334-3 chr2 170797283 170797448 + 2.66667 NA intron (NM_001289947, intron 3 of 4) intron (NM_001289947, intron 3 of 4) 13574 NM_001289947 285141 Hs.443729 NM_001289947 ENSG00000204334 ERICH2 - glutamate rich 2 protein-coding 549.333-3 chr4 103446707 103447034 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 21828 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 468.667-4 chr2 26918440 26918744 + 2.66667 NA intron (NM_020134, intron 2 of 12) intron (NM_020134, intron 2 of 12) -52045 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 438.667-5 chr19 28743935 28744266 + 2.66667 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -16406 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 387.333-6 chr2 172584264 172584486 + 2.66667 NA intron (NM_002610, intron 8 of 10) (TGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 28285 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 390.667-14 chr8 114481347 114481608 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -1044538 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 518.666 chr1 116320436 116320798 + 2.66667 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -52627 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 489.333-2 chr8 135423085 135423445 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -34191 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 395.334-2 chr12 69083332 69083519 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -120185 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 347.334-5 chr2 13476094 13476289 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -469178 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 528 chr15 66417190 66417592 + 2.66667 NA intron (NM_002755, intron 1 of 10) AluJb|SINE|Alu 30518 NM_002755 5604 Hs.145442 NM_002755 ENSG00000169032 MAP2K1 CFC3|MAPKK1|MEK1|MKK1|PRKMK1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 protein-coding 366.667-9 chr20 42348468 42348616 + 2.66667 NA intron (NM_133170, intron 11 of 31) MIRc|SINE|MIR -336941 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 450.667-2 chr10 25176857 25177289 + 2.66667 NA promoter-TSS (NR_027333) promoter-TSS (NR_027333) -797 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 397-4 chr3 23524248 23524517 + 2.66667 NA intron (NM_001370225, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR -281573 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 552 chr14 45408228 45408852 + 2.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -155338 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 402.667-7 chr4 104231899 104232154 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -258939 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 354.334-8 chr6 165741954 165742155 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -79774 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 447.333-2 chr12 24391403 24391848 + 2.66667 NA intron (NM_152989, intron 2 of 17) L3|LINE|CR1 168354 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 455.666-5 chr2 153883068 153883256 + 2.66667 NA intron (NM_052917, intron 1 of 12) HAL1|LINE|L1 11240 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 408-2 chr14 68801768 68802022 + 2.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -5652 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 569.333-2 chr4 78563889 78564163 + 2.66667 NA intron (NM_005139, intron 2 of 12) intron (NM_005139, intron 2 of 12) 12256 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 587.667-2 chr2 190687826 190688139 + 2.66667 NA intron (NM_001321314, intron 6 of 6) intron (NM_001321314, intron 6 of 6) 28824 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 370.334-3 chr2 206186429 206186669 + 2.66667 NA intron (NM_001098199, intron 2 of 2) intron (NM_001098199, intron 2 of 2) -16827 NR_104359 101669764 Hs.574781 NR_104359 GPR1-AS GPR1-AS1|GPR1AS GPR1 antisense RNA ncRNA 556.667-2 chr17 69844074 69844324 + 2.66667 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) intron (NR_109972, intron 3 of 4) -117508 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 519.334 chr18 1265698 1266125 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 93718 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 393.666-3 chr5 53169057 53169343 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 59358 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 406.667-6 chr3 141398497 141398778 + 2.66667 NA intron (NM_001080412, intron 6 of 7) L1MC5|LINE|L1 -3712 NM_001350100 253461 Hs.518301 NM_152535 ENSG00000177311 ZBTB38 CIBZ|PPP1R171|ZNF921 zinc finger and BTB domain containing 38 protein-coding 498.334 chr4 128940218 128940482 + 2.66667 NA intron (NM_144643, intron 17 of 20) intron (NM_144643, intron 17 of 20) 128506 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 546.001 chr15 70567689 70567987 + 2.66667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 18768 NR_135691 101929151 Hs.434703 NR_135691 ENSG00000280639 LINC02204 - long intergenic non-protein coding RNA 2204 ncRNA 394.334 chr10 51797559 51797863 + 2.66667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) L1MB4|LINE|L1 -98116 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 468.667-5 chr8 10068980 10069342 + 2.66667 NA intron (NM_001135670, intron 1 of 4) L1MC2|LINE|L1 14869 NM_012331 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 449.667-3 chr3 22070114 22070440 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 113138 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 385.001 chr12 69135900 69136143 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -103548 NM_001300947 11052 Hs.369606 NM_007007 ENSG00000111605 CPSF6 CFIM|CFIM68|CFIM72|HPBRII-4|HPBRII-7 cleavage and polyadenylation specific factor 6 protein-coding 515.334 chr14 41899150 41899391 + 2.66667 NA intron (NM_001330106, intron 4 of 4) intron (NM_001330106, intron 4 of 4) 292414 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 368-5 chr11 24513339 24513557 + 2.66667 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 16395 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 386.666-11 chr4 29160671 29160936 + 2.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -53489 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 246-95 chr6 144857986 144858145 + 2.66667 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 452410 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 410.666-7 chr5 87297408 87297830 + 2.66667 NA intron (NM_022650, intron 1 of 24) L1MC1|LINE|L1 26009 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 421.334-4 chr20 52261612 52261804 + 2.66667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -69723 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 568-2 chr7 105850136 105850412 + 2.66667 NA intron (NM_152749, intron 2 of 3) intron (NM_152749, intron 2 of 3) 26311 NM_020725 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 404-5 chr12 59293927 59294124 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -302004 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 180.667-143 chr8 77893238 77893343 + 2.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 442593 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 610.666 chr11 105194004 105194391 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -54428 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 411-5 chr18 9118338 9118583 + 2.66667 NA intron (NM_021074, intron 2 of 7) intron (NM_021074, intron 2 of 7) 15761 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 484.667-2 chr21 27782342 27782607 + 2.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 60095 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 401.333 chr1 67433582 67433789 + 2.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3283 NM_015640 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 351.667-7 chr15 98251304 98251460 + 2.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 80176 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 456-4 chr4 105149852 105150169 + 2.66667 NA intron (NM_001127208, intron 1 of 10) intron (NM_001127208, intron 1 of 10) 3325 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 503.667 chr14 49708725 49709010 + 2.66667 NA intron (NM_172193, intron 1 of 12) intron (NM_172193, intron 1 of 12) 15747 NM_172193 122773 Hs.509258 NM_172193 ENSG00000197776 KLHDC1 MST025 kelch domain containing 1 protein-coding 392-10 chr2 179840252 179840551 + 2.66667 NA intron (NM_001352808, intron 1 of 10) L2|LINE|L2 20507 NR_031659 100302172 NR_031659 ENSG00000221240 MIR1258 MIRN1258|hsa-mir-1258|mir-1258 microRNA 1258 ncRNA 397-2 chr12 50682051 50682236 + 2.66667 NA intron (NM_173602, intron 9 of 37) intron (NM_173602, intron 9 of 37) -81958 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 249.667-75 chr5 17228854 17228977 + 2.66667 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 11284 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 485.001-2 chr3 183948894 183949275 + 2.66667 NA intron (NM_001320032, intron 22 of 29) L1ME4b|LINE|L1 -57254 NR_046570 100873982 Hs.570696 NR_046570 ENSG00000223882 ABCC5-AS1 - ABCC5 antisense RNA 1 ncRNA 266.667-68 chr6 163543262 163543434 + 2.66667 NA intron (NM_206853, intron 4 of 6) intron (NM_206853, intron 4 of 6) 128136 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 566.667-3 chr5 12379953 12380190 + 2.66667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -194786 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 536.667 chr1 168383455 168383710 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 8058 NR_030284 693142 NR_030284 ENSG00000207974 MIR557 MIRN557|hsa-mir-557 microRNA 557 ncRNA 356.667-14 chr4 163673639 163673788 + 2.66667 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) intron (NM_001166373, intron 4 of 7) -60179 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 652.333 chr14 39903392 39903822 + 2.66667 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -471107 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 535.334 chr10 28800702 28801239 + 2.66667 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) intron (NR_120652, intron 2 of 3) -4920 NR_038374 100507605 Hs.119207 NR_038374 ENSG00000235824 LINC00837 - long intergenic non-protein coding RNA 837 ncRNA 568.667 chr3 108076556 108077000 + 2.66667 NA intron (NM_198793, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 14310 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 386.999 chr11 107351885 107352162 + 2.66667 NA intron (NM_152434, intron 13 of 17) intron (NM_152434, intron 13 of 17) 105823 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 369.333-12 chr2 23972862 23973046 + 2.66667 NA intron (NM_181713, intron 3 of 6) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 32491 NM_181713 165324 Hs.591576 NM_181713 ENSG00000173960 UBXN2A UBXD4 UBX domain protein 2A protein-coding 423.334-4 chr8 137114217 137114488 + 2.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 299236 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 395-23 chr7 26810452 26810615 + 2.66667 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) L1MA8|LINE|L1 47190 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 362.666-15 chr7 31618346 31618559 + 2.66667 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) intron (NM_194300, intron 8 of 12) 65450 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 625.333 chr10 36597541 36598012 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -528081 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 481.667-5 chr2 98577716 98578005 + 2.66667 NA intron (NM_001351428, intron 24 of 24) intron (NM_001351428, intron 24 of 24) 30652 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 365.667-4 chr11 94715560 94715766 + 2.66667 NA intron (NR_135096, intron 1 of 6) L1MD2|LINE|L1 24692 NR_135094 105369438 Hs.568921 NR_135093 ENSG00000255929 LOC105369438 - uncharacterized LOC105369438 ncRNA 449.333-4 chr11 107334853 107335288 + 2.66667 NA intron (NM_152434, intron 15 of 17) intron (NM_152434, intron 15 of 17) 122776 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 450-7 chr8 88080619 88080837 + 2.66667 NA intron (NM_005941, intron 6 of 9) AluSx1|SINE|Alu -206713 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 423.333-9 chr8 134401122 134401449 + 2.66667 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -196786 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 422-10 chr8 19214245 19214436 + 2.66667 NA intron (NR_038919, intron 3 of 4) intron (NR_038919, intron 3 of 4) 31182 NR_038919 100128993 Hs.697742 NR_038919 LOC100128993 - uncharacterized LOC100128993 ncRNA 383.667-3 chr3 40968359 40968592 + 2.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -231030 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 606.334-2 chr5 53406794 53407164 + 2.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -73650 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 276.667-6 chr1 216255323 216255453 + 2.66667 NA intron (NM_206933, intron 11 of 71) L1MEc|LINE|L1 168008 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 428.334 chr18 9592510 9592776 + 2.66667 NA intron (NR_052003, intron 3 of 19) intron (NR_052003, intron 3 of 19) 21916 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 410.333-4 chr2 230123358 230123624 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -54567 NM_152527 151473 Hs.504317 NM_152527 ENSG00000163053 SLC16A14 MCT14 solute carrier family 16 member 14 protein-coding 436.001 chr9 14526673 14527001 + 2.66667 NA intron (NM_001369458, intron 1 of 11) intron (NM_001369458, intron 1 of 11) 5240 NM_001369459 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 391.667-4 chr12 113212776 113212930 + 2.66667 NA intron (NM_001330452, intron 1 of 4) intron (NM_001330452, intron 1 of 4) 8241 NM_138451 115811 Hs.568276 NM_138451 ENSG00000166578 IQCD 4933433C09Rik|CFAP84|DRC10 IQ motif containing D protein-coding 513.334 chr1 177632682 177632978 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -67694 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 646.334-2 chr21 28548747 28549298 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 9704 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 397.333 chr1 28843875 28844075 + 2.66667 NA intron (NM_000911, intron 1 of 2) L1MB3|LINE|L1 31805 NM_000911 4985 Hs.372 NM_000911 ENSG00000116329 OPRD1 DOP|DOR|DOR1|OPRD opioid receptor delta 1 protein-coding 480-9 chr9 120210159 120210406 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 34768 NR_029604 406939 NR_029604 ENSG00000207814 MIR147A MIR147|MIRN147|hsa-mir-147a microRNA 147a ncRNA 360-17 chr21 37317353 37317551 + 2.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -48121 NM_001396 1859 Hs.368240 NM_001396 ENSG00000157540 DYRK1A DYRK|DYRK1|HP86|MNB|MNBH|MRD7 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A protein-coding 559.667 chr14 68090161 68090687 + 2.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 266832 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 481.667-2 chr1 80737982 80738224 + 2.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 96816 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 468-5 chr15 61864423 61864764 + 2.66667 NA 3' UTR (NM_018080, exon 80 of 80) 3' UTR (NM_018080, exon 80 of 80) 134675 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 334.334-11 chr8 121499691 121499875 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -139563 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 421.667-4 chr18 8660178 8660396 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 47334 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 412-12 chr6 135187716 135187972 + 2.66667 NA non-coding (NR_134964, exon 3 of 16) non-coding (NR_134964, exon 3 of 16) 6536 NM_001130172 4602 Hs.606320 NM_005375 ENSG00000118513 MYB Cmyb|c-myb|c-myb_CDS|efg MYB proto-oncogene, transcription factor protein-coding 422.333-4 chr3 21452014 21452231 + 2.66667 NA intron (NM_024697, intron 4 of 7) intron (NM_024697, intron 4 of 7) 46396 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 478.334 chr16 76289129 76289436 + 2.66667 NA intron (NR_136213, intron 1 of 23) intron (NR_136213, intron 1 of 23) 11881 NM_033401 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 391.334-3 chr4 55462613 55462762 + 2.66667 NA intron (NM_004898, intron 9 of 22) intron (NM_004898, intron 9 of 22) 66730 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 561.001 chr2 81372796 81373209 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 93944 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 406.001 chr11 67038465 67038676 + 2.66667 NA intron (NM_001318773, intron 4 of 8) intron (NM_001318773, intron 4 of 8) -7073 NR_106920 102465518 NR_106920 ENSG00000283326 MIR6860 hsa-mir-6860 microRNA 6860 ncRNA 603.666 chr12 29454260 29454979 + 2.66667 NA intron (NM_001353179, intron 21 of 25) intron (NM_001353179, intron 21 of 25) 45074 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 305-9 chr18 12697979 12698163 + 2.66667 NA intron (NM_001271989, intron 3 of 10) intron (NM_001271989, intron 3 of 10) 4652 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 445-5 chr2 54348191 54348526 + 2.66667 NA intron (NM_001369403, intron 2 of 3) intron (NM_001369403, intron 2 of 3) 17474 NM_001369403 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 393-6 chr22 19288247 19288476 + 2.66667 NA intron (NM_007098, intron 1 of 32) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 3358 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 382.334-9 chr3 25264660 25264912 + 2.66667 NA intron (NM_001290216, intron 4 of 10) intron (NM_001290216, intron 4 of 10) -76016 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 446.667-4 chr14 32570348 32570545 + 2.66667 NA intron (NM_004274, intron 4 of 13) intron (NM_004274, intron 4 of 13) 241148 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 331.334-2 chr10 74250977 74251158 + 2.66667 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) intron (NM_001369124, intron 3 of 9) 74304 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 442.667-2 chr2 73548968 73549270 + 2.66667 NA intron (NM_015120, intron 12 of 22) intron (NM_015120, intron 12 of 22) 92016 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 450.334-2 chr18 9628687 9628915 + 2.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 13537 NR_110774 101927323 Hs.151204 NR_110773 ENSG00000263627 PPP4R1-AS1 - PPP4R1 antisense RNA 1 ncRNA 451.334-3 chr5 33706023 33706270 + 2.66667 NA intron (NM_001324512, intron 3 of 21) L2c|LINE|L2 185844 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 339.334-7 chr3 177872408 177872557 + 2.66667 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) L1ME2|LINE|L1 55617 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 596.001 chr2 79812035 79812593 + 2.66667 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) L1M5|LINE|L1 54269 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 413.333-13 chr5 106655509 106655783 + 2.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 355368 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 449.667-2 chr14 52940743 52941079 + 2.66667 NA intron (NM_006832, intron 2 of 14) L1ME1|LINE|L1 10139 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 319-21 chr5 168046040 168046237 + 2.66667 NA intron (NM_001080428, intron 3 of 24) intron (NM_001080428, intron 3 of 24) -119707 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 398.667 chr1 199519018 199519183 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 370502 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 393.333-12 chr20 22438948 22439187 + 2.66667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -18424 NR_027090 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 1130.67 chr4 49149154 49149865 + 2.66667 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 162867 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 410-8 chr14 49256404 49256561 + 2.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 329898 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 405.334-3 chr6 57328812 57329007 + 2.66667 NA intron (NM_000947, intron 5 of 13) L1MB5|LINE|L1 11279 NM_000947 5558 Hs.654580 NM_000947 ENSG00000146143 PRIM2 PRIM2A|p58 DNA primase subunit 2 protein-coding 591.667-2 chr8 125123902 125124329 + 2.66667 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) L1MB8|LINE|L1 32255 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 586.333 chr4 42720416 42720704 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -63455 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 518.667-2 chr22 27564229 27564698 + 2.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 237293 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 552.001 chr1 201544619 201544855 + 2.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 24833 NR_026667 376693 Hs.605989 NR_026667 RPS10P7 RPS10_2_147 ribosomal protein S10 pseudogene 7 pseudo 396.001 chr9 36476068 36476226 + 2.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -74949 NM_194330 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 425.666 chr14 57472095 57472369 + 2.66667 NA intron (NM_018168, intron 5 of 5) L1MC4|LINE|L1 21625 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 262.667-63 chr5 123215832 123216027 + 2.66667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -125613 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 309.333-40 chr2 97953777 97954045 + 2.66667 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) L1MDa|LINE|L1 42037 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 411-12 chr7 53353661 53353873 + 2.66667 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 318134 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 682.667-2 chrX 40101379 40101775 + 2.66667 NA intron (NM_001123384, intron 1 of 13) CpG-29594 -3619 NM_017745 54880 Hs.659681 NM_017745 ENSG00000183337 BCOR ANOP2|MAA2|MCOPS2 BCL6 corepressor protein-coding 370.666-4 chr17 52629896 52630099 + 2.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -232124 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 537.334 chr6 45457368 45457706 + 2.66667 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 35262 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 581 chr3 17230795 17231236 + 2.66667 NA intron (NM_014744, intron 17 of 21) MER2|DNA|TcMar-Tigger 297819 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 358.667-16 chr2 196885279 196885469 + 2.66667 NA intron (NM_001321099, intron 13 of 27) intron (NM_001321099, intron 13 of 27) 41333 NM_024989 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 393.334 chr1 219571286 219571477 + 2.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -14057 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 404-10 chr3 62117946 62118126 + 2.66667 NA intron (NM_002841, intron 5 of 29) MIR|SINE|MIR 200911 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 444.333-4 chr2 191184243 191184472 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -32761 NM_001243835 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 422-8 chr5 18770957 18771205 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 963807 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 472.667 chr14 45625521 45625816 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 89934 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 415.334-2 chr3 56054073 56054290 + 2.66667 NA intron (NR_132749, intron 7 of 17) intron (NR_132749, intron 7 of 17) -201587 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 499.333-6 chr3 121836902 121837287 + 2.66667 NA intron (NM_018456, intron 1 of 5) intron (NM_018456, intron 1 of 5) 1885 NM_018456 55840 Hs.477325 NM_018456 ENSG00000145088 EAF2 BM040|TRAITS|U19 ELL associated factor 2 protein-coding 426-3 chr10 79367822 79368223 + 2.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 20553 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 412.334-3 chr15 64514323 64514632 + 2.66667 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 15057 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 487.001 chr3 119778125 119778399 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -2222 NM_033013 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 241-22 chr14 75032119 75032225 + 2.66667 NA exon (NM_001040108, exon 8 of 13) exon (NM_001040108, exon 8 of 13) 19295 NM_014381 27030 Hs.436650 NM_014381 ENSG00000119684 MLH3 HNPCC7 mutL homolog 3 protein-coding 620.667-2 chr5 60110698 60111193 + 2.66667 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) L1MA5|LINE|L1 -217219 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 316-40 chr4 158617951 158618129 + 2.66667 NA intron (NM_001253733, intron 10 of 17) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 53847 NM_001008393 201725 Hs.380920 NM_001008393 ENSG00000205208 C4orf46 RCDG1 chromosome 4 open reading frame 46 protein-coding 641.334 chr8 85176387 85176845 + 2.66667 NA promoter-TSS (NM_001951) promoter-TSS (NM_001951) 425 NR_134311 102723322 Hs.535913 NR_134311 ENSG00000260493 LOC102723322 - uncharacterized LOC102723322 ncRNA 612 chr16 56375507 56376106 + 2.66667 NA intron (NM_001144, intron 10 of 13) AluSz|SINE|Alu 49183 NM_001323511 267 Hs.295137 NM_001144 ENSG00000159461 AMFR GP78|RNF45 autocrine motility factor receptor protein-coding 414.666-2 chr1 208835492 208835786 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 106951 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 518.333 chr2 161292286 161292765 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -15900 NM_005805 10213 Hs.740477 NM_005805 ENSG00000115233 PSMD14 PAD1|POH1|RPN11 proteasome 26S subunit, non-ATPase 14 protein-coding 395.667-8 chr7 126744639 126744897 + 2.66667 NA intron (NM_001371088, intron 7 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 313416 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 582.667-5 chr8 63563207 63563704 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 97606 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 396.334-6 chr8 81399309 81399540 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 48015 NM_002677 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 563 chr1 114259277 114259710 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -105624 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 743.667 chr15 95571973 95572400 + 2.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 139093 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 682.667 chr1 62986617 62986956 + 2.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 24139 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 400-15 chr7 29912779 29912937 + 2.66667 NA intron (NM_001080529, intron 8 of 8) L1MB3|LINE|L1 76943 NM_001145515 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 569 chr1 118020693 118021103 + 2.66667 NA intron (NM_206996, intron 28 of 48) MER58B|DNA|hAT-Charlie 91159 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 573.333 chr11 98802346 98802639 + 2.66667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -218457 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 336.334-2 chr14 105031377 105031550 + 2.66667 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 -10380 NM_145701 55038 Hs.34045 NM_017955 ENSG00000170779 CDCA4 HEPP|SEI-3/HEPP cell division cycle associated 4 protein-coding 272.667-60 chr6 57267106 57267266 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -3840 NR_109774 100506188 Hs.485640 NR_109774 LOC100506188 - uncharacterized LOC100506188 ncRNA 517-3 chr22 25452224 25452746 + 2.66667 NA intron (NR_033734, intron 1 of 4) AluSg|SINE|Alu -3161 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 473.666-2 chr5 18018435 18018786 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 211336 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 407-8 chr3 163600023 163600246 + 2.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -296833 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 535.001 chr10 60890406 60890757 + 2.66667 NA intron (NM_001350906, intron 7 of 12) intron (NM_001350906, intron 7 of 12) 53604 NM_001350910 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 444.667-5 chr4 133314284 133314620 + 2.66667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 165158 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 429.667-5 chr7 9281703 9281928 + 2.66667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -352455 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 438-14 chr8 92179806 92180129 + 2.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -76582 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 655.999 chr14 45108631 45109098 + 2.66667 NA intron (NM_017922, intron 7 of 13) intron (NM_017922, intron 7 of 13) -2011 NR_003691 100113389 Hs.712501 NR_003691 ENSG00000239043 SNORD127 - small nucleolar RNA, C/D box 127 snoRNA 431-16 chr9 27056398 27056704 + 2.66667 NA intron (NM_025103, intron 18 of 19) intron (NM_025103, intron 18 of 19) -50879 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 408.334-3 chr3 96073168 96073382 + 2.66667 NA Intergenic (ATATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -286689 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 554.667 chr12 81187197 81187618 + 2.66667 NA intron (NM_024560, intron 8 of 15) intron (NM_024560, intron 8 of 15) 29019 NR_039848 100616133 NR_039848 ENSG00000265227 MIR4699 - microRNA 4699 ncRNA 381.667 chr12 41903324 41903474 + 2.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 139210 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 438.667-3 chr10 99648813 99649121 + 2.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -10542 NM_020354 57089 Hs.28326 NM_020354 ENSG00000198018 ENTPD7 LALP1 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 protein-coding 573.667-3 chr9 77787633 77787867 + 2.66667 NA intron (NM_002072, intron 5 of 6) AluSq|SINE|Alu -139428 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 331.334-14 chr7 20313909 20314085 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -16903 NM_002214 3696 Hs.592171 NM_002214 ENSG00000105855 ITGB8 - integrin subunit beta 8 protein-coding 371.666-9 chr20 6483194 6483362 + 2.66667 NA intron (NR_109953, intron 3 of 3) intron (NR_109953, intron 3 of 3) 56546 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 440.334-2 chr18 13710996 13711233 + 2.66667 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 15444 NM_152352 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 539-2 chr5 26040173 26040708 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 849487 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 400.667-12 chr8 119508059 119508354 + 2.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 84802 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 358-7 chr14 58514192 58514392 + 2.66667 NA 3' UTR (NM_001364700, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_001364700, exon 30 of 30) 74611 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 310.334-10 chr6 24614725 24614900 + 2.66667 NA intron (NM_001350409, intron 1 of 21) intron (NM_001350409, intron 1 of 21) 31209 NM_001168376 9856 Hs.26441 NM_014809 ENSG00000137261 KIAA0319 AAVR|DYLX2|DYX2|NMIG KIAA0319 protein-coding 418-9 chr5 83213346 83213567 + 2.66667 NA intron (NM_001318012, intron 6 of 7) L1M4a2|LINE|L1 135909 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 424.001 chr8 104207360 104207562 + 2.66667 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) intron (NM_001348498, intron 20 of 24) -15874 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 400.333-2 chr10 61269545 61269769 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -182982 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 417.999-3 chr18 10103807 10104109 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 189942 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 485.334-2 chr12 14481295 14481490 + 2.66667 NA 3' UTR (NM_001286515, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001286515, exon 13 of 13) -86340 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 402.667-8 chr5 23849558 23849773 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -101683 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 220.333-2 chr1 21012562 21012758 + 2.66667 NA intron (NM_003760, intron 2 of 31) intron (NM_003760, intron 2 of 31) -24228 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 381.667-4 chr2 139422737 139422941 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 525515 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 165.667-52 chr14 61867120 61867188 + 2.66667 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 54451 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 348.333-29 chr6 141440400 141440650 + 2.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 648274 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 620 chr14 39283690 39283968 + 2.66667 NA intron (NM_001354157, intron 4 of 22) L1MA9|LINE|L1 16444 NM_203355 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 622-2 chr16 59081944 59082272 + 2.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -347792 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 224.667 chr1 167574338 167574515 + 2.66667 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 -20664 NM_003851 8804 Hs.5710 NM_003851 ENSG00000143162 CREG1 CREG cellular repressor of E1A stimulated genes 1 protein-coding 417.667-9 chr6 155376558 155376767 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -62178 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 402-8 chr5 2451549 2451885 + 2.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -139516 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 565.667-3 chr8 136297780 136298239 + 2.66667 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -232789 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 414.333-5 chr3 76040246 76040520 + 2.66667 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -254834 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 397.334-10 chr7 78159489 78159667 + 2.66667 NA intron (NM_001301128, intron 15 of 20) L2b|LINE|L2 -187664 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 572-2 chr6 100426089 100426406 + 2.66667 NA intron (NM_005068, intron 8 of 10) intron (NM_005068, intron 8 of 10) 37428 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 402-13 chr9 69665219 69665528 + 2.66667 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) LTR16C|LTR|ERVL 6998 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 499-6 chrX 7250437 7250811 + 2.66667 NA intron (NM_000351, intron 1 of 9) intron (NM_000351, intron 1 of 9) -1620 NM_001320753 412 Hs.522578 NM_000351 ENSG00000101846 STS ARSC|ARSC1|ASC|ES|SSDD|XLI steroid sulfatase protein-coding 372.333-24 chr9 32366341 32366580 + 2.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -18143 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 614.667-2 chr6 51074351 51074838 + 2.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 255723 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 395.334-4 chr3 186189089 186189318 + 2.66667 NA intron (NM_001346, intron 21 of 24) intron (NM_001346, intron 21 of 24) -80114 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 490.334 chr10 90284313 90284702 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 256298 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 373-17 chr6 87714758 87714920 + 2.66667 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -12606 NM_018064 55122 Hs.485915 NM_018064 ENSG00000135334 AKIRIN2 C6orf166|FBI1|dJ486L4.2 akirin 2 protein-coding 387-14 chr6 129737191 129737443 + 2.66667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -27140 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 502.667-2 chr12 60583765 60584196 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 894610 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 746.001 chr1 217434662 217435033 + 2.66667 NA intron (NM_018040, intron 9 of 9) intron (NM_018040, intron 9 of 9) 196243 NM_001297754 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 456.333-8 chr2 213022225 213022675 + 2.66667 NA intron (NM_001371277, intron 5 of 6) intron (NM_001371277, intron 5 of 6) -96114 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 357.334-4 chr14 48436248 48436447 + 2.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -641333 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 802.668 chr8 22936749 22937217 + 2.66667 NA intron (NM_001363233, intron 1 of 6) L1M4c|LINE|L1 4094 NM_001363233 157310 Hs.491242 NM_144962 ENSG00000134020 PEBP4 CORK-1|CORK1|GWTM1933|HEL-S-300|PEBP-4|PRO4408|hPEBP4 phosphatidylethanolamine binding protein 4 protein-coding 277-10 chr14 24906071 24906257 + 2.66667 NA intron (NM_001351943, intron 3 of 6) intron (NM_001351943, intron 3 of 6) 142836 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 473.333-8 chr8 121763476 121763779 + 2.66667 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -122187 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 528.001-2 chr7 16545475 16545768 + 2.66667 NA intron (NM_001195280, intron 3 of 8) intron (NM_001195280, intron 3 of 8) 18796 NM_001195280 100506049 Hs.278036 NM_001195280 ENSG00000205858 LRRC72 - leucine rich repeat containing 72 protein-coding 487.666-3 chr17 61024687 61025118 + 2.66667 NA intron (NM_001320470, intron 16 of 25) intron (NM_001320470, intron 16 of 25) 342802 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 534-3 chr15 67579319 67579608 + 2.66667 NA intron (NM_001206804, intron 3 of 21) intron (NM_001206804, intron 3 of 21) 30369 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 407.334-5 chr4 105666437 105666686 + 2.66667 NA intron (NM_001242729, intron 11 of 13) L2a|LINE|L2 42128 NM_020395 57117 Hs.480454 NM_020395 ENSG00000138785 INTS12 INT12|PHF22|SBBI22 integrator complex subunit 12 protein-coding 520.667-3 chr3 98650145 98650601 + 2.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -56762 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 387.667-14 chr7 27759257 27759439 + 2.66667 NA intron (NM_001206902, intron 3 of 15) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 19253 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 388.667-3 chr11 41289707 41289936 + 2.66667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 169815 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 670 chr12 20426791 20427166 + 2.66667 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 57733 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 601.999 chr17 61846591 61847070 + 2.66667 NA intron (NM_032043, intron 6 of 19) MIR3|SINE|MIR 16729 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 569-2 chr14 73950510 73950909 + 2.66667 NA promoter-TSS (NM_152445) promoter-TSS (NM_152445) 407 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 373.667-17 chr8 88148334 88148502 + 2.66667 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) L1MEd|LINE|L1 179065 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 504.001 chr15 67644569 67644765 + 2.66667 NA intron (NM_001206804, intron 9 of 21) intron (NM_001206804, intron 9 of 21) 95573 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 409.333-2 chr1 235464193 235464507 + 2.66667 NA 3' UTR (NM_001277155, exon 8 of 8).2 3' UTR (NM_001277155, exon 8 of 8).2 40102 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 441.333-3 chr17 41198547 41198846 + 2.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 8809 NM_001190460 728318 Hs.727478 NM_001190460 ENSG00000240542 KRTAP9-1 KAP9.1|KRTAP9L3 keratin associated protein 9-1 protein-coding 434-6 chr5 42283671 42283922 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -108451 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 401.334-4 chr8 111873600 111873816 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 497069 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 447.333-7 chr3 23612860 23613137 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -192957 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 394.333-12 chr22 36617348 36617563 + 2.66667 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 85403 NM_006078 10369 Hs.146766 NM_006078 ENSG00000166862 CACNG2 MRD10 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2 protein-coding 387.999-5 chr5 165522613 165522890 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 1052472 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 414.667-16 chr7 119637272 119637484 + 2.66667 NA intron (NR_131960, intron 4 of 4) L1MA8|LINE|L1 269997 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 521-2 chr10 64132931 64133144 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -611147 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 391.001-2 chr18 10397263 10397543 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 16967 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 460.667-3 chr18 63463837 63464272 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -12904 NM_002639 5268 Hs.55279 NM_002639 ENSG00000206075 SERPINB5 PI5|maspin serpin family B member 5 protein-coding 375.333-26 chr5 41615938 41616202 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -105469 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 600.333 chr7 4036364 4036815 + 2.66667 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -93096 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 433.001 chr10 21739081 21739350 + 2.66667 NA intron (NM_004641, intron 22 of 23) intron (NM_004641, intron 22 of 23) 205043 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 393.667-6 chr14 65092892 65093229 + 2.66667 NA intron (NR_045122, intron 2 of 2) intron (NR_045122, intron 2 of 2) 3142 NR_045122 100506321 Hs.711267 NR_045122 ENSG00000259118 LOC100506321 - uncharacterized LOC100506321 ncRNA 371-2 chr10 21764534 21764792 + 2.66667 NA intron (NM_022365, intron 10 of 11) intron (NM_022365, intron 10 of 11) 230491 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 452.667 chr1 93419111 93419301 + 2.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -28912 NM_017737 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 666.334 chr5 23838786 23839284 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -112313 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 493.333-2 chr2 238790686 238791003 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 57063 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 451.667-6 chr8 115926293 115926514 + 2.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -257428 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 509.333-4 chr8 131627488 131627830 + 2.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -276434 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 468.001-2 chr2 96726259 96726526 + 2.66667 NA intron (NM_001322354, intron 3 of 7) L1MB8|LINE|L1 13684 NM_001142292 81562 Hs.655743 NM_030805 ENSG00000114988 LMAN2L MRT52|VIPL lectin, mannose binding 2 like protein-coding 512.333-4 chr8 117252032 117252536 + 2.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 117289 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 386.999-3 chr20 4462439 4462786 + 2.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -213325 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 399.001 chr10 4847790 4848001 + 2.66667 NA non-coding (NR_073125, exon 10 of 10) non-coding (NR_073125, exon 10 of 10) 21688 NM_001040177 83592 Hs.657944 NM_031436 ENSG00000165568 AKR1E2 AKR1CL2|AKRDC1|LoopADR|TAKR|hTSP|htAKR aldo-keto reductase family 1 member E2 protein-coding 527-2 chr4 64376968 64377274 + 2.66667 NA intron (NM_001363796, intron 1 of 11) intron (NM_001363796, intron 1 of 11) 32329 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 378-20 chr4 60062167 60062370 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -860351 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 541.001 chr15 56771744 56772078 + 2.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -37825 NM_001002843 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 432-2 chr10 59118217 59118442 + 2.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 58135 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 332.334-6 chr8 110461430 110461581 + 2.66667 NA Intergenic LTR89|LTR|ERVL? -485734 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 455.667-6 chr12 6395074 6395382 + 2.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 11066 NM_002342 4055 Hs.1116 NM_002342 ENSG00000111321 LTBR D12S370|LT-BETA-R|TNF-R-III|TNFCR|TNFR-RP|TNFR2-RP|TNFR3|TNFRSF3 lymphotoxin beta receptor protein-coding 325.333-45 chr7 35412904 35413173 + 2.66667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 99183 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 487.334-2 chr4 96735917 96736316 + 2.66667 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 425413 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 389.333-2 chr1 180806445 180806630 + 2.66667 NA exon (NM_001328662, exon 6 of 11) exon (NM_001328662, exon 6 of 11) -106360 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 282.667-31 chr3 96135516 96135733 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -224340 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 393.333-10 chr19 3065025 3065278 + 2.66667 NA promoter-TSS (NR_031672).6 promoter-TSS (NR_031672).6 -437 NR_031672 100302233 NR_031672 ENSG00000221641 MIR1268A MIR1268|MIRN1268|hsa-mir-1268|hsa-mir-1268a microRNA 1268a ncRNA 665.334 chr10 93936255 93936687 + 2.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 25444 NR_002319 266971 Hs.149255 NR_002319 ENSG00000180764 PIPSL PIP5K1L1|PIP5K1P3|PSMD4P2|bA429H9.1 PIP5K1A and PSMD4 like (pseudogene) pseudo 355.334-5 chr18 53594799 53594969 + 2.66667 NA intron (NR_110798, intron 5 of 5) intron (NR_110798, intron 5 of 5) -13825 NR_110800 101928167 Hs.382012 NR_110800 ENSG00000260433 LINC01917 - long intergenic non-protein coding RNA 1917 ncRNA 222.333-85 chr6 156678076 156678252 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -99691 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 407.999 chr17 12624217 12624471 + 2.66667 NA intron (NR_034145, intron 3 of 3) L1MA8|LINE|L1 -41546 NM_001146312 93649 Hs.462257 NM_153604 ENSG00000141052 MYOCD MYCD myocardin protein-coding 443.334-2 chr2 207663514 207663832 + 2.66667 NA intron (NR_135566, intron 1 of 3) intron (NR_135566, intron 1 of 3) 1243 NR_135567 102724714 Hs.443475 NR_135566 ENSG00000224137 LINC01857 - long intergenic non-protein coding RNA 1857 ncRNA 622.667 chr2 69925851 69926165 + 2.66667 NA intron (NM_001202513, intron 3 of 5) L1ME3G|LINE|L1 10899 NM_001202513 4084 Hs.468908 NM_002357 ENSG00000059728 MXD1 BHLHC58|MAD|MAD1 MAX dimerization protein 1 protein-coding 443.667-4 chr9 102949621 102949798 + 2.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -45624 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 738.666 chr16 84400986 84401863 + 2.66667 NA intron (NM_014861, intron 2 of 26) AluSx|SINE|Alu -5164 NM_001291454 9914 Hs.6168 NM_014861 ENSG00000064270 ATP2C2 SPCA2 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2 protein-coding 432 chr1 191577464 191577707 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -349087 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 244.334-17 chr5 106264752 106264916 + 2.66667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 746180 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 233.334-4 chr3 96835691 96835839 + 2.66667 NA intron (NM_001080448, intron 1 of 17) intron (NM_001080448, intron 1 of 17) 21171 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 512.667-2 chr12 90607266 90607482 + 2.66667 NA Intergenic (ATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -310649 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 464.334 chr3 114661248 114661540 + 2.66667 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) -36449 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 429.666-5 chr9 95223136 95223465 + 2.66667 NA intron (NM_001243744, intron 4 of 13) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 93954 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 388 chr1 40546293 40546552 + 2.66667 NA intron (NM_152373, intron 4 of 4) intron (NM_152373, intron 4 of 4) 14785 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 391.999-3 chr22 46034805 46035058 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 9937 NR_027036 100271722 Hs.528519 NR_027036 LINC00899 - long intergenic non-protein coding RNA 899 ncRNA 774.333 chr2 195712969 195713277 + 2.66667 NA intron (NM_020342, intron 5 of 9) intron (NM_020342, intron 5 of 9) 55897 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 677.334 chr4 73185725 73186155 + 2.66667 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) 37117 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 438-4 chr14 28995910 28996112 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -210224 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 431-2 chr10 54486691 54486977 + 2.66667 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 604 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 520.333-2 chrX 45329592 45329971 + 2.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -128905 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 387.667-9 chr22 28382251 28382437 + 2.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -77525 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 358.666-17 chr7 43542361 43542617 + 2.66667 NA intron (NM_001287059, intron 24 of 27) L1MB1|LINE|L1 -19947 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 412.334 chr1 244765894 244766157 + 2.66667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -69281 NM_001312871 116228 Hs.411490 NM_198076 ENSG00000203667 COX20 FAM36A cytochrome c oxidase assembly factor COX20 protein-coding 470.667-5 chr2 138871552 138871740 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -25678 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 511.667-3 chr6 46185203 46185578 + 2.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14380 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 491.667-4 chr5 42847373 42847766 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -35493 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 520-4 chr9 26475785 26476087 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 409261 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 1242.67 chr6 62041411 62042229 + 2.66667 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) intron (NR_146874, intron 3 of 13) 244405 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 412.667-16 chr8 126147375 126147657 + 2.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -177979 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 534.667-4 chr8 76490644 76490916 + 2.66667 NA intron (NR_105006, intron 3 of 5) Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 84126 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 452-3 chr17 35261899 35262191 + 2.66667 NA intron (NM_001330183, intron 3 of 3) intron (NM_001330183, intron 3 of 3) 18973 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 416.001 chr2 60823560 60823796 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 57636 NR_033980 400957 Hs.170358 NR_033980 ENSG00000228414 LINC01185 - long intergenic non-protein coding RNA 1185 ncRNA 468.334 chr1 235291714 235292001 + 2.66667 NA intron (NR_135074, intron 2 of 24) L1ME4b|LINE|L1 35630 NM_001206794 51742 Hs.575782 NM_016374 ENSG00000054267 ARID4B BCAA|BRCAA1|RBBP1L1|RBP1L1|SAP180 AT-rich interaction domain 4B protein-coding 416.667-10 chr22 29011454 29011772 + 2.66667 NA intron (NM_001206998, intron 2 of 8) intron (NM_001206998, intron 2 of 8) 19863 NR_046851 100874123 Hs.674708 NR_046851 ENSG00000177993 ZNRF3-AS1 - ZNRF3 antisense RNA 1 ncRNA 427-5 chr5 16141978 16142261 + 2.66667 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 37672 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 410.334-2 chr3 43828673 43828910 + 2.66667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -137197 NM_001346468 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 360.667-13 chr4 113084833 113084981 + 2.66667 NA intron (NM_001354232, intron 1 of 46) MIRb|SINE|MIR -21956 NR_031641 100302188 NR_031641 ENSG00000283193 MIR1243 MIRN1243|hsa-mir-1243 microRNA 1243 ncRNA 285.334-5 chr14 80161840 80162026 + 2.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -49486 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 257-19 chr16 74742921 74743124 + 2.66667 NA intron (NM_024306, intron 1 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 31798 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 321.333-51 chr6 113801448 113801606 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -55818 NM_002356 4082 Hs.519909 NM_002356 ENSG00000277443 MARCKS 80K-L|MACS|PKCSL|PRKCSL myristoylated alanine rich protein kinase C substrate protein-coding 476.667-4 chr2 117540576 117540832 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -273987 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 375.667-12 chr20 35730117 35730335 + 2.66667 NA intron (NR_040722, intron 5 of 17) intron (NR_040722, intron 5 of 17) 12034 NR_040722 9584 Hs.282901 NM_004902 ENSG00000131051 RBM39 CAPER|CAPERalpha|FSAP59|HCC1|RNPC2 RNA binding motif protein 39 protein-coding 708.001 chr15 85572740 85573352 + 2.66667 NA intron (NM_007200, intron 5 of 36) intron (NM_007200, intron 5 of 36) -46904 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 436-7 chr2 80490922 80491194 + 2.66667 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 177679 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 604 chr5 32613068 32613419 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 27686 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 318.667-22 chr3 113507843 113508035 + 2.66667 NA intron (NM_001331078, intron 1 of 17) intron (NM_001331078, intron 1 of 17) 6905 NM_001331079 152185 Hs.477144 NM_144718 ENSG00000163611 SPICE1 CCDC52|SPICE spindle and centriole associated protein 1 protein-coding 378-18 chr3 48033361 48033583 + 2.66667 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) intron (NM_002375, intron 1 of 18) 55376 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 421.667-7 chr5 23419031 23419319 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -88434 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 637.334 chr3 85511291 85511539 + 2.66667 NA intron (NM_001256502, intron 1 of 10) intron (NM_001256502, intron 1 of 10) 6356 NM_001256505 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 509.334 chr18 31290289 31290503 + 2.66667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -27764 NM_001942 1828 Hs.2633 NM_001942 ENSG00000134760 DSG1 CDHF4|DG1|DSG|EPKHE|EPKHIA|PPKS1|SPPK1 desmoglein 1 protein-coding 468.666-3 chr18 57106691 57107077 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -34765 NR_048536 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 332-16 chr2 63630246 63630395 + 2.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 41169 NM_001199112 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 684.333 chr8 126987837 126988321 + 2.66667 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -25075 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 396-17 chr8 127306370 127306547 + 2.66667 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR 61821 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 485.001 chr1 236350445 236350705 + 2.66667 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -43711 NM_145861 128178 Hs.352224 NM_080738 ENSG00000186197 EDARADD ECTD11A|ECTD11B|ED3|EDA3 EDAR associated death domain protein-coding 441.333-7 chr7 51720688 51721076 + 2.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -327626 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 493.333-3 chr5 50773056 50773360 + 2.66667 NA intron (NM_024615, intron 7 of 25) L1MA6|LINE|L1 105794 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 438.666-3 chr10 60620399 60620743 + 2.66667 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) -47615 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 463.999 chr3 119996095 119996437 + 2.66667 NA intron (NM_002093, intron 2 of 11) intron (NM_002093, intron 2 of 11) 88382 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 413.334-4 chr15 68935982 68936250 + 2.66667 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) intron (NM_001184780, intron 1 of 15) 5591 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 726.667 chr8 85102306 85102941 + 2.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -4615 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 417.667 chr12 17135111 17135398 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 146507 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 408.667 chr1 44163588 44163847 + 2.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -22086 NM_001358438 105378952 NM_001358438 ENSG00000283039 KLF18 - Kruppel like factor 18 protein-coding 454.667-5 chr3 187677448 187677666 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -7163 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 286-31 chr2 162220985 162221223 + 2.66667 NA intron (NM_004460, intron 6 of 25) intron (NM_004460, intron 6 of 25) 22341 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 300-40 chr3 33305368 33305560 + 2.66667 NA intron (NR_146129, intron 4 of 15) intron (NR_146129, intron 4 of 15) 28022 NR_146133 25827 Hs.475872 NM_012157 ENSG00000153558 FBXL2 FBL2|FBL3 F-box and leucine rich repeat protein 2 protein-coding 510-2 chr14 45224622 45225054 + 2.66667 NA intron (NM_018353, intron 10 of 16) intron (NM_018353, intron 10 of 16) 28364 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 388.333-10 chr2 123747483 123747765 + 2.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 277550 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 488.334 chr5 38996196 38996579 + 2.66667 NA intron (NM_001285439, intron 6 of 38) intron (NM_001285439, intron 6 of 38) 78012 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 329-20 chr5 94267021 94267266 + 2.66667 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -155444 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 640.001 chr4 60920291 60920861 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -2043 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 350-14 chr2 107241352 107241518 + 2.66667 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 108090 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 614.333 chr2 144437010 144437277 + 2.66667 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -82471 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 267.667-60 chr6 56890381 56890490 + 2.66667 NA intron (NM_001144769, intron 3 of 96) intron (NM_001144769, intron 3 of 96) -38519 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 336.667-16 chr3 179990028 179990223 + 2.66667 NA intron (NM_016559, intron 1 of 14) MIR3|SINE|MIR -15900 NM_001349388 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 386.667-5 chr14 31529241 31529493 + 2.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32037 NM_025152 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 412.667-2 chr10 52524490 52524848 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -54136 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 363.667-15 chr7 50944945 50945142 + 2.66667 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -151590 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 463.667-2 chr20 43890852 43891275 + 2.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -3655 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 510.667-3 chr8 84546946 84547231 + 2.66667 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1PA8|LINE|L1 131604 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 311-23 chr3 181379171 181379317 + 2.66667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 63242 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 471.667 chr22 25244724 25245057 + 2.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 25251 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 388.667-11 chr5 168187440 168187668 + 2.66667 NA intron (NM_001368145, intron 12 of 26) intron (NM_001368145, intron 12 of 26) 21709 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 472-8 chr4 156051748 156052131 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -98073 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 411.334-4 chr20 19849948 19850172 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -36461 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 334.667-23 chr5 77060767 77060939 + 2.66667 NA intron (NM_018046, intron 12 of 13) intron (NM_018046, intron 12 of 13) 19718 NR_003014 677828 Hs.693249 NR_003014 ENSG00000238961 SNORA47 HBI-115 small nucleolar RNA, H/ACA box 47 snoRNA 292.334 chr10 4451768 4451970 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 45400 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 310.667-34 chr6 34671713 34671877 + 2.66667 NA intron (NM_022758, intron 1 of 3) HAL1|LINE|L1 -24359 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 376.334-4 chr14 72854398 72854614 + 2.66667 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 38143 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 530 chr3 111142297 111142641 + 2.66667 NA intron (NM_001243288, intron 5 of 8) intron (NM_001243288, intron 5 of 8) 70653 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 429.667 chr10 61754501 61754764 + 2.66667 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) intron (NM_173554, intron 4 of 6) 91671 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 423.334-2 chr8 86751407 86751646 + 2.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -7851 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 537.667 chr8 138256481 138256837 + 2.66667 NA intron (NM_015912, intron 5 of 19) intron (NM_015912, intron 5 of 19) -173114 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 423.334 chr1 79601890 79602062 + 2.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -595246 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 418.334-2 chr18 7058125 7058379 + 2.66667 NA intron (NM_005559, intron 3 of 62) intron (NM_005559, intron 3 of 62) 59545 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 466-6 chr18 3243359 3243645 + 2.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -3980 NM_001303048 10627 Hs.190086 NM_006471 ENSG00000101608 MYL12A HEL-S-24|MLC-2B|MLCB|MRCL3|MRLC3|MYL2B myosin light chain 12A protein-coding 385.333-11 chr14 32993476 32993750 + 2.66667 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) intron (NM_001165893, intron 1 of 10) 54734 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 395.333-5 chr11 22819960 22820242 + 2.66667 NA TTS (NR_135213) TTS (NR_135213) 9278 NR_135213 258010 Hs.349096 NM_148893 ENSG00000198168 SVIP - small VCP interacting protein protein-coding 447.333-3 chr14 51879861 51880232 + 2.66667 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) 19434 NM_053064 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 347.667-12 chr3 28115750 28115900 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -125794 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 481-5 chr5 36211762 36212069 + 2.66667 NA exon (NM_153013, exon 7 of 12) exon (NM_153013, exon 7 of 12) 29476 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 406.334-7 chr9 97705360 97705657 + 2.66667 NA intron (NR_147055, intron 10 of 10) intron (NR_147055, intron 10 of 10) -8099 NR_149091 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 416.001-2 chr20 43218994 43219204 + 2.66667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -29193 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 374-16 chr5 3246066 3246304 + 2.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 68350 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 409.001 chr6 128982313 128982486 + 2.66667 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 99258 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 267.334-17 chr5 24709502 24709659 + 2.66667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -64602 NM_001362460 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 397.334-7 chr3 77870897 77871079 + 2.66667 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger 177975 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 461 chr10 61088567 61088853 + 2.66667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 72435 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 351-2 chr1 111692787 111692988 + 2.66667 NA intron (NM_001370216, intron 2 of 7) L1ME4b|LINE|L1 28093 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 557.334 chr17 80042320 80042829 + 2.66667 NA intron (NM_001330508, intron 3 of 10) L1M4|LINE|L1 5932 NM_017950 55036 Hs.202542 NM_017950 ENSG00000141519 CCDC40 CILD15|FAP172 coiled-coil domain containing 40 protein-coding 482-4 chr8 63830335 63830672 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 61073 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 508.333-3 chr21 30978661 30979004 + 2.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 59644 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 458-9 chr8 115231090 115231399 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 436769 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 413-2 chr14 47131472 47131648 + 2.66667 NA intron (NM_001113498, intron 5 of 16) intron (NM_001113498, intron 5 of 16) 211686 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 415-7 chr20 36436320 36436600 + 2.66667 NA intron (NM_001365621, intron 4 of 12) intron (NM_001365621, intron 4 of 12) -25008 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 581.667 chr12 81185692 81186062 + 2.66667 NA intron (NM_024560, intron 8 of 15) L1MA9|LINE|L1 27489 NR_039848 100616133 NR_039848 ENSG00000265227 MIR4699 - microRNA 4699 ncRNA 444.666-6 chrX 39496732 39497073 + 2.66667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -105128 NR_110385 101927449 Hs.553988 NR_110385 ENSG00000236747 LINC01282 - long intergenic non-protein coding RNA 1282 ncRNA 616.001 chr7 49826960 49827306 + 2.66667 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) intron (NR_136188, intron 2 of 3) 51800 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 475.999 chr15 67736701 67737005 + 2.66667 NA intron (NM_001206804, intron 17 of 21) intron (NM_001206804, intron 17 of 21) -88656 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 395.333-3 chr1 181232349 181232629 + 2.66667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -3899 NR_046249 100287948 Hs.742594 NR_046249 ENSG00000179452 LINC01699 GM140 long intergenic non-protein coding RNA 1699 ncRNA 476-6 chr6 157413243 157413479 + 2.66667 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) intron (NM_024630, intron 1 of 8) 32171 NM_153746 79683 Hs.596214 NM_024630 ENSG00000175048 ZDHHC14 NEW1CP zinc finger DHHC-type containing 14 protein-coding 928 chr5 8741226 8741905 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -98167 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 452.667-9 chr5 13772414 13772592 + 2.66667 NA intron (NM_001369, intron 55 of 78) LTR84b|LTR|ERVL 171977 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 419.667-11 chrUn_KI270333v1 2469 2668 + 2.66667 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 390.667-5 chr21 24951468 24951640 + 2.66667 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 111004 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 802.666 chr5 109406376 109406889 + 2.66667 NA intron (NM_014819, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 3342 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 494 chr1 169210121 169210315 + 2.66667 NA intron (NR_104229, intron 10 of 12) intron (NR_104229, intron 10 of 12) 103528 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 528.667-6 chr8 124010324 124010580 + 2.66667 NA intron (NR_040044, intron 4 of 5) intron (NR_040044, intron 4 of 5) 30330 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 530-2 chr7 113488820 113489156 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -370406 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 633.999 chr1 77536037 77536561 + 2.66667 NA intron (NM_012093, intron 13 of 13) AluJo|SINE|Alu 146359 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 759 chr14 53182447 53182990 + 2.66667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 29364 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 399-3 chr1 241024764 241024992 + 2.66667 NA intron (NM_001350116, intron 3 of 16) intron (NM_001350116, intron 3 of 16) -107394 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 485.667-2 chr16 62197472 62197759 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -161177 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 392.001-2 chr2 107246556 107246802 + 2.66667 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 102846 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 419.667-4 chr4 138384786 138384952 + 2.66667 NA intron (NR_051987, intron 2 of 2) intron (NR_051987, intron 2 of 2) 75158 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 377.334 chr11 114672888 114673034 + 2.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -5566 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 358.334-6 chr7 141487300 141487530 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -63995 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 404 chr10 51556419 51556649 + 2.66667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) L1PA16|LINE|L1 143061 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 367-8 chr5 109112276 109112472 + 2.66667 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) intron (NR_146155, intron 17 of 19) 187768 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 648.334 chr10 68365655 68366164 + 2.66667 NA intron (NR_103476, intron 13 of 18) intron (NR_103476, intron 13 of 18) -32981 NM_022129 64081 Hs.198158 NM_022129 ENSG00000108187 PBLD HEL-S-306|MAWBP|MAWDBP phenazine biosynthesis like protein domain containing protein-coding 413.334-7 chr7 48272784 48272949 + 2.66667 NA exon (NM_152701, exon 17 of 62) exon (NM_152701, exon 17 of 62) 101408 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 373.334 chr1 82662727 82662881 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -240379 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 533.667 chr11 111985640 111986113 + 2.66667 NA intron (NM_001037954, intron 8 of 19) L2|LINE|L2 8567 NM_033425 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 584.667 chr20 38059702 38060043 + 2.66667 NA intron (NM_021215, intron 5 of 6) intron (NM_021215, intron 5 of 6) 26126 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 385.334-3 chr3 129841723 129842116 + 2.66667 NA intron (NM_001349263, intron 2 of 7) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -47307 NM_001349273 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 492.667 chr22 40549288 40549694 + 2.66667 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) L1ME3A|LINE|L1 -15664 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 401.333-3 chr1 213169338 213169534 + 2.66667 NA intron (NM_001349670, intron 7 of 11) intron (NM_001349670, intron 7 of 11) 118195 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 462-6 chr14 42526896 42527220 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 920202 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 459.999 chr2 43949235 43949585 + 2.66667 NA intron (NM_133259, intron 16 of 37) intron (NM_133259, intron 16 of 37) 46579 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 484.334-2 chr3 130680512 130680834 + 2.66667 NA exon (NM_014602, exon 19 of 20) exon (NM_014602, exon 19 of 20) 66156 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 415.334 chr12 41832023 41832227 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 67936 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 447.667 chr3 31123000 31123276 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 38649 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 416.667-2 chr14 56436756 56437097 + 2.66667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -77405 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 383.333-17 chr7 117785345 117785661 + 2.66667 NA intron (NM_001363351, intron 4 of 22) intron (NM_001363351, intron 4 of 22) 86717 NM_001363350 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 355-3 chr12 43884098 43884338 + 2.66667 NA intron (NM_001286213, intron 2 of 6) intron (NM_001286213, intron 2 of 6) 48137 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 646.667-2 chr5 19789617 19789950 + 2.66667 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) intron (NM_001349559, intron 3 of 12) 96489 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 519 chr10 85554666 85555089 + 2.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -22854 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 430.001 chr14 47168674 47168905 + 2.66667 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 174457 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 493.667 chr1 163978211 163978515 + 2.66667 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -555172 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 348.334-3 chr11 81243279 81243453 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -480563 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 1223.67 chr5 49666327 49667330 + 2.66667 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 774460 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 577.001 chr5 45490811 45491063 + 2.66667 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 205443 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 532.667 chr17 79649208 79649411 + 2.66667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -38258 NM_001350451 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 301.334-3 chr12 110382252 110382435 + 2.66667 NA intron (NM_001137664, intron 7 of 9) MIRb|SINE|MIR 21387 NM_016238 51434 Hs.719935 NM_016238 ENSG00000196510 ANAPC7 APC7 anaphase promoting complex subunit 7 protein-coding 618.333 chr17 58418214 58418811 + 2.66667 NA promoter-TSS (NM_017763) promoter-TSS (NM_017763) -930 NM_017763 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 497.001 chr17 30314925 30315112 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 19039 NM_001319942 388364 Hs.371005 NM_206832 ENSG00000182271 TMIGD1 TMIGD|UNQ9372 transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 protein-coding 647 chr8 122859980 122860503 + 2.66667 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 78586 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 468.667 chr1 211184267 211184695 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -50333 NM_172362 3756 Hs.553187 NM_002238 ENSG00000143473 KCNH1 EAG|EAG1|Kv10.1|TMBTS|ZLS1|h-eag|hEAG1 potassium voltage-gated channel subfamily H member 1 protein-coding 369.333-6 chr14 49590887 49591150 + 2.66667 NA intron (NM_001351375, intron 1 of 2) intron (NM_001351375, intron 1 of 2) 4438 NR_002715 6029 NR_002715 ENSG00000276168 RN7SL1 7L1a|7SL|RN7SL|RNSRP1 RNA component of signal recognition particle 7SL1 scRNA 417-12 chr7 112253578 112253827 + 2.66667 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) intron (NM_021994, intron 1 of 11) 47007 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 336.667-15 chr3 143957774 143958024 + 2.66667 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -13899 NM_001363944 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 441.334-2 chr3 179098111 179098320 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -26406 NM_152240 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 511.334-2 chr9 105484675 105484975 + 2.66667 NA intron (NM_001287191, intron 6 of 13) MIR|SINE|MIR -34999 NR_104269 26134 Hs.113150 NR_104269 ENSG00000229419 RALGAPA1P1 GARNL2|GARNL2P|RALGAPA1P|bA235C23.1 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1 pseudogene 1 pseudo 513-2 chr12 95086005 95086413 + 2.66667 NA intron (NM_018351, intron 18 of 20) intron (NM_018351, intron 18 of 20) -12591 NM_001127362 7181 Hs.108301 NM_003297 ENSG00000120798 NR2C1 TR2 nuclear receptor subfamily 2 group C member 1 protein-coding 375.667-13 chr3 192320743 192321005 + 2.66667 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) L1MA3|LINE|L1 82244 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 586.667 chr3 94055745 94056032 + 2.66667 NA TTS (NM_001174150) TTS (NM_001174150) 7028 NM_001195643 200895 Hs.718516 NM_176815 ENSG00000178700 DHFR2 DHFRL1|DHFRP4 dihydrofolate reductase 2 protein-coding 432.667-6 chr17 61900546 61900796 + 2.66667 NA intron (NM_001351695, intron 9 of 24) HAL1|LINE|L1 27311 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 430.334 chr1 198792749 198793058 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 66079 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 454.667-8 chr8 75186427 75186635 + 2.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 91950 NR_103850 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 520.334 chr2 220697850 220698135 + 2.66667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -791427 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 410.667-15 chr5 115513711 115513871 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 30984 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 422.001-3 chr4 61178628 61178869 + 2.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -22482 NM_001371343 423.001-2 chr5 25731907 25732181 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 541091 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 449.667-6 chr5 43095234 43095578 + 2.66667 NA Intergenic MER67A|LTR|ERV1 -25508 NM_001330707 7690 Hs.535804 NM_003432 ENSG00000172262 ZNF131 ZBTB35|pHZ-10 zinc finger protein 131 protein-coding 516 chr12 12403908 12404276 + 2.66667 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 47014 NM_001330356 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 317-3 chr1 157070776 157070907 + 2.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -25099 NM_014784 9826 Hs.516954 NM_014784 ENSG00000132694 ARHGEF11 GTRAP48|PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 11 protein-coding 444.334 chr3 47102163 47102416 + 2.66667 NA intron (NR_146158, intron 7 of 21) MIRb|SINE|MIR 61688 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 397.667-11 chr7 84061711 84061929 + 2.66667 NA intron (NM_006080, intron 4 of 16) intron (NM_006080, intron 4 of 16) 132969 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 532.333-2 chr5 36230229 36230597 + 2.66667 NA intron (NM_001287341, intron 1 of 12) intron (NM_001287341, intron 1 of 12) 10978 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 414.667-7 chr19 6186364 6186562 + 2.66667 NA intron (NM_030924, intron 11 of 14) MER58B|DNA|hAT-Charlie 50796 NM_001289177 81616 Hs.465720 NM_030924 ENSG00000130377 ACSBG2 BGR|BRGL|PRTD-NY3|PRTDNY3 acyl-CoA synthetase bubblegum family member 2 protein-coding 378.334 chr1 59487939 59488133 + 2.66667 NA intron (NM_001350794, intron 6 of 14) L1ME4a|LINE|L1 -27594 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 438-5 chr14 68227747 68228058 + 2.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 400885 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 390.667-10 chr5 179282203 179282353 + 2.66667 NA intron (NM_014244, intron 2 of 21) L1MB7|LINE|L1 63183 NM_021599 9509 Hs.23871 NM_014244 ENSG00000087116 ADAMTS2 ADAM-TS2|ADAMTS-2|ADAMTS-3|EDSDERMS|NPI|PC I-NP|PCI-NP|PCINP|PCPNI|PNPI ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2 protein-coding 370.666-23 chr7 41455636 41455913 + 2.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -238145 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 496.667-4 chr3 18604532 18604799 + 2.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -159073 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 664.001 chr4 99890707 99891273 + 2.66667 NA intron (NM_021970, intron 3 of 6) intron (NM_021970, intron 3 of 6) 3437 NM_021970 8649 Hs.433332 NM_021970 ENSG00000109270 LAMTOR3 MAP2K1IP1|MAPBP|MAPKSP1|MP1|PRO0633|Ragulator3 late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 protein-coding 702.334-2 chr8 79585685 79586184 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -25183 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 398.667-3 chr12 86101072 86101229 + 2.66667 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) intron (NM_001351286, intron 4 of 7) 155241 NM_001351289 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 599.666-2 chr3 107089337 107089657 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 151141 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 341.333-17 chr4 59334743 59334976 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 321286 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 701.333 chr9 8390870 8391435 + 2.66667 NA intron (NM_130392, intron 21 of 30) intron (NM_130392, intron 21 of 30) 342794 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 453.334-2 chr10 83641128 83641392 + 2.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 35829 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 354.667-18 chr5 129174361 129174522 + 2.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 76753 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 720-2 chr6 56517378 56517887 + 2.66667 NA intron (NM_001144770, intron 61 of 94) intron (NM_001144770, intron 61 of 94) -123504 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 476.667-8 chr7 31166681 31166930 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 114344 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 408-9 chr7 41087500 41087744 + 2.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -13982 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 380.333-7 chr4 72257101 72257312 + 2.66667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 218074 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 513.334-4 chr7 6291862 6292133 + 2.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -19373 NM_001367581 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 414.666-3 chr11 63158521 63158825 + 2.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -14452 NM_001136506 283238 Hs.375139 NM_173586 ENSG00000197658 SLC22A24 NET46 solute carrier family 22 member 24 protein-coding 508.001 chr2 162943262 162943537 + 2.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -104632 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 396.667-6 chr2 56897266 56897485 + 2.66667 NA Intergenic Charlie17a|DNA|hAT-Charlie -711605 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 366.667-12 chr3 28451908 28452177 + 2.66667 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) intron (NM_001324170, intron 3 of 6) 102893 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 434.333-3 chr14 66282980 66283237 + 2.66667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -203263 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 525 chr17 58642136 58642434 + 2.66667 NA intron (NM_031272, intron 2 of 31) intron (NM_031272, intron 2 of 31) 49770 NM_031272 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 398.334-2 chr2 214930556 214930747 + 2.66667 NA TTS (NM_173076) TTS (NM_173076) 83704 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 520.667-2 chr10 43402740 43403059 + 2.66667 NA intron (NM_001098204, intron 1 of 3) FRAM|SINE|Alu 4952 NM_001098206 3185 Hs.808 NM_004966 ENSG00000169813 HNRNPF HNRPF|OK/SW-cl.23|mcs94-1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F protein-coding 563-2 chr2 110144058 110144564 + 2.66667 NA intron (NM_207181, intron 15 of 19) intron (NM_207181, intron 15 of 19) -27745 NM_005434 7851 Hs.185055 NM_005434 ENSG00000144063 MALL BENE mal, T cell differentiation protein like protein-coding 564.999 chr7 16893671 16894017 + 2.66667 NA Intergenic LTR102_Mam|LTR|ERVL -11861 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 462.666-6 chr6 156215542 156215792 + 2.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -163083 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 397.667-9 chr5 64957641 64957819 + 2.66667 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) intron (NM_005869, intron 11 of 13) 188800 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 582.667-2 chr2 51345514 51345941 + 2.66667 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) intron (NR_135237, intron 3 of 10) 313126 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 268-50 chr6 113116022 113116146 + 2.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 317363 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 753.333 chr5 19104435 19104819 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 781645 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 419.334-9 chr7 55444871 55445041 + 2.66667 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 79508 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 394-2 chr10 39287718 39287916 + 2.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 591221 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 548.333 chr14 19786095 19786659 + 2.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 6054 NM_001005500 441670 Hs.553829 NM_001005500 ENSG00000176299 OR4M1 OR14-7 olfactory receptor family 4 subfamily M member 1 protein-coding 353 chr1 235265726 235265935 + 2.66667 NA intron (NR_135074, intron 2 of 24) MIR|SINE|MIR 61657 NM_001206794 51742 Hs.575782 NM_016374 ENSG00000054267 ARID4B BCAA|BRCAA1|RBBP1L1|RBP1L1|SAP180 AT-rich interaction domain 4B protein-coding 370-8 chr16 26648066 26648282 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -418753 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 502.334 chr5 26038899 26039278 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 848135 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 468.001-3 chr9 73921746 73921925 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -449696 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 360-10 chr15 75960410 75960558 + 2.66667 NA intron (NM_138573, intron 4 of 5) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 51940 NM_138573 145957 Hs.732438 NM_138573 ENSG00000169752 NRG4 HRG4 neuregulin 4 protein-coding 372.667-21 chr8 84704917 84705137 + 2.66667 NA promoter-TSS (NM_001287244) promoter-TSS (NM_001287244) -900 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 528.667-5 chr4 30569544 30569927 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -150634 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 392.001-4 chr4 142153069 142153345 + 2.66667 NA intron (NM_001331040, intron 17 of 25) intron (NM_001331040, intron 17 of 25) 516624 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 382.666 chr12 19454328 19454612 + 2.66667 NA intron (NM_001267043, intron 1 of 8) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 13871 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 342-34 chr6 138447908 138448108 + 2.66667 NA intron (NM_020464, intron 3 of 6) intron (NM_020464, intron 3 of 6) -12714 NR_036099 100423001 NR_036099 ENSG00000266555 MIR3145 mir-3145 microRNA 3145 ncRNA 448.667-5 chr4 31299658 31299967 + 2.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 128668 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 517-2 chr18 1804503 1804852 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -445048 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 394.667-7 chr4 72328848 72329079 + 2.66667 NA intron (NM_014243, intron 5 of 21) intron (NM_014243, intron 5 of 21) 240258 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 312-14 chr11 94892893 94893089 + 2.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 80565 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 334-14 chr17 51095770 51095994 + 2.66667 NA intron (NM_001130527, intron 1 of 29) intron (NM_001130527, intron 1 of 29) 24986 NM_001130528 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 432-6 chr18 12844996 12845227 + 2.66667 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) L1MD2|LINE|L1 -4149 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 315.999-3 chr7 16405820 16406050 + 2.66667 NA intron (NM_001101426, intron 2 of 9) intron (NM_001101426, intron 2 of 9) 15603 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 385.334-6 chr9 87269804 87270066 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 121291 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 429.334-6 chr8 89870555 89870731 + 2.66667 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -31225 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 375.667 chr1 112631322 112631526 + 2.66667 NA intron (NM_006135, intron 1 of 9) MIRc|SINE|MIR 11592 NM_006135 829 Hs.744974 NM_006135 ENSG00000116489 CAPZA1 CAPPA1|CAPZ|CAZ1 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 1 protein-coding 896 chr4 74491833 74492310 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 46935 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 621.334 chr10 59033627 59034011 + 2.66667 NA Intergenic LTR88c|LTR|Gypsy? 34301 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 390.667-2 chr13 89395641 89395840 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 104769 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 423.333-4 chr13 49490593 49490888 + 2.66667 NA intron (NM_031915, intron 13 of 14) intron (NM_031915, intron 13 of 14) -5213 NM_001040443 51131 Hs.369039 NM_001040443 ENSG00000136147 PHF11 APY|BCAP|IGEL|IGER|IGHER|NY-REN-34|NYREN34 PHD finger protein 11 protein-coding 412-8 chr5 109326131 109326399 + 2.66667 NA non-coding (NR_149040, exon 1 of 4) non-coding (NR_149040, exon 1 of 4) 104 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 456.999 chr4 123631556 123631873 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -18277 NR_027105 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 410.333-6 chr21 24653076 24653299 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -187363 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 528.333 chr14 63854261 63854701 + 2.66667 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) intron (NM_015180, intron 1 of 114) 1477 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 434.334 chr15 62159775 62160022 + 2.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 5387 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 424 chr1 80355151 80355377 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -180491 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 372-21 chr8 62252981 62253235 + 2.66667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 4254 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 400.667-8 chr7 25990785 25991112 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -40962 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 368.333-12 chr8 118377631 118377906 + 2.66667 NA TTS (NM_207506) TTS (NM_207506) -243233 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 412.001-3 chr8 99965177 99965344 + 2.66667 NA intron (NM_015668, intron 24 of 27) intron (NM_015668, intron 24 of 27) -39322 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 417.333-7 chr3 97286143 97286388 + 2.66667 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) L1MA4A|LINE|L1 -153342 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 698 chr10 120925765 120926257 + 2.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 74649 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 614.333-2 chr8 121838020 121838331 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -196735 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 515.667 chr7 21004165 21004428 + 2.66667 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) L1MA4|LINE|L1 168865 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 345.667-6 chr12 93090299 93090615 + 2.66667 NA intron (NR_040096, intron 3 of 4) MIRc|SINE|MIR -83909 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 473.001-3 chr5 65836935 65837207 + 2.66667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -89483 NM_001006600 55914 Hs.591774 NM_018695 ENSG00000112851 ERBIN ERBB2IP|HEL-S-78|LAP2 erbb2 interacting protein protein-coding 346-30 chr6 42604031 42604236 + 2.66667 NA intron (NM_015255, intron 5 of 46) intron (NM_015255, intron 5 of 46) 40104 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 368.333-8 chr6 36812166 36812384 + 2.66667 NA intron (NM_020939, intron 3 of 20) intron (NM_020939, intron 3 of 20) 27169 NM_001314017 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 385.667-6 chr2 145773611 145773816 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -813344 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 425.333 chr10 75155557 75155771 + 2.66667 NA intron (NM_001174156, intron 2 of 5) L2-3_Crp|LINE|L2 44008 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 493.667-3 chr4 95678115 95678524 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -129346 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 397.334-11 chr8 140578786 140578945 + 2.66667 NA intron (NM_001164623, intron 2 of 17) intron (NM_001164623, intron 2 of 17) 56768 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 437.999-2 chr10 94452429 94452749 + 2.66667 NA intron (NM_015188, intron 2 of 12) L1MC1|LINE|L1 50048 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 468-6 chr17 63105162 63105657 + 2.66667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 139174 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 440-5 chr15 57452570 57452859 + 2.66667 NA intron (NM_032866, intron 6 of 18) intron (NM_032866, intron 6 of 18) 76209 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 346.001 chr1 158423314 158423512 + 2.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2547 NM_001004476 391107 Hs.626815 NM_001004476 ENSG00000180708 OR10K2 OR1-4 olfactory receptor family 10 subfamily K member 2 protein-coding 676 chr7 77450122 77450456 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -33940 NR_146937 54103 Hs.186649 NM_017439 ENSG00000186088 GSAP PION gamma-secretase activating protein protein-coding 507.667-2 chr19 32367170 32367538 + 2.66667 NA intron (NM_001136156, intron 5 of 6) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 21744 NM_014910 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 453.334 chr10 81664029 81664211 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -211074 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 409.334 chr2 116631359 116631641 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -1183191 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 459-2 chr10 25278702 25278999 + 2.66667 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) L1MEd|LINE|L1 -102574 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 437.334-2 chr3 111130141 111130435 + 2.66667 NA intron (NM_001243288, intron 5 of 8) intron (NM_001243288, intron 5 of 8) 58472 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 681.001 chr11 101996480 101996935 + 2.66667 NA intron (NM_001363543, intron 11 of 11) intron (NM_001363543, intron 11 of 11) -50730 NM_032930 85016 Hs.98328 NM_032930 ENSG00000137691 CFAP300 C11orf70|CILD38 cilia and flagella associated protein 300 protein-coding 270.667-23 chr2 17053015 17053168 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -387257 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 603.334 chr3 27420458 27421006 + 2.66667 NA non-coding (NR_135544, exon 10 of 25) non-coding (NR_135544, exon 10 of 25) 36046 NM_001258380 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 710 chr14 68053351 68053760 + 2.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 229963 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 442.333-2 chr8 123128985 123129305 + 2.66667 NA exon (NM_001145088, exon 15 of 20) exon (NM_001145088, exon 15 of 20) -49902 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 423.999-3 chr2 150292272 150292564 + 2.66667 NA Intergenic MER57E1|LTR|ERV1 -35411 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 462.667-6 chr4 124900657 124900851 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -188022 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 651.001 chr5 119911697 119912112 + 2.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 282345 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 558 chr15 60476479 60476814 + 2.66667 NA intron (NR_147171, intron 2 of 16) intron (NR_147171, intron 2 of 16) 2496 NM_024611 79664 Hs.200943 NM_024611 ENSG00000128915 ICE2 BRCC1|NARG2 interactor of little elongation complex ELL subunit 2 protein-coding 406.667-5 chr19 53151564 53151771 + 2.66667 NA intron (NM_001172675, intron 2 of 4) intron (NM_001172675, intron 2 of 4) 7386 NM_032584 84671 Hs.467239 NM_032584 ENSG00000197937 ZNF347 ZNF1111 zinc finger protein 347 protein-coding 428.667 chr10 130599818 130600072 + 2.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 362723 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 418-8 chr3 115324411 115324607 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -177221 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 411.333-5 chr12 5253994 5254316 + 2.66667 NA Intergenic Ricksha|DNA|MULE-MuDR -11004 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 449.667-4 chr4 64184903 64185080 + 2.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 224459 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 357.334-3 chr14 39139911 39140062 + 2.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 25702 NM_001009182 8487 Hs.652307 NM_003616 ENSG00000092208 GEMIN2 SIP1|SIP1-delta gem nuclear organelle associated protein 2 protein-coding 556.001 chr5 4573108 4573398 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -200228 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 819.667 chr1 108506973 108507602 + 2.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -52813 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 371.333-12 chr2 39446457 39446744 + 2.66667 NA intron (NR_037875, intron 1 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 9184 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 411.334 chr1 239015449 239015605 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -371041 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 586.001 chr12 2432562 2432857 + 2.66667 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 162933 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 416-10 chr4 31392026 31392275 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -114394 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 578.334-2 chr8 139224262 139224944 + 2.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -310562 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 581.333 chr1 165126692 165127050 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 229370 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 477-2 chr3 7067909 7068252 + 2.66667 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -174063 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 484-7 chr9 81563424 81563770 + 2.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 125938 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 364-2 chr12 46592851 46593062 + 2.66667 NA intron (NR_125377, intron 3 of 3) intron (NR_125377, intron 3 of 3) 208849 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 366.333-19 chr5 106418801 106419045 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 592091 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 187.667-20 chr11 11947709 11947856 + 2.66667 NA intron (NM_001282659, intron 20 of 27) intron (NM_001282659, intron 20 of 27) 60857 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 434-4 chr20 58905890 58906191 + 2.66667 NA intron (NM_080425, intron 6 of 12) intron (NM_080425, intron 6 of 12) 13877 NR_132272 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 390-5 chr10 72902143 72902340 + 2.66667 NA intron (NR_130125, intron 3 of 7) intron (NR_130125, intron 3 of 7) 8502 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 628.334 chr8 88796323 88796609 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -468983 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 395.667-5 chr2 179355376 179355524 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -90618 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 601.334 chrX 38762814 38763072 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic -38489 NM_021242 58526 Hs.522605 NM_021242 ENSG00000165175 MID1IP1 G12-like|MIG12|S14R|STRAIT11499|THRSPL MID1 interacting protein 1 protein-coding 336.334-6 chr5 56204511 56204767 + 2.66667 NA intron (NM_024669, intron 2 of 11) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 28691 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 514.667-2 chr3 111576192 111576472 + 2.66667 NA intron (NM_001318889, intron 3 of 7) intron (NM_001318889, intron 3 of 7) 19014 NM_024508 79413 Hs.136912 NM_024508 ENSG00000177494 ZBED2 - zinc finger BED-type containing 2 protein-coding 645 chr3 68679744 68680118 + 2.66667 NA Intergenic Intergenic 179294 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 607.667 chr10 82023444 82023889 + 2.66667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) L1M2|LINE|L1 145979 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 372.334-6 chr4 109306768 109307032 + 2.33333 NA intron (NR_160939, intron 1 of 2) intron (NR_160939, intron 1 of 2) 3865 NR_160939 645078 Hs.518784 NM_001039778 ZCCHC23 - zinc finger CCHC-type containing 23 ncRNA 524.667-3 chr2 49226838 49227217 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -72500 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 505.666-2 chr7 78301367 78301766 + 2.33333 NA intron (NM_001301128, intron 9 of 20) intron (NM_001301128, intron 9 of 20) -45676 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 534.332 chr2 48378496 48378913 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_002158, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_002158, exon 7 of 7) -62062 NM_001135629 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 370.666-7 chr2 119988721 119988915 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -24259 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 533.666-3 chr2 150744017 150744347 + 2.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 115285 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 367.333-3 chr1 205824044 205824292 + 2.33333 NA Intergenic U6|snRNA|snRNA -10970 NM_173854 254428 Hs.20274 NM_173854 ENSG00000133065 SLC41A1 MgtE solute carrier family 41 member 1 protein-coding 356.666-3 chr10 107794868 107795033 + 2.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 274343 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 397.333-8 chr5 167582984 167583305 + 2.33333 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) 9485 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 548-3 chr20 31510193 31510700 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -3964 NM_030789 81502 Hs.373741 NM_030789 ENSG00000101294 HM13 H13|IMP1|IMPAS|IMPAS-1|MSTP086|PSENL3|PSL3|SPP|SPPL1 histocompatibility minor 13 protein-coding 163.666-9 chr2 176971978 176972126 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 240359 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 349.333-14 chr17 32603933 32604112 + 2.33333 NA intron (NM_001303279, intron 21 of 21) intron (NM_001303279, intron 21 of 21) 117029 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 376.999 chr14 72735007 72735202 + 2.33333 NA intron (NM_001280544, intron 3 of 9) MIRc|SINE|MIR 157545 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 355-10 chr17 41850311 41850597 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_018143, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_018143, exon 2 of 2) 12629 NM_001329596 317719 Hs.127510 NM_152467 ENSG00000161594 KLHL10 SPGF11 kelch like family member 10 protein-coding 383.999-2 chr18 6387919 6388130 + 2.33333 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) L1ME3G|LINE|L1 -13599 NR_036205 100422840 NR_036205 ENSG00000283532 MIR4317 - microRNA 4317 ncRNA 329.999-10 chr6 70193666 70193854 + 2.33333 NA intron (NM_001858, intron 48 of 50) intron (NM_001858, intron 48 of 50) 89437 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 364.667-18 chr9 80825858 80826166 + 2.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 850989 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 356.999-5 chr2 77176017 77176320 + 2.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 190203 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 339-6 chr14 48480135 48480343 + 2.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -685225 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 610.001 chr12 38736481 38736908 + 2.33333 NA intron (NM_153634, intron 10 of 19) intron (NM_153634, intron 10 of 19) 168897 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 416.334-5 chr8 136787855 136788150 + 2.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 257204 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 348-2 chr1 246109246 246109440 + 2.33333 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 308069 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 473.333-4 chr22 19425855 19426184 + 2.33333 NA intron (NM_003325, intron 1 of 24) AluSx|SINE|Alu 5714 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 437.666 chr1 42987592 42988019 + 2.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 28756 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 586.999 chr1 81465861 81466279 + 2.33333 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) intron (NM_001366008, intron 2 of 26) 91632 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 509.999 chr2 127304412 127304731 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_006609, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_006609, exon 16 of 16) -10395 NM_000122 2071 Hs.469872 NM_000122 ENSG00000163161 ERCC3 BTF2|GTF2H|RAD25|TFIIH|TTD2|XPB ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit protein-coding 510-4 chr4 104313313 104313681 + 2.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -177468 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 251.667-96 chr8 86685648 86685833 + 2.33333 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) intron (NM_019098, intron 3 of 17) 57935 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 386.666-13 chr8 82751718 82751922 + 2.33333 NA Intergenic HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner -160284 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 309.666-14 chr5 22975380 22975552 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -122122 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 463-4 chr4 179236696 179237043 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -1328933 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 453-4 chr10 60716593 60716983 + 2.33333 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) AluJb|SINE|Alu 16740 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 304.666-11 chr14 59169058 59169217 + 2.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -19530 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 588.332 chr4 155235120 155235575 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 26711 NM_000910 4887 Hs.37125 NM_000910 ENSG00000185149 NPY2R NPY2-R neuropeptide Y receptor Y2 protein-coding 306.666-24 chr4 4504272 4504504 + 2.33333 NA intron (NM_001346282, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 -22688 NR_126434 104472519 Hs.691848 NR_126434 ENSG00000248221 STX18-IT1 - STX18 intronic transcript 1 ncRNA 494.666-2 chr8 110797338 110797594 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 229967 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 352-27 chr6 136625947 136626222 + 2.33333 NA intron (NM_005923, intron 14 of 29) intron (NM_005923, intron 14 of 29) -3030 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 347.333-19 chr3 105462069 105462282 + 2.33333 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 95266 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 406 chr1 38524026 38524435 + 2.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 49034 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 352-22 chr5 150101607 150101930 + 2.33333 NA intron (NM_005211, intron 1 of 21) intron (NM_005211, intron 1 of 21) -9144 NM_001349736 1436 Hs.586219 NM_005211 ENSG00000182578 CSF1R C-FMS|CD115|CSF-1R|CSFR|FIM2|FMS|HDLS|M-CSF-R colony stimulating factor 1 receptor protein-coding 474.666-5 chr5 32055225 32055601 + 2.33333 NA intron (NM_178140, intron 10 of 24) AluJr|SINE|Alu 118906 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 285.333-22 chr15 67600212 67600481 + 2.33333 NA intron (NM_001206804, intron 7 of 21) intron (NM_001206804, intron 7 of 21) 51252 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 320.666-21 chrX 86568272 86568432 + 2.33333 NA intron (NM_001139515, intron 3 of 11) L1MC1|LINE|L1 305384 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 384.666-3 chr14 46613915 46614169 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 37739 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 354.666-20 chr8 96438920 96439082 + 2.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -51563 NR_125828 102724804 Hs.571415 NR_125828 ENSG00000253105 LOC102724804 - uncharacterized LOC102724804 ncRNA 587.333 chr14 82972116 82972466 + 2.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 329659 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 498.333-3 chr6 146044422 146044734 + 2.33333 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) intron (NM_001278065, intron 2 of 9) 15380 NM_001278067 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 332.666-19 chr22 20794728 20795005 + 2.33333 NA intron (NM_058004, intron 18 of 54) MER58A|DNA|hAT-Charlie 20753 NM_000185 3053 Hs.474270 NM_000185 ENSG00000099937 SERPIND1 D22S673|HC2|HCF2|HCII|HLS2|LS2|THPH10 serpin family D member 1 protein-coding 290-20 chr2 76504623 76504852 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -481228 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 376.666-8 chr4 142198770 142198933 + 2.33333 NA intron (NM_001331040, intron 14 of 25) intron (NM_001331040, intron 14 of 25) 562268 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 353.666-2 chr11 102313254 102313487 + 2.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4114 NM_182962 330 Hs.127799 NM_001165 ENSG00000023445 BIRC3 AIP1|API2|CIAP2|HAIP1|HIAP1|IAP-1|MALT2|MIHC|RNF49|c-IAP2 baculoviral IAP repeat containing 3 protein-coding 375.333-27 chr5 134855842 134856117 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001135586, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001135586, exon 2 of 2) 10011 NM_001135586 134553 Hs.708536 NM_152409 ENSG00000181904 C5orf24 - chromosome 5 open reading frame 24 protein-coding 413.667-3 chr17 71518160 71518470 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -316136 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 442-6 chr8 18884757 18885254 + 2.33333 NA intron (NM_015310, intron 2 of 15) intron (NM_015310, intron 2 of 15) 2052 NM_001362819 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 381-16 chr8 131976325 131976656 + 2.33333 NA intron (NR_136616, intron 11 of 23) intron (NR_136616, intron 11 of 23) 59717 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 319-2 chr1 158832397 158832593 + 2.33333 NA intron (NM_002432, intron 1 of 6) L1MEd|LINE|L1 1144 NM_002432 4332 Hs.153837 NM_002432 ENSG00000163563 MNDA PYHIN3 myeloid cell nuclear differentiation antigen protein-coding 334.666-18 chr8 85015584 85015742 + 2.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -91575 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 535 chr17 33493150 33493667 + 2.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L1MD2|LINE|L1 40352 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 452.333-7 chr3 168434823 168435088 + 2.33333 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) intron (NR_021485, intron 3 of 15) -116899 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 350-20 chr3 95058338 95058612 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 120212 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 418.333-14 chr8 116944602 116944967 + 2.33333 NA TTS (NM_001025357) TTS (NM_001025357) -5433 NM_001172811 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 390.666-3 chr14 49523986 49524319 + 2.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 62228 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 422.666-4 chr2 156888693 156888964 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -368877 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 372-19 chr7 8475512 8475721 + 2.33333 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 42007 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 935.332 chr5 4679811 4680463 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -93344 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 436.333-2 chr14 82379344 82379587 + 2.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -263167 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 509.666 chr8 100925427 100925856 + 2.33333 NA intron (NM_001135700, intron 2 of 5) intron (NM_001135700, intron 2 of 5) 24930 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 339.333-13 chr14 96790345 96790574 + 2.33333 NA non-coding (NR_146552, exon 4 of 4) non-coding (NR_146552, exon 4 of 4) -6923 NM_003384 7443 Hs.422662 NM_003384 ENSG00000100749 VRK1 PCH1|PCH1A VRK serine/threonine kinase 1 protein-coding 416.666-3 chr11 114290167 114290390 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -5535 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 329.333-18 chr2 53702444 53702704 + 2.33333 NA intron (NM_001201965, intron 6 of 8) intron (NM_001201965, intron 6 of 8) -65209 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 308.666-23 chr8 129320951 129321129 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -79800 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 452.333-5 chr2 175515862 175516212 + 2.33333 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -334327 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 395.333-16 chr2 158490134 158490324 + 2.33333 NA intron (NM_001005476, intron 1 of 20) intron (NM_001005476, intron 1 of 20) 33277 NM_001304969 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 458.999 chr1 63770446 63770844 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -3372 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 352.333-27 chr7 120328455 120328615 + 2.33333 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 55360 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 339.999-7 chr5 155888806 155888988 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -437860 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 370.333-23 chr6 26193791 26193985 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -4812 NM_003539 8360 Hs.248179 NM_003539 ENSG00000277157 HIST1H4D H4/b|H4FB|dJ221C16.9 histone cluster 1 H4 family member d protein-coding 364.333-23 chr6 19651062 19651269 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 153594 NR_134649 100506885 Hs.346489 NR_134649 ENSG00000228412 LOC100506885 - uncharacterized LOC100506885 ncRNA 303-10 chr11 91258760 91258906 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -389631 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 390.333-3 chr12 65869632 65869847 + 2.33333 NA intron (NR_158984, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 11839 NR_120478 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 540.333 chr18 5210923 5211229 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13324 NM_001330553 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 394.333-2 chr11 65677926 65678225 + 2.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15103 NM_001243985 5970 Hs.502875 NM_021975 ENSG00000173039 RELA CMCU|NFKB3|p65 RELA proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 233.666-21 chr3 140614039 140614229 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -63930 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 332.333-7 chr10 89632661 89632842 + 2.33333 NA intron (NM_148977, intron 1 of 6) intron (NM_148977, intron 1 of 6) 11165 NM_148978 53354 Hs.163555 NM_138316 ENSG00000152782 PANK1 PANK pantothenate kinase 1 protein-coding 303-47 chr7 83099764 83100028 + 2.33333 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 62988 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 373-5 chr17 29549227 29549492 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_020791, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_020791, exon 20 of 20) 17678 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 363.666-9 chr8 130177758 130178049 + 2.33333 NA intron (NM_001362925, intron 9 of 29) MIRb|SINE|MIR -93135 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 376-3 chr11 28038995 28039276 + 2.33333 NA intron (NM_031217, intron 13 of 16) MIR1_Amn|SINE|MIR -17680 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 282-36 chr3 46376135 46376388 + 2.33333 NA TTS (NM_001100168) TTS (NM_001100168) 6119 NM_000579 1234 Hs.450802 NM_000579 ENSG00000160791 CCR5 CC-CKR-5|CCCKR5|CCR-5|CD195|CKR-5|CKR5|CMKBR5|IDDM22 C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene) protein-coding 542.666-2 chr8 125710337 125710766 + 2.33333 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 240646 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 471.999 chr1 70287028 70287480 + 2.33333 NA intron (NM_030816, intron 9 of 12) L1M5|LINE|L1 65874 NR_146810 9295 Hs.479693 NM_004768 ENSG00000116754 SRSF11 NET2|SFRS11|dJ677H15.2|p54 serine and arginine rich splicing factor 11 protein-coding 371.333-15 chr2 180024589 180024891 + 2.33333 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -17443 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 465-4 chr8 118734116 118734447 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -112318 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 440-6 chr3 51343104 51343356 + 2.33333 NA intron (NM_004947, intron 38 of 52) intron (NM_004947, intron 38 of 52) -42061 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 359.666-11 chr4 75484985 75485256 + 2.33333 NA intron (NM_015436, intron 8 of 8) MER57A-int|LTR|ERV1 24176 NR_103725 25898 Hs.48297 NM_015436 ENSG00000163743 RCHY1 ARNIP|CHIMP|PIRH2|PRO1996|RNF199|ZCHY|ZNF363 ring finger and CHY zinc finger domain containing 1 protein-coding 611.667 chr11 15473942 15474447 + 2.33333 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -169691 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 386-7 chr2 112309526 112309904 + 2.33333 NA intron (NM_198581, intron 3 of 11) intron (NM_198581, intron 3 of 11) 34118 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 370.666-10 chr22 31792693 31792867 + 2.33333 NA exon (NM_001369903, exon 12 of 42) exon (NM_001369903, exon 12 of 42) 38757 NM_001369901 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 349-14 chr3 56867133 56867359 + 2.33333 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) L2a|LINE|L2 49190 NM_001289698 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 383.999 chr12 114580452 114580639 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 103630 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 282.334-3 chr10 77279098 77279256 + 2.33333 NA intron (NM_001271518, intron 1 of 27) intron (NM_001271518, intron 1 of 27) 71584 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 370-22 chr6 36220803 36221078 + 2.33333 NA intron (NM_015695, intron 9 of 12) intron (NM_015695, intron 9 of 12) -22228 NM_173676 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 344.333-8 chr2 62557482 62557714 + 2.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -51403 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 464.666-4 chr7 78043508 78043900 + 2.33333 NA intron (NM_001301128, intron 20 of 20) intron (NM_001301128, intron 20 of 20) 203574 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 603 chr6 57197238 57197649 + 2.33333 NA intron (NM_001278667, intron 3 of 6) intron (NM_001278667, intron 3 of 6) 24018 NM_001278668 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 507.332 chr13 42434736 42435048 + 2.33333 NA intron (NR_135319, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 10000 NR_135319 105370177 NR_135319 ENSG00000283554 LINC02341 - long intergenic non-protein coding RNA 2341 ncRNA 466.667-4 chr3 185506 185886 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -10900 NM_001253387 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 481.667-8 chr8 70155212 70155660 + 2.33333 NA intron (NM_001321711, intron 11 of 21) intron (NM_001321711, intron 11 of 21) -84184 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 476.001 chr10 89901086 89901457 + 2.33333 NA intron (NR_149079, intron 1 of 1) intron (NR_149079, intron 1 of 1) 13137 NR_149079 105378425 Hs.559891 NR_149079 ENSG00000280560 LINC01374 TCONS_00018278 long intergenic non-protein coding RNA 1374 ncRNA 351.334-2 chr1 157647057 157647261 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -49074 NM_031282 83417 Hs.120260 NM_031282 ENSG00000163518 FCRL4 CD307d|FCRH4|IGFP2|IRTA1 Fc receptor like 4 protein-coding 166.333-238 chr9 29250807 29250957 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -37281 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 362.333-3 chr14 86323306 86323561 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 388755 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 600.999 chr14 67802092 67802551 + 2.33333 NA intron (NM_015346, intron 9 of 41) intron (NM_015346, intron 9 of 41) 14269 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 530.333 chr14 59497798 59498270 + 2.33333 NA intron (NM_016475, intron 4 of 6) intron (NM_016475, intron 4 of 6) 13517 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 522.333-2 chr21 31207442 31207926 + 2.33333 NA intron (NM_001353686, intron 11 of 27) intron (NM_001353686, intron 11 of 27) -46744 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 312-59 chr8 136781222 136781479 + 2.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1MA5A|LINE|L1 250552 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 616.333-2 chr8 122617524 122617972 + 2.33333 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -49104 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 338.333-21 chr8 134519663 134519899 + 2.33333 NA intron (NM_020863, intron 13 of 15) L1MC4a|LINE|L1 -78290 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 351.333-18 chr2 187852341 187852603 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -297967 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 352.333-8 chr14 70411326 70411489 + 2.33333 NA intron (NM_001202549, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 5683 NM_001202549 100529257 Hs.443661 NM_001202547 ENSG00000258644 SYNJ2BP-COX16 - SYNJ2BP-COX16 readthrough protein-coding 326 chr1 35533010 35533209 + 2.33333 NA intron (NM_024874, intron 2 of 20) intron (NM_024874, intron 2 of 20) 24294 NM_024874 79932 Hs.456507 NM_024874 ENSG00000142687 KIAA0319L AAVR|AAVRL KIAA0319 like protein-coding 360.666-8 chr18 2818895 2819092 + 2.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -28013 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 484-3 chr3 94033564 94033987 + 2.33333 NA intron (NM_001174151, intron 2 of 8) L1MC5a|LINE|L1 -5178 NM_001001850 415117 Hs.679768 NM_001001850 ENSG00000178750 STX19 - syntaxin 19 protein-coding 363.999-8 chr8 9464534 9464755 + 2.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -91268 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 370.666-5 chr2 70600132 70600345 + 2.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -46412 NM_001099691 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 634.999 chr4 90854140 90854615 + 2.33333 NA intron (NM_001145065, intron 8 of 10) intron (NM_001145065, intron 8 of 10) 619346 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 355.999-3 chr17 59546800 59547014 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -18703 NM_024612 79665 Hs.29403 NM_024612 ENSG00000108406 DHX40 ARG147|DDX40|PAD DEAH-box helicase 40 protein-coding 320-40 chr7 36436111 36436359 + 2.33333 NA intron (NM_001284302, intron 19 of 22) L1MB5|LINE|L1 -45878 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 360.333-9 chr18 66468845 66469007 + 2.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 135164 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 312.333-13 chr2 182586224 182586389 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -63461 NM_001003683 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 349.333-20 chr2 202211095 202211279 + 2.33333 NA intron (NR_163943, intron 3 of 5) intron (NR_163943, intron 3 of 5) 27410 NM_001005781 7341 Hs.81424 NM_003352 ENSG00000116030 SUMO1 DAP1|GMP1|OFC10|PIC1|SENP2|SMT3|SMT3C|SMT3H3|UBL1 small ubiquitin like modifier 1 protein-coding 381.667-9 chr6 35314975 35315331 + 2.33333 NA intron (NM_022047, intron 5 of 10) L1MA4|LINE|L1 17335 NM_022047 50619 Hs.15476 NM_022047 ENSG00000023892 DEF6 IBP|SLAT|SWAP70L DEF6 guanine nucleotide exchange factor protein-coding 541.667 chr4 135209315 135209616 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -85906 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 384-15 chr6 135385081 135385264 + 2.33333 NA intron (NM_017651, intron 22 of 27) intron (NM_017651, intron 22 of 27) 112568 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 279.333-47 chr2 187444500 187444650 + 2.33333 NA intron (NM_001369435, intron 1 of 15) intron (NM_001369435, intron 1 of 15) 3677 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 483.999-3 chr5 82171358 82171567 + 2.33333 NA intron (NM_031482, intron 4 of 7) intron (NM_031482, intron 4 of 7) 106892 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 377.333-18 chr6 132774448 132774743 + 2.33333 NA intron (NM_052831, intron 8 of 13) intron (NM_052831, intron 8 of 13) -11136 NM_078488 8875 Hs.293130 NM_004665 ENSG00000112303 VNN2 FOAP-4|GPI-80 vanin 2 protein-coding 345.666-7 chr2 233534628 233534869 + 2.33333 NA intron (NM_001365479, intron 10 of 31) intron (NM_001365479, intron 10 of 31) 30825 NM_018218 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 547.999 chr18 48395559 48395905 + 2.33333 NA intron (NM_001371287, intron 1 of 5) intron (NM_001371287, intron 1 of 5) 13651 NM_001318841 201501 Hs.515388 NM_001039360 ENSG00000184828 ZBTB7C APM-1|APM1|ZBTB36|ZNF857C zinc finger and BTB domain containing 7C protein-coding 555.333 chr11 31703570 31704052 + 2.33333 NA intron (NM_001288726, intron 10 of 11) intron (NM_001288726, intron 10 of 11) 96850 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 368-17 chr3 52933379 52933645 + 2.33333 NA intron (NM_016329, intron 5 of 20) intron (NM_016329, intron 5 of 20) -35964 NM_001198974 100526772 NM_001198974 ENSG00000248592 STIMATE-MUSTN1 TMEM110-MUSTN1 STIMATE-MUSTN1 readthrough protein-coding 354.666 chr1 20129687 20129990 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -9485 NM_022819 64600 Hs.302034 NM_022819 ENSG00000158786 PLA2G2F GIIFsPLA2|sPLA2-IIF phospholipase A2 group IIF protein-coding 330-38 chrX 35895168 35895341 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -24480 NM_152632 286464 Hs.376425 NM_152632 ENSG00000165164 CFAP47 CHDC2|CXorf22|CXorf30|CXorf59 cilia and flagella associated protein 47 protein-coding 376-2 chr11 5354705 5355000 + 2.33333 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) intron (NM_001005567, intron 1 of 4) 3344 NM_001004750 390058 Hs.553730 NM_001004750 ENSG00000176239 OR51B6 HOR5'Beta6 olfactory receptor family 51 subfamily B member 6 protein-coding 304.666-6 chr10 84358589 84358811 + 2.33333 NA intron (NM_018999, intron 1 of 10) intron (NM_018999, intron 1 of 10) 30111 NM_001284241 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 471-2 chr14 65836287 65836734 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 365408 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 468.334-2 chr10 31557214 31557665 + 2.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -157684 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 360-3 chr1 191657525 191657817 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -429173 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 419.333-3 chr14 36531689 36532067 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -11646 NM_001079668 7080 Hs.94367 NM_003317 ENSG00000136352 NKX2-1 BCH|BHC|NK-2|NKX2.1|NKX2A|NMTC1|T/EBP|TEBP|TITF1|TTF-1|TTF1 NK2 homeobox 1 protein-coding 342.999 chr13 38537073 38537341 + 2.33333 NA intron (NR_126377, intron 2 of 2) intron (NR_126377, intron 2 of 2) -30517 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 271-22 chr2 35498413 35498618 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 27110 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 338.666-8 chr21 22913045 22913211 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -166156 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 413.999 chr1 207428857 207429170 + 2.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -25287 NM_001006658 1380 Hs.445757 NM_001877 ENSG00000117322 CR2 C3DR|CD21|CR|CVID7|SLEB9 complement C3d receptor 2 protein-coding 270.334-21 chrX 120516145 120516393 + 2.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 43629 NM_001369145 8450 Hs.102914 NM_003588 ENSG00000158290 CUL4B CUL-4B|MRXHF2|MRXS15|MRXSC|SFM2 cullin 4B protein-coding 414.333-3 chr17 35268861 35269164 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001330183, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001330183, exon 4 of 4) 25940 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 566.667 chr12 125207800 125208312 + 2.33333 NA intron (NM_001366854, intron 1 of 8) intron (NM_001366854, intron 1 of 8) 21670 NM_001366854 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 346.333-24 chr4 66212779 66213024 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -63923 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 386.333-15 chr7 17513586 17513869 + 2.33333 NA intron (NR_110013, intron 1 of 3) intron (NR_110013, intron 1 of 3) 45182 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 338.333-7 chr17 67426880 67427033 + 2.33333 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) intron (NM_181671, intron 1 of 9) -44533 NR_037517 100500895 NR_037517 ENSG00000207688 MIR548AA2 - microRNA 548aa-2 ncRNA 516.999-2 chr7 45898594 45899121 + 2.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 10369 NM_000596 3484 Hs.642938 NM_000596 ENSG00000146678 IGFBP1 AFBP|IBP1|IGF-BP25|PP12|hIGFBP-1 insulin like growth factor binding protein 1 protein-coding 472.333-2 chr2 212374833 212375193 + 2.33333 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 51347 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 528.999 chr5 171494613 171495004 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 75161 NM_003862 8817 Hs.87191 NM_003862 ENSG00000156427 FGF18 FGF-18|ZFGF5 fibroblast growth factor 18 protein-coding 559.666-2 chr15 97506489 97506887 + 2.33333 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) Charlie10|DNA|hAT-Charlie 15123 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 335-2 chr1 110075446 110075633 + 2.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4867 NM_006492 257 Hs.669953 NM_006492 ENSG00000156150 ALX3 FND|FND1 ALX homeobox 3 protein-coding 359.666-4 chr13 90295257 90295491 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 64192 NR_030754 693207 NR_030754 ENSG00000283783 MIR622 MIRN622|hsa-mir-622 microRNA 622 ncRNA 401-10 chr22 28156029 28156340 + 2.33333 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -235572 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 435.666-4 chr4 132299779 132300088 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -291156 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 369.333-28 chr8 126262087 126262361 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -63271 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 407.333-14 chr17 27194944 27195282 + 2.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 98883 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 353.333-27 chr5 39836924 39837214 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -215222 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 244.333-62 chr2 162567022 162567210 + 2.33333 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -201820 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 287.333-60 chr6 131060152 131060454 + 2.33333 NA intron (NM_001135554, intron 1 of 14) intron (NM_001135554, intron 1 of 14) 2942 NM_001431 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 352.333-28 chr8 49280067 49280234 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 207806 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 388.333-14 chr3 82590715 82590919 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 604675 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 290-3 chr1 116752098 116752305 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -2229 NM_001767 914 Hs.523500 NM_001767 ENSG00000116824 CD2 LFA-2|SRBC|T11 CD2 molecule protein-coding 463.333-3 chr12 19872108 19872472 + 2.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -142395 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 347.666-16 chr6 62291592 62291847 + 2.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -5492 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 303.333-77 chr8 112296903 112297163 + 2.33333 NA intron (NM_001363185, intron 49 of 66) L1ME2z|LINE|L1 -346460 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 341.666-19 chr9 36649621 36649799 + 2.33333 NA intron (NM_001256691, intron 9 of 15) AluSz|SINE|Alu 76815 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 547.666-2 chr5 174743901 174744667 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -7450 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 459.334-2 chr3 94989173 94989470 + 2.33333 NA intron (NR_015400, intron 5 of 7) intron (NR_015400, intron 5 of 7) 51058 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 396.667-5 chr2 23451319 23451688 + 2.33333 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) intron (NM_052920, intron 1 of 13) 66324 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 538.333-2 chr5 62768953 62769428 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 190371 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 316.333-23 chr5 65006738 65006952 + 2.33333 NA intron (NM_005869, intron 13 of 13) L1PA14|LINE|L1 237915 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 593.666 chr17 61039784 61040353 + 2.33333 NA intron (NM_001330413, intron 19 of 25) intron (NM_001330413, intron 19 of 25) 327636 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 579.333-5 chr8 119533601 119533886 + 2.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 59265 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 351.333-10 chr14 56477718 56477920 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -36512 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 351.666-9 chr20 33695472 33695654 + 2.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -9178 NM_005225 1869 Hs.654393 NM_005225 ENSG00000101412 E2F1 E2F-1|RBAP1|RBBP3|RBP3 E2F transcription factor 1 protein-coding 272.333-56 chr6 11911871 11912024 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 89297 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 349.666-12 chr7 48131325 48131536 + 2.33333 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -40028 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 379.333-2 chr18 47483988 47484317 + 2.33333 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) intron (NR_147192, intron 1 of 2) 103656 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 356-39 chr9 107078167 107078435 + 2.33333 NA intron (NR_126029, intron 3 of 4) MamGyp-int|LTR|Gypsy 24687 NR_126029 340512 Hs.432529 NR_126029 ENSG00000230782 LOC340512 - uncharacterized LOC340512 ncRNA 504.666-6 chr6 52357541 52357819 + 2.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4471 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 322-50 chr9 36216074 36216342 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001190383, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001190383, exon 11 of 11) 25287 NM_001184760 1211 Hs.522114 NM_001833 ENSG00000122705 CLTA LCA clathrin light chain A protein-coding 316.333-14 chr19 4277115 4277275 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -1406 NM_020209 56961 Hs.7423 NM_020209 ENSG00000105251 SHD - Src homology 2 domain containing transforming protein D protein-coding 384-8 chr16 68677529 68677916 + 2.33333 NA intron (NM_001793, intron 3 of 15) AluSx1|SINE|Alu 32412 NM_001793 1001 Hs.191842 NM_001793 ENSG00000062038 CDH3 CDHP|HJMD|PCAD cadherin 3 protein-coding 284.333-3 chr1 111560422 111560615 + 2.33333 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 3485 NM_001081976 57413 Hs.281342 NM_020683 ENSG00000121933 TMIGD3 AD026 transmembrane and immunoglobulin domain containing 3 protein-coding 338.333-19 chr8 92262626 92262895 + 2.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -159375 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 344.666-3 chr1 93417340 93417597 + 2.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -30650 NM_017737 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 536.666 chr17 59117518 59117899 + 2.33333 NA intron (NM_001100595, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu -10828 NM_001353082 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 327.333-31 chr4 64467403 64467671 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -58077 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 349-2 chr10 58020035 58020303 + 2.33333 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 247725 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 344.333-5 chr15 92745847 92746105 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -49508 NR_033769 728619 Hs.684129 NR_033769 ASB9P1 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 pseudogene 1 pseudo 405.333 chr10 52132069 52132379 + 2.33333 NA intron (NM_001098512, intron 7 of 17) L1M5|LINE|L1 181904 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 437.666-2 chr11 115311061 115311311 + 2.33333 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -22391 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 396.333-11 chr6 134315182 134315489 + 2.33333 NA intron (NM_001143676, intron 1 of 13) intron (NM_001143676, intron 1 of 13) 2723 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 450-5 chr6 158763741 158764062 + 2.33333 NA TTS (NR_037482) TTS (NR_037482) 852 NR_037482 100500851 NR_037482 ENSG00000265558 MIR3918 mir-3918 microRNA 3918 ncRNA 350.334-7 chr4 12963922 12964234 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 520262 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 595.999 chr2 102705634 102706080 + 2.33333 NA exon (NM_003048, exon 11 of 12) exon (NM_003048, exon 11 of 12) 31031 NR_136174 84804 Hs.590898 NM_032718 ENSG00000135953 MFSD9 - major facilitator superfamily domain containing 9 protein-coding 340.333-13 chr4 30739193 30739478 + 2.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 18966 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 375.333-7 chr12 59850150 59850516 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 160963 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 480.333 chr17 59460704 59461063 + 2.33333 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) intron (NR_110813, intron 2 of 2) 65974 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 280-44 chr4 107234278 107234510 + 2.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -198081 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 363.333-15 chr2 60862610 60862874 + 2.33333 NA intron (NR_033980, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 18572 NR_033980 400957 Hs.170358 NR_033980 ENSG00000228414 LINC01185 - long intergenic non-protein coding RNA 1185 ncRNA 387.333-16 chr8 59712744 59712986 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 568535 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 548.666-2 chr17 60360317 60360712 + 2.33333 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) AluSx|SINE|Alu 31619 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 370.666-11 chr3 29327583 29327811 + 2.33333 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 46385 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 372-2 chr1 30999934 31000111 + 2.33333 NA intron (NM_001020658, intron 5 of 21) intron (NM_001020658, intron 5 of 21) -31785 NR_003066 692200 NR_003066 SNORD103C HBII-251|SNORD85 small nucleolar RNA, C/D box 103C snoRNA 270.333-46 chr4 136274105 136274433 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -360589 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 373.333-14 chr2 77552181 77552488 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -29901 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 431.667-5 chr5 117332734 117333035 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -82628 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 366-19 chr5 57236082 57236333 + 2.33333 NA intron (NM_001203246, intron 5 of 10) intron (NM_001203246, intron 5 of 10) 22133 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 631.333 chr10 107284589 107285032 + 2.33333 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -120104 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 390-15 chr2 121974167 121974633 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 218749 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 416.333-10 chr3 129864096 129864420 + 2.33333 NA intron (NM_001349263, intron 2 of 7) intron (NM_001349263, intron 2 of 7) 29318 NM_001128224 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 421.333-2 chr15 56927453 56927850 + 2.33333 NA intron (NM_207038, intron 3 of 19) L1ME4a|LINE|L1 8206 NM_001322165 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 393.333-16 chr5 21846054 21846347 + 2.33333 NA intron (NM_001317228, intron 4 of 11) LTR9A1|LTR|ERV1 -38254 NR_132787 106635539 NR_132787 SNORA105A - small nucleolar RNA, H/ACA box 105A snoRNA 279.667-10 chr12 115754410 115754638 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 394130 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 371.333-19 chr5 107656381 107656624 + 2.33333 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 14435 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 380-12 chr4 30447795 30448093 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -272425 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 467.666-3 chr9 107640762 107641082 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -151153 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 358.666-5 chr2 54495879 54496082 + 2.33333 NA intron (NM_003128, intron 1 of 35) intron (NM_003128, intron 1 of 35) -33242 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 542-2 chr17 73084476 73084848 + 2.33333 NA intron (NM_001352692, intron 3 of 9) intron (NM_001352692, intron 3 of 9) 8026 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 406.333-2 chr10 31162143 31162492 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -25566 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 364.667-6 chr14 50474019 50474302 + 2.33333 NA intron (NM_198794, intron 9 of 31) AluJb|SINE|Alu 58409 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 485.334 chr10 54691791 54692238 + 2.33333 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) -84057 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 355.666-11 chr7 130095489 130095758 + 2.33333 NA intron (NM_014997, intron 1 of 9) intron (NM_014997, intron 1 of 9) 25089 NM_014997 23008 Hs.520710 NM_014997 ENSG00000128607 KLHDC10 slim kelch domain containing 10 protein-coding 360.666-13 chr5 127715639 127715928 + 2.33333 NA intron (NM_001317938, intron 2 of 6) L1MA6|LINE|L1 12394 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 375.333-24 chr5 16688020 16688269 + 2.33333 NA intron (NM_012334, intron 28 of 40) intron (NM_012334, intron 28 of 40) -71086 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 370.666-2 chr10 76173088 76173291 + 2.33333 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) L1MEc|LINE|L1 390428 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 246-17 chr11 72507545 72507691 + 2.33333 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -63038 NR_126364 101928555 Hs.376950 NR_126364 ENSG00000227467 LINC01537 - long intergenic non-protein coding RNA 1537 ncRNA 308.333-30 chr5 68777209 68777424 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 252611 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 459-6 chr2 28946314 28946643 + 2.33333 NA exon (NM_015131, exon 17 of 18) exon (NM_015131, exon 17 of 18) 18495 NR_145755 109617012 NR_145755 ENSG00000265706 SNORD53B - small nucleolar RNA, C/D box 53B snoRNA 582-2 chr1 190277702 190278016 + 2.33333 NA intron (NM_001317188, intron 2 of 6) intron (NM_001317188, intron 2 of 6) 198151 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 291.333-22 chr14 46465826 46466005 + 2.33333 NA intron (NR_102701, intron 5 of 5) intron (NR_102701, intron 5 of 5) -5444 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 401.999-3 chr2 110960797 110961077 + 2.33333 NA intron (NM_001142807, intron 12 of 17) intron (NM_001142807, intron 12 of 17) 154651 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 585.333-3 chr8 106406898 106407315 + 2.33333 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) intron (NM_018002, intron 2 of 15) -40818 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 353.667-17 chr9 95165695 95165929 + 2.33333 NA intron (NM_001243744, intron 6 of 13) L1MB2|LINE|L1 -79718 NR_036109 100422842 NR_036109 ENSG00000207617 MIR3074 mir-3074 microRNA 3074 ncRNA 404-11 chr4 67615217 67615595 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_018227, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_018227, exon 33 of 33) 56679 NM_001317769 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 379.333-9 chr4 123032599 123032778 + 2.33333 NA intron (NM_001345856, intron 11 of 15) AluSg7|SINE|Alu 109610 NM_145207 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 388.333-12 chr21 26906794 26906982 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -47073 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 433-7 chr8 29618415 29618756 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 129524 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 346.334-6 chr5 44872842 44873114 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 64031 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 373.666-5 chr2 72324172 72324477 + 2.33333 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -176462 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 456-8 chr9 98445556 98446080 + 2.33333 NA intron (NM_005458, intron 7 of 18) LTR16A1|LTR|ERVL -190169 NR_051978 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 581.666 chr9 27201708 27201973 + 2.33333 NA intron (NM_001290077, intron 11 of 21) MIRc|SINE|MIR 80953 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 367-10 chr7 40397306 40397553 + 2.33333 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) L2c|LINE|L2 262453 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 397-6 chr4 145042926 145043229 + 2.33333 NA intron (NM_001256710, intron 4 of 5) intron (NM_001256710, intron 4 of 5) 54305 NM_001318367 10393 Hs.480876 NM_014885 ENSG00000164162 ANAPC10 APC10|DOC1 anaphase promoting complex subunit 10 protein-coding 603.667-2 chr5 83615001 83615504 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -52938 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 331.333-34 chr3 77800331 77800481 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 248557 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 337.666-13 chr8 126721414 126721582 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -163020 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 335-11 chr17 62303820 62304037 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -28273 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 336-31 chr7 3922985 3923298 + 2.33333 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) L1MEj|LINE|L1 -206544 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 374.667-10 chr4 92015118 92015436 + 2.33333 NA Intergenic MER92D|LTR|ERV1 262025 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 349.333 chr1 41789539 41789779 + 2.33333 NA intron (NM_024503, intron 1 of 8) MER113B|DNA|hAT-Charlie 129263 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 365.666-8 chr7 92523540 92523848 + 2.33333 NA intron (NM_001282677, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 4826 NM_001282678 5189 Hs.164682 NM_000466 ENSG00000127980 PEX1 HMLR1|PBD1A|PBD1B|ZWS|ZWS1 peroxisomal biogenesis factor 1 protein-coding 354-10 chr15 69924436 69924728 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 89348 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 339.333-21 chr2 30792466 30792727 + 2.33333 NA intron (NM_144575, intron 1 of 22) L1ME1|LINE|L1 14850 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 623.667 chr8 117997348 117997949 + 2.33333 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -76735 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 363.667-14 chr7 38011480 38011781 + 2.33333 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 90311 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 442-5 chr5 175410412 175410711 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 33621 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 587.666 chr14 75175122 75175438 + 2.33333 NA intron (NM_006827, intron 1 of 4) intron (NM_006827, intron 1 of 4) 1332 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 379-2 chr12 28713072 28713296 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -436094 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 389.333-23 chr9 99056891 99057110 + 2.33333 NA intron (NM_001855, intron 35 of 41) L1MB7|LINE|L1 -48113 NM_004612 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 565.666-3 chr9 33098981 33099394 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -9505 NR_162131 113219452 NR_162131 MIR12117 - microRNA 12117 ncRNA 295.334-2 chr14 55477004 55477192 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -36553 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 580 chr1 172269812 172270198 + 2.33333 NA intron (NR_146559, intron 16 of 20) intron (NR_146559, intron 16 of 20) -125170 NR_038397 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 276-53 chr5 58046306 58046449 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 75964 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 359.333-8 chr18 778641 778906 + 2.33333 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) intron (NM_005433, intron 1 of 11) 33469 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 607.666 chr1 96980332 96980668 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -115423 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 614.666 chr9 38746932 38747202 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 125979 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 625.332 chr15 83182055 83182400 + 2.33333 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) intron (NM_016073, intron 1 of 5) 25596 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 378-22 chr5 24276847 24277158 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 325654 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 359.333-2 chr10 65585823 65586017 + 2.33333 NA intron (NR_120647, intron 2 of 5) intron (NR_120647, intron 2 of 5) 14495 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 304.333-4 chr1 184065473 184065629 + 2.33333 NA intron (NR_125335, intron 4 of 5) L1MC2|LINE|L1 13821 NR_125335 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 445.333-8 chr7 129642970 129643287 + 2.33333 NA intron (NM_001040110, intron 1 of 10) intron (NM_001040110, intron 1 of 10) 13050 NM_001040110 4899 Hs.654363 NM_005011 ENSG00000106459 NRF1 ALPHA-PAL nuclear respiratory factor 1 protein-coding 354.666-7 chr17 68637375 68637577 + 2.33333 NA intron (NR_110825, intron 1 of 4) intron (NR_110825, intron 1 of 4) 9322 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 331.666-22 chr8 81871172 81871447 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -29023 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 636.999 chr20 5077447 5077869 + 2.33333 NA intron (NM_001330987, intron 3 of 3) AluSx1|SINE|Alu 35418 NM_001009923 29058 Hs.472024 NM_014145 ENSG00000089063 TMEM230 C20orf30|HSPC274|dJ1116H23.2.1 transmembrane protein 230 protein-coding 247.999-10 chr5 149490425 149490619 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 59843 NM_001271742 1452 Hs.529862 NM_001892 ENSG00000113712 CSNK1A1 CK1|CK1a|CKIa|HEL-S-77p|HLCDGP1|PRO2975 casein kinase 1 alpha 1 protein-coding 296.666-15 chr2 54671174 54671394 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_003128, exon 36 of 36) 3' UTR (NM_003128, exon 36 of 36) -53728 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 301.333-46 chr6 77143023 77143196 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 320913 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 434.001 chr5 42637062 42637401 + 2.33333 NA intron (NM_001242403, intron 3 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie 71367 NM_001242462 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 407.666-3 chr11 32770598 32770801 + 2.33333 NA intron (NM_001008391, intron 1 of 17) MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR 23959 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 332.666-14 chr2 40458710 40458899 + 2.33333 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) intron (NM_001112802, intron 1 of 7) -6714 NM_001351491 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 412.666-7 chr8 108714595 108714920 + 2.33333 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 72837 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 349.667-9 chr17 13969670 13969963 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -54682 NR_003261 94158 Hs.633073 NR_003261 CDRT15P1 CDRT15P CMT1A duplicated region transcript 15 pseudogene 1 pseudo 399.333 chr1 205122655 205122943 + 2.33333 NA promoter-TSS (NM_005057) promoter-TSS (NM_005057) -821 NM_001193272 5929 Hs.519230 NM_005057 ENSG00000117222 RBBP5 RBQ3|SWD1 RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 389-8 chr5 13798732 13798993 + 2.33333 NA intron (NM_001369, intron 47 of 78) AluSx|SINE|Alu 145618 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 540.999 chr15 24662218 24662468 + 2.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -13051 NM_018958 23742 Hs.649663 NM_018958 ENSG00000185823 NPAP1 C15orf2 nuclear pore associated protein 1 protein-coding 274.333-31 chr17 72173994 72174194 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 53074 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 365-22 chr9 83635435 83635726 + 2.33333 NA intron (NM_001001551, intron 3 of 4) MamRep605|LTR?|LTR? 12437 NM_001351535 414328 Hs.530261 NM_001001551 ENSG00000148057 IDNK C9orf103|bA522I20.2|hGntK IDNK gluconokinase protein-coding 345.333-5 chr11 29008430 29008688 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -531011 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 365.667-16 chr7 18490896 18491154 + 2.33333 NA intron (NM_001204144, intron 3 of 12) intron (NM_001204144, intron 3 of 12) -4685 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 384.666-8 chr20 41633799 41634109 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -15577 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 376.667-12 chr6 106246842 106247203 + 2.33333 NA intron (NR_104402, intron 4 of 5) intron (NR_104402, intron 4 of 5) 69244 NR_104403 9474 Hs.486063 NM_004849 ENSG00000057663 ATG5 APG5|APG5-LIKE|APG5L|ASP|SCAR25|hAPG5 autophagy related 5 protein-coding 253.666-19 chr4 97724727 97724918 + 2.33333 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) L1MD|LINE|L1 357896 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 350-26 chr5 91638769 91639035 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -255585 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 208-120 chr4 48310019 48310170 + 2.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -31435 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 518.667-3 chr3 189129782 189130252 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -41954 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 510.667-2 chr5 1680350 1680753 + 2.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 28317 NR_036240 100422966 NR_036240 ENSG00000263746 MIR4277 - microRNA 4277 ncRNA 329-18 chr5 38038635 38038922 + 2.33333 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) 13081 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 434.666-10 chr8 111142227 111142672 + 2.33333 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) 93754 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 439.333-10 chr6 115548943 115549135 + 2.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 94796 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 347-26 chr8 105258497 105258709 + 2.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -59835 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 357-21 chr6 149325221 149325440 + 2.33333 NA intron (NM_015093, intron 1 of 8) intron (NM_015093, intron 1 of 8) 7030 NM_015093 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 422.999 chr2 149491750 149492032 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -95467 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 587.333-2 chr5 53245408 53245905 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 135814 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 419-7 chr6 67439170 67439494 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -616019 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 521.333-3 chr5 179901292 179901663 + 2.33333 NA intron (NM_198868, intron 2 of 21) intron (NM_198868, intron 2 of 21) 6420 NM_015043 23061 Hs.155829 NM_015043 ENSG00000197226 TBC1D9B GRAMD9B TBC1 domain family member 9B protein-coding 354.333-12 chr20 2231168 2231394 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 24353 NR_161305 388780 Hs.132163 NR_161305 LOC388780 - uncharacterized LOC388780 ncRNA 273.334-6 chr2 103833617 103833849 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 574599 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 356.666 chr1 62456303 62456534 + 2.33333 NA intron (NM_001367561, intron 49 of 49) LTR81AB|LTR|Gypsy 19369 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 415.666-6 chr7 52161550 52161839 + 2.33333 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -768438 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 301.666-2 chr10 32372174 32372346 + 2.33333 NA intron (NR_104163, intron 1 of 1) MER5A|DNA|hAT-Charlie 6509 NM_001282391 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 519.333-2 chr8 132007137 132007527 + 2.33333 NA intron (NR_136616, intron 23 of 23) L1ME2|LINE|L1 52050 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 420-5 chr10 94807965 94808478 + 2.33333 NA intron (NM_000769, intron 5 of 8) L1MA5|LINE|L1 45540 NM_000769 1557 Hs.282409 NM_000769 ENSG00000165841 CYP2C19 CPCJ|CYP2C|CYPIIC17|CYPIIC19|P450C2C|P450IIC19 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19 protein-coding 347.666-15 chr5 176966427 176966706 + 2.33333 NA intron (NM_001317961, intron 6 of 14) intron (NM_001317961, intron 6 of 14) 39876 NM_016290 51720 Hs.232721 NM_016290 ENSG00000087206 UIMC1 RAP80|X2HRIP110 ubiquitin interaction motif containing 1 protein-coding 337-16 chr2 67483575 67483822 + 2.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 86365 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 586.334 chr4 31894661 31895033 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -102532 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 411-11 chr7 45447244 45447515 + 2.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -126761 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 580.666 chr8 88729937 88730489 + 2.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -402730 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 387-15 chr6 130232202 130232444 + 2.33333 NA intron (NM_001258275, intron 2 of 13) LTR16C|LTR|ERVL -9372 NM_001017373 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 325.333-53 chr8 141010274 141010447 + 2.33333 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -8281 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 284.333-9 chr11 31756551 31756801 + 2.33333 NA intron (NM_001288726, intron 10 of 11) L2a|LINE|L2 43985 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 353.333-36 chr7 71310182 71310340 + 2.33333 NA intron (NM_022479, intron 1 of 10) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -2491 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 547-3 chr3 139040662 139041262 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 3930 NM_001134657 389152 Hs.531377 NM_001004315 ENSG00000233701 PRR23C - proline rich 23C protein-coding 357-11 chr20 21386647 21386863 + 2.33333 NA intron (NM_001317960, intron 28 of 29) intron (NM_001317960, intron 28 of 29) 10771 NM_033176 644524 NM_033176 ENSG00000125816 NKX2-4 NKX2.4|NKX2D NK2 homeobox 4 protein-coding 407.334-7 chr8 32965821 32966202 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 244176 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 845.332 chr8 118657685 118658354 + 2.33333 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) intron (NR_038210, intron 2 of 4) -36056 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 396.333-3 chr13 41722341 41722542 + 2.33333 NA intron (NM_001009814, intron 24 of 25) intron (NM_001009814, intron 24 of 25) -154046 NR_049803 100847026 NR_049803 ENSG00000284584 MIR5006 - microRNA 5006 ncRNA 361.333-31 chr8 116645083 116645315 + 2.33333 NA intron (NM_003756, intron 7 of 7) intron (NM_003756, intron 7 of 7) -6901 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 452.999-2 chr8 17744726 17744932 + 2.33333 NA intron (NM_001363057, intron 2 of 14) AluSx3|SINE|Alu -22254 NM_001166393 57509 Hs.7946 NM_020749 ENSG00000129422 MTUS1 ATBP|ATIP|ATIP3|ICIS|MP44|MTSG1 microtubule associated scaffold protein 1 protein-coding 685.333-2 chr3 62321962 62322440 + 2.33333 NA intron (NM_001291941, intron 4 of 5) intron (NM_001291941, intron 4 of 5) 3179 NM_020685 57415 Hs.47166 NM_020685 ENSG00000114405 C3orf14 HT021 chromosome 3 open reading frame 14 protein-coding 425-4 chr4 102013061 102013398 + 2.33333 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 199387 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 371.333-6 chr11 114435544 114435816 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -3787 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 478.667 chr18 1352733 1353160 + 2.33333 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) L1M4c|LINE|L1 6683 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 399.667-2 chr12 55292261 55292545 + 2.33333 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie 2829 NM_001005493 283365 Hs.554555 NM_001005493 ENSG00000188324 OR6C6 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 6 protein-coding 349.999-2 chr14 66740353 66740595 + 2.33333 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 233067 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 185.667-103 chr5 102396545 102396686 + 2.33333 NA intron (NM_173488, intron 10 of 13) L1M5|LINE|L1 -100331 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 435.999 chr7 22396312 22396559 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -39281 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 468.666 chr10 102886600 102886931 + 2.33333 NA intron (NM_020682, intron 9 of 10) AluJb|SINE|Alu 17295 NM_020682 57412 Hs.720370 NM_020682 ENSG00000214435 AS3MT CYT19 arsenite methyltransferase protein-coding 499.333-3 chr21 28109368 28109743 + 2.33333 NA intron (NR_126010, intron 2 of 4) intron (NR_126010, intron 2 of 4) 19152 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 521-4 chr17 52201005 52201376 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -41173 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 414.666-4 chr14 33417355 33417702 + 2.33333 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -291409 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 315.667-19 chr5 9769631 9769876 + 2.33333 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) L1MA3|LINE|L1 -84624 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 346-28 chr5 94379206 94379418 + 2.33333 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) L1PA15|LINE|L1 239292 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 499.333-10 chr8 128301493 128301927 + 2.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 151594 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 377-2 chr10 67935805 67935973 + 2.33333 NA intron (NM_001278185, intron 21 of 23) intron (NM_001278185, intron 21 of 23) 44487 NM_001314049 23411 Hs.369779 NM_012238 ENSG00000096717 SIRT1 SIR2|SIR2L1|SIR2alpha sirtuin 1 protein-coding 488.333-5 chr5 124178434 124178698 + 2.33333 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) LTR48|LTR|ERV1 259954 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 364.333-7 chr12 5199812 5199980 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 43255 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 348.666-8 chr2 104623471 104623699 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -113076 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 413.333-6 chr16 52342346 52342684 + 2.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 83951 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 340.333-16 chr6 43560719 43560965 + 2.33333 NA intron (NR_144392, intron 10 of 32) intron (NR_144392, intron 10 of 32) 15196 NM_020750 57510 Hs.203206 NM_020750 ENSG00000124571 XPO5 exp5 exportin 5 protein-coding 264-54 chr9 91255141 91255334 + 2.33333 NA intron (NM_001698, intron 6 of 9) intron (NM_001698, intron 6 of 9) 106687 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 357-8 chr17 58492967 58493236 + 2.33333 NA intron (NM_004687, intron 16 of 18) MIR|SINE|MIR -4693 NM_001080439 124535 Hs.380061 NM_001080439 ENSG00000176160 HSF5 HSF 5|HSTF 5 heat shock transcription factor 5 protein-coding 326-25 chr3 62832065 62832259 + 2.33333 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) intron (NM_003716, intron 1 of 29) 43254 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 340.333-9 chr2 24232619 24232853 + 2.33333 NA intron (NM_001348182, intron 28 of 38) intron (NM_001348182, intron 28 of 38) 57683 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 374.666-5 chr2 77433950 77434186 + 2.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 88308 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 366.333-18 chr4 116230417 116230622 + 2.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -69206 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 431-4 chr14 49811699 49812094 + 2.33333 NA intron (NM_001301732, intron 17 of 31) L1MB7|LINE|L1 40892 NM_004713 9147 Hs.655964 NM_004713 ENSG00000165525 NEMF NY-CO-1|SDCCAG1 nuclear export mediator factor protein-coding 363.333-28 chrX 151742770 151742928 + 2.33333 NA intron (NM_005140, intron 6 of 6) intron (NM_005140, intron 6 of 6) 8103 NM_005140 1260 Hs.447360 NM_005140 ENSG00000183862 CNGA2 CNCA|CNCA1|CNG2|OCNC1|OCNCALPHA|OCNCa cyclic nucleotide gated channel alpha 2 protein-coding 369.666-4 chr15 62682324 62682522 + 2.33333 NA intron (NM_015059, intron 8 of 55) intron (NM_015059, intron 8 of 55) 35112 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 330.333-13 chr5 77450188 77450364 + 2.33333 NA intron (NM_018268, intron 7 of 12) intron (NM_018268, intron 7 of 12) 42040 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 320.667-33 chr8 136678266 136678499 + 2.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 147584 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 488.667-6 chr8 124316424 124316795 + 2.33333 NA intron (NM_194291, intron 6 of 6) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 56090 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 371.999-2 chr2 215299448 215299607 + 2.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -12532 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 294.666-28 chr5 151124164 151124315 + 2.33333 NA intron (NM_001193544, intron 14 of 24) intron (NM_001193544, intron 14 of 24) 17445 NM_001193544 309 Hs.412117 NM_001155 ENSG00000197043 ANXA6 ANX6|CBP68|CPB-II|p68|p70 annexin A6 protein-coding 478.666 chr1 167408013 167408288 + 2.33333 NA intron (NM_001198783, intron 13 of 15) L1MB7|LINE|L1 79080 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 252.333-63 chr5 132446396 132446538 + 2.33333 NA intron (NR_161242, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 35538 NR_161242 441108 Hs.658288 NM_001013717 C5orf56 - chromosome 5 open reading frame 56 ncRNA 376.666-13 chr8 138561005 138561218 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -63381 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 309-5 chr1 117942551 117942696 + 2.33333 NA intron (NM_006784, intron 10 of 26) intron (NM_006784, intron 10 of 26) 12884 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 406.333-3 chr10 38072230 38072459 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -21992 NM_001324253 7587 Hs.292575 NM_003421 ENSG00000075407 ZNF37A KOX21|ZNF37 zinc finger protein 37A protein-coding 393-9 chr3 142435038 142435226 + 2.33333 NA intron (NM_019001, intron 1 of 41) AluY|SINE|Alu 12905 NM_019001 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 286.333-15 chr17 14689139 14689327 + 2.33333 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -325572 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 584.666-2 chr20 46454705 46455039 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 2771 NR_045983 100130934 Hs.712133 NM_173643 ZNF663P ZNF663 zinc finger protein 663, pseudogene pseudo 507.666-2 chr14 54226084 54226439 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -170607 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 418.999 chr15 46137667 46138008 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 432642 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 360.333 chr1 90367669 90367956 + 2.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -289938 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 531.666 chr1 236221873 236222288 + 2.33333 NA intron (NM_019891, intron 13 of 15) intron (NM_019891, intron 13 of 15) 59878 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 238.667-70 chr5 101062338 101062548 + 2.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -159161 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 551.333 chr17 61289283 61289855 + 2.33333 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 78135 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 400.333-12 chr3 70033880 70034171 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 34281 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 393.333-4 chr10 83077741 83077955 + 2.33333 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 599241 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 421.999-6 chr6 38217415 38217696 + 2.33333 NA intron (NM_052893, intron 10 of 11) intron (NM_052893, intron 10 of 11) -264041 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 565.999 chr15 37161985 37162593 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -60978 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 460.333 chr20 22129413 22129779 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 75506 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 431.666-2 chr17 52912659 52913000 + 2.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 50708 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 727.665 chr3 172972133 172972563 + 2.33333 NA intron (NM_031955, intron 5 of 10) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 168887 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 402.666-10 chr8 87241985 87242184 + 2.33333 NA intron (NM_173538, intron 6 of 10) MER4D1|LTR|ERV1 375669 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 342.333-20 chr3 85968183 85968359 + 2.33333 NA intron (NM_001256504, intron 9 of 10) intron (NM_001256504, intron 9 of 10) -140221 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 292.333-46 chr9 12583299 12583521 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -109975 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 362.333-2 chr13 79262652 79262808 + 2.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 143491 NM_001286632 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 451.999-2 chr1 180612097 180612617 + 2.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -19665 NM_001328662 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 325.334-7 chr8 118739235 118739495 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -117402 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 781.999 chr8 119709571 119710149 + 2.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -36470 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 352.333-14 chr3 3446411 3446630 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -266803 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 375.666 chr11 104434775 104434956 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 174437 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 357.667-13 chr7 54286999 54287299 + 2.33333 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -43548 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 476-5 chr22 25082651 25083033 + 2.33333 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) AluJo|SINE|Alu 29850 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 296.666-25 chr4 82969985 82970136 + 2.33333 NA intron (NM_001288996, intron 2 of 10) intron (NM_001288996, intron 2 of 10) 40763 NM_194282 132660 Hs.96952 NM_194282 ENSG00000189308 LIN54 CXCDC1|JC8.6|MIP120|TCX1 lin-54 DREAM MuvB core complex component protein-coding 358-24 chr8 82738801 82739008 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -173200 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 428.999-2 chr7 48173604 48173912 + 2.33333 NA intron (NM_152701, intron 1 of 61) MIR|SINE|MIR 2300 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 384-13 chr4 30440712 30441032 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -279497 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 583.334 chr14 71784087 71784746 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -147755 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 337.333-43 chr6 108041810 108042036 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_014028, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_014028, exon 6 of 6) 32818 NM_014028 28962 Hs.226780 NM_014028 ENSG00000081087 OSTM1 GIPN|GL|HSPC019|OPTB5 osteoclastogenesis associated transmembrane protein 1 protein-coding 350.666-2 chr11 74316715 74316924 + 2.33333 NA intron (NR_120556, intron 3 of 6) L1MD2|LINE|L1 -5179 NM_182904 283208 Hs.660541 NM_182904 ENSG00000149380 P4HA3 - prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 3 protein-coding 897.668 chr7 53801969 53802614 + 2.33333 NA intron (NR_038371, intron 1 of 5) intron (NR_038371, intron 1 of 5) 9640 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 678.666 chr17 39817841 39818338 + 2.33333 NA intron (NM_001257409, intron 2 of 5) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -39864 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 461-6 chr3 189072077 189072353 + 2.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -99756 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 504.333-3 chr2 130364046 130364481 + 2.33333 NA intron (NM_014369, intron 5 of 14) L1MB4|LINE|L1 8207 NM_014369 26469 Hs.516390 NM_014369 ENSG00000072135 PTPN18 BDP1|PTP-HSCF protein tyrosine phosphatase non-receptor type 18 protein-coding 329.666-12 chr6 126030618 126030772 + 2.33333 NA intron (NM_001031712, intron 12 of 12) intron (NM_001031712, intron 12 of 12) 44155 NR_146803 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 345.666-14 chr7 14150945 14151112 + 2.33333 NA intron (NM_001350717, intron 24 of 24) L2c|LINE|L2 -159603 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 389.333-10 chr2 219915426 219915776 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -9036 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 389-11 chr9 88169628 88169852 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -31259 NM_001350978 645961 Hs.632070 NM_001166137 SPATA31C2 FAM75C2 SPATA31 subfamily C member 2 protein-coding 359.666-7 chr2 133641200 133641461 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -72867 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 387.333-4 chr14 73959970 73960298 + 2.33333 NA TTS (NM_001321984) TTS (NM_001321984) 9832 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 435-6 chr5 154144341 154144754 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -46186 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 571.333 chr16 9864034 9864476 + 2.33333 NA intron (NM_001134408, intron 4 of 13) intron (NM_001134408, intron 4 of 13) 317812 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 493.334 chr7 109788885 109789234 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 171154 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 370.666-6 chr2 106029235 106029415 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -36363 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 289-24 chr4 151913033 151913222 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -152104 NM_001363341 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 387.333-9 chr4 37118340 37118517 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 116649 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 522.999 chr15 33154705 33155092 + 2.33333 NA exon (NM_001277314, exon 4 of 5) exon (NM_001277314, exon 4 of 5) 39816 NM_001277314 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 375.999 chr1 202939367 202939629 + 2.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10899 NM_001303051 59349 Hs.706793 NM_021633 ENSG00000117153 KLHL12 C3IP1|DKIR kelch like family member 12 protein-coding 357.333-20 chr7 7607884 7608126 + 2.33333 NA non-coding (NR_163250, exon 12 of 12) non-coding (NR_163250, exon 12 of 12) -32747 NM_001302349 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 463.333-9 chr6 125056907 125057552 + 2.33333 NA intron (NR_136734, intron 3 of 6) AluSz|SINE|Alu 73861 NM_152553 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 539.666 chr14 49899418 49899768 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 6511 NM_001663 382 Hs.525330 NM_001663 ENSG00000165527 ARF6 - ADP ribosylation factor 6 protein-coding 469.667 chr4 41375596 41376197 + 2.33333 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 15089 NM_001330787 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 365.667-5 chr11 111823250 111823518 + 2.33333 NA intron (NR_147984, intron 13 of 15) intron (NR_147984, intron 13 of 15) 47897 NM_001352415 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 384.666-2 chr10 28465156 28465412 + 2.33333 NA intron (NR_134496, intron 1 of 2) L1M2|LINE|L1 30529 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 488-6 chr6 112702198 112702508 + 2.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 355023 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 523-2 chr16 88592659 88592923 + 2.33333 NA intron (NM_001294340, intron 4 of 18) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 22388 NM_144604 124245 Hs.93670 NM_144604 ENSG00000158545 ZC3H18 NHN1 zinc finger CCCH-type containing 18 protein-coding 309.333-42 chr22 31795583 31795733 + 2.33333 NA intron (NR_146296, intron 12 of 42) AluSx1|SINE|Alu 41635 NM_001369901 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 353-12 chr20 52425033 52425458 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -195593 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 451-3 chr14 60781440 60781705 + 2.33333 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 46811 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 387-8 chr19 47122193 47122557 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -8460 NR_027280 10055 Hs.515500 NM_005500 ENSG00000142230 SAE1 AOS1|HSPC140|SUA1|UBLE1A SUMO1 activating enzyme subunit 1 protein-coding 289-25 chr5 72396093 72396351 + 2.33333 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 75849 NM_001284403 79810 Hs.126906 NM_024754 ENSG00000049883 PTCD2 - pentatricopeptide repeat domain 2 protein-coding 444-2 chr15 71132221 71132464 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -9107 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 343-20 chr8 82466103 82466269 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -445918 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 194-97 chr3 184330497 184330590 + 2.33333 NA intron (NM_198244, intron 25 of 29) intron (NM_198244, intron 25 of 29) 4847 NR_003055 692107 NR_003055 ENSG00000212158 SNORD66 HBII-142 small nucleolar RNA, C/D box 66 snoRNA 503.333-4 chr4 53396961 53397435 + 2.33333 NA intron (NM_001134937, intron 8 of 17) intron (NM_001134937, intron 8 of 17) 19545 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 372.333 chr10 28398534 28398778 + 2.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -95592 NR_134518 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 451.666-5 chr6 143517269 143517711 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -5770 NM_032020 2519 Hs.17680 NM_032020 ENSG00000001036 FUCA2 dJ20N2.5 alpha-L-fucosidase 2 protein-coding 424-14 chr6 7733086 7733292 + 2.33333 NA intron (NM_001718, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 7090 NM_001718 654 Hs.285671 NM_001718 ENSG00000153162 BMP6 VGR|VGR1 bone morphogenetic protein 6 protein-coding 352.333-11 chr17 20935393 20935560 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -3090 NR_160719 339260 Hs.661076 NR_123730 ENSG00000233098 LOC339260 - uncharacterized LOC339260 ncRNA 339.666-8 chr20 53577292 53577494 + 2.33333 NA intron (NM_006526, intron 2 of 4) intron (NM_006526, intron 2 of 4) 5704 NM_006526 7764 Hs.155040 NM_006526 ENSG00000171940 ZNF217 ZABC1 zinc finger protein 217 protein-coding 380.333-12 chr8 123990849 123991149 + 2.33333 NA intron (NM_001039112, intron 12 of 40) L1PB3|LINE|L1 49783 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 542 chr10 48533604 48534033 + 2.33333 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) intron (NR_144642, intron 3 of 9) -22229 NR_146782 100689073 Hs.667964 NR_146782 ARHGAP22-IT1 - ARHGAP22 intronic transcript 1 ncRNA 414.666 chr1 44999763 45000080 + 2.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 11403 NM_024602 79654 Hs.525084 NM_024602 ENSG00000126107 HECTD3 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 472-9 chr5 110645584 110645888 + 2.33333 NA intron (NM_001039763, intron 2 of 13) L1M3|LINE|L1 80935 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 453-5 chr14 60665162 60665579 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -15893 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 336.666-23 chr8 124965196 124965481 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -7957 NM_152412 137209 Hs.175350 NM_152412 ENSG00000180938 ZNF572 - zinc finger protein 572 protein-coding 409.333-8 chr2 54509976 54510250 + 2.33333 NA intron (NM_003128, intron 1 of 35) AluSx1|SINE|Alu -19109 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 363-8 chr2 110145030 110145303 + 2.33333 NA intron (NM_207181, intron 14 of 19) intron (NM_207181, intron 14 of 19) -28600 NM_005434 7851 Hs.185055 NM_005434 ENSG00000144063 MALL BENE mal, T cell differentiation protein like protein-coding 379.667-11 chr7 85386124 85386349 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -34886 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 437.333-12 chr8 27591865 27592141 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 18748 NR_106902 102465508 NR_106902 ENSG00000284280 MIR6843 hsa-mir-6843 microRNA 6843 ncRNA 354.333-19 chr7 134954243 134954499 + 2.33333 NA intron (NM_033139, intron 7 of 12) intron (NM_033139, intron 7 of 12) -32137 NM_001367817 340351 Hs.648616 NM_178563 ENSG00000146856 AGBL3 CCP3 ATP/GTP binding protein like 3 protein-coding 404.666-2 chr11 84745572 84745768 + 2.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -24728 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 717.333 chr10 28979756 28980337 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 133638 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 414.999 chr10 12016246 12016575 + 2.33333 NA intron (NM_080599, intron 3 of 21) intron (NM_080599, intron 3 of 21) 26399 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 344.666-21 chr4 184851642 184851844 + 2.33333 NA promoter-TSS (NR_037510) promoter-TSS (NR_037510) -633 NR_037510 100500818 NR_037510 ENSG00000266698 MIR3945 - microRNA 3945 ncRNA 449.333-5 chr18 749897 750106 + 2.33333 NA intron (NM_005433, intron 3 of 11) intron (NM_005433, intron 3 of 11) -37337 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 422.667-2 chr10 77932942 77933275 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 6296 NR_024585 100128292 Hs.547908 NR_024585 DLG5-AS1 - DLG5 antisense RNA 1 ncRNA 531.999-2 chr10 87507239 87507549 + 2.33333 NA promoter-TSS (NM_001178118) promoter-TSS (NM_001178118) -439 NM_001178118 9562 Hs.121260 NM_004897 ENSG00000107789 MINPP1 HIPER1|MINPP2|MIPP multiple inositol-polyphosphate phosphatase 1 protein-coding 276.333-41 chr3 193187833 193188025 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -53293 NM_001366112 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 450.667-4 chr2 231957503 231957843 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -3910 NM_001257282 129563 Hs.732236 NM_152383 ENSG00000144535 DIS3L2 FAM6A|PRLMNS|hDIS3L2 DIS3 like 3'-5' exoribonuclease 2 protein-coding 421.667-10 chr8 114888975 114889263 + 2.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 778894 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 375.667-6 chr14 60843970 60844232 + 2.33333 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) L1ME2z|LINE|L1 109340 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 558.999 chr1 27773864 27774259 + 2.33333 NA intron (NM_177424, intron 1 of 8) intron (NM_177424, intron 1 of 8) 842 NM_177424 23673 Hs.523855 NM_177424 ENSG00000117758 STX12 STX13|STX14 syntaxin 12 protein-coding 326.666 chr10 9313231 9313379 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -17712 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 398.333-6 chr4 85793694 85794022 + 2.33333 NA intron (NM_001346093, intron 1 of 6) intron (NM_001346093, intron 1 of 6) 15060 NM_001346093 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 340.333-3 chr10 20254259 20254426 + 2.33333 NA intron (NM_032812, intron 13 of 13) intron (NM_032812, intron 13 of 13) -297628 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 325-18 chr2 31818417 31818577 + 2.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -14517 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 519.333-3 chr8 133936227 133936524 + 2.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 49879 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 228-3 chr1 190829997 190830144 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 205180 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 322.333-25 chr5 44679740 44679892 + 2.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 128977 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 188.333-125 chr5 169237657 169237772 + 2.33333 NA intron (NM_003062, intron 3 of 35) L1MC3|LINE|L1 25980 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 367.999-6 chr9 27644168 27644342 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -70389 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 382.333-9 chr2 146882256 146882519 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 295330 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 401.333-16 chr6 83623370 83623648 + 2.33333 NA intron (NM_001242792, intron 8 of 28) intron (NM_001242792, intron 8 of 28) 85050 NM_001363677 9892 Hs.368046 NM_014841 ENSG00000065609 SNAP91 AP180|CALM synaptosome associated protein 91 protein-coding 296.666-29 chr5 69119002 69119250 + 2.33333 NA intron (NM_022902, intron 12 of 15) intron (NM_022902, intron 12 of 15) 25112 NM_022902 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 356.666-2 chr1 145921781 145922068 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_005105, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_005105, exon 6 of 6) 2580 NR_104033 114814 Hs.356873 NM_057163 ENSG00000211451 GNRHR2 GnRH-II-R gonadotropin releasing hormone receptor 2 (pseudogene) pseudo 366.666-7 chr2 21171278 21171484 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 47395 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 488 chr11 101400109 101400561 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 119570 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 467.333-10 chr7 54297181 54297492 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -33361 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 373.334-5 chr20 18754893 18755195 + 2.33333 NA intron (NM_080820, intron 5 of 5) intron (NM_080820, intron 5 of 5) 38938 NR_026884 29075 Hs.584899 NM_014162 LINC00652 HSPC072 long intergenic non-protein coding RNA 652 ncRNA 214.333-167 chrX 154688024 154688182 + 2.33333 NA intron (NR_104114, intron 7 of 8) L1MD2|LINE|L1 -34524 NM_172377 30848 Hs.87225 NM_020994 ENSG00000126890 CTAG2 CAMEL|CT2|CT6.2|CT6.2a|CT6.2b|ESO2|LAGE-1|LAGE2B cancer/testis antigen 2 protein-coding 532.666-2 chr8 87834161 87834507 + 2.33333 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 39681 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 360.666-17 chr8 105867241 105867436 + 2.33333 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) L1MCc|LINE|L1 193165 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 420.666-2 chr12 47123555 47123834 + 2.33333 NA intron (NM_001281429, intron 2 of 2) intron (NM_001281429, intron 2 of 2) -43735 NM_001370299 347902 Hs.121520 NM_181847 ENSG00000139211 AMIGO2 ALI1|AMIGO-2|DEGA adhesion molecule with Ig like domain 2 protein-coding 413-7 chr2 57914517 57914893 + 2.33333 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) intron (NM_001288838, intron 1 of 15) 7054 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 305.666-2 chr1 207177158 207177340 + 2.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 73016 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 360.667-14 chr5 117982350 117982641 + 2.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) 252134 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 368.333-3 chr17 47271244 47271488 + 2.33333 NA intron (NM_000212, intron 1 of 14) LTR37B|LTR|ERV1 17524 NM_000212 3690 Hs.218040 NM_000212 ENSG00000259207 ITGB3 BDPLT16|BDPLT2|CD61|GP3A|GPIIIa|GT integrin subunit beta 3 protein-coding 613.333 chr1 77295227 77295838 + 2.33333 NA intron (NM_012093, intron 3 of 13) intron (NM_012093, intron 3 of 13) 12445 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 362-8 chr12 62947712 62947970 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -12691 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 350-38 chr8 100247031 100247205 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 55075 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 426-6 chr12 65478141 65478349 + 2.33333 NA intron (NR_120431, intron 3 of 3) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 79066 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 448.333-8 chr8 32161277 32161615 + 2.33333 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 135228 NR_104156 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 249-22 chr13 104749358 104749542 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -716417 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 459.333-7 chr15 56577707 56578038 + 2.33333 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -112735 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 275.333-58 chr5 110862531 110862704 + 2.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 123610 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 294.666-32 chr7 48712264 48712511 + 2.33333 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -212160 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 395.334 chr12 17460003 17460311 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 128921 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 330.334-5 chr11 75773308 75773523 + 2.33333 NA intron (NM_001253891, intron 1 of 6) MIR3|SINE|MIR 4637 NM_032564 84649 Hs.129798 NM_032564 ENSG00000062282 DGAT2 ARAT|GS1999FULL|HMFN1045 diacylglycerol O-acyltransferase 2 protein-coding 303-12 chr12 25023958 25024138 + 2.33333 NA intron (NM_001321724, intron 9 of 17) intron (NM_001321724, intron 9 of 17) 26473 NM_001321724 645177 Hs.569157 NM_001321724 LOC645177 - uncharacterized LOC645177 protein-coding 501.333-9 chrX 151803960 151804329 + 2.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 69398 NM_005140 1260 Hs.447360 NM_005140 ENSG00000183862 CNGA2 CNCA|CNCA1|CNG2|OCNC1|OCNCALPHA|OCNCa cyclic nucleotide gated channel alpha 2 protein-coding 358.666-15 chr6 125071993 125072192 + 2.33333 NA intron (NR_136734, intron 4 of 6) intron (NR_136734, intron 4 of 6) -81681 NM_003287 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 290-36 chr3 194415436 194415597 + 2.33333 NA intron (NM_001367549, intron 31 of 33) L1ME4b|LINE|L1 -16250 NM_004488 2814 Hs.73734 NM_004488 ENSG00000178732 GP5 CD42d|GPV glycoprotein V platelet protein-coding 426-11 chr5 110922950 110923220 + 2.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -146995 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 629.332 chr4 174955336 174955837 + 2.33333 NA intron (NM_001278126, intron 5 of 5) intron (NM_001278126, intron 5 of 5) 37228 NM_001278127 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 422-12 chr9 90296740 90296989 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 136625 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 322.333-4 chr10 107413439 107413709 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -248868 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 404-6 chr14 85721036 85721219 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 187778 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 342-21 chr2 156280449 156280625 + 2.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -25606 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 458.666-2 chr5 163895237 163895560 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 389779 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 389.333-16 chr6 49215103 49215374 + 2.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 248015 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 346.666 chr1 93122701 93122912 + 2.33333 NA intron (NM_007358, intron 9 of 14) intron (NM_007358, intron 9 of 14) 43523 NM_007358 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 286-43 chr3 176128367 176128585 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -116075 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 529.666 chr11 45741600 45741975 + 2.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 19479 NR_047569 100507384 Hs.259426 NR_047569 ENSG00000254519 LOC100507384 - uncharacterized LOC100507384 ncRNA 353-8 chr17 75194162 75194384 + 2.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -11163 NM_001330472 79902 Hs.362817 NM_024844 ENSG00000125450 NUP85 FROUNT|NPHS17|Nup75 nucleoporin 85 protein-coding 395.666-4 chrX 127709599 127709779 + 2.33333 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 342714 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 435.333-6 chr7 45368262 45368577 + 2.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -205721 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 366.666-4 chr15 70648954 70649256 + 2.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 13856 NR_126482 104548973 NR_126482 ENSG00000280515 SALRNA2 SAL-RNA2|XLOC_025931 senescence associated long non-coding RNA 2 ncRNA 474.666-2 chr14 35679748 35680333 + 2.33333 NA intron (NM_014990, intron 20 of 40) intron (NM_014990, intron 20 of 40) 82891 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 248-7 chr10 25827619 25827762 + 2.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 106020 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 466-8 chr8 126548925 126549196 + 2.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 9418 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 410.666-2 chr10 56933697 56933906 + 2.33333 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 370758 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 343-8 chr17 69944545 69944802 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -17034 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 359.666 chr10 102165148 102165385 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 12877 NM_001284389 9221 Hs.523238 NM_004741 ENSG00000166197 NOLC1 NOPP130|NOPP140|NS5ATP13|P130 nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 protein-coding 499.666 chr12 7167092 7167644 + 2.33333 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -21317 NM_001351124 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 479.666-2 chr17 63404401 63404706 + 2.33333 NA intron (NM_025185, intron 18 of 25) intron (NM_025185, intron 18 of 25) 35714 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 337.333-6 chr11 5977688 5977867 + 2.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 9208 NM_001005173 338751 Hs.553703 NM_001005173 ENSG00000183313 OR52L1 OR11-50 olfactory receptor family 52 subfamily L member 1 protein-coding 619.999 chr14 27916724 27917159 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -243720 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 327.333-14 chr14 27899974 27900148 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -226840 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 413-8 chr2 156890311 156890568 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -367266 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 503-4 chr7 7475503 7475921 + 2.33333 NA intron (NM_001037763, intron 14 of 34) intron (NM_001037763, intron 14 of 34) 60161 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 387.667-4 chr12 59702351 59702768 + 2.33333 NA intron (NR_073055, intron 1 of 6) intron (NR_073055, intron 1 of 6) 13189 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 339.999-4 chr13 40126226 40126420 + 2.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -55486 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 383.999-3 chr2 153849262 153849525 + 2.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -22529 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 411.333-17 chr7 5224753 5224984 + 2.33333 NA intron (NM_016003, intron 7 of 11) LTR8|LTR|ERV1 10599 NM_001033520 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 395.333 chr1 39208163 39208410 + 2.33333 NA intron (NM_012090, intron 1 of 92) intron (NM_012090, intron 1 of 92) 124119 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 308.666-21 chr8 118038255 118038489 + 2.33333 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 73447 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 419-10 chr8 141830674 141830964 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -44506 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 293.666-11 chr6 129473704 129473930 + 2.33333 NA intron (NM_001079823, intron 52 of 63) intron (NM_001079823, intron 52 of 63) 236360 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 290-9 chr10 32579824 32580104 + 2.33333 NA intron (NM_001321115, intron 17 of 43) intron (NM_001321115, intron 17 of 43) 133824 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 412.667 chr1 87085256 87085629 + 2.33333 NA intron (NM_012262, intron 3 of 6) intron (NM_012262, intron 3 of 6) -44323 NR_026989 339524 Hs.306423 NM_207357 ENSG00000267272 LINC01140 - long intergenic non-protein coding RNA 1140 ncRNA 338-2 chr1 90162904 90163127 + 2.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 167905 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 355.999 chr1 236592441 236592677 + 2.33333 NA exon (NM_018072, exon 10 of 45) exon (NM_018072, exon 10 of 45) 11957 NM_018072 55127 Hs.708114 NM_018072 ENSG00000119285 HEATR1 BAP28|UTP10 HEAT repeat containing 1 protein-coding 543 chr12 18183296 18183764 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -78010 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 379.666-9 chr18 55094480 55094651 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 29741 NR_110743 101927229 Hs.638474 NR_110743 ENSG00000267013 LINC01929 - long intergenic non-protein coding RNA 1929 ncRNA 295.667-33 chr7 137854145 137854343 + 2.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -7380 NM_001321708 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 389.333-9 chr2 108128655 108128940 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -76042 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 352-6 chr10 64402590 64402808 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -422829 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 369.333-13 chr2 165178756 165178918 + 2.33333 NA intron (NM_006922, intron 2 of 27) intron (NM_006922, intron 2 of 27) 25213 NM_006922 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 348.333-4 chr1 197384506 197384701 + 2.33333 NA intron (NM_001193640, intron 3 of 9) intron (NM_001193640, intron 3 of 9) 116351 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 345.333-38 chr7 130032994 130033178 + 2.33333 NA intron (NM_016478, intron 4 of 9) AluJb|SINE|Alu 18299 NM_001363701 51530 Hs.194157 NM_016478 ENSG00000091732 ZC3HC1 HSPC216|NIPA zinc finger C3HC-type containing 1 protein-coding 396.999-4 chr4 79803662 79803979 + 2.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -23651 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 362.333-13 chr6 36052845 36053132 + 2.33333 NA intron (NM_139012, intron 2 of 11) intron (NM_139012, intron 2 of 11) 25180 NM_139013 1432 Hs.485233 NM_001315 ENSG00000112062 MAPK14 CSBP|CSBP1|CSBP2|CSPB1|EXIP|Mxi2|PRKM14|PRKM15|RK|SAPK2A|p38|p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 protein-coding 349.999 chr12 114466166 114466392 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -57837 NM_000192 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 413.666 chr1 8257028 8257266 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 48475 NR_125998 102724539 Hs.516816 NR_125998 ENSG00000227634 LINC01714 - long intergenic non-protein coding RNA 1714 ncRNA 442-2 chr10 33686737 33687115 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 85754 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 365.666 chr1 27928734 27928990 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -6093 NM_001009568 27293 Hs.123659 NM_014474 ENSG00000130768 SMPDL3B ASML3B sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3B protein-coding 424.333-2 chr14 64049550 64049848 + 2.33333 NA exon (NM_182914, exon 47 of 116) exon (NM_182914, exon 47 of 116) 45426 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 378.333-8 chr21 26912179 26912370 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -41687 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 327.666-13 chr8 137710840 137711019 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -297341 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 482.333-3 chr2 126675983 126676380 + 2.33333 NA intron (NM_016815, intron 1 of 2) intron (NM_016815, intron 1 of 2) 20023 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 347.334-10 chr7 40736815 40737070 + 2.33333 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) L1ME3E|LINE|L1 242997 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 447.999 chr17 81629224 81629520 + 2.33333 NA intron (NM_001369698, intron 2 of 16) AluSg7|SINE|Alu 7740 NM_017921 55666 Hs.464333 NM_017921 ENSG00000182446 NPLOC4 NPL4 NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor protein-coding 371-18 chr7 109982327 109982507 + 2.33333 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -22204 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 351.333-13 chr17 69783075 69783489 + 2.33333 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1MA6|LINE|L1 -178425 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 381.333-13 chr2 177743179 177743353 + 2.33333 NA intron (NM_001077197, intron 11 of 20) intron (NM_001077197, intron 11 of 20) 69944 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 453.333-5 chr5 110410565 110410999 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 103133 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 548.334-2 chr18 22994934 22995423 + 2.33333 NA intron (NM_002894, intron 12 of 18) L1MEd|LINE|L1 61302 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 235.333-58 chr2 66687475 66687628 + 2.33333 NA intron (NR_110156, intron 4 of 5) intron (NR_110156, intron 4 of 5) 15676 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 646.666-2 chr17 66185605 66185912 + 2.33333 NA intron (NM_001353129, intron 1 of 26) intron (NM_001353129, intron 1 of 26) 6134 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 518 chr14 64451525 64451921 + 2.33333 NA intron (NM_001304508, intron 2 of 2) intron (NM_001304508, intron 2 of 2) -13776 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 510.333 chr1 95822819 95823131 + 2.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -169093 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 292-55 chr8 54831734 54831885 + 2.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 215713 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 366.666-3 chr14 34330443 34330636 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 131701 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 305.333-60 chr6 17468603 17468767 + 2.33333 NA intron (NM_001363533, intron 4 of 9) LTR83|LTR|ERVL 42580 NR_110855 101928491 Hs.622876 NR_110855 LOC101928491 - uncharacterized LOC101928491 ncRNA 422-11 chr8 125364287 125364596 + 2.33333 NA intron (NM_001349486, intron 7 of 7) intron (NM_001349486, intron 7 of 7) -65917 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 406.333-18 chrX 126112004 126112333 + 2.33333 NA intron (NR_110409, intron 2 of 2) MER66D|LTR|ERV1 2406 NR_110409 101928495 Hs.545998 NR_110409 ENSG00000237208 LOC101928495 - uncharacterized LOC101928495 ncRNA 408.333-7 chr2 186904532 186904805 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -55498 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 336-12 chr2 56313088 56313246 + 2.33333 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -127397 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 314.333-5 chr10 107192048 107192210 + 2.33333 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -27423 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 309-33 chr6 152349015 152349240 + 2.33333 NA intron (NM_033071, intron 71 of 145) intron (NM_033071, intron 71 of 145) -31403 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 455.667-4 chr11 55553046 55553417 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -1038 NM_001001920 81309 NM_001001920 ENSG00000181939 OR4C15 OR11-127|OR11-134 olfactory receptor family 4 subfamily C member 15 protein-coding 444-5 chr5 177029528 177029823 + 2.33333 NA intron (NM_001308213, intron 2 of 8) MER50|LTR|ERV1 6979 NM_001308218 23567 Hs.484259 NM_012279 ENSG00000113761 ZNF346 JAZ|Zfp346 zinc finger protein 346 protein-coding 370.666-13 chr4 85000515 85000789 + 2.33333 NA intron (NR_152782, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR 33168 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 488-7 chr8 119060370 119060709 + 2.33333 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) HAL1|LINE|L1 -6708 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 400.333-14 chr4 92717209 92717428 + 2.33333 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 412919 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 339.333-24 chr2 145046694 145046945 + 2.33333 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) L2|LINE|L2 378852 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 753.999 chr20 38516226 38516914 + 2.33333 NA promoter-TSS (NR_039605) promoter-TSS (NR_039605) 7 NR_039605 100616190 NR_039605 ENSG00000275453 MIR548O2 - microRNA 548o-2 ncRNA 287.999 chr14 61048736 61048891 + 2.33333 NA intron (NR_033344, intron 12 of 16) intron (NR_033344, intron 12 of 16) -67123 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 600.667-4 chr6 48009983 48010447 + 2.33333 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) intron (NM_207499, intron 1 of 2) 58474 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 487.667-3 chr8 131394853 131395252 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -354143 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 369.666-8 chr20 3294466 3294785 + 2.33333 NA exon (NM_001009984, exon 24 of 37) exon (NM_001009984, exon 24 of 37) -55435 NM_001363745 83959 Hs.105607 NM_032034 ENSG00000088836 SLC4A11 BTR1|CDPD1|CHED|CHED2|NABC1|dJ794I6.2 solute carrier family 4 member 11 protein-coding 337.666-10 chr7 12410935 12411136 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -7094 NM_001346972 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 322.667-24 chr5 124281760 124281948 + 2.33333 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 156666 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 379.999-7 chr3 89393976 89394329 + 2.33333 NA intron (NM_182644, intron 5 of 6) AluJb|SINE|Alu 286531 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 747.999 chr5 87336176 87336688 + 2.33333 NA intron (NM_022650, intron 4 of 24) intron (NM_022650, intron 4 of 24) -12804 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 396-4 chr14 45153235 45153411 + 2.33333 NA intron (NM_001308133, intron 4 of 21) MIR|SINE|MIR 17384 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 411.666-8 chr6 146564613 146564988 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 20967 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 482.999-2 chr2 141744775 141745114 + 2.33333 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) L1MA3|LINE|L1 386757 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 356.334-2 chr11 40802566 40802829 + 2.33333 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) HAL1|LINE|L1 -509567 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 444.666-3 chr19 3562608 3562879 + 2.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -5157 NM_174983 126321 Hs.656901 NM_021731 ENSG00000161091 MFSD12 C19orf28|PP3501 major facilitator superfamily domain containing 12 protein-coding 449.667-5 chr5 18497830 18498238 + 2.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 690760 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 502.667 chr11 123814685 123815074 + 2.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -8530 NM_001005325 390261 Hs.557924 NM_001005325 ENSG00000196099 OR6M1 OR11-271 olfactory receptor family 6 subfamily M member 1 protein-coding 292.333-48 chrX 49787439 49787689 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -41696 NM_001318877 9506 Hs.441038 NM_007003 ENSG00000101951 PAGE4 CT16.7|GAGE-9|GAGEC1|JM-27|JM27|PAGE-1|PAGE-4 PAGE family member 4 protein-coding 477.999 chr15 96950033 96950384 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 166773 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 384-19 chr8 77731109 77731449 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 280582 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 351-10 chr17 66255689 66255999 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -26429 NM_000042 350 Hs.445358 NM_000042 ENSG00000091583 APOH B2G1|B2GP1|BG apolipoprotein H protein-coding 388.333-8 chr15 58125185 58125493 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -12830 NM_001320636 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 431-14 chr6 53921432 53921930 + 2.33333 NA intron (NM_018214, intron 13 of 13) intron (NM_018214, intron 13 of 13) -8301 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 462.666-2 chr12 62535495 62535734 + 2.33333 NA exon (NM_001278471, exon 14 of 34) exon (NM_001278471, exon 14 of 34) 67820 NR_121682 283416 Hs.375881 NM_175895 ENSG00000221949 LINC01465 C12orf61 long intergenic non-protein coding RNA 1465 ncRNA 327.333-41 chr6 159559849 159560022 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 133306 NM_000636 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 319.666-9 chr15 67010317 67010481 + 2.33333 NA intron (NR_135686, intron 2 of 5) intron (NR_135686, intron 2 of 5) 53783 NR_135686 102723493 Hs.419760 NR_135686 LOC102723493 - uncharacterized LOC102723493 ncRNA 361.666-8 chr7 30705404 30705687 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -5442 NM_001202475 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 356-38 chr9 103743019 103743335 + 2.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -256532 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 401.333-2 chr1 67603597 67603810 + 2.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -81498 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 481.667-6 chr3 111406618 111406907 + 2.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -135435 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 458-4 chr3 149721750 149722151 + 2.33333 NA intron (NM_001348362, intron 2 of 9) L1MB3|LINE|L1 2838 NM_001348362 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 403.333-9 chr3 27844851 27845078 + 2.33333 NA intron (NR_146630, intron 3 of 4) intron (NR_146630, intron 3 of 4) -10828 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 399.333-5 chr10 121320535 121320965 + 2.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 210564 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 354-21 chr6 56732633 56732843 + 2.33333 NA intron (NM_001144770, intron 3 of 94) intron (NM_001144770, intron 3 of 94) -89849 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 441.333-4 chr2 99800480 99800699 + 2.33333 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) L1ME1|LINE|L1 304994 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 403.333-3 chr18 4295888 4296100 + 2.33333 NA TTS (NR_036489) TTS (NR_036489) 31392 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 393-13 chr5 65895929 65896220 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -30480 NM_001006600 55914 Hs.591774 NM_018695 ENSG00000112851 ERBIN ERBB2IP|HEL-S-78|LAP2 erbb2 interacting protein protein-coding 300.334-7 chr2 202540460 202540662 + 2.33333 NA intron (NM_001204, intron 9 of 12) intron (NM_001204, intron 9 of 12) -94408 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 453.666-2 chr2 201513262 201513598 + 2.33333 NA intron (NM_001168216, intron 11 of 12) L1PA16|LINE|L1 61690 NM_018571 55437 Hs.652338 NM_018571 ENSG00000082146 STRADB ALS2CR2|CALS-21|ILPIP|ILPIPA|PAPK|PRO1038 STE20 related adaptor beta protein-coding 344.666-10 chr16 85972089 85972388 + 2.33333 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 53891 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 319.667-25 chr4 58556810 58557032 + 2.33333 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -20593 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 403.666 chr20 5981519 5981723 + 2.33333 NA intron (NM_182802, intron 13 of 18) HAL1b|LINE|L1 24200 NR_110101 101929225 Hs.635771 NR_110101 ENSG00000278719 MCM8-AS1 - MCM8 antisense RNA 1 ncRNA 346.334-3 chr12 32476815 32477093 + 2.33333 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) intron (NM_001370298, intron 1 of 16) -9018 NM_001330374 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 420.666-10 chr8 81711745 81712022 + 2.33333 NA intron (NR_033193, intron 5 of 7) L1MEi|LINE|L1 9417 NM_024699 79752 Hs.655453 NM_024699 ENSG00000104231 ZFAND1 - zinc finger AN1-type containing 1 protein-coding 371.667-8 chr4 167023531 167023878 + 2.33333 NA intron (NM_001204354, intron 2 of 9) intron (NM_001204354, intron 2 of 9) 210722 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 376.333-5 chr17 55835236 55835436 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 84231 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 749 chr1 87255125 87255634 + 2.33333 NA Intergenic MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 42710 NM_001290053 101927844 Hs.694591 NM_001290053 LINC02801 - long intergenic non-protein coding RNA 2801 protein-coding 369.666 chr11 20795419 20795676 + 2.33333 NA intron (NM_001288714, intron 3 of 18) intron (NM_001288714, intron 3 of 18) 125961 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 256.333-89 chr9 33320555 33320757 + 2.33333 NA intron (NM_002504, intron 9 of 23) intron (NM_002504, intron 9 of 23) 30140 NM_002504 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 216-46 chr17 69018609 69018788 + 2.33333 NA TTS (NR_126414) TTS (NR_126414) 13984 NR_126414 104355297 Hs.569827 NR_126414 ENSG00000231749 ABCA9-AS1 - ABCA9 antisense RNA 1 ncRNA 467-4 chr9 24699687 24699963 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -153928 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 594.333 chr11 13403581 13403996 + 2.33333 NA intron (NM_032320, intron 7 of 8) intron (NM_032320, intron 7 of 8) 36491 NM_001297742 84280 Hs.332382 NM_032320 ENSG00000148925 BTBD10 GMRP-1|GMRP1 BTB domain containing 10 protein-coding 507.666 chr10 114470449 114470696 + 2.33333 NA intron (NM_001352440, intron 10 of 20) intron (NM_001352440, intron 10 of 20) 56341 NM_001322898 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 359.333-13 chr2 125823663 125823899 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 294204 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 224.667-71 chr7 35030032 35030185 + 2.33333 NA intron (NM_015283, intron 1 of 21) intron (NM_015283, intron 1 of 21) 7377 NM_001366673 23333 Hs.408623 NM_015283 ENSG00000173852 DPY19L1 - dpy-19 like C-mannosyltransferase 1 protein-coding 405-6 chr2 50211553 50211781 + 2.33333 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 136087 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 402.333-4 chr15 65611606 65611850 + 2.33333 NA promoter-TSS (NM_001136043) promoter-TSS (NM_001136043) 378 NM_001301033 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 458.666 chr12 97039218 97039444 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 131865 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 348-3 chr10 27820449 27820690 + 2.33333 NA intron (NM_018076, intron 19 of 19) intron (NM_018076, intron 19 of 19) -74750 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 351-20 chr8 89271829 89272013 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 485790 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 304.333-26 chr4 179039695 179039843 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1131833 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 504.666-4 chr16 34593240 34593686 + 2.33333 NA Intergenic (GATTCCATTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -211983 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 358.333-23 chr7 79998282 79998469 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -136456 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 469.333-2 chr14 51245311 51245705 + 2.33333 NA intron (NM_030755, intron 3 of 7) intron (NM_030755, intron 3 of 7) 5261 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 419.333-9 chr3 100063899 100064092 + 2.33333 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 50518 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 370.999-4 chr8 32515009 32515320 + 2.33333 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) L1PA16|LINE|L1 -33046 NM_013958 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 440.333-5 chr2 71112699 71113064 + 2.33333 NA intron (NM_032601, intron 2 of 2) L1MDa|LINE|L1 17348 NM_032601 84693 Hs.94949 NM_032601 ENSG00000124370 MCEE GLOD2 methylmalonyl-CoA epimerase protein-coding 258.333-37 chr20 14041175 14041429 + 2.33333 NA intron (NM_001351663, intron 2 of 17) intron (NM_001351663, intron 2 of 17) 45786 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 397.999-2 chr13 87249420 87249668 + 2.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 337624 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 460-3 chr16 4535932 4536236 + 2.33333 NA intron (NM_001199055, intron 1 of 5) intron (NM_001199055, intron 1 of 5) 2345 NM_001199054 29965 Hs.654653 NM_013399 ENSG00000089486 CDIP1 C16orf5|CDIP|I1|LITAFL cell death inducing p53 target 1 protein-coding 472.999 chr12 12573205 12573451 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -10465 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 430.333-3 chr14 86531802 86532098 + 2.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -373828 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 389.333-8 chr17 77098820 77099044 + 2.33333 NA intron (NM_001204410, intron 2 of 17) intron (NM_001204410, intron 2 of 17) 9515 NR_106997 102466864 NR_106997 ENSG00000284250 MIR6516 hsa-mir-6516 microRNA 6516 ncRNA 428.333-7 chr9 97560429 97560615 + 2.33333 NA intron (NM_001166116, intron 4 of 9) AluSg7|SINE|Alu 58856 NM_003275 7111 Hs.404289 NM_003275 ENSG00000136842 TMOD1 D9S57E|ETMOD|TMOD tropomodulin 1 protein-coding 492.999 chr5 45107810 45108244 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 299080 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 632 chr14 99487168 99487526 + 2.33333 NA intron (NM_001099402, intron 1 of 10) MER20|DNA|hAT-Charlie 5938 NM_001099402 8812 Hs.510409 NM_003858 ENSG00000090061 CCNK CPR4|IDDHDF cyclin K protein-coding 354.334-9 chr7 33677966 33678245 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -226810 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 286.334-5 chr18 7550287 7550490 + 2.33333 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 -16928 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 363.999-2 chr11 76558682 76558991 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 111102 NM_001370188 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 352.666-4 chr10 106784956 106785237 + 2.33333 NA intron (NM_001206569, intron 3 of 25) LTR48B|LTR|ERV1 379610 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 372.333-3 chr12 31546986 31547185 + 2.33333 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) intron (NM_001308339, intron 1 of 22) -42838 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 661.001 chr10 73136058 73136647 + 2.33333 NA intron (NM_007265, intron 13 of 13) MER4D|LTR|ERV1 -10145 NR_145776 109617000 NR_145776 ENSG00000221164 SNORA11F - small nucleolar RNA, H/ACA box 11F snoRNA 521.666 chr3 16750842 16751122 + 2.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -133973 NM_001144382 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 340.666-12 chr20 4434542 4434812 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -185390 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 340.333-10 chr2 73731656 73731895 + 2.33333 NA intron (NM_001330392, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 5486 NM_001330388 51002 Hs.157401 NM_016058 ENSG00000144034 TPRKB CGI-121|CGI121|GAMOS5 TP53RK binding protein protein-coding 493.333 chr2 120029396 120029741 + 2.33333 NA intron (NM_001330307, intron 2 of 16) HUERS-P1-int|LTR|ERV1 16491 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 350.667-11 chr5 89015120 89015412 + 2.33333 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) intron (NR_136221, intron 3 of 6) -111161 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 335-22 chr4 75344887 75345090 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9088 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 339-13 chr4 111429343 111429497 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -568773 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 361.999-5 chr18 67635590 67635905 + 2.33333 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) -119027 NM_032160 92126 Hs.124673 NM_032160 ENSG00000171451 DSEL C18orf4|DE-epi2 dermatan sulfate epimerase like protein-coding 349.666-13 chr7 138148102 138148274 + 2.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 24430 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 274.333-69 chr8 109956988 109957294 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 18630 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 388-3 chr10 92776744 92776976 + 2.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -49971 NM_001013848 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 369.666-6 chr18 13376372 13376565 + 2.33333 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 51066 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 533.666 chr14 59850951 59851455 + 2.33333 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 19573 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 521.666-2 chr8 118611305 118611895 + 2.33333 NA intron (NR_109794, intron 1 of 4) intron (NR_109794, intron 1 of 4) -9401 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 373.333-21 chr5 36618580 36618769 + 2.33333 NA intron (NM_001289939, intron 2 of 8) intron (NM_001289939, intron 2 of 8) 12068 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 357.667-6 chr3 177741593 177741813 + 2.33333 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -75162 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 372.333-20 chr5 51084 51325 + 2.33333 NA Intergenic CpG -40964 NM_052909 153478 Hs.535800 NM_052909 ENSG00000153404 PLEKHG4B - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G4B protein-coding 388.333 chr1 28483248 28483445 + 2.33333 NA intron (NM_023923, intron 8 of 12) AluJb|SINE|Alu -22597 NR_002909 8420 Hs.469723 NR_002909 ENSG00000242125 SNHG3 NCRNA00014|RNU17C|RNU17D|U17HG|U17HG-A|U17HG-AB small nucleolar RNA host gene 3 ncRNA 276.333-38 chr3 109576834 109577059 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -25882 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 405.333-8 chr7 30592507 30592897 + 2.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -2033 NM_001316772 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 362.333-15 chr7 44486645 44486898 + 2.33333 NA intron (NM_015332, intron 1 of 5) intron (NM_015332, intron 1 of 5) 3887 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 368.666-10 chr18 8679466 8679643 + 2.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 28067 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 501.333-3 chr10 49362028 49362483 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 33834 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 417.333-4 chr2 63597389 63597666 + 2.33333 NA exon (NM_001199112, exon 3 of 8) exon (NM_001199112, exon 3 of 8) 8376 NM_001199112 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 356-25 chr4 66880255 66880477 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 541634 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 215.667-85 chr3 107932314 107932485 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 49194 NR_015394 285205 Hs.134882 NR_015394 ENSG00000240423 LINC00636 - long intergenic non-protein coding RNA 636 ncRNA 499.999 chr3 51296071 51296390 + 2.33333 NA intron (NM_004947, intron 27 of 52) L1M4|LINE|L1 -89061 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 331-7 chr11 26612456 26612729 + 2.33333 NA intron (NM_031418, intron 17 of 26) L1MA6|LINE|L1 -40329 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 411.333-16 chr5 20047704 20047946 + 2.33333 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -59625 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 307-39 chrX 72990267 72990513 + 2.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 12466 NR_110398 101928345 Hs.584657 NR_110398 ENSG00000226725 PABPC1L2B-AS1 - PABPC1L2B antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 317.999-5 chr16 59802817 59802969 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -47702 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 448.666 chr14 36629990 36630267 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -27440 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 325-11 chr15 94045906 94046078 + 2.33333 NA intron (NR_120320, intron 2 of 8) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 61946 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 370.666-16 chr5 27569181 27569402 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 96999 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 397.666-5 chr22 35277997 35278206 + 2.33333 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) L1MC1|LINE|L1 20608 NM_001003681 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 503.333-8 chr9 37074601 37074974 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -5109 NR_036592 100506710 Hs.446271 NR_036592 ENSG00000281649 EBLN3P EBLN3 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 3, pseudogene pseudo 333.333-37 chr3 87299907 87300085 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -23412 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 312.333-8 chr18 3600512 3600731 + 2.33333 NA intron (NM_001242761, intron 7 of 11) intron (NM_001242761, intron 7 of 11) -3116 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 437-5 chr3 170984164 170984493 + 2.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 42392 NM_001278658 6514 Hs.167584 NM_000340 ENSG00000163581 SLC2A2 GLUT2 solute carrier family 2 member 2 protein-coding 367.333-19 chr7 49956763 49956998 + 2.33333 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) L1MD|LINE|L1 136366 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 294.667-12 chr14 63827691 63827869 + 2.33333 NA Intergenic MER51D|LTR|ERV1 -25185 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 866.666 chr7 50110752 50111329 + 2.33333 NA intron (NM_001161834, intron 2 of 8) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 14954 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 487.999-2 chr5 159117246 159117500 + 2.33333 NA non-coding (NR_109890, exon 3 of 3) non-coding (NR_109890, exon 3 of 3) 16890 NR_109890 101927740 Hs.738721 NR_109890 ENSG00000245812 LINC02202 - long intergenic non-protein coding RNA 2202 ncRNA 370.999 chr1 177775619 177775805 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 75188 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 363.333-10 chr15 75916986 75917254 + 2.33333 NA intron (NM_012170, intron 4 of 5) intron (NM_012170, intron 4 of 5) 13242 NM_147188 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 536.333 chr1 83042591 83043152 + 2.33333 NA intron (NR_147074, intron 5 of 10) intron (NR_147074, intron 5 of 10) -56663 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 729.001 chr16 53544190 53544695 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -41138 NM_001012398 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 462-13 chr2 103698496 103699019 + 2.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 709575 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 312.667-35 chr6 111755731 111755886 + 2.33333 NA intron (NM_153047, intron 3 of 13) L1ME4a|LINE|L1 3323 NM_153048 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 363.001-2 chr10 4502829 4503123 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 96507 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 319.666-13 chr5 92638896 92639076 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 932357 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 377.666-8 chr2 19423253 19423477 + 2.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -64742 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 492.333-6 chr8 119446874 119447292 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 30637 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 467-2 chr18 42281649 42281958 + 2.33333 NA intron (NR_046454, intron 3 of 6) intron (NR_046454, intron 3 of 6) 95135 NR_046174 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 366-20 chr5 64344436 64344676 + 2.33333 NA intron (NM_001113561, intron 7 of 7) intron (NM_001113561, intron 7 of 7) -161459 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 599.666 chr2 128155949 128156377 + 2.33333 NA intron (NR_027671, intron 20 of 40) intron (NR_027671, intron 20 of 40) 64963 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 422.333-5 chr5 10703664 10703848 + 2.33333 NA intron (NM_004394, intron 2 of 3) intron (NM_004394, intron 2 of 3) 57478 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 331.333-45 chr7 133832072 133832313 + 2.33333 NA intron (NM_021807, intron 11 of 17) L1MC3|LINE|L1 -7304 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 352.333-21 chr5 106085024 106085206 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 925899 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 527-3 chr9 1320945 1321222 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 269596 NM_001370532 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 440-2 chr12 62156721 62157087 + 2.33333 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 35935 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 482.333 chr12 74904703 74905125 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 304834 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 337.333-2 chr10 21221327 21221472 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 47097 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 337.333-3 chr10 25053262 25053535 + 2.33333 NA intron (NM_001270383, intron 2 of 5) L1MA7|LINE|L1 8881 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 533-2 chr4 60706800 60707246 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -215596 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 340-29 chrX 84643869 84644027 + 2.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -141495 NM_001177479 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 313.666-2 chr10 17906746 17906956 + 2.33333 NA intron (NM_002438, intron 26 of 29) intron (NM_002438, intron 26 of 29) -44988 NM_001282733 221074 Hs.350895 NM_152725 ENSG00000148482 SLC39A12 LZT-Hs8|ZIP-12|bA570F3.1 solute carrier family 39 member 12 protein-coding 362.333-18 chr9 104437746 104437932 + 2.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -66424 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 524.333 chr1 217157851 217158170 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -20308 NM_001243510 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 372.333-13 chr3 120918856 120919104 + 2.33333 NA intron (NR_145517, intron 2 of 8) intron (NR_145517, intron 2 of 8) 10303 NM_001348345 9515 Hs.477315 NM_014980 ENSG00000145087 STXBP5L LLGL4 syntaxin binding protein 5 like protein-coding 504.666-9 chr9 17424344 17424672 + 2.33333 NA intron (NM_001365029, intron 18 of 25) intron (NM_001365029, intron 18 of 25) -154558 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 597.666 chr5 114565516 114565959 + 2.33333 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) intron (NR_130785, intron 3 of 12) -10304 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 357-9 chr2 210093943 210094215 + 2.33333 NA intron (NM_001307976, intron 5 of 13) L1MB3|LINE|L1 64157 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 451.667-5 chr2 75160139 75160531 + 2.33333 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) intron (NM_015727, intron 1 of 3) 39185 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 351.667-18 chr8 124200305 124200674 + 2.33333 NA intron (NR_125420, intron 2 of 2) intron (NR_125420, intron 2 of 2) -28967 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 364.333-27 chr8 120822148 120822375 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -10215 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 236-40 chr2 76320704 76320851 + 2.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -609862 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 384-5 chr13 92491312 92491574 + 2.33333 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 1280 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 198.667-180 chr8 78832655 78832823 + 2.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -4790 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 482.667-4 chrX 44807433 44807803 + 2.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -36403 NM_022076 63904 Hs.534478 NM_022076 ENSG00000189037 DUSP21 LMWDSP21 dual specificity phosphatase 21 protein-coding 400.333-7 chr2 118820894 118821198 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 27137 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 367.333-15 chr22 30450445 30450669 + 2.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 17871 NR_148046 105372990 Hs.565803 NR_148046 LOC105372990 - uncharacterized LOC105372990 ncRNA 355.333-27 chr5 78994747 78994938 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -8884 NM_198709 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 373-9 chr2 153090069 153090316 + 2.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 371555 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 663.666 chr8 135886358 135886939 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 429192 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 322.666-9 chr12 108860860 108861037 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -3365 NM_018984 54434 Hs.199763 NM_018984 ENSG00000084112 SSH1 SSH1L slingshot protein phosphatase 1 protein-coding 492.001-2 chr6 38263233 38263549 + 2.33333 NA intron (NM_052893, intron 9 of 11) intron (NM_052893, intron 9 of 11) -218205 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 533.666-4 chr22 46724191 46724620 + 2.33333 NA intron (NM_022766, intron 1 of 12) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 13847 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 384.334-3 chr14 41277037 41277315 + 2.33333 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 322465 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 499 chr15 100648156 100648600 + 2.33333 NA exon (NM_198243, exon 6 of 6) exon (NM_198243, exon 6 of 6) 45789 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 547.666-3 chr8 112964922 112965379 + 2.33333 NA intron (NM_052900, intron 6 of 68) intron (NM_052900, intron 6 of 68) 321657 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 648.333 chr18 10855816 10856250 + 2.33333 NA intron (NM_022068, intron 6 of 51) intron (NM_022068, intron 6 of 51) -96384 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 257.333-78 chr5 21577659 21577836 + 2.33333 NA intron (NR_027026, intron 4 of 4) intron (NR_027026, intron 4 of 4) 118267 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 226.667-8 chr1 163670926 163671077 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -247810 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 379.333-15 chr9 4022653 4022901 + 2.33333 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) L1ME1|LINE|L1 124131 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 410.667-11 chr3 143467268 143467561 + 2.33333 NA intron (NM_173653, intron 11 of 15) L1MD1|LINE|L1 125168 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 452-4 chr18 12536929 12537260 + 2.33333 NA intron (NM_020148, intron 3 of 15) intron (NM_020148, intron 3 of 15) 104320 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 335-25 chr5 150275175 150275372 + 2.33333 NA intron (NM_001369025, intron 1 of 17) intron (NM_001369025, intron 1 of 17) 14500 NM_001369025 815 Hs.743976 NM_015981 ENSG00000070808 CAMK2A CAMKA|CaMKIINalpha|MRD53|MRT63 calcium/calmodulin dependent protein kinase II alpha protein-coding 311.667-8 chr16 13191740 13191989 + 2.33333 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 290266 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 360.333-17 chr7 29287479 29287757 + 2.33333 NA intron (NM_001293072, intron 1 of 12) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -78648 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 348-6 chr11 90425488 90425711 + 2.33333 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 130258 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 372.333-5 chr12 42681627 42681798 + 2.33333 NA intron (NR_135026, intron 4 of 4) L1ME4c|LINE|L1 -10504 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 329.333-56 chr7 109589961 109590158 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 370154 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 529.333-2 chr11 127023944 127024395 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 21259 NR_040078 283165 Hs.730461 NM_173579 ENSG00000218109 KIRREL3-AS3 NCRNA00288|PRR10 KIRREL3 antisense RNA 3 ncRNA 364.333 chr1 79517635 79517908 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -511041 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 412.666-2 chr1 102537788 102538000 + 2.33333 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -540660 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 521-5 chr5 65227178 65227516 + 2.33333 NA intron (NR_135689, intron 16 of 25) intron (NR_135689, intron 16 of 25) 254573 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 395.667-2 chr12 112358641 112358964 + 2.33333 NA intron (NM_001109662, intron 1 of 75) intron (NM_001109662, intron 1 of 75) 23629 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 417.999 chr1 88219034 88219375 + 2.33333 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -464940 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 346.333-11 chr14 81615616 81615837 + 2.33333 NA intron (NR_110074, intron 1 of 2) LTR8|LTR|ERV1 7335 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 360.667-7 chr15 56674572 56674921 + 2.33333 NA intron (NM_001002843, intron 12 of 20) intron (NM_001002843, intron 12 of 20) 59340 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 632.666 chr3 56005504 56005881 + 2.33333 NA intron (NR_132749, intron 10 of 17) intron (NR_132749, intron 10 of 17) -153098 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 356.666-17 chr6 88843359 88843553 + 2.33333 NA intron (NM_003800, intron 11 of 15) L1ME3G|LINE|L1 120162 NM_001286428 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 324.333-10 chr11 77713498 77713707 + 2.33333 NA intron (NM_016578, intron 5 of 15) HAL1M8|LINE|L1 -75796 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 334.333-32 chr8 117457370 117457540 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -63258 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 610 chr14 62107722 62108241 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) -9376 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 361.333-24 chr4 186592288 186592503 + 2.33333 NA intron (NM_005245, intron 26 of 26) intron (NM_005245, intron 26 of 26) -36828 NM_005958 4543 Hs.243467 NM_005958 ENSG00000168412 MTNR1A MEL-1A-R|MT1 melatonin receptor 1A protein-coding 390.333-8 chr5 39255520 39255857 + 2.33333 NA intron (NM_001243093, intron 1 of 18) intron (NM_001243093, intron 1 of 18) 14961 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 388-11 chr2 73906903 73907188 + 2.33333 NA intron (NM_001615, intron 3 of 8) intron (NM_001615, intron 3 of 8) 14037 NM_001615 72 Hs.516105 NM_001615 ENSG00000163017 ACTG2 ACT|ACTA3|ACTE|ACTL3|ACTSG|VSCM actin gamma 2, smooth muscle protein-coding 341-20 chr3 98413443 98413660 + 2.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 22885 NM_001005516 403277 Hs.554709 NM_001005516 ENSG00000206536 OR5K3 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 3 protein-coding 360.666-11 chr3 112730331 112730547 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -6650 NR_162092 113218483 NR_162092 MIR9900 - microRNA 9900 ncRNA 342.666-9 chr14 80842430 80842605 + 2.33333 NA intron (NM_152446, intron 9 of 24) intron (NM_152446, intron 9 of 24) 99221 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 678.332 chr8 24583822 24584277 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -35431 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 339.333-18 chr16 80541919 80542101 + 2.33333 NA intron (NR_130943, intron 1 of 4) MER113|DNA|hAT-Charlie 1017 NR_130943 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 393-4 chr18 13957338 13957734 + 2.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -41829 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 418.333-13 chr8 50596415 50596779 + 2.33333 NA intron (NR_135797, intron 15 of 20) L1MC|LINE|L1 432466 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 307-14 chr2 140961826 140962024 + 2.33333 NA intron (NM_018557, intron 18 of 90) HAL1|LINE|L1 -375240 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 431.333-3 chr14 74132457 74133057 + 2.33333 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) AluSc|SINE|Alu 47804 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 443.333-2 chr11 3783917 3784205 + 2.33333 NA intron (NR_157590, intron 1 of 31) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 13485 NR_157591 4928 Hs.524750 NM_005387 ENSG00000110713 NUP98 ADIR2|NUP196|NUP96 nucleoporin 98 protein-coding 423.667-3 chr10 51251850 51252075 + 2.33333 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -47611 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 428-2 chr10 121319227 121319527 + 2.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 211937 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 404.666-3 chr12 44837986 44838169 + 2.33333 NA intron (NM_006159, intron 3 of 20) intron (NM_006159, intron 3 of 20) 37584 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 347.333-32 chr9 102236541 102236741 + 2.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -282996 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 469.999-2 chr1 113732613 113732925 + 2.33333 NA intron (NM_001323046, intron 3 of 15) intron (NM_001323046, intron 3 of 15) 26386 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 359.666-2 chr11 113746846 113747267 + 2.33333 NA intron (NM_004724, intron 9 of 15) intron (NM_004724, intron 9 of 15) 26636 NM_004724 9183 Hs.503886 NM_004724 ENSG00000086827 ZW10 HZW10|KNTC1AP zw10 kinetochore protein protein-coding 369.667-5 chr14 59760069 59760375 + 2.33333 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) L1ME4b|LINE|L1 110554 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 406.333-7 chr2 29293527 29293845 + 2.33333 NA intron (NM_004304, intron 9 of 28) intron (NM_004304, intron 9 of 28) -69786 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 600.667 chr12 88634851 88635193 + 2.33333 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL -54549 NM_003994 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 346-35 chr7 14938416 14938645 + 2.33333 NA intron (NM_001350717, intron 1 of 24) intron (NM_001350717, intron 1 of 24) -34874 NM_001350705 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 478.333-2 chr2 83184857 83185168 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 328209 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 358.333-17 chr2 150132174 150132382 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 124729 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 618-3 chr6 61254317 61254828 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -319558 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 382.334-8 chr2 61147379 61147676 + 2.33333 NA intron (NM_001316317, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 2411 NM_001367069 339804 Hs.140617 NM_001143959 ENSG00000237651 C2orf74 - chromosome 2 open reading frame 74 protein-coding 371.666-10 chr3 126194252 126194579 + 2.33333 NA intron (NR_046383, intron 1 of 1) MER57-int|LTR|ERV1 -13229 NM_001270364 10840 Hs.434435 NM_012190 ENSG00000144908 ALDH1L1 10-FTHFDH|10-fTHF|FDH|FTHFD aldehyde dehydrogenase 1 family member L1 protein-coding 313-6 chr10 110774621 110774862 + 2.33333 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) MIR3|SINE|MIR 96163 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 426.667 chr12 4010167 4010510 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -136890 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 275-4 chr10 62967652 62967856 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -148587 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 393.667-3 chr11 34092019 34092257 + 2.33333 NA intron (NM_005898, intron 15 of 18) intron (NM_005898, intron 15 of 18) -13491 NM_024662 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 419.667-5 chr5 37006879 37007277 + 2.33333 NA intron (NM_015384, intron 17 of 45) intron (NM_015384, intron 17 of 45) 130309 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 494-2 chr14 53051259 53051637 + 2.33333 NA intron (NM_030637, intron 11 of 11) intron (NM_030637, intron 11 of 11) -100351 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 331-33 chr5 124347651 124347891 + 2.33333 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 90749 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 319.666-6 chr14 45030259 45030410 + 2.33333 NA intron (NR_131765, intron 10 of 19) intron (NR_131765, intron 10 of 19) -53782 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 462.667-8 chr5 122546122 122546443 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 38318 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 372.666-4 chr13 102322919 102323138 + 2.33333 NA intron (NM_001321941, intron 1 of 5) intron (NM_001321941, intron 1 of 5) -5324 NM_001321935 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 452.666-3 chr20 54460892 54461205 + 2.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -14545 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 344-5 chr10 65733153 65733404 + 2.33333 NA intron (NR_120647, intron 4 of 5) LTR1A2|LTR|ERV1 161853 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 424.999-3 chr3 60236649 60236916 + 2.33333 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) L1ME3G|LINE|L1 -155873 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 323.667-24 chr7 30123065 30123295 + 2.33333 NA intron (NM_001350973, intron 13 of 13) intron (NM_001350973, intron 13 of 13) -11806 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 361-6 chr11 109787131 109787449 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -306102 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 385-9 chr3 25555396 25555675 + 2.33333 NA intron (NR_110892, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 97225 NM_001290217 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 459.666-3 chr8 117463238 117463513 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -57338 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 437.999-3 chr15 63461679 63462047 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -42648 NM_001256702 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 342.333-17 chr2 113045111 113045406 + 2.33333 NA intron (NM_173178, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 7609 NM_014438 27177 Hs.278909 NM_014438 ENSG00000136696 IL36B FIL1|FIL1-(ETA)|FIL1H|FILI-(ETA)|IL-1F8|IL-1H2|IL1-ETA|IL1F8|IL1H2 interleukin 36 beta protein-coding 465.666-3 chr7 6619638 6619930 + 2.33333 NA intron (NM_001353546, intron 2 of 2) intron (NM_001353546, intron 2 of 2) 4174 NM_001353546 54753 Hs.592170 NM_017560 ENSG00000236609 ZNF853 - zinc finger protein 853 protein-coding 431.333-6 chr2 112074938 112075234 + 2.33333 NA intron (NM_001329914, intron 5 of 18) intron (NM_001329914, intron 5 of 18) 19817 NM_001329914 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 668.334-2 chr4 42017891 42018396 + 2.33333 NA exon (NM_006345, exon 3 of 18) exon (NM_006345, exon 3 of 18) 27613 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 391-4 chr14 52525802 52526046 + 2.33333 NA intron (NM_020784, intron 6 of 20) MER2|DNA|TcMar-Tigger 26581 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 370.667-26 chr7 93680762 93681023 + 2.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -36036 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 323.333-30 chr7 20290908 20291146 + 2.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -5681 NR_110117 101927769 Hs.256080 NR_110117 ENSG00000226097 LOC101927769 - uncharacterized LOC101927769 ncRNA 366.666-17 chr9 13910759 13911021 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -17081 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 333.333-43 chr6 64107747 64107988 + 2.33333 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) L1MCa|LINE|L1 301031 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 380.999-4 chr7 77180657 77180947 + 2.33333 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) L1MB2|LINE|L1 19017 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 340.666-23 chr9 35435153 35435376 + 2.33333 NA intron (NR_003581, intron 3 of 17) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 28509 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 356.333-4 chr10 43493752 43493985 + 2.33333 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 56757 NM_001355450 642819 Hs.719657 NM_001355444 ENSG00000243660 ZNF487 KRBO1|ZNF487P zinc finger protein 487 protein-coding 363-13 chr5 84094859 84095037 + 2.33333 NA intron (NM_001278642, intron 5 of 9) intron (NM_001278642, intron 5 of 9) 289919 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 376.333-11 chr5 12122443 12122712 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -218131 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 389.999-3 chr6 4121946 4122175 + 2.33333 NA intron (NM_001085401, intron 4 of 5) intron (NM_001085401, intron 4 of 5) 13408 NM_001166010 10455 Hs.15250 NM_006117 ENSG00000198721 ECI2 ACBD2|DRS-1|DRS1|HCA88|PECI|dJ1013A10.3 enoyl-CoA delta isomerase 2 protein-coding 397.999-3 chr7 12238126 12238378 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_018374, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_018374, exon 9 of 9) 26958 NM_001134232 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 371.666-8 chr2 196000138 196000622 + 2.33333 NA intron (NM_018897, intron 12 of 64) intron (NM_018897, intron 12 of 64) 68457 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 508.999 chr1 190507283 190507618 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 28899 NR_110717 101929120 Hs.602301 NR_110716 LINC01351 - long intergenic non-protein coding RNA 1351 ncRNA 435.666-5 chr8 69243211 69243417 + 2.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -139124 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 351.333-28 chr6 65212906 65213150 + 2.33333 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -88390 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 360.666-9 chr18 22695458 22695655 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 91281 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 384.333-8 chr19 51943117 51943285 + 2.33333 NA intron (NM_001031721, intron 5 of 5) L2a|LINE|L2 -5933 NR_103847 101669766 Hs.637744 NR_103847 ENSG00000269235 ZNF350-AS1 HCCAT3|uc002pyc ZNF350 antisense RNA 1 ncRNA 502.999 chr12 41184391 41184771 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -3739 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 372.333-7 chr14 48517554 48517940 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -722733 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 503.666-4 chr6 144754917 144755362 + 2.33333 NA intron (NM_007124, intron 56 of 73) intron (NM_007124, intron 56 of 73) 349484 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 380.666-5 chr16 19079140 19079432 + 2.33333 NA non-coding (NR_163448, exon 6 of 6) non-coding (NR_163448, exon 6 of 6) 10639 NM_001370489 10229 Hs.157113 NM_016138 ENSG00000167186 COQ7 CAT5|CLK-1|CLK1|COQ10D8 coenzyme Q7, hydroxylase protein-coding 364-11 chr17 66349047 66349238 + 2.33333 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 46529 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 512 chr1 44419043 44419481 + 2.33333 NA intron (NM_001319956, intron 2 of 14) intron (NM_001319956, intron 2 of 14) -4739 NM_001319957 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 327 chr1 189438524 189438681 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 1037408 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 646.666-3 chr4 41217159 41217666 + 2.33333 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -2870 NM_173075 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 471.666 chr17 73187287 73187683 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -5570 NM_018714 9382 Hs.103555 NM_018714 ENSG00000166685 COG1 CDG2G|LDLB component of oligomeric golgi complex 1 protein-coding 399.667-10 chr8 123605084 123605436 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 48541 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 311.667-25 chr7 47413517 47413777 + 2.33333 NA intron (NM_022748, intron 12 of 30) intron (NM_022748, intron 12 of 30) 51156 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 359.666-8 chr2 149268622 149268806 + 2.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -61271 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 439.999-2 chr12 26369958 26370175 + 2.33333 NA intron (NM_002223, intron 55 of 56) MER21C|LTR|ERVL 174493 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 433.667-6 chr2 187341291 187341580 + 2.33333 NA TTS (NM_001271751) TTS (NM_001271751) 106817 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 399.667-9 chr6 139897347 139897588 + 2.33333 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 42617 NR_138541 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 293.666-6 chr15 78097127 78097301 + 2.33333 NA intron (NM_001101404, intron 2 of 5) L1ME3|LINE|L1 4629 NM_001101404 646892 Hs.569511 NM_001101404 ENSG00000183476 SH2D7 - SH2 domain containing 7 protein-coding 214.333-151 chr7 146240396 146240506 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -533820 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 202-18 chr10 61702240 61702385 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001366909, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001366909, exon 5 of 5) 39351 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 469.666 chr16 48697807 48698045 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -87746 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 682.666 chr17 4078583 4079070 + 2.33333 NA intron (NM_015113, intron 18 of 54) L2b|LINE|L2 64204 NM_015113 23140 Hs.277624 NM_015113 ENSG00000074755 ZZEF1 ZZZ4 zinc finger ZZ-type and EF-hand domain containing 1 protein-coding 331.333-28 chr20 14061124 14061280 + 2.33333 NA intron (NM_001351663, intron 2 of 17) intron (NM_001351663, intron 2 of 17) 65686 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 312.667-18 chr16 64029350 64029588 + 2.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 1092594 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 322.334-12 chr8 126592771 126593049 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -34432 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 338-14 chr18 27731000 27731250 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 305516 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 464.999 chr2 58842347 58842678 + 2.33333 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 321759 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 363.666-5 chr4 32935399 32935624 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 584473 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 384.999 chr2 181817979 181818246 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -73618 NM_001287503 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 392.333 chr1 241770944 241771159 + 2.33333 NA intron (NM_001367482, intron 18 of 27) intron (NM_001367482, intron 18 of 27) -77140 NM_001319224 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 309.666-3 chr11 11676223 11676426 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -19602 NR_036184 100423026 NR_036184 ENSG00000266645 MIR4299 - microRNA 4299 ncRNA 230.333-87 chr4 144639196 144639362 + 2.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 6740 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 390-16 chr2 241660468 241660779 + 2.33333 NA intron (NM_013325, intron 7 of 12) L1ME4a|LINE|L1 22930 NM_178326 23192 Hs.283610 NM_013325 ENSG00000168397 ATG4B APG4B|AUTL1 autophagy related 4B cysteine peptidase protein-coding 381.333-4 chr13 42938166 42938414 + 2.33333 NA intron (NM_033255, intron 6 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 53951 NM_001330543 94240 Hs.546467 NM_033255 ENSG00000133106 EPSTI1 BRESI1 epithelial stromal interaction 1 protein-coding 434.666-8 chr22 24751583 24751915 + 2.33333 NA intron (NM_001008496, intron 8 of 20) L1MB8|LINE|L1 -12752 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 426.666-3 chr10 74088640 74088935 + 2.33333 NA intron (NM_014000, intron 8 of 21) intron (NM_014000, intron 8 of 21) 62041 NR_135191 26985 Hs.500104 NM_012095 ENSG00000185009 AP3M1 - adaptor related protein complex 3 subunit mu 1 protein-coding 423 chr11 47486969 47487294 + 2.33333 NA intron (NM_198700, intron 3 of 13) intron (NM_198700, intron 3 of 13) 1893 NM_001172640 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 312.666-3 chr11 119552394 119552645 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -127534 NM_001311162 7070 Hs.644697 NM_006288 ENSG00000154096 THY1 CD90|CDw90 Thy-1 cell surface antigen protein-coding 353-19 chr5 125109762 125109929 + 2.33333 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) intron (NR_109882, intron 2 of 5) 73014 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 325.999-5 chr3 131412281 131412529 + 2.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 30631 NR_033268 131870 Hs.282050 NM_152395 ENSG00000198585 NUDT16 - nudix hydrolase 16 protein-coding 309-22 chr21 28949397 28949651 + 2.33333 NA intron (NM_015565, intron 18 of 29) L1MB2|LINE|L1 43353 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 385.333-20 chr3 186316019 186316268 + 2.33333 NA intron (NM_001346, intron 2 of 24) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 46091 NM_001080744 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 424.332 chr3 89409332 89409716 + 2.33333 NA intron (NM_005233, intron 9 of 16) intron (NM_005233, intron 9 of 16) 301903 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 545.333 chr14 56035434 56036071 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -82659 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 408.667-2 chr11 87912140 87912491 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -192904 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 341.333-8 chr13 97313772 97313930 + 2.33333 NA intron (NM_144778, intron 2 of 8) intron (NM_144778, intron 2 of 8) 91518 NM_144778 10150 Hs.657347 NM_144778 ENSG00000139793 MBNL2 MBLL|MBLL39|PRO2032 muscleblind like splicing regulator 2 protein-coding 382.999 chr12 57296251 57296454 + 2.33333 NA intron (NM_001351215, intron 8 of 22) intron (NM_001351215, intron 8 of 22) -45165 NR_104422 246329 Hs.417595 NM_145064 ENSG00000185482 STAC3 MYPBB|NAM SH3 and cysteine rich domain 3 protein-coding 382.667-13 chr8 130600284 130600563 + 2.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -156749 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 283.333-43 chr21 31723561 31723738 + 2.33333 NA intron (NM_020706, intron 1 of 19) MER97d|DNA|hAT-Tip100 8469 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 457.999-2 chr9 124158589 124158882 + 2.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -98871 NM_001166167 10783 Hs.197071 NM_014397 ENSG00000119408 NEK6 SID6-1512 NIMA related kinase 6 protein-coding 361-3 chr11 25548699 25548918 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -640315 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 358.333-7 chr10 115022411 115022654 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 27875 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 821 chr2 82121722 82122382 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -655106 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 469.999-4 chr13 58373297 58373611 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -140337 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 346.333-25 chr4 111363802 111363973 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -503240 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 330.333-6 chr12 8775205 8775356 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001352267, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001352267, exon 6 of 6) -47341 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 480.666-4 chr4 34090044 34090345 + 2.33333 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -50301 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 358.333-16 chr2 128146726 128146919 + 2.33333 NA intron (NR_027671, intron 18 of 40) L1MB7|LINE|L1 55622 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 412.666-10 chr9 91324600 91324904 + 2.33333 NA intron (NM_001306190, intron 3 of 8) intron (NM_001306190, intron 3 of 8) 37172 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 303.666-8 chr2 47355179 47355362 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -10196 NR_110208 101927043 Hs.515976 NR_110207 ENSG00000234690 EPCAM-DT - EPCAM divergent transcript ncRNA 474.666-6 chr6 11465698 11466042 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -71879 NM_001100829 100113407 Hs.146317 NM_001100829 ENSG00000205269 TMEM170B - transmembrane protein 170B protein-coding 336-19 chr3 7217997 7218169 + 2.33333 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) 317201 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 345.999-7 chr8 136277542 136277827 + 2.33333 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -253114 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 372.333-9 chr14 66162033 66162407 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -324151 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 653.667 chr15 60010812 60011453 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 6821 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 326.333-21 chr4 34390445 34390618 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -120784 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 384.333 chr1 111935151 111935412 + 2.33333 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 25624 NR_046619 100873995 Hs.535274 NR_046619 ENSG00000237556 KCND3-AS1 - KCND3 antisense RNA 1 ncRNA 688.666 chr20 9931111 9931621 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -54967 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 317.667-20 chr17 68739392 68739612 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 111348 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 394.666-2 chr12 42230565 42230953 + 2.33333 NA TTS (NM_001190980) TTS (NM_001190980) 7609 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 350-13 chr2 106802911 106803191 + 2.33333 NA non-coding (NR_136313, exon 5 of 5) non-coding (NR_136313, exon 5 of 5) 82977 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 356-36 chr9 31236210 31236491 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 145140 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 264-55 chrX 99950592 99950738 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 459608 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 471 chr10 85086981 85087386 + 2.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 111722 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 404.666-12 chr5 6246150 6246533 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 90951 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 312-57 chr8 72117053 72117190 + 2.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -41537 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 446-8 chr3 43187414 43187701 + 2.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -81478 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 364-7 chr14 69095769 69096168 + 2.33333 NA intron (NM_003861, intron 5 of 8) intron (NM_003861, intron 5 of 8) 56631 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 418-6 chr16 69632703 69633068 + 2.33333 NA intron (NM_138713, intron 3 of 14) intron (NM_138713, intron 3 of 14) 66919 NM_138713 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 371.667-7 chr4 65011636 65011944 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -7290 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 345.333-33 chr5 142284952 142285102 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 33295 NR_131221 100642175 Hs.684549 NR_131221 SPRY4-IT1 SPRIGHTLY SPRY4 intronic transcript 1 ncRNA 388.666-5 chr3 180234875 180235189 + 2.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -179141 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 421.334-5 chr9 16688017 16688411 + 2.33333 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) intron (NM_001317940, intron 2 of 5) -38600 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 362 chr1 24376605 24376819 + 2.33333 NA intron (NM_001199013, intron 5 of 8) intron (NM_001199013, intron 5 of 8) -36775 NM_001322854 57185 Hs.523442 NM_020448 ENSG00000001461 NIPAL3 DJ462O23.2|NPAL3 NIPA like domain containing 3 protein-coding 471-6 chr8 15542094 15542497 + 2.33333 NA intron (NM_001356429, intron 1 of 10) MER4B|LTR|ERV1 2032 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 448.666-2 chr15 61634721 61635147 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -94984 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 403.333-17 chr8 131369094 131369341 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -328308 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 396.333-14 chr9 30141277 30141541 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 267045 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 333.667-11 chr19 50885947 50886212 + 2.33333 NA intron (NR_002948, intron 4 of 4) intron (NR_002948, intron 4 of 4) 10319 NR_002948 606293 Hs.643424 NR_002948 ENSG00000197588 KLKP1 KARMA|KLK31P|KRSP1|PsiKLK1|YKLK1 kallikrein pseudogene 1 pseudo 249.333-28 chr13 100349698 100349842 + 2.33333 NA intron (NR_148031, intron 18 of 22) intron (NR_148031, intron 18 of 22) 131245 NR_047686 100885777 Hs.662554 NR_047686 PCCA-AS1 - PCCA antisense RNA 1 ncRNA 412.333-6 chr2 142474672 142474922 + 2.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -343096 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 452-9 chr4 32501746 32502132 + 2.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 150901 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 383.667-4 chr3 62022705 62022997 + 2.33333 NA intron (NM_002841, intron 4 of 29) intron (NM_002841, intron 4 of 29) 296096 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 314.333-33 chr9 95816936 95817176 + 2.33333 NA intron (NR_023390, intron 2 of 2) intron (NR_023390, intron 2 of 2) -58635 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 438.667-7 chr4 54655803 54656113 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1970 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 393.666 chr1 18176631 18176924 + 2.33333 NA intron (NM_032880, intron 1 of 9) intron (NM_032880, intron 1 of 9) 68979 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 636 chr17 58463479 58464161 + 2.33333 NA intron (NM_001080439, intron 3 of 5) intron (NM_001080439, intron 3 of 5) 24588 NM_001080439 124535 Hs.380061 NM_001080439 ENSG00000176160 HSF5 HSF 5|HSTF 5 heat shock transcription factor 5 protein-coding 441.333-5 chr21 27067163 27067565 + 2.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -100276 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 371.999-6 chrX 94454683 94454965 + 2.33333 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 608402 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 402.666-7 chr17 69178078 69178250 + 2.33333 NA intron (NM_080282, intron 23 of 39) intron (NM_080282, intron 23 of 39) -36269 NM_080284 23460 Hs.709514 NM_080284 ENSG00000154262 ABCA6 EST155051 ATP binding cassette subfamily A member 6 protein-coding 356.333-19 chr20 21916973 21917235 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -136986 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 426.999 chr1 220526131 220526439 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -1851 NM_001286128 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 387.333-11 chr5 159244240 159244441 + 2.33333 NA intron (NR_134261, intron 2 of 2) L1MB7|LINE|L1 16625 NR_134261 105377682 NR_134261 ENSG00000253315 LINC01932 - long intergenic non-protein coding RNA 1932 ncRNA 325-26 chr5 37228422 37228689 + 2.33333 NA intron (NM_023073, intron 9 of 51) L1ME4a|LINE|L1 -20491 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 416.999-3 chr17 63735404 63735674 + 2.33333 NA intron (NR_156741, intron 1 of 11) intron (NR_156741, intron 1 of 11) 6260 NM_001003787 92335 Hs.514402 NM_153335 ENSG00000266173 STRADA LYK5|NY-BR-96|PMSE|STRAD|STRAD alpha|Stlk STE20 related adaptor alpha protein-coding 336.333-16 chr15 68087871 68088103 + 2.33333 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 33411 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 346.667-12 chr5 155917609 155917801 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -409052 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 436.666-5 chr4 6842025 6842380 + 2.33333 NA exon (NM_014743, exon 4 of 10) exon (NM_014743, exon 4 of 10) 59470 NM_001100590 9778 Hs.79276 NM_014743 ENSG00000170871 KIAA0232 - KIAA0232 protein-coding 409.666-5 chr2 96290714 96291024 + 2.33333 NA intron (NM_014014, intron 18 of 44) intron (NM_014014, intron 18 of 44) 14677 NM_014014 23020 Hs.246112 NM_014014 ENSG00000144028 SNRNP200 ASCC3L1|BRR2|HELIC2|RP33|U5-200KD small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200 protein-coding 410-3 chr1 111839428 111839812 + 2.33333 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 17285 NR_046783 100874295 Hs.738190 NR_046783 ENSG00000232558 KCND3-IT1 - KCND3 intronic transcript 1 ncRNA 646.333 chr4 30731411 30731820 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_002589, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_002589, exon 2 of 2) 11246 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 261.333-107 chr8 123841056 123841280 + 2.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -10819 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 411.333-21 chr8 139040648 139041046 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -126806 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 366.333-25 chr8 119411659 119411863 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -4685 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 193.333-168 chr7 49560425 49560623 + 2.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -213114 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 325.333-16 chr18 6810619 6810815 + 2.33333 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -23768 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 260-75 chr7 45538453 45538634 + 2.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -35597 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 363.333-14 chr2 20232572 20232843 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7274 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 500.667-3 chr5 65027370 65027625 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 258567 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 403-4 chr2 188678427 188678643 + 2.33333 NA Intergenic Tigger5|DNA|TcMar-Tigger 111588 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 347.333-31 chr9 31498790 31499031 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -117420 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 300.334-15 chr8 114495639 114495854 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -1058807 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 346-19 chr20 13150255 13150725 + 2.33333 NA intron (NM_001349945, intron 10 of 12) intron (NM_001349945, intron 10 of 12) -70784 NM_080826 140862 Hs.559353 NM_080826 ENSG00000101230 ISM1 C20orf82|ISM|Isthmin|bA149I18.1|dJ1077I2.1 isthmin 1 protein-coding 1015 chr11 37877056 37878251 + 2.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -60948 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 364.666-5 chr17 62055962 62056202 + 2.33333 NA intron (NM_005121, intron 2 of 29) intron (NM_005121, intron 2 of 29) 9196 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 376.667-5 chr14 101988879 101989167 + 2.33333 NA intron (NM_001376, intron 10 of 77) L1MD3|LINE|L1 24450 NM_001376 1778 Hs.614080 NM_001376 ENSG00000197102 DYNC1H1 CMT2O|DHC1|DHC1a|DNCH1|DNCL|DNECL|DYHC|Dnchc1|HL-3|SMALED1|p22 dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1 protein-coding 352.333-7 chr12 22348557 22348756 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -13942 NM_003034 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 340.333-5 chr13 26438594 26438817 + 2.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -118978 NM_006646 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 481.667-3 chr11 114411774 114412193 + 2.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 11317 NM_001286048 10179 Hs.7527 NM_016090 ENSG00000076053 RBM7 - RNA binding motif protein 7 protein-coding 287-4 chr1 217238963 217239172 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -101365 NM_001243510 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 285.667-51 chr8 86663965 86664195 + 2.33333 NA intron (NM_019098, intron 6 of 17) UCON4|Unknown|Unknown 79595 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 381.333-2 chr10 103152525 103152812 + 2.33333 NA intron (NM_001351187, intron 3 of 21) intron (NM_001351187, intron 3 of 21) 1153 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 755.666 chr8 138590222 138590870 + 2.33333 NA intron (NM_152888, intron 64 of 64) (ATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -92816 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 441.999 chr1 113936076 113936279 + 2.33333 NA intron (NM_001369807, intron 1 of 15) intron (NM_001369807, intron 1 of 15) 6333 NM_001369806 204851 Hs.532363 NM_152696 ENSG00000163349 HIPK1 Myak|Nbak2 homeodomain interacting protein kinase 1 protein-coding 343.333-36 chr8 90314272 90314478 + 2.33333 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 92887 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 415.333-9 chr4 114212969 114213171 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -233423 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 206-87 chr2 127949144 127949381 + 2.33333 NA intron (NM_001330303, intron 17 of 19) intron (NM_001330303, intron 17 of 19) -63322 NM_001199140 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 446.666-2 chr17 61466794 61467123 + 2.33333 NA intron (NM_001321120, intron 4 of 8) AluJr|SINE|Alu 10470 NM_018488 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 420.333-9 chr7 9953132 9953366 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 318979 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 347.666-14 chr4 177656379 177656632 + 2.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -72252 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 422 chr1 84171597 84171946 + 2.33333 NA intron (NM_001300915, intron 1 of 11) L1MEd|LINE|L1 7077 NM_001300915 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 272-39 chr5 40951267 40951449 + 2.33333 NA intron (NM_000587, intron 9 of 17) L1PA16|LINE|L1 41861 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 353-17 chr4 73582163 73582358 + 2.33333 NA exon (NM_001270392, exon 6 of 10) exon (NM_001270392, exon 6 of 10) 38176 NM_001270391 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 345.666-5 chr14 55274239 55274417 + 2.33333 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 2174 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 337.666-2 chr1 235624436 235624611 + 2.33333 NA intron (NM_001098721, intron 1 of 3) intron (NM_001098721, intron 1 of 3) 25261 NM_001098722 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 350.333-20 chr5 14372478 14372663 + 2.33333 NA intron (NM_007118, intron 18 of 56) L1MC5a|LINE|L1 -91413 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 323-4 chr1 172807894 172808295 + 2.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 148991 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 503.333-6 chr7 19918037 19918351 + 2.33333 NA TTS (NR_110114) TTS (NR_110114) -144577 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 654.999 chr8 4383985 4384386 + 2.33333 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 610729 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 339-5 chr12 32177495 32177699 + 2.33333 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) intron (NR_148725, intron 1 of 9) 70750 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 424-18 chr9 109811245 109811485 + 2.33333 NA intron (NM_053016, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 31167 NM_053016 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 382.333-18 chr6 79472399 79472625 + 2.33333 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 64918 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 357-7 chr17 3467505 3467749 + 2.33333 NA intron (NM_001321336, intron 2 of 8) intron (NM_001321336, intron 2 of 8) 4120 NM_032598 84690 Hs.351068 NM_032598 ENSG00000141255 SPATA22 NYD-SP20|NYDSP20 spermatogenesis associated 22 protein-coding 372.666-2 chr10 118049366 118049560 + 2.33333 NA intron (NR_026939, intron 1 of 4) intron (NR_026939, intron 1 of 4) -2522 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 385.333-25 chr6 113871872 113872107 + 2.33333 NA intron (NR_038863, intron 1 of 2) intron (NR_038863, intron 1 of 2) 1358 NR_038863 285758 Hs.359399 NR_038863 ENSG00000227502 LINC01268 ROCKI long intergenic non-protein coding RNA 1268 ncRNA 611.332 chr10 8337900 8338264 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -69777 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 425.999-4 chr8 137065014 137065304 + 2.33333 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 348429 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 358.999-2 chr4 110943168 110943337 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -82605 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 519.332 chr8 137429549 137429825 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -16099 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 414-13 chr5 120467128 120467527 + 2.33333 NA intron (NM_001308087, intron 1 of 1) intron (NM_001308087, intron 1 of 1) 1696 NM_001308087 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 462.333-4 chr15 68933153 68933410 + 2.33333 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) intron (NM_001184780, intron 1 of 15) 2756 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 600 chr11 37331373 37331698 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -607066 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 354.666-5 chr14 43902094 43902282 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 605095 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 411.666-7 chr5 12584026 12584328 + 2.33333 NA intron (NR_033383, intron 1 of 3) L1MA2|LINE|L1 9320 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 360.333-3 chr10 87700722 87700900 + 2.33333 NA intron (NM_001015880, intron 1 of 12) intron (NM_001015880, intron 1 of 12) 40933 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 731.333 chr2 145195208 145195749 + 2.33333 NA Intergenic (ATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 527511 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 281-26 chr22 46837436 46837698 + 2.33333 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) L1MA9|LINE|L1 63640 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 384-22 chr8 99289832 99290062 + 2.33333 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 246783 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 556-5 chr22 28197508 28197942 + 2.33333 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -262144 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 337.333-44 chr8 30209194 30209376 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 52916 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 399.667 chr12 40311915 40312355 + 2.33333 NA intron (NM_198578, intron 31 of 50) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -81259 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 355-21 chr3 9671561 9671862 + 2.33333 NA intron (NM_001077525, intron 6 of 18) intron (NM_001077525, intron 6 of 18) 22206 NM_001077526 64419 Hs.475382 NM_022485 ENSG00000163719 MTMR14 C3orf29 myotubularin related protein 14 protein-coding 373.666-2 chr11 12726575 12726845 + 2.33333 NA intron (NM_021961, intron 2 of 12) AluJb|SINE|Alu 52289 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 354.666-10 chr2 133221718 133221968 + 2.33333 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -44352 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 336-22 chr3 138246822 138247100 + 2.33333 NA TTS (NM_014154) TTS (NM_014154) 59430 NM_001267042 25852 Hs.744868 NM_014154 ENSG00000114098 ARMC8 GID5|HSPC056|S863-2|VID28 armadillo repeat containing 8 protein-coding 310.666-6 chr12 64616119 64616315 + 2.33333 NA intron (NR_040718, intron 1 of 3) intron (NR_040718, intron 1 of 3) 5722 NM_178169 283349 Hs.643605 NM_178169 ENSG00000153179 RASSF3 RASSF5 Ras association domain family member 3 protein-coding 250-36 chr2 15874050 15874203 + 2.33333 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -46273 NR_125783 103752554 Hs.269571 NR_125783 ENSG00000223850 MYCNUT MYCNUN|lncUSMycN MYCN upstream transcript ncRNA 703.334 chr11 62547657 62548153 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -1099 NM_001620 79026 Hs.502756 NM_001620 ENSG00000124942 AHNAK AHNAKRS|PM227 AHNAK nucleoprotein protein-coding 473.333-2 chr17 42222386 42222716 + 2.33333 NA intron (NM_012448, intron 5 of 18) FLAM_C|SINE|Alu -28057 NM_001142623 84514 Hs.38039 NM_032484 ENSG00000167925 GHDC D11LGP1|LGP1 GH3 domain containing protein-coding 389.666-9 chr9 33284174 33284485 + 2.33333 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -6187 NM_001318758 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 848.999 chr17 63194321 63195033 + 2.33333 NA intron (NM_025185, intron 5 of 25) L1M5|LINE|L1 228442 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 344.666-5 chr12 111038144 111038304 + 2.33333 NA intron (NM_015267, intron 1 of 21) intron (NM_015267, intron 1 of 21) 4059 NM_015267 23316 Hs.124953 NM_015267 ENSG00000111249 CUX2 CDP2|CUTL2|EIEE67 cut like homeobox 2 protein-coding 358.667-3 chr11 60202965 60203226 + 2.33333 NA intron (NM_001351235, intron 5 of 5) intron (NM_001351235, intron 5 of 5) 6061 NR_106758 102465250 NR_106758 ENSG00000275344 MIR6503 hsa-mir-6503 microRNA 6503 ncRNA 605.999 chr4 67585322 67585875 + 2.33333 NA intron (NM_012108, intron 6 of 8) intron (NM_012108, intron 6 of 8) 26871 NM_001317769 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 467.666-4 chrX 80432770 80433234 + 2.33333 NA intron (NM_152630, intron 1 of 2) LTR25|LTR|ERV1 12555 NM_152630 169966 Hs.367959 NM_152630 ENSG00000174016 TENT5D CT1.26|CT112|FAM46D terminal nucleotidyltransferase 5D protein-coding 487.666-5 chr7 86050202 86050529 + 2.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -593544 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 400.667-13 chr9 75583553 75583906 + 2.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -306915 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 370.999-2 chr10 26298424 26298737 + 2.33333 NA intron (NM_000818, intron 15 of 16) intron (NM_000818, intron 15 of 16) 81806 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 330.666-11 chr2 118092484 118092629 + 2.33333 NA intron (NM_001321331, intron 2 of 5) intron (NM_001321331, intron 2 of 5) 4006 NM_001321332 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 258.333-30 chr2 32323374 32323582 + 2.33333 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? -33550 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 390.333-7 chr4 30606948 30607228 + 2.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -113281 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 389-10 chr8 27641704 27642026 + 2.33333 NA intron (NM_182826, intron 1 of 5) intron (NM_182826, intron 1 of 5) 7805 NM_182826 51435 Hs.128856 NM_016240 ENSG00000168077 SCARA3 APC7|CSR|CSR1|MSLR1|MSRL1 scavenger receptor class A member 3 protein-coding 347.666-13 chr4 77780364 77780531 + 2.33333 NA intron (NM_001365006, intron 1 of 11) intron (NM_001365006, intron 1 of 11) 38617 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 290.666-21 chr3 143976115 143976319 + 2.33333 NA intron (NM_001134470, intron 1 of 2) intron (NM_001134470, intron 1 of 2) 3136 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 290-41 chr5 32129398 32129656 + 2.33333 NA intron (NM_022130, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 44792 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 353.333-29 chr6 57008928 57009244 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001318539, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001318539, exon 4 of 4) -37446 NM_001286275 57691 Hs.709521 NM_020931 ENSG00000168116 KIAA1586 - KIAA1586 protein-coding 259.666-16 chr16 72932038 72932215 + 2.33333 NA intron (NM_001164766, intron 2 of 8) intron (NM_001164766, intron 2 of 8) 116002 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 442.666-5 chrX 37046226 37046463 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -2552 NM_001271682 441490 NM_001271682 FTH1P18 FTHL18 ferritin heavy chain 1 pseudogene 18 protein-coding 465.333-3 chr11 76714279 76714971 + 2.33333 NA intron (NR_024042, intron 6 of 20) intron (NR_024042, intron 6 of 20) 7164 NR_024042 390226 Hs.440026 NR_024042 GUCY2EP GC-E|GCD|GUCY2E guanylate cyclase 2E, pseudogene pseudo 339.333-17 chr16 79639984 79640229 + 2.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -39369 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 540.333-3 chr3 78113588 78114066 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -64864 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 366.666-13 chr6 129287090 129287374 + 2.33333 NA intron (NM_000426, intron 18 of 64) intron (NM_000426, intron 18 of 64) 404091 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 359-8 chr2 171630216 171630413 + 2.33333 NA Intergenic MER34C|LTR|ERV1 -57155 NM_001271786 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 403-2 chr16 8100028 8100253 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 489698 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 421.667-9 chr5 148134772 148135221 + 2.33333 NA intron (NM_006846, intron 32 of 32) intron (NM_006846, intron 32 of 32) -33550 NM_001001325 408187 Hs.553815 NM_001001325 ENSG00000196800 SPINK14 SPINK5L2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (putative) protein-coding 339.666-11 chr4 53413386 53413670 + 2.33333 NA intron (NM_001134938, intron 8 of 14) L1MC4|LINE|L1 35875 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 527.001 chr2 196988788 196989259 + 2.33333 NA non-coding (NR_160034, exon 29 of 29) non-coding (NR_160034, exon 29 of 29) -62316 NM_001321099 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 394-11 chr21 15024381 15024560 + 2.33333 NA intron (NM_003489, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 40530 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 342-13 chr15 41745326 41745532 + 2.33333 NA intron (NM_001164273, intron 15 of 23) MER113|DNA|hAT-Charlie -29055 NM_001265611 23005 Hs.513661 NM_014994 ENSG00000137802 MAPKBP1 JNKBP-1|JNKBP1|NPHP20 mitogen-activated protein kinase binding protein 1 protein-coding 536.334 chr14 69634719 69635196 + 2.33333 NA intron (NM_014734, intron 1 of 5) intron (NM_014734, intron 1 of 5) 23361 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 455.333-9 chr7 48053516 48053849 + 2.33333 NA intron (NM_001267866, intron 6 of 6) AluJo|SINE|Alu 18139 NM_001267866 136288 Hs.258357 NM_001100159 ENSG00000164746 C7orf57 - chromosome 7 open reading frame 57 protein-coding 402.666-8 chr5 146702674 146702867 + 2.33333 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) intron (NM_001271899, intron 2 of 9) 176015 NM_001271948 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 372-4 chr10 60794686 60794955 + 2.33333 NA TTS (NM_001320918) TTS (NM_001320918) 16342 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 413.333-7 chr2 95569358 95569653 + 2.33333 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 -22496 NM_138800 129868 Hs.232026 NM_138800 ENSG00000144015 TRIM43 TRIM43A tripartite motif containing 43 protein-coding 250.333-45 chr3 132740736 132740946 + 2.33333 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) L1MEg|LINE|L1 -18382 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 506.666-3 chr5 101558332 101558575 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -655171 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 367.667-3 chr11 74927908 74928144 + 2.33333 NA intron (NM_001270380, intron 6 of 14) L1ME3G|LINE|L1 21065 NM_001270380 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 369.667-10 chr3 33318839 33319100 + 2.33333 NA intron (NR_146129, intron 4 of 15) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 41527 NR_146133 25827 Hs.475872 NM_012157 ENSG00000153558 FBXL2 FBL2|FBL3 F-box and leucine rich repeat protein 2 protein-coding 355.333-40 chr9 103146531 103146759 + 2.33333 NA intron (NR_121578, intron 8 of 9) intron (NR_121578, intron 8 of 9) 151312 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 324.667-30 chr5 159213086 159213330 + 2.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -3155 NM_001199380 153830 Hs.349306 NM_144726 ENSG00000145860 RNF145 - ring finger protein 145 protein-coding 438-8 chr3 193946341 193946738 + 2.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 47699 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 348.333-14 chr17 56093232 56093439 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -60140 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 417-8 chr5 78153125 78153343 + 2.33333 NA intron (NM_003664, intron 14 of 26) L1M1|LINE|L1 141464 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 396.333-8 chr2 166529962 166530184 + 2.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -43102 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 355.333-8 chr13 98400729 98400932 + 2.33333 NA intron (NM_005766, intron 13 of 26) intron (NM_005766, intron 13 of 26) 121295 NM_003576 8428 Hs.508514 NM_003576 ENSG00000102572 STK24 HEL-S-95|MST3|MST3B|STE20|STK3 serine/threonine kinase 24 protein-coding 429.666-4 chr9 9267469 9267825 + 2.33333 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) L1MA9|LINE|L1 409629 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 248.666-22 chr2 192329664 192329852 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -134825 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 768.334 chr17 62951075 62951847 + 2.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 7246 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 466.999 chr2 189925974 189926181 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 136652 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 693 chr1 35380353 35380956 + 2.33333 NA intron (NM_005095, intron 7 of 29) intron (NM_005095, intron 7 of 29) -14577 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 333-21 chr5 39943187 39943399 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -108998 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 310.333-26 chr20 39460728 39461232 + 2.33333 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -236232 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 372-14 chr3 99203591 99203803 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -302002 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 581.333-2 chr12 110898510 110899069 + 2.33333 NA intron (NM_152591, intron 9 of 11) MER112|DNA|hAT-Charlie 21811 NM_000432 4633 Hs.75535 NM_000432 ENSG00000111245 MYL2 CMH10|MLC-2s/v|MLC2 myosin light chain 2 protein-coding 347.334-11 chr8 47532840 47533100 + 2.33333 NA intron (NM_001352958, intron 10 of 21) L1MC2|LINE|L1 -121118 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 379.666-12 chr6 115885360 115885638 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -153232 NR_027338 728402 Hs.729953 NR_027338 TPI1P3 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 3 pseudo 529.666-3 chr21 42304466 42304793 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 10967 NM_003226 7033 Hs.82961 NM_003226 ENSG00000160180 TFF3 ITF|P1B|TFI trefoil factor 3 protein-coding 437.666-4 chr14 51633173 51633535 + 2.33333 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu 18390 NR_037676 145438 Hs.645410 NR_037676 ENSG00000273888 FRMD6-AS1 C14orf82 FRMD6 antisense RNA 1 ncRNA 352.666-5 chr12 6277346 6277509 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -33009 NM_018173 55200 Hs.631660 NM_018173 ENSG00000008323 PLEKHG6 MyoGEF pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G6 protein-coding 395.334-3 chr3 86211710 86211980 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -270098 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 569.334 chr15 86341957 86342368 + 2.33333 NA intron (NM_152336, intron 17 of 24) intron (NM_152336, intron 17 of 24) -25194 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 412.666-9 chr9 37604994 37605248 + 2.33333 NA intron (NM_001371225, intron 1 of 15) intron (NM_001371225, intron 1 of 15) 1892 NM_001371225 428.667-4 chr14 65477718 65478018 + 2.33333 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 6766 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 336.333-22 chr3 96179227 96179382 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -180660 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 334-32 chr5 177140717 177140933 + 2.33333 NA intron (NM_172349, intron 3 of 23) intron (NM_172349, intron 3 of 23) 6596 NM_001365684 64324 Hs.106861 NM_022455 ENSG00000165671 NSD1 ARA267|KMT3B|SOTOS|SOTOS1|STO nuclear receptor binding SET domain protein 1 protein-coding 547.333-5 chr6 46760532 46761269 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 13983 NM_001162435 100287718 Hs.736491 NM_001162435 ENSG00000230062 ANKRD66 - ankyrin repeat domain 66 protein-coding 383.666-2 chr12 88308352 88308603 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 166170 NM_001366579 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 373.667-15 chr8 76030209 76030486 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -376307 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 362.334-2 chr10 62384444 62384639 + 2.33333 NA intron (NM_199451, intron 2 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -9414 NR_104162 283045 NR_104162 LOC283045 - uncharacterized LOC283045 ncRNA 372.667-2 chr10 35202589 35203015 + 2.33333 NA intron (NM_182717, intron 2 of 3) intron (NM_182717, intron 2 of 3) 6900 NM_001267570 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 430.667-2 chr11 78355129 78355486 + 2.33333 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) intron (NM_080491, intron 1 of 9) -13427 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 275.333-69 chr7 25071938 25072140 + 2.33333 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 53322 NM_018947 54205 Hs.437060 NM_018947 ENSG00000172115 CYCS CYC|HCS|THC4 cytochrome c, somatic protein-coding 334.334-12 chr8 127370595 127370868 + 2.33333 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR -29668 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 356.334-3 chr3 168684453 168684750 + 2.33333 NA intron (NR_021485, intron 5 of 15) LTR16A|LTR|ERVL 132747 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 415.666-3 chr2 219109081 219109421 + 2.33333 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) intron (NM_024782, intron 5 of 7) -48330 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 339-8 chr15 34703504 34703698 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -47837 NR_146869 105370762 Hs.569462 NR_146869 ENSG00000261304 LINC02252 - long intergenic non-protein coding RNA 2252 ncRNA 382.333-4 chr17 44572104 44572390 + 2.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 14763 NM_001466 2535 Hs.142912 NM_001466 ENSG00000180340 FZD2 Fz2|OMOD2|fz-2|fzE2|hFz2 frizzled class receptor 2 protein-coding 549.333-2 chr18 39495864 39496232 + 2.33333 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) intron (NR_024391, intron 3 of 3) 126127 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 438.667 chr1 162618637 162618994 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -12048 NM_001354983 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 303-43 chr6 64841572 64841734 + 2.33333 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) intron (NM_001292009, intron 19 of 43) -459765 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 402-3 chr15 51840694 51840992 + 2.33333 NA intron (NM_014547, intron 1 of 9) intron (NM_014547, intron 1 of 9) 11190 NM_014547 29766 Hs.4998 NM_014547 ENSG00000138594 TMOD3 UTMOD tropomodulin 3 protein-coding 436.333-5 chr7 84369599 84369812 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -162771 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 667 chr7 99648754 99649200 + 2.33333 NA intron (NR_033807, intron 12 of 12) intron (NR_033807, intron 12 of 12) 31019 NM_001291830 1577 Hs.571258 NM_000777 ENSG00000106258 CYP3A5 CP35|CYPIIIA5|P450PCN3|PCN3 cytochrome P450 family 3 subfamily A member 5 protein-coding 370.333-7 chr14 20019124 20019371 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -4054 NM_001004712 122740 Hs.626814 NM_001004712 ENSG00000169484 OR4K14 OR14-18|OR14-22 olfactory receptor family 4 subfamily K member 14 protein-coding 343.333-33 chr7 77369580 77369769 + 2.33333 NA intron (NR_146937, intron 12 of 31) intron (NR_146937, intron 12 of 31) -45524 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 526.999 chr5 171752781 171753097 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -32933 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 587.332 chr15 58568499 58568943 + 2.33333 NA exon (NM_000236, exon 9 of 9) exon (NM_000236, exon 9 of 9) -69986 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 351.666-2 chr11 81623692 81623852 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 267064 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 567.333 chr4 32546308 32546723 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 195477 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 373.667-18 chr9 3244761 3244996 + 2.33333 NA intron (NM_134428, intron 16 of 17) L2c|LINE|L2 63289 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 346-3 chr1 150400043 150400323 + 2.33333 NA intron (NM_015203, intron 1 of 10) L1ME1|LINE|L1 36072 NM_001297674 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 356-30 chr5 37930801 37931064 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -17559 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 416.667-7 chr20 4785799 4786206 + 2.33333 NA intron (NM_014737, intron 11 of 11) intron (NM_014737, intron 11 of 11) 29121 NM_170774 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 389-3 chr18 54295468 54295766 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_007195, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_007195, exon 10 of 10) 26043 NM_001351618 11201 Hs.438533 NM_007195 ENSG00000101751 POLI RAD30B|RAD3OB|eta2 DNA polymerase iota protein-coding 265-9 chr1 235289620 235289837 + 2.33333 NA intron (NR_135074, intron 2 of 24) AluJb|SINE|Alu 37759 NM_001206794 51742 Hs.575782 NM_016374 ENSG00000054267 ARID4B BCAA|BRCAA1|RBBP1L1|RBP1L1|SAP180 AT-rich interaction domain 4B protein-coding 504-3 chr10 84751410 84751854 + 2.33333 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 326463 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 400-9 chr3 2683721 2684073 + 2.33333 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) MER5A|DNA|hAT-Charlie -208318 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 305.333-13 chr11 79836587 79836761 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -395644 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 225-30 chr18 2393576 2393720 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 177857 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 591.001 chr1 244545156 244545630 + 2.33333 NA intron (NM_001130957, intron 8 of 21) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 84022 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 484.666-4 chr9 27183385 27183827 + 2.33333 NA exon (NM_001290078, exon 6 of 21) exon (NM_001290078, exon 6 of 21) 74465 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 577.333-4 chr7 26018807 26019305 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -69070 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 438.666-8 chr6 8713544 8713873 + 2.33333 NA intron (NR_038980, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 61499 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 337.333-21 chr18 3164490 3164764 + 2.33333 NA intron (NM_019856, intron 9 of 36) intron (NM_019856, intron 9 of 36) 55341 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 282.333-33 chr22 33789583 33789758 + 2.33333 NA intron (NM_001362953, intron 1 of 14) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 64684 NR_038950 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 682.999 chr7 106585749 106586223 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 75172 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 429-2 chr10 73180138 73180380 + 2.33333 NA intron (NM_173348, intron 3 of 13) L2c|LINE|L2 12140 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 542.666-3 chrX 42332901 42333294 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -409543 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 477.666 chr2 26225002 26225536 + 2.33333 NA intron (NM_000182, intron 7 of 19) AluY|SINE|Alu 19363 NM_000182 3030 Hs.516032 NM_000182 ENSG00000084754 HADHA ECHA|GBP|HADH|LCEH|LCHAD|MTPA|TP-ALPHA hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alpha protein-coding 269.333-54 chr2 226542268 226542465 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 116427 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 434.666-4 chr11 21234929 21235318 + 2.33333 NA intron (NM_201551, intron 14 of 18) intron (NM_201551, intron 14 of 18) 565537 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 393.333 chr1 72953677 72953884 + 2.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -352390 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 387.333-13 chr6 96560949 96561140 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -1481 NM_001170807 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 377.001 chr6 5398120 5398429 + 2.33333 NA intron (NM_006567, intron 2 of 6) L1MC4a|LINE|L1 59801 NR_125847 101927972 Hs.668417 NR_125846 ENSG00000269985 LOC101927972 - uncharacterized LOC101927972 ncRNA 455-2 chr12 8904128 8904432 + 2.33333 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -10229 NM_004426 1911 Hs.744902 NM_004426 ENSG00000111752 PHC1 EDR1|HPH1|MCPH11|RAE28 polyhomeotic homolog 1 protein-coding 260.667-87 chr7 135640280 135640438 + 2.33333 NA intron (NM_015135, intron 38 of 42) L1ME1|LINE|L1 -22155 NM_001130929 647087 Hs.200022 NM_001130929 ENSG00000243317 STMP1 C7orf73|PL-5283 short transmembrane mitochondrial protein 1 protein-coding 309-24 chr3 95886580 95886749 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -203471 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 286-34 chr20 51538522 51538786 + 2.33333 NA intron (NM_001258292, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 4065 NM_001258297 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 362.666-7 chr2 187303505 187303670 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 144665 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 385.666-10 chr7 64644654 64644924 + 2.33333 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite -21294 NM_001282359 51427 Hs.50216 NM_016220 ENSG00000196247 ZNF107 Y8|ZFD25|ZNF588|smap-7 zinc finger protein 107 protein-coding 340-22 chr4 54241900 54242153 + 2.33333 NA intron (NM_001347828, intron 2 of 23) intron (NM_001347828, intron 2 of 23) 8066 NM_001347830 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 348-15 chr20 57510047 57510320 + 2.33333 NA intron (NM_001269048, intron 4 of 5) intron (NM_001269048, intron 4 of 5) 14684 NM_001269044 140690 Hs.131543 NM_080618 ENSG00000124092 CTCFL BORIS|CT27|CTCF-T|HMGB1L1|dJ579F20.2 CCCTC-binding factor like protein-coding 338.667-9 chr14 24078709 24078909 + 2.33333 NA TTS (NM_001280558) TTS (NM_001280558) 7247 NM_006032 9362 Hs.6132 NM_006032 ENSG00000100884 CPNE6 - copine 6 protein-coding 400-6 chr14 74077771 74078107 + 2.33333 NA intron (NM_001278593, intron 1 of 11) intron (NM_001278593, intron 1 of 11) 6514 NM_001278593 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 335-5 chr11 38635937 38636101 + 2.33333 NA intron (NR_120554, intron 1 of 4) L1MA3|LINE|L1 10337 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 365.333-6 chr13 107145016 107145304 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 175803 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 390.666-5 chr4 8443395 8443583 + 2.33333 NA intron (NM_152544, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 2692 NM_001350233 152992 Hs.566191 NM_024950 ENSG00000155275 TRMT44 C4orf23|METTL19|TRM44 tRNA methyltransferase 44 homolog protein-coding 396.334-3 chr21 32256978 32257323 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 21899 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 351-6 chr11 101732586 101732749 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -148660 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 660.667 chr8 85370416 85370795 + 2.33333 NA intron (NM_001738, intron 1 of 8) intron (NM_001738, intron 1 of 8) 7508 NM_001291967 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 390.333-6 chr20 24710363 24710560 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -238808 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 479-3 chr2 64032942 64033299 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -13692 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 291.333-68 chr8 126191369 126191606 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -134008 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 303-27 chr18 6255909 6256137 + 2.33333 NA promoter-TSS (NR_110765) promoter-TSS (NR_110765) -721 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 343-11 chr2 9786714 9786988 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -56591 NM_001318976 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 466.666-4 chr6 139552702 139553040 + 2.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -78275 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 552-3 chr20 8869871 8870236 + 2.33333 NA intron (NM_182734, intron 32 of 32) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 38868 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 499.666-2 chr14 87514959 87515339 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 140145 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 418.333-9 chr22 26177869 26178351 + 2.33333 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 8636 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 479.667 chr18 11352425 11352835 + 2.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -101848 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 564.333 chr10 21955784 21956243 + 2.33333 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) intron (NM_022365, intron 1 of 11) 47717 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 371.666-16 chr8 121039614 121039831 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -227676 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 575.333 chr10 13122565 13123100 + 2.33333 NA intron (NM_001008213, intron 9 of 15) AluSc|SINE|Alu 22669 NM_001008212 10133 Hs.332706 NM_021980 ENSG00000123240 OPTN ALS12|FIP2|GLC1E|HIP7|HYPL|NRP|TFIIIA-INTP optineurin protein-coding 362-6 chr10 27669597 27669833 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -74900 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 181-59 chr5 60203630 60203719 + 2.33333 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) 168989 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 356.666-16 chr5 130244838 130245105 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 340506 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 187.666-3 chr12 30327339 30327531 + 2.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 349809 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 393-10 chr4 11835002 11835344 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 51995 NR_162127 113218507 NR_162127 MIR12113 - microRNA 12113 ncRNA 361.667-20 chr8 102967927 102968234 + 2.33333 NA intron (NR_126338, intron 3 of 3) intron (NR_126338, intron 3 of 3) -53003 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 363-3 chr12 121342840 121343125 + 2.33333 NA intron (NM_001137559, intron 4 of 16) intron (NM_001137559, intron 4 of 16) 9429 NM_016237 51433 Hs.7101 NM_016237 ENSG00000089053 ANAPC5 APC5 anaphase promoting complex subunit 5 protein-coding 550.333-3 chr4 51854131 51854783 + 2.33333 NA intron (NM_001287757, intron 2 of 11) intron (NM_001287757, intron 2 of 11) 10878 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 306.667-23 chr2 100561854 100562001 + 2.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -1066 NM_024065 79031 Hs.469459 NM_024065 ENSG00000115539 PDCL3 HTPHLP|PHLP2A|PHLP3|VIAF|VIAF1 phosducin like 3 protein-coding 334.667 chr1 111437416 111437637 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -9791 NM_002557 5016 Hs.1154 NM_002557 ENSG00000085465 OVGP1 CHIT5|EGP|MUC9|OGP oviductal glycoprotein 1 protein-coding 229.666-28 chr6 48532883 48533027 + 2.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -464266 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 373-18 chr7 3851106 3851347 + 2.33333 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -278459 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 415.333-3 chr2 38354228 38354553 + 2.33333 NA intron (NM_001330462, intron 1 of 13) L1MEf|LINE|L1 22140 NM_001330459 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 443-5 chr17 59687012 59687246 + 2.33333 NA intron (NM_001288653, intron 30 of 31) intron (NM_001288653, intron 30 of 31) 20469 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 376.333-6 chr18 6943396 6943686 + 2.33333 NA intron (NM_005559, intron 61 of 62) intron (NM_005559, intron 61 of 62) -11136 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 341.666-15 chr7 10457226 10457463 + 2.33333 NA intron (NR_147499, intron 2 of 2) L1ME2|LINE|L1 -245332 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 411.333-11 chr20 4390077 4390347 + 2.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -140925 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 389.666-4 chr2 115510622 115510979 + 2.33333 NA intron (NM_001321912, intron 5 of 25) L1M4|LINE|L1 166985 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 382.333-16 chr5 129355277 129355445 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 41786 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 471-4 chr4 120595984 120596317 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 326716 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 276.666-23 chr3 116065497 116065743 + 2.33333 NA intron (NM_001318915, intron 2 of 8) intron (NM_001318915, intron 2 of 8) -160494 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 359.333-24 chr7 135084756 135085033 + 2.33333 NA intron (NR_144293, intron 10 of 10) L1MA5|LINE|L1 -63178 NM_018295 55281 Hs.521213 NM_018295 ENSG00000146859 TMEM140 - transmembrane protein 140 protein-coding 413.667-5 chr2 33674571 33674866 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -32168 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 304.333-25 chr4 47877278 47877540 + 2.33333 NA intron (NR_103795, intron 17 of 23) intron (NR_103795, intron 17 of 23) -36818 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 428.666-9 chr7 92163755 92164044 + 2.33333 NA exon (NM_001161528, exon 1 of 5) exon (NM_001161528, exon 1 of 5) 1377 NM_001161528 401387 Hs.671729 NM_001045475 ENSG00000240720 LRRD1 - leucine rich repeats and death domain containing 1 protein-coding 554.333 chr1 45980745 45981237 + 2.33333 NA intron (NM_001324320, intron 5 of 29) LTR8|LTR|ERV1 116643 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 333-13 chr20 14338941 14339107 + 2.33333 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -1357 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 356-24 chr2 186695570 186695814 + 2.33333 NA intron (NM_177454, intron 1 of 7) intron (NM_177454, intron 1 of 7) 1632 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 371.999-4 chr5 100678742 100679008 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 137690 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 424.333-12 chr9 106091478 106091782 + 2.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 397089 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 357.333-17 chr4 67123933 67124335 + 2.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 297866 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 403.666-5 chr4 44874221 44874510 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -147731 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 231.333-74 chr4 14462385 14462602 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 350525 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 603.666-2 chr13 87087467 87087743 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 175685 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 455.333-3 chr18 21798022 21798344 + 2.33333 NA exon (NM_020774, exon 8 of 21) exon (NM_020774, exon 8 of 21) 27602 NR_029675 406922 NR_029675 ENSG00000283927 MIR133A1 MIRN133A1|mir-133a-1 microRNA 133a-1 ncRNA 342.333-22 chr4 48879192 48879350 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -19068 NR_146806 100861517 Hs.661065 NR_146806 ENSG00000248256 OCIAD1-AS1 - OCIAD1 antisense RNA 1 ncRNA 410.333-2 chr11 120320299 120320524 + 2.33333 NA TTS (NM_014352) TTS (NM_014352) -4888 NM_001198670 219902 Hs.643516 NM_174926 ENSG00000181264 TLCD5 TMEM136 TLC domain containing 5 protein-coding 534.667-2 chr4 136898184 136898730 + 2.33333 NA intron (NR_149105, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 -295299 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 419.333-12 chr4 154440325 154440626 + 2.33333 NA intron (NM_001358235, intron 1 of 19) MER106A|DNA|hAT-Charlie 51324 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 327-21 chr3 197905326 197905560 + 2.33333 NA intron (NM_001323029, intron 9 of 11) intron (NM_001323029, intron 9 of 11) 44482 NM_001323027 84223 Hs.591675 NM_032263 ENSG00000114473 IQCG CFAP122|DRC9 IQ motif containing G protein-coding 346.333-22 chr3 122451606 122451772 + 2.33333 NA intron (NR_026698, intron 8 of 14) intron (NR_026698, intron 8 of 14) 35483 NR_125405 102723582 Hs.675056 NR_125405 ENSG00000272758 LOC102723582 - uncharacterized LOC102723582 ncRNA 364.333-5 chr10 53247598 53247761 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -475979 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 339-4 chr10 92208735 92209023 + 2.33333 NA intron (NM_001178137, intron 2 of 9) AluSz|SINE|Alu 34400 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 386.333-14 chr7 14505915 14506099 + 2.33333 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) intron (NM_001350717, intron 19 of 24) 335443 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 363.666-2 chr14 51976511 51976716 + 2.33333 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -12933 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 457-7 chr5 165812169 165812454 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 1114059 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 461.667 chr2 149658324 149658827 + 2.33333 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) intron (NR_110240, intron 1 of 2) -70800 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 357-5 chr10 93318312 93318589 + 2.33333 NA intron (NM_013451, intron 49 of 53) intron (NM_013451, intron 49 of 53) 163884 NM_133337 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 314.666-17 chr14 88879341 88879614 + 2.33333 NA non-coding (NR_159362, exon 15 of 15) non-coding (NR_159362, exon 15 of 15) 54826 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 340.333-22 chr8 129629679 129629902 + 2.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 50449 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 410.667-16 chr6 56840176 56840470 + 2.33333 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 3342 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 444.666-2 chr16 61666369 61666589 + 2.33333 NA intron (NM_001796, intron 10 of 11) intron (NM_001796, intron 10 of 11) 369959 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 293-40 chr7 130173346 130173495 + 2.33333 NA intron (NR_156699, intron 13 of 14) intron (NR_156699, intron 13 of 14) 31689 NR_149033 100128325 Hs.105944 NR_149033 ENSG00000229196 LOC100128325 - uncharacterized LOC100128325 ncRNA 362.666 chr1 115464214 115464414 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -126078 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 303-44 chr6 129164500 129164672 + 2.33333 NA intron (NM_000426, intron 8 of 64) intron (NM_000426, intron 8 of 64) 281445 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 406-14 chr8 84095577 84095827 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -87085 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 325.666-14 chr5 132721388 132721566 + 2.33333 NA intron (NM_007054, intron 4 of 16) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 16069 NM_001300791 11127 Hs.43670 NM_007054 ENSG00000131437 KIF3A FLA10|KLP-20 kinesin family member 3A protein-coding 398.333-7 chr8 117802726 117803035 + 2.33333 NA intron (NM_000127, intron 10 of 10) L2a|LINE|L2 118033 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 476.667-3 chr16 69004925 69005205 + 2.33333 NA intron (NM_024562, intron 15 of 17) MER66-int|LTR|ERV1 -100588 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 455.667-5 chr11 112870696 112871062 + 2.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -90541 NM_001242607 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 556-2 chr17 57561627 57561913 + 2.33333 NA intron (NM_001322250, intron 7 of 13) intron (NM_001322250, intron 7 of 13) -38173 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 398.333 chr1 95397769 95398199 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -45877 NR_146486 101928169 NR_146486 LINC01650 - long intergenic non-protein coding RNA 1650 ncRNA 275.333-66 chr6 130580059 130580204 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 143014 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 367-11 chr7 95715875 95716105 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -56516 NM_001278422 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 280.999-2 chr12 31671007 31671209 + 2.33333 NA TTS (NM_001278411) TTS (NM_001278411) 11420 NM_001135863 254013 Hs.740628 NM_173802 ENSG00000139160 ETFBKMT C12orf72|ETFB-KMT|METTL20 electron transfer flavoprotein subunit beta lysine methyltransferase protein-coding 622 chr14 46888877 46889399 + 2.33333 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -237357 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 355-12 chr17 70248501 70248756 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 79093 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 409.333-15 chr8 110679915 110680252 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 347350 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 345.333-27 chr3 179632544 179632831 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -20353 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 430-4 chr4 26739068 26739308 + 2.33333 NA intron (NM_001292054, intron 13 of 17) intron (NM_001292054, intron 13 of 17) 121056 NR_134675 105374546 Hs.548859 NR_134673 STIM2-AS1 - STIM2 antisense RNA 1 ncRNA 341.999-7 chr20 59012632 59012816 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5470 NM_001336 1522 Hs.252549 NM_001336 ENSG00000101160 CTSZ CTSX cathepsin Z protein-coding 379.666-11 chr4 78738158 78738394 + 2.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -38074 NM_017593 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 357.333 chr1 165389953 165390144 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -33333 NM_177398 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 446-12 chr7 3668512 3668856 + 2.33333 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) AluSg|SINE|Alu 367432 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 355.666-3 chr2 136827034 136827189 + 2.33333 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) intron (NM_001316349, intron 1 of 27) 61566 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 626.666 chr20 53318316 53318863 + 2.33333 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) 133306 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 431.666-3 chr5 95404442 95404770 + 2.33333 NA intron (NM_152548, intron 3 of 9) intron (NM_152548, intron 3 of 9) 13240 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 391.333-3 chr1 221880330 221880536 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -39767 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 521-3 chr15 60027388 60027757 + 2.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 23261 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 383-8 chr4 42804218 42804462 + 2.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -88926 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 450.333 chr11 85811623 85811855 + 2.33333 NA promoter-TSS (NM_001289608) promoter-TSS (NM_001289608) -580 NM_001289608 54843 Hs.369520 NM_032379 ENSG00000137501 SYTL2 CHR11SYT|EXO4|PPP1R151|SGA72M|SLP2|SLP2A synaptotagmin like 2 protein-coding 516.333-3 chr4 68185221 68185792 + 2.33333 NA non-coding (NR_104048, exon 9 of 10) non-coding (NR_104048, exon 9 of 10) 3214 NR_015446 100130017 Hs.582037 NR_015446 ENSG00000250426 FTLP10 - ferritin light chain pseudogene 10 pseudo 371.333-7 chr12 3049962 3050151 + 2.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -27299 NM_001168320 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 386.333-16 chr8 82652268 82652489 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -259726 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 372.666-3 chr11 83121084 83121390 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -35894 NM_015885 51585 Hs.128959 NM_015885 ENSG00000165494 PCF11 - PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit protein-coding 379.999 chr11 3385098 3385310 + 2.33333 NA intron (NR_024248, intron 3 of 10) L1MEj|LINE|L1 4243 NR_024248 650368 Hs.640450 NR_024248 ENSG00000223756 TSSC2 - tumor suppressing subtransferable candidate 2 pseudogene pseudo 402.333-2 chr10 74257750 74258008 + 2.33333 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) intron (NM_001369124, intron 3 of 9) 81116 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 384.667-8 chr5 127863914 127864190 + 2.33333 NA intron (NM_001317938, intron 5 of 6) intron (NM_001317938, intron 5 of 6) 160663 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 389.333-20 chr8 36021022 36021198 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -310790 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 552-2 chr16 64818452 64818812 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 303431 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 347.666-2 chr10 64267517 64267702 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -557919 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 520.666 chr12 41308395 41308960 + 2.33333 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 120357 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 218-105 chr7 104994500 104994672 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -3421 NR_039981 100216546 Hs.369356 NR_039981 LINC01004 - long intergenic non-protein coding RNA 1004 ncRNA 410.667-9 chr20 20576196 20576498 + 2.33333 NA intron (NM_020343, intron 20 of 39) L1MC3|LINE|L1 136297 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 346.333-18 chr2 83417706 83417940 + 2.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -104991 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 346-2 chr1 77863071 77863342 + 2.33333 NA intron (NM_198549, intron 12 of 15) L2|LINE|L2 -25309 NM_001172309 91624 Hs.612385 NM_144573 ENSG00000162614 NEXN CMH20|NELIN nexilin F-actin binding protein protein-coding 326.666-8 chr2 132647952 132648105 + 2.33333 NA intron (NM_144586, intron 2 of 2) intron (NM_144586, intron 2 of 2) 22177 NM_001321234 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 319.333-8 chr12 11515361 11515593 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -28799 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 452.333-2 chr10 107734858 107735121 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 334304 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 404.333-8 chr5 15240743 15241183 + 2.33333 NA intron (NR_109944, intron 2 of 2) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 25597 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 366-7 chr14 67253058 67253237 + 2.33333 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 11712 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 377.667-16 chr8 88625712 88626056 + 2.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -298401 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 401.999-2 chr13 49734158 49734492 + 2.33333 NA intron (NM_002267, intron 2 of 16) L1M5|LINE|L1 -42838 NR_103802 84650 Hs.433278 NM_032565 ENSG00000123179 EBPL EBRP EBP like protein-coding 507.666-3 chr6 35766914 35767226 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -9524 NR_104469 389383 Hs.259563 NM_207409 ENSG00000196748 CLPSL2 AAAL3045|C6orf126|UNQ3045|dJ510O8.5 colipase like 2 protein-coding 442.999 chr10 111627358 111627678 + 2.33333 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 513227 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 368-22 chr8 132886362 132886627 + 2.33333 NA exon (NM_003235, exon 9 of 48) exon (NM_003235, exon 9 of 48) 19536 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 405.333-11 chr8 118323310 118323564 + 2.33333 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -211618 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 240.333-7 chr10 16589749 16589856 + 2.33333 NA TTS (NM_012425) TTS (NM_012425) -67923 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 342.666-12 chr18 64714101 64714374 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -454182 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 481.666 chr5 11809167 11809555 + 2.33333 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 95085 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 362.666-11 chr3 188027782 188028032 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -51500 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 317.666-2 chr13 76233505 76233714 + 2.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -298477 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 368.333-5 chr4 52306769 52307118 + 2.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 255639 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 532.333 chr2 77728484 77728806 + 2.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -187289 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 598.333 chr12 60050966 60051338 + 2.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 361782 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 364.333-12 chr14 66652599 66652815 + 2.33333 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 145300 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 359.667 chr12 4658090 4658315 + 2.33333 NA intron (NM_005002, intron 4 of 10) intron (NM_005002, intron 4 of 10) 9088 NM_005002 4704 Hs.75227 NM_005002 ENSG00000139180 NDUFA9 CC6|CI-39k|CI39k|COQ11|MC1DN26|NDUFS2L|SDR22E1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 protein-coding 339.333-16 chr16 79149447 79149689 + 2.33333 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 451169 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 368.333-11 chr8 116010044 116010207 + 2.33333 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 314934 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 358.333-32 chr9 36532254 36532462 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -40504 NR_046337 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 486.333 chr11 75016826 75017311 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 28135 NM_001367864 10825 Hs.191074 NM_006656 ENSG00000162139 NEU3 SIAL3 neuraminidase 3 protein-coding 394.667 chr10 34446273 34446626 + 2.33333 NA intron (NM_001184791, intron 4 of 20) MIR|SINE|MIR 368847 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 359.333-3 chr10 88921427 88921611 + 2.33333 NA intron (NM_020799, intron 9 of 10) intron (NM_020799, intron 9 of 10) -11165 NR_125373 100132116 NR_125373 ENSG00000180139 ACTA2-AS1 UC001kfo|ZXF1|uc001kfo.1 ACTA2 antisense RNA 1 ncRNA 264.666-18 chr2 66878098 66878325 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -26225 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 429-5 chr17 27065494 27065864 + 2.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 23562 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 419.334 chr10 61280943 61281306 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -171515 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 407.667-5 chr11 129165839 129166268 + 2.33333 NA intron (NM_001142685, intron 1 of 21) L1ME3|LINE|L1 26145 NM_001142685 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 293.667-33 chr2 226789413 226789587 + 2.33333 NA intron (NM_005544, intron 1 of 1) intron (NM_005544, intron 1 of 1) 9290 NM_005544 3667 Hs.471508 NM_005544 ENSG00000169047 IRS1 HIRS-1 insulin receptor substrate 1 protein-coding 416.667-5 chr2 57681073 57681352 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -226439 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 409.666-4 chr17 63847176 63847376 + 2.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4591 NM_001098426 6603 Hs.250581 NM_003077 ENSG00000108604 SMARCD2 BAF60B|CRACD2|PRO2451|Rsc6p|SGD2 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 2 protein-coding 364.333-11 chr13 72774397 72774661 + 2.33333 NA intron (NM_014953, intron 6 of 20) intron (NM_014953, intron 6 of 20) 7371 NM_001128226 22894 Hs.744104 NM_014953 ENSG00000083520 DIS3 2810028N01Rik|EXOSC11|KIAA1008|RRP44|dis3p DIS3 homolog, exosome endoribonuclease and 3'-5' exoribonuclease protein-coding 450.333-9 chr6 55237188 55237612 + 2.33333 NA intron (NM_001526, intron 2 of 7) L1MEg|LINE|L1 -90069 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 420.333-8 chr6 142135070 142135323 + 2.33333 NA TTS (NM_001358410) TTS (NM_001358410) 2037 NM_001358410 100126572 NM_001358410 ENSG00000203733 GJE1 CX23 gap junction protein epsilon 1 protein-coding 378.999-5 chr9 14527866 14528179 + 2.33333 NA intron (NM_001369458, intron 1 of 11) intron (NM_001369458, intron 1 of 11) 4055 NM_001369459 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 370 chr1 41691535 41691774 + 2.33333 NA intron (NM_001127714, intron 1 of 7) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -206971 NR_126098 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 293.666-13 chr7 95237540 95237767 + 2.33333 NA intron (NM_017650, intron 7 of 15) L1MD|LINE|L1 86879 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 327.667-26 chr6 80774641 80774859 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 668079 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 339-15 chr5 117681660 117681875 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -48594 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 346.333-8 chr12 39374718 39374950 + 2.33333 NA intron (NM_001173464, intron 1 of 37) intron (NM_001173464, intron 1 of 37) 68286 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 563.666-2 chr3 48827521 48827961 + 2.33333 NA intron (NM_001321982, intron 1 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 20133 NM_001321982 5576 Hs.631923 NM_004157 ENSG00000114302 PRKAR2A PKR2|PRKAR2 protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit alpha protein-coding 421.666-7 chr5 111340109 111340332 + 2.33333 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) L1ME3G|LINE|L1 115836 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 486.666-3 chr6 41990471 41991069 + 2.33333 NA intron (NM_001136017, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu -48922 NM_001760 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 332.333-11 chr14 63862150 63862305 + 2.33333 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) intron (NM_015180, intron 1 of 114) 9223 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 468.666-5 chrUn_KI270333v1 8 587 + 2.33333 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 409.666-11 chr8 132822125 132822496 + 2.33333 NA intron (NM_001277196, intron 11 of 19) intron (NM_001277196, intron 11 of 19) -44648 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 458.333-2 chr2 13602181 13602562 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -595358 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 370.999-3 chr13 86112938 86113136 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -313618 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 296.667-52 chr6 75246073 75246228 + 2.33333 NA intron (NM_001865, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 -2349 NR_158784 1347 Hs.70312 NM_001865 ENSG00000112695 COX7A2 COX7AL|COX7AL1|COXVIIAL|COXVIIa-L|VIIAL cytochrome c oxidase subunit 7A2 protein-coding 361-8 chr14 100488493 100488712 + 2.33333 NA intron (NM_001350950, intron 3 of 5) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 79468 NM_001159531 57596 Hs.211751 NM_020836 ENSG00000183092 BEGAIN - brain enriched guanylate kinase associated protein-coding 350-36 chr8 57755168 57755436 + 2.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 9153 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 379.666-5 chr12 37912873 37913090 + 2.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -403793 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 275.666-2 chr12 45721846 45722011 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 5993 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 307.333-60 chr3 159147467 159147643 + 2.33333 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) 78236 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 366.333-8 chr17 63808799 63809004 + 2.33333 NA exon (NM_007372, exon 11 of 19) exon (NM_007372, exon 11 of 19) -18530 NM_002805 5705 Hs.79387 NM_002805 ENSG00000087191 PSMC5 S8|SUG-1|SUG1|TBP10|TRIP1|p45|p45/SUG proteasome 26S subunit, ATPase 5 protein-coding 403.999-5 chr6 154783287 154783596 + 2.33333 NA intron (NM_014892, intron 3 of 19) intron (NM_014892, intron 3 of 19) 50063 NM_001286199 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 360.666-12 chr3 132938576 132938853 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -99574 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 305-15 chr4 31692039 31692214 + 2.33333 NA Intergenic (TATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 185582 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 259-9 chr10 77135829 77135992 + 2.33333 NA intron (NM_001271519, intron 5 of 28) L1MA8|LINE|L1 -4921 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 371-5 chr14 30286290 30286511 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -272723 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 486.333-2 chr15 27312478 27313089 + 2.33333 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) L1M3d|LINE|L1 -151464 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 306.667-25 chr2 102824813 102824962 + 2.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 62856 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 399-11 chr8 121109619 121109923 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -297725 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 511.666-2 chr4 119967630 119967953 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 28251 NR_121639 100996694 Hs.119926 NR_121639 ENSG00000250392 LINC02502 - long intergenic non-protein coding RNA 2502 ncRNA 338.333-8 chr18 2433033 2433215 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 138381 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 416.001-4 chr7 27833292 27833624 + 2.33333 NA intron (NM_175061, intron 4 of 4) intron (NM_175061, intron 4 of 4) 93363 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 239.666-10 chr14 30926546 30926671 + 2.33333 NA intron (NM_001083893, intron 8 of 17) intron (NM_001083893, intron 8 of 17) -36800 NR_038356 100506071 Hs.729195 NR_038356 ENSG00000258525 LOC100506071 - uncharacterized LOC100506071 ncRNA 345-13 chr4 115591825 115592086 + 2.33333 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -478335 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 440.334 chr11 44913166 44913480 + 2.33333 NA intron (NM_130783, intron 5 of 9) intron (NM_130783, intron 5 of 9) 36837 NM_001318384 9537 Hs.554791 NM_006034 ENSG00000175274 TP53I11 PIG11 tumor protein p53 inducible protein 11 protein-coding 362.667-24 chr6 41094233 41094523 + 2.33333 NA intron (NM_021705, intron 7 of 8) intron (NM_021705, intron 7 of 8) 3409 NM_001329684 221443 Hs.227457 NM_145063 ENSG00000124596 OARD1 C6orf130|TARG1|dJ34B21.3 O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 protein-coding 571.333-2 chr2 30306840 30307543 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -39455 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 480.667-3 chr2 72165157 72165556 + 2.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -17494 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 253.667-41 chr3 87281118 87281360 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4655 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 364-28 chr8 85248932 85249247 + 2.33333 NA intron (NM_198584, intron 1 of 6) intron (NM_198584, intron 1 of 6) 3631 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 340.334-4 chr2 179718094 179718364 + 2.33333 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) intron (NR_148056, intron 3 of 9) 27437 NM_001352813 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 372.334-5 chr4 60546869 60547218 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -375576 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 496-4 chr16 69003799 69004377 + 2.33333 NA intron (NM_024562, intron 15 of 17) LOR1-int|LTR|ERV1 -101565 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 448.333 chr1 19156225 19156638 + 2.33333 NA intron (NM_020765, intron 41 of 105) intron (NM_020765, intron 41 of 105) 53835 NM_020765 23352 Hs.148078 NM_020765 ENSG00000127481 UBR4 RBAF600|ZUBR1|p600 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4 protein-coding 355.666-4 chr2 160034069 160034262 + 2.33333 NA intron (NM_001007267, intron 3 of 26) MER103C|DNA|hAT-Charlie 28450 NM_001195641 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 547 chr10 48292417 48292943 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -13959 NM_001278547 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 419.666-4 chr22 24721800 24722016 + 2.33333 NA intron (NM_001008496, intron 19 of 20) intron (NM_001008496, intron 19 of 20) -42593 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 363.999-6 chr7 22728297 22728557 + 2.33333 NA promoter-TSS (NR_131935) promoter-TSS (NR_131935) -807 NR_131935 541472 Hs.512234 NR_131935 ENSG00000179428 LOC541472 - uncharacterized LOC541472 ncRNA 354.999-2 chr5 42602298 42602550 + 2.33333 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 36560 NM_001242462 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 436.666-12 chr8 140721399 140721660 + 2.33333 NA intron (NM_001352718, intron 22 of 32) intron (NM_001352718, intron 22 of 32) -2960 NM_001352750 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 386.666-2 chr10 116977939 116978249 + 2.33333 NA intron (NM_001258298, intron 1 of 15) intron (NM_001258298, intron 1 of 15) 27093 NM_018330 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 381.999-5 chr20 34594056 34594227 + 2.33333 NA intron (NM_080476, intron 7 of 11) AluJb|SINE|Alu 35423 NM_032514 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 348-22 chr7 15330134 15330283 + 2.33333 NA intron (NM_001004320, intron 12 of 12) intron (NM_001004320, intron 12 of 12) 231807 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 239.333-93 chr6 63257929 63258222 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 61902 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 336.333-33 chr7 16336980 16337232 + 2.33333 NA intron (NM_001101417, intron 2 of 8) L1M1|LINE|L1 84432 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 386.333-10 chr3 153890488 153890682 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -128059 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 412.333-4 chr12 63014263 63014585 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -79274 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 595-2 chr6 135320756 135321334 + 2.33333 NA intron (NM_017651, intron 24 of 27) intron (NM_017651, intron 24 of 27) 81885 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 365.666-2 chr1 52754155 52754423 + 2.33333 NA intron (NM_024646, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu 27836 NM_024646 79699 Hs.476280 NM_024646 ENSG00000162378 ZYG11B ZYG11 zyg-11 family member B, cell cycle regulator protein-coding 497.333-5 chr3 129768732 129769032 + 2.33333 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) intron (NM_001349271, intron 2 of 4) 25730 NM_001349273 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 501.999-3 chr9 93878495 93878782 + 2.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 59281 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 354.666-18 chr6 63726104 63726303 + 2.33333 NA intron (NM_001292009, intron 43 of 43) intron (NM_001292009, intron 43 of 43) 79677 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 273-37 chr6 66200452 66200649 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 412671 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 443.334-3 chr8 86871129 86871474 + 2.33333 NA intron (NM_173538, intron 1 of 10) intron (NM_173538, intron 1 of 10) 4886 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 391.999 chr12 63149376 63149658 + 2.33333 NA intron (NM_000706, intron 1 of 1) intron (NM_000706, intron 1 of 1) 3293 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 570.666 chr3 97668254 97668702 + 2.33333 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) LTR82A|LTR|ERVL -96043 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 345.333-6 chr11 103933866 103934145 + 2.33333 NA intron (NM_025208, intron 5 of 6) intron (NM_025208, intron 5 of 6) 84099 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 344.666-7 chr14 62658132 62658375 + 2.33333 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 387205 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 331-25 chr3 11111632 11111803 + 2.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -25521 NM_001098213 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 381-10 chr4 46116588 46116853 + 2.33333 NA intron (NM_173536, intron 1 of 8) intron (NM_173536, intron 1 of 8) 7334 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 428.333-6 chr8 121984746 121985179 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -343522 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 428.999 chr10 61676225 61676429 + 2.33333 NA intron (NM_001366906, intron 2 of 7) HAL1b|LINE|L1 13366 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 486.666-2 chr5 161236289 161236553 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -297795 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 407-7 chr22 43695904 43696357 + 2.33333 NA intron (NM_198856, intron 8 of 29) L1ME1|LINE|L1 116175 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 334.333-4 chr10 92989394 92989587 + 2.33333 NA intron (NM_001319195, intron 18 of 21) intron (NM_001319195, intron 18 of 21) -71308 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 345.333-4 chr10 76228480 76228710 + 2.33333 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) LTR8A|LTR|ERV1 445834 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 273.333-8 chr10 82950535 82950764 + 2.33333 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) L2|LINE|L2 -717729 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 508.333 chr14 38615729 38616280 + 2.33333 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 -266592 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 307.667-13 chr14 73455452 73455644 + 2.33333 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) intron (NM_001005743, intron 1 of 12) 3032 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 280.667-59 chr8 120197477 120197685 + 2.33333 NA intron (NM_021110, intron 6 of 47) intron (NM_021110, intron 6 of 47) 72479 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 412-3 chr15 47694876 47695077 + 2.33333 NA intron (NM_001198999, intron 4 of 19) intron (NM_001198999, intron 4 of 19) -22529 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 514-2 chr12 38993949 38994233 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -88500 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 324.666-6 chr14 30578057 30578282 + 2.33333 NA promoter-TSS (NR_151720) promoter-TSS (NR_151720) -812 NR_151720 105370431 Hs.603980 NR_151720 ENSG00000257636 G2E3-AS1 CAT1647 G2E3 antisense RNA 1 ncRNA 465.333-8 chr22 41105962 41106504 + 2.33333 NA intron (NM_001429, intron 1 of 30) intron (NM_001429, intron 1 of 30) 13641 NM_001429 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 181.333-40 chr13 67587431 67587551 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 215104 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 465-2 chr3 120105218 120105606 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -10965 NM_001146156 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 291.999-7 chr3 175542744 175542921 + 2.33333 NA intron (NM_207015, intron 9 of 13) intron (NM_207015, intron 9 of 13) 173292 NR_039952 100616395 NR_039952 ENSG00000264974 MIR4789 - microRNA 4789 ncRNA 314-24 chr2 205413444 205413592 + 2.33333 NA intron (NM_205863, intron 19 of 21) intron (NM_205863, intron 19 of 21) -268982 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 373.666-6 chr2 165847771 165848000 + 2.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 24056 NR_045375 100506124 Hs.709870 NR_045375 LOC100506124 - uncharacterized LOC100506124 ncRNA 480.667 chr11 10979313 10979623 + 2.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 121251 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 391.333-4 chr10 61067081 61067402 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 50966 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 659.001 chr4 40758542 40759088 + 2.33333 NA intron (NM_024677, intron 2 of 11) AluSz6|SINE|Alu 8860 NM_024677 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 320.333-17 chr2 171938212 171938378 + 2.33333 NA intron (NR_027862, intron 2 of 9) intron (NR_027862, intron 2 of 9) 15834 NM_003642 8520 Hs.632532 NM_003642 ENSG00000128708 HAT1 KAT1 histone acetyltransferase 1 protein-coding 441.666-3 chr5 74817098 74817398 + 2.33333 NA intron (NR_046462, intron 4 of 11) L1MB7|LINE|L1 -48645 NR_134288 441086 Hs.653007 NR_134288 LOC441086 - uncharacterized LOC441086 ncRNA 370.333-26 chr7 70225355 70225682 + 2.33333 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 627043 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 391.333-16 chr4 32651362 32651542 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 300414 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 356.999-3 chr11 30852239 30852426 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 140354 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 350-5 chr10 83874996 83875180 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -197999 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 311.333-43 chr4 176821504 176821660 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -28660 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 367.666-2 chr10 25310989 25311161 + 2.33333 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) L1MC4a|LINE|L1 -134799 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 343-17 chr4 135332899 135333159 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -209470 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 379.333-4 chr2 213399389 213399579 + 2.33333 NA intron (NR_047660, intron 8 of 14) L1ME3F|LINE|L1 115020 NR_047660 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 444.667-2 chr14 71304041 71304386 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -16263 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 449.999-2 chr5 75989712 75990137 + 2.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -93459 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 468.333-2 chr7 115662875 115663079 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -81536 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 385.333-15 chr14 64628704 64628917 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -75614 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 355.333-13 chr2 83130084 83130251 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 273364 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 503.999-3 chr6 45393007 45393363 + 2.33333 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) L1MCb|LINE|L1 -15251 NM_003599 8464 Hs.368325 NM_003599 ENSG00000196284 SUPT3H SPT3|SPT3L SPT3 homolog, SAGA and STAGA complex component protein-coding 340.666-8 chr15 85862378 85862578 + 2.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 36843 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 300.666-17 chr6 41111690 41111873 + 2.33333 NA intron (NR_026938, intron 6 of 22) intron (NR_026938, intron 6 of 22) 10747 NR_026938 221442 Hs.374076 NM_001010871 ENSG00000161912 ADCY10P1 - ADCY10 pseudogene 1 pseudo 405.334-2 chr16 83988570 83988911 + 2.33333 NA intron (NM_019065, intron 5 of 12) intron (NM_019065, intron 5 of 12) 20092 NM_001329749 54550 Hs.140950 NM_019065 ENSG00000103154 NECAB2 EFCBP2|stip-2 N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 protein-coding 473-3 chr8 120972401 120972775 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -160542 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 314.999-4 chr8 16939666 16939922 + 2.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 62551 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 766.666 chr6 64213641 64214463 + 2.33333 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 407216 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 439.667-4 chr22 27361053 27361392 + 2.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 50571 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 344.667-9 chr3 26639062 26639344 + 2.33333 NA intron (NM_001317810, intron 2 of 2) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 14536 NM_001317810 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 456.999-2 chr5 113721740 113722027 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 208189 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 361.999-10 chr7 70420553 70420741 + 2.33333 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) -711497 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 303.667-19 chr4 57446859 57447072 + 2.33333 NA intron (NR_125907, intron 4 of 5) intron (NR_125907, intron 4 of 5) 21093 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 424.333-8 chr7 8350474 8350820 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -82962 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 342.666-23 chr8 87919319 87919587 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -45438 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 129.667-44 chr13 19960609 19960714 + 2.33333 NA intron (NM_197968, intron 2 of 24) intron (NM_197968, intron 2 of 24) 847 NR_148365 7750 Hs.507433 NM_003453 ENSG00000121741 ZMYM2 FIM|MYM|RAMP|SCLL|ZNF198 zinc finger MYM-type containing 2 protein-coding 391.999-6 chr5 103808570 103808797 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -245894 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 351-16 chr5 178687855 178688095 + 2.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 42684 NM_005649 6940 Hs.484324 NM_005649 ENSG00000169131 ZNF354A EZNF|HEL104|HKL1|KID-1|KID1|TCF17 zinc finger protein 354A protein-coding 476.333-2 chr5 98865430 98865882 + 2.33333 NA intron (NM_001364113, intron 32 of 36) intron (NM_001364113, intron 32 of 36) 60878 NM_001270 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 350-12 chr2 63375373 63375609 + 2.33333 NA intron (NM_001354045, intron 12 of 12) intron (NM_001354045, intron 12 of 12) 62516 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 345.333-25 chr3 57542640 57543037 + 2.33333 NA exon (NM_001366028, exon 2 of 74) exon (NM_001366028, exon 2 of 74) 1506 NM_198564 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 452-6 chr20 56285127 56285419 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 36541 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 557.334-2 chr2 178088238 178088562 + 2.33333 NA intron (NM_001077197, intron 2 of 20) intron (NM_001077197, intron 2 of 20) -15623 NM_016953 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 571.666-2 chr8 56733020 56733491 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -173432 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 291.333-17 chr12 57706280 57706483 + 2.33333 NA intron (NM_001017956, intron 5 of 13) L1M5|LINE|L1 12249 NM_006812 10956 Hs.527861 NM_006812 ENSG00000135506 OS9 ERLEC2|OS-9 OS9 endoplasmic reticulum lectin protein-coding 389.333-22 chr9 24255727 24255930 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 289848 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 345.333-32 chr4 65241008 65241167 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -236587 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 420-7 chr14 71291525 71291786 + 2.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -28821 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 291-43 chr8 79304749 79305007 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -27310 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 476.666-4 chr6 94988688 94988979 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 588618 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 359.999 chr20 33583033 33583289 + 2.33333 NA intron (NM_005093, intron 2 of 11) intron (NM_005093, intron 2 of 11) 20796 NM_005093 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 494-6 chr5 87914542 87914796 + 2.33333 NA Intergenic MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR 252627 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 371.666-4 chr12 115888707 115888917 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 259842 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 358-25 chr9 27273363 27273573 + 2.33333 NA intron (NR_026679, intron 8 of 16) intron (NR_026679, intron 8 of 16) 9325 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 258.666-30 chr4 161903909 161904063 + 2.33333 NA intron (NM_001128428, intron 4 of 14) intron (NM_001128428, intron 4 of 14) -118747 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 335-17 chr2 180030552 180030716 + 2.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -23337 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 521.333 chr3 30427766 30428174 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -90898 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 459.333-3 chr10 56542018 56542316 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -180894 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 325-32 chrX 40594075 40594327 + 2.33333 NA intron (NM_005765, intron 3 of 8) L1MA7|LINE|L1 13231 NM_005765 10159 Hs.495960 NM_005765 ENSG00000182220 ATP6AP2 APT6M8-9|ATP6IP2|ATP6M8-9|ELDF10|HT028|M8-9|MRXE|MRXSH|MSTP009|PRR|RENR|XMRE|XPDS ATPase H+ transporting accessory protein 2 protein-coding 409.333 chr1 159590506 159590918 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 2886 NM_001639 325 Hs.507080 NM_001639 ENSG00000132703 APCS HEL-S-92n|PTX2|SAP amyloid P component, serum protein-coding 358.666-14 chr6 111351143 111351366 + 2.33333 NA intron (NM_001286431, intron 22 of 34) intron (NM_001286431, intron 22 of 34) 91915 NM_153369 91749 Hs.400572 NM_153369 ENSG00000173214 MFSD4B KIAA1919|NaGLT1 major facilitator superfamily domain containing 4B protein-coding 380.333-2 chr12 110716284 110716481 + 2.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 26509 NM_002710 5501 Hs.79081 NM_002710 ENSG00000186298 PPP1CC PP-1G|PP1C|PPP1G protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma protein-coding 438.999-3 chr5 57463017 57463457 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 19574 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 339-17 chr7 67522327 67522567 + 2.33333 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 186471 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 350.666-8 chr14 88485260 88485600 + 2.33333 NA intron (NM_007039, intron 11 of 18) intron (NM_007039, intron 11 of 18) 69577 NM_007039 11099 Hs.437040 NM_007039 ENSG00000070778 PTPN21 PTPD1|PTPRL10 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 21 protein-coding 310.333-6 chr1 213508414 213508637 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -416224 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 311.333-36 chr3 98357390 98357544 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 3613 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 373.666-12 chr8 114140229 114140433 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -703392 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 325.333-8 chr10 125957705 125957907 + 2.33333 NA intron (NM_001363549, intron 1 of 10) AluSx1|SINE|Alu 15467 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 349.666-11 chr6 138544274 138544534 + 2.33333 NA intron (NM_020464, intron 1 of 6) intron (NM_020464, intron 1 of 6) 28165 NM_020464 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 446.667-8 chr4 48141030 48141362 + 2.33333 NA intron (NM_003215, intron 15 of 17) intron (NM_003215, intron 15 of 17) -6946 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 378.999-4 chr2 136486299 136486534 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -279129 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 841.666 chr5 151341979 151342572 + 2.33333 NA intron (NM_181776, intron 4 of 9) L2c|LINE|L2 5284 NM_181776 153201 Hs.483877 NM_181776 ENSG00000186335 SLC36A2 PAT2|TRAMD1 solute carrier family 36 member 2 protein-coding 528.666 chr2 9887143 9887592 + 2.33333 NA intron (NM_001318977, intron 7 of 13) L1MEc|LINE|L1 43893 NM_005680 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 434.666-9 chr3 193883623 193883981 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -39793 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 434.999 chr8 118484913 118485329 + 2.33333 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -135880 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 379.333-3 chr2 46696752 46696956 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -2106 NM_014011 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 432.999 chr12 21923179 21923479 + 2.33333 NA intron (NM_005691, intron 3 of 37) L1ME2z|LINE|L1 13365 NM_005691 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 469.333-3 chr14 72696534 72697050 + 2.33333 NA intron (NM_001280544, intron 6 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie 179972 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 349.333-31 chr8 77433833 77434012 + 2.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -16775 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 382.666-10 chr2 173613743 173614051 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 259025 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 262.666-2 chr10 23942214 23942395 + 2.33333 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) L1M4a1|LINE|L1 247577 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 242-47 chr2 174167092 174167253 + 2.33333 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) intron (NM_001011708, intron 3 of 9) 81360 NM_001011708 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 396.333-2 chr10 110230540 110230778 + 2.33333 NA intron (NM_001008541, intron 2 of 4) intron (NM_001008541, intron 2 of 4) 4663 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 380.333-11 chr8 41107022 41107336 + 2.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 163964 NR_049801 100847068 NR_049801 ENSG00000263372 MIR548AO - microRNA 548ao ncRNA 331-9 chr11 83076818 83077056 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 4871 NR_038903 100506233 Hs.503429 NR_038903 ENSG00000246067 RAB30-DT RAB30-AS1 RAB30 divergent transcript ncRNA 309.667-7 chr12 70276301 70276517 + 2.33333 NA intron (NM_001199303, intron 1 of 15) intron (NM_001199303, intron 1 of 15) 32695 NM_001199303 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 352.667-15 chr2 9489912 9490175 + 2.33333 NA TTS (NM_001320859) TTS (NM_001320859) 14988 NM_001320858 285148 Hs.667226 NM_001039613 ENSG00000134330 IAH1 - isoamyl acetate hydrolyzing esterase 1 (putative) protein-coding 448.333-9 chr9 31447161 31447515 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -65848 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 520-2 chr3 61524621 61525093 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -36714 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 344-47 chr8 92966636 92966863 + 2.33333 NA promoter-TSS (NM_001171795) promoter-TSS (NM_001171795) -605 NM_001171797 286144 Hs.440643 NM_001171795 ENSG00000205133 TRIQK C8orf83|PRO0845|UPF0599 triple QxxK/R motif containing protein-coding 437.333 chr1 219783837 219784169 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 144648 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 652.999 chr10 88599193 88599647 + 2.33333 NA intron (NM_001010939, intron 8 of 10) L1MA9|LINE|L1 12658 NM_001010939 142910 Hs.440959 NM_001010939 ENSG00000204022 LIPJ LIPL1|bA425M17.2 lipase family member J protein-coding 610.333 chr9 95394292 95394714 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -69106 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 333-27 chr8 92063300 92063540 + 2.33333 NA promoter-TSS (NM_004349) promoter-TSS (NM_004349) -786 NM_004349 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 404-13 chr5 81222271 81222506 + 2.33333 NA intron (NM_006909, intron 26 of 26) L2b|LINE|L2 -10932 NM_001099736 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 370.333-13 chr18 79739193 79739475 + 2.33333 NA intron (NM_004715, intron 12 of 12) intron (NM_004715, intron 12 of 12) 57904 NM_001202504 9150 Hs.465490 NM_004715 ENSG00000060069 CTDP1 CCFDN|FCP1 CTD phosphatase subunit 1 protein-coding 374.667-5 chr12 80561711 80561923 + 2.33333 NA intron (NM_001145026, intron 25 of 44) L1MD1|LINE|L1 117582 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 402-2 chr11 76002807 76003123 + 2.33333 NA intron (NM_003369, intron 8 of 14) AluJb|SINE|Alu 187755 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 349.667-5 chr12 33276321 33276621 + 2.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 163348 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 451.666-4 chr5 15222471 15222851 + 2.33333 NA intron (NR_109944, intron 2 of 2) LTR16A|LTR|ERVL 43899 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 435.666 chr1 40260629 40261070 + 2.33333 NA exon (NM_005857, exon 2 of 10) exon (NM_005857, exon 2 of 10) 2613 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 371.666-15 chr8 99199926 99200186 + 2.33333 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) L1MB8|LINE|L1 186790 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 303-48 chr8 82542956 82543225 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -369014 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 426.333-2 chr10 48363373 48363936 + 2.33333 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) intron (NM_001323302, intron 3 of 13) -37958 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 434-5 chr5 23243882 23244335 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -263501 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 337-2 chr1 236455361 236455515 + 2.33333 NA intron (NM_080738, intron 4 of 5) intron (NM_080738, intron 4 of 5) 60025 NM_080738 128178 Hs.352224 NM_080738 ENSG00000186197 EDARADD ECTD11A|ECTD11B|ED3|EDA3 EDAR associated death domain protein-coding 341.333-21 chr5 22222031 22222275 + 2.33333 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -8303 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 368-13 chr2 174434998 174435316 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_152529, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_152529, exon 16 of 16) 39427 NM_024583 79634 Hs.470679 NM_024583 ENSG00000144306 SCRN3 SES3 secernin 3 protein-coding 454.333 chr1 20243981 20244279 + 2.33333 NA intron (NR_147205, intron 1 of 1) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 1035 NR_147205 105376827 Hs.559701 NR_147205 ENSG00000228105 LINC01757 - long intergenic non-protein coding RNA 1757 ncRNA 412.667-12 chr4 10048458 10048738 + 2.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -8350 NM_001001290 56606 Hs.444612 NM_020041 ENSG00000109667 SLC2A9 GLUT9|GLUTX|UAQTL2|URATv1 solute carrier family 2 member 9 protein-coding 369.666-11 chr6 28500306 28500558 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 15361 NM_182701 257202 Hs.448570 NM_182701 ENSG00000198704 GPX6 GPX5p|GPXP3|GPx-6|GSHPx-6|dJ1186N24|dJ1186N24.1 glutathione peroxidase 6 protein-coding 356.666-12 chr3 113990187 113990357 + 2.33333 NA intron (NR_148531, intron 11 of 14) L1ME1|LINE|L1 42259 NM_001320467 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 385.333-23 chr5 114006435 114006603 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -355551 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 350.666-19 chr5 168004655 168004813 + 2.33333 NA intron (NM_001080428, intron 3 of 24) intron (NM_001080428, intron 3 of 24) -161111 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 383-4 chr16 86307815 86308077 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 21515 NR_038438 146513 Hs.434338 NR_038438 ENSG00000268532 LINC02135 - long intergenic non-protein coding RNA 2135 ncRNA 350.666-6 chr12 116401322 116401622 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 26846 NR_039683 100616309 NR_039683 ENSG00000264037 MIR4472-2 - microRNA 4472-2 ncRNA 458 chr1 114091802 114092289 + 2.33333 NA exon (NM_001366224, exon 7 of 7) exon (NM_001366224, exon 7 of 7) 60395 NM_205848 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 436.333 chr1 171856927 171857219 + 2.33333 NA intron (NM_001278252, intron 1 of 14) intron (NM_001278252, intron 1 of 14) -7119 NR_046845 100874284 NR_046845 ENSG00000233540 DNM3-IT1 - DNM3 intronic transcript 1 ncRNA 366-18 chr4 88502961 88503232 + 2.33333 NA intron (NM_016323, intron 20 of 22) L1ME3A|LINE|L1 20680 NM_032906 100996939 Hs.26136 NM_032906 ENSG00000145337 PYURF PREY PIGY upstream reading frame protein-coding 341.333-22 chr5 62422076 62422265 + 2.33333 NA intron (NM_001134779, intron 1 of 29) AluSx1|SINE|Alu 3286 NM_001134779 51194 Hs.482269 NM_016338 ENSG00000086200 IPO11 RanBP11 importin 11 protein-coding 389.666-7 chr8 128961294 128961469 + 2.33333 NA intron (NR_145483, intron 2 of 3) intron (NR_145483, intron 2 of 3) 4620 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 503.332-2 chr5 101033391 101033694 + 2.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -130260 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 383.666-3 chr14 60700537 60700763 + 2.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 23701 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 347.666-20 chr9 22342618 22342873 + 2.33333 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -104079 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 557.999 chr2 149296799 149297233 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -32969 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 371.333-23 chr8 122373067 122373336 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 195443 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 341.666-10 chr4 29141796 29142075 + 2.33333 NA Intergenic (TTAATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -72357 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 507.666-4 chr6 113560325 113560672 + 2.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 89577 NR_125844 101927686 Hs.402044 NR_125844 ENSG00000230943 LINC02541 - long intergenic non-protein coding RNA 2541 ncRNA 609.333 chr2 76520311 76520760 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -465430 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 285-31 chr6 130451605 130451775 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 14573 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 323.666-6 chr17 51252891 51253054 + 2.33333 NA intron (NM_017643, intron 2 of 16) HAL1|LINE|L1 7077 NM_017643 54799 Hs.656803 NM_017643 ENSG00000011258 MBTD1 SA49P01 mbt domain containing 1 protein-coding 541.667-2 chr6 57068441 57068820 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -21400 NM_015555 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 384.999-4 chr6 9031727 9031892 + 2.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 379600 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 325.666-16 chr7 33911593 33911751 + 2.33333 NA intron (NM_133468, intron 3 of 15) MIRb|SINE|MIR 6133 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 380.666-13 chr5 124996087 124996346 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -40615 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 364.333-22 chr5 117074077 117074263 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -311961 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 358.666-13 chr6 54334968 54335152 + 2.33333 NA intron (NM_014464, intron 4 of 10) intron (NM_014464, intron 4 of 10) 26619 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 602 chr11 90469647 90470149 + 2.33333 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 85959 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 406.666-2 chr14 71837285 71837580 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -94739 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 383-10 chr8 100983777 100984065 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -30539 NM_003406 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 498.999-2 chr2 185798068 185798318 + 2.33333 NA intron (NM_173651, intron 16 of 22) intron (NM_173651, intron 16 of 22) 1957 NR_144453 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 357-19 chr5 58871409 58871588 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 128400 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 466.667-2 chr17 67877047 67877319 + 2.33333 NA intron (NM_004459, intron 5 of 29) L2a|LINE|L2 51680 NM_004459 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 246.666-25 chr20 35844725 35844856 + 2.33333 NA intron (NM_016436, intron 3 of 17) intron (NM_016436, intron 3 of 17) 72775 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 372.333-17 chr4 37461053 37461244 + 2.33333 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) L1PA10|LINE|L1 7223 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 353.333-38 chr8 82657442 82657593 + 2.33333 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -254587 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 354.333-9 chr19 27618264 27618420 + 2.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -175089 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 387-6 chr12 107758285 107758525 + 2.33333 NA intron (NR_120474, intron 4 of 4) AluJr|SINE|Alu 2732 NM_012406 11108 Hs.506655 NM_012406 ENSG00000110851 PRDM4 PFM1 PR/SET domain 4 protein-coding 567.999-2 chr2 25853188 25853544 + 2.33333 NA intron (NM_018263, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 -22465 NM_001369346 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 805.332 chr4 34415128 34415940 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -145787 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 329.333-19 chr2 55101273 55101496 + 2.33333 NA intron (NM_001321904, intron 1 of 9) intron (NM_001321904, intron 1 of 9) 36447 NM_001321904 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 392.333-8 chr6 56978997 56979282 + 2.33333 NA intron (NM_001318539, intron 1 of 3) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 24032 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 713.333 chr3 163420094 163420425 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -116958 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 278.999-2 chr1 46566343 46566498 + 2.33333 NA intron (NM_198973, intron 8 of 11) L1MB4|LINE|L1 -14763 NM_001322255 148930 Hs.350764 NM_182516 ENSG00000162456 KNCN Kino|L5 kinocilin protein-coding 417.666 chr10 39071857 39072222 + 2.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 375443 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 501.999-2 chr2 237460608 237461189 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -25512 NM_001281474 79083 Hs.102406 NM_024101 ENSG00000115648 MLPH SLAC2-A melanophilin protein-coding 374-15 chr4 143738742 143738983 + 2.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -38187 NM_001168235 166752 Hs.252714 NM_001168235 ENSG00000183090 FREM3 - FRAS1 related extracellular matrix 3 protein-coding 272.666-9 chr18 71526464 71526627 + 2.33333 NA intron (NR_038326, intron 3 of 4) intron (NR_038326, intron 3 of 4) 52411 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 380.333-10 chr7 53344725 53344985 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 309222 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 341-28 chr8 129127808 129128053 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 113310 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 370.333-15 chr2 118277091 118277326 + 2.33333 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -90822 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 370.333 chr1 16266901 16267161 + 2.33333 NA intron (NM_018994, intron 4 of 9) intron (NM_018994, intron 4 of 9) -29848 NM_030907 79363 Hs.546430 NM_030907 ENSG00000132881 CPLANE2 C1orf89|RSG1 ciliogenesis and planar polarity effector 2 protein-coding 564.666 chr3 90090032 90090452 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 982621 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 381.333-15 chr22 25179697 25179888 + 2.33333 NA intron (NM_001145206, intron 7 of 10) L1M5|LINE|L1 -20066 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 486.334 chr10 28764498 28764988 + 2.33333 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) AluSz|SINE|Alu 21093 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 308-7 chr10 59221666 59221880 + 2.33333 NA intron (NM_001143774, intron 1 of 4) intron (NM_001143774, intron 1 of 4) 44306 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 551.667 chr2 196864724 196865093 + 2.33333 NA intron (NM_001321099, intron 21 of 27) intron (NM_001321099, intron 21 of 27) -54632 NM_213608 401027 Hs.245666 NM_213608 ENSG00000187944 C2orf66 IIDS6411|UNQ6411 chromosome 2 open reading frame 66 protein-coding 405.999-2 chr9 111226912 111227409 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 44054 NR_106989 102465800 NR_106989 ENSG00000274263 MIR7702 hsa-mir-7702 microRNA 7702 ncRNA 348.333-16 chr2 68442177 68442341 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 25035 NR_133923 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 620.333 chr11 124107912 124108422 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -7237 NM_014622 4013 Hs.152944 NM_014622 ENSG00000110002 VWA5A BCSC-1|BCSC1|LOH11CR2A von Willebrand factor A domain containing 5A protein-coding 520-5 chr9 28754125 28754430 + 2.33333 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR -34972 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 501-3 chr2 48686568 48686852 + 2.33333 NA TTS (NM_000233) TTS (NM_000233) 68854 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 332.333-15 chr2 188485929 188486205 + 2.33333 NA intron (NM_001252669, intron 4 of 8) intron (NM_001252669, intron 4 of 8) 188575 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 346.666-11 chr3 96875646 96875831 + 2.33333 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 61144 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 664.666 chr8 121785564 121786043 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -144363 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 381.666-2 chr11 17289232 17289406 + 2.33333 NA intron (NM_001352669, intron 3 of 14) Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 12349 NM_001352670 4925 Hs.654599 NM_005013 ENSG00000070081 NUCB2 HEL-S-109|NEFA nucleobindin 2 protein-coding 395.333-13 chr18 34939649 34939944 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -37132 NM_001143826 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 365-11 chr17 39560229 39560442 + 2.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 47585 NM_006160 4761 Hs.322431 NM_006160 ENSG00000171532 NEUROD2 EIEE72|NDRF|bHLHa1 neuronal differentiation 2 protein-coding 331.666-16 chr3 128877448 128877696 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -1918 NR_033426 28976 Hs.567482 NM_014049 ENSG00000177646 ACAD9 MC1DN20|NPD002 acyl-CoA dehydrogenase family member 9 protein-coding 338.999-2 chr12 71145696 71145956 + 2.33333 NA intron (NM_001369760, intron 1 of 7) intron (NM_001369760, intron 1 of 7) 11983 NM_001369760 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 357-2 chr1 97597982 97598151 + 2.33333 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) MIR|SINE|MIR -198855 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 320.667-27 chr4 61258836 61259057 + 2.33333 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 56774 NM_001371342 424.667-5 chr2 40907347 40907750 + 2.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -395113 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 391-8 chr15 92775418 92775617 + 2.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -19967 NR_033769 728619 Hs.684129 NR_033769 ASB9P1 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 pseudogene 1 pseudo 366.999-4 chr2 233962842 233963091 + 2.33333 NA intron (NM_024080, intron 12 of 25) intron (NM_024080, intron 12 of 25) 45593 NM_024080 79054 Hs.366053 NM_024080 ENSG00000144481 TRPM8 LTRPC6|LTrpC-6|TRPP8|trp-p8 transient receptor potential cation channel subfamily M member 8 protein-coding 469.999-3 chr12 55332676 55332909 + 2.33333 NA TTS (NM_054104) TTS (NM_054104) 1091 NM_054104 254786 Hs.553653 NM_054104 ENSG00000205329 OR6C3 OST709 olfactory receptor family 6 subfamily C member 3 protein-coding 353.666-7 chr4 60425138 60425346 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -497377 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 364.333-25 chr6 159821410 159821671 + 2.33333 NA TTS (NM_001271862) TTS (NM_001271862) 21264 NM_001271862 154197 Hs.349077 NM_173516 ENSG00000146453 PNLDC1 HsPNLDC1 PARN like, ribonuclease domain containing 1 protein-coding 493.666 chr14 55212673 55213022 + 2.33333 NA Intergenic MER61D|LTR|ERV1 -21262 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 345.666-2 chr1 207465717 207465865 + 2.33333 NA intron (NM_001006658, intron 1 of 19) intron (NM_001006658, intron 1 of 19) 11463 NM_001877 1380 Hs.445757 NM_001877 ENSG00000117322 CR2 C3DR|CD21|CR|CVID7|SLEB9 complement C3d receptor 2 protein-coding 355.334-6 chr2 163991651 163991930 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -255782 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 320-5 chr11 36285235 36285447 + 2.33333 NA intron (NM_001307932, intron 1 of 4) L1MD1|LINE|L1 4083 NM_001307932 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 424.333-6 chr5 66543949 66544203 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -32472 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 451.999-3 chr3 152587392 152587716 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -246564 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 357.333-27 chr9 31616837 31617097 + 2.33333 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -235477 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 270.333-51 chr6 17852902 17853085 + 2.33333 NA intron (NM_001105567, intron 6 of 36) intron (NM_001105567, intron 6 of 36) 134642 NM_001105568 63971 Hs.94499 NM_022113 ENSG00000137177 KIF13A RBKIN|bA500C11.2 kinesin family member 13A protein-coding 326.333-10 chr17 52357747 52357897 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -32700 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 597.666-2 chr8 60427424 60427895 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -13841 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 269.666-3 chr1 201826790 201826937 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001167738, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001167738, exon 27 of 27) -2294 NM_018085 55705 Hs.596014 NM_018085 ENSG00000198700 IPO9 Imp9 importin 9 protein-coding 354.666-12 chr3 73115963 73116121 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 54383 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 360 chr1 34557788 34558086 + 2.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 111757 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 522.667 chr1 84103993 84104490 + 2.33333 NA intron (NM_002731, intron 1 of 9) L1MA5|LINE|L1 26162 NM_207578 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 349.333-13 chr14 84827512 84827768 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -444292 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 331.333-24 chr2 15742957 15743124 + 2.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 52258 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 549.666-2 chr2 159466198 159466645 + 2.33333 NA intron (NM_001329858, intron 3 of 36) L2c|LINE|L2 -148873 NR_110587 643072 Hs.632541 NR_110587 LOC643072 - uncharacterized LOC643072 ncRNA 381-9 chr3 118487927 118488163 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -153723 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 262-46 chr2 182740107 182740287 + 2.33333 NA non-coding (NR_073365, exon 12 of 24) non-coding (NR_073365, exon 12 of 24) 23940 NR_073367 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 609 chr4 64544765 64545270 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -135557 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 378-4 chr11 13802976 13803245 + 2.33333 NA intron (NR_149108, intron 3 of 3) L1ME3B|LINE|L1 18724 NR_149108 105376562 Hs.577257 NR_149108 ENSG00000255411 LINC02548 - long intergenic non-protein coding RNA 2548 ncRNA 300.666-7 chr2 138451526 138451706 + 2.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -50154 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 428.333 chr10 82551121 82551450 + 2.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -318365 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 334.666-16 chr7 97569310 97569543 + 2.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -162660 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 360-26 chr8 121058175 121058403 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -246243 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 299.333-38 chr2 52247757 52247904 + 2.33333 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1ME4b|LINE|L1 -122818 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 378.999 chr1 61232961 61233135 + 2.33333 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 20470 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 250.667-3 chr1 119056575 119056774 + 2.33333 NA intron (NR_126447, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 9269 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 337.666-5 chr2 40309805 40309992 + 2.33333 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) L1MB7|LINE|L1 120406 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 360-14 chr2 128877458 128877627 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 12942 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 475.666-2 chr19 30575940 30576382 + 2.33333 NA intron (NM_001352260, intron 4 of 5) intron (NM_001352260, intron 4 of 5) 203777 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 206.333-167 chr8 120980687 120980945 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -168770 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 550-2 chr22 34985195 34985672 + 2.33333 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 12483 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 543.999 chr2 129493882 129494172 + 2.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -220136 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 364.333-18 chr21 30694448 30694745 + 2.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 24181 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 308.667-9 chr10 67039478 67039678 + 2.33333 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) intron (NR_111909, intron 2 of 2) 27312 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 475.666-3 chr4 89099020 89099415 + 2.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -13600 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 371.666-7 chr2 111032664 111032898 + 2.33333 NA intron (NM_001371254, intron 16 of 18) intron (NM_001371254, intron 16 of 18) 82807 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 343.333-9 chr12 123989225 123989403 + 2.33333 NA intron (NM_001204298, intron 3 of 4) intron (NM_001204298, intron 3 of 4) 16099 NM_001204298 144348 Hs.524828 NM_152437 ENSG00000179195 ZNF664 ZFOC1|ZNF176 zinc finger protein 664 protein-coding 389.333-19 chr7 138286313 138286526 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 162661 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 292-44 chr5 175560236 175560464 + 2.33333 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 81790 NM_001322977 94081 Hs.369440 NM_022754 ENSG00000164466 SFXN1 SLC56A1|TCC sideroflexin 1 protein-coding 563.666-4 chr8 49714368 49714609 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -195308 NM_001321775 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 370-19 chr4 105131467 105131736 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -14274 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 350.333-18 chr4 70130265 70130716 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -3114 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 711 chr10 113846618 113847165 + 2.33333 NA intron (NM_001271816, intron 4 of 9) MER2|DNA|TcMar-Tigger 7191 NM_014881 9937 Hs.1560 NM_014881 ENSG00000198924 DCLRE1A PSO2|SNM1|SNM1A DNA cross-link repair 1A protein-coding 336.333-13 chr14 31402274 31402494 + 2.33333 NA intron (NM_015473, intron 2 of 35) intron (NM_015473, intron 2 of 35) 18166 NM_015473 25938 Hs.744979 NM_015473 ENSG00000129493 HEATR5A C14orf125 HEAT repeat containing 5A protein-coding 381.999-6 chr22 28110541 28110723 + 2.33333 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -190020 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 326.333-29 chr6 162233038 162233231 + 2.33333 NA intron (NM_004562, intron 3 of 11) intron (NM_004562, intron 3 of 11) -493998 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 304.666-5 chr10 32631270 32631447 + 2.33333 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) L1M4|LINE|L1 185218 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 270-9 chr11 79679409 79679592 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -238470 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 456.666-2 chr17 83164880 83165344 + 2.33333 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -61785 NR_029406 388574 Hs.546918 NR_029406 ENSG00000232938 RPL23AP87 - ribosomal protein L23a pseudogene 87 pseudo 446-13 chr9 74011751 74012049 + 2.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -359631 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 312.333-20 chr4 89903485 89903719 + 2.33333 NA intron (NM_001371403, intron 2 of 8) intron (NM_001371403, intron 2 of 8) 8748 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 368.666-13 chr2 158605418 158605590 + 2.33333 NA intron (NM_001005476, intron 4 of 20) intron (NM_001005476, intron 4 of 20) 129498 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 258.666-4 chr10 57273250 57273426 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 31221 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 301-31 chr3 126825808 126825989 + 2.33333 NA intron (NM_032343, intron 4 of 7) L1ME3|LINE|L1 121658 NM_001320610 84303 Hs.518119 NM_032343 ENSG00000159685 CHCHD6 CHCM1|MICOS25|Mic25|PPP1R23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 protein-coding 447.999-2 chr19 44156383 44156641 + 2.33333 NA exon (NM_001144824, exon 6 of 6) exon (NM_001144824, exon 6 of 6) -8550 NM_001319089 7769 Hs.145956 NM_015919 ENSG00000167380 ZNF226 - zinc finger protein 226 protein-coding 413.333 chr1 40234633 40234962 + 2.33333 NA intron (NM_012421, intron 7 of 7) intron (NM_012421, intron 7 of 7) -13140 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 372.999-2 chr4 185335448 185335657 + 2.33333 NA intron (NM_001317781, intron 10 of 18) intron (NM_001317781, intron 10 of 18) 43446 NM_018409 55805 Hs.558513 NM_018409 ENSG00000109771 LRP2BP - LRP2 binding protein protein-coding 227.333-79 chr3 78670922 78671140 + 2.33333 NA intron (NM_002941, intron 10 of 30) intron (NM_002941, intron 10 of 30) 348428 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 369.333-21 chr5 119108984 119109168 + 2.33333 NA intron (NM_001290322, intron 4 of 42) AluSp|SINE|Alu 37989 NM_001290322 1657 Hs.181042 NM_005509 ENSG00000172869 DMXL1 - Dmx like 1 protein-coding 373.666-8 chr22 28027480 28027805 + 2.33333 NA intron (NM_001145418, intron 13 of 22) intron (NM_001145418, intron 13 of 22) -107030 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 338.333-12 chr2 155972469 155972655 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 282369 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 394.333-11 chr20 56966581 56966755 + 2.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -247028 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 559-2 chr4 89642392 89642731 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -193840 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 398.666-6 chr2 162529620 162529805 + 2.33333 NA intron (NM_033272, intron 3 of 15) intron (NM_033272, intron 3 of 15) 185344 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 293.666-15 chr8 117324572 117324843 + 2.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 189712 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 368-7 chr13 37243451 37243729 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -137926 NM_145203 122011 Hs.512897 NM_145203 ENSG00000180138 CSNK1A1L CK1 casein kinase 1 alpha 1 like protein-coding 407.666-8 chr3 146515316 146515609 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_021105, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_021105, exon 9 of 9) -19471 NM_001199979 57047 Hs.744414 NM_020359 ENSG00000163746 PLSCR2 - phospholipid scramblase 2 protein-coding 373.666 chr10 54143011 54143177 + 2.33333 NA intron (NM_001354411, intron 15 of 34) LOR1-int|LTR|ERV1 -343136 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 631.333-2 chrX 49167009 49167388 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_024859, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_024859, exon 6 of 6) 4355 NM_001099681 79917 Hs.193170 NM_024859 ENSG00000269313 MAGIX JM10|PDZX MAGI family member, X-linked protein-coding 358-14 chr3 72018911 72019177 + 2.33333 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 81411 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 364.333-16 chr2 133751933 133752167 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -183587 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 284.666-7 chr14 70200617 70200869 + 2.33333 NA intron (NR_135825, intron 2 of 3) L1ME3A|LINE|L1 -11673 NM_033262 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 388-4 chr10 102889206 102889509 + 2.33333 NA intron (NM_020682, intron 9 of 10) L1MA4|LINE|L1 19887 NM_020682 57412 Hs.720370 NM_020682 ENSG00000214435 AS3MT CYT19 arsenite methyltransferase protein-coding 484.333-2 chr5 33363170 33363415 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -77404 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 380.667-8 chr20 53213012 53213226 + 2.33333 NA intron (NM_001193421, intron 1 of 2) intron (NM_001193421, intron 1 of 2) 27836 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 563.332 chr6 168580154 168580474 + 2.33333 NA intron (NM_001166412, intron 7 of 12) intron (NM_001166412, intron 7 of 12) 139130 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 263.667-50 chr2 182790862 182791059 + 2.33333 NA non-coding (NR_073365, exon 24 of 24) non-coding (NR_073365, exon 24 of 24) 74703 NR_073367 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 462-4 chr10 96372436 96373013 + 2.33333 NA intron (NM_012465, intron 19 of 20) intron (NM_012465, intron 19 of 20) -13359 NM_001284321 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 312-39 chr4 98711680 98711847 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 52861 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 436.666-7 chr4 187686080 187686279 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -13538 NR_110436 100506272 Hs.508163 NR_110436 ENSG00000250590 LINC02492 - long intergenic non-protein coding RNA 2492 ncRNA 489.333 chr2 109041981 109042409 + 2.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -52975 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 357.666-8 chr5 26635265 26635442 + 2.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 403233 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 333.333-31 chr2 164227632 164227800 + 2.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 340779 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 332.333-25 chr8 119152396 119152637 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -55847 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 348.333-18 chr2 100331450 100331688 + 2.33333 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -8836 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 412.334-4 chr2 122980774 122981085 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 92552 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 355.333-30 chr5 125494926 125495079 + 2.33333 NA intron (NR_109887, intron 1 of 3) L1PB3|LINE|L1 1741 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 329-22 chr6 43373078 43373342 + 2.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -3563 NM_014345 24149 Hs.509718 NM_014345 ENSG00000171467 ZNF318 HRIHFB2436|TZF|ZFP318 zinc finger protein 318 protein-coding 446.667-3 chr14 31833427 31833756 + 2.33333 NA intron (NM_001201573, intron 6 of 8) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -111262 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 373.334-3 chr11 38926338 38926604 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 277613 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 326.333-24 chr5 106768895 106769065 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 242034 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 353.666-11 chr7 111254329 111254508 + 2.33333 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 163291 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 322.667-6 chr11 65258804 65259037 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -3042 NM_002689 23649 Hs.201897 NM_002689 ENSG00000014138 POLA2 - DNA polymerase alpha 2, accessory subunit protein-coding 363.333-4 chr11 113494293 113494573 + 2.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19035 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 357.334-2 chr13 67195739 67196007 + 2.33333 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) L1MB8|LINE|L1 34463 NM_001318372 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 523.333-5 chr6 71348307 71348748 + 2.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 28504 NR_029598 407032 NR_029598 ENSG00000199094 MIR30C2 MIRN30C2|mir-30c-2 microRNA 30c-2 ncRNA 597.667 chr4 124919281 124919686 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -206751 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 344.333-18 chr4 180707775 180707984 + 2.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 451270 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 448.667-4 chr20 49625142 49625504 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -57186 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 881 chr10 86505684 86506455 + 2.33333 NA intron (NM_001318328, intron 2 of 18) AluJb|SINE|Alu 15715 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 557.667 chr13 113099094 113099561 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001112732, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_001112732, exon 30 of 30) -6461 NM_019616 2155 Hs.36989 NM_000131 ENSG00000057593 F7 SPCA coagulation factor VII protein-coding 343-19 chr7 31574707 31574892 + 2.33333 NA intron (NM_194300, intron 6 of 12) intron (NM_194300, intron 6 of 12) 21797 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 392.666-9 chr5 149567245 149567587 + 2.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -14082 NM_001001669 389337 Hs.256206 NM_001001669 ENSG00000183111 ARHGEF37 - Rho guanine nucleotide exchange factor 37 protein-coding 422.333-6 chr5 119933552 119934030 + 2.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 304232 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 367.667-21 chr8 120202218 120202503 + 2.33333 NA intron (NM_021110, intron 8 of 47) intron (NM_021110, intron 8 of 47) 77258 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 454.666-5 chr7 152401861 152402388 + 2.33333 NA intron (NM_170606, intron 1 of 58) AluSp|SINE|Alu 33879 NM_170606 58508 Hs.647120 NM_021230 ENSG00000055609 KMT2C HALR|KLEFS2|MLL3 lysine methyltransferase 2C protein-coding 238.667-8 chr1 215391897 215392122 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -175295 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 647.667 chr5 6725213 6725704 + 2.33333 NA intron (NM_001171805, intron 1 of 12) intron (NM_001171805, intron 1 of 12) 12026 NM_001171805 11044 Hs.481542 NM_006999 ENSG00000112941 TENT4A LAK-1|LAK1|PAPD7|POLK|POLS|TRF4|TRF4-1|TRF41|TUTASE5 terminal nucleotidyltransferase 4A protein-coding 207.334-7 chr8 85908382 85908583 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -80540 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 412.001 chr10 87626962 87627340 + 2.33333 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -32727 NM_004670 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 491.334 chr14 68219548 68219884 + 2.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1PB1|LINE|L1 396124 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 574.666 chr1 14443419 14444114 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -23793 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 416.667-16 chr6 61793487 61793765 + 2.33333 NA intron (NR_146874, intron 6 of 13) L1ME3Cz|LINE|L1 219496 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 299-19 chr17 31367573 31367810 + 2.33333 NA intron (NM_001042492, intron 57 of 57) intron (NM_001042492, intron 57 of 57) -23984 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 410.667-4 chr14 49023729 49024115 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 562458 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 387.333-2 chr14 56501403 56501582 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -12839 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 386-11 chr5 8920371 8920628 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 80767 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 470.666-2 chr21 28956814 28957051 + 2.33333 NA exon (NM_001320766, exon 15 of 29) exon (NM_001320766, exon 15 of 29) 35945 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 421.333 chr14 75788984 75789234 + 2.33333 NA intron (NM_015072, intron 26 of 31) L1ME3F|LINE|L1 127863 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 539.666-2 chr8 104519800 104520194 + 2.33333 NA intron (NM_001135703, intron 1 of 5) intron (NM_001135703, intron 1 of 5) -35532 NR_030330 693127 NR_030330 ENSG00000208032 MIR548A3 MIRN548A3 microRNA 548a-3 ncRNA 438-9 chr4 171037538 171037854 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -2906 NR_038838 100506122 Hs.434205 NR_038838 ENSG00000248872 LINC02431 - long intergenic non-protein coding RNA 2431 ncRNA 316-23 chr2 38781376 38781525 + 2.33333 NA intron (NM_024775, intron 2 of 2) intron (NM_024775, intron 2 of 2) 3240 NM_024775 79833 Hs.143818 NM_024775 ENSG00000152147 GEMIN6 - gem nuclear organelle associated protein 6 protein-coding 454.999 chr12 45944844 45945043 + 2.33333 NA intron (NM_004719, intron 6 of 14) intron (NM_004719, intron 6 of 14) 45631 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 379.333-6 chr21 29145544 29145783 + 2.33333 NA promoter-TSS (NM_001286624) promoter-TSS (NM_001286624) 86 NM_001286624 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 443.333-11 chr9 12781351 12781566 + 2.33333 NA intron (NM_203403, intron 1 of 1) L1MA3|LINE|L1 6438 NM_203403 286343 Hs.445356 NM_203403 ENSG00000153714 LURAP1L C9orf150|HYST0841|LRAP35b|bA3L8.2 leucine rich adaptor protein 1 like protein-coding 190-61 chr2 48261506 48261605 + 2.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -53127 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 327-26 chr8 24023939 24024087 + 2.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -169207 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 436-4 chr11 98968403 98968895 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -52300 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 515.999 chr14 60224147 60224571 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -21391 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 321.666-11 chr4 65978635 65978785 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -298114 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 287-33 chr7 46513398 46513650 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 183598 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 500.333 chr14 74845555 74845824 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 18145 NM_001243007 283571 Hs.675293 NM_001080408 ENSG00000119608 PROX2 PROX-2 prospero homeobox 2 protein-coding 215-76 chr7 1986749 1986953 + 2.33333 NA intron (NM_001013837, intron 14 of 18) intron (NM_001013837, intron 14 of 18) -46280 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 558.999-2 chr18 63246203 63246635 + 2.33333 NA intron (NM_000633, intron 2 of 2) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 72961 NM_000657 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 388-12 chr2 182065361 182065706 + 2.33333 NA intron (NM_001261425, intron 4 of 5) intron (NM_001261425, intron 4 of 5) 79680 NM_001261425 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 361.999-9 chr6 42415115 42415271 + 2.33333 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) L1ME4b|LINE|L1 36858 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 427.333-5 chr2 61561508 61561863 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -23329 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 570.999 chr4 65821993 65822286 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -151644 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 424.999-2 chr2 27478783 27479169 + 2.33333 NA intron (NM_015662, intron 10 of 47) intron (NM_015662, intron 10 of 47) 10767 NM_015662 26160 Hs.127401 NM_015662 ENSG00000138002 IFT172 BBS20|NPHP17|RP71|SLB|SRTD10|osm-1|wim intraflagellar transport 172 protein-coding 409.666 chr10 33241712 33242078 + 2.33333 NA intron (NM_001244973, intron 6 of 16) intron (NM_001244973, intron 6 of 16) 92772 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 416.666-5 chr2 44418405 44418713 + 2.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L1ME2|LINE|L1 56612 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 370.666-20 chr7 2155652 2155846 + 2.33333 NA intron (NM_001013837, intron 10 of 18) L1MB3|LINE|L1 -66697 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 459.333-6 chr14 45227863 45228199 + 2.33333 NA intron (NM_018353, intron 8 of 16) AluJb|SINE|Alu 25171 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 504.999 chr17 8695806 8696112 + 2.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 48877 NM_001158261 146849 Hs.121438 NM_144681 ENSG00000161973 CCDC42 CCDC42A coiled-coil domain containing 42 protein-coding 460.667-2 chr14 84602136 84602476 + 2.33333 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 -669626 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 517.666-2 chr7 53466954 53467280 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 344814 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 392.666-7 chr5 59272984 59273158 + 2.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 3044 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 390-18 chr3 102385786 102386071 + 2.33333 NA Intergenic MER99|DNA|hAT? -49087 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 497.333-4 chr3 88652534 88652887 + 2.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 314254 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 361.333-23 chr4 161038223 161038396 + 2.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -984424 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 342.333-18 chr20 52559662 52559856 + 2.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -61079 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 364.666-3 chr14 40031302 40031604 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -598953 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 374.333-14 chr6 119696618 119696846 + 2.33333 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 146924 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 447 chr1 86261038 86261519 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 96409 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 386.666-12 chr6 111797076 111797335 + 2.33333 NA intron (NM_153047, intron 2 of 13) intron (NM_153047, intron 2 of 13) -37288 NM_001370529 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 345.333-7 chr12 16980418 16980592 + 2.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -8242 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 448.333-5 chr17 66145523 66145832 + 2.33333 NA intron (NM_001353129, intron 4 of 26) L1ME1|LINE|L1 46215 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 379.666 chr1 184596524 184596759 + 2.33333 NA intron (NM_030806, intron 4 of 5) AluSx3|SINE|Alu 158217 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 498.999 chr18 60697550 60697813 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -324906 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 341.666-17 chr7 87739707 87739934 + 2.33333 NA exon (NM_001134405, exon 5 of 11) exon (NM_001134405, exon 5 of 11) -26497 NM_001348944 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 463.333-6 chr21 45225739 45226068 + 2.33333 NA non-coding (NR_027673, exon 13 of 13) non-coding (NR_027673, exon 13 of 13) -8437 NR_135279 114042 Hs.375832 NR_135279 ENSG00000182586 LINC00334 C21orf89|NCRNA00334 long intergenic non-protein coding RNA 334 ncRNA 556.666 chr17 27224426 27224871 + 2.33333 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 69348 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 367-7 chr2 72550298 72550541 + 2.33333 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) intron (NR_135774, intron 8 of 19) 275614 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 329.666-7 chr22 24089657 24089881 + 2.33333 NA intron (NM_012295, intron 23 of 36) intron (NM_012295, intron 23 of 36) 78399 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 766.334 chr10 19036119 19036868 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -12308 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 416.667-15 chr6 54352471 54352740 + 2.33333 NA intron (NM_014464, intron 8 of 10) MIRb|SINE|MIR 44164 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 417.999-4 chr4 65108038 65108313 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -103675 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 752.999 chr9 27895295 27896029 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -321796 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 275.333 chr1 77585250 77585414 + 2.33333 NA intron (NM_001308237, intron 4 of 13) intron (NM_001308237, intron 4 of 13) 97326 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 452.666 chr10 68103181 68103467 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -2683 NR_045662 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 457-3 chr17 59348703 59349156 + 2.33333 NA intron (NM_001005404, intron 1 of 4) AluYc|SINE|Alu -17154 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 387.334-2 chr10 24328816 24329245 + 2.33333 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) (TAGCATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 53345 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 442.666 chr3 80460873 80461190 + 2.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -303866 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 359.333-9 chr18 10218009 10218270 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 196231 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 351.333-31 chr8 137791330 137791491 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 292135 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 268.333-20 chr15 25994955 25995125 + 2.33333 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) intron (NR_040082, intron 1 of 4) 92680 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 299.666-9 chr18 20963492 20963661 + 2.33333 NA intron (NM_005406, intron 27 of 32) intron (NM_005406, intron 27 of 32) 148237 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 333.333-34 chr21 19301264 19301418 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -541529 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 630.667 chr11 95063208 95063635 + 2.33333 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -3456 NR_103726 10929 Hs.476680 NM_032102 ENSG00000263465 SRSF8 DSM-1|SFRS2B|SRP46 serine and arginine rich splicing factor 8 protein-coding 349.666-5 chr11 74372862 74373160 + 2.33333 NA intron (NM_173582, intron 2 of 13) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 25422 NM_173582 283209 Hs.26612 NM_173582 ENSG00000165434 PGM2L1 BM32A|PMMLP phosphoglucomutase 2 like 1 protein-coding 232.667-41 chr2 128653487 128653695 + 2.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -211009 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 253.666-14 chr22 26871748 26871921 + 2.33333 NA intron (NR_146604, intron 3 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 11623 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 466.333-2 chr5 3486075 3486658 + 2.33333 NA intron (NR_033898, intron 2 of 4) L1MB5|LINE|L1 17638 NR_104618 102467075 Hs.652949 NR_104618 ENSG00000250716 LINC01017 - long intergenic non-protein coding RNA 1017 ncRNA 401.666 chr1 193853211 193853474 + 2.33333 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 548597 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 351.333-11 chr15 86781117 86781360 + 2.33333 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) L1MEi|LINE|L1 -151642 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 343.334-6 chr5 25549879 25550143 + 2.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 359058 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 391.999-7 chrX 50379866 50380105 + 2.33333 NA exon (NM_001013742, exon 19 of 28) exon (NM_001013742, exon 19 of 28) 90840 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 487-3 chr7 82322515 82322942 + 2.33333 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 121049 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 391 chr10 70370781 70371076 + 2.33333 NA intron (NR_103468, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 5851 NM_001278213 55222 Hs.7778 NM_018205 ENSG00000172731 LRRC20 - leucine rich repeat containing 20 protein-coding 767.334 chr5 25977311 25977824 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 786614 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 379.667-9 chr6 67718317 67718526 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -336930 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 395.333-17 chr4 101163651 101163894 + 2.33333 NA intron (NM_001130691, intron 2 of 12) intron (NM_001130691, intron 2 of 12) 77100 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 556.332 chr10 49694138 49694441 + 2.33333 NA intron (NM_182554, intron 2 of 2) intron (NM_182554, intron 2 of 2) 14638 NM_001042427 282966 Hs.131287 NM_182554 ENSG00000178645 C10orf53 - chromosome 10 open reading frame 53 protein-coding 348-11 chr17 63057129 63057420 + 2.33333 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) intron (NM_025185, intron 2 of 25) 91039 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 505.999 chr11 46961961 46962386 + 2.33333 NA intron (NM_001278222, intron 1 of 7) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 25412 NM_024113 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 366.666 chr10 74008129 74008382 + 2.33333 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) intron (NM_014000, intron 1 of 21) 10139 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 593.333-2 chr15 42180300 42180767 + 2.33333 NA intron (NM_015289, intron 8 of 24) intron (NM_015289, intron 8 of 24) 19133 NR_030357 693212 NR_030357 ENSG00000207712 MIR627 MIRN627|hsa-mir-627|mir-627 microRNA 627 ncRNA 523.334 chr9 75284284 75284730 + 2.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 195993 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 387.666-2 chr3 148546350 148546614 + 2.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -151389 NM_009585 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 395-8 chr17 59111306 59111637 + 2.33333 NA 3' UTR (NM_001330399, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001330399, exon 4 of 4) -4591 NM_001353082 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 359.999-2 chr22 38469651 38469853 + 2.33333 NA intron (NM_016657, intron 1 of 3) intron (NM_016657, intron 1 of 3) 1656 NM_006855 11015 Hs.745072 NM_006855 ENSG00000100196 KDELR3 ERD2L3 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3 protein-coding 304.666-15 chr20 53768279 53768494 + 2.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 107323 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 386.666-10 chr3 178554644 178554941 + 2.33333 NA intron (NR_126560, intron 5 of 7) intron (NR_126560, intron 5 of 7) -4058 NM_001278911 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 451.667 chr11 22168363 22168780 + 2.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -24514 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 398.666-5 chr16 60992922 60993295 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 62658 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 348.667-3 chr1 220797507 220797721 + 2.33333 NA intron (NM_022746, intron 3 of 6) MIR3|SINE|MIR 10701 NM_022746 64757 Hs.497816 NM_022746 ENSG00000186205 MARC1 MOSC1 mitochondrial amidoxime reducing component 1 protein-coding 447.666-2 chr2 57917585 57917893 + 2.33333 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) intron (NM_001288838, intron 1 of 15) 10088 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 410.666 chr1 118344670 118344993 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -159603 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 302.666-5 chr11 106522910 106523093 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 271594 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 402.333-16 chr9 119513066 119513428 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -143812 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 454.666 chr1 177954370 177954865 + 2.33333 NA intron (NR_151492, intron 19 of 22) intron (NR_151492, intron 19 of 22) 15305 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 385.666-2 chr10 58826219 58826560 + 2.33333 NA intron (NM_001080512, intron 20 of 20) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 111374 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 353.666 chr10 63611310 63611576 + 2.33333 NA intron (NM_001001330, intron 6 of 7) intron (NM_001001330, intron 6 of 7) -89553 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 298-12 chr10 56023722 56023950 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 337423 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 350.666-15 chr21 19091070 19091335 + 2.33333 NA Intergenic MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR -331390 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 407.333-3 chr1 110429659 110429960 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -21340 NM_032414 84432 Hs.514793 NM_032414 ENSG00000143125 PROK1 EGVEGF|PK1|PRK1 prokineticin 1 protein-coding 349-13 chr3 17271245 17271524 + 2.33333 NA intron (NM_014744, intron 15 of 21) L1PA17|LINE|L1 338188 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 397.667-10 chr5 108544625 108545063 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -162746 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 441.667-4 chr7 35338366 35338713 + 2.33333 NA intron (NR_038864, intron 1 of 2) MIR3|SINE|MIR 24684 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 526 chr16 21097550 21097818 + 2.33333 NA intron (NM_001347886, intron 17 of 61) intron (NM_001347886, intron 17 of 61) 53162 NM_001347886 55567 Hs.526500 NM_017539 ENSG00000158486 DNAH3 DNAHC3-B|DNAHC3B|HDHC8|HEL-36|HSADHC3 dynein axonemal heavy chain 3 protein-coding 322-23 chr2 205353602 205353747 + 2.33333 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) MIR3|SINE|MIR -328826 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 349.666-10 chr6 116153480 116153824 + 2.33333 NA intron (NM_152729, intron 6 of 11) MADE2|DNA|TcMar-Mariner -27520 NM_000493 1300 Hs.520339 NM_000493 ENSG00000123500 COL10A1 - collagen type X alpha 1 chain protein-coding 377.666-10 chr2 175007234 175007550 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -2013 NM_001025201 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 394.667-6 chr3 156506942 156507254 + 2.33333 NA intron (NM_172159, intron 8 of 13) intron (NM_172159, intron 8 of 13) 47027 NM_001308205 6747 Hs.518346 NM_007107 ENSG00000114850 SSR3 TRAPG signal sequence receptor subunit 3 protein-coding 316.666-5 chr14 85073131 85073431 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -198651 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 298-19 chr12 62140457 62140603 + 2.33333 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) LTR16A|LTR|ERVL 52309 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 380-8 chr16 2873200 2873388 + 2.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9901 NM_001142500 114984 Hs.534525 NM_138439 ENSG00000162076 FLYWCH2 - FLYWCH family member 2 protein-coding 347-25 chr8 78356845 78357113 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -159361 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 457.333-3 chr20 33539667 33540086 + 2.33333 NA intron (NM_001032999, intron 1 of 10) AluJr|SINE|Alu -22489 NM_001039709 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 370.666-3 chr14 88434991 88435215 + 2.33333 NA intron (NM_001040428, intron 9 of 10) MIRb|SINE|MIR 49446 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 264.333-38 chr2 105480198 105480364 + 2.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -41768 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 292.666-11 chr14 35259043 35259272 + 2.33333 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) L1MDa|LINE|L1 -19401 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 331.666-18 chr4 105095776 105095989 + 2.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -49993 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 332.999 chr3 79406055 79406224 + 2.33333 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -5588 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 354.333-15 chr6 45143895 45144115 + 2.33333 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1PB2|LINE|L1 53765 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 379.666-4 chr12 1655585 1655952 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 4612 NR_037422 100500816 NR_037422 ENSG00000266043 MIR3649 - microRNA 3649 ncRNA 348.666-3 chr10 74910736 74910940 + 2.33333 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) L3|LINE|CR1 -1948 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 369.333-2 chr1 219014710 219014941 + 2.33333 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) -96314 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 471.333-3 chr11 75091515 75091890 + 2.33333 NA intron (NM_001005285, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 5188 NM_001005285 341152 Hs.554515 NM_001005285 ENSG00000171561 OR2AT4 OR11-265 olfactory receptor family 2 subfamily AT member 4 protein-coding 499.666-3 chr2 124459865 124460149 + 2.33333 NA intron (NM_130773, intron 6 of 23) LTR75|LTR|ERVL 434720 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 371.666-14 chr6 161061242 161061507 + 2.33333 NA intron (NM_005922, intron 3 of 26) L1MC5|LINE|L1 69605 NM_005922 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 353.333-7 chr11 102635969 102636244 + 2.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -10774 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 346-31 chr6 53781770 53782059 + 2.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -13091 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 378.333-12 chr5 94530354 94530543 + 2.33333 NA intron (NM_001145678, intron 3 of 20) FLAM_C|SINE|Alu 88156 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 336.666-18 chr5 73500183 73500481 + 2.33333 NA intron (NM_001037637, intron 2 of 5) intron (NM_001037637, intron 2 of 5) 1907 NM_001207 689 Hs.591768 NM_001207 ENSG00000145741 BTF3 BETA-NAC|BTF3a|BTF3b|NACB basic transcription factor 3 protein-coding 429-9 chr7 80668582 80668973 + 2.33333 NA intron (NM_001371079, intron 8 of 13) intron (NM_001371079, intron 8 of 13) 22124 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 315-26 chr8 79058646 79058861 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 221224 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 372.333-19 chr4 167733403 167733572 + 2.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -359050 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 345.666-13 chr7 12741658 12741932 + 2.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 54162 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 335.333-15 chr15 64216127 64216279 + 2.33333 NA intron (NM_001329607, intron 5 of 11) AluJr4|SINE|Alu -53048 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 312 chr1 39853149 39853307 + 2.33333 NA intron (NM_001312692, intron 1 of 8) intron (NM_001312692, intron 1 of 8) 30276 NM_017646 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 342.666-15 chr2 123853212 123853393 + 2.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 171872 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 325.667-11 chr2 15530219 15530487 + 2.33333 NA intron (NR_052013, intron 9 of 50) L1MEd|LINE|L1 30981 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 438.666-5 chr18 10987523 10987807 + 2.33333 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) L1MA10|LINE|L1 161097 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 331.666-10 chr2 119512819 119512974 + 2.33333 NA intron (NM_002980, intron 1 of 12) HAL1|LINE|L1 11556 NM_002980 6344 Hs.42091 NM_002980 ENSG00000080293 SCTR SR secretin receptor protein-coding 382-9 chr4 32672409 32672724 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 321528 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 165-69 chr4 116339006 116339140 + 2.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 39348 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 360.666-6 chr14 83725102 83725304 + 2.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 1082571 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 361.333-10 chr2 34955025 34955202 + 2.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 277556 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 360.333-6 chr13 31360968 31361122 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 161070 NM_194318 145173 Hs.13205 NM_194318 ENSG00000187676 B3GLCT B3GALTL|B3GTL|B3Glc-T|Gal-T|beta3Glc-T beta 3-glucosyltransferase protein-coding 367.666-5 chr14 68128943 68129249 + 2.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) MIRc|SINE|MIR 305504 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 443.667-2 chr5 38544667 38545102 + 2.33333 NA intron (NM_002310, intron 1 of 19) L2b|LINE|L2 11762 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 346.666-5 chr15 64399300 64399482 + 2.33333 NA intron (NM_001321924, intron 4 of 12) intron (NM_001321924, intron 4 of 12) 11555 NM_016213 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 353-6 chr15 26596318 26596505 + 2.33333 NA intron (NM_001191320, intron 2 of 6) intron (NM_001191320, intron 2 of 6) 32679 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 381.999 chr12 91996063 91996331 + 2.33333 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 145516 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 367.666-4 chr10 58484621 58484861 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -28131 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 375.667-10 chr2 27319041 27319309 + 2.33333 NA intron (NM_002437, intron 2 of 7) LTR16E2|LTR|ERVL 3922 NM_002437 4358 Hs.75659 NM_002437 ENSG00000115204 MPV17 CMT2EE|MTDPS6|SYM1 mitochondrial inner membrane protein MPV17 protein-coding 563.666-3 chr3 119928035 119928489 + 2.33333 NA intron (NM_002093, intron 3 of 11) intron (NM_002093, intron 3 of 11) 145552 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 368.667-3 chr17 62885342 62885616 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -58736 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 440-15 chr8 121064675 121065043 + 2.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -252813 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 278-43 chr4 135799939 135800143 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 88052 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 513.999-2 chr5 57461778 57462078 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 20883 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 318.334-5 chr14 51187564 51187801 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -52565 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 425.667-9 chr5 109787730 109788012 + 2.33333 NA intron (NM_002372, intron 10 of 21) intron (NM_002372, intron 10 of 21) -95311 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 225.333-39 chr12 130029906 130030075 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 12352 NR_024457 100190940 Hs.625993 NR_024457 ENSG00000214039 LINC02418 - long intergenic non-protein coding RNA 2418 ncRNA 486.333-6 chr6 50656462 50656690 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -56968 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 599.334-2 chr3 121950385 121950784 + 2.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 56183 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 469.333-7 chrX 77497541 77497831 + 2.33333 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 50297 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 366-21 chr5 83149611 83149784 + 2.33333 NA intron (NM_001318012, intron 3 of 7) intron (NM_001318012, intron 3 of 7) 72150 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 379-5 chr2 69253490 69253885 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 133540 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 443.666 chr12 121742758 121743100 + 2.33333 NA intron (NM_001080825, intron 1 of 11) intron (NM_001080825, intron 1 of 11) 30177 NM_001080825 144404 Hs.644504 NM_001080825 ENSG00000188735 TMEM120B - transmembrane protein 120B protein-coding 500.333-2 chr2 147218751 147219068 + 2.33333 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -625608 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 311.333-31 chr20 58406583 58406822 + 2.33333 NA intron (NR_036633, intron 1 of 3) intron (NR_036633, intron 1 of 3) 17473 NR_036633 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 280.667-38 chr5 24614628 24614828 + 2.33333 NA intron (NM_001362460, intron 1 of 9) intron (NM_001362460, intron 1 of 9) 30250 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 375.333-29 chr6 64745500 64745751 + 2.33333 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -555793 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 260.667-81 chr7 32339265 32339446 + 2.33333 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L1MB2|LINE|L1 -40027 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 371-10 chr19 27957770 27957966 + 2.33333 NA intron (NR_146734, intron 3 of 7) intron (NR_146734, intron 3 of 7) -163928 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 268.666-27 chr6 152267176 152267340 + 2.33333 NA intron (NM_182961, intron 100 of 145) intron (NM_182961, intron 100 of 145) -81880 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 389-6 chr4 66404815 66405131 + 2.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 128149 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 439-5 chr6 84472803 84473164 + 2.33333 NA intron (NR_132100, intron 1 of 4) L1M4|LINE|L1 1946 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 425.334 chr15 76773936 76774356 + 2.33333 NA intron (NR_148227, intron 9 of 32) L1MC4|LINE|L1 87798 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 634.667-2 chr8 121281528 121282244 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -357460 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 339.666-10 chr3 115385640 115385870 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -237755 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 533.333-2 chr12 62922157 62922584 + 2.33333 NA intron (NM_020700, intron 1 of 9) intron (NM_020700, intron 1 of 9) 12780 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 416.333 chr1 42240381 42240636 + 2.33333 NA intron (NM_001198850, intron 4 of 12) L1M4|LINE|L1 -75763 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 476.666-5 chr7 93515503 93515837 + 2.33333 NA intron (NM_001164737, intron 2 of 15) Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 -31651 NR_030164 574442 NR_030164 ENSG00000207656 MIR489 MIRN489|hsa-mir-489|mir-489 microRNA 489 ncRNA 462-2 chr10 56218899 56219244 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 142188 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 380.333-6 chr3 46156787 46156952 + 2.33333 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 51444 NM_001295 1230 Hs.301921 NM_001295 ENSG00000163823 CCR1 CD191|CKR-1|CKR1|CMKBR1|HM145|MIP1aR|SCYAR1 C-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 545.667 chr12 24731029 24731351 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -147022 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 325.666-8 chr18 62363504 62363804 + 2.33333 NA intron (NM_001270950, intron 7 of 7) AluSg|SINE|Alu 38344 NM_003839 8792 Hs.204044 NM_003839 ENSG00000141655 TNFRSF11A CD265|FEO|LOH18CR1|ODFR|OFE|OPTB7|OSTS|PDB2|RANK|TRANCER TNF receptor superfamily member 11a protein-coding 394-19 chr8 117235462 117235798 + 2.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 100635 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 310-32 chr20 38556542 38556694 + 2.33333 NA intron (NM_001282917, intron 22 of 29) intron (NM_001282917, intron 22 of 29) -24579 NM_001018082 149685 Hs.368028 NM_174906 ENSG00000182035 ADIG SMAF1 adipogenin protein-coding 345.666-4 chr13 104509191 104509345 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -956599 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 347.333-13 chr20 2093930 2094172 + 2.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -7776 NM_080836 140901 Hs.100057 NM_080836 ENSG00000125834 STK35 CLIK1|STK35L1 serine/threonine kinase 35 protein-coding 385.334-4 chr8 54054332 54054622 + 2.33333 NA intron (NM_001279357, intron 5 of 7) intron (NM_001279357, intron 5 of 7) -32029 NM_201437 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 295-43 chr6 70023545 70023736 + 2.33333 NA exon (NM_001858, exon 12 of 51) exon (NM_001858, exon 12 of 51) 157084 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 375.666-3 chr3 56254582 56254860 + 2.33333 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) MIR|SINE|MIR 213746 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 493-4 chr6 92471531 92471779 + 2.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -781227 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 236.666-12 chr13 113474732 113474925 + 2.33333 NA intron (NM_001014283, intron 3 of 6) intron (NM_001014283, intron 3 of 6) 15883 NM_001014283 55208 Hs.682987 NM_018185 ENSG00000150401 DCUN1D2 C13orf17 defective in cullin neddylation 1 domain containing 2 protein-coding 373.666-10 chr4 71072269 71072579 + 2.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 78775 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 316-48 chr7 9447124 9447296 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -187060 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 393.333-7 chr11 21030972 21031270 + 2.33333 NA intron (NM_201551, intron 12 of 18) L1ME4a|LINE|L1 361535 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 391.667-2 chr10 19818312 19818633 + 2.33333 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 2040 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 221-7 chr1 183966376 183966549 + 2.33333 NA intron (NM_015101, intron 5 of 11) MIRb|SINE|MIR 71266 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 346.333-20 chr20 39243263 39243455 + 2.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -18611 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 414.666-5 chr15 66471256 66471616 + 2.33333 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) MIRb|SINE|MIR 25598 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 356.333-23 chr22 24830868 24831057 + 2.33333 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) intron (NM_001098498, intron 2 of 23) 24741 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 364-17 chr3 58696127 58696416 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -29497 NM_138805 131177 Hs.61265 NM_138805 ENSG00000198643 FAM3D EF7|OIT1 family with sequence similarity 3 member D protein-coding 381.667-2 chr14 85502977 85503220 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -26927 NR_144387 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 301.667-26 chr2 90070518 90070730 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -432717 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 257.666-27 chr8 130579484 130579644 + 2.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -135890 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 392.999 chr11 72863642 72863953 + 2.33333 NA intron (NM_014824, intron 13 of 19) L1MEc|LINE|L1 49386 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 325.667-12 chr2 65684604 65684805 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -252105 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 354.333 chr1 97247811 97247999 + 2.33333 NA intron (NM_000110, intron 18 of 22) L1ME2|LINE|L1 151982 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 342.333-3 chr10 28715060 28715292 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -28474 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 708.333 chr2 19765611 19766123 + 2.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -102987 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 777.999 chr18 10977365 10977993 + 2.33333 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) intron (NM_022068, intron 3 of 51) 171083 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 367.333-17 chr3 174826814 174827014 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic -32420 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 469-9 chr5 23354689 23355031 + 2.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -152749 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 459 chr1 240410204 240410447 + 2.33333 NA intron (NM_020066, intron 15 of 17) intron (NM_020066, intron 15 of 17) 201830 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 415.999 chr1 174157551 174157864 + 2.33333 NA intron (NR_121197, intron 2 of 3) intron (NR_121197, intron 2 of 3) 1580 NR_121197 102724601 Hs.563791 NR_121197 ENSG00000227373 RABGAP1L-DT - RABGAP1L divergent transcript ncRNA 267-12 chr11 39077139 39077263 + 2.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 428343 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 298.666-12 chr4 42612088 42612260 + 2.33333 NA intron (NM_001105529, intron 5 of 35) intron (NM_001105529, intron 5 of 35) 44931 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 345.333-30 chr4 33418623 33418846 + 2.33333 NA Intergenic Intergenic 621159 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 378.333-15 chr8 144609729 144610034 + 2.33333 NA intron (NM_001308207, intron 1 of 11) L1MEc|LINE|L1 3622 NM_001308207 80728 Hs.148988 NM_025251 ENSG00000147799 ARHGAP39 CrGAP|Vilse Rho GTPase activating protein 39 protein-coding 532-4 chr3 150108604 150109145 + 2 NA intron (NR_136187, intron 1 of 2) L1MC1|LINE|L1 12431 NR_136187 105374313 Hs.151216 NR_136187 LOC105374313 - uncharacterized LOC105374313 ncRNA 228-52 chr22 28254329 28254470 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L2|LINE|L2 -205470 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 408.666 chr14 63806255 63806652 + 2 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -46512 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 188-115 chr8 101391276 101391395 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 22442 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 413.666-2 chr2 30573276 30573595 + 2 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) L2b|LINE|L2 126189 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 487.667-2 chr7 149406303 149406684 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 54569 NM_015694 27153 Hs.38512 NM_015694 ENSG00000196453 ZNF777 - zinc finger protein 777 protein-coding 324-21 chr4 72457638 72457829 + 2 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 111488 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 321.667-11 chr2 89841011 89841294 + 2 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -203245 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 293-16 chr12 117713063 117713314 + 2 NA intron (NM_173598, intron 4 of 19) (AGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 255802 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 431.333 chr1 174892132 174892384 + 2 NA intron (NM_001366451, intron 5 of 12) intron (NM_001366451, intron 5 of 12) 16740 NM_001035230 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 248-24 chr14 60090148 60090329 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1673 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 641.667 chr13 96567539 96568210 + 2 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L1ME3G|LINE|L1 140645 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 409-8 chr3 86785187 86785489 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 205811 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 307.667-39 chr8 62641358 62641556 + 2 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) intron (NM_001304533, intron 3 of 6) -336404 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 507.334-6 chr6 164389293 164389572 + 2 NA Intergenic Intergenic 432631 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 384-2 chr10 91478358 91478657 + 2 NA intron (NM_182765, intron 6 of 20) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 68222 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 367.333-9 chr2 40521923 40522144 + 2 NA Intergenic Intergenic -9598 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 312.666-24 chr8 47877161 47877435 + 2 NA intron (NM_001081640, intron 40 of 84) L1MC5a|LINE|L1 82838 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 312.667-10 chr10 107616214 107616398 + 2 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -451600 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 297-15 chr11 76216411 76216559 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -9983 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 378-9 chr18 42242788 42243101 + 2 NA intron (NR_046454, intron 3 of 6) intron (NR_046454, intron 3 of 6) 56276 NR_046174 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 394.666-5 chr17 68862131 68862428 + 2 NA Intergenic Intergenic 93113 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 325-12 chr17 29877713 29877896 + 2 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) L1MA2|LINE|L1 -52099 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 312.333-4 chr11 113191108 113191347 + 2 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) 82674 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 319.333 chr1 147386698 147386909 + 2 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) L1PA10|LINE|L1 131072 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 315.666-16 chr9 29599991 29600387 + 2 NA Intergenic Intergenic -386588 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 396.667 chr1 165493805 165494109 + 2 NA intron (NR_026744, intron 5 of 6) MIR|SINE|MIR -48602 NM_001256570 6258 Hs.26550 NM_006917 ENSG00000143171 RXRG NR2B3|RXRC retinoid X receptor gamma protein-coding 299.667-26 chr4 145868967 145869237 + 2 NA intron (NM_178835, intron 5 of 14) intron (NM_178835, intron 5 of 14) 69721 NM_178835 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 294.666-33 chr7 49674033 49674282 + 2 NA Intergenic Intergenic -99481 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 307-16 chr2 221721512 221721720 + 2 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -147414 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 260-84 chr8 78255545 78255779 + 2 NA Intergenic Intergenic -260678 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 223.667-3 chr1 46125020 46125296 + 2 NA intron (NM_001303427, intron 1 of 9) intron (NM_001303427, intron 1 of 9) 5515 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 312-17 chr12 29963534 29963818 + 2 NA Intergenic Intergenic -178917 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 302.667-41 chrX 146648011 146648209 + 2 NA Intergenic Intergenic -161661 NM_001244892 100133053 NM_001244892 ENSG00000235699 CXorf51B CXorf51A chromosome X open reading frame 51B protein-coding 258-80 chr7 92072192 92072416 + 2 NA intron (NM_147185, intron 28 of 49) MIR3|SINE|MIR 62173 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 273.333-76 chr9 110423417 110423679 + 2 NA intron (NM_153366, intron 36 of 47) L1ME4a|LINE|L1 -85664 NM_001286947 255220 Hs.147064 NM_001003936 ENSG00000204193 TXNDC8 SPTRX-3|SPTRX3|TRX6|bA427L11.2 thioredoxin domain containing 8 protein-coding 325.333-19 chr2 70857050 70857248 + 2 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -21333 NM_015717 50489 Hs.199731 NM_015717 ENSG00000116031 CD207 CLEC4K CD207 molecule protein-coding 382.667-6 chr12 32114456 32114743 + 2 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 7752 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 203.667-26 chr13 90631841 90632061 + 2 NA Intergenic Intergenic 138663 NR_120414 101927224 Hs.385801 NR_120414 LINC01049 - long intergenic non-protein coding RNA 1049 ncRNA 300-64 chr8 3498068 3498333 + 2 NA intron (NM_033225, intron 10 of 69) L1M2|LINE|L1 -769749 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 265-4 chr1 96591107 96591254 + 2 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -130425 NM_001300988 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 472.666 chr17 59541037 59541543 + 2 NA Intergenic Intergenic -14433 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 469.333-5 chr7 56307819 56308210 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 140361 NR_029420 650226 Hs.448401 NR_029420 LOC650226 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene pseudo 313.333-17 chr18 4189904 4190208 + 2 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) L1MC2|LINE|L1 -74546 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 345-18 chr6 51904295 51904665 + 2 NA intron (NM_138694, intron 41 of 66) intron (NM_138694, intron 41 of 66) 183133 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 273.667-48 chr6 100479040 100479220 + 2 NA Intergenic Intergenic -15455 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 199.667-37 chr13 22692540 22692671 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 205576 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 316-25 chr2 117151611 117151817 + 2 NA Intergenic Intergenic -662977 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 394.666 chr10 120768586 120768925 + 2 NA intron (NR_033850, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 82424 NR_033850 283089 Hs.568750 NR_033850 ENSG00000227165 WDR11-AS1 - WDR11 antisense RNA 1 ncRNA 335.666-10 chr5 100737624 100737858 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 78824 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 316-7 chr11 84298438 84298725 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) L2c|LINE|L2 18758 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 470-2 chr22 28444947 28445402 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -14695 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 409.333-5 chr11 91502541 91502897 + 2 NA Intergenic Intergenic -633517 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 622-3 chr2 16652466 16652928 + 2 NA intron (NM_030797, intron 1 of 11) intron (NM_030797, intron 1 of 11) 13137 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 283.667-26 chr4 36157278 36157467 + 2 NA intron (NR_146894, intron 15 of 32) intron (NR_146894, intron 15 of 32) 86567 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 318-33 chr20 54594919 54595152 + 2 NA intron (NM_018431, intron 5 of 7) (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 119442 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 282.334-2 chr1 164657045 164657252 + 2 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) Mam_R4|LINE|Dong-R4 97426 NM_001353130 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 413.333-17 chr9 33868481 33868826 + 2 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) intron (NM_017811, intron 1 of 4) 51493 NM_017811 54926 Hs.643648 NM_017811 ENSG00000107341 UBE2R2 CDC34B|E2-CDC34B|UBC3B ubiquitin conjugating enzyme E2 R2 protein-coding 320-15 chr14 51016874 51017136 + 2 NA intron (NM_015163, intron 3 of 9) intron (NM_015163, intron 3 of 9) -72522 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 316-27 chr2 126270977 126271150 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -153078 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 259.667-33 chr2 66500795 66500984 + 2 NA intron (NM_002398, intron 7 of 12) intron (NM_002398, intron 7 of 12) -60559 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 220-29 chr12 28828205 28828386 + 2 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner -320983 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 558.666-2 chr21 27470252 27470745 + 2 NA Intergenic Intergenic -251881 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 313-39 chr8 11698442 11698705 + 2 NA intron (NM_001308094, intron 1 of 6) intron (NM_001308094, intron 1 of 6) -5629 NM_002052 2626 Hs.243987 NM_002052 ENSG00000136574 GATA4 ASD2|TACHD|TOF|VSD1 GATA binding protein 4 protein-coding 434.667-7 chr7 13231681 13232024 + 2 NA Intergenic Intergenic 544219 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 328-35 chr6 39963614 39963853 + 2 NA Intergenic Intergenic -29271 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 295.333-26 chr2 138561366 138561647 + 2 NA intron (NM_001001664, intron 8 of 10) (TATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 59736 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 301-60 chr9 15459450 15459620 + 2 NA intron (NM_001369648, intron 8 of 8) intron (NM_001369648, intron 8 of 8) 36659 NR_161440 6619 Hs.546299 NM_003084 ENSG00000164975 SNAPC3 PTFbeta|SNAP50 small nuclear RNA activating complex polypeptide 3 protein-coding 275-2 chr1 31027617 31027793 + 2 NA intron (NM_001020658, intron 3 of 21) intron (NM_001020658, intron 3 of 21) 38012 NM_014676 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 383.333-15 chr7 2990494 2990808 + 2 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) L1ME2|LINE|L1 53216 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 343.667-2 chr14 60634588 60634771 + 2 NA Intergenic UCON35|Unknown|Unknown -4537 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 252-17 chr11 77810399 77810551 + 2 NA intron (NM_016578, intron 1 of 15) intron (NM_016578, intron 1 of 15) 10359 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 321.333-19 chr12 118160441 118160697 + 2 NA intron (NM_001346490, intron 19 of 21) intron (NM_001346490, intron 19 of 21) 24445 NM_002567 5037 Hs.433863 NM_002567 ENSG00000089220 PEBP1 HCNP|HCNPpp|HEL-210|HEL-S-34|HEL-S-96|PBP|PEBP|PEBP-1|RKIP phosphatidylethanolamine binding protein 1 protein-coding 287-41 chr9 87432233 87432392 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -64916 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 288-29 chr2 100952574 100952790 + 2 NA intron (NM_002518, intron 7 of 20) intron (NM_002518, intron 7 of 20) 24479 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 307.334 chr1 46368799 46369033 + 2 NA Intergenic Intergenic -25401 NM_001441 2166 Hs.720143 NM_001441 ENSG00000117480 FAAH FAAH-1|PSAB fatty acid amide hydrolase protein-coding 221.333-24 chr11 32810435 32810593 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -15856 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 369.666-7 chr2 223685089 223685382 + 2 NA Intergenic Intergenic -82874 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 266-62 chr4 53524719 53524897 + 2 NA intron (NM_001126328, intron 2 of 10) MER91A|DNA|hAT-Tip100 24731 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 242.666-13 chr12 127332092 127332289 + 2 NA intron (NR_110057, intron 2 of 2) intron (NR_110057, intron 2 of 2) 7882 NR_110057 101927616 Hs.637827 NR_110057 ENSG00000256362 LINC02375 - long intergenic non-protein coding RNA 2375 ncRNA 319-6 chr13 33011058 33011249 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5270 NM_004795 9365 Hs.524953 NM_004795 ENSG00000133116 KL HFTC3 klotho protein-coding 337-29 chr8 125020538 125020895 + 2 NA intron (NM_003129, intron 9 of 10) intron (NM_003129, intron 9 of 10) 22211 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 673 chr1 42887512 42887897 + 2 NA non-coding (NR_104171, exon 4 of 4) non-coding (NR_104171, exon 4 of 4) 30082 NR_104171 339539 Hs.434301 NR_104171 LOC339539 - uncharacterized LOC339539 ncRNA 411-4 chr12 86352449 86352702 + 2 NA intron (NM_001351286, intron 3 of 7) L1ME4b|LINE|L1 -95276 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 261-4 chr1 99869435 99869651 + 2 NA intron (NM_000028, intron 5 of 33) MIR|SINE|MIR 18568 NM_000646 178 Hs.904 NM_000028 ENSG00000162688 AGL GDE amylo-alpha-1, 6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase protein-coding 227.333-14 chr1 234615662 234615793 + 2 NA Intergenic Intergenic -6202 NM_001077397 359948 Hs.350268 NM_182972 ENSG00000168264 IRF2BP2 CVID14 interferon regulatory factor 2 binding protein 2 protein-coding 376-16 chr5 90544576 90544933 + 2 NA Intergenic Intergenic -14043 NR_003149 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 431.333-7 chr2 143577144 143577535 + 2 NA intron (NM_018460, intron 11 of 13) intron (NM_018460, intron 11 of 13) -359728 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 386.666-5 chr18 1915939 1916285 + 2 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -556483 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 326-38 chr6 51269578 51269754 + 2 NA Intergenic Intergenic -352204 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 300-18 chr14 29456486 29456755 + 2 NA Intergenic Intergenic 470476 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 324-19 chr4 31883555 31883866 + 2 NA Intergenic Intergenic -113669 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 311.333-63 chrX 83000272 83000464 + 2 NA Intergenic Intergenic -507922 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 306-4 chr10 32471559 32471862 + 2 NA intron (NR_109826, intron 7 of 16) intron (NR_109826, intron 7 of 16) 25570 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 374-6 chr12 60434690 60435016 + 2 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 745483 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 409-9 chr3 100260627 100260942 + 2 NA promoter-TSS (NM_018309) promoter-TSS (NM_018309) -208 NM_018309 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 405-4 chr14 82749105 82749546 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 106693 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 510.334 chr10 83875282 83875795 + 2 NA Intergenic Intergenic -198449 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 295.333-58 chr8 130255738 130255948 + 2 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 40690 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 668.334 chr3 15906764 15907134 + 2 NA Intergenic Intergenic 33178 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 365.667-8 chr17 81941398 81941755 + 2 NA exon (NM_001145113, exon 3 of 3) exon (NM_001145113, exon 3 of 3) -4248 NM_001330523 5831 Hs.163451 NM_006907 ENSG00000183010 PYCR1 ARCL2B|ARCL3B|P5C|P5CR|PIG45|PP222|PRO3|PYCR pyrroline-5-carboxylate reductase 1 protein-coding 255.333-111 chr8 111223947 111224183 + 2 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) (AATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 12138 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 312-43 chr5 36779028 36779325 + 2 NA Intergenic Intergenic 97518 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 402-6 chr4 70786780 70787153 + 2 NA intron (NM_001130709, intron 10 of 11) AluJo|SINE|Alu 52537 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 282-16 chr15 22850006 22850247 + 2 NA intron (NM_001184889, intron 5 of 9) intron (NM_001184889, intron 5 of 9) 11485 NM_001008894 81614 Hs.591003 NM_030922 ENSG00000140157 NIPA2 SLC57A2 NIPA magnesium transporter 2 protein-coding 307.333-78 chr8 61206075 61206236 + 2 NA Intergenic Intergenic -81815 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 310-51 chr7 973203 973358 + 2 NA exon (NM_001031617, exon 2 of 3) exon (NM_001031617, exon 2 of 3) 2269 NM_001031617 90639 Hs.121593 NM_001031617 ENSG00000240230 COX19 - cytochrome c oxidase assembly factor COX19 protein-coding 271.333-3 chr1 153642243 153642403 + 2 NA exon (NM_001317077, exon 4 of 5) exon (NM_001317077, exon 4 of 5) -7962 NM_001024210 6284 Hs.516505 NM_005979 ENSG00000189171 S100A13 - S100 calcium binding protein A13 protein-coding 245-49 chr3 168787485 168787709 + 2 NA intron (NR_021485, intron 6 of 15) L1M4|LINE|L1 -114348 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 313.334-7 chr6 55593320 55593528 + 2 NA Intergenic Intergenic -14210 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 261.666-20 chr9 27444829 27445045 + 2 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -79377 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 313.667-38 chr8 108625870 108626065 + 2 NA intron (NR_136411, intron 2 of 3) intron (NR_136411, intron 2 of 3) 161627 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 271-52 chr8 144569592 144569853 + 2 NA intron (NM_025251, intron 2 of 10) L1ME1|LINE|L1 35973 NM_025251 80728 Hs.148988 NM_025251 ENSG00000147799 ARHGAP39 CrGAP|Vilse Rho GTPase activating protein 39 protein-coding 312-30 chr3 27031866 27032047 + 2 NA Intergenic Intergenic 184567 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 194-152 chr9 80474583 80474684 + 2 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 499610 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 401.333-17 chr7 37663327 37663711 + 2 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -20247 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 298-64 chr5 128803428 128803629 + 2 NA Intergenic Intergenic -161599 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 278.667-28 chr2 186763273 186763479 + 2 NA 3' UTR (NM_177454, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_177454, exon 8 of 8) 69316 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 280-25 chr2 108048119 108048282 + 2 NA TTS (NR_135071) TTS (NR_135071) 4555 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 330-37 chr9 75840742 75841162 + 2 NA Intergenic Intergenic -49692 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 322.667-32 chr7 38815574 38815762 + 2 NA intron (NM_014396, intron 7 of 28) MLT2A2|LTR|ERVL 93523 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 286-40 chr3 83294081 83294246 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 1308021 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 267.667-25 chr2 4673892 4674078 + 2 NA Intergenic Intergenic -17763 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 257.667-63 chr5 28713691 28713906 + 2 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -213072 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 363.667-6 chr17 62189359 62189572 + 2 NA Intergenic Intergenic 86190 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 320.333-19 chr3 108636141 108636474 + 2 NA intron (NM_014648, intron 10 of 32) intron (NM_014648, intron 10 of 32) 46585 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 345.333-40 chr9 80178360 80178677 + 2 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 203495 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 310.667-22 chr2 106878313 106878554 + 2 NA intron (NM_032528, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 7595 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 362-25 chr9 77314168 77314487 + 2 NA intron (NM_001018038, intron 36 of 68) intron (NM_001018038, intron 36 of 68) -133322 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 298-45 chr2 57156381 57156589 + 2 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -751166 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 406.334 chr18 3305884 3306234 + 2 NA Intergenic Intergenic 43340 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 351.333-5 chr11 132991618 132991795 + 2 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) -47938 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 674.999 chr5 38478219 38478754 + 2 NA 3' UTR (NM_002310, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_002310, exon 20 of 20) 32940 NM_182801 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 286.666 chr10 111025310 111025494 + 2 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 36476 NR_031614 100313921 NR_031614 ENSG00000221214 MIR548E MIRN548E|hsa-mir-548e microRNA 548e ncRNA 434.333-9 chrX 57707283 57707679 + 2 NA Intergenic Intergenic -27221 NM_001319967 286430 Hs.306842 NM_001319967 ENSG00000215174 NLRP2B CLRX.1|NALP2P|NLRP2P|NOD24|POP4 NLR family pyrin domain containing 2B protein-coding 475.667-2 chr5 92628492 92629003 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 942596 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 310.666-27 chr9 76701624 76701913 + 2 NA intron (NM_001308048, intron 9 of 17) intron (NM_001308048, intron 9 of 17) -9353 NM_001308050 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 616.333 chr4 43982721 43983369 + 2 NA Intergenic Intergenic -33816 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 595.999-2 chr22 24750197 24750654 + 2 NA intron (NM_001008496, intron 9 of 20) intron (NM_001008496, intron 9 of 20) -14076 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 271.333 chr1 20905873 20906025 + 2 NA intron (NM_003760, intron 9 of 31) intron (NM_003760, intron 9 of 31) 82483 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 429.667-2 chr11 87332045 87332537 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 294357 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 202.667-29 chr11 59436232 59436413 + 2 NA Intergenic Intergenic -6847 NM_001004728 219982 Hs.553649 NM_001004728 ENSG00000172320 OR5A1 OR11-249|OR5A1P|OST181 olfactory receptor family 5 subfamily A member 1 protein-coding 595.333-2 chr8 118743025 118743668 + 2 NA Intergenic Intergenic -121383 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 546.334 chr3 149512717 149513013 + 2 NA Intergenic Intergenic 38168 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 412.667-4 chr11 78477610 78477867 + 2 NA intron (NM_024678, intron 9 of 13) MLT2D|LTR|ERVL -47902 NR_120564 101928865 Hs.407574 NR_120564 ENSG00000251323 LINC02728 - long intergenic non-protein coding RNA 2728 ncRNA 360-12 chr18 62966188 62966385 + 2 NA intron (NM_194449, intron 14 of 16) intron (NM_194449, intron 14 of 16) 250745 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 386.667-6 chr17 29870054 29870312 + 2 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) L1ME4b|LINE|L1 -59720 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 355.333-36 chr7 90864803 90865137 + 2 NA intron (NM_012395, intron 5 of 13) intron (NM_012395, intron 5 of 13) 155154 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 296.667-50 chr6 48409610 48409773 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -341002 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 426-10 chr3 84371645 84372195 + 2 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 497655 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 248.666-16 chr14 77163003 77163200 + 2 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -18697 NM_020431 57156 Hs.22452 NM_020431 ENSG00000165548 TMEM63C C14orf171|CSC1|hsCSC1 transmembrane protein 63C protein-coding 600.667-3 chr3 89195589 89196087 + 2 NA intron (NM_182644, intron 2 of 6) intron (NM_182644, intron 2 of 6) 88217 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 352 chr1 30016496 30016713 + 2 NA intron (NR_110790, intron 5 of 6) L1M4|LINE|L1 21008 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 456.333-6 chr18 70224985 70225547 + 2 NA Intergenic Intergenic -19579 NM_001318520 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 277.333-81 chr7 47406884 47407105 + 2 NA intron (NM_022748, intron 13 of 30) intron (NM_022748, intron 13 of 30) 57809 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 355.667-14 chr7 87413968 87414325 + 2 NA intron (NM_018849, intron 21 of 27) intron (NM_018849, intron 21 of 27) 61534 NM_018849 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 315-21 chr3 136702356 136702523 + 2 NA intron (NM_005862, intron 1 of 33) AluSx1|SINE|Alu 49939 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 394-21 chr9 3512440 3512747 + 2 NA intron (NM_134428, intron 1 of 17) intron (NM_134428, intron 1 of 17) 13408 NM_134428 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 429.334-3 chr18 13416405 13416751 + 2 NA intron (NM_181482, intron 3 of 5) intron (NM_181482, intron 3 of 5) 10956 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 258.666-29 chr4 97065338 97065519 + 2 NA Intergenic MER57C2|LTR|ERV1 -301498 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 424-16 chr8 31483369 31483759 + 2 NA Intergenic Intergenic -156188 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 514-4 chr2 96298801 96299063 + 2 NA exon (NM_014014, exon 7 of 45) exon (NM_014014, exon 7 of 45) 6614 NM_014014 23020 Hs.246112 NM_014014 ENSG00000144028 SNRNP200 ASCC3L1|BRR2|HELIC2|RP33|U5-200KD small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200 protein-coding 314-32 chr4 46851928 46852145 + 2 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) L1MC4a|LINE|L1 57209 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 361.667-6 chr18 61845678 61846037 + 2 NA intron (NM_173557, intron 1 of 1) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 47150 NM_173557 220441 Hs.165062 NM_173557 ENSG00000176641 RNF152 - ring finger protein 152 protein-coding 219.333-119 chr3 129847257 129847488 + 2 NA intron (NM_001349263, intron 2 of 7) intron (NM_001349263, intron 2 of 7) 46204 NM_001128224 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 387.667-2 chr10 44311847 44312340 + 2 NA Intergenic Intergenic 19343 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 330.667-13 chr2 232109337 232109726 + 2 NA intron (NR_046477, intron 6 of 18) L1PA11|LINE|L1 -63122 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 305.333-16 chr12 20204669 20204915 + 2 NA Intergenic Intergenic -76891 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 333.999-7 chr8 70649130 70649417 + 2 NA intron (NM_016027, intron 3 of 6) HAL1|LINE|L1 19912 NM_016027 51110 Hs.118554 NM_016027 ENSG00000147592 LACTB2 CGI-83 lactamase beta 2 protein-coding 375-4 chr11 65709421 65709764 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2660 NM_182709 10524 Hs.397010 NM_006388 ENSG00000172977 KAT5 ESA1|HTATIP|HTATIP1|PLIP|TIP|TIP60|ZC2HC5|cPLA2 lysine acetyltransferase 5 protein-coding 312-18 chr14 73318325 73318482 + 2 NA intron (NM_001005743, intron 5 of 12) intron (NM_001005743, intron 5 of 12) -72402 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 304.666-25 chr7 28353855 28354084 + 2 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) L2|LINE|L2 54648 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 550-3 chr5 20617304 20617596 + 2 NA intron (NR_149120, intron 1 of 11) intron (NR_149120, intron 1 of 11) -1915 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 314-7 chr12 14635705 14635870 + 2 NA intron (NM_004963, intron 19 of 26) L1MA4A|LINE|L1 60812 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 238-56 chr20 14750791 14750940 + 2 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 178653 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 318-53 chr8 77400412 77400665 + 2 NA Intergenic Intergenic -50159 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 325.667-8 chr16 47263738 47264028 + 2 NA intron (NM_030790, intron 10 of 17) intron (NM_030790, intron 10 of 17) 119815 NR_110903 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 303.334-6 chr22 40862717 40862970 + 2 NA promoter-TSS (NM_145174) promoter-TSS (NM_145174) -730 NM_145174 150353 Hs.585042 NM_145174 ENSG00000172404 DNAJB7 DJ5|HSC3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B7 protein-coding 307.001 chr12 39971137 39971389 + 2 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) intron (NM_052885, intron 3 of 9) 134818 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 598.667 chr15 89755375 89755928 + 2 NA Intergenic Intergenic -4342 NM_018670 55897 Hs.447531 NM_018670 ENSG00000166823 MESP1 bHLHc5 mesoderm posterior bHLH transcription factor 1 protein-coding 380-2 chr10 51884650 51884973 + 2 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -185216 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 316.667-21 chr3 89676519 89676679 + 2 NA Intergenic Intergenic 568978 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 339-19 chr8 123392168 123392528 + 2 NA intron (NM_014109, intron 1 of 27) L2a|LINE|L2 4099 NM_014109 29028 Hs.370834 NM_014109 ENSG00000156802 ATAD2 ANCCA|CT137|PRO2000 ATPase family AAA domain containing 2 protein-coding 304.334 chr1 83120686 83120960 + 2 NA intron (NR_147074, intron 9 of 10) intron (NR_147074, intron 9 of 10) -134615 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 352-13 chr17 61258230 61258469 + 2 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 109355 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 268.333-52 chr7 146477392 146477569 + 2 NA Intergenic Intergenic -296791 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 302.333-36 chr8 125203585 125203753 + 2 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 111809 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 395-4 chr15 62937742 62938099 + 2 NA Intergenic Intergenic -104827 NM_001018004 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 319-26 chr7 52671133 52671309 + 2 NA Intergenic Intergenic -364412 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 278-2 chr1 45169005 45169207 + 2 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) intron (NM_020883, intron 1 of 13) 37499 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 480-7 chr6 16753681 16754131 + 2 NA intron (NR_152111, intron 1 of 2) intron (NR_152111, intron 1 of 2) 6278 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 271.333-10 chr11 93657999 93658261 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3552 NM_033395 85459 Hs.458418 NM_033395 ENSG00000166004 CEP295 KIAA1731 centrosomal protein 295 protein-coding 334.333-19 chr2 65701268 65701590 + 2 NA Intergenic Intergenic -268830 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 351.333-3 chr1 210140298 210140630 + 2 NA intron (NM_153262, intron 6 of 7) L1M4|LINE|L1 -92332 NM_019605 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 325-6 chr10 100170218 100170403 + 2 NA intron (NR_144757, intron 5 of 10) intron (NR_144757, intron 5 of 10) 15719 NM_001100626 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 235-39 chr22 24374915 24375097 + 2 NA intron (NM_001254732, intron 13 of 14) L1MB5|LINE|L1 32898 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 564.667 chr10 74489963 74490629 + 2 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) intron (NM_001369124, intron 6 of 9) 39028 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 255.334-13 chr18 57008878 57009218 + 2 NA intron (NM_015285, intron 26 of 27) intron (NM_015285, intron 26 of 27) 63071 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 296-22 chr17 75371262 75371528 + 2 NA intron (NM_002086, intron 2 of 5) intron (NM_002086, intron 2 of 5) 34283 NM_002086 2885 Hs.444356 NM_002086 ENSG00000177885 GRB2 ASH|EGFRBP-GRB2|Grb3-3|MST084|MSTP084|NCKAP2 growth factor receptor bound protein 2 protein-coding 305.333-61 chr6 28067545 28067825 + 2 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -5631 NM_001355425 442179 NM_001355425 OR1F12 OR1F12P|OR1F12Q|OR6-12|hs6M1-35P olfactory receptor family 1 subfamily F member 12 protein-coding 227.333-134 chrX 48638977 48639127 + 2 NA Intergenic Intergenic 41560 NM_001347217 64743 Hs.521973 NM_017883 ENSG00000101940 WDR13 MG21 WD repeat domain 13 protein-coding 303-49 chr8 93678012 93678199 + 2 NA intron (NR_033858, intron 3 of 10) intron (NR_033858, intron 3 of 10) 22328 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 300.667-21 chr2 122997508 122997788 + 2 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 75833 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 227.667-13 chr12 24828466 24828622 + 2 NA intron (NM_001178091, intron 9 of 9) L1ME4a|LINE|L1 73678 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 344 chr1 29492119 29492303 + 2 NA Intergenic Intergenic -142097 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 288-57 chr8 88082042 88082232 + 2 NA intron (NM_005941, intron 6 of 9) L1MC5a|LINE|L1 -208122 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 540.667 chr3 96052962 96053458 + 2 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -306754 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 361.999-7 chr5 69035329 69035729 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -5602 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 317.333-44 chr8 138000165 138000343 + 2 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) L1PA12|LINE|L1 83291 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 340.666-9 chr17 60893188 60893524 + 2 NA intron (NM_001330413, intron 10 of 25) L1PB4|LINE|L1 215505 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 536-4 chr7 20725104 20725731 + 2 NA intron (NM_178559, intron 12 of 18) AluSg|SINE|Alu 61469 NM_182700 221833 Hs.195922 NM_182700 ENSG00000164651 SP8 BTD Sp8 transcription factor protein-coding 416.666-8 chr8 80249226 80249667 + 2 NA Intergenic Intergenic 8057 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 443.666-3 chr5 72529646 72530160 + 2 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -22493 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 547.667-2 chr5 20046703 20047001 + 2 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L2a|LINE|L2 -58652 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 245-3 chr1 112390227 112390452 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -5875 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 365.333-5 chr12 47609848 47610130 + 2 NA Intergenic Intergenic 96041 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 299-8 chr10 84614993 84615171 + 2 NA Intergenic Intergenic 189913 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 382.333-15 chr5 32976638 32977024 + 2 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 29388 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 333.333-20 chr14 47886303 47886499 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -91387 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 278-3 chr10 11654646 11654810 + 2 NA Intergenic Intergenic -42939 NR_125732 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 313.667-37 chr6 43601942 43602118 + 2 NA intron (NM_006502, intron 6 of 10) AluSq2|SINE|Alu 25323 NM_001286216 54676 Hs.485449 NM_019096 ENSG00000172432 GTPBP2 JABELS GTP binding protein 2 protein-coding 357-6 chr12 48367250 48367489 + 2 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -16123 NM_001172682 121274 Hs.23492 NM_152320 ENSG00000167528 ZNF641 - zinc finger protein 641 protein-coding 378.667-11 chr18 66463899 66464217 + 2 NA Intergenic Intergenic 140032 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 297.667-10 chr14 65618062 65618256 + 2 NA intron (NM_004480, intron 4 of 9) FLAM_A|SINE|Alu 147057 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 294.666-39 chr8 114351688 114351900 + 2 NA Intergenic Intergenic -914855 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 348.667-21 chr5 44926881 44927112 + 2 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 118049 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 529.333 chr1 92986830 92987121 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -25453 NM_001252270 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 529.667 chr1 102417322 102418009 + 2 NA Intergenic Intergenic -420431 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 282-27 chr2 76786322 76786508 + 2 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -199550 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 325.333-4 chr1 194172564 194172834 + 2 NA Intergenic Intergenic 867954 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 436.666-11 chr8 131685940 131686413 + 2 NA Intergenic Intergenic -217917 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 336-5 chr13 32515874 32516113 + 2 NA 3' UTR (NM_014887, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_014887, exon 6 of 6) -6598 NR_026928 116828 Hs.658751 NR_026928 ENSG00000281026 N4BP2L2-IT2 CG030 N4BPL2 intronic transcript 2 ncRNA 408-7 chr6 72511011 72511373 + 2 NA Intergenic Intergenic -110651 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 198-95 chr2 106626282 106626390 + 2 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 138972 NM_001349727 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 254.667-65 chr5 38956133 38956387 + 2 NA intron (NM_001285439, intron 25 of 38) L2c|LINE|L2 110248 NM_003999 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 295.667-14 chr2 24242458 24242624 + 2 NA intron (NM_001348184, intron 29 of 29) intron (NM_001348184, intron 29 of 29) 67488 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 465.333-9 chr5 148377970 148378249 + 2 NA intron (NR_105057, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 5741 NR_105057 102546294 Hs.660461 NR_105057 ENSG00000247199 LOC102546294 - uncharacterized LOC102546294 ncRNA 242.667-24 chr11 114463029 114463256 + 2 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 23675 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 307-28 chr4 39102134 39102290 + 2 NA intron (NM_199039, intron 5 of 9) intron (NM_199039, intron 5 of 9) 39980 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 299-4 chr1 187456102 187456333 + 2 NA intron (NR_132374, intron 1 of 2) intron (NR_132374, intron 1 of 2) 12589 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 254.667-38 chr2 107152824 107152993 + 2 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 196617 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 283-35 chr7 42054134 42054415 + 2 NA intron (NM_000168, intron 4 of 14) intron (NM_000168, intron 4 of 14) 182935 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 377-5 chr16 64661591 64661943 + 2 NA Intergenic Intergenic 460296 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 333-17 chr22 27838469 27838797 + 2 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -36877 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 355.334-3 chr10 72855082 72855395 + 2 NA intron (NM_138357, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu -38501 NM_152635 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 337-11 chr15 42391413 42391724 + 2 NA intron (NM_000070, intron 6 of 23) intron (NM_000070, intron 6 of 23) -10822 NM_173088 825 Hs.143261 NM_000070 ENSG00000092529 CAPN3 CANP3|CANPL3|LGMD2|LGMD2A|LGMDD4|LGMDR1|nCL-1|p94 calpain 3 protein-coding 329.333-50 chr6 40977430 40977769 + 2 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) L1PREC2|LINE|L1 45681 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 266-54 chr3 26782836 26783020 + 2 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 88371 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 298-25 chr14 51960321 51960510 + 2 NA intron (NM_001243773, intron 3 of 3) L1MEc|LINE|L1 -29131 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 208.667-68 chr2 89839646 89839809 + 2 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -201820 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 282.667-15 chr2 32429979 32430158 + 2 NA intron (NM_016252, intron 11 of 73) intron (NM_016252, intron 11 of 73) 73040 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 285.333-63 chr6 154856735 154856908 + 2 NA Intergenic Intergenic 3461 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 293-30 chr4 113242589 113242750 + 2 NA intron (NM_001354275, intron 10 of 43) intron (NM_001354275, intron 10 of 43) -50170 NM_001354282 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 366.333-6 chr11 68509011 68509311 + 2 NA intron (NR_147971, intron 2 of 24) intron (NR_147971, intron 2 of 24) 48409 NM_001164164 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 323-3 chr1 162127984 162128186 + 2 NA intron (NM_014697, intron 1 of 9) L1MC5a|LINE|L1 -29022 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 532.333-3 chr8 137779386 137779913 + 2 NA Intergenic Intergenic 303896 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 269-39 chr4 102076539 102076785 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 247650 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 326-29 chr3 136741332 136741629 + 2 NA intron (NM_005862, intron 1 of 33) AluSp|SINE|Alu 10898 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 530.667 chr1 222842955 222843354 + 2 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 28115 NM_001350630 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 377.667-4 chr12 123195218 123195561 + 2 NA intron (NR_103517, intron 12 of 23) AluSx3|SINE|Alu 37752 NM_022782 10198 Hs.577404 NM_022782 ENSG00000051825 MPHOSPH9 MPP-9|MPP9 M-phase phosphoprotein 9 protein-coding 474 chr1 74893152 74893440 + 2 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -159888 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 301-21 chr2 168220669 168220901 + 2 NA intron (NM_013233, intron 1 of 17) intron (NM_013233, intron 1 of 17) 26810 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 358.667-26 chr6 102750682 102750868 + 2 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 1351790 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 314-53 chr9 71038641 71038810 + 2 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) L2b|LINE|L2 82896 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 630.666 chr5 67833331 67834340 + 2 NA Intergenic Intergenic 40622 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 300-14 chr12 10150227 10150437 + 2 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -20063 NM_197947 64581 Hs.143929 NM_022570 ENSG00000172243 CLEC7A BGR|CANDF4|CD369|CLECSF12|DECTIN1|SCARE2 C-type lectin domain containing 7A protein-coding 292 chr1 111205561 111205768 + 2 NA Intergenic Intergenic -1126 NM_001271833 79961 Hs.557850 NM_024901 ENSG00000162777 DENND2D - DENN domain containing 2D protein-coding 237-68 chr7 48378377 48378568 + 2 NA intron (NM_152701, intron 35 of 61) intron (NM_152701, intron 35 of 61) 207014 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 313.333-43 chr8 68348060 68348231 + 2 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) L1PA14|LINE|L1 -16654 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 296.666-16 chr2 105350851 105351074 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 13422 NM_024093 79074 Hs.549577 NM_024093 ENSG00000135974 C2orf49 asw chromosome 2 open reading frame 49 protein-coding 457-9 chrX 45347575 45347941 + 2 NA Intergenic Intergenic -146882 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 318.333-24 chr3 192647968 192648187 + 2 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) MIRc|SINE|MIR 79464 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 370.333-17 chr3 110020026 110020330 + 2 NA Intergenic Intergenic 417350 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 335.333-19 chr18 3982198 3982367 + 2 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) intron (NR_102696, intron 1 of 4) 19929 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 246-79 chr4 47144890 47145044 + 2 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 113400 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 417.333-10 chr5 63665062 63665601 + 2 NA Intergenic Intergenic 296961 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 467.333-7 chr4 74076465 74076747 + 2 NA Intergenic Intergenic -21207 NR_026769 10895 Hs.3134 NM_006692 ENSG00000248848 PPBPP2 PPBPL2|SPBPBP pro-platelet basic protein pseudogene 2 pseudo 279.333-18 chr11 90150816 90150973 + 2 NA intron (NM_001300930, intron 5 of 17) intron (NM_001300930, intron 5 of 17) 16231 NM_001300930 10003 Hs.112482 NM_005467 ENSG00000077616 NAALAD2 GCPIII|GPCIII|NAADALASE2|NAALADASE2 N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2 protein-coding 332-28 chr5 39713296 39713504 + 2 NA Intergenic Intergenic 192969 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 296.334-9 chr2 74255504 74255773 + 2 NA intron (NM_133478, intron 13 of 30) intron (NM_133478, intron 13 of 30) 57023 NM_006636 10797 Hs.469030 NM_006636 ENSG00000065911 MTHFD2 NMDMC methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase protein-coding 307.333-67 chr6 37936771 37936960 + 2 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 117138 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 567.999 chr19 24339607 24340059 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -176386 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 336.334-5 chr4 166436396 166436578 + 2 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 563250 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 402.666-2 chr10 73099987 73100287 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3163 NM_000917 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 365-9 chr14 56612259 56612537 + 2 NA intron (NM_017799, intron 7 of 15) intron (NM_017799, intron 7 of 15) 32600 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 234-54 chr5 6565967 6566111 + 2 NA Intergenic Intergenic -16097 NR_024423 255167 Hs.435515 NR_024423 ENSG00000250056 LINC01018 SRHC long intergenic non-protein coding RNA 1018 ncRNA 335.667-8 chr15 67580247 67580572 + 2 NA intron (NM_001206804, intron 3 of 21) intron (NM_001206804, intron 3 of 21) 31315 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 514-7 chr9 86299842 86300435 + 2 NA intron (NM_001185059, intron 26 of 26) intron (NM_001185059, intron 26 of 26) -17600 NM_030940 81689 Hs.449291 NM_030940 ENSG00000135070 ISCA1 HBLD2|ISA1|MMDS5|hIscA iron-sulfur cluster assembly 1 protein-coding 352.667-30 chr8 125080794 125081197 + 2 NA intron (NM_014846, intron 5 of 28) intron (NM_014846, intron 5 of 28) 10797 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 289.333-57 chr6 63480796 63480947 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -91141 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 379-3 chr16 28179079 28179449 + 2 NA intron (NM_001270940, intron 3 of 24) AluJo|SINE|Alu 32701 NM_015171 23214 Hs.460468 NM_015171 ENSG00000169180 XPO6 EXP6|RANBP20 exportin 6 protein-coding 411 chr1 103491330 103491633 + 2 NA intron (NM_001347929, intron 1 of 5) intron (NM_001347929, intron 1 of 5) 34030 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 316-6 chr10 114825759 114826066 + 2 NA intron (NM_001135051, intron 1 of 16) intron (NM_001135051, intron 1 of 16) 4132 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 260-40 chr2 146621876 146622052 + 2 NA Intergenic Intergenic 34907 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 287-9 chr11 39529665 39529887 + 2 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 763354 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 251-13 chr11 112332381 112332535 + 2 NA intron (NR_126004, intron 2 of 3) intron (NR_126004, intron 2 of 3) 61709 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 186-6 chr1 149968440 149968717 + 2 NA intron (NM_020205, intron 3 of 11) intron (NM_020205, intron 3 of 11) -31699 NM_001145862 10903 Hs.425144 NM_006697 ENSG00000014914 MTMR11 CRA myotubularin related protein 11 protein-coding 285.667-34 chr3 85605833 85606049 + 2 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) 100882 NM_001256505 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 268-9 chr10 78000647 78000796 + 2 NA intron (NM_007055, intron 18 of 30) AluJr|SINE|Alu 28794 NM_007055 11128 Hs.436896 NM_007055 ENSG00000148606 POLR3A ADDH|HLD7|RPC1|RPC155|WDRTS|hRPC155 RNA polymerase III subunit A protein-coding 421.333-8 chr8 130550480 130550790 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -106961 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 294-42 chr3 55463029 55463255 + 2 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 18256 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 440.666-8 chr21 30963074 30963359 + 2 NA Intergenic Intergenic 75260 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 224-4 chr1 89791049 89791267 + 2 NA Intergenic Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -29874 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 323-21 chr4 141043195 141043379 + 2 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) intron (NM_020724, intron 1 of 6) 90182 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 371.333-13 chr2 66353626 66353998 + 2 NA Intergenic Intergenic 4516 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 301-20 chr2 57363325 57363482 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -544248 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 197.333-237 chr8 113845309 113845454 + 2 NA Intergenic Intergenic -408442 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 358.667-6 chr12 9339654 9339899 + 2 NA Intergenic Intergenic -27688 NR_120479 101930452 Hs.734183 NR_120479 ENSG00000260423 LINC02367 - long intergenic non-protein coding RNA 2367 ncRNA 308-45 chr6 46320307 46320546 + 2 NA intron (NR_125838, intron 2 of 3) intron (NR_125838, intron 2 of 3) 5466 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 301.667-7 chr11 40398087 40398285 + 2 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 -105056 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 315-4 chr10 106125768 106126068 + 2 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -14247 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 332-9 chr12 100917573 100917894 + 2 NA intron (NM_178826, intron 2 of 26) intron (NM_178826, intron 2 of 26) 16087 NM_001286616 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 206.667-122 chr6 128822104 128822253 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -60960 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 767.667 chr2 165063886 165064522 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -108679 NM_001351540 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 399.667-4 chr15 59658297 59658606 + 2 NA promoter-TSS (NM_004492) promoter-TSS (NM_004492) -936 NM_004492 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 392.666 chr1 102465453 102465820 + 2 NA Intergenic Intergenic -468402 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 372.333-11 chr2 18884805 18885132 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 142003 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 306-35 chr3 180034079 180034267 + 2 NA intron (NM_016559, intron 1 of 14) intron (NM_016559, intron 1 of 14) 2764 NM_001256751 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 190.667-146 chr8 74348933 74349094 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1370 NM_001362932 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 322.667-26 chr6 38553676 38553854 + 2 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) AluJr|SINE|Alu 42302 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 248-92 chr8 136175971 136176211 + 2 NA Intergenic Intergenic -354707 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 357.333-4 chr12 4908152 4908450 + 2 NA Intergenic Intergenic -1604 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 232.666-36 chr3 118120942 118121097 + 2 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -430094 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 382.334-3 chr12 64727875 64728312 + 2 NA intron (NM_002076, intron 10 of 13) AluSq2|SINE|Alu 31313 NM_002076 2799 Hs.334534 NM_002076 ENSG00000135677 GNS G6S glucosamine (N-acetyl)-6-sulfatase protein-coding 313-40 chr8 92472345 92472576 + 2 NA Intergenic Intergenic 183034 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 230.667-60 chr4 62095713 62095907 + 2 NA intron (NR_110595, intron 6 of 7) intron (NR_110595, intron 6 of 7) 65955 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 590.667 chr5 28899225 28899684 + 2 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -27416 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 360-6 chr11 115315711 115316042 + 2 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -17701 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 326.334 chr10 32018743 32018950 + 2 NA intron (NM_004521, intron 20 of 25) AluJb|SINE|Alu 37579 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 405-11 chr4 35044217 35044502 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -774612 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 354.333-2 chr1 229657028 229657254 + 2 NA intron (NM_014777, intron 9 of 9) intron (NM_014777, intron 9 of 9) 30894 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 301.333-29 chr2 216408513 216408729 + 2 NA Intergenic Intergenic -3793 NM_014140 50485 Hs.516674 NM_014140 ENSG00000138375 SMARCAL1 HARP|HHARP SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a like 1 protein-coding 272-49 chr8 27739962 27740218 + 2 NA intron (NR_130761, intron 6 of 6) intron (NR_130761, intron 6 of 6) 32550 NM_018246 55246 Hs.445512 NM_018246 ENSG00000147419 CCDC25 - coiled-coil domain containing 25 protein-coding 367.667-17 chr5 39700823 39701144 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 180552 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 467.333-11 chr8 104678646 104679142 + 2 NA Intergenic Intergenic -89870 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 304-34 chr2 189734052 189734291 + 2 NA intron (NM_144708, intron 17 of 22) L1MC4a|LINE|L1 -28609 NR_102429 101409258 Hs.738558 NR_102429 OSGEPL1-AS1 - OSGEPL1 antisense RNA 1 ncRNA 302-68 chr8 65838162 65838422 + 2 NA intron (NM_001242318, intron 1 of 12) intron (NM_001242318, intron 1 of 12) 3772 NM_001242318 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 293.333-58 chr7 56441417 56441632 + 2 NA intron (NR_029420, intron 1 of 5) L1MA3|LINE|L1 6851 NR_029420 650226 Hs.448401 NR_029420 LOC650226 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene pseudo 284-28 chr2 115887860 115888011 + 2 NA Intergenic Intergenic 544120 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 278-29 chr3 11676686 11676869 + 2 NA intron (NM_001284390, intron 2 of 6) intron (NM_001284390, intron 2 of 6) -32862 NM_001128219 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 311-24 chr4 31838853 31839159 + 2 NA Intergenic Intergenic -158373 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 327.334 chr1 16629616 16629967 + 2 NA intron (NR_026752, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 1115 NR_026752 84809 Hs.631865 NR_026752 ENSG00000215908 CROCCP2 CROCCL1 CROCC pseudogene 2 pseudo 383.334-7 chr9 86403608 86403827 + 2 NA Intergenic Intergenic -49307 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 334.667-14 chr2 35146563 35146799 + 2 NA Intergenic LTR86A1|LTR|ERVL -324724 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 333-8 chr11 95675442 95675762 + 2 NA Intergenic Intergenic 114180 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 231.333-124 chr9 13866124 13866278 + 2 NA Intergenic Intergenic -61770 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 254-38 chr2 117301328 117301580 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -513237 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 316-30 chr2 218622602 218622868 + 2 NA exon (NM_032726, exon 6 of 16) exon (NM_032726, exon 6 of 16) 14836 NM_032726 84812 Hs.632528 NM_032726 ENSG00000115556 PLCD4 - phospholipase C delta 4 protein-coding 277.667-22 chr2 90203048 90203191 + 2 NA Intergenic Intergenic -565212 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 491 chr1 166993946 166994411 + 2 NA intron (NM_032858, intron 5 of 11) intron (NM_032858, intron 5 of 11) 4898 NM_032858 84944 Hs.651245 NM_032858 ENSG00000143194 MAEL CT128|SPATA35 maelstrom spermatogenic transposon silencer protein-coding 425.333-2 chr12 46664728 46665153 + 2 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 161057 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 442 chr1 244647134 244647521 + 2 NA Intergenic Intergenic -5721 NR_123736 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 530.666 chr4 26983024 26983483 + 2 NA intron (NM_001169118, intron 3 of 12) intron (NM_001169118, intron 3 of 12) 122412 NM_001169118 57620 Hs.744950 NM_020860 ENSG00000109689 STIM2 - stromal interaction molecule 2 protein-coding 313.333-26 chr3 136821128 136821373 + 2 NA intron (NM_025246, intron 1 of 1) intron (NM_025246, intron 1 of 1) 2124 NM_025246 80723 Hs.477692 NM_025246 ENSG00000168917 SLC35G2 TMEM22 solute carrier family 35 member G2 protein-coding 287.667-2 chr1 203816442 203816642 + 2 NA intron (NM_014827, intron 4 of 19) AluJr4|SINE|Alu 19019 NM_001174108 100381270 NM_001174108 ENSG00000257315 ZBED6 MGR zinc finger BED-type containing 6 protein-coding 313-28 chr4 157355034 157355341 + 2 NA intron (NM_001083620, intron 12 of 15) intron (NM_001083620, intron 12 of 15) 134459 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 294-62 chr8 4172079 4172389 + 2 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 822680 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 389.333-3 chr10 9445974 9446270 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -150529 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 224-25 chr15 53837254 53837440 + 2 NA Intergenic Intergenic -74469 NR_102334 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 305.667-11 chr15 93499149 93499320 + 2 NA Intergenic Intergenic 293168 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 227.334-9 chr5 9019685 9019925 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 34090 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 430.667-5 chr14 75669125 75669390 + 2 NA intron (NM_015072, intron 2 of 31) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 8011 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 414.666-8 chr19 43885330 43885636 + 2 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -5347 NM_001033719 342908 Hs.76561 NM_001033719 ENSG00000176222 ZNF404 - zinc finger protein 404 protein-coding 321-11 chr17 64294249 64294446 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -31087 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 322-2 chr1 64571295 64571531 + 2 NA intron (NM_020925, intron 2 of 26) intron (NM_020925, intron 2 of 26) -8434 NR_039957 100616338 NR_039957 ENSG00000264470 MIR4794 - microRNA 4794 ncRNA 440-9 chr5 3521314 3521593 + 2 NA intron (NR_033898, intron 2 of 4) intron (NR_033898, intron 2 of 4) 14641 NR_033898 285577 Hs.582442 NR_033898 ENSG00000248118 LINC01019 - long intergenic non-protein coding RNA 1019 ncRNA 295-45 chr6 125962362 125962574 + 2 NA intron (NM_138571, intron 1 of 4) intron (NM_138571, intron 1 of 4) 5698 NM_138571 135114 Hs.72325 NM_138571 ENSG00000111911 HINT3 HINT4 histidine triad nucleotide binding protein 3 protein-coding 302-51 chr5 35879828 35880114 + 2 NA TTS (NM_002185) TTS (NM_002185) 23080 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 356-32 chr7 54054501 54054795 + 2 NA Intergenic Intergenic -242717 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 380.333-8 chr5 94949502 94949862 + 2 NA intron (NM_001297777, intron 3 of 19) intron (NM_001297777, intron 3 of 19) 132184 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 404.667-4 chr2 34341404 34341698 + 2 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 274325 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 323-5 chr1 180560575 180560818 + 2 NA intron (NR_125716, intron 1 of 2) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 1722 NR_125716 148756 NR_125716 ENSG00000236719 OVAAL LINC01131|OVAL ovarian adenocarcinoma amplified long non-coding RNA ncRNA 363.667-7 chr2 127745542 127745985 + 2 NA intron (NM_001006623, intron 7 of 7) intron (NM_001006623, intron 7 of 7) 44266 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 274.666-24 chr4 112940204 112940480 + 2 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) 79355 NM_001354267 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 310-34 chr22 28712044 28712323 + 2 NA intron (NM_001349956, intron 4 of 13) intron (NM_001349956, intron 4 of 13) 29637 NM_001005735 11200 Hs.291363 NM_007194 ENSG00000183765 CHEK2 CDS1|CHK2|HuCds1|LFS2|PP1425|RAD53|hCds1 checkpoint kinase 2 protein-coding 305.667-12 chr17 32703155 32703402 + 2 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) intron (NM_015194, intron 16 of 21) 173846 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 315.333-37 chr5 40412602 40412899 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -267165 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 327.333-7 chr10 104016871 104017136 + 2 NA intron (NM_014720, intron 13 of 18) intron (NM_014720, intron 13 of 18) 31183 NR_030760 100126326 NR_030760 ENSG00000283788 MIR936 MIRN936|hsa-mir-936 microRNA 936 ncRNA 188-12 chr1 189525398 189525544 + 2 NA Intergenic Intergenic 950539 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 299.333-19 chr13 47788717 47788967 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 143780 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 413.333-3 chr11 16010960 16011204 + 2 NA intron (NM_017508, intron 12 of 14) intron (NM_017508, intron 12 of 14) -41461 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 303-29 chr2 59550086 59550321 + 2 NA Intergenic Intergenic 332495 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 324.667-2 chr1 98643096 98643404 + 2 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -18471 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 288-11 chr10 17043435 17043688 + 2 NA intron (NM_001081, intron 26 of 66) intron (NM_001081, intron 26 of 66) 86256 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 364-16 chr22 26875975 26876194 + 2 NA intron (NR_146604, intron 3 of 5) L1MEg2|LINE|L1 15873 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 301-49 chr6 41165022 41165355 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -2002 NM_018965 54209 Hs.435295 NM_018965 ENSG00000095970 TREM2 PLOSL2|TREM-2|Trem2a|Trem2b|Trem2c triggering receptor expressed on myeloid cells 2 protein-coding 251.333-34 chr14 51210066 51210272 + 2 NA Intergenic Intergenic -30078 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 475.667-4 chr8 111194405 111194804 + 2 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) 41599 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 302-28 chr2 33958703 33958972 + 2 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) LTR16A2|LTR|ERVL -108389 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 282.666-16 chr3 185732257 185732506 + 2 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) 19129 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 451.333 chr10 32600681 32601075 + 2 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) L1M4|LINE|L1 154738 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 296-36 chr20 34690185 34690351 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12983 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 280-3 chr1 95041709 95041866 + 2 NA intron (NM_001305242, intron 2 of 4) intron (NM_001305242, intron 2 of 4) -19809 NR_132786 101928098 Hs.730090 NR_132786 ENSG00000230427 LOC101928098 - uncharacterized LOC101928098 ncRNA 302.667-7 chr12 26487141 26487319 + 2 NA exon (NM_002223, exon 40 of 57) exon (NM_002223, exon 40 of 57) 291657 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 376.666-4 chr2 39044103 39044459 + 2 NA intron (NM_005633, intron 6 of 22) AluSz6|SINE|Alu 76182 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 280-9 chr13 41846145 41846362 + 2 NA intron (NM_001009814, intron 12 of 25) intron (NM_001009814, intron 12 of 25) 114832 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 382.666-15 chr5 9037815 9038165 + 2 NA 3' UTR (NM_003966, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_003966, exon 23 of 23) 15905 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 335.667-20 chr4 80635996 80636265 + 2 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) 300410 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 305.333-46 chr3 114707006 114707213 + 2 NA intron (NM_001348805, intron 5 of 10) intron (NM_001348805, intron 5 of 10) 36416 NR_039959 100616166 NR_039959 ENSG00000264623 MIR4796 mir-4796 microRNA 4796 ncRNA 331.334-11 chr5 172600048 172600236 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -41121 NM_001142651 54492 Hs.91521 NM_001142651 ENSG00000214357 NEURL1B NEURL3|RNF67B|hNeur2|neur2 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B protein-coding 325 chr1 27814877 27815256 + 2 NA intron (NM_177424, intron 6 of 8) (TAATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15716 NM_138558 5511 Hs.533474 NM_002713 ENSG00000117751 PPP1R8 ARD-1|ARD1|NIPP-1|NIPP1|PRO2047 protein phosphatase 1 regulatory subunit 8 protein-coding 312.666-5 chr12 27455342 27455556 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -8815 NR_109975 101928646 Hs.434269 NR_109975 ENSG00000245311 ARNTL2-AS1 - ARNTL2 antisense RNA 1 ncRNA 322.667-31 chr7 31608341 31608562 + 2 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) L1M4|LINE|L1 55449 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 312-55 chr8 17444646 17444897 + 2 NA Intergenic Intergenic -31420 NM_004686 9108 Hs.625674 NM_004686 ENSG00000003987 MTMR7 - myotubularin related protein 7 protein-coding 313-34 chr5 110295701 110295998 + 2 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger 218066 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 464.333 chr5 13774063 13774369 + 2 NA intron (NM_001369, intron 55 of 78) L2|LINE|L2 170264 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 368-21 chr8 79379348 79379599 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 47285 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 212.667-131 chr8 29800500 29800640 + 2 NA Intergenic Intergenic 27934 NR_125817 101929470 Hs.204721 NR_125817 ENSG00000248964 LOC101929470 - uncharacterized LOC101929470 ncRNA 343.334-4 chr2 31929347 31929649 + 2 NA intron (NM_001137602, intron 2 of 7) intron (NM_001137602, intron 2 of 7) 81166 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 299-24 chr2 98603111 98603435 + 2 NA intron (NM_001008215, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu 5239 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 256-81 chr5 106234750 106234924 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 776177 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 305-14 chr3 35421902 35422170 + 2 NA Intergenic Intergenic -28013 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 430-2 chr16 10973285 10973626 + 2 NA intron (NM_015226, intron 6 of 22) L1MB7|LINE|L1 28891 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 311-16 chr2 221079527 221079693 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 492694 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 309.333-2 chr1 112744726 112744962 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 24277 NM_001004440 284467 Hs.439116 NM_182759 ENSG00000184599 TAFA3 FAM19A3|TAFA-3 TAFA chemokine like family member 3 protein-coding 272-42 chr5 111537625 111537776 + 2 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) intron (NR_040093, intron 1 of 6) -25103 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 322-14 chr14 69154997 69155202 + 2 NA Intergenic Intergenic -1902 NM_001284206 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 332.666-25 chr5 63292503 63292842 + 2 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 669620 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 258-85 chr8 102534351 102534624 + 2 NA Intergenic MER73|LTR|ERVL -17102 NM_024410 4956 Hs.159274 NM_024410 ENSG00000155087 ODF1 CT133|HSPB10|ODF|ODF2|ODF27|ODFP|ODFPG|ODFPGA|ODFPGB|RT7|SODF outer dense fiber of sperm tails 1 protein-coding 335.333-52 chr7 99270132 99270328 + 2 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -3071 NR_002147 84176 Hs.621401 NR_002147 MYH16 MHC20|MYH16P|MYH5 myosin heavy chain 16 pseudogene pseudo 335.333-55 chr9 73801159 73801406 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -570249 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 358.333-25 chr7 92818667 92818988 + 2 NA intron (NM_001259, intron 2 of 7) L1ME1|LINE|L1 15132 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 216.667-76 chr4 45040147 45040291 + 2 NA Intergenic Intergenic -313585 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 460.666-2 chr5 74186952 74187228 + 2 NA Intergenic Intergenic 121235 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 248.667-77 chr3 120065101 120065359 + 2 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) L1MB5|LINE|L1 19418 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 363.333-6 chr12 33431745 33432117 + 2 NA intron (NM_198992, intron 1 of 6) Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 7888 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 327-19 chr3 51727598 51727792 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 20627 NM_001349117 2912 Hs.121510 NM_000839 ENSG00000164082 GRM2 GLUR2|GPRC1B|MGLUR2|mGlu2 glutamate metabotropic receptor 2 protein-coding 143-49 chr16 13857235 13857327 + 2 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -62876 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 590.666 chr5 53780846 53781324 + 2 NA intron (NR_147167, intron 4 of 5) intron (NR_147167, intron 4 of 5) 38597 NR_147168 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 453.666-3 chr22 25599702 25600118 + 2 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) L1M4|LINE|L1 35235 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 509 chr12 39315763 39316205 + 2 NA intron (NM_001173464, intron 29 of 37) intron (NM_001173464, intron 29 of 37) 127136 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 379.334-9 chr8 85352225 85352441 + 2 NA intron (NM_001738, intron 1 of 8) intron (NM_001738, intron 1 of 8) -10619 NM_001164830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 373-19 chr8 37317488 37317803 + 2 NA Intergenic Intergenic 176268 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 561.334-3 chr5 129967058 129967446 + 2 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 62787 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 271.666-19 chr9 108247037 108247315 + 2 NA Intergenic Intergenic 608810 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 355.333-26 chr5 76973284 76973693 + 2 NA Intergenic Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 20443 NM_001882 1393 Hs.115617 NM_001882 ENSG00000145708 CRHBP CRF-BP|CRFBP corticotropin releasing hormone binding protein protein-coding 327.667-21 chr3 87064389 87064627 + 2 NA Intergenic Intergenic -24772 NR_047469 100846978 Hs.570649 NR_047469 ENSG00000281392 LINC00506 - long intergenic non-protein coding RNA 506 ncRNA 293.667-45 chr3 153344760 153344955 + 2 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -139638 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 293-8 chr10 68564929 68565126 + 2 NA intron (NM_030625, intron 1 of 11) AluJr|SINE|Alu 4690 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 246-72 chr3 172148711 172148880 + 2 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 108264 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 312-9 chr10 44463500 44463696 + 2 NA Intergenic Intergenic -78501 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 288.333-31 chr5 89263253 89263524 + 2 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) intron (NR_136219, intron 7 of 9) -359283 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 290-51 chr8 110160155 110160391 + 2 NA Intergenic Intergenic -184502 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 279-15 chr2 61139963 61140183 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 4902 NR_036496 339803 Hs.252433 NR_036496 ENSG00000212978 LOC339803 - uncharacterized LOC339803 ncRNA 330-9 chr11 108166284 108166585 + 2 NA intron (NM_001321307, intron 15 of 17) L1M5|LINE|L1 44867 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 311-26 chr4 48096770 48097067 + 2 NA intron (NM_003328, intron 6 of 14) L1M5|LINE|L1 37332 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 310-22 chr15 86213453 86213738 + 2 NA intron (NM_152336, intron 5 of 24) intron (NM_152336, intron 5 of 24) -96878 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 374.666-2 chr1 111016004 111016387 + 2 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -52251 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 255.333-10 chr10 92235469 92235667 + 2 NA intron (NM_001178137, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 7711 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 606.666 chr17 63819476 63819833 + 2 NA TTS (NM_007372) TTS (NM_007372) -7777 NM_002805 5705 Hs.79387 NM_002805 ENSG00000087191 PSMC5 S8|SUG-1|SUG1|TBP10|TRIP1|p45|p45/SUG proteasome 26S subunit, ATPase 5 protein-coding 302.666-10 chr2 14215076 14215309 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 185766 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 319.333-22 chr22 28476025 28476441 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1ME3F|LINE|L1 16364 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 362-3 chr1 178490946 178491280 + 2 NA Intergenic Intergenic -21996 NM_032126 84066 Hs.534501 NM_032126 ENSG00000240021 TEX35 C1orf49|TSC24 testis expressed 35 protein-coding 268.666-29 chr7 43306157 43306361 + 2 NA intron (NM_001287059, intron 2 of 27) (CTATTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 155364 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 267-74 chr8 119078261 119078415 + 2 NA intron (NM_006438, intron 1 of 5) intron (NM_006438, intron 1 of 5) -9556 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 476.666-3 chr4 57798421 57798793 + 2 NA Intergenic Intergenic 372735 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 320-39 chr6 79463681 79463984 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 73598 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 311.333-37 chr4 36054976 36055268 + 2 NA intron (NR_146893, intron 33 of 36) intron (NR_146893, intron 33 of 36) 188817 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 518.666-2 chr5 121515079 121515754 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 192866 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 378.334-4 chr9 13923053 13923250 + 2 NA Intergenic Intergenic -4820 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 297.333-15 chr12 25611990 25612153 + 2 NA intron (NM_001352232, intron 1 of 10) intron (NM_001352232, intron 1 of 10) 36507 NM_001145727 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 131-68 chr3 187873896 187874058 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 102430 NR_135537 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 322-10 chr11 115591377 115591640 + 2 NA Intergenic Intergenic -87093 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 441.333-9 chr8 108995017 108995414 + 2 NA Intergenic Intergenic -91413 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 320.666-8 chr2 151052175 151052439 + 2 NA Intergenic Intergenic 209556 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 300-25 chr16 63987550 63987730 + 2 NA Intergenic Intergenic 1134423 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 310.667-12 chr15 56748901 56749064 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -14896 NM_001002843 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 361.333-28 chr6 138472523 138472712 + 2 NA intron (NM_020464, intron 3 of 6) intron (NM_020464, intron 3 of 6) 26877 NM_001144060 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 328-23 chr22 36390229 36390402 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2248 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 519.333 chr3 28709189 28709671 + 2 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 134152 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 523 chr1 150569957 150570576 + 2 NA intron (NR_104133, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 4286 NR_104133 574406 Hs.516243 NM_001025493 ENSG00000203804 ADAMTSL4-AS1 C1orf138 ADAMTSL4 antisense RNA 1 ncRNA 322-19 chr16 68635871 68636294 + 2 NA Intergenic Intergenic -9228 NM_001317195 1001 Hs.191842 NM_001793 ENSG00000062038 CDH3 CDHP|HJMD|PCAD cadherin 3 protein-coding 489-3 chr3 85510350 85510816 + 2 NA intron (NM_001256502, intron 1 of 10) intron (NM_001256502, intron 1 of 10) 5524 NM_001256505 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 331-45 chr9 79377849 79378067 + 2 NA Intergenic Intergenic -193815 NM_001282753 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 307-8 chr13 82708721 82709024 + 2 NA Intergenic Intergenic 1173521 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 291-9 chr11 57820801 57820969 + 2 NA Intergenic Intergenic 59083 NM_001206890 1500 Hs.166011 NM_001331 ENSG00000198561 CTNND1 BCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN) catenin delta 1 protein-coding 333.667-23 chrX 5054880 5055049 + 2 NA Intergenic Intergenic -421392 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 301-22 chr2 170171011 170171201 + 2 NA Intergenic Intergenic -7041 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 368-19 chr7 1772989 1773319 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -30844 NR_120509 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 336.667-23 chr8 31778376 31778578 + 2 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 138725 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 343.333-12 chr17 76068342 76068593 + 2 NA intron (NR_048541, intron 1 of 14) AluSg7|SINE|Alu 4050 NM_014230 6730 Hs.514495 NM_014230 ENSG00000167881 SRP68 - signal recognition particle 68 protein-coding 236-67 chr4 148152145 148152292 + 2 NA intron (NR_148974, intron 4 of 6) intron (NR_148974, intron 4 of 6) 290196 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 293.667-35 chr20 50099053 50099291 + 2 NA intron (NM_001282579, intron 1 of 4) intron (NM_001282579, intron 1 of 4) 13978 NM_001282577 7335 Hs.420529 NM_021988 ENSG00000244687 UBE2V1 CIR1|CROC-1|CROC1|UBE2V|UEV-1|UEV1|UEV1A ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 protein-coding 311.333-41 chr4 71881754 71881959 + 2 NA Intergenic Intergenic -76336 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 377-8 chr19 36579683 36579921 + 2 NA TTS (NR_027239) TTS (NR_027239) -6510 NM_001321351 57711 Hs.654960 NM_020951 ENSG00000186020 ZNF529 - zinc finger protein 529 protein-coding 278-35 chr3 85595047 85595268 + 2 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) 90098 NM_001256505 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 302.666-6 chr12 11721271 11721536 + 2 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) L1PA16|LINE|L1 71549 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 268.666-28 chr7 34475287 34475458 + 2 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 -182846 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 354.334-2 chr20 56568242 56568538 + 2 NA Intergenic MER57C2|LTR|ERV1 -9173 NR_136537 105372682 Hs.517135 NR_136537 ENSG00000225657 LINC01716 - long intergenic non-protein coding RNA 1716 ncRNA 319.333-13 chr18 11326395 11326656 + 2 NA Intergenic Intergenic -127953 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 310.667 chr1 72099094 72099467 + 2 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) 183259 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 385.334-5 chr9 79941794 79942070 + 2 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) intron (NR_121213, intron 1 of 2) -33091 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 288-33 chr3 49498450 49498633 + 2 NA intron (NM_001177641, intron 2 of 3) intron (NM_001177641, intron 2 of 3) 28409 NM_001177644 1605 Hs.76111 NM_004393 ENSG00000173402 DAG1 156DAG|A3a|AGRNR|DAG|LGMDR16|MDDGA9|MDDGC7|MDDGC9 dystroglycan 1 protein-coding 344-48 chr8 105746108 105746336 + 2 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 314281 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 230-68 chr7 109427059 109427285 + 2 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 533041 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 443.333-8 chr8 118052060 118052591 + 2 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 59494 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 522 chr1 210415491 210416001 + 2 NA intron (NM_001122834, intron 6 of 11) AluSx1|SINE|Alu 86380 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 509.667-2 chr17 34948013 34948336 + 2 NA intron (NM_006584, intron 5 of 13) L1PB1|LINE|L1 13286 NM_001193529 10693 Hs.73072 NM_006584 ENSG00000132141 CCT6B CCT-zeta-2|CCTZ-2|Cctz2|TCP-1-zeta-2|TSA303 chaperonin containing TCP1 subunit 6B protein-coding 396.334-5 chr6 37922563 37922959 + 2 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 103034 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 346.666-15 chr8 77732590 77732888 + 2 NA Intergenic Intergenic 282042 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 512-4 chr3 42455301 42455578 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -33860 NM_001251882 7433 Hs.348500 NM_004624 ENSG00000114812 VIPR1 HVR1|II|PACAP-R-2|PACAP-R2|RDC1|V1RG|VAPC1|VIP-R-1|VIPR|VIRG|VPAC1|VPAC1R|VPCAP1R vasoactive intestinal peptide receptor 1 protein-coding 306-28 chr21 22522176 22522452 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 423697 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 295.667-27 chr5 113164034 113164276 + 2 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) L3|LINE|CR1 130783 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 400.667-11 chr8 15783724 15784024 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 243611 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 374-12 chr2 222983099 222983430 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -68666 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 313-3 chr1 99683704 99683955 + 2 NA intron (NM_017734, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 29124 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 392.333-4 chr2 115395088 115395456 + 2 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 51457 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 343.667-8 chr2 148059009 148059198 + 2 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -37499 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 340-12 chr15 69753492 69753748 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -81614 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 322.666-19 chr3 98918246 98918514 + 2 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -16685 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 304.666-26 chr7 135223412 135223679 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -8434 NM_182489 346673 Hs.592279 NM_182489 ENSG00000146857 STRA8 - stimulated by retinoic acid 8 protein-coding 291.333-28 chr17 60267292 60267459 + 2 NA intron (NM_032582, intron 7 of 33) AluSx3|SINE|Alu -35730 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 237.333-14 chr10 14493086 14493289 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 39527 NM_001320741 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 450.667-3 chr2 19575014 19575397 + 2 NA Intergenic Intergenic -216582 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 348-17 chr3 45515754 45515973 + 2 NA intron (NM_001368263, intron 15 of 20) intron (NM_001368263, intron 15 of 20) -6318 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 373-4 chr14 103963993 103964221 + 2 NA intron (NM_153046, intron 3 of 35) AluJr|SINE|Alu -21578 NM_001257268 647286 Hs.632325 NM_001257268 ENSG00000227729 RD3L TDRD9-AS1|TDRD9AS1 retinal degeneration 3 like protein-coding 205.333-145 chr21 28326430 28326650 + 2 NA Intergenic Intergenic -97873 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 367.333-22 chr9 91486444 91486679 + 2 NA Intergenic Intergenic -61935 NM_001290000 4783 Hs.79334 NM_005384 ENSG00000165030 NFIL3 E4BP4|IL3BP1|NF-IL3A|NFIL3A nuclear factor, interleukin 3 regulated protein-coding 491-4 chr8 84289063 84289451 + 2 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) MER67C|LTR|ERV1 104591 NM_001100391 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 305.333-33 chr2 57868133 57868396 + 2 NA Intergenic Intergenic -39387 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 472 chr1 187373710 187374040 + 2 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -69753 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 612.334 chr8 135216661 135217063 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -17269 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 452-2 chr12 99379965 99380270 + 2 NA intron (NM_152788, intron 12 of 25) intron (NM_152788, intron 12 of 25) -225027 NM_001352189 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 302.334-6 chr2 64727122 64727383 + 2 NA Intergenic Intergenic -73339 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 212-31 chr11 115145486 115145716 + 2 NA Intergenic Intergenic -187976 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 381-6 chr18 6104572 6104921 + 2 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) intron (NM_001365769, intron 14 of 16) -151998 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 374-24 chr8 103979153 103979449 + 2 NA intron (NR_145711, intron 13 of 21) L1MA8|LINE|L1 160081 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 318.667-32 chr7 21123939 21124234 + 2 NA Intergenic Intergenic 288655 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 512.666-2 chr11 26415905 26416300 + 2 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) intron (NM_031418, intron 1 of 26) -57800 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 430.667-7 chr2 80480652 80481089 + 2 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) MIRc|SINE|MIR 167491 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 326-5 chr1 173668720 173668965 + 2 NA intron (NM_198493, intron 1 of 5) intron (NM_198493, intron 1 of 5) 1009 NM_198493 339416 Hs.130054 NM_198493 ENSG00000183831 ANKRD45 CT117 ankyrin repeat domain 45 protein-coding 260-13 chr10 84871552 84871749 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 327255 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 274-47 chr5 93548931 93549182 + 2 NA intron (NR_109819, intron 4 of 5) intron (NR_109819, intron 4 of 5) 22287 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 390-12 chr2 41430052 41430302 + 2 NA Intergenic (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -447378 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 249.667-46 chr2 132918440 132918682 + 2 NA intron (NR_135572, intron 1 of 1) intron (NR_135572, intron 1 of 1) 3004 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 428.667-11 chr8 87605084 87605462 + 2 NA Intergenic Intergenic 268742 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 476.666-2 chr2 73469164 73469449 + 2 NA intron (NM_015120, intron 9 of 22) L1M5|LINE|L1 12203 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 348.667-19 chr4 71031565 71031837 + 2 NA TTS (NM_000788) TTS (NM_000788) 38052 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 361.333-6 chr14 48174875 48175122 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -379984 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 296.667-56 chr7 97821258 97821412 + 2 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 50830 NM_133436 440 Hs.489207 NM_001673 ENSG00000070669 ASNS ASNSD|TS11 asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing) protein-coding 512-5 chr8 34905928 34906434 + 2 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 122260 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 278-39 chr4 47474528 47474742 + 2 NA Intergenic Intergenic -10640 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 326.667-21 chr2 7773193 7773418 + 2 NA Intergenic Intergenic 126350 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 372.667-17 chr3 195389083 195389435 + 2 NA intron (NM_012287, intron 2 of 22) intron (NM_012287, intron 2 of 22) 53761 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 297-9 chr10 31848253 31848550 + 2 NA intron (NM_001270696, intron 6 of 17) L1MEi|LINE|L1 60525 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 279.333-72 chr8 135346268 135346435 + 2 NA Intergenic Intergenic -111105 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 300.334-6 chr18 48465915 48466210 + 2 NA Intergenic Intergenic -53477 NM_001371287 296-65 chr8 109094623 109094897 + 2 NA intron (NM_003301, intron 2 of 2) intron (NM_003301, intron 2 of 2) 8132 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 320.667-3 chr1 110798848 110799127 + 2 NA Intergenic Intergenic -72212 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 322.667-37 chr9 29480413 29480738 + 2 NA Intergenic Intergenic -266974 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 386.333-9 chr3 117235486 117235893 + 2 NA Intergenic Intergenic 314258 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 341.667-7 chr14 47692301 47692598 + 2 NA Intergenic Intergenic -17495 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 334-34 chr6 143106656 143106831 + 2 NA intron (NM_001366344, intron 2 of 6) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -19396 NM_001366358 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 255.333-65 chr20 59976426 59976747 + 2 NA intron (NM_177980, intron 4 of 17) intron (NM_177980, intron 4 of 17) 18163 NM_177980 60437 Hs.729046 NM_021810 ENSG00000124215 CDH26 VR20 cadherin 26 protein-coding 475.666-4 chr6 55665561 55666072 + 2 NA Intergenic Intergenic -86602 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 336-18 chr22 47870475 47870709 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 238918 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 438-15 chr9 29034094 29034535 + 2 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -145359 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 288.667-11 chr14 40207263 40207417 + 2 NA Intergenic Intergenic -747371 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 346.333-33 chr9 78536556 78536870 + 2 NA Intergenic Intergenic 239588 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 312.666-18 chr3 162767769 162768050 + 2 NA Intergenic Intergenic 535392 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 457-5 chr22 31754962 31755250 + 2 NA intron (NR_146296, intron 2 of 42) intron (NR_146296, intron 2 of 42) 1083 NM_001369901 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 293.667-20 chr18 65097253 65097446 + 2 NA Intergenic Intergenic -652903 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 311.667-20 chr4 117741458 117741643 + 2 NA Intergenic Intergenic -92851 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 440-11 chr7 5407713 5408034 + 2 NA intron (NM_001080495, intron 2 of 29) intron (NM_001080495, intron 2 of 29) 15673 NM_001080495 84629 Hs.520638 NM_001013722 ENSG00000182095 TNRC18 CAGL79|TNRC18A trinucleotide repeat containing 18 protein-coding 354.666-2 chr10 123944386 123944619 + 2 NA Intergenic Intergenic -52695 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 486-4 chr11 122921526 122921911 + 2 NA intron (NM_001363088, intron 3 of 7) AluSz|SINE|Alu 38788 NM_001363089 79864 Hs.164705 NM_024806 ENSG00000109944 JHY C11orf63 junctional cadherin complex regulator protein-coding 294-15 chr11 103802427 103802656 + 2 NA Intergenic Intergenic -47365 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 399 chr1 88687331 88687670 + 2 NA intron (NM_001320708, intron 1 of 20) intron (NM_001320708, intron 1 of 20) -2296 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 314-42 chr6 92247628 92247813 + 2 NA Intergenic Intergenic -557292 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 174-86 chr6 142074281 142074430 + 2 NA TTS (NM_002511) TTS (NM_002511) 14444 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 265-42 chr20 12613350 12613537 + 2 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 323520 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 315.666-7 chr2 127311775 127312168 + 2 NA intron (NM_006609, intron 14 of 15) L1MC5|LINE|L1 -17795 NM_000122 2071 Hs.469872 NM_000122 ENSG00000163161 ERCC3 BTF2|GTF2H|RAD25|TFIIH|TTD2|XPB ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit protein-coding 591.666 chr7 805279 805703 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10066 NM_001171946 23353 Hs.438072 NM_025154 ENSG00000164828 SUN1 UNC84A Sad1 and UNC84 domain containing 1 protein-coding 301-51 chr6 144313413 144313636 + 2 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) intron (NM_007124, intron 1 of 73) 21787 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 369.667-12 chr7 27566103 27566468 + 2 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) L1ME1|LINE|L1 -49689 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 381.333-20 chr7 49465457 49465732 + 2 NA Intergenic Intergenic -308044 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 308.334-5 chr17 72492996 72493261 + 2 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 99676 NR_152515 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 314.666-24 chr3 127838060 127838317 + 2 NA Intergenic Intergenic -14938 NM_001003794 11343 Hs.277035 NM_007283 ENSG00000074416 MGLL HU-K5|HUK5|MAGL|MGL monoglyceride lipase protein-coding 287.667-21 chr2 73947917 73948173 + 2 NA intron (NR_134893, intron 2 of 3) intron (NR_134893, intron 2 of 3) 21165 NM_080916 1716 Hs.469022 NM_001929 ENSG00000114956 DGUOK MTDPS3|NCPH|PEOB4|dGK deoxyguanosine kinase protein-coding 361-13 chr3 165994734 165995076 + 2 NA Intergenic Intergenic -157482 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 296.667-36 chr21 31847064 31847229 + 2 NA Intergenic Intergenic -25874 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 215.667-90 chr4 12141727 12141939 + 2 NA Intergenic Intergenic -81618 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 249-6 chr1 241739288 241739478 + 2 NA intron (NM_001367482, intron 11 of 27) intron (NM_001367482, intron 11 of 27) 87102 NM_001367482 128025 Hs.97527 NM_144625 ENSG00000162843 WDR64 - WD repeat domain 64 protein-coding 528.667-4 chr2 18952606 18953070 + 2 NA Intergenic Intergenic 74133 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 284.667-56 chr8 113750694 113750849 + 2 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -313832 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 246-6 chr1 204364308 204364482 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4466 NM_014935 22874 Hs.253146 NM_014935 ENSG00000143850 PLEKHA6 PEPP-3|PEPP3 pleckstrin homology domain containing A6 protein-coding 264.667-24 chr13 73813266 73813457 + 2 NA intron (NM_007249, intron 4 of 7) intron (NM_007249, intron 4 of 7) 249117 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 250.666-32 chr5 158778213 158778447 + 2 NA intron (NM_001324107, intron 9 of 15) X6B_LINE|LINE|CR1 319626 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 452.333-6 chr3 99198406 99198756 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -296886 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 407-5 chr2 154728620 154729015 + 2 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 30122 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 226-21 chr13 104971012 104971151 + 2 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -494786 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 256.666-39 chr5 81174550 81174717 + 2 NA intron (NM_006909, intron 17 of 26) intron (NM_006909, intron 17 of 26) -58687 NM_001099736 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 293.667-58 chr8 86397168 86397442 + 2 NA intron (NM_007013, intron 5 of 24) intron (NM_007013, intron 5 of 24) 54758 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 309-31 chr5 163483007 163483501 + 2 NA non-coding (NR_109892, exon 4 of 4) non-coding (NR_109892, exon 4 of 4) 10804 NR_109892 101927813 Hs.726818 NR_109892 HMMR-AS1 - HMMR antisense RNA 1 ncRNA 357.667-3 chr17 19525540 19525822 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8173 NM_018242 55244 Hs.232054 NM_018242 ENSG00000142494 SLC47A1 MATE1 solute carrier family 47 member 1 protein-coding 304.333-6 chr10 67272649 67272875 + 2 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 130648 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 135-69 chr3 147813567 147813706 + 2 NA Intergenic Intergenic -264523 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 401.667-6 chr17 60060938 60061238 + 2 NA intron (NM_022070, intron 9 of 19) intron (NM_022070, intron 9 of 19) 17843 NM_022070 63897 Hs.221899 NM_022070 ENSG00000068097 HEATR6 ABC1 HEAT repeat containing 6 protein-coding 432.666 chr1 42573430 42573697 + 2 NA intron (NM_001080850, intron 7 of 16) L1ME3B|LINE|L1 40543 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 599.333 chr14 57432661 57433023 + 2 NA Intergenic Intergenic 42256 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 317-13 chr17 74718524 74718835 + 2 NA intron (NM_175738, intron 1 of 8) intron (NM_175738, intron 1 of 8) -5756 NM_001289083 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 361-16 chr8 118371878 118372209 + 2 NA intron (NM_001363274, intron 4 of 4) intron (NM_001363274, intron 4 of 4) -248958 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 416.666-4 chr14 32074715 32075107 + 2 NA TTS (NR_027263) TTS (NR_027263) 1788 NR_027263 84837 Hs.496755 NM_032751 ARHGAP5-AS1 C14orf128 ARHGAP5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 322-8 chr10 94737259 94737561 + 2 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -25271 NM_000769 1557 Hs.282409 NM_000769 ENSG00000165841 CYP2C19 CPCJ|CYP2C|CYPIIC17|CYPIIC19|P450C2C|P450IIC19 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19 protein-coding 473.333-5 chr4 41718493 41718846 + 2 NA Intergenic Intergenic 30301 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 406.333-6 chr19 30006554 30007022 + 2 NA intron (NM_001252641, intron 6 of 10) intron (NM_001252641, intron 6 of 10) 64549 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 260.667-96 chr9 19478460 19478636 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 69539 NM_001010887 340485 Hs.41379 NM_001010887 ENSG00000177076 ACER2 ALKCDase2|ASAH3L alkaline ceramidase 2 protein-coding 340-3 chr1 231116807 231117133 + 2 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -45958 NM_001300889 440730 Hs.655089 NM_001004342 ENSG00000119283 TRIM67 TNL tripartite motif containing 67 protein-coding 346-39 chr8 47842375 47842658 + 2 NA intron (NM_001081640, intron 54 of 84) L1PA16|LINE|L1 -104352 NM_005195 1052 Hs.440829 NM_005195 ENSG00000221869 CEBPD C/EBP-delta|CELF|CRP3|NF-IL6-beta CCAAT enhancer binding protein delta protein-coding 304-46 chr4 111694782 111695017 + 2 NA Intergenic Intergenic -450555 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 356-28 chr4 153325943 153326299 + 2 NA intron (NM_001351057, intron 11 of 12) intron (NM_001351057, intron 11 of 12) -17310 NR_001562 303 Hs.546235 NR_001562 ANXA2P1 ANX2L1|ANX2P1|LPC2A annexin A2 pseudogene 1 pseudo 309-4 chr1 113979866 113980152 + 2 NA 5' UTR (NM_001286352, exon 2 of 4) 5' UTR (NM_001286352, exon 2 of 4) 535 NM_001286352 56944 Hs.9315 NM_020190 ENSG00000116774 OLFML3 HNOEL-iso|OLF44 olfactomedin like 3 protein-coding 388-2 chr1 190988039 190988591 + 2 NA Intergenic Intergenic 240183 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 292.666-31 chr6 56810397 56810652 + 2 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 33141 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 365.333-26 chr9 124531026 124531418 + 2 NA intron (NM_001278546, intron 7 of 9) intron (NM_001278546, intron 7 of 9) -23823 NM_004959 2516 Hs.495108 NM_004959 ENSG00000136931 NR5A1 AD4BP|ELP|FTZ1|FTZF1|POF7|SF-1|SF1|SPGF8|SRXX4|SRXY3|hSF-1 nuclear receptor subfamily 5 group A member 1 protein-coding 374.333-4 chr12 90315401 90315812 + 2 NA Intergenic Intergenic 22288 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 240-12 chr10 125729462 125729627 + 2 NA intron (NM_001202438, intron 8 of 24) intron (NM_001202438, intron 8 of 24) 9835 NR_110859 26098 Hs.468688 NM_015608 ENSG00000107938 EDRF1 C10orf137 erythroid differentiation regulatory factor 1 protein-coding 333.333-24 chr18 2382179 2382479 + 2 NA Intergenic Intergenic 189176 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 405-5 chr2 13739291 13739649 + 2 NA Intergenic Intergenic 661488 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 284-21 chr18 6499522 6499771 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -11770 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 326.334-12 chr8 122670303 122670597 + 2 NA TTS (NR_126348) TTS (NR_126348) 23656 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 301-55 chr8 49409410 49409618 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 102666 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 349.667-18 chr4 178982601 178983055 + 2 NA Intergenic Intergenic -1074892 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 323-14 chr18 59544188 59544412 + 2 NA intron (NM_133459, intron 2 of 10) intron (NM_133459, intron 2 of 10) 153123 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 359.333-28 chr9 73152589 73152905 + 2 NA intron (NM_000700, intron 1 of 12) intron (NM_000700, intron 1 of 12) 882 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 298.666-19 chr7 81165001 81165274 + 2 NA Intergenic Intergenic -242748 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 522-2 chr11 40830735 40831015 + 2 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -537745 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 372.333-10 chr17 32391328 32391516 + 2 NA Intergenic Intergenic 41284 NM_003457 7756 Hs.500775 NM_003457 ENSG00000010244 ZNF207 BuGZ|hBuGZ zinc finger protein 207 protein-coding 293.333-28 chr2 53006902 53007067 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -304369 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 322-5 chr1 235417379 235417688 + 2 NA intron (NM_001287801, intron 4 of 17).2 MER119|DNA|hAT-Charlie 50106 NM_001287801 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 309-36 chr8 122619700 122619933 + 2 NA Intergenic Intergenic -51172 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 409.667-10 chr8 109552679 109553051 + 2 NA intron (NM_198120, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu 12239 NM_001278938 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 322-42 chr7 32433223 32433509 + 2 NA Intergenic Intergenic -5142 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 298.333-11 chr14 65002736 65002925 + 2 NA intron (NM_002028, intron 1 of 11) LTR26C|LTR|ERV1 15935 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 350-23 chr5 3715110 3715395 + 2 NA Intergenic Intergenic 119420 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 359.333-16 chr3 164033841 164034135 + 2 NA Intergenic Intergenic 137568 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 269.333-95 chr9 108883826 108884019 + 2 NA intron (NM_001330749, intron 27 of 34) L1ME1|LINE|L1 21656 NM_006687 10881 Hs.123530 NM_006687 ENSG00000187003 ACTL7A - actin like 7A protein-coding 308-35 chr3 114489364 114489667 + 2 NA intron (NR_121661, intron 1 of 2) L1ME4a|LINE|L1 35922 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 305.666-13 chr2 181510747 181511073 + 2 NA intron (NM_000885, intron 16 of 27) intron (NM_000885, intron 16 of 27) 53524 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 377.667-15 chr7 122932596 122932969 + 2 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -46023 NM_001167940 93664 Hs.649459 NM_017954 ENSG00000081803 CADPS2 CAPS2 calcium dependent secretion activator 2 protein-coding 318-41 chr3 116565472 116565776 + 2 NA intron (NR_046624, intron 1 of 1) intron (NR_046624, intron 1 of 1) 13151 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 322.333-23 chr4 134894135 134894306 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 229339 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 464-3 chr16 22921470 22921929 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 107537 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 429.333-6 chr5 103361219 103361584 + 2 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 101977 NM_001316968 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 321-16 chr22 24481664 24481882 + 2 NA intron (NR_028483, intron 1 of 7) intron (NR_028483, intron 1 of 7) 13301 NR_028483 646023 Hs.632761 NM_001039784 ENSG00000178803 ADORA2A-AS1 C22orf45 ADORA2A antisense RNA 1 ncRNA 344-50 chr8 130537774 130538131 + 2 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -94278 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 293.333-36 chr2 224500120 224500323 + 2 NA intron (NM_001257197, intron 10 of 14) intron (NM_001257197, intron 10 of 14) 69734 NM_001257198 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 410.666-10 chr8 100468325 100468575 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 85687 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 298.666-16 chr5 111334320 111334533 + 2 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 110042 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 297.667-23 chr22 25044464 25044636 + 2 NA intron (NM_001145206, intron 3 of 10) intron (NM_001145206, intron 3 of 10) 16576 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 410.667-12 chr5 15133473 15133926 + 2 NA Intergenic Intergenic 132861 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 318-56 chr8 117568883 117569042 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 48249 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 426-7 chr17 55459435 55459712 + 2 NA Intergenic Intergenic -37738 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 327.333-6 chr10 75833407 75833728 + 2 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 50806 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 282-10 chr12 81609151 81609342 + 2 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) L1PA16|LINE|L1 -10875 NM_001220477 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 315-12 chr16 79618972 79619143 + 2 NA Intergenic Intergenic -18320 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 295.333-4 chr10 96161747 96162033 + 2 NA 3' UTR (NM_001330737, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001330737, exon 7 of 7) 31268 NM_001330734 9849 Hs.600823 NM_014803 ENSG00000177853 ZNF518A ZNF518 zinc finger protein 518A protein-coding 306.667-24 chr2 101269420 101269715 + 2 NA 3' UTR (NM_017546, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_017546, exon 7 of 7) 3482 NR_003070 692205 Hs.656503 NR_003070 ENSG00000212283 SNORD89 HBII-289 small nucleolar RNA, C/D box 89 snoRNA 516.667-3 chr14 66023584 66023912 + 2 NA Intergenic Intergenic -462623 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 319 chr1 97339613 97339796 + 2 NA intron (NM_000110, intron 16 of 22) intron (NM_000110, intron 16 of 22) 243781 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 437.333-13 chr8 145009992 145010347 + 2 NA Intergenic Intergenic -7270 NR_023392 286101 Hs.367856 NR_023392 ZNF252P ZNF252 zinc finger protein 252, pseudogene pseudo 300.333-35 chr4 49634221 49634497 + 2 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 647717 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 268-37 chr3 54430188 54430484 + 2 NA intron (NM_018398, intron 4 of 37) intron (NM_018398, intron 4 of 37) 209521 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 303-8 chr11 34339867 34340066 + 2 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) intron (NM_145804, intron 1 of 16) 18044 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 451.999 chr1 83840036 83840442 + 2 NA intron (NR_119374, intron 2 of 2) MamRep605|LTR?|LTR? 20307 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 459.333 chr1 92009090 92009346 + 2 NA intron (NM_001726, intron 18 of 18) L1MA8|LINE|L1 -20767 NM_173567 253152 Hs.201555 NM_173567 ENSG00000172031 EPHX4 ABHD7|EH4|EPHXRP epoxide hydrolase 4 protein-coding 257.333-32 chr14 50776339 50776501 + 2 NA intron (NM_016350, intron 7 of 28) intron (NM_016350, intron 7 of 28) -45377 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 420.667 chr1 42727036 42727369 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 13034 NM_001123395 149461 Hs.496270 NM_148960 ENSG00000164007 CLDN19 HOMG5 claudin 19 protein-coding 497.333-2 chr18 40464878 40465283 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 398794 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 329.667-15 chr5 56888500 56888783 + 2 NA intron (NM_005921, intron 19 of 19) MER47B|DNA|TcMar-Tigger -20619 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 328.667-2 chr1 82075879 82076166 + 2 NA Intergenic Intergenic 273569 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 509.667-3 chr2 132578537 132578842 + 2 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) L1MD1|LINE|L1 91516 NM_001321234 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 323.333-12 chr17 29784918 29785188 + 2 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) intron (NM_033389, intron 2 of 14) -23621 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 254-68 chr5 166040047 166040258 + 2 NA Intergenic Intergenic 886218 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 419.332-2 chr4 53376892 53377219 + 2 NA promoter-TSS (NM_030917) promoter-TSS (NM_030917) -586 NM_030917 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 284.334-7 chr12 22638461 22638752 + 2 NA intron (NM_001039481, intron 1 of 2) intron (NM_001039481, intron 1 of 2) 13435 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 382-12 chr8 78582704 78583065 + 2 NA intron (NM_006823, intron 2 of 3) intron (NM_006823, intron 2 of 3) -24381 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 507 chr8 76724946 76725380 + 2 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) intron (NM_024721, intron 3 of 10) -41888 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 421-5 chr2 45225807 45226114 + 2 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) L1MB8|LINE|L1 28981 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 331.333-6 chr1 115269426 115269655 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -13494 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 208-146 chr6 68682462 68682671 + 2 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 47284 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 431-12 chr5 77094001 77094313 + 2 NA intron (NR_024398, intron 2 of 3) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -6872 NM_001329564 84327 Hs.584988 NM_032367 ENSG00000132846 ZBED3 - zinc finger BED-type containing 3 protein-coding 298-47 chr2 163774516 163774794 + 2 NA Intergenic Intergenic -38647 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 571.666 chr14 69130622 69131184 + 2 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 21696 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 348.667-26 chr7 94729600 94729824 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 73342 NM_001184962 23089 Hs.147492 NM_015068 ENSG00000242265 PEG10 EDR|HB-1|MEF3L|Mar2|Mart2|RGAG3|RTL2|SIRH1 paternally expressed 10 protein-coding 277.333-89 chrX 96127437 96127594 + 2 NA Intergenic Intergenic 210387 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 276-11 chr11 65027165 65027330 + 2 NA promoter-TSS (NM_147777) promoter-TSS (NM_147777) -192 NM_147777 29907 Hs.80132 NM_013306 ENSG00000110025 SNX15 HSAF001435 sorting nexin 15 protein-coding 366-10 chr2 30125258 30125550 + 2 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -21603 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 316.667-6 chr10 122769203 122769395 + 2 NA intron (NR_003570, intron 7 of 27) intron (NR_003570, intron 7 of 27) 12605 NR_003570 375940 Hs.650695 NM_198577 ENSG00000176584 DMBT1P1 - deleted in malignant brain tumors 1 pseudogene 1 pseudo 308-50 chr6 156506658 156506939 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 128048 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 308-31 chr22 27861644 27861922 + 2 NA intron (NM_001284278, intron 8 of 11) intron (NM_001284278, intron 8 of 11) 57431 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 627 chr18 9283834 9284372 + 2 NA 3' UTR (NM_015208, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_015208, exon 13 of 13) -50670 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 547.667 chr15 76049206 76049679 + 2 NA Intergenic Intergenic -10543 NM_152335 123591 Hs.661411 NM_152335 ENSG00000169758 TMEM266 C15orf27|HVRP1|HsHVRP1|hTMEM266 transmembrane protein 266 protein-coding 438.666-4 chr11 77805640 77806177 + 2 NA intron (NM_016578, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 14926 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 296-2 chr1 65093792 65093985 + 2 NA Intergenic Intergenic -26142 NM_001321853 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 366.334-4 chr7 93562854 93563091 + 2 NA intron (NM_001164737, intron 2 of 15) intron (NM_001164737, intron 2 of 15) -3162 NM_001164738 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 300-9 chr10 56305735 56305964 + 2 NA Intergenic Intergenic 55410 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 325-31 chr8 137278743 137278977 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 134728 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 420.666-6 chr5 25863823 25864064 + 2 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 672990 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 365.667-15 chr7 3739441 3739782 + 2 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1MA9|LINE|L1 -390074 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 319.334-3 chr20 40973940 40974167 + 2 NA Intergenic (ATTCTATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6660 NR_145524 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 356.667-9 chr20 52149669 52150066 + 2 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) intron (NM_199427, intron 5 of 8) 41912 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 250-64 chr5 85715119 85715320 + 2 NA Intergenic Intergenic -567225 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 336.666-2 chr10 5856764 5856981 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -32700 NM_001258452 84893 Hs.498543 NM_032807 ENSG00000134452 FBH1 FBXO18|Fbx18|hFBH1 F-box DNA helicase 1 protein-coding 402-5 chr3 79177466 79177822 + 2 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -158185 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 273-29 chr4 109273512 109273785 + 2 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 29010 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 298-52 chr20 50525574 50525735 + 2 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) intron (NM_001278618, intron 1 of 8) 15271 NM_002827 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 485.667-3 chr6 34749213 34749615 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7680 NR_029472 6631 Hs.1063 NM_003093 ENSG00000124562 SNRPC U1C|Yhc1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C protein-coding 370.666-12 chr3 181095469 181095839 + 2 NA intron (NR_075091, intron 2 of 7) MER103C|DNA|hAT-Charlie 38974 NR_075092 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 299-13 chr12 109485728 109485944 + 2 NA intron (NM_001270449, intron 4 of 8) intron (NM_001270449, intron 4 of 8) 8202 NM_130466 89910 Hs.374067 NM_130466 ENSG00000151148 UBE3B BPIDS|KOS ubiquitin protein ligase E3B protein-coding 307.667-31 chr5 52704462 52704645 + 2 NA Intergenic Intergenic -83363 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 259.333-34 chr15 72930650 72930867 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -121705 NM_002499 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 428.666-4 chr16 75175555 75176005 + 2 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 26729 NM_001318475 162239 Hs.388813 NM_153688 ENSG00000184517 ZFP1 ZNF475 ZFP1 zinc finger protein protein-coding 460.999 chr2 13361039 13361388 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -354200 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 326.333-13 chr2 117054737 117054990 + 2 NA Intergenic Intergenic -759828 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 328-25 chr3 68730761 68730939 + 2 NA TTS (NM_182522) TTS (NM_182522) 201697 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 318.666-22 chr8 74715010 74715298 + 2 NA intron (NR_033830, intron 4 of 5) intron (NR_033830, intron 4 of 5) 9461 NR_031744 100302260 NR_031744 ENSG00000283188 MIR2052 hsa-mir-2052 microRNA 2052 ncRNA 360-20 chr3 25187547 25187806 + 2 NA intron (NM_001290216, intron 4 of 10) L1M5|LINE|L1 -153126 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 309.333-22 chr15 43013313 43013670 + 2 NA intron (NM_174916, intron 29 of 46) intron (NM_174916, intron 29 of 46) 92547 NM_174916 197131 Hs.591121 NM_174916 ENSG00000159459 UBR1 JBS ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 protein-coding 291-48 chr9 98526655 98526818 + 2 NA intron (NM_005458, intron 3 of 18) L2a|LINE|L2 182199 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 317.333-18 chr17 69768055 69768303 + 2 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 174192 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 295-51 chrX 127297274 127297441 + 2 NA Intergenic Intergenic 477628 NM_001122716 100130613 Hs.130370 NM_001122716 ENSG00000183631 PRR32 CXorf64 proline rich 32 protein-coding 395-12 chr2 116712635 116712974 + 2 NA Intergenic Intergenic -1101887 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 255-38 chr17 65086839 65086993 + 2 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -13896 NR_110801 100507002 Hs.729924 NR_110801 LOC100507002 - uncharacterized LOC100507002 ncRNA 315.667-25 chr8 104120821 104121017 + 2 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) intron (NM_001348498, intron 19 of 24) -102416 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 300.334-17 chr9 24162444 24162660 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -311951 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 342-27 chr4 107226736 107227009 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -190559 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 307.333-22 chr12 60559247 60559417 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 869962 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 251.667-102 chr9 86743827 86743969 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 203608 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 257-71 chr8 86914863 86915081 + 2 NA intron (NM_173538, intron 3 of 10) LTR8A|LTR|ERV1 48557 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 317.333-26 chr2 208756872 208757128 + 2 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) (TCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 214358 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 432.666-2 chr18 60438987 60439310 + 2 NA Intergenic Intergenic -66373 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 400.333 chr10 5742844 5743304 + 2 NA intron (NM_017782, intron 14 of 20) intron (NM_017782, intron 14 of 20) 58236 NM_017782 54906 Hs.610717 NM_017782 ENSG00000108021 TASOR2 C10orf18|FAM208B|bA318E3.2 transcription activation suppressor family member 2 protein-coding 272.667-35 chr2 216800679 216800827 + 2 NA Intergenic Intergenic 59311 NM_003284 7141 Hs.3017 NM_003284 ENSG00000118245 TNP1 TP1 transition protein 1 protein-coding 372.333-12 chr2 184336406 184336716 + 2 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -42414 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 355.001-2 chr5 58247415 58247728 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -125230 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 314-35 chr4 97822347 97822523 + 2 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 321041 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 235.333-122 chr8 86206749 86206962 + 2 NA Intergenic Intergenic 23526 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 237-56 chr5 23309238 23309381 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -198300 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 409.333-13 chr7 94408285 94408588 + 2 NA intron (NM_000089, intron 15 of 51) intron (NM_000089, intron 15 of 51) 13875 NM_000089 1278 Hs.489142 NM_000089 ENSG00000164692 COL1A2 EDSARTH2|EDSCV|OI4 collagen type I alpha 2 chain protein-coding 255.333-81 chr5 19237020 19237183 + 2 NA Intergenic Intergenic 649171 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 307.333-20 chr11 91046783 91046943 + 2 NA Intergenic Intergenic -177661 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 277.333-76 chr5 122824860 122825015 + 2 NA intron (NM_003100, intron 11 of 14) MIRb|SINE|MIR -20512 NR_146145 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 302-65 chr7 125407592 125407900 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -143455 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 376.666-10 chr8 59741969 59742301 + 2 NA Intergenic Intergenic 539265 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 358.666 chr10 83878054 83878341 + 2 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -201108 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 516-2 chr14 50554388 50554859 + 2 NA intron (NM_001127713, intron 1 of 13) LTR57|LTR|ERVL -5402 NM_015915 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 320-42 chr7 39115532 39115763 + 2 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -102080 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 309-21 chr2 42819877 42820032 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -27371 NM_012205 23498 Hs.368805 NM_012205 ENSG00000162882 HAAO 3-HAO|HAO|VCRL1|h3HAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase protein-coding 328.666-19 chr5 120987817 120988047 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -334618 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 301-9 chr11 100828282 100828481 + 2 NA intron (NM_001367945, intron 5 of 25) intron (NM_001367945, intron 5 of 25) -105893 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 561.667 chr1 224236038 224236651 + 2 NA intron (NM_002533, intron 20 of 22) intron (NM_002533, intron 20 of 22) 16731 NR_110668 101927164 Hs.710128 NR_110668 ENSG00000237101 LOC101927164 - uncharacterized LOC101927164 ncRNA 456-7 chr8 140853924 140854351 + 2 NA intron (NR_148037, intron 6 of 34) intron (NR_148037, intron 6 of 34) -121484 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 271.667-29 chr15 59748514 59748692 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -59283 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 350.666-4 chr11 114019030 114019318 + 2 NA Intergenic LTR86C|LTR|ERVL -40537 NM_001354750 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 190-19 chr11 90672789 90672983 + 2 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) intron (NR_104190, intron 3 of 6) -117029 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 246.666-14 chr14 61750637 61750895 + 2 NA intron (NR_144368, intron 1 of 2) intron (NR_144368, intron 1 of 2) 331 NR_144368 105370526 Hs.661638 NR_144368 ENSG00000258667 HIF1A-AS3 - HIF1A antisense RNA 3 ncRNA 328-4 chr10 83098748 83098957 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 578237 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 264.667-26 chr14 52416142 52416331 + 2 NA Intergenic Intergenic 101924 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 308.333-7 chr10 77091685 77091980 + 2 NA intron (NM_001271519, intron 9 of 28) intron (NM_001271519, intron 9 of 28) -48999 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 224-21 chr14 36635634 36635799 + 2 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -21852 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 408.666-3 chr16 62714166 62714532 + 2 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -677911 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 316-41 chr5 91542918 91543192 + 2 NA Intergenic Intergenic -159738 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 328.333-35 chr6 145074372 145074650 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 612366 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 488.666-2 chr14 70044410 70044810 + 2 NA non-coding (NR_104122, exon 6 of 6) non-coding (NR_104122, exon 6 of 6) 35607 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 340-16 chr2 48113469 48113674 + 2 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -201111 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 415.333-8 chr4 88573565 88573859 + 2 NA Intergenic Intergenic -18711 NM_001271602 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 284-24 chr2 29120595 29120746 + 2 NA intron (NM_024692, intron 1 of 15) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 5255 NM_001287527 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 343-14 chr20 59846763 59847325 + 2 NA intron (NM_080672, intron 12 of 12) intron (NM_080672, intron 12 of 12) 86593 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 301.667-17 chr16 59320311 59320729 + 2 NA Intergenic Intergenic 434671 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 543.333-3 chr5 160724974 160725584 + 2 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) intron (NM_001366652, intron 2 of 24) -39888 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 265-33 chr2 76400570 76400721 + 2 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -585320 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 378.666-3 chr14 73364560 73365057 + 2 NA intron (NM_001320114, intron 3 of 11) AluJr|SINE|Alu 93772 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 302-3 chr1 103060110 103060289 + 2 NA intron (NM_001854, intron 4 of 66) L1MC1|LINE|L1 48297 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 301-56 chr8 50019222 50019513 + 2 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) 107960 NR_135796 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 651 chr2 31509953 31510562 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 70681 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 401.333-9 chr14 60483396 60483705 + 2 NA intron (NM_174978, intron 4 of 17) intron (NM_174978, intron 4 of 17) 2513 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 388-10 chr19 12727478 12727793 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3703 NM_001136195 30000 Hs.416049 NM_013433 ENSG00000105576 TNPO2 IPO3|KPNB2B|TRN2 transportin 2 protein-coding 323.333-17 chr2 188163062 188163230 + 2 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) L1MA9|LINE|L1 124545 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 398-9 chr3 32381366 32381616 + 2 NA Intergenic Intergenic -10362 NM_181472 112616 Hs.440494 NM_138410 ENSG00000153551 CMTM7 CKLFSF7 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 7 protein-coding 321.333-61 chr9 30044376 30044653 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 363940 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 310-37 chr3 150559965 150560185 + 2 NA intron (NM_001319045, intron 3 of 13) intron (NM_001319045, intron 3 of 13) 13288 NM_032025 83939 Hs.655782 NM_032025 ENSG00000144895 EIF2A CDA02|EIF-2A|MST089|MSTP004|MSTP089 eukaryotic translation initiation factor 2A protein-coding 490.334-2 chr12 10471153 10471592 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -16687 NM_001304448 3821 Hs.512576 NM_002259 ENSG00000134545 KLRC1 CD159A|NKG2|NKG2A killer cell lectin like receptor C1 protein-coding 330-35 chr8 52412462 52412797 + 2 NA Intergenic Intergenic -2750 NM_001352863 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 299.667-38 chr8 128443135 128443321 + 2 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MER5B|DNA|hAT-Charlie 121451 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 351.333-2 chr1 178386626 178386958 + 2 NA intron (NM_004841, intron 1 of 15) intron (NM_004841, intron 1 of 15) 45341 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 501.332 chr6 36249618 36249965 + 2 NA intron (NM_173676, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 6623 NM_001145716 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 525.334 chr10 79608523 79608965 + 2 NA Intergenic Intergenic -2195 NM_001164647 653509 Hs.535295 NM_005411 ENSG00000122852 SFTPA1 COLEC4|PSAP|PSP-A|PSPA|SFTP1|SFTPA1B|SP-A|SP-A1|SPA|SPA1 surfactant protein A1 protein-coding 447.333-6 chr2 64477265 64477735 + 2 NA Intergenic Intergenic -8853 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 399.333-14 chr7 11670263 11670737 + 2 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 161698 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 410-7 chr12 71488668 71489070 + 2 NA intron (NR_110596, intron 1 of 19) MER57A-int|LTR|ERV1 49071 NM_001277226 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 374.333-21 chr9 104738529 104738865 + 2 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -8986 NM_015469 25934 Hs.530275 NM_015469 ENSG00000136783 NIPSNAP3A HSPC299|NIPSNAP4|TASSC nipsnap homolog 3A protein-coding 369.333-8 chr16 26005360 26005638 + 2 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) intron (NM_006040, intron 1 of 1) -19738 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 370.667-30 chr8 125303725 125304001 + 2 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger -126495 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 534 chr1 182022561 182022928 + 2 NA Intergenic Intergenic 38968 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 330.666-6 chr12 76713319 76713640 + 2 NA Intergenic MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? -50595 NM_015336 23390 Hs.4014 NM_015336 ENSG00000186908 ZDHHC17 DHHC-17|HIP14|HIP3|HSPC294|HYPH zinc finger DHHC-type containing 17 protein-coding 216-70 chr21 29169372 29169536 + 2 NA intron (NM_001286620, intron 4 of 4) intron (NM_001286620, intron 4 of 4) 23877 NM_001286624 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 387-18 chr8 117978187 117978547 + 2 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -57454 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 274-2 chr1 115824418 115824648 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 16170 NM_001111061 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 417.667-10 chr9 30486835 30487389 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -78658 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 513.999 chr5 41984946 41985387 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 59885 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 335-15 chr19 48260520 48260889 + 2 NA Intergenic Intergenic -4758 NR_147707 22900 Hs.68846 NM_014959 ENSG00000105483 CARD8 CARDINAL|DACAR|DAKAR|NDPP|NDPP1|TUCAN caspase recruitment domain family member 8 protein-coding 370.667-10 chr13 47290240 47290552 + 2 NA Intergenic Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -393320 NM_001165947 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 234.666-10 chr11 40553365 40553538 + 2 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -260321 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 613.667 chr5 83110737 83111287 + 2 NA intron (NM_001318012, intron 2 of 7) intron (NM_001318012, intron 2 of 7) 33465 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 219-83 chr8 130932551 130932720 + 2 NA intron (NM_001115, intron 5 of 17) L1MA8|LINE|L1 108274 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 476 chr1 235492680 235492991 + 2 NA intron (NM_152490, intron 2 of 11) L2a|LINE|L2 11617 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 395-2 chr14 64390834 64391168 + 2 NA intron (NM_005956, intron 1 of 27) MIR3|SINE|MIR 2648 NM_001364837 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 357.333-13 chr3 35384774 35385086 + 2 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) intron (NR_110817, intron 1 of 3) 9093 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 508-5 chr3 94712184 94712458 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -225942 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 646.666 chr1 178481310 178481926 + 2 NA 3' UTR (NM_170692, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_170692, exon 18 of 18) -31491 NM_032126 84066 Hs.534501 NM_032126 ENSG00000240021 TEX35 C1orf49|TSC24 testis expressed 35 protein-coding 304-33 chr2 175217498 175217715 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -35896 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 435 chr1 113240878 113241198 + 2 NA Intergenic Intergenic -34785 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 293.667-2 chr1 81928631 81928871 + 2 NA intron (NM_001366002, intron 4 of 20) intron (NM_001366002, intron 4 of 20) 126298 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 316-29 chr2 192002072 192002374 + 2 NA intron (NM_001305134, intron 5 of 9) intron (NM_001305134, intron 5 of 9) -155135 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 459.666-2 chr2 44263023 44263432 + 2 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -12253 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 281-38 chr6 65545047 65545210 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) 34676 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 269.334-12 chr5 116096417 116096568 + 2 NA intron (NM_001308080, intron 4 of 6) L1MD|LINE|L1 11030 NM_001308080 51397 Hs.483136 NM_016144 ENSG00000145781 COMMD10 PTD002 COMM domain containing 10 protein-coding 314-19 chr2 71673575 71673773 + 2 NA intron (NM_001130985, intron 50 of 54) MIR|SINE|MIR 206975 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 333.334 chr12 126927236 126927577 + 2 NA intron (NR_104646, intron 4 of 6) intron (NR_104646, intron 4 of 6) -52716 NR_033970 440117 Hs.127100 NR_033970 ENSG00000249873 LINC02372 - long intergenic non-protein coding RNA 2372 ncRNA 362-2 chr1 98278195 98278602 + 2 NA Intergenic Intergenic 67687 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 205-41 chr17 42270571 42270738 + 2 NA intron (NM_012448, intron 1 of 18) intron (NM_012448, intron 1 of 18) 5752 NM_012448 6777 Hs.595276 NM_012448 ENSG00000173757 STAT5B STAT5 signal transducer and activator of transcription 5B protein-coding 260-63 chr5 88853403 88853603 + 2 NA intron (NM_001131005, intron 2 of 10) intron (NM_001131005, intron 2 of 10) -26315 NM_001364341 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 324-5 chr12 1565775 1566091 + 2 NA TTS (NM_152441) TTS (NM_152441) 28648 NM_152441 144699 Hs.367956 NM_152441 ENSG00000171823 FBXL14 Fbl14 F-box and leucine rich repeat protein 14 protein-coding 292.666-8 chr13 37444561 37444831 + 2 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 40088 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 294-12 chr10 110252233 110252568 + 2 NA intron (NM_005962, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 26404 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 345-20 chr9 14096068 14096483 + 2 NA intron (NR_161384, intron 7 of 7) intron (NR_161384, intron 7 of 7) 84527 NM_001282787 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 306.333 chr1 20049208 20049490 + 2 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -20845 NM_000929 5322 Hs.319438 NM_000929 ENSG00000127472 PLA2G5 FRFB|GV-PLA2|PLA2-10|hVPLA(2) phospholipase A2 group V protein-coding 193.333-188 chr8 77344920 77345093 + 2 NA Intergenic Intergenic -105691 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 324.667-22 chr3 10743399 10743638 + 2 NA Intergenic Intergenic 20691 NR_152730 285370 Hs.157613 NR_027102 ENSG00000226567 LINC00606 - long intergenic non-protein coding RNA 606 ncRNA 294-47 chr4 83843192 83843396 + 2 NA Intergenic Intergenic 307186 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 417.334-2 chr8 84862828 84863167 + 2 NA intron (NM_001287244, intron 5 of 7) intron (NM_001287244, intron 5 of 7) 157070 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 212.667-21 chr11 80047262 80047501 + 2 NA Intergenic Intergenic -606351 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 334-9 chr14 99823173 99823435 + 2 NA intron (NM_004434, intron 1 of 21) intron (NM_004434, intron 1 of 21) 29891 NM_004434 2009 Hs.12451 NM_004434 ENSG00000066629 EML1 BH|ELP79|EMAP|EMAPL|HuEMAP EMAP like 1 protein-coding 298-60 chr4 30291748 30292103 + 2 NA Intergenic Intergenic -428444 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 201-98 chr6 75468417 75468625 + 2 NA intron (NR_110608, intron 1 of 1) L1MEi|LINE|L1 25279 NM_015687 27145 Hs.201488 NM_015687 ENSG00000118407 FILIP1 FILIP filamin A interacting protein 1 protein-coding 271-51 chr8 125749935 125750165 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 201147 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 300.666-12 chr5 8670956 8671140 + 2 NA Intergenic Intergenic -168684 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 314.333-7 chr11 104737175 104737550 + 2 NA Intergenic Intergenic -128060 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 326.666-4 chr16 69764711 69764974 + 2 NA intron (NM_001270455, intron 1 of 8) MER33|DNA|hAT-Charlie 2510 NM_007014 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 311.333-38 chr4 39615094 39615332 + 2 NA intron (NM_001317896, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 11908 NM_001317897 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 356-34 chr8 122503992 122504306 + 2 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR 64495 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 388.667-4 chr13 76608601 76608855 + 2 NA Intergenic Intergenic 277677 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 506.333-3 chr5 77442403 77442835 + 2 NA intron (NM_018268, intron 8 of 12) AluY|SINE|Alu 49697 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 415.667-5 chr5 5456839 5457263 + 2 NA intron (NM_015325, intron 11 of 18) intron (NM_015325, intron 11 of 18) 34374 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 448-3 chr12 38570157 38570526 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 253567 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 337-20 chr4 71646314 71646614 + 2 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 137615 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 372.666-9 chr3 30583944 30584467 + 2 NA Intergenic Intergenic -22297 NM_001024847 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 407.666-2 chr1 238071866 238072265 + 2 NA Intergenic Intergenic -181143 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 299-40 chr8 82886787 82886937 + 2 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -25242 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 294.667-32 chr3 49861552 49861815 + 2 NA intron (NM_024046, intron 4 of 10) intron (NM_024046, intron 4 of 10) -5119 NM_005879 10293 Hs.517972 NM_005879 ENSG00000183763 TRAIP RNF206|SCKL9|TRIP TRAF interacting protein protein-coding 316.666-10 chr19 39564581 39564851 + 2 NA Intergenic Intergenic -24555 NM_153232 163126 Hs.18949 NM_153232 ENSG00000176396 EID2 CRI2|EID-2 EP300 interacting inhibitor of differentiation 2 protein-coding 361.333-26 chr5 172321660 172321950 + 2 NA Intergenic Intergenic 36208 NR_130933 100288254 Hs.531911 NM_001007542 LOC100288254 - uncharacterized LOC100288254 ncRNA 393-14 chr5 103717561 103718031 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -155007 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 194-43 chr15 60113902 60114014 + 2 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 109647 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 270.666-19 chr3 193534181 193534356 + 2 NA intron (NM_032279, intron 1 of 29) L1MD1|LINE|L1 -18945 NR_121666 101929198 Hs.450092 NR_046726 ATP13A4-AS1 - ATP13A4 antisense RNA 1 ncRNA 271.667-82 chr9 103383739 103383975 + 2 NA Intergenic Intergenic -58824 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 325.333-15 chr17 72163064 72163355 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 42189 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 215-5 chr1 186379664 186379859 + 2 NA intron (NM_001164246, intron 1 of 12) intron (NM_001164246, intron 1 of 12) 3923 NM_017847 54953 Hs.371210 NM_017847 ENSG00000157181 ODR4 C1orf27|TTG1|odr-4 odr-4 GPCR localization factor homolog protein-coding 306.667-47 chr9 118973018 118973178 + 2 NA Intergenic Intergenic 293427 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 310-48 chr6 56456894 56457155 + 2 NA TTS (NM_015548) TTS (NM_015548) -62896 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 489-2 chr17 60443382 60443914 + 2 NA 3' UTR (NM_001282476, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001282476, exon 12 of 12) 21159 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 319-7 chr15 60903864 60904132 + 2 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 222429 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 378.666-7 chr8 124359005 124359353 + 2 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) MER57A-int|LTR|ERV1 13520 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 267.333-76 chr6 23796343 23796567 + 2 NA Intergenic Intergenic -329760 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 331-42 chr8 67794112 67794294 + 2 NA Intergenic Intergenic -47843 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 554 chr15 89155559 89156076 + 2 NA intron (NM_007011, intron 9 of 14) MIR|SINE|MIR 65762 NM_000326 6017 Hs.1933 NM_000326 ENSG00000140522 RLBP1 CRALBP retinaldehyde binding protein 1 protein-coding 247-27 chr15 97885076 97885227 + 2 NA Intergenic Intergenic -10722 NR_024173 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 335.667-15 chr2 59115492 59115813 + 2 NA Intergenic Intergenic -102056 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 718.333 chr7 43613557 43614245 + 2 NA intron (NR_135582, intron 6 of 6) intron (NR_135582, intron 6 of 6) 30793 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 242.334-3 chr11 112501922 112502121 + 2 NA intron (NR_120559, intron 2 of 2) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 17676 NR_120560 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 280.666-20 chr4 161813915 161814180 + 2 NA intron (NM_001128428, intron 4 of 14) intron (NM_001128428, intron 4 of 14) -208686 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 321.667-22 chr7 15429033 15429360 + 2 NA intron (NM_001004320, intron 4 of 12) intron (NM_001004320, intron 4 of 12) 132819 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 471.333-2 chr10 30609684 30610259 + 2 NA Intergenic Intergenic 19782 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 252-41 chr18 66997963 66998134 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -83536 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 347.667-15 chr4 120152091 120152516 + 2 NA Intergenic Intergenic -85455 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 266-31 chr17 68482726 68482988 + 2 NA intron (NM_001278433, intron 1 of 10) intron (NM_001278433, intron 1 of 10) -25333 NM_001320772 55062 Hs.463964 NM_017983 ENSG00000070540 WIPI1 ATG18|ATG18A|WIPI49 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 protein-coding 470.666-5 chr8 138519880 138520313 + 2 NA Intergenic Intergenic -22366 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 303-50 chr9 111218886 111219089 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 52227 NR_106989 102465800 NR_106989 ENSG00000274263 MIR7702 hsa-mir-7702 microRNA 7702 ncRNA 427.333-9 chr6 72995876 72996418 + 2 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) -28394 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 314.667-38 chr8 144343914 144344119 + 2 NA Intergenic Intergenic -7534 NM_031309 83482 Hs.31746 NM_031309 ENSG00000261678 SCRT1 SCRT|ZNF898 scratch family transcriptional repressor 1 protein-coding 493.999 chr10 70633589 70633951 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -30982 NM_005041 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 221-60 chr6 128872001 128872163 + 2 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -11056 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 217-82 chr6 102954202 102954409 + 2 NA Intergenic Intergenic 1555320 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 326.666-3 chr11 79529525 79529792 + 2 NA Intergenic Intergenic -88628 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 212-71 chr17 58857698 58857867 + 2 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 101913 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 350.667-4 chr12 13461134 13461435 + 2 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -84539 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 302-55 chr5 41226973 41227234 + 2 NA intron (NM_001115131, intron 1 of 17) L1MA8|LINE|L1 -13571 NM_000065 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 310.667-15 chr18 8153245 8153436 + 2 NA intron (NM_002845, intron 14 of 30) intron (NM_002845, intron 14 of 30) 213694 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 405.333-4 chr14 52378857 52379104 + 2 NA Intergenic Intergenic 64668 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 435.333-2 chr2 160688835 160689107 + 2 NA Intergenic Intergenic -195164 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 352.667-29 chr8 91806026 91806402 + 2 NA Intergenic Intergenic 211466 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 293.334-9 chr9 71040327 71040481 + 2 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 81217 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 648 chr18 27776647 27777014 + 2 NA Intergenic Intergenic 259811 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 470.667-3 chr15 71501222 71501769 + 2 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -45741 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 328-14 chr14 70340821 70341107 + 2 NA intron (NM_001202549, intron 3 of 4) intron (NM_001202549, intron 3 of 4) 18719 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 354-15 chr21 29465798 29466135 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -30081 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 300.001-3 chr2 75849034 75849273 + 2 NA Intergenic Intergenic -138238 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 341-8 chr14 53295469 53295706 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 142233 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 266.667-75 chr9 34741947 34742174 + 2 NA Intergenic Intergenic -12572 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 357.334-5 chr2 122431548 122431916 + 2 NA Intergenic Intergenic 641749 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 336-15 chr2 234083517 234083782 + 2 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 32947 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 505.333-4 chr14 46898850 46899193 + 2 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) intron (NM_001113498, intron 10 of 16) -247240 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 297-20 chr13 66992040 66992326 + 2 NA intron (NR_046637, intron 1 of 2) intron (NR_046637, intron 1 of 2) 1297 NR_046637 100874087 Hs.606903 NR_046637 ENSG00000233840 PCDH9-AS4 - PCDH9 antisense RNA 4 ncRNA 261-34 chr2 22335130 22335334 + 2 NA Intergenic Intergenic -201247 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 206.666-133 chrX 89058097 89058325 + 2 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 310986 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 491-5 chr9 36070618 36071052 + 2 NA intron (NM_001316345, intron 8 of 22) intron (NM_001316345, intron 8 of 22) 33922 NM_001316345 8434 Hs.388918 NM_021111 ENSG00000122707 RECK ST15 reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs protein-coding 465.334-2 chr1 247723043 247723303 + 2 NA exon (NM_001355292, exon 5 of 5) exon (NM_001355292, exon 5 of 5) -10418 NM_001005286 343169 Hs.591529 NM_001005286 ENSG00000169214 OR6F1 OR1-34|OR1-38|OST731 olfactory receptor family 6 subfamily F member 1 protein-coding 286-59 chr7 152168292 152168485 + 2 NA intron (NM_170606, intron 41 of 58) intron (NM_170606, intron 41 of 58) 93351 NM_001371474 462-7 chr14 71818033 71818424 + 2 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -113943 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 363.667-8 chr20 49005630 49006035 + 2 NA intron (NM_006420, intron 26 of 38) intron (NM_006420, intron 26 of 38) 40224 NR_110625 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 457.334 chr10 24943252 24943851 + 2 NA intron (NM_020200, intron 1 of 8) AluSz6|SINE|Alu 9055 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 266.667-56 chr4 158048185 158048336 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -122492 NR_147408 285505 NR_147407 ENSG00000248429 FAM198B-AS1 - FAM198B antisense RNA 1 ncRNA 416.333-7 chr2 43589870 43590178 + 2 NA intron (NM_001083953, intron 4 of 37) intron (NM_001083953, intron 4 of 37) 5950 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 334-30 chr4 86641751 86642077 + 2 NA intron (NM_080685, intron 2 of 47) L1M3|LINE|L1 47599 NM_006264 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 232.667-56 chr4 48679193 48679357 + 2 NA intron (NM_015030, intron 3 of 63) intron (NM_015030, intron 3 of 63) 101024 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 298.667-24 chr6 132275765 132275935 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 125625 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 445-10 chr7 41650702 41651068 + 2 NA Intergenic Intergenic -43034 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 335.333-25 chr2 157418679 157418895 + 2 NA intron (NM_004288, intron 6 of 7) intron (NM_004288, intron 6 of 7) 25302 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 399.333-6 chr10 123082250 123082535 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -53578 NM_001105574 340784 Hs.531194 NM_001105574 ENSG00000188620 HMX3 NKX-5.1|NKX5.1|Nkx5-1 H6 family homeobox 3 protein-coding 300-58 chr6 99391225 99391442 + 2 NA intron (NM_017421, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 2862 NM_017421 51805 Hs.713623 NM_017421 ENSG00000132423 COQ3 DHHBMT|DHHBMTASE|UG0215E05|bA9819.1 coenzyme Q3, methyltransferase protein-coding 371-11 chr2 32405362 32405797 + 2 NA intron (NM_016252, intron 8 of 73) AluYi6|SINE|Alu 48551 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 395.333-10 chr15 69177827 69178139 + 2 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) L1ME1|LINE|L1 17348 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 287.333-27 chr2 38606731 38607007 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3833 NM_001142650 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 192-34 chr11 68748370 68748477 + 2 NA intron (NM_001039656, intron 2 of 5) intron (NM_001039656, intron 2 of 5) 3097 NM_001039656 9633 Hs.145932 NM_004923 ENSG00000132749 TESMIN CXCDC2|MTL5|MTLT testis expressed metallothionein like protein protein-coding 366-22 chr5 90288651 90288862 + 2 NA intron (NR_120601, intron 1 of 5) intron (NR_120601, intron 1 of 5) 1315 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 508-2 chr2 59984629 59984974 + 2 NA Intergenic Intergenic 398235 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 298.334 chr10 120970417 120970578 + 2 NA Intergenic Intergenic 119135 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 132-31 chr12 96904857 96904925 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -2366 NM_001135177 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 324.667-4 chr10 47051620 47051863 + 2 NA Intergenic Intergenic 140019 NM_001352524 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 389.333-15 chr5 177346807 177347056 + 2 NA intron (NM_006816, intron 2 of 7) L1M5|LINE|L1 4737 NM_006816 10960 Hs.75864 NM_006816 ENSG00000169223 LMAN2 C5orf8|GP36B|VIP36 lectin, mannose binding 2 protein-coding 391-7 chr15 89305770 89306115 + 2 NA intron (NM_001113378, intron 31 of 37) intron (NM_001113378, intron 31 of 37) 20868 NR_106824 102466983 NR_106824 ENSG00000275101 MIR6766 hsa-mir-6766 microRNA 6766 ncRNA 334.333-27 chr6 142320071 142320334 + 2 NA intron (NM_198569, intron 2 of 24) intron (NM_198569, intron 2 of 24) 18195 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 328-7 chr11 83200706 83200900 + 2 NA intron (NM_001300975, intron 2 of 10) intron (NM_001300975, intron 2 of 10) 7091 NR_125355 338699 Hs.503438 NM_182603 ENSG00000137494 ANKRD42 PPP1R79|SARP ankyrin repeat domain 42 protein-coding 239-52 chr4 108988294 108988416 + 2 NA intron (NM_198721, intron 5 of 36) intron (NM_198721, intron 5 of 36) -225302 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 205.333-172 chr4 73924215 73924459 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 54944 NR_046035 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 221-21 chr14 99913042 99913154 + 2 NA intron (NM_004434, intron 13 of 21) intron (NM_004434, intron 13 of 21) -58324 NM_001330221 51466 Hs.125867 NM_016337 ENSG00000196405 EVL RNB6 Enah/Vasp-like protein-coding 468.334-4 chr8 66805689 66806217 + 2 NA intron (NM_001204173, intron 6 of 18) L2|LINE|L2 30748 NM_170709 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 308-15 chr13 76456306 76456521 + 2 NA Intergenic Intergenic 429992 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 353.667-9 chr2 174125855 174126183 + 2 NA intron (NM_001011708, intron 4 of 9) intron (NM_001011708, intron 4 of 9) 100739 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 295-20 chr16 85042411 85042566 + 2 NA intron (NM_001286566, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 14737 NM_001297766 9764 Hs.301658 NM_014732 ENSG00000135709 KIAA0513 - KIAA0513 protein-coding 288.667-6 chr12 18239661 18239840 + 2 NA Intergenic Intergenic -21790 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 356-37 chr9 100015834 100016116 + 2 NA intron (NM_015051, intron 8 of 11) MER1B|DNA|hAT-Charlie 83025 NM_015051 23071 Hs.154023 NM_015051 ENSG00000023318 ERP44 PDIA10|TXNDC4 endoplasmic reticulum protein 44 protein-coding 343.333-29 chr6 53979869 53980078 + 2 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -18917 NR_046832 100874282 Hs.571169 NR_046832 ENSG00000236996 MLIP-IT1 - MLIP intronic transcript 1 ncRNA 292.333-22 chr2 35172538 35172743 + 2 NA Intergenic Intergenic -298765 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 335.334-8 chrX 151094011 151094288 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -74073 NR_036256 100422930 NR_036256 ENSG00000265789 MIR4330 - microRNA 4330 ncRNA 248.666-15 chr14 47016734 47016882 + 2 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) intron (NM_001113498, intron 8 of 16) 326438 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 725.333 chr18 50846963 50847371 + 2 NA Intergenic Intergenic -21787 NM_001369508 83876 Hs.30495 NM_031939 ENSG00000134042 MRO B29|C18orf3 maestro protein-coding 393.333-19 chr7 24677588 24677944 + 2 NA intron (NM_016447, intron 10 of 12) intron (NM_016447, intron 10 of 12) 79698 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 361.333-21 chr3 168885597 168885895 + 2 NA Intergenic Intergenic -16199 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 406.333-10 chr2 215054939 215055492 + 2 NA intron (NR_103740, intron 3 of 54) intron (NR_103740, intron 3 of 54) -23129 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 478.666-2 chr20 5839243 5839711 + 2 NA intron (NM_001303478, intron 3 of 3) intron (NM_001303478, intron 3 of 3) -72033 NM_001819 1114 Hs.516874 NM_001819 ENSG00000089199 CHGB SCG1 chromogranin B protein-coding 471.333-4 chr18 42637150 42637470 + 2 NA intron (NR_046174, intron 7 of 9) intron (NR_046174, intron 7 of 9) 450642 NR_046174 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 245.333-67 chr2 163476296 163476473 + 2 NA Intergenic Intergenic 259624 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 280.667-43 chr5 146174448 146174611 + 2 NA intron (NM_001317965, intron 1 of 30) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8121 NM_020117 51520 Hs.432674 NM_016460 ENSG00000133706 LARS HSPC192|ILFS1|LARS1|LEURS|LEUS|LFIS|LRS|PIG44|RNTLS|hr025Cl leucyl-tRNA synthetase protein-coding 332.667-17 chr2 224376620 224376874 + 2 NA Intergenic Intergenic 25247 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 218-85 chr4 125988006 125988225 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 480856 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 508.667 chrX 57750492 57750766 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -70369 NM_001319967 286430 Hs.306842 NM_001319967 ENSG00000215174 NLRP2B CLRX.1|NALP2P|NLRP2P|NOD24|POP4 NLR family pyrin domain containing 2B protein-coding 213.667-84 chr6 126116668 126116826 + 2 NA Intergenic Intergenic 130207 NR_146803 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 245-38 chr2 135983327 135983484 + 2 NA exon (NM_001349, exon 2 of 16) exon (NM_001349, exon 2 of 16) -1771 NR_110199 101928243 Hs.602178 NR_110199 ENSG00000231890 DARS-AS1 - DARS antisense RNA 1 ncRNA 367 chr1 39282139 39282471 + 2 NA exon (NM_012090, exon 6 of 93) exon (NM_012090, exon 6 of 93) -126768 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 304-36 chr2 231974680 231974888 + 2 NA intron (NR_046477, intron 1 of 18) intron (NR_046477, intron 1 of 18) 13071 NR_046477 129563 Hs.732236 NM_152383 ENSG00000144535 DIS3L2 FAM6A|PRLMNS|hDIS3L2 DIS3 like 3'-5' exoribonuclease 2 protein-coding 289-4 chr12 23847170 23847321 + 2 NA intron (NM_001330785, intron 2 of 14) intron (NM_001330785, intron 2 of 14) 102425 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 294.666-31 chr7 26862492 26862748 + 2 NA intron (NM_003930, intron 1 of 12) intron (NM_003930, intron 1 of 12) 1970 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 328-24 chr3 34134485 34134670 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 335947 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 310-3 chr1 172664636 172664875 + 2 NA intron (NM_001302746, intron 2 of 2) intron (NM_001302746, intron 2 of 2) 5652 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 406.666-7 chr6 23355765 23356132 + 2 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -638024 NR_134614 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 334-5 chr11 47080905 47081129 + 2 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) AluJb|SINE|Alu 95862 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 482.666-2 chr21 27567782 27568312 + 2 NA Intergenic Intergenic -154332 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 332-33 chr8 43793152 43793371 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 500819 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 318.333-16 chr17 35349382 35349570 + 2 NA TTS (NM_001104587) TTS (NM_001104587) 24145 NM_001104590 91607 Hs.745059 NM_152270 ENSG00000172716 SLFN11 SLFN8/9 schlafen family member 11 protein-coding 348-16 chr3 8851732 8852056 + 2 NA Intergenic Intergenic -82280 NM_001354653 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 292.666-17 chr19 45924275 45924561 + 2 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -9640 NM_001029861 339345 Hs.434218 NM_001029861 ENSG00000188425 NANOS2 NOS2|ZC2HC12B nanos C2HC-type zinc finger 2 protein-coding 355.333-28 chr5 82889871 82890271 + 2 NA Intergenic Intergenic -30235 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 357.334-8 chr4 75802227 75802504 + 2 NA intron (NM_003715, intron 17 of 23) intron (NM_003715, intron 17 of 23) 77843 NM_001290049 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 307.333-80 chr8 120969965 120970125 + 2 NA Intergenic Intergenic -157999 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 555.667 chr8 3916458 3916784 + 2 NA intron (NM_033225, intron 5 of 69) intron (NM_033225, intron 5 of 69) 1078293 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 248.667-62 chr2 157551363 157551563 + 2 NA intron (NM_001111032, intron 2 of 7) L1ME4c|LINE|L1 46097 NM_001111031 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 361.333-18 chr3 112807889 112808215 + 2 NA intron (NR_149026, intron 2 of 4) intron (NR_149026, intron 2 of 4) 5574 NR_149026 100129297 Hs.570655 NR_149026 CD200R1L-AS1 - CD200R1L antisense RNA 1 ncRNA 306-9 chr11 99245746 99245965 + 2 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) MER20|DNA|hAT-Charlie 224906 NM_001243270 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 301-26 chr21 32892298 32892473 + 2 NA Intergenic Intergenic -66503 NR_135522 102724502 Hs.130572 NR_135522 ENSG00000228961 LINC01690 - long intergenic non-protein coding RNA 1690 ncRNA 297.666-10 chr3 191293463 191293731 + 2 NA intron (NM_198152, intron 4 of 8) intron (NM_198152, intron 4 of 8) -35797 NM_174908 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 306-29 chr22 33182826 33183031 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 74399 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 277-46 chr5 59693282 59693460 + 2 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 10332 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 466-5 chr15 83782614 83782984 + 2 NA intron (NM_207517, intron 4 of 29) L1PA13|LINE|L1 128676 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 525.333-2 chr1 169291690 169292167 + 2 NA intron (NR_104229, intron 6 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 75869 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 312-36 chr4 58924004 58924210 + 2 NA Intergenic Intergenic -60175 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 539.667-3 chr9 87792919 87793421 + 2 NA Intergenic Intergenic 20255 NR_027917 392360 Hs.690450 NM_001023564 ENSG00000188029 CTSL3P CTSL3|HCTSL-s cathepsin L family member 3, pseudogene pseudo 347-23 chr6 145039365 145039622 + 2 NA Intergenic Intergenic 633838 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 325.333-52 chr8 136470790 136470974 + 2 NA Intergenic Intergenic -59916 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 288.667-35 chr8 76780596 76780861 + 2 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -97453 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 226.667-37 chr15 58062614 58062755 + 2 NA intron (NM_001206897, intron 1 of 13) intron (NM_001206897, intron 1 of 13) -2541 NR_147215 283665 Hs.638961 NR_147215 LOC283665 - uncharacterized LOC283665 ncRNA 306-17 chr15 58702754 58703022 + 2 NA intron (NM_001320570, intron 2 of 14) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -9281 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 260-60 chr5 22831127 22831278 + 2 NA intron (NM_001364105, intron 1 of 15) intron (NM_001364105, intron 1 of 15) 22142 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 297.333-17 chr13 40487994 40488144 + 2 NA Intergenic Intergenic -7063 NR_024506 646982 Hs.287664 NR_024505 ENSG00000215483 LINC00598 lncFOXO1 long intergenic non-protein coding RNA 598 ncRNA 619.334 chr1 246046363 246047329 + 2 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) L1M5|LINE|L1 370566 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 311.333-2 chr1 101566360 101566649 + 2 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 242667 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 468-2 chr1 99324060 99324336 + 2 NA Intergenic Intergenic 59906 NM_014839 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 490.333-2 chr11 97952278 97952667 + 2 NA Intergenic Intergenic -1068477 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 442.667-3 chr3 78902964 78903200 + 2 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 116377 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 279.333-42 chr2 71124394 71124620 + 2 NA exon (NM_032601, exon 2 of 3) exon (NM_032601, exon 2 of 3) 5722 NM_032601 84693 Hs.94949 NM_032601 ENSG00000124370 MCEE GLOD2 methylmalonyl-CoA epimerase protein-coding 283.333-77 chr8 130053009 130053168 + 2 NA 3' UTR (NM_001362926, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_001362926, exon 29 of 29) 31680 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 533.001 chr5 52560983 52561424 + 2 NA Intergenic Intergenic -226713 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 324.333-37 chr8 51431096 51431262 + 2 NA intron (NM_144651, intron 12 of 22) intron (NM_144651, intron 12 of 22) 378266 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 289.333-59 chr7 41911733 41911969 + 2 NA Intergenic Intergenic -208761 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 337.333-47 chr9 129845465 129845709 + 2 NA intron (NM_001008563, intron 1 of 25) FRAM|SINE|Alu 10129 NM_001110303 10868 Hs.5452 NM_006676 ENSG00000136878 USP20 LSFR3A|VDU2|hVDU2 ubiquitin specific peptidase 20 protein-coding 320-38 chr6 62769626 62769881 + 2 NA Intergenic Intergenic -483526 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 338-6 chr11 81977747 81978017 + 2 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) L1MC3|LINE|L1 -87046 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 229.667-36 chr15 66578696 66578874 + 2 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -3405 NR_110372 102723165 Hs.636703 NR_110372 ENSG00000259471 LINC01169 - long intergenic non-protein coding RNA 1169 ncRNA 398-3 chr13 82241582 82241879 + 2 NA Intergenic Intergenic -1014747 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 326-53 chr9 134460445 134460699 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 54012 NM_001291921 6256 Hs.590886 NM_002957 ENSG00000186350 RXRA NR2B1 retinoid X receptor alpha protein-coding 341-26 chr8 77955810 77955986 + 2 NA Intergenic Intergenic 505201 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 280-46 chr5 62629599 62629802 + 2 NA Intergenic Intergenic 50881 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 269-25 chr2 139256318 139256552 + 2 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 359111 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 440.666-3 chr13 68352043 68352554 + 2 NA Intergenic Intergenic 533027 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 394-7 chr15 93300931 93301154 + 2 NA Intergenic Intergenic 94976 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 329.333-44 chr5 29281667 29281987 + 2 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 114149 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 402-11 chr5 131473986 131474222 + 2 NA intron (NM_016340, intron 16 of 27) intron (NM_016340, intron 16 of 27) 161125 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 451.667-2 chr15 43147119 43147658 + 2 NA intron (NM_024956, intron 5 of 13) intron (NM_024956, intron 5 of 13) 13802 NM_024956 80021 Hs.511175 NM_024956 ENSG00000137842 TMEM62 - transmembrane protein 62 protein-coding 294.667-47 chr6 104009095 104009280 + 2 NA Intergenic Intergenic 850359 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 331.667-18 chr7 54568956 54569248 + 2 NA 3' UTR (NM_182546, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_182546, exon 5 of 5) 12132 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 363.333-12 chr16 76265176 76265477 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -12075 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 330-24 chr3 42847942 42848198 + 2 NA intron (NM_001296, intron 2 of 2) intron (NM_001296, intron 2 of 2) 27809 NM_004391 1582 Hs.447793 NM_004391 ENSG00000180432 CYP8B1 CP8B|CYP12 cytochrome P450 family 8 subfamily B member 1 protein-coding 166.667-227 chr8 24054918 24055071 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -200188 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 190.667-130 chr7 9216879 9217065 + 2 NA Intergenic Intergenic -417298 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 442.666-3 chr5 19318887 19319196 + 2 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 567231 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 538.333 chr14 64033150 64033720 + 2 NA intron (NM_015180, intron 45 of 114) AluJb|SINE|Alu 61690 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 308 chr1 113808161 113808321 + 2 NA intron (NR_130896, intron 1 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 4235 NM_018364 54665 Hs.486285 NM_018364 ENSG00000081019 RSBN1 KDM9|ROSBIN round spermatid basic protein 1 protein-coding 430.667-4 chr14 71458023 71458390 + 2 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) L1M5|LINE|L1 19267 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 284.666-3 chr10 66668916 66669167 + 2 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -256995 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 368-4 chr10 57574127 57574574 + 2 NA Intergenic Intergenic -269791 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 226-22 chr14 45257914 45258080 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -4795 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 284-25 chr2 56955558 56955752 + 2 NA Intergenic Intergenic -769885 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 447.666 chr10 73424669 73425054 + 2 NA intron (NM_001024593, intron 6 of 6) intron (NM_001024593, intron 6 of 6) 8700 NM_001024593 118490 Hs.631823 NM_001024593 ENSG00000166343 MSS51 ZMYND17 MSS51 mitochondrial translational activator protein-coding 328-36 chr6 65363803 65363999 + 2 NA intron (NM_198283, intron 7 of 9) intron (NM_198283, intron 7 of 9) 62483 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 311-36 chr8 118225975 118226268 + 2 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR -114302 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 444 chr14 60223470 60223817 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -22107 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 300-33 chr2 155707104 155707368 + 2 NA Intergenic Intergenic 547695 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 304-5 chr1 165589971 165590144 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7902 NR_026744 400794 Hs.374847 NR_026744 ENSG00000237463 LRRC52-AS1 - LRRC52 antisense RNA 1 ncRNA 446-5 chr17 61424107 61424502 + 2 NA Intergenic Intergenic 12553 NR_160788 388407 Hs.434459 NM_203425 C17orf82 - chromosome 17 open reading frame 82 ncRNA 210.667-82 chr22 39838239 39838414 + 2 NA intron (NM_152512, intron 3 of 6) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 55434 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 258-50 chr4 31843477 31843643 + 2 NA Intergenic Intergenic -153819 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 378.334-3 chr8 131412960 131413374 + 2 NA Intergenic Intergenic -372258 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 287.667-6 chr10 74713789 74713959 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -111381 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 300-69 chr8 114496417 114496567 + 2 NA Intergenic Intergenic -1059553 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 288-10 chr1 244511267 244511670 + 2 NA intron (NM_001130957, intron 7 of 21) L1MA4|LINE|L1 50097 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 364-23 chr5 91680098 91680437 + 2 NA Intergenic Intergenic -296950 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 288.667-14 chr2 176896096 176896302 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 258445 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 313.333-35 chr6 36394083 36394275 + 2 NA intron (NM_152990, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR -6379 NM_001207041 51513 Hs.272398 NM_016135 ENSG00000010030 ETV7 TEL-2|TEL2|TELB ETS variant 7 protein-coding 238-53 chr2 166680341 166680595 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -193497 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 394-9 chr19 31471832 31472153 + 2 NA Intergenic Intergenic -116197 NM_001278578 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 383-2 chr13 50969128 50969610 + 2 NA intron (NM_001142279, intron 9 of 9) intron (NM_001142279, intron 9 of 9) -58657 NR_046552 100874255 Hs.741501 NR_046552 RNASEH2B-AS1 - RNASEH2B antisense RNA 1 ncRNA 319.333-19 chr2 223404585 223404892 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 197623 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 370.667-2 chr1 50983192 50983649 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 13175 NM_078626 1031 Hs.525324 NM_001262 ENSG00000123080 CDKN2C INK4C|p18|p18-INK4C cyclin dependent kinase inhibitor 2C protein-coding 259-22 chr17 82571018 82571166 + 2 NA intron (NM_004514, intron 3 of 8) intron (NM_004514, intron 3 of 8) 51360 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 474-2 chr2 35170933 35171297 + 2 NA Intergenic Intergenic -300290 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 303-42 chr6 47032499 47032739 + 2 NA intron (NM_153840, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 9713 NM_153840 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 263.667-27 chr15 38914904 38915084 + 2 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 218396 NR_160786 273.333-3 chr1 104699316 104699516 + 2 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 626393 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 315-13 chr2 41034855 41035110 + 2 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -522547 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 330.333-26 chr8 133530375 133530682 + 2 NA intron (NM_003033, intron 2 of 8) AluSq2|SINE|Alu 41359 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 464-5 chr3 190662744 190663311 + 2 NA Intergenic Intergenic 148942 NM_001364879 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 300-23 chr15 86181447 86181642 + 2 NA intron (NM_152336, intron 5 of 24) L1ME1|LINE|L1 -64827 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 346-36 chr7 17087736 17088080 + 2 NA Intergenic Intergenic -205925 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 437.999-5 chr6 11991858 11992140 + 2 NA non-coding (NR_125853, exon 2 of 3) non-coding (NR_125853, exon 2 of 3) 9245 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 436.667-2 chr11 86410321 86410675 + 2 NA intron (NM_001156474, intron 10 of 14) L2c|LINE|L2 35611 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 516-3 chr20 5233883 5234376 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 82603 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 286-6 chr11 115892073 115892344 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -132008 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 391.666-3 chr22 27355232 27355567 + 2 NA Intergenic Intergenic 44748 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 320-20 chr17 39873704 39873896 + 2 NA intron (NM_198844, intron 5 of 6) intron (NM_198844, intron 5 of 6) 5598 NM_199321 124626 Hs.367245 NM_198844 ENSG00000186075 ZPBP2 ZPBPL zona pellucida binding protein 2 protein-coding 296.334-2 chr11 86616015 86616252 + 2 NA intron (NM_001014811, intron 1 of 13) L1ME4c|LINE|L1 56065 NM_001014811 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 395.001 chr17 30357101 30357352 + 2 NA Intergenic Intergenic -21701 NM_001304 1362 Hs.446079 NM_001304 ENSG00000108582 CPD GP180 carboxypeptidase D protein-coding 357.334-10 chr6 144614608 144614930 + 2 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) intron (NM_007124, intron 50 of 73) 209114 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 322.667 chr1 85834186 85834374 + 2 NA intron (NM_152890, intron 43 of 59) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -125847 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 285.333-10 chr10 31830483 31830759 + 2 NA intron (NM_001270696, intron 8 of 17) intron (NM_001270696, intron 8 of 17) 78305 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 304-51 chr6 73172882 73173075 + 2 NA intron (NM_001160132, intron 11 of 13) intron (NM_001160132, intron 11 of 13) -29464 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 334.667-17 chr22 48470626 48470849 + 2 NA Intergenic Intergenic -18816 NM_001082967 25817 Hs.436854 NM_015381 ENSG00000219438 TAFA5 FAM19A5|QLLK5208|TAFA-5|UNQ5208 TAFA chemokine like family member 5 protein-coding 381.333-27 chrX 101294303 101294543 + 2 NA Intergenic Intergenic -1340 NM_024885 54457 Hs.223806 NM_024885 ENSG00000102387 TAF7L CT40|TAF2Q TATA-box binding protein associated factor 7 like protein-coding 586.666 chr7 21304274 21304626 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -123633 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 218.666-66 chr7 31584403 31584561 + 2 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) intron (NM_194300, intron 8 of 12) 31480 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 262-61 chr4 150170578 150170801 + 2 NA intron (NM_001040260, intron 2 of 15) MIR3|SINE|MIR 92244 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 202-152 chr5 131069519 131069714 + 2 NA Intergenic Intergenic 95640 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 532.666 chr2 107707908 107708317 + 2 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -46000 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 289.667-19 chr2 61091071 61091279 + 2 NA intron (NM_001129993, intron 10 of 21) intron (NM_001129993, intron 10 of 21) 24966 NM_032506 84542 Hs.468653 NM_032506 ENSG00000162929 KIAA1841 - KIAA1841 protein-coding 292.667-12 chr14 71842088 71842283 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -89986 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 304-12 chr10 60546755 60546957 + 2 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 26100 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 348.666-9 chr2 128914453 128914750 + 2 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 50001 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 347-13 chr17 71116346 71116664 + 2 NA intron (NR_104152, intron 3 of 3) intron (NR_104152, intron 3 of 3) 85674 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 244.334-5 chr10 103533866 103534125 + 2 NA intron (NM_004210, intron 1 of 5) L1MA5|LINE|L1 -16553 NR_120676 102724341 Hs.599425 NR_120675 ENSG00000235470 NEURL1-AS1 - NEURL1 antisense RNA 1 ncRNA 238-100 chr7 114269930 114270156 + 2 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) -144772 NM_014491 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 315.333-13 chr14 52669175 52669372 + 2 NA intron (NM_014584, intron 6 of 15) intron (NM_014584, intron 6 of 15) 26285 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 307.667-32 chr5 112959253 112959476 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -17434 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 307.667-8 chr11 24295068 24295222 + 2 NA Intergenic Intergenic -201908 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 266.334-17 chr3 197098353 197098494 + 2 NA intron (NM_001366216, intron 13 of 23) intron (NM_001366216, intron 13 of 23) -68606 NM_033316 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 278-20 chr2 158080330 158080569 + 2 NA intron (NM_001135098, intron 2 of 8) intron (NM_001135098, intron 2 of 8) -21421 NM_173355 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 295-3 chr10 53429436 53429625 + 2 NA Intergenic Intergenic -657830 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 452-13 chr8 138002946 138003209 + 2 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) L1ME1|LINE|L1 80468 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 359.667-5 chr14 74814853 74815235 + 2 NA intron (NM_019589, intron 11 of 20) L1M4|LINE|L1 48790 NM_001243007 283571 Hs.675293 NM_001080408 ENSG00000119608 PROX2 PROX-2 prospero homeobox 2 protein-coding 294-61 chr7 120812951 120813130 + 2 NA intron (NM_012338, intron 5 of 7) intron (NM_012338, intron 5 of 7) 45104 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 265-53 chr4 184829778 184830037 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3793 NM_001286711 2180 Hs.406678 NM_001995 ENSG00000151726 ACSL1 ACS1|FACL1|FACL2|LACS|LACS1|LACS2 acyl-CoA synthetase long chain family member 1 protein-coding 311.666-2 chr10 9192597 9192838 + 2 NA Intergenic Intergenic -82896 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 364-12 chr18 10307963 10308301 + 2 NA Intergenic Intergenic 106238 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 361.333-3 chr11 28343557 28343885 + 2 NA Intergenic Intergenic 133827 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 330-14 chr14 68368806 68369095 + 2 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 259837 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 393-11 chr4 123562443 123562885 + 2 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -87327 NR_027105 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 439 chr1 37456982 37457353 + 2 NA intron (NR_038842, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 17276 NR_038842 728431 Hs.380738 NR_038842 ENSG00000233621 LINC01137 - long intergenic non-protein coding RNA 1137 ncRNA 298-83 chr9 105943666 105943922 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 249253 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 314-49 chr8 104537805 104538010 + 2 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) L1ME2|LINE|L1 51117 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 444-7 chr7 97351712 97351979 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 235252 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 295-8 chr12 24811405 24811557 + 2 NA 3' UTR (NM_001178093, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001178093, exon 11 of 11) 90741 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 406.666-6 chr5 89651984 89652408 + 2 NA Intergenic MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR 364524 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 198.667-31 chr11 14829876 14829991 + 2 NA intron (NM_000922, intron 7 of 15) L1ME3A|LINE|L1 62272 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 345.667-15 chr4 140654502 140654836 + 2 NA intron (NM_015130, intron 13 of 20) intron (NM_015130, intron 13 of 20) -11589 NR_077215 644962 Hs.676500 NR_077215 TNRC18P1 - trinucleotide repeat containing 18 pseudogene 1 pseudo 188.667-61 chr18 4246283 4246389 + 2 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -18266 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 583.999 chr20 52082483 52083032 + 2 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 22727 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 225-2 chr1 48335739 48335908 + 2 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) L1PREC2|LINE|L1 113107 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 231.333-8 chr1 175295990 175296154 + 2 NA Intergenic AluSq10|SINE|Alu -103085 NM_001162893 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 305.333-75 chr9 102851056 102851265 + 2 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -144173 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 458.333-3 chr4 65075435 65075823 + 2 NA Intergenic Intergenic -71129 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 484-4 chr4 78174506 78174833 + 2 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) intron (NM_001166133, intron 2 of 41) -114316 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 268-45 chr5 44410988 44411261 + 2 NA intron (NR_108034, intron 2 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -21704 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 351.333 chr1 173694651 173694875 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -20218 NM_014458 27252 Hs.495035 NM_014458 ENSG00000076321 KLHL20 KHLHX|KLEIP|KLHLX kelch like family member 20 protein-coding 207-5 chr1 108753090 108753280 + 2 NA intron (NM_007269, intron 3 of 18) intron (NM_007269, intron 3 of 18) 6511 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 309.333-35 chr2 41007040 41007241 + 2 NA Intergenic Intergenic -494705 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 308.334-4 chr15 73879075 73879418 + 2 NA intron (NM_001286434, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 5682 NM_153356 161514 Hs.124512 NM_153356 ENSG00000167139 TBC1D21 MgcRabGAP TBC1 domain family member 21 protein-coding 414.666-10 chr3 81989085 81989517 + 2 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) MER61-int|LTR|ERV1 3159 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 329.667-4 chr12 43434368 43434534 + 2 NA intron (NM_025003, intron 18 of 38) intron (NM_025003, intron 18 of 38) 117752 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 235.333-87 chr4 105230899 105231092 + 2 NA intron (NM_001127208, intron 2 of 10) L1M4|LINE|L1 84310 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 419.333-8 chr3 89916251 89916632 + 2 NA Intergenic Intergenic 808820 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 288.667-19 chr3 114654910 114655090 + 2 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) L1ME2|LINE|L1 -30055 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 491-3 chr22 25073881 25074248 + 2 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) L1MA9|LINE|L1 38628 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 368.666-7 chr13 87373409 87373765 + 2 NA Intergenic Intergenic 245153 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 320.667-17 chr17 76994785 76995007 + 2 NA Intergenic Intergenic -25697 NR_136417 105371899 Hs.634683 NR_136416 ENSG00000267568 LOC105371899 - uncharacterized LOC105371899 ncRNA 337-21 chr4 102580943 102581119 + 2 NA intron (NM_003998, intron 9 of 23) intron (NM_003998, intron 9 of 23) -78545 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 438.667-6 chr3 177794280 177794833 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -22309 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 364-14 chr2 206464147 206464463 + 2 NA intron (NM_003812, intron 2 of 25) AluSx|SINE|Alu 20773 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 319-24 chr7 18624141 18624365 + 2 NA intron (NM_001321893, intron 7 of 11) intron (NM_001321893, intron 7 of 11) 114983 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 149-150 chr8 121096589 121096721 + 2 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -284609 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 291.667-37 chr8 61872945 61873389 + 2 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -16672 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 277-42 chr4 102679907 102680174 + 2 NA intron (NM_005908, intron 7 of 16) Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 80928 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 419-9 chr8 75805822 75806107 + 2 NA Intergenic Intergenic 265996 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 567.667-2 chr2 112325924 112326454 + 2 NA intron (NM_198581, intron 11 of 11) L1MA3|LINE|L1 50592 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 540.667-3 chr8 88505241 88505885 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -178080 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 264.666-22 chr20 54582596 54582817 + 2 NA intron (NM_018431, intron 2 of 7) L1PA7|LINE|L1 107113 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 266.667 chr1 10348481 10348640 + 2 NA intron (NM_001365951, intron 36 of 48) intron (NM_001365951, intron 36 of 48) 49594 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 283-12 chr15 72314030 72314176 + 2 NA intron (NM_052840, intron 2 of 12) intron (NM_052840, intron 2 of 12) 5843 NM_001172684 60677 Hs.348342 NM_052840 ENSG00000140488 CELF6 BRUNOL6 CUGBP Elav-like family member 6 protein-coding 335.667-23 chr6 129442998 129443269 + 2 NA intron (NM_000426, intron 44 of 64) intron (NM_000426, intron 44 of 64) 267044 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 338.666-19 chr9 90065456 90065787 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24122 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 437.333-3 chr10 62397701 62398097 + 2 NA intron (NM_199451, intron 3 of 7) L1PB2|LINE|L1 -22772 NR_104162 283045 NR_104162 LOC283045 - uncharacterized LOC283045 ncRNA 343-21 chr8 105914970 105915198 + 2 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) intron (NR_125796, intron 2 of 7) 145419 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 318.666-10 chr16 73061935 73062139 + 2 NA Intergenic Intergenic -3016 NM_001164766 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 294-32 chr2 56896358 56896515 + 2 NA Intergenic Intergenic -710666 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 349-23 chr9 106585546 106585886 + 2 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -15212 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 350.334-9 chr6 52163227 52163632 + 2 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -12406 NR_131248 101154644 Hs.582788 NR_131248 LINCMD1 LINC-MD1|MIR133BHG long intergenic non-protein coding RNA, muscle differentiation 1 ncRNA 207-24 chr12 49368835 49369007 + 2 NA intron (NM_001293286, intron 1 of 12) intron (NM_001293286, intron 1 of 12) 2016 NM_023071 65244 Hs.654826 NM_023071 ENSG00000123352 SPATS2 Nbla00526|P59SCR|SCR59|SPATA10 spermatogenesis associated serine rich 2 protein-coding 310-66 chrX 34914248 34914478 + 2 NA Intergenic Intergenic -28433 NM_152631 170062 Hs.197801 NM_152631 ENSG00000189132 FAM47B - family with sequence similarity 47 member B protein-coding 249.667-34 chr17 57821477 57821692 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 28460 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 397-3 chr15 69883268 69883514 + 2 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 48157 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 279.333-38 chr2 4677984 4678194 + 2 NA Intergenic Intergenic -21867 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 457.333-5 chr8 106045083 106045442 + 2 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) LTR48B|LTR|ERV1 15241 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 321-18 chr4 179419809 179420080 + 2 NA Intergenic Intergenic -1512008 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 480-5 chr4 43609755 43610012 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -117340 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 285.334-10 chr7 26861704 26861974 + 2 NA intron (NM_003930, intron 1 of 12) intron (NM_003930, intron 1 of 12) 2751 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 483.333 chr11 111276833 111277157 + 2 NA intron (NM_198498, intron 2 of 4) L1MEd|LINE|L1 -21551 NM_001271458 120376 Hs.31409 NM_001136105 ENSG00000214290 COLCA2 C11orf93|CASC13|LOH11CR1G colorectal cancer associated 2 protein-coding 284.667-26 chr2 108288957 108289110 + 2 NA 5' UTR (NM_176825, exon 1 of 9) 5' UTR (NM_176825, exon 1 of 9) 138 NM_001056 6819 Hs.436123 NM_001056 ENSG00000198203 SULT1C2 ST1C1|ST1C2|SULT1C1|humSULTC2 sulfotransferase family 1C member 2 protein-coding 324.333-34 chr6 98513079 98513488 + 2 NA Intergenic Intergenic 318417 NR_148381 105447646 Hs.211213 NR_148381 PNKY - long intergenic non-protein coding RNA PNKY ncRNA 248-17 chr12 63511733 63511873 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 156690 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 305.333-30 chr19 34714709 34714911 + 2 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -19433 NM_001029997 339318 Hs.720472 NM_001029997 ENSG00000197841 ZNF181 HHZ181 zinc finger protein 181 protein-coding 301.667-32 chr4 58130230 58130412 + 2 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 406007 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 320-32 chr3 69189403 69189715 + 2 NA intron (NM_015123, intron 18 of 22) L1MC4a|LINE|L1 -66964 NM_198271 56203 Hs.350621 NM_198271 ENSG00000163380 LMOD3 NEM10 leiomodin 3 protein-coding 496-6 chr6 64991734 64992199 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 14 of 43) intron (NM_001292009, intron 14 of 43) -309452 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 440.333-3 chr17 69126733 69127061 + 2 NA intron (NM_080284, intron 8 of 38) L1ME3B|LINE|L1 14998 NM_080284 23460 Hs.709514 NM_080284 ENSG00000154262 ABCA6 EST155051 ATP binding cassette subfamily A member 6 protein-coding 266.667-67 chr6 126698200 126698343 + 2 NA Intergenic Intergenic 213640 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 362.667-30 chr8 125165468 125165994 + 2 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) intron (NR_146191, intron 5 of 8) 73871 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 325.333-40 chr6 35639394 35639599 + 2 NA intron (NM_001145775, intron 3 of 11) intron (NM_001145775, intron 3 of 11) 25293 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 269.333-47 chr2 143732474 143732625 + 2 NA intron (NM_018460, intron 13 of 13) intron (NM_018460, intron 13 of 13) -204518 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 295-7 chr11 81058299 81058506 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -295599 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 340-25 chr6 64983102 64983418 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 14 of 43) intron (NM_001292009, intron 14 of 43) -318158 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 360.667-10 chr2 25621829 25622057 + 2 NA intron (NM_033147, intron 4 of 19) intron (NM_033147, intron 4 of 19) 28279 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 311.333-52 chr7 40601300 40601487 + 2 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 378546 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 318.666-20 chr6 130996523 130996827 + 2 NA intron (NM_001135554, intron 1 of 14) intron (NM_001135554, intron 1 of 14) 4092 NM_001252660 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 274.666-18 chr2 73466787 73467030 + 2 NA intron (NM_015120, intron 9 of 22) L1ME3|LINE|L1 9805 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 251-84 chr8 82471332 82471474 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -440701 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 277.333-27 chr14 26795433 26795587 + 2 NA intron (NR_147061, intron 6 of 6) intron (NR_147061, intron 6 of 6) -13838 NR_110557 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 582.667-3 chr2 70326142 70326971 + 2 NA Intergenic Intergenic -24489 NM_001329755 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 283-28 chr4 35815437 35815715 + 2 NA Intergenic Intergenic 428363 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 370.666-9 chr2 233501876 233502252 + 2 NA intron (NM_001365479, intron 21 of 31) L2|LINE|L2 63509 NM_018218 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 276.666-34 chrX 69809199 69809483 + 2 NA intron (NM_001005613, intron 2 of 2) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 193228 NM_001005612 1896 Hs.105407 NM_001399 ENSG00000158813 EDA ECTD1|ED1|ED1-A1|ED1-A2|EDA-A1|EDA-A2|EDA1|EDA2|HED|HED1|ODT1|STHAGX1|TNLG7C|XHED|XLHED ectodysplasin A protein-coding 155.333-56 chr11 95378653 95378858 + 2 NA Intergenic Intergenic -146280 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 303.666-13 chr5 8062720 8063017 + 2 NA Intergenic Intergenic 193720 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 342-37 chr7 52924157 52924401 + 2 NA Intergenic Intergenic -111354 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 393.666-2 chr4 34466944 34467393 + 2 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -197421 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 371-19 chr8 14301138 14301385 + 2 NA intron (NM_001322879, intron 2 of 6) intron (NM_001322879, intron 2 of 6) 552249 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 244-6 chr1 97974878 97975046 + 2 NA Intergenic Intergenic -33222 NR_146275 109729128 NR_146275 LINC01930 - long intergenic non-protein coding RNA 1930 ncRNA 392-7 chr16 53263089 53263492 + 2 NA intron (NM_001352157, intron 19 of 37) intron (NM_001352157, intron 19 of 37) 54839 NM_001352158 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 577.333-2 chr22 28110946 28111481 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -190601 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 206.333-95 chr2 195739535 195739692 + 2 NA intron (NM_018897, intron 64 of 64) intron (NM_018897, intron 64 of 64) 82387 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 305-20 chr5 73766399 73766573 + 2 NA intron (NM_001177693, intron 4 of 35) intron (NM_001177693, intron 4 of 35) -47060 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 344.667-4 chr16 6763529 6763808 + 2 NA intron (NM_018723, intron 3 of 15) intron (NM_018723, intron 3 of 15) -10141 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 333.333-55 chrX 66081018 66081323 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -41045 NM_001184830 11326 Hs.8904 NM_007268 ENSG00000155659 VSIG4 CRIg|Z39IG V-set and immunoglobulin domain containing 4 protein-coding 330-11 chr12 39889012 39889192 + 2 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) intron (NM_052885, intron 4 of 9) 216979 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 193-56 chr3 30989916 30990086 + 2 NA Intergenic Intergenic -95340 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 317.333-17 chr17 66692767 66692976 + 2 NA intron (NM_002737, intron 8 of 16) intron (NM_002737, intron 8 of 16) -94201 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 259.333-95 chr8 26903427 26903649 + 2 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -36260 NM_000680 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 504-7 chrX 52285989 52286350 + 2 NA Intergenic Intergenic 50473 NR_107055 102466880 NR_107055 ENSG00000275335 MIR8088 hsa-mir-8088 microRNA 8088 ncRNA 178.667-127 chr5 40890904 40891062 + 2 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -18514 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 318.667-21 chr3 22981503 22981732 + 2 NA Intergenic Intergenic 220961 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 299.333-80 chrX 97631745 97631979 + 2 NA Intergenic Intergenic -67327 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 285-22 chr3 194455970 194456176 + 2 NA intron (NM_001367549, intron 7 of 33) intron (NM_001367549, intron 7 of 33) 12166 NM_024524 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 578.666-2 chr7 86642409 86642858 + 2 NA Intergenic Intergenic -1276 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 400 chr1 226234466 226234799 + 2 NA intron (NM_001366239, intron 11 of 13) L1MC4a|LINE|L1 10968 NM_001282402 83881 Hs.282079 NM_031944 ENSG00000185155 MIXL1 MILD1|MIX|MIXL Mix paired-like homeobox protein-coding 329.667-5 chr12 67002759 67003050 + 2 NA Intergenic Intergenic 93380 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 298.333-22 chr2 82287178 82287390 + 2 NA Intergenic (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -569519 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 400.334 chr15 70127259 70127657 + 2 NA Intergenic Intergenic -29541 NM_001282980 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 271-21 chr2 25986504 25986724 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -4117 NM_002254 3797 Hs.21611 NM_002254 ENSG00000084731 KIF3C - kinesin family member 3C protein-coding 532 chr2 126193856 126194576 + 2 NA Intergenic Intergenic -76231 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 315.667-3 chr10 30111627 30111848 + 2 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) L1MB5|LINE|L1 3757 NM_001350021 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 331-21 chr2 202001350 202001577 + 2 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -33124 NM_003507 8324 Hs.173859 NM_003507 ENSG00000155760 FZD7 FzE3 frizzled class receptor 7 protein-coding 392.666-2 chr11 99025555 99025854 + 2 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 4755 NM_001243270 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 321.333-53 chr7 9147698 9147860 + 2 NA Intergenic Intergenic -486491 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 426 chr1 66714130 66714638 + 2 NA intron (NM_001350218, intron 16 of 22) intron (NM_001350218, intron 16 of 22) -38075 NM_152665 200132 Hs.479226 NM_152665 ENSG00000152760 TCTEX1D1 - Tctex1 domain containing 1 protein-coding 306-38 chr4 35234609 35234797 + 2 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -964956 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 360-9 chr14 63190788 63191261 + 2 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -13419 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 369.333-19 chr5 4589175 4589479 + 2 NA Intergenic Intergenic -184154 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 298-77 chr7 95626008 95626181 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -29578 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 325.333-21 chr20 53427042 53427239 + 2 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -125630 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 268.667-7 chr11 23319048 23319197 + 2 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 100068 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 300.667-25 chr22 28420961 28421202 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -38788 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 423.667-2 chr1 170435882 170436103 + 2 NA Intergenic Intergenic -96130 NM_001146039 92344 Hs.183702 NM_152281 ENSG00000120370 GORAB GO|NTKLBP1|SCYL1BP1 golgin, RAB6 interacting protein-coding 336.667-18 chr4 100889422 100889608 + 2 NA Intergenic Intergenic -214402 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 592.667 chr1 105080043 105080372 + 2 NA Intergenic Intergenic 538728 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 565.667 chr3 64580728 64581162 + 2 NA intron (NM_001318781, intron 27 of 38) MIRb|SINE|MIR 19599 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 341.333-23 chr5 71622498 71622850 + 2 NA intron (NM_001363147, intron 6 of 15) L1MB8|LINE|L1 35334 NM_001363147 64087 Hs.604789 NM_022132 ENSG00000131844 MCCC2 MCCB methylcrotonoyl-CoA carboxylase 2 protein-coding 266-24 chr15 83880776 83880932 + 2 NA intron (NM_207517, intron 9 of 29) intron (NM_207517, intron 9 of 29) -199333 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 340.667-18 chr7 97155499 97155692 + 2 NA intron (NM_020186, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 39002 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 454-9 chr5 36991194 36991588 + 2 NA intron (NM_015384, intron 10 of 45) intron (NM_015384, intron 10 of 45) 114622 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 724.667 chr18 67401056 67401591 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -115223 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 303-21 chr15 40623841 40624108 + 2 NA exon (NM_170589, exon 11 of 27) exon (NM_170589, exon 11 of 27) 29725 NM_170589 57082 Hs.181855 NM_144508 ENSG00000137812 KNL1 AF15Q14|CASC5|CT29|D40|MCPH4|PPP1R55|Spc7|hKNL-1|hSpc105 kinetochore scaffold 1 protein-coding 521.333-4 chrX 131956023 131956510 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -67036 NM_001042453 51765 Hs.444247 NM_016542 ENSG00000134602 STK26 MASK|MST4 serine/threonine kinase 26 protein-coding 246.667-33 chr16 61640143 61640314 + 2 NA Intergenic Intergenic 396210 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 350.334-3 chr12 19098900 19099149 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -30709 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 252-4 chr1 118502125 118502311 + 2 NA Intergenic Intergenic -316990 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 380-3 chr10 120521989 120522320 + 2 NA intron (NM_001030059, intron 5 of 6) intron (NM_001030059, intron 5 of 6) 65200 NM_001318169 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 579.333-3 chr4 55261510 55262179 + 2 NA Intergenic Intergenic -84398 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 562.001 chr12 45980735 45981131 + 2 NA intron (NM_004719, intron 1 of 14) intron (NM_004719, intron 1 of 14) 9641 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 284.666-10 chr16 72252755 72253002 + 2 NA Intergenic Intergenic -80428 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 342-22 chr2 165994664 165994882 + 2 NA intron (NR_148667, intron 27 of 28) intron (NR_148667, intron 27 of 28) 37355 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 304.666-12 chr15 68292828 68293103 + 2 NA 3' UTR (NM_015322, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_015322, exon 2 of 2) 15220 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 312-6 chr1 215874676 215874890 + 2 NA intron (NM_206933, intron 43 of 71) intron (NM_206933, intron 43 of 71) -197682 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 598.334 chr5 23639908 23640326 + 2 NA Intergenic Intergenic 132462 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 403.667-9 chr3 114867239 114867837 + 2 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) AluSz|SINE|Alu -5495 NR_126422 104413890 Hs.612732 NR_126422 ENSG00000239946 ZBTB20-AS3 - ZBTB20 antisense RNA 3 ncRNA 462-16 chr5 65266853 65267127 + 2 NA intron (NR_135689, intron 13 of 25) intron (NR_135689, intron 13 of 25) 214930 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 302-49 chr4 153098435 153098598 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -53818 NM_001351056 23321 Hs.435711 NM_015271 ENSG00000109654 TRIM2 CMT2R|RNF86 tripartite motif containing 2 protein-coding 466 chr1 44690745 44691043 + 2 NA intron (NM_001145636, intron 2 of 11) AluSg|SINE|Alu 16180 NM_001145636 339541 Hs.173679 NM_001004307 ENSG00000198520 ARMH1 C1orf228|NCRNA00082|p40 armadillo like helical domain containing 1 protein-coding 395.333-7 chr11 39444677 39444898 + 2 NA Intergenic Intergenic 795929 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 297-21 chr14 66370778 66371057 + 2 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -115454 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 251.667-79 chr5 58406378 58406587 + 2 NA Intergenic Intergenic 53604 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 492.333 chr1 239162098 239162534 + 2 NA Intergenic Intergenic -224252 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 328-21 chr20 52259432 52259678 + 2 NA Intergenic Intergenic -67570 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 308-17 chr14 72695364 72695663 + 2 NA intron (NM_001280544, intron 6 of 9) L1PA17|LINE|L1 178693 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 436-3 chr1 107361409 107362086 + 2 NA intron (NM_001113226, intron 2 of 6) UCON2|DNA?|DNA? 213678 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 606.333 chr8 81963968 81964556 + 2 NA Intergenic Intergenic -121976 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 346-12 chr18 2161320 2161534 + 2 NA Intergenic Intergenic 410078 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 487 chr14 63534461 63534949 + 2 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu -8079 NR_158218 112268140 Hs.632347 NR_158218 LOC112268140 - loricrin-like ncRNA 293-4 chr1 90805543 90805831 + 2 NA intron (NR_135038, intron 1 of 2) L1PA15|LINE|L1 30474 NR_147932 105378853 Hs.546492 NR_135038 ENSG00000233593 LINC02609 - long intergenic non-protein coding RNA 2609 ncRNA 294.333-26 chr2 234457066 234457248 + 2 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -2562 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 349.333-21 chr2 229129027 229129220 + 2 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 102969 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 336-23 chr4 38350586 38350858 + 2 NA Intergenic Intergenic -16192 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 276.667-25 chr14 51404482 51404667 + 2 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -7439 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 260-21 chr12 112529415 112529701 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -45678 NM_001347952 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 357.333-7 chr2 33066468 33066701 + 2 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) Cheshire|DNA|hAT-Charlie -68013 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 301-4 chr1 84556768 84556940 + 2 NA TTS (NM_001310156) TTS (NM_001310156) 17586 NM_004388 1486 Hs.513557 NM_004388 ENSG00000117151 CTBS CTB chitobiase protein-coding 376.667-14 chr7 8873513 8873852 + 2 NA Intergenic Intergenic 440073 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 225.333-111 chr5 96690785 96690970 + 2 NA intron (NM_001330629, intron 2 of 30) intron (NM_001330629, intron 2 of 30) -11783 NM_173060 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 359-17 chr5 139597243 139597517 + 2 NA intron (NM_181838, intron 2 of 7) L1ME1|LINE|L1 36041 NM_003339 7322 Hs.108332 NM_003339 ENSG00000131508 UBE2D2 E2(17)KB2|PUBC1|UBC4|UBC4/5|UBCH4|UBCH5B ubiquitin conjugating enzyme E2 D2 protein-coding 389-2 chr18 45761819 45762021 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 34967 NM_001146037 6563 Hs.101307 NM_015865 ENSG00000141469 SLC14A1 HUT11|HsT1341|JK|RACH1|RACH2|UT-B1|UT1|UTE solute carrier family 14 member 1 (Kidd blood group) protein-coding 267.667-13 chr14 75942717 75942903 + 2 NA intron (NM_015072, intron 31 of 31) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 39185 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 303-32 chr2 133535890 133536091 + 2 NA intron (NM_207481, intron 2 of 17) L1PB4|LINE|L1 32473 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 450.333-4 chr2 65807406 65807949 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -375078 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 420.666-9 chr8 75663987 75664367 + 2 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 124209 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 395-6 chr16 17574312 17574646 + 2 NA Intergenic Intergenic -103519 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 374-9 chr15 93626667 93626939 + 2 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -229757 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 310-14 chr11 84715397 84715673 + 2 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L1MA9|LINE|L1 5407 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 404-14 chr5 89172751 89173202 + 2 NA intron (NR_136219, intron 6 of 9) L2c|LINE|L2 -268871 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 276-27 chr15 65709943 65710090 + 2 NA intron (NM_005848, intron 14 of 31) intron (NM_005848, intron 14 of 31) 9316 NR_039736 100616379 NR_039736 ENSG00000264737 MIR4511 mir-4511 microRNA 4511 ncRNA 537.999 chr14 70342918 70343329 + 2 NA intron (NM_001202548, intron 3 of 5) intron (NM_001202548, intron 3 of 5) 16560 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 188-59 chr2 142146967 142147122 + 2 NA Intergenic Intergenic -15343 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 305.667-7 chr12 27506283 27506550 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17790 NM_001198915 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 378 chr1 170294989 170295441 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -11007 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 339-21 chr9 27549805 27550116 + 2 NA intron (NM_001256054, intron 9 of 10) intron (NM_001256054, intron 9 of 10) -20146 NM_024761 79817 Hs.369022 NM_024761 ENSG00000120162 MOB3B C9orf35|MOB1D|MOBKL2B MOB kinase activator 3B protein-coding 368.667-11 chr5 113865742 113866050 + 2 NA Intergenic Intergenic 352202 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 366-4 chr11 111506521 111506813 + 2 NA intron (NM_001367974, intron 1 of 4) intron (NM_001367974, intron 1 of 4) -3935 NR_147706 728196 Hs.363156 NR_147706 ENSG00000286028 LOC728196 - uncharacterized LOC728196 ncRNA 203.333-80 chr14 66176228 66176452 + 2 NA Intergenic Intergenic -310031 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 307-34 chr6 72460132 72460381 + 2 NA Intergenic Intergenic 93510 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 242.666-23 chr2 82773102 82773252 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -83626 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 420.333-3 chr11 124318524 124318983 + 2 NA TTS (NM_001002918) TTS (NM_001002918) 1444 NM_001002918 283160 Hs.504212 NM_001002918 ENSG00000279116 OR8D2 JCG2 olfactory receptor family 8 subfamily D member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 203.333-140 chr2 112126173 112126553 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -12022 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 337.333-37 chr5 115226510 115226804 + 2 NA intron (NM_005023, intron 6 of 8) L2c|LINE|L2 36220 NM_005023 5229 Hs.254006 NM_005023 ENSG00000164219 PGGT1B BGGI|GGTI protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta protein-coding 273.334-19 chr8 125760881 125761088 + 2 NA Intergenic Intergenic 190213 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 294-60 chr7 67832139 67832421 + 2 NA Intergenic Intergenic -187973 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 376.666-6 chr2 163329880 163330226 + 2 NA Intergenic Intergenic 405955 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 286-52 chr6 51680392 51680556 + 2 NA intron (NM_138694, intron 60 of 66) intron (NM_138694, intron 60 of 66) 58604 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 377.333-13 chr20 21192347 21192730 + 2 NA intron (NM_018474, intron 6 of 12) intron (NM_018474, intron 6 of 12) 25751 NR_109956 101929591 Hs.656066 NR_109956 ENSG00000232712 KIZ-AS1 - KIZ antisense RNA 1 ncRNA 506 chr20 1345987 1346365 + 2 NA intron (NR_040047, intron 1 of 2) L1MC2|LINE|L1 -17037 NM_080489 27111 Hs.657015 NM_015685 ENSG00000125775 SDCBP2 SITAC|SITAC18|ST-2|ST2 syndecan binding protein 2 protein-coding 470.667 chr10 108673841 108674336 + 2 NA Intergenic Intergenic -604795 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 479.333-9 chr7 46175261 46175700 + 2 NA Intergenic Intergenic -254208 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 356.333-11 chr14 25820453 25820723 + 2 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie 732842 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 284-38 chr3 176693180 176693410 + 2 NA Intergenic Intergenic -57763 NR_109968 100505547 Hs.253350 NR_109968 LINC01208 - long intergenic non-protein coding RNA 1208 ncRNA 392-23 chr8 106143262 106143519 + 2 NA Intergenic Intergenic -82887 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 324.333-13 chr13 29932534 29932722 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -3903 NR_033889 440131 Hs.132371 NM_001010918 LINC00544 - long intergenic non-protein coding RNA 544 ncRNA 461.666 chr18 22772913 22773383 + 2 NA intron (NR_110782, intron 1 of 1) L1MA1|LINE|L1 13689 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 629.334 chr12 113722717 113723218 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 50716 NR_110026 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 276-39 chr20 54653034 54653261 + 2 NA Intergenic Intergenic 177554 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 359.333-18 chr4 63371292 63371604 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 1038002 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 315.333-24 chr20 6250826 6251024 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -127381 NM_017671 55612 Hs.472054 NM_017671 ENSG00000101311 FERMT1 C20orf42|DTGCU2|KIND1|UNC112A|URP1 fermitin family member 1 protein-coding 371.333-2 chr1 158835015 158835361 + 2 NA intron (NM_002432, intron 1 of 6) L1MB2|LINE|L1 3837 NM_002432 4332 Hs.153837 NM_002432 ENSG00000163563 MNDA PYHIN3 myeloid cell nuclear differentiation antigen protein-coding 256-61 chr3 86506977 86507134 + 2 NA Intergenic Intergenic 25112 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 306-14 chr14 27420373 27420620 + 2 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -192092 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 264-7 chr1 162988986 162989148 + 2 NA Intergenic Intergenic -79539 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 372.334-9 chr8 131814698 131815032 + 2 NA Intergenic Intergenic -89228 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 305.667-27 chr4 83988741 83989040 + 2 NA intron (NR_125909, intron 8 of 8) L1ME4b|LINE|L1 310279 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 211-32 chr14 51267792 51268090 + 2 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 27694 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 403-9 chr8 63307677 63308065 + 2 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 138868 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 355.667-9 chr5 29709466 29709704 + 2 NA Intergenic Intergenic -170975 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 433.333-4 chr14 84373023 84373374 + 2 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -898734 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 346-27 chr5 81977919 81978198 + 2 NA intron (NM_001131028, intron 2 of 8) intron (NM_001131028, intron 2 of 8) 6035 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 368-12 chr2 126135122 126135464 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -17308 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 290.666-9 chr13 73932018 73932298 + 2 NA intron (NM_007249, intron 3 of 7) intron (NM_007249, intron 3 of 7) 201771 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 337.333-18 chr16 69369851 69370210 + 2 NA intron (NM_005652, intron 5 of 9) AluSx1|SINE|Alu 15977 NM_005652 7014 Hs.63335 NM_005652 ENSG00000132604 TERF2 TRBF2|TRF2 telomeric repeat binding factor 2 protein-coding 563.333-2 chr4 41579313 41579662 + 2 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) intron (NM_001330786, intron 1 of 22) -33222 NM_001330793 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 515.334-2 chr5 42093566 42093870 + 2 NA Intergenic Intergenic 81627 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 343.333-5 chr11 46800804 46801086 + 2 NA intron (NM_001008938, intron 9 of 43) (GTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -38446 NR_003056 692108 Hs.693252 NR_003056 ENSG00000212135 SNORD67 HBII-166 small nucleolar RNA, C/D box 67 snoRNA 330.333-27 chr8 142117477 142117832 + 2 NA Intergenic Intergenic -58685 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 349.333-28 chr7 49203447 49203649 + 2 NA Intergenic Intergenic 279001 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 150-103 chr4 65959405 65959517 + 2 NA Intergenic LTR87|LTR|ERVL? -288966 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 486-7 chr2 31402252 31402537 + 2 NA intron (NM_000379, intron 3 of 35) MER57F|LTR|ERV1 12348 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 422-7 chr4 76448249 76448512 + 2 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) intron (NM_020859, intron 1 of 10) 13151 NM_020859 57619 Hs.683808 NM_020859 ENSG00000138771 SHROOM3 APXL3|MSTP013|SHRM|ShrmL shroom family member 3 protein-coding 420.667-8 chr6 94882151 94882690 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 695031 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 304.666-24 chr6 129935297 129935539 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -74103 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 327.333-13 chr14 27182685 27182866 + 2 NA Intergenic Intergenic 274133 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 556.667 chr14 68828787 68829262 + 2 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -32781 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 409-11 chr5 27284233 27284570 + 2 NA Intergenic Intergenic -187891 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 275.667-22 chr16 8515829 8516027 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 73910 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 273-10 chr11 46888621 46888850 + 2 NA intron (NM_002334, intron 16 of 37) intron (NM_002334, intron 16 of 37) 29815 NM_002334 4038 Hs.4930 NM_002334 ENSG00000134569 LRP4 CLSS|CMS17|LRP-4|LRP10|MEGF7|SOST2 LDL receptor related protein 4 protein-coding 289-18 chr3 45824552 45824796 + 2 NA non-coding (NR_075080, exon 9 of 9) non-coding (NR_075080, exon 9 of 9) 17445 NM_020347 54585 Hs.30824 NM_020347 ENSG00000163818 LZTFL1 BBS17 leucine zipper transcription factor like 1 protein-coding 285-8 chr15 74497401 74497585 + 2 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 36228 NR_038449 440288 Hs.611046 NR_038448 ENSG00000247240 UBL7-AS1 - UBL7 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 481.333-4 chr6 44387027 44387559 + 2 NA promoter-TSS (NM_001253) promoter-TSS (NM_001253) -413 NM_001253 988 Hs.485471 NM_001253 ENSG00000096401 CDC5L CDC5|CDC5-LIKE|CEF1|PCDC5RP|dJ319D22.1 cell division cycle 5 like protein-coding 330-21 chr22 25820563 25820881 + 2 NA intron (NM_001318245, intron 12 of 43) L1MA5A|LINE|L1 78534 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 290.334-5 chr3 67595938 67596151 + 2 NA intron (NM_001177599, intron 2 of 10) MamRep605|LTR?|LTR? 58570 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 358-2 chr1 190636247 190636653 + 2 NA intron (NR_033922, intron 1 of 4) intron (NR_033922, intron 1 of 4) 11560 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 311.667-22 chr5 144365864 144366173 + 2 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 160627 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 300.666-15 chr5 127925835 127926022 + 2 NA intron (NM_001317938, intron 6 of 6) MER57A1|LTR|ERV1 157247 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 373.333-8 chr14 58843038 58843271 + 2 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) intron (NR_110547, intron 1 of 5) 14866 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 298-72 chr6 54303440 54303672 + 2 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -4885 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 276-36 chr2 151465118 151465324 + 2 NA exon (NM_001177663, exon 30 of 35) exon (NM_001177663, exon 30 of 35) 55319 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 317.667-21 chr18 65029089 65029317 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -721049 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 401.333-5 chr12 9105940 9106307 + 2 NA intron (NM_000014, intron 10 of 35) intron (NM_000014, intron 10 of 35) 10106 NM_001347425 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 356.333-6 chr10 67817087 67817444 + 2 NA intron (NM_021800, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 20914 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 429.667-3 chr17 63387454 63387783 + 2 NA intron (NM_025185, intron 14 of 25) intron (NM_025185, intron 14 of 25) 52649 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 317-5 chr10 70107783 70108087 + 2 NA intron (NM_018649, intron 7 of 8) intron (NM_018649, intron 7 of 8) 24890 NM_032797 84883 Hs.650680 NM_032797 ENSG00000042286 AIFM2 AMID|PRG3 apoptosis inducing factor mitochondria associated 2 protein-coding 304-61 chr8 134059277 134059441 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 172863 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 267.333-53 chr2 173711363 173711538 + 2 NA Intergenic Intergenic 252430 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 338.334 chr1 63224043 63224302 + 2 NA intron (NR_038252, intron 4 of 11) L1M4|LINE|L1 93085 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 340.667-15 chr4 55113639 55113859 + 2 NA intron (NM_002253, intron 6 of 29) intron (NM_002253, intron 6 of 29) 11846 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 334-28 chr3 81653724 81654075 + 2 NA intron (NM_000158, intron 3 of 15) intron (NM_000158, intron 3 of 15) 107746 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 420-9 chr2 147265256 147265569 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -579105 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 375.333-5 chr11 83532931 83533130 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 20 of 27) intron (NM_001142699, intron 20 of 27) 149395 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 310.667-26 chr21 31026451 31026653 + 2 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 11924 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 315.333-3 chr1 115252114 115252409 + 2 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -30773 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 180-19 chr11 93812142 93812314 + 2 NA 3' UTR (NM_004268, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_004268, exon 12 of 12) 27946 NM_004268 9440 Hs.444931 NM_004268 ENSG00000042429 MED17 CRSP6|CRSP77|DRIP80|SRB4|TRAP80 mediator complex subunit 17 protein-coding 303-13 chr13 51952308 51952594 + 2 NA intron (NM_001005918, intron 6 of 16) intron (NM_001005918, intron 6 of 16) 58999 NM_000053 540 Hs.492280 NM_000053 ENSG00000123191 ATP7B PWD|WC1|WD|WND ATPase copper transporting beta protein-coding 481.333-5 chr8 130578804 130579271 + 2 NA Intergenic (ATTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -135363 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 424-3 chr11 40016591 40017003 + 2 NA Intergenic Intergenic 276333 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 250.333-16 chr12 61287680 61287925 + 2 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 905037 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 488-8 chr8 134347836 134348191 + 2 NA Intergenic Intergenic -250058 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 300.667-10 chr14 62130603 62130856 + 2 NA non-coding (NR_015358, exon 4 of 4) non-coding (NR_015358, exon 4 of 4) 9244 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 305.333-36 chr2 101778697 101778907 + 2 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 81095 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 417-2 chr11 82373267 82373582 + 2 NA intron (NR_120571, intron 1 of 7) LTR86C|LTR|ERVL 30489 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 287-18 chr21 24688631 24688790 + 2 NA Intergenic Intergenic -151840 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 335.333-11 chr12 42199328 42199561 + 2 NA intron (NM_001320080, intron 2 of 4) intron (NM_001320080, intron 2 of 4) 38924 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 554-3 chr7 4005736 4006339 + 2 NA intron (NM_152744, intron 14 of 44) AluJb|SINE|Alu -123648 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 277.667-9 chr12 44382270 44382472 + 2 NA intron (NM_001286213, intron 6 of 6) intron (NM_001286213, intron 6 of 6) 493290 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 304-35 chr2 193935982 193936170 + 2 NA Intergenic Intergenic -408193 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 465.666-2 chr3 123862182 123862734 + 2 NA intron (NM_001321309, intron 2 of 32) MIRb|SINE|MIR 21874 NM_053025 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 384-20 chr8 87686636 87686941 + 2 NA Intergenic Intergenic 187227 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 180.667-150 chr8 129503668 129503790 + 2 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1MDa|LINE|L1 -19587 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 357.333-18 chr5 58166406 58166707 + 2 NA Intergenic Intergenic -44215 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 416.667-4 chr18 31556048 31556352 + 2 NA non-coding (NR_045216, exon 1 of 6) non-coding (NR_045216, exon 1 of 6) 711 NR_045216 100652770 Hs.562766 NR_045216 ENSG00000264859 DSG2-AS1 - DSG2 antisense RNA 1 ncRNA 361.333-20 chr3 149801986 149802291 + 2 NA Intergenic Intergenic -9584 NM_001315506 389161 Hs.665988 NM_001144960 ENSG00000206199 ANKUB1 C3orf16 ankyrin repeat and ubiquitin domain containing 1 protein-coding 354-3 chr1 206894299 206894610 + 2 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -2989 NM_006850 11009 Hs.58831 NM_006850 ENSG00000162892 IL24 C49A|FISP|IL10B|MDA7|MOB5|ST16 interleukin 24 protein-coding 280.666-8 chr15 89917723 89917926 + 2 NA Intergenic Intergenic -4872 NM_182616 348110 Hs.6734 NM_182616 ENSG00000242498 ARPIN C15orf38 actin related protein 2/3 complex inhibitor protein-coding 319.667-26 chr5 124353244 124353464 + 2 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR 85166 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 217.667-10 chr10 33405100 33405314 + 2 NA Intergenic Intergenic -70302 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 392-3 chr14 38791858 38792227 + 2 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) intron (NR_039982, intron 4 of 4) -90554 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 297.667-36 chr8 82984650 82984841 + 2 NA Intergenic Intergenic 72641 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 344.001-3 chr17 67062503 67062762 + 2 NA Intergenic Intergenic 18078 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 371-15 chr6 76447547 76447915 + 2 NA Intergenic Intergenic 145892 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 616.667 chr13 33498518 33498857 + 2 NA intron (NM_001243476, intron 4 of 17) intron (NM_001243476, intron 4 of 17) -163421 NR_146541 105370154 NR_146541 LINC02344 - long intergenic non-protein coding RNA 2344 ncRNA 408.333-9 chr3 80378248 80378562 + 2 NA Intergenic Intergenic -386492 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 239-48 chr4 73947386 73947556 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 34556 NM_002619 5196 Hs.81564 NM_002619 ENSG00000163737 PF4 CXCL4|PF-4|SCYB4 platelet factor 4 protein-coding 426-15 chr8 106709294 106709757 + 2 NA intron (NM_181354, intron 7 of 13) intron (NM_181354, intron 7 of 13) -16582 NM_001198534 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 413.999-3 chr14 31868503 31868874 + 2 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -76165 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 289-27 chr5 160577357 160577577 + 2 NA intron (NM_001366652, intron 23 of 24) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 92115 NR_029701 406938 NR_029701 ENSG00000283733 MIR146A MIRN146|MIRN146A|miR-146a|miRNA146A microRNA 146a ncRNA 384.667-10 chr7 109794573 109794928 + 2 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 165463 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 343-2 chr1 247542626 247542809 + 2 NA intron (NM_001281834, intron 3 of 6) intron (NM_001281834, intron 3 of 6) -6417 NM_145278 148823 Hs.732113 NM_145278 ENSG00000169224 GCSAML C1orf150 germinal center associated signaling and motility like protein-coding 275.333-46 chr3 11029756 11029934 + 2 NA intron (NM_001348251, intron 12 of 15) AluSq2|SINE|Alu -10621 NR_046647 100874090 Hs.628542 NR_046647 ENSG00000232287 SLC6A1-AS1 - SLC6A1 antisense RNA 1 ncRNA 433.333-5 chr16 52119444 52119811 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 34346 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 446.334 chr1 52288671 52288908 + 2 NA intron (NM_007324, intron 9 of 17) AluSz|SINE|Alu 77416 NM_032449 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 276.666-29 chr5 53131814 53132049 + 2 NA Intergenic Intergenic 22089 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 372-17 chr5 35886738 35887157 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 30056 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 332.667-7 chr10 77085364 77085646 + 2 NA intron (NM_001271519, intron 11 of 28) intron (NM_001271519, intron 11 of 28) -55326 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 273-31 chr5 98652448 98652623 + 2 NA Intergenic Intergenic -116097 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 320.666-9 chr2 167553964 167554204 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -264588 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 314-41 chr5 174263829 174264007 + 2 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -72436 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 551.999 chr11 7436710 7437042 + 2 NA TTS (NR_103855) TTS (NR_103855) 28959 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 290-48 chr8 81981372 81981523 + 2 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -139161 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 276.666-21 chr20 39362920 39363193 + 2 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -138308 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 274-7 chr11 111573676 111573855 + 2 NA Intergenic Intergenic -28684 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 309.333-6 chr10 21988078 21988306 + 2 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) intron (NM_022365, intron 1 of 11) 15538 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 296.667-13 chr13 44602349 44602581 + 2 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -25900 NM_001243799 8848 Hs.436383 NM_006022 ENSG00000102804 TSC22D1 Ptg-2|TGFB1I4|TSC22 TSC22 domain family member 1 protein-coding 347-5 chr10 113146795 113147014 + 2 NA intron (NM_001198528, intron 7 of 14) intron (NM_001198528, intron 7 of 14) 17633 NM_001349870 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 327.333-22 chr2 134006591 134006886 + 2 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 -113197 NM_001371457 307-24 chr3 179754134 179754347 + 2 NA intron (NM_003940, intron 14 of 20) MER102c|DNA|hAT-Charlie 101200 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 510.667 chr14 76797528 76797853 + 2 NA intron (NM_001370747, intron 9 of 11) intron (NM_001370747, intron 9 of 11) -10966 NR_104183 100506603 Hs.673984 NR_104183 ENSG00000258301 VASH1-AS1 - VASH1 antisense RNA 1 ncRNA 265-14 chr12 10171463 10171880 + 2 NA intron (NM_001079815, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 461 NM_002543 4973 Hs.412484 NM_002543 ENSG00000173391 OLR1 CLEC8A|LOX1|LOXIN|SCARE1|SLOX1 oxidized low density lipoprotein receptor 1 protein-coding 281.333-19 chr15 38480958 38481144 + 2 NA intron (NM_173611, intron 6 of 7) intron (NM_173611, intron 6 of 7) 26924 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 443 chr11 111826385 111826779 + 2 NA intron (NR_147984, intron 13 of 15) AluSz6|SINE|Alu 44699 NM_001352415 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 327-9 chr16 89475067 89475372 + 2 NA intron (NM_001256182, intron 1 of 13) intron (NM_001256182, intron 1 of 13) 15342 NM_013275 29123 Hs.335003 NM_013275 ENSG00000167522 ANKRD11 ANCO-1|ANCO1|LZ16|T13 ankyrin repeat domain 11 protein-coding 419.333-2 chr1 194138725 194138980 + 2 NA Intergenic Intergenic 834107 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 275-42 chr5 13788834 13789094 + 2 NA intron (NM_001369, intron 50 of 78) intron (NM_001369, intron 50 of 78) 155516 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 480.667-5 chr6 69708065 69708504 + 2 NA intron (NM_001367272, intron 9 of 15) intron (NM_001367272, intron 9 of 15) 88182 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 298-73 chr6 91400616 91400797 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -120954 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 332-12 chr15 54286700 54286974 + 2 NA intron (NM_001329919, intron 9 of 31) intron (NM_001329919, intron 9 of 31) 274189 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 528-4 chr5 103478320 103478606 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 63522 NR_104670 102467212 Hs.641885 NR_104670 ENSG00000248757 LINC02115 - long intergenic non-protein coding RNA 2115 ncRNA 322.666-23 chr8 39093447 39093691 + 2 NA intron (NR_027638, intron 19 of 20) L1MEd|LINE|L1 -13960 NM_001313994 203102 Hs.521545 NM_145004 ENSG00000197140 ADAM32 - ADAM metallopeptidase domain 32 protein-coding 292.666-32 chr6 129163384 129163628 + 2 NA intron (NM_000426, intron 8 of 64) AluSx1|SINE|Alu 280365 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 443.333 chr1 53765452 53765993 + 2 NA non-coding (NR_033142, exon 17 of 17) non-coding (NR_033142, exon 17 of 17) -26558 NM_001367484 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 232.667-63 chr5 23683027 23683211 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 175464 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 355.333-37 chr7 92207490 92207678 + 2 NA intron (NM_001013406, intron 15 of 16) AluSz6|SINE|Alu -3486 NR_031616 100302218 NR_031616 ENSG00000221520 MIR1285-1 MIRN1285-1|hsa-mir-1285-1 microRNA 1285-1 ncRNA 289.333-9 chr10 55109713 55109920 + 2 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) intron (NM_001354404, intron 3 of 34) -308525 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 308.666-14 chr4 83674340 83674565 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 138344 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 314.666 chr1 18508593 18508829 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 27781 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 401-3 chr10 12010731 12011168 + 2 NA intron (NM_080599, intron 4 of 21) L1MEc|LINE|L1 31860 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 453-11 chr8 111893923 111894223 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 517434 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 331-27 chr4 147900822 147900987 + 2 NA intron (NM_024605, intron 10 of 22) AluJo|SINE|Alu 118309 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 324-15 chr20 40318741 40318992 + 2 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 314405 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 277.667-51 chrX 82797853 82798060 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -710334 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 345.667-13 chr3 81853343 81853678 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -91865 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 611.333 chr8 85264133 85264651 + 2 NA intron (NM_198584, intron 3 of 6) intron (NM_198584, intron 3 of 6) 18934 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 302-5 chr1 117376989 117377153 + 2 NA intron (NM_006699, intron 1 of 12) intron (NM_006699, intron 1 of 12) 9622 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 467.333-6 chr2 107801460 107801967 + 2 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) intron (NR_126370, intron 2 of 4) 25056 NR_024439 729121 Hs.386155 NR_024439 ENSG00000230651 RGPD4-AS1 - RGPD4 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 301.333-37 chr4 66955371 66955596 + 2 NA Intergenic Intergenic 466517 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 316.666-7 chr16 73919017 73919324 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 296351 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 324.667-19 chr2 199275072 199275314 + 2 NA intron (NM_001172509, intron 10 of 10) intron (NM_001172509, intron 10 of 10) 182746 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 461.333-3 chr7 46616690 46617062 + 2 NA Intergenic Intergenic 80246 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 210.333-105 chr3 98651034 98651221 + 2 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -57516 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 300.667-18 chr2 81678017 81678285 + 2 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -211205 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 314.334-5 chr2 194864163 194864386 + 2 NA Intergenic Intergenic 133679 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 362.667-25 chr6 55698405 55698741 + 2 NA Intergenic Intergenic -119359 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 432-7 chr4 59099162 59099447 + 2 NA Intergenic (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 85731 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 463 chr1 178868551 178868934 + 2 NA intron (NM_004673, intron 2 of 5) intron (NM_004673, intron 2 of 5) 2335 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 316.666-17 chr9 70317112 70317390 + 2 NA intron (NM_015110, intron 13 of 24) (TACTCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 58273 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 339.334-4 chr18 10829291 10829518 + 2 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) L1M1|LINE|L1 -69755 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 504.333 chr1 193763557 193763904 + 2 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 458985 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 233-40 chr2 100169731 100169951 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -27251 NM_002285 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 518-3 chr5 55703047 55703418 + 2 NA intron (NM_001349382, intron 3 of 17) MIR|SINE|MIR 9092 NM_173514 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 419.666-3 chr15 59483779 59484368 + 2 NA intron (NM_152450, intron 3 of 8) L1MEj|LINE|L1 45887 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 563.666 chr1 41458950 41459411 + 2 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 25503 NM_001302269 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 300-4 chr10 13598188 13598383 + 2 NA intron (NM_003675, intron 2 of 9) intron (NM_003675, intron 2 of 9) 11320 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 368.667-12 chr8 137552137 137552566 + 2 NA Intergenic Intergenic -138763 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 365-12 chr2 121437759 121438104 + 2 NA intron (NM_015282, intron 19 of 38) intron (NM_015282, intron 19 of 38) -92949 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 316-42 chr5 118701926 118702185 + 2 NA Intergenic Intergenic 105867 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 213.333-198 chr7 109411528 109411692 + 2 NA Intergenic Intergenic -527023 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 292.667-5 chr11 102339774 102339983 + 2 NA TTS (NM_001165) TTS (NM_001165) -7304 NM_001166 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 271.333-26 chr2 43505076 43505214 + 2 NA intron (NM_001083953, intron 24 of 37) intron (NM_001083953, intron 24 of 37) 90829 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 357-14 chr22 30457176 30457379 + 2 NA Intergenic Intergenic 14770 NM_001257379 266629 Hs.505601 NM_174975 ENSG00000100012 SEC14L3 TAP2 SEC14 like lipid binding 3 protein-coding 308-58 chr9 34152094 34152369 + 2 NA Intergenic Intergenic -25533 NM_015397 25853 Hs.493750 NM_015397 ENSG00000198876 DCAF12 CT102|KIAA1892|TCC52|WDR40A DDB1 and CUL4 associated factor 12 protein-coding 269.333-61 chr3 114114987 114115192 + 2 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 58352 NM_001256836 79691 Hs.477162 NM_024638 ENSG00000151576 QTRT2 QTRTD1 queuine tRNA-ribosyltransferase accessory subunit 2 protein-coding 347-24 chr8 9744460 9744657 + 2 NA intron (NM_003747, intron 17 of 26) intron (NM_003747, intron 17 of 26) 2886 NR_030327 693182 NR_030327 ENSG00000207701 MIR597 MIRN597|hsa-mir-597|mir-597 microRNA 597 ncRNA 362.667-18 chr3 47191732 47192060 + 2 NA intron (NR_033373, intron 2 of 6) LTR37B|LTR|ERV1 27526 NR_033373 285352 Hs.570631 NR_033373 KIF9-AS1 - KIF9 antisense RNA 1 ncRNA 322-11 chr12 920941 921130 + 2 NA intron (NM_001297421, intron 5 of 9) L1MB2|LINE|L1 12041 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 310-46 chr5 147427065 147427242 + 2 NA intron (NM_001197294, intron 1 of 13) intron (NM_001197294, intron 1 of 13) 26539 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 310.667-36 chr6 127041985 127042145 + 2 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -76606 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 208-130 chr5 1989138 1989289 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 101882 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 450.333-6 chr2 121619533 121619895 + 2 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) intron (NM_015282, intron 1 of 38) 29748 NM_015282 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 303.333-11 chr10 14570033 14570202 + 2 NA intron (NM_001320736, intron 1 of 4) intron (NM_001320736, intron 1 of 4) 1882 NM_001282701 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 407.333-11 chr14 102198270 102198568 + 2 NA intron (NM_001242415, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 37007 NM_001353832 5891 Hs.36859 NM_014226 ENSG00000080823 MOK RAGE|RAGE-1|RAGE1|STK30 MOK protein kinase protein-coding 301.333-3 chr1 69197358 69197515 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 141538 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 319.333-26 chr5 121363534 121363823 + 2 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 41128 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 345.333-36 chr7 70621064 70621267 + 2 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) intron (NM_015570, intron 5 of 18) -510979 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 229.667-22 chr12 124787736 124787936 + 2 NA intron (NM_001367987, intron 7 of 9) intron (NM_001367987, intron 7 of 9) 51835 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 318-19 chr14 63781459 63781651 + 2 NA Intergenic Alu|SINE|Alu -53490 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 322.666-8 chr11 105282459 105282750 + 2 NA Intergenic Intergenic -142835 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 311.333-26 chr18 53981482 53981646 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 240848 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 281-27 chr3 31534966 31535137 + 2 NA intron (NM_178862, intron 1 of 15) intron (NM_178862, intron 1 of 15) 2126 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 353.333-24 chr3 193243339 193243554 + 2 NA non-coding (NR_026877, exon 1 of 1) non-coding (NR_026877, exon 1 of 1) 1667 NR_026877 84789 Hs.676481 NM_032703 MGC2889 - uncharacterized protein MGC2889 ncRNA 306.666-29 chr5 61150803 61151054 + 2 NA intron (NM_174889, intron 3 of 3) intron (NM_174889, intron 3 of 3) -11388 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 237-58 chr5 26355160 26355344 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 683334 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 247-53 chr3 90078367 90078517 + 2 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 970821 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 331-34 chr6 7222903 7223113 + 2 NA intron (NM_001003699, intron 8 of 12) AluJr|SINE|Alu 90191 NM_001292008 6745 Hs.114033 NM_003144 ENSG00000124783 SSR1 TRAPA signal sequence receptor subunit 1 protein-coding 334.666-7 chr21 22072057 22072347 + 2 NA intron (NR_109959, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 26257 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 301-5 chr1 173421362 173421551 + 2 NA intron (NR_125960, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 39906 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 345.334 chr12 101777681 101778021 + 2 NA intron (NM_024312, intron 7 of 20) intron (NM_024312, intron 7 of 20) -38379 NM_153694 50511 Hs.506504 NM_153694 ENSG00000139351 SYCP3 COR1|RPRGL4|SCP3|SPGF4 synaptonemal complex protein 3 protein-coding 342.667-8 chr4 47573343 47573640 + 2 NA intron (NM_020453, intron 18 of 22) intron (NM_020453, intron 18 of 22) -79178 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 706.001 chr8 86046528 86047069 + 2 NA TTS (NM_033126) TTS (NM_033126) 22870 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 238-105 chr8 125757618 125757780 + 2 NA Intergenic Intergenic 193498 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 313.333-52 chr9 77287656 77287887 + 2 NA intron (NM_001018038, intron 31 of 68) L2a|LINE|L2 -109854 NR_026668 100286938 Hs.662256 NR_026668 ENSG00000232998 VPS13A-AS1 - VPS13A antisense RNA 1 ncRNA 472.333-4 chr8 57426913 57427261 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 83300 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 399.667-6 chr2 61087130 61087552 + 2 NA intron (NM_001129993, intron 8 of 21) AluJr|SINE|Alu 21132 NM_032506 84542 Hs.468653 NM_032506 ENSG00000162929 KIAA1841 - KIAA1841 protein-coding 243.334-4 chr11 112937714 112937971 + 2 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -23578 NM_001242607 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 304-49 chr6 14355278 14355439 + 2 NA Intergenic Intergenic -69904 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 388-6 chr13 102046701 102047008 + 2 NA promoter-TSS (NR_039854) promoter-TSS (NR_039854) -850 NR_039854 100616239 NR_039854 ENSG00000264482 MIR4705 - microRNA 4705 ncRNA 497-3 chr7 5068921 5069390 + 2 NA 3' UTR (NM_021163, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_021163, exon 5 of 5) -2905 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 280.667-51 chr7 53774762 53774916 + 2 NA intron (NR_038371, intron 2 of 5) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 37092 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 309.333-13 chr12 21876254 21876442 + 2 NA intron (NM_005691, intron 14 of 37) intron (NM_005691, intron 14 of 37) 60346 NM_005691 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 451 chr1 44980708 44981012 + 2 NA intron (NM_001166588, intron 2 of 9) intron (NM_001166588, intron 2 of 9) 5735 NM_020365 8891 Hs.533549 NM_020365 ENSG00000070785 EIF2B3 EIF-2B|EIF2Bgamma eukaryotic translation initiation factor 2B subunit gamma protein-coding 361-18 chr9 132061817 132062082 + 2 NA intron (NM_001253881, intron 2 of 6) intron (NM_001253881, intron 2 of 6) 17918 NM_001253882 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 272-33 chr3 128358700 128358952 + 2 NA intron (NM_021937, intron 6 of 6) intron (NM_021937, intron 6 of 6) -104768 NR_037890 285224 Hs.683815 NR_037890 ENSG00000242049 DNAJB8-AS1 - DNAJB8 antisense RNA 1 ncRNA 361.333-2 chr1 119079381 119079643 + 2 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 32107 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 374-18 chr6 8082384 8082635 + 2 NA intron (NM_004280, intron 3 of 3) AluSz6|SINE|Alu 4024 NR_003703 100124533 NR_003703 SCARNA27 - small Cajal body-specific RNA 27 ncRNA 410.001 chr14 78481874 78482201 + 2 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 78318 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 287.333-31 chr2 147939702 147939866 + 2 NA intron (NM_001190881, intron 7 of 10) intron (NM_001190881, intron 7 of 10) 80953 NM_002552 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 576.666-2 chr4 122424870 122425227 + 2 NA intron (NM_001159285, intron 11 of 11) L1ME1|LINE|L1 31447 NM_000586 3558 Hs.89679 NM_000586 ENSG00000109471 IL2 IL-2|TCGF|lymphokine interleukin 2 protein-coding 326.667-31 chr5 38271760 38271953 + 2 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) intron (NM_152403, intron 1 of 21) 13297 NM_001205301 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 346-40 chr9 34961073 34961307 + 2 NA intron (NM_015297, intron 1 of 7) intron (NM_015297, intron 1 of 7) 2905 NM_001347983 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 294-39 chr22 28490671 28490938 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 30935 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 304.666 chr1 167727453 167727723 + 2 NA intron (NM_024569, intron 1 of 4) intron (NM_024569, intron 1 of 4) 5606 NM_024569 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 283-19 chr2 225415058 225415225 + 2 NA intron (NM_001371273, intron 3 of 7) intron (NM_001371273, intron 3 of 7) 14255 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 326.666-10 chr22 41095794 41096041 + 2 NA intron (NM_001429, intron 1 of 30) intron (NM_001429, intron 1 of 30) 3325 NM_001429 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 281-6 chr11 111756451 111756658 + 2 NA intron (NM_001177563, intron 3 of 12) intron (NM_001177563, intron 3 of 12) 9835 NM_181699 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 314.333-9 chr16 72400859 72401088 + 2 NA intron (NR_126330, intron 7 of 13) intron (NR_126330, intron 7 of 13) -228523 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 335.333-48 chr7 4325864 4326141 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -191165 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 322.667-3 chr1 199729501 199729718 + 2 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -298101 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 664.333 chr1 167995561 167996168 + 2 NA intron (NM_001017977, intron 7 of 18) L2a|LINE|L2 -2796 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 312-41 chr4 152450721 152450986 + 2 NA intron (NM_001349798, intron 2 of 13) intron (NM_001349798, intron 2 of 13) 38563 NR_036092 100422896 NR_036092 ENSG00000264678 MIR3140 mir-3140 microRNA 3140 ncRNA 195.333-71 chr13 91984243 91984410 + 2 NA intron (NM_004466, intron 6 of 7) intron (NM_004466, intron 6 of 7) 367881 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 317.667-4 chr1 104716388 104716548 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 643445 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 313-4 chr1 195605193 195605355 + 2 NA Intergenic Intergenic 483441 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 250.666-30 chr5 98250568 98250754 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -89422 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 303.333-46 chr2 219052747 219052964 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 5895 NR_036081 100422957 NR_036081 ENSG00000264755 MIR3131 mir-3131 microRNA 3131 ncRNA 436.334-3 chr4 48691053 48691395 + 2 NA intron (NM_015030, intron 2 of 63) L1M5|LINE|L1 89075 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 427-3 chr2 128398013 128398276 + 2 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -79276 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 275.667-73 chrX 124563113 124563307 + 2 NA intron (NM_014253, intron 13 of 30) intron (NM_014253, intron 13 of 30) 216928 NM_002351 4068 Hs.349094 NM_002351 ENSG00000183918 SH2D1A DSHP|EBVS|IMD5|LYP|MTCP1|SAP|SAP/SH2D1A|XLP|XLPD|XLPD1 SH2 domain containing 1A protein-coding 407.333-6 chr11 111747410 111747787 + 2 NA intron (NM_181699, intron 11 of 15) intron (NM_181699, intron 11 of 15) 18791 NM_181699 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 353.667-3 chr10 79496381 79496716 + 2 NA Intergenic Intergenic 14434 NR_136625 729815 Hs.564060 NR_136624 ENSG00000235705 LOC729815 - uncharacterized LOC729815 ncRNA 294-69 chrX 68443254 68443407 + 2 NA Intergenic Intergenic -9835 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 292-14 chr14 64356762 64357045 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9292 NR_033777 441687 Hs.685242 NR_033777 TEX21P - testis expressed 21, pseudogene pseudo 291-17 chr15 76666747 76667003 + 2 NA intron (NR_148227, intron 20 of 32) L2a|LINE|L2 80228 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 296.666-21 chr3 113722961 113723238 + 2 NA intron (NM_025146, intron 3 of 4) intron (NM_025146, intron 3 of 4) 23150 NM_025146 80218 Hs.372378 NM_025146 ENSG00000121579 NAA50 MAK3|NAT13|NAT13P|NAT5|NAT5P|SAN|hNaa50p N(alpha)-acetyltransferase 50, NatE catalytic subunit protein-coding 246.667-68 chr5 37584002 37584218 + 2 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) MIR|SINE|MIR 204792 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 565.334 chr5 51602069 51602419 + 2 NA Intergenic Intergenic 218796 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 457.333-4 chr3 34283772 34284206 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 485359 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 297.333-5 chr1 181764446 181764617 + 2 NA intron (NM_001205293, intron 34 of 47) intron (NM_001205293, intron 34 of 47) 281014 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 344.333-23 chr7 93875743 93876080 + 2 NA Intergenic Intergenic 14842 NM_001271004 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 202.666-132 chrX 152005611 152005809 + 2 NA Intergenic L1M2b|LINE|L1 -31034 NM_004961 2564 Hs.22785 NM_004961 ENSG00000102287 GABRE - gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit protein-coding 312.666-11 chr2 102548358 102548586 + 2 NA Intergenic Intergenic -71081 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 430.667-3 chr14 54650465 54650933 + 2 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 83087 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 483 chr12 18743115 18743689 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 5283 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 326.667-25 chr2 237206188 237206421 + 2 NA Intergenic Intergenic 120415 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 362-5 chr1 212133614 212133847 + 2 NA Intergenic Intergenic 56117 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 474.333-3 chr6 36601487 36601924 + 2 NA intron (NM_003017, intron 4 of 5) intron (NM_003017, intron 4 of 5) 7343 NM_003017 6428 Hs.405144 NM_003017 ENSG00000112081 SRSF3 SFRS3|SRp20 serine and arginine rich splicing factor 3 protein-coding 312.334-7 chr8 124483972 124484185 + 2 NA intron (NM_007218, intron 1 of 1) intron (NM_007218, intron 1 of 1) 9311 NM_007218 11236 Hs.744151 NM_007218 ENSG00000170881 RNF139 HRCA1|RCA1|TRC8 ring finger protein 139 protein-coding 396-11 chr4 30698656 30699050 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -21516 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 314.666-31 chr7 8067930 8068183 + 2 NA intron (NM_138426, intron 5 of 7) L1PA15|LINE|L1 99260 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 357-10 chr20 2981266 2981501 + 2 NA intron (NM_002836, intron 10 of 27) MER20|DNA|hAT-Charlie 58176 NM_080841 5786 Hs.269577 NM_002836 ENSG00000132670 PTPRA HEPTP|HLPR|HPTPA|HPTPalpha|LRP|PTPA|PTPRL2|R-PTP-alpha|RPTPA protein tyrosine phosphatase receptor type A protein-coding 279-30 chr6 44785289 44785435 + 2 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -233481 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 375-11 chr3 191562625 191563060 + 2 NA intron (NR_120606, intron 4 of 6) intron (NR_120606, intron 4 of 6) 101679 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 512-2 chr11 19648723 19649161 + 2 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) L1ME4a|LINE|L1 -63895 NM_145117 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 247.667-97 chr8 115681732 115681862 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12822 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 391.999-4 chr3 192108095 192108417 + 2 NA Intergenic Intergenic -130374 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 477-5 chr8 137014183 137014492 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 399251 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 255.333-74 chr4 32503642 32503824 + 2 NA Intergenic Intergenic 152695 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 463.333-4 chr16 61140588 61140973 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -85014 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 410 chr1 57149895 57150395 + 2 NA intron (NM_001353980, intron 5 of 5) MIR|SINE|MIR -184005 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 462-21 chrX 14885169 14885557 + 2 NA promoter-TSS (NM_001177475) promoter-TSS (NM_001177475) 72 NM_001177475 158747 Hs.744919 NM_152581 ENSG00000130150 MOSPD2 - motile sperm domain containing 2 protein-coding 356.667-16 chr6 64321828 64322130 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 515143 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 457-4 chr21 29258950 29259339 + 2 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) intron (NR_027072, intron 1 of 1) -39778 NM_001186 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 297-34 chr22 41164988 41165246 + 2 NA intron (NM_001429, intron 22 of 30) intron (NM_001429, intron 22 of 30) 32384 NR_110514 101927279 Hs.517517 NR_110514 EP300-AS1 - EP300 antisense RNA 1 ncRNA 302-2 chr1 81443954 81444135 + 2 NA intron (NM_001366004, intron 2 of 27) intron (NM_001366004, intron 2 of 27) 113658 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 501-5 chr6 124168174 124168508 + 2 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -114664 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 506-2 chr4 143129712 143130116 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 54947 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 405-2 chr11 11654009 11654492 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 2472 NR_036184 100423026 NR_036184 ENSG00000266645 MIR4299 - microRNA 4299 ncRNA 367.667-2 chr11 42557731 42558068 + 2 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -304209 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 495-2 chr5 109153491 109153933 + 2 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) MIR|SINE|MIR 172657 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 388.334 chr10 6506737 6507042 + 2 NA intron (NM_001282645, intron 3 of 16) intron (NM_001282645, intron 3 of 16) 73387 NM_001323266 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 363-11 chr20 55330366 55330838 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -92441 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 419.667-8 chr6 126181628 126182099 + 2 NA Intergenic Intergenic -157926 NM_001286525 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 299 chr1 50584710 50584896 + 2 NA exon (NM_007051, exon 10 of 19) exon (NM_007051, exon 10 of 19) -161360 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 298.667-17 chr3 51498979 51499258 + 2 NA intron (NM_001349169, intron 1 of 25) intron (NM_001349169, intron 1 of 25) 884 NM_001171904 9730 Hs.716623 NM_014703 ENSG00000145041 DCAF1 RIP|VPRBP DDB1 and CUL4 associated factor 1 protein-coding 700.333 chr10 65269909 65270486 + 2 NA Intergenic Intergenic -301228 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 408 chr12 87053689 87053930 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -214809 NM_001351285 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 302-14 chr11 77644972 77645206 + 2 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -7283 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 276-49 chr4 71235560 71235772 + 2 NA intron (NM_001098484, intron 1 of 25) intron (NM_001098484, intron 1 of 25) 48380 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 422.333-9 chr7 92995292 92995610 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 122528 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 298.667-15 chr20 24075399 24075576 + 2 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -86708 NM_178311 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 347-6 chr11 33614056 33614294 + 2 NA intron (NM_012194, intron 15 of 20) MER74A|LTR|ERVL 86565 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 325.333-23 chr21 29754233 29754439 + 2 NA intron (NR_027021, intron 2 of 4) intron (NR_027021, intron 2 of 4) 6161 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 309.333-34 chr2 38596376 38596594 + 2 NA intron (NM_138394, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 6443 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 223-9 chr10 87815568 87815715 + 2 NA intron (NM_001321967, intron 1 of 9) intron (NM_001321967, intron 1 of 9) 2590 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 378.334-2 chr7 46472777 46473268 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 224100 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 326-51 chr9 92919518 92919732 + 2 NA Intergenic Intergenic -27898 NM_001083536 89846 Hs.411081 NM_033086 ENSG00000127084 FGD3 ZFYVE5 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3 protein-coding 310.666-20 chr6 118463177 118463464 + 2 NA 3' UTR (NM_001178035, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001178035, exon 14 of 14) -38053 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 485.666 chr2 71211358 71211754 + 2 NA intron (NM_020459, intron 1 of 3) intron (NM_020459, intron 1 of 3) 15547 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 478-3 chr2 126629764 126630091 + 2 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -26008 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 307.333-82 chr8 140795475 140795723 + 2 NA intron (NR_148037, intron 13 of 34) L2a|LINE|L2 -62946 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 461-8 chr5 147071057 147071503 + 2 NA intron (NM_181677, intron 2 of 10) intron (NM_181677, intron 2 of 10) 10190 NM_181678 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 202.667-159 chr9 97660845 97661039 + 2 NA intron (NM_001351507, intron 14 of 21) intron (NM_001351507, intron 14 of 21) 27121 NM_002486 4686 Hs.595669 NM_002486 ENSG00000136937 NCBP1 CBP80|NCBP|Sto1 nuclear cap binding protein subunit 1 protein-coding 337.333-7 chr11 76499721 76499964 + 2 NA intron (NM_001300942, intron 10 of 21) AluJr4|SINE|Alu 54817 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 348.667-12 chr2 164303139 164303358 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 265247 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 336.666-11 chr14 64181193 64181399 + 2 NA intron (NM_015180, intron 96 of 114) L1ME3Cz|LINE|L1 -32848 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 293-14 chr12 37876922 37877112 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -439757 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 355.334-8 chr8 129258576 129258825 + 2 NA Intergenic L1P5|LINE|L1 -17460 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 424-13 chr5 36252072 36252352 + 2 NA intron (NM_001323279, intron 11 of 12) MIR3|SINE|MIR -9933 NM_001287341 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 318-16 chr12 72944707 72944953 + 2 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -214360 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 229.667-74 chr7 36492494 36492858 + 2 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -102319 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 388-20 chr6 155584750 155585082 + 2 NA Intergenic MER57C2|LTR|ERV1 70072 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 337-14 chr18 2164017 2164189 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 407402 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 313-19 chr2 189126295 189126557 + 2 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) 6685 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 497.334 chr13 46262685 46262964 + 2 NA intron (NM_001282460, intron 8 of 9) L1M4|LINE|L1 35020 NR_047493 100861554 Hs.90866 NR_047493 ENSG00000261097 LINC00563 - long intergenic non-protein coding RNA 563 ncRNA 419.667-9 chr8 15117743 15118197 + 2 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 120461 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 306.666-27 chr5 13909089 13909377 + 2 NA intron (NM_001369, intron 12 of 78) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 35247 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 243-55 chr6 4247952 4248113 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -58003 NR_125874 102724096 Hs.571140 NR_125874 LOC102724096 - uncharacterized LOC102724096 ncRNA 323.333-36 chr9 23314039 23314202 + 2 NA Intergenic Intergenic 358279 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 260.667-53 chr2 175550208 175550388 + 2 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -368588 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 258.666-14 chr16 25837702 25837956 + 2 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) L1PA16|LINE|L1 145870 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 328.666-13 chr3 146134761 146135041 + 2 NA intron (NM_182943, intron 1 of 19) intron (NM_182943, intron 1 of 19) 26283 NM_182943 5352 Hs.477866 NM_000935 ENSG00000152952 PLOD2 BRKS2|LH2|TLH procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 protein-coding 295.334-6 chr5 102413798 102414159 + 2 NA intron (NM_001308014, intron 3 of 8) L1ME1|LINE|L1 85023 NM_001289002 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 536.667-2 chr5 21237512 21237956 + 2 NA Intergenic Intergenic -221746 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 383.333-10 chr3 172413730 172414169 + 2 NA Intergenic Intergenic 34507 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 295.333-47 chr4 140457460 140457687 + 2 NA intron (NM_001277353, intron 8 of 10) intron (NM_001277353, intron 8 of 10) -29912 NM_001130675 1047 Hs.86368 NM_004362 ENSG00000153132 CLGN - calmegin protein-coding 291.333-55 chr5 66562446 66562686 + 2 NA Intergenic Intergenic -33827 NM_001290228 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 306-56 chr8 140872883 140873172 + 2 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) L1ME3F|LINE|L1 127977 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 307-2 chr1 86091612 86091846 + 2 NA intron (NM_152890, intron 6 of 59) MIRc|SINE|MIR 64742 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 616.667-2 chr6 99436177 99437202 + 2 NA intron (NR_144344, intron 15 of 15) intron (NR_144344, intron 15 of 15) -11344 NM_001322416 25957 Hs.520287 NM_015491 ENSG00000132424 PNISR C6orf111|HSPC306|SFRS18|SRrp130|bA98I9.2 PNN interacting serine and arginine rich protein protein-coding 365.999-4 chr5 112350378 112350697 + 2 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) L1MA4A|LINE|L1 68740 NM_001347887 64097 Hs.584954 NM_022140 ENSG00000129595 EPB41L4A EPB41L4|NBL4 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A protein-coding 657.334 chr10 48630972 48631447 + 2 NA intron (NM_001347738, intron 2 of 10) L1MCa|LINE|L1 21293 NM_001256025 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 358.333-2 chr1 68665011 68665320 + 2 NA Intergenic Intergenic -168083 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 474-5 chr8 59668314 59668725 + 2 NA Intergenic Intergenic 549309 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 536-2 chr2 182365800 182366216 + 2 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 61040 NM_001258313 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 332.666-13 chr18 6301087 6301298 + 2 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) intron (NM_001365769, intron 4 of 16) 44448 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 292-59 chrX 49659532 49659768 + 2 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 36334 NM_003785 8712 Hs.128231 NM_003785 ENSG00000068985 PAGE1 AL5|CT16.3|GAGE-9|GAGEB1|PAGE-1 PAGE family member 1 protein-coding 306-45 chr6 54742200 54742391 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -104476 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 505-2 chr17 72120975 72121410 + 2 NA promoter-TSS (NR_103737) promoter-TSS (NR_103737) 172 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 305.667-32 chr5 115808801 115809072 + 2 NA intron (NR_136618, intron 4 of 6) MIR3|SINE|MIR 7721 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 335.333-2 chr1 228545196 228545419 + 2 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -33019 NM_001287262 100129094 Hs.730208 NM_001287262 BTNL10 BTN4|BUTR1 butyrophilin like 10 protein-coding 223-29 chr18 67146714 67146857 + 2 NA Intergenic Intergenic 65201 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 314-18 chr2 62545829 62545993 + 2 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 -39716 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 369-7 chr17 75965552 75965943 + 2 NA intron (NM_004035, intron 2 of 13) AluJo|SINE|Alu 13419 NM_001185039 51 Hs.464137 NM_004035 ENSG00000161533 ACOX1 ACOX|PALMCOX|SCOX acyl-CoA oxidase 1 protein-coding 302-70 chr8 92015488 92015728 + 2 NA intron (NM_004349, intron 2 of 10) intron (NM_004349, intron 2 of 10) 2072 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 449.333-3 chr10 126550639 126551014 + 2 NA intron (NM_001350922, intron 2 of 8) L1MD1|LINE|L1 -29333 NM_001004298 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 282.666-3 chr12 11933057 11933312 + 2 NA Intergenic Intergenic -116677 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 460.666-3 chr7 55844770 55845059 + 2 NA intron (NM_207366, intron 3 of 9) intron (NM_207366, intron 3 of 9) 17838 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 413.334-5 chr5 24485945 24486288 + 2 NA TTS (NM_001317224) TTS (NM_001317224) 158862 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 328.666-16 chr5 38498717 38498961 + 2 NA intron (NM_001127671, intron 12 of 19) intron (NM_001127671, intron 12 of 19) 53293 NM_182801 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 329.667-17 chr6 73003390 73003648 + 2 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) -35766 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 430-3 chr3 71116786 71117072 + 2 NA intron (NR_146142, intron 6 of 19) intron (NR_146142, intron 6 of 19) 13657 NM_001370548 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 302-32 chr2 123545672 123545897 + 2 NA Intergenic Intergenic -472303 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 344-24 chr2 133823405 133823667 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -255073 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 310.333-20 chr18 1495034 1495205 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -135490 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 350.333-4 chr12 13764783 13765104 + 2 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) intron (NM_000834, intron 2 of 12) 215413 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 363-14 chr7 82588684 82588885 + 2 NA Intergenic Intergenic -144828 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 334.333-36 chr9 109684656 109684972 + 2 NA intron (NM_001037293, intron 1 of 6) L1ME1|LINE|L1 44026 NM_001037293 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 302-46 chr4 83642522 83642690 + 2 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 106498 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 580.001-2 chr2 103295298 103295715 + 2 NA Intergenic Intergenic -311077 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 380-4 chr11 18012440 18012685 + 2 NA intron (NR_104040, intron 1 of 11) intron (NR_104040, intron 1 of 11) 485 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 260.334-16 chr5 74982958 74983142 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 69508 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 331.333-36 chr4 11640774 11640996 + 2 NA Intergenic Intergenic 128583 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 307.333-59 chr3 134248222 134248417 + 2 NA intron (NM_001005861, intron 1 of 14) intron (NM_001005861, intron 1 of 14) 2425 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 149.333-169 chr2 25629464 25629552 + 2 NA intron (NM_033147, intron 3 of 19) L1MB7|LINE|L1 20714 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 315-24 chr5 53619998 53620168 + 2 NA intron (NR_134474, intron 3 of 5) FLAM_C|SINE|Alu 59444 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 294-18 chr12 44861068 44861302 + 2 NA intron (NM_006159, intron 3 of 20) L1M1|LINE|L1 14476 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 269.333-93 chr9 20475599 20475871 + 2 NA intron (NM_001286691, intron 2 of 10) intron (NM_001286691, intron 2 of 10) 26607 NR_039685 100616441 NR_039685 ENSG00000264941 MIR4474 - microRNA 4474 ncRNA 340-27 chr8 25405233 25405426 + 2 NA intron (NM_024940, intron 48 of 51) L1M5|LINE|L1 18932 NM_001083111 2796 Hs.82963 NM_000825 ENSG00000147437 GNRH1 GNRH|GRH|LHRH|LNRH gonadotropin releasing hormone 1 protein-coding 377 chr1 93543665 93543903 + 2 NA intron (NM_001164473, intron 11 of 16) intron (NM_001164473, intron 11 of 16) 41378 NM_001308251 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 407.334-8 chr9 37245320 37245728 + 2 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 124926 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 487.999 chr12 84927257 84927641 + 2 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -14620 NM_018057 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 172.666-6 chr14 85893774 85893920 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -40831 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 654.666 chr17 59826526 59827106 + 2 NA intron (NM_001329400, intron 8 of 9) intron (NM_001329400, intron 8 of 9) -14450 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 596-2 chr13 49718948 49719505 + 2 NA intron (NM_002267, intron 10 of 16) intron (NM_002267, intron 10 of 16) -27739 NR_103802 84650 Hs.433278 NM_032565 ENSG00000123179 EBPL EBRP EBP like protein-coding 455.333-10 chr7 82153819 82154298 + 2 NA intron (NM_000722, intron 4 of 38) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 144881 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 325.667-15 chr21 29809367 29809609 + 2 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 61313 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 391-20 chr8 136673352 136673846 + 2 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 142801 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 317.334-5 chr4 33184272 33184569 + 2 NA Intergenic Intergenic 833382 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 297-5 chr1 239475579 239475792 + 2 NA intron (NM_001347716, intron 1 of 7) L1MC3|LINE|L1 89117 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 347.334 chr12 26603412 26603819 + 2 NA intron (NM_002223, intron 26 of 56) intron (NM_002223, intron 26 of 56) 229579 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 624-2 chr7 7637210 7637632 + 2 NA intron (NM_002947, intron 7 of 7) intron (NM_002947, intron 7 of 7) -3331 NM_001302349 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 339.999 chr10 66584346 66584624 + 2 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) L1PB3|LINE|L1 -341551 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 277-32 chr3 782226 782530 + 2 NA intron (NR_110118, intron 2 of 3) intron (NR_110118, intron 2 of 3) 190273 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 406.334-3 chr2 66109244 66109494 + 2 NA Intergenic Intergenic 248959 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 277-47 chr6 53344122 53344443 + 2 NA intron (NM_001242830, intron 1 of 6) intron (NM_001242830, intron 1 of 6) 4668 NM_021814 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 405-17 chr8 103548076 103548324 + 2 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1PA15|LINE|L1 -46290 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 429.333 chr1 74529596 74529961 + 2 NA intron (NM_015978, intron 23 of 24) intron (NM_015978, intron 23 of 24) -17164 NM_001364666 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 258-42 chr2 208352342 208352564 + 2 NA intron (NM_015040, intron 38 of 41) intron (NM_015040, intron 38 of 41) -7239 NM_001309516 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 322.333-15 chr20 70394 70605 + 2 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -17173 NM_153325 245938 Hs.380220 NM_153325 ENSG00000178591 DEFB125 DEFB-25 defensin beta 125 protein-coding 392-9 chr2 177745116 177745468 + 2 NA intron (NM_001077197, intron 11 of 20) intron (NM_001077197, intron 11 of 20) 71970 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 174.667-48 chr14 48807583 48807733 + 2 NA Intergenic Intergenic 778722 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 207.667-123 chr8 128509699 128509832 + 2 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 54914 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 323.667-9 chr16 14204693 14204985 + 2 NA intron (NM_001365411, intron 1 of 14) intron (NM_001365411, intron 1 of 14) 18153 NM_001365416 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 313.667-25 chr2 185091590 185091750 + 2 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 75402 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 287.333-45 chr5 7259106 7259362 + 2 NA Intergenic Intergenic 10120 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 410.666-6 chr18 13497548 13497872 + 2 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) 37763 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 344.667 chr1 185036115 185036506 + 2 NA Intergenic Intergenic -9248 NM_007212 6045 Hs.591490 NM_007212 ENSG00000121481 RNF2 BAP-1|BAP1|DING|HIPI3|RING1B|RING2 ring finger protein 2 protein-coding 305.667-33 chr5 145489524 145489792 + 2 NA Intergenic Intergenic 345684 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 424-10 chr20 59914356 59914704 + 2 NA intron (NM_014258, intron 10 of 44) intron (NM_014258, intron 10 of 44) 19107 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 354.666-15 chr4 79546357 79546644 + 2 NA intron (NR_038826, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 53907 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 538.666 chr16 72668237 72668767 + 2 NA Intergenic Intergenic -3532 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 312-24 chr2 77656563 77656846 + 2 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -134271 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 309.333-49 chr3 174690307 174690545 + 2 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -168908 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 313.333-13 chr14 69047914 69048097 + 2 NA Intergenic Intergenic 68323 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 230.333-75 chr3 35698585 35698781 + 2 NA intron (NM_016300, intron 9 of 19) intron (NM_016300, intron 9 of 19) 17743 NM_198399 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 297-7 chr10 19193992 19194287 + 2 NA intron (NM_001142308, intron 14 of 39) intron (NM_001142308, intron 14 of 39) 145338 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 248-22 chr14 53858255 53858436 + 2 NA Intergenic Intergenic 90139 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 258.666-16 chr16 80193598 80193818 + 2 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -347026 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 286.666-13 chr3 55786002 55786265 + 2 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) intron (NR_132749, intron 13 of 17) 66461 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 246-14 chr10 92226143 92226334 + 2 NA intron (NM_001178137, intron 2 of 9) intron (NM_001178137, intron 2 of 9) 17041 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 290-47 chr7 39492855 39493077 + 2 NA Intergenic Intergenic -73438 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 318-12 chr11 90846797 90846998 + 2 NA intron (NR_104190, intron 5 of 6) intron (NR_104190, intron 5 of 6) 22305 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 297-39 chr5 27852208 27852444 + 2 NA Intergenic Intergenic 380034 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 278-4 chr11 41173753 41174030 + 2 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 285745 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 337.333-10 chr12 79388225 79388482 + 2 NA intron (NM_001291901, intron 8 of 9) intron (NM_001291901, intron 8 of 9) -30904 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 384.666-7 chr20 19526790 19527176 + 2 NA intron (NM_020689, intron 3 of 16) intron (NM_020689, intron 3 of 16) -242387 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 418.667 chr1 186701061 186701293 + 2 NA Intergenic Intergenic 20523 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 414.334-3 chr9 35328127 35328486 + 2 NA intron (NM_006377, intron 10 of 38) AluSx|SINE|Alu -13590 NM_001371188 207.333-190 chr3 177644531 177644726 + 2 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) LTR37B|LTR|ERV1 -172237 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 505 chr10 83754392 83754992 + 2 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -77603 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 358-15 chr4 63162867 63163308 + 2 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -1001322 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 296.334-4 chr12 39325943 39326226 + 2 NA intron (NM_001173464, intron 25 of 37) intron (NM_001173464, intron 25 of 37) 117036 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 220-49 chr17 61569140 61569311 + 2 NA Intergenic Intergenic 21994 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 322.333-31 chrX 154714190 154714509 + 2 NA intron (NR_104114, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 36728 NM_001081573 139716 Hs.496982 NM_080612 ENSG00000160219 GAB3 - GRB2 associated binding protein 3 protein-coding 345.333-23 chr22 28276015 28276384 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) AluJb|SINE|Alu -183670 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 342-9 chr14 46228370 46228613 + 2 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 164332 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 461-3 chr12 125340654 125341235 + 2 NA intron (NM_052907, intron 1 of 8) intron (NM_052907, intron 1 of 8) 14328 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 313.667-7 chr10 61422568 61422813 + 2 NA intron (NR_134508, intron 4 of 6) L1ME1|LINE|L1 -29949 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 287.667-26 chr3 10528398 10528626 + 2 NA intron (NM_001353564, intron 2 of 20) intron (NM_001353564, intron 2 of 20) -22926 NM_001330611 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 304.667-42 chr9 89871457 89871680 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -97848 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 309.333-54 chr5 78161274 78161569 + 2 NA intron (NM_003664, intron 13 of 26) intron (NM_003664, intron 13 of 26) 133277 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 143-11 chr1 163357095 163357185 + 2 NA Intergenic Intergenic 35186 NM_031423 83540 Hs.651950 NM_031423 ENSG00000143228 NUF2 CDCA1|CT106|NUF2R NUF2 component of NDC80 kinetochore complex protein-coding 220-32 chr13 21994941 21995080 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -116850 NR_047040 100874182 Hs.148951 NR_047040 ENSG00000226722 LINC00424 - long intergenic non-protein coding RNA 424 ncRNA 239.333-39 chr16 59150282 59150492 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -416071 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 300-20 chr14 53282856 53283110 + 2 NA Intergenic Intergenic 129629 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 413.667-9 chr8 83631151 83631576 + 2 NA Intergenic Intergenic 227605 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 336.334 chr12 47961447 47961758 + 2 NA Intergenic Intergenic -1945 NM_024056 79022 Hs.596726 NM_024056 ENSG00000134291 TMEM106C - transmembrane protein 106C protein-coding 465.999 chr7 33640916 33641199 + 2 NA Intergenic Intergenic -263858 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 332-29 chr5 168099342 168099540 + 2 NA intron (NM_001368145, intron 8 of 26) MIRb|SINE|MIR -66404 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 349.333-34 chr9 104521982 104522270 + 2 NA Intergenic Intergenic 5083 NM_001001919 138804 Hs.553601 NM_001001919 ENSG00000148136 OR13C4 HSHTPCRX17|HTPCRX17|OR2K1|OR37F|OR9-7 olfactory receptor family 13 subfamily C member 4 protein-coding 353.333-22 chr3 102650591 102650927 + 2 NA Intergenic Intergenic 215744 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 334.666-20 chr8 141650508 141650803 + 2 NA Intergenic Intergenic 135658 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 447.333 chr1 246342975 246343351 + 2 NA intron (NM_022743, intron 2 of 11) intron (NM_022743, intron 2 of 11) 74249 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 293.333-15 chr14 85383625 85383776 + 2 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -3575 NR_135155 105370605 NR_135155 ENSG00000258814 LINC02329 - long intergenic non-protein coding RNA 2329 ncRNA 563.999 chr1 29816001 29816457 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 221383 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 316.667-28 chr5 97149472 97149670 + 2 NA Intergenic Intergenic -6960 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 463.333-2 chr12 17915057 17915328 + 2 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 175001 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 329.667-22 chr9 129539837 129540010 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 51263 NR_038955 100506190 Hs.529860 NR_038955 LINC00963 MetaLnc9 long intergenic non-protein coding RNA 963 ncRNA 319.667-22 chr3 98364250 98364484 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 10513 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 437.333-10 chr5 43490518 43490780 + 2 NA exon (NM_198566, exon 11 of 13) exon (NM_198566, exon 11 of 13) -6784 NM_022483 64417 Hs.732093 NM_022483 ENSG00000151881 TMEM267 C5orf28 transmembrane protein 267 protein-coding 382-11 chr7 62661718 62661951 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 642222 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 360.333-11 chr2 58673346 58673626 + 2 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu 152733 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 265-23 chr15 56929114 56929274 + 2 NA intron (NM_207038, intron 3 of 19) intron (NM_207038, intron 3 of 19) 9749 NM_001322165 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 319.667-30 chr7 89104611 89104838 + 2 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) MER4B-int|LTR|ERV1 -308987 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 297-17 chr12 31927902 31928156 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -31386 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 415 chr1 13980302 13980571 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 231021 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 338-7 chr14 39304601 39304906 + 2 NA intron (NM_001354150, intron 12 of 23) intron (NM_001354150, intron 12 of 23) 37368 NM_203355 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 333.333-19 chr13 33154380 33154696 + 2 NA intron (NM_178007, intron 3 of 13) intron (NM_178007, intron 3 of 13) 31553 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 557.333-2 chr6 4542363 4542703 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 53735 NR_149117 105374895 Hs.436882 NR_149117 LINC02533 - long intergenic non-protein coding RNA 2533 ncRNA 280-20 chr2 35900451 35900610 + 2 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 429125 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 370-14 chr18 12164560 12164788 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -36105 NR_049896 497259 Hs.451609 NR_049896 C18orf61 - uncharacterized LOC497259 ncRNA 315-7 chr12 16335544 16335842 + 2 NA Intergenic Intergenic -11449 NM_145792 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 349.666-3 chr10 49101314 49101593 + 2 NA TTS (NM_144984) TTS (NM_144984) 14069 NM_001031746 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 299.333-29 chr15 94890284 94890480 + 2 NA Intergenic Intergenic 35019 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 272-38 chr5 3798401 3798558 + 2 NA Intergenic Intergenic 202647 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 313-22 chr21 30703319 30703516 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 15360 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 467.333-9 chr6 165343463 165343947 + 2 NA intron (NM_006661, intron 19 of 22) intron (NM_006661, intron 19 of 22) -34100 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 305-7 chr17 22243849 22244118 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 40988 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 198.333-88 chr19 18107321 18107485 + 2 NA intron (NM_015016, intron 1 of 26) L2b|LINE|L2 -8587 NM_001290024 3594 Hs.567294 NM_005535 ENSG00000096996 IL12RB1 CD212|IL-12R-BETA1|IL12RB|IMD30 interleukin 12 receptor subunit beta 1 protein-coding 255-50 chr21 21973523 21973772 + 2 NA Intergenic Intergenic 124812 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 246-55 chr2 221283959 221284165 + 2 NA Intergenic Intergenic 288242 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 332.666-24 chr5 27593581 27593853 + 2 NA Intergenic Intergenic 121425 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 290 chr1 87412993 87413238 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -41460 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 410-16 chr7 95194746 95195201 + 2 NA intron (NM_017650, intron 5 of 15) L1ME2|LINE|L1 129559 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 417.333-13 chr6 56142329 56142907 + 2 NA intron (NR_134849, intron 10 of 29) intron (NR_134849, intron 10 of 29) -50956 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 582.667 chr12 13017383 13017746 + 2 NA intron (NR_149067, intron 2 of 2) intron (NR_149067, intron 2 of 2) 17122 NR_002774 93164 Hs.593282 NR_002774 ENSG00000183935 HTR7P1 HTR7P 5-hydroxytryptamine receptor 7 pseudogene 1 pseudo 275.667-33 chr2 199793357 199793514 + 2 NA intron (NM_001350855, intron 3 of 3) intron (NM_001350855, intron 3 of 3) 57738 NM_001350853 348751 Hs.734578 NM_001350853 ENSG00000226124 FTCDNL1 FONG formiminotransferase cyclodeaminase N-terminal like protein-coding 303.334-4 chr14 62975189 62975446 + 2 NA intron (NM_139318, intron 6 of 10) intron (NM_139318, intron 6 of 10) 70141 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 274-3 chr10 76449446 76449658 + 2 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -438492 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 330.667 chr1 177924422 177924688 + 2 NA Intergenic Intergenic 45367 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 279.667-20 chr17 71178265 71178557 + 2 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) intron (NR_104152, intron 2 of 3) 23768 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 255.666-2 chr1 147217574 147217969 + 2 NA intron (NM_001461, intron 2 of 8) intron (NM_001461, intron 2 of 8) 7568 NM_001461 2330 Hs.642706 NM_001461 ENSG00000131781 FMO5 - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 5 protein-coding 174.667-24 chr10 47213367 47213532 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -86748 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 368.333-2 chr10 109245913 109246219 + 2 NA Intergenic Intergenic 677180 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 299.333-52 chr22 34392562 34392719 + 2 NA Intergenic Intergenic -469752 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 308.666-13 chr3 117129281 117129490 + 2 NA Intergenic Intergenic 207954 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 332-11 chr14 51086446 51086772 + 2 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 9095 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 191.667-4 chr1 74613822 74613994 + 2 NA intron (NM_001002912, intron 8 of 14) intron (NM_001002912, intron 8 of 14) 24173 NR_121670 101927320 Hs.662589 NR_121670 ENSG00000234497 ERICH3-AS1 - ERICH3 antisense RNA 1 ncRNA 284.334-15 chr8 78051731 78051920 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -464515 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 359.333-19 chr5 27176951 27177145 + 2 NA Intergenic Intergenic -138462 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 320-25 chr2 86496548 86496899 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 55262 NM_001146688 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 306.666-21 chr3 142234083 142234376 + 2 NA Intergenic Intergenic -8644 NR_033289 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 526-2 chr2 144776727 144777135 + 2 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) intron (NR_033870, intron 2 of 4) 108964 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 289.333-24 chr18 65894685 65894943 + 2 NA Intergenic Intergenic 143802 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 459.667 chr3 107186054 107186350 + 2 NA intron (NR_028303, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu 54436 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 416.333-9 chr3 28830280 28830667 + 2 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 255195 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 354-13 chr2 18474516 18474775 + 2 NA Intergenic Intergenic 86008 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 276-5 chr1 103202192 103202536 + 2 NA Intergenic Intergenic -93842 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 311-25 chr4 35971870 35972101 + 2 NA Intergenic Intergenic 271954 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 511.334 chr10 6898419 6899020 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 119121 NR_038291 100507127 Hs.498571 NR_038291 ENSG00000238266 LINC00707 - long intergenic non-protein coding RNA 707 ncRNA 255.334-30 chr8 122539980 122540163 + 2 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 28573 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 305.333-10 chr10 89006208 89006363 + 2 NA intron (NR_028034, intron 2 of 5) intron (NR_028034, intron 2 of 5) -13310 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 368.667-4 chr18 10335860 10336210 + 2 NA Intergenic Intergenic 78335 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 271.334-6 chr11 77265243 77265432 + 2 NA intron (NM_182833, intron 10 of 16) L2|LINE|L2 36329 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 345.667-4 chr11 26123377 26123651 + 2 NA Intergenic Intergenic -65609 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 314-12 chr14 66769177 66769426 + 2 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 261894 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 422.666-7 chr7 11147661 11148046 + 2 NA intron (NR_033436, intron 16 of 16) L2a|LINE|L2 173981 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 284-16 chr14 69790673 69790851 + 2 NA intron (NM_003049, intron 1 of 4) L1ME3C|LINE|L1 6479 NM_003049 6554 Hs.952 NM_003049 ENSG00000100652 SLC10A1 NTCP solute carrier family 10 member 1 protein-coding 403-6 chr3 111980261 111980617 + 2 NA intron (NR_073571, intron 1 of 2) intron (NR_073571, intron 1 of 2) 1413 NR_073570 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 362-24 chr7 29242100 29242308 + 2 NA intron (NM_001293072, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR -33234 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 324.667-11 chr15 86910221 86910492 + 2 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) L2b|LINE|L2 -22524 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 673.667 chr8 121045420 121046017 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -233672 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 300-2 chr1 77117974 77118137 + 2 NA intron (NM_005482, intron 10 of 10) L1M5|LINE|L1 57912 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 395-16 chr3 42967680 42968009 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -11467 NM_001129908 729085 Hs.729533 NM_001129908 ENSG00000144649 GASK1A C3orf41|FAM198A golgi associated kinase 1A protein-coding 286-13 chr14 42688675 42688895 + 2 NA Intergenic Intergenic 1081929 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 219.333-162 chr7 2751636 2751814 + 2 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) L1MEf|LINE|L1 11415 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 317.667-37 chr6 169594449 169594812 + 2 NA intron (NM_182552, intron 23 of 25) L1M8|LINE|L1 107399 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 512.333-2 chr14 42769529 42769996 + 2 NA Intergenic Intergenic 1162906 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 404.667-6 chr5 30420082 30420552 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 539757 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 312-51 chr7 22977743 22977979 + 2 NA intron (NM_032581, intron 4 of 10) intron (NM_032581, intron 4 of 10) 36269 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 344-11 chr13 68140885 68141079 + 2 NA Intergenic Intergenic 744343 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 312.667-9 chr10 95243512 95243709 + 2 NA intron (NM_020992, intron 5 of 6) intron (NM_020992, intron 5 of 6) 47393 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 374.666-6 chr3 18086731 18087100 + 2 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) UCON89|DNA|hAT? 124363 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 347.333-15 chr21 32230266 32230453 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 48690 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 297.333-26 chr16 60413855 60414085 + 2 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -54177 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 246-92 chr6 102836806 102836965 + 2 NA Intergenic Intergenic 1437900 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 299.334-5 chr2 40327096 40327355 + 2 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) L1ME4c|LINE|L1 103079 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 298-44 chr2 40644069 40644254 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -131726 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 297.333-36 chr20 15475052 15475315 + 2 NA intron (NM_001351663, intron 7 of 17) MER2|DNA|TcMar-Tigger 278343 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 286-29 chr2 101017741 101017943 + 2 NA intron (NM_001102426, intron 17 of 19) Charlie17|DNA|hAT-Charlie 15553 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 304-25 chr18 74306655 74306816 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -9104 NM_001174123 644041 Hs.465414 NM_001174123 ENSG00000206043 C18orf63 DKFZP781G0119 chromosome 18 open reading frame 63 protein-coding 258.666-44 chr8 17241530 17241738 + 2 NA intron (NM_001322093, intron 3 of 7) intron (NM_001322093, intron 3 of 7) 4824 NM_001322089 29883 Hs.587465 NM_013354 ENSG00000198791 CNOT7 CAF-1|CAF1|Caf1a|hCAF-1 CCR4-NOT transcription complex subunit 7 protein-coding 407.667-9 chr5 8524872 8525085 + 2 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL 64053 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 305-28 chr7 25869372 25869534 + 2 NA Intergenic Intergenic -79334 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 304-24 chr18 71344864 71345098 + 2 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 233975 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 305.333-57 chr5 40371945 40372248 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -307819 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 266.667-16 chr11 83569126 83569421 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) intron (NM_001142699, intron 19 of 27) 113152 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 317.334-6 chr4 88612432 88612682 + 2 NA intron (NM_001318505, intron 3 of 8) intron (NM_001318505, intron 3 of 8) 20077 NM_014606 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 329.333-33 chr3 87792880 87793199 + 2 NA 5' UTR (NM_001322208, exon 1 of 3) 5' UTR (NM_001322208, exon 1 of 3) 333 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 297.333-21 chr14 74109903 74110141 + 2 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) L1MB8|LINE|L1 25069 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 259.667-52 chr4 43921629 43921780 + 2 NA Intergenic Intergenic -95157 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 306.666-8 chr15 50503805 50504053 + 2 NA 3' UTR (NM_001283049, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001283049, exon 17 of 17) 42737 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 259-20 chr17 8325960 8326149 + 2 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 -13786 NM_153007 146852 Hs.186045 NM_153007 ENSG00000184650 ODF4 CT134|CT136|OPPO1 outer dense fiber of sperm tails 4 protein-coding 366.667-13 chr4 116231379 116231621 + 2 NA Intergenic Intergenic -68225 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 434.333-5 chr4 113348194 113348664 + 2 NA intron (NM_001354275, intron 36 of 43) intron (NM_001354275, intron 36 of 43) 55590 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 303-4 chr1 111633877 111634108 + 2 NA intron (NM_001010935, intron 2 of 8) intron (NM_001010935, intron 2 of 8) -13594 NR_160737 107985184 NR_160737 LOC107985184 - uncharacterized LOC107985184 ncRNA 292-41 chr5 25933172 25933342 + 2 NA Intergenic Intergenic 742304 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 308.333-8 chr10 82661008 82661265 + 2 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -428216 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 298-18 chr12 15687615 15687935 + 2 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) intron (NM_004447, intron 1 of 20) 101613 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 211.333-207 chr6 64236944 64237197 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) L1ME3G|LINE|L1 430234 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 337-24 chr7 7678130 7678298 + 2 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) L1MA3|LINE|L1 37462 NM_001302348 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 342.334-2 chr12 29109486 29109819 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -39626 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 341.333-31 chr8 117715749 117715972 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 195147 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 529.667-2 chr11 117239249 117240018 + 2 NA intron (NM_001077239, intron 3 of 14) intron (NM_001077239, intron 3 of 14) 6897 NM_001077239 257160 Hs.591934 NM_207343 ENSG00000167257 RNF214 - ring finger protein 214 protein-coding 275.333-19 chr12 108073888 108074096 + 2 NA Intergenic MER131|DNA?|DNA? -55296 NM_014653 9671 Hs.143591 NM_014653 ENSG00000075035 WSCD2 - WSC domain containing 2 protein-coding 288-8 chr1 188058150 188058390 + 2 NA Intergenic Intergenic 614642 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 352.333-12 chr2 120889706 120890005 + 2 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) L1MD2|LINE|L1 97574 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 336-9 chr14 64697827 64698006 + 2 NA Intergenic Intergenic -6508 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 375.333-23 chr5 5541507 5541833 + 2 NA Intergenic Intergenic 118993 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 342.333-12 chr18 66382777 66383104 + 2 NA Intergenic Intergenic 221150 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 269.333-25 chr16 11701566 11701775 + 2 NA intron (NR_136673, intron 4 of 9) L1ME3G|LINE|L1 33215 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 383-7 chr3 85168438 85168876 + 2 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -106393 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 344.667-20 chr7 55841041 55841340 + 2 NA intron (NM_207366, intron 5 of 9) AluSx1|SINE|Alu 21562 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 244-10 chr1 166750806 166750964 + 2 NA Intergenic Intergenic -88590 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 376.667-8 chr22 27835297 27835606 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -33695 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 320-18 chr15 95301170 95301405 + 2 NA intron (NR_034095, intron 1 of 3) intron (NR_034095, intron 1 of 3) 25813 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 572.667 chr15 68959837 68960522 + 2 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) intron (NM_001184780, intron 1 of 15) 29654 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 423.333-7 chr16 75889072 75889417 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -162754 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 341.333-24 chr5 84184554 84184861 + 2 NA intron (NM_001278642, intron 2 of 9) LTR85b|LTR|Gypsy? 200160 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 371.667-3 chr14 57184664 57185001 + 2 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 84073 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 507.333 chr2 8984507 8984811 + 2 NA intron (NR_135603, intron 1 of 13) intron (NR_135603, intron 1 of 13) 19025 NM_001321265 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 339.333-45 chr7 89723050 89723319 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -396216 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 297.333-43 chr4 63489470 63489685 + 2 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 919873 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 267-25 chr15 34616224 34616379 + 2 NA Intergenic Intergenic -32731 NR_027410 440270 Hs.720151 NM_001023567 ENSG00000215252 GOLGA8B GOLGA5 golgin A8 family member B protein-coding 702.334 chr7 3307249 3307991 + 2 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 6368 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 258-49 chr3 192573080 192573330 + 2 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 58183 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 245-8 chr10 75717901 75718050 + 2 NA intron (NR_132791, intron 1 of 2) intron (NR_132791, intron 1 of 2) 5520 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 262-82 chr8 122061149 122061360 + 2 NA Intergenic Intergenic -419814 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 280.667 chr1 29028378 29028556 + 2 NA intron (NM_001166007, intron 7 of 17) intron (NM_001166007, intron 7 of 17) 94034 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 305.334-5 chr18 3959473 3959698 + 2 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) AluSz|SINE|Alu -2768 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 387-3 chr10 96276674 96276882 + 2 NA Intergenic Intergenic -5202 NM_001114094 29760 Hs.665244 NM_013314 ENSG00000095585 BLNK AGM4|BASH|BLNK-S|LY57|SLP-65|SLP65|bca B cell linker protein-coding 459.334 chr13 95974451 95974696 + 2 NA intron (NM_020121, intron 10 of 38) intron (NM_020121, intron 10 of 38) 78828 NM_020121 55757 Hs.193226 NM_020121 ENSG00000102595 UGGT2 HUGT2|UGCGL2|UGT2 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 2 protein-coding 316-53 chr8 132847796 132848088 + 2 NA non-coding (NR_156424, exon 19 of 19) non-coding (NR_156424, exon 19 of 19) -19016 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 342.333-6 chr14 55032361 55032721 + 2 NA intron (NM_199421, intron 2 of 2) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 5305 NM_199421 122809 Hs.744302 NM_080867 ENSG00000180008 SOCS4 SOCS7 suppressor of cytokine signaling 4 protein-coding 359-4 chr13 82279476 82279747 + 2 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -1052628 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 345.333-31 chr4 47966096 47966401 + 2 NA intron (NR_125879, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 15285 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 340-4 chr1 239221516 239221789 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -164916 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 345.334-4 chr2 32015497 32015769 + 2 NA intron (NM_001321210, intron 5 of 5) AluJo|SINE|Alu -4625 NR_126034 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 289.333-68 chr9 88158823 88159101 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -20481 NM_001350978 645961 Hs.632070 NM_001166137 SPATA31C2 FAM75C2 SPATA31 subfamily C member 2 protein-coding 272.667-39 chr21 27660333 27660571 + 2 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -61927 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 314.667-27 chr22 18045981 18046208 + 2 NA Intergenic Intergenic 16709 NR_024417 100192420 Hs.589947 NR_024417 ENSG00000235295 LINC01634 - long intergenic non-protein coding RNA 1634 ncRNA 365.333-21 chr5 58815190 58815591 + 2 NA intron (NM_138453, intron 3 of 4) MIR3|SINE|MIR 184508 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 498.667-3 chr6 73585890 73586312 + 2 NA Intergenic Intergenic -65069 NM_001402 1915 Hs.535192 NM_001402 ENSG00000156508 EEF1A1 CCS-3|CCS3|EE1A1|EEF-1|EEF1A|EF-Tu|EF1A|GRAF-1EF|HNGC:16303|LENG7|PTI1|eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 protein-coding 359-15 chr5 59054405 59054761 + 2 NA intron (NM_006203, intron 5 of 14) (ATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15107 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 379-11 chr5 16765723 16766067 + 2 NA intron (NM_012334, intron 11 of 40) intron (NM_012334, intron 11 of 40) -148837 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 747 chr1 165511108 165511747 + 2 NA intron (NR_026744, intron 4 of 6) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -32814 NM_001005214 440699 Hs.664975 NM_001005214 ENSG00000162763 LRRC52 - leucine rich repeat containing 52 protein-coding 299-38 chr8 34167387 34167656 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -567415 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 315-19 chr3 13624740 13624975 + 2 NA intron (NM_001004019, intron 9 of 17) intron (NM_001004019, intron 9 of 17) 6476 NR_132775 106635526 NR_132775 SNORA93 - small nucleolar RNA, H/ACA box 93 snoRNA 296 chr1 22520570 22520746 + 2 NA intron (NM_001083621, intron 15 of 18) intron (NM_001083621, intron 15 of 18) -42831 NM_001006943 2046 Hs.283613 NM_020526 ENSG00000070886 EPHA8 EEK|EK3|HEK3 EPH receptor A8 protein-coding 349.667-11 chr19 51843508 51843894 + 2 NA intron (NR_163433, intron 6 of 11) intron (NR_163433, intron 6 of 11) 44235 NM_001135590 84765 Hs.723015 NM_032679 ENSG00000161551 ZNF577 - zinc finger protein 577 protein-coding 288-14 chr10 118118339 118118525 + 2 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) intron (NR_026940, intron 3 of 3) -71491 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 464.667 chr14 60227479 60227907 + 2 NA Intergenic Intergenic -18057 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 318-50 chr7 77289013 77289194 + 2 NA intron (NM_020879, intron 17 of 18) intron (NM_020879, intron 17 of 18) -89284 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 437.667-4 chr16 24578698 24579027 + 2 NA Intergenic Intergenic -31343 NM_001351850 27327 Hs.655057 NM_014494 ENSG00000090905 TNRC6A CAGH26|FAME6|GW1|GW182|TNRC6 trinucleotide repeat containing adaptor 6A protein-coding 344.334-2 chr1 194329941 194330149 + 2 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 1025300 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 330-12 chr12 58829239 58829404 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -47605 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 347.333-14 chr20 8401808 8402115 + 2 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) L1M5|LINE|L1 153257 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 359.333-4 chr11 130497291 130497649 + 2 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 48496 NM_139055 170689 Hs.534221 NM_139055 ENSG00000166106 ADAMTS15 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 15 protein-coding 297-8 chr10 25301286 25301576 + 2 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) L3|LINE|CR1 -125155 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 308-36 chr4 40476673 40476928 + 2 NA intron (NM_001098634, intron 2 of 6) intron (NM_001098634, intron 2 of 6) 25319 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 297.334-6 chr14 57524401 57524601 + 2 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -30644 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 266-41 chr2 74324660 74324868 + 2 NA intron (NM_133478, intron 5 of 30) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -9739 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 353.333-33 chr7 8545188 8545538 + 2 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 111754 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 312-7 chr10 17213193 17213431 + 2 NA TTS (NR_108060) TTS (NR_108060) -11241 NM_001351223 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 303.333-2 chr1 29026685 29026861 + 2 NA intron (NM_001166007, intron 7 of 17) AluJr|SINE|Alu 95728 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 406-9 chr3 62786853 62787293 + 2 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) AluJb|SINE|Alu 88343 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 293-32 chr5 24223879 24224036 + 2 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 272609 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 572.001 chr12 80720194 80720747 + 2 NA TTS (NM_005593) TTS (NM_005593) 3558 NM_005593 4617 Hs.178023 NM_005593 ENSG00000111049 MYF5 EORVA|bHLHc2 myogenic factor 5 protein-coding 296-12 chr11 29286008 29286184 + 2 NA Intergenic Intergenic -308317 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 182-63 chr22 35661680 35661822 + 2 NA 3' UTR (NM_030641, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_030641, exon 3 of 3) 13305 NM_030641 80830 Hs.257352 NM_030641 ENSG00000221963 APOL6 APOL-VI|APOLVI apolipoprotein L6 protein-coding 345.667-8 chr15 86745595 86745949 + 2 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -187108 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 317-20 chr4 86825461 86825622 + 2 NA exon (NM_197965, exon 5 of 6) exon (NM_197965, exon 5 of 6) 23843 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 391-11 chr22 17200297 17200595 + 2 NA promoter-TSS (NM_177405) promoter-TSS (NM_177405) -791 NM_177405 51816 Hs.170310 NM_017424 ENSG00000093072 ADA2 ADGF|CECR1|IDGFL|PAN|SNEDS|VAIHS adenosine deaminase 2 protein-coding 277.333-12 chr10 117294400 117294661 + 2 NA intron (NM_173791, intron 3 of 4) L1MA6|LINE|L1 53416 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 358.667-22 chr3 98986769 98987023 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -85201 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 243.333-20 chr12 112236581 112236731 + 2 NA intron (NM_001109662, intron 35 of 75) intron (NM_001109662, intron 35 of 75) -73335 NR_106921 102465519 NR_106921 ENSG00000283793 MIR6861 hsa-mir-6861 microRNA 6861 ncRNA 488-5 chr4 169417723 169418161 + 2 NA intron (NM_001199400, intron 28 of 32) L1MEc|LINE|L1 -146986 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 359.333-23 chr6 69806076 69806320 + 2 NA Intergenic Intergenic -9188 NM_018368 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 303-41 chr5 77453905 77454126 + 2 NA intron (NM_018268, intron 5 of 12) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 38301 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 282-28 chr2 109002552 109002739 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13425 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 250-10 chr10 22721173 22721325 + 2 NA Intergenic Intergenic -6671 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 407.333-24 chr8 117034400 117034718 + 2 NA intron (NM_001172813, intron 2 of 10) MIR|SINE|MIR 83584 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 298-21 chr12 118442240 118442412 + 2 NA Intergenic Intergenic 65771 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 364 chr11 46325742 46325969 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7071 NM_201532 8525 Hs.502461 NM_003646 ENSG00000149091 DGKZ DAGK5|DAGK6|DGK-ZETA|hDGKzeta diacylglycerol kinase zeta protein-coding 396-7 chr2 77308269 77308634 + 2 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 213925 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 315-31 chr9 25245174 25245454 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 433544 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 431.333-5 chr2 68147843 68148324 + 2 NA intron (NR_046234, intron 1 of 6) intron (NR_046234, intron 1 of 6) 9444 NR_046234 116143 Hs.631877 NM_138458 ENSG00000243667 WDR92 - WD repeat domain 92 protein-coding 279-25 chr4 111813068 111813217 + 2 NA Intergenic Intergenic -332312 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 327.333 chr1 20880394 20880642 + 2 NA intron (NM_003760, intron 14 of 31) AluSz6|SINE|Alu -93830 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 587.332-3 chr4 101009927 101010321 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 230748 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 323.667-7 chr14 20127234 20127511 + 2 NA Intergenic Intergenic 9904 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 350-16 chr2 178046110 178046409 + 2 NA intron (NM_001077197, intron 2 of 20) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 26518 NM_016953 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 144-106 chr3 50715953 50716099 + 2 NA intron (NM_004947, intron 1 of 52) intron (NM_004947, intron 1 of 52) 40946 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 336.667-21 chr6 70703101 70703271 + 2 NA intron (NM_001281440, intron 1 of 10) AluSx1|SINE|Alu 34656 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 318-13 chr12 3986030 3986269 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -112701 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 305-11 chr2 30048228 30048419 + 2 NA Intergenic UCON74|DNA?|DNA? -98684 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 444.333-8 chr7 95930573 95930925 + 2 NA intron (NM_004411, intron 6 of 16) intron (NM_004411, intron 6 of 16) 158243 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 215-40 chr2 129543565 129543743 + 2 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -269763 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 294-34 chr2 189670705 189670867 + 2 NA TTS (NM_001353497) TTS (NM_001353497) -5199 NM_144708 150709 Hs.60772 NM_144708 ENSG00000151687 ANKAR - ankyrin and armadillo repeat containing protein-coding 685.999 chr1 57056064 57056606 + 2 NA intron (NM_001353986, intron 9 of 14) AluJr4|SINE|Alu -90195 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 340.666-21 chr9 22528188 22528527 + 2 NA Intergenic Intergenic 81533 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 302-12 chr11 58185972 58186255 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4321 NM_001005283 219957 Hs.553643 NM_001005283 ENSG00000186513 OR9Q2 OR9Q2P olfactory receptor family 9 subfamily Q member 2 protein-coding 250.667-83 chr8 131888812 131888984 + 2 NA Intergenic Intergenic -15195 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 294-13 chr11 5865792 5866072 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -8230 NM_001005168 390079 Hs.553738 NM_001005168 ENSG00000183269 OR52E8 OR11-54 olfactory receptor family 52 subfamily E member 8 protein-coding 355-20 chr22 34722163 34722487 + 2 NA Intergenic Intergenic 275591 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 304-22 chr17 50701790 50702050 + 2 NA intron (NM_052855, intron 1 of 4) intron (NM_052855, intron 1 of 4) 5994 NM_052855 91369 Hs.463426 NM_052855 ENSG00000154945 ANKRD40 - ankyrin repeat domain 40 protein-coding 587.001 chr1 54661395 54661733 + 2 NA intron (NR_037639, intron 4 of 32) L2a|LINE|L2 19778 NM_001039464 374977 Hs.412482 NM_198547 ENSG00000184313 MROH7 C1orf175|HEATR8 maestro heat like repeat family member 7 protein-coding 393.333-6 chr10 125156336 125156701 + 2 NA intron (NM_001290214, intron 1 of 10) intron (NM_001290214, intron 1 of 10) 2259 NM_001321013 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 344-54 chrX 32384353 32384712 + 2 NA intron (NM_000109, intron 33 of 78) intron (NM_000109, intron 33 of 78) 27696 NM_004012 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 417.333-9 chr4 96305293 96305526 + 2 NA Intergenic Intergenic -5294 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 267-57 chr6 98671239 98671425 + 2 NA Intergenic Intergenic 160368 NR_148381 105447646 Hs.211213 NR_148381 PNKY - long intergenic non-protein coding RNA PNKY ncRNA 501.333-4 chr2 7411322 7411743 + 2 NA Intergenic Intergenic -9729 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 400-5 chr12 68462788 68463197 + 2 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -11508 NR_120458 100507195 Hs.450772 NR_120458 ENSG00000251301 LINC02384 - long intergenic non-protein coding RNA 2384 ncRNA 320.666-3 chr10 26370564 26370813 + 2 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -67653 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 284-48 chr5 118836171 118836339 + 2 NA 3' UTR (NM_173666, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_173666, exon 6 of 6) -138331 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 370.667-31 chr9 26161948 26162391 + 2 NA Intergenic Intergenic 95494 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 404.666-15 chr8 132809560 132809923 + 2 NA intron (NM_198513, intron 7 of 7) intron (NM_198513, intron 7 of 7) 34353 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 347.666-10 chr3 134259362 134259662 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -8768 NM_001005861 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 594.333-3 chr16 78200899 78201512 + 2 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 101551 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 362.333-16 chr7 108042049 108042324 + 2 NA intron (NM_001318046, intron 29 of 33) intron (NM_001318046, intron 29 of 33) -39025 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 360.667-17 chr9 81171809 81172021 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 517620 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 303-25 chr17 64098219 64098465 + 2 NA intron (NM_001433, intron 1 of 21) MIR3|SINE|MIR 31802 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 328-30 chr5 21204274 21204490 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -255098 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 285.334-8 chr2 184841756 184841982 + 2 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 243340 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 525.333 chr1 60315918 60316369 + 2 NA Intergenic Intergenic -242373 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 311.334-7 chr5 149081560 149081800 + 2 NA intron (NR_122044, intron 2 of 2) L1MA9|LINE|L1 18363 NR_122044 255187 Hs.149321 NR_122044 ENSG00000250072 SH3TC2-DT - SH3TC2 divergent transcript ncRNA 275-50 chr7 135079133 135079281 + 2 NA intron (NR_144293, intron 8 of 10) intron (NR_144293, intron 8 of 10) -68865 NM_018295 55281 Hs.521213 NM_018295 ENSG00000146859 TMEM140 - transmembrane protein 140 protein-coding 365.667-3 chr10 61504715 61505026 + 2 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 24829 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 320.667-29 chr7 15652736 15653004 + 2 NA intron (NM_005924, intron 1 of 2) L1MD1|LINE|L1 -15077 NR_134258 105375166 Hs.658822 NR_134258 ENSG00000237070 LOC105375166 - uncharacterized LOC105375166 ncRNA 312.666-6 chr12 40151185 40151484 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -4905 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 189.667-45 chr14 67748714 67748879 + 2 NA intron (NM_015346, intron 41 of 41) intron (NM_015346, intron 41 of 41) 46910 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 317.333-24 chr2 119541815 119541981 + 2 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -2534 NR_073133 200373 Hs.496753 NM_001029996 ENSG00000163075 CFAP221 FAP221|PCDP1 cilia and flagella associated protein 221 protein-coding 327-15 chr2 222548348 222548614 + 2 NA intron (NM_152386, intron 4 of 4) intron (NM_152386, intron 4 of 4) 107611 NR_130154 10056 Hs.471452 NM_005687 ENSG00000116120 FARSB FARSLB|FRSB|HSPC173|NEDBLLA|PheHB|PheRS|RILDBC phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta protein-coding 460 chr10 21933523 21933904 + 2 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 70017 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 300-30 chr2 73412087 73412268 + 2 NA intron (NM_015120, intron 2 of 22) L1MD3|LINE|L1 26419 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 345.333-24 chr3 16268026 16268210 + 2 NA intron (NM_001330670, intron 1 of 8) intron (NM_001330670, intron 1 of 8) 2906 NM_138381 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 183.667-4 chr1 81399347 81399582 + 2 NA intron (NM_001366003, intron 2 of 27) L1MA5|LINE|L1 93069 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 702 chr15 35995039 35995429 + 2 NA Intergenic Intergenic 68378 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 307.333-26 chr14 47071465 47071729 + 2 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) intron (NM_001113498, intron 6 of 16) 271649 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 339.333-33 chr3 171900520 171900788 + 2 NA promoter-TSS (NR_046852) promoter-TSS (NR_046852) 86 NR_046852 100874219 Hs.730556 NR_046852 ENSG00000234717 TMEM212-AS1 - TMEM212 antisense RNA 1 ncRNA 314-11 chr14 38941918 38942093 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -25123 NR_039982 283547 Hs.675941 NR_039982 ENSG00000259070 LINC00639 - long intergenic non-protein coding RNA 639 ncRNA 337.333-41 chr6 62486580 62486826 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -200476 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 350-29 chr5 124950012 124950318 + 2 NA Intergenic Intergenic -86666 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 267-43 chr2 228236313 228236571 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -54755 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 291.333-57 chr5 133749509 133749686 + 2 NA Intergenic Intergenic -137056 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 274-61 chr9 73281656 73281872 + 2 NA Intergenic Intergenic 129899 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 268-5 chr1 197342202 197342358 + 2 NA intron (NM_001193640, intron 2 of 9) intron (NM_001193640, intron 2 of 9) 74028 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 256.667-48 chr2 172570411 172570623 + 2 NA intron (NM_002610, intron 7 of 10) intron (NM_002610, intron 7 of 10) 14427 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 537.333-3 chr16 47083920 47084282 + 2 NA intron (NM_001201477, intron 8 of 8) intron (NM_001201477, intron 8 of 8) 59844 NM_018092 81831 Hs.645802 NM_018092 ENSG00000171208 NETO2 BTCL2|NEOT2 neuropilin and tolloid like 2 protein-coding 341.667-5 chr12 37368245 37368504 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -948400 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 345.334-7 chr2 116343069 116343379 + 2 NA Intergenic Intergenic 999409 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 265-66 chr8 126069510 126069732 + 2 NA Intergenic Intergenic -118424 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 441 chr1 108608408 108609057 + 2 NA intron (NM_001010883, intron 3 of 10) intron (NM_001010883, intron 3 of 10) 48632 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 352.667-12 chr15 60304213 60304488 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 93636 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 277.333-74 chr5 84329433 84329702 + 2 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 55300 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 602-2 chr2 65088693 65089410 + 2 NA exon (NM_004161, exon 5 of 6) exon (NM_004161, exon 5 of 6) 32635 NM_001319100 23177 Hs.709257 NM_015147 ENSG00000011523 CEP68 KIAA0582 centrosomal protein 68 protein-coding 775.666 chr5 71778657 71779429 + 2 NA Intergenic Intergenic 59768 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 713.666 chr17 71379607 71380237 + 2 NA Intergenic Intergenic -177743 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 319-18 chr3 195376888 195377090 + 2 NA intron (NM_012287, intron 4 of 22) intron (NM_012287, intron 4 of 22) 66031 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 317.333-39 chr7 107979183 107979397 + 2 NA intron (NM_002291, intron 8 of 33) intron (NM_002291, intron 8 of 33) 23871 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 301.333-40 chr4 150763401 150763662 + 2 NA intron (NM_001367550, intron 34 of 56) intron (NM_001367550, intron 34 of 56) 181380 NM_006439 10586 Hs.584852 NM_006439 ENSG00000181541 MAB21L2 MCOPS14|MCSKS14 mab-21 like 2 protein-coding 214-16 chr10 59299199 59299412 + 2 NA intron (NM_001347852, intron 5 of 12) intron (NM_001347852, intron 5 of 12) 63244 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 477.333-4 chr4 154825156 154825522 + 2 NA intron (NM_001277171, intron 5 of 5) intron (NM_001277171, intron 5 of 5) 43834 NM_001277173 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 332.333-10 chr12 2717760 2718077 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -26761 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 320.666-16 chr8 66896778 66897080 + 2 NA exon (NM_001136161, exon 12 of 13) exon (NM_001136161, exon 12 of 13) 25427 NM_001136160 157777 Hs.437006 NM_173518 ENSG00000178460 MCMDC2 C8orf45 minichromosome maintenance domain containing 2 protein-coding 117-98 chr3 191809635 191809727 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 348518 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 307.667-28 chr3 189646513 189646773 + 2 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) intron (NM_003722, intron 1 of 13) 15254 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 428-3 chr14 56081649 56081955 + 2 NA Intergenic Intergenic -36609 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 331.667-2 chr11 96958865 96959074 + 2 NA Intergenic Intergenic 450544 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 180.667-84 chr21 19746377 19746630 + 2 NA Intergenic Intergenic 153252 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 285.667-8 chr12 10733750 10733901 + 2 NA Intergenic Intergenic -10502 NM_001145426 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 316-19 chr16 55471887 55472052 + 2 NA Intergenic Intergenic -6861 NM_001302508 4313 Hs.513617 NM_004530 ENSG00000087245 MMP2 CLG4|CLG4A|MMP-2|MMP-II|MONA|TBE-1 matrix metallopeptidase 2 protein-coding 483.999 chr1 211401863 211402159 + 2 NA intron (NR_026761, intron 4 of 5) L1MA3|LINE|L1 19256 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 302-53 chr5 36936540 36936812 + 2 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) L1MC5a|LINE|L1 59907 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 297.667-40 chr8 127012614 127012821 + 2 NA promoter-TSS (NR_045262) promoter-TSS (NR_045262) -437 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 546-2 chr8 133016058 133016799 + 2 NA intron (NM_003235, intron 37 of 47) MER20|DNA|hAT-Charlie 30153 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 312-54 chr8 13606278 13606536 + 2 NA Intergenic Intergenic -1787 NM_001348081 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 305.333-48 chr3 155391920 155392091 + 2 NA Intergenic Intergenic -93798 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 363.667-10 chr4 89929891 89930375 + 2 NA intron (NM_001371403, intron 6 of 8) intron (NM_001371403, intron 6 of 8) 35279 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 392-16 chr5 39661081 39661382 + 2 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 140800 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 357-17 chr4 31360588 31361002 + 2 NA Intergenic Intergenic -145749 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 177-71 chr6 120809739 120809895 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 524663 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 386.667-10 chr7 49725036 49725337 + 2 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -48452 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 196-64 chr16 58774076 58774203 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -39823 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 274-45 chr5 11097441 11097611 + 2 NA intron (NM_001364128, intron 12 of 19) intron (NM_001364128, intron 12 of 19) -336292 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 355.333-4 chr11 21707400 21707606 + 2 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -485582 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 276.666-13 chr15 90676756 90676984 + 2 NA intron (NR_120372, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 16636 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 321.333-20 chr13 93047132 93047426 + 2 NA intron (NR_126360, intron 2 of 3) L1PA15-16|LINE|L1 1938 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 326-22 chr2 138303285 138303617 + 2 NA Intergenic Intergenic -198319 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 378.667-18 chr5 65669963 65670333 + 2 NA 3' UTR (NM_019072, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_019072, exon 11 of 11) 45121 NM_001365341 112441434 NM_001365341 SHLD3 CTC-534A2.2|RINN1 shieldin complex subunit 3 protein-coding 330.667-21 chr5 90569914 90570102 + 2 NA intron (NR_003149, intron 1 of 89) L1MB7|LINE|L1 11211 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 308.667-41 chr8 109818011 109818297 + 2 NA Intergenic Intergenic -126363 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 334-31 chr5 66690049 66690306 + 2 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR 93784 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 313-15 chr16 24963889 24964062 + 2 NA intron (NM_001006634, intron 7 of 19) intron (NM_001006634, intron 7 of 19) 51394 NM_001006634 55114 Hs.373793 NM_018054 ENSG00000140750 ARHGAP17 MST066|MST110|MSTP038|MSTP066|MSTP110|NADRIN|PP367|PP4534|RICH-1|RICH1|WBP15 Rho GTPase activating protein 17 protein-coding 208.334-3 chr5 131367144 131367383 + 2 NA intron (NM_001038702, intron 2 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 103254 NM_001038702 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 302.667-16 chr17 71299822 71300014 + 2 NA Intergenic Intergenic -97739 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 329.333-61 chr9 83743663 83743881 + 2 NA intron (NM_025211, intron 10 of 12) intron (NM_025211, intron 10 of 12) 35441 NR_135840 105376114 Hs.9589 NR_135839 ENSG00000254473 LOC105376114 - uncharacterized LOC105376114 ncRNA 400.666-4 chr17 73978791 73979217 + 2 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -150467 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 319.333-5 chr11 25928825 25929014 + 2 NA Intergenic Intergenic -260204 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 270.666-7 chr14 68834348 68834596 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -38229 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 297.334-10 chr5 94520646 94520865 + 2 NA exon (NM_173665, exon 5 of 5) exon (NM_173665, exon 5 of 5) 97849 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 326.333-38 chr9 7206526 7206765 + 2 NA Intergenic Intergenic 449295 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 282.333-12 chr14 54356829 54357091 + 2 NA Intergenic Intergenic -39908 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 517.334-2 chr15 75917721 75918188 + 2 NA intron (NM_012170, intron 5 of 5) intron (NM_012170, intron 5 of 5) 14076 NM_147188 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 593.333-4 chr5 38619873 38620304 + 2 NA intron (NR_103554, intron 2 of 8) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -24683 NM_002310 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 244-84 chr5 37617803 37618029 + 2 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 216906 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 292.333-8 chr10 92994186 92994407 + 2 NA intron (NM_001319195, intron 18 of 21) intron (NM_001319195, intron 18 of 21) -66502 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 418-2 chr12 14160538 14160776 + 2 NA Intergenic Mam_R4|LINE|Dong-R4 -180301 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 298.667-2 chr1 62443208 62443373 + 2 NA exon (NM_003368, exon 5 of 9) exon (NM_003368, exon 5 of 9) 6241 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 238-41 chr2 18234878 18235025 + 2 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 325702 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 511.667-2 chr16 51907713 51908133 + 2 NA Intergenic Intergenic 145404 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 293-43 chr8 71426701 71426914 + 2 NA intron (NM_001370336, intron 2 of 17) intron (NM_001370336, intron 2 of 17) -64738 NM_000503 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 287.333-35 chr3 839598 839826 + 2 NA intron (NR_110118, intron 2 of 3) intron (NR_110118, intron 2 of 3) 247607 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 296-34 chr2 222212246 222212521 + 2 NA intron (NM_181457, intron 7 of 7) intron (NM_181457, intron 7 of 7) -85764 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 339.333-22 chr2 61466814 61467133 + 2 NA intron (NM_014709, intron 1 of 79) intron (NM_014709, intron 1 of 79) 4114 NM_014709 9736 Hs.644708 NM_014709 ENSG00000115464 USP34 - ubiquitin specific peptidase 34 protein-coding 331.666-24 chr8 137495539 137495766 + 2 NA Intergenic Intergenic -82064 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 282.334-13 chr4 168249247 168249463 + 2 NA intron (NM_017631, intron 28 of 37) intron (NM_017631, intron 28 of 37) 69397 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 529 chr1 30693553 30693914 + 2 NA Intergenic Intergenic -25039 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 299-16 chr14 79139024 79139287 + 2 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -60827 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 299.333-51 chr22 31439327 31439561 + 2 NA TTS (NM_001164501) TTS (NM_001164501) 39840 NM_004147 4733 Hs.115242 NM_004147 ENSG00000185721 DRG1 NEDD3 developmentally regulated GTP binding protein 1 protein-coding 285-18 chr2 125551508 125551739 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 566362 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 716.333 chr5 42023698 42024580 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 98858 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 339-18 chr8 55144624 55145033 + 2 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) (TATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 42800 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 522-4 chr4 11206518 11207020 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -162058 NR_030298 693157 NR_030298 ENSG00000207716 MIR572 MIRN572|hsa-mir-572 microRNA 572 ncRNA 468-8 chr20 59811881 59812188 + 2 NA intron (NM_080672, intron 8 of 12) intron (NM_080672, intron 8 of 12) 90824 NM_183246 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 315.667-11 chr2 71254111 71254390 + 2 NA Intergenic Intergenic -27147 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 331-40 chr7 91259947 91260221 + 2 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -4349 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 297-40 chr5 33356957 33357216 + 2 NA Intergenic Intergenic -83610 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 308.334-3 chr10 33669607 33669895 + 2 NA Intergenic Intergenic 102929 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 338-8 chr14 48556086 48556364 + 2 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -761211 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 509.667-4 chr5 27694222 27694519 + 2 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 222078 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 266-68 chr5 45845311 45845486 + 2 NA Intergenic Intergenic -149018 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 280.667-56 chr8 77930618 77930841 + 2 NA Intergenic Intergenic 480032 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 338-9 chr14 59049356 59049586 + 2 NA Intergenic Intergenic -139196 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 196 chr1 8376746 8376936 + 2 NA intron (NM_001042681, intron 12 of 22) intron (NM_001042681, intron 12 of 22) 46991 NM_001042682 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 419.666-5 chr3 31518737 31519150 + 2 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -13982 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 246.666-20 chr2 40052497 40052643 + 2 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 134936 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 451.333-5 chr2 109099086 109099460 + 2 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 -29932 NM_001099289 344558 Hs.171244 NM_001099289 ENSG00000172985 SH3RF3 POSH2|SH3MD4 SH3 domain containing ring finger 3 protein-coding 403.334-2 chr10 79153182 79153590 + 2 NA intron (NM_020338, intron 3 of 24) MIR1_Amn|SINE|MIR 84420 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 335-9 chr16 11886300 11886598 + 2 NA intron (NM_002094, intron 9 of 14) intron (NM_002094, intron 9 of 14) 29507 NM_002094 2935 Hs.528780 NM_002094 ENSG00000103342 GSPT1 551G9.2|ETF3A|GST1|eRF3a G1 to S phase transition 1 protein-coding 560 chr10 117417134 117417529 + 2 NA Intergenic Intergenic -41891 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 511.666 chr3 44340303 44340874 + 2 NA intron (NM_001282914, intron 1 of 10) intron (NM_001282914, intron 1 of 10) 1822 NM_001282914 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 338.667-13 chr17 58785509 58785848 + 2 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 29809 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 289.333-26 chr2 67100135 67100326 + 2 NA intron (NR_110564, intron 1 of 4) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 13784 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 585.333 chr10 11530656 11531304 + 2 NA intron (NM_014688, intron 2 of 14) intron (NM_014688, intron 2 of 14) 1300 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 257.333-47 chr18 53615314 53615471 + 2 NA Intergenic Intergenic -34333 NR_110800 101928167 Hs.382012 NR_110800 ENSG00000260433 LINC01917 - long intergenic non-protein coding RNA 1917 ncRNA 294-41 chr3 29493707 29493855 + 2 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) intron (NM_001003792, intron 3 of 13) 212469 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 351.667-11 chr3 74585265 74585572 + 2 NA Intergenic Intergenic -64278 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 382.334-4 chr14 41075743 41076035 + 2 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 121178 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 424.667-7 chr3 13537625 13538101 + 2 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -11262 NM_001004019 2199 Hs.198862 NM_001998 ENSG00000163520 FBLN2 - fibulin 2 protein-coding 287-20 chr3 15101538 15101744 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2484 NR_126155 64145 Hs.475565 NM_022340 ENSG00000131381 RBSN Rabenosyn-5|ZFYVE20 rabenosyn, RAB effector protein-coding 416.666 chr10 92212657 92213104 + 2 NA intron (NM_001178137, intron 2 of 9) AluJr|SINE|Alu 30399 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 350.334-4 chr13 36875716 36876112 + 2 NA intron (NM_001127217, intron 2 of 6) intron (NM_001127217, intron 2 of 6) 44324 NM_005905 4093 Hs.123119 NM_005905 ENSG00000120693 SMAD9 MADH6|MADH9|PPH2|SMAD8|SMAD8/9|SMAD8A|SMAD8B SMAD family member 9 protein-coding 505.667 chr1 50638902 50639351 + 2 NA intron (NM_007051, intron 8 of 18) L1ME1|LINE|L1 -215683 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 408.333-2 chr11 87326947 87327509 + 2 NA non-coding (NR_033149, exon 14 of 14) non-coding (NR_033149, exon 14 of 14) 289294 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 261.333-2 chr1 41214551 41214756 + 2 NA intron (NM_001172218, intron 1 of 15) intron (NM_001172218, intron 1 of 15) 27653 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 292.667-10 chr14 37097211 37097418 + 2 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) AluSz6|SINE|Alu -74712 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 401.666-2 chr14 21200725 21201165 + 2 NA non-coding (NR_038971, exon 2 of 2) non-coding (NR_038971, exon 2 of 2) 4558 NR_038970 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 376-14 chr5 51799782 51800125 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -208078 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 355.334 chr1 66921309 66921548 + 2 NA intron (NM_024763, intron 1 of 16) intron (NM_024763, intron 1 of 16) 3428 NM_024763 79819 Hs.49421 NM_024763 ENSG00000152763 WDR78 DIC4 WD repeat domain 78 protein-coding 315-30 chr8 139457671 139458028 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 245274 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 343.667-16 chr9 97573534 97573727 + 2 NA intron (NM_001166116, intron 8 of 9) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 59738 NM_139246 158427 Hs.723236 NM_139246 ENSG00000136925 TSTD2 C9orf97 thiosulfate sulfurtransferase like domain containing 2 protein-coding 753.333-2 chr7 77199393 77200181 + 2 NA promoter-TSS (NM_006682) promoter-TSS (NM_006682) 32 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 354.667-16 chr3 112231188 112231488 + 2 NA intron (NM_001320531, intron 12 of 27).2 intron (NM_001320531, intron 12 of 27).2 62878 NM_001320531 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 292-32 chr2 203468428 203468702 + 2 NA intron (NM_213589, intron 4 of 13) L2a|LINE|L2 66736 NM_203365 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 343-15 chr4 61098010 61098236 + 2 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -45533 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 301.333-35 chr3 151519699 151519886 + 2 NA Intergenic Intergenic 46203 NR_049818 100847036 NR_049818 ENSG00000264330 MIR5186 - microRNA 5186 ncRNA 328-34 chr5 66303990 66304274 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -94686 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 289.667-29 chr4 92855223 92855421 + 2 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 550923 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 334-26 chr3 4278173 4278484 + 2 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -24976 NM_001320677 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 299.333-68 chr7 8282277 8282489 + 2 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) ERVL-E-int|LTR|ERVL -19771 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 385.667-5 chr2 102583691 102584059 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -35678 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 381-8 chr3 99656168 99656404 + 2 NA intron (NM_020351, intron 1 of 3) intron (NM_020351, intron 1 of 3) 17692 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 306.667-6 chr10 75807876 75808082 + 2 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 25218 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 458.333 chr10 72509889 72510315 + 2 NA intron (NM_006077, intron 5 of 11) intron (NM_006077, intron 5 of 11) 13884 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 217-47 chr2 135019114 135019269 + 2 NA intron (NM_001321177, intron 2 of 9) L1MD|LINE|L1 4458 NM_001321177 80122 Hs.659395 NM_025052 ENSG00000176601 MAP3K19 RCK|YSK4 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 protein-coding 307.333-43 chr2 116226230 116226473 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 882536 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 228-34 chr17 58943142 58943370 + 2 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 163624 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 381-3 chr14 53358743 53359041 + 2 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 205538 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 300.666-3 chr10 118089264 118089494 + 2 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) intron (NR_026940, intron 3 of 3) -42438 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 300-41 chr3 60529192 60529473 + 2 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) 88538 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 216-95 chr5 37492966 37493124 + 2 NA intron (NM_001345998, intron 8 of 17) MLT1E2-int|LTR|ERVL-MaLR 113727 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 331.333-12 chr11 81644468 81644714 + 2 NA Intergenic Intergenic 246245 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 256-24 chr13 61474514 61474723 + 2 NA Intergenic Intergenic -46672 NR_134946 101926951 Hs.732367 NR_134946 ENSG00000279797 LINC02339 - long intergenic non-protein coding RNA 2339 ncRNA 424-17 chr9 27649041 27649278 + 2 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -75293 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 274.666 chr1 112578699 112578957 + 2 NA intron (NM_017744, intron 9 of 14) intron (NM_017744, intron 9 of 14) 40313 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 208.667-18 chr10 25206472 25206578 + 2 NA intron (NM_020752, intron 1 of 10) L1ME4a|LINE|L1 -30249 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 278-55 chr7 25602552 25602805 + 2 NA intron (NR_157815, intron 3 of 4) intron (NR_157815, intron 3 of 4) 60462 NR_157826 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 394.334-5 chr5 18068045 18068432 + 2 NA Intergenic Intergenic 260964 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 304-53 chr6 124380982 124381251 + 2 NA intron (NM_153355, intron 3 of 5) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 98111 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 351.334-3 chr2 107706479 107706963 + 2 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -47391 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 183.333-81 chr2 45119731 45119928 + 2 NA Intergenic Intergenic -110377 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 303.333-27 chr15 76956027 76956312 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 24420 NM_002902 5955 Hs.79088 NM_002902 ENSG00000117906 RCN2 E6BP|ERC-55|ERC55|TCBP49 reticulocalbin 2 protein-coding 333.333-12 chr10 83813479 83813826 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -136563 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 400-4 chr12 39072433 39072800 + 2 NA Intergenic Intergenic -167025 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 329-15 chr22 31503772 31504143 + 2 NA intron (NM_001258326, intron 1 of 30) intron (NM_001258326, intron 1 of 30) 7421 NM_014775 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 363-7 chr2 33576026 33576461 + 2 NA Intergenic Intergenic -6813 NR_146505 105374454 NR_146505 LOC105374454 - uncharacterized LOC105374454 ncRNA 310-7 chr10 30171681 30171891 + 2 NA Intergenic Intergenic -40066 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 268-8 chr10 66995629 66995854 + 2 NA intron (NR_111911, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 16412 NR_111911 101928961 Hs.687014 NR_111911 LOC101928961 - uncharacterized LOC101928961 ncRNA 263.333-37 chr18 64256253 64256457 + 2 NA intron (NR_033881, intron 3 of 9) MIRb|SINE|MIR 3700 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 344.667-19 chr6 57096852 57097216 + 2 NA intron (NM_001257273, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 6846 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 348.666-15 chr5 146481589 146481880 + 2 NA intron (NM_006706, intron 12 of 21) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 34379 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 463.333-5 chr17 39622299 39622646 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4480 NM_032192 84152 Hs.286192 NM_032192 ENSG00000131771 PPP1R1B DARPP-32|DARPP32 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1B protein-coding 260-47 chr21 17466268 17466521 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 27504 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 293.333-42 chr3 25238261 25238542 + 2 NA intron (NM_001290216, intron 4 of 10) L1MA4A|LINE|L1 -102401 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 192-135 chr7 40467696 40467865 + 2 NA intron (NM_024728, intron 11 of 14) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 332804 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 247.667-21 chr12 11555201 11555409 + 2 NA non-coding (NR_033890, exon 6 of 8) non-coding (NR_033890, exon 6 of 8) 7275 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 257.334-16 chr8 138032322 138032600 + 2 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 51084 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 323.334-12 chr8 136344006 136344180 + 2 NA Intergenic Intergenic -186705 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 292-29 chr2 124945254 124945460 + 2 NA Intergenic Intergenic 920070 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 286.667-15 chr16 71902650 71902853 + 2 NA intron (NM_001270979, intron 1 of 5) L1MEf|LINE|L1 7220 NM_014761 9798 Hs.232194 NM_014761 ENSG00000182149 IST1 CHMP8|OLC1 IST1 factor associated with ESCRT-III protein-coding 333.667-2 chr1 191906055 191906277 + 2 NA Intergenic Intergenic -252296 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 324.666-15 chr5 19801700 19801930 + 2 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) intron (NM_001349559, intron 3 of 12) 84457 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 304.666-3 chr10 12660810 12661019 + 2 NA intron (NM_001351032, intron 4 of 11) intron (NM_001351032, intron 4 of 11) -7717 NR_039701 100616320 NR_039701 ENSG00000283699 MIR4481 - microRNA 4481 ncRNA 435.667 chr3 183047194 183047567 + 2 NA intron (NR_120639, intron 7 of 15) L1MC1|LINE|L1 51863 NR_120640 56922 Hs.47649 NM_020166 ENSG00000078070 MCCC1 MCC-B|MCCA methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1 protein-coding 368-20 chr8 51311702 51312075 + 2 NA Intergenic Intergenic 497557 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 310-67 chrX 91426253 91426418 + 2 NA intron (NR_110659, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 -8504 NM_080832 140886 Hs.246590 NM_080832 ENSG00000174740 PABPC5 PABP5 poly(A) binding protein cytoplasmic 5 protein-coding 225.333-34 chr12 75134420 75134560 + 2 NA intron (NM_001260499, intron 2 of 3) intron (NM_001260499, intron 2 of 3) 75258 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 307.333-77 chr8 59981522 59981692 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 299793 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 167.333-42 chr10 56714813 56715001 + 2 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -353634 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 307-40 chrX 76333086 76333373 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -94481 NM_020932 57692 Hs.8453 NM_020932 ENSG00000198934 MAGEE1 DAMAGE|HCA1 MAGE family member E1 protein-coding 365.333-8 chr14 60023371 60023655 + 2 NA intron (NR_075071, intron 27 of 32) intron (NR_075071, intron 27 of 32) -68398 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 315-28 chr8 123120192 123120366 + 2 NA intron (NM_001363149, intron 11 of 21) intron (NM_001363149, intron 11 of 21) 47030 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 342.666-2 chr1 98911441 98911687 + 2 NA intron (NM_001010861, intron 5 of 5) intron (NM_001010861, intron 5 of 5) -92712 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 196-143 chr5 37544408 37544506 + 2 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) intron (NM_001345998, intron 9 of 17) 165139 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 341.667-14 chr21 28232638 28232962 + 2 NA Intergenic Intergenic -4133 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 283-4 chr1 225983253 225983490 + 2 NA 3' UTR (NM_152608, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_152608, exon 7 of 7) 15972 NM_152608 163859 Hs.520192 NM_152608 ENSG00000143751 SDE2 C1orf55|dJ671D7.1 SDE2 telomere maintenance homolog protein-coding 285-9 chr17 16124578 16124822 + 2 NA intron (NM_001190440, intron 14 of 44) intron (NM_001190440, intron 14 of 44) 28496 NR_145787 109623477 NR_145787 SNORD163 - small nucleolar RNA, C/D box 163 snoRNA 301-15 chr15 23807690 23807882 + 2 NA Intergenic Intergenic -120481 NM_002487 4692 Hs.50130 NM_002487 ENSG00000182636 NDN HsT16328|PWCR necdin, MAGE family member protein-coding 498 chr4 170549167 170549957 + 2 NA Intergenic Intergenic 194173 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 328.334-3 chr6 142533091 142533424 + 2 NA intron (NR_027311, intron 2 of 2) intron (NR_027311, intron 2 of 2) 104579 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 344.334 chr1 102374997 102375312 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -377920 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 303.333-7 chr1 192406351 192406535 + 2 NA Intergenic Intergenic 89451 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 314.666-10 chr1 232634696 232634915 + 2 NA Intergenic Intergenic -83266 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 506.334 chr13 89531695 89532093 + 2 NA Intergenic Intergenic -31385 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 380.666-9 chr4 30727491 30727729 + 2 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 7241 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 298-5 chr1 90231732 90231972 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 236742 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 303.667-18 chr3 132402550 132402825 + 2 NA Intergenic (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14815 NM_001329126 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 302.666-24 chr8 115341557 115341851 + 2 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 326309 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 303.334-11 chr6 146252110 146252335 + 2 NA intron (NM_001278065, intron 3 of 9) intron (NM_001278065, intron 3 of 9) 223024 NM_001278067 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 309-26 chr4 1259657 1259935 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 10356 NR_033339 92070 Hs.561314 NM_052861 CTBP1-DT C4orf42|CTBP1-AS1|CTBP1-AS2 CTBP1 divergent transcript ncRNA 284-31 chr3 59912742 59912909 + 2 NA intron (NR_135491, intron 5 of 6) intron (NR_135491, intron 5 of 6) 168084 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 300.666-9 chr2 173169878 173170087 + 2 NA intron (NM_133646, intron 3 of 11) intron (NM_133646, intron 3 of 11) 94136 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 484.334-4 chr8 88268551 88268941 + 2 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 58737 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 248-95 chr9 102303281 102303450 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -216272 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 241.666-10 chr20 55798646 55798801 + 2 NA Intergenic Intergenic 206796 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 306.333-28 chr21 30343001 30343319 + 2 NA Intergenic Intergenic 5446 NM_181624 337963 Hs.553688 NM_181624 ENSG00000186980 KRTAP23-1 KAP23.1 keratin associated protein 23-1 protein-coding 437.999-4 chr4 93580009 93580363 + 2 NA intron (NM_001286838, intron 12 of 14) intron (NM_001286838, intron 12 of 14) -248567 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 390-14 chr2 74662017 74662364 + 2 NA intron (NR_073398, intron 4 of 11) intron (NR_073398, intron 4 of 11) 7943 NR_073399 10505 Hs.25887 NM_004263 ENSG00000135622 SEMA4F M-SEMA|PRO2353|S4F|SEMAM|SEMAW|m-Sema-M ssemaphorin 4F protein-coding 373.333-17 chr22 24781969 24782308 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -7418 NM_001008496 440822 Hs.448343 NM_001008496 ENSG00000184571 PIWIL3 HIWI3 piwi like RNA-mediated gene silencing 3 protein-coding 354-25 chr8 106454600 106454904 + 2 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 6828 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 437.667 chr12 30151284 30151763 + 2 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -366764 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 335.334-7 chr7 27930719 27930981 + 2 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) 190755 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 313.333-18 chr2 30568258 30568415 + 2 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) intron (NM_182551, intron 6 of 6) 121090 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 303.334 chr1 58946692 58946960 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -73650 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 342.334 chr10 60407524 60407833 + 2 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) MIRb|SINE|MIR -17803 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 274-40 chr4 58599796 58599999 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -63569 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 360-19 chr3 17576560 17576980 + 2 NA intron (NM_001349089, intron 1 of 20) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 123250 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 367-2 chr1 227112156 227112405 + 2 NA intron (NM_001366019, intron 14 of 36) intron (NM_001366019, intron 14 of 36) 171986 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 294 chr1 15273731 15273936 + 2 NA intron (NM_052929, intron 3 of 30) L1MB3|LINE|L1 26608 NM_052929 114827 Hs.659997 NM_052929 ENSG00000142621 FHAD1 - forkhead associated phosphopeptide binding domain 1 protein-coding 350-35 chr7 80655316 80655534 + 2 NA intron (NM_001371079, intron 3 of 13) MIR3|SINE|MIR 8772 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 198.667-172 chr7 77546908 77547077 + 2 NA intron (NM_001131009, intron 1 of 16) intron (NM_001131009, intron 1 of 16) 8949 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 200.667-51 chr15 89985709 89985899 + 2 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -15520 NM_198526 374655 Hs.459311 NM_198526 ENSG00000140548 ZNF710 - zinc finger protein 710 protein-coding 313.334-6 chr6 21452136 21452376 + 2 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 59636 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 332.334-2 chr17 44816169 44816495 + 2 NA intron (NM_001080383, intron 1 of 2) intron (NM_001080383, intron 1 of 2) 13955 NM_005497 10052 Hs.712052 NM_005497 ENSG00000182963 GJC1 CX45|GJA7 gap junction protein gamma 1 protein-coding 287-19 chr3 11602439 11602707 + 2 NA intron (NM_014667, intron 2 of 5) intron (NM_014667, intron 2 of 5) 2008 NM_001284391 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 302.666-11 chr2 159388348 159388570 + 2 NA intron (NM_001329858, intron 21 of 36) intron (NM_001329858, intron 21 of 36) -101756 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 319.667-31 chr8 34331324 34331559 + 2 NA Intergenic Intergenic -452480 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 529.667-4 chr21 23194241 23194964 + 2 NA Intergenic Intergenic 115318 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 292.666-28 chr5 93723323 93723550 + 2 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) intron (NM_032042, intron 10 of 10) 18164 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 334.667-2 chr1 121489512 121489713 + 2 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -29500 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 366.667-6 chr17 42839626 42839975 + 2 NA intron (NR_049772, intron 9 of 9) AluSp|SINE|Alu -4780 NM_001158 314 Hs.143102 NM_001158 ENSG00000131480 AOC2 DAO2|RAO|SSAO amine oxidase copper containing 2 protein-coding 358.333-10 chr12 22821894 22822207 + 2 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 196879 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 406.667 chr11 31244837 31245271 + 2 NA intron (NM_001367979, intron 8 of 38) L2c|LINE|L2 124685 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 285-13 chr18 12745334 12745520 + 2 NA intron (NR_110763, intron 1 of 1) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 3995 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 570.667-2 chr5 39629618 39630236 + 2 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 109496 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 362-11 chr17 55900333 55900702 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 149412 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 306-19 chr16 76889066 76889380 + 2 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 20287 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 397.334-4 chr18 24649925 24650433 + 2 NA intron (NR_040033, intron 1 of 2) HERV16-int|LTR|ERVL 21997 NR_040033 729950 Hs.585850 NR_040033 ENSG00000265485 LINC01915 - long intergenic non-protein coding RNA 1915 ncRNA 255.333-85 chr5 104328807 104328968 + 2 NA Intergenic Intergenic -766098 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 319.333-21 chr21 28518273 28518439 + 2 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -20962 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 351-21 chr8 128465286 128465585 + 2 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 99244 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 317.333-31 chr5 107511623 107511788 + 2 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 159232 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 579.999 chr6 88619522 88620190 + 2 NA intron (NM_001286428, intron 12 of 13) MER126|DNA|DNA -80487 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 322.667-11 chr13 53988699 53988903 + 2 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 144070 NR_108063 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 332-26 chr3 197178540 197178878 + 2 NA intron (NM_001290983, intron 5 of 25) L2a|LINE|L2 5163 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 282.667-29 chr3 71093636 71093981 + 2 NA intron (NR_146142, intron 7 of 19) intron (NR_146142, intron 7 of 19) -28884 NM_001244813 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 312.667-3 chr1 113797622 113797902 + 2 NA exon (NM_018364, exon 2 of 7) exon (NM_018364, exon 2 of 7) 14714 NM_018364 54665 Hs.486285 NM_018364 ENSG00000081019 RSBN1 KDM9|ROSBIN round spermatid basic protein 1 protein-coding 386.666-7 chr2 27476233 27476633 + 2 NA intron (NM_015662, intron 14 of 47) intron (NM_015662, intron 14 of 47) 13310 NM_015662 26160 Hs.127401 NM_015662 ENSG00000138002 IFT172 BBS20|NPHP17|RP71|SLB|SRTD10|osm-1|wim intraflagellar transport 172 protein-coding 286.667-34 chr6 24520025 24520178 + 2 NA intron (NM_170740, intron 6 of 10) FLAM_A|SINE|Alu 25132 NM_001368954 7915 Hs.371723 NM_001080 ENSG00000112294 ALDH5A1 SSADH|SSDH aldehyde dehydrogenase 5 family member A1 protein-coding 501 chr14 47872024 47872375 + 2 NA Intergenic Intergenic -77185 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 259-44 chr5 171829514 171829737 + 2 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 43753 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 337-5 chr11 83847204 83847427 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 16 of 27) intron (NM_001142699, intron 16 of 27) -164890 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 361.667-5 chr17 58540051 58540380 + 2 NA intron (NM_001256782, intron 1 of 12) intron (NM_001256782, intron 1 of 12) 603 NM_001256782 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 254.666-12 chr12 2610596 2610750 + 2 NA exon (NM_001129827, exon 29 of 49) exon (NM_001129827, exon 29 of 49) 61547 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 228-8 chr10 22342796 22342966 + 2 NA Intergenic Intergenic -2564 NM_001253855 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 370-20 chr5 91587178 91587517 + 2 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -204030 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 373-8 chr2 78010609 78010999 + 2 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -55778 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 170-102 chr5 178312418 178312530 + 2 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) intron (NM_173465, intron 2 of 28) -79652 NR_103508 85007 Hs.248746 NM_153373 ENSG00000175309 PHYKPL AGXT2L2|PHLU 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase protein-coding 300.333-18 chr17 53330378 53330644 + 2 NA Intergenic Intergenic 345006 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 302-39 chr3 81648755 81649077 + 2 NA exon (NM_000158, exon 5 of 16) exon (NM_000158, exon 5 of 16) 112729 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 418.333-8 chr20 40913661 40914064 + 2 NA Intergenic Intergenic -66851 NR_145524 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 151.333-426 chr8 110122004 110122150 + 2 NA Intergenic Intergenic -146306 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 322.666-13 chr16 78313143 78313463 + 2 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) MIRc|SINE|MIR 213649 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 395-17 chr3 113973158 113973547 + 2 NA intron (NR_148531, intron 14 of 14) L1MA4|LINE|L1 25339 NM_001320467 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 382.666-2 chr14 57217525 57217900 + 2 NA intron (NM_006544, intron 15 of 17) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 51193 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 302.333-8 chr10 9188093 9188268 + 2 NA Intergenic Intergenic -87433 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 295.333-33 chr2 237260102 237260269 + 2 NA Intergenic Intergenic 153979 NM_057165 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 302-40 chr3 95503759 95504031 + 2 NA Intergenic Intergenic 179298 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 273.333-35 chr2 139844465 139844709 + 2 NA Intergenic Intergenic 742098 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 382.666-4 chr14 71627767 71628075 + 2 NA intron (NM_001354286, intron 8 of 24) intron (NM_001354286, intron 8 of 24) 41623 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 249.333-47 chr18_GL383571v1_alt 96276 96423 + 2 NA Intergenic Intergenic 66098 NM_032160 92126 Hs.124673 NM_032160 ENSG00000171451 DSEL C18orf4|DE-epi2 dermatan sulfate epimerase like protein-coding 320.666-17 chr8 130859410 130859646 + 2 NA intron (NM_001115, intron 9 of 17) L1MC3|LINE|L1 181381 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 357.666 chr1 87135012 87135320 + 2 NA non-coding (NR_026988, exon 3 of 3) non-coding (NR_026988, exon 3 of 3) 3240 NR_026985 339524 Hs.306423 NM_207357 ENSG00000267272 LINC01140 - long intergenic non-protein coding RNA 1140 ncRNA 325-21 chr3 53532161 53532326 + 2 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) intron (NM_001128840, intron 3 of 47) 37632 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 246-76 chr4 35441940 35442102 + 2 NA Intergenic Intergenic 801918 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 262-16 chr14 21130709 21130864 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 25277 NM_001004731 390445 Hs.553768 NM_001004731 ENSG00000169327 OR5AU1 OR14-38 olfactory receptor family 5 subfamily AU member 1 protein-coding 257.333-55 chr2 129077495 129077692 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 196298 NR_122042 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 353.333-4 chr11 25684222 25684560 + 2 NA Intergenic Intergenic -504732 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 270-41 chr3 153125161 153125419 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -36936 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 324.667-31 chr6 52371010 52371318 + 2 NA intron (NM_133367, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 9013 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 424.333-9 chr7 28177718 28177992 + 2 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -2602 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 294.666-7 chr14 48285786 48286050 + 2 NA Intergenic Intergenic -490904 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 333-18 chr3 10128209 10128435 + 2 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 12647 NM_018462 55845 Hs.649307 NM_018462 ENSG00000254999 BRK1 C3orf10|HSPC300|MDS027|hHBrk1 BRICK1 subunit of SCAR/WAVE actin nucleating complex protein-coding 313.333-12 chr14 50427087 50427391 + 2 NA intron (NM_198794, intron 29 of 31) intron (NM_198794, intron 29 of 31) -29941 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 356-23 chr2 154492232 154492485 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -34920 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 410.667-14 chr5 88559153 88559641 + 2 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) intron (NR_152235, intron 2 of 3) 107542 NR_030741 407047 NR_030741 ENSG00000284447 MIR9-2 MIRN9-2|hsa-mir-9-2|miRNA9-2|mir-9-2 microRNA 9-2 ncRNA 451.334 chr13 23543447 23543748 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -26773 NM_001204459 55504 Hs.149168 NM_018647 ENSG00000127863 TNFRSF19 TAJ|TAJ-alpha|TRADE|TROY TNF receptor superfamily member 19 protein-coding 450-6 chr7 11545323 11545751 + 2 NA intron (NM_015204, intron 4 of 26) L1PA15|LINE|L1 286661 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 236.333-50 chr2 173053302 173053509 + 2 NA TTS (NM_001100397) TTS (NM_001100397) -22441 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 318.333-31 chr7 105350549 105350762 + 2 NA intron (NM_001350746, intron 2 of 14) AluSx4|SINE|Alu 38266 NM_182692 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 398-14 chr5 101691800 101692117 + 2 NA Intergenic Intergenic 604326 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 289-15 chr21 27699066 27699300 + 2 NA Intergenic Intergenic -23196 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 301-39 chr5 6372782 6372940 + 2 NA intron (NM_032286, intron 3 of 3) intron (NM_032286, intron 3 of 3) 5686 NM_032286 84246 Hs.13885 NM_032286 ENSG00000133398 MED10 L6|NUT2|TRG20 mediator complex subunit 10 protein-coding 324.667-25 chr4 27405205 27405456 + 2 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 187851 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 306.334-8 chr7 37228088 37228356 + 2 NA intron (NM_001206480, intron 8 of 21) intron (NM_001206480, intron 8 of 21) 125446 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 330-26 chr3 186035641 186035823 + 2 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 73357 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 431-8 chr22 34091064 34091466 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -168377 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 297.667-26 chr3 121687848 121688121 + 2 NA intron (NM_001256486, intron 14 of 21) intron (NM_001256486, intron 14 of 21) -27081 NM_001292041 3059 Hs.14601 NM_005335 ENSG00000180353 HCLS1 CTTNL|HS1|lckBP1|p75 hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 protein-coding 288.667-17 chr3 96099962 96100231 + 2 NA Intergenic Intergenic -259868 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 395-20 chr5 132905990 132906475 + 2 NA intron (NM_014423, intron 5 of 20) L1MB7|LINE|L1 32564 NM_052971 116842 Hs.337588 NM_052971 ENSG00000164406 LEAP2 LEAP-2 liver enriched antimicrobial peptide 2 protein-coding 451.333-7 chr6 53932013 53932411 + 2 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) intron (NR_125842, intron 1 of 3) 2230 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 390.667 chr11 74225355 74225622 + 2 NA intron (NM_001271593, intron 5 of 13) intron (NM_001271593, intron 5 of 13) 54199 NM_001271593 51400 Hs.503251 NM_016147 ENSG00000214517 PPME1 ABDH19|PME-1 protein phosphatase methylesterase 1 protein-coding 265.667-76 chr9 86020895 86021268 + 2 NA intron (NM_024635, intron 22 of 22) intron (NM_024635, intron 22 of 22) 78477 NM_016548 51280 Hs.494337 NM_016548 ENSG00000135052 GOLM1 C9orf155|GOLPH2|GP73|HEL46|PSEC0257|bA379P1.3 golgi membrane protein 1 protein-coding 366-13 chr21 22869650 22869946 + 2 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -209486 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 334-29 chr4 76277574 76277744 + 2 NA intron (NM_001242939, intron 5 of 6) intron (NM_001242939, intron 5 of 6) 25938 NM_001136570 100129583 Hs.720509 NM_001136570 ENSG00000189157 FAM47E - family with sequence similarity 47 member E protein-coding 310.666-5 chr10 108596834 108597118 + 2 NA Intergenic Intergenic -527683 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 391.334-4 chr6 17533164 17533503 + 2 NA intron (NM_006366, intron 7 of 12) intron (NM_006366, intron 7 of 12) -22068 NR_110855 101928491 Hs.622876 NR_110855 LOC101928491 - uncharacterized LOC101928491 ncRNA 272-35 chr4 43856136 43856374 + 2 NA Intergenic Intergenic -160606 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 304.666-10 chr12 38758331 38758554 + 2 NA intron (NM_153634, intron 10 of 19) intron (NM_153634, intron 10 of 19) 147149 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 317-27 chrX 140550208 140550550 + 2 NA Intergenic Intergenic -45319 NM_005634 6658 Hs.157429 NM_005634 ENSG00000134595 SOX3 GHDX|MRGH|PHP|PHPX|SOXB SRY-box transcription factor 3 protein-coding 267.667-44 chr3 165459397 165459599 + 2 NA intron (NR_125764, intron 3 of 5) HAL1ME|LINE|L1 252538 NR_125764 103695433 Hs.570689 NR_125764 LINC01322 - long intergenic non-protein coding RNA 1322 ncRNA 271.333-59 chr5 144952325 144952505 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 747024 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 208-169 chr8 111122175 111122293 + 2 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) -94801 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 179-34 chr15 85872826 85873049 + 2 NA Intergenic Intergenic 47302 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 383 chr1 23316331 23316754 + 2 NA intron (NM_001297622, intron 6 of 8).2 intron (NM_001297622, intron 6 of 8).2 27742 NM_001102398 10236 Hs.373763 NM_005826 ENSG00000125944 HNRNPR HNRPR|hnRNP-R heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R protein-coding 374 chr1 97491563 97491832 + 2 NA intron (NM_000110, intron 13 of 22) intron (NM_000110, intron 13 of 22) -305224 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 580.667 chr1 33239476 33239910 + 2 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -16799 NM_152493 149076 Hs.743358 NM_152493 ENSG00000160094 ZNF362 RN|lin-29 zinc finger protein 362 protein-coding 315-11 chr15 81049490 81049707 + 2 NA Intergenic Intergenic 48675 NM_022566 59274 Hs.513071 NM_022566 ENSG00000140406 TLNRD1 MESDC1 talin rod domain containing 1 protein-coding 440.667-5 chr20 20268311 20268671 + 2 NA intron (NM_015585, intron 21 of 26) intron (NM_015585, intron 21 of 26) -99613 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 307.333-53 chr3 25866724 25866914 + 2 NA intron (NR_034055, intron 4 of 7) (TCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 6876 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 376-15 chr5 58334170 58334550 + 2 NA Intergenic Intergenic 125726 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 251.333-11 chr10 57320679 57320872 + 2 NA Intergenic Intergenic -16216 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 257.667-37 chr2 37189189 37189486 + 2 NA promoter-TSS (NM_001367551) promoter-TSS (NM_001367551) -667 NM_001367551 391365 Hs.631892 NM_001032377 ENSG00000138068 SULT6B1 ST6B1 sulfotransferase family 6B member 1 protein-coding 269.333-39 chr2 35635742 35636005 + 2 NA Intergenic Intergenic 164468 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 505.666 chr14 52615134 52615442 + 2 NA intron (NM_001353361, intron 4 of 7) L1MA2|LINE|L1 62452 NR_148417 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 226-7 chr10 36906185 36906343 + 2 NA Intergenic Intergenic -219593 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 419-3 chr19 52196907 52197169 + 2 NA intron (NM_014225, intron 1 of 14) intron (NM_014225, intron 1 of 14) -4158 NM_001363656 5518 Hs.467192 NM_014225 ENSG00000105568 PPP2R1A MRD36|PP2A-Aalpha|PP2AA|PP2AAALPHA|PR65A protein phosphatase 2 scaffold subunit Aalpha protein-coding 288.334-4 chr4 79134723 79134973 + 2 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) L1PA14|LINE|L1 163100 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 351.333-32 chr8 145044533 145044915 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -7743 NM_023080 65265 Hs.169615 NM_023080 ENSG00000182307 C8orf33 - chromosome 8 open reading frame 33 protein-coding 351 chr1 64820060 64820284 + 2 NA intron (NM_001366165, intron 11 of 11) L1MEf|LINE|L1 75097 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 440.333-2 chr14 44469325 44469834 + 2 NA Intergenic Intergenic 37704 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 492 chr15 68856340 68856681 + 2 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -35615 NM_006305 8125 Hs.458747 NM_006305 ENSG00000140350 ANP32A C15orf1|HPPCn|I1PP2A|LANP|MAPM|PHAP1|PHAPI|PP32 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A protein-coding 152-141 chr7 2829529 2829623 + 2 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) HAL1b|LINE|L1 -14346 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 382 chr10 64345426 64345751 + 2 NA Intergenic Intergenic -479940 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 300.667-13 chr17 18083372 18083523 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4501 NM_001388 1819 Hs.78582 NM_001388 ENSG00000108591 DRG2 - developmentally regulated GTP binding protein 2 protein-coding 347.333-25 chr7 35316985 35317165 + 2 NA intron (NR_038864, intron 1 of 2) intron (NR_038864, intron 1 of 2) 3220 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 345.333-18 chr2 226198061 226198266 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 55369 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 364-8 chr15 65752469 65752830 + 2 NA intron (NM_005848, intron 3 of 31) intron (NM_005848, intron 3 of 31) -33317 NR_039736 100616379 NR_039736 ENSG00000264737 MIR4511 mir-4511 microRNA 4511 ncRNA 536-3 chr4 86356786 86357316 + 2 NA intron (NM_002753, intron 1 of 13) intron (NM_002753, intron 1 of 13) -2407 NM_001318067 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 287.333-19 chr14 57640850 57641044 + 2 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) intron (NM_001352014, intron 1 of 9) -147090 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 310-24 chr18 7641453 7641654 + 2 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 74237 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 328-33 chr5 58422476 58422665 + 2 NA Intergenic Intergenic 37516 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 291.333-72 chr9 91762067 91762310 + 2 NA intron (NM_001318204, intron 2 of 7) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -125843 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 313.667-23 chr2 32391542 32391740 + 2 NA intron (NM_016252, intron 4 of 73) intron (NM_016252, intron 4 of 73) 34613 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 359.333-25 chr8 33286421 33286665 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 186603 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 315.333-41 chr5 178608970 178609217 + 2 NA intron (NM_020666, intron 9 of 12) intron (NM_020666, intron 9 of 12) 17957 NM_020666 57396 Hs.406557 NM_020666 ENSG00000113240 CLK4 - CDC like kinase 4 protein-coding 268.667-38 chr22 19606343 19606704 + 2 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -39684 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 311.666-13 chr5 38310496 38310791 + 2 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) intron (NM_152403, intron 1 of 21) -19657 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 217.667-29 chr15 34676547 34676776 + 2 NA Intergenic Intergenic -20897 NR_146869 105370762 Hs.569462 NR_146869 ENSG00000261304 LINC02252 - long intergenic non-protein coding RNA 2252 ncRNA 294.667-53 chr7 90440103 90440292 + 2 NA Intergenic Intergenic -29442 NM_001365443 102723899 Hs.731917 NM_001365443 LOC102723899 - uncharacterized LOC102723899 protein-coding 755.333-2 chr12 20213520 20214091 + 2 NA Intergenic Intergenic -85904 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 278.334-5 chr3 96136953 96137108 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -222934 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 406-5 chr2 65108788 65109138 + 2 NA intron (NM_015543, intron 1 of 3) intron (NM_015543, intron 1 of 3) 21143 NM_004161 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 369-14 chr8 129002740 129003002 + 2 NA Intergenic Intergenic -36870 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 313-24 chr3 7053861 7054132 + 2 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 -159979 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 196.667-84 chr20 577145 577298 + 2 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 33045 NM_004609 6939 Hs.437 NM_004609 ENSG00000125878 TCF15 EC2|PARAXIS|bHLHa40 transcription factor 15 protein-coding 232-36 chr18 25508046 25508205 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -155959 NM_001308225 25925 Hs.116935 NM_015461 ENSG00000198795 ZNF521 EHZF|Evi3 zinc finger protein 521 protein-coding 288.333-23 chr2 103881559 103881746 + 2 NA Intergenic Intergenic 526680 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 314.666-11 chr10 17419986 17420245 + 2 NA intron (NM_001004470, intron 2 of 7) intron (NM_001004470, intron 2 of 7) 33179 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 273.334-10 chr4 36083621 36083772 + 2 NA intron (NR_146894, intron 28 of 32) intron (NR_146894, intron 28 of 32) 160243 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 394-8 chr17 11317390 11317787 + 2 NA intron (NM_001173461, intron 2 of 3) intron (NM_001173461, intron 2 of 3) 76165 NM_001173461 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 262.334-9 chr3 193242631 193242799 + 2 NA non-coding (NR_026877, exon 1 of 1) non-coding (NR_026877, exon 1 of 1) 936 NR_026877 84789 Hs.676481 NM_032703 MGC2889 - uncharacterized protein MGC2889 ncRNA 338.667-25 chr4 100135260 100135495 + 2 NA Intergenic Intergenic -54656 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 334.667-9 chr13 25145885 25146056 + 2 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 26197 NM_199138 219287 Hs.528335 NM_152704 ENSG00000165566 AMER2 FAM123A APC membrane recruitment protein 2 protein-coding 304.667-13 chr15 92690969 92691263 + 2 NA Intergenic Intergenic -35341 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 467.333-4 chr12 38600828 38601198 + 2 NA Intergenic Intergenic 284239 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 269.333-26 chr16 19551931 19552121 + 2 NA 3' UTR (NM_001323569, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001323569, exon 16 of 16) -3677 NM_001365294 57020 Hs.654964 NM_020314 ENSG00000103544 VPS35L C16orf62 VPS35 endosomal protein sorting factor like protein-coding 394.333-18 chr6 62784955 62785367 + 2 NA Intergenic Intergenic -498934 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 295.667-22 chr5 73058911 73059077 + 2 NA intron (NM_001146032, intron 16 of 24) L1ME4b|LINE|L1 -61581 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 430.666 chr14 60928588 60929071 + 2 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) L1MB8|LINE|L1 52250 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 312-42 chr4 172964607 172964861 + 2 NA intron (NM_001034845, intron 10 of 12) intron (NM_001034845, intron 10 of 12) -204077 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 291-13 chr13 102662754 102662917 + 2 NA intron (NM_001330588, intron 25 of 29) intron (NM_001330588, intron 25 of 29) 31686 NM_001010977 196541 Hs.508623 NM_001010977 ENSG00000139780 METTL21C C13orf39 methyltransferase like 21C protein-coding 317.333-5 chr10 83040188 83040358 + 2 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 636816 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 332.667-11 chr18 22718991 22719187 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 67748 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 325.333-50 chr8 86158743 86158930 + 2 NA Intergenic Intergenic 59926 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 296.666-26 chr4 111814065 111814337 + 2 NA Intergenic Intergenic -331253 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 400-18 chr9 28665773 28666271 + 2 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) AluSq2|SINE|Alu 53283 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 185.667-90 chr3 76006958 76007093 + 2 NA Intergenic Intergenic -221476 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 270.667-22 chr18 70450997 70451148 + 2 NA Intergenic Intergenic -66481 NR_110764 101060542 Hs.586967 NR_110764 ENSG00000266278 LINC01910 - long intergenic non-protein coding RNA 1910 ncRNA 318-4 chr1 88742484 88742673 + 2 NA intron (NM_006256, intron 2 of 21) intron (NM_006256, intron 2 of 21) -57374 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 461.333 chr12 52586371 52586872 + 2 NA intron (NM_080747, intron 8 of 8) (TCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12778 NM_175053 121391 Hs.660125 NM_175053 ENSG00000170484 KRT74 ADWH|HTSS2|HYPT3|K6IRS4|KRT5C|KRT6IRS4 keratin 74 protein-coding 359.333-10 chr18 22706690 22706976 + 2 NA Intergenic Intergenic 80004 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 436 chr1 22906995 22907272 + 2 NA intron (NM_004442, intron 11 of 15) MER117|DNA|hAT-Charlie -43907 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 232-8 chr1 101551958 101552123 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 228203 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 336-29 chr6 123398593 123398763 + 2 NA intron (NM_001251987, intron 12 of 20) intron (NM_001251987, intron 12 of 20) -40926 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 278.334-2 chr12 886841 887038 + 2 NA intron (NM_001184985, intron 19 of 27) intron (NM_001184985, intron 19 of 27) 46137 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 433.999-2 chr16 10897372 10897716 + 2 NA intron (NR_104444, intron 3 of 17) intron (NR_104444, intron 3 of 17) 20342 NM_001286403 4261 Hs.592051 NM_000246 ENSG00000179583 CIITA C2TA|CIITAIV|MHC2TA|NLRA class II major histocompatibility complex transactivator protein-coding 315.667-17 chr4 92047093 92047335 + 2 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL 230088 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 322-48 chr8 70309412 70309580 + 2 NA intron (NM_001321703, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 93894 NM_001321713 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 643.334 chr2 52901743 52902423 + 2 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -199468 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 305.334-11 chr6 45349430 45349699 + 2 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie 21234 NR_103533 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 317.333-3 chr10 23031941 23032161 + 2 NA intron (NM_001282745, intron 17 of 18) AluJr|SINE|Alu -63528 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 280.334-13 chr6 118312321 118312523 + 2 NA intron (NM_001029858, intron 7 of 7) intron (NM_001029858, intron 7 of 7) -188951 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 380.667-9 chr20 54913378 54913802 + 2 NA Intergenic Intergenic 437997 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 266.667-37 chr2 42113398 42113687 + 2 NA Intergenic Intergenic -55811 NM_001145076 27436 Hs.713173 NM_019063 ENSG00000143924 EML4 C2orf2|ELP120|EMAP-4|EMAPL4|ROPP120 EMAP like 4 protein-coding 467.667-8 chr5 126861948 126862309 + 2 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 84992 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 307-23 chr3 36292807 36292981 + 2 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -87593 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 416.667-3 chr17 60481834 60482282 + 2 NA intron (NM_006380, intron 3 of 12) AluSp|SINE|Alu 44182 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 414.666-6 chr18 57903210 57903671 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -100125 NM_005603 5205 Hs.216623 NM_005603 ENSG00000081923 ATP8B1 ATPIC|BRIC|FIC1|ICP1|PFIC|PFIC1 ATPase phospholipid transporting 8B1 protein-coding 212.667-128 chr7 52246447 52246585 + 2 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -789117 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 483-4 chr3 38674447 38675055 + 2 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -25064 NM_001160160 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 634.333-2 chr2 122498396 122498930 + 2 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 574818 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 274-57 chr7 42274429 42274684 + 2 NA Intergenic Charlie20a|DNA|hAT-Charlie -37347 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 304.667-39 chr9 29698767 29698955 + 2 NA Intergenic Intergenic -485260 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 295-41 chr6 41662628 41662872 + 2 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 24282 NM_001300805 4188 Hs.520119 NM_005586 ENSG00000112559 MDFI I-MF|I-mfa MyoD family inhibitor protein-coding 305.333-49 chr3 176111300 176111454 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -133174 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 379-4 chr18 14045242 14045549 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 87040 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 370-7 chr15 60728100 60728435 + 2 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 46698 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 394.667-4 chr22 36125680 36126018 + 2 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 34906 NM_030644 80833 Hs.474737 NM_014349 ENSG00000128284 APOL3 APOLIII|CG121|CG12_1|apoL-III apolipoprotein L3 protein-coding 385.666-3 chr16 52162609 52162852 + 2 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 77449 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 315-22 chr4 89362635 89362832 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -54933 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 278-60 chr7 85954620 85954795 + 2 NA Intergenic Intergenic 533585 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 322-28 chr4 69075583 69075893 + 2 NA intron (NM_001349568, intron 1 of 6) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -20736 NM_001330719 7364 Hs.654424 NM_001074 ENSG00000171234 UGT2B7 UDPGT 2B7|UDPGT 2B9|UDPGT2B7|UDPGTH2|UDPGTh-2|UGT2B9 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B7 protein-coding 516.667-5 chr5 106884224 106884598 + 2 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) L1MEf|LINE|L1 126603 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 265-10 chr10 75601598 75601746 + 2 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) -45837 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 296-63 chr7 146096988 146097273 + 2 NA Intergenic Intergenic -677141 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 316.667-27 chr5 32112527 32112734 + 2 NA Intergenic Intergenic 61689 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 305-36 chr9 3011052 3011213 + 2 NA Intergenic Intergenic -167037 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 457-6 chr5 96904337 96904729 + 2 NA intron (NM_001329229, intron 12 of 17) intron (NM_001329229, intron 12 of 17) 28594 NM_001130140 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 358.667-2 chr1 154176148 154176489 + 2 NA intron (NM_152263, intron 2 of 9) intron (NM_152263, intron 2 of 9) 1886 NM_001278191 7170 Hs.535581 NM_152263 ENSG00000143549 TPM3 CAPM1|CFTD|HEL-189|HEL-S-82p|NEM1|OK/SW-cl.5|TM-5|TM3|TM30|TM30nm|TM5|TPM3nu|TPMsk3|TRK|hscp30 tropomyosin 3 protein-coding 275-10 chr13 37137282 37137467 + 2 NA Intergenic Intergenic -31710 NM_145203 122011 Hs.512897 NM_145203 ENSG00000180138 CSNK1A1L CK1 casein kinase 1 alpha 1 like protein-coding 295-24 chr2 112081297 112081447 + 2 NA exon (NM_032824, exon 8 of 19) exon (NM_032824, exon 8 of 19) 26103 NM_001329914 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 304-37 chr20 2156537 2156718 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -50301 NR_161305 388780 Hs.132163 NR_161305 LOC388780 - uncharacterized LOC388780 ncRNA 344-44 chr8 50598952 50599249 + 2 NA intron (NR_135797, intron 15 of 20) L1M1|LINE|L1 434969 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 488.333 chr2 50887262 50887748 + 2 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 144627 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 304-17 chr11 39411971 39412218 + 2 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 763236 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 584-2 chr5 31222122 31222456 + 2 NA intron (NM_001362435, intron 1 of 10) intron (NM_001362435, intron 1 of 10) 28603 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 200.667-120 chr4 77693184 77693360 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 125792 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 317-24 chr8 80526791 80526974 + 2 NA TTS (NM_023929) TTS (NM_023929) 40656 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 297-24 chr15 93865951 93866186 + 2 NA intron (NR_120321, intron 2 of 3) intron (NR_120321, intron 2 of 3) 9508 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 277-53 chr8 117535986 117536189 + 2 NA intron (NM_080651, intron 3 of 3) intron (NM_080651, intron 3 of 3) 15374 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 339-2 chr1 160573267 160573491 + 2 NA intron (NM_003874, intron 1 of 6) intron (NM_003874, intron 1 of 6) 6117 NM_001330742 8832 Hs.398093 NM_003874 ENSG00000066294 CD84 LY9B|SLAMF5|hCD84|mCD84 CD84 molecule protein-coding 279-10 chr14 54224776 54224944 + 2 NA Intergenic Intergenic -172008 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 334.667-27 chr6 141861162 141861335 + 2 NA Intergenic Intergenic 227551 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 152-50 chr13 56356358 56356545 + 2 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -784467 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 306.666-26 chr5 8076320 8076604 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 207314 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 298-71 chr6 48763655 48763858 + 2 NA Intergenic Intergenic -695067 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 272-54 chr8 113747379 113747586 + 2 NA Intergenic Intergenic -310543 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 144.333-140 chr2 183672906 183673003 + 2 NA Intergenic Intergenic 548511 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 308.666-15 chr6 115543591 115543834 + 2 NA Intergenic Intergenic 100123 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 326-3 chr1 101777690 101777930 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 69270 NM_001288821 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 369.667-11 chr5 108807305 108807588 + 2 NA intron (NM_001308028, intron 3 of 17) L1PA16|LINE|L1 58498 NM_001308038 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 481.333-2 chr17 64529971 64530481 + 2 NA intron (NM_138363, intron 12 of 19) AluSx|SINE|Alu 23249 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 313-35 chr5 111202316 111202591 + 2 NA Intergenic Intergenic -21130 NM_001323375 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 400-2 chr10 99076823 99077170 + 2 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1MB1|LINE|L1 -152428 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 314.333-14 chr2 162706427 162706630 + 2 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) MIRb|SINE|MIR -62408 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 286-30 chr2 120755787 120755972 + 2 NA intron (NM_001371271, intron 1 of 13) L1ME1|LINE|L1 20011 NM_001371271 400.333-19 chr7 64961755 64962312 + 2 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 29003 NM_015852 51351 Hs.250693 NM_015852 ENSG00000152926 ZNF117 H-plk|HPF9 zinc finger protein 117 protein-coding 324.667-8 chr14 48145240 48145427 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -350319 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 451-5 chr22 34927630 34928139 + 2 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 70032 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 255-65 chr5 55267272 55267471 + 2 NA intron (NR_144323, intron 22 of 26) intron (NR_144323, intron 22 of 26) -33654 NR_125347 10309 Hs.3041 NM_021147 ENSG00000152669 CCNO CCNU|CILD29|UDG2 cyclin O protein-coding 484.666-3 chr2 145346631 145347158 + 2 NA Intergenic Intergenic 678927 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 311.333-8 chr10 67150235 67150427 + 2 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) 138065 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 262.667-48 chr21 14940807 14940994 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -22232 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 319-23 chr6 131537285 131537591 + 2 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -35788 NR_160934 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 258-51 chr4 32820674 32820858 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 469728 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 456-2 chr21 37258946 37259260 + 2 NA intron (NM_001331022, intron 1 of 6) intron (NM_001331022, intron 1 of 6) 8231 NM_006052 10311 Hs.369488 NM_006052 ENSG00000157538 VPS26C DCRA|DSCR3|DSCRA VPS26 endosomal protein sorting factor C protein-coding 450.667-7 chr9 26954343 26954824 + 2 NA intron (NM_001099222, intron 1 of 19) L2c|LINE|L2 1724 NR_121605 101929602 Hs.127665 NR_121605 ENSG00000234676 IFT74-AS1 - IFT74 antisense RNA 1 ncRNA 304-19 chr14 84387161 84387444 + 2 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -884630 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 264-22 chr15 35089901 35090087 + 2 NA Intergenic Intergenic -4586 NM_001355281 388112 Hs.635882 NM_001355281 ENSG00000255192 NANOGP8 NANOGP1|PN8 Nanog homeobox retrogene P8 protein-coding 510.666 chr9 984055 984533 + 2 NA intron (NM_021240, intron 1 of 1) intron (NM_021240, intron 1 of 1) 7639 NM_021240 58524 Hs.189174 NM_021240 ENSG00000064218 DMRT3 DMRTA3 doublesex and mab-3 related transcription factor 3 protein-coding 230.666-4 chr1 190740476 190740609 + 2 NA intron (NR_033922, intron 2 of 4) intron (NR_033922, intron 2 of 4) 115652 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 289-33 chr9 32455283 32455435 + 2 NA TTS (NM_001362840) TTS (NM_001362840) 70716 NM_001362840 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 279.333-35 chr18 4744447 4744653 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -289243 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 486.667-5 chr7 106258718 106259049 + 2 NA intron (NM_005746, intron 8 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 26100 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 447.667-2 chr3 122482539 122482783 + 2 NA intron (NR_026698, intron 2 of 14) L1ME1|LINE|L1 32278 NR_026698 3836 Hs.161008 NM_002264 ENSG00000114030 KPNA1 IPOA5|NPI-1|RCH2|SRP1 karyopherin subunit alpha 1 protein-coding 340.667-9 chr19 57305555 57305737 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -14826 NM_213598 125919 Hs.202544 NM_213598 ENSG00000178229 ZNF543 - zinc finger protein 543 protein-coding 561.334 chr20 53334893 53335197 + 2 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 149762 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 404.666-14 chr5 156636343 156636585 + 2 NA intron (NM_001128209, intron 5 of 7) L2c|LINE|L2 -213831 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 341-23 chr5 17721292 17721609 + 2 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -65812 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 295.667-6 chr12 13781148 13781295 + 2 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) L3|LINE|CR1 199135 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 410-13 chr3 14118674 14118949 + 2 NA intron (NM_001098502, intron 1 of 2) intron (NM_001098502, intron 1 of 2) 6059 NM_001098502 131474 Hs.517815 NM_144636 ENSG00000163528 CHCHD4 MIA40|TIMM40 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4 protein-coding 222-61 chr3 81723679 81723822 + 2 NA intron (NM_000158, intron 1 of 15) intron (NM_000158, intron 1 of 15) 37895 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 312.333-22 chr5 52447913 52448207 + 2 NA Intergenic Intergenic -339856 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 286.667-3 chr1 87631078 87631275 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -259521 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 383-3 chr15 71582228 71582515 + 2 NA intron (NM_001286429, intron 1 of 11) L1MA9|LINE|L1 35135 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 326.667-11 chr12 3233993 3234222 + 2 NA intron (NM_001168320, intron 2 of 7) intron (NM_001168320, intron 2 of 7) 132015 NR_148995 100128253 Hs.447497 NR_148995 LOC100128253 - uncharacterized LOC100128253 ncRNA 366.667-2 chr12 88627246 88627529 + 2 NA Intergenic Intergenic -46914 NM_003994 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 449 chr14 68989661 68990043 + 2 NA Intergenic Intergenic 10170 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 389.333-17 chr7 11236034 11236406 + 2 NA Intergenic Intergenic 262348 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 307.333-28 chr14 59883677 59883870 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -12997 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 262.333-5 chr1 117149820 117150065 + 2 NA intron (NM_024626, intron 4 of 5) intron (NM_024626, intron 4 of 5) -28193 NM_025188 80263 Hs.301526 NM_025188 ENSG00000134253 TRIM45 RNF99 tripartite motif containing 45 protein-coding 321-8 chr14 80354909 80355151 + 2 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) intron (NR_038355, intron 2 of 8) -123973 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 326.667-12 chr14 53721845 53722012 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 226556 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 367.334 chr12 40239340 40239657 + 2 NA intron (NM_198578, intron 5 of 50) intron (NM_198578, intron 5 of 50) 14501 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 312.334-6 chr8 119667478 119667732 + 2 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) intron (NM_001330600, intron 1 of 25) 5785 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 451.667-3 chr18 4251888 4252370 + 2 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -12473 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 330.666-16 chr4 84428136 84428416 + 2 NA Intergenic Intergenic 69958 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 261-16 chr11 80916526 80916785 + 2 NA Intergenic Intergenic -153852 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 362-26 chr9 124768085 124768393 + 2 NA intron (NM_001278546, intron 1 of 9) intron (NM_001278546, intron 1 of 9) 3072 NM_001489 2649 Hs.20131 NM_001489 ENSG00000148200 NR6A1 CT150|GCNF|GCNF1|NR61|RTR|hGCNF|hRTR nuclear receptor subfamily 6 group A member 1 protein-coding 259.667-20 chr14 53405336 53405541 + 2 NA Intergenic Intergenic 252084 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 252.666-40 chr6 86860502 86860647 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -76954 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 160-49 chr17 70787110 70787261 + 2 NA Intergenic Intergenic 414994 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 315-29 chr8 126139295 126139498 + 2 NA Intergenic Intergenic -186099 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 319-31 chr8 34566452 34566694 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -217348 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 338-23 chr4 142103748 142104006 + 2 NA intron (NM_001331040, intron 23 of 25) intron (NM_001331040, intron 23 of 25) 467294 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 236-10 chr11 15949451 15949603 + 2 NA Intergenic Intergenic 20094 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 190.666-22 chr17 30838840 30839008 + 2 NA intron (NM_024857, intron 3 of 22) intron (NM_024857, intron 3 of 22) 6958 NM_024857 79915 Hs.528902 NM_024857 ENSG00000176208 ATAD5 C17orf41|ELG1|FRAG1 ATPase family AAA domain containing 5 protein-coding 310.667-4 chr10 30681450 30681660 + 2 NA Intergenic Intergenic -10719 NR_036438 645954 Hs.408581 NR_036438 SVIL2P SVILP1 supervillin family member 2, pseudogene pseudo 481.667 chr1 30137776 30138181 + 2 NA Intergenic Intergenic -100366 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 361-12 chr21 23572285 23572593 + 2 NA Intergenic Intergenic -187604 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 306.666-10 chr16 55632849 55633067 + 2 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -23106 NM_001172501 6530 Hs.78036 NM_001043 ENSG00000103546 SLC6A2 NAT1|NET|NET1|SLC6A5 solute carrier family 6 member 2 protein-coding 324-11 chr19 28117343 28117607 + 2 NA Intergenic Intergenic -323535 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 283-38 chr8 130649166 130649416 + 2 NA Intergenic Intergenic -205617 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 435.667-4 chr6 47855077 47855430 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 68185 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 305-12 chr20 38686036 38686239 + 2 NA Intergenic Intergenic -38349 NM_080552 140679 Hs.179080 NM_080552 ENSG00000101438 SLC32A1 VGAT|VIAAT solute carrier family 32 member 1 protein-coding 424.334-2 chr15 58617558 58618046 + 2 NA intron (NM_001320570, intron 10 of 14) L1MA4|LINE|L1 75805 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 412.333-9 chr8 74083734 74084158 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 92554 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 398-8 chr2 181522793 181523238 + 2 NA intron (NM_000885, intron 18 of 27) intron (NM_000885, intron 18 of 27) 65629 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 567 chr1 64371867 64372382 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -98005 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 398-7 chr18 70027760 70027991 + 2 NA intron (NM_001318520, intron 42 of 47) intron (NM_001318520, intron 42 of 47) -71076 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 304.667-37 chr8 117220166 117220335 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 85255 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 458-3 chr2 83983110 83983565 + 2 NA Intergenic Intergenic -307345 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 297-36 chr4 66290253 66290407 + 2 NA Intergenic Intergenic 13506 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 170-75 chr3 31640654 31640819 + 2 NA Intergenic Intergenic -63477 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 501.666 chrX 91450692 91451284 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -15989 NR_110659 102724167 Hs.571694 NR_110659 ENSG00000234161 PABPC5-AS1 CXorf46 PABPC5 antisense RNA 1 ncRNA 338.667-15 chr17 75652366 75652564 + 2 NA intron (NM_001003716, intron 7 of 7) intron (NM_001003716, intron 7 of 7) 6214 NM_001162997 100130933 Hs.662541 NM_001162997 ENSG00000259120 SMIM6 C17orf110|ELN small integral membrane protein 6 protein-coding 283.667-40 chrX 151362028 151362230 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -34466 NM_001363810 203547 Hs.58633 NM_001017980 ENSG00000160131 VMA21 MEAX|XMEA vacuolar ATPase assembly factor VMA21 protein-coding 245.667-29 chr2 13693053 13693189 + 2 NA Intergenic Intergenic -686108 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 300-61 chr7 23641326 23641547 + 2 NA intron (NM_138771, intron 3 of 3) L1MB4|LINE|L1 -38763 NM_199136 340277 Hs.592178 NM_199136 ENSG00000188732 FAM221A C7orf46 family with sequence similarity 221 member A protein-coding 426-12 chr6 43412189 43412457 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -15218 NM_001198934 89845 Hs.55879 NM_033450 ENSG00000124574 ABCC10 EST182763|MRP7|SIMRP7 ATP binding cassette subfamily C member 10 protein-coding 164.333-194 chr5 56380925 56381031 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 100791 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 364-22 chr5 36004497 36004835 + 2 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -3644 NM_001171873 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 362.334-6 chr9 29262633 29262876 + 2 NA Intergenic Intergenic -49153 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 338-25 chr5 94702799 94703066 + 2 NA Intergenic Intergenic 84263 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 406-4 chr14 26417985 26418386 + 2 NA Intergenic Intergenic 135245 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 310-35 chr3 112288169 112288419 + 2 NA intron (NM_001320531, intron 1 of 27).2 intron (NM_001320531, intron 1 of 27).2 5922 NM_001320531 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 235-38 chr21 42525841 42526070 + 2 NA intron (NM_001320537, intron 3 of 19) intron (NM_001320537, intron 3 of 19) 12103 NM_001320537 54020 Hs.547009 NM_018964 ENSG00000160190 SLC37A1 G3PP solute carrier family 37 member 1 protein-coding 275.666-9 chr2 48887272 48887526 + 2 NA Intergenic Intergenic -131675 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 241.333-29 chr12 6713648 6713876 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -10284 NM_001164095 50813 Hs.530823 NM_016319 ENSG00000111652 COPS7A CSN7|CSN7A|SGN7a COP9 signalosome subunit 7A protein-coding 463-2 chr2 149699593 149699983 + 2 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 -112013 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 394.667-9 chr7 46073552 46074110 + 2 NA Intergenic Intergenic -152559 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 452.333-4 chr2 81108261 81108613 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 358509 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 226-39 chr2 57255290 57255484 + 2 NA Intergenic Intergenic -652264 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 358.667-12 chr14 67983523 67983733 + 2 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 160036 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 395.999-3 chr7 83578869 83579159 + 2 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 62417 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 548.334 chr12 65600524 65600860 + 2 NA intron (NR_120434, intron 2 of 4) intron (NR_120434, intron 2 of 4) -2177 NR_146529 105369807 NR_146529 ENSG00000256268 LINC02454 - long intergenic non-protein coding RNA 2454 ncRNA 372.334-8 chr8 61235836 61236334 + 2 NA Intergenic Intergenic -51885 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 284-14 chr12 89799502 89799737 + 2 NA Intergenic Intergenic -90253 NM_001366531 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 394.667-10 chr7 49902309 49902623 + 2 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) L1MD2|LINE|L1 127133 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 300.667-12 chr16 12253076 12253237 + 2 NA intron (NM_032167, intron 14 of 20) intron (NM_032167, intron 14 of 20) 276422 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 318-21 chr16 82239436 82239652 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -69320 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 284-52 chr6 52087815 52088040 + 2 NA promoter-TSS (NM_170724) promoter-TSS (NM_170724) -314 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 360.667-8 chr17 60736339 60736718 + 2 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) L1MCa|LINE|L1 58677 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 351-22 chr8 132879213 132879450 + 2 NA intron (NM_003235, intron 5 of 47) MIRb|SINE|MIR 12373 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 276.667-71 chr9 28216674 28216840 + 2 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 502548 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 453.333-2 chr15 54823626 54824024 + 2 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -232922 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 340-17 chr2 66898305 66898550 + 2 NA Intergenic Intergenic -6009 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 211-12 chr10 113851297 113851463 + 2 NA intron (NM_001271816, intron 2 of 9) intron (NM_001271816, intron 2 of 9) 2702 NM_014881 9937 Hs.1560 NM_014881 ENSG00000198924 DCLRE1A PSO2|SNM1|SNM1A DNA cross-link repair 1A protein-coding 353.667-2 chr10 72408886 72409184 + 2 NA intron (NM_001195519, intron 4 of 6) intron (NM_001195519, intron 4 of 6) -54116 NM_001002762 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 307.333-68 chr6 46628146 46628360 + 2 NA intron (NM_016593, intron 6 of 11) intron (NM_016593, intron 6 of 11) 24565 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 250.666-26 chr4 44944920 44945166 + 2 NA Intergenic Intergenic -218409 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 344.334-7 chr9 5901598 5901867 + 2 NA intron (NM_005511, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 10843 NM_005511 2315 Hs.154069 NM_005511 ENSG00000120215 MLANA MART-1|MART1 melan-A protein-coding 307-37 chr8 81007766 81007965 + 2 NA intron (NM_018440, intron 3 of 8) intron (NM_018440, intron 3 of 8) 104203 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 306.333-15 chr12 50546829 50547055 + 2 NA intron (NM_173602, intron 1 of 37) intron (NM_173602, intron 1 of 37) 41957 NM_173602 57609 Hs.505516 NM_020849 ENSG00000066084 DIP2B - disco interacting protein 2 homolog B protein-coding 243-57 chr6 41850660 41850973 + 2 NA intron (NM_001286554, intron 1 of 5) AluSc|SINE|Alu 20821 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 248.666-2 chr1 47508883 47509143 + 2 NA Intergenic Intergenic -71696 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 388-7 chr16 76421579 76421815 + 2 NA intron (NR_136213, intron 3 of 23) intron (NR_136213, intron 3 of 23) 111845 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 335-4 chr10 22301795 22301985 + 2 NA Intergenic Intergenic -14493 NM_001204062 100532731 Hs.380403 NM_001204062 ENSG00000269897 COMMD3-BMI1 BMI1|PCGF4|RNF51 COMMD3-BMI1 readthrough protein-coding 525.001 chr15 48519798 48520259 + 2 NA intron (NM_000138, intron 10 of 65) L1MA8|LINE|L1 125760 NM_000138 2200 Hs.591133 NM_000138 ENSG00000166147 FBN1 ACMICD|ECTOL1|FBN|GPHYSD2|MASS|MFLS|MFS1|OCTD|SGS|SSKS|WMS|WMS2 fibrillin 1 protein-coding 261.333-88 chr5 82180211 82180403 + 2 NA intron (NM_031482, intron 5 of 7) intron (NM_031482, intron 5 of 7) 98047 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 447.333-5 chr14 57848328 57848805 + 2 NA intron (NM_001352012, intron 1 of 8) HAL1|LINE|L1 16433 NM_001352013 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 395.667-4 chr15 94356081 94356419 + 2 NA exon (NM_001159643, exon 8 of 20) exon (NM_001159643, exon 8 of 20) 320 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 300.667-42 chr8 78521762 78521972 + 2 NA intron (NM_181839, intron 1 of 2) L1MB4|LINE|L1 5527 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 360-22 chr4 35352580 35352896 + 2 NA Intergenic Intergenic 891201 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 327-18 chr22 40265060 40265378 + 2 NA exon (NM_001162501, exon 5 of 23) exon (NM_001162501, exon 5 of 23) -81281 NR_134256 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 374.666-7 chr6 112833980 112834249 + 2 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 486784 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 350.667-5 chr17 48497134 48497492 + 2 NA Intergenic Intergenic 33698 NM_002144 3211 Hs.99992 NM_002144 ENSG00000120094 HOXB1 HCFP3|HOX2|HOX2I|Hox-2.9 homeobox B1 protein-coding 256-47 chr2 145694241 145694549 + 2 NA Intergenic Intergenic -892662 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 300.667-33 chr5 16152154 16152311 + 2 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 27559 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 351.333-22 chr3 159730649 159730873 + 2 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 37851 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 312-15 chr11 103717840 103718070 + 2 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -131951 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 258.666-21 chr2 114838730 114838968 + 2 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -5301 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 362-13 chr2 77300533 77300795 + 2 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 221712 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 405-18 chr9 85276686 85276961 + 2 NA Intergenic Intergenic 465206 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 393-12 chr5 37628994 37629262 + 2 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) L1MA5A|LINE|L1 205694 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 361.667-17 chr6 122166662 122166977 + 2 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -232732 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 293.333-35 chr2 211743950 211744307 + 2 NA intron (NM_001042599, intron 5 of 26) intron (NM_001042599, intron 5 of 26) 682232 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 308.333-33 chr6 70327671 70327856 + 2 NA Intergenic Intergenic -24679 NM_001851 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 349.333-32 chr8 135942830 135943251 + 2 NA Intergenic Intergenic 485584 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 301-38 chr4 122125462 122125616 + 2 NA Intergenic Intergenic -45064 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 213.667-34 chr15 69959393 69959567 + 2 NA Intergenic Intergenic 119988 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 345.333-8 chr13 94957046 94957387 + 2 NA Intergenic Intergenic -2825 NR_047487 100861544 Hs.48706 NR_047487 ENSG00000260962 LINC00557 - long intergenic non-protein coding RNA 557 ncRNA 389.333-11 chr22 29146743 29147022 + 2 NA TTS (NM_001039570) TTS (NM_001039570) -59014 NM_001267895 129080 Hs.289106 NM_133455 ENSG00000186998 EMID1 EMI5|EMU1 EMI domain containing 1 protein-coding 306.667-12 chr15 42849342 42849696 + 2 NA intron (NM_173500, intron 3 of 14) L1MD2|LINE|L1 71259 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 303.333-73 chr8 28431388 28431551 + 2 NA intron (NM_001258211, intron 6 of 7) intron (NM_001258211, intron 6 of 7) -45009 NM_018660 55893 Hs.435535 NM_018660 ENSG00000186918 ZNF395 HDBP-2|HDBP2|HDRF-2|PBF|PRF-1|PRF1|Si-1-8-14 zinc finger protein 395 protein-coding 400-13 chr5 167720329 167720587 + 2 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -34471 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 372-9 chr16 8143960 8144579 + 2 NA Intergenic Intergenic 445569 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 293-27 chr2 181761777 181761950 + 2 NA Intergenic MER126|DNA|DNA -81198 NM_002500 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 299.333-5 chr10 50327751 50327927 + 2 NA intron (NM_147156, intron 7 of 10) intron (NM_147156, intron 7 of 10) -79229 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 391-13 chr7 28027517 28027907 + 2 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR -152745 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 307-30 chr4 96873988 96874239 + 2 NA Intergenic Intergenic -492813 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 440-8 chr4 115787153 115787445 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -512426 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 306.667-33 chr3 112535838 112536067 + 2 NA intron (NM_001278712, intron 10 of 10) intron (NM_001278712, intron 10 of 10) -25368 NM_001348906 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 741.667 chr6 74911185 74911694 + 2 NA Intergenic Intergenic 217343 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 470-4 chr6 102971556 102971919 + 2 NA Intergenic Intergenic 1572752 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 580.667-2 chr12 4026699 4027371 + 2 NA Intergenic Intergenic -153587 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 399.667-3 chr14 77463691 77464199 + 2 NA intron (NM_012111, intron 4 of 8) intron (NM_012111, intron 4 of 8) 5852 NM_012111 10598 Hs.204041 NM_012111 ENSG00000100591 AHSA1 AHA1|C14orf3|hAha1|p38 activator of HSP90 ATPase activity 1 protein-coding 276-8 chr10 59629547 59629750 + 2 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 80243 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 360-8 chr13 79375811 79376021 + 2 NA intron (NM_022118, intron 3 of 20) MIRb|SINE|MIR 30305 NM_001286632 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 375.333-6 chr11 103079883 103080285 + 2 NA intron (NM_001318740, intron 3 of 6) intron (NM_001318740, intron 3 of 6) 12076 NM_032299 84259 Hs.503716 NM_032299 ENSG00000137692 DCUN1D5 SCCRO5 defective in cullin neddylation 1 domain containing 5 protein-coding 689 chr2 73553522 73554154 + 2 NA intron (NM_015120, intron 13 of 22) HAL1|LINE|L1 88584 NM_003960 9027 Hs.14637 NM_003960 ENSG00000144035 NAT8 ATase2|CCNAT|CML1|GLA|Hcml1|TSC501|TSC510 N-acetyltransferase 8 (putative) protein-coding 286-28 chr2 89847562 89847738 + 2 NA Intergenic Intergenic -209743 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 280-52 chr7 89988823 89989060 + 2 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) intron (NR_110029, intron 2 of 2) -130459 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 450 chr14 27945096 27945527 + 2 NA Intergenic Intergenic -272090 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 605 chr2 65277380 65277959 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 49974 NM_005722 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 221.333-114 chr5 77569353 77569619 + 2 NA Intergenic Intergenic 69211 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 359.333-6 chr13 53938467 53938774 + 2 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 123201 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 305.333-8 chr10 60636977 60637162 + 2 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) -64113 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 289.333-50 chr5 87239759 87240003 + 2 NA promoter-TSS (NR_130914) promoter-TSS (NR_130914) -680 NR_130914 55338 Hs.677194 NM_018382 LINC01949 - long intergenic non-protein coding RNA 1949 ncRNA 539.333 chr22 41054740 41055327 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 18688 NR_132979 106635682 NR_132979 SNORD140 - small nucleolar RNA, C/D box 140 snoRNA 630.667-2 chr3 21006275 21006775 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -399201 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 246-2 chr1 77364319 77364567 + 2 NA intron (NM_012093, intron 6 of 13) L1MA5A|LINE|L1 81356 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 294.666-3 chr12 89669825 89670045 + 2 NA intron (NM_001001323, intron 1 of 21) intron (NM_001001323, intron 1 of 21) 38903 NM_001366525 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 277.334-9 chr21 22858365 22858537 + 2 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -220833 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 826.333 chr12 128499055 128499834 + 2 NA intron (NM_001136103, intron 2 of 8) L1MA4|LINE|L1 205352 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 296-45 chr4 19492490 19492713 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -759304 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 443.333-6 chr20 50000266 50000578 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 17442 NM_005985 6615 Hs.48029 NM_005985 ENSG00000124216 SNAI1 SLUGH2|SNA|SNAH|SNAIL|SNAIL1|dJ710H13.1 snail family transcriptional repressor 1 protein-coding 361-7 chr14 43205680 43206005 + 2 NA Intergenic Intergenic 1301441 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 370.667-14 chr2 45522572 45522940 + 2 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 88511 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 467.333-8 chr5 16913505 16913938 + 2 NA intron (NM_012334, intron 1 of 40) intron (NM_012334, intron 1 of 40) 22567 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 210-132 chr6 63222037 63222232 + 2 NA Intergenic Intergenic 97843 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 300.333-28 chr20 51201382 51201537 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -178352 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 465.334 chr1 22331263 22331665 + 2 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 65225 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 490.667 chr10 108444865 108445292 + 2 NA Intergenic Intergenic -375785 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 444-8 chr8 85427748 85428164 + 2 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -10903 NM_005181 761 Hs.82129 NM_005181 ENSG00000164879 CA3 CAIII|Car3 carbonic anhydrase 3 protein-coding 336.667-4 chr1 66138752 66138937 + 2 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -88126 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 420.666 chr10 95987785 95988201 + 2 NA intron (NM_001349008, intron 19 of 34) intron (NM_001349008, intron 19 of 34) -12098 NM_001001732 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 374.667-7 chr19 32885644 32885942 + 2 NA intron (NM_032816, intron 17 of 18) L1M7|LINE|L1 -16026 NM_014270 11136 Hs.743345 NM_014270 ENSG00000021488 SLC7A9 BAT1|CSNU3 solute carrier family 7 member 9 protein-coding 303-2 chr1 77822228 77822494 + 2 NA intron (NM_198549, intron 7 of 15) AluJo|SINE|Alu 42556 NM_001363586 374986 Hs.437755 NM_198549 ENSG00000180488 MIGA1 FAM73A mitoguardin 1 protein-coding 309.333-43 chr3 7416810 7416990 + 2 NA intron (NM_000844, intron 5 of 9) intron (NM_000844, intron 5 of 9) 118384 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 309.667-3 chr1 50708491 50708804 + 2 NA intron (NM_007051, intron 6 of 18) L2|LINE|L2 251620 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 261-25 chr16 31287204 31287424 + 2 NA intron (NM_001145808, intron 12 of 29) L1PA16|LINE|L1 27339 NM_000632 3684 Hs.172631 NM_000632 ENSG00000169896 ITGAM CD11B|CR3A|MAC-1|MAC1A|MO1A|SLEB6 integrin subunit alpha M protein-coding 323.667-12 chr19 28129831 28130117 + 2 NA Intergenic Intergenic -336034 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 282.666-23 chr7 12250375 12250545 + 2 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 39166 NM_001134232 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 308-34 chr3 100273893 100274070 + 2 NA intron (NM_001199198, intron 1 of 18) L1ME4a|LINE|L1 12989 NM_001199198 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 309.334-2 chr13 30338684 30338938 + 2 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -31260 NM_032116 84056 Hs.243596 NM_032116 ENSG00000102781 KATNAL1 - katanin catalytic subunit A1 like 1 protein-coding 720 chr19 41314273 41314783 + 2 NA intron (NM_001346100, intron 1 of 4) intron (NM_001346100, intron 1 of 4) 4051 NM_001346100 90324 Hs.437497 NM_052848 ENSG00000142039 CCDC97 - coiled-coil domain containing 97 protein-coding 307.333-71 chr7 8863777 8864002 + 2 NA Intergenic Intergenic 430280 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 297.333-58 chrX 127589274 127589541 + 2 NA Intergenic Intergenic 462996 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 457.334-2 chr8 142387596 142388041 + 2 NA intron (NM_001366903, intron 1 of 9) L1M7|LINE|L1 15364 NM_001366902 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 318-29 chr2 177376626 177376912 + 2 NA intron (NR_026966, intron 1 of 8) intron (NR_026966, intron 1 of 8) 15922 NR_026966 100130691 Hs.707723 NM_182585 ENSG00000213963 LOC100130691 - uncharacterized LOC100130691 ncRNA 433-5 chr4 76102407 76102983 + 2 NA intron (NM_001130017, intron 8 of 9) L1ME4a|LINE|L1 28000 NM_001179 419 Hs.24976 NM_001179 ENSG00000156219 ART3 ARTC3 ADP-ribosyltransferase 3 protein-coding 438-6 chr16 80074701 80074970 + 2 NA Intergenic Intergenic 279586 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 243-21 chr18 56009573 56009757 + 2 NA intron (NR_148972, intron 8 of 8) intron (NR_148972, intron 8 of 8) -32613 NR_146510 102724698 NR_146510 ENSG00000267057 LINC01905 - long intergenic non-protein coding RNA 1905 ncRNA 227.334-6 chr2 125114998 125115221 + 2 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 1002876 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 562.334-2 chr8 134748553 134748891 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -35691 NM_001289394 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 482-3 chr14 86764389 86764713 + 2 NA Intergenic Intergenic -141227 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 324-7 chr14 58281196 58281494 + 2 NA intron (NR_029435, intron 2 of 3) intron (NR_029435, intron 2 of 3) -6688 NR_146595 55451 NR_146595 ENSG00000279636 LINC00216 C14orf107|NCRNA00216|PRO1617 long intergenic non-protein coding RNA 216 ncRNA 446.667 chr1 117310119 117310674 + 2 NA intron (NR_126408, intron 2 of 2) intron (NR_126408, intron 2 of 2) 14930 NR_126408 104355292 Hs.576446 NR_126408 ENSG00000235202 LINC01525 lnc-MAN1A2-1 long intergenic non-protein coding RNA 1525 ncRNA 388.333-20 chr7 44483347 44483743 + 2 NA intron (NM_015332, intron 2 of 5) intron (NM_015332, intron 2 of 5) 7113 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 292.667-9 chr12 125991214 125991425 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -7945 NR_034132 400084 Hs.156191 NR_034132 ENSG00000249267 LINC00939 - long intergenic non-protein coding RNA 939 ncRNA 304.667-3 chr10 9037672 9037948 + 2 NA Intergenic Intergenic 139821 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 319.333-25 chr4 101030243 101030564 + 2 NA intron (NM_000944, intron 12 of 13) intron (NM_000944, intron 12 of 13) 210469 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 496.667-7 chrX 20486256 20486718 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -219578 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 309-2 chr1 46044334 46044604 + 2 NA intron (NM_001328652, intron 8 of 8) intron (NM_001328652, intron 8 of 8) 86204 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 336.333-12 chr13 36253740 36254023 + 2 NA intron (NM_001144981, intron 5 of 7) intron (NM_001144981, intron 5 of 7) -39266 NM_001282147 54937 Hs.124519 NM_017826 ENSG00000120669 SOHLH2 SOSF2|SPATA28|TEB1|bHLHe81 spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2 protein-coding 204.667-146 chr8 57880078 57880252 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -98193 NR_130934 100505477 Hs.434693 NR_130934 ENSG00000205293 LINC01602 T1560 long intergenic non-protein coding RNA 1602 ncRNA 437.334 chr1 189965379 189965745 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 510448 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 322.666-18 chr2 88910456 88910705 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 98210 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 219-73 chr6 119910006 119910234 + 2 NA Intergenic Intergenic -105059 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 267.333-59 chr21 34961227 34961385 + 2 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) AluSc8|SINE|Alu -72607 NM_001001890 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 308.667-40 chr8 107086871 107087110 + 2 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 249525 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 180.667-120 chr6 46708656 46708800 + 2 NA intron (NM_005084, intron 9 of 11) intron (NM_005084, intron 9 of 11) -20563 NR_134643 101926934 Hs.664979 NR_134642 ENSG00000242973 LOC101926934 - uncharacterized LOC101926934 ncRNA 310-59 chr8 66841618 66841905 + 2 NA intron (NM_170709, intron 13 of 15) intron (NM_170709, intron 13 of 15) -29010 NM_173518 157777 Hs.437006 NM_173518 ENSG00000178460 MCMDC2 C8orf45 minichromosome maintenance domain containing 2 protein-coding 461-4 chr18 6313251 6313560 + 2 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 45625 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 342-38 chr7 107465070 107465466 + 2 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) L1MCc|LINE|L1 -4789 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 343.333-37 chr8 130254608 130254822 + 2 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 41818 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 310.667-19 chr2 99882358 99882550 + 2 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 223129 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 290-23 chr2 150784277 150784431 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 155457 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 414.666-11 chr5 53775090 53775360 + 2 NA TTS (NR_147167) TTS (NR_147167) 44457 NR_147168 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 328.667-6 chr14 49177365 49177663 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 408866 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 306 chr1 85726923 85727164 + 2 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -18610 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 354.333-13 chr20 10845204 10845578 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 63881 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 394.666-9 chr4 100392336 100392673 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 2743 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 327.666 chr11 15849561 15849805 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 119938 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 534.333 chr6 153314463 153315094 + 2 NA Intergenic Intergenic -183496 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 304.333-32 chr7 7158585 7158829 + 2 NA Intergenic Intergenic -23908 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 415.333-2 chr18 21032875 21033157 + 2 NA intron (NM_005406, intron 9 of 32) AluJr4|SINE|Alu 78797 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 303 chr1 71007135 71007313 + 2 NA 3' UTR (NM_198715, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_198715, exon 2 of 2) -39282 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 307.333-45 chr2 174537791 174538059 + 2 NA Intergenic Intergenic 20147 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 330.666-14 chr3 41600126 41600358 + 2 NA intron (NR_136342, intron 29 of 34) L2a|LINE|L2 361861 NM_001322501 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 325.333-35 chr5 40121957 40122126 + 2 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 69750 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 295.333-18 chr15 64697471 64697678 + 2 NA intron (NM_002537, intron 1 of 4) MER2|DNA|TcMar-Tigger 5707 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 310.667-8 chr12 77163942 77164138 + 2 NA Intergenic Intergenic -98471 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 279.667-32 chr4 32398316 32398471 + 2 NA Intergenic Intergenic 47355 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 297.333-48 chr6 141033539 141033718 + 2 NA Intergenic Intergenic 349814 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 375.667-5 chr11 114701750 114702134 + 2 NA intron (NM_182495, intron 3 of 5) MER8|DNA|TcMar-Tigger 23415 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 324.333-36 chr7 54841320 54841550 + 2 NA Intergenic Intergenic 82122 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 553.667 chr2 144959068 144959906 + 2 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) intron (NR_033870, intron 3 of 4) 291520 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 424-12 chr4 32759293 32759591 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 408404 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 248-27 chr15 76878371 76878611 + 2 NA intron (NM_001353012, intron 2 of 32) L1MEg|LINE|L1 -16547 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 304-40 chr3 21094240 21094399 + 2 NA Intergenic Intergenic -311407 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 314-38 chr5 103472525 103472782 + 2 NA Intergenic Intergenic 69332 NR_104670 102467212 Hs.641885 NR_104670 ENSG00000248757 LINC02115 - long intergenic non-protein coding RNA 2115 ncRNA 354.334-7 chr5 40926992 40927323 + 2 NA intron (NM_000587, intron 1 of 17) L1MA3|LINE|L1 17660 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 391.667-5 chr14 48063031 48063429 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -268216 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 296.667-9 chr12 15277219 15277457 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -45170 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 295-37 chr5 100888943 100889101 + 2 NA intron (NM_005668, intron 2 of 4) intron (NM_005668, intron 2 of 4) 14260 NM_005668 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 295-16 chr15 72776117 72776361 + 2 NA intron (NM_001365225, intron 1 of 6) intron (NM_001365225, intron 1 of 6) -6596 NR_040107 100287559 Hs.562587 NR_040107 ENSG00000260898 ADPGK-AS1 - ADPGK antisense RNA 1 ncRNA 374.666-9 chr8 108471328 108471600 + 2 NA TTS (NM_001329494) TTS (NM_001329494) 27840 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 302.333-38 chr9 21866752 21867212 + 2 NA TTS (NM_002451) TTS (NM_002451) 64346 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 299.333-44 chr2 217691506 217691864 + 2 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 64908 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 549.333 chr10 29106505 29106839 + 2 NA Intergenic Intergenic -182398 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 280.666-7 chr14 88825778 88825942 + 2 NA intron (NR_159362, intron 1 of 14) intron (NR_159362, intron 1 of 14) 1209 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 218-116 chr8 126051131 126051322 + 2 NA Intergenic Intergenic -100029 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 316.666-16 chr5 150741915 150742249 + 2 NA intron (NM_001135643, intron 4 of 13) intron (NM_001135643, intron 4 of 13) 16438 NM_001135644 51164 Hs.675564 NM_016221 ENSG00000132912 DCTN4 DYN4|P62 dynactin subunit 4 protein-coding 303.333-66 chr6 66344121 66344285 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 556324 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 426-9 chr3 70663289 70663567 + 2 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -350790 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 291.667-30 chr6 41865242 41865391 + 2 NA intron (NM_001286554, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 6321 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 219-78 chr7 91918194 91918402 + 2 NA Intergenic Intergenic -22564 NM_147185 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 383-11 chrX 41584495 41584768 + 2 NA intron (NM_003688, intron 14 of 26) MER1B|DNA|hAT-Charlie -104342 NM_001097579 2857 Hs.495989 NM_005300 ENSG00000171659 GPR34 LYPSR1 G protein-coupled receptor 34 protein-coding 364.333-4 chr10 45053606 45054017 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 52888 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 328-17 chr2 9448973 9449268 + 2 NA intron (NM_016207, intron 11 of 17) AluSx1|SINE|Alu -25431 NM_001320859 285148 Hs.667226 NM_001039613 ENSG00000134330 IAH1 - isoamyl acetate hydrolyzing esterase 1 (putative) protein-coding 329.333-51 chr6 55331305 55331471 + 2 NA intron (NM_207410, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 3919 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 375.333-32 chr8 26997717 26998071 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 51069 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 311.333-5 chr1 226533950 226534162 + 2 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL -14708 NM_001003665 375057 Hs.116827 NM_001003665 ENSG00000203685 STUM C1orf95 stum, mechanosensory transduction mediator homolog protein-coding 400.667 chr17 61199223 61199539 + 2 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 168323 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 315.333-53 chr8 126704011 126704198 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -145626 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 277-5 chr10 31333395 31333640 + 2 NA intron (NM_001323675, intron 1 of 6) L1ME3E|LINE|L1 11857 NM_001323673 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 298-58 chr3 194918533 194918827 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -149971 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 254-26 chr17 48380842 48380998 + 2 NA intron (NM_001075099, intron 2 of 12) intron (NM_001075099, intron 2 of 12) 49294 NM_003726 8631 Hs.316931 NM_003726 ENSG00000141293 SKAP1 HEL-S-81p|SCAP1|SKAP55 src kinase associated phosphoprotein 1 protein-coding 266-4 chr1 117890463 117890721 + 2 NA intron (NM_001135589, intron 8 of 12) intron (NM_001135589, intron 8 of 12) 39029 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 563-5 chr7 53579354 53580104 + 2 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 232202 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 302.667-22 chr3 63226354 63226587 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -51838 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 269.333-91 chr8 141833627 141833853 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -47427 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 476-4 chr14 52853021 52853394 + 2 NA Intergenic Intergenic -61600 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 240.333-71 chr5 15641685 15641901 + 2 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) MLT2B4|LTR|ERVL -26791 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 231.333-122 chr8 135104447 135104618 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -129599 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 368.667-10 chr5 43802656 43802896 + 2 NA Intergenic Intergenic -199546 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 315-32 chr9 102885166 102885424 + 2 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -110038 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 347-15 chr2 43122624 43122805 + 2 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -20269 NR_151714 100506047 Hs.127112 NR_151714 LINC02580 - long intergenic non-protein coding RNA 2580 ncRNA 300.667-48 chr9 80198474 80198734 + 2 NA Intergenic Intergenic 223581 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 222-104 chr9 83787556 83787769 + 2 NA intron (NM_025211, intron 5 of 12) intron (NM_025211, intron 5 of 12) 30107 NM_025211 80318 Hs.522255 NM_025211 ENSG00000165113 GKAP1 FKSG21|GKAP42 G kinase anchoring protein 1 protein-coding 294-2 chr1 41122602 41122879 + 2 NA intron (NM_001172218, intron 7 of 15) MIRb|SINE|MIR 38692 NM_001031694 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 348.334 chr1 84707023 84707305 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -16696 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 282-24 chr2 50671543 50671718 + 2 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 24632 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 338.666-4 chr12 57301766 57302132 + 2 NA intron (NM_001351215, intron 3 of 22) intron (NM_001351215, intron 3 of 22) 39825 NM_001351206 22864 Hs.443673 NM_014925 ENSG00000179912 R3HDM2 CAG6|PR01365 R3H domain containing 2 protein-coding 444.666-5 chr9 132275484 132275758 + 2 NA intron (NM_001351527, intron 22 of 25) intron (NM_001351527, intron 22 of 25) 79235 NM_001351527 23064 Hs.460317 NM_015046 ENSG00000107290 SETX ALS4|AOA2|SCAN2|SCAR1|Sen1|bA479K20.2 senataxin protein-coding 322-16 chr15 63746152 63746351 + 2 NA intron (NM_003922, intron 12 of 77) L1MB7|LINE|L1 87697 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 279.999-4 chr17 64091287 64091530 + 2 NA intron (NM_001433, intron 2 of 21) intron (NM_001433, intron 2 of 21) 38736 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 320-8 chr12 15922047 15922245 + 2 NA intron (NM_015954, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 10814 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 235.333-49 chr19 44616818 44616991 + 2 NA intron (NM_001205280, intron 1 of 4) (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3341 NM_001205280 147710 Hs.512509 NM_001205280 ENSG00000216588 IGSF23 - immunoglobulin superfamily member 23 protein-coding 336-10 chr14 70018489 70018758 + 2 NA intron (NM_001034852, intron 10 of 11) intron (NM_001034852, intron 10 of 11) 40490 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 426-13 chr6 136495879 136496224 + 2 NA intron (NM_001198617, intron 1 of 15) intron (NM_001198617, intron 1 of 15) -29176 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 282-37 chr3 114357956 114358200 + 2 NA intron (NR_038993, intron 3 of 8) intron (NR_038993, intron 3 of 8) 6267 NR_038993 100131117 Hs.122417 NR_038993 ENSG00000241560 ZBTB20-AS1 - ZBTB20 antisense RNA 1 ncRNA 455-11 chr7 38079615 38080122 + 2 NA Intergenic (TATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -98377 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 341-3 chr1 203738724 203738981 + 2 NA intron (NM_001001396, intron 21 of 21) intron (NM_001001396, intron 21 of 21) 8275 NR_046213 84719 Hs.661178 NM_032633 LINC00260 C1orf217|NCRNA00260 long intergenic non-protein coding RNA 260 ncRNA 465 chr11 15311418 15311740 + 2 NA Intergenic Intergenic 162477 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 449.999 chr1 191384785 191385147 + 2 NA Intergenic Intergenic -156468 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 291.333-62 chr7 81908885 81909199 + 2 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -100135 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 393.333-8 chr17 59030369 59030678 + 2 NA intron (NR_148346, intron 18 of 23) intron (NR_148346, intron 18 of 23) 76357 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 308-14 chr13 32431099 32431285 + 2 NA Intergenic Intergenic -3062 NR_148477 90634 Hs.732118 NM_052818 ENSG00000139597 N4BP2L1 CG018 NEDD4 binding protein 2 like 1 protein-coding 324-26 chr6 55615319 55615621 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -36256 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 484-2 chr2 22235591 22236101 + 2 NA Intergenic Intergenic -300633 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 351.334-4 chr5 52432281 52432592 + 2 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -355480 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 334-39 chr9 76622562 76622774 + 2 NA intron (NM_001308050, intron 9 of 10) intron (NM_001308050, intron 9 of 10) 69747 NM_001330680 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 306-42 chr5 132799481 132799679 + 2 NA Intergenic Intergenic -13722 NM_175873 134548 Hs.13308 NM_175873 ENSG00000198944 SOWAHA ANKRD43 sosondowah ankyrin repeat domain family member A protein-coding 372.667-22 chr8 122463916 122464170 + 2 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) MER21C|LTR|ERVL 104601 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 359.334 chr12 17485187 17485435 + 2 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 103767 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 291-21 chr17 59764345 59764491 + 2 NA intron (NM_001329401, intron 4 of 9) AluJr|SINE|Alu 56764 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 531 chr10 60508906 60509496 + 2 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 63755 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 266.666-19 chr2 176316913 176317085 + 2 NA intron (NM_001319097, intron 3 of 9) intron (NM_001319097, intron 3 of 9) 47557 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 250.666-13 chr15 83647021 83647232 + 2 NA Intergenic Intergenic -6997 NM_207517 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 301.667-40 chr7 16635319 16635485 + 2 NA intron (NM_020319, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 10352 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 246.333-63 chr3 114737389 114737595 + 2 NA intron (NM_001348801, intron 4 of 11) intron (NM_001348801, intron 4 of 11) 6033 NR_039959 100616166 NR_039959 ENSG00000264623 MIR4796 mir-4796 microRNA 4796 ncRNA 294-9 chr10 33683243 33683500 + 2 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 89309 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 314-56 chrX 140082756 140083035 + 2 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -8772 NM_001271560 389895 Hs.127679 NM_001271560 LOC389895 - chromosome 16 open reading frame 72-like protein-coding 379.666-10 chr20 46581798 46582079 + 2 NA intron (NM_001193340, intron 9 of 12) intron (NM_001193340, intron 9 of 12) -31284 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 303-15 chr14 43432157 43432433 + 2 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 1074988 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 289-32 chr8 66084800 66085012 + 2 NA intron (NM_001349432, intron 5 of 5) L1MD|LINE|L1 -42223 NM_184085 84675 Hs.85524 NM_033058 ENSG00000147573 TRIM55 MURF-2|RNF29|muRF2 tripartite motif containing 55 protein-coding 300-63 chr7 141413509 141413791 + 2 NA intron (NM_001195278, intron 2 of 3) intron (NM_001195278, intron 2 of 3) -137760 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 270-58 chr7 39142875 39143021 + 2 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -129381 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 291.333-39 chr2 179113209 179113492 + 2 NA intron (NM_178123, intron 16 of 17) intron (NM_178123, intron 16 of 17) -63213 NM_173648 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 427.667-6 chr18 74870820 74871250 + 2 NA intron (NM_017757, intron 3 of 7) intron (NM_017757, intron 3 of 7) 240072 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 284-63 chr8 108697665 108697819 + 2 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) intron (NR_136411, intron 1 of 3) 89852 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 205.667-107 chr4 89342241 89342432 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -34536 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 328-19 chr2 182739180 182739357 + 2 NA intron (NM_018981, intron 11 of 23) intron (NM_018981, intron 11 of 23) 23011 NR_073367 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 246-32 chr15 45563530 45563732 + 2 NA Intergenic Intergenic -23492 NM_012388 26258 Hs.7037 NM_012388 ENSG00000104164 BLOC1S6 BLOS6|HPS9|PA|PALLID|PLDN biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 6 protein-coding 404.667-8 chr8 126486790 126487070 + 2 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 71548 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 334.666-9 chr3 166181278 166181558 + 2 NA Intergenic Intergenic -343995 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 348 chr1 164727047 164727376 + 2 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 47430 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 222-5 chr1 170913449 170913634 + 2 NA Intergenic Intergenic -21930 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 309.334 chr12 105047775 105048006 + 2 NA intron (NR_027752, intron 13 of 22) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 36568 NR_027752 160428 Hs.42572 NM_001034173 ENSG00000136010 ALDH1L2 mtFDH aldehyde dehydrogenase 1 family member L2 protein-coding 327-16 chr21 20636032 20636223 + 2 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 166981 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 174-55 chr2 174451469 174451584 + 2 NA intron (NM_001267051, intron 10 of 14) intron (NM_001267051, intron 10 of 14) 35503 NM_152529 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 320-30 chr20 52918230 52918453 + 2 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -54017 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 302.667-28 chr5 130724477 130724690 + 2 NA Intergenic Intergenic 440673 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 454-7 chr2 57632885 57633326 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -274546 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 302.334-4 chr17 59015826 59016027 + 2 NA intron (NR_148346, intron 20 of 23) AluSz6|SINE|Alu 90954 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 204.666-77 chr5 165543790 165543998 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 1073615 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 308-19 chr15 79888497 79888783 + 2 NA intron (NR_037654, intron 2 of 2) L2|LINE|L2 8357 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 387.333-10 chr5 116440131 116440413 + 2 NA Intergenic Intergenic -7226 NR_109879 101927233 Hs.732850 NR_109879 ENSG00000248445 SEMA6A-AS1 CTB-118N6.3 SEMA6A antisense RNA 1 ncRNA 275-49 chr7 108620518 108620696 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 50733 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 312.666-10 chr2 30164129 30164378 + 2 NA Intergenic Intergenic 17246 NM_001127401 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 379.667-7 chr22 27894144 27894496 + 2 NA intron (NM_001284278, intron 7 of 11) intron (NM_001284278, intron 7 of 11) 24894 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 298-84 chrX 75123154 75123435 + 2 NA intron (NM_001271699, intron 1 of 14) L1M3|LINE|L1 32989 NM_001271698 22 Hs.370480 NM_004299 ENSG00000131269 ABCB7 ABC7|ASAT|Atm1p|EST140535 ATP binding cassette subfamily B member 7 protein-coding 412-5 chr2 18542346 18542694 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 18133 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 239.667 chr1 34387361 34387542 + 2 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 210544 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 631.666 chr14 50159312 50159960 + 2 NA exon (NM_006939, exon 10 of 23) exon (NM_006939, exon 10 of 23) -43064 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 313.667-11 chr12 30428922 30429193 + 2 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 248187 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 301-17 chr16 17914263 17914462 + 2 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 418300 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 514.666 chr1 172102181 172102635 + 2 NA intron (NR_146559, intron 14 of 20) intron (NR_146559, intron 14 of 20) -36400 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 325-15 chr18 54794825 54795095 + 2 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -33517 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 467.999 chr11 102531099 102531403 + 2 NA promoter-TSS (NM_002423) promoter-TSS (NM_002423) -504 NM_002423 4316 Hs.2256 NM_002423 ENSG00000137673 MMP7 MMP-7|MPSL1|PUMP-1 matrix metallopeptidase 7 protein-coding 314.666-35 chr7 132584287 132584569 + 2 NA intron (NM_181775, intron 2 of 4) intron (NM_181775, intron 2 of 4) -7864 NM_020911 91584 Hs.511454 NM_020911 ENSG00000221866 PLXNA4 FAYV2820|PLEXA4|PLXNA4A|PLXNA4B|PRO34003 plexin A4 protein-coding 337.333-23 chr2 76006054 76006323 + 2 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -295273 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 294.666-14 chr17 71558967 71559180 + 2 NA Intergenic Intergenic -356894 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 314.666-5 chr1 106226591 106226834 + 2 NA Intergenic Intergenic -198459 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 517-4 chr4 36787854 36788328 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -146191 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 220-68 chr2 229059341 229059478 + 2 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 172683 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 299.333-76 chr8 137578937 137579162 + 2 NA Intergenic Intergenic -165461 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 455.333-4 chr18 67351394 67351678 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 -165010 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 277.333-43 chr2 8706054 8706293 + 2 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 24117 NM_002166 3398 Hs.180919 NM_002166 ENSG00000115738 ID2 GIG8|ID2A|ID2H|bHLHb26 inhibitor of DNA binding 2 protein-coding 142-89 chr3 70169211 70169377 + 2 NA Intergenic Intergenic 143344 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 325.333-47 chr7 55453751 55454045 + 2 NA Intergenic Intergenic 72982 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 235.667-8 chr10 123871603 123871839 + 2 NA intron (NM_198148, intron 2 of 13) L1ME3|LINE|L1 20086 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 344-37 chr6 90117995 90118212 + 2 NA intron (NM_021813, intron 4 of 8) intron (NM_021813, intron 4 of 8) 178740 NM_021813 60468 Hs.269764 NM_021813 ENSG00000112182 BACH2 BTBD25|IMD60 BTB domain and CNC homolog 2 protein-coding 502-2 chr17 20097673 20098115 + 2 NA intron (NM_001033553, intron 2 of 14) MER20B|DNA|hAT-Charlie 10872 NM_001033553 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 472-4 chr11 85102915 85103306 + 2 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L1MB8|LINE|L1 -179689 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 576 chr10 18967804 18968263 + 2 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -80768 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 307-18 chr20 56388097 56388386 + 2 NA intron (NM_198437, intron 1 of 8) intron (NM_198437, intron 1 of 8) 3974 NM_198433 6790 Hs.250822 NM_003600 ENSG00000087586 AURKA AIK|ARK1|AURA|BTAK|PPP1R47|STK15|STK6|STK7 aurora kinase A protein-coding 390-13 chr2 53246826 53247157 + 2 NA Intergenic Intergenic -520792 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 940.333 chr8 115510787 115511714 + 2 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 156763 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 330-22 chr22 35229115 35229397 + 2 NA intron (NR_126356, intron 1 of 5) LTR16C|LTR|ERVL 1800 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 407.333-22 chr7 105151225 105151571 + 2 NA intron (NM_182692, intron 7 of 15) MIRb|SINE|MIR 117679 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 236-5 chr1 217740175 217740383 + 2 NA intron (NM_138796, intron 5 of 10) intron (NM_138796, intron 5 of 10) 44841 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 266.666-15 chr15 64259910 64260068 + 2 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) intron (NM_001329607, intron 2 of 11) 96184 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 435-3 chr15 70039551 70039827 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 39779 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 520.333 chr11 31602366 31602863 + 2 NA intron (NM_001288726, intron 4 of 11) intron (NM_001288726, intron 4 of 11) 92847 NM_001288725 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 330.667-11 chr2 108786090 108786461 + 2 NA promoter-TSS (NM_001351544) promoter-TSS (NM_001351544) -475 NM_001351544 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 303.333-47 chr2 221145985 221146241 + 2 NA Intergenic 7SK|RNA|RNA 426191 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 366.666-2 chr13 88797682 88797913 + 2 NA Intergenic Intergenic 170944 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 266.666-24 chr6 93801070 93801225 + 2 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 82844 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 263.333-44 chr2 127475912 127476244 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 50411 NM_017969 55677 Hs.469879 NM_017969 ENSG00000163166 IWS1 - interacts with SUPT6H, CTD assembly factor 1 protein-coding 281.333-25 chr17 35586818 35587028 + 2 NA promoter-TSS (NM_001282) promoter-TSS (NM_001282) -399 NM_001282 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 265.333-33 chr18 69126261 69126447 + 2 NA Intergenic Intergenic -274534 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 240.667-68 chr6 40835046 40835211 + 2 NA Intergenic Intergenic 188152 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 468.667-2 chr10 64590576 64590925 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -234778 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 283.999-6 chr21 22913611 22913832 + 2 NA Intergenic Intergenic -165563 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 317.667-41 chrX 66321593 66321865 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 153979 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 318.334-6 chr18 70270806 70271186 + 2 NA Intergenic Intergenic -18049 NM_004232 9306 Hs.44439 NM_004232 ENSG00000170677 SOCS6 CIS-4|CIS4|HSPC060|SOCS-4|SOCS-6|SOCS4|SSI4|STAI4|STATI4 suppressor of cytokine signaling 6 protein-coding 282.666-2 chr12 8824252 8824484 + 2 NA intron (NM_144670, intron 3 of 35) L1MA3|LINE|L1 1747 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 294.666-30 chr7 14960785 14960991 + 2 NA intron (NM_001350717, intron 1 of 24) intron (NM_001350717, intron 1 of 24) 13970 NM_001350722 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 304-6 chr1 182406884 182407053 + 2 NA promoter-TSS (NR_034131) promoter-TSS (NR_034131) -653 NR_034131 388719 Hs.508989 NM_001010899 ENSG00000203729 LINC00272 C1orf120|NCRNA00272 long intergenic non-protein coding RNA 272 ncRNA 299.333-14 chr12 40821882 40822093 + 2 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) L1ME3C|LINE|L1 -5951 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 435.333-8 chr8 134809698 134810139 + 2 NA Intergenic Intergenic -4973 NR_029599 407033 NR_029599 ENSG00000199153 MIR30D MIRN30D|mir-30d microRNA 30d ncRNA 468.666-2 chr18 10734194 10734570 + 2 NA intron (NM_022068, intron 32 of 51) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 25267 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 452-8 chr3 165021761 165022131 + 2 NA intron (NM_001041, intron 26 of 47) intron (NM_001041, intron 26 of 47) 56550 NM_001041 6476 Hs.429596 NM_001041 ENSG00000090402 SI - sucrase-isomaltase protein-coding 504-2 chr10 51195482 51195817 + 2 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -103924 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 451-4 chr15 95707643 95708312 + 2 NA Intergenic Intergenic 274884 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 348-13 chr2 113070390 113070622 + 2 NA intron (NM_173161, intron 1 of 4) intron (NM_173161, intron 1 of 4) -1812 NM_032556 84639 Hs.306974 NM_032556 ENSG00000136697 IL1F10 FIL1-theta|FKSG75|IL-1HY2|IL-38|IL1-theta|IL1HY2 interleukin 1 family member 10 protein-coding 321.333-16 chr12 59665076 59665300 + 2 NA intron (NM_001270622, intron 2 of 5) intron (NM_001270622, intron 2 of 5) -24182 NR_073055 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 423.333-10 chrX 126136319 126136651 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 26723 NR_110409 101928495 Hs.545998 NR_110409 ENSG00000237208 LOC101928495 - uncharacterized LOC101928495 ncRNA 362.667-26 chr8 74409014 74409285 + 2 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) 58746 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 314.666-14 chr10 74191691 74191972 + 2 NA intron (NM_001369124, intron 1 of 9) L1MD2|LINE|L1 15068 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 320.667-25 chr3 182351339 182351535 + 2 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 134925 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 503.667-2 chr14 54434634 54435156 + 2 NA intron (NM_005776, intron 2 of 4) intron (NM_005776, intron 2 of 4) 6479 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 360-28 chr9 11328928 11329153 + 2 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 715834 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 285.334-9 chr6 75462612 75462828 + 2 NA intron (NR_110608, intron 1 of 1) intron (NR_110608, intron 1 of 1) 31080 NM_015687 27145 Hs.201488 NM_015687 ENSG00000118407 FILIP1 FILIP filamin A interacting protein 1 protein-coding 318-2 chr1 40063923 40064180 + 2 NA intron (NM_001350484, intron 5 of 13) intron (NM_001350484, intron 5 of 13) 23200 NM_001350481 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 345.334-5 chr2 73444745 73445134 + 2 NA intron (NM_015120, intron 7 of 22) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie -12164 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 304-15 chr10 116351890 116352144 + 2 NA intron (NM_198515, intron 5 of 8) L1MB7|LINE|L1 27569 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 428.333-3 chr14 58472853 58473339 + 2 NA intron (NM_001329944, intron 18 of 31) MIRc|SINE|MIR 33415 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 299.333-66 chr6 152941250 152941526 + 2 NA Intergenic Intergenic 41653 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 344.667-22 chr9 10514663 10514849 + 2 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) intron (NM_002839, intron 2 of 45) 98246 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 247-58 chr4 77830599 77830900 + 2 NA Intergenic Intergenic -10480 NM_001365006 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 324.333-28 chr3 179456819 179457212 + 2 NA Intergenic Intergenic -5545 NM_021629 59345 Hs.173030 NM_021629 ENSG00000114450 GNB4 CMTD1F G protein subunit beta 4 protein-coding 504.666-2 chr12 3262865 3263161 + 2 NA intron (NM_001168320, intron 2 of 7) intron (NM_001168320, intron 2 of 7) 103109 NR_148995 100128253 Hs.447497 NR_148995 LOC100128253 - uncharacterized LOC100128253 ncRNA 402-10 chr5 111348728 111349148 + 2 NA intron (NM_001323376, intron 2 of 8) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 124554 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 308-51 chr7 15531642 15531929 + 2 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) AluSx1|SINE|Alu 30230 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 276-38 chr20 2887353 2887705 + 2 NA intron (NM_080840, intron 1 of 22) intron (NM_080840, intron 1 of 22) 14033 NM_080840 5786 Hs.269577 NM_002836 ENSG00000132670 PTPRA HEPTP|HLPR|HPTPA|HPTPalpha|LRP|PTPA|PTPRL2|R-PTP-alpha|RPTPA protein tyrosine phosphatase receptor type A protein-coding 382.667-11 chr3 152524816 152525098 + 2 NA Intergenic Intergenic -183967 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 298-69 chr6 45887544 45887838 + 2 NA Intergenic Intergenic 49906 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 360-16 chr21 27958688 27958890 + 2 NA Intergenic Intergenic -54574 NR_027246 246705 Hs.505079 NM_145180 ENSG00000178457 LINC00314 C21orf94|NCRNA00314 long intergenic non-protein coding RNA 314 ncRNA 147-26 chr12 19035998 19036079 + 2 NA Intergenic Intergenic -93695 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 293-22 chr16 7120387 7120596 + 2 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) L1ME1|LINE|L1 -212354 NM_145892 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 489 chr12 57294208 57294678 + 2 NA intron (NM_001351206, intron 9 of 24) intron (NM_001351206, intron 9 of 24) -43256 NR_104422 246329 Hs.417595 NM_145064 ENSG00000185482 STAC3 MYPBB|NAM SH3 and cysteine rich domain 3 protein-coding 323-12 chr16 80036597 80036815 + 2 NA Intergenic Intergenic 241457 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 522.333-3 chr4 43543545 43544204 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -51331 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 203-96 chr6 122350519 122350676 + 2 NA Intergenic Intergenic -48954 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 200-139 chr5 163540764 163540893 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 35209 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 284.333-8 chr11 21394399 21394559 + 2 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) 724893 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 373-12 chr3 184988357 184988610 + 2 NA intron (NM_001009921, intron 41 of 46) L1MC2|LINE|L1 164577 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 329.667-21 chr9 119734226 119734471 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -200712 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 333-22 chr5 85008769 85008997 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -624003 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 394.666-6 chr18 74323179 74323481 + 2 NA intron (NM_001174123, intron 4 of 13) intron (NM_001174123, intron 4 of 13) 7491 NM_001174123 644041 Hs.465414 NM_001174123 ENSG00000206043 C18orf63 DKFZP781G0119 chromosome 18 open reading frame 63 protein-coding 233.333-19 chr10 74769319 74769535 + 2 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -55828 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 566.334-2 chr8 140436777 140437256 + 2 NA intron (NM_001160372, intron 3 of 22) AluJo|SINE|Alu 20728 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 479.333 chr12 49594755 49595135 + 2 NA intron (NR_027450, intron 5 of 6) L1MEc|LINE|L1 10694 NM_032130 84070 Hs.524406 NM_032130 ENSG00000135436 FAM186B C12orf25 family with sequence similarity 186 member B protein-coding 463.333-7 chr4 35259589 35259855 + 2 NA Intergenic Intergenic 984217 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 260-72 chr6 129438607 129438842 + 2 NA exon (NM_001079823, exon 42 of 64) exon (NM_001079823, exon 42 of 64) 271453 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 337-12 chr15 43353004 43353259 + 2 NA 3' UTR (NM_001159280, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001159280, exon 12 of 12) 16929 NM_152455 146050 Hs.418287 NM_152455 ENSG00000140265 ZSCAN29 ZNF690|Zfp690 zinc finger and SCAN domain containing 29 protein-coding 185.333-54 chr15 79142367 79142509 + 2 NA Intergenic Intergenic -51658 NM_001145648 5923 Hs.459035 NM_002891 ENSG00000058335 RASGRF1 CDC25|CDC25L|GNRP|GRF1|GRF55|H-GRF55|PP13187|ras-GRF1 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1 protein-coding 399.333-15 chr8 101782006 101782336 + 2 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) 8798 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 296.333-27 chr22 28485695 28485934 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 25945 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 262-75 chr7 104459552 104459711 + 2 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 130975 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 198-80 chr18 51079531 51079721 + 2 NA 3' UTR (NM_005359, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_005359, exon 12 of 12) 49413 NM_005359 4089 Hs.75862 NM_005359 ENSG00000141646 SMAD4 DPC4|JIP|MADH4|MYHRS SMAD family member 4 protein-coding 325.333-33 chr4 113500758 113500920 + 2 NA intron (NM_001221, intron 13 of 18) intron (NM_001221, intron 13 of 18) 208000 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 339.333-38 chr5 121802038 121802310 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -49708 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 617-2 chr7 42471018 42471486 + 2 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger -234043 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 375.333-2 chr1 157467861 157468111 + 2 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 84529 NM_031281 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 305.667-10 chr14 63226279 63226492 + 2 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) L1M7|LINE|L1 21942 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 280-53 chr8 68340351 68340617 + 2 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) L1MD1|LINE|L1 -8993 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 301.667-20 chr18 9465823 9466090 + 2 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -9557 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 505.667-2 chr10 92956872 92957323 + 2 NA intron (NM_001319195, intron 17 of 21) intron (NM_001319195, intron 17 of 21) -103701 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 374-21 chr8 76397660 76397937 + 2 NA Intergenic Intergenic -8856 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 411.333-13 chr3 54694160 54694460 + 2 NA intron (NM_018398, intron 11 of 37) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -54453 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 474.667-5 chr2 77068328 77068659 + 2 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 82528 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 256.666-23 chr21 31925332 31925534 + 2 NA intron (NM_014586, intron 2 of 10) intron (NM_014586, intron 2 of 10) 52413 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 381.333-11 chr2 133932077 133932467 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -187663 NM_001371457 403-7 chr4 59856731 59857020 + 2 NA Intergenic Intergenic 843302 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 305.333-12 chr10 122232988 122233182 + 2 NA intron (NM_206862, intron 16 of 22) intron (NM_206862, intron 16 of 22) -38211 NM_144587 118663 Hs.422466 NM_144587 ENSG00000138152 BTBD16 C10orf87 BTB domain containing 16 protein-coding 384-16 chr7 15626171 15626533 + 2 NA intron (NM_005924, intron 2 of 2) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -41595 NR_134258 105375166 Hs.658822 NR_134258 ENSG00000237070 LOC105375166 - uncharacterized LOC105375166 ncRNA 316.667-11 chr14 64918632 64918876 + 2 NA intron (NM_001204063, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 4299 NM_001202558 100529261 Hs.325531 NM_001202558 ENSG00000125954 CHURC1-FNTB FNTB|FTase-beta CHURC1-FNTB readthrough protein-coding 416-4 chr16 79970145 79970427 + 2 NA Intergenic Intergenic 175037 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 344-29 chr3 31619341 31619630 + 2 NA intron (NM_178862, intron 8 of 15) intron (NM_178862, intron 8 of 15) -84728 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 358.334 chr15 60648488 60648803 + 2 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -21115 NM_134260 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 304-18 chr11 129934747 129934989 + 2 NA intron (NM_199437, intron 9 of 20) intron (NM_199437, intron 9 of 20) 12716 NM_199439 56980 Hs.275086 NM_020228 ENSG00000170325 PRDM10 PFM7|TRIS PR/SET domain 10 protein-coding 315-27 chr8 87091257 87091565 + 2 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 224996 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 459-7 chr20 28495216 28495678 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 107218 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 418-3 chr14 53677685 53678305 + 2 NA Intergenic Intergenic 270489 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 334.666-4 chr11 105128221 105128472 + 2 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 11423 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 577.333 chr15 52654683 52655238 + 2 NA intron (NM_019600, intron 2 of 12) intron (NM_019600, intron 2 of 12) -2920 NM_001286495 56204 Hs.152385 NM_019600 ENSG00000047346 FAM214A KIAA1370 family with sequence similarity 214 member A protein-coding 541.999 chr1 195462712 195463038 + 2 NA Intergenic Intergenic 625840 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 533.333-3 chr5 16328087 16328614 + 2 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 112752 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 295.334 chr11 94906127 94906315 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 67335 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 263.333-85 chr8 124694297 124694534 + 2 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 34058 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 257.333-18 chr10 103094261 103094403 + 2 NA intron (NM_001351194, intron 12 of 17) intron (NM_001351194, intron 12 of 17) 59489 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 436-14 chr8 122212389 122212804 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 356048 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 403.667-5 chr17 59298356 59298859 + 2 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 -33048 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 350-4 chr10 75799807 75800033 + 2 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) L1M4a1|LINE|L1 17159 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 341-18 chr21 17023622 17023933 + 2 NA Intergenic Intergenic -415113 NR_037585 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 264-45 chr5 149064172 149064412 + 2 NA non-coding (NR_122044, exon 2 of 3) non-coding (NR_122044, exon 2 of 3) 975 NR_122044 255187 Hs.149321 NR_122044 ENSG00000250072 SH3TC2-DT - SH3TC2 divergent transcript ncRNA 289.334-10 chr5 54110079 54110293 + 2 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -158587 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 365-20 chr7 52672934 52673179 + 2 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -362577 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 394-5 chr14 66320189 66320552 + 2 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -166001 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 334.333-26 chr4 96334370 96334671 + 2 NA intron (NR_147149, intron 1 of 3) (ATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 23817 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 311-17 chr20 54311251 54311414 + 2 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 103245 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 486.333-5 chr22 35106906 35107364 + 2 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 40977 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 348-23 chr7 105674748 105674981 + 2 NA intron (NM_020725, intron 3 of 11) intron (NM_020725, intron 3 of 11) 4291 NM_001318229 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 499.667-3 chr7 118651512 118651892 + 2 NA Intergenic Intergenic 426998 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 448.667-2 chr19 4809719 4810021 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 18136 NM_018708 55527 Hs.515082 NM_018708 ENSG00000141965 FEM1A EPRAP fem-1 homolog A protein-coding 390.334-2 chr15 91441918 91442400 + 2 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 -21180 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 421.333-6 chr4 61922473 61922899 + 2 NA intron (NM_001322246, intron 12 of 25) intron (NM_001322246, intron 12 of 25) 239079 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 254-36 chr2 103965255 103965419 + 2 NA Intergenic Intergenic 442995 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 333.667-10 chr17 59053171 59053469 + 2 NA intron (NR_148346, intron 13 of 23) intron (NR_148346, intron 13 of 23) 53560 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 327-8 chr16 14289374 14289568 + 2 NA Intergenic Intergenic -12817 NR_132983 100129781 Hs.190748 NR_132983 MIR193BHG - MIR193B host gene ncRNA 304-29 chr2 86310486 86310752 + 2 NA intron (NM_001164730, intron 1 of 6) intron (NM_001164730, intron 1 of 6) 27007 NM_001371279 311.667-23 chr6 139118114 139118300 + 2 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -16873 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 371.667-9 chr5 18628315 18628642 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 821204 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 425.333-3 chr13 33290828 33291211 + 2 NA intron (NM_001243476, intron 5 of 17) intron (NM_001243476, intron 5 of 17) -5264 NM_178006 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 371-17 chr7 77869357 77869736 + 2 NA intron (NM_001366089, intron 2 of 18) L1MA4|LINE|L1 29416 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 316.334 chr12 23329604 23329813 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 154072 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 332.333-3 chr1 207306625 207306920 + 2 NA Intergenic Intergenic -14906 NR_125349 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 314.666-19 chr2 72682317 72682552 + 2 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 143599 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 377-13 chr8 50970116 50970377 + 2 NA Intergenic Intergenic 806115 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 271.667-32 chr17 6613833 6614100 + 2 NA intron (NM_014804, intron 7 of 18) L1ME3Cz|LINE|L1 26745 NM_001351225 9851 Hs.28070 NM_014804 ENSG00000198920 KIAA0753 MNR|OFIP KIAA0753 protein-coding 297-22 chr14 67294134 67294365 + 2 NA intron (NM_001256550, intron 4 of 14) intron (NM_001256550, intron 4 of 14) 52814 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 240.333-57 chr21 14707865 14708088 + 2 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -64869 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 305.667-31 chr5 101656505 101656754 + 2 NA Intergenic Intergenic 639655 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 299.667-31 chr6 37447077 37447235 + 2 NA intron (NM_015050, intron 4 of 23) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 13935 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 236-80 chr6 90970656 90970847 + 2 NA Intergenic Intergenic -383679 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 315-25 chr7 28664108 28664456 + 2 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -21851 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 286-64 chr8 118320319 118320532 + 2 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -208606 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 344.334-4 chr16 25378951 25379259 + 2 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -121260 NM_001012981 342357 Hs.513451 NM_001012981 ENSG00000155592 ZKSCAN2 ZNF694|ZSCAN31|ZSCAN34 zinc finger with KRAB and SCAN domains 2 protein-coding 495-3 chr7 85578423 85578757 + 2 NA Intergenic (ATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 157468 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 273-13 chr13 50418307 50418568 + 2 NA intron (NR_109974, intron 3 of 6) intron (NR_109974, intron 3 of 6) 109012 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 391.333-20 chr7 91052341 91052607 + 2 NA intron (NM_012395, intron 10 of 13) intron (NM_012395, intron 10 of 13) -211959 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 453.332 chr5 104389349 104389712 + 2 NA Intergenic Intergenic -709944 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 257.333-73 chr5 2556106 2556269 + 2 NA Intergenic Intergenic -156404 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 299-25 chr2 224052697 224052890 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -13474 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 530.334-2 chr5 122294756 122295031 + 2 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -16798 NR_131762 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 281.333-8 chr11 3700434 3700582 + 2 NA intron (NR_157590, intron 23 of 31) intron (NR_157590, intron 23 of 31) -29124 NM_001303034 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 382-4 chr12 109082204 109082477 + 2 NA intron (NM_001301175, intron 12 of 15) MER102c|DNA|hAT-Charlie 11132 NM_001145374 121642 Hs.374458 NM_001001655 ENSG00000189046 ALKBH2 ABH2 alkB homolog 2, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 273.334-2 chr11 31442817 31443032 + 2 NA intron (NM_001304274, intron 4 of 5) intron (NM_001304274, intron 4 of 5) 66698 NM_001304274 196294 Hs.502223 NM_144981 ENSG00000148950 IMMP1L IMMP1|IMP1|IMP1-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 1 protein-coding 413.333-16 chr9 1817921 1818305 + 2 NA Intergenic Intergenic -197234 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 332-10 chr14 31641441 31641739 + 2 NA intron (NM_001201573, intron 2 of 8) L1MA4|LINE|L1 63674 NM_001201573 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 552-5 chr8 64654700 64655081 + 2 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) L1PA14|LINE|L1 -72998 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 330-2 chr1 41156568 41156745 + 2 NA intron (NM_001031694, intron 3 of 15) AluJb|SINE|Alu 4776 NM_001031694 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 390.333-10 chrX 53029816 53030201 + 2 NA Intergenic Intergenic -19316 NM_018969 54328 Hs.193011 NM_018969 ENSG00000184194 GPR173 SREB3 G protein-coupled receptor 173 protein-coding 316.334-6 chr3 159212422 159212659 + 2 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 -60707 NM_001197108 29970 Hs.134665 NM_014575 ENSG00000151967 SCHIP1 SCHIP-1 schwannomin interacting protein 1 protein-coding 280-47 chr6 27956926 27957086 + 2 NA promoter-TSS (NM_012367) promoter-TSS (NM_012367) -235 NM_012367 26212 Hs.532145 NM_012367 ENSG00000124657 OR2B6 OR2B1|OR2B1P|OR2B5|OR2B6P|OR5-40|OR5-41|OR6-31|dJ408B20.2 olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 protein-coding 418.667-4 chr18 72404039 72404255 + 2 NA Intergenic Intergenic 140195 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 477.334-3 chr20 4866342 4866829 + 2 NA intron (NM_005116, intron 13 of 16) intron (NM_005116, intron 13 of 16) -42977 NM_014737 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 530.333-3 chr4 108118916 108119517 + 2 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) intron (NM_001130713, intron 3 of 10) 47581 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 307.333-3 chr1 96404223 96404429 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -30201 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 302.334-3 chr16 6748483 6748684 + 2 NA intron (NM_018723, intron 3 of 15) AluJo|SINE|Alu -25226 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 310-5 chr1 191149247 191149527 + 2 NA Intergenic Intergenic 79111 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 322-41 chr7 21857103 21857324 + 2 NA intron (NM_001277115, intron 68 of 81) L1ME1|LINE|L1 88686 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 324.666-4 chr12 49394460 49394724 + 2 NA intron (NM_001293285, intron 3 of 14) L1MEd|LINE|L1 5418 NR_033267 100335030 Hs.687044 NR_033267 LOC100335030 - FGFR1 oncogene partner 2 pseudogene pseudo 333-3 chr1 92002551 92002880 + 2 NA intron (NM_001726, intron 16 of 18) intron (NM_001726, intron 16 of 18) -27270 NM_173567 253152 Hs.201555 NM_173567 ENSG00000172031 EPHX4 ABHD7|EH4|EPHXRP epoxide hydrolase 4 protein-coding 280-22 chr2 49609343 49609587 + 2 NA Intergenic Intergenic 364738 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 262-58 chr3 122633625 122633823 + 2 NA intron (NM_152615, intron 6 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 18109 NM_152615 165631 Hs.120250 NM_152615 ENSG00000173200 PARP15 ARTD7|BAL3|pART7 poly(ADP-ribose) polymerase family member 15 protein-coding 336-6 chr13 48167839 48168143 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -65215 NM_021999 9445 Hs.643683 NM_021999 ENSG00000136156 ITM2B ABRI|BRI|BRI2|BRICD2B|E25B|E3-16|FBD|RDGCA|imBRI2 integral membrane protein 2B protein-coding 252-46 chr2 81709216 81709362 + 2 NA Intergenic Intergenic -242343 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 328-29 chr4 163349564 163349858 + 2 NA intron (NM_001317091, intron 3 of 3) intron (NM_001317091, intron 3 of 3) 5609 NM_001317091 4889 Hs.519058 NM_006174 ENSG00000164129 NPY5R NPY5-R|NPYR5|NPYY5-R neuropeptide Y receptor Y5 protein-coding 278.667-15 chr15 76601355 76601602 + 2 NA intron (NR_148227, intron 22 of 32) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 14831 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 330.667-23 chr5 103294823 103295014 + 2 NA Intergenic Intergenic 35494 NM_001316968 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 352.667-6 chr11 84011681 84012061 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 11 of 27) intron (NM_001142699, intron 11 of 27) 261409 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 296.667-58 chr8 112155553 112155701 + 2 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -487866 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 302.667-17 chr2 202976362 202976547 + 2 NA intron (NR_136330, intron 11 of 14) AluSx1|SINE|Alu -38425 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 303.667-25 chr8 91438734 91439014 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 189555 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 334-2 chr1 242585019 242585261 + 2 NA Intergenic Intergenic -60443 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 529.334-2 chr11 111530471 111531095 + 2 NA intron (NM_207430, intron 4 of 6) intron (NM_207430, intron 4 of 6) -9497 NM_001318799 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 353-13 chr3 105551242 105551521 + 2 NA intron (NM_001243280, intron 12 of 14) intron (NM_001243280, intron 12 of 14) 184472 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 348.667-20 chr5 33007310 33007628 + 2 NA Intergenic Intergenic 60026 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 419 chr17 67742992 67743363 + 2 NA intron (NM_001303272, intron 15 of 16) AluJr|SINE|Alu 2507 NR_003706 100124536 Hs.693446 NR_003706 ENSG00000200394 SNORA38B - small nucleolar RNA, H/ACA box 38B snoRNA 391.333-6 chr11 43599713 43600096 + 2 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 18510 NR_029697 406918 NR_029697 ENSG00000199077 MIR129-2 MIR-129b|MIRN129-2|mir-129-2 microRNA 129-2 ncRNA 168.667-89 chr19 44237723 44237879 + 2 NA TTS (NM_001289166) TTS (NM_001289166) -22079 NM_001330529 353355 Hs.466891 NM_181756 ENSG00000159915 ZNF233 - zinc finger protein 233 protein-coding 304-7 chr1 237844691 237844905 + 2 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -17377 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 366.333-20 chr7 36419582 36419998 + 2 NA intron (NM_001284302, intron 9 of 22) MIR|SINE|MIR -29433 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 547.333 chr1 83603383 83603743 + 2 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) L1MA9|LINE|L1 157509 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 301-41 chr5 44363949 44364334 + 2 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) intron (NM_004465, intron 1 of 2) -24591 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 304.667-33 chr6 99788806 99789050 + 2 NA Intergenic Intergenic 182154 NM_021620 59336 Hs.287386 NM_021620 ENSG00000112238 PRDM13 MU-MB-20.220|PFM10 PR/SET domain 13 protein-coding 620.667 chr18 5650894 5651310 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -22111 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 293-42 chr8 36598194 36598450 + 2 NA Intergenic Intergenic -186052 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 325.334-6 chr5 14480341 14480601 + 2 NA intron (NM_007118, intron 43 of 56) intron (NM_007118, intron 43 of 56) 16488 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 291-19 chr16 81589094 81589344 + 2 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) AluSz|SINE|Alu -22129 NR_106759 102465251 NR_106759 ENSG00000275109 MIR6504 hsa-mir-6504 microRNA 6504 ncRNA 631.667 chr5 13357810 13358368 + 2 NA Intergenic X2_LINE|LINE|CR1 -325203 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 505.333-6 chr20 15722584 15722987 + 2 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) L1ME3B|LINE|L1 200529 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 287.333-26 chr19 18882189 18882378 + 2 NA intron (NM_021267, intron 3 of 7) MER3|DNA|hAT-Charlie 13875 NM_021267 10715 Hs.412355 NM_021267 ENSG00000223802 CERS1 EPM8|GDF-1|GDF1|LAG1|LASS1|UOG1 ceramide synthase 1 protein-coding 290-15 chr17 31080317 31080497 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 14018 NR_039886 100616266 NR_039886 ENSG00000265444 MIR4733 - microRNA 4733 ncRNA 237.667-23 chr15 20645167 20645489 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 82979 NR_027411 729786 Hs.592025 NR_027411 ENSG00000181984 GOLGA8CP GOLGA8C golgin A8 family member C, pseudogene pseudo 291-25 chr2 104430478 104430723 + 2 NA Intergenic Intergenic -3747 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 307.333-50 chr21 21775261 21775502 + 2 NA intron (NR_109958, intron 2 of 4) (CATGTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 28396 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 270.667-37 chr4 34413543 34413774 + 2 NA Intergenic Intergenic -143911 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 311-22 chr3 169356008 169356197 + 2 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) intron (NM_001205194, intron 1 of 15) -91765 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 312-26 chr2 179464828 179465030 + 2 NA intron (NR_148054, intron 5 of 8) intron (NR_148054, intron 5 of 8) 97659 NM_001113398 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 381.334 chr1 45531305 45531572 + 2 NA Intergenic Intergenic -8548 NM_001202431 5052 Hs.180909 NM_002574 ENSG00000117450 PRDX1 MSP23|NKEF-A|NKEFA|PAG|PAGA|PAGB|PRX1|PRXI|TDPX2 peroxiredoxin 1 protein-coding 317.333-38 chr7 31267211 31267428 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 73407 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 281.333-39 chr3 59070272 59070417 + 2 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -20312 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 194.666-60 chr6 18624361 18624537 + 2 NA intron (NR_149116, intron 4 of 7) L1MA8|LINE|L1 52665 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 366-5 chr12 15503223 15503591 + 2 NA intron (NM_030667, intron 5 of 26) intron (NM_030667, intron 5 of 26) -43204 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 486.333-3 chr16 83017446 83017934 + 2 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) intron (NM_001220490, intron 2 of 12) -27392 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 423.333 chr1 214119006 214119332 + 2 NA Intergenic Intergenic 130636 NM_002763 5629 Hs.741808 NM_002763 ENSG00000117707 PROX1 - prospero homeobox 1 protein-coding 321.334-3 chr1 114090564 114090851 + 2 NA 3' UTR (NM_205848, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_205848, exon 8 of 8) 61733 NM_205848 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 197.333-172 chr4 112214617 112214805 + 2 NA Intergenic Intergenic -17076 NR_136622 55435 Hs.435991 NM_018569 ENSG00000138660 AP1AR 2C18|C4orf16|GBAR|PRO0971|gamma-BAR adaptor related protein complex 1 associated regulatory protein protein-coding 278-18 chr2 108147211 108147411 + 2 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 70530 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 311.333-57 chr8 120392701 120392977 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 52311 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 373.333-11 chr15 67602044 67602346 + 2 NA intron (NM_001206804, intron 8 of 21) intron (NM_001206804, intron 8 of 21) 53101 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 314.667-2 chr1 84949954 84950131 + 2 NA intron (NM_153259, intron 6 of 13) L1M2|LINE|L1 47071 NM_153259 255231 Hs.591446 NM_153259 ENSG00000153898 MCOLN2 TRP-ML2|TRPML2 mucolipin 2 protein-coding 219.333-190 chr9 15825215 15825421 + 2 NA intron (NM_001355547, intron 20 of 24) intron (NM_001355547, intron 20 of 24) 261340 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 189-21 chr13 66106780 66106929 + 2 NA Intergenic Intergenic -111396 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 379.333-13 chr8 87548700 87549104 + 2 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 325113 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 295-32 chr4 48858173 48858415 + 2 NA intron (NM_001079839, intron 8 of 8) intron (NM_001079839, intron 8 of 8) 1909 NR_146806 100861517 Hs.661065 NR_146806 ENSG00000248256 OCIAD1-AS1 - OCIAD1 antisense RNA 1 ncRNA 390-9 chr11 94023148 94023557 + 2 NA intron (NM_001098672, intron 1 of 19) intron (NM_001098672, intron 1 of 19) 1998 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 301.333-13 chr11 127787796 127788062 + 2 NA Intergenic Intergenic -420837 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 326.333-12 chr2 103739802 103740053 + 2 NA Intergenic Intergenic 668405 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 367.667-18 chr5 56627267 56627577 + 2 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -21166 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 376.667-2 chr10 108707870 108708337 + 2 NA Intergenic Intergenic -638810 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 417 chr1 54401440 54401800 + 2 NA intron (NM_001009955, intron 4 of 16) intron (NM_001009955, intron 4 of 16) 4774 NM_018070 23648 Hs.476706 NM_018070 ENSG00000157216 SSBP3 CSDP|SSDP|SSDP1 single stranded DNA binding protein 3 protein-coding 398-11 chr3 189246518 189246822 + 2 NA intron (NM_198485, intron 4 of 5) L1ME4b|LINE|L1 -6076 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 589.333 chr9 29883335 29883806 + 2 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 524884 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 323.334-10 chr8 113956239 113956438 + 2 NA Intergenic Intergenic -519399 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 274.667-13 chr12 56127997 56128415 + 2 NA promoter-TSS (NM_015292) promoter-TSS (NM_015292) 4 NM_015292 23344 Hs.632729 NM_015292 ENSG00000139641 ESYT1 FAM62A|MBC2 extended synaptotagmin 1 protein-coding 233-54 chr5 2675561 2675786 + 2 NA Intergenic Intergenic -36918 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 470.666-4 chr8 120877369 120877767 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -65522 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 263-50 chr5 27107043 27107284 + 2 NA Intergenic Intergenic -68577 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 370.334 chr2 40573136 40573423 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -60844 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 449-3 chr5 27786894 27787299 + 2 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 314804 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 326.667-8 chr11 39711589 39711913 + 2 NA Intergenic Intergenic 581379 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 455.667-3 chr10 64093724 64094263 + 2 NA Intergenic Intergenic -572103 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 326.667-13 chr14 78835016 78835186 + 2 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -364881 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 286.666-2 chr13 36232060 36232321 + 2 NA intron (NM_001144981, intron 7 of 7) L1MB5|LINE|L1 -17575 NM_001282147 54937 Hs.124519 NM_017826 ENSG00000120669 SOHLH2 SOSF2|SPATA28|TEB1|bHLHe81 spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2 protein-coding 264-14 chr12 8516785 8516930 + 2 NA intron (NM_080387, intron 2 of 5) L1MA10|LINE|L1 3354 NM_080387 338339 Hs.351811 NM_080387 ENSG00000166527 CLEC4D CD368|CLEC-6|CLEC6|CLECSF8|Dectin-3|MCL|MPCL C-type lectin domain family 4 member D protein-coding 360.333-7 chr14 60157337 60157647 + 2 NA intron (NM_001322280, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 7906 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 330-23 chr22 42822185 42822395 + 2 NA exon (NM_014570, exon 9 of 16) exon (NM_014570, exon 9 of 16) 34983 NM_014570 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 300.666-18 chr6 48479539 48479835 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -410998 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 331-37 chr6 52886512 52886684 + 2 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 23100 NM_000847 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 262-18 chr14 51220992 51221130 + 2 NA Intergenic Intergenic -19186 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 410.333-7 chr3 57517356 57517850 + 2 NA intron (NM_198564, intron 4 of 11) intron (NM_198564, intron 4 of 11) 26741 NM_198564 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 300-42 chr3 73894632 73894807 + 2 NA Intergenic Intergenic 85475 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 289.667-34 chr8 82050981 82051167 + 2 NA Intergenic Intergenic -208788 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 194-83 chr2 194752955 194753108 + 2 NA intron (NR_110223, intron 3 of 3) intron (NR_110223, intron 3 of 3) 22436 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 379.334-8 chr7 43677933 43678244 + 2 NA intron (NR_163914, intron 1 of 8) intron (NR_163914, intron 1 of 8) 51435 NM_001371317 312.333-12 chr2 182233180 182233469 + 2 NA intron (NM_005019, intron 4 of 14) MER1B|DNA|hAT-Charlie 8739 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 316-37 chr4 39626581 39626954 + 2 NA intron (NM_001317896, intron 1 of 5) intron (NM_001317896, intron 1 of 5) 354 NM_001317897 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 475-2 chr17 61548149 61548488 + 2 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 42901 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 289-7 chr13 64531452 64531618 + 2 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -455524 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 194-53 chr16 78540342 78540488 + 2 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 440761 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 321.333-38 chr2 120111457 120111637 + 2 NA intron (NM_001330310, intron 16 of 24) L2a|LINE|L2 98470 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 343-12 chr2 27011452 27011702 + 2 NA intron (NR_149018, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 3011 NR_149018 100129724 Hs.666730 NR_149018 ENSG00000205500 LOC100129724 - uncharacterized LOC100129724 ncRNA 534.666 chr10 73925996 73926399 + 2 NA Intergenic Intergenic -3420 NR_160938 414236 Hs.585453 NM_001001791 ENSG00000222047 C10orf55 - chromosome 10 open reading frame 55 ncRNA 316.667-19 chr22 26002845 26003083 + 2 NA intron (NM_001318245, intron 40 of 43) intron (NM_001318245, intron 40 of 43) -166498 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 308.666-17 chr7 107440434 107440666 + 2 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) MER21B|LTR|ERVL -29507 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 315-8 chr14 27274968 27275221 + 2 NA Intergenic Intergenic -337494 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 310.667-31 chr4 44797885 44798044 + 2 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -71330 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 219.333-157 chr6 71569806 71570013 + 2 NA Intergenic Intergenic 148882 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 367.667-16 chr4 65575588 65576006 + 2 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) AluSx1|SINE|Alu 93691 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 163-31 chr16 61006511 61006657 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 49182 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 417.667-7 chr4 111030147 111030483 + 2 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -169668 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 332-8 chr12 70104385 70104618 + 2 NA Intergenic Intergenic -138529 NM_001199302 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 302-48 chr4 87515086 87515266 + 2 NA intron (NM_001128310, intron 1 of 11) MIRc|SINE|MIR 14327 NM_001128310 8404 Hs.62886 NM_004684 ENSG00000152583 SPARCL1 MAST 9|MAST9|PIG33|SC1 SPARC like 1 protein-coding 284.666-12 chr18 21552539 21552786 + 2 NA intron (NM_052911, intron 8 of 11) L1MC1|LINE|L1 48042 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 339.333-48 chr8 129809509 129809848 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -23054 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 298-76 chr7 52007950 52008147 + 2 NA Intergenic Intergenic -614792 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 310-61 chr8 129010859 129011138 + 2 NA Intergenic Intergenic -44997 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 550.666-2 chr8 141160964 141161694 + 2 NA intron (NM_001362798, intron 9 of 21) intron (NM_001362798, intron 9 of 21) 32740 NR_148197 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 336.334-9 chr8 120913920 120914164 + 2 NA Intergenic Intergenic -101996 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 337-28 chr8 123312617 123313096 + 2 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -35178 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 292-45 chr6 22929719 22929923 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -211897 NR_134614 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 407-10 chr8 99155679 99156029 + 2 NA intron (NM_017890, intron 14 of 61) intron (NM_017890, intron 14 of 61) 142588 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 337.333-9 chr11 108587714 108587891 + 2 NA intron (NM_015065, intron 1 of 5) AluSq2|SINE|Alu 5966 NM_001308019 23086 Hs.28540 NM_015065 ENSG00000110723 EXPH5 SLAC2-B|SLAC2B exophilin 5 protein-coding 233.333-118 chr7 23888401 23888545 + 2 NA Intergenic Intergenic 178254 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 380-15 chr5 33380221 33380653 + 2 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -60259 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 304.333-3 chr1 101762987 101763348 + 2 NA Intergenic Intergenic 83913 NM_001288821 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 364-24 chr7 20150095 20150345 + 2 NA intron (NR_046756, intron 2 of 3) intron (NR_046756, intron 2 of 3) 8304 NR_046756 100874041 Hs.145104 NR_046756 ENSG00000228598 MACC1-AS1 - MACC1 antisense RNA 1 ncRNA 333.333-4 chr1 229608899 229609181 + 2 NA intron (NM_001025247, intron 3 of 3) intron (NM_001025247, intron 3 of 3) 17007 NM_014409 27097 Hs.270621 NM_014409 ENSG00000135801 TAF5L PAF65B TATA-box binding protein associated factor 5 like protein-coding 380.667-6 chr2 39821510 39821835 + 2 NA Intergenic Intergenic -42396 NM_001321468 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 293-15 chr12 89865525 89865764 + 2 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -82049 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 345.333-22 chr21 43327416 43327678 + 2 NA intron (NR_103713, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 4492 NR_103713 100126693 Hs.473952 NR_103713 LINC00322 C21orf136|NCRNA00322 long intergenic non-protein coding RNA 322 ncRNA 369.667-7 chr2 30120041 30120255 + 2 NA Intergenic Intergenic -26859 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 503.999 chr10 22232403 22232806 + 2 NA Intergenic Intergenic -19468 NR_038921 100130992 Hs.48501 NR_038921 LOC100130992 - uncharacterized LOC100130992 ncRNA 289-11 chr2 169563845 169564119 + 2 NA intron (NM_001322049, intron 2 of 12) L1ME3A|LINE|L1 9883 NM_024622 79675 Hs.529276 NM_024622 ENSG00000138399 FASTKD1 - FAST kinase domains 1 protein-coding 305.333-19 chr13 25487389 25487622 + 2 NA intron (NM_016529, intron 2 of 36) MIR|SINE|MIR 18731 NM_001313741 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 286.666-3 chr13 71568039 71568255 + 2 NA intron (NM_080759, intron 4 of 10) L3|LINE|CR1 299045 NM_004392 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 378-23 chr5 41464416 41464653 + 2 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) L1PA7|LINE|L1 46067 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 289.667-26 chr3 178820126 178820469 + 2 NA intron (NM_181361, intron 2 of 4) intron (NM_181361, intron 2 of 4) 40108 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 426-4 chr11 6830166 6830464 + 2 NA Intergenic Intergenic -15368 NM_178168 144124 Hs.447478 NM_178168 ENSG00000166363 OR10A5 JCG6|OR10A1|OR11-403 olfactory receptor family 10 subfamily A member 5 protein-coding 360-7 chr11 117288877 117289116 + 2 NA 3' UTR (NM_001207049, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001207049, exon 8 of 8) -2350 NR_037803 100379571 Hs.736305 NR_037803 BACE1-AS BACE1-AS1|BACE1AS|NCRNA00177 BACE1 antisense RNA ncRNA 314-50 chr8 115866585 115866875 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -197755 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 279.333-37 chr18 75035516 75035662 + 2 NA intron (NM_017757, intron 7 of 7) intron (NM_017757, intron 7 of 7) 169924 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 396.666-6 chr8 48491958 48492302 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -59437 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 286-17 chr14 66795312 66795550 + 2 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) L1MEg2|LINE|L1 288024 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 469-6 chr3 53133565 53133872 + 2 NA Intergenic Intergenic -3283 NM_052859 91869 Hs.631910 NM_052859 ENSG00000163933 RFT1 CDG1N RFT1 homolog protein-coding 395-19 chr5 62897321 62897570 + 2 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 318626 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 434.666-6 chr12 16443172 16443497 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 89917 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 454-8 chr20 24163329 24163590 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -36308 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 383.333-14 chr5 102657472 102657807 + 2 NA intron (NR_103753, intron 1 of 2) intron (NR_103753, intron 1 of 2) 13825 NR_103755 285708 Hs.533011 NR_103753 LINC00491 - long intergenic non-protein coding RNA 491 ncRNA 244-31 chr14 33144244 33144394 + 2 NA intron (NM_001164749, intron 2 of 11) L1MB5|LINE|L1 205440 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 344.667-17 chr6 36178916 36179291 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -17641 NM_015695 27154 Hs.520096 NM_015695 ENSG00000096070 BRPF3 - bromodomain and PHD finger containing 3 protein-coding 420.333-6 chr3 96579115 96579477 + 2 NA Intergenic Intergenic 219332 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 298-80 chr8 115075471 115075734 + 2 NA Intergenic Intergenic 592411 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 306-13 chr13 56816206 56816454 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -324588 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 330.334-6 chr18 34521226 34521478 + 2 NA intron (NM_001198945, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 28040 NM_032979 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 279.333-3 chr1 102884446 102884610 + 2 NA intron (NM_001854, intron 63 of 66) MER50|LTR|ERV1 223968 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 351-7 chr12 16345497 16345873 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1457 NM_145792 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 215.333-6 chr1 86427168 86427368 + 2 NA intron (NM_006536, intron 2 of 13) intron (NM_006536, intron 2 of 13) 3097 NM_006536 9635 Hs.241551 NM_006536 ENSG00000137975 CLCA2 CACC|CACC3|CLCRG2|CaCC-3 chloride channel accessory 2 protein-coding 286.667-44 chr9 30398867 30399105 + 2 NA intron (NR_046204, intron 1 of 2) L1MA7|LINE|L1 9468 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 296.667-47 chr5 130326198 130326391 + 2 NA Intergenic Intergenic 421829 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 296-33 chr2 186612570 186612821 + 2 NA intron (NM_001145000, intron 2 of 27) LTR84b|LTR|ERVL 12490 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 652.001 chr3 64595983 64596528 + 2 NA intron (NM_001318781, intron 26 of 38) MIR|SINE|MIR 34909 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 225.667-23 chr13 66690830 66690974 + 2 NA intron (NM_020403, intron 2 of 3) intron (NM_020403, intron 2 of 3) -134267 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 546.999 chr11 36747368 36747922 + 2 NA Intergenic Intergenic -149366 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 389-5 chr3 130596680 130597065 + 2 NA intron (NM_001102608, intron 17 of 35) intron (NM_001102608, intron 17 of 35) 36538 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 360.334-3 chr20 30999941 31000234 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -257577 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 544.334 chr3 184370335 184370772 + 2 NA Intergenic Intergenic 7192 NM_001278698 5437 Hs.432574 NM_006232 ENSG00000163882 POLR2H RPABC3|RPB17|RPB8 RNA polymerase II subunit H protein-coding 345.334-11 chr4 106862486 106862837 + 2 NA Intergenic Intergenic 173652 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 305-23 chr6 51377573 51377845 + 2 NA Intergenic Intergenic -244161 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 299-36 chr7 31260362 31260514 + 2 NA Intergenic Intergenic 80288 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 386-3 chr15 77350845 77351109 + 2 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 69127 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 333.333-3 chr1 185659032 185659281 + 2 NA Intergenic Intergenic -30668 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 467 chr11 9341616 9341952 + 2 NA Intergenic Intergenic -27191 NM_015012 440026 Hs.594563 NM_015012 ENSG00000166471 TMEM41B - transmembrane protein 41B protein-coding 429.334-5 chr7 73532541 73532915 + 2 NA Intergenic Intergenic -10435 NM_032408 9031 Hs.743372 NM_023005 ENSG00000009954 BAZ1B WBSCR10|WBSCR9|WSTF bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B protein-coding 402.334-4 chr4 133879549 133879797 + 2 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger 322116 NM_001114734 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 278-7 chr11 81007290 81007446 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -244565 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 471.667-2 chr8 74777807 74778246 + 2 NA Intergenic Intergenic -46508 NM_015886 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 298-68 chr6 38496134 38496425 + 2 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) 14683 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 282.667-25 chr21 30885425 30885629 + 2 NA Intergenic Intergenic -3947 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 387.667-6 chr17 44007713 44008152 + 2 NA intron (NM_153006, intron 6 of 6) intron (NM_153006, intron 6 of 6) 3310 NM_153006 162417 Hs.8876 NM_153006 ENSG00000161653 NAGS AGAS|ARGA N-acetylglutamate synthase protein-coding 525.667 chr12 58761501 58761773 + 2 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 20079 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 326.667-6 chr1 185124988 185125275 + 2 NA intron (NM_030934, intron 11 of 14) intron (NM_030934, intron 11 of 14) 31822 NM_030934 81627 Hs.107149 NM_030934 ENSG00000121486 TRMT1L C1orf25|MST070|MSTP070|TRM1L|bG120K12.3 tRNA methyltransferase 1 like protein-coding 317.334-4 chr4 31541951 31542248 + 2 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) L1MC3|LINE|L1 35555 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 336.334-11 chrX 96917023 96917256 + 2 NA intron (NM_007309, intron 8 of 26) intron (NM_007309, intron 8 of 26) 33231 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 274-49 chr5 108955125 108955378 + 2 NA intron (NR_146155, intron 12 of 19) intron (NR_146155, intron 12 of 19) 30645 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 367-9 chr5 121380939 121381271 + 2 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 58555 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 469.999 chr1 80049875 80050256 + 2 NA Intergenic Intergenic -485690 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 243-4 chr1 92469364 92469543 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 14501 NM_001127215 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 313-17 chr18 782326 782491 + 2 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 29834 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 346-15 chr2 28810949 28811352 + 2 NA intron (NM_001142634, intron 1 of 6) intron (NM_001142634, intron 1 of 6) 316 NM_182756 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 301.333-32 chr21 30124954 30125167 + 2 NA Intergenic Intergenic 41745 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 302.667-38 chr9 25353437 25353628 + 2 NA Intergenic Intergenic 325326 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 416.666-6 chr2 144141179 144141437 + 2 NA intron (NM_001354355, intron 6 of 13) intron (NM_001354355, intron 6 of 13) 70271 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 241.333-11 chr1 240452515 240452677 + 2 NA intron (NM_020066, intron 16 of 17) intron (NM_020066, intron 16 of 17) 159559 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 332.667 chr1 27750087 27750432 + 2 NA intron (NM_152660, intron 6 of 8) intron (NM_152660, intron 6 of 8) -22960 NM_177424 23673 Hs.523855 NM_177424 ENSG00000117758 STX12 STX13|STX14 syntaxin 12 protein-coding 578.334 chr11 31087939 31088247 + 2 NA intron (NM_001367979, intron 17 of 38) L1ME1|LINE|L1 -95407 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 549.333-4 chr8 38302657 38303215 + 2 NA intron (NM_023034, intron 14 of 23) intron (NM_023034, intron 14 of 23) -33704 NM_001354454 84513 Hs.567619 NM_032483 ENSG00000147535 PLPP5 DPPL1|HTPAP|PPAPDC1B phospholipid phosphatase 5 protein-coding 582-4 chrX 57902151 57902693 + 2 NA Intergenic Intergenic 8211 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 386.333-8 chr3 99622983 99623268 + 2 NA Intergenic Intergenic -15469 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 506.666-2 chr2 213969340 213969669 + 2 NA intron (NR_047660, intron 11 of 14) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 211437 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 163-90 chr9 6220520 6220668 + 2 NA intron (NM_001199640, intron 1 of 6) intron (NM_001199640, intron 1 of 6) 4787 NM_001199640 90865 Hs.731660 NM_033439 ENSG00000137033 IL33 C9orf26|DVS27|IL1F11|NF-HEV|NFEHEV interleukin 33 protein-coding 387-13 chr3 124450021 124450256 + 2 NA intron (NM_001024660, intron 21 of 59) L1MB7|LINE|L1 75806 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 305.333-9 chr10 65493849 65494220 + 2 NA Intergenic Intergenic -77391 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 439.333-5 chr2 45447086 45447472 + 2 NA intron (NM_018079, intron 16 of 20) AluSc|SINE|Alu 163988 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 183.333-4 chr1 82331108 82331230 + 2 NA Intergenic LTR28C|LTR|ERV1 528716 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 300.333-53 chrX 76745091 76745270 + 2 NA intron (NR_110400, intron 1 of 3) L1PB1|LINE|L1 174180 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 343.334-3 chr11 72918824 72919244 + 2 NA intron (NM_014824, intron 9 of 19) intron (NM_014824, intron 9 of 19) 104623 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 450-2 chr15 100742658 100743070 + 2 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -106888 NR_160703 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 352-23 chr6 2157202 2157442 + 2 NA intron (NM_001500, intron 1 of 10) intron (NM_001500, intron 1 of 10) 18669 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 358.667-18 chr22 38499246 38499519 + 2 NA intron (NM_006386, intron 3 of 12) intron (NM_006386, intron 3 of 12) 6929 NM_001098504 10521 Hs.528305 NM_006386 ENSG00000100201 DDX17 P72|RH70 DEAD-box helicase 17 protein-coding 316-31 chr22 17632215 17632459 + 2 NA Intergenic Intergenic -3515 NM_001039366 529 Hs.517338 NM_001696 ENSG00000131100 ATP6V1E1 ARCL2C|ATP6E|ATP6E2|ATP6V1E|P31|Vma4 ATPase H+ transporting V1 subunit E1 protein-coding 268.334-10 chr2 53781864 53782052 + 2 NA intron (NM_001164165, intron 1 of 9) AluYc|SINE|Alu -4973 NM_001127398 27248 Hs.438336 NM_015701 ENSG00000068912 ERLEC1 C2orf30|CIM|CL24936|CL25084|HEL117|XTP3-B|XTP3TPB endoplasmic reticulum lectin 1 protein-coding 271-23 chr2 118932151 118932411 + 2 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -9888 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 288.666-21 chr20 37212780 37212992 + 2 NA intron (NM_001135771, intron 7 of 16) intron (NM_001135771, intron 7 of 16) -33338 NM_213632 140699 Hs.349125 NM_152503 ENSG00000101353 MROH8 C20orf131|C20orf132 maestro heat like repeat family member 8 protein-coding 379-12 chr5 44713098 44713377 + 2 NA Intergenic Intergenic 95556 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 349.667-6 chr13 31090310 31090568 + 2 NA Intergenic Intergenic 71465 NM_001349704 10808 Hs.743267 NM_006644 ENSG00000120694 HSPH1 HSP105|HSP105A|HSP105B|NY-CO-25 heat shock protein family H (Hsp110) member 1 protein-coding 308.667-29 chr4 145812732 145812894 + 2 NA intron (NM_178835, intron 8 of 14) AluSx|SINE|Alu 126010 NM_178835 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 320-41 chr7 36943807 36944112 + 2 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) intron (NM_001206480, intron 16 of 21) -24527 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 306-16 chr15 27635064 27635363 + 2 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 464102 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 348.667-10 chr14 30712664 30713058 + 2 NA intron (NM_016106, intron 19 of 24) intron (NM_016106, intron 19 of 24) 90542 NM_001257376 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 286-53 chr6 162228861 162229013 + 2 NA intron (NM_004562, intron 3 of 11) L2a|LINE|L2 -498195 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 412-9 chr5 132788243 132788627 + 2 NA Intergenic LTR102_Mam|LTR|ERVL -10566 NM_001098813 23176 Hs.522057 NM_015146 ENSG00000164402 SEPTIN8 SEP2|SEPT8 septin 8 protein-coding 244-68 chr3 52188993 52189229 + 2 NA Intergenic Intergenic -8972 NM_001304443 211 Hs.476308 NM_000688 ENSG00000023330 ALAS1 ALAS|ALAS-H|ALAS3|ALASH|MIG4 5'-aminolevulinate synthase 1 protein-coding 296.666-20 chr3 101762063 101762274 + 2 NA intron (NM_024548, intron 9 of 10) intron (NM_024548, intron 9 of 10) -17043 NM_001348992 91775 Hs.595933 NM_145037 ENSG00000144815 NXPE3 FAM55C|MST115|MSTP115 neurexophilin and PC-esterase domain family member 3 protein-coding 558.666 chr17 8756440 8756788 + 2 NA intron (NM_001128076, intron 2 of 6) intron (NM_001128076, intron 2 of 6) 1932 NM_001128076 388333 Hs.230205 NM_001128076 ENSG00000183318 SPDYE4 - speedy/RINGO cell cycle regulator family member E4 protein-coding 440 chr10 129426341 129426736 + 2 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? -40703 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 483-3 chr20 13120436 13120767 + 2 NA intron (NM_001349945, intron 9 of 12) intron (NM_001349945, intron 9 of 12) -100673 NM_080826 140862 Hs.559353 NM_080826 ENSG00000101230 ISM1 C20orf82|ISM|Isthmin|bA149I18.1|dJ1077I2.1 isthmin 1 protein-coding 312-52 chr7 46895923 46896171 + 2 NA Intergenic Intergenic -198925 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 295-11 chr13 76642284 76642452 + 2 NA Intergenic Intergenic 244037 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 417.667-5 chr22 28177758 28178062 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L1MC2|LINE|L1 -257298 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 303-24 chr16 80432223 80432389 + 2 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) L1MA2|LINE|L1 -108428 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 306.334-3 chr11 29199930 29200101 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -394398 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 291-42 chr8 30429475 30429746 + 2 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) intron (NM_001008710, intron 1 of 8) -44209 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 339.333-28 chr2 212259594 212259865 + 2 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 166631 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 304.666-28 chr8 104076453 104076689 + 2 NA intron (NR_145711, intron 17 of 21) intron (NR_145711, intron 17 of 21) -146764 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 363.667-16 chr8 55994461 55994707 + 2 NA intron (NM_002350, intron 10 of 12) intron (NM_002350, intron 10 of 12) 79317 NR_002437 26795 NR_002437 ENSG00000238650 SNORD54 RNU54|U54 small nucleolar RNA, C/D box 54 snoRNA 440-14 chr8 119570541 119570877 + 2 NA non-coding (NR_045555, exon 9 of 14) non-coding (NR_045555, exon 9 of 14) 22299 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 490 chr11 115001253 115001593 + 2 NA Intergenic Intergenic 322896 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 560.666 chr8 141955948 141956582 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -169952 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 627.999 chr13 77111065 77111672 + 2 NA intron (NM_015057, intron 55 of 82) intron (NM_015057, intron 55 of 82) 35854 NR_046716 100874212 Hs.569288 NR_046716 ENSG00000236051 MYCBP2-AS1 - MYCBP2 antisense RNA 1 ncRNA 490.333-3 chr14 48660858 48661171 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -866000 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 401.667 chr10 69567665 69567962 + 2 NA Intergenic Intergenic 5609 NM_020999 50674 Hs.532682 NM_020999 ENSG00000122859 NEUROG3 Atoh5|Math4B|NGN-3|bHLHa7|ngn3 neurogenin 3 protein-coding 313.333-5 chr10 95683887 95684093 + 2 NA intron (NM_001143973, intron 5 of 9) intron (NM_001143973, intron 5 of 9) 9937 NM_015631 26123 Hs.438991 NM_015631 ENSG00000119977 TCTN3 C10orf61|JBTS18|OFD4|TECT3 tectonic family member 3 protein-coding 304-58 chr7 95050048 95050235 + 2 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) L1MC1|LINE|L1 140243 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 276-2 chr1 23473020 23473168 + 2 NA intron (NM_001143778, intron 1 of 23).2 intron (NM_001143778, intron 1 of 23).2 11085 NM_017707 55616 Hs.437379 NM_017707 ENSG00000088280 ASAP3 ACAP4|CENTB6|DDEFL1|UPLC1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 3 protein-coding 273.333-67 chr6 75153262 75153540 + 2 NA intron (NM_080645, intron 2 of 50) intron (NM_080645, intron 2 of 50) -24619 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 326-23 chr21 37195479 37195766 + 2 NA intron (NM_003316, intron 41 of 45) intron (NM_003316, intron 41 of 45) -1696 NR_046651 100874006 Hs.570411 NR_046651 ENSG00000228677 TTC3-AS1 - TTC3 antisense RNA 1 ncRNA 268-43 chr4 113419838 113420010 + 2 NA Intergenic 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 127085 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 311-28 chr5 76810424 76810616 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -8510 NM_005242 2150 Hs.744181 NM_005242 ENSG00000164251 F2RL1 GPR11|PAR2 F2R like trypsin receptor 1 protein-coding 306-3 chr1 205650358 205650589 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17601 NM_021795 2005 Hs.497520 NM_001973 ENSG00000158711 ELK4 SAP1 ETS transcription factor ELK4 protein-coding 518.667 chr12 121217192 121217546 + 2 NA intron (NR_046372, intron 2 of 12) intron (NR_046372, intron 2 of 12) 7240 NM_002560 5025 Hs.321709 NM_002560 ENSG00000135124 P2RX4 P2X4|P2X4R purinergic receptor P2X 4 protein-coding 404-15 chr5 119605979 119606259 + 2 NA Intergenic Intergenic -23439 NM_001367956 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 383-5 chr2 77765669 77766092 + 2 NA intron (NR_110288, intron 3 of 3) L1MEd|LINE|L1 -150054 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 313-31 chr5 34859561 34859816 + 2 NA intron (NM_001317949, intron 4 of 10) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 20307 NM_001317949 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 337.333-27 chr21 42521522 42521768 + 2 NA intron (NM_001320537, intron 2 of 19) intron (NM_001320537, intron 2 of 19) 7793 NM_001320537 54020 Hs.547009 NM_018964 ENSG00000160190 SLC37A1 G3PP solute carrier family 37 member 1 protein-coding 357-16 chr3 37842750 37843045 + 2 NA intron (NR_110531, intron 1 of 3) L1PA6|LINE|L1 18883 NR_110532 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 308-26 chr2 105113232 105113481 + 2 NA Intergenic Intergenic -10412 NR_110227 101927492 Hs.469537 NR_110227 ENSG00000231851 UTAT33 - uncharacterized LOC101927492 ncRNA 272-30 chr3 98812054 98812297 + 2 NA intron (NM_080927, intron 10 of 15) intron (NM_080927, intron 10 of 15) 48868 NM_001323367 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 330.667-17 chr3 44317654 44317899 + 2 NA intron (NM_001145030, intron 16 of 19) intron (NM_001145030, intron 16 of 19) -20343 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 415-8 chr20 60530941 60531568 + 2 NA Intergenic Intergenic -33308 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 308.667-43 chr8 125885702 125886016 + 2 NA Intergenic X6A_LINE|LINE|CR1 65338 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 296.667-5 chr10 98335093 98335285 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 60118 NR_031619 100302133 NR_031619 ENSG00000284415 MIR1287 MIRN1287|hsa-mir-1287|mir-1287 microRNA 1287 ncRNA 388.667-6 chr16 79793877 79794301 + 2 NA intron (NR_104660, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 -1160 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 169.333-235 chr6 140665233 140665384 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -18506 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 354-8 chr12 16522574 16522851 + 2 NA Intergenic Intergenic 82667 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 400-12 chr5 133492195 133492516 + 2 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) L1MEd|LINE|L1 -64649 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 305.667-4 chr10 70029907 70030184 + 2 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -22801 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 324.333-35 chr6 117011847 117012107 + 2 NA Intergenic Intergenic 134735 NM_173560 222546 Hs.352276 NM_173560 ENSG00000185002 RFX6 MTCHRS|MTFS|RFXDC1|dJ955L16.1 regulatory factor X6 protein-coding 344-12 chr14 29111817 29112019 + 2 NA Intergenic Intergenic -326131 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 312.334-3 chr1 241687996 241688266 + 2 NA intron (NM_001367482, intron 8 of 27) L1MB8|LINE|L1 35850 NM_001367482 128025 Hs.97527 NM_144625 ENSG00000162843 WDR64 - WD repeat domain 64 protein-coding 325.333-30 chr4 44151776 44151958 + 2 NA Intergenic Intergenic 134805 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 634.333 chr1 72505962 72506761 + 2 NA Intergenic Intergenic -223822 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 302-34 chr21 42487685 42487897 + 2 NA intron (NM_080860, intron 3 of 8) intron (NM_080860, intron 3 of 8) 8433 NM_001286506 89765 Hs.661069 NM_080860 ENSG00000160188 RSPH1 CT79|RSP44|RSPH10A|TSA2|TSGA2 radial spoke head component 1 protein-coding 335-32 chr8 127563841 127564013 + 2 NA Intergenic Intergenic -81788 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 337-17 chr21 18021373 18021702 + 2 NA intron (NM_001204177, intron 1 of 4) intron (NM_001204177, intron 1 of 4) 104197 NM_001204175 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 309.667-29 chr8 92076002 92076215 + 2 NA 5' UTR (NM_175634, exon 2 of 12) 5' UTR (NM_175634, exon 2 of 12) -13474 NM_004349 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 272.667-42 chr3 114666366 114666515 + 2 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) -41495 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 342.334-3 chr14 39007470 39007710 + 2 NA Intergenic Intergenic -90708 NR_039982 283547 Hs.675941 NR_039982 ENSG00000259070 LINC00639 - long intergenic non-protein coding RNA 639 ncRNA 402-4 chr18 2522198 2522511 + 2 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 49151 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 261-45 chr4 80504935 80505131 + 2 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) intron (NM_152770, intron 2 of 5) 169313 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 253-10 chr10 41858266 41858417 + 2 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 509704 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 289.333-21 chr17 48707990 48708387 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 14330 NM_032391 84366 Hs.116467 NM_032391 ENSG00000159182 PRAC1 C17orf92|PRAC PRAC1 small nuclear protein protein-coding 304.667-34 chr7 52200520 52200795 + 2 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -807401 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 295-34 chr4 87698893 87699127 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 48730 NM_001079911 1758 Hs.652366 NM_004407 ENSG00000152592 DMP1 ARHP|ARHR|DMP-1 dentin matrix acidic phosphoprotein 1 protein-coding 450.667 chr1 165747604 165747991 + 2 NA intron (NM_001256164, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR 21071 NM_001366129 54499 Hs.31498 NM_019026 ENSG00000143183 TMCO1 HP10122|PCIA3|PNAS-136|TMCC4 transmembrane and coiled-coil domains 1 protein-coding 470 chr14 67060706 67061064 + 2 NA intron (NM_001024218, intron 10 of 21) L2c|LINE|L2 -128555 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 401.333-14 chr2 35193774 35194147 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -277445 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 421-4 chr14 64239775 64240045 + 2 NA intron (NM_001271877, intron 4 of 5) intron (NM_001271877, intron 4 of 5) 23956 NM_182910 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 326-27 chr3 97549330 97549677 + 2 NA intron (NM_001080448, intron 11 of 17) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 109896 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 416-3 chr15 35786706 35787133 + 2 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) L1MA4A|LINE|L1 -139937 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 534-4 chr18 1752096 1752419 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -392628 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 282-32 chr2 213481206 213481401 + 2 NA intron (NR_047660, intron 8 of 14) intron (NR_047660, intron 8 of 14) 196839 NR_047660 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 307.334-2 chr11 126836327 126836586 + 2 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) -104290 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 439-4 chr4 36463550 36464134 + 2 NA Intergenic Intergenic -37414 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 305.333-45 chr3 76117798 76118085 + 2 NA Intergenic Intergenic -332392 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 608.666-2 chr15 85995630 85996007 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -83802 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 346.667-4 chr18 3137971 3138204 + 2 NA intron (NM_019856, intron 14 of 36) intron (NM_019856, intron 14 of 36) 81881 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 372.667 chr1 99305334 99305541 + 2 NA intron (NM_014839, intron 6 of 6) intron (NM_014839, intron 6 of 6) 41145 NM_014839 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 310.333-24 chr2 118353523 118353685 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -167218 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 372.667-4 chr10 77273626 77273871 + 2 NA intron (NM_001271518, intron 1 of 27) intron (NM_001271518, intron 1 of 27) 77013 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 341-14 chr2 11391804 11392066 + 2 NA Intergenic Intergenic -2046 NR_047499 100874055 Hs.102428 NR_047499 ENSG00000224177 LINC00570 ncRNA-a5 long intergenic non-protein coding RNA 570 ncRNA 289-5 chr12 41256443 41256615 + 2 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 68209 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 384-26 chr9 33205451 33205972 + 2 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -34456 NM_014471 27290 Hs.555934 NM_014471 ENSG00000122711 SPINK4 HEL136|PEC-60|PEC60 serine peptidase inhibitor, Kazal type 4 protein-coding 238-72 chr5 6019633 6019887 + 2 NA Intergenic Intergenic 317532 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 402.667-10 chr8 83587630 83588015 + 2 NA Intergenic Intergenic 184064 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 331.333-32 chr3 44176664 44176846 + 2 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 62543 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 489-4 chr3 148016493 148016789 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -61518 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 338-5 chr10 112053267 112053531 + 2 NA Intergenic Intergenic 130366 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 440.666-12 chr5 12866747 12867113 + 2 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 165956 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 588 chr1 90301890 90302435 + 2 NA Intergenic Intergenic 307052 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 308-52 chr7 40086167 40086400 + 2 NA intron (NM_003718, intron 11 of 13) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 48339 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 315-5 chr10 109595970 109596145 + 2 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 327189 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 291-47 chr9 71349494 71349646 + 2 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 97401 NM_001366141 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 390.667-9 chr5 55622302 55622752 + 2 NA Intergenic Intergenic 70526 NM_001258286 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 414.666-7 chr19 14774902 14775158 + 2 NA intron (NM_013447, intron 2 of 20) AluSx|SINE|Alu 1897 NM_001271052 30817 Hs.531619 NM_013447 ENSG00000127507 ADGRE2 CD312|CD97|EMR2|VBU adhesion G protein-coupled receptor E2 protein-coding 374-10 chr16 76520528 76520937 + 2 NA intron (NR_136213, intron 15 of 23) intron (NR_136213, intron 15 of 23) -114266 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 555.001 chr4 37554751 37555138 + 2 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) intron (NM_001104629, intron 1 of 3) -29289 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 314-6 chr11 119000038 119000232 + 2 NA intron (NR_104049, intron 3 of 10) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 1997 NR_104050 338657 Hs.534613 NM_198489 ENSG00000186166 CCDC84 DLNB14 coiled-coil domain containing 84 protein-coding 296-66 chr8 134068091 134068321 + 2 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 181710 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 617 chr2 60859654 60860290 + 2 NA intron (NR_033980, intron 1 of 2) AluSq2|SINE|Alu 21342 NR_033980 400957 Hs.170358 NR_033980 ENSG00000228414 LINC01185 - long intergenic non-protein coding RNA 1185 ncRNA 337-13 chr17 28065539 28065738 + 2 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 22961 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 350.333-11 chr2 22692985 22693314 + 2 NA Intergenic Intergenic 156670 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 350-3 chr10 17565497 17565817 + 2 NA Intergenic Intergenic 51717 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 333.333-15 chr11 76915482 76915785 + 2 NA intron (NM_001300953, intron 1 of 9) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 54715 NM_001300953 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 380.667-3 chr14 25334403 25334680 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -284244 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 411.667-5 chr2 70433276 70433781 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 48112 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 294-17 chr12 33899425 33899686 + 2 NA Intergenic Intergenic -122941 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 281.333 chr1 56688144 56688567 + 2 NA intron (NM_006252, intron 2 of 8) intron (NM_006252, intron 2 of 8) -43037 NR_135111 101929935 NR_135111 LOC101929935 - uncharacterized LOC101929935 ncRNA 265.333-36 chr2 68035722 68035959 + 2 NA Intergenic Intergenic 27164 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 368.334-8 chr6 55060314 55060708 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -45949 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 342.333-2 chr1 222880124 222880680 + 2 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) L1ME4a|LINE|L1 -48022 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 336.333-9 chr10 74524850 74525073 + 2 NA intron (NR_120673, intron 2 of 4) intron (NR_120673, intron 2 of 4) 4363 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 580.333 chr2 53145197 53145711 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -442839 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 633 chr3 97149664 97150224 + 2 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) -289663 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 298-3 chr1 75088990 75089176 + 2 NA Intergenic Intergenic -39351 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 269.667-16 chr12 30569779 30569930 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 107390 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 398.334-3 chr22 30126629 30126940 + 2 NA intron (NM_001329457, intron 11 of 11) L1ME3A|LINE|L1 46320 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 195-108 chr8 102118531 102118671 + 2 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 5733 NM_001040629 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 309.334-9 chr3 179746938 179747131 + 2 NA intron (NM_003940, intron 13 of 20) intron (NM_003940, intron 13 of 20) 93994 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 401.333-4 chr10 8834345 8834656 + 2 NA Intergenic Intergenic -63489 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 274.666-27 chr6 70775536 70775824 + 2 NA intron (NM_021940, intron 4 of 9) intron (NM_021940, intron 4 of 9) 107150 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 448.333-3 chr17 59134538 59134989 + 2 NA intron (NM_182620, intron 1 of 3) intron (NM_182620, intron 1 of 3) 3109 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 541.333 chr14 69408435 69408853 + 2 NA intron (NM_001330185, intron 1 of 5) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 9952 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 282.667-21 chr2 163386696 163386849 + 2 NA Intergenic Intergenic 349236 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 299.333-8 chr11 11506764 11507010 + 2 NA intron (NM_001363464, intron 1 of 9) intron (NM_001363464, intron 1 of 9) 115118 NM_001363464 374378 Hs.655152 NM_198516 ENSG00000110328 GALNT18 GALNACT18|GALNT15|GALNTL4|GalNAc-T15|GalNAc-T18 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18 protein-coding 468-10 chr4 41646996 41647258 + 2 NA intron (NM_001330786, intron 9 of 22) intron (NM_001330786, intron 9 of 22) 34225 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 449-6 chr8 78961507 78961840 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 124144 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 289.334-8 chr3 167493867 167494154 + 2 NA intron (NM_001348951, intron 18 of 18) intron (NM_001348951, intron 18 of 18) -19878 NM_001012303 5276 Hs.445555 NM_006217 ENSG00000114204 SERPINI2 MEPI|PANCPIN|PI14|TSA2004 serpin family I member 2 protein-coding 290.333-48 chr8 131848476 131848806 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -55452 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 611 chr7 48471271 48471633 + 2 NA intron (NM_152701, intron 44 of 61) Eulor2B|DNA?|DNA? 299994 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 303.333-36 chr2 44135495 44135787 + 2 NA Intergenic MER34C|LTR|ERV1 -33162 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 566.334-3 chrX 83861003 83861325 + 2 NA promoter-TSS (NM_001271680) promoter-TSS (NM_001271680) 18 NM_021118 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 482.667-2 chr4 26723311 26723614 + 2 NA intron (NM_001292054, intron 12 of 17) LTR84b|LTR|ERVL 136782 NR_134675 105374546 Hs.548859 NR_134673 STIM2-AS1 - STIM2 antisense RNA 1 ncRNA 335-29 chr7 40834072 40834404 + 2 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) L3|LINE|CR1 145701 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 340-19 chr20 11313163 11313351 + 2 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -39874 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 314.667-20 chr15 91922752 91922915 + 2 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) intron (NR_135775, intron 2 of 10) 68529 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 378.667-13 chr2 68118814 68119353 + 2 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 38444 NR_046234 116143 Hs.631877 NM_138458 ENSG00000243667 WDR92 - WD repeat domain 92 protein-coding 451.666-3 chr4 90807056 90807387 + 2 NA intron (NM_001145065, intron 7 of 10) intron (NM_001145065, intron 7 of 10) 572190 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 315.333-42 chr6 56147445 56147616 + 2 NA intron (NR_134849, intron 10 of 29) intron (NR_134849, intron 10 of 29) -55868 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 301-46 chr5 99993884 99994095 + 2 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 394265 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 268-47 chr5 101131257 101131417 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -228055 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 306.667-4 chr1 231118479 231118668 + 2 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -44355 NM_001300889 440730 Hs.655089 NM_001004342 ENSG00000119283 TRIM67 TNL tripartite motif containing 67 protein-coding 287.333-7 chr10 81358405 81358672 + 2 NA Intergenic Intergenic -516656 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 383.334-3 chr14 53610728 53611080 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 337580 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 219.333-76 chr17 64640364 64640502 + 2 NA intron (NM_022739, intron 1 of 18) L2|LINE|L2 21874 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 376.667-6 chr2 42202146 42202508 + 2 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) AluJr|SINE|Alu -32096 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 298.667-22 chr5 135894057 135894208 + 2 NA exon (NM_000590, exon 4 of 5) exon (NM_000590, exon 4 of 5) 1709 NM_000590 3578 Hs.960 NM_000590 ENSG00000145839 IL9 HP40|IL-9|P40 interleukin 9 protein-coding 380.666-2 chr1 184442067 184442298 + 2 NA intron (NM_030806, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 55153 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 556 chr10 9281547 9281958 + 2 NA intron (NR_108039, intron 1 of 1) intron (NR_108039, intron 1 of 1) 6139 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 362.667-17 chr20 35255723 35256075 + 2 NA intron (NM_006690, intron 4 of 8) intron (NM_006690, intron 4 of 8) 22223 NM_001355003 101410538 Hs.356273 NM_001355003 ENSG00000126005 MMP24OS MMP24-AS1 MMP24 opposite strand protein-coding 340-6 chr10 49807328 49807539 + 2 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -45054 NM_001347826 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 310-52 chr7 28278540 28278717 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -20693 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 525-3 chr5 174551121 174551639 + 2 NA Intergenic Intergenic -173202 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 359.333-12 chr2 99068572 99068832 + 2 NA intron (NR_146001, intron 14 of 18) intron (NR_146001, intron 14 of 18) 72478 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 245.333-38 chr13 77191877 77192098 + 2 NA intron (NM_015057, intron 27 of 82) intron (NM_015057, intron 27 of 82) 116473 NR_046716 100874212 Hs.569288 NR_046716 ENSG00000236051 MYCBP2-AS1 - MYCBP2 antisense RNA 1 ncRNA 379.334-5 chr3 46036811 46037168 + 2 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -9506 NM_005283 2829 Hs.128375 NM_005283 ENSG00000173578 XCR1 CCXCR1|GPR5 X-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 308.666-18 chr7 115622801 115623036 + 2 NA Intergenic Intergenic -41477 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 411.667-8 chr9 78714781 78715118 + 2 NA Intergenic Intergenic 417824 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 311.333-49 chr5 87011378 87011641 + 2 NA Intergenic Intergenic 103445 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 223.333-118 chr4 116632220 116632415 + 2 NA Intergenic Intergenic 332592 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 312-45 chr5 127943923 127944177 + 2 NA intron (NR_152813, intron 3 of 3) intron (NR_152813, intron 3 of 3) 139125 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 230-48 chr4 39169861 39170101 + 2 NA Intergenic (GATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12548 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 334.333-16 chr18 7034852 7035264 + 2 NA intron (NM_005559, intron 13 of 62) intron (NM_005559, intron 13 of 62) 80381 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 269.667-23 chr15 58776731 58776950 + 2 NA intron (NM_001040450, intron 1 of 8) FLAM_C|SINE|Alu 5538 NM_001040453 54629 Hs.591122 NM_019092 ENSG00000128923 MINDY2 FAM63B MINDY lysine 48 deubiquitinase 2 protein-coding 253-54 chr5 76655147 76655350 + 2 NA intron (NM_006633, intron 20 of 35) intron (NM_006633, intron 20 of 35) -31845 NM_001256566 2151 Hs.42502 NM_004101 ENSG00000164220 F2RL2 PAR-3|PAR3 coagulation factor II thrombin receptor like 2 protein-coding 343-6 chr14 77680005 77680310 + 2 NA intron (NM_006020, intron 3 of 5) intron (NM_006020, intron 3 of 5) 27866 NM_006020 8846 Hs.94542 NM_006020 ENSG00000100601 ALKBH1 ABH|ABH1|ALKBH|alkB|hABH alkB homolog 1, histone H2A dioxygenase protein-coding 292-42 chr5 79266880 79267135 + 2 NA intron (NM_152405, intron 1 of 10) L1MC3|LINE|L1 30876 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 419-8 chr7 40329522 40329798 + 2 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 194684 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 234.667-29 chr13 100464857 100465101 + 2 NA intron (NR_047686, intron 4 of 4) intron (NR_047686, intron 4 of 4) 16036 NR_047686 100885777 Hs.662554 NR_047686 PCCA-AS1 - PCCA antisense RNA 1 ncRNA 326.667-16 chr15 94262412 94262584 + 2 NA Intergenic Intergenic -35703 NM_001159643 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 428 chr1 84653909 84654276 + 2 NA intron (NM_001166417, intron 12 of 14) HAL1ME|LINE|L1 -19072 NR_027379 439927 Hs.407054 NM_001033660 ENSG00000180869 LINC01555 C1orf180 long intergenic non-protein coding RNA 1555 ncRNA 281.667-35 chr3 126359739 126359993 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2458 NM_014079 28999 Hs.272215 NM_014079 ENSG00000163884 KLF15 KKLF Kruppel like factor 15 protein-coding 200.667-43 chr14 55138751 55138993 + 2 NA intron (NR_003225, intron 1 of 3) intron (NR_003225, intron 1 of 3) 1889 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 304-43 chr4 18529006 18529210 + 2 NA Intergenic Intergenic -507233 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 405-13 chr4 157120534 157120913 + 2 NA intron (NM_000824, intron 3 of 9) (TTTTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 44320 NM_001166060 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 311.333-15 chr12 132544895 132545226 + 2 NA intron (NM_001142641, intron 4 of 16) MIR|SINE|MIR -36937 NR_106821 102465975 NR_106821 ENSG00000277052 MIR6763 hsa-mir-6763 microRNA 6763 ncRNA 328.667-14 chr5 123750411 123750656 + 2 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 205116 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 335.667-7 chr15 24921360 24921695 + 2 NA intron (NM_001349456, intron 4 of 12) intron (NM_001349456, intron 4 of 12) -33366 NM_005678 8926 Hs.564847 NM_005678 ENSG00000273173 SNURF - SNRPN upstream reading frame protein-coding 292.667-44 chr8 99189416 99189565 + 2 NA intron (NM_017890, intron 16 of 61) HAL1b|LINE|L1 176224 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 290-38 chr4 94827410 94827562 + 2 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 69531 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 318.667-15 chr17 7781995 7782309 + 2 NA intron (NM_020877, intron 39 of 85) L1MEd|LINE|L1 27832 NR_002778 118432 Hs.658086 NR_002778 ENSG00000240480 RPL29P2 RPL29_10_1510 ribosomal protein L29 pseudogene 2 pseudo 235-45 chr5 161292121 161292355 + 2 NA 3' UTR (NM_021911, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_021911, exon 11 of 11) 255886 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 316.666-15 chr5 28246539 28246780 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 41006 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 283.333-69 chr6 161004240 161004452 + 2 NA intron (NM_005922, intron 1 of 26) MER92-int|LTR|ERV1 12577 NM_005922 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 273-8 chr10 97070118 97070330 + 2 NA intron (NM_003061, intron 4 of 36) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -32532 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 324.667-14 chr19 10944580 10944752 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 15855 NM_138358 90580 Hs.164026 NM_138358 ENSG00000142444 TIMM29 C19orf52|TIM29 translocase of inner mitochondrial membrane 29 protein-coding 277.333-35 chr16 54352501 54352679 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 17868 NR_134924 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 351-12 chr20 45937757 45937991 + 2 NA intron (NM_022104, intron 2 of 16) intron (NM_022104, intron 2 of 16) 3191 NM_022104 63935 Hs.472856 NM_022104 ENSG00000100982 PCIF1 C20orf67|CAPAM|PPP1R121|hCAPAM|hPCIF1 PDX1 C-terminal inhibiting factor 1 protein-coding 301-36 chr4 75306269 75306428 + 2 NA Intergenic Intergenic -47728 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 339.666-3 chr12 777748 778093 + 2 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) intron (NM_001184985, intron 1 of 27) 24997 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 400.667-5 chr4 150338372 150338680 + 2 NA intron (NM_001367550, intron 48 of 56) intron (NM_001367550, intron 48 of 56) -240563 NR_149035 729558 Hs.647978 NR_149035 ENSG00000249690 LOC729558 - uncharacterized LOC729558 ncRNA 315.667-4 chr11 55682462 55682641 + 2 NA Intergenic Intergenic 17384 NM_001004704 219432 Hs.511921 NM_001004704 ENSG00000181903 OR4C6 OR11-138 olfactory receptor family 4 subfamily C member 6 protein-coding 238.667-41 chr2 74740812 74740975 + 2 NA Intergenic Intergenic 86646 NR_073399 10505 Hs.25887 NM_004263 ENSG00000135622 SEMA4F M-SEMA|PRO2353|S4F|SEMAM|SEMAW|m-Sema-M ssemaphorin 4F protein-coding 295.667-28 chr6 119034127 119034315 + 2 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) intron (NM_001288576, intron 1 of 15) 34922 NR_030315 693128 NR_030315 ENSG00000207982 MIR548B MIRN548B microRNA 548b ncRNA 312.667-27 chr4 33713807 33714076 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 325952 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 500.667-2 chr4 62748906 62749201 + 2 NA Intergenic Intergenic -587288 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 225.666-6 chr13 108962335 108962514 + 2 NA exon (NM_001198950, exon 19 of 35) exon (NM_001198950, exon 19 of 35) 204879 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 409-5 chr17 17250546 17250994 + 2 NA intron (NM_003653, intron 9 of 11) intron (NM_003653, intron 9 of 11) -13602 NM_144606 201163 Hs.31652 NM_144606 ENSG00000154803 FLCN BHD|DENND8B|FLCL folliculin protein-coding 269-5 chr1 197750651 197750859 + 2 NA intron (NM_001195216, intron 2 of 2) L1MEf|LINE|L1 24725 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 370-16 chr2 113855788 113856069 + 2 NA intron (NR_110174, intron 2 of 4) intron (NR_110174, intron 2 of 4) -34006 NR_102318 10096 Hs.433512 NM_005721 ENSG00000115091 ACTR3 ARP3 actin related protein 3 protein-coding 485.333-3 chr21 18528867 18529368 + 2 NA Intergenic Intergenic -125332 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 251.333-29 chr14 26893455 26893663 + 2 NA intron (NR_110041, intron 3 of 3) intron (NR_110041, intron 3 of 3) -15083 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 344-4 chr1 221815921 221816260 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 24576 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 354.666-21 chrUn_KI270337v1 293 552 + 2 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 310.666-13 chr22 26495753 26495940 + 2 NA intron (NM_001346861, intron 12 of 14) intron (NM_001346861, intron 12 of 14) 11969 NM_001013694 402055 Hs.709914 NM_001013694 ENSG00000100104 SRRD HC/HCC|SRR1L SRR1 domain containing protein-coding 309.333-33 chr2 37274978 37275330 + 2 NA intron (NM_005813, intron 9 of 17) intron (NM_005813, intron 9 of 17) 41930 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 305-18 chr5 51209579 51209865 + 2 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 173610 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 374-3 chr12 17662991 17663317 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -10145 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 291.333-5 chr1 225914323 225914504 + 2 NA Intergenic Intergenic 7729 NR_106799 102466270 NR_106799 ENSG00000284519 MIR6741 hsa-mir-6741 microRNA 6741 ncRNA 412.667-15 chr7 7847344 7847666 + 2 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) 121247 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 356.667-17 chr7 24827081 24827484 + 2 NA intron (NR_104111, intron 15 of 21) intron (NR_104111, intron 15 of 21) 65339 NM_145320 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 299.333-36 chr2 10483573 10483740 + 2 NA Intergenic Intergenic 33928 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 295.667-25 chr5 103683913 103684070 + 2 NA Intergenic Intergenic -121202 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 335.333-14 chr15 61948955 61949286 + 2 NA intron (NM_001018088, intron 42 of 81) intron (NM_001018088, intron 42 of 81) 111327 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 391.333-8 chr14 80959308 80959760 + 2 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) intron (NM_001142626, intron 1 of 8) 3913 NM_000369 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 290.667-16 chr15 40219922 40220188 + 2 NA intron (NM_001211, intron 22 of 22) intron (NM_001211, intron 22 of 22) 2627 NM_001128629 106821730 Hs.732375 NM_001128628 ENSG00000259288 BUB1B-PAK6 PAK-5|PAK-6|PAK5|PAK6 BUB1B-PAK6 readthrough protein-coding 323.333-19 chr2 225185940 225186293 + 2 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -143648 NM_014689 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 327.667-5 chr11 37519821 37520132 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -418625 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 343-3 chr10 11642867 11643100 + 2 NA Intergenic MamGypLTR1a|LTR|Gypsy -31194 NR_125732 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 384 chr10 63826807 63827049 + 2 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -305038 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 292.334-11 chr6 115749180 115749408 + 2 NA Intergenic Intergenic -105459 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 274-32 chr3 71649098 71649304 + 2 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -65212 NM_001244810 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 358.666-9 chr4 44834269 44834613 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -107807 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 304.667-27 chr3 116254832 116255028 + 2 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -105094 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 302-61 chr6 167155629 167155888 + 2 NA Intergenic Intergenic 2073 NM_005299 2853 Hs.248124 NM_005299 ENSG00000120436 GPR31 12-HETER|HETER|HETER1 G protein-coupled receptor 31 protein-coding 472-2 chr1 208136513 208136901 + 2 NA intron (NM_025179, intron 4 of 31) intron (NM_025179, intron 4 of 31) 107677 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 222.667-13 chr11 9668267 9668409 + 2 NA intron (NM_015055, intron 1 of 11) intron (NM_015055, intron 1 of 11) 4261 NM_015055 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 285.667-18 chr18 9595877 9596140 + 2 NA intron (NM_001042388, intron 2 of 19) L2|LINE|L2 18551 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 284-27 chr2 100232459 100232648 + 2 NA intron (NR_103730, intron 1 of 2) intron (NR_103730, intron 1 of 2) 24299 NR_103730 150577 Hs.434127 NM_001102655 ENSG00000232084 LINC01104 - long intergenic non-protein coding RNA 1104 ncRNA 238-103 chr8 49968417 49968598 + 2 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) 57100 NR_135796 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 419.667-2 chr11 20024866 20025310 + 2 NA intron (NM_001111019, intron 2 of 27) MIRb|SINE|MIR 2532 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 236-4 chr1 208170274 208170476 + 2 NA intron (NM_025179, intron 3 of 31) intron (NM_025179, intron 3 of 31) 74009 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 293.333-66 chr8 130773414 130773700 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 267352 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 336-8 chr14 24975664 24976026 + 2 NA intron (NM_014178, intron 1 of 5) intron (NM_014178, intron 1 of 5) 73155 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 586-4 chr8 84541688 84542092 + 2 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1M8|LINE|L1 126406 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 275.667-17 chr12 55874436 55874700 + 2 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -31632 NM_001272101 4327 Hs.591033 NM_002429 ENSG00000123342 MMP19 CODA|MMP18|RASI-1 matrix metallopeptidase 19 protein-coding 273.333-10 chr10 96484966 96485179 + 2 NA intron (NM_012465, intron 1 of 20) intron (NM_012465, intron 1 of 20) 28854 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 212-69 chr16 81961125 81961275 + 2 NA 3' UTR (NM_002661, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_002661, exon 33 of 33) 50270 NM_145168 93517 Hs.87779 NM_145168 ENSG00000184860 SDR42E1 HSPC105 short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 protein-coding 308.333-17 chr18 9156291 9156472 + 2 NA intron (NM_001204056, intron 1 of 11) L1M3|LINE|L1 18818 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 193.333-154 chr5 129372937 129373116 + 2 NA Intergenic Intergenic 24121 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 334-12 chr17 28069462 28069715 + 2 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) L1ME2|LINE|L1 26911 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 299-33 chr6 27498728 27498967 + 2 NA Intergenic Intergenic -25729 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 279.667-23 chr2 4367170 4367349 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 288963 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 203.667-23 chr12 17076531 17076689 + 2 NA Intergenic Intergenic 87863 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 305.333-17 chr12 61638886 61639172 + 2 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 553810 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 398 chr1 41217335 41217609 + 2 NA intron (NM_001172218, intron 1 of 15) MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR 24834 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 306.667-43 chr8 111923797 111923986 + 2 NA Intergenic Intergenic 547252 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 244.667-98 chr8 112671330 112671508 + 2 NA intron (NM_001363185, intron 14 of 66) MER67D|LTR|ERV1 27926 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 471-5 chr5 146699957 146700337 + 2 NA intron (NM_181678, intron 4 of 10) intron (NM_181678, intron 4 of 10) 178638 NM_001271948 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 294.666-40 chrX 50018060 50018305 + 2 NA intron (NM_001127899, intron 3 of 14) L1MD3|LINE|L1 3584 NR_030226 574504 NR_030226 ENSG00000272080 MIR502 MIRN502|hsa-mir-502|mir-502 microRNA 502 ncRNA 321-19 chr5 5112936 5113226 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 26973 NR_109915 101929176 Hs.208717 NR_109915 CTD-2297D10.2 - uncharacterized LOC101929176 ncRNA 266.333-40 chr3 159108264 159108582 + 2 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) 39104 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 414.334 chr1 69733574 69733950 + 2 NA intron (NM_001366839, intron 3 of 25) intron (NM_001366839, intron 3 of 25) 164421 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 380-17 chr7 95073879 95074108 + 2 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) MIR|SINE|MIR 164095 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 296-19 chr14 82515678 82515885 + 2 NA Intergenic Intergenic -126851 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 329-6 chr12 2833719 2834021 + 2 NA intron (NR_147202, intron 13 of 15) MIR|SINE|MIR 1165 NM_031474 83714 Hs.530816 NM_031474 ENSG00000053702 NRIP2 - nuclear receptor interacting protein 2 protein-coding 348.666-17 chr6 121492158 121492418 + 2 NA Intergenic (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 56642 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 320.666-18 chr9 23272863 23273115 + 2 NA Intergenic (CAGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 399410 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 314.666-28 chr4 28980262 28980531 + 2 NA Intergenic Intergenic -16388 NR_146499 102723764 NR_146499 LINC02364 - long intergenic non-protein coding RNA 2364 ncRNA 287.334-10 chr2 190897108 190897297 + 2 NA intron (NM_014905, intron 3 of 17) AluSx1|SINE|Alu 16381 NM_014905 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 330-13 chr14 64979628 64979822 + 2 NA intron (NM_001202559, intron 3 of 13) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -7170 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 365-2 chr10 83273162 83273506 + 2 NA Intergenic Intergenic 403755 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 431-11 chr4 146112420 146112712 + 2 NA intron (NR_038331, intron 3 of 5) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 9347 NR_038331 100505545 Hs.122199 NR_038331 ENSG00000248809 LINC01095 - long intergenic non-protein coding RNA 1095 ncRNA 241.333-50 chr2 19658756 19658915 + 2 NA Intergenic Intergenic -210019 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 296.667-64 chrX 94687456 94687664 + 2 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 375666 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 360-2 chr1 52423724 52424049 + 2 NA 3' UTR (NM_015269, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_015269, exon 30 of 30) 19284 NM_032864 84950 Hs.5301 NM_032284 ENSG00000134748 PRPF38A PRP38A|Prp38 pre-mRNA processing factor 38A protein-coding 295.667-12 chr18 30508665 30508911 + 2 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 209878 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 292.334-14 chr8 28272474 28272776 + 2 NA Intergenic Intergenic -44643 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 382-14 chr8 132762131 132762470 + 2 NA Intergenic Intergenic -1718 NM_144649 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 312.333-25 chr7 62979243 62979454 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 324708 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 319.334 chr1 176378670 176378854 + 2 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -84413 NM_021936 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 587.332-2 chr17 71496203 71496645 + 2 NA Intergenic Intergenic -294245 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 338.666-6 chr18 2988374 2988588 + 2 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) 23466 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 338.334-9 chr9 108332284 108332587 + 2 NA Intergenic Intergenic 523551 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 219-84 chr9 24684301 24684470 + 2 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -138488 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 293-5 chr1 110810871 110811102 + 2 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -60213 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 378-5 chr11 84205622 84206005 + 2 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) L1ME2|LINE|L1 67467 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 151.333-116 chr13 66850558 66850646 + 2 NA intron (NR_046527, intron 1 of 5) intron (NR_046527, intron 1 of 5) 25433 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 331.667-12 chr21 30056362 30056581 + 2 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 110334 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 276-32 chr19 37418357 37418519 + 2 NA intron (NM_001330482, intron 4 of 4) HAL1|LINE|L1 47339 NM_032453 84503 Hs.590940 NM_032453 ENSG00000189164 ZNF527 - zinc finger protein 527 protein-coding 416.333-5 chr14 41043011 41043399 + 2 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 88494 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 403-8 chr8 62083848 62084237 + 2 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -164812 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 364.333-14 chr15 61276451 61276862 + 2 NA Intergenic Intergenic -47354 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 278-26 chr21 25725238 25725551 + 2 NA intron (NM_001003703, intron 2 of 3) intron (NM_001003703, intron 2 of 3) -9578 NM_001197297 2551 Hs.473470 NM_002040 ENSG00000154727 GABPA E4TF1-60|E4TF1A|NFT2|NRF2|NRF2A|RCH04A07 GA binding protein transcription factor subunit alpha protein-coding 263-13 chr11 76448625 76448892 + 2 NA intron (NM_001300942, intron 2 of 21) intron (NM_001300942, intron 2 of 21) 3733 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 380-10 chr20 55084753 55085060 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -338137 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 288.667-2 chr1 248917304 248917500 + 2 NA exon (NM_001017434, exon 3 of 3) exon (NM_001017434, exon 3 of 3) 11159 NM_001017434 267002 Hs.602037 NM_170725 ENSG00000185220 PGBD2 - piggyBac transposable element derived 2 protein-coding 466-9 chr9 134617361 134617781 + 2 NA Intergenic Intergenic -24234 NM_001278074 1289 Hs.210283 NM_000093 ENSG00000130635 COL5A1 EDSC|EDSCL1 collagen type V alpha 1 chain protein-coding 164.667-177 chr5 4772939 4773087 + 2 NA promoter-TSS (NR_104619) promoter-TSS (NR_104619) -468 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 302-41 chr3 121270715 121270982 + 2 NA intron (NM_001348343, intron 18 of 27) L1MC4|LINE|L1 221208 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 323.667-16 chr21 34506938 34507120 + 2 NA intron (NM_000219, intron 2 of 3) intron (NM_000219, intron 2 of 3) 4286 NM_001270403 3753 Hs.121495 NM_000219 ENSG00000180509 KCNE1 ISK|JLNS|JLNS2|LQT2/5|LQT5|MinK potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1 protein-coding 308-2 chr1 198821277 198821497 + 2 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) 37595 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 350-22 chr4 128540807 128541071 + 2 NA Intergenic Intergenic 112923 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 508.334 chr1 222566525 222566922 + 2 NA intron (NM_001201536, intron 7 of 11) MER1A|DNA|hAT-Charlie -18619 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 359.999-5 chr4 77744046 77744368 + 2 NA intron (NM_001365006, intron 7 of 11) intron (NM_001365006, intron 7 of 11) 74857 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 377-14 chr9 69349414 69349714 + 2 NA intron (NM_001127608, intron 2 of 10) L1MB8|LINE|L1 20239 NM_004816 9413 Hs.118003 NM_004816 ENSG00000135063 FAM189A2 C9orf61|X123 family with sequence similarity 189 member A2 protein-coding 258-38 chr2 144474937 144475184 + 2 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -44554 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 349-21 chr8 91063579 91063782 + 2 NA non-coding (NR_110438, exon 3 of 3) non-coding (NR_110438, exon 3 of 3) 6509 NR_110438 100506365 Hs.153412 NR_110438 ENSG00000253738 OTUD6B-AS1 GS1-251I9.4 OTUD6B antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 410-5 chr11 38329210 38329652 + 2 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 316925 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 292.666-33 chr8 107763457 107763728 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -265674 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 300.334-16 chr8 125836907 125837127 + 2 NA Intergenic Intergenic 114180 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 256-34 chr18 432697 432931 + 2 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 67887 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 297.666 chr10 11375193 11375454 + 2 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -30649 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 269-15 chr14 20671794 20671947 + 2 NA Intergenic Intergenic -12307 NM_001145 283 Hs.283749 NM_001145 ENSG00000214274 ANG ALS9|HEL168|RAA1|RNASE4|RNASE5 angiogenin protein-coding 260-12 chr10 20373991 20374205 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -177872 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 430 chr1 184492809 184493108 + 2 NA intron (NM_030806, intron 2 of 5) intron (NM_030806, intron 2 of 5) 105929 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 356.667-7 chr12 85220282 85220643 + 2 NA intron (NM_001079910, intron 24 of 26) intron (NM_001079910, intron 24 of 26) -59758 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 419.667-10 chr8 61592186 61592560 + 2 NA intron (NM_004318, intron 14 of 24) intron (NM_004318, intron 14 of 24) 97438 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 318-5 chr1 194604104 194604295 + 2 NA Intergenic Intergenic 1299454 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 303-9 chr11 60847313 60847537 + 2 NA intron (NM_024098, intron 1 of 3) intron (NM_024098, intron 1 of 3) 5312 NM_024098 79080 Hs.4253 NM_024098 ENSG00000110104 CCDC86 - coiled-coil domain containing 86 protein-coding 325-33 chrX 48640479 48640741 + 2 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 43118 NM_001347217 64743 Hs.521973 NM_017883 ENSG00000101940 WDR13 MG21 WD repeat domain 13 protein-coding 236.667-8 chr1 214591702 214591859 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -11415 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 266-35 chr2 13032593 13032769 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -25668 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 360-4 chr10 46077299 46077623 + 2 NA Intergenic LTR89|LTR|ERVL? -31192 NM_002443 4477 Hs.255462 NM_002443 ENSG00000263639 MSMB HPC13|IGBF|MSP|MSPB|PN44|PRPS|PSP|PSP-94|PSP57|PSP94 microseminoprotein beta protein-coding 278.667-13 chr14 31851859 31852123 + 2 NA intron (NM_001201573, intron 8 of 8) intron (NM_001201573, intron 8 of 8) -92862 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 349-3 chr10 109782332 109782861 + 2 NA Intergenic Intergenic 140650 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 303.333-59 chr5 28718016 28718307 + 2 NA Intergenic Intergenic -208709 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 220.667-71 chr4 35993669 35993853 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 250178 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 247.333-29 chr15 60451166 60451364 + 2 NA 3' UTR (NM_001276385, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001276385, exon 9 of 9) 27877 NM_024611 79664 Hs.200943 NM_024611 ENSG00000128915 ICE2 BRCC1|NARG2 interactor of little elongation complex ELL subunit 2 protein-coding 430-9 chr8 100262988 100263602 + 2 NA intron (NM_001353837, intron 7 of 9) L2a|LINE|L2 38898 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 490.333 chr10 97820458 97820819 + 2 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 29160 NR_108035 100505561 Hs.351904 NR_108035 ENSG00000227356 LINC00866 - long intergenic non-protein coding RNA 866 ncRNA 256-85 chr6 151573149 151573305 + 2 NA exon (NM_025059, exon 6 of 11) exon (NM_025059, exon 6 of 11) 79210 NM_025059 80129 Hs.660044 NM_025059 ENSG00000120262 CCDC170 C6orf97|bA282P11.1 coiled-coil domain containing 170 protein-coding 210.667-40 chr14 53835809 53836019 + 2 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 112570 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 308-47 chr6 83732323 83732561 + 2 NA Intergenic Intergenic 23000 NR_136251 105377879 Hs.736886 NR_136251 LOC105377879 - uncharacterized LOC105377879 ncRNA 266-40 chr2 66813370 66813546 + 2 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -90978 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 277.333-24 chr13 92929973 92930184 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -115263 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 315.333-12 chr14 49979895 49980179 + 2 NA Intergenic Intergenic 13097 NR_126499 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 292-52 chr7 120932785 120932977 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -17896 NM_019071 54556 Hs.489811 NM_019071 ENSG00000071243 ING3 Eaf4|ING2|MEAF4|p47ING3 inhibitor of growth family member 3 protein-coding 326-20 chr19 4814020 4814186 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 17639 NM_182919 148022 Hs.29344 NM_014261 ENSG00000127666 TICAM1 IIAE6|MyD88-3|PRVTIRB|TICAM-1|TRIF toll like receptor adaptor molecule 1 protein-coding 436.666-4 chr2 156344446 156344812 + 2 NA Intergenic Intergenic -2509 NR_147695 440918 Hs.641142 NR_147695 FLJ46875 - uncharacterized LOC440918 ncRNA 471.333-6 chr7 70021052 70021331 + 2 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) AluSp|SINE|Alu 422716 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 309.334-11 chr7 21142823 21143114 + 2 NA Intergenic Intergenic -285115 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 547.666 chr13 55414166 55414605 + 2 NA Intergenic Intergenic 239931 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 289-29 chr7 24920639 24920843 + 2 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) -28120 NM_145322 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 419.333-18 chr8 137385481 137385841 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 27927 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 353.333-32 chr7 4352815 4353040 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -218090 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 149.333-129 chr16 13918023 13918202 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -2045 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 480-6 chr5 29530275 29530629 + 2 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -134476 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 235.333-119 chr8 8793360 8793509 + 2 NA intron (NM_004225, intron 2 of 2) intron (NM_004225, intron 2 of 2) 91497 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 411-2 chr10 43020626 43020904 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 23202 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 431-3 chr11 88089379 88089671 + 2 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 85918 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 215-80 chr8 91393350 91393520 + 2 NA intron (NM_134266, intron 16 of 18) intron (NM_134266, intron 16 of 18) 144116 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 368-9 chr14 50804843 50805192 + 2 NA intron (NM_016350, intron 4 of 28) MER91B|DNA|hAT-Tip100 -16780 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 380-16 chr7 85612653 85613029 + 2 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 191719 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 237-32 chr16 61420142 61420286 + 2 NA Intergenic Intergenic -364448 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 290.667-21 chr19 44061905 44062102 + 2 NA intron (NM_013361, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 9967 NM_013361 7766 Hs.720813 NM_013361 ENSG00000178386 ZNF223 - zinc finger protein 223 protein-coding 413.333-9 chr20 13176925 13177311 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -44156 NM_080826 140862 Hs.559353 NM_080826 ENSG00000101230 ISM1 C20orf82|ISM|Isthmin|bA149I18.1|dJ1077I2.1 isthmin 1 protein-coding 329-21 chr5 104636395 104636571 + 2 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -462991 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 647.333 chr20 54020384 54020865 + 2 NA intron (NM_001366297, intron 4 of 8) L2a|LINE|L2 38396 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 288-58 chr8 89566756 89567029 + 2 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 190819 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 308-55 chr7 144382321 144382586 + 2 NA Intergenic Intergenic 18820 NR_033942 728377 Hs.744262 NR_033942 ARHGEF34P - Rho guanine nucleotide exchange factor 34, pseudogene pseudo 360-11 chr17 62573731 62574027 + 2 NA intron (NM_001284363, intron 10 of 19) intron (NM_001284363, intron 10 of 19) -53791 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 313.333-47 chr8 130139509 130139732 + 2 NA intron (NM_001362925, intron 14 of 29) AluSx|SINE|Alu -54852 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 355.333-17 chr21 24588546 24588998 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 160032 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 317.333 chr1 106824050 106824357 + 2 NA intron (NR_147165, intron 2 of 2) L1MA5A|LINE|L1 5964 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 300.667-39 chr7 55371327 55371711 + 2 NA intron (NM_018697, intron 1 of 8) L1M3|LINE|L1 6071 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 240.333-59 chr22 25915706 25915887 + 2 NA intron (NM_001318245, intron 33 of 43) L1ME3Cz|LINE|L1 173608 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 475.333-4 chr7 51286029 51286381 + 2 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) L1PA16|LINE|L1 30604 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 299.333-57 chr4 110205584 110205742 + 2 NA Intergenic Intergenic -7048 NM_024090 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 359.333-17 chr4 60681033 60681411 + 2 NA Intergenic Intergenic -241397 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 260-62 chr5 58453111 58453282 + 2 NA TTS (NM_001252226) TTS (NM_001252226) 6890 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 369.333-24 chr7 24357173 24357573 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 73183 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 219-48 chr2 112020097 112020289 + 2 NA intron (NM_006343, intron 16 of 18) intron (NM_006343, intron 16 of 18) -35076 NM_032824 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 626.333 chr8 79663164 79663875 + 2 NA intron (NM_007029, intron 4 of 4) intron (NM_007029, intron 4 of 4) 52402 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 311.334 chr10 108549393 108549673 + 2 NA Intergenic Intergenic -480240 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 529-2 chr12 7464665 7465237 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -20766 NM_001297650 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 320-36 chr5 39141685 39141928 + 2 NA intron (NM_001243093, intron 3 of 18) AluSx|SINE|Alu -67407 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 308-23 chr2 31473317 31473529 + 2 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -58681 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 380.667-5 chr2 18784903 18785174 + 2 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -195458 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 342-4 chr11 132863320 132863590 + 2 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) MER39B|LTR|ERV1 80182 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 409.667-8 chr5 122712129 122712543 + 2 NA intron (NR_109881, intron 4 of 11) intron (NR_109881, intron 4 of 11) 18224 NR_109881 101927379 Hs.536399 NR_109881 ENSG00000251538 LINC02201 - long intergenic non-protein coding RNA 2201 ncRNA 520.666-4 chr2 32360408 32360700 + 2 NA intron (NM_016252, intron 1 of 73) intron (NM_016252, intron 1 of 73) 3526 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 573.667 chr17 71223974 71224402 + 2 NA Intergenic Intergenic -22009 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 675.666 chr4 69925393 69926254 + 2 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -5245 NM_001890 1446 Hs.3155 NM_001890 ENSG00000126545 CSN1S1 CASA|CSN1 casein alpha s1 protein-coding 155.333-13 chr1 184155110 184155277 + 2 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 103463 NR_125335 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 330.334-7 chr18 61478447 61478751 + 2 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) intron (NM_031891, intron 1 of 11) 145169 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 279-18 chr2 134212991 134213192 + 2 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) intron (NM_001371457, intron 1 of 16) -40981 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 329-17 chr3 3704801 3705194 + 2 NA intron (NR_149025, intron 5 of 5) intron (NR_149025, intron 5 of 5) -94434 NM_001324189 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 323-24 chr5 172380039 172380212 + 2 NA intron (NM_001017995, intron 5 of 12) AluJo|SINE|Alu 74398 NM_001308175 285590 Hs.285666 NM_001017995 ENSG00000174705 SH3PXD2B FAD49|FTHS|HOFI|KIAA1295|TKS4|TSK4 SH3 and PX domains 2B protein-coding 242-66 chr7 47251666 47251851 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 213045 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 376.667-4 chr14 70531148 70531491 + 2 NA intron (NM_003814, intron 1 of 1) L1PA8|LINE|L1 3685 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 303.667-17 chr3 103555907 103556216 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -31945 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 310.333-9 chr11 7741894 7742104 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -35522 NM_198185 341277 Hs.532475 NM_198185 ENSG00000183378 OVCH2 OVTN ovochymase 2 (gene/pseudogene) protein-coding 226.333-76 chr3 27350284 27350464 + 2 NA intron (NM_152534, intron 4 of 38) intron (NM_152534, intron 4 of 38) 19009 NM_199347 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 295-44 chr6 101037541 101037754 + 2 NA Intergenic Intergenic -156275 NM_022091 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 248-91 chr8 135698336 135698600 + 2 NA Intergenic LTR47B2|LTR|ERVL 241012 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 246-71 chr3 159956765 159956942 + 2 NA intron (NR_108088, intron 9 of 9) intron (NR_108088, intron 9 of 9) -31982 NM_000882 3592 Hs.673 NM_000882 ENSG00000168811 IL12A CLMF|IL-12A|NFSK|NKSF1|P35 interleukin 12A protein-coding 330.333 chr1 97265361 97265721 + 2 NA intron (NR_046590, intron 2 of 4) intron (NR_046590, intron 2 of 4) 169618 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 347-11 chr16 68431914 68432232 + 2 NA intron (NM_018667, intron 1 of 8) AluSz6|SINE|Alu 16435 NM_018667 55512 Hs.368421 NM_018667 ENSG00000103056 SMPD3 NSMASE2 sphingomyelin phosphodiesterase 3 protein-coding 428.667-3 chr11 81968504 81968912 + 2 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -77872 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 441.333-6 chr5 13871314 13871565 + 2 NA intron (NM_001369, intron 23 of 78) intron (NM_001369, intron 23 of 78) 73041 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 331.667-7 chr18 1227637 1228085 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 131768 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 239-36 chr2 192184971 192185124 + 2 NA intron (NM_001305134, intron 2 of 9) intron (NM_001305134, intron 2 of 9) 9886 NM_016192 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 441-4 chr5 35882515 35882881 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 25807 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 294.667-49 chr7 6668119 6668273 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 30878 NM_001278559 100131017 Hs.112668 NM_001278559 ENSG00000205903 ZNF316 MZF-3 zinc finger protein 316 protein-coding 303-19 chr14 73912402 73912747 + 2 NA intron (NR_040251, intron 8 of 11) L1MC5a|LINE|L1 25715 NM_001242927 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 238-92 chr6 154743307 154743477 + 2 NA intron (NM_001286189, intron 3 of 21) intron (NM_001286189, intron 3 of 21) 10014 NM_001286199 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 323.333-4 chr11 14586274 14586727 + 2 NA intron (NM_148976, intron 2 of 10) L1ME3D|LINE|L1 57134 NM_148976 5682 Hs.102798 NM_002786 ENSG00000129084 PSMA1 HC2|HEL-S-275|NU|PROS30 proteasome subunit alpha 1 protein-coding 434-2 chr17 60836266 60836769 + 2 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 158666 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 392 chr10 102745415 102745977 + 2 NA intron (NM_001083913, intron 1 of 3) L1MB5|LINE|L1 1748 NM_001083913 54838 Hs.500897 NM_017787 ENSG00000166272 WBP1L C10orf26|OPA1L|OPAL1 WW domain binding protein 1 like protein-coding 253.333-65 chr20 36425502 36425655 + 2 NA intron (NM_001365621, intron 2 of 12) AluSg4|SINE|Alu -35890 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 205.667-60 chr17 60454937 60455256 + 2 NA intron (NM_006380, intron 10 of 12) L1M5|LINE|L1 32607 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 281.333-30 chr2 53868622 53868767 + 2 NA intron (NM_014614, intron 44 of 46) intron (NM_014614, intron 44 of 46) -8661 NM_001164165 100302652 Hs.40763 NM_001164165 ENSG00000270898 GPR75-ASB3 ASB-3|ASB3 GPR75-ASB3 readthrough protein-coding 284-19 chr16 77455354 77455527 + 2 NA Intergenic Intergenic -20406 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 558-2 chr4 39010400 39010811 + 2 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) L1PA17|LINE|L1 21804 NM_024943 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 528.666-3 chr3 89895655 89895975 + 2 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 788194 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 216-83 chr3 112232436 112232592 + 2 NA intron (NM_001320531, intron 11 of 27).2 intron (NM_001320531, intron 11 of 27).2 61702 NM_001320531 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 362.666-3 chr10 75699154 75699467 + 2 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -13145 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 202.334-7 chr8 115538108 115538327 + 2 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 129796 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 304-11 chr10 55347998 55348162 + 2 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -250962 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 379.667-4 chr15 68971138 68971436 + 2 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) intron (NM_001184780, intron 1 of 15) 40762 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 277.333-46 chr2 83669737 83669948 + 2 NA Intergenic Intergenic 147028 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 230.333-79 chr3 131776884 131777239 + 2 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) intron (NM_130808, intron 2 of 15) 208870 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 321-10 chr15 37080138 37080455 + 2 NA intron (NM_172316, intron 7 of 12) intron (NM_172316, intron 7 of 12) 18400 NM_172315 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 459-10 chr6 166713722 166713965 + 2 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -86592 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 420.667-5 chr2 78693633 78694095 + 2 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 148333 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 293-7 chr1 225555069 225555259 + 2 NA intron (NM_001008493, intron 2 of 14) intron (NM_001008493, intron 2 of 14) 97959 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 307-27 chr4 33197945 33198196 + 2 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 841823 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 233.667-42 chr2 146245561 146245811 + 2 NA Intergenic Intergenic -341371 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 286-11 chr12 101959274 101959428 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 81771 NM_018370 55332 Hs.525634 NM_018370 ENSG00000136048 DRAM1 DRAM DNA damage regulated autophagy modulator 1 protein-coding 592 chr14 26704475 26704979 + 2 NA intron (NR_147061, intron 2 of 6) intron (NR_147061, intron 2 of 6) -104621 NR_110557 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 285-11 chr17 59503506 59503740 + 2 NA intron (NR_110813, intron 1 of 2) ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 23234 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 303.333-24 chr14 77039290 77039533 + 2 NA Intergenic Intergenic -1638 NR_110554 283575 Hs.651736 NR_110554 ENSG00000246548 LINC02288 - long intergenic non-protein coding RNA 2288 ncRNA 321.333-37 chr2 76872979 76873192 + 2 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -112880 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 333.333-21 chr15 70976988 70977302 + 2 NA intron (NM_017691, intron 9 of 15) intron (NM_017691, intron 9 of 15) 84702 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 491.333-2 chr14 45053477 45054007 + 2 NA intron (NR_131765, intron 15 of 19) intron (NR_131765, intron 15 of 19) -30374 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 304-60 chr8 119018191 119018399 + 2 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) -48952 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 331.333 chr1 16397083 16397378 + 2 NA non-coding (NR_073500, exon 2 of 2) non-coding (NR_073500, exon 2 of 2) 29988 NR_073502 26099 Hs.252967 NM_001114600 ENSG00000055070 SZRD1 C1orf144 SUZ RNA binding domain containing 1 protein-coding 368.667-8 chr3 122321170 122321430 + 2 NA Intergenic Intergenic -3948 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 347-10 chr16 49556960 49557187 + 2 NA intron (NM_001271620, intron 5 of 7) intron (NM_001271620, intron 5 of 7) -38488 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 307.333-27 chr14 53548605 53548759 + 2 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 395328 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 356-15 chr15 22806390 22806618 + 2 NA intron (NM_144599, intron 1 of 4) intron (NM_144599, intron 1 of 4) 19860 NM_144599 123606 Hs.511797 NM_144599 ENSG00000170113 NIPA1 FSP3|SLC57A1|SPG6 NIPA magnesium transporter 1 protein-coding 243.333-57 chr2 195576600 195576806 + 2 NA Intergenic Intergenic -80255 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 385-11 chr5 17165956 17166242 + 2 NA intron (NR_027253, intron 1 of 2) intron (NR_027253, intron 1 of 2) -10107 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 310-41 chr4 44041894 44042139 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 24954 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 361.333-12 chr2 109183139 109183427 + 2 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -41695 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 395-3 chr14 67310848 67311154 + 2 NA intron (NM_001256550, intron 8 of 14) intron (NM_001256550, intron 8 of 14) 48803 NM_015994 51382 Hs.272630 NM_015994 ENSG00000100554 ATP6V1D ATP6M|VATD|VMA8 ATPase H+ transporting V1 subunit D protein-coding 275-31 chr20 52529374 52529566 + 2 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -91368 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 288.667-36 chr8 131613340 131613486 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -290680 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 318-32 chr20 23905685 23905942 + 2 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -26065 NM_001900 1473 Hs.121489 NM_001900 ENSG00000170367 CST5 - cystatin D protein-coding 332.667-23 chr8 110356465 110356632 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -380777 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 385.333-14 chr14 63387027 63387286 + 2 NA intron (NR_104104, intron 10 of 12) intron (NR_104104, intron 10 of 12) -68221 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 301.667-2 chr1 66662781 66662931 + 2 NA intron (NM_001350218, intron 7 of 22) intron (NM_001350218, intron 7 of 22) 34416 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 396.333-7 chr2 79456603 79456938 + 2 NA Intergenic Intergenic 44074 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 303.333-65 chr5 154226504 154226669 + 2 NA intron (NM_198321, intron 1 of 11) L1ME1|LINE|L1 35853 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 180-31 chr14 20122647 20122803 + 2 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 5257 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 448-8 chr8 81046461 81046812 + 2 NA intron (NM_018440, intron 2 of 8) intron (NM_018440, intron 2 of 8) 65432 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 308.667-20 chr2 207463069 207463259 + 2 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -66798 NR_135473 1385 Hs.516646 NM_004379 ENSG00000118260 CREB1 CREB|CREB-1 cAMP responsive element binding protein 1 protein-coding 303.667 chr10 52444313 52444574 + 2 NA Intergenic Intergenic 10829 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 347-4 chr10 91778884 91779195 + 2 NA Intergenic MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR 19157 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 447-2 chr10 28737513 28737779 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6004 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 422-4 chr14 28946155 28946440 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -160510 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 360-5 chr10 91340917 91341161 + 2 NA intron (NR_024467, intron 4 of 4) intron (NR_024467, intron 4 of 4) -68196 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 397.333-9 chr7 31089571 31089844 + 2 NA intron (NM_001199637, intron 10 of 13) intron (NM_001199637, intron 10 of 13) 37246 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 378.667-6 chr12 4532143 4532418 + 2 NA intron (NR_144382, intron 2 of 9) MER83|LTR|ERV1 6189 NM_020374 57102 Hs.302977 NM_020374 ENSG00000047621 C12orf4 - chromosome 12 open reading frame 4 protein-coding 278-45 chr4 160095938 160096098 + 2 NA Intergenic Intergenic -318234 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 344-16 chr17 70256047 70256266 + 2 NA Intergenic Intergenic 86621 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 524.667-2 chr12 98357621 98357903 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 99383 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 308.666-7 chr14 54104004 54104302 + 2 NA Intergenic Intergenic -147262 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 283-24 chr3 105965067 105965247 + 2 NA Intergenic Intergenic -95756 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 292.333-18 chr17 61893258 61893439 + 2 NA intron (NM_001351695, intron 13 of 24) intron (NM_001351695, intron 13 of 24) -29789 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 303.333-75 chr8 103168046 103168309 + 2 NA intron (NR_109954, intron 1 of 2) HAL1|LINE|L1 3963 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 296.334-11 chr4 45443529 45443783 + 2 NA Intergenic Intergenic 680398 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 262-37 chr19 11643429 11643652 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 23549 NR_002944 664709 Hs.534822 NR_002944 HNRNPA1P10 HNRPA1L-2 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 10 pseudo 314-8 chr12 28438306 28438463 + 2 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -247646 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 466.666-2 chr3 80728881 80729287 + 2 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -35813 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 380-7 chr15 57231104 57231377 + 2 NA exon (NM_001322151, exon 9 of 21) exon (NM_001322151, exon 9 of 21) 11810 NM_001306219 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 598-2 chr5 39063912 39064380 + 2 NA intron (NM_001285439, intron 2 of 38) intron (NM_001285439, intron 2 of 38) 10253 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 178-68 chr2 190231059 190231212 + 2 NA intron (NM_198047, intron 11 of 12) L1M5|LINE|L1 50272 NM_032321 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 338.667-8 chr12 33249835 33250015 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 189894 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 274.667-38 chr4 35008741 35008910 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -739078 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 457-8 chr7 98492676 98492973 + 2 NA Intergenic Intergenic -91734 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 182-55 chr2 191076257 191076367 + 2 NA exon (NM_001243835, exon 4 of 24) exon (NM_001243835, exon 4 of 24) 54786 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 345-16 chr6 15820572 15820860 + 2 NA Intergenic Intergenic -157658 NM_001271669 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 299-31 chr5 125556616 125556795 + 2 NA intron (NR_109887, intron 3 of 3) intron (NR_109887, intron 3 of 3) 63444 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 339.333-12 chr14 60755787 60755986 + 2 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 21125 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 231.667-29 chr2 54084957 54085139 + 2 NA intron (NM_001320587, intron 3 of 5) L1MC4|LINE|L1 -30567 NM_138448 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 386 chr10 123167715 123168162 + 2 NA 3' UTR (NM_004725, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_004725, exon 8 of 8) 13536 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 313-18 chr2 3955311 3955516 + 2 NA Intergenic Intergenic 18619 NR_037881 100505964 Hs.190267 NR_037881 ENSG00000237401 LINC01304 - long intergenic non-protein coding RNA 1304 ncRNA 310.666-15 chr4 39820901 39821151 + 2 NA Intergenic Intergenic 122890 NM_001111112 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 465.333-4 chr12 53330552 53331010 + 2 NA intron (NM_001300837, intron 2 of 2) intron (NM_001300837, intron 2 of 2) 4995 NM_152860 121340 Hs.209402 NM_152860 ENSG00000170374 SP7 OI11|OI12|OSX|osterix Sp7 transcription factor protein-coding 307-21 chr3 10098448 10098731 + 2 NA intron (NM_001018115, intron 42 of 43) intron (NM_001018115, intron 42 of 43) 9666 NM_173472 115795 Hs.190413 NM_173472 ENSG00000163705 FANCD2OS C3orf24 FANCD2 opposite strand protein-coding 532-2 chr2 150640193 150641013 + 2 NA Intergenic Intergenic 11706 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 159.334-2 chr4 133387042 133387146 + 2 NA Intergenic Intergenic 237800 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 316-12 chr12 120421551 120421828 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -16424 NM_004373 1337 Hs.369624 NM_004373 ENSG00000111775 COX6A1 CMTRID|COX6A|COX6AL cytochrome c oxidase subunit 6A1 protein-coding 384-21 chr8 94670985 94671262 + 2 NA intron (NM_017697, intron 10 of 15) intron (NM_017697, intron 10 of 15) 29949 NM_001122825 54845 Hs.487471 NM_017697 ENSG00000104413 ESRP1 DFNB109|RBM35A|RMB35A epithelial splicing regulatory protein 1 protein-coding 323.667-26 chr8 83017320 83017506 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 105309 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 478-2 chr18 13012210 13012919 + 2 NA intron (NM_032142, intron 4 of 44) intron (NM_032142, intron 4 of 44) 21202 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 436.666-8 chr5 87188491 87188857 + 2 NA intron (NR_105018, intron 2 of 3) intron (NR_105018, intron 2 of 3) 50527 NR_130914 55338 Hs.677194 NM_018382 LINC01949 - long intergenic non-protein coding RNA 1949 ncRNA 372-22 chr8 90744844 90745039 + 2 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -46834 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 710.999 chr3 69583120 69583853 + 2 NA Intergenic Intergenic -155978 NM_001354605 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 317-15 chr2 19981047 19981326 + 2 NA intron (NM_001006657, intron 3 of 27) intron (NM_001006657, intron 3 of 27) 8919 NM_001006657 57539 Hs.205427 NM_020779 ENSG00000118965 WDR35 CED2|IFT121|IFTA1|SRTD7 WD repeat domain 35 protein-coding 277.333-6 chr1 244630811 244630990 + 2 NA intron (NM_001130957, intron 20 of 21) intron (NM_001130957, intron 20 of 21) -22148 NR_123736 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 468.666-4 chr8 103054459 103054852 + 2 NA intron (NM_001695, intron 7 of 12) intron (NM_001695, intron 7 of 12) 33572 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 280.667-18 chr11 122807066 122807212 + 2 NA intron (NM_001363365, intron 12 of 13) intron (NM_001363365, intron 12 of 13) -31361 NM_019604 56253 Hs.159523 NM_019604 ENSG00000109943 CRTAM CD355 cytotoxic and regulatory T cell molecule protein-coding 287-14 chr2 59523182 59523336 + 2 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 305551 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 348.667-17 chr3 83849807 83850123 + 2 NA Intergenic Intergenic 1019610 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 310.667-38 chr7 7452232 7452404 + 2 NA intron (NM_001037763, intron 18 of 34) intron (NM_001037763, intron 18 of 34) 83555 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 333.666-2 chr10 68073987 68074329 + 2 NA intron (NM_001278185, intron 1 of 23) intron (NM_001278185, intron 1 of 23) 1125 NM_001278187 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 378.667-7 chr13 72497289 72497715 + 2 NA Intergenic Intergenic 230127 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 200-98 chr21 25521829 25521981 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -40240 NR_001458 114614 Hs.697120 NR_001458 ENSG00000234883 MIR155HG BIC|MIRHG2|NCRNA00172 MIR155 host gene ncRNA 327-27 chr8 104513019 104513284 + 2 NA intron (NM_001135703, intron 1 of 5) intron (NM_001135703, intron 1 of 5) -28686 NR_030330 693127 NR_030330 ENSG00000208032 MIR548A3 MIRN548A3 microRNA 548a-3 ncRNA 324.333-4 chr10 58823107 58823283 + 2 NA intron (NM_001080512, intron 20 of 20) intron (NM_001080512, intron 20 of 20) 108180 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 338-16 chr2 41153663 41153935 + 2 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -641364 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 299.333-77 chr8 140848372 140848666 + 2 NA intron (NR_148037, intron 6 of 34) intron (NR_148037, intron 6 of 34) -115866 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 293.333-65 chr8 125385936 125386222 + 2 NA Intergenic Intergenic -44279 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 168-47 chr19 35702756 35702901 + 2 NA Intergenic (AGTGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1730 NM_001316903 27033 Hs.99430 NM_014383 ENSG00000011590 ZBTB32 FAXF|FAZF|Rog|TZFP|ZNF538 zinc finger and BTB domain containing 32 protein-coding 210.333-118 chr4 82852245 82852540 + 2 NA intron (NM_016211, intron 16 of 24) intron (NM_016211, intron 16 of 24) 38761 NM_001077207 22872 Hs.370024 NM_014933 ENSG00000138674 SEC31A ABP125|ABP130|HSPC275|HSPC334|SEC31L1 SEC31 homolog A, COPII coat complex component protein-coding 153.333-389 chr7 107376277 107376354 + 2 NA intron (NM_181733, intron 7 of 20) L1ME3A|LINE|L1 -93742 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 307-7 chr12 41499712 41499905 + 2 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) intron (NM_013377, intron 1 of 7) 62069 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 297-30 chr2 67350226 67350380 + 2 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -47030 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 325.333-49 chr8 46978518 46978815 + 2 NA Intergenic (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 137780 NR_027012 497634 Hs.406982 NR_027012 LINC00293 BEYLA|NCRNA00293 long intergenic non-protein coding RNA 293 ncRNA 329.333-48 chr5 167669547 167669782 + 2 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -85265 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 324.667-28 chr5 3704863 3705152 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 109175 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 411.667-6 chr2 152145397 152145855 + 2 NA intron (NM_005843, intron 5 of 13) intron (NM_005843, intron 5 of 13) 30137 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 482.666-4 chr4 58859821 58860486 + 2 NA Intergenic Intergenic -124129 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 320.667-20 chr18 64508536 64508855 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -248640 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 312-13 chr11 90292927 90293162 + 2 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 41812 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 371.333-17 chr3 176493943 176494229 + 2 NA Intergenic Intergenic -21017 NR_107017 102465858 NR_107017 ENSG00000283333 MIR7977 hsa-mir-7977 microRNA 7977 ncRNA 417-3 chr14 82584008 82584342 + 2 NA Intergenic Intergenic -58457 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 198.333-109 chr20 31187164 31187347 + 2 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -70409 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 502 chr14 58194795 58195219 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5142 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 406.333-5 chr18 6152583 6153042 + 2 NA intron (NM_001365769, intron 13 of 16) L1MA9|LINE|L1 -103932 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 459-11 chr9 95957244 95957588 + 2 NA intron (NM_020207, intron 13 of 18) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 64395 NR_024129 100188953 Hs.434310 NR_024129 ENSG00000225194 LINC00092 NCRNA00092 long intergenic non-protein coding RNA 92 ncRNA 327-12 chr2 121656877 121657090 + 2 NA intron (NR_037857, intron 2 of 3) AluSz6|SINE|Alu 6994 NR_037856 254128 Hs.712685 NR_037856 ENSG00000236859 NIFK-AS1 - NIFK antisense RNA 1 ncRNA 277-27 chr2 70479863 70480091 + 2 NA intron (NR_046798, intron 1 of 2) intron (NR_046798, intron 1 of 2) 1663 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 234.334-7 chr2 78559593 78559905 + 2 NA intron (NR_136311, intron 2 of 2) intron (NR_136311, intron 2 of 2) 14218 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 306-54 chr8 17533097 17533270 + 2 NA intron (NM_001370338, intron 2 of 12) intron (NM_001370338, intron 2 of 12) -5594 NM_003046 6542 Hs.448520 NM_003046 ENSG00000003989 SLC7A2 ATRC2|CAT2|HCAT2 solute carrier family 7 member 2 protein-coding 387.333-14 chr6 164216719 164217050 + 2 NA Intergenic Intergenic -545400 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 458.666-3 chr6 155419130 155419579 + 2 NA intron (NM_015718, intron 10 of 13) MIR3|SINE|MIR 36485 NM_015718 50508 Hs.247776 NM_015718 ENSG00000074771 NOX3 GP91-3|MOX-2 NADPH oxidase 3 protein-coding 322.667-33 chr8 100099706 100099898 + 2 NA intron (NM_015668, intron 2 of 27) intron (NM_015668, intron 2 of 27) 5824 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 293-19 chr14 62253435 62253646 + 2 NA Intergenic Intergenic -113567 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 284-29 chr2 117881207 117881424 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 47584 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 449.999-4 chr5 167512230 167512594 + 2 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -61247 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 641.667-2 chr22 25038236 25038656 + 2 NA intron (NM_001145206, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 10472 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 323 chr1 119137507 119137683 + 2 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) intron (NM_015836, intron 1 of 5) -2801 NR_125974 101929147 Hs.697821 NR_125974 ENSG00000231365 WARS2-AS1 - WARS2 antisense RNA 1 ncRNA 372-16 chr4 72145982 72146388 + 2 NA intron (NM_053036, intron 3 of 3) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 107053 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 657.333-2 chr18 21470933 21471337 + 2 NA intron (NM_001142966, intron 15 of 32) intron (NM_001142966, intron 15 of 32) 129569 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 189.667-10 chr1 214956591 214956738 + 2 NA Intergenic Intergenic -48878 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 326.667-34 chr6 115709737 115710119 + 2 NA Intergenic Intergenic -66093 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 299.333-62 chr5 171736596 171736756 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -49196 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 462.667 chr1 198858364 198858690 + 2 NA TTS (NR_029612) TTS (NR_029612) 455 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 458.334 chr15 56613717 56614350 + 2 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 120053 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 321.333-6 chr1 208320607 208320872 + 2 NA Intergenic Intergenic -76355 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 238-102 chr7 133122008 133122184 + 2 NA Intergenic Intergenic -13585 NR_133931 105375512 Hs.521205 NR_133931 LOC105375512 - uncharacterized LOC105375512 ncRNA 382.667-10 chr22 37668735 37669042 + 2 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -6748 NM_002305 3956 Hs.445351 NM_002305 ENSG00000100097 LGALS1 GAL1|GBP galectin 1 protein-coding 243-6 chr1 118664469 118664637 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 323790 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 322.666 chr1 162680576 162680811 + 2 NA intron (NM_006182, intron 2 of 17) intron (NM_006182, intron 2 of 17) 48229 NM_001014796 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 356.667-8 chr20 31731534 31731825 + 2 NA Intergenic Intergenic -7611 NM_012112 22974 Hs.244580 NM_012112 ENSG00000088325 TPX2 C20orf1|C20orf2|DIL-2|DIL2|FLS353|GD:C20orf1|HCA519|HCTP4|REPP86|p100 TPX2 microtubule nucleation factor protein-coding 278-37 chr4 31936119 31936380 + 2 NA Intergenic Intergenic -61130 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 269.333-10 chr11 29376162 29376351 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -218157 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 251.333-111 chr8 133384260 133384414 + 2 NA Intergenic Intergenic -87033 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 270-5 chr10 90472445 90472708 + 2 NA intron (NR_110657, intron 2 of 6) L1MC3|LINE|L1 68229 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 298.667-9 chr13 91773630 91773791 + 2 NA intron (NM_004466, intron 5 of 7) intron (NM_004466, intron 5 of 7) 375089 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 272.667-23 chr17 50985434 50985595 + 2 NA intron (NM_001130527, intron 23 of 29) intron (NM_001130527, intron 23 of 29) 61364 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 487.333 chr1 150361682 150361963 + 2 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -2289 NM_001297673 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 475.999-6 chr8 107406197 107406551 + 2 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) -69859 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 391-15 chr7 85101735 85101998 + 2 NA intron (NM_152754, intron 1 of 16) intron (NM_152754, intron 1 of 16) 20065 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 313.667-30 chr22 27468268 27468535 + 2 NA Intergenic Intergenic 157750 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 373.333-27 chr8 65697703 65698068 + 2 NA intron (NM_001145839, intron 4 of 6) L1MD1|LINE|L1 28012 NM_001145838 9650 Hs.584788 NM_014637 ENSG00000066855 MTFR1 CHPPR|FAM54A2 mitochondrial fission regulator 1 protein-coding 296-55 chr5 120310005 120310164 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -154194 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 300-34 chr2 202906057 202906322 + 2 NA intron (NM_018256, intron 2 of 12) intron (NM_018256, intron 2 of 12) -6029 NM_001282911 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 283.334-5 chr15 53302587 53302837 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 186347 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 326.333-20 chr3 186592952 186593135 + 2 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -20017 NM_001354572 197 Hs.324746 NM_001622 ENSG00000145192 AHSG A2HS|AHS|APMR1|FETUA|HSGA alpha 2-HS glycoprotein protein-coding 388.667-12 chr6 45126118 45126441 + 2 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) 71491 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 391-19 chr8 129480962 129481386 + 2 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 2968 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 481.334 chr2 119979246 119979655 + 2 NA 3' UTR (NM_002830, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_002830, exon 27 of 27) -33627 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 301.667-16 chr15 88514611 88514841 + 2 NA intron (NM_001144074, intron 4 of 4) L1ME4c|LINE|L1 31649 NM_001321596 55070 Hs.655064 NM_017996 ENSG00000140543 DET1 - DET1 partner of COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 296-18 chr14 33222106 33222334 + 2 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) MER39|LTR|ERV1 283341 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 801.334 chr1 218136757 218137320 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 93533 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 314-25 chr2 210188963 210189254 + 2 NA intron (NM_001608, intron 10 of 10) intron (NM_001608, intron 10 of 10) -17699 NM_001307976 151050 Hs.282260 NM_152519 ENSG00000144445 KANSL1L C2orf67|MSL1v2 KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 like protein-coding 298-48 chr2 223542927 223543108 + 2 NA Intergenic Intergenic 59344 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 332-21 chr21 29438316 29438608 + 2 NA Intergenic Intergenic -57585 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 224-43 chr2 69288642 69288805 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 98504 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 287.667-10 chr12 22570214 22570379 + 2 NA Intergenic Intergenic -25750 NM_001286177 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 314.334-2 chr14 48551117 48551435 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -756262 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 305.333-43 chr3 33183002 33183243 + 2 NA intron (NM_015551, intron 3 of 4) L1MC1|LINE|L1 35688 NM_015551 26032 Hs.196647 NM_015551 ENSG00000173705 SUSD5 - sushi domain containing 5 protein-coding 356-29 chr4 155375511 155375855 + 2 NA intron (NM_001039580, intron 2 of 13) intron (NM_001039580, intron 2 of 13) 1282 NM_001039580 79884 Hs.61271 NM_001039580 ENSG00000164114 MAP9 ASAP microtubule associated protein 9 protein-coding 567.667 chr10 21259037 21259421 + 2 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 84927 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 361.333-17 chr3 104553747 104554109 + 2 NA Intergenic Intergenic -812785 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 345.666-9 chr3 171190116 171190502 + 2 NA intron (NM_001161563, intron 6 of 31) intron (NM_001161563, intron 6 of 31) -83550 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 256-89 chr7 47756476 47756904 + 2 NA Intergenic Intergenic -4786 NR_038407 84847 Hs.488236 NR_038407 ENSG00000146666 LINC00525 - long intergenic non-protein coding RNA 525 ncRNA 330-3 chr1 48978488 48978672 + 2 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) LTR50|LTR|ERVL -201611 NM_001302082 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 308.334-11 chr9 115269996 115270263 + 2 NA intron (NR_163556, intron 2 of 7) L1MA3|LINE|L1 128311 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 279.667-6 chr12 20838293 20838432 + 2 NA intron (NM_001349920, intron 1 of 13) L1MCa|LINE|L1 15814 NM_001349920 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 276-15 chr13 54174547 54174746 + 2 NA Intergenic Intergenic -41775 NR_108062 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 366.333-17 chr4 69642500 69642720 + 2 NA intron (NM_001252274, intron 2 of 6) intron (NM_001252274, intron 2 of 6) -2968 NM_001301233 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 245-47 chr3 120865756 120865938 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -29490 NR_135570 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 431-7 chr20 25439213 25439830 + 2 NA intron (NM_021067, intron 5 of 6) L1MC5|LINE|L1 31838 NR_134574 9837 Hs.658464 NM_021067 ENSG00000101003 GINS1 IMD55|PSF1 GINS complex subunit 1 protein-coding 301.333-44 chr5 117884425 117884667 + 2 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 154185 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 297.333-44 chr4 111742485 111742659 + 2 NA Intergenic Intergenic -402882 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 559.333-2 chr3 48200460 48200977 + 2 NA Intergenic Intergenic 4154 NR_039645 100616407 NR_039645 ENSG00000265483 MIR4443 mir-4443 microRNA 4443 ncRNA 398-13 chr4 70128542 70128771 + 2 NA Intergenic Intergenic -4948 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 425.333-8 chr3 84451016 84451253 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 418441 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 317-2 chr1 115955631 115955906 + 2 NA intron (NR_125970, intron 2 of 4) L2b|LINE|L2 -20745 NM_018420 55356 Hs.125482 NM_018420 ENSG00000163393 SLC22A15 FLIPT1|PRO34686 solute carrier family 22 member 15 protein-coding 324.666-2 chr10 74543785 74544085 + 2 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) intron (NM_001369123, intron 7 of 9) -14611 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 285.333-64 chr7 4002838 4003052 + 2 NA intron (NM_152744, intron 14 of 44) intron (NM_152744, intron 14 of 44) -126740 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 438.333 chr2 116531426 116531978 + 2 NA Intergenic Intergenic 1187887 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 503.333-7 chr7 21286613 21286915 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -141319 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 174-78 chr5 36563051 36563197 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -43231 NM_001166696 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 324.333-9 chr11 58198562 58198747 + 2 NA Intergenic Intergenic 5527 NM_001004459 219958 Hs.553644 NM_001004459 ENSG00000197887 OR1S2 OR11-231 olfactory receptor family 1 subfamily S member 2 protein-coding 338-30 chr8 123803512 123803696 + 2 NA intron (NM_144963, intron 18 of 23) intron (NM_144963, intron 18 of 23) 35165 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 290-43 chr5 145473110 145473322 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 362126 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 349.333-19 chr2 171368094 171368392 + 2 NA intron (NM_001321158, intron 1 of 8) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 65747 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 342.666-3 chr1 114542058 114542323 + 2 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -30987 NM_015906 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 300-59 chr6 160130295 160130461 + 2 NA intron (NM_153187, intron 2 of 9) L2|LINE|L2 8547 NM_153187 6580 Hs.117367 NM_003057 ENSG00000175003 SLC22A1 HOCT1|OCT1|oct1_cds solute carrier family 22 member 1 protein-coding 398.666-7 chr4 57842306 57842538 + 2 NA Intergenic Intergenic 416550 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 262.667-84 chr9 31809739 31809917 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -428338 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 479.667-3 chr2 215018813 215019136 + 2 NA intron (NR_103740, intron 14 of 54) intron (NR_103740, intron 14 of 54) 13112 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 351.667-8 chr2 24319403 24319815 + 2 NA intron (NM_001348182, intron 2 of 38) intron (NM_001348182, intron 2 of 38) 40927 NM_019595 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 404.666-16 chrX 89718148 89718512 + 2 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -203578 NM_138960 90316 Hs.592220 NM_138960 ENSG00000153779 TGIF2LX TGIFLX TGFB induced factor homeobox 2 like X-linked protein-coding 395-25 chr8 92566617 92566899 + 2 NA intron (NR_125827, intron 4 of 4) intron (NR_125827, intron 4 of 4) 88736 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 332-25 chr3 103616638 103616905 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -92655 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 486.667 chr11 116189307 116189720 + 2 NA Intergenic Intergenic -429313 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 458-5 chr6 149297005 149297353 + 2 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) L1MC4|LINE|L1 -20533 NM_001369506 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 302-38 chr3 80656750 80657020 + 2 NA Intergenic Intergenic -108012 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 198-23 chr10 112948259 112948437 + 2 NA Intergenic Intergenic -1899 NM_001367943 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 305-25 chr6 102542774 102543063 + 2 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 1143933 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 365-21 chr8 121839357 121839593 + 2 NA Intergenic Intergenic -198035 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 302.667-33 chr7 90167461 90167639 + 2 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) intron (NR_110029, intron 2 of 2) 13081 NM_012449 26872 Hs.61635 NM_012449 ENSG00000164647 STEAP1 PRSS24|STEAP STEAP family member 1 protein-coding 342.666-20 chr7 62590654 62590916 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 713271 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 296.667-8 chr11 118786594 118786799 + 2 NA intron (NM_004397, intron 1 of 13) intron (NM_004397, intron 1 of 13) 4252 NM_001257191 1656 Hs.408461 NM_004397 ENSG00000110367 DDX6 HLR2|P54|RCK DEAD-box helicase 6 protein-coding 318.667-23 chr3 124371393 124371668 + 2 NA intron (NM_001024660, intron 10 of 59) L1MA8|LINE|L1 -2802 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 289.333-67 chr8 134625159 134625347 + 2 NA intron (NM_020863, intron 3 of 15) intron (NM_020863, intron 3 of 15) 27182 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 309.333-36 chr2 44694989 44695214 + 2 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 243787 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 320-13 chr14 26249237 26249527 + 2 NA Intergenic Intergenic 304048 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 315.333-5 chr11 17244839 17245004 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -31793 NM_001352663 4925 Hs.654599 NM_005013 ENSG00000070081 NUCB2 HEL-S-109|NEFA nucleobindin 2 protein-coding 275-40 chr4 154240328 154240506 + 2 NA intron (NM_001358235, intron 18 of 19) intron (NM_001358235, intron 18 of 19) 251382 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 468 chr1 10275118 10275611 + 2 NA intron (NM_001365951, intron 10 of 48) intron (NM_001365951, intron 10 of 48) -23602 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 277.333-45 chr2 73877046 73877299 + 2 NA Intergenic Intergenic -15836 NM_001199893 72 Hs.516105 NM_001615 ENSG00000163017 ACTG2 ACT|ACTA3|ACTE|ACTL3|ACTSG|VSCM actin gamma 2, smooth muscle protein-coding 275.333-47 chr3 33540655 33540937 + 2 NA intron (NM_001365634, intron 29 of 35) AluSz|SINE|Alu -100391 NM_001128161 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 420-3 chr1 212334296 212334586 + 2 NA intron (NM_006243, intron 3 of 12) AluSz|SINE|Alu -18377 NR_004389 692157 Hs.707958 NR_004389 ENSG00000201544 SNORA16B U98b small nucleolar RNA, H/ACA box 16B snoRNA 244.666-8 chr10 63676927 63677097 + 2 NA Intergenic Intergenic -155122 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 396-19 chr9 120964322 120964701 + 2 NA intron (NM_001735, intron 33 of 40) L1ME4a|LINE|L1 -11680 NR_148450 110599590 NR_148450 C5-OT1 C5T1LNCRNA C5 3' UTR overlapping transcript 1 ncRNA 398.333-9 chr9 102754555 102754892 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 235086 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 448.333-2 chr11 6691852 6692268 + 2 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -8720 NM_022061 63875 Hs.523456 NM_022061 ENSG00000158042 MRPL17 L17mt|LIP2|MRP-L17|MRP-L26|RPL17L|RPML26 mitochondrial ribosomal protein L17 protein-coding 506.334-2 chr3 72926308 72926677 + 2 NA intron (NM_001080393, intron 3 of 6) intron (NM_001080393, intron 3 of 6) 38446 NR_138564 727936 Hs.710275 NM_001080393 ENSG00000172986 GXYLT2 GLT8D4 glucoside xylosyltransferase 2 protein-coding 452-11 chr6 132090328 132090774 + 2 NA Intergenic Intergenic 24712 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 691.667 chr5 44392431 44393074 + 2 NA intron (NR_108034, intron 1 of 2) intron (NR_108034, intron 1 of 2) -3332 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 396-5 chr17 38956759 38956959 + 2 NA intron (NM_001008777, intron 4 of 10) intron (NM_001008777, intron 4 of 10) 10544 NM_001008777 494188 Hs.549536 NM_001008777 ENSG00000204952 FBXO47 - F-box protein 47 protein-coding 309.333-61 chr8 131946621 131946872 + 2 NA intron (NR_136616, intron 4 of 23) intron (NR_136616, intron 4 of 23) 29973 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 228-47 chr2 177991307 177991443 + 2 NA intron (NM_001077197, intron 3 of 20) AluSx3|SINE|Alu -68538 NM_001077358 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 340.667-7 chr14 19885542 19885842 + 2 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 9424 NM_001005501 390431 Hs.551345 NM_001005501 ENSG00000165762 OR4K2 OR14-15 olfactory receptor family 4 subfamily K member 2 protein-coding 306-8 chr11 78692913 78693123 + 2 NA intron (NM_001098816, intron 28 of 33) L2a|LINE|L2 -118154 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 407.333-21 chr7 102916191 102916454 + 2 NA intron (NR_105043, intron 11 of 20) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 3322 NM_005824 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 306-30 chr3 1816696 1816968 + 2 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -281971 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 546.333 chr17 60861794 60862346 + 2 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) AluY|SINE|Alu 184219 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 120.667-23 chr10 115328156 115328262 + 2 NA intron (NM_207303, intron 18 of 28) intron (NM_207303, intron 18 of 28) 234844 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 291.333-76 chrX 93420106 93420507 + 2 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 253272 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 388-19 chr6 151522712 151522951 + 2 NA intron (NM_025059, intron 1 of 10) LTR10F|LTR|ERV1 28814 NM_025059 80129 Hs.660044 NM_025059 ENSG00000120262 CCDC170 C6orf97|bA282P11.1 coiled-coil domain containing 170 protein-coding 282.667-43 chr6 154139426 154139698 + 2 NA intron (NM_001008503, intron 3 of 3) intron (NM_001008503, intron 3 of 3) 49800 NM_001285528 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 300-29 chr2 14171177 14171361 + 2 NA Intergenic Intergenic 229689 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 391-6 chr15 76762181 76762539 + 2 NA intron (NR_148227, intron 14 of 32) L1MA9|LINE|L1 99584 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 370-9 chr16 26832885 26833242 + 2 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -233864 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 320-23 chr19 38952858 38953106 + 2 NA promoter-TSS (NM_148169) promoter-TSS (NM_148169) -295 NM_148169 115290 Hs.531770 NM_024907 ENSG00000269190 FBXO17 FBG4|FBX26|FBXO26|Fbx17 F-box protein 17 protein-coding 276.666-6 chr10 116278447 116278668 + 2 NA Intergenic Eulor6E|DNA?|DNA? -4912 NM_001145453 2674 Hs.388347 NM_005264 ENSG00000151892 GFRA1 GDNFR|GDNFRA|GFR-ALPHA-1|RET1L|RETL1|TRNR1 GDNF family receptor alpha 1 protein-coding 230.667-39 chr2 82018151 82018408 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -551333 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 372-11 chr2 53266655 53266871 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -501020 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 295-6 chr10 89374674 89374872 + 2 NA Intergenic Intergenic -3283 NM_001010987 439996 Hs.500491 NM_001010987 ENSG00000204010 IFIT1B IFIT1L|bA149I23.6 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1B protein-coding 351-9 chr14 37391004 37391322 + 2 NA intron (NM_138731, intron 11 of 13) L1MEg|LINE|L1 193226 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 288-43 chr5 110748643 110748896 + 2 NA intron (NM_138773, intron 5 of 7) intron (NM_138773, intron 5 of 7) 9762 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 411.333-6 chr14 27554055 27554422 + 2 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -58350 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 523.333 chr1 60799796 60800166 + 2 NA intron (NR_110628, intron 1 of 5) intron (NR_110628, intron 1 of 5) 25603 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 322.667-13 chr2 18935240 18935445 + 2 NA Intergenic Intergenic 91629 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 270-31 chr2 221828302 221828528 + 2 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -254213 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 291.334 chr1 63255480 63255640 + 2 NA intron (NR_038252, intron 4 of 11) MIRc|SINE|MIR 61697 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 231.333-118 chr8 108901896 108902167 + 2 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -114437 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 244.667-74 chr4 109406354 109406544 + 2 NA Intergenic Intergenic -27266 NM_001318086 10427 Hs.292472 NM_006323 ENSG00000138802 SEC24B SEC24 SEC24 homolog B, COPII coat complex component protein-coding 329-3 chr1 169222542 169222954 + 2 NA intron (NR_104229, intron 10 of 12) intron (NR_104229, intron 10 of 12) 116058 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 324.333-8 chr11 41091879 41092139 + 2 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) L1ME4a|LINE|L1 367627 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 300-22 chr14 74561688 74561873 + 2 NA intron (NM_000428, intron 3 of 35) intron (NM_000428, intron 3 of 35) 50457 NM_000428 4053 Hs.512776 NM_000428 ENSG00000119681 LTBP2 C14orf141|GLC3D|LTBP3|MSPKA|MSTP031|WMS3 latent transforming growth factor beta binding protein 2 protein-coding 311-12 chr18 41854607 41854828 + 2 NA Intergenic Intergenic -100517 NM_002647 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 350.666-3 chr11 76511398 76511724 + 2 NA intron (NM_001300942, intron 10 of 21) AluSx1|SINE|Alu 66536 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 587.667 chr12 7268972 7269462 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -35115 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 211.667-61 chr2 109012964 109013181 + 2 NA Intergenic Intergenic -23852 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 288-15 chr11 85287383 85287587 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) L1ME3Cz|LINE|L1 339785 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 268.333-22 chr15 57201645 57201860 + 2 NA intron (NM_207038, intron 8 of 19) intron (NM_207038, intron 8 of 19) -17678 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 404.667 chr12 51123241 51123566 + 2 NA intron (NM_005653, intron 1 of 14) intron (NM_005653, intron 1 of 14) -39807 NR_045072 81566 Hs.524425 NM_030809 ENSG00000110925 CSRNP2 C12orf2|C12orf22|FAM130A1|PPP1R72|TAIP-12 cysteine and serine rich nuclear protein 2 protein-coding 462.667-5 chr4 67738346 67738805 + 2 NA 3' UTR (NM_000406, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_000406, exon 3 of 3) 17511 NM_001012763 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 289.666-19 chr7 44482907 44483186 + 2 NA intron (NM_015332, intron 2 of 5) L1MEf|LINE|L1 7612 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 331.333-38 chr4 54398157 54398419 + 2 NA Intergenic Intergenic 65396 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 271-2 chr1 60824322 60824484 + 2 NA intron (NR_110628, intron 1 of 5) AluSz6|SINE|Alu 1181 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 337-3 chr10 101696713 101697074 + 2 NA Intergenic Intergenic -1598 NM_001323541 6468 Hs.500822 NM_022039 ENSG00000107829 FBXW4 DAC|FBW4|FBWD4|SHFM3|SHSF3 F-box and WD repeat domain containing 4 protein-coding 288-39 chr4 151622186 151622336 + 2 NA intron (NM_001109977, intron 7 of 13) L3b|LINE|CR1 138746 NM_004564 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 275.667-5 chr1 175956050 175956223 + 2 NA intron (NM_022457, intron 18 of 19) L1ME2|LINE|L1 12343 NR_162097 113839518 NR_162097 MIR1843 - microRNA 1843 ncRNA 373.333-6 chr12 56595252 56595559 + 2 NA TTS (NM_013449) TTS (NM_013449) 34921 NM_001300905 11176 Hs.314263 NM_013449 ENSG00000076108 BAZ2A TIP5|WALp3 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A protein-coding 252-24 chr13 80296891 80297055 + 2 NA Intergenic Intergenic 42686 NM_001318538 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 381.334-6 chr21 27538567 27538779 + 2 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -183706 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 349.333-4 chr10 13140345 13140581 + 2 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -21095 NM_182751 55388 Hs.198363 NM_018518 ENSG00000065328 MCM10 CNA43|DNA43|PRO2249 minichromosome maintenance 10 replication initiation factor protein-coding 582 chr1 20990156 20990695 + 2 NA intron (NM_001198802, intron 5 of 34) AluSg|SINE|Alu -1993 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 292-11 chr14 27618537 27618754 + 2 NA intron (NR_039992, intron 2 of 4) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 6057 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 316.666 chr1 48544434 48544693 + 2 NA intron (NM_001323575, intron 11 of 12) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -72355 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 303.667-2 chr11 28980122 28980376 + 2 NA Intergenic Intergenic -502701 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 245.333-13 chr10 68129532 68129756 + 2 NA intron (NR_045663, intron 2 of 17) L1ME3E|LINE|L1 20156 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 353.333-39 chr8 124868617 124868801 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -46651 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 269.333-27 chr16 76909233 76909457 + 2 NA Intergenic Intergenic 40409 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 389-7 chr4 178239084 178239360 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -331286 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 247.667-75 chr4 132530810 132531015 + 2 NA Intergenic Intergenic -60177 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 316-35 chr4 6466365 6466618 + 2 NA intron (NM_001206994, intron 2 of 9) intron (NM_001206994, intron 2 of 9) 6123 NM_001363388 5522 Hs.479069 NM_020416 ENSG00000074211 PPP2R2C B55-GAMMA|B55gamma|IMYPNO|IMYPNO1|PR52|PR55G protein phosphatase 2 regulatory subunit Bgamma protein-coding 254.666-7 chr11 26688663 26688823 + 2 NA intron (NM_178498, intron 9 of 14) L1M6|LINE|L1 33317 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 336.666-22 chr6 4924176 4924399 + 2 NA intron (NM_001368126, intron 2 of 6) intron (NM_001368126, intron 2 of 6) 34247 NM_001143971 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 295.333-35 chr21 34726956 34727163 + 2 NA intron (NR_024351, intron 4 of 5) MIR3|SINE|MIR 10123 NR_024351 54064 Hs.436868 NR_024351 ENSG00000230978 LINC00160 C21orf52|NCRNA00160 long intergenic non-protein coding RNA 160 ncRNA 328.667-20 chr8 140179477 140179704 + 2 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L1ME1|LINE|L1 -79055 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 495.999 chr3 178227916 178228224 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -191131 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 328.666-23 chr8 144100136 144100430 + 2 NA intron (NR_038270, intron 2 of 7) intron (NR_038270, intron 2 of 7) 3490 NM_030974 81858 Hs.529755 NM_030974 ENSG00000179526 SHARPIN SIPL1 SHANK associated RH domain interactor protein-coding 400-17 chr8 133348397 133348724 + 2 NA Intergenic Intergenic -51256 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 269.667-41 chr5 31524233 31524470 + 2 NA intron (NM_013235, intron 4 of 34) intron (NM_013235, intron 4 of 34) 7742 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 390-3 chr1 247604921 247605161 + 2 NA promoter-TSS (NM_001001914) promoter-TSS (NM_001001914) -545 NM_001001914 81469 Hs.653227 NM_001001914 ENSG00000177476 OR2G3 OR1-33 olfactory receptor family 2 subfamily G member 3 protein-coding 305.333-41 chr22 40163067 40163363 + 2 NA intron (NM_001024843, intron 4 of 23) AluJb|SINE|Alu -14710 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 461-7 chr4 30520776 30521193 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -199385 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 295-26 chr2 164587931 164588206 + 2 NA intron (NM_004490, intron 2 of 13) intron (NM_004490, intron 2 of 13) -19573 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 281.333-72 chr8 121002684 121002978 + 2 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -190785 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 308-16 chr14 63831030 63831204 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -21848 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 490.666 chr12 110007329 110007717 + 2 NA intron (NM_033121, intron 1 of 14) AluSp|SINE|Alu 8093 NM_033121 88455 Hs.528703 NM_033121 ENSG00000076513 ANKRD13A ANKRD13|NY-REN-25 ankyrin repeat domain 13A protein-coding 538 chr1 56268256 56268545 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -146563 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 307-5 chr11 40211629 40211811 + 2 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 81410 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 344.667-8 chr20 53423135 53423510 + 2 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu -129448 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 320.666-5 chr12 52337952 52338136 + 2 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -16646 NM_002282 3889 Hs.720768 NM_002282 ENSG00000170523 KRT83 EKVP5|HB3|Hb-3|KRTHB3|MNLIX keratin 83 protein-coding 257.333-108 chr8 136751766 136752029 + 2 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1M3b|LINE|L1 221099 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 413.333-12 chr5 54643582 54643874 + 2 NA Intergenic Intergenic 59596 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 326.667-39 chr9 27263631 27263953 + 2 NA intron (NR_026679, intron 10 of 16) intron (NR_026679, intron 10 of 16) 19001 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 331-36 chr6 41907896 41908083 + 2 NA intron (NR_131160, intron 2 of 2) intron (NR_131160, intron 2 of 2) -12614 NM_018561 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 218-74 chr3 57927213 57927399 + 2 NA exon (NM_001304422, exon 10 of 10) exon (NM_001304422, exon 10 of 10) 37304 NM_001304422 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 388-9 chr17 69190558 69190808 + 2 NA intron (NM_080282, intron 18 of 39) intron (NM_080282, intron 18 of 39) 44329 NR_130736 100133319 NR_130736 ENSG00000278873 PRO1804 - uncharacterized LOC100133319 ncRNA 306-31 chr3 12334966 12335177 + 2 NA intron (NM_001330615, intron 1 of 5) Mam_R4|LINE|Dong-R4 -16346 NM_001354668 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 705.666-2 chr7 35672936 35673642 + 2 NA intron (NM_022373, intron 2 of 8) intron (NM_022373, intron 2 of 8) 21846 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 434.667-3 chr4 48892250 48892500 + 2 NA intron (NR_104589, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 14399 NM_001014446 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 291.334-3 chr11 22956144 22956405 + 2 NA Intergenic Intergenic -95800 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 404.667-10 chr9 110127870 110128289 + 2 NA intron (NM_001136562, intron 1 of 3) intron (NM_001136562, intron 1 of 3) 2578 NM_001136562 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 299.667 chr1 15567896 15568082 + 2 NA exon (NM_001287811, exon 14 of 14) exon (NM_001287811, exon 14 of 14) 17062 NM_024758 79814 Hs.461532 NM_024758 ENSG00000116771 AGMAT - agmatinase protein-coding 301.667-21 chr2 26440059 26440222 + 2 NA intron (NM_145038, intron 7 of 16) intron (NM_145038, intron 7 of 16) 37984 NM_004802 9381 Hs.91608 NM_004802 ENSG00000115155 OTOF AUNB1|DFNB6|DFNB9|FER1L2|NSRD9 otoferlin protein-coding 186-9 chr1 212346941 212347089 + 2 NA intron (NM_006243, intron 5 of 12) intron (NM_006243, intron 5 of 12) -5803 NR_004389 692157 Hs.707958 NR_004389 ENSG00000201544 SNORA16B U98b small nucleolar RNA, H/ACA box 16B snoRNA 306.667-36 chr5 44324943 44325129 + 2 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) L1PA4|LINE|L1 -63696 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 350.667-15 chr9 100570606 100570805 + 2 NA intron (NM_001198812, intron 8 of 9) intron (NM_001198812, intron 8 of 9) -7374 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 296.334-10 chr2 202829749 202829999 + 2 NA promoter-TSS (NM_001288624) promoter-TSS (NM_001288624) -640 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 316-50 chr7 91740689 91740929 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 139893 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 304-50 chr6 56929308 56929535 + 2 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) L1ME4b|LINE|L1 25409 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 422-6 chr17 35516874 35517160 + 2 NA intron (NM_001363830, intron 2 of 4) MER33|DNA|hAT-Charlie 20844 NM_001363830 100506736 Hs.447559 NM_001145027 ENSG00000205045 SLFN12L - schlafen family member 12 like protein-coding 212-96 chr20 34635199 34635361 + 2 NA intron (NM_080476, intron 5 of 11) intron (NM_080476, intron 5 of 11) 42005 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 516-4 chr6 73608090 73608430 + 2 NA intron (NM_012434, intron 9 of 10) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 45732 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 300.334-12 chr6 65386405 65386629 + 2 NA intron (NM_198283, intron 6 of 9) intron (NM_198283, intron 6 of 9) 85099 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 259-4 chr1 216276903 216277077 + 2 NA intron (NM_206933, intron 11 of 71) intron (NM_206933, intron 11 of 71) 146406 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 339.333-31 chr3 97750123 97750579 + 2 NA 3' UTR (NM_001080448, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001080448, exon 18 of 18) -14170 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 250-95 chr9 14147188 14147535 + 2 NA intron (NR_161384, intron 4 of 7) MIRb|SINE|MIR 33441 NM_001282787 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 246-99 chr7 53522667 53522903 + 2 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 289146 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 340.667-20 chr9 32965306 32965562 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 36142 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 473.999-5 chr8 82194904 82195326 + 2 NA Intergenic Intergenic -352829 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 517.666 chr3 25084449 25084774 + 2 NA intron (NM_001290216, intron 3 of 10) intron (NM_001290216, intron 3 of 10) 255288 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 317.667-14 chr15 59718682 59718954 + 2 NA Intergenic Intergenic -29498 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 287.333-39 chr3 137173512 137173771 + 2 NA Intergenic L2|LINE|L2 215658 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 313 chr1 44836276 44836543 + 2 NA intron (NM_003738, intron 2 of 21) AluJo|SINE|Alu 6535 NM_001166292 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 594.666 chr21 29328355 29328831 + 2 NA intron (NM_206866, intron 3 of 4) L1MB1|LINE|L1 23389 NR_027655 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 236-64 chr4 58676910 58677107 + 2 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -140680 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 313.667-9 chr10 120978831 120979012 + 2 NA Intergenic Intergenic 127559 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 369.333-20 chr5 43561372 43561606 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -4070 NM_183323 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 410-10 chr16 57286821 57287190 + 2 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -2333 NM_015993 51090 Hs.632215 NM_015993 ENSG00000102934 PLLP PMLP|TM4SF11 plasmolipin protein-coding 433.333-8 chr4 65799887 65800183 + 2 NA Intergenic Intergenic -129540 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 327.333-39 chr6 47006122 47006443 + 2 NA intron (NM_153840, intron 12 of 14) intron (NM_153840, intron 12 of 14) 36050 NM_153840 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 531.333-2 chr21 28268826 28269333 + 2 NA Intergenic Intergenic -40412 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 515.333 chr1 93802622 93803237 + 2 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) intron (NM_001261408, intron 2 of 13) -27546 NR_148965 723788 Hs.659312 NR_148965 ENSG00000137936 MIG7 - mig-7 ncRNA 459.333-4 chr11 80805750 80806133 + 2 NA Intergenic Intergenic -43138 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 323.333-22 chr3 97487670 97487911 + 2 NA intron (NM_001080448, intron 10 of 17) intron (NM_001080448, intron 10 of 17) 48183 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 406-3 chr12 47040416 47040993 + 2 NA Intergenic Intergenic -38899 NM_001281429 91523 Hs.560100 NM_138371 ENSG00000179715 PCED1B FAM113B PC-esterase domain containing 1B protein-coding 363-6 chr2 29675552 29675926 + 2 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) MIR|SINE|MIR -200362 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 500-3 chr15 64589505 64589907 + 2 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 90286 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 635.333 chr1 99733780 99734338 + 2 NA intron (NM_001013660, intron 7 of 16) L1MC4|LINE|L1 -21106 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 488.667-2 chr14 51295180 51295482 + 2 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 33054 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 275-39 chr4 58325929 58326180 + 2 NA Intergenic Intergenic 210274 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 289-3 chr10 106868364 106868569 + 2 NA intron (NM_001206569, intron 2 of 25) L1PA12|LINE|L1 296240 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 271.333-22 chr18 58360865 58361013 + 2 NA intron (NM_001144965, intron 19 of 30) L1MEd|LINE|L1 -90135 NR_029667 406906 NR_029667 ENSG00000284440 MIR122 MIR122A|MIRN122|MIRN122A|hsa-mir-122|miRNA122|miRNA122A|mir-122 microRNA 122 ncRNA 330.333-25 chr8 130635791 130636099 + 2 NA Intergenic Intergenic -192271 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 270.333-31 chr2 138715946 138716207 + 2 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) HAL1ME|LINE|L1 64314 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 584.666 chr13 106990360 106990968 + 2 NA Intergenic Intergenic 330299 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 244.666-39 chr5 85207495 85207735 + 2 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -822735 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 470.334 chr1 63034114 63034517 + 2 NA Intergenic Intergenic -21844 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 459-3 chr12 8642128 8642533 + 2 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 20496 NM_003480 8076 Hs.512842 NM_003480 ENSG00000197614 MFAP5 AAT9|MAGP-2|MAGP2|MFAP-5|MP25 microfibril associated protein 5 protein-coding 251.667-93 chr8 53274481 53274683 + 2 NA Intergenic Intergenic -22885 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 224-54 chr20 37819633 37819816 + 2 NA intron (NM_001281495, intron 12 of 16) intron (NM_001281495, intron 12 of 16) -83403 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 294.667-40 chr5 23813927 23814202 + 2 NA Intergenic Intergenic -137284 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 651.334 chr16 85260562 85260946 + 2 NA Intergenic Intergenic -22204 NR_038859 197196 Hs.679002 NM_153238 ENSG00000179219 LINC00311 NCRNA00311|TMEM148 long intergenic non-protein coding RNA 311 ncRNA 376.333-8 chr2 34533429 34533784 + 2 NA Intergenic Intergenic -143951 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 359-19 chr6 138449480 138449797 + 2 NA intron (NM_020464, intron 3 of 6) AluSc|SINE|Alu -14344 NR_036099 100423001 NR_036099 ENSG00000266555 MIR3145 mir-3145 microRNA 3145 ncRNA 594.001 chr12 23228242 23228786 + 2 NA Intergenic Intergenic 52878 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 606.334 chr4 60022170 60022609 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -900230 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 276-65 chr9 30197549 30197748 + 2 NA Intergenic Intergenic 210806 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 278.666-24 chr8 106275397 106275657 + 2 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) intron (NM_018002, intron 1 of 15) 5349 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 377-11 chr3 15557582 15557880 + 2 NA Intergenic Intergenic -36025 NM_005677 8292 Hs.146735 NM_005677 ENSG00000206561 COLQ CMS5|EAD collagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesterase protein-coding 313.333-27 chr3 162170658 162170955 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 673998 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 429.999-2 chr5 19617981 19618361 + 2 NA intron (NM_001349559, intron 5 of 12) intron (NM_001349559, intron 5 of 12) 268101 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 295-39 chr5 155981613 155981932 + 2 NA Intergenic Intergenic -344985 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 394-6 chr15 63716477 63716860 + 2 NA intron (NM_003922, intron 21 of 77) intron (NM_003922, intron 21 of 77) -115841 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 528-5 chr9 32895184 32895773 + 2 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 106098 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 252-101 chr8 10739899 10740147 + 2 NA intron (NR_146188, intron 1 of 2) intron (NR_146188, intron 1 of 2) -9512 NM_031439 83595 Hs.709543 NM_031439 ENSG00000171056 SOX7 - SRY-box transcription factor 7 protein-coding 328-42 chr8 142710718 142710891 + 2 NA intron (NR_038925, intron 1 of 2) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 10693 NM_001160354 54742 Hs.69517 NM_017527 ENSG00000160886 LY6K CT97|HSJ001348|URLC10|ly-6K lymphocyte antigen 6 family member K protein-coding 292.666-34 chr8 117140977 117141207 + 2 NA intron (NM_173851, intron 1 of 7) L1M4b|LINE|L1 6097 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 332.666 chr1 182106402 182106651 + 2 NA Intergenic Intergenic -44814 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 334.667-13 chr18 23629117 23629405 + 2 NA intron (NM_173505, intron 6 of 9) AluSz|SINE|Alu 33650 NM_173505 147463 Hs.355689 NM_173505 ENSG00000154065 ANKRD29 - ankyrin repeat domain 29 protein-coding 299.333-4 chr10 7162485 7162708 + 2 NA 3' UTR (NM_001018039, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001018039, exon 21 of 21) 24188 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 413-9 chr3 5021810 5022157 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -42022 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 275.333-27 chr16 84880491 84880685 + 2 NA intron (NM_031476, intron 13 of 14) intron (NM_031476, intron 13 of 14) 60603 NM_031476 83716 Hs.513779 NM_031476 ENSG00000103196 CRISPLD2 CRISP11|LCRISP2|LGL1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 protein-coding 315.333-10 chr13 48069020 48069327 + 2 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -7964 NR_046511 100873965 Hs.616241 NR_046511 ENSG00000229111 MED4-AS1 MED4-AS MED4 antisense RNA 1 ncRNA 238-106 chr8 141947030 141947264 + 2 NA Intergenic Intergenic -160834 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 310-31 chr2 135007351 135007597 + 2 NA intron (NM_001321177, intron 2 of 9) L1MA2|LINE|L1 16175 NM_001321177 80122 Hs.659395 NM_025052 ENSG00000176601 MAP3K19 RCK|YSK4 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 protein-coding 404.666-4 chr14 65075267 65075685 + 2 NA non-coding (NR_073137, exon 4 of 4) non-coding (NR_073137, exon 4 of 4) -14442 NR_045122 100506321 Hs.711267 NR_045122 ENSG00000259118 LOC100506321 - uncharacterized LOC100506321 ncRNA 427.667-2 chr1 215868927 215869218 + 2 NA intron (NM_206933, intron 43 of 71) intron (NM_206933, intron 43 of 71) -203393 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 335-26 chr5 160603477 160603778 + 2 NA intron (NM_001366652, intron 19 of 24) intron (NM_001366652, intron 19 of 24) 81764 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 445-8 chr5 28562824 28563248 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -275371 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 302-50 chr5 5294804 5294998 + 2 NA intron (NM_139056, intron 18 of 22) L2|LINE|L2 -127776 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 355.667-4 chr15 59985861 59986176 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18293 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 429.333-4 chr21 20663908 20664383 + 2 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 138963 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 307.667-41 chr8 137004078 137004374 + 2 NA Intergenic Intergenic 409362 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 234.334-2 chr10 33984562 33984722 + 2 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -211962 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 390-4 chr10 20828883 20829095 + 2 NA intron (NM_006393, intron 16 of 27) intron (NM_006393, intron 16 of 27) 68613 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 324.666-19 chr8 119510321 119510573 + 2 NA Intergenic Intergenic 82561 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 335.333-3 chr1 246163223 246163476 + 2 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 254063 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 308-10 chr10 122785913 122786081 + 2 NA non-coding (NR_003570, exon 21 of 28) non-coding (NR_003570, exon 21 of 28) 29303 NR_003570 375940 Hs.650695 NM_198577 ENSG00000176584 DMBT1P1 - deleted in malignant brain tumors 1 pseudogene 1 pseudo 336-20 chr3 110128611 110128884 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 525919 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 318-54 chr8 84956397 84956678 + 2 NA Intergenic Intergenic -150701 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 303.333-81 chr8 133311422 133311692 + 2 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -14253 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 397.667-3 chr12 68349486 68349847 + 2 NA Intergenic Intergenic -17252 NM_001354974 56890 Hs.655702 NM_017440 ENSG00000111554 MDM1 - Mdm1 nuclear protein protein-coding 430-5 chr5 26017390 26017666 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 826575 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 273-26 chr4 26737087 26737349 + 2 NA intron (NM_001292054, intron 13 of 17) intron (NM_001292054, intron 13 of 17) 123026 NR_134675 105374546 Hs.548859 NR_134673 STIM2-AS1 - STIM2 antisense RNA 1 ncRNA 294-19 chr13 61533235 61533383 + 2 NA Intergenic Intergenic -105363 NR_134946 101926951 Hs.732367 NR_134946 ENSG00000279797 LINC02339 - long intergenic non-protein coding RNA 2339 ncRNA 307.333-75 chr7 95332353 95332597 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -7943 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 378.666-5 chr3 50209899 50210117 + 2 NA intron (NM_006841, intron 1 of 15) intron (NM_006841, intron 1 of 15) 4737 NM_006841 10991 Hs.76460 NM_006841 ENSG00000188338 SLC38A3 G17|NAT1|SN1|SNAT3 solute carrier family 38 member 3 protein-coding 316-33 chr3 106173186 106173523 + 2 NA Intergenic Intergenic -303953 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 236.667-40 chr2 66469957 66470119 + 2 NA intron (NM_002398, intron 7 of 12) intron (NM_002398, intron 7 of 12) -29708 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 448-2 chr12 17406391 17406720 + 2 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 182523 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 255.333-32 chr14 56957945 56958175 + 2 NA Intergenic Intergenic 144902 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 374-22 chr8 79786916 79787247 + 2 NA intron (NR_125410, intron 3 of 3) L1MB2|LINE|L1 18939 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 386.666-8 chr2 113719836 113720225 + 2 NA intron (NM_001330315, intron 14 of 16) intron (NM_001330315, intron 14 of 16) 1338 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 381-7 chr21 34134659 34134986 + 2 NA intron (NM_032476, intron 2 of 2) MER47A|DNA|TcMar-Tigger -45855 NR_027267 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 297.667-6 chr10 94051579 94051861 + 2 NA intron (NM_001288989, intron 2 of 32) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie -37306 NM_001165979 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 315.333-54 chr8 129187349 129187653 + 2 NA Intergenic Intergenic 53739 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 274-54 chr6 56084622 56084866 + 2 NA intron (NM_030820, intron 17 of 29) intron (NM_030820, intron 17 of 29) 6918 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 503.999-4 chr6 161144630 161145029 + 2 NA intron (NM_020133, intron 7 of 8) AluY|SINE|Alu 17153 NR_024277 79992 Hs.664873 NM_024929 ENSG00000279355 AGPAT4-IT1 C6orf59|NCRNA00241 AGPAT4 intronic transcript 1 ncRNA 356.666-4 chr12 96753119 96753394 + 2 NA intron (NM_001306084, intron 55 of 67) L2c|LINE|L2 -154001 NM_001135177 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 394.333-9 chr2 88074970 88075324 + 2 NA intron (NM_001330364, intron 1 of 8) intron (NM_001330364, intron 1 of 8) 7322 NM_001330364 150572 Hs.516176 NM_198274 ENSG00000115593 SMYD1 BOP|KMT3D|ZMYND18|ZMYND22 SET and MYND domain containing 1 protein-coding 253-39 chr2 126549158 126549367 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -106673 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 319.667-7 chr15 90436660 90436889 + 2 NA intron (NM_003870, intron 5 of 37) intron (NM_003870, intron 5 of 37) 48532 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 303-45 chr6 162266599 162266852 + 2 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) MIRb|SINE|MIR -460407 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 344.666-18 chr2 218055531 218055813 + 2 NA intron (NR_034176, intron 2 of 13) MER31-int|LTR|ERV1 5618 NR_002712 3580 Hs.647858 NR_002712 CXCR2P1 CXCR2P|IL8RBP C-X-C motif chemokine receptor 2 pseudogene 1 pseudo 410.667-13 chr5 31155797 31156084 + 2 NA Intergenic Intergenic -37746 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 392-17 chr6 122464206 122464578 + 2 NA intron (NM_020755, intron 1 of 9) HAL1b|LINE|L1 7415 NM_020755 57515 Hs.146668 NM_020755 ENSG00000111897 SERINC1 TDE1L|TDE2|TMS-2|TMS2 serine incorporator 1 protein-coding 428.667-5 chr14 72938365 72938726 + 2 NA intron (NM_001352448, intron 2 of 13) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 12081 NM_181341 26094 Hs.331491 NM_015604 ENSG00000119599 DCAF4 WDR21|WDR21A DDB1 and CUL4 associated factor 4 protein-coding 362-27 chrX 24020746 24021072 + 2 NA intron (NM_030624, intron 2 of 3) intron (NM_030624, intron 2 of 3) 6277 NM_030624 80311 Hs.495854 NM_030624 ENSG00000174010 KLHL15 HEL-S-305 kelch like family member 15 protein-coding 301-48 chr6 20711005 20711206 + 2 NA intron (NM_017774, intron 5 of 15) intron (NM_017774, intron 5 of 15) 176648 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 306.666-28 chr5 50795306 50795609 + 2 NA intron (NM_024615, intron 12 of 25) intron (NM_024615, intron 12 of 25) 128043 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 365.333-27 chr9 135598345 135598540 + 2 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 23517 NR_034016 100130954 Hs.550769 NR_034016 ENSG00000237339 LINC01502 - long intergenic non-protein coding RNA 1502 ncRNA 486-10 chr5 137358746 137359237 + 2 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) intron (NM_004598, intron 2 of 10) 140335 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 297.334-3 chr12 96761813 96762026 + 2 NA intron (NM_001306084, intron 58 of 67) L1MB8|LINE|L1 -145338 NM_001135177 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 299.333-22 chr13 104484044 104484237 + 2 NA Intergenic (ATATTAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -981727 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 473.667-2 chr2 171013776 171014300 + 2 NA intron (NM_001136555, intron 11 of 18) intron (NM_001136555, intron 11 of 18) 52935 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 391.333-14 chr3 43667677 43668094 + 2 NA intron (NM_001346469, intron 1 of 11) L1PB2|LINE|L1 -22985 NM_001365650 51099 Hs.19385 NM_016006 ENSG00000011198 ABHD5 CGI58|IECN2|NCIE2 abhydrolase domain containing 5 protein-coding 293.333-56 chr7 29490408 29490663 + 2 NA intron (NM_001293081, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 6719 NM_001293081 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 579.333 chr12 8847456 8847764 + 2 NA exon (NM_144670, exon 15 of 36) exon (NM_144670, exon 15 of 36) 2606 NM_001282424 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 334.334-9 chr6 117945945 117946203 + 2 NA intron (NM_001029858, intron 1 of 7) intron (NM_001029858, intron 1 of 7) 38810 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 338-3 chr1 179720948 179721241 + 2 NA Intergenic Intergenic -6682 NM_001329714 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 467.333-12 chr8 125060705 125061250 + 2 NA intron (NM_014846, intron 12 of 28) L1ME4c|LINE|L1 30815 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 356-33 chr7 56437814 56438097 + 2 NA intron (NR_029420, intron 1 of 5) L1MA3|LINE|L1 10420 NR_029420 650226 Hs.448401 NR_029420 LOC650226 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene pseudo 342.666-4 chr1 244858216 244858541 + 2 NA intron (NM_031844, intron 6 of 13) intron (NM_031844, intron 6 of 13) -4161 NR_132782 106635532 NR_132782 SNORA100 - small nucleolar RNA, H/ACA box 100 snoRNA 248.666-17 chr15 25310068 25310320 + 2 NA intron (NR_146177, intron 146 of 147) L1MB5|LINE|L1 31851 NR_001295 338428 NR_001295 ENSG00000274640 SNORD109A HBII-438A small nucleolar RNA, C/D box 109A snoRNA 338-15 chr19 32396171 32396357 + 2 NA intron (NR_046201, intron 2 of 2) intron (NR_046201, intron 2 of 2) 9275 NR_046201 400684 Hs.438766 NR_046201 ENSG00000267213 LOC400684 - uncharacterized LOC400684 ncRNA 324.667-9 chr14 49640044 49640222 + 2 NA Intergenic Intergenic -4903 NM_018139 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 431.667-4 chr2 97810202 97810607 + 2 NA intron (NM_015348, intron 18 of 40) intron (NM_015348, intron 18 of 40) 75998 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 292-21 chr17 35604898 35605123 + 2 NA intron (NM_001030006, intron 3 of 21) AluJr4|SINE|Alu 17688 NM_001030006 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 379.334 chr10 74248192 74248669 + 2 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) AluSc8|SINE|Alu 71667 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 398-5 chr17 66072725 66072989 + 2 NA intron (NM_001302891, intron 6 of 24) intron (NM_001302891, intron 6 of 24) 119035 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 331.667 chr10 103803482 103803746 + 2 NA intron (NM_014631, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 51792 NM_014631 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 230-39 chr21 20930041 20930284 + 2 NA Intergenic Intergenic -68247 NM_001352592 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 246.667-96 chr8 88589684 88589901 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -262309 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 197-45 chr18 10305835 10306012 + 2 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 108447 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 239.333-13 chr10 48711172 48711398 + 2 NA intron (NM_020945, intron 2 of 61) intron (NM_020945, intron 2 of 61) 25822 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 302-69 chr8 79879291 79879445 + 2 NA Intergenic Intergenic -7631 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 408.667-3 chr14 70512749 70513103 + 2 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 22078 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 295.333-54 chr7 37868543 37868760 + 2 NA intron (NM_016616, intron 11 of 17) intron (NM_016616, intron 11 of 17) 20054 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 369-3 chr12 58097935 58098206 + 2 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 10178 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 365-4 chr12 1197255 1197560 + 2 NA intron (NM_001301248, intron 11 of 18) intron (NM_001301248, intron 11 of 18) 169659 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 358.333-9 chr11 102711248 102711583 + 2 NA TTS (NM_002424) TTS (NM_002424) -5646 NM_022122 64066 Hs.534479 NM_022122 ENSG00000137675 MMP27 MMP-27 matrix metallopeptidase 27 protein-coding 325.333-42 chr6 48095579 48095897 + 2 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -27049 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 666.666 chr10 122185806 122186297 + 2 NA intron (NM_001291878, intron 1 of 16) AluSq|SINE|Alu 22421 NM_006997 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 402-7 chr4 178287954 178288221 + 2 NA Intergenic Intergenic -380151 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 385-6 chr2 51537733 51538061 + 2 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 505296 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 401.666-3 chr14 53738853 53739226 + 2 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 209445 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 319-13 chr2 64703767 64704020 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -49980 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 341.667-16 chr3 168404089 168404499 + 2 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) intron (NR_021485, intron 3 of 15) -147560 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 245 chr1 10515224 10515462 + 2 NA intron (NM_004565, intron 2 of 8) intron (NM_004565, intron 2 of 8) 40393 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 690.667 chr6 163689396 163689971 + 2 NA Intergenic Intergenic -18199 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 306-53 chr7 93838122 93838404 + 2 NA Intergenic Intergenic 52490 NM_001271004 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 282-30 chr2 175515516 175515693 + 2 NA Intergenic Intergenic -333894 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 330-30 chr5 51814138 51814462 + 2 NA Intergenic Intergenic -193731 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 200.667-104 chr3 1038603 1038827 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -54309 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 552-4 chr3 1615568 1615986 + 2 NA Intergenic Intergenic -483026 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 456.666-3 chr3 64284603 64284874 + 2 NA Intergenic Intergenic -16565 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 260.666-27 chr4 55812489 55812710 + 2 NA Intergenic Intergenic -7404 NM_001351574 644145 Hs.570825 NM_001351574 ENSG00000250821 EXOC1L - exocyst complex component 1 like protein-coding 475.999-3 chr2 221148238 221148571 + 2 NA Intergenic Intergenic 423900 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 251-40 chr21 14581018 14581255 + 2 NA intron (NM_001256370, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR -1066 NR_046512 100874190 Hs.563053 NR_046512 ENSG00000223662 SAMSN1-AS1 - SAMSN1 antisense RNA 1 ncRNA 326.667-29 chr5 17672100 17672294 + 2 NA Intergenic Intergenic -16559 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 428.333-4 chr16 7278389 7278965 + 2 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -54168 NM_145892 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 298.667-4 chr10 35452430 35452616 + 2 NA intron (NM_001282853, intron 2 of 10) intron (NM_001282853, intron 2 of 10) 115649 NM_001282852 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 317.333-8 chr12 5021591 5021857 + 2 NA Intergenic Intergenic -22155 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 277-50 chr8 65958883 65959132 + 2 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -55971 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 264-39 chr4 67934256 67934497 + 2 NA intron (NM_001114387, intron 3 of 9) intron (NM_001114387, intron 3 of 9) 29117 NM_001114387 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 282-4 chr10 102281320 102281571 + 2 NA intron (NM_001199378, intron 3 of 39) intron (NM_001199378, intron 3 of 39) 35913 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 290-49 chr8 82205376 82205550 + 2 NA Intergenic Intergenic -363177 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 299.667-21 chr2 169428848 169429076 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -50532 NM_152384 129880 Hs.233398 NM_152384 ENSG00000163093 BBS5 - Bardet-Biedl syndrome 5 protein-coding 370.667-4 chr1 204764746 204765095 + 2 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -63732 NM_001005389 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 301.667-24 chr2 55618493 55618962 + 2 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -1105 NM_020463 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 315.333-33 chr4 40921713 40921987 + 2 NA intron (NM_173075, intron 9 of 16) intron (NM_173075, intron 9 of 16) -64658 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 295-28 chr20 49305636 49305797 + 2 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 25033 NR_003030 692057 NR_003030 ENSG00000212304 SNORD12 HBII-99|MIR1259|MIRN1259 small nucleolar RNA, C/D box 12 snoRNA 356.333-10 chr14 24556610 24556977 + 2 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 19457 NM_001911 1511 Hs.421724 NM_001911 ENSG00000100448 CTSG CATG|CG cathepsin G protein-coding 341.667-20 chr6 34649494 34649814 + 2 NA intron (NM_024294, intron 2 of 4) intron (NM_024294, intron 2 of 4) -46500 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 494-8 chr7 28780487 28780983 + 2 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 94602 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 323-18 chr2 205516308 205516474 + 2 NA intron (NM_205863, intron 20 of 21) L1PA14|LINE|L1 -166109 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 597 chr5 97095317 97095670 + 2 NA intron (NM_153234, intron 5 of 5) intron (NM_153234, intron 5 of 5) 47118 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 210.333-15 chr10 55081902 55082177 + 2 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L1MA3|LINE|L1 -280748 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 444-6 chr7 45331451 45332094 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 173981 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 407.333-23 chr8 47127305 47127592 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -61859 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 338-19 chr2 240801128 240801305 + 2 NA intron (NM_004321, intron 1 of 46) L1MEg|LINE|L1 19003 NM_001330289 547 Hs.516802 NM_004321 ENSG00000130294 KIF1A ATSV|C2orf20|HSN2C|MRD9|SPG30|UNC104 kinesin family member 1A protein-coding 274.666-34 chrX 88650947 88651156 + 2 NA Intergenic Intergenic -96174 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 367.667-12 chr2 206878071 206878269 + 2 NA Intergenic Intergenic -61348 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 466.666-3 chr6 49625264 49625563 + 2 NA intron (NM_000324, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 11461 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 314.667-8 chr10 106694418 106694615 + 2 NA intron (NM_001206569, intron 9 of 25) AluSx|SINE|Alu 470190 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 354-20 chr5 11546383 11546571 + 2 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) L1ME3E|LINE|L1 42440 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 305.333-56 chr5 36213632 36213799 + 2 NA intron (NM_001085411, intron 6 of 11) intron (NM_001085411, intron 6 of 11) 27676 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 322.666-17 chr17 70673105 70673400 + 2 NA Intergenic Intergenic 503717 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 302-42 chr4 43854325 43854537 + 2 NA Intergenic Intergenic -162430 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 241.333-7 chr1 108187612 108187788 + 2 NA intron (NM_013386, intron 1 of 9).2 L1M5|LINE|L1 5135 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 368.666-17 chr8 73319903 73320262 + 2 NA intron (NM_172037, intron 3 of 5) intron (NM_172037, intron 3 of 5) 25480 NM_172037 157506 Hs.244940 NM_172037 ENSG00000121039 RDH10 SDR16C4 retinol dehydrogenase 10 protein-coding 472-10 chr6 132796593 132797233 + 2 NA intron (NM_052831, intron 2 of 13) intron (NM_052831, intron 2 of 13) 1724 NM_052831 116843 Hs.347144 NM_052831 ENSG00000146409 SLC18B1 C6orf192|dJ55C23.6 solute carrier family 18 member B1 protein-coding 328.667-11 chr4 70580733 70581011 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11384 NM_016519 258 Hs.272396 NM_016519 ENSG00000178522 AMBN AI1F ameloblastin protein-coding 273.667-17 chr12 46469917 46470063 + 2 NA intron (NR_125378, intron 3 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 85883 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 204-101 chr2 139068992 139069193 + 2 NA Intergenic Intergenic 171768 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 367.667-8 chr17 33916815 33917185 + 2 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 239806 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 296.666-3 chr10 115567439 115567680 + 2 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) intron (NM_207303, intron 26 of 28) 474194 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 264-47 chr6 143319810 143319978 + 2 NA intron (NM_016108, intron 4 of 5) L1MA10|LINE|L1 122783 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 281-16 chr17 63103834 63104096 + 2 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) MIR|SINE|MIR 137730 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 350-30 chr5 166360250 166360541 + 2 NA Intergenic Intergenic 565975 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 450-4 chr4 22015275 22015625 + 2 NA Intergenic Intergenic -66699 NM_147182 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 414-10 chr4 70240703 70241018 + 2 NA Intergenic Intergenic -1756 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 314.667-13 chr12 46437812 46438087 + 2 NA intron (NR_125381, intron 2 of 2) intron (NR_125381, intron 2 of 2) 53842 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 294.666-2 chr11 81148897 81149136 + 2 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -386213 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 293 chr1 40019487 40019796 + 2 NA Intergenic Intergenic -20424 NM_001350480 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 442.334-3 chr5 140699885 140700401 + 2 NA promoter-TSS (NM_144723) promoter-TSS (NM_144723) -304 NM_144723 153527 Hs.350194 NM_144723 ENSG00000146007 ZMAT2 Ptg-12|Snu23 zinc finger matrin-type 2 protein-coding 206-12 chr1 172187624 172187771 + 2 NA intron (NR_146559, intron 15 of 20) intron (NR_146559, intron 15 of 20) -42862 NR_038397 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 296.667-21 chr17 29486933 29487083 + 2 NA intron (NM_025142, intron 8 of 17) AluSx|SINE|Alu 80029 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 309-8 chr10 64046024 64046322 + 2 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -524283 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 251.666-8 chr12 122413453 122413650 + 2 NA intron (NM_198240, intron 1 of 23) intron (NM_198240, intron 1 of 23) 9018 NM_001247997 6249 Hs.524809 NM_002956 ENSG00000130779 CLIP1 CLIP|CLIP-170|CLIP170|CYLN1|RSN CAP-Gly domain containing linker protein 1 protein-coding 491-2 chr14 58094703 58095117 + 2 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) L1ME1|LINE|L1 57303 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 421.999 chr1 173101484 173101880 + 2 NA Intergenic Intergenic -50719 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 447-4 chr11 8674622 8674969 + 2 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -7997 NM_000990 6157 Hs.523463 NM_000990 ENSG00000166441 RPL27A L27A ribosomal protein L27a protein-coding 245-45 chr21 35389776 35390020 + 2 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 190866 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 302-9 chr11 5207355 5207580 + 2 NA Intergenic Intergenic -6767 NM_001004760 283111 Hs.553670 NM_001004760 ENSG00000176742 OR51V1 OR11-36|OR51A12 olfactory receptor family 51 subfamily V member 1 protein-coding 327-5 chr11 68091443 68091641 + 2 NA intron (NM_001277, intron 2 of 11) intron (NM_001277, intron 2 of 11) 29846 NM_001277 1119 Hs.77221 NM_001277 ENSG00000110721 CHKA CHK|CK|CKI|EK choline kinase alpha protein-coding 274.666-3 chr10 25469227 25469471 + 2 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) L2|LINE|L2 -182363 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 285-19 chr22 24337210 24337553 + 2 NA intron (NM_015330, intron 9 of 16) L1MB5|LINE|L1 -4727 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 269.333-52 chr2 178168610 178168753 + 2 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -25800 NM_001201482 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 402.666-5 chr14 57029064 57029456 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 216102 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 469-2 chr14 48633160 48633565 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -838348 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 364.334-3 chr5 19369929 19370239 + 2 NA Intergenic Intergenic 516188 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 257-36 chr3 5483481 5483629 + 2 NA Intergenic Intergenic -233300 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 394.334-6 chr5 54030196 54030515 + 2 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie -78756 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 296-60 chr7 7734690 7734961 + 2 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -16218 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 291.333-61 chr7 51270601 51270790 + 2 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) intron (NM_015198, intron 1 of 12) 46114 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 425-5 chr8 135316908 135317125 + 2 NA Intergenic Intergenic 82885 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 344-2 chr1 80477316 80477563 + 2 NA Intergenic Intergenic -58316 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 434.666-11 chr8 140691185 140691798 + 2 NA intron (NR_148037, intron 28 of 34) intron (NR_148037, intron 28 of 34) 27078 NM_001352749 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 304-9 chr10 9339587 9339887 + 2 NA Intergenic Intergenic -44144 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 462.666-4 chr13 74840256 74840681 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 287625 NR_034025 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 420-2 chr1 197820110 197820388 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -44769 NM_001195215 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 233.667-65 chr6 130352635 130352767 + 2 NA intron (NM_001258275, intron 1 of 13) intron (NM_001258275, intron 1 of 13) 13167 NM_001258275 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 418-11 chr6 62509860 62510120 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -223763 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 300-48 chr4 183316756 183316931 + 2 NA 3' UTR (NM_024949, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_024949, exon 23 of 23) 3931 NM_001111319 53842 Hs.333179 NM_001111319 ENSG00000177300 CLDN22 CLDN21 claudin 22 protein-coding 321.666-13 chr7 33370686 33371038 + 2 NA intron (NM_198428, intron 17 of 22) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 241298 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 323.333-15 chr2 48730113 48730347 + 2 NA intron (NM_000233, intron 2 of 10) intron (NM_000233, intron 2 of 10) 25494 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 335.667-6 chr12 111546178 111546504 + 2 NA intron (NR_132311, intron 5 of 23) MER58A|DNA|hAT-Charlie 52974 NM_002973 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 323.334-11 chr8 135444089 135444384 + 2 NA Intergenic Intergenic -13220 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 375.333-13 chr2 186347501 186347791 + 2 NA Intergenic Intergenic -138614 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 322-31 chr4 121324672 121324947 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 56209 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 409.666-6 chr2 102541334 102541729 + 2 NA Intergenic Intergenic 68305 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 325.667-14 chr2 150247784 150248092 + 2 NA intron (NR_146972, intron 1 of 2) intron (NR_146972, intron 1 of 2) 9069 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 445.333-5 chr22 30419194 30419573 + 2 NA intron (NM_001204204, intron 9 of 9) AluSz6|SINE|Alu -6385 NM_001003704 51537 Hs.713636 NM_016498 ENSG00000242114 MTFP1 HSPC242|MTP18 mitochondrial fission process 1 protein-coding 509.666-2 chr9 30229921 30230278 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 178355 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 337.333-20 chr17 68936792 68937042 + 2 NA intron (NM_001288985, intron 5 of 39) intron (NM_001288985, intron 5 of 39) 18475 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 294-50 chr5 23045666 23045833 + 2 NA Intergenic Intergenic -192405 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 298.667-13 chr2 115093299 115093545 + 2 NA intron (NM_001178037, intron 1 of 25) intron (NM_001178037, intron 1 of 25) 28849 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 392.667-11 chr7 43168404 43168654 + 2 NA intron (NM_015052, intron 2 of 29) AluJr|SINE|Alu 17634 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 396.333-6 chr18 74224830 74225155 + 2 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 66971 NM_148923 1528 Hs.465413 NM_001914 ENSG00000166347 CYB5A CYB5|MCB5|METAG cytochrome b5 type A protein-coding 183.333-17 chr11 16993010 16993211 + 2 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) intron (NM_001329630, intron 3 of 26) 21304 NM_175058 144100 Hs.12332 NM_175058 ENSG00000166689 PLEKHA7 - pleckstrin homology domain containing A7 protein-coding 247.667-101 chr9 33886097 33886254 + 2 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) intron (NM_017811, intron 1 of 4) 48189 NM_001282530 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 625.333-2 chr4 74404957 74405348 + 2 NA Intergenic MER90|LTR|ERV1 -39984 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 253.333-109 chr8 81586216 81586350 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 44994 NR_146081 650747 NR_146081 IMPA1P1 IMPA1P inositol monophosphatase 1 pseudogene 1 pseudo 409.667-2 chr16 56579004 56579326 + 2 NA Intergenic Intergenic -10363 NM_005954 4504 Hs.73133 NM_005954 ENSG00000087250 MT3 GIF|GIFB|GRIF|ZnMT3 metallothionein 3 protein-coding 395-22 chr6 161064178 161064396 + 2 NA intron (NM_005922, intron 3 of 26) intron (NM_005922, intron 3 of 26) 72518 NM_005922 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 330.666-17 chr5 12787394 12787855 + 2 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) L1M5|LINE|L1 119765 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 318-38 chr3 100784172 100784346 + 2 NA intron (NM_001349331, intron 32 of 42) intron (NM_001349331, intron 32 of 42) 74717 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 423.667-11 chr22 34797220 34797765 + 2 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) L2b|LINE|L2 200424 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 324-22 chr4 81916069 81916298 + 2 NA Intergenic Intergenic -444276 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 364-10 chr17 62652337 62652645 + 2 NA intron (NM_006039, intron 1 of 29) CpG 24821 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 309.334-6 chr2 64056794 64057070 + 2 NA Intergenic Intergenic -37504 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 333-16 chr22 26506747 26506963 + 2 NA exon (NM_001346862, exon 3 of 13) exon (NM_001346862, exon 3 of 13) 5618 NM_012143 24144 Hs.20225 NM_012143 ENSG00000100109 TFIP11 NTR1|STIP|STIP-1|Spp382|TIP39|bK445C9.6 tuftelin interacting protein 11 protein-coding 301.667-14 chr15 56253419 56253802 + 2 NA Intergenic Intergenic -8528 NM_001370561 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 335.333-7 chr10 89587937 89588247 + 2 NA intron (NM_148977, intron 6 of 6) L1MA7|LINE|L1 4735 NR_029524 406901 NR_029524 ENSG00000198997 MIR107 MIRN107|miR-107 microRNA 107 ncRNA 407.333-13 chr16 73587788 73588139 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 201158 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 348.334-5 chr16 8344698 8345067 + 2 NA Intergenic Intergenic 244956 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 410-17 chr8 77280642 77281034 + 2 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -169859 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 314.667-37 chr8 130596568 130596876 + 2 NA Intergenic Intergenic -153048 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 363.333-22 chr4 127453814 127454203 + 2 NA Intergenic Intergenic -178949 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 415-5 chr17 47119003 47119381 + 2 NA non-coding (NR_148340, exon 17 of 17) non-coding (NR_148340, exon 17 of 17) 70103 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 273-45 chrX 143752033 143752293 + 2 NA Intergenic Intergenic -31495 NM_001009615 494119 NM_001009615 ENSG00000268988 SPANXN2 CT11.7|SPANX-N2 SPANX family member N2 protein-coding 463.334-2 chr5 19700046 19700658 + 2 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 185920 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 244-78 chr4 47323807 47324002 + 2 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 139798 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 299.333-24 chr14 51115818 51115998 + 2 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -20204 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 343.334-2 chr10 32794745 32795153 + 2 NA intron (NM_001321115, intron 30 of 43) L1PA16|LINE|L1 106523 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 362.334 chr10 52728781 52729046 + 2 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 26491 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 228.666-22 chr2 125659167 125659337 + 2 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 458733 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 250-80 chr7 111230110 111230281 + 2 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 139068 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 330-16 chr17 14803804 14804003 + 2 NA Intergenic Intergenic -210902 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 288-20 chr15 33950650 33950907 + 2 NA intron (NM_020371, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu -17719 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 306-5 chr10 78163410 78163715 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -85063 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 592.333 chr15 25387815 25388245 + 2 NA intron (NM_001354546, intron 1 of 9) L1MC1|LINE|L1 50199 NM_001354526 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 296-14 chr12 14273013 14273302 + 2 NA Intergenic Intergenic -92475 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 343.333-16 chr21 26934589 26934943 + 2 NA intron (NM_007038, intron 3 of 7) intron (NM_007038, intron 3 of 7) -19195 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 337-18 chr21 28300015 28300192 + 2 NA Intergenic Intergenic -71436 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 527.333 chr10 30075476 30075790 + 2 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) intron (NM_001350022, intron 1 of 4) -16047 NM_001350001 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 346.333-4 chr1 112571023 112571236 + 2 NA intron (NM_017744, intron 11 of 14) AluSz|SINE|Alu 48012 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 310-17 chr12 20740071 20740236 + 2 NA intron (NM_017435, intron 11 of 14) intron (NM_017435, intron 11 of 14) 44688 NM_017435 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 220-81 chr4 83860005 83860225 + 2 NA Intergenic Intergenic 324007 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 292.666-19 chr2 71169254 71169416 + 2 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL 38701 NM_005791 10199 Hs.656208 NM_005791 ENSG00000124383 MPHOSPH10 CT90|MPP10|MPP10P|PPP1R106 M-phase phosphoprotein 10 protein-coding 295-2 chr10 25071589 25071767 + 2 NA Intergenic Intergenic -9399 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 557.001 chr5 132383726 132384442 + 2 NA intron (NM_003060, intron 2 of 9) intron (NM_003060, intron 2 of 9) -14168 NR_110997 553103 Hs.570908 NR_110997 ENSG00000233006 MIR3936HG SLC22A5-AS1 MIR3936 host gene ncRNA 305.666-11 chr17 56176273 56176588 + 2 NA intron (NM_153228, intron 1 of 16) intron (NM_153228, intron 1 of 16) 22955 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 351-18 chr7 27955364 27955689 + 2 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) 215431 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 348-12 chr17 80472159 80472414 + 2 NA intron (NM_002522, intron 3 of 4) intron (NM_002522, intron 3 of 4) 4321 NM_002522 4884 Hs.514556 NM_002522 ENSG00000171246 NPTX1 NP1 neuronal pentraxin 1 protein-coding 473 chr12 100297416 100297918 + 2 NA intron (NM_001330256, intron 4 of 19) intron (NM_001330256, intron 4 of 19) 30283 NM_001330253 55681 Hs.506481 NM_017988 ENSG00000136021 SCYL2 CVAK104 SCY1 like pseudokinase 2 protein-coding 337.333-42 chr6 92293225 92293509 + 2 NA Intergenic Intergenic -602939 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 218.667-103 chr7 107756133 107756256 + 2 NA intron (NR_024199, intron 6 of 6) intron (NR_024199, intron 6 of 6) -11613 NR_144537 101927974 Hs.432792 NR_144536 ENSG00000241764 LOC101927974 - uncharacterized LOC101927974 ncRNA 472-3 chr10 75073494 75073788 + 2 NA Intergenic Intergenic -15058 NM_001003892 338599 Hs.535090 NM_001003892 ENSG00000188716 DUPD1 DUSP27|FMDSP dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 protein-coding 430.667-6 chr15 100356097 100356466 + 2 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -5563 NR_028139 388182 Hs.136982 NM_207383 ENSG00000189419 SPATA41 HSD47 spermatogenesis associated 41 ncRNA 313-25 chr3 146304398 146304554 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -53297 NM_001128306 57088 Hs.477869 NM_020353 ENSG00000114698 PLSCR4 TRA1 phospholipid scramblase 4 protein-coding 408-5 chr3 76087637 76087908 + 2 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -302223 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 321-4 chr10 50655262 50655483 + 2 NA Intergenic (ATATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 30421 NR_126411 104355295 Hs.450493 NR_126411 SGMS1-AS1 - SGMS1 antisense RNA 1 ncRNA 706 chr5 84403614 84404024 + 2 NA Intergenic Intergenic -18939 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 416.667-14 chr6 45433072 45433511 + 2 NA intron (NM_001015051, intron 4 of 7) intron (NM_001015051, intron 4 of 7) 11016 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 222-49 chr2 177303813 177303951 + 2 NA intron (NR_026966, intron 8 of 8) intron (NR_026966, intron 8 of 8) 10000 NR_106767 102465255 NR_106767 ENSG00000278418 MIR6512 hsa-mir-6512|mir-6512 microRNA 6512 ncRNA 235-7 chr1 178138985 178139140 + 2 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) intron (NM_170692, intron 1 of 17) 44958 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 297-12 chr10 58462109 58462302 + 2 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -50667 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 281.333-51 chr5 114614459 114614719 + 2 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) L1MC1|LINE|L1 38548 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 296-4 chr1 108997834 108998070 + 2 NA intron (NM_014969, intron 7 of 14) intron (NM_014969, intron 7 of 14) -34453 NM_001048210 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 229.666-8 chr13 39900502 39900750 + 2 NA Intergenic Intergenic -236491 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 205.667-23 chr11 29589140 29589367 + 2 NA Intergenic Intergenic -5160 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 289.333-12 chr11 107892504 107892672 + 2 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -33801 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 218.667-36 chr15 69242095 69242308 + 2 NA intron (NM_001324092, intron 2 of 3) intron (NM_001324092, intron 2 of 3) -56711 NM_017705 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 317.333-37 chr7 4965662 4965903 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6595 NM_001100600 221938 Hs.558694 NM_198403 ENSG00000136297 MMD2 PAQR10 monocyte to macrophage differentiation associated 2 protein-coding 479-6 chr5 102961106 102961560 + 2 NA non-coding (NR_157231, exon 15 of 15) non-coding (NR_157231, exon 15 of 15) 95510 NM_000919 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 351-11 chr18 5274383 5274593 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 21238 NM_001243702 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 292-49 chr7 38011820 38011982 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 90582 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 390.667-8 chr4 95979102 95979318 + 2 NA Intergenic Intergenic 139117 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 200.667-169 chr9 97943871 97944080 + 2 NA intron (NM_018437, intron 1 of 4) L2|LINE|L2 877 NM_018437 55363 Hs.176626 NM_018437 ENSG00000136929 HEMGN CT155|EDAG|EDAG-1|NDR hemogen protein-coding 356-12 chr12 60424918 60425231 + 2 NA Intergenic Intergenic 735704 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 246.333-43 chr17 60520046 60520258 + 2 NA intron (NM_006380, intron 1 of 12) intron (NM_006380, intron 1 of 12) 6088 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 302-56 chr5 112315524 112315718 + 2 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) intron (NM_001347887, intron 1 of 23) 87338 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 412.667-14 chr6 1897091 1897470 + 2 NA intron (NM_001253846, intron 7 of 10) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 278711 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 302-31 chr2 103553638 103553920 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -569350 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 359.667-2 chr13 46069349 46069740 + 2 NA intron (NM_001872, intron 6 of 10) L1MB7|LINE|L1 16696 NR_046226 100509894 Hs.626139 NR_046226 ENSG00000235903 CPB2-AS1 - CPB2 antisense RNA 1 ncRNA 332-20 chr2 166109207 166109431 + 2 NA intron (NR_110260, intron 2 of 11) intron (NR_110260, intron 2 of 11) 18701 NM_006920 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 332-3 chr10 58873324 58873619 + 2 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -126047 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 294.667-2 chr1 217007177 217007350 + 2 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) -67590 NM_001243512 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 532-3 chr21 30665579 30666026 + 2 NA Intergenic Intergenic 22938 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 309.333-11 chr11 37321564 37321729 + 2 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -616955 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 219-13 chr11 29014025 29014196 + 2 NA Intergenic Intergenic -536562 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 305-22 chr5 128022013 128022381 + 2 NA non-coding (NR_015360, exon 3 of 3) non-coding (NR_015360, exon 3 of 3) 60978 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 298-54 chr3 9011204 9011380 + 2 NA intron (NM_014850, intron 17 of 21) L2a|LINE|L2 -47820 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 375.334-5 chr4 152616176 152616465 + 2 NA Intergenic Intergenic 63677 NM_152680 201799 Hs.518900 NM_152680 ENSG00000170006 TMEM154 - transmembrane protein 154 protein-coding 284-12 chr12 42354611 42354770 + 2 NA intron (NM_016488, intron 3 of 12) intron (NM_016488, intron 3 of 12) 22892 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 287-39 chr9 27827863 27828106 + 2 NA Intergenic Intergenic -254118 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 462-18 chr7 27811038 27811486 + 2 NA intron (NM_001362795, intron 13 of 14) intron (NM_001362795, intron 13 of 14) 71167 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 281.333-32 chr2 123116596 123116774 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -43204 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 295-18 chr16 69829179 69829350 + 2 NA intron (NM_001270455, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 -9473 NM_001270453 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 507.667 chr11 78606984 78607307 + 2 NA Intergenic Intergenic -32281 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 452-7 chr21 20409483 20409836 + 2 NA Intergenic (TATTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -150974 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 446.333-9 chr6 55335622 55336324 + 2 NA intron (NM_207410, intron 3 of 8) AluSz6|SINE|Alu 8504 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 322.666-10 chr13 68991946 68992186 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -106741 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 343.667-15 chr8 131068338 131068590 + 2 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -27555 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 132-32 chr12 115148539 115148647 + 2 NA Intergenic Intergenic -464418 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 424-11 chr22 37253101 37253600 + 2 NA Intergenic Intergenic -9081 NM_002872 5880 Hs.517601 NM_002872 ENSG00000128340 RAC2 EN-7|Gx|HSPC022|p21-Rac2 Rac family small GTPase 2 protein-coding 577.333-3 chr5 43611206 43611536 + 2 NA intron (NM_001331026, intron 2 of 20) L1MC5a|LINE|L1 -8141 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 305.333-51 chr4 71670322 71670497 + 2 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 113670 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 306-49 chr7 46448308 46448480 + 2 NA Intergenic Intergenic 248728 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 307-4 chr11 14650794 14650957 + 2 NA intron (NM_000922, intron 1 of 15) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 7071 NM_000922 5140 Hs.445711 NM_000922 ENSG00000152270 PDE3B HcGIP1|cGIPDE1 phosphodiesterase 3B protein-coding 289.334-3 chr11 60364718 60364984 + 2 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -13634 NM_206938 58475 Hs.530735 NM_021201 ENSG00000166927 MS4A7 4SPAN2|CD20L4|CFFM4|MS4A8 membrane spanning 4-domains A7 protein-coding 267-67 chr8 52183629 52183877 + 2 NA intron (NM_014682, intron 8 of 25) intron (NM_014682, intron 8 of 25) -10609 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 293-39 chr7 41855317 41855565 + 2 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -152351 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 318-3 chr1 74801486 74801724 + 2 NA Intergenic Intergenic -68197 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 412.333-3 chr11 110279187 110279603 + 2 NA intron (NM_001260493, intron 2 of 15) AluSx1|SINE|Alu 17317 NM_001260494 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 314.666-18 chr15 56723480 56723702 + 2 NA intron (NM_001002843, intron 1 of 20) intron (NM_001002843, intron 1 of 20) 10495 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 488.334-2 chr8 86779343 86779753 + 2 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -35873 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 319.667-5 chr14 59718492 59718805 + 2 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) intron (NM_021136, intron 3 of 8) -71628 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 317 chr1 48132152 48132313 + 2 NA intron (NR_026749, intron 7 of 9) L1PB4|LINE|L1 50196 NR_026749 391037 Hs.585393 NR_026749 SKINT1L BTN12|SKINT1|SKINTL|SKINTP Skint1 like (pseudogene) pseudo 301.999 chr14 80180996 80181258 + 2 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -30292 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 327-6 chr14 66987883 66988175 + 2 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -201411 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 384-3 chr12 2559329 2559680 + 2 NA intron (NM_199460, intron 11 of 49).2 intron (NM_199460, intron 11 of 49).2 112716 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 444-3 chr2 204420756 204421240 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -124477 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 295.667-23 chr5 93813963 93814221 + 2 NA intron (NM_032042, intron 8 of 10) intron (NM_032042, intron 8 of 10) -72492 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 281-17 chr17 76753952 76754139 + 2 NA intron (NM_001353019, intron 8 of 13) intron (NM_001353019, intron 8 of 13) 16544 NR_148234 79157 Hs.73965 NM_024311 ENSG00000092931 MFSD11 ET major facilitator superfamily domain containing 11 protein-coding 358.666-2 chr14 54547881 54548209 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -19567 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 387.666-3 chr5 19816765 19817154 + 2 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) L1MEd|LINE|L1 69313 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 582.667-4 chr4 45721142 45721643 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 402662 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 312-8 chr10 33938092 33938312 + 2 NA Intergenic Intergenic -165522 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 461.334 chr14 97296920 97297645 + 2 NA Intergenic Intergenic 142425 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 374.666-4 chr17 62768016 62768351 + 2 NA intron (NM_001288780, intron 4 of 10) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 38457 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 308-9 chr10 96728165 96728342 + 2 NA Intergenic L1MEa|LINE|L1 -7739 NM_152309 118788 Hs.310456 NM_152309 ENSG00000155629 PIK3AP1 BCAP phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 protein-coding 413-3 chr14 67244490 67244806 + 2 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) L1M5|LINE|L1 3213 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 478.334-2 chr5 37240679 37240949 + 2 NA intron (NM_023073, intron 6 of 51) intron (NM_023073, intron 6 of 51) -8232 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 321.333-46 chr4 31137258 31137490 + 2 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) AluSz6|SINE|Alu -33770 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 296-62 chr7 54089997 54090241 + 2 NA Intergenic Intergenic -240578 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 385-13 chr6 70036574 70036939 + 2 NA intron (NM_001858, intron 14 of 50) intron (NM_001858, intron 14 of 50) 170200 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 300.667-16 chr2 21357679 21357914 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 233810 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 398.666-2 chr11 37807307 37807645 + 2 NA Intergenic Intergenic -131125 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 321-21 chr7 23671329 23671529 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8770 NM_199136 340277 Hs.592178 NM_199136 ENSG00000188732 FAM221A C7orf46 family with sequence similarity 221 member A protein-coding 283-17 chr2 21127925 21128135 + 2 NA intron (NM_001306137, intron 2 of 3) intron (NM_001306137, intron 2 of 3) 4044 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 304-54 chr6 136275193 136275356 + 2 NA intron (NM_001363659, intron 6 of 11) intron (NM_001363659, intron 6 of 11) 14572 NM_001363659 9774 Hs.486542 NM_014739 ENSG00000029363 BCLAF1 BTF|bK211L9.1 BCL2 associated transcription factor 1 protein-coding 299.667-19 chr2 70421391 70421688 + 2 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 60101 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 384.334 chr10 19763076 19763438 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -34707 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 302-22 chr16 79774564 79774823 + 2 NA intron (NR_104660, intron 1 of 3) intron (NR_104660, intron 1 of 3) -4161 NR_104663 102467146 Hs.657587 NR_104663 ENSG00000261390 MAFTRR linc-MAF-4|lincMAF4 MAF transcriptional regulator RNA ncRNA 325.333-24 chr22 26210281 26210465 + 2 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 40899 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 367-4 chr10 114938634 114938899 + 2 NA intron (NM_139169, intron 1 of 7) intron (NM_139169, intron 1 of 7) 571 NM_139169 142940 Hs.21187 NM_139169 ENSG00000165832 TRUB1 PUS4 TruB pseudouridine synthase family member 1 protein-coding 322.334-9 chr7 37833095 37833388 + 2 NA Intergenic Intergenic -15356 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 339-3 chr1 215722977 215723312 + 2 NA intron (NM_206933, intron 61 of 71) intron (NM_206933, intron 61 of 71) 155840 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 347.333-11 chr2 58494991 58495206 + 2 NA Intergenic Intergenic -25655 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 311.333 chr1 69350264 69350447 + 2 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -82900 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 543.333-5 chr7 95489651 95490188 + 2 NA intron (NM_145872, intron 1 of 2) intron (NM_145872, intron 1 of 2) 3976 NM_016116 51666 Hs.602765 NM_016116 ENSG00000005981 ASB4 ASB-4 ankyrin repeat and SOCS box containing 4 protein-coding 317-11 chr15 58219466 58219676 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 81190 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 390-8 chr11 90340898 90341326 + 2 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 89880 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 281-29 chr3 70160070 70160257 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 152475 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 291.333-37 chr2 67833489 67833721 + 2 NA Intergenic Intergenic -8043 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 548.666 chr12 1458634 1458966 + 2 NA intron (NR_027948, intron 19 of 19) AluSp|SINE|Alu -41691 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 479.333-6 chr2 175891315 175891599 + 2 NA Intergenic Intergenic 110810 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 296.667-29 chr2 109634615 109634856 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 20371 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 263-6 chr1 173078708 173078898 + 2 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 -27840 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 336.666-4 chr12 16759207 16759438 + 2 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -151108 NM_001243609 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 265-37 chr2 131067640 131067826 + 2 NA intron (NM_001321746, intron 3 of 6) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 25429 NM_001321747 130074 Hs.534679 NM_001009993 ENSG00000152102 FAM168B MANI family with sequence similarity 168 member B protein-coding 291.333-56 chr5 117448226 117448428 + 2 NA intron (NR_046089, intron 2 of 5) intron (NR_046089, intron 2 of 5) 32815 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 378.667-15 chr2 210802477 210802731 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 185033 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 366-2 chr1 218736336 218736801 + 2 NA intron (NR_031644, intron 4 of 6) intron (NR_031644, intron 4 of 6) 181943 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 391-10 chr2 74128267 74128667 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 19445 NM_001035505 388962 Hs.61472 NM_212552 ENSG00000163170 BOLA3 MMDS2 bolA family member 3 protein-coding 419-11 chr9 38142920 38143197 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -73831 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 465-3 chr4 38714181 38714521 + 2 NA Intergenic Intergenic -49723 NR_026804 79667 Hs.29725 NM_024614 ENSG00000231160 KLF3-AS1 - KLF3 antisense RNA 1 ncRNA 308.667-42 chr8 118657131 118657323 + 2 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) intron (NR_038210, intron 2 of 4) -35264 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 332 chr1 69294685 69295080 + 2 NA Intergenic Intergenic -138373 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 605.333-2 chr22 33288259 33288854 + 2 NA intron (NM_133642, intron 12 of 14) MLT2C1|LTR|ERVL 148113 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 342.334-6 chr5 102695294 102695592 + 2 NA Intergenic MER84-int|LTR|ERV1 -23979 NR_103753 285708 Hs.533011 NR_103753 LINC00491 - long intergenic non-protein coding RNA 491 ncRNA 302-58 chr6 46987006 46987227 + 2 NA Intergenic Intergenic -32177 NM_015234 221395 Hs.362806 NM_015234 ENSG00000069122 ADGRF5 GPR116|KPG_001 adhesion G protein-coupled receptor F5 protein-coding 372.667-10 chr22 26358264 26358554 + 2 NA intron (NM_001184777, intron 12 of 14) MIR|SINE|MIR -70851 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 235.333-115 chr7 109539214 109539385 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 420914 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 524.667 chr11 88682579 88682966 + 2 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) intron (NM_001143831, intron 2 of 8) 178196 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 303.333-32 chr17 51418769 51418930 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -16578 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 263-18 chr13 96348080 96348294 + 2 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -79042 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 386.667-4 chr12 133005153 133005430 + 2 NA intron (NM_001256279, intron 2 of 4) AluSg|SINE|Alu 18924 NM_019591 7574 Hs.489608 NM_019591 ENSG00000198393 ZNF26 HEL-179|KOX20 zinc finger protein 26 protein-coding 396.666-5 chr5 30338349 30338702 + 2 NA Intergenic Intergenic 457965 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 440.666-4 chr18 1830344 1830794 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -470940 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 270.334 chr1 76815939 76816083 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36744 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 333.334-6 chr5 92004230 92004415 + 2 NA Intergenic Intergenic -621005 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 344.334-3 chr10 50892705 50893069 + 2 NA Intergenic Intergenic -7212 NM_001198819 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 356-5 chr10 61157786 61158046 + 2 NA Intergenic Intergenic 141641 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 437.333-2 chr10 51510187 51510504 + 2 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) L1MA8|LINE|L1 189250 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 365.667-11 chr3 141571187 141571581 + 2 NA intron (NM_006506, intron 10 of 23) intron (NM_006506, intron 10 of 23) 84357 NM_001303245 5922 Hs.98445 NM_006506 ENSG00000155903 RASA2 GAP1M RAS p21 protein activator 2 protein-coding 316-55 chr9 31192283 31192476 + 2 NA Intergenic Intergenic 189111 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 298-43 chr2 39833388 39833646 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -54241 NM_001321468 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 282.667-27 chr3 17579475 17579711 + 2 NA intron (NM_001349089, intron 1 of 20) intron (NM_001349089, intron 1 of 20) 120427 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 219-58 chr3 57178696 57178888 + 2 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -8475 NM_001318864 54756 Hs.150725 NM_017563 ENSG00000144730 IL17RD HH18|IL-17RD|IL17RLM|SEF interleukin 17 receptor D protein-coding 300.667-17 chr2 25647528 25647729 + 2 NA intron (NM_033147, intron 2 of 19) AluJo|SINE|Alu 2594 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 345.667-22 chr7 95269714 95270051 + 2 NA intron (NM_001166160, intron 14 of 19) intron (NM_001166160, intron 14 of 19) 54650 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 348.333-15 chr2 35544601 35544836 + 2 NA Intergenic Intergenic 73313 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 270-30 chr2 174560649 174560826 + 2 NA 3' UTR (NM_003387, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_003387, exon 8 of 8) -2665 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 313.667-3 chr1 235287076 235287233 + 2 NA intron (NR_135074, intron 2 of 24) AluSx1|SINE|Alu 40333 NM_001206794 51742 Hs.575782 NM_016374 ENSG00000054267 ARID4B BCAA|BRCAA1|RBBP1L1|RBP1L1|SAP180 AT-rich interaction domain 4B protein-coding 503-2 chr4 74179970 74180307 + 2 NA intron (NM_001144978, intron 3 of 7) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 22020 NM_001004346 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 230-43 chr3 115376845 115377011 + 2 NA Intergenic Intergenic -229640 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 410.667-18 chr9 37702664 37702975 + 2 NA intron (NM_001371225, intron 2 of 15) intron (NM_001371225, intron 2 of 15) 34810 NM_001371223 299.333-69 chr7 23728904 23729174 + 2 NA intron (NM_031414, intron 5 of 23) intron (NM_031414, intron 5 of 23) 18820 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 490-4 chr7 105510908 105511217 + 2 NA intron (NM_019042, intron 1 of 15) AluSx3|SINE|Alu -2542 NM_001318163 54517 Hs.520619 NM_019042 ENSG00000091127 PUS7 IDDABS pseudouridine synthase 7 protein-coding 382.666-9 chr2 160543731 160544049 + 2 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -50083 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 306.666-23 chr3 159418738 159419028 + 2 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 136237 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 539 chr2 74181548 74181987 + 2 NA Intergenic Intergenic -2888 NM_001317112 55233 Hs.602092 NM_018221 ENSG00000114978 MOB1A C2orf6|MATS1|MOB1|MOBK1B|MOBKL1B|Mob4B MOB kinase activator 1A protein-coding 264.666-30 chr4 66870956 66871126 + 2 NA Intergenic MER97d|DNA|hAT-Tip100 550959 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 314-28 chr3 89148852 89149107 + 2 NA intron (NM_182644, intron 2 of 6) intron (NM_182644, intron 2 of 6) 41358 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 299.333-61 chr5 168402823 168402996 + 2 NA intron (NM_001161661, intron 5 of 22) intron (NM_001161661, intron 5 of 22) -83562 NM_002887 5917 Hs.654907 NM_002887 ENSG00000113643 RARS ArgRS|DALRD1|HLD9 arginyl-tRNA synthetase protein-coding 245-21 chr14 65250176 65250413 + 2 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -27947 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 212-145 chr7 33176784 33176948 + 2 NA intron (NM_198428, intron 4 of 22) intron (NM_198428, intron 4 of 22) 47302 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 456.334 chr10 74284998 74285414 + 2 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) L2c|LINE|L2 108443 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 262-53 chr3 55218803 55218971 + 2 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 40715 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 306-47 chr6 143440935 143441142 + 2 NA intron (NM_182503, intron 1 of 5) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 1639 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 324.667-35 chr7 79271854 79272078 + 2 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) MER5B|DNA|hAT-Charlie -180991 NR_038346 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 358-20 chr5 65457195 65457418 + 2 NA intron (NR_135689, intron 4 of 25) intron (NR_135689, intron 4 of 25) 24614 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 314.667-40 chr9 38326538 38326892 + 2 NA Intergenic Intergenic -65987 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 279.333-70 chr8 118823706 118823846 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 128109 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 859.666 chr6 154620163 154620999 + 2 NA Intergenic Intergenic -109896 NM_001368117 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 364.666-14 chr7 82772592 82772813 + 2 NA intron (NM_033026, intron 22 of 24) intron (NM_033026, intron 22 of 24) -328746 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 292-58 chr9 112185675 112185861 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -10471 NM_001282640 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 333.333-44 chr7 6709917 6710190 + 2 NA Intergenic LTR45B|LTR|ERV1 -3106 NM_016265 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 319.333-7 chr11 77667501 77667819 + 2 NA intron (NM_016578, intron 15 of 15) intron (NM_016578, intron 15 of 15) -29854 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 288-50 chr7 42815563 42815850 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 96137 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 350-18 chr22 28617752 28618014 + 2 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 61982 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 322.666-7 chr11 103837376 103837696 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -12370 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 338-18 chr2 188493199 188493497 + 2 NA intron (NM_001252669, intron 4 of 8) HAL1b|LINE|L1 195856 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 428-8 chr7 5667217 5667742 + 2 NA intron (NR_046834, intron 1 of 2) intron (NR_046834, intron 1 of 2) 12982 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 373.333-3 chr11 112357916 112358226 + 2 NA intron (NR_126004, intron 2 of 3) intron (NR_126004, intron 2 of 3) 87322 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 283-27 chr4 23060709 23060933 + 2 NA Intergenic Intergenic 346732 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 315.667-23 chr6 136701366 136701644 + 2 NA intron (NM_005923, intron 3 of 29) intron (NM_005923, intron 3 of 29) 72391 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 308-5 chr10 27213984 27214250 + 2 NA intron (NM_001271512, intron 7 of 11) L1MA3|LINE|L1 26369 NM_001301252 91452 Hs.530597 NM_145698 ENSG00000107897 ACBD5 - acyl-CoA binding domain containing 5 protein-coding 254-47 chr21 30751374 30751570 + 2 NA Intergenic Intergenic 3956 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 421.333-9 chr9 91705600 91705949 + 2 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -69429 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 318-49 chr7 12127804 12128049 + 2 NA Intergenic Intergenic -83368 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 299-39 chr8 59362005 59362215 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 242900 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 252-37 chr16 8144949 8145193 + 2 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 444767 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 332.666-17 chr20 35361638 35361895 + 2 NA intron (NM_001184977, intron 4 of 7) MIRb|SINE|MIR 50207 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 299.667-22 chr20 32120701 32120944 + 2 NA intron (NM_001363731, intron 1 of 17) L1M4|LINE|L1 11094 NM_001363731 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 177.333-148 chr7 1730772 1730934 + 2 NA intron (NM_001128636, intron 2 of 2) L1MC|LINE|L1 11457 NR_120508 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 337.666-3 chr14 64291778 64292159 + 2 NA intron (NR_073496, intron 1 of 7) intron (NR_073496, intron 1 of 7) 2442 NM_001040275 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 348.666 chr1 160815761 160816055 + 2 NA intron (NM_001261457, intron 4 of 8) intron (NM_001261457, intron 4 of 8) 19734 NM_002348 4063 Hs.403857 NM_002348 ENSG00000122224 LY9 CD229|SLAMF3|hly9|mLY9 lymphocyte antigen 9 protein-coding 322-4 chr1 116034979 116035269 + 2 NA intron (NM_018420, intron 6 of 11) intron (NM_018420, intron 6 of 11) -57848 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 339.667-20 chr5 96387442 96387805 + 2 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) intron (NR_130776, intron 4 of 4) 44536 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 241-19 chr13 55596146 55596286 + 2 NA Intergenic Intergenic 421762 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 417.333-6 chr21 15294506 15294801 + 2 NA Intergenic Intergenic -229653 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 260-71 chr6 64762292 64762473 + 2 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -539036 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 303-26 chr18 3857200 3857410 + 2 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) intron (NM_001242761, intron 4 of 11) -11947 NM_001003809 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 259.667-21 chr14 68709595 68709823 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -80922 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 364-6 chr14 60202114 60202423 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -32404 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 329.333-9 chr12 98389019 98389229 + 2 NA Intergenic Intergenic 68021 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 380.667-12 chr5 163162374 163162667 + 2 NA Intergenic Intergenic -275051 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 364-4 chr12 120887735 120888030 + 2 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) L1MB8|LINE|L1 16476 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 295.666 chr1 57492435 57492710 + 2 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) MER3|DNA|hAT-Charlie -67651 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 359.999-4 chr3 186022906 186023248 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 63134 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 292-4 chr11 20490384 20490572 + 2 NA intron (NM_005788, intron 13 of 15) intron (NM_005788, intron 13 of 15) 102762 NM_005788 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 403.667-10 chr5 20089448 20089839 + 2 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -101443 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 432.333-11 chr8 140756203 140756585 + 2 NA intron (NR_148037, intron 19 of 34) intron (NR_148037, intron 19 of 34) -23741 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 504.666-3 chr14 28462770 28463247 + 2 NA Intergenic Intergenic 302311 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 298.666-3 chr12 119702711 119702966 + 2 NA intron (NM_007174, intron 40 of 46) intron (NM_007174, intron 40 of 46) 10886 NR_031589 100302274 NR_031589 ENSG00000283768 MIR1178 MIRN1178|hsa-mir-1178 microRNA 1178 ncRNA 326.667-20 chr18 9899885 9900056 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 13997 NM_001098529 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 393.333-17 chr5 38520967 38521296 + 2 NA intron (NM_001127671, intron 5 of 19) L1MA4A|LINE|L1 35515 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 261.333-72 chr4 32435335 32435489 + 2 NA Intergenic Intergenic 84374 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 381.666-3 chr17 61503717 61504095 + 2 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 47418 NM_018488 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 196.666-72 chr3 185656398 185656517 + 2 NA intron (NR_138486, intron 11 of 15) intron (NR_138486, intron 11 of 15) -56795 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 440.666-2 chr11 103381961 103382293 + 2 NA intron (NM_001377, intron 83 of 88) intron (NM_001377, intron 83 of 88) 272701 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 285.667-20 chr2 12976299 12976537 + 2 NA intron (NR_038434, intron 5 of 5) (ACAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 30595 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 319.333-14 chr2 23420628 23420790 + 2 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) intron (NM_052920, intron 1 of 13) 35530 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 318-8 chr10 58142727 58143042 + 2 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 125010 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 452 chr1 162163845 162164116 + 2 NA intron (NM_014697, intron 2 of 9) intron (NM_014697, intron 2 of 9) 6873 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 308-33 chr3 73594906 73595161 + 2 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) MER117|DNA|hAT-Charlie -25518 NM_001303139 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 326-40 chr6 167910488 167910701 + 2 NA intron (NM_001207008, intron 12 of 31) intron (NM_001207008, intron 12 of 31) 66345 NM_001129895 100128124 Hs.448059 NM_001129895 HGC6.3 - uncharacterized LOC100128124 protein-coding 276.666-25 chr4 147922865 147923168 + 2 NA intron (NM_024605, intron 13 of 22) L2b|LINE|L2 140421 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 511 chr2 98486875 98487154 + 2 NA intron (NM_001351428, intron 1 of 24) intron (NM_001351428, intron 1 of 24) 41004 NM_001351427 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 432.666-3 chr6 38449804 38450244 + 2 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) L1MA8|LINE|L1 -31572 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 337.333-38 chr6 20793305 20793566 + 2 NA intron (NM_017774, intron 8 of 15) intron (NM_017774, intron 8 of 15) 258978 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 312.334-2 chr1 107711246 107711477 + 2 NA intron (NM_006113, intron 15 of 26) MER68B|LTR|ERVL -22862 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 289.667 chr1 200650229 200650478 + 2 NA intron (NM_001320182, intron 2 of 4) intron (NM_001320182, intron 2 of 4) 16398 NM_001320182 83479 Hs.497332 NM_031306 ENSG00000118197 DDX59 OFD5|ZNHIT5 DEAD-box helicase 59 protein-coding 311.333-14 chr12 116901813 116902052 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -9018 NM_153348 26259 Hs.624537 NM_012174 ENSG00000174989 FBXW8 FBW6|FBW8|FBX29|FBXO29|FBXW6 F-box and WD repeat domain containing 8 protein-coding 306.333-39 chr7 70260930 70261091 + 2 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) AluSc8|SINE|Alu 662535 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 283.667-12 chr18 9342502 9342701 + 2 NA intron (NM_020648, intron 2 of 4) intron (NM_020648, intron 2 of 4) 7828 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 264.667-52 chr3 60054356 60054539 + 2 NA intron (NM_001320901, intron 2 of 6) intron (NM_001320901, intron 2 of 6) 26462 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 357.333-6 chr15 98569851 98570272 + 2 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -55725 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 304-8 chr1 238500646 238500876 + 2 NA Intergenic Intergenic -14744 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 310-29 chr2 107964355 107964606 + 2 NA Intergenic Intergenic -22044 NM_001305006 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 458-10 chr8 126921567 126921915 + 2 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -91413 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 308.666 chr1 63557926 63558180 + 2 NA intron (NM_032437, intron 10 of 13) intron (NM_032437, intron 10 of 13) 9073 NR_002771 79469 Hs.659291 NR_002771 DLEU2L BCMSUNL deleted in lymphocytic leukemia 2 like ncRNA 317-6 chr11 33058688 33058904 + 2 NA intron (NM_001145541, intron 5 of 9) FLAM_C|SINE|Alu -17354 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 308-11 chr11 31210786 31210993 + 2 NA intron (NM_001367979, intron 9 of 38) MIR|SINE|MIR 158850 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 440-4 chr14 49946602 49947053 + 2 NA Intergenic Intergenic -19572 NR_106724 102464828 NR_106724 ENSG00000278038 MIR6076 hsa-mir-6076 microRNA 6076 ncRNA 344-45 chr8 83992654 83993001 + 2 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -189960 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 200.333-140 chr7 38948939 38949094 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -28893 NM_007252 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 583.666-2 chr5 105236063 105236566 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 136840 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 290.667-5 chr1 199902979 199903142 + 2 NA Intergenic Intergenic -124650 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 317-21 chr4 93786078 93786341 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -42544 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 280-40 chr4 33100653 33100803 + 2 NA Intergenic Intergenic 749690 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 328 chr1 242724069 242724375 + 2 NA Intergenic Intergenic -199525 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 329.667-2 chr1 159740211 159740421 + 2 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -25727 NM_001329058 1401 Hs.76452 NM_000567 ENSG00000132693 CRP PTX1 C-reactive protein protein-coding 322.334 chr11 38240426 38240666 + 2 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 301945 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 443-4 chr14 95395106 95395451 + 2 NA Intergenic Intergenic 65694 NR_110127 101929080 Hs.525567 NR_110127 ENSG00000258630 LINC02292 - long intergenic non-protein coding RNA 2292 ncRNA 366-26 chr8 137749312 137749530 + 2 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 334124 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 214.333-111 chr4 181549991 181550228 + 2 NA Intergenic Intergenic 279864 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 280.666-19 chr4 93082771 93082942 + 2 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) -745897 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 300.334-5 chr16 47340772 47341001 + 2 NA intron (NM_030790, intron 8 of 17) L1MB4|LINE|L1 120177 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 320-12 chr13 45527196 45527418 + 2 NA intron (NM_031431, intron 20 of 22) intron (NM_031431, intron 20 of 22) 62368 NM_031431 83548 Hs.507948 NM_031431 ENSG00000136152 COG3 SEC34 component of oligomeric golgi complex 3 protein-coding 261-55 chr8 31977137 31977359 + 2 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -48488 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 504.666-8 chr8 132793448 132793880 + 2 NA intron (NM_198513, intron 2 of 7) intron (NM_198513, intron 2 of 7) 18276 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 336-33 chr8 123518332 123518554 + 2 NA intron (NM_148177, intron 1 of 5) intron (NM_148177, intron 1 of 5) 13700 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 468.667-7 chrX 81571405 81571735 + 2 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 369468 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 207.667-9 chr1 239306937 239307118 + 2 NA Intergenic Intergenic -79541 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 647.332 chr3 27065605 27066013 + 2 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 150714 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 235.333-108 chr6 141256372 141256620 + 2 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 572682 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 291-2 chr1 109078152 109078325 + 2 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -2235 NM_005645 6884 Hs.632426 NM_005645 ENSG00000197780 TAF13 MRT60|TAF(II)18|TAF2K|TAFII-18|TAFII18 TATA-box binding protein associated factor 13 protein-coding 287-11 chr15 48414112 48414357 + 2 NA intron (NM_000138, intron 64 of 65) intron (NM_000138, intron 64 of 65) 82037 NM_001948 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 297-18 chr12 55245937 55246201 + 2 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? -1219 NM_001005490 254783 Hs.554556 NM_001005490 ENSG00000197706 OR6C74 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 74 protein-coding 325-10 chr14 77632536 77632746 + 2 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -15874 NM_004863 9517 Hs.435661 NM_004863 ENSG00000100596 SPTLC2 HSN1C|LCB2|LCB2A|NSAN1C|SPT2|hLCB2a serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2 protein-coding 286-16 chr14 62691769 62691967 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 353590 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 458-8 chr8 91344581 91344904 + 2 NA intron (NM_134266, intron 9 of 18) intron (NM_134266, intron 9 of 18) 95423 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 176.333-66 chr17 67083127 67083326 + 2 NA intron (NM_001330447, intron 32 of 32) intron (NM_001330447, intron 32 of 32) 38672 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 225.667-86 chr9 125539262 125539428 + 2 NA intron (NM_001006618, intron 7 of 7) intron (NM_001006618, intron 7 of 7) 167863 NM_001006617 79109 Hs.495138 NM_024117 ENSG00000119487 MAPKAP1 JC310|MIP1|SIN1|SIN1b|SIN1g MAPK associated protein 1 protein-coding 306-52 chr7 79463450 79463685 + 2 NA non-coding (NR_038343, exon 4 of 4) non-coding (NR_038343, exon 4 of 4) 9607 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 297-26 chr16 64813869 64814095 + 2 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 308081 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 405.667-2 chr14 72667652 72667974 + 2 NA intron (NM_001280544, intron 9 of 9) intron (NM_001280544, intron 9 of 9) 150993 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 303.334-7 chr3 73523303 73523544 + 2 NA intron (NR_121660, intron 1 of 1) intron (NR_121660, intron 1 of 1) 2101 NR_121660 101927296 Hs.662049 NR_121660 LOC101927296 - uncharacterized LOC101927296 ncRNA 341-15 chr20 48048385 48048687 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -58419 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 328-26 chr3 105550782 105550999 + 2 NA intron (NM_001243280, intron 12 of 14) intron (NM_001243280, intron 12 of 14) 183981 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 317.333-35 chr6 80882437 80882607 + 2 NA Intergenic Intergenic 775851 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 318.666-17 chr4 62501443 62501730 + 2 NA Intergenic Intergenic -339821 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 276-60 chr7 52088989 52089185 + 2 NA Intergenic Intergenic -695831 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 347.333-8 chr17 60622311 60622672 + 2 NA intron (NM_003620, intron 1 of 5) intron (NM_003620, intron 1 of 5) 22308 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 283-9 chr12 55015546 55015729 + 2 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -4337 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 486-2 chr1 104065671 104066125 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -7125 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 230.667-6 chr1 227324890 227325134 + 2 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -6520 NM_001366019 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 191.333-139 chr4 2707219 2707362 + 2 NA intron (NM_001256668, intron 17 of 19) L1MC4|LINE|L1 49046 NM_001161527 79155 Hs.368551 NM_024309 ENSG00000168884 TNIP2 ABIN2|FLIP1|KLIP TNFAIP3 interacting protein 2 protein-coding 326-42 chr7 4557158 4557370 + 2 NA Intergenic Intergenic -125031 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 462.666-3 chr12 68253929 68254203 + 2 NA promoter-TSS (NM_020525) promoter-TSS (NM_020525) -462 NM_020525 50616 Hs.287369 NM_020525 ENSG00000127318 IL22 IL-21|IL-22|IL-D110|IL-TIF|ILTIF|TIFIL-23|TIFa|zcyto18 interleukin 22 protein-coding 295.333-40 chr3 162754333 162754625 + 2 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 548822 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 392-24 chr8 134691694 134692051 + 2 NA intron (NM_001289394, intron 1 of 16) intron (NM_001289394, intron 1 of 16) 4683 NM_001174158 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 358-5 chr12 63353919 63354291 + 2 NA Intergenic Intergenic -201295 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 226.666-11 chr13 87156685 87156908 + 2 NA Intergenic Intergenic 244876 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 272-46 chr7 24533479 24533669 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -39878 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 379.334-7 chr4 92230995 92231365 + 2 NA Intergenic Intergenic 46122 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 339.333-26 chr2 150710688 150710950 + 2 NA Intergenic Intergenic 81922 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 326-37 chr6 38768826 38769058 + 2 NA intron (NM_001371, intron 10 of 91) L1MEh|LINE|L1 53631 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 285-21 chr3 117910481 117910641 + 2 NA Intergenic Intergenic -219636 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 310.667-14 chr16 30592680 30592839 + 2 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -7062 NM_152458 146540 Hs.513509 NM_152458 ENSG00000197162 ZNF785 ZNF688 zinc finger protein 785 protein-coding 604.334 chr3 30832741 30833195 + 2 NA intron (NM_207359, intron 11 of 14) intron (NM_207359, intron 11 of 14) 61693 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 327.333-23 chr2 171375788 171376079 + 2 NA intron (NM_001321158, intron 1 of 8) HAL1b|LINE|L1 58057 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 292-17 chr14 88074945 88075141 + 2 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) L1MC1|LINE|L1 -48731 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 451.666-2 chr15 48407654 48408003 + 2 NA TTS (NM_000138) TTS (NM_000138) 75631 NM_001948 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 619.333 chr4 173295620 173296218 + 2 NA intron (NM_017423, intron 5 of 11) intron (NM_017423, intron 5 of 11) 27759 NR_036093 100422849 NR_036093 ENSG00000221296 MIR548T - microRNA 548t ncRNA 186-63 chr3 88032329 88032509 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 26577 NM_003663 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 298-37 chr18 57649751 57650026 + 2 NA intron (NM_005603, intron 27 of 27) intron (NM_005603, intron 27 of 27) 19557 NM_001242804 100505549 Hs.660645 NM_001242804 LOC100505549 - uncharacterized LOC100505549 protein-coding 503.332 chr4 119098143 119098586 + 2 NA Intergenic Intergenic -37420 NM_016599 51778 Hs.732122 NM_016599 ENSG00000172399 MYOZ2 C4orf5|CMH16|CS-1|FATZ-2 myozenin 2 protein-coding 279.333-10 chr10 51064470 51064667 + 2 NA intron (NR_120678, intron 1 of 1) intron (NR_120678, intron 1 of 1) 3984 NR_120678 102724719 NR_120678 ENSG00000223502 LOC102724719 - uncharacterized LOC102724719 ncRNA 331.333-40 chr5 126810221 126810422 + 2 NA exon (NM_001198557, exon 4 of 11) exon (NM_001198557, exon 4 of 11) 33185 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 288-47 chr6 103188252 103188450 + 2 NA Intergenic Intergenic 1671195 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 309.333-52 chr5 20134978 20135199 + 2 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L1MC3|LINE|L1 -146888 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 365-17 chr3 41671488 41671770 + 2 NA intron (NR_136342, intron 27 of 34) L1MA4A|LINE|L1 290474 NM_001322501 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 548.999 chr8 36537832 36538307 + 2 NA Intergenic Intergenic -246305 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 323-2 chr1 158541817 158542005 + 2 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 6194 NM_001005189 391112 Hs.553780 NM_001005189 ENSG00000197532 OR6Y1 OR1-11|OR6Y2 olfactory receptor family 6 subfamily Y member 1 protein-coding 355.334-4 chr12 95938598 95938991 + 2 NA intron (NM_182496, intron 1 of 15) intron (NM_182496, intron 1 of 15) 3820 NM_182496 120935 Hs.210377 NM_182496 ENSG00000165972 CCDC38 - coiled-coil domain containing 38 protein-coding 319-10 chr19 14499840 14500116 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3829 NM_202494 10755 Hs.655012 NM_005716 ENSG00000123159 GIPC1 C19orf3|GIPC|GLUT1CBP|Hs.6454|IIP-1|NIP|RGS19IP1|SEMCAP|SYNECTIIN|SYNECTIN|TIP-2 GIPC PDZ domain containing family member 1 protein-coding 230.667-96 chrX 136357359 136357516 + 2 NA intron (NM_153834, intron 9 of 25) MIRc|SINE|MIR 56474 NM_153834 139378 Hs.381354 NM_153834 ENSG00000156920 ADGRG4 GPR112|PGR17|RP1-299I16 adhesion G protein-coupled receptor G4 protein-coding 310-30 chr2 118706390 118706589 + 2 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -103523 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 348.667-14 chr20 47607475 47607725 + 2 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) MER34C|LTR|ERV1 105713 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 231-2 chr1 88950036 88950219 + 2 NA intron (NM_001008661, intron 10 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 42502 NM_001008661 56267 Hs.481898 NM_001008661 ENSG00000137944 KYAT3 CCBL2|KAT3|KATIII kynurenine aminotransferase 3 protein-coding 638.666 chr2 75925386 75926082 + 2 NA Intergenic Intergenic -214819 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 305-5 chr14 100092057 100092314 + 2 NA intron (NM_001330221, intron 2 of 13) AluJo|SINE|Alu 17329 NR_039601 100616247 NR_039601 ENSG00000265154 MIR151B - microRNA 151b ncRNA 525.333-4 chr8 83117790 83118241 + 2 NA Intergenic Intergenic 205911 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 336.333-11 chr10 92213935 92214277 + 2 NA intron (NM_001178137, intron 2 of 9) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 29173 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 258-47 chr3 161731531 161731782 + 2 NA Intergenic Intergenic 234848 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 324-13 chr2 79265100 79265385 + 2 NA Intergenic Intergenic -105489 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 276-40 chr21 22335600 22335762 + 2 NA Intergenic Intergenic 237064 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 318-39 chr3 105291519 105291776 + 2 NA Intergenic Intergenic -75066 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 299.666-20 chr8 119444355 119444644 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 28053 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 378-10 chr2 13066280 13066478 + 2 NA Intergenic Intergenic -59366 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 305-29 chr7 36701619 36701787 + 2 NA intron (NM_001637, intron 1 of 20) L1M4a1|LINE|L1 22791 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 264.666-10 chr11 98820124 98820289 + 2 NA Intergenic Intergenic -200743 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 462-3 chr10 87948441 87949078 + 2 NA intron (NM_001304718, intron 5 of 8) AluSz|SINE|Alu 85134 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 455-8 chr4 134476961 134477254 + 2 NA intron (NR_147155, intron 3 of 3) L1ME3|LINE|L1 53239 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 363.333-5 chr12 10775095 10775466 + 2 NA intron (NR_120463, intron 4 of 6) AluJo|SINE|Alu 25046 NR_120463 101928162 Hs.112950 NR_120463 ENSG00000256888 LINC02366 - long intergenic non-protein coding RNA 2366 ncRNA 411.666 chr12 14434655 14435173 + 2 NA intron (NM_181352, intron 3 of 14) AluJr|SINE|Alu 49633 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 464 chr10 18510889 18511162 + 2 NA intron (NM_201597, intron 6 of 13) intron (NM_201597, intron 6 of 13) 110450 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 362-10 chr14 55226601 55226892 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -35161 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 316.667-25 chr4 124512887 124513169 + 2 NA intron (NR_110838, intron 7 of 8) intron (NR_110838, intron 7 of 8) 45406 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 336.999-2 chr4 44685389 44685716 + 2 NA intron (NM_001345869, intron 5 of 15) MIRc|SINE|MIR 7132 NM_021927 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 399.333-7 chr11 6919449 6919797 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -1379 NM_001004684 120775 Hs.446766 NM_001004684 ENSG00000178358 OR2D3 OR11-89 olfactory receptor family 2 subfamily D member 3 protein-coding 343.667-11 chr5 44436532 44436772 + 2 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger -47232 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 501.333-5 chr20 55635675 55636050 + 2 NA Intergenic Intergenic -208665 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 280.334-3 chr1 178574589 178574758 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 31877 NR_033186 400798 Hs.668085 NM_207467 ENSG00000213057 C1orf220 - chromosome 1 open reading frame 220 (putative) ncRNA 349.667-22 chr7 31194936 31195364 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 142689 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 486-12 chr8 82271646 82272000 + 2 NA Intergenic Intergenic -429537 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 312-19 chr16 63418843 63419043 + 2 NA Intergenic Intergenic -1382505 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 328-18 chr2 67687233 67687575 + 2 NA Intergenic Intergenic 138158 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 319.333-33 chr7 22755648 22755855 + 2 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -28131 NR_131935 541472 Hs.512234 NR_131935 ENSG00000179428 LOC541472 - uncharacterized LOC541472 ncRNA 280-49 chr6 69380728 69380941 + 2 NA intron (NM_001704, intron 30 of 31) L2c|LINE|L2 415632 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 790.666 chr4 30436053 30436618 + 2 NA Intergenic Intergenic -284034 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 430-8 chr8 90315830 90316244 + 2 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) LTR82B|LTR|ERVL 94549 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 384.333-2 chr1 152015357 152015670 + 2 NA Intergenic Intergenic -2765 NR_103561 441908 Hs.656557 NR_103561 NBPF18P - NBPF member 18, pseudogene pseudo 308.667-3 chr1 154258662 154258818 + 2 NA promoter-TSS (NR_145714) promoter-TSS (NR_145714) -987 NR_145714 109617023 NR_145714 ENSG00000201129 SNORA58B - small nucleolar RNA, H/ACA box 58B snoRNA 254-60 chr4 149892435 149892619 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -76684 NM_001363507 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 309.333-46 chr3 81608628 81608900 + 2 NA intron (NM_000158, intron 7 of 15) MIRb|SINE|MIR 152881 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 198.333-82 chr17 65044434 65044690 + 2 NA intron (NM_006572, intron 2 of 3) FLAM_C|SINE|Alu 11212 NM_001282425 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 302-19 chr16 1839215 1839411 + 2 NA exon (NM_152764, exon 12 of 13) exon (NM_152764, exon 12 of 13) 12089 NM_001018104 81889 Hs.513265 NM_031208 ENSG00000180185 FAHD1 C16orf36|YISKL fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1 protein-coding 338-20 chr22 19079790 19079970 + 2 NA intron (NR_033674, intron 1 of 8) intron (NR_033674, intron 1 of 8) -31505 NR_024157 25786 Hs.720269 NR_024157 ENSG00000273311 DGCR11 DGS-D DiGeorge syndrome critical region gene 11 ncRNA 266-43 chr2 86694917 86695099 + 2 NA intron (NM_001198954, intron 1 of 7) LTR10A|LTR|ERV1 -25283 NM_022780 64795 Hs.75277 NM_022780 ENSG00000153561 RMND5A CTLH|GID2|GID2A|RMD5|p44CTLH required for meiotic nuclear division 5 homolog A protein-coding 457.999 chr1 6933995 6934363 + 2 NA intron (NM_001349608, intron 2 of 21) intron (NM_001349608, intron 2 of 21) 148725 NR_146204 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 322-43 chr7 68757966 68758189 + 2 NA Intergenic (AAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 737824 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 383.333-5 chr15 72894579 72894813 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -110938 NM_001365228 83440 Hs.562587 NM_031284 ENSG00000159322 ADPGK 2610017G09Rik|ADP-GK ADP dependent glucokinase protein-coding 244-43 chr17 58821040 58821187 + 2 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 65244 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 497.333 chr10 61789822 61790229 + 2 NA Intergenic Intergenic -111674 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 358.333-33 chr9 70823795 70824147 + 2 NA intron (NM_001366152, intron 6 of 27) intron (NM_001366152, intron 6 of 27) -13887 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 265.667-7 chr10 58753830 58754027 + 2 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) intron (NM_001080512, intron 3 of 20) 38913 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 259-53 chr8 137712294 137712533 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -298825 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 307-9 chr13 103612361 103612626 + 2 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 187293 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 268-19 chr14 52465784 52466004 + 2 NA intron (NM_001160047, intron 16 of 20) L1ME2z|LINE|L1 86611 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 291-23 chr2 61720346 61720567 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 133604 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 328.333-19 chr2 64656928 64657239 + 2 NA Intergenic Intergenic -3170 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 313.667 chr1 26086799 26087051 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -19291 NM_032588 84676 Hs.279709 NM_032588 ENSG00000158022 TRIM63 IRF|MURF1|MURF2|RNF28|SMRZ tripartite motif containing 63 protein-coding 305-17 chr5 9102679 9102979 + 2 NA intron (NM_003966, intron 16 of 22) intron (NM_003966, intron 16 of 22) -48934 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 220-48 chr17 60393109 60393254 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -1048 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 286.333-48 chr9 27382680 27382940 + 2 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -85660 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 371-12 chr2 222347242 222347578 + 2 NA intron (NR_136642, intron 2 of 3) intron (NR_136642, intron 2 of 3) 26749 NR_136640 440934 Hs.732732 NR_136638 ENSG00000237732 CT75 - cancer/testis associated transcript 75 ncRNA 479.999 chr12 26366323 26366723 + 2 NA intron (NM_002223, intron 55 of 56) intron (NM_002223, intron 55 of 56) 170950 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 351.666-15 chr6 126192872 126193264 + 2 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -146721 NM_001286525 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 318.666-19 chr6 72403732 72404012 + 2 NA TTS (NM_001168407) TTS (NM_001168407) 37126 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 278.333-32 chr3 97975427 97975732 + 2 NA Intergenic Intergenic -3128 NM_001042533 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 310.666-19 chr5 92408308 92408524 + 2 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -1025099 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 317.333-20 chr19 57531190 57531397 + 2 NA intron (NM_001199295, intron 2 of 3) intron (NM_001199295, intron 2 of 3) 3937 NM_001199295 256051 Hs.744289 NM_153263 ENSG00000121406 ZNF549 - zinc finger protein 549 protein-coding 365-8 chr14 54453427 54453751 + 2 NA Intergenic Intergenic -12215 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 404-7 chr2 19523754 19524011 + 2 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -165259 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 346-14 chr19 51466214 51466480 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -7893 NM_001363548 27181 Hs.447899 NM_014442 ENSG00000105366 SIGLEC8 SAF2|SIGLEC-8|SIGLEC8L sialic acid binding Ig like lectin 8 protein-coding 342-26 chr4 61827634 61827817 + 2 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 334040 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 388-21 chr8 64589699 64589900 + 2 NA intron (NM_001324112, intron 6 of 6) intron (NM_001324112, intron 6 of 6) -7907 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 462-9 chr16 83279932 83280211 + 2 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -228275 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 306.666-32 chr6 98721861 98722075 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 109732 NR_148381 105447646 Hs.211213 NR_148381 PNKY - long intergenic non-protein coding RNA PNKY ncRNA 295.667-3 chr10 74070119 74070280 + 2 NA intron (NM_014000, intron 2 of 21) intron (NM_014000, intron 2 of 21) 72083 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 523.333-3 chr13 106618647 106619021 + 2 NA intron (NR_051977, intron 1 of 3) intron (NR_051977, intron 1 of 3) 1024 NR_051977 283483 Hs.651365 NR_051977 ENSG00000272274 LINC00551 - long intergenic non-protein coding RNA 551 ncRNA 317-25 chr8 134329612 134329795 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -268368 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 280-18 chr18 66528061 66528256 + 2 NA intron (NR_073130, intron 9 of 11) intron (NR_073130, intron 9 of 11) 75932 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 379.333-12 chr8 82774757 82775226 + 2 NA Intergenic Intergenic -137113 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 297.667-13 chr15 60446990 60447369 + 2 NA intron (NR_147171, intron 11 of 16) intron (NR_147171, intron 11 of 16) 31963 NM_024611 79664 Hs.200943 NM_024611 ENSG00000128915 ICE2 BRCC1|NARG2 interactor of little elongation complex ELL subunit 2 protein-coding 290-26 chr2 208310621 208310810 + 2 NA intron (NM_015040, intron 12 of 41) L1MC5a|LINE|L1 44448 NM_152671 200576 Hs.744997 NM_015040 ENSG00000115020 PIKFYVE CFD|FAB1|HEL37|PIP5K|PIP5K3|ZFYVE29 phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing protein-coding 248.666-12 chr12 51261973 51262221 + 2 NA intron (NM_001031628, intron 2 of 3) intron (NM_001031628, intron 2 of 3) 8113 NM_001033873 57228 Hs.652389 NM_001031628 ENSG00000170545 SMAGP hSMAGP small cell adhesion glycoprotein protein-coding 415.001-2 chr20 45252697 45253153 + 2 NA intron (NM_003064, intron 3 of 3) intron (NM_003064, intron 3 of 3) 1639 NM_003064 6590 Hs.517070 NM_003064 ENSG00000124107 SLPI ALK1|ALP|BLPI|HUSI|HUSI-I|MPI|WAP4|WFDC4 secretory leukocyte peptidase inhibitor protein-coding 287-5 chr1 217612557 217612813 + 2 NA intron (NM_001297754, intron 3 of 5) intron (NM_001297754, intron 3 of 5) 18405 NM_001297754 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 410-11 chr21 28113801 28114148 + 2 NA intron (NR_126010, intron 2 of 4) intron (NR_126010, intron 2 of 4) 23571 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 268.666-6 chr11 46165893 46166047 + 2 NA Intergenic Intergenic -5985 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 292-13 chr14 55668905 55669200 + 2 NA intron (NR_073129, intron 35 of 45) intron (NR_073129, intron 35 of 45) 88845 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 450.666-2 chr3 102706563 102706986 + 2 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 271759 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 373-13 chr4 63001092 63001379 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -839470 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 499-4 chr2 202696282 202696611 + 2 NA intron (NM_173511, intron 2 of 7) MER30|DNA|hAT-Charlie 61477 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 487.667 chr6 55822583 55822846 + 2 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) intron (NM_001329754, intron 1 of 5) 52876 NM_001329754 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 245-30 chr18 67382518 67382706 + 2 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -133934 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 371.999-5 chr9 3283472 3283764 + 2 NA intron (NM_134428, intron 8 of 17) intron (NM_134428, intron 8 of 17) 102029 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 407.667-7 chr16 8404548 8404950 + 2 NA Intergenic Intergenic 185089 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 352-12 chr17 31927281 31927589 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -9572 NM_001321207 23512 Hs.462732 NM_015355 ENSG00000178691 SUZ12 CHET9|JJAZ1 SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit protein-coding 448-5 chr5 79223619 79223925 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12359 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 296.667-31 chr2 170163937 170164106 + 2 NA Intergenic Intergenic -14126 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 299-2 chr1 70300135 70300405 + 2 NA intron (NM_030816, intron 7 of 12) intron (NM_030816, intron 7 of 12) 54452 NM_030816 81573 Hs.744989 NM_030816 ENSG00000118454 ANKRD13C dJ677H15.3 ankyrin repeat domain 13C protein-coding 498.334-3 chr9 73411787 73412378 + 2 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 260217 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 459-8 chr5 64401578 64401966 + 2 NA Intergenic Intergenic -104243 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 315.333-51 chr8 51674908 51675095 + 2 NA intron (NM_144651, intron 1 of 22) intron (NM_144651, intron 1 of 22) 134444 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 322.334-2 chr11 48650472 48650676 + 2 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 161781 NM_001005512 403253 Hs.554532 NM_001005512 ENSG00000237388 OR4A47 OR11-113 olfactory receptor family 4 subfamily A member 47 protein-coding 296.666-24 chr4 43899376 43899653 + 2 NA Intergenic Intergenic -117347 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 406-11 chr3 172303040 172303338 + 2 NA intron (NM_001135095, intron 9 of 25) intron (NM_001135095, intron 9 of 25) 145267 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 425.667-8 chr5 75946174 75946511 + 2 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -137041 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 372-5 chr11 43533896 43534201 + 2 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -25608 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 264-44 chr5 145953296 145953502 + 2 NA intron (NM_152550, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 16821 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 314-4 chr11 72539705 72539881 + 2 NA Intergenic Intergenic -30863 NR_126364 101928555 Hs.376950 NR_126364 ENSG00000227467 LINC01537 - long intergenic non-protein coding RNA 1537 ncRNA 487.666-4 chr3 39120361 39120741 + 2 NA intron (NR_159494, intron 8 of 28) intron (NR_159494, intron 8 of 28) -12188 NM_031899 64689 Hs.721946 NM_031899 ENSG00000114745 GORASP1 GOLPH5|GRASP65|P65 golgi reassembly stacking protein 1 protein-coding 419.333-6 chr2 134688560 134689022 + 2 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 30209 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 387.334-3 chr14 99372532 99372815 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -100476 NM_138576 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 362-9 chr14 20135547 20135799 + 2 NA Intergenic Intergenic -8063 NM_001004724 390437 Hs.553766 NM_001004724 ENSG00000184394 OR4N5 - olfactory receptor family 4 subfamily N member 5 protein-coding 300.666-4 chr14 80444641 80444966 + 2 NA intron (NR_038355, intron 8 of 8) intron (NR_038355, intron 8 of 8) -213746 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 437.333-7 chr2 28689460 28689787 + 2 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 46582 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 370.667-22 chr5 150503883 150504257 + 2 NA intron (NM_001301063, intron 1 of 13) intron (NM_001301063, intron 1 of 13) -4061 NM_001543 3340 Hs.222055 NM_001543 ENSG00000070614 NDST1 HSST|MRT46|NST1 N-deacetylase and N-sulfotransferase 1 protein-coding 295.334-4 chr4 188690656 188690926 + 2 NA Intergenic Intergenic -85866 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 340-5 chr10 32679782 32680083 + 2 NA intron (NM_001321115, intron 22 of 43) MER76-int|LTR|ERVL 221540 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 359-13 chr5 27659447 27659745 + 2 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 187304 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 321.333-3 chr1 78543733 78543943 + 2 NA Intergenic LTR3B_|LTR|ERVK 52864 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 346-24 chr3 114968355 114968659 + 2 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) intron (NM_001348805, intron 3 of 10) -67882 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 310.667-30 chr4 42855593 42855813 + 2 NA Intergenic Intergenic -37563 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 361.334-4 chr3 134219373 134219753 + 2 NA intron (NM_001005861, intron 2 of 14) intron (NM_001005861, intron 2 of 14) 31181 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 233-4 chr1 83877559 83877781 + 2 NA intron (NM_001350215, intron 19 of 19) L1ME3B|LINE|L1 -16674 NR_119375 101927587 Hs.621230 NR_119375 ENSG00000233008 LINC01725 - long intergenic non-protein coding RNA 1725 ncRNA 326.333-26 chr6 50009065 50009276 + 2 NA TTS (NM_001037728) TTS (NM_001037728) 12811 NM_001037728 245913 Hs.571093 NM_001037497 ENSG00000203970 DEFB110 DEFB-10|DEFB-11|DEFB111 defensin beta 110 protein-coding 567.333-3 chr7 36428145 36428692 + 2 NA intron (NM_001284302, intron 19 of 22) intron (NM_001284302, intron 19 of 22) -38061 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 289.333-4 chr1 184204465 184204670 + 2 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 152837 NR_125335 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 376-17 chr6 46563738 46564081 + 2 NA intron (NM_016593, intron 10 of 11) intron (NM_016593, intron 10 of 11) -71842 NM_001251973 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 301-40 chr5 19248904 19249061 + 2 NA Intergenic Intergenic 637290 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 330-17 chr17 58882326 58882557 + 2 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) AluSq2|SINE|Alu 126572 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 332-4 chr10 60106108 60106293 + 2 NA intron (NM_001204403, intron 28 of 43) intron (NM_001204403, intron 28 of 43) 34816 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 200.667-147 chr7 83646656 83646791 + 2 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 2416 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 232.666-14 chr14 55019512 55019661 + 2 NA intron (NM_001008396, intron 1 of 24) intron (NM_001008396, intron 1 of 24) 7513 NM_007086 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 438.667-2 chr10 19198019 19198364 + 2 NA intron (NM_001142308, intron 14 of 39) LTR40a|LTR|ERVL 149390 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 233.333-92 chr4 54681650 54681868 + 2 NA intron (NM_000222, intron 1 of 20) AluSx1|SINE|Alu 23831 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 319-11 chr2 29935233 29935472 + 2 NA Intergenic Intergenic -13766 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 303.333-49 chr22 46772732 46772942 + 2 NA intron (NR_104292, intron 2 of 13) AluSc|SINE|Alu -1090 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 548.333-3 chr6 148704746 148705358 + 2 NA Intergenic Intergenic -41978 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 332.666-23 chr5 10906302 10906591 + 2 NA Intergenic Intergenic -145212 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 306.667-14 chr16 35584555 35584718 + 2 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -77466 NR_034019 100130700 Hs.97712 NR_034018 TP53TG3HP - TP53 target 3 family member H, pseudogene pseudo 209.667-74 chr20 36703155 36703324 + 2 NA intron (NM_022477, intron 2 of 14) intron (NM_022477, intron 2 of 14) 42851 NM_022477 57446 Hs.437338 NM_022477 ENSG00000101079 NDRG3 - NDRG family member 3 protein-coding 295.667-18 chr4 40160178 40160357 + 2 NA Intergenic Intergenic -30813 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 137-29 chr15 47712677 47712865 + 2 NA intron (NM_001198999, intron 4 of 19) intron (NM_001198999, intron 4 of 19) -4734 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 297.333-41 chr3 193642973 193643156 + 2 NA intron (NM_130831, intron 10 of 27) intron (NM_130831, intron 10 of 27) -15732 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 391.333-10 chr19 28566373 28566639 + 2 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) FLAM_C|SINE|Alu -40182 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 260.333-36 chr3 3196465 3196721 + 2 NA Intergenic Intergenic -16876 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 314.333-20 chr4 44294595 44294789 + 2 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 154117 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 542.666 chr1 146024992 146025503 + 2 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -3425 NM_213653 148738 Hs.632436 NM_145277 ENSG00000168509 HJV HFE2|HFE2A|JH|RGMC hemojuvelin BMP co-receptor protein-coding 451.667-7 chr8 117927217 117927571 + 2 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -6481 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 359.667-8 chr4 37736926 37737309 + 2 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -50741 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 209.333-58 chr14 52321775 52321952 + 2 NA intron (NM_000956, intron 1 of 1) intron (NM_000956, intron 1 of 1) 7551 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 508-3 chr2 72744988 72745556 + 2 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) AluJr|SINE|Alu 80761 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 295-48 chr8 117908085 117908342 + 2 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 12700 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 306-26 chr2 187602448 187602744 + 2 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -48091 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 496-5 chr5 37799956 37800438 + 2 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 34625 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 300-70 chr8 139470759 139471016 + 2 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 232236 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 191.667-113 chr6 155914516 155914770 + 2 NA Intergenic Intergenic -32154 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 188-112 chr8 90198409 90198589 + 2 NA Intergenic Intergenic -22989 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 360.667-15 chr7 115763664 115763947 + 2 NA Intergenic Intergenic -182364 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 332-23 chr3 3507982 3508275 + 2 NA Intergenic Intergenic -291303 NM_001324189 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 236.667-35 chr19 29284156 29284326 + 2 NA Intergenic Intergenic -71090 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 506.333-4 chr5 126366945 126367290 + 2 NA intron (NM_001146319, intron 1 of 13) AluSx|SINE|Alu 6997 NM_001146319 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 265.334 chr1 16334484 16334722 + 2 NA intron (NM_018994, intron 1 of 9) intron (NM_018994, intron 1 of 9) 17877 NM_018994 54455 Hs.522384 NM_018994 ENSG00000037637 FBXO42 Fbx42|JFK F-box protein 42 protein-coding 374.667-8 chr2 72723689 72724038 + 2 NA intron (NR_135774, intron 5 of 19) L1MEc|LINE|L1 102170 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 424.333 chr14 53442167 53442622 + 2 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 289040 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 344.666-20 chr4 70810001 70810320 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 29343 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 293.334-5 chr5 81264197 81264357 + 2 NA intron (NM_001099735, intron 9 of 9) intron (NM_001099735, intron 9 of 9) 30955 NM_001099735 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 314-13 chr14 88403156 88403346 + 2 NA intron (NM_001040428, intron 3 of 10) L1MA9|LINE|L1 17594 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 312.667-5 chr1 184266709 184266927 + 2 NA Intergenic X6A_LINE|LINE|CR1 -120211 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 280-14 chr14 74795394 74795639 + 2 NA intron (NM_019589, intron 4 of 20) intron (NM_019589, intron 4 of 20) 32200 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 421.999-2 chr12 28215689 28216074 + 2 NA intron (NM_001352080, intron 2 of 13) intron (NM_001352080, intron 2 of 13) -25143 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 578.001-2 chr8 81274424 81274758 + 2 NA Intergenic Intergenic -5945 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 346.333-17 chr2 78064883 78065174 + 2 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -23702 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 399.333-16 chr8 112733683 112734098 + 2 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) MIR|SINE|MIR 90397 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 422.334-2 chr5 90708517 90708779 + 2 NA intron (NR_003149, intron 38 of 89) intron (NR_003149, intron 38 of 89) 149851 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 461.666-3 chr2 212561178 212561557 + 2 NA Intergenic Intergenic -22565 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 312.667-30 chr5 38501830 38502006 + 2 NA intron (NM_001127671, intron 11 of 19) intron (NM_001127671, intron 11 of 19) 54728 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 285.667-27 chr2 180491447 180491696 + 2 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -200533 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 425-2 chr18 8107154 8107484 + 2 NA intron (NM_002845, intron 11 of 30) intron (NM_002845, intron 11 of 30) 259715 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 520.666-3 chr17 53535666 53536225 + 2 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -286982 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 379.333-11 chr6 114940107 114940314 + 2 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 703625 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 426-5 chr12 20011707 20012212 + 2 NA Intergenic Intergenic -2726 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 324.667-6 chr11 86987322 86987509 + 2 NA intron (NR_038905, intron 2 of 2) AluSg|SINE|Alu 31794 NR_038905 100506368 Hs.559920 NR_038905 ENSG00000246523 FZD4-DT - FZD4 divergent transcript ncRNA 376-18 chr7 71301619 71301955 + 2 NA intron (NM_022479, intron 1 of 10) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -5887 NR_037479 100500920 NR_037479 ENSG00000283278 MIR3914-2 - microRNA 3914-2 ncRNA 321.333-25 chr14 70078718 70078929 + 2 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) 1394 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 282-23 chr2 43403238 43403457 + 2 NA intron (NM_001083953, intron 28 of 37) intron (NM_001083953, intron 28 of 37) 176136 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 377.333-16 chr5 52892995 52893384 + 2 NA intron (NM_181501, intron 8 of 28) intron (NM_181501, intron 8 of 28) -96163 NR_073103 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 365-14 chr2 174804548 174804810 + 2 NA intron (NM_001025201, intron 11 of 12) L2a|LINE|L2 -40207 NM_001039523 1134 Hs.434479 NM_000079 ENSG00000138435 CHRNA1 ACHRA|ACHRD|CHRNA|CMS1A|CMS1B|CMS2A|FCCMS|SCCMS cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunit protein-coding 500-5 chr5 65097703 65098045 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 328944 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 349.333-27 chr6 102521337 102521779 + 2 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 1122573 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 346.666-10 chr21 28613936 28614428 + 2 NA Intergenic Intergenic 74864 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 341-2 chr1 153699535 153699789 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9869 NR_107050 102466879 NR_107050 ENSG00000274940 MIR8083 hsa-mir-8083 microRNA 8083 ncRNA 323-9 chr11 39599175 39599510 + 2 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 693788 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 321.334-8 chr5 8589310 8589598 + 2 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL 128529 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 497.667 chr2 69375748 69376085 + 2 NA intron (NM_002056, intron 1 of 18) intron (NM_002056, intron 1 of 18) 11311 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 418.334-3 chr6 36076464 36076682 + 2 NA exon (NM_001315, exon 8 of 12) exon (NM_001315, exon 8 of 12) 48765 NM_139013 1432 Hs.485233 NM_001315 ENSG00000112062 MAPK14 CSBP|CSBP1|CSBP2|CSPB1|EXIP|Mxi2|PRKM14|PRKM15|RK|SAPK2A|p38|p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 protein-coding 394.666-8 chr3 20984124 20984489 + 2 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -421420 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 300-6 chr10 33184912 33185122 + 2 NA intron (NM_001244973, intron 15 of 16) intron (NM_001244973, intron 15 of 16) -68210 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 455.667 chr1 62492842 62493274 + 2 NA intron (NM_001367561, intron 40 of 49) intron (NM_001367561, intron 40 of 49) 56009 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 213.333-108 chr2 196703430 196703594 + 2 NA intron (NM_001080539, intron 15 of 27) MIRc|SINE|MIR 9500 NR_034036 100130452 Hs.591625 NR_034036 LOC100130452 - uncharacterized LOC100130452 ncRNA 226-68 chr4 87143832 87144009 + 2 NA Intergenic Intergenic 76348 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 387.667-8 chr2 42486328 42486829 + 2 NA intron (NM_172344, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 7404 NM_133329 170850 Hs.352633 NM_133329 ENSG00000171126 KCNG3 KV10.1|KV6.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 3 protein-coding 283-16 chr18 22517096 22517244 + 2 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? -99255 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 300-55 chr6 48777955 48778252 + 2 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 685150 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 241-46 chr5 169354435 169354582 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -53369 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 294.334-4 chr2 33503677 33503937 + 2 NA intron (NM_001349975, intron 3 of 19) intron (NM_001349975, intron 3 of 19) -10068 NM_015376 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 387.333-7 chr3 53536505 53536769 + 2 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) MER58B|DNA|hAT-Charlie 42026 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 313-9 chr12 19143119 19143409 + 2 NA intron (NM_019012, intron 3 of 25) L1MA9|LINE|L1 13531 NM_019012 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 325-9 chr13 91364429 91364648 + 2 NA Intergenic Intergenic 13224 NR_029508 407048 Hs.24115 NR_029508 ENSG00000283705 MIR92A1 C13orf25|MIR17HG|MIR92-1|MIRH1|MIRHG1|MIRN92-1|MIRN92A-1|MIRN92A1|miRNA92-1|mir-92a-1 microRNA 92a-1 ncRNA 253-71 chr8 87659221 87659379 + 2 NA Intergenic Intergenic 214715 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 264.667-54 chr3 79547461 79547665 + 2 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) 39676 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 475.333-3 chr2 124371234 124371671 + 2 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 346165 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 314.667-7 chr10 82280784 82280971 + 2 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -47957 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 289.333-47 chr5 26766047 26766311 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 272407 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 342.333-23 chr4 96505556 96505773 + 2 NA intron (NR_147149, intron 2 of 3) intron (NR_147149, intron 2 of 3) 194961 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 296-50 chr5 30811760 30811975 + 2 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -381819 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 514-6 chr3 97193637 97194129 + 2 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) L1MA3|LINE|L1 -245724 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 284.667-3 chr1 121589785 121589938 + 2 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 70749 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 296-13 chr11 107720336 107720529 + 2 NA Intergenic Intergenic -8376 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 302.667-24 chr3 121431855 121432059 + 2 NA 3' UTR (NM_199420, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_199420, exon 30 of 30) 114031 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 322-27 chr4 43090331 43090646 + 2 NA Intergenic Intergenic 197222 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 438.666 chr1 51120885 51121165 + 2 NA intron (NM_001136508, intron 3 of 4) L1MA8|LINE|L1 18797 NM_001136508 284546 Hs.176177 NM_001136508 ENSG00000204006 C1orf185 - chromosome 1 open reading frame 185 protein-coding 476.666 chr15 45509697 45510042 + 2 NA intron (NM_001321036, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu -1267 NR_022014 283651 Hs.574240 NM_173609 HMGN2P46 C15orf21|D-PCa-2 high mobility group nucleosomal binding domain 2 pseudogene 46 pseudo 399.667-8 chr5 75411753 75412096 + 2 NA intron (NM_031361, intron 7 of 16) intron (NM_031361, intron 7 of 16) 74704 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 348-10 chr15 60891553 60891798 + 2 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 210106 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 588-2 chr4 112963172 112963503 + 2 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) -86077 NM_001354265 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 318.667-2 chr10 66008361 66008528 + 2 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) intron (NM_001127384, intron 15 of 17) 437019 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 345.333-39 chr8 98107970 98108287 + 2 NA intron (NM_005836, intron 2 of 5) AluSz|SINE|Alu 9043 NM_005836 10247 Hs.18426 NM_005836 ENSG00000132541 RIDA HRSP12|P14.5|PSP|UK114|hp14.5 reactive intermediate imine deaminase A homolog protein-coding 369.333-3 chr11 103907610 103907947 + 2 NA 3' UTR (NM_033135, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_033135, exon 7 of 7) 57872 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 464.667-2 chr2 58234677 58235000 + 2 NA intron (NM_001114636, intron 1 of 13) L1MC4|LINE|L1 6542 NM_018062 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 516.667 chr12 6264962 6265440 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -45235 NM_018173 55200 Hs.631660 NM_018173 ENSG00000008323 PLEKHG6 MyoGEF pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G6 protein-coding 310-53 chr7 43125071 43125370 + 2 NA intron (NR_135295, intron 3 of 6) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 7324 NR_135295 100127950 Hs.666610 NR_135295 ENSG00000181211 HECW1-IT1 - HECW1 intronic transcript 1 ncRNA 267.333-62 chr3 171991647 171991818 + 2 NA Intergenic Intergenic -47846 NM_022763 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 419.334-6 chr2 70179682 70180129 + 2 NA intron (NR_145969, intron 3 of 8) AluJr|SINE|Alu 10806 NM_001348763 54980 Hs.720049 NM_017880 ENSG00000115998 C2orf42 - chromosome 2 open reading frame 42 protein-coding 575.667 chr22 30270843 30271569 + 2 NA Intergenic Intergenic -4355 NM_020530 5008 Hs.248156 NM_020530 ENSG00000099985 OSM - oncostatin M protein-coding 205.333-201 chr6 52690180 52690337 + 2 NA Intergenic Intergenic 19145 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 294-38 chr22 22041267 22041542 + 2 NA intron (NR_135291, intron 1 of 6) intron (NR_135291, intron 1 of 6) 2530 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 188.667-106 chr3 168737491 168737676 + 2 NA intron (NR_021485, intron 6 of 15) MER2|DNA|TcMar-Tigger -164362 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 443.999 chr11 74479961 74480345 + 2 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -12598 NM_005472 10008 Hs.523899 NM_005472 ENSG00000175538 KCNE3 BRGDA6|HOKPP|HYPP|MiRP2 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 3 protein-coding 222-9 chr10 16504724 16504880 + 2 NA intron (NM_001261837, intron 4 of 4) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 17077 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 331.666-15 chr3 45109137 45109439 + 2 NA TTS (NM_178181) TTS (NM_178181) 37090 NM_022842 64866 Hs.476093 NM_022842 ENSG00000163814 CDCP1 CD318|SIMA135|TRASK CUB domain containing protein 1 protein-coding 217.333-31 chr11 38407095 38407301 + 2 NA Intergenic Intergenic 239158 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 386-2 chr13 19960797 19961149 + 2 NA intron (NM_197968, intron 2 of 24) intron (NM_197968, intron 2 of 24) 1159 NR_148365 7750 Hs.507433 NM_003453 ENSG00000121741 ZMYM2 FIM|MYM|RAMP|SCLL|ZNF198 zinc finger MYM-type containing 2 protein-coding 365.999-2 chr22 31508128 31508405 + 2 NA 5' UTR (NM_001258327, exon 2 of 31) 5' UTR (NM_001258327, exon 2 of 31) 11730 NM_014775 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 371.667-10 chr6 39165444 39165661 + 2 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -50366 NM_001304793 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 330-28 chr4 40443063 40443288 + 2 NA intron (NM_001098634, intron 3 of 6) L1MB3|LINE|L1 58944 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 368-18 chr3 63098877 63099221 + 2 NA Intergenic Intergenic -3639 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 298.667-32 chr9 98996699 98996872 + 2 NA intron (NM_001855, intron 5 of 41) intron (NM_001855, intron 5 of 41) 52878 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 307.334-6 chr2 127997072 127997352 + 2 NA intron (NM_001330303, intron 10 of 19) intron (NM_001330303, intron 10 of 19) 30083 NM_001145928 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 324-18 chr4 14518656 14518836 + 2 NA intron (NR_126435, intron 5 of 6) intron (NR_126435, intron 5 of 6) 369423 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 345-14 chr5 4755066 4755333 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -18282 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 334-33 chr6 45072032 45072208 + 2 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) MIRc|SINE|MIR 125650 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 432.667-9 chr3 177849754 177850155 + 2 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) intron (NR_110826, intron 1 of 2) 33089 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 362-16 chr3 45694161 45694353 + 2 NA intron (NM_001319073, intron 2 of 20) intron (NM_001319073, intron 2 of 20) 4861 NM_001319073 22908 Hs.156509 NM_014016 ENSG00000211456 SACM1L SAC1 SAC1 like phosphatidylinositide phosphatase protein-coding 309.333-15 chr14 33075094 33075386 + 2 NA intron (NM_001164749, intron 2 of 11) intron (NM_001164749, intron 2 of 11) 136361 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 311-10 chr15 81750620 81750862 + 2 NA Intergenic Intergenic 295277 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 407.333-4 chr10 73506844 73507293 + 2 NA non-coding (NR_132103, exon 5 of 5) non-coding (NR_132103, exon 5 of 5) -11044 NM_001289969 5532 Hs.500067 NM_021132 ENSG00000107758 PPP3CB CALNA2|CALNB|CNA2|PP2Bbeta protein phosphatase 3 catalytic subunit beta protein-coding 351.667-14 chr5 42213723 42213909 + 2 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -38471 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 415.666-8 chr7 137532435 137532684 + 2 NA intron (NM_001321710, intron 20 of 32) intron (NM_001321710, intron 20 of 32) -188826 NM_001321387 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 255.333-79 chr4 143116561 143116863 + 2 NA Intergenic Intergenic 68149 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 306.667-27 chr2 153210106 153210292 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 268563 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 316.667-8 chr12 47468075 47468251 + 2 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy 53155 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 291.333-58 chr5 175799039 175799234 + 2 NA intron (NM_006650, intron 1 of 4) intron (NM_006650, intron 1 of 4) 2603 NM_006650 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 178.333-98 chr3 13956599 13956793 + 2 NA intron (NR_002223, intron 1 of 2) L1PB3|LINE|L1 19389 NR_002223 348825 Hs.529180 NR_002223 ENSG00000180438 TPRXL TPRX3P tetrapeptide repeat homeobox like pseudo 353-5 chr14 57283110 57283342 + 2 NA exon (NM_018229, exon 6 of 8) exon (NM_018229, exon 6 of 8) 14255 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 311.333-19 chr15 55722514 55722814 + 2 NA intron (NM_173814, intron 2 of 19) intron (NM_173814, intron 2 of 19) 20488 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 391-9 chr2 26766540 26766967 + 2 NA intron (NM_017877, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 2469 NM_017877 54978 Hs.1594 NM_017877 ENSG00000213699 SLC35F6 ANT2BP|C2orf18|TANGO9 solute carrier family 35 member F6 protein-coding 278.667-12 chr12 23164160 23164364 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -11374 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 309.333-38 chr2 54979806 54980059 + 2 NA intron (NM_020532, intron 5 of 8) intron (NM_020532, intron 5 of 8) 30340 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 145.667-286 chr8 90939509 90939692 + 2 NA intron (NM_022351, intron 9 of 12) intron (NM_022351, intron 9 of 12) 45477 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 342-7 chr13 67765688 67765981 + 2 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 393447 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 454.333-4 chr15 70543999 70544495 + 2 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -38319 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 484.667 chr11 36871406 36872008 + 2 NA Intergenic Intergenic -273428 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 399-10 chr8 113318270 113318621 + 2 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) L1MA9|LINE|L1 58707 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 651.667 chr14 57307238 57307770 + 2 NA Intergenic Intergenic 38533 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 285-29 chr5 124346713 124346955 + 2 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1MEc|LINE|L1 91686 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 330.334-12 chr8 78745159 78745584 + 2 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) intron (NM_001199886, intron 2 of 4) -20997 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 372-13 chr20 45389851 45390151 + 2 NA intron (NR_003189, intron 3 of 5) L1MD1|LINE|L1 -11676 NM_014477 27296 Hs.710271 NM_014477 ENSG00000124251 TP53TG5 C20orf10|CLG01 TP53 target 5 protein-coding 267.333-2 chr1 31073113 31073344 + 2 NA Intergenic Intergenic -7511 NM_001020658 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 299.333-55 chr3 43548542 43548714 + 2 NA intron (NM_001346464, intron 12 of 13) intron (NM_001346464, intron 12 of 13) 73298 NM_001346466 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 319-17 chr20 54571897 54572104 + 2 NA intron (NM_018431, intron 2 of 7) L2b|LINE|L2 96407 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 369-10 chr2 148589256 148589475 + 2 NA Intergenic Intergenic -55386 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 318-58 chr9 29264360 29264591 + 2 NA Intergenic Intergenic -50874 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 237-62 chr5 133257857 133258055 + 2 NA intron (NM_015082, intron 6 of 15) intron (NM_015082, intron 6 of 15) 169750 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 342-42 chr9 96109303 96109591 + 2 NA intron (NR_132344, intron 2 of 2) intron (NR_132344, intron 2 of 2) 6964 NR_132344 158434 Hs.381771 NM_001256408 ENSG00000275465 LOC158434 - uncharacterized LOC158434 ncRNA 424.666-4 chr3 180888628 180889158 + 2 NA Intergenic Intergenic -18715 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 444.667 chr11 80984692 80985046 + 2 NA Intergenic Intergenic -222066 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 344-36 chr5 148488678 148488984 + 2 NA intron (NM_001040173, intron 5 of 6) intron (NM_001040173, intron 5 of 6) 104873 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 272.333-11 chr12 28265811 28266102 + 2 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) intron (NM_001352082, intron 4 of 13) -75218 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 448.667-3 chr20 1495220 1495562 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -3971 NM_001134836 284759 Hs.721685 NM_001122962 ENSG00000196209 SIRPB2 PTPN1L|PTPNS1L3|dJ776F14.2 signal regulatory protein beta 2 protein-coding 336.667-11 chr17 65027595 65027831 + 2 NA intron (NM_006572, intron 2 of 3) intron (NM_006572, intron 2 of 3) 28061 NM_001282425 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 485.333-2 chr13 88267411 88267842 + 2 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 124759 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 231.333 chr1 43509732 43509924 + 2 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy -16209 NM_001329138 5792 Hs.272062 NM_002840 ENSG00000142949 PTPRF BNAH2|LAR protein tyrosine phosphatase receptor type F protein-coding 324.667-39 chr8 84914612 84914859 + 2 NA intron (NM_001287244, intron 7 of 7) intron (NM_001287244, intron 7 of 7) -192503 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 288-35 chr3 123931532 123931761 + 2 NA intron (NM_001366336, intron 6 of 8) intron (NM_001366336, intron 6 of 8) 29583 NM_001366339 64770 Hs.645028 NM_022757 ENSG00000175455 CCDC14 - coiled-coil domain containing 14 protein-coding 237-26 chr13 100432414 100432598 + 2 NA intron (NM_001352605, intron 20 of 22) intron (NM_001352605, intron 20 of 22) 48509 NR_047686 100885777 Hs.662554 NR_047686 PCCA-AS1 - PCCA antisense RNA 1 ncRNA 286.667-24 chr3 106912595 106912858 + 2 NA Intergenic Intergenic 327912 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 432.667-13 chr9 29120799 29121090 + 2 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 91355 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 309.666-17 chr8 114556112 114556377 + 2 NA Intergenic Intergenic 1111769 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 339.667-24 chr8 112557423 112557681 + 2 NA intron (NM_001363185, intron 22 of 66) MER21C|LTR|ERVL -85941 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 292.333-31 chr4 48168573 48168805 + 2 NA intron (NM_003215, intron 5 of 17) intron (NM_003215, intron 5 of 17) -34439 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 241.333-61 chr20 55621867 55622109 + 2 NA Intergenic LTR10B|LTR|ERV1 -194791 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 331-17 chr2 41752415 41752718 + 2 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -124989 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 432-3 chr10 87681151 87681445 + 2 NA intron (NM_001015880, intron 1 of 12) intron (NM_001015880, intron 1 of 12) 21420 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 378-12 chr2 116132551 116133010 + 2 NA Intergenic Intergenic 788965 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 536 chr15 61335416 61335828 + 2 NA Intergenic Intergenic -106320 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 322-39 chr7 7647112 7647279 + 2 NA intron (NM_002947, intron 4 of 7) L1MEd|LINE|L1 6443 NM_001302348 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 282-42 chr5 128225655 128225826 + 2 NA Intergenic Intergenic 141974 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 306-23 chr2 55429506 55429711 + 2 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9752 NM_018084 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 303.333-60 chr5 35493711 35493913 + 2 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -124051 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 516.666 chr8 100790318 100790920 + 2 NA Intergenic Intergenic -68531 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 355-8 chr16 56177320 56177588 + 2 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 13640 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 352-5 chr10 60015672 60016063 + 2 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -54954 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 270-39 chr3 99164817 99164987 + 2 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -263207 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 279.667-9 chr12 65343133 65343321 + 2 NA intron (NM_001031679, intron 4 of 6) intron (NM_001031679, intron 4 of 6) 64240 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 425.333-6 chr2 78272766 78272990 + 2 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MA9|LINE|L1 17853 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 295-27 chr2 229256446 229256726 + 2 NA intron (NM_001330158, intron 1 of 3) MER103C|DNA|hAT-Charlie 14701 NM_001330158 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 195.333-180 chr5 90159245 90159431 + 2 NA intron (NR_120601, intron 5 of 5) intron (NR_120601, intron 5 of 5) 130733 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 293.333-9 chr13 38817169 38817452 + 2 NA intron (NM_207361, intron 6 of 23) L1MA6|LINE|L1 10281 NR_146963 100874073 Hs.253994 NR_146963 FREM2-AS1 - FREM2 antisense RNA 1 ncRNA 310.667-16 chr18 74392809 74393019 + 2 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -16534 NR_131977 101927606 Hs.623809 NR_131977 ENSG00000259779 LINC01922 - long intergenic non-protein coding RNA 1922 ncRNA 325.333-51 chr8 99649060 99649302 + 2 NA intron (NM_017890, intron 34 of 61) L1MEf|LINE|L1 -112320 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 293.334-4 chr18 39713378 39713664 + 2 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) intron (NR_024391, intron 2 of 3) -36744 NR_049848 100846997 NR_049848 ENSG00000283645 MIR5583-2 - microRNA 5583-2 ncRNA 270-59 chr8 25369234 25369488 + 2 NA intron (NM_024940, intron 33 of 51) intron (NM_024940, intron 33 of 51) -7849 NR_159962 105379331 NR_159962 LOC105379331 - uncharacterized LOC105379331 ncRNA 342.667-9 chr5 36201655 36201989 + 2 NA intron (NM_001085411, intron 8 of 11) intron (NM_001085411, intron 8 of 11) 39569 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 182.333-173 chrX 38333666 38333812 + 2 NA Intergenic Intergenic -6230 NR_159807 6103 Hs.61438 NM_000328 ENSG00000156313 RPGR COD1|CORDX1|CRD|PCDX|RP15|RP3|XLRP3|orf15 retinitis pigmentosa GTPase regulator protein-coding 382-2 chr10 73217423 73217713 + 2 NA intron (NM_173348, intron 7 of 13) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 29687 NM_015190 23234 Hs.408577 NM_015190 ENSG00000213551 DNAJC9 HDJC9|JDD1|SB73 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C9 protein-coding 522.334-3 chr22 26991350 26991856 + 2 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 68915 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 333.333-46 chr7 17345728 17345960 + 2 NA 3' UTR (NM_001621, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001621, exon 11 of 11) -29073 NR_110015 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 292-7 chr12 22885377 22885588 + 2 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 260311 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 290.666-23 chr4 71446992 71447229 + 2 NA intron (NM_003759, intron 5 of 22) intron (NM_003759, intron 5 of 22) 108057 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 512.666-4 chr5 80340994 80341294 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 10822 NR_003665 441089 Hs.568291 NR_003665 CRSP8P - mediator complex subunit 27 pseudogene pseudo 246-34 chr15 76864210 76864358 + 2 NA intron (NR_148227, intron 2 of 32) L1MC4a|LINE|L1 -2340 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 335.333-16 chr16 9826337 9826573 + 2 NA intron (NM_001134408, intron 9 of 13) intron (NM_001134408, intron 9 of 13) 355612 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 343-16 chr4 79929878 79930105 + 2 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) MIR|SINE|MIR 102520 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 291-8 chr11 39172303 39172509 + 2 NA Intergenic Intergenic 523548 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 296.667-54 chr7 29981220 29981385 + 2 NA intron (NM_001145514, intron 1 of 7) intron (NM_001145514, intron 1 of 7) 8499 NM_001145515 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 307.333-58 chr3 134016984 134017277 + 2 NA intron (NM_005630, intron 1 of 13) L1MD2|LINE|L1 12795 NM_005630 6578 Hs.518270 NM_005630 ENSG00000174640 SLCO2A1 MATR1|OATP2A1|PGT|PHOAR2|SLC21A2 solute carrier organic anion transporter family member 2A1 protein-coding 299.333-12 chr11 111709248 111709497 + 2 NA intron (NM_015191, intron 8 of 14) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 57017 NM_181699 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 363.333 chr1 154621064 154621326 + 2 NA intron (NM_001365045, intron 1 of 14) intron (NM_001365045, intron 1 of 14) 6776 NM_001025107 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 357.667-5 chr3 27783304 27783656 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -14108 NR_146630 105377007 NR_146630 LINC01980 - long intergenic non-protein coding RNA 1980 ncRNA 356.667-15 chr5 151444522 151444745 + 2 NA intron (NM_001308151, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu -2970 NM_078483 206358 Hs.269004 NM_078483 ENSG00000123643 SLC36A1 Dct1|LYAAT1|PAT1|TRAMD3 solute carrier family 36 member 1 protein-coding 297.333-31 chr2 15556912 15557171 + 2 NA intron (NR_052013, intron 2 of 50) intron (NR_052013, intron 2 of 50) 4293 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 410.334-6 chr8 79035156 79035510 + 2 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 197804 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 499.667-2 chr14 73966643 73967315 + 2 NA exon (NM_001321985, exon 17 of 17) exon (NM_001321985, exon 17 of 17) 16677 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 437 chr1 56034707 56035150 + 2 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 89841 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 309.333-64 chr9 123741096 123741288 + 2 NA intron (NM_001352968, intron 4 of 18) intron (NM_001352968, intron 4 of 18) 188934 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 310-13 chr11 76078154 76078458 + 2 NA intron (NM_003369, intron 13 of 14) intron (NM_003369, intron 13 of 14) 128196 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 392.666-3 chr12 65577635 65577986 + 2 NA intron (NR_120434, intron 3 of 4) L1ME1|LINE|L1 -20499 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 321.333-13 chr11 76893297 76893630 + 2 NA intron (NM_001300953, intron 1 of 9) MIRc|SINE|MIR 32545 NM_001300953 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 287-26 chr5 7038424 7038651 + 2 NA Intergenic Intergenic -210616 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 411.666-3 chr18 49594897 49595367 + 2 NA 3' UTR (NM_001308006, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001308006, exon 9 of 9) 33075 NM_001308006 9388 Hs.465102 NM_006033 ENSG00000101670 LIPG EDL|EL|PRO719 lipase G, endothelial type protein-coding 300-32 chr2 126095201 126095498 + 2 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 22636 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 215.333-92 chr2 109592863 109593051 + 2 NA intron (NM_001321500, intron 1 of 8) intron (NM_001321500, intron 1 of 8) 20710 NM_001321513 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 510-3 chr20 21146409 21146756 + 2 NA intron (NM_018474, intron 4 of 12) intron (NM_018474, intron 4 of 12) 20500 NM_001352436 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 380.666-10 chr5 62611997 62612371 + 2 NA intron (NM_016338, intron 29 of 29) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 33365 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 326.334-10 chr5 68986855 68987256 + 2 NA intron (NR_130778, intron 1 of 3) L1MB5|LINE|L1 42872 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 279.333-74 chr9 99303063 99303350 + 2 NA Intergenic Intergenic 72051 NR_102270 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 393.333-3 chr1 208366567 208367004 + 2 NA Intergenic Intergenic -122401 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 299.667-5 chr12 46967478 46967656 + 2 NA Intergenic Intergenic -112036 NM_001281429 91523 Hs.560100 NM_138371 ENSG00000179715 PCED1B FAM113B PC-esterase domain containing 1B protein-coding 314-10 chr14 23773750 23773996 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 137509 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 332.333-24 chr7 49163121 49163536 + 2 NA Intergenic Intergenic 238781 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 402.333-11 chr5 35730980 35731592 + 2 NA intron (NM_024867, intron 21 of 36) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 113423 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 462-20 chrUn_KI270517v1 2412 2823 + 2 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 286.667-23 chr3 79475795 79475997 + 2 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -31991 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 352.667-13 chr17 54152460 54152710 + 2 NA Intergenic Intergenic 329658 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 300-51 chr5 79317228 79317456 + 2 NA intron (NM_152405, intron 10 of 10) intron (NM_152405, intron 10 of 10) 81211 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 321.333-50 chr6 85883713 85883951 + 2 NA Intergenic (CTTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -205099 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 422.333-2 chr2 54974637 54974907 + 2 NA intron (NM_020532, intron 5 of 8) intron (NM_020532, intron 5 of 8) 35500 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 378.667-17 chr4 58569299 58569693 + 2 NA Intergenic Intergenic -33168 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 252-103 chr8 36852531 36852692 + 2 NA intron (NM_001031836, intron 18 of 26) L1MB7|LINE|L1 68237 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 348.333-23 chr4 44697222 44697543 + 2 NA intron (NM_001345869, intron 14 of 15) intron (NM_001345869, intron 14 of 15) 18962 NM_021927 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 287.333-15 chr12 57919686 57919961 + 2 NA Intergenic Intergenic 16341 NR_038269 100506844 Hs.90286 NR_038269 GIHCG - GIHCG inhibitor of miR-200b/200a/429 expression ncRNA 267-42 chr2 173927461 173927738 + 2 NA intron (NM_003111, intron 4 of 6) intron (NM_003111, intron 4 of 6) 36281 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 471.333 chr1 59315468 59316197 + 2 NA intron (NR_103473, intron 2 of 16) intron (NR_103473, intron 2 of 16) 5800 NM_001350794 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 389.999-5 chr9 35307369 35307690 + 2 NA exon (NM_001371189, exon 9 of 40) exon (NM_001371189, exon 9 of 40) -34367 NM_001371188 499-3 chr2 193943477 193943899 + 2 NA Intergenic Intergenic -400581 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 228-87 chr8 82845781 82845989 + 2 NA Intergenic Intergenic -66219 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 341-21 chr4 58449879 58450119 + 2 NA Intergenic Intergenic 86329 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 336.666-7 chr12 127927034 127927234 + 2 NA intron (NR_046392, intron 1 of 4) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11724 NR_046392 100862680 Hs.385496 NR_046392 ENSG00000256193 LINC00507 - long intergenic non-protein coding RNA 507 ncRNA 331.333-29 chr22 42344816 42345046 + 2 NA Intergenic Intergenic 24277 NR_120597 102723775 Hs.335413 NR_120595 ENSG00000229891 LINC01315 C22orf32-1|lnc-C22orf32-1 long intergenic non-protein coding RNA 1315 ncRNA 480.666 chr11 43404197 43404588 + 2 NA intron (NM_001307943, intron 11 of 19) intron (NM_001307943, intron 11 of 19) 45472 NM_018259 55761 Hs.191186 NM_018259 ENSG00000052841 TTC17 - tetratricopeptide repeat domain 17 protein-coding 392.667-7 chr20 44877227 44877519 + 2 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -8332 NM_003404 7529 Hs.643544 NM_003404 ENSG00000166913 YWHAB GW128|HEL-S-1|HS1|KCIP-1|YWHAA tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta protein-coding 299-41 chr8 116918616 116918802 + 2 NA Intergenic Intergenic -19498 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 232.667-72 chr7 74725771 74726063 + 2 NA intron (NM_033000, intron 11 of 33) intron (NM_033000, intron 11 of 33) 3001 NR_110044 101926943 Hs.654772 NR_110044 ENSG00000232729 LOC101926943 - uncharacterized LOC101926943 ncRNA 303.333-43 chr2 148030800 148031070 + 2 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -9331 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 291-30 chr3 62246560 62246727 + 2 NA intron (NM_002841, intron 15 of 29) intron (NM_002841, intron 15 of 29) 72304 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 357.333-19 chr5 74489728 74490128 + 2 NA intron (NR_126354, intron 1 of 2) L1ME3Cz|LINE|L1 47048 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 335.667-4 chr10 73986973 73987250 + 2 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11003 NM_014000 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 456-5 chr5 41755154 41755520 + 2 NA intron (NM_001364302, intron 13 of 15) intron (NM_001364302, intron 13 of 15) 88320 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 375.667-17 chr7 33661447 33661791 + 2 NA Intergenic Intergenic -243296 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 268.333-17 chr13 79339653 79340003 + 2 NA intron (NM_022118, intron 17 of 20) MER103C|DNA|hAT-Charlie 66393 NM_001286632 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 244-39 chr15 88212498 88212663 + 2 NA intron (NM_001007156, intron 3 of 15) intron (NM_001007156, intron 3 of 15) -6606 NM_001320135 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 344-14 chr14 89652072 89652360 + 2 NA Intergenic Intergenic -33051 NM_001085471 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 304.667-29 chr5 55756591 55756806 + 2 NA intron (NM_024415, intron 3 of 21) intron (NM_024415, intron 3 of 21) -10187 NM_001166534 54514 Hs.223581 NM_019039 ENSG00000152670 DDX4 VASA DEAD-box helicase 4 protein-coding 278-13 chr16 84535392 84535636 + 2 NA Intergenic Intergenic -30855 NM_020947 57707 Hs.288274 NM_020947 ENSG00000140950 MEAK7 KIAA1609|TLDC1|mEAK-7 MTOR associated protein, eak-7 homolog protein-coding 267-71 chr8 89929679 89929889 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 27214 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 356.334-4 chr3 189921842 189922114 + 2 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 92056 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 159-109 chr7 45712098 45712202 + 2 NA intron (NM_021116, intron 19 of 19) L1M4c|LINE|L1 56868 NR_024271 641977 Hs.723477 NR_024271 ENSG00000214765 SEPTIN7P2 SEPT13|SEPT7B|SEPT7P2 septin 7 pseudogene 2 pseudo 761 chr1 222590909 222591697 + 2 NA intron (NR_110614, intron 1 of 1) intron (NR_110614, intron 1 of 1) 1344 NR_110614 100506161 Hs.553851 NR_110613 ENSG00000225265 TAF1A-AS1 - TAF1A antisense RNA 1 ncRNA 294-20 chr13 66076016 66076263 + 2 NA Intergenic Intergenic -109710 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 305-4 chr12 115152840 115153002 + 2 NA Intergenic Intergenic -468746 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 314.333-13 chr19 30306897 30307112 + 2 NA Intergenic Intergenic -65380 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 287.667-4 chr10 22385431 22385701 + 2 NA intron (NM_172242, intron 4 of 9) L2a|LINE|L2 40070 NM_001253854 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 226.667-50 chr2 78709506 78709705 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 164074 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 303.333-10 chr10 13572088 13572377 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -14733 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 290-29 chr20 54702809 54703001 + 2 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 227312 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 347.667-14 chr4 57328015 57328275 + 2 NA Intergenic Intergenic -97727 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 318 chr1 37791975 37792211 + 2 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2009 NM_001031740 149175 Hs.534562 NM_152496 ENSG00000185090 MANEAL - mannosidase endo-alpha like protein-coding 345-17 chr6 47984938 47985247 + 2 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) intron (NM_207499, intron 2 of 2) 83597 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 304.333-7 chr11 46638516 46638790 + 2 NA intron (NM_001346351, intron 3 of 17) L1MA6|LINE|L1 21377 NM_001346326 9776 Hs.127403 NM_014741 ENSG00000175224 ATG13 KIAA0652|PARATARG8 autophagy related 13 protein-coding 294-36 chr2 233523288 233523481 + 2 NA exon (NM_018218, exon 15 of 31) exon (NM_018218, exon 15 of 31) 42189 NM_018218 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 467.667-5 chr15 58221386 58221772 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 83198 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 438-12 chr7 26042592 26043267 + 2 NA Intergenic Intergenic -92943 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 417.333-12 chr5 161773221 161773505 + 2 NA Intergenic Intergenic -73828 NM_000806 2554 Hs.175934 NM_000806 ENSG00000022355 GABRA1 ECA4|EIEE19|EJM|EJM5 gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit protein-coding 222-76 chr5 89324111 89324257 + 2 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) L1MA7|LINE|L1 -420079 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 343.334-5 chr3 63508535 63509023 + 2 NA intron (NM_001130003, intron 3 of 5) intron (NM_001130003, intron 3 of 5) 41272 NR_046677 100874016 Hs.441275 NR_046677 ENSG00000241359 SYNPR-AS1 - SYNPR antisense RNA 1 ncRNA 329.333-53 chr7 11063822 11063989 + 2 NA intron (NR_033436, intron 15 of 16) intron (NR_033436, intron 15 of 16) 90033 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 316-26 chr2 120974328 120974584 + 2 NA intron (NM_005270, intron 8 of 13) intron (NM_005270, intron 8 of 13) 182175 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 332-37 chr9 102057212 102057447 + 2 NA Intergenic Intergenic -318749 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 345 chr14 40079555 40079810 + 2 NA Intergenic Intergenic -647182 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 328-41 chr8 130685539 130685798 + 2 NA Intergenic Intergenic -241994 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 328-20 chr2 193745633 193745923 + 2 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -598491 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 267.333-27 chr13 96373675 96373865 + 2 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) -53459 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 315-18 chr3 13482605 13482897 + 2 NA intron (NM_001136041, intron 2 of 9) AluJr|SINE|Alu 2445 NM_001136041 79885 Hs.744132 NM_024827 ENSG00000163517 HDAC11 HD11 histone deacetylase 11 protein-coding 383.333-7 chr2 57542876 57543234 + 2 NA Intergenic Intergenic -364596 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 472.667-3 chr2 239284396 239284822 + 2 NA intron (NM_006037, intron 2 of 26) LTR16E2|LTR|ERVL -20853 NR_036229 100423043 NR_036229 ENSG00000265215 MIR4269 - microRNA 4269 ncRNA 408.667-4 chr2 128540727 128540994 + 2 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -221992 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 333.333-23 chr16 60425021 60425262 + 2 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -65348 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 646.334 chr13 56843058 56843673 + 2 NA Intergenic Intergenic -297553 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 362.334-3 chr22 25547498 25547919 + 2 NA Intergenic Intergenic -16967 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 240-44 chr2 21193377 21193555 + 2 NA Intergenic Intergenic 69480 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 310-25 chr2 4315363 4315641 + 2 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 340720 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 308-3 chr1 215833525 215833711 + 2 NA intron (NM_206933, intron 47 of 71) L1ME1|LINE|L1 -238847 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 325.333-26 chr3 118031440 118031628 + 2 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -340609 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 375.667-11 chr2 68120851 68121262 + 2 NA Intergenic Intergenic 36471 NR_046234 116143 Hs.631877 NM_138458 ENSG00000243667 WDR92 - WD repeat domain 92 protein-coding 312.333-10 chr2 56379775 56379956 + 2 NA intron (NM_001348513, intron 5 of 5) intron (NM_001348513, intron 5 of 5) -194095 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 301-59 chr8 124671936 124672166 + 2 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 56422 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 298-63 chr5 12874093 12874335 + 2 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 158672 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 468-9 chr4 30708833 30709146 + 2 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -11380 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 310.334-5 chr18 3281145 3281370 + 2 NA Intergenic Intergenic 18538 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 293.666-14 chr7 122086195 122086487 + 2 NA intron (NM_005763, intron 18 of 23) intron (NM_005763, intron 18 of 23) 57908 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 414-2 chr11 130983759 130984205 + 2 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -67495 NM_001347926 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 293-3 chr1 60760328 60760488 + 2 NA intron (NR_110628, intron 1 of 5) (TAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 65176 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 312.333-14 chr2 192804327 192804608 + 2 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 54622 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 344-52 chr9 34432847 34433110 + 2 NA intron (NM_001184942, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 25592 NM_001184940 203259 Hs.493771 NM_147202 ENSG00000164970 FAM219A C9orf25 family with sequence similarity 219 member A protein-coding 474.666 chr11 96640785 96641315 + 2 NA Intergenic Intergenic 132625 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 381-5 chr18 2556063 2556468 + 2 NA intron (NM_022840, intron 3 of 8) L1MEc|LINE|L1 15240 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 285.333-19 chr13 83091310 83091574 + 2 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 790951 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 417.333-2 chr11 83814827 83815293 + 2 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) intron (NM_001142699, intron 17 of 27) -132635 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 423-8 chr5 97415444 97415798 + 2 NA Intergenic Intergenic -89075 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 329.334-8 chr7 15199728 15200026 + 2 NA TTS (NM_001004320) TTS (NM_001004320) -225019 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 291-11 chr13 48089869 48090124 + 2 NA intron (NM_014166, intron 2 of 6) intron (NM_014166, intron 2 of 6) 5108 NM_014166 29079 Hs.181112 NM_014166 ENSG00000136146 MED4 ARC36|DRIP36|HSPC126|TRAP36|VDRIP mediator complex subunit 4 protein-coding 306.333-2 chr1 44593435 44593660 + 2 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 48054 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 298.667-19 chr4 71921577 71921776 + 2 NA Intergenic Intergenic -110128 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 454-12 chr7 37676513 37676922 + 2 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -7049 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 334-7 chr14 27901256 27901525 + 2 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -228169 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 303.333-80 chr8 128937274 128937427 + 2 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 28651 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 440-10 chr6 78368656 78369017 + 2 NA Intergenic MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR 170473 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 456.667 chr16 80486923 80487165 + 2 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) L1MC5|LINE|L1 -53690 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 284.667-42 chr5 74814411 74814686 + 2 NA intron (NR_046462, intron 4 of 11) intron (NR_046462, intron 4 of 11) -47177 NM_170681 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 298-65 chr5 147925942 147926217 + 2 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -19541 NM_206966 389336 Hs.660038 NM_206966 ENSG00000178776 C5orf46 SSSP1 chromosome 5 open reading frame 46 protein-coding 349-12 chr22 33296042 33296408 + 2 NA intron (NM_133642, intron 12 of 14) MIR|SINE|MIR 140444 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 322-21 chr18 8704769 8705004 + 2 NA intron (NR_120598, intron 1 of 1) CpG 2735 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 537-2 chr9 77636385 77636828 + 2 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 11716 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 474.666-3 chr17 31697063 31697535 + 2 NA Intergenic L3|LINE|CR1 121888 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 360.667-9 chr17 65909174 65909497 + 2 NA intron (NM_001353129, intron 19 of 26) intron (NM_001353129, intron 19 of 26) -82792 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 367.333-14 chr22 30123281 30123614 + 2 NA intron (NM_001329457, intron 11 of 11) AluJo|SINE|Alu 42983 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 277.667-20 chr2 48455530 48455687 + 2 NA intron (NR_024188, intron 3 of 21) intron (NR_024188, intron 3 of 21) 14839 NM_001193475 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 261.334-10 chr2 145052677 145052821 + 2 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 384782 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 313.333-41 chr7 65221221 65221451 + 2 NA intron (NR_146906, intron 15 of 17) MER57B1|LTR|ERV1 80306 NR_146905 285905 Hs.567827 NM_182596 ENSG00000164669 INTS4P1 INTS4L1 integrator complex subunit 4 pseudogene 1 pseudo 313-42 chr9 92961303 92961548 + 2 NA intron (NM_001083536, intron 1 of 17) intron (NM_001083536, intron 1 of 17) -2536 NM_001286993 89846 Hs.411081 NM_033086 ENSG00000127084 FGD3 ZFYVE5 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3 protein-coding 355.001 chr17 14413286 14413609 + 2 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 109707 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 372.666 chr1 170824798 170825119 + 2 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -110513 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 342-15 chr16 51885510 51885742 + 2 NA Intergenic Intergenic 123107 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 497.001-2 chr2 29109145 29109429 + 2 NA intron (NM_001287528, intron 1 of 14) intron (NM_001287528, intron 1 of 14) -5591 NR_109844 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 425.667-3 chr11 55803408 55803802 + 2 NA Intergenic Intergenic -7762 NM_001004738 219437 Hs.553623 NM_001004738 ENSG00000279395 OR5L1 OR11-151|OST262 olfactory receptor family 5 subfamily L member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 267.334-5 chr14 53676109 53676293 + 2 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 272283 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 194.333-131 chr6 55924643 55924879 + 2 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -49171 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 340.001 chr5 22866871 22867155 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13669 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 492.666 chr1 174117682 174118246 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 41323 NR_121197 102724601 Hs.563791 NR_121197 ENSG00000227373 RABGAP1L-DT - RABGAP1L divergent transcript ncRNA 364.333-28 chr8 128448851 128449187 + 1.66667 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 115660 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 350-2 chr1 166372968 166373327 + 1.66667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 116892 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 483.667 chr19 50693525 50694023 + 1.66667 NA intron (NM_016148, intron 15 of 23) intron (NM_016148, intron 15 of 23) 26028 NM_016148 50944 Hs.274255 NM_016148 ENSG00000161681 SHANK1 SPANK-1|SSTRIP|synamon SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1 protein-coding 456.333-11 chr8 110439001 110439521 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -463490 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 257-3 chr1 94189172 94189427 + 1.66667 NA exon (NM_001328667, exon 13 of 22) exon (NM_001328667, exon 13 of 22) 48285 NM_001328666 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 322.333-10 chr14 80782581 80782968 + 1.66667 NA intron (NM_152446, intron 15 of 24) L2|LINE|L2 158964 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 403.667-7 chr20 13608402 13608755 + 1.66667 NA intron (NM_001323604, intron 4 of 14) MER58B|DNA|hAT-Charlie 30354 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 500-6 chr6 36355622 36356244 + 1.66667 NA intron (NM_001207035, intron 7 of 7) intron (NM_001207035, intron 7 of 7) -19045 NM_001010903 389384 Hs.162104 NM_001010903 ENSG00000189325 BNIP5 C6orf222 BCL2 interacting protein 5 protein-coding 236-79 chr6 56000931 56001161 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 90616 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 222.334-9 chr5 102406473 102406621 + 1.66667 NA intron (NM_173488, intron 9 of 13) L1MEg|LINE|L1 92454 NM_001289002 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 269.999-5 chr21 20974206 20974517 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24048 NM_001352592 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 248-85 chr8 64022872 64023162 + 1.66667 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) L1MA4A|LINE|L1 253587 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 331-44 chr9 29236509 29236864 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23085 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 476.334 chr2 23780526 23781167 + 1.66667 NA intron (NR_125717, intron 23 of 28) AluSx|SINE|Alu 146277 NM_017552 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 473.667 chr11 25380493 25380895 + 1.66667 NA Intergenic L1P4e|LINE|L1 -808429 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 235.667-14 chr12 90423050 90423278 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 129846 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 370.334-5 chr5 62386528 62386889 + 1.66667 NA TTS (NM_014473) TTS (NM_014473) 17197 NM_014473 27292 Hs.731665 NM_014473 ENSG00000086189 DIMT1 DIM1|DIMT1L|HSA9761|HUSSY5 DIMT1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor protein-coding 271.667-16 chr11 84078068 84078304 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 10 of 27) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 195094 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 193.333-118 chr3 42315774 42315973 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -49688 NM_000729 885 Hs.458426 NM_000729 ENSG00000187094 CCK - cholecystokinin protein-coding 392.001 chr11 107126945 107127265 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -108629 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 316-10 chr12 12604404 12604598 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7375 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 284.334 chr1 22784099 22784286 + 1.66667 NA intron (NM_004442, intron 2 of 15) intron (NM_004442, intron 2 of 15) 64675 NR_039832 100616391 NR_039832 ENSG00000265422 MIR4684 - microRNA 4684 ncRNA 225-45 chr3 197177267 197177454 + 1.66667 NA intron (NM_001290983, intron 5 of 25) intron (NM_001290983, intron 5 of 25) 6512 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 413-12 chr9 20119847 20120274 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 291178 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 242.334 chr1 35006661 35006816 + 1.66667 NA intron (NM_007167, intron 12 of 15) intron (NM_007167, intron 12 of 15) -21391 NM_001195156 100506144 Hs.533986 NM_001195156 ENSG00000243749 TMEM35B ZMYM6NB transmembrane protein 35B protein-coding 248.334-10 chr2 191522155 191522313 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -155838 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 214-133 chr8 56208582 56208805 + 1.66667 NA intron (NM_002655, intron 1 of 4) intron (NM_002655, intron 1 of 4) 2580 NM_001114634 5324 Hs.14968 NM_002655 ENSG00000181690 PLAG1 PSA|SGPA|ZNF912 PLAG1 zinc finger protein-coding 241.667-59 chr3 194073290 194073516 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2433 NR_136180 285389 Hs.157102 NR_136179 ENSG00000230102 LINC02028 - long intergenic non-protein coding RNA 2028 ncRNA 361.333-8 chr17 73112900 73113440 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20482 NM_001159770 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 406.667-8 chr7 101369872 101370259 + 1.66667 NA intron (NM_133457, intron 1 of 12) AluSp|SINE|Alu 7190 NM_001278563 136227 Hs.654854 NM_133457 ENSG00000160963 COL26A1 EMI6|EMID2|EMU2|SH2B collagen type XXVI alpha 1 chain protein-coding 193.333-137 chr4 67755517 67755701 + 1.66667 NA 5' UTR (NM_000406, exon 1 of 3) 5' UTR (NM_000406, exon 1 of 3) 477 NM_001012763 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 292.667-6 chr11 118298749 118299238 + 1.66667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -5587 NM_000733 916 Hs.3003 NM_000733 ENSG00000198851 CD3E IMD18|T3E|TCRE CD3e molecule protein-coding 256.667-15 chr11 106293324 106293556 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 42033 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 261-3 chr1 89641993 89642221 + 1.66667 NA intron (NM_032270, intron 1 of 2) intron (NM_032270, intron 1 of 2) 8987 NM_032270 84230 Hs.412836 NM_032270 ENSG00000171488 LRRC8C AD158|FAD158 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit C protein-coding 209.667-117 chr8 139321941 139322219 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 381043 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 196.667-44 chr14 50363704 50363938 + 1.66667 NA intron (NM_001282236, intron 2 of 8) intron (NM_001282236, intron 2 of 8) 33060 NM_001367065 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 237.334-4 chr2 33058556 33058734 + 1.66667 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) intron (NM_206943, intron 3 of 33) -75952 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 290.334-2 chr10 72719828 72720030 + 1.66667 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) -1100 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 229.667-17 chr11 114726557 114726800 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 48151 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 325.667-25 chr9 99637011 99637212 + 1.66667 NA intron (NR_109802, intron 3 of 6) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 182778 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 391.001 chr11 20167752 20168096 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -7449 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 226.334-4 chr2 60575388 60575544 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21812 NM_018014 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 382.334-10 chr4 118743568 118743900 + 1.66667 NA intron (NM_014822, intron 15 of 22) MER2|DNA|TcMar-Tigger 58342 NM_020961 57721 Hs.596872 NM_020961 ENSG00000145388 METTL14 hMETTL14 methyltransferase like 14 protein-coding 292.333-39 chr6 134607738 134608053 + 1.66667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -67890 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 219.334-3 chr20 41043172 41043403 + 1.66667 NA intron (NM_003286, intron 2 of 20) intron (NM_003286, intron 2 of 20) 14465 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 264.667-64 chr5 42342683 42342864 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -80666 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 318.667 chr1 80820683 80820982 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 179545 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 251.666-17 chr22 26641590 26641843 + 1.66667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -15766 NR_033319 440823 Hs.517502 NR_003491 ENSG00000225783 MIAT C22orf35|GOMAFU|LINC00066|NCRNA00066|RNCR2|lncRNA-MIAT myocardial infarction associated transcript ncRNA 246-25 chr14 62501884 62502078 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -362008 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 251-71 chr5 123388871 123389058 + 1.66667 NA intron (NM_153223, intron 9 of 20) intron (NM_153223, intron 9 of 20) 34628 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 256.333-17 chr10 106531649 106531886 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 391602 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 453-12 chr9 38203837 38204386 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -134884 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 256.667-75 chr6 44772773 44772948 + 1.66667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -220979 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 238-88 chr6 91569896 91570147 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 48361 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 272.333-57 chr6 18559147 18559451 + 1.66667 NA intron (NR_149116, intron 3 of 7) intron (NR_149116, intron 3 of 7) -12485 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 280.667-48 chr6 137365466 137365780 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 128771 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 289.333-52 chr5 156880719 156880936 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 30532 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 331.001-2 chr2 99887025 99887285 + 1.66667 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 218428 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 505.334-3 chr15 77464575 77465240 + 1.66667 NA intron (NM_001304505, intron 3 of 9) intron (NM_001304505, intron 3 of 9) 44019 NM_001304504 10363 Hs.69594 NM_018200 ENSG00000140382 HMG20A HMGX1|HMGXB1 high mobility group 20A protein-coding 310-28 chr2 67533338 67533720 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 136196 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 346.334-2 chr12 8680341 8680559 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1150 NR_123740 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 335-18 chr2 233280326 233280630 + 1.66667 NA intron (NM_030803, intron 10 of 17).2 intron (NM_030803, intron 10 of 17).2 4752 NR_003008 677775 Hs.663619 NR_003008 ENSG00000252010 SCARNA5 U87 small Cajal body-specific RNA 5 ncRNA 188-69 chr3 6523502 6523641 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 281878 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 299-5 chr1 215987724 215987959 + 1.66667 NA intron (NM_206933, intron 35 of 71) L1ME3G|LINE|L1 -84624 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 252.334-2 chr11 89441485 89441690 + 1.66667 NA intron (NM_001143837, intron 8 of 20) intron (NM_001143837, intron 8 of 20) 49173 NM_001291929 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 429-4 chr14 59029838 59030430 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -158533 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 350.667-6 chr18 3228848 3229240 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8936 NM_003803 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 235.333-15 chr10 113160465 113160704 + 1.66667 NA intron (NM_030756, intron 13 of 13) intron (NM_030756, intron 13 of 13) 31313 NM_001349870 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 295.333-51 chr5 57874650 57874981 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 24347 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 296-57 chr6 60230199 60230491 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -1343785 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 319-25 chr7 49960380 49960628 + 1.66667 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) L1ME1|LINE|L1 132742 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 304-57 chr7 79962846 79963222 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -171797 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 349-15 chr4 39115758 39116130 + 1.66667 NA intron (NM_199039, intron 9 of 9) intron (NM_199039, intron 9 of 9) 53712 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 179-84 chr6 45451250 45451387 + 1.66667 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 29043 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 247.667-12 chr10 58457110 58457419 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -55608 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 465.333-5 chr13 79284469 79284998 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 121488 NM_001286632 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 252-84 chr5 131551052 131551248 + 1.66667 NA intron (NM_016340, intron 5 of 27) MIRb|SINE|MIR 84079 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 359.667-9 chr8 123553256 123553494 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12169 NM_001242463 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 240.667-55 chr3 51782711 51782900 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -3568 NM_001368369 440956 Hs.444316 NM_001143833 ENSG00000214686 IQCF6 - IQ motif containing F6 protein-coding 543.334-3 chr8 122087849 122088328 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -446648 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 172-93 chr5 119203452 119203649 + 1.66667 NA intron (NM_005509, intron 33 of 42) intron (NM_005509, intron 33 of 42) 48913 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 279.333-25 chr12 92033284 92033643 + 1.66667 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) intron (NR_132341, intron 1 of 4) 108250 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 282.333-43 chr5 38712584 38712863 + 1.66667 NA intron (NR_104631, intron 3 of 4) intron (NR_104631, intron 3 of 4) 7550 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 291.333-66 chr8 79725064 79725395 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 41246 NM_001282851 23462 Hs.234434 NM_012258 ENSG00000164683 HEY1 BHLHb31|CHF2|HERP2|HESR1|HRT-1|NERP2|OAF1|hHRT1 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1 protein-coding 311.333-12 chr11 106379393 106379877 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 128228 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 311-18 chr21 33703263 33703675 + 1.66667 NA intron (NM_001001132, intron 1 of 29) intron (NM_001001132, intron 1 of 29) 60968 NM_001331011 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 173.667-29 chr11 64706859 64707077 + 1.66667 NA intron (NM_015080, intron 2 of 22) AluSz6|SINE|Alu 16220 NM_015080 9379 Hs.372938 NM_015080 ENSG00000110076 NRXN2 - neurexin 2 protein-coding 316-38 chr4 43430714 43431003 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 61685 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 119.667-49 chr14 63691678 63691803 + 1.66667 NA intron (NM_030791, intron 2 of 2).2 MER5B|DNA|hAT-Charlie 36325 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 279.667-38 chr6 6009604 6009898 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2146 NM_001278710 51299 Hs.103291 NM_016588 ENSG00000124785 NRN1 NRN|dJ380B8.2 neuritin 1 protein-coding 307-19 chr21 19050758 19051050 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -291092 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 372.333-8 chr14 60825739 60826220 + 1.66667 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) intron (NM_002431, intron 6 of 7) 91218 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 255.334-31 chr9 78776252 78776519 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 369281 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 263-7 chr1 218717075 218717358 + 1.66667 NA intron (NR_031644, intron 4 of 6) intron (NR_031644, intron 4 of 6) 201295 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 218.333-65 chr2 42204631 42204881 + 1.66667 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) intron (NM_001145076, intron 1 of 21) -34525 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 225.333-57 chr15 39663776 39664003 + 1.66667 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) intron (NM_152597, intron 10 of 11) 82810 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 249.333-60 chr2 175048011 175048234 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -42743 NM_001025201 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 266.667-36 chr2 11224335 11224515 + 1.66667 NA exon (NM_004850, exon 7 of 33) exon (NM_004850, exon 7 of 33) 68958 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 224.667-55 chr3 95476072 95476294 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 207010 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 335-19 chr3 81914712 81915082 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -71245 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 343.001-2 chr2 192141397 192141690 + 1.66667 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) intron (NM_001305134, intron 4 of 9) 53390 NM_016192 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 235.667-43 chr3 140780486 140780668 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 102513 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 385.334-2 chr16 7723964 7724452 + 1.66667 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 391363 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 193.333-18 chr10 23848947 23849177 + 1.66667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) L2b|LINE|L2 154335 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 322.001-2 chr2 4257534 4257747 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 283479 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 257-62 chr6 109731577 109731770 + 1.66667 NA intron (NM_014845, intron 4 of 22) MER2|DNA|TcMar-Tigger 40452 NM_014845 9896 Hs.529959 NM_014845 ENSG00000112367 FIG4 ALS11|BTOP|CMT4J|KIAA0274|SAC3|YVS|dJ249I4.1 FIG4 phosphoinositide 5-phosphatase protein-coding 498.667-2 chr14 47199786 47200222 + 1.66667 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 143242 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 265.667-40 chr20 11886791 11886990 + 1.66667 NA Intergenic LTR47B2|LTR|ERVL -3833 NM_181443 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 262.667-32 chr18 40217596 40217819 + 1.66667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 151421 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 338-13 chr17 66023553 66023961 + 1.66667 NA intron (NM_001353129, intron 16 of 26) L1M2|LINE|L1 168135 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 301.334-5 chr18 56594773 56595066 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 43673 NR_024546 9352 Hs.114412 NM_004786 ENSG00000091164 TXNL1 HEL-S-114|TRP32|TXL-1|TXNL|Txl thioredoxin like 1 protein-coding 220.334 chr12 87443958 87444106 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 113293 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 231-40 chr3 61978801 61979022 + 1.66667 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) MIRb|SINE|MIR 340036 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 213.333-226 chr9 92794309 92794495 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 13685 NR_136301 101929748 Hs.551296 NR_136301 LOC101929748 - uncharacterized LOC101929748 ncRNA 251.334-20 chr3 160432411 160432582 + 1.66667 NA exon (NM_005496, exon 21 of 23) exon (NM_005496, exon 21 of 23) 17290 NM_173084 286827 Hs.212957 NM_173084 ENSG00000213186 TRIM59 IFT80L|MRF1|RNF104|TRIM57|TSBF1 tripartite motif containing 59 protein-coding 261.334-15 chr4 111016492 111016681 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -155939 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 223.333-48 chr16 56939311 56939564 + 1.66667 NA intron (NM_001010989, intron 5 of 7) intron (NM_001010989, intron 5 of 7) 7295 NM_014685 9709 Hs.146393 NM_014685 ENSG00000051108 HERPUD1 HERP|Mif1|SUP homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1 protein-coding 276.334-7 chr15 91389271 91389459 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -73974 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 266-19 chr12 105281637 105281849 + 1.66667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 45274 NR_131986 105369954 Hs.368938 NR_131986 ENSG00000257642 KCCAT198 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 198 ncRNA 269.667-46 chr6 138939620 138939930 + 1.66667 NA intron (NM_031922, intron 8 of 19) intron (NM_031922, intron 8 of 19) 48486 NM_001286612 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 418.333-2 chr15 66758791 66759179 + 1.66667 NA intron (NR_027654, intron 4 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie 56749 NR_027654 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 177.667-72 chr2 102054541 102054730 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15755 NM_001320978 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 375.667-2 chr1 238971313 238971657 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -415083 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 470.666 chr1 35982844 35983355 + 1.66667 NA intron (NM_024852, intron 5 of 18) MLT2C1|LTR|ERVL 51994 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 308-29 chr2 240432518 240432832 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2988 NM_002081 2817 Hs.328232 NM_002081 ENSG00000063660 GPC1 glypican glypican 1 protein-coding 243-53 chr5 113176156 113176353 + 1.66667 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 118684 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 232.334 chr11 25870183 25870345 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -318859 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 191.667-104 chr5 178716182 178716372 + 1.66667 NA intron (NM_005649, intron 4 of 4) L2|LINE|L2 14382 NM_005649 6940 Hs.484324 NM_005649 ENSG00000169131 ZNF354A EZNF|HEL104|HKL1|KID-1|KID1|TCF17 zinc finger protein 354A protein-coding 403.667-4 chr14 80265103 80265590 + 1.66667 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) intron (NR_038355, intron 2 of 8) -34289 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 221.667-37 chr19 27592548 27592686 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -200814 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 404-8 chr2 61033645 61033954 + 1.66667 NA intron (NM_002618, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 -15540 NM_001322127 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 415.667-6 chr5 38089780 38090211 + 1.66667 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) L1ME2|LINE|L1 -58485 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 425.999-2 chr17 34998639 34999121 + 1.66667 NA intron (NM_013975, intron 14 of 19) intron (NM_013975, intron 14 of 19) 18368 NM_013975 3980 Hs.100299 NM_002311 ENSG00000005156 LIG3 LIG2|LIG3alpha DNA ligase 3 protein-coding 323-10 chr15 71449448 71449802 + 1.66667 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -97611 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 240.334-9 chr21 31235246 31235452 + 1.66667 NA intron (NM_001353686, intron 6 of 27) HAL1|LINE|L1 -74409 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 197-79 chr4 17948671 17948789 + 1.66667 NA intron (NR_158563, intron 4 of 5) intron (NR_158563, intron 4 of 5) 73025 NR_136669 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 350-32 chr6 56952613 56953004 + 1.66667 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) MIRb|SINE|MIR 2022 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 292-57 chr9 2815222 2815532 + 1.66667 NA intron (NM_014878, intron 13 of 17) intron (NM_014878, intron 13 of 17) 28718 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 274.333-38 chr2 28361454 28361757 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31253 NM_005253 2355 Hs.220971 NM_005253 ENSG00000075426 FOSL2 FRA2 FOS like 2, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 278.334-8 chr7 52761092 52761384 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -274395 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 311-5 chr10 66075531 66075852 + 1.66667 NA intron (NM_001127384, intron 14 of 17) intron (NM_001127384, intron 14 of 17) 504266 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 264.667-60 chr4 90435715 90436008 + 1.66667 NA intron (NM_207491, intron 4 of 7) intron (NM_207491, intron 4 of 7) 200830 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 377.666-9 chr2 108824566 108825116 + 1.66667 NA intron (NM_001351559, intron 10 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 38070 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 251.667-35 chr2 8965276 8965478 + 1.66667 NA intron (NR_135606, intron 1 of 12) intron (NR_135606, intron 1 of 12) 38307 NM_001321265 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 236.334-2 chr10 58424292 58424488 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 38980 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 309 chr1 18084990 18085302 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 19489 NR_125946 101927876 Hs.522954 NR_125946 ENSG00000261781 LINC01654 - long intergenic non-protein coding RNA 1654 ncRNA 282-12 chr14 43101756 43101929 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 1405441 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 254.667-15 chr12 1509143 1509296 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8728 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 241.333-52 chr2 69070762 69071014 + 1.66667 NA intron (NM_032208, intron 4 of 17) intron (NM_032208, intron 4 of 17) -32794 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 282-31 chr2 179741422 179741695 + 1.66667 NA intron (NM_001352815, intron 1 of 8) intron (NM_001352815, intron 1 of 8) 4108 NM_001352813 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 251-12 chr11 111769439 111769611 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3136 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 171.334 chr14 59578969 59579093 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -2219 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 264-5 chr1 156286305 156286492 + 1.66667 NA non-coding (NR_026678, exon 3 of 4) non-coding (NR_026678, exon 3 of 4) 2073 NM_032323 84283 Hs.347408 NM_032323 ENSG00000163472 TMEM79 MATT transmembrane protein 79 protein-coding 424-7 chr2 83202824 83203192 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -319806 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 294.667-13 chr14 73895793 73896110 + 1.66667 NA intron (NM_001242924, intron 4 of 13) intron (NM_001242924, intron 4 of 13) 9092 NM_001242927 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 294.667-56 chr8 121359925 121360261 + 1.66667 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -279253 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 316.333-30 chr8 118072827 118073206 + 1.66667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) L3|LINE|CR1 38803 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 204-212 chrX 90091320 90091518 + 1.66667 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 169511 NM_138960 90316 Hs.592220 NM_138960 ENSG00000153779 TGIF2LX TGIFLX TGFB induced factor homeobox 2 like X-linked protein-coding 258.333-58 chr7 20421140 20421369 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -89492 NR_110120 101927811 Hs.285724 NR_110119 ENSG00000271133 LOC101927811 - uncharacterized LOC101927811 ncRNA 242.334-16 chr8 67861426 67861642 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -90512 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 485.666-2 chr5 140287111 140287552 + 1.66667 NA intron (NM_002622, intron 2 of 3) L1MC4a|LINE|L1 15770 NM_002622 5201 Hs.483564 NM_002622 ENSG00000113068 PFDN1 PDF|PFD1 prefoldin subunit 1 protein-coding 197-113 chr7 62745721 62745884 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 558254 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 269-48 chr6 98161068 98161346 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 136676 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 268-25 chr17 59483024 59483263 + 1.66667 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) intron (NR_110813, intron 2 of 2) 43714 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 205.667-113 chr5 87183366 87183514 + 1.66667 NA intron (NR_105018, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 55761 NR_130914 55338 Hs.677194 NM_018382 LINC01949 - long intergenic non-protein coding RNA 1949 ncRNA 180.334-2 chr4 76165292 76165508 + 1.66667 NA intron (NM_001204255, intron 7 of 8) intron (NM_001204255, intron 7 of 8) -16885 NR_103781 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 275.334 chr1 8162340 8162552 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -46226 NR_125998 102724539 Hs.516816 NR_125998 ENSG00000227634 LINC01714 - long intergenic non-protein coding RNA 1714 ncRNA 337.667-25 chr8 88764825 88765240 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -437549 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 365-18 chr4 36511865 36512203 + 1.66667 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) intron (NR_149124, intron 3 of 4) -85606 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 249.667-78 chr5 129949364 129949530 + 1.66667 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) L1M3|LINE|L1 44982 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 209-106 chr6 153205917 153206213 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -74783 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 192.334-2 chr17 54469009 54469149 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -431612 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 310-23 chr15 95485388 95485612 + 1.66667 NA intron (NR_027133, intron 3 of 5) intron (NR_027133, intron 3 of 5) 52407 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 250-45 chr2 217438404 217438605 + 1.66667 NA intron (NR_026597, intron 3 of 12) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 155771 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 254.667-78 chr7 134764699 134764922 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14824 NM_033138 800 Hs.490203 NM_004342 ENSG00000122786 CALD1 CDM|H-CAD|HCAD|L-CAD|LCAD|NAG22 caldesmon 1 protein-coding 332.667-16 chr2 78785165 78785459 + 1.66667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 239781 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 207.333-95 chr14 73047634 73047861 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -10787 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 206.334-6 chr2 34115349 34115520 + 1.66667 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 48208 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 321.667-9 chr17 69717491 69717824 + 1.66667 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) intron (NR_109972, intron 3 of 4) 123670 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 197-65 chr20 50013197 50013331 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 28365 NR_051976 100887755 Hs.195705 NR_051976 TRERNA1 LINC00651|treRNA translation regulatory long non-coding RNA 1 ncRNA 239.334-10 chr6 45369416 45369614 + 1.66667 NA intron (NM_181356, intron 1 of 12) intron (NM_181356, intron 1 of 12) 8003 NR_146635 8464 Hs.368325 NM_003599 ENSG00000196284 SUPT3H SPT3|SPT3L SPT3 homolog, SAGA and STAGA complex component protein-coding 256.334-23 chr9 69994437 69994632 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -49047 NR_125850 256691 Hs.547172 NM_153267 ENSG00000165072 MAMDC2 - MAM domain containing 2 protein-coding 257.666-6 chr13 49746758 49747043 + 1.66667 NA intron (NM_002267, intron 2 of 16) intron (NM_002267, intron 2 of 16) 45782 NM_002267 3839 Hs.527919 NM_002267 ENSG00000102753 KPNA3 IPOA4|SRP1|SRP1gamma|SRP4|hSRP1 karyopherin subunit alpha 3 protein-coding 553.666 chr7 12280592 12281111 + 1.66667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 69557 NM_001134232 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 213.667-3 chr1 59714798 59714957 + 1.66667 NA intron (NM_001350790, intron 15 of 16) intron (NM_001350790, intron 15 of 16) 18419 NR_039861 100616409 NR_039861 ENSG00000266150 MIR4711 - microRNA 4711 ncRNA 254.667-12 chr11 16295160 16295350 + 1.66667 NA intron (NM_033326, intron 3 of 15) intron (NM_033326, intron 3 of 15) 61291 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 255.334-23 chr4 60897696 60897918 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24812 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 252-57 chr20 12963793 12963975 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11365 NR_109868 101929486 Hs.548761 NR_109868 ENSG00000233048 LINC01722 - long intergenic non-protein coding RNA 1722 ncRNA 215.667-70 chr2 198622685 198622929 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -247710 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 263.667-15 chr11 85493118 85493318 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) intron (NM_001142699, intron 3 of 27) 134052 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 423.667-10 chr21 26826678 26826987 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 18577 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 186-53 chr2 215581797 215581967 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 128175 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 404.334 chr11 6220548 6220951 + 1.66667 NA intron (NM_032127, intron 6 of 11) intron (NM_032127, intron 6 of 11) 13887 NM_001098794 84067 Hs.501793 NM_032127 ENSG00000051009 FAM160A2 C11orf56|FHIP family with sequence similarity 160 member A2 protein-coding 254.667-87 chrX 85963065 85963276 + 1.66667 NA intron (NM_001320959, intron 5 of 14) L1PA7|LINE|L1 -59463 NR_029848 494323 NR_029848 ENSG00000199051 MIR361 MIRN361|hsa-mir-361|mir-361 microRNA 361 ncRNA 362.334-5 chr7 107598156 107598578 + 1.66667 NA intron (NR_163936, intron 5 of 6) intron (NR_163936, intron 5 of 6) 18121 NR_163938 358.333-26 chr8 40714064 40714496 + 1.66667 NA intron (NM_024645, intron 3 of 6) L1M5|LINE|L1 183546 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 205.667-89 chr22 40140490 40140642 + 1.66667 NA intron (NM_001024843, intron 3 of 23) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -37359 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 203.667-12 chr10 64455885 64456028 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -369572 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 255.666-27 chr8 52499541 52499812 + 1.66667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 65754 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 239.666-6 chr12 76781204 76781453 + 1.66667 NA intron (NM_015336, intron 1 of 16) L1ME3Cz|LINE|L1 17070 NM_001359626 23390 Hs.4014 NM_015336 ENSG00000186908 ZDHHC17 DHHC-17|HIP14|HIP3|HSPC294|HYPH zinc finger DHHC-type containing 17 protein-coding 247-16 chr12 9257089 9257303 + 1.66667 NA intron (NR_137429, intron 5 of 6) intron (NR_137429, intron 5 of 6) 17193 NR_137430 100499405 Hs.182314 NR_036466 ENSG00000237248 LINC00987 - long intergenic non-protein coding RNA 987 ncRNA 246.333-14 chr10 81426509 81426771 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -448554 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 294.666-29 chr6 42396991 42397376 + 1.66667 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) intron (NM_001297573, intron 2 of 17) 54868 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 275.333-16 chr12 79077266 79077541 + 1.66667 NA intron (NM_005639, intron 3 of 10) intron (NM_005639, intron 3 of 10) 31711 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 303-3 chr1 107305904 107306198 + 1.66667 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 157982 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 137.333-126 chr3 192372759 192372957 + 1.66667 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 36191 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 306.666-9 chr15 73103310 73103704 + 1.66667 NA intron (NM_002499, intron 1 of 28) L2c|LINE|L2 51023 NM_001172623 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 236.666-19 chr15 68704336 68704537 + 1.66667 NA intron (NM_006091, intron 3 of 11) MIRb|SINE|MIR 62933 NM_001324015 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 247-49 chr22 48110705 48110979 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -163522 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 262.667-55 chr3 71399721 71399892 + 1.66667 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) intron (NR_146142, intron 3 of 19) -95035 NM_001244812 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 405.333-14 chrX 151310396 151310781 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -86007 NM_001363810 203547 Hs.58633 NM_001017980 ENSG00000160131 VMA21 MEAX|XMEA vacuolar ATPase assembly factor VMA21 protein-coding 304-20 chr14 103263234 103263525 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -53905 NR_135269 105378183 Hs.132624 NR_135269 LOC105378183 - uncharacterized LOC105378183 ncRNA 414.667-11 chr3 16468092 16468516 + 1.66667 NA intron (NM_015150, intron 2 of 9) intron (NM_015150, intron 2 of 9) 45395 NM_015150 23180 Hs.98910 NM_015150 ENSG00000131378 RFTN1 MIG2|PIB10|PIG9|RAFTLIN raftlin, lipid raft linker 1 protein-coding 328.333-23 chr2 159261530 159261849 + 1.66667 NA intron (NM_001330280, intron 4 of 9) L1M3e|LINE|L1 25014 NM_001307994 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 254.333-25 chr15 61127074 61127309 + 1.66667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 102111 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 328.667-3 chr12 16239855 16240100 + 1.66667 NA intron (NM_001170798, intron 4 of 8) intron (NM_001170798, intron 4 of 8) 37708 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 275-11 chr13 41465643 41465960 + 1.66667 NA intron (NM_014059, intron 2 of 4) intron (NM_014059, intron 2 of 4) 8251 NM_014059 28984 Hs.507866 NM_014059 ENSG00000102760 RGCC C13orf15|RGC-32|RGC32|bA157L14.2 regulator of cell cycle protein-coding 253.667-65 chr6 119900010 119900252 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -115048 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 276.667-10 chr10 76813433 76813729 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -74463 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 373.667 chr1 151884241 151884664 + 1.66667 NA intron (NM_053055, intron 4 of 5) intron (NM_053055, intron 4 of 5) 25059 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 241-11 chr11 91285573 91285801 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -416485 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 254.333-8 chr11 71192756 71192998 + 1.66667 NA intron (NM_012309, intron 1 of 24) intron (NM_012309, intron 1 of 24) 31919 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 250.334-17 chr5 146125797 146125969 + 1.66667 NA intron (NM_016460, intron 27 of 30) MER20|DNA|hAT-Charlie -20306 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 250.334-4 chr12 113713015 113713244 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 60554 NR_110026 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 352.333-17 chr4 32707564 32708055 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 356771 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 249.667-25 chr12 63411592 63411761 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 256817 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 258-61 chr5 53555735 53556036 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4754 NR_134474 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 326-46 chr8 79956149 79956564 + 1.66667 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 73903 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 210.333-132 chr5 52801268 52801465 + 1.66667 NA intron (NM_015946, intron 2 of 2) intron (NM_015946, intron 2 of 2) 13450 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 368.334-3 chr12 131930766 131931096 + 1.66667 NA intron (NM_025215, intron 2 of 5) AluJo|SINE|Alu 1655 NM_001002019 80324 Hs.592004 NM_025215 ENSG00000177192 PUS1 MLASA1 pseudouridine synthase 1 protein-coding 415.667-9 chr7 4667207 4667606 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -14889 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 362.667-22 chr4 94233601 94234064 + 1.66667 NA intron (NM_001128429, intron 3 of 23) intron (NM_001128429, intron 3 of 23) -19477 NM_001254949 56916 Hs.410406 NM_020159 ENSG00000163104 SMARCAD1 ADERM|BASNS|ETL1|HEL1|HRZ SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 protein-coding 210-70 chr2 126711703 126711888 + 1.66667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 55637 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 218.667-35 chr15 69208981 69209216 + 1.66667 NA intron (NM_001324094, intron 2 of 5) L1MD3|LINE|L1 48463 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 453.333 chr1 149977988 149978673 + 1.66667 NA intron (NM_020205, intron 1 of 11) AluSq|SINE|Alu 32396 NM_020205 56957 Hs.98322 NM_020205 ENSG00000264522 OTUD7B CEZANNE|ZA20D1 OTU deubiquitinase 7B protein-coding 151.333-352 chr5 147892391 147892512 + 1.66667 NA TTS (NM_206966) TTS (NM_206966) 13740 NM_054023 117156 Hs.483765 NM_054023 ENSG00000164265 SCGB3A2 LU103|PNSP1|UGRP1|pnSP-1 secretoglobin family 3A member 2 protein-coding 364.334 chr1 194973515 194973807 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1115054 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 370.667-28 chr8 115141134 115141536 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 526678 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 197-70 chr3 40244649 40244853 + 1.66667 NA intron (NM_001284424, intron 12 of 15) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 64947 NR_033965 440952 Hs.660388 NR_033965 ENSG00000280739 EIF1B-AS1 - EIF1B antisense RNA 1 ncRNA 262.667-75 chr7 44069243 44069418 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001122956, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001122956, exon 13 of 13) -3763 NM_000290 5224 Hs.632642 NM_000290 ENSG00000164708 PGAM2 GSD10|PGAM-M|PGAMM phosphoglycerate mutase 2 protein-coding 312.666-13 chr2 107509824 107510109 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19453 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 234-8 chr10 78021602 78021817 + 1.66667 NA intron (NM_007055, intron 7 of 30) intron (NM_007055, intron 7 of 30) 7806 NM_007055 11128 Hs.436896 NM_007055 ENSG00000148606 POLR3A ADDH|HLD7|RPC1|RPC155|WDRTS|hRPC155 RNA polymerase III subunit A protein-coding 267.334-6 chr14 59392655 59392854 + 1.66667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 72626 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 277-15 chr14 76054335 76054553 + 1.66667 NA intron (NR_045664, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 68681 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 251.333-71 chr21 44760839 44761108 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 40847 NM_001202489 7327 Hs.529420 NM_003343 ENSG00000184787 UBE2G2 UBC7 ubiquitin conjugating enzyme E2 G2 protein-coding 576.999 chr14 92001471 92001972 + 1.66667 NA intron (NM_004239, intron 11 of 20) intron (NM_004239, intron 11 of 20) 38338 NM_004239 9321 Hs.632339 NM_004239 ENSG00000100815 TRIP11 ACG1A|CEV14|GMAP-210|GMAP210|ODCD|TRIP-11|TRIP230 thyroid hormone receptor interactor 11 protein-coding 298.667-14 chr2 155195564 155195924 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 497049 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 255.333-23 chr12 22396382 22396684 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -61819 NM_003034 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 232-61 chr3 82639704 82639854 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 653637 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 176-88 chr7 89692270 89692488 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -427021 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 262.333-47 chr2 76899790 76900009 + 1.66667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -86066 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 270-17 chr16 54613620 54613798 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 234524 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 264.333-21 chr14 73096842 73097121 + 1.66667 NA exon (NM_021239, exon 7 of 19) exon (NM_021239, exon 7 of 19) 38447 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 302.667-13 chr16 77760509 77760825 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27897 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 242.667-23 chr11 97577305 97577549 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1069002 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 238.333-67 chr4 67044521 67044814 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 377333 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 272.334-13 chr3 158072463 158072629 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 33617 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 239.667-61 chr5 95495328 95495578 + 1.66667 NA intron (NM_014639, intron 34 of 42) intron (NM_014639, intron 34 of 42) 59552 NM_014639 9652 Hs.482868 NM_014639 ENSG00000198677 TTC37 KIAA0372|Ski3|THES tetratricopeptide repeat domain 37 protein-coding 256.333-54 chr3 120955909 120956209 + 1.66667 NA intron (NR_145517, intron 3 of 8) L1MD1|LINE|L1 47382 NM_001348345 9515 Hs.477315 NM_014980 ENSG00000145087 STXBP5L LLGL4 syntaxin binding protein 5 like protein-coding 150.667-264 chr4 63258791 63258924 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1097092 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 345.334-9 chr22 22715819 22716041 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 69618 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 245.334 chr1 42541148 42541368 + 1.66667 NA intron (NM_001080850, intron 4 of 16) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 8238 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 251-78 chr7 49990765 49991002 + 1.66667 NA intron (NM_001159878, intron 6 of 7) intron (NM_001159878, intron 6 of 7) 102363 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 444.334-2 chr5 30731375 30731715 + 1.66667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -462141 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 264-10 chr10 53312067 53312355 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -540511 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 365.001 chr11 93795115 93795363 + 1.66667 NA intron (NM_004268, intron 6 of 11) intron (NM_004268, intron 6 of 11) 10957 NM_004268 9440 Hs.444931 NM_004268 ENSG00000042429 MED17 CRSP6|CRSP77|DRIP80|SRB4|TRAP80 mediator complex subunit 17 protein-coding 313.667-27 chr20 18294786 18295102 + 1.66667 NA intron (NM_001283001, intron 2 of 4) L1MC4|LINE|L1 6417 NM_001352462 7692 Hs.472221 NM_003434 ENSG00000125846 ZNF133 ZNF150|pHZ-13|pHZ-66 zinc finger protein 133 protein-coding 282.667-17 chr2 47165522 47165783 + 1.66667 NA intron (NM_001305625, intron 2 of 5) intron (NM_001305625, intron 2 of 5) 8555 NM_001305626 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 443-8 chr2 68579595 68580156 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_173545, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_173545, exon 10 of 10) -63713 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 263.001-3 chr3 102626873 102627030 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 191936 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 259.001 chr7 19509560 19509720 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 195796 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 443-2 chr12 25544424 25544768 + 1.66667 NA intron (NM_152590, intron 3 of 8) L1M1|LINE|L1 8687 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 405.001 chr12 11528506 11528831 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -19362 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 248.667-19 chr11 20809650 20809944 + 1.66667 NA intron (NM_001288714, intron 3 of 18) L1MA6|LINE|L1 140211 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 258.334-24 chr8 129307559 129307813 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -66446 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 200.334-5 chr7 29326025 29326226 + 1.66667 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) intron (NM_001293070, intron 2 of 13) -117155 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 213-15 chr12 63785756 63785903 + 1.66667 NA intron (NM_014254, intron 3 of 5) intron (NM_014254, intron 3 of 5) 5703 NM_001278237 10329 Hs.216386 NM_014254 ENSG00000118600 RXYLT1 HP10481|MDDGA10|TMEM5 ribitol xylosyltransferase 1 protein-coding 344-9 chr12 129471852 129472315 + 1.66667 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 263482 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 361.334-5 chr8 86917870 86918177 + 1.66667 NA intron (NM_173538, intron 3 of 10) LTR81C|LTR|Gypsy 51608 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 672.667 chr2 27659242 27659687 + 1.66667 NA intron (NM_001282732, intron 2 of 4) L1MC4|LINE|L1 -4007 NM_018158 22950 Hs.306000 NM_018158 ENSG00000163798 SLC4A1AP HLC3 solute carrier family 4 member 1 adaptor protein protein-coding 331.334-3 chr2 9971358 9971673 + 1.66667 NA intron (NM_198182, intron 8 of 15) intron (NM_198182, intron 8 of 15) 19822 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 247.667-10 chr10 14732940 14733154 + 1.66667 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) (ATAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 41850 NM_031453 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 317-14 chr2 12964806 12965141 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 42040 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 182.333-81 chr2 65215162 65215338 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -12445 NM_001005386 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 534.001 chr7 124107770 124108217 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -74926 NM_001136002 730130 Hs.450249 NM_001136002 ENSG00000234224 TMEM229A - transmembrane protein 229A protein-coding 301-61 chr9 37213939 37214249 + 1.66667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 93496 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 281.334-2 chr11 26069217 26069573 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -119728 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 311-30 chr5 115540887 115541223 + 1.66667 NA intron (NM_020177, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 3720 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 377-4 chr15 87214627 87215184 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -226479 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 374.001 chr22 35301992 35302288 + 1.66667 NA intron (NR_156428, intron 1 of 13) intron (NR_156428, intron 1 of 13) 2246 NR_024194 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 267.333-17 chr10 113760189 113760409 + 1.66667 NA intron (NM_001193435, intron 2 of 10) L1ME1|LINE|L1 -4520 NM_182601 79949 Hs.228320 NM_024889 ENSG00000148735 PLEKHS1 C10orf81|HEL185 pleckstrin homology domain containing S1 protein-coding 312.334-4 chr11 25685240 25685532 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -503737 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 365-19 chr5 118229346 118229643 + 1.66667 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -53080 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 412-6 chr4 30648692 30649308 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -71369 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 160.667-56 chr11 39481214 39481408 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 811819 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 347.667-19 chr7 18681113 18681417 + 1.66667 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) intron (NM_058176, intron 11 of 22) 171995 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 396.333-5 chr14 75125297 75125755 + 1.66667 NA intron (NM_001329238, intron 1 of 21) MIR1_Amn|SINE|MIR 1522 NM_033116 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 148.333-129 chr14 72295894 72296124 + 1.66667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L1ME2|LINE|L1 -220811 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 264.333-9 chr10 115396987 115397225 + 1.66667 NA intron (NM_207303, intron 20 of 28) intron (NM_207303, intron 20 of 28) 303741 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 350.667-10 chr21 25714346 25714661 + 1.66667 NA TTS (NM_001270408) TTS (NM_001270408) -20469 NM_001197297 2551 Hs.473470 NM_002040 ENSG00000154727 GABPA E4TF1-60|E4TF1A|NFT2|NRF2|NRF2A|RCH04A07 GA binding protein transcription factor subunit alpha protein-coding 260.334-14 chr22 34492788 34493024 + 1.66667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 505010 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 277.667-50 chr9 21042192 21042446 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10679 NM_001321883 401494 Hs.716678 NM_001010915 ENSG00000188921 HACD4 PTPLAD2 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 protein-coding 339.667-2 chr1 182744685 182744998 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 31979 NR_146548 105371644 Hs.496952 NR_146548 ENSG00000227181 LINC01688 - long intergenic non-protein coding RNA 1688 ncRNA 207.334-6 chr7 55616814 55616993 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -44401 NM_001321247 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 437.667-7 chr7 39141980 39142570 + 1.66667 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -128708 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 195-112 chr8 122695784 122695974 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -1773 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 330.666-7 chr12 80619837 80620147 + 1.66667 NA intron (NM_001145026, intron 31 of 44) intron (NM_001145026, intron 31 of 44) -87642 NM_002469 4618 Hs.35937 NM_002469 ENSG00000111046 MYF6 CNM3|MRF4|bHLHc4|myf-6 myogenic factor 6 protein-coding 143.334 chr12 27358597 27358727 + 1.66667 NA intron (NM_001248003, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 25826 NM_001248002 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 150.667-26 chr1 246914417 246914555 + 1.66667 NA intron (NM_015446, intron 3 of 35) intron (NM_015446, intron 3 of 35) 16872 NM_015446 25909 Hs.300887 NM_015446 ENSG00000153207 AHCTF1 ELYS|MST108|MSTP108|TMBS62 AT-hook containing transcription factor 1 protein-coding 377.667-9 chr4 64820560 64820891 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 183775 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 289.334 chr1 77235282 77235520 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15971 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 352.667-3 chr1 170520110 170520419 + 1.66667 NA intron (NR_125958, intron 1 of 2) intron (NR_125958, intron 1 of 2) -11858 NM_001146039 92344 Hs.183702 NM_152281 ENSG00000120370 GORAB GO|NTKLBP1|SCYL1BP1 golgin, RAB6 interacting protein-coding 450.666 chr12 108376496 108377262 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -37568 NM_004072 1240 Hs.197143 NM_004072 ENSG00000174600 CMKLR1 CHEMERINR|ChemR23|DEZ|RVER1 chemerin chemokine-like receptor 1 protein-coding 277-51 chr8 80997275 80997490 + 1.66667 NA intron (NM_018440, intron 3 of 8) AluJr|SINE|Alu 114686 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 270.333-7 chr1 219328335 219328700 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 153548 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 218-82 chr4 90150584 90150811 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) Penelope1_Vert|LINE|Penelope 23164 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 226-55 chr21 28471196 28471423 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -68009 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 227.667-38 chr2 182203386 182203622 + 1.66667 NA intron (NM_005019, intron 8 of 14) intron (NM_005019, intron 8 of 14) 38559 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 220.667-13 chr10 48410899 48411139 + 1.66667 NA intron (NM_001323302, intron 7 of 13) L1MB5|LINE|L1 9407 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 331.667-10 chr2 202739640 202739952 + 1.66667 NA intron (NM_173511, intron 4 of 7) intron (NM_173511, intron 4 of 7) 89438 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 374.334 chr13 68472451 68472723 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 412738 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 244.667-32 chr12 44050020 44050302 + 1.66667 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 214080 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 251.333-50 chr18 44218211 44218379 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 313402 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 256.333-67 chr5 120505864 120506126 + 1.66667 NA intron (NM_016644, intron 2 of 2) L1MC4|LINE|L1 -25469 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 478-5 chr8 111099646 111100362 + 1.66667 NA intron (NR_125418, intron 3 of 3) intron (NR_125418, intron 3 of 3) -72571 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 416.667 chr11 98533325 98533804 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -487385 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 333.333-47 chr7 28303870 28304321 + 1.66667 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) 4774 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 217.333-144 chr7 158612336 158612587 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 20845 NR_049893 100847032 NR_049893 ENSG00000265598 MIR5707 - microRNA 5707 ncRNA 253-74 chr8 120072194 120072385 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -52813 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 427.333-7 chr3 77692814 77693095 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 356009 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 472.667-5 chr6 38282763 38283312 + 1.66667 NA intron (NM_052893, intron 9 of 11) L2a|LINE|L2 -198559 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 378-6 chr11 114515563 114516103 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 44048 NM_001367953 120400 Hs.550126 NM_152315 ENSG00000095110 NXPE1 FAM55A neurexophilin and PC-esterase domain family member 1 protein-coding 653.333 chr11 86118741 86119514 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -49267 NM_001206947 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 240.667-41 chr19 50601032 50601190 + 1.66667 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -3852 NR_004384 100126781 Hs.707968 NR_004384 SNAR-F - small NF90 (ILF3) associated RNA F snRNA 381.334-3 chr12 22507551 22508054 + 1.66667 NA intron (NM_001286176, intron 9 of 26) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 36395 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 356.999-4 chr15 33403486 33403890 + 1.66667 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 92721 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 215.333-185 chr7 78571941 78572143 + 1.66667 NA intron (NM_001301128, intron 3 of 20) intron (NM_001301128, intron 3 of 20) 224800 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 427.667-4 chr15 93782357 93782687 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -74038 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 263.334-18 chr9 110246113 110246370 + 1.66667 NA intron (NM_001244938, intron 2 of 3) intron (NM_001244938, intron 2 of 3) 10266 NM_001244938 7295 Hs.435136 NM_003329 ENSG00000136810 TXN TRDX|TRX|TRX1 thioredoxin protein-coding 304.334-7 chr4 70897020 70897474 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5122 NM_001244767 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 388.334-4 chr5 33045461 33045804 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 98189 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 214.334-5 chr3 149972622 149972788 + 1.66667 NA non-coding (NR_036538, exon 1 of 1) non-coding (NR_036538, exon 1 of 1) 1426 NR_036538 646903 Hs.632559 NR_036538 LOC646903 - uncharacterized LOC646903 ncRNA 252-76 chr5 22900382 22900589 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -47141 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 332.667-20 chr5 22798479 22798762 + 1.66667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 54724 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 370.001-4 chr9 38103813 38104118 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34738 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 258.334-9 chr17 65593307 65593476 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31743 NM_001363813 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 278.667-29 chr20 49270613 49270948 + 1.66667 NA exon (NM_021035, exon 3 of 14) exon (NM_021035, exon 3 of 14) 7277 NM_021035 57169 Hs.371794 NM_021035 ENSG00000124201 ZNFX1 - zinc finger NFX1-type containing 1 protein-coding 214.667-5 chr1 104207227 104207497 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 134339 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 278-66 chr8 91579369 91579622 + 1.66667 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger 330176 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 227.334-10 chr5 31316623 31316785 + 1.66667 NA intron (NM_001362435, intron 9 of 10) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 123018 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 252.666-49 chr9 21102085 21102383 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24292 NM_002176 3456 Hs.93177 NM_002176 ENSG00000171855 IFNB1 IFB|IFF|IFN-beta|IFNB interferon beta 1 protein-coding 262-60 chr4 70702655 70702953 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2133 NM_001130709 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 313.667-36 chr5 99306617 99306932 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -227216 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 256.667-69 chr4 77980231 77980516 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -76950 NM_025074 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 474.667 chr1 66023506 66023972 + 1.66667 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) 26979 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 267-32 chr17 43860509 43860827 + 1.66667 NA intron (NM_145273, intron 6 of 6) intron (NM_145273, intron 6 of 6) 13492 NM_145273 146894 Hs.147313 NM_145273 ENSG00000161649 CD300LG CLM-9|CLM9|NEPMUCIN|TREM-4|TREM4 CD300 molecule like family member g protein-coding 247-62 chr5 51735973 51736125 + 1.66667 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -271982 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 113-83 chr17 30052777 30052853 + 1.66667 NA intron (NR_026738, intron 9 of 15) intron (NR_026738, intron 9 of 15) -63992 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 415.334-3 chr7 46578668 46578967 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 118305 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 310-47 chr5 152269858 152270225 + 1.66667 NA intron (NR_109876, intron 2 of 2) intron (NR_109876, intron 2 of 2) 135238 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 196.667-146 chr7 90959788 90959976 + 1.66667 NA intron (NM_012395, intron 8 of 13) intron (NM_012395, intron 8 of 13) 250066 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 241.333-94 chr7 8431782 8431977 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1730 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 265.667-50 chr3 184944016 184944289 + 1.66667 NA intron (NM_001009921, intron 35 of 46) intron (NM_001009921, intron 35 of 46) 131645 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 267.333-75 chr5 84940452 84940747 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -555719 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 252.334-15 chr3 197740107 197740357 + 1.66667 NA intron (NM_001145642, intron 1 of 20) intron (NM_001145642, intron 1 of 20) -3306 NM_001346873 9711 Hs.478868 NM_014687 ENSG00000145016 RUBCN KIAA0226|RUBICON|SCAR15 rubicon autophagy regulator protein-coding 328.333-15 chr16 62762706 62763176 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -726503 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 164.334 chr10 126738803 126738941 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -68362 NM_001350923 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 237.666-14 chr3 186443892 186444136 + 1.66667 NA intron (NR_151710, intron 3 of 3) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 3669 NR_151708 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 271.667-61 chr7 25865981 25866155 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -75949 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 340.667-6 chr10 74898708 74898982 + 1.66667 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) intron (NM_001370144, intron 3 of 15) -13941 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 292-35 chr3 120398473 120398767 + 1.66667 NA intron (NM_007085, intron 10 of 10) LTR16C|LTR|ERVL -2891 NR_029584 406975 NR_029584 ENSG00000284121 MIR198 MIRN198|miR-198 microRNA 198 ncRNA 209.667-17 chr10 21707828 21708002 + 1.66667 NA intron (NM_004641, intron 14 of 23) L2a|LINE|L2 173743 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 167.667-155 chr4 66411318 66411470 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 134570 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 115.667-188 chr6 34952391 34952485 + 1.66667 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) intron (NM_015245, intron 1 of 23) 63183 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 152.667-221 chr20 25740665 25740838 + 1.66667 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 -10457 NR_135006 105372582 Hs.516951 NR_135006 LOC105372582 - uncharacterized LOC105372582 ncRNA 317.667-33 chr4 106627064 106627393 + 1.66667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 193604 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 295.667-10 chr16 47586721 47586910 + 1.66667 NA intron (NM_001031835, intron 9 of 31) intron (NM_001031835, intron 9 of 31) 125484 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 266.333-34 chr21 44596554 44596882 + 1.66667 NA intron (NM_144991, intron 1 of 11) L1ME4b|LINE|L1 -3879 NM_198689 386675 Hs.473999 NM_198689 ENSG00000272804 KRTAP10-7 KAP10.7|KAP18.7|KRTAP18-7 keratin associated protein 10-7 protein-coding 462-8 chr15 64476480 64477031 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22665 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 308.333-24 chr21 19830844 19831143 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 68762 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 327-23 chr4 44156867 44157144 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 139943 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 257-39 chr3 87100479 87100708 + 1.66667 NA intron (NR_104153, intron 1 of 2) intron (NR_104153, intron 1 of 2) 11313 NR_104153 100846978 Hs.570649 NR_047469 ENSG00000281392 LINC00506 - long intergenic non-protein coding RNA 506 ncRNA 380.667-2 chr11 29151815 29152243 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -442384 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 178.333-91 chr20 19474623 19474827 + 1.66667 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) L1MA7|LINE|L1 -190129 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 228.333-3 chr1 118621885 118622132 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 366335 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 427-7 chr8 59087158 59087562 + 1.66667 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 31787 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 344-10 chr13 37211964 37212344 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -106490 NM_145203 122011 Hs.512897 NM_145203 ENSG00000180138 CSNK1A1L CK1 casein kinase 1 alpha 1 like protein-coding 248.334-11 chr3 12283181 12283376 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4207 NM_001354666 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 267.667-5 chr1 233839122 233839376 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -65427 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 318-25 chr2 61112856 61113173 + 1.66667 NA intron (NM_001129993, intron 16 of 21) L1ME1|LINE|L1 31961 NR_036496 339803 Hs.252433 NR_036496 ENSG00000212978 LOC339803 - uncharacterized LOC339803 ncRNA 229-21 chr15 97259175 97259451 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 262498 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 245.667-75 chr8 107320805 107321029 + 1.66667 NA intron (NM_001199859, intron 4 of 8) intron (NM_001199859, intron 4 of 8) 15598 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 266-32 chr18 12603905 12604119 + 1.66667 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) MER21B|LTR|ERVL 52720 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 347.667-2 chr10 62904663 62905062 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -85695 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 269-4 chr1 158452514 158452682 + 1.66667 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -12964 NM_001004473 391109 Hs.690410 NM_001004473 ENSG00000173285 OR10K1 OR1-6 olfactory receptor family 10 subfamily K member 1 protein-coding 176-30 chr14 60180498 60180667 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -10718 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 262.334-2 chr10 82481484 82481643 + 1.66667 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -248643 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 249.667-71 chr4 124424298 124424489 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 134041 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 300-21 chr14 73908993 73909214 + 1.66667 NA intron (NR_040251, intron 7 of 11) intron (NR_040251, intron 7 of 11) 22244 NM_001242927 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 254-19 chr13 56686743 56686989 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -454052 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 374.333-10 chr4 28612427 28612789 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -206974 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 151.667-166 chr2 76569053 76569201 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -416838 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 432.333-4 chr11 28794698 28795076 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -317339 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 366.334-2 chr3 10566187 10566435 + 1.66667 NA intron (NM_001353564, intron 1 of 20) intron (NM_001353564, intron 1 of 20) 53650 NM_001353564 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 261.334-23 chr8 88342823 88343004 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -15430 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 534.666-2 chr5 17352006 17352927 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 34844 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 239.667-58 chr5 38158217 38158370 + 1.66667 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) L1MEf|LINE|L1 9813 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 282-2 chr1 108571818 108572016 + 1.66667 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 11817 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 257-11 chr12 96823998 96824176 + 1.66667 NA intron (NM_001306084, intron 65 of 67) intron (NM_001306084, intron 65 of 67) -83170 NM_001135177 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 274-21 chr17 71400459 71400779 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -198440 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 282.999-3 chr1 183814702 183815027 + 1.66667 NA intron (NM_001297671, intron 2 of 17) intron (NM_001297671, intron 2 of 17) 9744 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 355.667-13 chr7 26568087 26568508 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -29472 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 294.666-23 chr3 149031767 149032084 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_003071, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_003071, exon 25 of 25) 40517 NM_001184721 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 250.667-69 chr6 55524478 55524631 + 1.66667 NA intron (NM_001287746, intron 4 of 9) intron (NM_001287746, intron 4 of 9) 54660 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 209.666-32 chr2 152486310 152486486 + 1.66667 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 151224 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 265-6 chr1 119771125 119771386 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -2323 NM_001166107 3158 Hs.59889 NM_005518 ENSG00000134240 HMGCS2 - 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2 protein-coding 308.667-35 chr5_GL383530v1_alt 45421 45626 + 1.66667 NA NA L1M1|LINE|L1 NA NA 251.667-60 chr3 67670859 67671044 + 1.66667 NA non-coding (NR_109993, exon 3 of 4) non-coding (NR_109993, exon 3 of 4) 16254 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 261-33 chr2 19843050 19843236 + 1.66667 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger -25711 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 244.334-2 chr1 98986700 98986880 + 1.66667 NA intron (NM_001037317, intron 1 of 5) MER31-int|LTR|ERV1 -17486 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 269-13 chr12 15067204 15067490 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65514 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 287-21 chr3 84513812 84514227 + 1.66667 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 355556 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 260-64 chr5 106522446 106522669 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 488457 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 231-68 chr9 11514095 11514261 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 900972 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 291.667-9 chr10 68638825 68639079 + 1.66667 NA intron (NM_030625, intron 3 of 11) intron (NM_030625, intron 3 of 11) 78615 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 238-89 chr6 96185912 96186070 + 1.66667 NA intron (NM_006581, intron 2 of 2) intron (NM_006581, intron 2 of 2) 170017 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 212.334-4 chr9 129540239 129540440 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 51679 NR_038955 100506190 Hs.529860 NR_038955 LINC00963 MetaLnc9 long intergenic non-protein coding RNA 963 ncRNA 282-41 chr5 88409552 88409767 + 1.66667 NA non-coding (NR_105021, exon 6 of 6) non-coding (NR_105021, exon 6 of 6) 17464 NR_105020 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 377.667-11 chr5 44374945 44375431 + 1.66667 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 -13544 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 259.334-12 chr2 123300039 123300200 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -226638 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 266-80 chr8 60461697 60461942 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -48001 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 253.334-16 chr4 169419084 169419263 + 1.66667 NA intron (NM_001199400, intron 28 of 32) L1MEc|LINE|L1 -148217 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 212.667-84 chr21 36125579 36125776 + 1.66667 NA intron (NR_040084, intron 1 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 963 NR_040084 100133286 Hs.728809 NR_040084 ENSG00000230212 LOC100133286 - uncharacterized LOC100133286 ncRNA 266-27 chr16 75802778 75803057 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -76427 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 346.333-32 chr8 120563372 120563799 + 1.66667 NA intron (NM_021021, intron 4 of 6) intron (NM_021021, intron 4 of 6) 118166 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 254-16 chr11 111155221 111155405 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -57995 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 337-4 chr11 15332975 15333321 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 184046 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 263.667-39 chr17 80735466 80735667 + 1.66667 NA intron (NM_020761, intron 5 of 33) intron (NM_020761, intron 5 of 33) 70066 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 248.667-94 chr7 19053024 19053199 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 64525 NR_149001 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 411-6 chr2 59728603 59729032 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 511109 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 289.334-12 chrX 56125605 56125866 + 1.66667 NA intron (NM_001324104, intron 2 of 6) intron (NM_001324104, intron 2 of 6) -106621 NM_007250 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 438.334-2 chr5 19152374 19152943 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 733614 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 462.666 chr11 111908273 111908665 + 1.66667 NA TTS (NM_001368246) TTS (NM_001368246) 2270 NM_001368246 1410 Hs.53454 NM_001885 ENSG00000109846 CRYAB CMD1II|CRYA2|CTPP2|CTRCT16|HEL-S-101|HSPB5|MFM2 crystallin alpha B protein-coding 408.667-5 chr2 177620456 177620953 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1962 NM_152275 92104 Hs.128384 NM_152275 ENSG00000197557 TTC30A IFT70A|TTC30B tetratricopeptide repeat domain 30A protein-coding 229-75 chrX 50935728 50936085 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 25171 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 258-43 chr20 9299019 9299239 + 1.66667 NA intron (NM_182797, intron 1 of 35) intron (NM_182797, intron 1 of 35) -8671 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 263.667-63 chr5 11253720 11253988 + 1.66667 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 335063 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 241-51 chr7 30821055 30821260 + 1.66667 NA intron (NR_037598, intron 7 of 19) L1MEd|LINE|L1 49740 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 252.667-23 chr12 41777074 41777284 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 12990 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 281.334-7 chr21 14315726 14316030 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 42079 NR_003087 150000 Hs.366575 NM_138726 ENSG00000243064 ABCC13 ABCC13P|C21orf73|PRED6 ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) pseudo 250-66 chr5 126645467 126645716 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 13886 NM_207408 389320 Hs.177983 NM_207408 ENSG00000196900 TEX43 C5orf48|Tseg7 testis expressed 43 protein-coding 274.334-5 chr3 8619660 8619864 + 1.66667 NA non-coding (NR_046358, exon 13 of 13) non-coding (NR_046358, exon 13 of 13) 25036 NR_046358 51066 Hs.736935 NM_015931 ENSG00000125046 SSUH2 C3orf32|SSU-2|fls485 ssu-2 homolog protein-coding 317.333-34 chr6 48178006 48178389 + 1.66667 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -109508 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 265.333-71 chr6 69681588 69681824 + 1.66667 NA intron (NM_001367272, intron 14 of 15) intron (NM_001367272, intron 14 of 15) 114760 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 212-110 chr3 158983371 158983562 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -85786 NM_001197114 100505385 Hs.134665 NM_001197113 ENSG00000283154 IQCJ-SCHIP1 - IQCJ-SCHIP1 readthrough protein-coding 249.333-5 chr1 60239381 60239616 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -165728 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 280.667-54 chr7 144033861 144034124 + 1.66667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -16410 NM_012365 393046 Hs.553793 NM_012365 ENSG00000221836 OR2A5 OR2A11P|OR2A26|OR2A8|OR7-138|OR7-141 olfactory receptor family 2 subfamily A member 5 protein-coding 278.334-10 chr8 86324868 86325149 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -17539 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 251-28 chr17 11472616 11472873 + 1.66667 NA intron (NM_001173462, intron 3 of 4) L1MC1|LINE|L1 -125726 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 203-79 chr5 53729296 53729504 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 90282 NR_147168 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 224-8 chr10 29218737 29219009 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70197 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 455.334-2 chr12 23598750 23599116 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 12 of 17) intron (NM_152989, intron 12 of 17) -14347 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 515.333-3 chr18 13396507 13397018 + 1.66667 NA intron (NM_181482, intron 3 of 5) AluJo|SINE|Alu 30772 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 488.333-3 chr3 78886696 78887131 + 1.66667 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) L1ME3A|LINE|L1 132546 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 404.666 chr10 18064837 18065211 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -54462 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 254.667-16 chr12 13051969 13052189 + 1.66667 NA intron (NM_020853, intron 1 of 12) intron (NM_020853, intron 1 of 12) 7698 NM_020853 57613 Hs.132660 NM_020853 ENSG00000084444 FAM234B KIAA1467 family with sequence similarity 234 member B protein-coding 193.333-148 chr5 33002290 33002601 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 55002 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 240-45 chr2 57400500 57400741 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -507031 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 222.667-14 chr11 104080407 104080578 + 1.66667 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) intron (NM_025208, intron 1 of 6) 43852 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 338-31 chr8 129358127 129358356 + 1.66667 NA intron (NR_130920, intron 3 of 3) intron (NR_130920, intron 3 of 3) -117001 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 253.334-18 chr5 94723166 94723396 + 1.66667 NA intron (NM_001297777, intron 16 of 19) intron (NM_001297777, intron 16 of 19) 104612 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 269.333-36 chr18 60426386 60426653 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -53744 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 262.333-68 chr5 41715658 41715964 + 1.66667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 127846 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 263-32 chr2 158462484 158462690 + 1.66667 NA intron (NM_001005476, intron 1 of 20) intron (NM_001005476, intron 1 of 20) 5635 NM_001304969 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 270.333-44 chr4 98749006 98749351 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 90276 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 218.667-15 chr10 92175280 92175431 + 1.66667 NA intron (NM_001178137, intron 4 of 9) L1MB7|LINE|L1 67924 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 401.667-3 chr12 15472751 15473125 + 1.66667 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) -73673 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 273.334-11 chr4 37753311 37753598 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -67078 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 251.667-16 chr11 105259487 105259729 + 1.66667 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger -119839 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 341.666-18 chr8 100305779 100306103 + 1.66667 NA intron (NM_001280539, intron 2 of 10) intron (NM_001280539, intron 2 of 10) -2682 NM_015435 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 453.333-4 chr4 98246857 98247368 + 1.66667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -14272 NM_001100430 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 196.334-8 chr7 82851655 82851837 + 1.66667 NA intron (NM_033026, intron 10 of 24) intron (NM_033026, intron 10 of 24) 311138 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 341-11 chr15 33988417 33988732 + 1.66667 NA intron (NM_001320917, intron 1 of 1) intron (NM_001320917, intron 1 of 1) 20077 NM_001320917 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 187.667-12 chr10 36648963 36649154 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -476799 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 243.333-107 chr7 77387342 77387561 + 1.66667 NA intron (NR_146937, intron 5 of 31) intron (NR_146937, intron 5 of 31) -27747 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 469.667-3 chr9 34428640 34429055 + 1.66667 NA intron (NM_001184942, intron 1 of 5) intron (NM_001184942, intron 1 of 5) 29723 NM_001184940 203259 Hs.493771 NM_147202 ENSG00000164970 FAM219A C9orf25 family with sequence similarity 219 member A protein-coding 423.667-4 chr10 126716351 126716622 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -45976 NM_001350923 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 211-9 chr10 45548451 45548616 + 1.66667 NA intron (NM_145021, intron 1 of 6) intron (NM_145021, intron 1 of 6) -13162 NM_001002266 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 270.334-20 chr8 116815299 116815582 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 48916 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 348.334-7 chr8 10207950 10208199 + 1.66667 NA intron (NM_001135670, intron 2 of 4) intron (NM_001135670, intron 2 of 4) 112423 NM_001135671 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 202.333-153 chr6 82671831 82672042 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 307692 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 225.667-38 chr2 115720620 115720771 + 1.66667 NA intron (NM_001321912, intron 8 of 25) intron (NM_001321912, intron 8 of 25) 376880 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 257.333-51 chr2 49734796 49735120 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 239245 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 244-17 chr10 90248590 90248736 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -291290 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 358.666-20 chrX 77169622 77170056 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -155307 NR_110406 101928469 Hs.640805 NR_110400 ENSG00000280870 MIR325HG MIR384HG MIR325 host gene ncRNA 282.001-2 chr7 89738415 89738596 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -380895 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 279.333-39 chr2 28371030 28371305 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21691 NM_005253 2355 Hs.220971 NM_005253 ENSG00000075426 FOSL2 FRA2 FOS like 2, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 239.667-50 chr4 53814801 53815005 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 119002 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 245.333-37 chr13 73471411 73471671 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -92703 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 243-28 chr2 68388138 68388298 + 1.66667 NA intron (NM_002664, intron 5 of 8) intron (NM_002664, intron 5 of 8) 22936 NM_002664 5341 Hs.468840 NM_002664 ENSG00000115956 PLEK P47 pleckstrin protein-coding 249.334 chr1 180887996 180888154 + 1.66667 NA non-coding (NR_137330, exon 13 of 13) non-coding (NR_137330, exon 13 of 13) -24822 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 265-38 chr2 146963019 146963197 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 376051 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 462-19 chr9 116061205 116061915 + 1.66667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -92231 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 275.333-13 chr12 19351243 19351613 + 1.66667 NA intron (NM_001256787, intron 19 of 25) L1MEd|LINE|L1 -88064 NM_001363736 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 276.667-47 chr3 114067682 114068099 + 1.66667 NA intron (NM_001256837, intron 3 of 7) intron (NM_001256837, intron 3 of 7) 11153 NM_001256836 79691 Hs.477162 NM_024638 ENSG00000151576 QTRT2 QTRTD1 queuine tRNA-ribosyltransferase accessory subunit 2 protein-coding 324-3 chr10 78139976 78140257 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 106253 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 491.666-3 chr14 71563791 71564258 + 1.66667 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) AluJr|SINE|Alu -22274 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 200-158 chr7 93458019 93458166 + 1.66667 NA intron (NM_001164738, intron 7 of 12) intron (NM_001164738, intron 7 of 12) 24763 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 233.333-72 chr2 231447875 231448141 + 1.66667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 7928 NR_002921 654321 Hs.674388 NR_002921 ENSG00000206885 SNORA75 SNORA75A|U23 small nucleolar RNA, H/ACA box 75 snoRNA 278.333-47 chr8 129099161 129099426 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -133292 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 150-84 chr20 48641046 48641222 + 1.66667 NA intron (NM_020820, intron 29 of 39) intron (NM_020820, intron 29 of 39) 186865 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 260.334-19 chr7 24666702 24666934 + 1.66667 NA intron (NM_016447, intron 9 of 12) intron (NM_016447, intron 9 of 12) 90646 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 226-18 chr12 105591932 105592095 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -112190 NR_110108 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 224.334-2 chr14 57181894 57182072 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 86922 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 212.333-41 chr14 47921164 47921356 + 1.66667 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -126246 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 349.667-21 chr5 106110005 106110522 + 1.66667 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL 900751 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 381-13 chr5 59241625 59242223 + 1.66667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 34191 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 503.333-3 chr14 62655974 62656642 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 389150 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 222.667-60 chr3 146351379 146351529 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -100275 NM_001128306 57088 Hs.477869 NM_020353 ENSG00000114698 PLSCR4 TRA1 phospholipid scramblase 4 protein-coding 256.333-52 chr3 49790523 49790832 + 1.66667 NA TTS (NM_001007540) TTS (NM_001007540) -4135 NM_153273 9807 Hs.386168 NM_153273 ENSG00000176095 IP6K1 IHPK1|PiUS inositol hexakisphosphate kinase 1 protein-coding 554-2 chr18 6595845 6596356 + 1.66667 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 84684 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 496.667-3 chr22 28596531 28597073 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 83063 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 331-4 chr1 211596402 211596774 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17427 NM_021194 7779 Hs.519469 NM_021194 ENSG00000170385 SLC30A1 ZNT1|ZRC1 solute carrier family 30 member 1 protein-coding 368.334-6 chr3 136028405 136028738 + 1.66667 NA intron (NM_181897, intron 2 of 12) intron (NM_181897, intron 2 of 12) 5829 NM_181897 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 348.333-35 chr8 132848701 132849080 + 1.66667 NA TTS (NM_016018) TTS (NM_016018) -18068 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 243-19 chr15 64993206 64993472 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3425 NM_001127890 51324 Hs.242458 NM_016630 ENSG00000090487 SPG21 ABHD21|ACP33|BM-019|GL010|MAST SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin protein-coding 669 chr6 148850816 148851519 + 1.66667 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) intron (NM_005715, intron 1 of 7) 104137 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 225-5 chr1 113627248 113627565 + 1.66667 NA intron (NM_001142782, intron 9 of 20) L1MA3|LINE|L1 131749 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 341.667-11 chr2 60609667 60610036 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -56197 NM_018014 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 257.667-80 chr7 124818231 124818539 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27575 NM_001024603 154872 Hs.444163 NM_001024603 ENSG00000275356 C7orf77 - chromosome 7 open reading frame 77 protein-coding 307.667-34 chr6 57053903 57054222 + 1.66667 NA exon (NM_001286274, exon 3 of 3) exon (NM_001286274, exon 3 of 3) 7315 NM_001286276 57691 Hs.709521 NM_020931 ENSG00000168116 KIAA1586 - KIAA1586 protein-coding 269.333-43 chr2 80466786 80467087 + 1.66667 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 153557 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 279-23 chr4 82889065 82889388 + 1.66667 NA intron (NM_016211, intron 1 of 24) intron (NM_016211, intron 1 of 24) 1927 NM_001077207 22872 Hs.370024 NM_014933 ENSG00000138674 SEC31A ABP125|ABP130|HSPC275|HSPC334|SEC31L1 SEC31 homolog A, COPII coat complex component protein-coding 212.666-39 chr2 39306227 39306377 + 1.66667 NA intron (NM_001270425, intron 14 of 32) intron (NM_001270425, intron 14 of 32) -62319 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 217-63 chr3 129453596 129453791 + 1.66667 NA intron (NM_052990, intron 3 of 26) L2a|LINE|L2 13469 NM_052985 55764 Hs.655284 NM_018262 ENSG00000163913 IFT122 CED|CED1|SPG|WDR10|WDR10p|WDR140 intraflagellar transport 122 protein-coding 235.333-35 chr15 35447946 35448178 + 1.66667 NA intron (NM_080650, intron 5 of 8) intron (NM_080650, intron 5 of 8) -75698 NR_037507 100500904 NR_037507 ENSG00000265102 MIR3942 - microRNA 3942 ncRNA 256.334-14 chr4 99710771 99710956 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -56184 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 203.334-2 chr2 142852159 142852355 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25407 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 280.333-30 chr4 77448561 77448803 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -63071 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 250-5 chr1 184053700 184053855 + 1.66667 NA intron (NR_125335, intron 1 of 5) intron (NR_125335, intron 1 of 5) 2047 NR_125335 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 366-23 chr6 17575159 17575591 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24927 NM_016255 51439 Hs.95260 NM_016255 ENSG00000137414 FAM8A1 AHCP family with sequence similarity 8 member A1 protein-coding 254.334-36 chr9 34307175 34307338 + 1.66667 NA intron (NM_194313, intron 2 of 12) AluJr|SINE|Alu 22012 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 258-48 chr3 191942377 191942672 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -296106 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 305.667-5 chr10 116044837 116045066 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 149838 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 273.001-2 chr10 90740508 90740686 + 1.66667 NA TTS (NM_019859) TTS (NM_019859) 117442 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 205.667-34 chr12 58844430 58844577 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -62787 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 253-19 chr13 31551411 31551676 + 1.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -187983 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 302.334-9 chr5 75000853 75001078 + 1.66667 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR 51593 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 411.666-5 chr3 23717590 23717989 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -88166 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 209.333-64 chr14 74740664 74740810 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -22579 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 247.334-18 chr4 170657350 170657590 + 1.66667 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 86265 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 366.666-5 chr2 4538660 4539168 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 117308 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 260.667-50 chr2 121937327 121937570 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 181797 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 309-35 chr8 62496682 62497026 + 1.66667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 248000 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 112.333-202 chr5 38813273 38813367 + 1.66667 NA intron (NR_109951, intron 1 of 3) L1ME3E|LINE|L1 32509 NR_109951 101929768 Hs.546623 NR_109951 OSMR-AS1 CTD-2127H9.1 OSMR antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 308.333-9 chr10 103998332 103998654 + 1.66667 NA intron (NM_001304743, intron 4 of 17) intron (NM_001304743, intron 4 of 17) 31353 NM_001304743 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 381.667-7 chr5 27188156 27188434 + 1.66667 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -149709 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 321.667-16 chr5 87733017 87733322 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 71127 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 388.667-15 chr9 29457090 29457456 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -243672 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 257-8 chr11 33453393 33453673 + 1.66667 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) CR1-3_Croc|LINE|CR1 77425 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 259.667-24 chr17 41436941 41437112 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_006771, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_006771, exon 7 of 7) 4318 NM_006771 8687 Hs.248188 NM_006771 ENSG00000171360 KRT38 HA8|KRTHA8|hHa8 keratin 38 protein-coding 263.334-4 chr18 3345397 3345603 + 1.66667 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 5059 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 274-42 chr4 91564470 91564709 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1PA14|LINE|L1 712713 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 286-33 chr2 209404272 209404523 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -19650 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 254.333-89 chr8 123965815 123966105 + 1.66667 NA intron (NM_001039112, intron 3 of 40) intron (NM_001039112, intron 3 of 40) 74822 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 257.667-77 chr7 43175621 43175913 + 1.66667 NA intron (NM_015052, intron 2 of 29) intron (NM_015052, intron 2 of 29) 24872 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 321.334-7 chr3 196296566 196296924 + 1.66667 NA intron (NM_152773, intron 3 of 4) intron (NM_152773, intron 3 of 4) -9019 NM_001312673 5130 Hs.135997 NM_005017 ENSG00000161217 PCYT1A CCTA|CT|CTA|CTPCT|PCYT1|SMDCRD phosphate cytidylyltransferase 1, choline, alpha protein-coding 231.667-19 chr15 23827901 23828049 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -140670 NM_002487 4692 Hs.50130 NM_002487 ENSG00000182636 NDN HsT16328|PWCR necdin, MAGE family member protein-coding 252.334-10 chr2 64261352 64261533 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 33041 NR_120420 100507006 Hs.442789 NR_120420 LOC100507006 - uncharacterized LOC100507006 ncRNA 300.334-4 chr14 22913613 22913827 + 1.66667 NA intron (NM_001352763, intron 1 of 14) AluSx4|SINE|Alu 5429 NM_001352763 55147 Hs.4997 NM_018107 ENSG00000100461 RBM23 CAPERbeta|PP239|RNPC4 RNA binding motif protein 23 protein-coding 202.334-3 chr18 78267976 78268181 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -274351 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 296.667-12 chr13 37687793 37688057 + 1.66667 NA intron (NM_001354806, intron 3 of 9) intron (NM_001354806, intron 3 of 9) -89081 NM_001286666 10631 Hs.136348 NM_006475 ENSG00000133110 POSTN OSF-2|OSF2|PDLPOSTN|PN periostin protein-coding 268.667-50 chr5 19457057 19457350 + 1.66667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 429069 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 267-28 chr15 76582444 76582765 + 1.66667 NA intron (NR_148227, intron 22 of 32) L1MA3|LINE|L1 -4043 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 334.334 chr1 64202871 64203309 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_158768) promoter-TSS (NR_158768) -533 NM_152489 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 277-18 chr15 58985814 58985987 + 1.66667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -1763 NM_001270528 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 203.334-3 chr9 137649605 137649770 + 1.66667 NA intron (NM_001354612, intron 1 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 30682 NM_001354611 79813 Hs.495511 NM_024757 ENSG00000181090 EHMT1 EHMT1-IT1|EUHMTASE1|Eu-HMTase1|FP13812|GLP|GLP1|KLEFS1|KMT1D euchromatic histone lysine methyltransferase 1 protein-coding 252-98 chr7 53171691 53171895 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 136160 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 216.333-104 chr4 22969782 22969927 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 255765 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 314.333-21 chr4 60360189 60360469 + 1.66667 NA Intergenic (ATTAGCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -562290 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 364.666-16 chr9 23514049 23514620 + 1.66667 NA intron (NR_121602, intron 23 of 27) LTR89|LTR|ERVL? 158065 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 264.333-79 chr9 32066706 32066995 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -317753 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 309.334-12 chr7 96523592 96523925 + 1.66667 NA intron (NR_163953, intron 2 of 5) intron (NR_163953, intron 2 of 5) -20235 NR_163948 370.334-7 chr8 123660553 123660811 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -6881 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 368-15 chr3 28073276 28073587 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -168188 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 177.667-53 chr15 56204577 56204740 + 1.66667 NA intron (NM_001370561, intron 4 of 11) intron (NM_001370561, intron 4 of 11) -14726 NM_001370554 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 215.667-110 chr6 156043225 156043419 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 96525 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 240-21 chr14 43462152 43462574 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 1044920 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 268-3 chr1 150959364 150959538 + 1.66667 NA intron (NM_001366417, intron 15 of 21) intron (NM_001366417, intron 15 of 21) 15384 NM_022075 29956 Hs.744017 NM_013384 ENSG00000143418 CERS2 L3|LASS2|SP260|TMSG1 ceramide synthase 2 protein-coding 238-67 chr4 55501711 55502061 + 1.66667 NA intron (NM_004898, intron 2 of 22) L1MC5|LINE|L1 44046 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 250.667-48 chr3 47613053 47613236 + 1.66667 NA intron (NM_003074, intron 25 of 27) L1ME3G|LINE|L1 -32904 NM_001206942 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 315.334-9 chr8 103117733 103118090 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3121 NR_145429 379034 Hs.591862 NR_145429 LINC01181 - long intergenic non-protein coding RNA 1181 ncRNA 202.667-8 chr1 104410714 104410879 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 337773 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 277.667-38 chr4 152636209 152636397 + 1.66667 NA intron (NM_152680, intron 6 of 6) intron (NM_152680, intron 6 of 6) 43694 NM_152680 201799 Hs.518900 NM_152680 ENSG00000170006 TMEM154 - transmembrane protein 154 protein-coding 270.333-41 chr4 31746536 31746886 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 240167 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 230.667-82 chr7 130267298 130267485 + 1.66667 NA intron (NM_001869, intron 1 of 10) intron (NM_001869, intron 1 of 10) 528 NM_001869 1358 Hs.490038 NM_001869 ENSG00000158516 CPA2 - carboxypeptidase A2 protein-coding 495.667 chr12 17751257 17751657 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 78158 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 246.667-15 chr11 22955046 22955317 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -94707 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 336.666-5 chr12 25961918 25962360 + 1.66667 NA intron (NM_001164748, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 -2697 NR_038228 100506451 Hs.560092 NR_038227 RASSF8-AS1 - RASSF8 antisense RNA 1 ncRNA 251.667-5 chr1 92271095 92271295 + 1.66667 NA intron (NR_135089, intron 8 of 17) intron (NR_135089, intron 8 of 17) 27792 NM_053274 11146 Hs.49105 NM_007070 ENSG00000174842 GLMN FAP|FAP48|FAP68|FKBPAP|GLML|GVM|VMGLOM glomulin, FKBP associated protein protein-coding 231-62 chr8 98706570 98706866 + 1.66667 NA intron (NM_006281, intron 5 of 10) intron (NM_006281, intron 5 of 10) 118953 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 382.334-6 chr16 67856604 67856888 + 1.66667 NA intron (NM_001322041, intron 1 of 4) AluSq|SINE|Alu -9053 NM_025082 80152 Hs.288382 NM_025082 ENSG00000102901 CENPT C16orf56|CENP-T centromere protein T protein-coding 255-57 chr4 69921096 69921369 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -9836 NM_001890 1446 Hs.3155 NM_001890 ENSG00000126545 CSN1S1 CASA|CSN1 casein alpha s1 protein-coding 277-20 chr17 55602885 55603197 + 1.66667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 119823 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 421.667-8 chr5 39070715 39071137 + 1.66667 NA intron (NM_001285439, intron 2 of 38) intron (NM_001285439, intron 2 of 38) 3473 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 258.667-99 chr8 129141604 129141876 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 99500 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 236-8 chr10 75761438 75761609 + 1.66667 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) L1MB4|LINE|L1 -21238 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 113.333-204 chr5 17866610 17866707 + 1.66667 NA intron (NR_134286, intron 4 of 7) L1M1|LINE|L1 59384 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 260.667-12 chr10 94457582 94457879 + 1.66667 NA intron (NM_015188, intron 2 of 12) L1MC1|LINE|L1 55189 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 240.334-14 chr9 105250569 105250753 + 1.66667 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) MIR3|SINE|MIR 6010 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 251.333-51 chr18 63414623 63414919 + 1.66667 NA intron (NM_004869, intron 1 of 10) intron (NM_004869, intron 1 of 10) 7705 NM_004869 9525 Hs.126550 NM_004869 ENSG00000119541 VPS4B MIG1|SKD1|SKD1B|VPS4-2 vacuolar protein sorting 4 homolog B protein-coding 526.667-3 chr6 169295368 169295817 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -41478 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 227.333-10 chr1 173917612 173917843 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_000488) promoter-TSS (NM_000488) -349 NM_000488 462 Hs.75599 NM_000488 ENSG00000117601 SERPINC1 AT3|AT3D|ATIII|ATIII-R2|ATIII-T1|ATIII-T2|THPH7 serpin family C member 1 protein-coding 245.666-16 chr3 68109418 68109660 + 1.66667 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 105292 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 226.667-30 chr12 28991850 28992028 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -157339 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 322.334-8 chr6 147696430 147696753 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 187901 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 258.333-38 chr21 21144838 21145135 + 1.66667 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) -2176 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 306.666-17 chr2 121086992 121087333 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 198040 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 248-64 chr4 113347387 113347618 + 1.66667 NA intron (NM_001354274, intron 34 of 42) intron (NM_001354274, intron 34 of 42) 54663 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 263.667-13 chr11 79597479 79597672 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -156545 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 303-31 chr2 66230858 66231215 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 127292 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 239.667-31 chr17 80588006 80588156 + 1.66667 NA intron (NM_020761, intron 1 of 33) L1MA7|LINE|L1 43243 NM_020761 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 210-107 chr4 93214926 93215240 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 4 of 14) MIR|SINE|MIR -613670 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 256-80 chr5 105655425 105655596 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 556036 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 285.667-33 chr3 59579659 59579920 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 78708 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 455.666-8 chr5 169334325 169334768 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -33407 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 249-13 chr10 88666357 88666542 + 1.66667 NA intron (NM_001198829, intron 2 of 10) L3|LINE|CR1 2007 NM_001198830 8513 Hs.523130 NM_004190 ENSG00000182333 LIPF GL|HGL|HLAL lipase F, gastric type protein-coding 275.667-18 chr12 118042060 118042363 + 1.66667 NA intron (NM_001278558, intron 2 of 6) intron (NM_001278558, intron 2 of 6) 19000 NM_018639 55884 Hs.506985 NM_018639 ENSG00000176871 WSB2 SBA2 WD repeat and SOCS box containing 2 protein-coding 310-45 chr5 128422953 128423292 + 1.66667 NA intron (NM_001999, intron 7 of 64) L2b|LINE|L2 115123 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 262.667-58 chr4 150293463 150293705 + 1.66667 NA intron (NM_001199282, intron 53 of 56) intron (NM_001199282, intron 53 of 56) 215139 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 286-51 chr5 102174478 102174653 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 121719 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 257.667-87 chr8 133826959 133827181 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -49718 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 284.334-6 chr10 70902734 70902994 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14299 NM_000281 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 239.667-49 chr4 39803906 39804132 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 105883 NM_001111112 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 263.334-16 chr7 54027239 54027451 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -215414 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 183.667-53 chr15 71435329 71435458 + 1.66667 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) LTR49-int|LTR|ERV1 -111843 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 247-63 chr5 86321551 86321711 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 39187 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 170.666-3 chr10 30995369 30995576 + 1.66667 NA intron (NM_001143766, intron 1 of 7) L1M4b|LINE|L1 4045 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 285.666-10 chr7 31860416 31860816 + 1.66667 NA intron (NM_001191059, intron 8 of 18) L1ME3G|LINE|L1 173401 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 353.667-16 chr8 109239635 109239892 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 90170 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 206.666-76 chr3 94709445 94709771 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -228655 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 180.334-4 chr8 92303343 92303503 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -200038 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 204.667-121 chr5 66897655 66897858 + 1.66667 NA intron (NM_015183, intron 1 of 27) intron (NM_015183, intron 1 of 27) -61317 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 543.333-2 chr12 66176132 66176661 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -6324 NM_001282606 51643 Hs.505934 NM_016056 ENSG00000155957 TMBIM4 CGI-119|GAAP|LFG4|S1R|ZPRO transmembrane BAX inhibitor motif containing 4 protein-coding 270.667-8 chr11 32777977 32778190 + 1.66667 NA intron (NM_001008391, intron 1 of 17) intron (NM_001008391, intron 1 of 17) 16575 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 491.334-4 chr4 80668674 80669092 + 1.66667 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) L1MA4|LINE|L1 333163 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 273-32 chr5 150602638 150602955 + 1.66667 NA intron (NM_001166208, intron 1 of 2) FLAM_C|SINE|Alu 1720 NM_001166208 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 220.334-3 chr4 30629095 30629245 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -91199 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 267.333-8 chr1 211656718 211656985 + 1.66667 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 17043 NR_131925 105748977 Hs.553186 NR_131925 LINC01693 - long intergenic non-protein coding RNA 1693 ncRNA 634.667 chr4 183628160 183628693 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 30759 NM_001307922 201965 Hs.133337 NM_152682 ENSG00000182552 RWDD4 FAM28A|RWDD4A RWD domain containing 4 protein-coding 250-22 chr12 17734893 17735091 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 61693 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 261-59 chr8 103537379 103537561 + 1.66667 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) intron (NM_001348497, intron 1 of 22) -35560 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 407-9 chr5 161759623 161760068 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 74124 NM_000811 2559 Hs.90791 NM_000811 ENSG00000145863 GABRA6 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha6 subunit protein-coding 262.333-26 chr15 38166210 38166540 + 1.66667 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 -86461 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 241.667-3 chr1 103012847 103013025 + 1.66667 NA intron (NM_001854, intron 13 of 66) intron (NM_001854, intron 13 of 66) 95560 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 426.333-4 chr15 57795058 57795385 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 88507 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 358.001-2 chr21 29723222 29723574 + 1.66667 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -24777 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 267.333-94 chr9 6811414 6811718 + 1.66667 NA intron (NR_148680, intron 3 of 21) intron (NR_148680, intron 3 of 21) 54216 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 272.334-3 chr1 215709965 215710177 + 1.66667 NA intron (NM_206933, intron 61 of 71) intron (NM_206933, intron 61 of 71) 142767 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 420.334-2 chr15 77256257 77256699 + 1.66667 NA intron (NM_024776, intron 3 of 7) intron (NM_024776, intron 3 of 7) -31074 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 264.334-6 chr13 33902272 33902521 + 1.66667 NA intron (NM_181558, intron 8 of 8) intron (NM_181558, intron 8 of 8) 84247 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 216.334 chr3 120894144 120894308 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13979 NM_014980 9515 Hs.477315 NM_014980 ENSG00000145087 STXBP5L LLGL4 syntaxin binding protein 5 like protein-coding 254.667-18 chr12 62074048 62074232 + 1.66667 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 118699 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 357.667 chr10 68352364 68352737 + 1.66667 NA intron (NR_103476, intron 16 of 18) HAL1|LINE|L1 -19622 NM_022129 64081 Hs.198158 NM_022129 ENSG00000108187 PBLD HEL-S-306|MAWBP|MAWDBP phenazine biosynthesis like protein domain containing protein-coding 234-9 chr10 93650719 93650963 + 1.66667 NA intron (NM_006204, intron 15 of 21) HAL1b|LINE|L1 38304 NM_006204 5146 Hs.658121 NM_006204 ENSG00000095464 PDE6C ACHM5|COD4|PDEA2 phosphodiesterase 6C protein-coding 247.333-34 chr18 9679623 9679872 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28554 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 433.334-3 chr9 28158850 28159165 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 560298 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 469-7 chr3 183372831 183373293 + 1.66667 NA intron (NM_015078, intron 3 of 29) intron (NM_015078, intron 3 of 29) 55207 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 234.667-25 chr12 43965436 43965662 + 1.66667 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 129468 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 419.333-13 chr5 34998316 34998847 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_031900, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_031900, exon 14 of 14) 49368 NM_031900 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 430.667-8 chr2 224534315 224534658 + 1.66667 NA intron (NM_001257197, intron 2 of 14) intron (NM_001257197, intron 2 of 14) 35469 NM_001257198 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 280-56 chr9 25407259 25407560 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 271449 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 321-12 chr18 42434580 42434796 + 1.66667 NA intron (NR_046174, intron 4 of 9) intron (NR_046174, intron 4 of 9) 248020 NR_046174 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 224-63 chr3 169002853 169003028 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 100995 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 244.334-19 chr5 145417997 145418225 + 1.66667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 417231 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 258.333-67 chr8 120032874 120033090 + 1.66667 NA intron (NM_022783, intron 8 of 8) intron (NM_022783, intron 8 of 8) -92120 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 460.999-2 chr2 114661026 114661439 + 1.66667 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 172316 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 252-121 chrX 96324406 96324612 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 13393 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 188.334-3 chr4 81308942 81309097 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -93797 NM_001363401 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 179.667-34 chr12 9049945 9050129 + 1.66667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 15033 NR_034140 253128 Hs.408739 NM_001039381 ENSG00000214851 LINC00612 C12orf33 long intergenic non-protein coding RNA 612 ncRNA 432.667-12 chr8 29866440 29866957 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -38194 NR_125817 101929470 Hs.204721 NR_125817 ENSG00000248964 LOC101929470 - uncharacterized LOC101929470 ncRNA 222.333-88 chr7 43126572 43126775 + 1.66667 NA intron (NR_135295, intron 3 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 8777 NR_135295 100127950 Hs.666610 NR_135295 ENSG00000181211 HECW1-IT1 - HECW1 intronic transcript 1 ncRNA 264.666-19 chr2 100954237 100954525 + 1.66667 NA intron (NM_002518, intron 7 of 20) MER74A|LTR|ERVL 22780 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 307.333-37 chr18 31744554 31744931 + 1.66667 NA Intergenic LTR9C|LTR|ERV1 16138 NM_001034172 147407 Hs.567708 NM_001034172 ENSG00000141437 SLC25A52 MCART2 solute carrier family 25 member 52 protein-coding 341.333-18 chr4 62763781 62764102 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -602176 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 391.334-2 chr20 54867787 54868206 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 392403 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 363.667-3 chr14 46259833 46260163 + 1.66667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) 195839 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 266.333-59 chr7 83543800 83544117 + 1.66667 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 97473 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 226.667-16 chr10 17244746 17244905 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -14840 NR_108061 100507347 Hs.740502 NR_108060 ENSG00000229124 VIM-AS1 - VIM antisense RNA 1 ncRNA 234.333-78 chr7 83340626 83340945 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -177901 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 285.666-3 chr17 61801711 61802045 + 1.66667 NA intron (NM_032043, intron 7 of 19) L1ME4b|LINE|L1 61681 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 221-27 chr16 85470870 85471065 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -140442 NM_001134473 23199 Hs.461647 NM_014615 ENSG00000131149 GSE1 CRHSP24|KIAA0182 Gse1 coiled-coil protein protein-coding 258.667-85 chr6 84028167 84028338 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5520 NM_138409 112609 Hs.370055 NM_138409 ENSG00000135324 MRAP2 C6orf117|bA51G5.2 melanocortin 2 receptor accessory protein 2 protein-coding 512.334-2 chr9 89702858 89703264 + 1.66667 NA intron (NR_024280, intron 5 of 5) AluSx1|SINE|Alu 63278 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 246.667-98 chr8 108186282 108186504 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 62324 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 303.667-27 chr8 120690377 120690673 + 1.66667 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) L1M5|LINE|L1 -70728 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 224.666-30 chr5 9869583 9869831 + 1.66667 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) MER68|LTR|ERVL 15330 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 318.333-17 chr18 62092035 62092466 + 1.66667 NA intron (NM_176787, intron 23 of 30) intron (NM_176787, intron 23 of 30) 94806 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 233.334-3 chr21 28946138 28946338 + 1.66667 NA exon (NM_001320766, exon 19 of 29) exon (NM_001320766, exon 19 of 29) 46639 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 287.333-29 chr2 50608352 50608665 + 1.66667 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) intron (NM_001330093, intron 8 of 22) 87754 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 388.667-7 chr2 173190963 173191202 + 1.66667 NA exon (NM_016653, exon 7 of 20) exon (NM_016653, exon 7 of 20) 90954 NR_033882 339751 Hs.570083 NR_033882 ENSG00000238133 MAP3K20-AS1 MLK7-AS1 MAP3K20 antisense RNA 1 ncRNA 278.333 chr1 9944663 9945009 + 1.66667 NA intron (NM_001297779, intron 1 of 4) intron (NM_001297779, intron 1 of 4) 1361 NM_022787 64802 Hs.633762 NM_022787 ENSG00000173614 NMNAT1 LCA9|NMNAT|PNAT1 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 protein-coding 280.334-2 chr1 98012391 98012687 + 1.66667 NA intron (NR_046105, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 32812 NR_039604 100616452 NR_039604 ENSG00000284247 MIR2682 mir-2682 microRNA 2682 ncRNA 263.334-17 chr8 61377667 61377916 + 1.66667 NA intron (NM_173519, intron 3 of 5) intron (NM_173519, intron 3 of 5) 89821 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 173-17 chr11 85040024 85040215 + 1.66667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -116698 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 262.667-11 chr10 32994467 32994712 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -36359 NM_002211 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 445.001 chr11 66227080 66227520 + 1.66667 NA intron (NM_018026, intron 10 of 23) intron (NM_018026, intron 10 of 23) -29994 NM_001134775 64837 Hs.280792 NM_022822 ENSG00000174996 KLC2 - kinesin light chain 2 protein-coding 307.667-36 chr7 4090339 4090708 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 22 of 44) L1MC4|LINE|L1 -39162 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 380-19 chr8 118374076 118374530 + 1.66667 NA intron (NM_001363274, intron 4 of 4) L1MB2|LINE|L1 -246698 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 178.333-104 chr3 89274239 89274461 + 1.66667 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 166729 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 247.667-102 chr9 104158675 104158845 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 64133 NM_001042550 10592 Hs.119023 NM_006444 ENSG00000136824 SMC2 CAP-E|CAPE|SMC-2|SMC2L1 structural maintenance of chromosomes 2 protein-coding 347.334-7 chr5 20284371 20284764 + 1.66667 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) intron (NM_001349556, intron 1 of 13) -20984 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 261.667-60 chr5 67577607 67577797 + 1.66667 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA 69087 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 253.334-2 chr10 99890018 99890285 + 1.66667 NA intron (NM_015221, intron 11 of 16) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 23941 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 390.333 chr1 45715859 45716288 + 1.66667 NA intron (NM_001145349, intron 7 of 9) intron (NM_001145349, intron 7 of 9) 27892 NM_016486 51249 Hs.699548 NM_016486 ENSG00000159596 TMEM69 C1orf154 transmembrane protein 69 protein-coding 239.333-66 chr3 11558019 11558354 + 1.66667 NA TTS (NM_006395) TTS (NM_006395) 10612 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 484-6 chr8 62486814 62487281 + 1.66667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 238193 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 269.333-55 chr20 58831592 58831926 + 1.66667 NA intron (NR_002785, intron 4 of 4) intron (NR_002785, intron 4 of 4) -7989 NM_016592 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 278.667-35 chr3 122056808 122057110 + 1.66667 NA intron (NM_001206925, intron 1 of 5) intron (NM_001206925, intron 1 of 5) 1597 NM_001206924 942 Hs.171182 NM_006889 ENSG00000114013 CD86 B7-2|B7.2|B70|CD28LG2|LAB72 CD86 molecule protein-coding 353-10 chr2 99249976 99250281 + 1.66667 NA intron (NM_175735, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 4979 NM_175735 254773 Hs.436468 NM_175735 ENSG00000185674 LYG2 LYGH|LYSG2 lysozyme g2 protein-coding 290.667-29 chr3 83547287 83547591 + 1.66667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 1322136 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 252.334-18 chr5 59609032 59609256 + 1.66667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -21519 NM_001364604 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 294.333-29 chr3 167339221 167339616 + 1.66667 NA intron (NM_001199202, intron 9 of 20) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 40865 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 292-6 chr12 3629691 3630038 + 1.66667 NA intron (NM_001144958, intron 15 of 19) intron (NM_001144958, intron 15 of 19) 123245 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 262-5 chr1 240447462 240447656 + 1.66667 NA intron (NM_020066, intron 16 of 17) L1MB7|LINE|L1 164596 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 227-13 chr11 114602162 114602397 + 1.66667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6493 NM_001077639 54827 Hs.179100 NM_017678 ENSG00000137634 NXPE4 C11orf33|FAM55D neurexophilin and PC-esterase domain family member 4 protein-coding 190.667-49 chr15 92234211 92234380 + 1.66667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -159586 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 251.667-27 chr17 53604338 53604496 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -218510 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 259-45 chr6 42384279 42384582 + 1.66667 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) L1ME4b|LINE|L1 67621 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 155.333-109 chr14 62668776 62668945 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 376598 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 473.333-7 chr7 6382924 6383469 + 1.66667 NA intron (NM_006908, intron 1 of 5) intron (NM_006908, intron 1 of 5) 8669 NM_006908 5879 Hs.413812 NM_006908 ENSG00000136238 RAC1 MIG5|MRD48|Rac-1|TC-25|p21-Rac1 Rac family small GTPase 1 protein-coding 257.667-49 chr20 51644379 51644636 + 1.66667 NA intron (NM_006045, intron 14 of 27) AluY|SINE|Alu -81668 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 424.667-3 chr15 65002260 65002572 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_139242, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_139242, exon 9 of 9) -12502 NM_001127890 51324 Hs.242458 NM_016630 ENSG00000090487 SPG21 ABHD21|ACP33|BM-019|GL010|MAST SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin protein-coding 329-5 chr10 95962195 95962543 + 1.66667 NA intron (NM_001349008, intron 12 of 34) L1M5|LINE|L1 -37722 NM_001001732 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 237-9 chr10 4726800 4727056 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48858 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 305.667-3 chr10 64403525 64403814 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -421859 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 249-43 chr2 220081974 220082155 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -175499 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 222.334-5 chr16 54245231 54245388 + 1.66667 NA TTS (NR_126340) TTS (NR_126340) 25570 NR_126340 100996338 Hs.232014 NR_126340 LINC02169 - long intergenic non-protein coding RNA 2169 ncRNA 258-71 chr6 53783216 53783461 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -11667 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 328.667-10 chr4 37692935 37693315 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -6749 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 250.333-71 chr7 93286361 93286627 + 1.66667 NA intron (NM_001257998, intron 13 of 28) MIRc|SINE|MIR 54128 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 256.667-26 chr14 44779435 44779618 + 1.66667 NA intron (NR_146457, intron 2 of 4) L1MC5a|LINE|L1 19600 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 226.333-27 chr13 87235437 87235628 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 323612 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 273.333-58 chr5 28511830 28512082 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -224291 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 450.001 chr2 48377324 48377770 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_002158, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_002158, exon 7 of 7) 62865 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 436.334-2 chr2 28481087 28481573 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -14730 NM_153021 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 240.333-58 chr21 30658687 30658870 + 1.66667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 15914 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 315.667-22 chr6 129651801 129652157 + 1.66667 NA intron (NM_033515, intron 1 of 14) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 58198 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 275.999-8 chrX 96808902 96809238 + 1.66667 NA intron (NM_007309, intron 4 of 26) intron (NM_007309, intron 4 of 26) -74838 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 206.334-5 chr14 60777799 60777928 + 1.66667 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 43102 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 265.667-21 chr14 68874387 68874561 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001130004, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_001130004, exon 22 of 22) -78231 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 260.333-3 chr10 16007579 16007838 + 1.66667 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -147175 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 326.334-3 chr15 89210137 89210451 + 1.66667 NA exon (NM_000326, exon 9 of 9) exon (NM_000326, exon 9 of 9) 11285 NM_000326 6017 Hs.1933 NM_000326 ENSG00000140522 RLBP1 CRALBP retinaldehyde binding protein 1 protein-coding 253.667-77 chr8 107138964 107139224 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 197421 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 230.334-5 chr14 43042915 43043072 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1436137 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 220.333-103 chr4 56663959 56664248 + 1.66667 NA intron (NM_032495, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR -7581 NM_001145459 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 414-4 chr12 121787196 121787509 + 1.66667 NA intron (NM_019034, intron 2 of 4) intron (NM_019034, intron 2 of 4) 6336 NM_019034 54509 Hs.707579 NM_019034 ENSG00000139725 RHOF ARHF|RIF ras homolog family member F, filopodia associated protein-coding 262.667-31 chr17 68380715 68380949 + 1.66667 NA intron (NM_001352899, intron 8 of 12) MIRb|SINE|MIR -32791 NM_001278433 5573 Hs.280342 NM_002734 ENSG00000108946 PRKAR1A ACRDYS1|ADOHR|CAR|CNC|CNC1|PKR1|PPNAD1|PRKAR1|TSE1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha protein-coding 225.333-31 chr12 3814949 3815182 + 1.66667 NA intron (NR_104461, intron 6 of 8) L1ME3Cz|LINE|L1 58334 NR_104461 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 327.334-10 chr9 89533979 89534258 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36145 NM_001371194 234.333-71 chr7 3033162 3033422 + 1.66667 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 10575 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 235.667-20 chr14 66915292 66915482 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) intron (NM_001024218, intron 5 of 21) -274053 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 149.667-324 chr5 93969648 93969800 + 1.66667 NA intron (NR_028080, intron 3 of 8) intron (NR_028080, intron 3 of 8) 141939 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 372-15 chr4 26325163 26325402 + 1.66667 NA intron (NM_001363577, intron 1 of 10) L2|LINE|L2 4054 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 238.667-42 chr2 74803478 74803749 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -29042 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 189-83 chr6 138670139 138670371 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -21413 NR_033896 441172 Hs.92290 NR_033896 FLJ46906 - uncharacterized LOC441172 ncRNA 272.667-2 chr1 12487179 12487366 + 1.66667 NA intron (NM_015378, intron 67 of 69) intron (NM_015378, intron 67 of 69) -19974 NR_003022 677882 Hs.658450 NR_003022 ENSG00000266079 SNORA59B ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59B snoRNA 300-37 chr21 30453807 30454058 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 13653 NM_181623 254950 Hs.553654 NM_181623 ENSG00000186970 KRTAP15-1 KAP15.1 keratin associated protein 15-1 protein-coding 252.667-35 chr15 91489378 91489565 + 1.66667 NA non-coding (NR_110106, exon 3 of 4) non-coding (NR_110106, exon 3 of 4) 26132 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 365.334-8 chr5 174451846 174452080 + 1.66667 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) L1MA5|LINE|L1 115609 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 160.333-206 chr4 36931067 36931285 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70603 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 293-6 chr1 212773520 212773814 + 1.66667 NA intron (NM_001042549, intron 4 of 6) L1MA3|LINE|L1 18110 NM_001297736 25936 Hs.497692 NM_015471 ENSG00000117697 NSL1 C1orf48|DC8|MIS14 NSL1 component of MIS12 kinetochore complex protein-coding 227.333-125 chr8 86369107 86369342 + 1.66667 NA intron (NM_007013, intron 2 of 24) MIRc|SINE|MIR 26677 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 270.667-14 chr13 64202707 64202926 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -126805 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 211-54 chr20 44482714 44482905 + 1.66667 NA intron (NM_001039199, intron 2 of 4) intron (NM_001039199, intron 2 of 4) 6935 NM_024331 79183 Hs.283869 NM_024331 ENSG00000124120 TTPAL C20orf121 alpha tocopherol transfer protein like protein-coding 376.666-15 chr9 131616747 131617166 + 1.66667 NA intron (NM_198679, intron 11 of 23) intron (NM_198679, intron 11 of 23) 71433 NM_001365666 642515 NM_001365666 ENSG00000283526 PRRT1B DSPD2|IFITMD8 proline rich transmembrane protein 1B protein-coding 284.334-2 chr1 69881008 69881320 + 1.66667 NA intron (NM_001370785, intron 7 of 26) L2c|LINE|L2 -38158 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 241.334-2 chr1 183720191 183720376 + 1.66667 NA intron (NM_001297669, intron 2 of 18) intron (NM_001297669, intron 2 of 18) -66967 NM_203454 403314 Hs.97335 NM_203454 ENSG00000173627 APOBEC4 C1orf169 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4 protein-coding 217-56 chr3 22527005 22527234 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 569980 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 282.334-12 chr4 48751897 48752081 + 1.66667 NA intron (NM_015030, intron 1 of 63) intron (NM_015030, intron 1 of 63) 28310 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 335.667-12 chr18 2740437 2740817 + 1.66667 NA intron (NM_015295, intron 27 of 47) intron (NM_015295, intron 27 of 47) 84740 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 151-58 chr2 104602816 104603099 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -92448 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 547.334-2 chr9 24096557 24096988 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -246171 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 256.334-19 chr7 70321978 70322141 + 1.66667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 723584 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 188.333-117 chr5 14046844 14047065 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -96388 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 279-8 chr12 33007497 33007783 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -110794 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 316.666-14 chr4 114023434 114023681 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -43910 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 272.667-54 chr5 108593093 108593301 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 135064 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 219.667-56 chr3 107096521 107096716 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 144020 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 263-14 chr11 113912951 113913188 + 1.66667 NA intron (NM_006028, intron 2 of 8) L1ME2|LINE|L1 4228 NM_001363563 9177 Hs.241377 NM_006028 ENSG00000149305 HTR3B 5-HT3B 5-hydroxytryptamine receptor 3B protein-coding 253.667-24 chr15 92939979 92940143 + 1.66667 NA intron (NM_001042572, intron 7 of 12) intron (NM_001042572, intron 7 of 12) 35662 NR_036136 100422995 NR_036136 ENSG00000284324 MIR3175 mir-3175 microRNA 3175 ncRNA 366.333 chr1 12347377 12347913 + 1.66667 NA intron (NM_015378, intron 44 of 69) intron (NM_015378, intron 44 of 69) 117615 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 240.666-7 chr10 59800942 59801170 + 1.66667 NA intron (NM_005436, intron 7 of 8) intron (NM_005436, intron 7 of 8) -47601 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 236-30 chr17 63143525 63143694 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 177374 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 246.334-7 chr14 83229652 83229863 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 587125 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 249.333-70 chr3 100721074 100721347 + 1.66667 NA intron (NM_001007565, intron 3 of 7) L1MEd|LINE|L1 11668 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 169.333-52 chr12 45246018 45246226 + 1.66667 NA intron (NM_001025356, intron 1 of 19) intron (NM_001025356, intron 1 of 19) 30027 NM_001142679 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 114.333-30 chr10 74621667 74621737 + 1.66667 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) L1MC4a|LINE|L1 -92378 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 242.333-31 chr14 60312385 60312594 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10707 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 316-52 chr8 125844565 125844816 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 106507 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 367.001 chr5 17125821 17126135 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 30014 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 320-49 chr8 76527646 76527978 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 121158 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 250.334-3 chr11 88200881 88201105 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 24491 NR_036124 100423040 NR_036124 ENSG00000266581 MIR3166 - microRNA 3166 ncRNA 248.667-86 chr5 42610042 42610245 + 1.66667 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 44279 NM_001242462 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 360.333-14 chr2 190531721 190532064 + 1.66667 NA intron (NR_136298, intron 1 of 8) intron (NR_136298, intron 1 of 8) 2830 NM_001142645 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 311-15 chr2 76837472 76837780 + 1.66667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1PA3|LINE|L1 -148339 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 251.667-22 chr13 55314724 55314968 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 140392 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 432.334 chr12 32169262 32169594 + 1.66667 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) intron (NR_148725, intron 1 of 9) 62581 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 394.667-11 chr8 111784014 111784445 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 407590 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 277.666-7 chr14 32669308 32669591 + 1.66667 NA intron (NM_004274, intron 7 of 13) intron (NM_004274, intron 7 of 13) -269430 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 331-12 chr12 82571266 82571498 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -115524 NM_152588 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 266-9 chr10 44683162 44683453 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -228009 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 250.667-90 chr9 94669270 94669425 + 1.66667 NA Intergenic MER61F|LTR|ERV1 -29098 NM_001127628 2203 Hs.494496 NM_000507 ENSG00000165140 FBP1 FBP fructose-bisphosphatase 1 protein-coding 546.667 chr2 206561124 206561660 + 1.66667 NA intron (NM_003812, intron 12 of 25) intron (NM_003812, intron 12 of 25) -82835 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 295.667-4 chr10 92524074 92524254 + 1.66667 NA intron (NR_136399, intron 4 of 25) AluSg7|SINE|Alu -26403 NM_001165946 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 231.334-4 chr15 90581254 90581457 + 1.66667 NA intron (NM_001042574, intron 2 of 14) intron (NM_001042574, intron 2 of 14) 51432 NM_022769 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 280.334-8 chr5 134054047 134054236 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -49166 NM_003374 7416 Hs.519320 NM_003374 ENSG00000213585 VDAC1 PORIN|VDAC-1 voltage dependent anion channel 1 protein-coding 255.334-5 chr10 62378082 62378302 + 1.66667 NA intron (NM_199451, intron 2 of 7) intron (NM_199451, intron 2 of 7) -3065 NR_104162 283045 NR_104162 LOC283045 - uncharacterized LOC283045 ncRNA 356.667-11 chr3 118067828 118068284 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -377131 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 333.333-25 chr18 12682608 12682977 + 1.66667 NA intron (NM_001271989, intron 7 of 10) AluSz|SINE|Alu 19931 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 391.333-17 chr5 50924490 50924958 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 45463 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 389.666-6 chr22 28323197 28323661 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1M1|LINE|L1 -136440 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 260-67 chr5 169238029 169238333 + 1.66667 NA intron (NM_003062, intron 3 of 35) L1MC3|LINE|L1 25513 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 251-93 chr9 132821520 132821784 + 1.66667 NA intron (NM_001317959, intron 11 of 14) intron (NM_001317959, intron 11 of 14) -56692 NR_133631 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 279-2 chr1 45662173 45662455 + 1.66667 NA intron (NM_021639, intron 2 of 12) AluJr|SINE|Alu -15629 NR_026768 728963 Hs.675157 NR_026768 RPS15AP10 RPS15A_4_42 ribosomal protein S15a pseudogene 10 pseudo 357-18 chr5 25756017 25756396 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 565253 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 323-16 chr2 33107835 33108147 + 1.66667 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) intron (NM_206943, intron 3 of 33) -26606 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 248-37 chr19 45190990 45191309 + 1.66667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 12404 NM_212550 388552 Hs.103902 NM_212550 ENSG00000189114 BLOC1S3 BLOS3|HPS8|RP biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 3 protein-coding 298.333-5 chr10 28900368 28900659 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 54105 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 338.666-18 chr9 70759990 70760488 + 1.66667 NA intron (NM_001366143, intron 8 of 25) intron (NM_001366143, intron 8 of 25) 49845 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 308.667-17 chr17 61737025 61737470 + 1.66667 NA intron (NM_032043, intron 16 of 19) L1M4|LINE|L1 126312 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 263.667-29 chr15 63545043 63545298 + 1.66667 NA intron (NM_006537, intron 3 of 14) intron (NM_006537, intron 3 of 14) 40577 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 316-36 chr4 15423231 15423553 + 1.66667 NA intron (NM_001135171, intron 1 of 2) intron (NM_001135171, intron 1 of 2) 4522 NR_125911 101929095 Hs.656908 NR_125911 ENSG00000249252 LOC101929095 - uncharacterized LOC101929095 ncRNA 239.667-76 chr8 121043345 121043582 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -231417 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 278.333-40 chr7 34467661 34467897 + 1.66667 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) L1MA4A|LINE|L1 -190439 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 491.666-4 chr7 44365811 44366156 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -40352 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 335.333-46 chr6 64801707 64801994 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -499568 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 305 chr10 75042525 75042756 + 1.66667 NA intron (NM_001003892, intron 2 of 2) intron (NM_001003892, intron 2 of 2) 15943 NM_001003892 338599 Hs.535090 NM_001003892 ENSG00000188716 DUPD1 DUSP27|FMDSP dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 protein-coding 277.667-32 chr3 121128463 121128775 + 1.66667 NA intron (NR_145517, intron 7 of 8) ERVL-E-int|LTR|ERVL 78979 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 250.333-82 chrX 124947228 124947495 + 1.66667 NA intron (NM_014253, intron 1 of 30) intron (NM_014253, intron 1 of 30) 16456 NM_001163278 10178 Hs.23796 NM_014253 ENSG00000009694 TENM1 ODZ1|ODZ3|TEN-M1|TNM|TNM1|ten-1 teneurin transmembrane protein 1 protein-coding 233-43 chr21 15230090 15230276 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -165183 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 254.334-3 chr10 22434890 22435080 + 1.66667 NA TTS (NR_036533) TTS (NR_036533) 2944 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 454.667 chr10 91188725 91189174 + 1.66667 NA intron (NM_001257101, intron 1 of 9) L2|LINE|L2 25937 NM_001257101 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 245.334-11 chr2 152207284 152207493 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31625 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 255.334-17 chr2 106185674 106185866 + 1.66667 NA intron (NM_025076, intron 1 of 14) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 8569 NM_001253875 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 229.667-84 chr9 130731325 130731475 + 1.66667 NA intron (NM_007313, intron 1 of 10) L1M5|LINE|L1 17519 NM_007313 25 Hs.431048 NM_005157 ENSG00000097007 ABL1 ABL|CHDSKM|JTK7|bcr/abl|c-ABL|c-ABL1|p150|v-abl ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 253.667-40 chr3 31063457 31063726 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 98196 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 268.667-64 chr8 131083222 131083397 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -42400 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 260.667-97 chr9 72536662 72536949 + 1.66667 NA intron (NM_138691, intron 1 of 23) MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR 15004 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 248.667-115 chrX 46222645 46222803 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 104950 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 287-15 chr2 80120491 80120825 + 1.66667 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 184094 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 247.667-5 chr1 196512413 196512651 + 1.66667 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) L2b|LINE|L2 69949 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 407 chr1 54726248 54726572 + 1.66667 NA intron (NM_004623, intron 5 of 9) L1M4|LINE|L1 10549 NM_004623 7268 Hs.412482 NM_004623 ENSG00000243725 TTC4 CNS1 tetratricopeptide repeat domain 4 protein-coding 230.334-6 chr16 83887153 83887308 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11885 NM_012213 23417 Hs.644610 NM_012213 ENSG00000103150 MLYCD MCD malonyl-CoA decarboxylase protein-coding 257.333-93 chr7 84377418 84377675 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -154930 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 342.667-7 chr4 38839324 38839695 + 1.66667 NA intron (NM_006068, intron 1 of 1) intron (NM_006068, intron 1 of 1) 17308 NM_006068 10333 Hs.575090 NM_006068 ENSG00000174130 TLR6 CD286 toll like receptor 6 protein-coding 314.667-17 chr14 55168021 55168273 + 1.66667 NA intron (NM_001146015, intron 12 of 19) AluJo|SINE|Alu 23438 NM_014750 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 296-25 chr2 9157635 9157963 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48966 NM_001135191 8853 Hs.555902 NM_003887 ENSG00000151693 ASAP2 AMAP2|CENTB3|DDEF2|PAG3|PAP|Pap-alpha|SHAG1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 329.333-28 chr20 54877150 54877516 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 401740 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 291-5 chr10 18229530 18229868 + 1.66667 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) -31023 NM_001330060 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 289.667-31 chr5 43827269 43827568 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -224188 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 358.333-6 chr10 69391202 69391714 + 1.66667 NA intron (NM_033496, intron 14 of 17) AluJb|SINE|Alu 25460 NM_001057 6865 Hs.88372 NM_001057 ENSG00000075073 TACR2 NK2R|NKNAR|SKR|TAC2R tachykinin receptor 2 protein-coding 412.667-7 chr2 44676224 44676585 + 1.66667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L2|LINE|L2 262484 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 255-86 chr8 140442212 140442411 + 1.66667 NA intron (NM_001160372, intron 2 of 22) intron (NM_001160372, intron 2 of 22) 15433 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 253.334-9 chr2 115768800 115769006 + 1.66667 NA intron (NM_001321912, intron 14 of 25) L1MC4a|LINE|L1 425088 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 354.667-22 chr8 112866402 112866707 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 8 of 66) intron (NM_001363185, intron 8 of 66) 223061 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 300-66 chr8 67924810 67925093 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -27095 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 400.334-4 chr5 101882580 101882863 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 413563 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 231-13 chr13 94208357 94208613 + 1.66667 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 -20494 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 175 chr1 38438222 38438346 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -36912 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 217-88 chr8 116212484 116212705 + 1.66667 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 112465 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 263-15 chr12 68099540 68099710 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 60115 NM_000619 3458 Hs.856 NM_000619 ENSG00000111537 IFNG IFG|IFI interferon gamma protein-coding 414.667-8 chr2 19333626 19333937 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -14648 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 408.667-9 chr7 40533308 40533721 + 1.66667 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 398538 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 267.334-3 chr13 58171640 58171912 + 1.66667 NA intron (NR_120416, intron 1 of 2) intron (NR_120416, intron 1 of 2) 5949 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 181.334-4 chr17 71233630 71233772 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31522 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 270.666-2 chr10 73982418 73982720 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15545 NM_014000 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 455.333-5 chr2 104571091 104571574 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -60823 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 237.667-42 chr2 144883888 144884078 + 1.66667 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) intron (NR_033870, intron 2 of 4) 216016 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 257.667-8 chr10 59301318 59301485 + 1.66667 NA intron (NM_001347852, intron 5 of 12) intron (NM_001347852, intron 5 of 12) 61148 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 377.667-2 chr1 193783702 193783928 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 479070 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 319-33 chr9 105337966 105338338 + 1.66667 NA intron (NM_001330731, intron 4 of 15) intron (NM_001330731, intron 4 of 15) 93501 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 224.667-37 chr2 24524911 24525124 + 1.66667 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) intron (NM_001362952, intron 1 of 23) 33140 NM_001362954 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 343.667-17 chr9 102428370 102428670 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -91117 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 375.667-7 chr15 64256278 64256688 + 1.66667 NA intron (NM_001329607, intron 3 of 11) intron (NM_001329607, intron 3 of 11) -93328 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 252-112 chr8 137423033 137423226 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -9541 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 289.334-9 chr5 13487694 13487911 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -454916 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 176-100 chr8 78111038 78111192 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -405225 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 354.334-4 chr3 122223152 122223401 + 1.66667 NA intron (NM_001178065, intron 1 of 6) L1PA16|LINE|L1 38949 NM_001178065 846 Hs.435615 NM_000388 ENSG00000036828 CASR CAR|EIG8|FHH|FIH|GPRC2A|HHC|HHC1|HYPOC1|NSHPT|PCAR1|hCasR calcium sensing receptor protein-coding 408.999-2 chr2 18035361 18035715 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 156871 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 221.334-6 chr20 20968983 20969128 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 137303 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 269-7 chr10 33719141 33719343 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 53438 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 375.666-2 chr16 72000502 72001001 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_181536) promoter-TSS (NM_181536) -773 NM_181536 342372 Hs.675286 NM_181536 ENSG00000277481 PKD1L3 - polycystin 1 like 3, transient receptor potential channel interacting protein-coding 220.667-82 chr5 44802150 44802301 + 1.66667 NA intron (NR_109863, intron 1 of 3) intron (NR_109863, intron 1 of 3) 6568 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 254.667-85 chr9 34733018 34733210 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -3626 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 270.334-14 chr2 67183885 67184166 + 1.66667 NA intron (NR_038844, intron 3 of 7) intron (NR_038844, intron 3 of 7) -29383 NR_110568 101927661 Hs.580508 NR_110568 ENSG00000235885 LOC101927661 - uncharacterized LOC101927661 ncRNA 330.333-8 chr15 81857283 81857765 + 1.66667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 188494 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 358.667 chr1 90944795 90945083 + 1.66667 NA intron (NM_201269, intron 2 of 5) intron (NM_201269, intron 2 of 5) 76569 NM_016620 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 417-10 chr6 169272490 169272837 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -18549 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 303-6 chr11 7067656 7067986 + 1.66667 NA intron (NM_176822, intron 10 of 11) L1M5|LINE|L1 -21177 NM_014469 27288 Hs.121605 NM_014469 ENSG00000170748 RBMXL2 HNRNPG-T|HNRNPGT|HNRPGT RBMX like 2 protein-coding 268.333-9 chr10 116792333 116792675 + 1.66667 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) AluJo|SINE|Alu 35064 NR_162126 113218494 NR_162126 MIR9851 - microRNA 9851 ncRNA 236-47 chr2 193510457 193510633 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 760700 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 213.334 chr12 50138137 50138308 + 1.66667 NA intron (NR_138536, intron 5 of 10) intron (NR_138536, intron 5 of 10) 25986 NM_032901 84987 Hs.388645 NM_032901 ENSG00000178449 COX14 C12orf62|PCAG1 cytochrome c oxidase assembly factor COX14 protein-coding 422.333-3 chr22 35230294 35230744 + 1.66667 NA intron (NR_126356, intron 1 of 5) L1ME1|LINE|L1 537 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 259-49 chr7 125105904 125106184 + 1.66667 NA intron (NR_125719, intron 5 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -78525 NR_110188 101928283 Hs.566650 NR_110188 ENSG00000224897 LOC101928283 - uncharacterized LOC101928283 ncRNA 332-22 chr22 42861948 42862377 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4889 NM_001142293 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 240-84 chr8 14965974 14966176 + 1.66667 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) -112565 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 461-9 chr8 123477708 123478169 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 54205 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 427 chr10 61268893 61269306 + 1.66667 NA Intergenic LTR26D|LTR|ERV1 -183540 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 378-21 chr5 10135466 10135970 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 114170 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 253.333-76 chr4 38599915 38600181 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 36045 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 263-61 chr6 168334858 168335117 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15210 NM_001286351 168002 Hs.673059 NM_214462 ENSG00000164488 DACT2 C6orf116|DAPPER2|DPR2|bA503C24.7 dishevelled binding antagonist of beta catenin 2 protein-coding 221-41 chr21 22835379 22835746 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -243722 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 387.333-12 chr6 16973702 16974004 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -128405 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 313.667-5 chr10 21238738 21239115 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 64624 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 303.666-14 chr5 139324673 139325002 + 1.66667 NA intron (NM_018834, intron 12 of 14) intron (NM_018834, intron 12 of 14) -16995 NR_109830 51247 Hs.396644 NM_016480 ENSG00000120727 PAIP2 PAIP-2|PAIP2A poly(A) binding protein interacting protein 2 protein-coding 190-45 chr16 63550489 63550648 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1514130 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 221-29 chr18 10265649 10265860 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 148616 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 261.334 chr10 90217068 90217227 + 1.66667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -259774 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 373.333-23 chr5 75341768 75342143 + 1.66667 NA intron (NM_001130996, intron 1 of 18) intron (NM_001130996, intron 1 of 18) 4735 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 285.667-38 chr3 167038161 167038345 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 139570 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 189.667-144 chr8 112786365 112786550 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) L1MA3|LINE|L1 142964 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 264.667-81 chr7 54958558 54958736 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -60370 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 326.999-3 chr5 107557364 107557880 + 1.66667 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 113315 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 350.667-8 chr2 220569448 220569811 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -663064 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 446.001 chr3 186471034 186471330 + 1.66667 NA intron (NR_033844, intron 3 of 7) intron (NR_033844, intron 3 of 7) 22479 NR_033844 253573 Hs.97386 NR_033844 ENSG00000224406 LINC02052 - long intergenic non-protein coding RNA 2052 ncRNA 282.334-4 chr12 18852855 18853038 + 1.66667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 114827 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 270.999-2 chr4 53465499 53465801 + 1.66667 NA intron (NM_001126328, intron 9 of 10) Charlie10|DNA|hAT-Charlie -34427 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 488.667-4 chr7 29782036 29782405 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -24334 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 331.333-16 chr13 36327242 36327758 + 1.66667 NA intron (NM_015087, intron 4 of 8) intron (NM_015087, intron 4 of 8) 18894 NM_015087 23111 Hs.440414 NM_015087 ENSG00000133104 SPART SPG20|TAHCCP1 spartin protein-coding 263-2 chr1 86115696 86115922 + 1.66667 NA intron (NM_152890, intron 3 of 59) intron (NM_152890, intron 3 of 59) 40662 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 307.001-2 chr12 113083680 113083895 + 1.66667 NA intron (NM_004416, intron 2 of 8) intron (NM_004416, intron 2 of 8) 25930 NM_004416 1840 Hs.372152 NM_004416 ENSG00000135144 DTX1 RNF140|hDx-1 deltex E3 ubiquitin ligase 1 protein-coding 440.667-2 chr10 32363482 32363891 + 1.66667 NA intron (NR_104163, intron 1 of 1) intron (NR_104163, intron 1 of 1) 15083 NM_001282391 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 239.334-14 chrX 123241167 123241355 + 1.66667 NA intron (NM_007325, intron 2 of 15) L3|LINE|CR1 56983 NM_007325 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 276-63 chr8 134984084 134984342 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 134278 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 252-77 chr5 27019084 27019308 + 1.66667 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) intron (NM_016279, intron 1 of 11) 19390 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 543.999-2 chr4 140691372 140691874 + 1.66667 NA intron (NM_015130, intron 2 of 20) intron (NM_015130, intron 2 of 20) -48543 NR_077215 644962 Hs.676500 NR_077215 TNRC18P1 - trinucleotide repeat containing 18 pseudogene 1 pseudo 234.667-107 chr8 20056168 20056421 + 1.66667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 117041 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 511.001 chr11 68064240 68064552 + 1.66667 NA intron (NM_001277, intron 10 of 11) AluSx1|SINE|Alu 19602 NR_106811 102465451 NR_106811 ENSG00000275022 MIR6753 hsa-mir-6753 microRNA 6753 ncRNA 439.334-3 chr4 157148276 157148556 + 1.66667 NA intron (NM_001166061, intron 8 of 8) L1M5|LINE|L1 72013 NM_001166060 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 218.667-112 chr8 123631444 123631630 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 22264 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 317.999 chr10 54951463 54951824 + 1.66667 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L1MC2|LINE|L1 -150352 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 306.333-41 chr7 95028002 95028406 + 1.66667 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 118306 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 307.334-7 chr22 35010437 35010801 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12703 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 258-54 chr4 124242695 124242875 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 315649 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 230-45 chr3 142466223 142466420 + 1.66667 NA intron (NM_001354579, intron 39 of 45) intron (NM_001354579, intron 39 of 45) -18259 NM_001282859 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 231-52 chr5 77370761 77370906 + 1.66667 NA intron (NM_001029854, intron 9 of 20) L1ME2z|LINE|L1 121483 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 267.333-89 chr8 28897885 28898137 + 1.66667 NA intron (NM_024567, intron 2 of 10) intron (NM_024567, intron 2 of 10) 6697 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 269.333-58 chr3 30350693 30350986 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -168029 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 307-32 chr5 73004489 73004752 + 1.66667 NA intron (NM_001146032, intron 5 of 24) MIRb|SINE|MIR 48579 NM_001146032 115548 Hs.165762 NM_138782 ENSG00000157107 FCHO2 - FCH domain only 2 protein-coding 185.333-113 chr21 26823791 26823945 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 21541 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 244.667-23 chr11 39625887 39626094 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 667140 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 255.667-54 chr3 60178755 60178909 + 1.66667 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) MER103C|DNA|hAT-Charlie -97923 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 361.667-21 chr8 140502430 140502662 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -8752 NR_023360 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 345.334-10 chr4 34411832 34412255 + 1.66667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -142296 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 530.334-3 chr7 19819200 19819987 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -45976 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 412.667-9 chr2 72196378 72196792 + 1.66667 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -48723 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 267.667-18 chr15 64751777 64751959 + 1.66667 NA intron (NR_138350, intron 1 of 7) intron (NR_138350, intron 1 of 7) 9349 NR_138364 348093 Hs.436518 NM_194272 ENSG00000166831 RBPMS2 - RNA binding protein, mRNA processing factor 2 protein-coding 230.667-51 chr3 5842338 5842542 + 1.66667 NA Intergenic LTR16D1|LTR|ERVL -592185 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 219.667-69 chr5 3370307 3370496 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -82415 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 247.666-33 chr6 163915215 163915390 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -243818 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 251.334-10 chr12 7745616 7745804 + 1.66667 NA intron (NM_203503, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu 1665 NM_001371390 271.334-13 chr20 36185564 36185742 + 1.66667 NA intron (NM_177996, intron 7 of 19) intron (NM_177996, intron 7 of 19) -29893 NR_147703 100130373 Hs.570339 NR_147703 LOC100130373 - uncharacterized LOC100130373 ncRNA 253.667-56 chr5 74027157 74027351 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 213708 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 250.333-4 chr1 105850207 105850483 + 1.66667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 177908 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 267-33 chr17 60933292 60933562 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 13 of 25) intron (NM_001330413, intron 13 of 25) 255576 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 331-20 chr2 98625061 98625475 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_012214, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_012214, exon 16 of 16) 16679 NM_001330353 25972 Hs.13370 NM_014044 ENSG00000115446 UNC50 GMH1|HSD23|PDLs22|UNCL|URP unc-50 inner nuclear membrane RNA binding protein protein-coding 376.001-2 chrX 138362579 138362839 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 305084 NR_030229 574507 NR_030229 ENSG00000207800 MIR504 MIRN504|hsa-mir-504|mir-504 microRNA 504 ncRNA 221.667-74 chr7 72483661 72483840 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -36607 NM_001363460 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 160-79 chr3 130267012 130267253 + 1.66667 NA non-coding (NR_027898, exon 23 of 23) non-coding (NR_027898, exon 23 of 23) 54312 NR_027898 646300 Hs.170475 NR_027898 COL6A4P2 COL6A4 collagen type VI alpha 4 pseudogene 2 pseudo 262.667-15 chr11 76413147 76413383 + 1.66667 NA non-coding (NR_130990, exon 4 of 4) non-coding (NR_130990, exon 4 of 4) -31753 NM_001300943 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 221-11 chr10 37869579 37869846 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -11609 NR_147992 57209 Hs.528423 NM_021045 ENSG00000198105 ZNF248 bA162G10.3 zinc finger protein 248 protein-coding 348.667-11 chr14 82052589 82052938 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -309625 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 242-6 chr1 159593820 159594082 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6125 NM_001639 325 Hs.507080 NM_001639 ENSG00000132703 APCS HEL-S-92n|PTX2|SAP amyloid P component, serum protein-coding 242.667-77 chr4 91813328 91813475 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 463901 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 148.334 chr1 247566036 247566169 + 1.66667 NA intron (NM_145278, intron 4 of 4) intron (NM_145278, intron 4 of 4) 16968 NM_145278 148823 Hs.732113 NM_145278 ENSG00000169224 GCSAML C1orf150 germinal center associated signaling and motility like protein-coding 236.667-19 chr12 33678223 33678635 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -238610 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 474.667-8 chr9 28562246 28562832 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 156766 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 391.667-7 chr3 15201713 15202103 + 1.66667 NA intron (NR_027927, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu 4051 NR_027927 344875 Hs.722756 NR_027927 ENSG00000230524 COL6A4P1 COL6A4|COL6A4P|DIVA|DVWA|VWA6 collagen type VI alpha 4 pseudogene 1 pseudo 321.667-25 chr9 22527873 22528073 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 81149 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 273-23 chr22 45397148 45397419 + 1.66667 NA intron (NM_148674, intron 6 of 24) AluJr4|SINE|Alu 16316 NM_148674 27127 Hs.334176 NM_148674 ENSG00000077935 SMC1B SMC1BETA|SMC1L2 structural maintenance of chromosomes 1B protein-coding 258.334-23 chr7 93301967 93302128 + 1.66667 NA intron (NM_001257998, intron 17 of 28) L1M4|LINE|L1 69681 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 256-16 chr11 79819412 79819627 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -378489 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 257-51 chr5 45951657 45951942 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -255419 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 277-34 chr3 71525479 71525674 + 1.66667 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) intron (NR_146142, intron 2 of 19) 16513 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 279.334-8 chr3 192140633 192140913 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_021032, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_021032, exon 5 of 5) -97857 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 360.667-2 chr11 112820069 112820331 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -141220 NM_001242607 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 285-24 chr4 58329163 58329473 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 207010 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 251.667-33 chr19 10206348 10206536 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11489 NM_001318731 1786 Hs.202672 NM_001379 ENSG00000130816 DNMT1 ADCADN|AIM|CXXC9|DNMT|HSN1E|MCMT|m.HsaI DNA methyltransferase 1 protein-coding 259-55 chr9 96745433 96745613 + 1.66667 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 19702 NR_026792 441455 Hs.229613 NR_026792 LOC441455 - makorin ring finger protein 1 pseudogene pseudo 280.334-7 chr22 26223683 26224007 + 1.66667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 54371 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 288.666-26 chr4 32575533 32575787 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 224622 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 253-9 chr1 246950799 246951045 + 1.66667 NA intron (NR_037892, intron 5 of 5) intron (NR_037892, intron 5 of 5) -18974 NM_001323342 25909 Hs.300887 NM_015446 ENSG00000153207 AHCTF1 ELYS|MST108|MSTP108|TMBS62 AT-hook containing transcription factor 1 protein-coding 238.334-10 chr5 12051012 12051189 + 1.66667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -146654 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 298.333-17 chr17 28870631 28870988 + 1.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -9079 NR_039885 100616385 NR_039885 ENSG00000284085 MIR4732 mir-4732 microRNA 4732 ncRNA 141.667-93 chr17 7861173 7861329 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_144607, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_144607, exon 4 of 4) 3248 NM_001330110 124637 Hs.27475 NM_144607 ENSG00000182224 CYB5D1 - cytochrome b5 domain containing 1 protein-coding 381.666-12 chr9 30059802 30060108 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 348499 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 248.333-86 chr5 144912279 144912560 + 1.66667 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu 707028 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 190.667-93 chr4 111420106 111420274 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -559543 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 344-32 chr4 117478046 117478474 + 1.66667 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) intron (NR_125757, intron 2 of 3) 49862 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 253-67 chr8 33394717 33394953 + 1.66667 NA intron (NM_032664, intron 3 of 4) intron (NM_032664, intron 3 of 4) 78311 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 205.333-146 chr21 29531305 29531525 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 35368 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 318.334-2 chr10 87663867 87664226 + 1.66667 NA intron (NM_001015880, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu 4168 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 150.334 chr1 112424321 112424472 + 1.66667 NA intron (NM_018704, intron 3 of 5) L1ME1|LINE|L1 28182 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 315.333-45 chr7 1312785 1313079 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 80060 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 258-24 chr18 9806066 9806343 + 1.66667 NA intron (NM_006868, intron 3 of 6) MIRc|SINE|MIR -79769 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 319.333-12 chr16 69625762 69626069 + 1.66667 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) intron (NM_138714, intron 2 of 15) 59949 NM_138713 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 299.334-3 chr14 46020197 46020492 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -43815 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 403.333-8 chr22 25582330 25582804 + 1.66667 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) L1M5|LINE|L1 17892 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 302.334-10 chr5 140526200 140526392 + 1.66667 NA exon (NM_017747, exon 26 of 34) exon (NM_017747, exon 26 of 34) -21366 NM_003732 8637 Hs.594084 NM_003732 ENSG00000243056 EIF4EBP3 4E-BP3|4EBP3 eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 3 protein-coding 264-16 chr13 57398320 57398547 + 1.66667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 231236 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 348.334-2 chr11 16748179 16748483 + 1.66667 NA intron (NM_014267, intron 3 of 4) FRAM|SINE|Alu 9684 NM_014267 10944 Hs.368226 NM_014267 ENSG00000110696 C11orf58 IMAGE145052|SMAP chromosome 11 open reading frame 58 protein-coding 401.667-7 chr3 183105226 183105518 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -5785 NR_120639 56922 Hs.47649 NM_020166 ENSG00000078070 MCCC1 MCC-B|MCCA methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1 protein-coding 263.666-7 chr20 16879360 16879671 + 1.66667 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 131162 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 257.667-31 chr16 80574670 80574928 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1991 NR_104666 101928276 Hs.149769 NR_104665 ENSG00000260737 LINC01227 - long intergenic non-protein coding RNA 1227 ncRNA 446.334-2 chr1 99811467 99811813 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -38721 NM_000642 178 Hs.904 NM_000028 ENSG00000162688 AGL GDE amylo-alpha-1, 6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase protein-coding 265.334-11 chr16 74863703 74863953 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -89008 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 302.334-11 chr9 24887720 24888053 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -341989 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 305.666-17 chr5 23876318 23876629 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -74875 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 273-33 chr5 151801545 151801735 + 1.66667 NA intron (NM_198395, intron 11 of 11) L1MB5|LINE|L1 -29464 NR_132345 100652758 Hs.587054 NM_001278082 LOC100652758 - uncharacterized LOC100652758 ncRNA 186.667-56 chr18 1936491 1936658 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -576945 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 341-25 chr7 83071269 83071647 + 1.66667 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 91426 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 328-38 chr8 71264005 71264438 + 1.66667 NA intron (NM_001370335, intron 14 of 20) intron (NM_001370335, intron 14 of 20) 92485 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 211-69 chr3 156935343 156935576 + 1.66667 NA intron (NM_001004316, intron 5 of 12) intron (NM_001004316, intron 5 of 12) 109106 NM_001193283 389170 Hs.478048 NM_001004316 ENSG00000197980 LEKR1 - leucine, glutamate and lysine rich 1 protein-coding 230-57 chr5 166802092 166802254 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 124197 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 306.667-16 chr17 59327493 59327857 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3980 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 352.333-31 chr8 136932705 136933107 + 1.66667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 402108 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 310.667-10 chr13 80627174 80627539 + 1.66667 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -286230 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 326.334-11 chr8 88943471 88943857 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -616181 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 246-37 chr16 23984778 23984956 + 1.66667 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) intron (NM_002738, intron 2 of 16) 148884 NM_212535 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 404.333-11 chr8 122590081 122590460 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21626 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 238.333-74 chr5 83039118 83039289 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 25134 NR_003139 677765 Hs.693283 NR_003139 ENSG00000238835 SCARNA18 SCARNA18A|U109 small Cajal body-specific RNA 18 ncRNA 330.667-2 chr10 15702900 15703267 + 1.66667 NA intron (NM_001291494, intron 2 of 28) intron (NM_001291494, intron 2 of 28) 16839 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 263-10 chr10 59231506 59231750 + 1.66667 NA intron (NM_001143774, intron 1 of 4) L1MC4|LINE|L1 54161 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 520.667-5 chrX 51228312 51228749 + 1.66667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -57109 NR_110382 101926971 Hs.657995 NR_110382 ENSG00000230317 LINC01284 - long intergenic non-protein coding RNA 1284 ncRNA 252-81 chr5 92867572 92867811 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 703652 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 230.333-84 chr4 36845523 36845721 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -156157 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 246.334-13 chr3 153746277 153746440 + 1.66667 NA intron (NR_146713, intron 1 of 6) L1M7|LINE|L1 16168 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 452-12 chr7 116641818 116642132 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27155 NR_120506 100996266 Hs.552122 NR_120506 LINC01510 - long intergenic non-protein coding RNA 1510 ncRNA 281.334-11 chr4 48232954 48233168 + 1.66667 NA intron (NM_003215, intron 1 of 17) HAL1|LINE|L1 36777 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 284.334-13 chr6 157306953 157307139 + 1.66667 NA intron (NM_018452, intron 3 of 3) intron (NM_018452, intron 3 of 3) 17213 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 245.667-28 chr2 10621988 10622154 + 1.66667 NA intron (NR_048552, intron 12 of 19) MER3|DNA|hAT-Charlie 67904 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 287.333-64 chr8 31113938 31114225 + 1.66667 NA intron (NM_000553, intron 19 of 34) intron (NM_000553, intron 19 of 34) -80725 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 243-43 chr3 149695082 149695343 + 1.66667 NA intron (NM_001348362, intron 3 of 9) L1MA3|LINE|L1 8061 NM_001168278 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 354-12 chr17 72261193 72261549 + 1.66667 NA Intergenic (CATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -81440 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 267-9 chr10 90948828 90949073 + 1.66667 NA intron (NR_131214, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 1650 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 353.667-10 chr21 24371683 24371972 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50450 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 218-31 chr16 9490776 9490929 + 1.66667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -35347 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 273 chr1 40270018 40270297 + 1.66667 NA intron (NM_005857, intron 5 of 9) intron (NM_005857, intron 5 of 9) 11921 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 363.334-2 chr2 176930115 176930618 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 282045 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 340.334-12 chr3 172248379 172248671 + 1.66667 NA intron (NM_001135095, intron 5 of 25) intron (NM_001135095, intron 5 of 25) 199931 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 313.333-3 chr10 17472542 17472965 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -18158 NR_144322 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 268.667-6 chr10 125420973 125421252 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -153259 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 263-36 chr21 27412189 27412437 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -310066 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 250-93 chr8 114533159 114533355 + 1.66667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -1096318 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 508.334-2 chr2 158419293 158419928 + 1.66667 NA intron (NM_138803, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 37143 NM_001301685 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 415.667-2 chr16 82287678 82288089 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -117659 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 198.334 chr1 215955606 215955756 + 1.66667 NA intron (NM_206933, intron 37 of 71) intron (NM_206933, intron 37 of 71) -116784 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 256.667-21 chr12 111508224 111508416 + 1.66667 NA intron (NR_132311, intron 14 of 23) L1ME3E|LINE|L1 73458 NM_001291424 10019 Hs.506784 NM_005475 ENSG00000111252 SH2B3 IDDM20|LNK SH2B adaptor protein 3 protein-coding 228.667-34 chr18 8113418 8113655 + 1.66667 NA exon (NM_001105244, exon 12 of 33) exon (NM_001105244, exon 12 of 33) 253498 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 517.001 chr2 69064077 69064616 + 1.66667 NA intron (NM_032208, intron 3 of 17) intron (NM_032208, intron 3 of 17) -39336 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 433.667-5 chr12 119011189 119011466 + 1.66667 NA intron (NM_194286, intron 1 of 12) MER20|DNA|hAT-Charlie 29786 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 259-33 chr3 4985329 4985502 + 1.66667 NA TTS (NM_003670) TTS (NM_003670) -5454 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 227.667-9 chr10 106301799 106302004 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 161736 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 272.001-2 chr2 231752092 231752260 + 1.66667 NA intron (NM_002601, intron 1 of 4) intron (NM_002601, intron 1 of 4) 29106 NR_110994 5147 Hs.516808 NM_002601 ENSG00000156973 PDE6D JBTS22|PDED phosphodiesterase 6D protein-coding 261-19 chr14 29227506 29227799 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -441865 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 300.001-2 chr2 43195842 43196034 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 30668 NM_006887 678 Hs.503093 NM_006887 ENSG00000152518 ZFP36L2 BRF2|ERF-2|ERF2|RNF162C|TIS11D ZFP36 ring finger protein like 2 protein-coding 255.334-16 chr2 53999522 53999695 + 1.66667 NA intron (NM_001320587, intron 2 of 5) intron (NM_001320587, intron 2 of 5) 28495 NM_001320586 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 219-53 chr20 40034817 40035000 + 1.66667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 30447 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 314.333 chr1 90661299 90661730 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 3764 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 433.666-5 chrX 49958474 49958871 + 1.66667 NA intron (NM_001127899, intron 3 of 14) L3|LINE|CR1 36076 NM_001127898 1184 Hs.166486 NM_000084 ENSG00000171365 CLCN5 CLC5|CLCK2|ClC-5|DENTS|NPHL1|NPHL2|XLRH|XRN|hCIC-K2 chloride voltage-gated channel 5 protein-coding 264.667-43 chr2 154786350 154786617 + 1.66667 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) intron (NM_002239, intron 2 of 2) 87788 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 220.667-102 chr8 84481619 84481764 + 1.66667 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) L1ME2|LINE|L1 66207 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 342-11 chr14 67599054 67599422 + 1.66667 NA intron (NM_004569, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 1030 NM_004569 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 233-9 chr10 65331187 65331406 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -240129 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 361.667-13 chr20 47384930 47385334 + 1.66667 NA intron (NR_146496, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 26262 NR_146494 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 255.334-3 chr1 65678022 65678241 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -114379 NM_001037341 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 263.666-15 chr8 114806211 114806490 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 861663 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 272-51 chr8 81799163 81799574 + 1.66667 NA TTS (NM_022133) TTS (NM_022133) 42817 NR_145472 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 233.667-60 chr5 32700240 32700417 + 1.66667 NA intron (NM_001364458, intron 1 of 7) L1MA3|LINE|L1 9456 NM_001364458 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 311.333-48 chr5 80782854 80783074 + 1.66667 NA intron (NM_002439, intron 17 of 23) intron (NM_002439, intron 17 of 23) -127981 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 251.334-24 chr5 32015470 32015629 + 1.66667 NA intron (NM_178140, intron 6 of 24) AluJr|SINE|Alu -79390 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 270.334-10 chr16 21186896 21187137 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 27494 NM_003460 7783 Hs.73982 NM_003460 ENSG00000103310 ZP2 OOMD6|ZPA|Zp-2 zona pellucida glycoprotein 2 protein-coding 221.334-5 chr2 59242387 59242556 + 1.66667 NA intron (NR_110219, intron 1 of 2) intron (NR_110219, intron 1 of 2) 24763 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 315.334-2 chr2 101969994 101970264 + 1.66667 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -13336 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 267-3 chr1 155737003 155737189 + 1.66667 NA intron (NM_001199850, intron 11 of 11) intron (NM_001199850, intron 11 of 11) -8672 NR_024117 100129405 Hs.656361 NR_024117 MSTO2P MSTO2 misato family member 2, pseudogene pseudo 185-57 chr5 124076771 124076921 + 1.66667 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1MA5A|LINE|L1 361674 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 360-21 chr3 37356788 37357211 + 1.66667 NA intron (NM_001172713, intron 22 of 22) intron (NM_001172713, intron 22 of 22) -29270 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 245.333-64 chr2 36823343 36823535 + 1.66667 NA Intergenic LTR75B|LTR|ERVL 126732 NM_053276 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 292-33 chr2 236841042 236841241 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 215026 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 324.334-8 chr2 198134666 198134878 + 1.66667 NA intron (NM_006226, intron 5 of 5) intron (NM_006226, intron 5 of 5) 240325 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 228.333-52 chr2 197928366 197928603 + 1.66667 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 123891 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 211-87 chr6 87045422 87045610 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 49590 NM_001252383 1081 Hs.119689 NM_000735 ENSG00000135346 CGA CG-ALPHA|FSHA|GPA1|GPHA1|GPHa|HCG|LHA|TSHA glycoprotein hormones, alpha polypeptide protein-coding 361.999-6 chr2 121607706 121608184 + 1.66667 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) intron (NM_015282, intron 1 of 38) 41517 NM_015282 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 251.667-7 chr1 163207220 163207424 + 1.66667 NA intron (NR_110699, intron 3 of 3) intron (NR_110699, intron 3 of 3) -4406 NM_001195303 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 275-38 chr4 47491927 47492135 + 1.66667 NA intron (NM_020453, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 6756 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 362.001-3 chr12 24535537 24535910 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 26768 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 320.333-11 chr2 52166026 52166316 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) AluJr|SINE|Alu -204477 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 336-32 chr8 121892727 121893246 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -251546 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 284.334-3 chr1 176137582 176137773 + 1.66667 NA intron (NM_022457, intron 6 of 19) MIR|SINE|MIR 69567 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 291.667-20 chr20 55190258 55190581 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -232624 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 277-19 chr16 28940062 28940395 + 1.66667 NA TTS (NM_001770) TTS (NM_001770) 8257 NM_001178098 930 Hs.652262 NM_001770 ENSG00000177455 CD19 B4|CVID3 CD19 molecule protein-coding 251.333-25 chr12 81564243 81564526 + 1.66667 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) MIR3|SINE|MIR 33987 NM_001220478 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 260-20 chr11 111863211 111863411 + 1.66667 NA intron (NR_147984, intron 4 of 15) AluSc8|SINE|Alu 7970 NM_001352415 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 271-50 chr8 122174846 122175042 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 393700 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 243-32 chr2 100577466 100577611 + 1.66667 NA TTS (NM_024065) TTS (NM_024065) 14545 NM_024065 79031 Hs.469459 NM_024065 ENSG00000115539 PDCL3 HTPHLP|PHLP2A|PHLP3|VIAF|VIAF1 phosducin like 3 protein-coding 255.334-20 chr3 62643688 62643843 + 1.66667 NA intron (NM_003716, intron 6 of 29) intron (NM_003716, intron 6 of 29) 231651 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 245-73 chr8 87245634 87245818 + 1.66667 NA intron (NM_173538, intron 6 of 10) L1M5|LINE|L1 379311 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 350.334-8 chr4 53650919 53651187 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -44848 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 252.334-13 chr3 164268762 164268943 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -97296 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 258-18 chr16 71229425 71229623 + 1.66667 NA intron (NM_001198543, intron 1 of 18) L1ME1|LINE|L1 1198 NM_001198542 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 277.334-2 chr11 113668293 113668500 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 37912 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 239.667-17 chr12 128245240 128245453 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22057 NM_001136103 92293 Hs.49599 NM_001136103 ENSG00000181234 TMEM132C PPP1R152 transmembrane protein 132C protein-coding 404.333-7 chr3 159450160 159450499 + 1.66667 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 167683 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 252-65 chr3 149606520 149606807 + 1.66667 NA intron (NM_001348362, intron 5 of 9) L2b|LINE|L2 51362 NM_015472 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 112.667-59 chr13 72966467 72966565 + 1.66667 NA intron (NR_146206, intron 15 of 16) intron (NR_146206, intron 15 of 16) -88460 NM_001286818 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 263.334-8 chr3 21714480 21714646 + 1.66667 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 36647 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 304.667-10 chr12 129614263 129614631 + 1.66667 NA intron (NM_133448, intron 2 of 8) intron (NM_133448, intron 2 of 8) 289578 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 282.333 chr1 85458826 85459178 + 1.66667 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) 6157 NM_012137 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 206.334-4 chr12 26963701 26963912 + 1.66667 NA intron (NM_015633, intron 6 of 6) intron (NM_015633, intron 6 of 6) 25336 NM_015633 26127 Hs.591162 NM_015633 ENSG00000111790 FGFR1OP2 HSPC123-like|WIT3.0 FGFR1 oncogene partner 2 protein-coding 129-126 chr8 82814142 82814296 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -97885 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 258-7 chr10 68062348 68062565 + 1.66667 NA intron (NM_001278185, intron 3 of 23) intron (NM_001278185, intron 3 of 23) 12827 NM_001278187 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 268.334-21 chr9 135273738 135273920 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -69420 NM_173520 157927 Hs.559511 NM_173520 C9orf62 - chromosome 9 open reading frame 62 protein-coding 341-16 chr20 49534800 49535342 + 1.66667 NA intron (NM_000961, intron 5 of 9) L1ME3G|LINE|L1 33066 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 406.333-11 chr20 25429636 25430065 + 1.66667 NA intron (NM_021067, intron 5 of 6) L1MB3|LINE|L1 22167 NR_134574 9837 Hs.658464 NM_021067 ENSG00000101003 GINS1 IMD55|PSF1 GINS complex subunit 1 protein-coding 207.667-68 chr20 58451101 58451263 + 1.66667 NA TTS (NM_004738) TTS (NM_004738) 61953 NR_036633 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 263-39 chr3 13159890 13160068 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -86550 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 246.334-10 chr2 125583611 125583769 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 534295 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 276-34 chr2 108398026 108398318 + 1.66667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 20218 NM_006588 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 246.334-18 chr6 1353034 1353222 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -36448 NM_001452 2295 Hs.484423 NM_001452 ENSG00000137273 FOXF2 FKHL6|FREAC-2|FREAC2 forkhead box F2 protein-coding 246.333-83 chr5 132335104 132335363 + 1.66667 NA intron (NM_003059, intron 7 of 9) intron (NM_003059, intron 7 of 9) 30366 NR_037500 100500865 NR_037500 ENSG00000263597 MIR3936 mir-3936 microRNA 3936 ncRNA 466.334-2 chr12 112063511 112063913 + 1.66667 NA intron (NM_024953, intron 11 of 23) HAL1|LINE|L1 -25997 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 435.667-2 chr4 63209023 63209522 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -1047507 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 265-40 chr2 204492283 204492561 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -53053 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 230.667-89 chr8 110844026 110844290 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 183275 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 414.667-15 chr7 111275168 111275707 + 1.66667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 184310 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 358.334-5 chr3 179872172 179872440 + 1.66667 NA intron (NR_146167, intron 6 of 13) intron (NR_146167, intron 6 of 13) -25888 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 292-37 chr4 32315571 32315870 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -35318 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 281-32 chr4 93994254 93994502 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 165625 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 354-9 chr14 26419796 26420089 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 133488 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 850.667 chr12 70355088 70356026 + 1.66667 NA TTS (NR_037615) TTS (NR_037615) -10733 NM_014505 27345 Hs.525529 NM_014505 ENSG00000135643 KCNMB4 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 protein-coding 440.334-3 chr2 108398636 108398976 + 1.66667 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 20852 NM_006588 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 252.667-53 chr2 221733621 221733816 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -159516 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 313.667-31 chr3 56856744 56857083 + 1.66667 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) intron (NM_001128615, intron 4 of 12) -54964 NM_019555 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 347.334-4 chr18 65132470 65132773 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -617631 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 256.667-12 chr11 77655128 77655415 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -17465 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 206.333-16 chr10 84832471 84832702 + 1.66667 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL 366319 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 257.333-8 chr10 27980152 27980442 + 1.66667 NA intron (NM_018076, intron 7 of 19) L1MB4|LINE|L1 1574 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 247.334-2 chr10 50980812 50981022 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -9971 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 264-19 chr14 56136926 56137201 + 1.66667 NA intron (NM_021255, intron 1 of 5) intron (NM_021255, intron 1 of 5) 18652 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 278-63 chr8 80503271 80503440 + 1.66667 NA intron (NM_001105539, intron 2 of 5) L3|LINE|CR1 17129 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 490-2 chr17 57840657 57841139 + 1.66667 NA intron (NM_016070, intron 4 of 4) intron (NM_016070, intron 4 of 4) 9146 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 300-67 chr8 76524760 76525193 + 1.66667 NA TTS (NR_105006) TTS (NR_105006) 118322 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 381.334-2 chr10 18463095 18463346 + 1.66667 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) L2|LINE|L2 62645 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 430.666-3 chr2 24865804 24866227 + 1.66667 NA intron (NM_001320613, intron 3 of 21) L1MEg|LINE|L1 54222 NM_004036 109 Hs.467898 NM_004036 ENSG00000138031 ADCY3 AC-III|AC3|BMIQ19 adenylate cyclase 3 protein-coding 291.667-41 chr9 108044012 108044438 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -554456 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 238.667-78 chr6 53390000 53390201 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -40921 NM_001242831 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 275.667 chr1 31640423 31640760 + 1.66667 NA intron (NM_012392, intron 1 of 4) intron (NM_012392, intron 1 of 4) 4026 NM_001359651 553115 Hs.470417 NM_012392 ENSG00000162517 PEF1 ABP32|PEF1A penta-EF-hand domain containing 1 protein-coding 403.667-8 chr3 107221875 107222249 + 1.66667 NA intron (NR_028303, intron 1 of 3) intron (NR_028303, intron 1 of 3) 18576 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 198-54 chr14 95877814 95877950 + 1.66667 NA intron (NR_038861, intron 1 of 1) intron (NR_038861, intron 1 of 1) 1110 NR_132398 100507043 Hs.455955 NR_038861 ENSG00000250366 TUNAR HI-LNC78|LINC00617|TUNA TCL1 upstream neural differentiation-associated RNA ncRNA 178.667-63 chr17 68692209 68692372 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 64136 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 321.333-30 chr15 71181344 71181770 + 1.66667 NA intron (NR_120349, intron 1 of 1) intron (NR_120349, intron 1 of 1) 7502 NR_120351 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 330.667-26 chr7 41456751 41457201 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -236943 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 237-19 chr11 88787350 88787625 + 1.66667 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 260585 NM_001143831 2915 Hs.147361 NM_000842 ENSG00000168959 GRM5 GPRC1E|MGLUR5|PPP1R86|mGlu5 glutamate metabotropic receptor 5 protein-coding 317-10 chr15 39399332 39399651 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 148822 NR_144507 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 300.333-3 chr1 195264106 195264569 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 824378 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 417-9 chr6 45321146 45321610 + 1.66667 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1MC4|LINE|L1 -6939 NM_001015051 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 299.001-2 chr14 48229232 48229453 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -434328 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 252.999-3 chr17 64434098 64434399 + 1.66667 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -14867 NM_001291317 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 266.334-8 chr10 56052241 56052515 + 1.66667 NA Intergenic MER4E1|LTR|ERV1 308881 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 315.333-52 chr8 67412376 67412724 + 1.66667 NA intron (NR_136224, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 68716 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 311.333-53 chr7 40722899 40723278 + 1.66667 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) intron (NM_024728, intron 13 of 14) 256851 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 347.666-8 chr22 26249307 26249638 + 1.66667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) L1MA5|LINE|L1 79998 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 261.334-5 chr17 30485292 30485606 + 1.66667 NA intron (NM_004871, intron 4 of 8) AluJb|SINE|Alu 8041 NM_004871 9527 Hs.462680 NM_004871 ENSG00000108587 GOSR1 GOLIM2|GOS-28|GOS28|GOS28/P28|GS28|P28 golgi SNAP receptor complex member 1 protein-coding 373.333-7 chr14 20015292 20015780 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001004712) promoter-TSS (NM_001004712) -343 NM_001004712 122740 Hs.626814 NM_001004712 ENSG00000169484 OR4K14 OR14-18|OR14-22 olfactory receptor family 4 subfamily K member 14 protein-coding 249.667-38 chr17 70717146 70717338 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 484937 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 447.001-2 chr6 13987036 13987338 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 61994 NM_001165033 221687 Hs.111164 NM_152737 ENSG00000180537 RNF182 - ring finger protein 182 protein-coding 356-11 chr12 43923929 43924250 + 1.66667 NA intron (NM_001286213, intron 2 of 6) intron (NM_001286213, intron 2 of 6) 88008 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 412-14 chr8 105288116 105288453 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30154 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 255.666-29 chr8 129856514 129856773 + 1.66667 NA intron (NM_001353282, intron 4 of 10) intron (NM_001353282, intron 4 of 10) -70019 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 284.001 chr6 35096272 35096471 + 1.66667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 44968 NM_001366324 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 273.334-13 chr6 158807865 158808179 + 1.66667 NA intron (NM_003379, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 -9957 NR_102425 101409257 Hs.571207 NR_102425 ENSG00000233893 EZR-AS1 - EZR antisense RNA 1 ncRNA 217-24 chr15 68236543 68236706 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -6896 NM_017882 54982 Hs.584921 NM_017882 ENSG00000128973 CLN6 CLN4A|HsT18960|nclf CLN6 transmembrane ER protein protein-coding 507.334-3 chr2 149316055 149316778 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13569 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 287.334-13 chr9 5941811 5941988 + 1.66667 NA intron (NM_001017969, intron 5 of 7) intron (NM_001017969, intron 5 of 7) 51010 NM_005511 2315 Hs.154069 NM_005511 ENSG00000120215 MLANA MART-1|MART1 melan-A protein-coding 279.001-3 chr5 5777862 5778035 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 355271 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 354.667-17 chr3 122382087 122382442 + 1.66667 NA intron (NM_001017928, intron 1 of 4) AluSc8|SINE|Alu 967 NM_001308326 131076 Hs.220594 NM_001017928 ENSG00000160124 CCDC58 - coiled-coil domain containing 58 protein-coding 547.333-4 chr6 16885352 16885726 + 1.66667 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -124049 NM_001128164 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 324.667-18 chr2 197535546 197535877 + 1.66667 NA intron (NM_199482, intron 3 of 7) intron (NM_199482, intron 3 of 7) 19413 NM_001204094 25843 Hs.633165 NM_015387 ENSG00000115540 MOB4 2C4D|CGI-95|MOB1|MOB3|MOBKL3|PHOCN|PREI3 MOB family member 4, phocein protein-coding 245.667-68 chr7 122766669 122766935 + 1.66667 NA intron (NM_001167940, intron 1 of 29) intron (NM_001167940, intron 1 of 29) -63880 NM_198085 378925 Hs.675191 NM_198085 ENSG00000235631 RNF148 - ring finger protein 148 protein-coding 347.334-9 chr7 8202766 8203062 + 1.66667 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) intron (NM_001350836, intron 7 of 14) 59138 NM_022307 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 262-6 chr10 54172564 54172870 + 1.66667 NA intron (NM_001354411, intron 14 of 34) intron (NM_001354411, intron 14 of 34) -313513 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 308.667 chr1 14500105 14500391 + 1.66667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -80275 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 232-37 chr18 31878494 31878684 + 1.66667 NA intron (NM_014939, intron 12 of 28) L1PA17|LINE|L1 64539 NM_014939 22878 Hs.202001 NM_014939 ENSG00000153339 TRAPPC8 GSG1|HsT2706|KIAA1012|TRS85 trafficking protein particle complex 8 protein-coding 282.666-14 chr2 182612574 182612915 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -89899 NM_001003683 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 253.333-91 chr6 67104617 67104919 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -950583 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 240.667-40 chr18 69034128 69034325 + 1.66667 NA intron (NM_001093729, intron 9 of 9) L1ME1|LINE|L1 236146 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 247.667-100 chr9 32724470 32724656 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -58977 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 270.334-19 chr6 98037996 98038273 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 13603 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 240.334-11 chr5 68842622 68842776 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 187228 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 270.667-9 chr11 78101734 78102007 + 1.66667 NA intron (NM_024079, intron 12 of 12) AluSx1|SINE|Alu -22008 NM_001204055 4718 Hs.407860 NM_004549 ENSG00000151366 NDUFC2 B14.5b|CI-B14.5b|HLC-1|NADHDH2 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C2 protein-coding 413.334-3 chr15 59647402 59647870 + 1.66667 NA intron (NM_001320930, intron 4 of 5) AluSz|SINE|Alu 9669 NM_001320929 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 324.334 chr10 34001023 34001426 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -228544 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 229-54 chr5 101344646 101344856 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR -441469 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 266.667-6 chr1 103889536 103889805 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 139829 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 179.667-152 chr9 90332957 90333099 + 1.66667 NA intron (NR_109795, intron 2 of 2) L1MCa|LINE|L1 100461 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 243.666-27 chr4 61359782 61360005 + 1.66667 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 157721 NM_001371342 274.667-11 chr11 27385281 27385463 + 1.66667 NA exon (NM_001346432, exon 4 of 17) exon (NM_001346432, exon 4 of 17) -22124 NM_080654 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 210-121 chr5 111069911 111070098 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_045089) promoter-TSS (NR_045089) -76 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 409 chr10 64203328 64203966 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -621881 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 271.333-9 chr11 70220842 70221134 + 1.66667 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 17825 NM_003824 8772 Hs.86131 NM_003824 ENSG00000168040 FADD GIG3|MORT1 Fas associated via death domain protein-coding 245-32 chr2 41325475 41325695 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -551970 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 314.334-6 chr9 71102506 71102733 + 1.66667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) L2c|LINE|L2 19002 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 280-29 chr20 50676524 50676848 + 1.66667 NA intron (NM_001290268, intron 1 of 21) intron (NM_001290268, intron 1 of 21) 14856 NM_001290268 140876 Hs.372578 NM_080829 ENSG00000042062 RIPOR3 C20orf175|C20orf176|FAM65C RIPOR family member 3 protein-coding 370-10 chr16 56465227 56465593 + 1.66667 NA intron (NM_001324363, intron 4 of 11) L1MC4|LINE|L1 13326 NM_001324358 55239 Hs.231883 NM_018233 ENSG00000087263 OGFOD1 TPA1 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 1 protein-coding 326.667 chr1 10593892 10594255 + 1.66667 NA intron (NM_004565, intron 3 of 8) intron (NM_004565, intron 3 of 8) 119123 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 336 chr1 62653572 62653981 + 1.66667 NA exon (NM_001272001, exon 4 of 48) exon (NM_001272001, exon 4 of 48) 34592 NM_033407 85440 Hs.744927 NM_033407 ENSG00000116641 DOCK7 EIEE23|ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 protein-coding 535.333 chr12 10515720 10516282 + 1.66667 NA intron (NM_001357731, intron 1 of 1) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10108 NM_001357734 255308 Hs.547382 NM_001357731 ENSG00000180574 EIF2S3B EIF2S3L|eIF-2gA|eIF2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma B protein-coding 276.334-12 chr4 79651530 79651742 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 159043 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 406.667-3 chr16 76831129 76831492 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37626 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 246.666-9 chr12 7293505 7293759 + 1.66667 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -10700 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 400.334-3 chr5 67253603 67253895 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -56950 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 355.334-7 chr4 52336909 52337228 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 285764 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 293.334-8 chr8 127782879 127783145 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11521 NR_003367 5820 Hs.133107 NR_003367 ENSG00000249859 PVT1 LINC00079|MIR1204HG|NCRNA00079|onco-lncRNA-100 Pvt1 oncogene ncRNA 408.333-8 chr21 29143148 29143425 + 1.66667 NA intron (NM_001286620, intron 2 of 4) intron (NM_001286620, intron 2 of 4) -2291 NM_001286624 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 293.001-3 chr12 111399069 111399290 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6769 NM_005475 10019 Hs.506784 NM_005475 ENSG00000111252 SH2B3 IDDM20|LNK SH2B adaptor protein 3 protein-coding 283.333-56 chr4 35570898 35571219 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 672881 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 274.333-45 chr21 27684467 27684751 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -37770 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 283.001 chr7 36702382 36702562 + 1.66667 NA intron (NM_001637, intron 1 of 20) L1M4a1|LINE|L1 22022 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 381.001-3 chrX 112973323 112973628 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -69252 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 185.334-4 chr5 40268177 40268330 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 215962 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 343.667-12 chr5 161679611 161679959 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -5936 NM_000811 2559 Hs.90791 NM_000811 ENSG00000145863 GABRA6 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha6 subunit protein-coding 311-27 chr5 8018743 8019054 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 149750 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 203-95 chr6 84242978 84243119 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15405 NM_001286206 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 271.334-10 chr15 97018101 97018304 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 234767 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 276.667-66 chr8 109259424 109259702 + 1.66667 NA intron (NM_032869, intron 8 of 9) HERVL40-int|LTR|ERVL 70370 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 274-15 chr14 32666696 32666993 + 1.66667 NA intron (NM_004274, intron 7 of 13) intron (NM_004274, intron 7 of 13) -272035 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 279.334-10 chr4 183859946 183860201 + 1.66667 NA intron (NR_132761, intron 1 of 2) intron (NR_132761, intron 1 of 2) -45234 NM_020225 56977 Hs.21958 NM_020225 ENSG00000173320 STOX2 - storkhead box 2 protein-coding 407.333-16 chr4 146616395 146616822 + 1.66667 NA Intergenic MER47C|DNA|TcMar-Tigger -22285 NM_004575 5458 Hs.266 NM_004575 ENSG00000151615 POU4F2 BRN3.2|BRN3B|Brn-3b POU class 4 homeobox 2 protein-coding 333.001-2 chr6 103502128 103502346 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1357309 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 248.334-14 chr5 17144649 17144882 + 1.66667 NA intron (NR_027253, intron 2 of 2) L1P3|LINE|L1 11227 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 438.334-3 chr7 24688250 24688708 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001303037, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001303037, exon 12 of 12) 68985 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 265.667-33 chr2 17564398 17564675 + 1.66667 NA intron (NM_001366806, intron 1 of 3) intron (NM_001366806, intron 1 of 3) 23840 NM_003385 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 359-6 chr15 34985158 34985394 + 1.66667 NA intron (NM_014106, intron 2 of 2) intron (NM_014106, intron 2 of 2) 3011 NM_014106 54989 Hs.744990 NM_014106 ENSG00000198146 ZNF770 PRO1914 zinc finger protein 770 protein-coding 331-10 chr11 133116128 133116516 + 1.66667 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) L1MC4|LINE|L1 -172554 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 266.667-31 chr18 7188468 7188680 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -42530 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 211.334-3 chr12 22764089 22764264 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 139005 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 401.667-8 chr5 153011139 153011548 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -38994 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 238-18 chr12 119914821 119915095 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37638 NM_001206999 11113 Hs.119594 NM_007174 ENSG00000122966 CIT CITK|CRIK|MCPH17|STK21 citron rho-interacting serine/threonine kinase protein-coding 518.333-3 chr8 125232542 125233127 + 1.66667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 140974 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 249-9 chr10 25407577 25407858 + 1.66667 NA intron (NM_020752, intron 3 of 10) L2|LINE|L2 -231441 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 249-14 chr10 114891917 114892184 + 1.66667 NA intron (NM_001135051, intron 16 of 16) intron (NM_001135051, intron 16 of 16) -46145 NM_139169 142940 Hs.21187 NM_139169 ENSG00000165832 TRUB1 PUS4 TruB pseudouridine synthase family member 1 protein-coding 344.667-11 chr3 55197194 55197603 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 19226 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 248.667-71 chr21 39791375 39791657 + 1.66667 NA intron (NM_001080444, intron 6 of 8) MER58A|DNA|hAT-Charlie 46109 NM_001080444 150084 Hs.422120 NM_001080444 ENSG00000183067 IGSF5 GSF5|JAM4 immunoglobulin superfamily member 5 protein-coding 227.333-117 chr7 62744970 62745208 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 558967 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 260.667-14 chr11 75967678 75967867 + 1.66667 NA intron (NM_003369, intron 7 of 14) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 152562 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 353.666-10 chr7 73542008 73542531 + 1.66667 NA intron (NM_001707, intron 3 of 5) intron (NM_001707, intron 3 of 5) 14967 NR_036682 9275 Hs.647051 NM_001707 ENSG00000106635 BCL7B - BAF chromatin remodeling complex subunit BCL7B protein-coding 133-74 chr5 42569108 42569234 + 1.66667 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 3307 NM_001242462 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 295.333 chr1 166354880 166355231 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 134984 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 264.667-14 chr10 66190263 66190560 + 1.66667 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) 618986 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 264.334-16 chr5 37174067 37174266 + 1.66667 NA intron (NM_023073, intron 31 of 51) intron (NM_023073, intron 31 of 51) -74880 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 477.001 chr10 63295433 63295865 + 1.66667 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) intron (NM_001322258, intron 2 of 24) -26406 NM_001318153 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 275.333-82 chr9 31939035 31939277 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -445447 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 297.333-2 chr1 62465019 62465404 + 1.66667 NA intron (NM_001367561, intron 48 of 49) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 28162 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 348.001-3 chr13 104584592 104584807 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -881168 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 214.667-52 chr16 67510332 67510487 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 18336 NR_104656 100505942 Hs.121233 NR_104656 LOC100505942 - uncharacterized LOC100505942 ncRNA 313.334-5 chr18 2797038 2797385 + 1.66667 NA intron (NM_015295, intron 47 of 47) intron (NM_015295, intron 47 of 47) -49795 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 252-49 chr2 103447455 103447701 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -463149 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 252.333-32 chr2 75040063 75040353 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -50604 NR_049796 100846995 NR_049796 ENSG00000263909 MIR5000 - microRNA 5000 ncRNA 276.667-63 chr8 9793488 9793656 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 51900 NR_030327 693182 NR_030327 ENSG00000207701 MIR597 MIRN597|hsa-mir-597|mir-597 microRNA 597 ncRNA 261.666-2 chr1 220796798 220797105 + 1.66667 NA intron (NM_022746, intron 3 of 6) intron (NM_022746, intron 3 of 6) 10038 NM_022746 64757 Hs.497816 NM_022746 ENSG00000186205 MARC1 MOSC1 mitochondrial amidoxime reducing component 1 protein-coding 256.667-60 chr3 115241799 115242034 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -94628 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 222.333-27 chr13 93382978 93383217 + 1.66667 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) intron (NM_005708, intron 1 of 8) 156290 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 353.001 chr10 26053003 26053314 + 1.66667 NA intron (NM_017433, intron 10 of 34) intron (NM_017433, intron 10 of 34) 118929 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 306.333-43 chr9 29097090 29097474 + 1.66667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 115017 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 392-20 chr8 23389309 23389602 + 1.66667 NA intron (NM_002318, intron 1 of 13) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 14665 NM_002318 4017 Hs.626637 NM_002318 ENSG00000134013 LOXL2 LOR|LOR2|WS9-14 lysyl oxidase like 2 protein-coding 207-66 chr2 76143749 76143903 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -432911 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 245.667-6 chr10 57644162 57644341 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -339692 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 326-26 chr3 80222814 80223105 + 1.66667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -454961 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 416.333-4 chr11 81140677 81141194 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -378132 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 473-2 chr8 61303749 61304196 + 1.66667 NA intron (NM_173519, intron 2 of 5) intron (NM_173519, intron 2 of 5) 16002 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 345.666-12 chr6 24828428 24828710 + 1.66667 NA intron (NM_001286445, intron 17 of 21) L1ME3|LINE|L1 -29652 NM_001282492 101928603 Hs.635133 NM_001282492 ENSG00000260286 ARMH2 C6orf229 armadillo like helical domain containing 2 protein-coding 281-12 chr16 13222881 13223075 + 1.66667 NA intron (NM_001145204, intron 4 of 4) intron (NM_001145204, intron 4 of 4) 321380 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 465.333-7 chr21 28292832 28293398 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -64448 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 255-64 chr5 45221639 45221936 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 412840 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 241-48 chr6 20864718 20865003 + 1.66667 NA intron (NM_017774, intron 9 of 15) intron (NM_017774, intron 9 of 15) 330403 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 279.333-20 chr11 91804498 91804801 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -420385 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 399.667-7 chr20 21400594 21400904 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3223 NM_033176 644524 NM_033176 ENSG00000125816 NKX2-4 NKX2.4|NKX2D NK2 homeobox 4 protein-coding 469.666-4 chr22 46832358 46832692 + 1.66667 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) AluSq4|SINE|Alu 58598 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 249-74 chr9 93474853 93475122 + 1.66667 NA intron (NM_001286723, intron 2 of 9) intron (NM_001286723, intron 2 of 9) -21386 NR_136229 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 291-6 chr10 22633801 22634085 + 1.66667 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 80165 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 276.334-15 chr8 117112379 117112576 + 1.66667 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -22518 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 361-9 chr15 66898944 66899276 + 1.66667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 57405 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 311.667-9 chr18 13546808 13547059 + 1.66667 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -64181 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 493.667-4 chr8 75771794 75772162 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 232010 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 436-9 chr4 128667820 128668113 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -141734 NM_199320 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 260.334-13 chr2 82712386 82712617 + 1.66667 NA Intergenic (AATAATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -144302 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 249.667-28 chr14 52531636 52531903 + 1.66667 NA intron (NM_020784, intron 6 of 20) L1MC2|LINE|L1 20736 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 331.666-13 chr20 55018356 55018864 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -404433 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 248.666-8 chr11 34787461 34787721 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -128539 NM_001135024 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 369-5 chr14 29145207 29145529 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -359581 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 266-42 chr2 82111870 82112177 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -645077 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 265.334-20 chr9 80831243 80831435 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 856316 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 328.333-7 chr10 73103984 73104438 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6164 NM_001283017 25961 Hs.533657 NM_015901 ENSG00000166321 NUDT13 - nudix hydrolase 13 protein-coding 287.333-44 chr4 133023647 133024023 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 125281 NR_125885 101927359 Hs.649960 NR_125885 ENSG00000250241 LOC101927359 - uncharacterized LOC101927359 ncRNA 247.334-10 chr14 62356590 62356757 + 1.66667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -216700 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 420.333-5 chr20 28750502 28750834 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -148003 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 287 chr1 51731420 51731641 + 1.66667 NA intron (NM_148905, intron 1 of 18) AluSx1|SINE|Alu 1680 NM_148907 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 242.667-2 chr1 61312488 61312674 + 1.66667 NA intron (NM_001134673, intron 3 of 10) AluJb|SINE|Alu -59063 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 216.667-35 chr14 55288364 55288532 + 1.66667 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 16294 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 194-66 chr2 12965423 12965575 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 41514 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 321.667-6 chr14 58660424 58660756 + 1.66667 NA Intergenic (ATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 21753 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 355-7 chr15 80415449 80415726 + 1.66667 NA intron (NM_014862, intron 1 of 18) L2|LINE|L2 11205 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 238-63 chr3 146050787 146050948 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18318 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 249.334-19 chr5 104174132 104174281 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -611417 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 249.334-17 chr4 112536420 112536673 + 1.66667 NA intron (NR_161159, intron 3 of 3) intron (NR_161159, intron 3 of 3) -20366 NM_024019 63973 Hs.744415 NM_024019 ENSG00000178403 NEUROG2 Atoh4|Math4A|NGN2|bHLHa8|ngn-2 neurogenin 2 protein-coding 287.667-14 chr14 30838216 30838525 + 1.66667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -36165 NM_001135058 1690 Hs.21016 NM_004086 ENSG00000100473 COCH COCH-5B2|COCH5B2|DFNA9|DFNB110 cochlin protein-coding 152.667-321 chr6 48476333 48476518 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -407736 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 352.667-25 chr6 48550685 48551000 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -482153 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 306.667-45 chr8 122913492 122913912 + 1.66667 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) intron (NM_001362797, intron 3 of 4) 112070 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 251.333-120 chr9 110877944 110878229 + 1.66667 NA intron (NM_001351417, intron 5 of 5) intron (NM_001351417, intron 5 of 5) 149824 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 306.334-6 chr4 96848842 96849048 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -517981 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 470.334-3 chr4 18735070 18735448 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -713384 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 279.334-15 chr9 105582699 105582992 + 1.66667 NA intron (NM_001351502, intron 5 of 13) intron (NM_001351502, intron 5 of 13) 24714 NM_001351501 2218 Hs.55777 NM_006731 ENSG00000106692 FKTN CMD1X|FCMD|LGMD2M|LGMDR13|MDDGA4|MDDGB4|MDDGC4 fukutin protein-coding 203-100 chr7 49686887 49687070 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -86660 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 276.334-13 chr5 136148489 136148684 + 1.66667 NA intron (NM_005903, intron 2 of 7) LTR40a|LTR|ERVL -13696 NR_026763 9597 Hs.59666 NM_022001 ENSG00000164621 SMAD5-AS1 DAMS|SMAD5AS|SMAD5OS SMAD5 antisense RNA 1 ncRNA 289-34 chr9 95196033 95196338 + 1.66667 NA intron (NM_001243744, intron 4 of 13) L1MD|LINE|L1 -110091 NR_036109 100422842 NR_036109 ENSG00000207617 MIR3074 mir-3074 microRNA 3074 ncRNA 211-27 chr13 41339498 41339648 + 1.66667 NA intron (NM_001110798, intron 9 of 10) AluSx1|SINE|Alu -27535 NM_001354076 9617 Hs.382176 NM_004294 ENSG00000120662 MTRF1 MRF1|MTTRF1|RF1 mitochondrial translation release factor 1 protein-coding 309-37 chr8 129855638 129856228 + 1.66667 NA intron (NM_001353282, intron 4 of 10) intron (NM_001353282, intron 4 of 10) -69309 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 271-25 chr2 131113194 131113444 + 1.66667 NA intron (NM_001309448, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 8472 NM_001267066 55041 Hs.469944 NM_017958 ENSG00000115762 PLEKHB2 EVT2 pleckstrin homology domain containing B2 protein-coding 406.333-17 chr9 14902359 14902837 + 1.66667 NA intron (NM_001370065, intron 1 of 7) intron (NM_001370065, intron 1 of 7) 7830 NM_001370065 158326 Hs.50850 NM_144966 ENSG00000164946 FREM1 BNAR|C9orf143|C9orf145|C9orf154|MOTA|TILRR|TRIGNO2 FRAS1 related extracellular matrix 1 protein-coding 302-36 chr22 34938272 34938503 + 1.66667 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) L1MA6|LINE|L1 59529 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 347.667-13 chr3 86865474 86865804 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 125510 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 239.667-4 chr1 69177790 69177975 + 1.66667 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) intron (NR_146608, intron 3 of 4) 121984 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 359.334-3 chr2 112316585 112316927 + 1.66667 NA intron (NM_198581, intron 6 of 11) intron (NM_198581, intron 6 of 11) 41159 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 198.666-71 chr4 114442101 114442335 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -156184 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 263.667-4 chr1 117622231 117622517 + 1.66667 NA intron (NM_017709, intron 1 of 1) intron (NM_017709, intron 1 of 1) 16326 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 354.333-21 chr8 121770642 121770889 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -129325 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 596.666 chr4 122209186 122209695 + 1.66667 NA intron (NM_015312, intron 16 of 83) AluSx|SINE|Alu 38837 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 244.667-27 chr11 115205079 115205272 + 1.66667 NA intron (NM_001301045, intron 7 of 10) intron (NM_001301045, intron 7 of 10) -128402 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 272 chr1 224548257 224548526 + 1.66667 NA intron (NR_136295, intron 2 of 7) SATR2|Satellite|Satellite -67926 NR_136287 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 245.333-52 chr16 83067327 83067545 + 1.66667 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) MIRb|SINE|MIR -77138 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 315.334-7 chr4 94068710 94068941 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 138731 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 324-25 chr5 157194827 157195170 + 1.66667 NA intron (NM_005546, intron 1 of 16) intron (NM_005546, intron 1 of 16) 14102 NM_005546 3702 Hs.558348 NM_005546 ENSG00000113263 ITK EMT|LPFS1|LYK|PSCTK2 IL2 inducible T cell kinase protein-coding 276.667-22 chr13 80501769 80502013 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -160765 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 222.334-3 chr14 58783698 58783868 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44505 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 350.001 chr1 150857554 150857853 + 1.66667 NA intron (NM_001350225, intron 2 of 21) intron (NM_001350225, intron 2 of 21) 18896 NM_001350224 405 Hs.632446 NM_001668 ENSG00000143437 ARNT HIF-1-beta|HIF-1beta|HIF1-beta|HIF1B|HIF1BETA|TANGO|bHLHe2 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein-coding 281-48 chr9 71139981 71140493 + 1.66667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -18616 NM_001366148 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 294.667-50 chr7 8238900 8239221 + 1.66667 NA intron (NM_001350826, intron 1 of 14) intron (NM_001350826, intron 1 of 14) 22992 NM_022307 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 294.334-2 chr12 12700925 12701305 + 1.66667 NA Intergenic Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger -4932 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 289-31 chr7 36380451 36380705 + 1.66667 NA intron (NM_001100425, intron 2 of 6) intron (NM_001100425, intron 2 of 6) -9284 NM_018685 54443 Hs.62180 NM_018685 ENSG00000011426 ANLN FSGS8|Scraps|scra anillin actin binding protein protein-coding 263-25 chr17 12391304 12391575 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -158529 NR_034145 284034 Hs.376614 NR_034144 ENSG00000179136 LINC00670 - long intergenic non-protein coding RNA 670 ncRNA 272.667-40 chr3 43604568 43604788 + 1.66667 NA intron (NM_001346463, intron 2 of 12) intron (NM_001346463, intron 2 of 12) 17248 NM_001346466 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 396.334-7 chr8 120693986 120694440 + 1.66667 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) -67040 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 268.667-27 chr2 19285125 19285286 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -63224 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 303.334-8 chr5 38068605 38068876 + 1.66667 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) 43043 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 233-65 chr8 120830574 120830796 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -18639 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 297.334-11 chr7 9180365 9180562 + 1.66667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -453807 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 248.334-2 chr1 246308983 246309204 + 1.66667 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 108319 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 167.333-62 chr12 17183715 17183923 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 195072 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 455.334 chr11 34742477 34742907 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 110126 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 308.667-27 chr4 82236839 82237202 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 136971 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 246.333-60 chr3 96180417 96180698 + 1.66667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -179407 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 268-60 chr8 97477741 97478034 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -31390 NR_125390 101927066 Hs.732112 NR_125390 LOC101927066 - uncharacterized LOC101927066 ncRNA 241.667-27 chr16 76207660 76207841 + 1.66667 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -69651 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 335.334 chr1 107183814 107184263 + 1.66667 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 35969 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 242-38 chr2 38236531 38236706 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 105513 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 253.333-94 chr6 156031912 156032197 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 85257 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 415.333-4 chr2 67301118 67301508 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -85994 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 155-47 chr16 78171851 78172033 + 1.66667 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 72288 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 399-12 chr8 121888780 121889229 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -247564 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 149.667-403 chr8 99542604 99542744 + 1.66667 NA intron (NM_017890, intron 30 of 61) intron (NM_017890, intron 30 of 61) -5813 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 266-14 chr11 93360611 93360786 + 1.66667 NA intron (NM_181645, intron 4 of 13) L1MDa|LINE|L1 29981 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 291-38 chr5 31036359 31036680 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -157167 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 246-64 chr3 1602990 1603157 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -495730 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 430.667-11 chr9 31561477 31561909 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -180203 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 268-13 chr11 112511084 112511338 + 1.66667 NA intron (NR_120559, intron 2 of 2) intron (NR_120559, intron 2 of 2) 26866 NR_120560 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 265.334-3 chr1 223776050 223776321 + 1.66667 NA TTS (NM_001748) TTS (NM_001748) 63646 NM_001748 824 Hs.350899 NM_001748 ENSG00000162909 CAPN2 CANP2|CANPL2|CANPml|mCANP calpain 2 protein-coding 574.667-2 chr4 48656849 48657380 + 1.66667 NA intron (NM_015030, intron 3 of 63) intron (NM_015030, intron 3 of 63) 123185 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 247.333-92 chr8 135592397 135592595 + 1.66667 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) intron (NM_006558, intron 6 of 8) 135040 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 273-27 chr4 52439580 52439905 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 216797 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 279.333-52 chr3 5126325 5126563 + 1.66667 NA intron (NM_018184, intron 1 of 6) intron (NM_018184, intron 1 of 6) 4152 NM_018184 55207 Hs.250009 NM_018184 ENSG00000134108 ARL8B ARL10C|Gie1 ADP ribosylation factor like GTPase 8B protein-coding 384.667-6 chr21 27179772 27180271 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -212933 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 254-22 chr14 70988475 70988645 + 1.66667 NA intron (NM_001308160, intron 6 of 33) intron (NM_001308160, intron 6 of 33) 81101 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 246-80 chr4 88073805 88073983 + 1.66667 NA intron (NR_156488, intron 12 of 13) L1M4b|LINE|L1 66259 NR_156488 5311 Hs.181272 NM_000297 ENSG00000118762 PKD2 APKD2|PC2|PKD4|Pc-2|TRPP2 polycystin 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 284.667-60 chr9 95827612 95827938 + 1.66667 NA intron (NR_023390, intron 2 of 2) MER97b|DNA|hAT-Tip100 -47916 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 222.667-17 chr12 42848445 42848661 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 156337 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 364.334-4 chr8 121528630 121529012 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -110525 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 412.667-8 chr2 46599964 46600408 + 1.66667 NA intron (NM_173074, intron 4 of 6) intron (NM_173074, intron 4 of 6) 16855 NM_173074 5281 Hs.468415 NM_002643 ENSG00000151665 PIGF - phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class F protein-coding 275-51 chr8 107092737 107092942 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 243676 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 299.333-53 chr22 47160488 47160902 + 1.66667 NA intron (NM_001284305, intron 12 of 12) intron (NM_001284305, intron 12 of 12) -184876 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 282-38 chr4 42191347 42191618 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -38827 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 267-63 chr7 78676220 78676524 + 1.66667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) 329130 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 241.334-6 chr2 118234351 118234628 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -48103 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 239.666-16 chr2 44560179 44560412 + 1.66667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) AluJr4|SINE|Alu 198348 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 256.334-3 chr11 109343039 109343233 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -79054 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 274.334-3 chr2 52745411 52745682 + 1.66667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -42931 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 228-61 chr4 36414937 36415125 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 11397 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 462.667-2 chr11 25550121 25550496 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -638815 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 329.334-3 chr10 43157674 43157905 + 1.66667 NA intron (NM_018590, intron 2 of 7) AluSc|SINE|Alu 2892 NM_001319654 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 267.334-12 chr20 62718601 62718844 + 1.66667 NA intron (NM_002531, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 9886 NM_002531 4923 Hs.590869 NM_002531 ENSG00000101188 NTSR1 NTR neurotensin receptor 1 protein-coding 528-3 chr4 155719065 155719602 + 1.66667 NA intron (NM_001130685, intron 8 of 9) intron (NM_001130685, intron 8 of 9) -39688 NM_000857 2983 Hs.77890 NM_000857 ENSG00000061918 GUCY1B1 GC-S-beta-1|GC-SB3|GUC1B3|GUCB3|GUCSB3|GUCY1B3 guanylate cyclase 1 soluble subunit beta 1 protein-coding 326-24 chr3 43122721 43123124 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -16843 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 401.666-7 chr8 134515880 134516423 + 1.66667 NA intron (NM_020863, intron 13 of 15) L1MC5|LINE|L1 -81920 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 462.667-3 chr2 164698129 164698730 + 1.66667 NA intron (NM_001365671, intron 12 of 15) intron (NM_001365671, intron 12 of 15) -10652 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 292-31 chr2 167397719 167398065 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 210520 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 474.667-6 chr4 111361333 111361760 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -500899 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 241-31 chr2 32615064 32615299 + 1.66667 NA intron (NM_016252, intron 73 of 73) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -12869 NM_001193509 55622 Hs.468125 NM_017735 ENSG00000018699 TTC27 - tetratricopeptide repeat domain 27 protein-coding 306.333-46 chr9 78239875 78240247 + 1.66667 NA exon (NM_001098802, exon 2 of 16) exon (NM_001098802, exon 2 of 16) 3986 NM_001349839 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 393.001 chr22 28188805 28189177 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) HAL1|LINE|L1 -268379 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 377.666 chr1 30234240 30234923 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -196969 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 251-24 chr15 44640601 44640898 + 1.66667 NA intron (NM_025137, intron 7 of 39) AluSc|SINE|Alu 22913 NM_001160227 80208 Hs.656271 NM_025137 ENSG00000104133 SPG11 ALS5|CMT2X|KIAA1840 SPG11 vesicle trafficking associated, spatacsin protein-coding 297-16 chr12 10116057 10116375 + 1.66667 NA TTS (NM_022570) TTS (NM_022570) 13983 NM_197954 64581 Hs.143929 NM_022570 ENSG00000172243 CLEC7A BGR|CANDF4|CD369|CLECSF12|DECTIN1|SCARE2 C-type lectin domain containing 7A protein-coding 502.666-2 chr17 32188147 32188656 + 1.66667 NA intron (NM_001033566, intron 8 of 19) Cheshire|DNA|hAT-Charlie -36830 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 183-44 chr15 38209742 38209916 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -43007 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 268-58 chr8 31091986 31092258 + 1.66667 NA intron (NM_000553, intron 16 of 34) intron (NM_000553, intron 16 of 34) -58766 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 259.334-17 chr4 129005076 129005342 + 1.66667 NA intron (NM_144643, intron 5 of 20) intron (NM_144643, intron 5 of 20) 88330 NM_001300897 132320 Hs.654690 NM_144643 ENSG00000151466 SCLT1 CAP-1A|CAP1A sodium channel and clathrin linker 1 protein-coding 240.333-82 chr6 116742074 116742310 + 1.66667 NA TTS (NM_002269) TTS (NM_002269) 23527 NM_001085480 221303 Hs.126712 NM_001085480 ENSG00000183807 FAM162B C6orf189|bA86F4.2 family with sequence similarity 162 member B protein-coding 350-25 chr5 16965754 16966120 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29649 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 612-2 chr3 17007144 17007708 + 1.66667 NA intron (NM_015184, intron 1 of 5) intron (NM_015184, intron 1 of 5) 74230 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 248.667-12 chr10 51152326 51152520 + 1.66667 NA intron (NM_006258, intron 1 of 17) intron (NM_006258, intron 1 of 17) 77936 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 503.667-3 chr2 210641610 210642145 + 1.66667 NA intron (NR_163592, intron 14 of 27) intron (NR_163592, intron 14 of 27) 24306 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 228-67 chr5 123563420 123563610 + 1.66667 NA intron (NM_001044723, intron 3 of 12) intron (NM_001044723, intron 3 of 12) 18098 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 279.334-13 chr8 49793318 49793594 + 1.66667 NA Intergenic MLT1-int|LTR|ERVL-MaLR -116340 NM_001321775 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 252-7 chr1 247480217 247480380 + 1.66667 NA Intergenic (CAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10770 NM_001004698 441932 Hs.591526 NM_001004698 OR2W5 OR2W5P|OST722 olfactory receptor family 2 subfamily W member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 251-22 chr14 63237699 63237879 + 1.66667 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 33346 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 314-29 chr3 99161380 99161761 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -259875 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 282.667-46 chr7 130932178 130932355 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18802 NR_109780 100506860 Hs.635013 NR_109780 LINC00513 - long intergenic non-protein coding RNA 513 ncRNA 242-75 chr8 88428410 88428595 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -101019 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 269.333-31 chr17 70562259 70562544 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 392866 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 219-7 chr10 4710320 4710474 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -32327 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 386.667-3 chr10 52174266 52174675 + 1.66667 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) intron (NM_001098512, intron 9 of 17) 139658 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 373.333-13 chr19 35783239 35783642 + 1.66667 NA intron (NM_001366178, intron 15 of 20) L2a|LINE|L2 7876 NM_001366178 115703 Hs.515364 NM_052948 ENSG00000004777 ARHGAP33 NOMA-GAP|SNX26|TCGAP Rho GTPase activating protein 33 protein-coding 219.333-10 chr1 153125933 153126145 + 1.66667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -12523 NM_001014450 6705 Hs.490252 NM_001014450 ENSG00000244094 SPRR2F - small proline rich protein 2F protein-coding 319-29 chr7 95657200 95657570 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -60869 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 255.334-22 chr3 185375865 185376048 + 1.66667 NA intron (NM_004721, intron 1 of 13) HERVH-int|LTR|ERV1 12820 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 255-4 chr1 84743801 84744022 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -53443 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 264.334-24 chr9 12710029 12710187 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_000550, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_000550, exon 8 of 8) 16723 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 280-2 chr1 83537402 83537637 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 91465 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 368.666-2 chr10 75321666 75321977 + 1.66667 NA intron (NR_038226, intron 2 of 3) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 25438 NR_038225 253264 Hs.662111 NR_038223 ENSG00000226051 ZNF503-AS1 - ZNF503 antisense RNA 1 ncRNA 251.666-2 chr1 104030865 104031115 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -42033 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 454.999-3 chr4 47664225 47664747 + 1.66667 NA intron (NM_006587, intron 11 of 21) MIRb|SINE|MIR 11817 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 252.334-7 chr17 53905979 53906233 + 1.66667 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 83179 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 296.334-6 chr12 132047161 132047372 + 1.66667 NA intron (NM_015409, intron 39 of 52) intron (NM_015409, intron 39 of 52) 16042 NR_002979 677829 Hs.742405 NR_002979 ENSG00000208892 SNORA49 ACA49 small nucleolar RNA, H/ACA box 49 snoRNA 246.666-31 chr4 157312006 157312284 + 1.66667 NA intron (NM_001083620, intron 3 of 15) intron (NM_001083620, intron 3 of 15) 91417 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 476.667-2 chr15 25353589 25354193 + 1.66667 NA intron (NM_001354542, intron 10 of 11) MIR|SINE|MIR 75548 NR_001295 338428 NR_001295 ENSG00000274640 SNORD109A HBII-438A small nucleolar RNA, C/D box 109A snoRNA 258.667 chr1 9816881 9817089 + 1.66667 NA intron (NM_001009566, intron 1 of 18) intron (NM_001009566, intron 1 of 18) 7541 NM_014944 22883 Hs.29665 NM_014944 ENSG00000171603 CLSTN1 ALC-ALPHA|CDHR12|CST-1|CSTN1|PIK3CD|XB31alpha|alcalpha1|alcalpha2 calsyntenin 1 protein-coding 343.667-4 chr18 39179303 39179541 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 442753 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 232.334-2 chr11 38323400 38323623 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 322845 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 273.333-42 chr3 4848773 4849073 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 57578 NR_125914 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 263-67 chr8 140649174 140649445 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -13676 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 339.667-15 chr3 80462949 80463353 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -301746 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 263.667-10 chr10 68736809 68737100 + 1.66667 NA exon (NM_001282960, exon 3 of 24) exon (NM_001282960, exon 3 of 24) 15715 NR_104262 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 550 chr1 245772467 245773017 + 1.66667 NA intron (NM_022743, intron 10 of 11) intron (NM_022743, intron 10 of 11) -538225 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 247-43 chr2 221714842 221715029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -140733 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 255-69 chr5 147672159 147672363 + 1.66667 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) intron (NM_001270934, intron 1 of 20) 110467 NM_001282282 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 288-62 chr9 95917233 95917472 + 1.66667 NA intron (NM_020207, intron 6 of 18) intron (NM_020207, intron 6 of 18) 41344 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 242-41 chr2 71114044 71114427 + 1.66667 NA intron (NM_032601, intron 2 of 2) L1PA10|LINE|L1 15994 NM_032601 84693 Hs.94949 NM_032601 ENSG00000124370 MCEE GLOD2 methylmalonyl-CoA epimerase protein-coding 224.333-98 chr5 73771581 73771757 + 1.66667 NA intron (NM_001177693, intron 4 of 35) intron (NM_001177693, intron 4 of 35) -41877 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 430.333-2 chr14 62835060 62835345 + 1.66667 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) intron (NM_139318, intron 8 of 10) 210256 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 257-61 chr6 50767991 50768181 + 1.66667 NA intron (NM_172238, intron 7 of 7) intron (NM_172238, intron 7 of 7) -50785 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 411.334-2 chr20 4506631 4506893 + 1.66667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -179694 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 266.334-4 chr1 48539115 48539279 + 1.66667 NA intron (NM_001323574, intron 12 of 13) MIRb|SINE|MIR -66989 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 415.333-13 chr7 8400200 8400678 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -33170 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 391.334 chr14 73084478 73084845 + 1.66667 NA intron (NM_021239, intron 5 of 18) AluSp|SINE|Alu 26127 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 362.667-31 chrX 49022911 49023138 + 1.66667 NA Intergenic FAM|SINE|Alu 20333 NM_006521 7030 Hs.730740 NM_006521 ENSG00000068323 TFE3 RCCP2|RCCX1|TFEA|bHLHe33 transcription factor binding to IGHM enhancer 3 protein-coding 245-43 chr20 31749422 31749604 + 1.66667 NA intron (NM_012112, intron 2 of 17) MIR|SINE|MIR 10223 NM_012112 22974 Hs.244580 NM_012112 ENSG00000088325 TPX2 C20orf1|C20orf2|DIL-2|DIL2|FLS353|GD:C20orf1|HCA519|HCTP4|REPP86|p100 TPX2 microtubule nucleation factor protein-coding 215.667-24 chr12 4094930 4095125 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -178735 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 247.667-92 chr7 97638352 97638523 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -93649 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 214.334-4 chr3 87599802 87599981 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -192815 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 247.667-77 chr5 52847848 52848022 + 1.66667 NA intron (NM_181501, intron 1 of 28) intron (NM_181501, intron 1 of 28) 60019 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 234.333-5 chr1 175270749 175270997 + 1.66667 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 -77886 NM_001162893 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 254.334-32 chr7 32562416 32562676 + 1.66667 NA intron (NM_015060, intron 10 of 15) intron (NM_015060, intron 10 of 15) 67057 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 263.667-42 chr18 3323894 3324195 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26515 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 236.333-90 chr8 78488376 78488611 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27847 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 248.334-13 chr3 165688595 165688851 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 148700 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 250.334-6 chr14 75764113 75764276 + 1.66667 NA intron (NM_015072, intron 18 of 31) L1ME3E|LINE|L1 102948 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 244-3 chr1 69412981 69413167 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20181 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 251-52 chr4 53226608 53226872 + 1.66667 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 139321 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 282.334-5 chr12 123160783 123161073 + 1.66667 NA intron (NR_103517, intron 22 of 23) intron (NR_103517, intron 22 of 23) -50439 NM_001300801 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 280.667-10 chr1 227831010 227831257 + 1.66667 NA intron (NM_183062, intron 3 of 4) L1M4a1|LINE|L1 15416 NM_183062 339501 Hs.97604 NM_183062 ENSG00000185888 PRSS38 MPN2 serine protease 38 protein-coding 425.332 chr1 29055721 29056110 + 1.66667 NA intron (NM_001166007, intron 12 of 17) AluSx1|SINE|Alu 66586 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 283.333-53 chr3 154391741 154391990 + 1.66667 NA intron (NM_001038705, intron 3 of 3) L1M3d|LINE|L1 38325 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 321.333-40 chr2 164932055 164932483 + 1.66667 NA intron (NM_001199148, intron 6 of 10) L1PA13|LINE|L1 23256 NM_001351539 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 419.667-7 chr5 77592261 77592678 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 46228 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 277.334-6 chr2 119866184 119866464 + 1.66667 NA intron (NM_002830, intron 3 of 26) intron (NM_002830, intron 3 of 26) 106402 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 276.667-20 chr13 68447922 68448158 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 437285 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 254-39 chr2 154459892 154460157 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2586 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 382.333-17 chr6 37727318 37727607 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -29579 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 264.334-5 chr11 18452454 18452614 + 1.66667 NA TTS (NM_017448) TTS (NM_017448) -3322 NM_144972 160287 Hs.668877 NM_144972 ENSG00000166800 LDHAL6A LDH6A lactate dehydrogenase A like 6A protein-coding 234.334-17 chr6 73680963 73681111 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15048 NM_001159587 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 296.667-6 chr11 10566429 10566807 + 1.66667 NA intron (NM_006691, intron 1 of 5) intron (NM_006691, intron 1 of 5) 2047 NM_006691 10894 Hs.655332 NM_006691 ENSG00000133800 LYVE1 CRSBP-1|HAR|LYVE-1|XLKD1 lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 protein-coding 425.666-2 chr2 116128445 116128774 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 784794 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 195.667-11 chr10 74534619 74534911 + 1.66667 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -5441 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 206-19 chr10 52560251 52560443 + 1.66667 NA intron (NR_155748, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR -89814 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 392.667-2 chr12 87894010 87894372 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -109480 NR_033410 400058 Hs.572212 NR_033410 MKRN9P MKRN5|MKRN9|MKRNP6|RNF65|ZNF127L3 makorin ring finger protein 9, pseudogene pseudo 319.667-8 chr16 66355114 66355377 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -11446 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 321.999-4 chr2 25580294 25580646 + 1.66667 NA intron (NM_033147, intron 7 of 19) AluSx1|SINE|Alu 69752 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 205.667-103 chr3 186514244 186514435 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20678 NR_033844 253573 Hs.97386 NR_033844 ENSG00000224406 LINC02052 - long intergenic non-protein coding RNA 2052 ncRNA 219.333-109 chr21 22728213 22728426 + 1.66667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -350965 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 303-33 chr21 29107824 29108177 + 1.66667 NA intron (NM_001286634, intron 5 of 7) L1M5|LINE|L1 -13990 NM_001371376 296.667-26 chr2 57763600 57763785 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -143959 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 348-20 chr5 43267981 43268298 + 1.66667 NA intron (NR_072980, intron 2 of 3) L1PB3|LINE|L1 45042 NM_001330663 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 246-11 chr10 31525751 31525905 + 1.66667 NA intron (NM_001323638, intron 12 of 12) intron (NM_001323638, intron 12 of 12) -126073 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 374.334-5 chr9 90355533 90355972 + 1.66667 NA intron (NR_109795, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 77737 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 257.667-74 chr7 5147180 5147400 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2744 NR_034163 645700 Hs.690815 NR_034163 ENSG00000159904 ZNF890P - zinc finger protein 890, pseudogene pseudo 204-66 chr15 61289211 61289349 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -59978 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 157.667-83 chr12 85078141 85078299 + 1.66667 NA intron (NM_001079910, intron 11 of 26) intron (NM_001079910, intron 11 of 26) 41869 NM_001079910 84125 Hs.402200 NM_032165 ENSG00000133640 LRRIQ1 - leucine rich repeats and IQ motif containing 1 protein-coding 206.667-55 chr18 55363727 55363931 + 1.66667 NA intron (NM_001348217, intron 5 of 18) AluSz|SINE|Alu 37859 NM_001330605 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 241-14 chr11 115669393 115669644 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 65244 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 307.666-11 chr3 69822532 69822810 + 1.66667 NA intron (NM_001354607, intron 2 of 10) intron (NM_001354607, intron 2 of 10) -43553 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 160-95 chr5 45360439 45360627 + 1.66667 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) intron (NM_021072, intron 4 of 7) 335847 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 417.667-4 chr2 199363999 199364403 + 1.66667 NA intron (NM_001172509, intron 6 of 10) intron (NM_001172509, intron 6 of 10) 93738 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 254.667-47 chr21 31394104 31394291 + 1.66667 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) L1MC1|LINE|L1 -49843 NM_001353687 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 329-13 chr2 206984620 206984952 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 45268 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 458.667 chr14 50164775 50165130 + 1.66667 NA intron (NM_006939, intron 8 of 22) L1MC4|LINE|L1 -48380 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 362.667-10 chr14 64560608 64560987 + 1.66667 NA intron (NM_172365, intron 3 of 11) L2c|LINE|L2 10836 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 295-19 chr16 74561358 74561652 + 1.66667 NA intron (NR_027264, intron 1 of 26) MER57A-int|LTR|ERV1 45609 NM_001145667 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 237.333-99 chr6 68618127 68618286 + 1.66667 NA Intergenic (TATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16118 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 278-25 chr20 41423145 41423387 + 1.66667 NA intron (NM_032221, intron 30 of 36) intron (NM_032221, intron 30 of 36) -56448 NM_052846 90187 Hs.726525 NM_052846 ENSG00000183798 EMILIN3 C20orf130|EMILIN5|dJ620E11.4 elastin microfibril interfacer 3 protein-coding 241.667-77 chr5 111632903 111633067 + 1.66667 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) intron (NR_040093, intron 1 of 6) -120388 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 336-17 chr21 16562984 16563361 + 1.66667 NA intron (NR_136547, intron 2 of 2) intron (NR_136547, intron 2 of 2) 23344 NR_029480 406885 NR_029480 ENSG00000199030 MIRLET7C LET7C|MIRNLET7C|hsa-let-7c|let-7c microRNA let-7c ncRNA 300.667-2 chr10 32145354 32145661 + 1.66667 NA Intergenic (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -89082 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 255.667-47 chr2 157422310 157422570 + 1.66667 NA intron (NM_004288, intron 6 of 7) AluSq2|SINE|Alu 21649 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 263-11 chr10 96007647 96007911 + 1.66667 NA intron (NM_001349008, intron 25 of 34) intron (NM_001349008, intron 25 of 34) 7688 NM_001159747 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 347-9 chr14 51908950 51909242 + 1.66667 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) L1ME4b|LINE|L1 9475 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 274.334 chr10 64038510 64038761 + 1.66667 NA Intergenic MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 -516745 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 305.667-37 chr8 82805005 82805377 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -106913 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 424-4 chr12 31488833 31489282 + 1.66667 NA intron (NM_144973, intron 2 of 20) intron (NM_144973, intron 2 of 20) -100866 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 338.667-29 chr7 8033822 8034181 + 1.66667 NA intron (NM_138426, intron 3 of 7) L1ME1|LINE|L1 65205 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 341.667-10 chr18 12391740 12392129 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14658 NM_006796 10939 Hs.726355 NM_006796 ENSG00000141385 AFG3L2 SCA28|SPAX5 AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2 protein-coding 260.333-37 chr3 57984085 57984369 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -24195 NM_001164317 2317 Hs.476448 NM_001457 ENSG00000136068 FLNB ABP-278|ABP-280|AOI|FH1|FLN-B|FLN1L|LRS1|SCT|TABP|TAP filamin B protein-coding 328.001 chr16 79992675 79992994 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 197585 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 376.001 chr2 49859680 49860039 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 114344 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 318.333-32 chr7 140139446 140139805 + 1.66667 NA intron (NM_030647, intron 1 of 19) L1ME3B|LINE|L1 37358 NM_030647 80853 Hs.308710 NM_030647 ENSG00000006459 KDM7A JHDM1D lysine demethylase 7A protein-coding 259.666-4 chr1 234686119 234686419 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -37773 NR_038856 100506810 Hs.586634 NR_038856 ENSG00000227630 LINC01132 - long intergenic non-protein coding RNA 1132 ncRNA 516.667-4 chr16 9813135 9813568 + 1.66667 NA intron (NM_001134408, intron 10 of 13) intron (NM_001134408, intron 10 of 13) -357846 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 499.333-9 chr5 19772876 19773449 + 1.66667 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) intron (NM_001349559, intron 3 of 12) 113110 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 191-46 chr5 7543131 7543376 + 1.66667 NA intron (NM_020546, intron 3 of 24) intron (NM_020546, intron 3 of 24) 147115 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 263-28 chr2 24617384 24617608 + 1.66667 NA intron (NM_001362950, intron 3 of 23) L2|LINE|L2 33019 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 357.334-11 chr7 91582904 91583283 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 297609 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 203-14 chr10 81048816 81048952 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 399087 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 225.333-101 chr4 84812825 84813088 + 1.66667 NA intron (NM_014991, intron 13 of 67) Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger -152660 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 275.334-11 chr3 191479411 191479606 + 1.66667 NA intron (NR_120606, intron 1 of 6) intron (NR_120606, intron 1 of 6) 18345 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 335.334-5 chr21 21397871 21398172 + 1.66667 NA intron (NM_001352592, intron 10 of 18) L1PB1|LINE|L1 250859 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 248.333-67 chr4 40882186 40882405 + 1.66667 NA intron (NM_173075, intron 11 of 16) LTR50|LTR|ERVL -25103 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 517-6 chr6 137200031 137200601 + 1.66667 NA intron (NM_001363526, intron 7 of 7) intron (NM_001363526, intron 7 of 7) 18880 NM_001363527 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 255.667-58 chr3 180436681 180436915 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 22625 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 310.334-6 chr2 201114777 201115024 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -1204 NM_001127184 8837 Hs.390736 NM_003879 ENSG00000003402 CFLAR CASH|CASP8AP1|CLARP|Casper|FLAME|FLAME-1|FLAME1|FLIP|I-FLICE|MRIT|c-FLIP|c-FLIPL|c-FLIPR|c-FLIPS|cFLIP CASP8 and FADD like apoptosis regulator protein-coding 485.334-3 chr8 118293229 118293827 + 1.66667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -181709 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 553.333 chr2 162514849 162515729 + 1.66667 NA intron (NM_033272, intron 4 of 15) intron (NM_033272, intron 4 of 15) 170921 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 296-10 chr10 69132016 69132377 + 1.66667 NA intron (NM_001035260, intron 1 of 7) intron (NM_001035260, intron 1 of 7) 8018 NM_001318945 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 248-88 chr8 87611317 87611517 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 262598 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 207.666-8 chr10 91192076 91192260 + 1.66667 NA intron (NM_001257101, intron 1 of 9) intron (NM_001257101, intron 1 of 9) -27983 NM_001256549 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 247-70 chr7 54377258 54377461 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 46662 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 246-84 chr5 50750582 50750748 + 1.66667 NA intron (NM_024615, intron 3 of 25) intron (NM_024615, intron 3 of 25) 83251 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 249-53 chr3 161864237 161864503 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 367562 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 240-53 chr2 221928467 221928757 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -354410 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 363-9 chr2 239140568 239141016 + 1.66667 NA intron (NM_006037, intron 8 of 26) intron (NM_006037, intron 8 of 26) 54665 NR_026664 85009 Hs.744565 NM_032923 MGC16025 - uncharacterized LOC85009 ncRNA 309-9 chr10 91403713 91403904 + 1.66667 NA intron (NR_024467, intron 3 of 4) intron (NR_024467, intron 3 of 4) -5427 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 261-10 chr10 47106088 47106345 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -193981 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 210.667-60 chr19 30161672 30161849 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -210624 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 243.334-5 chr13 101983680 101983930 + 1.66667 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) intron (NM_175929, intron 1 of 4) -16059 NR_039603 100616110 NR_039603 ENSG00000265164 MIR2681 - microRNA 2681 ncRNA 370.334-6 chr7 113646092 113646326 + 1.66667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 272800 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 297.999-4 chr2 11598182 11598510 + 1.66667 NA intron (NM_014668, intron 14 of 32) intron (NM_014668, intron 14 of 32) 55660 NM_033090 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 375.667-9 chr18 5995573 5995922 + 1.66667 NA intron (NR_158609, intron 15 of 17) intron (NR_158609, intron 15 of 17) -99793 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 286.334-6 chr2 174080585 174080937 + 1.66667 NA intron (NM_001011708, intron 8 of 9) intron (NM_001011708, intron 8 of 9) 55481 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 233.667-26 chr16 27730146 27730315 + 1.66667 NA intron (NM_015202, intron 14 of 27) Charlie8|DNA|hAT-Charlie -11201 NR_147898 100128079 Hs.610277 NR_147898 LOC100128079 - uncharacterized LOC100128079 ncRNA 268.334-11 chr2 71381906 71382100 + 1.66667 NA intron (NM_001252613, intron 10 of 27) intron (NM_001252613, intron 10 of 27) 50221 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 276.333-26 chr2 147063165 147063405 + 1.66667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 476228 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 264.667-21 chr12 60451560 60451734 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 762277 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 306.667-46 chr9 34995714 34995921 + 1.66667 NA intron (NM_001135005, intron 2 of 3) intron (NM_001135005, intron 2 of 3) 5527 NM_001135005 25822 Hs.237506 NM_012266 ENSG00000137094 DNAJB5 Hsc40 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B5 protein-coding 260.334-18 chr6 73009929 73010121 + 1.66667 NA intron (NM_001160132, intron 2 of 13) L1MB3|LINE|L1 -42272 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 361.334-3 chr2 80829116 80829444 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 515901 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 252-13 chr11 27120317 27120554 + 1.66667 NA intron (NM_003986, intron 7 of 8) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 79620 NM_003986 8424 Hs.591996 NM_003986 ENSG00000129151 BBOX1 BBH|BBOX|G-BBH|gamma-BBH gamma-butyrobetaine hydroxylase 1 protein-coding 386.334-2 chr21 18590918 18591282 + 1.66667 NA intron (NR_109925, intron 2 of 3) intron (NR_109925, intron 2 of 3) 95064 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 356.333-16 chr18 640541 640972 + 1.66667 NA intron (NM_199167, intron 6 of 8) intron (NM_199167, intron 6 of 8) -16897 NM_001354867 7298 Hs.369762 NM_001071 ENSG00000176890 TYMS HST422|TMS|TS thymidylate synthetase protein-coding 453.001 chr11 16361480 16361828 + 1.66667 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) intron (NM_001367872, intron 3 of 16) -5108 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 220.333-69 chr2 214281726 214281880 + 1.66667 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) L1ME1|LINE|L1 -129251 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 252.333-7 chr10 21092880 21093054 + 1.66667 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) intron (NM_001173484, intron 2 of 6) -81023 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 262-63 chr5 14399143 14399434 + 1.66667 NA intron (NM_007118, intron 30 of 56) intron (NM_007118, intron 30 of 56) -64695 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 376.667-9 chr4 65139424 65139765 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -135094 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 251-64 chr5 44691888 44692074 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 116812 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 244-36 chr14 73643163 73643337 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1736 NM_001201366 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 244.333-3 chr1 59121246 59121510 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 25429 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 304-14 chr10 112960743 112961187 + 1.66667 NA intron (NM_001198530, intron 3 of 10) AluSq|SINE|Alu 10715 NM_001198530 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 177.333-183 chrX 53172643 53172856 + 1.66667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 22739 NR_106955 102465539 NR_106955 ENSG00000276575 MIR6895 hsa-mir-6895 microRNA 6895 ncRNA 241.667-5 chr1 119892457 119892613 + 1.66667 NA TTS (NM_021794) TTS (NM_021794) 3980 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 269.333-53 chr2 199527080 199527338 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -55943 NM_015265 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 259-56 chr9 109799903 109800161 + 1.66667 NA intron (NM_053016, intron 1 of 6) intron (NM_053016, intron 1 of 6) 19834 NM_053016 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 283.333-57 chr4 83075264 83075582 + 1.66667 NA exon (NM_016129, exon 10 of 10) exon (NM_016129, exon 10 of 10) 34466 NM_001130716 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 309-34 chr8 20544479 20544836 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 70269 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 326.334-6 chr3 64065113 64065410 + 1.66667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -2703 NR_045697 100652759 Hs.731187 NR_045697 ENSG00000241111 PRICKLE2-AS1 - PRICKLE2 antisense RNA 1 ncRNA 261-60 chr8 120762623 120762857 + 1.66667 NA intron (NR_125419, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 1487 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 330-19 chr2 88256844 88257245 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 83905 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 250.667-89 chr9 34968713 34968878 + 1.66667 NA intron (NM_015297, intron 1 of 7) intron (NM_015297, intron 1 of 7) 10510 NM_001347983 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 442.334 chr1 178563495 178563830 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 20866 NR_033186 400798 Hs.668085 NM_207467 ENSG00000213057 C1orf220 - chromosome 1 open reading frame 220 (putative) ncRNA 173.333-214 chr9 76453041 76453439 + 1.66667 NA intron (NM_001097634, intron 1 of 2) MER92-int|LTR|ERV1 -5912 NM_001097633 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 248.334-7 chr19 43801581 43801763 + 1.66667 NA intron (NM_182573, intron 1 of 4) intron (NM_182573, intron 1 of 4) 775 NM_001031749 284348 Hs.44289 NM_182573 ENSG00000159871 LYPD5 PRO4356 LY6/PLAUR domain containing 5 protein-coding 217-8 chr1 226760001 226760151 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20901 NM_002221 3707 Hs.528087 NM_002221 ENSG00000143772 ITPKB IP3-3KB|IP3K|IP3K-B|IP3KB|PIG37 inositol-trisphosphate 3-kinase B protein-coding 433-6 chr5 120795078 120795566 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 263858 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 180-108 chr8 78763938 78764202 + 1.66667 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L1MC1|LINE|L1 -39696 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 389.334-3 chr4 56279078 56279444 + 1.66667 NA intron (NM_020722, intron 3 of 10) L1P1|LINE|L1 108230 NM_001323890 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 268.334-17 chr5 128357804 128357989 + 1.66667 NA intron (NM_001999, intron 19 of 64) intron (NM_001999, intron 19 of 64) 180349 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 274.333-64 chr7 108326313 108326628 + 1.66667 NA intron (NM_001371131, intron 2 of 33) intron (NM_001371131, intron 2 of 33) 2056 NM_001371178 186.667-47 chr16 47372178 47372371 + 1.66667 NA intron (NM_030790, intron 7 of 17) FRAM|SINE|Alu 88789 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 306.667-19 chr2 21030939 21031230 + 1.66667 NA intron (NM_000384, intron 10 of 28) L1PB4|LINE|L1 12989 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 256.667-61 chr3 120093406 120093595 + 1.66667 NA 5' UTR (NM_001146156, exon 1 of 11) 5' UTR (NM_001146156, exon 1 of 11) 947 NM_001354596 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 416.334 chr1 175938572 175938896 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 29745 NR_162097 113839518 NR_162097 MIR1843 - microRNA 1843 ncRNA 271.333-64 chr7 51159740 51160031 + 1.66667 NA intron (NM_015198, intron 5 of 12) intron (NM_015198, intron 5 of 12) 156924 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 241.667-18 chr12 60420635 60420810 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 731352 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 450.667-6 chr8 102211672 102212044 + 1.66667 NA intron (NM_001172477, intron 8 of 8) intron (NM_001172477, intron 8 of 8) 26973 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 275.333-11 chr11 23894782 23895086 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -475744 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 403.667-2 chr1 178122286 178122577 + 1.66667 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) intron (NM_170692, intron 1 of 17) 28327 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 244-4 chr1 75366653 75366841 + 1.66667 NA intron (NM_001320283, intron 1 of 21) L1M3a|LINE|L1 232359 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 261.334-4 chr14 40598975 40599199 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -355624 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 334.334-6 chr4 158146089 158146299 + 1.66667 NA intron (NM_016613, intron 3 of 4) intron (NM_016613, intron 3 of 4) -24558 NR_147408 285505 NR_147407 ENSG00000248429 FAM198B-AS1 - FAM198B antisense RNA 1 ncRNA 371-3 chr10 68752388 68752913 + 1.66667 NA intron (NR_104262, intron 10 of 23) AluJr4|SINE|Alu -2522 NR_003076 692211 NR_003076 ENSG00000283551 SNORD98 HBII-419 small nucleolar RNA, C/D box 98 snoRNA 238.667-24 chr14 50733587 50733740 + 1.66667 NA intron (NM_016350, intron 27 of 28) intron (NM_016350, intron 27 of 28) -65357 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 254.333-29 chr17 57312750 57313020 + 1.66667 NA intron (NM_001322250, intron 5 of 13) AluSc|SINE|Alu 55866 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 365-7 chr14 50199615 50200113 + 1.66667 NA intron (NM_006939, intron 3 of 22) intron (NM_006939, intron 3 of 22) 31714 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 322.334-10 chr7 110073761 110074065 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -113700 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 416-7 chr2 85071231 85071590 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -4063 NR_146453 100996478 Hs.434398 NR_146453 ENSG00000260840 LINC01964 - long intergenic non-protein coding RNA 1964 ncRNA 241.334-3 chr1 222328236 222328402 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 219785 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 349.333-30 chr7 114645485 114645982 + 1.66667 NA intron (NR_033767, intron 9 of 17) intron (NR_033767, intron 9 of 17) -7612 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 258.667-28 chr14 66020277 66020513 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -465976 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 227.667-23 chr16 31440028 31440245 + 1.66667 NA intron (NM_001353381, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 2653 NM_001136509 283933 Hs.722243 NM_001136509 ENSG00000176723 ZNF843 - zinc finger protein 843 protein-coding 235-35 chr2 219979033 219979286 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -72594 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 296-5 chr1 119984258 119984496 + 1.66667 NA intron (NM_001200001, intron 5 of 21) MIRb|SINE|MIR 85285 NM_024408 4853 Hs.487360 NM_024408 ENSG00000134250 NOTCH2 AGS2|HJCYS|hN2 notch receptor 2 protein-coding 372.334 chr10 17468787 17469141 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14369 NR_144322 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 259.334-23 chr8 118249967 118250244 + 1.66667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -138286 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 290.667-24 chr2 119762260 119762574 + 1.66667 NA intron (NM_002830, intron 1 of 26) intron (NM_002830, intron 1 of 26) 2495 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 143.333-168 chr22 37657456 37657669 + 1.66667 NA intron (NR_109952, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 815 NR_109952 101927051 NR_109952 ENSG00000233360 LOC101927051 - uncharacterized LOC101927051 ncRNA 268.667-24 chr18 21557549 21557894 + 1.66667 NA intron (NM_052911, intron 8 of 11) intron (NM_052911, intron 8 of 11) 42983 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 226.334-5 chr2 61798007 61798163 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 55975 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 534.667-3 chr5 81902620 81903013 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -69207 NM_031482 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 186-74 chr4 61725693 61725930 + 1.66667 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) intron (NM_001371342, intron 4 of 20) 435954 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 484.666-5 chr9 125502956 125503409 + 1.66667 NA intron (NM_024117, intron 7 of 10) intron (NM_024117, intron 7 of 10) 204026 NM_001006617 79109 Hs.495138 NM_024117 ENSG00000119487 MAPKAP1 JC310|MIP1|SIN1|SIN1b|SIN1g MAPK associated protein 1 protein-coding 385.333-16 chr18 1448628 1449029 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -89199 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 261.667-14 chr13 58592649 58592882 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -359648 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 249.333-80 chr5 13610165 13610450 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 334173 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 322.667-34 chr8 123848085 123848480 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3705 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 242.666-14 chr13 87882104 87882304 + 1.66667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -71684 NR_104059 101930749 Hs.539610 NR_104059 ENSG00000223404 LINC00397 - long intergenic non-protein coding RNA 397 ncRNA 345.334-2 chr17 30265076 30265523 + 1.66667 NA intron (NM_000386, intron 11 of 11) intron (NM_000386, intron 11 of 11) 26645 NM_000386 642 Hs.371914 NM_000386 ENSG00000108578 BLMH BH|BMH bleomycin hydrolase protein-coding 248.667-11 chr10 43442719 43442931 + 1.66667 NA intron (NM_001355444, intron 1 of 3) L1MEc|LINE|L1 5714 NM_001355450 642819 Hs.719657 NM_001355444 ENSG00000243660 ZNF487 KRBO1|ZNF487P zinc finger protein 487 protein-coding 244.333-81 chr5 24678559 24678874 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -33738 NM_001362460 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 277.333-22 chr13 59322823 59323113 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -689750 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 359.667-3 chr14 51259891 51260305 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 19851 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 199-48 chr2 76039023 76039149 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -328171 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 183.667-135 chr8 28355741 28355927 + 1.66667 NA intron (NM_018660, intron 4 of 9) intron (NM_018660, intron 4 of 9) 17187 NM_001284244 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 265-65 chr8 117218654 117218964 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 83814 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 331.667-21 chr9 81331595 81331819 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 357828 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 189.666-26 chr21 28424235 28424496 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -114953 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 240.333-66 chr3 50735027 50735283 + 1.66667 NA intron (NM_004947, intron 1 of 52) L1M4c|LINE|L1 60075 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 242.334-10 chr2 219801987 219802170 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 102811 NR_146975 105373889 Hs.570066 NR_146975 ENSG00000228909 LINC01803 - long intergenic non-protein coding RNA 1803 ncRNA 265.667-23 chr15 45254969 45255238 + 1.66667 NA intron (NR_120335, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 2869 NM_004212 9153 Hs.367833 NM_004212 ENSG00000137860 SLC28A2 CNT2|HCNT2|HsT17153|SPNT1 solute carrier family 28 member 2 protein-coding 282-46 chr7 51094294 51094691 + 1.66667 NA intron (NM_015198, intron 6 of 12) L1MA6|LINE|L1 222317 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 230-30 chr17 61570210 61570459 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 20885 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 366.001 chr1 147289729 147290052 + 1.66667 NA intron (NM_001348462, intron 19 of 22) intron (NM_001348462, intron 19 of 22) 46748 NM_001348452 9557 Hs.191164 NM_004284 ENSG00000131778 CHD1L ALC1|CHDL chromodomain helicase DNA binding protein 1 like protein-coding 290.667-6 chr10 30065008 30065405 + 1.66667 NA intron (NM_001350021, intron 1 of 4) L1MA4|LINE|L1 -5620 NM_001350001 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 283.334-8 chr4 94778481 94778672 + 1.66667 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) L1ME3Cz|LINE|L1 20621 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 361.667-11 chr2 192219402 192219712 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24624 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 232-21 chr12 39176873 39177052 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 266158 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 265.667-73 chr8 52582879 52583073 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17546 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 247-37 chr2 99728550 99728719 + 1.66667 NA intron (NM_001025108, intron 9 of 23) intron (NM_001025108, intron 9 of 23) -238617 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 291-46 chr9 32492541 32492825 + 1.66667 NA intron (NM_014314, intron 3 of 17) intron (NM_014314, intron 3 of 17) 33513 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 216-61 chr2 117727859 117728062 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -86731 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 298-9 chr10 15458886 15459177 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -87742 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 274-37 chr4 44011736 44011950 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5018 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 232-40 chr2 16370123 16370290 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 295628 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 297.667-31 chr5 115620113 115620329 + 1.66667 NA non-coding (NR_109874, exon 4 of 4) non-coding (NR_109874, exon 4 of 4) 5815 NM_001164468 100302736 NM_001164468 ENSG00000251201 TMED7-TICAM2 MyD88-4|TICAM-2|TICAM2|TIRAP3|TIRP|TRAM TMED7-TICAM2 readthrough protein-coding 364-18 chr4 32746276 32746639 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 395419 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 276.667-67 chr8 119369857 119370082 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 44798 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 258-16 chr14 55636204 55636387 + 1.66667 NA intron (NR_073129, intron 10 of 45) intron (NR_073129, intron 10 of 45) 56088 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 252-6 chr1 194748585 194748829 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1340008 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 330.334-8 chr20 54821616 54821965 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 346197 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 215.334 chr10 66268619 66268776 + 1.66667 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -657339 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 310.001 chr1 167330469 167330698 + 1.66667 NA intron (NM_001198783, intron 1 of 15) intron (NM_001198783, intron 1 of 15) 1513 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 251.334-17 chr20 38850481 38850709 + 1.66667 NA intron (NM_015568, intron 2 of 10) intron (NM_015568, intron 2 of 10) 44898 NM_001172735 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 243.334-12 chr20 32751522 32751734 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7620 NM_001099339 149951 Hs.408427 NM_053041 ENSG00000149600 COMMD7 C20orf92|dJ1085F17.3 COMM domain containing 7 protein-coding 307.667-10 chr12 56221769 56222110 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_040053) promoter-TSS (NR_040053) -17 NM_005785 10193 Hs.524502 NM_005785 ENSG00000181852 RNF41 FLRF|NRDP1|SBBI03 ring finger protein 41 protein-coding 233.667-23 chr15 57747750 57747913 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 41117 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 260.667-57 chr22 25125681 25125919 + 1.66667 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) -13108 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 369-8 chr19 37131745 37132181 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 40473 NM_199126 199704 Hs.659236 NM_152655 ENSG00000196967 ZNF585A - zinc finger protein 585A protein-coding 203.667-79 chr3 65354266 65354447 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001365903, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001365903, exon 25 of 25) -539460 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 280.667-22 chr14 65610572 65610751 + 1.66667 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) AluSp|SINE|Alu 139559 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 264-8 chr1 206595813 206596267 + 1.66667 NA intron (NM_006893, intron 12 of 14) MER5B|DNA|hAT-Charlie 16425 NM_006893 1939 Hs.497581 NM_006893 ENSG00000143486 EIF2D HCA56|LGTN eukaryotic translation initiation factor 2D protein-coding 312.667-17 chr15 64289397 64289698 + 1.66667 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) intron (NM_001329607, intron 2 of 11) 66626 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 256.333-61 chr4 66593764 66594022 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 317069 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 225.334-4 chr5 18925774 18925960 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 960405 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 459.667-3 chr5 10232100 10232465 + 1.66667 NA intron (NR_047668, intron 3 of 3) intron (NR_047668, intron 3 of 3) 17606 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 199.667-129 chr7 49452113 49452321 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -321421 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 233.333-84 chr3 97986387 97986549 + 1.66667 NA TTS (NR_047685) TTS (NR_047685) -14017 NM_001042533 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 297-11 chr10 43662765 43663006 + 1.66667 NA intron (NR_038867, intron 1 of 4) AluJr4|SINE|Alu -14004 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 409.667-9 chr8 43773385 43773858 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 481179 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 233.333-48 chr18 516957 517228 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -1798 NR_136505 105376854 NR_136505 ENSG00000264265 LINC01925 - long intergenic non-protein coding RNA 1925 ncRNA 333.667-6 chr11 97851283 97851562 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1169527 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 229.667-61 chr3 122699974 122700160 + 1.66667 NA exon (NM_017554, exon 6 of 17) exon (NM_017554, exon 6 of 17) 19228 NM_017554 54625 Hs.518203 NM_017554 ENSG00000173193 PARP14 ARTD8|BAL2|PARP-14|pART8 poly(ADP-ribose) polymerase family member 14 protein-coding 223.333-119 chr4 136513261 136513512 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -599706 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 196.334-7 chr17 47979100 47979308 + 1.66667 NA intron (NM_176096, intron 11 of 13) L2a|LINE|L2 8091 NM_001278198 80279 Hs.20157 NM_025197 ENSG00000108465 CDK5RAP3 C53|HSF-27|IC53|LZAP|MST016|OK/SW-cl.114|PP1553 CDK5 regulatory subunit associated protein 3 protein-coding 307.999-4 chr6 122492018 122492338 + 1.66667 NA intron (NM_001270393, intron 3 of 7) intron (NM_001270393, intron 3 of 7) 20261 NM_001270394 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 246.334-5 chr12 40433911 40434113 + 1.66667 NA intron (NM_173600, intron 25 of 173) intron (NM_173600, intron 25 of 173) 40618 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 429-10 chr9 106796881 106797461 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -65995 NM_021224 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 296-11 chr10 114698878 114699071 + 1.66667 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) HAL1|LINE|L1 -13971 NM_001322882 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 259.334-10 chr2 29143183 29143350 + 1.66667 NA intron (NM_001287528, intron 6 of 14) L2a|LINE|L2 27851 NM_001287527 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 234.667-18 chr11 72493943 72494161 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -59368 NM_001258394 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 390.667-12 chr7 31690621 31690872 + 1.66667 NA intron (NM_001145123, intron 1 of 3) intron (NM_001145123, intron 1 of 3) 3531 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 238-70 chr4 117867830 117868055 + 1.66667 NA intron (NR_147154, intron 1 of 1) intron (NR_147154, intron 1 of 1) 33541 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 147-41 chr14 54918301 54918471 + 1.66667 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -15560 NM_000161 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 310.667-28 chr3 25121826 25122207 + 1.66667 NA intron (NM_001290216, intron 3 of 10) intron (NM_001290216, intron 3 of 10) -218786 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 259-46 chr6 44567024 44567201 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15231 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 334.999-2 chr6 56961311 56961664 + 1.66667 NA intron (NM_001318539, intron 1 of 3) intron (NM_001318539, intron 1 of 3) 6380 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 298-61 chr4 63391854 63392173 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 1017437 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 305.667-9 chr12 92185392 92185662 + 1.66667 NA non-coding (NR_135036, exon 3 of 3) non-coding (NR_135036, exon 3 of 3) 39442 NR_135037 101928617 Hs.434392 NR_135036 LOC101928617 - uncharacterized LOC101928617 ncRNA 305.334-4 chr16 6911882 6912100 + 1.66667 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 138182 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 240.333-36 chr14 62088023 62088241 + 1.66667 NA intron (NM_001367661, intron 8 of 8) L1ME2z|LINE|L1 -29225 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 335.334-3 chr2 183167518 183167927 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 43279 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 227-56 chr8 47861270 47861434 + 1.66667 NA intron (NM_001081640, intron 44 of 84) intron (NM_001081640, intron 44 of 84) 98784 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 389.667-2 chr1 194633433 194633769 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 1328856 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 273.334-18 chr8 84845889 84846123 + 1.66667 NA intron (NM_001287244, intron 3 of 7) L1P4d|LINE|L1 140079 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 317.667-6 chr1 240215295 240215540 + 1.66667 NA intron (NM_020066, intron 6 of 17) MIR|SINE|MIR 123534 NM_001305424 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 143-9 chr1 108751397 108751510 + 1.66667 NA intron (NM_007269, intron 1 of 18) intron (NM_007269, intron 1 of 18) 4779 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 269.334-3 chr11 112741702 112741990 + 1.66667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -186044 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 227.334-11 chr5 120529553 120529713 + 1.66667 NA intron (NM_016644, intron 2 of 2) intron (NM_016644, intron 2 of 2) -1831 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 242-73 chr8 68948826 68949100 + 1.66667 NA intron (NR_039986, intron 3 of 4) intron (NR_039986, intron 3 of 4) 155227 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 592.666 chr22 26944000 26944447 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 40931 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 332-14 chr19 7782588 7782934 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -4723 NR_002931 440508 Hs.568222 NR_002931 CLEC4GP1 - C-type lectin domain family 4 member G pseudogene 1 pseudo 230.666-20 chr16 8199694 8199976 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 390003 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 255.667-74 chr6 58074277 58074492 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -112938 NR_132994 106660612 Hs.561539 NR_125727 ENSG00000215190 LINC00680 - long intergenic non-protein coding RNA 680 ncRNA 259.667-25 chr17 61196791 61196990 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 170814 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 320.334-7 chr4 112986868 112987078 + 1.66667 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) MER30|DNA|hAT-Charlie -62441 NM_001354265 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 272-26 chr2 180676671 180676971 + 1.66667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -15283 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 394.667-3 chr14 53778540 53778834 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 169797 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 416-8 chr2 102807472 102807861 + 1.66667 NA intron (NM_001321345, intron 4 of 4) intron (NM_001321345, intron 4 of 4) 45635 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 328-2 chr10 54485312 54485586 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_134503) promoter-TSS (NR_134503) -781 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 265.667-47 chr3 65570285 65570469 + 1.66667 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) AluSz|SINE|Alu -323439 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 263-70 chr9 82600059 82600448 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 462889 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 276 chr1 10266853 10267130 + 1.66667 NA intron (NM_001365953, intron 5 of 20) intron (NM_001365953, intron 5 of 20) -31975 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 247.667-26 chr12 89522958 89523239 + 1.66667 NA exon (NM_003774, exon 1 of 1) exon (NM_003774, exon 1 of 1) 1698 NM_003774 8693 Hs.25130 NM_003774 ENSG00000257594 GALNT4 GALNAC-T4|GALNACT4 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4 protein-coding 349.333-18 chr2 110809350 110809709 + 1.66667 NA intron (NM_001371254, intron 9 of 18) intron (NM_001371254, intron 9 of 18) 76956 NM_001371254 388.333-7 chr15 41756173 41756532 + 1.66667 NA intron (NM_001164273, intron 18 of 23) L1ME3C|LINE|L1 -18132 NM_001265611 23005 Hs.513661 NM_014994 ENSG00000137802 MAPKBP1 JNKBP-1|JNKBP1|NPHP20 mitogen-activated protein kinase binding protein 1 protein-coding 167-60 chr2 128803897 128804037 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -60633 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 269-22 chr2 68526050 68526272 + 1.66667 NA exon (NM_173545, exon 6 of 10) exon (NM_173545, exon 6 of 10) 58576 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 254.666-14 chr16 56548299 56548592 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -16628 NM_032935 84560 Hs.567624 NM_032935 ENSG00000102891 MT4 MT-4|MT-IV|MTIV metallothionein 4 protein-coding 268.334-7 chr15 58570389 58570649 + 1.66667 NA TTS (NM_000236) TTS (NM_000236) -71784 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 240.667-53 chr21 35374181 35374391 + 1.66667 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) L1ME4c|LINE|L1 206478 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 255.667-86 chr9 33942957 33943120 + 1.66667 NA intron (NR_163243, intron 11 of 24) L1MB7|LINE|L1 -8663 NR_102370 101340252 NR_102370 ENSG00000238300 SNORD121B - small nucleolar RNA, C/D box 121B snoRNA 265.334-16 chr3 18131460 18131631 + 1.66667 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) intron (NR_161333, intron 4 of 4) 168993 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 253-52 chr5 40656311 40656465 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -23527 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 243-44 chr4 73228111 73228328 + 1.66667 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) -5162 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 192.667-172 chr8 77470031 77470178 + 1.66667 NA intron (NR_125830, intron 2 of 2) intron (NR_125830, intron 2 of 2) 19407 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 269.001 chr1 91339766 91339930 + 1.66667 NA intron (NM_001017975, intron 20 of 38) L1PA14|LINE|L1 64989 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 272.334-7 chr10 51424687 51424945 + 1.66667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 125243 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 290.333-33 chr4 58846944 58847338 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -137141 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 260-68 chr6 45545387 45545620 + 1.66667 NA intron (NM_001369405, intron 6 of 6) intron (NM_001369405, intron 6 of 6) 123228 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 233-7 chr10 43346627 43346908 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24869 NM_173160 53828 Hs.130497 NM_173160 ENSG00000150201 FXYD4 CHIF FXYD domain containing ion transport regulator 4 protein-coding 267-73 chr8 116728984 116729169 + 1.66667 NA intron (NM_003756, intron 1 of 7) intron (NM_003756, intron 1 of 7) 26747 NM_003756 8667 Hs.492599 NM_003756 ENSG00000147677 EIF3H EIF3S3|eIF3-gamma|eIF3-p40 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H protein-coding 283.667-9 chr15 70611879 70612053 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3581 NR_126481 104548972 NR_126481 ENSG00000281264 SALRNA3 SAL-RNA3|XLOC_025918 senescence associated long non-coding RNA 3 ncRNA 213.667-98 chr9 71135675 71135972 + 1.66667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) L2|LINE|L2 -14202 NM_001366148 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 284.667-59 chr8 138910636 138910996 + 1.66667 NA intron (NM_152888, intron 1 of 64) intron (NM_152888, intron 1 of 64) 3225 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 197.667-115 chr4 127522212 127522452 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -110625 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 275-46 chr5 178963767 178964061 + 1.66667 NA intron (NM_001178089, intron 4 of 4) intron (NM_001178089, intron 4 of 4) 22716 NM_001323310 285676 Hs.259441 NM_182594 ENSG00000178187 ZNF454 - zinc finger protein 454 protein-coding 308.333 chr1 26333616 26333928 + 1.66667 NA intron (NM_001039775, intron 14 of 19) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -15507 NM_145345 91544 Hs.145061 NM_145345 ENSG00000158062 UBXN11 COA-1|PP2243|SOC|SOCI|UBXD5 UBX domain protein 11 protein-coding 579.333-4 chr5 8972670 8973453 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 80834 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 235.333-6 chr1 218163347 218163578 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 119957 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 268.333-16 chr13 72120827 72121111 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -253765 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 512.001-2 chr2 207803139 207803692 + 1.66667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -33509 NM_003468 7855 Hs.17631 NM_003468 ENSG00000163251 FZD5 C2orf31|HFZ5 frizzled class receptor 5 protein-coding 249-48 chr22 49430941 49431147 + 1.66667 NA intron (NR_110522, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 112422 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 191.333-89 chr17 65951196 65951387 + 1.66667 NA intron (NM_001353129, intron 18 of 26) L1M4|LINE|L1 -124748 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 350.333-9 chr18 2901150 2901665 + 1.66667 NA intron (NM_032048, intron 4 of 7) intron (NM_032048, intron 4 of 7) 45216 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 207.334-4 chr15 35856765 35856920 + 1.66667 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) intron (NR_038251, intron 2 of 2) -70014 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 290.334-8 chr5 63764669 63764995 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 197460 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 360.334-4 chr6 47290040 47290425 + 1.66667 NA intron (NM_014452, intron 1 of 5) intron (NM_014452, intron 1 of 5) 19673 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 323.666-11 chr6 158107769 158108179 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 60288 NR_073096 84947 Hs.154706 NM_032861 ENSG00000122335 SERAC1 - serine active site containing 1 protein-coding 305.666-16 chr5 8263735 8264155 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 193619 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 364.667-3 chr11 42270366 42270854 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -16920 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 243.334-6 chr14 27084164 27084372 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 175626 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 405-10 chr3 95927252 95927798 + 1.66667 NA Intergenic LTR9B|LTR|ERV1 -244332 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 235.333-61 chr2 169373872 169374309 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11556 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 297-42 chr7 76351031 76351291 + 1.66667 NA intron (NM_012479, intron 1 of 1) intron (NM_012479, intron 1 of 1) 7830 NM_012479 7532 Hs.744840 NM_012479 ENSG00000170027 YWHAG 14-3-3GAMMA|EIEE56|PPP1R170 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein gamma protein-coding 258.667-92 chr7 106760553 106760807 + 1.66667 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -99522 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 226.334-2 chr15 25309600 25309766 + 1.66667 NA intron (NR_146177, intron 146 of 147) L1MB5|LINE|L1 31340 NR_001295 338428 NR_001295 ENSG00000274640 SNORD109A HBII-438A small nucleolar RNA, C/D box 109A snoRNA 333.667-12 chr3 4560692 4561153 + 1.66667 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) intron (NM_001168272, intron 4 of 60) 67574 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 330.001 chr1 115441507 115441764 + 1.66667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -103399 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 231-9 chr11 33305790 33305959 + 1.66667 NA intron (NM_001278162, intron 2 of 15) AluJo|SINE|Alu 47543 NM_001278162 10114 Hs.201918 NM_005734 ENSG00000110422 HIPK3 DYRK6|FIST3|PKY|YAK1 homeodomain interacting protein kinase 3 protein-coding 322.667-28 chr7 2833176 2833596 + 1.66667 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) intron (NM_001293092, intron 1 of 2) 10922 NM_001293092 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 251.334-15 chr18 2585761 2585985 + 1.66667 NA intron (NM_006101, intron 7 of 16) intron (NM_006101, intron 7 of 16) 14316 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 317.333-19 chr19 33369060 33369477 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4441 NM_001806 1054 Hs.429666 NM_001806 ENSG00000153879 CEBPG GPE1BP|IG/EBP-1 CCAAT enhancer binding protein gamma protein-coding 432.667 chr10 71402342 71402657 + 1.66667 NA intron (NM_052836, intron 1 of 12) MIRb|SINE|MIR 5565 NM_001171932 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 410-14 chr4 10645264 10645683 + 1.66667 NA intron (NM_052964, intron 2 of 18) intron (NM_052964, intron 2 of 18) 39295 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 326.333-6 chr12 61509044 61509371 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 683632 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 298-38 chr19 27610368 27610681 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -182907 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 280.333-25 chr3 79281296 79281613 + 1.66667 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -130273 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 245.667-32 chr2 69411209 69411371 + 1.66667 NA intron (NR_045632, intron 4 of 5) intron (NR_045632, intron 4 of 5) -24036 NM_001244710 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 294-59 chr7 52898703 52899080 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -136742 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 232.667-60 chr4 103955471 103955642 + 1.66667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -235571 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 277-23 chr18 6857689 6858012 + 1.66667 NA intron (NM_001010000, intron 3 of 16) HAL1ME|LINE|L1 23365 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 230.333-121 chr8 121237243 121237505 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -401972 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 230.667-88 chr8 92779951 92780242 + 1.66667 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 5964 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 252-43 chr2 11013915 11014192 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 102119 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 320-10 chr12 121855031 121855416 + 1.66667 NA intron (NM_002150, intron 6 of 13) MIR|SINE|MIR 3636 NM_002150 3242 Hs.2899 NM_002150 ENSG00000158104 HPD 4-HPPD|4HPPD|GLOD3|HPPDASE|PPD 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase protein-coding 185.334-5 chr5 72336120 72336256 + 1.66667 NA intron (NM_001284405, intron 5 of 8) L2b|LINE|L2 15815 NM_001284403 79810 Hs.126906 NM_024754 ENSG00000049883 PTCD2 - pentatricopeptide repeat domain 2 protein-coding 207.334-5 chr3 99189365 99189514 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -287744 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 362.667-19 chr3 94242992 94243362 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 180116 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 491.333 chr10 65249096 65249644 + 1.66667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -322055 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 305.667-14 chr18 1364504 1364794 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -5020 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 367.334-4 chr8 79773347 79773717 + 1.66667 NA intron (NR_110954, intron 4 of 5) intron (NR_110954, intron 4 of 5) 5390 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 237-8 chr1 205197635 205197821 + 1.66667 NA intron (NM_199462, intron 1 of 11) intron (NM_199462, intron 1 of 11) 13974 NM_199462 25778 Hs.6874 NM_015375 ENSG00000133059 DSTYK CAKUT1|DustyPK|HDCMD38P|RIP5|RIPK5|SPG23 dual serine/threonine and tyrosine protein kinase protein-coding 291.333-50 chr5 11844422 11844784 + 1.66667 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 59843 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 403.001-3 chr8 105272364 105272808 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -45852 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 258.667-38 chr16 49093721 49093895 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 188030 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 311.334-4 chr2 184778538 184778877 + 1.66667 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 180178 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 303.334-12 chr7 45930228 45930536 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -9110 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 197.334-5 chr8 102915586 102915747 + 1.66667 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 51395 NR_126338 100506753 Hs.602901 NR_126338 AZIN1-AS1 - AZIN1 antisense RNA 1 ncRNA 250.334-16 chr5 129392213 129392400 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 4841 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 312.667-29 chr4 123698432 123698688 + 1.66667 NA intron (NR_027105, intron 3 of 5) intron (NR_027105, intron 3 of 5) 48569 NR_027105 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 241-28 chr18 53206652 53206811 + 1.66667 NA intron (NM_005215, intron 10 of 28) intron (NM_005215, intron 10 of 28) -30370 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 257.334-9 chr3 90296232 90296396 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1188693 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 349.667-3 chr11 82044382 82044889 + 1.66667 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -153799 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 267-10 chr10 99985188 99985371 + 1.66667 NA intron (NM_015221, intron 1 of 16) intron (NM_015221, intron 1 of 16) 24668 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 283.333-76 chr8 118679412 118679736 + 1.66667 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) L1MC3|LINE|L1 -57611 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 252-39 chr16 80184106 80184381 + 1.66667 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) L1ME1|LINE|L1 -356491 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 340.333-17 chr6 81760531 81760950 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8059 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 271.334-9 chr15 71014281 71014597 + 1.66667 NA intron (NM_017691, intron 14 of 15) intron (NM_017691, intron 14 of 15) 121996 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 240.667-46 chr2 117422831 117423031 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -391760 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 216-37 chr15 70978928 70979169 + 1.66667 NA intron (NM_017691, intron 9 of 15) intron (NM_017691, intron 9 of 15) 86605 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 388-18 chr6 67077357 67077739 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -977803 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 237.667-40 chr2 103945793 103946077 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 462397 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 266-7 chr1 209226749 209227067 + 1.66667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -98548 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 291.334-11 chr4 123788649 123788876 + 1.66667 NA intron (NR_027106, intron 1 of 2) intron (NR_027106, intron 1 of 2) 14498 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 241-24 chr15 98350257 98350424 + 1.66667 NA intron (NR_146567, intron 1 of 2) intron (NR_146567, intron 1 of 2) -18782 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 212-48 chr13 94649617 94649830 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 47866 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 458.667-3 chr5 64447196 64447487 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -58674 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 628 chr11 28242742 28243331 + 1.66667 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) intron (NM_001113528, intron 4 of 6) 134648 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 245.334-10 chr2 28141901 28142052 + 1.66667 NA intron (NM_199193, intron 8 of 13) intron (NM_199193, intron 8 of 13) 64985 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 225-69 chrX 84757491 84757704 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -176554 NR_024062 100131816 Hs.460809 NM_178567 ENSG00000229547 UBE2DNL - ubiquitin conjugating enzyme E2 D N-terminal like (pseudogene) pseudo 208.667-123 chr7 4476086 4476284 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -206110 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 294.667-27 chr2 215169136 215169369 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -30626 NM_173076 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 263.667-7 chr1 207853667 207853871 + 1.66667 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -31066 NR_135298 100128537 Hs.445414 NR_135298 MIR29B2CHG C1orf132 MIR29B2 and MIR29C host gene ncRNA 259.667-28 chr19 35906506 35906676 + 1.66667 NA intron (NR_033390, intron 3 of 3) intron (NR_033390, intron 3 of 3) 1704 NR_033390 7305 Hs.515369 NM_003332 ENSG00000011600 TYROBP DAP12|KARAP|PLOSL|PLOSL1 TYRO protein tyrosine kinase binding protein protein-coding 266-66 chr4 97310243 97310549 + 1.66667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -56530 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 430.333 chr10 16786821 16787480 + 1.66667 NA intron (NM_152724, intron 1 of 7) LTR108d_Mam|LTR|ERVL 30274 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 277.667-7 chr11 77470953 77471130 + 1.66667 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) intron (NM_001128620, intron 1 of 15) 3022 NM_001128620 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 254.334-17 chr2 22074451 22074625 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -363886 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 260.999-3 chr2 184777264 184777578 + 1.66667 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 178892 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 196.334-6 chr16 80076260 80076412 + 1.66667 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 281087 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 622.334-2 chr4 59665060 59665738 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 651826 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 168-96 chr6 124316336 124316494 + 1.66667 NA intron (NM_001040214, intron 2 of 6) intron (NM_001040214, intron 2 of 6) 33410 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 281.667-3 chr1 91992041 91992359 + 1.66667 NA intron (NM_001726, intron 13 of 18) intron (NM_001726, intron 13 of 18) -37785 NM_173567 253152 Hs.201555 NM_173567 ENSG00000172031 EPHX4 ABHD7|EH4|EPHXRP epoxide hydrolase 4 protein-coding 366.333-24 chr7 126002601 126002920 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -738469 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 257.334-11 chr5 27159557 27159728 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -121056 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 197.667-159 chrX 132605327 132605494 + 1.66667 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -62232 NR_046691 100874102 Hs.619341 NR_046691 ENSG00000235849 HS6ST2-AS1 - HS6ST2 antisense RNA 1 ncRNA 310.334-11 chr6 113254759 113254975 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 178580 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 507.334-2 chr2 40412324 40412774 + 1.66667 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 17755 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 266.333-7 chr10 75008981 75009275 + 1.66667 NA intron (NM_001370144, intron 11 of 15) intron (NM_001370144, intron 11 of 15) -12605 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 279.333-68 chr6 119074255 119074569 + 1.66667 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) LTR78|LTR|ERV1 4252 NM_024581 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 392.334-2 chr5 154743939 154744335 + 1.66667 NA intron (NM_001367717, intron 1 of 18) intron (NM_001367717, intron 1 of 18) -11240 NM_001367718 23367 Hs.292078 NM_015315 ENSG00000155506 LARP1 LARP La ribonucleoprotein domain family member 1 protein-coding 295-25 chr2 133524295 133524590 + 1.66667 NA intron (NM_207481, intron 2 of 17) intron (NM_207481, intron 2 of 17) 44021 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 270-28 chr2 83444186 83444430 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -78506 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 276.667-9 chr10 73477359 73477529 + 1.66667 NA intron (NM_001289968, intron 3 of 12) L1ME4a|LINE|L1 -18308 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 416.667-11 chr4 99627348 99627645 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 27183 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 233.667-51 chr3 63515902 63516108 + 1.66667 NA intron (NM_001130003, intron 3 of 5) L1MC|LINE|L1 34046 NR_046677 100874016 Hs.441275 NR_046677 ENSG00000241359 SYNPR-AS1 - SYNPR antisense RNA 1 ncRNA 278.667-57 chrX 80211950 80212246 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 123220 NR_110646 101060146 Hs.546064 NR_110646 ENSG00000278530 CHMP1B2P - charged multivesicular body protein 1B2, pseudogene pseudo 217.667-18 chr10 114033671 114033873 + 1.66667 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -10094 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 403.667 chr1 104110274 104110736 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 37482 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 277.667-34 chr3 170346305 170346543 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11291 NM_001145098 6498 Hs.536655 NM_005414 ENSG00000136603 SKIL SNO|SnoA|SnoI|SnoN SKI like proto-oncogene protein-coding 421-3 chr13 65430984 65431622 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -434744 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 306-11 chr12 103121234 103121568 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30441 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 257.333-23 chr11 93828193 93828501 + 1.66667 NA intron (NM_001144871, intron 1 of 3) intron (NM_001144871, intron 1 of 3) 22271 NM_001144871 387804 Hs.512252 NM_001144871 ENSG00000214376 VSTM5 C11orf90 V-set and transmembrane domain containing 5 protein-coding 401.334-2 chr14 61525348 61525708 + 1.66667 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 44666 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 311.666-6 chr16 70263042 70263380 + 1.66667 NA intron (NM_001605, intron 11 of 20) intron (NM_001605, intron 11 of 20) -11271 NM_058219 118460 Hs.660633 NM_058219 ENSG00000223496 EXOSC6 EAP4|MTR3|Mtr3p|hMtr3p|p11 exosome component 6 protein-coding 337.667-22 chr7 41153619 41154188 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 52299 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 330.333-15 chr5 169606266 169606694 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 22400 NM_001329641 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 138.667-11 chr1 219275629 219275726 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 100708 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 242.667-65 chr22 27704811 27704981 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 96860 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 243.667-76 chr8 130701385 130701583 + 1.66667 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -257810 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 433.667-4 chr12 8937909 8938299 + 1.66667 NA intron (NM_004426, intron 14 of 14) intron (NM_004426, intron 14 of 14) 11541 NM_002355 4074 Hs.134084 NM_002355 ENSG00000003056 M6PR CD-M6PR|CD-MPR|MPR 46|MPR-46|MPR46|SMPR mannose-6-phosphate receptor, cation dependent protein-coding 171-8 chr10 57429184 57429336 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -124701 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 294.667-44 chr5 114463361 114463648 + 1.66667 NA intron (NM_021614, intron 4 of 7) MIRc|SINE|MIR 29993 NR_103458 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 283-2 chr1 97571159 97571333 + 1.66667 NA intron (NM_000110, intron 11 of 22) intron (NM_000110, intron 11 of 22) -225675 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 330.667-20 chr5 32309714 32310071 + 1.66667 NA intron (NM_001294344, intron 1 of 13) L1MA3|LINE|L1 3047 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 218.667-13 chr10 66994485 66994699 + 1.66667 NA intron (NR_111911, intron 1 of 6) intron (NR_111911, intron 1 of 6) 17561 NR_111911 101928961 Hs.687014 NR_111911 LOC101928961 - uncharacterized LOC101928961 ncRNA 184.667-31 chr14 61303684 61303842 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -17680 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 358-10 chr18 3213838 3214180 + 1.66667 NA intron (NM_019856, intron 2 of 36) LTR65|LTR|ERV1 5959 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 241.333-101 chr8 71549588 71549811 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1605 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 266.333-45 chr5 29406530 29406823 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -10700 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 291.334-7 chr19 36373925 36374178 + 1.66667 NA intron (NM_001297619, intron 1 of 4) L1ME4c|LINE|L1 5150 NM_001297619 57677 Hs.35524 NM_020917 ENSG00000142065 ZFP14 ZNF531 ZFP14 zinc finger protein protein-coding 392.667-12 chr8 83304622 83304909 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -98993 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 264.667-69 chr5 160522325 160522615 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 37118 NR_029701 406938 NR_029701 ENSG00000283733 MIR146A MIRN146|MIRN146A|miR-146a|miRNA146A microRNA 146a ncRNA 417.666-4 chrX 49670159 49670622 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 25594 NM_003785 8712 Hs.128231 NM_003785 ENSG00000068985 PAGE1 AL5|CT16.3|GAGE-9|GAGEB1|PAGE-1 PAGE family member 1 protein-coding 257-13 chr14 31283724 31283952 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -76045 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 285-28 chr5 57198968 57199248 + 1.66667 NA intron (NM_001331037, intron 2 of 12) intron (NM_001331037, intron 2 of 12) -14966 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 192.667-189 chrX 143070835 143071070 + 1.66667 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 45024 NM_001009613 441525 Hs.535082 NM_001009613 ENSG00000189326 SPANXN4 CT11.9 SPANX family member N4 protein-coding 259.666-22 chr20 9780581 9780881 + 1.66667 NA intron (NM_177990, intron 1 of 9) intron (NM_177990, intron 1 of 9) 58345 NM_177990 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 431-9 chr3 152309247 152309616 + 1.66667 NA intron (NM_207296, intron 1 of 7) intron (NM_207296, intron 1 of 7) 10026 NM_207295 4154 Hs.201858 NM_021038 ENSG00000152601 MBNL1 EXP|MBNL muscleblind like splicing regulator 1 protein-coding 262.667-30 chr17 32691052 32691327 + 1.66667 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) AluJo|SINE|Alu 185935 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 294.667-26 chr2 178578779 178579024 + 1.66667 NA exon (NM_133432, exon 149 of 192) exon (NM_133432, exon 149 of 192) 55710 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 297-27 chr17 60362865 60363136 + 1.66667 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) intron (NM_032582, intron 1 of 33) 29133 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 366-28 chr9 137361054 137361515 + 1.66667 NA intron (NM_017820, intron 7 of 21) L1MEc|LINE|L1 -59013 NM_001004354 441478 Hs.535075 NM_001004354 ENSG00000198435 NRARP - NOTCH regulated ankyrin repeat protein protein-coding 251.667-58 chr3 33326718 33326959 + 1.66667 NA intron (NR_146129, intron 4 of 15) intron (NR_146129, intron 4 of 15) 49396 NR_146133 25827 Hs.475872 NM_012157 ENSG00000153558 FBXL2 FBL2|FBL3 F-box and leucine rich repeat protein 2 protein-coding 313.667-13 chr14 63759789 63760014 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31836 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 401.001-2 chr7 28914205 28914588 + 1.66667 NA Intergenic (ATATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 43934 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 276-7 chr10 53960940 53961255 + 1.66667 NA intron (NM_001354411, intron 23 of 34) intron (NM_001354411, intron 23 of 34) -525133 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 260.667-45 chr2 61005780 61006028 + 1.66667 NA intron (NM_144709, intron 4 of 17) intron (NM_144709, intron 4 of 17) 11308 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 252.334-21 chr6 103217125 103217356 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 1642306 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 437-4 chr3 95498668 95499125 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 184297 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 319.001 chr20 16480495 16480775 + 1.66667 NA intron (NM_001199866, intron 12 of 22) intron (NM_001199866, intron 12 of 22) 92813 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 603.333 chr17 69026462 69027019 + 1.66667 NA intron (NM_080283, intron 15 of 38) intron (NM_080283, intron 15 of 38) 22026 NR_126414 104355297 Hs.569827 NR_126414 ENSG00000231749 ABCA9-AS1 - ABCA9 antisense RNA 1 ncRNA 254.667-81 chr8 103656248 103656427 + 1.66667 NA intron (NM_001348488, intron 3 of 25) L2|LINE|L2 -154427 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 258-90 chr9 29784232 29784441 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -570735 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 355-6 chr15 60161095 60161406 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 156939 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 262-4 chr1 199148476 199148728 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_147896) promoter-TSS (NR_147896) 4 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 478.332 chr3 28184753 28185207 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -56639 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 290-27 chr2 237939646 237939918 + 1.66667 NA Intergenic MER61E|LTR|ERV1 -27163 NM_001278308 140739 Hs.471785 NM_080678 ENSG00000184182 UBE2F NCE2 ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) protein-coding 261-23 chr14 76621209 76621439 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -140144 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 247.334-22 chr7 106664474 106664697 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3427 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 250.333-65 chr6 115025149 115025509 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 618506 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 373.334-4 chr14 81520500 81520831 + 1.66667 NA intron (NM_005065, intron 3 of 20) LTR80B|LTR|ERVL 13188 NM_005065 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 252.333-41 chr20 20227772 20228051 + 1.66667 NA intron (NM_015585, intron 17 of 26) intron (NM_015585, intron 17 of 26) -140193 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 240.667-43 chr2 43439758 43439921 + 1.66667 NA intron (NM_001083953, intron 26 of 37) L1ME3D|LINE|L1 156135 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 232.667-70 chr7 1013989 1014255 + 1.66667 NA intron (NR_146964, intron 1 of 4) intron (NR_146964, intron 1 of 4) 8904 NR_029898 442907 NR_029898 ENSG00000199023 MIR339 MIRN339|hsa-mir-339|mir-339 microRNA 339 ncRNA 355.667-12 chr5 166535510 166535913 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 390659 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 244.334-6 chr10 115066932 115067092 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -26353 NM_001276282 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 250-30 chr16 47789903 47790118 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -68571 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 270.334-7 chr14 97078360 97078603 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -76376 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 190.667-47 chr15 60671568 60671772 + 1.66667 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu -9899 NR_120319 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 297.334 chr1 51832398 51832623 + 1.66667 NA intron (NM_001101662, intron 4 of 30) L2a|LINE|L2 3892 NR_031580 100313892 NR_031580 ENSG00000283899 MIR761 hsa-mir-761 microRNA 761 ncRNA 265-48 chr3 109162832 109163029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15235 NR_026767 677779 Hs.618669 NM_001040054 ENSG00000214381 LINC00488 C3orf66 long intergenic non-protein coding RNA 488 ncRNA 348.333-32 chr8 68392925 68393266 + 1.66667 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) intron (NR_146187, intron 1 of 13) -61604 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 287.001 chr8 75840561 75840737 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 300681 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 219.667-81 chr6 37716456 37716628 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -18659 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 348-5 chr11 4490714 4491110 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 2033 NM_001005171 390036 Hs.553726 NM_001005171 ENSG00000196778 OR52K1 OR11-8 olfactory receptor family 52 subfamily K member 1 protein-coding 232.333-13 chr11 30880041 30880310 + 1.66667 NA intron (NM_001367979, intron 37 of 38) intron (NM_001367979, intron 37 of 38) 112511 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 261-30 chr17 65957526 65957826 + 1.66667 NA intron (NM_001353129, intron 18 of 26) intron (NM_001353129, intron 18 of 26) -131133 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 280.333-40 chr7 22690820 22691143 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25448 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 335.667 chr1 68596729 68597139 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -99852 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 271-4 chr1 101070265 101070516 + 1.66667 NA intron (NR_109849, intron 1 of 4) intron (NR_109849, intron 1 of 4) 44544 NR_109849 102606465 Hs.593669 NR_109849 LOC102606465 - uncharacterized LOC102606465 ncRNA 214-127 chr7 85642362 85642523 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 221320 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 372.333-16 chr4 32907095 32907344 + 1.66667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 556181 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 194.666-66 chr7 95839760 95840002 + 1.66667 NA intron (NM_004411, intron 5 of 16) L1M3de|LINE|L1 67375 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 246.334-4 chr11 47627903 47628085 + 1.66667 NA intron (NM_014342, intron 9 of 12) intron (NM_014342, intron 9 of 12) 14565 NM_014342 23788 Hs.269944 NM_014342 ENSG00000109919 MTCH2 HSPC032|MIMP|SLC25A50 mitochondrial carrier 2 protein-coding 354.667-6 chr11 68490821 68491169 + 1.66667 NA intron (NM_001352362, intron 2 of 24) AluJb|SINE|Alu 30243 NM_001164164 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 289-35 chr9 133290303 133290680 + 1.66667 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -15290 NM_020469 28 Hs.654423 NM_020469 ENSG00000175164 ABO A3GALNT|A3GALT1|GTB|NAGAT ABO, alpha 1-3-N-acetylgalactosaminyltransferase and alpha 1-3-galactosyltransferase protein-coding 416-11 chr4 65706420 65706853 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36141 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 340.334-7 chr22 40172292 40172678 + 1.66667 NA intron (NM_001024843, intron 4 of 23) intron (NM_001024843, intron 4 of 23) -5440 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 276.667-40 chr2 129290878 129291141 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17118 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 260 chr1 48426463 48426622 + 1.66667 NA intron (NM_019073, intron 3 of 12) HAL1M8|LINE|L1 45662 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 263.333-6 chr10 53645714 53645983 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -840382 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 298.333-26 chr3 6506990 6507280 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 298314 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 240.334-8 chr20 17006603 17006798 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -219407 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 253.334-10 chr2 186258093 186258302 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -171880 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 248.666-29 chr4 78369867 78370076 + 1.66667 NA exon (NM_025074, exon 23 of 74) exon (NM_025074, exon 23 of 74) 80986 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 305.666-7 chr11 124256704 124257245 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 7298 NM_001002905 26494 Hs.448172 NM_001002905 ENSG00000197849 OR8G1 HSTPCR25|OR8G1P|TPCR25 olfactory receptor family 8 subfamily G member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 335-14 chr18 7276351 7276739 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 45441 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 238-99 chr7 111824165 111824385 + 1.66667 NA intron (NM_001363540, intron 26 of 52) intron (NM_001363540, intron 26 of 52) 15770 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 375.334-4 chr3 104154274 104154688 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -630365 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 411-14 chr8 88786702 88787068 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -459402 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 178.667-112 chr3 194921032 194921196 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -152405 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 276-33 chr2 70218512 70218797 + 1.66667 NA intron (NR_147232, intron 5 of 10) AluY|SINE|Alu -27635 NM_001348762 54980 Hs.720049 NM_017880 ENSG00000115998 C2orf42 - chromosome 2 open reading frame 42 protein-coding 241.333-17 chr10 70665098 70665336 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7289 NM_139155 140766 Hs.352156 NM_080722 ENSG00000138316 ADAMTS14 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 14 protein-coding 195.666-28 chr21 28777802 28778017 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 107458 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 260.334-15 chr3 149591172 149591384 + 1.66667 NA intron (NM_001348362, intron 5 of 9) intron (NM_001348362, intron 5 of 9) 66747 NM_015472 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 219-14 chr11 36575220 36575375 + 1.66667 NA exon (NM_000448, exon 2 of 2) exon (NM_000448, exon 2 of 2) 7284 NM_000448 5896 Hs.73958 NM_000448 ENSG00000166349 RAG1 RAG-1|RNF74 recombination activating 1 protein-coding 254.999-4 chr21 30584206 30584505 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 6042 NM_001164434 100288287 Hs.580880 NM_001164434 ENSG00000206106 KRTAP22-2 KAP22.2 keratin associated protein 22-2 protein-coding 363.333-23 chr5 6513362 6513748 + 1.66667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 64696 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 371-20 chr8 87143588 87144029 + 1.66667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 277393 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 151-111 chr5 132203358 132203493 + 1.66667 NA intron (NM_001365681, intron 9 of 13) intron (NM_001365681, intron 9 of 13) 14493 NR_106888 102465498 NR_106888 ENSG00000283678 MIR6830 hsa-mir-6830 microRNA 6830 ncRNA 455-4 chr4 47714408 47714837 + 1.66667 NA intron (NM_006587, intron 5 of 21) MER58A|DNA|hAT-Charlie 61953 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 183.667-71 chr2 21843075 21843246 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -132508 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 352-15 chr18 11228629 11228980 + 1.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -80042 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 382.334-11 chr5 100980688 100980972 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -77548 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 272.334-10 chr15 87314737 87314914 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -262104 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 268.667-40 chr22 36915902 36916270 + 1.66667 NA intron (NM_000395, intron 1 of 13) L1ME3G|LINE|L1 2458 NM_000395 1439 Hs.592192 NM_000395 ENSG00000100368 CSF2RB CD131|CDw131|IL3RB|IL5RB|SMDP5|betaGMR colony stimulating factor 2 receptor beta common subunit protein-coding 242.667-11 chr1 192269665 192269903 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -47208 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 226.334-3 chr2 13343810 13343971 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -336877 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 259-38 chr4 112540238 112540488 + 1.66667 NA intron (NM_018392, intron 26 of 27) intron (NM_018392, intron 26 of 27) -24183 NM_024019 63973 Hs.744415 NM_024019 ENSG00000178403 NEUROG2 Atoh4|Math4A|NGN2|bHLHa8|ngn-2 neurogenin 2 protein-coding 247.333-37 chr19 27799210 27799373 + 1.66667 NA intron (NR_146736, intron 2 of 2) MER53|DNA|hAT -5351 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 254.667-71 chr5 170337943 170338272 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 6714 NR_108024 257358 Hs.249689 NM_001025454 LINC01366 - long intergenic non-protein coding RNA 1366 ncRNA 243.334-13 chr5 85780115 85780306 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -502234 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 276-23 chr14 67257769 67258073 + 1.66667 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) intron (NM_001256550, intron 1 of 14) 16486 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 177.666-26 chr6 55117269 55117488 + 1.66667 NA intron (NM_001526, intron 1 of 7) MIRc|SINE|MIR 10918 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 463.001 chr2 57861467 57862019 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -45908 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 327.333-21 chr2 129184603 129185017 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 89081 NR_122042 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 289.333-14 chr14 50457540 50457832 + 1.66667 NA intron (NM_198794, intron 13 of 31) L2b|LINE|L2 -60388 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 452.667-5 chr2 148757199 148757769 + 1.66667 NA intron (NM_015630, intron 4 of 13) L1MC4|LINE|L1 112733 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 278.667-4 chr10 59832200 59832429 + 1.66667 NA intron (NM_005436, intron 3 of 8) intron (NM_005436, intron 3 of 8) 74242 NM_005436 8030 Hs.591360 NM_005436 ENSG00000108091 CCDC6 D10S170|H4|PTC|TPC|TST1 coiled-coil domain containing 6 protein-coding 267.334-15 chr3 47913168 47913374 + 1.66667 NA intron (NM_002375, intron 8 of 18) intron (NM_002375, intron 8 of 18) 63716 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 445.334-2 chr3 56473456 56473754 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5138 NM_015576 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 326.667-10 chr11 81142187 81142451 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -379516 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 373.333-18 chr3 45971282 45971746 + 1.66667 NA intron (NM_024513, intron 6 of 17) L1MC4|LINE|L1 24310 NM_024513 79443 Hs.200227 NM_024513 ENSG00000163820 FYCO1 CATC2|CTRCT18|RUFY3|ZFYVE7 FYVE and coiled-coil domain containing 1 protein-coding 263.667-45 chr2 53172874 53173112 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -470378 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 289.334-6 chr20 33960654 33960942 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -33113 NM_016732 22913 Hs.136947 NM_007367 ENSG00000125970 RALY HNRPCL2|P542 RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein-coding 263-65 chr7 41329433 41329632 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 227928 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 269-14 chr13 67264527 67264776 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34315 NM_020403 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 368-2 chr1 88669893 88670424 + 1.66667 NA intron (NR_110682, intron 1 of 3) intron (NR_110682, intron 1 of 3) -13986 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 698.667 chr12 4840069 4840760 + 1.66667 NA intron (NM_002235, intron 1 of 1) L1P4|LINE|L1 31238 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 221-20 chr14 55385727 55385909 + 1.66667 NA intron (NM_014924, intron 5 of 9) intron (NM_014924, intron 5 of 9) 26040 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 404.667-7 chr7 42725540 42725846 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19246 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 298.334-10 chr6 120259173 120259417 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 244116 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 259.667-18 chr12 48431687 48431929 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -40857 NM_012404 23519 Hs.532658 NM_012404 ENSG00000139223 ANP32D PP32R2 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member D protein-coding 313.667-20 chr18 2705717 2706009 + 1.66667 NA intron (NM_015295, intron 14 of 47) intron (NM_015295, intron 14 of 47) 49976 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 274-28 chr21 27007285 27007643 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -40376 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 274.334-9 chr8 81141180 81141447 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29245 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 256-31 chr15 85710769 85711030 + 1.66667 NA intron (NM_007200, intron 19 of 36) MIRc|SINE|MIR 47826 NR_120366 101929679 Hs.513112 NR_120366 LOC101929679 - uncharacterized LOC101929679 ncRNA 254.667-36 chr2 54417378 54417567 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -38855 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 218.333-59 chr2 19721668 19721911 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -147065 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 431-15 chr8 140016196 140016548 + 1.66667 NA intron (NM_001160372, intron 18 of 22) MER81|DNA|hAT-Blackjack 84163 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 249.334-6 chr12 14060134 14060287 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -79854 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 254.334-33 chr8 37476751 37476923 + 1.66667 NA intron (NR_121620, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 17076 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 291-7 chr10 68906924 68907302 + 1.66667 NA intron (NM_024045, intron 2 of 14) intron (NM_024045, intron 2 of 14) 5798 NM_024045 79009 Hs.522984 NM_024045 ENSG00000107625 DDX50 GU2|GUB|RH-II/GuB|mcdrh DExD-box helicase 50 protein-coding 318.667-17 chr17 70014574 70014887 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36541 NR_104130 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 314.333-26 chr7 31238634 31238958 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 101930 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 260-73 chr7 32158000 32158189 + 1.66667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -86658 NM_001322057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 331.334-7 chr4 91040512 91040889 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) intron (NM_001145065, intron 9 of 10) 805669 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 292.333-49 chrY 11294295 11294599 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1127143 NR_033667 352887 Hs.546221 NR_033667 ENSG00000206159 GYG2P1 GYG2P glycogenin 2 pseudogene 1 pseudo 512.666 chr10 88130516 88131218 + 1.66667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 267242 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 243.334-7 chr14 34016517 34016669 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -65519 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 258.667-44 chr2 57876566 57876843 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30947 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 280.333-18 chr2 35717621 35717978 + 1.66667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 246394 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 379-9 chr3 103456182 103456497 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 67777 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 341.001 chr11 58555140 58555433 + 1.66667 NA intron (NM_001307951, intron 2 of 7) MER58A|DNA|hAT-Charlie 20631 NM_004811 9404 Hs.125474 NM_004811 ENSG00000110031 LPXN LDPL leupaxin protein-coding 257-33 chr22 28430198 28430472 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -29534 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 172.667-65 chr17 39264083 39264223 + 1.66667 NA intron (NM_001370209, intron 13 of 13) intron (NM_001370209, intron 13 of 13) -33247 NR_162098 113839521 NR_162098 MIR548BC - microRNA 548BC ncRNA 248.667-41 chr15 65066713 65066919 + 1.66667 NA intron (NM_016563, intron 1 of 4) intron (NM_016563, intron 1 of 4) 1175 NM_001307930 51285 Hs.27018 NM_016563 ENSG00000103710 RASL12 RIS RAS like family 12 protein-coding 299-6 chr1 234672276 234672476 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26087 NR_125944 101927787 Hs.520658 NR_125944 ENSG00000228044 LOC101927787 - uncharacterized LOC101927787 ncRNA 210-7 chr1 114497510 114497753 + 1.66667 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 13572 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 240-24 chr14 62852469 62852627 + 1.66667 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) L1MC4a|LINE|L1 192910 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 249-19 chr12 44770069 44770362 + 1.66667 NA intron (NM_006159, intron 10 of 20) intron (NM_006159, intron 10 of 20) 105446 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 239.334-13 chr7 94538439 94538656 + 1.66667 NA intron (NM_001363428, intron 9 of 17) intron (NM_001363428, intron 9 of 17) 28738 NM_022900 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 521.667 chr15 49670666 49671305 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 49937 NM_020234 56986 Hs.127432 NM_020234 ENSG00000104047 DTWD1 MDS009 DTW domain containing 1 protein-coding 316.333-27 chr8 52790799 52791116 + 1.66667 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 -76491 NM_001083617 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 395 chr13 45022682 45023079 + 1.66667 NA intron (NM_001316952, intron 7 of 8) AluJr4|SINE|Alu 33342 NM_018559 55425 Hs.731811 NM_018559 ENSG00000133114 GPALPP1 AD029|KIAA1704|LSR7|bA245H20.2 GPALPP motifs containing 1 protein-coding 219-46 chr2 13323423 13323570 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -316483 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 298-41 chr2 22020896 22021143 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -310367 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 311-33 chr6 103965209 103965513 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 894185 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 236.333-92 chr8 113115547 113115714 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) L1ME3A|LINE|L1 261522 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 327.333-2 chr1 196437390 196437674 + 1.66667 NA intron (NM_001287820, intron 8 of 26) intron (NM_001287820, intron 8 of 26) 144949 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 318.333-11 chr14 33170555 33170822 + 1.66667 NA intron (NM_001164749, intron 2 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 231809 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 260.667-99 chr9 99238486 99238670 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 16296 NM_006808 10952 Hs.191887 NM_006808 ENSG00000106803 SEC61B - SEC61 translocon beta subunit protein-coding 246.334-16 chr5 114716971 114717192 + 1.66667 NA intron (NR_130785, intron 1 of 12) L1MC4|LINE|L1 56332 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 265-49 chr3 119863237 119863476 + 1.66667 NA intron (NM_002093, intron 10 of 11) intron (NM_002093, intron 10 of 11) 80646 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 456.333-4 chr14 49953187 49953748 + 1.66667 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -12932 NR_106724 102464828 NR_106724 ENSG00000278038 MIR6076 hsa-mir-6076 microRNA 6076 ncRNA 309.667-28 chr7 77361885 77362096 + 1.66667 NA intron (NR_146937, intron 13 of 31) intron (NR_146937, intron 13 of 31) -53208 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 260.667-82 chr7 38610430 38610621 + 1.66667 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) intron (NM_001635, intron 1 of 20) 20848 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 418.667-6 chr3 47125926 47126223 + 1.66667 NA intron (NM_001349370, intron 1 of 19) AluSz|SINE|Alu 37903 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 283.667-13 chr18 35203116 35203468 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37742 NM_032347 84307 Hs.591061 NM_032347 ENSG00000186812 ZNF397 ZNF47|ZSCAN15 zinc finger protein 397 protein-coding 239-65 chr9 29033613 29033756 + 1.66667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -144729 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 300.666-13 chr5 19489793 19490165 + 1.66667 NA intron (NM_001349559, intron 11 of 12) intron (NM_001349559, intron 11 of 12) 396293 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 270.666-13 chr18 29068526 29068819 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -891542 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 247-50 chr3 64955881 64956041 + 1.66667 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) intron (NR_038264, intron 4 of 5) -267961 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 232-80 chr6 154325381 154325569 + 1.66667 NA intron (NM_001130699, intron 1 of 12) intron (NM_001130699, intron 1 of 12) 4606 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 244.333-90 chr6 108992828 108993081 + 1.66667 NA intron (NM_001199933, intron 6 of 9) intron (NM_001199933, intron 6 of 9) 16034 NM_001199934 27244 Hs.591336 NM_014454 ENSG00000080546 SESN1 PA26|SEST1 sestrin 1 protein-coding 338.667-5 chr11 13121318 13121558 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 112122 NM_001080521 644943 Hs.134650 NM_001080521 ENSG00000189431 RASSF10 - Ras association domain family member 10 protein-coding 260.667-89 chr8 19651388 19651547 + 1.66667 NA intron (NR_148898, intron 1 of 9) L1PA15|LINE|L1 31116 NM_018371 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 242-51 chr4 43587771 43587986 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95335 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 237-7 chr1 188443026 188443206 + 1.66667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 999488 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 249-36 chr18 739693 739971 + 1.66667 NA intron (NM_005433, intron 8 of 11) intron (NM_005433, intron 8 of 11) -27168 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 227-41 chr4 99041511 99041722 + 1.66667 NA intron (NM_015143, intron 6 of 10) intron (NM_015143, intron 6 of 10) 44229 NR_037455 100500867 NR_037455 ENSG00000265213 MIR3684 - microRNA 3684 ncRNA 283.334-7 chr2 224946180 224946418 + 1.66667 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) intron (NM_014689, intron 1 of 55) 750 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 271.999-7 chr8 118787613 118787906 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 164126 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 177.667-75 chr2 132843345 132843522 + 1.66667 NA intron (NM_207481, intron 11 of 17) L1ME3G|LINE|L1 -72124 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 282-17 chr15 55128736 55128938 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 68104 NM_016304 51187 Hs.274772 NM_016304 ENSG00000137876 RSL24D1 C15orf15|HRP-L30-iso|L30|RLP24|RPL24|RPL24L|TVAS3 ribosomal L24 domain containing 1 protein-coding 368.333-7 chr5 115268088 115268467 + 1.66667 NA intron (NM_001040440, intron 9 of 9) AluSx3|SINE|Alu -5400 NM_005023 5229 Hs.254006 NM_005023 ENSG00000164219 PGGT1B BGGI|GGTI protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta protein-coding 277.333-52 chr20 31658550 31658809 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 20767 NM_032609 84701 Hs.277101 NM_032609 ENSG00000131055 COX4I2 COX4|COX4-2|COX4B|COX4L2|COXIV-2|dJ857M17.2 cytochrome c oxidase subunit 4I2 protein-coding 527.333-2 chr17 63155438 63156246 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 189607 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 187-85 chr8 46477239 46477430 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 140309 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 239.667-35 chr19 37716153 37716441 + 1.66667 NA intron (NM_032689, intron 1 of 4) LTR54B|LTR|ERV1 2891 NM_001172677 84775 Hs.116622 NM_032689 ENSG00000198182 ZNF607 - zinc finger protein 607 protein-coding 251.667-26 chr16 71181798 71181954 + 1.66667 NA intron (NM_017558, intron 3 of 19) L2a|LINE|L2 48846 NM_001198542 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 382-8 chr3 95466698 95467076 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 216306 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 288-45 chr6 69944680 69944882 + 1.66667 NA intron (NM_001858, intron 9 of 50) intron (NM_001858, intron 9 of 50) 78225 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 209-60 chr2 128570626 128570881 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -251885 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 238.334-2 chr10 99727418 99727609 + 1.66667 NA exon (NM_001320974, exon 3 of 9) exon (NM_001320974, exon 3 of 9) -4721 NM_015960 51076 Hs.16606 NM_015960 ENSG00000119929 CUTC CGI-32 cutC copper transporter protein-coding 315.667-15 chr3 132387966 132388308 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29365 NM_001329126 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 247.334-21 chr7 40213579 40213782 + 1.66667 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) L1MC3|LINE|L1 78704 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 177.667-41 chr13 34416979 34417104 + 1.66667 NA intron (NR_146542, intron 1 of 3) intron (NR_146542, intron 1 of 3) 68998 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 223-53 chr5 155662035 155662470 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 648497 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 261.667-29 chr18 28822603 28822822 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -645582 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 270.667-30 chr20 22637861 22638089 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -30458 NR_109883 101929685 Hs.563018 NR_109883 ENSG00000237396 LNCNEF LINC01384|lncRNA-NEF lncRNA neighboring enhancer of FOXA2 ncRNA 269.333-37 chr18 64726078 64726362 + 1.66667 NA Intergenic MER101B|LTR|ERV1 -466165 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 305.334-6 chr3 42940852 42941118 + 1.66667 NA intron (NM_001205272, intron 2 of 4) intron (NM_001205272, intron 2 of 4) -4200 NR_122033 100506275 Hs.517918 NR_122033 ENSG00000206552 KRBOX1-AS1 - KRBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 272.667-24 chr18 2566923 2567124 + 1.66667 NA exon (NM_001308401, exon 2 of 8) exon (NM_001308401, exon 2 of 8) 4482 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 278.999-6 chr20 46235469 46235786 + 1.66667 NA intron (NM_021248, intron 3 of 11) L2-1_AMi|LINE|L2 72871 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 361.333-19 chr3 114205361 114205876 + 1.66667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -6211 NM_001282563 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 362.667-3 chr1 178365110 178365452 + 1.66667 NA intron (NM_004841, intron 1 of 15) intron (NM_004841, intron 1 of 15) 23830 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 310.334-8 chr4 184191710 184192048 + 1.66667 NA intron (NM_153343, intron 1 of 7) L1MB7|LINE|L1 25994 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 271-10 chr12 28243921 28244231 + 1.66667 NA intron (NM_001352082, intron 2 of 13) L1ME3F|LINE|L1 -53338 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 200.334-4 chr6 136943284 136943423 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 21052 NM_001008783 340146 Hs.369703 NM_001008783 ENSG00000182747 SLC35D3 FRCL1 solute carrier family 35 member D3 protein-coding 371-4 chr11 109648677 109649034 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 226665 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 254.333-6 chr11 29427707 29427977 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -166571 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 262-42 chr2 108154718 108154905 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 63030 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 255.334-9 chr14 79375835 79376088 + 1.66667 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 96581 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 361.999-2 chr14 50747576 50748064 + 1.66667 NA intron (NM_016350, intron 21 of 28) intron (NM_016350, intron 21 of 28) -73977 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 161.334-2 chr3 196077979 196078145 + 1.66667 NA intron (NM_001313966, intron 1 of 16) intron (NM_001313966, intron 1 of 16) 4028 NM_003234 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 385.667 chr10 105796150 105796501 + 1.66667 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) intron (NR_120625, intron 3 of 3) 24008 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 369.333-5 chr13 81003147 81003729 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -14953 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 257-5 chr10 114653591 114653756 + 1.66667 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) 4602 NM_002313 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 252.333-76 chr8 120405881 120406101 + 1.66667 NA intron (NM_014078, intron 6 of 6) intron (NM_014078, intron 6 of 6) 39159 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 270.667-57 chr8 129999293 129999628 + 1.66667 NA intron (NM_001353245, intron 1 of 13) intron (NM_001353245, intron 1 of 13) 8993 NR_049826 100847051 NR_049826 ENSG00000264653 MIR5194 mir-5194 microRNA 5194 ncRNA 274-52 chr5 170463765 170463993 + 1.66667 NA intron (NM_001034838, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 -40141 NM_001278340 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 302.667-11 chr15 42744408 42744722 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_173500, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_173500, exon 15 of 15) -7437 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 322-40 chr7 18383205 18383469 + 1.66667 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) MER117|DNA|hAT-Charlie 93245 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 163.667-18 chr10 14538381 14538577 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001320740) promoter-TSS (NM_001320740) 63 NM_001320740 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 349.333-23 chr4 56808748 56809304 + 1.66667 NA TTS (NM_001271718) TTS (NM_001271718) 12447 NR_073419 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 381.666-4 chr19 28961606 28962135 + 1.66667 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -3261 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 140.667-208 chr7 7516969 7517070 + 1.66667 NA intron (NM_001037763, intron 7 of 34) intron (NM_001037763, intron 7 of 34) 18854 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 298-59 chr4 7858385 7858686 + 1.66667 NA intron (NM_198595, intron 3 of 16) intron (NM_198595, intron 3 of 16) 13773 NM_001371090 281.334-12 chr6 8059215 8059450 + 1.66667 NA intron (NM_001199322, intron 2 of 5) intron (NM_001199322, intron 2 of 5) 5057 NM_201280 63915 Hs.719272 NM_201280 ENSG00000188428 BLOC1S5 BLOS5|MU|MUTED biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 5 protein-coding 288.333-19 chr2 55318734 55319058 + 1.66667 NA exon (NM_018084, exon 19 of 32) exon (NM_018084, exon 19 of 32) 36577 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 286.667-28 chr4 71789328 71789506 + 1.66667 NA intron (NM_001204306, intron 1 of 13) intron (NM_001204306, intron 1 of 13) -5338 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 295-35 chr4 88951573 88951902 + 1.66667 NA intron (NM_014883, intron 4 of 23) L2c|LINE|L2 105448 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 381.333-5 chr14 54617430 54618011 + 1.66667 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 50108 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 389.333-14 chr5 106300723 106301396 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 709955 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 446.667-2 chr1 187890204 187890751 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 446849 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 256.333-51 chr22 20013929 20014188 + 1.66667 NA intron (NM_001670, intron 1 of 19) AluSx|SINE|Alu 2765 NM_001670 421 Hs.713616 NM_001670 ENSG00000099889 ARVCF - ARVCF delta catenin family member protein-coding 262.666-8 chr17 8274633 8274913 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13897 NM_001177801 29098 Hs.408233 NM_016492 ENSG00000108961 RANGRF HSPC165|HSPC236|MOG1|RANGNRF RAN guanine nucleotide release factor protein-coding 272.667-29 chr2 49982271 49982472 + 1.66667 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) -8168 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 209-93 chr5 112746275 112746447 + 1.66667 NA intron (NM_001354904, intron 2 of 15) L1M5|LINE|L1 8476 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 344.667-14 chr4 65445821 65446185 + 1.66667 NA intron (NM_001281767, intron 5 of 16) L2|LINE|L2 223485 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 255.334-21 chr3 161236737 161236911 + 1.66667 NA intron (NM_015938, intron 7 of 15) L1M4|LINE|L1 15534 NM_015938 51068 Hs.598836 NM_015938 ENSG00000169251 NMD3 CGI-07 NMD3 ribosome export adaptor protein-coding 178-3 chr1 44513906 44514017 + 1.66667 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) -31532 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 255.333-46 chr17 61257664 61257951 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) MIRb|SINE|MIR 109897 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 217.667-28 chr14 46033263 46033487 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -30784 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 278.333-34 chr4 99935071 99935343 + 1.66667 NA intron (NM_001031723, intron 1 of 7) HAL1M8|LINE|L1 11411 NM_001278310 79982 Hs.577426 NM_024920 ENSG00000164031 DNAJB14 EGNR9427|PRO34683 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B14 protein-coding 444.666-4 chr7 10136204 10136666 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 502165 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 258.667-61 chr3 21162477 21162698 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -243139 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 253.333-89 chr6 4157104 4157378 + 1.66667 NA non-coding (NR_103764, exon 4 of 4) non-coding (NR_103764, exon 4 of 4) 21169 NR_103764 100507506 Hs.665936 NR_103764 ENSG00000234817 LOC100507506 - uncharacterized LOC100507506 ncRNA 254.334-22 chr4 39223875 39224119 + 1.66667 NA intron (NM_025132, intron 14 of 36) L1MD1|LINE|L1 41468 NM_025132 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 129.667-175 chr8 120386668 120386818 + 1.66667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 58407 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 142.667-48 chr13 72588112 72588217 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 139465 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 246-12 chr10 41722134 41722331 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 645813 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 211.666-38 chr4 180056720 180057054 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1102262 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 257-30 chr2 202125151 202125336 + 1.66667 NA exon (NM_001367720, exon 12 of 24) exon (NM_001367720, exon 12 of 24) -8185 NR_135244 729224 Hs.623895 NR_135243 KIAA2012-AS1 - KIAA2012 antisense RNA 1 ncRNA 257.667-5 chr10 24748439 24748741 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -24703 NM_020824 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 369.333-14 chr2 175748435 175748772 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 253664 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 246-66 chr3 38679584 38679813 + 1.66667 NA Intergenic MER96|DNA|hAT-Tip100 -30011 NM_001160160 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 266-57 chr3 82878887 82879082 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 892842 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 259.333-59 chr2 222703957 222704238 + 1.66667 NA intron (NM_058165, intron 5 of 5) intron (NM_058165, intron 5 of 5) 32439 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 253.333-10 chr10 96335154 96335447 + 1.66667 NA intron (NM_001017520, intron 9 of 10) intron (NM_001017520, intron 9 of 10) 21859 NM_001284324 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 418-5 chr15 55449922 55450318 + 1.66667 NA intron (NM_001033560, intron 6 of 8) intron (NM_001033560, intron 6 of 8) -41610 NM_001204450 9236 Hs.285051 NM_004748 ENSG00000260916 CCPG1 CPR8 cell cycle progression 1 protein-coding 212.667-64 chr19 13583413 13583546 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -77000 NM_001174080 773 Hs.501632 NM_000068 ENSG00000141837 CACNA1A APCA|BI|CACNL1A4|CAV2.1|EA2|EIEE42|FHM|HPCA|MHP|MHP1|SCA6 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A protein-coding 259-8 chr10 50257383 50257679 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8921 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 192-75 chr2 126367286 126367475 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -249395 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 263.333-39 chr2 21138239 21138537 + 1.66667 NA exon (NM_001306137, exon 4 of 4) exon (NM_001306137, exon 4 of 4) 14402 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 286.999-8 chr22 25035694 25036070 + 1.66667 NA intron (NM_001145206, intron 2 of 10) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 7908 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 469.666-5 chr5 88235436 88235878 + 1.66667 NA intron (NM_001349403, intron 1 of 10) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 33188 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 252.333-42 chr20 58987441 58987723 + 1.66667 NA intron (NM_198976, intron 3 of 14) intron (NM_198976, intron 3 of 14) 6326 NM_198976 51497 Hs.517148 NM_016397 ENSG00000101158 NELFCD HSPC130|NELF-C|NELF-D|TH1|TH1L negative elongation factor complex member C/D protein-coding 238-45 chr2 51708222 51708421 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) -662327 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 277.666-11 chr3 90388868 90389230 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1281428 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 254.667-73 chr6 71023932 71024195 + 1.66667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -67003 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 188-93 chr5 146657368 146657529 + 1.66667 NA intron (NM_181678, intron 6 of 10) intron (NM_181678, intron 6 of 10) -141335 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 424-15 chr7 144712462 144712919 + 1.66667 NA intron (NM_001042482, intron 3 of 7) L1ME2|LINE|L1 26208 NR_146936 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 241.667-17 chr12 43197497 43197718 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 42292 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 484.334 chr3 8413809 8414185 + 1.66667 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) AluY|SINE|Alu 87661 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 317.667-40 chr8 132590552 132590976 + 1.66667 NA intron (NR_135913, intron 9 of 10) intron (NR_135913, intron 9 of 10) -29285 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 297.334-7 chr17 74168528 74168827 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -35001 NM_001035258 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 202.667-155 chr9 76008895 76009078 + 1.66667 NA intron (NR_120409, intron 3 of 19) MER53|DNA|hAT 118313 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 255-71 chr6 95813636 95813799 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -202257 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 415.666-5 chr5 121772995 121773447 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -78661 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 279.334-5 chr21 21891599 21891786 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 144707 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 309.334-4 chr16 3223457 3223808 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001145446, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001145446, exon 5 of 5) 8070 NR_002169 26184 Hs.651203 NR_002169 ENSG00000203581 OR1F2P OLFMF2|OR16-3|OR1F11|OR1F2|OR1F3P|hg91 olfactory receptor family 1 subfamily F member 2 pseudogene pseudo 238-36 chr18 5162732 5162953 + 1.66667 NA intron (NM_001330553, intron 1 of 1) intron (NM_001330553, intron 1 of 1) 34415 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 242.666-19 chr18 3927399 3927656 + 1.66667 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -34826 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 242-7 chr1 173113780 173113935 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -62894 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 141-7 chr1 222632382 222632532 + 1.66667 NA intron (NM_198551, intron 5 of 27) intron (NM_198551, intron 5 of 27) -11846 NM_001324065 375056 Hs.118474 NM_198551 ENSG00000154305 MIA3 ARNT|D320|TANGO|TANGO1|UNQ6077 MIA SH3 domain ER export factor 3 protein-coding 239-33 chr2 148460155 148460363 + 1.66667 NA intron (NM_018328, intron 6 of 14) intron (NM_018328, intron 6 of 14) -184492 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 224.333-112 chr7 4811191 4811480 + 1.66667 NA intron (NM_018059, intron 9 of 14) intron (NM_018059, intron 9 of 14) -22696 NR_039800 100616465 NR_039800 ENSG00000264474 MIR4656 - microRNA 4656 ncRNA 316.667-17 chr2 178672468 178672818 + 1.66667 NA exon (NM_001267550, exon 153 of 363) exon (NM_001267550, exon 153 of 363) -104283 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 251.334-22 chr4 108839212 108839394 + 1.66667 NA intron (NM_001256074, intron 27 of 31) intron (NM_001256074, intron 27 of 31) -76250 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 281-23 chr20 34124390 34124600 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -12252 NM_003908 8894 Hs.429180 NM_003908 ENSG00000125977 EIF2S2 EIF2|EIF2B|EIF2beta|PPP1R67|eIF-2-beta eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta protein-coding 240-31 chr15 101040064 101040310 + 1.66667 NA intron (NM_024652, intron 20 of 33) L1ME2|LINE|L1 120830 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 305.333-47 chr3 125257965 125258268 + 1.66667 NA intron (NM_001348434, intron 6 of 7) intron (NM_001348434, intron 6 of 7) -45351 NM_024628 84561 Hs.658514 NM_024628 ENSG00000221955 SLC12A8 CCC9 solute carrier family 12 member 8 protein-coding 211.667-13 chr10 17132163 17132321 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2425 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 288.333-30 chr5 44127668 44128116 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -260840 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 238.667-5 chr1 201772305 201772494 + 1.66667 NA intron (NM_001167738, intron 1 of 26) intron (NM_001167738, intron 1 of 26) 32499 NM_001167738 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 253.666-22 chr5 112304699 112305010 + 1.66667 NA intron (NM_001347887, intron 2 of 23) MIRc|SINE|MIR 76571 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 261-40 chr20 60493908 60494133 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 15909 NR_039758 100616362 NR_039758 ENSG00000266140 MIR4533 - microRNA 4533 ncRNA 307.334-10 chr4 113526053 113526361 + 1.66667 NA intron (NM_001221, intron 8 of 18) intron (NM_001221, intron 8 of 18) 233368 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 553.001 chr6 44195865 44196293 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -20847 NM_001315494 101929726 Hs.438979 NM_001315494 ENSG00000262179 MYMX MINION|hMINION myomixer, myoblast fusion factor protein-coding 233.667-52 chr3 90056886 90057119 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 949381 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 236.333-98 chrX 98191255 98191518 + 1.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -626851 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 267.667-41 chr3 42982044 42982281 + 1.66667 NA intron (NM_001129908, intron 1 of 4) intron (NM_001129908, intron 1 of 4) 2851 NM_001129908 729085 Hs.729533 NM_001129908 ENSG00000144649 GASK1A C3orf41|FAM198A golgi associated kinase 1A protein-coding 225-29 chr17 63264831 63265161 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 7 of 25) intron (NM_025185, intron 7 of 25) 175271 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 341.333-14 chr22 28471689 28472116 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 12033 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 231.333-129 chrX 63679340 63679557 + 1.66667 NA intron (NM_001353922, intron 4 of 8) L1MEg|LINE|L1 -7946 NR_138419 100874355 Hs.671524 NR_138419 ENSG00000231729 ARHGEF9-IT1 - ARHGEF9 intronic transcript 1 ncRNA 301.333-55 chr9 103441932 103442280 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -117073 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 382.333-19 chr7 44473295 44473915 + 1.66667 NA intron (NM_015332, intron 2 of 5) intron (NM_015332, intron 2 of 5) 17053 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 247.334-3 chr11 11102395 11102572 + 1.66667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 244266 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 374.333-12 chr5 30018305 30018617 + 1.66667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 137901 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 354.667-15 chr3 106039113 106039444 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -169877 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 265-11 chr11 2633547 2633745 + 1.66667 NA non-coding (NR_002728, exon 1 of 1) non-coding (NR_002728, exon 1 of 1) 66352 NR_002728 10984 Hs.604823 NR_002728 ENSG00000269821 KCNQ1OT1 KCNQ1-AS2|KCNQ10T1|Kncq1|KvDMR1|KvLQT1-AS|LIT1|NCRNA00012 KCNQ1 opposite strand/antisense transcript 1 ncRNA 455-3 chr17 32703967 32704283 + 1.66667 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) intron (NM_015194, intron 16 of 21) 172999 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 228.333-82 chr6 69586514 69586663 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 209878 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 254.334-35 chr8 84485750 84486011 + 1.66667 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) L2|LINE|L2 70396 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 246.334-19 chr6 135831680 135831850 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19936 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 253.334-3 chr10 115182925 115183164 + 1.66667 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) intron (NM_207303, intron 8 of 28) 89679 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 399.667-5 chr16 81390123 81390412 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 5249 NR_039871 100616150 NR_039871 ENSG00000284473 MIR4720 - microRNA 4720 ncRNA 252-26 chr14 24361444 24361748 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -5315 NM_001136022 4776 Hs.77810 NM_004554 ENSG00000100968 NFATC4 NF-AT3|NF-ATC4|NFAT3 nuclear factor of activated T cells 4 protein-coding 223.334-7 chr2 188101306 188101508 + 1.66667 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) intron (NR_126396, intron 2 of 2) 186284 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 223.667-80 chr8 14778860 14779160 + 1.66667 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) L1ME3F|LINE|L1 74500 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 240-99 chr9 112795348 112795627 + 1.66667 NA intron (NM_001012994, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 44727 NM_001012994 401548 Hs.522350 NM_001012994 ENSG00000148158 SNX30 ATG24A sorting nexin family member 30 protein-coding 350.334-5 chr18 1781893 1782277 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -422456 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 275.667-2 chr1 89816251 89816501 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4656 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 252-14 chr11 55958795 55959070 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 9531 NM_001005491 282770 Hs.554525 NM_001005491 ENSG00000174970 OR10AG1 OR11-160 olfactory receptor family 10 subfamily AG member 1 protein-coding 174.334-3 chr5 75392156 75392320 + 1.66667 NA intron (NM_031361, intron 10 of 16) tRNA-Gly-GGY|tRNA|tRNA 55018 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 269.334-5 chr13 88270176 88270350 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 127396 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 248-6 chr10 22339514 22339673 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5852 NM_001253855 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 350.666-16 chr21 19955730 19956006 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -56113 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 292-47 chr6 123684765 123685024 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -47801 NM_001256022 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 268.667-32 chr2 74786823 74787155 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -45666 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 372.667-9 chr2 54683574 54683931 + 1.66667 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -41260 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 496.667 chr14 35014162 35014645 + 1.66667 NA intron (NM_003136, intron 10 of 15) AluSq2|SINE|Alu -30504 NM_001079519 283635 Hs.446357 NM_173607 ENSG00000151327 FAM177A1 C14orf24 family with sequence similarity 177 member A1 protein-coding 257 chr1 25583365 25583546 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -34013 NM_020379 57134 Hs.197043 NM_020379 ENSG00000117643 MAN1C1 HMIC|MAN1A3|MAN1C|pp6318 mannosidase alpha class 1C member 1 protein-coding 365.334-5 chr3 172106138 172106466 + 1.66667 NA intron (NM_001135095, intron 1 of 25) intron (NM_001135095, intron 1 of 25) 65771 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 242.667-107 chr8 80111702 80111881 + 1.66667 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR -30960 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 324.333-26 chr2 185108309 185108616 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 58610 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 169.666-4 chr2 115550100 115550379 + 1.66667 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 206424 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 202.333-21 chr10 20107645 20107858 + 1.66667 NA intron (NM_032812, intron 4 of 13) intron (NM_032812, intron 4 of 13) 291319 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 291.334-13 chr6 66215501 66215699 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 427721 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 268-22 chr16 62286911 62287221 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -250628 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 262.333-45 chr2 55309510 55309689 + 1.66667 NA intron (NM_001254943, intron 23 of 33) intron (NM_001254943, intron 23 of 33) 27280 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 327.333-17 chr18 42630502 42631013 + 1.66667 NA intron (NR_046174, intron 7 of 9) intron (NR_046174, intron 7 of 9) 444089 NR_046174 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 419-2 chr18 3080261 3080714 + 1.66667 NA intron (NM_019856, intron 32 of 36) AluSx|SINE|Alu -68540 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 287.333-4 chr10 27519183 27519593 + 1.66667 NA intron (NR_046172, intron 2 of 5) L1M4|LINE|L1 15084 NM_021252 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 547-2 chr18 4496674 4497405 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -41732 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 245.333-29 chr12 30718764 30718993 + 1.66667 NA intron (NM_023925, intron 12 of 16) intron (NM_023925, intron 12 of 16) -23009 NM_006390 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 364-15 chr21 21461023 21461454 + 1.66667 NA intron (NM_001352592, intron 13 of 18) intron (NM_001352592, intron 13 of 18) 276081 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 244.334-14 chr3 110659959 110660141 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 409909 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 236.667-84 chr7 92070869 92071020 + 1.66667 NA exon (NM_005751, exon 28 of 50) exon (NM_005751, exon 28 of 50) 63533 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 396.666-2 chr13 93238231 93238620 + 1.66667 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) L1PB3|LINE|L1 11618 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 303-7 chr11 27298175 27298465 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 64895 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 241.333-55 chr2 118000037 118000288 + 1.66667 NA intron (NM_019044, intron 4 of 23) L2c|LINE|L2 13908 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 212.667-102 chr5 32304616 32304850 + 1.66667 NA intron (NM_001294344, intron 1 of 13) intron (NM_001294344, intron 1 of 13) 8206 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 168-68 chr3 98846195 98846375 + 1.66667 NA intron (NM_080927, intron 3 of 15) intron (NM_080927, intron 3 of 15) 55410 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 252-61 chr3 8704072 8704344 + 1.66667 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -29592 NM_033337 859 Hs.98303 NM_001234 ENSG00000182533 CAV3 LGMD1C|LQT9|MPDT|RMD2|VIP-21|VIP21 caveolin 3 protein-coding 224-5 chr10 4700072 4700331 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -22131 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 238.666-33 chr5 30500637 30500836 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 620176 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 358.334-3 chr17 31277984 31278374 + 1.66667 NA intron (NM_001042492, intron 36 of 57) intron (NM_001042492, intron 36 of 57) 19060 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 132-62 chr2 105043564 105043738 + 1.66667 NA intron (NM_182640, intron 1 of 10) AluSg|SINE|Alu -5155 NR_110603 102724691 Hs.606390 NR_110603 ENSG00000224509 LOC102724691 - uncharacterized LOC102724691 ncRNA 244-34 chr14 69390376 69390615 + 1.66667 NA intron (NM_004450, intron 2 of 3) L1MC2|LINE|L1 7804 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 239-5 chr1 118354965 118355183 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -169846 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 193-72 chr5 39154099 39154271 + 1.66667 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) MER63D|DNA|hAT-Blackjack 65378 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 258-13 chr14 48378173 48378408 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -583276 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 286.333-37 chr5 133775061 133775508 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -138393 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 211.333-20 chr1 216562703 216562917 + 1.66667 NA intron (NM_001243518, intron 6 of 7) intron (NM_001243518, intron 6 of 7) -139362 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 187-65 chr5 67084451 67084678 + 1.66667 NA intron (NM_001297651, intron 2 of 25) intron (NM_001297651, intron 2 of 25) 79909 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 325.334-4 chr22 26607339 26607672 + 1.66667 NA intron (NM_001887, intron 4 of 5) FRAM|SINE|Alu 10522 NM_001887 1414 Hs.37135 NM_001887 ENSG00000100122 CRYBB1 CATCN3|CTRCT17 crystallin beta B1 protein-coding 321.667-15 chr5 8950549 8950875 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 103183 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 266-18 chr12 97477211 97477497 + 1.66667 NA intron (NR_024037, intron 2 of 8) intron (NR_024037, intron 2 of 8) 12334 NR_024037 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 381-11 chr4 77123546 77124064 + 1.66667 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 -33402 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 326-12 chr13 95215460 95215754 + 1.66667 NA intron (NM_001301830, intron 3 of 19) L1MEf|LINE|L1 5263 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 284.667-35 chr4 30768591 30768967 + 1.66667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 48410 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 383.667-2 chr15 97824164 97824408 + 1.66667 NA intron (NR_024172, intron 1 of 2) L1MA8|LINE|L1 50143 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 349.334-5 chr14 26976816 26977245 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 68388 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 368.334 chr1 191340585 191340886 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -112237 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 264.333-64 chr5 168505273 168505556 + 1.66667 NA intron (NM_002887, intron 9 of 14) intron (NM_002887, intron 9 of 14) 18943 NM_002887 5917 Hs.654907 NM_002887 ENSG00000113643 RARS ArgRS|DALRD1|HLD9 arginyl-tRNA synthetase protein-coding 343.667-6 chr2 122190907 122191219 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 435412 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 383.667-5 chr3 113507181 113507477 + 1.66667 NA intron (NM_001331078, intron 1 of 17) intron (NM_001331078, intron 1 of 17) 7515 NM_001331079 152185 Hs.477144 NM_144718 ENSG00000163611 SPICE1 CCDC52|SPICE spindle and centriole associated protein 1 protein-coding 225.333-40 chr13 75817274 75817547 + 1.66667 NA intron (NM_005358, intron 11 of 29) intron (NM_005358, intron 11 of 29) -53628 NM_001257995 729420 Hs.586820 NM_001257995 LMO7DN C13orf45 LMO7 downstream neighbor protein-coding 237-76 chr8 117701527 117701685 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 180893 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 499.334-3 chr8 118671323 118671978 + 1.66667 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu -49687 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 352-17 chr2 116591543 116591869 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1222985 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 194.667-137 chr6 123389785 123390033 + 1.66667 NA intron (NM_001251987, intron 13 of 20) intron (NM_001251987, intron 13 of 20) -49695 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 394.667-2 chr11 107487491 107487866 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -29832 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 252.667-102 chr8 79207407 79207560 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -124705 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 231.667-14 chr14 20138798 20139059 + 1.66667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -4808 NM_001004724 390437 Hs.553766 NM_001004724 ENSG00000184394 OR4N5 - olfactory receptor family 4 subfamily N member 5 protein-coding 190.333-111 chr5 2318364 2318602 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6282 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 176.666-27 chr5 148957583 148957847 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 104694 NR_030310 693169 NR_030310 ENSG00000207714 MIR584 MIRN584|hsa-mir-584 microRNA 584 ncRNA 229-76 chrX 87437968 87438211 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -79713 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 244-89 chr6 69356169 69356333 + 1.66667 NA intron (NM_001704, intron 28 of 31) LTR47B3|LTR|ERVL 440215 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 582-3 chr3 186542209 186542685 + 1.66667 NA intron (NM_017541, intron 1 of 2) intron (NM_017541, intron 1 of 2) 1933 NM_017541 1427 Hs.376209 NM_017541 ENSG00000213139 CRYGS CRYG8|CTRCT20 crystallin gamma S protein-coding 494.001 chr18 9351228 9351606 + 1.66667 NA intron (NM_020648, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 16644 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 252.333-39 chr2 218523186 218523451 + 1.66667 NA intron (NM_020935, intron 10 of 25) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 45033 NM_020935 57695 Hs.166068 NM_020935 ENSG00000135913 USP37 - ubiquitin specific peptidase 37 protein-coding 218-70 chr21 28709433 28709614 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 170205 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 247.667-64 chr3 117658090 117658332 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 32714 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 287.667-12 chr12 46172206 46172508 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 94159 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 332-30 chr7 4376229 4376593 + 1.66667 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -241574 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 330.667-7 chr13 106703584 106703901 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 49862 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 332.334-5 chr7 93777017 93777437 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 60299 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 328.333-17 chr18 63016620 63017034 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 301286 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 230.667-79 chr7 9100403 9100580 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -533779 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 309-11 chr10 106158390 106158772 + 1.66667 NA TTS (NR_134331) TTS (NR_134331) 18416 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 251-47 chr3 178149235 178149517 + 1.66667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -269825 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 197.667-117 chr5 14174553 14174720 + 1.66667 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 31294 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 362-4 chr1 208144910 208145184 + 1.66667 NA intron (NM_025179, intron 3 of 31) intron (NM_025179, intron 3 of 31) 99337 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 310.667-27 chr21 45727103 45727366 + 1.66667 NA intron (NM_001348238, intron 2 of 16) L1MEc|LINE|L1 -20780 NM_001348243 54039 Hs.474049 NM_020528 ENSG00000183570 PCBP3 ALPHA-CP3|PCBP3-OT1|PCBP3OT poly(rC) binding protein 3 protein-coding 327.667-16 chr18 36122005 36122243 + 1.66667 NA exon (NM_001099406, exon 4 of 8) exon (NM_001099406, exon 4 of 8) 7216 NM_012319 25800 Hs.79136 NM_012319 ENSG00000141424 SLC39A6 LIV-1|ZIP6 solute carrier family 39 member 6 protein-coding 321-5 chr13 43181550 43181812 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 68516 NR_047013 100874159 Hs.633241 NR_047013 LINC00400 - long intergenic non-protein coding RNA 400 ncRNA 405 chr10 67040206 67040598 + 1.66667 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) intron (NR_111909, intron 2 of 2) 28136 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 227-45 chr5 40138382 40138613 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 86206 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 248-71 chr5 61210648 61210814 + 1.66667 NA intron (NR_109908, intron 3 of 3) HAL1M8|LINE|L1 -48263 NM_001048249 643155 Hs.508479 NM_001048249 ENSG00000188725 SMIM15 C5orf43 small integral membrane protein 15 protein-coding 267.333-91 chr8 83750519 83750804 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 346903 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 240.667-48 chr2 139167329 139167599 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 270140 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 609.334-2 chr17 31873156 31873794 + 1.66667 NA exon (NM_018428, exon 16 of 19) exon (NM_018428, exon 16 of 19) -14231 NM_018405 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 262.666-24 chr7 31091538 31091830 + 1.66667 NA intron (NM_001199637, intron 10 of 13) L1PA16|LINE|L1 39223 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 195.667-6 chr10 12191902 12192150 + 1.66667 NA intron (NM_001321648, intron 1 of 10) intron (NM_001321648, intron 1 of 10) 3865 NM_014142 11164 Hs.555956 NM_014142 ENSG00000165609 NUDT5 YSA1|YSA1H|YSAH1|hNUDT5 nudix hydrolase 5 protein-coding 328-37 chr7 146682852 146683113 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -91289 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 250-53 chr3 175386244 175386432 + 1.66667 NA intron (NM_207015, intron 5 of 13) L1MC5|LINE|L1 16798 NR_039952 100616395 NR_039952 ENSG00000264974 MIR4789 - microRNA 4789 ncRNA 249.333-3 chr1 52215624 52215981 + 1.66667 NA intron (NM_007324, intron 1 of 17) intron (NM_007324, intron 1 of 17) 73708 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 396.333-13 chr8 125550746 125551178 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 118753 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 287-38 chr9 12909598 12909824 + 1.66667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 62922 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 349-16 chr4 102985708 102985995 + 1.66667 NA intron (NR_047513, intron 3 of 10) L1MC1|LINE|L1 33854 NR_047513 150159 Hs.666728 NM_139173 ENSG00000164037 SLC9B1 NHA1|NHEDC1 solute carrier family 9 member B1 protein-coding 256.334-10 chr22 25678355 25678519 + 1.66667 NA intron (NM_001362778, intron 7 of 19) AluY|SINE|Alu -63751 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 283.334 chr1 51051549 51051856 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -8135 NR_039617 100616189 NR_039617 ENSG00000265538 MIR4421 - microRNA 4421 ncRNA 251.334-32 chr8 48317989 48318140 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -233503 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 277.667-14 chr13 46275681 46275961 + 1.66667 NA intron (NM_001282460, intron 9 of 9) L1MA5|LINE|L1 22023 NR_047493 100861554 Hs.90866 NR_047493 ENSG00000261097 LINC00563 - long intergenic non-protein coding RNA 563 ncRNA 229.667-27 chr14 51488455 51488596 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001042481) promoter-TSS (NM_001042481) -603 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 188-51 chr2 23294529 23294719 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -90555 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 256.667-46 chr2 129123537 129123785 + 1.66667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 150230 NR_122042 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 348.333-38 chr9 116239094 116239487 + 1.66667 NA intron (NM_002581, intron 7 of 21) intron (NM_002581, intron 7 of 21) 85499 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 404.666-9 chr2 146035566 146035874 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -551337 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 207.334-2 chr11 91559674 91559835 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -665280 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 530.667-2 chr7 81503858 81504517 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 57632 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 255.334-26 chr5 121502206 121502467 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 179786 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 429.334-4 chr2 109178211 109178489 + 1.66667 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -36762 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 311.333-10 chr10 86384950 86385427 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -18393 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 308.333-16 chr17 59658628 59658993 + 1.66667 NA intron (NM_001288653, intron 6 of 31) intron (NM_001288653, intron 6 of 31) 38915 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 273-18 chr18 9595300 9595557 + 1.66667 NA intron (NM_001042388, intron 2 of 19) intron (NM_001042388, intron 2 of 19) 19131 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 177.333-172 chr8 88964920 88965147 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -637550 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 259.333-75 chr5 3694049 3694220 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 98302 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 265.333-12 chr11 12862335 12862643 + 1.66667 NA intron (NM_021961, intron 4 of 12) intron (NM_021961, intron 4 of 12) 127059 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 138.333-13 chr1 219777700 219777832 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 150885 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 252.667-65 chr3 104715445 104715647 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -651167 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 305-8 chr17 65266619 65267004 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 129441 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 269.667-6 chr10 54997738 54997908 + 1.66667 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) LOR1-int|LTR|ERV1 -196532 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 414.667-5 chr14 74074691 74075089 + 1.66667 NA intron (NM_001278593, intron 2 of 11) intron (NM_001278593, intron 2 of 11) 9563 NM_001278593 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 285.333-36 chr2 173048139 173048447 + 1.66667 NA intron (NM_001282901, intron 23 of 24) intron (NM_001282901, intron 23 of 24) -27553 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 255.334-7 chr11 29748777 29749021 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 130097 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 240-82 chr7 3911734 3911896 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -217870 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 263-30 chr2 103493545 103493762 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -509224 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 245.333-28 chr12 28879788 28880083 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -269343 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 271.667-79 chr9 26765362 26765531 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 127356 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 335.666-5 chr11 134710153 134710503 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -25617 NR_147836 729305 Hs.148365 NR_147836 ENSG00000251226 LINC02714 - long intergenic non-protein coding RNA 2714 ncRNA 194.667-124 chr5 94556396 94556533 + 1.66667 NA intron (NM_001145678, intron 2 of 20) intron (NM_001145678, intron 2 of 20) 62140 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 294.667-5 chr10 87508870 87509158 + 1.66667 NA intron (NM_001178117, intron 2 of 2) intron (NM_001178117, intron 2 of 2) 1181 NM_001178118 9562 Hs.121260 NM_004897 ENSG00000107789 MINPP1 HIPER1|MINPP2|MIPP multiple inositol-polyphosphate phosphatase 1 protein-coding 244.334-9 chr13 95043279 95043432 + 1.66667 NA intron (NM_005845, intron 29 of 30) intron (NM_005845, intron 29 of 30) 83314 NR_047487 100861544 Hs.48706 NR_047487 ENSG00000260962 LINC00557 - long intergenic non-protein coding RNA 557 ncRNA 306.334-7 chr5 27419724 27419953 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -52454 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 255.667-26 chr15 68969878 68970055 + 1.66667 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) L1M4|LINE|L1 39441 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 277.667-25 chr20 46424652 46424878 + 1.66667 NA intron (NR_146919, intron 2 of 3) AluJo|SINE|Alu -17714 NM_182764 63916 Hs.210469 NM_022086 ENSG00000062598 ELMO2 CED-12|CED12|Ced-12A|ELMO-2|VMPI engulfment and cell motility 2 protein-coding 156-128 chr6 135534587 135534759 + 1.66667 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) intron (NR_152845, intron 2 of 4) 36872 NR_026805 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 321.667-19 chr5 132984989 132985389 + 1.66667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -21555 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 227.667-82 chr9 83946364 83946506 + 1.66667 NA intron (NM_001317997, intron 3 of 4) intron (NM_001317997, intron 3 of 4) 10307 NM_032307 84267 Hs.208914 NM_032307 ENSG00000165118 C9orf64 - chromosome 9 open reading frame 64 protein-coding 265.334-17 chr3 60972138 60972342 + 1.66667 NA intron (NR_148922, intron 3 of 3) L1MEg|LINE|L1 279212 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 409.666-3 chr12 50838707 50839352 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -3897 NM_182559 283471 Hs.125571 NM_182559 ENSG00000186452 TMPRSS12 CT151 transmembrane serine protease 12 protein-coding 318.334-7 chr2 66074402 66074737 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 283759 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 255-59 chr4 91953817 91954014 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 323387 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 489.666 chr2 20093900 20094250 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -42447 NM_014713 9741 Hs.467807 NM_014713 ENSG00000068697 LAPTM4A HUMORF13|LAPTM4|MBNT|Mtrp lysosomal protein transmembrane 4 alpha protein-coding 247.667-55 chr2 157065741 157065992 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -191839 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 256.334-6 chr17 62046162 62046330 + 1.66667 NA intron (NM_005121, intron 3 of 29) intron (NM_005121, intron 3 of 29) 19032 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 289.667-25 chr3 172289688 172289881 + 1.66667 NA intron (NM_001135095, intron 7 of 25) MIRb|SINE|MIR 158672 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 287.333-25 chr17 62310454 62310865 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -35004 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 211.667-68 chr2 168975013 168975169 + 1.66667 NA intron (NM_003742, intron 12 of 27) intron (NM_003742, intron 12 of 27) 56233 NM_003742 8647 Hs.158316 NM_003742 ENSG00000073734 ABCB11 ABC16|BRIC2|BSEP|PFIC-2|PFIC2|PGY4|SPGP ATP binding cassette subfamily B member 11 protein-coding 501.667 chr8 105671940 105672370 + 1.66667 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 352612 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 181-6 chr10 91814362 91814562 + 1.66667 NA intron (NM_025235, intron 2 of 26) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 16036 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 299.334 chr1 118621345 118621536 + 1.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 366903 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 324.667-13 chr17 61000075 61000344 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 15 of 25) L1P4|LINE|L1 322358 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 416.334-2 chr11 45540301 45540788 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 125078 NM_003654 8534 Hs.104576 NM_003654 ENSG00000175264 CHST1 C6ST|GST-1|KS6ST|KSGal6ST|KSST carbohydrate sulfotransferase 1 protein-coding 386-10 chr4 74877947 74878369 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -54958 NM_015393 25849 Hs.105460 NM_015393 ENSG00000169116 PARM1 Cipar1|DKFZP564O0823|PARM-1|WSC4 prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 protein-coding 252.667-93 chr6 165661432 165661614 + 1.66667 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) CpG 577 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 276.334-5 chr11 32395966 32396153 + 1.66667 NA intron (NR_160306, intron 7 of 9) intron (NR_160306, intron 7 of 9) 4341 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 256-86 chr7 10269606 10269892 + 1.66667 NA Intergenic (GTTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -432927 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 300-3 chr1 190696833 190697128 + 1.66667 NA intron (NR_033922, intron 1 of 4) intron (NR_033922, intron 1 of 4) 72090 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 259-47 chr7 13939499 13939886 + 1.66667 NA intron (NM_001163148, intron 5 of 12) MIRc|SINE|MIR 46822 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 406.334-4 chr3 115451809 115452233 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -171489 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 162.667-190 chr4 33541803 33541981 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 498001 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 261.333-50 chr2 135120803 135121100 + 1.66667 NA intron (NM_001172435, intron 8 of 24) intron (NM_001172435, intron 8 of 24) -15677 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 294.333-32 chr4 185124246 185124535 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -18876 NM_001151 291 Hs.246506 NM_001151 ENSG00000151729 SLC25A4 AAC1|ANT|ANT 1|ANT1|MTDPS12|MTDPS12A|PEO2|PEO3|PEOA2|T1 solute carrier family 25 member 4 protein-coding 462.999 chr2 6542475 6542805 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 91147 NR_110500 102800315 Hs.729713 NR_110498 ENSG00000236172 LINC01246 - long intergenic non-protein coding RNA 1246 ncRNA 345.333-28 chr3 184868077 184868633 + 1.66667 NA intron (NM_001009921, intron 17 of 46) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 55848 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 298-51 chr20 21139123 21139433 + 1.66667 NA intron (NM_018474, intron 3 of 12) L1MC4|LINE|L1 13196 NM_001352436 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 191.667-66 chr19 44062817 44062972 + 1.66667 NA intron (NM_013361, intron 4 of 4) intron (NM_013361, intron 4 of 4) -9265 NM_001037813 342909 Hs.445395 NM_001037813 ENSG00000186026 ZNF284 ZNF284L zinc finger protein 284 protein-coding 265.333-28 chr16 87009096 87009334 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48569 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 172.334 chr2 171232114 171232266 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001136554) promoter-TSS (NM_001136554) -897 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 316.334-3 chr2 47922070 47922462 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16473 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 253.334-19 chr5 111209309 111209556 + 1.66667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -14151 NM_001323375 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 333-6 chr11 40347289 40347664 + 1.66667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -54346 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 278.667-25 chr2 80298015 80298390 + 1.66667 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 6550 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 273.667-22 chr14 71580488 71580730 + 1.66667 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -5689 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 276.334 chr1 204841210 204841454 + 1.66667 NA intron (NM_001160332, intron 1 of 27) MIRb|SINE|MIR 12678 NM_001160332 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 257.334-3 chr10 95318499 95318677 + 1.66667 NA intron (NM_001034955, intron 29 of 30) intron (NM_001034955, intron 29 of 30) -27585 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 162.667-61 chr12 68626086 68626213 + 1.66667 NA intron (NM_015646, intron 1 of 7) intron (NM_015646, intron 1 of 7) 1226 NR_033335 100379132 Hs.724530 NR_033335 ENSG00000206650 SNORA70G U70G small nucleolar RNA, H/ACA box 70G snoRNA 314-45 chr7 53446730 53446977 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 365078 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 398.333-4 chr11 111996554 111997051 + 1.66667 NA intron (NM_001037954, intron 17 of 19) AluSx|SINE|Alu 19493 NM_033425 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 186.334-3 chr6 138718820 138718966 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 27225 NR_033896 441172 Hs.92290 NR_033896 FLJ46906 - uncharacterized LOC441172 ncRNA 390.667-16 chr8 140618970 140619284 + 1.66667 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 16506 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 180.334-3 chr5 62420353 62420521 + 1.66667 NA intron (NM_001134779, intron 1 of 29) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 1553 NM_001134779 51194 Hs.482269 NM_016338 ENSG00000086200 IPO11 RanBP11 importin 11 protein-coding 351.666-19 chr8 71748395 71748816 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -94518 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 117.334 chr15 58591355 58591425 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001110, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001110, exon 16 of 16) -92655 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 270-7 chr11 11763876 11764088 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 19240 NR_107037 102465870 NR_107037 ENSG00000278529 MIR8070 hsa-mir-8070 microRNA 8070 ncRNA 269.667-31 chr2 61068414 61068717 + 1.66667 NA intron (NM_032506, intron 1 of 21) MIRb|SINE|MIR 2356 NM_032506 84542 Hs.468653 NM_032506 ENSG00000162929 KIAA1841 - KIAA1841 protein-coding 403-5 chr2 215602034 215602358 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -115847 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 263.333-73 chr6 53372464 53372700 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23403 NM_001242831 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 236.333-48 chr2 121891502 121891776 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 135988 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 281-44 chr8 121896149 121896491 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -254880 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 234.667-10 chr10 32006670 32006919 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 49631 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 229.667-21 chr12 58210677 58210918 + 1.66667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 122905 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 435.666-2 chr12 13938195 13938621 + 1.66667 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) L1ME2|LINE|L1 41948 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 269.667-45 chr6 125752256 125752610 + 1.66667 NA intron (NM_012259, intron 3 of 4) intron (NM_012259, intron 3 of 4) 2801 NM_012259 23493 Hs.144287 NM_012259 ENSG00000135547 HEY2 CHF1|GRIDLOCK|GRL|HERP1|HESR2|HRT2|bHLHb32 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2 protein-coding 221.667-39 chr19 53522859 53523032 + 1.66667 NA intron (NM_018555, intron 2 of 6) intron (NM_018555, intron 2 of 6) 1931 NM_018555 55422 Hs.185674 NM_018555 ENSG00000130844 ZNF331 RITA|ZNF361|ZNF463 zinc finger protein 331 protein-coding 171-18 chr14 25065934 25066141 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15740 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 246-27 chr14 67088249 67088514 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 10 of 21) L1ME4a|LINE|L1 -101059 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 260-52 chr3 110589044 110589227 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 480824 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 197.334-4 chr6 16490419 16490558 + 1.66667 NA intron (NM_000332, intron 6 of 8) intron (NM_000332, intron 6 of 8) 251901 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 399.333-12 chr22 32838587 32839118 + 1.66667 NA intron (NM_000362, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 38036 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 292.667-29 chr5 17222697 17223002 + 1.66667 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 5218 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 411.334-5 chr6 47946206 47946570 + 1.66667 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) L1MEd|LINE|L1 122301 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 245-72 chr8 83593614 83593817 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 189957 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 210.667-94 chr3 156023557 156023719 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -96910 NM_001308217 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 308.666-11 chr21 33999090 33999511 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 22918 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 310.334-2 chr10 19175480 19175790 + 1.66667 NA intron (NM_001142308, intron 14 of 39) intron (NM_001142308, intron 14 of 39) 126834 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 236.667-48 chr22 36768158 36768331 + 1.66667 NA intron (NM_001177701, intron 1 of 6) intron (NM_001177701, intron 1 of 6) 7875 NR_033531 11020 Hs.415172 NM_006860 ENSG00000100360 IFT27 BBS19|RABL4|RAYL intraflagellar transport 27 protein-coding 239.667-5 chr10 12456323 12456488 + 1.66667 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) intron (NM_001351032, intron 3 of 11) 67423 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 215.667-32 chr13 55356122 55356290 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 181752 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 309-12 chr10 118084037 118084336 + 1.66667 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -37245 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 261.333-115 chr9 91051415 91051738 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 23556 NR_033912 100129316 Hs.458154 NR_033912 LOC100129316 - uncharacterized LOC100129316 ncRNA 252.667-24 chr12 120375385 120375666 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -6361 NM_002442 4440 Hs.158311 NM_002442 ENSG00000135097 MSI1 - musashi RNA binding protein 1 protein-coding 374-4 chr12 42817764 42818217 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 125774 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 336-21 chr3 110724666 110725036 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 345108 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 254.334-4 chr10 53466278 53466471 + 1.66667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -694674 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 326.333-36 chr8 120959386 120959794 + 1.66667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -147544 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 218.666-52 chr3 84742307 84742538 + 1.66667 NA intron (NR_033860, intron 11 of 20) intron (NR_033860, intron 11 of 20) 127153 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 299-43 chrX 88146038 88146240 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -601086 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 246-48 chr19 47979977 47980258 + 1.66667 NA intron (NM_001128326, intron 2 of 5) intron (NM_001128326, intron 2 of 5) 12053 NM_001128326 100131137 Hs.651072 NM_001128326 ENSG00000188334 BSPH1 BSP1|ELSPBP2 binder of sperm protein homolog 1 protein-coding 432-8 chr5 40667968 40668398 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -11732 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 516.334 chr5 10880468 10880823 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -119411 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 411.333-14 chr3 66126261 66126791 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7084 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 307-33 chr5 109524593 109524913 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -114779 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 264.333-72 chr7 77960750 77961023 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 120756 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 337-7 chr14 45615603 45616050 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 99776 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 413.334-6 chr7 8926220 8926618 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 492810 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 302-16 chr12 52535591 52535920 + 1.66667 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -15361 NM_000424 3852 Hs.433845 NM_000424 ENSG00000186081 KRT5 CK5|DDD|DDD1|EBS2|K5|KRT5A keratin 5 protein-coding 263-5 chr1 172365853 172366099 + 1.66667 NA intron (NM_015569, intron 17 of 20) AluJr4|SINE|Alu -54709 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 278.667-17 chr16 31837342 31837707 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -28671 NM_174980 317702 Hs.257746 NM_174980 VN1R3 FKSG46|V1RL3|V1RL3p vomeronasal 1 receptor 3 (gene/pseudogene) protein-coding 261.334-2 chr12 4396885 4397155 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17308 NM_020638 8074 Hs.287370 NM_020638 ENSG00000118972 FGF23 ADHR|FGFN|HFTC2|HPDR2|HYPF|PHPTC fibroblast growth factor 23 protein-coding 546 chr14 74068574 74069241 + 1.66667 NA exon (NM_001278594, exon 7 of 12) exon (NM_001278594, exon 7 of 12) 15546 NM_001278593 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 278.001-2 chr11 37551226 37551405 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -387286 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 276.334-10 chr19 27734331 27734571 + 1.66667 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -58980 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 301-29 chr22 27863159 27863436 + 1.66667 NA intron (NM_001284278, intron 8 of 11) intron (NM_001284278, intron 8 of 11) 55917 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 336.334-3 chr20 20449858 20450082 + 1.66667 NA intron (NM_020343, intron 37 of 39) intron (NM_020343, intron 37 of 39) 81866 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 510 chr1 90924621 90925032 + 1.66667 NA intron (NM_032186, intron 2 of 3) intron (NM_032186, intron 2 of 3) 73067 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 250-58 chr4 113693825 113694016 + 1.66667 NA intron (NM_001321585, intron 2 of 19) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 67818 NM_001321592 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 392.667-8 chr4 30650042 30650527 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70085 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 199-76 chr4 151432087 151432271 + 1.66667 NA intron (NM_001348694, intron 1 of 12) L2b|LINE|L2 23003 NM_001109977 729830 Hs.633810 NM_001109977 ENSG00000164142 FAM160A1 - family with sequence similarity 160 member A1 protein-coding 212.667-23 chr11 100427535 100427678 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -259682 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 268-38 chr3 54868393 54868668 + 1.66667 NA intron (NM_018398, intron 17 of 37) intron (NM_018398, intron 17 of 37) 32725 NR_046666 100874237 Hs.570583 NR_046666 ENSG00000243715 CACNA2D3-AS1 - CACNA2D3 antisense RNA 1 ncRNA 262.667-73 chr6 123094045 123094283 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 97929 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 253-4 chr1 107762465 107762617 + 1.66667 NA intron (NM_006113, intron 9 of 26) intron (NM_006113, intron 9 of 26) -74042 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 266-29 chr17 59769365 59769540 + 1.66667 NA intron (NM_001329400, intron 4 of 9) intron (NM_001329400, intron 4 of 9) 61798 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 377.333-4 chr14 88877215 88877647 + 1.66667 NA non-coding (NR_159362, exon 15 of 15) non-coding (NR_159362, exon 15 of 15) 52780 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 257-23 chr18 7356501 7356766 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 104373 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 423.999-2 chr2 66990582 66990903 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -68252 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 366.001-4 chr17 57380450 57380721 + 1.66667 NA intron (NM_001322250, intron 5 of 13) intron (NM_001322250, intron 5 of 13) 123566 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 254.667-2 chr1 63875734 63875946 + 1.66667 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 101823 NM_005012 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 239-64 chr8 132749304 132749555 + 1.66667 NA intron (NM_001364885, intron 4 of 9) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 11153 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 295.667-19 chr4 57102692 57102998 + 1.66667 NA intron (NM_001553, intron 1 of 4) intron (NM_001553, intron 1 of 4) -6917 NR_034081 255130 Hs.691061 NR_034081 ENSG00000245067 IGFBP7-AS1 - IGFBP7 antisense RNA 1 ncRNA 286.333-14 chr14 79187063 79187551 + 1.66667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) MIRb|SINE|MIR -12675 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 469.666-6 chrX 72598853 72599195 + 1.66667 NA intron (NM_001122670, intron 27 of 30) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -25921 NM_001166420 55869 Hs.310536 NM_018486 ENSG00000147099 HDAC8 CDA07|CDLS5|HD8|HDACL1|KDAC8|MRXS6|RPD3|WTS histone deacetylase 8 protein-coding 313.333-28 chr4 43662735 43663047 + 1.66667 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -170348 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 284.667-13 chr13 30700190 30700472 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13147 NM_001204406 241 Hs.507658 NM_001629 ENSG00000132965 ALOX5AP FLAP arachidonate 5-lipoxygenase activating protein protein-coding 240-26 chr15 35648374 35648564 + 1.66667 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) intron (NR_038251, intron 1 of 2) 102274 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 250.334-15 chr4 30467568 30467826 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -252672 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 333.666-11 chr8 36430937 36431339 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -353236 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 266.667-34 chr19 32062543 32062834 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 36826 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 338.666-16 chr6 145747460 145747814 + 1.66667 NA intron (NR_038246, intron 1 of 2) intron (NR_038246, intron 1 of 2) -11614 NR_153398 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 160-103 chr5 151892153 151892308 + 1.66667 NA intron (NM_001292000, intron 1 of 7) MER117|DNA|hAT-Charlie 32621 NM_000171 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 227-19 chr14 36052600 36052788 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17733 NR_073454 101101773 Hs.640678 NR_073454 ENSG00000257585 LINC00609 - long intergenic non-protein coding RNA 609 ncRNA 394.001-2 chr12 2084205 2084476 + 1.66667 NA intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 L3|LINE|CR1 31055 NM_199460 775 Hs.118262 NM_000719 ENSG00000151067 CACNA1C CACH2|CACN2|CACNL1A1|CCHL1A1|CaV1.2|LQT8|TS|TS. LQT8 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C protein-coding 346.333 chr1 31536126 31536429 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 17842 NR_027085 284551 Hs.658659 NR_027085 LINC01226 - long intergenic non-protein coding RNA 1226 ncRNA 221-42 chr21 24018566 24018727 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 302731 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 261-18 chr13 36384868 36385072 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14790 NM_001142294 23111 Hs.440414 NM_015087 ENSG00000133104 SPART SPG20|TAHCCP1 spartin protein-coding 236-88 chr8 83713468 83713667 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 309809 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 317.334-2 chr22 21865372 21865697 + 1.66667 NA intron (NM_002745, intron 1 of 8) intron (NM_002745, intron 1 of 8) 2146 NM_138957 5594 Hs.431850 NM_002745 ENSG00000100030 MAPK1 ERK|ERK-2|ERK2|ERT1|MAPK2|P42MAPK|PRKM1|PRKM2|p38|p40|p41|p41mapk|p42-MAPK mitogen-activated protein kinase 1 protein-coding 322.334-7 chr5 121202743 121203061 + 1.66667 NA Intergenic (CTTATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -119648 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 355.666-7 chr22 35966230 35966752 + 1.66667 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) L1ME3A|LINE|L1 -4861 NM_001349994 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 254.667-74 chr6 73177345 73177498 + 1.66667 NA intron (NM_001160132, intron 11 of 13) intron (NM_001160132, intron 11 of 13) -33907 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 203.667-91 chr5 7442728 7442925 + 1.66667 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) L1MC5a|LINE|L1 46688 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 215.334-2 chr11 46118119 46118348 + 1.66667 NA intron (NM_001352029, intron 2 of 20) intron (NM_001352029, intron 2 of 20) 2586 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 287.667-28 chr3 106339492 106339701 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -470195 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 233-11 chr11 22294792 22294950 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -43510 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 232-84 chr7 80954776 80954962 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -32480 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 269.001-4 chr8 88369771 88369947 + 1.66667 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -42376 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 228.334-7 chrX 28242715 28242898 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 252857 NR_106750 102465140 NR_106750 ENSG00000277569 MIR6134 hsa-mir-6134 microRNA 6134 ncRNA 329.334-2 chr1 195760464 195760787 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 328090 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 231-56 chr6 161963364 161963645 + 1.66667 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 492527 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 265.666-2 chr1 92365935 92366192 + 1.66667 NA intron (NM_024813, intron 11 of 12) intron (NM_024813, intron 11 of 12) 67004 NM_024813 79871 Hs.444421 NM_024813 ENSG00000122484 RPAP2 C1orf82|Rtr1 RNA polymerase II associated protein 2 protein-coding 181.334-2 chr10 44743076 44743248 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -168154 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 253.334-13 chr3 185291174 185291349 + 1.66667 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) intron (NM_001242317, intron 2 of 12) 8300 NM_001242314 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 258.667-3 chr1 44668512 44668793 + 1.66667 NA intron (NM_001300748, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu 2404 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 259.666-26 chr3 180225406 180225658 + 1.66667 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -188595 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 366.667-20 chr8 16477070 16477382 + 1.66667 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -284435 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 304-41 chr3 104646409 104646807 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -720105 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 229-7 chr10 45652709 45652892 + 1.66667 NA intron (NM_174890, intron 3 of 9) intron (NM_174890, intron 3 of 9) 19932 NM_001282905 93550 Hs.89029 NM_174890 ENSG00000172671 ZFAND4 ANUBL1 zinc finger AN1-type containing 4 protein-coding 296.333-2 chr1 67217799 67218201 + 1.66667 NA intron (NM_144701, intron 6 of 10) intron (NM_144701, intron 6 of 10) 51546 NM_144701 149233 Hs.677426 NM_144701 ENSG00000162594 IL23R - interleukin 23 receptor protein-coding 334 chr1 172206130 172206466 + 1.66667 NA intron (NR_146559, intron 15 of 20) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -61463 NR_038397 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 324.666-8 chr15 79705285 79705592 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 191559 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 251.334-14 chr15 58399623 58399838 + 1.66667 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -32261 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 267-72 chr8 102246646 102246827 + 1.66667 NA intron (NR_125415, intron 2 of 2) intron (NR_125415, intron 2 of 2) 7285 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 254-76 chr8 37136798 37137040 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 352545 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 221-28 chr17 71020057 71020316 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 181993 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 316.333-10 chr15 98581074 98581550 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -66976 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 262.667-27 chr15 42921781 42922007 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1116 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 296-27 chr2 18180441 18180710 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 301908 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 360.667-4 chr12 81007660 81008070 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -69950 NM_004664 8825 Hs.144333 NM_004664 ENSG00000111052 LIN7A LIN-7A|LIN7|MALS-1|MALS1|TIP-33|VELI1 lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component protein-coding 425.666-3 chr4 98027532 98028051 + 1.66667 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 115685 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 346-9 chr14 65643996 65644395 + 1.66667 NA intron (NM_004480, intron 5 of 9) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 173093 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 361-14 chr7 41600551 41600947 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -93170 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 339.667-12 chr20 40728606 40728897 + 1.66667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -14128 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 296.667-43 chr4 67639140 67639395 + 1.66667 NA intron (NM_018227, intron 18 of 32) intron (NM_018227, intron 18 of 32) 61888 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 247-42 chr2 212567491 212567647 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28767 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 322.667-29 chr7 8058628 8058953 + 1.66667 NA intron (NM_138426, intron 4 of 7) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 89994 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 204-201 chr8 124457081 124457254 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6347 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 267.667-39 chr22 27061511 27061800 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -1137 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 387.334 chr1 23321476 23321848 + 1.66667 NA exon (NM_001102398, exon 7 of 11) exon (NM_001102398, exon 7 of 11) 22622 NM_001102398 10236 Hs.373763 NM_005826 ENSG00000125944 HNRNPR HNRPR|hnRNP-R heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R protein-coding 247.334-17 chr4 106824938 106825098 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 211295 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 265.667-75 chr8 122648080 122648391 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 45871 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 265-8 chr1 189773788 189774015 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 702109 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 223.333-65 chr2 34618181 34618362 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -59286 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 419.333-7 chr3 30118581 30119261 + 1.66667 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger -184765 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 418.334 chr15 26496383 26496700 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 132549 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 266-3 chr1 109409978 109410221 + 1.66667 NA intron (NM_001199774, intron 7 of 8) intron (NM_001199774, intron 7 of 8) -12181 NM_002959 6272 Hs.485195 NM_002959 ENSG00000134243 SORT1 Gp95|LDLCQ6|NT3|NTR3 sortilin 1 protein-coding 433.666 chr1 187548226 187548584 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 104777 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 259.333-16 chr10 100892942 100893201 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -19892 NM_001243770 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 222.667-103 chrX 46691422 46691677 + 1.66667 NA intron (NM_001257291, intron 1 of 16) MIRc|SINE|MIR 67569 NM_032591 84679 Hs.91389 NM_032591 ENSG00000065923 SLC9A7 MRX108|NHE-7|NHE7|SLC9A6 solute carrier family 9 member A7 protein-coding 225.667-27 chr14 84367419 84367593 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -904426 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 250.667-63 chr5 38938595 38938827 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_152756, exon 38 of 38) 3' UTR (NM_152756, exon 38 of 38) 92699 NM_003999 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 260.667-80 chr7 8363261 8363481 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70238 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 265.334-5 chr10 32865620 32865873 + 1.66667 NA intron (NM_001321115, intron 42 of 43) L1ME2z|LINE|L1 35726 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 327.667-12 chr15 57635665 57635924 + 1.66667 NA intron (NM_001018100, intron 8 of 12) intron (NM_001018100, intron 8 of 12) 43890 NM_001018090 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 246-30 chr14 92693049 92693312 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 55447 NM_001363696 5641 Hs.18069 NM_005606 ENSG00000100600 LGMN AEP|LGMN1|PRSC1 legumain protein-coding 269.334-11 chr5 38242124 38242407 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -16294 NM_152403 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 259-39 chr4 184769255 184769531 + 1.66667 NA intron (NM_001995, intron 11 of 20) intron (NM_001995, intron 11 of 20) 29653 NR_003542 643036 Hs.689630 NR_003542 ENSG00000249138 SLED1 - proteoglycan 3, pro eosinophil major basic protein 2 pseudogene pseudo 267.667-17 chr15 60565199 60565517 + 1.66667 NA intron (NM_134260, intron 1 of 11) intron (NM_134260, intron 1 of 11) 27168 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 254.667-43 chr20 22206934 22207096 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 75786 NR_110615 101929663 Hs.143562 NR_110615 ENSG00000225321 LINC01427 - long intergenic non-protein coding RNA 1427 ncRNA 233.334-2 chr20 48787815 48787963 + 1.66667 NA intron (NM_020820, intron 1 of 39) intron (NM_020820, intron 1 of 39) 40110 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 321 chr1 66947366 66947589 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001278215, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001278215, exon 5 of 5) 17221 NM_001077701 57708 Hs.605432 NM_020948 ENSG00000198160 MIER1 ER1|MI-ER1 MIER1 transcriptional regulator protein-coding 216.334-2 chr7 81735224 81735432 + 1.66667 NA intron (NM_001010932, intron 7 of 17) intron (NM_001010932, intron 7 of 17) 34719 NM_001010932 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 337.667-6 chr11 103715200 103715432 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -134590 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 303-23 chr16 66859715 66860027 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 14942 NM_001014435 766 Hs.37014 NM_005182 ENSG00000168748 CA7 CA-VII|CAVII carbonic anhydrase 7 protein-coding 296.667-22 chr17 59030951 59031218 + 1.66667 NA intron (NR_148346, intron 18 of 23) intron (NR_148346, intron 18 of 23) 75796 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 233.334 chr12 32674059 32674284 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -5029 NM_012063 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 413.667-10 chr8 103679898 103680276 + 1.66667 NA intron (NM_001348488, intron 3 of 25) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -139133 NR_145711 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 255.334-28 chr6 119469610 119469772 + 1.66667 NA non-coding (NR_046100, exon 3 of 6) non-coding (NR_046100, exon 3 of 6) 21611 NR_046100 285762 Hs.571063 NR_046100 LOC285762 - uncharacterized LOC285762 ncRNA 161.667-33 chr11 8682513 8682691 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_000990) promoter-TSS (NM_000990) -190 NM_000990 6157 Hs.523463 NM_000990 ENSG00000166441 RPL27A L27A ribosomal protein L27a protein-coding 305.333-70 chr7 115754710 115755104 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -173466 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 345.667-9 chr17 32244444 32244849 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21186 NM_001330181 162494 Hs.655027 NM_138328 ENSG00000141314 RHBDL3 RHBDL4|VRHO rhomboid like 3 protein-coding 236.667-18 chr12 17672078 17672227 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1147 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 258.334-14 chr2 46056666 46056912 + 1.66667 NA intron (NM_005400, intron 10 of 14) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -240618 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 461.667-3 chr9 24297226 24297587 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 248270 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 354.334-3 chr3 15654524 15654910 + 1.66667 NA intron (NM_001370752, intron 4 of 4) AluSx1|SINE|Alu 42654 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 387-5 chr12 107018192 107018541 + 1.66667 NA intron (NM_004075, intron 2 of 12) AluSz6|SINE|Alu -31200 NM_025198 80298 Hs.5009 NM_025198 ENSG00000120832 MTERF2 MTERFD3|mTERFL mitochondrial transcription termination factor 2 protein-coding 199.667-26 chr11 13996507 13996736 + 1.66667 NA intron (NM_006108, intron 2 of 15) L1ME4a|LINE|L1 33898 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 437.666-5 chr17 57499658 57500213 + 1.66667 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 23662 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 388.333-6 chr14 59998125 59998469 + 1.66667 NA intron (NR_075071, intron 18 of 32) intron (NR_075071, intron 18 of 32) 78584 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 263.334-3 chr11 101483315 101483568 + 1.66667 NA intron (NM_004621, intron 4 of 12) intron (NM_004621, intron 4 of 12) 36464 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 253-46 chr3 22335133 22335303 + 1.66667 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 378079 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 226.667-18 chr10 29748808 29748985 + 1.66667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -11960 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 295-49 chr8 122312405 122312765 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 256059 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 320.667-7 chr10 99016798 99016996 + 1.66667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1PA13|LINE|L1 -92329 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 198.334-2 chr14 37340263 37340421 + 1.66667 NA intron (NM_138731, intron 10 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 142405 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 196-81 chr2 13344021 13344167 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -337081 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 304.334-5 chr2 47593706 47594035 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23539 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 466.334 chr1 166538128 166538663 + 1.66667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -48356 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 414-14 chr9 6595466 6595806 + 1.66667 NA intron (NM_000170, intron 8 of 24) L1M7|LINE|L1 50056 NM_000170 2731 Hs.584238 NM_000170 ENSG00000178445 GLDC GCE|GCSP|HYGN1 glycine decarboxylase protein-coding 262-41 chr2 51960098 51960314 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -410442 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 424-9 chr20 15624921 15625207 + 1.66667 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 298250 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 432.667-10 chr4 70176741 70177220 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19547 NM_017855 54959 Hs.143811 NM_017855 ENSG00000109205 ODAM APIN odontogenic, ameloblast associated protein-coding 266.334-11 chr12 118636730 118636890 + 1.66667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 124869 NR_134998 105370014 Hs.550870 NR_134998 ENSG00000256750 LINC02423 - long intergenic non-protein coding RNA 2423 ncRNA 256-94 chr9 93771561 93771833 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -47660 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 250.667-78 chr8 86356295 86356463 + 1.66667 NA intron (NM_007013, intron 1 of 24) intron (NM_007013, intron 1 of 24) 13832 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 314-37 chr4 185912630 185912947 + 1.66667 NA intron (NM_001270771, intron 1 of 23) intron (NM_001270771, intron 1 of 23) 43584 NM_001270771 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 290.333-7 chr12 27353478 27353827 + 1.66667 NA intron (NM_001248003, intron 1 of 14) L1PA15|LINE|L1 20816 NM_001248002 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 400-16 chr7 33073447 33073786 + 1.66667 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -10819 NM_001002009 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 290.334-4 chr20 40252899 40253215 + 1.66667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 248596 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 279-29 chr5 148553180 148553420 + 1.66667 NA intron (NM_001040172, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 83761 NM_001286410 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 358-16 chr4 114506507 114506819 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -91739 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 175.667-65 chr2 23265685 23265828 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -119423 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 366.667-11 chr3 12525084 12525410 + 1.66667 NA intron (NM_025265, intron 8 of 11) L1MC4|LINE|L1 20217 NM_001195279 100129480 Hs.572974 NM_001195279 ENSG00000225526 MKRN2OS C3orf83|MKRN2-AS1 MKRN2 opposite strand protein-coding 454.667-3 chr3 74813800 74814219 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -292869 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 353.666-4 chr2 107030665 107031011 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -143729 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 337.999-2 chr9 13191984 13192488 + 1.66667 NA exon (NM_001330637, exon 15 of 47) exon (NM_001330637, exon 15 of 47) 87328 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 253.667-52 chr4 84007481 84007758 + 1.66667 NA intron (NR_125909, intron 8 of 8) L1MC3|LINE|L1 291550 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 318-46 chr5 24812063 24812364 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 28370 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 272.333-8 chr11 21907431 21907724 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -285508 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 260.666-33 chr9 111655536 111655827 + 1.66667 NA intron (NM_004125, intron 1 of 2) intron (NM_004125, intron 1 of 2) -5924 NM_001198664 2790 Hs.534196 NM_001017998 ENSG00000242616 GNG10 - G protein subunit gamma 10 protein-coding 120.333-31 chr11 26676298 26676407 + 1.66667 NA intron (NM_178498, intron 13 of 14) MER58A|DNA|hAT-Charlie 45708 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 258-89 chr8 139144927 139145161 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -231003 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 419.334-7 chr3 111433695 111434219 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -108240 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 435.334-2 chr4 51833142 51833464 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9697 NM_001287757 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 282-49 chr8 112952147 112952355 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 6 of 66) intron (NM_001363185, intron 6 of 66) 308758 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 341-13 chr19 36725775 36726083 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 22248 NM_001363651 163081 Hs.412517 NM_152603 ENSG00000189042 ZNF567 - zinc finger protein 567 protein-coding 161-41 chr2 72816634 72816829 + 1.66667 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 9302 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 417-15 chr9 34916533 34917029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21017 NM_001309427 100129969 Hs.571602 NM_001309426 ENSG00000187791 FAM205C FAM205CP family with sequence similarity 205 member C protein-coding 267.667-7 chr10 73469814 73470051 + 1.66667 NA intron (NM_001142353, intron 8 of 13) intron (NM_001142353, intron 8 of 13) -25820 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 261-2 chr1 80655247 80655423 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 14048 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 334-36 chr7 51578099 51578364 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -184975 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 253.667-44 chr3 163606096 163606325 + 1.66667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -302909 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 258.666-23 chr2 215010630 215010886 + 1.66667 NA intron (NR_103740, intron 18 of 54) intron (NR_103740, intron 18 of 54) 21328 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 395.001-2 chr21 31623003 31623440 + 1.66667 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -36401 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 202.667-93 chr22 28592511 28592731 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L2|LINE|L2 87244 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 238.334-9 chr2 115114461 115114631 + 1.66667 NA intron (NM_001178037, intron 1 of 25) intron (NM_001178037, intron 1 of 25) 46797 NR_036580 389023 Hs.97540 NR_036580 ENSG00000235026 DPP10-AS1 - DPP10 antisense RNA 1 ncRNA 260-92 chrX 102885415 102885675 + 1.66667 NA non-coding (NR_146587, exon 13 of 13) non-coding (NR_146587, exon 13 of 13) -51727 NM_001031834 282808 Hs.449517 NM_001031834 ENSG00000102128 RAB40AL MRXSMP|RAR2|RLGP RAB40A like protein-coding 285.333-75 chr9 21485341 21485666 + 1.66667 NA intron (NR_152877, intron 1 of 3) L1MEc|LINE|L1 -3190 NM_176891 338376 Hs.682604 NM_176891 ENSG00000184995 IFNE IFN-E|IFNE1|IFNT1|INFE1|PRO655 interferon epsilon protein-coding 257-54 chr5 110479430 110479701 + 1.66667 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) L1ME3A|LINE|L1 34350 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 463.334 chr14 79578027 79578523 + 1.66667 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) MER77B|LTR|ERVL 298895 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 233.333-77 chr21 27222880 27223083 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -255893 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 251.667-13 chr11 35599786 35599963 + 1.66667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -18586 NM_014344 24147 Hs.39384 NM_014344 ENSG00000179431 FJX1 - four-jointed box kinase 1 protein-coding 439.667-5 chr3 57755489 57756012 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1506 NM_001304420 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 257-68 chr7 127566909 127567068 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 18608 NM_024523 79571 Hs.521168 NM_024523 ENSG00000179562 GCC1 GCC1P|GCC88 GRIP and coiled-coil domain containing 1 protein-coding 242-17 chr10 71095277 71095512 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -117176 NM_170744 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 281.333-4 chr1 212200966 212201198 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 33654 NR_125982 101929541 Hs.632493 NR_125982 ENSG00000226251 LINC02608 - long intergenic non-protein coding RNA 2608 ncRNA 371 chr1 222248130 222248436 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -269763 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 282.333-60 chr8 99546932 99547230 + 1.66667 NA intron (NM_017890, intron 30 of 61) intron (NM_017890, intron 30 of 61) -10220 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 284.667-31 chr3 28437173 28437377 + 1.66667 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) intron (NM_001324170, intron 3 of 6) 88126 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 281.666-5 chr16 5703173 5703500 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 70869 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 245.334-14 chr4 20395807 20395954 + 1.66667 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) intron (NM_001289135, intron 4 of 35) 3691 NR_037876 100505893 Hs.665305 NR_037876 ENSG00000248228 SLIT2-IT1 - SLIT2 intronic transcript 1 ncRNA 339.333-20 chr18 77953058 77953334 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 40531 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 391.333-12 chr2 122056890 122057162 + 1.66667 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 301375 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 349.333-10 chr13 112081875 112082423 + 1.66667 NA intron (NR_120392, intron 1 of 3) intron (NR_120392, intron 1 of 3) 15000 NM_005986 6656 NM_005986 ENSG00000182968 SOX1 - SRY-box transcription factor 1 protein-coding 270-24 chr2 13906568 13906847 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 494251 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 145.333-16 chr1 185089384 185089578 + 1.66667 NA intron (NM_007212, intron 2 of 6) L2b|LINE|L2 43923 NM_007212 6045 Hs.591490 NM_007212 ENSG00000121481 RNF2 BAP-1|BAP1|DING|HIPI3|RING1B|RING2 ring finger protein 2 protein-coding 245.667-36 chr2 166343570 166343751 + 1.66667 NA intron (NM_001365536, intron 1 of 26) AluYb8|SINE|Alu 32284 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 299-18 chr16 51441763 51441984 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -290601 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 261-50 chr6 112176353 112176570 + 1.66667 NA intron (NM_001105206, intron 10 of 38) intron (NM_001105206, intron 10 of 38) -60135 NR_121193 101927640 Hs.510007 NR_121193 LOC101927640 - uncharacterized LOC101927640 ncRNA 241.334-12 chr6 73637934 73638127 + 1.66667 NA intron (NM_012434, intron 4 of 10) intron (NM_012434, intron 4 of 10) 15962 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 325.666-9 chr2 32929662 32930082 + 1.66667 NA TTS (NR_027098) TTS (NR_027098) 2745 NR_027097 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 304-59 chr7 99651495 99651714 + 1.66667 NA intron (NR_033807, intron 11 of 12) L2b|LINE|L2 28392 NM_001291830 1577 Hs.571258 NM_000777 ENSG00000106258 CYP3A5 CP35|CYPIIIA5|P450PCN3|PCN3 cytochrome P450 family 3 subfamily A member 5 protein-coding 225-38 chr2 154649283 154649471 + 1.66667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -49204 NM_001260508 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 206-125 chr4 57009846 57010001 + 1.66667 NA intron (NM_001303269, intron 11 of 25) MER117|DNA|hAT-Charlie 31027 NM_000938 5431 Hs.602757 NM_000938 ENSG00000047315 POLR2B POL2RB|RPB2|hRPB140 RNA polymerase II subunit B protein-coding 251.666-20 chr3 170945532 170945779 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -37018 NM_020390 56648 Hs.164144 NM_020390 ENSG00000163577 EIF5A2 EIF-5A2|eIF5AII eukaryotic translation initiation factor 5A2 protein-coding 242-71 chr7 104988665 104988936 + 1.66667 NA non-coding (NR_039981, exon 1 of 1) non-coding (NR_039981, exon 1 of 1) 2365 NR_039981 100216546 Hs.369356 NR_039981 LINC01004 - long intergenic non-protein coding RNA 1004 ncRNA 396-10 chr3 63006783 63007109 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95742 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 244.667-50 chr18 38256674 38256846 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 599625 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 365.334-7 chr4 31022128 31022380 + 1.66667 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -148890 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 215.333-186 chr7 82037678 82037895 + 1.66667 NA intron (NM_000722, intron 11 of 38) intron (NM_000722, intron 11 of 38) 28609 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 266.667-61 chr5 81568549 81568853 + 1.66667 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) intron (NM_012446, intron 4 of 16) -174567 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 190-64 chr2 96477537 96477723 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 27727 NM_001285486 93082 Hs.149219 NM_001080535 ENSG00000163121 NEURL3 LINCR|RNF132 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 193-23 chr14 70625897 70626155 + 1.66667 NA intron (NR_110071, intron 2 of 2) L1M4|LINE|L1 15272 NR_110071 101928075 Hs.737532 NR_110071 ENSG00000245466 LOC101928075 - uncharacterized LOC101928075 ncRNA 263.667-58 chr3 43196327 43196500 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -90099 NM_001100594 54861 Hs.476052 NM_017719 ENSG00000163788 SNRK HSNFRK SNF related kinase protein-coding 484.333 chr1 93458921 93459351 + 1.66667 NA intron (NM_001024948, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu 11005 NM_001024948 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 225.334-5 chr5 150826269 150826426 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -20174 NM_001346557 345611 Hs.519680 NM_001145805 ENSG00000237693 IRGM IFI1|IRGM1|LRG-47|LRG47 immunity related GTPase M protein-coding 280.666-15 chr2 147863997 147864189 + 1.66667 NA intron (NM_001278579, intron 2 of 11) intron (NM_001278579, intron 2 of 11) 19064 NM_001616 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 281-31 chr4 56540615 56540821 + 1.66667 NA intron (NM_001256475, intron 1 of 8) intron (NM_001256475, intron 1 of 8) 10112 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 502.001 chr20 56616280 56616716 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12808 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 296.667-45 chr5 88734271 88734552 + 1.66667 NA intron (NM_001131005, intron 7 of 10) intron (NM_001131005, intron 7 of 10) -43370 NR_152232 645323 Hs.12827 NR_015436 ENSG00000245526 LINC00461 ECONEXIN|EyeLinc1|VISC long intergenic non-protein coding RNA 461 ncRNA 231.666-31 chr8 62539190 62539554 + 1.66667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 290518 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 169.667-47 chr12 128921745 128921893 + 1.66667 NA intron (NM_001366886, intron 6 of 11) intron (NM_001366886, intron 6 of 11) 68341 NM_001366886 144423 Hs.655668 NM_144669 ENSG00000151948 GLT1D1 - glycosyltransferase 1 domain containing 1 protein-coding 287-23 chr4 79112600 79112855 + 1.66667 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) intron (NR_038342, intron 3 of 5) 140979 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 242.334-9 chr2 107772093 107772245 + 1.66667 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) intron (NR_126370, intron 2 of 4) 18057 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 315.667-7 chr14 49647487 49647815 + 1.66667 NA intron (NM_001348385, intron 17 of 18) AluJb|SINE|Alu -12421 NM_018139 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 219.334-2 chr11 106480860 106481002 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 229524 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 309-10 chr10 93101804 93102149 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 28083 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 342-33 chr6 15567495 15567838 + 1.66667 NA intron (NR_036448, intron 8 of 9) MER4D|LTR|ERV1 95362 NR_036448 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 378.667-9 chr16 26406053 26406322 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 380950 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 280.667-8 chr1 174739237 174739449 + 1.66667 NA intron (NM_001366451, intron 2 of 12) intron (NM_001366451, intron 2 of 12) 38348 NM_001366453 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 306-43 chr5 145310550 145310859 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 524638 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 239.333-70 chr3 105679110 105679278 + 1.66667 NA intron (NR_135809, intron 16 of 18) intron (NR_135809, intron 16 of 18) 188397 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 219.666-9 chr12 23668318 23668476 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 9 of 17) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -83811 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 332.667-21 chr5 115467416 115467741 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 77197 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 308.667-23 chr20 39667520 39667714 + 1.66667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -336844 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 262.334-11 chr4 76744635 76744808 + 1.66667 NA intron (NM_020859, intron 5 of 10) intron (NM_020859, intron 5 of 10) 153423 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 387.334-9 chr8 136269080 136269494 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -261511 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 315.333-22 chr2 174163800 174164113 + 1.66667 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 84576 NM_001011708 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 452.667-2 chr14 20102441 20102804 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14846 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 226.334 chr10 6698753 6698967 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -38522 NR_138480 108570035 Hs.568834 NR_138480 LINP1 - lncRNA in non-homologous end joining pathway 1 ncRNA 356-17 chr15 69434118 69434428 + 1.66667 NA intron (NM_138555, intron 10 of 22) intron (NM_138555, intron 10 of 22) -18545 NM_001003 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 264.334-11 chr2 175806252 175806491 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 195896 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 191.333-71 chr15 40469230 40469445 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1624 NM_130468 113189 Hs.442449 NM_130468 ENSG00000169105 CHST14 ATCS|D4ST1|EDSMC1|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 14 protein-coding 246-102 chr8 35200264 35200547 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -35070 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 324-14 chr2 124635930 124636220 + 1.66667 NA intron (NM_130773, intron 12 of 23) intron (NM_130773, intron 12 of 23) 610788 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 247-74 chr8 80049163 80049410 + 1.66667 NA intron (NM_001287142, intron 4 of 6) L2c|LINE|L2 -19027 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 244-52 chr2 65598677 65598834 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -166156 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 415-3 chr1 151941895 151942345 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32609 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 343.333-38 chr9 37293263 37293768 + 1.66667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) -129181 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 260.667-41 chr2 10529196 10529452 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 79596 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 207.667-3 chr1 86589722 86589938 + 1.66667 NA intron (NR_135837, intron 4 of 4) intron (NR_135837, intron 4 of 4) 42752 NM_012128 22802 Hs.567422 NM_012128 ENSG00000016602 CLCA4 CaCC|CaCC2 chloride channel accessory 4 protein-coding 271.666-10 chr5 29029661 29029993 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35417 NR_109948 101929645 Hs.531878 NR_109948 LOC101929645 - uncharacterized LOC101929645 ncRNA 358.667-25 chr6 55472352 55472955 + 1.66667 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) L1MC3|LINE|L1 106561 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 304.334-2 chr13 50716238 50716594 + 1.66667 NA intron (NM_198989, intron 1 of 1) intron (NM_198989, intron 1 of 1) -91439 NR_046551 100874074 Hs.734030 NR_046551 ENSG00000176124 DLEU7-AS1 - DLEU7 antisense RNA 1 ncRNA 352.333-10 chr15 43552320 43552784 + 1.66667 NA intron (NM_001130858, intron 29 of 30) AluJb|SINE|Alu 32340 NM_014659 9677 Hs.156814 NM_014659 ENSG00000168781 PPIP5K1 HISPPD2A|IP6K|IPS1|VIP1|hsVIP1 diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 1 protein-coding 304-47 chr4 125032190 125032543 + 1.66667 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL -284046 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 223-26 chr17 65035844 65036032 + 1.66667 NA intron (NM_006572, intron 2 of 3) intron (NM_006572, intron 2 of 3) 19836 NM_001282425 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 340.334-3 chr2 12510414 12510688 + 1.66667 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) -206321 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 379.333-8 chr4 35415801 35416048 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 828015 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 342.666-22 chr8 26403396 26403662 + 1.66667 NA intron (NM_004331, intron 3 of 5) AluJr|SINE|Alu 13116 NM_001330491 665 Hs.131226 NM_004331 ENSG00000104765 BNIP3L BNIP3a|NIX BCL2 interacting protein 3 like protein-coding 196.334-9 chr8 140592257 140592443 + 1.66667 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 43283 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 249-40 chr2 160436837 160437109 + 1.66667 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) L3|LINE|CR1 -29091 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 287.667-44 chr9 107658376 107658586 + 1.66667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -168712 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 307.334-8 chr3 85802867 85803079 + 1.66667 NA intron (NM_001256502, intron 3 of 10) intron (NM_001256502, intron 3 of 10) 25077 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 179.333-185 chr8 75967537 75967756 + 1.66667 NA Intergenic (AATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 427678 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 404.667-3 chr18 22598487 22598762 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -180709 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 271-47 chr8 86874359 86874608 + 1.66667 NA intron (NM_173538, intron 1 of 10) L1MC4|LINE|L1 8068 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 259-10 chr11 79448465 79448704 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -7554 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 523.333-2 chr1 229764467 229765005 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 121082 NR_146476 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 531.667 chr5 12971356 12972032 + 1.66667 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) ERVL-E-int|LTR|ERVL 61192 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 301-10 chr12 490765 491157 + 1.66667 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) L1MCa|LINE|L1 31022 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 349.001-2 chr5 23827326 23827607 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -123882 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 250-46 chr2 221896898 221897084 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -322789 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 298.334-2 chr12 88809088 88809295 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 210501 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 600-3 chr2 72195773 72196267 + 1.66667 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -48158 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 269.334-13 chr5 144924284 144924534 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 719018 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 379-8 chr3 78995209 78995728 + 1.66667 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) L2|LINE|L2 23991 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 258.334-4 chr12 41830191 41830413 + 1.66667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 66113 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 262.667-67 chr6 49669840 49670018 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -33055 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 371-23 chr9 27926235 27926557 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -352530 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 269.333-74 chr5 160964226 160964536 + 1.66667 NA Intergenic (AAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -25755 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 266.666-3 chr1 199779871 199780132 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -247709 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 441.667-3 chr5 82086647 82087013 + 1.66667 NA intron (NM_031482, intron 3 of 7) intron (NM_031482, intron 3 of 7) 114807 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 249.334-2 chr1 222597611 222597800 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 7746 NR_110614 100506161 Hs.553851 NR_110613 ENSG00000225265 TAF1A-AS1 - TAF1A antisense RNA 1 ncRNA 335-6 chr13 30606173 30606485 + 1.66667 NA intron (NM_001370340, intron 1 of 4) intron (NM_001370340, intron 1 of 4) 11258 NM_001370340 3146 Hs.434102 NM_002128 ENSG00000189403 HMGB1 HMG-1|HMG1|HMG3|SBP-1 high mobility group box 1 protein-coding 334.334-7 chr5 54626957 54627224 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 76234 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 339.667-21 chr5 145165150 145165511 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 670012 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 434.334-4 chr4 160225503 160225873 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -447904 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 359-11 chr4 12472907 12473319 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 249662 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 420-11 chr5 16942889 16943468 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6890 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 221.666-22 chr16 87061356 87061582 + 1.66667 NA intron (NR_126008, intron 2 of 2) intron (NR_126008, intron 2 of 2) 3685 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 260.667-2 chr1 61240217 61240373 + 1.66667 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 13223 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 410.999 chr12 14383035 14383345 + 1.66667 NA intron (NM_001286515, intron 1 of 12) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -2091 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 301-19 chr19 31958605 31958815 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -67152 NR_110675 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 348.667-24 chr7 50222631 50222948 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -81275 NM_001291839 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 358.333-28 chr8 77162827 77163458 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -162098 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 288-55 chr8 78961037 78961352 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 123665 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 216.667-22 chr11 81765309 81765480 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 125442 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 318.334 chr1 59150461 59150673 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3760 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 280.667-25 chr15 99939956 99940201 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 133055 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 287.334-11 chr3 190130789 190130961 + 1.66667 NA intron (NR_126419, intron 2 of 3) intron (NR_126419, intron 2 of 3) -8438 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 646.665 chr21 42338808 42339430 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 11875 NM_005423 7032 Hs.2979 NM_005423 ENSG00000160181 TFF2 SML1|SP trefoil factor 2 protein-coding 345.667-17 chr5 81523300 81523542 + 1.66667 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger -129287 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 245.667-10 chr12 20063007 20063202 + 1.66667 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) L1MB7|LINE|L1 48419 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 295-42 chr6 51278235 51278690 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -343408 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 277-29 chr2 187429675 187429892 + 1.66667 NA intron (NM_005795, intron 1 of 14) intron (NM_005795, intron 1 of 14) 18469 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 274.667-33 chr20 52737937 52738164 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 117212 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 255-36 chr17 30234501 30234766 + 1.66667 NA intron (NM_001045, intron 1 of 14) intron (NM_001045, intron 1 of 14) 1064 NM_001045 6532 Hs.29792 NM_001045 ENSG00000108576 SLC6A4 5-HTT|5-HTTLPR|5HTT|HTT|OCD1|SERT|SERT1|hSERT solute carrier family 6 member 4 protein-coding 162-120 chr8 89244752 89244901 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 512885 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 282-20 chr17 49963734 49963975 + 1.66667 NA Intergenic CpG -5336 NM_138281 1748 Hs.591167 NM_001934 ENSG00000108813 DLX4 BP1|DLX7|DLX8|DLX9|OFC15 distal-less homeobox 4 protein-coding 245.334-9 chr18 55340645 55340825 + 1.66667 NA intron (NM_001243228, intron 8 of 19) intron (NM_001243228, intron 8 of 19) -18894 NM_001348214 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 347-22 chr6 72308779 72309146 + 1.66667 NA intron (NM_001350433, intron 19 of 25) intron (NM_001350433, intron 19 of 25) -57784 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 271.667-54 chr5 166624192 166624376 + 1.66667 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 302086 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 355.667-6 chr22 25821815 25822071 + 1.66667 NA intron (NM_001318245, intron 12 of 43) intron (NM_001318245, intron 12 of 43) 79755 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 419.334-2 chr10 115281704 115282045 + 1.66667 NA intron (NM_207303, intron 14 of 28) intron (NM_207303, intron 14 of 28) 188509 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 267.333-78 chr6 54450813 54451092 + 1.66667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 142511 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 246-111 chrX 105056479 105056637 + 1.66667 NA intron (NM_017416, intron 2 of 10) intron (NM_017416, intron 2 of 10) 164135 NM_001291277 56157 Hs.567543 NM_031274 ENSG00000268629 TEX13A - testis expressed 13A protein-coding 243-3 chr1 83131963 83132124 + 1.66667 NA intron (NR_147074, intron 9 of 10) intron (NR_147074, intron 9 of 10) -145835 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 312.667-12 chr12 11987493 11987714 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -62258 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 683.667 chr5 41620679 41621495 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -110486 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 260.667-26 chr15 71544208 71544426 + 1.66667 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -2919 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 182.334-5 chr5 30379030 30379225 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 498567 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 241.334-14 chr9 131856658 131856830 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -116800 NM_001304275 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 250.667-15 chr13 104446132 104446313 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1019645 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 326.667-19 chr18 1202239 1202586 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 157217 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 263.667-80 chr8 72555478 72555775 + 1.66667 NA intron (NM_004770, intron 1 of 2) intron (NM_004770, intron 1 of 2) 18401 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 254.334-8 chr13 46896321 46896501 + 1.66667 NA intron (NM_000621, intron 1 of 3) intron (NM_000621, intron 1 of 3) 665 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 540.334 chr6 11441557 11442143 + 1.66667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -59502 NR_073131 4739 Hs.37982 NM_006403 ENSG00000111859 NEDD9 CAS-L|CAS2|CASL|CASS2|HEF1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 protein-coding 405-15 chr5 50731984 50732359 + 1.66667 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) intron (NM_024615, intron 2 of 25) 64757 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 265.333-40 chr2 120536284 120536591 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70088 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 320.334-8 chr6 157908675 157909064 + 1.66667 NA intron (NM_016224, intron 7 of 17) intron (NM_016224, intron 7 of 17) -72994 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 271.667-3 chr1 111977834 111978129 + 1.66667 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 11174 NM_004980 3752 Hs.666367 NM_004980 ENSG00000171385 KCND3 BRGDA9|KCND3L|KCND3S|KSHIVB|KV4.3|SCA19|SCA22 potassium voltage-gated channel subfamily D member 3 protein-coding 234.333-24 chr14 44410235 44410592 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 96870 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 239.667-69 chr7 88956543 88956698 + 1.66667 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -160883 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 263-44 chr3 192120170 192120487 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -118302 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 176.667-135 chr7 51429408 51429519 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -36207 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 416.667-8 chr20 45591973 45592298 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -12851 NM_130896 90199 Hs.116128 NM_130896 ENSG00000158901 WFDC8 C20orf170|HEL-S-292|WAP8|dJ461P17.1 WAP four-disulfide core domain 8 protein-coding 235.666-10 chr3 134080473 134080709 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -22943 NR_135574 100507210 Hs.669052 NR_135574 ENSG00000243832 LINC02000 - long intergenic non-protein coding RNA 2000 ncRNA 234-42 chr2 153289943 153290152 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 188715 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 405.667-7 chr8 122301550 122301980 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 266879 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 184.334-2 chr11 107079193 107079343 + 1.66667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -60792 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 234.667-59 chr2 187098597 187098782 + 1.66667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -249519 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 402-12 chr7 1217204 1217517 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15512 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 322-33 chr5 25326670 25327027 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 135895 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 281.334-10 chr3 195454871 195455043 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -11937 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 312-3 chr1 193685759 193686054 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 381161 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 278.667-11 chr12 15543033 15543334 + 1.66667 NA intron (NM_030667, intron 12 of 26) LTR84a|LTR|ERVL -3428 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 251-21 chr14 62022103 62022308 + 1.66667 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) L1MEg|LINE|L1 94510 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 293.667-4 chr1 197238771 197239020 + 1.66667 NA intron (NM_001257965, intron 1 of 14) intron (NM_001257965, intron 1 of 14) -29309 NM_001257966 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 271.333-60 chr5 162123514 162123827 + 1.66667 NA intron (NM_198904, intron 6 of 9) MIRb|SINE|MIR 56028 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 538-2 chr1 224653299 224653846 + 1.66667 NA intron (NM_152495, intron 1 of 5) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 37255 NM_152495 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 450.999 chr2 68287528 68287933 + 1.66667 NA intron (NM_001111101, intron 2 of 2) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 32321 NM_001111101 25927 Hs.212885 NM_015463 ENSG00000119865 CNRIP1 C2orf32|CRIP1 cannabinoid receptor interacting protein 1 protein-coding 419.667-3 chr17 75025565 75026183 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -6693 NR_110835 23510 Hs.514468 NM_015353 ENSG00000180901 KCTD2 - potassium channel tetramerization domain containing 2 protein-coding 257.667-65 chr5 44065648 44065829 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -322994 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 370-29 chr8 106961431 106961779 + 1.66667 NA Intergenic LTR29|LTR|ERV1 -191361 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 149.334-3 chr2 66445402 66445547 + 1.66667 NA intron (NM_002398, intron 6 of 12) CpG -5144 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 352.333-2 chr10 17820530 17820968 + 1.66667 NA intron (NM_002438, intron 1 of 29) intron (NM_002438, intron 1 of 29) 11401 NM_002438 4360 Hs.75182 NM_002438 ENSG00000260314 MRC1 CD206|CLEC13D|CLEC13DL|MMR|MRC1L1|bA541I19.1|hMR mannose receptor C-type 1 protein-coding 315.333-16 chr18 8021852 8022379 + 1.66667 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 344919 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 264.667-72 chr6 61823192 61823490 + 1.66667 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 249211 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 522.334-2 chr18 12921574 12922349 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -26023 NM_031216 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 245.667-71 chr8 79175890 79176041 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -156223 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 198.333-185 chr7 49008634 49008786 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 84163 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 224.333-88 chr4 65031069 65031389 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26729 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 256.666-29 chr3 74988340 74988670 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -225971 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 261.334-13 chr3 176905786 176906042 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -88913 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 250.667-56 chr4 55081313 55081472 + 1.66667 NA intron (NM_002253, intron 29 of 29) intron (NM_002253, intron 29 of 29) 44203 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 271-38 chr5 148912927 148913159 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 86450 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 416.334-3 chr3 60448526 60448842 + 1.66667 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) 169186 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 324.334-4 chr11 20283851 20284118 + 1.66667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -79701 NM_006410 10553 Hs.90753 NM_006410 ENSG00000109854 HTATIP2 CC3|SDR44U1|TIP30 HIV-1 Tat interactive protein 2 protein-coding 336.667-6 chr10 32899135 32899443 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 2183 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 203.333-229 chr6 21531826 21532065 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20053 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 202.667-142 chr8 68778809 68778985 + 1.66667 NA intron (NR_146187, intron 11 of 13) intron (NR_146187, intron 11 of 13) 325293 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 264-17 chr14 43509946 43510294 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 997163 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 297.333-8 chr10 132201468 132201721 + 1.66667 NA intron (NM_006426, intron 10 of 13) intron (NM_006426, intron 10 of 13) 14646 NM_006426 10570 Hs.100058 NM_006426 ENSG00000151640 DPYSL4 CRMP3|DRP-4|ULIP4 dihydropyrimidinase like 4 protein-coding 355.666 chr11 55643160 55643450 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 4947 NM_001004124 81300 NM_001004124 ENSG00000181927 OR4P4 OR4P3P olfactory receptor family 4 subfamily P member 4 protein-coding 554.333-2 chr8 136168443 136169142 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -362006 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 320-46 chr7 130429458 130429862 + 1.66667 NA intron (NR_046443, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 11356 NM_001257158 95681 Hs.368315 NM_018718 ENSG00000106477 CEP41 JBTS15|TSGA14 centrosomal protein 41 protein-coding 255-9 chr1 206872676 206872850 + 1.66667 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 6954 NM_018724 50604 Hs.272373 NM_018724 ENSG00000162891 IL20 IL-20|IL10D|ZCYTO10 interleukin 20 protein-coding 243.667-10 chr10 120064803 120064982 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 106379 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 291.666 chr10 51545577 51546049 + 1.66667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 153782 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 320.667-2 chr1 78904081 78904381 + 1.66667 NA intron (NM_022159, intron 12 of 14) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 102499 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 189-13 chr11 26646046 26646188 + 1.66667 NA intron (NM_031418, intron 23 of 26) intron (NM_031418, intron 23 of 26) -73854 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 262.333-75 chr8 28536954 28537196 + 1.66667 NA intron (NM_017412, intron 5 of 7) intron (NM_017412, intron 5 of 7) -31893 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 275-21 chr19 31376303 31376667 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -27049 NM_020856 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 250.334-8 chr15 65462840 65463071 + 1.66667 NA intron (NR_135485, intron 15 of 20) intron (NR_135485, intron 15 of 20) -40008 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 379-14 chr8 123068523 123068853 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4019 NM_001145088 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 240.333-73 chr5 60416698 60416900 + 1.66667 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -44136 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 282.334-8 chr2 83006870 83007072 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 150168 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 212.333-52 chr16 51051420 51051633 + 1.66667 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) L1ME3A|LINE|L1 33768 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 231.666-28 chr7 81699537 81699721 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_000601, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_000601, exon 18 of 18) -8223 NR_126025 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 268-33 chr20 56889383 56889547 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 260159 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 385.333-8 chr11 81348449 81348915 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 542154 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 253.333-17 chr12 90731250 90731466 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -186665 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 291-33 chr4 100684498 100684818 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -9545 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 247.666-9 chr13 112579861 112580126 + 1.66667 NA intron (NM_006322, intron 1 of 21) L1ME1|LINE|L1 8160 NM_001286278 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 239.334-3 chr12 69709005 69709195 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -9684 NM_001282614 144453 Hs.280782 NM_032735 ENSG00000127325 BEST3 VMD2L3 bestrophin 3 protein-coding 671 chr2 122792592 122793327 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 280522 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 259.667-74 chr7 41495475 41495683 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -198340 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 276-61 chr8 68717711 68717961 + 1.66667 NA intron (NR_146187, intron 9 of 13) intron (NR_146187, intron 9 of 13) -386345 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 234.334 chr1 212886247 212886432 + 1.66667 NA intron (NM_014053, intron 5 of 9) AluSx|SINE|Alu 28064 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 303.333-45 chr2 211385186 211385508 + 1.66667 NA intron (NM_001042599, intron 26 of 26) MIRc|SINE|MIR 767776 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 245-52 chr5 19266797 19267047 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 619350 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 487.334 chr15 58739619 58740056 + 1.66667 NA intron (NM_001320570, intron 1 of 14) intron (NM_001320570, intron 1 of 14) 9870 NM_001110 102 Hs.172028 NM_001110 ENSG00000137845 ADAM10 AD10|AD18|CD156c|CDw156|HsT18717|MADM|RAK|kuz ADAM metallopeptidase domain 10 protein-coding 236.334 chr10 30971431 30971604 + 1.66667 NA intron (NR_026560, intron 1 of 6) L1ME3G|LINE|L1 28000 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 251.667-71 chr4 92830560 92830743 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 526252 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 161-8 chr10 111111845 111112007 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2365 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 258.334-12 chr19 28558002 28558182 + 1.66667 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1ME4b|LINE|L1 -48596 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 248.666-10 chr11 66147502 66147798 + 1.66667 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) L1MEc|LINE|L1 77378 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 253-31 chr17 72000906 72001110 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 24971 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 519-2 chr2 161131486 161132149 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -5138 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 504.667-3 chr3 49567035 49567550 + 1.66667 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) L1MC5a|LINE|L1 12815 NM_003458 8927 Hs.194684 NM_003458 ENSG00000164061 BSN ZNF231 bassoon presynaptic cytomatrix protein protein-coding 239-30 chr2 77443935 77444130 + 1.66667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 78344 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 297-2 chr1 45943362 45943649 + 1.66667 NA intron (NM_001324321, intron 3 of 28) MER41D|LTR|ERV1 79157 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 284.333-46 chr9 96580436 96580665 + 1.66667 NA intron (NR_147239, intron 1 of 14) L1ME3G|LINE|L1 -13574 NM_001351570 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 255-41 chr2 36854535 36854778 + 1.66667 NA intron (NM_003162, intron 15 of 17) intron (NM_003162, intron 15 of 17) 111880 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 379.667-3 chr11 113614009 113614367 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 92120 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 248.667-42 chr15 65305158 65305317 + 1.66667 NA TTS (NR_002757) TTS (NR_002757) 560 NR_002757 26832 NR_002757 ENSG00000200156 RNU5B-1 RNU5B|RNU5B-1P|U5B1 RNA, U5B small nuclear 1 snRNA 181.667-47 chr16 77485437 77485660 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50514 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 274.667-15 chr12 130266707 130266988 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -71040 NM_001190971 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 331-23 chr20 31320774 31321087 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12345 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 180-5 chr1 93207218 93207504 + 1.66667 NA exon (NM_206886, exon 9 of 28) exon (NM_206886, exon 9 of 28) 26645 NM_001306076 343099 Hs.482873 NM_206886 ENSG00000122483 CCDC18 NY-SAR-41 coiled-coil domain containing 18 protein-coding 365-16 chr2 199505873 199506321 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34831 NM_015265 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 246-97 chr6 164547306 164547523 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 274649 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 190.333-67 chr2 32962177 32962377 + 1.66667 NA intron (NM_206943, intron 2 of 33) intron (NM_206943, intron 2 of 33) 15324 NM_206943 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 249-37 chr18 3860146 3860325 + 1.66667 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) intron (NM_001242761, intron 4 of 11) 14067 NM_001242764 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 277-26 chr2 57208570 57209040 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -698846 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 261.667-71 chr8 106527862 106528035 + 1.66667 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) 80024 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 243-58 chr6 121851586 121851791 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 416042 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 290-37 chr4 45384564 45384859 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -658077 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 421.333-4 chr20 54579137 54579845 + 1.66667 NA intron (NM_018431, intron 2 of 7) L1MB1|LINE|L1 103898 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 165-88 chr6 113548653 113548844 + 1.66667 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 101327 NR_125844 101927686 Hs.402044 NR_125844 ENSG00000230943 LINC02541 - long intergenic non-protein coding RNA 2541 ncRNA 144-147 chr7 92954794 92954910 + 1.66667 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -118225 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 366-27 chr9 109336869 109337321 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16131 NM_019114 54566 Hs.591901 NM_018424 ENSG00000095203 EPB41L4B CG1|EHM2 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4B protein-coding 264.334-4 chr10 93126197 93126396 + 1.66667 NA Intergenic Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 52403 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 361.334 chr2 52708827 52709109 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6353 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 297-33 chr20 54523014 54523293 + 1.66667 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) intron (NM_018431, intron 1 of 7) 47560 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 269.334-7 chr2 32331730 32331927 + 1.66667 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -25200 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 242.334-14 chr4 138616308 138616533 + 1.66667 NA Intergenic Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 306709 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 214-67 chr2 58641783 58641934 + 1.66667 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 121105 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 185.333-119 chr3 37612394 37612613 + 1.66667 NA intron (NM_002207, intron 15 of 27) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 160362 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 240.333-30 chr12 97133133 97133377 + 1.66667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 225789 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 378.667-20 chr6 40141528 40142011 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -207307 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 276-41 chr21 26303556 26303754 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -89980 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 272.334-9 chr10 111155489 111155673 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 41290 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 291-32 chr4 74552016 74552223 + 1.66667 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 106983 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 276.667-48 chr3 114875075 114875532 + 1.66667 NA intron (NR_126422, intron 2 of 2) intron (NR_126422, intron 2 of 2) 2270 NR_126422 104413890 Hs.612732 NR_126422 ENSG00000239946 ZBTB20-AS3 - ZBTB20 antisense RNA 3 ncRNA 291-3 chr1 205392953 205393134 + 1.66667 NA intron (NR_037583, intron 2 of 3) FLAM_C|SINE|Alu 19791 NR_038425 284576 Hs.585440 NR_038425 ENSG00000226235 LEMD1-AS1 - LEMD1 antisense RNA 1 ncRNA 296.667-17 chr14 59474392 59474635 + 1.66667 NA non-coding (NR_138571, exon 4 of 5) non-coding (NR_138571, exon 4 of 5) 9062 NM_001331159 112849 Hs.729061 NM_144581 ENSG00000126790 L3HYPDH C14orf149 trans-L-3-hydroxyproline dehydratase protein-coding 497.001-3 chr8 59763182 59763537 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 518041 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 290-18 chr2 16157821 16158098 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 107532 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 239.666-3 chr10 106255394 106255620 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 115342 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 340.999-2 chr1 166635577 166636093 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 31919 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 217-89 chr8 119863129 119863277 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7309 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 314.667-31 chr5 24712121 24712430 + 1.66667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -67297 NM_001362460 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 397.334-3 chr16 12789043 12789353 + 1.66667 NA intron (NM_018340, intron 1 of 3) MER102a|DNA|hAT-Charlie 14689 NM_001099455 55313 Hs.460002 NM_018340 ENSG00000103381 CPPED1 CSTP1 calcineurin like phosphoesterase domain containing 1 protein-coding 253.334-8 chr17 70633866 70634084 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 464440 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 144-82 chr20 13058992 13059191 + 1.66667 NA intron (NM_001349945, intron 3 of 12) MER87B|LTR|ERV1 50119 NM_001349945 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 245.334-15 chr4 69750182 69750346 + 1.66667 NA intron (NM_014465, intron 3 of 7) intron (NM_014465, intron 3 of 7) 10356 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 317.667-25 chr2 172586142 172586390 + 1.66667 NA intron (NM_002610, intron 8 of 10) intron (NM_002610, intron 8 of 10) 30176 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 236.334-9 chr8 10084714 10084882 + 1.66667 NA intron (NM_001135670, intron 1 of 4) intron (NM_001135670, intron 1 of 4) -10853 NM_001199729 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 264.334-10 chr2 121604811 121605027 + 1.66667 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 44543 NM_015282 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 280-36 chr3 115080348 115080578 + 1.66667 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) -9049 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 188.333-11 chr1 179495536 179495768 + 1.66667 NA intron (NM_144696, intron 20 of 25) L1ME1|LINE|L1 80296 NM_001297575 7827 Hs.412710 NM_014625 ENSG00000116218 NPHS2 PDCN|SRN1 NPHS2 stomatin family member, podocin protein-coding 241.334-5 chr2 24639556 24639724 + 1.66667 NA intron (NM_001362950, intron 3 of 23) AluSx3|SINE|Alu 55163 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 262.334-10 chr4 71749322 71749508 + 1.66667 NA intron (NM_000583, intron 11 of 12) intron (NM_000583, intron 11 of 12) 34664 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 266-55 chr3 67918995 67919273 + 1.66667 NA intron (NR_109992, intron 6 of 6) intron (NR_109992, intron 6 of 6) -72458 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 173.334-3 chr6 64829868 64830004 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) intron (NM_001292009, intron 19 of 43) -471482 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 191.667-84 chr3 99918510 99918742 + 1.66667 NA intron (NM_001042459, intron 4 of 4) intron (NM_001042459, intron 4 of 4) -42423 NM_001282794 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 262.667 chr1 21207462 21207695 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -30681 NM_001198801 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 364.667-16 chr8 121187034 121187387 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -375164 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 344-15 chr16 6515983 6516434 + 1.66667 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) AluSx|SINE|Alu -257601 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 484.666-2 chr2 125562453 125562800 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 555359 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 407.999-2 chr2 191041088 191041601 + 1.66667 NA intron (NM_003151, intron 14 of 23) intron (NM_003151, intron 14 of 23) 19818 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 537.333-4 chr2 72834500 72835052 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -8743 NM_001321733 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 463.667 chr17 65421068 65421368 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -36323 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 312.334 chr1 43597874 43598157 + 1.66667 NA exon (NM_130440, exon 12 of 33) exon (NM_130440, exon 12 of 33) -52134 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 391.334-5 chr9 35667240 35667630 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -2240 NM_032818 84904 Hs.534579 NM_032818 ENSG00000137135 ARHGEF39 C9orf100 Rho guanine nucleotide exchange factor 39 protein-coding 269-37 chr4 79958353 79958644 + 1.66667 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 114731 NM_058172 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 168.667-120 chr20 16901189 16901323 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 152903 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 378-8 chr14 46280985 46281447 + 1.66667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -190143 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 417.333-8 chr3 98156343 98156779 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 7175 NM_001005514 403273 Hs.554714 NM_001005514 ENSG00000236032 OR5H14 - olfactory receptor family 5 subfamily H member 14 protein-coding 262-12 chr12 12589088 12589246 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -22709 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 205.334 chr1 23312136 23312279 + 1.66667 NA intron (NM_001297622, intron 7 of 8).2 intron (NM_001297622, intron 7 of 8).2 -26689 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 461.667-2 chr4 152262820 152263296 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -74597 NR_104273 102191832 Hs.712524 NR_104273 ENSG00000270751 FBXW7-AS1 DEAR|DEspR FBXW7 antisense RNA 1 ncRNA 266.333-46 chr5 80483541 80483821 + 1.66667 NA TTS (NR_146173) TTS (NR_146173) -4419 NM_205548 167555 Hs.338182 NM_205548 ENSG00000152380 FAM151B UNQ9217 family with sequence similarity 151 member B protein-coding 249-61 chr5 76515568 76515773 + 1.66667 NA intron (NM_006633, intron 2 of 35) intron (NM_006633, intron 2 of 35) -31739 NM_001285460 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 238.333-63 chr3 189059623 189059884 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -112114 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 439.001 chr14 71787603 71788042 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -144349 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 253.667-57 chr5 79576688 79576971 + 1.66667 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 -35588 NM_001114394 167153 Hs.418198 NM_173797 ENSG00000164329 TENT2 APD4|GLD2|PAPD4|TUT2 terminal nucleotidyltransferase 2 protein-coding 338.334-2 chr1 173312483 173312851 + 1.66667 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) LTR79|LTR|ERVL -105336 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 204.667-130 chr5 146925013 146925160 + 1.66667 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) L1M4a2|LINE|L1 -5580 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 225.666-24 chr6 55866704 55866918 + 1.66667 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) intron (NM_001329754, intron 1 of 5) 8779 NM_001329754 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 265.667-56 chr4 172986235 172986403 + 1.66667 NA intron (NM_001034845, intron 10 of 12) intron (NM_001034845, intron 10 of 12) -182492 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 312-53 chr7 106143281 106143689 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30909 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 195.334-2 chr2 183605698 183605899 + 1.66667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 481355 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 274.333-74 chr9 118137356 118137665 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 433107 NM_003266 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 206.667-58 chr2 17727560 17727706 + 1.66667 NA intron (NM_024624, intron 6 of 26) intron (NM_024624, intron 6 of 26) 26177 NM_001142286 79677 Hs.526728 NM_024624 ENSG00000163029 SMC6 SMC-6|SMC6L1|hSMC6 structural maintenance of chromosomes 6 protein-coding 201-20 chr10 96964706 96964913 + 1.66667 NA TTS (NM_032440) TTS (NM_032440) 131864 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 436-8 chr2 103177873 103178340 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -193677 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 428.333-2 chr14 48526913 48527327 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -732106 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 276.667-2 chr1 111030941 111031129 + 1.66667 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -67091 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 336-30 chr6 165671978 165672357 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9887 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 323.667-19 chr4 31925828 31926221 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -71355 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 260.667-49 chr2 103337650 103337835 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -353313 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 234-16 chr12 54198773 54198981 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9883 NM_014311 23583 Hs.632721 NM_014311 ENSG00000123415 SMUG1 FDG|HMUDG|UNG3 single-strand-selective monofunctional uracil-DNA glycosylase 1 protein-coding 384.334-4 chr16 62883944 62884226 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -847647 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 272-27 chr2 223213829 223214137 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 162053 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 251.334-33 chr8 84512822 84513002 + 1.66667 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) L1MA4A|LINE|L1 97428 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 225-58 chr7 3439757 3439925 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 138589 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 301-35 chr4 57307363 57307562 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -118410 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 259.333-36 chr15 95053686 95053936 + 1.66667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 198448 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 315.334-5 chr2 220124818 220125058 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -218373 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 386.334 chr1 174478850 174479292 + 1.66667 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) intron (NM_001366446, intron 13 of 25) 31107 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 335.333-28 chr2 231304367 231304956 + 1.66667 NA intron (NM_001352759, intron 19 of 19) AluSx|SINE|Alu -58047 NR_039937 100616317 NR_039937 ENSG00000263641 MIR4777 - microRNA 4777 ncRNA 244-29 chr14 21182946 21183148 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 22456 NR_038970 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 251-34 chr2 40394573 40394867 + 1.66667 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 35584 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 354.334-10 chrX 94217415 94217897 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 543450 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 337.667-8 chr13 79779268 79779607 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24949 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 340.333-7 chr17 29067451 29067966 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 7901 NM_004740 9220 Hs.462590 NM_004740 ENSG00000221995 TIAF1 MAJN|SPR210 TGFB1-induced anti-apoptotic factor 1 protein-coding 244.334-22 chr7 77441285 77441448 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25017 NR_146937 54103 Hs.186649 NM_017439 ENSG00000186088 GSAP PION gamma-secretase activating protein protein-coding 402.334-3 chr20 54041149 54041427 + 1.66667 NA intron (NM_001366297, intron 3 of 8) L1MB7|LINE|L1 17732 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 403.001-2 chr6 68823936 68824236 + 1.66667 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) L1MEd|LINE|L1 188804 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 240-38 chr17 70634345 70634751 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 465013 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 186.667-84 chr21 19896367 19896591 + 1.66667 NA intron (NR_146910, intron 2 of 2) intron (NR_146910, intron 2 of 2) 3276 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 262-55 chr3 113785943 113786227 + 1.66667 NA intron (NM_001690, intron 5 of 14) intron (NM_001690, intron 5 of 14) 39050 NM_001690 523 Hs.477155 NM_001690 ENSG00000114573 ATP6V1A ARCL2D|ATP6A1|ATP6V1A1|HO68|IECEE3|VA68|VPP2|Vma1 ATPase H+ transporting V1 subunit A protein-coding 277.667-24 chr2 113914787 113914959 + 1.66667 NA intron (NR_102318, intron 2 of 10) intron (NR_102318, intron 2 of 10) -23881 NR_110174 101060091 Hs.741753 NR_110174 ACTR3-AS1 - ACTR3 antisense RNA 1 ncRNA 259.667-13 chr11 57131200 57131356 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50675 NM_001005210 219527 Hs.199853 NM_001005210 ENSG00000183908 LRRC55 - leucine rich repeat containing 55 protein-coding 268.334-19 chr8 92176360 92176545 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -73067 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 232.666-51 chr8 114602435 114602638 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 1065477 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 258.334-10 chr17 68403392 68403570 + 1.66667 NA intron (NM_001352910, intron 11 of 12) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -10142 NM_001278433 5573 Hs.280342 NM_002734 ENSG00000108946 PRKAR1A ACRDYS1|ADOHR|CAR|CNC|CNC1|PKR1|PPNAD1|PRKAR1|TSE1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha protein-coding 287.666-8 chr20 9045250 9045493 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23683 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 241.667-19 chr12 101517319 101517589 + 1.66667 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL 42118 NM_152323 121599 Hs.577097 NM_152323 ENSG00000166211 SPIC SPI-C Spi-C transcription factor protein-coding 286.334-8 chr5 119144591 119144791 + 1.66667 NA intron (NM_001290321, intron 15 of 43) intron (NM_001290321, intron 15 of 43) -9946 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 253-3 chr1 85857834 85858006 + 1.66667 NA intron (NM_152890, intron 37 of 59) LTR81B|LTR|Gypsy -149487 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 348.667-23 chr7 42256396 42256681 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -19329 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 262.667-5 chr1 190818939 190819209 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 194184 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 280.334-6 chr2 29516721 29516961 + 1.66667 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) intron (NM_004304, intron 4 of 28) -41464 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 201-87 chr4 165776381 165776617 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -33428 NR_121677 101928131 Hs.406479 NR_121677 LOC101928131 - uncharacterized LOC101928131 ncRNA 194-158 chrX 99932958 99933115 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 477237 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 283.333-81 chr9 116750626 116750937 + 1.66667 NA intron (NM_014010, intron 12 of 21) intron (NM_014010, intron 12 of 21) 63476 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 191.333-73 chr15 53423149 53423322 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 117617 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 230.334-10 chr22 32744235 32744430 + 1.66667 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) -56484 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 210.333-50 chr15 90593889 90594230 + 1.66667 NA intron (NM_001042574, intron 3 of 14) intron (NM_001042574, intron 3 of 14) 64136 NM_022769 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 314.666-23 chr3 64657338 64657761 + 1.66667 NA intron (NM_182920, intron 4 of 39) AluJr|SINE|Alu -27321 NR_038264 100507098 Hs.660881 NR_038264 ENSG00000241684 ADAMTS9-AS2 - ADAMTS9 antisense RNA 2 ncRNA 362.001-4 chr2 38630242 38630577 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -27373 NM_001142650 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 240-7 chr1 179719979 179720182 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -7696 NM_001329714 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 356.001-3 chr4 119243548 119243841 + 1.66667 NA intron (NM_001371399, intron 3 of 16) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 30981 NM_001371396 157-60 chr2 55265643 55265799 + 1.66667 NA intron (NM_001321004, intron 2 of 14) intron (NM_001321004, intron 2 of 14) 3458 NM_001005369 4528 Hs.149894 NM_002453 ENSG00000085760 MTIF2 - mitochondrial translational initiation factor 2 protein-coding 251.333-46 chr17 71151433 71151709 + 1.66667 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) intron (NR_104152, intron 2 of 3) 50608 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 260-32 chr18 6820644 6820837 + 1.66667 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) L1MEg|LINE|L1 -13745 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 249.667-67 chr4 70142528 70142703 + 1.66667 NA intron (NR_033311, intron 6 of 7) intron (NR_033311, intron 6 of 7) 9011 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 267-15 chr11 114331036 114331343 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 35376 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 265-29 chr2 14770053 14770286 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 137452 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 270.334-3 chr1 116493778 116493962 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15044 NR_125972 101929023 Hs.668091 NR_125972 ENSG00000233154 LINC01762 - long intergenic non-protein coding RNA 1762 ncRNA 278.333-28 chr2 103388064 103388376 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -403791 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 301-57 chr8 55587760 55588104 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -66954 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 264.667-15 chr11 7520844 7521012 + 1.66667 NA intron (NM_003621, intron 1 of 23) intron (NM_003621, intron 1 of 23) 6929 NM_003621 8495 Hs.655714 NM_003621 ENSG00000166387 PPFIBP2 Cclp1 PPFIA binding protein 2 protein-coding 466.666 chr12 56047893 56048528 + 1.66667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 6292 NM_001029 6231 Hs.447562 NM_001029 ENSG00000197728 RPS26 DBA10|S26|eS26 ribosomal protein S26 protein-coding 234.667-27 chr13 46210976 46211252 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001282460) promoter-TSS (NM_001282460) -814 NM_001282460 220416 Hs.267765 NM_001024609 ENSG00000173988 LRRC63 - leucine rich repeat containing 63 protein-coding 370.001-3 chr4 91485427 91485781 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 791698 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 272.333-17 chr15 57065841 57066116 + 1.66667 NA intron (NM_207038, intron 4 of 19) intron (NM_207038, intron 4 of 19) 146533 NM_001322165 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 275.667-16 chr12 33625516 33625688 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -185783 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 245.333-108 chr7 32867106 32867348 + 1.66667 NA TTS (NM_015483) TTS (NM_015483) 24533 NM_015483 25948 Hs.372541 NM_015483 ENSG00000170852 KBTBD2 BKLHD1 kelch repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 405.667-8 chr8 135356172 135356439 + 1.66667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -101151 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 200.666-18 chr10 68775172 68775433 + 1.66667 NA intron (NR_104262, intron 18 of 23) intron (NR_104262, intron 18 of 23) 20130 NR_003076 692211 NR_003076 ENSG00000283551 SNORD98 HBII-419 small nucleolar RNA, C/D box 98 snoRNA 282.667-34 chr4 98338374 98338685 + 1.66667 NA intron (NM_021159, intron 2 of 14) intron (NM_021159, intron 2 of 14) 77145 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 381-14 chr5 140090101 140090491 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 17716 NR_102741 100505636 Hs.438871 NR_102739 ENSG00000245146 MALINC1 LINC01024|MA-linc1 mitosis associated long intergenic non-coding RNA 1 ncRNA 257.333-60 chr22 27939821 27940079 + 1.66667 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1MEd|LINE|L1 -19338 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 301.667-8 chr11 84063105 84063448 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 10 of 27) intron (NM_001142699, intron 10 of 27) 210004 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 299.001-3 chr21 20679740 20679944 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 123266 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 220-92 chr5 107693115 107693300 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -22270 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 316.333-16 chr2 63695631 63695948 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 106638 NM_001199112 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 293.333-70 chr9 103784282 103784671 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -215233 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 271.667-63 chr7 102821055 102821291 + 1.66667 NA intron (NR_105043, intron 20 of 20) intron (NR_105043, intron 20 of 20) 72174 NR_146982 222234 Hs.202543 NM_147194 ENSG00000222011 FAM185A - family with sequence similarity 185 member A protein-coding 262.334-7 chr3 4881132 4881356 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 25257 NR_125914 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 408.667-8 chr7 23410530 23411091 + 1.66667 NA intron (NM_006547, intron 3 of 14) intron (NM_006547, intron 3 of 14) 14364 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 274-43 chr4 110525241 110525588 + 1.66667 NA intron (NM_001977, intron 10 of 19) intron (NM_001977, intron 10 of 19) 49259 NM_001977 2028 Hs.435765 NM_001977 ENSG00000138792 ENPEP APA|CD249|gp160 glutamyl aminopeptidase protein-coding 265.334-7 chr12 6979476 6979645 + 1.66667 NA exon (NM_005768, exon 7 of 13) exon (NM_005768, exon 7 of 13) 8647 NR_135131 10436 Hs.558447 NM_006331 ENSG00000126749 EMG1 C2F|Grcc2f|NEP1 EMG1 N1-specific pseudouridine methyltransferase protein-coding 247-5 chr1 194740252 194740402 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1348388 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 301-25 chr21 23228607 23228936 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 149487 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 292.001 chr1 163056533 163056744 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11968 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 301.667-37 chr5 137722902 137723229 + 1.66667 NA intron (NM_017415, intron 1 of 14) L1M5|LINE|L1 -1755 NM_001257194 26249 Hs.655084 NM_017415 ENSG00000146021 KLHL3 PHA2D kelch like family member 3 protein-coding 199-95 chr6 84158247 84158458 + 1.66667 NA intron (NM_001286206, intron 21 of 26) MIR|SINE|MIR 69291 NM_014895 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 366-24 chr6 66627618 66628054 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 839957 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 253-7 chr1 151361258 151361559 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 11297 NM_001258289 8991 Hs.632460 NM_003944 ENSG00000143416 SELENBP1 EHMTO|HEL-S-134P|LPSB|MTO|SBP56|SP56|hSBP selenium binding protein 1 protein-coding 262.666-23 chr7 13299720 13300019 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 612236 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 129-33 chr14 22564186 22564336 + 1.66667 NA TTS (NM_001344) TTS (NM_001344) -7199 NR_146543 105370400 NR_146543 ENSG00000259054 LINC02332 - long intergenic non-protein coding RNA 2332 ncRNA 232.334-7 chr8 78934984 78935166 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 97546 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 204.334-3 chr2 54354748 54354967 + 1.66667 NA intron (NM_001369403, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 23973 NM_001369403 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 336.334-10 chr9 91829877 91830139 + 1.66667 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) intron (NM_001318204, intron 1 of 7) 120220 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 398-16 chr6 140134920 140135282 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -70151 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 279-4 chr10 21926500 21926753 + 1.66667 NA intron (NM_022365, intron 3 of 11) intron (NM_022365, intron 3 of 11) 77104 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 260-3 chr1 93109170 93109475 + 1.66667 NA intron (NM_001164393, intron 1 of 12) intron (NM_001164393, intron 1 of 12) 30039 NM_007358 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 281.334-4 chr18 62583197 62583436 + 1.66667 NA intron (NR_126534, intron 14 of 14) intron (NR_126534, intron 14 of 14) 60291 NR_126534 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 215-55 chr3 20611091 20611317 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 268736 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 237-23 chr12 57778989 57779213 + 1.66667 NA intron (NM_206914, intron 3 of 3) intron (NM_206914, intron 3 of 3) -3644 NM_001172697 10102 Hs.632704 NM_005726 ENSG00000123297 TSFM EFTS|EFTSMT Ts translation elongation factor, mitochondrial protein-coding 274.334-7 chr5 127502710 127502894 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -14838 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 265.667-8 chr10 63377170 63377369 + 1.66667 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) L1MB3|LINE|L1 -4221 NR_031566 100302150 NR_031566 ENSG00000221063 MIR1296 MIRN1296|hsa-mir-1296|mir-1296 microRNA 1296 ncRNA 267.334-21 chr8 63835062 63835231 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65716 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 270.334-5 chr11 20077331 20077495 + 1.66667 NA intron (NM_182964, intron 22 of 37) L2c|LINE|L2 -28110 NR_046672 100874014 Hs.557916 NR_046672 ENSG00000254453 NAV2-AS2 - NAV2 antisense RNA 2 ncRNA 250.666-34 chr6 25896017 25896313 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21922 NM_001098486 10786 Hs.327179 NM_006632 ENSG00000124564 SLC17A3 GOUT4|NPT4|UAQTL4 solute carrier family 17 member 3 protein-coding 275-41 chr5 8560868 8561129 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 100073 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 256.667-44 chr2 115655797 115656002 + 1.66667 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 312084 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 261.667-65 chr6 156096211 156096519 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 149568 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 182.334 chr15 48162347 48162481 + 1.66667 NA intron (NR_125408, intron 4 of 8) MIR|SINE|MIR 15881 NM_016132 50804 Hs.6638 NM_016132 ENSG00000104177 MYEF2 HsT18564|MEF-2|MST156|MSTP156|myEF-2 myelin expression factor 2 protein-coding 228.667-12 chr10 92988229 92988385 + 1.66667 NA intron (NM_001319195, intron 18 of 21) intron (NM_001319195, intron 18 of 21) -72491 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 212.334-3 chr7 6222858 6223022 + 1.66667 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) (TCAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 49684 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 238-54 chr2 203222785 203223041 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15528 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 281.667-37 chr4 57678319 57678491 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 252533 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 337.001 chr1 160942956 160943229 + 1.66667 NA intron (NR_110695, intron 3 of 5) MER20|DNA|hAT-Charlie 10627 NR_110695 101928372 NR_110695 ENSG00000198358 LOC101928372 - uncharacterized LOC101928372 ncRNA 304-48 chr5 114597334 114597634 + 1.66667 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) intron (NR_130785, intron 3 of 12) 21443 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 267-37 chr2 69097864 69098171 + 1.66667 NA intron (NM_032208, intron 9 of 17) L1ME1|LINE|L1 -5665 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 454.001 chr11 104790283 104790590 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 108234 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 195.334-5 chr6 45191955 45192175 + 1.66667 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) 5705 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 344-38 chr6 103422248 103422569 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1437138 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 226.667-66 chr4 71614779 71615102 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 169139 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 327-7 chr14 97441819 97442143 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16835 NR_110165 101929241 Hs.650839 NR_110165 ENSG00000246084 LINC02325 - long intergenic non-protein coding RNA 2325 ncRNA 213.333-36 chr11 110962903 110963169 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 134282 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 258.667-91 chr7 86086297 86086454 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -557534 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 362-14 chr2 133646647 133647127 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -78424 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 306-25 chr2 181669816 181670276 + 1.66667 NA non-coding (NR_146176, exon 2 of 2) non-coding (NR_146176, exon 2 of 2) 10471 NR_146176 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 194-20 chr11 98989106 98989250 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -31771 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 232.667-15 chr12 70244539 70244754 + 1.66667 NA intron (NM_001199303, intron 1 of 15) intron (NM_001199303, intron 1 of 15) 932 NM_001199303 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 216.667-29 chr12 42364330 42364556 + 1.66667 NA intron (NM_001364830, intron 3 of 6) AluJr|SINE|Alu 32645 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 271.667-40 chr2 85045468 85045678 + 1.66667 NA intron (NM_020122, intron 4 of 6) intron (NM_020122, intron 4 of 6) 21774 NR_146453 100996478 Hs.434398 NR_146453 ENSG00000260840 LINC01964 - long intergenic non-protein coding RNA 1964 ncRNA 332-31 chr7 45938943 45939420 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17909 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 255-54 chr3 193213984 193214224 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27118 NM_001366112 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 249.333-21 chr11 84345414 84345704 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -28220 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 331.667-11 chr21 15829570 15829971 + 1.66667 NA intron (NM_001283042, intron 14 of 24) intron (NM_001283042, intron 14 of 24) 99788 NM_013396 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 247-23 chr14 69789196 69789352 + 1.66667 NA intron (NM_003049, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 7967 NM_003049 6554 Hs.952 NM_003049 ENSG00000100652 SLC10A1 NTCP solute carrier family 10 member 1 protein-coding 308.999-2 chr3 98614426 98614882 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -21043 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 255.333-56 chr2 88403057 88403330 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 49500 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 288-53 chr8 5869481 5869811 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 536902 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 174.667-43 chr14 20869612 20869768 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21713 NM_002935 6037 Hs.73839 NM_002935 ENSG00000169397 RNASE3 ECP|RAF1|RNS3 ribonuclease A family member 3 protein-coding 256.333-83 chr8 116021454 116021689 + 1.66667 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 303488 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 314-23 chr2 190781921 190782275 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -98723 NM_001256310 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 228.333-65 chr3 182258136 182258319 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 228135 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 321.333-12 chr11 41143259 41143605 + 1.66667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 316204 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 365-15 chr2 181963217 181963768 + 1.66667 NA intron (NR_048567, intron 1 of 4) AluSg|SINE|Alu 9251 NR_048567 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 269.333-14 chr12 19493258 19493546 + 1.66667 NA intron (NM_001114176, intron 3 of 8) AluSz6|SINE|Alu 52803 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 159-90 chr4 58945626 58945782 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -38578 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 280.667-21 chr14 50223027 50223228 + 1.66667 NA intron (NM_006939, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 8451 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 454.334-2 chr5 108706009 108706340 + 1.66667 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 22087 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 344.666-9 chr15 63529069 63529496 + 1.66667 NA intron (NR_046341, intron 2 of 15) intron (NR_046341, intron 2 of 15) 24689 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 262.667-14 chr11 26298373 26298558 + 1.66667 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) -10458 NR_132968 105376599 Hs.125537 NR_132968 ENSG00000254819 ANO3-AS1 - ANO3 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-117 chr14 55420485 55420659 + 1.66667 NA intron (NM_199047, intron 6 of 6) intron (NM_199047, intron 6 of 6) -8714 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 243-27 chr2 51063875 51064056 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 31364 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 265-19 chr13 78008073 78008307 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4693 NR_047028 100874175 Hs.130364 NR_047028 LINC00446 - long intergenic non-protein coding RNA 446 ncRNA 294.667-34 chr3 69640777 69641024 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -98564 NM_001354605 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 266-74 chr5 167666518 167666874 + 1.66667 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -88233 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 253.333-119 chrX 44523693 44523980 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_173794, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_173794, exon 5 of 5) 19023 NM_173794 139341 Hs.7549 NM_173794 ENSG00000069509 FUNDC1 - FUN14 domain containing 1 protein-coding 271-48 chr8 111307188 111307463 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -69314 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 368.334-7 chr4 93625903 93626357 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 12 of 14) MER2|DNA|TcMar-Tigger -202623 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 324.667-32 chr7 5599510 5599871 + 1.66667 NA intron (NM_003088, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 6874 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 411.333-15 chr5 17812616 17813054 + 1.66667 NA TTS (NR_134287) TTS (NR_134287) 5561 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 266.667-29 chr16 53276529 53276810 + 1.66667 NA intron (NM_001352157, intron 23 of 37) L2a|LINE|L2 68218 NM_001352158 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 259.667-22 chr15 38456786 38456946 + 1.66667 NA intron (NM_173611, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 2739 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 278.667-41 chr4 182669575 182669898 + 1.66667 NA intron (NM_001080477, intron 6 of 27) intron (NM_001080477, intron 6 of 27) 247517 NM_001351744 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 285.667-32 chr3 56027522 56027694 + 1.66667 NA intron (NR_132749, intron 7 of 17) L1MD2|LINE|L1 -175014 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 237.334-12 chr8 92524428 92524694 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 130933 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 220-113 chr7 61732949 61733098 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1571033 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 230.333-94 chr5 104213730 104214004 + 1.66667 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -651078 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 391.666-5 chr4 59034658 59035007 + 1.66667 NA intron (NR_133942, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 21259 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 249.334-14 chr22 32761459 32761728 + 1.66667 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) -39223 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 287.334-2 chr1 157526490 157526749 + 1.66667 NA intron (NM_001195388, intron 9 of 16) intron (NM_001195388, intron 9 of 16) 25896 NM_031281 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 249-2 chr1 99058769 99058950 + 1.66667 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) intron (NR_033940, intron 1 of 2) -53998 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 322.333 chr1 22081284 22081604 + 1.66667 NA intron (NM_001039802, intron 3 of 6) intron (NM_001039802, intron 3 of 6) 28735 NM_001039802 998 Hs.467637 NM_001791 ENSG00000070831 CDC42 CDC42Hs|G25K|TKS cell division cycle 42 protein-coding 317.667-24 chr2 45948858 45949108 + 1.66667 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) L1ME3Cz|LINE|L1 297308 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 248.333-13 chr10 122225255 122225534 + 1.66667 NA intron (NM_206862, intron 12 of 22) intron (NM_206862, intron 12 of 22) -45902 NM_144587 118663 Hs.422466 NM_144587 ENSG00000138152 BTBD16 C10orf87 BTB domain containing 16 protein-coding 253-65 chr7 90188854 90189050 + 1.66667 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) L1MA4|LINE|L1 22683 NR_110029 100874100 Hs.573339 NR_110029 ENSG00000227646 STEAP2-AS1 - STEAP2 antisense RNA 1 ncRNA 262-24 chr15 57617395 57617605 + 1.66667 NA intron (NM_001018100, intron 2 of 12) intron (NM_001018100, intron 2 of 12) 25596 NM_001018090 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 317-9 chr12 40145924 40146264 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10145 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 503.668 chr4 90138884 90139202 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) intron (NM_001145065, intron 1 of 10) 11510 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 315-16 chr2 233851369 233851672 + 1.66667 NA intron (NM_018410, intron 3 of 8) intron (NM_018410, intron 3 of 8) 3015 NM_018410 55355 Hs.532968 NM_018410 ENSG00000123485 HJURP FAKTS|URLC9|hFLEG1 Holliday junction recognition protein protein-coding 306-15 chr14 47845257 47845597 + 1.66667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -50413 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 190.667-13 chr1 197667826 197667975 + 1.66667 NA intron (NR_125340, intron 5 of 19) intron (NR_125340, intron 5 of 19) 107580 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 348.667-7 chr12 38720284 38720721 + 1.66667 NA intron (NM_153634, intron 13 of 19) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 185089 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 265.666-25 chr7 41151074 41151356 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 49611 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 337.334-3 chr20 19148150 19148441 + 1.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -64347 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 259.667-89 chr8 134519389 134519598 + 1.66667 NA intron (NM_020863, intron 13 of 15) L1MC4a|LINE|L1 -78578 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 322-47 chr8 56790286 56790525 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 203462 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 392.334 chr3 87008732 87009125 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -17779 NM_001320493 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 271.667-67 chr8 48811506 48811822 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -76353 NR_157026 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 243.667-27 chr15 57304955 57305209 + 1.66667 NA intron (NR_024433, intron 1 of 2) intron (NR_024433, intron 1 of 2) 4717 NR_024433 283663 Hs.181297 NR_024433 ENSG00000247982 LINC00926 - long intergenic non-protein coding RNA 926 ncRNA 274.333-71 chr8 120161005 120161278 + 1.66667 NA intron (NM_021110, intron 3 of 47) intron (NM_021110, intron 3 of 47) 36039 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 311.667-11 chr20 1884891 1885093 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -9175 NM_001330728 140885 Hs.581021 NM_080792 ENSG00000198053 SIRPA BIT|CD172A|MFR|MYD-1|P84|PTPNS1|SHPS1|SIRP signal regulatory protein alpha protein-coding 221-61 chr6 162144701 162144848 + 1.66667 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) intron (NM_004562, intron 4 of 11) -582358 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 270.333-24 chr15 70779005 70779232 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15560 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 397.001-2 chr9 31766032 31766308 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -384680 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 629.333 chr11 11141288 11142186 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 211513 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 343.667 chr11 66808000 66808279 + 1.66667 NA intron (NM_024650, intron 9 of 16) L1MEg|LINE|L1 -35302 NM_005133 9986 Hs.654972 NM_005133 ENSG00000173653 RCE1 FACE2|RCE1A|RCE1B Ras converting CAAX endopeptidase 1 protein-coding 260.001-2 chr5 58015291 58015452 + 1.66667 NA Intergenic MER45R|DNA|hAT-Tip100 106970 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 271.667-26 chr14 72220924 72221150 + 1.66667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 287510 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 436.667-3 chr12 60411345 60411757 + 1.66667 NA Intergenic LTR38A1|LTR|ERV1 722181 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 258.667-63 chr3 87450574 87450748 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -174077 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 230.333-95 chr5 105878488 105878743 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 779141 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 258.334-22 chr7 6259549 6259745 + 1.66667 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) 12977 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 418.001 chr1 209514323 209514677 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -69214 NM_020439 57172 Hs.199068 NM_020439 ENSG00000008118 CAMK1G CLICK3|CLICKIII|VWS1|dJ272L16.1 calcium/calmodulin dependent protein kinase IG protein-coding 262-26 chr15 67702032 67702246 + 1.66667 NA intron (NM_001206804, intron 15 of 21) intron (NM_001206804, intron 15 of 21) -123370 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 347.334-6 chr4 53236505 53236837 + 1.66667 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) intron (NM_152540, intron 4 of 8) 129390 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 269.667-14 chr11 64804198 64804404 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_130801, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_130801, exon 10 of 10) -1087 NM_001307990 5871 Hs.534341 NM_004579 ENSG00000168067 MAP4K2 BL44|GCK|RAB8IP mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 2 protein-coding 244.333 chr1 22903225 22903466 + 1.66667 NA intron (NM_004442, intron 9 of 15) intron (NM_004442, intron 9 of 15) -40119 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 213.334-3 chr7 85418006 85418230 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -3004 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 300-13 chr11 102708315 102708707 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -2742 NM_022122 64066 Hs.534479 NM_022122 ENSG00000137675 MMP27 MMP-27 matrix metallopeptidase 27 protein-coding 253-47 chr4 39522288 39522535 + 1.66667 NA intron (NM_003359, intron 1 of 11) MIR3|SINE|MIR 5028 NM_001184701 7358 Hs.572518 NM_003359 ENSG00000109814 UGDH GDH|UDP-GlcDH|UDPGDH|UGD UDP-glucose 6-dehydrogenase protein-coding 427.334 chr10 26784893 26785430 + 1.66667 NA intron (NM_001012752, intron 2 of 9) HERVL40-int|LTR|ERVL 75926 NM_001348031 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 242.667-28 chr13 50798080 50798273 + 1.66667 NA intron (NM_198989, intron 1 of 1) intron (NM_198989, intron 1 of 1) -9679 NR_046551 100874074 Hs.734030 NR_046551 ENSG00000176124 DLEU7-AS1 - DLEU7 antisense RNA 1 ncRNA 259-12 chr13 92123800 92124020 + 1.66667 NA intron (NM_004466, intron 6 of 7) intron (NM_004466, intron 6 of 7) 228297 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 295.667-17 chr3 135489106 135489456 + 1.66667 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR -476447 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 270.333-50 chr5 91624090 91624394 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -240925 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 349-11 chr22 29064302 29064653 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2558 NM_015370 25770 Hs.50891 NM_015370 ENSG00000100249 C22orf31 HS747E2A|bK747E2.1 chromosome 22 open reading frame 31 protein-coding 308.666-9 chr18 65515377 65515656 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -234736 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 307.667-35 chr6 120769308 120769589 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 565032 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 301-7 chr10 43978120 43978541 + 1.66667 NA intron (NR_136147, intron 4 of 4) intron (NR_136147, intron 4 of 4) 65928 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 210-108 chr4 145521357 145521555 + 1.66667 NA intron (NM_005900, intron 2 of 6) intron (NM_005900, intron 2 of 6) -4262 NR_126371 104326058 Hs.714527 NR_126371 ENSG00000250902 SMAD1-AS1 - SMAD1 antisense RNA 1 ncRNA 254.333-17 chr13 49877185 49877390 + 1.66667 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -13122 NR_003268 220429 Hs.448219 NR_003268 ENSG00000181358 CTAGE10P - CTAGE family member 10, pseudogene pseudo 235.333-41 chr17 60682308 60682535 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 2 of 25) intron (NM_001330413, intron 2 of 25) 4570 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 250-24 chr13 69926121 69926333 + 1.66667 NA intron (NM_001286725, intron 3 of 9) intron (NM_001286725, intron 3 of 9) -180986 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 528.001 chr10 17024525 17025116 + 1.66667 NA intron (NM_001081, intron 27 of 66) intron (NM_001081, intron 27 of 66) 104997 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 265.334-9 chr12 61684906 61685153 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 507810 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 305-24 chr6 63909015 63909331 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) intron (NM_001292009, intron 35 of 43) 102337 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 288.666-32 chr5 121358047 121358338 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 35642 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 271.667-41 chr2 156788892 156789087 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 352610 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 181.667-129 chr6 38842787 38842953 + 1.66667 NA exon (NM_001206927, exon 35 of 93) exon (NM_001206927, exon 35 of 93) 110237 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 303.667-31 chr9 131323483 131323786 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 33911 NM_032728 84814 Hs.134292 NM_032728 ENSG00000160539 PLPP7 C9orf67|NET39|PPAPDC3 phospholipid phosphatase 7 (inactive) protein-coding 218.667-68 chr3 95419193 95419568 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 263813 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 305.667-29 chr4 109409029 109409366 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -24518 NM_001318086 10427 Hs.292472 NM_006323 ENSG00000138802 SEC24B SEC24 SEC24 homolog B, COPII coat complex component protein-coding 247.334-4 chr11 22297433 22297677 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -40826 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 339-12 chr20 4124231 4124454 + 1.66667 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -24437 NM_001270691 54498 Hs.433337 NM_175839 ENSG00000088826 SMOX C20orf16|PAO|PAO-1|PAO1|PAOH|PAOH1|SMO spermine oxidase protein-coding 195.333-47 chr11 47842766 47842984 + 1.66667 NA intron (NM_001318399, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 5475 NR_134636 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 325-16 chr18 69503307 69503637 + 1.66667 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) intron (NM_152721, intron 1 of 7) 33541 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 248-21 chr14 50521663 50521919 + 1.66667 NA intron (NM_198794, intron 2 of 31) intron (NM_198794, intron 2 of 31) 10778 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 310.667-21 chr2 105053514 105053820 + 1.66667 NA intron (NM_182640, intron 2 of 10) intron (NM_182640, intron 2 of 10) -15171 NR_110603 102724691 Hs.606390 NR_110603 ENSG00000224509 LOC102724691 - uncharacterized LOC102724691 ncRNA 246.667-95 chr8 64376495 64376724 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_034103) promoter-TSS (NR_034103) -718 NR_034103 100130155 Hs.7023 NR_034102 ENSG00000254377 MIR124-2HG LINC00966 MIR124-2 host gene ncRNA 331.334-10 chr5 121628684 121628978 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -223051 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 221.333-126 chr6 118648133 118648398 + 1.66667 NA intron (NM_001178035, intron 2 of 13) AluSz6|SINE|Alu 3326 NM_001042475 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 311.334-3 chr2 176023551 176023952 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20931 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 240-56 chr20 32725184 32725342 + 1.66667 NA intron (NM_001099339, intron 3 of 8) L1ME3G|LINE|L1 18745 NM_053041 149951 Hs.408427 NM_053041 ENSG00000149600 COMMD7 C20orf92|dJ1085F17.3 COMM domain containing 7 protein-coding 412-13 chr6 158578150 158578430 + 1.66667 NA intron (NM_020823, intron 2 of 16) L1M4c|LINE|L1 -31417 NR_106981 102465694 NR_106981 ENSG00000278571 MIR7161 hsa-mir-7161 microRNA 7161 ncRNA 187-79 chr7 32058246 32058417 + 1.66667 NA intron (NM_001191059, intron 2 of 18) intron (NM_001191059, intron 2 of 18) 12076 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 247.667-54 chr2 151414737 151414948 + 1.66667 NA exon (NM_001177663, exon 4 of 35) exon (NM_001177663, exon 4 of 35) 4940 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 229-16 chr12 55032573 55032821 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 12723 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 258-91 chr9 119103877 119104044 + 1.66667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 265475 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 263.333-46 chr2 197030654 197031008 + 1.66667 NA intron (NM_001367496, intron 16 of 27) intron (NM_001367496, intron 16 of 27) -104124 NM_001321099 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 308.667-4 chr1 181493050 181493409 + 1.66667 NA intron (NM_001205293, intron 1 of 47) intron (NM_001205293, intron 1 of 47) 9712 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 355-2 chr10 95725319 95725575 + 1.66667 NA intron (NM_001098175, intron 1 of 9) L1M4a1|LINE|L1 13683 NM_001098175 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 424-2 chr10 44447503 44447850 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -62579 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 357.334-9 chr6 141019099 141019439 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 335455 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 138.333-163 chr6 45086799 45086993 + 1.66667 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 110874 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 381.333-12 chr2 157464196 157464631 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20324 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 242.333-59 chr20 55100775 55101032 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -322140 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 194.333-35 chr12 79347846 79348078 + 1.66667 NA intron (NM_001291901, intron 7 of 9) L2a|LINE|L2 -71295 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 462.667-7 chr5 30463634 30464219 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 583366 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 189-77 chr5 175073523 175073679 + 1.66667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -77870 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 446.667-9 chr4 188743828 188744137 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -32675 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 336-27 chr6 46385113 46385458 + 1.66667 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) intron (NM_001251973, intron 2 of 4) -59393 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 213.334-4 chr8 60958595 60958744 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 9079 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 257.667-17 chr14 42941784 42942042 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1335057 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 423.667-8 chr2 5319571 5319976 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 371345 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 284.334-16 chr8 112907502 112907740 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 8 of 66) intron (NM_001363185, intron 8 of 66) 264128 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 347-16 chr2 53934745 53935155 + 1.66667 NA intron (NM_014614, intron 7 of 46) intron (NM_014614, intron 7 of 46) 36043 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 441-8 chr8 130164524 130165137 + 1.66667 NA intron (NM_001362925, intron 11 of 29) intron (NM_001362925, intron 11 of 29) -80062 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 250.667-45 chr20 40088994 40089237 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 84654 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 253.334-4 chr12 32759410 32759569 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3592 NM_001040436 51067 Hs.505231 NM_015936 ENSG00000139131 YARS2 CGI-04|MLASA2|MT-TYRRS|TYRRS tyrosyl-tRNA synthetase 2 protein-coding 331-28 chr5 13334304 13334663 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -301597 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 181.667-52 chr18 37679811 37680034 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 22787 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 195.667-141 chr8 83729057 83729211 + 1.66667 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 325376 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 256.667-59 chr3 114346050 114346337 + 1.66667 NA intron (NR_121662, intron 6 of 6) intron (NR_121662, intron 6 of 6) -5618 NR_038993 100131117 Hs.122417 NR_038993 ENSG00000241560 ZBTB20-AS1 - ZBTB20 antisense RNA 1 ncRNA 141.667-115 chr2 41627229 41627341 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -250270 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 226.333-92 chr4 104283577 104283798 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -207278 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 258.667-2 chr1 43617047 43617292 + 1.66667 NA intron (NM_001329137, intron 24 of 34) intron (NM_001329137, intron 24 of 34) -32980 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 260.333-31 chr2 152749989 152750215 + 1.66667 NA intron (NR_146431, intron 3 of 3) intron (NR_146431, intron 3 of 3) 31465 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 176-69 chr4 173157019 173157277 + 1.66667 NA intron (NR_134241, intron 3 of 3) L1MEd|LINE|L1 -11663 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 528.667-3 chr17 63135709 63136186 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 169712 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 443.001 chr10 44280613 44281062 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11913 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 407-6 chr2 178217126 178217434 + 1.66667 NA intron (NM_001201480, intron 1 of 25) intron (NM_001201480, intron 1 of 25) 22768 NM_001201480 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 195-78 chr4 69081135 69081322 + 1.66667 NA intron (NM_001349568, intron 1 of 6) intron (NM_001349568, intron 1 of 6) -15246 NM_001330719 7364 Hs.654424 NM_001074 ENSG00000171234 UGT2B7 UDPGT 2B7|UDPGT 2B9|UDPGT2B7|UDPGTH2|UDPGTh-2|UGT2B9 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B7 protein-coding 273.334-20 chrX 44332093 44332287 + 1.66667 NA intron (NM_025184, intron 1 of 14) intron (NM_025184, intron 1 of 14) 11482 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 263-23 chr15 46112911 46113180 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 407850 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 282.999 chr1 83859291 83859588 + 1.66667 NA intron (NR_119374, intron 1 of 2) intron (NR_119374, intron 1 of 2) 1107 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 255-78 chr7 48994598 48994790 + 1.66667 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 70147 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 237.334-5 chr4 57688619 57688854 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 262864 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 136-5 chr1 211865756 211865922 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 34878 NR_135820 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 311.666-11 chr4 42626904 42627335 + 1.66667 NA intron (NM_001105529, intron 1 of 35) intron (NM_001105529, intron 1 of 35) 29986 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 167.667-218 chr9 107581968 107582125 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -92277 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 357.333-5 chr13 92648162 92648571 + 1.66667 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 71589 NR_049776 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 202.334-4 chr20 56457093 56457251 + 1.66667 NA intron (NM_001164116, intron 6 of 6) intron (NM_001164116, intron 6 of 6) -11413 NM_001283035 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 184-81 chr5 19419114 19419269 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 467081 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 208.667-148 chr8 119402710 119402872 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13655 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 253.333-15 chr12 6353258 6353523 + 1.66667 NA intron (NM_001038, intron 8 of 12) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -11273 NM_001065 7132 Hs.279594 NM_001065 ENSG00000067182 TNFRSF1A CD120a|FPF|TBP1|TNF-R|TNF-R-I|TNF-R55|TNFAR|TNFR1|TNFR55|TNFR60|p55|p55-R|p60 TNF receptor superfamily member 1A protein-coding 281.334-3 chr18 13150022 13150235 + 1.66667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -68632 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 325-28 chr8 48440117 48440551 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -111233 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 483.001 chr1 41602745 41603121 + 1.66667 NA intron (NM_024503, intron 3 of 8) L1M3|LINE|L1 -118250 NR_126098 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 266-59 chr4 17181875 17182082 + 1.66667 NA intron (NR_125919, intron 1 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 4079 NR_125919 101929123 Hs.638913 NR_125919 ENSG00000250819 LINC02493 - long intergenic non-protein coding RNA 2493 ncRNA 319.667-14 chr2 58399678 58399911 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -120959 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 446-6 chr2 42552524 42552964 + 1.66667 NA intron (NM_001282755, intron 2 of 17) AluSc|SINE|Alu -15301 NM_001282756 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 276.001 chr1 172389352 172389525 + 1.66667 NA intron (NM_001350206, intron 20 of 20) intron (NM_001350206, intron 20 of 20) -31247 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 149.667-404 chr8 102313167 102313315 + 1.66667 NA intron (NM_001282873, intron 16 of 58) intron (NM_001282873, intron 16 of 58) 73790 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 467.334 chr11 128297379 128297720 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 88783 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 277-8 chr12 54691732 54692074 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -43538 NM_001300854 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 178.334 chr18 2703099 2703247 + 1.66667 NA intron (NM_015295, intron 12 of 47) MER106B|DNA|hAT-Charlie 47286 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 432.333-2 chr10 24536823 24537377 + 1.66667 NA intron (NM_001282768, intron 16 of 17) intron (NM_001282768, intron 16 of 17) 70569 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 297.667-15 chr15 76749919 76750197 + 1.66667 NA intron (NR_148227, intron 15 of 32) L1ME1|LINE|L1 111886 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 246-21 chr12 61867748 61868030 + 1.66667 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 324950 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 353-22 chr9 23241784 23242009 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 430503 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 315.667-12 chr2 124184917 124185231 + 1.66667 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 159787 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 294-21 chr13 93323230 93323470 + 1.66667 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) intron (NM_005708, intron 1 of 8) 96543 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 256.667-35 chr19 41167173 41167472 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25897 NM_030622 29785 Hs.98370 NM_030622 ENSG00000167600 CYP2S1 CYPIIS1 cytochrome P450 family 2 subfamily S member 1 protein-coding 303-37 chr3 159120483 159120791 + 1.66667 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) 51318 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 319.667-32 chr8 37008344 37008599 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 224097 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 490.001-2 chr8 90981976 90982526 + 1.66667 NA intron (NM_001190972, intron 1 of 5) intron (NM_001190972, intron 1 of 5) 2826 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 257.334 chr1 111621830 111622014 + 1.66667 NA intron (NM_001291896, intron 1 of 7) intron (NM_001291896, intron 1 of 7) -1524 NR_160737 107985184 NR_160737 LOC107985184 - uncharacterized LOC107985184 ncRNA 193.334 chr2 24518286 24518439 + 1.66667 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) L1ME1|LINE|L1 26485 NM_001362954 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 228.667 chr1 23033568 23033810 + 1.66667 NA intron (NM_015013, intron 2 of 18) L2|LINE|L2 -10616 NR_036057 100422866 NR_036057 ENSG00000263793 MIR3115 mir-3115 microRNA 3115 ncRNA 413.334-2 chr13 65084236 65084573 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -781643 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 321.334-9 chr7 93427196 93427425 + 1.66667 NA intron (NM_001164738, intron 12 of 12) intron (NM_001164738, intron 12 of 12) 55545 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 197-81 chr4 44034539 44034710 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 17562 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 405.333-5 chr18 2447550 2447930 + 1.66667 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 123765 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 183.333-63 chr17 57358285 57358413 + 1.66667 NA intron (NM_001322250, intron 5 of 13) intron (NM_001322250, intron 5 of 13) 101330 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 359.666-6 chr17 61232578 61233028 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 134901 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 499.333-7 chr4 43144956 43145342 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 251883 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 320.334-3 chr13 66170928 66171252 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -47160 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 269.667-15 chr11 68719980 68720219 + 1.66667 NA intron (NM_004923, intron 6 of 9) L1MEd|LINE|L1 31421 NM_001039656 9633 Hs.145932 NM_004923 ENSG00000132749 TESMIN CXCDC2|MTL5|MTLT testis expressed metallothionein like protein protein-coding 397.333-6 chr2 163377311 163377709 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 358498 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 263.667-67 chr5 151366075 151366347 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -18652 NM_181776 153201 Hs.483877 NM_181776 ENSG00000186335 SLC36A2 PAT2|TRAMD1 solute carrier family 36 member 2 protein-coding 349.667-4 chr12 14178630 14178912 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -186861 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 262.667-82 chr8 100866190 100866349 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 84302 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 361.667-9 chr2 61219836 61220282 + 1.66667 NA intron (NM_014709, intron 67 of 79) intron (NM_014709, intron 67 of 79) 42641 NR_152216 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 279.333-29 chr14 59243812 59244062 + 1.66667 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) -19504 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 224.667-74 chr7 93886670 93886869 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001271004, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001271004, exon 5 of 5) 3984 NM_001271004 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 219.334-7 chrX 8636296 8636481 + 1.66667 NA intron (NM_000216, intron 2 of 13) intron (NM_000216, intron 2 of 13) 95749 NM_000216 3730 Hs.521869 NM_000216 ENSG00000011201 ANOS1 ADMLX|HH1|HHA|KAL|KAL1|KALIG-1|KMS|WFDC19 anosmin 1 protein-coding 330.333-24 chr8 64971853 64972271 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -173325 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 396.333-9 chr4 85090913 85091336 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 123640 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 388.667-16 chr9 29695257 29695522 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -481788 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 279.667-47 chr8 122259129 122259389 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 309385 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 476.667-9 chr8 92771304 92771682 + 1.66667 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) intron (NR_046114, intron 1 of 2) 14567 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 197.334-2 chr10 68985397 68985562 + 1.66667 NA TTS (NM_004728) TTS (NM_004728) -3324 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 260-38 chr2 112766334 112766537 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -1826 NM_001304361 150468 Hs.434250 NM_152515 ENSG00000169607 CKAP2L - cytoskeleton associated protein 2 like protein-coding 234.334-12 chr4 66596115 66596276 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 319371 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 127.667-196 chr9 87447958 87448107 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -49196 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 325.334-5 chr4 61356440 61356718 + 1.66667 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 154407 NM_001371342 286-25 chr2 76975057 76975389 + 1.66667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -10742 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 283-7 chr11 77874095 77874355 + 1.66667 NA intron (NR_133637, intron 3 of 4) intron (NR_133637, intron 3 of 4) 33087 NM_001363564 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 392.667-10 chr5 166158553 166159013 + 1.66667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 767587 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 271-34 chr4 73137128 73137321 + 1.66667 NA intron (NM_198889, intron 14 of 32) intron (NM_198889, intron 14 of 32) -67465 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 135.667-95 chr2 99118816 99118937 + 1.66667 NA intron (NM_001349014, intron 1 of 16) intron (NM_001349014, intron 1 of 16) 22304 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 270.334-4 chr11 15001676 15001958 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -29466 NR_125898 796 Hs.37058 NM_001741 ENSG00000110680 CALCA CALC1|CGRP|CGRP-I|CGRP1|CT|KC|PCT calcitonin related polypeptide alpha protein-coding 238.333-54 chr20 55317017 55317239 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -105915 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 649.667 chr14 61717379 61717858 + 1.66667 NA intron (NR_144368, intron 1 of 2) intron (NR_144368, intron 1 of 2) 19996 NM_001243084 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 273-30 chr5 51125275 51125504 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -155202 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 304-10 chr10 31280164 31280350 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -38160 NM_001323638 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 256.666-5 chr1 78317994 78318306 + 1.66667 NA intron (NR_027310, intron 3 of 5) intron (NR_027310, intron 3 of 5) 88551 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 209-6 chr1 192680623 192680791 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35621 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 312.667-39 chr9 19625991 19626379 + 1.66667 NA intron (NM_020344, intron 1 of 9) intron (NM_020344, intron 1 of 9) 160834 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 268.334-18 chr8 18279493 18279808 + 1.66667 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 57982 NM_001160174 9 Hs.591847 NM_000662 ENSG00000171428 NAT1 AAC1|MNAT|NAT-1|NATI N-acetyltransferase 1 protein-coding 312.667-7 chr10 31700592 31700829 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 208216 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 339-16 chr7 42188323 42188679 + 1.66667 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) L1M5|LINE|L1 48708 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 516.999 chr2 227537783 227538468 + 1.66667 NA intron (NM_004504, intron 10 of 12) intron (NM_004504, intron 10 of 12) 65953 NM_001135187 3267 Hs.352962 NM_004504 ENSG00000173744 AGFG1 HRB|RAB|RIP ArfGAP with FG repeats 1 protein-coding 328.333-11 chr12 33252032 33252341 + 1.66667 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 187633 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 419.333-10 chr3 105506717 105507117 + 1.66667 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 140008 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 280.667-46 chr6 91588766 91589018 + 1.66667 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 67232 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 286.333-9 chr13 72525622 72525981 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 201828 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 384.333-7 chr18 67768008 67768395 + 1.66667 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) 46621 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 268.333-10 chr11 6126346 6126605 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18791 NM_001005181 196335 Hs.632154 NM_001005181 ENSG00000180919 OR56B4 OR11-67 olfactory receptor family 56 subfamily B member 4 protein-coding 267.333-95 chr9 88464780 88465184 + 1.66667 NA intron (NM_006717, intron 4 of 5) L1MB2|LINE|L1 -70119 NM_001161625 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 284.667-49 chr7 54461088 54461346 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81108 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 210.666-46 chr17 10764888 10765149 + 1.66667 NA intron (NR_073457, intron 2 of 3) L1MC|LINE|L1 -34689 NM_001004313 388335 Hs.462230 NM_001004313 ENSG00000187824 TMEM220 - transmembrane protein 220 protein-coding 248.333-43 chr2 68061914 68062165 + 1.66667 NA intron (NM_001190263, intron 1 of 5) intron (NM_001190263, intron 1 of 5) 965 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 230.333-55 chr2 26977146 26977299 + 1.66667 NA intron (NM_012326, intron 1 of 6) intron (NM_012326, intron 1 of 6) 6585 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 243.333-5 chr1 108105716 108105998 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 86978 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 194.667-36 chr13 102635996 102636205 + 1.66667 NA intron (NM_001330588, intron 12 of 29) intron (NM_001330588, intron 12 of 29) 39114 NR_160411 7174 Hs.432424 NM_003291 ENSG00000134900 TPP2 TPP-2|TPP-II|TPPII tripeptidyl peptidase 2 protein-coding 268.333-23 chr16 35440532 35440835 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 39913 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 263.334-10 chr4 53006798 53006965 + 1.66667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) MER102a|DNA|hAT-Charlie 144564 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 254-70 chr6 120948162 120948340 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 386229 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 229-37 chr22 24375974 24376194 + 1.66667 NA intron (NM_001254732, intron 13 of 14) L1MB5|LINE|L1 33976 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 244-2 chr1 47683979 47684138 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -246741 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 335.001 chrX 57234531 57234859 + 1.66667 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -51982 NM_001353840 158584 Hs.496205 NM_174912 ENSG00000165591 FAAH2 AMDD fatty acid amide hydrolase 2 protein-coding 167-52 chr19 31282006 31282164 + 1.66667 NA intron (NM_020856, intron 1 of 1) L3b|LINE|CR1 67351 NR_138036 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 434.667-4 chr5 19776851 19777292 + 1.66667 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) AluSq2|SINE|Alu 109201 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 355.333-16 chr2 201571184 201571652 + 1.66667 NA intron (NM_001168221, intron 8 of 15) intron (NM_001168221, intron 8 of 15) 47760 NM_001168216 151254 Hs.335788 NM_152525 ENSG00000155754 C2CD6 ALS2CR11 C2 calcium dependent domain containing 6 protein-coding 262.334-8 chr3 151353136 151353355 + 1.66667 NA intron (NM_053002, intron 15 of 42) intron (NM_053002, intron 15 of 42) -12423 NM_176876 64805 Hs.591281 NM_022788 ENSG00000169313 P2RY12 ADPG-R|BDPLT8|HORK3|P2T(AC)|P2Y(12)R|P2Y(AC)|P2Y(ADP)|P2Y(cyc)|P2Y12|SP1999 purinergic receptor P2Y12 protein-coding 242-5 chr1 152892005 152892221 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 13791 NM_030663 4184 Hs.111850 NM_030663 ENSG00000163206 SMCP HSMCSGEN1|MCS|MCSP sperm mitochondria associated cysteine rich protein protein-coding 246.667-41 chr2 77846724 77846963 + 1.66667 NA intron (NR_110288, intron 2 of 3) intron (NR_110288, intron 2 of 3) -69091 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 358.667-15 chr2 158610771 158611099 + 1.66667 NA intron (NM_001005476, intron 4 of 20) intron (NM_001005476, intron 4 of 20) 124067 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 254-15 chr11 63177195 63177448 + 1.66667 NA intron (NM_199352, intron 6 of 8) L1MA4|LINE|L1 -33100 NM_001136506 283238 Hs.375139 NM_173586 ENSG00000197658 SLC22A24 NET46 solute carrier family 22 member 24 protein-coding 257.334-4 chr10 122635268 122635497 + 1.66667 NA intron (NM_004406, intron 36 of 39) L3|LINE|CR1 -37500 NM_001364461 112577516 NM_001364461 LOC112577516 - carbohydrate-binding protein AQN-1-like protein-coding 223.334-6 chr2 139067417 139067577 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 170173 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 200.333-18 chr11 42182891 42183118 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 70686 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 319.666-12 chr2 237196272 237196687 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 110590 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 444.001-2 chr7 45297202 45297525 + 1.66667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 139572 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 237-46 chr22 28427062 28427261 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -32708 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 283-5 chr10 49504707 49504893 + 1.66667 NA intron (NM_001346440, intron 6 of 20) intron (NM_001346440, intron 6 of 20) 19481 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 456.334-2 chr2 80567664 80568105 + 1.66667 NA intron (NM_001282599, intron 6 of 11) intron (NM_001282599, intron 6 of 11) 254505 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 224-37 chr18 22945102 22945297 + 1.66667 NA intron (NM_002894, intron 2 of 18) intron (NM_002894, intron 2 of 18) 11323 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 263.667-64 chr5 13439078 13439342 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -406324 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 259.667-79 chr7 90478361 90478679 + 1.66667 NA intron (NM_001365443, intron 1 of 6) intron (NM_001365443, intron 1 of 6) 8881 NM_001365443 102723899 Hs.731917 NM_001365443 LOC102723899 - uncharacterized LOC102723899 protein-coding 341-7 chr13 62373406 62373624 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 49858 NR_047038 100874180 Hs.7415 NR_047038 ENSG00000229307 LINC00459 - long intergenic non-protein coding RNA 459 ncRNA 455.001 chr10 73184341 73184889 + 1.66667 NA intron (NM_173348, intron 3 of 13) L1MEf|LINE|L1 16496 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 269.667-24 chr15 78328233 78328463 + 1.66667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -12005 NM_004378 1381 Hs.346950 NM_004378 ENSG00000166426 CRABP1 CRABP|CRABP-I|CRABPI|RBP5 cellular retinoic acid binding protein 1 protein-coding 170-49 chr17 69978050 69978240 + 1.66667 NA intron (NR_110875, intron 2 of 4) intron (NR_110875, intron 2 of 4) 16438 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 257.667-57 chr3 88699069 88699328 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 360742 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 250-33 chr18 11494046 11494273 + 1.66667 NA intron (NR_110778, intron 1 of 2) intron (NR_110778, intron 1 of 2) 4111 NR_110778 101927433 Hs.331210 NR_110778 ENSG00000267252 LINC01255 - long intergenic non-protein coding RNA 1255 ncRNA 281.334-14 chrX 20687013 20687228 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -420211 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 368.667-9 chr3 126251355 126251734 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -70358 NM_001270364 10840 Hs.434435 NM_012190 ENSG00000144908 ALDH1L1 10-FTHFDH|10-fTHF|FDH|FTHFD aldehyde dehydrogenase 1 family member L1 protein-coding 231-42 chr3 85626005 85626326 + 1.66667 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) -100317 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 308.667-12 chr11 107617842 107618051 + 1.66667 NA intron (NM_001308018, intron 1 of 12) intron (NM_001308018, intron 1 of 12) 26799 NM_018712 55531 Hs.495779 NM_018712 ENSG00000110675 ELMOD1 - ELMO domain containing 1 protein-coding 359.334-4 chr3 44520775 44521072 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10306 NM_001287349 285346 Hs.648974 NM_001287349 ENSG00000178917 ZNF852 - zinc finger protein 852 protein-coding 272-29 chr3 48194166 48194341 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2311 NR_039645 100616407 NR_039645 ENSG00000265483 MIR4443 mir-4443 microRNA 4443 ncRNA 314.666-36 chr8 32664325 32664695 + 1.66667 NA intron (NM_001322205, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 17421 NM_001322206 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 291.667-36 chr8 53616758 53617072 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -92950 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 398.334 chr17 58148442 58148815 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6526 NM_012374 26689 Hs.531188 NM_012374 ENSG00000141194 OR4D1 OR17-23|OR4D3|OR4D4P|TPCR16 olfactory receptor family 4 subfamily D member 1 protein-coding 194-35 chr14 50741554 50741717 + 1.66667 NA exon (NM_020921, exon 25 of 31) exon (NM_020921, exon 25 of 31) -73329 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 237-14 chr10 82038500 82038748 + 1.66667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 160937 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 296-6 chr1 204308888 204309091 + 1.66667 NA intron (NM_014935, intron 1 of 22) intron (NM_014935, intron 1 of 22) 50940 NM_014935 22874 Hs.253146 NM_014935 ENSG00000143850 PLEKHA6 PEPP-3|PEPP3 pleckstrin homology domain containing A6 protein-coding 210.667-9 chr1 199004034 199004230 + 1.66667 NA intron (NR_110525, intron 2 of 2) intron (NR_110525, intron 2 of 2) -12001 NR_126351 104266961 Hs.576501 NR_126351 ENSG00000235492 LINC01221 TCONS_00000366 long intergenic non-protein coding RNA 1221 ncRNA 491.667 chr1 48347337 48347956 + 1.66667 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) LTR8B|LTR|ERV1 124558 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 312-5 chr1 201418521 201418829 + 1.66667 NA intron (NM_003281, intron 1 of 7) intron (NM_003281, intron 1 of 7) 3055 NM_003281 7135 Hs.320890 NM_003281 ENSG00000159173 TNNI1 SSTNI|TNN1 troponin I1, slow skeletal type protein-coding 383-6 chr21 28904759 28905125 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19569 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 301.667-10 chr13 59783340 59783528 + 1.66667 NA intron (NM_001258369, intron 25 of 26) L2|LINE|L2 -229284 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 250.667-44 chr20 33742792 33743024 + 1.66667 NA intron (NM_001282935, intron 2 of 13) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 10912 NM_001282933 84905 Hs.516989 NM_032819 ENSG00000131061 ZNF341 HIES3 zinc finger protein 341 protein-coding 421-8 chr7 91561628 91562209 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 297485 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 233.667-77 chr8 125785192 125785465 + 1.66667 NA Intergenic LTR1A2|LTR|ERV1 165869 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 414-12 chr5 106182757 106183069 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 828101 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 476.667-6 chr3 99174700 99175275 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -273292 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 469-5 chr22 49068655 49069067 + 1.66667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 202091 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 233-25 chr14 45132670 45132939 + 1.66667 NA intron (NM_002013, intron 1 of 6) intron (NM_002013, intron 1 of 6) 1677 NM_002013 2287 Hs.509226 NM_002013 ENSG00000100442 FKBP3 FKBP-25|FKBP-3|FKBP25|PPIase FKBP prolyl isomerase 3 protein-coding 285-27 chr5 17766422 17766661 + 1.66667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -40733 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 228.333-14 chr11 67227141 67227308 + 1.66667 NA intron (NR_027473, intron 10 of 20) intron (NR_027473, intron 10 of 20) -12790 NM_001256405 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 256.999-2 chr11 50589401 50589710 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 180408 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 233.667-10 chr11 21947996 21948169 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -245003 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 258.667-78 chr5 113585209 113585434 + 1.66667 NA intron (NM_001345975, intron 25 of 28) intron (NM_001345975, intron 25 of 28) 71627 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 281.333-64 chr7 112414750 112414998 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8270 NM_001197080 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 334-24 chr20 17256935 17257308 + 1.66667 NA intron (NM_001201529, intron 1 of 10) L1PA7|LINE|L1 30081 NM_001201529 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 148-78 chr2 60273876 60274060 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 109068 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 220-13 chr10 79970606 79970782 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -21589 NM_003019 6441 Hs.253495 NM_003019 ENSG00000133661 SFTPD COLEC7|PSP-D|SFTP4|SP-D surfactant protein D protein-coding 250-77 chr7 48484669 48484923 + 1.66667 NA intron (NM_152701, intron 47 of 61) intron (NM_152701, intron 47 of 61) 313338 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 316.667-10 chr13 24702269 24702635 + 1.66667 NA intron (NM_001676, intron 14 of 22) intron (NM_001676, intron 14 of 22) 22041 NM_001185085 479 Hs.147111 NM_001676 ENSG00000075673 ATP12A ATP1AL1|HK ATPase H+/K+ transporting non-gastric alpha2 subunit protein-coding 208.334-2 chr14 84672884 84673032 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -598974 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 193-74 chr5 97066201 97066335 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 76343 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 478.333 chr14 20662047 20662416 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20540 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 421-7 chr5 14449547 14449997 + 1.66667 NA intron (NM_007118, intron 34 of 56) intron (NM_007118, intron 34 of 56) -14211 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 218.667-20 chr11 114461639 114461872 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 22288 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 446.666 chr12 24267098 24267606 + 1.66667 NA intron (NM_001261414, intron 4 of 16) intron (NM_001261414, intron 4 of 16) 44081 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 218-84 chr4 102757826 102758006 + 1.66667 NA intron (NM_005908, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 3052 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 207.667-11 chr10 76654813 76654950 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -233163 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 356.333-7 chr10 109874828 109875216 + 1.66667 NA intron (NM_001167604, intron 14 of 19) intron (NM_001167604, intron 14 of 19) 48224 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 252.333-78 chr9 23060768 23060997 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 414682 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 465.667-8 chr3 101044182 101044646 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -50924 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 264.667-68 chr5 156619368 156619646 + 1.66667 NA intron (NM_001128209, intron 5 of 7) intron (NM_001128209, intron 5 of 7) -230788 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 237.667-49 chr20 48992110 48992267 + 1.66667 NA intron (NM_006420, intron 21 of 38) intron (NM_006420, intron 21 of 38) 53868 NR_110625 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 306.334-10 chr8 89318559 89318830 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 439017 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 632.334 chr18 58847338 58848040 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15235 NM_001353533 55205 Hs.529023 NM_018181 ENSG00000074657 ZNF532 - zinc finger protein 532 protein-coding 251-69 chr5 105226255 105226547 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 126927 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 305.667-36 chr6 165217883 165218160 + 1.66667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 91584 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 187.334-3 chr4 78146809 78146980 + 1.66667 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) HAL1|LINE|L1 89324 NM_001166133 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 395-18 chr4 77372716 77373125 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -138833 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 317.001 chr11 83282124 83282338 + 1.66667 NA intron (NM_001286116, intron 1 of 8) Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 4176 NM_021825 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 335.667-9 chr16 78478439 78478758 + 1.66667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 378944 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 234.334-3 chr14 51556368 51556726 + 1.66667 NA intron (NR_047477, intron 2 of 3) intron (NR_047477, intron 2 of 3) 43405 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 274-39 chr4 57358986 57359304 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -66727 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 245.334-13 chr21 27114097 27114257 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -147089 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 285.667-29 chr21 21509288 21509480 + 1.66667 NA intron (NM_001352592, intron 17 of 18) intron (NM_001352592, intron 17 of 18) 227935 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 273.667-15 chr11 31190555 31190813 + 1.66667 NA intron (NM_001367979, intron 9 of 38) L1MC5|LINE|L1 179055 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 318-15 chr12 47721695 47722039 + 1.66667 NA intron (NM_001172439, intron 1 of 9) intron (NM_001172439, intron 1 of 9) 3623 NM_006025 8909 Hs.997 NM_006025 ENSG00000111405 ENDOU P11|PP11|PRSS26 endonuclease, poly(U) specific protein-coding 265.334-18 chr6 47382904 47383068 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -73081 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 292-23 chr18 10241588 10241820 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 172666 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 306-57 chr9 14766987 14767444 + 1.66667 NA intron (NR_163242, intron 3 of 11) intron (NR_163242, intron 3 of 11) 12318 NM_001177704 158326 Hs.50850 NM_144966 ENSG00000164946 FREM1 BNAR|C9orf143|C9orf145|C9orf154|MOTA|TILRR|TRIGNO2 FRAS1 related extracellular matrix 1 protein-coding 236.667-17 chr12 13618688 13618860 + 1.66667 NA intron (NM_000834, intron 4 of 12) L3|LINE|CR1 -242029 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 355.667-3 chr12 92806415 92806700 + 1.66667 NA intron (NM_003566, intron 18 of 28) L1M5|LINE|L1 70068 NM_001004330 440107 Hs.591013 NM_001004330 ENSG00000187510 PLEKHG7 - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G7 protein-coding 261.334-24 chr9 131961948 131962135 + 1.66667 NA intron (NM_001253881, intron 3 of 6) MIR3|SINE|MIR 117826 NM_001253882 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 248.667-109 chr9 27584434 27584635 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10668 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 325.334-3 chr20 9583225 9583458 + 1.66667 NA intron (NM_020341, intron 4 of 10) L1MC3|LINE|L1 -68343 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 249.667-98 chr8 85049817 85050069 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -57295 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 244-83 chr5 27214395 27214608 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -175915 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 315.333-17 chr2 24397623 24397938 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -37244 NM_001348182 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 137.667-100 chr2 181120091 181120212 + 1.66667 NA Intergenic Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger -3686 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 412.001-2 chr4 92898166 92898473 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 593920 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 254-27 chr17 57124032 57124297 + 1.66667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 28675 NM_001370427 8165 Hs.463506 NM_003488 ENSG00000121057 AKAP1 AKAP|AKAP121|AKAP149|AKAP84|D-AKAP1|PPP1R43|PRKA1|SAKAP84|TDRD17 A-kinase anchoring protein 1 protein-coding 308.333-35 chr7 52266005 52266302 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -769480 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 163-51 chr21 30865774 30865981 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 15703 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 254.333-35 chr19 51621750 51622058 + 1.66667 NA intron (NM_003830, intron 8 of 8) L1ME3F|LINE|L1 8570 NM_003830 8778 Hs.310333 NM_003830 ENSG00000105501 SIGLEC5 CD170|CD33L2|OB-BP2|OBBP2|SIGLEC-5 sialic acid binding Ig like lectin 5 protein-coding 300.334-9 chr5 41513938 41514176 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3456 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 327.667-20 chr21 23286127 23286391 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 98576 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 441.667 chr2 55570489 55571055 + 1.66667 NA intron (NM_020463, intron 10 of 14) intron (NM_020463, intron 10 of 14) 46850 NM_001282850 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 424.667-8 chr4 89615296 89615733 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -220887 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 274.667-58 chr8 140585589 140585865 + 1.66667 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 49906 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 247.334-5 chr11 44481569 44481801 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -83978 NM_001024844 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 465.667-2 chr10 56663034 56663615 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -302051 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 344-43 chr8 27339140 27339457 + 1.66667 NA intron (NM_173175, intron 1 of 29) intron (NM_173175, intron 1 of 29) 13734 NM_173175 2185 Hs.491322 NM_004103 ENSG00000120899 PTK2B CADTK|CAKB|FADK2|FAK2|PKB|PTK|PYK2|RAFTK protein tyrosine kinase 2 beta protein-coding 249-17 chr11 91595475 91595698 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -629448 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 197.667-101 chr3 186854031 186854197 + 1.66667 NA intron (NR_046662, intron 2 of 3) intron (NR_046662, intron 2 of 3) 7254 NR_046662 100874095 Hs.638968 NR_046662 ENSG00000226482 ADIPOQ-AS1 - ADIPOQ antisense RNA 1 ncRNA 278.333-45 chr8 88657414 88657641 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -330044 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 362.001-5 chr2 85151310 85151565 + 1.66667 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) L1MC5|LINE|L1 18045 NM_031283 83439 Hs.516297 NM_031283 ENSG00000152284 TCF7L1 TCF-3|TCF3 transcription factor 7 like 1 protein-coding 232.334-5 chr19 33114466 33114659 + 1.66667 NA intron (NM_018025, intron 15 of 19) L1M5|LINE|L1 -17552 NM_173479 126248 Hs.211046 NM_173479 ENSG00000166359 WDR88 PQWD WD repeat domain 88 protein-coding 337.667-7 chr13 32180502 32180881 + 1.66667 NA intron (NM_023037, intron 23 of 60) intron (NM_023037, intron 23 of 60) 131263 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 220.334-5 chr9 89653407 89653592 + 1.66667 NA intron (NR_024280, intron 1 of 5) L1ME4b|LINE|L1 13716 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 507.667-4 chr4 111906735 111907378 + 1.66667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -238398 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 297-47 chr9 27898152 27898538 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -324479 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 295.333-60 chrX 81496275 81496792 + 1.66667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 294431 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 218-56 chr2 154854137 154854291 + 1.66667 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 155519 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 239.667-72 chr7 132812585 132812747 + 1.66667 NA intron (NM_001317177, intron 7 of 8) L2|LINE|L2 53696 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 212-146 chr7 73760393 73760554 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 9797 NM_001306 1365 Hs.647023 NM_001306 ENSG00000165215 CLDN3 C7orf1|CPE-R2|CPETR2|HRVP1|RVP1 claudin 3 protein-coding 310-20 chr15 56954106 56954360 + 1.66667 NA intron (NM_207038, intron 3 of 19) L1ME1|LINE|L1 34788 NM_001322165 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 300.666-2 chr10 20878638 20878969 + 1.66667 NA intron (NM_006393, intron 5 of 27) intron (NM_006393, intron 5 of 27) 18799 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 251-63 chr5 35938829 35939125 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_144647) promoter-TSS (NM_144647) 176 NR_104630 100506406 Hs.116864 NR_104630 ENSG00000249748 LOC100506406 - uncharacterized LOC100506406 ncRNA 396-9 chr21 24603208 24603743 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 174735 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 253-42 chr2 214027027 214027326 + 1.66667 NA intron (NR_047660, intron 12 of 14) L1ME4a|LINE|L1 269109 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 354-6 chr11 26933733 26934010 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -60241 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 264.334-15 chr5 4310402 4310568 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -462996 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 419-6 chr20 53069823 53070117 + 1.66667 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) 97612 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 343.667-3 chr15 64598088 64598365 + 1.66667 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) AluSz6|SINE|Alu 98806 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 502-3 chr9 24008542 24009065 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -158202 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 233.667-67 chr6 141159221 141159424 + 1.66667 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 475508 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 267-59 chr6 112877224 112877454 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 530009 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 412.334-5 chr22 47751972 47752312 + 1.66667 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) L1MEd|LINE|L1 120468 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 266.334-13 chr2 51445845 51446127 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) L1MB7|LINE|L1 413385 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 246-88 chr5 106282005 106282287 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 728868 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 392.333-10 chr7 20470247 20470739 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -138731 NR_110120 101927811 Hs.285724 NR_110119 ENSG00000271133 LOC101927811 - uncharacterized LOC101927811 ncRNA 253-11 chr10 63882061 63882261 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -360271 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 243-75 chr8 141162040 141162230 + 1.66667 NA intron (NM_001362798, intron 9 of 21) intron (NM_001362798, intron 9 of 21) 33546 NR_148197 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 245-41 chr2 190099570 190099771 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -36941 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 284-54 chr6 129273616 129273885 + 1.66667 NA intron (NM_000426, intron 17 of 64) intron (NM_000426, intron 17 of 64) 390609 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 378-7 chr12 64123461 64123829 + 1.66667 NA intron (NM_001346201, intron 18 of 21) (ATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 98651 NM_001300940 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 248.333-89 chr6 25496629 25496844 + 1.66667 NA intron (NM_001173977, intron 16 of 36) L2c|LINE|L2 -155479 NM_006998 10590 Hs.116428 NM_006998 ENSG00000079689 SCGN CALBL|DJ501N12.8|SECRET|SEGN|setagin secretagogin, EF-hand calcium binding protein protein-coding 576.334 chr11 50721130 50721629 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 312232 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 431-5 chr16 71932814 71933336 + 1.66667 NA intron (NM_181536, intron 28 of 29) intron (NM_181536, intron 28 of 29) 37544 NM_014761 9798 Hs.232194 NM_014761 ENSG00000182149 IST1 CHMP8|OLC1 IST1 factor associated with ESCRT-III protein-coding 539.333-2 chr3 78781081 78781441 + 1.66667 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 238198 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 276.334-8 chr15 94900981 94901224 + 1.66667 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 45739 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 424-5 chr14 50675692 50676023 + 1.66667 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL -7551 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 433.333-6 chr18 2264352 2264735 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 306962 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 260.334-20 chr9 123071794 123071982 + 1.66667 NA intron (NM_012197, intron 15 of 25) intron (NM_012197, intron 15 of 25) 38245 NM_005294 2844 Hs.722039 NM_005294 ENSG00000011454 GPR21 - G protein-coupled receptor 21 protein-coding 344-33 chr5 10403579 10403998 + 1.66667 NA intron (NM_001270660, intron 14 of 24) intron (NM_001270660, intron 14 of 24) 1424 NR_162106 113218502 NR_162106 MIR10397 - microRNA 10397 ncRNA 268.667-8 chr11 110829442 110829673 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -116368 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 334.667-20 chr3 164984159 164984482 + 1.66667 NA intron (NM_001041, intron 45 of 47) intron (NM_001041, intron 45 of 47) 94176 NM_001041 6476 Hs.429596 NM_001041 ENSG00000090402 SI - sucrase-isomaltase protein-coding 269.334-14 chrX 97163689 97163889 + 1.66667 NA intron (NM_007309, intron 22 of 26) L1MEd|LINE|L1 279881 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 419-5 chr2 208281986 208282512 + 1.66667 NA intron (NM_001178000, intron 5 of 11) ERVL-E-int|LTR|ERVL 15982 NM_152671 200576 Hs.744997 NM_015040 ENSG00000115020 PIKFYVE CFD|FAB1|HEL37|PIP5K|PIP5K3|ZFYVE29 phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing protein-coding 251.667-92 chr8 49318214 49318376 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 193885 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 286.667-38 chr6 142106768 142106963 + 1.66667 NA intron (NM_001324308, intron 1 of 2) MER57A-int|LTR|ERV1 -18066 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 367.667-5 chr14 54541010 54541379 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -26418 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 467.333-3 chr10 73761975 73762339 + 1.66667 NA intron (NM_198597, intron 6 of 22) intron (NM_198597, intron 6 of 22) -10119 NM_173540 170384 Hs.588854 NM_173540 ENSG00000196968 FUT11 FUCTXI fucosyltransferase 11 protein-coding 269-49 chr6 166328537 166328795 + 1.66667 NA intron (NR_130113, intron 4 of 6) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 13879 NM_145169 113402 Hs.487143 NM_145169 ENSG00000198818 SFT2D1 C6orf83|pRGR1 SFT2 domain containing 1 protein-coding 374-5 chr12 46616768 46617068 + 1.66667 NA intron (NR_125377, intron 3 of 3) L1ME1|LINE|L1 209079 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 366.667-16 chr6 69704483 69704781 + 1.66667 NA intron (NM_001367272, intron 9 of 15) L1MC4|LINE|L1 91834 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 259.334-8 chr16 70486156 70486378 + 1.66667 NA intron (NM_001195139, intron 12 of 17) intron (NM_001195139, intron 12 of 17) 31672 NM_145059 197258 Hs.7907 NM_145059 ENSG00000157353 FCSK 1110046B12Rik|CDGF2|FUK fucose kinase protein-coding 259.334-16 chr22 44999742 44999955 + 1.66667 NA TTS (NR_147506) TTS (NR_147506) 3771 NR_147506 101927551 Hs.683911 NR_147506 ENSG00000230922 LOC101927551 - uncharacterized LOC101927551 ncRNA 262.667-37 chr2 100287285 100287448 + 1.66667 NA intron (NM_198461, intron 10 of 11) L1ME4c|LINE|L1 35367 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 271-27 chr2 164362987 164363187 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 205408 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 230-8 chr10 56852112 56852285 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 452361 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 363-5 chr17 65930361 65930727 + 1.66667 NA intron (NM_001353129, intron 18 of 26) intron (NM_001353129, intron 18 of 26) -104001 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 264.334-17 chr5 62525746 62525994 + 1.66667 NA intron (NM_016338, intron 20 of 29) intron (NM_016338, intron 20 of 29) -52865 NR_073584 101180901 Hs.482269 NR_073584 ENSG00000086200 IPO11-LRRC70 - IPO11-LRRC70 readthrough ncRNA 407.667-3 chr10 101712174 101712480 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -17032 NM_001323541 6468 Hs.500822 NM_022039 ENSG00000107829 FBXW4 DAC|FBW4|FBWD4|SHFM3|SHSF3 F-box and WD repeat domain containing 4 protein-coding 385.334 chr1 44990842 44991117 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -4257 NM_001261418 8891 Hs.533549 NM_020365 ENSG00000070785 EIF2B3 EIF-2B|EIF2Bgamma eukaryotic translation initiation factor 2B subunit gamma protein-coding 269.667-35 chr22 39746946 39747148 + 1.66667 NA intron (NM_152512, intron 6 of 6) AluJr|SINE|Alu 146713 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 209-9 chr10 25318427 25318617 + 1.66667 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) L1MC4a|LINE|L1 -142246 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 268.333-43 chr4 71091465 71091707 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95673 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 256-45 chr2 124755709 124755875 + 1.66667 NA intron (NM_130773, intron 14 of 23) MIR|SINE|MIR 730505 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 278.333-18 chr14 26906601 26906916 + 1.66667 NA intron (NR_110041, intron 3 of 3) intron (NR_110041, intron 3 of 3) -1884 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 288.666-4 chr1 216663852 216664054 + 1.66667 NA intron (NM_001243506, intron 2 of 6) intron (NM_001243506, intron 2 of 6) 59476 NM_001438 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 237.333-41 chr17 52006257 52006420 + 1.66667 NA intron (NM_001082533, intron 3 of 9) intron (NM_001082533, intron 3 of 9) 152376 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 152-79 chr19 11601314 11601505 + 1.66667 NA intron (NM_001290084, intron 1 of 3) AluJr4|SINE|Alu 3926 NM_001290084 199692 Hs.526665 NM_145295 ENSG00000198551 ZNF627 - zinc finger protein 627 protein-coding 404.666-7 chr19 32798136 32798449 + 1.66667 NA intron (NM_001366102, intron 15 of 32) intron (NM_001366102, intron 15 of 32) 71475 NM_001243036 11136 Hs.743345 NM_014270 ENSG00000021488 SLC7A9 BAT1|CSNU3 solute carrier family 7 member 9 protein-coding 248.334-5 chr11 45292635 45292883 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6418 NM_001247987 57586 Hs.436643 NM_020826 ENSG00000019505 SYT13 - synaptotagmin 13 protein-coding 376.334-6 chr2 139415179 139415491 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 518011 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 403 chr1 183600634 183600936 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9871 NM_001127651 4688 Hs.587558 NM_000433 ENSG00000116701 NCF2 NCF-2|NOXA2|P67-PHOX|P67PHOX neutrophil cytosolic factor 2 protein-coding 318-40 chr3 114191079 114191494 + 1.66667 NA intron (NM_001282563, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 8121 NM_001282563 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 298.334-3 chr13 58382149 58382456 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -149185 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 260.667-68 chr5 3597099 3597326 + 1.66667 NA intron (NM_024337, intron 1 of 3) CpG-21939 1380 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 253.667-23 chr15 67142814 67143079 + 1.66667 NA intron (NM_001145103, intron 1 of 8) intron (NM_001145103, intron 1 of 8) 4925 NM_001145103 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 378.333-4 chr2 26111355 26111876 + 1.66667 NA intron (NM_016131, intron 3 of 5) AluSp|SINE|Alu -61473 NM_001168241 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 218.667-85 chr5 91175232 91175430 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 139071 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 381.666-11 chr8 138421978 138422375 + 1.66667 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) L1PA15|LINE|L1 75085 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 226.334-8 chr7 17493831 17494018 + 1.66667 NA intron (NR_110013, intron 1 of 3) intron (NR_110013, intron 1 of 3) 64985 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 257.667-29 chr16 35304094 35304293 + 1.66667 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite -59223 NR_027080 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 293.334 chr1 81865508 81865795 + 1.66667 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 63198 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 701 chr3 85879856 85880591 + 1.66667 NA intron (NM_001256502, intron 3 of 10) L1MDa|LINE|L1 -52173 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 279.001 chr10 43707250 43707426 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -58457 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 249.334-22 chr9 37504078 37504313 + 1.66667 NA TTS (NM_022490) TTS (NM_022490) 18247 NM_022490 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 273.001-3 chr6 79873403 79873566 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -61238 NR_131786 89758 Hs.288213 NM_001243308 LINC01621 C6orf7 long intergenic non-protein coding RNA 1621 ncRNA 254.666-30 chr8 66663485 66663764 + 1.66667 NA intron (NM_025054, intron 1 of 2) intron (NM_025054, intron 1 of 2) 3607 NM_025054 80124 Hs.632066 NM_025054 ENSG00000175073 VCPIP1 DUBA3|VCIP135 valosin containing protein interacting protein 1 protein-coding 351.666-14 chr4 124921944 124922278 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -209379 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 208-176 chr9 4940521 4940751 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -44450 NM_001322194 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 275.666-20 chrX 46123382 46123665 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 204151 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 247.333-6 chr10 32890494 32890718 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 10866 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 381.333-21 chr8 60896788 60897171 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 70769 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 309.667-27 chr7 47387476 47387850 + 1.66667 NA intron (NM_022748, intron 16 of 30) intron (NM_022748, intron 16 of 30) 77140 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 129-28 chr12 51319732 51319869 + 1.66667 NA intron (NM_001290007, intron 1 of 12) intron (NM_001290007, intron 1 of 12) 4374 NM_016293 51411 Hs.14770 NM_016293 ENSG00000110934 BIN2 BRAP-1 bridging integrator 2 protein-coding 325.667-10 chr18 11461724 11462069 + 1.66667 NA intron (NR_146901, intron 2 of 3) L1MDa|LINE|L1 7418 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 251.334-28 chr6 156469421 156469595 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 90758 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 373.667-5 chr17 45060306 45060742 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_021079) promoter-TSS (NM_021079) 605 NM_001288654 79877 Hs.463148 NM_024819 ENSG00000172992 DCAKD - dephospho-CoA kinase domain containing protein-coding 276-43 chr3 30773578 30773860 + 1.66667 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) intron (NM_207359, intron 14 of 14) 120942 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 259.334-6 chr13 39100705 39100959 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 62376 NM_001012754 387921 Hs.507783 NM_001012754 ENSG00000188811 NHLRC3 - NHL repeat containing 3 protein-coding 227.334-7 chr3 35103433 35103596 + 1.66667 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 290509 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 389.333-21 chr8 43557196 43557548 + 1.66667 NA Intergenic HERVS71-int|LTR|ERV1 264930 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 351-15 chr5 127976938 127977339 + 1.66667 NA intron (NR_152803, intron 1 of 1) intron (NR_152803, intron 1 of 1) 106037 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 251.333-103 chr7 96223387 96223603 + 1.66667 NA intron (NR_027662, intron 3 of 16) intron (NR_027662, intron 3 of 16) -3739 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 253-30 chr17 66364892 66365182 + 1.66667 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 51817 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 510.333-2 chr1 236915257 236915745 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 88940 NM_001276687 645745 Hs.632513 NM_001039954 ENSG00000244020 MT1HL1 MT1P2 metallothionein 1H like 1 protein-coding 278.334-3 chr2 65289266 65289571 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 61723 NM_005722 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 439.333-3 chr12 90030519 90031109 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 83121 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 323.334-4 chr12 115610988 115611333 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 537494 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 338.334-5 chr15 57359765 57360088 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -16579 NM_001252335 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 496.668 chr14 60884566 60884941 + 1.66667 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) L1MA2|LINE|L1 96326 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 246.667-40 chr2 75896182 75896342 + 1.66667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -185347 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 269.333-67 chr4 31567280 31567536 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 60864 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 263-17 chr13 41706978 41707210 + 1.66667 NA intron (NM_015058, intron 26 of 44) intron (NM_015058, intron 26 of 44) -138699 NR_049803 100847026 NR_049803 ENSG00000284584 MIR5006 - microRNA 5006 ncRNA 458-2 chr11 111351043 111351472 + 1.66667 NA TTS (NM_006235) TTS (NM_006235) 3500 NR_039712 100616330 NR_039712 ENSG00000264032 MIR4491 mir-4491 microRNA 4491 ncRNA 302.667-35 chr8 83468799 83469105 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65194 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 424.667-6 chr2 154636522 154636807 + 1.66667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -61917 NM_001260508 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 261.334-3 chr13 39552133 39552373 + 1.66667 NA intron (NM_005780, intron 2 of 3) intron (NM_005780, intron 2 of 3) 50940 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 231-11 chr13 41996469 41996678 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 35404 NR_039974 100507240 Hs.147766 NR_039974 ENSG00000278338 VWA8-AS1 - VWA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 218.667-50 chr2 46719204 46719407 + 1.66667 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) intron (NM_144949, intron 1 of 1) 20010 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 245.666-7 chr12 79317359 79317618 + 1.66667 NA intron (NM_001291901, intron 7 of 9) intron (NM_001291901, intron 7 of 9) -101769 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 379 chr10 73251250 73251582 + 1.66667 NA intron (NM_016065, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 1228 NM_016065 51021 Hs.180312 NM_016065 ENSG00000182180 MRPS16 CGI-132|COXPD2|MRP-S16|RPMS16 mitochondrial ribosomal protein S16 protein-coding 275-13 chr15 56555173 56555469 + 1.66667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -90184 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 278.334-4 chr2 99932238 99932431 + 1.66667 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 173249 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 152.333-328 chr6 39572315 39572517 + 1.66667 NA intron (NM_001289020, intron 10 of 21) L2a|LINE|L2 -141026 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 233.667-9 chr10 127596133 127596319 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46877 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 143.667-89 chr16 51344863 51345047 + 1.66667 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) L2a|LINE|L2 -193683 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 335.333-32 chr3 32772397 32772749 + 1.66667 NA intron (NM_001256741, intron 17 of 17) AluSx|SINE|Alu -45424 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 259.334-2 chr1 114938781 114938976 + 1.66667 NA intron (NM_001282542, intron 23 of 30) L1M3|LINE|L1 84015 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 244.666-43 chr6 27548501 27548800 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -75532 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 362.667-11 chr15 98528793 98529105 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14613 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 258.334-13 chr2 29537146 29537319 + 1.66667 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -61855 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 299.999-10 chr8 108957280 108957697 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -129140 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 245.667-85 chrX 76274286 76274471 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 101316 NM_016500 51260 Hs.370100 NM_016500 ENSG00000102390 PBDC1 CXorf26 polysaccharide biosynthesis domain containing 1 protein-coding 275.667-43 chr4 101234842 101235111 + 1.66667 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) 5896 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 325-8 chr12 12329831 12330209 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_018050, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_018050, exon 4 of 4) 20222 NM_001363613 54682 Hs.591145 NM_018050 ENSG00000111261 MANSC1 9130403P13Rik|LOH12CR3 MANSC domain containing 1 protein-coding 353.333-14 chr13 37578821 37579159 + 1.66667 NA intron (NM_001286667, intron 14 of 18) intron (NM_001286667, intron 14 of 18) 19778 NM_001330517 10631 Hs.136348 NM_006475 ENSG00000133110 POSTN OSF-2|OSF2|PDLPOSTN|PN periostin protein-coding 282.667-53 chrX 101223274 101223602 + 1.66667 NA intron (NM_001171184, intron 1 of 21) L1ME3C|LINE|L1 3494 NM_001171184 1821 Hs.159291 NM_001939 ENSG00000102385 DRP2 DRP-2 dystrophin related protein 2 protein-coding 401.334 chr1 179990650 179990909 + 1.66667 NA intron (NM_014810, intron 4 of 37) AluJr4|SINE|Alu 35969 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 444.001 chr1 17398085 17398447 + 1.66667 NA intron (NM_207421, intron 14 of 15).2 intron (NM_207421, intron 14 of 15).2 26070 NM_207421 353238 Hs.531598 NM_207421 ENSG00000276747 PADI6 PREMBL2|hPADVI peptidyl arginine deiminase 6 protein-coding 332-19 chr2 161945717 161946086 + 1.66667 NA intron (NM_001354443, intron 16 of 25) intron (NM_001354443, intron 16 of 25) 128314 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 163.666-3 chr11 14332834 14333033 + 1.66667 NA intron (NM_001177314, intron 1 of 5) intron (NM_001177314, intron 1 of 5) 25552 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 342.667-10 chr5 67067041 67067251 + 1.66667 NA intron (NM_001297651, intron 2 of 25) intron (NM_001297651, intron 2 of 25) 62491 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 248.667-96 chr7 37232376 37232646 + 1.66667 NA intron (NM_001206480, intron 8 of 21) intron (NM_001206480, intron 8 of 21) 121157 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 207-47 chr16 79887580 79887716 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 92399 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 285-26 chr4 85767933 85768134 + 1.66667 NA intron (NM_001025616, intron 3 of 9) HAL1b|LINE|L1 -10765 NM_001042669 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 170.333-104 chr19 32749695 32749946 + 1.66667 NA exon (NM_001110822, exon 6 of 13) exon (NM_001110822, exon 6 of 13) 30053 NM_001366102 91646 Hs.646351 NM_001015890 ENSG00000173809 TDRD12 ECAT8 tudor domain containing 12 protein-coding 240-70 chr4 174443287 174443469 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 19583 NR_036236 100423042 NR_036236 ENSG00000265846 MIR4276 - microRNA 4276 ncRNA 239.333-85 chr5 53123760 53124059 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 14067 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 300.999-2 chr16 77621465 77621866 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -100827 NM_001243657 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 310.334 chr1 15375515 15375861 + 1.66667 NA exon (NM_052929, exon 27 of 31) exon (NM_052929, exon 27 of 31) -31805 NR_148919 101927417 Hs.715313 NR_148918 ENSG00000233485 LOC101927417 - uncharacterized LOC101927417 ncRNA 410.333-9 chr6 48601602 48601992 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -533108 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 249.666-15 chr18 6607796 6608020 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 96492 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 157.667-24 chr10 25380915 25381095 + 1.66667 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -204729 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 262.333-67 chr5 24366180 24366475 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 278651 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 240-30 chr15 87039456 87039644 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -51124 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 234.667-36 chr14 84258186 84258339 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -1013670 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 254.667-64 chr5 27255959 27256201 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -216212 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 215-33 chr2 63396983 63397286 + 1.66667 NA intron (NR_148704, intron 11 of 18) L2|LINE|L2 40873 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 237.333-3 chr1 99061948 99062104 + 1.66667 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) L1MC5|LINE|L1 -57165 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 664 chr8 113309466 113310352 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 67243 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 253.667-34 chr2 182234345 182234497 + 1.66667 NA intron (NM_005019, intron 4 of 14) intron (NM_005019, intron 4 of 14) 7642 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 223.667-89 chr8 135960260 135960401 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 502874 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 391.667-6 chr2 36899295 36899726 + 1.66667 NA intron (NM_003162, intron 6 of 17) intron (NM_003162, intron 6 of 17) 67026 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 445.333-4 chr2 136395456 136396097 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -277621 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 202.667-157 chr9 91325247 91325457 + 1.66667 NA exon (NM_001351433, exon 5 of 10) exon (NM_001351433, exon 5 of 10) 36572 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 283.667-10 chr15 101330897 101331215 + 1.66667 NA intron (NM_138319, intron 14 of 20) intron (NM_138319, intron 14 of 20) -3381 NR_132373 105371027 NR_132373 ENSG00000259764 PCSK6-AS1 - PCSK6 antisense RNA 1 ncRNA 292-56 chr8 129227210 129227502 + 1.66667 NA intron (NR_033916, intron 1 of 2) intron (NR_033916, intron 1 of 2) 13884 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 285.333-67 chr7 145838471 145838780 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -935646 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 244.334-4 chr10 23690657 23690866 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3966 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 250.667-25 chr15 47741096 47741389 + 1.66667 NA intron (NM_153618, intron 1 of 18) MIR|SINE|MIR 22753 NM_153619 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 283.334-4 chr11 18186062 18186247 + 1.66667 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 13317 NM_054032 117196 Hs.632138 NM_054032 ENSG00000179817 MRGPRX4 GPCR|MRGX4|SNSR6 MAS related GPR family member X4 protein-coding 246.334-17 chr5 173601890 173602057 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 14677 NM_138369 91272 Hs.425091 NM_138369 ENSG00000145919 BOD1 FAM44B biorientation of chromosomes in cell division 1 protein-coding 368.334-2 chr10 87647407 87647673 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12338 NM_004670 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 349.334-2 chr10 105763570 105763823 + 1.66667 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) intron (NR_120625, intron 3 of 3) 56637 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 582.333 chr15 58735165 58735934 + 1.66667 NA intron (NM_001320570, intron 1 of 14) MER2|DNA|TcMar-Tigger 14158 NM_001110 102 Hs.172028 NM_001110 ENSG00000137845 ADAM10 AD10|AD18|CD156c|CDw156|HsT18717|MADM|RAK|kuz ADAM metallopeptidase domain 10 protein-coding 234-71 chr8 111728996 111729263 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 352490 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 254.334-34 chr8 82034855 82035099 + 1.66667 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -192691 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 285.333-62 chr6 146018390 146018684 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9170 NM_001278065 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 207-101 chr5 166884682 166884861 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 41599 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 270.667-52 chr8 67066246 67066430 + 1.66667 NA intron (NM_001363133, intron 1 of 27) intron (NM_001363133, intron 1 of 27) 1946 NM_001364869 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 255-13 chr10 75780979 75781203 + 1.66667 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 -1670 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 258.333-71 chr8 137715459 137715768 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -302025 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 175.667-126 chr6 97515560 97515743 + 1.66667 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) L1PA4|LINE|L1 210065 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 261-57 chr8 72821662 72821827 + 1.66667 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 89699 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 300.667-28 chr4 30812438 30812698 + 1.66667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 92199 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 239.334-11 chr6 54019583 54019749 + 1.66667 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) 696 NM_001281746 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 230.666-9 chr10 100169555 100169766 + 1.66667 NA intron (NR_144757, intron 5 of 10) intron (NR_144757, intron 5 of 10) 16369 NM_001100626 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 271.667-80 chr9 34962205 34962374 + 1.66667 NA intron (NM_015297, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 4004 NM_001347983 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 249.333-89 chr6 145925819 145926025 + 1.66667 NA intron (NM_001370328, intron 18 of 31) intron (NM_001370328, intron 18 of 31) 38175 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 267.667-46 chr4 105096580 105096798 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -49186 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 391-5 chr14 61660868 61661462 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -34348 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 459.334-3 chr4 31711392 31711802 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 205053 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 422.667-3 chr10 111262900 111263181 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 148749 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 300.667-49 chr9 87054213 87054583 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -12272 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 258-34 chr2 88304419 88304789 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 131465 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 480.001 chr3 18600647 18601209 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -155336 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 281-33 chr4 102005217 102005618 + 1.66667 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 191575 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 365.666-6 chr3 113852155 113852573 + 1.66667 NA intron (NM_017577, intron 2 of 17) intron (NM_017577, intron 2 of 17) 13576 NM_017577 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 310-10 chr11 18274314 18274664 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 8225 NM_199161 6288 Hs.632144 NM_000331 ENSG00000173432 SAA1 PIG4|SAA|SAA2|TP53I4 serum amyloid A1 protein-coding 248 chr1 64730189 64730413 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -14672 NM_001366165 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 436.667 chr10 76840830 76841399 + 1.66667 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -46930 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 245.333-6 chr1 173765966 173766188 + 1.66667 NA intron (NM_014458, intron 7 of 11) intron (NM_014458, intron 7 of 11) 51096 NM_014458 27252 Hs.495035 NM_014458 ENSG00000076321 KLHL20 KHLHX|KLEIP|KLHLX kelch like family member 20 protein-coding 438.666-7 chr2 73063422 73063901 + 1.66667 NA intron (NM_001330402, intron 1 of 12) LTR65|LTR|ERV1 -4489 NR_138476 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 265-27 chr16 77003991 77004302 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 135210 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 251.667-73 chr4 150312617 150312855 + 1.66667 NA intron (NM_001367550, intron 51 of 56) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 234291 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 186.667-131 chr7 3742956 3743124 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -386645 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 372-8 chr15 27411542 27411873 + 1.66667 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) L1MCa|LINE|L1 -250388 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 235.334-7 chr5 30568396 30568568 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -625204 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 138-3 chr1 100915860 100916029 + 1.66667 NA intron (NM_133496, intron 6 of 10) L1MB1|LINE|L1 19854 NM_133496 148867 Hs.533903 NM_133496 ENSG00000162695 SLC30A7 ZNT7|ZnT-7|ZnTL2 solute carrier family 30 member 7 protein-coding 455.667-7 chr17 63594882 63595317 + 1.66667 NA TTS (NM_005828) TTS (NM_005828) -5796 NM_016360 51204 Hs.174134 NM_016360 ENSG00000136463 TACO1 CCDC44 translational activator of cytochrome c oxidase I protein-coding 252-69 chr4 56810885 56811048 + 1.66667 NA intron (NM_001271722, intron 1 of 1) intron (NM_001271722, intron 1 of 1) 10507 NR_073419 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 567.666 chr2 16702632 16703222 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -37093 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 244.333-102 chr8 96983843 96984131 + 1.66667 NA intron (NM_016134, intron 5 of 7) L1MEd|LINE|L1 293941 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 269.667-59 chrX 72492001 72492292 + 1.66667 NA intron (NR_051952, intron 4 of 9) intron (NR_051952, intron 4 of 9) 80697 NR_051952 55869 Hs.310536 NM_018486 ENSG00000147099 HDAC8 CDA07|CDLS5|HD8|HDACL1|KDAC8|MRXS6|RPD3|WTS histone deacetylase 8 protein-coding 323.333-31 chr7 41893761 41894137 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -190859 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 280.333-16 chr17 70052012 70052196 + 1.66667 NA intron (NR_104130, intron 1 of 1) L1MC1|LINE|L1 833 NR_104129 101928141 Hs.639899 NR_104129 ENSG00000267603 LINC01028 TCONS_00025127 long intergenic non-protein coding RNA 1028 ncRNA 278.334-6 chr4 18029548 18029729 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7763 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 276.333-37 chr3 82801320 82801548 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 815292 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 303.333-40 chr2 119634626 119634895 + 1.66667 NA intron (NR_073132, intron 20 of 24) L1MB1|LINE|L1 -44407 NM_001105198 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 239.333-22 chr12 2330799 2331054 + 1.66667 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 61150 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 336.667-13 chr2 156417628 156417881 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -17798 NM_001083112 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 240.333-60 chr22 34265690 34265912 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -342913 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 310.667-25 chr2 179576309 179576635 + 1.66667 NA intron (NR_104234, intron 2 of 12) intron (NR_104234, intron 2 of 12) 5199 NM_001352814 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 378-17 chr21 30946188 30946614 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -64821 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 342.667-12 chr7 26255413 26255715 + 1.66667 NA Intergenic MamGypLTR1d|LTR|Gypsy -36314 NM_001362753 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 434.333-4 chr2 48099267 48099988 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -193834 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 339.334-5 chr21 21935144 21935640 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 163067 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 299.001 chr11 31786571 31786761 + 1.66667 NA non-coding (NR_160916, exon 11 of 11) non-coding (NR_160916, exon 11 of 11) 13995 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 294.667 chr1 185738698 185738985 + 1.66667 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) intron (NM_031935, intron 1 of 106) 4450 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 369.667-4 chr14 26115421 26115893 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 437773 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 346-37 chr7 39506315 39506892 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -59801 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 303.334-14 chr9 123857490 123857767 + 1.66667 NA intron (NM_001352968, intron 2 of 18) L1MC4|LINE|L1 72498 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 473.667-6 chr9 69143384 69143792 + 1.66667 NA intron (NM_001369871, intron 1 of 24) intron (NM_001369871, intron 1 of 24) 20573 NM_001369871 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 331.334 chr1 241514146 241514393 + 1.66667 NA intron (NM_000143, intron 2 of 9) intron (NM_000143, intron 2 of 9) 5516 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 321.333-62 chr9 108152457 108152833 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -662876 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 270-33 chr20 51991674 51991850 + 1.66667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 113722 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 363.667-5 chr17 60466084 60466485 + 1.66667 NA intron (NM_006380, intron 5 of 12) intron (NM_006380, intron 5 of 12) 43795 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 221.334-7 chr6 126485569 126485730 + 1.66667 NA TTS (NR_030316) TTS (NR_030316) 1018 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 302.334-7 chr3 2661104 2661385 + 1.66667 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) intron (NM_175607, intron 4 of 24) -230971 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 342.666-25 chr9 9799222 9799694 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_135135) promoter-TSS (NR_135135) 66 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 279-19 chr2 177861421 177861592 + 1.66667 NA intron (NM_001077197, intron 6 of 20) L1MB7|LINE|L1 27250 NM_001077196 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 230.334-11 chr7 104195323 104195494 + 1.66667 NA intron (NM_181747, intron 4 of 8) intron (NM_181747, intron 4 of 8) 12605 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 274-58 chr8 124150526 124150718 + 1.66667 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) intron (NR_103547, intron 1 of 4) 20900 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 256-4 chr1 60003922 60004138 + 1.66667 NA intron (NM_152377, intron 9 of 11) intron (NM_152377, intron 9 of 11) 69740 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 207-111 chr7 94307502 94307750 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 84566 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 185-24 chr15 91964184 91964332 + 1.66667 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) intron (NR_135775, intron 2 of 10) 109954 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 283 chr1 57651628 57651866 + 1.66667 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -208834 NR_104362 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 252.667-108 chr9 130098568 130098749 + 1.66667 NA intron (NM_020960, intron 9 of 17) intron (NM_020960, intron 9 of 17) 44752 NM_020960 57720 Hs.512461 NM_020960 ENSG00000148358 GPR107 GCDRP|LUSTR1|bA138E2.2 G protein-coupled receptor 107 protein-coding 254.333-93 chr9 92162938 92163227 + 1.66667 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 21615 NR_027341 158314 Hs.149940 NR_027341 LINC00475 C9orf44 long intergenic non-protein coding RNA 475 ncRNA 240.667-28 chr15 79685575 79685720 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 211350 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 191.333-55 chr13 78982265 78982489 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -142327 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 266.334-22 chr7 82730526 82730714 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -286664 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 267.667-56 chr5 126195112 126195279 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 15618 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 275.333-48 chr3 34499676 34499922 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 701169 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 205.333-143 chr20 58568399 58568722 + 1.66667 NA intron (NR_034147, intron 6 of 6) intron (NR_034147, intron 6 of 6) -53161 NM_001304787 164284 Hs.119286 NM_153360 ENSG00000198768 APCDD1L - APC down-regulated 1 like protein-coding 282.667-36 chr5 20483667 20483896 + 1.66667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) L1MA3|LINE|L1 91932 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 257-25 chr18 76355218 76355512 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -136287 NR_136504 101927989 Hs.665186 NR_136504 ENSG00000265778 LOC101927989 - uncharacterized LOC101927989 ncRNA 242-18 chr11 22596756 22597172 + 1.66667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 28877 NM_022725 2188 Hs.632151 NM_022725 ENSG00000183161 FANCF FAF FA complementation group F protein-coding 246-100 chr7 74260891 74261095 + 1.66667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -6535 NM_001278792 5982 Hs.647062 NM_002914 ENSG00000049541 RFC2 RFC40 replication factor C subunit 2 protein-coding 267-31 chr17 42382051 42382352 + 1.66667 NA intron (NM_213662, intron 1 of 23) intron (NM_213662, intron 1 of 23) 6241 NM_001369514 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 426.333-8 chr9 87348275 87348606 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -148788 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 198.333-111 chr20 37030034 37030187 + 1.66667 NA intron (NM_002895, intron 16 of 21) L1MB3|LINE|L1 65887 NM_001323282 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 259.334-3 chr10 126398529 126398744 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10159 NM_001288975 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 268.666-4 chr10 32235819 32236125 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 111186 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 251-45 chr3 43973562 43973715 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -140574 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 287.334-3 chr10 108145638 108145853 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -76452 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 522.666-2 chr9 83404329 83404884 + 1.66667 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) intron (NM_174938, intron 1 of 13) 63136 NM_001244960 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 290-19 chr2 68222523 68222803 + 1.66667 NA intron (NM_000945, intron 1 of 5) MLT2B1|LTR|ERVL 29869 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 272.667-3 chr1 96085467 96085661 + 1.66667 NA Intergenic LTR84a|LTR|ERVL 93496 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 543.001-2 chr4 37929193 37929636 + 1.66667 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) intron (NM_001253912, intron 2 of 20) -30984 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 276.334-9 chr18 80142392 80142608 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5424 NR_028340 100130522 Hs.352602 NM_001145731 ENSG00000267270 PARD6G-AS1 - PARD6G antisense RNA 1 ncRNA 381.666 chr1 246161868 246162434 + 1.66667 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 255261 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 159-118 chr8 81393300 81393484 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 54047 NM_002677 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 270.333-32 chr2 183347580 183347885 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 223289 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 354.333-11 chr2 170679928 170680224 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 34491 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 230.334-4 chr13 27469957 27470163 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19458 NM_152912 219402 Hs.534582 NM_152912 ENSG00000122033 MTIF3 IF3mt mitochondrial translational initiation factor 3 protein-coding 246.667-69 chr5 41705903 41706191 + 1.66667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 137610 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 270.666-9 chr15 69433160 69433426 + 1.66667 NA intron (NM_138555, intron 10 of 22) intron (NM_138555, intron 10 of 22) -18264 NR_132969 145694 Hs.147229 NR_132969 ENSG00000259426 LOC145694 - uncharacterized LOC145694 ncRNA 445-3 chr12 58274749 58275060 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 187012 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 250-68 chr5 150681979 150682171 + 1.66667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 18987 NM_018047 55696 Hs.713564 NM_018047 ENSG00000086589 RBM22 Cwc2|ZC3H16|fSAP47 RNA binding motif protein 22 protein-coding 239.333-24 chr12 10265719 10265901 + 1.66667 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) intron (NM_001351060, intron 2 of 8) 26849 NM_001351060 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 634 chr11 28227993 28228628 + 1.66667 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) MIR|SINE|MIR 119922 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 439.667 chr1 62191442 62191918 + 1.66667 NA Intergenic LTR35|LTR|ERV1 -3169 NM_001164835 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 264.333-31 chr17 66286628 66286926 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15836 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 362.667-15 chr2 213710669 213710978 + 1.66667 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) -47244 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 295.333-48 chr4 156111014 156111362 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -157322 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 253.667-32 chr2 135171421 135171603 + 1.66667 NA TTS (NM_012233) TTS (NM_012233) 34884 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 242.666-29 chr4 68246505 68246801 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_182502) promoter-TSS (NM_182502) -959 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 279-5 chr10 43883470 43883667 + 1.66667 NA intron (NR_038268, intron 4 of 4) intron (NR_038268, intron 4 of 4) 24157 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 277.334-18 chr9 31316003 31316243 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 65367 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 396-13 chr5 129565168 129565717 + 1.66667 NA intron (NM_133638, intron 7 of 22) intron (NM_133638, intron 7 of 22) -104753 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 178.334-3 chr7 24611500 24611666 + 1.66667 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) L2c|LINE|L2 38131 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 200.667-127 chr5 60299056 60299259 + 1.66667 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) L1M6|LINE|L1 73506 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 280.666-9 chr16 53925734 53926031 + 1.66667 NA intron (NM_001363894, intron 8 of 9) intron (NM_001363894, intron 8 of 9) -113511 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 287.334-5 chr12 55015907 55016163 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3939 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 215-84 chr9 87762253 87762467 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -10555 NR_027917 392360 Hs.690450 NM_001023564 ENSG00000188029 CTSL3P CTSL3|HCTSL-s cathepsin L family member 3, pseudogene pseudo 251-86 chr8 101270242 101270489 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -64301 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 208.333-61 chr18 21668332 21668551 + 1.66667 NA intron (NM_138340, intron 4 of 8) intron (NM_138340, intron 4 of 8) -4227 NM_001308257 171586 Hs.397978 NM_138340 ENSG00000158201 ABHD3 LABH3 abhydrolase domain containing 3 protein-coding 353.001-2 chr11 76026656 76026933 + 1.66667 NA intron (NM_003369, intron 12 of 14) AmnSINE2|SINE|tRNA-Deu 179708 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 256.333-25 chr12 76529627 76529901 + 1.66667 NA intron (NM_001003712, intron 1 of 22) L2|LINE|L2 30007 NM_001319652 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 335.666-7 chr2 43382584 43382922 + 1.66667 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) L1M5|LINE|L1 155542 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 351-13 chr3 155110324 155110676 + 1.66667 NA intron (NM_000902, intron 3 of 22) intron (NM_000902, intron 3 of 22) 30489 NM_001354644 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 255-45 chr2 71420797 71421028 + 1.66667 NA intron (NM_001252613, intron 21 of 27) intron (NM_001252613, intron 21 of 27) -32649 NM_001130978 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 271.667-6 chr1 192585509 192585795 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 9879 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 243.667-40 chr2 109119863 109120076 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9236 NM_001099289 344558 Hs.171244 NM_001099289 ENSG00000172985 SH3RF3 POSH2|SH3MD4 SH3 domain containing ring finger 3 protein-coding 299-42 chr9 30487793 30488115 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -79500 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 387.334-8 chr8 51817740 51818023 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_052937, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_052937, exon 6 of 6) -8436 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 271.667-71 chr8 82699946 82700220 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -212021 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 305.333-52 chr4 88991293 88991798 + 1.66667 NA intron (NM_014883, intron 3 of 23) intron (NM_014883, intron 3 of 23) 65640 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 279-40 chrX 74374879 74375150 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -46479 NM_006517 6567 Hs.75317 NM_006517 ENSG00000147100 SLC16A2 AHDS|DXS128|DXS128E|MCT 7|MCT 8|MCT7|MCT8|MRX22|XPCT solute carrier family 16 member 2 protein-coding 244.667-9 chr1 221842742 221842978 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2194 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 225.666-26 chr6 134768313 134768470 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 181710 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 454 chr10 99722287 99722808 + 1.66667 NA intron (NM_004376, intron 5 of 8) intron (NM_004376, intron 5 of 8) -9687 NM_015960 51076 Hs.16606 NM_015960 ENSG00000119929 CUTC CGI-32 cutC copper transporter protein-coding 264.334-19 chr6 139600566 139600741 + 1.66667 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie -126057 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 333.001 chr3 41722483 41722809 + 1.66667 NA intron (NR_136342, intron 21 of 34) AluSp|SINE|Alu 239457 NM_001322501 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 280.333-4 chr10 119646541 119646746 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -4727 NM_004281 9531 Hs.523309 NM_004281 ENSG00000151929 BAG3 BAG-3|BIS|CAIR-1|MFM6 BCL2 associated athanogene 3 protein-coding 267-35 chr17 76253844 76254094 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11379 NM_182565 283991 Hs.744981 NM_182565 ENSG00000185262 UBALD2 FAM100B UBA like domain containing 2 protein-coding 347.667-10 chr2 191615109 191615460 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -62788 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 505.334-4 chr6 52657902 52658432 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -6234 NR_024405 730101 Hs.7921 NR_024403 ENSG00000216775 LOC730101 - uncharacterized LOC730101 ncRNA 439.333-8 chr3 19450401 19450865 + 1.66667 NA intron (NM_144633, intron 9 of 15) intron (NM_144633, intron 9 of 15) -135702 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 129-15 chr10 50557101 50557248 + 1.66667 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) MER99|DNA|hAT? 66782 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 229.333-95 chr5 24423588 24423856 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 221256 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 261-26 chr17 2478844 2479052 + 1.66667 NA intron (NM_024086, intron 2 of 9) L1MB7|LINE|L1 32940 NM_024086 79066 Hs.632237 NM_024086 ENSG00000127804 METTL16 METT10D methyltransferase like 16 protein-coding 249-31 chr16 47687367 47687537 + 1.66667 NA intron (NM_001031835, intron 27 of 31) intron (NM_001031835, intron 27 of 31) -171129 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 398.333-5 chr13 108046090 108046425 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 168525 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 265.667-59 chr5 84202370 84202562 + 1.66667 NA intron (NM_001278642, intron 2 of 9) intron (NM_001278642, intron 2 of 9) 182401 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 388.333-13 chr22 28544367 28544805 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MER41B|LTR|ERV1 84717 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 390-21 chr5 44855381 44855877 + 1.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 46682 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 344.334-6 chr7 12331545 12331898 + 1.66667 NA intron (NM_001135924, intron 28 of 28) MIR|SINE|MIR 72144 NM_001135924 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 373.333-16 chr21 31696743 31697065 + 1.66667 NA intron (NM_020706, intron 7 of 19) intron (NM_020706, intron 7 of 19) 35214 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 260-48 chr21 30130659 30130828 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 36062 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 275.667-28 chr18 60122457 60122656 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 222560 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 244-32 chr14 33700892 33701152 + 1.66667 NA intron (NM_001165893, intron 5 of 10) L2c|LINE|L2 -7915 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 238.667-28 chr14 81651323 81651559 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -28380 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 183.333-93 chr20 14455936 14456146 + 1.66667 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -98343 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 469-4 chr16 46394143 46394829 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 174611 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 378.667-4 chr1 217599050 217599312 + 1.66667 NA intron (NM_018040, intron 5 of 9) intron (NM_018040, intron 5 of 9) 31909 NM_001297754 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 271-44 chr8 58603253 58603433 + 1.66667 NA exon (NM_003580, exon 13 of 31) exon (NM_003580, exon 13 of 31) 50082 NM_005625 6386 Hs.200804 NM_005625 ENSG00000137575 SDCBP MDA-9|MDA9|ST1|SYCL|TACIP18 syndecan binding protein protein-coding 212.334 chr1 246412932 246413088 + 1.66667 NA intron (NM_001167740, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 4402 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 241.334-4 chr10 121222691 121222882 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 308528 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 316-34 chr3 112239916 112240329 + 1.66667 NA intron (NR_135297, intron 7 of 22) intron (NR_135297, intron 7 of 22) 54094 NM_001320531 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 222.334-7 chr2 77462310 77462491 + 1.66667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 59976 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 261.667-5 chr1 106339609 106339799 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -311451 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 404-12 chr5 57566356 57566767 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -3781 NR_120607 100996645 Hs.582496 NR_120607 LINCR-0003 - uncharacterized LincR-0003 ncRNA 247-32 chr17 27343017 27343310 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 49049 NR_145520 26118 Hs.446017 NM_015626 ENSG00000109046 WSB1 SWIP1|WSB-1 WD repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 352-21 chr5 34878769 34879115 + 1.66667 NA intron (NM_001317949, intron 8 of 10) L1PB4|LINE|L1 36562 NM_002853 5810 Hs.38114 NM_002853 ENSG00000113456 RAD1 HRAD1|REC1 RAD1 checkpoint DNA exonuclease protein-coding 243.334-18 chrX 106520257 106520501 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -91551 NM_001184782 55086 Hs.274267 NM_018015 ENSG00000147231 RADX CXorf57 RPA1 related single stranded DNA binding protein, X-linked protein-coding 212.333-66 chr2 49516486 49516668 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -362050 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 396-6 chr18 3455923 3456264 + 1.66667 NA intron (NM_173211, intron 1 of 2) intron (NM_173211, intron 1 of 2) 2319 NM_173211 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 172.333-134 chr5 35652354 35652602 + 1.66667 NA intron (NM_144722, intron 6 of 9) intron (NM_144722, intron 6 of 9) 34615 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 282.334-10 chr2 193608922 193609122 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -735247 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 247-4 chr1 183591119 183591405 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_000433) promoter-TSS (NM_000433) -348 NM_001127651 4688 Hs.587558 NM_000433 ENSG00000116701 NCF2 NCF-2|NOXA2|P67-PHOX|P67PHOX neutrophil cytosolic factor 2 protein-coding 266-78 chr6 144510142 144510338 + 1.66667 NA intron (NM_007124, intron 33 of 73) intron (NM_007124, intron 33 of 73) 104585 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 257.667-23 chr14 91063854 91064039 + 1.66667 NA intron (NM_001358312, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 -3297 NM_182398 9252 Hs.510225 NM_004755 ENSG00000100784 RPS6KA5 MSK1|MSPK1|RLPK ribosomal protein S6 kinase A5 protein-coding 477.667 chr3 99046675 99047154 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -145219 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 209-49 chr15 86228760 86228930 + 1.66667 NA intron (NM_152336, intron 6 of 24) intron (NM_152336, intron 6 of 24) 88123 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 243.667-65 chr6 38259125 38259412 + 1.66667 NA intron (NM_052893, intron 9 of 11) intron (NM_052893, intron 9 of 11) -222328 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 189-34 chr16 46801777 46801931 + 1.66667 NA non-coding (NR_145835, exon 5 of 5) non-coding (NR_145835, exon 5 of 5) 29194 NR_145837 388272 Hs.406551 NM_001001436 ENSG00000155330 C16orf87 - chromosome 16 open reading frame 87 protein-coding 233-18 chr12 100713697 100713967 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -80944 NM_178826 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 265.667-74 chr8 107902076 107902375 + 1.66667 NA intron (NM_001282863, intron 4 of 4) intron (NM_001282863, intron 4 of 4) 179714 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 231-14 chr14 26022043 26022203 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 531307 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 211.666-9 chr11 98253353 98253602 + 1.66667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -767472 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 250-83 chr8 28894461 28894722 + 1.66667 NA intron (NM_024567, intron 2 of 10) intron (NM_024567, intron 2 of 10) 3277 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 239.333-82 chr5 22883455 22883624 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR -30195 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 224-83 chr6 41612061 41612239 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 13427 NR_039784 100616178 NR_039784 ENSG00000266494 MIR4641 - microRNA 4641 ncRNA 358.334-2 chr16 50325539 50325867 + 1.66667 NA intron (NM_013263, intron 11 of 16) intron (NM_013263, intron 11 of 16) 33087 NR_106829 102465462 NR_106829 ENSG00000274969 MIR6771 hsa-mir-6771 microRNA 6771 ncRNA 168.333-197 chr7 73896297 73896486 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 35232 NM_182504 135886 Hs.647026 NM_182504 ENSG00000175877 TMEM270 WBSCR28 transmembrane protein 270 protein-coding 351.667-12 chr3 171350143 171350499 + 1.66667 NA intron (NR_027767, intron 2 of 2) intron (NR_027767, intron 2 of 2) 110084 NM_001161566 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 264.667-32 chr15 47440965 47441208 + 1.66667 NA intron (NM_001198999, intron 2 of 19) intron (NM_001198999, intron 2 of 19) 256997 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 270 chr1 38502032 38502303 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26971 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 382.666-14 chr4 60782062 60782685 + 1.66667 NA Intergenic (ATAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -140246 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 221-19 chr14 19778613 19778817 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1608 NM_001005500 441670 Hs.553829 NM_001005500 ENSG00000176299 OR4M1 OR14-7 olfactory receptor family 4 subfamily M member 1 protein-coding 298.667-29 chr8 106462075 106462414 + 1.66667 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 14320 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 291-29 chr3 9466493 9466807 + 1.66667 NA intron (NM_001080517, intron 18 of 22) intron (NM_001080517, intron 18 of 22) 68950 NM_001080517 55209 Hs.288164 NM_018187 ENSG00000168137 SETD5 - SET domain containing 5 protein-coding 324.999-5 chr11 125238196 125238591 + 1.66667 NA intron (NM_022062, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR 73642 NM_022062 63876 Hs.278564 NM_022062 ENSG00000165495 PKNOX2 PREP2 PBX/knotted 1 homeobox 2 protein-coding 306-58 chr9 100839051 100839288 + 1.66667 NA Intergenic (TTCAATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -189558 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 213-47 chr21 35720038 35720246 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_030414) promoter-TSS (NR_030414) -573 NR_030414 768219 NR_030414 ENSG00000211590 MIR802 MIRN802|hsa-mir-802 microRNA 802 ncRNA 254.333-51 chr22 34795138 34795532 + 1.66667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 202581 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 263.334-11 chr4 146711754 146712006 + 1.66667 NA intron (NR_133922, intron 12 of 13) intron (NR_133922, intron 12 of 13) 72987 NM_004575 5458 Hs.266 NM_004575 ENSG00000151615 POU4F2 BRN3.2|BRN3B|Brn-3b POU class 4 homeobox 2 protein-coding 400.334-5 chr8 101511154 101511567 + 1.66667 NA intron (NM_001330593, intron 1 of 15) L1ME4b|LINE|L1 18921 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 346.334 chr11 84783177 84783442 + 1.66667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) MIR3|SINE|MIR -62367 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 272.666-12 chr2 149637401 149637617 + 1.66667 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR -49734 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 377.667-14 chr6 140985367 140985807 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 301773 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 224.667-10 chr11 7459177 7459468 + 1.66667 NA intron (NR_103855, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 6513 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 254.334-28 chr6 126549116 126549341 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 64597 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 336.667-20 chr6 67125036 67125372 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -930147 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 318.667-7 chr11 36864502 36864844 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -266394 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 315.666-10 chr3 89258957 89259291 + 1.66667 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) L1MC4a|LINE|L1 151503 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 252.666-22 chr2 123556918 123557197 + 1.66667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 468117 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 221-37 chr2 187711523 187711819 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -157166 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 244.667-88 chr7 34807411 34807699 + 1.66667 NA intron (NM_207172, intron 3 of 8) L1M6|LINE|L1 26776 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 382.334-7 chr19 27607947 27608449 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -185233 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 264.666-38 chr9 112870972 112871213 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001012994, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001012994, exon 9 of 9) 19784 NM_033051 57864 Hs.512668 NM_033051 ENSG00000119457 SLC46A2 Ly110|TSCOT solute carrier family 46 member 2 protein-coding 219.334-5 chr7 28934954 28935114 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 23296 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 179.667-86 chr20 45013090 45013248 + 1.66667 NA intron (NM_001352385, intron 9 of 11) L1M5|LINE|L1 46657 NM_006282 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 266.667-23 chr14 61653629 61653827 + 1.66667 NA non-coding (NR_039985, exon 3 of 3) non-coding (NR_039985, exon 3 of 3) -41785 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 667.001 chr8 81287618 81288249 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 7397 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 436-10 chr5 93482172 93482500 + 1.66667 NA intron (NR_021491, intron 4 of 5) L1PA7|LINE|L1 89007 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 255.334-29 chr8 115857568 115857766 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -188692 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 221.666-13 chr11 29332406 29332669 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -261876 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 260.667-47 chr2 77435668 77435859 + 1.66667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 86613 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 258.666-8 chr11 36752384 36752661 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -154243 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 277.333-66 chr4 34895382 34895670 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -625779 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 252-38 chr16 72602519 72602781 + 1.66667 NA intron (NR_159372, intron 1 of 7) intron (NR_159372, intron 1 of 7) 62320 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 289.667-2 chr1 244648731 244648920 + 1.66667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -4223 NR_123736 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 277.333-73 chr5 66047507 66047758 + 1.66667 NA intron (NM_001253697, intron 18 of 25) MER3|DNA|hAT-Charlie -96668 NM_001323534 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 282.333-38 chr4 61096183 61096454 + 1.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -47338 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 229-71 chr8 130917021 130917255 + 1.66667 NA intron (NM_001115, intron 5 of 17) MIRc|SINE|MIR 123771 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 321.333-58 chr7 138915808 138916293 + 1.66667 NA intron (NM_020910, intron 2 of 19) intron (NM_020910, intron 2 of 19) 65339 NM_001164665 57670 Hs.605380 NM_020910 ENSG00000122778 KIAA1549 - KIAA1549 protein-coding 238.333-95 chr8 143257962 143258181 + 1.66667 NA intron (NM_173832, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu -9374 NM_138465 2738 Hs.400533 NM_138465 ENSG00000250571 GLI4 HKR4|ZNF928 GLI family zinc finger 4 protein-coding 256.667-47 chr2 153600402 153600702 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -121790 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 309.667 chr1 41437097 41437489 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 47390 NM_001302269 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 237-15 chr10 96168056 96168290 + 1.66667 NA intron (NR_138482, intron 3 of 4) intron (NR_138482, intron 3 of 4) 37551 NM_001330734 9849 Hs.600823 NM_014803 ENSG00000177853 ZNF518A ZNF518 zinc finger protein 518A protein-coding 296.667-3 chr1 170355288 170355593 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -71232 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 297.667-20 chr2 101300525 101300925 + 1.66667 NA intron (NM_173647, intron 1 of 6) intron (NM_173647, intron 1 of 6) 7976 NM_173647 284996 Hs.142074 NM_173647 ENSG00000163162 RNF149 DNAPTP2 ring finger protein 149 protein-coding 256-53 chr20 47602461 47602679 + 1.66667 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) intron (NM_181659, intron 2 of 22) 100683 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 394-17 chr8 51129652 51130082 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 679578 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 427.667-7 chr20 59519163 59519461 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -58197 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 261.333-38 chr17 68345467 68345777 + 1.66667 NA intron (NM_001352909, intron 3 of 10) intron (NM_001352909, intron 3 of 10) 53487 NM_001352901 22901 Hs.437249 NM_014960 ENSG00000141337 ARSG USH4 arylsulfatase G protein-coding 255.333-19 chr11 84704547 84704833 + 1.66667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 16252 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 294.666-15 chr2 43624912 43625145 + 1.66667 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -12232 NM_172069 130271 Hs.164162 NM_172069 ENSG00000152527 PLEKHH2 PLEKHH1L pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H2 protein-coding 261-29 chr17 65107743 65107965 + 1.66667 NA intron (NR_110801, intron 2 of 2) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 7042 NR_110801 100507002 Hs.729924 NR_110801 LOC100507002 - uncharacterized LOC100507002 ncRNA 294.667-52 chr7 20507656 20507935 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -107872 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 330.667-3 chr10 68229801 68230010 + 1.66667 NA TTS (NM_145178) TTS (NM_145178) 2208 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 244-74 chr3 131909481 131909688 + 1.66667 NA intron (NM_001289112, intron 1 of 15) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 76347 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 280.667-26 chr16 67066710 67066989 + 1.66667 NA intron (NM_001755, intron 4 of 5) intron (NM_001755, intron 4 of 5) 37700 NM_001368707 865 Hs.460988 NM_001755 ENSG00000067955 CBFB PEBP2B core-binding factor subunit beta protein-coding 407.667 chr1 57276779 57277211 + 1.66667 NA intron (NM_001353980, intron 5 of 5) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 146117 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 280-28 chr2 175077496 175077731 + 1.66667 NA intron (NR_045770, intron 14 of 15) intron (NR_045770, intron 14 of 15) -72234 NM_001025201 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 217.333-46 chr15 50637813 50637993 + 1.66667 NA intron (NR_149154, intron 6 of 37) intron (NR_149154, intron 6 of 37) 48894 NR_149153 54822 Hs.512894 NM_017672 ENSG00000092439 TRPM7 ALSPDC|CHAK|CHAK1|LTRPC7|LTrpC-7|TRP-PLIK transient receptor potential cation channel subfamily M member 7 protein-coding 231.333-59 chr2 105885119 105885275 + 1.66667 NA intron (NM_001004720, intron 3 of 3) intron (NM_001004720, intron 3 of 3) 33350 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 258.667-86 chr6 91967527 91967812 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -277241 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 173.333-210 chr9 17953479 17953645 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 374496 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 159.667-236 chr4 84729074 84729220 + 1.66667 NA intron (NM_014991, intron 44 of 67) intron (NM_014991, intron 44 of 67) 146020 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 386-9 chr3 100305939 100306281 + 1.66667 NA intron (NM_001199198, intron 12 of 18) intron (NM_001199198, intron 12 of 18) -28647 NM_020202 56954 Hs.439152 NM_020202 ENSG00000114021 NIT2 HEL-S-8a nitrilase family member 2 protein-coding 240-57 chr22 33564453 33564640 + 1.66667 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) -127877 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 342-36 chr7 34006039 34006368 + 1.66667 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) intron (NM_133468, intron 7 of 15) 100664 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 243-39 chr22 23194618 23194770 + 1.66667 NA intron (NM_004327, intron 1 of 22) AluY|SINE|Alu 14185 NM_021574 613 Hs.517461 NM_004327 ENSG00000186716 BCR ALL|BCR1|CML|D22S11|D22S662|PHL BCR activator of RhoGEF and GTPase protein-coding 251-58 chr4 164606597 164606834 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -147416 NM_001352885 100505989 Hs.328236 NM_001352885 ENSG00000248771 SMIM31 LINC01207 small integral membrane protein 31 protein-coding 329-11 chr19 35909994 35910400 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1888 NM_003332 7305 Hs.515369 NM_003332 ENSG00000011600 TYROBP DAP12|KARAP|PLOSL|PLOSL1 TYRO protein tyrosine kinase binding protein protein-coding 246-4 chr1 109997569 109997742 + 1.66667 NA intron (NM_001242673, intron 1 of 16) intron (NM_001242673, intron 1 of 16) -3272 NM_001242674 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 320.667-28 chr4 164395808 164396157 + 1.66667 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -12727 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 232-69 chr5 54748226 54748376 + 1.66667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -4043 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 242.667-57 chr2 218970241 218970469 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -5929 NR_024385 151300 Hs.420716 NR_015390 LINC00608 - long intergenic non-protein coding RNA 608 ncRNA 229.333-7 chr1 155343509 155343840 + 1.66667 NA exon (NM_001366177, exon 23 of 28) exon (NM_001366177, exon 23 of 28) 2771 NR_030282 693140 NR_030282 ENSG00000283701 MIR555 MIRN555|hsa-mir-555 microRNA 555 ncRNA 220.666-23 chr14 68365248 68365435 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 263446 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 333.667-4 chr10 99756162 99756442 + 1.66667 NA TTS (NM_015960) TTS (NM_015960) -23636 NM_004376 1355 Hs.28326 NM_004376 ENSG00000014919 COX15 CEMCOX2 cytochrome c oxidase assembly homolog COX15 protein-coding 320.333-22 chr5 19650923 19651251 + 1.66667 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 235185 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 256.666-49 chr8 76627969 76628247 + 1.66667 NA intron (NR_024360, intron 2 of 3) intron (NR_024360, intron 2 of 3) -53139 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 272.334-4 chr1 234410897 234411103 + 1.66667 NA intron (NM_005646, intron 22 of 29) AluSz|SINE|Alu 37299 NM_001301733 388753 Hs.23198 NM_001012985 ENSG00000168275 COA6 C1orf31|CEMCOX4 cytochrome c oxidase assembly factor 6 protein-coding 513.667-3 chr7 55023745 55024185 + 1.66667 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) 4933 NM_201283 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 426.334 chr1 192801364 192801914 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7400 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 356-22 chr2 100049371 100049703 + 1.66667 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) L1MC4|LINE|L1 56046 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 256.667-67 chr4 65989209 65989374 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -287533 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 450-8 chr8 121835613 121835984 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -194358 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 427-2 chr2 123564264 123564879 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 460603 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 362.334-4 chr3 143312774 143313081 + 1.66667 NA intron (NM_173653, intron 14 of 15) intron (NM_173653, intron 14 of 15) -29319 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 196-93 chr2 158911441 158911660 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -57084 NM_001350065 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 247-47 chr21 31397171 31397370 + 1.66667 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) MIRc|SINE|MIR -52916 NM_001353687 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 460.667 chr1 64013349 64013745 + 1.66667 NA intron (NM_005012, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 98658 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 323.001 chr13 87486475 87486695 + 1.66667 NA intron (NR_033829, intron 2 of 5) intron (NR_033829, intron 2 of 5) 132155 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 382.667-3 chr1 106611588 106611866 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -206512 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 297-49 chr9 132500261 132500564 + 1.66667 NA intron (NM_207417, intron 4 of 6) MIR|SINE|MIR -82194 NM_020064 56751 Hs.283809 NM_020064 ENSG00000125492 BARHL1 - BarH like homeobox 1 protein-coding 345.667-23 chr9 26854049 26854309 + 1.66667 NA intron (NM_001167575, intron 5 of 5) MIR|SINE|MIR 38623 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 414.334-2 chr7 7842652 7843095 + 1.66667 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 -124266 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 242-76 chr8 88854535 88854705 + 1.66667 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -527137 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 268-63 chr9 27774545 27774738 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -200775 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 265.667-35 chr2 81161216 81161387 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 305645 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 268-42 chr4 33096851 33097148 + 1.66667 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 745961 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 345.999-5 chr4 130324792 130325184 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -51373 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 417.334 chr12 50625116 50625546 + 1.66667 NA intron (NM_173602, intron 1 of 37) intron (NM_173602, intron 1 of 37) 120346 NM_173602 57609 Hs.505516 NM_020849 ENSG00000066084 DIP2B - disco interacting protein 2 homolog B protein-coding 255.333-68 chr22 26935026 26935303 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 31872 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 208-112 chr3 183996363 183996511 + 1.66667 NA intron (NR_135125, intron 2 of 6) intron (NR_135125, intron 2 of 6) -9901 NR_046570 100873982 Hs.570696 NR_046570 ENSG00000223882 ABCC5-AS1 - ABCC5 antisense RNA 1 ncRNA 256.333-73 chr7 33718196 33718415 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -186610 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 316.333-12 chr17 31399686 31400224 + 1.66667 NA intron (NM_032932, intron 1 of 14) AluSx|SINE|Alu 8280 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 249-66 chr7 107316919 107317073 + 1.66667 NA intron (NM_181733, intron 11 of 20) intron (NM_181733, intron 11 of 20) 147993 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 286.333-50 chrX 126957210 126957434 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 137593 NM_001122716 100130613 Hs.130370 NM_001122716 ENSG00000183631 PRR32 CXorf64 proline rich 32 protein-coding 437.334-3 chr3 123132992 123133541 + 1.66667 NA intron (NM_006810, intron 11 of 16) L3|LINE|CR1 -28528 NR_106960 102465667 NR_106960 ENSG00000284421 MIR7110 hsa-mir-7110 microRNA 7110 ncRNA 268.333-11 chr11 71550265 71550572 + 1.66667 NA TTS (NM_005553) TTS (NM_005553) 1998 NM_005553 3846 Hs.709220 NM_005553 ENSG00000254997 KRTAP5-9 KRN1|KRTAP5-1|KRTAP5.9 keratin associated protein 5-9 protein-coding 250.334-12 chr3 23608370 23608543 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -197499 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 353.334-6 chr3 20223194 20223508 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37118 NM_001199255 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 261.333-53 chr2 200590686 200590949 + 1.66667 NA intron (NM_001159, intron 1 of 34) intron (NM_001159, intron 1 of 34) 4803 NM_001159 316 Hs.406238 NM_001159 ENSG00000138356 AOX1 AO|AOH1 aldehyde oxidase 1 protein-coding 286-65 chrX 36525188 36525388 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -84996 NR_110412 101928627 Hs.590831 NR_110412 ENSG00000226484 LOC101928627 - uncharacterized LOC101928627 ncRNA 358.333-31 chr8 142300043 142300355 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001366902, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001366902, exon 10 of 10) 101843 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 470.666-3 chr7 10561133 10561638 + 1.66667 NA intron (NR_147499, intron 2 of 2) intron (NR_147499, intron 2 of 2) -141291 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 414.667-3 chr12 25508149 25508550 + 1.66667 NA intron (NM_152590, intron 7 of 8) L1ME3A|LINE|L1 44934 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 314.333-27 chr8 37250800 37251048 + 1.66667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 242989 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 216.666-15 chr10 69214055 69214220 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -6195 NM_025130 80201 Hs.522988 NM_025130 ENSG00000156510 HKDC1 - hexokinase domain containing 1 protein-coding 226.333-46 chr17 70936848 70937124 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 265193 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 419.334-3 chr15 48678087 48678410 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -32460 NM_000138 2200 Hs.591133 NM_000138 ENSG00000166147 FBN1 ACMICD|ECTOL1|FBN|GPHYSD2|MASS|MFLS|MFS1|OCTD|SGS|SSKS|WMS|WMS2 fibrillin 1 protein-coding 181.333-194 chrX 24935738 24935895 + 1.66667 NA intron (NM_016937, intron 36 of 36) MIRc|SINE|MIR 80149 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 272.001 chr2 34922714 34922899 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 245249 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 264.667-40 chr2 18532354 18532596 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 28178 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 225.667-83 chr9 27604216 27604429 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30456 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 481 chr1 97567668 97568328 + 1.66667 NA intron (NM_000110, intron 11 of 22) intron (NM_000110, intron 11 of 22) -228923 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 246.333-51 chr2 124796149 124796402 + 1.66667 NA intron (NM_130773, intron 18 of 23) intron (NM_130773, intron 18 of 23) 770988 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 284-39 chr3 184976066 184976415 + 1.66667 NA intron (NM_001009921, intron 39 of 46) HAL1b|LINE|L1 163733 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 185-76 chr8 71577612 71577886 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -29655 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 366.001-2 chr11 82076378 82076668 + 1.66667 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) MIRc|SINE|MIR -185687 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 473.001-2 chr3 79849631 79850113 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81874 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 285.001-4 chr16 84148252 84148434 + 1.66667 NA intron (NM_178452, intron 1 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 3035 NM_178452 123872 Hs.310164 NM_178452 ENSG00000154099 DNAAF1 CILD13|LRRC50|ODA7|swt dynein axonemal assembly factor 1 protein-coding 203.667-33 chr15 91066775 91066942 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32730 NM_001323031 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 309.334-15 chr8 144027344 144027691 + 1.66667 NA intron (NM_198572, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 15237 NM_198572 375686 Hs.97726 NM_198572 ENSG00000186583 SPATC1 SPATA15 spermatogenesis and centriole associated 1 protein-coding 246.666-37 chr7 94674445 94674716 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 18210 NM_001184962 23089 Hs.147492 NM_015068 ENSG00000242265 PEG10 EDR|HB-1|MEF3L|Mar2|Mart2|RGAG3|RTL2|SIRH1 paternally expressed 10 protein-coding 199-35 chr17 80535524 80535747 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9203 NM_001163034 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 160-116 chr8 64851570 64851759 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -52927 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 248.333-91 chr6 43234737 43234935 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -5355 NM_199184 10591 Hs.109752 NM_006443 ENSG00000112667 DNPH1 C6orf108|RCL|dJ330M21.3 2'-deoxynucleoside 5'-phosphate N-hydrolase 1 protein-coding 262.667-78 chr8 9586817 9587013 + 1.66667 NA intron (NM_003747, intron 2 of 26) intron (NM_003747, intron 2 of 26) 31003 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 431.667-2 chr11 17319822 17320281 + 1.66667 NA intron (NM_001352669, intron 12 of 14) L1PA13|LINE|L1 -31749 NM_001202439 374383 Hs.146274 NM_001009913 ENSG00000188211 NCR3LG1 B7-H6|B7H6|DKFZp686O24166 natural killer cell cytotoxicity receptor 3 ligand 1 protein-coding 471.666-2 chr6 49532647 49533113 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17788 NR_146855 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 325.667-5 chr14 20080748 20081150 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 20904 NM_001004717 122742 Hs.553574 NM_001004717 ENSG00000176246 OR4L1 OR14-28|OR4L2P olfactory receptor family 4 subfamily L member 1 protein-coding 272.334-17 chr8 129303969 129304251 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -62870 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 340.667-8 chr14 49376902 49377352 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 209253 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 385-2 chr1 116507879 116508435 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29331 NR_125972 101929023 Hs.668091 NR_125972 ENSG00000233154 LINC01762 - long intergenic non-protein coding RNA 1762 ncRNA 223.667-8 chr1 218036749 218036962 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6650 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 246-60 chr21 26224420 26224597 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -53380 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 463.001-2 chr3 85634708 85635204 + 1.66667 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR -91526 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 365.667-10 chr2 215719364 215719624 + 1.66667 NA non-coding (NR_132383, exon 2 of 2) non-coding (NR_132383, exon 2 of 2) 1451 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 473.001 chr14 84375357 84375737 + 1.66667 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -896385 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 258.334-21 chr7 1799274 1799431 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 44901 NR_039799 100616160 NR_039799 ENSG00000265089 MIR4655 - microRNA 4655 ncRNA 484.001 chr7 120656032 120656472 + 1.66667 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 201892 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 238-49 chr2 113151151 113151359 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -22716 NM_012455 23550 Hs.516306 NM_012455 ENSG00000125637 PSD4 EFA6B|TIC pleckstrin and Sec7 domain containing 4 protein-coding 252.667-98 chr8 18606967 18607129 + 1.66667 NA intron (NM_015310, intron 11 of 15) intron (NM_015310, intron 11 of 15) 201819 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 238.334-3 chr10 110033049 110033293 + 1.66667 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) intron (NM_001121, intron 1 of 13) -24790 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 285.334-12 chr8 119950348 119950610 + 1.66667 NA intron (NM_022783, intron 3 of 8) AluSx|SINE|Alu 76757 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 184.334-4 chr20 53789447 53789607 + 1.66667 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 86182 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 528.333-2 chr4 154162301 154162979 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 329159 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 318.667-30 chr6 162239420 162239782 + 1.66667 NA intron (NM_004562, intron 3 of 11) intron (NM_004562, intron 3 of 11) -487531 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 246-96 chr6 150102054 150102364 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -33088 NM_024518 79465 Hs.15422 NM_024518 ENSG00000131019 ULBP3 N2DL-3|NKG2DL3|RAET1N UL16 binding protein 3 protein-coding 215-78 chr7 138375426 138375670 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -84711 NM_003852 8805 Hs.490287 NM_003852 ENSG00000122779 TRIM24 PTC6|RNF82|TF1A|TIF1|TIF1A|TIF1ALPHA|hTIF1 tripartite motif containing 24 protein-coding 366 chr1 61451602 61451909 + 1.66667 NA intron (NM_001134673, intron 10 of 10) intron (NM_001134673, intron 10 of 10) -198237 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 303-36 chr3 16657301 16657603 + 1.66667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -52029 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 341.333-5 chr10 82077147 82077458 + 1.66667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 155618 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 268.334-9 chr17 57598119 57598378 + 1.66667 NA intron (NM_001322250, intron 8 of 13) intron (NM_001322250, intron 8 of 13) 10164 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 313-32 chr5 52452830 52453199 + 1.66667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -334902 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 189.334-3 chr3 55182370 55182535 + 1.66667 NA intron (NR_147142, intron 1 of 2) intron (NR_147142, intron 1 of 2) 4280 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 400.333-13 chr3 197843500 197843764 + 1.66667 NA intron (NM_001365717, intron 10 of 19) AluSx|SINE|Alu 52378 NM_001365718 84859 Hs.518414 NM_032773 ENSG00000186001 LRCH3 - leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3 protein-coding 289.334-7 chr22 31201640 31201864 + 1.66667 NA intron (NR_024210, intron 6 of 6) intron (NR_024210, intron 6 of 6) -10546 NM_005569 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 282.334-9 chr2 177475808 177476080 + 1.66667 NA intron (NM_003659, intron 10 of 19) L1MB7|LINE|L1 76852 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 248-58 chr4 30301239 30301400 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -419050 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 392-19 chr7 4541492 4542060 + 1.66667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -140519 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 280.667-27 chr17 72936553 72936740 + 1.66667 NA intron (NM_139177, intron 5 of 9) intron (NM_139177, intron 5 of 9) 156042 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 304.333-12 chr14 50420622 50420982 + 1.66667 NA intron (NM_198794, intron 31 of 31) intron (NM_198794, intron 31 of 31) -23504 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 365.667-19 chr8 131447799 131448186 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -407083 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 214-75 chr2 239680520 239680782 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -82209 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 442.667 chr18 581450 581930 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_004066, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_004066, exon 1 of 1) 1310 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 152.334 chr16 47082860 47083008 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_018092, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_018092, exon 9 of 9) 61011 NM_018092 81831 Hs.645802 NM_018092 ENSG00000171208 NETO2 BTCL2|NEOT2 neuropilin and tolloid like 2 protein-coding 244.333-79 chr5 15683782 15683956 + 1.66667 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -68867 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 251.334-34 chr8 136681952 136682211 + 1.66667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 151283 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 410.333-5 chr20 52200263 52200597 + 1.66667 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR -8445 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 408.666-2 chr14 70154426 70154789 + 1.66667 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -32501 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 172.334-2 chr3 96108810 96108960 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -251079 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 344-26 chr21 30800119 30800505 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 12962 NM_175857 337879 Hs.407655 NM_175857 ENSG00000183640 KRTAP8-1 KAP8.1 keratin associated protein 8-1 protein-coding 375.999-2 chr20 52202862 52203291 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11091 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 416.667-9 chr20 46428245 46428668 + 1.66667 NA intron (NR_146919, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 -21405 NM_182764 63916 Hs.210469 NM_022086 ENSG00000062598 ELMO2 CED-12|CED12|Ced-12A|ELMO-2|VMPI engulfment and cell motility 2 protein-coding 601 chr1 237703645 237704411 + 1.66667 NA intron (NM_001035, intron 66 of 104) L2c|LINE|L2 -158147 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 401-11 chr22 29054094 29054549 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_032173, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_032173, exon 9 of 9) 7598 NM_015370 25770 Hs.50891 NM_015370 ENSG00000100249 C22orf31 HS747E2A|bK747E2.1 chromosome 22 open reading frame 31 protein-coding 330.667-22 chr5 101401671 101402073 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -498590 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 269.334 chr1 67182926 67183128 + 1.66667 NA intron (NM_144701, intron 4 of 10) intron (NM_144701, intron 4 of 10) 16573 NM_144701 149233 Hs.677426 NM_144701 ENSG00000162594 IL23R - interleukin 23 receptor protein-coding 423-4 chr2 27919536 27920052 + 1.66667 NA intron (NM_199193, intron 3 of 13) intron (NM_199193, intron 3 of 13) -28680 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 247.666-7 chr12 7426748 7427045 + 1.66667 NA intron (NM_001297650, intron 4 of 19) L1M3|LINE|L1 17289 NM_174941 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 369.999 chr10 93265210 93265684 + 1.66667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 191554 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 199.333-80 chr14 70964475 70964663 + 1.66667 NA intron (NM_014982, intron 3 of 35) intron (NM_014982, intron 3 of 35) 57110 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 268.333-18 chr13 94519510 94519822 + 1.66667 NA intron (NM_001322186, intron 1 of 9) MER91A|DNA|hAT-Tip100 29740 NM_001322185 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 362.001 chr1 172743459 172743772 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 84512 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 259.333-74 chr4 157378689 157378985 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 158109 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 257.333-64 chr3 98627341 98627600 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -33859 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 336.333 chr1 69155370 69155743 + 1.66667 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) L1PB4|LINE|L1 99658 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 217.333-133 chr6 142169993 142170221 + 1.66667 NA intron (NM_001286371, intron 3 of 6) intron (NM_001286371, intron 3 of 6) 22844 NM_016485 51534 Hs.431367 NM_016485 ENSG00000009844 VTA1 C6orf55|DRG-1|DRG1|HSPC228|LIP5|My012|SBP1 vesicle trafficking 1 protein-coding 241.334 chr1 118370343 118370539 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -185213 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 238.334 chr1 117063082 117063428 + 1.66667 NA intron (NM_003594, intron 3 of 22) L1ME2|LINE|L1 2929 NM_003594 8458 Hs.32333 NM_003594 ENSG00000116830 TTF2 HuF2|ZGRF6 transcription termination factor 2 protein-coding 231-34 chr2 177396181 177396370 + 1.66667 NA intron (NM_003659, intron 1 of 19) L2b|LINE|L2 3502 NM_003659 8540 Hs.516543 NM_003659 ENSG00000018510 AGPS ADAP-S|ADAS|ADHAPS|ADPS|ALDHPSY|RCDP3 alkylglycerone phosphate synthase protein-coding 370.667-19 chr4 35453450 35453825 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 790302 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 179.334-3 chr2 8393131 8393269 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -64781 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 211.334-4 chr18 1736888 1737069 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -377349 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 255-34 chr16 80321459 80321682 + 1.66667 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -219164 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 213.667-89 chr7 54190898 54191060 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -139718 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 272.667-33 chr2 122033696 122033882 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 278138 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 201.334-2 chr17 80624661 80624828 + 1.66667 NA intron (NM_020761, intron 1 of 33) L1PREC2|LINE|L1 79906 NM_020761 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 252.667-22 chr12 31461402 31461566 + 1.66667 NA intron (NM_001366891, intron 3 of 4) MER46C|DNA|TcMar-Tigger -92183 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 118-72 chr2 171419296 171419489 + 1.66667 NA intron (NM_001321157, intron 1 of 10) L1MC3|LINE|L1 14598 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 253.667-37 chr2 224759501 224759756 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -174231 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 321.334-4 chr10 123398281 123398582 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 244029 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 332.334-4 chr4 187582049 187582283 + 1.66667 NA intron (NR_110436, intron 2 of 2) L1ME4c|LINE|L1 -76553 NR_038931 339975 Hs.639361 NR_038931 LOC339975 - uncharacterized LOC339975 ncRNA 246-91 chr6 100307474 100307669 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 156104 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 290-28 chr20 54191977 54192254 + 1.66667 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -15972 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 219.667-24 chr15 46405927 46406141 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 700839 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 284-9 chr11 120613960 120614224 + 1.66667 NA intron (NM_001282470, intron 1 of 19) intron (NM_001282470, intron 1 of 19) 49656 NM_001282470 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 299.333-78 chr8 142688688 142689093 + 1.66667 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 8395 NM_005672 8000 Hs.652235 NM_005672 ENSG00000167653 PSCA PRO232 prostate stem cell antigen protein-coding 198.667-75 chr16 47779324 47779510 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -79164 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 378.001 chr12 22417233 22417605 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -82705 NM_003034 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 341.999-2 chr10 21134424 21134959 + 1.66667 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -39299 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 371.333-8 chr12 121381019 121381429 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -18859 NM_025126 80196 Hs.292804 NM_025126 ENSG00000170633 RNF34 CARP-1|CARP1|RFI|RIF|RIFF|hRFI ring finger protein 34 protein-coding 272.667-61 chr6 128919289 128919526 + 1.66667 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 36266 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 273.334-4 chr17 22237740 22238002 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 34876 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 512.667-3 chr3 187334746 187335219 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -33403 NM_022147 64108 Hs.43388 NM_022147 ENSG00000136514 RTP4 IFRG28|Z3CXXC4 receptor transporter protein 4 protein-coding 214.667-105 chr7 26618756 26618968 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19009 NR_161202 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 193.334-3 chr4 61781760 61781924 + 1.66667 NA intron (NM_001371343, intron 8 of 23) intron (NM_001371343, intron 8 of 23) 379923 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 327-10 chr17 40139412 40139810 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_007359) promoter-TSS (NM_007359) -926 NM_007359 22794 Hs.743287 NM_007359 ENSG00000108349 CASC3 BTZ|MLN51 CASC3 exon junction complex subunit protein-coding 423.001 chr3 180551309 180551656 + 1.66667 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL -50681 NM_133462 151613 Hs.43213 NM_133462 ENSG00000163728 TTC14 DRDL5813|PRO19630 tetratricopeptide repeat domain 14 protein-coding 332-6 chr12 3026364 3026727 + 1.66667 NA intron (NM_201443, intron 8 of 10) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -50810 NM_001168320 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 255-72 chr6 124170198 124170458 + 1.66667 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 -112677 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 251.667-61 chr3 77564903 77565096 + 1.66667 NA exon (NM_002942, exon 12 of 26) exon (NM_002942, exon 12 of 26) 466987 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 236-53 chr3 49373681 49373944 + 1.66667 NA intron (NM_001664, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu -15212 NM_001329455 2876 Hs.76686 NM_000581 ENSG00000233276 GPX1 GPXD|GSHPX1 glutathione peroxidase 1 protein-coding 247.667-34 chr15 46144411 46144693 + 1.66667 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 439357 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 262.667-57 chr4 113401740 113401996 + 1.66667 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 109029 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 219.333-144 chr5 66815049 66815350 + 1.66667 NA intron (NM_001290228, intron 3 of 4) intron (NM_001290228, intron 3 of 4) -13574 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 198-78 chr18 3825339 3825524 + 1.66667 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) MER2B|DNA|TcMar-Tigger 19927 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 266.667-18 chr12 23415187 23415396 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 169295 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 242.333 chr1 43371036 43371318 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3103 NM_001256401 64834 Hs.25597 NM_022821 ENSG00000066322 ELOVL1 CGI-88|Ssc1 ELOVL fatty acid elongase 1 protein-coding 263.334-15 chr6 166103837 166104002 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6199 NR_147704 729681 Hs.520550 NR_147704 LOC729681 - uncharacterized LOC729681 ncRNA 253.667 chr1 31916831 31917128 + 1.66667 NA intron (NM_001369860, intron 2 of 5) intron (NM_001369860, intron 2 of 5) 20839 NM_001369860 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 465.667 chr1 81074342 81074727 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -231658 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 177.667-90 chr3 115522090 115522265 + 1.66667 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -101333 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 399.666-5 chr8 26809576 26809877 + 1.66667 NA intron (NM_001322504, intron 1 of 1) intron (NM_001322504, intron 1 of 1) 55929 NM_033304 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 219-29 chr15 100737467 100737631 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -112203 NR_160703 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 433.667-2 chr10 81311587 81311998 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -563402 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 298.333-4 chr10 19346976 19347299 + 1.66667 NA intron (NM_001142308, intron 24 of 39) intron (NM_001142308, intron 24 of 39) 298336 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 144.666-5 chr11 100713297 100713507 + 1.66667 NA intron (NM_001367945, intron 1 of 25) MIRb|SINE|MIR -25447 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 169-45 chr2 75421048 75421224 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -102932 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 220-88 chr5 45719728 45719945 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23456 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 376.334 chr1 68065985 68066442 + 1.66667 NA intron (NR_040077, intron 2 of 9) intron (NR_040077, intron 2 of 9) -14582 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 374-2 chr10 44619222 44619630 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -234329 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 311.667-10 chr2 73046499 73046833 + 1.66667 NA intron (NM_001330406, intron 2 of 14) intron (NM_001330406, intron 2 of 14) 12506 NM_001330407 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 271.667-62 chr7 48328128 48328365 + 1.66667 NA intron (NM_152701, intron 27 of 61) intron (NM_152701, intron 27 of 61) 156788 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 231-25 chr2 42173038 42173195 + 1.66667 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) intron (NM_001145076, intron 1 of 21) -2885 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 276.001-2 chr20 47952927 47953098 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -30214 NR_109942 101060004 Hs.129970 NR_109942 LINC01523 - long intergenic non-protein coding RNA 1523 ncRNA 228.333-4 chr1 185834922 185835156 + 1.66667 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) intron (NM_031935, intron 1 of 106) 100648 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 244.667-15 chr10 50883759 50883925 + 1.66667 NA intron (NM_001198818, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 1785 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 319.667-18 chr21 33818557 33818919 + 1.66667 NA intron (NM_001001132, intron 23 of 29) intron (NM_001001132, intron 23 of 29) 97066 NM_001697 539 Hs.409140 NM_001697 ENSG00000241837 ATP5PO ATP5O|ATPO|HMC08D05|OSCP ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP protein-coding 316.334-2 chr15 41808351 41808659 + 1.66667 NA intron (NM_001128608, intron 3 of 31) AluSq2|SINE|Alu -19580 NM_001198588 8681 Hs.198161 NM_005090 ENSG00000168970 JMJD7-PLA2G4B HsT16992|cPLA2-beta JMJD7-PLA2G4B readthrough protein-coding 264.667-5 chr1 113356859 113357125 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -33523 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 291.333-21 chr13 111846609 111846951 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -46598 NR_046992 101928616 Hs.528450 NR_046992 LINC00354 - long intergenic non-protein coding RNA 354 ncRNA 283-10 chr12 106376378 106376606 + 1.66667 NA intron (NM_001160708, intron 7 of 27) intron (NM_001160708, intron 7 of 27) 18410 NM_001160708 55703 Hs.62696 NM_018082 ENSG00000013503 POLR3B C128|HLD8|INMAP|RPC2 RNA polymerase III subunit B protein-coding 327.333-29 chr3 118732665 118732998 + 1.66667 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 78002 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 305.333-31 chr2 43846580 43846893 + 1.66667 NA intron (NM_001357321, intron 3 of 12) intron (NM_001357321, intron 3 of 12) 7765 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 205.667-32 chr12 6498329 6498563 + 1.66667 NA intron (NM_014865, intron 2 of 31) L2a|LINE|L2 4344 NM_014865 9918 Hs.5719 NM_014865 ENSG00000010292 NCAPD2 CAP-D2|CNAP1|MCPH21|hCAP-D2 non-SMC condensin I complex subunit D2 protein-coding 316.333-29 chr8 82768959 82769429 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -142910 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 300.667-35 chr5 51603045 51603240 + 1.66667 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 219694 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 361-11 chr2 28026729 28026990 + 1.66667 NA intron (NM_199193, intron 6 of 13) intron (NM_199193, intron 6 of 13) 30492 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 199.333-40 chr11 47987542 47987786 + 1.66667 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) 7105 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 246.667-101 chr8 120633252 120633420 + 1.66667 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) AluSx1|SINE|Alu -127917 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 275.667-45 chr5 90661032 90661244 + 1.66667 NA intron (NR_003149, intron 21 of 89) intron (NR_003149, intron 21 of 89) 102341 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 225-53 chr5 128270829 128270993 + 1.66667 NA intron (NM_001999, intron 62 of 64) intron (NM_001999, intron 62 of 64) 187145 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 215.667-107 chr6 67618795 67618994 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -436457 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 238.333-52 chr20 3985431 3985634 + 1.66667 NA intron (NM_001134338, intron 1 of 6) intron (NM_001134338, intron 1 of 6) 30026 NM_001134338 11237 Hs.547576 NM_007219 ENSG00000101236 RNF24 G1L ring finger protein 24 protein-coding 294.333-16 chr16 12973986 12974321 + 1.66667 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 72555 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 171.667-89 chr2 199508355 199508553 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -37188 NM_015265 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 377.667-6 chr2 55967199 55967521 + 1.66667 NA intron (NR_126406, intron 2 of 2) intron (NR_126406, intron 2 of 2) 15716 NR_029630 406999 NR_029630 ENSG00000207548 MIR217 MIRN217|mir-217 microRNA 217 ncRNA 402.666-3 chr11 79766408 79766782 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -325565 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 244.334-12 chr18 6439942 6440138 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24781 NM_001365765 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 304.334-11 chr7 40230251 40230594 + 1.66667 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) intron (NM_024728, intron 6 of 14) 95446 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 149.667-256 chr3 82199110 82199370 + 1.66667 NA intron (NR_147146, intron 2 of 8) intron (NR_147146, intron 2 of 8) 213098 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 197-13 chr1 244839414 244839611 + 1.66667 NA intron (NM_001312872, intron 2 of 4) intron (NM_001312872, intron 2 of 4) 3854 NM_198076 116228 Hs.411490 NM_198076 ENSG00000203667 COX20 FAM36A cytochrome c oxidase assembly factor COX20 protein-coding 490.334-3 chr3 133639698 133640206 + 1.66667 NA intron (NM_001363889, intron 13 of 27) intron (NM_001363889, intron 13 of 27) 21989 NM_001363889 11073 Hs.593379 NM_007027 ENSG00000163781 TOPBP1 Dpb11|TOP2BP1 DNA topoisomerase II binding protein 1 protein-coding 771.333 chr14 62838748 62839867 + 1.66667 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) intron (NM_139318, intron 8 of 10) 206151 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 234-39 chr2 123070280 123070445 + 1.66667 NA non-coding (NR_147208, exon 2 of 3) non-coding (NR_147208, exon 2 of 3) 3119 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 312-34 chr3 144047785 144048168 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 74895 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 254.334-23 chr4 74724583 74724818 + 1.66667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 69823 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 275-17 chr17 50723275 50723543 + 1.66667 NA intron (NM_006107, intron 1 of 10) intron (NM_006107, intron 1 of 10) 3806 NM_001330330 51747 Hs.130293 NM_006107 ENSG00000108848 LUC7L3 CRA|CREAP-1|CROP|LUC7A|OA48-18|hLuc7A LUC7 like 3 pre-mRNA splicing factor protein-coding 329.667-11 chr2 159258494 159258908 + 1.66667 NA intron (NM_001330279, intron 5 of 9) intron (NM_001330279, intron 5 of 9) 28002 NM_001307994 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 254.334-5 chr11 23988409 23988610 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -508544 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 284-22 chr18 49179859 49180146 + 1.66667 NA intron (NM_001353210, intron 13 of 16) intron (NM_001353210, intron 13 of 16) -130234 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 549-3 chr7 82346632 82347182 + 1.66667 NA intron (NM_000722, intron 2 of 38) intron (NM_000722, intron 2 of 38) 96870 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 270.333-2 chr1 110279219 110279548 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 59788 NR_036595 440600 Hs.649375 NR_036595 ENSG00000227963 RBM15-AS1 AS-RBM15 RBM15 antisense RNA 1 ncRNA 438.334 chr10 117127913 117128245 + 1.66667 NA TTS (NM_199131) TTS (NM_199131) -1493 NM_001258300 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 285.667-52 chr8 106400378 106400700 + 1.66667 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) intron (NM_018002, intron 2 of 15) -47385 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 233.666-28 chr7 106478779 106478944 + 1.66667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 182297 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 381.334-5 chr18 7389635 7389982 + 1.66667 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? 71198 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 233-26 chr14 53461982 53462197 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 308735 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 273.334-17 chr8 54579505 54579802 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36443 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 211.667 chr1 7842518 7842657 + 1.66667 NA intron (NM_001289861, intron 22 of 22) intron (NM_001289861, intron 22 of 22) 10478 NM_006786 10911 Hs.715862 NM_006786 ENSG00000049247 UTS2 PRO1068|U-II|UCN2|UII urotensin 2 protein-coding 321.334-10 chr8 123534192 123534478 + 1.66667 NA intron (NM_058229, intron 2 of 8) intron (NM_058229, intron 2 of 8) -2192 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 269.334-10 chr4 30953021 30953278 + 1.66667 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) L3|LINE|CR1 -217995 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 285.334-4 chr13 78000228 78000424 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5553 NR_108076 101927176 Hs.116150 NR_108076 LINC01069 - long intergenic non-protein coding RNA 1069 ncRNA 275-53 chr9 105811825 105812076 + 1.66667 NA Intergenic SATR2|Satellite|Satellite 117409 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 557.333 chr14 56533187 56533684 + 1.66667 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) intron (NR_135241, intron 1 of 1) 19104 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 255-83 chr8 17803884 17804102 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -2414 NM_001363061 57509 Hs.7946 NM_020749 ENSG00000129422 MTUS1 ATBP|ATIP|ATIP3|ICIS|MP44|MTSG1 microtubule associated scaffold protein 1 protein-coding 277-9 chr13 71536374 71536654 + 1.66667 NA intron (NM_004392, intron 2 of 6) intron (NM_004392, intron 2 of 6) 330678 NM_004392 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 310.334-3 chr11 58857656 58857979 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13113 NM_145016 219970 Hs.254271 NM_145016 ENSG00000156689 GLYATL2 BXMAS2-10|GATF-B glycine-N-acyltransferase like 2 protein-coding 535.334-3 chr5 77657321 77657824 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -18875 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 345-19 chr6 167475711 167476025 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3078 NR_134591 105378127 Hs.58456 NR_134591 LOC105378127 - uncharacterized LOC105378127 ncRNA 289.667-4 chr10 65416000 65416242 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -155304 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 298.334-11 chr7 40228477 40228679 + 1.66667 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) L1MC5|LINE|L1 93602 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 195-66 chr2 169757883 169758067 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 24143 NM_144711 151230 Hs.655150 NM_144711 ENSG00000213160 KLHL23 DITHP kelch like family member 23 protein-coding 248.333-101 chr8 123774860 123775174 + 1.66667 NA intron (NM_144963, intron 2 of 23) intron (NM_144963, intron 2 of 23) 6578 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 310-36 chr3 149517811 149518163 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_015472, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_015472, exon 7 of 7) 43290 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 251.667-42 chr2 81057510 81057754 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 409314 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 369-9 chr2 27401182 27401497 + 1.66667 NA intron (NM_177983, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 -7763 NR_002201 2498 Hs.658438 NR_002201 FTH1P3 FTHL3|FTHL3P ferritin heavy chain 1 pseudogene 3 pseudo 335.333-10 chr11 119564082 119564450 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -139281 NM_001311162 7070 Hs.644697 NM_006288 ENSG00000154096 THY1 CD90|CDw90 Thy-1 cell surface antigen protein-coding 329.334 chr1 193845657 193845931 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 541049 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 261.667-78 chr9 92028888 92029104 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -78768 NM_001318204 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 286.334-10 chr6 148139221 148139438 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -132999 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 340.334-14 chr6 49179222 49179464 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 283910 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 266.334-15 chr21 28869194 28869391 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 16075 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 279.667-18 chr15 78469270 78469536 + 1.66667 NA intron (NM_001320941, intron 5 of 20) intron (NM_001320941, intron 5 of 20) 30982 NM_001320942 3658 Hs.436031 NM_004136 ENSG00000136381 IREB2 ACO3|IRE-BP 2|IRE-BP2|IRP2|IRP2AD|NDCAMA iron responsive element binding protein 2 protein-coding 281-2 chr1 55428809 55429050 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 203288 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 224.667-69 chr6 136576679 136576847 + 1.66667 NA intron (NM_005923, intron 25 of 29) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -25944 NM_001198617 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 494.667 chr18 70661798 70662349 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11119 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 278.667-31 chr21 29969723 29969913 + 1.66667 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 -29766 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 263-12 chr11 33325916 33326204 + 1.66667 NA intron (NM_001278162, intron 2 of 15) intron (NM_001278162, intron 2 of 15) -50048 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 297.333-7 chr10 33866612 33866844 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -94048 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 602.667 chr8 81677346 81677855 + 1.66667 NA intron (NM_005536, intron 4 of 8) intron (NM_005536, intron 4 of 8) 8725 NM_005536 3612 Hs.656694 NM_005536 ENSG00000133731 IMPA1 IMP|IMPA|MRT59 inositol monophosphatase 1 protein-coding 266-82 chr8 131210321 131210595 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -169549 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 230.667-70 chr6 72562769 72562958 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -58980 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 174.333-105 chr4 93651777 93651967 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) L2b|LINE|L2 -176881 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 351.334 chr1 56928477 56928816 + 1.66667 NA TTS (NM_001278543) TTS (NM_001278543) 37369 NM_000066 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 217.667-46 chr2 69947570 69947780 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 14590 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 326-9 chr11 20644549 20644920 + 1.66667 NA intron (NM_004211, intron 13 of 15) L1ME3|LINE|L1 -24817 NM_201551 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 357.666-9 chr5 65757828 65758124 + 1.66667 NA intron (NM_020726, intron 1 of 12) AluJr|SINE|Alu 35771 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 297.333-13 chr12 330772 331137 + 1.66667 NA intron (NM_001042603, intron 13 of 27) intron (NM_001042603, intron 13 of 27) 58366 NM_001042603 5927 Hs.76272 NM_005056 ENSG00000073614 KDM5A RBBP-2|RBBP2|RBP2 lysine demethylase 5A protein-coding 426.667-3 chr6 99366732 99367176 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16898 NM_001346530 84553 Hs.573245 NM_032511 ENSG00000146267 FAXC C6orf168|dJ273F20 failed axon connections homolog, metaxin like GST domain containing protein-coding 298.333-27 chr3 74878717 74879043 + 1.66667 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -335596 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 291-14 chr14 56062168 56062435 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -56110 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 277.667-35 chr4 66170177 66170486 + 1.66667 NA Intergenic MER9a1|LTR|ERVK -106493 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 235-44 chr5 58872421 58872612 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 127382 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 599.334 chr2 236679292 236679777 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 109709 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 383-12 chrX 82417199 82417743 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -1090819 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 241.667-53 chr3 31826159 31826428 + 1.66667 NA intron (NM_001174060, intron 3 of 10) intron (NM_001174060, intron 3 of 10) 122080 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 268.333-30 chr2 37467977 37468274 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 123495 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 289.334-11 chr8 118737436 118737780 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -115645 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 287-24 chr4 149997809 149998069 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -80506 NM_001040260 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 272.667-70 chr9 87052355 87052562 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10332 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 292.666-4 chr1 227087312 227087710 + 1.66667 NA intron (NM_001366019, intron 16 of 36) L1ME1|LINE|L1 147217 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 679.334 chr10 23117183 23117764 + 1.66667 NA intron (NM_012228, intron 3 of 4) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 21894 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 255.667-15 chr11 91387450 91387604 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -518325 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 219-60 chr3 108597129 108597323 + 1.66667 NA intron (NM_014648, intron 1 of 32) intron (NM_014648, intron 1 of 32) 7504 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 258.667-90 chr7 51807486 51807873 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -414423 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 220.334-4 chr6 50393302 50393478 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -320154 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 345.666-11 chr5 59950313 59950838 + 1.66667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -56849 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 433.333 chr1 92137181 92137590 + 1.66667 NA intron (NM_183242, intron 5 of 8) L2c|LINE|L2 -31539 NM_015237 23285 Hs.21554 NM_015237 ENSG00000189195 KIAA1107 - KIAA1107 protein-coding 260.334-8 chr12 43926863 43927097 + 1.66667 NA intron (NM_001286213, intron 2 of 6) L1MEd|LINE|L1 90899 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 256-9 chr10 58071928 58072083 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 195889 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 237-71 chr8 30442971 30443213 + 1.66667 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) intron (NM_001008710, intron 1 of 8) -57691 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 289.667-13 chr15 88371223 88371521 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 96016 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 342-2 chr11 91551558 91551951 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -673280 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 222-6 chr1 203106669 203106966 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -20805 NM_002479 4656 Hs.2830 NM_002479 ENSG00000122180 MYOG MYF4|bHLHc3|myf-4 myogenin protein-coding 436.999 chr4 43129831 43130217 + 1.66667 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner 236758 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 306.666-20 chr3 5855583 5855896 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -605484 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 388.333-19 chr7 35728224 35728641 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 11995 NR_108083 100506725 Hs.304253 NR_108082 ENSG00000227544 LOC100506725 - uncharacterized LOC100506725 ncRNA 329.334-7 chr4 84162973 84163312 + 1.66667 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) intron (NR_125909, intron 5 of 8) 136027 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 349.334-3 chr11 45778709 45779120 + 1.66667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 7482 NR_027134 374387 Hs.632142 NM_199137 ENSG00000205106 LINC02716 DKFZp779M0652 long intergenic non-protein coding RNA 2716 ncRNA 434.666-3 chr10 75367194 75367949 + 1.66667 NA intron (NR_120651, intron 1 of 3) intron (NR_120651, intron 1 of 3) -33957 NR_024421 100131213 Hs.534598 NR_024421 ENSG00000237149 ZNF503-AS2 C10orf41|NCRNA00245 ZNF503 antisense RNA 2 ncRNA 281.333-15 chr12 57141643 57141912 + 1.66667 NA intron (NM_002332, intron 3 of 88) MIR3|SINE|MIR 5842 NR_131938 105751187 Hs.609540 NR_131938 ENSG00000259125 LRP1-AS - LRP1 antisense RNA ncRNA 326.667-37 chr8 140372121 140372468 + 1.66667 NA intron (NM_001160372, intron 7 of 22) intron (NM_001160372, intron 7 of 22) 85450 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 309.999-4 chr4 45721881 45722348 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 401940 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 326.334-9 chr4 77262469 77262686 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 105370 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 190.334 chr10 4915082 4915215 + 1.66667 NA intron (NR_026743, intron 1 of 10) L1PA16|LINE|L1 1125 NR_026743 389932 Hs.631812 NR_026743 AKR1C6P TAKR aldo-keto reductase family 1 member C6, pseudogene pseudo 249.667-61 chr3 42580024 42580296 + 1.66667 NA intron (NM_001201572, intron 1 of 6) intron (NM_001201572, intron 1 of 6) -1680 NM_016305 51188 Hs.534454 NM_016305 ENSG00000008324 SS18L2 KIAA-iso SS18 like 2 protein-coding 209.334 chr1 78826939 78827104 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 177190 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 254-67 chr5 132555970 132556183 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_005732) promoter-TSS (NM_005732) -901 NM_005732 10111 Hs.633509 NM_005732 ENSG00000113522 RAD50 NBSLD|RAD502|hRad50 RAD50 double strand break repair protein protein-coding 262.333-57 chr3 102524898 102525120 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 89994 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 291.333-65 chr8 56030987 56031353 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 42731 NR_002437 26795 NR_002437 ENSG00000238650 SNORD54 RNU54|U54 small nucleolar RNA, C/D box 54 snoRNA 244-49 chr2 63947540 63947745 + 1.66667 NA intron (NM_001005739, intron 8 of 22) intron (NM_001005739, intron 8 of 22) 71786 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 231.333-19 chr10 65629192 65629375 + 1.66667 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) intron (NR_120647, intron 3 of 5) 57858 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 356.666-10 chr2 39150779 39151029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30441 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 273.333-54 chr4 153591702 153592023 + 1.66667 NA intron (NM_001131007, intron 17 of 34) L1MC4|LINE|L1 -48306 NR_134873 100419170 Hs.382102 NR_134873 ENSG00000250771 LOC100419170 - toll like receptor 2 pseudogene pseudo 367.333-20 chr7 51720142 51720477 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -327053 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 213-85 chr8 91411637 91411779 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 162389 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 457.667-4 chr4 53394230 53394660 + 1.66667 NA intron (NM_001134937, intron 8 of 17) HAL1|LINE|L1 16792 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 330.333-3 chr10 51378173 51378528 + 1.66667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 78777 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 241.334-15 chrX 88431774 88432000 + 1.66667 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger -315338 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 232-43 chr2 52230399 52230635 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -140131 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 477.334-2 chr2 146593646 146593943 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6737 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 440.667-4 chr2 79592315 79592763 + 1.66667 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) intron (NM_001282598, intron 1 of 17) 56820 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 373.334-2 chr11 19459819 19460154 + 1.66667 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) MIR|SINE|MIR 47243 NR_049725 100874012 Hs.434602 NR_049725 ENSG00000255043 NAV2-AS5 - NAV2 antisense RNA 5 ncRNA 210-151 chr8 126503243 126503444 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 55135 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 374-7 chr15 42114495 42114852 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -20111 NM_178034 283748 Hs.380225 NM_178034 ENSG00000159337 PLA2G4D cPLA2delta phospholipase A2 group IVD protein-coding 335-31 chr8 91469487 91469717 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 220283 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 269-52 chrX 153175632 153175906 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -3515 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 168.667-113 chr2 201733610 201733739 + 1.66667 NA intron (NM_020919, intron 12 of 33) intron (NM_020919, intron 12 of 33) -35030 NM_033066 58538 Hs.63085 NM_033066 ENSG00000082126 MPP4 ALS2CR5|DLG6 membrane palmitoylated protein 4 protein-coding 273.334-3 chr12 26294072 26294345 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 98635 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 328.667-8 chr2 139956567 139956782 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 630011 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 268.334 chr1 225629982 225630238 + 1.66667 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) intron (NM_001008493, intron 1 of 14) 23013 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 239.334 chr1 62449419 62449571 + 1.66667 NA intron (NM_001017415, intron 8 of 8) intron (NM_001017415, intron 8 of 8) 12446 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 337.667-23 chr7 95405685 95406063 + 1.66667 NA intron (NM_000305, intron 8 of 8) intron (NM_000305, intron 8 of 8) -9499 NM_000940 5446 Hs.440967 NM_000940 ENSG00000105852 PON3 - paraoxonase 3 protein-coding 256.333-15 chr10 92546418 92546723 + 1.66667 NA intron (NR_136399, intron 1 of 25) intron (NR_136399, intron 1 of 25) 26936 NM_001322796 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 283.667-27 chr4 73973768 73973986 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 8150 NM_002619 5196 Hs.81564 NM_002619 ENSG00000163737 PF4 CXCL4|PF-4|SCYB4 platelet factor 4 protein-coding 301-44 chr5 89965293 89965531 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 51308 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 330.334-4 chr10 74395104 74395408 + 1.66667 NA intron (NM_001369124, intron 5 of 9) intron (NM_001369124, intron 5 of 9) 134068 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 299.667-40 chr9 86489722 86489946 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -135424 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 216.333-110 chr4 156465743 156466007 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 505924 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 220.667-92 chr6 47649124 47649275 + 1.66667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -7273 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 149.334-2 chr14 77936077 77936208 + 1.66667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 136033 NR_158987 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 257-69 chr8 75604897 75605201 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65081 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 231.667-6 chr11 113710113 113710258 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -3812 NR_110047 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 291-26 chr2 199314213 199314394 + 1.66667 NA intron (NM_001172509, intron 9 of 10) intron (NM_001172509, intron 9 of 10) 143636 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 273.667-38 chr20 6866633 6866866 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 99063 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 344-35 chr5 74011429 74011871 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 198104 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 262.667-4 chr1 173829250 173829514 + 1.66667 NA intron (NM_001365212, intron 3 of 15) L1ME4b|LINE|L1 4709 NM_001365212 55157 Hs.647707 NM_018122 ENSG00000117593 DARS2 ASPRS|LBSL|MT-ASPRS|mtAspRS aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 339-9 chr18 21443494 21443808 + 1.66667 NA intron (NM_001142966, intron 10 of 32) intron (NM_001142966, intron 10 of 32) 157053 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 256.334-5 chr12 47761593 47761773 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2803 NM_001098531 10411 Hs.8578 NM_006105 ENSG00000079337 RAPGEF3 CAMP-GEFI|EPAC|EPAC1|HSU79275|bcm910 Rap guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 270.334-15 chr2 108408467 108408714 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 30636 NM_006588 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 254.667-29 chr17 27221451 27221645 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 72448 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 301-12 chr14 39167465 39167748 + 1.66667 NA intron (NM_001079537, intron 1 of 5) L1MC5|LINE|L1 2727 NM_177452 122553 Hs.13303 NM_177452 ENSG00000182400 TRAPPC6B NEDMEBA|TPC6 trafficking protein particle complex 6B protein-coding 446-7 chr20 1103449 1104044 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -9483 NM_178578 9491 Hs.471917 NM_006814 ENSG00000125818 PSMF1 PI31 proteasome inhibitor subunit 1 protein-coding 254.667-84 chr9 30534338 30534521 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -125975 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 165-80 chr5 114334448 114334626 + 1.66667 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -27533 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 314.667-16 chr14 20984518 20984841 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5301 NM_022734 64745 Hs.512693 NM_022734 ENSG00000165792 METTL17 METT11D1 methyltransferase like 17 protein-coding 250.667-52 chr3 176753883 176754055 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 63032 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 303-46 chr7 7831506 7831793 + 1.66667 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR -113042 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 244-18 chr11 12480400 12480662 + 1.66667 NA intron (NM_018222, intron 4 of 12) intron (NM_018222, intron 4 of 12) 102960 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 328.666-6 chr14 45962928 45963342 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -101024 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 252.334 chr11 28731016 28731231 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -253575 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 326.334-2 chr10 55533721 55533965 + 1.66667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1PA16|LINE|L1 -65199 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 216-69 chr21 15899277 15899488 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 169400 NM_013396 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 367-3 chr10 84611277 84611781 + 1.66667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 186360 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 341.001-2 chr21 22649048 22649317 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -430102 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 258-84 chr8 60363853 60364132 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 49826 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 317.334-3 chr3 175866486 175866747 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -90283 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 186.334-4 chr8 12827841 12828001 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16443 NR_152742 340357 Hs.434302 NR_015383 ENSG00000254813 LOC340357 - uncharacterized LOC340357 ncRNA 206-69 chr2 33667424 33667635 + 1.66667 NA Intergenic Tigger10|DNA|TcMar-Tigger -39357 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 265-25 chr15 98080435 98080747 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8162 NR_120325 101927332 NR_120325 LINC01582 - long intergenic non-protein coding RNA 1582 ncRNA 196-2 chr1 19293470 19293696 + 1.66667 NA non-coding (NR_037847, exon 1 of 1) non-coding (NR_037847, exon 1 of 1) 2153 NR_037847 100506730 NR_037847 LOC100506730 - uncharacterized LOC100506730 ncRNA 626.334 chr12 12186052 12186596 + 1.66667 NA intron (NM_002336, intron 4 of 22).2 intron (NM_002336, intron 4 of 22).2 74372 NR_128710 103504734 NR_128710 ENSG00000283475 MIR1244-4 hsa-mir-1244-4 microRNA 1244-4 ncRNA 346-10 chr16 48627283 48627604 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17263 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 498.333-2 chr16 76560465 76560803 + 1.66667 NA non-coding (NR_136216, exon 26 of 26) non-coding (NR_136216, exon 26 of 26) -74364 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 354-2 chr1 163585100 163585549 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -162133 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 334.334-4 chr2 109183972 109184255 + 1.66667 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -42525 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 289-28 chr6 41571156 41571578 + 1.66667 NA intron (NM_001012427, intron 2 of 16) intron (NM_001012427, intron 2 of 16) -22746 NR_126415 101060264 Hs.571099 NR_126415 ENSG00000234753 FOXP4-AS1 - FOXP4 antisense RNA 1 ncRNA 235.334-4 chr2 176029664 176029890 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26957 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 206-138 chr5 38030246 38030434 + 1.66667 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 4643 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 254.333-34 chr18 68338431 68338718 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 376534 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 312-10 chr10 107992877 107993314 + 1.66667 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) L1MEf|LINE|L1 76198 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 406-13 chr7 24374805 24375312 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 90868 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 304.667-15 chr2 28671411 28671652 + 1.66667 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? 64674 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 249.666-5 chr1 81934507 81934781 + 1.66667 NA intron (NM_001366002, intron 4 of 20) intron (NM_001366002, intron 4 of 20) 132191 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 256.333-79 chr8 77572941 77573205 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 122376 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 334.667-24 chr5 126627014 126627351 + 1.66667 NA TTS (NM_032177) TTS (NM_032177) -4523 NM_207408 389320 Hs.177983 NM_207408 ENSG00000196900 TEX43 C5orf48|Tseg7 testis expressed 43 protein-coding 296.334-13 chr8 129862610 129862981 + 1.66667 NA intron (NM_001353307, intron 6 of 13) (GAGTGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -76171 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 358.667-20 chr3 55801068 55801433 + 1.66667 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) intron (NR_132749, intron 13 of 17) 51344 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 221.666-5 chr1 230125600 230125869 + 1.66667 NA intron (NM_004481, intron 1 of 15) intron (NM_004481, intron 1 of 15) 58496 NM_004481 2590 Hs.743964 NM_004481 ENSG00000143641 GALNT2 GalNAc-T2 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 280.667-49 chr6 152798762 152799003 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 48085 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 288.667-32 chr7 16009778 16010073 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -200561 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 203.333-127 chr2 47371695 47371895 + 1.66667 NA intron (NM_002354, intron 1 of 8) intron (NM_002354, intron 1 of 8) 2647 NM_002354 4072 Hs.542050 NM_002354 ENSG00000119888 EPCAM DIAR5|EGP-2|EGP314|EGP40|ESA|HNPCC8|KS1/4|KSA|M4S1|MIC18|MK-1|TACSTD1|TROP1 epithelial cell adhesion molecule protein-coding 239-22 chr15 95233254 95233507 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 93720 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 272-12 chr14 43749839 43750014 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 757357 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 338-4 chr10 12742648 12742953 + 1.66667 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) intron (NM_001351032, intron 5 of 11) -17447 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 257.333-16 chr10 92502493 92502676 + 1.66667 NA intron (NR_136399, intron 11 of 25) intron (NR_136399, intron 11 of 25) -4823 NM_001165946 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 246.333-38 chr16 50037115 50037401 + 1.66667 NA TTS (NM_001281789) TTS (NM_001281789) 12052 NM_153261 255919 Hs.59134 NM_153261 ENSG00000205423 CNEP1R1 C16orf69|NEP1-R1|NEP1R1|TMEM188|TMP125 CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1 protein-coding 318-26 chr2 76262686 76262954 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -551905 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 187.667-126 chr6 46621530 46621728 + 1.66667 NA intron (NM_016593, intron 7 of 11) L1M4|LINE|L1 31189 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 394.001 chr11 81760169 81760556 + 1.66667 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 130474 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 452.667-8 chr4 109277665 109277997 + 1.66667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 24827 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 436.667-4 chr12 97111778 97112220 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 204533 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 264.334-8 chr15 64956410 64956599 + 1.66667 NA intron (NM_182703, intron 14 of 14) AluY|SINE|Alu 32966 NM_001127889 51324 Hs.242458 NM_016630 ENSG00000090487 SPG21 ABHD21|ACP33|BM-019|GL010|MAST SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin protein-coding 440.333-7 chr4 75523857 75524338 + 1.66667 NA intron (NM_144721, intron 4 of 4) L1MA3|LINE|L1 9624 NM_144721 152815 Hs.479971 NM_144721 ENSG00000174796 THAP6 - THAP domain containing 6 protein-coding 385.667-8 chr4 33088364 33088756 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 737522 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 229.667-25 chr14 42423281 42423512 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 816540 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 292.667-36 chr6 56080829 56081024 + 1.66667 NA intron (NM_030820, intron 17 of 29) MIR|SINE|MIR 10736 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 238.334-6 chr19 42491873 42492050 + 1.66667 NA intron (NR_073180, intron 2 of 2) MER41-int|LTR|ERV1 36520 NM_001712 634 Hs.512682 NM_001712 ENSG00000079385 CEACAM1 BGP|BGP1|BGPI carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 1 protein-coding 241.333-70 chr3 94623341 94623542 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -314822 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 274.333-30 chr17 51565540 51565782 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 130234 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 257-21 chr17 62091887 62092157 + 1.66667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -26744 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 262.666-10 chr17 82682362 82682625 + 1.66667 NA intron (NM_006822, intron 1 of 5) L1ME1|LINE|L1 -14186 NR_039751 100616196 NR_039751 ENSG00000266107 MIR4525 - microRNA 4525 ncRNA 237-33 chr17 58680332 58680497 + 1.66667 NA intron (NM_031272, intron 1 of 31) intron (NM_031272, intron 1 of 31) 11641 NM_031272 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 210.334-6 chr4 173467142 173467280 + 1.66667 NA intron (NM_001329597, intron 1 of 3) intron (NM_001329597, intron 1 of 3) 52027 NM_001329597 11341 Hs.7122 NM_007281 ENSG00000164106 SCRG1 SCRG-1 stimulator of chondrogenesis 1 protein-coding 356.666-5 chr13 108016671 108016979 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -149329 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 378.667-8 chr14 27093773 27094200 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 185344 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 273.334 chr1 113136285 113136540 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 63214 NM_001312686 9860 Hs.448972 NM_014813 ENSG00000198799 LRIG2 LIG-2|LIG2|UFS2 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 protein-coding 269.667-40 chr4 124278575 124278814 + 1.66667 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 279740 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 418-15 chrX 67889919 67890421 + 1.66667 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 345547 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 207.334 chr1 235482012 235482205 + 1.66667 NA intron (NM_152490, intron 4 of 11) L1MEf|LINE|L1 22344 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 246-15 chr11 6486881 6487094 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 5486 NM_012192 26515 Hs.54943 NM_012192 ENSG00000132286 TIMM10B FXC1|TIM10B|Tim9b translocase of inner mitochondrial membrane 10B protein-coding 434.334-2 chr18 57218508 57218915 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -47517 NR_149129 105372138 Hs.574448 NR_149129 ENSG00000267726 LINC02565 - long intergenic non-protein coding RNA 2565 ncRNA 228-33 chr17 52854649 52854796 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7399 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 264.333-12 chr11 78247816 78248139 + 1.66667 NA intron (NM_012296, intron 3 of 9) intron (NM_012296, intron 3 of 9) 59058 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 162.333-249 chr8 72597524 72597727 + 1.66667 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 60400 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 410.667-2 chr1 228964487 228964868 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 210124 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 243-26 chr2 49984479 49984645 + 1.66667 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) -10359 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 469.333 chr12 21646132 21646447 + 1.66667 NA intron (NM_001174097, intron 3 of 7) intron (NM_001174097, intron 3 of 7) 11505 NM_001174097 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 315.667-2 chr1 45089118 45089420 + 1.66667 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 77015 NR_158185 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 236-21 chr14 39530746 39530939 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -98342 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 228.333-48 chr2 76327055 76327416 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -616320 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 274.333-21 chr15 45767777 45768027 + 1.66667 NA intron (NR_135680, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 62707 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 259 chr1 30564238 30564513 + 1.66667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -154397 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 232.333-2 chr1 63792557 63792819 + 1.66667 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) MIRc|SINE|MIR 18671 NM_005012 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 541.333-2 chr8 133226117 133226472 + 1.66667 NA intron (NM_003882, intron 4 of 4) LTR103b_Mam|LTR|ERV1? 35255 NM_001204870 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 385.666-8 chr6 144785602 144785961 + 1.66667 NA intron (NM_007124, intron 60 of 73) MIRc|SINE|MIR 380126 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 322.667-4 chr10 74484529 74484804 + 1.66667 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) L1ME3G|LINE|L1 44658 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 259.667-60 chr5 15952008 15952246 + 1.66667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 16945 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 269-18 chr16 53656103 53656331 + 1.66667 NA intron (NM_001127897, intron 14 of 24) AluJr4|SINE|Alu 47642 NM_015272 23322 Hs.298382 NM_015272 ENSG00000103494 RPGRIP1L CORS3|FTM|JBTS7|MKS5|NPHP8|PPP1R134 RPGRIP1 like protein-coding 314.666-16 chr13 59452347 59452686 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -560202 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 292.334-8 chr5 121943876 121944099 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17988 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 404-2 chr10 99364069 99364471 + 1.66667 NA intron (NM_020348, intron 4 of 10) intron (NM_020348, intron 4 of 10) 34914 NM_020348 26507 Hs.274579 NM_020348 ENSG00000119946 CNNM1 ACDP1|CLP-1 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1 protein-coding 262-3 chr1 108599014 108599227 + 1.66667 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) AluJb|SINE|Alu 39020 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 300-43 chr3 89644972 89645270 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 537500 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 490-5 chr8 112330049 112330591 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 41 of 66) intron (NM_001363185, intron 41 of 66) -313173 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 250-13 chr10 60889780 60889984 + 1.66667 NA intron (NM_001350906, intron 7 of 12) MIRb|SINE|MIR 54303 NM_001350910 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 395-21 chr6 137114626 137115062 + 1.66667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 58800 NM_181310 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 277.334-3 chr14 67362521 67362712 + 1.66667 NA intron (NM_004094, intron 1 of 7) intron (NM_004094, intron 1 of 7) 2288 NM_004094 1965 Hs.151777 NM_004094 ENSG00000134001 EIF2S1 EIF-2|EIF-2A|EIF-2alpha|EIF2|EIF2A eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha protein-coding 265.334-2 chr1 107129478 107129667 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10516 NM_014917 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 318-55 chr8 91129524 91129941 + 1.66667 NA intron (NM_001129890, intron 3 of 7) intron (NM_001129890, intron 3 of 7) 27113 NM_001354470 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 266-44 chr2 98618565 98618852 + 1.66667 NA TTS (NM_001330353) TTS (NM_001330353) 10119 NM_001330353 25972 Hs.13370 NM_014044 ENSG00000115446 UNC50 GMH1|HSD23|PDLs22|UNCL|URP unc-50 inner nuclear membrane RNA binding protein protein-coding 237-13 chr10 81424228 81424463 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -450849 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 294-54 chr5 167343759 167344103 + 1.66667 NA intron (NM_001122679, intron 2 of 29) intron (NM_001122679, intron 2 of 29) -175530 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 260.667-71 chr5 37277931 37278227 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -28651 NM_023073 65250 Hs.586199 NM_023073 ENSG00000197603 CPLANE1 C5orf42|Hug|JBTS17|OFD6 ciliogenesis and planar polarity effector 1 protein-coding 255.667-53 chr3 56520114 56520328 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36935 NR_024460 285331 Hs.476399 NM_001012506 ENSG00000180376 CCDC66 - coiled-coil domain containing 66 protein-coding 157-69 chr2 148493516 148493710 + 1.66667 NA intron (NM_018328, intron 12 of 14) intron (NM_018328, intron 12 of 14) -151138 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 266-77 chr6 72593346 72593582 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -28379 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 180-21 chr11 125544814 125544957 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -24592 NM_001330419 9538 Hs.643514 NM_004879 ENSG00000149547 EI24 EPG4|PIG8|TP53I8 EI24 autophagy associated transmembrane protein protein-coding 252.667-5 chr1 103831637 103831911 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 81933 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 227-21 chr15 64317623 64317855 + 1.66667 NA intron (NM_001329606, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 38434 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 281.333-54 chr6 40520853 40521155 + 1.66667 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 66360 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 252-63 chr3 110171388 110171577 + 1.66667 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 568654 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 252.667-28 chr14 34601603 34601759 + 1.66667 NA intron (NM_001366519, intron 5 of 12) AluSq2|SINE|Alu 28467 NR_159357 58533 Hs.276523 NM_021249 ENSG00000129515 SNX6 MSTP010|TFAF2 sorting nexin 6 protein-coding 258.667-89 chr7 46419051 46419233 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 277980 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 355-19 chr22 25648655 25649057 + 1.66667 NA intron (NM_005160, intron 3 of 20) intron (NM_005160, intron 3 of 20) 84181 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 256-88 chr7 46152193 46152475 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -231062 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 449.334 chr14 69414474 69414881 + 1.66667 NA intron (NM_001330185, intron 1 of 5) L1ME2|LINE|L1 15985 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 288-49 chr7 12942558 12942904 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 255098 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 286.001 chr13 76386364 76386567 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -451333 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 226.333-28 chr14 44586726 44586910 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 79409 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 253.333-26 chr14 69676993 69677243 + 1.66667 NA intron (NM_014734, intron 2 of 5) intron (NM_014734, intron 2 of 5) 65522 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 257.333-21 chr11 35306855 35307097 + 1.66667 NA intron (NM_001252652, intron 5 of 11) MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 112582 NM_004171 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 259.667-61 chr5 51086366 51086603 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -116297 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 297.334-2 chr10 73434394 73434583 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001024593) promoter-TSS (NM_001024593) -927 NM_001024593 118490 Hs.631823 NM_001024593 ENSG00000166343 MSS51 ZMYND17 MSS51 mitochondrial translational activator protein-coding 232.667-67 chr6 114543679 114543859 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -480892 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 470.999 chr7 111374201 111374538 + 1.66667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 187922 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 291-45 chr8 128099237 128099558 + 1.66667 NA non-coding (NR_003367, exon 8 of 9) non-coding (NR_003367, exon 8 of 9) 50245 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 244.666-23 chr2 28827566 28827827 + 1.66667 NA intron (NM_001008779, intron 3 of 4) L1MEc|LINE|L1 11699 NM_001008779 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 292-48 chr6 135629246 135629585 + 1.66667 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 131614 NR_026805 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 265.333-43 chr2 157016069 157016254 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -241544 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 273-36 chr6 62434382 62434628 + 1.66667 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -148278 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 322.334-6 chr4 95492954 95493190 + 1.66667 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 55901 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 472.667-4 chr3 22588312 22588767 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 614039 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 228.667-15 chr11 38243049 38243222 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 304534 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 389.333 chr1 66996000 66996475 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 57911 NM_015139 23169 Hs.213642 NM_015139 ENSG00000116704 SLC35D1 SHNKND|UGTREL7 solute carrier family 35 member D1 protein-coding 248.334-15 chr6 158156605 158156761 + 1.66667 NA intron (NM_032861, intron 2 of 16) intron (NM_032861, intron 2 of 16) 11579 NR_073096 84947 Hs.154706 NM_032861 ENSG00000122335 SERAC1 - serine active site containing 1 protein-coding 239.667-46 chr3 131293835 131293985 + 1.66667 NA intron (NM_001353043, intron 17 of 17) L1MC1|LINE|L1 -67935 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 259.667-40 chr2 211179110 211179294 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 561631 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 406.334-6 chr4 36285269 36285529 + 1.66667 NA intron (NM_001170700, intron 2 of 9) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 3783 NM_001136536 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 356.001-2 chr15 71804253 71804572 + 1.66667 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -6142 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 521.333-2 chr5 23228226 23228628 + 1.66667 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL -279182 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 267-48 chr3 131282747 131283033 + 1.66667 NA intron (NM_001353043, intron 17 of 17) intron (NM_001353043, intron 17 of 17) -78955 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 254.334-12 chr15 65452006 65452201 + 1.66667 NA intron (NM_017743, intron 15 of 17) intron (NM_017743, intron 15 of 17) -29156 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 690.999 chr2 153037379 153038025 + 1.66667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 319065 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 193.667-76 chr20 58230320 58230558 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1786 NM_001304369 140731 Hs.266571 NM_080674 ENSG00000124227 ANKRD60 C20orf86|bA196N14.3 ankyrin repeat domain 60 protein-coding 404.333-3 chr10 7905446 7905796 + 1.66667 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) AluSx3|SINE|Alu 87116 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 267.667-32 chr2 141033517 141033711 + 1.66667 NA intron (NM_018557, intron 11 of 90) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -446929 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 486.667-4 chr5 6541209 6541612 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -40726 NR_024423 255167 Hs.435515 NR_024423 ENSG00000250056 LINC01018 SRHC long intergenic non-protein coding RNA 1018 ncRNA 206-81 chr2 81859640 81859831 + 1.66667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -392789 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 274.667-57 chr8 108471769 108471955 + 1.66667 NA TTS (NM_001329494) TTS (NM_001329494) 28238 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 395.667-3 chr14 66083402 66083762 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -402789 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 236.667 chr1 14043185 14043423 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 293889 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 275.334-9 chr2 65876177 65876398 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -443688 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 275.334-13 chr9 103955862 103956113 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -43722 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 210-10 chr1 169836758 169836976 + 1.66667 NA intron (NM_001366772, intron 15 of 22) intron (NM_001366772, intron 15 of 22) 41827 NR_159440 55732 Hs.443551 NM_018186 ENSG00000000460 C1orf112 - chromosome 1 open reading frame 112 protein-coding 204.334-5 chr9 105397169 105397321 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001286730, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001286730, exon 16 of 16) -50789 NM_001287191 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 509-4 chr3 102437482 102438001 + 1.66667 NA intron (NM_001329788, intron 2 of 11) intron (NM_001329788, intron 2 of 11) 2726 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 247.333-68 chr6 51474944 51475234 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -146781 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 228-77 chr6 144087189 144087358 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8300 NM_031287 83443 Hs.110695 NM_031287 ENSG00000169976 SF3B5 SF3b10|Ysf3 splicing factor 3b subunit 5 protein-coding 278-50 chr6 77057672 77057960 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 406206 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 309.333-21 chr14 87411202 87411684 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 243851 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 248.334 chr1 92467038 92467228 + 1.66667 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac 16821 NM_001127215 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 252-66 chr4 33693461 33693683 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 346321 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 423-7 chr5 46027342 46027747 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -331164 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 234.333-48 chr3 23843419 23843575 + 1.66667 NA intron (NM_003341, intron 3 of 5) intron (NM_003341, intron 3 of 5) 33043 NM_001202476 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 197.667-86 chr3 103278335 103278508 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 245695 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 262.667-54 chr3 21369917 21370084 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35726 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 342.333-9 chr17 63270142 63270454 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 8 of 25) intron (NM_025185, intron 8 of 25) 169969 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 301.667-41 chr7 23090395 23090740 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 15136 NR_046220 100775104 NR_046220 ENSG00000230658 KLHL7-DT KLHL7-AS1|PLATAK KLHL7 divergent transcript ncRNA 257.667-35 chr18 74715955 74716204 + 1.66667 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) intron (NM_001146190, intron 2 of 3) 85116 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 319.334-5 chr7 46996034 46996294 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -299042 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 234.667-38 chr15 61871344 61871582 + 1.66667 NA intron (NM_001018088, intron 79 of 81) L1MB7|LINE|L1 141545 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 336.334-7 chr6 56070026 56070348 + 1.66667 NA intron (NM_030820, intron 21 of 29) intron (NM_030820, intron 21 of 29) 21475 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 244.334-3 chr1 99949102 99949254 + 1.66667 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -20818 NM_001271684 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 334.667-32 chr9 22080643 22081145 + 1.66667 NA intron (NR_003529, intron 12 of 18) intron (NR_003529, intron 12 of 18) -71581 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 348-18 chr3 98874755 98875149 + 1.66667 NA intron (NM_080927, intron 2 of 15) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 26743 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 437.667-6 chr6 137000252 137000738 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001278723, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001278723, exon 6 of 6) -7264 NR_027994 100294720 Hs.520412 NR_027994 ENSG00000225391 NHEG1 - neuroblastoma highly expressed 1 ncRNA 227-11 chr10 109517022 109517184 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 406143 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 235-47 chr6 51697384 51697581 + 1.66667 NA intron (NM_138694, intron 60 of 66) MER20|DNA|hAT-Charlie 75612 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 455-10 chr6 66599610 66600181 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 812016 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 447.334 chr1 234233325 234233670 + 1.66667 NA intron (NM_173508, intron 3 of 7) intron (NM_173508, intron 3 of 7) 19286 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 266.334-20 chr5 131252296 131252468 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -11627 NM_020240 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 488.001 chr6 120942058 120942513 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 392195 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 361-15 chr8 30416445 30416943 + 1.66667 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) AluY|SINE|Alu -31293 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 221.667-50 chr3 55934110 55934341 + 1.66667 NA intron (NR_132749, intron 12 of 17) intron (NR_132749, intron 12 of 17) -81631 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 228.334-2 chr14 31435702 31435860 + 1.66667 NA intron (NR_110045, intron 2 of 3) intron (NR_110045, intron 2 of 3) 15023 NR_110045 101927124 Hs.647561 NR_110045 ENSG00000250365 LOC101927124 - uncharacterized LOC101927124 ncRNA 251-92 chr9 127642092 127642338 + 1.66667 NA intron (NM_001032221, intron 1 of 18) AluSp|SINE|Alu 29938 NM_001032221 6812 Hs.288229 NM_003165 ENSG00000136854 STXBP1 MUNC18-1|NSEC1|P67|RBSEC1|UNC18 syntaxin binding protein 1 protein-coding 531.333-3 chr3 120967220 120967847 + 1.66667 NA intron (NR_145517, intron 3 of 8) L1M1|LINE|L1 58856 NM_001348345 9515 Hs.477315 NM_014980 ENSG00000145087 STXBP5L LLGL4 syntaxin binding protein 5 like protein-coding 332.667-5 chr10 67517725 67518024 + 1.66667 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) L2a|LINE|L2 -114464 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 178.667-80 chr2 113901431 113901566 + 1.66667 NA intron (NM_001277140, intron 1 of 11) intron (NM_001277140, intron 1 of 11) -10506 NR_110174 101060091 Hs.741753 NR_110174 ACTR3-AS1 - ACTR3 antisense RNA 1 ncRNA 256-29 chr14 99310492 99310663 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -38380 NM_138576 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 224.333-97 chr5 41803310 41803569 + 1.66667 NA intron (NR_157114, intron 9 of 15) intron (NR_157114, intron 9 of 15) 40218 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 200.666-52 chr18 72067007 72067231 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -284893 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 428.667-2 chr11 22431667 22432074 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 60149 NR_120583 102723378 Hs.374255 NR_120583 ENSG00000255323 LINC01495 - long intergenic non-protein coding RNA 1495 ncRNA 267-55 chr6 34700972 34701264 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 4173 NR_134626 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 228.334 chr1 172472070 172472224 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 19254 NM_001300760 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 210.334-4 chr2 120260930 120261192 + 1.66667 NA intron (NM_002881, intron 1 of 4) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 8209 NM_002881 5899 Hs.469820 NM_002881 ENSG00000144118 RALB - RAS like proto-oncogene B protein-coding 247.334-24 chr8 88521404 88521616 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -194027 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 245.334-8 chr17 14003160 14003371 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21233 NR_003261 94158 Hs.633073 NR_003261 CDRT15P1 CDRT15P CMT1A duplicated region transcript 15 pseudogene 1 pseudo 380-20 chrUn_KI270333v1 1594 2151 + 1.66667 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 254.334-11 chr15 48137667 48137852 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001301210, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001301210, exon 16 of 16) 16769 NM_205850 283652 Hs.710240 NM_205850 ENSG00000188467 SLC24A5 JSX|NCKX5|OCA6|SHEP4 solute carrier family 24 member 5 protein-coding 250-70 chr6 37359784 37359964 + 1.66667 NA intron (NR_046399, intron 1 of 7) L3|LINE|CR1 5891 NM_003958 9025 Hs.485278 NM_003958 ENSG00000112130 RNF8 hRNF8 ring finger protein 8 protein-coding 353.334-2 chr13 39675141 39675460 + 1.66667 NA intron (NM_001145079, intron 4 of 18) L2b|LINE|L2 -11165 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 299.667-39 chr9 82799534 82799792 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 263479 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 252-12 chr11 17018950 17019221 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -4671 NM_001329630 144100 Hs.12332 NM_175058 ENSG00000166689 PLEKHA7 - pleckstrin homology domain containing A7 protein-coding 292.667-13 chr17 49096621 49096916 + 1.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -35692 NM_001159388 124872 Hs.374679 NM_153446 ENSG00000167080 B4GALNT2 B4GALT|GALGT2 beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 2 protein-coding 196.334 chr10 33802187 33802341 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29584 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 270.334-17 chr3 38630934 38631204 + 1.66667 NA intron (NM_198056, intron 2 of 27) intron (NM_198056, intron 2 of 27) 18603 NM_001099405 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 336.667 chr1 47314101 47314378 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001282937) promoter-TSS (NM_001282937) -92 NM_001282937 6491 Hs.525198 NM_003035 ENSG00000123473 STIL MCPH7|SIL STIL centriolar assembly protein protein-coding 266.667-51 chr4 30454465 30454681 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -265796 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 230-51 chr4 105805058 105805226 + 1.66667 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) MER20B|DNA|hAT-Charlie 22030 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 387.334-6 chr4 23597522 23597826 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 283618 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 240-39 chr18 3220588 3220747 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_003803) promoter-TSS (NM_003803) -559 NM_003803 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 257.667-13 chr11 112069246 112069480 + 1.66667 NA intron (NM_138789, intron 5 of 5) MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 4808 NM_138789 120379 Hs.420662 NM_138789 ENSG00000150773 PIH1D2 - PIH1 domain containing 2 protein-coding 261.334-21 chr7 108200908 108201082 + 1.66667 NA intron (NM_001371137, intron 10 of 25) L1PB1|LINE|L1 42390 NM_001371181 362.667-8 chr14 39605916 39606309 + 1.66667 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -173612 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 252.667-99 chr8 71365903 71366203 + 1.66667 NA intron (NM_001370336, intron 2 of 17) intron (NM_001370336, intron 2 of 17) -3984 NM_000503 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 247.667-25 chr12 85250285 85250568 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29794 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 186.667-115 chr5 38510878 38511060 + 1.66667 NA intron (NM_001127671, intron 6 of 19) intron (NM_001127671, intron 6 of 19) 45677 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 423.667-5 chr12 2422599 2422903 + 1.66667 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 MER117|DNA|hAT-Charlie 152975 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 277-35 chr3 95130335 95130555 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 192182 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 281-45 chr8 125075206 125075525 + 1.66667 NA intron (NM_014846, intron 7 of 28) L1M4|LINE|L1 16427 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 264.333-13 chr12 2922099 2922369 + 1.66667 NA intron (NM_003324, intron 3 of 10) intron (NM_003324, intron 3 of 10) 31343 NM_001160408 7289 Hs.655333 NM_003324 ENSG00000078246 TULP3 TUBL3 TUB like protein 3 protein-coding 336-25 chr4 97929386 97929669 + 1.66667 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) L1PA14|LINE|L1 213949 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 302.334-5 chr2 64472895 64473257 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13277 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 243.333-117 chr9 81182981 81183220 + 1.66667 NA Intergenic (TCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 506435 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 332-32 chr7 50427688 50428031 + 1.66667 NA Intergenic MLT1F2-int|LTR|ERVL-MaLR 22491 NM_001042762 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 402.333-9 chr4 158709742 158710170 + 1.66667 NA TTS (NM_004453) TTS (NM_004453) 13440 NM_005038 5481 Hs.183958 NM_005038 ENSG00000171497 PPID CYP-40|CYPD peptidylprolyl isomerase D protein-coding 238.667-20 chr13 22027884 22028089 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -149826 NR_047040 100874182 Hs.148951 NR_047040 ENSG00000226722 LINC00424 - long intergenic non-protein coding RNA 424 ncRNA 286.334-12 chr8 61243629 61243906 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -44203 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 182.333-49 chr14 83478954 83479165 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 836427 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 216-65 chr2 237406235 237406423 + 1.66667 NA intron (NM_057165, intron 1 of 7) intron (NM_057165, intron 1 of 7) 7835 NM_057165 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 241-15 chr12 824646 824884 + 1.66667 NA intron (NM_001184985, intron 2 of 27) intron (NM_001184985, intron 2 of 27) 71842 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 232.333-11 chr10 110301562 110301767 + 1.66667 NA intron (NM_005871, intron 2 of 5) MER3|DNA|hAT-Charlie 3256 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 477-4 chr6 47575459 47575835 + 1.66667 NA intron (NM_012120, intron 6 of 17) intron (NM_012120, intron 6 of 17) -80825 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 260.667-4 chr1 107702938 107703168 + 1.66667 NA intron (NM_006113, intron 17 of 26) MIRb|SINE|MIR -14554 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 241.667-95 chr8 134833183 134833337 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4809 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 461-10 chr9 85587728 85588124 + 1.66667 NA intron (NM_015239, intron 21 of 25) intron (NM_015239, intron 21 of 25) 154103 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 204.667-38 chr14 44794108 44794259 + 1.66667 NA intron (NR_146457, intron 2 of 4) intron (NR_146457, intron 2 of 4) 4943 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 245-26 chr17 13363491 13363708 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -56839 NR_146885 105371541 NR_146885 ENSG00000234634 LINC02093 - long intergenic non-protein coding RNA 2093 ncRNA 350.666-14 chr18 69981123 69981696 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24610 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 308-40 chr4 99613223 99613508 + 1.66667 NA intron (NM_001300785, intron 15 of 17) intron (NM_001300785, intron 15 of 17) 41314 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 227.667-2 chr1 162363546 162363796 + 1.66667 NA 5' UTR (NM_001126060, exon 1 of 2) 5' UTR (NM_001126060, exon 1 of 2) 688 NM_001126060 9722 Hs.731942 NM_014697 ENSG00000198929 NOS1AP 6330408P19Rik|CAPON nitric oxide synthase 1 adaptor protein protein-coding 245-64 chr6 139971964 139972226 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4224 NR_121622 100507477 Hs.179213 NR_121622 ENSG00000236013 LOC100507477 - uncharacterized LOC100507477 ncRNA 216-4 chr1 113544931 113545082 + 1.66667 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) L3|LINE|CR1 154491 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 233.667-69 chr6 164789082 164789282 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 32881 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 257.333-58 chr20 24853944 24854144 + 1.66667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -95225 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 256.667-70 chr5 82553151 82553317 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 273772 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 292.334-7 chr5 115911439 115911731 + 1.66667 NA intron (NM_001318093, intron 6 of 6) intron (NM_001318093, intron 6 of 6) -44986 NR_157226 107986443 NR_157226 LINCADL LINC-ADAL lincRNA adipogenesis and lipogenesis associated ncRNA 174.334-4 chr5 97643987 97644130 + 1.66667 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) L1PA16|LINE|L1 139362 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 223.666-34 chr9 13779000 13779197 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -148873 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 457.332 chr8 117957156 117957607 + 1.66667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -36468 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 440.333-10 chr8 140024029 140024535 + 1.66667 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) 76253 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 321-20 chr5 120809350 120809847 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 278134 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 219.667-63 chr4 48685893 48686167 + 1.66667 NA intron (NM_015030, intron 2 of 63) AluSq|SINE|Alu 94269 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 251.333-112 chr9 2184975 2185248 + 1.66667 NA intron (NM_001289397, intron 30 of 32) L1MB2|LINE|L1 26655 NM_001289400 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 417.332-2 chr14 70974806 70975219 + 1.66667 NA intron (NM_014982, intron 5 of 35) intron (NM_014982, intron 5 of 35) 67553 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 283.666 chr10 32804874 32805145 + 1.66667 NA intron (NM_001321115, intron 30 of 43) intron (NM_001321115, intron 30 of 43) 96463 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 173.333-205 chr8 115262725 115262911 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 405195 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 257.333-41 chr16 53592752 53592927 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -89535 NM_001012398 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 231.667-62 chr8 107997484 107997663 + 1.66667 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) intron (NM_178565, intron 2 of 5) 84366 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 559.666-3 chr2 99883278 99883931 + 1.66667 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 221979 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 286-56 chr7 84416874 84417271 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -115404 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 160.667-130 chr18 11284072 11284239 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -135393 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 294.666-38 chr8 88507585 88507941 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -180280 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 336.666-14 chr2 112223258 112223619 + 1.66667 NA intron (NM_032494, intron 8 of 8) intron (NM_032494, intron 8 of 8) 31604 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 345-11 chr3 117548616 117549012 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 142111 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 433.666-2 chr1 246170897 246171236 + 1.66667 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 246346 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 418.667-3 chr17 58470770 58471256 + 1.66667 NA intron (NM_001080439, intron 2 of 5) L1MB3|LINE|L1 17395 NM_001080439 124535 Hs.380061 NM_001080439 ENSG00000176160 HSF5 HSF 5|HSTF 5 heat shock transcription factor 5 protein-coding 302.667-23 chr3 105514516 105514793 + 1.66667 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 147745 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 350.334 chr10 16704123 16704536 + 1.66667 NA intron (NM_152724, intron 6 of 7) MIRb|SINE|MIR 113095 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 256.667-37 chr2 10967333 10967640 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 55552 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 279-31 chr6 49146328 49146613 + 1.66667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 316783 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 282.333-36 chr4 33249090 33249469 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 790614 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 295-21 chr17 35519465 35519689 + 1.66667 NA intron (NM_001363830, intron 2 of 4) L1MC3|LINE|L1 18284 NM_001363830 100506736 Hs.447559 NM_001145027 ENSG00000205045 SLFN12L - schlafen family member 12 like protein-coding 400-14 chr6 56579153 56579462 + 1.66667 NA intron (NM_001144770, intron 41 of 94) intron (NM_001144770, intron 41 of 94) 63582 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 269.001-2 chr10 90380051 90380224 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 160668 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 245-19 chr14 48303893 48304155 + 1.66667 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -509010 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 201.667-35 chr14 79300590 79300756 + 1.66667 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 21293 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 345.334-8 chr20 52886584 52886882 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -85625 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 251.333-65 chr2 202870102 202870409 + 1.66667 NA intron (NM_001288622, intron 1 of 12) intron (NM_001288622, intron 1 of 12) 1217 NM_001288623 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 310.666-23 chr8 99263247 99263526 + 1.66667 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 250120 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 323-6 chr1 188627380 188627884 + 1.66667 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 1184004 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 234.667-20 chr11 113555740 113555909 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -80426 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 294.333-28 chr22 26650357 26650578 + 1.66667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -7015 NR_033319 440823 Hs.517502 NR_003491 ENSG00000225783 MIAT C22orf35|GOMAFU|LINC00066|NCRNA00066|RNCR2|lncRNA-MIAT myocardial infarction associated transcript ncRNA 453.999-2 chr5 145069904 145070427 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 765177 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 203-109 chr8 111910356 111910618 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 533848 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 341-6 chr12 115627333 115627769 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 521103 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 335 chr1 101057559 101057879 + 1.66667 NA intron (NR_109849, intron 1 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 31873 NR_109849 102606465 Hs.593669 NR_109849 LOC102606465 - uncharacterized LOC102606465 ncRNA 427-9 chrX 95265480 95265777 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -202402 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 263-38 chr22 34691853 34692086 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 305947 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 316-5 chr10 62049061 62049387 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001244638) promoter-TSS (NM_001244638) -133 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 154-120 chr6 36622589 36622764 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_037491) promoter-TSS (NR_037491) -164 NR_037491 100500885 NR_037491 ENSG00000263894 MIR3925 - microRNA 3925 ncRNA 242.333-83 chr5 10702744 10703058 + 1.66667 NA intron (NM_004394, intron 2 of 3) intron (NM_004394, intron 2 of 3) 58333 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 248.667-38 chr14 62208766 62208915 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -68867 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 573.999 chr14 33988230 33988819 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37450 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 282.333-11 chr14 25573987 25574345 + 1.66667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -523869 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 214.667-51 chr16 66394624 66394775 + 1.66667 NA intron (NM_001795, intron 7 of 11) intron (NM_001795, intron 7 of 11) -13825 NR_046242 100505865 Hs.314372 NR_046242 LINC00920 - long intergenic non-protein coding RNA 920 ncRNA 142-64 chr2 133255898 133255997 + 1.66667 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -10248 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 312.666-22 chr5 91942872 91943335 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -559786 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 442-7 chr8 134144088 134144596 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 257846 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 248.333-26 chr13 61131128 61131339 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 68647 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 278.667-23 chr2 53185622 53185836 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -483114 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 231.333-113 chr7 122125980 122126238 + 1.66667 NA intron (NM_005763, intron 4 of 23) intron (NM_005763, intron 4 of 23) 18140 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 426.333-6 chr2 49908077 49908632 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 65849 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 352.334-6 chr8 122397129 122397430 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 171365 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 322.667-18 chr3 69256308 69256684 + 1.66667 NA intron (NM_015123, intron 5 of 22) AluSz|SINE|Alu 129592 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 289.667-5 chr10 124074947 124075347 + 1.66667 NA intron (NM_001270765, intron 1 of 5) intron (NM_001270765, intron 1 of 5) 17259 NM_014863 51363 Hs.287537 NM_014863 ENSG00000182022 CHST15 BRAG|GALNAC4S-6ST carbohydrate sulfotransferase 15 protein-coding 409-3 chr14 20990621 20991096 + 1.66667 NA intron (NM_022734, intron 3 of 13) AluSx|SINE|Alu 878 NM_001029991 64745 Hs.512693 NM_022734 ENSG00000165792 METTL17 METT11D1 methyltransferase like 17 protein-coding 270.334-18 chr4 100173897 100174147 + 1.66667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -16011 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 231.667-26 chr18 534395 534573 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19190 NR_136505 105376854 NR_136505 ENSG00000264265 LINC01925 - long intergenic non-protein coding RNA 1925 ncRNA 259.667-36 chr2 106615815 106616082 + 1.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 128584 NM_001349727 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 217-74 chr5 59978055 59978206 + 1.66667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -84404 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 287.334 chr1 46200461 46200761 + 1.66667 NA intron (NM_001243766, intron 1 of 22) intron (NM_001243766, intron 1 of 22) -2162 NM_017739 55624 Hs.525134 NM_017739 ENSG00000085998 POMGNT1 GNTI.2|GnT I.2|LGMD2O|LGMDR15|MEB|MGAT1.2|RP76|gnT-I.2 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-) protein-coding 505.334-2 chr14 75693949 75694473 + 1.66667 NA intron (NM_015072, intron 6 of 31) intron (NM_015072, intron 6 of 31) 32965 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 616.334 chr17 62036322 62037239 + 1.66667 NA intron (NM_005121, intron 3 of 29) HAL1ME|LINE|L1 28498 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 312.667-26 chr3 94136970 94137341 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 74094 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 374-25 chr8 117111450 117111911 + 1.66667 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -23315 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 310.667-41 chr8 16833911 16834107 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 168336 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 365.667-9 chr18 73667457 73667850 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 342712 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 302.333 chr1 35046827 35047261 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12742 NM_001289088 79830 Hs.471243 NM_024772 ENSG00000197056 ZMYM1 MYM zinc finger MYM-type containing 1 protein-coding 250-62 chr5 59822661 59822866 + 1.66667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -53915 NM_001364603 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 247.334-8 chr14 26508584 26508808 + 1.66667 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) intron (NM_001366393, intron 2 of 4) 44734 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 178-120 chrX 98934941 98935137 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1370504 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 309.334-7 chr2 150912237 150912508 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 283475 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 263-56 chr5 154685846 154686087 + 1.66667 NA TTS (NR_031638) TTS (NR_031638) 190 NR_031638 100302284 NR_031638 ENSG00000221552 MIR1303 MIRN1303|hsa-mir-1303 microRNA 1303 ncRNA 226-83 chr6 155954498 155954656 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 7780 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 220-58 chr2 33549212 33549428 + 1.66667 NA intron (NM_015376, intron 12 of 16) intron (NM_015376, intron 12 of 16) 20110 NR_146505 105374454 NR_146505 LOC105374454 - uncharacterized LOC105374454 ncRNA 388.667 chr1 190722141 190722602 + 1.66667 NA intron (NR_033922, intron 1 of 4) L1MC2|LINE|L1 97481 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 515.334-4 chr9 112225353 112225855 + 1.66667 NA intron (NM_001244896, intron 11 of 12) MIRb|SINE|MIR -50307 NM_001282640 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 234-61 chr5 166351814 166351971 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 574478 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 247-40 chr2 169857096 169857270 + 1.66667 NA intron (NM_172070, intron 1 of 38) AluSx|SINE|Alu 29675 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 246-13 chr10 56678344 56678532 + 1.66667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -317165 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 219-64 chr4 62109930 62110100 + 1.66667 NA intron (NR_110595, intron 6 of 7) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 51750 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 321-22 chr9 73930739 73931061 + 1.66667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -440631 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 176-77 chr5 103771574 103771721 + 1.66667 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 -208858 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 244.333-82 chr5 37626644 37626893 + 1.66667 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) L1MA5A|LINE|L1 208054 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 255.667-11 chr10 103310341 103310516 + 1.66667 NA intron (NM_001011663, intron 9 of 9) L1ME2z|LINE|L1 33290 NM_032727 9118 Hs.500916 NM_032727 ENSG00000148798 INA NEF5|NF-66|TXBP-1 internexin neuronal intermediate filament protein alpha protein-coding 269.667-39 chr4 60165174 60165427 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -757319 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 253.667-50 chr4 63555396 63555670 + 1.66667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 853917 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 273.667-30 chr2 39304595 39304976 + 1.66667 NA intron (NM_001270425, intron 14 of 32) L1MB3|LINE|L1 -60802 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 256.334-13 chr3 156490495 156490706 + 1.66667 NA intron (NM_172159, intron 8 of 13) HAL1|LINE|L1 -43664 NR_046618 100874084 Hs.131282 NR_046618 ENSG00000242370 KCNAB1-AS1 - KCNAB1 antisense RNA 1 ncRNA 162.667-165 chr22 28090181 28090345 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) L1ME4a|LINE|L1 -169651 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 235.333-38 chr16 68391132 68391373 + 1.66667 NA intron (NM_018667, intron 1 of 8) intron (NM_018667, intron 1 of 8) 57256 NM_018667 55512 Hs.368421 NM_018667 ENSG00000103056 SMPD3 NSMASE2 sphingomyelin phosphodiesterase 3 protein-coding 233-3 chr1 80699212 80699511 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 58074 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 196-154 chr6 19016339 19016483 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 164069 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 255-56 chr4 45503043 45503321 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 620872 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 412.667-13 chr5 86968671 86969112 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 146063 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 242.333-52 chr2 144727645 144727876 + 1.66667 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 59793 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 246.334-12 chr3 148143471 148143643 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65398 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 244-51 chr2 65452248 65452502 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -19776 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 257-53 chr5 106091542 106091771 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 919358 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 286.667-36 chr6 91539250 91539498 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 17714 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 345.334-12 chr6 149127933 149128324 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -89796 NR_125861 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 169.667-103 chr2 41645885 41646041 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -231592 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 290.667-27 chr3 7233061 7233260 + 1.66667 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) 302124 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 237-20 chr12 840947 841124 + 1.66667 NA intron (NM_001184985, intron 4 of 27) intron (NM_001184985, intron 4 of 27) 88112 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 372-24 chr8 138731761 138732204 + 1.66667 NA intron (NM_152888, intron 23 of 64) intron (NM_152888, intron 23 of 64) 182059 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 254.333-49 chr20 32370296 32370536 + 1.66667 NA intron (NM_015338, intron 3 of 11) MER58A|DNA|hAT-Charlie 11351 NM_001363734 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 228-97 chr9 106404434 106404629 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -196397 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 320.334-5 chr3 169412722 169412990 + 1.66667 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) intron (NM_001366473, intron 1 of 15) -35011 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 500-7 chr8 71312027 71312612 + 1.66667 NA intron (NM_001370336, intron 8 of 17) intron (NM_001370336, intron 8 of 17) 44387 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 194.666-23 chr14 78053536 78053748 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -116731 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 253.334-23 chr8 130096019 130096222 + 1.66667 NA intron (NM_018482, intron 24 of 29) intron (NM_018482, intron 24 of 29) -11352 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 294.667-42 chr5 54913622 54913905 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 71830 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 333 chr1 35546429 35546824 + 1.66667 NA intron (NM_024874, intron 2 of 20) intron (NM_024874, intron 2 of 20) 10777 NM_024874 79932 Hs.456507 NM_024874 ENSG00000142687 KIAA0319L AAVR|AAVRL KIAA0319 like protein-coding 479.333-3 chr12 87494944 87495500 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 164483 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 241-38 chr3 113460064 113460375 + 1.66667 NA intron (NM_001331078, intron 12 of 17) intron (NM_001331078, intron 12 of 17) -18705 NM_018338 55779 Hs.584936 NM_018338 ENSG00000206530 CFAP44 SPGF20|WDR52 cilia and flagella associated protein 44 protein-coding 595.667 chr10 18741872 18742577 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 82793 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 208.333-108 chr4 82964585 82964731 + 1.66667 NA intron (NM_001288996, intron 2 of 10) intron (NM_001288996, intron 2 of 10) 46165 NM_194282 132660 Hs.96952 NM_194282 ENSG00000189308 LIN54 CXCDC1|JC8.6|MIP120|TCX1 lin-54 DREAM MuvB core complex component protein-coding 222-24 chr14 43753524 43753750 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 753646 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 299.667-17 chr2 50141375 50141694 + 1.66667 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) L1MA4A|LINE|L1 -167331 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 233-10 chr10 96003288 96003453 + 1.66667 NA intron (NM_001159747, intron 2 of 11) LTR90A|LTR|LTR 3279 NM_001159747 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 280-41 chr4 75367359 75367630 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 13418 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 172.667-139 chr6 142178368 142178527 + 1.66667 NA intron (NM_001286371, intron 4 of 6) L1MEf|LINE|L1 31184 NM_016485 51534 Hs.431367 NM_016485 ENSG00000009844 VTA1 C6orf55|DRG-1|DRG1|HSPC228|LIP5|My012|SBP1 vesicle trafficking 1 protein-coding 237.667-2 chr1 105035953 105036172 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 582873 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 247-71 chr7 72051532 72051769 + 1.66667 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) intron (NM_001363460, intron 3 of 5) 285741 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 154-41 chr12 66994944 66995114 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 101255 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 289.667-22 chr2 128678565 128678751 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -185942 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 321.667-4 chr12 125246177 125246524 + 1.66667 NA intron (NM_001366854, intron 1 of 8) intron (NM_001366854, intron 1 of 8) 59964 NM_001366854 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 295-14 chr15 42342275 42342570 + 1.66667 NA intron (NM_198141, intron 18 of 23) AluJr4|SINE|Alu -17078 NM_173087 825 Hs.143261 NM_000070 ENSG00000092529 CAPN3 CANP3|CANPL3|LGMD2|LGMD2A|LGMDD4|LGMDR1|nCL-1|p94 calpain 3 protein-coding 248-73 chr5 162357040 162357406 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 289581 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 250.667-4 chr1 194165909 194166135 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 861277 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 331.333-2 chr1 32150285 32150504 + 1.66667 NA intron (NM_012316, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu -29281 NM_175852 200081 Hs.17987 NM_175852 ENSG00000084652 TXLNA IL14|TXLN taxilin alpha protein-coding 252.667-88 chr6 15602885 15603045 + 1.66667 NA intron (NR_036448, intron 7 of 9) intron (NR_036448, intron 7 of 9) 60063 NR_036448 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 156.667-365 chrX 105707126 105707278 + 1.66667 NA intron (NM_017416, intron 6 of 10) intron (NM_017416, intron 6 of 10) -115337 NM_198465 203447 Hs.209527 NM_198465 ENSG00000123572 NRK NESK Nik related kinase protein-coding 253.667-64 chr6 56919804 56919974 + 1.66667 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) AluSz|SINE|Alu 34941 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 264.667-11 chr1 238371340 238371637 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 114529 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 365.667-20 chr8 134315419 134315737 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -282493 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 390 chr1 112792834 112793255 + 1.66667 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 57599 NR_103746 100996702 Hs.632431 NR_103746 ENSG00000215866 LINC01356 - long intergenic non-protein coding RNA 1356 ncRNA 221-62 chr6 162716373 162716551 + 1.66667 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) intron (NM_004562, intron 1 of 11) -10670 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 235-4 chr1 80825319 80825601 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 184173 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 267-68 chr8 55349341 55349549 + 1.66667 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 105876 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 268.334-5 chr14 25495320 25495516 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -445121 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 258.334-2 chr11 83680786 83680974 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) intron (NM_001142699, intron 18 of 27) 1545 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 209-12 chr10 68896203 68896353 + 1.66667 NA TTS (NM_001130161) TTS (NM_001130161) -5037 NM_024045 79009 Hs.522984 NM_024045 ENSG00000107625 DDX50 GU2|GUB|RH-II/GuB|mcdrh DExD-box helicase 50 protein-coding 273-28 chr4 107558652 107558836 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 161490 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 397.334 chr10 44287643 44288059 + 1.66667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -4899 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 247.667-74 chr4 119194098 119194316 + 1.66667 NA non-coding (NR_125931, exon 3 of 3) non-coding (NR_125931, exon 3 of 3) -18420 NM_019050 54532 Hs.431081 NM_019050 ENSG00000145390 USP53 - ubiquitin specific peptidase 53 protein-coding 254-74 chr7 31865613 31865873 + 1.66667 NA intron (NM_001191059, intron 7 of 18) (TTTTGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 178528 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 228.667-3 chr1 32496496 32496744 + 1.66667 NA TTS (NM_001145720) TTS (NM_001145720) 31548 NM_001145720 728116 Hs.647658 NM_001145720 ENSG00000273274 ZBTB8B ZNF916B zinc finger and BTB domain containing 8B protein-coding 303.667-5 chr12 79762272 79762550 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -71314 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 562.333-2 chr4 148892099 148892562 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 50048 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 303-22 chr15 49331105 49331405 + 1.66667 NA non-coding (NR_147895, exon 11 of 11) non-coding (NR_147895, exon 11 of 11) -91987 NM_002009 2252 Hs.567268 NM_002009 ENSG00000140285 FGF7 HBGF-7|KGF fibroblast growth factor 7 protein-coding 245.667-30 chr2 28514230 28514395 + 1.66667 NA intron (NM_001170585, intron 1 of 56) L1MC|LINE|L1 18241 NM_001170585 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 241-25 chr16 8419531 8419754 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 170196 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 477.333 chr12 60698134 60698843 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 1009118 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 306.001-2 chr2 21132827 21133066 + 1.66667 NA intron (NM_001306137, intron 2 of 3) MER20|DNA|hAT-Charlie 8960 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 155-129 chr8 90891427 90891587 + 1.66667 NA intron (NM_022351, intron 5 of 12) intron (NM_022351, intron 5 of 12) 93570 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 161-60 chr3 99572026 99572211 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -66476 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 278-67 chr8 91928559 91928763 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 89019 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 241-2 chr1 179848457 179848709 + 1.66667 NA intron (NM_001349934, intron 5 of 6) intron (NM_001349934, intron 5 of 6) 20257 NM_001349933 163590 Hs.571797 NM_022347 ENSG00000169905 TOR1AIP2 IFRG15|LULL1|NET9 torsin 1A interacting protein 2 protein-coding 223.333-68 chr2 64043739 64043942 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -24412 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 246.333-2 chr1 83619711 83619983 + 1.66667 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) intron (NR_119375, intron 2 of 2) 173793 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 230-37 chr2 121802384 121802558 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 46820 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 210.667-16 chr10 26342445 26342671 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95783 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 302.001 chr14 47535825 47536074 + 1.66667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 139005 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 282-8 chr12 29568422 29568661 + 1.66667 NA intron (NM_001367875, intron 11 of 19) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -68848 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 251.666-30 chr8 117734947 117735239 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 185820 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 252.666-21 chr2 111151656 111151962 + 1.66667 NA intron (NM_001204106, intron 3 of 3) intron (NM_001204106, intron 3 of 3) 30895 NM_138626 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 354.334-5 chr4 47787258 47787486 + 1.66667 NA intron (NM_006587, intron 2 of 21) intron (NM_006587, intron 2 of 21) -43973 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 308.333-3 chr1 105916895 105917198 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 111207 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 260-70 chr6 55353602 55353838 + 1.66667 NA intron (NM_207410, intron 5 of 8) MER104|DNA|TcMar-Tc2 26251 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 403.001-4 chr9 91590686 91590974 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -45421 NR_037472 100500821 NR_037472 ENSG00000266855 MIR3910-1 mir-3910-1 microRNA 3910-1 ncRNA 244-82 chr5 20999959 21000212 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -384550 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 240.333-6 chr1 172372727 172373016 + 1.66667 NA intron (NM_015569, intron 17 of 20) AluJb|SINE|Alu -47814 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 225-55 chr6 49319990 49320185 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 143166 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 256.667-9 chr11 31663323 31663528 + 1.66667 NA intron (NM_019040, intron 9 of 9) intron (NM_019040, intron 9 of 9) 137236 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 321.334-6 chr2 74637221 74637512 + 1.66667 NA intron (NM_001321739, intron 2 of 10) L1MEc|LINE|L1 10671 NM_138804 130951 Hs.348645 NM_138804 ENSG00000159374 M1AP C2orf65|D6Mm5e|SPATA37 meiosis 1 associated protein protein-coding 483.667-3 chr2 185211987 185212488 + 1.66667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -45165 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 226-58 chr22 26932090 26932309 + 1.66667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 28907 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 205.334-6 chr7 112215771 112215918 + 1.66667 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) intron (NM_021994, intron 1 of 11) 9149 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 283.334-11 chr6 96849989 96850208 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -12621 NM_001143957 81491 Hs.221364 NM_030784 ENSG00000112218 GPR63 PSP24(beta)|PSP24B G protein-coupled receptor 63 protein-coding 265.333-14 chr11 34987333 34987614 + 1.66667 NA intron (NM_003477, intron 9 of 10) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 45636 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 243-67 chr7 147687490 147687781 + 1.66667 NA intron (NM_014141, intron 12 of 22) L2a|LINE|L2 15956 NR_133930 105375556 Hs.667432 NR_133929 ENSG00000230190 LOC105375556 - uncharacterized LOC105375556 ncRNA 304.334-10 chr6 72863249 72863472 + 1.66667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 104393 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 505.667-4 chr22 24898496 24898903 + 1.66667 NA intron (NM_001098498, intron 18 of 23) intron (NM_001098498, intron 18 of 23) 47996 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 249-64 chr7 7809113 7809266 + 1.66667 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) -90582 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 227.667-59 chr5 26308611 26308774 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 729894 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 243.666-30 chr5 21829703 21829956 + 1.66667 NA intron (NM_004061, intron 8 of 14) intron (NM_004061, intron 8 of 14) -54625 NR_132787 106635539 NR_132787 SNORA105A - small nucleolar RNA, H/ACA box 105A snoRNA 241-29 chr2 18298329 18298558 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 262210 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 268.334-4 chr13 73168992 73169206 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 110094 NM_001730 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 239-14 chr11 106509195 106509440 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 257910 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 236.334-3 chr15 59726744 59726983 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37543 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 250.333-10 chr11 26560359 26560566 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_145650, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_145650, exon 4 of 4) 11801 NM_001135091 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 300-11 chr11 23398834 23399139 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 20204 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 349-5 chr14 54993862 54994227 + 1.66667 NA intron (NM_007086, intron 11 of 25) intron (NM_007086, intron 11 of 25) 33055 NM_007086 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 271.334-18 chr4 137009674 137009852 + 1.66667 NA intron (NR_149105, intron 2 of 3) L1MA7|LINE|L1 -183993 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 192.334-5 chr7 7762033 7762225 + 1.66667 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -43522 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 255.667 chr1 40413353 40413584 + 1.66667 NA intron (NM_022733, intron 5 of 9) intron (NM_022733, intron 5 of 9) 16668 NM_001198980 64744 Hs.15200 NM_022733 ENSG00000084070 SMAP2 SMAP1L small ArfGAP2 protein-coding 187-51 chr3 99152220 99152333 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -250581 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 127 chr1 14305396 14305586 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 114482 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 301-3 chr1 43013772 43014023 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 54848 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 402.334 chr16 53125550 53125926 + 1.66667 NA intron (NM_025134, intron 1 of 38) MER47B|DNA|TcMar-Tigger -5274 NM_001352127 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 243.334-17 chrX 102806783 102806951 + 1.66667 NA intron (NR_038988, intron 2 of 7) intron (NR_038988, intron 2 of 7) 37714 NR_146590 100287765 Hs.556850 NR_038988 LINC00630 - long intergenic non-protein coding RNA 630 ncRNA 197-58 chr2 115145179 115145343 + 1.66667 NA intron (NR_036580, intron 1 of 2) L1MC2|LINE|L1 16082 NR_036580 389023 Hs.97540 NR_036580 ENSG00000235026 DPP10-AS1 - DPP10 antisense RNA 1 ncRNA 241-55 chr7 104718401 104718629 + 1.66667 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 85577 NR_034142 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 268.334-15 chr3 176754793 176754987 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 62111 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 214.334-6 chr7 93687680 93687903 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29137 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 232.334-3 chr13 94584557 94584732 + 1.66667 NA intron (NR_130732, intron 3 of 10) L1MC5|LINE|L1 11508 NM_001304430 23483 Hs.12393 NM_014305 ENSG00000088451 TGDS CATMANS|SDR2E1|TDPGD TDP-glucose 4,6-dehydratase protein-coding 395-24 chr8 59223068 59223525 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 104086 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 264.334-13 chr4 72468284 72468479 + 1.66667 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 100840 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 228-30 chr14 87206610 87206833 + 1.66667 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 300943 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 295-10 chr12 107036262 107036534 + 1.66667 NA intron (NM_004075, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 -49232 NM_025198 80298 Hs.5009 NM_025198 ENSG00000120832 MTERF2 MTERFD3|mTERFL mitochondrial transcription termination factor 2 protein-coding 252-44 chr2 64098829 64099036 + 1.66667 NA intron (NM_020651, intron 4 of 6) intron (NM_020651, intron 4 of 6) 45488 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 460.334-3 chr6 18814665 18815041 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 243069 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 308.333-25 chr22 23004641 23004893 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -65752 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 320.334-6 chr3 196608408 196608792 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 23987 NR_132101 101929769 Hs.518527 NR_132101 ENSG00000232065 LINC01063 - long intergenic non-protein coding RNA 1063 ncRNA 322-7 chr10 76508204 76508575 + 1.66667 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1MC4|LINE|L1 -379655 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 210.667-63 chr2 25469954 25470129 + 1.66667 NA intron (NM_033147, intron 10 of 19) intron (NM_033147, intron 10 of 19) -127451 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 214-97 chr4 47694175 47694321 + 1.66667 NA intron (NM_006587, intron 5 of 21) intron (NM_006587, intron 5 of 21) 41579 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 247.667-95 chr8 79541627 79541871 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -69368 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 394.334-3 chr18 10782588 10783051 + 1.66667 NA intron (NM_022068, intron 17 of 51) intron (NM_022068, intron 17 of 51) -23170 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 167.667-23 chr10 48670452 48670590 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14256 NR_045675 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 359.334-5 chr6 123020935 123021166 + 1.66667 NA intron (NM_001010852, intron 3 of 5) L1MEh|LINE|L1 24815 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 218.667-28 chr12 131956521 131956703 + 1.66667 NA intron (NM_015409, intron 1 of 52) intron (NM_015409, intron 1 of 52) 6670 NM_015409 57634 Hs.723478 NM_015409 ENSG00000183495 EP400 CAGH32|P400|TNRC12 E1A binding protein p400 protein-coding 300.333-37 chr5 44273399 44273706 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -115180 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 276.666-11 chr14 56148379 56148675 + 1.66667 NA intron (NM_021255, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 30116 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 437-6 chr4 91024783 91025155 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) intron (NM_001145065, intron 9 of 10) 789938 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 316.667-26 chr5 31545489 31545783 + 1.66667 NA intron (NR_134298, intron 6 of 8) intron (NR_134298, intron 6 of 8) 13335 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 227.334-5 chr15 62516999 62517208 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 128078 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 481-4 chr3 120623690 120624039 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 27528 NM_001168331 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 394.334-4 chr2 68213854 68214215 + 1.66667 NA intron (NM_000945, intron 2 of 5) L1PA15|LINE|L1 38498 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 299.334-2 chr1 179378772 179379070 + 1.66667 NA intron (NR_073544, intron 5 of 25) intron (NR_073544, intron 5 of 25) 12877 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 285-34 chr8 130777933 130778240 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 262823 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 252-97 chr7 30696608 30696893 + 1.66667 NA intron (NM_001202481, intron 1 of 13) AluSc8|SINE|Alu 3353 NM_001202481 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 324-24 chr5 58205912 58206361 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -83795 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 279.666-14 chr6 114986493 114986777 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 657200 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 269-2 chr1 101358249 101358438 + 1.66667 NA intron (NR_126402, intron 4 of 4) intron (NR_126402, intron 4 of 4) 34506 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 349-22 chr8 122730199 122730536 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -36261 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 235-34 chr2 125463213 125463380 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 654689 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 264.667-91 chr9 23619636 23619926 + 1.66667 NA intron (NR_121602, intron 9 of 27) MIR|SINE|MIR 52618 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 263 chr1 70040939 70041190 + 1.66667 NA intron (NM_001366839, intron 22 of 25) intron (NM_001366839, intron 22 of 25) 121742 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 279.666-11 chr5 19679349 19679608 + 1.66667 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) L1PA15|LINE|L1 206794 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 254.334-2 chr1 199042273 199042489 + 1.66667 NA intron (NR_126351, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR -23417 NR_110525 102800316 Hs.568480 NR_110525 LINC01222 TCONS_00000112 long intergenic non-protein coding RNA 1222 ncRNA 377.334-4 chr5 73907612 73907969 + 1.66667 NA intron (NM_001177693, intron 33 of 35) intron (NM_001177693, intron 33 of 35) 94244 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 271-57 chrUn_KI270757v1 14901 15094 + 1.66667 NA NA (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 272.334-2 chr1 110755612 110755799 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -80765 NM_002232 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 235.334 chr1 188142611 188142774 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 699064 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 504.666-7 chr8 103856824 103857211 + 1.66667 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) intron (NR_145711, intron 1 of 21) 37797 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 352.334-5 chr5 38396178 38396605 + 1.66667 NA intron (NM_152403, intron 6 of 21) intron (NM_152403, intron 6 of 21) 7080 NR_102750 100506475 Hs.662304 NR_102749 ENSG00000248572 EGFLAM-AS2 - EGFLAM antisense RNA 2 ncRNA 272.334-16 chr7 74392756 74392937 + 1.66667 NA intron (NM_032421, intron 12 of 15) intron (NM_032421, intron 12 of 15) -61060 NM_005685 9569 Hs.647056 NM_005685 ENSG00000006704 GTF2IRD1 BEN|CREAM1|GTF3|MUSTRD1|RBAP2|WBS|WBSCR11|WBSCR12|hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1 protein-coding 293-13 chr12 21701350 21701706 + 1.66667 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -43673 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 342-19 chr2 35077838 35078143 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -393415 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 297.667-17 chr17 48730918 48731112 + 1.66667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -2266 NM_006361 10481 Hs.66731 NM_006361 ENSG00000159184 HOXB13 HPC9|PSGD homeobox B13 protein-coding 235.667-56 chr7 12174408 12174614 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36783 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 231.667-54 chr6 151659599 151659753 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30820 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 236.334-7 chr7 32279407 32279570 + 1.66667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L1MA6|LINE|L1 19840 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 226.333-87 chr4 31595166 31595311 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 88694 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 214.667-96 chr5 23239958 23240160 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -267550 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 249.334-20 chr5 131776004 131776232 + 1.66667 NA intron (NM_133372, intron 1 of 17) intron (NM_133372, intron 1 of 17) 20899 NM_001008738 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 556-6 chr8 126749067 126749562 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -190836 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 243.334-3 chr11 79513950 79514145 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -73017 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 247.333-98 chrX 99556002 99556266 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 854139 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 301-32 chr3 172923403 172923682 + 1.66667 NA intron (NM_031955, intron 8 of 10) intron (NM_031955, intron 8 of 10) 172540 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 329.667-12 chr2 237353760 237354136 + 1.66667 NA intron (NM_057166, intron 21 of 40) MER4A1_|LTR|ERV1 60216 NM_057165 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 199.333-94 chr16 80940812 80941028 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48324 NR_131947 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 235.667-42 chr3 105571413 105571656 + 1.66667 NA intron (NM_001243280, intron 13 of 14) intron (NM_001243280, intron 13 of 14) 204625 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 331-41 chr8 35189657 35190011 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -45641 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 259.667-12 chr11 27411477 27411755 + 1.66667 NA intron (NM_001346432, intron 1 of 16) MIR|SINE|MIR -48368 NM_080654 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 287.333-37 chr3 89441045 89441292 + 1.66667 NA intron (NM_005233, intron 13 of 16) intron (NM_005233, intron 13 of 16) 333547 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 249.334-4 chr10 128131976 128132221 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5675 NM_001145966 4288 Hs.80976 NM_002417 ENSG00000148773 MKI67 KIA|MIB-|MIB-1|PPP1R105 marker of proliferation Ki-67 protein-coding 269.334-2 chr11 5081619 5081879 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 12377 NR_145505 79296 NM_001348221 ENSG00000273085 OR52E1 OR52E1P olfactory receptor family 52 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 246.667-43 chr2 129423022 129423197 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -149218 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 267-62 chr7 54824171 54824389 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 64967 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 280.999-6 chr3 142237852 142238105 + 1.66667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -12393 NR_033289 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 208.667-111 chr5 91666229 91666388 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -282991 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 258.333-68 chr8 120169440 120169734 + 1.66667 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 44485 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 256.334-20 chr7 108155655 108155847 + 1.66667 NA intron (NM_001371150, intron 28 of 29) L2c|LINE|L2 -25390 NM_007356 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 227-35 chr3 53321841 53321984 + 1.66667 NA intron (NM_001290207, intron 2 of 7) intron (NM_001290207, intron 2 of 7) 11215 NR_145715 109617024 NR_145715 ENSG00000207109 SNORD38C - small nucleolar RNA, C/D box 38C snoRNA 260.667-65 chr4 82808660 82808829 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -9887 NM_024906 79966 Hs.379191 NM_024906 ENSG00000145284 SCD5 ACOD4|FADS4|HSCD5|SCD2|SCD4 stearoyl-CoA desaturase 5 protein-coding 253-76 chr8 130871619 130871838 + 1.66667 NA intron (NM_001115, intron 8 of 17) intron (NM_001115, intron 8 of 17) 169181 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 321.667-20 chr5 149312355 149312677 + 1.66667 NA TTS (NM_001323063) TTS (NM_001323063) -32983 NM_152407 134266 Hs.511816 NM_152407 ENSG00000164284 GRPEL2 Mt-GrpE#2 GrpE like 2, mitochondrial protein-coding 435-7 chr9 28695317 28695726 + 1.66667 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) L1ME3G|LINE|L1 23784 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 394-13 chr3 161767937 161768245 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 271283 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 350.666 chr1 83953373 83953673 + 1.66667 NA intron (NM_024686, intron 1 of 20) intron (NM_024686, intron 1 of 20) 45609 NM_001350215 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 202-17 chr10 36767147 36767382 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -358593 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 260-37 chr2 78189999 78190255 + 1.66667 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 100604 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 277.334-11 chr4 95874178 95874370 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 34181 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 146.667-252 chr5 26136527 26136656 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 901995 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 260.334 chr1 82970524 82970748 + 1.66667 NA intron (NR_147074, intron 2 of 10) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 14286 NR_110632 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 230.667-47 chr2 210317350 210317526 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -2264 NM_079420 4632 Hs.187338 NM_079420 ENSG00000168530 MYL1 MLC1F|MLC3F|MYOFTA myosin light chain 1 protein-coding 249.667-40 chr18 12908115 12908314 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -23879 NM_080423 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 301.667-35 chr5 79819569 79819859 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -116865 NR_131226 105616916 Hs.590325 NR_131226 ENSG00000250888 LINC01455 MDONA|TCONS_00009433 long intergenic non-protein coding RNA 1455 ncRNA 219.667-99 chrX 98901928 98902101 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1337479 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 244.667-38 chr13 44528480 44528689 + 1.66667 NA intron (NM_183422, intron 1 of 2) L1MC2|LINE|L1 -47312 NR_038381 641467 Hs.624196 NR_038381 ENSG00000278156 TSC22D1-AS1 - TSC22D1 antisense RNA 1 ncRNA 132-12 chr1 196450987 196451113 + 1.66667 NA intron (NM_001287820, intron 8 of 26) L2a|LINE|L2 131431 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 181-73 chr8 14746512 14746642 + 1.66667 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 106933 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 281.666-7 chr17 76219615 76219982 + 1.66667 NA intron (NM_052916, intron 1 of 18) L1MC5|LINE|L1 20695 NM_052916 114804 Hs.500643 NM_052916 ENSG00000141576 RNF157 - ring finger protein 157 protein-coding 232.333-57 chr3 104985807 104986015 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -380802 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 227.333-126 chr8 103708748 103708961 + 1.66667 NA intron (NM_001348497, intron 2 of 22) L1MEc|LINE|L1 -110366 NR_145711 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 249.334-23 chr9 86688960 86689116 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 258468 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 208-93 chr20 60703656 60703805 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 139168 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 251.333-17 chr10 122470669 122470957 + 1.66667 NA intron (NM_002775, intron 1 of 8) intron (NM_002775, intron 1 of 8) 9260 NM_002775 5654 Hs.501280 NM_002775 ENSG00000166033 HTRA1 ARMD7|CADASIL2|CARASIL|HtrA|L56|ORF480|PRSS11 HtrA serine peptidase 1 protein-coding 253.334-6 chr14 82927502 82927731 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 284984 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 415-12 chr9 123280529 123280955 + 1.66667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -12156 NM_018387 55342 Hs.287659 NM_018387 ENSG00000165209 STRBP HEL162|ILF3L|SPNR|p74 spermatid perinuclear RNA binding protein protein-coding 223-57 chr6 123105544 123105763 + 1.66667 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 109418 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 276.334-14 chr6 63015036 63015232 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 304843 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 362.333-10 chr4 70107712 70108270 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25613 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 268-46 chr5 81650219 81650497 + 1.66667 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) intron (NM_012446, intron 1 of 16) 100895 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 238.333-22 chr14 56282366 56282610 + 1.66667 NA intron (NM_021255, intron 3 of 5) intron (NM_021255, intron 3 of 5) 164077 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 184.333-119 chr5 24671195 24671460 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26349 NM_001362460 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 244.334 chr1 65457056 65457262 + 1.66667 NA intron (NM_001003679, intron 2 of 19) L1MCa|LINE|L1 36443 NM_001198681 54741 Hs.23581 NM_017526 ENSG00000213625 LEPROT LEPR|OB-RGRP|OBRGRP|VPS55 leptin receptor overlapping transcript protein-coding 449-4 chr5 52785335 52785685 + 1.66667 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -2406 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 273.333-18 chr13 60909175 60909360 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 236312 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 670-2 chr19 29994744 29995474 + 1.66667 NA intron (NM_001252641, intron 4 of 10) L1MB2|LINE|L1 52870 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 245.334-6 chr12 6150508 6150702 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -25930 NM_000552 7450 Hs.440848 NM_000552 ENSG00000110799 VWF F8VWF|VWD von Willebrand factor protein-coding 352.333-16 chr3 196863337 196863643 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -4366 NM_001308045 205564 Hs.240770 NM_152699 ENSG00000119231 SENP5 - SUMO specific peptidase 5 protein-coding 419.334-4 chr15 85656436 85656921 + 1.66667 NA intron (NM_001270546, intron 4 of 28) AluY|SINE|Alu 36728 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 689.333 chr8 136519962 136520778 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -10428 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 277.667-16 chr14 72860180 72860384 + 1.66667 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu 32367 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 337-8 chr14 50500855 50501274 + 1.66667 NA intron (NM_198794, intron 3 of 31) intron (NM_198794, intron 3 of 31) 31505 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 255.334-25 chr5 113784307 113784523 + 1.66667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 270721 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 266-69 chr5 62560869 62561100 + 1.66667 NA intron (NM_016338, intron 26 of 29) intron (NM_016338, intron 26 of 29) -17751 NR_073584 101180901 Hs.482269 NR_073584 ENSG00000086200 IPO11-LRRC70 - IPO11-LRRC70 readthrough ncRNA 164.667-224 chr7 49805313 49805475 + 1.66667 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) intron (NR_136188, intron 2 of 3) 30061 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 244.334-8 chr12 40797387 40797545 + 1.66667 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 -30472 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 259.333-23 chr12 28652783 28653080 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -462193 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 220.667-37 chr17 54928438 54928652 + 1.66667 NA intron (NM_001321173, intron 7 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie 27693 NM_005486 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 274-31 chr3 44666941 44667248 + 1.66667 NA intron (NR_157564, intron 1 of 2) AluSq2|SINE|Alu 18362 NM_003420 7584 Hs.288658 NM_003420 ENSG00000169981 ZNF35 HF.10|HF10|Zfp105 zinc finger protein 35 protein-coding 200.334-2 chr3 87030041 87030204 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -38973 NM_001320493 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 245-18 chr14 41091073 41091376 + 1.66667 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) MER58B|DNA|hAT-Charlie 136513 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 490.333-4 chr2 149386932 149387542 + 1.66667 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) intron (NM_194317, intron 1 of 4) 56650 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 257.667-40 chr2 83194563 83194777 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -328144 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 487-2 chr5 57590951 57591549 + 1.66667 NA intron (NR_120607, intron 4 of 5) intron (NR_120607, intron 4 of 5) 20908 NR_120607 100996645 Hs.582496 NR_120607 LINCR-0003 - uncharacterized LincR-0003 ncRNA 348.334-4 chr14 67110073 67110385 + 1.66667 NA exon (NM_020806, exon 14 of 23) exon (NM_020806, exon 14 of 23) -79211 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 260-19 chr11 108259498 108259655 + 1.66667 NA intron (NM_001351834, intron 17 of 63) intron (NM_001351834, intron 17 of 63) 36047 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 185.667-116 chr7 40947672 40947859 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 32174 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 288-60 chr8 114697542 114697901 + 1.66667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 970292 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 395.333-15 chr2 98328134 98328536 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -17820 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 224.333-53 chr16 77248813 77248969 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 49483 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 250.333-18 chr12 65020025 65020243 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27843 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 245-61 chr6 73340054 73340260 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 14119 NM_001025290 340168 Hs.125331 NM_001025290 ENSG00000203909 DPPA5 ESG1 developmental pluripotency associated 5 protein-coding 288-22 chr16 73647758 73647997 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 261072 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 284.333-24 chr2 65117085 65117415 + 1.66667 NA intron (NM_015543, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 12856 NM_004161 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 264.667-45 chr2 183662676 183662896 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 538343 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 334-17 chr18 4506471 4506824 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -51340 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 240.333-95 chr8 96456294 96456530 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37401 NM_002998 6383 Hs.1501 NM_002998 ENSG00000169439 SDC2 CD362|HSPG|HSPG1|SYND2 syndecan 2 protein-coding 294.667-46 chr6 77911321 77911582 + 1.66667 NA intron (NM_001282136, intron 4 of 4) L1PA16|LINE|L1 258412 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 419.334-5 chr2 21157335 21157647 + 1.66667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 33505 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 221.333-46 chr16 85053626 85053796 + 1.66667 NA intron (NM_001286566, intron 1 of 11) AluSc|SINE|Alu -9501 NM_001286565 9764 Hs.301658 NM_014732 ENSG00000135709 KIAA0513 - KIAA0513 protein-coding 267.334-10 chr20 43213049 43213282 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23259 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 476.334-2 chr5 88697040 88697536 + 1.66667 NA intron (NR_146284, intron 1 of 3) intron (NR_146284, intron 1 of 3) -6247 NR_152232 645323 Hs.12827 NR_015436 ENSG00000245526 LINC00461 ECONEXIN|EyeLinc1|VISC long intergenic non-protein coding RNA 461 ncRNA 375.667-4 chr10 86516430 86516692 + 1.66667 NA intron (NM_001318328, intron 2 of 18) intron (NM_001318328, intron 2 of 18) 5223 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 399-6 chr14 56481070 56481370 + 1.66667 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -33111 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 225-14 chr12 22658314 22658537 + 1.66667 NA intron (NM_018638, intron 2 of 7) MER31-int|LTR|ERV1 33254 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 265.334-10 chr14 69604858 69605018 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6658 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 390-19 chr4 47033180 47033557 + 1.66667 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 1801 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 326.667-35 chr7 32586432 32586847 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_015060, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_015060, exon 16 of 16) 91150 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 310-56 chr7 112019436 112019748 + 1.66667 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 186807 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 379-15 chrX 46038047 46038460 + 1.66667 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -186763 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 272.667-13 chr12 14410788 14411024 + 1.66667 NA intron (NM_181352, intron 1 of 14) L1MB8|LINE|L1 25625 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 294.999-4 chr7 119621883 119622214 + 1.66667 NA intron (NR_131960, intron 4 of 4) intron (NR_131960, intron 4 of 4) 285327 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 267.333-69 chr4 89659755 89660057 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -176495 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 220-116 chr8 13651675 13651841 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 22068 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 243-54 chr5 133167187 133167351 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 115256 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 243.333-13 chr11 90407522 90407764 + 1.66667 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) L1MC4|LINE|L1 148214 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 256-25 chr14 68166925 68167213 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L2|LINE|L2 343477 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 232-83 chr7 48265362 48265539 + 1.66667 NA intron (NM_152701, intron 15 of 61) L1ME1|LINE|L1 93992 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 250-63 chr5 73391406 73391563 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 53578 NR_146627 105379033 Hs.145178 NR_146627 LINC02230 - long intergenic non-protein coding RNA 2230 ncRNA 264-25 chr15 65895252 65895435 + 1.66667 NA TTS (NM_032445).2 TTS (NM_032445).2 25852 NM_004663 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 177.667-109 chr5 44723377 44723535 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 85337 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 191.667-64 chr19 17661342 17661472 + 1.66667 NA intron (NM_001080421, intron 8 of 41) intron (NM_001080421, intron 8 of 41) 26792 NM_001080421 23025 Hs.164502 NM_001080421 ENSG00000130477 UNC13A Munc13-1 unc-13 homolog A protein-coding 286.334-3 chr11 103165612 103165787 + 1.66667 NA intron (NM_001377, intron 30 of 88) intron (NM_001377, intron 30 of 88) 56273 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 343.001-3 chr8 28969066 28969350 + 1.66667 NA intron (NM_001324384, intron 2 of 10) intron (NM_001324384, intron 2 of 10) 77894 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 194.334-3 chr4 111003015 111003211 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -142466 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 460.333-3 chr3 117832659 117833219 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -142014 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 266.666-2 chr1 190610344 190610662 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -14387 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 212.333-89 chr20 57313389 57313618 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8088 NR_036219 100422883 NR_036219 ENSG00000266666 MIR4325 - microRNA 4325 ncRNA 200.333-66 chr2 51957172 51957375 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -413375 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 258-58 chr5 23193707 23193926 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -313793 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 252.334-19 chr5 87757259 87757423 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 95299 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 213.333-17 chr10 5673391 5673600 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6900 NR_037164 79754 Hs.445899 NM_024701 ENSG00000196372 ASB13 - ankyrin repeat and SOCS box containing 13 protein-coding 206.333-82 chr2 69474081 69474233 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_014911, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_014911, exon 22 of 22) -36529 NM_001002756 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 237.334 chr12 131502014 131502187 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 146021 NR_146868 105370085 Hs.739274 NR_146868 LINC02414 - long intergenic non-protein coding RNA 2414 ncRNA 274.667-60 chr9 17228396 17228592 + 1.66667 NA intron (NM_001365029, intron 3 of 25) intron (NM_001365029, intron 3 of 25) 93454 NM_001365029 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 275.667-14 chr12 1697097 1697377 + 1.66667 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 6167 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 407.667-2 chr1 163860045 163860602 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -437132 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 258.667-27 chr14 57599609 57599796 + 1.66667 NA intron (NM_001306087, intron 1 of 7) AluSx|SINE|Alu -105845 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 225-15 chr12 49726450 49726602 + 1.66667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -15031 NM_003217 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 248-75 chr6 84921910 84922165 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -157439 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 282.667-5 chr11 19359212 19359494 + 1.66667 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) intron (NM_001111018, intron 1 of 37) 8629 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 295.666-15 chr5 16518500 16518779 + 1.66667 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) intron (NM_001034850, intron 3 of 8) -9641 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 195.334 chr2 114907140 114907327 + 1.66667 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) L1M4b|LINE|L1 -73685 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 202-48 chr14 72939360 72939540 + 1.66667 NA intron (NM_001352448, intron 2 of 13) intron (NM_001352448, intron 2 of 13) 12986 NM_181341 26094 Hs.331491 NM_015604 ENSG00000119599 DCAF4 WDR21|WDR21A DDB1 and CUL4 associated factor 4 protein-coding 258.667-53 chr20 17947285 17947471 + 1.66667 NA intron (NM_014426, intron 11 of 12) L1MC4|LINE|L1 15568 NR_003045 692086 Hs.680747 NR_003045 ENSG00000212232 SNORD17 HBI-43 small nucleolar RNA, C/D box 17 snoRNA 274-11 chr12 116705593 116705769 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 32388 NM_024738 79794 Hs.120170 NM_024738 ENSG00000111412 C12orf49 - chromosome 12 open reading frame 49 protein-coding 214.667-32 chr12 26692855 26693038 + 1.66667 NA intron (NM_002223, intron 10 of 56) intron (NM_002223, intron 10 of 56) 140248 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 378-11 chr2 55025267 55025672 + 1.66667 NA exon (NM_001321904, exon 4 of 10) exon (NM_001321904, exon 4 of 10) -15197 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 334-13 chr17 47171241 47171666 + 1.66667 NA intron (NM_001293091, intron 2 of 17) intron (NM_001293091, intron 2 of 17) 17842 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 221.333-6 chr1 92641521 92641827 + 1.66667 NA intron (NM_005665, intron 11 of 17) intron (NM_005665, intron 11 of 17) 143434 NM_001350197 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 200.334 chr11 132631049 132631199 + 1.66667 NA intron (NM_002545, intron 2 of 6) L1ME2|LINE|L1 312513 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 251.667-89 chr7 107290531 107290746 + 1.66667 NA intron (NM_181733, intron 12 of 20) L1MB8|LINE|L1 121635 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 234.666-21 chr2 67773111 67773314 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 52350 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 265-57 chr5 53091076 53091281 + 1.66667 NA non-coding (NR_073107, exon 29 of 29) non-coding (NR_073107, exon 29 of 29) 18579 NM_004531 4338 Hs.163645 NM_004531 ENSG00000164172 MOCS2 MCBPE|MOCO1|MOCODB|MPTS molybdenum cofactor synthesis 2 protein-coding 328-13 chr14 60109913 60110228 + 1.66667 NA intron (NM_001330177, intron 2 of 10) MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 18147 NM_001330177 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 254.333-62 chr4 118917519 118917755 + 1.66667 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) 28783 NM_001128933 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 249.667-86 chr6 140403225 140403392 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 198056 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 145-83 chr4 144540206 144540365 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 105734 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 291.334-9 chr2 102766868 102767167 + 1.66667 NA intron (NM_001321346, intron 3 of 3) MIRc|SINE|MIR 4986 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 396.667-8 chr4 56062434 56062793 + 1.66667 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -107582 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 322.334-11 chr8 125276234 125276514 + 1.66667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -153984 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 357.001-2 chr3 114225627 114225946 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 11792 NM_007136 7634 Hs.271079 NM_007136 ENSG00000174255 ZNF80 pT17 zinc finger protein 80 protein-coding 213.667-44 chr2 51269792 51270042 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 237316 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 198.334-4 chr2 124604281 124604432 + 1.66667 NA intron (NM_130773, intron 11 of 23) L1MC5a|LINE|L1 579069 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 244-61 chr20 4953503 4953697 + 1.66667 NA intron (NM_005116, intron 2 of 16) intron (NM_005116, intron 2 of 16) 47910 NM_005116 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 256-91 chr8 119552694 119552849 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 40237 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 311-21 chr3 95626311 95626557 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 56759 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 218.334-5 chr8 43104773 43104919 + 1.66667 NA intron (NM_032237, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 11331 NM_032237 84197 Hs.491646 NM_032237 ENSG00000185900 POMK MDDGA12|MDDGC12|SGK196 protein O-mannose kinase protein-coding 262-78 chr8 102641084 102641269 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 12788 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 223.667-45 chr22 28372309 28372522 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -87454 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 393.333-9 chr18 12844160 12844695 + 1.66667 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) L1MD2|LINE|L1 -3465 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 285.334-7 chr2 24047978 24048219 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001142319) promoter-TSS (NM_001142319) -672 NM_001142319 80304 Hs.24624 NM_025203 ENSG00000163026 WDCP C2orf44|MMAP|PP384 WD repeat and coiled coil containing protein-coding 336.333-14 chr14 64015627 64016016 + 1.66667 NA intron (NM_015180, intron 32 of 114) L1MD1|LINE|L1 79304 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 290.333-12 chr14 88154655 88154921 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 116123 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 345.666-3 chr12 121413621 121414042 + 1.66667 NA intron (NM_194271, intron 2 of 6) AluY|SINE|Alu 13713 NM_194271 80196 Hs.292804 NM_025126 ENSG00000170633 RNF34 CARP-1|CARP1|RFI|RIF|RIFF|hRFI ring finger protein 34 protein-coding 245.334-2 chr1 100022014 100022172 + 1.66667 NA intron (NM_001271685, intron 7 of 7) MIR|SINE|MIR -16002 NM_033055 64645 Hs.124156 NM_033055 ENSG00000156875 MFSD14A HIAT1 major facilitator superfamily domain containing 14A protein-coding 142-36 chr13 34432346 34432572 + 1.66667 NA intron (NR_146542, intron 2 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 84416 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 250.334-10 chr18 54393712 54393882 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 35880 NR_110234 162681 Hs.208701 NM_173529 ENSG00000166845 C18orf54 LAS2 chromosome 18 open reading frame 54 protein-coding 342.334-4 chr5 60883298 60883652 + 1.66667 NA intron (NM_001007233, intron 12 of 12) intron (NM_001007233, intron 12 of 12) -39201 NM_001104558 79993 Hs.274256 NM_024930 ENSG00000164181 ELOVL7 - ELOVL fatty acid elongase 7 protein-coding 156-105 chr4 100446366 100446552 + 1.66667 NA intron (NM_001159694, intron 4 of 10) intron (NM_001159694, intron 4 of 10) -51212 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 296-47 chr4 130138413 130138640 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -237835 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 311-7 chr11 108882742 108882954 + 1.66667 NA intron (NM_004398, intron 16 of 17) MIRc|SINE|MIR 217779 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 526.666 chr14 58108183 58108955 + 1.66667 NA intron (NM_001001872, intron 4 of 7) L1ME3D|LINE|L1 43644 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 422-9 chr5 42579226 42579504 + 1.66667 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 13501 NM_001242462 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 222.333-52 chr2 206540508 206540704 + 1.66667 NA intron (NM_003812, intron 4 of 25) intron (NM_003812, intron 4 of 25) 97074 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 185.667-122 chr7 129283220 129283367 + 1.66667 NA intron (NM_001130720, intron 1 of 16) L1ME1|LINE|L1 58263 NM_015328 23382 Hs.600789 NM_015328 ENSG00000158467 AHCYL2 ADOHCYASE3|IRBIT2 adenosylhomocysteinase like 2 protein-coding 330-36 chr8 109839350 109839728 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 136232 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 188.667-84 chr2 195621540 195621739 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35319 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 273.334-8 chr2 123969472 123969645 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 55616 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 362.667-6 chr12 9652222 9652570 + 1.66667 NA intron (NR_046444, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 4349 NR_046444 374443 Hs.569124 NR_002814 ENSG00000256594 LOC374443 - C-type lectin domain family 2 member D pseudogene pseudo 304.667-6 chr10 84981281 84981597 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 217466 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 281-5 chr11 14551922 14552095 + 1.66667 NA intron (NM_148976, intron 2 of 10) intron (NM_148976, intron 2 of 10) -31563 NM_002786 5682 Hs.102798 NM_002786 ENSG00000129084 PSMA1 HC2|HEL-S-275|NU|PROS30 proteasome subunit alpha 1 protein-coding 384.667-11 chr9 28055117 28055706 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -481545 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 256.666 chr1 44434070 44434334 + 1.66667 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) L2|LINE|L2 10201 NM_001319957 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 281-28 chr3 47614216 47614544 + 1.66667 NA intron (NM_003074, intron 25 of 27) intron (NM_003074, intron 25 of 27) -34140 NM_001206942 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 242-61 chr5 161571413 161571631 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23118 NM_000813 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 257.334-13 chr7 18691845 18692052 + 1.66667 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) intron (NM_058176, intron 11 of 22) 182678 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 227.667-19 chr13 72072571 72072757 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -205460 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 314.667-25 chr2 146025877 146026186 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -561026 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 252.667-4 chr1 98594801 98594962 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -66840 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 246.667-37 chr18 72784311 72784575 + 1.66667 NA intron (NR_148694, intron 6 of 11) intron (NR_148694, intron 6 of 11) 68939 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 250-40 chr2 161664330 161664687 + 1.66667 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) intron (NM_001354451, intron 1 of 25) 40092 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 156.667-41 chr10 41875343 41875523 + 1.66667 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 492612 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 260.334-4 chr10 53756917 53757153 + 1.66667 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger -729195 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 276.667-62 chr7 54979137 54979416 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -39741 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 278.001 chr10 80445297 80445487 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8873 NM_030927 81619 Hs.308615 NM_030927 ENSG00000108219 TSPAN14 DC-TM4F2|TM4SF14|tspan-14 tetraspanin 14 protein-coding 432-5 chr17 76070012 76070515 + 1.66667 NA intron (NR_048541, intron 1 of 14) intron (NR_048541, intron 1 of 14) 2254 NM_014230 6730 Hs.514495 NM_014230 ENSG00000167881 SRP68 - signal recognition particle 68 protein-coding 274.333 chr1 117790871 117791304 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 138534 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 271.667-13 chr11 3967340 3967519 + 1.66667 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) intron (NM_001277962, intron 1 of 12) 111367 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 230.334 chr1 184325768 184325980 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -61155 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 261.333-89 chr5 87755471 87755762 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 93574 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 342.333-16 chr2 80856782 80857183 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 543603 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 370.333-18 chr3 142418694 142419041 + 1.66667 NA exon (NM_001282859, exon 11 of 12) exon (NM_001282859, exon 11 of 12) 29170 NM_019001 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 380.001 chr3 112880767 112881090 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -34978 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 239.667-68 chr7 53455755 53456001 + 1.66667 NA Intergenic L1M|LINE|L1 356053 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 309.334-8 chr3 8106900 8107213 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -90749 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 334.667-19 chr3 125339311 125339599 + 1.66667 NA intron (NM_001348427, intron 1 of 9) intron (NM_001348427, intron 1 of 9) 17825 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 256-69 chr4 122415980 122416206 + 1.66667 NA intron (NM_001159285, intron 10 of 11) MIR|SINE|MIR 36575 NM_001159295 132612 Hs.518957 NM_139243 ENSG00000164113 ADAD1 Tenr adenosine deaminase domain containing 1 protein-coding 543.001 chr3 70828064 70828444 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 236670 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 249.334-21 chr9 14520246 14520458 + 1.66667 NA intron (NM_001369458, intron 1 of 11) intron (NM_001369458, intron 1 of 11) 11725 NM_001369459 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 217 chr1 14090533 14090703 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 329355 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 382.667-9 chr2 78198469 78198866 + 1.66667 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 92064 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 224-87 chr6 98871781 98872096 + 1.66667 NA non-coding (NR_103836, exon 8 of 8) non-coding (NR_103836, exon 8 of 8) 37364 NM_005604 5454 Hs.182505 NM_005604 ENSG00000184486 POU3F2 BRN2|N-Oct3|OCT7|OTF-7|OTF7|POUF3|brn-2|oct-7 POU class 3 homeobox 2 protein-coding 315.334-6 chr4 90519879 90520184 + 1.66667 NA intron (NM_207491, intron 5 of 7) MIR|SINE|MIR 285000 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 265-35 chr2 104961329 104961563 + 1.66667 NA intron (NR_110603, intron 1 of 2) L1MB2|LINE|L1 -76623 NM_182640 64965 Hs.590900 NM_182640 ENSG00000135972 MRPS9 MRP-S9|RPMS9|S9mt mitochondrial ribosomal protein S9 protein-coding 395-10 chr18 68310664 68310990 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 404281 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 243.667-51 chr3 145511809 145511992 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 557285 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 223.667-57 chr4 105048417 105048622 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -97356 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 266.334-2 chr1 25572639 25572882 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 29175 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 316-21 chr2 11623932 11624252 + 1.66667 NA intron (NM_014668, intron 23 of 32) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 46103 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 242.667-111 chr9 90601316 90601465 + 1.66667 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -18644 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 347.333-28 chr8 60855250 60855691 + 1.66667 NA intron (NM_017780, intron 32 of 37) intron (NM_017780, intron 32 of 37) 112278 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 248.667-28 chr12 101831847 101832127 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1028 NM_024312 79158 Hs.46850 NM_024312 ENSG00000111670 GNPTAB GNPTA|ICD N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta protein-coding 387.334-4 chr2 21657656 21658017 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 52816 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 282.667-23 chr20 30951611 30951892 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -305913 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 263.334-13 chr5 170048460 170048710 + 1.66667 NA intron (NR_156756, intron 41 of 52) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 20097 NR_039609 100616498 NR_039609 ENSG00000263831 MIR378E mir-378e microRNA 378e ncRNA 204.667-158 chrX 27236283 27236430 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 226985 NM_207319 139420 Hs.350673 NM_207319 ENSG00000224960 PPP4R3C FLFL3P|PPP4R3CP|SMEK3P|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3C protein-coding 301.334-11 chr5 86923124 86923339 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 176413 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 261-56 chr8 54186540 54186816 + 1.66667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 51437 NM_014175 29088 Hs.18349 NM_014175 ENSG00000137547 MRPL15 HSPC145|L15mt|MRP-L15|MRP-L7|RPML7 mitochondrial ribosomal protein L15 protein-coding 172.667-94 chr20 55619492 55619661 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -192379 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 287.667-35 chr8 26345803 26346097 + 1.66667 NA intron (NM_001177591, intron 3 of 9) intron (NM_001177591, intron 3 of 9) 37003 NR_144550 157489 Hs.586388 NR_144550 ENSG00000228451 SDAD1P1 - SDA1 domain containing 1 pseudogene 1 pseudo 268-27 chr18 25304087 25304299 + 1.66667 NA intron (NM_001308225, intron 2 of 6) intron (NM_001308225, intron 2 of 6) 47973 NM_015461 25925 Hs.116935 NM_015461 ENSG00000198795 ZNF521 EHZF|Evi3 zinc finger protein 521 protein-coding 397.667-5 chr2 123006612 123007101 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 66625 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 283.334-10 chr5 103360267 103360448 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 100933 NM_001316968 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 259.333-88 chr6 134978380 134978691 + 1.66667 NA TTS (NR_037435) TTS (NR_037435) 897 NR_037435 100500880 NR_037435 ENSG00000283409 MIR3662 mir-3662 microRNA 3662 ncRNA 616.666 chr2 88847720 88848543 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 35761 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 517.334 chr10 28931623 28932061 + 1.66667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 85434 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 391-2 chr12 23805739 23806195 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) 143703 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 190-110 chr6 88762541 88762730 + 1.66667 NA intron (NM_001286428, intron 11 of 13) intron (NM_001286428, intron 11 of 13) 200983 NM_001286428 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 182.667-129 chr5 40244878 40245026 + 1.66667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 192661 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 162-51 chr16 87382313 87382450 + 1.66667 NA intron (NM_001282683, intron 2 of 9) intron (NM_001282683, intron 2 of 9) 1395 NM_024735 79791 Hs.567582 NM_024735 ENSG00000103264 FBXO31 FBX14|FBXO14|Fbx31|MRT45|pp2386 F-box protein 31 protein-coding 255-60 chr4 162414296 162414574 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -250401 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 296.667-51 chr6 64918439 64918804 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 15 of 43) L2|LINE|L2 -382797 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 307.667-26 chr3 67927098 67927412 + 1.66667 NA intron (NR_109992, intron 6 of 6) intron (NR_109992, intron 6 of 6) -64337 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 538.334 chr7 33349047 33349439 + 1.66667 NA intron (NM_001348040, intron 13 of 20) intron (NM_001348040, intron 13 of 20) 219679 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 507.334-5 chr3 61864507 61865042 + 1.66667 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 303203 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 433.334 chr12 33314414 33314799 + 1.66667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 125213 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 307.667-27 chr3 147231406 147231666 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 160894 NR_040762 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 405.667-6 chr4 36135969 36136420 + 1.66667 NA intron (NR_146894, intron 19 of 32) intron (NR_146894, intron 19 of 32) 107745 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 309.667-26 chr7 35525164 35525408 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 169849 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 322 chr1 50622709 50623119 + 1.66667 NA intron (NM_007051, intron 8 of 18) intron (NM_007051, intron 8 of 18) -199471 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 251.667-45 chr2 149590346 149590517 + 1.66667 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) AluJr4|SINE|Alu -2656 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 347.666-7 chr2 233483670 233484011 + 1.66667 NA intron (NM_001365479, intron 30 of 31) L1M5|LINE|L1 81733 NM_018218 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 215.667-20 chr11 56149559 56149754 + 1.66667 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 10661 NM_001004058 219453 Hs.553626 NM_001004058 ENSG00000181752 OR8K5 OR11-174 olfactory receptor family 8 subfamily K member 5 protein-coding 397.333-10 chr7 88312385 88312869 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5733 NM_001205316 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 260.333-69 chr8 25287560 25287941 + 1.66667 NA intron (NM_024940, intron 5 of 51) intron (NM_024940, intron 5 of 51) -57652 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 232.667-21 chr13 86301001 86301265 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -501714 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 299.667-12 chr17 61573075 61573297 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18033 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 319.667-9 chr17 63109619 63109950 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) L3|LINE|CR1 143549 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 400.667-4 chr4 127999348 127999761 + 1.66667 NA intron (NM_001039717, intron 4 of 10) L1PA16|LINE|L1 -33591 NM_152778 256471 Hs.480701 NM_152778 ENSG00000164073 MFSD8 CCMD|CLN7 major facilitator superfamily domain containing 8 protein-coding 403.666-4 chr4 30600923 30601427 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -119194 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 256.999-3 chr4 98875071 98875374 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001130679, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001130679, exon 8 of 8) 53911 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 370-5 chr14 47682746 47683029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7933 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 374-23 chr8 82174681 82175110 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -332609 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 208.667-50 chr16 13577027 13577182 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -343053 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 222-63 chr3 95753126 95753395 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -70067 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 352.334-3 chr11 83842892 83843187 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 16 of 27) L2c|LINE|L2 -160614 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 331.667-14 chr3 96586681 96587115 + 1.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 226934 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 300.334-10 chr5 44451818 44452064 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 58341 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 255.667-43 chr2 60162817 60162993 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 220131 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 237-24 chr12 100604975 100605148 + 1.66667 NA intron (NM_001303130, intron 4 of 8) L1MA2|LINE|L1 11443 NM_001303131 283431 Hs.20575 NM_174942 ENSG00000139354 GAS2L3 G2L3 growth arrest specific 2 like 3 protein-coding 188.667-92 chr21 29339415 29339601 + 1.66667 NA intron (NR_027655, intron 4 of 7) intron (NR_027655, intron 4 of 7) -32993 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 241.667-61 chr4 44242888 44243096 + 1.66667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 205817 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 237.667-29 chr17 52941199 52941366 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -44223 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 294.667-3 chr10 55210354 55210615 + 1.66667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -388558 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 252.334-22 chr8 53017076 53017233 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 77246 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 217.666-18 chr18 46001160 46001426 + 1.66667 NA intron (NM_024430, intron 6 of 14) L1MB3|LINE|L1 -33964 NM_020964 57724 Hs.514843 NM_020964 ENSG00000152223 EPG5 HEEW1|KIAA1632|VICIS ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog protein-coding 549-2 chr14 67821874 67822484 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 1 of 10) intron (NM_133509, intron 1 of 10) -1362 NM_001321812 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 273-15 chr14 74126546 74126913 + 1.66667 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) L1MB5|LINE|L1 41776 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 412.333-2 chr1 226299747 226300104 + 1.66667 NA intron (NM_001366241, intron 2 of 14) AluSx1|SINE|Alu 9239 NM_001366245 286826 Hs.120817 NM_173083 ENSG00000183814 LIN9 BARA|BARPsv|Lin-9|TGS|TGS1|TGS2 lin-9 DREAM MuvB core complex component protein-coding 253.667-28 chr19 28670255 28670491 + 1.66667 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1ME3|LINE|L1 57321 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 222-31 chr15 33526723 33526940 + 1.66667 NA intron (NM_001243996, intron 3 of 102) L2a|LINE|L2 215864 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 331.667-3 chr14 50850184 50850537 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19239 NM_020921 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 383.334-2 chr13 20554184 20554433 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -12849 NM_001353578 8100 Hs.187376 NM_006531 ENSG00000032742 IFT88 D13S1056E|DAF19|TG737|TTC10|hTg737 intraflagellar transport 88 protein-coding 366.333-10 chr2 166006981 166007446 + 1.66667 NA intron (NM_001353957, intron 21 of 26) intron (NM_001353957, intron 21 of 26) 49795 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 223-3 chr1 187882337 187882481 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 438781 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 267-69 chr8 81031242 81031460 + 1.66667 NA intron (NM_018440, intron 2 of 8) intron (NM_018440, intron 2 of 8) 80717 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 257-55 chr5 126255091 126255392 + 1.66667 NA Intergenic LTR43|LTR|ERV1 29934 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 226.333-33 chr14 75730048 75730303 + 1.66667 NA intron (NM_015072, intron 12 of 31) intron (NM_015072, intron 12 of 31) 68929 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 278-30 chr3 36095337 36095544 + 1.66667 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -285047 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 275.334-8 chr18 22492353 22492576 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -74549 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 284-6 chr10 102390086 102390367 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3884 NM_001288724 4791 Hs.73090 NM_002502 ENSG00000077150 NFKB2 CVID10|H2TF1|LYT-10|LYT10|NF-kB2|p100|p49/p100|p52 nuclear factor kappa B subunit 2 protein-coding 290-40 chr4 150951688 150951926 + 1.66667 NA intron (NM_001367550, intron 2 of 56) MER20B|DNA|hAT-Charlie 63460 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 256.334-7 chr2 11264666 11264831 + 1.66667 NA intron (NM_001321643, intron 3 of 32) L2|LINE|L2 79888 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 262.334-13 chr5 166493534 166493702 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 432752 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 229-34 chr2 211294504 211294766 + 1.66667 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? 677064 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 294.334-5 chr3 112101223 112101526 + 1.66667 NA intron (NM_024616, intron 2 of 5) MER68|LTR|ERVL -11427 NR_030292 693152 NR_030292 ENSG00000207940 MIR567 MIRN567|hsa-mir-567 microRNA 567 ncRNA 248.667-18 chr10 116363433 116363667 + 1.66667 NA intron (NM_198515, intron 7 of 8) intron (NM_198515, intron 7 of 8) 39102 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 227.666-21 chr21 31203404 31203629 + 1.66667 NA intron (NM_001353686, intron 11 of 27) intron (NM_001353686, intron 11 of 27) -42576 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 256.666-24 chr22 25914193 25914467 + 1.66667 NA intron (NM_001318245, intron 33 of 43) L1ME3Cz|LINE|L1 172142 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 256-76 chr5 66774341 66774522 + 1.66667 NA intron (NM_001290228, intron 2 of 4) intron (NM_001290228, intron 2 of 4) -54342 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 194.334 chr13 110367289 110367433 + 1.66667 NA intron (NM_001846, intron 4 of 47) intron (NM_001846, intron 4 of 47) 26403 NR_107040 102465872 NR_107040 ENSG00000276765 MIR8073 hsa-mir-8073 microRNA 8073 ncRNA 351.334-5 chr5 125633691 125633988 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 140578 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 266.001-3 chr2 43921769 43921939 + 1.66667 NA intron (NM_133259, intron 27 of 37) intron (NM_133259, intron 27 of 37) 74135 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 262.333-4 chr1 80421323 80421618 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -114285 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 258-52 chr4 94909896 94910191 + 1.66667 NA intron (NM_001203, intron 2 of 12) intron (NM_001203, intron 2 of 12) -86189 NM_001256792 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 204.667-82 chr20 15633233 15633400 + 1.66667 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 289998 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 180.333-65 chr20 56180561 56180783 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -68060 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 257.667-69 chr6 45326420 45326582 + 1.66667 NA intron (NM_181356, intron 2 of 12) intron (NM_181356, intron 2 of 12) -1816 NM_001015051 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 246-39 chr16 78863435 78863584 + 1.66667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 737228 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 186.333-11 chr1 232043309 232043540 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 117590 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 434.001-2 chr8 125121519 125121850 + 1.66667 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) intron (NM_001349486, intron 3 of 7) 29824 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 290-57 chrX 81423294 81423579 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 221334 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 284.334-9 chr18 34762169 34762365 + 1.66667 NA intron (NM_001198945, intron 3 of 10) L3|LINE|CR1 6291 NM_001391 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 249-20 chr12 70879959 70880140 + 1.66667 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 40689 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 345-12 chr4 34483783 34484168 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -214228 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 280.667-23 chr14 73974077 73974369 + 1.66667 NA intron (NM_001249, intron 11 of 15) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 23921 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 271.334 chr1 97031286 97031459 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -64551 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 403.667-11 chr6 40060422 40060869 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -126183 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 184-55 chr2 161689772 161689931 + 1.66667 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) intron (NM_001354451, intron 1 of 25) 65435 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 263.667-47 chr2 116379559 116379770 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1035849 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 402 chr11 29553654 29553931 + 1.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -40621 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 253.001 chr14 54933227 54933379 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -30477 NM_000161 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 253.667-72 chr8 9824740 9824959 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 78480 NR_024281 157627 Hs.12513 NR_024281 ENSG00000253230 LINC00599 Rncr3 long intergenic non-protein coding RNA 599 ncRNA 313.667-18 chr17 30553352 30553667 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22956 NR_015341 107133515 Hs.568209 NR_015341 SMURF2P1-LRRC37BP1 - SMURF2P1-LRRC37BP1 readthrough transcribed pseudogene pseudo 656.667 chr6 86320790 86321651 + 1.66667 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -616308 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 282.667-44 chr7 71058129 71058319 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -73920 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 435.334 chr21 21261370 21261717 + 1.66667 NA intron (NM_001352592, intron 2 of 18) L1PA17|LINE|L1 114381 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 375.334-2 chr16 49103716 49103960 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 178000 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 359.001-2 chr2 112941357 112941667 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26319 NM_173205 27178 Hs.166371 NM_014439 ENSG00000125571 IL37 FIL1|FIL1(ZETA)|FIL1Z|IL-1F7|IL-1H|IL-1H4|IL-1RP1|IL-37|IL1F7|IL1H4|IL1RP1 interleukin 37 protein-coding 265.667-10 chr10 68712940 68713107 + 1.66667 NA Intergenic U13_|snRNA|snRNA -8216 NM_018237 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 401-6 chr18 12799166 12799582 + 1.66667 NA intron (NM_080422, intron 8 of 9) AluSg|SINE|Alu 41588 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 204-161 chr5 57256953 57257209 + 1.66667 NA intron (NM_001203246, intron 9 of 10) AluSq2|SINE|Alu 43007 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 237.667-27 chr16 68116551 68116697 + 1.66667 NA intron (NM_004555, intron 1 of 10) intron (NM_004555, intron 1 of 10) 31254 NM_173163 4775 Hs.436585 NM_004555 ENSG00000072736 NFATC3 NF-AT4c|NFAT4|NFATX nuclear factor of activated T cells 3 protein-coding 288.334-2 chr16 69386575 69386856 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_005652) promoter-TSS (NM_005652) -708 NM_005652 7014 Hs.63335 NM_005652 ENSG00000132604 TERF2 TRBF2|TRF2 telomeric repeat binding factor 2 protein-coding 204-150 chr4 44427522 44427676 + 1.66667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 21210 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 304.666-7 chr10 108934368 108934712 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -865247 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 242.334-5 chr14 56614699 56614848 + 1.66667 NA intron (NM_017799, intron 7 of 15) intron (NM_017799, intron 7 of 15) 34975 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 285.667-15 chr14 67936768 67937033 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MB7|LINE|L1 113308 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 360.667-16 chr8 139064597 139064932 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -150723 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 203-35 chr15 61986858 61987090 + 1.66667 NA intron (NM_001018088, intron 18 of 81) L1ME2|LINE|L1 73473 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 251.667-62 chr3 107303776 107303967 + 1.66667 NA intron (NR_028302, intron 2 of 3) intron (NR_028302, intron 2 of 3) 63179 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 259.334-14 chr20 51149557 51149732 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -126537 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 255.667-55 chr3 74495456 74495653 + 1.66667 NA intron (NM_020872, intron 2 of 21) intron (NM_020872, intron 2 of 21) 25586 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 243-61 chr6 147310276 147310526 + 1.66667 NA intron (NM_139244, intron 10 of 25) intron (NM_139244, intron 10 of 25) -105787 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 323.334-8 chr4 67879624 67879977 + 1.66667 NA intron (NM_004262, intron 1 of 9) L1ME3E|LINE|L1 4202 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 234.667-21 chr12 1782375 1782538 + 1.66667 NA intron (NM_024551, intron 6 of 7).2 intron (NM_024551, intron 6 of 7).2 -37811 NM_001163925 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 274-25 chr2 100584678 100584877 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -18962 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 386.333-13 chr4 63517649 63518019 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 891616 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 328.334-4 chr7 77391774 77391975 + 1.66667 NA intron (NR_146937, intron 5 of 31) MIR3|SINE|MIR -23324 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 245.667-61 chr6 52112331 52112603 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -24854 NM_138694 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 258.667-81 chr5 126079136 126079328 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -100345 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 275.667-10 chr10 93516669 93516996 + 1.66667 NA intron (NM_018131, intron 5 of 8) HAL1ME|LINE|L1 20220 NM_018131 55165 Hs.14559 NM_018131 ENSG00000138180 CEP55 C10orf3|CT111|MARCH|URCC6 centrosomal protein 55 protein-coding 259.667-72 chr7 27836099 27836409 + 1.66667 NA intron (NM_175061, intron 4 of 4) intron (NM_175061, intron 4 of 4) 96159 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 346.334-4 chr12 33878218 33878561 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -144107 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 454-5 chr14 49437374 49437869 + 1.66667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 148759 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 272.333-45 chr3 160308887 160309124 + 1.66667 NA intron (NM_001190242, intron 8 of 18) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 74761 NM_001190242 57560 Hs.478095 NM_020800 ENSG00000068885 IFT80 ATD2|SRTD2|WDR56 intraflagellar transport 80 protein-coding 242.667-90 chr5 164566615 164566800 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 96428 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 371.667-11 chr8 78250459 78250841 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -265690 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 346.333-14 chr17 69748430 69748825 + 1.66667 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 154640 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 251-57 chr4 160390672 160390873 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -612988 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 222.666-24 chr2 126017652 126017857 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 100231 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 285-32 chr7 72462032 72462274 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15010 NM_001363460 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 251-82 chr7 108074387 108074614 + 1.66667 NA intron (NM_001318046, intron 17 of 33) AluSz6|SINE|Alu 55861 NM_001318046 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 255.667-56 chr3 104593386 104593653 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -773194 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 467.333 chr1 246568612 246569043 + 1.66667 NA intron (NM_001139459, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 2371 NM_152609 163882 Hs.368353 NM_152609 ENSG00000162852 CNST C1orf71|PPP1R64 consortin, connexin sorting protein protein-coding 249.334-13 chr17 69365599 69365772 + 1.66667 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -38552 NM_172232 23461 Hs.731824 NM_018672 ENSG00000154265 ABCA5 ABC13|EST90625|HTC3 ATP binding cassette subfamily A member 5 protein-coding 241.333-39 chr14 60622135 60622400 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16949 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 245-10 chr11 33060985 33061152 + 1.66667 NA intron (NM_001145541, intron 6 of 9) AluJb|SINE|Alu -15082 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 374.667-9 chr3 178945052 178945357 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -84799 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 308.334-10 chr8 132582388 132582668 + 1.66667 NA intron (NR_073525, intron 11 of 12) intron (NR_073525, intron 11 of 12) -21049 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 281.667-56 chr9 26941336 26941566 + 1.66667 NA intron (NM_001321546, intron 1 of 12) HAL1|LINE|L1 -5539 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 390-11 chr15 24758576 24759182 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -64729 NM_001349459 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 245.666-17 chr4 25820684 25820995 + 1.66667 NA intron (NM_001297592, intron 7 of 23) AluSz|SINE|Alu 42149 NM_015187 23231 Hs.479384 NM_015187 ENSG00000091490 SEL1L3 Sel-1L3 SEL1L family member 3 protein-coding 140.667-249 chr9 87898776 87898967 + 1.66667 NA intron (NR_149022, intron 3 of 3) L1M4c|LINE|L1 15994 NM_178828 286234 Hs.130672 NM_178828 ENSG00000177992 SPATA31E1 C9orf79|FAM75E1 SPATA31 subfamily E member 1 protein-coding 258.334-11 chr18 1895930 1896110 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -536391 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 249.667-18 chr11 110233786 110233967 + 1.66667 NA intron (NM_001260493, intron 12 of 15) L1MC4|LINE|L1 62836 NM_001260494 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 300.334-8 chr4 48030479 48030771 + 1.66667 NA intron (NM_207330, intron 3 of 5) intron (NM_207330, intron 3 of 5) 13853 NM_207330 152519 Hs.134190 NM_207330 ENSG00000163293 NIPAL1 NPAL1 NIPA like domain containing 1 protein-coding 245.667-38 chr2 189620317 189620549 + 1.66667 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -39622 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 334.334-3 chr2 84352081 84352307 + 1.66667 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 61512 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 311.334-8 chr8 84959420 84959674 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -147691 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 266-15 chr11 97491144 97491375 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 982834 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 307.334-3 chr12 9726630 9726851 + 1.66667 NA intron (NM_001253750, intron 1 of 3) intron (NM_001253750, intron 1 of 3) 6559 NM_001253750 160365 Hs.560087 NM_172004 ENSG00000184293 CLECL1 DCAL-1|DCAL1 C-type lectin like 1 protein-coding 252.667-66 chr3 139792844 139793068 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -114906 NM_001320511 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 248.666-25 chr3 4260392 4260683 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -42767 NM_001320677 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 265-39 chr2 200976559 200976748 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_173822, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_173822, exon 12 of 12) -12993 NM_006190 4999 Hs.444870 NM_006190 ENSG00000115942 ORC2 ORC2L origin recognition complex subunit 2 protein-coding 184-110 chr8 118053542 118053735 + 1.66667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 58181 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 250-85 chr8 62922092 62922327 + 1.66667 NA intron (NR_130764, intron 5 of 6) intron (NR_130764, intron 5 of 6) -55652 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 247.333-56 chr4 51916077 51916359 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001287757, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001287757, exon 12 of 12) 72639 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 251.666-29 chr7 115286045 115286278 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -54806 NR_126407 104355291 NR_126407 ENSG00000233607 LINC01392 - long intergenic non-protein coding RNA 1392 ncRNA 160.667-309 chr8 109546321 109546511 + 1.66667 NA intron (NM_001278938, intron 1 of 6) L1ME1|LINE|L1 5790 NM_001278938 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 296.334 chr10 53103529 53103743 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -331936 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 194.334-4 chr8 139304348 139304562 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -390414 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 336.334-4 chr4 83982590 83982843 + 1.66667 NA intron (NR_125909, intron 8 of 8) L1ME1|LINE|L1 316453 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 260.333-72 chr8 121488191 121488485 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -151008 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 255.334 chr1 21610607 21610817 + 1.66667 NA intron (NM_001350526, intron 16 of 28) MIR3|SINE|MIR 41186 NM_001145658 5909 Hs.148178 NM_002885 ENSG00000076864 RAP1GAP RAP1GA1|RAP1GAP1|RAP1GAPII|RAPGAP RAP1 GTPase activating protein protein-coding 367.333-8 chr2 19267114 19267568 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81088 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 355-17 chr20 31067275 31067636 + 1.66667 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -190209 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 253.333-39 chr16 81053375 81053656 + 1.66667 NA TTS (NM_001100873) TTS (NM_001100873) 16317 NM_001300728 23300 Hs.16349 NM_015251 ENSG00000166454 ATMIN ASCIZ|ZNF822 ATM interactor protein-coding 239.666-17 chr2 49636100 49636392 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 337957 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 335-30 chr7 48153673 48154001 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -17621 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 232-64 chr4 1393830 1394042 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 12506 NM_001290079 54729 Hs.526396 NM_001290079 ENSG00000235608 NKX1-1 HSPX153|NKX-1.1|SAX2 NK1 homeobox 1 protein-coding 278.667 chr1 68794340 68794560 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -261448 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 360.333-2 chr10 82103891 82104265 + 1.66667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) L1MEf|LINE|L1 128842 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 486.667-3 chr14 65491440 65492159 + 1.66667 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 20697 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 268.667-17 chr15 37376157 37376453 + 1.66667 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -274994 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 364.667-4 chr11 76035954 76036386 + 1.66667 NA intron (NM_003369, intron 12 of 14) intron (NM_003369, intron 12 of 14) 170332 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 402.334-2 chr2 138862298 138862616 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -34867 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 230.667-78 chr7 8544544 8544766 + 1.66667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 111046 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 250-42 chr2 184656174 184656425 + 1.66667 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) MER89-int|LTR|ERV1 57770 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 296-35 chr20 12025883 12026162 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 108129 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 265.667-17 chr12 65774049 65774312 + 1.66667 NA intron (NR_026825, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu -50280 NM_001330190 8091 Hs.505924 NM_003483 ENSG00000149948 HMGA2 BABL|HMGI-C|HMGIC|LIPO|STQTL9 high mobility group AT-hook 2 protein-coding 382-3 chr11 77087472 77087853 + 1.66667 NA intron (NM_004055, intron 2 of 12) MIRc|SINE|MIR -15178 NM_006189 4975 Hs.673853 NM_006189 ENSG00000254550 OMP - olfactory marker protein protein-coding 294.333-7 chr11 102797255 102797593 + 1.66667 NA exon (NM_002421, exon 2 of 10) exon (NM_002421, exon 2 of 10) 736 NM_001145938 4312 Hs.83169 NM_002421 ENSG00000196611 MMP1 CLG|CLGN matrix metallopeptidase 1 protein-coding 270.333-67 chr9 85998594 85998844 + 1.66667 NA intron (NM_024635, intron 12 of 22) intron (NM_024635, intron 12 of 22) 57190 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 292.667-27 chr4 124761050 124761377 + 1.66667 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -48481 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 344-13 chr14 60705911 60706422 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18185 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 558.667 chr6 61890358 61890992 + 1.66667 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 316545 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 269 chr1 70897649 70897932 + 1.66667 NA intron (NR_028293, intron 2 of 4) intron (NR_028293, intron 2 of 4) -148716 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 321.333-31 chr18 1037490 1037847 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -109675 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 206.667-25 chr11 117601746 117601930 + 1.66667 NA intron (NM_020693, intron 3 of 32) intron (NM_020693, intron 3 of 32) 195378 NM_001367904 57453 Hs.659513 NM_020693 ENSG00000177103 DSCAML1 DSCAM2 DS cell adhesion molecule like 1 protein-coding 408.001 chr1 228542217 228542507 + 1.66667 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -30074 NM_001287262 100129094 Hs.730208 NM_001287262 BTNL10 BTN4|BUTR1 butyrophilin like 10 protein-coding 136.334 chr6 48910895 48911033 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 552289 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 354.999 chr20 21639130 21639707 + 1.66667 NA intron (NR_109878, intron 1 of 4) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 64167 NR_109878 101929608 Hs.694665 NR_109878 ENSG00000280350 LINC01726 - long intergenic non-protein coding RNA 1726 ncRNA 354.667-20 chr7 79765103 79765419 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 311301 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 368.667-13 chr9 12127198 12127525 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -566024 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 283.666-9 chr6 63303574 63303851 + 1.66667 NA intron (NM_001143940, intron 1 of 4) MER57A-int|LTR|ERV1 16265 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 214.333-123 chr5 161441302 161441530 + 1.66667 NA intron (NM_000813, intron 5 of 9) L1MA1|LINE|L1 106708 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 272.667-34 chr2 168336427 168336754 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -88995 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 486.666 chr14 62503077 62503527 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -363329 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 387.334-7 chr4 76981225 76981669 + 1.66667 NA intron (NM_018243, intron 1 of 9) intron (NM_018243, intron 1 of 9) 31695 NM_001306147 55752 Hs.128199 NM_018243 ENSG00000138758 SEPTIN11 SEPT11 septin 11 protein-coding 264-23 chr15 61254108 61254301 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -24902 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 444.333-7 chr7 69004515 69004914 + 1.66667 NA Intergenic MER123|DNA?|DNA? 592910 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 195.334-4 chr4 151987811 151987968 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -112864 NR_121628 100996286 Hs.322462 NR_121627 ENSG00000245954 LINC02273 - long intergenic non-protein coding RNA 2273 ncRNA 261-38 chr2 198534022 198534236 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -159032 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 463-7 chr8 50140210 50141054 + 1.66667 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -23499 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 251.667-103 chr9 100577844 100578005 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001018116) promoter-TSS (NM_001018116) -155 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 374.667-2 chr1 236057730 236058006 + 1.66667 NA intron (NM_002508, intron 1 of 19) intron (NM_002508, intron 1 of 19) 7222 NM_002508 4811 Hs.356624 NM_002508 ENSG00000116962 NID1 NID nidogen 1 protein-coding 438-10 chr5 78846532 78846945 + 1.66667 NA intron (NM_198709, intron 6 of 7) L1MA5|LINE|L1 138572 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 269-27 chr2 197712942 197713111 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 7657 NM_138395 92935 Hs.744330 NM_138395 ENSG00000247626 MARS2 COXPD25|MetRS|mtMetRS methionyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 461.334-2 chr15 63482413 63482705 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21952 NM_001256702 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 504 chr1 88719308 88719866 + 1.66667 NA intron (NM_001320708, intron 1 of 20) intron (NM_001320708, intron 1 of 20) -34383 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 263.667-35 chr17 49685363 49685594 + 1.66667 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -7315 NM_001007226 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 260.667-88 chr7 140933683 140933856 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8840 NM_001354609 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 247.667-29 chr13 106010760 106010937 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 304018 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 232.667-81 chrX 71038331 71038488 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 29925 NM_013346 29934 Hs.260750 NM_013346 ENSG00000147164 SNX12 - sorting nexin 12 protein-coding 279 chr1 17557897 17558114 + 1.66667 NA intron (NR_137287, intron 1 of 29) (CATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18307 NR_137288 55160 Hs.443460 NM_018125 ENSG00000074964 ARHGEF10L GrinchGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like protein-coding 290.667-41 chr7 52888380 52888659 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -147114 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 254.334-21 chr3 169607168 169607335 + 1.66667 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) MIRc|SINE|MIR 56461 NM_001205194 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 273-17 chr17 59539022 59539324 + 1.66667 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -12316 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 227.667-78 chr8 121955651 121955826 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -314298 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 234.666-48 chr7 106317594 106317843 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -32735 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 371.666-13 chr5 39545977 39546443 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 25779 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 496.667-2 chr17 58474279 58474870 + 1.66667 NA intron (NM_001080439, intron 2 of 5) intron (NM_001080439, intron 2 of 5) 13834 NM_001080439 124535 Hs.380061 NM_001080439 ENSG00000176160 HSF5 HSF 5|HSTF 5 heat shock transcription factor 5 protein-coding 241.334-11 chr4 185586493 185586644 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001145673, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_001145673, exon 23 of 23) -51010 NM_001114107 27295 Hs.701364 NM_014476 ENSG00000154553 PDLIM3 ALP PDZ and LIM domain 3 protein-coding 175.667-113 chr5 61514582 61514797 + 1.66667 NA intron (NM_020928, intron 4 of 13) L1MEf|LINE|L1 -123071 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 428.001 chr16 81896899 81897260 + 1.66667 NA intron (NM_002661, intron 13 of 32) MER58A|DNA|hAT-Charlie 114391 NM_145168 93517 Hs.87779 NM_145168 ENSG00000184860 SDR42E1 HSPC105 short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 protein-coding 353.666-3 chr18 68029851 68030418 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -215312 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 288.334-3 chr18 7740624 7740810 + 1.66667 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) AluJr|SINE|Alu 173401 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 293.334-6 chr6 84231330 84231633 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3838 NM_001286206 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 376.334-2 chr1 114319261 114319539 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -165531 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 325.334-2 chr11 5077719 5078054 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 8514 NR_145505 79296 NM_001348221 ENSG00000273085 OR52E1 OR52E1P olfactory receptor family 52 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 303.667-4 chr12 53395607 53395910 + 1.66667 NA intron (NM_003109, intron 3 of 5) AluY|SINE|Alu 15114 NM_003109 6667 Hs.620754 NM_003109 ENSG00000185591 SP1 - Sp1 transcription factor protein-coding 267-47 chr22 34751368 34751559 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 246453 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 369.667-6 chr18 47125945 47126395 + 1.66667 NA intron (NM_032124, intron 4 of 6) intron (NM_032124, intron 4 of 6) 24330 NM_032124 84064 Hs.465041 NM_032124 ENSG00000167220 HDHD2 3110052N05Rik|HEL-S-301 haloacid dehalogenase like hydrolase domain containing 2 protein-coding 320-2 chr10 87632952 87633231 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26787 NM_004670 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 318-42 chr3 150331966 150332162 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -8317 NR_110186 101928022 Hs.555199 NR_110186 LINC01214 - long intergenic non-protein coding RNA 1214 ncRNA 249.667-72 chr4 129111995 129112214 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_173487, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_173487, exon 6 of 6) 15952 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 245.334-18 chr7 93142221 93142372 + 1.66667 NA intron (NM_001303500, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 6089 NM_001303498 219285 Hs.489118 NM_152703 ENSG00000177409 SAMD9L ATXPC|C7orf6|DRIF2|UEF1 sterile alpha motif domain containing 9 like protein-coding 275.667-72 chrX 117431718 117431944 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 541907 NM_033495 90293 Hs.348262 NM_033495 ENSG00000003096 KLHL13 BKLHD2 kelch like family member 13 protein-coding 403.333 chr11 11135022 11135465 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 218007 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 269-41 chr4 139537486 139537668 + 1.66667 NA intron (NR_131339, intron 3 of 3) intron (NR_131339, intron 3 of 3) 19192 NR_131339 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 231.334 chr1 31114290 31114529 + 1.66667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -48692 NM_001020658 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 272.667-44 chr3 187355496 187355818 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12728 NM_022147 64108 Hs.43388 NM_022147 ENSG00000136514 RTP4 IFRG28|Z3CXXC4 receptor transporter protein 4 protein-coding 251-30 chr18 7456475 7456772 + 1.66667 NA intron (NM_001364581, intron 1 of 1) intron (NM_001364581, intron 1 of 1) 4383 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 251-56 chr4 119322851 119323128 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_000134) promoter-TSS (NM_000134) -851 NM_000134 2169 Hs.282265 NM_000134 ENSG00000145384 FABP2 FABPI|I-FABP fatty acid binding protein 2 protein-coding 233.333-6 chr1 152247904 152248182 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23847 NM_001009931 388697 Hs.490162 NM_001009931 ENSG00000197915 HRNR FLG3|S100A16|S100a18 hornerin protein-coding 335-28 chr7 28106506 28107071 + 1.66667 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -73669 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 278-46 chr5 27717853 27718104 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 245686 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 243.334-11 chr2 74738275 74738436 + 1.66667 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie 84108 NR_073399 10505 Hs.25887 NM_004263 ENSG00000135622 SEMA4F M-SEMA|PRO2353|S4F|SEMAM|SEMAW|m-Sema-M ssemaphorin 4F protein-coding 243-78 chr9 103330725 103330905 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5782 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 201.667-91 chr5 28160802 28161029 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 126750 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 301-50 chr6 99847122 99847395 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -146780 NR_038384 728012 Hs.434366 NR_038384 ENSG00000229315 MCHR2-AS1 - MCHR2 antisense RNA 1 ncRNA 218.333-57 chr18 72861982 72862244 + 1.66667 NA intron (NR_148694, intron 3 of 11) intron (NR_148694, intron 3 of 11) 3573 NM_138999 81832 Hs.465407 NM_138966 ENSG00000166342 NETO1 BCTL1|BTCL1 neuropilin and tolloid like 1 protein-coding 272.667-15 chr12 77443611 77443897 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -378185 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 243-46 chr4 85833754 85833990 + 1.66667 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) intron (NM_001287805, intron 1 of 7) 5935 NM_001287805 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 266.667-57 chr5 20625808 20625986 + 1.66667 NA intron (NR_149120, intron 1 of 11) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -10362 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 241.667-84 chr7 49017734 49017946 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 93293 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 210-65 chr2 103377383 103377652 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -393088 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 263-53 chr5 53059932 53060127 + 1.66667 NA intron (NR_073106, intron 11 of 29) intron (NR_073106, intron 11 of 29) 49728 NM_004531 4338 Hs.163645 NM_004531 ENSG00000164172 MOCS2 MCBPE|MOCO1|MOCODB|MPTS molybdenum cofactor synthesis 2 protein-coding 258-4 chr1 170748700 170748892 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 84665 NM_022716 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 310-49 chr6 56655236 56655431 + 1.66667 NA intron (NM_001144770, intron 7 of 94) intron (NM_001144770, intron 7 of 94) -12444 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 288.333-27 chr4 73709384 73709654 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31050 NM_000584 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 401.667-10 chr6 95154680 95154943 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 422640 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 249-51 chr3 2392791 2392961 + 1.66667 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) L1MA6|LINE|L1 154047 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 268.667-31 chr2 63651053 63651253 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 62002 NM_001199112 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 248.667-56 chr2 62794790 62794955 + 1.66667 NA intron (NM_001142615, intron 5 of 22) intron (NM_001142615, intron 5 of 22) 87975 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 373.667-14 chr8 47544907 47545302 + 1.66667 NA intron (NM_001352958, intron 10 of 21) (TCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -108984 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 338.334-6 chr2 54545257 54545567 + 1.66667 NA intron (NM_003128, intron 2 of 35) L1PA6|LINE|L1 -12982 NM_178313 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 373.667-13 chr6 148126978 148127295 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -145192 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 370.667-17 chr22 34964211 34964710 + 1.66667 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 33456 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 231-15 chr14 73256978 73257188 + 1.66667 NA intron (NM_001365907, intron 13 of 25) AluJo|SINE|Alu -11082 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 254-23 chr14 83029586 83029811 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 387066 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 226-10 chr10 69720497 69720706 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -81305 NM_001368884 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 247.666-32 chr6 87891306 87891672 + 1.66667 NA intron (NR_110869, intron 2 of 4) intron (NR_110869, intron 2 of 4) 106629 NR_110869 101928911 Hs.571178 NR_110869 LOC101928911 - uncharacterized LOC101928911 ncRNA 263-31 chr2 136681053 136681252 + 1.66667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -84393 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 336-7 chr13 112129898 112130222 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 22941 NR_120394 100505996 Hs.654853 NR_120392 ENSG00000224243 SOX1-OT LINC00403 SOX1 overlapping transcript ncRNA 332.333-5 chr10 25493912 25494247 + 1.66667 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) intron (NM_020752, intron 5 of 10) -157633 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 397.001 chr4 111032572 111032850 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -172064 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 346.333-5 chr1 197248523 197248947 + 1.66667 NA intron (NM_001257965, intron 1 of 14) intron (NM_001257965, intron 1 of 14) -19469 NM_001257966 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 165.334 chr20 13810562 13810749 + 1.66667 NA intron (NR_147978, intron 9 of 11) L2b|LINE|L2 25627 NR_147982 79133 Hs.472165 NM_024120 ENSG00000101247 NDUFAF5 C20orf7|MC1DN16|bA526K24.2|dJ842G6.1 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5 protein-coding 281-47 chr8 136380650 136380933 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -150007 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 318.334-8 chr5 175612706 175613056 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -45190 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 405-14 chr5 10064464 10064821 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -160818 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 237.667-76 chr7 54485402 54485568 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -56840 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 279.667-15 chr14 70769581 70769808 + 1.66667 NA intron (NM_001284231, intron 1 of 11) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 13758 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 450.333-10 chr8 60093984 60094330 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 187243 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 174-71 chr4 86773478 86773639 + 1.66667 NA intron (NM_080685, intron 32 of 47) intron (NM_080685, intron 32 of 47) 75826 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 280.667-16 chr11 85570262 85570474 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) L1MB7|LINE|L1 56902 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 249-54 chr4 97006903 97007093 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -359928 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 261-44 chr4 65952481 65952716 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -282103 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 382.334-12 chr5 120793402 120793768 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 262121 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 349-19 chr5 106726931 106727395 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 283851 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 199.333-154 chr2 205766754 205767041 + 1.66667 NA intron (NM_201266, intron 15 of 16) intron (NM_201266, intron 15 of 16) 84396 NM_018534 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 320.001 chr10 24500540 24500750 + 1.66667 NA intron (NM_001321681, intron 4 of 13) intron (NM_001321681, intron 4 of 13) 34114 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 307-12 chr2 45255845 45256155 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1059 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 237.334-10 chr7 119660238 119660420 + 1.66667 NA intron (NR_131960, intron 4 of 4) intron (NR_131960, intron 4 of 4) 247046 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 263-3 chr1 89645891 89646212 + 1.66667 NA intron (NM_032270, intron 1 of 2) L1MEf|LINE|L1 12931 NM_032270 84230 Hs.412836 NM_032270 ENSG00000171488 LRRC8C AD158|FAD158 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit C protein-coding 370.667 chr1 50520983 50521307 + 1.66667 NA intron (NM_007051, intron 15 of 18) L1MA8|LINE|L1 -97702 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 208.667-43 chr13 75347847 75348101 + 1.66667 NA intron (NM_001286658, intron 5 of 19) AluJb|SINE|Alu 107386 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 192.667-74 chr17 58652091 58652293 + 1.66667 NA intron (NM_031272, intron 1 of 31) intron (NM_031272, intron 1 of 31) 39863 NM_031272 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 263-20 chr14 42628014 42628225 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1021263 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 417.666-2 chr10 74485917 74486359 + 1.66667 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 43186 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 255.333-107 chr8 80574350 80574708 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 88303 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 208-161 chr7 137534594 137534825 + 1.66667 NA intron (NM_001321710, intron 20 of 32) intron (NM_001321710, intron 20 of 32) -190976 NM_001321387 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 205.334-4 chr2 202924338 202924495 + 1.66667 NA intron (NM_001352677, intron 3 of 13) L1M5|LINE|L1 12141 NR_148033 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 239.666-2 chr1 196492536 196492820 + 1.66667 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 89803 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 331.334-16 chrX 54781768 54782048 + 1.66667 NA intron (NM_198510, intron 5 of 12) L1PA13|LINE|L1 16347 NM_198510 347365 Hs.454272 NM_198510 ENSG00000102313 ITIH6 ITIH5L|UNQ6369|dJ14O9.1 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain family member 6 protein-coding 226.667-23 chr11 15203185 15203361 + 1.66667 NA intron (NM_001042536, intron 7 of 12) intron (NM_001042536, intron 7 of 12) 54171 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 237.333-111 chr7 55594999 55595276 + 1.66667 NA Intergenic LTR81C|LTR|Gypsy -22635 NM_001321247 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 253-25 chr15 57044425 57044694 + 1.66667 NA intron (NM_001322164, intron 3 of 19) intron (NM_001322164, intron 3 of 19) 125114 NM_001322165 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 440.999 chr14 24715952 24716377 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81974 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 344.667-16 chr5 92319672 92320053 + 1.66667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -936545 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 249.667-22 chr12 23614336 23614549 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 11 of 17) L1MB7|LINE|L1 -29856 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 405.667 chr11 95668933 95669328 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 120652 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 257-31 chr20 42474508 42474798 + 1.66667 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) intron (NM_133170, intron 7 of 31) -210830 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 283.334-6 chr2 220419395 220419714 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -512989 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 247.334-6 chr12 20992790 20993028 + 1.66667 NA intron (NM_001371097, intron 13 of 15) L1M5|LINE|L1 -22787 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 255.667-14 chr11 81669641 81669798 + 1.66667 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 221117 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 165-95 chr8 64875460 64875590 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -76788 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 294.333-43 chr7 3809773 3810024 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -319787 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 258.666-24 chr21 28757570 28757836 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 127664 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 249.334-7 chr12 38864236 38864404 + 1.66667 NA intron (NM_153634, intron 3 of 19) MER58A|DNA|hAT-Charlie 41271 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 272-21 chr2 32737072 32737246 + 1.66667 NA intron (NM_017735, intron 12 of 19) intron (NM_017735, intron 12 of 19) -88274 NR_027099 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 249-38 chr2 29300953 29301169 + 1.66667 NA intron (NM_004304, intron 8 of 28) LTR78|LTR|ERV1 -77161 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 275-16 chr16 48082775 48082951 + 1.66667 NA TTS (NM_033226) TTS (NM_033226) 63907 NM_033226 94160 Hs.410111 NM_033226 ENSG00000140798 ABCC12 MRP9 ATP binding cassette subfamily C member 12 protein-coding 358.667-4 chr11 62328649 62328969 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8639 NM_001083926 80150 Hs.535326 NM_025080 ENSG00000162174 ASRGL1 ALP|ALP1|CRASH asparaginase like 1 protein-coding 298.334-6 chr2 67444284 67444510 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 47064 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 243-68 chr8 33812372 33812561 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -212360 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 231-39 chr22 31134724 31135040 + 1.66667 NA TTS (NM_001284289) TTS (NM_001284289) 5626 NM_015715 50487 Hs.149623 NM_015715 ENSG00000100078 PLA2G3 GIII-SPLA2|SPLA2III|sPLA2-III phospholipase A2 group III protein-coding 211-89 chr7 7222285 7222504 + 1.66667 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 -32760 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 210-22 chr10 109406719 109406902 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 516436 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 209-104 chr6 148190079 148190333 + 1.66667 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -82122 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 400-11 chr5 81737434 81737902 + 1.66667 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) AluY|SINE|Alu 13585 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 219-54 chr22 35281446 35281743 + 1.66667 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) intron (NM_001003681, intron 5 of 10) -17681 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 193-68 chr4 61006252 61006398 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 83706 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 186.667-156 chrX 29806342 29806508 + 1.66667 NA intron (NM_014271, intron 6 of 10) L1M5|LINE|L1 232147 NR_049877 100847047 NR_049877 ENSG00000264090 MIR4666B - microRNA 4666b ncRNA 270.667-26 chr2 84774282 84774519 + 1.66667 NA intron (NM_001370, intron 64 of 76) L1PA16|LINE|L1 106684 NM_001307978 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 267-76 chr9 37177628 37177809 + 1.66667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) L1MC3|LINE|L1 57120 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 265.667-36 chr2 86816276 86816486 + 1.66667 NA intron (NM_001178100, intron 3 of 3) L1ME3Cz|LINE|L1 -7985 NM_001145873 925 Hs.85258 NM_001768 ENSG00000153563 CD8A CD8|Leu2|p32 CD8a molecule protein-coding 254.334-20 chr2 230221464 230221786 + 1.66667 NA intron (NM_001185015, intron 2 of 15) intron (NM_001185015, intron 2 of 15) -1513 NM_080424 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 246.334-9 chr2 66541493 66541654 + 1.66667 NA intron (NM_002398, intron 8 of 12) intron (NM_002398, intron 8 of 12) -32457 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 182.667-146 chr6 62874373 62874551 + 1.66667 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite 445515 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 250-96 chr9 79494149 79494321 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -77538 NM_001282753 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 202.333-30 chr10 99564445 99564630 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 31595 NM_145285 159296 Hs.243272 NM_145285 ENSG00000119919 NKX2-3 CSX3|NK2.3|NKX2.3|NKX2C|NKX4-3 NK2 homeobox 3 protein-coding 330-27 chr3 188068269 188068701 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -85413 NM_001167672 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 260-26 chr15 51444616 51444793 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 67458 NM_001330297 342035 Hs.526441 NM_181789 ENSG00000186417 GLDN CLOM|COLM|CRG-L2|CRGL2|LCCS11|UNC-112 gliomedin protein-coding 241.667-38 chr2 125203182 125203355 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 914717 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 400.001 chr1 109720708 109721027 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8616 NM_000851 2949 Hs.75652 NM_000851 ENSG00000134201 GSTM5 GSTM5-5|GTM5 glutathione S-transferase mu 5 protein-coding 333.333-41 chr4 52591156 52591502 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_022832, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_022832, exon 9 of 9) 65210 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 268.667-53 chr5 58306035 58306243 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 153947 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 325-20 chr22 29930809 29931253 + 1.66667 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) AluJb|SINE|Alu 47857 NM_021090 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 256.333-59 chr4 48534484 48534732 + 1.66667 NA exon (NM_015030, exon 49 of 64) exon (NM_015030, exon 49 of 64) 44356 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 268-39 chr3 162978980 162979189 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 324217 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 275.667-47 chr5 167395844 167396027 + 1.66667 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) L1MB1|LINE|L1 -177724 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 464.666-5 chr7 86356556 86357040 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -287111 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 262-44 chr2 144808988 144809240 + 1.66667 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 141147 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 228.333-30 chr14 66603737 66603890 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 96406 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 304.333-31 chr7 3402476 3402789 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 101380 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 236.333-44 chr2 51201876 51202131 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 169402 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 269.667-33 chr22 27102379 27102619 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -41981 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 249.666-3 chr1 74851926 74852136 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -118623 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 222-86 chr7 32006655 32006806 + 1.66667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 63677 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 223.667-9 chr1 246283904 246284128 + 1.66667 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 133396 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 452.667-3 chr15 60703995 60704510 + 1.66667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 22683 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 311-2 chr1 226562760 226563098 + 1.66667 NA intron (NM_001003665, intron 1 of 3) L1MC4|LINE|L1 14165 NM_001003665 375057 Hs.116827 NM_001003665 ENSG00000203685 STUM C1orf95 stum, mechanosensory transduction mediator homolog protein-coding 172.667-137 chr6 102035768 102035873 + 1.66667 NA intron (NM_001166247, intron 14 of 16) intron (NM_001166247, intron 14 of 16) 636835 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 310-21 chr15 67838099 67838365 + 1.66667 NA intron (NR_120345, intron 1 of 2) intron (NR_120345, intron 1 of 2) 647 NR_120345 101929076 Hs.297340 NR_120345 ENSG00000245719 LOC101929076 - uncharacterized LOC101929076 ncRNA 399.666-3 chr18 3767781 3768433 + 1.66667 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) L1MD1|LINE|L1 77251 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 212.667-106 chr5 92545940 92546106 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1025320 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 296-64 chr8 57705250 57705477 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -40786 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 256.666-45 chr6 119859711 119860013 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -155317 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 320-31 chr21 31738540 31738972 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -6638 NM_001145445 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 527 chr2 39482885 39483444 + 1.66667 NA intron (NR_037875, intron 3 of 5) intron (NR_037875, intron 3 of 5) 45748 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 293-21 chr15 82018869 82019219 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26974 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 228.667-66 chr6 9457596 9457945 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 805561 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 280.667-7 chr1 150866839 150867043 + 1.66667 NA intron (NM_001350224, intron 1 of 22) AluSz6|SINE|Alu 9658 NM_001350224 405 Hs.632446 NM_001668 ENSG00000143437 ARNT HIF-1-beta|HIF-1beta|HIF1-beta|HIF1B|HIF1BETA|TANGO|bHLHe2 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein-coding 337.334-5 chr8 137889387 137889664 + 1.66667 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 194020 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 249.667-92 chr7 86969570 86969782 + 1.66667 NA intron (NM_001142749, intron 1 of 21) L2c|LINE|L2 -3777 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 263.667-56 chr3 5278844 5279138 + 1.66667 NA Intergenic L1M3a|LINE|L1 -28736 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 249.667-91 chr7 80095001 80095180 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -39741 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 330-34 chr8 19954437 19954846 + 1.66667 NA intron (NM_000237, intron 5 of 9) intron (NM_000237, intron 5 of 9) 15388 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 307.666-4 chr13 81452243 81452638 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -225457 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 271.667-5 chr1 172335684 172335854 + 1.66667 NA intron (NM_015569, intron 17 of 20) L1PA16|LINE|L1 -84916 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 245-55 chr5 100258431 100258708 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 129685 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 251-23 chr14 66624295 66624576 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) HERVL40-int|LTR|ERVL 117028 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 275.666-15 chr4 48216563 48216774 + 1.66667 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 53170 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 262.667-19 chr12 55313780 55314009 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6706 NM_001005182 390321 Hs.553763 NM_001005182 ENSG00000205330 OR6C1 OST267 olfactory receptor family 6 subfamily C member 1 protein-coding 446.333-4 chr19 39673431 39673911 + 1.66667 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -5703 NR_034156 400696 Hs.456377 NM_207646 ENSG00000226025 LGALS17A - galectin 14 pseudogene pseudo 210.334-7 chr8 81017826 81018007 + 1.66667 NA intron (NM_018440, intron 3 of 8) intron (NM_018440, intron 3 of 8) 94152 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 274.667-22 chr16 60964217 60964452 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 91432 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 347.667-17 chr7 8676745 8677042 + 1.66667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 243284 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 251.666-9 chr14 42177992 42178282 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 571281 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 487.666 chr1 70153593 70154123 + 1.66667 NA intron (NM_017768, intron 11 of 14) AluJb|SINE|Alu 51721 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 232-29 chr14 82916500 82916740 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 273988 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 183-19 chr11 39717951 39718125 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 575092 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 188.334-4 chrUn_KI270442v1 92282 92519 + 1.66667 NA NA (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 357.667-9 chr5 112788821 112789145 + 1.66667 NA intron (NM_001354899, intron 6 of 14) L1M5|LINE|L1 51098 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 407-4 chr15 84917826 84918195 + 1.66667 NA intron (NM_001287761, intron 8 of 14) intron (NM_001287761, intron 8 of 14) 33348 NM_001287762 9154 Hs.459187 NM_004213 ENSG00000156222 SLC28A1 CNT1|HCNT1 solute carrier family 28 member 1 protein-coding 251-68 chr5 93713226 93713469 + 1.66667 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) L1M1|LINE|L1 28253 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 287.334-8 chr2 171914193 171914399 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8129 NR_027862 8520 Hs.632532 NM_003642 ENSG00000128708 HAT1 KAT1 histone acetyltransferase 1 protein-coding 222.667-2 chr1 99719001 99719225 + 1.66667 NA intron (NM_001013660, intron 10 of 16) intron (NM_001013660, intron 10 of 16) -6160 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 258-74 chr6 156802578 156802775 + 1.66667 NA intron (NM_020732, intron 1 of 19) intron (NM_020732, intron 1 of 19) -22945 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 234-44 chr2 202458477 202458762 + 1.66667 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) intron (NM_001204, intron 1 of 12) 82292 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 264.667-20 chr12 477372 477566 + 1.66667 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) intron (NM_173593, intron 1 of 19) 17530 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 456.333-9 chr5 61042360 61042811 + 1.66667 NA intron (NM_174889, intron 1 of 3) L1ME4b|LINE|L1 97380 NM_174889 91942 Hs.591757 NM_174889 ENSG00000164182 NDUFAF2 B17.2L|MC1DN10|MMTN|NDUFA12L|mimitin NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 protein-coding 414-15 chr9 27088905 27089331 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20023 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 320-45 chr7 113657341 113657553 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 261562 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 278-57 chr7 53414399 53414578 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 378855 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 236.334-10 chr8 88569384 88569567 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -241992 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 277-39 chr4 47688495 47688860 + 1.66667 NA intron (NM_006587, intron 6 of 21) intron (NM_006587, intron 6 of 21) 36008 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 359.666-12 chr8 26979906 26980398 + 1.66667 NA Intergenic LTR9|LTR|ERV1 68811 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 247.334-12 chr2 48781805 48781983 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26170 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 234.334-8 chr2 156065873 156066080 + 1.66667 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) intron (NR_110250, intron 1 of 3) 188955 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 246.334-21 chrX 99232285 99232442 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 1177910 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 289.334-5 chr20 22204150 22204438 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 78507 NR_110615 101929663 Hs.143562 NR_110615 ENSG00000225321 LINC01427 - long intergenic non-protein coding RNA 1427 ncRNA 306.667-11 chr14 61263335 61263581 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 17880 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 258.334-19 chr5 122951385 122951556 + 1.66667 NA intron (NM_014035, intron 3 of 6) intron (NM_014035, intron 3 of 6) 85255 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 201.667-29 chr13 28648135 28648271 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -10927 NM_015932 51371 Hs.268742 NM_015932 ENSG00000132963 POMP C13orf12|HSPC014|PNAS-110|PRAAS2|UMP1 proteasome maturation protein protein-coding 287.333-16 chr14 38866543 38866940 + 1.66667 NA intron (NR_039982, intron 2 of 4) intron (NR_039982, intron 2 of 4) -15855 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 264.667-55 chr3 90523316 90523615 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1415844 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 298.667-11 chr14 53453208 53453666 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 300083 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 282.333-55 chr7 53851546 53851958 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -39821 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 236.667-87 chr8 62009289 62009566 + 1.66667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 119588 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 271.334-14 chr3 19820701 19820875 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 113429 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 209.333-56 chr14 42907226 42907407 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1300460 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 225-36 chr2 68957280 68957464 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -4479 NM_182536 200504 Hs.16757 NM_182536 ENSG00000183607 GKN2 BRICD1B|GDDR|PRO813|TFIZ1|VLTI465 gastrokine 2 protein-coding 249.667-85 chr6 134125680 134125924 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -8122 NR_037938 387065 Hs.571061 NR_037938 HMGA1P7 HMGA1L7 high mobility group AT-hook 1 pseudogene 7 pseudo 253-8 chr1 234013678 234013909 + 1.66667 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) L1MA7|LINE|L1 109117 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 316.334-4 chr3 19364163 19364377 + 1.66667 NA intron (NM_144633, intron 5 of 15) intron (NM_144633, intron 5 of 15) -49339 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 257.667-91 chrX 155411153 155411388 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -28072 NR_036259 100422985 NR_036259 ENSG00000221190 MIR1184-2 - microRNA 1184-2 ncRNA 226.334-10 chr9 30547976 30548155 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -139611 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 253.333-93 chr6 135559968 135560233 + 1.66667 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 62299 NR_026805 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 152.333-40 chr10 42809678 42809777 + 1.66667 NA intron (NM_014753, intron 13 of 22) L1MDa|LINE|L1 26932 NM_014753 9790 Hs.10848 NM_014753 ENSG00000165733 BMS1 ACC|BMS1L BMS1 ribosome biogenesis factor protein-coding 285.333-59 chr6 56970560 56970798 + 1.66667 NA intron (NM_001318539, intron 1 of 3) intron (NM_001318539, intron 1 of 3) 15572 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 271.333-65 chr7 81370332 81370645 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 191331 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 258-20 chr17 41957163 41957389 + 1.66667 NA intron (NR_146622, intron 10 of 11) MER1B|DNA|hAT-Charlie -9519 NM_033133 1267 Hs.273621 NM_033133 ENSG00000173786 CNP CNP1 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase protein-coding 202-128 chr4 43794842 43795003 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -221939 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 207-37 chr14 69018751 69018994 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 39190 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 254.333-47 chr2 182344278 182344552 + 1.66667 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 82633 NM_001258313 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 320 chr10 76824263 76824597 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -63614 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 356.333-20 chr20 24183650 24184102 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15891 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 343.333-20 chr4 79037138 79037637 + 1.66667 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) intron (NR_038342, intron 2 of 5) 65639 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 249.333-75 chr4 44669357 44669582 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8926 NM_001345868 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 542.001 chr1 110010515 110011057 + 1.66667 NA intron (NM_001242673, intron 2 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 6838 NM_001242676 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 282-6 chr11 68895844 68896058 + 1.66667 NA intron (NM_181515, intron 4 of 6) AluJb|SINE|Alu 7881 NM_181514 219927 Hs.503047 NM_181512 ENSG00000197345 MRPL21 L21mt|MRP-L21 mitochondrial ribosomal protein L21 protein-coding 376-22 chr8 101883962 101884376 + 1.66667 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) L2c|LINE|L2 -93200 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 462 chr1 171640916 171641545 + 1.66667 NA intron (NM_000261, intron 1 of 2) L1MC1|LINE|L1 11458 NM_000261 4653 Hs.436037 NM_000261 ENSG00000034971 MYOC GLC1A|GPOA|JOAG|JOAG1|TIGR myocilin protein-coding 276.333-39 chr3 141586656 141586924 + 1.66667 NA intron (NM_001303245, intron 19 of 23) intron (NM_001303245, intron 19 of 23) -76409 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 257.333-70 chr4 30270701 30270988 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -449525 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 519.666-3 chr7 5757122 5757613 + 1.66667 NA intron (NM_207111, intron 2 of 16) L1MB5|LINE|L1 24296 NM_207111 54476 Hs.487458 NM_019011 ENSG00000011275 RNF216 CAHH|TRIAD3|U7I1|UBCE7IP1|ZIN ring finger protein 216 protein-coding 460.333-4 chr3 189186754 189187234 + 1.66667 NA intron (NM_198485, intron 1 of 5) AluSz6|SINE|Alu 15023 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 551.001 chr10 23840660 23841415 + 1.66667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) MIR|SINE|MIR 146310 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 252.667-21 chr12 26062103 26062277 + 1.66667 NA intron (NM_001164746, intron 2 of 4) intron (NM_001164746, intron 2 of 4) 9626 NM_001164746 11228 Hs.696433 NM_007211 ENSG00000123094 RASSF8 C12orf2|HOJ1 Ras association domain family member 8 protein-coding 199.334-2 chr1 45840354 45840514 + 1.66667 NA intron (NM_001324320, intron 3 of 29) MIRb|SINE|MIR -23914 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 224-30 chr16 69308504 69308702 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_006750, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_006750, exon 7 of 7) -2747 NM_013245 27183 Hs.128420 NM_013245 ENSG00000132612 VPS4A SKD1|SKD1A|SKD2|VPS4|VPS4-1 vacuolar protein sorting 4 homolog A protein-coding 255.334-4 chr1 80648133 80648293 + 1.66667 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy 6926 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 232-31 chr15 44398047 44398217 + 1.66667 NA intron (NR_157849, intron 9 of 9) intron (NR_157849, intron 9 of 9) -29497 NM_016396 51496 Hs.497967 NM_016396 ENSG00000137770 CTDSPL2 HSPC058|HSPC129 CTD small phosphatase like 2 protein-coding 341.001-4 chr7 118167982 118168278 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16034 NM_016200 51691 Hs.655046 NM_016200 ENSG00000128534 LSM8 NAA38 LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated protein-coding 386.333-4 chr2 154762632 154763193 + 1.66667 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) intron (NM_002239, intron 2 of 2) 64217 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 167.333-264 chr8 120665565 120665751 + 1.66667 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) L1ME1|LINE|L1 -95595 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 294.001-2 chr1 114252266 114252457 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -98492 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 255.667-38 chr17 74624968 74625145 + 1.66667 NA intron (NR_158152, intron 3 of 3) intron (NR_158152, intron 3 of 3) -1318 NM_181449 342510 Hs.158954 NM_181449 ENSG00000186407 CD300E CD300LE|CLM-2|CLM2|CMRF35-A5|IREM-2|IREM2|PIgR-2|PIgR2 CD300e molecule protein-coding 342-18 chr18 45784662 45784921 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -40884 NM_213602 284266 Hs.287692 NM_213602 ENSG00000197046 SIGLEC15 CD33L3|HsT1361|SIGLEC-15 sialic acid binding Ig like lectin 15 protein-coding 238.333-27 chr15 67773782 67774018 + 1.66667 NA intron (NM_001206804, intron 21 of 21) intron (NM_001206804, intron 21 of 21) -51609 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 256-71 chr4 165135118 165135313 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -22355 NM_001100389 201931 Hs.704511 NM_152681 ENSG00000170088 TMEM192 - transmembrane protein 192 protein-coding 264.667-9 chr1 201247383 201247556 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -35983 NM_000299 5317 Hs.497350 NM_000299 ENSG00000081277 PKP1 B6P plakophilin 1 protein-coding 514 chr10 56814136 56814919 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -453254 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 361.667-3 chr15 40447030 40447429 + 1.66667 NA intron (NR_125372, intron 1 of 4) intron (NR_125372, intron 1 of 4) 6276 NM_014952 22893 Hs.22109 NM_014952 ENSG00000140320 BAHD1 - bromo adjacent homology domain containing 1 protein-coding 298-26 chr14 71990847 71991209 + 1.66667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 57501 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 306.667-44 chr8 120666624 120666967 + 1.66667 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) L1ME1|LINE|L1 -94458 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 254.001 chr1 117180001 117180154 + 1.66667 NA intron (NM_024626, intron 1 of 5) intron (NM_024626, intron 1 of 5) 23759 NM_001253849 79679 Hs.546434 NM_024626 ENSG00000134258 VTCN1 B7-H4|B7H4|B7S1|B7X|B7h.5|PRO1291|VCTN1 V-set domain containing T cell activation inhibitor 1 protein-coding 228.333-53 chr2 208711971 208712125 + 1.66667 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) intron (NR_136588, intron 3 of 5) 169406 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 268-36 chr3 37297551 37297768 + 1.66667 NA intron (NM_001172713, intron 8 of 22) intron (NM_001172713, intron 8 of 22) -53464 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 246.666-23 chr2 217358918 217359221 + 1.66667 NA intron (NR_026597, intron 8 of 12) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 76336 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 194-72 chr2 41258180 41258325 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -619303 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 304-32 chr2 150352638 150352998 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95811 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 162.667-275 chr8 102061904 102062057 + 1.66667 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 62354 NM_001040629 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 158.333-110 chr17 32689141 32689341 + 1.66667 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) intron (NM_015194, intron 16 of 21) 187883 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 240-32 chr16 73208273 73208536 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -63957 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 350-28 chr5 101311851 101312374 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -408830 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 259.334-4 chr11 82264389 82264603 + 1.66667 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1ME2|LINE|L1 139417 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 168.334-2 chr8 42596646 42596806 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -54772 NM_006749 6575 Hs.653173 NM_006749 ENSG00000168575 SLC20A2 GLVR-2|GLVR2|IBGC1|IBGC3|MLVAR|PIT-2|PIT2|RAM1|Ram-1 solute carrier family 20 member 2 protein-coding 242.334-12 chr22 43046854 43047018 + 1.66667 NA intron (NR_027779, intron 10 of 11) AluSq|SINE|Alu 8351 NR_125362 100506679 Hs.706553 NR_125362 ENSG00000230319 LOC100506679 - uncharacterized LOC100506679 ncRNA 423.666 chr5 147954056 147954565 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -47772 NM_206966 389336 Hs.660038 NM_206966 ENSG00000178776 C5orf46 SSSP1 chromosome 5 open reading frame 46 protein-coding 201-58 chr2 101923075 101923222 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -60317 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 349.666-4 chr10 92663311 92663823 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26388 NM_002729 3087 Hs.118651 NM_002729 ENSG00000152804 HHEX HEX|HMPH|HOX11L-PEN|PRH|PRHX hematopoietically expressed homeobox protein-coding 402.667 chr13 31276890 31277347 + 1.66667 NA intron (NM_194318, intron 10 of 14) intron (NM_194318, intron 10 of 14) 77143 NM_194318 145173 Hs.13205 NM_194318 ENSG00000187676 B3GLCT B3GALTL|B3GTL|B3Glc-T|Gal-T|beta3Glc-T beta 3-glucosyltransferase protein-coding 394.001-4 chr3 119266869 119267220 + 1.66667 NA intron (NR_046574, intron 3 of 3) L1PA8|LINE|L1 -26166 NM_003778 8702 Hs.13225 NM_003778 ENSG00000121578 B4GALT4 B4Gal-T4|beta4Gal-T4 beta-1,4-galactosyltransferase 4 protein-coding 274-59 chr8 130332900 130333081 + 1.66667 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) -36457 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 260-18 chr11 94049001 94049285 + 1.66667 NA intron (NM_001098672, intron 2 of 19) AluSx|SINE|Alu 27789 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 245-23 chr14 70803468 70803671 + 1.66667 NA intron (NM_033141, intron 1 of 12) intron (NM_033141, intron 1 of 12) 5602 NM_001284230 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 267.667-33 chr2 161680049 161680300 + 1.66667 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) L2c|LINE|L2 55758 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 263-47 chr4 111100907 111101072 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -240342 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 311-14 chr2 42654033 42654306 + 1.66667 NA intron (NM_001330443, intron 6 of 16) intron (NM_001330443, intron 6 of 16) 85537 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 429-7 chr2 199931105 199931392 + 1.66667 NA non-coding (NR_109906, exon 7 of 7) non-coding (NR_109906, exon 7 of 7) 19955 NM_153689 205327 Hs.154494 NM_153689 ENSG00000178074 C2orf69 - chromosome 2 open reading frame 69 protein-coding 256-87 chr7 42077002 42077269 + 1.66667 NA intron (NM_000168, intron 3 of 14) intron (NM_000168, intron 3 of 14) 160074 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 253.333-18 chr12 114443247 114443534 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34948 NM_000192 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 245.334-3 chr10 63009957 63010118 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -123210 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 369.001-2 chr2 18018988 18019326 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 140490 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 231.334-2 chr1 150365466 150365696 + 1.66667 NA intron (NM_015203, intron 1 of 10) intron (NM_015203, intron 1 of 10) 1470 NM_001297674 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 164.667-248 chr8 125897614 125897776 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 53502 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 489.667-3 chr9 108602175 108602687 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 253555 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 380.333-14 chr9 24442193 24442766 + 1.66667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 103197 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 212.667-25 chr12 8801777 8801953 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20756 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 259-2 chr1 58314611 58314859 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -64188 NM_001353980 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 229.667-14 chr11 71940250 71940461 + 1.66667 NA intron (NM_001300926, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 11309 NM_018320 55298 Hs.368554 NM_018320 ENSG00000137522 RNF121 - ring finger protein 121 protein-coding 366.001-3 chr15 99547427 99547720 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17844 NM_001352617 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 248-48 chr22 28481016 28481274 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 21276 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 324.334-5 chr13 67520495 67520831 + 1.66667 NA Intergenic MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR 148276 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 261.667-21 chr16 6561281 6561497 + 1.66667 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -212420 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 203.667-115 chr7 134172144 134172352 + 1.66667 NA intron (NM_001365700, intron 7 of 15) intron (NM_001365700, intron 7 of 15) 44908 NM_144648 136332 Hs.149774 NM_144648 ENSG00000155530 LRGUK CFAP246 leucine rich repeats and guanylate kinase domain containing protein-coding 531.999 chr10 74006418 74006790 + 1.66667 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 8488 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 256.667-33 chr17 72131464 72131662 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 10543 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 298.667-3 chr1 108581189 108581488 + 1.66667 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 21238 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 434.667-5 chr5 117841084 117841432 + 1.66667 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) L1PREC2|LINE|L1 110897 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 346-26 chr5 36932076 36932408 + 1.66667 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) L1ME1|LINE|L1 55473 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 315.333-36 chr5 40377322 40377660 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -302424 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 479.334 chr2 99288312 99288742 + 1.66667 NA intron (NM_174898, intron 5 of 6) L1MEd|LINE|L1 12670 NM_174898 129530 Hs.164589 NM_174898 ENSG00000144214 LYG1 SALW1939 lysozyme g1 protein-coding 247-38 chr2 119866836 119866984 + 1.66667 NA intron (NM_002830, intron 3 of 26) intron (NM_002830, intron 3 of 26) 106988 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 266-53 chr3 17786007 17786230 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 43174 NR_135536 105376975 Hs.543238 NR_135536 LOC105376975 - uncharacterized LOC105376975 ncRNA 320-44 chr7 86664812 86665280 + 1.66667 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 21132 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 242.666-7 chr1 199028738 199029018 + 1.66667 NA intron (NR_126351, intron 1 of 2) HERV16-int|LTR|ERVL -9914 NR_110525 102800316 Hs.568480 NR_110525 LINC01222 TCONS_00000112 long intergenic non-protein coding RNA 1222 ncRNA 251-62 chr5 31143595 31143809 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -49984 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 368.667-7 chr3 117537600 117537865 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 153193 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 255.667-36 chr17 58283047 58283233 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -2205 NM_000250 4353 Hs.458272 NM_000250 ENSG00000005381 MPO - myeloperoxidase protein-coding 283-15 chr18 8630852 8631041 + 1.66667 NA intron (NM_001025300, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 21501 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 292.334-2 chr14 53381193 53381473 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 227979 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 405-9 chr3 56558995 56559414 + 1.66667 NA intron (NR_148376, intron 2 of 17) intron (NR_148376, intron 2 of 17) 2029 NM_001141947 285331 Hs.476399 NM_001012506 ENSG00000180376 CCDC66 - coiled-coil domain containing 66 protein-coding 274.667-59 chr9 16567626 16567927 + 1.66667 NA intron (NM_001317939, intron 3 of 6) intron (NM_001317939, intron 3 of 6) -159038 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 309.334-10 chr6 66346815 66347010 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 559033 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 256.333-9 chr1 222333955 222334230 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 214012 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 240.667-2 chr1 112600600 112600766 + 1.66667 NA intron (NM_001308264, intron 3 of 13) intron (NM_001308264, intron 3 of 13) 18458 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 220.667-88 chr5 155339694 155339854 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 326019 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 284.667-53 chr8 75499476 75499669 + 1.66667 NA intron (NM_001330561, intron 3 of 11) L1M4|LINE|L1 -40396 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 250.334-2 chr11 61656854 61657073 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23428 NM_006133 747 Hs.241564 NM_006133 ENSG00000134780 DAGLA C11orf11|DAGL(ALPHA)|DAGLALPHA|NSDDR diacylglycerol lipase alpha protein-coding 231.334-10 chr6 96348633 96348840 + 1.66667 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? -173070 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 190.334-2 chr4 96060123 96060256 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 220096 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 248-81 chr7 111326072 111326297 + 1.66667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 235057 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 337.001-2 chr12 7208421 7208684 + 1.66667 NA exon (NM_001351139, exon 12 of 15) exon (NM_001351139, exon 12 of 15) 18190 NM_000319 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 388.333-15 chr4 57444601 57444959 + 1.66667 NA intron (NR_125907, intron 4 of 5) intron (NR_125907, intron 4 of 5) 18908 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 366.999-2 chr12 24469277 24469894 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 92906 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 192.333-101 chr20 3508301 3508489 + 1.66667 NA intron (NM_001323332, intron 1 of 25) MER58A|DNA|hAT-Charlie 37377 NM_001207047 8455 Hs.276252 NM_012070 ENSG00000088812 ATRN DPPT-L|MGCA attractin protein-coding 296.333-13 chr15 75899347 75899569 + 1.66667 NA exon (NM_173469, exon 13 of 13) exon (NM_173469, exon 13 of 13) -4401 NM_012170 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 261.334-12 chr2 165343085 165343319 + 1.66667 NA intron (NM_001040143, intron 16 of 27) intron (NM_001040143, intron 16 of 27) 49147 NM_021007 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 270.333-69 chrX 121873810 121874005 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 502935 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 324.667-23 chr3 68129078 68129403 + 1.66667 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 124993 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 338.666-15 chr5 56350806 56351263 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -117704 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 313-27 chr4 97412580 97412843 + 1.66667 NA intron (NR_102713, intron 1 of 5) intron (NR_102713, intron 1 of 5) 45785 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 346.667-6 chr2 107789839 107790104 + 1.66667 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) L1MB2|LINE|L1 35859 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 253.667-15 chr12 845992 846239 + 1.66667 NA intron (NM_001184985, intron 4 of 27) intron (NM_001184985, intron 4 of 27) 86961 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 284.667-2 chr1 114691457 114691634 + 1.66667 NA intron (NM_001172626, intron 1 of 14) AluJr|SINE|Alu 4073 NM_000036 270 Hs.89570 NM_000036 ENSG00000116748 AMPD1 MAD|MADA|MMDD adenosine monophosphate deaminase 1 protein-coding 260.667 chr1 59980106 59980294 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -53402 NR_134981 1573 Hs.152096 NM_000775 ENSG00000134716 CYP2J2 CPJ2|CYPIIJ2 cytochrome P450 family 2 subfamily J member 2 protein-coding 417-13 chr9 27089410 27089771 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -19551 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 256-90 chr8 33817684 33817904 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -217688 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 275.334-2 chr10 23636352 23636542 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -58280 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 219.334-4 chr3 42158286 42158470 + 1.66667 NA intron (NM_001349249, intron 1 of 14) intron (NM_001349249, intron 1 of 14) -1815 NM_014965 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 245-35 chr2 59393704 59393905 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 176096 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 279-35 chr7 110500880 110501095 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -540774 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 221.667-4 chr1 170719309 170719495 + 1.66667 NA intron (NM_022716, intron 1 of 3) intron (NM_022716, intron 1 of 3) 55271 NM_022716 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 237-12 chr10 56965060 56965338 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 339360 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 137-76 chr4 168126719 168126858 + 1.66667 NA intron (NM_007193, intron 1 of 11) intron (NM_007193, intron 1 of 11) 34251 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 256.667-5 chr1 189460108 189460268 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 1015822 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 456.333-3 chr12 841832 842363 + 1.66667 NA intron (NM_001184985, intron 4 of 27) L2c|LINE|L2 89174 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 368.667-5 chr2 220768250 220768553 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 803903 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 361.667-18 chr6 136584208 136584627 + 1.66667 NA intron (NM_005923, intron 23 of 29) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -33598 NM_001198617 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 441.666 chr2 72520951 72521323 + 1.66667 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 304896 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 366.334-6 chr8 120331311 120331570 + 1.66667 NA intron (NM_021110, intron 40 of 47) intron (NM_021110, intron 40 of 47) 113710 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 264.334-2 chr1 113281193 113281450 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -75068 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 270.334-16 chr21 30797442 30797656 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 15725 NM_175857 337879 Hs.407655 NM_175857 ENSG00000183640 KRTAP8-1 KAP8.1 keratin associated protein 8-1 protein-coding 289.667-18 chr2 53798972 53799229 + 1.66667 NA intron (NM_015701, intron 6 of 13) intron (NM_015701, intron 6 of 13) 12056 NM_015701 27248 Hs.438336 NM_015701 ENSG00000068912 ERLEC1 C2orf30|CIM|CL24936|CL25084|HEL117|XTP3-B|XTP3TPB endoplasmic reticulum lectin 1 protein-coding 131.667-205 chr8 130285890 130286110 + 1.66667 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 10533 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 213.667-77 chr5 80719631 80719817 + 1.66667 NA intron (NM_002439, intron 8 of 23) HAL1M8|LINE|L1 -64741 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 156.667-332 chr8 77180561 77180747 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -179610 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 270.667-29 chr20 10755172 10755494 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 2243 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 480.667-4 chr4 30263828 30264301 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -456305 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 282.334 chr1 60461267 60461536 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 161284 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 238.667-43 chr2 79848120 79848305 + 1.66667 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) intron (NM_001282598, intron 3 of 17) 18371 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 255-32 chr15 82055750 82055997 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9855 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 207.334-3 chr14 68105739 68105928 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 282241 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 247.667-93 chr8 15775792 15775979 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 235622 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 280.667-15 chr11 19297685 19297963 + 1.66667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -52900 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 329.333-52 chr6 87608590 87608843 + 1.66667 NA intron (NM_181837, intron 6 of 19) intron (NM_181837, intron 6 of 19) 18649 NM_001197259 23595 Hs.410228 NM_012381 ENSG00000135336 ORC3 LAT|LATHEO|ORC3L origin recognition complex subunit 3 protein-coding 247.334-14 chr22 26928652 26928820 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 25444 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 372.667-6 chr17 60645608 60646016 + 1.66667 NA intron (NM_003620, intron 3 of 5) L1ME4b|LINE|L1 -32039 NM_001099432 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 231.667-4 chr1 160766389 160766601 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 27248 NM_001282590 57823 Hs.517265 NM_021181 ENSG00000026751 SLAMF7 19A|CD319|CRACC|CS1 SLAM family member 7 protein-coding 230.666-53 chrX 93305368 93305627 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 368081 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 379-13 chr7 110638986 110639272 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -451877 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 252.667-16 chr11 40809733 40809923 + 1.66667 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -516698 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 263.667-26 chr14 84858420 84858697 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -413374 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 336.334-8 chr7 96842476 96842912 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -132803 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 180.333-61 chr2 223375892 223376109 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 226361 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 379.001-2 chr7 47384165 47384509 + 1.66667 NA intron (NM_022748, intron 16 of 30) intron (NM_022748, intron 16 of 30) 80466 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 243.667-39 chr2 78310861 78311115 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -20257 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 360.667-6 chr14 82537773 82538148 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -104672 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 198-160 chr6 75159129 75159366 + 1.66667 NA intron (NM_004370, intron 14 of 65) intron (NM_004370, intron 14 of 65) -30465 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 271-20 chr2 11451597 11451813 + 1.66667 NA exon (NM_198256, exon 4 of 7) exon (NM_198256, exon 4 of 7) 14456 NR_103490 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 267.334 chr10 24459989 24460171 + 1.66667 NA intron (NM_001321681, intron 1 of 13) intron (NM_001321681, intron 1 of 13) -6451 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 245.667-33 chr2 106618908 106619067 + 1.66667 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL 131623 NM_001349727 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 400.333-8 chr2 121111369 121111648 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 173694 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 263.667-75 chr7 42121535 42121789 + 1.66667 NA intron (NM_000168, intron 3 of 14) intron (NM_000168, intron 3 of 14) 115547 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 283.334-2 chr1 167328325 167328546 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001198783) promoter-TSS (NM_001198783) -635 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 285-5 chr13 92904996 92905294 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -140196 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 247.334-16 chr3 145768145 145768293 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 300966 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 320-34 chr3 132801061 132801524 + 1.66667 NA intron (NR_002811, intron 5 of 10) intron (NR_002811, intron 5 of 10) -78833 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 456.666 chr12 63501785 63502221 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 166490 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 339.667-6 chr15 86312950 86313232 + 1.66667 NA intron (NR_046012, intron 1 of 3) intron (NR_046012, intron 1 of 3) 3877 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 252-9 chr10 22972410 22972600 + 1.66667 NA intron (NM_001282745, intron 8 of 18) MIR3|SINE|MIR 44452 NM_001282746 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 256.334-12 chr3 107537477 107537712 + 1.66667 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) intron (NM_001276286, intron 2 of 16) 14632 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 339.666-7 chr2 125319112 125319468 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 798695 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 408.334-2 chr3 71988298 71988604 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 112004 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 242-44 chr2 128707441 128707636 + 1.66667 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -157062 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 261.334-17 chr5 7269400 7269670 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_039659).4 promoter-TSS (NR_039659).4 -181 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 213-40 chr2 101896741 101896904 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -86643 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 262.667-21 chr12 99268272 99268534 + 1.66667 NA intron (NM_152788, intron 12 of 25) intron (NM_152788, intron 12 of 25) -113313 NM_001352189 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 306.667-29 chr20 46446452 46446686 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 11074 NR_045983 100130934 Hs.712133 NM_173643 ZNF663P ZNF663 zinc finger protein 663, pseudogene pseudo 314.333-23 chr5 52810518 52810833 + 1.66667 NA intron (NM_181501, intron 1 of 28) intron (NM_181501, intron 1 of 28) 22759 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 238.667-93 chr8 128537132 128537322 + 1.66667 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 27452 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 373.667-4 chr17 688802 689102 + 1.66667 NA intron (NM_001366254, intron 4 of 19).2 intron (NM_001366254, intron 4 of 19).2 25887 NM_001128159 55275 Hs.461819 NM_018289 ENSG00000141252 VPS53 HCCS1|PCH2E|hVps53L|pp13624 VPS53 subunit of GARP complex protein-coding 261-32 chr2 15044961 15045201 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 412364 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 206.334-2 chr1 81916832 81917031 + 1.66667 NA intron (NM_001366002, intron 4 of 20) intron (NM_001366002, intron 4 of 20) 114478 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 270-34 chr21 16315755 16315999 + 1.66667 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -31109 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 356-20 chr2 38975921 38976471 + 1.66667 NA TTS (NM_001367623) TTS (NM_001367623) -15852 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 247-76 chr8 121067415 121067565 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -255444 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 257.667-70 chr6 51870502 51870666 + 1.66667 NA exon (NM_170724, exon 47 of 61) exon (NM_170724, exon 47 of 61) 217029 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 404.666-13 chr5 133059916 133060285 + 1.66667 NA intron (NM_002154, intron 1 of 18) intron (NM_002154, intron 1 of 18) 8087 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 234.333-32 chr16 60975836 60976043 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 79827 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 260-56 chr4 101769546 101769719 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -20975 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 238-7 chr10 103109479 103109743 + 1.66667 NA intron (NM_001351194, intron 2 of 17) intron (NM_001351194, intron 2 of 17) 44210 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 283.667-5 chr10 21656238 21656471 + 1.66667 NA intron (NM_001195626, intron 9 of 22) L1MA4|LINE|L1 122182 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 248.667-17 chr10 104595408 104595641 + 1.66667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -45766 NM_014978 22986 Hs.671950 NM_014978 ENSG00000156395 SORCS3 SORCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 3 protein-coding 269.333-80 chr7 41143196 41143521 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 41754 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 228-90 chr8 90403440 90403608 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 182036 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 370.667-23 chr6 47795874 47796269 + 1.66667 NA intron (NR_033806, intron 4 of 6) intron (NR_033806, intron 4 of 6) 9003 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 256-41 chr2 88539357 88539558 + 1.66667 NA intron (NR_110236, intron 1 of 2) intron (NR_110236, intron 1 of 2) 737 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 213.333-145 chr4 43350800 43351062 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 141612 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 254-5 chr1 225902404 225902595 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -13353 NM_020997 10637 Hs.656214 NM_020997 ENSG00000243709 LEFTY1 LEFTB|LEFTYB left-right determination factor 1 protein-coding 230-49 chr4 43771278 43771503 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -245471 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 356-27 chr4 101168959 101169515 + 1.66667 NA intron (NM_001130691, intron 2 of 12) intron (NM_001130691, intron 2 of 12) 71635 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 212-121 chr4 106496076 106496293 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 62560 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 272.333-28 chr2 34897746 34898063 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 220347 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 530.334 chr13 103620953 103621381 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 195967 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 268.001 chr2 159862337 159862510 + 1.66667 NA intron (NM_002349, intron 14 of 34) AluJb|SINE|Alu 42333 NM_001198760 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 321-3 chr1 207757247 207757518 + 1.66667 NA intron (NM_172352, intron 2 of 11) intron (NM_172352, intron 2 of 11) 5328 NM_172352 4179 Hs.510402 NM_002389 ENSG00000117335 CD46 AHUS2|MCP|MIC10|TLX|TRA2.10 CD46 molecule protein-coding 333.333-11 chr10 81649550 81649803 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -225518 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 517 chr12 6256708 6257236 + 1.66667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -53464 NM_018173 55200 Hs.631660 NM_018173 ENSG00000008323 PLEKHG6 MyoGEF pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G6 protein-coding 267-18 chr12 100321279 100321534 + 1.66667 NA intron (NM_017988, intron 10 of 17) intron (NM_017988, intron 10 of 17) -35668 NM_001145288 246213 Hs.116871 NM_139319 ENSG00000179520 SLC17A8 DFNA25|VGLUT3 solute carrier family 17 member 8 protein-coding 289.667-10 chr12 114649581 114649873 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 34448 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 394.334-2 chr13 93174759 93175012 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -51922 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 215-64 chr4 159020261 159020450 + 1.66667 NA intron (NM_152543, intron 1 of 4) intron (NM_152543, intron 1 of 4) 14874 NM_152543 152940 Hs.415576 NM_152543 ENSG00000164123 C4orf45 - chromosome 4 open reading frame 45 protein-coding 268-51 chr6 140951628 140951895 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 267947 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 465.667-4 chr17 31279447 31279785 + 1.66667 NA intron (NM_001042492, intron 36 of 57) intron (NM_001042492, intron 36 of 57) 17623 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 355-14 chr2 56058841 56059168 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -11678 NR_126406 104355290 Hs.580331 NR_126406 MIR217HG MIR216AHG|MIR216BHG MIR217 host gene ncRNA 373.333-10 chr15 55533601 55533999 + 1.66667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -25566 NM_001033560 161582 Hs.126403 NM_130810 ENSG00000256061 DNAAF4 CILD25|DYX1|DYX1C1|DYXC1|EKN1|RD dynein axonemal assembly factor 4 protein-coding 326.667-26 chr3 53628765 53629157 + 1.66667 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) intron (NM_001128840, intron 3 of 47) 134350 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 277-31 chr20 40088039 40088353 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 83735 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 245.667-23 chr17 78418810 78419159 + 1.66667 NA intron (NR_110602, intron 7 of 8) intron (NR_110602, intron 7 of 8) 40335 NR_110601 9489 Hs.654671 NM_024419 ENSG00000087157 PGS1 - phosphatidylglycerophosphate synthase 1 protein-coding 248.334-19 chrX 98256419 98256606 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -691977 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 409.667 chr1 29877145 29877559 + 1.66667 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 160260 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 250.334-14 chr3 79330058 79330251 + 1.66667 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -81573 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 261.333-86 chr5 73242222 73242510 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -40405 NR_134291 340090 Hs.434311 NR_134291 LOC340090 - uncharacterized LOC340090 ncRNA 268.667-2 chr1 170852125 170852295 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -83261 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 272-20 chr2 32687001 32687219 + 1.66667 NA intron (NM_017735, intron 9 of 19) AluSx|SINE|Alu 51855 NR_039922 100616219 NR_039922 ENSG00000265057 MIR4765 - microRNA 4765 ncRNA 427.334-3 chr9 101630178 101630597 + 1.66667 NA intron (NM_133445, intron 3 of 8) intron (NM_133445, intron 3 of 8) -35418 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 185-3 chr10 30224320 30224457 + 1.66667 NA intron (NR_120653, intron 2 of 2) intron (NR_120653, intron 2 of 2) 12536 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 317.334 chr20 41067735 41067974 + 1.66667 NA intron (NM_003286, intron 3 of 20) intron (NM_003286, intron 3 of 20) 39032 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 535.001-2 chr14 43707157 43707652 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 799879 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 328-28 chr4 85204601 85205019 + 1.66667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 237326 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 298.334-4 chr14 35025399 35025682 + 1.66667 NA intron (NM_003136, intron 14 of 15) intron (NM_003136, intron 14 of 15) -19367 NM_001079519 283635 Hs.446357 NM_173607 ENSG00000151327 FAM177A1 C14orf24 family with sequence similarity 177 member A1 protein-coding 241.666-21 chr7 28969718 28970003 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -10107 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 231-18 chr16 13549091 13549300 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -370962 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 268-62 chr8 140421345 140421612 + 1.66667 NA intron (NM_001321646, intron 4 of 21) intron (NM_001321646, intron 4 of 21) 36266 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 372.333-21 chr5 24403015 24403499 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 241721 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 433.334-2 chr7 100527888 100528247 + 1.66667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -11136 NM_006076 3268 Hs.521083 NM_006076 ENSG00000106351 AGFG2 HRBL|RABR ArfGAP with FG repeats 2 protein-coding 353.333-23 chr3 118658750 118659176 + 1.66667 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) intron (NR_135547, intron 2 of 3) 17195 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 410.334-5 chr8 74477112 74477424 + 1.66667 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) L1PA13|LINE|L1 -71275 NR_049860 100847058 NR_049860 ENSG00000266502 MIR5681A - microRNA 5681a ncRNA 234.334-10 chr22 36097463 36097686 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 63181 NM_030644 80833 Hs.474737 NM_014349 ENSG00000128284 APOL3 APOLIII|CG121|CG12_1|apoL-III apolipoprotein L3 protein-coding 246.667-83 chr7 4351945 4352118 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -217194 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 253-35 chr2 49087408 49087663 + 1.66667 NA intron (NM_000145, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 27932 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 277-44 chr4 188125903 188126113 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13433 NM_178556 339976 Hs.348618 NM_178556 ENSG00000184108 TRIML1 RNF209 tripartite motif family like 1 protein-coding 255.667-2 chr1 63394611 63394888 + 1.66667 NA intron (NM_013339, intron 2 of 14) MIR|SINE|MIR 27122 NM_013339 29929 Hs.258501 NM_013339 ENSG00000088035 ALG6 CDG1C ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase protein-coding 252.667-9 chr1 183935702 183935903 + 1.66667 NA TTS (NM_001303421) TTS (NM_001303421) 101926 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 352-4 chr10 36987220 36987655 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -138420 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 245.333-25 chr12 5162970 5163199 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 80067 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 304.334-12 chr8 82008648 82008992 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -166534 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 368-14 chr2 187761176 187761516 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -206841 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 217-97 chr9 84058138 84058328 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5210 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 310.001-2 chr2 123735600 123735803 + 1.66667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 289473 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 504.334 chr2 69370302 69370852 + 1.66667 NA intron (NM_002056, intron 2 of 18) intron (NM_002056, intron 2 of 18) 16650 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 394.001-3 chr3 89970432 89970711 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 862950 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 245.667-3 chr10 21446919 21447066 + 1.66667 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 49649 NR_031736 100302129 NR_031736 ENSG00000222071 MIR1915 MIRN1915|hsa-mir-1915 microRNA 1915 ncRNA 220.333-87 chr3 29964009 29964230 + 1.66667 NA intron (NM_001003792, intron 11 of 13) intron (NM_001003792, intron 11 of 13) -29963 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 271.667-66 chr8 5952921 5953127 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 453524 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 439.666 chr10 11239993 11240331 + 1.66667 NA intron (NM_001025076, intron 3 of 13) intron (NM_001025076, intron 3 of 13) 75132 NM_001083591 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 141-3 chr1 87693865 87694005 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -322280 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 334.667-31 chr8 131811424 131811896 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -92433 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 328.334-6 chr8 112770170 112770407 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 126795 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 181.334-3 chr16 60769158 60769296 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 286539 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 285.667-41 chr4 148739785 148740078 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 202447 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 271.334-15 chr3 116801299 116801461 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 48987 NR_039649 100616485 NR_039649 ENSG00000265433 MIR4447 - microRNA 4447 ncRNA 252.667-26 chr14 22329355 22329599 + 1.66667 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 103276 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 271-18 chr16 82577307 82577610 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -49511 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 221.334-2 chr1 245301565 245301753 + 1.66667 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) intron (NM_018012, intron 2 of 14) -67142 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 339.334-8 chr5 40170386 40170823 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 118313 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 244-23 chr11 79501226 79501472 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -60319 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 490.333-5 chr3 24038471 24038833 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 64595 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 360.001 chr3 52169603 52169922 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -15339 NM_015426 25886 Hs.476306 NM_015426 ENSG00000164087 POC1A PIX2|SOFT|WDR51A POC1 centriolar protein A protein-coding 211.667-34 chr12 44414288 44414446 + 1.66667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 461294 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 383.334 chr12 60744501 60744819 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1055290 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 242.334-19 chr9 20616750 20616989 + 1.66667 NA intron (NM_001286691, intron 2 of 10) L1ME3G|LINE|L1 5069 NM_001286691 4300 Hs.317248 NM_004529 ENSG00000171843 MLLT3 AF9|YEATS3 MLLT3 super elongation complex subunit protein-coding 299.667-23 chr3 44193624 44193933 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -48108 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 209.334-3 chr1 239561515 239561723 + 1.66667 NA intron (NM_001347716, intron 3 of 7) intron (NM_001347716, intron 3 of 7) -67454 NM_000740 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 302.666-21 chr5 169960975 169961187 + 1.66667 NA intron (NM_001346304, intron 1 of 3) intron (NM_001346304, intron 1 of 3) 19414 NM_001129891 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 282.667-8 chr14 48124239 48124722 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -329466 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 332.667-6 chr10 76512357 76512635 + 1.66667 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1M4|LINE|L1 -375548 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 262.333-48 chr2 133146670 133146962 + 1.66667 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) intron (NM_207481, intron 5 of 17) -119379 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 319-8 chr16 82892944 82893254 + 1.66667 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) intron (NM_001220490, intron 2 of 12) 97199 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 264-21 chr14 67977403 67977658 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 153938 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 262.667-34 chr18 74840767 74841012 + 1.66667 NA intron (NM_017757, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 209926 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 277-4 chr1 201775825 201776120 + 1.66667 NA intron (NM_001167738, intron 1 of 26) AluJr|SINE|Alu -32639 NR_031599 100302158 NR_031599 ENSG00000221028 MIR1231 MIRN1231|hsa-mir-1231 microRNA 1231 ncRNA 320.334-4 chr2 54052192 54052524 + 1.66667 NA intron (NM_001320586, intron 3 of 6) intron (NM_001320586, intron 3 of 6) -63257 NM_138448 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 282.667-30 chr3 84295500 84295769 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 573941 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 276.334-4 chr11 13583149 13583324 + 1.66667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -85432 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 197.334 chr10 53929648 53929793 + 1.66667 NA intron (NM_001354411, intron 26 of 34) intron (NM_001354411, intron 26 of 34) -556510 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 213.333-49 chr12 91992152 91992334 + 1.66667 NA intron (NR_046160, intron 2 of 5) intron (NR_046160, intron 2 of 5) 149470 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 371.001-2 chr3 88270960 88271274 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -67339 NM_001368168 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 264-27 chr17 58261600 58261885 + 1.66667 NA intron (NR_027647, intron 8 of 11) L1MA1|LINE|L1 19193 NM_000250 4353 Hs.458272 NM_000250 ENSG00000005381 MPO - myeloperoxidase protein-coding 251.333-107 chr8 122478392 122478626 + 1.66667 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 90135 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 255.667-25 chr15 26423025 26423323 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 205916 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 308.334-9 chr6 13252540 13252831 + 1.66667 NA intron (NM_001322308, intron 9 of 13) intron (NM_001322308, intron 9 of 13) 30757 NR_134859 100130357 Hs.484678 NM_001242698 LOC100130357 - uncharacterized LOC100130357 ncRNA 297.334-4 chr14 38371146 38371343 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -115151 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 286-15 chr14 62001427 62001824 + 1.66667 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) L1MCc|LINE|L1 73930 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 247-33 chr17 60053402 60053596 + 1.66667 NA intron (NM_022070, intron 14 of 19) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -10394 NR_039890 100616210 NR_039890 ENSG00000264049 MIR4737 - microRNA 4737 ncRNA 220-59 chr2 63018328 63018483 + 1.66667 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) intron (NM_001142615, intron 19 of 22) 29306 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 265-54 chr5 3624183 3624460 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 28489 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 230.334-9 chr2 145580112 145580307 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 912242 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 214.333-59 chr17 31923535 31923789 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13345 NM_001321207 23512 Hs.462732 NM_015355 ENSG00000178691 SUZ12 CHET9|JJAZ1 SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit protein-coding 282-40 chr5 36043267 36043498 + 1.66667 NA intron (NR_031764, intron 3 of 5) L1MA3|LINE|L1 23500 NM_001168316 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 285.667-3 chr1 221032283 221032617 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -152310 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 271.334-2 chr1 110813382 110813550 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -57733 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 292.333-26 chr20 39822760 39823100 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -181531 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 333-23 chr6 43539544 43539846 + 1.66667 NA intron (NR_144392, intron 21 of 32) intron (NR_144392, intron 21 of 32) 22606 NM_001363658 9533 Hs.743509 NM_004875 ENSG00000171453 POLR1C AC40|HLD11|RPA39|RPA40|RPA5|RPAC1|RPC40|TCS3 RNA polymerase I and III subunit C protein-coding 149-13 chr1 205728489 205728638 + 1.66667 NA intron (NM_022731, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR 21619 NM_022731 64710 Hs.213061 NM_022731 ENSG00000069275 NUCKS1 JC7|NUCKS nuclear casein kinase and cyclin dependent kinase substrate 1 protein-coding 214.667-4 chr1 91484831 91485178 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15843 NM_001134419 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 279-39 chr8 127636722 127637102 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 97055 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 409-2 chr10 68662223 68662740 + 1.66667 NA intron (NM_030625, intron 6 of 11) intron (NM_030625, intron 6 of 11) -58758 NM_018237 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 261.334-11 chr2 163449038 163449245 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 286867 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 282-14 chr14 60252450 60252695 + 1.66667 NA intron (NM_177951, intron 2 of 3) intron (NM_177951, intron 2 of 3) 3351 NM_177951 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 199-42 chr2 26956481 26956639 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14077 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 306.334 chr1 102975544 102975858 + 1.66667 NA intron (NM_001854, intron 35 of 66) intron (NM_001854, intron 35 of 66) 132795 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 279-27 chr5 64822124 64822382 + 1.66667 NA intron (NM_005869, intron 10 of 13) intron (NM_005869, intron 10 of 13) 53323 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 429.001 chr5 36074009 36074311 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -7278 NM_174914 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 443.667 chr17 31646500 31646887 + 1.66667 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 71282 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 230-41 chr22 24042438 24042700 + 1.66667 NA intron (NM_012295, intron 5 of 36) AluJr|SINE|Alu 31199 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 421.334-3 chr20 40478939 40479354 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 210090 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 219.667-17 chr12 24514080 24514227 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 48338 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 321-17 chr3 105549755 105550108 + 1.66667 NA intron (NM_001243280, intron 11 of 14) intron (NM_001243280, intron 11 of 14) 183022 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 182-21 chr12 7608234 7608432 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 57575 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 252.334-12 chr22 47946836 47947026 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 315257 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 190-46 chr16 67262859 67263028 + 1.66667 NA intron (NR_136664, intron 13 of 16) intron (NR_136664, intron 13 of 16) 13964 NR_136667 6553 Hs.439650 NM_004594 ENSG00000135740 SLC9A5 NHE5 solute carrier family 9 member A5 protein-coding 296.334-7 chr13 104059417 104059632 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 634324 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 506.334-3 chr7 38951822 38952409 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25794 NM_007252 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 219-85 chr9 37264498 37264658 + 1.66667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 143980 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 333-9 chr13 73435303 73435623 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -128781 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 261.666-19 chr7 90216811 90217139 + 1.66667 NA intron (NM_001244944, intron 2 of 5) intron (NM_001244944, intron 2 of 5) 3155 NM_001040666 261729 Hs.489051 NM_152999 ENSG00000157214 STEAP2 IPCA1|PCANAP1|PUMPCn|STAMP1|STMP STEAP2 metalloreductase protein-coding 300.333-16 chr17 633876 634171 + 1.66667 NA intron (NM_001366254, intron 7 of 19).2 intron (NM_001366254, intron 7 of 19).2 80816 NM_001128159 55275 Hs.461819 NM_018289 ENSG00000141252 VPS53 HCCS1|PCH2E|hVps53L|pp13624 VPS53 subunit of GARP complex protein-coding 345.333-35 chr5 167088372 167088818 + 1.66667 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) AluSx1|SINE|Alu 15353 NM_001122679 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 229.334 chr1 198057369 198057523 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -99552 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 275-20 chr19 27576796 27577087 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -216490 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 342-25 chr3 98995608 98996043 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -94130 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 351.667-13 chr4 113486564 113487065 + 1.66667 NA intron (NM_001221, intron 14 of 18) intron (NM_001221, intron 14 of 18) 193975 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 248.667-35 chr14 49354870 49355055 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 231418 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 297.334-9 chr22 25173701 25174004 + 1.66667 NA intron (NM_001145206, intron 5 of 10) MER33|DNA|hAT-Charlie -26006 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 335.333-47 chr6 72618095 72618475 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3558 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 280.334-10 chr6 37912599 37912780 + 1.66667 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) intron (NM_021943, intron 1 of 5) 92962 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 281-25 chr21 23934690 23934906 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 386579 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 270-50 chr5 42966122 42966438 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 27053 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 238.667-35 chr17 71302465 71302704 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -100405 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 259.667-8 chr10 73480628 73480934 + 1.66667 NA intron (NM_001289969, intron 1 of 12) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -14971 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 332.667-12 chr18 30860088 30860316 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 182540 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 277.666-6 chr11 107676410 107676685 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 35509 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 252.667-36 chr15 95314641 95314840 + 1.66667 NA intron (NR_034095, intron 1 of 3) intron (NR_034095, intron 1 of 3) 12360 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 246.667-7 chr1 169948028 169948242 + 1.66667 NA intron (NM_014970, intron 19 of 19) L1M5|LINE|L1 -54176 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 225.667-84 chr9 36265438 36265756 + 1.66667 NA intron (NM_001128227, intron 1 of 11) intron (NM_001128227, intron 1 of 11) -7149 NM_001190384 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 253.667-14 chr11 103492676 103492849 + 1.66667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -357144 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 285.333-66 chr7 84295713 84296041 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -101088 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 297.667-19 chr19 46916499 46916854 + 1.66667 NA intron (NM_004491, intron 1 of 6) L1MC4|LINE|L1 55679 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 270.334-9 chr16 1626265 1626495 + 1.66667 NA intron (NM_020825, intron 2 of 19) intron (NM_020825, intron 2 of 19) 11740 NM_020825 57585 Hs.603676 NM_020825 ENSG00000007545 CRAMP1 CRAMP1L|HN1L|TCE4 cramped chromatin regulator homolog 1 protein-coding 275.667-54 chr7 28538296 28538465 + 1.66667 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) intron (NM_182899, intron 3 of 9) 102765 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 376-12 chr4 30274768 30275173 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -445399 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 152.334-2 chr4 163278507 163278659 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 54013 NM_000909 4886 Hs.519057 NM_000909 ENSG00000164128 NPY1R NPY1-R|NPYR neuropeptide Y receptor Y1 protein-coding 275-29 chr20 17317062 17317307 + 1.66667 NA intron (NM_002594, intron 2 of 11) intron (NM_002594, intron 2 of 11) 90144 NM_001201529 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 298.001 chr2 220879576 220879782 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 692625 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 221-58 chr5 88436788 88437010 + 1.66667 NA TTS (NR_039993) TTS (NR_039993) 2191 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 264-49 chr7 93161911 93162192 + 1.66667 NA Intergenic LTR1D1|LTR|ERV1 -13666 NM_001303497 219285 Hs.489118 NM_152703 ENSG00000177409 SAMD9L ATXPC|C7orf6|DRIF2|UEF1 sterile alpha motif domain containing 9 like protein-coding 331.666-8 chr15 80384486 80384853 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19713 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 195-99 chr7 99291240 99291419 + 1.66667 NA non-coding (NR_002147, exon 11 of 16) non-coding (NR_002147, exon 11 of 16) 18028 NR_002147 84176 Hs.621401 NR_002147 MYH16 MHC20|MYH16P|MYH5 myosin heavy chain 16 pseudogene pseudo 246.334-14 chr3 193288799 193288965 + 1.66667 NA intron (NM_198505, intron 26 of 29) MIR3|SINE|MIR -18362 NR_046758 100874218 Hs.407490 NR_046758 ATP13A5-AS1 - ATP13A5 antisense RNA 1 ncRNA 223.667-20 chr14 71433858 71434020 + 1.66667 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) intron (NM_015556, intron 4 of 26) -5000 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 391.666 chr11 75469894 75470271 + 1.66667 NA intron (NM_030792, intron 3 of 16) L2c|LINE|L2 -17755 NM_001351167 81544 Hs.503297 NM_030792 ENSG00000158555 GDPD5 GDE2|PP1665 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 protein-coding 275-52 chr8 134017492 134017738 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 131119 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 294.667-37 chr4 91307178 91307528 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 969949 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 313.666-9 chr3 190143745 190144145 + 1.66667 NA intron (NR_126419, intron 3 of 3) intron (NR_126419, intron 3 of 3) -21508 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 273.667-26 chr16 4726223 4726538 + 1.66667 NA intron (NM_001324129, intron 1 of 13) intron (NM_001324129, intron 1 of 13) 7891 NR_040252 124401 Hs.654859 NM_133450 ENSG00000168096 ANKS3 - ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 349.667-16 chr3 179893141 179893470 + 1.66667 NA intron (NM_001256753, intron 1 of 12) intron (NM_001256753, intron 1 of 12) -4889 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 426.334-5 chr6 134971701 134971981 + 1.66667 NA intron (NM_006620, intron 15 of 17) MIRc|SINE|MIR 7591 NR_037435 100500880 NR_037435 ENSG00000283409 MIR3662 mir-3662 microRNA 3662 ncRNA 496.667-6 chr8 140976947 140977451 + 1.66667 NA intron (NM_001352719, intron 1 of 32) AluJb|SINE|Alu 23805 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 305.667-18 chr2 161470161 161470477 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 37583 NR_077058 285116 Hs.470435 NR_077058 AHCTF1P1 AHCTF1P|ELYS-like AT-hook containing transcription factor 1 pseudogene 1 pseudo 232-56 chr20 13163471 13163691 + 1.66667 NA intron (NM_001349945, intron 12 of 12) intron (NM_001349945, intron 12 of 12) -57693 NM_080826 140862 Hs.559353 NM_080826 ENSG00000101230 ISM1 C20orf82|ISM|Isthmin|bA149I18.1|dJ1077I2.1 isthmin 1 protein-coding 202.667-89 chr2 237409987 237410168 + 1.66667 NA intron (NM_057165, intron 1 of 7) intron (NM_057165, intron 1 of 7) 4087 NM_057165 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 354-23 chr7 12015940 12016344 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -183944 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 234.334-15 chr5 170055384 170055546 + 1.66667 NA intron (NR_156756, intron 43 of 52) intron (NR_156756, intron 43 of 52) 26977 NR_039609 100616498 NR_039609 ENSG00000263831 MIR378E mir-378e microRNA 378e ncRNA 334.333-20 chr2 150738420 150738695 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 109660 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 293-33 chr5 28656491 28656683 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -270283 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 255-76 chr7 40381569 40381797 + 1.66667 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) intron (NM_024728, intron 9 of 14) 246707 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 329.334-5 chr22 27179525 27179790 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7859 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 163.334 chr9 18148466 18148575 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -325633 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 303.334-9 chr5 96620771 96621108 + 1.66667 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) intron (NR_130776, intron 4 of 4) -41098 NM_001042442 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 371.001 chr2 85587730 85587998 + 1.66667 NA intron (NM_006634, intron 1 of 2) intron (NM_006634, intron 1 of 2) 3433 NM_006634 10791 Hs.534373 NM_006634 ENSG00000168899 VAMP5 - vesicle associated membrane protein 5 protein-coding 334-10 chr15 96206931 96207193 + 1.66667 NA intron (NR_125738, intron 2 of 4) intron (NR_125738, intron 2 of 4) -79221 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 620-2 chr5 27640993 27641679 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 169044 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 315-33 chr9 104349981 104350339 + 1.66667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 79931 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 285.334-3 chr12 61195093 61195376 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 997605 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 293.667-39 chr22 29687289 29687496 + 1.66667 NA intron (NM_181832, intron 16 of 16) intron (NM_181832, intron 16 of 16) -32611 NM_182527 164633 Hs.643608 NM_182527 ENSG00000100314 CABP7 CALN2 calcium binding protein 7 protein-coding 249-30 chr15 68064162 68064357 + 1.66667 NA intron (NM_001320687, intron 2 of 14) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 9683 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 187-49 chr22 42954861 42955077 + 1.66667 NA intron (NM_001184970, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 4887 NM_001349973 11252 Hs.162877 NM_007229 ENSG00000100266 PACSIN2 SDPII protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2 protein-coding 230.333-24 chr11 81761982 81762137 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 128777 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 357 chr1 42675149 42675562 + 1.66667 NA intron (NM_006347, intron 9 of 9) intron (NM_006347, intron 9 of 9) -7063 NM_004559 4904 Hs.473583 NM_004559 ENSG00000065978 YBX1 BP-8|CBF-A|CSDA2|CSDB|DBPB|EFI-A|MDR-NF1|NSEP-1|NSEP1|YB-1|YB1 Y-box binding protein 1 protein-coding 318-51 chr7 152643002 152643202 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 33039 NM_005431 7516 Hs.647093 NM_005431 ENSG00000196584 XRCC2 FANCU X-ray repair cross complementing 2 protein-coding 335.667-3 chr10 61016293 61016590 + 1.66667 NA intron (NR_108052, intron 1 of 1) LTR90B|LTR|LTR 166 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 274.333-34 chr18 11577094 11577392 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -32315 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 294-3 chr1 56551915 56552151 + 1.66667 NA intron (NM_003713, intron 1 of 5) intron (NM_003713, intron 1 of 5) 27530 NM_003713 8613 Hs.405156 NM_003713 ENSG00000162407 PLPP3 Dri42|LPP3|PAP2B|PPAP2B|VCIP phospholipid phosphatase 3 protein-coding 270.334-13 chr2 59934346 59934607 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 448560 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 311.334-5 chr4 19172998 19173315 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1078749 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 266-60 chr4 23823448 23823713 + 1.66667 NA intron (NR_148986, intron 8 of 14) intron (NR_148986, intron 8 of 14) 57712 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 357-15 chr22 43065235 43065463 + 1.66667 NA intron (NR_027779, intron 6 of 11) AluSx1|SINE|Alu 24042 NM_012263 25809 Hs.660298 NM_012263 ENSG00000100271 TTLL1 C22orf7|HS323M22B tubulin tyrosine ligase like 1 protein-coding 350.333-5 chr14 67825773 67826088 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 3 of 10) AluSz|SINE|Alu 2338 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 274.333-6 chr10 72486155 72486444 + 1.66667 NA intron (NM_001195519, intron 1 of 6) intron (NM_001195519, intron 1 of 6) 37687 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 248.667-75 chr3 22880017 22880200 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 322470 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 235-2 chr1 48358190 48358390 + 1.66667 NA intron (NM_019073, intron 10 of 12) intron (NM_019073, intron 10 of 12) 113914 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 451-2 chr14 60019108 60019768 + 1.66667 NA intron (NR_075071, intron 26 of 32) intron (NR_075071, intron 26 of 32) -72473 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 493 chr18 39496978 39497500 + 1.66667 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) intron (NR_024391, intron 3 of 3) 124936 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 301-13 chr14 60365602 60365968 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 42589 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 425.667-4 chr14 55307365 55307890 + 1.66667 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 35473 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 282-34 chr22 26166735 26167164 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2513 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 322.667-22 chr4 155179758 155179961 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -28777 NM_001370180 4887 Hs.37125 NM_000910 ENSG00000185149 NPY2R NPY2-R neuropeptide Y receptor Y2 protein-coding 245.334-7 chr16 31305615 31305778 + 1.66667 NA intron (NM_001145808, intron 14 of 29) L1PB2|LINE|L1 45721 NM_000632 3684 Hs.172631 NM_000632 ENSG00000169896 ITGAM CD11B|CR3A|MAC-1|MAC1A|MO1A|SLEB6 integrin subunit alpha M protein-coding 245-34 chr2 57349495 57349665 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -558071 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 249.666-21 chr2 80769107 80769395 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 455872 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 246.333-99 chr8 107234906 107235176 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 101474 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 410.667-17 chr8 76587755 76588078 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -93331 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 232.667-46 chr22 21811669 21811931 + 1.66667 NA intron (NM_002745, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu 55880 NM_138957 5594 Hs.431850 NM_002745 ENSG00000100030 MAPK1 ERK|ERK-2|ERK2|ERT1|MAPK2|P42MAPK|PRKM1|PRKM2|p38|p40|p41|p41mapk|p42-MAPK mitogen-activated protein kinase 1 protein-coding 229-53 chr5 43532900 43533101 + 1.66667 NA intron (NM_006451, intron 9 of 10) L1MEd|LINE|L1 -17852 NM_198566 375444 Hs.661641 NM_198566 ENSG00000172244 C5orf34 - chromosome 5 open reading frame 34 protein-coding 307.667-16 chr15 99667662 99667917 + 1.66667 NA intron (NM_001365201, intron 4 of 11) LTR37A|LTR|ERV1 34811 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 282.334-14 chr5 120175292 120175525 + 1.66667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -288870 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 252.334-24 chr8 137748417 137748574 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -334907 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 260-22 chr12 120706189 120706434 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4147 NM_001080533 84747 Hs.127610 NM_032661 ENSG00000175970 UNC119B POC7B unc-119 lipid binding chaperone B protein-coding 283-6 chr11 66377958 66378211 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5608 NM_001300869 3177 Hs.569017 NM_001532 ENSG00000174669 SLC29A2 DER12|ENT2|HNP36 solute carrier family 29 member 2 protein-coding 261-39 chr2 213106868 213107141 + 1.66667 NA intron (NM_001371277, intron 3 of 6) intron (NM_001371277, intron 3 of 6) 43433 NM_001371275 237-10 chr10 17493749 17493940 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -39249 NR_144322 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 454.334 chr12 2409861 2410271 + 1.66667 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 140290 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 461-5 chr3 84303637 84303946 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 565784 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 264-4 chr1 96398601 96398844 + 1.66667 NA Intergenic LTR16D2|LTR|ERVL -24597 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 224.333-3 chr1 93302771 93302985 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 42933 NR_034089 100131564 Hs.732666 NR_034089 CCDC18-AS1 - CCDC18 antisense RNA 1 ncRNA 239-21 chr15 86978184 86978371 + 1.66667 NA intron (NR_135683, intron 1 of 2) intron (NR_135683, intron 1 of 2) 10149 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 395-13 chr2 159815040 159815357 + 1.66667 NA intron (NM_002349, intron 31 of 34) AluYj4|SINE|Alu -16943 NM_001198764 9936 Hs.130014 NM_014880 ENSG00000241399 CD302 BIMLEC|CLEC13A|DCL-1|DCL1 CD302 molecule protein-coding 414-8 chr21 33382748 33383172 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -19936 NM_005534 3460 Hs.634632 NM_005534 ENSG00000159128 IFNGR2 AF-1|IFGR2|IFNGT1|IMD28 interferon gamma receptor 2 protein-coding 264-24 chr15 65774486 65774716 + 1.66667 NA intron (NM_005848, intron 1 of 31) AluSz|SINE|Alu 17692 NM_001144823 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 443-3 chr14 38555780 38556113 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -299853 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 235.667-7 chr10 105420324 105420506 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 399918 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 293.001-2 chr12 765524 765710 + 1.66667 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) intron (NM_001184985, intron 1 of 27) 12694 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 301-34 chr4 39864406 39864808 + 1.66667 NA intron (NM_001100399, intron 23 of 32) intron (NM_001100399, intron 23 of 32) 113304 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 226.667-12 chr1 236325733 236325921 + 1.66667 NA Intergenic LTR47B|LTR|ERVL -43869 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 365.333-3 chr11 103016573 103017117 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -61113 NM_002427 4322 Hs.2936 NM_002427 ENSG00000137745 MMP13 CLG3|MANDP1|MDST|MMP-13 matrix metallopeptidase 13 protein-coding 448-7 chr6 133414757 133415284 + 1.66667 NA intron (NM_172103, intron 3 of 18) MIRb|SINE|MIR 173521 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 259.334-24 chr9 27961063 27961222 + 1.66667 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) MER47A|DNA|TcMar-Tigger -387276 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 153.667-176 chr2 41621525 41621622 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -255982 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 370-3 chr10 106983553 106983993 + 1.66667 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) intron (NM_001206569, intron 1 of 25) 180933 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 298.333-41 chr8 84238704 84239120 + 1.66667 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) 54246 NM_001100391 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 221-39 chr20 39542805 39542974 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -318141 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 423.334-5 chr8 141939582 141940001 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -153478 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 289.001 chr1 234313888 234314076 + 1.66667 NA intron (NM_173508, intron 4 of 7) intron (NM_173508, intron 4 of 7) 7515 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 230-7 chr1 216865725 216865910 + 1.66667 NA intron (NM_001243507, intron 2 of 7) intron (NM_001243507, intron 2 of 7) -60432 NM_001243514 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 327.666-4 chr2 39328459 39328900 + 1.66667 NA intron (NM_003618, intron 8 of 33) L1ME1|LINE|L1 -84696 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 355.667-7 chr3 135277185 135277593 + 1.66667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 482129 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 396.667-2 chr1 201812016 201812456 + 1.66667 NA intron (NM_020443, intron 26 of 29) intron (NM_020443, intron 26 of 29) 3625 NR_031599 100302158 NR_031599 ENSG00000221028 MIR1231 MIRN1231|hsa-mir-1231 microRNA 1231 ncRNA 330.334 chr1 104955333 104955721 + 1.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 663408 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 559.333 chr1 229095143 229095831 + 1.66667 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 79314 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 314.667-29 chr3 65319758 65320051 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -573912 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 291.667-22 chr3 26417784 26418119 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -204855 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 267.001 chr5 157699129 157699293 + 1.66667 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 27678 NM_001145132 100190949 Hs.720862 NM_001145132 ENSG00000187658 C5orf52 - chromosome 5 open reading frame 52 protein-coding 325.667-2 chr11 40543846 40544062 + 1.66667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -250824 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 167.333-157 chr20 58154597 58154756 + 1.66667 NA intron (NM_178456, intron 2 of 3) intron (NM_178456, intron 2 of 3) 3774 NM_178456 128602 Hs.43977 NM_178456 ENSG00000124237 C20orf85 LLC1|bA196N14.1 chromosome 20 open reading frame 85 protein-coding 298-36 chr18 40110026 40110385 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 43919 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 258.667-25 chr12 13467352 13467621 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -90741 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 334.334-5 chr3 18712768 18713051 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -267317 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 348.667-15 chr20 48428063 48428368 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 68304 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 204.333-127 chr3 111568051 111568325 + 1.66667 NA intron (NM_001318889, intron 3 of 7) intron (NM_001318889, intron 3 of 7) 25991 NM_005816 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 276.667-4 chr1 208465944 208466163 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -221669 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 490.001 chr14 62920652 62921039 + 1.66667 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 124613 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 279.334-16 chrX 106046406 106046597 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7774 NM_000354 6906 Hs.76838 NM_000354 ENSG00000123561 SERPINA7 TBG|TBGQTL serpin family A member 7 protein-coding 366.667 chr1 43407026 43407388 + 1.66667 NA intron (NM_015284, intron 4 of 70) intron (NM_015284, intron 4 of 70) 17308 NM_001365999 23334 Hs.643560 NM_015284 ENSG00000198198 SZT2 C1orf84|EIEE18|KIAA0467|SZT2A|SZT2B SZT2 subunit of KICSTOR complex protein-coding 612.999 chr3 97925149 97925737 + 1.66667 NA intron (NM_153605, intron 17 of 21) intron (NM_153605, intron 17 of 21) 46988 NM_153182 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 341.001-3 chr5 56110998 56111268 + 1.66667 NA exon (NM_024669, exon 10 of 12) exon (NM_024669, exon 10 of 12) 115966 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 329.333-2 chr1 89564019 89564415 + 1.66667 NA intron (NM_015350, intron 4 of 8) intron (NM_015350, intron 4 of 8) 39379 NM_015350 23507 Hs.482017 NM_015350 ENSG00000197147 LRRC8B TA-LRRP|TALRRP leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B protein-coding 269-9 chr10 81433247 81433538 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -441802 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 199-47 chr2 70631126 70631275 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -77374 NM_001099691 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 288-25 chr2 21946813 21947151 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -236330 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 232.667-36 chr2 43736370 43736517 + 1.66667 NA intron (NM_172069, intron 19 of 29) L1MEc|LINE|L1 -37596 NM_001193464 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 383.334-6 chr5 45051620 45051960 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 242843 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 327.334-5 chr2 14283945 14284252 + 1.66667 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) intron (NR_103814, intron 2 of 3) 116860 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 222-87 chr7 38875505 38875724 + 1.66667 NA intron (NM_014396, intron 2 of 28) intron (NM_014396, intron 2 of 28) 33577 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 270-47 chr4 128747584 128747838 + 1.66667 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -61989 NM_199320 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 206-141 chr5 68859876 68860076 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 169951 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 334-18 chr18 66745290 66745716 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -141413 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 423-3 chr19 30181641 30181971 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -190578 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 292.334-6 chr5 15258691 15258903 + 1.66667 NA intron (NR_109944, intron 1 of 2) intron (NR_109944, intron 1 of 2) 7763 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 360-13 chr19 52102294 52102824 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6794 NM_001369827 284371 Hs.665751 NM_001136499 ENSG00000197608 ZNF841 - zinc finger protein 841 protein-coding 301-6 chr10 32568868 32569138 + 1.66667 NA intron (NR_109826, intron 15 of 16) intron (NR_109826, intron 15 of 16) 122863 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 260.667-64 chr4 53102180 53102338 + 1.66667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) L1MC3|LINE|L1 239942 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 227.667-17 chr13 22264707 22264951 + 1.66667 NA intron (NR_103810, intron 1 of 1) intron (NR_103810, intron 1 of 1) 54544 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 233-55 chr5 29359748 29360061 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 36072 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 333.334-5 chr5 28724283 28724662 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -202398 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 282.334-7 chr2 43165045 43165319 + 1.66667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 61424 NM_006887 678 Hs.503093 NM_006887 ENSG00000152518 ZFP36L2 BRF2|ERF-2|ERF2|RNF162C|TIS11D ZFP36 ring finger protein like 2 protein-coding 247-13 chr11 83240143 83240333 + 1.66667 NA intron (NM_001300975, intron 8 of 10) intron (NM_001300975, intron 8 of 10) 46169 NM_021825 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 265.333-51 chr22 50308058 50308309 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_012401) promoter-TSS (NM_012401) -537 NM_012401 23654 Hs.3989 NM_012401 ENSG00000196576 PLXNB2 MM1|Nbla00445|PLEXB2|dJ402G11.3 plexin B2 protein-coding 267.333-96 chr9 100091410 100091686 + 1.66667 NA intron (NM_015051, intron 1 of 11) intron (NM_015051, intron 1 of 11) 7452 NM_015051 23071 Hs.154023 NM_015051 ENSG00000023318 ERP44 PDIA10|TXNDC4 endoplasmic reticulum protein 44 protein-coding 251.667-94 chr8 81279528 81279686 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001444) promoter-TSS (NM_001444) -929 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 269.667-2 chr1 176152676 176152920 + 1.66667 NA intron (NM_001286644, intron 3 of 17) intron (NM_001286644, intron 3 of 17) 54446 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 267.333-80 chr6 78624477 78624671 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -85265 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 247-24 chr14 77755275 77755547 + 1.66667 NA intron (NM_001318844, intron 1 of 12) intron (NM_001318844, intron 1 of 12) -5357 NR_161323 283579 Hs.375834 NM_174943 ENSG00000197734 C14orf178 - chromosome 14 open reading frame 178 ncRNA 246 chr1 22758223 22758384 + 1.66667 NA intron (NM_004442, intron 1 of 15) intron (NM_004442, intron 1 of 15) 38786 NR_039832 100616391 NR_039832 ENSG00000265422 MIR4684 - microRNA 4684 ncRNA 524.333-3 chr2 151489066 151489635 + 1.66667 NA intron (NM_001271208, intron 182 of 182) intron (NM_001271208, intron 182 of 182) 79448 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 331-13 chr14 50462305 50462619 + 1.66667 NA intron (NM_198794, intron 13 of 31) intron (NM_198794, intron 13 of 31) -65164 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 242.667-8 chr1 84686546 84686826 + 1.66667 NA intron (NM_014021, intron 1 of 14) intron (NM_014021, intron 1 of 14) 3775 NM_001166294 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 443-6 chr17 81999950 82000313 + 1.66667 NA intron (NR_045351, intron 6 of 14) intron (NR_045351, intron 6 of 14) 22502 NR_045351 79058 Hs.298351 NM_024083 ENSG00000169696 ASPSCR1 ASPCR1|ASPL|ASPS|RCC17|TUG|UBXD9|UBXN9 ASPSCR1 tether for SLC2A4, UBX domain containing protein-coding 148.667-54 chr10 83536657 83536814 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 140354 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 235.333-112 chr7 27568594 27568808 + 1.66667 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) AluSx1|SINE|Alu -47273 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 299.666-10 chr2 39342493 39342907 + 1.66667 NA intron (NM_003618, intron 4 of 33) intron (NM_003618, intron 4 of 33) 94585 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 270.667-61 chr9 94111135 94111341 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26774 NM_001253829 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 202.667-154 chr9 37312902 37313107 + 1.66667 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) intron (NR_110317, intron 4 of 7) -109692 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 195-106 chr8 83843956 83844104 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -338757 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 359.333-21 chr5 95990086 95990352 + 1.66667 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 28218 NR_130776 101929710 NR_130776 ENSG00000251314 LOC101929710 - uncharacterized LOC101929710 ncRNA 250.333-24 chr15 75212228 75212470 + 1.66667 NA TTS (NM_015492) TTS (NM_015492) 10467 NM_015492 56905 Hs.17936 NM_015492 ENSG00000167173 C15orf39 - chromosome 15 open reading frame 39 protein-coding 339.667-17 chr3 95412970 95413394 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 270011 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 259.667-19 chr13 32739851 32740035 + 1.66667 NA intron (NM_015032, intron 21 of 34) intron (NM_015032, intron 21 of 34) 153491 NM_015032 23047 Hs.744901 NM_015032 ENSG00000083642 PDS5B APRIN|AS3|CG008 PDS5 cohesin associated factor B protein-coding 240.334-12 chr7 78906079 78906269 + 1.66667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -102814 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 231.334-11 chr9 71348533 71348686 + 1.66667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) AluSx1|SINE|Alu 98362 NM_001366141 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 223.666-30 chr5 80662963 80663220 + 1.66667 NA intron (NM_002439, intron 2 of 23) AluJb|SINE|Alu -8108 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 218-12 chr10 76310021 76310255 + 1.66667 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 527377 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 255.333-119 chr9 26767654 26767948 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 125001 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 337.667-21 chr6 119089176 119089465 + 1.66667 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) AluSx1|SINE|Alu -10656 NM_024581 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 358-4 chr12 11489769 11490228 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -3320 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 217.666-5 chr10 76962041 76962212 + 1.66667 NA intron (NM_001271519, intron 20 of 28) intron (NM_001271519, intron 20 of 28) 74082 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 213-2 chr1 69765741 69765955 + 1.66667 NA intron (NM_001370785, intron 3 of 26) L3|LINE|CR1 -153474 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 244.333-29 chr12 19085825 19086094 + 1.66667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -43774 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 254-66 chr5 99358000 99358280 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -175850 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 251.667-105 chrX 91463073 91463228 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -28151 NR_110659 102724167 Hs.571694 NR_110659 ENSG00000234161 PABPC5-AS1 CXorf46 PABPC5 antisense RNA 1 ncRNA 251-59 chr5 3619026 3619219 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 23290 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 338-17 chr2 98501696 98502130 + 1.66667 NA intron (NM_001351428, intron 1 of 24) intron (NM_001351428, intron 1 of 24) 55903 NM_001351427 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 473.333 chr12 962731 963303 + 1.66667 NA intron (NM_001297419, intron 1 of 11) AluJr|SINE|Alu -13295 NR_123713 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 317.333-45 chr9 78174634 78174919 + 1.66667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -61299 NM_001330691 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 210.667-67 chr2 57101168 57101317 + 1.66667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -806409 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 281.667-29 chr2 186519257 186519457 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 33097 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 801.666 chr9 29088251 29088966 + 1.66667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 123691 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 357.667-14 chr7 124012929 124013229 + 1.66667 NA intron (NR_133947, intron 3 of 4) (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18457 NR_133947 105375483 Hs.435972 NR_133947 ENSG00000241345 LOC105375483 - uncharacterized LOC105375483 ncRNA 349.001 chr5 6459430 6459666 + 1.66667 NA intron (NM_001145161, intron 1 of 1) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 10689 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 265.333-68 chr5 139067329 139067624 + 1.66667 NA intron (NM_022464, intron 3 of 9) intron (NM_022464, intron 3 of 9) 130892 NM_022464 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 332.334 chr13 107728755 107728999 + 1.66667 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 106581 NR_046848 100874375 Hs.653972 NR_046848 FAM155A-IT1 - FAM155A intronic transcript 1 ncRNA 264.333-46 chr3 74414195 74414431 + 1.66667 NA intron (NM_020872, intron 4 of 21) intron (NM_020872, intron 4 of 21) 106827 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 325.666-2 chr10 91896164 91896657 + 1.66667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 13076 NM_152429 143282 Hs.466120 NM_152429 ENSG00000174721 FGFBP3 C10orf13|FGF-BP3 fibroblast growth factor binding protein 3 protein-coding 195.334-6 chr9 13512357 13512592 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81145 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 227.333-49 chr17 28917760 28917914 + 1.66667 NA intron (NM_001033561, intron 6 of 14) intron (NM_001033561, intron 6 of 14) -8438 NR_110803 101927018 Hs.665702 NR_110803 ENSG00000265845 LOC101927018 - uncharacterized LOC101927018 ncRNA 240.334 chr1 105345823 105345972 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 273038 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 259.667-76 chr7 48955917 48956200 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 31511 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 541.999-2 chr2 124708514 124709105 + 1.66667 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) intron (NM_130773, intron 13 of 23) 683522 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 359.333-27 chr9 15895550 15895997 + 1.66667 NA intron (NM_001355547, intron 23 of 24) intron (NM_001355547, intron 23 of 24) 331795 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 285.667-39 chr4 39195887 39196169 + 1.66667 NA intron (NM_025132, intron 5 of 36) intron (NM_025132, intron 5 of 36) 13499 NM_025132 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 251.333-28 chr13 108502883 108503077 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -92925 NM_015011 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 199.333-238 chr6 25932792 25932981 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -2195 NM_001286123 10246 Hs.591802 NM_005835 ENSG00000112337 SLC17A2 NPT3 solute carrier family 17 member 2 protein-coding 302.333-23 chr22 34142628 34142971 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -219911 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 266.666-25 chr6 134453897 134454176 + 1.66667 NA intron (NR_038219, intron 2 of 4) intron (NR_038219, intron 2 of 4) 15646 NR_038219 154092 Hs.223718 NR_038216 LINC01010 - long intergenic non-protein coding RNA 1010 ncRNA 332.667-9 chr11 83190542 83190916 + 1.66667 NA TTS (NR_149008) TTS (NR_149008) 2940 NR_149011 100506282 Hs.585502 NM_018705 LOC100506282 - uncharacterized LOC100506282 ncRNA 353-2 chr10 32039388 32039731 + 1.66667 NA intron (NM_004521, intron 3 of 25) intron (NM_004521, intron 3 of 25) 16866 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 237-3 chr1 154892802 154892971 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -22605 NM_002249 3782 Hs.490765 NM_002249 ENSG00000143603 KCNN3 KCa2.3|SK3|SKCA3|hSK3 potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 protein-coding 238.333-8 chr10 63679752 63680039 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -158005 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 166.667-140 chr22 25047799 25047966 + 1.66667 NA intron (NM_001145206, intron 3 of 10) L1M4|LINE|L1 19908 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 230.334-3 chr11 85237991 85238156 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -314652 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 262.667-51 chr22 20253962 20254212 + 1.66667 NA intron (NM_023004, intron 1 of 1) HAL1ME|LINE|L1 -4876 NR_031618 100302118 NR_031618 ENSG00000221039 MIR1286 MIRN1286|hsa-mir-1286|mir-1286 microRNA 1286 ncRNA 264.001 chr14 54867909 54868073 + 1.66667 NA intron (NM_001024071, intron 1 of 5) L1MD3|LINE|L1 10202 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 305-26 chr6 151256595 151256909 + 1.66667 NA intron (NM_005100, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu 16785 NM_005100 9590 Hs.371240 NM_005100 ENSG00000131016 AKAP12 AKAP250|SSeCKS A-kinase anchoring protein 12 protein-coding 259.334-7 chr14 28691742 28691910 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 73493 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 157-46 chr15 95551924 95552131 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 118934 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 301.667-12 chr14 63979193 63979592 + 1.66667 NA intron (NM_015180, intron 14 of 114) intron (NM_015180, intron 14 of 114) 115733 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 630.334 chr18 5448983 5449793 + 1.66667 NA intron (NM_001281535, intron 5 of 21) L1MC2|LINE|L1 91168 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 316.667-13 chr15 26191654 26191897 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 75962 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 267.667-48 chr4 139003008 139003195 + 1.66667 NA intron (NR_133945, intron 1 of 2) AluSc5|SINE|Alu 9545 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 247-11 chr11 26599645 26599846 + 1.66667 NA intron (NM_031418, intron 17 of 26) intron (NM_031418, intron 17 of 26) -27482 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 385.667-2 chr11 115339955 115340229 + 1.66667 NA non-coding (NR_135108, exon 2 of 2) non-coding (NR_135108, exon 2 of 2) 6515 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 537.333 chr10 7414730 7415405 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3581 NM_001029880 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 260.001 chr14 27341719 27341879 + 1.66667 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -270789 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 204.333-23 chr10 26161723 26162033 + 1.66667 NA intron (NM_017433, intron 26 of 34) intron (NM_017433, intron 26 of 34) -54429 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 298.334-5 chr2 38013665 38013990 + 1.66667 NA intron (NM_144713, intron 10 of 10) intron (NM_144713, intron 10 of 10) 22514 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 491.334-3 chr3 187511940 187512361 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65104 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 125.333-160 chr6 121346803 121346950 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -12147 NM_001367759 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 218.333-107 chr6 62450044 62450265 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -163927 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 339-22 chr9 35632798 35633460 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13141 NR_135130 101926948 Hs.639412 NR_135130 LOC101926948 - uncharacterized LOC101926948 ncRNA 315.666-12 chr3 175040295 175040697 + 1.66667 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) MIRc|SINE|MIR 74746 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 334.667-12 chr17 62399306 62399610 + 1.66667 NA intron (NM_001144933, intron 8 of 11) AluJb|SINE|Alu 18905 NM_173503 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 404.667-5 chr22 35948797 35949198 + 1.66667 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) L1MB3|LINE|L1 12633 NM_001349989 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 432.333-10 chr7 49402272 49402658 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -371173 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 291.666-7 chr2 178831314 178831618 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_173648, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_173648, exon 24 of 24) -24043 NM_133432 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 256.334-15 chr4 143150966 143151164 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 33796 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 213.333-15 chr1 233237362 233237591 + 1.66667 NA intron (NM_014801, intron 8 of 33) intron (NM_014801, intron 8 of 33) 58249 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 279.667-2 chr10 27891481 27891887 + 1.66667 NA intron (NM_001290021, intron 10 of 13) intron (NM_001290021, intron 10 of 13) 90187 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 324.001 chr8 118152945 118153209 + 1.66667 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) intron (NR_146234, intron 4 of 5) -41258 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 354.333-4 chr12 28848159 28848650 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -300874 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 296.666-17 chr2 133286682 133287150 + 1.66667 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) L3|LINE|CR1 20721 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 288.667-28 chr5 161017870 161018181 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -79399 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 239.333-20 chr11 90528591 90528826 + 1.66667 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 27149 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 185.667-102 chr5 57658272 57658455 + 1.66667 NA intron (NR_104668, intron 1 of 2) intron (NR_104668, intron 1 of 2) 7703 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 254.666-27 chr6 118939474 118939763 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -4456 NM_153255 254394 Hs.279008 NM_017696 ENSG00000111877 MCM9 C6orf61|MCMDC1|ODG4|dJ329L24.1|dJ329L24.3 minichromosome maintenance 9 homologous recombination repair factor protein-coding 221-70 chr9 34979515 34979731 + 1.66667 NA non-coding (NR_136307, exon 8 of 9) non-coding (NR_136307, exon 8 of 9) 9756 NR_109756 101926900 Hs.545814 NR_109756 ENSG00000281491 DNAJB5-DT DNAJB5-AS1 DNAJB5 divergent transcript ncRNA 221-44 chr22 28625827 28625981 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEa|LINE|L1 53961 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 233-16 chr11 85092393 85092572 + 1.66667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) Ricksha_b|DNA|MULE-MuDR -169061 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 552.333-3 chrUn_KI270544v1 144 1133 + 1.66667 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 301-24 chr20 54278559 54278870 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 70627 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 228.666-20 chr2 15238036 15238296 + 1.66667 NA intron (NR_052013, intron 45 of 50) intron (NR_052013, intron 45 of 50) 323168 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 306.001 chr17 65281855 65282117 + 1.66667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 144616 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 190.666-25 chr2 44181401 44181642 + 1.66667 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) intron (NM_177969, intron 1 of 4) 12646 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 269-32 chr3 73906072 73906378 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 96981 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 506-3 chr9 31262398 31262722 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 118930 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 239-39 chr2 229525985 229526188 + 1.66667 NA intron (NM_139072, intron 5 of 12) intron (NM_139072, intron 5 of 12) 188469 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 281.001-3 chr16 79899686 79899877 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 104532 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 241.333-78 chr4 149647117 149647332 + 1.66667 NA intron (NM_001363507, intron 7 of 13) intron (NM_001363507, intron 7 of 13) 168619 NM_001363509 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 248-35 chr19 34410535 34410755 + 1.66667 NA intron (NM_032346, intron 4 of 6) intron (NM_032346, intron 4 of 6) 6246 NM_032346 84306 Hs.515344 NM_032346 ENSG00000126249 PDCD2L - programmed cell death 2 like protein-coding 259.667-82 chr8 28785355 28785802 + 1.66667 NA intron (NR_026826, intron 9 of 14) L1MC4|LINE|L1 84077 NR_073469 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 247-45 chr20 3431317 3431515 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23754 NM_001009984 25943 Hs.516853 NM_001009984 ENSG00000088854 C20orf194 - chromosome 20 open reading frame 194 protein-coding 318.334-3 chr10 91677040 91677362 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -44130 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 211.333-156 chr3 180661302 180661487 + 1.66667 NA intron (NM_181426, intron 3 of 19) intron (NM_181426, intron 3 of 19) 18095 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 334-27 chr3 45734320 45734644 + 1.66667 NA intron (NM_001319071, intron 13 of 19) AluJo|SINE|Alu 45086 NM_001319073 22908 Hs.156509 NM_014016 ENSG00000211456 SACM1L SAC1 SAC1 like phosphatidylinositide phosphatase protein-coding 298.667-10 chr14 53084009 53084317 + 1.66667 NA intron (NM_030637, intron 4 of 11) intron (NM_030637, intron 4 of 11) 69160 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 302-4 chr1 109992981 109993315 + 1.66667 NA intron (NM_001242673, intron 1 of 16) intron (NM_001242673, intron 1 of 16) -7779 NM_001242674 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 270.333-62 chr8 111515232 111515552 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 138753 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 225.334 chr13 108558027 108558246 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37769 NM_015011 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 216.333-136 chr8 80623432 80623622 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 137301 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 228-40 chr2 42204939 42205088 + 1.66667 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) intron (NM_001145076, intron 1 of 21) -34782 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 247-48 chr22 28205471 28205746 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -254261 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 368-3 chr1 180361940 180362523 + 1.66667 NA intron (NM_032360, intron 6 of 7) intron (NM_032360, intron 6 of 7) 76159 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 441-6 chr6 155831819 155832284 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -114746 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 281.334 chr10 54239138 54239393 + 1.66667 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) intron (NM_001354411, intron 8 of 34) -246965 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 384.333-6 chr18 1616491 1617028 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -257130 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 361.001 chr4 79093733 79093984 + 1.66667 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) L1ME1|LINE|L1 122110 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 286.666-16 chr4 65912703 65912970 + 1.66667 NA Intergenic MSTB2-int|LTR|ERVL-MaLR -242341 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 281.334-13 chr8 134749179 134749356 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -36236 NM_001289394 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 127.667-155 chr6 143816278 143816422 + 1.66667 NA intron (NM_001100165, intron 11 of 11) intron (NM_001100165, intron 11 of 11) -26923 NM_001329953 84946 Hs.185675 NM_032860 ENSG00000135521 LTV1 C6orf93|dJ468K18.4 LTV1 ribosome biogenesis factor protein-coding 330.334-3 chr10 67969046 67969366 + 1.66667 NA intron (NM_001278185, intron 15 of 23) L1MCc|LINE|L1 41677 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 243-41 chr3 81032837 81033107 + 1.66667 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) intron (NR_132411, intron 1 of 1) 39104 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 324-16 chr3 5756464 5756854 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -506404 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 252.334-16 chr4 89618364 89618528 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -217955 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 253.667-80 chr8 139192714 139192950 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -278791 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 236.667-6 chr1 118030141 118030310 + 1.66667 NA intron (NM_206996, intron 25 of 48) intron (NM_206996, intron 25 of 48) 100486 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 299.334-6 chr7 70397173 70397441 + 1.66667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) AluSq2|SINE|Alu -734837 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 276-62 chr8 94714785 94715041 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4987 NM_181787 286148 Hs.567828 NM_181787 ENSG00000156162 DPY19L4 - dpy-19 like 4 protein-coding 215.667-5 chr1 169042067 169042292 + 1.66667 NA intron (NR_104091, intron 3 of 4) L1MA4|LINE|L1 44826 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 388.667-13 chr8 109285146 109285467 + 1.66667 NA intron (NM_032869, intron 5 of 9) L1PA16|LINE|L1 44627 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 370-21 chr5 109678201 109678585 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10973 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 253-18 chr12 63185290 63185614 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -32642 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 241.333-81 chr5 20240875 20241193 + 1.66667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -64517 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 252.334-20 chr6 72973421 72973600 + 1.66667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) -5757 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 284.667-12 chr12 43132505 43132675 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22725 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 311-19 chr22 24920544 24920883 + 1.66667 NA intron (NM_001098498, intron 23 of 23) intron (NM_001098498, intron 23 of 23) 25982 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 376.334-7 chr8 63039750 63040093 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1115 NM_003878 8836 Hs.78619 NM_003878 ENSG00000137563 GGH GH gamma-glutamyl hydrolase protein-coding 206-74 chr2 45404038 45404215 + 1.66667 NA intron (NM_018079, intron 19 of 20) L2c|LINE|L2 -149185 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 499.666-4 chr3 94980547 94981080 + 1.66667 NA intron (NR_015400, intron 4 of 7) intron (NR_015400, intron 4 of 7) 42550 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 252-11 chr10 62364760 62364913 + 1.66667 NA intron (NR_104162, intron 1 of 3) L1ME3A|LINE|L1 -9321 NM_199450 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 382.667-8 chr2 41271918 41272353 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -605420 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 206.333-78 chr2 30321062 30321278 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25476 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 262-59 chr3 175929647 175929825 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -153403 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 230.333-15 chr10 68484618 68484903 + 1.66667 NA intron (NM_001324312, intron 8 of 8) intron (NM_001324312, intron 8 of 8) -12639 NR_102264 1763 Hs.532446 NM_001080449 ENSG00000138346 DNA2 DNA2L|hDNA2 DNA replication helicase/nuclease 2 protein-coding 290.667-42 chr7 96567096 96567390 + 1.66667 NA intron (NR_163950, intron 3 of 6) L1M4|LINE|L1 -63720 NR_163948 395.667-11 chr9 35740558 35740945 + 1.66667 NA intron (NM_020944, intron 5 of 16) intron (NM_020944, intron 5 of 16) 7829 NR_106912 102466201 NR_106912 ENSG00000273945 MIR6853 hsa-mir-6853 microRNA 6853 ncRNA 279-17 chr2 106044396 106044649 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21166 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 285.334-14 chrX 116646160 116646355 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 171603 NR_145523 100126447 Hs.695847 NR_145523 LOC100126447 - uncharacterized LOC100126447 ncRNA 245-65 chr7 3925236 3925458 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -204338 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 446-10 chr5 146957080 146957558 + 1.66667 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) MER5B|DNA|hAT-Charlie -37813 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 370.667-18 chr3 168350611 168350872 + 1.66667 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) intron (NR_021485, intron 3 of 15) 101219 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 314.334 chr12 104450714 104450964 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -6109 NM_001173982 50515 Hs.17569 NM_018413 ENSG00000171310 CHST11 C4ST|C4ST-1|C4ST1|HSA269537|OCBMD carbohydrate sulfotransferase 11 protein-coding 252.333-61 chr5 118878539 118878815 + 1.66667 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) L1PA13|LINE|L1 -95909 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 303-30 chr2 62942352 62942703 + 1.66667 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) intron (NM_001142615, intron 10 of 22) 105184 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 176-8 chr1 119535068 119535187 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 27917 NM_000862 3283 Hs.364941 NM_000862 ENSG00000203857 HSD3B1 3BETAHSD|HSD3B|HSDB3|HSDB3A|SDR11E1 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 protein-coding 188.667-5 chr1 71228705 71228858 + 1.66667 NA intron (NR_046217, intron 3 of 3) intron (NR_046217, intron 3 of 3) 147457 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 185.667-135 chr8 126298094 126298297 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27300 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 245.667-74 chr8 93809364 93809563 + 1.66667 NA intron (NR_024522, intron 25 of 28) intron (NR_024522, intron 25 of 28) 54569 NR_024522 91147 Hs.116240 NM_153704 ENSG00000164953 TMEM67 JBTS6|MECKELIN|MKS3|NPHP11|TNEM67 transmembrane protein 67 protein-coding 243.334-10 chr2 28251712 28251981 + 1.66667 NA intron (NM_199193, intron 11 of 13) intron (NM_199193, intron 11 of 13) -44885 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 310.667-32 chr4 78483035 78483336 + 1.66667 NA intron (NM_025074, intron 58 of 73) intron (NM_025074, intron 58 of 73) -68585 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 363-10 chr20 52580026 52580578 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -40536 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 254-24 chr14 91286863 91287092 + 1.66667 NA intron (NM_001080414, intron 25 of 29) MIRb|SINE|MIR -33097 NM_003485 8111 Hs.8882 NM_003485 ENSG00000119714 GPR68 AI2A6|GPR12A|OGR1 G protein-coupled receptor 68 protein-coding 282.001 chr3 20544971 20545164 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 202599 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 305.334-7 chr3 114182785 114183086 + 1.66667 NA intron (NM_001282563, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 -3883 NM_033663 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 130.334 chr14 21205495 21205645 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_038970) promoter-TSS (NR_038970) -67 NR_038970 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 198-154 chr5 52567506 52567704 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -220311 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 318-31 chr20 7420332 7420551 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 48833 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 251-80 chr7 70150337 70150490 + 1.66667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) MER92-int|LTR|ERV1 551938 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 296.334-12 chr7 116359976 116360158 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -73340 NR_130922 102724434 Hs.667624 NR_130921 ENSG00000237870 LOC102724434 - uncharacterized LOC102724434 ncRNA 270.667-34 chr3 197604750 197605028 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 22992 NR_003266 220729 Hs.478854 NR_003266 ENSG00000214135 LOC220729 - succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A pseudogene pseudo 335-23 chr5 11902361 11902707 + 1.66667 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 1912 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 273.334-15 chr7 42316550 42316819 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -79475 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 306.666-14 chr18 1896530 1896938 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -537105 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 208-37 chr12 42262121 42262322 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23853 NM_001190979 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 288.666-19 chr2 180315108 180315387 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -307950 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 241-30 chr2 24217767 24217997 + 1.66667 NA intron (NM_001348182, intron 30 of 38) intron (NM_001348182, intron 30 of 38) 42829 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 296-59 chr6 121716886 121717298 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 281446 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 270-48 chr5 31938418 31938593 + 1.66667 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) intron (NM_178140, intron 2 of 24) -2346 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 436.334 chr1 33504481 33504937 + 1.66667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 32064 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 243.333-49 chr2 23264598 23264754 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -120503 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 278-22 chr20 6626210 6626427 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 109818 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 286-8 chr12 27713798 27714029 + 1.66667 NA intron (NM_021821, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 3081 NM_021821 60488 Hs.714076 NM_021821 ENSG00000061794 MRPS35 HDCMD11P|MDS023|MRP-S28|MRPS28 mitochondrial ribosomal protein S35 protein-coding 246.333-40 chr16 80976411 80976630 + 1.66667 NA intron (NR_147843, intron 1 of 1) intron (NR_147843, intron 1 of 1) 21156 NM_001351973 56942 Hs.55028 NM_020188 ENSG00000103121 CMC2 2310061C15Rik|C16orf61|DC13 C-X9-C motif containing 2 protein-coding 274.667-5 chr1 182884975 182885266 + 1.66667 NA intron (NM_001357, intron 27 of 27) intron (NM_001357, intron 27 of 27) -45529 NR_148933 647070 Hs.191518 NR_148933 LOC647070 - uncharacterized LOC647070 ncRNA 271.667-35 chr18 2445365 2445633 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 126006 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 277-11 chr14 57070403 57070688 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 198360 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 262.333-12 chr10 55417973 55418181 + 1.66667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -180965 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 257.333-3 chr1 42479798 42480079 + 1.66667 NA intron (NM_001355224, intron 2 of 22) LTR53B|LTR|ERVL 16652 NM_001355227 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 357-22 chr8 115924404 115924743 + 1.66667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -255598 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 332-7 chr12 40361381 40361794 + 1.66667 NA intron (NM_198578, intron 47 of 50) intron (NM_198578, intron 47 of 50) -31807 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 194-110 chr5 111622060 111622219 + 1.66667 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) intron (NR_040093, intron 1 of 6) -109542 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 246.333-4 chr1 114273595 114273786 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -119821 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 185-27 chr17 58800078 58800303 + 1.66667 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1ME2z|LINE|L1 44321 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 368-8 chr14 40107633 40108188 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -675410 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 342-31 chr5 118866894 118867414 + 1.66667 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) intron (NM_001308081, intron 4 of 5) -107432 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 297.667-2 chr1 186949812 186950183 + 1.66667 NA intron (NM_024420, intron 12 of 17) AluJb|SINE|Alu 121048 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 192.333-37 chr11 134479906 134480168 + 1.66667 NA intron (NR_033852, intron 3 of 5) intron (NR_033852, intron 3 of 5) 43555 NR_033852 283177 Hs.504390 NR_033852 LOC283177 - uncharacterized LOC283177 ncRNA 295-17 chr15 87801630 87801938 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 144484 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 274.667-37 chr3 126833469 126833634 + 1.66667 NA intron (NM_032343, intron 4 of 7) MIRc|SINE|MIR 129311 NM_001320610 84303 Hs.518119 NM_032343 ENSG00000159685 CHCHD6 CHCM1|MICOS25|Mic25|PPP1R23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 protein-coding 376.333-10 chr3 118577418 118577749 + 1.66667 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) intron (NR_135547, intron 2 of 3) -64185 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 249.667-29 chr15 59616932 59617123 + 1.66667 NA intron (NM_004751, intron 2 of 2) intron (NM_004751, intron 2 of 2) 5244 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 244-85 chr5 54686489 54686710 + 1.66667 NA intron (NR_104658, intron 1 of 2) L1PA4|LINE|L1 16725 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 215.333-215 chr9 104146843 104147071 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 52330 NM_001042550 10592 Hs.119023 NM_006444 ENSG00000136824 SMC2 CAP-E|CAPE|SMC-2|SMC2L1 structural maintenance of chromosomes 2 protein-coding 368.667 chr10 83063913 83064190 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 613038 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 273.667-33 chr2 137042627 137042807 + 1.66667 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) intron (NM_001316349, intron 2 of 27) 277172 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 238-96 chr7 36863571 36863776 + 1.66667 NA intron (NM_001206480, intron 20 of 21) L1ME4c|LINE|L1 55759 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 306.667-39 chr7 37241894 37242243 + 1.66667 NA intron (NM_001206480, intron 7 of 21) L1MEf|LINE|L1 111600 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 282.667-7 chr11 87070487 87070816 + 1.66667 NA intron (NR_033149, intron 2 of 13) AluSx3|SINE|Alu 32717 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 253-56 chr5 115545908 115546097 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1227 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 244.667-85 chr6 72375278 72375437 + 1.66667 NA intron (NM_001168411, intron 1 of 5) LTR101_Mam|LTR|ERVL 8611 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 405.334 chr1 99016232 99016535 + 1.66667 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 -11522 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 255.667-12 chr11 21426279 21426513 + 1.66667 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) L2c|LINE|L2 756810 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 400.667-6 chr5 22958459 22958819 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -105295 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 257-67 chr7 74163374 74163578 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10880 NM_022170 7458 Hs.520943 NM_022170 ENSG00000106682 EIF4H WBSCR1|WSCR1|eIF-4H eukaryotic translation initiation factor 4H protein-coding 434.667-6 chr5 133392326 133392766 + 1.66667 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) intron (NM_015082, intron 4 of 15) 35160 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 285-14 chr19 5389042 5389301 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48359 NM_130853 5802 Hs.744928 NM_002850 ENSG00000105426 PTPRS PTPSIGMA|R-PTP-S|R-PTP-sigma protein tyrosine phosphatase receptor type S protein-coding 317.667-16 chr16 84784765 84785114 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35046 NM_031476 83716 Hs.513779 NM_031476 ENSG00000103196 CRISPLD2 CRISP11|LCRISP2|LGL1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 protein-coding 320-14 chr14 43040653 43040985 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1433963 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 291.001 chr4 52779825 52780029 + 1.66667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -10067 NR_040106 152578 Hs.383806 NR_040106 ENSG00000250302 LINC01618 - long intergenic non-protein coding RNA 1618 ncRNA 358.667-8 chr12 77905375 77905672 + 1.66667 NA intron (NM_001024383, intron 1 of 39) intron (NM_001024383, intron 1 of 39) 74629 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 342-28 chr5 30462467 30462766 + 1.66667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 582056 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 267.334-19 chr7 8696306 8696493 + 1.66667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 262790 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 410.334-4 chr7 8603254 8603534 + 1.66667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 169785 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 328.333-22 chr2 107998641 107998968 + 1.66667 NA intron (NM_001305007, intron 5 of 8) intron (NM_001305007, intron 5 of 8) 12280 NM_001305005 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 283.333-66 chr6 64484536 64484782 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 677823 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 245.667-67 chr7 95998911 95999067 + 1.66667 NA intron (NM_004411, intron 10 of 16) intron (NM_004411, intron 10 of 16) 220767 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 386.334-3 chr8 126809629 126809943 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -203368 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 436.667-7 chr2 27563968 27564291 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -12393 NM_032266 84226 Hs.131021 NM_032266 ENSG00000221843 C2orf16 - chromosome 2 open reading frame 16 protein-coding 275.667-23 chr16 88600642 88600958 + 1.66667 NA intron (NM_001294340, intron 7 of 18) intron (NM_001294340, intron 7 of 18) 30397 NM_144604 124245 Hs.93670 NM_144604 ENSG00000158545 ZC3H18 NHN1 zinc finger CCCH-type containing 18 protein-coding 192-155 chr9 109969096 109969273 + 1.66667 NA intron (NM_147150, intron 6 of 9) L2b|LINE|L2 -79414 NM_001198656 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 248.334-12 chr3 85950207 85950378 + 1.66667 NA intron (NM_001256502, intron 7 of 10) intron (NM_001256502, intron 7 of 10) -122242 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 243.667-72 chr7 153676326 153676481 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -71730 NM_001364499 1804 Hs.490684 NM_001936 ENSG00000130226 DPP6 DPL1|DPPX|MRD33|VF2 dipeptidyl peptidase like 6 protein-coding 284-35 chr3 104406404 104406704 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -882438 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 447-7 chr7 40099813 40100229 + 1.66667 NA TTS (NM_003718) TTS (NM_003718) 34601 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 215.667-77 chr22 28251244 28251454 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) MER58A|DNA|hAT-Charlie -208520 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 352.667-16 chr2 12439113 12439448 + 1.66667 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 240150 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 258.667-43 chr2 37976195 37976411 + 1.66667 NA intron (NM_001170793, intron 3 of 9) intron (NM_001170793, intron 3 of 9) 25839 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 322-25 chr21 30632370 30632865 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -2589 NM_181616 337976 Hs.553698 NM_181616 ENSG00000184032 KRTAP20-2 KAP20.2 keratin associated protein 20-2 protein-coding 257.334-17 chr9 20674302 20674456 + 1.66667 NA intron (NM_017794, intron 2 of 45) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 10371 NR_121601 101929548 Hs.668302 NR_121601 ENSG00000227071 FOCAD-AS1 - FOCAD antisense RNA 1 ncRNA 263.667-66 chr5 140291826 140292058 + 1.66667 NA intron (NM_002622, intron 2 of 3) intron (NM_002622, intron 2 of 3) 11159 NM_002622 5201 Hs.483564 NM_002622 ENSG00000113068 PFDN1 PDF|PFD1 prefoldin subunit 1 protein-coding 494-4 chr22 39514573 39515090 + 1.66667 NA TTS (NR_130790) TTS (NR_130790) -5728 NM_001675 468 Hs.496487 NM_001675 ENSG00000128272 ATF4 CREB-2|CREB2|TAXREB67|TXREB activating transcription factor 4 protein-coding 259.334-5 chr11 95756382 95756577 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 33303 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 277.001-2 chr2 238071511 238071686 + 1.66667 NA intron (NM_016510, intron 4 of 11) AluSx1|SINE|Alu 10597 NM_016510 51540 Hs.731909 NM_016510 ENSG00000132330 SCLY SCL|hSCL selenocysteine lyase protein-coding 231.667-37 chr2 236122413 236122584 + 1.66667 NA intron (NM_001037131, intron 17 of 17) intron (NM_001037131, intron 17 of 17) 45888 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 343.333-8 chr12 3385594 3385961 + 1.66667 NA intron (NM_001256536, intron 1 of 9) intron (NM_001256536, intron 1 of 9) 4428 NM_001256536 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 247.667-31 chr14 71077009 71077187 + 1.66667 NA intron (NM_014982, intron 28 of 35) MER5A|DNA|hAT-Charlie 169639 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 277.333-58 chr21 21170952 21171252 + 1.66667 NA intron (NM_001352597, intron 1 of 10) intron (NM_001352597, intron 1 of 10) 23940 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 221.667-48 chr22 25373277 25373470 + 1.66667 NA intron (NM_001135772, intron 2 of 5) intron (NM_001135772, intron 2 of 5) 8204 NM_001135772 91355 Hs.634058 NM_182492 ENSG00000100068 LRP5L - LDL receptor related protein 5 like protein-coding 396 chr1 85745515 85745875 + 1.66667 NA intron (NR_146345, intron 55 of 59) intron (NR_146345, intron 55 of 59) -37262 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 372.667-12 chr3 328232 328503 + 1.66667 NA intron (NM_001253388, intron 3 of 24) intron (NM_001253388, intron 3 of 24) 8684 NM_001253388 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 239.334-5 chr18 35229211 35229404 + 1.66667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -11727 NM_032347 84307 Hs.591061 NM_032347 ENSG00000186812 ZNF397 ZNF47|ZSCAN15 zinc finger protein 397 protein-coding 231.334-7 chr5 50713415 50713607 + 1.66667 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) AluJb|SINE|Alu 46097 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 242.667-82 chr5 28304705 28304888 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17131 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 314-30 chr3 100158813 100159209 + 1.66667 NA intron (NM_001167924, intron 2 of 9) LFSINE_Vert|SINE|tRNA -26813 NR_028357 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 430.667 chr1 217829861 217830400 + 1.66667 NA intron (NM_138796, intron 9 of 10) intron (NM_138796, intron 9 of 10) -45010 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 249.333-104 chr9 28165583 28165835 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 553596 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 192-41 chr12 9039571 9039756 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 25407 NR_034140 253128 Hs.408739 NM_001039381 ENSG00000214851 LINC00612 C12orf33 long intergenic non-protein coding RNA 612 ncRNA 252.334-11 chr21 16726315 16726507 + 1.66667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 136174 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 296.333-22 chr2 164494480 164494789 + 1.66667 NA intron (NM_004490, intron 12 of 13) intron (NM_004490, intron 12 of 13) 73861 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 251-43 chr3 11273394 11273679 + 1.66667 NA intron (NM_001136031, intron 1 of 17) intron (NM_001136031, intron 1 of 17) 1139 NM_001349237 10533 Hs.38032 NM_006395 ENSG00000197548 ATG7 APG7-LIKE|APG7L|GSA7 autophagy related 7 protein-coding 274.667-24 chr17 15339526 15339839 + 1.66667 NA intron (NM_031898, intron 2 of 8) intron (NM_031898, intron 2 of 8) 1915 NM_031898 64518 Hs.414648 NM_031898 ENSG00000125409 TEKT3 - tektin 3 protein-coding 455.666-3 chr16 61194445 61194772 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -138842 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 164.334-2 chr6 70396695 70396843 + 1.66667 NA intron (NR_125857, intron 3 of 3) intron (NR_125857, intron 3 of 3) 2567 NR_125857 101928353 NR_125857 EVADR - uncharacterized LOC101928353 ncRNA 383.666-4 chr14 71385073 71385577 + 1.66667 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -13012 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 358-26 chr9 30582420 30582780 + 1.66667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -174146 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 225.666-10 chr17 60241532 60241806 + 1.66667 NA intron (NM_032582, intron 11 of 33) L1M4a2|LINE|L1 -10024 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 389.667-3 chr10 60423219 60423769 + 1.66667 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -33619 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 266.667-49 chr3 111812767 111813004 + 1.66667 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) -46295 NM_145753 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 272.334-15 chr7 46787932 46788097 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -90892 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 174.667-172 chr8 90014502 90014642 + 1.66667 NA intron (NM_001330575, intron 3 of 11) intron (NM_001330575, intron 3 of 11) 13095 NM_001359 1666 Hs.492212 NM_001359 ENSG00000104325 DECR1 DECR|NADPH|SDR18C1 2,4-dienoyl-CoA reductase 1 protein-coding 263.334-12 chr5 32927645 32927810 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -19716 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 293.666-10 chr5 84488519 84488728 + 1.66667 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -103743 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 276-56 chr5 173613295 173613470 + 1.66667 NA intron (NM_138369, intron 1 of 3) intron (NM_138369, intron 1 of 3) 3268 NM_138369 91272 Hs.425091 NM_138369 ENSG00000145919 BOD1 FAM44B biorientation of chromosomes in cell division 1 protein-coding 250-17 chr11 42130602 42130851 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -45268 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 415.667-7 chr5 77311269 77311747 + 1.66667 NA intron (NM_001349749, intron 2 of 22) intron (NM_001349749, intron 2 of 22) 100828 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 258.333-6 chr10 50524102 50524271 + 1.66667 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) intron (NM_147156, intron 2 of 10) 99770 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 246.333-101 chr8 131287248 131287534 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -246482 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 273.999 chr12 52467033 52467350 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6614 NM_173086 286887 Hs.709234 NM_173086 ENSG00000170465 KRT6C K6E|KRT6E|PPKNEFD keratin 6C protein-coding 256-74 chr5 15203403 15203595 + 1.66667 NA intron (NR_109944, intron 2 of 2) LTR16C|LTR|ERVL 63061 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 432.667-3 chr12 52196501 52197180 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -4826 NM_182507 144501 Hs.140978 NM_182507 ENSG00000167767 KRT80 KB20 keratin 80 protein-coding 338.334-7 chr7 47184972 47185261 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 279687 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 299.667-20 chr2 168709100 168709331 + 1.66667 NA intron (NM_001256126, intron 6 of 10) intron (NM_001256126, intron 6 of 10) 77214 NR_045786 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 286-44 chr4 82526485 82526683 + 1.66667 NA intron (NM_001353454, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 35404 NM_001353455 441027 Hs.507676 NM_001080506 ENSG00000249242 TMEM150C TTN3 transmembrane protein 150C protein-coding 606.667 chr3 64043514 64044105 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19799 NM_001271780 9861 Hs.152536 NM_014814 ENSG00000163636 PSMD6 Rpn7|S10|SGA-113M|p42A|p44S10 proteasome 26S subunit, non-ATPase 6 protein-coding 286.667-33 chr5 126709537 126709773 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 66831 NR_134485 102723557 Hs.582207 NR_134485 ENSG00000251072 LMNB1-DT - LMNB1 divergent transcript ncRNA 307.667-2 chr1 53058099 53058355 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3825 NM_001199081 127435 Hs.586141 NM_153703 ENSG00000174348 PODN PCAN|SLRR5A podocan protein-coding 278-32 chr3 77959734 77959963 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 89115 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 263.333-34 chr17 80693863 80694150 + 1.66667 NA intron (NM_020761, intron 3 of 33) intron (NM_020761, intron 3 of 33) 111626 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 361.667-12 chr20 4650733 4651089 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -35545 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 261-14 chr11 61463508 61463703 + 1.66667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -17515 NM_001170753 220004 Hs.729003 NM_145017 ENSG00000162148 PPP1R32 C11orf66|IIIG9 protein phosphatase 1 regulatory subunit 32 protein-coding 295-22 chr17 52437041 52437311 + 1.66667 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) intron (NR_146898, intron 1 of 3) 46654 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 424.334 chr10 113364009 113364469 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -186592 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 291-34 chr4 141793508 141793901 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 157121 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 353.334-4 chr15 38496242 38496632 + 1.66667 NA intron (NM_001128602, intron 14 of 15) intron (NM_001128602, intron 14 of 15) 42310 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 222-88 chr7 42501677 42501853 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 204682 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 137-80 chr5 57450965 57451058 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 31800 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 279.333-31 chr14 67321258 67321515 + 1.66667 NA intron (NM_001256550, intron 13 of 14) intron (NM_001256550, intron 13 of 14) 38418 NM_015994 51382 Hs.272630 NM_015994 ENSG00000100554 ATP6V1D ATP6M|VATD|VMA8 ATPase H+ transporting V1 subunit D protein-coding 239.333-110 chr9 13074989 13075251 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -102487 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 334.667-5 chr10 43901057 43901407 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8064 NR_033846 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 336-4 chr10 23135552 23135914 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 40154 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 314-9 chr12 119423493 119423909 + 1.66667 NA intron (NM_178499, intron 1 of 13) LTR33A|LTR|ERVL 88972 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 271.667-83 chrX 39024498 39024717 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -220724 NR_046706 100874211 Hs.662789 NR_046706 MID1IP1-AS1 - MID1IP1 antisense RNA 1 ncRNA 259.334-19 chr7 107200752 107201011 + 1.66667 NA TTS (NM_006348) TTS (NM_006348) 31878 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 237.667-86 chrX 82287356 82287574 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 1085363 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 266.334-16 chr22 20932617 20932877 + 1.66667 NA intron (NR_156180, intron 1 of 3) intron (NR_156180, intron 1 of 3) 15340 NR_156180 1399 Hs.5613 NM_005207 ENSG00000099942 CRKL - CRK like proto-oncogene, adaptor protein protein-coding 233-27 chr14 71049907 71050137 + 1.66667 NA intron (NM_014982, intron 22 of 35) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 142563 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 263-68 chr9 17487717 17487954 + 1.66667 NA intron (NM_001365029, intron 25 of 25) intron (NM_001365029, intron 25 of 25) -91231 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 270-49 chr5 34706544 34706808 + 1.66667 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) intron (NM_001145525, intron 4 of 19) 19117 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 117.333-195 chr7 79871880 79872027 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -262878 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 309.333-58 chr7 92779405 92779730 + 1.66667 NA intron (NM_001259, intron 2 of 7) intron (NM_001259, intron 2 of 7) 54392 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 244.667-83 chr6 35115481 35115635 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 25781 NM_001366324 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 332.333-2 chr1 73080782 73081085 + 1.66667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -225237 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 314.333-16 chr3 95873058 95873478 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -190075 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 318-27 chr2 81912770 81913003 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -445940 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 258-35 chr2 100912986 100913275 + 1.66667 NA intron (NM_002518, intron 2 of 20) intron (NM_002518, intron 2 of 20) 64031 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 247.667-39 chr16 64132948 64133250 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 988964 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 247.333-46 chr2 204599205 204599618 + 1.66667 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) L1MA5A|LINE|L1 53936 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 282.334-16 chr6 54125614 54125848 + 1.66667 NA intron (NM_138569, intron 3 of 12) intron (NM_138569, intron 3 of 12) 14288 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 205.333-131 chr2 183894240 183894499 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -484606 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 244.334-10 chr14 38570299 38570496 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -312199 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 227 chr1 43687109 43687259 + 1.66667 NA intron (NM_014663, intron 12 of 21) intron (NM_014663, intron 12 of 21) 20157 NR_033827 100132774 Hs.655569 NR_033827 KDM4A-AS1 - KDM4A antisense RNA 1 ncRNA 257.666-22 chr7 52073293 52073569 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -680175 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 252-54 chr2 208462723 208462994 + 1.66667 NA intron (NM_005048, intron 9 of 12) intron (NM_005048, intron 9 of 12) 56028 NM_005048 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 292.667-32 chr5 59859136 59859353 + 1.66667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 34482 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 264-50 chr8 7063926 7064128 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7288 NM_021010 1670 Hs.655233 NM_021010 ENSG00000164816 DEFA5 DEF5|HD-5 defensin alpha 5 protein-coding 405.667-5 chr4 26459284 26459724 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 30980 NM_000730 886 Hs.129 NM_000730 ENSG00000163394 CCKAR CCK-A|CCK1-R|CCK1R|CCKRA cholecystokinin A receptor protein-coding 321-13 chr2 45142290 45142645 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 112474 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 392.667-4 chr17 83157558 83157900 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -69168 NR_029406 388574 Hs.546918 NR_029406 ENSG00000232938 RPL23AP87 - ribosomal protein L23a pseudogene 87 pseudo 453.667-2 chr8 130542046 130542449 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -98573 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 212-111 chr3 186912404 186912641 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -18004 NM_173216 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 313.666-10 chr5 125884258 125884557 + 1.66667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -295170 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 206.333-178 chrX 82986791 82986933 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -521428 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 251.667-31 chr18 76794429 76794680 + 1.66667 NA TTS (NR_040024) TTS (NR_040024) 27741 NR_040024 100131655 Hs.385806 NR_040024 ENSG00000264278 ZNF236-DT - ZNF236 divergent transcript ncRNA 356.667-20 chr8 115541025 115541397 + 1.66667 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 126802 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 327.334-7 chr22 33042065 33042387 + 1.66667 NA intron (NM_003490, intron 1 of 13) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 10318 NM_001369908 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 207.667-115 chr7 89768993 89769402 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -350203 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 211.334-8 chr7 36730713 36730910 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -6262 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 426.666-2 chr10 27653104 27653515 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -91306 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 504.666-5 chr4 68611843 68612198 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -43493 NM_001077 7367 Hs.575083 NM_001077 ENSG00000197888 UGT2B17 BMND12|UDPGT2B17 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B17 protein-coding 325-24 chr4 67263220 67263569 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 158606 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 243-8 chr1 153508380 153508603 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 27500 NM_014624 6277 Hs.275243 NM_014624 ENSG00000197956 S100A6 2A9|5B10|CABP|CACY|PRA|S10A6 S100 calcium binding protein A6 protein-coding 253.333-44 chr17 66783510 66783755 + 1.66667 NA intron (NM_002737, intron 14 of 16) intron (NM_002737, intron 14 of 16) -3440 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 295.333-55 chr7 52673737 52674108 + 1.66667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -361711 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 217-31 chr17 58099222 58099410 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 15897 NM_080677 140735 Hs.720595 NM_080677 ENSG00000264364 DYNLL2 DNCL1B|Dlc2|RSPH22 dynein light chain LC8-type 2 protein-coding 322.334-4 chr2 113738658 113739008 + 1.66667 NA intron (NM_001330315, intron 7 of 16) MER33|DNA|hAT-Charlie -17465 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 270.667-51 chr8 47144030 47144234 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -45175 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 194-70 chr2 39030024 39030242 + 1.66667 NA intron (NM_005633, intron 8 of 22) AluJr4|SINE|Alu -69789 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 199.334-4 chr5 84434732 84434940 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -49956 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 483.001-2 chr4 13586908 13587310 + 1.66667 NA intron (NM_148894, intron 16 of 25) MER3|DNA|hAT-Charlie -39285 NR_015450 285548 Hs.529284 NR_015450 LINC01096 - long intergenic non-protein coding RNA 1096 ncRNA 309-38 chr9 6217337 6217693 + 1.66667 NA intron (NM_001199640, intron 1 of 6) LTR8A|LTR|ERV1 1708 NM_001199640 90865 Hs.731660 NM_033439 ENSG00000137033 IL33 C9orf26|DVS27|IL1F11|NF-HEV|NFEHEV interleukin 33 protein-coding 228-75 chr6 131685546 131685740 + 1.66667 NA intron (NR_133007, intron 13 of 23) intron (NR_133007, intron 13 of 23) 15758 NM_030908 79541 Hs.486488 NM_030908 ENSG00000180658 OR2A4 OR2A10 olfactory receptor family 2 subfamily A member 4 protein-coding 243.667-30 chr18 46809797 46810021 + 1.66667 NA non-coding (NR_148702, exon 13 of 13) non-coding (NR_148702, exon 13 of 13) -52856 NM_001307987 29906 Hs.465025 NM_013305 ENSG00000101638 ST8SIA5 SIAT8-E|SIAT8E|ST8SiaV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 protein-coding 422.333-10 chr7 107777594 107778120 + 1.66667 NA intron (NM_000111, intron 13 of 20) intron (NM_000111, intron 13 of 20) 25376 NM_000111 1811 Hs.1650 NM_000111 ENSG00000091138 SLC26A3 CLD|DRA solute carrier family 26 member 3 protein-coding 385-3 chr14 51458628 51458916 + 1.66667 NA intron (NR_051990, intron 2 of 2) intron (NR_051990, intron 2 of 2) -30356 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 229.333-82 chr3 145100322 145100582 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 968733 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 411-3 chr11 96373033 96373357 + 1.66667 NA intron (NM_024725, intron 6 of 9) intron (NM_024725, intron 6 of 9) 16621 NM_001363594 79780 Hs.525088 NM_014148 ENSG00000149231 CCDC82 HSPC048 coiled-coil domain containing 82 protein-coding 339.333-42 chr6 62691489 62691868 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -405451 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 245-74 chr8 91411237 91411471 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 162035 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 258.667-88 chr6 150415412 150415592 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46490 NR_134655 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 430.334-2 chr12 27402994 27403346 + 1.66667 NA intron (NM_001248003, intron 11 of 14) intron (NM_001248003, intron 11 of 14) 43464 NR_109975 101928646 Hs.434269 NR_109975 ENSG00000245311 ARNTL2-AS1 - ARNTL2 antisense RNA 1 ncRNA 242.334-6 chr15 59074179 59074352 + 1.66667 NA intron (NM_001270529, intron 6 of 13) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -30881 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 231.333-14 chr10 9864002 9864242 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -194600 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 253-62 chr7 24461180 24461465 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -112130 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 394.334-7 chr6 67430456 67430899 + 1.66667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -624674 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 266-52 chr3 17426233 17426658 + 1.66667 NA intron (NM_001349091, intron 2 of 19) intron (NM_001349091, intron 2 of 19) 273575 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 249-23 chr14 56563249 56563410 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16469 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 342.333-21 chr3 115863948 115864276 + 1.66667 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) 41014 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 297-28 chr18 5680052 5680427 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -51248 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 252.334-25 chr9 5756170 5756386 + 1.66667 NA exon (NM_020829, exon 16 of 26) exon (NM_020829, exon 16 of 26) 76839 NM_024896 79956 Hs.591078 NM_024896 ENSG00000099219 ERMP1 FXNA|KIAA1815|bA207C16.3 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 protein-coding 424.667-4 chr17 65483150 65483431 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 25749 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 215.666-25 chr22 28308246 28308439 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -151527 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 259.333-54 chr2 162938892 162939195 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -100276 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 304-45 chr4 94164816 94165068 + 1.66667 NA intron (NR_125922, intron 3 of 8) MIR|SINE|MIR 42614 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 273.334-7 chr2 122211141 122211371 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 455605 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 387-11 chr3 31441096 31441600 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -91577 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 276-66 chr9 36885585 36885884 + 1.66667 NA intron (NR_103999, intron 6 of 8) MIRb|SINE|MIR 7797 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 242-54 chr4 110928585 110928790 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -68040 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 257.666-9 chr17 69566570 69566852 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27276 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 234-60 chr5 154290347 154290530 + 1.66667 NA intron (NM_198321, intron 1 of 11) intron (NM_198321, intron 1 of 11) -56668 NR_031626 100302181 NR_031626 ENSG00000221430 MIR1294 MIRN1294|hsa-mir-1294|mir-1294 microRNA 1294 ncRNA 130.334-2 chr14 27570250 27570342 + 1.66667 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -42292 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 292.334-10 chr6 110097209 110097414 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 82359 NM_003931 8936 Hs.75850 NM_003931 ENSG00000112290 WASF1 SCAR1|WAVE|WAVE1 WASP family member 1 protein-coding 528.333-3 chr6 152766519 152767120 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 16022 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 218-8 chr1 225531781 225531948 + 1.66667 NA intron (NM_001008493, intron 3 of 14) intron (NM_001008493, intron 3 of 14) -103009 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 251.334-23 chr5 13793317 13793474 + 1.66667 NA intron (NM_001369, intron 49 of 78) intron (NM_001369, intron 49 of 78) 151085 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 297.333-22 chr14 78151080 78151377 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19145 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 231.333-123 chr8 140467620 140467870 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9166 NM_031466 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 269-11 chr10 105179061 105179279 + 1.66667 NA intron (NM_014978, intron 14 of 26) intron (NM_014978, intron 14 of 26) -512954 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 380.334 chr7 43744520 43744792 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -14017 NM_001253823 644 Hs.488143 NM_000712 ENSG00000106605 BLVRA BLVR|BVR|BVRA biliverdin reductase A protein-coding 254.334-6 chr12 55851120 55851321 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8284 NM_001272101 4327 Hs.591033 NM_002429 ENSG00000123342 MMP19 CODA|MMP18|RASI-1 matrix metallopeptidase 19 protein-coding 152-149 chr7 98993494 98993685 + 1.66667 NA intron (NM_003496, intron 63 of 70) intron (NM_003496, intron 63 of 70) -19576 NR_110102 101927550 Hs.636663 NR_110102 LOC101927550 - uncharacterized LOC101927550 ncRNA 258-87 chr8 122422591 122422824 + 1.66667 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 145937 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 226.334-7 chr3 97182607 97182961 + 1.66667 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) -256823 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 205.333-150 chr3 52985271 52985483 + 1.66667 NA intron (NM_016329, intron 1 of 20) intron (NM_016329, intron 1 of 20) 60696 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 255-84 chr8 66246532 66246751 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 54527 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 267.666-14 chr3 180716089 180716446 + 1.66667 NA intron (NR_109986, intron 11 of 13) intron (NR_109986, intron 11 of 13) -36778 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 294-29 chr18 12987090 12987379 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001013437, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001013437, exon 9 of 9) -4128 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 248.333-79 chr5 40360299 40360525 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 308121 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 305.333-25 chr15 66951516 66951957 + 1.66667 NA intron (NR_135687, intron 1 of 2) L1MA5|LINE|L1 4779 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 265.333-95 chrX 94786806 94787121 + 1.66667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 276263 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 230-71 chr8 53165579 53165780 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 85958 NM_001318497 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 222-81 chr6 70685863 70686103 + 1.66667 NA intron (NM_001281440, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu 17453 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 377.334-2 chr2 11323125 11323447 + 1.66667 NA intron (NM_001321643, intron 1 of 32) MIRc|SINE|MIR 21350 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 326-49 chr8 133226877 133227230 + 1.66667 NA intron (NM_003882, intron 4 of 4) intron (NM_003882, intron 4 of 4) 36014 NM_001204870 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 249-35 chr17 62403015 62403284 + 1.66667 NA intron (NM_001144933, intron 8 of 11) intron (NM_001144933, intron 8 of 11) -20736 NM_181725 339175 Hs.381204 NM_181725 ENSG00000087995 METTL2A METTL2 methyltransferase like 2A protein-coding 235.667-62 chr8 101565416 101565566 + 1.66667 NA intron (NM_024915, intron 4 of 15) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 73052 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 166.667-90 chr17 63207872 63208063 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) L1ME3E|LINE|L1 232300 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 365.334-4 chr3 95170189 95170436 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 232049 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 334.334-13 chr9 107762879 107763237 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -273289 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 400.667-15 chrX 66302772 66303179 + 1.66667 NA Intergenic MER66D|LTR|ERV1 135225 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 217.334 chr2 229458240 229458404 + 1.66667 NA intron (NM_139072, intron 7 of 12) L1MEf|LINE|L1 -187035 NM_017933 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 405.001-2 chr3 188491089 188491478 + 1.66667 NA intron (NM_001167672, intron 3 of 9) intron (NM_001167672, intron 3 of 9) 77383 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 332.667-3 chr1 71565427 71565796 + 1.66667 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) intron (NM_173808, intron 6 of 6) 271401 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 384-9 chr19 40317974 40318372 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 30224 NM_001256441 126526 Hs.631557 NM_178830 ENSG00000160392 C19orf47 - chromosome 19 open reading frame 47 protein-coding 247.334 chr1 172886252 172886427 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 164624 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 252.667-77 chr4 175956580 175956745 + 1.66667 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) intron (NR_048571, intron 1 of 5) 46029 NM_005277 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 577.667 chr12 107780738 107781223 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6595 NM_203436 121549 Hs.149910 NM_203436 ENSG00000187855 ASCL4 HASH4|bHLHa44 achaete-scute family bHLH transcription factor 4 protein-coding 256.333-28 chr14 68552964 68553263 + 1.66667 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) L1ME4a|LINE|L1 75674 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 255-73 chr6 129724359 129724551 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -14278 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 281.667-34 chr3 121013468 121013806 + 1.66667 NA intron (NR_145517, intron 3 of 8) L1PA17|LINE|L1 -36003 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 258-69 chr5 157606717 157606932 + 1.66667 NA Intergenic LTR24B|LTR|ERV1 -31049 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 400.334-2 chr16 75490054 75490316 + 1.66667 NA intron (NR_163481, intron 1 of 2) AluSq10|SINE|Alu 5256 NR_163480 4166 Hs.655622 NM_021615 ENSG00000183196 CHST6 C-GlcNAc6ST|GST4-beta|MCDC1|glcNAc6ST-5|gn6st-5|hCGn6ST carbohydrate sulfotransferase 6 protein-coding 244.667-94 chr8 52263978 52264181 + 1.66667 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) AluSz|SINE|Alu -9587 NM_001352849 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 227.334-4 chr14 68866920 68867061 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70747 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 301.667 chr1 64216508 64217026 + 1.66667 NA intron (NR_158768, intron 6 of 9) intron (NR_158768, intron 6 of 9) 13144 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 457.667-6 chr9 135869311 135869714 + 1.66667 NA intron (NM_015447, intron 3 of 16) AluSz|SINE|Alu 38034 NM_015447 157922 Hs.522493 NM_015447 ENSG00000130559 CAMSAP1 - calmodulin regulated spectrin associated protein 1 protein-coding 261.334-8 chr18 318681 318856 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_130386, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_130386, exon 10 of 10) -50721 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 199.667-39 chr14 22246258 22246428 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 186410 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 251.667-98 chr8 89941191 89941479 + 1.66667 NA intron (NM_001024688, intron 15 of 16) L1M7|LINE|L1 38765 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 206.667-20 chr10 122766007 122766163 + 1.66667 NA intron (NR_003570, intron 6 of 27) MIRb|SINE|MIR 9391 NR_003570 375940 Hs.650695 NM_198577 ENSG00000176584 DMBT1P1 - deleted in malignant brain tumors 1 pseudogene 1 pseudo 452.334 chr1 50955227 50955637 + 1.66667 NA intron (NM_007051, intron 1 of 18) intron (NM_007051, intron 1 of 18) 4835 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 349-7 chr15 76273530 76273766 + 1.66667 NA intron (NM_000126, intron 9 of 11) intron (NM_000126, intron 9 of 11) -13496 NR_028510 7302 Hs.684881 NR_002721 TYRO3P - TYRO3P protein tyrosine kinase pseudogene pseudo 377.667-5 chr14 32561037 32561560 + 1.66667 NA intron (NM_004274, intron 4 of 13) intron (NM_004274, intron 4 of 13) 232000 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 225-19 chr13 40965814 40966099 + 1.66667 NA intron (NM_001370329, intron 2 of 9) MER5B|DNA|hAT-Charlie 16326 NM_001145353 1997 Hs.135646 NM_172373 ENSG00000120690 ELF1 EFTUD1|RIA1 E74 like ETS transcription factor 1 protein-coding 242.333-77 chr4 99451358 99451530 + 1.66667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -15934 NM_000673 131 Hs.389 NM_000673 ENSG00000196344 ADH7 ADH4 alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide protein-coding 345.667-20 chr6 27707194 27707563 + 1.66667 NA non-coding (NR_038294, exon 3 of 4) non-coding (NR_038294, exon 3 of 4) 13299 NR_038292 100507173 Hs.635987 NR_038292 ENSG00000281706 LINC01012 - long intergenic non-protein coding RNA 1012 ncRNA 251.334-12 chr12 65898107 65898294 + 1.66667 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -15875 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 142-16 chr10 31485555 31485716 + 1.66667 NA intron (NM_001323678, intron 2 of 6) intron (NM_001323678, intron 2 of 6) -85880 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 284-44 chr4 95878349 95878523 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 38343 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 242.666-18 chr17 70751735 70752152 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 450236 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 386.667-8 chr4 70619794 70620132 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8781 NM_031889 10117 Hs.667018 NM_031889 ENSG00000132464 ENAM ADAI|AI1C|AIH2 enamelin protein-coding 494.334 chr8 82947094 82947462 + 1.66667 NA intron (NR_134295, intron 2 of 3) L1MC4|LINE|L1 35174 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 182.334-3 chr3 99107884 99108061 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -206277 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 225.334-6 chr7 111722300 111722550 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -86080 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 275.999-4 chr3 6567677 6567985 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 237618 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 266.334-3 chr1 32406629 32406816 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -12281 NM_001300958 55108 Hs.353454 NM_018045 ENSG00000160058 BSDC1 - BSD domain containing 1 protein-coding 206.667-101 chr4 68113372 68113667 + 1.66667 NA intron (NM_207407, intron 1 of 9) L1MD|LINE|L1 16350 NM_207407 389208 Hs.677557 NM_207407 ENSG00000198092 TMPRSS11F - transmembrane serine protease 11F protein-coding 255-21 chr11 63293488 63293705 + 1.66667 NA intron (NM_001039752, intron 2 of 9) L1PREC2|LINE|L1 3693 NM_001039752 387775 Hs.188982 NM_001039752 ENSG00000184999 SLC22A10 OAT5|hOAT5 solute carrier family 22 member 10 protein-coding 380.333 chr10 82594018 82594585 + 1.66667 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -361381 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 344.667-23 chrX 142530177 142530487 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -325042 NM_016249 51438 Hs.123536 NM_016249 ENSG00000046774 MAGEC2 CT10|HCA587|MAGEE1 MAGE family member C2 protein-coding 247-31 chr17 19860315 19860482 + 1.66667 NA intron (NM_014683, intron 3 of 26) intron (NM_014683, intron 3 of 26) 7538 NM_001142610 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 419.667 chr1 200096888 200097400 + 1.66667 NA intron (NM_205860, intron 5 of 7) intron (NM_205860, intron 5 of 7) 54319 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 242.333-8 chr1 190910593 190910761 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 285787 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 403.667-13 chr7 48771690 48771988 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -152708 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 245-75 chr8 104390825 104391064 + 1.66667 NA intron (NM_001385, intron 8 of 9) intron (NM_001385, intron 8 of 9) 51118 NM_030788 81501 Hs.652230 NM_030788 ENSG00000164935 DCSTAMP FIND|TM7SF4|hDC-STAMP dendrocyte expressed seven transmembrane protein protein-coding 275.667-42 chr4 34983652 34983941 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -714049 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 196.334-4 chr12 72676237 72676406 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -402812 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 252-119 chrX 51315942 51316121 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16200 NM_153183 170685 Hs.375178 NM_153183 ENSG00000122824 NUDT10 APS2|DIPP3-alpha|DIPP3a nudix hydrolase 10 protein-coding 267.333-66 chr4 44102370 44102663 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 85454 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 253.334-22 chr7 40913176 40913356 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 66673 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 185.334-2 chr15 70500720 70500867 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 5135 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 373.667-11 chr4 54833153 54833568 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 175432 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 206.333-88 chr2 120700931 120701133 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34836 NM_001371271 202-55 chr15 75899777 75899934 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_173469, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_173469, exon 13 of 13) -4004 NM_012170 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 267.667-62 chr7 22992678 22992872 + 1.66667 NA intron (NM_032581, intron 1 of 10) intron (NM_032581, intron 1 of 10) 21355 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 255-61 chr5 15775800 15776011 + 1.66667 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -159277 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 354.666-6 chr14 45183676 45184023 + 1.66667 NA exon (NM_020937, exon 17 of 23) exon (NM_020937, exon 17 of 23) 47910 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 236.667-4 chr1 103905251 103905519 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 155544 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 274-26 chr2 225272663 225272960 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -126899 NM_001371273 277.667-49 chr8 121236905 121237141 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -402323 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 296.666-35 chr7 26365091 26365456 + 1.66667 NA intron (NM_001318199, intron 5 of 6) intron (NM_001318199, intron 5 of 6) 948 NM_001199838 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 294-30 chr18 54183158 54183435 + 1.66667 NA intron (NM_003927, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 39116 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 241.334-13 chr6 116868098 116868290 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9048 NM_173560 222546 Hs.352276 NM_173560 ENSG00000185002 RFX6 MTCHRS|MTFS|RFXDC1|dJ955L16.1 regulatory factor X6 protein-coding 255.334-6 chr10 91657469 91657722 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -24524 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 281-30 chr3 76322921 76323240 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -537531 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 346.667-17 chr8 137708470 137708891 + 1.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -295092 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 184.333-65 chr18 72478673 72478879 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65566 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 225.333-94 chr3 99046166 99046395 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -144585 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 305.334-8 chr3 115778741 115778970 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 126271 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 300-39 chr3 23184103 23184415 + 1.66667 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy 18319 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 229-28 chr17 63311346 63311545 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 8 of 25) intron (NM_025185, intron 8 of 25) 128822 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 337.667-4 chr11 78017948 78018354 + 1.66667 NA intron (NM_001203261, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 5125 NM_023930 65987 Hs.709780 NM_023930 ENSG00000151364 KCTD14 - potassium channel tetramerization domain containing 14 protein-coding 231.334-6 chr3 130331611 130331799 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -13811 NR_022012 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 280-10 chr14 38116180 38116351 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -91639 NM_001049 6751 Hs.248160 NM_001049 ENSG00000139874 SSTR1 SRIF-2|SS-1-R|SS1-R|SS1R somatostatin receptor 1 protein-coding 473.334 chr22 17884024 17884608 + 1.66667 NA intron (NM_001136004, intron 15 of 21) intron (NM_001136004, intron 15 of 21) 22570 NM_001136004 57553 Hs.528024 NM_015241 ENSG00000243156 MICAL3 MICAL-3 microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3 protein-coding 217.667-19 chr11 71292275 71292474 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -67578 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 311 chr1 200123172 200123517 + 1.66667 NA intron (NM_205860, intron 7 of 7) L2c|LINE|L2 80519 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 273.667-49 chr8 122050662 122050868 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -409325 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 240-27 chr15 60290081 60290368 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 107762 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 254-46 chr21 24692232 24692527 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -148171 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 243.333-56 chr2 169093451 169093656 + 1.66667 NA intron (NM_001142271, intron 4 of 4) intron (NM_001142271, intron 4 of 4) 12446 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 365.334-2 chr16 81100934 81101367 + 1.66667 NA non-coding (NR_126532, exon 43 of 43) non-coding (NR_126532, exon 43 of 43) -4755 NR_033249 2653 Hs.546256 NM_004483 ENSG00000140905 GCSH GCE|NKH glycine cleavage system protein H protein-coding 247.334-19 chr5 30541647 30541844 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -651941 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 283.333-62 chr5 111807300 111807559 + 1.66667 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -49211 NM_001142476 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 356-2 chr1 86654379 86654688 + 1.66667 NA non-coding (NR_024604, exon 15 of 15) non-coding (NR_024604, exon 15 of 15) 20257 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 200-94 chr20 57641924 57642055 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -21563 NM_030776 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 276.667-56 chr5 11955332 11955527 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50983 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 436.667-5 chr13 42276730 42277016 + 1.66667 NA intron (NM_016248, intron 1 of 12) intron (NM_016248, intron 1 of 12) 4721 NM_016248 11215 Hs.105105 NM_016248 ENSG00000023516 AKAP11 AKAP-11|AKAP220|PPP1R44|PRKA11 A-kinase anchoring protein 11 protein-coding 255.667-6 chr10 36497405 36497650 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -628330 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 393-5 chr2 211541129 211541495 + 1.66667 NA intron (NM_001042599, intron 20 of 26) L3|LINE|CR1 885048 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 266.666-29 chr7 134284902 134285262 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 31848 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 183.667-136 chr8 64616393 64616616 + 1.66667 NA intron (NM_004820, intron 2 of 5) intron (NM_004820, intron 2 of 5) -34612 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 265-50 chr3 160129753 160130017 + 1.66667 NA intron (NR_108088, intron 3 of 9) MIR|SINE|MIR 77207 NR_108088 101928376 Hs.565865 NR_108088 ENSG00000244040 IL12A-AS1 ILAS1-AS1 IL12A antisense RNA 1 ncRNA 447.334-3 chr3 181230288 181230741 + 1.66667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) L1PB1|LINE|L1 -1223 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 253-5 chr1 109788584 109788832 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -24785 NM_133181 79574 Hs.485352 NM_024526 ENSG00000198758 EPS8L3 EPS8R3 EPS8 like 3 protein-coding 225.667-53 chr3 132106606 132106766 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -67080 NM_153429 131034 Hs.199877 NM_130808 ENSG00000196353 CPNE4 COPN4|CPN4 copine 4 protein-coding 227.667-61 chr5 63078616 63078817 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 499897 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 256.667-34 chr18 3386565 3386746 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -25272 NM_174886 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 281.334-5 chr2 18989921 18990143 + 1.66667 NA intron (NR_135287, intron 3 of 3) intron (NR_135287, intron 3 of 3) 36939 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 392.001-3 chr4 46467212 46467539 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -77247 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 241-6 chr11 18072780 18073047 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -32125 NM_004179 7166 Hs.591999 NM_004179 ENSG00000129167 TPH1 TPRH|TRPH tryptophan hydroxylase 1 protein-coding 282-47 chr7 51545405 51545702 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -152297 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 297-4 chr1 118258883 118259229 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -73828 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 287.334-14 chrX 37808954 37809137 + 1.66667 NA intron (NM_000397, intron 11 of 12) intron (NM_000397, intron 11 of 12) 29028 NM_000397 1536 Hs.292356 NM_000397 ENSG00000165168 CYBB AMCBX2|CGD|GP91-1|GP91-PHOX|GP91PHOX|IMD34|NOX2|p91-PHOX cytochrome b-245 beta chain protein-coding 279.333-62 chr4 124191233 124191532 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 367052 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 268.334-2 chr1 231863418 231863594 + 1.66667 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) AluSx1|SINE|Alu -44989 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 303.334-5 chr2 10676253 10676536 + 1.66667 NA intron (NR_048552, intron 2 of 19) L1ME3G|LINE|L1 13581 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 259-13 chr14 20787934 20788132 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 6765 NM_005615 6039 Hs.23262 NM_005615 ENSG00000169413 RNASE6 RAD1|RNS6|RNasek6 ribonuclease A family member k6 protein-coding 252.667-90 chr6 93501839 93502128 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -82401 NM_001288630 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 422.001 chr14 63475820 63476227 + 1.66667 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 32215 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 403.999-3 chr4 63583561 63584178 + 1.66667 NA Intergenic MER70B|LTR|ERVL 825581 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 247-36 chr2 98202185 98202404 + 1.66667 NA intron (NR_144297, intron 12 of 18) L1MD|LINE|L1 52761 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 251-91 chr9 125962560 125962841 + 1.66667 NA intron (NR_024122, intron 6 of 7) intron (NR_024122, intron 6 of 7) 214517 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 212.667-94 chr3 185494401 185494620 + 1.66667 NA intron (NM_080652, intron 4 of 4) intron (NM_080652, intron 4 of 4) 4525 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 302.333-35 chr8 75558881 75559199 + 1.66667 NA intron (NM_001330561, intron 10 of 11) intron (NM_001330561, intron 10 of 11) 19072 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 296.333-30 chr3 94517820 94518110 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -420298 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 246-38 chr16 70804821 70804999 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001270974, exon 86 of 86) 3' UTR (NM_001270974, exon 86 of 86) -3752 NM_001351157 55697 Hs.445061 NM_018052 ENSG00000103043 VAC14 ArPIKfyve|TAX1BP2|TRX VAC14 component of PIKFYVE complex protein-coding 253.333-102 chr7 135576342 135576628 + 1.66667 NA intron (NM_015135, intron 4 of 42) intron (NM_015135, intron 4 of 42) 18568 NM_015135 23165 Hs.743250 NM_015135 ENSG00000155561 NUP205 C7orf14|NPHS13 nucleoporin 205 protein-coding 314.667-9 chr11 28880108 28880383 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -402697 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 300.333-13 chr15 62836985 62837275 + 1.66667 NA intron (NM_015059, intron 54 of 55) intron (NM_015059, intron 54 of 55) 13173 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 222.666-9 chr10 91495987 91496180 + 1.66667 NA intron (NM_182765, intron 14 of 20) intron (NM_182765, intron 14 of 20) 85798 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 256.334-21 chr8 6896832 6897092 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19026 NM_005218 1672 Hs.32949 NM_005218 ENSG00000164825 DEFB1 BD1|DEFB-1|DEFB101|HBD1 defensin beta 1 protein-coding 226.666-18 chr17 9975747 9975904 + 1.66667 NA intron (NM_201432, intron 3 of 13) MER103C|DNA|hAT-Charlie -16330 NM_003644 8522 Hs.462214 NM_003644 ENSG00000007237 GAS7 - growth arrest specific 7 protein-coding 573.667-2 chr8 121950378 121951046 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -309272 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 203.333-130 chr2 57130946 57131191 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -776583 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 246.667-106 chr9 30489446 30489911 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81224 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 259.334-9 chr18 74908439 74908617 + 1.66667 NA intron (NM_017757, intron 6 of 7) intron (NM_017757, intron 6 of 7) 277565 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 302.334-12 chr9 35521543 35521874 + 1.66667 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) intron (NM_001330740, intron 1 of 10) -16924 NM_001135999 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 567.667-3 chr2 149922285 149923012 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -63457 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 331.333-25 chr2 39279371 39279825 + 1.66667 NA intron (NM_003618, intron 23 of 33) intron (NM_003618, intron 23 of 33) -35615 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 277.333-71 chr5 32846975 32847206 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -100353 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 283.333-51 chr3 107462530 107462791 + 1.66667 NA non-coding (NR_110039, exon 3 of 3) non-coding (NR_110039, exon 3 of 3) 31730 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 480-4 chr16 35638592 35639089 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -107712 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 245.667-18 chr14 48829442 48829631 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 756844 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 187-26 chr17 21086742 21086968 + 1.66667 NA intron (NR_110895, intron 2 of 2) intron (NR_110895, intron 2 of 2) 11299 NR_110896 101060544 Hs.585812 NR_110895 ENSG00000236819 LINC01563 HP08942 long intergenic non-protein coding RNA 1563 ncRNA 235.667-19 chr14 52367508 52367669 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 53276 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 287-32 chr7 4533364 4533641 + 1.66667 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -148793 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 255.334-11 chr17 56068899 56069132 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -84460 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 260.667-48 chr2 98578785 98578984 + 1.66667 NA intron (NM_001351428, intron 24 of 24) intron (NM_001351428, intron 24 of 24) 29628 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 206-18 chr10 32074210 32074403 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17881 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 317.667-8 chr10 74013093 74013600 + 1.66667 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) intron (NM_014000, intron 1 of 21) 15230 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 231.333-106 chr7 1631750 1631938 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 17374 NR_001288 260341 Hs.534596 NR_001288 TFAMP1 MTTF1|TCF6L1 transcription factor A, mitochondrial pseudogene 1 pseudo 262.334-5 chr14 98238896 98239082 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -260865 NR_152750 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 283.667-30 chr5 71738078 71738283 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18905 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 242-10 chr1 241348877 241349041 + 1.66667 NA intron (NM_001350116, intron 1 of 16) L2c|LINE|L2 6867 NM_001350116 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 381.333-3 chr11 115996453 115996728 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -236390 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 240-19 chr13 76639316 76639475 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 247010 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 315.334-3 chr2 206478077 206478421 + 1.66667 NA intron (NM_003812, intron 2 of 25) intron (NM_003812, intron 2 of 25) 34717 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 256.667-83 chr7 79061135 79061328 + 1.66667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 52243 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 374.667-12 chr6 64353736 64354066 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 547065 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 442.334-2 chr22 41113335 41113708 + 1.66667 NA intron (NM_001429, intron 1 of 30) intron (NM_001429, intron 1 of 30) 20929 NM_001429 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 303.667-7 chr14 80357137 80357412 + 1.66667 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) intron (NR_038355, intron 2 of 8) -126217 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 210.667-83 chr22 45758408 45758624 + 1.66667 NA intron (NM_013236, intron 9 of 11) intron (NM_013236, intron 9 of 11) -2008 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 407.334 chr11 98192392 98192834 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -828336 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 353.667-15 chr7 118848297 118848662 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 623775 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 204.667-25 chr11 102215062 102215364 + 1.66667 NA intron (NM_001130145, intron 6 of 8) intron (NM_001130145, intron 6 of 8) -102271 NM_182962 330 Hs.127799 NM_001165 ENSG00000023445 BIRC3 AIP1|API2|CIAP2|HAIP1|HIAP1|IAP-1|MALT2|MIHC|RNF49|c-IAP2 baculoviral IAP repeat containing 3 protein-coding 209-94 chr5 115683988 115684201 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11442 NR_104674 102467217 Hs.147738 NR_104674 LOC102467217 - uncharacterized LOC102467217 ncRNA 489.667 chr14 66645867 66646464 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) L1MB2|LINE|L1 138758 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 261-36 chr2 100697344 100697619 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 93742 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 399-4 chr12 39171120 39171555 + 1.66667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -265746 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 337.001-3 chr3 33488320 33488555 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48032 NM_001128161 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 353.334-3 chr14 79734774 79735120 + 1.66667 NA intron (NR_073547, intron 18 of 20) intron (NR_073547, intron 18 of 20) 455567 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 380-18 chr7 107038503 107038936 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5986 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 374.667-16 chr9 77554277 77554610 + 1.66667 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) intron (NM_004297, intron 1 of 6) 93879 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 488.333-2 chr2 98604572 98605437 + 1.66667 NA intron (NM_001008215, intron 1 of 2) intron (NM_001008215, intron 1 of 2) 3508 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 309-20 chr2 11827098 11827426 + 1.66667 NA non-coding (NR_146080, exon 20 of 20) non-coding (NR_146080, exon 20 of 20) 9724 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 271.334-17 chr4 44555937 44556118 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 95614 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 413-6 chr18 5305749 5306313 + 1.66667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -8978 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 294-5 chr1 172359581 172359876 + 1.66667 NA intron (NM_015569, intron 17 of 20) intron (NM_015569, intron 17 of 20) -60957 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 280.666-28 chr7 76396437 76396749 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_007155) promoter-TSS (NM_007155) -929 NM_007155 7784 Hs.656137 NM_007155 ENSG00000188372 ZP3 OOMD3|ZP3A|ZP3B|ZPC|Zp-3 zona pellucida glycoprotein 3 protein-coding 211.333-13 chr1 147615927 147616144 + 1.66667 NA intron (NM_004326, intron 7 of 9) intron (NM_004326, intron 7 of 9) 54489 NR_136635 51205 Hs.562154 NM_016361 ENSG00000162836 ACP6 ACPL1|LPAP|PACPL1 acid phosphatase 6, lysophosphatidic protein-coding 262.666-18 chr4 68118310 68118595 + 1.66667 NA intron (NM_207407, intron 1 of 9) intron (NM_207407, intron 1 of 9) 11417 NM_207407 389208 Hs.677557 NM_207407 ENSG00000198092 TMPRSS11F - transmembrane serine protease 11F protein-coding 339 chr1 79302943 79303375 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -296429 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 267.667-49 chr5 5160046 5160231 + 1.66667 NA intron (NM_139056, intron 3 of 22) intron (NM_139056, intron 3 of 22) 19808 NR_136935 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 391-14 chr7 74678466 74678774 + 1.66667 NA intron (NM_001163636, intron 1 of 33) intron (NM_001163636, intron 1 of 33) 20902 NM_032999 2969 Hs.647041 NM_001518 ENSG00000263001 GTF2I BAP135|BTKAP1|DIWS|GTFII-I|IB291|SPIN|TFII-I|WBS|WBSCR6 general transcription factor IIi protein-coding 407.666-5 chr14 34809606 34809930 + 1.66667 NA intron (NM_013448, intron 5 of 26) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -64423 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 249.667-110 chrX 97399188 97399448 + 1.66667 NA intron (NM_007309, intron 25 of 26) intron (NM_007309, intron 25 of 26) 165217 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 319.667-2 chr10 21978654 21978882 + 1.66667 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) intron (NM_022365, intron 1 of 11) 24962 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 277.334-15 chr5 163413298 163413541 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24152 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 245.667-13 chr12 123101803 123102041 + 1.66667 NA intron (NM_020845, intron 1 of 24) AluJb|SINE|Alu 8506 NM_020845 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 283-30 chr4 151038192 151038398 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -22568 NM_001367550 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 185.667-33 chr15 42845809 42846034 + 1.66667 NA intron (NM_173500, intron 3 of 14) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 74857 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 366-17 chr3 98058049 98058501 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22971 NM_001105580 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 257.333-46 chr18 7585778 7586023 + 1.66667 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 18584 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 390.334-3 chr7 69871126 69871476 + 1.66667 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) MER45B|DNA|hAT-Tip100 272826 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 406.334-5 chr3 123841783 123842219 + 1.66667 NA intron (NM_001321309, intron 2 of 32) intron (NM_001321309, intron 2 of 32) 42331 NM_053025 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 318.333-10 chr13 94647000 94647294 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 45290 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 229.334-3 chr3 188454381 188454538 + 1.66667 NA intron (NM_001167672, intron 2 of 9) intron (NM_001167672, intron 2 of 9) 114207 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 249.667-12 chr10 65919305 65919598 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_013266, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_013266, exon 18 of 18) 348026 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 257-44 chr4 56743505 56743730 + 1.66667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -61911 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 248.333-3 chr1 65518696 65518977 + 1.66667 NA intron (NM_001003679, intron 2 of 19) (CTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6815 NM_001198687 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 218.667-52 chr2 64186635 64186958 + 1.66667 NA intron (NR_033837, intron 5 of 5) intron (NR_033837, intron 5 of 5) 18689 NR_033837 150992 Hs.272318 NR_033837 ENSG00000230923 LINC00309 NCRNA00309 long intergenic non-protein coding RNA 309 ncRNA 245.667-80 chr9 68481435 68481690 + 1.66667 NA intron (NM_021965, intron 8 of 10) intron (NM_021965, intron 8 of 10) 59305 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 215.667-59 chr2 96598072 96598294 + 1.66667 NA intron (NR_146101, intron 19 of 20) L1M4|LINE|L1 39808 NR_047658 55683 Hs.516341 NM_017991 ENSG00000114982 KANSL3 KIAA1310|NSL3|Rcd1 KAT8 regulatory NSL complex subunit 3 protein-coding 275.334-4 chr11 16767482 16767760 + 1.66667 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 28974 NM_014267 10944 Hs.368226 NM_014267 ENSG00000110696 C11orf58 IMAGE145052|SMAP chromosome 11 open reading frame 58 protein-coding 272-11 chr12 101535219 101535484 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -59580 NM_001254719 4604 Hs.654589 NM_002465 ENSG00000196091 MYBPC1 LCCS4|MYBPCC|MYBPCS myosin binding protein C, slow type protein-coding 230.667-11 chr10 108550424 108550724 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -481281 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 311.334-9 chr8 133945886 133946165 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 59529 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 283.667-2 chr1 92669066 92669331 + 1.66667 NA intron (NM_001350198, intron 10 of 19) intron (NM_001350198, intron 10 of 19) 115910 NM_001350197 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 325-22 chr3 123617088 123617459 + 1.66667 NA intron (NM_001321309, intron 32 of 32) intron (NM_001321309, intron 32 of 32) 3275 NM_053032 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 269-19 chr17 48224300 48224518 + 1.66667 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -67898 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 349.334-6 chr2 57648980 57649262 + 1.66667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -258530 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 274.667-30 chr2 225757127 225757373 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 356364 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 256-33 chr17 62059378 62059793 + 1.66667 NA intron (NM_005121, intron 2 of 29) intron (NM_005121, intron 2 of 29) 5693 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 232.333-14 chr11 95641788 95642022 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 147877 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 291-44 chr8 125386261 125386561 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -43947 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 256.667-13 chr11 80351953 80352211 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 410721 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 251.334-16 chr2 179656690 179656915 + 1.66667 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) MER106B|DNA|hAT-Charlie 3392 NM_001352812 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 516.333 chr10 75441736 75442529 + 1.66667 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) L1MA9|LINE|L1 10508 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 236.667-51 chr3 85786599 85786885 + 1.66667 NA intron (NM_001256504, intron 3 of 10) intron (NM_001256504, intron 3 of 10) 41308 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 295.667-5 chr11 93476358 93476652 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 66886 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 272.667-59 chr6 47393208 47393449 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -83423 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 365.334-10 chr7 113728125 113728436 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 190729 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 388.334-3 chr17 63045623 63045937 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) L1ME3Cz|LINE|L1 79545 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 452.001 chr21 19789623 19789976 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 109956 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 322-17 chr15 79301334 79301644 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -9573 NM_001363735 23423 Hs.71608 NM_007364 ENSG00000166557 TMED3 C15orf22|P24B|p24g4|p24gamma4|p26 transmembrane p24 trafficking protein 3 protein-coding 285.667 chr1 112550558 112550827 + 1.66667 NA exon (NM_138729, exon 13 of 14) exon (NM_138729, exon 13 of 14) 41727 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 426.667-2 chr6 52460161 52460512 + 1.66667 NA intron (NR_033327, intron 4 of 9) L1ME1|LINE|L1 39328 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 248.334-9 chr2 119960413 119960581 + 1.66667 NA intron (NM_002830, intron 22 of 26) AluJo|SINE|Alu -52580 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 285.667-11 chr12 85818330 85818575 + 1.66667 NA intron (NM_005447, intron 1 of 1) intron (NM_005447, intron 1 of 1) 17957 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 301-11 chr12 4902178 4902612 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7510 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 257.334-6 chr12 4128820 4129022 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -144841 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 254.667-52 chr3 65633585 65633821 + 1.66667 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -260113 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 446.667-6 chr18 4996080 4996651 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -84817 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 301.667-18 chr17 59363535 59363933 + 1.66667 NA intron (NM_001005404, intron 2 of 4) intron (NM_001005404, intron 2 of 4) -2349 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 472.667-2 chr19 53649373 53649995 + 1.66667 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 -16989 NR_030181 574459 NR_030181 ENSG00000207644 MIR512-2 MIRN512-2|mir-512-2 microRNA 512-2 ncRNA 286.334-4 chr15 63341569 63341741 + 1.66667 NA intron (NR_135511, intron 5 of 9) intron (NR_135511, intron 5 of 9) 40191 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 252-70 chr4 61420109 61420315 + 1.66667 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 218040 NM_001371342 191.667-92 chr4 48544808 48545030 + 1.66667 NA intron (NM_015030, intron 42 of 63) intron (NM_015030, intron 42 of 63) 54667 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 171.334-2 chr2 43703391 43703532 + 1.66667 NA intron (NM_172069, intron 8 of 29) intron (NM_172069, intron 8 of 29) -27032 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 232.667-52 chr3 114528715 114528905 + 1.66667 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 75217 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 254.333-14 chr12 73582955 73583250 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 423912 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 177-77 chr8 112325683 112325839 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 41 of 66) MIR|SINE|MIR -317732 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 367.334-2 chr15 80687763 80688089 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -7384 NM_021214 58489 Hs.459072 NM_021214 ENSG00000136379 ABHD17C FAM108C1 abhydrolase domain containing 17C protein-coding 671.334 chr20 49019953 49020603 + 1.66667 NA intron (NM_006420, intron 34 of 38) intron (NM_006420, intron 34 of 38) 25778 NR_110625 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 258-30 chr2 13170591 13170803 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -163684 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 322.667-21 chr4 119316792 119317141 + 1.66667 NA TTS (NM_000134) TTS (NM_000134) 5172 NM_000134 2169 Hs.282265 NM_000134 ENSG00000145384 FABP2 FABPI|I-FABP fatty acid binding protein 2 protein-coding 303.333-37 chr2 51164044 51164498 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 131670 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 254-64 chr5 27789016 27789220 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 316826 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 302.334-2 chr15 58016898 58017132 + 1.66667 NA intron (NM_170696, intron 1 of 11) Looper|DNA|PiggyBac -2992 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 292.667-22 chr22 34979914 34980192 + 1.66667 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 17863 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 402.667-3 chr18 68040785 68041133 + 1.66667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -226137 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 525.333-3 chr3 190829724 190830079 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 32793 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 269.667-13 chr11 36752962 36753174 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -154789 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 180.333-50 chr18 74935974 74936172 + 1.66667 NA intron (NM_017757, intron 7 of 7) intron (NM_017757, intron 7 of 7) 269440 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 301.667-25 chr2 74404787 74405053 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 12797 NM_001145054 388963 Hs.445377 NM_001145054 ENSG00000284308 C2orf81 hCG40743 chromosome 2 open reading frame 81 protein-coding 332-17 chr2 99083753 99084072 + 1.66667 NA intron (NR_146001, intron 9 of 18) L1MD2|LINE|L1 57268 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 322.667-8 chr12 15296591 15296818 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -25804 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 192.334-4 chr3 36644261 36644432 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 95515 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 224-31 chr16 73584867 73585054 + 1.66667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 198155 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 282-26 chr2 68531667 68532043 + 1.66667 NA intron (NM_173545, intron 6 of 9) intron (NM_173545, intron 6 of 9) 64270 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 312-49 chr6 52016715 52017017 + 1.66667 NA intron (NM_138694, intron 34 of 66) intron (NM_138694, intron 34 of 66) 70747 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 256-57 chr22 40348934 40349091 + 1.66667 NA intron (NM_001363840, intron 1 of 13) intron (NM_001363840, intron 1 of 13) 2512 NM_001123378 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 370.667-9 chr11 103165924 103166394 + 1.66667 NA intron (NM_001377, intron 31 of 88) L1MEf|LINE|L1 56733 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 322-13 chr13 112861505 112861807 + 1.66667 NA intron (NM_032189, intron 24 of 28) intron (NM_032189, intron 24 of 28) -106925 NR_046661 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 327-29 chr9 88658115 88658620 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 87538 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 244.334-21 chr7 26172426 26172593 + 1.66667 NA intron (NM_004289, intron 1 of 3) L1MC4|LINE|L1 20311 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 412.334-2 chr12 22593680 22594156 + 1.66667 NA intron (NR_135030, intron 2 of 3) (CTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 31128 NR_135031 105369691 Hs.556287 NR_135030 LOC105369691 - uncharacterized LOC105369691 ncRNA 361.667-8 chr2 8692443 8692897 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 10614 NM_002166 3398 Hs.180919 NM_002166 ENSG00000115738 ID2 GIG8|ID2A|ID2H|bHLHb26 inhibitor of DNA binding 2 protein-coding 293.667-43 chr3 95044977 95045330 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 106890 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 374.333-13 chr5 32420349 32420905 + 1.66667 NA intron (NM_016107, intron 2 of 19) MER20|DNA|hAT-Charlie 24113 NR_144318 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 335.334-2 chr10 56078947 56079212 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 282180 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 249-10 chr10 65403989 65404194 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -167334 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 504.667-4 chr4 43840118 43840764 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -176420 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 242-11 chr10 22067953 22068221 + 1.66667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -64357 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 282.333-25 chr18 13689375 13689670 + 1.66667 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) L1MC2|LINE|L1 37036 NM_152352 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 242.333-37 chr18 39083683 39083976 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 538346 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 264.667-41 chr2 39952474 39952635 + 1.66667 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 34920 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 472-5 chr2 187639668 187640124 + 1.66667 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -85391 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 159.333-174 chr2 174531790 174531989 + 1.66667 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 26183 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 384.334-5 chr6 159646800 159647292 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46195 NM_000636 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 190.333-119 chr5 74691876 74692086 + 1.66667 NA intron (NM_001292004, intron 2 of 13) intron (NM_001292004, intron 2 of 13) 6748 NM_000521 3074 Hs.69293 NM_000521 ENSG00000049860 HEXB ENC-1AS|HEL-248|HEL-S-111 hexosaminidase subunit beta protein-coding 277.667-42 chr5 142521136 142521416 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 100058 NM_001144892 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 462.333-2 chr10 49573451 49574012 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34193 NM_001277059 2074 Hs.49063 NM_000124 ENSG00000225830 ERCC6 ARMD5|CKN2|COFS|COFS1|CSB|CSB-PGBD3|POF11|RAD26|UVSS1 ERCC excision repair 6, chromatin remodeling factor protein-coding 345.667-16 chr4 175743607 175743947 + 1.66667 NA intron (NM_201592, intron 1 of 6) L1MEg|LINE|L1 43899 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 159.333-296 chr6 152294722 152294898 + 1.66667 NA intron (NM_182961, intron 93 of 145) intron (NM_182961, intron 93 of 145) -85720 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 429.666 chr2 21006084 21006455 + 1.66667 NA exon (NM_000384, exon 26 of 29) exon (NM_000384, exon 26 of 29) 37804 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 423-12 chr8 52251678 52252206 + 1.66667 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) intron (NR_148195, intron 2 of 3) -2445 NM_001352878 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 286.667-39 chr7 28842691 28843050 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 115460 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 689.999 chr6 130756890 130757670 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70125 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 244.333-70 chr3 8394881 8395142 + 1.66667 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) L1PB2|LINE|L1 106647 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 248.333-12 chr10 90679934 90680193 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -139258 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 307.667-3 chr1 176943098 176943403 + 1.66667 NA intron (NM_207108, intron 14 of 21) intron (NM_207108, intron 14 of 21) 86195 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 259.667-57 chr4 92759088 92759413 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 454851 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 156-126 chr6 134039698 134039862 + 1.66667 NA intron (NM_145176, intron 1 of 4) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 12844 NM_145176 154091 Hs.486508 NM_145176 ENSG00000146411 SLC2A12 GLUT12|GLUT8 solute carrier family 2 member 12 protein-coding 299.667-9 chr14 51038934 51039313 + 1.66667 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 56581 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 256-35 chr18 5129016 5129286 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 47969 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 252-29 chr14 66635790 66636013 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) AluY|SINE|Alu 128494 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 310.667-43 chr9 104678870 104679188 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -15393 NM_001004484 286365 Hs.553683 NM_001004484 ENSG00000179055 OR13D1 OR9-15 olfactory receptor family 13 subfamily D member 1 protein-coding 241.333-58 chr2 221981521 221981790 + 1.66667 NA Intergenic MER131|DNA?|DNA? -316492 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 344-40 chr7 43724703 43725126 + 1.66667 NA intron (NM_001371314, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 4609 NM_001371317 370.001-2 chr14 56342679 56342997 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -171493 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 325.333-34 chr5 33974498 33974829 + 1.66667 NA intron (NM_001012509, intron 2 of 5) intron (NM_001012509, intron 2 of 5) 10030 NM_016180 51151 Hs.278962 NM_016180 ENSG00000164175 SLC45A2 1A1|AIM1|MATP|OCA4|SHEP5 solute carrier family 45 member 2 protein-coding 241-36 chr3 29611532 29611732 + 1.66667 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 322524 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 370.667-20 chr4 47449694 47450138 + 1.66667 NA TTS (NM_017845) TTS (NM_017845) 13786 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 250.667-86 chr9 25595080 25595372 + 1.66667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 83632 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 578.999 chr5 109127211 109127707 + 1.66667 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) AluSc5|SINE|Alu 198910 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 169.666-2 chr10 54274675 54274909 + 1.66667 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) L1ME3Cz|LINE|L1 -211438 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 226-46 chr2 188077147 188077467 + 1.66667 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) intron (NR_126396, intron 2 of 2) 210384 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 387.667-13 chr5 146456232 146456574 + 1.66667 NA intron (NM_006706, intron 2 of 21) intron (NM_006706, intron 2 of 21) 9070 NM_006706 10915 Hs.443465 NM_006706 ENSG00000113649 TCERG1 CA150|TAF2S|Urn1 transcription elongation regulator 1 protein-coding 460-4 chr20 480405 480901 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001895, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001895, exon 13 of 13) -18120 NR_111901 128637 Hs.590876 NM_144628 ENSG00000125875 TBC1D20 C20orf140|WARBM4 TBC1 domain family member 20 protein-coding 274.666-19 chr2 157432571 157432834 + 1.66667 NA intron (NM_004288, intron 3 of 7) intron (NM_004288, intron 3 of 7) 11387 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 264.667-71 chr6 53895342 53895645 + 1.66667 NA intron (NM_018214, intron 4 of 13) intron (NM_018214, intron 4 of 13) -34489 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 271.334-16 chr4 32890162 32890435 + 1.66667 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 539260 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 267-56 chr6 48678437 48678695 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -609877 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 266-51 chr20 57635194 57635424 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -14883 NM_030776 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 249-15 chr11 13514073 13514333 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -18028 NM_001316352 5741 Hs.37045 NM_000315 ENSG00000152266 PTH PTH1 parathyroid hormone protein-coding 264.667-17 chr11 73120383 73120561 + 1.66667 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) AluSq|SINE|Alu 21846 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 334.334-10 chr7 14565953 14566223 + 1.66667 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 275362 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 267.667-21 chr17 7772422 7772601 + 1.66667 NA intron (NM_020877, intron 28 of 85) intron (NM_020877, intron 28 of 85) 18191 NR_002778 118432 Hs.658086 NR_002778 ENSG00000240480 RPL29P2 RPL29_10_1510 ribosomal protein L29 pseudogene 2 pseudo 228.666-5 chr1 190758680 190758895 + 1.66667 NA intron (NR_033922, intron 2 of 4) L1MA4|LINE|L1 133897 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 212.334-2 chr10 112259059 112259275 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -24233 NM_058222 6975 Hs.345485 NM_058222 ENSG00000119913 TECTB - tectorin beta protein-coding 264.667-90 chr8 143003515 143003689 + 1.66667 NA intron (NR_026913, intron 1 of 1) L1PA13|LINE|L1 7774 NR_102426 100128627 NR_102426 CDC42P3 - cell division cycle 42 pseudogene 3 pseudo 329.666-14 chrX 100095488 100095837 + 1.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 314611 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 299.667-32 chr6 44677029 44677368 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -125317 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 411-9 chr5 76709745 76710057 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2502 NR_028375 100302746 NR_028375 NCRUPAR NCRNA00193|ncR-uPAR non-protein coding RNA, upstream of F2R/PAR1 ncRNA 247.667 chr1 45454928 45455092 + 1.66667 NA intron (NM_001320800, intron 1 of 9) LTR26D|LTR|ERV1 36153 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 314-54 chr9 85023050 85023409 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001369533, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001369533, exon 18 of 18) 317328 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 288.667-15 chr3 37203057 37203400 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26868 NM_001348299 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 241-4 chr10 24858387 24858608 + 1.66667 NA intron (NM_020200, intron 4 of 8) intron (NM_020200, intron 4 of 8) 94109 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 509.667 chr10 106722193 106722856 + 1.66667 NA intron (NM_001206569, intron 6 of 25) intron (NM_001206569, intron 6 of 25) 442182 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 273.667-27 chr17 50584323 50584517 + 1.66667 NA intron (NR_046058, intron 9 of 33) intron (NR_046058, intron 9 of 33) -22312 NR_038439 253962 Hs.558704 NR_038439 ENSG00000250107 CACNA1G-AS1 CAS1 CACNA1G antisense RNA 1 ncRNA 257.667-85 chr8 126686745 126686908 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -128348 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 249.667-26 chr14 20003470 20003628 + 1.66667 NA TTS (NM_001348271) TTS (NM_001348271) 1487 NR_145508 390432 NM_001348271 ENSG00000196383 OR4Q2 OR4Q2P olfactory receptor family 4 subfamily Q member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 177.667-88 chr3 77790984 77791122 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 257910 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 266.667-11 chr10 23972558 23972763 + 1.66667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) L1PA8A|LINE|L1 -236131 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 313.667-39 chr8 115748777 115749089 + 1.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -79958 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 220.334-2 chr2 181085342 181085532 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -38400 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 269-23 chr2 103293292 103293604 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -309019 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 214.333-165 chrX 106540522 106540701 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -71319 NM_001184782 55086 Hs.274267 NM_018015 ENSG00000147231 RADX CXorf57 RPA1 related single stranded DNA binding protein, X-linked protein-coding 257.667-42 chr2 106916228 106916421 + 1.66667 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -29215 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 334.001-2 chr21 46271770 46272052 + 1.66667 NA intron (NM_003906, intron 8 of 27) intron (NM_003906, intron 8 of 27) 13700 NM_003906 8888 Hs.389037 NM_003906 ENSG00000160294 MCM3AP GANP|MAP80|PNRIID|SAC3 minichromosome maintenance complex component 3 associated protein protein-coding 243.333-42 chr17 57768888 57769069 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23679 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 268.333-2 chr1 87570090 87570364 + 1.66667 NA Intergenic (CTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -198572 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 233.333-103 chr5 54909591 54909844 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 75876 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 275.667-71 chrX 66743949 66744242 + 1.66667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -104797 NM_001199687 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 247.667-33 chr14 83155047 83155230 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 512506 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 198.667-200 chrX 98110971 98111122 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -546511 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 366.999-5 chr20 41058266 41058814 + 1.66667 NA intron (NM_003286, intron 2 of 20) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 29718 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 355.333-7 chr12 9993575 9993936 + 1.66667 NA intron (NM_001099431, intron 4 of 4) intron (NM_001099431, intron 4 of 4) 5545 NM_016509 51266 Hs.409794 NM_016509 ENSG00000165682 CLEC1B 1810061I13Rik|CLEC2|CLEC2B|PRO1384|QDED721 C-type lectin domain family 1 member B protein-coding 413 chr12 115970000 115970466 + 1.66667 NA intron (NM_015335, intron 27 of 30) intron (NM_015335, intron 27 of 30) 178421 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 316-24 chr2 70292966 70293239 + 1.66667 NA 5' UTR (NM_001317168, exon 1 of 4) 5' UTR (NM_001317168, exon 1 of 4) 122 NM_001317167 6637 Hs.465167 NM_003096 ENSG00000143977 SNRPG SMG|Sm-G small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G protein-coding 244-48 chr18 2036036 2036231 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 535372 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 376.334-5 chr15 75240531 75240946 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11048 NM_001321990 105376731 NM_001321990 LOC105376731 - taste receptor cell protein 1-like protein-coding 248.667-104 chr8 121983885 121984040 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -342522 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 303.333-12 chr10 16929337 16929777 + 1.66667 NA intron (NM_001081, intron 40 of 66) intron (NM_001081, intron 40 of 66) -112103 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 315.667-26 chr8 118938556 118938784 + 1.66667 NA intron (NM_002546, intron 1 of 4) intron (NM_002546, intron 1 of 4) 13215 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 256.334-4 chr12 22871468 22871697 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 246411 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 476-3 chr11 58086518 58087033 + 1.66667 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) L1MA7|LINE|L1 32669 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 296-7 chr10 24125408 24125689 + 1.66667 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) L1MEd|LINE|L1 -83243 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 256.667-79 chr7 2289339 2289625 + 1.66667 NA intron (NM_013321, intron 1 of 10) L1ME3A|LINE|L1 24959 NM_013321 29886 Hs.584900 NM_013321 ENSG00000106266 SNX8 Mvp1 sorting nexin 8 protein-coding 251.667-18 chr12 5035351 5035631 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -8388 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 227-44 chr5 31902773 31903039 + 1.66667 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) L1MC|LINE|L1 33253 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 367.667-20 chr7 50256774 50257020 + 1.66667 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -47167 NM_001291839 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 255.667-3 chr1 73594772 73595047 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -79770 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 331.666-6 chr14 23654989 23655396 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18828 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 455 chr11 110863314 110864016 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -150476 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 395.666-2 chr5 7379603 7380248 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -16213 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 439.334 chr18 2978856 2979141 + 1.66667 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) -32375 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 411.334-3 chr20 11354618 11355102 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -81477 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 253.333-8 chr10 57257460 57257668 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46995 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 333-12 chr2 81542867 81543182 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -76078 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 239-3 chr1 99821484 99821645 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28797 NM_000642 178 Hs.904 NM_000028 ENSG00000162688 AGL GDE amylo-alpha-1, 6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase protein-coding 257.334-8 chr20 16731071 16731240 + 1.66667 NA intron (NM_003092, intron 1 of 6) intron (NM_003092, intron 1 of 6) 1129 NM_003092 6629 Hs.280378 NM_003092 ENSG00000125870 SNRPB2 Msl1|U2B'' small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2 protein-coding 202-76 chr2 29600312 29600514 + 1.66667 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) L1MEi|LINE|L1 -125036 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 220-55 chr2 22074140 22074322 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -363579 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 448-4 chr20 58925952 58926363 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 33994 NR_132272 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 212.333-81 chr2 228007901 228008149 + 1.66667 NA intron (NM_030623, intron 7 of 10) L1MC1|LINE|L1 136394 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 480.333-3 chr8 126637822 126638314 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -79590 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 423.667-14 chr7 31338862 31339184 + 1.66667 NA exon (NM_022728, exon 2 of 2) exon (NM_022728, exon 2 of 2) 1703 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 442.001 chr22 45015954 45016338 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -6141 NM_138415 112885 Hs.254097 NM_138415 ENSG00000056487 PHF21B BHC80L|PHF4 PHD finger protein 21B protein-coding 315.001 chr15 86630992 86631228 + 1.66667 NA intron (NM_152336, intron 22 of 24) MER48|LTR|ERV1 -301770 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 251-15 chr12 12258184 12258465 + 1.66667 NA intron (NM_002336, intron 1 of 22).2 AluJr4|SINE|Alu 8720 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 293.667-30 chr2 183063442 183063646 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15203 NM_001142314 142679 Hs.132237 NM_080876 ENSG00000162999 DUSP19 DUSP17|LMWDSP3|SKRP1|TS-DSP1 dual specificity phosphatase 19 protein-coding 373-15 chr4 98445861 98446330 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 184711 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 244.667-25 chr11 65043155 65043303 + 1.66667 NA intron (NM_001367488, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 2019 NM_001367486 29901 Hs.23642 NM_013299 ENSG00000168061 SAC3D1 HSU79266|SHD1 SAC3 domain containing 1 protein-coding 194.667-162 chr9 29001407 29001614 + 1.66667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -112555 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 259.333-60 chr21 18549258 18549548 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 136761 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 285.334-11 chr7 115902608 115902781 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65619 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 361.667-19 chr8 90767954 90768243 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23677 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 343.334-7 chr7 97270307 97270661 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 153891 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 278.667-45 chr6 38042809 38043039 + 1.66667 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 223197 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 434.333-7 chr7 87978525 87978929 + 1.66667 NA intron (NM_001324421, intron 3 of 28) intron (NM_001324421, intron 3 of 28) 44476 NM_001324417 53616 Hs.256398 NM_004194 ENSG00000008277 ADAM22 ADAM 22|EIEE61|MDC2 ADAM metallopeptidase domain 22 protein-coding 308.333-19 chr2 55284011 55284372 + 1.66667 NA non-coding (NR_027258, exon 1 of 1) non-coding (NR_027258, exon 1 of 1) 1872 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 509-2 chr14 43082948 43083490 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1424064 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 266.999-2 chr12 60476235 60476554 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 787024 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 205-80 chr6 67128118 67128269 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -927158 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 277.334-10 chr3 41103535 41103710 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95883 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 348.001 chr10 112246050 112246346 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37202 NM_058222 6975 Hs.345485 NM_058222 ENSG00000119913 TECTB - tectorin beta protein-coding 319.333-4 chr10 116951765 116952091 + 1.66667 NA exon (NM_001258298, exon 5 of 16) exon (NM_001258298, exon 5 of 16) 53259 NM_018330 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 309.333-57 chr7 27304889 27305245 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -57838 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 331-14 chr14 53222680 53222948 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 69460 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 254.334-26 chr6 24728490 24728741 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9461 NM_030939 81688 Hs.744857 NM_030939 ENSG00000112308 C6orf62 Nbla00237|XTP12|dJ30M3.2 chromosome 6 open reading frame 62 protein-coding 257.667-41 chr2 101075882 101076213 + 1.66667 NA intron (NM_001102426, intron 2 of 19) L1MC5a|LINE|L1 73758 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 352.667 chr1 115996997 115997381 + 1.66667 NA intron (NM_018420, intron 2 of 11) L1M1|LINE|L1 -19913 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 412.999-3 chr5 59191329 59191749 + 1.66667 NA intron (NM_006203, intron 3 of 14) intron (NM_006203, intron 3 of 14) 84576 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 239-24 chr16 22627031 22627196 + 1.66667 NA Intergenic LTR57|LTR|ERVL 81415 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 334.001 chr11 130308354 130308576 + 1.66667 NA intron (NR_163265, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 6247 NM_001301099 29068 Hs.721470 NM_014155 ENSG00000196323 ZBTB44 BTBD15|HSPC063|ZNF851 zinc finger and BTB domain containing 44 protein-coding 282-48 chr8 110155309 110155658 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -179712 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 287-42 chr9 87693372 87693656 + 1.66667 NA intron (NM_004938, intron 21 of 25) L1MA4A|LINE|L1 -32605 NM_001912 1514 Hs.731507 NM_001912 ENSG00000135047 CTSL CATL|CTSL1|MEP cathepsin L protein-coding 348.667-5 chr10 5191484 5191741 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -5225 NM_001818 1109 Hs.567245 NM_001818 ENSG00000198610 AKR1C4 3-alpha-HSD|C11|CDR|CHDR|DD-4|DD4|HAKRA aldo-keto reductase family 1 member C4 protein-coding 257.667-83 chr8 112295698 112295917 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 50 of 66) intron (NM_001363185, intron 50 of 66) -347686 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 235.334-5 chr3 197706088 197706283 + 1.66667 NA intron (NM_001346873, intron 2 of 21) intron (NM_001346873, intron 2 of 21) 30719 NM_014687 9711 Hs.478868 NM_014687 ENSG00000145016 RUBCN KIAA0226|RUBICON|SCAR15 rubicon autophagy regulator protein-coding 251-54 chr4 75727893 75728101 + 1.66667 NA intron (NM_003715, intron 1 of 23) L2c|LINE|L2 3475 NM_001290049 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 414-6 chr2 74578891 74579440 + 1.66667 NA intron (NM_001321739, intron 5 of 10) intron (NM_001321739, intron 5 of 10) 25005 NM_001318868 1796 Hs.103854 NM_001381 ENSG00000115325 DOK1 P62DOK|pp62 docking protein 1 protein-coding 251.334-13 chr14 84491156 84491407 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -780651 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 289.333-33 chr20 44993345 44993681 + 1.66667 NA intron (NM_001352385, intron 5 of 11) intron (NM_001352385, intron 5 of 11) 27001 NM_006282 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 242-74 chr8 88201676 88201923 + 1.66667 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 125684 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 279.333-34 chr18 3208417 3208721 + 1.66667 NA intron (NM_019856, intron 2 of 36) intron (NM_019856, intron 2 of 36) 11399 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 249.667-13 chr10 91938120 91938400 + 1.66667 NA intron (NM_003972, intron 2 of 37) L1MB7|LINE|L1 14490 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 258.333 chr1 52037603 52037851 + 1.66667 NA intron (NR_046405, intron 2 of 2) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -3917 NM_138417 112970 Hs.476033 NM_138417 ENSG00000198841 KTI12 SBBI81|TOT4 KTI12 chromatin associated homolog protein-coding 257.334-10 chr3 194461957 194462137 + 1.66667 NA intron (NM_001367549, intron 3 of 33) intron (NM_001367549, intron 3 of 33) 6192 NM_024524 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 179-6 chr1 117260629 117260773 + 1.66667 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -34765 NR_126408 104355292 Hs.576446 NR_126408 ENSG00000235202 LINC01525 lnc-MAN1A2-1 long intergenic non-protein coding RNA 1525 ncRNA 268.334-14 chr3 96537427 96537688 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 177593 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 257.667-86 chr8 129562820 129563012 + 1.66667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1PA10|LINE|L1 12102 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 467.667-9 chr6 52549538 52550359 + 1.66667 NA intron (NM_012288, intron 1 of 10) intron (NM_012288, intron 1 of 10) 27112 NM_012288 9697 Hs.520182 NM_012288 ENSG00000065308 TRAM2 - translocation associated membrane protein 2 protein-coding 561.334-2 chr5 129781204 129781570 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 33293 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 299-23 chr2 55416556 55416835 + 1.66667 NA intron (NM_001254943, intron 2 of 33) intron (NM_001254943, intron 2 of 33) 3161 NM_001135597 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 214-134 chr8 59319087 59319357 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 200012 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 221 chr1 42273087 42273338 + 1.66667 NA intron (NM_001198850, intron 3 of 12) L2c|LINE|L2 61743 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 190.667-106 chr5 145169815 145170033 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 665418 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 234.334-11 chr4 56752259 56752505 + 1.66667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 69091 NR_073419 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 219.667-18 chr12 42428288 42428460 + 1.66667 NA intron (NM_016488, intron 9 of 12) L1PB1|LINE|L1 55241 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 253.333-56 chr2 169540803 169541069 + 1.66667 NA intron (NM_024622, intron 9 of 14) intron (NM_024622, intron 9 of 14) 31234 NM_006063 10324 Hs.50550 NM_006063 ENSG00000239474 KLHL41 KBTBD10|Krp1|SARCOSIN kelch like family member 41 protein-coding 178.667-121 chr4 96208330 96208548 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -102264 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 272.333-42 chr3 70311320 70311612 + 1.66667 NA intron (NM_001364676, intron 2 of 4) intron (NM_001364676, intron 2 of 4) 1172 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 289-2 chr10 64267221 64267446 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -558195 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 340.333-4 chr10 88681399 88681729 + 1.66667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 17122 NM_001198830 8513 Hs.523130 NM_004190 ENSG00000182333 LIPF GL|HGL|HLAL lipase F, gastric type protein-coding 233.333-40 chr14 69178866 69179056 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12516 NR_034164 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 386-6 chr19 14818465 14818861 + 1.66667 NA intron (NM_001370485, intron 1 of 4) intron (NM_001370485, intron 1 of 4) 16522 NM_001370481 26659 Hs.137573 NM_017506 ENSG00000188269 OR7A5 HTPCR2 olfactory receptor family 7 subfamily A member 5 protein-coding 264-29 chr2 73572262 73572528 + 1.66667 NA exon (NM_015120, exon 16 of 23) exon (NM_015120, exon 16 of 23) 70027 NM_003960 9027 Hs.14637 NM_003960 ENSG00000144035 NAT8 ATase2|CCNAT|CML1|GLA|Hcml1|TSC501|TSC510 N-acetyltransferase 8 (putative) protein-coding 280.334-4 chr12 30825394 30825650 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 29841 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 304-52 chr6 96565652 96566041 + 1.66667 NA intron (NM_020482, intron 2 of 6) intron (NM_020482, intron 2 of 6) 2721 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 503.666-2 chr2 143595405 143595828 + 1.66667 NA intron (NM_018460, intron 11 of 13) L2c|LINE|L2 -341451 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 216-45 chr17 58566386 58566615 + 1.66667 NA intron (NM_031272, intron 26 of 31) intron (NM_031272, intron 26 of 31) -22172 NM_001368772 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 256.334-18 chr6 149584442 149584641 + 1.66667 NA intron (NM_138785, intron 7 of 7) intron (NM_138785, intron 7 of 7) -9075 NR_077247 645958 Hs.632614 NR_077247 RPS18P9 RPS18_6_767 ribosomal protein S18 pseudogene 9 pseudo 326-16 chr14 87435463 87435768 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 219679 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 305.667-15 chr2 52967770 52967993 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -265266 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 245.667-65 chr6 146130576 146130783 + 1.66667 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) intron (NM_001278065, intron 2 of 9) 101481 NM_001278067 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 242.667-34 chr15 60842241 60842484 + 1.66667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 160793 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 199.667-31 chr11 108762471 108762664 + 1.66667 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) intron (NM_004398, intron 13 of 17) 97498 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 282.334-6 chr15 41157710 41157931 + 1.66667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -41540 NM_017553 54617 Hs.292949 NM_017553 ENSG00000128908 INO80 INO80A|INOC1 INO80 complex ATPase subunit protein-coding 277.334-5 chr2 81085794 81085982 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 381058 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 322-22 chr19 51929188 51929659 + 1.66667 NA intron (NM_024840, intron 2 of 5) L1MB4|LINE|L1 1951 NM_024840 79898 Hs.183390 NM_024840 ENSG00000176024 ZNF613 - zinc finger protein 613 protein-coding 278.666-5 chr11 85720479 85720818 + 1.66667 NA intron (NM_001365826, intron 9 of 18) intron (NM_001365826, intron 9 of 18) -1298 NM_001162952 54843 Hs.369520 NM_032379 ENSG00000137501 SYTL2 CHR11SYT|EXO4|PPP1R151|SGA72M|SLP2|SLP2A synaptotagmin like 2 protein-coding 267.667-57 chr5 142398716 142398909 + 1.66667 NA intron (NR_120664, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 73519 NR_120664 101926941 Hs.658945 NR_120664 ENSG00000231185 SPRY4-AS1 THCAT68 SPRY4 antisense RNA 1 ncRNA 291.333-23 chr14 53081974 53082321 + 1.66667 NA intron (NM_030637, intron 4 of 11) intron (NM_030637, intron 4 of 11) 71176 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 362.999 chr11 32236134 32236634 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -92472 NR_132770 106635521 NR_132770 SNORA88 - small nucleolar RNA, H/ACA box 88 snoRNA 299.334-4 chr18 38212049 38212344 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 555061 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 268.667-23 chr18 3872989 3873239 + 1.66667 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) intron (NM_001242761, intron 4 of 11) 1188 NM_001242764 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 285.333-21 chr14 77404175 77404511 + 1.66667 NA intron (NM_001113475, intron 5 of 5) HAL1|LINE|L1 18713 NM_001113475 122945 Hs.97556 NM_138791 ENSG00000165555 NOXRED1 C14orf148 NADP dependent oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 254.667-62 chr4 70126139 70126348 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -7361 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 137.334 chr15 86498746 86498905 + 1.66667 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) intron (NM_152336, intron 18 of 24) -181857 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 275-3 chr1 197970627 197970943 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 53413 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 361.667 chr1 89669020 89669377 + 1.66667 NA intron (NM_032270, intron 1 of 2) L1MB1|LINE|L1 36078 NM_032270 84230 Hs.412836 NM_032270 ENSG00000171488 LRRC8C AD158|FAD158 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit C protein-coding 316.667-16 chr2 153396804 153397021 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 81850 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 254.333-28 chr17 33220262 33220543 + 1.66667 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 72586 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 281-3 chr1 189144124 189144445 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 1331726 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 353.334-5 chr2 137499365 137499670 + 1.66667 NA intron (NM_001316349, intron 15 of 27) intron (NM_001316349, intron 15 of 27) 428415 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 266.334-9 chr11 112638234 112638445 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -82537 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 424.333-11 chr8 37504045 37504595 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10407 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 266.334-19 chr5 40620409 40620595 + 1.66667 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -59413 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 189-92 chr8 101845232 101845440 + 1.66667 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) Charlie10b|DNA|hAT-Charlie -54367 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 243.334 chr10 15779343 15779506 + 1.66667 NA intron (NM_024948, intron 14 of 14) intron (NM_024948, intron 14 of 14) -59089 NM_001291494 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 255-16 chr10 112039283 112039496 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 144376 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 233.667-74 chr8 88307124 88307395 + 1.66667 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 20224 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 305.333-53 chr4 98066889 98067272 + 1.66667 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) intron (NM_174952, intron 5 of 10) 76396 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 430.333-5 chr8 85849164 85849629 + 1.66667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -21454 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 241.667-79 chr6 45724374 45724580 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 213120 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 241.333-4 chr1 88510894 88511125 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -173135 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 287.334-7 chr16 82994286 82994565 + 1.66667 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) intron (NM_001220490, intron 2 of 12) -4127 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 249.667-84 chr6 114307918 114308067 + 1.66667 NA intron (NR_125845, intron 9 of 9) intron (NR_125845, intron 9 of 9) -245115 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 249-57 chr5 36260452 36260662 + 1.66667 NA intron (NM_001323279, intron 7 of 12) intron (NM_001323279, intron 7 of 12) -18278 NM_001287341 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 211.667-98 chr6 55976647 55976799 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -101133 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 281-8 chr14 63069032 63069230 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -23673 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 180-63 chr21 28378178 28378313 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -149578 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 230.666-44 chr6 61761412 61761571 + 1.66667 NA intron (NR_146874, intron 6 of 13) intron (NR_146874, intron 6 of 13) 187361 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 237-36 chr19 31983110 31983355 + 1.66667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -42630 NR_110675 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 220.666-35 chr2 111242819 111243111 + 1.66667 NA intron (NR_015395, intron 3 of 6) L1MEf|LINE|L1 78121 NR_039636 100616341 NR_039636 ENSG00000266139 MIR4435-2 mir-4435-2 microRNA 4435-2 ncRNA 239-35 chr2 191632261 191632404 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -45740 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 257.667-59 chr3 124630697 124631005 + 1.66667 NA intron (NM_007064, intron 1 of 26) intron (NM_007064, intron 1 of 26) 46192 NM_001322997 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 215.667-61 chr2 116430329 116430550 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1086624 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 226-35 chr2 16423207 16423479 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 242491 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 231-55 chr5 176782106 176782300 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28356 NM_133369 90249 Hs.33191 NM_133369 ENSG00000113763 UNC5A UNC5H1 unc-5 netrin receptor A protein-coding 255.333-67 chr21 42884917 42885130 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5434 NR_048535 10785 Hs.248815 NM_018669 ENSG00000160193 WDR4 GAMOS6|MIGSB|TRM82|TRMT82 WD repeat domain 4 protein-coding 271.667-65 chr7 124566947 124567235 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 198701 NM_005302 2861 Hs.406094 NM_005302 ENSG00000170775 GPR37 EDNRBL|PAELR|hET(B)R-LP G protein-coupled receptor 37 protein-coding 330.334-2 chr1 240106881 240107148 + 1.66667 NA intron (NM_020066, intron 1 of 17) intron (NM_020066, intron 1 of 17) 15131 NM_001305424 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 362.001-6 chr20 58439247 58439555 + 1.66667 NA intron (NM_004738, intron 4 of 5) intron (NM_004738, intron 4 of 5) 50172 NR_036633 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 198.667-108 chr2 151573128 151573342 + 1.66667 NA intron (NM_001271208, intron 107 of 182) intron (NM_001271208, intron 107 of 182) 161241 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 303-20 chr14 87898863 87899225 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 94138 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 388-14 chr3 100472079 100472378 + 1.66667 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 -20391 NM_001363876 55076 Hs.658956 NM_018004 ENSG00000181458 TMEM45A DERP7|DNAPTP4 transmembrane protein 45A protein-coding 181.667-57 chr18 54761617 54761835 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -66751 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 184.334-7 chr9 75992291 75992463 + 1.66667 NA intron (NR_120409, intron 3 of 19) intron (NR_120409, intron 3 of 19) 101704 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 230.666-6 chr10 74448672 74448868 + 1.66667 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) intron (NM_001369124, intron 6 of 9) 80554 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 194.667-149 chr8 53999742 53999887 + 1.66667 NA intron (NM_201437, intron 2 of 8) intron (NM_201437, intron 2 of 8) 22634 NR_109902 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 456.333-2 chr11 96923358 96923775 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 415141 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 439-3 chr2 29688768 29689122 + 1.66667 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) OldhAT1|DNA|hAT-Ac -213568 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 250.333-12 chr11 102039273 102039464 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -8069 NM_032930 85016 Hs.98328 NM_032930 ENSG00000137691 CFAP300 C11orf70|CILD38 cilia and flagella associated protein 300 protein-coding 337.001-4 chr5 124102182 124102397 + 1.66667 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1M5|LINE|L1 336231 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 283.667-19 chr2 205758458 205758739 + 1.66667 NA intron (NM_018534, intron 12 of 15) intron (NM_018534, intron 12 of 15) 76097 NM_018534 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 247.334-7 chr12 29486958 29487195 + 1.66667 NA non-coding (NR_073172, exon 2 of 2) non-coding (NR_073172, exon 2 of 2) 12617 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 225.666-9 chr17 53714515 53714692 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -108324 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 288.999-10 chr5 163760913 163761236 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 255455 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 557.334-3 chr22 28580692 28581419 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 98810 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 229-2 chr1 163686369 163686699 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -263343 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 266.333-31 chr2 154928021 154928278 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 229454 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 355-5 chr14 64375884 64376269 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -12277 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 304.334-9 chr5 52904940 52905247 + 1.66667 NA intron (NM_181501, intron 11 of 28) L1ME4c|LINE|L1 -84259 NR_073103 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 266.334-23 chr9 119865477 119865717 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -69463 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 210.333-141 chr5 180621363 180621574 + 1.66667 NA intron (NM_002020, intron 13 of 29) CpG-22961 28132 NM_001354989 2324 Hs.646917 NM_002020 ENSG00000037280 FLT4 FLT-4|FLT41|LMPH1A|LMPHM1|PCL|VEGFR-3|VEGFR3 fms related tyrosine kinase 4 protein-coding 142-111 chr5 23120592 23120692 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -267298 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 249.667-73 chr4 138635187 138635409 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 325587 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 294-10 chr10 69776096 69776324 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25696 NM_001368884 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 200.667-115 chr3 193030731 193030889 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -112954 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 273.334-12 chr4 56311327 56311581 + 1.66667 NA intron (NM_020722, intron 6 of 10) intron (NM_020722, intron 6 of 10) 76037 NM_001323890 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 184.667-115 chr6 102449157 102449342 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 1050264 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 251-72 chr5 128696386 128696624 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -158260 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 121.667-4 chr1 47356114 47356214 + 1.66667 NA intron (NM_001136140, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 22374 NR_046395 51727 Hs.731647 NM_016308 ENSG00000162368 CMPK1 CK|CMK|CMPK|UMK|UMP-CMPK|UMPK cytidine/uridine monophosphate kinase 1 protein-coding 243-60 chr6 146442619 146442803 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -101122 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 352.667-8 chr12 76394103 76394571 + 1.66667 NA intron (NM_001319655, intron 6 of 20) intron (NM_001319655, intron 6 of 20) 28948 NM_001319655 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 200.667-91 chr2 204681127 204681315 + 1.66667 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) L1ME3A|LINE|L1 135746 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 240-59 chr22 47707541 47707712 + 1.66667 NA intron (NR_122046, intron 7 of 8) L1ME5|LINE|L1 75952 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 255.666-6 chr12 21844526 21844789 + 1.66667 NA intron (NM_005691, intron 25 of 37) intron (NM_005691, intron 25 of 37) -69951 NM_004982 3764 Hs.102308 NM_004982 ENSG00000121361 KCNJ8 KIR6.1|uKATP-1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 8 protein-coding 286.334-2 chr11 37897977 37898193 + 1.66667 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 -40516 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 225-42 chr3 29149894 29150070 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 130957 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 182.334-4 chr5 26212343 26212485 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 826172 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 278.667-39 chr4 92983766 92984011 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 679489 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 280.333-23 chr3 18342060 18342402 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 83108 NM_002971 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 346.666-2 chr10 95283462 95283798 + 1.66667 NA intron (NM_020992, intron 1 of 6) intron (NM_020992, intron 1 of 6) 7373 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 247-46 chr20 56038481 56038647 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -33045 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 247.667-103 chrX 93415638 93415861 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 257829 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 233.667-19 chr14 21647368 21647581 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12534 NM_001005466 26534 Hs.554580 NM_001005466 ENSG00000255582 OR10G2 OR14-41 olfactory receptor family 10 subfamily G member 2 protein-coding 315.667-24 chr8 13286267 13286513 + 1.66667 NA intron (NM_001348082, intron 5 of 16) intron (NM_001348082, intron 5 of 16) -9606 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 373.333-19 chr3 69431926 69432307 + 1.66667 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger -46028 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 451.334-2 chr2 42612160 42612540 + 1.66667 NA intron (NM_001330443, intron 4 of 16) AluJr|SINE|Alu 43718 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 313.334-4 chr17 55878753 55878974 + 1.66667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 127758 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 448.999 chr10 86774772 86775180 + 1.66667 NA intron (NM_004329, intron 1 of 12) L1M5|LINE|L1 18337 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 210.334 chr12 82966928 82967101 + 1.66667 NA intron (NM_152588, intron 7 of 11) intron (NM_152588, intron 7 of 11) 279859 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 256-77 chr5 72747629 72747841 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -68856 NM_002270 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 250-11 chr10 28576636 28576864 + 1.66667 NA intron (NM_100486, intron 3 of 12) intron (NM_100486, intron 3 of 12) 43632 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 257.333-38 chr15 65751518 65751805 + 1.66667 NA intron (NM_005848, intron 4 of 31) L2|LINE|L2 -32329 NR_039736 100616379 NR_039736 ENSG00000264737 MIR4511 mir-4511 microRNA 4511 ncRNA 427-6 chr5 24800174 24800479 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 40257 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 141.667-55 chr12 39951634 39951747 + 1.66667 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) intron (NM_052885, intron 3 of 9) 154391 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 237.667-71 chr6 55778308 55778508 + 1.66667 NA intron (NM_001329754, intron 3 of 5) intron (NM_001329754, intron 3 of 5) 97182 NM_001329754 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 277.334-4 chr15 65160256 65160480 + 1.66667 NA intron (NM_006660, intron 6 of 13) intron (NM_006660, intron 6 of 13) 24974 NR_133680 10845 Hs.113823 NM_006660 ENSG00000166855 CLPX EPP2 caseinolytic mitochondrial matrix peptidase chaperone subunit protein-coding 286.333-38 chr6 57314694 57315040 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001282488) promoter-TSS (NM_001282488) 62 NM_001282488 5558 Hs.654580 NM_000947 ENSG00000146143 PRIM2 PRIM2A|p58 DNA primase subunit 2 protein-coding 221-5 chr1 96907813 96907974 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 185255 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 228.667-26 chr15 67688810 67689073 + 1.66667 NA intron (NM_001206804, intron 13 of 21) intron (NM_001206804, intron 13 of 21) -136568 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 256.667-78 chr6 167043974 167044163 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_194429, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_194429, exon 12 of 12) 44671 NM_007045 11116 Hs.487175 NM_007045 ENSG00000213066 FGFR1OP FOP FGFR1 oncogene partner protein-coding 462.667-4 chr4 58500744 58501268 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 35322 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 293.667-11 chr12 10567249 10567543 + 1.66667 NA intron (NR_146456, intron 1 of 2) L1MC5|LINE|L1 14017 NR_146455 101060038 NR_146455 LINC02446 - long intergenic non-protein coding RNA 2446 ncRNA 265-21 chr15 26234415 26234648 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 118718 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 253-64 chr7 79384516 79384827 + 1.66667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L1MA10|LINE|L1 -68286 NR_038346 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 321.334-5 chr2 13696161 13696435 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -689285 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 566.332 chr3 14930630 14931308 + 1.66667 NA intron (NM_152536, intron 18 of 19) L1ME2z|LINE|L1 16536 NR_046252 100505641 Hs.517821 NR_046251 ENSG00000225733 FGD5-AS1 - FGD5 antisense RNA 1 ncRNA 263.667-14 chr11 81787103 81787308 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 103631 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 425.332-2 chr19 33978483 33978916 + 1.66667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 181829 NM_024076 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 292.334-5 chr3 57088141 57088437 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9021 NM_001128615 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 302.333-34 chr8 57969825 57970156 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -8368 NR_130934 100505477 Hs.434693 NR_130934 ENSG00000205293 LINC01602 T1560 long intergenic non-protein coding RNA 1602 ncRNA 420.667-7 chr6 75698039 75698366 + 1.66667 NA intron (NM_001100409, intron 17 of 22) MER90a|LTR|ERV1 -51037 NM_001368137 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 251.333-86 chr5 29328192 29328431 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 67665 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 489.001 chr1 21056106 21056524 + 1.66667 NA intron (NM_003760, intron 1 of 31) intron (NM_003760, intron 1 of 31) 55068 NM_003760 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 427.667-9 chr9 34951355 34951780 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -5920 NR_136307 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 225.333-20 chr10 79588451 79588663 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22382 NM_001164647 653509 Hs.535295 NM_005411 ENSG00000122852 SFTPA1 COLEC4|PSAP|PSP-A|PSPA|SFTP1|SFTPA1B|SP-A|SP-A1|SPA|SPA1 surfactant protein A1 protein-coding 370.333-9 chr17 27362628 27362940 + 1.66667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -55221 NR_033892 440419 Hs.385755 NR_033892 ENSG00000266433 TBC1D3P5 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 5 pseudo 216.333-11 chr1 173827083 173827321 + 1.66667 NA intron (NM_001365212, intron 2 of 15) intron (NM_001365212, intron 2 of 15) 2529 NM_001365212 55157 Hs.647707 NM_018122 ENSG00000117593 DARS2 ASPRS|LBSL|MT-ASPRS|mtAspRS aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 233-60 chr8 86521554 86521773 + 1.66667 NA intron (NM_003909, intron 2 of 16) MIRc|SINE|MIR 7228 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 265.333-72 chr6 127338516 127338805 + 1.66667 NA intron (NM_001002030, intron 1 of 5) intron (NM_001002030, intron 1 of 5) 3747 NM_001139510 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 199.334-3 chr3 67526713 67526886 + 1.66667 NA intron (NM_001177599, intron 4 of 10) L1MDa|LINE|L1 127815 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 275.334-3 chr10 43470256 43470456 + 1.66667 NA intron (NM_001355446, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 33245 NM_001355450 642819 Hs.719657 NM_001355444 ENSG00000243660 ZNF487 KRBO1|ZNF487P zinc finger protein 487 protein-coding 363-15 chr8 80673659 80673955 + 1.66667 NA intron (NM_001033723, intron 4 of 8) intron (NM_001033723, intron 4 of 8) 187581 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 304.333-23 chr3 71723184 71723420 + 1.66667 NA intron (NM_173359, intron 2 of 7) intron (NM_173359, intron 2 of 7) 2100 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 241.667-42 chr2 187072184 187072389 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -223116 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 242.667-80 chr4 167645847 167646065 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -411366 NM_001204352 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 289.667-33 chr7 17432436 17432673 + 1.66667 NA intron (NR_110015, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 57637 NR_110014 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 266.667-5 chr1 85908524 85908801 + 1.66667 NA intron (NM_152890, intron 26 of 59) intron (NM_152890, intron 26 of 59) -200229 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 348-19 chr4 180411065 180411408 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 747913 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 254.334-29 chr6 143353712 143353880 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 88881 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 248-84 chr8 51084893 51085119 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 724439 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 304.334-6 chr3 20225009 20225331 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -38937 NM_001199255 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 217.667-36 chr17 71533671 71533836 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -331574 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 358.334-4 chr2 156576063 156576488 + 1.66667 NA intron (NM_000408, intron 13 of 16) L3|LINE|CR1 139896 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 235.333-82 chr4 43584746 43585001 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -92330 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 264.667-67 chr5 82668600 82668849 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -171431 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 242.334-8 chr17 60524641 60524801 + 1.66667 NA intron (NM_006380, intron 1 of 12) intron (NM_006380, intron 1 of 12) 1519 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 373-16 chr4 114061446 114061856 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -82004 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 250.667-11 chr11 30597852 30598087 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -11616 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 342.667-11 chr6 39516429 39516720 + 1.66667 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) L1ME3G|LINE|L1 -85184 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 280.334-11 chr6 80457526 80457820 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 351002 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 300.334-14 chr8 88740500 88740800 + 1.66667 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -413167 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 378.667-5 chr1 233224201 233224529 + 1.66667 NA intron (NM_014801, intron 10 of 33) intron (NM_014801, intron 10 of 33) 71360 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 236.333-3 chr1 33274959 33275211 + 1.66667 NA intron (NM_001370212, intron 1 of 7) intron (NM_001370212, intron 1 of 7) 5392 NM_001370212 149076 Hs.743358 NM_152493 ENSG00000160094 ZNF362 RN|lin-29 zinc finger protein 362 protein-coding 286-57 chr7 91979313 91979595 + 1.66667 NA intron (NM_147185, intron 2 of 49) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 38579 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 269.667-30 chr2 47780775 47781045 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2172 NM_000179 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 274-23 chr2 12894189 12894378 + 1.66667 NA Intergenic ORSL|DNA|hAT-Tip100 112730 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 281-37 chr5 123873674 123873852 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 328346 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 359-16 chr5 115396673 115397119 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -100242 NM_001040440 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 276.667-31 chr16 1619280 1619553 + 1.66667 NA intron (NM_020825, intron 1 of 19) AluSx|SINE|Alu 4776 NM_020825 57585 Hs.603676 NM_020825 ENSG00000007545 CRAMP1 CRAMP1L|HN1L|TCE4 cramped chromatin regulator homolog 1 protein-coding 274.667-10 chr10 103137792 103138027 + 1.66667 NA intron (NM_001351175, intron 4 of 19) intron (NM_001351175, intron 4 of 19) 15912 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 382.334-2 chr12 12613071 12613351 + 1.66667 NA intron (NM_001310, intron 1 of 3) intron (NM_001310, intron 1 of 3) 1335 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 220.333-30 chr11 79222135 79222507 + 1.66667 NA intron (NM_001098816, intron 2 of 33) L1PA10|LINE|L1 179788 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 235.333-28 chr12 32359582 32359852 + 1.66667 NA intron (NM_001354186, intron 9 of 10) intron (NM_001354186, intron 9 of 10) -39841 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 256.667-86 chr8 118794082 118794358 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 157665 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 184.333-156 chr8 122203801 122203963 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 364762 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 348.667-16 chr20 62437273 62437659 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9927 NM_080833 140893 Hs.180374 NM_080833 ENSG00000130701 RBBP8NL C20orf151 RBBP8 N-terminal like protein-coding 255-47 chr20 42634958 42635274 + 1.66667 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) intron (NM_133170, intron 7 of 31) -50367 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 211.667-33 chr12 41193220 41193364 + 1.66667 NA intron (NM_001164595, intron 2 of 9) intron (NM_001164595, intron 2 of 9) 4972 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 286.667-13 chr15 58137697 58137992 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001320636) promoter-TSS (NM_001320636) -325 NM_001320636 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 313-2 chr1 97293322 97293600 + 1.66667 NA intron (NR_046590, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 197538 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 288.333-32 chr5 142229573 142230002 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 88535 NR_131221 100642175 Hs.684549 NR_131221 SPRY4-IT1 SPRIGHTLY SPRY4 intronic transcript 1 ncRNA 162.334-2 chr17 58862238 58862402 + 1.66667 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 106451 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 195-80 chr4 113654263 113654395 + 1.66667 NA intron (NM_001221, intron 3 of 18) intron (NM_001221, intron 3 of 18) 107409 NM_001321592 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 346.333-28 chr7 68302003 68302353 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 281925 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 307.667-7 chr10 74536428 74536782 + 1.66667 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) L1MB4|LINE|L1 -7281 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 311-3 chr10 50579816 50580119 + 1.66667 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) HAL1|LINE|L1 43989 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 317.667-34 chr5 78208529 78208866 + 1.66667 NA intron (NM_003664, intron 7 of 26) intron (NM_003664, intron 7 of 26) 86001 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 238.333-12 chr11 21824873 21825125 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -368086 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 241.667-69 chr5 12928666 12928847 + 1.66667 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 104130 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 252.667-29 chr14 50900709 50900880 + 1.66667 NA intron (NM_001206673, intron 9 of 12) L2a|LINE|L2 28634 NM_181814 145447 Hs.271896 NM_181533 ENSG00000131969 ABHD12B BEM46L3|C14orf29|c14_5314 abhydrolase domain containing 12B protein-coding 280.334 chr1 38896619 38896835 + 1.66667 NA intron (NM_001304746, intron 4 of 7) intron (NM_001304746, intron 4 of 7) -15101 NR_037635 100527950 Hs.591506 NR_037633 GJA9-MYCBP Cx58|Cx59|GJA10|GJA9 GJA9-MYCBP readthrough ncRNA 238-74 chr5 52564294 52564527 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -223506 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 295.667-21 chr5 21573646 21573959 + 1.66667 NA intron (NR_027026, intron 4 of 4) intron (NR_027026, intron 4 of 4) 114322 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 258.999-7 chr3 178867167 178867429 + 1.66667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6893 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 266.666-16 chr18 28658178 28658442 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -481180 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 360.334 chr18 38217167 38217494 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 560195 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 225.667-85 chr9 87084492 87084677 + 1.66667 NA non-coding (NR_036691, exon 1 of 1) non-coding (NR_036691, exon 1 of 1) 641 NR_036691 494127 Hs.626316 NR_036691 LOC494127 - NFYC pseudogene pseudo 248-31 chr17 59391454 59391739 + 1.66667 NA intron (NM_001005404, intron 4 of 4) intron (NM_001005404, intron 4 of 4) 25513 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 284.667-44 chr6 83525328 83525565 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001170423, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001170423, exon 3 of 3) 12912 NM_001170423 167681 Hs.98381 NM_153362 ENSG00000146250 PRSS35 C6orf158|dJ223E3.1 serine protease 35 protein-coding 323-25 chr6 51369967 51370280 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -251747 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 237.334-3 chr15 69074678 69074981 + 1.66667 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 -6021 NR_026949 283673 Hs.177927 NM_173610 ENSG00000212766 EWSAT1 LINC00277|NCRNA00277|TMEM84 Ewing sarcoma associated transcript 1 ncRNA 244.667-35 chr12 84378565 84378786 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 534124 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 320.667-5 chr10 51240330 51240559 + 1.66667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) L2c|LINE|L2 -59129 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 355.333-5 chr11 39102182 39102660 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 453563 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 264.334-9 chr16 35438104 35438294 + 1.66667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 42397 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 324.334-2 chr10 62930214 62930458 + 1.66667 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -111169 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 266.334-10 chr12 62493872 62494044 + 1.66667 NA exon (NM_001278471, exon 3 of 34) exon (NM_001278471, exon 3 of 34) 27132 NM_001278471 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 199.334 chr1 10282362 10282555 + 1.66667 NA exon (NM_015074, exon 13 of 47) exon (NM_015074, exon 13 of 47) -16508 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 260-51 chr3 5620923 5621152 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -370782 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 290.334 chr1 9403120 9403390 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 25661 NR_104623 100506022 Hs.131775 NR_104622 ENSG00000284693 LINC02606 - long intergenic non-protein coding RNA 2606 ncRNA 240.667-86 chr9 28081631 28081781 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR -507840 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 528.666-4 chr5 44277756 44278639 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -110535 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 329-10 chr18 1861784 1862308 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -502417 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 256.666-51 chr9 131932260 131932448 + 1.66667 NA intron (NM_004269, intron 4 of 7) L1MA2|LINE|L1 147513 NM_001253882 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 498.334-2 chr5 39099692 39100109 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25501 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 433.667-8 chr5 108928565 108929096 + 1.66667 NA intron (NM_001308031, intron 1 of 10) intron (NM_001308031, intron 1 of 10) 4224 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 270-45 chr4 108062339 108062515 + 1.66667 NA intron (NM_001130714, intron 9 of 9) L2|LINE|L2 57763 NM_001331027 3033 Hs.438289 NM_005327 ENSG00000138796 HADH HAD|HADH1|HADHSC|HCDH|HHF4|MSCHAD|SCHAD hydroxyacyl-CoA dehydrogenase protein-coding 438-13 chr8 66862672 66863034 + 1.66667 NA TTS (NM_170709) TTS (NM_170709) -7918 NM_173518 157777 Hs.437006 NM_173518 ENSG00000178460 MCMDC2 C8orf45 minichromosome maintenance domain containing 2 protein-coding 258.667-50 chr2 169934407 169934605 + 1.66667 NA intron (NM_172070, intron 19 of 38) Alu|SINE|Alu 106998 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 266.334-7 chr1 244403255 244403494 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 48535 NM_001126 159 Hs.498313 NM_001126 ENSG00000035687 ADSS ADEH|ADSS 2|ADSS2 adenylosuccinate synthase protein-coding 262.667-10 chr10 27056035 27056314 + 1.66667 NA intron (NM_014915, intron 15 of 33) AluSx1|SINE|Alu 44324 NM_001256053 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 199-90 chr6 61827265 61827465 + 1.66667 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) LTR80A|LTR|ERVL 253235 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 417-7 chr5 54779729 54780279 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35746 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 252-31 chr14 71410039 71410328 + 1.66667 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) 11846 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 254.334-18 chr2 53054410 53054586 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -351883 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 259.667-5 chr1 170827627 170827789 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -107763 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 178.667-27 chr10 106455176 106455388 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 315117 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 401-9 chr2 188288484 188288797 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_126396) promoter-TSS (NR_126396) -949 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 249.667-20 chr12 13675486 13675680 + 1.66667 NA intron (NM_000834, intron 4 of 12) intron (NM_000834, intron 4 of 12) -298838 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 302.667-39 chr9 27791618 27791905 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -217895 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 332.666-10 chr14 19871174 19871524 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2176 NR_145507 283617 NM_001348266 ENSG00000176290 OR4K3 OR14-10|OR4K3P olfactory receptor family 4 subfamily K member 3 (gene/pseudogene) protein-coding 277.667-30 chr3 103393991 103394307 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 129967 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 240-93 chr8 117399186 117399388 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -121426 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 277-30 chr20 18186788 18187143 + 1.66667 NA intron (NM_020536, intron 9 of 9) intron (NM_020536, intron 9 of 9) 41866 NR_028402 57325 Hs.488051 NM_020536 ENSG00000149474 KAT14 ATAC2|CRP2BP|CSRP2BP|PRO1194|dJ717M23.1 lysine acetyltransferase 14 protein-coding 267.333-28 chr13 97154590 97154790 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 24932 NR_125725 103625683 Hs.679591 NR_125725 ENSG00000233124 LINC00456 - long intergenic non-protein coding RNA 456 ncRNA 334.667-29 chr8 118561250 118561640 + 1.66667 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -59556 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 279.999-2 chr1 238411645 238412013 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 74188 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 251.333-97 chr6 41474216 41474505 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -28084 NR_120347 103106903 Hs.563396 NR_120347 ENSG00000226917 LINC01276 - long intergenic non-protein coding RNA 1276 ncRNA 229.666-29 chr7 40873402 40873617 + 1.66667 NA Intergenic (CCATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 106430 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 182.333-144 chr7 52098831 52099046 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -705682 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 464.999-2 chr8 125328992 125329430 + 1.66667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -101147 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 220.333-18 chr10 102055273 102055511 + 1.66667 NA intron (NM_024541, intron 1 of 25) intron (NM_024541, intron 1 of 25) 781 NM_024541 79591 Hs.16004 NM_024541 ENSG00000120029 ARMH3 C10orf76 armadillo like helical domain containing 3 protein-coding 333-26 chr8 80758929 80759161 + 1.66667 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR 115423 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 252.999-2 chr13 49574714 49575009 + 1.66667 NA intron (NM_001352502, intron 1 of 11) L1MB3|LINE|L1 10697 NR_148015 55213 Hs.508021 NM_018191 ENSG00000136144 RCBTB1 CLLD7|CLLL7|GLP|RDEOA RCC1 and BTB domain containing protein 1 protein-coding 420.334 chr10 34486114 34486780 + 1.66667 NA intron (NM_001184789, intron 3 of 22) L2b|LINE|L2 328849 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 187-45 chr20 45239649 45239850 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 14815 NM_003064 6590 Hs.517070 NM_003064 ENSG00000124107 SLPI ALK1|ALP|BLPI|HUSI|HUSI-I|MPI|WAP4|WFDC4 secretory leukocyte peptidase inhibitor protein-coding 242-43 chr2 124004417 124004656 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 20638 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 367.667-7 chr15 44434263 44434799 + 1.66667 NA intron (NM_016396, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 6902 NM_016396 51496 Hs.497967 NM_016396 ENSG00000137770 CTDSPL2 HSPC058|HSPC129 CTD small phosphatase like 2 protein-coding 231.667-57 chr7 134170202 134170401 + 1.66667 NA intron (NM_001365700, intron 7 of 15) intron (NM_001365700, intron 7 of 15) 42961 NM_144648 136332 Hs.149774 NM_144648 ENSG00000155530 LRGUK CFAP246 leucine rich repeats and guanylate kinase domain containing protein-coding 251-18 chr12 88082167 88082337 + 1.66667 NA intron (NM_025114, intron 37 of 53) intron (NM_025114, intron 37 of 53) 46716 NM_001009894 91298 Hs.591009 NM_001009894 ENSG00000133641 C12orf29 - chromosome 12 open reading frame 29 protein-coding 646.666-4 chr5 17713581 17714454 + 1.66667 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -58379 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 334.001-4 chr7 95510486 95510768 + 1.66667 NA intron (NM_145872, intron 2 of 2) intron (NM_145872, intron 2 of 2) 24684 NM_016116 51666 Hs.602765 NM_016116 ENSG00000005981 ASB4 ASB-4 ankyrin repeat and SOCS box containing 4 protein-coding 240.667-78 chr8 62613432 62613584 + 1.66667 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) L1MA1|LINE|L1 -364353 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 162-33 chr12 115050984 115051107 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -366870 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 547.334 chr1 200099340 200099980 + 1.66667 NA intron (NM_205860, intron 5 of 7) AluSc8|SINE|Alu 56835 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 235.334-9 chr8 122395284 122395456 + 1.66667 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 173274 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 291.333 chr1 48270106 48270473 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 47573 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 194.666-71 chr8 119001019 119001253 + 1.66667 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 48873 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 308.667-44 chr8 130147622 130147860 + 1.66667 NA intron (NM_001362925, intron 14 of 29) intron (NM_001362925, intron 14 of 29) -62973 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 222-82 chr6 72779205 72779422 + 1.66667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) L2b|LINE|L2 148818 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 552.667-2 chr2 180131851 180132306 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -124781 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 204.333-8 chr1 69667474 69667687 + 1.66667 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) L1MA3|LINE|L1 98239 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 301.334-8 chr3 13108478 13108701 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35160 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 261.333-37 chr17 59722670 59722950 + 1.66667 NA intron (NM_001329394, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 15156 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 264.333-63 chr5 149936673 149936944 + 1.66667 NA intron (NM_000440, intron 1 of 21) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -3831 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 513 chr11 21861260 21861856 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -331527 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 435.334-4 chr8 119059350 119059630 + 1.66667 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) L1ME1|LINE|L1 -7757 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 196.334-5 chr14 60842799 60842941 + 1.66667 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 108109 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 257.667-84 chr8 120542983 120543266 + 1.66667 NA intron (NM_021021, intron 5 of 6) intron (NM_021021, intron 5 of 6) 97705 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 211.667-57 chr2 63061260 63061485 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 10542 NR_130153 5013 Hs.734360 NM_014562 ENSG00000115507 OTX1 - orthodenticle homeobox 1 protein-coding 294-52 chr5 85354649 85355066 + 1.66667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -927587 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 274.334-4 chr2 156204268 156204511 + 1.66667 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) intron (NR_110250, intron 1 of 3) 50542 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 286-3 chr1 245230767 245231042 + 1.66667 NA intron (NR_151721, intron 1 of 4) L1MC4|LINE|L1 3613 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 159-60 chr2 79799505 79799699 + 1.66667 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) intron (NM_001282598, intron 3 of 17) 66981 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 227.333-44 chr16 60105323 60105533 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 250075 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 248-90 chr8 99379074 99379306 + 1.66667 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) MER1B|DNA|hAT-Charlie 157540 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 229.666-9 chr13 56001270 56001468 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 826915 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 238.334-8 chr2 101815372 101815554 + 1.66667 NA intron (NM_145686, intron 3 of 30) L1MEc|LINE|L1 117756 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 473.999 chr12 4346784 4347317 + 1.66667 NA intron (NM_020375, intron 3 of 5) L1MA2|LINE|L1 25837 NM_020375 57103 Hs.504545 NM_020375 ENSG00000078237 TIGAR C12orf5|FR2BP TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase protein-coding 260.334-5 chr11 107459942 107460114 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -2182 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 199-118 chr8 92091721 92091915 + 1.66667 NA intron (NM_001198627, intron 2 of 13) intron (NM_001198627, intron 2 of 13) 3412 NM_001198629 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 251.334-19 chr3 136974696 136974854 + 1.66667 NA intron (NM_144717, intron 1 of 6) L1MA4A|LINE|L1 16792 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 480 chr10 25413245 25414164 + 1.66667 NA intron (NM_020752, intron 4 of 10) intron (NM_020752, intron 4 of 10) -237428 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 256.667-17 chr12 9765225 9765502 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4462 NM_001781 969 Hs.208854 NM_001781 ENSG00000110848 CD69 AIM|BL-AC/P26|CLEC2C|EA1|GP32/28|MLR-3 CD69 molecule protein-coding 255.334-12 chr17 60742071 60742334 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) LTR37A|LTR|ERV1 64351 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 331.334-4 chr21 26019632 26020009 + 1.66667 NA intron (NM_001204301, intron 6 of 16) intron (NM_001204301, intron 6 of 16) 120570 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 194.333-30 chr11 31539808 31540056 + 1.66667 NA intron (NM_001288725, intron 3 of 10) intron (NM_001288725, intron 3 of 10) 30165 NM_001288725 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 218.334-3 chr3 15947525 15947724 + 1.66667 NA Intergenic AluYe5|SINE|Alu 73853 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 430.667-9 chr5 160570945 160571367 + 1.66667 NA intron (NM_001366652, intron 23 of 24) L1MEd|LINE|L1 85804 NR_029701 406938 NR_029701 ENSG00000283733 MIR146A MIRN146|MIRN146A|miR-146a|miRNA146A microRNA 146a ncRNA 166.667-208 chr6 126618737 126618893 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 134184 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 287.334-6 chr14 36938830 36939041 + 1.66667 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) 13456 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 308.333-15 chr16 74236619 74236938 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21257 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 236-9 chr10 111317206 111317564 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 203094 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 284.667-46 chr6 162813769 162814023 + 1.66667 NA intron (NM_001080379, intron 1 of 4) intron (NM_001080379, intron 1 of 4) 85926 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 173.334 chr17 29857841 29858004 + 1.66667 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) L1MB2|LINE|L1 -71981 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 248-5 chr1 229500218 229500472 + 1.66667 NA intron (NM_018230, intron 4 of 25) L1MD|LINE|L1 7996 NM_018230 55746 Hs.12457 NM_018230 ENSG00000069248 NUP133 GAMOS8|NPHS18|hNUP133 nucleoporin 133 protein-coding 401.999-4 chr5 37814350 37814742 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001278098, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001278098, exon 3 of 3) 20276 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 207-67 chr2 82812748 82812944 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -43957 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 246.667-57 chr3 88041720 88041911 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 17181 NM_003663 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 229.334-2 chr14 82743437 82743614 + 1.66667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 100893 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 273.667-50 chr9 4808878 4809088 + 1.66667 NA intron (NM_001286699, intron 1 of 6) intron (NM_001286699, intron 1 of 6) 16039 NM_005772 10171 Hs.194121 NM_005772 ENSG00000120158 RCL1 RNAC|RPCL1 RNA terminal phosphate cyclase like 1 protein-coding 260.334-2 chr1 87402000 87402219 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30454 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 117.667-143 chr4 157711000 157711102 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 138561 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 242.667-4 chr1 69141286 69141478 + 1.66667 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) L1PA7|LINE|L1 85484 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 231.334-8 chr5 55472063 55472310 + 1.66667 NA intron (NM_176895, intron 2 of 5) intron (NM_176895, intron 2 of 5) 36740 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 326.334-4 chr17 49348108 49348418 + 1.66667 NA intron (NR_135579, intron 1 of 7) AluJr4|SINE|Alu -12902 NR_110884 102724596 Hs.559253 NR_110882 ENSG00000248714 LOC102724596 - uncharacterized LOC102724596 ncRNA 258-82 chr7 123120077 123120337 + 1.66667 NA intron (NM_022444, intron 12 of 14) HAL1|LINE|L1 79762 NM_022444 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 267.667-4 chr1 220790276 220790576 + 1.66667 NA intron (NM_022746, intron 1 of 6) intron (NM_022746, intron 1 of 6) 3513 NM_022746 64757 Hs.497816 NM_022746 ENSG00000186205 MARC1 MOSC1 mitochondrial amidoxime reducing component 1 protein-coding 232-20 chr11 114814950 114815102 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 136499 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 290-17 chr2 10589890 10590200 + 1.66667 NA intron (NR_048552, intron 16 of 19) intron (NR_048552, intron 16 of 19) 99930 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 259.667-70 chr7 8270141 8270296 + 1.66667 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) L1MC|LINE|L1 -7606 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 507.334 chr13 79553004 79553525 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001161407, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001161407, exon 8 of 8) -13463 NR_125772 103724388 Hs.434862 NR_125772 ENSG00000227676 LINC01068 - long intergenic non-protein coding RNA 1068 ncRNA 253-57 chr5 151289843 151290082 + 1.66667 NA intron (NM_001145017, intron 4 of 10) L1MC4a|LINE|L1 13804 NM_181774 285641 Hs.720893 NM_181774 ENSG00000186334 SLC36A3 PAT3|TRAMD2|tramdorin2 solute carrier family 36 member 3 protein-coding 256.667-93 chr9 99128648 99128824 + 1.66667 NA intron (NM_004612, intron 1 of 8) intron (NM_004612, intron 1 of 8) 23623 NM_001130916 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 352.333-25 chr7 53655066 53655548 + 1.66667 NA TTS (NR_038371) TTS (NR_038371) 156624 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 323.334 chr1 111071190 111071425 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -68076 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 237.333-93 chr5 172512089 172512345 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 46797 NR_146726 105377728 Hs.131465 NR_146726 LINC01944 CTB-54I1.1 long intergenic non-protein coding RNA 1944 ncRNA 251.333-91 chr5 166117189 166117498 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 809027 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 400.333-15 chr5 9976557 9976986 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -72947 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 244.666-48 chr7 33377262 33377621 + 1.66667 NA intron (NM_198428, intron 17 of 22) L1PREC2|LINE|L1 247877 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 258.667-33 chr15 55955968 55956150 + 1.66667 NA intron (NM_001329212, intron 2 of 28) AluJb|SINE|Alu 37553 NM_001329212 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 264.334-25 chrX 155299391 155299553 + 1.66667 NA intron (NM_001289, intron 1 of 5) L1ME4b|LINE|L1 -34981 NM_171998 116442 Hs.632832 NM_171998 ENSG00000155961 RAB39B BGMR|MRX72|WSMN|WSN RAB39B, member RAS oncogene family protein-coding 263.334-5 chr2 22067296 22067559 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -356775 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 331.334-13 chr6 156867655 156867925 + 1.66667 NA intron (NM_017519, intron 2 of 18) intron (NM_017519, intron 2 of 18) -88059 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 151.667-267 chr5 20688141 20688281 + 1.66667 NA intron (NR_149120, intron 3 of 11) intron (NR_149120, intron 3 of 11) -72676 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 251.667-69 chr4 55276513 55276697 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -69637 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 266.667-69 chr7 54063893 54064100 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -252065 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 338.999-4 chr4 47742314 47742736 + 1.66667 NA intron (NM_006587, intron 5 of 21) L1MC3|LINE|L1 -88820 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 260.667-60 chr4 35545708 35545939 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 698116 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 262.333-80 chr8 134027416 134027728 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 141076 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 265.333-31 chr18 9199712 9199938 + 1.66667 NA intron (NM_001204056, intron 3 of 11) HAL1b|LINE|L1 62262 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 244.334-20 chr6 21710531 21710682 + 1.66667 NA intron (NR_015410, intron 2 of 11) intron (NR_015410, intron 2 of 11) 44193 NR_015410 401237 Hs.712707 NR_015410 CASC15 CANT|LINC00340|lnc-SOX4-1 cancer susceptibility 15 ncRNA 369-6 chr15 34080202 34080585 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 21469 NM_020154 56851 Hs.160565 NM_020154 ENSG00000134153 EMC7 C11orf3|C15orf24|HT022|ORF1-FL1 ER membrane protein complex subunit 7 protein-coding 275-9 chr12 78572358 78572584 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -212725 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 343.667-7 chr2 136295487 136295860 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -177518 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 438 chr10 22784501 22784894 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -70119 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 247.334-20 chr7 3060986 3061189 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -17220 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 430-6 chr7 41496322 41496899 + 1.66667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -197309 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 345.334-6 chr2 82094448 82094799 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -627677 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 158.666-32 chr8 130926044 130926264 + 1.66667 NA intron (NM_001115, intron 5 of 17) (TACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 114755 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 232-91 chr8 121834256 121834483 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -192929 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 299-26 chr2 231678712 231679028 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -29655 NM_001099285 5757 Hs.459927 NM_002823 ENSG00000187514 PTMA TMSA prothymosin alpha protein-coding 331-35 chr6 25859177 25859539 + 1.66667 NA intron (NM_006632, intron 4 of 11) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 14885 NM_006632 10786 Hs.327179 NM_006632 ENSG00000124564 SLC17A3 GOUT4|NPT4|UAQTL4 solute carrier family 17 member 3 protein-coding 472.333-5 chrX 122184685 122185102 + 1.66667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 813921 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 210.334-5 chr22 28065258 28065439 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -144736 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 257.333-74 chr5 15182452 15182663 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 84003 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 234.667-79 chr4 31190431 31190608 + 1.66667 NA intron (NR_125935, intron 2 of 4) intron (NR_125935, intron 2 of 4) 19375 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 291.666-2 chr10 101276042 101276323 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12632 NR_120621 101927419 Hs.638503 NR_120621 ENSG00000229649 LINC02681 - long intergenic non-protein coding RNA 2681 ncRNA 255-75 chr7 37606165 37606379 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -77494 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 328.333-18 chr2 64179611 64180021 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 25669 NR_033837 150992 Hs.272318 NR_033837 ENSG00000230923 LINC00309 NCRNA00309 long intergenic non-protein coding RNA 309 ncRNA 438.334-4 chr7 67900444 67900782 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -119640 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 235.333-95 chr5 65356958 65357139 + 1.66667 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) intron (NR_135689, intron 7 of 25) 124872 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 190.334-3 chr5 19178764 19178918 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 707431 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 393.334-4 chr3 133429238 133429619 + 1.66667 NA non-coding (NR_135278, exon 5 of 5) non-coding (NR_135278, exon 5 of 5) 26348 NR_135278 85003 Hs.659202 NR_135276 ENSG00000249993 BFSP2-AS1 - BFSP2 antisense RNA 1 ncRNA 265-36 chr2 129007024 129007326 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 142575 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 196.333-106 chr3 70682955 70683087 + 1.66667 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -370383 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 289-19 chr3 95613244 95613515 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 69814 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 155.667-207 chr22 38159922 38160045 + 1.66667 NA intron (NM_001349869, intron 2 of 16) L1ME3A|LINE|L1 21847 NM_001004426 8398 Hs.170479 NM_003560 ENSG00000184381 PLA2G6 CaI-PLA2|GVI|INAD1|IPLA2-VIA|NBIA2|NBIA2A|NBIA2B|PARK14|PLA2|PNPLA9|iPLA2|iPLA2beta phospholipase A2 group VI protein-coding 341.334-2 chr14 64360928 64361248 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13477 NR_033777 441687 Hs.685242 NR_033777 TEX21P - testis expressed 21, pseudogene pseudo 181.667-145 chr8 71729248 71729424 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -113787 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 193.667-105 chr5 124063539 124063727 + 1.66667 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 374887 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 242-14 chr10 56194721 56194970 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 166414 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 341.334-3 chr3 176560948 176561240 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 45991 NR_107017 102465858 NR_107017 ENSG00000283333 MIR7977 hsa-mir-7977 microRNA 7977 ncRNA 503 chr18 12676673 12677001 + 1.66667 NA intron (NM_001271989, intron 9 of 10) L1MEd|LINE|L1 18098 NM_147163 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 249-52 chr3 55302582 55302774 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 124506 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 257.667-16 chr12 128991688 128991866 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -117913 NR_104172 283352 Hs.665667 NR_104172 ENSG00000249196 TMEM132D-AS1 - TMEM132D antisense RNA 1 ncRNA 222-60 chr3 80761090 80761275 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3715 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 246.333-95 chr8 36345507 36345764 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -438739 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 229.333-87 chr4 89587378 89587634 + 1.66667 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -248895 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 307.333-42 chr2 79247504 79247853 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -87925 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 260-78 chr8 11510045 11510305 + 1.66667 NA intron (NM_001330465, intron 1 of 11).2 intron (NM_001330465, intron 1 of 11).2 15788 NM_001715 640 Hs.146591 NM_001715 ENSG00000136573 BLK MODY11 BLK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 265-63 chr8 73074067 73074289 + 1.66667 NA intron (NM_153225, intron 2 of 4) intron (NM_153225, intron 2 of 4) 18994 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 293.333-14 chr14 74004639 74004981 + 1.66667 NA intron (NM_001321986, intron 3 of 16) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 14478 NM_001321988 957 Hs.655070 NM_001249 ENSG00000187097 ENTPD5 CD39L4|NTPDase-5|PCPH ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (inactive) protein-coding 339.334-2 chr11 90885070 90885415 + 1.66667 NA intron (NR_104190, intron 6 of 6) MER110A|LTR|ERV1 -16040 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 238.667-74 chr5 154050980 154051137 + 1.66667 NA intron (NM_001242336, intron 2 of 2) intron (NM_001242336, intron 2 of 2) 12091 NM_001135037 4238 Hs.432818 NM_005927 ENSG00000037749 MFAP3 - microfibril associated protein 3 protein-coding 257-38 chr3 68140644 68140858 + 1.66667 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 136504 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 218.667-19 chr11 47630634 47630871 + 1.66667 NA intron (NM_014342, intron 7 of 12) intron (NM_014342, intron 7 of 12) 11807 NM_014342 23788 Hs.269944 NM_014342 ENSG00000109919 MTCH2 HSPC032|MIMP|SLC25A50 mitochondrial carrier 2 protein-coding 257.667-24 chr14 98978976 98979132 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 267441 NR_161367 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 257.667-67 chr6 12766737 12766934 + 1.66667 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) intron (NM_001322308, intron 3 of 13) 48136 NM_001322310 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 265.667-41 chr20 47469399 47469630 + 1.66667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -32373 NM_001174088 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 275.334-5 chr15 49876264 49876496 + 1.66667 NA exon (NM_024837, exon 25 of 28) exon (NM_024837, exon 25 of 28) 236999 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 330.667-29 chr8 21292196 21292550 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -5866 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 257-56 chr5 127774333 127774609 + 1.66667 NA intron (NM_001317938, intron 3 of 6) L1MB5|LINE|L1 71082 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 223.334-3 chr10 111012512 111012680 + 1.66667 NA non-coding (NR_136749, exon 8 of 8) non-coding (NR_136749, exon 8 of 8) 23670 NR_031614 100313921 NR_031614 ENSG00000221214 MIR548E MIRN548E|hsa-mir-548e microRNA 548e ncRNA 182.667-111 chr3 192599665 192599883 + 1.66667 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 84752 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 401.334-3 chr5 56677162 56677467 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -71058 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 246-62 chr22 24331582 24331737 + 1.66667 NA intron (NM_015330, intron 8 of 16) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -10449 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 389.667-4 chr10 74657648 74657969 + 1.66667 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) L2c|LINE|L2 -128484 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 254.334-24 chr5 44143506 44143679 + 1.66667 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -245140 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 252.334-17 chr5 58572399 58572600 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9653 NM_001317915 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 249.667-30 chr15 63128429 63128639 + 1.66667 NA intron (NM_001288585, intron 4 of 4) AluJr|SINE|Alu 6673 NM_171846 114294 Hs.410388 NM_032857 ENSG00000103642 LACTB G24|MRPL56 lactamase beta protein-coding 268-12 chr11 41375192 41375541 + 1.66667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 84270 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 249.667-69 chr4 79952134 79952303 + 1.66667 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) (TAGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 121011 NM_058172 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 479.667-2 chr2 102599762 102600233 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19556 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 293.999-2 chr10 90574715 90575124 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34114 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 242.667-89 chr5 138029424 138029706 + 1.66667 NA intron (NM_001101801, intron 1 of 21) intron (NM_001101801, intron 1 of 21) -3209 NR_037900 100130172 Hs.616629 NR_037900 LOC100130172 - uncharacterized LOC100130172 ncRNA 452.666-4 chr8 108429517 108430094 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13778 NM_001329495 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 393 chr10 75704492 75704869 + 1.66667 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) -7775 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 266-61 chr4 43635334 43635540 + 1.66667 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -142894 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 436-2 chr1 40117487 40118083 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -20315 NM_000310 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 240.334-13 chr8 78883014 78883181 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 45568 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 235.666-15 chr5 87534163 87534403 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -121250 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 433.333-3 chr12 3769617 3770134 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -16766 NM_001144958 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 370.667-16 chr2 119507132 119507665 + 1.66667 NA intron (NM_002980, intron 1 of 12) intron (NM_002980, intron 1 of 12) 17054 NM_002980 6344 Hs.42091 NM_002980 ENSG00000080293 SCTR SR secretin receptor protein-coding 274.666-6 chr11 30615601 30615940 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29417 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 505.334 chr14 67475033 67475791 + 1.66667 NA intron (NM_001348543, intron 2 of 2) L1MB3|LINE|L1 13309 NM_001348542 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 260-90 chrX 57544412 57544678 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -47291 NM_007157 158586 Hs.156257 NM_007157 ENSG00000198455 ZXDB ZNF905|dJ83L6.1 zinc finger X-linked duplicated B protein-coding 271.334-20 chr7 43714725 43714995 + 1.66667 NA intron (NM_001371314, intron 1 of 7) AluSz6|SINE|Alu 14663 NM_001371317 330.333-23 chr8 33908650 33908956 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -308697 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 377-7 chr17 62857199 62857626 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 48910 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 259.334-20 chr8 48807485 48807660 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -72261 NR_157026 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 311.667-4 chr14 69197756 69198081 + 1.66667 NA intron (NM_001193363, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 6152 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 194.667-41 chr14 69418454 69418637 + 1.66667 NA intron (NM_001330185, intron 1 of 5) L1PA6|LINE|L1 19853 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 125.333-24 chr10 56726190 56726357 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -365000 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 401-2 chr1 159982197 159982614 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 21181 NR_038849 100505633 Hs.445045 NR_038849 ENSG00000224259 LINC01133 - long intergenic non-protein coding RNA 1133 ncRNA 247.334-9 chr14 47960957 47961199 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -166064 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 250.334-7 chr15 58728726 58728959 + 1.66667 NA intron (NM_001320570, intron 1 of 14) intron (NM_001320570, intron 1 of 14) 20865 NM_001110 102 Hs.172028 NM_001110 ENSG00000137845 ADAM10 AD10|AD18|CD156c|CDw156|HsT18717|MADM|RAK|kuz ADAM metallopeptidase domain 10 protein-coding 284-11 chr12 26227466 26227759 + 1.66667 NA intron (NM_005086, intron 2 of 2) intron (NM_005086, intron 2 of 2) 32039 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 278.334 chr11 73727788 73728022 + 1.66667 NA intron (NM_198896, intron 2 of 7) intron (NM_198896, intron 2 of 7) 32188 NM_001243719 5870 Hs.503222 NM_002869 ENSG00000175582 RAB6A RAB6 RAB6A, member RAS oncogene family protein-coding 245.333-100 chr6 43319005 43319286 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10319 NM_001366068 401262 Hs.653165 NM_206922 ENSG00000146215 CRIP3 CRP-3|TLP|TLP-A|h6LIMo cysteine rich protein 3 protein-coding 303-17 chr14 65463711 65464064 + 1.66667 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) -7215 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 286-38 chr3 65837747 65838068 + 1.66667 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) L1MC4a|LINE|L1 -55909 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 308.333-36 chr8 115294639 115295079 + 1.66667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 373154 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 283.333-45 chr22 29980679 29981067 + 1.66667 NA intron (NM_153051, intron 5 of 18) intron (NM_153051, intron 5 of 18) -26176 NR_106876 102466742 NR_106876 ENSG00000275818 MIR6818 hsa-mir-6818 microRNA 6818 ncRNA 252-115 chr9 69068693 69068865 + 1.66667 NA intron (NM_181425, intron 4 of 4) intron (NM_181425, intron 4 of 4) 33027 NM_000144 2395 Hs.20685 NM_000144 ENSG00000165060 FXN CyaY|FA|FARR|FRDA|X25 frataxin protein-coding 235.666-22 chr8 118746622 118746828 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -124762 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 256.334-9 chr20 9909484 9909718 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70525 NM_020341 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 254.334-30 chr7 4429382 4429587 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -252811 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 392-11 chr2 213313314 213313691 + 1.66667 NA intron (NM_001025436, intron 4 of 4) MIRc|SINE|MIR 29038 NR_047660 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 360.334-2 chr2 182817685 182817917 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 48836 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 272.334-6 chr10 36860206 36860405 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -265552 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 407.334-4 chr4 82031064 82031673 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 342623 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 193.334-5 chr7 11229437 11229629 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 255661 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 245-25 chr17 7862922 7863189 + 1.66667 NA TTS (NM_144607) TTS (NM_144607) 5052 NM_001330110 124637 Hs.27475 NM_144607 ENSG00000182224 CYB5D1 - cytochrome b5 domain containing 1 protein-coding 225.334-3 chr3 34241875 34242054 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 443334 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 464.666-3 chr5 148747893 148748417 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -78438 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 146.666 chr1 71399395 71399556 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_173808, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_173808, exon 7 of 7) 318151 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 367.667-9 chr19 50180737 50180975 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -17575 NM_152358 126123 Hs.414175 NM_152358 ENSG00000161652 IZUMO2 C19orf41|PLAL6978|PRO21961|SCRL IZUMO family member 2 protein-coding 228.334-3 chr17 48481314 48481515 + 1.66667 NA Intergenic FAM|SINE|Alu 36581 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 587 chr6 27003325 27003887 + 1.66667 NA intron (NR_026775, intron 2 of 2) intron (NR_026775, intron 2 of 2) 16700 NR_026776 100270746 Hs.590428 NR_026776 LOC100270746 - uncharacterized LOC100270746 ncRNA 276.333-55 chr6 81076889 81077173 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 675650 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 293.666-4 chr1 205231058 205231660 + 1.66667 NA intron (NM_001242925, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 2428 NM_001242925 9911 Hs.6360 NM_014858 ENSG00000133069 TMCC2 HUCEP11 transmembrane and coiled-coil domain family 2 protein-coding 296-42 chr3 28730493 28730725 + 1.66667 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 155331 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 446-2 chr10 33328052 33328567 + 1.66667 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 6358 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 208-184 chr9 103057613 103057783 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 62365 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 367.667-19 chr6 128763657 128763951 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -119334 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 480.667-2 chr15 63289725 63290313 + 1.66667 NA intron (NM_031301, intron 4 of 5) AluJb|SINE|Alu 12414 NM_031301 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 232.333-15 chr11 102152273 102152466 + 1.66667 NA intron (NM_001130145, intron 2 of 8) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 39921 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 323.666-4 chr12 14534011 14534428 + 1.66667 NA intron (NM_024829, intron 6 of 10) intron (NM_024829, intron 6 of 10) -33513 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 249.333-100 chr8 99959163 99959389 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -45306 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 239-17 chr12 67183503 67183772 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -85721 NM_018448 55832 Hs.546407 NM_018448 ENSG00000111530 CAND1 TIP120|TIP120A cullin associated and neddylation dissociated 1 protein-coding 234-13 chr11 93663798 93663994 + 1.66667 NA intron (NM_033395, intron 1 of 29) L1ME3|LINE|L1 2214 NM_033395 85459 Hs.458418 NM_033395 ENSG00000166004 CEP295 KIAA1731 centrosomal protein 295 protein-coding 333.333-28 chr2 152378279 152378562 + 1.66667 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 43246 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 196-53 chr14 97855801 97856008 + 1.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -93073 NR_146447 100132612 Hs.587781 NR_146447 ENSG00000258869 LINC02312 - long intergenic non-protein coding RNA 2312 ncRNA 315-15 chr2 152672760 152673046 + 1.66667 NA intron (NM_001365601, intron 11 of 24) intron (NM_001365601, intron 11 of 24) 44558 NM_001365604 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 260.667-61 chr4 39927591 39927799 + 1.66667 NA intron (NM_001100399, intron 3 of 32) intron (NM_001100399, intron 3 of 32) 50216 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 402.333-3 chr12 41110285 41110549 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -77903 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 239-4 chr1 103938747 103938947 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -134176 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 378.667-14 chr2 163665076 163665489 + 1.66667 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 70726 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 271.667-31 chr16 67769150 67769336 + 1.66667 NA intron (NM_001320240, intron 3 of 16) AluJb|SINE|Alu 37317 NM_001320239 57610 Hs.368569 NM_020850 ENSG00000141084 RANBP10 - RAN binding protein 10 protein-coding 251.334-29 chr6 157665247 157665494 + 1.66667 NA intron (NM_153746, intron 8 of 8) intron (NM_153746, intron 8 of 8) 136238 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 301-43 chr5 61369811 61370122 + 1.66667 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) L2|LINE|L2 37708 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 257.666-29 chrX 122769824 122770118 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -414272 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 249.666-26 chr22 26632430 26632728 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 10616 NM_001886 1413 Hs.57690 NM_001886 ENSG00000196431 CRYBA4 CTRCT23|CYRBA4|MCOPCT4 crystallin beta A4 protein-coding 193.667-26 chr11 40862440 40862611 + 1.66667 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -569395 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 492-2 chr8 137542984 137543544 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -129676 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 285-33 chr8 120538348 120538642 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_021021, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_021021, exon 7 of 7) 93076 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 268.334-13 chr3 511081 511257 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -80936 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 410.667-8 chr2 43595999 43596391 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001271643) promoter-TSS (NM_001271643) -149 NM_001345923 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 292.667-11 chr14 51252628 51252960 + 1.66667 NA intron (NM_030755, intron 7 of 7) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 12547 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 245.334-17 chr7 41176814 41177051 + 1.66667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 75328 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 259.333-70 chr4 33640862 33641151 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 398887 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 420.667-6 chr5 20481045 20481468 + 1.66667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) L1MA3|LINE|L1 94457 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 153.334 chr10 70013410 70013543 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -39370 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 220-97 chr5 174460813 174461048 + 1.66667 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 124576 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 271.667-38 chr2 28189826 28190035 + 1.66667 NA intron (NR_120504, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 17031 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 333.334-4 chr3 168830650 168830954 + 1.66667 NA TTS (NR_021485) TTS (NR_021485) -71143 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 237.334-8 chr6 50351912 50352063 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -302058 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 286-7 chr12 2426831 2427097 + 1.66667 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 157188 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 255.667-60 chr4 30373479 30373704 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -346778 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 158-9 chr10 25305193 25305382 + 1.66667 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -129011 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 228.667-39 chr2 15863516 15863670 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -56806 NR_125783 103752554 Hs.269571 NR_125783 ENSG00000223850 MYCNUT MYCNUN|lncUSMycN MYCN upstream transcript ncRNA 261.667-63 chr5 113192037 113192242 + 1.66667 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 102799 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 272.333-37 chr20 5363503 5363739 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -46889 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 437-3 chr2 145838723 145839087 + 1.66667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -748152 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 247-80 chrX 69864227 69864396 + 1.66667 NA intron (NM_001005609, intron 1 of 7) L1PB1|LINE|L1 -158546 NR_037494 100500887 NR_037494 ENSG00000211991 MIR676 hsa-mir-676|mir-676 microRNA 676 ncRNA 253.334-21 chr5 166405895 166406114 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 520366 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 193.333-63 chr15 59058146 59058365 + 1.66667 NA intron (NM_001270529, intron 4 of 13) intron (NM_001270529, intron 4 of 13) -46891 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 233.333-93 chr4 59492344 59492617 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 478907 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 380-9 chr2 212552045 212552380 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13410 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 371.334 chr20 21144956 21145269 + 1.66667 NA intron (NM_001352436, intron 4 of 13) intron (NM_001352436, intron 4 of 13) 19030 NM_001352436 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 470.334-2 chr10 44840487 44840969 + 1.66667 NA intron (NR_033842, intron 2 of 7) L1MD1|LINE|L1 -70588 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 328.667-16 chr6 127175158 127175550 + 1.66667 NA intron (NM_032784, intron 4 of 4) intron (NM_032784, intron 4 of 4) 56683 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 385 chr1 40083000 40083422 + 1.66667 NA intron (NM_001363695, intron 5 of 7) AluJr|SINE|Alu 14041 NM_001363695 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 194-76 chr2 98103929 98104084 + 1.66667 NA intron (NR_144297, intron 2 of 18) L1MEf|LINE|L1 16839 NR_144296 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 236.334-12 chrX 115146632 115146804 + 1.66667 NA intron (NM_001243963, intron 14 of 19) intron (NM_001243963, intron 14 of 19) -20276 NR_145764 109617004 NR_145764 ENSG00000271907 SNORA35B - small nucleolar RNA, H/ACA box 35B snoRNA 237.334-7 chr5 133718734 133718951 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -106301 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 385.999-2 chr5 123976720 123977268 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 431577 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 267.667-45 chr4 13352984 13353168 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 131264 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 354 chr1 62928371 62928711 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 82384 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 253.334-25 chr9 10007432 10007605 + 1.66667 NA intron (NM_002839, intron 4 of 45) Plat_L3|LINE|CR1 208126 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 244.667-91 chr7 104146178 104146417 + 1.66667 NA intron (NM_002553, intron 12 of 13) L1MD2|LINE|L1 61716 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 358.667-13 chr14 88526102 88526385 + 1.66667 NA intron (NM_007039, intron 2 of 18) L1MB5|LINE|L1 28764 NM_007039 11099 Hs.437040 NM_007039 ENSG00000070778 PTPN21 PTPD1|PTPRL10 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 21 protein-coding 251.334-27 chr6 133327783 133327988 + 1.66667 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 86386 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 272.333-59 chr6 110209637 110209912 + 1.66667 NA intron (NM_015891, intron 5 of 14) L2a|LINE|L2 29347 NM_015891 51362 Hs.428147 NM_015891 ENSG00000168438 CDC40 EHB3|PRP17|PRPF17 cell division cycle 40 protein-coding 295.667-8 chr14 33723736 33724068 + 1.66667 NA intron (NM_001165893, intron 5 of 10) intron (NM_001165893, intron 5 of 10) 14965 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 289-8 chr14 35605519 35605732 + 1.66667 NA exon (NM_001346249, exon 36 of 42) exon (NM_001346249, exon 36 of 42) 71461 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 395.001-4 chr8 18495957 18496223 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 104808 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 270.667-27 chr2 100690135 100690457 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 86557 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 246-16 chr11 11947998 11948212 + 1.66667 NA exon (NM_017944, exon 20 of 27) exon (NM_017944, exon 20 of 27) 60534 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 261.333-85 chr5 72143563 72143848 + 1.66667 NA intron (NM_005909, intron 2 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -25762 NR_039967 100616377 NR_039967 ENSG00000264099 MIR4803 - microRNA 4803 ncRNA 386-5 chr16 78642947 78643285 + 1.66667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 543462 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 241.667-90 chr8 103421100 103421365 + 1.66667 NA intron (NM_015420, intron 3 of 10) intron (NM_015420, intron 3 of 10) 5846 NM_015420 25879 Hs.532265 NM_015420 ENSG00000164934 DCAF13 GM83|HSPC064|Sof1|WDSOF1 DDB1 and CUL4 associated factor 13 protein-coding 410-6 chr12 22134915 22135267 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 88873 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 347.001-2 chr12 76309399 76309651 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 38890 NM_024685 79738 Hs.96322 NM_024685 ENSG00000179941 BBS10 C12orf58 Bardet-Biedl syndrome 10 protein-coding 279.334 chr1 154644521 154644726 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -16626 NM_001365045 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 276-48 chr3 116466855 116467234 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21557 NM_001318915 4045 Hs.26409 NM_002338 ENSG00000185565 LSAMP IGLON3|LAMP limbic system associated membrane protein protein-coding 321.999-2 chr14 68688424 68688700 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -59775 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 385.667-11 chr6 145720396 145720953 + 1.66667 NA intron (NM_001360064, intron 1 of 3) intron (NM_001360064, intron 1 of 3) -14195 NR_038246 100507557 Hs.124537 NR_038244 ENSG00000235652 LOC100507557 - uncharacterized LOC100507557 ncRNA 281.334-8 chr3 71933038 71933215 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -147978 NM_001126128 60675 Hs.528665 NM_021935 ENSG00000163421 PROK2 BV8|HH4|KAL4|MIT1|PK2 prokineticin 2 protein-coding 326.001-2 chr6 8703356 8703628 + 1.66667 NA intron (NR_038980, intron 3 of 4) intron (NR_038980, intron 3 of 4) 51283 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 279.666-6 chr17 78064729 78065033 + 1.66667 NA exon (NM_001142640, exon 5 of 22) exon (NM_001142640, exon 5 of 22) 46918 NR_040071 100131096 Hs.635442 NR_040071 ENSG00000204282 TNRC6C-AS1 TMC6|lnc TNRC6C antisense RNA 1 ncRNA 258.667-59 chr22 34690900 34691084 + 1.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 306924 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 276.334-2 chr10 91352525 91352768 + 1.66667 NA intron (NR_024467, intron 3 of 4) intron (NR_024467, intron 3 of 4) -56589 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 422-3 chr13 109024233 109024511 + 1.66667 NA intron (NM_015011, intron 23 of 34) intron (NM_015011, intron 23 of 34) 142931 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 254.334-9 chr14 46395082 46395264 + 1.66667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu -76186 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 242.667-6 chr1 71758649 71758905 + 1.66667 NA intron (NM_173808, intron 3 of 6) intron (NM_173808, intron 3 of 6) 78235 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 256.667-56 chr3 62783328 62783625 + 1.66667 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) intron (NM_003716, intron 1 of 29) 91940 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 298.999 chr2 191681054 191681379 + 1.66667 NA intron (NR_045623, intron 2 of 6) intron (NR_045623, intron 2 of 6) 3080 NR_045623 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 266.333-54 chr6 49104510 49104747 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 358625 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 246.667-34 chr16 71687146 71687372 + 1.66667 NA intron (NM_015020, intron 4 of 18) L1ME1|LINE|L1 11442 NR_033337 100379141 Hs.725116 NR_033337 ENSG00000263666 SNORA70D U70D small nucleolar RNA, H/ACA box 70D snoRNA 240.667-61 chr4 48497235 48497505 + 1.66667 NA TTS (NM_015030) TTS (NM_015030) 7118 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 256-66 chr4 100616052 100616235 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 58970 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 310.334-4 chr15 60146175 60146504 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 142028 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 276-44 chr3 40986082 40986371 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -213279 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 429 chr10 45513785 45514235 + 1.66667 NA intron (NM_001282866, intron 2 of 7) intron (NM_001282866, intron 2 of 7) 21361 NM_001282866 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 255.667-45 chr2 113230867 113231128 + 1.66667 NA intron (NM_013953, intron 7 of 9) intron (NM_013953, intron 7 of 9) -4530 NR_047570 654433 Hs.656660 NR_015377 ENSG00000189223 PAX8-AS1 - PAX8 antisense RNA 1 ncRNA 466-7 chr5 34801777 34802172 + 1.66667 NA intron (NM_015577, intron 4 of 17) AluJr|SINE|Alu -37190 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 463.667-3 chr8 91513829 91514327 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 264759 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 249.667-108 chr9 90795326 90795499 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6188 NM_001174168 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 279.334-3 chr14 48874198 48874461 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 712051 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 434-3 chr2 206465504 206466019 + 1.66667 NA intron (NM_003812, intron 2 of 25) intron (NM_003812, intron 2 of 25) 22229 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 663.667 chr4 38143763 38144461 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 24158 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 244.333-77 chr4 113612252 113612530 + 1.66667 NA intron (NM_001221, intron 3 of 18) intron (NM_001221, intron 3 of 18) 149347 NM_001321592 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 246-94 chr6 117889960 117890139 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -17215 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 218.333-49 chr16 79641340 79641533 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -40699 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 255.334-15 chr19 44197617 44197868 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -14786 NM_001289170 7770 Hs.298089 NM_182490 ENSG00000131115 ZNF227 - zinc finger protein 227 protein-coding 344.001 chr1 159153994 159154280 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17478 NM_001346510 57863 Hs.365689 NM_021189 ENSG00000162706 CADM3 BIgR|IGSF4B|NECL1|Necl-1|TSLL1|synCAM3 cell adhesion molecule 3 protein-coding 312-58 chr8 119859294 119859556 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -3531 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 286.334-9 chr5 147874408 147874643 + 1.66667 NA Intergenic LTR7|LTR|ERV1 -4186 NM_054023 117156 Hs.483765 NM_054023 ENSG00000164265 SCGB3A2 LU103|PNSP1|UGRP1|pnSP-1 secretoglobin family 3A member 2 protein-coding 354.001-2 chr2 33116342 33116632 + 1.66667 NA intron (NM_206943, intron 4 of 33) intron (NM_206943, intron 4 of 33) -18110 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 245.666-3 chr1 195515856 195516029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 572773 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 230.334-2 chr1 202091659 202091849 + 1.66667 NA Intergenic (TCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -31163 NM_004767 9283 Hs.132049 NM_004767 ENSG00000170075 GPR37L1 ET(B)R-LP-2|ETBR-LP-2|ETBRLP2 G protein-coupled receptor 37 like 1 protein-coding 226-43 chr2 120680040 120680324 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -55686 NM_001371271 286.667-35 chr6 39654540 39654757 + 1.66667 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) L1ME3G|LINE|L1 70760 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 268.333-34 chr20 12871833 12872220 + 1.66667 NA intron (NR_109868, intron 10 of 11) MamRep1527|LTR|LTR 64937 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 178-35 chr12 29030215 29030368 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -118987 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 373.001-4 chr4 47459261 47459587 + 1.66667 NA intron (NM_001329668, intron 2 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 4278 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 238.667-32 chr15 97307257 97307447 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 214459 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 373.001-2 chr12 45301821 45302129 + 1.66667 NA intron (NM_001142678, intron 1 of 19) intron (NM_001142678, intron 1 of 19) 9285 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 301.666-8 chr3 105360586 105360926 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5957 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 259-18 chr16 56455452 56455692 + 1.66667 NA intron (NM_001324363, intron 2 of 11) intron (NM_001324363, intron 2 of 11) 3488 NM_001324358 55239 Hs.231883 NM_018233 ENSG00000087263 OGFOD1 TPA1 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 1 protein-coding 286.334-7 chr3 115266567 115266751 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -119371 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 319-22 chr6 122449396 122449699 + 1.66667 NA intron (NM_020755, intron 7 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 22260 NM_020755 57515 Hs.146668 NM_020755 ENSG00000111897 SERINC1 TDE1L|TDE2|TMS-2|TMS2 serine incorporator 1 protein-coding 248.667-68 chr2 221443747 221443964 + 1.66667 NA intron (NM_001363748, intron 9 of 17) intron (NM_001363748, intron 9 of 17) 128449 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 258.334-5 chr14 26463832 26464066 + 1.66667 NA intron (NM_006489, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 89481 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 271.334-19 chr5 123519505 123519688 + 1.66667 NA intron (NM_001364148, intron 1 of 8) intron (NM_001364148, intron 1 of 8) 7419 NM_001270573 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 264-35 chr3 42644232 42644502 + 1.66667 NA intron (NM_001349126, intron 18 of 18) intron (NM_001349126, intron 18 of 18) -9330 NM_145166 92999 Hs.409561 NM_145166 ENSG00000114853 ZBTB47 ZNF651 zinc finger and BTB domain containing 47 protein-coding 384.667-7 chr5 39496231 39496696 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -23968 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 201-95 chr6 35197629 35197856 + 1.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -16214 NM_152753 222663 Hs.12923 NM_152753 ENSG00000146197 SCUBE3 CEGF3 signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3 protein-coding 241-42 chr5 53657356 53657592 + 1.66667 NA intron (NM_001318051, intron 3 of 3) intron (NM_001318051, intron 3 of 3) 96835 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 267.334-14 chr22 34235433 34235638 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -312647 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 249-71 chr8 132283519 132283807 + 1.66667 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 163599 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 321.333-27 chr15 39545686 39546012 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -35230 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 291.667-8 chr10 45025729 45025995 + 1.66667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 24939 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 426.001 chr10 92476143 92476540 + 1.66667 NA intron (NR_136399, intron 16 of 25) AluSq2|SINE|Alu 21420 NM_001322797 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 281.333-27 chr18 34622252 34622481 + 1.66667 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) intron (NM_001198939, intron 1 of 21) 29031 NM_001128175 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 199-13 chr10 95369673 95369834 + 1.66667 NA intron (NM_001034957, intron 11 of 21) intron (NM_001034957, intron 11 of 21) 71427 NM_001034956 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 232.667-38 chr2 98388326 98388474 + 1.66667 NA intron (NM_001298, intron 5 of 7) intron (NM_001298, intron 5 of 7) 41944 NM_001079878 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 223-34 chr2 80848030 80848181 + 1.66667 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 534726 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 263.334-2 chr10 87545273 87545432 + 1.66667 NA intron (NM_001178118, intron 4 of 4) intron (NM_001178118, intron 4 of 4) 37519 NM_001178118 9562 Hs.121260 NM_004897 ENSG00000107789 MINPP1 HIPER1|MINPP2|MIPP multiple inositol-polyphosphate phosphatase 1 protein-coding 306-60 chrX 24283879 24284194 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 29357 NM_001136233 170067 Hs.716893 NM_001136233 SUPT20HL2 FAM48B1|FAM48B2 SUPT20H like 2 protein-coding 445.334-3 chr4 146145255 146145634 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -23531 NR_038331 100505545 Hs.122199 NR_038331 ENSG00000248809 LINC01095 - long intergenic non-protein coding RNA 1095 ncRNA 349.667-15 chr22 46891208 46891514 + 1.66667 NA exon (NM_014346, exon 6 of 13) exon (NM_014346, exon 6 of 13) 24681 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 466.334-3 chr20 63213946 63214430 + 1.66667 NA intron (NM_017798, intron 2 of 4) intron (NM_017798, intron 2 of 4) 1943 NM_017798 54915 Hs.744852 NM_017798 ENSG00000149658 YTHDF1 C20orf21 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1 protein-coding 534.667 chr4 58234991 58235921 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 300872 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 255-23 chr11 120475905 120476195 + 1.66667 NA intron (NM_015313, intron 33 of 40) intron (NM_015313, intron 33 of 40) -35696 NM_014619 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 365-10 chr16 84964598 84965052 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 46710 NM_001145548 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 300.001 chr2 4384198 4384395 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 271926 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 218.334-4 chr3 65158242 65158396 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -470319 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 319-12 chr2 62012829 62013152 + 1.66667 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 107348 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 317-12 chr15 70940500 70940810 + 1.66667 NA intron (NM_017691, intron 8 of 15) intron (NM_017691, intron 8 of 15) 48212 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 232-59 chr3 14747519 14747667 + 1.66667 NA intron (NM_001184957, intron 12 of 16) MER65-int|LTR|ERV1 63821 NR_135245 152274 Hs.434128 NR_135245 ENSG00000260902 LINC02011 - long intergenic non-protein coding RNA 2011 ncRNA 267-16 chr12 1144100 1144316 + 1.66667 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) intron (NR_027948, intron 7 of 19) 116460 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 249.333-73 chr4 39926648 39926920 + 1.66667 NA exon (NM_001100400, exon 4 of 16) exon (NM_001100400, exon 4 of 16) 51127 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 261.334-7 chr17 73700453 73700617 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -37319 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 275-45 chr5 128681738 128681986 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -143617 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 400.667-2 chr18 66237794 66238156 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 366115 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 233 chr1 40443922 40444158 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -6024 NM_001369565 65243 Hs.133034 NM_023070 ENSG00000187801 ZFP69B ZKSCAN23B|ZNF643|ZSCAN54B ZFP69 zinc finger protein B protein-coding 185-47 chr4 45698784 45698951 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 425187 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 252-8 chr10 15607443 15607721 + 1.66667 NA intron (NM_001291494, intron 16 of 28) intron (NM_001291494, intron 16 of 28) 112340 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 518.667-5 chr8 89549247 89549917 + 1.66667 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 208129 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 226-13 chr11 43543245 43543475 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -16296 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 240.334-15 chrX 85885978 85886178 + 1.66667 NA intron (NM_001320959, intron 12 of 14) intron (NM_001320959, intron 12 of 14) 17629 NR_029848 494323 NR_029848 ENSG00000199051 MIR361 MIRN361|hsa-mir-361|mir-361 microRNA 361 ncRNA 258.334-20 chr6 141324888 141325177 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 641218 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 331.001 chr1 52025594 52025814 + 1.66667 NA intron (NM_015913, intron 4 of 6) intron (NM_015913, intron 4 of 6) 8106 NM_138417 112970 Hs.476033 NM_138417 ENSG00000198841 KTI12 SBBI81|TOT4 KTI12 chromatin associated homolog protein-coding 291-22 chr18 39683392 39683673 + 1.66667 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) L1MEi|LINE|L1 -6755 NR_049848 100846997 NR_049848 ENSG00000283645 MIR5583-2 - microRNA 5583-2 ncRNA 283.666-5 chr22 23132780 23133090 + 1.66667 NA intron (NM_014433, intron 4 of 6) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 9055 NM_014433 27156 Hs.526920 NM_014433 ENSG00000100218 RSPH14 RTDR1 radial spoke head 14 homolog protein-coding 170.666-7 chr13 80143768 80143905 + 1.66667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 132759 NR_104138 101515984 Hs.569290 NR_104138 LINC01080 TCONS_00021856 long intergenic non-protein coding RNA 1080 ncRNA 249.334-10 chr14 21184688 21184856 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 20731 NR_038970 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 135-87 chr5 88842220 88842376 + 1.66667 NA intron (NM_001131005, intron 2 of 10) intron (NM_001131005, intron 2 of 10) -15110 NM_001364341 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 413-5 chr16 52191533 52191990 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -66803 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 538.999 chr8 112693103 112693608 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 49862 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 257.333-56 chr2 183759609 183760039 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -619151 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 472.666-3 chr8 119911393 119911905 + 1.66667 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 37927 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 501.001 chr10 34044391 34044944 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -271987 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 347.667-7 chr18 11983179 11983461 + 1.66667 NA intron (NM_014214, intron 1 of 7) (TCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1813 NM_014214 3613 Hs.743311 NM_014214 ENSG00000141401 IMPA2 - inositol monophosphatase 2 protein-coding 265.333-22 chr13 91650145 91650394 + 1.66667 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) L1MD2|LINE|L1 251648 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 284-49 chr5 125942952 125943219 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -236492 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 354.667-21 chr8 64254691 64255131 + 1.66667 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 113647 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 214-108 chr5 61090471 61090667 + 1.66667 NA intron (NM_174889, intron 2 of 3) intron (NM_174889, intron 2 of 3) -71747 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 269-20 chr17 61630678 61630912 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -39576 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 234.334-5 chr18 31868460 31868614 + 1.66667 NA intron (NM_014939, intron 16 of 28) intron (NM_014939, intron 16 of 28) 74591 NM_014939 22878 Hs.202001 NM_014939 ENSG00000153339 TRAPPC8 GSG1|HsT2706|KIAA1012|TRS85 trafficking protein particle complex 8 protein-coding 245.667-83 chr9 82306903 82307109 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 318234 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 249.667-6 chr1 209205158 209205437 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -120159 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 249-67 chr7 122114934 122115226 + 1.66667 NA exon (NM_005763, exon 9 of 24) exon (NM_005763, exon 9 of 24) 29169 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 257-6 chr11 19227320 19227608 + 1.66667 NA intron (NM_001256372, intron 10 of 12) intron (NM_001256372, intron 10 of 12) 13481 NM_024680 79733 Hs.523526 NM_024680 ENSG00000129173 E2F8 E2F-8 E2F transcription factor 8 protein-coding 197.333 chr1 35004134 35004301 + 1.66667 NA intron (NM_007167, intron 13 of 15) MER5A|DNA|hAT-Charlie -18870 NM_001195156 100506144 Hs.533986 NM_001195156 ENSG00000243749 TMEM35B ZMYM6NB transmembrane protein 35B protein-coding 124.334 chr8 76568447 76568544 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -112752 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 168-12 chr10 111240095 111240321 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 125917 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 370.667-5 chr10 104107239 104107730 + 1.66667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -14574 NM_145247 119392 Hs.93667 NM_145247 ENSG00000156384 SFR1 C10orf78|MEI5|MEIR5|bA373N18.1 SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 protein-coding 527.333-3 chr4 71981979 71982771 + 1.66667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -49429 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 257.667-47 chr20 47026070 47026231 + 1.66667 NA intron (NM_172110, intron 5 of 13) L1M5|LINE|L1 131307 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 263.667-5 chr1 158063095 158063272 + 1.66667 NA intron (NM_001286349, intron 1 of 12) intron (NM_001286349, intron 1 of 12) 37633 NR_145471 100505785 Hs.664656 NR_145471 KIRREL1-IT1 KIRREL-IT1 KIRREL1 intronic transcript 1 ncRNA 423.667-9 chr2 168142385 168142770 + 1.66667 NA intron (NM_013233, intron 5 of 17) intron (NM_013233, intron 5 of 17) 105018 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 246.333-13 chr10 65536674 65536981 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34598 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 249.667-102 chr8 133477026 133477268 + 1.66667 NA intron (NM_003033, intron 3 of 8) MIRc|SINE|MIR 94740 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 420-6 chr12 118375751 118376156 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_022491) promoter-TSS (NM_022491) -602 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 248.667-87 chr5 61595776 61596048 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -41848 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 257-26 chr2 50811580 50811890 + 1.66667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -115473 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 166.667-126 chr2 220521672 220521815 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -615178 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 267.667-65 chr7 96510494 96510666 + 1.66667 NA intron (NR_163953, intron 2 of 5) intron (NR_163953, intron 2 of 5) -7057 NR_163948 344.334-5 chr3 189582743 189583060 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13845 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 244.667-63 chr22 22231606 22231915 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -13026 NM_007128 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 255-39 chr2 10608216 10608369 + 1.66667 NA intron (NR_048552, intron 12 of 19) intron (NR_048552, intron 12 of 19) 81683 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 315.334-10 chr8 103660615 103660863 + 1.66667 NA intron (NM_001348488, intron 3 of 25) intron (NM_001348488, intron 3 of 25) -158481 NR_145711 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 261.667-8 chr10 71225783 71226006 + 1.66667 NA intron (NM_001244889, intron 1 of 15) intron (NM_001244889, intron 1 of 15) -7666 NR_038453 728978 Hs.646725 NR_038453 ENSG00000237512 UNC5B-AS1 - UNC5B antisense RNA 1 ncRNA 461.334-3 chr5 79558386 79558938 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -44528 NM_004272 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 309.667-19 chr4 161184117 161184329 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -838510 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 190.333-121 chr5 82697561 82697767 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -142491 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 402.666 chr1 239678462 239678801 + 1.66667 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) intron (NM_000740, intron 3 of 4) 40488 NR_103776 100506915 Hs.667175 NR_103776 ENSG00000233355 CHRM3-AS2 - CHRM3 antisense RNA 2 ncRNA 249.333-7 chr1 104058777 104058977 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14146 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 133.334 chr10 92249694 92249797 + 1.66667 NA intron (NM_014912, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu -6466 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 226.667-62 chr3 112582141 112582380 + 1.66667 NA intron (NM_001348908, intron 4 of 4) intron (NM_001348908, intron 4 of 4) 19709 NR_109779 100506621 Hs.86538 NR_109779 LINC01279 - long intergenic non-protein coding RNA 1279 ncRNA 254-49 chr3 14780224 14780473 + 1.66667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 31066 NR_135245 152274 Hs.434128 NR_135245 ENSG00000260902 LINC02011 - long intergenic non-protein coding RNA 2011 ncRNA 215.667-122 chr8 110591754 110591947 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 435583 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 373.667-7 chr2 66411701 66411971 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 21634 NR_046438 730198 Hs.526753 NR_046438 MEIS1-AS3 - MEIS1 antisense RNA 3 ncRNA 356.667-18 chr8 75075863 75076224 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 75888 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 183.667-63 chr17 66086582 66086801 + 1.66667 NA intron (NM_001302891, intron 6 of 24) AluY|SINE|Alu 105201 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 184.334-5 chr7 80901037 80901224 + 1.66667 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) intron (NM_006379, intron 2 of 17) 17921 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 378.666 chr10 128592125 128592515 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 306370 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 418-7 chr17 2728590 2729022 + 1.66667 NA intron (NM_001355573, intron 3 of 3) intron (NM_001355573, intron 3 of 3) 16497 NR_136412 105371592 Hs.731739 NR_136412 ENSG00000262050 LOC105371592 - uncharacterized LOC105371592 ncRNA 175.667-108 chr4 64593085 64593268 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -183716 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 278-44 chr4 142775074 142775287 + 1.66667 NA intron (NM_001331040, intron 1 of 25) L1MC3|LINE|L1 71355 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 234.667-37 chr15 58499292 58499590 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_120338) promoter-TSS (NR_120338) -706 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 210-9 chr1 158153848 158154018 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13293 NR_033946 646268 Hs.506902 NR_033946 ENSG00000231666 LINC01704 - long intergenic non-protein coding RNA 1704 ncRNA 305.333-32 chr2 51585428 51585760 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 552993 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 326.667-3 chr1 48401348 48401621 + 1.66667 NA intron (NM_019073, intron 6 of 12) intron (NM_019073, intron 6 of 12) 70720 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 480.666-2 chr16 10393190 10393838 + 1.66667 NA intron (NM_024997, intron 1 of 11) intron (NM_024997, intron 1 of 11) 7453 NM_001352120 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 223.334-8 chr6 25735115 25735291 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 2770 NR_045125 387319 Hs.741681 NR_045125 HIST1H2APS1 H2AFSP|bA317E16.5 histone cluster 1 H2A pseudogene 1 pseudo 268.667-26 chr2 16840887 16841056 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -175137 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 654.334 chr2 156065122 156065693 + 1.66667 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) intron (NR_110250, intron 1 of 3) 189524 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 227.666-7 chr11 25465355 25465527 + 1.66667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -723682 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 322.667-12 chr14 33976977 33977338 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26083 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 283.333-23 chr17 35683829 35684146 + 1.66667 NA intron (NM_001030006, intron 18 of 21) L1MEd|LINE|L1 -47652 NM_033315 91608 Hs.744994 NM_033315 ENSG00000270885 RASL10B RRP17|VTS58635 RAS like family 10 member B protein-coding 294.667-51 chr7 11385464 11385703 + 1.66667 NA intron (NM_015204, intron 22 of 26) L1M5|LINE|L1 411711 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 257-35 chr22 35140401 35140564 + 1.66667 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 74324 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 252.667-12 chr10 33867115 33867380 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -94567 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 264.334-22 chr8 108908699 108908874 + 1.66667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -121192 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 254.334-7 chr13 29383876 29384046 + 1.66667 NA intron (NM_001033602, intron 6 of 13) intron (NM_001033602, intron 6 of 13) -44699 NM_015233 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 280.333-22 chr21 46475319 46475615 + 1.66667 NA intron (NM_001146115, intron 1 of 19) intron (NM_001146115, intron 1 of 19) 12996 NR_046400 100862692 Hs.737163 NR_046400 ENSG00000223692 DIP2A-IT1 - DIP2A intronic transcript 1 ncRNA 251-77 chr7 14017025 14017218 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25696 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 234-55 chr5 37272192 37272434 + 1.66667 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 -22885 NM_023073 65250 Hs.586199 NM_023073 ENSG00000197603 CPLANE1 C5orf42|Hug|JBTS17|OFD6 ciliogenesis and planar polarity effector 1 protein-coding 375.667-3 chr10 62257089 62257381 + 1.66667 NA intron (NM_001282941, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 11609 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 279.667-41 chr7 18580909 18581083 + 1.66667 NA intron (NM_001204147, intron 1 of 9) intron (NM_001204147, intron 1 of 9) 71726 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 209.334-4 chr4 63787904 63788076 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 621460 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 318.667-19 chr2 58703643 58704055 + 1.66667 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 183096 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 238-77 chr5 82428386 82428551 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 149006 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 230-47 chr4 30814771 30815030 + 1.66667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 94531 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 365.667-14 chr6 42561149 42561471 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -2712 NM_015255 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 341.333-19 chr4 120801517 120801751 + 1.66667 NA intron (NM_001300824, intron 7 of 13) intron (NM_001300824, intron 7 of 13) 121232 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 267.667-66 chr7 116154509 116154679 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -55945 NM_015641 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 296.667-25 chr19 30010327 30010629 + 1.66667 NA intron (NM_001252641, intron 8 of 10) intron (NM_001252641, intron 8 of 10) 68239 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 306.001-3 chr7 78809382 78809609 + 1.66667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -199493 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 343.333-27 chr5 125220988 125221352 + 1.66667 NA intron (NR_109882, intron 4 of 5) intron (NR_109882, intron 4 of 5) 184339 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 302.667-10 chr15 39440796 39441121 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -140121 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 241 chr1 109592436 109592713 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_006496, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_006496, exon 9 of 9) -6319 NR_029583 406974 NR_029583 ENSG00000284443 MIR197 MIRN197|miR-197|miRNA197 microRNA 197 ncRNA 238.667-6 chr1 203028352 203028581 + 1.66667 NA intron (NM_001304331, intron 1 of 29) intron (NM_001304331, intron 1 of 29) 1975 NM_001304331 8497 Hs.153648 NM_015053 ENSG00000143847 PPFIA4 - PTPRF interacting protein alpha 4 protein-coding 259-7 chr10 33232126 33232394 + 1.66667 NA intron (NM_001244973, intron 6 of 16) intron (NM_001244973, intron 6 of 16) 102407 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 237.333-88 chr5 28773025 28773279 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -153718 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 270.334-2 chr1 102957035 102957255 + 1.66667 NA intron (NM_001854, intron 41 of 66) intron (NM_001854, intron 41 of 66) 151351 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 256.334-2 chr1 86137434 86137644 + 1.66667 NA intron (NM_152890, intron 2 of 59) intron (NM_152890, intron 2 of 59) 18932 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 253.333-58 chr2 182570964 182571252 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48263 NM_001003683 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 337.667-5 chr11 83357476 83357787 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -71224 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 256-48 chr2 164224050 164224270 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 344335 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 245.333-72 chr20 54658615 54658827 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 183128 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 305-34 chr8 130295904 130296211 + 1.66667 NA non-coding (NR_002765, exon 1 of 1) non-coding (NR_002765, exon 1 of 1) 476 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 258-21 chr17 54137922 54138164 + 1.66667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 315116 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 263.667-55 chr22 17218012 17218180 + 1.66667 NA intron (NM_001282225, intron 1 of 9) MER113B|DNA|hAT-Charlie 1339 NM_001282226 51816 Hs.170310 NM_017424 ENSG00000093072 ADA2 ADGF|CECR1|IDGFL|PAN|SNEDS|VAIHS adenosine deaminase 2 protein-coding 465.667-5 chr17 59511631 59512181 + 1.66667 NA intron (NR_110813, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 14951 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 289.667-6 chr11 19339060 19339349 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11520 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 320-28 chr2 218356753 218357262 + 1.66667 NA intron (NM_198559, intron 1 of 9) intron (NM_198559, intron 1 of 9) 150 NM_001320865 375307 Hs.645453 NM_198559 ENSG00000158428 CATIP C2orf62 ciliogenesis associated TTC17 interacting protein protein-coding 348.001-2 chr12 109570084 109570365 + 1.66667 NA intron (NM_052845, intron 2 of 8) AluSz6|SINE|Alu 3280 NM_052845 326625 Hs.12106 NM_052845 ENSG00000139428 MMAB ATR|CFAP23|cblB|cob metabolism of cobalamin associated B protein-coding 258-11 chr13 31540734 31541001 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -198659 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 174-8 chr10 41728331 41728484 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 639638 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 343.667-5 chr2 35765029 35765429 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 293824 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 405.667-4 chr3 165213735 165214029 + 1.66667 NA intron (NR_125764, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 6922 NR_125764 103695433 Hs.570689 NR_125764 LINC01322 - long intergenic non-protein coding RNA 1322 ncRNA 235.333-50 chr2 9567000 9567296 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11318 NM_003183 6868 Hs.404914 NM_003183 ENSG00000151694 ADAM17 ADAM18|CD156B|CSVP|NISBD|NISBD1|TACE ADAM metallopeptidase domain 17 protein-coding 405-3 chr13 62076313 62076802 + 1.66667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -47009 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 226.667-43 chr18 13580624 13580890 + 1.66667 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -30357 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 236.667-75 chr6 133148159 133148370 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 60184 NR_026969 285735 Hs.407549 NM_001037231 LINC00326 NCRNA00326 long intergenic non-protein coding RNA 326 ncRNA 247-35 chr18 10790104 10790301 + 1.66667 NA intron (NM_022068, intron 14 of 51) intron (NM_022068, intron 14 of 51) -30553 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 428.666-3 chr12 65207893 65208302 + 1.66667 NA intron (NM_001167614, intron 1 of 12) intron (NM_001167614, intron 1 of 12) 38514 NM_001167614 23592 Hs.744150 NM_014319 ENSG00000174106 LEMD3 MAN1 LEM domain containing 3 protein-coding 241.667-23 chr14 61686668 61686816 + 1.66667 NA intron (NR_047116, intron 1 of 1) L1MC2|LINE|L1 -8771 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 367.333-18 chr4 93291084 93291453 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) intron (NM_001286838, intron 7 of 14) -537485 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 299-28 chr3 82282143 82282552 + 1.66667 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 296205 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 324.334-3 chr10 87835051 87835319 + 1.66667 NA intron (NR_028492, intron 3 of 3) L1MEf|LINE|L1 16872 NR_028492 142913 Hs.369431 NR_028492 ENSG00000223820 CFL1P1 CFLP1 cofilin 1 pseudogene 1 pseudo 241.334-9 chr3 83818826 83819027 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1050649 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 254-43 chr2 223229086 223229348 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 177287 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 318-45 chr4 185959706 185960071 + 1.66667 NA Intergenic Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger -3516 NM_021069 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 263.667-21 chr14 32555514 32555802 + 1.66667 NA intron (NM_004274, intron 4 of 13) L1MB2|LINE|L1 226360 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 255-48 chr20 49271934 49272133 + 1.66667 NA intron (NM_021035, intron 2 of 13) intron (NM_021035, intron 2 of 13) 6024 NM_021035 57169 Hs.371794 NM_021035 ENSG00000124201 ZNFX1 - zinc finger NFX1-type containing 1 protein-coding 239-45 chr3 152347692 152347956 + 1.66667 NA intron (NM_001314057, intron 2 of 11) intron (NM_001314057, intron 2 of 11) -6834 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 276.001-3 chr5 177562913 177563108 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8447 NM_001190946 54540 Hs.484289 NM_019057 ENSG00000146067 FAM193B IRIZIO family with sequence similarity 193 member B protein-coding 238-24 chr14 66291072 66291308 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -195181 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 365.667-18 chr8 109606035 109606362 + 1.66667 NA intron (NM_001099754, intron 3 of 6) intron (NM_001099754, intron 3 of 6) 1864 NM_001330596 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 177.334 chr20 52008740 52008897 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 96666 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 199-27 chr14 67704215 67704432 + 1.66667 NA intron (NM_152443, intron 1 of 8) ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 2437 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 369.334 chr3 138288139 138288446 + 1.66667 NA intron (NM_001282342, intron 17 of 19) intron (NM_001282342, intron 17 of 19) 41559 NM_001349025 347736 Hs.660992 NM_178130 ENSG00000181322 NME9 NM23-H9|TXL-2|TXL2|TXNDC6 NME/NM23 family member 9 protein-coding 264.334-14 chr4 108490300 108490481 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -66843 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 215-11 chr11 75867053 75867315 + 1.66667 NA intron (NM_003369, intron 3 of 14) L1ME3A|LINE|L1 51974 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 258.334-8 chr16 74007326 74007506 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 208105 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 166.334-2 chr13 67270446 67270604 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -40189 NM_020403 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 277-17 chr15 38170990 38171274 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81704 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 391-17 chr8 109817494 109817806 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -125859 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 260.666-23 chr22 37947852 37948139 + 1.66667 NA intron (NM_001207062, intron 2 of 5) AluY|SINE|Alu 5606 NM_032561 84645 Hs.517612 NM_032561 ENSG00000128346 C22orf23 EVG1|dJ1039K5.6 chromosome 22 open reading frame 23 protein-coding 250-59 chr4 146409587 146409820 + 1.66667 NA intron (NM_001317816, intron 4 of 10) intron (NM_001317816, intron 4 of 10) 1120 NR_107003 102465837 NR_107003 ENSG00000278438 MIR7849 hsa-mir-7849 microRNA 7849 ncRNA 275-15 chr16 27841205 27841417 + 1.66667 NA intron (NM_001109763, intron 4 of 6) intron (NM_001109763, intron 4 of 6) 46846 NM_144675 146395 Hs.91910 NM_144675 ENSG00000169181 GSG1L PRO19651 GSG1 like protein-coding 295.667-20 chr5 19732755 19733029 + 1.66667 NA intron (NM_001349559, intron 4 of 12) MER52-int|LTR|ERV1 153380 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 276.333-4 chr10 25217500 25217792 + 1.66667 NA intron (NM_020752, intron 1 of 10) intron (NM_020752, intron 1 of 10) -41370 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 342-20 chr2 55810807 55811170 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 112794 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 427.333-3 chr2 28060275 28060577 + 1.66667 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) L1M5|LINE|L1 64059 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 445 chr10 83017048 83017340 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 659895 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 394-4 chr14 43382586 43382911 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1124535 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 342.333-15 chr2 80272431 80272805 + 1.66667 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 32134 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 238-97 chr7 39189917 39190213 + 1.66667 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu 139069 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 599.999 chr10 76303963 76304460 + 1.66667 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 521450 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 238-12 chr11 46040453 46040694 + 1.66667 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 80246 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 353-14 chr3 124822660 124823078 + 1.66667 NA intron (NM_001354766, intron 5 of 13) L2b|LINE|L2 64496 NM_002213 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 579.667 chr18 21202670 21203310 + 1.66667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -39252 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 267-53 chr5 81320326 81320506 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 18829 NM_001131035 84240 Hs.15536 NM_032280 ENSG00000131732 ZCCHC9 PPP1R41 zinc finger CCHC-type containing 9 protein-coding 467-3 chr8 82949249 82949592 + 1.66667 NA intron (NR_134295, intron 2 of 3) MER51C|LTR|ERV1 37316 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 346.666-14 chr5 57265343 57265688 + 1.66667 NA TTS (NM_001127235) TTS (NM_001127235) 51441 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 562.334 chr3 151095119 151095706 + 1.66667 NA intron (NM_053002, intron 1 of 42) AluSx|SINE|Alu 8614 NM_053002 116931 Hs.744234 NM_053002 ENSG00000144893 MED12L NOPAR|TNRC11L|TRALP|TRALPUSH mediator complex subunit 12L protein-coding 306-41 chr5 95859210 95859586 + 1.66667 NA non-coding (NR_026936, exon 3 of 3) non-coding (NR_026936, exon 3 of 3) 7166 NR_026936 202299 Hs.8373 NM_175616 ENSG00000236882 LINC01554 C5orf27|FIS long intergenic non-protein coding RNA 1554 ncRNA 293-41 chr8 31015689 31015881 + 1.66667 NA intron (NM_001323312, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 17016 NM_013357 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 302.334 chr13 98729277 98729507 + 1.66667 NA intron (NM_005073, intron 1 of 22) intron (NM_005073, intron 1 of 22) 23280 NM_005073 6564 Hs.436893 NM_005073 ENSG00000088386 SLC15A1 HPECT1|HPEPT1|PEPT1 solute carrier family 15 member 1 protein-coding 251.334-18 chr3 104508515 104508685 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -858113 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 243-49 chr5 52622507 52622673 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -165326 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 205.667-80 chr2 196020097 196020280 + 1.66667 NA intron (NM_018897, intron 8 of 64) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 48649 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 113-150 chr4 36173817 36173954 + 1.66667 NA intron (NR_146894, intron 9 of 32) intron (NR_146894, intron 9 of 32) 70054 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 224-111 chr9 25562819 25562995 + 1.66667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 115951 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 438-3 chr12 113263158 113263470 + 1.66667 NA intron (NM_001143819, intron 4 of 28) AluSx1|SINE|Alu 18946 NM_001351347 53373 Hs.524763 NM_017901 ENSG00000186815 TPCN1 TPC1 two pore segment channel 1 protein-coding 316.666-11 chr2 58233347 58233722 + 1.66667 NA intron (NM_001114636, intron 1 of 13) intron (NM_001114636, intron 1 of 13) 7846 NM_018062 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 366.333-2 chr1 100867909 100868471 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26652 NM_001033025 2135 Hs.357637 NM_001439 ENSG00000162694 EXTL2 EXTR2 exostosin like glycosyltransferase 2 protein-coding 287.334-4 chr11 58529758 58529968 + 1.66667 NA intron (NM_001307951, intron 6 of 7) L1PA7|LINE|L1 -21758 NM_001005218 219968 Hs.553647 NM_001005218 ENSG00000198283 OR5B21 - olfactory receptor family 5 subfamily B member 21 protein-coding 309.334-14 chr8 117189153 117189413 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 54288 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 482-5 chr8 117259869 117260258 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 125068 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 249.667-94 chr7 103302989 103303225 + 1.66667 NA intron (NM_004279, intron 4 of 12) intron (NM_004279, intron 4 of 12) 5672 NM_004279 9512 Hs.184211 NM_004279 ENSG00000105819 PMPCB Beta-MPP|MPP11|MPPB|MPPP52|P-52 peptidase, mitochondrial processing beta subunit protein-coding 251-53 chr4 60190920 60191159 + 1.66667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -731580 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 411.999 chr10 65130501 65130912 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -206188 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 251-35 chr2 61931542 61931779 + 1.66667 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) intron (NM_152516, intron 1 of 2) 26018 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 251.667-78 chr5 44174206 44174441 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -214409 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 387.334-5 chr3 66231140 66231486 + 1.66667 NA intron (NM_001350992, intron 1 of 8) intron (NM_001350992, intron 1 of 8) 10310 NM_001350992 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 256.333-87 chr9 29186676 29186958 + 1.66667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 25482 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 243-20 chr17 41930467 41930638 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_110662) promoter-TSS (NR_110662) -65 NM_001350319 83538 Hs.201134 NM_031421 ENSG00000204815 TTC25 - tetratricopeptide repeat domain 25 protein-coding 314-55 chrX 50280318 50280512 + 1.66667 NA intron (NM_033031, intron 1 of 12) intron (NM_033031, intron 1 of 12) -4127 NM_033670 85417 Hs.130310 NM_033031 ENSG00000147082 CCNB3 - cyclin B3 protein-coding 267.333-9 chr10 7746972 7747196 + 1.66667 NA intron (NM_002216, intron 20 of 20) intron (NM_002216, intron 20 of 20) 40909 NR_045609 22944 Hs.397918 NM_012311 ENSG00000151657 KIN BTCD|KIN17|Rts2 Kin17 DNA and RNA binding protein protein-coding 254-51 chr3 117685041 117685290 + 1.66667 NA intron (NR_146652, intron 2 of 3) intron (NR_146652, intron 2 of 3) 5760 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 257-72 chr8 90249594 90249771 + 1.66667 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 28194 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 236.667-52 chr3 107302769 107303022 + 1.66667 NA intron (NR_028302, intron 2 of 3) intron (NR_028302, intron 2 of 3) 62203 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 275.667-19 chr14 52788491 52788749 + 1.66667 NA intron (NM_198066, intron 1 of 5) intron (NM_198066, intron 1 of 5) 2987 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 250-78 chr7 86475224 86475399 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -168598 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 192-103 chr4 84320119 84320265 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21023 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 256.667-76 chr6 64497838 64498038 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 691102 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 248-55 chr3 162728234 162728526 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 574921 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 244-98 chr8 89897356 89897527 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -4427 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 280.334-9 chr5 172991656 172991899 + 1.66667 NA intron (NM_003945, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 8006 NM_003945 8992 Hs.484188 NM_003945 ENSG00000113732 ATP6V0E1 ATP6H|ATP6V0E|M9.2|Vma21|Vma21p ATPase H+ transporting V0 subunit e1 protein-coding 379.333 chr14 81936191 81936558 + 1.66667 NA Intergenic LTR85b|LTR|Gypsy? -193236 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 417.667-8 chr4 145945979 145946387 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7360 NM_001306215 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 252.667-42 chr19 12634409 12634673 + 1.66667 NA TTS (NM_153358) TTS (NM_153358) 23621 NM_153358 163049 Hs.720677 NM_153358 ENSG00000173875 ZNF791 - zinc finger protein 791 protein-coding 193.334-4 chr5 105257311 105257525 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 157944 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 358.667-27 chr8 112797538 112797882 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 154217 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 262.334-3 chr11 83998171 83998416 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 11 of 27) intron (NM_001142699, intron 11 of 27) 274987 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 481.001 chr14 67907363 67907849 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 84014 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 264.334-7 chr13 113476190 113476387 + 1.66667 NA intron (NM_001014283, intron 3 of 6) L1ME3B|LINE|L1 14423 NM_001014283 55208 Hs.682987 NM_018185 ENSG00000150401 DCUN1D2 C13orf17 defective in cullin neddylation 1 domain containing 2 protein-coding 337-6 chr13 62807623 62807931 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_120403) promoter-TSS (NR_120403) -418 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 215-18 chr14 55691254 55691562 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -74837 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 346-32 chr6 117626133 117626439 + 1.66667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -23775 NM_020399 57120 Hs.191539 NM_020399 ENSG00000047932 GOPC CAL|FIG|GOPC1|PIST|dJ94G16.2 golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing protein-coding 159.667-158 chr2 15743418 15743568 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 52711 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 250.667-74 chr7 85232893 85233112 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -111071 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 266-39 chr2 66686732 66687006 + 1.66667 NA intron (NR_110156, intron 4 of 5) intron (NR_110156, intron 4 of 5) 16358 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 313-30 chr5 11993291 11993597 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -88998 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 249.667-89 chr7 53561373 53561550 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 250470 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 154-152 chr9 92707309 92707475 + 1.66667 NA Intergenic AluYj4|SINE|Alu -37261 NM_022755 64768 Hs.459896 NM_022755 ENSG00000127080 IPPK C9orf12|INSP5K2|IP5K|IPK1|bA476B13.1 inositol-pentakisphosphate 2-kinase protein-coding 333-25 chr8 73041354 73041739 + 1.66667 NA intron (NM_017489, intron 9 of 9) L1MCb|LINE|L1 32682 NM_017489 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 486.999 chr4 98114223 98114604 + 1.66667 NA intron (NM_174952, intron 3 of 10) intron (NM_174952, intron 3 of 10) 29063 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 339.334-6 chr3 105134111 105134415 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -232450 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 358.667-10 chr14 39902241 39902494 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -469867 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 219.333-40 chr12 66145648 66145897 + 1.66667 NA intron (NM_016056, intron 5 of 6) intron (NM_016056, intron 5 of 6) 15021 NR_125724 103625681 Hs.504820 NR_125724 ENSG00000239335 LLPH-DT LLPH-AS1 LLPH divergent transcript ncRNA 381.666-7 chr3 135518605 135519137 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -446857 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 353.667-6 chr14 64061353 64061699 + 1.66667 NA intron (NM_015180, intron 49 of 114) L1M4|LINE|L1 33599 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 281.667 chr1 9309418 9309609 + 1.66667 NA intron (NM_025106, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 16619 NM_025106 80176 Hs.8261 NM_025106 ENSG00000171621 SPSB1 SSB-1|SSB1 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1 protein-coding 281-49 chr9 98664948 98665271 + 1.66667 NA intron (NM_005458, intron 1 of 18) AluJb|SINE|Alu 43826 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 237.334-11 chr8 28996435 28996586 + 1.66667 NA intron (NM_001324384, intron 4 of 10) AluSx|SINE|Alu 105196 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 259-48 chr7 87198553 87198757 + 1.66667 NA intron (NR_138030, intron 2 of 3) intron (NR_138030, intron 2 of 3) 21077 NM_024315 79161 Hs.619593 NM_024315 ENSG00000135185 TMEM243 C7orf23|MM-TRAG|MMTRAG transmembrane protein 243 protein-coding 293-11 chr11 23271209 23271417 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 147877 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 269.667-10 chr11 11316620 11316935 + 1.66667 NA intron (NM_001363464, intron 8 of 9) intron (NM_001363464, intron 8 of 9) 36473 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 258.667-21 chr11 61998448 61998654 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30917 NM_002032 2495 Hs.524910 NM_002032 ENSG00000167996 FTH1 FHC|FTH|FTHL6|HFE5|PIG15|PLIF ferritin heavy chain 1 protein-coding 123.334 chr5 37713435 37713524 + 1.66667 NA intron (NM_001345998, intron 13 of 17) intron (NM_001345998, intron 13 of 17) 121343 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 313-10 chr12 33686684 33687025 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -247035 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 269.667-44 chr6 47470074 47470242 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -7631 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 274.333-37 chr2 17991320 17991517 + 1.66667 NA Intergenic THE1-int|LTR|ERVL-MaLR 112751 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 163.667-211 chr6 66475049 66475220 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 687255 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 270.667-49 chr7 77929394 77929702 + 1.66667 NA intron (NM_001366082, intron 10 of 11) intron (NM_001366082, intron 10 of 11) 89418 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 175.667-150 chr9 74176667 74176817 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -194789 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 261-43 chr4 30304332 30304549 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -415929 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 153-105 chr4 126068081 126068258 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 560910 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 446.333-10 chr8 110763125 110763619 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 264061 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 241.667-10 chr10 42373092 42373239 + 1.66667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -5120 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 262-20 chr14 67346235 67346433 + 1.66667 NA intron (NM_015994, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu 13470 NM_015994 51382 Hs.272630 NM_015994 ENSG00000100554 ATP6V1D ATP6M|VATD|VMA8 ATPase H+ transporting V1 subunit D protein-coding 249-63 chr6 143132280 143132540 + 1.66667 NA intron (NM_001366358, intron 1 of 5) L1MEc|LINE|L1 6271 NM_001366358 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 365.334-6 chr4 30716362 30716810 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3783 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 292.667-37 chr6 83347723 83347979 + 1.66667 NA intron (NM_002395, intron 4 of 13) MIR3|SINE|MIR 83200 NM_002395 4199 Hs.21160 NM_002395 ENSG00000065833 ME1 HUMNDME|MES malic enzyme 1 protein-coding 177.667-154 chr9 134455397 134455583 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 48930 NM_001291921 6256 Hs.590886 NM_002957 ENSG00000186350 RXRA NR2B1 retinoid X receptor alpha protein-coding 308.666-10 chr2 100864294 100864619 + 1.66667 NA intron (NM_002518, intron 1 of 20) intron (NM_002518, intron 1 of 20) 44317 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 248.667-113 chr9 105543146 105543349 + 1.66667 NA intron (NM_001287191, intron 13 of 13) intron (NM_001287191, intron 13 of 13) -14883 NM_006731 2218 Hs.55777 NM_006731 ENSG00000106692 FKTN CMD1X|FCMD|LGMD2M|LGMDR13|MDDGA4|MDDGB4|MDDGC4 fukutin protein-coding 244.667-57 chr2 144919457 144919736 + 1.66667 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) HAL1|LINE|L1 251629 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 291.334-4 chr13 32782509 32782708 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 129044 NR_047020 100874167 Hs.406290 NR_047020 LINC00423 - long intergenic non-protein coding RNA 423 ncRNA 271.334-7 chr13 56208066 56208258 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -932756 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 264.333-60 chr5 43641671 43641980 + 1.66667 NA intron (NM_012343, intron 7 of 21) intron (NM_012343, intron 7 of 21) -38595 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 265-64 chr8 109164558 109164811 + 1.66667 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 78056 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 325.667-24 chr6 140350195 140350423 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 145057 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 278.667-27 chr2 180644804 180645044 + 1.66667 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL -47180 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 416.334-4 chr4 23674774 23675108 + 1.66667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 206351 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 249.666-35 chr5 88638458 88638759 + 1.66667 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) AluSz6|SINE|Alu 28331 NR_030741 407047 NR_030741 ENSG00000284447 MIR9-2 MIRN9-2|hsa-mir-9-2|miRNA9-2|mir-9-2 microRNA 9-2 ncRNA 372-10 chr17 59258667 59259092 + 1.66667 NA intron (NM_182569, intron 6 of 9) AluJo|SINE|Alu 38368 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 475.667-3 chr5 147820918 147821308 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18118 NM_001354966 6690 Hs.407856 NM_003122 ENSG00000164266 SPINK1 PCTT|PSTI|Spink3|TATI|TCP serine peptidase inhibitor, Kazal type 1 protein-coding 249.667-57 chr22 40179973 40180315 + 1.66667 NA intron (NM_015088, intron 1 of 20) intron (NM_015088, intron 1 of 20) 2219 NM_015088 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 302.667-25 chr4 33531468 33531667 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 508326 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 261.667-4 chr1 103864270 103864441 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 114514 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 614.667 chr12 24807495 24808384 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 94283 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 300.334-3 chr10 22290363 22290659 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -25872 NM_001204062 100532731 Hs.380403 NM_001204062 ENSG00000269897 COMMD3-BMI1 BMI1|PCGF4|RNF51 COMMD3-BMI1 readthrough protein-coding 431.667-3 chr16 5893207 5893650 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -125596 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 273.333-50 chr4 99149730 99149977 + 1.66667 NA intron (NR_037884, intron 2 of 9) intron (NR_037884, intron 2 of 9) -5555 NM_001306172 127 Hs.1219 NM_000670 ENSG00000198099 ADH4 ADH-2|HEL-S-4 alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide protein-coding 232.666-21 chr18 7844756 7845129 + 1.66667 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR 277626 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 234.333-45 chr2 211292865 211293105 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 675414 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 320.667-11 chr12 48647505 48647857 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 6837 NR_002968 677815 Hs.689717 NR_002968 ENSG00000221491 SNORA2C ACA34|MIR1291|SNORA34 small nucleolar RNA, H/ACA box 2C snoRNA 227-42 chr4 169015791 169015971 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -5626 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 233.333-105 chr5 65346076 65346314 + 1.66667 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) L1MA7|LINE|L1 135725 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 397.334-9 chr4 39080632 39081040 + 1.66667 NA intron (NM_001171654, intron 2 of 10) intron (NM_001171654, intron 2 of 10) 18604 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 205-51 chr2 147054795 147054945 + 1.66667 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 467813 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 473.667-5 chr4 129242519 129243006 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 146610 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 295.334-5 chr5 81694804 81694987 + 1.66667 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) AluJr|SINE|Alu 56358 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 345.667-11 chr2 73273952 73274325 + 1.66667 NA intron (NM_001080410, intron 3 of 16) intron (NM_001080410, intron 3 of 16) 10340 NM_001080410 150726 Hs.23158 NM_001080410 ENSG00000163013 FBXO41 FBX41 F-box protein 41 protein-coding 272.667-28 chr2 36118951 36119143 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 236523 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 226-51 chr20 49511659 49511849 + 1.66667 NA intron (NM_000961, intron 8 of 9) intron (NM_000961, intron 8 of 9) -29086 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 263-35 chr20 54398425 54398612 + 1.66667 NA Intergenic LTR28|LTR|ERV1 -77075 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 270.667-46 chr6 87765809 87766119 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -18896 NR_110869 101928911 Hs.571178 NR_110869 LOC101928911 - uncharacterized LOC101928911 ncRNA 257.333-24 chr11 106802346 106802581 + 1.66667 NA intron (NM_001256424, intron 5 of 8) intron (NM_001256424, intron 5 of 8) 216013 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 273.667 chr1 28411821 28412088 + 1.66667 NA intron (NM_001350160, intron 3 of 14) intron (NM_001350160, intron 3 of 14) -26196 NM_023923 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 309.334-5 chr2 12507896 12508238 + 1.66667 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) -208805 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 354.333-10 chr2 110969881 110970263 + 1.66667 NA intron (NM_001371254, intron 13 of 18) L1MDb|LINE|L1 145516 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 241-34 chr2 118318720 118318990 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -132469 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 261.666-3 chr10 76185167 76185448 + 1.66667 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 402546 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 251.667-47 chr2 184034031 184034275 + 1.66667 NA Intergenic MER6B|DNA|TcMar-Tigger -344822 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 239.667-39 chr2 147122174 147122422 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 535241 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 255.667-65 chr4 78139356 78139550 + 1.66667 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) intron (NM_001166133, intron 2 of 41) 81883 NM_001166133 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 232.667-39 chr2 105083776 105083919 + 1.66667 NA intron (NM_182640, intron 5 of 10) MER103C|DNA|hAT-Charlie 19097 NR_110227 101927492 Hs.469537 NR_110227 ENSG00000231851 UTAT33 - uncharacterized LOC101927492 ncRNA 262.333-60 chr4 31319163 31319462 + 1.66667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 148168 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 318.667-18 chr18 10955201 10955438 + 1.66667 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) intron (NM_022068, intron 3 of 51) 193443 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 305.334 chr1 38870425 38870624 + 1.66667 NA intron (NR_037636, intron 1 of 3) AluYb8|SINE|Alu 2824 NM_012333 26292 Hs.591506 NM_012333 ENSG00000214114 MYCBP AMY-1 MYC binding protein protein-coding 276.333-45 chr4 107489797 107490231 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 230220 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 226.667-3 chr1 85089871 85090093 + 1.66667 NA intron (NM_001288563, intron 7 of 21) (ATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 27655 NM_145172 126820 Hs.97933 NM_145172 ENSG00000162643 WDR63 DIC3|NYD-SP29 WD repeat domain 63 protein-coding 223.334 chr1 179470639 179470826 + 1.66667 NA intron (NR_073544, intron 16 of 25) L1MB7|LINE|L1 104688 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 337-10 chr14 64201176 64201683 + 1.66667 NA intron (NM_015180, intron 99 of 114) intron (NM_015180, intron 99 of 114) -12715 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 263.667-30 chr15 80852353 80852630 + 1.66667 NA intron (NM_018689, intron 1 of 28) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -10418 NR_030393 693132 NR_030393 ENSG00000208003 MIR549A MIR549|MIRN549|hsa-mir-549|hsa-mir-549a|mir-549a microRNA 549a ncRNA 225-18 chr13 38313027 38313244 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36716 NR_104584 51569 Hs.643655 NM_016617 ENSG00000120686 UFM1 BM-002|C13orf20|HLD14 ubiquitin fold modifier 1 protein-coding 240.667-59 chr4 31221241 31221418 + 1.66667 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 50185 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 320.667 chr1 50787082 50787464 + 1.66667 NA intron (NM_007051, intron 4 of 18) intron (NM_007051, intron 4 of 18) 172994 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 262-21 chr14 69762116 69762287 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4941 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 265-41 chr20 12521161 12521431 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 415667 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 521.334-2 chr21 16750936 16751398 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 160930 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 186.667-104 chr4 58796439 58796622 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -187752 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 314.334-7 chr9 134769990 134770200 + 1.66667 NA intron (NM_001278074, intron 25 of 65) intron (NM_001278074, intron 25 of 65) 79274 NR_039691 100616333 NR_039691 ENSG00000264744 MIR3689C - microRNA 3689c ncRNA 275-6 chr10 90801714 90801947 + 1.66667 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) HERV35I-int|LTR|ERV1 56209 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 316.333-4 chr1 227302810 227303216 + 1.66667 NA intron (NM_001366019, intron 1 of 36) HAL1|LINE|L1 15479 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 244.334-7 chr11 81223957 81224139 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -461245 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 232.667-30 chr18 50018724 50018945 + 1.66667 NA intron (NM_001080467, intron 4 of 39) intron (NM_001080467, intron 4 of 39) 107729 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 157.333-368 chr9 120477058 120477163 + 1.66667 NA intron (NR_073558, intron 15 of 37) intron (NR_073558, intron 15 of 37) 103057 NM_001011649 55755 Hs.269560 NM_018249 ENSG00000136861 CDK5RAP2 C48|Cep215|MCPH3 CDK5 regulatory subunit associated protein 2 protein-coding 167.667-194 chr7 39227361 39227539 + 1.66667 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) MER5B|DNA|hAT-Charlie 101684 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 271.667-64 chr7 109695257 109695472 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 264849 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 447.001 chr5 22799260 22799619 + 1.66667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 53905 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 301.334 chr1 55900475 55900854 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 44299 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 349.667-8 chr16 7734488 7734725 + 1.66667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 401761 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 344.667-21 chr8 136878197 136878638 + 1.66667 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 347619 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 256.667-64 chr4 31607138 31607307 + 1.66667 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 100678 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 251.667-30 chr18 70058609 70058809 + 1.66667 NA intron (NM_001318520, intron 35 of 47) intron (NM_001318520, intron 35 of 47) -101910 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 221.333-139 chr8 82463402 82463594 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -448606 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 388.333-2 chr1 51548547 51549130 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29572 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 288-61 chr8 130974677 130975011 + 1.66667 NA intron (NM_001115, intron 2 of 17) LTR67B|LTR|ERVL 66065 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 304.333-35 chr7 48066244 48066662 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -22150 NM_001362774 7378 Hs.488240 NM_003364 ENSG00000183696 UPP1 UDRPASE|UP|UPASE|UPP uridine phosphorylase 1 protein-coding 357.334-6 chr21 26064180 26064584 + 1.66667 NA intron (NM_001136131, intron 3 of 15) L1MC3|LINE|L1 76008 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 220-20 chr11 21140721 21140890 + 1.66667 NA intron (NM_201551, intron 13 of 18) MIR3|SINE|MIR 471219 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 254.667-34 chr2 21140449 21140732 + 1.66667 NA exon (NM_001306137, exon 4 of 4) exon (NM_001306137, exon 4 of 4) 16604 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 355-24 chr7 3276744 3277141 + 1.66667 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu -24310 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 247.334-13 chr2 167520435 167520643 + 1.66667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -298133 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 396.334-4 chr6 18216839 18217187 + 1.66667 NA intron (NM_001364614, intron 20 of 21) intron (NM_001364614, intron 20 of 21) 47517 NM_003472 7913 Hs.484813 NM_003472 ENSG00000124795 DEK D6S231E DEK proto-oncogene protein-coding 218.333-86 chr3 103366441 103366667 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 157562 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 360-15 chr20 59921996 59922290 + 1.66667 NA intron (NM_014258, intron 3 of 44) intron (NM_014258, intron 3 of 44) 11494 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 270-62 chrX 78322503 78322687 + 1.66667 NA intron (NM_001282188, intron 1 of 3) intron (NM_001282188, intron 1 of 3) 5016 NM_006639 10800 Hs.733809 NM_006639 ENSG00000173198 CYSLTR1 CYSLT1|CYSLT1R|CYSLTR|HMTMF81 cysteinyl leukotriene receptor 1 protein-coding 222.334-6 chr18 9463226 9463401 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12200 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 472.001 chr5 24615783 24616080 + 1.66667 NA intron (NM_001362460, intron 1 of 9) intron (NM_001362460, intron 1 of 9) 29047 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 258.667-37 chr16 10394450 10394701 + 1.66667 NA intron (NM_024997, intron 1 of 11) L1M4|LINE|L1 8514 NM_001352120 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 432.667-5 chr16 58112819 58113175 + 1.66667 NA TTS (NR_136632) TTS (NR_136632) 16384 NM_013242 29105 Hs.532755 NM_013242 ENSG00000070761 CFAP20 BUG22|C16orf80|EVORF|GTL3|fSAP23 cilia and flagella associated protein 20 protein-coding 314.666-2 chr1 64536856 64537296 + 1.66667 NA intron (NM_001293274, intron 1 of 25) intron (NM_001293274, intron 1 of 25) 31162 NM_001293274 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 231-69 chr9 88950968 88951166 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -39796 NM_001001938 286223 Hs.585118 NM_001001938 ENSG00000213694 C9orf47 C9orf108|bA791O21.3 chromosome 9 open reading frame 47 protein-coding 248.667-83 chr4 128892285 128892511 + 1.66667 NA intron (NM_144643, intron 18 of 20) intron (NM_144643, intron 18 of 20) 80554 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 354.666-11 chr3 26805874 26806331 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 111545 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 330.667-16 chr22 41214285 41214635 + 1.66667 NA non-coding (NR_148200, exon 2 of 3) non-coding (NR_148200, exon 2 of 3) 3167 NR_148200 100506544 Hs.627409 NR_148200 ENSG00000235513 LOC100506544 - uncharacterized LOC100506544 ncRNA 221.334-4 chr19 34521111 34521313 + 1.66667 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 24174 NR_146880 100129800 NR_146880 ZNF807 ZNF181P1|ZNF807P zinc finger protein 807 pseudo 286.333-42 chr8 17104293 17104487 + 1.66667 NA intron (NR_146233, intron 10 of 15) intron (NR_146233, intron 10 of 15) -52092 NM_016353 51201 Hs.728241 NM_016353 ENSG00000104219 ZDHHC2 DHHC2|ZNF372 zinc finger DHHC-type containing 2 protein-coding 263.333-41 chr2 39971652 39971965 + 1.66667 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 54174 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 239-6 chr1 191972253 191972433 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -186119 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 184.667-4 chr1 92840063 92840219 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_002444) promoter-TSS (NR_002444) -578 NR_002444 26782 Hs.180946 NR_002444 ENSG00000207523 SNORA66 RNU66|U66 small nucleolar RNA, H/ACA box 66 snoRNA 191.333-117 chr2 174991147 174991366 + 1.66667 NA intron (NR_038133, intron 1 of 11) intron (NR_038133, intron 1 of 11) 13997 NM_001822 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 248-83 chr8 30761505 30761751 + 1.66667 NA intron (NM_005671, intron 6 of 7) FLAM_C|SINE|Alu 17463 NM_001282189 7993 Hs.153678 NM_005671 ENSG00000104691 UBXN8 D8S2298E|REP8|UBXD6 UBX domain protein 8 protein-coding 262-51 chr20 52578658 52578957 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -42031 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 270.333-40 chr3 183869845 183870084 + 1.66667 NA intron (NM_001324437, intron 1 of 7) intron (NM_001324437, intron 1 of 7) 14916 NM_001324438 55486 Hs.478469 NM_018622 ENSG00000175193 PARL PRO2207|PSARL|PSARL1|PSENIP2|RHBDS1 presenilin associated rhomboid like protein-coding 301-28 chr22 24989262 24989474 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -38606 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 246-22 chr12 86116715 86116899 + 1.66667 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) intron (NM_001351286, intron 4 of 7) 139584 NM_001351289 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 245.667-82 chr9 77376663 77376886 + 1.66667 NA intron (NM_001018038, intron 67 of 68) L2a|LINE|L2 -70875 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 266-10 chr10 56594424 56594651 + 1.66667 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -233264 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 277-33 chr3 34930652 34930939 + 1.66667 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 463228 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 248.334-16 chr7 7580268 7580422 + 1.66667 NA intron (NM_001370078, intron 3 of 8) intron (NM_001370078, intron 3 of 8) 12319 NM_001370078 54468 Hs.520215 NM_019005 ENSG00000164654 MIOS MIO|Sea4|Yulink meiosis regulator for oocyte development protein-coding 180.667-38 chr14 25665232 25665409 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -615023 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 283.333-13 chr12 51491813 51492108 + 1.66667 NA intron (NM_001039960, intron 19 of 24) L2a|LINE|L2 66843 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 224.667-15 chr12 10131105 10131293 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_022570) promoter-TSS (NM_022570) -930 NM_197947 64581 Hs.143929 NM_022570 ENSG00000172243 CLEC7A BGR|CANDF4|CD369|CLECSF12|DECTIN1|SCARE2 C-type lectin domain containing 7A protein-coding 290.334-9 chr6 101872493 101872742 + 1.66667 NA intron (NM_001166247, intron 10 of 16) intron (NM_001166247, intron 10 of 16) 473632 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 233.333-124 chr7 77748201 77748434 + 1.66667 NA intron (NM_198467, intron 2 of 7) intron (NM_198467, intron 2 of 7) 50117 NM_032936 85025 Hs.19025 NM_032936 ENSG00000135211 TMEM60 C7orf35|DC32 transmembrane protein 60 protein-coding 372.334-3 chr2 78298564 78298855 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7978 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 248.667-98 chr7 42791441 42791687 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -85117 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 222.334-4 chr15 68659945 68660092 + 1.66667 NA intron (NM_006091, intron 2 of 11) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 18515 NM_001324015 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 239.333-100 chr7 92979271 92979464 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 138612 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 217.667-79 chr7 38941095 38941275 + 1.66667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -31985 NM_080631 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 264.333-45 chr3 42469298 42469577 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -19862 NM_001251882 7433 Hs.348500 NM_004624 ENSG00000114812 VIPR1 HVR1|II|PACAP-R-2|PACAP-R2|RDC1|V1RG|VAPC1|VIP-R-1|VIPR|VIRG|VPAC1|VPAC1R|VPCAP1R vasoactive intestinal peptide receptor 1 protein-coding 230-75 chr8 122572569 122572720 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4000 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 300.333-36 chr5 18237286 18237586 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 430162 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 147.666-5 chr2 35180746 35180912 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -290576 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 236.334-11 chr9 116298261 116298478 + 1.66667 NA intron (NM_002581, intron 9 of 21) intron (NM_002581, intron 9 of 21) 102237 NR_103711 493913 Hs.728832 NR_103711 ENSG00000256040 PAPPA-AS1 DIPAS|NCRNA00156|PAPPA-AS|PAPPAAS|PAPPAS|TAF2C2|TAF4B|TAFII105 PAPPA antisense RNA 1 ncRNA 256.667-63 chr3 189785201 189785403 + 1.66667 NA intron (NM_003722, intron 3 of 13) intron (NM_003722, intron 3 of 13) -4357 NM_001329146 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 258.666-41 chr6 63772164 63772449 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 40 of 43) L1MC5a|LINE|L1 -34530 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 395.667-6 chr3 69077162 69077600 + 1.66667 NA intron (NM_198195, intron 2 of 16) intron (NM_198195, intron 2 of 16) 2984 NM_198195 9039 Hs.154320 NM_003968 ENSG00000144744 UBA3 NAE2|UBE1C|hUBA3 ubiquitin like modifier activating enzyme 3 protein-coding 255.334-10 chr15 64235589 64235816 + 1.66667 NA intron (NM_001329607, intron 4 of 11) intron (NM_001329607, intron 4 of 11) -72547 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 292.334-15 chr8 87469530 87469870 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 404315 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 272.333-27 chr2 18137833 18138137 + 1.66667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 259318 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 261.333-119 chr9 123786964 123787182 + 1.66667 NA intron (NM_001352965, intron 1 of 20) intron (NM_001352965, intron 1 of 20) 143053 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 292.667-46 chr8 121906765 121906945 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -265415 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 267.334-20 chr8 38338709 38338884 + 1.66667 NA intron (NM_023034, intron 2 of 23) intron (NM_023034, intron 2 of 23) 43475 NM_023034 54904 Hs.434966 NM_017778 ENSG00000147548 NSD3 KMT3F|KMT3G|WHISTLE|WHSC1L1|pp14328 nuclear receptor binding SET domain protein 3 protein-coding 272.667-5 chr1 215485214 215485423 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81986 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 376-7 chr15 72435907 72436393 + 1.66667 NA intron (NR_135678, intron 1 of 3) L1MB3|LINE|L1 37845 NR_148418 338949 Hs.446069 NM_001080462 ENSG00000187806 TMEM202 - transmembrane protein 202 protein-coding 369.666-13 chr8 81545767 81546145 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14566 NM_001105281 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 192-148 chr8 117346924 117347100 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -173701 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 244.667-22 chr11 27654128 27654357 + 1.66667 NA TTS (NM_001143806) TTS (NM_001143806) 5407 NM_170735 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 286-35 chr22 26668385 26668712 + 1.66667 NA non-coding (NR_003491, exon 5 of 5) non-coding (NR_003491, exon 5 of 5) -4295 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 277-7 chr11 21112046 21112279 + 1.66667 NA intron (NM_201551, intron 12 of 18) intron (NM_201551, intron 12 of 18) 442576 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 260-14 chr10 91958814 91959049 + 1.66667 NA intron (NM_003972, intron 8 of 37) intron (NM_003972, intron 8 of 37) 35161 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 256.667-73 chr5 136366992 136367337 + 1.66667 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -1688 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 358 chr1 44198942 44199467 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -14267 NM_019100 55929 Hs.8008 NM_019100 ENSG00000178028 DMAP1 DNMAP1|DNMTAP1|EAF2|MEAF2|SWC4 DNA methyltransferase 1 associated protein 1 protein-coding 243.667-42 chr2 119963823 119964074 + 1.66667 NA intron (NM_002830, intron 24 of 26) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -49129 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 255.667-40 chr18 77360586 77360739 + 1.66667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 110814 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 205-36 chr15 80345638 80345804 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3916 NR_033833 283688 Hs.525933 NR_033833 ENSG00000259361 LINC00927 - long intergenic non-protein coding RNA 927 ncRNA 242.333-65 chr3 20725096 20725331 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 382745 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 488.667-5 chr7 97503136 97503895 + 1.66667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -228571 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 229.333-89 chr4 106794514 106794669 + 1.66667 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL 241722 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 238.667-33 chr17 5331713 5331920 + 1.66667 NA intron (NM_001291582, intron 2 of 4) intron (NM_001291582, intron 2 of 4) 49532 NM_001291582 9135 Hs.584784 NM_004703 ENSG00000029725 RABEP1 RAB5EP|RABPT5 rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 protein-coding 248.334-3 chr10 72530455 72530636 + 1.66667 NA intron (NM_001363513, intron 5 of 12) intron (NM_001363513, intron 5 of 12) -6559 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 314.667-6 chr10 74496652 74496971 + 1.66667 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) intron (NM_001369124, intron 6 of 9) 32513 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 319-3 chr1 190055202 190055528 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 420645 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 263-57 chr6 38761832 38762105 + 1.66667 NA intron (NM_001371, intron 10 of 91) intron (NM_001371, intron 10 of 91) 46657 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 217-87 chr7 90669818 90669953 + 1.66667 NA intron (NM_001287135, intron 2 of 14) intron (NM_001287135, intron 2 of 14) -39513 NM_012395 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 333.667-9 chr14 89878957 89879334 + 1.66667 NA intron (NM_001284269, intron 5 of 5) intron (NM_001284269, intron 5 of 5) 75391 NM_001284269 90141 Hs.123232 NM_145231 ENSG00000140025 EFCAB11 C14orf143 EF-hand calcium binding domain 11 protein-coding 344.667-6 chr18 8187177 8187498 + 1.66667 NA intron (NM_002845, intron 14 of 30) L2|LINE|L2 179697 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 265.666-21 chr5 105273440 105273703 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 174097 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 321.333-9 chr10 25365781 25366073 + 1.66667 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) L1ME3|LINE|L1 -189651 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 238-85 chr6 38439263 38439433 + 1.66667 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) AluSq2|SINE|Alu -42248 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 260-31 chr18 5533656 5533967 + 1.66667 NA intron (NM_001330557, intron 1 of 21) intron (NM_001330557, intron 1 of 21) 6745 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 356-13 chr13 39407733 39408152 + 1.66667 NA intron (NM_005780, intron 2 of 3) intron (NM_005780, intron 2 of 3) 195251 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 244.667-58 chr2 184906463 184906666 + 1.66667 NA intron (NM_194250, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 260508 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 501.001-2 chr4 121116372 121116748 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -44025 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 202.333-167 chr8 27654100 27654288 + 1.66667 NA intron (NM_182826, intron 3 of 5) L1ME2z|LINE|L1 20134 NM_182826 51435 Hs.128856 NM_016240 ENSG00000168077 SCARA3 APC7|CSR|CSR1|MSLR1|MSRL1 scavenger receptor class A member 3 protein-coding 529.334-4 chr6 86787436 86787923 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -149849 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 251.334-30 chr7 83707929 83708117 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -58884 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 249-29 chr15 65595688 65595924 + 1.66667 NA exon (NM_001136043, exon 7 of 12) exon (NM_001136043, exon 7 of 12) 15325 NR_045106 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 298.667-20 chr5 59187763 59188054 + 1.66667 NA intron (NM_006203, intron 3 of 14) intron (NM_006203, intron 3 of 14) 88207 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 271.334-5 chr11 16060763 16061024 + 1.66667 NA intron (NM_017508, intron 8 of 14) L2c|LINE|L2 -91272 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 320.334 chr1 40749971 40750242 + 1.66667 NA intron (NM_001142588, intron 4 of 10) intron (NM_001142588, intron 4 of 10) -4249 NR_029846 407034 NR_029846 ENSG00000198974 MIR30E MIRN30E|mir-30e microRNA 30e ncRNA 157.333-122 chr15 66637787 66638097 + 1.66667 NA intron (NR_110372, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 55752 NR_110372 102723165 Hs.636703 NR_110372 ENSG00000259471 LINC01169 - long intergenic non-protein coding RNA 1169 ncRNA 365.667-17 chr8 62643805 62644195 + 1.66667 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) LTR33|LTR|ERVL -333861 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 276.666-16 chr2 28284751 28285038 + 1.66667 NA intron (NM_199193, intron 11 of 13) MIRb|SINE|MIR 25565 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 123-56 chr17 67159264 67159372 + 1.66667 NA intron (NM_001330447, intron 17 of 32) intron (NM_001330447, intron 17 of 32) -85458 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 310-57 chr7 127845454 127845789 + 1.66667 NA intron (NM_014390, intron 12 of 23) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -151888 NR_027330 27099 Hs.657377 NM_014411 ENSG00000279078 SND1-IT1 C7orf54|NAG8|NSG-X SND1 intronic transcript 1 ncRNA 365.334-3 chr2 64712048 64712495 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -58358 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 425.667-5 chr19 38371175 38371595 + 1.66667 NA TTS (NM_021185) TTS (NM_021185) -3165 NM_002812 5714 Hs.78466 NM_002812 ENSG00000099341 PSMD8 HEL-S-91n|HIP6|HYPF|Nin1p|Rpn12|S14|p31 proteasome 26S subunit, non-ATPase 8 protein-coding 315-10 chr14 53683286 53683607 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 265038 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 390.667-3 chr17 71543778 71544284 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -341852 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 290.334-6 chr3 188268364 188268690 + 1.66667 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) MER57B2|LTR|ERV1 43122 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 298.334-8 chr4 79531715 79532030 + 1.66667 NA intron (NR_038826, intron 3 of 3) intron (NR_038826, intron 3 of 3) 39279 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 282.333-31 chr20 17253167 17253473 + 1.66667 NA intron (NM_001201529, intron 1 of 10) L1MB7|LINE|L1 26280 NM_001201529 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 277.001 chr10 90098921 90099097 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -141636 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 209.667-31 chr12 13937553 13937697 + 1.66667 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) L1ME2|LINE|L1 42731 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 257.334-2 chr1 191713172 191713425 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -445164 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 261.334-6 chr17 56968529 56968690 + 1.66667 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -7559 NM_004645 8161 Hs.532795 NM_004645 ENSG00000121058 COIL CLN80|p80-coilin coilin protein-coding 326-36 chr5 107849941 107850373 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -179220 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 260.333-50 chr5 45052962 45053301 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 244184 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 285-16 chr2 37112853 37113095 + 1.66667 NA intron (NM_002759, intron 14 of 16) L1M5|LINE|L1 28523 NM_001278505 253635 Hs.595250 NM_174931 ENSG00000152133 GPATCH11 CCDC75|CENP-Y|CENPY G-patch domain containing 11 protein-coding 312-31 chr3 58370040 58370388 + 1.66667 NA intron (NR_146193, intron 2 of 16) intron (NR_146193, intron 2 of 16) 36908 NM_001349498 54899 Hs.190544 NM_017771 ENSG00000168297 PXK MONAKA|SLOB PX domain containing serine/threonine kinase like protein-coding 238.667-69 chr5 95080511 95080716 + 1.66667 NA intron (NM_024717, intron 1 of 22) intron (NM_024717, intron 1 of 22) 1253 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 269.667-26 chr18 2467146 2467337 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 104264 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 278-15 chr18 22632787 22632964 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 153962 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 299.667-16 chr2 37518293 37518499 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 153803 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 238.667-101 chrX 126668270 126668457 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -115549 NM_178470 139170 Hs.120403 NM_178470 ENSG00000198889 DCAF12L1 KIAA1892L|WDR40B DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 1 protein-coding 332.334-7 chr9 95484059 95484519 + 1.66667 NA intron (NM_000264, intron 3 of 23) intron (NM_000264, intron 3 of 23) 20680 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 230-29 chr17 61149678 61149930 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 217900 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 246-50 chr2 78508942 78509091 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36515 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 258.667-80 chr5 120691332 120691614 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 160009 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 240.333-45 chr17 70645643 70645968 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 476270 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 333.333-29 chr2 160775686 160776094 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -282083 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 238.334-4 chr14 50599367 50599529 + 1.66667 NA intron (NM_015915, intron 6 of 13) L1M5|LINE|L1 39423 NM_181598 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 333.334-7 chrX 151642768 151643063 + 1.66667 NA intron (NM_173493, intron 8 of 15) intron (NM_173493, intron 8 of 15) -52343 NM_024082 79057 Hs.209253 NM_024082 ENSG00000130032 PRRG3 PRGP3|TMG3 proline rich and Gla domain 3 protein-coding 405.334-4 chr8 59423626 59423961 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 304583 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 392.667 chr11 123837921 123838285 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31754 NM_001005325 390261 Hs.557924 NM_001005325 ENSG00000196099 OR6M1 OR11-271 olfactory receptor family 6 subfamily M member 1 protein-coding 302.333-7 chr1 221890970 221891305 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50471 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 242.667-76 chr4 69650984 69651155 + 1.66667 NA intron (NM_001252274, intron 1 of 6) L1MA2|LINE|L1 2178 NM_001252274 10941 Hs.225950 NM_006798 ENSG00000173610 UGT2A1 UDPGT2A1 UDP glucuronosyltransferase family 2 member A1 complex locus protein-coding 494.334-2 chr8 121354732 121355079 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -284441 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 253.667-27 chr18 13266951 13267202 + 1.66667 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) intron (NM_181482, intron 1 of 5) -11029 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 265.667-43 chr21 26288588 26288902 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -104890 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 184.667-74 chr22 42991921 42992087 + 1.66667 NA intron (NM_001184970, intron 1 of 10) L1M4|LINE|L1 23145 NM_001184970 11252 Hs.162877 NM_007229 ENSG00000100266 PACSIN2 SDPII protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2 protein-coding 368.334-5 chr2 187567792 187568088 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13435 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 277.334-12 chr4 106667433 106667610 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 233897 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 265.334-14 chr2 81333730 81334041 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 133061 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 240.334-5 chr14 69272558 69272770 + 1.66667 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 12506 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 313.667-34 chr4 62042870 62043103 + 1.66667 NA intron (NM_001371343, intron 22 of 23) L1ME3A|LINE|L1 118779 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 219.667-42 chr2 123222461 123222664 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -149081 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 248.667-110 chr9 31962764 31962992 + 1.66667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -421725 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 410.334-3 chr4 121631920 121632265 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 64888 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 463.666 chr5 24858388 24858769 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17995 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 312.333 chr1 202777041 202777405 + 1.66667 NA intron (NM_001314042, intron 1 of 27) intron (NM_001314042, intron 1 of 27) 32247 NM_001347591 10765 Hs.18891 NM_006618 ENSG00000117139 KDM5B CT31|JARID1B|MRT65|PLU-1|PLU1|PPP1R98|PUT1|RBBP2H1A|RBP2-H1 lysine demethylase 5B protein-coding 252 chr1 20693820 20694063 + 1.66667 NA intron (NM_001122819, intron 6 of 14) intron (NM_001122819, intron 6 of 14) 24066 NM_001122819 57576 Hs.130411 NM_020816 ENSG00000117245 KIF17 KIF17B|KIF3X|KLP-2|OSM-3 kinesin family member 17 protein-coding 247-3 chr1 161188859 161189050 + 1.66667 NA TTS (NM_001320336) TTS (NM_001320336) 10100 NM_005099 9507 Hs.211604 NM_005099 ENSG00000158859 ADAMTS4 ADAMTS-2|ADAMTS-4|ADMP-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4 protein-coding 277-43 chr4 172598719 172598919 + 1.66667 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 90098 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 224-7 chr10 26248318 26248533 + 1.66667 NA intron (NM_000818, intron 8 of 16) LTR39|LTR|ERV1 31651 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 269.334-8 chr2 117252137 117252364 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -562441 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 517.667 chr11 39708728 39709277 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 584128 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 230.667-5 chr1 153239444 153239707 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20112 NM_000427 4014 Hs.251680 NM_000427 ENSG00000203782 LOR - loricrin protein-coding 362.333-8 chr21 18208609 18209151 + 1.66667 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) L1M1|LINE|L1 -35953 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 326-4 chr1 168126195 168126451 + 1.66667 NA intron (NM_001267610, intron 1 of 6) intron (NM_001267610, intron 1 of 6) 10113 NM_001267612 23432 Hs.271809 NM_007369 ENSG00000143147 GPR161 RE2 G protein-coupled receptor 161 protein-coding 274.667-12 chr11 106848791 106848966 + 1.66667 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) intron (NM_001256424, intron 4 of 8) 169598 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 276.667-17 chr13 21035437 21035662 + 1.66667 NA intron (NM_014572, intron 2 of 7) intron (NM_014572, intron 2 of 7) 26037 NM_014572 26524 Hs.78960 NM_014572 ENSG00000150457 LATS2 KPM large tumor suppressor kinase 2 protein-coding 269.334-4 chr11 115688870 115689080 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 45787 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 261.334-16 chr4 115163437 115163603 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -49900 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 260.333-30 chr2 141719315 141719605 + 1.66667 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) MIRc|SINE|MIR 412241 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 436.333-3 chr2 102166886 102167247 + 1.66667 NA intron (NM_001320978, intron 6 of 11) intron (NM_001320978, intron 6 of 11) 13125 NM_001320984 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 255.667-82 chr8 75871105 75871369 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 331269 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 246.333-78 chr5 105391747 105391951 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 292375 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 298-31 chr16 73627124 73627382 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 240448 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 237.667-45 chr2 232303359 232303628 + 1.66667 NA intron (NR_046476, intron 14 of 20) intron (NR_046476, intron 14 of 20) -75258 NM_001632 250 Hs.284255 NM_001632 ENSG00000163283 ALPP ALP|ALPI|IAP|PALP|PLAP|PLAP-1 alkaline phosphatase, placental protein-coding 324.667-16 chr2 59525975 59526339 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 308449 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 210.667-47 chr15 61669561 61669712 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -60282 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 267-45 chr20 54998704 54999059 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -424162 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 294.667-39 chr5 961314 961564 + 1.66667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 35901 NR_104614 100506688 Hs.532063 NM_001242737 ENSG00000215246 LOC100506688 - uncharacterized LOC100506688 ncRNA 409-7 chr3 19059359 19059803 + 1.66667 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -88929 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 237.667-75 chr7 33298198 33298449 + 1.66667 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) MIR|SINE|MIR 168759 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 278.334-7 chr6 51945476 51945693 + 1.66667 NA intron (NM_138694, intron 36 of 66) intron (NM_138694, intron 36 of 66) 142029 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 372-20 chr7 130480173 130480495 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -5841 NM_001253901 4232 Hs.270978 NM_002402 ENSG00000106484 MEST PEG1 mesoderm specific transcript protein-coding 243.667-50 chr3 94950704 94950896 + 1.66667 NA intron (NR_015400, intron 1 of 7) intron (NR_015400, intron 1 of 7) 12537 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 310-58 chr8 11177963 11178349 + 1.66667 NA intron (NR_138154, intron 1 of 2) intron (NR_138154, intron 1 of 2) 23210 NR_138152 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 291.334-5 chr18 30208490 30208756 + 1.66667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -90287 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 270.334-6 chr12 114240057 114240227 + 1.66667 NA intron (NR_146536, intron 1 of 1) intron (NR_146536, intron 1 of 1) 1628 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 183.334 chr3 185145556 185145737 + 1.66667 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) intron (NM_001025266, intron 1 of 1) 7414 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 309.333-50 chr4 114607998 114608307 + 1.66667 NA intron (NM_001322114, intron 1 of 5) intron (NM_001322114, intron 1 of 5) 8867 NM_001322114 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 239.667-38 chr2 128133355 128133585 + 1.66667 NA intron (NR_027671, intron 14 of 40) intron (NR_027671, intron 14 of 40) 42270 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 479.333-10 chr7 69075984 69076508 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 521378 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 258.667-104 chrX 55157521 55157780 + 1.66667 NA intron (NM_138362, intron 2 of 3) intron (NM_138362, intron 2 of 3) 3452 NM_001166703 90736 Hs.415414 NM_138362 ENSG00000182518 FAM104B CXorf44 family with sequence similarity 104 member B protein-coding 209.333-86 chr16 78726454 78726674 + 1.66667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 626910 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 372.333-25 chr9 75494947 75495462 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -395440 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 260.333-7 chr12 13908456 13908694 + 1.66667 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 71781 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 176-66 chr4 60928871 60929014 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6323 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 355-23 chr6 121663083 121663523 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 227657 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 331.001-3 chr6 152813686 152813958 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 63025 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 273.667-8 chr1 228865369 228865625 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 130018 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 317.667-13 chr15 59312458 59312761 + 1.66667 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) AluJo|SINE|Alu 60262 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 535.001-3 chr2 157743643 157744155 + 1.66667 NA intron (NM_001111067, intron 9 of 10) MIR3|SINE|MIR 94731 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 157.333-315 chr7 5415564 5415806 + 1.66667 NA intron (NM_001080495, intron 2 of 29) intron (NM_001080495, intron 2 of 29) 7861 NM_001080495 84629 Hs.520638 NM_001013722 ENSG00000182095 TNRC18 CAGL79|TNRC18A trinucleotide repeat containing 18 protein-coding 357.667-11 chr6 144521478 144521926 + 1.66667 NA intron (NM_007124, intron 38 of 73) intron (NM_007124, intron 38 of 73) 116047 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 245.334-16 chr5 175765506 175765719 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -30921 NM_006650 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 181.333-69 chr19 32737439 32737658 + 1.66667 NA intron (NM_001366102, intron 2 of 32) AluJr|SINE|Alu 17781 NM_001366102 91646 Hs.646351 NM_001015890 ENSG00000173809 TDRD12 ECAT8 tudor domain containing 12 protein-coding 252.667-97 chr7 94169034 94169325 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -164824 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 283.333-42 chr20 50255195 50255476 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -12151 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 387.667-11 chr5 38208796 38209195 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -49564 NM_152403 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 372.334-4 chr3 33637830 33638091 + 1.66667 NA intron (NM_015097, intron 8 of 38) L1ME4b|LINE|L1 21719 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 325-17 chr2 28029491 28029812 + 1.66667 NA intron (NM_199193, intron 6 of 13) L1MB2|LINE|L1 33284 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 278.334-9 chr8 86095258 86095505 + 1.66667 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -3529 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 271.667-34 chr17 61648905 61649116 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -57791 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 193.333-28 chr10 110646578 110646776 + 1.66667 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 2341 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 252.667-51 chr2 142283141 142283332 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -151535 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 250.667-23 chr15 25577373 25577559 + 1.66667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -138410 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 254-11 chr10 103124864 103125098 + 1.66667 NA intron (NM_001351176, intron 2 of 17) intron (NM_001351176, intron 2 of 17) 28840 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 242-65 chr7 35597256 35597401 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 97807 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 243.333-70 chr3 43505486 43505642 + 1.66667 NA intron (NM_001346464, intron 12 of 13) intron (NM_001346464, intron 12 of 13) 116362 NM_001346466 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 330.667-18 chr3 59498339 59498630 + 1.66667 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 160013 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 285.667-9 chr12 29685070 29685322 + 1.66667 NA intron (NM_001367875, intron 5 of 19) intron (NM_001367875, intron 5 of 19) 98746 NM_001367875 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 301.001 chr16 80231835 80232025 + 1.66667 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -308804 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 455.667-2 chr1 220857589 220858011 + 1.66667 NA intron (NR_046901, intron 1 of 2) L1MA2|LINE|L1 -21643 NM_021958 3142 Hs.74870 NM_021958 ENSG00000136630 HLX HB24|HLX1 H2.0 like homeobox protein-coding 353-21 chr8 50037269 50037588 + 1.66667 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) 126021 NR_135796 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 179-58 chr2 226105718 226105850 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37010 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 251-39 chr20 33079299 33079472 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2127 NM_182519 149954 Hs.38961 NM_182519 ENSG00000186191 BPIFB4 C20orf186|LPLUNC4|RY2G5|dJ726C3.5 BPI fold containing family B member 4 protein-coding 253.334-17 chr5 26915270 26915430 + 1.66667 NA intron (NM_016279, intron 3 of 11) intron (NM_016279, intron 3 of 11) 123236 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 274-8 chr11 123293528 123293724 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -64796 NM_001367419 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 374-26 chr8 133942689 133943046 + 1.66667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 56371 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 327.334-8 chr22 42590277 42590566 + 1.66667 NA intron (NR_103820, intron 7 of 8) AluJb|SINE|Alu -8410 NR_002184 91695 Hs.534041 NR_002184 ENSG00000182841 RRP7BP RRP7B|dJ222E13.2 ribosomal RNA processing 7 homolog B, pseudogene pseudo 320.334-2 chr1 102126680 102126886 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -129549 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 264.333-77 chr8 121260245 121260550 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -378949 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 286.999-10 chr8 136772989 136773412 + 1.66667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 242402 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 344-25 chr20 9176708 9177111 + 1.66667 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) intron (NM_001172646, intron 1 of 37) -40481 NM_182797 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 234-52 chr4 44324349 44324630 + 1.66667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) MamRep605|LTR?|LTR? 124320 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 291.333-8 chr10 75147030 75147284 + 1.66667 NA intron (NM_144660, intron 1 of 4) intron (NM_144660, intron 1 of 4) 35501 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 285.333-61 chr6 129521250 129521553 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 188776 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 324.334-10 chr4 92176070 92176430 + 1.66667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 101052 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 275.667-20 chr15 46895926 46896098 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -288077 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 160.667-116 chr16 73641180 73641316 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 254443 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 249-5 chr1 214863554 214863829 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -141851 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 258-76 chr6 166561881 166562157 + 1.66667 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) MIRb|SINE|MIR -17329 NM_001318938 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 298.334-7 chr3 15468653 15468929 + 1.66667 NA intron (NM_080539, intron 10 of 15) MIR3|SINE|MIR 27517 NR_036232 100422868 NR_036232 ENSG00000263573 MIR4270 - microRNA 4270 ncRNA 317.334-8 chr9 33990154 33990427 + 1.66667 NA intron (NR_163243, intron 3 of 24) intron (NR_163243, intron 3 of 24) -37436 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 303.333-62 chr5 84491173 84491614 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -106513 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 358.001 chr1 55250963 55251182 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 25431 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 459.667-2 chr3 163574553 163575001 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -271476 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 239.334-4 chr12 102034405 102034560 + 1.66667 NA intron (NM_016053, intron 5 of 6) L3|LINE|CR1 27509 NM_016053 51019 Hs.405692 NM_016053 ENSG00000120860 WASHC3 CCDC53|CGI-116 WASH complex subunit 3 protein-coding 480-2 chr12 19542833 19543152 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 102393 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 364.667-15 chr8 103845165 103845614 + 1.66667 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) intron (NR_145711, intron 1 of 21) 26169 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 124-106 chr6 164816616 164816761 + 1.66667 NA intron (NR_131926, intron 1 of 3) intron (NR_131926, intron 1 of 3) 5375 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 383-9 chr4 83483318 83483578 + 1.66667 NA intron (NM_139076, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 1652 NM_139076 84142 Hs.334772 NM_139076 ENSG00000163322 ABRAXAS1 ABRA1|CCDC98|FAM175A abraxas 1, BRCA1 A complex subunit protein-coding 253-20 chr13 36720826 36721073 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 46929 NM_203451 400120 Hs.422375 NM_203451 ENSG00000180440 SERTM1 C13orf36 serine rich and transmembrane domain containing 1 protein-coding 451.333-6 chr4 59681201 59681670 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 667862 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 239.333-92 chr6 54791081 54791252 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -55605 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 349.667-2 chr10 99073986 99074349 + 1.66667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1MB1|LINE|L1 -149599 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 259-35 chr3 109831958 109832202 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 229252 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 224.334-3 chr17 63236989 63237180 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) L1PB4|LINE|L1 203183 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 359.334-2 chr2 47168884 47169115 + 1.66667 NA intron (NM_001305625, intron 2 of 5) AluSz|SINE|Alu 5208 NM_001305626 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 362.667-27 chr8 119531479 119531740 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 61399 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 659.667 chr8 77825236 77825896 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 374869 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 244.667-46 chr17 55026175 55026448 + 1.66667 NA intron (NM_178509, intron 8 of 17) L1M4|LINE|L1 -57526 NM_001321518 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 250.334-9 chr17 59003409 59003602 + 1.66667 NA intron (NR_148346, intron 22 of 23) L1MD2|LINE|L1 103375 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 289.333-19 chr17 2332318 2332672 + 1.66667 NA intron (NM_018128, intron 7 of 14) intron (NM_018128, intron 7 of 14) -2125 NR_003072 692207 NR_003072 ENSG00000212163 SNORD91A HBII-296a small nucleolar RNA, C/D box 91A snoRNA 259-42 chr5 67053389 67053641 + 1.66667 NA intron (NM_001297651, intron 1 of 25) intron (NM_001297651, intron 1 of 25) 48860 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 388.999 chr10 24233518 24234031 + 1.66667 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) L1MEj|LINE|L1 24636 NM_019590 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 409.333-6 chr12 115137232 115137548 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -453215 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 270.334-11 chr17 29993765 29993932 + 1.66667 NA intron (NR_026738, intron 5 of 15) AluJr|SINE|Alu 52214 NM_198529 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 250-67 chr5 149482942 149483163 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 52406 NR_029686 406937 NR_029686 ENSG00000276365 MIR145 MIRN145|miR-145|miRNA145 microRNA 145 ncRNA 291-39 chr5 76956076 76956364 + 1.66667 NA intron (NM_001882, intron 4 of 6) intron (NM_001882, intron 4 of 6) 3175 NM_001882 1393 Hs.115617 NM_001882 ENSG00000145708 CRHBP CRF-BP|CRFBP corticotropin releasing hormone binding protein protein-coding 301.334-10 chr3 193143645 193143862 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -97469 NM_001366112 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 327.334-4 chr18 42692235 42692512 + 1.66667 NA TTS (NR_046174) TTS (NR_046174) 423312 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 272-55 chr9 24285247 24285545 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 260280 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 166.334-4 chr8 137872143 137872309 + 1.66667 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 211319 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 287.334-9 chr2 188570602 188570798 + 1.66667 NA intron (NM_016315, intron 9 of 11) intron (NM_016315, intron 9 of 11) 219423 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 437.333-5 chr15 61273317 61273799 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -44256 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 339.334-3 chr14 53967643 53967981 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -10921 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 176.334 chr3 40833808 40833956 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 308922 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 330 chr1 24198458 24198860 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1581 NR_027087 284632 Hs.638906 NR_027087 ENSG00000230023 LINC02800 - long intergenic non-protein coding RNA 2800 ncRNA 403.333-11 chr4 22923514 22924029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 209682 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 215.333-52 chr13 93447953 93448196 + 1.66667 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) intron (NM_005708, intron 1 of 8) 221267 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 225.667-18 chr12 59297537 59297714 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -298404 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 257.333-15 chr10 81048354 81048650 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 398705 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 439.667-2 chr2 134726530 134726950 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7740 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 437-7 chr6 26590351 26590785 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -6385 NM_013375 29777 Hs.254406 NM_013375 ENSG00000146109 ABT1 Esf2|hABT1 activator of basal transcription 1 protein-coding 369.333-10 chr18 11205599 11205960 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -57017 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 194.333-132 chr6 92048632 92048852 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -358314 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 277-38 chr3 126250113 126250431 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -69086 NM_001270364 10840 Hs.434435 NM_012190 ENSG00000144908 ALDH1L1 10-FTHFDH|10-fTHF|FDH|FTHFD aldehyde dehydrogenase 1 family member L1 protein-coding 259-3 chr1 208798508 208798694 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 69913 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 249.334-12 chr17 58839152 58839315 + 1.66667 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) FLAM_A|SINE|Alu 83364 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 260.667-9 chr1 240031503 240031764 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 24109 NR_036695 645884 Hs.613280 NR_036695 RPS7P5 RPS7_2_183 ribosomal protein S7 pseudogene 5 pseudo 304.667-26 chr3 100520125 100520430 + 1.66667 NA intron (NM_001363876, intron 2 of 6) intron (NM_001363876, intron 2 of 6) 27658 NM_018004 55076 Hs.658956 NM_018004 ENSG00000181458 TMEM45A DERP7|DNAPTP4 transmembrane protein 45A protein-coding 266.333-43 chr4 39898234 39898481 + 1.66667 NA exon (NM_001100400, exon 16 of 16) exon (NM_001100400, exon 16 of 16) 79554 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 222.667-22 chr13 68688212 68688437 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 197001 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 267-27 chr15 70031967 70032145 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 47412 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 372.333-23 chr8 136995640 136995984 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 417776 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 376-6 chr14 38386927 38387319 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -131030 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 379.001 chr5 63837476 63837752 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 124678 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 240.333-35 chr14 57026924 57027124 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 213866 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 248.333-45 chr2 111996055 111996273 + 1.66667 NA intron (NM_006343, intron 9 of 18) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -59105 NM_032824 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 198.333-159 chr5 40222159 40222334 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 169955 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 255-55 chr4 40455285 40455571 + 1.66667 NA intron (NM_001098634, intron 3 of 6) MIR|SINE|MIR 46691 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 268.667-43 chr3 101064324 101064526 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70935 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 274.333-55 chr6 56167807 56168158 + 1.66667 NA intron (NM_030820, intron 6 of 29) intron (NM_030820, intron 6 of 29) -76320 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 323.666-5 chr14 61633362 61633701 + 1.66667 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -61982 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 244.334-23 chr7 118517838 118518078 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 293254 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 222.334 chr1 29386154 29386360 + 1.66667 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -36143 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 338.666-2 chr10 130736857 130737220 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 225630 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 300-46 chr3 170812175 170812478 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 57869 NM_001320451 200916 Hs.380933 NM_001099645 ENSG00000163584 RPL22L1 - ribosomal protein L22 like 1 protein-coding 349.667-19 chr4 183437579 183437801 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -6946 NM_017632 55602 Hs.592508 NM_017632 ENSG00000168564 CDKN2AIP CARF CDKN2A interacting protein protein-coding 165-102 chrX 53039680 53039842 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -9563 NM_018969 54328 Hs.193011 NM_018969 ENSG00000184194 GPR173 SREB3 G protein-coupled receptor 173 protein-coding 257.667-25 chr15 38135242 38135617 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -62439 NR_147201 107984773 Hs.285193 NR_147199 ENSG00000236914 LINC01852 - long intergenic non-protein coding RNA 1852 ncRNA 252.666-37 chr5 147751758 147752007 + 1.66667 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) intron (NM_001270934, intron 1 of 20) 30846 NM_001282282 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 312.667-25 chr3 64412359 64412669 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -144341 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 328.667-19 chr8 134119981 134120186 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 233587 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 252.334-3 chr12 31609852 31610009 + 1.66667 NA intron (NR_046909, intron 2 of 2) intron (NR_046909, intron 2 of 2) -18794 NM_144973 160518 Hs.118166 NM_144973 ENSG00000170456 DENND5B - DENN domain containing 5B protein-coding 306.667-40 chr7 95226231 95226418 + 1.66667 NA intron (NM_017650, intron 7 of 15) intron (NM_017650, intron 7 of 15) 98208 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 231.334-5 chr2 38761728 38761893 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10316 NM_001195446 6432 Hs.309090 NM_006276 ENSG00000115875 SRSF7 9G8|AAG3|SFRS7 serine and arginine rich splicing factor 7 protein-coding 499.334 chr11 12593988 12594556 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -80149 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 281.667-15 chr12 89622678 89622955 + 1.66667 NA intron (NM_001001323, intron 9 of 21) intron (NM_001001323, intron 9 of 21) 86022 NM_001366525 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 540.667-2 chr5 81848457 81848885 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -97418 NM_001256734 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 259.667-62 chr5 67492795 67493109 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 153837 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 241-61 chr8 144801174 144801422 + 1.66667 NA intron (NR_134285, intron 1 of 3) intron (NR_134285, intron 1 of 3) 2422 NR_134285 340385 Hs.521942 NM_213605 ENSG00000197363 ZNF517 - zinc finger protein 517 protein-coding 308.667-39 chr8 100462165 100462406 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 79522 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 482.333-2 chr17 66440199 66440666 + 1.66667 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) -23578 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 264.667-38 chr18 31580161 31580357 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11508 NM_000371 7276 Hs.427202 NM_000371 ENSG00000118271 TTR ATTR|CTS|CTS1|HEL111|HsT2651|PALB|TBPA transthyretin protein-coding 182.333-31 chr12 15396379 15396592 + 1.66667 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) 73977 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 227.333-78 chr22 31573622 31573865 + 1.66667 NA intron (NM_001007467, intron 9 of 32) (TATATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 47788 NR_106959 102465666 NR_106959 ENSG00000284082 MIR7109 hsa-mir-7109 microRNA 7109 ncRNA 536.999 chr14 65448265 65448987 + 1.66667 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 -22476 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 333.333-52 chr8 135587637 135587953 + 1.66667 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) intron (NM_006558, intron 6 of 8) 130339 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 287.333-17 chr14 44288759 44289033 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 218387 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 270-3 chr1 112769284 112769572 + 1.66667 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 48861 NM_001004440 284467 Hs.439116 NM_182759 ENSG00000184599 TAFA3 FAM19A3|TAFA-3 TAFA chemokine like family member 3 protein-coding 258-55 chr4 176068622 176068838 + 1.66667 NA intron (NM_181265, intron 1 of 28) intron (NM_181265, intron 1 of 28) 2889 NM_170710 116966 Hs.532056 NM_170710 ENSG00000150627 WDR17 - WD repeat domain 17 protein-coding 186.334 chr20 9725132 9725294 + 1.66667 NA intron (NM_177990, intron 1 of 9) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 113863 NM_177990 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 249.667-74 chr5 12619260 12619465 + 1.66667 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) L1PB3|LINE|L1 44505 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 262.667-65 chr5 173000405 173000690 + 1.66667 NA intron (NM_003945, intron 2 of 3) intron (NM_003945, intron 2 of 3) 16776 NM_003945 8992 Hs.484188 NM_003945 ENSG00000113732 ATP6V0E1 ATP6H|ATP6V0E|M9.2|Vma21|Vma21p ATPase H+ transporting V0 subunit e1 protein-coding 352.334 chr10 36363829 36364215 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 585720 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 309.667-24 chr6 4622778 4623085 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 12366 NR_122107 497048 Hs.591355 NM_001011540 ENSG00000205444 KU-MEL-3 - uncharacterized LOC497048 ncRNA 285.666-8 chr5 105146088 105146408 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46774 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 254.667-20 chr14 45875982 45876297 + 1.66667 NA Intergenic MER4C|LTR|ERV1 -160537 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 267.667-9 chr10 118479141 118479342 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 116407 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 281-43 chr8 105451657 105451934 + 1.66667 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 132252 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 306.334-9 chr7 117981559 117981820 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -108248 NM_033427 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 333.667-15 chr5 71802405 71802656 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 83255 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 500.667-4 chr8 48872031 48872586 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 49121 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 271.334-8 chr14 42506571 42506761 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 899810 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 398-17 chr8 145012683 145013236 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10060 NR_023392 286101 Hs.367856 NR_023392 ZNF252P ZNF252 zinc finger protein 252, pseudogene pseudo 281.334-9 chr3 127217122 127217328 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 24094 NM_001007534 285311 Hs.591284 NM_001007534 ENSG00000214324 C3orf56 - chromosome 3 open reading frame 56 protein-coding 362.667-13 chr2 125908821 125909080 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 209035 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 252-68 chr4 49646207 49646393 + 1.66667 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 659658 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 327.667-24 chr5 23578486 23578788 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 70982 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 220.667-26 chr13 62196026 62196195 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -16172 NR_125787 103752583 Hs.578048 NR_125787 LINC01075 - long intergenic non-protein coding RNA 1075 ncRNA 513.667-2 chr14 44564411 44564824 + 1.66667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 57208 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 376.334-3 chr1 159420527 159420873 + 1.66667 NA intron (NM_001363558, intron 3 of 3) L1MA4A|LINE|L1 -11492 NR_145510 391121 NM_001348286 ENSG00000249730 OR10J4 OR10J4P|OST717 olfactory receptor family 10 subfamily J member 4 (gene/pseudogene) protein-coding 330-32 chr6 56046578 56046988 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 44879 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 260-88 chr8 140958944 140959123 + 1.66667 NA intron (NM_001352719, intron 1 of 32) L1ME3B|LINE|L1 41971 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 219.667-58 chr4 32017299 32017488 + 1.66667 NA intron (NR_134682, intron 1 of 3) (ATATAGC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 5029 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 284.999-5 chr9 28238869 28239189 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1M1|LINE|L1 480276 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 303.667-15 chr3 84355258 84355547 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 514173 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 249-4 chr1 172871198 172871445 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 179642 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 260.334-6 chr12 3388303 3388460 + 1.66667 NA intron (NM_001256536, intron 1 of 9) L1MC4|LINE|L1 7032 NM_001256536 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 235-32 chr2 50074663 50074880 + 1.66667 NA intron (NM_001330093, intron 19 of 22) intron (NM_001330093, intron 19 of 22) -100568 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 234-23 chr14 58810955 58811146 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17238 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 223-33 chr2 54939383 54939529 + 1.66667 NA intron (NM_001039753, intron 27 of 40) intron (NM_001039753, intron 27 of 40) 70816 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 400.667-10 chr7 105497377 105497751 + 1.66667 NA intron (NM_001318163, intron 4 of 15) L1MC5a|LINE|L1 10956 NM_001318163 54517 Hs.520619 NM_019042 ENSG00000091127 PUS7 IDDABS pseudouridine synthase 7 protein-coding 254.667-49 chr21 43708081 43708369 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10904 NM_003681 8566 Hs.284491 NM_003681 ENSG00000160209 PDXK C21orf124|C21orf97|HEL-S-1a|PKH|PNK|PRED79 pyridoxal kinase protein-coding 282.666 chr11 86024432 86024706 + 1.66667 NA intron (NM_001008660, intron 3 of 19) intron (NM_001008660, intron 3 of 19) 44515 NM_001206946 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 286.667-8 chr10 68152043 68152249 + 1.66667 NA intron (NR_045663, intron 6 of 17) MER4B|LTR|ERV1 42658 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 257.667-2 chr1 107335298 107335513 + 1.66667 NA intron (NM_001113226, intron 2 of 6) intron (NM_001113226, intron 2 of 6) 187336 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 377.333-19 chr7 115820594 115820911 + 1.66667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 147561 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 226-8 chr10 56229118 56229424 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 131988 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 282.667-13 chr18 66463190 66463455 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 140768 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 225.333-41 chr13 103568463 103568715 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 143389 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 375.334 chr14 36747731 36748074 + 1.66667 NA intron (NM_001171170, intron 3 of 10) intron (NM_001171170, intron 3 of 10) 90334 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 341-9 chr14 67885597 67886050 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 5 of 10) intron (NM_133509, intron 5 of 10) 62231 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 269.333-83 chr7 134595129 134595432 + 1.66667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 46170 NM_001367821 441282 Hs.729418 NM_001080538 ENSG00000227471 AKR1B15 AKR1B10L|AKR1B10L, AK1R1B7|AKR1R1B7 aldo-keto reductase family 1 member B15 protein-coding 222-42 chr2 42388671 42388918 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -19837 NM_001319036 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 371.334-2 chr5 60838877 60839374 + 1.66667 NA intron (NM_024930, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 5144 NM_001297617 79993 Hs.274256 NM_024930 ENSG00000164181 ELOVL7 - ELOVL fatty acid elongase 7 protein-coding 255.667-24 chr14 101687433 101687645 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -42898 NR_026774 145200 Hs.150840 NR_026774 ENSG00000258512 LINC00239 C14orf72|NCRNA00239 long intergenic non-protein coding RNA 239 ncRNA 262-74 chr7 93615635 93615864 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -41019 NM_001164737 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 347.334-8 chr6 159308766 159309043 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -74627 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 195-94 chr6 123260345 123260517 + 1.66667 NA intron (NM_006073, intron 34 of 40) intron (NM_006073, intron 34 of 40) -179173 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 156-15 chr1 194507051 194507234 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1202397 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 273-21 chr2 119954128 119954422 + 1.66667 NA intron (NM_002830, intron 19 of 26) intron (NM_002830, intron 19 of 26) -58802 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 297.334-8 chr2 139438484 139438774 + 1.66667 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 541305 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 355.333-31 chr5 175268270 175268674 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 175710 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 220.333-3 chr1 28438711 28438913 + 1.66667 NA intron (NM_023923, intron 1 of 12) intron (NM_023923, intron 1 of 12) 662 NM_023923 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 249.334-9 chr13 50150178 50150349 + 1.66667 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) intron (NR_109974, intron 2 of 6) -21755 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 139.667-133 chr4 33425842 33425970 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 613987 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 244-62 chr20 10339314 10339511 + 1.66667 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 92513 NM_018848 8195 Hs.472119 NM_018848 ENSG00000125863 MKKS BBS6|HMCS|KMS|MKS McKusick-Kaufman syndrome protein-coding 565 chr16 6545896 6546505 + 1.66667 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -227609 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 296-31 chr2 111955468 111955737 + 1.66667 NA intron (NM_006343, intron 4 of 18) L1MD2|LINE|L1 56995 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 263.333-8 chr10 91586292 91586574 + 1.66667 NA intron (NR_024467, intron 1 of 4) intron (NR_024467, intron 1 of 4) 25027 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 283.667-33 chr6 126655580 126655844 + 1.66667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 171081 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 609.334 chr15 59486058 59486558 + 1.66667 NA intron (NM_152450, intron 3 of 8) L1MA3|LINE|L1 48122 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 450.333-7 chr2 239581389 239581684 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 179788 NR_135577 101928111 Hs.534680 NR_135575 ENSG00000222020 HDAC4-AS1 - HDAC4 antisense RNA 1 ncRNA 246.333-84 chr5 159837143 159837343 + 1.66667 NA intron (NR_109891, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 34141 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 243-9 chr1 235203670 235203892 + 1.66667 NA intron (NM_031371, intron 16 of 22) intron (NM_031371, intron 16 of 22) -13665 NR_039908 100616224 NR_039908 ENSG00000263439 MIR4753 mir-4753 microRNA 4753 ncRNA 306.333-25 chr2 101075012 101075387 + 1.66667 NA intron (NM_001102426, intron 2 of 19) AluSx3|SINE|Alu 72910 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 310.666-14 chr3 169778561 169778783 + 1.66667 NA intron (NR_033703, intron 2 of 7) intron (NR_033703, intron 2 of 7) 4407 NM_001185119 55892 Hs.507025 NM_018657 ENSG00000085274 MYNN OSZF|SBBIZ1|ZBTB31|ZNF902 myoneurin protein-coding 417.667-2 chr16 6677393 6677777 + 1.66667 NA intron (NM_018723, intron 3 of 15) intron (NM_018723, intron 3 of 15) -96224 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 218.667-46 chr2 15328130 15328352 + 1.66667 NA exon (NM_015909, exon 37 of 52) exon (NM_015909, exon 37 of 52) 233093 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 438.334-5 chr7 109023554 109023987 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -139183 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 197.667-135 chr6 117347516 117347696 + 1.66667 NA intron (NM_002944, intron 26 of 42) L1MC1|LINE|L1 78249 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 328.334-7 chr9 78763375 78763691 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 382133 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 345-10 chr3 22141042 22141406 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 184085 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 265.334-19 chr7 75031759 75031943 + 1.66667 NA TTS (NM_001145064) TTS (NM_001145064) 41951 NM_030798 81554 Hs.529623 NM_030798 ENSG00000274523 RCC1L WBSCR16 RCC1 like protein-coding 156-65 chr19 45829456 45829626 + 1.66667 NA intron (NM_004819, intron 13 of 26) intron (NM_004819, intron 13 of 26) -14233 NM_030785 81492 Hs.146544 NM_030785 ENSG00000104941 RSPH6A RSHL1|RSP4|RSP6|RSPH4B radial spoke head 6 homolog A protein-coding 197-52 chr2 12274204 12274354 + 1.66667 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 75149 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 423-11 chr7 77393119 77393605 + 1.66667 NA intron (NR_146937, intron 5 of 31) intron (NR_146937, intron 5 of 31) -21836 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 332-38 chrX 73474655 73475030 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 27588 NM_005193 1046 Hs.553488 NM_005193 ENSG00000131264 CDX4 - caudal type homeobox 4 protein-coding 290.667-36 chr6 49575894 49576100 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 25329 NR_146858 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 221.666-27 chr2 64832137 64832385 + 1.66667 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie 31370 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 326.334-5 chr3 24051562 24051769 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 51582 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 346-25 chr3 185854587 185854810 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -29656 NM_006548 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 225.667-60 chr5 28066280 28066591 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 221230 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 308.334-7 chr3 96579662 96579945 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 219839 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 384.333-12 chr6 45105719 45106043 + 1.66667 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 91889 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 257.334-7 chr12 97287387 97287564 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -175301 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 248.333-84 chr5 110819346 110819571 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 80451 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 259.334-18 chr5 9854532 9854716 + 1.66667 NA intron (NR_147004, intron 1 of 1) intron (NR_147004, intron 1 of 1) 247 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 474.667-2 chr11 73826361 73826730 + 1.66667 NA intron (NM_001318500, intron 4 of 5) AluSx1|SINE|Alu 38671 NM_016055 51642 Hs.503239 NM_016055 ENSG00000175581 MRPL48 CGI-118|HSPC290|L48MT|MRP-L48 mitochondrial ribosomal protein L48 protein-coding 389 chr1 55272318 55272678 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 46857 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 256.667-74 chr5 167623094 167623259 + 1.66667 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) 49517 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 261.334-20 chr7 27697964 27698156 + 1.66667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -35177 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 204-105 chr2 169257380 169257516 + 1.66667 NA intron (NM_004525, intron 17 of 78) intron (NM_004525, intron 17 of 78) 105086 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 211.334-7 chr4 96761315 96761507 + 1.66667 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) L1MA4A|LINE|L1 450708 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 239.334-2 chr1 65098178 65098401 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -30543 NM_001321853 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 186-37 chr15 61114165 61114320 + 1.66667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 115060 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 260-25 chr14 50917776 50918021 + 1.66667 NA intron (NM_002863, intron 7 of 19) intron (NM_002863, intron 7 of 19) 26585 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 272.667-68 chr9 72115758 72115989 + 1.66667 NA intron (NM_001242507, intron 1 of 13) intron (NM_001242507, intron 1 of 13) 1278 NM_001242507 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 242.333-101 chr8 131188920 131189159 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -148130 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 252.667-73 chr4 104395043 104395288 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95800 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 249-47 chr22 36274879 36275129 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 11903 NR_106877 102465491 NR_106877 ENSG00000278420 MIR6819 hsa-mir-6819 microRNA 6819 ncRNA 259-54 chr9 38320478 38320785 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -72071 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 416-12 chr5 107657770 107658121 + 1.66667 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 12992 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 283.666-14 chr8 132790343 132790661 + 1.66667 NA intron (NM_198513, intron 2 of 7) intron (NM_198513, intron 2 of 7) 15114 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 242.667-15 chr10 72394056 72394392 + 1.66667 NA intron (NM_001195519, intron 5 of 6) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -39305 NM_001002762 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 248.667-55 chr2 55781962 55782201 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -88237 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 326-44 chr7 79658407 79658640 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 204563 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 326.667-4 chr1 107428775 107429013 + 1.66667 NA intron (NM_001113228, intron 6 of 6) intron (NM_001113228, intron 6 of 6) 259605 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 234.334-18 chr7 40495267 40495476 + 1.66667 NA intron (NM_024728, intron 11 of 14) intron (NM_024728, intron 11 of 14) 360395 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 367-5 chr13 70120317 70120636 + 1.66667 NA intron (NR_002717, intron 2 of 4) intron (NR_002717, intron 2 of 4) -11983 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 311.333-13 chr12 53581651 53582033 + 1.66667 NA intron (NR_073163, intron 2 of 12) AluJr|SINE|Alu 44148 NM_001366562 11016 Hs.12286 NM_006856 ENSG00000170653 ATF7 ATFA activating transcription factor 7 protein-coding 363.667-2 chr10 108590790 108591070 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -521637 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 222-93 chr8 17891270 17891511 + 1.66667 NA intron (NM_004467, intron 1 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 4014 NM_201553 2267 Hs.491143 NM_004467 ENSG00000104760 FGL1 HFREP1|HP-041|HPS|LFIRE-1|LFIRE1 fibrinogen like 1 protein-coding 239.667-23 chr15 60809182 60809439 + 1.66667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 127741 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 283.667-35 chr8 53770813 53771072 + 1.66667 NA intron (NM_213620, intron 10 of 13) intron (NM_213620, intron 10 of 13) 72100 NM_213620 51606 Hs.491737 NM_015941 ENSG00000047249 ATP6V1H CGI-11|MSTP042|NBP1|SFD|SFDalpha|SFDbeta|VMA13 ATPase H+ transporting V1 subunit H protein-coding 236-43 chr2 100070708 100070914 + 1.66667 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) L2a|LINE|L2 34772 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 263.667-49 chr2 160502202 160502470 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -8529 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 254.333-85 chr8 102224734 102225002 + 1.66667 NA intron (NM_001172477, intron 4 of 8) intron (NM_001172477, intron 4 of 8) 13963 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 343.667-13 chr6 55401437 55401727 + 1.66667 NA intron (NM_207410, intron 8 of 8) intron (NM_207410, intron 8 of 8) 74113 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 266.334-6 chr1 112539183 112539422 + 1.66667 NA intron (NM_017744, intron 14 of 14) intron (NM_017744, intron 14 of 14) 30337 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 310-33 chr20 47010338 47010678 + 1.66667 NA intron (NM_172110, intron 4 of 13) AluJb|SINE|Alu 115665 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 454.667-7 chr6 119355790 119356164 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6216 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 284.667-33 chr3 124516105 124516500 + 1.66667 NA intron (NM_001024660, intron 33 of 59) MIRb|SINE|MIR -68356 NM_007064 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 398-10 chr3 94724361 94724954 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -213606 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 138.667-24 chr10 102639760 102639901 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4665 NM_030912 81603 Hs.336810 NM_030912 ENSG00000171206 TRIM8 GERP|RNF27 tripartite motif containing 8 protein-coding 468.999-3 chr5 25274380 25274968 + 1.66667 NA intron (NR_136209, intron 1 of 3) intron (NR_136209, intron 1 of 3) 83721 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 185-37 chr2 141094559 141094743 + 1.66667 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -507966 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 301-30 chr3 33590269 33590567 + 1.66667 NA intron (NM_001365634, intron 19 of 35) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 69261 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 299-21 chr2 11022248 11022438 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 109833 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 295.667 chr1 110889332 110889622 + 1.66667 NA intron (NM_001040033, intron 2 of 8) AluSx1|SINE|Alu 16329 NM_000560 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 312-40 chr4 104607848 104608240 + 1.66667 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 -113150 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 241-12 chr11 106553642 106553904 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 302366 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 569.667 chr2 118046387 118047081 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -32664 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 243.667-52 chr4 39190005 39190157 + 1.66667 NA intron (NM_001317924, intron 4 of 35) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 7552 NM_025132 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 246-24 chr14 58440518 58440696 + 1.66667 NA intron (NM_001244193, intron 1 of 26) AluSq2|SINE|Alu 926 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 317.667-3 chr1 101646946 101647145 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 200035 NM_001288821 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 201.667-89 chr5 24275095 24275289 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 323844 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 306.333-5 chr1 181069168 181069448 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19392 NM_016545 51278 Hs.15725 NM_016545 ENSG00000162783 IER5 SBBI48 immediate early response 5 protein-coding 227-2 chr1 81864337 81864533 + 1.66667 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 61982 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 276.333-31 chr21 29439675 29439988 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -56216 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 244-65 chr21 31218053 31218253 + 1.66667 NA intron (NM_001353686, intron 8 of 27) intron (NM_001353686, intron 8 of 27) -57213 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 271.667-43 chr2 164035797 164036028 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -299904 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 239-59 chr6 110756403 110756552 + 1.66667 NA intron (NM_001300964, intron 1 of 12) AluSx3|SINE|Alu -58144 NM_001287215 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 359.667-4 chr14 62192055 62192443 + 1.66667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -52276 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 431.333-10 chr8 122079030 122079636 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -437893 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 257.667-55 chr22 49684165 49684380 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -26753 NM_001289922 348645 Hs.133159 NM_198851 ENSG00000188511 C22orf34 - chromosome 22 open reading frame 34 protein-coding 283.334-13 chr8 81935279 81935647 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -93177 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 245.667-46 chr3 154514954 154515154 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -84864 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 330.001-2 chr5 137307915 137308228 + 1.66667 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 179874 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 452.667-7 chr4 70719764 70720213 + 1.66667 NA intron (NM_001130709, intron 1 of 11) intron (NM_001130709, intron 1 of 11) -1976 NM_014961 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 181.334 chr1 195489953 195490084 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 598697 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 208.667-139 chr8 65559116 65559293 + 1.66667 NA intron (NR_033893, intron 1 of 4) intron (NR_033893, intron 1 of 4) 3462 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 232.333-51 chr20 44183776 44183934 + 1.66667 NA intron (NM_175913, intron 1 of 1) MER58D|DNA|hAT-Charlie 3333 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 276.334-16 chr9 27788525 27788732 + 1.66667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -214762 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 239-9 chr10 34786542 34786817 + 1.66667 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 28617 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 425.666-4 chr8 124186141 124186638 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -14867 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 356-31 chr7 35700445 35700903 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 5468 NR_136255 101930085 Hs.599851 NR_136255 ENSG00000271122 LOC101930085 - uncharacterized LOC101930085 ncRNA 301.334-9 chr3 123928711 123928931 + 1.66667 NA intron (NM_001366336, intron 8 of 8) MIRc|SINE|MIR 32408 NM_001366339 64770 Hs.645028 NM_022757 ENSG00000175455 CCDC14 - coiled-coil domain containing 14 protein-coding 325.334 chr1 42313765 42314006 + 1.66667 NA intron (NM_001198850, intron 1 of 12) L2|LINE|L2 21070 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 396-18 chr9 19728981 19729362 + 1.66667 NA intron (NM_020344, intron 1 of 9) L1MA5A|LINE|L1 57848 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 238.334-13 chr9 87601563 87601792 + 1.66667 NA intron (NM_004938, intron 2 of 25) MIR|SINE|MIR 48223 NR_146781 100506897 Hs.656160 NR_146781 ENSG00000236709 DAPK1-IT1 - DAPK1 intronic transcript 1 ncRNA 256-2 chr1 29531985 29532199 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -181978 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 181.333-116 chr4 45386696 45386875 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -660151 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 201.667-5 chr10 22347583 22347803 + 1.66667 NA intron (NM_172242, intron 2 of 9) intron (NM_172242, intron 2 of 9) 2197 NM_001253854 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 286.667-7 chr10 26675534 26675797 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21759 NM_001321979 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 179.334 chr10 28978817 28978998 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 132499 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 284.666-8 chr14 70520403 70520723 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 14441 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 605.667 chr14 64813282 64813993 + 1.66667 NA intron (NM_001024858, intron 1 of 34) AluSx|SINE|Alu 9743 NM_001024858 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 283.334-3 chr1 204869693 204869868 + 1.66667 NA intron (NM_001160332, intron 1 of 27) MIR|SINE|MIR 41126 NM_001160332 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 181.333-76 chr2 108874565 108874814 + 1.66667 NA intron (NM_144978, intron 14 of 14) intron (NM_144978, intron 14 of 14) 87918 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 187.667-14 chr10 57464518 57464679 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -160039 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 288-37 chr4 4532558 4532803 + 1.66667 NA intron (NM_001346282, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 9368 NR_144414 53407 Hs.584913 NM_016930 ENSG00000168818 STX18 Ufe1 syntaxin 18 protein-coding 194-39 chr14 91188881 91189016 + 1.66667 NA exon (NM_001358310, exon 9 of 14) exon (NM_001358310, exon 9 of 14) 55756 NM_001177676 8111 Hs.8882 NM_003485 ENSG00000119714 GPR68 AI2A6|GPR12A|OGR1 G protein-coupled receptor 68 protein-coding 276-35 chr2 124784439 124784733 + 1.66667 NA intron (NM_130773, intron 17 of 23) intron (NM_130773, intron 17 of 23) 759299 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 284.334-5 chr1 196208181 196208385 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -119568 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 284.667-10 chr12 18406162 18406425 + 1.66667 NA intron (NM_001288774, intron 16 of 32) L1MA7|LINE|L1 144753 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 447-3 chr10 120160216 120160675 + 1.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 194778 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 246.667-18 chr11 99907598 99907805 + 1.66667 NA intron (NM_001243270, intron 5 of 23) intron (NM_001243270, intron 5 of 23) 351556 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 237-11 chr10 54723245 54723407 + 1.66667 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) L1PB4|LINE|L1 77905 NM_001142763 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 370-6 chr15 41049040 41049394 + 1.66667 NA intron (NM_017553, intron 21 of 35) intron (NM_017553, intron 21 of 35) 67029 NR_104038 54617 Hs.292949 NM_017553 ENSG00000128908 INO80 INO80A|INOC1 INO80 complex ATPase subunit protein-coding 419.666-2 chr1 176146972 176147371 + 1.66667 NA intron (NM_022457, intron 6 of 19) intron (NM_022457, intron 6 of 19) 60073 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 326-45 chr8 68033242 68033510 + 1.66667 NA intron (NM_024870, intron 6 of 39) MIRc|SINE|MIR 81330 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 261.667-7 chr10 52265861 52266102 + 1.66667 NA intron (NM_001098512, intron 10 of 17) intron (NM_001098512, intron 10 of 17) 48147 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 273.334-5 chr17 69011944 69012161 + 1.66667 NA exon (NM_080283, exon 23 of 39) exon (NM_080283, exon 23 of 39) 7338 NR_126414 104355297 Hs.569827 NR_126414 ENSG00000231749 ABCA9-AS1 - ABCA9 antisense RNA 1 ncRNA 274.667-48 chr6 144619257 144619460 + 1.66667 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) intron (NM_007124, intron 50 of 73) 213703 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 275.333-7 chr10 33940635 33940933 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -168104 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 422.001-2 chr14 67668111 67668474 + 1.66667 NA intron (NM_006370, intron 1 of 5) intron (NM_006370, intron 1 of 5) 6340 NM_006370 10490 Hs.741177 NM_006370 ENSG00000100568 VTI1B VTI1|VTI1-LIKE|VTI1L|VTI2|v-SNARE|vti1-rp1 vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B protein-coding 451.001 chr10 27751740 27752208 + 1.66667 NA intron (NR_121652, intron 1 of 1) MER58B|DNA|hAT-Charlie -6155 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 329.667-23 chrX 72284826 72285128 + 1.66667 NA Intergenic HY3|scRNA|scRNA -7729 NM_001007 6191 Hs.118076 NM_001007 ENSG00000198034 RPS4X CCG2|DXS306|RPS4|S4|SCAR|SCR10 ribosomal protein S4 X-linked protein-coding 254.334-27 chr6 54138069 54138255 + 1.66667 NA exon (NM_001281747, exon 4 of 14) exon (NM_001281747, exon 4 of 14) 26719 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 308.334-8 chr5 67245946 67246285 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -49316 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 240.334-2 chr11 77581446 77581612 + 1.66667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -8106 NM_001363477 282679 Hs.503345 NM_173039 ENSG00000178301 AQP11 AQPX1 aquaporin 11 protein-coding 298-78 chr8 60095942 60096163 + 1.66667 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 185348 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 503.333 chr10 95880997 95881528 + 1.66667 NA intron (NR_038444, intron 2 of 5) intron (NR_038444, intron 2 of 5) -26703 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 217-94 chr9 26572349 26572588 + 1.66667 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL 320334 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 258.667-65 chr3 121131461 121131709 + 1.66667 NA intron (NR_145517, intron 7 of 8) MER58B|DNA|hAT-Charlie 81945 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 249.667-100 chr8 104936635 104936879 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -347733 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 692.334 chr12 51494544 51495129 + 1.66667 NA intron (NM_001039960, intron 20 of 24) MIRc|SINE|MIR 69719 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 269.001-3 chr2 53752565 53752738 + 1.66667 NA intron (NM_145863, intron 1 of 8) intron (NM_145863, intron 1 of 8) -15132 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 242.334-18 chr9 16597371 16597539 + 1.66667 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) intron (NM_001317940, intron 2 of 5) -129359 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 292.334-9 chr6 34488980 34489165 + 1.66667 NA intron (NM_020804, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 22996 NM_020804 29993 Hs.520087 NM_020804 ENSG00000124507 PACSIN1 SDPI protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 protein-coding 308.333-4 chr1 214200413 214200710 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -80598 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 288.334-5 chr6 160328481 160328776 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19750 NM_021977 6581 Hs.567337 NM_021977 ENSG00000146477 SLC22A3 EMT|EMTH|OCT3 solute carrier family 22 member 3 protein-coding 345.667-14 chr3 163850524 163850984 + 1.66667 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 320802 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 222.667-23 chr13 92604899 92605152 + 1.66667 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 114862 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 324.333-18 chr16 78601904 78602371 + 1.66667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 502483 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 241.666-15 chr5 49659371 49659650 + 1.66667 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 781778 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 220.667-25 chr13 50230031 50230229 + 1.66667 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) intron (NR_109974, intron 2 of 6) 58112 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 242-56 chr5 2317027 2317209 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -4917 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 309.667-11 chr2 161667605 161667932 + 1.66667 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) intron (NM_001354451, intron 1 of 25) 43352 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 523-4 chr6 167412427 167413032 + 1.66667 NA Intergenic MER83|LTR|ERV1 -28219 NR_163194 6953 Hs.351 NM_004610 ENSG00000203690 TCP10 TCP10A t-complex 10 pseudo 184.666-29 chr5 89774170 89774439 + 1.66667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 242416 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 260.666-35 chrX 106147211 106147491 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -20954 NM_152423 139221 Hs.592221 NM_152423 ENSG00000157502 PWWP3B MUM1L1 PWWP domain containing 3B protein-coding 275.667-13 chr11 122468363 122468577 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -45599 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 396-8 chr20 49673368 49673838 + 1.66667 NA intron (NM_004776, intron 1 of 8) intron (NM_004776, intron 1 of 8) 40275 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 392.667-6 chr19 27929775 27930074 + 1.66667 NA intron (NR_146733, intron 2 of 6) intron (NR_146733, intron 2 of 6) -135984 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 243.667-29 chr18 2322056 2322282 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 249336 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 244-45 chr17 66381331 66381491 + 1.66667 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 35443 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 277.334-14 chr5 134677163 134677469 + 1.66667 NA intron (NM_021982, intron 7 of 22) AluJr|SINE|Alu 28531 NM_001252231 10802 Hs.595540 NM_021982 ENSG00000113615 SEC24A - SEC24 homolog A, COPII coat complex component protein-coding 218.666-77 chr9 37171193 37171455 + 1.66667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 50726 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 346.667-9 chr3 95596570 95596811 + 1.66667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 86503 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 285.001-2 chr11 82938238 82938438 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36598 NM_001319214 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 256.334-11 chr22 39304569 39304756 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 9249 NR_000028 116938 NR_000028 ENSG00000209480 SNORD83B RNU83B|U83B small nucleolar RNA, C/D box 83B snoRNA 262.333-8 chr10 1740779 1741089 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -3409 NM_018702 105 Hs.586663 NM_018702 ENSG00000185736 ADARB2 ADAR3|RED2 adenosine deaminase RNA specific B2 (inactive) protein-coding 357-20 chr5 121421317 121421564 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 98890 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 409-6 chr2 39688311 39688755 + 1.66667 NA intron (NM_152390, intron 1 of 3) intron (NM_152390, intron 1 of 3) 22616 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 415-2 chr1 15558862 15559223 + 1.66667 NA intron (NR_109898, intron 7 of 14) AluSg|SINE|Alu 16876 NR_135613 107397391 NR_135613 ENSG00000251866 SCARNA21B - small Cajal body-specific RNA 21B ncRNA 288.667-20 chr4 58803674 58804057 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -180417 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 287.333-52 chr5 45863048 45863431 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -166859 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 247.667-3 chr1 106884778 106884978 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 66639 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 253.334-20 chr5 122765062 122765255 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9838 NM_001278199 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 191-75 chr8 84863840 84864009 + 1.66667 NA intron (NM_001287244, intron 5 of 7) intron (NM_001287244, intron 5 of 7) 157997 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 239.333-105 chr8 84860830 84861078 + 1.66667 NA intron (NM_001287244, intron 4 of 7) intron (NM_001287244, intron 4 of 7) 155027 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 190.666-39 chr4 80815685 80815923 + 1.66667 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) L1ME4a|LINE|L1 -214904 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 379.334-6 chr3 193621187 193621648 + 1.66667 NA intron (NR_046634, intron 1 of 2) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 5915 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 267.667-59 chr6 11414325 11414506 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -32067 NR_073131 4739 Hs.37982 NM_006403 ENSG00000111859 NEDD9 CAS-L|CAS2|CASL|CASS2|HEF1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 protein-coding 299-14 chr14 37283713 37283989 + 1.66667 NA intron (NM_138731, intron 7 of 13) intron (NM_138731, intron 7 of 13) 85914 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 274.334-6 chr4 123215403 123215668 + 1.66667 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) MIR3|SINE|MIR -181260 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 165.667-113 chr21 21862495 21862710 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 115617 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 289.667-3 chr10 50385507 50385697 + 1.66667 NA intron (NM_147156, intron 6 of 10) intron (NM_147156, intron 6 of 10) -136992 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 237.667-20 chr14 54750435 54750593 + 1.66667 NA intron (NM_015589, intron 4 of 11) intron (NM_015589, intron 4 of 11) -4319 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 313-33 chr5 68548675 68548988 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 256254 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 335.667-25 chr8 49111197 49111656 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 39082 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 272.666-3 chr10 120783818 120784147 + 1.66667 NA intron (NR_033850, intron 1 of 2) intron (NR_033850, intron 1 of 2) 67197 NR_033850 283089 Hs.568750 NR_033850 ENSG00000227165 WDR11-AS1 - WDR11 antisense RNA 1 ncRNA 696 chr14 101801551 101802329 + 1.66667 NA intron (NM_001161726, intron 3 of 14) L1M3|LINE|L1 -7895 NM_002719 5527 Hs.368264 NM_002719 ENSG00000078304 PPP2R5C B56G|B56gamma|PR61G protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma protein-coding 334.667-16 chr2 186512529 186512829 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26419 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 137-103 chr8 88252499 88252611 + 1.66667 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 74928 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 217.667-20 chr11 96743582 96743733 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 235232 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 251.333-73 chr3 24363651 24363936 + 1.66667 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -130294 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 272-10 chr12 87872621 87872907 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -88053 NR_033410 400058 Hs.572212 NR_033410 MKRN9P MKRN5|MKRN9|MKRNP6|RNF65|ZNF127L3 makorin ring finger protein 9, pseudogene pseudo 314-44 chr7 50437789 50438014 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001346564, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001346564, exon 4 of 4) 12449 NM_001042762 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 339.334-9 chr8 104016606 104016892 + 1.66667 NA intron (NM_001348497, intron 18 of 22) intron (NM_001348497, intron 18 of 22) 197529 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 254-10 chr10 73008358 73008629 + 1.66667 NA intron (NM_001017962, intron 14 of 14) intron (NM_001017962, intron 14 of 14) -53687 NM_001318124 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 350.666-10 chr15 63579097 63579542 + 1.66667 NA intron (NM_001256702, intron 10 of 13) intron (NM_001256702, intron 10 of 13) -18068 NM_203373 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 263-40 chr3 44311303 44311606 + 1.66667 NA intron (NM_001145030, intron 16 of 19) intron (NM_001145030, intron 16 of 19) -26665 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 231.667-32 chr2 141099656 141099828 + 1.66667 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -513057 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 250-7 chr1 235691312 235691593 + 1.66667 NA intron (NM_000081, intron 47 of 52) intron (NM_000081, intron 47 of 52) -40698 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 296-21 chr16 68050827 68051144 + 1.66667 NA intron (NM_017803, intron 4 of 16) intron (NM_017803, intron 4 of 16) -27118 NM_018380 55794 Hs.458313 NM_018380 ENSG00000182810 DDX28 MDDX28 DEAD-box helicase 28 protein-coding 269-30 chr21 31016647 31016934 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 21686 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 419.333 chr1 110781145 110781420 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -89917 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 684.334 chr13 19774055 19774595 + 1.66667 NA intron (NM_001042414, intron 2 of 9) intron (NM_001042414, intron 2 of 9) 8620 NR_156729 55269 Hs.213198 NM_001042414 ENSG00000121390 PSPC1 PSP1 paraspeckle component 1 protein-coding 606-3 chr8 129622023 129622559 + 1.66667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) (AATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -47273 NR_130920 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 260-83 chr8 66270303 66270486 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 78280 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 212-94 chr2 193482822 193483047 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 733089 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 252-19 chr12 12196703 12196961 + 1.66667 NA intron (NM_002336, intron 3 of 22).2 L1MC5|LINE|L1 70212 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 251-5 chr1 211602189 211602474 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23170 NM_021194 7779 Hs.519469 NM_021194 ENSG00000170385 SLC30A1 ZNT1|ZRC1 solute carrier family 30 member 1 protein-coding 382.334-5 chr14 57123422 57123846 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 145271 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 319.334-2 chr1 181432507 181432864 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -50832 NM_001205293 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 258.333-10 chr10 103595415 103595705 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_014631, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_014631, exon 14 of 14) -78118 NR_120676 102724341 Hs.599425 NR_120675 ENSG00000235470 NEURL1-AS1 - NEURL1 antisense RNA 1 ncRNA 259.667-39 chr2 185324146 185324376 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -157189 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 320.667-13 chr12 84215703 84216027 + 1.66667 NA Intergenic LTR69|LTR|ERVL 696934 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 398.667-8 chr4 61225595 61225888 + 1.66667 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 23569 NM_001371342 269-8 chr10 63956633 63956953 + 1.66667 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR -434903 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 259.999-13 chr9 135649723 135650030 + 1.66667 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -10336 NM_182974 360203 Hs.522491 NM_182974 ENSG00000204007 GLT6D1 GLTDC1|GT6M7 glycosyltransferase 6 domain containing 1 protein-coding 458.667-2 chr3 95810373 95810847 + 1.66667 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -127417 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 292-18 chr15 56854546 56854985 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -63325 NM_001322151 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 331.334-5 chr21 30154529 30154930 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 12076 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 266-70 chr5 91328569 91328829 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14297 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 148.333-2 chr1 17262838 17263020 + 1.66667 NA intron (NM_016233, intron 3 of 15) AluSp|SINE|Alu 13831 NM_016233 51702 Hs.149195 NM_016233 ENSG00000142619 PADI3 PAD3|PDI3|UHS1 peptidyl arginine deiminase 3 protein-coding 258.333-34 chr2 182658486 182658699 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -57665 NR_073365 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 243-24 chr2 29346483 29346657 + 1.66667 NA intron (NM_004304, intron 5 of 28) intron (NM_004304, intron 5 of 28) -122670 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 252-18 chr11 84580549 84580712 + 1.66667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 140312 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 195-32 chr12 67386187 67386337 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 56297 NR_146500 102724433 NR_146500 ENSG00000256172 LINC02420 - long intergenic non-protein coding RNA 2420 ncRNA 230.667-50 chr22 28464964 28465167 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 5196 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 478.333-4 chr6 41606365 41606859 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 7889 NR_039784 100616178 NR_039784 ENSG00000266494 MIR4641 - microRNA 4641 ncRNA 254 chr1 103044261 103044428 + 1.66667 NA intron (NM_001854, intron 4 of 66) intron (NM_001854, intron 4 of 66) 64152 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 407.334-6 chr5 126081498 126081773 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -97942 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 308.667-28 chr4 95954751 95955254 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 114909 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 310.667-39 chr7 12837092 12837286 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 149556 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 345.667 chr1 179321761 179322157 + 1.66667 NA intron (NM_001252511, intron 2 of 14) AluJr|SINE|Alu 28162 NM_003101 6646 Hs.445588 NM_003101 ENSG00000057252 SOAT1 ACACT|ACAT|ACAT-1|ACAT1|SOAT|STAT sterol O-acyltransferase 1 protein-coding 274 chr1 114199739 114199917 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -45959 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 260.667-94 chr8 130702689 130702874 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -259107 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 185.334 chr14 74572687 74572848 + 1.66667 NA intron (NM_000428, intron 3 of 35) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 39470 NM_000428 4053 Hs.512776 NM_000428 ENSG00000119681 LTBP2 C14orf141|GLC3D|LTBP3|MSPKA|MSTP031|WMS3 latent transforming growth factor beta binding protein 2 protein-coding 263.667-34 chr17 19492417 19492695 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -41298 NM_018242 55244 Hs.232054 NM_018242 ENSG00000142494 SLC47A1 MATE1 solute carrier family 47 member 1 protein-coding 332-36 chr9 29611721 29612188 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -398353 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 303.333-84 chr9 89045848 89046141 + 1.66667 NA intron (NM_016848, intron 8 of 11) intron (NM_016848, intron 8 of 11) 54526 NM_005226 1903 Hs.585118 NM_005226 ENSG00000213694 S1PR3 EDG-3|EDG3|LPB3|S1P3 sphingosine-1-phosphate receptor 3 protein-coding 278-14 chr17 48813082 48813393 + 1.66667 NA intron (NM_001130918, intron 1 of 15) intron (NM_001130918, intron 1 of 15) 3853 NM_001366314 284076 Hs.91930 NM_173623 ENSG00000170703 TTLL6 TTL.6 tubulin tyrosine ligase like 6 protein-coding 257.667-81 chr8 57448990 57449208 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 105312 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 236.333-23 chr12 55796945 55797210 + 1.66667 NA intron (NM_033082, intron 4 of 10) intron (NM_033082, intron 4 of 10) 20647 NM_033082 84324 Hs.505676 NM_033082 ENSG00000205323 SARNP CIP29|HCC1|HSPC316|THO1 SAP domain containing ribonucleoprotein protein-coding 319.667-4 chr10 116758173 116758393 + 1.66667 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) intron (NM_001330164, intron 2 of 12) -15717 NM_025015 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 213.333-160 chr5 77607826 77607971 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 30799 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 272.667-7 chr10 28328645 28328820 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25668 NR_134518 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 269-24 chr2 123961244 123961417 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 63844 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 204.667-137 chr6 152364257 152364504 + 1.66667 NA intron (NM_182961, intron 63 of 145) LTR16C|LTR|ERVL -16150 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 276-6 chr1 112354539 112354769 + 1.66667 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy -41560 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 246.667-23 chr13 50314414 50314562 + 1.66667 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) intron (NR_109974, intron 2 of 6) 142470 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 269.334-6 chr15 100074884 100075169 + 1.66667 NA intron (NM_139057, intron 15 of 21) L1M7|LINE|L1 266949 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 224-112 chr9 27205839 27206062 + 1.66667 NA intron (NM_001290077, intron 13 of 21) intron (NM_001290077, intron 13 of 21) 76843 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 219.333-97 chr2 106904756 106904994 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -17766 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 182.334-2 chr21 32341055 32341242 + 1.66667 NA intron (NM_014825, intron 25 of 38) L1ME3Cz|LINE|L1 36174 NR_002996 677846 Hs.712293 NR_002996 ENSG00000200792 SNORA80A ACA67|SNORA80 small nucleolar RNA, H/ACA box 80A snoRNA 353-20 chr8 38490499 38490911 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -21871 NM_001354370 2260 Hs.264887 NM_015850 ENSG00000077782 FGFR1 BFGFR|CD331|CEK|ECCL|FGFBR|FGFR-1|FLG|FLT-2|FLT2|HBGFR|HH2|HRTFDS|KAL2|N-SAM|OGD|bFGF-R-1 fibroblast growth factor receptor 1 protein-coding 219.666-36 chr5 27729273 27729424 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 257056 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 155.333-282 chr5 16140298 16140421 + 1.66667 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 39432 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 231-27 chr2 48630457 48630630 + 1.66667 NA intron (NM_001198594, intron 4 of 7) L1PA16|LINE|L1 12687 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 243-56 chr6 36296352 36296580 + 1.66667 NA intron (NM_173676, intron 5 of 7) L1ME4c|LINE|L1 26006 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 479-4 chr2 184012506 184012994 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -366225 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 458-6 chr7 43143832 43144270 + 1.66667 NA intron (NR_135295, intron 3 of 6) L1MC3|LINE|L1 -6844 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 197.667-46 chr15 73814874 73815078 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46762 NR_120352 101929221 NR_120352 INSYN1-AS1 C15orf59-AS1 INSYN1 antisense RNA 1 ncRNA 319.334-4 chr5 143611817 143612046 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -67929 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 348.667-9 chr13 79708838 79709268 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95333 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 209-102 chr6 123576276 123576419 + 1.66667 NA intron (NM_001256020, intron 1 of 8) intron (NM_001256020, intron 1 of 8) 60603 NM_001251987 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 354.667-7 chr11 83625510 83625881 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) intron (NM_001142699, intron 19 of 27) 56730 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 221.334 chr1 8816668 8816822 + 1.66667 NA intron (NM_012102, intron 1 of 23) intron (NM_012102, intron 1 of 23) 895 NM_012102 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 258-2 chr1 111063878 111064165 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -75362 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 288.667-18 chr3 104132089 104132283 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -608070 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 220.667-39 chr18 6665817 6666050 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -63783 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 449.001 chr3 135991857 135992308 + 1.66667 NA intron (NM_001190447, intron 1 of 12) intron (NM_001190447, intron 1 of 12) 26354 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 433.666-3 chr12 40594286 40594681 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -97956 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 252.333-54 chr5 20981896 20982204 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -366515 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 249.333-55 chr2 112149916 112150155 + 1.66667 NA intron (NM_001128165, intron 1 of 6) MamRep488|DNA|hAT-Tip100 11650 NM_001128165 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 253.667-70 chr7 46311172 46311333 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 385870 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 245.667-48 chr3 183426149 183426431 + 1.66667 NA intron (NM_015078, intron 1 of 29) MIR3|SINE|MIR 1979 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 233.334-5 chr6 84215313 84215491 + 1.66667 NA exon (NM_014895, exon 5 of 27) exon (NM_014895, exon 5 of 27) 12241 NM_014895 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 374.334-4 chr8 105289100 105289431 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -29173 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 216.667-68 chr22 50452189 50452419 + 1.66667 NA intron (NM_001365819, intron 35 of 39) L1MEf|LINE|L1 22731 NM_002972 6305 Hs.589924 NM_002972 ENSG00000100241 SBF1 CMT4B3|DENND7A|MTMR5 SET binding factor 1 protein-coding 239.667-48 chr4 11937863 11938128 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 154817 NR_162127 113218507 NR_162127 MIR12113 - microRNA 12113 ncRNA 255.666-21 chr6 57120918 57121223 + 1.66667 NA intron (NR_110742, intron 2 of 3) L1MC1|LINE|L1 30882 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 352.667-20 chr3 189325445 189325723 + 1.66667 NA TTS (NM_198485) TTS (NM_198485) -84990 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 248-53 chr3 48747629 48747839 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_004157, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_004157, exon 11 of 11) -30456 NM_001190317 51447 Hs.595983 NM_016291 ENSG00000068745 IP6K2 IHPK2|InsP6K2|PIUS inositol hexakisphosphate kinase 2 protein-coding 363.667-12 chr5 16000158 16000406 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65100 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 253-78 chrX 10483174 10483429 + 1.66667 NA intron (NM_000381, intron 4 of 9) intron (NM_000381, intron 4 of 9) 84302 NM_001193279 4281 Hs.27695 NM_000381 ENSG00000101871 MID1 BBBG1|FXY|GBBB1|MIDIN|OGS1|OS|OSX|RNF59|TRIM18|XPRF|ZNFXY midline 1 protein-coding 293.333-57 chr7 50328560 50328907 + 1.66667 NA intron (NM_001291840, intron 2 of 2) intron (NM_001291840, intron 2 of 2) 9685 NM_001291841 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 161.667-119 chr2 15073541 15073730 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 440918 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 366.334 chr2 206940196 206940645 + 1.66667 NA intron (NM_173077, intron 1 of 8) L1ME3G|LINE|L1 902 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 425.667-7 chr3 194436709 194436990 + 1.66667 NA intron (NM_001367549, intron 20 of 33) AluSz6|SINE|Alu 31390 NM_024524 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 255.334-19 chr3 34023825 34024055 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 225310 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 388.334-2 chr14 54342790 54343208 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -53869 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 266.667-54 chr4 86429533 86429781 + 1.66667 NA intron (NM_002753, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 23538 NM_002753 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 466.667 chr16 3716428 3716737 + 1.66667 NA intron (NM_016292, intron 1 of 17) L1ME3G|LINE|L1 942 NM_001272049 10131 Hs.30345 NM_016292 ENSG00000126602 TRAP1 HSP 75|HSP75|HSP90L|TRAP-1 TNF receptor associated protein 1 protein-coding 255.667-32 chr16 74798197 74798355 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -23456 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 254.333-61 chr4 60396617 60396888 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -525867 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 292-10 chr14 20817719 20817942 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -14986 NM_198234 6035 Hs.78224 NM_002933 ENSG00000129538 RNASE1 RAC1|RIB1|RNS1 ribonuclease A family member 1, pancreatic protein-coding 215.666-45 chr9 27976119 27976384 + 1.66667 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) intron (NM_001354574, intron 5 of 5) -402385 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 370.334-2 chr2 182787045 182787424 + 1.66667 NA non-coding (NR_073365, exon 24 of 24) non-coding (NR_073365, exon 24 of 24) 70977 NR_073367 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 326.667-36 chr8 123524553 123524940 + 1.66667 NA intron (NM_148177, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 7397 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 260.667-34 chr17 17957185 17957471 + 1.66667 NA intron (NM_001288787, intron 1 of 13) intron (NM_001288787, intron 1 of 13) 15072 NM_001350333 146691 Hs.462379 NM_144678 ENSG00000175662 TOM1L2 - target of myb1 like 2 membrane trafficking protein protein-coding 305-32 chr8 88700880 88701226 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -373570 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 566.334 chr2 26026699 26027287 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7091 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 258-64 chr5 67464589 67464857 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 182066 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 306.334-11 chr8 134313091 134313305 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -284873 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 302-20 chr16 2168830 2169146 + 1.66667 NA intron (NM_032271, intron 4 of 20) AluSp|SINE|Alu 13206 NM_032271 84231 Hs.713632 NM_032271 ENSG00000131653 TRAF7 CAFDADD|RFWD1|RNF119 TNF receptor associated factor 7 protein-coding 251-81 chr7 88819685 88819960 + 1.66667 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -24085 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 262.667-66 chr6 10037891 10038159 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -366477 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 235-20 chr14 60564641 60564825 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 55587 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 271-3 chr1 84316952 84317173 + 1.66667 NA intron (NM_001134663, intron 2 of 3) L1MB1|LINE|L1 14411 NM_001134664 148418 Hs.591445 NM_001010971 ENSG00000203943 SAMD13 HSD-41|HSD-42 sterile alpha motif domain containing 13 protein-coding 336.333-7 chr10 58469985 58470258 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -42751 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 319-4 chr10 34509037 34509392 + 1.66667 NA intron (NM_001184789, intron 3 of 22) intron (NM_001184789, intron 3 of 22) 306082 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 272-14 chr15 71010209 71010463 + 1.66667 NA intron (NM_017691, intron 13 of 15) intron (NM_017691, intron 13 of 15) 117893 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 215-15 chr13 77798064 77798270 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -20770 NR_103853 100505518 Hs.742215 NR_103853 EDNRB-AS1 - EDNRB antisense RNA 1 ncRNA 270-51 chr5 61525372 61525641 + 1.66667 NA intron (NM_020928, intron 5 of 13) intron (NM_020928, intron 5 of 13) -112254 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 237.334-2 chr14 67369454 67369602 + 1.66667 NA intron (NM_004094, intron 2 of 7) L1MEb|LINE|L1 9200 NM_004094 1965 Hs.151777 NM_004094 ENSG00000134001 EIF2S1 EIF-2|EIF-2A|EIF-2alpha|EIF2|EIF2A eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha protein-coding 280-13 chr14 63086588 63086896 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -41284 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 182.333-103 chr3 16275956 16276184 + 1.66667 NA intron (NM_001352981, intron 5 of 10) AluSz6|SINE|Alu 10858 NM_138381 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 238-22 chr14 59299318 59299483 + 1.66667 NA intron (NM_001270520, intron 3 of 24) MIRb|SINE|MIR 35959 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 263-42 chr3 71229140 71229331 + 1.66667 NA intron (NR_146142, intron 5 of 19) intron (NR_146142, intron 5 of 19) 15842 NM_001244814 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 279.667-39 chr6 17518250 17518450 + 1.66667 NA intron (NM_006366, intron 7 of 12) intron (NM_006366, intron 7 of 12) -7085 NR_110855 101928491 Hs.622876 NR_110855 LOC101928491 - uncharacterized LOC101928491 ncRNA 368.334-4 chr14 90403061 90403398 + 1.66667 NA intron (NM_006888, intron 3 of 5) intron (NM_006888, intron 3 of 5) 4979 NM_001363670 801 Hs.282410 NM_006888 ENSG00000198668 CALM1 CALML2|CAM2|CAM3|CAMB|CAMC|CAMI|CAMIII|CPVT4|DD132|LQT14|PHKD|caM calmodulin 1 protein-coding 375.334-6 chr7 1970475 1970915 + 1.66667 NA intron (NM_001013837, intron 15 of 18) intron (NM_001013837, intron 15 of 18) -30124 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 233-31 chr18 6419177 6419477 + 1.66667 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -4068 NM_001365765 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 238.334-12 chr6 65051851 65052018 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 13 of 43) intron (NM_001292009, intron 13 of 43) -249484 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 223.667-16 chr13 66714519 66714691 + 1.66667 NA intron (NM_020403, intron 2 of 3) intron (NM_020403, intron 2 of 3) -110564 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 291.334-8 chr2 44493396 44493630 + 1.66667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 131566 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 579.333-2 chr14 68279973 68280763 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 348419 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 369 chr10 107486827 107487254 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -322334 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 240-81 chr6 130021497 130021648 + 1.66667 NA intron (NM_001346550, intron 1 of 21) intron (NM_001346550, intron 1 of 21) 1928 NM_001346550 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 307.666-15 chrX 74822805 74823118 + 1.66667 NA intron (NM_001008537, intron 1 of 3) L1MB8|LINE|L1 102491 NM_001008537 340533 Hs.124128 NM_001008537 ENSG00000050030 NEXMIF KIAA2022|KIDLIA|MRX98|XPN neurite extension and migration factor protein-coding 361-2 chr10 82033383 82033871 + 1.66667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) (GAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 155940 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 238.667-55 chr3 62251927 62252186 + 1.66667 NA intron (NM_002841, intron 15 of 29) intron (NM_002841, intron 15 of 29) 66891 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 218-113 chr8 87443473 87443633 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 430462 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 388.667-10 chr5 42672182 42672703 + 1.66667 NA intron (NM_001242403, intron 3 of 9) L1PA16|LINE|L1 -84376 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 308.666-22 chr8 124282811 124283159 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35587 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 242.334-11 chr20 54228675 54228853 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 20677 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 267-39 chr2 98148670 98148924 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001345864) promoter-TSS (NM_001345864) -736 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 240-97 chr9 77853469 77853663 + 1.66667 NA intron (NM_002072, intron 2 of 6) intron (NM_002072, intron 2 of 6) 178245 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 246-41 chr17 74282401 74282624 + 1.66667 NA intron (NM_023036, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu 8278 NM_001172810 64446 Hs.147472 NM_023036 ENSG00000171595 DNAI2 CILD9|DIC2 dynein axonemal intermediate chain 2 protein-coding 242.666-28 chr3 174876176 174876411 + 1.66667 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) intron (NM_207015, intron 1 of 13) 16959 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 384.333-10 chr5 44745477 44745860 + 1.66667 NA intron (NR_109864, intron 2 of 2) intron (NR_109864, intron 2 of 2) 63125 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 641.666 chr21 30708428 30709122 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 10002 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 232.333-45 chr2 153928786 153928990 + 1.66667 NA intron (NM_052917, intron 2 of 12) intron (NM_052917, intron 2 of 12) -15506 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 213-62 chr4 73757841 73758036 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 17369 NM_001354840 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 251-33 chr18 70260016 70260261 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28907 NM_004232 9306 Hs.44439 NM_004232 ENSG00000170677 SOCS6 CIS-4|CIS4|HSPC060|SOCS-4|SOCS-6|SOCS4|SSI4|STAI4|STATI4 suppressor of cytokine signaling 6 protein-coding 266.667-32 chr18 76104449 76104626 + 1.66667 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -18461 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 254.667-61 chr4 62477151 62477322 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -315471 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 213-74 chr6 100955496 100955714 + 1.66667 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 -74233 NM_022091 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 365.667-12 chr3 187401360 187401706 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 33148 NM_022147 64108 Hs.43388 NM_022147 ENSG00000136514 RTP4 IFRG28|Z3CXXC4 receptor transporter protein 4 protein-coding 355-18 chr20 46414262 46414559 + 1.66667 NA intron (NR_146919, intron 1 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -7359 NM_182764 63916 Hs.210469 NM_022086 ENSG00000062598 ELMO2 CED-12|CED12|Ced-12A|ELMO-2|VMPI engulfment and cell motility 2 protein-coding 297.333-56 chrX 70147519 70147839 + 1.66667 NA intron (NM_001370193, intron 4 of 6) intron (NM_001370193, intron 4 of 6) 13744 NM_001370194 3476 Hs.496267 NM_001551 ENSG00000089289 IGBP1 ALPHA-4|IBP1 immunoglobulin binding protein 1 protein-coding 439.667-7 chr5 112137738 112138125 + 1.66667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -22595 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 224.667-16 chr12 32219558 32219879 + 1.66667 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) intron (NR_148725, intron 2 of 9) 112871 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 317-4 chr1 203741892 203742113 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001684, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001684, exon 21 of 21) 11425 NR_046213 84719 Hs.661178 NM_032633 LINC00260 C1orf217|NCRNA00260 long intergenic non-protein coding RNA 260 ncRNA 260.667-93 chr8 126123074 126123242 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -171961 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 168.667-51 chr13 46303466 46303625 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -5701 NR_047493 100861554 Hs.90866 NR_047493 ENSG00000261097 LINC00563 - long intergenic non-protein coding RNA 563 ncRNA 231-35 chr2 182733062 182733264 + 1.66667 NA intron (NM_001271581, intron 10 of 22) L1MEg|LINE|L1 16906 NR_073367 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 385.333 chr1 94211396 94211647 + 1.66667 NA intron (NM_001328665, intron 2 of 21) L1MEc|LINE|L1 26063 NM_001328666 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 376.667-16 chr9 32583605 32583906 + 1.66667 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -10571 NM_001199987 4712 Hs.493668 NM_002493 ENSG00000165264 NDUFB6 B17|CI NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B6 protein-coding 185.333-157 chr5 100122885 100123010 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 265307 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 279.334-6 chr21 46089080 46089325 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -8910 NM_058174 1292 Hs.420269 NM_001849 ENSG00000142173 COL6A2 BTHLM1|PP3610|UCMD1 collagen type VI alpha 2 chain protein-coding 314.667-10 chr11 66803753 66803993 + 1.66667 NA intron (NM_024650, intron 8 of 16) intron (NM_024650, intron 8 of 16) -39568 NM_005133 9986 Hs.654972 NM_005133 ENSG00000173653 RCE1 FACE2|RCE1A|RCE1B Ras converting CAAX endopeptidase 1 protein-coding 267.667-34 chr2 173186192 173186368 + 1.66667 NA intron (NM_133646, intron 4 of 11) intron (NM_133646, intron 4 of 11) 95756 NR_033882 339751 Hs.570083 NR_033882 ENSG00000238133 MAP3K20-AS1 MLK7-AS1 MAP3K20 antisense RNA 1 ncRNA 253.334 chr1 158397799 158398030 + 1.66667 NA TTS (NM_001004475) TTS (NM_001004475) 1552 NM_001004475 128360 Hs.553588 NM_001004475 ENSG00000186306 OR10T2 OR1-3 olfactory receptor family 10 subfamily T member 2 protein-coding 274.666-32 chr8 134163624 134163987 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 277309 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 252-28 chr14 59504715 59504976 + 1.66667 NA TTS (NM_001164399) TTS (NM_001164399) 20328 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 242-70 chr7 92132094 92132242 + 1.66667 NA intron (NM_001146152, intron 1 of 9) intron (NM_001146152, intron 1 of 9) 2309 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 216.667-63 chr20 12356529 12356715 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 438729 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 377.334-5 chr7 85243778 85244144 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -122030 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 412.667-6 chr16 75818757 75819421 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -92599 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 255.333-21 chr12 275452 275709 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12707 NM_001190997 6540 Hs.504398 NM_016615 ENSG00000010379 SLC6A13 GAT-2|GAT2|GAT3 solute carrier family 6 member 13 protein-coding 268-18 chr13 53842991 53843221 + 1.66667 NA intron (NR_047488, intron 3 of 5) intron (NR_047488, intron 3 of 5) 27687 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 228.667-24 chr14 73087657 73087836 + 1.66667 NA intron (NM_021239, intron 5 of 18) intron (NM_021239, intron 5 of 18) 29212 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 357-13 chr20 52574500 52574842 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -46167 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 219.667-6 chr1 226452622 226452796 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -44616 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 251-14 chr12 492989 493153 + 1.66667 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) L1MCa|LINE|L1 33132 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 336-16 chr20 51399150 51399493 + 1.66667 NA intron (NM_012340, intron 9 of 10) intron (NM_012340, intron 9 of 10) 53656 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 495.667-2 chr8 119713181 119713658 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -40029 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 395.333-12 chr17 69520904 69521287 + 1.66667 NA exon (NM_002758, exon 7 of 12) exon (NM_002758, exon 7 of 12) 18833 NM_001330450 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 238.666-41 chr8 62651900 62652175 + 1.66667 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -325824 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 476.667-7 chr7 4664321 4664892 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -17689 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 550.001 chr9 25934392 25934787 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -132086 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 115-21 chr10 6356184 6356300 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 5926 NR_148966 399716 Hs.737229 NR_148966 LINC02656 - long intergenic non-protein coding RNA 2656 ncRNA 330.334-11 chr8 37275116 37275371 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 218670 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 239.667-56 chr5 3240662 3240911 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 62951 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 324.667-10 chr14 76602417 76602622 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -158949 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 360.667 chr11 63476843 63477203 + 1.66667 NA intron (NM_054108, intron 3 of 5) L1M4a2|LINE|L1 14144 NM_001146728 117245 Hs.410316 NM_054108 ENSG00000168004 PLAAT5 HRASLS5|HRLP5|HRSL5|PLAAT-5|RLP1|iNAT phospholipase A and acyltransferase 5 protein-coding 219.334-6 chr7 51139862 51140041 + 1.66667 NA intron (NM_015198, intron 5 of 12) intron (NM_015198, intron 5 of 12) 176858 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 455.333-7 chr5 8866771 8867266 + 1.66667 NA intron (NR_109932, intron 1 of 2) intron (NR_109932, intron 1 of 2) 27286 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 235-52 chr8 131270889 131271086 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -230078 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 262.667-42 chr2 169603581 169603874 + 1.66667 NA intron (NM_004792, intron 2 of 13) intron (NM_004792, intron 2 of 13) 19376 NM_004792 9360 Hs.470544 NM_004792 ENSG00000138398 PPIG CARS-Cyp|CYP|SCAF10|SRCyp peptidylprolyl isomerase G protein-coding 207-85 chr4 42180521 42180689 + 1.66667 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger -27950 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 249.999 chr10 67777719 67777932 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 60354 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 399-9 chr4 108902295 108902724 + 1.66667 NA intron (NM_198721, intron 12 of 36) intron (NM_198721, intron 12 of 36) -139456 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 302-33 chr2 156937419 156937800 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -320096 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 271.334-4 chr10 7505616 7505781 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -94212 NM_001029880 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 195.334-7 chr9 25638170 25638357 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 40595 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 261-22 chr14 72363447 72363623 + 1.66667 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -153285 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 467.334-3 chr3 136136111 136136610 + 1.66667 NA intron (NM_181897, intron 12 of 12) intron (NM_181897, intron 12 of 12) 58108 NM_001145417 55167 Hs.18631 NM_018133 ENSG00000174579 MSL2 MSL-2|MSL2L1|RNF184 MSL complex subunit 2 protein-coding 312.666-21 chr4 168716632 168716965 + 1.66667 NA intron (NM_001166108, intron 10 of 21) intron (NM_001166108, intron 10 of 21) 85220 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 268.667-52 chr5 35556294 35556581 + 1.66667 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -61426 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 231-8 chr10 107149225 107149374 + 1.66667 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) intron (NM_001206569, intron 1 of 25) 15407 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 153-69 chr19 10821225 10821371 + 1.66667 NA intron (NM_001005362, intron 15 of 19) intron (NM_001005362, intron 15 of 19) -3802 NR_029586 406976 NR_029586 ENSG00000207752 MIR199A1 MIR-199-s|MIRN199A1|mir-199a-1 microRNA 199a-1 ncRNA 494-5 chr4 60867259 60867769 + 1.66667 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -55105 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 243.334-8 chr14 52982643 52982807 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31628 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 463-5 chr5 20448511 20449050 + 1.66667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 126933 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 363.334 chr10 72096180 72096496 + 1.66667 NA non-coding (NR_045564, exon 10 of 10) non-coding (NR_045564, exon 10 of 10) -7306 NM_014767 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 290-45 chr6 79965061 79965296 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17625 NM_022726 6785 Hs.101915 NM_022726 ENSG00000118402 ELOVL4 ADMD|CT118|ISQMR|SCA34|STGD2|STGD3 ELOVL fatty acid elongase 4 protein-coding 300-45 chr3 149470984 149471275 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3568 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 303.334-13 chr8 138508095 138508342 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -10488 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 449.333-6 chr2 66953663 66954144 + 1.66667 NA intron (NR_110169, intron 4 of 4) intron (NR_110169, intron 4 of 4) -31413 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 248.334-8 chr2 21858217 21858460 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -147686 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 216.333-145 chr9 26848607 26848800 + 1.66667 NA intron (NM_001167575, intron 5 of 5) intron (NM_001167575, intron 5 of 5) 44099 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 338.334-8 chr9 30815632 30816030 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -407377 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 240.333-68 chr4 67554053 67554214 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4594 NM_012108 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 384-17 chr7 27829828 27830379 + 1.66667 NA TTS (NM_001206901) TTS (NM_001206901) 90008 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 293.334-2 chr1 248343614 248343825 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5056 NM_001001918 127066 Hs.553583 NM_001001918 ENSG00000177174 OR14C36 OR5BF1 olfactory receptor family 14 subfamily C member 36 protein-coding 294.333-3 chr10 18607112 18607393 + 1.66667 NA intron (NM_182543, intron 6 of 10) intron (NM_182543, intron 6 of 10) 44335 NM_001351118 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 340.334 chr11 38612609 38613029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 33537 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 294-67 chr9 109226844 109227066 + 1.66667 NA intron (NM_019114, intron 15 of 25) AluJr|SINE|Alu -59664 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 255.333-98 chr7 63980160 63980463 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -18495 NR_145488 100419780 Hs.742917 NR_145488 ZNF722P ZNF722 zinc finger protein 722, pseudogene pseudo 327.667-2 chr1 113432714 113433129 + 1.66667 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) AluJr|SINE|Alu 42406 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 221.667-45 chr20 16401636 16401810 + 1.66667 NA intron (NM_001199866, intron 17 of 22) L2c|LINE|L2 171725 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 273.334-9 chr3 116304956 116305159 + 1.66667 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -54967 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 433.667-3 chr11 78268177 78268677 + 1.66667 NA intron (NM_012296, intron 2 of 9) intron (NM_012296, intron 2 of 9) 73453 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 298.333-37 chr5 152070906 152071304 + 1.66667 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) intron (NR_109876, intron 1 of 2) 112207 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 255.333-48 chr18 47882950 47883229 + 1.66667 NA intron (NM_001003652, intron 2 of 10) L1ME2z|LINE|L1 47570 NM_005901 4087 Hs.12253 NM_005901 ENSG00000175387 SMAD2 JV18|JV18-1|MADH2|MADR2|hMAD-2|hSMAD2 SMAD family member 2 protein-coding 291.333-14 chr11 95766851 95767124 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 22795 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 237.667-26 chr15 93445562 93445845 + 1.66667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 239637 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 327.667 chr1 102981453 102981772 + 1.66667 NA intron (NR_134980, intron 31 of 67) intron (NR_134980, intron 31 of 67) 126884 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 216-80 chr3 83252333 83252539 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1266294 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 402.666-11 chr8 109734455 109734880 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -42876 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 285-4 chr11 56167022 56167200 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6794 NM_001004058 219453 Hs.553626 NM_001004058 ENSG00000181752 OR8K5 OR11-174 olfactory receptor family 8 subfamily K member 5 protein-coding 271.667-10 chr10 86728358 86728579 + 1.66667 NA intron (NM_001368066, intron 14 of 14) intron (NM_001368066, intron 14 of 14) -28171 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 249.667-54 chr21 27440139 27440355 + 1.66667 NA Intergenic LTR1B|LTR|ERV1 -282132 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 402.667-2 chr17 61181736 61182161 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) AluJr|SINE|Alu 185756 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 288-7 chr1 186750928 186751220 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 70420 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 207.667-105 chr6 53592016 53592184 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -18825 NR_110840 101927136 Hs.509788 NR_110840 ENSG00000231683 LOC101927136 - uncharacterized LOC101927136 ncRNA 220.666-62 chr6 81445563 81445819 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 306990 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 254.333-38 chr2 40228669 40228914 + 1.66667 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 201513 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 252-36 chr15 96463699 96463858 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 130013 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 511.667 chr11 14258376 14258935 + 1.66667 NA intron (NM_006108, intron 11 of 15) intron (NM_006108, intron 11 of 15) 99830 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 251.667-10 chr10 115720139 115720390 + 1.66667 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 474525 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 242.666-38 chr8 18407344 18407672 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 16226 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 264.334-20 chr8 16585813 16586050 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -393140 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 269.667-7 chr10 63551477 63551787 + 1.66667 NA intron (NM_001001330, intron 1 of 7) L1MC3|LINE|L1 -29742 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 278.333-31 chr3 45873404 45873716 + 1.66667 NA intron (NM_001276379, intron 2 of 9) HAL1|LINE|L1 -12944 NM_001256369 10803 Hs.225946 NM_006641 ENSG00000173585 CCR9 CC-CKR-9|CDw199|GPR-9-6|GPR28 C-C motif chemokine receptor 9 protein-coding 243.334-15 chr8 71459099 71459262 + 1.66667 NA intron (NM_001370336, intron 2 of 17) intron (NM_001370336, intron 2 of 17) 88524 NM_001370334 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 307-25 chr3 185471664 185471954 + 1.66667 NA intron (NM_004721, intron 10 of 13) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 27226 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 331.667-17 chr4 173812166 173812441 + 1.66667 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie -84970 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 439.334-2 chr2 36201225 36201576 + 1.66667 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL 154170 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 252-100 chr7 85595745 85595940 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 174720 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 163-71 chr5 165876082 165876222 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 1050218 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 263.334-9 chr3 153020341 153020520 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -141796 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 240.666-19 chr2 17183048 17183293 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 335270 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 227.333-103 chr5 83866852 83867176 + 1.66667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -146159 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 278-23 chr20 8790572 8790871 + 1.66667 NA intron (NM_015192, intron 31 of 31) intron (NM_015192, intron 31 of 31) -40464 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 488.667-3 chr17 65699298 65699653 + 1.66667 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) intron (NR_126542, intron 2 of 5) 126976 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 257.333-40 chr16 25971093 25971371 + 1.66667 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 -54005 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 255.667-87 chr9 75073972 75074196 + 1.66667 NA intron (NM_001330679, intron 5 of 9) AluSx3|SINE|Alu 14071 NM_001330678 54981 Hs.494186 NM_017881 ENSG00000106733 NMRK1 C9orf95|NRK1|bA235O14.2 nicotinamide riboside kinase 1 protein-coding 243-48 chr5 16840787 16840945 + 1.66667 NA intron (NM_012334, intron 2 of 40) AluSq2|SINE|Alu 95422 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 227-46 chr5 54690460 54690654 + 1.66667 NA intron (NR_104658, intron 1 of 2) L1PA4|LINE|L1 12767 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 223-38 chr2 175123328 175123498 + 1.66667 NA intron (NR_045770, intron 5 of 15) intron (NR_045770, intron 5 of 15) 44296 NR_030630 100126350 NR_030630 ENSG00000215973 MIR933 MIRN933|hsa-mir-933|mir-933 microRNA 933 ncRNA 237.667-68 chr5 133075093 133075257 + 1.66667 NA intron (NM_002154, intron 6 of 18) intron (NM_002154, intron 6 of 18) 23162 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 347-8 chr13 46877620 46877985 + 1.66667 NA intron (NM_001165947, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 19274 NM_000621 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 255.334-14 chr19 7773060 7773239 + 1.66667 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 9906 NM_001144909 10332 Hs.421437 NM_014257 ENSG00000104938 CLEC4M CD209L|CD299|DC-SIGN2|DC-SIGNR|DCSIGNR|HP10347|L-SIGN|LSIGN C-type lectin domain family 4 member M protein-coding 296.667 chr1 42346851 42347034 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -11062 NM_001198850 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 219-8 chr10 23709342 23709537 + 1.66667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) AluJr|SINE|Alu 14712 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 249.666-29 chr4 48273007 48273228 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3279 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 203-70 chr3 144436652 144436914 + 1.66667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 463702 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 230.334-7 chr18 43967561 43967777 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 564028 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 342 chr10 98415124 98415518 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_032709) promoter-TSS (NM_032709) -139 NM_032709 84795 Hs.238303 NM_032709 ENSG00000119943 PYROXD2 C10orf33|FP3420|YUEF pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 2 protein-coding 305.334-2 chr10 68566075 68566346 + 1.66667 NA intron (NM_030625, intron 1 of 11) intron (NM_030625, intron 1 of 11) 5873 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 211-5 chr1 180624959 180625182 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -6952 NM_001328662 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 224-29 chr16 24079550 24079796 + 1.66667 NA intron (NM_002738, intron 5 of 16) L1M5|LINE|L1 -123443 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 359.001 chr12 46336840 46337121 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 35793 NM_001307936 54407 Hs.221847 NM_018976 ENSG00000134294 SLC38A2 ATA2|PRO1068|SAT2|SNAT2 solute carrier family 38 member 2 protein-coding 253.333-95 chr7 7247390 7247742 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_020156, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_020156, exon 4 of 4) -7588 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 239-25 chr17 3429362 3429545 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 4388 NM_003554 8388 Hs.533931 NM_003554 ENSG00000127780 OR1E2 OR17-135|OR17-136|OR17-93|OR1E4|OR1E7|OST529 olfactory receptor family 1 subfamily E member 2 protein-coding 348.666-4 chr12 80949146 80949455 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11385 NM_004664 8825 Hs.144333 NM_004664 ENSG00000111052 LIN7A LIN-7A|LIN7|MALS-1|MALS1|TIP-33|VELI1 lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component protein-coding 296.666-34 chr7 9637668 9638084 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 3606 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 305.333-11 chr10 92178812 92179180 + 1.66667 NA intron (NM_001178137, intron 4 of 9) intron (NM_001178137, intron 4 of 9) 64283 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 245.334-4 chr11 91304747 91304920 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -435631 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 361.333-9 chr18 1660456 1660824 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -301011 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 313-21 chr20 54977118 54977482 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -445743 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 218-44 chr2 39654201 39654347 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11224 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 299-15 chr14 39490149 39490444 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -57796 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 294.334-3 chr18 10874049 10874351 + 1.66667 NA intron (NM_022068, intron 4 of 51) L1MA4|LINE|L1 -114551 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 210-57 chr18 74605804 74606049 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8091 NR_024484 400657 Hs.61508 NM_001008234 ENSG00000264247 LINC00909 - long intergenic non-protein coding RNA 909 ncRNA 245.667-53 chr5 30682547 30682709 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -511058 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 303.333-14 chr11 33109717 33109971 + 1.66667 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) L1MEj|LINE|L1 33694 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 261.667-58 chr4 110345339 110345550 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -130711 NM_001977 2028 Hs.435765 NM_001977 ENSG00000138792 ENPEP APA|CD249|gp160 glutamyl aminopeptidase protein-coding 402.999 chr2 144417181 144417665 + 1.66667 NA intron (NM_001171653, intron 3 of 8) intron (NM_001171653, intron 3 of 8) -84354 NM_001354360 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 290.334-7 chr5 33413381 33413687 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27162 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 331 chr1 6040771 6041051 + 1.66667 NA intron (NM_172130, intron 2 of 14) intron (NM_172130, intron 2 of 14) -4977 NM_001199862 8514 Hs.440497 NM_003636 ENSG00000069424 KCNAB2 AKR6A5|HKvbeta2|HKvbeta2.1|HKvbeta2.2|KCNA2B|KV-BETA-2 potassium voltage-gated channel subfamily A regulatory beta subunit 2 protein-coding 289.333-35 chr21 23382214 23382553 + 1.66667 NA intron (NR_040254, intron 1 of 4) L1M4|LINE|L1 2452 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 275.333-26 chr16 65072984 65073311 + 1.66667 NA intron (NM_001330576, intron 1 of 11) intron (NM_001330576, intron 1 of 11) 48916 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 253-77 chr9 76725858 76726048 + 1.66667 NA intron (NM_001308048, intron 6 of 17) intron (NM_001308048, intron 6 of 17) -33538 NM_001308050 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 404.333-10 chr8 116564467 116564808 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -87463 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 414.667-4 chr13 55601577 55601950 + 1.66667 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 427309 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 279.667-43 chr7 115952274 115952552 + 1.66667 NA intron (NM_001244583, intron 3 of 5) intron (NM_001244583, intron 3 of 5) 15900 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 329.333-29 chr20 62150035 62150395 + 1.66667 NA intron (NM_198935, intron 1 of 10) intron (NM_198935, intron 1 of 10) 6446 NM_198935 26039 Hs.154429 NM_015558 ENSG00000184402 SS18L1 CREST|LP2261 SS18L1 subunit of BAF chromatin remodeling complex protein-coding 329-2 chr1 119657047 119657406 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8960 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 358.667-5 chr11 110457977 110458300 + 1.66667 NA intron (NM_004109, intron 3 of 3) intron (NM_004109, intron 3 of 3) 28190 NM_004109 2230 Hs.744 NM_004109 ENSG00000137714 FDX1 ADX|FDX|LOH11CR1D ferredoxin 1 protein-coding 361.333-27 chr6 129478521 129479031 + 1.66667 NA exon (NM_001079823, exon 53 of 64) exon (NM_001079823, exon 53 of 64) 231401 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 309.334-3 chr14 53080207 53080502 + 1.66667 NA intron (NM_030637, intron 4 of 11) AluSz|SINE|Alu 72969 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 514-5 chr2 152243153 152243771 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -67699 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 164.667-64 chr13 90239920 90240093 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8824 NR_030754 693207 NR_030754 ENSG00000283783 MIR622 MIRN622|hsa-mir-622 microRNA 622 ncRNA 284.334-14 chr7 3594992 3595218 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 293853 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 271.667-76 chr9 6133961 6134143 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81097 NM_001314044 90865 Hs.731660 NM_033439 ENSG00000137033 IL33 C9orf26|DVS27|IL1F11|NF-HEV|NFEHEV interleukin 33 protein-coding 445-6 chr2 153371488 153372019 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 107009 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 238.334-7 chr2 71170241 71170384 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 39678 NM_005791 10199 Hs.656208 NM_005791 ENSG00000124383 MPHOSPH10 CT90|MPP10|MPP10P|PPP1R106 M-phase phosphoprotein 10 protein-coding 291.334-10 chr3 36800317 36800524 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 22080 NR_147141 105377031 Hs.333862 NR_147141 ENSG00000279727 LINC02033 - long intergenic non-protein coding RNA 2033 ncRNA 197-102 chr6 130725741 130725896 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -101587 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 477.333-2 chr4 47883732 47884217 + 1.66667 NA intron (NR_103795, intron 15 of 23) intron (NR_103795, intron 15 of 23) -30253 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 263.001-2 chr19 28782360 28782524 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -54748 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 297.667-27 chr4 58253150 58253495 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 283006 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 479.334-2 chr20 52894253 52894760 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -77852 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 480.666-5 chr5 9736627 9737006 + 1.66667 NA intron (NR_027112, intron 5 of 12) L3|LINE|CR1 -106465 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 280-51 chr7 39165846 39166121 + 1.66667 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -152416 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 252-117 chr9 114958581 114958744 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28067 NM_001244 944 Hs.494901 NM_001244 ENSG00000106952 TNFSF8 CD153|CD30L|CD30LG|TNLG3A TNF superfamily member 8 protein-coding 276.667-26 chr14 54882086 54882394 + 1.66667 NA intron (NM_001024071, intron 1 of 5) intron (NM_001024071, intron 1 of 5) -4047 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 243.667-8 chr10 77231569 77231756 + 1.66667 NA intron (NM_001322838, intron 3 of 29) intron (NM_001322838, intron 3 of 29) 90831 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 162.667-156 chr20 40087593 40087756 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 83213 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 210.333-45 chr14 63034844 63035026 + 1.66667 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) intron (NM_139318, intron 1 of 10) 10523 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 313.667-32 chr3 111693132 111693506 + 1.66667 NA intron (NM_001185106, intron 1 of 4) intron (NM_001185106, intron 1 of 4) -15886 NR_046733 100874115 Hs.626740 NR_046733 PLCXD2-AS1 - PLCXD2 antisense RNA 1 ncRNA 248.333-81 chr5 65627626 65627821 + 1.66667 NA intron (NM_001365342, intron 1 of 10) intron (NM_001365342, intron 1 of 10) 2696 NM_001365341 112441434 NM_001365341 SHLD3 CTC-534A2.2|RINN1 shieldin complex subunit 3 protein-coding 281.001-2 chr10 129258407 129258586 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -208745 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 325.001 chr6 61823586 61823864 + 1.66667 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 249595 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 249.667-9 chr10 28530811 28530971 + 1.66667 NA intron (NR_033805, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 1463 NR_033805 220906 Hs.403253 NR_033805 WAC-AS1 - WAC antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 308.667-25 chr3 145030635 145030963 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1038386 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 314-3 chr10 92876944 92877294 + 1.66667 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) intron (NM_001319195, intron 1 of 21) 28599 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 785.001 chr17 59021532 59022237 + 1.66667 NA intron (NR_148346, intron 19 of 23) L1MA3|LINE|L1 84996 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 261.667-15 chr13 80640345 80640650 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -299371 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 451.666 chr1 101033728 101034209 + 1.66667 NA intron (NR_109849, intron 1 of 4) intron (NR_109849, intron 1 of 4) 8122 NR_109849 102606465 Hs.593669 NR_109849 LOC102606465 - uncharacterized LOC102606465 ncRNA 238.667-85 chr7 72342453 72342640 + 1.66667 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) intron (NM_001363460, intron 1 of 5) -5155 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 350.334-6 chr2 187037 187265 + 1.66667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 69189 NM_001282687 26751 Hs.515951 NM_015677 ENSG00000035115 SH3YL1 RAY SH3 and SYLF domain containing 1 protein-coding 226-15 chr11 106435941 106436128 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 184627 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 178.667-107 chr3 139166229 139166361 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 62110 NR_026783 60467 Hs.512673 NM_021812 ENSG00000232416 BPESC1 NCRNA00187 blepharophimosis, epicanthus inversus and ptosis candidate 1 ncRNA 328.667-9 chr21 30782199 30782594 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26968 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 335.667-13 chr2 42572627 42572947 + 1.66667 NA intron (NM_001330443, intron 2 of 16) AluSq2|SINE|Alu 4155 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 261.667-51 chr3 174973633 174973882 + 1.66667 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 114423 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 488.667 chr12 43058594 43058970 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -96533 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 447.334-2 chr2 209525062 209525408 + 1.66667 NA intron (NM_001039538, intron 2 of 14) intron (NM_001039538, intron 2 of 14) -54101 NM_001363913 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 479.667-5 chr8 124737602 124738144 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9366 NM_001282974 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 258.666-37 chr5 96726271 96726449 + 1.66667 NA intron (NM_001042446, intron 2 of 26) intron (NM_001042446, intron 2 of 26) -17242 NR_104285 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 268-53 chr6 167459683 167459984 + 1.66667 NA intron (NR_134591, intron 3 of 3) intron (NR_134591, intron 3 of 3) 12957 NR_134591 105378127 Hs.58456 NR_134591 LOC105378127 - uncharacterized LOC105378127 ncRNA 363.334-4 chr3 104731232 104731565 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -635315 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 231-16 chr15 86085456 86085655 + 1.66667 NA intron (NR_120368, intron 5 of 5) intron (NR_120368, intron 5 of 5) 5935 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 257-40 chr3 96714693 96714904 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -99796 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 235-26 chr16 77949560 77949800 + 1.66667 NA intron (NM_020927, intron 7 of 8) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -72868 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 280.666-13 chr2 122971869 122972331 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 101381 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 355.667 chr10 100212198 100212586 + 1.66667 NA intron (NM_001278, intron 9 of 20) L1MA9|LINE|L1 17204 NM_001278 1147 Hs.198998 NM_001278 ENSG00000213341 CHUK IKBKA|IKK-alpha|IKK1|IKKA|NFKBIKA|TCF16 component of inhibitor of nuclear factor kappa B kinase complex protein-coding 228.667-68 chr6 120135082 120135311 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 120017 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 271.667-15 chr11 74964253 74964527 + 1.66667 NA intron (NM_014752, intron 1 of 4) intron (NM_014752, intron 1 of 4) 15124 NM_014752 9789 Hs.282700 NM_014752 ENSG00000118363 SPCS2 - signal peptidase complex subunit 2 protein-coding 162.334 chr10 31198536 31198695 + 1.66667 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) intron (NR_134478, intron 1 of 2) 10732 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 261.667-24 chr17 51291840 51292042 + 1.66667 NA intron (NM_016001, intron 11 of 13) intron (NM_016001, intron 11 of 13) 31395 NM_016001 51096 Hs.709327 NM_016001 ENSG00000011260 UTP18 CGI-48|WDR50 UTP18 small subunit processome component protein-coding 320.001-2 chr3 30531279 30531530 + 1.66667 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL 12536 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 397.667-4 chr19 56778320 56778798 + 1.66667 NA intron (NR_163143, intron 12 of 12) intron (NR_163143, intron 12 of 12) 13237 NR_110744 101929059 Hs.607132 NR_110744 ENSG00000286125 ZIM2-AS1 ZIM2as ZIM2 antisense RNA 1 ncRNA 247-19 chr12 115998729 115999012 + 1.66667 NA intron (NM_015335, intron 14 of 30) intron (NM_015335, intron 14 of 30) 149784 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 436.667-6 chr14 82664938 82665376 + 1.66667 NA intron (NR_146650, intron 2 of 5) intron (NR_146650, intron 2 of 5) 22525 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 178-44 chr14 54074380 54074577 + 1.66667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -117587 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 182.333-3 chr1 56486015 56486173 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 71131 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 281.001 chr1 104729801 104729980 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 656867 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 247.667-84 chr6 74415611 74415761 + 1.66667 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR 346235 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 305-19 chr5 62086097 62086507 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -219860 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 220.667-7 chr1 77080063 77080198 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 19987 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 261.666-21 chr9 100329373 100329648 + 1.66667 NA intron (NM_001161584, intron 6 of 14) intron (NM_001161584, intron 6 of 14) 23061 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 257-18 chr15 54562319 54562553 + 1.66667 NA intron (NM_001329919, intron 28 of 31) L3|LINE|CR1 -494311 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 243.334-9 chr14 87218510 87218706 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 312830 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 459-5 chr13 102151463 102151860 + 1.66667 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu -105657 NR_039854 100616239 NR_039854 ENSG00000264482 MIR4705 - microRNA 4705 ncRNA 266.667-58 chr5 28026036 28026286 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 261504 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 255.667-76 chr6 135166875 135167111 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14315 NM_001161656 4602 Hs.606320 NM_005375 ENSG00000118513 MYB Cmyb|c-myb|c-myb_CDS|efg MYB proto-oncogene, transcription factor protein-coding 215.667-31 chr12 121879796 121879963 + 1.66667 NA intron (NM_001171993, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu 8732 NM_001171993 3242 Hs.2899 NM_002150 ENSG00000158104 HPD 4-HPPD|4HPPD|GLOD3|HPPDASE|PPD 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase protein-coding 318.334-4 chr12 62808718 62808982 + 1.66667 NA intron (NM_020700, intron 2 of 9) intron (NM_020700, intron 2 of 9) 126300 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 618-2 chr5 6761314 6761828 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -34309 NR_146281 109729133 Hs.582455 NR_146281 ENSG00000251365 LINC02236 - long intergenic non-protein coding RNA 2236 ncRNA 340.334-10 chr3 133563234 133563692 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10223 NM_017548 55573 Hs.518265 NM_017548 ENSG00000091527 CDV3 H41 CDV3 homolog protein-coding 467.334-2 chr2 95387299 95387822 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -15148 NM_016044 51011 Hs.531247 NM_016044 ENSG00000115042 FAHD2A CGI-105 fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 2A protein-coding 250.334-19 chr7 112778037 112778187 + 1.66667 NA intron (NR_109840, intron 1 of 3) intron (NR_109840, intron 1 of 3) 12281 NM_001287497 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 255.667-57 chr3 165537102 165537257 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 300244 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 280.667-9 chr1 194142027 194142279 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 837408 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 253.667-18 chr14 33752617 33752780 + 1.66667 NA intron (NM_001165893, intron 6 of 10) intron (NM_001165893, intron 6 of 10) 43761 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 176.667-20 chr1 209868747 209868906 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 40854 NM_014388 27042 Hs.194754 NM_014388 ENSG00000117597 UTP25 C1orf107|DEF|DIEXF|DJ434O14.5 UTP25 small subunit processor component protein-coding 243.667-63 chr5 164916584 164916802 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 446414 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 248.667-60 chr2 128219126 128219412 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 99599 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 210-51 chr17 80521018 80521207 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23726 NM_001163034 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 226.667-25 chr11 47485064 47485216 + 1.66667 NA intron (NM_198700, intron 4 of 13) MIR|SINE|MIR 3884 NM_001172640 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 485-3 chr2 121742804 121743134 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -6094 NM_032390 84365 Hs.367842 NM_032390 ENSG00000155438 NIFK MKI67IP|Nopp34 nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 protein-coding 298-22 chr12 122595017 122595222 + 1.66667 NA intron (NM_014708, intron 43 of 63) AluSz|SINE|Alu 67870 NM_014708 9735 Hs.300559 NM_014708 ENSG00000184445 KNTC1 ROD kinetochore associated 1 protein-coding 318-23 chr2 35223582 35223801 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -247714 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 272.334-8 chr10 69311122 69311315 + 1.66667 NA intron (NM_033500, intron 5 of 21) MER4B|LTR|ERV1 -4636 NM_033496 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 260.667-79 chr6 154034902 154035092 + 1.66667 NA intron (NM_001145280, intron 1 of 3) intron (NM_001145280, intron 1 of 3) -4105 NM_001285523 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 338.334-3 chr11 54923430 54923726 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 216746 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 238.667-16 chr12 25061576 25061804 + 1.66667 NA intron (NM_001366547, intron 2 of 22) intron (NM_001366547, intron 2 of 22) 8984 NM_001204127 4033 Hs.124922 NM_006152 ENSG00000118308 LRMP JAW1 lymphoid restricted membrane protein protein-coding 363.334-5 chr3 160428688 160429009 + 1.66667 NA exon (NM_005496, exon 17 of 23) exon (NM_005496, exon 17 of 23) 20938 NM_173084 286827 Hs.212957 NM_173084 ENSG00000213186 TRIM59 IFT80L|MRF1|RNF104|TRIM57|TSBF1 tripartite motif containing 59 protein-coding 256-12 chr10 100334139 100334383 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4033 NM_016112 9033 Hs.159241 NM_016112 ENSG00000107593 PKD2L1 PCL|PKD2L|PKDL|TRPP3 polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel protein-coding 249-70 chr8 120855897 120856062 + 1.66667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -43933 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 273.666-25 chr8 49340065 49340369 + 1.66667 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 171963 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 327.667-10 chr14 71395133 71395609 + 1.66667 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -2966 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 299.666 chr1 52855394 52855656 + 1.66667 NA intron (NM_001307931, intron 2 of 12) L1MB7|LINE|L1 12765 NM_001307931 440590 Hs.658458 NM_001004339 ENSG00000203995 ZYG11A ZYG11 zyg-11 family member A, cell cycle regulator protein-coding 176-35 chr14 70857076 70857247 + 1.66667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -47648 NM_033141 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 338.667-28 chr6 53984341 53984563 + 1.66667 NA intron (NR_125842, intron 2 of 3) intron (NR_125842, intron 2 of 3) -14438 NR_046832 100874282 Hs.571169 NR_046832 ENSG00000236996 MLIP-IT1 - MLIP intronic transcript 1 ncRNA 387 chr1 83109575 83110037 + 1.66667 NA intron (NR_147074, intron 9 of 10) L2|LINE|L2 -123598 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 272-18 chr17_KI270729v1_random 5763 5951 + 1.66667 NA NA (TTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 305-6 chr15 56790764 56791022 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -56807 NM_001002843 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 275.334-6 chr16 11949566 11949763 + 1.66667 NA intron (NM_001355514, intron 3 of 8) intron (NM_001355514, intron 3 of 8) 14774 NM_001355514 729978 Hs.730028 NM_001355514 ENSG00000234719 NPIPB2 - nuclear pore complex interacting protein family, member B2 protein-coding 291.667-26 chr5 6983687 6983979 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -155912 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 278.333-42 chr7 91354431 91354737 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 90151 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 163.333-141 chr2 53502025 53502230 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -265656 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 245-46 chr3 96019864 96020107 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -336792 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 419-4 chr2 161399968 161400359 + 1.66667 NA intron (NM_005805, intron 10 of 11) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -16134 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 318-18 chr14 54435620 54435996 + 1.66667 NA intron (NM_005776, intron 2 of 4) intron (NM_005776, intron 2 of 4) 5566 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 251-17 chr12 66530040 66530286 + 1.66667 NA intron (NM_001366722, intron 4 of 24) intron (NM_001366722, intron 4 of 24) 148913 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 398.667-5 chr15 101729187 101729629 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -4935 NM_152334 123283 Hs.657163 NM_152334 ENSG00000185418 TARSL2 - threonyl-tRNA synthetase like 2 protein-coding 335.667-5 chr10 110202042 110202402 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5383 NM_130439 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 300.333-7 chr10 105399463 105399857 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 420673 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 265.334-13 chr19 27841384 27841550 + 1.66667 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) MER4A1|LTR|ERV1 -47527 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 264.333-42 chr2 236314916 236315225 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -50725 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 352.334-4 chr3 172915301 172915613 + 1.66667 NA intron (NM_031955, intron 9 of 10) intron (NM_031955, intron 9 of 10) 164455 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 343.334 chr1 43598636 43598875 + 1.66667 NA exon (NM_001329139, exon 12 of 33) exon (NM_001329139, exon 12 of 33) -51394 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 223.666-36 chrX 114686837 114687025 + 1.66667 NA intron (NM_001256761, intron 2 of 5) intron (NM_001256761, intron 2 of 5) -28302 NR_031578 100302153 NR_031578 ENSG00000221710 MIR1298 MIRN1298|hsa-mir-1298 microRNA 1298 ncRNA 301.334-4 chr13 22571298 22571509 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 326778 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 281-15 chr17 60617080 60617322 + 1.66667 NA intron (NM_003620, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 17018 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 352-7 chr11 120381404 120381774 + 1.66667 NA intron (NM_015313, intron 1 of 40) L1MC3|LINE|L1 -3738 NM_001301084 23365 Hs.24598 NM_015313 ENSG00000196914 ARHGEF12 LARG|PRO2792 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 protein-coding 261.667-73 chr8 119306748 119306924 + 1.66667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -18335 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 210-78 chr2 190693771 190693989 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 34722 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 191.333-29 chr10 80611419 80611720 + 1.66667 NA intron (NM_207372, intron 6 of 6) intron (NM_207372, intron 6 of 6) -38228 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 232-48 chr2 78148038 78148245 + 1.66667 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MEd|LINE|L1 59411 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 238.333-75 chr5 125658983 125659249 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 165855 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 265.001 chr3 37908801 37908971 + 1.66667 NA intron (NM_001008392, intron 1 of 7) L1ME4c|LINE|L1 47006 NM_001008392 10217 Hs.475963 NM_005808 ENSG00000144677 CTDSPL C3orf8|HYA22|PSR1|RBSP3|SCP3 CTD small phosphatase like protein-coding 302.334-8 chr3 114808131 114808366 + 1.66667 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) intron (NM_001348805, intron 4 of 10) -49141 NM_001164344 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 344-23 chr2 122368585 122368900 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 613091 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 365.333-11 chr17 70672682 70673028 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 503320 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 244.333-8 chr10 31337108 31337399 + 1.66667 NA intron (NM_001323675, intron 1 of 6) L1ME3E|LINE|L1 15593 NM_001323673 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 269-50 chr7 129010572 129010856 + 1.66667 NA intron (NM_001191028, intron 4 of 21) L1MC4|LINE|L1 44459 NM_012470 23534 Hs.193613 NM_012470 ENSG00000064419 TNPO3 IPO12|LGMD1F|LGMDD2|MTR10A|TRN-SR|TRN-SR2|TRNSR transportin 3 protein-coding 241-45 chr5 97139316 97139574 + 1.66667 NA intron (NM_153234, intron 1 of 5) intron (NM_153234, intron 1 of 5) 3166 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 302.333-21 chr20 35783854 35784117 + 1.66667 NA intron (NM_016436, intron 1 of 17) AluSp|SINE|Alu 11970 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 244.333-105 chr8 125321253 125321472 + 1.66667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) L1ME1|LINE|L1 -108996 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 247.667-52 chr2 137402850 137403024 + 1.66667 NA intron (NM_001316349, intron 12 of 27) intron (NM_001316349, intron 12 of 27) 524995 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 196.334-3 chr11 113521853 113522025 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -46541 NM_000795 1813 Hs.73893 NM_000795 ENSG00000149295 DRD2 D2DR|D2R dopamine receptor D2 protein-coding 259.333-99 chr8 77094808 77095005 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -93862 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 292.667-19 chr2 210077237 210077463 + 1.66667 NA intron (NM_001307976, intron 5 of 13) intron (NM_001307976, intron 5 of 13) 47428 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 207-63 chr2 52510279 52510459 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 139721 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 247.667-59 chr22 25878685 25878996 + 1.66667 NA intron (NM_001318245, intron 25 of 43) L1ME3D|LINE|L1 136652 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 372.667-11 chr22 41097764 41098154 + 1.66667 NA intron (NM_001429, intron 1 of 30) AluYk11|SINE|Alu 5367 NM_001429 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 267.334-13 chr22 18107333 18107568 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3359 NM_001193414 51807 Hs.137400 NM_018943 ENSG00000183785 TUBA8 CDCBM8|TUBAL2 tubulin alpha 8 protein-coding 288-38 chr4 87389085 87389449 + 1.66667 NA intron (NM_016245, intron 1 of 6) AluSq2|SINE|Alu 1921 NM_016245 51170 Hs.594923 NM_016245 ENSG00000198189 HSD17B11 17-BETA-HSD11|17-BETA-HSDXI|17BHSD11|DHRS8|PAN1B|RETSDR2|SDR16C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 11 protein-coding 260.667-77 chr5 169321203 169321427 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20176 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 221-57 chr5 13172384 13172574 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -139593 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 277.667-23 chr2 102389987 102390260 + 1.66667 NA exon (NM_001371419, exon 9 of 9) exon (NM_001371419, exon 9 of 9) -28667 NM_003853 8807 Hs.158315 NM_003853 ENSG00000115607 IL18RAP ACPL|CD218b|CDw218b|IL-18R-beta|IL-18RAcP|IL-18Rbeta|IL-1R-7|IL-1R7|IL-1RAcPL|IL18RB interleukin 18 receptor accessory protein protein-coding 341.334-5 chr5 139515610 139515899 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -32996 NM_001301738 340061 Hs.379754 NM_198282 ENSG00000184584 TMEM173 ERIS|MITA|MPYS|NET23|SAVI|STING|STING-beta|hMITA|hSTING transmembrane protein 173 protein-coding 233-42 chr20 16466889 16467136 + 1.66667 NA intron (NM_001199866, intron 12 of 22) L1MC1|LINE|L1 106436 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 175.334 chrX 67550608 67550733 + 1.66667 NA intron (NM_001348064, intron 1 of 2) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 6047 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 283-11 chr14 22332412 22332699 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 100198 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 296.334-3 chr12 6350726 6351043 + 1.66667 NA intron (NM_001038, intron 8 of 12) AluSx|SINE|Alu -8767 NM_001065 7132 Hs.279594 NM_001065 ENSG00000067182 TNFRSF1A CD120a|FPF|TBP1|TNF-R|TNF-R-I|TNF-R55|TNFAR|TNFR1|TNFR55|TNFR60|p55|p55-R|p60 TNF receptor superfamily member 1A protein-coding 244-75 chr3 149189632 149189852 + 1.66667 NA intron (NM_000096, intron 9 of 18) intron (NM_000096, intron 9 of 18) 32087 NR_046371 1356 Hs.558314 NM_000096 ENSG00000047457 CP CP-2 ceruloplasmin protein-coding 288.667-8 chr12 81889635 81889881 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -63961 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 388.667-8 chr2 198295491 198295786 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 79459 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 198.667-33 chr11 23947019 23947154 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -527896 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 426.334-4 chr6 89074007 89074399 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6548 NM_006813 10957 Hs.75969 NM_006813 ENSG00000146278 PNRC1 B4-2|PNAS-145|PROL2|PRR2 proline rich nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 285.333-2 chr1 119438585 119438834 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 23559 NM_000198 3284 Hs.654399 NM_000198 ENSG00000203859 HSD3B2 HSD3B|HSDB|SDR11E2 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2 protein-coding 254.334-19 chr2 95556672 95556891 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35220 NM_138800 129868 Hs.232026 NM_138800 ENSG00000144015 TRIM43 TRIM43A tripartite motif containing 43 protein-coding 596.001-2 chr8 117451135 117451508 + 1.66667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -69392 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 232-35 chr17 60714772 60715055 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) intron (NM_001330413, intron 5 of 25) 37062 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 399-13 chr9 70647543 70647947 + 1.66667 NA intron (NM_001366143, intron 9 of 25) L1PA15|LINE|L1 162339 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 255-37 chr17 60461885 60462123 + 1.66667 NA exon (NM_001282476, exon 6 of 12) exon (NM_001282476, exon 6 of 12) 39515 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 416.667-13 chr5 168491180 168491549 + 1.66667 NA intron (NM_002887, intron 2 of 14) AluJr4|SINE|Alu 4893 NM_002887 5917 Hs.654907 NM_002887 ENSG00000113643 RARS ArgRS|DALRD1|HLD9 arginyl-tRNA synthetase protein-coding 212-143 chr6 163588451 163588606 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 82956 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 238.334-14 chrX 57935497 57935680 + 1.66667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -24955 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 259.334 chr1 100497747 100498017 + 1.66667 NA intron (NM_001319212, intron 12 of 13) MIR|SINE|MIR -40257 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 140.334 chr8 91136523 91136641 + 1.66667 NA intron (NR_148895, intron 7 of 10) L1MB3|LINE|L1 33963 NM_001354470 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 243.667-68 chr6 74520452 74520712 + 1.66667 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 451131 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 279.334-14 chr9 99067424 99067621 + 1.66667 NA intron (NM_001855, intron 40 of 41) intron (NM_001855, intron 40 of 41) -37591 NM_004612 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 251.333-85 chr5 19529934 19530187 + 1.66667 NA intron (NM_001349559, intron 9 of 12) L1ME1|LINE|L1 356212 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 238-16 chr12 15622252 15622461 + 1.66667 NA intron (NM_004447, intron 20 of 20) intron (NM_004447, intron 20 of 20) 75745 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 406-10 chr3 104654427 104654745 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -712127 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 323.334-7 chr4 36247857 36248143 + 1.66667 NA intron (NR_122079, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -3486 NM_015230 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 243-14 chr12 41843544 41843741 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 79453 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 205.667-96 chr3 89729410 89729653 + 1.66667 NA Intergenic L1M2b|LINE|L1 621910 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 252.666-17 chr2 14181532 14181866 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 219259 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 239.334-8 chr3 43610687 43610876 + 1.66667 NA intron (NM_001346469, intron 1 of 11) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie 11145 NM_001346466 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 320.666-12 chr5 116088475 116088868 + 1.66667 NA intron (NM_001308080, intron 2 of 6) L2c|LINE|L2 3209 NM_001308080 51397 Hs.483136 NM_016144 ENSG00000145781 COMMD10 PTD002 COMM domain containing 10 protein-coding 599-2 chr22 37835253 37835942 + 1.66667 NA intron (NM_001349853, intron 3 of 7) AluJo|SINE|Alu 8251 NM_001363839 129138 Hs.135259 NM_138797 ENSG00000100124 ANKRD54 LIAR ankyrin repeat domain 54 protein-coding 321-14 chr2 107300184 107300463 + 1.66667 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 49202 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 332.334-3 chr2 230077220 230077576 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8474 NM_152527 151473 Hs.504317 NM_152527 ENSG00000163053 SLC16A14 MCT14 solute carrier family 16 member 14 protein-coding 270.333-38 chr3 101222488 101222759 + 1.66667 NA TTS (NM_016247) TTS (NM_016247) 97952 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 323.334-6 chr2 35163195 35163486 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -308065 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 226-86 chr7 43793339 43793532 + 1.66667 NA intron (NM_001253823, intron 6 of 8) MIRb|SINE|MIR 34755 NM_000712 644 Hs.488143 NM_000712 ENSG00000106605 BLVRA BLVR|BVR|BVRA biliverdin reductase A protein-coding 306.667-31 chr21 25299112 25299455 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 132418 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 131.334 chr9 74715288 74715398 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 99809 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 323.334-3 chr12 64919946 64920265 + 1.66667 NA TTS (NR_146276) TTS (NR_146276) 36331 NR_033988 400046 Hs.591032 NR_033988 ENSG00000255693 LINC02389 - long intergenic non-protein coding RNA 2389 ncRNA 270.667-54 chr8 78738953 78739245 + 1.66667 NA intron (NM_001199887, intron 3 of 4) intron (NM_001199887, intron 3 of 4) -14725 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 246.667-5 chr1 81922219 81922418 + 1.66667 NA intron (NM_001366002, intron 4 of 20) intron (NM_001366002, intron 4 of 20) 119865 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 239.333-11 chr10 32191183 32191482 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -134907 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 255.333-86 chr5 120337051 120337317 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -127094 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 297-29 chr18 6287904 6288262 + 1.66667 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) MER65-int|LTR|ERV1 31339 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 331.001-4 chr7 49103952 49104220 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 179539 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 274.667-28 chr2 120518882 120519154 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -52669 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 254-48 chr22 19554020 19554307 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 12676 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 261.666-11 chr2 112762440 112762703 + 1.66667 NA intron (NR_130712, intron 1 of 9) intron (NR_130712, intron 1 of 9) 2038 NR_130712 150468 Hs.434250 NM_152515 ENSG00000169607 CKAP2L - cytoskeleton associated protein 2 like protein-coding 293-20 chr14 83957136 83957390 + 1.66667 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 1314631 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 305.667-38 chr8 86757976 86758198 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14412 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 529.334-3 chr12 28681925 28682473 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -467079 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 302.667-14 chr17 62051851 62052056 + 1.66667 NA intron (NM_005121, intron 3 of 29) intron (NM_005121, intron 3 of 29) 13325 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 323.667-25 chr7 116137874 116138299 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -72453 NM_015641 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 245-37 chr2 77053409 77053650 + 1.66667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 67564 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 382.666-11 chr2 176060529 176060924 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 23236 NM_001080458 344191 Hs.452341 NM_001080458 ENSG00000174279 EVX2 EVX-2 even-skipped homeobox 2 protein-coding 341.334-4 chr5 113740655 113741070 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 227168 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 354-4 chr10 53702030 53702459 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -783986 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 325.667-9 chr17 66366660 66367024 + 1.66667 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 50012 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 226.667-63 chr4 22902635 22902776 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 188616 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 262-49 chr2 220256052 220256397 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -349659 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 349.333-26 chr5 63496289 63496583 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 465856 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 309-6 chr1 152136557 152136868 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -21258 NM_007113 7062 Hs.432416 NM_007113 ENSG00000159450 TCHH THH|THL|TRHY|UHS3 trichohyalin protein-coding 187.334-4 chr5 65290618 65290779 + 1.66667 NA intron (NM_197941, intron 11 of 24) intron (NM_197941, intron 11 of 24) 191222 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 301-14 chr14 75194347 75194609 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -17866 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 431.666 chr1 28211428 28212032 + 1.66667 NA intron (NM_014280, intron 3 of 8) L1MC4|LINE|L1 -17794 NM_001164721 5724 Hs.77542 NM_000952 ENSG00000169403 PTAFR PAFR platelet activating factor receptor protein-coding 269.334-9 chr21 45260469 45260647 + 1.66667 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 26218 NR_135279 114042 Hs.375832 NR_135279 ENSG00000182586 LINC00334 C21orf89|NCRNA00334 long intergenic non-protein coding RNA 334 ncRNA 390-17 chr3 78302603 78303107 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -253892 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 276.667-29 chr15 69510185 69510354 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -51451 NR_026979 145837 Hs.410126 NR_026979 DRAIC - downregulated RNA in cancer, inhibitor of cell invasion and migration ncRNA 357.334-7 chr4 10187358 10187655 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70707 NM_005112 9948 Hs.128548 NM_005112 ENSG00000071127 WDR1 AIP1|HEL-S-52|NORI-1 WD repeat domain 1 protein-coding 262.333-61 chr4 33449328 33449564 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 590447 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 270-8 chr11 36171198 36171369 + 1.66667 NA intron (NM_001304263, intron 3 of 4) L1PB1|LINE|L1 -93382 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 203.667-9 chr1 209983199 209983373 + 1.66667 NA intron (NM_001146261, intron 3 of 9) L1MC1|LINE|L1 45069 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 416.667-12 chr5 32393561 32394023 + 1.66667 NA TTS (NR_030305) TTS (NR_030305) 683 NR_030305 693164 NR_030305 ENSG00000207956 MIR579 MIRN579|hsa-mir-579 microRNA 579 ncRNA 307-17 chr20 49037371 49037647 + 1.66667 NA TTS (NM_006420) TTS (NM_006420) 8547 NR_110625 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 344-3 chr1 182764493 182764733 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24836 NM_001200050 80896 Hs.496969 NM_030769 ENSG00000135838 NPL C112|C1orf13|NAL|NPL1 N-acetylneuraminate pyruvate lyase protein-coding 258.666-26 chr3 109885703 109886008 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 283027 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 427.334-2 chr4 70872159 70872703 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29938 NM_001244767 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 259.667-59 chr5 7891550 7891744 + 1.66667 NA intron (NR_157177, intron 10 of 14) intron (NR_157177, intron 10 of 14) 22499 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 279.667-27 chr2 216355466 216355709 + 1.66667 NA intron (NM_020814, intron 1 of 3) intron (NM_020814, intron 1 of 3) 16896 NM_020814 57574 Hs.170388 NM_020814 ENSG00000144583 MARCH4 MARCH-IV|RNF174 membrane associated ring-CH-type finger 4 protein-coding 326-17 chr17 31746525 31746864 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 112268 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 260.667-36 chr17 64566325 64566526 + 1.66667 NA intron (NM_022739, intron 10 of 18) intron (NM_022739, intron 10 of 18) 59448 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 266.667-60 chr5 75964400 75964571 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -118898 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 257-66 chr7 39999648 39999810 + 1.66667 NA intron (NM_003718, intron 4 of 13) intron (NM_003718, intron 4 of 13) 49369 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 238.667-48 chr2 174134443 174134621 + 1.66667 NA intron (NM_001011708, intron 4 of 9) L1ME3|LINE|L1 109252 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 307.666-9 chr2 31445680 31445984 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31090 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 315.333-15 chr14 70957941 70958483 + 1.66667 NA intron (NM_014982, intron 2 of 35) intron (NM_014982, intron 2 of 35) 50753 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 470.667-4 chr2 63381186 63381856 + 1.66667 NA intron (NR_148704, intron 12 of 18) intron (NR_148704, intron 12 of 18) 56486 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 339.334 chr1 247640880 247641207 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 31998 NM_001005487 441933 Hs.553834 NM_001005487 ENSG00000197437 OR13G1 OR1-37 olfactory receptor family 13 subfamily G member 1 protein-coding 268.333-40 chr3 115042619 115042929 + 1.66667 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) intron (NM_015642, intron 1 of 9) 28640 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 257.667-64 chr5 38908828 38908983 + 1.66667 NA intron (NM_003999, intron 9 of 17) L1PA16|LINE|L1 62893 NM_003999 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 265.667-54 chr4 95865861 95866106 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 25890 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 482.001 chr10 105540636 105541031 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 279500 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 329.334-6 chr22 29972243 29972523 + 1.66667 NA intron (NM_153051, intron 3 of 18) intron (NM_153051, intron 3 of 18) -34666 NR_106876 102466742 NR_106876 ENSG00000275818 MIR6818 hsa-mir-6818 microRNA 6818 ncRNA 245.666-2 chr1 112776287 112776563 + 1.66667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 55858 NM_001004440 284467 Hs.439116 NM_182759 ENSG00000184599 TAFA3 FAM19A3|TAFA-3 TAFA chemokine like family member 3 protein-coding 202-158 chr6 28347814 28348051 + 1.66667 NA intron (NM_001135215, intron 3 of 7) L1M5|LINE|L1 -2015 NM_001242894 80317 Hs.380930 NM_024493 ENSG00000189298 ZKSCAN3 ZF47|ZFP306|ZNF306|ZNF309|ZSCAN13|ZSCAN35|Zfp47|dJ874C20.1|dJ874C20.1.|zfp-47 zinc finger with KRAB and SCAN domains 3 protein-coding 218.334-2 chr2 19979246 19979411 + 1.66667 NA intron (NM_001006657, intron 4 of 27) intron (NM_001006657, intron 4 of 27) 10777 NM_001006657 57539 Hs.205427 NM_020779 ENSG00000118965 WDR35 CED2|IFT121|IFTA1|SRTD7 WD repeat domain 35 protein-coding 638.001 chr5 44638361 44638966 + 1.66667 NA Intergenic LTR53B|LTR|ERVL -128381 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 180.667-51 chr17 70585813 70586086 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 416414 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 439.667-6 chr4 20152365 20152651 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -99397 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 406.666-3 chr2 58164631 58165147 + 1.66667 NA intron (NR_156742, intron 4 of 9) intron (NR_156742, intron 4 of 9) 76491 NM_018062 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 258.334-17 chr4 94501728 94501995 + 1.66667 NA intron (NM_001256428, intron 2 of 11) intron (NM_001256428, intron 2 of 11) 49919 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 303-38 chr4 87857272 87857464 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 22665 NM_001291183 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 264.333-69 chr6 106190002 106190445 + 1.66667 NA intron (NR_104402, intron 5 of 5) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 91282 NM_182907 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 246-75 chr4 31976989 31977186 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20292 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 408.333-4 chr17 61379833 61380212 + 1.66667 NA intron (NM_001099432, intron 24 of 24) intron (NM_001099432, intron 24 of 24) -12318 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 326-14 chr14 54437512 54437929 + 1.66667 NA intron (NM_005776, intron 1 of 4) intron (NM_005776, intron 1 of 4) 3654 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 265.667-3 chr1 205292436 205292597 + 1.66667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 29229 NM_030952 81788 Hs.497512 NM_030952 ENSG00000163545 NUAK2 SNARK NUAK family kinase 2 protein-coding 352.333-29 chr8 53599684 53600024 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR -75889 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 256.666-31 chr3 133385966 133386324 + 1.66667 NA intron (NM_023943, intron 4 of 5) LTR16B|LTR|ERVL -13911 NM_003571 8419 Hs.659862 NM_003571 ENSG00000170819 BFSP2 CP47|CP49|CTRCT12|LIFL-L|PHAKOSIN beaded filament structural protein 2 protein-coding 252.667-33 chr15 64257605 64257885 + 1.66667 NA intron (NM_001329607, intron 3 of 11) AluJb|SINE|Alu -94590 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 234.334-4 chr15 95682374 95682544 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 249366 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 235-27 chr17 19985201 19985540 + 1.66667 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -7514 NM_001330152 11216 Hs.642676 NM_007202 ENSG00000108599 AKAP10 AKAP-10|D-AKAP-2|D-AKAP2|PRKA10 A-kinase anchoring protein 10 protein-coding 391-16 chr7 114070272 114070615 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -15884 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 452.333 chr10 57658049 57658350 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -353640 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 357.001 chr10 59236995 59237268 + 1.66667 NA intron (NM_001143774, intron 3 of 4) intron (NM_001143774, intron 3 of 4) 59664 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 254-44 chr2 232736608 232736827 + 1.66667 NA TTS (NR_103493) TTS (NR_103493) 2300 NR_103492 26058 Hs.565319 NM_015575 ENSG00000204120 GIGYF2 GYF2|PARK11|PERQ2|PERQ3|TNRC15 GRB10 interacting GYF protein 2 protein-coding 132-106 chr6 61933919 61934057 + 1.66667 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) L1MA8|LINE|L1 352237 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 474.333 chr1 47874649 47874969 + 1.66667 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu 122576 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 280.667-37 chr5 20562172 20562461 + 1.66667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 13397 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 254.667-23 chr14 68504480 68504660 + 1.66667 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 124217 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 260.334-9 chr12 59724019 59724208 + 1.66667 NA intron (NM_001270623, intron 3 of 5) intron (NM_001270623, intron 3 of 5) 34743 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 242-35 chr18 31827278 31827454 + 1.66667 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -66486 NM_001034172 147407 Hs.567708 NM_001034172 ENSG00000141437 SLC25A52 MCART2 solute carrier family 25 member 52 protein-coding 252.667-44 chr19 49565094 49565363 + 1.66667 NA intron (NM_001270960, intron 1 of 8) AluJo|SINE|Alu 15328 NM_001270960 51070 Hs.7236 NM_015953 ENSG00000142546 NOSIP CGI-25 nitric oxide synthase interacting protein protein-coding 370.333-11 chr18 9554309 9554709 + 1.66667 NA intron (NR_052003, intron 15 of 19) L1MC4|LINE|L1 60050 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 421 chr10 76378204 76378817 + 1.66667 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1P4|LINE|L1 -509534 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 267.667-70 chr8 130091785 130091959 + 1.66667 NA intron (NM_001362925, intron 25 of 29) intron (NM_001362925, intron 25 of 29) -7104 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 565.999-2 chr21 32671733 32672244 + 1.66667 NA intron (NM_203446, intron 14 of 32) AluSq|SINE|Alu 55933 NM_001160306 8867 Hs.473632 NM_003895 ENSG00000159082 SYNJ1 EIEE53|INPP5G|PARK20 synaptojanin 1 protein-coding 308.667-5 chr10 22865537 22865732 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -62390 NM_001282747 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 389.334 chr10 50488226 50488635 + 1.66667 NA intron (NM_147156, intron 3 of 10) intron (NM_147156, intron 3 of 10) 135526 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 248.667-97 chr7 39169303 39169479 + 1.66667 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -155824 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 216-91 chr4 114547927 114548135 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50371 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 292.667-4 chr11 82884174 82884390 + 1.66667 NA intron (NM_005040, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 16148 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 271.334-3 chr1 199887149 199887335 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -140468 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 319-27 chr7 70305423 70305796 + 1.66667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 707134 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 291.667-2 chr1 82640209 82640435 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -262861 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 219.667-47 chr21 23166603 23166788 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 87411 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 299-32 chr5 143438898 143439127 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3500 NM_001018077 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 250.334-11 chr19 31457032 31457206 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -107683 NM_020856 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 239.334-7 chr22 26851651 26851974 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8399 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 247.667-23 chr12 49687426 49687589 + 1.66667 NA intron (NM_001367835, intron 1 of 26) FLAM_A|SINE|Alu 19898 NM_175736 91010 Hs.179838 NM_175736 ENSG00000161791 FMNL3 FHOD3|FRL2|WBP-3|WBP3 formin like 3 protein-coding 262.667-49 chr21 31463880 31464116 + 1.66667 NA 5' UTR (NM_001353692, exon 2 of 28) 5' UTR (NM_001353692, exon 2 of 28) 95089 NM_003253 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 271-41 chr7 70336971 70337176 + 1.66667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 738598 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 352.667-17 chr2 203517131 203517474 + 1.66667 NA intron (NM_001329728, intron 1 of 15) L1MCa|LINE|L1 17999 NM_203365 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 280-17 chr17 61955960 61956228 + 1.66667 NA intron (NM_005121, intron 24 of 29) intron (NM_005121, intron 24 of 29) -28112 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 318.667-31 chr7 3849876 3850142 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -279676 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 302-43 chr4 44627256 44627600 + 1.66667 NA intron (NM_182592, intron 4 of 5) (GATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 24213 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 303.667-8 chr15 43189471 43189747 + 1.66667 NA intron (NR_027513, intron 3 of 8) intron (NR_027513, intron 3 of 8) 4206 NM_012142 23582 Hs.36794 NM_012142 ENSG00000166946 CCNDBP1 DIP1|GCIP|HHM cyclin D1 binding protein 1 protein-coding 333.667-20 chr8 27049135 27049539 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_031680) promoter-TSS (NR_031680) -374 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 251.333-119 chr9 104485845 104486098 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -18292 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 269.333-30 chr17 67932718 67932926 + 1.66667 NA intron (NM_182641, intron 18 of 27) intron (NM_182641, intron 18 of 27) 60784 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 169-76 chr4 110764748 110764913 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 95817 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 248.334-17 chr7 40254052 40254215 + 1.66667 NA intron (NM_001193312, intron 7 of 12) intron (NM_001193312, intron 7 of 12) 119157 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 301.667-27 chr2 172144554 172144825 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 41683 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 268-15 chr12 15767390 15767715 + 1.66667 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) intron (NM_004447, intron 1 of 20) 21836 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 290-16 chr18 74156965 74157234 + 1.66667 NA intron (NM_014177, intron 3 of 5) intron (NM_014177, intron 3 of 5) 8576 NM_014177 29090 Hs.532835 NM_014177 ENSG00000075336 TIMM21 C18orf55|HSPC154|TIM21 translocase of inner mitochondrial membrane 21 protein-coding 274-55 chr6 169082687 169083013 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 15064 NR_134619 102724357 Hs.129310 NR_134619 ENSG00000234519 LOC102724357 - uncharacterized LOC102724357 ncRNA 259-36 chr3 134007350 134007510 + 1.66667 NA intron (NM_005630, intron 1 of 13) L1MB3|LINE|L1 22495 NM_005630 6578 Hs.518270 NM_005630 ENSG00000174640 SLCO2A1 MATR1|OATP2A1|PGT|PHOAR2|SLC21A2 solute carrier organic anion transporter family member 2A1 protein-coding 360.667-18 chrX 41607711 41608130 + 1.66667 NA intron (NM_003688, intron 12 of 26) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -81053 NM_001097579 2857 Hs.495989 NM_005300 ENSG00000171659 GPR34 LYPSR1 G protein-coupled receptor 34 protein-coding 235.333-74 chr3 107563702 107563912 + 1.66667 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) L2a|LINE|L2 40845 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 220-90 chr5 67292440 67292671 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95756 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 239-56 chr6 17051710 17051901 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -50453 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 225-10 chr10 66553258 66553506 + 1.66667 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) L1MEg|LINE|L1 -372654 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 293-26 chr2 155812812 155813047 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 442002 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 253.667-33 chr2 162201890 162202083 + 1.66667 NA intron (NM_004460, intron 14 of 25) intron (NM_004460, intron 14 of 25) 41459 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 332.001 chr2 139179443 139179700 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 282247 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 272-6 chr11 39368287 39368666 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 719618 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 256.333-45 chr2 118916398 118916679 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25631 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 305.667-21 chr22 20196230 20196509 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 8549 NR_038460 284865 Hs.638498 NR_038460 ENSG00000249923 LOC284865 - uncharacterized LOC284865 ncRNA 505.332 chr5 63760143 63760699 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 201871 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 307 chr1 26820127 26820328 + 1.66667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -6461 NM_032283 84243 Hs.523710 NM_032283 ENSG00000204160 ZDHHC18 DHHC-18|DHHC18 zinc finger DHHC-type containing 18 protein-coding 214.334-3 chr3 55704313 55704619 + 1.66667 NA intron (NR_132749, intron 14 of 17) intron (NR_132749, intron 14 of 17) -44997 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 159-73 chr21 30213816 30213983 + 1.66667 NA TTS (NM_199328) TTS (NM_199328) -2116 NR_038855 266919 Hs.561028 NR_038855 ENSG00000227342 LINC00307 D21S2091E|NCRNA00307 long intergenic non-protein coding RNA 307 ncRNA 434-8 chr7 77380341 77380687 + 1.66667 NA intron (NR_146937, intron 8 of 31) intron (NR_146937, intron 8 of 31) -34684 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 229.667-8 chr1 218209873 218210119 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -75297 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 212-99 chr22 26878309 26878517 + 1.66667 NA intron (NR_146604, intron 4 of 5) L1MEg2|LINE|L1 18202 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 237-28 chr14 58336359 58336545 + 1.66667 NA intron (NM_002892, intron 11 of 23) intron (NM_002892, intron 11 of 23) 37897 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 396-20 chrX 83979950 83980427 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 119042 NM_021118 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 262-88 chr9 30388829 30389080 + 1.66667 NA TTS (NR_046204) TTS (NR_046204) 19500 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 245-77 chr9 15623186 15623372 + 1.66667 NA exon (NM_173550, exon 7 of 26) exon (NM_173550, exon 7 of 26) 59301 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 266.667-28 chr15 56546895 56547175 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81898 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 360.666-4 chr14 61613633 61614119 + 1.66667 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) MLT2C1|LTR|ERVL -43223 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 249.333-82 chr5 40145900 40146160 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 93739 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 459.333-8 chr6 150840855 150841334 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001329799, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001329799, exon 16 of 16) -24585 NM_015440 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 328-39 chr8 88720653 88721113 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -393400 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 244-15 chr10 31187541 31187759 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_134478) promoter-TSS (NR_134478) -233 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 340.334-11 chr3 157821526 157822002 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 278420 NM_001099777 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 342.334-5 chr5 83337385 83337807 + 1.66667 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -134078 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 370-28 chr8 101920363 101920926 + 1.66667 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) L1PA16|LINE|L1 -63788 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 296-61 chr7 37039512 37040024 + 1.66667 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) intron (NM_001206480, intron 15 of 21) 41972 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 207.667-4 chr1 102790949 102791101 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 317471 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 268-20 chr15 48761849 48762107 + 1.66667 NA intron (NM_014985, intron 18 of 25) intron (NM_014985, intron 18 of 25) 49091 NM_014985 22995 Hs.443005 NM_014985 ENSG00000103995 CEP152 MCPH4|MCPH9|SCKL5 centrosomal protein 152 protein-coding 235.333-88 chr4 113901893 113902149 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_024590, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_024590, exon 2 of 2) 77626 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 278-8 chr11 93027174 93027370 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 57649 NM_005959 4544 Hs.569039 NM_005959 ENSG00000134640 MTNR1B FGQTL2|MEL-1B-R|MT2 melatonin receptor 1B protein-coding 258-60 chr5 50277081 50277251 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 164122 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 378-14 chr2 137328004 137328309 + 1.66667 NA intron (NM_001316349, intron 12 of 27) intron (NM_001316349, intron 12 of 27) 562611 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 327.334-6 chr20 48301021 48301388 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -58707 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 346-5 chr10 92538833 92539213 + 1.66667 NA intron (NR_136399, intron 1 of 25) intron (NR_136399, intron 1 of 25) 34483 NM_001322796 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 141.333-52 chr13 25889051 25889211 + 1.66667 NA intron (NM_016529, intron 33 of 36) intron (NM_016529, intron 33 of 36) 161929 NM_001007538 387914 Hs.433791 NM_001007538 ENSG00000180730 SHISA2 C13orf13|PRO28631|TMEM46|WGAR9166|bA398O19.2|hShisa shisa family member 2 protein-coding 493-3 chr3 128698662 128699018 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27296 NM_004637 7879 Hs.684374 NM_004637 ENSG00000075785 RAB7A PRO2706|RAB7 RAB7A, member RAS oncogene family protein-coding 330.667-19 chr4 30396065 30396352 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -324161 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 196.333-141 chr5 59017804 59018043 + 1.66667 NA intron (NM_006203, intron 6 of 14) MIRb|SINE|MIR -18025 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 244.333-36 chr14 74788578 74788798 + 1.66667 NA intron (NM_019589, intron 4 of 20) AluJr|SINE|Alu 25372 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 265-12 chr11 66354084 66354310 + 1.66667 NA intron (NR_135761, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 6206 NR_135761 102724064 Hs.614641 NR_135761 ENSG00000255468 LOC102724064 - uncharacterized LOC102724064 ncRNA 445.334 chr14 88751881 88752170 + 1.66667 NA intron (NM_183387, intron 2 of 42) MIR|SINE|MIR 40928 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 252.667-3 chr1 39944595 39944790 + 1.66667 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -10420 NM_001287808 84879 Hs.655177 NM_032793 ENSG00000168389 MFSD2A MCPH15|MFSD2|NLS1 major facilitator superfamily domain containing 2A protein-coding 262-10 chr11 67113042 67113327 + 1.66667 NA intron (NR_160735, intron 1 of 1) intron (NR_160735, intron 1 of 1) 5164 NR_160735 107984341 NR_160735 LOC107984341 - uncharacterized LOC107984341 ncRNA 281.333-42 chr3 113305783 113306078 + 1.66667 NA intron (NM_001164496, intron 30 of 34) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 93814 NM_001301861 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 264.666-15 chr2 39430294 39430672 + 1.66667 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) intron (NM_003618, intron 1 of 33) 6802 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 273.666-12 chr2 58396253 58396492 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 120495 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 333-20 chr4 11835876 11836126 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 52823 NR_162127 113218507 NR_162127 MIR12113 - microRNA 12113 ncRNA 276.667-64 chr8 49507898 49508101 + 1.66667 NA intron (NR_134294, intron 1 of 1) L1MB3|LINE|L1 4181 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 394.667-12 chr8 124924989 124925472 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16778 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 219-47 chr2 38190215 38190465 + 1.66667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 59235 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 293-24 chr2 26084623 26084824 + 1.66667 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) intron (NM_016131, intron 1 of 5) 50639 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 250-41 chr2 173518934 173519141 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 164165 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 435-5 chr4 93235525 93236028 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 6 of 14) intron (NM_001286838, intron 6 of 14) -592977 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 245-42 chr2 212465930 212466091 + 1.66667 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) -39650 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 285.001-3 chr15 42979978 42980180 + 1.66667 NA intron (NM_174916, intron 37 of 46) intron (NM_174916, intron 37 of 46) -59301 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 527.001-2 chr4 36057427 36057847 + 1.66667 NA intron (NR_146893, intron 33 of 36) L1MEg|LINE|L1 186302 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 313.001 chr20 15878340 15878558 + 1.66667 NA intron (NM_001351663, intron 9 of 17) MER5A|DNA|hAT-Charlie 44865 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 255.333-49 chr18 75538871 75539147 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -111306 NM_001303482 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 188.334 chr17 56330929 56331077 + 1.66667 NA intron (NM_001370326, intron 4 of 20) intron (NM_001370326, intron 4 of 20) 177528 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 311-38 chr9 89941410 89941733 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27845 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 330.334-9 chr3 115391985 115392192 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -231422 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 297-23 chr15 52377992 52378278 + 1.66667 NA intron (NM_001142495, intron 18 of 39) intron (NM_001142495, intron 18 of 39) -82331 NM_018728 55930 Hs.487036 NM_018728 ENSG00000128833 MYO5C - myosin VC protein-coding 326.334-8 chr3 186872082 186872308 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -10827 NR_046662 100874095 Hs.638968 NR_046662 ENSG00000226482 ADIPOQ-AS1 - ADIPOQ antisense RNA 1 ncRNA 216-53 chr19 35044494 35044655 + 1.66667 NA intron (NM_002151, intron 3 of 13) MamRep564|Unknown|Unknown 4068 NM_002151 3249 Hs.182385 NM_002151 ENSG00000105707 HPN TMPRSS1 hepsin protein-coding 375-7 chr19 55872339 55872648 + 1.66667 NA intron (NM_134444, intron 7 of 9) intron (NM_134444, intron 7 of 9) -35731 NM_145007 204801 Hs.375039 NM_145007 ENSG00000179873 NLRP11 CLR19.6|NALP11|NOD17|PAN10|PYPAF6|PYPAF7 NLR family pyrin domain containing 11 protein-coding 355 chr10 62325374 62325839 + 1.66667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -48551 NM_199450 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 338.667-10 chr14 63115997 63116413 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -70747 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 242-20 chr12 14796138 14796352 + 1.66667 NA intron (NM_016312, intron 5 of 11) L1ME2z|LINE|L1 7233 NM_016312 51729 Hs.655138 NM_016312 ENSG00000084463 WBP11 NPWBP|PPP1R165|SIPP1|WBP-11 WW domain binding protein 11 protein-coding 484.334-3 chr7 42008769 42009269 + 1.66667 NA intron (NM_000168, intron 10 of 14) L3|LINE|CR1 228190 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 245.667-50 chr4 71735608 71735793 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 48379 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 260.333-61 chr7 44235599 44235894 + 1.66667 NA intron (NM_172081, intron 12 of 18) intron (NM_172081, intron 12 of 18) 34768 NM_006555 10652 Hs.520794 NM_006555 ENSG00000106636 YKT6 - YKT6 v-SNARE homolog protein-coding 249.666-20 chr2 62546360 62546648 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -40309 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 297.666-5 chr14 52990217 52990502 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -39262 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 202.334-6 chr8 17222284 17222447 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001362988, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001362988, exon 14 of 14) 24093 NM_001322089 29883 Hs.587465 NM_013354 ENSG00000198791 CNOT7 CAF-1|CAF1|Caf1a|hCAF-1 CCR4-NOT transcription complex subunit 7 protein-coding 255.333 chr1 119644428 119644707 + 1.66667 NA intron (NM_001080470, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 3699 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 187.334 chr3 107480042 107480223 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -42830 NM_001142568 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 431.001 chr8 133000891 133001253 + 1.66667 NA intron (NM_003235, intron 35 of 47) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 45509 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 249-55 chr4 146939819 146940102 + 1.66667 NA intron (NR_133922, intron 2 of 13) intron (NR_133922, intron 2 of 13) 5904 NR_133922 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 294-43 chr3 67030657 67030924 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 32483 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 200.333-40 chr14 40542507 40542767 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -412074 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 255.667-51 chr21 30473666 30473829 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6620 NM_181607 337882 Hs.61552 NM_181607 ENSG00000184351 KRTAP19-1 KAP19.1 keratin associated protein 19-1 protein-coding 242.334-17 chr8 125606886 125607041 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 174754 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 313.333-11 chr13 94289669 94290024 + 1.66667 NA intron (NM_005708, intron 5 of 8) intron (NM_005708, intron 5 of 8) -101855 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 368.667-6 chr22 20944372 20944735 + 1.66667 NA intron (NR_156180, intron 2 of 3) AluSc|SINE|Alu -12539 NR_110537 101928891 Hs.648264 NR_110537 ENSG00000237476 LINC01637 - long intergenic non-protein coding RNA 1637 ncRNA 259.333-4 chr1 105699027 105699297 + 1.66667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -80227 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 311.333-7 chr10 60234365 60234725 + 1.66667 NA intron (NM_001204403, intron 9 of 43) intron (NM_001204403, intron 9 of 43) -93529 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 374-20 chr6 140994199 140994465 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 310518 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 237.334-6 chr5 65584524 65584691 + 1.66667 NA intron (NM_001278929, intron 7 of 9) FLAM_C|SINE|Alu 21311 NM_015342 23398 Hs.121432 NM_015342 ENSG00000113593 PPWD1 - peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1 protein-coding 242.667-105 chr8 53458066 53458211 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65827 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 210.667-89 chr3 98578366 98578531 + 1.66667 NA TTS (NM_000097) TTS (NM_000097) 15163 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 328.333 chr1 42578541 42578859 + 1.66667 NA intron (NM_001080850, intron 8 of 16) L1M5|LINE|L1 45680 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 264-9 chr10 45819084 45819249 + 1.66667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -1842 NM_001351234 643479 Hs.522900 NM_001351234 FAM25E FAM25D family with sequence similarity 25 member E protein-coding 153-38 chr13 37044048 37044230 + 1.66667 NA exon (NM_001278482, exon 7 of 25) exon (NM_001278482, exon 7 of 25) 15348 NM_001278482 55578 Hs.435815 NM_017569 ENSG00000102710 SUPT20H C13|C13orf19|FAM48A|FP757|P38IP|SPT20 SPT20 homolog, SAGA complex component protein-coding 244.334-13 chr21 28721565 28721737 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 163716 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 370.001 chr14 35110737 35111069 + 1.66667 NA intron (NR_110415, intron 4 of 4) intron (NR_110415, intron 4 of 4) 11639 NM_001305155 55012 Hs.530712 NM_017917 ENSG00000092020 PPP2R3C C14orf10|G4-1|G5pr|GDRM|SPGF36 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''gamma protein-coding 220-72 chr21 19550761 19550924 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 348913 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 403.334-3 chr14 59078250 59078599 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -110243 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 205-5 chr1 81454220 81454427 + 1.66667 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) intron (NM_001366008, intron 2 of 26) 103379 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 296.667-23 chr18 51223626 51224027 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26145 NM_016626 51320 Hs.465144 NM_016626 ENSG00000176624 MEX3C BM-013|MEX-3C|RKHD2|RNF194 mex-3 RNA binding family member C protein-coding 266.667-44 chr2 224481369 224481667 + 1.66667 NA intron (NM_001257197, intron 13 of 14) intron (NM_001257197, intron 13 of 14) -79411 NM_001122779 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 273.667-43 chr5 25127544 25127817 + 1.66667 NA intron (NR_147006, intron 4 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie 62976 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 291.334-12 chr5 144275747 144275935 + 1.66667 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 70450 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 254-77 chr8 131658859 131659011 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -245158 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 385-4 chr14 72013746 72014046 + 1.66667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 80369 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 162-72 chr2 179019299 179019406 + 1.66667 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) intron (NM_001316745, intron 2 of 11) 30785 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 431.333-11 chr8 127478721 127479109 + 1.66667 NA intron (NR_024393, intron 4 of 4) intron (NR_024393, intron 4 of 4) 3224 NR_024393 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 229.667-57 chr3 33773509 33773768 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24933 NM_001256192 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 268.334-6 chr14 83776435 83776755 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1133963 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 506.333 chr14 63224711 63225049 + 1.66667 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 20437 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 245.334-12 chr20 47631199 47631417 + 1.66667 NA intron (NM_181659, intron 8 of 22) intron (NM_181659, intron 8 of 22) 129421 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 334.667-25 chr5 129156908 129157267 + 1.66667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 59399 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 254.667-42 chr20 20761357 20761580 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48824 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 265-69 chr9 87282584 87282777 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 134036 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 334-11 chr16 57547243 57547560 + 1.66667 NA intron (NM_153837, intron 1 of 11) intron (NM_153837, intron 1 of 11) 4758 NM_153837 221188 Hs.187884 NM_153837 ENSG00000159618 ADGRG5 GPR114|PGR27 adhesion G protein-coupled receptor G5 protein-coding 266.334-12 chr14 57638776 57639015 + 1.66667 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) intron (NM_001352014, intron 1 of 9) -145038 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 255.334-27 chr5 126241061 126241279 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 44005 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 477.334 chr1 212031525 212032058 + 1.66667 NA intron (NM_015434, intron 1 of 19) intron (NM_015434, intron 1 of 19) -3762 NM_001286230 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 294-35 chr2 192583791 192583996 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -165952 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 419.333-14 chr6 68963449 68963938 + 1.66667 NA intron (NM_001704, intron 8 of 31) intron (NM_001704, intron 8 of 31) 328411 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 250.334-13 chr3 78031827 78032008 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 17046 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 463-6 chr5 40143581 40144084 + 1.66667 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 91541 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 344.667-5 chr17 39014285 39014618 + 1.66667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 12659 NR_135645 105371766 Hs.311469 NR_135645 ENSG00000266013 LINC02079 - long intergenic non-protein coding RNA 2079 ncRNA 292.667-15 chr17 63073353 63073675 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) intron (NM_025185, intron 2 of 25) 107279 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 290.333-19 chr18 4085000 4085311 + 1.66667 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 122802 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 418-10 chr5 146415723 146416250 + 1.66667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -31347 NM_001040006 10915 Hs.443465 NM_006706 ENSG00000113649 TCERG1 CA150|TAF2S|Urn1 transcription elongation regulator 1 protein-coding 379.334-2 chr14 59256105 59256478 + 1.66667 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) -7150 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 227-9 chr10 44002185 44002343 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 89862 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 496.001 chr14 59057056 59057363 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -131458 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 290.001 chr2 18034369 18034569 + 1.66667 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR 155802 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 247-26 chr15 77488121 77488320 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37375 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 251-87 chr9 11336527 11336805 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 723460 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 249-69 chr8 99039928 99040117 + 1.66667 NA intron (NM_017890, intron 3 of 61) intron (NM_017890, intron 3 of 61) 26756 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 462-14 chr2 236517679 236518026 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10317 NM_001270584 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 211.667-112 chr8 124352311 124352483 + 1.66667 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) intron (NM_194291, intron 1 of 6) 20302 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 158-93 chr4 53055631 53055789 + 1.66667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 193393 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 250.333-30 chr2 4858209 4858507 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -202136 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 333.666-3 chr11 37735244 37735555 + 1.66667 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie -203202 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 145-66 chr3 29988523 29988706 + 1.66667 NA intron (NM_001003792, intron 12 of 13) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -54458 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 512.001 chr18 14099609 14099929 + 1.66667 NA TTS (NM_145287) TTS (NM_145287) 32666 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 485.333-6 chr6 56520184 56520915 + 1.66667 NA intron (NM_001144770, intron 61 of 94) L1MD1|LINE|L1 122340 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 241-27 chr17 53390453 53390611 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 405027 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 266.334-5 chr1 73047120 73047389 + 1.66667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -258916 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 343.333-28 chr6 47364934 47365433 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -55278 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 184-71 chr3 185316066 185316256 + 1.66667 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) intron (NM_001242317, intron 2 of 12) 33200 NM_001242314 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 475.001 chr12 39129587 39129886 + 1.66667 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 -224145 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 252.334-5 chr14 68734502 68734730 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 59298 NM_001244698 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 371.334-3 chr6 124228915 124229307 + 1.66667 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -53894 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 177.667-119 chr6 89073448 89073618 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7218 NM_006813 10957 Hs.75969 NM_006813 ENSG00000146278 PNRC1 B4-2|PNAS-145|PROL2|PRR2 proline rich nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 367.334-3 chr2 209250726 209251058 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -173155 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 294-44 chr3 71261544 71261858 + 1.66667 NA intron (NR_146142, intron 5 of 19) intron (NR_146142, intron 5 of 19) -16624 NM_001244814 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 342.666-13 chr2 46706135 46706509 + 1.66667 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 7027 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 251.334-31 chr7 113696911 113697066 + 1.66667 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL 222021 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 316.667-9 chr12 99576321 99576553 + 1.66667 NA intron (NM_152788, intron 9 of 25) L1PA15|LINE|L1 -71316 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 413.667-2 chr14 43018945 43019318 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1412275 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 229-31 chr2 164153533 164153708 + 1.66667 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 414875 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 369-13 chr8 31543481 31543787 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -96118 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 219-49 chr2 206162214 206162435 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_002590) promoter-TSS (NR_002590) 96 NR_002590 619569 Hs.742407 NR_002590 ENSG00000207406 SNORA41 ACA41|SNORA41A small nucleolar RNA, H/ACA box 41 snoRNA 410.334-7 chr8 144777042 144777381 + 1.66667 NA intron (NM_001286770, intron 4 of 4) intron (NM_001286770, intron 4 of 4) 10134 NM_001286769 80778 Hs.631854 NM_030580 ENSG00000196378 ZNF34 KOX32 zinc finger protein 34 protein-coding 265-34 chr2 104363399 104363611 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 44827 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 266.334-18 chr5 39313776 39313981 + 1.66667 NA intron (NM_001737, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 -43229 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 309-28 chr4 107773349 107773672 + 1.66667 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL -51055 NM_001136258 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 197.333-124 chr2 186529696 186529854 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 43515 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 247-18 chr12 66262592 66262858 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 11643 NR_106757 102465249 NR_106757 ENSG00000284011 MIR6502 hsa-mir-6502 microRNA 6502 ncRNA 306-37 chr4 31771262 31771623 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -225937 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 279.666-2 chr1 198260752 198261031 + 1.66667 NA intron (NM_133494, intron 3 of 9) intron (NM_133494, intron 3 of 9) 103893 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 250.333-3 chr1 102819799 102820041 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 288576 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 251-79 chr7 62838907 62839067 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 465069 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 288-16 chr11 111152567 111152768 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -55349 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 253.667-36 chr2 191650223 191650419 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27751 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 319-15 chr2 85227785 85227993 + 1.66667 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) AluJr|SINE|Alu 14237 NR_136323 102724579 Hs.669216 NR_136323 LOC102724579 - uncharacterized LOC102724579 ncRNA 263-43 chr3 122400411 122400705 + 1.66667 NA intron (NM_014367, intron 1 of 4) AluSp|SINE|Alu 15504 NM_019069 54554 Hs.567513 NM_019069 ENSG00000196981 WDR5B - WD repeat domain 5B protein-coding 387.001 chr8 99959786 99960130 + 1.66667 NA TTS (NM_001286693) TTS (NM_001286693) -44624 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 652.668 chr5 83198203 83198744 + 1.66667 NA intron (NM_001318012, intron 4 of 7) intron (NM_001318012, intron 4 of 7) 120926 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 254-4 chr1 224815323 224815619 + 1.66667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -114183 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 267.334-11 chr20 49833686 49833942 + 1.66667 NA intron (NR_048539, intron 3 of 13) intron (NR_048539, intron 3 of 13) 20986 NR_048539 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 223.334-9 chr7 111459031 111459229 + 1.66667 NA intron (NM_001350961, intron 4 of 7) intron (NM_001350961, intron 4 of 7) 103161 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 256.333-5 chr1 75024307 75024589 + 1.66667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -103986 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 429.666-3 chr5 154431896 154432426 + 1.66667 NA intron (NR_037897, intron 2 of 2) intron (NR_037897, intron 2 of 2) 13661 NR_037897 386627 Hs.652021 NR_037897 SAP30L-AS1 GALNT10-AS1 SAP30L antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 387-16 chr6 144632137 144632491 + 1.66667 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) intron (NM_007124, intron 50 of 73) 226659 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 232.667-50 chr3 80434402 80434610 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -330391 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 352.334-2 chr11 43763103 43763521 + 1.66667 NA intron (NM_016142, intron 3 of 10) intron (NM_016142, intron 3 of 10) 82574 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 257.334-5 chr11 30880476 30880702 + 1.66667 NA intron (NM_001367979, intron 37 of 38) intron (NM_001367979, intron 37 of 38) 112097 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 271-6 chr1 173587739 173588052 + 1.66667 NA intron (NM_178527, intron 4 of 27) intron (NM_178527, intron 4 of 27) 15177 NM_178527 284525 Hs.494981 NM_178527 ENSG00000162753 SLC9C2 SLC9A11 solute carrier family 9 member C2 (putative) protein-coding 253.667-83 chr9 31856685 31856926 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -475315 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 280-38 chr3 162889333 162889600 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 413835 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 309.999-8 chr8 84440739 84441006 + 1.66667 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 25388 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 358.667-21 chr3 68859598 68859943 + 1.66667 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) intron (NM_001005527, intron 3 of 5) 72777 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 347.666-17 chr7 28178560 28178851 + 1.66667 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -1752 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 356.001-4 chr5 84020309 84020556 + 1.66667 NA intron (NM_001278642, intron 8 of 9) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -299577 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 471.001 chr10 16385696 16386050 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -51070 NM_001001484 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 162-76 chr20 51424883 51425088 + 1.66667 NA intron (NM_012340, intron 9 of 10) MER106A|DNA|hAT-Charlie 27992 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 192-114 chr5 91860004 91860176 + 1.66667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -476773 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 231.334-3 chr15 26522840 26523051 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 106145 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 171-56 chr3 174357334 174357453 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -436597 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 423.667-12 chr3 77449603 77449996 + 1.66667 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 351787 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 298-57 chr3 172195247 172195638 + 1.66667 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 154911 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 363.999-3 chr2 50672290 50672574 + 1.66667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 23830 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 283.333-68 chr6 142184815 142185177 + 1.66667 NA intron (NM_001286371, intron 4 of 6) intron (NM_001286371, intron 4 of 6) 37733 NM_016485 51534 Hs.431367 NM_016485 ENSG00000009844 VTA1 C6orf55|DRG-1|DRG1|HSPC228|LIP5|My012|SBP1 vesicle trafficking 1 protein-coding 265.667-22 chr14 68902568 68902796 + 1.66667 NA intron (NM_001102, intron 7 of 20) L1MC5a|LINE|L1 76620 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 217.666-22 chr22 26368420 26368693 + 1.66667 NA intron (NM_001184775, intron 13 of 15) L1MB5|LINE|L1 -60704 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 365.001-2 chr22 47418521 47418835 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 68433 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 302-6 chr1 161044976 161045177 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001276373) promoter-TSS (NM_001276373) -92 NM_001276373 7391 Hs.414880 NM_007122 ENSG00000158773 USF1 FCHL|FCHL1|HYPLIP1|MLTF|MLTFI|UEF|bHLHb11 upstream transcription factor 1 protein-coding 307.333-23 chr12 61102955 61103363 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 1089680 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 264.667-63 chr5 34865533 34865790 + 1.66667 NA intron (NM_001317949, intron 6 of 10) MIR|SINE|MIR 26280 NM_001317949 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 181-14 chr12 46154801 46155033 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 111599 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 411.667-7 chr20 8042614 8042998 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23045 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 311.667-18 chr4 71006632 71006926 + 1.66667 NA intron (NM_000788, intron 2 of 6) AluJo|SINE|Alu 13130 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 275.667-48 chr6 6508925 6509182 + 1.66667 NA intron (NR_026970, intron 3 of 7) MLT1-int|LTR|ERVL-MaLR -79667 NM_004271 9450 Hs.653138 NM_004271 ENSG00000112799 LY86 MD-1|MD1|MMD-1|dJ80N2.1 lymphocyte antigen 86 protein-coding 233.333-43 chr15 70149129 70149385 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -51340 NM_001282980 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 260.333-70 chr8 87478936 87479175 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 394960 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 210.667-15 chr10 18271291 18271485 + 1.66667 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) intron (NM_000724, intron 1 of 12) 10666 NM_000724 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 152.667-58 chr11 39038931 39039086 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 390150 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 189.334 chr1 89124421 89124597 + 1.66667 NA intron (NM_004120, intron 1 of 10) intron (NM_004120, intron 1 of 10) 1605 NM_004120 2634 Hs.386567 NM_004120 ENSG00000162645 GBP2 - guanylate binding protein 2 protein-coding 239.333-3 chr1 56130911 56131080 + 1.66667 NA Intergenic (ATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 185908 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 243.667-78 chr8 136832772 136832930 + 1.66667 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) L1MA9|LINE|L1 302053 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 411-13 chr8 18554022 18554423 + 1.66667 NA intron (NM_015310, intron 15 of 15) (GAGGTGCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 162940 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 282.667-10 chr17 62976283 62976456 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) intron (NM_025185, intron 1 of 25) 10134 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 251.667-81 chr6 38761407 38761655 + 1.66667 NA intron (NM_001371, intron 9 of 91) FLAM_C|SINE|Alu 46220 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 242-50 chr4 35727544 35727760 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 516287 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 185.334-3 chr22 30895260 30895393 + 1.66667 NA intron (NM_001282741, intron 11 of 12) L1MEh|LINE|L1 13645 NM_001282742 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 422.667 chr1 29374497 29374974 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -24621 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 246.667-105 chr8 137674660 137674875 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -261179 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 293.333-64 chr8 124775996 124776284 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -45845 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 247.334-11 chr2 22096378 22096586 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -385830 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 183-45 chr15 101805091 101805306 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001005326) promoter-TSS (NM_001005326) -522 NM_001005326 390648 Hs.553399 NM_001005326 ENSG00000184140 OR4F6 OR15-15|OR4F12 olfactory receptor family 4 subfamily F member 6 protein-coding 250.667-71 chr7 13600271 13600463 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 386147 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 265.667-39 chr2 225696601 225696817 + 1.66667 NA intron (NM_001371273, intron 7 of 7) intron (NM_001371273, intron 7 of 7) 295823 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 729.667 chr5 35422548 35423034 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -192304 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 445.999-2 chr9 96236705 96237116 + 1.66667 NA intron (NM_000197, intron 10 of 10) intron (NM_000197, intron 10 of 10) -9553 NR_146524 105376162 Hs.662614 NR_146524 ENSG00000232283 HSD17B3-AS1 - HSD17B3 antisense RNA 1 ncRNA 250.667-46 chr21 26051090 26051260 + 1.66667 NA exon (NM_001204302, exon 5 of 16) exon (NM_001204302, exon 5 of 16) 89215 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 265-31 chr2 54141741 54141992 + 1.66667 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) AluJr|SINE|Alu 18583 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 224-39 chr18 60051472 60051712 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 151596 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 410.334 chr11 106950452 106950819 + 1.66667 NA intron (NM_001256424, intron 3 of 8) intron (NM_001256424, intron 3 of 8) 67841 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 311.667-12 chr20 18537937 18538307 + 1.66667 NA intron (NM_032986, intron 12 of 19) AluSx1|SINE|Alu -29298 NM_001348957 388789 Hs.349092 NM_001348957 ENSG00000232388 SMIM26 LINC00493 small integral membrane protein 26 protein-coding 403-10 chr8 110368886 110369150 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -393247 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 236.334-6 chr5 136518229 136518411 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -152844 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 395.001-3 chr5 151153871 151154163 + 1.66667 NA intron (NM_001363114, intron 1 of 24) intron (NM_001363114, intron 1 of 24) 3762 NM_001155 309 Hs.412117 NM_001155 ENSG00000197043 ANXA6 ANX6|CBP68|CPB-II|p68|p70 annexin A6 protein-coding 288-48 chr6 119583036 119583430 + 1.66667 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) L1MD|LINE|L1 33425 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 282.667-4 chr11 6703337 6703571 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18425 NR_003945 387751 Hs.494757 NR_003945 ENSG00000254838 GVINP1 GVIN1|GVIN1P|VLIG-1|VLIG1 GTPase, very large interferon inducible pseudogene 1 pseudo 478-4 chr8 79118456 79118838 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -213541 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 251.334-25 chr6 69875453 69875621 + 1.66667 NA intron (NM_001858, intron 1 of 50) L2b|LINE|L2 8981 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 235.333-30 chr12 86184180 86184428 + 1.66667 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) AluSx1|SINE|Alu 72087 NM_001351289 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 247.333-70 chr6 68026296 68026548 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -28929 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 409.667-4 chr20 52370254 52370704 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -178494 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 354.667-5 chr10 70202203 70202606 + 1.66667 NA TTS (NM_021129) TTS (NM_021129) 31025 NM_021129 5464 Hs.437403 NM_021129 ENSG00000180817 PPA1 HEL-S-66p|IOPPP|PP|PP1|SID6-8061 pyrophosphatase (inorganic) 1 protein-coding 285.333-34 chr2 142699995 142700313 + 1.66667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -177510 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 251.667-37 chr2 36985867 36986116 + 1.66667 NA intron (NM_019024, intron 35 of 35) intron (NM_019024, intron 35 of 35) -19455 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 420.666-8 chr7 58119276 58119652 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 669287 NM_001159279 441234 Hs.533121 NM_001159279 ENSG00000182111 ZNF716 - zinc finger protein 716 protein-coding 437.667-5 chr3 192121047 192121457 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -117378 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 250.334-5 chr14 46535944 46536105 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 64665 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 263.667-59 chr3 59403869 59404087 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 254519 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 169-101 chr8 120287697 120287823 + 1.66667 NA intron (NM_021110, intron 33 of 47) intron (NM_021110, intron 33 of 47) 157390 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 166.334 chr1 161963120 161963277 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_007348, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_007348, exon 16 of 16) 61267 NM_015441 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 321.334-2 chr1 62817004 62817358 + 1.66667 NA intron (NM_178221, intron 4 of 10) intron (NM_178221, intron 4 of 10) 33049 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 299-35 chr6 148130719 148131067 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -141435 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 259.333-73 chr4 91506998 91507273 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1MB7|LINE|L1 770167 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 200.334-3 chr5 18273806 18273956 + 1.66667 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie 466607 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 345-3 chr17 31349834 31350314 + 1.66667 NA intron (NM_001042492, intron 49 of 57) intron (NM_001042492, intron 49 of 57) -28452 NM_014210 2123 Hs.591198 NM_014210 ENSG00000126860 EVI2A EVDA|EVI-2A|EVI2 ecotropic viral integration site 2A protein-coding 366.333-22 chr7 111787413 111787716 + 1.66667 NA intron (NM_001363540, intron 32 of 52) intron (NM_001363540, intron 32 of 52) -20941 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 258-29 chr19 15758542 15758735 + 1.66667 NA TTS (NR_033864) TTS (NR_033864) 17245 NM_013938 26532 Hs.553524 NM_013938 ENSG00000171936 OR10H3 - olfactory receptor family 10 subfamily H member 3 protein-coding 294.667-54 chr8 74546377 74546652 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2029 NR_049860 100847058 NR_049860 ENSG00000266502 MIR5681A - microRNA 5681a ncRNA 249.667-36 chr17 62054406 62054644 + 1.66667 NA intron (NM_005121, intron 2 of 29) intron (NM_005121, intron 2 of 29) 10753 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 491.667-3 chr4 103705536 103706105 + 1.66667 NA intron (NM_001059, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 14165 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 250-54 chr4 20586521 20586776 + 1.66667 NA intron (NM_001289135, intron 28 of 35) MIR|SINE|MIR 58373 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 232-12 chr10 72043465 72043727 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 44955 NM_001244950 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 309-7 chr10 28958362 28958660 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 112103 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 251-3 chr1 78048846 78049110 + 1.66667 NA intron (NM_017655, intron 1 of 5) intron (NM_017655, intron 1 of 5) 3012 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 272.667-30 chr2 50670221 50670452 + 1.66667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 25926 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 328.667-5 chr12 93138682 93138879 + 1.66667 NA intron (NR_040096, intron 3 of 4) intron (NR_040096, intron 3 of 4) -35586 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 286-9 chr12 44400801 44400996 + 1.66667 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 474763 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 254.334-10 chr14 54368164 54368408 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -28582 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 276-16 chr13 95117639 95117953 + 1.66667 NA intron (NM_001105515, intron 19 of 20) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -92548 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 329.667-16 chr6 54548192 54548509 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 239909 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 281.333-66 chr8 57558602 57558919 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -187389 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 275.667-39 chr3 60810968 60811237 + 1.66667 NA intron (NR_148921, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR -193232 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 297.333-18 chr13 67762253 67762534 + 1.66667 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 390006 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 276.334-11 chr2 9983343 9983591 + 1.66667 NA intron (NM_198182, intron 8 of 15) intron (NM_198182, intron 8 of 15) 31774 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 317.667-9 chr12 43267903 43268192 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 112732 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 180-16 chr11 63398960 63399188 + 1.66667 NA intron (NM_080866, intron 6 of 9) L1M1|LINE|L1 29289 NM_080866 114571 Hs.502772 NM_080866 ENSG00000149742 SLC22A9 HOAT4|OAT4|OAT7|UST3H|ust3 solute carrier family 22 member 9 protein-coding 276.334-3 chr10 97415248 97415455 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 10706 NR_157582 644215 NR_157582 LOC644215 - uncharacterized LOC644215 ncRNA 219.333-15 chr1 214337985 214338213 + 1.66667 NA TTS (NM_020197) TTS (NM_020197) 56940 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 250-51 chr3 117482554 117482776 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 208260 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 433.667-7 chr21 14795217 14795701 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 123209 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 247-54 chr3 106985107 106985370 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 255400 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 256.667-4 chr1 150948978 150949213 + 1.66667 NA intron (NM_001366417, intron 10 of 21) intron (NM_001366417, intron 10 of 21) 22732 NM_001366418 9869 Hs.643565 NM_012432 ENSG00000143379 SETDB1 ESET|H3-K9-HMTase4|KG1T|KMT1E|TDRD21 SET domain bifurcated histone lysine methyltransferase 1 protein-coding 264.333-30 chr17 53793800 53794089 + 1.66667 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -28983 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 262-70 chr7 7809316 7809747 + 1.66667 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) L1MA7|LINE|L1 -90924 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 242.667-71 chr3 195155387 195155742 + 1.66667 NA intron (NM_152531, intron 3 of 3) intron (NM_152531, intron 3 of 3) 7693 NR_102711 101410543 Hs.658170 NR_102710 ENSG00000230266 XXYLT1-AS2 - XXYLT1 antisense RNA 2 ncRNA 313-16 chr17 60931085 60931391 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 13 of 25) intron (NM_001330413, intron 13 of 25) 253387 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 248-40 chr2 150951959 150952248 + 1.66667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 309760 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 293.333-48 chr5 15064429 15064738 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -192805 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 270.666-28 chr9 87061742 87062049 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -19769 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 238-2 chr1 75275455 75275703 + 1.66667 NA intron (NM_001320283, intron 3 of 21) intron (NM_001320283, intron 3 of 21) 141191 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 158.667-158 chr2 79359163 79359330 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 141598 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 204-148 chr4 43664261 43664441 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -171808 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 255-27 chr12 63090208 63090537 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 62438 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 270.667-17 chr15 79775034 79775222 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 121869 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 298-40 chr2 9795458 9795724 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -47851 NM_001318976 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 267-4 chr1 173610295 173610573 + 1.66667 NA intron (NM_198493, intron 5 of 5) intron (NM_198493, intron 5 of 5) -7362 NM_178527 284525 Hs.494981 NM_178527 ENSG00000162753 SLC9C2 SLC9A11 solute carrier family 9 member C2 (putative) protein-coding 340.667-12 chr2 172207602 172207951 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 104770 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 293-29 chr3 27145164 27145435 + 1.66667 NA intron (NM_001304384, intron 10 of 16) intron (NM_001304384, intron 10 of 16) 71224 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 277.667-15 chr14 66601288 66601465 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 93969 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 276.667-65 chr8 72950211 72950533 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -58492 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 238.667-14 chr10 103954452 103954623 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -12603 NM_014720 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 322.333-16 chr21 26866072 26866416 + 1.66667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -20835 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 227.333-106 chr5 120753764 120753931 + 1.66667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 222383 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 421.667-2 chr11 67424983 67425387 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001166222, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001166222, exon 10 of 10) -3309 NM_003952 6199 Hs.534345 NM_003952 ENSG00000175634 RPS6KB2 KLS|P70-beta|P70-beta-1|P70-beta-2|S6K-beta2|S6K2|S6KB|S6KI(2)|S6Kbeta|SRK|STK14B|p70(S6K)-beta|p70S6Kb ribosomal protein S6 kinase B2 protein-coding 235.334-2 chr10 52156082 52156277 + 1.66667 NA intron (NM_001098512, intron 8 of 17) intron (NM_001098512, intron 8 of 17) 157949 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 251.334 chr1 11594782 11595040 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14620 NR_104624 101929181 Hs.568616 NR_104624 ENSG00000235643 LINC01647 - long intergenic non-protein coding RNA 1647 ncRNA 251-9 chr10 89800579 89800815 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28796 NR_038382 643529 Hs.618956 NR_038382 ENSG00000232229 LINC00865 - long intergenic non-protein coding RNA 865 ncRNA 260.667-7 chr1 163523751 163523912 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -100640 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 253.333-52 chr2 68502956 68503255 + 1.66667 NA intron (NM_173545, intron 3 of 9) intron (NM_173545, intron 3 of 9) 35520 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 256-36 chr18 30646534 30646812 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 347763 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 234.334-6 chr2 21109078 21109284 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -14805 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 254.667-86 chr9 79902768 79902935 + 1.66667 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) intron (NR_121213, intron 1 of 2) -72172 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 434.333-2 chr11 80297816 80298246 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 464772 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 429.334-2 chr16 8461689 8462120 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 127934 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 281-42 chr8 86946579 86946917 + 1.66667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 80333 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 465.666 chr11 31447981 31448815 + 1.66667 NA intron (NM_001304274, intron 4 of 5) intron (NM_001304274, intron 4 of 5) 61224 NM_001304274 196294 Hs.502223 NM_144981 ENSG00000148950 IMMP1L IMMP1|IMP1|IMP1-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 1 protein-coding 196.334-2 chr11 110830213 110830373 + 1.66667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -117104 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 361-4 chr11 62430102 62430451 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 11243 NM_003357 7356 Hs.523732 NM_003357 ENSG00000149021 SCGB1A1 CC10|CC16|CCPBP|CCSP|UGB|UP-1|UP1 secretoglobin family 1A member 1 protein-coding 273-42 chr8 131154886 131155126 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -114097 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 197.334-3 chr4 112117488 112117627 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -27897 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 413.666-3 chr8 85071920 85072285 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35136 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 285-17 chr2 76156018 76156230 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -445209 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 205.334-2 chr13 38220120 38220306 + 1.66667 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -76981 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 266.333-57 chr6 62520471 62520737 + 1.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -234377 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 230.667-30 chr18 6754532 6754726 + 1.66667 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) X6B_LINE|LINE|CR1 -24767 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 264.666-14 chr18 62563075 62563399 + 1.66667 NA intron (NR_126534, intron 9 of 14) intron (NR_126534, intron 9 of 14) 40212 NR_126534 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 254.666-31 chr8 99020020 99020296 + 1.66667 NA intron (NR_047582, intron 2 of 8) L1MB3|LINE|L1 6892 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 337-15 chr2 45226221 45226589 + 1.66667 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 28536 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 515-2 chr14 72582304 72582798 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 65731 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 247.667-87 chr6 161221657 161221847 + 1.66667 NA intron (NM_020133, intron 2 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 52309 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 301.334-7 chr2 114951379 114951588 + 1.66667 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -113090 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 251.334-7 chr10 21084996 21085245 + 1.66667 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) intron (NM_001173484, intron 2 of 6) -88870 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 235-49 chr6 140203981 140204257 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1133 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 256.666-22 chr21 18559523 18559834 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 126486 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 320-17 chr14 88390988 88391240 + 1.66667 NA intron (NM_001040428, intron 1 of 10) intron (NM_001040428, intron 1 of 10) 5457 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 248.334-6 chr11 77850228 77850402 + 1.66667 NA intron (NM_001316962, intron 3 of 4) intron (NM_001316962, intron 3 of 4) 9177 NM_001363564 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 448 chr10 82305600 82306036 + 1.66667 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) L1M5|LINE|L1 -72898 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 348.001-4 chr3 195340119 195340362 + 1.66667 NA intron (NM_012287, intron 6 of 22) intron (NM_012287, intron 6 of 22) -69081 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 146.334-2 chr8 95668172 95668305 + 1.66667 NA intron (NR_038205, intron 2 of 2) intron (NR_038205, intron 2 of 2) 280110 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 267.666-10 chr2 103635950 103636192 + 1.66667 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -651642 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 418.333-10 chr4 35451296 35451675 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 792454 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 247-68 chr7 31733008 31733174 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 45876 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 366.334-7 chr9 34799213 34799738 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 39111 NR_024481 389715 Hs.713965 NM_001126494 FAM205BP C9orf144|C9orf144A|FAM205B transmembrane protein C9orf144B pseudogene pseudo 246-3 chr1 102633403 102633685 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 474952 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 223-59 chr6 155682442 155682702 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 167728 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 410.333 chr1 241338206 241338491 + 1.66667 NA intron (NM_001350116, intron 1 of 16) intron (NM_001350116, intron 1 of 16) 17478 NM_001350116 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 335.334-4 chr20 54263151 54263425 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 55201 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 225-37 chr2 136893893 136894068 + 1.66667 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) intron (NM_001316349, intron 2 of 27) 128435 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 234.334-14 chr5 129417198 129417411 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -20157 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 313.334-9 chr9 132105868 132106112 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26123 NM_001253881 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 166-43 chr14 88133049 88133195 + 1.66667 NA Intergenic LTR31|LTR|ERV1 -106810 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 260.666-9 chr14 70517420 70517715 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 17437 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 312-48 chr6 51972435 51972798 + 1.66667 NA intron (NM_138694, intron 35 of 66) MIR|SINE|MIR 114997 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 350-17 chr20 38740440 38740664 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -7908 NM_024855 79913 Hs.371585 NM_024855 ENSG00000101442 ACTR5 Arp5|INO80M actin related protein 5 protein-coding 384-11 chr2 178311664 178311921 + 1.66667 NA intron (NM_001201480, intron 3 of 25) L2|LINE|L2 -8450 NM_145739 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 261.667-18 chr14 60787044 60787288 + 1.66667 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 52405 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 366.667-19 chr7 36869519 36869876 + 1.66667 NA intron (NM_001206480, intron 20 of 21) intron (NM_001206480, intron 20 of 21) 49735 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 313.334 chr10 72518398 72518627 + 1.66667 NA intron (NM_006077, intron 5 of 11) intron (NM_006077, intron 5 of 11) 5474 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 295.334-7 chr8 25695850 25696283 + 1.66667 NA Intergenic LTR81AB|LTR|Gypsy 236833 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 248.667-80 chr4 22473914 22474081 + 1.66667 NA intron (NM_145290, intron 1 of 18) intron (NM_145290, intron 1 of 18) -41315 NR_162129 113219450 NR_162129 MIR12115 - microRNA 12115 ncRNA 269.333-88 chr8 80059103 80059310 + 1.66667 NA intron (NR_105034, intron 1 of 4) L1MB5|LINE|L1 21624 NM_001025252 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 208-40 chr13 26235536 26235706 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13250 NM_183045 6049 Hs.136885 NM_005977 ENSG00000127870 RNF6 - ring finger protein 6 protein-coding 437.667-3 chr16 11688438 11688748 + 1.66667 NA intron (NR_136673, intron 6 of 9) intron (NR_136673, intron 6 of 9) 20138 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 265-51 chr4 58176871 58177094 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 359346 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 192.334-3 chr2 84654359 84654537 + 1.66667 NA intron (NM_001370, intron 34 of 76) intron (NM_001370, intron 34 of 76) 137993 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 240-95 chr8 145009339 145009513 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -6527 NR_023392 286101 Hs.367856 NR_023392 ZNF252P ZNF252 zinc finger protein 252, pseudogene pseudo 262-89 chr9 30424910 30425083 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -16542 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 168-121 chr9 71465086 71465261 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -18202 NM_001366144 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 294-4 chr1 119795861 119796261 + 1.66667 NA intron (NM_032044, intron 5 of 5) intron (NM_032044, intron 5 of 5) 15399 NM_001159353 83998 Hs.660883 NM_032044 ENSG00000134193 REG4 GISP|REG-IV|RELP regenerating family member 4 protein-coding 352.667-4 chr10 26022712 26022938 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001368265, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001368265, exon 8 of 8) 88596 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 274-46 chr5 22947174 22947442 + 1.66667 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -93964 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 241.667-64 chr4 104159958 104160188 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -330892 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 182.334-6 chr6 51043100 51043267 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 224312 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 315.334-4 chr2 208002491 208002863 + 1.66667 NA intron (NM_001080475, intron 1 of 7) intron (NM_001080475, intron 1 of 7) 22850 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 286.667-11 chr13 72960053 72960382 + 1.66667 NA intron (NR_146206, intron 14 of 16) intron (NR_146206, intron 14 of 16) -94759 NM_001286818 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 302.667-20 chr3 32619753 32620088 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -48996 NM_001329135 51143 Hs.529495 NM_016141 ENSG00000144635 DYNC1LI1 DLC-A|DNCLI1|LIC1 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 protein-coding 246.667-91 chr8 25102171 25102365 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -82421 NM_001322810 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 444.667-7 chr8 130458642 130459238 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15266 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 142-14 chr10 17880047 17880209 + 1.66667 NA intron (NM_002438, intron 19 of 29) MIR|SINE|MIR 35021 NR_030167 574445 NR_030167 ENSG00000207938 MIR511 MIR511-1|MIR511-2|MIRN511-1|MIRN511-2|hsa-mir-511|hsa-mir-511-2|mir-511 microRNA 511 ncRNA 270.334-8 chr15 82954712 82954890 + 1.66667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -2081 NM_199330 9455 Hs.578443 NM_004839 ENSG00000103942 HOMER2 ACPD|CPD|DFNA68|HOMER-2|VESL-2 homer scaffold protein 2 protein-coding 201.666-46 chr8 134604636 134604913 + 1.66667 NA intron (NM_020863, intron 5 of 15) intron (NM_020863, intron 5 of 15) 6703 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 262.334-4 chr14 83027707 83027975 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 385209 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 183-57 chr2 73763934 73764090 + 1.66667 NA intron (NM_003584, intron 8 of 8) L1M5|LINE|L1 16145 NM_003584 8446 Hs.14611 NM_003584 ENSG00000144048 DUSP11 PIR1 dual specificity phosphatase 11 protein-coding 199.333-84 chr15 26548091 26548300 + 1.66667 NA intron (NM_001191320, intron 6 of 6) intron (NM_001191320, intron 6 of 6) 80895 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 248-93 chr8 137367139 137367391 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46323 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 490-3 chr22 24393277 24393729 + 1.66667 NA intron (NM_001254732, intron 13 of 14) intron (NM_001254732, intron 13 of 14) -30094 NM_001278500 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 296-32 chr2 137230253 137230553 + 1.66667 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 464858 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 217.666-9 chr12 34429661 34429923 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 407296 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 316-11 chr12 25904570 25904817 + 1.66667 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -30614 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 311.334-6 chr5 120154076 120154397 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -310042 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 362.333-4 chr15 70655626 70655974 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001008224, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001008224, exon 19 of 19) 20551 NR_126482 104548973 NR_126482 ENSG00000280515 SALRNA2 SAL-RNA2|XLOC_025931 senescence associated long non-coding RNA 2 ncRNA 317.667-38 chr7 77931941 77932285 + 1.66667 NA intron (NM_001366082, intron 10 of 11) AluSx1|SINE|Alu 91983 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 273.334-16 chr7 115697080 115697319 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -115758 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 298.667 chr1 35470760 35471023 + 1.66667 NA exon (NM_024874, exon 6 of 21) exon (NM_024874, exon 6 of 21) 86512 NM_024874 79932 Hs.456507 NM_024874 ENSG00000142687 KIAA0319L AAVR|AAVRL KIAA0319 like protein-coding 248.667-90 chr6 72654897 72655046 + 1.66667 NA intron (NR_120503, intron 2 of 3) intron (NR_120503, intron 2 of 3) 24476 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 240.667-81 chr8 84357613 84357760 + 1.66667 NA intron (NM_001354319, intron 2 of 8) intron (NM_001354319, intron 2 of 8) -57798 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 228-17 chr11 87054313 87054480 + 1.66667 NA intron (NR_033149, intron 1 of 13) AluSx|SINE|Alu 16462 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 268-34 chr22 31227921 31228120 + 1.66667 NA intron (NM_005569, intron 2 of 15) intron (NM_005569, intron 2 of 15) 15722 NM_005569 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 222-28 chr14 63877646 63877788 + 1.66667 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) intron (NM_015180, intron 1 of 114) 24713 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 428.666-7 chr3 188612636 188612973 + 1.66667 NA intron (NM_005578, intron 6 of 10) intron (NM_005578, intron 6 of 10) -44138 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 332-35 chr8 131678650 131678978 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -225279 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 551 chr2 38836910 38837585 + 1.66667 NA intron (NM_001329963, intron 13 of 23) MIRb|SINE|MIR 38687 NM_198963 90957 Hs.468226 NM_198963 ENSG00000163214 DHX57 DDX57 DExH-box helicase 57 protein-coding 264.334-23 chr8 136471975 136472155 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -58733 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 366-3 chr11 30757957 30758232 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -171741 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 195.667-90 chr3 88455956 88456084 + 1.66667 NA intron (NM_001368168, intron 2 of 2) L1MA9|LINE|L1 117564 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 161.334 chr1 89534029 89534192 + 1.66667 NA intron (NM_001369819, intron 2 of 6) intron (NM_001369819, intron 2 of 6) 9272 NM_015350 23507 Hs.482017 NM_015350 ENSG00000197147 LRRC8B TA-LRRP|TALRRP leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B protein-coding 302-26 chr18 73585500 73585736 + 1.66667 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 260677 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 257.667-60 chr4 35249461 35249620 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -979793 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 331-8 chr11 30232946 30233278 + 1.66667 NA intron (NM_000510, intron 2 of 2) intron (NM_000510, intron 2 of 2) 2098 NM_000510 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 331.334-8 chr4 91486670 91486889 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger 790523 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 336-28 chr6 57147040 57147416 + 1.66667 NA exon (NM_001031623, exon 10 of 15) exon (NM_001031623, exon 10 of 15) 24985 NR_110742 101927211 Hs.705718 NR_110742 ZNF451-AS1 - ZNF451 regulatory antisense RNA 1 ncRNA 199-23 chr13 72908395 72908547 + 1.66667 NA intron (NR_146206, intron 11 of 16) intron (NR_146206, intron 11 of 16) 126338 NR_146206 10464 Hs.441926 NM_006346 ENSG00000083535 PIBF1 C13orf24|CEP90|JBTS33|PIBF progesterone immunomodulatory binding factor 1 protein-coding 237-67 chr7 11659506 11659722 + 1.66667 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L2a|LINE|L2 172584 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 523.667 chr19 30742433 30743024 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 370344 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 545.333-2 chr6 86562354 86562715 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -374994 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 300.333-10 chr12 43075804 43076159 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -79334 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 382.667-12 chr4 122064116 122064439 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -106326 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 320.333-23 chr5 40310992 40311393 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 258901 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 203-46 chr18 13070898 13071047 + 1.66667 NA intron (NM_032142, intron 27 of 44) intron (NM_032142, intron 27 of 44) 79610 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 275-43 chr5 82362177 82362497 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 82875 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 239-40 chr20 6757999 6758209 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9582 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 296.333-21 chr2 135990724 135991083 + 1.66667 NA intron (NR_110199, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu -5219 NM_001293312 1615 Hs.503787 NM_001349 ENSG00000115866 DARS HBSL|aspRS aspartyl-tRNA synthetase protein-coding 276.667-70 chr9 8511271 8511452 + 1.66667 NA intron (NM_130392, intron 10 of 30) AluJb|SINE|Alu 222585 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 259.667-93 chrX 111674750 111674933 + 1.66667 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 -6277 NR_033125 79868 Hs.443061 NM_018466 ENSG00000101901 ALG13 CDG1S|CXorf45|EIEE36|GLT28D1|MDS031|TDRD13|YGL047W ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit protein-coding 233.333-110 chr5 125035260 125035501 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1451 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 253-24 chr14 82144755 82145007 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -401743 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 274.667-35 chr3 62735587 62735814 + 1.66667 NA intron (NM_003716, intron 3 of 29) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 139716 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 609.666 chr2 63630543 63630959 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 41600 NM_001199112 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 224.667-77 chr7 113094093 113094251 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6394 NM_018970 54329 Hs.152009 NM_018970 ENSG00000164604 GPR85 SREB|SREB2 G protein-coupled receptor 85 protein-coding 241-13 chr11 111818872 111819036 + 1.66667 NA intron (NR_147984, intron 13 of 15) intron (NR_147984, intron 13 of 15) 52327 NM_001352415 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 301.334-2 chr1 183201355 183201572 + 1.66667 NA intron (NM_005562, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 15199 NM_005562 3918 Hs.591484 NM_005562 ENSG00000058085 LAMC2 B2T|BM600|CSF|EBR2|EBR2A|LAMB2T|LAMNB2 laminin subunit gamma 2 protein-coding 184.334 chr1 60815139 60815323 + 1.66667 NA intron (NR_110628, intron 1 of 5) intron (NR_110628, intron 1 of 5) 10353 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 174.334-2 chr2 183505777 183505919 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 381405 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 310.333-31 chr4 95585315 95585564 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36466 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 260.333-55 chr6 73302413 73302614 + 1.66667 NA intron (NR_027005, intron 2 of 4) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 7646 NM_001251874 80759 Hs.433062 NM_030568 ENSG00000135314 KHDC1 C6orf147|C6orf148|Em:AC019205.8|KHDC1L|NDG1|bA257K9.4 KH domain containing 1 protein-coding 337.999 chr10 93236041 93236398 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 162326 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 250.666-44 chr9 80887270 80887508 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 802146 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 250.667-26 chr15 63836785 63836989 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2939 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 420-4 chr10 65065032 65065353 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -140674 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 245-79 chr9 123891350 123891629 + 1.66667 NA intron (NM_001352968, intron 1 of 18) intron (NM_001352968, intron 1 of 18) 38637 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 272-23 chr2 58204384 58204595 + 1.66667 NA intron (NR_156742, intron 1 of 9) intron (NR_156742, intron 1 of 9) 36891 NM_018062 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 199-72 chr3 170286917 170287085 + 1.66667 NA intron (NM_002740, intron 12 of 17) intron (NM_002740, intron 12 of 17) 64577 NM_002740 5584 Hs.478199 NM_002740 ENSG00000163558 PRKCI DXS1179E|PKCI|nPKC-iota protein kinase C iota protein-coding 271-11 chr12 28437339 28437624 + 1.66667 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) Tigger8|DNA|TcMar-Tigger -246743 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 252.667-104 chr8 133946217 133946458 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 59841 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 378.666-6 chr8 122212910 122213292 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 355543 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 260.667-76 chr5 92796794 92796988 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 774452 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 241.333-97 chr7 93477625 93477824 + 1.66667 NA intron (NM_001164738, intron 3 of 12) intron (NM_001164738, intron 3 of 12) 5131 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 310.667-5 chr10 122324593 122324919 + 1.66667 NA intron (NM_001318189, intron 10 of 15) intron (NM_001318189, intron 10 of 15) -49952 NM_001001974 59338 Hs.643512 NM_021622 ENSG00000107679 PLEKHA1 TAPP1 pleckstrin homology domain containing A1 protein-coding 226.333-73 chr22 37194423 37194717 + 1.66667 NA intron (NM_001365878, intron 2 of 4) MER41-int|LTR|ERV1 4853 NM_001365878 114904 Hs.22011 NM_031910 ENSG00000133466 C1QTNF6 CTFP6|CTRP6|ZACRP6 C1q and TNF related 6 protein-coding 225-41 chr21 30360382 30360668 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 11746 NM_181621 337959 Hs.58152 NM_181621 ENSG00000182816 KRTAP13-2 KAP13-2 keratin associated protein 13-2 protein-coding 484.332 chr2 32837335 32837747 + 1.66667 NA intron (NR_027099, intron 3 of 10) intron (NR_027099, intron 3 of 10) 12108 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 267.334-18 chr6 108620812 108620984 + 1.66667 NA intron (NM_201559, intron 2 of 3) intron (NM_201559, intron 2 of 3) 59981 NM_001455 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 330-25 chr3 185631804 185632170 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_021627, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_021627, exon 17 of 17) 45692 NM_021627 59343 Hs.401388 NM_021627 ENSG00000163904 SENP2 AXAM2|SMT3IP2 SUMO specific peptidase 2 protein-coding 230.333-125 chr9 36094833 36095053 + 1.66667 NA intron (NM_021111, intron 10 of 20) L1MA8|LINE|L1 -41593 NR_104637 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 213.667-25 chr11 115022806 115022997 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -310676 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 347.667-3 chr11 41125610 41125871 + 1.66667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 333896 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 411.667-2 chr10 54549219 54549626 + 1.66667 NA intron (NM_001142771, intron 2 of 34) L1ME3D|LINE|L1 58535 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 234.667-51 chr2 60005694 60005908 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 377235 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 319.667-10 chr17 67203231 67203474 + 1.66667 NA exon (NM_014877, exon 6 of 33) exon (NM_014877, exon 6 of 33) -41424 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 225.667-66 chr6 16026845 16026999 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -102164 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 227.667-73 chr7 70429810 70429969 + 1.66667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) -702255 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 252.333-75 chr8 114840754 114841022 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 827125 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 260-87 chr8 131569763 131570023 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -334200 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 288.667-3 chr10 42491213 42491514 + 1.66667 NA intron (NR_026827, intron 3 of 4) HERVK9-int|LTR|ERVK 15872 NR_026827 84856 Hs.55977 NM_032770 ENSG00000185904 LINC00839 - long intergenic non-protein coding RNA 839 ncRNA 253.333-70 chr3 57910387 57910661 + 1.66667 NA intron (NM_001304420, intron 17 of 21) intron (NM_001304420, intron 17 of 21) 20522 NM_001304422 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 244-60 chr2 230193237 230193465 + 1.66667 NA intron (NM_080424, intron 10 of 18) L1PB3|LINE|L1 26633 NM_004510 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 245.333-16 chr10 110580067 110580284 + 1.66667 NA intron (NM_005445, intron 7 of 28) MER2|DNA|TcMar-Tigger 12484 NM_005445 9126 Hs.24485 NM_005445 ENSG00000108055 SMC3 BAM|BMH|CDLS3|CSPG6|HCAP|SMC3L1 structural maintenance of chromosomes 3 protein-coding 247-30 chr16 73810671 73810865 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 404753 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 250.667-27 chr15 64695637 64695873 + 1.66667 NA intron (NM_002537, intron 1 of 4) intron (NM_002537, intron 1 of 4) 7526 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 270-55 chr6 119353223 119353461 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3581 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 243.333-94 chr5 176911603 176911930 + 1.66667 NA intron (NM_016290, intron 10 of 14) intron (NM_016290, intron 10 of 14) -12420 NM_002115 3101 Hs.411695 NM_002115 ENSG00000160883 HK3 HKIII|HXK3 hexokinase 3 protein-coding 232-54 chr2 220132474 220132676 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -226010 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 200.333-67 chr2 57280540 57280775 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -626994 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 373.667-12 chr5 38961330 38961678 + 1.66667 NA intron (NM_001285439, intron 19 of 38) intron (NM_001285439, intron 19 of 38) 112895 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 250.667-50 chr3 120816229 120816466 + 1.66667 NA intron (NR_135570, intron 1 of 1) intron (NR_135570, intron 1 of 1) 20010 NR_135571 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 341.333-12 chr17 60767635 60768027 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) AluJr|SINE|Alu 89980 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 292-5 chr11 57620270 57620535 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20796 NR_029673 406919 NR_029673 ENSG00000208009 MIR130A MIRN130A|miRNA130A|mir-130a microRNA 130a ncRNA 210.667-100 chr4 71562268 71562427 + 1.66667 NA intron (NM_001134742, intron 23 of 24) intron (NM_001134742, intron 23 of 24) 221732 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 265.667-55 chr4 133528347 133528658 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 379208 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 298-4 chr1 88044003 88044272 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -640007 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 154-131 chr7 27992345 27992502 + 1.66667 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -188034 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 240-96 chr9 29288998 29289219 + 1.66667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -75507 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 269-47 chr6 74776112 74776328 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 352562 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 235.667-47 chr4 85601995 85602140 + 1.66667 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) intron (NM_001025616, intron 2 of 9) -120401 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 296-58 chr6 113440497 113440934 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7268 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 377.667-12 chr5 117700540 117700879 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -29652 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 201.334 chr15 61997091 61997246 + 1.66667 NA intron (NM_001018088, intron 16 of 81) L2a|LINE|L2 63279 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 577 chr11 54544321 54544983 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 59346 NM_001004703 119749 Hs.553564 NM_001004703 ENSG00000185926 OR4C46 - olfactory receptor family 4 subfamily C member 46 protein-coding 186-49 chr2 138676912 138677123 + 1.66667 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 103373 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 249.334-16 chr4 82036980 82037141 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 336931 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 249.333-92 chr7 26745248 26745455 + 1.66667 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 107480 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 272.667-53 chr5 79545707 79545941 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31690 NM_004272 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 331.334-12 chr6 19798741 19799098 + 1.66667 NA intron (NR_134651, intron 2 of 3) L1MD2|LINE|L1 5840 NR_134649 100506885 Hs.346489 NR_134649 ENSG00000228412 LOC100506885 - uncharacterized LOC100506885 ncRNA 231-51 chr5 11394186 11394427 + 1.66667 NA intron (NM_001288715, intron 5 of 20) L2a|LINE|L2 194611 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 382-5 chr13 36053756 36054189 + 1.66667 NA intron (NM_001330071, intron 3 of 16) intron (NM_001330071, intron 3 of 16) 77410 NM_001330071 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 245-27 chr17 60809350 60809514 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) L1M4a2|LINE|L1 131581 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 244.334-16 chr5 94220743 94220899 + 1.66667 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -109122 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 283.333-3 chr1 93699330 93699585 + 1.66667 NA intron (NM_001261408, intron 3 of 13) intron (NM_001261408, intron 3 of 13) -17620 NM_003567 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 413.667-7 chr7 9442835 9443226 + 1.66667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -191240 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 265-67 chr8 135893798 135893996 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 436441 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 241.667-35 chr2 88532697 88532919 + 1.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -5912 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 244.667-21 chr11 25768023 25768253 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -420985 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 230-55 chr5 51361504 51361764 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 21698 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 403.667-14 chr7 50633559 50634002 + 1.66667 NA intron (NM_001350816, intron 6 of 17) L1PB4|LINE|L1 -68375 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 228-26 chr13 54352785 54353011 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40850 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 247.667-49 chr2 73153318 73153499 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -40460 NM_015470 26056 Hs.24557 NM_015470 ENSG00000135631 RAB11FIP5 GAF1|RIP11|pp75 RAB11 family interacting protein 5 protein-coding 309.667-16 chr3 126707367 126707698 + 1.66667 NA intron (NM_032343, intron 1 of 7) intron (NM_032343, intron 1 of 7) 3292 NM_001320610 84303 Hs.518119 NM_032343 ENSG00000159685 CHCHD6 CHCM1|MICOS25|Mic25|PPP1R23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 protein-coding 293.667-29 chr2 147346234 147346447 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -498177 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 318.667-8 chr12 91269692 91269968 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -87013 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 345-2 chr14 41379830 41380236 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -226823 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 295.667-29 chr6 131212298 131212580 + 1.66667 NA intron (NM_016377, intron 6 of 7) intron (NM_016377, intron 6 of 7) -37965 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 193.333-16 chr1 233360870 233361112 + 1.66667 NA intron (NM_032435, intron 4 of 9) intron (NM_032435, intron 4 of 9) 33267 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 251.667-36 chr2 17591058 17591237 + 1.66667 NA intron (NM_001366806, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 50451 NM_003385 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 326.334-7 chr3 147253126 147253464 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 139135 NR_040762 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 486.667-2 chr14 53518176 53518616 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 365042 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 366.334-3 chr4 30293704 30294128 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -426453 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 237.334-9 chr7 7037052 7037228 + 1.66667 NA Intergenic LTR107_Mam|LTR|LTR 29905 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 246.667-88 chr7 118915218 118915434 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 690622 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 253.334-11 chr3 81679718 81679970 + 1.66667 NA intron (NM_000158, intron 2 of 15) intron (NM_000158, intron 2 of 15) 81801 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 257-73 chr8 105192631 105192874 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -125686 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 372.667-15 chr3 140232027 140232332 + 1.66667 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) intron (NM_022131, intron 2 of 16) 276610 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 293.333-53 chr5 158090409 158090701 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -231410 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 370.667-11 chr14 51578415 51578766 + 1.66667 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) intron (NM_001042481, intron 2 of 14) 21362 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 210.667-54 chr16 80794814 80795075 + 1.66667 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) intron (NM_152342, intron 1 of 6) 9654 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 337.334-2 chr20 18053035 18053349 + 1.66667 NA intron (NM_001303462, intron 1 of 2) intron (NM_001303462, intron 1 of 2) 4724 NM_021220 58495 Hs.661013 NM_021220 ENSG00000125850 OVOL2 CHED|CHED1|CHED2|EUROIMAGE566589|PPCD1|ZNF339 ovo like zinc finger 2 protein-coding 376-10 chr2 63878581 63878871 + 1.66667 NA intron (NM_001001521, intron 3 of 9) AluJb|SINE|Alu 36846 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 271.334-11 chr18 8698874 8699094 + 1.66667 NA intron (NR_120598, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 8637 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 265.334-4 chr10 30461295 30461493 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001320961, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001320961, exon 8 of 8) 26748 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 381.334-4 chr12 33705623 33705872 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -265928 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 291-27 chr2 231134744 231134989 + 1.66667 NA intron (NM_001191037, intron 16 of 23) intron (NM_001191037, intron 16 of 23) -9824 NM_001320758 3357 Hs.421649 NM_000867 ENSG00000135914 HTR2B 5-HT(2B)|5-HT-2B|5-HT2B 5-hydroxytryptamine receptor 2B protein-coding 392.667-5 chr18 56739003 56739549 + 1.66667 NA intron (NM_015285, intron 14 of 27) L1MEg|LINE|L1 87891 NM_015285 23335 Hs.465213 NM_015285 ENSG00000091157 WDR7 TRAG WD repeat domain 7 protein-coding 292.334-3 chr16 86334104 86334481 + 1.66667 NA intron (NR_024406, intron 4 of 6) intron (NR_024406, intron 4 of 6) 11387 NR_024406 732275 Hs.558087 NR_024406 ENSG00000168367 LINC00917 - long intergenic non-protein coding RNA 917 ncRNA 235.667-58 chr7 49375822 49376031 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -397712 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 338.333-2 chr1 163053417 163053826 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14985 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 306.334-4 chr19 28356997 28357227 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -249576 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 346.667-16 chr8 131037160 131037418 + 1.66667 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) intron (NM_001115, intron 1 of 17) 3620 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 300-35 chr20 3581579 3581822 + 1.66667 NA intron (NM_001207047, intron 15 of 24) intron (NM_001207047, intron 15 of 24) 81699 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 363-2 chr12 44885566 44885976 + 1.66667 NA intron (NM_001145110, intron 1 of 20) L1MEf|LINE|L1 -8921 NM_001145107 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 322.001 chr13 74863399 74863612 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 310662 NR_034025 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 260-54 chr4 62662732 62662905 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -501053 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 328.667-17 chr7 8849318 8849648 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 415874 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 222.334-2 chr1 213488758 213488916 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -435912 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 313.666-5 chr2 47338223 47338689 + 1.66667 NA intron (NR_110208, intron 1 of 4) FAM|SINE|Alu 3141 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 293-10 chr10 97991618 97991961 + 1.66667 NA intron (NM_001206528, intron 2 of 14) intron (NM_001206528, intron 2 of 14) 38832 NM_018058 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 279.334-12 chr7 112303338 112303549 + 1.66667 NA intron (NM_021994, intron 4 of 11) intron (NM_021994, intron 4 of 11) 96748 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 262.667-44 chr2 202727039 202727239 + 1.66667 NA intron (NM_173511, intron 4 of 7) intron (NM_173511, intron 4 of 7) 92170 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 243.334-14 chr6 68892940 68893160 + 1.66667 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 257768 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 254.667-28 chr17 9658309 9658529 + 1.66667 NA intron (NM_001267576, intron 2 of 14) MIRb|SINE|MIR 12882 NM_001267576 124739 Hs.709621 NM_153210 ENSG00000154914 USP43 - ubiquitin specific peptidase 43 protein-coding 263.667-83 chr9 85585647 85585863 + 1.66667 NA intron (NM_015239, intron 22 of 25) intron (NM_015239, intron 22 of 25) 156274 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 177.666-3 chr11 9958766 9959005 + 1.66667 NA intron (NM_030962, intron 16 of 39) intron (NM_030962, intron 16 of 39) 119743 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 197.667-29 chr11 99787154 99787295 + 1.66667 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 231079 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 367.001-2 chr7 30495498 30495803 + 1.66667 NA TTS (NM_001199817) TTS (NM_001199817) 9179 NM_001199815 79017 Hs.530024 NM_024051 ENSG00000006625 GGCT C7orf24|CRF21|GCTG|GGC gamma-glutamylcyclotransferase protein-coding 194.334-2 chr2 164400053 164400243 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 168347 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 295.333-2 chr1 220926600 220926936 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -46628 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 367.334-5 chr8 106808515 106808845 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -38436 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 252-42 chr19 29467569 29467780 + 1.66667 NA intron (NR_040029, intron 1 of 9) L1MEi|LINE|L1 58078 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 254.667-58 chr4 41931841 41932039 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -3489 NM_018126 55161 Hs.31082 NM_018126 ENSG00000109133 TMEM33 1600019D15Rik|Pom33|SHINC-3|SHINC3 transmembrane protein 33 protein-coding 465.001 chr3 105836023 105836383 + 1.66667 NA intron (NR_135809, intron 3 of 18) intron (NR_135809, intron 3 of 18) 31388 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 283.333-30 chr2 48919889 48920201 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -139558 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 204.333-52 chr14 58176534 58176690 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23537 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 446 chr10 21868585 21868957 + 1.66667 NA intron (NM_022365, intron 8 of 11) MER4D|LTR|ERV1 134959 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 732-2 chr9 27285786 27286849 + 1.66667 NA exon (NM_020641, exon 7 of 8) exon (NM_020641, exon 7 of 8) -3524 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 267.667-10 chr12 10384108 10384429 + 1.66667 NA intron (NR_120430, intron 3 of 3) L1MA5|LINE|L1 5773 NM_007360 22914 Hs.387787 NM_007360 ENSG00000213809 KLRK1 CD314|D12S2489E|KLR|NKG2-D|NKG2D killer cell lectin like receptor K1 protein-coding 306.334-5 chr2 89838295 89838571 + 1.66667 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -200526 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 293.667-22 chr2 11150862 11151067 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001371320, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001371320, exon 4 of 4) -4408 NM_001282710 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 257.667-27 chr15 68141454 68141630 + 1.66667 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 64568 NR_104583 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 254.334-13 chr15 69268141 69268399 + 1.66667 NA TTS (NM_001324091) TTS (NM_001324091) -30642 NM_017705 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 265.667-34 chr2 28749364 28749681 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2226 NM_206876 5500 Hs.702907 NM_002709 ENSG00000213639 PPP1CB HEL-S-80p|NSLH2|PP-1B|PP1B|PP1beta|PPP1CD protein phosphatase 1 catalytic subunit beta protein-coding 139.333-166 chr4 70032988 70033193 + 1.66667 NA intron (NM_000200, intron 4 of 5).2 intron (NM_000200, intron 4 of 5).2 4631 NM_000200 3347 Hs.654442 NM_000200 ENSG00000205649 HTN3 HIS2|HTN2|HTN5|PB histatin 3 protein-coding 395.667-10 chr8 86650009 86650382 + 1.66667 NA intron (NM_019098, intron 7 of 17) intron (NM_019098, intron 7 of 17) 93480 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 200.667-7 chr1 99763309 99763441 + 1.66667 NA intron (NM_001361041, intron 1 of 16) intron (NM_001361041, intron 1 of 16) 2418 NM_001013660 391059 Hs.454779 NM_001013660 ENSG00000156869 FRRS1 SDFR2|SDR2 ferric chelate reductase 1 protein-coding 273.333-26 chr17 63234441 63234678 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) intron (NM_025185, intron 6 of 25) 205708 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 479.667-4 chr7 110361580 110362154 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -401654 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 238.666-23 chr2 39461794 39462042 + 1.66667 NA intron (NR_037875, intron 3 of 5) AluSz6|SINE|Alu 24502 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 168.333-52 chr13 61312545 61312711 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 102894 NM_022843 64881 Hs.391781 NM_022843 ENSG00000280165 PCDH20 PCDH13 protocadherin 20 protein-coding 342-16 chr16 86900073 86900486 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -157505 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 364.666-11 chr5 41619575 41620088 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -109230 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 252.334-14 chr3 195309689 195310097 + 1.66667 NA intron (NM_012287, intron 10 of 22) intron (NM_012287, intron 10 of 22) -38734 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 264.667-48 chr21 18550768 18550981 + 1.66667 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu 135290 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 454-10 chr5 68841395 68841799 + 1.66667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 188330 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 346.001-2 chr3 56172751 56172989 + 1.66667 NA intron (NR_132749, intron 4 of 17) intron (NR_132749, intron 4 of 17) 295597 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 384.001 chr13 64792138 64792485 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -716300 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 192.667-164 chr7 90299160 90299313 + 1.66667 NA intron (NM_001039706, intron 16 of 22) intron (NM_001039706, intron 16 of 22) -35987 NR_110085 101927446 Hs.734999 NR_110085 ENSG00000105793 LOC101927446 - uncharacterized LOC101927446 ncRNA 270.667-56 chr8 114515054 114515417 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -1078296 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 233.667-72 chr8 76909026 76909190 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 57742 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 277.667-11 chr12 79746283 79746516 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -55302 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 223-14 chr13 45513520 45513669 + 1.66667 NA intron (NM_031431, intron 16 of 22) intron (NM_031431, intron 16 of 22) 48655 NM_031431 83548 Hs.507948 NM_031431 ENSG00000136152 COG3 SEC34 component of oligomeric golgi complex 3 protein-coding 255-77 chr7 48665360 48665586 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -259074 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 237.334-14 chr9 70228508 70228669 + 1.66667 NA intron (NR_039990, intron 3 of 3) intron (NR_039990, intron 3 of 3) 30286 NR_039990 100507299 Hs.556816 NR_039990 SMC5-AS1 MAMDC2-AS2 SMC5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 274.333-13 chr12 75870860 75871229 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 160732 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 270-18 chr16 69584624 69584830 + 1.66667 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) AluJo|SINE|Alu 18761 NM_138713 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 246.334 chr1 145753075 145753255 + 1.66667 NA intron (NM_014455, intron 4 of 8) intron (NM_014455, intron 4 of 8) 33666 NR_103845 11126 Hs.488237 NM_007053 ENSG00000117281 CD160 BY55|NK1|NK28 CD160 molecule protein-coding 354.001 chr14 90683669 90683944 + 1.66667 NA intron (NM_001320421, intron 7 of 20) intron (NM_001320421, intron 7 of 20) -13527 NR_135190 105370622 Hs.662373 NR_135190 ENSG00000258716 LOC105370622 - uncharacterized LOC105370622 ncRNA 192.667-122 chr4 60749367 60749523 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -173174 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 246-44 chr18 4752558 4752846 + 1.66667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -297395 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 185.333-77 chr18 79816526 79816777 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -47017 NM_012283 26251 Hs.247905 NM_012283 ENSG00000178342 KCNG2 KCNF2|KV6.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 2 protein-coding 322-6 chr10 15889190 15889618 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28871 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 182.667-54 chr15 96022036 96022193 + 1.66667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 105727 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 261.667-53 chr4 42394557 42394929 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2745 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 191.667-36 chr12 10243864 10244016 + 1.66667 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) intron (NM_001351060, intron 2 of 8) 4979 NM_001351060 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 250-48 chr20 16535416 16535602 + 1.66667 NA intron (NM_001199866, intron 1 of 22) L1MA4A|LINE|L1 37939 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 293.667-38 chr22 28376764 28377188 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEc|LINE|L1 -82893 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 375.334-3 chr2 139952573 139952907 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 633945 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 398.334-4 chr8 97219703 97220027 + 1.66667 NA intron (NR_125390, intron 2 of 2) intron (NR_125390, intron 2 of 2) 58063 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 254.667-35 chr2 46718045 46718333 + 1.66667 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) L1MEg|LINE|L1 18894 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 485.667 chr10 34349693 34350177 + 1.66667 NA intron (NM_001184789, intron 13 of 22) intron (NM_001184789, intron 13 of 22) 465361 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 248-36 chr19 44258929 44259169 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001330529) promoter-TSS (NM_001330529) -831 NM_001330529 353355 Hs.466891 NM_181756 ENSG00000159915 ZNF233 - zinc finger protein 233 protein-coding 165-86 chr6 61856166 61856385 + 1.66667 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 282145 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 261.667-36 chr2 62887743 62887996 + 1.66667 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) intron (NM_001142615, intron 10 of 22) 159842 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 267.667-75 chr9 132277812 132278031 + 1.66667 NA intron (NM_001351527, intron 21 of 25) intron (NM_001351527, intron 21 of 25) 76935 NM_001351527 23064 Hs.460317 NM_015046 ENSG00000107290 SETX ALS4|AOA2|SCAN2|SCAR1|Sen1|bA479K20.2 senataxin protein-coding 326.001 chr10 20974671 20974870 + 1.66667 NA intron (NM_001173484, intron 3 of 6) intron (NM_001173484, intron 3 of 6) -77168 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 295-13 chr14 84781243 84781443 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -490589 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 258-62 chr5 53953582 53953746 + 1.66667 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -2065 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 257-46 chr4 76185446 76185608 + 1.66667 NA intron (NM_005506, intron 2 of 11) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 28297 NM_005506 950 Hs.349656 NM_005506 ENSG00000138760 SCARB2 AMRF|CD36L2|EPM4|HLGP85|LGP85|LIMP-2|LIMPII|SR-BII scavenger receptor class B member 2 protein-coding 239.667-14 chr12 1322236 1322428 + 1.66667 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) MIRc|SINE|MIR -178159 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 289-10 chr2 62590381 62590748 + 1.66667 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -83314 NM_001142615 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 375-6 chr19 28340878 28341490 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -265504 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 338.667-27 chr5 122922848 122923165 + 1.66667 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) intron (NM_014035, intron 1 of 6) 77393 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 156-56 chr16 10163059 10163260 + 1.66667 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 18908 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 247-20 chr14 33483209 33483414 + 1.66667 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -225626 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 251.667-6 chr1 113516612 113516770 + 1.66667 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) L1MC3|LINE|L1 126176 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 260-2 chr1 71439683 71439906 + 1.66667 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) intron (NM_173808, intron 6 of 6) 358470 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 228-80 chr7 62833436 62833671 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 470503 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 375.334-7 chr7 79786046 79786417 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 332271 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 261.334-9 chr2 25793628 25793886 + 1.66667 NA intron (NM_001369347, intron 1 of 9) intron (NM_001369347, intron 1 of 9) 934 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 289.667-35 chr8 122502748 122502981 + 1.66667 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 65780 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 270-26 chr2 15327095 15327303 + 1.66667 NA intron (NR_052013, intron 38 of 50) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 234135 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 218.333-110 chr6 127390842 127391071 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -47347 NM_001002030 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 353-16 chr4 43178139 43178529 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 285068 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 349.334 chr1 84123786 84124198 + 1.66667 NA intron (NM_002731, intron 1 of 9) intron (NM_002731, intron 1 of 9) -20279 NM_001300916 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 222.333 chr1 40574490 40574694 + 1.66667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 42955 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 310.333-18 chr17 43728857 43729327 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 29699 NM_025237 50964 Hs.349204 NM_025237 ENSG00000167941 SOST CDD|DAND6|SOST1|VBCH sclerostin protein-coding 214.667-64 chr2 55889604 55889778 + 1.66667 NA intron (NM_001039349, intron 4 of 10) L1MEg|LINE|L1 34091 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 260-66 chr5 143110221 143110390 + 1.66667 NA intron (NR_146198, intron 17 of 22) L2a|LINE|L2 -82195 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 318-36 chr22 39962988 39963324 + 1.66667 NA intron (NM_001291828, intron 2 of 4) intron (NM_001291828, intron 2 of 4) 16339 NM_001291825 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 352.333-20 chr5 41109696 41110039 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -38525 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 159-125 chrX 48658105 48658211 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -25639 NM_000377 7454 Hs.2157 NM_000377 ENSG00000015285 WAS IMD2|SCNX|THC|THC1|WASP|WASPA WASP actin nucleation promoting factor protein-coding 193.334-2 chr3 180603571 180603740 + 1.66667 NA intron (NM_001288582, intron 3 of 12) intron (NM_001288582, intron 3 of 12) 1492 NM_001288582 151613 Hs.43213 NM_133462 ENSG00000163728 TTC14 DRDL5813|PRO19630 tetratricopeptide repeat domain 14 protein-coding 382.001-2 chr5 149787456 149787774 + 1.66667 NA intron (NM_001172699, intron 1 of 10) intron (NM_001172699, intron 1 of 10) 15675 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 245.667-4 chr10 28608987 28609183 + 1.66667 NA intron (NM_100486, intron 7 of 12) intron (NM_100486, intron 7 of 12) -68436 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 192.667-27 chr10 68731401 68731527 + 1.66667 NA intron (NR_104262, intron 2 of 23) intron (NR_104262, intron 2 of 23) 10225 NR_104262 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 473.334-2 chr7 78479799 78480271 + 1.66667 NA intron (NM_001301128, intron 6 of 20) L1MD2|LINE|L1 132793 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 297.667-18 chr17 60468829 60469014 + 1.66667 NA intron (NM_006380, intron 4 of 12) intron (NM_006380, intron 4 of 12) 46432 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 328.666-4 chr12 75451403 75451656 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -29226 NM_006851 11010 Hs.205558 NM_006851 ENSG00000139278 GLIPR1 CRISP7|GLIPR|RTVP1 GLI pathogenesis related 1 protein-coding 246.333-67 chr4 36087773 36088038 + 1.66667 NA intron (NR_146894, intron 28 of 32) MIR|SINE|MIR 156034 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 238.333-17 chr11 107898831 107899127 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29469 NM_017516 54734 Hs.354906 NM_017516 ENSG00000179331 RAB39A RAB39 RAB39A, member RAS oncogene family protein-coding 407.333-25 chr8 133685558 133685941 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1683 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 272.667-63 chr8 37112834 37113161 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 328623 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 215-75 chr6 134313770 134314084 + 1.66667 NA intron (NM_001143676, intron 1 of 13) intron (NM_001143676, intron 1 of 13) 4131 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 366.999-3 chr14 44444518 44444940 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 62554 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 297.334-5 chr14 39256733 39257028 + 1.66667 NA intron (NM_001329214, intron 6 of 28) L1MEj|LINE|L1 -8411 NM_001354145 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 213.333-192 chr7 48347830 48348079 + 1.66667 NA intron (NM_152701, intron 29 of 61) MIRb|SINE|MIR 176496 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 201.667-102 chr6 50460871 50461067 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -252575 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 278-64 chr8 81870473 81870645 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28273 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 269-46 chr6 72558508 72558778 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -63200 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 476.667-5 chr20 10773525 10774031 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 20688 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 263.334-7 chr22 39818576 39818841 + 1.66667 NA intron (NM_152512, intron 5 of 6) L2c|LINE|L2 75052 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 251.333-94 chr6 24264664 24264898 + 1.66667 NA intron (NM_016356, intron 7 of 9) L1M1|LINE|L1 -92122 NM_181337 353219 Hs.697888 NM_181337 ENSG00000146049 KAAG1 RU2AS kidney associated antigen 1 protein-coding 245.334-5 chr11 110039238 110039524 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -54011 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 229.667-71 chr6 69457640 69457843 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 338725 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 293-31 chr4 137037511 137037874 + 1.66667 NA intron (NR_149105, intron 2 of 3) MSTC|LTR|ERVL-MaLR -156064 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 425.667 chr1 39602945 39603348 + 1.66667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -26356 NM_003819 8761 Hs.169900 NM_003819 ENSG00000090621 PABPC4 APP-1|APP1|PABP4|iPABP poly(A) binding protein cytoplasmic 4 protein-coding 252.667-103 chr8 105731755 105732025 + 1.66667 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 328613 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 251.667-19 chr12 41360855 41361074 + 1.66667 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -76775 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 252-40 chr18 3328087 3328291 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 22370 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 300-57 chr6 98124477 98124900 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 100157 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 349-8 chr16 9422905 9423261 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 21902 NR_126397 104355218 Hs.564967 NR_126397 ENSG00000261397 LINC01177 - long intergenic non-protein coding RNA 1177 ncRNA 365-6 chr12 11575737 11576077 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 27877 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 380-14 chr5 21833609 21833890 + 1.66667 NA intron (NM_004061, intron 8 of 14) MER5A|DNA|hAT-Charlie -50705 NR_132787 106635539 NR_132787 SNORA105A - small nucleolar RNA, H/ACA box 105A snoRNA 301-52 chr6 157474351 157474680 + 1.66667 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) L1MA10|LINE|L1 -54617 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 253-26 chr15 70759265 70759469 + 1.66667 NA intron (NM_018003, intron 1 of 18) intron (NM_018003, intron 1 of 18) 4191 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 302.333-9 chr10 21082419 21082756 + 1.66667 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) intron (NM_001173484, intron 2 of 6) -91403 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 292.667-47 chr9 35443710 35443991 + 1.66667 NA intron (NR_003581, intron 6 of 17) L1MC5a|LINE|L1 37095 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 250.667-34 chr17 70724360 70724545 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 477727 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 330-15 chr15 33475969 33476358 + 1.66667 NA intron (NM_001243996, intron 2 of 102) intron (NM_001243996, intron 2 of 102) 165196 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 246.334-2 chr10 92853633 92853865 + 1.66667 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) L1M4|LINE|L1 5229 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 199-117 chr8 91988945 91989184 + 1.66667 NA intron (NM_004349, intron 6 of 10) intron (NM_004349, intron 6 of 10) 28616 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 244-22 chr11 62109789 62110015 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -14109 NM_001040694 3619 Hs.142179 NM_020238 ENSG00000149503 INCENP - inner centromere protein protein-coding 202-169 chr6 156113954 156114132 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 167246 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 253.333-114 chr8 126851139 126851324 + 1.66667 NA Intergenic LTR81C|LTR|Gypsy -161923 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 315.334 chr1 115957842 115958195 + 1.66667 NA intron (NR_125970, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 -18495 NM_018420 55356 Hs.125482 NM_018420 ENSG00000163393 SLC22A15 FLIPT1|PRO34686 solute carrier family 22 member 15 protein-coding 250.667-43 chr2 234512907 234513148 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15946 NM_001282431 10123 Hs.111554 NM_005737 ENSG00000188042 ARL4C ARL7|LAK ADP ribosylation factor like GTPase 4C protein-coding 296.334-8 chr19 35633445 35633679 + 1.66667 NA intron (NM_001319113, intron 5 of 8) intron (NM_001319113, intron 5 of 8) 4526 NM_024321 79171 Hs.5086 NM_024321 ENSG00000126254 RBM42 - RNA binding motif protein 42 protein-coding 255-35 chr17 29889164 29889330 + 1.66667 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) AluSz|SINE|Alu -40656 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 263.333-56 chr3 11723297 11723543 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2881 NM_014667 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 266-47 chr2 230811363 230811586 + 1.66667 NA intron (NM_001130850, intron 6 of 8) intron (NM_001130850, intron 6 of 8) -52711 NM_001287240 81618 Hs.111577 NM_030926 ENSG00000135916 ITM2C BRI3|BRICD2C|E25|E25C|ITM3 integral membrane protein 2C protein-coding 325-7 chr11 47792158 47792546 + 1.66667 NA intron (NM_015231, intron 28 of 35) intron (NM_015231, intron 28 of 35) -25011 NM_015308 23360 Hs.6834 NM_015308 ENSG00000109920 FNBP4 FBP30 formin binding protein 4 protein-coding 242-72 chr7 118830468 118830692 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 605876 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 309.334-13 chr8 72196220 72196425 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 55312 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 246-86 chr5 96574791 96575044 + 1.66667 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) L1MDb|LINE|L1 -87120 NM_001042442 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 197.333-105 chr2 51157675 51157907 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 125190 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 324.334-9 chr22 32833633 32833988 + 1.66667 NA intron (NM_000362, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 32994 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 266.001 chr12 96353995 96354165 + 1.66667 NA intron (NM_002595, intron 1 of 16) intron (NM_002595, intron 1 of 16) 46359 NM_001170464 5128 Hs.506415 NM_002595 ENSG00000059758 CDK17 PCTAIRE2|PCTK2 cyclin dependent kinase 17 protein-coding 244.334-15 chr4 72397924 72398096 + 1.66667 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) intron (NM_014243, intron 4 of 21) 171211 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 279.334-9 chr4 87182396 87182595 + 1.66667 NA intron (NR_120447, intron 2 of 7) intron (NR_120447, intron 2 of 7) 37773 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 263.334-6 chr21 31856441 31856622 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16489 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 282.333-13 chr14 55002278 55002559 + 1.66667 NA intron (NM_007086, intron 7 of 25) FLAM_A|SINE|Alu 24681 NM_007086 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 481.667-4 chr17 51067789 51068359 + 1.66667 NA intron (NM_001130527, intron 2 of 29) intron (NM_001130527, intron 2 of 29) -21196 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 242-24 chr14 65348682 65348875 + 1.66667 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -13595 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 255.334-8 chr12 10285460 10285687 + 1.66667 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) intron (NM_001351060, intron 2 of 8) -18873 NM_001114396 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 384.333-3 chr10 117717077 117717510 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -172225 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 160.667-291 chr7 104386140 104386334 + 1.66667 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 57581 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 257-78 chr9 37192483 37192738 + 1.66667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 72012 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 294.667-9 chr12 10528194 10528514 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 22461 NM_001357734 255308 Hs.547382 NM_001357731 ENSG00000180574 EIF2S3B EIF2S3L|eIF-2gA|eIF2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma B protein-coding 351.667-3 chr12 3899672 3900134 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26455 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 352.667-10 chr14 60285043 60285359 + 1.66667 NA intron (NM_021003, intron 2 of 5) intron (NM_021003, intron 2 of 5) 35980 NM_177951 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 247-28 chr16 6622018 6622266 + 1.66667 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -151667 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 280-42 chr4 80430545 80430736 + 1.66667 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 94920 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 192.334 chr15 25930059 25930207 + 1.66667 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) L1M1|LINE|L1 27773 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 273.667-44 chr5 130413651 130413816 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 509268 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 314.334-3 chr2 135927304 135927543 + 1.66667 NA intron (NM_001293312, intron 6 of 14) intron (NM_001293312, intron 6 of 14) -50980 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 254-2 chr1 176513335 176513544 + 1.66667 NA intron (NM_021936, intron 1 of 4) intron (NM_021936, intron 1 of 4) 50264 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 254.666-5 chr10 11987226 11987490 + 1.66667 NA intron (NM_080599, intron 8 of 21) intron (NM_080599, intron 8 of 21) 55451 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 157.667-256 chr5 86228686 86228876 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -53663 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 254-35 chr2 83644634 83644940 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 121973 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 374.667-17 chr9 104750820 104751216 + 1.66667 NA exon (NM_001329570, exon 2 of 5) exon (NM_001329570, exon 2 of 5) 3335 NM_001329570 25934 Hs.530275 NM_015469 ENSG00000136783 NIPSNAP3A HSPC299|NIPSNAP4|TASSC nipsnap homolog 3A protein-coding 239-51 chr4 105894370 105894518 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1027 NM_001184692 255743 Hs.518921 NM_198278 ENSG00000168743 NPNT EGFL6L|POEM nephronectin protein-coding 250.666-3 chr10 88976483 88976748 + 1.66667 NA intron (NM_001320855, intron 1 of 8) intron (NM_001320855, intron 1 of 8) -14183 NM_000043 355 Hs.244139 NM_000043 ENSG00000026103 FAS ALPS1A|APO-1|APT1|CD95|FAS1|FASTM|TNFRSF6 Fas cell surface death receptor protein-coding 422.667-5 chr3 108068706 108069230 + 1.66667 NA intron (NM_198793, intron 3 of 8) intron (NM_198793, intron 3 of 8) 22120 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 167.667-223 chrX 50569226 50569407 + 1.66667 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -98491 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 258.334-3 chr12 34571283 34571439 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 548865 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 227.666-23 chr4 12901809 12902037 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 582417 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 322-29 chr4 87781687 87782184 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17619 NM_004967 3381 Hs.518726 NM_004967 ENSG00000029559 IBSP BNSP|BSP|BSP-II|SP-II integrin binding sialoprotein protein-coding 271 chr1 52261270 52261482 + 1.66667 NA intron (NM_007324, intron 4 of 17) FAM|SINE|Alu 104829 NM_032449 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 289.334-4 chr17 28428199 28428399 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -22087 NM_001242366 113235 Hs.446689 NM_080669 ENSG00000076351 SLC46A1 G21|HCP1|PCFT solute carrier family 46 member 1 protein-coding 371.334-4 chr8 85608557 85608858 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46969 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 348.334-6 chr7 3251159 3251480 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -49933 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 285-3 chr10 88364118 88364352 + 1.66667 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 219083 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 249.667-81 chr6 37668317 37668575 + 1.66667 NA intron (NM_153487, intron 1 of 16) L1ME3|LINE|L1 29437 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 219-9 chr10 52636158 52636308 + 1.66667 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 119171 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 290.667-4 chr1 156116384 156116699 + 1.66667 NA intron (NM_005572, intron 1 of 9) intron (NM_005572, intron 1 of 9) 1830 NM_170707 4000 Hs.594444 NM_005572 ENSG00000160789 LMNA CDCD1|CDDC|CMD1A|CMT2B1|EMD2|FPL|FPLD|FPLD2|HGPS|IDC|LDP1|LFP|LGMD1B|LMN1|LMNC|LMNL1|MADA|PRO1 lamin A/C protein-coding 271.667-44 chr3 1769476 1769747 + 1.66667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -329192 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 245.667-2 chr1 106649409 106649620 + 1.66667 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -168725 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 299.666-6 chr14 61857016 61857346 + 1.66667 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) LTR16E1|LTR|ERVL 44478 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 276-55 chr5 149995785 149996000 + 1.66667 NA exon (NM_030953, exon 2 of 2) exon (NM_030953, exon 2 of 2) 4762 NM_001243253 81789 Hs.169333 NM_030953 ENSG00000164296 TIGD6 - tigger transposable element derived 6 protein-coding 241.333-31 chr12 48887493 48887653 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -16560 NM_033124 85478 Hs.512805 NM_033124 ENSG00000139537 CCDC65 CFAP250|DRC2|FAP250|NYD-SP28 coiled-coil domain containing 65 protein-coding 268.667-63 chr8 120988621 120988792 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -176660 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 453-7 chr18 77829709 77830171 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 163787 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 512.667 chr12 50858568 50858957 + 1.66667 NA intron (NM_182559, intron 2 of 4) intron (NM_182559, intron 2 of 4) 15836 NM_182559 283471 Hs.125571 NM_182559 ENSG00000186452 TMPRSS12 CT151 transmembrane serine protease 12 protein-coding 546.666 chr14 65951287 65951659 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 480371 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 216.333-26 chr11 30190091 30190507 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -40715 NM_001018080 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 269-35 chr3 185140055 185140326 + 1.66667 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) MER8|DNA|TcMar-Tigger 12870 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 231-29 chr2 51250651 51250819 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 218134 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 255.667-17 chr11 115767159 115767381 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7070 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 246.667-103 chr8 124677494 124677688 + 1.66667 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) MER58B|DNA|hAT-Charlie 50882 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 188.333-52 chr16 7767925 7768115 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 435175 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 252.333-6 chr1 232667312 232667580 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50625 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 231-57 chr6 164106117 164106299 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -434724 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 256.667-72 chr5 128888286 128888660 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -76654 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 378-19 chr4 38030762 38031311 + 1.66667 NA intron (NM_001253912, intron 7 of 20) intron (NM_001253912, intron 7 of 20) 70638 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 423-10 chr7 40259587 40259861 + 1.66667 NA intron (NM_001193312, intron 7 of 12) intron (NM_001193312, intron 7 of 12) 124748 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 257.667-44 chr2 146181407 146181635 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -405536 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 237-52 chr4 31833367 31833665 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -163863 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 252-3 chr1 112527568 112527918 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_024494, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_024494, exon 5 of 5) 18778 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 255-31 chr14 52877675 52877959 + 1.66667 NA intron (NM_006832, intron 7 of 14) intron (NM_006832, intron 7 of 14) 73233 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 234.666-36 chr4 93367972 93368220 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) intron (NM_001286838, intron 7 of 14) -460657 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 297.666-2 chr11 99160159 99160612 + 1.66667 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 139436 NM_001243270 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 262.667-9 chr1 224454087 224454248 + 1.66667 NA intron (NR_136293, intron 2 of 9) intron (NR_136293, intron 2 of 9) 19318 NR_136297 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 285.001 chr1 78194373 78194548 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -35139 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 246.334-11 chr2 173138327 173138554 + 1.66667 NA intron (NM_133646, intron 2 of 11) intron (NM_133646, intron 2 of 11) 62594 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 365-3 chr11 116503953 116504270 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -135311 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 270-23 chr2 12759900 12760082 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 22624 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 452.667-4 chr16 68460833 68461400 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12608 NM_018667 55512 Hs.368421 NM_018667 ENSG00000103056 SMPD3 NSMASE2 sphingomyelin phosphodiesterase 3 protein-coding 247-34 chr18 4045224 4045413 + 1.66667 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 82965 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 158.334 chr11 80645925 80646087 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 116797 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 203-71 chr4 38062971 38063191 + 1.66667 NA intron (NM_001253912, intron 14 of 20) intron (NM_001253912, intron 14 of 20) -47100 NM_001253913 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 251.333-68 chr2 236006549 236006749 + 1.66667 NA intron (NM_001037131, intron 13 of 17) intron (NM_001037131, intron 13 of 17) 161737 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 337-19 chr3 88475770 88476042 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 137450 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 306.667-26 chr2 143465256 143465472 + 1.66667 NA intron (NM_018460, intron 8 of 13) intron (NM_018460, intron 8 of 13) 335945 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 302.333-2 chr1 68650347 68650626 + 1.66667 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? -153404 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 305.667-39 chr8 107285712 107285962 + 1.66667 NA intron (NM_001199859, intron 6 of 8) L2c|LINE|L2 50678 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 411-7 chr2 166453069 166453371 + 1.66667 NA intron (NR_045628, intron 10 of 25) MIRb|SINE|MIR 33751 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 199-40 chr19 42345157 42345354 + 1.66667 NA intron (NM_001410, intron 12 of 40) AluSx1|SINE|Alu -5876 NR_107044 102465875 NR_107044 ENSG00000277533 MIR8077 hsa-mir-8077 microRNA 8077 ncRNA 294.667-17 chr14 88601877 88602318 + 1.66667 NA intron (NM_001326297, intron 11 of 16) intron (NM_001326297, intron 11 of 16) 7677 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 271-8 chr1 232117083 232117292 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 191353 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 262.666-13 chr20 59394894 59395170 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 94421 NM_207033 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 264.333-48 chr3 90141504 90141723 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1033992 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 367-6 chr14 77648420 77648770 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -31828 NM_004863 9517 Hs.435661 NM_004863 ENSG00000100596 SPTLC2 HSN1C|LCB2|LCB2A|NSAN1C|SPT2|hLCB2a serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2 protein-coding 240.333-96 chr8 123355152 123355419 + 1.66667 NA intron (NM_014109, intron 13 of 27) intron (NM_014109, intron 13 of 27) -7155 NR_030382 693130 NR_030382 ENSG00000283172 MIR548D1 MIRN548D1 microRNA 548d-1 ncRNA 374.667-14 chr7 127812514 127812763 + 1.66667 NA intron (NM_014390, intron 11 of 23) intron (NM_014390, intron 11 of 23) 160444 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 296.667-42 chr4 58175711 58175940 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 360503 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 253-17 chr12 58143453 58143632 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 55650 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 353.334-7 chr4 161684225 161684531 + 1.66667 NA intron (NM_001128428, intron 6 of 14) L1PB1|LINE|L1 -338355 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 201.333-293 chr8 132126263 132126461 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_004519, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_004519, exon 15 of 15) -21097 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 356.333-3 chr10 24643401 24643864 + 1.66667 NA intron (NM_001367447, intron 4 of 24) intron (NM_001367447, intron 4 of 24) -20789 NM_001367455 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 329.334-4 chr11 94631522 94631901 + 1.66667 NA intron (NR_135096, intron 4 of 6) L1ME4b|LINE|L1 64343 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 261.667-45 chr22 26173099 26173269 + 1.66667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 3710 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 327.334-9 chr3 72980064 72980337 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16543 NM_001318026 151987 Hs.431092 NM_174907 ENSG00000163605 PPP4R2 PP4R2 protein phosphatase 4 regulatory subunit 2 protein-coding 428.667-9 chr3 174444115 174444557 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -414998 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 310-39 chr4 40148699 40149016 + 1.66667 NA intron (NM_001318359, intron 17 of 18) L1MA9|LINE|L1 -42223 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 308.334-6 chr2 19115038 19115374 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -88235 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 191.667-61 chr17 72263976 72264159 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -78744 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 171-13 chr12 27606953 27607156 + 1.66667 NA intron (NM_001198915, intron 2 of 26) MER5A|DNA|hAT-Charlie 82848 NM_001198916 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 297.667-12 chr14 88841066 88841304 + 1.66667 NA exon (NM_198309, exon 5 of 15) exon (NM_198309, exon 5 of 15) 16534 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 208.333-34 chr14 21885434 21885656 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -214528 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 280-15 chr15 57298839 57299079 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1406 NR_024433 283663 Hs.181297 NR_024433 ENSG00000247982 LINC00926 - long intergenic non-protein coding RNA 926 ncRNA 208.334 chr14 56366403 56366548 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -147856 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 459-9 chr6 47875185 47875587 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 88318 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 244-19 chr11 21490508 21490786 + 1.66667 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) L1MA4A|LINE|L1 -702438 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 340.667-19 chr8 122550849 122551294 + 1.66667 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 17573 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 404.667-9 chr9 2463417 2463855 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -158151 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 224-26 chr15 56303909 56304103 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -58924 NM_001370561 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 335.667-22 chr5 17272953 17273333 + 1.66667 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 55512 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 259.667-90 chr9 28213467 28213821 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 505661 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 294.667-6 chr10 91293912 91294104 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 73345 NM_032373 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 282.334-15 chr5 173239857 173240058 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4751 NM_001166176 1482 Hs.54473 NM_004387 ENSG00000183072 NKX2-5 CHNG5|CSX|CSX1|HLHS2|NKX2.5|NKX2E|NKX4-1|VSD3 NK2 homeobox 5 protein-coding 242.333-96 chr8 32288920 32289203 + 1.66667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -151685 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 316.334-8 chr4 34419203 34419525 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -149617 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 326.666-2 chr11 44217741 44218163 + 1.66667 NA intron (NM_207122, intron 10 of 13) intron (NM_207122, intron 10 of 13) 92187 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 236.333-13 chr10 39077292 39077505 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 380802 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 302-17 chr13 73727080 73727370 + 1.66667 NA intron (NM_007249, intron 6 of 7) L1MB7|LINE|L1 162981 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 280-8 chr12 41287699 41287872 + 1.66667 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 99465 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 279.667-34 chr4 57423741 57423951 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -2026 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 300-10 chr10 72373326 72373533 + 1.66667 NA intron (NM_001195519, intron 6 of 6) AluJr|SINE|Alu -18510 NM_001002762 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 291.334-2 chr1 82590982 82591239 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -312073 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 249.334-11 chr14 44280009 44280226 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 227166 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 227.334 chr1 200569830 200570051 + 1.66667 NA exon (NM_001305792, exon 21 of 28) exon (NM_001305792, exon 21 of 28) 48898 NM_001305792 9928 Hs.3104 NM_014875 ENSG00000118193 KIF14 MCPH20|MKS12 kinesin family member 14 protein-coding 261.333-57 chr20 11680353 11680560 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 190259 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 184.333-134 chr6 151321608 151321806 + 1.66667 NA intron (NM_005100, intron 3 of 4) L1MB8|LINE|L1 -3824 NM_144497 9590 Hs.371240 NM_005100 ENSG00000131016 AKAP12 AKAP250|SSeCKS A-kinase anchoring protein 12 protein-coding 210.333-111 chr4 10516030 10516295 + 1.66667 NA intron (NM_052964, intron 15 of 18) L1MEd|LINE|L1 -58736 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 460.334-2 chr5 27703326 27703882 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 231312 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 166.334-3 chr2 27782807 27783009 + 1.66667 NA intron (NM_022128, intron 7 of 7) L1MC3|LINE|L1 11189 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 186-81 chr5 67107250 67107484 + 1.66667 NA intron (NM_001297651, intron 7 of 25) intron (NM_001297651, intron 7 of 25) 89432 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 227.334-8 chr4 151046699 151046912 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31078 NM_001367550 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 578.001 chr2 212782120 212782750 + 1.66667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -12896 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 251-7 chr10 14629081 14629233 + 1.66667 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) MamRep1151|LTR?|LTR? -24756 NM_001282697 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 234.667-30 chr13 105443531 105443720 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22242 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 266.333-5 chr10 31475915 31476190 + 1.66667 NA intron (NM_001323678, intron 2 of 6) L1PB4|LINE|L1 -76297 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 452.999 chr18 7068909 7069265 + 1.66667 NA intron (NM_005559, intron 3 of 62) intron (NM_005559, intron 3 of 62) 48710 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 277.334-16 chr8 84402255 84402441 + 1.66667 NA intron (NM_001354319, intron 2 of 8) intron (NM_001354319, intron 2 of 8) -13136 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 207-34 chr14 50464065 50464255 + 1.66667 NA intron (NM_198794, intron 11 of 31) intron (NM_198794, intron 11 of 31) -66862 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 277.333-86 chr9 94011422 94011678 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -19263 NM_001253830 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 244-28 chr13 114223448 114223788 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11227 NM_003903 8881 Hs.374127 NM_003903 ENSG00000130177 CDC16 ANAPC6|APC6|CDC16Hs|CUT9 cell division cycle 16 protein-coding 252.667-75 chr4 142997498 142997727 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -151077 NM_001101669 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 220.333-23 chr11 10292806 10293039 + 1.66667 NA intron (NM_030962, intron 1 of 39) intron (NM_030962, intron 1 of 39) 1285 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 543.334-2 chr4 137723794 137724362 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 178347 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 291-18 chr16 77807078 77807318 + 1.66667 NA intron (NM_020927, intron 1 of 8) intron (NM_020927, intron 1 of 8) 18634 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 232.334-6 chr3 52437180 52437394 + 1.66667 NA intron (NM_020163, intron 15 of 15) intron (NM_020163, intron 15 of 15) 7816 NM_020163 56920 Hs.59729 NM_020163 ENSG00000010319 SEMA3G sem2 semaphorin 3G protein-coding 223-45 chr4 60992441 60992626 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 69914 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 533.333 chr11 83802820 83803317 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) intron (NM_001142699, intron 17 of 27) -120643 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 422.334 chr10 65293671 65294080 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -277550 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 299.667-15 chr2 33361612 33361846 + 1.66667 NA intron (NM_206943, intron 28 of 33) MIRb|SINE|MIR -56787 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 266-46 chr2 179273881 179274044 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -9130 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 401.001 chr18 37273721 37274019 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_134588) promoter-TSS (NR_134588) -590 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 253.334-12 chr3 95748660 95748904 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -65589 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 186-87 chr5 151933077 151933238 + 1.66667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -8306 NM_001292000 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 230.334-8 chr2 67234911 67235138 + 1.66667 NA intron (NR_110568, intron 2 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL -19705 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 308-43 chr5 109846617 109846988 + 1.66667 NA intron (NM_002372, intron 18 of 21) intron (NM_002372, intron 18 of 21) -36380 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 262.334 chr1 193752309 193752487 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 447653 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 229-17 chr12 65472404 65472658 + 1.66667 NA intron (NR_120431, intron 3 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 84780 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 271-29 chr2 203526202 203526512 + 1.66667 NA intron (NM_001329728, intron 1 of 15) intron (NM_001329728, intron 1 of 15) 8944 NM_203365 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 219.667-36 chr18 66079029 66079163 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 328084 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 340.333-12 chr21 35387647 35387877 + 1.66667 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) L1MEf|LINE|L1 193002 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 385.333-10 chr13 56333418 56333761 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -807329 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 270-13 chr14 66853770 66853960 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) intron (NM_001024218, intron 4 of 21) -335575 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 312.333-24 chr7 3535354 3535745 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) MIR3|SINE|MIR 234297 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 206-95 chr20 14112716 14112895 + 1.66667 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 117289 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 259.667-91 chr9 126100849 126101010 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 174986 NR_121584 101929116 Hs.382124 NR_121584 ENSG00000228392 LOC101929116 - uncharacterized LOC101929116 ncRNA 356.667 chr1 91455013 91455429 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -45626 NM_001134419 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 477.333-3 chr4 140879609 140880013 + 1.66667 NA intron (NM_020724, intron 6 of 6) AluJr|SINE|Alu -123426 NM_015130 23158 Hs.480819 NM_015130 ENSG00000109436 TBC1D9 GRAMD9|MDR1 TBC1 domain family member 9 protein-coding 220.667-64 chr3 107598646 107598814 + 1.66667 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) MIR3|SINE|MIR 75768 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 256.333-30 chr14 82726720 82726946 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 84201 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 192.667-83 chr2 31878690 31878875 + 1.66667 NA intron (NR_126032, intron 5 of 6) intron (NR_126032, intron 5 of 6) -74802 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 312.667-32 chr6 48048227 48048434 + 1.66667 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) intron (NM_207499, intron 1 of 2) 20359 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 389.334-2 chr22 28518253 28518624 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluJr4|SINE|Alu 58569 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 239.667-55 chr4 181742251 181742524 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 87586 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 251.667-38 chr2 58165193 58165374 + 1.66667 NA intron (NR_156742, intron 4 of 9) intron (NR_156742, intron 4 of 9) 76097 NM_018062 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 281.333-29 chr2 29464256 29464522 + 1.66667 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) MER58A|DNA|hAT-Charlie 10988 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 277-57 chrX 105193034 105193254 + 1.66667 NA intron (NM_017416, intron 2 of 10) intron (NM_017416, intron 2 of 10) 27549 NM_001291277 56157 Hs.567543 NM_031274 ENSG00000268629 TEX13A - testis expressed 13A protein-coding 253.333-84 chr5 67132091 67132307 + 1.66667 NA intron (NM_001297651, intron 13 of 25) L1PA7|LINE|L1 64600 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 247.333-17 chr11 96759728 96759997 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 251437 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 202.334-2 chr10 98846084 98846240 + 1.66667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 78406 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 304.334-4 chr14 77508529 77508731 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_004863, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_004863, exon 12 of 12) -9814 NM_182509 145501 Hs.29742 NM_182509 ENSG00000100593 ISM2 TAIL1|THSD3 isthmin 2 protein-coding 323.667-10 chr17 40271700 40272020 + 1.66667 NA intron (NM_133264, intron 5 of 7) intron (NM_133264, intron 5 of 7) -16019 NM_001254 990 Hs.405958 NM_001254 ENSG00000094804 CDC6 CDC18L|HsCDC18|HsCDC6|MGORS5 cell division cycle 6 protein-coding 219-50 chr2 231350227 231350456 + 1.66667 NA intron (NM_001352754, intron 21 of 24) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -12367 NR_039937 100616317 NR_039937 ENSG00000263641 MIR4777 - microRNA 4777 ncRNA 256.666-25 chr3 2272803 2273067 + 1.66667 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) intron (NM_001206955, intron 1 of 23) 34106 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 501-2 chr14 71554419 71554969 + 1.66667 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -31604 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 236-72 chr5 126516602 126516846 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 51574 NM_001146322 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 348.333-30 chr7 3358838 3359106 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 57720 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 275.334-10 chr2 190527600 190527849 + 1.66667 NA intron (NR_136298, intron 1 of 8) MER1B|DNA|hAT-Charlie 6998 NM_001142645 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 513.667 chr12 10021490 10021908 + 1.66667 NA intron (NR_120484, intron 2 of 2) intron (NR_120484, intron 2 of 2) 8907 NR_120484 102724020 Hs.737731 NR_120484 ENSG00000256803 LOC102724020 - uncharacterized LOC102724020 ncRNA 308.333-22 chr2 137828455 137828778 + 1.66667 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 99316 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 270.333-65 chr8 119371963 119372250 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -44340 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 432.333-3 chr10 56311227 56311522 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 49885 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 252.333-4 chr1 187194565 187194877 + 1.66667 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) 101879 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 238.333-66 chr4 33950861 33951042 + 1.66667 NA intron (NR_125902, intron 3 of 4) L1MC1|LINE|L1 88942 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 312-44 chr5 73063432 73063780 + 1.66667 NA intron (NM_001146032, intron 16 of 24) intron (NM_001146032, intron 16 of 24) -56969 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 223.667-15 chr12 19173610 19173801 + 1.66667 NA intron (NM_019012, intron 3 of 25) intron (NM_019012, intron 3 of 25) -31620 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 222-8 chr1 234532926 234533079 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1223 NR_038426 100506795 Hs.448989 NR_038426 ENSG00000231768 LINC01354 - long intergenic non-protein coding RNA 1354 ncRNA 254.667-40 chr2 199843661 199843945 + 1.66667 NA intron (NM_001363886, intron 3 of 4) intron (NM_001363886, intron 3 of 4) 7370 NM_001350853 348751 Hs.734578 NM_001350853 ENSG00000226124 FTCDNL1 FONG formiminotransferase cyclodeaminase N-terminal like protein-coding 257-65 chr7 20990664 20990914 + 1.66667 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) AluSp|SINE|Alu 155358 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 307.667-42 chr9 103961534 103961867 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -38009 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 224.667-49 chr20 15263615 15263793 + 1.66667 NA intron (NM_001351663, intron 6 of 17) L1MA3|LINE|L1 66864 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 351-8 chr12 58448120 58448370 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -143457 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 219.667-53 chr3 29050542 29050750 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 230293 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 393.667-4 chr11 59363208 59363559 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1076 NM_001004729 390195 Hs.553755 NM_001004729 ENSG00000176495 OR5AN1 OR11-244 olfactory receptor family 5 subfamily AN member 1 protein-coding 423.334-3 chr8 118066077 118066515 + 1.66667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 45523 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 201-108 chr8 86727077 86727276 + 1.66667 NA intron (NM_019098, intron 2 of 17) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 16499 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 137.334-2 chr7 45322071 45322180 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 164334 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 436.667-9 chr5 164909447 164909741 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 439315 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 323.334-2 chr12 40293078 40293331 + 1.66667 NA intron (NM_198578, intron 20 of 50) L2a|LINE|L2 68207 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 275-12 chr13 93076931 93077115 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 31682 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 328.333-26 chr22 38557008 38557339 + 1.66667 NA intron (NM_001363017, intron 5 of 11) intron (NM_001363017, intron 5 of 11) 11236 NM_001278208 11144 Hs.339396 NM_007068 ENSG00000100206 DMC1 DMC1H|LIM15|dJ199H16.1 DNA meiotic recombinase 1 protein-coding 234.333-22 chr13 40603012 40603271 + 1.66667 NA intron (NM_002015, intron 1 of 2) intron (NM_002015, intron 1 of 2) 63500 NM_002015 2308 Hs.370666 NM_002015 ENSG00000150907 FOXO1 FKH1|FKHR|FOXO1A forkhead box O1 protein-coding 266-17 chr12 52961712 52962018 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12005 NM_001256293 3856 Hs.533782 NM_002273 ENSG00000170421 KRT8 CARD2|CK-8|CK8|CYK8|K2C8|K8|KO keratin 8 protein-coding 231.667-55 chr7 82900651 82900930 + 1.66667 NA intron (NM_033026, intron 9 of 24) L1MC4a|LINE|L1 262094 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 245.333-12 chr10 59010486 59010659 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 11054 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 261.667-43 chr20 54456366 54456595 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19113 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 222.667-65 chr4 66879277 66879523 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 542600 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 240.334-3 chr12 91482962 91483175 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -300251 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 242.334-15 chr8 8798863 8799082 + 1.66667 NA intron (NM_004225, intron 1 of 2) AluSg4|SINE|Alu 94658 NM_004225 9258 Hs.379414 NM_004225 ENSG00000147324 MFHAS1 LRRC65|MASL1|ROCO4 malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 protein-coding 158-124 chr7 17309407 17309568 + 1.66667 NA intron (NM_001621, intron 1 of 10) intron (NM_001621, intron 1 of 10) 10835 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 279-24 chr4 97555015 97555328 + 1.66667 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 188245 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 406.334-2 chr2 33677479 33677865 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -29214 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 322.333-13 chr2 34614677 34615027 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -62705 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 268-44 chr4 142280894 142281078 + 1.66667 NA intron (NM_001331040, intron 9 of 25) intron (NM_001331040, intron 9 of 25) 565549 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 267.334-7 chr16 5205175 5205401 + 1.66667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -107468 NM_001289029 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 208.333-19 chr11 77359884 77360119 + 1.66667 NA intron (NM_001128620, intron 5 of 15) L2b|LINE|L2 -58335 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 648.667 chr6 54373803 54374472 + 1.66667 NA intron (NM_014464, intron 9 of 10) intron (NM_014464, intron 9 of 10) 65696 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 200.333-109 chr4 174589198 174589383 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -66392 NM_001145816 3248 Hs.596913 NM_000860 ENSG00000164120 HPGD 15-PGDH|PGDH|PGDH1|PHOAR1|SDR36C1 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase protein-coding 217.333-42 chr14 44741911 44742176 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 57083 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 265.333-65 chr5 24275614 24275862 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 324390 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 255.667-19 chr12 56869495 56869665 + 1.66667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 64828 NM_148897 121214 Hs.380178 NM_148897 ENSG00000170426 SDR9C7 ARCI13|RDHS|SDR-O|SDRO short chain dehydrogenase/reductase family 9C member 7 protein-coding 295.667-9 chr14 48893891 48894149 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 692360 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 224.667-29 chr16 26452536 26452683 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 427372 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 264.667-56 chr3 130683063 130683250 + 1.66667 NA intron (NM_014602, intron 16 of 19) L2a|LINE|L2 63673 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 244.667-20 chr11 12586071 12586220 + 1.66667 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -88276 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 198.667-14 chr1 214944730 214944885 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -60735 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 272-2 chr10 56399841 56400101 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -38698 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 280.667-58 chr8 114961303 114961504 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 706610 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 251.334-11 chr12 27526885 27527125 + 1.66667 NA intron (NM_003622, intron 1 of 29) intron (NM_003622, intron 1 of 29) 2799 NM_001198916 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 237.667-15 chr11 93183430 93183673 + 1.66667 NA intron (NM_152313, intron 3 of 10) intron (NM_152313, intron 3 of 10) 13875 NM_001286139 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 252-52 chr2 183203778 183203934 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 79413 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 210-43 chr14 81697725 81698002 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 45275 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 349.334-8 chr7 38813151 38813582 + 1.66667 NA intron (NM_014396, intron 7 of 28) L1MB7|LINE|L1 95825 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 364.667-13 chr5 80524181 80524516 + 1.66667 NA intron (NM_205548, intron 5 of 5) L1MA9|LINE|L1 36248 NM_205548 167555 Hs.338182 NM_205548 ENSG00000152380 FAM151B UNQ9217 family with sequence similarity 151 member B protein-coding 234.667-2 chr1 90373790 90373959 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -283876 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 202.334-5 chr5 71909442 71909654 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 190273 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 249-8 chr10 18090066 18090267 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50258 NM_001167945 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 292.334-12 chr7 28477820 28478033 + 1.66667 NA intron (NM_004904, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu 42311 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 322.334-3 chr14 66479594 66479906 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6621 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 280.334-14 chr8 127027005 127027294 + 1.66667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 13995 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 335.334-6 chr3 30863589 30863866 + 1.66667 NA intron (NM_207359, intron 1 of 14) intron (NM_207359, intron 1 of 14) 30934 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 215.667-66 chr2 178383532 178383765 + 1.66667 NA intron (NM_001201480, intron 18 of 25) intron (NM_001201480, intron 18 of 25) -30011 NR_110204 101927027 Hs.715694 NR_110204 ENSG00000223960 CHROMR CHROME|PRKRA-AS1 cholesterol induced regulator of metabolism RNA ncRNA 228.333-97 chr8 73853550 73853753 + 1.66667 NA intron (NR_073119, intron 1 of 5) intron (NR_073119, intron 1 of 5) 25211 NM_001271015 55284 Hs.128841 NM_018299 ENSG00000104343 UBE2W UBC-16|UBC16 ubiquitin conjugating enzyme E2 W protein-coding 295.667-31 chr7 25974926 25975152 + 1.66667 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -25053 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 353-9 chr2 29130032 29130398 + 1.66667 NA intron (NM_001287528, intron 2 of 14) intron (NM_001287528, intron 2 of 14) 14800 NM_001287527 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 237.667-3 chr1 188619143 188619380 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1175633 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 245-57 chr5 110475086 110475273 + 1.66667 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) L1MEg1|LINE|L1 38736 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 243.334-16 chr8 91405034 91405236 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 155816 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 238-17 chr12 78834176 78834378 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -29705 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 236.333-83 chr7 9765693 9765849 + 1.66667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 131501 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 486-6 chr17 53832625 53832932 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 9851 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 252.667-7 chr1 118637320 118637546 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 350910 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 295.334-3 chr14 57209867 57210132 + 1.66667 NA exon (NM_006544, exon 16 of 18) exon (NM_006544, exon 16 of 18) 58906 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 180.667-107 chr4 180759704 180759861 + 1.66667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 399367 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 492.333-3 chr4 30821314 30821811 + 1.66667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 101193 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 244-95 chr8 13545912 13546114 + 1.66667 NA intron (NM_001348082, intron 1 of 16) intron (NM_001348082, intron 1 of 16) -20856 NM_001007090 157773 Hs.104941 NM_001007090 ENSG00000164743 C8orf48 - chromosome 8 open reading frame 48 protein-coding 293.667-6 chr10 30493479 30493659 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 58923 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 198.667-50 chr12 84127702 84127889 + 1.66667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 785004 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 272.667-37 chr20 58735353 58735570 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -37964 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 501.333-8 chr6 157056850 157057733 + 1.66667 NA intron (NM_001363725, intron 2 of 17) intron (NM_001363725, intron 2 of 17) 20864 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 240.334-7 chr2 194007484 194007664 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -336695 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 229.667-46 chr2 199709208 199709368 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 101220 NR_110270 101927641 Hs.549598 NR_110270 ENSG00000238217 LINC01877 - long intergenic non-protein coding RNA 1877 ncRNA 232.667-47 chr22 27345871 27346092 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 35330 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 307-31 chr5 43383635 43383915 + 1.66667 NA intron (NM_001301874, intron 2 of 3) intron (NM_001301874, intron 2 of 3) 13362 NM_001301875 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 513.334-2 chr12 44537501 44537908 + 1.66667 NA intron (NM_006159, intron 16 of 20) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 337957 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 307.333-69 chr6 154280273 154280606 + 1.66667 NA intron (NM_015553, intron 2 of 11) L1ME3B|LINE|L1 49642 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 340-10 chr14 26059497 26059968 + 1.66667 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 493698 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 116-104 chr3 43003702 43003848 + 1.66667 NA intron (NM_001129908, intron 1 of 4) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 24464 NM_001129908 729085 Hs.729533 NM_001129908 ENSG00000144649 GASK1A C3orf41|FAM198A golgi associated kinase 1A protein-coding 261.667-31 chr18 68478727 68479042 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 236224 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 254-32 chr2 22230211 22230387 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -306180 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 305.667-25 chr3 185592070 185592419 + 1.66667 NA intron (NM_021627, intron 2 of 16) AluJo|SINE|Alu 5949 NM_021627 59343 Hs.401388 NM_021627 ENSG00000163904 SENP2 AXAM2|SMT3IP2 SUMO specific peptidase 2 protein-coding 335.667-17 chr3 21648324 21648565 + 1.66667 NA intron (NM_024697, intron 2 of 7) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 102766 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 325.333-46 chr7 38031387 38031617 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 110183 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 249.333-87 chr6 12074930 12075182 + 1.66667 NA intron (NM_002114, intron 2 of 8) intron (NM_002114, intron 2 of 8) 62744 NM_002114 3096 Hs.567284 NM_002114 ENSG00000095951 HIVEP1 CIRIP|CRYBP1|GAAP|MBP-1|PRDII-BF1|Schnurri-1|ZAS1|ZNF40|ZNF40A human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 protein-coding 205.667-93 chr3 45751972 45752153 + 1.66667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 44474 NM_020208 54716 Hs.413095 NM_020208 ENSG00000163817 SLC6A20 SIT1|XT3|Xtrp3 solute carrier family 6 member 20 protein-coding 438-11 chr6 53859277 53859753 + 1.66667 NA intron (NM_018214, intron 2 of 13) intron (NM_018214, intron 2 of 13) 64510 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 359-12 chr5 6408727 6409291 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -30462 NM_032286 84246 Hs.13885 NM_032286 ENSG00000133398 MED10 L6|NUT2|TRG20 mediator complex subunit 10 protein-coding 228.334-4 chr21 30432887 30433086 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 2732 NM_181600 284827 Hs.553677 NM_181600 ENSG00000186971 KRTAP13-4 KAP13.4 keratin associated protein 13-4 protein-coding 159-3 chr1 33559579 33559697 + 1.66667 NA intron (NM_001281956, intron 53 of 70) intron (NM_001281956, intron 53 of 70) 86993 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 258-23 chr18 6533021 6533257 + 1.66667 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) intron (NR_120518, intron 2 of 5) 21723 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 354.667-8 chr12 2839037 2839443 + 1.66667 NA intron (NR_147202, intron 14 of 15) AluSz|SINE|Alu -4205 NM_031474 83714 Hs.530816 NM_031474 ENSG00000053702 NRIP2 - nuclear receptor interacting protein 2 protein-coding 376-9 chr18 10106605 10107169 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 192871 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 261.334-19 chr7 6093888 6094045 + 1.66667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -10983 NM_001365764 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 285 chr1 154713069 154713276 + 1.66667 NA intron (NM_170782, intron 7 of 7) intron (NM_170782, intron 7 of 7) -85175 NM_001365045 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 239-50 chr4 91351210 91351415 + 1.66667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 925990 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 291-15 chr14 65690251 65690508 + 1.66667 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) L1MC2|LINE|L1 219277 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 185.667-125 chr8 27424541 27424740 + 1.66667 NA intron (NM_173175, intron 5 of 29) intron (NM_173175, intron 5 of 29) -8730 NR_106901 102465507 NR_106901 ENSG00000273836 MIR6842 hsa-mir-6842 microRNA 6842 ncRNA 243.666-29 chr4 143690334 143690554 + 1.66667 NA intron (NM_001168235, intron 2 of 7) intron (NM_001168235, intron 2 of 7) 10231 NM_001168235 166752 Hs.252714 NM_001168235 ENSG00000183090 FREM3 - FRAS1 related extracellular matrix 3 protein-coding 297.667-28 chr4 117073221 117073489 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 12221 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 276.667-34 chr17 58833988 58834268 + 1.66667 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 78259 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 255.667-20 chr12 115138144 115138436 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -454115 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 268.334-3 chr10 101802766 101802971 + 1.66667 NA intron (NM_012215, intron 7 of 15) AluSx|SINE|Alu 15576 NM_012215 10724 Hs.500842 NM_012215 ENSG00000198408 OGA MEA5|MGEA5|NCOAT O-GlcNAcase protein-coding 206.667-14 chr10 17797710 17797919 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001098844, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001098844, exon 4 of 4) -11534 NM_002438 4360 Hs.75182 NM_002438 ENSG00000260314 MRC1 CD206|CLEC13D|CLEC13DL|MMR|MRC1L1|bA541I19.1|hMR mannose receptor C-type 1 protein-coding 345.334-3 chr18 69286866 69287337 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -113787 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 229-70 chr8 128529808 128530059 + 1.66667 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 34746 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 271.667-8 chr10 15927307 15927482 + 1.66667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -66861 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 397.334-2 chr14 49174614 49175064 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 411541 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 388.667-5 chr15 74567079 74567406 + 1.66667 NA intron (NM_001307939, intron 2 of 8) intron (NM_001307939, intron 2 of 8) 26022 NM_006465 10620 Hs.647642 NM_006465 ENSG00000179361 ARID3B BDP|DRIL2 AT-rich interaction domain 3B protein-coding 254.334-31 chr7 19516686 19516857 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 188665 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 259.333-66 chr22 48110125 48110407 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -164098 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 497.333-6 chr5 139975491 139976269 + 1.66667 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) intron (NM_013983, intron 1 of 10) 67419 NM_013982 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 247.667-71 chr4 39164652 39164828 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17789 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 230-46 chr4 28625172 28625322 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -194335 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 266.333-60 chr7 84120384 84120608 + 1.66667 NA intron (NM_006080, intron 3 of 16) intron (NM_006080, intron 3 of 16) 74293 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 273.001 chr1 219735920 219736083 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -122856 NM_001355457 643136 Hs.647764 NM_001085394 ENSG00000215817 ZC3H11B ZC3HDC11B zinc finger CCCH-type containing 11B protein-coding 434.334-3 chr22 31722076 31722489 + 1.66667 NA intron (NM_173566, intron 3 of 8) AluSx|SINE|Alu 27850 NM_173566 253143 Hs.438906 NM_173566 ENSG00000183530 PRR14L C22orf30 proline rich 14 like protein-coding 324-31 chr8 116692331 116692572 + 1.66667 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 40351 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 327.667-14 chr17 60588653 60588998 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11358 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 362-7 chr11 114523022 114523338 + 1.66667 NA intron (NM_152315, intron 4 of 5) intron (NM_152315, intron 4 of 5) 36701 NM_001367953 120400 Hs.550126 NM_152315 ENSG00000095110 NXPE1 FAM55A neurexophilin and PC-esterase domain family member 1 protein-coding 410.667-3 chr10 70426899 70427454 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_004096, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_004096, exon 3 of 3) 14505 NM_018055 4838 Hs.370414 NM_018055 ENSG00000156574 NODAL HTX5 nodal growth differentiation factor protein-coding 290.667-28 chr3 81131858 81132149 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 138135 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 244.667-47 chr17 73879483 73879632 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -51020 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 379.334-4 chr17 72953218 72953614 + 1.66667 NA intron (NM_001352692, intron 4 of 9) intron (NM_001352692, intron 4 of 9) 139272 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 264.334 chr1 64055229 64055436 + 1.66667 NA intron (NM_005012, intron 4 of 8) Zaphod|DNA|hAT-Tip100 56873 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 272.667-41 chr3 45956912 45957146 + 1.66667 NA intron (NM_024513, intron 13 of 17) L1M5|LINE|L1 13565 NM_006564 10663 Hs.34526 NM_006564 ENSG00000172215 CXCR6 BONZO|CD186|STRL33|TYMSTR C-X-C motif chemokine receptor 6 protein-coding 200.667-5 chr1 54954541 54954730 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25993 NM_182532 199964 Hs.663950 NM_182532 ENSG00000143001 TMEM61 - transmembrane protein 61 protein-coding 303-28 chr19 46052380 46052739 + 1.66667 NA intron (NR_163177, intron 2 of 5) AluSq2|SINE|Alu -11543 NM_001002923 444882 Hs.531310 NM_001002923 ENSG00000204869 IGFL4 - IGF like family member 4 protein-coding 319.333-36 chr9 69361579 69362033 + 1.66667 NA intron (NM_001127608, intron 2 of 10) HAL1|LINE|L1 32481 NM_004816 9413 Hs.118003 NM_004816 ENSG00000135063 FAM189A2 C9orf61|X123 family with sequence similarity 189 member A2 protein-coding 293.667-26 chr2 77349305 77349661 + 1.66667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 172893 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 388.001 chr17 30042890 30043233 + 1.66667 NA intron (NR_026738, intron 8 of 15) FLAM_A|SINE|Alu -73746 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 323.333-34 chr8 112345383 112345855 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 37 of 66) L1MA8|LINE|L1 -297874 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 260.667-5 chr1 145922351 145922522 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_005105, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_005105, exon 6 of 6) 3092 NR_104033 114814 Hs.356873 NM_057163 ENSG00000211451 GNRHR2 GnRH-II-R gonadotropin releasing hormone receptor 2 (pseudogene) pseudo 245.667-19 chr14 55141319 55141502 + 1.66667 NA intron (NR_003225, intron 2 of 3) intron (NR_003225, intron 2 of 3) 4427 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 644.999 chr3 81253567 81254301 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 260066 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 344-7 chr12 56606905 56607308 + 1.66667 NA intron (NM_001351156, intron 12 of 30) intron (NM_001351156, intron 12 of 30) 23220 NM_001300905 11176 Hs.314263 NM_013449 ENSG00000076108 BAZ2A TIP5|WALp3 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A protein-coding 467.667-2 chr12 74599910 74600323 + 1.66667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 62281 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 334-3 chr10 71409167 71409643 + 1.66667 NA intron (NM_052836, intron 1 of 12) intron (NM_052836, intron 1 of 12) 12471 NM_001171932 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 295.333-49 chr4 167897367 167897574 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -195067 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 276-67 chr9 87168062 87168313 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 19543 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 254.333-10 chr11 132391728 132391966 + 1.66667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 107545 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 316.667-15 chr2 31544216 31544415 + 1.66667 NA intron (NM_000348, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 36623 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 266.666-30 chr8 107525215 107525512 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -27445 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 299.999-4 chr16 69355349 69355596 + 1.66667 NA TTS (NM_005652) TTS (NM_005652) -3686 NM_144676 146456 Hs.729118 NM_144676 ENSG00000157315 TMED6 PRO34237|SPLL9146|p24g5 transmembrane p24 trafficking protein 6 protein-coding 257.333-83 chr5 99055032 99055308 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -125456 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 230-79 chr9 69298040 69298189 + 1.66667 NA intron (NR_047671, intron 3 of 3) intron (NR_047671, intron 3 of 3) 8942 NR_047671 100885775 Hs.49768 NR_047671 ENSG00000278910 BANCR LINC00586 BRAF-activated non-protein coding RNA ncRNA 272-8 chr12 24309610 24309918 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 86493 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 234.334-16 chr6 55908475 55908623 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -32959 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 256.667-68 chr4 70970664 70970961 + 1.66667 NA intron (NM_173468, intron 3 of 5) intron (NM_173468, intron 3 of 5) -22837 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 235-19 chr14 50827209 50827437 + 1.66667 NA intron (NM_016350, intron 2 of 28) intron (NM_016350, intron 2 of 28) 3798 NM_016350 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 424.333-5 chr3 140847659 140848114 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -93950 NM_018155 55186 Hs.144130 NM_018155 ENSG00000114120 SLC25A36 PNC2 solute carrier family 25 member 36 protein-coding 263-59 chr6 52271701 52271908 + 1.66667 NA intron (NR_158963, intron 9 of 13) L2c|LINE|L2 12938 NM_002388 4172 Hs.179565 NM_002388 ENSG00000112118 MCM3 HCC5|P1-MCM3|P1.h|RLFB minichromosome maintenance complex component 3 protein-coding 275-25 chr2 113216956 113217184 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_013992, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_013992, exon 9 of 9) -18457 NR_047570 654433 Hs.656660 NR_015377 ENSG00000189223 PAX8-AS1 - PAX8 antisense RNA 1 ncRNA 245.667-58 chr5 114466154 114466441 + 1.66667 NA intron (NM_021614, intron 4 of 7) intron (NM_021614, intron 4 of 7) 32786 NR_103458 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 377-6 chr17 61584873 61585340 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6113 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 288.333-36 chr7 108777780 108778208 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 106593 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 334.667-4 chr10 16676646 16676894 + 1.66667 NA intron (NM_152724, intron 7 of 7) intron (NM_152724, intron 7 of 7) 140654 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 272-25 chr2 149455667 149455991 + 1.66667 NA intron (NM_194317, intron 3 of 4) intron (NM_194317, intron 3 of 4) 125242 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 275-36 chr3 184942829 184943024 + 1.66667 NA intron (NM_001009921, intron 35 of 46) intron (NM_001009921, intron 35 of 46) 130419 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 311-6 chr11 22812055 22812319 + 1.66667 NA non-coding (NR_147085, exon 11 of 11) non-coding (NR_147085, exon 11 of 11) 17192 NR_135213 258010 Hs.349096 NM_148893 ENSG00000198168 SVIP - small VCP interacting protein protein-coding 378.334-5 chrX 34793884 34794168 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -136741 NM_031442 83604 Hs.8769 NM_031442 ENSG00000147027 TMEM47 BCMP1|TM4SF10|VAB-9 transmembrane protein 47 protein-coding 283-21 chr3 79974185 79974422 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -206305 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 467.001 chr2 173771476 173771950 + 1.66667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 192167 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 283.333-34 chr2 81965700 81966030 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -498919 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 291.667-13 chr14 63867844 63868137 + 1.66667 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) AluJr|SINE|Alu 14986 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 329.667-7 chr15 63751707 63751919 + 1.66667 NA intron (NM_003922, intron 8 of 77) intron (NM_003922, intron 8 of 77) 82135 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 262-34 chr18 1239842 1240028 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 119694 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 416.001-3 chr6 145227757 145228095 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 458951 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 319-14 chr2 70763362 70763648 + 1.66667 NA intron (NM_017482, intron 1 of 12) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 4210 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 226.334-6 chr2 67060291 67060462 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -26070 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 310.333-4 chr1 109412438 109412793 + 1.66667 NA intron (NM_001199774, intron 4 of 8) intron (NM_001199774, intron 4 of 8) 13833 NM_002790 5686 Hs.485246 NM_002790 ENSG00000143106 PSMA5 PSC5|ZETA proteasome subunit alpha 5 protein-coding 506.667 chr10 100008080 100008773 + 1.66667 NA intron (NM_015221, intron 1 of 16) intron (NM_015221, intron 1 of 16) 1521 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 235.333-69 chr3 11573359 11573658 + 1.66667 NA intron (NM_001128219, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 -4710 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 345.667-5 chr11 82186493 82186803 + 1.66667 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 217265 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 345.667-7 chr15 40384785 40385013 + 1.66667 NA intron (NM_033286, intron 2 of 8) intron (NM_033286, intron 2 of 8) 2178 NM_033286 90417 Hs.525796 NM_033286 ENSG00000128944 KNSTRN C15orf23|HSD11|SKAP|TRAF4AF1 kinetochore localized astrin (SPAG5) binding protein protein-coding 204.333-85 chr18 69575461 69575747 + 1.66667 NA intron (NM_152721, intron 2 of 7) intron (NM_152721, intron 2 of 7) 105673 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 243-23 chr2 16851195 16851402 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -185464 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 263.667-11 chr10 72727612 72727776 + 1.66667 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) L2a|LINE|L2 6665 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 232-79 chr6 142885929 142886192 + 1.66667 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 59116 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 175-75 chr6 136667431 136667583 + 1.66667 NA intron (NM_005923, intron 8 of 29) AluJb|SINE|Alu 38393 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 281.667-58 chr9 112461142 112461390 + 1.66667 NA intron (NM_001350649, intron 3 of 4) AluSq2|SINE|Alu -25561 NM_133465 158405 Hs.656619 NM_133465 ENSG00000165185 KIAA1958 - KIAA1958 protein-coding 276-46 chr3 68116445 68116697 + 1.66667 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) intron (NM_001252216, intron 2 of 4) 112324 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 218.333-73 chr2 167120079 167120259 + 1.66667 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 20786 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 339.667-16 chr3 82448825 82449095 + 1.66667 NA intron (NR_147146, intron 4 of 8) THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 462818 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 276-31 chr17 62316104 62316442 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -40618 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 286.667-20 chr2 204066016 204066312 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 129416 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 238.667-86 chr8 53049450 53049625 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 109629 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 321.666-8 chr3 79347218 79347649 + 1.66667 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -64294 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 288.999-4 chr19 57925554 57925877 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001317030, exon 2 of 4) 3' UTR (NM_001317030, exon 2 of 4) -9123 NM_001297734 147687 Hs.567710 NM_152475 ENSG00000173480 ZNF417 - zinc finger protein 417 protein-coding 259-27 chr2 134841008 134841180 + 1.66667 NA intron (NM_138326, intron 1 of 9) intron (NM_138326, intron 1 of 9) 2478 NM_138326 130013 Hs.655728 NM_138326 ENSG00000153086 ACMSD - aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase protein-coding 219.667-30 chr17 20052413 20052707 + 1.66667 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) intron (NM_001243439, intron 1 of 14) -34462 NM_152904 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 257.667-73 chr6 169606304 169606494 + 1.66667 NA intron (NM_182552, intron 22 of 25) L1PA10|LINE|L1 95630 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 296-48 chr4 141150565 141150819 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17223 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 300-62 chr7 131391477 131391713 + 1.66667 NA intron (NM_001321316, intron 4 of 17) intron (NM_001321316, intron 4 of 17) 63719 NM_013255 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 334.334-2 chr12 44737488 44737826 + 1.66667 NA intron (NM_006159, intron 10 of 20) intron (NM_006159, intron 10 of 20) 138004 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 441.334 chr2 111206381 111206741 + 1.66667 NA intron (NR_136162, intron 4 of 4) L1ME3|LINE|L1 85647 NM_138626 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 403.999-6 chr8 98544783 98545147 + 1.66667 NA intron (NM_006281, intron 9 of 10) intron (NM_006281, intron 9 of 10) 118007 NM_020697 3788 Hs.388045 NM_020697 ENSG00000156486 KCNS2 KV9.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 2 protein-coding 600.667-2 chr3 74126756 74127309 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 317788 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 241.667-75 chr5 77072158 77072343 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_032367, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_032367, exon 3 of 3) 8321 NR_003014 677828 Hs.693249 NR_003014 ENSG00000238961 SNORA47 HBI-115 small nucleolar RNA, H/ACA box 47 snoRNA 246-87 chr5 100003924 100004099 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 384243 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 422-5 chr16 13237697 13238163 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001145204, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001145204, exon 5 of 5) 336332 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 236.667-33 chr17 68636416 68636596 + 1.66667 NA intron (NR_110825, intron 1 of 4) HAL1|LINE|L1 8352 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 238-98 chr7 95451128 95451369 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16176 NM_001018161 5445 Hs.514420 NM_000305 ENSG00000105854 PON2 - paraoxonase 2 protein-coding 291-37 chr5 24740811 24741145 + 1.66667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -96000 NM_001362460 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 275 chr1 4247951 4248192 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -163980 NR_027088 284661 Hs.278112 NR_027088 ENSG00000235054 LINC01777 - long intergenic non-protein coding RNA 1777 ncRNA 259-28 chr2 138083922 138084165 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17841 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 294.334-6 chr4 43514587 43514786 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22143 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 236-15 chr11 106897474 106897633 + 1.66667 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) L1MC1|LINE|L1 120923 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 277.667-33 chr3 131200090 131200332 + 1.66667 NA intron (NM_001353043, intron 14 of 17) L1ME3B|LINE|L1 -161634 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 259-11 chr12 83330082 83330259 + 1.66667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 643015 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 417.333-5 chr2 144601948 144602495 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -65746 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 307.334-5 chr17 82625031 82625295 + 1.66667 NA intron (NM_019613, intron 5 of 9) intron (NM_019613, intron 5 of 9) 23281 NM_019613 56270 Hs.132161 NM_019613 ENSG00000141580 WDR45B NEDSBAS|WDR45L|WIPI-3|WIPI3 WD repeat domain 45B protein-coding 278.999 chr1 43251685 43252013 + 1.66667 NA intron (NM_001195831, intron 23 of 23) HAL1|LINE|L1 -18134 NM_001320244 128218 Hs.104476 NM_144626 ENSG00000179178 TMEM125 - transmembrane protein 125 protein-coding 234.667-28 chr13 94041394 94041634 + 1.66667 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) intron (NM_005708, intron 4 of 8) 146477 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 298-49 chr2 233520753 233521069 + 1.66667 NA intron (NM_001365479, intron 17 of 31) intron (NM_001365479, intron 17 of 31) 44662 NM_018218 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 392-6 chr16 10218116 10218637 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -35468 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 397.334-6 chr3 18758227 18758576 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -312809 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 206.333-127 chr5 37974482 37974706 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26103 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 258.333-54 chr6 85978609 85978876 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -300009 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 468.001 chr12 99021355 99021662 + 1.66667 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) intron (NM_152788, intron 17 of 25) -71851 NR_110095 101928937 Hs.555499 NR_110095 ENSG00000258039 LOC101928937 - uncharacterized LOC101928937 ncRNA 313.667-26 chr2 196454298 196454654 + 1.66667 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) L1ME4a|LINE|L1 -92299 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 341.667-9 chr16 73479797 73480140 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 93163 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 249.334-8 chr12 99026734 99026967 + 1.66667 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) intron (NM_152788, intron 17 of 25) -66509 NR_110095 101928937 Hs.555499 NR_110095 ENSG00000258039 LOC101928937 - uncharacterized LOC101928937 ncRNA 342.667-5 chr18 12603186 12603432 + 1.66667 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 53423 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 325-4 chr1 175059039 175059353 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -8637 NM_022093 63923 Hs.156369 NM_022093 ENSG00000120332 TNN TN-W tenascin N protein-coding 187.334-2 chr4 54933614 54933756 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 191910 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 213-6 chr1 223624634 223624855 + 1.66667 NA intron (NM_001143962, intron 6 of 20) AluJo|SINE|Alu 40957 NM_001143962 388743 Hs.291487 NM_001143962 ENSG00000203697 CAPN8 nCL-2 calpain 8 protein-coding 305.667-20 chr20 13705184 13705534 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -66423 NR_136630 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 269.333-34 chr18 23490230 23490580 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -13065 NM_001318707 29919 Hs.464779 NM_013326 ENSG00000141452 RMC1 C18orf8|HsT2591|MIC1|Mic-1|WDR98 regulator of MON1-CCZ1 protein-coding 265.333-75 chr7 41601011 41601291 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -92768 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 314.667-5 chr10 62935474 62935728 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -116434 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 223.334-5 chr11 110117285 110117518 + 1.66667 NA intron (NM_033390, intron 1 of 5) intron (NM_033390, intron 1 of 5) 24009 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 262.333-76 chr8 107473389 107473649 + 1.66667 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 24399 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 240-22 chr14 52618754 52618904 + 1.66667 NA intron (NR_148417, intron 4 of 7) intron (NR_148417, intron 4 of 7) 65993 NR_148417 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 361.334-2 chr2 67985023 67985478 + 1.66667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 77754 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 276-10 chr10 113033269 113033579 + 1.66667 NA intron (NM_001367943, intron 4 of 14) AluJr|SINE|Alu -11931 NR_132769 106635520 NR_132769 SNORA87 - small nucleolar RNA, H/ACA box 87 snoRNA 358-22 chr5 130962127 130962382 + 1.66667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 203002 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 311.666-14 chr6 121847314 121847718 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 411870 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 187.667-62 chr18 48593770 48593941 + 1.66667 NA intron (NM_001142397, intron 2 of 12).2 intron (NM_001142397, intron 2 of 12).2 54824 NM_001142397 9811 Hs.145230 NM_014772 ENSG00000134030 CTIF Gm672|KIAA0427 cap binding complex dependent translation initiation factor protein-coding 302-57 chr5 142578976 142579300 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 42196 NM_001144892 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 273-22 chr20 13367311 13367616 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -127776 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 260-49 chr21 41987659 41987856 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001320729, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001320729, exon 3 of 3) -21437 NR_119384 150142 Hs.143833 NM_198078 ENSG00000237232 ZNF295-AS1 C21orf121|NCRNA00318|PRED87 ZNF295 antisense RNA 1 ncRNA 271-42 chr7 117492392 117492704 + 1.66667 NA intron (NM_000492, intron 1 of 26) L2c|LINE|L2 12585 NM_000492 1080 Hs.489786 NM_000492 ENSG00000001626 CFTR ABC35|ABCC7|CF|CFTR/MRP|MRP7|TNR-CFTR|dJ760C5.1 CF transmembrane conductance regulator protein-coding 279.333-69 chr7 32358384 32358693 + 1.66667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) -59210 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 246.667-85 chr7 22626359 22626517 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 39095 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 511.333-2 chr18 13749349 13749778 + 1.66667 NA intron (NM_003799, intron 9 of 11) intron (NM_003799, intron 9 of 11) 22890 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 493-2 chr2 150684737 150685094 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 56018 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 514.667 chr2 171941745 171942281 + 1.66667 NA intron (NR_027862, intron 2 of 9) AluSx|SINE|Alu 19552 NM_003642 8520 Hs.632532 NM_003642 ENSG00000128708 HAT1 KAT1 histone acetyltransferase 1 protein-coding 241.667-29 chr17 50298207 50298509 + 1.66667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -10503 NR_125805 103752589 Hs.612913 NR_125805 ENSG00000251179 TMEM92-AS1 TCONS_00025237|lncRNA-508851 TMEM92 antisense RNA 1 ncRNA 272.667-45 chr4 60742283 60742510 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -180223 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 253.334-14 chr4 46900197 46900419 + 1.66667 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) LTR68|LTR|ERV1 8937 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 241.667-94 chr8 134830940 134831124 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7037 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 174.334 chr11 15969180 15969310 + 1.66667 NA TTS (NR_106721) TTS (NR_106721) 376 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 226.333-22 chr12 16879129 16879310 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -109528 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 370.666-14 chr4 100018657 100018957 + 1.66667 NA intron (NR_125923, intron 1 of 3) intron (NR_125923, intron 1 of 3) 68313 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 255-17 chr10 116385984 116386178 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -41766 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 347-3 chr10 77029141 77029498 + 1.66667 NA intron (NM_001271519, intron 15 of 28) intron (NM_001271519, intron 15 of 28) -111512 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 311.666-15 chr8 68407714 68408119 + 1.66667 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) HAL1ME|LINE|L1 -76425 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 189.667-94 chr3 80856940 80857129 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 86330 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 247 chr1 60639438 60639673 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16870 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 275.334-12 chr6 71305351 71305545 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_024576, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_024576, exon 7 of 7) 16637 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 300.333-11 chr14 48787795 48788111 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 798427 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 256-42 chr2 104126322 104126529 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 281907 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 336.333-30 chr6 26632845 26633120 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26764 NM_024639 79692 Hs.126280 NM_024639 ENSG00000181315 ZNF322 HCG12|ZNF322A|ZNF388|ZNF489 zinc finger protein 322 protein-coding 239.333-36 chr14 82177936 82178115 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -434887 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 255.333-73 chr3 139211532 139211834 + 1.66667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 21839 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 549.001 chr14 63801062 63801619 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -51625 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 266.667-40 chr2 115265236 115265483 + 1.66667 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) -43878 NM_020868 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 275.667-62 chr8 52665854 52666091 + 1.66667 NA intron (NM_001083617, intron 8 of 23) L1MEg|LINE|L1 48463 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 259-5 chr1 234880914 234881211 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 82937 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 433-3 chr11 123738505 123738818 + 1.66667 NA intron (NM_001301780, intron 1 of 6) intron (NM_001301780, intron 1 of 6) 2999 NM_001301779 7753 Hs.112556 NM_003455 ENSG00000166261 ZNF202 ZKSCAN10|ZSCAN42 zinc finger protein 202 protein-coding 265-7 chr1 150881984 150882312 + 1.66667 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -5105 NR_148929 100996521 Hs.208452 NR_148929 CTXND2 - cortexin domain containing 2 ncRNA 230-24 chr15 57149524 57149762 + 1.66667 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -69787 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 231.667-15 chr14 43054903 43055076 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1448133 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 263-22 chr14 85696068 85696332 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 162851 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 270.667-53 chr8 76814261 76814525 + 1.66667 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -131118 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 328.333-33 chr5 157504287 157504676 + 1.66667 NA intron (NM_033274, intron 11 of 22) AluSx|SINE|Alu -44381 NR_136204 102724404 Hs.570889 NR_136204 LOC102724404 - uncharacterized LOC102724404 ncRNA 194.667-122 chr5 60132114 60132315 + 1.66667 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) intron (NM_001349243, intron 2 of 16) -238488 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 232.333-77 chr6 92837868 92838061 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 581595 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 271.334-12 chr19 37351175 37351365 + 1.66667 NA intron (NM_001329779, intron 4 of 4) L1ME3D|LINE|L1 16621 NM_001353804 284459 Hs.640243 NM_181786 ENSG00000181666 ZNF875 HKR1 zinc finger protein 875 protein-coding 206.334-3 chr12 4359742 4359962 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_020375, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_020375, exon 6 of 6) 19860 NM_020638 8074 Hs.287370 NM_020638 ENSG00000118972 FGF23 ADHR|FGFN|HFTC2|HPDR2|HYPF|PHPTC fibroblast growth factor 23 protein-coding 200.667-49 chr15 61163080 61163239 + 1.66667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 66143 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 240.666-10 chr12 24635709 24636006 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -51689 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 407.333 chr1 65204141 65204633 + 1.66667 NA intron (NM_001005353, intron 3 of 5) AluSz|SINE|Alu 55393 NM_001330616 205 Hs.10862 NM_013410 ENSG00000162433 AK4 AK 4|AK3|AK3L1|AK3L2 adenylate kinase 4 protein-coding 313-20 chr20 40590123 40590533 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 98908 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 271.667-68 chr8 55587292 55587585 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -66460 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 265.333-5 chr1 187681111 187681451 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 237653 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 306.334-2 chr10 63801382 63801630 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -279616 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 143-35 chr12 98003388 98003495 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7993 NR_036189 100422924 NR_036189 ENSG00000263890 MIR4303 - microRNA 4303 ncRNA 282.666-7 chr14 68261876 68262238 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 366730 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 194-113 chr5 133483393 133483564 + 1.66667 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -55772 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 512-3 chr14 39818163 39818890 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -386026 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 263.333-53 chr21 31399558 31399828 + 1.66667 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) intron (NM_001353690, intron 1 of 27) -55339 NM_001353687 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 249.334-18 chr5 33224286 33224460 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5362 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 248.334-18 chr8 139425667 139425819 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 277380 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 334-19 chr18 71637400 71637736 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -58612 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 248.667-31 chr13 41183808 41183961 + 1.66667 NA intron (NR_120423, intron 3 of 3) intron (NR_120423, intron 3 of 3) 10685 NM_032138 84078 Hs.63841 NM_032138 ENSG00000120696 KBTBD7 - kelch repeat and BTB domain containing 7 protein-coding 343-9 chr18 2798694 2799014 + 1.66667 NA intron (NM_015295, intron 47 of 47) intron (NM_015295, intron 47 of 47) -48152 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 264.999-7 chr4 99241813 99242129 + 1.66667 NA intron (NR_037884, intron 4 of 9) L1MA2|LINE|L1 -22725 NM_001102470 130 Hs.586161 NM_000672 ENSG00000172955 ADH6 ADH-5 alcohol dehydrogenase 6 (class V) protein-coding 254.334-25 chr5 83281805 83282067 + 1.66667 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) intron (NM_022550, intron 7 of 7) -189738 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 256-27 chr14 68486024 68486229 + 1.66667 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 142661 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 145.667-117 chr18 5347297 5347473 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -50332 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 333.334-3 chr22 46659951 46660204 + 1.66667 NA intron (NM_015124, intron 4 of 18) intron (NM_015124, intron 4 of 18) 39691 NM_015124 23151 Hs.475150 NM_015124 ENSG00000075240 GRAMD4 DIP GRAM domain containing 4 protein-coding 248-59 chr4 48677730 48677989 + 1.66667 NA intron (NM_015030, intron 3 of 63) intron (NM_015030, intron 3 of 63) 102440 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 230.667-81 chr7 51953138 51953334 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -559980 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 331-18 chr2 56388686 56389098 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -203122 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 257.667-50 chr20 53969190 53969372 + 1.66667 NA intron (NM_001366295, intron 7 of 10) MIR|SINE|MIR 89739 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 339.667-14 chr3 29789766 29790068 + 1.66667 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) intron (NM_001003792, intron 6 of 13) 144239 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 486-8 chr22 31578048 31578862 + 1.66667 NA intron (NM_014775, intron 11 of 31) intron (NM_014775, intron 11 of 31) 43076 NR_106959 102465666 NR_106959 ENSG00000284082 MIR7109 hsa-mir-7109 microRNA 7109 ncRNA 253-13 chr11 77578361 77578640 + 1.66667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 7411 NR_130930 646029 Hs.609654 NM_001039908 LOC646029 - uncharacterized LOC646029 ncRNA 397.667-7 chr2 184888647 184889023 + 1.66667 NA intron (NM_194250, intron 2 of 3) intron (NM_194250, intron 2 of 3) 278237 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 242.667-52 chr2 82904333 82904508 + 1.66667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 47617 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 188-104 chr7 90200030 90200208 + 1.66667 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) intron (NR_110029, intron 2 of 2) 11516 NR_110029 100874100 Hs.573339 NR_110029 ENSG00000227646 STEAP2-AS1 - STEAP2 antisense RNA 1 ncRNA 296.667-7 chr11 57447118 57447449 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13245 NM_178570 349667 Hs.502618 NM_178570 ENSG00000186907 RTN4RL2 NGRH1|NgR2 reticulon 4 receptor like 2 protein-coding 309-29 chr5 102588380 102588785 + 1.66667 NA intron (NR_047462, intron 1 of 1) intron (NR_047462, intron 1 of 1) 7214 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 263.667-51 chr2 184309125 184309416 + 1.66667 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 -69705 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 234.667-54 chr2 134026001 134026263 + 1.66667 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -93803 NM_001371457 254.333-26 chr16 82422267 82422498 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -204587 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 309.667-20 chr5 4557307 4557745 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -215955 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 308.667-18 chr19 40518395 40518846 + 1.66667 NA intron (NM_020971, intron 15 of 35) AluJb|SINE|Alu -11871 NM_025213 57731 Hs.32706 NM_020971 ENSG00000160460 SPTBN4 CMND|NEDHND|QV|SPNB4|SPTBN3 spectrin beta, non-erythrocytic 4 protein-coding 293.667-17 chr15 68597664 68597940 + 1.66667 NA intron (NM_006091, intron 1 of 11) intron (NM_006091, intron 1 of 11) -18738 NM_001190456 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 281.667-10 chr11 33554883 33555096 + 1.66667 NA intron (NM_012194, intron 6 of 20) intron (NM_012194, intron 6 of 20) 145751 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 255.666-5 chr10 60165603 60165885 + 1.66667 NA intron (NM_001204404, intron 23 of 43) intron (NM_001204404, intron 23 of 43) -24728 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 328.334-5 chr8 32220589 32220980 + 1.66667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 194566 NR_104156 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 256.334 chr1 8579481 8579674 + 1.66667 NA intron (NM_001042681, intron 4 of 22) intron (NM_001042681, intron 4 of 22) -84664 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 276.667-61 chr6 46384370 46384639 + 1.66667 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) intron (NM_001251973, intron 2 of 4) -58612 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 322-9 chr10 109971217 109971501 + 1.66667 NA intron (NR_038943, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu -25014 NM_001320591 120 Hs.501012 NM_001121 ENSG00000148700 ADD3 ADDL|CPSQ3 adducin 3 protein-coding 180.333-120 chr7 108210457 108210667 + 1.66667 NA intron (NM_001371137, intron 8 of 25) intron (NM_001371137, intron 8 of 25) 32823 NM_001371181 232.334-8 chr8 88417054 88417245 + 1.66667 NA Intergenic (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -89666 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 243-11 chr10 61346261 61346546 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -106236 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 310.333-11 chr11 60987587 60987836 + 1.66667 NA intron (NM_001254751, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 16031 NM_006725 923 Hs.744366 NM_006725 ENSG00000013725 CD6 TP120 CD6 molecule protein-coding 311.666-16 chr9 110013837 110014267 + 1.66667 NA intron (NM_147150, intron 6 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie -34546 NM_001198656 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 261-54 chr7 103377449 103377606 + 1.66667 NA intron (NR_135802, intron 16 of 17) intron (NR_135802, intron 16 of 17) 29884 NM_002803 5701 Hs.437366 NM_002803 ENSG00000161057 PSMC2 MSS1|Nbla10058|S7 proteasome 26S subunit, ATPase 2 protein-coding 363.001-3 chr14 50505161 50505499 + 1.66667 NA intron (NM_198794, intron 2 of 31) intron (NM_198794, intron 2 of 31) 27239 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 274.333-62 chr7 102423317 102423651 + 1.66667 NA intron (NR_038967, intron 8 of 8) MIR|SINE|MIR -10046 NM_001271818 80228 Hs.363308 NM_032831 ENSG00000160991 ORAI2 C7orf19|CBCIP2|MEM142B|TMEM142B ORAI calcium release-activated calcium modulator 2 protein-coding 246.334-3 chr11 37074630 37074839 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -476455 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 269.666-14 chr5 27492745 27493049 + 1.66667 NA intron (NR_038848, intron 3 of 4) intron (NR_038848, intron 3 of 4) 20605 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 240-18 chr12 24409724 24409880 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) L1MD1|LINE|L1 152689 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 529.667-3 chr2 162359751 162360208 + 1.66667 NA intron (NM_001330271, intron 7 of 7) intron (NM_001330271, intron 7 of 7) 15611 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 290.334-3 chr18 5737954 5738266 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10709 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 264.666-4 chr1 204808606 204808892 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19903 NM_001005389 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 221.334-3 chr15 42041423 42041602 + 1.66667 NA intron (NM_001206670, intron 1 of 19) MamGypLTR3a|LTR|Gypsy 9191 NM_001206670 123745 Hs.668060 NM_001080490 ENSG00000188089 PLA2G4E - phospholipase A2 group IVE protein-coding 269-28 chr2 231240137 231240328 + 1.66667 NA intron (NM_001352759, intron 9 of 19) intron (NM_001352759, intron 9 of 19) 41601 NM_001352759 80210 Hs.162411 NM_025139 ENSG00000135931 ARMC9 ARM|JBTS30|KU-MEL-1|NS21 armadillo repeat containing 9 protein-coding 341 chr1 152522339 152522615 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 7995 NM_019060 54544 Hs.110196 NM_019060 ENSG00000169509 CRCT1 C1orf42|NICE-1|NICE1 cysteine rich C-terminal 1 protein-coding 234.334-9 chr22 22360501 22360673 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 62489 NR_027293 96610 Hs.449601 NM_080926 BMS1P20 IGL|IGLV|IGLV1 BMS1 pseudogene 20 pseudo 235.334-8 chr8 79739625 79739775 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26775 NM_001282851 23462 Hs.234434 NM_012258 ENSG00000164683 HEY1 BHLHb31|CHF2|HERP2|HESR1|HRT-1|NERP2|OAF1|hHRT1 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1 protein-coding 303-40 chr4 129204752 129204987 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 108717 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 233.667-22 chr14 72659723 72659873 + 1.66667 NA intron (NM_001280542, intron 8 of 10) intron (NM_001280542, intron 8 of 10) 142978 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 343.999 chr4 81677907 81678267 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -206180 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 352-2 chr1 219065840 219066068 + 1.66667 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) 107834 NR_038845 643723 Hs.519774 NR_038845 LYPLAL1-DT LYPLAL1-AS1 LYPLAL1 divergent transcript ncRNA 285-15 chr2 32247636 32247894 + 1.66667 NA intron (NM_001302504, intron 3 of 7) intron (NM_001302504, intron 3 of 7) 17121 NM_001199138 58484 Hs.574741 NM_021209 ENSG00000091106 NLRC4 AIFEC|CARD12|CLAN|CLAN1|CLANA|CLANB|CLANC|CLAND|CLR2.1|FCAS4|IPAF NLR family CARD domain containing 4 protein-coding 284.999-3 chr5 127940053 127940409 + 1.66667 NA TTS (NR_152804) TTS (NR_152804) 142944 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 365.333-20 chr5 39398132 39398554 + 1.66667 NA intron (NM_001343, intron 1 of 14) intron (NM_001343, intron 1 of 14) 26637 NM_001343 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 330.667-12 chr2 159717796 159718239 + 1.66667 NA intron (NM_001282805, intron 3 of 11) intron (NM_001282805, intron 3 of 11) 5511 NM_022826 64844 Hs.529272 NM_022826 ENSG00000136536 MARCH7 AXO|AXOT|MARCH-VII|RNF177 membrane associated ring-CH-type finger 7 protein-coding 313.667-15 chr15 58201145 58201532 + 1.66667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 62957 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 413-11 chr8 131970474 131971001 + 1.66667 NA intron (NR_136616, intron 10 of 23) intron (NR_136616, intron 10 of 23) 53964 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 168-15 chr11 7012096 7012241 + 1.66667 NA intron (NM_013249, intron 1 of 2) L1ME3D|LINE|L1 8178 NM_001354832 7761 Hs.445849 NM_013249 ENSG00000149050 ZNF214 BAZ-1|BAZ1 zinc finger protein 214 protein-coding 318.999-5 chr7 113806067 113806414 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 112769 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 289.667-32 chr6 137111470 137111677 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 62071 NM_181310 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 262-81 chr8 120946482 120946671 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -134530 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 288.334-6 chr8 98919486 98919747 + 1.66667 NA intron (NM_001256312, intron 1 of 12) L1ME2z|LINE|L1 22994 NM_001256312 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 312.666-15 chr3 57827929 57828372 + 1.66667 NA intron (NM_001304420, intron 1 of 21) AluSx|SINE|Alu -61764 NM_001311178 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 296.667-14 chr14 23357723 23358131 + 1.66667 NA intron (NM_032459, intron 4 of 4) MER33|DNA|hAT-Charlie -5015 NM_016609 51310 Hs.373498 NM_016609 ENSG00000092096 SLC22A17 24p3R|BOCT|BOIT|NGALR|NGALR2|NGALR3|hBOIT solute carrier family 22 member 17 protein-coding 307.334-11 chr5 95937548 95937821 + 1.66667 NA intron (NM_012081, intron 2 of 11) intron (NM_012081, intron 2 of 11) 24167 NM_012081 22936 Hs.192221 NM_012081 ENSG00000118985 ELL2 MRCCAT1 elongation factor for RNA polymerase II 2 protein-coding 363.667-13 chr5 167704333 167704695 + 1.66667 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -50415 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 474.667-3 chr14 97146409 97146854 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -8226 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 353.001-3 chr12 14668681 14668960 + 1.66667 NA intron (NM_004963, intron 10 of 26) intron (NM_004963, intron 10 of 26) 27779 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 260.333-26 chr18 47292522 47292804 + 1.66667 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 6939 NR_147192 110175910 Hs.639112 NR_147192 ENSG00000267761 MIR4527HG - MIR4527 host gene ncRNA 251.667-64 chr3 126087463 126087734 + 1.66667 NA intron (NM_001164475, intron 1 of 9) MER4B-int|LTR|ERV1 -3307 NM_001008486 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 298.001-2 chr8 50097152 50097397 + 1.66667 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) -66857 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 251.334-6 chr1 202765483 202765687 + 1.66667 NA intron (NM_001347591, intron 4 of 25) intron (NM_001347591, intron 4 of 25) 43885 NM_001347591 10765 Hs.18891 NM_006618 ENSG00000117139 KDM5B CT31|JARID1B|MRT65|PLU-1|PLU1|PPP1R98|PUT1|RBBP2H1A|RBP2-H1 lysine demethylase 5B protein-coding 175.666-20 chr6 38094524 38094678 + 1.66667 NA intron (NM_021943, intron 4 of 5) intron (NM_021943, intron 4 of 5) 274874 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 324-9 chr18 13208451 13208796 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10137 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 375-10 chr3 131003173 131003466 + 1.66667 NA TTS (NM_014382) TTS (NM_014382) 23535 NM_014065 28990 Hs.100878 NM_014065 ENSG00000034533 ASTE1 HT001 asteroid homolog 1 protein-coding 267-13 chr11 83644111 83644310 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) intron (NM_001142699, intron 18 of 27) 38215 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 225.667-19 chr12 71565926 71566135 + 1.66667 NA intron (NR_110596, intron 8 of 19) intron (NR_110596, intron 8 of 19) 97818 NM_144982 196441 Hs.245798 NM_144982 ENSG00000133858 ZFC3H1 CCDC131|CSRC2|PSRC2 zinc finger C3H1-type containing protein-coding 196.333-28 chr12 57679145 57679341 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -14712 NM_001261422 10956 Hs.527861 NM_006812 ENSG00000135506 OS9 ERLEC2|OS-9 OS9 endoplasmic reticulum lectin protein-coding 313.334-2 chr14 72584804 72585087 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 68125 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 363.333-25 chr8 77159305 77159750 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -158483 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 193.333-95 chr2 116465363 116465570 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 1121651 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 251.334-21 chr4 61437251 61437412 + 1.66667 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 235159 NM_001371342 244.667-30 chr12 16945998 16946273 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -42612 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 255.333-51 chr2 42265657 42265930 + 1.66667 NA intron (NM_001145076, intron 5 of 21) intron (NM_001145076, intron 5 of 21) 94245 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 414 chr1 63298618 63299033 + 1.66667 NA intron (NR_038252, intron 3 of 11) AluSx|SINE|Alu 18432 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 276-51 chr4 163623137 163623412 + 1.66667 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) intron (NM_001166373, intron 4 of 7) -9740 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 363.333-19 chr20 46790520 46790949 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 81085 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 245-54 chr5 84668816 84669055 + 1.66667 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -284055 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 245-9 chr11 29435416 29435651 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -158880 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 304.333-17 chr2 18358034 18358531 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 202371 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 277.334-8 chr21 21185871 21186066 + 1.66667 NA intron (NM_001352597, intron 1 of 10) L1ME3A|LINE|L1 38806 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 160.333-181 chr3 27843489 27843719 + 1.66667 NA intron (NR_146630, intron 3 of 4) intron (NR_146630, intron 3 of 4) -9468 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 298.333-2 chr1 21122807 21123075 + 1.66667 NA intron (NM_001198803, intron 1 of 12) intron (NM_001198803, intron 1 of 12) -11558 NM_003760 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 257.667-61 chr4 124021884 124022107 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 247731 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 279.334-11 chr5 174435978 174436227 + 1.66667 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) intron (NR_125806, intron 2 of 5) 99748 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 166.667-200 chr6 71910914 71911099 + 1.66667 NA intron (NM_001350412, intron 1 of 2) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 24303 NM_001350411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 257-47 chr4 88569995 88570262 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22295 NM_001271602 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 352.333-18 chr4 44385506 44385817 + 1.66667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) L1MB3|LINE|L1 63148 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 357.667-2 chr15 36708816 36709101 + 1.66667 NA intron (NM_032499, intron 9 of 11) intron (NM_032499, intron 9 of 11) 109548 NR_027320 161635 Hs.659822 NR_027320 CSNK1A1P1 CSNK1A1P casein kinase 1 alpha 1 pseudogene 1 pseudo 342-6 chr12 95266619 95267039 + 1.66667 NA intron (NR_147922, intron 6 of 12) intron (NR_147922, intron 6 of 12) -41591 NR_029895 442903 NR_029895 ENSG00000199172 MIR331 MIRN331|hsa-mir-331|mir-331 microRNA 331 ncRNA 299-29 chr3 151062923 151063301 + 1.66667 NA intron (NR_024066, intron 2 of 5) L1ME4a|LINE|L1 -23686 NM_053002 116931 Hs.744234 NM_053002 ENSG00000144893 MED12L NOPAR|TNRC11L|TRALP|TRALPUSH mediator complex subunit 12L protein-coding 227-36 chr3 177879028 177879195 + 1.66667 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) intron (NR_110826, intron 1 of 2) 62246 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 347.334-2 chr12 40017990 40018273 + 1.66667 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie 87950 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 301-18 chr18 62078604 62078995 + 1.66667 NA intron (NM_176787, intron 28 of 30) intron (NM_176787, intron 28 of 30) 108257 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 363.333-17 chr2 68755155 68755596 + 1.66667 NA intron (NM_001364821, intron 1 of 10) intron (NM_001364821, intron 1 of 10) -19535 NM_001166276 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 237-70 chr7 104081606 104081869 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -92079 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 344.666-4 chr10 58959690 58960072 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -39637 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 192-36 chr11 86436779 86437004 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 62004 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 224-51 chr2 195195549 195195824 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -461272 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 324.334-7 chr2 57127192 57127562 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -780274 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 272.667-58 chr6 44994279 44994544 + 1.66667 NA intron (NM_181356, intron 8 of 12) intron (NM_181356, intron 8 of 12) 203359 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 468.333 chr4 103139444 103139890 + 1.66667 NA intron (NM_001286734, intron 36 of 46) intron (NM_001286734, intron 36 of 46) -39833 NM_020139 56898 Hs.124696 NM_020139 ENSG00000164039 BDH2 DHRS6|EFA6R|PRO20933|SDR15C1|UCPA-OR|UNQ6308 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 2 protein-coding 243.334-2 chr11 60684981 60685215 + 1.66667 NA intron (NR_026946, intron 6 of 6) L1M4|LINE|L1 -14514 NM_031457 83661 Hs.150878 NM_031457 ENSG00000166959 MS4A8 4SPAN4|CD20L5|MS4A4|MS4A8B membrane spanning 4-domains A8 protein-coding 247.667-19 chr11 111633722 111633883 + 1.66667 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) intron (NM_015191, intron 3 of 14) 31353 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 327-3 chr10 73458432 73458785 + 1.66667 NA intron (NM_001142353, intron 9 of 13) AluJo|SINE|Alu -25047 NM_001024593 118490 Hs.631823 NM_001024593 ENSG00000166343 MSS51 ZMYND17 MSS51 mitochondrial translational activator protein-coding 156.667-99 chr14 41166750 41166847 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 212087 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 261-27 chr17 35719653 35719921 + 1.66667 NA intron (NM_001030006, intron 21 of 21) AluJr|SINE|Alu -11852 NM_033315 91608 Hs.744994 NM_033315 ENSG00000270885 RASL10B RRP17|VTS58635 RAS like family 10 member B protein-coding 344.666-8 chr14 80979662 80979965 + 1.66667 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) L2|LINE|L2 24192 NM_000369 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 255.667-68 chr5 34728722 34729008 + 1.66667 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) AluJr|SINE|Alu 41306 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 259.667-68 chr6 56816597 56816763 + 1.66667 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 26985 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 270.667-33 chr3 169242906 169243074 + 1.66667 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) intron (NM_001205194, intron 1 of 15) -95519 NM_001164000 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 293.999-3 chr14 51521007 51521338 + 1.66667 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) L1ME1|LINE|L1 32044 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 257-28 chr2 133570310 133570581 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1982 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 193-48 chr2 123637716 123637909 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 387362 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 298.667-23 chr6 118484171 118484418 + 1.66667 NA intron (NM_001042475, intron 6 of 12) AluSz6|SINE|Alu -17079 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 391.667-8 chr8 108540987 108541277 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 97508 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 334.666-10 chr4 70996846 70997145 + 1.66667 NA intron (NM_000788, intron 1 of 6) intron (NM_000788, intron 1 of 6) 3346 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 343.001 chr17 52320434 52320715 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -69948 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 315.334-8 chr4 166835422 166835757 + 1.66667 NA intron (NM_001040159, intron 6 of 10) intron (NM_001040159, intron 6 of 10) 398837 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 333.667-21 chr8 86187020 86187396 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 43173 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 263.334-14 chr6 48024266 48024486 + 1.66667 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) intron (NM_207499, intron 1 of 2) 44313 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 382.001 chr4 145505918 145506274 + 1.66667 NA intron (NM_001354817, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -3116 NR_108077 101927659 Hs.519005 NR_108077 ENSG00000250582 SMAD1-AS2 - SMAD1 antisense RNA 2 ncRNA 184.334-3 chr2 106230412 106230552 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -36143 NM_025076 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 283.666-2 chr11 12355736 12356093 + 1.66667 NA intron (NM_032867, intron 8 of 8) intron (NM_032867, intron 8 of 8) -21657 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 337.334-4 chr20 44781235 44781488 + 1.66667 NA intron (NM_001205317, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 29185 NM_182970 140730 Hs.517065 NM_182970 ENSG00000101098 RIMS4 C20orf190|RIM 4|RIM-4|RIM4|RIM4-gamma|RIM4gamma regulating synaptic membrane exocytosis 4 protein-coding 266.667-72 chr8 120060691 120060862 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -64326 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 436.667-8 chr3 67182997 67183392 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -42270 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 254.667-50 chr3 12121169 12121428 + 1.66667 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) L2c|LINE|L2 37614 NM_003256 7079 Hs.591665 NM_003256 ENSG00000157150 TIMP4 TIMP-4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 protein-coding 352-14 chr17 61530223 61530566 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 60825 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 202.334 chr1 195006570 195006720 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1082070 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 261-11 chr10 107659764 107659934 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 409444 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 255-43 chr2 49227392 49227589 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -72963 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 253-23 chr14 76220129 76220423 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 65922 NM_017972 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 271-5 chr1 102421030 102421341 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -423951 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 294.001 chr1 104725714 104725932 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 652800 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 244-40 chr16 53739734 53740035 + 1.66667 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) intron (NM_001363897, intron 1 of 7) 35728 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 256.667-24 chr14 24229679 24229855 + 1.66667 NA intron (NR_137631, intron 1 of 6) intron (NR_137631, intron 1 of 6) 2600 NM_006156 4738 Hs.531064 NM_006156 ENSG00000129559 NEDD8 NEDD-8 NEDD8 ubiquitin like modifier protein-coding 272.334 chr1 38442395 38442646 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -32676 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 337.667-16 chr3 44059447 44059827 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -54575 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 329-7 chr16 8902156 8902440 + 1.66667 NA intron (NM_001286458, intron 18 of 31) intron (NM_001286458, intron 18 of 31) -33286 NM_001278260 23589 Hs.632184 NM_014316 ENSG00000153048 CARHSP1 CRHSP-24|CRHSP24|CSDC1 calcium regulated heat stable protein 1 protein-coding 285.334 chr1 50620279 50620477 + 1.66667 NA intron (NM_007051, intron 8 of 18) L1PA16|LINE|L1 -196935 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 280.666-18 chr21 21798200 21798558 + 1.66667 NA TTS (NR_109958) TTS (NR_109958) 51394 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 353.334 chr10 14241211 14241484 + 1.66667 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 89537 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 375.667-16 chr5 99753362 99753686 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 219534 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 310-42 chr4 54059366 54059684 + 1.66667 NA intron (NM_012110, intron 1 of 5) AluJr4|SINE|Alu 5080 NM_012110 26511 Hs.335393 NM_012110 ENSG00000109220 CHIC2 BTL cysteine rich hydrophobic domain 2 protein-coding 277.334-7 chr20 2771959 2772166 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 28565 NM_019609 56265 Hs.659346 NM_019609 ENSG00000088882 CPXM1 CPX1|CPXM carboxypeptidase X, M14 family member 1 protein-coding 230.667-24 chr17 61023435 61023703 + 1.66667 NA intron (NM_001320470, intron 16 of 25) intron (NM_001320470, intron 16 of 25) 344135 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 196.667-87 chr21 16451320 16451492 + 1.66667 NA intron (NR_136550, intron 1 of 3) intron (NR_136550, intron 1 of 3) 31111 NR_136550 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 333.333-45 chr7 8082764 8083156 + 1.66667 NA intron (NM_138426, intron 6 of 7) intron (NM_138426, intron 6 of 7) 114164 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 282.667-3 chr10 96852174 96852553 + 1.66667 NA intron (NM_001170766, intron 2 of 8) AluJo|SINE|Alu 19418 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 225.334-2 chr15 52014676 52014860 + 1.66667 NA intron (NR_156732, intron 1 of 1) MER104|DNA|TcMar-Tc2 4327 NR_156732 112543478 NR_156732 MAPK6-DT lncMAPK6 MAPK6 divergent transcript ncRNA 280-37 chr3 149429537 149429830 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -45014 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 258.667-34 chr15 89603808 89603982 + 1.66667 NA intron (NM_001308025, intron 13 of 21) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 28308 NM_001308025 90381 Hs.441708 NM_152259 ENSG00000140534 TICRR C15orf42|SLD3|Treslin TOPBP1 interacting checkpoint and replication regulator protein-coding 192.667-52 chr12 112752353 112752571 + 1.66667 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) intron (NM_001347952, intron 1 of 21) -39076 NM_001347953 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 270.333-23 chr15 56443936 56444232 + 1.66667 NA intron (NM_018365, intron 5 of 9) intron (NM_018365, intron 5 of 9) 21053 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 535-3 chr3 79415752 79416350 + 1.66667 NA intron (NR_110133, intron 1 of 2) intron (NR_110133, intron 1 of 2) 4324 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 249.667-101 chr8 117363519 117363735 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -157086 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 301.667-15 chr15 59932998 59933298 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -71163 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 209.333-245 chr8 125905871 125906098 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 45213 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 350-7 chr14 50153583 50154001 + 1.66667 NA intron (NM_006939, intron 12 of 22) AluSq2|SINE|Alu -37220 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 212.333-63 chr2 20876075 20876315 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -53065 NM_001282719 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 820.667 chr11 82661155 82662042 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 72266 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 356.999 chr1 95521363 95521702 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 11416 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 197.667-98 chr3 181753056 181753220 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 41213 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 239.334-6 chr22 21807661 21807848 + 1.66667 NA exon (NM_138957, exon 2 of 8) exon (NM_138957, exon 2 of 8) 59926 NM_138957 5594 Hs.431850 NM_002745 ENSG00000100030 MAPK1 ERK|ERK-2|ERK2|ERT1|MAPK2|P42MAPK|PRKM1|PRKM2|p38|p40|p41|p41mapk|p42-MAPK mitogen-activated protein kinase 1 protein-coding 373.333-22 chr5 38432022 38432421 + 1.66667 NA intron (NM_182798, intron 10 of 16) intron (NM_182798, intron 10 of 16) -13325 NM_182801 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 172.667-53 chr14 49764516 49764661 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3565 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 272-5 chr11 35692203 35692374 + 1.66667 NA intron (NM_017583, intron 2 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie 29513 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 378.333-3 chr14 51157384 51157988 + 1.66667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -61982 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 417.332-5 chr8 67759783 67760196 + 1.66667 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -13629 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 327.334-3 chr17 74111468 74111765 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -92062 NM_001035258 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 184.333-97 chr3 12137838 12138087 + 1.66667 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) MIRb|SINE|MIR 20950 NM_003256 7079 Hs.591665 NM_003256 ENSG00000157150 TIMP4 TIMP-4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 protein-coding 440-13 chr8 89392639 89393110 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 364837 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 209.667-25 chr10 112196961 112197118 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13274 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 260.334-10 chr14 43238195 43238391 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 1268990 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 230.333-19 chr10 109343212 109343393 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 579944 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 505.667-3 chr14 58220298 58220673 + 1.66667 NA intron (NM_018477, intron 8 of 12) intron (NM_018477, intron 8 of 12) 20336 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 258.334-6 chr14 66568474 66568742 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 61201 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 418-14 chr9 85709814 85710196 + 1.66667 NA intron (NM_001286717, intron 1 of 24) intron (NM_001286717, intron 1 of 24) 32024 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 247-7 chr10 55183102 55183302 + 1.66667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -381911 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 261-24 chr15 69052613 69052809 + 1.66667 NA intron (NM_024505, intron 14 of 15) LTR106_Mam|LTR|LTR -28139 NR_026949 283673 Hs.177927 NM_173610 ENSG00000212766 EWSAT1 LINC00277|NCRNA00277|TMEM84 Ewing sarcoma associated transcript 1 ncRNA 290.667-37 chr6 52890513 52890844 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 19020 NM_000847 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 230-64 chr6 158466619 158466830 + 1.66667 NA intron (NM_020245, intron 6 of 13) L2b|LINE|L2 -69712 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 264-41 chr5 52150202 52150375 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 142257 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 260.333-34 chr20 32842690 32842993 + 1.66667 NA intron (NM_012325, intron 5 of 6) intron (NM_012325, intron 5 of 6) -16082 NM_001143967 388795 NM_001143967 ENSG00000215529 EFCAB8 - EF-hand calcium binding domain 8 protein-coding 369.666-3 chr12 121431561 121432065 + 1.66667 NA intron (NM_001005366, intron 21 of 22) intron (NM_001005366, intron 21 of 22) 12539 NR_106957 102465665 NR_106957 ENSG00000284402 MIR7107 hsa-mir-7107 microRNA 7107 ncRNA 584.333 chr18 11718187 11718938 + 1.66667 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) intron (NM_182978, intron 1 of 11) 29298 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 236-12 chr11 46734711 46734860 + 1.66667 NA intron (NM_000506, intron 12 of 13) AluSx1|SINE|Alu 15572 NM_001311257 2147 Hs.655207 NM_000506 ENSG00000180210 F2 PT|RPRGL2|THPH1 coagulation factor II, thrombin protein-coding 297.333-39 chr3 61980591 61980935 + 1.66667 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 338184 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 238-82 chr5 179608464 179608643 + 1.66667 NA intron (NM_001040452, intron 17 of 17) intron (NM_001040452, intron 17 of 17) -4812 NR_110560 101928445 Hs.663255 NR_110560 ENSG00000244945 LOC101928445 - uncharacterized LOC101928445 ncRNA 255-33 chr16 10640537 10640819 + 1.66667 NA intron (NM_144674, intron 5 of 6) L1ME1|LINE|L1 54252 NM_144674 146279 Hs.143519 NM_144674 ENSG00000153060 TEKT5 CT149 tektin 5 protein-coding 310.667-35 chr6 91197736 91198047 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -323769 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 489.334-2 chr4 169551025 169551362 + 1.66667 NA intron (NM_001199400, intron 16 of 32) intron (NM_001199400, intron 16 of 32) 61390 NM_001199400 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 157-22 chr10 68140268 68140502 + 1.66667 NA intron (NM_001256268, intron 6 of 23) L2c|LINE|L2 30897 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 289.666-6 chr17 60308750 60309123 + 1.66667 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) AluSz6|SINE|Alu -77291 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 287.333-59 chr6 126314680 126315001 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24949 NM_001286525 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 269.333-96 chrX 82978939 82979341 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -529150 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 354.667-9 chr12 49470926 49471319 + 1.66667 NA intron (NM_001293285, intron 4 of 14) MIRb|SINE|MIR -67908 NM_001314030 23416 Hs.64064 NM_012284 ENSG00000135519 KCNH3 BEC1|ELK2|Kv12.2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 3 protein-coding 443.333-5 chr2 229543537 229543835 + 1.66667 NA intron (NM_139072, intron 5 of 12) intron (NM_139072, intron 5 of 12) 170869 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 181.334-5 chr7 32806957 32807134 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -19257 NR_132360 102724668 Hs.636806 NR_132360 DPY19L1P2 THC1072510 DPY19L1 pseudogene 2 pseudo 222.667-58 chr3 96112589 96112793 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -247273 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 265-46 chr22 41191846 41192033 + 1.66667 NA intron (NR_110514, intron 2 of 2) intron (NR_110514, intron 2 of 2) 5562 NR_110514 101927279 Hs.517517 NR_110514 EP300-AS1 - EP300 antisense RNA 1 ncRNA 184.334-6 chr9 34843324 34843464 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -4808 NR_024481 389715 Hs.713965 NM_001126494 FAM205BP C9orf144|C9orf144A|FAM205B transmembrane protein C9orf144B pseudogene pseudo 292.333-3 chr1 174260671 174261006 + 1.66667 NA intron (NM_001366445, intron 7 of 13) intron (NM_001366445, intron 7 of 13) -14262 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 267.334-2 chr13 31664218 31664428 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -75203 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 253-22 chr14 65681282 65681522 + 1.66667 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 210300 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 229-63 chr7 32437520 32437716 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9394 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 311-9 chr14 61939473 61940000 + 1.66667 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 12041 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 246.667-13 chr10 92483114 92483327 + 1.66667 NA intron (NR_136399, intron 14 of 25) intron (NR_136399, intron 14 of 25) 14541 NM_001322797 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 331.334-6 chr4 72286157 72286558 + 1.66667 NA intron (NM_014243, intron 21 of 21) intron (NM_014243, intron 21 of 21) 247225 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 220.333-51 chr18 731229 731418 + 1.66667 NA intron (NM_005433, intron 11 of 11) L2|LINE|L2 -18659 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 189.333-77 chr17 74494646 74494775 + 1.66667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 28076 NM_001330457 11314 Hs.9688 NM_007261 ENSG00000167851 CD300A CLM-8|CMRF-35-H9|CMRF-35H|CMRF35-H|CMRF35-H9|CMRF35H|CMRF35H9|IGSF12|IRC1|IRC1/IRC2|IRC2|IRp60 CD300a molecule protein-coding 277.667-12 chr12 98671777 98671996 + 1.66667 NA intron (NM_001160, intron 12 of 25) intron (NM_001160, intron 12 of 25) 26586 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 423-6 chr20 10205673 10206069 + 1.66667 NA intron (NR_040710, intron 1 of 4) L1M4|LINE|L1 -12927 NM_003081 6616 Hs.167317 NM_003081 ENSG00000132639 SNAP25 CMS18|RIC-4|RIC4|SEC9|SNAP|SNAP-25|SUP|bA416N4.2|dJ1068F16.2 synaptosome associated protein 25 protein-coding 168.334 chr14 71900583 71900731 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -31514 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 264.667-83 chr8 55742783 55743016 + 1.66667 NA intron (NM_152417, intron 5 of 5) L2|LINE|L2 30479 NM_001286660 137695 Hs.420076 NM_152417 ENSG00000167904 TMEM68 - transmembrane protein 68 protein-coding 270.667-4 chr1 172427473 172427648 + 1.66667 NA intron (NM_139240, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 6875 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 644.332 chr10 119911394 119912170 + 1.66667 NA intron (NM_007190, intron 5 of 18) intron (NM_007190, intron 5 of 18) 19052 NR_037771 11196 Hs.435004 NM_007190 ENSG00000107651 SEC23IP MSTP053|P125|P125A SEC23 interacting protein protein-coding 258-53 chr4 109135105 109135332 + 1.66667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) L2c|LINE|L2 167440 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 352.667-22 chr5 45773646 45774097 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -77491 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 289-14 chr20 11201290 11201572 + 1.66667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 71952 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 258-41 chr2 196609611 196609766 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -16134 NM_001348768 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 420.667-3 chr14 78930633 78931019 + 1.66667 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -269156 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 258.334-25 chrX 27217869 27218072 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 245371 NM_207319 139420 Hs.350673 NM_207319 ENSG00000224960 PPP4R3C FLFL3P|PPP4R3CP|SMEK3P|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3C protein-coding 268.667-47 chr4 64570844 64571030 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -161477 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 259.667 chr1 8096723 8097002 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70553 NM_018948 54206 Hs.605445 NM_018948 ENSG00000116285 ERRFI1 GENE-33|MIG-6|MIG6|RALT ERBB receptor feedback inhibitor 1 protein-coding 468.667-3 chr14 52155352 52155928 + 1.66667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -86581 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 509.333-3 chr3 22072728 22073068 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 115759 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 256.667-87 chr8 131977001 131977255 + 1.66667 NA intron (NR_136616, intron 12 of 23) intron (NR_136616, intron 12 of 23) 60355 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 356.666-20 chr8 121049993 121050624 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -238262 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 252.666-29 chr3 125237536 125237817 + 1.66667 NA intron (NM_001348434, intron 6 of 7) intron (NM_001348434, intron 6 of 7) -24911 NM_024628 84561 Hs.658514 NM_024628 ENSG00000221955 SLC12A8 CCC9 solute carrier family 12 member 8 protein-coding 222.334-8 chr20 53174580 53174752 + 1.66667 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) -10617 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 253.334-5 chr12 75148785 75148949 + 1.66667 NA intron (NM_001260499, intron 2 of 3) intron (NM_001260499, intron 2 of 3) 60881 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 321.334 chr1 40581371 40581594 + 1.66667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 49845 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 298-14 chr10 104237570 104237827 + 1.66667 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 -5321 NM_025145 80217 Hs.288927 NM_025145 ENSG00000197748 CFAP43 C10orf79|SPGF19|WDR96|bA373N18.2 cilia and flagella associated protein 43 protein-coding 228.334-6 chr9 89467876 89468026 + 1.66667 NA intron (NM_001371194, intron 1 of 15) intron (NM_001371194, intron 1 of 15) 11939 NM_001371200 393-8 chr3 105560582 105561069 + 1.66667 NA intron (NM_001243280, intron 13 of 14) L1ME2|LINE|L1 193916 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 431 chr1 78571750 78572183 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48482 NM_006820 10964 Hs.744918 NM_006820 ENSG00000137959 IFI44L C1orf29|GS3686 interferon induced protein 44 like protein-coding 157-115 chr6 77104910 77105162 + 1.66667 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR 358986 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 246.334-20 chr8 60767342 60767599 + 1.66667 NA intron (NM_017780, intron 2 of 37) intron (NM_017780, intron 2 of 37) 26211 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 252.667-25 chr13 80371428 80371689 + 1.66667 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -30432 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 297-46 chr9 25830209 25830453 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 50275 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 281.334-6 chr2 26813652 26813871 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 27705 NM_001809 1058 Hs.1594 NM_001809 ENSG00000115163 CENPA CENP-A|CenH3 centromere protein A protein-coding 320-22 chr19 11740537 11740788 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1716 NM_001297610 55552 Hs.142167 NM_017507 ENSG00000197933 ZNF823 HSZFP36 zinc finger protein 823 protein-coding 332.001-2 chr9 121035059 121035270 + 1.66667 NA intron (NM_001735, intron 4 of 40) intron (NM_001735, intron 4 of 40) 15111 NM_001317164 727 Hs.494997 NM_001735 ENSG00000106804 C5 C5D|C5a|C5b|CPAMD4|ECLZB complement C5 protein-coding 137.666-2 chr13 53582946 53583081 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -232406 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 243-15 chr12 58618531 58618846 + 1.66667 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 26986 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 257-37 chr3 33946004 33946264 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 147504 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 498.667 chr12 132838007 132838356 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9312 NM_001172557 2802 Hs.507333 NM_005895 ENSG00000090615 GOLGA3 GCP170|MEA-2 golgin A3 protein-coding 293-25 chr2 122260193 122260527 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 504709 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 235.333-37 chr16 61682927 61683153 + 1.66667 NA intron (NM_001796, intron 10 of 11) L1MC5|LINE|L1 353398 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 347.667-5 chr14 27125977 27126349 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 217521 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 247.667-2 chr1 74104127 74104329 + 1.66667 NA intron (NM_001105659, intron 5 of 7) L1MC1|LINE|L1 93948 NM_001105659 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 383.334-5 chr3 185388651 185388952 + 1.66667 NA intron (NM_004721, intron 1 of 13) L1M2|LINE|L1 25665 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 264.334-12 chr21 26988870 26989040 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -21867 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 261.333-76 chr4 88839160 88839459 + 1.66667 NA intron (NM_014883, intron 7 of 23) intron (NM_014883, intron 7 of 23) -15948 NM_001265579 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 197.667-158 chrX 87953294 87953456 + 1.66667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 435573 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 414.666-12 chr5 149866087 149866384 + 1.66667 NA exon (NM_000440, exon 20 of 22) exon (NM_000440, exon 20 of 22) 66742 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 365.001-3 chr3 100851154 100851465 + 1.66667 NA intron (NM_001349329, intron 12 of 64) intron (NM_001349329, intron 12 of 64) 141767 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 285.334-2 chr1 212664252 212664442 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 35493 NM_018664 55509 Hs.62919 NM_018664 ENSG00000123685 BATF3 JDP1|JUNDM1|SNFT basic leucine zipper ATF-like transcription factor 3 protein-coding 252-35 chr15 67261214 67261412 + 1.66667 NA non-coding (NR_147832, exon 2 of 18) non-coding (NR_147832, exon 2 of 18) -6115 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 275-24 chr2 65976794 65977038 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 381412 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 272.334-11 chr16 55513737 55513933 + 1.66667 NA intron (NM_017839, intron 1 of 13) L1M4|LINE|L1 4763 NM_017839 54947 Hs.460857 NM_017839 ENSG00000087253 LPCAT2 AGPAT11|AYTL1|LysoPAFAT lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 protein-coding 168.667-162 chr4 91785423 91785591 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 491795 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 283.333-25 chr17 71034611 71034890 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 167429 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 252-105 chr8 67331043 67331231 + 1.66667 NA intron (NM_006421, intron 1 of 38) intron (NM_006421, intron 1 of 38) 12644 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 246-104 chr8 107679661 107679887 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -181856 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 252.667-71 chr4 94107701 94107889 + 1.66667 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy 99761 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 610.666-2 chr11 116628434 116629646 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR -10382 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 375-2 chr10 55563994 55564432 + 1.66667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1MB3|LINE|L1 -34829 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 215.333-200 chr8 108528416 108528645 + 1.66667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 84906 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 252-118 chrX 38969721 38970012 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -165983 NR_046706 100874211 Hs.662789 NR_046706 MID1IP1-AS1 - MID1IP1 antisense RNA 1 ncRNA 418.333-4 chr2 38764154 38764429 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12797 NM_001195446 6432 Hs.309090 NM_006276 ENSG00000115875 SRSF7 9G8|AAG3|SFRS7 serine and arginine rich splicing factor 7 protein-coding 499.667 chr10 81242204 81242802 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 592706 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 248-87 chr8 76511902 76512222 + 1.66667 NA intron (NR_105006, intron 4 of 5) intron (NR_105006, intron 4 of 5) 105408 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 663.333 chr2 103576341 103576917 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -592200 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 445-2 chr11 28299735 28300202 + 1.66667 NA intron (NM_001113528, intron 6 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 177580 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 260-79 chr8 14949423 14949614 + 1.66667 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) -96008 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 216.666-54 chr4 139551738 139552010 + 1.66667 NA intron (NR_131339, intron 1 of 3) intron (NR_131339, intron 1 of 3) 4895 NR_131339 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 177.667-11 chr1 197526567 197526711 + 1.66667 NA intron (NR_125340, intron 17 of 19) intron (NR_125340, intron 17 of 19) 248841 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 257-76 chr8 130659504 130659696 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -215926 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 197.667-73 chr20 7652030 7652240 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 280527 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 340.667-5 chr10 65495505 65495755 + 1.66667 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -75795 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 311.334-2 chr11 13059837 13060127 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 50666 NM_001080521 644943 Hs.134650 NM_001080521 ENSG00000189431 RASSF10 - Ras association domain family member 10 protein-coding 225.333-52 chr14 66496478 66496684 + 1.66667 NA intron (NR_024338, intron 8 of 10) intron (NR_024338, intron 8 of 10) 10210 NR_110308 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 373-20 chr8 90145805 90146162 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -63104 NM_004929 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 345-5 chr2 32006886 32007250 + 1.66667 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) intron (NR_126034, intron 1 of 6) 3596 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 221-52 chr4 99931831 99932071 + 1.66667 NA intron (NM_001031723, intron 1 of 7) L1MB8|LINE|L1 14667 NM_001278310 79982 Hs.577426 NM_024920 ENSG00000164031 DNAJB14 EGNR9427|PRO34683 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B14 protein-coding 396.667-9 chr5 20459484 20459902 + 1.66667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 116020 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 297.666-8 chr2 118418052 118418490 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 184695 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 321.001 chr12 6164431 6164650 + 1.66667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -35406 NM_001330312 928 Hs.114286 NM_001769 ENSG00000010278 CD9 BTCC-1|DRAP-27|MIC3|MRP-1|TSPAN-29|TSPAN29 CD9 molecule protein-coding 301-53 chr7 29514946 29515283 + 1.66667 NA TTS (NM_004067) TTS (NM_004067) 31298 NM_001293081 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 252.667-76 chr4 149224872 149225218 + 1.66667 NA intron (NR_125887, intron 9 of 12) L1ME3D|LINE|L1 70750 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 271.667-69 chr8 59689919 59690170 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 570834 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 253.667-73 chr8 40826497 40826778 + 1.66667 NA intron (NM_024645, intron 1 of 6) intron (NM_024645, intron 1 of 6) 71189 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 252.333-80 chr9 68442268 68442488 + 1.66667 NA intron (NM_021965, intron 6 of 10) AluSq2|SINE|Alu -84512 NR_121192 572558 Hs.552819 NR_015423 ENSG00000224958 PGM5-AS1 FAM233A PGM5 antisense RNA 1 ncRNA 447-6 chr5 76963553 76964063 + 1.66667 NA intron (NM_001882, intron 6 of 6) intron (NM_001882, intron 6 of 6) 10763 NM_001882 1393 Hs.115617 NM_001882 ENSG00000145708 CRHBP CRF-BP|CRFBP corticotropin releasing hormone binding protein protein-coding 269.333-62 chr3 118704098 118704329 + 1.66667 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) intron (NR_135547, intron 1 of 3) 62445 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 233-23 chr13 114027400 114027627 + 1.66667 NA intron (NM_001320821, intron 8 of 25).2 intron (NM_001320821, intron 8 of 25).2 50442 NM_001320822 22821 Hs.593075 NM_007368 ENSG00000185989 RASA3 GAP1IP4BP|GAPIII RAS p21 protein activator 3 protein-coding 265.334-6 chr12 1227805 1228081 + 1.66667 NA intron (NR_027948, intron 12 of 19) L1MA9|LINE|L1 200195 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 332.667-22 chr5 132206163 132206588 + 1.66667 NA intron (NM_001365681, intron 7 of 13) intron (NM_001365681, intron 7 of 13) 11543 NR_106888 102465498 NR_106888 ENSG00000283678 MIR6830 hsa-mir-6830 microRNA 6830 ncRNA 233.667-62 chr5 87440412 87440557 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27451 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 230-31 chr18 6237804 6237965 + 1.66667 NA intron (NM_001365769, intron 10 of 16) intron (NM_001365769, intron 10 of 16) -18860 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 318-44 chr4 106350569 106350859 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 16721 NM_001195138 100507096 Hs.722750 NM_001195138 ENSG00000250298 GIMD1 - GIMAP family P-loop NTPase domain containing 1 protein-coding 191-3 chr1 88009108 88009256 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -637527 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 275-8 chr11 116113464 116113745 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -353404 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 247-75 chr8 96183191 96183375 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -22477 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 189.333-67 chr16 86128585 86128789 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -67494 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 238.667-31 chr15 59281615 59281897 + 1.66667 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) MER113B|DNA|hAT-Charlie 74913 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 258-5 chr10 10098096 10098277 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 39464 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 238.334-11 chr5 52113262 52113433 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 105316 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 288.001 chr10 92237530 92237742 + 1.66667 NA intron (NM_001178137, intron 2 of 9) intron (NM_001178137, intron 2 of 9) 5643 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 408.333 chr1 108759380 108759800 + 1.66667 NA intron (NM_007269, intron 5 of 18) intron (NM_007269, intron 5 of 18) 12916 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 478.333-5 chr9 28014205 28014749 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -440611 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 341.667-13 chr20 50529080 50529370 + 1.66667 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) intron (NM_001278618, intron 1 of 8) 18842 NM_002827 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 346.333-29 chr8 24878238 24878843 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35221 NM_005382 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 229-23 chr15 98536348 98536510 + 1.66667 NA Intergenic L1P4e|LINE|L1 -22093 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 138-77 chr3 101979694 101979839 + 1.66667 NA intron (NR_026934, intron 2 of 3) intron (NR_026934, intron 2 of 3) 38907 NR_026934 152225 Hs.376768 NR_026934 ENSG00000214407 LINC02085 - long intergenic non-protein coding RNA 2085 ncRNA 319.333-24 chr3 71545046 71545294 + 1.66667 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) MIRc|SINE|MIR -1613 NM_001244816 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 298.334-9 chr6 106461238 106461540 + 1.66667 NA intron (NM_001371242, intron 2 of 21) intron (NM_001371242, intron 2 of 21) -4141 NR_134603 105377924 Hs.741855 NR_134603 ENSG00000282408 LOC105377924 - uncharacterized LOC105377924 ncRNA 335.333-4 chr10 32533556 32534049 + 1.66667 NA intron (NR_109826, intron 11 of 16) L1M3f|LINE|L1 87662 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 156.333-254 chr3 177969696 177969895 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 152930 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 249.667-77 chr5 124506014 124506167 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -67570 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 287-35 chr8 82515740 82516037 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -396216 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 261.333-46 chr2 58905384 58905669 + 1.66667 NA intron (NR_033873, intron 3 of 13) intron (NR_033873, intron 3 of 13) -312182 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 261.333-8 chr1 223784445 223784668 + 1.66667 NA intron (NM_005426, intron 17 of 18) intron (NM_005426, intron 17 of 18) 61391 NM_001031685 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 231.667-3 chr1 73819171 73819316 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 144564 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 443-9 chr8 10001610 10002083 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -52446 NM_001135670 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 223-49 chr4 111545343 111545486 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -600040 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 299.333-50 chr20 58485917 58486270 + 1.66667 NA intron (NR_130908, intron 1 of 1) L1ME3F|LINE|L1 28845 NR_130908 164284 Hs.119286 NM_153360 ENSG00000198768 APCDD1L - APC down-regulated 1 like protein-coding 432.333-6 chr2 5175504 5175887 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 515423 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 226-47 chr2 191169605 191169896 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -18154 NM_001243835 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 347 chr10 29029063 29029369 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 182808 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 287.667-17 chr17 32816729 32817020 + 1.66667 NA intron (NM_015194, intron 1 of 21) intron (NM_015194, intron 1 of 21) 60250 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 279.667-3 chr10 31251883 31252195 + 1.66667 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) L1MB3|LINE|L1 64156 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 201.333-224 chr5 28512360 28512564 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -224797 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 219.667-85 chr6 80798179 80798320 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 691578 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 261.667-61 chr5 72703815 72704063 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -43270 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 438.667-8 chr5 28945080 28945555 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18447 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 291-49 chr9 112449876 112450141 + 1.66667 NA intron (NR_036651, intron 7 of 9) L1M6|LINE|L1 -36819 NM_133465 158405 Hs.656619 NM_133465 ENSG00000165185 KIAA1958 - KIAA1958 protein-coding 400-8 chr2 63969001 63969485 + 1.66667 NA intron (NM_001005739, intron 4 of 22) intron (NM_001005739, intron 4 of 22) 50185 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 528-2 chr21 22330516 22330946 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 232114 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 152.667-297 chr5 84760007 84760178 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -375212 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 338.334-4 chr11 77380303 77380619 + 1.66667 NA intron (NM_001128620, intron 2 of 15) AluSz6|SINE|Alu -78795 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 235-23 chr15 40840252 40840515 + 1.66667 NA intron (NR_146467, intron 1 of 1) intron (NR_146467, intron 1 of 1) -3665 NM_003710 6692 Hs.233950 NM_003710 ENSG00000166145 SPINT1 HAI|HAI1|MANSC2 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 1 protein-coding 384-6 chr14 66157665 66157960 + 1.66667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -328559 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 315.667-16 chr3 175590603 175590854 + 1.66667 NA intron (NM_207015, intron 10 of 13) intron (NM_207015, intron 10 of 13) 185605 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 220.666-76 chr8 133084389 133084742 + 1.66667 NA intron (NM_001045556, intron 1 of 8) intron (NM_001045556, intron 1 of 8) 18037 NM_001045557 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 252-78 chr5 60748162 60748366 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48098 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 406.333-9 chr2 183996337 183996755 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -382429 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 605.666 chr5 16218756 16219322 + 1.66667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 38798 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 257.667-53 chr22 25713437 25713596 + 1.66667 NA intron (NM_001362778, intron 16 of 19) intron (NM_001362778, intron 16 of 19) -28672 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 214.667-18 chr10 88999675 88999904 + 1.66667 NA intron (NR_135314, intron 1 of 8) intron (NR_135314, intron 1 of 8) -6814 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 253.667-71 chr7 110144280 110144461 + 1.66667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -184157 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 455.333-8 chr6 154580056 154580361 + 1.66667 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -69523 NM_001368117 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 262.333-34 chr16 79804651 79804893 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 9523 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 249.667-33 chr17 42135317 42135470 + 1.66667 NA intron (NM_001252039, intron 1 of 6) intron (NM_001252039, intron 1 of 6) 12589 NM_033194 94086 Hs.620611 NM_033194 ENSG00000260325 HSPB9 CT51 heat shock protein family B (small) member 9 protein-coding 260.667-20 chr12 104682419 104682619 + 1.66667 NA intron (NM_018413, intron 2 of 2) intron (NM_018413, intron 2 of 2) 90886 NR_037487 100500843 NR_037487 ENSG00000264295 MIR3922 - microRNA 3922 ncRNA 391.666-4 chr4 37090385 37090730 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 88778 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 265-47 chr3 45014305 45014516 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11893 NM_003278 7123 Hs.476092 NM_003278 ENSG00000163815 CLEC3B TN|TNA C-type lectin domain family 3 member B protein-coding 258.334 chr1 200828091 200828247 + 1.66667 NA intron (NM_001297708, intron 4 of 16) intron (NM_001297708, intron 4 of 16) -44812 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 429.667-4 chr4 103561142 103561490 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 136274 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 199-73 chr3 172133027 172133251 + 1.66667 NA intron (NM_001135095, intron 2 of 25) intron (NM_001135095, intron 2 of 25) 92608 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 293.667-21 chr18 70790450 70790763 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -139652 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 274-30 chr3 43989487 43989702 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -124618 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 293.667-15 chr13 24655009 24655332 + 1.66667 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie -25238 NM_001676 479 Hs.147111 NM_001676 ENSG00000075673 ATP12A ATP1AL1|HK ATPase H+/K+ transporting non-gastric alpha2 subunit protein-coding 393.334-3 chr3 74163740 74164096 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 354674 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 323.667-27 chr8 119203103 119203426 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5099 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 381.001 chr1 8543536 8543877 + 1.66667 NA intron (NM_001042681, intron 6 of 22) MER20|DNA|hAT-Charlie -48793 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 192-104 chr4 89129835 89130014 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 17107 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 306.333-24 chr19 34653621 34653894 + 1.66667 NA intron (NR_027620, intron 1 of 3) L1M3|LINE|L1 7884 NR_045208 100130342 Hs.679909 NR_045208 SCGB2B3P C2B|SCGB4A3P secretoglobin family 2B member 3, pseudogene pseudo 259-14 chr14 67874947 67875135 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 5 of 10) intron (NM_133509, intron 5 of 10) 51449 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 258-70 chr5 180248566 180248798 + 1.66667 NA intron (NM_139070, intron 6 of 11) intron (NM_139070, intron 6 of 11) 31926 NM_001308244 5601 Hs.484371 NM_002752 ENSG00000050748 MAPK9 JNK-55|JNK2|JNK2A|JNK2ALPHA|JNK2B|JNK2BETA|PRKM9|SAPK|SAPK1a|p54a|p54aSAPK mitogen-activated protein kinase 9 protein-coding 403.667-12 chr7 3420538 3421014 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1PA10|LINE|L1 119524 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 400.667-9 chr7 28936482 28936781 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 21699 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 292-3 chr10 37911074 37911444 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -53156 NR_147992 57209 Hs.528423 NM_021045 ENSG00000198105 ZNF248 bA162G10.3 zinc finger protein 248 protein-coding 197.333-90 chr18 1637384 1637580 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -277853 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 252.666-35 chr5 44814880 44815159 + 1.66667 NA exon (NM_016640, exon 5 of 5) exon (NM_016640, exon 5 of 5) 6072 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 258-10 chr11 78765359 78765645 + 1.66667 NA intron (NM_001098816, intron 18 of 33) intron (NM_001098816, intron 18 of 33) -190638 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 373.001 chr1 29865384 29865710 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 172065 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 212.667-95 chr3 188046759 188046916 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -70430 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 403.667-3 chr14 27436247 27436823 + 1.66667 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -176053 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 261.333-106 chr8 120626614 120626903 + 1.66667 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -134495 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 455-9 chr6 56182907 56183418 + 1.66667 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) intron (NM_001318752, intron 1 of 28) 64418 NR_134849 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 224.667-70 chr7 1926768 1926911 + 1.66667 NA intron (NM_001013837, intron 17 of 18) L1MDa|LINE|L1 13732 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 307.334-4 chr14 43663819 43664007 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 843370 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 211.334-6 chr22 40547877 40548019 + 1.66667 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) L2a|LINE|L2 -14121 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 308-6 chr10 36453843 36454153 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -671859 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 374.334-2 chr15 87476115 87476481 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -100631 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 286.333-7 chr12 52454677 52454997 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2691 NM_005555 3854 Hs.708950 NM_005555 ENSG00000185479 KRT6B CK-6B|CK6B|K6B|KRTL1|PC2|PC4 keratin 6B protein-coding 254.667-17 chr12 27270193 27270385 + 1.66667 NA intron (NM_015000, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 26003 NM_015000 23012 Hs.184523 NM_015000 ENSG00000211455 STK38L NDR2 serine/threonine kinase 38 like protein-coding 322.333-30 chr8 127306820 127307185 + 1.66667 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) intron (NR_117100, intron 5 of 5) 62365 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 325.667-16 chr22 42773122 42773470 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -51995 NM_001318038 53947 Hs.105956 NM_017436 ENSG00000128274 A4GALT A14GALT|A4GALT1|Gb3S|P(k)|P1|P1PK|PK alpha 1,4-galactosyltransferase (P blood group) protein-coding 330.334-13 chr8 81134973 81135295 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -23066 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 296.667-18 chr15 57089372 57089745 + 1.66667 NA intron (NM_001322158, intron 5 of 20) intron (NM_001322158, intron 5 of 20) -129872 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 246.667-55 chr3 28922611 28922781 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 347418 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 326-15 chr14 61370318 61370720 + 1.66667 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 49076 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 224.333-31 chr12 105273394 105273620 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -37277 NM_001251904 55198 Hs.506603 NM_018171 ENSG00000136044 APPL2 DIP13B adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 2 protein-coding 410.667-5 chr14 61029069 61029495 + 1.66667 NA intron (NR_033344, intron 5 of 16) AluSq4|SINE|Alu -47592 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 272.666-20 chr5 54459246 54459658 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 3753 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 248.666-35 chr7 3900332 3900595 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -229222 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 247.667-46 chr2 22681987 22682175 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 145602 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 389.333-6 chr12 124800602 124801177 + 1.66667 NA intron (NR_160424, intron 7 of 11) intron (NR_160424, intron 7 of 11) 38782 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 429.334 chr14 68825487 68825816 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -29408 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 250.333-46 chr3 179589174 179589409 + 1.66667 NA TTS (NM_178042) TTS (NM_178042) 15347 NM_020409 57129 Hs.283734 NM_020409 ENSG00000136522 MRPL47 CGI-204|L47mt|MRP-L47|NCM1 mitochondrial ribosomal protein L47 protein-coding 389.333-13 chr3 57280306 57280744 + 1.66667 NA intron (NM_001142733, intron 6 of 10) intron (NM_001142733, intron 6 of 10) -1573 NM_130387 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 272-24 chr2 101168642 101168843 + 1.66667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 17082 NR_135594 100506286 Hs.679790 NR_135594 ENSG00000272902 TBC1D8-AS1 - TBC1 domain family member 8 antisense RNA 1 ncRNA 408.333-13 chrUn_GL000216v2 72558 73149 + 1.66667 NA NA (TTCCATTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 237.333-75 chr3 22924438 22924646 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 278036 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 249.334-3 chr10 79458887 79459069 + 1.66667 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -13354 NM_153367 219654 Hs.523080 NM_153367 ENSG00000165424 ZCCHC24 C10orf56|Z3CXXC8 zinc finger CCHC-type containing 24 protein-coding 446.333-7 chr4 69957628 69958052 + 1.66667 NA intron (NM_001891, intron 4 of 6) intron (NM_001891, intron 4 of 6) 3171 NM_001302770 1447 Hs.2242 NM_001891 ENSG00000135222 CSN2 CASB casein beta protein-coding 115.333-61 chr14 36710932 36711077 + 1.66667 NA intron (NM_001171170, intron 7 of 10) intron (NM_001171170, intron 7 of 10) 53436 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 197.667-106 chr4 37087713 37087861 + 1.66667 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 86008 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 248.667-114 chrX 39484930 39485258 + 1.66667 NA Intergenic Charlie30a|DNA|hAT-Charlie -93320 NR_110385 101927449 Hs.553988 NR_110385 ENSG00000236747 LINC01282 - long intergenic non-protein coding RNA 1282 ncRNA 252.666-11 chr14 58917532 58917738 + 1.66667 NA intron (NR_110547, intron 3 of 5) intron (NR_110547, intron 3 of 5) 89347 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 143.334-2 chr4 86096242 86096371 + 1.66667 NA intron (NM_001363657, intron 8 of 13) intron (NM_001363657, intron 8 of 13) -23500 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 150.333-365 chr6 103065248 103065419 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 1666348 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 246-28 chr14 74897587 74897885 + 1.66667 NA intron (NR_045209, intron 9 of 13) intron (NR_045209, intron 9 of 13) 15820 NM_001244883 1743 Hs.525459 NM_001933 ENSG00000119689 DLST DLTS dihydrolipoamide S-succinyltransferase protein-coding 251.333-102 chr6 153931690 153931902 + 1.66667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -78700 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 233-30 chr18 6243726 6243960 + 1.66667 NA intron (NM_001365769, intron 6 of 16) intron (NM_001365769, intron 6 of 16) -12901 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 256.667-14 chr11 84661548 84661707 + 1.66667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L2c|LINE|L2 59315 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 246-46 chr18 13992422 13992589 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -76798 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 266.333-6 chr10 53927284 53927510 + 1.66667 NA intron (NM_001354411, intron 26 of 34) intron (NM_001354411, intron 26 of 34) -558833 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 393-15 chr5 158669236 158669736 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -259713 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 284-47 chr5 58971756 58972028 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001197219, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001197219, exon 15 of 15) 28006 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 280-45 chr4 129788537 129788765 + 1.66667 NA intron (NR_151713, intron 2 of 16) intron (NR_151713, intron 2 of 16) 17032 NR_151713 107986313 Hs.112740 NR_151713 ENSG00000249618 LINC02465 - long intergenic non-protein coding RNA 2465 ncRNA 266.001-2 chr16 84625102 84625278 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7112 NM_021149 23406 Hs.289092 NM_021149 ENSG00000103187 COTL1 CLP coactosin like F-actin binding protein 1 protein-coding 388-13 chr3 53607763 53608143 + 1.66667 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) L1ME1|LINE|L1 113342 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 270.334-12 chr2 41048131 41048356 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -535808 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 333.333-48 chr7 30680350 30680693 + 1.66667 NA intron (NM_001202481, intron 4 of 13) intron (NM_001202481, intron 4 of 13) 1935 NM_001883 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 292.667-40 chr7 77320661 77320963 + 1.66667 NA exon (NM_001350899, exon 26 of 30) exon (NM_001350899, exon 26 of 30) -94386 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 286.001-2 chr18 55036669 55036844 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -77295 NM_025214 80323 Hs.120790 NM_025214 ENSG00000166510 CCDC68 SE57-1 coiled-coil domain containing 68 protein-coding 254-69 chr6 93101900 93102125 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 317547 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 261.333-16 chr10 93917213 93917454 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 23355 NR_144336 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 352-25 chr6 54533352 54533672 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 225071 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 218.667-34 chr15 68921843 68922099 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -8529 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 245-59 chr6 50313686 50313932 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -263880 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 276.667-44 chr21 28497310 28497479 + 1.66667 NA Intergenic (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -41924 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 288-54 chr8 77958400 77958711 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 507858 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 331.334-9 chr4 100105038 100105355 + 1.66667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -84837 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 251.667-8 chr1 221136676 221136846 + 1.66667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 199535 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 468-3 chr1 202365287 202365908 + 1.66667 NA intron (NM_002481, intron 1 of 23) MIRb|SINE|MIR 16895 NM_001167857 4660 Hs.444403 NM_002481 ENSG00000077157 PPP1R12B MYPT2|PP1bp55 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B protein-coding 591.667 chr3 33700476 33701048 + 1.66667 NA intron (NM_001365634, intron 1 of 35) AluSq2|SINE|Alu 17492 NM_001365633 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 383.667 chr15 81667693 81668062 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -293664 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 326.333-33 chr7 92271119 92271553 + 1.66667 NA intron (NM_019004, intron 1 of 19) L1MD|LINE|L1 -25236 NM_001350677 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 344-21 chr2 57885076 57885452 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22387 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 159.334 chr4 42916782 42916927 + 1.66667 NA intron (NM_001080476, intron 1 of 3) L1MC4|LINE|L1 23588 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 232-38 chr18 39773015 39773211 + 1.66667 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -21118 NR_024391 647946 Hs.649350 NR_024391 ENSG00000267374 MIR924HG LINC00669 MIR924 host gene ncRNA 499.334-2 chr6 61657420 61657813 + 1.66667 NA intron (NR_146873, intron 10 of 11) intron (NR_146873, intron 10 of 11) 83486 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 414.667-14 chr6 63063398 63063885 + 1.66667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 256336 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 262.667-59 chr4 155636358 155636629 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -30217 NM_001130687 2982 Hs.24258 NM_000856 ENSG00000164116 GUCY1A1 GC-SA3|GUC1A3|GUCA3|GUCSA3|GUCY1A3|MYMY6 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 1 protein-coding 257.667-76 chr7 22870470 22870851 + 1.66667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 14047 NR_003075 692210 NR_003075 ENSG00000221740 SNORD93 HBII-336 small nucleolar RNA, C/D box 93 snoRNA 208-149 chr6 134866074 134866259 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 83935 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 348.333 chr1 30720548 30720877 + 1.66667 NA intron (NR_034182, intron 1 of 3) intron (NR_034182, intron 1 of 3) 1940 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 240.667-52 chr20 53078908 53079158 + 1.66667 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 -106250 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 323.334-9 chr5 27221796 27222123 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -183373 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 302.667-34 chr7 116154155 116154458 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -56233 NM_015641 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 322-36 chr6 11887308 11887689 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -108451 NM_032744 84830 Hs.126409 NM_032744 ENSG00000111863 ADTRP AIG1L|C6orf105|dJ413H6.1 androgen dependent TFPI regulating protein protein-coding 246.334-6 chr14 55547508 55547667 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 32505 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 244.334-11 chr17 47618090 47618324 + 1.66667 NA intron (NM_001330257, intron 20 of 23) intron (NM_001330257, intron 20 of 23) -31712 NM_002265 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 144-157 chr9 24126610 24126699 + 1.66667 NA Intergenic (CAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -276053 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 341.333-34 chr9 29526969 29527452 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -313609 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 357-3 chr1 113320088 113320429 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -70257 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 228-35 chr17 60721767 60721920 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) L1ME3|LINE|L1 43992 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 284.667-47 chr7 10163199 10163570 + 1.66667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 529114 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 244.667-64 chr22 28274336 28274548 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -185427 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 347-12 chr17 53409841 53410322 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -412846 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 243-50 chr5 65771131 65771286 + 1.66667 NA intron (NM_020726, intron 3 of 12) intron (NM_020726, intron 3 of 12) 49003 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 241-3 chr1 189915082 189915395 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 560772 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 282-7 chr12 24069104 24069448 + 1.66667 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -118244 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 232.333-87 chr8 67563915 67564191 + 1.66667 NA intron (NM_020361, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 182307 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 234-34 chr2 66809279 66809534 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -95030 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 320.667-16 chr16 27416690 27417058 + 1.66667 NA intron (NM_181079, intron 2 of 9) L1MB7|LINE|L1 -10397 NM_021798 50615 Hs.210546 NM_021798 ENSG00000103522 IL21R CD360|IMD56|NILR interleukin 21 receptor protein-coding 356.666-7 chr14 72214801 72215136 + 1.66667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MIRb|SINE|MIR 281441 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 329.667-19 chr8 87178547 87178897 + 1.66667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 312307 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 186.667-129 chr6 94632726 94632963 + 1.66667 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 914541 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 282.334-17 chr9 33336195 33336389 + 1.66667 NA intron (NM_002504, intron 11 of 23) AluSg|SINE|Alu 45776 NM_002504 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 206.333-65 chr16 74801157 74801376 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -26446 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 136-39 chr16 23530000 23530093 + 1.66667 NA intron (NM_001083614, intron 5 of 8) intron (NM_001083614, intron 5 of 8) -19552 NM_015044 23062 Hs.460336 NM_015044 ENSG00000103365 GGA2 VEAR golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2 protein-coding 370-25 chr7 26381498 26381867 + 1.66667 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -4981 NR_136270 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 313.333-32 chr4 185118287 185118673 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -24786 NM_001151 291 Hs.246506 NM_001151 ENSG00000151729 SLC25A4 AAC1|ANT|ANT 1|ANT1|MTDPS12|MTDPS12A|PEO2|PEO3|PEOA2|T1 solute carrier family 25 member 4 protein-coding 317.667-26 chr2 195427498 195427913 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -229253 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 208.667-45 chr13 79499164 79499459 + 1.66667 NA intron (NM_019080, intron 1 of 7) L1MC|LINE|L1 -18080 NR_046685 100874208 Hs.602801 NR_046685 ENSG00000232132 NDFIP2-AS1 - NDFIP2 antisense RNA 1 ncRNA 224.333-45 chr15 57719610 57719822 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 13002 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 230-34 chr2 36893824 36893983 + 1.66667 NA exon (NM_003162, exon 7 of 18) exon (NM_003162, exon 7 of 18) 72633 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 372.334-2 chr11 18424676 18425173 + 1.66667 NA intron (NM_017448, intron 3 of 7) AluSz|SINE|Alu 12606 NM_017448 3948 Hs.654377 NM_002301 ENSG00000166796 LDHC CT32|LDH3|LDHX lactate dehydrogenase C protein-coding 247.334-15 chr3 102258669 102258905 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 95082 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 288.334 chr10 37314968 37315261 + 1.66667 NA intron (NR_104061, intron 2 of 4) intron (NR_104061, intron 2 of 4) 5928 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 259.334-13 chr2 174475850 174476054 + 1.66667 NA intron (NM_001267051, intron 2 of 14) intron (NM_001267051, intron 2 of 14) 11077 NM_152529 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 229.333-5 chr1 94197532 94197796 + 1.66667 NA intron (NM_001328665, intron 11 of 21) L1MEf|LINE|L1 39920 NM_001328666 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 218.667-111 chr8 123305125 123305428 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -29735 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 533.666-5 chr7 90430225 90430840 + 1.66667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 27071 NM_001185073 9069 Hs.731917 NM_012129 ENSG00000157224 CLDN12 - claudin 12 protein-coding 245.667-69 chr7 146783854 146784081 + 1.66667 NA intron (NM_014141, intron 1 of 22) intron (NM_014141, intron 1 of 22) 9696 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 372.334-7 chr6 61803303 61803670 + 1.66667 NA intron (NR_146874, intron 6 of 13) MIR|SINE|MIR 229356 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 267.334-9 chr19 29636584 29636782 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28778 NM_024310 79156 Hs.466383 NM_024310 ENSG00000166289 PLEKHF1 APPD|LAPF|PHAFIN1|ZFYVE15 pleckstrin homology and FYVE domain containing 1 protein-coding 343.333-17 chr22 27928328 27928640 + 1.66667 NA intron (NR_026963, intron 1 of 4) L1ME2|LINE|L1 -7872 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 242-4 chr1 111546552 111546774 + 1.66667 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 4654 NM_001370216 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 263-46 chr4 60958659 60958927 + 1.66667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 36174 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 416 chr10 98246533 98246880 + 1.66667 NA TTS (NM_032211) TTS (NM_032211) 21488 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 251.334-5 chr1 187285451 187285636 + 1.66667 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) -158085 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 265-28 chr18 27947645 27947924 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 88857 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 267.667-23 chr18 77956837 77957063 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 36777 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 298-50 chr20 4791583 4791820 + 1.66667 NA intron (NM_014737, intron 6 of 11) L1ME4b|LINE|L1 23422 NM_170774 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 337-23 chr7 3876407 3876849 + 1.66667 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -253057 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 256-11 chr10 97753585 97753882 + 1.66667 NA intron (NM_001002261, intron 9 of 11) intron (NM_001002261, intron 9 of 11) 15256 NM_001002261 118813 Hs.744075 NM_144588 ENSG00000155256 ZFYVE27 PROTRUDIN|SPG33 zinc finger FYVE-type containing 27 protein-coding 252.334-23 chr8 119253696 119253959 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -6970 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 284.334-11 chr3 177840351 177840629 + 1.66667 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) intron (NR_110826, intron 1 of 2) 23625 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 252-15 chr11 63021702 63021969 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5990 NM_001184732 9376 Hs.266223 NM_004254 ENSG00000149452 SLC22A8 OAT3 solute carrier family 22 member 8 protein-coding 267.333-30 chr14 46119130 46119445 + 1.66667 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 55128 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 241.333-64 chr22 25901288 25901544 + 1.66667 NA intron (NM_001318245, intron 29 of 43) intron (NM_001318245, intron 29 of 43) 159228 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 313.667-19 chr17 65352606 65352925 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -104776 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 460.667-4 chr7 92619587 92620106 + 1.66667 NA intron (NM_001259, intron 6 of 7) intron (NM_001259, intron 6 of 7) -29456 NR_109929 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 313.333-36 chr6 47604255 47604504 + 1.66667 NA intron (NM_012120, intron 13 of 17) intron (NM_012120, intron 13 of 17) -52093 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 615.333-2 chr18_GL383571v1_alt 95722 96239 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 66467 NM_032160 92126 Hs.124673 NM_032160 ENSG00000171451 DSEL C18orf4|DE-epi2 dermatan sulfate epimerase like protein-coding 173.334-2 chr4 81650774 81650940 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -178950 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 433.333-2 chr1 181163089 181163424 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -11228 NR_125966 101928973 Hs.637822 NR_125966 ENSG00000237292 LINC01732 - long intergenic non-protein coding RNA 1732 ncRNA 219.333-71 chr16 87398671 87398888 + 1.66667 NA intron (NM_022818, intron 1 of 3) intron (NM_022818, intron 1 of 3) 6443 NM_022818 81631 Hs.356061 NM_022818 ENSG00000140941 MAP1LC3B ATG8F|LC3B|MAP1A/1BLC3|MAP1LC3B-a microtubule associated protein 1 light chain 3 beta protein-coding 206.334 chr1 31277375 31277538 + 1.66667 NA intron (NM_004814, intron 5 of 9) intron (NM_004814, intron 5 of 9) 19332 NM_004814 9410 Hs.33962 NM_004814 ENSG00000060688 SNRNP40 40K|HPRP8BP|PRP8BP|PRPF8BP|SPF38|WDR57 small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40 protein-coding 271.667-37 chr2 8508562 8508773 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 75125 NR_110257 101929567 Hs.634706 NR_110257 ENSG00000236008 LINC01814 - long intergenic non-protein coding RNA 1814 ncRNA 266.334-21 chr6 99473189 99473374 + 1.66667 NA intron (NR_144348, intron 9 of 12) AluSz|SINE|Alu 42095 NM_001346033 85015 Hs.143410 NM_032929 ENSG00000123552 USP45 - ubiquitin specific peptidase 45 protein-coding 244.667-67 chr3 105947515 105947737 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -78225 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 317.667-2 chr1 60624680 60624976 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2143 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 347-18 chr2 78986602 78986999 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -38902 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 262.667-86 chrX 67539746 67539982 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -4157 NM_000044 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 255.333-33 chr14 83572148 83572437 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 929660 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 228.334-5 chr4 58972156 58972307 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12051 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 379.999-11 chr7 1392377 1392894 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 66835 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 254.334 chr1 28375360 28375564 + 1.66667 NA intron (NM_001048183, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 5722 NM_001350158 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 275.334-7 chr18 3719942 3720170 + 1.66667 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 116319 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 350-19 chr22 49604920 49605217 + 1.66667 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) L1ME4a|LINE|L1 52451 NR_110522 348645 Hs.133159 NM_198851 ENSG00000188511 C22orf34 - chromosome 22 open reading frame 34 protein-coding 277.334-13 chr5 109741532 109741826 + 1.66667 NA intron (NM_002372, intron 4 of 21) intron (NM_002372, intron 4 of 21) 52313 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 225.667-51 chr3 56312636 56312800 + 1.66667 NA intron (NR_132749, intron 2 of 17) intron (NR_132749, intron 2 of 17) 155749 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 279-36 chr8 82387045 82387362 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -524901 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 261.001 chr5 51659489 51659651 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 276122 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 282.333-26 chr19 30568629 30568880 + 1.66667 NA intron (NM_001352260, intron 4 of 5) intron (NM_001352260, intron 4 of 5) 196370 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 289.001-2 chr5 106599412 106599627 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 411495 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 503.333-2 chr12 26524016 26524503 + 1.66667 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 308935 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 243.333-109 chr7 83736019 83736248 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -86994 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 236.334-4 chr18 77804430 77804615 + 1.66667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 189205 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 217.667-91 chr8 140006240 140006453 + 1.66667 NA intron (NM_001160372, intron 18 of 22) L1MB8|LINE|L1 94189 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 127.667-36 chr12 45628162 45628309 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 99686 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 275.667-55 chr7 40132993 40133195 + 1.66667 NA exon (NM_138701, exon 2 of 2) exon (NM_138701, exon 2 of 2) 1528 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 286.334 chr1 103387937 103388157 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 137464 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 316.667-14 chr17 20151098 20151461 + 1.66667 NA intron (NM_001033553, intron 3 of 14) Tigger5|DNA|TcMar-Tigger -4793 NM_001033555 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 380.666-7 chr2 144614552 144615031 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -53176 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 248.667-79 chr3 162938999 162939196 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 364204 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 224.333-103 chr5 132190558 132190712 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001365678, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001365678, exon 16 of 16) 5759 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 301.001-2 chr8 102701921 102702131 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 45778 NR_160672 101927245 NR_160672 LOC101927245 - uncharacterized LOC101927245 ncRNA 185 chr1 168060224 168060477 + 1.66667 NA intron (NM_001198956, intron 17 of 21) AluJo|SINE|Alu 61690 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 260.667-91 chr8 94644506 94644729 + 1.66667 NA intron (NM_017697, intron 3 of 15) intron (NM_017697, intron 3 of 15) 3443 NM_001122825 54845 Hs.487471 NM_017697 ENSG00000104413 ESRP1 DFNB109|RBM35A|RMB35A epithelial splicing regulatory protein 1 protein-coding 235.334-3 chr14 79899900 79900053 + 1.66667 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL -311443 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 250-79 chr7 92347825 92348054 + 1.66667 NA intron (NM_019004, intron 7 of 19) intron (NM_019004, intron 7 of 19) 89375 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 211.334 chr1 59121868 59122026 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 24860 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 258.666-13 chr15 55531748 55531928 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -23604 NM_001033560 161582 Hs.126403 NM_130810 ENSG00000256061 DNAAF4 CILD25|DYX1|DYX1C1|DYXC1|EKN1|RD dynein axonemal assembly factor 4 protein-coding 263-37 chr22 26187988 26188274 + 1.66667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 18657 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 293.333-26 chr2 28855863 28856190 + 1.66667 NA intron (NM_017910, intron 3 of 6) intron (NM_017910, intron 3 of 6) 14283 NM_017910 55006 Hs.468026 NM_017910 ENSG00000171103 TRMT61B - tRNA methyltransferase 61B protein-coding 240-87 chr8 70401239 70401401 + 1.66667 NA intron (NM_001321703, intron 1 of 22) intron (NM_001321703, intron 1 of 22) 2070 NM_001321713 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 251.667-91 chr7 114626522 114626679 + 1.66667 NA intron (NM_148898, intron 4 of 17) (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -26745 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 326.666-11 chr5 129132613 129132957 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 35097 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 260.334-11 chr14 81305948 81306129 + 1.66667 NA intron (NM_001366850, intron 5 of 7) intron (NM_001366850, intron 5 of 7) -84648 NM_201595 2957 Hs.592334 NM_015859 ENSG00000165417 GTF2A1 TF2A1|TFIIA|TFIIA-42|TFIIAL general transcription factor IIA subunit 1 protein-coding 322.333-22 chr4 86437753 86438142 + 1.66667 NA intron (NM_002753, intron 1 of 13) L1ME3A|LINE|L1 15248 NM_002753 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 473.667-3 chr2 191209146 191209761 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35951 NM_001330238 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 381.334-7 chr4 20472270 20472618 + 1.66667 NA intron (NM_001289135, intron 5 of 35) intron (NM_001289135, intron 5 of 35) -55831 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 373.667-3 chr15 58627097 58627476 + 1.66667 NA intron (NM_001320570, intron 9 of 14) L1ME2z|LINE|L1 66321 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 153.667-348 chr6 163743388 163743531 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -71975 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 244.667-79 chr5 51507230 51507480 + 1.66667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 123907 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 246.667-51 chr21 24264709 24264887 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 56579 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 303.333-55 chr4 77885778 77886092 + 1.66667 NA intron (NM_020236, intron 4 of 8) intron (NM_020236, intron 4 of 8) 23105 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 279.667-29 chr22 34466469 34466811 + 1.66667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 531276 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 234.334-19 chr8 86280952 86281186 + 1.66667 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -50688 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 284.667-5 chr1 182579047 182579328 + 1.66667 NA intron (NM_021133, intron 5 of 6) L1PB4|LINE|L1 10069 NM_021133 6041 Hs.518545 NM_021133 ENSG00000135828 RNASEL PRCA1|RNS4 ribonuclease L protein-coding 247-21 chr14 52859005 52859319 + 1.66667 NA TTS (NM_001135000) TTS (NM_001135000) -67555 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 499.001 chr3 1497949 1498251 + 1.66667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 405076 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 278.667-49 chr7 12546550 12546789 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24051 NR_156701 85477 Hs.633359 NM_033128 ENSG00000006747 SCIN - scinderin protein-coding 465.667-7 chr2 69895943 69896334 + 1.66667 NA intron (NR_037862, intron 2 of 6) intron (NR_037862, intron 2 of 6) 2182 NR_037862 11017 Hs.54649 NM_006857 ENSG00000124380 SNRNP27 27K|RY1 small nuclear ribonucleoprotein U4/U6.U5 subunit 27 protein-coding 262.001 chr10 6090164 6090328 + 1.66667 NA intron (NM_001145547, intron 1 of 11) intron (NM_001145547, intron 1 of 11) 900 NM_001145547 84991 Hs.498548 NM_032905 ENSG00000134453 RBM17 SPF45 RNA binding motif protein 17 protein-coding 265 chr1 64732544 64732858 + 1.66667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -12272 NM_001366165 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 190-43 chr15 94866390 94866579 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 11121 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 261-37 chr2 158381606 158381854 + 1.66667 NA intron (NM_138803, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 75023 NM_001301685 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 254.667-27 chr15 74678275 74678569 + 1.66667 NA intron (NM_001142443, intron 3 of 9) L1MC1|LINE|L1 17602 NM_001351378 80153 Hs.96852 NM_025083 ENSG00000179151 EDC3 LSM16|MRT50|YJDC|YJEFN2|hYjeF_N2-15q23 enhancer of mRNA decapping 3 protein-coding 246-54 chr2 213861855 213862139 + 1.66667 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) 103930 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 302.333-18 chr2 149898715 149899024 + 1.66667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -39678 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 362-15 chr22 26419449 26419858 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9607 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 275-44 chr5 82719469 82719776 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -120533 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 255.334-2 chr1 60879585 60879739 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -54078 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 295-38 chr5 149188491 149188771 + 1.66667 NA intron (NM_001370418, intron 2 of 18) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 46900 NM_001370418 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 259.667-41 chr20 53055722 53056002 + 1.66667 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) MER58A|DNA|hAT-Charlie 83504 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 227.667-28 chr17 65678237 65678421 + 1.66667 NA intron (NM_001353129, intron 24 of 26) intron (NM_001353129, intron 24 of 26) -116681 NM_001363813 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 161.667-41 chr11 40055962 40056143 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 237078 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 205-89 chr7 99026175 99026333 + 1.66667 NA intron (NR_110102, intron 1 of 5) AluSg|SINE|Alu 13089 NR_110102 101927550 Hs.636663 NR_110102 LOC101927550 - uncharacterized LOC101927550 ncRNA 362.667-20 chr3 112456698 112456973 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 42637 NM_001085357 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 264.333-61 chr5 121415848 121416139 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 93443 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 293.667-54 chr6 142674251 142674503 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36488 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 273-34 chr6 10151729 10151996 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -252640 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 260.001-3 chr5 122094043 122094204 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15864 NM_002317 4015 Hs.102267 NM_002317 ENSG00000113083 LOX AAT10 lysyl oxidase protein-coding 504-5 chr17 59090446 59091158 + 1.66667 NA intron (NM_001320990, intron 3 of 23) AluSx|SINE|Alu 16078 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 259.333-28 chr13 96902057 96902290 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 81999 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 363.667-17 chr8 72493651 72493966 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -43417 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 284-50 chr5 153707308 153707647 + 1.66667 NA intron (NM_000827, intron 11 of 15) intron (NM_000827, intron 11 of 15) 191510 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 206-175 chr7 158564014 158564223 + 1.66667 NA intron (NM_130843, intron 1 of 21) L1ME4b|LINE|L1 -22342 NM_001308268 5799 Hs.490789 NM_002847 ENSG00000155093 PTPRN2 IA-2beta|IAR|ICAAR|PTPRP|R-PTP-N2 protein tyrosine phosphatase receptor type N2 protein-coding 221-8 chr1 196271934 196272069 + 1.66667 NA intron (NR_146058, intron 26 of 29) intron (NR_146058, intron 26 of 29) -183286 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 250.334 chr1 79670167 79670337 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -663522 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 279.667-14 chr14 64113853 64114065 + 1.66667 NA intron (NM_015180, intron 66 of 114) MIRc|SINE|MIR -18834 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 264.333-66 chr6 45629565 45629814 + 1.66667 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 207414 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 263.333-70 chr5 41893631 41893893 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -10582 NM_175921 285636 Hs.29899 NM_175921 ENSG00000205765 C5orf51 - chromosome 5 open reading frame 51 protein-coding 275.333-51 chr4 30730027 30730363 + 1.66667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 9826 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 261.667-39 chr2 135184052 135184247 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 47521 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 267.666-16 chr4 41257477 41257794 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_102709) promoter-TSS (NR_102709) 707 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 237.667-59 chr4 45024161 45024343 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -297618 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 235.667-25 chr15 76377804 76378002 + 1.66667 NA intron (NR_148227, intron 29 of 32) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 41130 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 318-35 chr22 32895222 32895501 + 1.66667 NA intron (NM_003490, intron 4 of 13) MLT2B4|LTR|ERVL 94545 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 269.667-37 chr3 3325515 3325719 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -145900 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 253.667-13 chr11 32982100 32982272 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -33692 NM_001077242 91614 Hs.280990 NM_139160 ENSG00000121690 DEPDC7 TR2|dJ85M6.4 DEP domain containing 7 protein-coding 325.333-12 chr12 87896919 87897271 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -112384 NR_033410 400058 Hs.572212 NR_033410 MKRN9P MKRN5|MKRN9|MKRNP6|RNF65|ZNF127L3 makorin ring finger protein 9, pseudogene pseudo 219.667-61 chr4 34920596 34920740 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -650921 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 236-85 chr7 90217947 90218095 + 1.66667 NA intron (NM_001244944, intron 2 of 5) L1MA4A|LINE|L1 4201 NM_001040666 261729 Hs.489051 NM_152999 ENSG00000157214 STEAP2 IPCA1|PCANAP1|PUMPCn|STAMP1|STMP STEAP2 metalloreductase protein-coding 514.333-2 chr8 136037437 136037979 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -493090 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 411.667-9 chr9 102261937 102262276 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -257531 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 286.334-11 chr7 84153285 84153555 + 1.66667 NA intron (NM_006080, intron 1 of 16) intron (NM_006080, intron 1 of 16) 41369 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 177-34 chr18 62296058 62296228 + 1.66667 NA intron (NM_001346234, intron 27 of 27) L1ME3E|LINE|L1 -29144 NM_001270949 8792 Hs.204044 NM_003839 ENSG00000141655 TNFRSF11A CD265|FEO|LOH18CR1|ODFR|OFE|OPTB7|OSTS|PDB2|RANK|TRANCER TNF receptor superfamily member 11a protein-coding 291.666-8 chr3 29178380 29178613 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 102443 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 206.333-104 chr21 29678966 29679188 + 1.66667 NA intron (NM_001320621, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR -69098 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 196.667-54 chr15 96003562 96003740 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 124190 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 211.334-9 chr7 136526296 136526566 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -342221 NM_001006630 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 255-29 chr14 45638496 45638697 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 77006 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 252-5 chr1 186312370 186312632 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_003292, exon 51 of 51) 3' UTR (NM_003292, exon 51 of 51) 16228 NM_001127710 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 354.334 chr1 97674814 97675136 + 1.66667 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) MER112|DNA|hAT-Charlie -121946 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 259.334-22 chr8 115342298 115342482 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 325623 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 268.334-20 chr8 113310938 113311104 + 1.66667 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) intron (NM_001363185, intron 2 of 66) 66131 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 250.666-2 chr10 43786359 43786661 + 1.66667 NA TTS (NR_002726) TTS (NR_002726) 3907 NR_002726 10151 Hs.632956 NR_002726 HNRNPA3P1 D10S102|FBRNP|HNRPA3|HNRPA3P1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 1 pseudo 273.333-57 chr4 187453487 187453794 + 1.66667 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) intron (NR_038931, intron 1 of 4) 51973 NR_038931 339975 Hs.639361 NR_038931 LOC339975 - uncharacterized LOC339975 ncRNA 353.666-5 chr2 113945179 113945454 + 1.66667 NA intron (NM_005721, intron 8 of 11) HAL1|LINE|L1 -24006 NR_148507 440900 Hs.662205 NR_034128 ENSG00000234199 LINC01191 VIN|lnc-ACTR3 long intergenic non-protein coding RNA 1191 ncRNA 370-24 chr7 23609163 23609671 + 1.66667 NA intron (NM_138771, intron 2 of 3) AluSq2|SINE|Alu 12035 NM_138771 90693 Hs.232296 NM_138771 ENSG00000169193 CCDC126 - coiled-coil domain containing 126 protein-coding 243-5 chr1 117556526 117556802 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 49106 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 274.667-54 chr7 121072927 121073244 + 1.66667 NA intron (NM_001105533, intron 4 of 17) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 83694 NM_001105533 79974 Hs.189652 NM_024913 ENSG00000106034 CPED1 C7orf58 cadherin like and PC-esterase domain containing 1 protein-coding 400.001-2 chr5 4441405 4441791 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -331883 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 365.001-4 chr9 33953011 33953292 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_003685) promoter-TSS (NR_003685) -297 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 302.333-3 chr1 69026024 69026385 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -29694 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 198.333-149 chr4 124189306 124189503 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 369030 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 248-32 chr17 67201460 67201722 + 1.66667 NA intron (NM_001330447, intron 6 of 32) intron (NM_001330447, intron 6 of 32) -43185 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 267.667-27 chr2 41488175 41488419 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -389258 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 256.334-8 chr20 4126526 4126680 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -22176 NM_001270691 54498 Hs.433337 NM_175839 ENSG00000088826 SMOX C20orf16|PAO|PAO-1|PAO1|PAOH|PAOH1|SMO spermine oxidase protein-coding 369.001 chr12 45092578 45092907 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27331 NR_026583 83956 Hs.650500 NM_032032 RACGAP1P FKSG42 Rac GTPase activating protein 1 pseudogene pseudo 412-11 chr6 48476829 48477144 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -408297 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 246.334-15 chr4 128885821 128885985 + 1.66667 NA intron (NM_144643, intron 20 of 20) L1ME4b|LINE|L1 74059 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 286.667-16 chr18 50628314 50628562 + 1.66667 NA intron (NM_001292039, intron 1 of 4) intron (NM_001292039, intron 1 of 4) 68351 NM_002747 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 519.334-2 chr6 131286686 131287038 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 36458 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 292.667-23 chr3 6757982 6758271 + 1.66667 NA intron (NR_110125, intron 2 of 3) intron (NR_110125, intron 2 of 3) 47323 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 331-31 chr5 90384320 90384668 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 25292 NM_001297765 1070 Hs.591767 NM_004365 ENSG00000153140 CETN3 CDC31|CEN3 centrin 3 protein-coding 356.667-10 chr21 43664350 43664659 + 1.66667 NA intron (NM_015056, intron 1 of 15) intron (NM_015056, intron 1 of 15) 4944 NM_015056 23076 Hs.565725 NM_015056 ENSG00000160208 RRP1B KIAA0179|NNP1L|Nnp1|PPP1R136|RRP1 ribosomal RNA processing 1B protein-coding 245.333-5 chr1 159127991 159128280 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -43480 NM_001346510 57863 Hs.365689 NM_021189 ENSG00000162706 CADM3 BIgR|IGSF4B|NECL1|Necl-1|TSLL1|synCAM3 cell adhesion molecule 3 protein-coding 181-65 chr6 97461095 97461259 + 1.66667 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) intron (NR_110757, intron 1 of 4) 155591 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 251.334-26 chr6 91866717 91866923 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -176392 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 237.334-13 chr9 3296320 3296493 + 1.66667 NA intron (NM_134428, intron 6 of 17) intron (NM_134428, intron 6 of 17) 99190 NM_002919 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 572.667-2 chr22 32453085 32453605 + 1.66667 NA intron (NM_174932, intron 2 of 14) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 4041 NM_174932 254240 Hs.372939 NM_174932 ENSG00000184459 BPIFC BPIL2 BPI fold containing family C protein-coding 286.333-28 chr3 78056591 78056934 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7799 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 246-8 chr1 233301582 233301737 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5934 NM_014801 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 251.334-9 chr10 70922333 70922486 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -16644 NR_134314 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 298.666-6 chr14 71560798 71561051 + 1.66667 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -25374 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 181.334-6 chr8 142728752 142728882 + 1.66667 NA intron (NM_016647, intron 1 of 1) MER41C|LTR|ERV1 1594 NM_016647 51337 Hs.368402 NM_016647 ENSG00000130193 THEM6 C8orf55|DSCD75 thioesterase superfamily member 6 protein-coding 221.667-41 chr2 41883136 41883284 + 1.66667 NA intron (NR_033996, intron 1 of 2) intron (NR_033996, intron 1 of 2) 5655 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 178.334-2 chr4 107817308 107817433 + 1.66667 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 -7195 NM_001136258 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 251.334-4 chr1 111385098 111385341 + 1.66667 NA intron (NR_029429, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 4632 NR_029429 441897 Hs.568387 NR_029429 ENSG00000227179 PGCP1 - progastricsin pseudogene 1 pseudo 260.667-63 chr4 46440488 46440704 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50468 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 278.334-11 chr9 6063867 6064072 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -48345 NM_001243202 26953 Hs.167496 NM_012416 ENSG00000137040 RANBP6 - RAN binding protein 6 protein-coding 255-62 chr5 40254212 40254427 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 202028 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 454.667-4 chr3 136318179 136318528 + 1.66667 NA intron (NM_000532, intron 10 of 14) AluSc|SINE|Alu 68013 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 252.334-4 chr12 41489819 41490041 + 1.66667 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) intron (NM_013377, intron 1 of 7) 52191 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 273.334-14 chr7 6243395 6243637 + 1.66667 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 29108 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 247-39 chr2 124587844 124588049 + 1.66667 NA intron (NM_130773, intron 11 of 23) intron (NM_130773, intron 11 of 23) 562659 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 361.333-15 chr22 25932684 25933173 + 1.66667 NA intron (NM_001318245, intron 34 of 43) MER58D|DNA|hAT-Charlie 190740 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 316.667-24 chr4 39533148 39533509 + 1.66667 NA intron (NR_047679, intron 2 of 4) AluSx4|SINE|Alu 5489 NR_047679 100885776 Hs.640769 NR_047679 ENSG00000249348 UGDH-AS1 - UGDH antisense RNA 1 ncRNA 256.333-64 chr5 60901933 60902224 + 1.66667 NA intron (NM_001007233, intron 8 of 12) L2b|LINE|L2 42992 NM_001007234 1161 Hs.435237 NM_000082 ENSG00000049167 ERCC8 CKN1|CSA|UVSS2 ERCC excision repair 8, CSA ubiquitin ligase complex subunit protein-coding 290-24 chr2 169567972 169568341 + 1.66667 NA intron (NM_001322049, intron 2 of 12) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 5709 NM_024622 79675 Hs.529276 NM_024622 ENSG00000138399 FASTKD1 - FAST kinase domains 1 protein-coding 261.333-18 chr11 45756222 45756521 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -15061 NR_027134 374387 Hs.632142 NM_199137 ENSG00000205106 LINC02716 DKFZp779M0652 long intergenic non-protein coding RNA 2716 ncRNA 272.334-5 chr10 14301329 14301506 + 1.66667 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) MER77B|LTR|ERVL 29467 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 307.999 chr17 19871018 19871299 + 1.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -3222 NM_014683 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 420.334-3 chr3 190622161 190622489 + 1.66667 NA intron (NR_157352, intron 6 of 10) MER21C|LTR|ERVL 108240 NM_001364879 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 246.667-82 chr6 112623305 112623591 + 1.66667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 276118 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 334.333-21 chr20 34810261 34810684 + 1.66667 NA intron (NM_001318240, intron 1 of 15) intron (NM_001318240, intron 1 of 15) 11167 NM_001318240 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 390.667-13 chr8 70557595 70557930 + 1.66667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 49907 NM_001317805 23471 Hs.491988 NM_014294 ENSG00000067167 TRAM1 PNAS8|TRAM|TRAMP translocation associated membrane protein 1 protein-coding 136.667-120 chr3 108960900 108961016 + 1.66667 NA intron (NM_014429, intron 27 of 27) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -7079 NM_005459 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 328.334 chr12 85189637 85189911 + 1.66667 NA intron (NM_001079910, intron 24 of 26) (ATATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -90446 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 353.001-4 chr7 29598309 29598611 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 32927 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 217.333-47 chr15 63357964 63358304 + 1.66667 NA intron (NR_135511, intron 2 of 9) intron (NR_135511, intron 2 of 9) 23712 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 272.334-14 chr5 57483272 57483485 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001017992) promoter-TSS (NM_001017992) -567 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 252.666-47 chr8 120134031 120134317 + 1.66667 NA intron (NM_021110, intron 1 of 47) L1M5|LINE|L1 9072 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 412.667-11 chr3 187221425 187221956 + 1.66667 NA intron (NM_001879, intron 14 of 15) intron (NM_001879, intron 14 of 15) -14061 NR_110052 101929106 Hs.640145 NR_110052 ENSG00000198491 LOC101929106 - uncharacterized LOC101929106 ncRNA 259.334-21 chr8 87314815 87315049 + 1.66667 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) L1M5|LINE|L1 448517 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 258.333-33 chr2 134894677 134894975 + 1.66667 NA intron (NR_036549, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 23780 NR_036549 100129961 Hs.729028 NR_036549 CCNT2-AS1 - CCNT2 antisense RNA 1 ncRNA 345.001 chr2 151916169 151916480 + 1.66667 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) intron (NM_000726, intron 2 of 13) 55728 NM_001330118 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 263.333-57 chr3 72716899 72717185 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -52793 NR_135531 105377162 Hs.123457 NR_135531 LOC105377162 - uncharacterized LOC105377162 ncRNA 205.667-126 chr7 97791726 97791878 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 59716 NM_013998 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 264.667-23 chr13 33822023 33822227 + 1.66667 NA intron (NM_002915, intron 2 of 8) intron (NM_002915, intron 2 of 8) 3976 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 359-10 chr3 121878844 121879092 + 1.66667 NA intron (NM_018456, intron 5 of 5) L1MA4|LINE|L1 -15433 NM_001145998 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 333-24 chr7 2780444 2780792 + 1.66667 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) L1ME3B|LINE|L1 -17478 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 310.667-11 chr14 50098819 50099114 + 1.66667 NA intron (NR_131171, intron 1 of 8) Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 6077 NR_131171 196913 Hs.406934 NM_001014830 LINC01599 C14orf183 long intergenic non-protein coding RNA 1599 ncRNA 250-52 chr3 174428621 174428897 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -430575 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 260.667-6 chr1 152846133 152846392 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 3406 NM_001128600 448835 Hs.62927 NM_001128600 ENSG00000235942 LCE6A C1orf44 late cornified envelope 6A protein-coding 147-12 chr10 57913176 57913368 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 354622 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 268-23 chr16 67455617 67455856 + 1.66667 NA intron (NM_004691, intron 1 of 7) intron (NM_004691, intron 1 of 7) 24615 NM_000196 3291 Hs.1376 NM_000196 ENSG00000176387 HSD11B2 AME|AME1|HSD11K|HSD2|SDR9C3 hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2 protein-coding 478.001 chr12 116044356 116044845 + 1.66667 NA intron (NM_015335, intron 4 of 30) intron (NM_015335, intron 4 of 30) 104054 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 136.667-37 chr12 27776803 27776930 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -3367 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 248-72 chr5 148189132 148189346 + 1.66667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -13555 NM_001195290 404203 Hs.334274 NM_205841 ENSG00000178172 SPINK6 BUSI2|UNQ844 serine peptidase inhibitor, Kazal type 6 protein-coding 252.667-45 chr2 48981094 48981272 + 1.66667 NA intron (NM_000145, intron 8 of 9) L2a|LINE|L2 -78420 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 340.334-13 chr5 58585796 58586178 + 1.66667 NA intron (NM_138453, intron 1 of 4) intron (NM_138453, intron 1 of 4) 2912 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 223.333-106 chr3 95299919 95300166 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 361779 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 260.667-21 chr14 58156227 58156451 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4126 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 339.666-9 chr22 31644446 31644888 + 1.66667 NA intron (NM_001326416, intron 3 of 10) intron (NM_001326416, intron 3 of 10) -6144 NM_178022 23761 Hs.420559 NM_014338 ENSG00000241878 PISD DJ858B16|PSD|PSDC|PSSC|dJ858B16.2 phosphatidylserine decarboxylase protein-coding 241.667-6 chr1 157928093 157928346 + 1.66667 NA intron (NR_135760, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 2252 NR_135760 105371458 Hs.591494 NR_135760 ENSG00000236957 LOC105371458 - uncharacterized LOC105371458 ncRNA 286.001-3 chr22 27275714 27275892 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34848 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 303-18 chr14 67491083 67491477 + 1.66667 NA intron (NM_001348546, intron 1 of 2) MER21B|LTR|ERVL -2559 NM_001348543 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 231.333-90 chr5 100124391 100124689 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 263714 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 493.333-4 chr9 28294134 28294460 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 425008 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 216-26 chr14 29108088 29108241 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -322377 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 320-3 chr10 119556365 119556754 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -13840 NM_001005339 6001 Hs.501200 NM_002925 ENSG00000148908 RGS10 - regulator of G protein signaling 10 protein-coding 294.334 chr12 12191893 12192171 + 1.66667 NA intron (NM_002336, intron 3 of 22).2 L1M4a2|LINE|L1 75012 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 226.333-94 chr4 107985704 107985852 + 1.66667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -3936 NM_001184705 3033 Hs.438289 NM_005327 ENSG00000138796 HADH HAD|HADH1|HADHSC|HCDH|HHF4|MSCHAD|SCHAD hydroxyacyl-CoA dehydrogenase protein-coding 693.666 chr8 123426386 123426867 + 1.66667 NA intron (NM_018024, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 9852 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 204-173 chr6 37581945 37582194 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26647 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 238-23 chr14 60639869 60640024 + 1.66667 NA non-coding (NR_126480, exon 1 of 1) non-coding (NR_126480, exon 1 of 1) 730 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 367.666-3 chr10 57635955 57636538 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -331687 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 290.667-43 chr7 114024401 114024607 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -61823 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 285.333-30 chr2 41341904 41342173 + 1.66667 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -535517 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 251.334-2 chr1 32835867 32836042 + 1.66667 NA intron (NR_135107, intron 5 of 6) L1MB2|LINE|L1 10641 NR_135107 64766 Hs.440880 NM_022753 ENSG00000116497 S100PBP S100PBPR S100P binding protein protein-coding 233-2 chr1 51858135 51858297 + 1.66667 NA intron (NM_001101662, intron 1 of 30) AluJr|SINE|Alu 19824 NM_001242361 4898 Hs.584782 NM_002525 ENSG00000078618 NRDC NRD1|hNRD1|hNRD2 nardilysin convertase protein-coding 272.333-46 chr4 58725259 58725584 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -189093 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 232.333-17 chr12 15224125 15224393 + 1.66667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -2842 NM_032918 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 400-3 chr12 8893424 8893826 + 1.66667 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -20884 NM_004426 1911 Hs.744902 NM_004426 ENSG00000111752 PHC1 EDR1|HPH1|MCPH11|RAE28 polyhomeotic homolog 1 protein-coding 247-66 chr6 72782815 72783067 + 1.66667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 152446 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 258-19 chr16 76467930 76468108 + 1.66667 NA intron (NR_136213, intron 10 of 23) intron (NR_136213, intron 10 of 23) 158167 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 217.666-37 chr8 52201894 52202081 + 1.66667 NA intron (NM_001352863, intron 9 of 27) intron (NM_001352863, intron 9 of 27) 7625 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 270.001 chr21 37464020 37464199 + 1.66667 NA intron (NM_001347721, intron 2 of 11) intron (NM_001347721, intron 2 of 11) 43810 NM_130438 1859 Hs.368240 NM_001396 ENSG00000157540 DYRK1A DYRK|DYRK1|HP86|MNB|MNBH|MRD7 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 1A protein-coding 317.667-23 chr2 21332574 21332858 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 208730 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 359-7 chr2 125376668 125376940 + 1.66667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 741181 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 267-23 chr14 70112280 70112553 + 1.66667 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -32199 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 263.667-38 chr17 80113519 80113802 + 1.66667 NA intron (NM_001079804, intron 15 of 19) L1M5|LINE|L1 12079 NM_000152 2548 Hs.1437 NM_000152 ENSG00000171298 GAA LYAG glucosidase alpha, acid protein-coding 311.333-17 chr14 66773119 66773519 + 1.66667 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 265912 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 443.667-3 chr8 80479608 80479950 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -5814 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 255-26 chr12 41485989 41486185 + 1.66667 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) intron (NM_013377, intron 1 of 7) 48348 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 249.667-55 chr21 31272234 31272575 + 1.66667 NA intron (NM_001353688, intron 4 of 29) intron (NM_001353688, intron 4 of 29) 71950 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 233.667-81 chrX 39359986 39360229 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 31667 NR_110385 101927449 Hs.553988 NR_110385 ENSG00000236747 LINC01282 - long intergenic non-protein coding RNA 1282 ncRNA 303.333-67 chr6 90534011 90534437 + 1.66667 NA intron (NM_145331, intron 13 of 16) intron (NM_145331, intron 13 of 16) 52848 NM_145332 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 236-39 chr2 76043082 76043341 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -332296 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 316-9 chr12 5444755 5445196 + 1.66667 NA intron (NM_001102654, intron 1 of 1) intron (NM_001102654, intron 1 of 1) 12867 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 527.334 chr12 73282751 73283292 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 123831 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 250.667-87 chr9 28541501 28541716 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 177697 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 317-23 chr7 98893978 98894251 + 1.66667 NA intron (NM_003496, intron 6 of 70) intron (NM_003496, intron 6 of 70) 12417 NR_132754 106633801 NR_132754 SCARNA28 ZL1 small Cajal body-specific RNA 28 ncRNA 252.667-11 chr1 215367886 215368263 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -199230 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 257.333-97 chr8 78574242 78574517 + 1.66667 NA intron (NM_006823, intron 2 of 3) intron (NM_006823, intron 2 of 3) -15876 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 335.667-19 chr4 73626280 73626700 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -5859 NM_201431 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 191-8 chr10 25171277 25171505 + 1.66667 NA intron (NR_027333, intron 1 of 1) intron (NR_027333, intron 1 of 1) -3610 NM_020752 57512 Hs.499108 NM_020752 ENSG00000151025 GPR158 - G protein-coupled receptor 158 protein-coding 241.667 chr1 35622365 35622525 + 1.66667 NA intron (NM_002794, intron 3 of 5) intron (NM_002794, intron 3 of 5) 9092 NM_001199780 5690 Hs.471441 NM_002794 ENSG00000126067 PSMB2 HC7-I proteasome subunit beta 2 protein-coding 257.667-78 chr7 45168494 45168731 + 1.66667 NA intron (NM_005856, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 10821 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 275.667-67 chr8 124984221 124984408 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 11019 NM_152412 137209 Hs.175350 NM_152412 ENSG00000180938 ZNF572 - zinc finger protein 572 protein-coding 241.667-24 chr14 102851830 102852086 + 1.66667 NA intron (NM_145725, intron 2 of 11) AluJo|SINE|Alu -70698 NM_030943 81693 Hs.534494 NM_030943 ENSG00000166126 AMN PRO1028|amnionless amnion associated transmembrane protein protein-coding 252-87 chr6 38478232 38478429 + 1.66667 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) -3266 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 522.334 chr10 9472037 9472617 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -176734 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 410.666-11 chr8 104115587 104115892 + 1.66667 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) MER102c|DNA|hAT-Charlie -107596 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 310.333-33 chr5 26984356 26984620 + 1.66667 NA intron (NM_016279, intron 2 of 11) intron (NM_016279, intron 2 of 11) 54098 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 372.333-14 chr3 180332329 180332827 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -81595 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 267.334-22 chr9 20626673 20626920 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -4297 NM_004529 4300 Hs.317248 NM_004529 ENSG00000171843 MLLT3 AF9|YEATS3 MLLT3 super elongation complex subunit protein-coding 338-27 chr6 132061509 132062044 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 53487 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 482-2 chr14 54327753 54328429 + 1.66667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -68777 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 301.333-53 chr8 100294144 100294546 + 1.66667 NA intron (NM_001280539, intron 2 of 10) intron (NM_001280539, intron 2 of 10) 7848 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 421.334-2 chr2 54486783 54487070 + 1.66667 NA intron (NM_003128, intron 1 of 35) intron (NM_003128, intron 1 of 35) 30599 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 405.667-3 chr3 115491736 115492128 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -131578 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 256-39 chr2 58465744 58466060 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -54851 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 271.666-14 chr8 122220194 122220495 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 348300 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 305.334-9 chr4 24677845 24678163 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -93450 NM_001358 1665 Hs.696074 NM_001358 ENSG00000109606 DHX15 DBP1|DDX15|HRH2|PRP43|PRPF43|PrPp43p DEAH-box helicase 15 protein-coding 355-13 chr2 11573231 11573632 + 1.66667 NA intron (NM_014668, intron 4 of 32) intron (NM_014668, intron 4 of 32) 30745 NM_033090 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 338.667-3 chr1 150870924 150871215 + 1.66667 NA intron (NM_001350224, intron 1 of 22) intron (NM_001350224, intron 1 of 22) 5530 NM_001350224 405 Hs.632446 NM_001668 ENSG00000143437 ARNT HIF-1-beta|HIF-1beta|HIF1-beta|HIF1B|HIF1BETA|TANGO|bHLHe2 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein-coding 231.334-12 chrX 39099421 39099599 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 227852 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 260.667-16 chr12 26189304 26189469 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5950 NM_001135823 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 686.999 chr8 58104325 58104800 + 1.66667 NA intron (NM_147189, intron 4 of 4) intron (NM_147189, intron 4 of 4) 110039 NM_147189 90362 Hs.154652 NM_147189 ENSG00000169122 FAM110B C8orf72 family with sequence similarity 110 member B protein-coding 464.666 chr1 161047736 161048089 + 1.66667 NA exon (NM_181720, exon 13 of 13) exon (NM_181720, exon 13 of 13) -1935 NM_007122 7391 Hs.414880 NM_007122 ENSG00000158773 USF1 FCHL|FCHL1|HYPLIP1|MLTF|MLTFI|UEF|bHLHb11 upstream transcription factor 1 protein-coding 466.666-5 chr7 50958343 50958664 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -165050 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 265-26 chr16 48653440 48653722 + 1.66667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -43401 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 173.667-123 chr3 179425651 179425847 + 1.66667 NA intron (NM_021629, intron 2 of 9) AluSx|SINE|Alu 25721 NM_021629 59345 Hs.173030 NM_021629 ENSG00000114450 GNB4 CMTD1F G protein subunit beta 4 protein-coding 565.334-2 chr6 37045133 37045629 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 39726 NM_173558 221472 Hs.509664 NM_173558 ENSG00000146192 FGD2 ZFYVE4 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 protein-coding 134.334 chr7 137779183 137779270 + 1.66667 NA intron (NM_001321708, intron 1 of 32) L1MEb|LINE|L1 67106 NM_001321709 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 262.667-77 chr7 117358480 117358757 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -35560 NM_003391 7472 Hs.567356 NM_003391 ENSG00000105989 WNT2 INT1L1|IRP Wnt family member 2 protein-coding 437-2 chr14 62812744 62813162 + 1.66667 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) L1ME4a|LINE|L1 232505 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 274.667-49 chr7 25051921 25052229 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -71897 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 367.667 chr1 199240056 199240418 + 1.66667 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 91639 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 363.334-3 chr22 37769334 37769648 + 1.66667 NA intron (NM_001039141, intron 21 of 23) intron (NM_001039141, intron 21 of 23) 23257 NM_138632 11078 Hs.533030 NM_007032 ENSG00000100106 TRIOBP DFNB28|HRIHFB2122|TAP68|TARA|dJ37E16.4 TRIO and F-actin binding protein protein-coding 250-15 chr10 75758657 75758887 + 1.66667 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) -23989 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 198-179 chr8 40526943 40527091 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -183654 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 204.334 chr11 79086869 79087046 + 1.66667 NA intron (NM_001098816, intron 4 of 33) intron (NM_001098816, intron 4 of 33) 315152 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 500-4 chr22 22018761 22019300 + 1.66667 NA intron (NR_135291, intron 4 of 6) AluSp|SINE|Alu 24904 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 240.334-4 chr12 122277880 122278070 + 1.66667 NA intron (NM_198240, intron 22 of 23) L1ME4b|LINE|L1 -11481 NM_001351019 65082 Hs.487883 NM_022916 ENSG00000139719 VPS33A MPSPS VPS33A core subunit of CORVET and HOPS complexes protein-coding 154.334 chr5 27552629 27552795 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 80420 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 247-41 chr2 196682718 196682964 + 1.66667 NA intron (NM_001080539, intron 13 of 27) L1MB5|LINE|L1 30171 NR_034036 100130452 Hs.591625 NR_034036 LOC100130452 - uncharacterized LOC100130452 ncRNA 465.667-3 chr12 45841848 45842254 + 1.66667 NA intron (NM_152641, intron 11 of 20) AluJr|SINE|Alu 112342 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 246.333-59 chr3 89742424 89742647 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 634914 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 317.667-28 chr21 34586525 34587036 + 1.66667 NA intron (NM_004414, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu 27063 NM_001285389 1827 Hs.282326 NM_004414 ENSG00000159200 RCAN1 ADAPT78|CSP1|DSC1|DSCR1|MCIP1|RCN1 regulator of calcineurin 1 protein-coding 397.334-8 chr3 114602864 114603259 + 1.66667 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) 21145 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 380.667-10 chr22 26303043 26303352 + 1.66667 NA intron (NM_001184776, intron 5 of 14) intron (NM_001184776, intron 5 of 14) -126063 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 248-29 chr15 97144956 97145127 + 1.66667 NA Intergenic (ATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 361606 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 308-37 chr4 54789291 54789568 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 131501 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 282.667-20 chr2 99377626 99377907 + 1.66667 NA intron (NM_015904, intron 10 of 23) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 40377 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 321.667-10 chr18 29334361 29334645 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -964407 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 402.333-12 chr5 159490341 159490769 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -24279 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 241.667-50 chr3 2700316 2700507 + 1.66667 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) intron (NM_175607, intron 4 of 24) -191804 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 267.666-9 chr2 52077281 52077556 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -293230 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 253-53 chr5 59166512 59166687 + 1.66667 NA intron (NM_001364602, intron 5 of 5) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 109516 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 255.334-18 chr2 216874872 216875057 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 4192 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 313.333-54 chrX 71205106 71205375 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -9972 NM_001097642 2705 Hs.333303 NM_000166 ENSG00000169562 GJB1 CMTX|CMTX1|CX32 gap junction protein beta 1 protein-coding 274.667-42 chr4 130346529 130346772 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29711 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 225.667-8 chr10 22253542 22253818 + 1.66667 NA non-coding (NR_038921, exon 1 of 1) non-coding (NR_038921, exon 1 of 1) 1608 NR_038921 100130992 Hs.48501 NR_038921 LOC100130992 - uncharacterized LOC100130992 ncRNA 267.334-8 chr17 62996286 62996486 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) MER57A1|LTR|ERV1 30151 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 381.333-22 chr8 100585989 100586482 + 1.66667 NA intron (NM_152628, intron 11 of 13) intron (NM_152628, intron 11 of 13) -26476 NM_001270378 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 297.333-34 chr2 172407108 172407418 + 1.66667 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -20073 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 269.667-51 chr7 88992015 88992268 + 1.66667 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) LTR81B|LTR|Gypsy -196404 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 333.667-22 chr9 104579695 104580086 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 10722 NM_001004483 138802 Hs.553599 NM_001004483 ENSG00000186943 OR13C8 OR37H|OR9-10 olfactory receptor family 13 subfamily C member 8 protein-coding 131.333-118 chr3 173268933 173269135 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -126918 NM_001365930 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 258.334-16 chr3 177307203 177307371 + 1.66667 NA intron (NR_047465, intron 1 of 1) intron (NR_047465, intron 1 of 1) 12845 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 480.667-6 chr7 47364114 47364629 + 1.66667 NA intron (NM_022748, intron 17 of 30) AluSx|SINE|Alu 100432 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 355-11 chr17 64480321 64480561 + 1.66667 NA intron (NM_007215, intron 6 of 7) intron (NM_007215, intron 6 of 7) 16613 NM_007215 11232 Hs.437009 NM_007215 ENSG00000256525 POLG2 HP55|MTPOLB|PEOA4|POLB|POLG-BETA|POLGB DNA polymerase gamma 2, accessory subunit protein-coding 254.333-86 chr8 110224380 110224560 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -248699 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 515-3 chr3 98876985 98877601 + 1.66667 NA intron (NM_080927, intron 2 of 15) L1MC4a|LINE|L1 24402 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 334-6 chr13 31006454 31006785 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 73963 NM_001353390 122046 Hs.124463 NM_152325 ENSG00000175664 TEX26 C13orf26 testis expressed 26 protein-coding 234.667-49 chr2 28466974 28467203 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -28972 NM_153021 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 403.667-6 chr2 52444973 52445298 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 74487 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 315-20 chr3 70977130 70977491 + 1.66667 NA intron (NR_146142, intron 15 of 19) intron (NR_146142, intron 15 of 19) 87614 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 213.334-2 chr3 30860362 30860535 + 1.66667 NA intron (NM_207359, intron 2 of 14) intron (NM_207359, intron 2 of 14) 34213 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 118.667-171 chr6 122116909 122117005 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -282594 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 312-4 chr1 195399587 195399820 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 689012 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 279-6 chr10 95995834 95996076 + 1.66667 NA intron (NM_001349008, intron 23 of 34) L2c|LINE|L2 -4136 NM_001001732 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 355.333-24 chr5 40172057 40172566 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 120020 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 293-2 chr1 52437986 52438315 + 1.66667 NA intron (NM_001009881, intron 25 of 29) intron (NM_001009881, intron 25 of 29) 33548 NM_032864 84950 Hs.5301 NM_032284 ENSG00000134748 PRPF38A PRP38A|Prp38 pre-mRNA processing factor 38A protein-coding 371.333-4 chr1 191598029 191598536 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -369784 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 240-69 chr4 117484565 117484824 + 1.66667 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) FLAM_A|SINE|Alu 56296 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 145.334 chr1 51524414 51524556 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -5219 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 293.667-53 chr6 135898594 135898891 + 1.66667 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) L1M6|LINE|L1 47041 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 512.666-3 chr14 65210863 65211539 + 1.66667 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 11146 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 248-52 chr3 29523161 29523448 + 1.66667 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) intron (NM_001003792, intron 3 of 13) 241992 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 334.667-11 chr17 61582110 61582347 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8991 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 275-37 chr4 32467180 32467500 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 116302 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 352.667-5 chr10 39415920 39416183 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 719455 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 304.667-24 chr3 16999146 16999459 + 1.66667 NA intron (NM_015184, intron 1 of 5) intron (NM_015184, intron 1 of 5) 66106 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 357-23 chr9 21461182 21461562 + 1.66667 NA intron (NR_152878, intron 2 of 2) L1M3|LINE|L1 20933 NM_024013 3439 Hs.37026 NM_024013 ENSG00000197919 IFNA1 IFL|IFN|IFN-ALPHA|IFN-alphaD|IFNA13|IFNA@ interferon alpha 1 protein-coding 236.667-34 chr19 27798018 27798190 + 1.66667 NA non-coding (NR_110688, exon 2 of 3) non-coding (NR_110688, exon 2 of 3) -4164 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 261.334-14 chr4 35849859 35850037 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 393991 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 358-6 chr12 114714191 114714467 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -30154 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 191-51 chr5 79729082 79729237 + 1.66667 NA exon (NM_153610, exon 2 of 13) exon (NM_153610, exon 2 of 13) 39323 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 277.333-21 chr12 84095288 84095638 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 817336 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 299-9 chr10 92873164 92873349 + 1.66667 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) intron (NM_001319195, intron 1 of 21) 24736 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 271-14 chr13 49029758 49030034 + 1.66667 NA intron (NM_001079673, intron 2 of 25) L1MB7|LINE|L1 53234 NR_103528 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 215.667-109 chr6 142836800 142837010 + 1.66667 NA intron (NM_006734, intron 2 of 9) intron (NM_006734, intron 2 of 9) 108271 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 320.666-2 chr1 199305465 199305794 + 1.66667 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 157031 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 254-63 chr5 8228819 8229041 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 228634 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 437.001 chr1 190365905 190366237 + 1.66667 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 109939 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 119.667-26 chr11 23853504 23853655 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -434389 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 292.666-22 chr2 202141010 202141300 + 1.66667 NA intron (NM_001277372, intron 13 of 23) intron (NM_001277372, intron 13 of 23) -24097 NR_135244 729224 Hs.623895 NR_135243 KIAA2012-AS1 - KIAA2012 antisense RNA 1 ncRNA 298.333-43 chr8 126494563 126494926 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 63734 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 401.667-2 chr11 50663123 50663533 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 254181 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 306.667-5 chr10 56021721 56021940 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 339429 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 257.667-71 chr6 64985366 64985555 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 14 of 43) intron (NM_001292009, intron 14 of 43) -315958 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 284.334-10 chr3 146454057 146454247 + 1.66667 NA exon (NM_020359, exon 6 of 9) exon (NM_020359, exon 6 of 9) 15149 NM_001199978 57047 Hs.744414 NM_020359 ENSG00000163746 PLSCR2 - phospholipid scramblase 2 protein-coding 222.666-40 chr4 108869612 108869933 + 1.66667 NA intron (NM_198721, intron 18 of 36) intron (NM_198721, intron 18 of 36) -106719 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 265.667-28 chr17 61247295 61247527 + 1.66667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 120293 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 494.333-4 chr6 61922942 61923296 + 1.66667 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) L1MEc|LINE|L1 348989 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 178.667-132 chr5 101335235 101335381 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -432026 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 288-27 chr2 57795641 57795922 + 1.66667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -111870 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 220.999-4 chr17 5939535 5939761 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -130966 NM_015253 23302 Hs.370166 NM_015253 ENSG00000179314 WSCD1 - WSC domain containing 1 protein-coding 315-9 chr14 37033525 37033881 + 1.66667 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -81312 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 236-75 chr5 167321322 167321528 + 1.66667 NA intron (NM_001122679, intron 2 of 29) intron (NM_001122679, intron 2 of 29) -153024 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 223.334-4 chr11 104053420 104053585 + 1.66667 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) intron (NM_025208, intron 1 of 6) 16862 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 284.667-37 chr4 72142857 72143076 + 1.66667 NA intron (NM_053036, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 103834 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 265-18 chr13 49365675 49365988 + 1.66667 NA intron (NM_001079670, intron 5 of 10) L1MA2|LINE|L1 35711 NM_030925 81617 Hs.87159 NM_030925 ENSG00000102547 CAB39L MO25-BETA|MO2L|bA103J18.3 calcium binding protein 39 like protein-coding 244.333-2 chr1 57076037 57076457 + 1.66667 NA intron (NM_001365793, intron 4 of 14) intron (NM_001365793, intron 4 of 14) -110107 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 446.333-2 chr16 12415531 12415853 + 1.66667 NA intron (NM_032167, intron 18 of 20) intron (NM_032167, intron 18 of 20) -304629 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 256.667-91 chr9 36814990 36815273 + 1.66667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 8468 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 190-32 chr14 54164551 54164700 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -207734 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 414.667-6 chr17 52462198 52462563 + 1.66667 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) L1ME3G|LINE|L1 71858 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 252.334-6 chr15 71757900 71758072 + 1.66667 NA exon (NM_024817, exon 14 of 17) exon (NM_024817, exon 14 of 17) -52568 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 257.667-79 chr7 52707661 52707967 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -327819 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 460-2 chr10 78581901 78582206 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 314711 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 307.333-9 chr10 6700783 6701213 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36384 NR_138480 108570035 Hs.568834 NR_138480 LINP1 - lncRNA in non-homologous end joining pathway 1 ncRNA 299.333-48 chr20 40265570 40265927 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 261287 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 307.666-13 chr8 94646698 94647115 + 1.66667 NA intron (NM_017697, intron 4 of 15) intron (NM_017697, intron 4 of 15) 5732 NM_001122825 54845 Hs.487471 NM_017697 ENSG00000104413 ESRP1 DFNB109|RBM35A|RMB35A epithelial splicing regulatory protein 1 protein-coding 340.334-6 chr20 23196370 23196686 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -63892 NR_034149 200261 Hs.352228 NM_182535 ENSG00000233746 LINC00656 - long intergenic non-protein coding RNA 656 ncRNA 516.667-2 chr13 28213188 28213703 + 1.66667 NA intron (NM_175854, intron 5 of 18) L1MEc|LINE|L1 -74271 NR_029383 100288730 Hs.123191 NR_029383 PAN3-AS1 - PAN3 antisense RNA 1 ncRNA 275.667-36 chr21 18240220 18240439 + 1.66667 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -4504 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 264.001-2 chr2 222949151 222949315 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 88197 NM_001354159 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 254.333-69 chr5 147772603 147772820 + 1.66667 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) intron (NM_001270934, intron 1 of 20) 10017 NM_001282282 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 261.333-7 chr1 195818078 195818355 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 270499 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 299.666-15 chr4 75809075 75809488 + 1.66667 NA intron (NM_003715, intron 21 of 23) intron (NM_003715, intron 21 of 23) 84759 NM_001290049 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 152.667-212 chr2 221788667 221788870 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -214566 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 241.667-58 chr3 193280369 193280538 + 1.66667 NA intron (NM_198505, intron 27 of 29) intron (NM_198505, intron 27 of 29) -26791 NR_046758 100874218 Hs.407490 NR_046758 ATP13A5-AS1 - ATP13A5 antisense RNA 1 ncRNA 246.333-105 chrX 98779375 98779637 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1214971 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 234.334-13 chr4 72745037 72745193 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -175894 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 303.667-26 chr8 105883910 105884257 + 1.66667 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) LTR16A2|LTR|ERVL 176420 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 264.333-5 chr1 165449771 165450057 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -4559 NM_001256570 6258 Hs.26550 NM_006917 ENSG00000143171 RXRG NR2B3|RXRC retinoid X receptor gamma protein-coding 378.667-2 chr1 110712738 110713089 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -37973 NM_002232 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 224.333-23 chr11 18020088 18020326 + 1.66667 NA TTS (NM_004179) TTS (NM_004179) -7045 NR_104041 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 342-8 chr14 45648815 45649082 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 66654 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 421-6 chr2 164496907 164497231 + 1.66667 NA exon (NM_001303422, exon 11 of 13) exon (NM_001303422, exon 11 of 13) 71426 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 278.667-6 chr11 29126850 29127137 + 1.66667 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -467420 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 184.667-130 chr8 52397502 52397646 + 1.66667 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) L1MA9|LINE|L1 12182 NM_001352884 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 355.667-5 chr15 65310588 65310974 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 6104 NR_002757 26832 NR_002757 ENSG00000200156 RNU5B-1 RNU5B|RNU5B-1P|U5B1 RNA, U5B small nuclear 1 snRNA 194-87 chr20 41853025 41853209 + 1.66667 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger -234740 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 307.333-16 chr11 18879001 18879421 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 55791 NM_147199 259249 Hs.711459 NM_147199 ENSG00000170255 MRGPRX1 GPCR|MGRG2|MRGX1|SNSR4 MAS related GPR family member X1 protein-coding 250-88 chr8 82298849 82299093 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -456685 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 354-14 chr2 117439996 117440469 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -374459 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 259-40 chr5 3292535 3292784 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 114824 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 300.334-2 chr1 182597271 182597643 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6932 NM_002928 6004 Hs.413297 NM_002928 ENSG00000143333 RGS16 A28-RGS14|A28-RGS14P|RGS-R regulator of G protein signaling 16 protein-coding 261.333-54 chr2 207685838 207686170 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 23574 NR_135567 102724714 Hs.443475 NR_135566 ENSG00000224137 LINC01857 - long intergenic non-protein coding RNA 1857 ncRNA 284.334-8 chr14 65679671 65679897 + 1.66667 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) Charlie17|DNA|hAT-Charlie 208682 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 201.334-3 chr7 22742699 22742844 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15151 NR_131935 541472 Hs.512234 NR_131935 ENSG00000179428 LOC541472 - uncharacterized LOC541472 ncRNA 238-46 chr2 72252693 72252858 + 1.66667 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) L1PA16|LINE|L1 -104913 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 410-2 chr1 111656392 111656799 + 1.66667 NA intron (NM_001010935, intron 2 of 8) L2|LINE|L2 -8199 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 235.333-126 chr8 134653067 134653265 + 1.66667 NA intron (NM_020863, intron 2 of 15) L1P1|LINE|L1 43389 NM_001174158 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 274.667-7 chr10 18867647 18867828 + 1.66667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -181064 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 258-44 chr20 47133567 47133814 + 1.66667 NA intron (NM_172110, intron 9 of 13) MER77|LTR|ERVL -33277 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 241-20 chr14 58145955 58146199 + 1.66667 NA intron (NM_001320173, intron 1 of 4) intron (NM_001320173, intron 1 of 4) 6136 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 293-38 chr7 27627707 27627906 + 1.66667 NA TTS (NR_122122) TTS (NR_122122) 11832 NR_122123 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 259-51 chr8 87541202 87541438 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 332695 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 330.667-15 chr21 28332773 28333171 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -104305 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 262.334-12 chr4 84086738 84086962 + 1.66667 NA intron (NR_125909, intron 7 of 8) intron (NR_125909, intron 7 of 8) 212319 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 383.334-4 chr21 16866223 16866700 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 276224 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 254-9 chr10 72985414 72985616 + 1.66667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -30709 NM_001318124 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 218.334 chr11 99789461 99789652 + 1.66667 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 233411 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 309.667-4 chr1 114894304 114894510 + 1.66667 NA intron (NM_001282542, intron 15 of 30) intron (NM_001282542, intron 15 of 30) 39544 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 243-2 chr1 41493363 41493537 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8767 NR_126098 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 209.667-84 chr3 75199235 75199419 + 1.66667 NA Intergenic (TATATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15149 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 326.667-5 chr1 150030130 150030370 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -19524 NM_020205 56957 Hs.98322 NM_020205 ENSG00000264522 OTUD7B CEZANNE|ZA20D1 OTU deubiquitinase 7B protein-coding 358.667-7 chr12 74819261 74819694 + 1.66667 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie 281642 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 325.666-4 chr11 73663182 73663632 + 1.66667 NA TTS (NM_001130033) TTS (NM_001130033) 14494 NM_001130036 58473 Hs.445489 NM_021200 ENSG00000021300 PLEKHB1 KPL1|PHR1|PHRET1 pleckstrin homology domain containing B1 protein-coding 238.333-87 chr8 79102263 79102539 + 1.66667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -229787 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 418.667-7 chr8 92984998 92985317 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19013 NM_001171797 286144 Hs.440643 NM_001171795 ENSG00000205133 TRIQK C8orf83|PRO0845|UPF0599 triple QxxK/R motif containing protein-coding 262-22 chr14 74089040 74089220 + 1.66667 NA intron (NM_001024674, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 4177 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 247-14 chr11 101895302 101895494 + 1.66667 NA intron (NM_178127, intron 7 of 8) intron (NM_178127, intron 7 of 8) -19612 NM_001363543 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 275.666-6 chr18 50689783 50690073 + 1.66667 NA intron (NM_002747, intron 2 of 5) intron (NM_002747, intron 2 of 5) 129841 NM_002747 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 267-11 chr11 25934185 25934351 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -254855 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 167-75 chr4 52878203 52878388 + 1.66667 NA intron (NM_152540, intron 8 of 8) intron (NM_152540, intron 8 of 8) 15978 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 284.334-4 chr1 179468590 179468862 + 1.66667 NA intron (NR_073544, intron 16 of 25) L1MB7|LINE|L1 102682 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 271-9 chr12 3143030 3143328 + 1.66667 NA intron (NM_006675, intron 2 of 8) L1MC4a|LINE|L1 65800 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 234-4 chr1 64750698 64750973 + 1.66667 NA intron (NM_001366165, intron 1 of 11) intron (NM_001366165, intron 1 of 11) 5760 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 225.667-50 chr3 32510912 32511076 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -4605 NR_106753 102465247 NR_106753 ENSG00000276147 MIR548AY hsa-mir-548ay microRNA 548ay ncRNA 119-144 chr8 117033206 117033301 + 1.66667 NA intron (NM_001172813, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 82278 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 194.667-21 chr10 51361885 51362017 + 1.66667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 62378 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 262-31 chr17 72201379 72201659 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 80499 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 281.667-38 chr4 123274951 123275264 + 1.66667 NA intron (NM_001345856, intron 15 of 15) intron (NM_001345856, intron 15 of 15) -121688 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 259.667-43 chr3 36058365 36058668 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 314040 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 344.667-12 chr3 184827702 184828008 + 1.66667 NA intron (NM_001009921, intron 3 of 46) intron (NM_001009921, intron 3 of 46) 15348 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 290.667-44 chr7 128376346 128376577 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -10221 NR_148338 107986845 Hs.592261 NR_148338 LOC107986845 - uncharacterized LOC107986845 ncRNA 288.333-13 chr16 25430236 25430528 + 1.66667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -172537 NM_001012981 342357 Hs.513451 NM_001012981 ENSG00000155592 ZKSCAN2 ZNF694|ZSCAN31|ZSCAN34 zinc finger with KRAB and SCAN domains 2 protein-coding 284.334-12 chr5 56980824 56981035 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28799 NM_001297598 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 259.667-77 chr7 64699396 64699570 + 1.66667 NA intron (NM_016220, intron 6 of 6) AluJr|SINE|Alu 20419 NR_106898 102465505 NR_106898 ENSG00000275667 MIR6839 hsa-mir-6839 microRNA 6839 ncRNA 192.666-20 chr12 127539170 127539408 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 97178 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 489.334 chr4 96707986 96708543 + 1.66667 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) L1ME2|LINE|L1 397561 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 301.666-5 chr12 40467855 40468061 + 1.66667 NA intron (NM_173600, intron 51 of 173) L1MC5a|LINE|L1 74564 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 380-11 chr3 193239713 193240120 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1306 NM_001366112 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 333-15 chr22 24047807 24048108 + 1.66667 NA intron (NM_012295, intron 6 of 36) intron (NM_012295, intron 6 of 36) 36587 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 241.667-32 chr19 31064435 31064699 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -102943 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 314.333-18 chr4 27965392 27965773 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 748103 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 257.334-14 chr7 32042447 32042613 + 1.66667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) MIRb|SINE|MIR 27877 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 385.001-2 chr4 121398645 121398923 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -17766 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 259.666-34 chr8 47959012 47959264 + 1.66667 NA intron (NM_001081640, intron 1 of 84) intron (NM_001081640, intron 1 of 84) 998 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 247.334-23 chr7 146422557 146422723 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -351631 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 292.667-3 chr10 99740532 99740716 + 1.66667 NA intron (NM_015960, intron 3 of 8) L1MEc|LINE|L1 -7958 NM_004376 1355 Hs.28326 NM_004376 ENSG00000014919 COX15 CEMCOX2 cytochrome c oxidase assembly homolog COX15 protein-coding 182-31 chr14 68753748 68753945 + 1.66667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 40068 NM_001244698 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 234.667-4 chr1 101180122 101180317 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 56309 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 133.333-187 chr8 123980180 123980325 + 1.66667 NA intron (NM_001039112, intron 10 of 40) L1ME4a|LINE|L1 60530 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 359-14 chr5 54458546 54458891 + 1.66667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 3019 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 221-25 chr15 93229645 93229871 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 23692 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 233-15 chr11 82334077 82334320 + 1.66667 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 69715 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 326.333-7 chr12 121102694 121103062 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -29998 NM_002562 5027 Hs.439682 NM_002562 ENSG00000089041 P2RX7 P2X7 purinergic receptor P2X 7 protein-coding 247.333-52 chr3 102243431 102243639 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 79830 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 269.666-15 chr5 160031823 160032140 + 1.66667 NA intron (NM_003314, intron 2 of 7) AluJo|SINE|Alu 22842 NM_003314 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 260-46 chr20 43283529 43283720 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -93718 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 362-20 chr5 11450934 11451248 + 1.66667 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 137826 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 174.334-5 chr7 55082096 55082241 + 1.66667 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) -27671 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 439.333-2 chr1 233158904 233159271 + 1.66667 NA intron (NM_014801, intron 19 of 33) intron (NM_014801, intron 19 of 33) 136638 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 220-37 chr15 46303311 46303494 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 598207 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 253-37 chr2 77568899 77569127 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -46580 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 326-28 chr3 112542725 112543038 + 1.66667 NA intron (NM_001278712, intron 6 of 10) intron (NM_001278712, intron 6 of 10) -18439 NM_001348906 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 338.667-12 chr16 84593475 84593834 + 1.66667 NA intron (NM_021149, intron 2 of 3) AluYc|SINE|Alu 24424 NM_021149 23406 Hs.289092 NM_021149 ENSG00000103187 COTL1 CLP coactosin like F-actin binding protein 1 protein-coding 304.667-31 chr6 38603380 38603792 + 1.66667 NA intron (NM_001099272, intron 1 of 10) intron (NM_001099272, intron 1 of 10) -7519 NM_152733 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 357-12 chr20 35734304 35734667 + 1.66667 NA TTS (NR_136587) TTS (NR_136587) 7775 NR_040722 9584 Hs.282901 NM_004902 ENSG00000131051 RBM39 CAPER|CAPERalpha|FSAP59|HCC1|RNPC2 RNA binding motif protein 39 protein-coding 249-49 chr22 49529548 49529761 + 1.66667 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) intron (NR_110523, intron 1 of 4) 13812 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 252.334-27 chr9 104669100 104669349 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25198 NM_001004484 286365 Hs.553683 NM_001004484 ENSG00000179055 OR13D1 OR9-15 olfactory receptor family 13 subfamily D member 1 protein-coding 401.333-12 chr16 87047885 87048435 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9624 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 275-18 chr17 70067062 70067280 + 1.66667 NA intron (NR_104129, intron 2 of 2) intron (NR_104129, intron 2 of 2) -8054 NM_001291622 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 293-44 chr8 105938405 105938773 + 1.66667 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 121914 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 233.334-6 chr8 128286871 128287218 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 136928 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 425.001 chr20 6110639 6110945 + 1.66667 NA intron (NM_017671, intron 4 of 14) intron (NM_017671, intron 4 of 14) 12752 NM_017671 55612 Hs.472054 NM_017671 ENSG00000101311 FERMT1 C20orf42|DTGCU2|KIND1|UNC112A|URP1 fermitin family member 1 protein-coding 342.667-13 chr7 54630380 54630656 + 1.66667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 73548 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 206-177 chr8 61604848 61605075 + 1.66667 NA intron (NM_004318, intron 14 of 24) intron (NM_004318, intron 14 of 24) 84850 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 268.334-8 chr15 90306975 90307152 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -41304 NR_102428 10519 Hs.715556 NM_006384 ENSG00000185043 CIB1 CIB|CIBP|KIP1|PRKDCIP|SIP2-28 calcium and integrin binding 1 protein-coding 385-7 chr2 120913270 120913584 + 1.66667 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie 121146 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 221-63 chr7 43783336 43783624 + 1.66667 NA intron (NM_001253823, intron 3 of 8) L1ME4b|LINE|L1 24800 NM_000712 644 Hs.488143 NM_000712 ENSG00000106605 BLVRA BLVR|BVR|BVRA biliverdin reductase A protein-coding 214-54 chr18 9255252 9255420 + 1.66667 NA exon (NM_015208, exon 9 of 13) exon (NM_015208, exon 9 of 13) -79437 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 221-32 chr19 46939766 46939934 + 1.66667 NA intron (NM_004491, intron 3 of 6) L1MC4|LINE|L1 78853 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 259.667-6 chr10 16718328 16718619 + 1.66667 NA intron (NM_152724, intron 6 of 7) intron (NM_152724, intron 6 of 7) 98951 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 383.001 chr15 74833299 74833635 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 6840 NM_001030005 594855 Hs.187694 NM_001030005 ENSG00000213578 CPLX3 CPX-III|CPXIII|Nbla11589 complexin 3 protein-coding 255.667-77 chr6 135288235 135288491 + 1.66667 NA intron (NM_001350504, intron 27 of 27) MIRc|SINE|MIR 49203 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 366.334-5 chr8 101335440 101335807 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -33270 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 226.334-9 chr8 87477137 87477314 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 396790 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 268.334-12 chr2 112100848 112101076 + 1.66667 NA intron (NM_001329914, intron 15 of 18) intron (NM_001329914, intron 15 of 18) -37423 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 285.666-12 chr8 123287428 123287819 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12082 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 347.667-8 chr18 66952189 66952499 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -129240 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 300-15 chr12 50718825 50719056 + 1.66667 NA intron (NM_173602, intron 24 of 37) intron (NM_173602, intron 24 of 37) -45161 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 222.333-73 chr5 45521278 45521506 + 1.66667 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 174988 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 243-71 chr8 119976869 119977126 + 1.66667 NA intron (NM_022783, intron 4 of 8) MIR|SINE|MIR 103275 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 194.667-115 chr4 163962538 163962693 + 1.66667 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) 235096 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 227.667-34 chr2 104948815 104949084 + 1.66667 NA intron (NR_110603, intron 1 of 2) intron (NR_110603, intron 1 of 2) -76354 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 250-75 chr7 32009959 32010109 + 1.66667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) L1ME1|LINE|L1 60373 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 552.667-3 chr6 77875269 77875635 + 1.66667 NA intron (NM_001282136, intron 4 of 4) intron (NM_001282136, intron 4 of 4) 222413 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 205.334-3 chr14 47339252 47339426 + 1.66667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 3907 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 250.333-21 chr13 30413477 30413741 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 8635 NR_125771 103724387 NR_125771 ENSG00000225039 LINC01058 - long intergenic non-protein coding RNA 1058 ncRNA 370-2 chr10 10283937 10284513 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 178124 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 256.334-16 chr5 40758687 40758843 + 1.66667 NA TTS (NM_001355037) TTS (NM_001355037) -2804 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 262.334-6 chr2 188294778 188294940 + 1.66667 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 2031 NR_045562 51454 Hs.470887 NM_016315 ENSG00000144366 GULP1 CED-6|CED6|GULP GULP PTB domain containing engulfment adaptor 1 protein-coding 384.334-2 chr12 53807444 53807811 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -50593 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 269-26 chr2 173525043 173525380 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 170339 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 317.333-23 chr2 97802011 97802380 + 1.66667 NA intron (NM_015348, intron 24 of 40) intron (NM_015348, intron 24 of 40) 67789 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 210-152 chr8 131958124 131958358 + 1.66667 NA intron (NR_136616, intron 7 of 23) intron (NR_136616, intron 7 of 23) 41468 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 347.333-20 chr3 155388282 155388758 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -94837 NM_001352129 100507537 Hs.518341 NM_001352129 ENSG00000240045 STRIT1 DWORF small transmembrane regulator of ion transport 1 protein-coding 329-16 chr22 40254300 40254708 + 1.66667 NA intron (NM_015088, intron 3 of 20) AluJo|SINE|Alu 76579 NM_015088 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 266.667-12 chr10 44417322 44417648 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -32388 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 266-2 chr1 93903858 93904063 + 1.66667 NA intron (NM_001308253, intron 1 of 5) intron (NM_001308253, intron 1 of 5) 5470 NM_002061 2730 Hs.315562 NM_002061 ENSG00000023909 GCLM GLCLR glutamate-cysteine ligase modifier subunit protein-coding 285.667-6 chr10 65485638 65486011 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -85601 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 259-6 chr1 244038310 244038477 + 1.66667 NA intron (NR_033883, intron 8 of 11) intron (NR_033883, intron 8 of 11) -10546 NM_001278196 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 278-48 chr5 101535846 101536162 + 1.66667 NA Intergenic LTR77|LTR|ERV1 -632722 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 239.334-9 chr3 146586563 146586758 + 1.66667 NA intron (NM_001085420, intron 6 of 7) intron (NM_001085420, intron 6 of 7) 19556 NM_001321245 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 159.334-3 chr6 126700632 126700749 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 216059 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 254.333-82 chr7 116333104 116333401 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -46525 NR_130922 102724434 Hs.667624 NR_130921 ENSG00000237870 LOC102724434 - uncharacterized LOC102724434 ncRNA 211.333 chr1 15976070 15976389 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001324138) promoter-TSS (NM_001324138) -97 NM_001324138 7709 Hs.433764 NM_003443 ENSG00000116809 ZBTB17 MIZ-1|ZNF151|ZNF60|pHZ-67 zinc finger and BTB domain containing 17 protein-coding 313-26 chr4 71251784 71252112 + 1.66667 NA intron (NM_001098484, intron 2 of 25) intron (NM_001098484, intron 2 of 25) 64662 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 302-63 chr7 8281776 8281963 + 1.66667 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) intron (NR_125740, intron 3 of 5) -19257 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 442.666-4 chr8 57914867 57915193 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -63328 NR_130934 100505477 Hs.434693 NR_130934 ENSG00000205293 LINC01602 T1560 long intergenic non-protein coding RNA 1602 ncRNA 372.667-20 chr7 38857325 38857600 + 1.66667 NA intron (NM_014396, intron 4 of 28) intron (NM_014396, intron 4 of 28) 51729 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 445.667 chr10 27122713 27123052 + 1.66667 NA exon (NM_014263, exon 11 of 19) exon (NM_014263, exon 11 of 19) -22384 NM_014915 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 474-3 chr5 119894461 119894810 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 265076 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 266.666-21 chr3 9462056 9462322 + 1.66667 NA intron (NM_001080517, intron 17 of 22) intron (NM_001080517, intron 17 of 22) 64489 NM_001080517 55209 Hs.288164 NM_018187 ENSG00000168137 SETD5 - SET domain containing 5 protein-coding 220.667-41 chr2 18808345 18808480 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 218559 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 130.333-56 chr12 106762021 106762178 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_213594, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_213594, exon 18 of 18) -12583 NR_147137 55188 Hs.131306 NM_018157 ENSG00000111785 RIC8B RIC8|hSyn RIC8 guanine nucleotide exchange factor B protein-coding 262-28 chr16 52510180 52510378 + 1.66667 NA intron (NM_001080430, intron 1 of 6) intron (NM_001080430, intron 1 of 6) 36864 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 326.333-11 chr17 74819304 74819776 + 1.66667 NA intron (NM_017728, intron 8 of 9) intron (NM_017728, intron 8 of 9) 40344 NR_103735 2905 Hs.436980 NM_000835 ENSG00000161509 GRIN2C GluN2C|NMDAR2C|NR2C glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C protein-coding 258.333-20 chr13 70518117 70518442 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -409786 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 295.001 chr6 70173018 70173230 + 1.66667 NA intron (NM_001858, intron 41 of 50) L2a|LINE|L2 110073 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 397.334-5 chr2 39708724 39709090 + 1.66667 NA intron (NM_152390, intron 3 of 3) intron (NM_152390, intron 3 of 3) 42990 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 435.667-3 chr4 117598068 117598417 + 1.66667 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) intron (NR_125757, intron 2 of 3) 169844 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 440.666-9 chr22 35367180 35367834 + 1.66667 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 -13589 NM_002133 3162 Hs.517581 NM_002133 ENSG00000100292 HMOX1 HMOX1D|HO-1|HSP32|bK286B10 heme oxygenase 1 protein-coding 179.333-108 chr2 231985207 231985422 + 1.66667 NA intron (NR_046477, intron 1 of 18) L1MD2|LINE|L1 23601 NR_046477 129563 Hs.732236 NM_152383 ENSG00000144535 DIS3L2 FAM6A|PRLMNS|hDIS3L2 DIS3 like 3'-5' exoribonuclease 2 protein-coding 468.999 chr2 204672524 204672958 + 1.66667 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) intron (NM_205863, intron 1 of 21) 127266 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 276-52 chr5 13096117 13096326 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -63335 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 350.667-3 chr1 94991188 94991542 + 1.66667 NA intron (NM_144988, intron 3 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 63337 NR_033998 729970 Hs.297988 NR_033998 ENSG00000235501 LOC729970 - hCG2028352-like ncRNA 287.667-38 chr8 84043409 84043731 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -139217 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 192-22 chr10 76238745 76238912 + 1.66667 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 456067 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 260.334-3 chr10 9416553 9416796 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -121081 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 243.667-31 chr2 13622147 13622491 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -615306 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 406-12 chr4 72700428 72701106 + 1.66667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -131546 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 588.667 chr12 10491516 10492007 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -14132 NM_001357731 255308 Hs.547382 NM_001357731 ENSG00000180574 EIF2S3B EIF2S3L|eIF-2gA|eIF2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma B protein-coding 252.334-26 chr9 87425951 87426116 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -71195 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 241.333-106 chrX 117219065 117219297 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -401321 NR_145523 100126447 Hs.695847 NR_145523 LOC100126447 - uncharacterized LOC100126447 ncRNA 220.667-50 chr2 140508148 140508396 + 1.66667 NA intron (NM_018557, intron 52 of 90) intron (NM_018557, intron 52 of 90) 78413 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 464-2 chr11 73017838 73018317 + 1.66667 NA intron (NM_014824, intron 3 of 19) L1MC5|LINE|L1 124241 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 290-46 chr6 135285956 135286196 + 1.66667 NA intron (NM_001350504, intron 27 of 27) intron (NM_001350504, intron 27 of 27) 46916 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 241.333-9 chr1 217633208 217633423 + 1.66667 NA intron (NM_138796, intron 1 of 10) intron (NM_138796, intron 1 of 10) 1971 NM_138796 128153 Hs.171130 NM_138796 ENSG00000162814 SPATA17 IQCH|MSRG-11|MSRG11 spermatogenesis associated 17 protein-coding 239.333-23 chr12 6795323 6795586 + 1.66667 NA intron (NM_001195016, intron 1 of 7) intron (NM_001195016, intron 1 of 7) 5926 NM_001195015 920 Hs.631659 NM_000616 ENSG00000010610 CD4 CD4mut CD4 molecule protein-coding 242.667-67 chr3 31844308 31844467 + 1.66667 NA intron (NM_017784, intron 3 of 11) L1MB5|LINE|L1 -137363 NM_001137674 344787 Hs.585139 NM_001137674 ENSG00000197385 ZNF860 - zinc finger protein 860 protein-coding 287.333-23 chr15 100093840 100094104 + 1.66667 NA intron (NM_139057, intron 15 of 21) intron (NM_139057, intron 15 of 21) 248003 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 251.999-5 chr17 32239837 32240132 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25848 NM_001330181 162494 Hs.655027 NM_138328 ENSG00000141314 RHBDL3 RHBDL4|VRHO rhomboid like 3 protein-coding 315.667-21 chr5 88465298 88465656 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26387 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 254-20 chr14 63952828 63952986 + 1.66667 NA intron (NM_015180, intron 7 of 114) intron (NM_015180, intron 7 of 114) 99903 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 370.666-17 chr5 33681778 33682402 + 1.66667 NA intron (NM_001324512, intron 5 of 21) L2a|LINE|L2 209900 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 358.333-15 chr19 36551715 36552068 + 1.66667 NA 5' UTR (NM_001321351, exon 5 of 6) 5' UTR (NM_001321351, exon 5 of 6) -21179 NR_110706 101927599 Hs.515376 NR_110703 ENSG00000233527 ZNF529-AS1 - ZNF529 antisense RNA 1 ncRNA 250.667-40 chr2 174774163 174774409 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9814 NM_001039523 1134 Hs.434479 NM_000079 ENSG00000138435 CHRNA1 ACHRA|ACHRD|CHRNA|CMS1A|CMS1B|CMS2A|FCCMS|SCCMS cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunit protein-coding 199-50 chr2 96490555 96490719 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 14720 NM_001285486 93082 Hs.149219 NM_001080535 ENSG00000163121 NEURL3 LINCR|RNF132 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 535.999 chr12 74577736 74578178 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 40122 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 326.333-16 chr2 233286962 233287347 + 1.66667 NA intron (NM_030803, intron 12 of 17).2 intron (NM_030803, intron 12 of 17).2 -1522 NR_003006 677772 Hs.689637 NR_003006 ENSG00000251791 SCARNA6 U88 small Cajal body-specific RNA 6 ncRNA 220.333-76 chr20 62181733 62181950 + 1.66667 NA non-coding (NR_125981, exon 12 of 12) non-coding (NR_125981, exon 12 of 12) -1184 NM_015666 26164 Hs.340636 NM_015666 ENSG00000101181 MTG2 GTPBP5|ObgH1|dJ1005F21.2 mitochondrial ribosome associated GTPase 2 protein-coding 209.334-5 chr8 130052356 130052551 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001362926, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_001362926, exon 29 of 29) 32315 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 350-31 chr6 41931340 41931672 + 1.66667 NA exon (NM_004053, exon 5 of 7) exon (NM_004053, exon 5 of 7) 10007 NM_004053 705 Hs.106880 NM_004053 ENSG00000112578 BYSL BYSTIN|Enp1 bystin like protein-coding 504.667-5 chr5 82332790 82333474 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 53670 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 341.667-15 chr21 31649232 31649520 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10246 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 248-97 chrX 75084191 75084407 + 1.66667 NA intron (NM_001271699, intron 3 of 14) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 71984 NM_001271698 22 Hs.370480 NM_004299 ENSG00000131269 ABCB7 ABC7|ASAT|Atm1p|EST140535 ATP binding cassette subfamily B member 7 protein-coding 327.667-28 chr8 111719545 111719894 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 343080 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 252-60 chr20 46628716 46628974 + 1.66667 NA intron (NM_001193340, intron 2 of 12) MER3|DNA|hAT-Charlie 22614 NM_022829 64849 Hs.655498 NM_022829 ENSG00000158296 SLC13A3 ARLIAK|NADC3|SDCT2 solute carrier family 13 member 3 protein-coding 303.334-3 chr12 42212822 42213128 + 1.66667 NA intron (NR_135140, intron 2 of 6) intron (NR_135140, intron 2 of 6) 25393 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 307.333-47 chr2 220152357 220152693 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -245960 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 420-10 chr5 15288494 15288862 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22118 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 252.667-85 chr5 129742230 129742474 + 1.66667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -5742 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 382.334 chr11 106014997 106015345 + 1.66667 NA intron (NM_001318750, intron 1 of 2) intron (NM_001318750, intron 1 of 2) 7069 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 423.667 chr1 28409470 28409798 + 1.66667 NA intron (NM_001350160, intron 3 of 14) intron (NM_001350160, intron 3 of 14) -28516 NM_023923 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 234.333-26 chr14 60159396 60159622 + 1.66667 NA intron (NM_001322280, intron 1 of 6) intron (NM_001322280, intron 1 of 6) 5889 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 319.667-24 chr4 48940065 48940310 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -33359 NM_001286773 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 271-53 chr9 19013164 19013430 + 1.66667 NA intron (NM_001287049, intron 1 of 3) intron (NM_001287049, intron 1 of 3) 19912 NM_153707 158297 Hs.731593 NM_153707 ENSG00000155875 SAXO1 C9orf138|FAM154A stabilizer of axonemal microtubules 1 protein-coding 246-47 chr18 77494222 77494374 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 244450 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 244-71 chr3 88110017 88110201 + 1.66667 NA intron (NM_001350135, intron 2 of 6) intron (NM_001350135, intron 2 of 6) 39757 NM_001195308 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 338.333-15 chr6 69787749 69788121 + 1.66667 NA intron (NM_001367272, intron 2 of 15) intron (NM_001367272, intron 2 of 15) 8531 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 253.667-45 chr3 190674174 190674442 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 160223 NM_001364879 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 244.334-18 chr5 111449607 111449844 + 1.66667 NA intron (NM_001744, intron 7 of 10) intron (NM_001744, intron 7 of 10) -62501 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 353.667-7 chr14 73154606 73155000 + 1.66667 NA intron (NM_000021, intron 3 of 11) L1MC5a|LINE|L1 18296 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 255.334-24 chr5 100586016 100586170 + 1.66667 NA intron (NM_198507, intron 2 of 2) intron (NM_198507, intron 2 of 2) 50719 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 230-54 chr5 51013149 51013398 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -43086 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 272-56 chr9 135945928 135946232 + 1.66667 NA intron (NM_016172, intron 5 of 9) intron (NM_016172, intron 5 of 9) 15293 NM_016172 10422 Hs.9194 NM_016172 ENSG00000130560 UBAC1 GBDR1|KPC2|UBADC1 UBA domain containing 1 protein-coding 486.334-2 chr3 7819792 7820187 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 196318 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 236-41 chr2 78332213 78332472 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -41611 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 233-21 chr13 66474803 66474966 + 1.66667 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) intron (NM_001318373, intron 3 of 3) 256634 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 283-33 chr6 141860418 141860692 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 228244 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 222-29 chr14 86350077 86350294 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 415507 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 257-7 chr11 31944482 31944647 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 96754 NR_120526 100506675 Hs.446169 NR_120526 ENSG00000254584 LOC100506675 - uncharacterized LOC100506675 ncRNA 507.667-3 chr2 40471470 40472095 + 1.66667 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) intron (NM_001112802, intron 1 of 7) -19692 NM_001351491 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 207-51 chr17 34191762 34192067 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -8282 NR_110748 101927239 Hs.603592 NR_110748 ENSG00000261156 LINC01989 - long intergenic non-protein coding RNA 1989 ncRNA 241-57 chr8 57440716 57440869 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 97005 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 406.667-7 chr4 43525089 43525470 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -32736 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 215-7 chr10 63544973 63545206 + 1.66667 NA intron (NM_001001330, intron 1 of 7) intron (NM_001001330, intron 1 of 7) -23199 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 348.667-4 chr1 231781753 231782054 + 1.66667 NA intron (NM_001164547, intron 6 of 7) intron (NM_001164547, intron 6 of 7) 36614 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 257-43 chr4 44610785 44611006 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 40746 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 269-16 chr15 58596592 58596907 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001110, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001110, exon 16 of 16) 96858 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 378-13 chr2 131008197 131008667 + 1.66667 NA intron (NM_001367493, intron 4 of 13) L1ME3A|LINE|L1 84730 NM_001321747 130074 Hs.534679 NM_001009993 ENSG00000152102 FAM168B MANI family with sequence similarity 168 member B protein-coding 244.666-16 chr14 83235683 83235936 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 593177 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 323.333-28 chr6 116178390 116178878 + 1.66667 NA intron (NM_152729, intron 6 of 11) intron (NM_152729, intron 6 of 11) -52502 NM_000493 1300 Hs.520339 NM_000493 ENSG00000123500 COL10A1 - collagen type X alpha 1 chain protein-coding 266-72 chr5 143938802 143939049 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 126764 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 218.667-88 chr6 38147358 38147571 + 1.66667 NA intron (NM_021943, intron 5 of 5) L1MA4A|LINE|L1 327737 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 185.333-84 chr2 51956027 51956236 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -414517 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 222.667-59 chr3 136561663 136561867 + 1.66667 NA intron (NM_005862, intron 5 of 33) L1P4|LINE|L1 190613 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 248.667-25 chr12 24242906 24243095 + 1.66667 NA intron (NM_001261414, intron 4 of 16) intron (NM_001261414, intron 4 of 16) 19729 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 267.334-4 chr13 113591997 113592276 + 1.66667 NA intron (NM_007111, intron 2 of 11) intron (NM_007111, intron 2 of 11) 7383 NM_007111 7027 Hs.79353 NM_007111 ENSG00000198176 TFDP1 DILC|DP1|DRTF1|Dp-1 transcription factor Dp-1 protein-coding 169.334 chr1 179223445 179223575 + 1.66667 NA intron (NM_007314, intron 1 of 11) intron (NM_007314, intron 1 of 11) 6167 NM_007314 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 266-33 chr18 68806169 68806435 + 1.66667 NA intron (NM_024781, intron 1 of 7) intron (NM_024781, intron 1 of 7) 8222 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 251.667-29 chr17 58266189 58266396 + 1.66667 NA exon (NM_001160102, exon 9 of 11) exon (NM_001160102, exon 9 of 11) 14643 NM_000250 4353 Hs.458272 NM_000250 ENSG00000005381 MPO - myeloperoxidase protein-coding 265-3 chr1 74579318 74579517 + 1.66667 NA intron (NR_121671, intron 1 of 2) intron (NR_121671, intron 1 of 2) 1987 NR_121671 101927320 Hs.662589 NR_121670 ENSG00000234497 ERICH3-AS1 - ERICH3 antisense RNA 1 ncRNA 227.334-2 chr10 95839739 95839908 + 1.66667 NA intron (NM_001164182, intron 3 of 8) intron (NM_001164182, intron 3 of 8) -68142 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 260.334-7 chr12 20678862 20679028 + 1.66667 NA intron (NM_000921, intron 15 of 15) intron (NM_000921, intron 15 of 15) -16410 NM_001145946 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 334.334-8 chr5 148139298 148139648 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -29073 NM_001001325 408187 Hs.553815 NM_001001325 ENSG00000196800 SPINK14 SPINK5L2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (putative) protein-coding 293-9 chr10 88099007 88099416 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 235586 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 397.667-12 chr9 76829146 76829498 + 1.66667 NA intron (NM_001308048, intron 4 of 17) L1MEg|LINE|L1 64886 NR_132313 50652 Hs.663766 NR_015342 ENSG00000225937 PCA3 DD3|NCRNA00019|PCAT3|PRUNE2-AS1 prostate cancer associated 3 ncRNA 258-12 chr14 28890440 28890632 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -104749 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 249.334-5 chr11 15279991 15280142 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 130964 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 327.999-4 chr2 51074798 51075247 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 42421 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 244.333-84 chr5 76576466 76576695 + 1.66667 NA intron (NM_006633, intron 5 of 35) intron (NM_006633, intron 5 of 35) 29171 NM_001285460 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 266-71 chr5 97053516 97053790 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 88958 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 263.666-10 chr3 6831759 6832002 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -26431 NR_110123 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 274.333-2 chr1 155804104 155804338 + 1.66667 NA intron (NM_032292, intron 11 of 20) AluJr4|SINE|Alu -20389 NR_132767 106633816 NR_132767 SCARNA26B - small Cajal body-specific RNA 26B ncRNA 506.666 chr15 95076374 95077103 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 221375 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 363-4 chr16 88394522 88394895 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -32763 NM_001367624 84627 Hs.54925 NM_001127464 ENSG00000225614 ZNF469 BCS|BCS1 zinc finger protein 469 protein-coding 167.666-13 chr8 67134066 67134261 + 1.66667 NA intron (NM_001363133, intron 14 of 27) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 50315 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 303.334-15 chrX 33655668 33655860 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -316376 NM_000109 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 284.333-10 chr11 129088086 129088396 + 1.66667 NA intron (NM_001142685, intron 5 of 21) intron (NM_001142685, intron 5 of 21) -64053 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 257.333-45 chr17 76389907 76390213 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_022066, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_022066, exon 18 of 18) 4782 NM_001142602 8877 Hs.68061 NM_021972 ENSG00000176170 SPHK1 SPHK sphingosine kinase 1 protein-coding 426.334-2 chr13 69035433 69035753 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -150268 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 170-74 chr3 28834964 28835153 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 259780 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 249.334-15 chr3 181456014 181456187 + 1.66667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) -13614 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 181.667-111 chr4 82512595 82512728 + 1.66667 NA intron (NM_001353454, intron 1 of 7) intron (NM_001353454, intron 1 of 7) 49327 NM_001353455 441027 Hs.507676 NM_001080506 ENSG00000249242 TMEM150C TTN3 transmembrane protein 150C protein-coding 310.667-17 chr2 88859139 88859382 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46890 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 355-9 chr17 32432934 32433253 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -11417 NM_001270482 5717 Hs.443379 NM_002815 ENSG00000108671 PSMD11 Rpn6|S9|p44.5 proteasome 26S subunit, non-ATPase 11 protein-coding 292.334-4 chr2 66055344 66055648 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 302832 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 242-34 chr18 12685911 12686112 + 1.66667 NA intron (NM_001271989, intron 7 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger 16712 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 333.333-36 chr3 69445987 69446329 + 1.66667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -60070 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 304.334-8 chr4 87826898 87827208 + 1.66667 NA intron (NM_001184694, intron 1 of 3) intron (NM_001184694, intron 1 of 3) 5655 NM_001184694 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 291.667-39 chr8 140888287 140888561 + 1.66667 NA intron (NR_148037, intron 4 of 34) intron (NR_148037, intron 4 of 34) 112580 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 540.668 chr2 57541912 57542335 + 1.66667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -365528 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 269.667-57 chr8 133332528 133332820 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -35370 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 239-42 chr3 84610401 84610642 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 259054 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 238.667-97 chr9 27063099 27063266 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001349928, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001349928, exon 20 of 20) -45959 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 242-63 chr6 107572098 107572269 + 1.66667 NA intron (NM_018013, intron 4 of 6) intron (NM_018013, intron 4 of 6) 82066 NM_018013 55084 Hs.445244 NM_018013 ENSG00000112320 SOBP JXC1|MRAMS sine oculis binding protein homolog protein-coding 381.001-2 chr9 28264022 28264345 + 1.66667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 455122 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 241.667-82 chr6 141375901 141376052 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 692162 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 347.334-3 chr14 57891546 57891873 + 1.66667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -25617 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 232.666-15 chr15 38520328 38520550 + 1.66667 NA intron (NM_001306086, intron 3 of 14) MamRep1151|LTR?|LTR? 44375 NM_005739 10125 Hs.591127 NM_005739 ENSG00000172575 RASGRP1 CALDAG-GEFI|CALDAG-GEFII|RASGRP RAS guanyl releasing protein 1 protein-coding 357.333-26 chr9 24027171 24027485 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -176727 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 303.666-16 chr9 80883694 80884098 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 805639 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 148.667-68 chr11 29463938 29464051 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -130419 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 250.667-70 chr6 79887043 79887298 + 1.66667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 60383 NM_022726 6785 Hs.101915 NM_022726 ENSG00000118402 ELOVL4 ADMD|CT118|ISQMR|SCA34|STGD2|STGD3 ELOVL fatty acid elongase 4 protein-coding 198.334-3 chr2 9484930 9485105 + 1.66667 NA intron (NM_001320858, intron 5 of 5) L1ME1|LINE|L1 9962 NM_001320858 285148 Hs.667226 NM_001039613 ENSG00000134330 IAH1 - isoamyl acetate hydrolyzing esterase 1 (putative) protein-coding 252-20 chr12 19866539 19866714 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -148059 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 341.667-6 chr12 38533388 38533732 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 216786 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 180.333-83 chr3 118614372 118614653 + 1.66667 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) intron (NR_135547, intron 2 of 3) -27256 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 246.667-92 chr8 48828089 48828294 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -92880 NR_157026 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 403.001 chr10 5163500 5163880 + 1.66667 NA intron (NR_027916, intron 1 of 7) MER61E|LTR|ERV1 21497 NR_027916 340811 Hs.282513 NM_001007536 ENSG00000264006 AKR1C8P AKR1CL1 aldo-keto reductase family 1 member C8, pseudogene pseudo 262.667-83 chr8 142132491 142132690 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -43749 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 178-114 chr8 125361730 125361889 + 1.66667 NA intron (NM_001349486, intron 7 of 7) intron (NM_001349486, intron 7 of 7) -68549 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 296-41 chr22 24825120 24825411 + 1.66667 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) intron (NM_001098498, intron 2 of 23) 19044 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 180.334 chr11 109830863 109831014 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -262454 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 260-57 chr4 163784384 163784688 + 1.66667 NA intron (NM_001166373, intron 3 of 7) intron (NM_001166373, intron 3 of 7) -171002 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 370.333-6 chr12 120168274 120168660 + 1.66667 NA intron (NM_006836, intron 15 of 57) intron (NM_006836, intron 15 of 57) -12968 NR_039719 100616179 NR_039719 ENSG00000266704 MIR4498 mir-4498 microRNA 4498 ncRNA 264.667 chr1 88389321 88389557 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -294705 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 250.333-63 chr6 51818286 51818525 + 1.66667 NA intron (NM_138694, intron 52 of 66) intron (NM_138694, intron 52 of 66) 196535 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 363.001 chr1 159821549 159821867 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5165 NM_020125 56833 Hs.438683 NM_020125 ENSG00000158714 SLAMF8 BLAME|CD353|SBBI42 SLAM family member 8 protein-coding 280 chr1 67396570 67396869 + 1.66667 NA non-coding (NR_047583, exon 14 of 14) non-coding (NR_047583, exon 14 of 14) 33683 NM_001018067 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 301.333-27 chr2 99950401 99950721 + 1.66667 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 155022 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 253.334-24 chr8 132633815 132633999 + 1.66667 NA intron (NR_073525, intron 4 of 12) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 41638 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 203-44 chr17 53914459 53914676 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 91640 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 381.666-10 chr5 153993169 153993681 + 1.66667 NA intron (NM_001317993, intron 14 of 14) intron (NM_001317993, intron 14 of 14) 45485 NM_018691 10827 Hs.166551 NM_018691 ENSG00000055147 FAM114A2 133K02|C5orf3 family with sequence similarity 114 member A2 protein-coding 350.334-2 chr10 29207933 29208282 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -80963 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 223-24 chr16 56185194 56185410 + 1.66667 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) intron (NR_027078, intron 2 of 4) 5792 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 547.333-2 chr14 73331834 73332427 + 1.66667 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) L1MEd|LINE|L1 -86129 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 234.667-95 chr6 47078078 47078236 + 1.66667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -35825 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 269-36 chr4 19323718 19324023 + 1.66667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -928035 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 264.334-18 chr6 95258332 95258490 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 319040 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 260.667-84 chr7 93729168 93729366 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 12339 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 490.666-2 chr8 91474114 91474596 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 225036 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 327.667-13 chr15 63422960 63423218 + 1.66667 NA intron (NR_120375, intron 4 of 6) intron (NR_120375, intron 4 of 6) 32859 NR_120375 102723344 Hs.569500 NR_120375 LINC02568 - long intergenic non-protein coding RNA 2568 ncRNA 260.334-17 chr6 459384 459588 + 1.66667 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 67734 NM_001195286 3662 Hs.401013 NM_002460 ENSG00000137265 IRF4 LSIRF|MUM1|NF-EM5|SHEP8 interferon regulatory factor 4 protein-coding 373.334-6 chr3 21590509 21590846 + 1.66667 NA intron (NM_024697, intron 2 of 7) (TTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 47888 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 254.333-41 chr2 105528461 105528723 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 81967 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 211.667-44 chr17 18204859 18205086 + 1.66667 NA intron (NM_017758, intron 2 of 3) AluJo|SINE|Alu -20663 NM_004140 3996 Hs.513983 NM_004140 ENSG00000131899 LLGL1 DLG4|HUGL|HUGL-1|HUGL1|LLGL|Lgl1|Mgl1 LLGL scribble cell polarity complex component 1 protein-coding 296.667-34 chr20 11696450 11696660 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 174160 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 345-7 chr2 238360681 238361070 + 1.66667 NA intron (NM_001139490, intron 13 of 14) AluSc8|SINE|Alu 40331 NM_001139490 26146 Hs.631898 NM_015650 ENSG00000204104 TRAF3IP1 IFT54|MIP-T3|MIPT3|SLSN9 TRAF3 interacting protein 1 protein-coding 190-84 chr3 195286017 195286164 + 1.66667 NA intron (NM_012287, intron 21 of 22) intron (NM_012287, intron 21 of 22) -14931 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 274.334-8 chr7 126308920 126309190 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 749129 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 440.667 chr1 159674067 159674603 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 40254 NM_001329057 1401 Hs.76452 NM_000567 ENSG00000132693 CRP PTX1 C-reactive protein protein-coding 278.667-2 chr1 221428908 221429160 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -92738 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 313-11 chr13 22028834 22029142 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -150828 NR_047040 100874182 Hs.148951 NR_047040 ENSG00000226722 LINC00424 - long intergenic non-protein coding RNA 424 ncRNA 262.333-7 chr1 179227122 179227435 + 1.66667 NA intron (NM_007314, intron 1 of 11) Plat_L3|LINE|CR1 2399 NM_007314 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 249.667-65 chr4 15439481 15439726 + 1.66667 NA intron (NM_001135171, intron 2 of 2) intron (NM_001135171, intron 2 of 2) 11570 NM_031911 114905 Hs.153714 NM_031911 ENSG00000163145 C1QTNF7 CTRP7|ZACRP7 C1q and TNF related 7 protein-coding 416.667-18 chr8 107539408 107539999 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -41785 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 277.334 chr1 207707521 207707688 + 1.66667 NA intron (NM_175710, intron 9 of 11) AluSx|SINE|Alu -44434 NM_002389 4179 Hs.510402 NM_002389 ENSG00000117335 CD46 AHUS2|MCP|MIC10|TLX|TRA2.10 CD46 molecule protein-coding 255-25 chr12 39360880 39361151 + 1.66667 NA intron (NM_001173464, intron 7 of 37) intron (NM_001173464, intron 7 of 37) 82105 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 290-50 chr8 88926253 88926540 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -598913 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 316.334-7 chr3 167027878 167028081 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 129296 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 406.333-15 chr6 113110102 113110570 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 323111 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 343.001-4 chr8 43886710 43887009 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 594417 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 308.334-2 chr10 14811571 14811900 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26302 NM_001029954 441549 Hs.559067 NM_001029954 ENSG00000185267 CDNF ARMETL1 cerebral dopamine neurotrophic factor protein-coding 283.667 chr1 73026478 73026764 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -279549 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 211.334-5 chr2 97869553 97869708 + 1.66667 NA intron (NM_015348, intron 4 of 40) intron (NM_015348, intron 4 of 40) 126318 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 264.667-61 chr4 182942804 182943077 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -25463 NM_001351753 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 479-5 chr5 52506384 52506756 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -281346 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 259.667-9 chr10 89673269 89673475 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 24556 NR_026835 283011 Hs.679445 NR_026835 FLJ37201 - tigger transposable element derived 2 pseudogene pseudo 260.333-32 chr2 195779567 195779872 + 1.66667 NA intron (NM_018897, intron 58 of 64) AluJb|SINE|Alu 122493 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 365.334-9 chr7 107996027 107996288 + 1.66667 NA intron (NM_002291, intron 4 of 33) intron (NM_002291, intron 4 of 33) 7004 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 338.667-31 chr9 122208081 122208304 + 1.66667 NA intron (NM_199160, intron 8 of 8) intron (NM_199160, intron 8 of 8) 13548 NM_001242335 26468 Hs.103137 NM_014368 ENSG00000106852 LHX6 LHX6.1 LIM homeobox 6 protein-coding 448-6 chr5 152911756 152912054 + 1.66667 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) L1MEg|LINE|L1 60444 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 492.001 chr10 68545080 68545435 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15080 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 277.999-4 chr17 64520912 64521231 + 1.66667 NA intron (NM_138363, intron 6 of 19) AluSq2|SINE|Alu 14094 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 293.667-19 chr17 32211520 32211850 + 1.66667 NA intron (NM_001033566, intron 19 of 19) intron (NM_001033566, intron 19 of 19) -54147 NM_001330181 162494 Hs.655027 NM_138328 ENSG00000141314 RHBDL3 RHBDL4|VRHO rhomboid like 3 protein-coding 248-54 chr3 104934078 104934247 + 1.66667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -432551 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 192.334-6 chr7 52819362 52819483 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -216211 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 364.667-17 chr9 29674917 29675308 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -461511 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 273-43 chr8 133443621 133443864 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 128145 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 334.001-3 chr5 107692489 107692752 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -21683 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 309-27 chr4 61027028 61027370 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 104580 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 223-36 chr2 140634945 140635192 + 1.66667 NA intron (NM_018557, intron 41 of 90) L1MC3|LINE|L1 -48383 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 500.334 chr14 69268466 69269003 + 1.66667 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 8576 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 403.333-16 chr8 99371100 99371546 + 1.66667 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) L1PA8|LINE|L1 165407 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 334.333-17 chr18 7523724 7524145 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -43382 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 250.667-30 chr15 90622315 90622507 + 1.66667 NA intron (NR_120372, intron 3 of 3) intron (NR_120372, intron 3 of 3) -37823 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 265-43 chr20 54599332 54599665 + 1.66667 NA intron (NM_018431, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR 123905 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 243-76 chr9 31599944 31600169 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -218566 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 500.668 chr12 14496998 14497340 + 1.66667 NA intron (NM_181352, intron 14 of 14) intron (NM_181352, intron 14 of 14) -70563 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 184-29 chr14 75077424 75077573 + 1.66667 NA intron (NM_024643, intron 2 of 2) intron (NM_024643, intron 2 of 2) 7857 NR_110315 79696 Hs.48642 NM_024643 ENSG00000119703 ZC2HC1C C14orf140|FAM164C zinc finger C2HC-type containing 1C protein-coding 246.667-67 chr5 30514691 30515012 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 634291 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 406-7 chr20 43735450 43735878 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8662 NM_176791 149699 Hs.447626 NM_176791 ENSG00000124196 GTSF1L C20orf65|FAM112A|dJ1028D15.4 gametocyte specific factor 1 like protein-coding 297-19 chr12 127559322 127559559 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 77027 NR_120451 101927637 Hs.170413 NR_120451 ENSG00000256022 LINC02411 - long intergenic non-protein coding RNA 2411 ncRNA 323.666-9 chr3 25463850 25464279 + 1.66667 NA intron (NR_110892, intron 2 of 6) intron (NR_110892, intron 2 of 6) 5754 NM_001290217 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 239-43 chr3 104857690 104857911 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -508913 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 421.667-11 chr8 118404095 118404739 + 1.66667 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) L1MCa|LINE|L1 -216584 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 232.334-4 chr16 75199465 75199646 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 7606 NM_001025200 440387 Hs.610926 NM_001025200 ENSG00000168928 CTRB2 - chymotrypsinogen B2 protein-coding 165.667-130 chr3 148928690 148928889 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -62619 NM_004130 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 415.333-14 chr8 132831718 132832360 + 1.66667 NA intron (NM_001277196, intron 13 of 19) intron (NM_001277196, intron 13 of 19) -34919 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 203-8 chr1 163494964 163495173 + 1.66667 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -71877 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 289-13 chr20 10632442 10632746 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 17101 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 258-9 chr11 63666184 63666375 + 1.66667 NA intron (NM_001290048, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu 5097 NM_015459 25923 Hs.356719 NM_015459 ENSG00000184743 ATL3 HSN1F atlastin GTPase 3 protein-coding 287-8 chr10 130126025 130126389 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10168 NM_001199868 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 261-7 chr1 247725222 247725517 + 1.66667 NA intron (NM_001355292, intron 4 of 4) intron (NM_001355292, intron 4 of 4) -12614 NM_001005286 343169 Hs.591529 NM_001005286 ENSG00000169214 OR6F1 OR1-34|OR1-38|OST731 olfactory receptor family 6 subfamily F member 1 protein-coding 192.667-40 chr11 73537824 73538051 + 1.66667 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) intron (NM_001286051, intron 1 of 5) 60175 NM_015159 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 254-42 chr2 215340305 215340577 + 1.66667 NA intron (NM_004044, intron 12 of 15) L1MEg|LINE|L1 28382 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 184-10 chr10 32469028 32469215 + 1.66667 NA intron (NR_109827, intron 6 of 8) intron (NR_109827, intron 6 of 8) 22981 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 247.667-51 chr2 134483995 134484248 + 1.66667 NA intron (NM_030923, intron 5 of 7) AluSx|SINE|Alu 230049 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 274.334-2 chr14 57287853 57288137 + 1.66667 NA intron (NR_026895, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR 19024 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 402.333-13 chr7 89012799 89013244 + 1.66667 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -217284 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 387.001-2 chr9 27602183 27602468 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -28459 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 569.334-2 chr5 100274857 100275545 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 113053 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 175.333-128 chr3 164603611 164603793 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 227778 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 447.666-6 chr8 118687835 118688579 + 1.66667 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) intron (NR_038210, intron 3 of 4) -66244 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 277-14 chr14 72425809 72426002 + 1.66667 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -90915 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 255.333-52 chr2 52440440 52440695 + 1.66667 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 69919 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 242.667-44 chr17 65230140 65230304 + 1.66667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 92852 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 231.334-9 chr6 65632592 65632792 + 1.66667 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) -52888 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 281.667-9 chr10 122365391 122365569 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -9228 NM_001001974 59338 Hs.643512 NM_021622 ENSG00000107679 PLEKHA1 TAPP1 pleckstrin homology domain containing A1 protein-coding 447.667-4 chr4 101356002 101356459 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8453 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 292.667-48 chr9 80567206 80567416 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 592288 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 286-32 chr2 209014313 209014518 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -409632 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 257-60 chr6 49849836 49849993 + 1.66667 NA intron (NM_170609, intron 3 of 6) intron (NM_170609, intron 3 of 6) 16621 NM_170609 167 Hs.109620 NM_001131 ENSG00000124812 CRISP1 AEGL1|ARP|CRISP-1|HEL-S-57|HSCRISP1D|HSCRISP1G|HUMARP cysteine rich secretory protein 1 protein-coding 298.667-12 chr17 20309230 20309749 + 1.66667 NA intron (NM_001033553, intron 14 of 14) L1PA16|LINE|L1 -11685 NR_023380 348254 Hs.462475 NR_023380 CCDC144CP CCDC144C coiled-coil domain containing 144C, pseudogene pseudo 365 chr1 163183729 163184061 + 1.66667 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) intron (NM_001254748, intron 2 of 5) 19021 NM_001254749 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 179.334-2 chr18 62140492 62140631 + 1.66667 NA intron (NM_176787, intron 11 of 30) intron (NM_176787, intron 11 of 30) 46495 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 278-10 chr11 122535563 122535831 + 1.66667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -112826 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 329.667-3 chr11 87388225 87388430 + 1.66667 NA Intergenic L1P2|LINE|L1 331084 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 279.334-2 chr1 167397280 167397524 + 1.66667 NA intron (NM_001198783, intron 10 of 15) intron (NM_001198783, intron 10 of 15) 68332 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 254.667-25 chr15 59306577 59306744 + 1.66667 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) intron (NM_004998, intron 1 of 27) 66211 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 385-8 chr2 158405019 158405456 + 1.66667 NA intron (NM_138803, intron 1 of 13) L1MC5a|LINE|L1 51516 NM_001301685 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 460.334 chr19 29980048 29980433 + 1.66667 NA intron (NM_001252641, intron 2 of 10) intron (NM_001252641, intron 2 of 10) 38001 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 541 chr1 101801370 101801915 + 1.66667 NA TTS (NR_110212) TTS (NR_110212) 45438 NM_001288821 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 256-26 chr14 68342631 68342808 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 286068 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 280.333 chr1 44473746 44474010 + 1.66667 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 49877 NM_001319957 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 266.334 chr1 16432794 16432972 + 1.66667 NA 5' UTR (NM_198546, exon 2 of 13) 5' UTR (NM_198546, exon 2 of 13) 4541 NM_198546 374955 Hs.705501 NM_198546 ENSG00000187144 SPATA21 spergen-2|spergen2 spermatogenesis associated 21 protein-coding 215.667-124 chr8 142307136 142307318 + 1.66667 NA intron (NM_001366903, intron 9 of 9) L1ME3|LINE|L1 95955 NM_001366902 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 231-50 chr4 86120971 86121195 + 1.66667 NA intron (NR_110879, intron 2 of 3) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 1277 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 279.667-30 chr3 40808707 40808959 + 1.66667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 283873 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 324.667-37 chr7 85881453 85881680 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 460444 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 251-74 chr6 127037315 127037553 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -81237 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 476.667 chr1 119329805 119330264 + 1.66667 NA intron (NR_146623, intron 2 of 3) intron (NR_146623, intron 2 of 3) 1782 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 331.333-27 chr2 70233431 70233826 + 1.66667 NA intron (NR_147232, intron 1 of 10) AluSg|SINE|Alu 15000 NM_001351516 7072 Hs.413123 NM_022037 ENSG00000116001 TIA1 TIA-1|WDM TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein protein-coding 353.667-8 chr2 116577690 116578042 + 1.66667 NA Intergenic LTR27D|LTR|ERV1 1234051 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 397.667-6 chr2 143259822 143260342 + 1.66667 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 130663 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 459.333-2 chr1 221310972 221311467 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 25077 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 353-3 chr11 20502833 20503110 + 1.66667 NA intron (NM_005788, intron 15 of 15) intron (NM_005788, intron 15 of 15) -96429 NM_004211 9152 Hs.136557 NM_004211 ENSG00000165970 SLC6A5 GLYT-2|GLYT2|HKPX3|NET1 solute carrier family 6 member 5 protein-coding 257.667-15 chr12 9168300 9168534 + 1.66667 NA intron (NM_002864, intron 17 of 35) intron (NM_002864, intron 17 of 35) 39978 NM_002864 5858 Hs.707491 NM_002864 ENSG00000126838 PZP CPAMD6 PZP alpha-2-macroglobulin like protein-coding 262-7 chr10 57403588 57403779 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -99124 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 278.333-11 chr10 33969389 33969691 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -196860 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 207.666-21 chr19 56056051 56056258 + 1.66667 NA intron (NM_153447, intron 13 of 14) intron (NM_153447, intron 13 of 14) -10530 NR_110741 101928886 Hs.434652 NR_110741 ENSG00000267522 LINC01864 - long intergenic non-protein coding RNA 1864 ncRNA 249-62 chr5 92816548 92816788 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 754675 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 208-110 chr3 142806201 142806399 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_003304, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_003304, exon 12 of 12) 81876 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 252-67 chr4 43265363 43265604 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 227060 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 226.333-98 chr6 56214370 56214528 + 1.66667 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) intron (NM_001318752, intron 1 of 28) 33131 NR_134849 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 293.334-3 chr12 28366822 28367032 + 1.66667 NA intron (NM_001330367, intron 7 of 11) L1MDa|LINE|L1 -176189 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 269.667-38 chr3 33473282 33473504 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -32988 NM_001128161 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 254-34 chr2 65173048 65173283 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -42864 NM_015543 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 274.001 chr1 19164342 19164510 + 1.66667 NA exon (NM_020765, exon 33 of 106) exon (NM_020765, exon 33 of 106) 45840 NM_020765 23352 Hs.148078 NM_020765 ENSG00000127481 UBR4 RBAF600|ZUBR1|p600 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4 protein-coding 370-17 chr3 44336657 44337027 + 1.66667 NA Intergenic MER84-int|LTR|ERV1 -1277 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 244-56 chr2 78380018 78380221 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -89388 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 228-39 chr2 27924145 27924317 + 1.66667 NA intron (NM_199193, intron 3 of 13) intron (NM_199193, intron 3 of 13) -33117 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 199.667-51 chr15 58868394 58868572 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 65196 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 293-18 chr14 48247083 48247423 + 1.66667 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -452239 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 247.333-42 chr2 71329570 71329813 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -2064 NM_001014972 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 296.333-32 chr4 53844937 53845280 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 142174 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 366.667-18 chr7 28054235 28054549 + 1.66667 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -126065 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 346.667-19 chr9 105290941 105291290 + 1.66667 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) intron (NM_001330731, intron 1 of 15) 46464 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 304.333-36 chr8 9582455 9582853 + 1.66667 NA intron (NM_003747, intron 2 of 26) MIR|SINE|MIR 26742 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 314.667-18 chr14 71179479 71179755 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -140859 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 204-41 chr11 84456129 84456311 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -138881 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 209.333-157 chr3 119849370 119849602 + 1.66667 NA intron (NM_002093, intron 10 of 11) intron (NM_002093, intron 10 of 11) 66776 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 146.334 chr4 28375691 28375796 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -443839 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 257.667-51 chr20 55881039 55881218 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 124391 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 309.001 chr3 79488259 79488477 + 1.66667 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -19519 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 249-68 chr8 76792498 76792797 + 1.66667 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -109372 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 406.001-2 chr6 50937547 50937966 + 1.66667 NA Intergenic hAT-N1_Mam|DNA|hAT-Tip100? 118885 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 288.333-6 chr10 74928804 74929218 + 1.66667 NA intron (NR_134476, intron 1 of 1) intron (NR_134476, intron 1 of 1) 16225 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 263.333-22 chr14 64368131 64368315 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20130 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 249.667-19 chr11 111901013 111901172 + 1.66667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 9647 NM_001368246 1410 Hs.53454 NM_001885 ENSG00000109846 CRYAB CMD1II|CRYA2|CTPP2|CTRCT16|HEL-S-101|HSPB5|MFM2 crystallin alpha B protein-coding 377.667-13 chr5 126322524 126322949 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37384 NM_001146319 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 426.334-3 chr5 159029751 159030249 + 1.66667 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) L1M5|LINE|L1 67956 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 204.334-4 chr7 146445522 146445691 + 1.66667 NA Intergenic (TGTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -328665 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 283.667-39 chrX 77985474 77985746 + 1.66667 NA intron (NR_104109, intron 2 of 9) MER3|DNA|hAT-Charlie -15972 NM_001029891 441531 Hs.632822 NM_001029891 ENSG00000226784 PGAM4 PGAM-B|PGAM1|PGAM3|dJ1000K24.1 phosphoglycerate mutase family member 4 protein-coding 351.333-7 chr12 69600434 69600964 + 1.66667 NA intron (NM_006431, intron 15 of 15) intron (NM_006431, intron 15 of 15) 10208 NM_201550 376132 Hs.448708 NM_201550 ENSG00000198812 LRRC10 HRLRRP|LRRC10A leucine rich repeat containing 10 protein-coding 286.333-19 chr2 22602733 22603080 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 66427 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 224.334 chr11 87842157 87842317 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -122826 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 241.334-10 chr3 159133105 159133324 + 1.66667 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) ORSL-2b|DNA|hAT-Tip100 63895 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 302.666-18 chr4 98777127 98777569 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 118446 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 241.334-8 chr22 34719957 34720124 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 277876 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 298-32 chr17 16242051 16242250 + 1.66667 NA intron (NM_004278, intron 2 of 6) AluJr4|SINE|Alu 24940 NM_004278 9487 Hs.499793 NM_004278 ENSG00000108474 PIGL CHIME phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class L protein-coding 294.333-14 chr15 34151747 34152078 + 1.66667 NA intron (NM_024713, intron 4 of 9) intron (NM_024713, intron 4 of 9) 49829 NM_152595 161779 Hs.156317 NM_152595 ENSG00000182405 PGBD4 - piggyBac transposable element derived 4 protein-coding 424.666 chr10 73454290 73454846 + 1.66667 NA intron (NM_001142353, intron 9 of 13) intron (NM_001142353, intron 9 of 13) -21007 NM_001024593 118490 Hs.631823 NM_001024593 ENSG00000166343 MSS51 ZMYND17 MSS51 mitochondrial translational activator protein-coding 270.333-16 chr12 61358535 61358837 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 834153 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 247.666-37 chr8 78949490 78949745 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 112088 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 321.333-60 chr8 126247128 126247473 + 1.66667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -78195 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 241.667-63 chr4 102373323 102373540 + 1.66667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -27949 NM_001135146 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 248-70 chr5 36163231 36163407 + 1.66667 NA intron (NM_001243120, intron 2 of 7) intron (NM_001243120, intron 2 of 7) 11208 NM_032637 6502 Hs.23348 NM_005983 ENSG00000145604 SKP2 FBL1|FBXL1|FLB1|p45 S-phase kinase associated protein 2 protein-coding 238.667-47 chr2 118145608 118145873 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 40646 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 406.666 chr1 39875546 39876112 + 1.66667 NA intron (NM_017646, intron 1 of 10) intron (NM_017646, intron 1 of 10) 7675 NM_017646 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 251.334-3 chr1 101394979 101395191 + 1.66667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 71248 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 351.666-20 chr9 77935944 77936393 + 1.66667 NA intron (NM_002072, intron 1 of 6) intron (NM_002072, intron 1 of 6) 95643 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 284.667-58 chr8 127127741 127128054 + 1.66667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -45676 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 345-21 chr9 34591795 34592255 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1885 NM_001207011 1271 Hs.129966 NM_001842 ENSG00000122756 CNTFR - ciliary neurotrophic factor receptor protein-coding 193-39 chr19 29166456 29166608 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46619 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 262-67 chr5 120695016 120695224 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 163656 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 203-24 chr12 40337597 40337776 + 1.66667 NA intron (NM_198578, intron 40 of 50) intron (NM_198578, intron 40 of 50) -55708 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 496 chr1 164832939 164833654 + 1.66667 NA intron (NM_001353131, intron 7 of 7) intron (NM_001353131, intron 7 of 7) -58655 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 202.333-165 chr7 111623336 111623554 + 1.66667 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -60928 NM_001350959 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 264.334-21 chr8 40844912 40845160 + 1.66667 NA intron (NM_024645, intron 1 of 6) intron (NM_024645, intron 1 of 6) 52790 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 323-11 chr15 93363487 93363855 + 1.66667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 157605 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 215.667-53 chr18 68956035 68956230 + 1.66667 NA intron (NM_001093729, intron 8 of 9) L1MA3|LINE|L1 158052 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 197.333-254 chrX 88358345 88358600 + 1.66667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -388753 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 346.334-5 chr17 35585844 35586178 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1311 NM_001282 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 265.667-38 chr2 124516278 124516557 + 1.66667 NA intron (NM_130773, intron 8 of 23) intron (NM_130773, intron 8 of 23) 491130 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 374.001-2 chr8 30105605 30105913 + 1.66667 NA exon (NM_015344, exon 4 of 4) exon (NM_015344, exon 4 of 4) 10351 NM_001128208 23484 Hs.146585 NM_015344 ENSG00000104660 LEPROTL1 HSPC112|Vps55|my047 leptin receptor overlapping transcript like 1 protein-coding 288.666-36 chr7 70336253 70336582 + 1.66667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 737942 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 311-29 chr5 101298124 101298444 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -395002 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 403.334 chr10 57185171 57185541 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 119203 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 208.334-4 chr6 53984677 53984864 + 1.66667 NA intron (NR_125842, intron 2 of 3) intron (NR_125842, intron 2 of 3) -14120 NR_046832 100874282 Hs.571169 NR_046832 ENSG00000236996 MLIP-IT1 - MLIP intronic transcript 1 ncRNA 169.667-138 chr3 130728863 130729050 + 1.66667 NA intron (NM_014602, intron 5 of 19) intron (NM_014602, intron 5 of 19) 17873 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 204.667-150 chr8 123066753 123066927 + 1.66667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -5867 NM_001145088 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 257-29 chr2 160491745 160491916 + 1.66667 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 1977 NM_016836 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 218.667-78 chr4 116769761 116769921 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 315735 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 175.333-209 chrX 11346864 11347144 + 1.66667 NA intron (NR_109776, intron 1 of 14) intron (NR_109776, intron 1 of 14) -28318 NR_049865 100847063 NR_049865 ENSG00000263652 MIR548AX - microRNA 548ax ncRNA 262.333-58 chr3 106815636 106815934 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 424853 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 252.333-14 chr12 30350848 30351046 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 326297 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 513.667-4 chr8 119765229 119765741 + 1.66667 NA intron (NM_003184, intron 18 of 25) intron (NM_003184, intron 18 of 25) 67356 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 255-5 chr1 106678675 106678832 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -139486 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 251-16 chr12 21603232 21603424 + 1.66667 NA intron (NM_021957, intron 1 of 15) intron (NM_021957, intron 1 of 15) 1519 NM_021957 2998 Hs.82614 NM_021957 ENSG00000111713 GYS2 - glycogen synthase 2 protein-coding 321.667-21 chr6 135646511 135646779 + 1.66667 NA intron (NR_152842, intron 3 of 5) L1MCa|LINE|L1 148844 NR_026805 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 207.333-105 chr15 96433749 96433905 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 100062 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 390.334 chr12 39024799 39025128 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -119372 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 364-25 chr7 30284196 30284711 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_147128) promoter-TSS (NM_147128) -144 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 225.333-114 chr6 3424965 3425109 + 1.66667 NA intron (NM_015482, intron 1 of 9) intron (NM_015482, intron 1 of 9) 19976 NM_021945 63027 Hs.713588 NM_015482 ENSG00000137266 SLC22A23 C6orf85 solute carrier family 22 member 23 protein-coding 253.667-78 chr8 114750595 114750783 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 917324 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 249.333-11 chr1 212047716 212048014 + 1.66667 NA intron (NM_001286229, intron 4 of 12) intron (NM_001286229, intron 4 of 12) 4186 NR_026911 100131205 Hs.126774 NR_026911 ENSG00000220749 RPL21P28 RPL21_8_160 ribosomal protein L21 pseudogene 28 pseudo 189.334-2 chr12 30698332 30698510 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -2552 NM_006390 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 214.667-21 chr11 18309422 18309639 + 1.66667 NA intron (NM_181507, intron 5 of 22) intron (NM_181507, intron 5 of 22) 12610 NM_007216 11234 Hs.437599 NM_007216 ENSG00000110756 HPS5 AIBP63|BLOC2S2 HPS5 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 2 protein-coding 424.667-9 chr6 97810444 97810767 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -213926 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 237.333-135 chrX 18323477 18323677 + 1.66667 NA intron (NR_033717, intron 5 of 15) intron (NR_033717, intron 5 of 15) 31111 NM_006089 10389 Hs.495774 NM_006089 ENSG00000102098 SCML2 - Scm polycomb group protein like 2 protein-coding 371.667-4 chr17 52836144 52836420 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -25839 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 379.334-3 chr15 60198435 60198714 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 194263 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 150.666-8 chr16 35489027 35489226 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8530 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 442-4 chr5 88603794 88604105 + 1.66667 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR 62990 NR_030741 407047 NR_030741 ENSG00000284447 MIR9-2 MIRN9-2|hsa-mir-9-2|miRNA9-2|mir-9-2 microRNA 9-2 ncRNA 301.334-6 chr19 51171384 51171631 + 1.66667 NA intron (NR_047529, intron 4 of 6) L1MB7|LINE|L1 4179 NR_047529 284367 Hs.132045 NR_002804 ENSG00000171101 SIGLEC17P HSPC078|SIGLECP2|SIGLECP3 sialic acid binding Ig like lectin 17, pseudogene pseudo 190.334-4 chr5 40481065 40481191 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -198787 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 265-61 chr8 13782776 13783043 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 153219 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 404.333-2 chr1 93246152 93246688 + 1.66667 NA intron (NM_001306076, intron 22 of 28) intron (NM_001306076, intron 22 of 28) 65704 NM_001306076 343099 Hs.482873 NM_206886 ENSG00000122483 CCDC18 NY-SAR-41 coiled-coil domain containing 18 protein-coding 232.333-69 chr5 81045348 81045581 + 1.66667 NA intron (NM_006909, intron 2 of 26) intron (NM_006909, intron 2 of 26) -84557 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 301.334-12 chr6 45201018 45201487 + 1.66667 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) -3482 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 377.333-14 chr3 121924958 121925365 + 1.66667 NA intron (NM_021082, intron 13 of 21) intron (NM_021082, intron 13 of 21) 30760 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 324.334-6 chr15 61084239 61084596 + 1.66667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 144885 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 255-91 chrX 47694995 47695291 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -12048 NR_033924 392459 Hs.562045 NR_033924 ENSG00000187893 CXXC1P1 CXorf25|NCRNA00236 CXXC finger protein 1 pseudogene 1 pseudo 374.667-11 chr4 117235893 117236184 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 124601 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 266-50 chr20 55441839 55442014 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -14729 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 304.334-3 chr13 108961592 108961848 + 1.66667 NA intron (NM_015011, intron 18 of 34) intron (NM_015011, intron 18 of 34) 205583 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 263-62 chr7 4406728 4406913 + 1.66667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -271983 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 217-10 chr10 53691620 53691816 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -794512 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 334-21 chr2 9940450 9940707 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11115 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 349-9 chr17 55852146 55852573 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 101254 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 329.667 chr1 25814690 25814964 + 1.66667 NA intron (NM_020451, intron 12 of 12) intron (NM_020451, intron 12 of 12) -5079 NM_001099627 56181 Hs.149305 NM_019557 ENSG00000117640 MTFR1L FAM54B|HYST1888|MST116|MSTP116 mitochondrial fission regulator 1 like protein-coding 249.667-106 chr9 30665263 30665507 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -256931 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 247.334-25 chrX 118310558 118310718 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -35435 NM_001184966 54521 Hs.98510 NM_019045 ENSG00000131725 WDR44 RAB11BP|RPH11|SYM-4 WD repeat domain 44 protein-coding 192.667-34 chr10 107497663 107497812 + 1.66667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -333031 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 288-23 chr17 7698947 7699228 + 1.66667 NA intron (NM_001143991, intron 4 of 10) L1ME3C|LINE|L1 -6115 NM_001406 1949 Hs.26988 NM_001406 ENSG00000108947 EFNB3 EFL6|EPLG8|LERK8 ephrin B3 protein-coding 382-13 chr8 86415735 86416293 + 1.66667 NA intron (NM_007013, intron 9 of 24) intron (NM_007013, intron 9 of 24) 73467 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 220-85 chr5 23566447 23566613 + 1.66667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 58875 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 418.333-6 chr2 212514911 212515240 + 1.66667 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 23553 NM_001042599 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 300.334-11 chr5 57724178 57724413 + 1.66667 NA Intergenic MLT1N2-int|LTR|ERVL-MaLR 73635 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 268.667-3 chr1 212821173 212821337 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 26394 NM_001024601 149643 Hs.153274 NM_001024601 ENSG00000185523 SPATA45 C1orf227 spermatogenesis associated 45 protein-coding 507.334-4 chr22 25877114 25877621 + 1.66667 NA intron (NM_001318245, intron 24 of 43) L1MA7|LINE|L1 135179 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 574.999 chr2 130887638 130888347 + 1.66667 NA intron (NM_001367493, intron 1 of 13) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 51078 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 203-74 chr4 116942696 116942896 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 142780 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 272-28 chr21 28203676 28203922 + 1.66667 NA intron (NR_126012, intron 3 of 5) L1MA1|LINE|L1 24868 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 287-28 chr5 165906825 165907105 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 1019405 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 262.334-14 chrX 102542939 102543127 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6932 NR_002216 55999 Hs.454283 NR_002216 ENSG00000196970 NXF4 - nuclear RNA export factor 4 pseudogene pseudo 300.666-19 chr7 54932367 54932673 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -86497 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 194.333-115 chr5 29285525 29285887 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 110270 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 420.667-2 chr1 50522164 50522554 + 1.66667 NA intron (NM_007051, intron 15 of 18) MIRb|SINE|MIR -98916 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 221.667-84 chr8 120854626 120854777 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -42655 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 153.667-356 chr7 36925112 36925238 + 1.66667 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) intron (NM_001206480, intron 16 of 21) -5743 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 317.666-10 chr20 34982665 34983043 + 1.66667 NA intron (NM_020884, intron 10 of 44) intron (NM_020884, intron 10 of 44) -7522 NR_030223 574501 NR_030223 ENSG00000207635 MIR499A MIR499|MIRN499|hsa-mir-499a|mir-499a microRNA 499a ncRNA 265.334-15 chr22 24322196 24322427 + 1.66667 NA exon (NM_001254732, exon 4 of 15) exon (NM_001254732, exon 4 of 15) -19797 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 225.667-34 chr18 5379439 5379672 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -82502 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 248-45 chr20 47917594 47917757 + 1.66667 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -65551 NR_109942 101060004 Hs.129970 NR_109942 LINC01523 - long intergenic non-protein coding RNA 1523 ncRNA 314-33 chr4 74062478 74062790 + 1.66667 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR -7235 NR_026769 10895 Hs.3134 NM_006692 ENSG00000248848 PPBPP2 PPBPL2|SPBPBP pro-platelet basic protein pseudogene 2 pseudo 306.666-36 chr8 51566332 51566694 + 1.66667 NA intron (NM_144651, intron 3 of 22) L1MCa|LINE|L1 242932 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 242.333-10 chr10 28450051 28450256 + 1.66667 NA intron (NR_134496, intron 1 of 2) intron (NR_134496, intron 1 of 2) 45660 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 256-60 chr3 56613334 56613596 + 1.66667 NA intron (NR_148376, intron 10 of 17) L1MA4A|LINE|L1 50581 NM_015224 23272 Hs.116877 NM_015224 ENSG00000163946 TASOR C3orf63|FAM208A|RAP140|TASOR1|se89-1 transcription activation suppressor protein-coding 267-26 chr15 64678192 64678443 + 1.66667 NA exon (NM_015042, exon 5 of 9) exon (NM_015042, exon 5 of 9) 24964 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 279-34 chr7 42511111 42511394 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 195195 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 294-49 chr4 138404556 138404790 + 1.66667 NA intron (NR_051987, intron 2 of 2) intron (NR_051987, intron 2 of 2) 94962 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 251.333-114 chr9 32245920 32246197 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -138545 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 207.667-2 chr1 81674571 81674731 + 1.66667 NA intron (NM_001366008, intron 3 of 26) intron (NM_001366008, intron 3 of 26) -25119 NM_001297704 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 228.667-79 chr8 88748820 88748976 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -421415 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 254.334-15 chr17 54960467 54960712 + 1.66667 NA TTS (NM_004375) TTS (NM_004375) 8065 NR_135677 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 295-5 chr10 89369622 89369925 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -8283 NM_001010987 439996 Hs.500491 NM_001010987 ENSG00000204010 IFIT1B IFIT1L|bA149I23.6 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1B protein-coding 236.333-10 chr1 167538210 167538459 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 15428 NM_003851 8804 Hs.5710 NM_003851 ENSG00000143162 CREG1 CREG cellular repressor of E1A stimulated genes 1 protein-coding 319.667-23 chr4 31919014 31919294 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -78225 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 215-77 chr7 113897769 113897975 + 1.66667 NA intron (NM_002711, intron 1 of 3) intron (NM_002711, intron 1 of 3) 21137 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 305.666-5 chr11 227434 227762 + 1.66667 NA intron (NR_163397, intron 4 of 7) intron (NR_163397, intron 4 of 7) 8744 NR_163398 23410 Hs.716456 NM_012239 ENSG00000142082 SIRT3 SIR2L3 sirtuin 3 protein-coding 240.334-10 chr4 56483108 56483317 + 1.66667 NA exon (NM_006947, exon 9 of 19) exon (NM_006947, exon 9 of 19) 15595 NM_001267722 6731 Hs.237825 NM_006947 ENSG00000174780 SRP72 BMFF|BMFS1|HEL103 signal recognition particle 72 protein-coding 271.667-19 chr12 100706524 100706732 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -88148 NM_178826 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 327-22 chr4 15023596 15023908 + 1.66667 NA intron (NR_125911, intron 2 of 5) intron (NR_125911, intron 2 of 5) 21271 NM_182646 132864 Hs.656937 NM_182485 ENSG00000137449 CPEB2 CPE-BP2|CPEB-2|hCPEB-2 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2 protein-coding 245-4 chr1 183969230 183969463 + 1.66667 NA exon (NM_001303420, exon 5 of 12) exon (NM_001303420, exon 5 of 12) 68382 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 305-33 chr8 117099538 117099754 + 1.66667 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -35349 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 352.667-19 chr3 182336748 182337093 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 149442 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 316.334-9 chr5 115810422 115810887 + 1.66667 NA intron (NR_136619, intron 3 of 5) intron (NR_136619, intron 3 of 5) 6003 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 510.334-2 chr17 78514177 78514522 + 1.66667 NA intron (NM_173628, intron 26 of 80) AluSx4|SINE|Alu 29439 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 248.667-15 chr10 89732943 89733185 + 1.66667 NA intron (NM_016195, intron 19 of 32) intron (NM_016195, intron 19 of 32) 31474 NM_001284259 9585 Hs.240 NM_016195 ENSG00000138182 KIF20B CT90|KRMP1|MPHOSPH1|MPP-1|MPP1 kinesin family member 20B protein-coding 256.333-35 chr19 9606764 9607057 + 1.66667 NA TTS (NM_152289) TTS (NM_152289) 14322 NM_001330365 93134 Hs.720081 NM_152289 ENSG00000171469 ZNF561 - zinc finger protein 561 protein-coding 253-2 chr1 45255036 45255235 + 1.66667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -48530 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 283.334-9 chr5 51373553 51373746 + 1.66667 NA non-coding (NR_046243, exon 2 of 2) non-coding (NR_046243, exon 2 of 2) 9683 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 149.334-4 chr8 116347607 116347696 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22592 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 186.667-103 chr4 54877277 54877471 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 219446 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 318-30 chr2 191551165 191551529 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -126725 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 274.666-5 chr11 27818899 27819161 + 1.66667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -97000 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 245.667-55 chr5 52348240 52348440 + 1.66667 NA Intergenic UCON1|Unknown|Unknown 340309 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 300.667-11 chr14 74246220 74246463 + 1.66667 NA intron (NM_182894, intron 3 of 4) intron (NM_182894, intron 3 of 4) 6892 NM_182894 338917 Hs.449771 NM_182894 ENSG00000119614 VSX2 CHX10|HOX10|MCOP2|MCOPCB3|RET1 visual system homeobox 2 protein-coding 203.334 chr1 33806757 33806949 + 1.66667 NA intron (NM_052896, intron 10 of 69) L1ME3E|LINE|L1 -53622 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 249-27 chr14 79889157 79889402 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -322140 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 459-4 chr12 45772252 45772558 + 1.66667 NA intron (NM_152641, intron 3 of 20) FLAM_A|SINE|Alu 42696 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 274.333-60 chr7 3138628 3138936 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 19791 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 328.667-4 chr12 72562145 72562535 + 1.66667 NA intron (NM_013381, intron 8 of 18) (TTTTACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -288831 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 461.666-2 chr2 55003488 55004086 + 1.66667 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) MER2|DNA|TcMar-Tigger 6485 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 333.667-18 chr7 48518246 48518643 + 1.66667 NA intron (NM_152701, intron 52 of 61) intron (NM_152701, intron 52 of 61) 346986 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 123.333-46 chr11 40773414 40773571 + 1.66667 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) L1MA3|LINE|L1 -480362 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 161.667-113 chr18 55028962 55029153 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -69596 NM_025214 80323 Hs.120790 NM_025214 ENSG00000166510 CCDC68 SE57-1 coiled-coil domain containing 68 protein-coding 262-39 chr2 34856884 34857186 + 1.66667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 179478 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 291.667-29 chr5 74144857 74145054 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 163370 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 275.333-25 chr16 58174407 58174689 + 1.66667 NA intron (NM_001896, intron 4 of 11) intron (NM_001896, intron 4 of 11) 23558 NM_001896 1459 Hs.82201 NM_001896 ENSG00000070770 CSNK2A2 CK2A2|CK2alpha'|CSNK2A1 casein kinase 2 alpha 2 protein-coding 221-59 chr5 92885487 92885716 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 685742 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 353.667-13 chr3 105002448 105002863 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -364058 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 330.667-25 chr7 40868072 40868372 + 1.66667 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 111717 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 432.333-12 chrX 80740489 80740905 + 1.66667 NA intron (NM_153252, intron 8 of 40) AluJb|SINE|Alu 69180 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 248.667-51 chr2 11211154 11211391 + 1.66667 NA intron (NM_001321643, intron 18 of 32) intron (NM_001321643, intron 18 of 32) 55805 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 264.667-42 chr2 133038837 133039003 + 1.66667 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 123363 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 247.667-13 chr10 63351147 63351403 + 1.66667 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) AluSx1|SINE|Alu 21773 NR_031566 100302150 NR_031566 ENSG00000221063 MIR1296 MIRN1296|hsa-mir-1296|mir-1296 microRNA 1296 ncRNA 222-46 chr2 73407414 73407652 + 1.66667 NA intron (NM_015120, intron 1 of 22) L1MA9|LINE|L1 21775 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 365.999-3 chr5 4173184 4173582 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 577551 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 404.334-2 chr3 162720928 162721398 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 582138 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 276.333-10 chr12 2365464 2365646 + 1.66667 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 L3|LINE|CR1 95779 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 275.667-60 chr8 33236949 33237231 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 236056 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 340.334-9 chr3 80794141 80794531 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 23632 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 300.334-13 chr7 33301646 33301952 + 1.66667 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) L1MA3|LINE|L1 172235 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 204-180 chr6 155259906 155260112 + 1.66667 NA intron (NM_016020, intron 6 of 6) intron (NM_016020, intron 6 of 6) -4004 NM_001001346 49861 Hs.567491 NM_001001346 ENSG00000171217 CLDN20 - claudin 20 protein-coding 206.667-54 chr18 52436321 52436520 + 1.66667 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 96223 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 214.334-2 chr15 39573703 39573869 + 1.66667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -7293 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 256-5 chr1 119945882 119946104 + 1.66667 NA intron (NM_001200001, intron 17 of 21) L1MEc|LINE|L1 -49478 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 157.667-260 chr5 116294604 116294774 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 38946 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 244-94 chr7 89281469 89281671 + 1.66667 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) intron (NM_181646, intron 2 of 3) -485833 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 120-62 chr2 32847959 32848036 + 1.66667 NA intron (NR_027098, intron 2 of 5) intron (NR_027098, intron 2 of 5) 22564 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 248.667-36 chr14 53890937 53891216 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 57408 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 263.333-25 chr15 37457557 37457802 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -356368 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 205.667-76 chr2 135622552 135622764 + 1.66667 NA exon (NM_015361, exon 7 of 26) exon (NM_015361, exon 7 of 26) 36306 NM_001282800 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 293.667-24 chr2 37888279 37888614 + 1.66667 NA Intergenic MLT2E|LTR|ERVL -12583 NR_110012 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 260.334-12 chr2 63167443 63167687 + 1.66667 NA intron (NR_148704, intron 16 of 18) L1MC4|LINE|L1 -48023 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 239-61 chr7 81681950 81682160 + 1.66667 NA intron (NR_126025, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 9351 NR_126025 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 247-79 chr9 94063867 94064070 + 1.66667 NA intron (NM_177995, intron 1 of 9) intron (NM_177995, intron 1 of 9) -20461 NM_152422 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 265.667-71 chr8 21148673 21148902 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -149452 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 255.667-22 chr14 67544331 67544561 + 1.66667 NA intron (NM_020715, intron 2 of 28) L1ME3Cz|LINE|L1 -10596 NM_001348546 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 328-10 chr13 47602442 47602800 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 330001 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 370.667-15 chr2 76823089 76823475 + 1.66667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -162683 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 397 chr1 158027713 158028242 + 1.66667 NA intron (NR_145471, intron 1 of 1) intron (NR_145471, intron 1 of 1) 2427 NR_145471 100505785 Hs.664656 NR_145471 KIRREL1-IT1 KIRREL-IT1 KIRREL1 intronic transcript 1 ncRNA 145.333-18 chr1 193849713 193849881 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 545052 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 172-62 chr2 233278011 233278166 + 1.66667 NA intron (NM_030803, intron 10 of 17).2 intron (NM_030803, intron 10 of 17).2 2362 NR_003008 677775 Hs.663619 NR_003008 ENSG00000252010 SCARNA5 U87 small Cajal body-specific RNA 5 ncRNA 414.667-17 chr9 84460841 84461122 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -92254 NM_022127 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 273.001-4 chr8 2885271 2885453 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -156911 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 256-44 chr2 120086397 120086580 + 1.66667 NA intron (NM_001330307, intron 10 of 16) AluJo|SINE|Alu 73411 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 337 chr1 37320600 37321076 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 153605 NR_038842 728431 Hs.380738 NR_038842 ENSG00000233621 LINC01137 - long intergenic non-protein coding RNA 1137 ncRNA 393.001-2 chr6 150112707 150113009 + 1.66667 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -30186 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 239.333-87 chr5 91047744 91047976 + 1.66667 NA intron (NR_003149, intron 85 of 89) LTR78|LTR|ERV1 266542 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 229.667-26 chr14 46905276 46905484 + 1.66667 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) intron (NM_001113498, intron 10 of 16) -253599 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 214.667-33 chr12 29802814 29802975 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -18135 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 306-2 chr1 156349996 156350331 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 11261 NM_001304820 128229 Hs.534539 NM_144627 ENSG00000163467 TSACC C1orf182|SIP|SSTK-IP TSSK6 activating cochaperone protein-coding 217.333-123 chr5 147424912 147425077 + 1.66667 NA intron (NM_001197294, intron 1 of 13) intron (NM_001197294, intron 1 of 13) 28698 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 249-72 chr9 2558209 2558442 + 1.66667 NA intron (NR_015375, intron 1 of 3) L1MC1|LINE|L1 -63462 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 267.334-16 chr3 109611708 109611909 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8980 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 255-11 chr10 53932025 53932236 + 1.66667 NA intron (NM_001354411, intron 26 of 34) intron (NM_001354411, intron 26 of 34) -554100 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 242.334-4 chr13 88772468 88772652 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 145707 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 686.667 chr2 186550878 186551623 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -38806 NM_002210 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 238-42 chr2 18703841 18703990 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -114335 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 299.666-19 chr6 50652185 50652598 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -61153 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 344.001-2 chr11 57110154 57110447 + 1.66667 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -71653 NM_001005210 219527 Hs.199853 NM_001005210 ENSG00000183908 LRRC55 - leucine rich repeat containing 55 protein-coding 233.333-108 chr5 93459271 93459517 + 1.66667 NA intron (NR_021491, intron 4 of 5) L1MEc|LINE|L1 111949 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 246.334-8 chr2 57994507 57994670 + 1.66667 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) intron (NM_001288838, intron 1 of 15) -52054 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 409.667-6 chr3 196788221 196788556 + 1.66667 NA intron (NM_002577, intron 2 of 14) intron (NM_002577, intron 2 of 14) 48531 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 356.001 chr14 50851498 50851809 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -20400 NM_001206673 145447 Hs.271896 NM_181533 ENSG00000131969 ABHD12B BEM46L3|C14orf29|c14_5314 abhydrolase domain containing 12B protein-coding 316-16 chr15 37233538 37233900 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -132408 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 589.334 chr14 84069779 84070158 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1201964 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 462-17 chr6 61634559 61635197 + 1.66667 NA intron (NR_146874, intron 13 of 13) L2c|LINE|L2 60748 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 289 chr1 13905442 13905734 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 156173 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 607.334 chr2 237972615 237973018 + 1.66667 NA intron (NM_001278305, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 4023 NM_001278305 140739 Hs.471785 NM_080678 ENSG00000184182 UBE2F NCE2 ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) protein-coding 281.333-20 chr15 38748125 38748457 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 51693 NR_160786 218.667-60 chr20 59381931 59382181 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 81445 NM_207033 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 272.667-4 chr1 213883835 213884147 + 1.66667 NA intron (NR_037850, intron 4 of 5) intron (NR_037850, intron 4 of 5) -40758 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 236-89 chr8 118564596 118564788 + 1.66667 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -56309 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 445-4 chr14 87727921 87728366 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -72849 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 256-15 chr11 29042214 29042405 + 1.66667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -552104 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 234.667-94 chr5 108627479 108627662 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 100691 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 389.667-6 chrX 86838425 86838980 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 575734 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 236.666-25 chr19 28101789 28102022 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -307965 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 252.667-54 chr2 228494791 228494961 + 1.66667 NA intron (NR_151716, intron 2 of 3) L1MEf|LINE|L1 116519 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 362-22 chr5 62785892 62786204 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 207229 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 264.333-29 chr17 41164231 41164492 + 1.66667 NA intron (NM_001277332, intron 1 of 5) L1MA9|LINE|L1 3382 NM_001277332 100505724 NM_001277332 ENSG00000180386 KRTAP9-7 KAP9.7|KRTAP9L1 keratin associated protein 9-7 protein-coding 252-23 chr12 71649137 71649288 + 1.66667 NA intron (NM_144982, intron 2 of 34) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 14636 NM_144982 196441 Hs.245798 NM_144982 ENSG00000133858 ZFC3H1 CCDC131|CSRC2|PSRC2 zinc finger C3H1-type containing protein-coding 265.667-68 chr7 79562104 79562272 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 108228 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 218-18 chr11 93170033 93170204 + 1.66667 NA intron (NM_152313, intron 6 of 10) intron (NM_152313, intron 6 of 10) 27308 NM_001286139 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 369.667-2 chr11 116781075 116781539 + 1.66667 NA intron (NM_003904, intron 12 of 13) HAL1|LINE|L1 6716 NM_003904 8882 Hs.7165 NM_003904 ENSG00000109917 ZPR1 ZNF259 ZPR1 zinc finger protein-coding 263-45 chr4 13954345 13954515 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -157538 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 227.667-42 chr21 27394706 27394931 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -327561 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 290.667-22 chr2 38124936 38125254 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6010 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 245.667-47 chr3 180823518 180823670 + 1.66667 NA intron (NR_109986, intron 2 of 13) L1MC5|LINE|L1 46584 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 248-26 chr15 74051573 74051778 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 30875 NM_001038640 342096 Hs.546408 NM_001038640 ENSG00000159289 GOLGA6A GLP|GOLGA6 golgin A6 family member A protein-coding 334.333-5 chr10 100993380 100993704 + 1.66667 NA non-coding (NR_160738, exon 5 of 5) non-coding (NR_160738, exon 5 of 5) -3529 NM_032429 84445 Hs.523221 NM_032429 ENSG00000107816 LZTS2 LAPSER1 leucine zipper tumor suppressor 2 protein-coding 199-64 chr21 30762949 30763191 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7642 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 314.666-21 chr2 219841343 219841767 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 63334 NR_146975 105373889 Hs.570066 NR_146975 ENSG00000228909 LINC01803 - long intergenic non-protein coding RNA 1803 ncRNA 227.333-128 chr8 118193553 118193813 + 1.66667 NA non-coding (NR_109794, exon 5 of 5) non-coding (NR_109794, exon 5 of 5) -81864 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 241.334-7 chr2 145926037 145926197 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -660940 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 252.334-9 chr18 23795476 23795636 + 1.66667 NA intron (NM_001127717, intron 12 of 73) intron (NM_001127717, intron 12 of 73) -77464 NM_001127718 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 316.333-9 chr14 20423715 20424070 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10391 NM_007110 7011 Hs.508835 NM_007110 ENSG00000129566 TEP1 TLP1|TP1|TROVE1|VAULT2|p240 telomerase associated protein 1 protein-coding 195.334-3 chr4 43954727 43954921 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -62037 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 242.334-2 chr11 15850155 15850301 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 119393 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 287.334-12 chr4 72461676 72461869 + 1.66667 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 107449 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 227.334-3 chr11 6138521 6138758 + 1.66667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 30955 NM_001005181 196335 Hs.632154 NM_001005181 ENSG00000180919 OR56B4 OR11-67 olfactory receptor family 56 subfamily B member 4 protein-coding 338.667-23 chr3 187228172 187228523 + 1.66667 NA intron (NM_001879, intron 11 of 15) intron (NM_001879, intron 11 of 15) -20718 NR_110052 101929106 Hs.640145 NR_110052 ENSG00000198491 LOC101929106 - uncharacterized LOC101929106 ncRNA 249-12 chr10 71415134 71415304 + 1.66667 NA intron (NM_052836, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu 18285 NM_001171932 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 263.667-28 chr15 55829837 55830130 + 1.66667 NA exon (NM_001284338, exon 25 of 25) exon (NM_001284338, exon 25 of 25) -86831 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 280.334-12 chr6 100525649 100525851 + 1.66667 NA intron (NM_006828, intron 37 of 41) L1MC3|LINE|L1 -62075 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 386.667 chr1 180024684 180025310 + 1.66667 NA intron (NM_014810, intron 14 of 37) AluY|SINE|Alu 70187 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 412.667-3 chr11 30348053 30348354 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 25099 NM_152316 120534 Hs.502208 NM_152316 ENSG00000152219 ARL14EP ARF7EP|C11orf46|dJ299F11.1 ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein protein-coding 427.667 chr1 39478328 39478882 + 1.66667 NA intron (NM_012090, intron 90 of 92) intron (NM_012090, intron 90 of 92) -13031 NM_181809 353500 Hs.472497 NM_181809 ENSG00000183682 BMP8A - bone morphogenetic protein 8a protein-coding 275.001 chr10 30084294 30084468 + 1.66667 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) MLT2B4|LTR|ERVL -24795 NM_001350001 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 444.333-3 chr14 68315251 68315719 + 1.66667 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 313302 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 296.334-5 chr12 61379232 61379504 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 813471 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 259.667-44 chr3 60849554 60849713 + 1.66667 NA intron (NM_001320900, intron 4 of 9) MIRb|SINE|MIR -231763 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 285.334-6 chr15 59387784 59388067 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -15054 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 258.667-13 chr10 86437373 86437579 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_015045, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_015045, exon 19 of 19) -70681 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 220.333-140 chrX 141336392 141336544 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -93951 NM_022661 64663 Hs.375036 NM_022661 ENSG00000198573 SPANXC CT11.3|CTp11|SPANX-C|SPANX-E|SPANXE SPANX family member C protein-coding 316.667-32 chr8 117258911 117259175 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 124048 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 253.334-7 chr17 69543889 69544147 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_002758, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_002758, exon 12 of 12) 41756 NM_001330450 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 211.334-2 chr1 203880145 203880298 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 18374 NM_001328637 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 413.334-9 chrX 58161767 58162173 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -251337 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 244.667-82 chr6 34877895 34878096 + 1.66667 NA TTS (NM_017754) TTS (NM_017754) 10047 NM_005643 6882 Hs.112444 NM_005643 ENSG00000064995 TAF11 MGC:15243|PRO2134|TAF2I|TAFII28 TATA-box binding protein associated factor 11 protein-coding 204.334-2 chr12 105003670 105003874 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_152318, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_152318, exon 4 of 4) 17456 NM_152318 121053 Hs.295563 NM_152318 ENSG00000151131 C12orf45 - chromosome 12 open reading frame 45 protein-coding 268-10 chr10 98159350 98159640 + 1.66667 NA intron (NM_001351010, intron 4 of 11) L1MC4a|LINE|L1 24838 NM_014472 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 341.667-12 chr2 61006814 61007117 + 1.66667 NA intron (NM_144709, intron 3 of 17) intron (NM_144709, intron 3 of 17) 10247 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 188.667-47 chr14 83443412 83443598 + 1.66667 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 800873 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 255.667-81 chr8 27772426 27772590 + 1.66667 NA intron (NR_156432, intron 1 of 7) CpG 132 NM_018246 55246 Hs.445512 NM_018246 ENSG00000147419 CCDC25 - coiled-coil domain containing 25 protein-coding 276.667-37 chr2 69378884 69379077 + 1.66667 NA intron (NM_002056, intron 1 of 18) AluJo|SINE|Alu 8247 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 345.001-2 chr7 9789174 9789473 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 155053 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 255.667-46 chr2 118110146 118110333 + 1.66667 NA TTS (NM_001321333) TTS (NM_001321333) 21689 NM_001321332 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 401-8 chr2 99412470 99412833 + 1.66667 NA intron (NR_135652, intron 13 of 21) intron (NR_135652, intron 13 of 21) 75262 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 279.667-5 chr10 98161701 98161918 + 1.66667 NA intron (NM_001351010, intron 4 of 11) L1MC4a|LINE|L1 27152 NM_014472 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 445.333-6 chr4 53992564 53992872 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -5436 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 295.001-2 chr8 122266131 122266347 + 1.66667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 302405 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 245-51 chr4 45930815 45930993 + 1.66667 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 193150 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 260.667-83 chr7 80011350 80011545 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -123384 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 347-17 chr2 69104282 69104751 + 1.66667 NA TTS (NR_036073) TTS (NR_036073) 834 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 580.001 chr14 88399254 88399823 + 1.66667 NA intron (NM_001040428, intron 3 of 10) MIR3|SINE|MIR 13881 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 247.667-62 chr3 103962140 103962304 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -438106 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 351.667-5 chr13 68219856 68220151 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 665322 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 237.667-60 chr4 53080681 53080938 + 1.66667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 218492 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 210.667-55 chr16 81751369 81751561 + 1.66667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -27826 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 195.667-87 chr3 58255071 58255297 + 1.66667 NA intron (NM_001320126, intron 2 of 9) intron (NM_001320126, intron 2 of 9) 17392 NM_001320126 57406 Hs.476454 NM_020676 ENSG00000163686 ABHD6 - abhydrolase domain containing 6 protein-coding 116.334 chr11 84724632 84724718 + 1.66667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) MIR|SINE|MIR -3733 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 258.667-39 chr18 53734832 53735033 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -153873 NR_110800 101928167 Hs.382012 NR_110800 ENSG00000260433 LINC01917 - long intergenic non-protein coding RNA 1917 ncRNA 249.333-59 chr2 166793650 166793938 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -94693 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 230-28 chr16 72643262 72643418 + 1.66667 NA intron (NR_159372, intron 1 of 7) intron (NR_159372, intron 1 of 7) 21630 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 344.001-4 chr4 32166245 32166596 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -143998 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 263.334 chr1 106495689 106495919 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -322435 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 251.667-46 chr2 156021978 156022158 + 1.66667 NA intron (NR_110250, intron 3 of 3) MER104|DNA|TcMar-Tc2 232863 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 230-59 chr6 56456486 56456695 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -62462 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 237-65 chr6 68191899 68192100 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 136648 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 305.667-19 chr2 216569708 216570012 + 1.66667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 37078 NR_110392 101928232 Hs.694592 NR_110392 LINC01280 - long intergenic non-protein coding RNA 1280 ncRNA 405.666-2 chr2 122203719 122204227 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 448322 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 344.667-18 chr6 56730337 56730767 + 1.66667 NA intron (NM_001144770, intron 3 of 94) intron (NM_001144770, intron 3 of 94) -87663 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 218-77 chr4 34173150 34173350 + 1.66667 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) L1PA15|LINE|L1 96497 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 206-61 chr17 79157434 79157619 + 1.66667 NA intron (NM_001350453, intron 3 of 13) intron (NM_001350453, intron 3 of 13) 82589 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 228.666-43 chr7 21806179 21806340 + 1.66667 NA intron (NM_001277115, intron 62 of 81) intron (NM_001277115, intron 62 of 81) 139640 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 224.667-50 chr20 21364376 21364605 + 1.66667 NA intron (NM_001317960, intron 24 of 29) intron (NM_001317960, intron 24 of 29) 33036 NM_033176 644524 NM_033176 ENSG00000125816 NKX2-4 NKX2.4|NKX2D NK2 homeobox 4 protein-coding 355.334-2 chr1 199608673 199609069 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -418839 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 186.334-2 chr5 82887142 82887265 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -27367 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 397.667-8 chr20 32758894 32759212 + 1.66667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -3332 NM_001207055 1789 Hs.643024 NM_006892 ENSG00000088305 DNMT3B ICF|ICF1|M.HsaIIIB DNA methyltransferase 3 beta protein-coding 267.667-58 chr5 154232554 154232836 + 1.66667 NA intron (NM_198321, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 41962 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 517.334-4 chr4 72114577 72114979 + 1.66667 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) intron (NM_001144756, intron 2 of 4) 75646 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 440-12 chr8 83432969 83433368 + 1.66667 NA Intergenic Helitron1Nb_Mam|RC|Helitron 29410 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 272.333-62 chr7 53602458 53602743 + 1.66667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 209331 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 226.333-80 chr3 98855566 98855823 + 1.66667 NA intron (NM_080927, intron 2 of 15) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 46001 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 252-59 chr20 42326001 42326280 + 1.66667 NA intron (NM_133170, intron 11 of 31) intron (NM_133170, intron 11 of 31) -359343 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 305.667-34 chr6 50764414 50764765 + 1.66667 NA intron (NM_172238, intron 7 of 7) intron (NM_172238, intron 7 of 7) 51045 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 284.666-21 chr5 141401850 141402244 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_018921) promoter-TSS (NM_018921) -906 NM_032089 56107 Hs.368160 NM_018921 ENSG00000261934 PCDHGA9 PCDH-GAMMA-A9 protocadherin gamma subfamily A, 9 protein-coding 270.667-20 chr18 3442124 3442377 + 1.66667 NA intron (NM_001278686, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 -5292 NM_173207 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 303.334-10 chr5 178196677 178196994 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7698 NM_004499 3182 Hs.591731 NM_004499 ENSG00000197451 HNRNPAB ABBP1|HNRPAB heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B protein-coding 329.667-6 chr12 126594215 126594450 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 95986 NR_110036 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 306.667-2 chr1 110601971 110602290 + 1.66667 NA exon (NM_001204269, exon 4 of 5) exon (NM_001204269, exon 4 of 5) 4228 NM_004974 3737 Hs.248139 NM_004974 ENSG00000177301 KCNA2 EIEE32|HBK5|HK4|HUKIV|KV1.2|MK2|NGK1|RBK2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 protein-coding 425 chr1 186947152 186947557 + 1.66667 NA intron (NM_024420, intron 12 of 17) intron (NM_024420, intron 12 of 17) 118405 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 265-17 chr13 28975053 28975224 + 1.66667 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) intron (NM_001366651, intron 2 of 14) -49319 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 687.666 chr5 38246541 38247272 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11653 NM_152403 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 222.666-47 chr5 39321360 39321513 + 1.66667 NA intron (NM_001737, intron 5 of 10) L1M1|LINE|L1 43059 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 339.667-7 chr15 91510099 91510435 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 46928 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 369-4 chr13 114191742 114191991 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -42979 NM_003903 8881 Hs.374127 NM_003903 ENSG00000130177 CDC16 ANAPC6|APC6|CDC16Hs|CUT9 cell division cycle 16 protein-coding 386-13 chr7 18749969 18750449 + 1.66667 NA intron (NM_058176, intron 13 of 22) intron (NM_058176, intron 13 of 22) 240939 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 253-29 chr17 56361604 56361777 + 1.66667 NA intron (NM_001370326, intron 6 of 20) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 208215 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 393.667-10 chr5 129391619 129392053 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 5311 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 254.667-57 chr3 181571800 181571973 + 1.66667 NA intron (NR_075091, intron 4 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -38448 NR_004053 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 340.334-8 chr3 28256921 28257207 + 1.66667 NA intron (NM_001331189, intron 2 of 4) intron (NM_001331189, intron 2 of 4) 15445 NM_182523 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 340.334-2 chr11 80150501 80150837 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 612134 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 251-66 chr5 62076799 62077014 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -229256 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 201-18 chr10 85296800 85297050 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -97987 NR_120667 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 284-2 chr1 98603153 98603485 + 1.66667 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -58402 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 285-23 chr4 26285928 26286167 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -33663 NM_005349 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 294.667-10 chr12 40859961 40860154 + 1.66667 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) 32119 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 260-6 chr1 195229539 195229754 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 859069 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 193-79 chr6 2925036 2925194 + 1.66667 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -21806 NM_004155 5272 Hs.104879 NM_004155 ENSG00000170542 SERPINB9 CAP-3|CAP3|PI-9|PI9 serpin family B member 9 protein-coding 304.667-40 chr9 79991218 79991586 + 1.66667 NA intron (NR_121212, intron 3 of 4) intron (NR_121212, intron 3 of 4) 16379 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 301-54 chr7 50201701 50201908 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -102260 NM_001291839 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 245-70 chr8 23245247 23245458 + 1.66667 NA intron (NM_152272, intron 1 of 10) L1MC|LINE|L1 -1289 NM_001317899 91782 Hs.5019 NM_152272 ENSG00000147457 CHMP7 - charged multivesicular body protein 7 protein-coding 444.667-6 chr6 157300484 157301020 + 1.66667 NA intron (NM_018452, intron 3 of 3) intron (NM_018452, intron 3 of 3) 23507 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 346.333-19 chr2 112765774 112766141 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -1348 NM_001304361 150468 Hs.434250 NM_152515 ENSG00000169607 CKAP2L - cytoskeleton associated protein 2 like protein-coding 217-50 chr2 186832482 186832627 + 1.66667 NA intron (NM_182521, intron 7 of 8) intron (NM_182521, intron 7 of 8) 16616 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 272-4 chr11 31623842 31624066 + 1.66667 NA intron (NM_001288725, intron 5 of 10) L1MA8|LINE|L1 114187 NM_001288725 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 216.333-77 chr2 67697049 67697323 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 128376 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 236-63 chr4 56416279 56416445 + 1.66667 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) intron (NR_156493, intron 1 of 10) 19253 NR_156493 5471 Hs.331420 NM_002703 ENSG00000128059 PPAT ATASE|GPAT|PRAT phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase protein-coding 284.667-41 chr5 36335709 36335899 + 1.66667 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -33902 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 354.667-10 chr14 20630632 20630965 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 10893 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 395.667-7 chr3 198036449 198036703 + 1.66667 NA intron (NR_026786, intron 16 of 16) L3|LINE|CR1 2891 NR_046669 100873947 Hs.637166 NR_046669 ENSG00000232832 LMLN-AS1 - LMLN antisense RNA 1 ncRNA 245-13 chr12 38680454 38680615 + 1.66667 NA intron (NM_153634, intron 16 of 19) intron (NM_153634, intron 16 of 19) 225057 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 249.667-104 chr9 24821191 24821417 + 1.66667 NA Intergenic (ATAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -275407 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 172-43 chr14 83393368 83393514 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 750809 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 310.333-27 chr20 54979058 54979405 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -443812 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 429-6 chr2 46394442 46394850 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_146999) promoter-TSS (NR_146999) -479 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 282.334-11 chr20 12890224 12890467 + 1.66667 NA intron (NR_109868, intron 10 of 11) L1ME2z|LINE|L1 46618 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 745.332 chr1 172863695 172864401 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 186915 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 281.667-53 chr8 83963486 83963748 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -219170 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 240.333-8 chr10 23823411 23823570 + 1.66667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 128763 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 257-2 chr1 85078053 85078319 + 1.66667 NA intron (NM_001288563, intron 3 of 21) MIR|SINE|MIR 15859 NM_145172 126820 Hs.97933 NM_145172 ENSG00000162643 WDR63 DIC3|NYD-SP29 WD repeat domain 63 protein-coding 260-80 chr8 48677705 48677881 + 1.66667 NA intron (NR_105002, intron 2 of 3) intron (NR_105002, intron 2 of 3) 57390 NR_105004 101929217 Hs.547790 NR_105004 ENSG00000253455 LOC101929217 - uncharacterized LOC101929217 ncRNA 516.001 chr11 131870318 131870706 + 1.66667 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) intron (NM_001352006, intron 2 of 9) -39412 NM_001352009 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 239-12 chr10 119717861 119718072 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -8081 NM_001243195 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 219-20 chr13 107671194 107671362 + 1.66667 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 -140030 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 174-54 chr2 81198603 81198749 + 1.66667 NA Intergenic (TGTCTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 268270 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 324.667-3 chr10 32522065 32522324 + 1.66667 NA intron (NR_109826, intron 11 of 16) L1MA2|LINE|L1 76054 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 246.667-53 chr22 40313475 40313638 + 1.66667 NA intron (NM_015088, intron 17 of 20) intron (NM_015088, intron 17 of 20) -32944 NR_134256 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 411.667 chr10 15101770 15102160 + 1.66667 NA intron (NM_001265601, intron 1 of 1) intron (NM_001265601, intron 1 of 1) 4610 NM_006414 10557 Hs.94986 NM_006414 ENSG00000152464 RPP38 - ribonuclease P/MRP subunit p38 protein-coding 263.001 chr11 101315509 101315666 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -185774 NM_001271162 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 432.334-2 chr6 151979029 151979488 + 1.66667 NA intron (NM_001122741, intron 5 of 8) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 170151 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 252.333-25 chr17 61661484 61661776 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -70411 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 309-17 chr17 77541199 77541460 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5612 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 253.667-19 chr14 61085887 61086100 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -104303 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 138.667-37 chr11 110967148 110967283 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 130103 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 339.001 chr14 62616427 62616702 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 428894 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 455.667-8 chr2 37565229 37565577 + 1.66667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 106796 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 382.667-4 chr10 15152432 15152975 + 1.66667 NA intron (NM_001308295, intron 1 of 12) intron (NM_001308295, intron 1 of 12) 2644 NR_036506 100192204 Hs.714691 NR_036506 ENSG00000206448 PPIAP30 - peptidylprolyl isomerase A pseudogene 30 pseudo 298.666-17 chr6 67048589 67048962 + 1.66667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -1006576 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 328.334-2 chr13 100465967 100466316 + 1.66667 NA non-coding (NR_047686, exon 4 of 5) non-coding (NR_047686, exon 4 of 5) 14874 NR_047686 100885777 Hs.662554 NR_047686 PCCA-AS1 - PCCA antisense RNA 1 ncRNA 259-50 chr8 8737271 8737523 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 35460 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 251-73 chr6 5265712 5265929 + 1.66667 NA intron (NM_006567, intron 1 of 6) intron (NM_006567, intron 1 of 6) 4307 NM_006567 10667 Hs.484547 NM_006567 ENSG00000145982 FARS2 COXPD14|FARS1|HSPC320|PheRS|SPG77|mtPheRS phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 323.667-28 chr8 119822540 119822948 + 1.66667 NA intron (NM_003184, intron 2 of 25) intron (NM_003184, intron 2 of 25) 10097 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 480-3 chr13 39890542 39891063 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -226667 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 260.333-25 chr18 12741507 12741728 + 1.66667 NA intron (NR_110763, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 7805 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 336.333-35 chr7 151542043 151542409 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -22331 NM_005614 6009 Hs.283521 NM_005614 ENSG00000106615 RHEB RHEB2 Ras homolog, mTORC1 binding protein-coding 252.666-19 chr2 33075917 33076215 + 1.66667 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) intron (NM_206943, intron 3 of 33) -58531 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 187.667-147 chr8 144817279 144817432 + 1.66667 NA intron (NR_147501, intron 1 of 4) L2|LINE|L2 9685 NR_147501 100130027 Hs.639618 NR_147501 LOC100130027 - uncharacterized LOC100130027 ncRNA 501.333-7 chr6 15978750 15979118 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -150152 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 208-150 chr6 136753347 136753556 + 1.66667 NA intron (NM_005923, intron 1 of 29) intron (NM_005923, intron 1 of 29) -30596 NR_134635 101928429 Hs.672896 NR_134635 LOC101928429 - uncharacterized LOC101928429 ncRNA 369.333-4 chr11 113079401 113079789 + 1.66667 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -116135 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 362.666-16 chr9 134899743 134900282 + 1.66667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 17900 NM_002003 2219 Hs.440898 NM_002003 ENSG00000085265 FCN1 FCNM ficolin 1 protein-coding 659.333 chrX 101856852 101857525 + 1.66667 NA intron (NR_159739, intron 1 of 18) intron (NR_159739, intron 1 of 18) 389 NR_159736 55998 Hs.307077 NM_032946 ENSG00000126952 NXF5 - nuclear RNA export factor 5 protein-coding 333-19 chr3 17245626 17246017 + 1.66667 NA intron (NM_014744, intron 16 of 21) intron (NM_014744, intron 16 of 21) 312625 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 251.334-8 chr10 24624861 24625024 + 1.66667 NA intron (NM_001367452, intron 4 of 22) intron (NM_001367452, intron 4 of 22) -2099 NM_001367455 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 342-24 chr22 24929344 24929762 + 1.66667 NA Intergenic (TTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 17142 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 448.666-3 chr8 125252819 125253407 + 1.66667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 161253 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 456-6 chr8 83156088 83156540 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 244210 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 311.667-21 chr5 66437323 66437539 + 1.66667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 74173 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 394-14 chr5 24006367 24006801 + 1.66667 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 55236 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 251-49 chr4 33173138 33173388 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 822225 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 332.667-25 chr8 127639299 127639609 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 94513 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 331.666-19 chr6 34707370 34707891 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 10685 NR_134626 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 254.667-77 chr7 102861447 102861765 + 1.66667 NA intron (NR_105043, intron 17 of 20) intron (NR_105043, intron 17 of 20) -51394 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 376.667-15 chr8 128062304 128062649 + 1.66667 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) intron (NR_003367, intron 5 of 8) 13324 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 249-46 chr22 28429656 28429832 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -30125 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 261.333-32 chr15 38883847 38884134 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 187392 NR_160786 225.667-49 chr3 31239884 31240108 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -78209 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 194.666-38 chr2 229744170 229744425 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -29742 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 330.334-10 chr6 99617272 99617494 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 10609 NM_021620 59336 Hs.287386 NM_021620 ENSG00000112238 PRDM13 MU-MB-20.220|PFM10 PR/SET domain 13 protein-coding 255-81 chr7 79685189 79685498 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 231383 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 190.667-18 chr10 88214223 88214376 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 350674 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 224.667-78 chr7 134521259 134521441 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -6217 NM_020299 57016 Hs.116724 NM_020299 ENSG00000198074 AKR1B10 AKR1B11|AKR1B12|ALDRLn|ARL-1|ARL1|HIS|HSI aldo-keto reductase family 1 member B10 protein-coding 227.667-50 chr3 97714398 97714572 + 1.66667 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -50036 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 253-79 chrX 152623626 152623795 + 1.66667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -14185 NM_018558 55879 Hs.283081 NM_018558 ENSG00000268089 GABRQ THETA gamma-aminobutyric acid type A receptor theta subunit protein-coding 247-78 chr9 73574394 73574599 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 422631 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 217-73 chr5 37844181 37844375 + 1.66667 NA intron (NR_103441, intron 1 of 3) intron (NR_103441, intron 1 of 3) 3840 NR_103441 100861519 Hs.536820 NM_001278094 GDNF-AS1 GDNFOS GDNF antisense RNA 1 ncRNA 270.333-36 chr22 35299537 35299827 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_005488) promoter-TSS (NM_005488) -122 NM_001135730 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 243.667-58 chr4 137058291 137058529 + 1.66667 NA intron (NR_149105, intron 2 of 3) MER2|DNA|TcMar-Tigger -135346 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 305.667-6 chr11 95376453 95376657 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -144080 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 346.667-15 chr8 84543536 84543965 + 1.66667 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1MC5|LINE|L1 128266 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 167-82 chr5 36933055 36933204 + 1.66667 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) L1M4a2|LINE|L1 56360 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 287-37 chr8 116165196 116165474 + 1.66667 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 159724 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 342.667-16 chr9 30278845 30279142 + 1.66667 NA Intergenic LTR27E|LTR|ERV1 129461 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 314.666-7 chr1 190298589 190299011 + 1.66667 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) L1MDa|LINE|L1 177210 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 274.333-61 chr7 4964873 4965109 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5804 NM_001100600 221938 Hs.558694 NM_198403 ENSG00000136297 MMD2 PAQR10 monocyte to macrophage differentiation associated 2 protein-coding 348-7 chr11 104155309 104155628 + 1.66667 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 8679 NM_025208 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 299.666-5 chr13 19251907 19252259 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 70050 NR_126054 101928697 Hs.742697 NR_126054 LOC101928697 - uncharacterized LOC101928697 ncRNA 170-122 chr8 118431517 118431681 + 1.66667 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) L1ME2|LINE|L1 -189402 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 193.667-23 chr10 123542529 123542706 + 1.66667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -123738 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 229.333-24 chr12 30770634 30770846 + 1.66667 NA intron (NR_135046, intron 1 of 1) intron (NR_135046, intron 1 of 1) 15666 NR_135046 645485 Hs.232332 NR_135046 ENSG00000246331 LOC645485 - uncharacterized LOC645485 ncRNA 188.334-2 chr2 60303410 60303573 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 79545 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 212-97 chr21 14650516 14650775 + 1.66667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -7538 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 300.667-40 chr7 129046958 129047256 + 1.66667 NA intron (NR_034053, intron 1 of 23) intron (NR_034053, intron 1 of 23) 8066 NM_012470 23534 Hs.193613 NM_012470 ENSG00000064419 TNPO3 IPO12|LGMD1F|LGMDD2|MTR10A|TRN-SR|TRN-SR2|TRNSR transportin 3 protein-coding 257-10 chr12 39206075 39206350 + 1.66667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 236908 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 349.334-4 chr13 38263749 38264029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -85962 NR_104584 51569 Hs.643655 NM_016617 ENSG00000120686 UFM1 BM-002|C13orf20|HLD14 ubiquitin fold modifier 1 protein-coding 206-129 chr4 92976900 92977070 + 1.66667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) MIRc|SINE|MIR 672586 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 237-48 chr3 48176230 48176474 + 1.66667 NA intron (NM_201567, intron 7 of 13) intron (NM_201567, intron 7 of 13) 12065 NM_201567 993 Hs.437705 NM_001789 ENSG00000164045 CDC25A CDC25A2 cell division cycle 25A protein-coding 229.333-114 chr7 24512298 24512521 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -61043 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 258.667-75 chr5 65624008 65624222 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001365341) promoter-TSS (NM_001365341) 218 NM_033227 373 Hs.792 NM_001656 ENSG00000113595 TRIM23 ARD1|ARFD1|RNF46 tripartite motif containing 23 protein-coding 263.667-54 chr20 46415711 46415879 + 1.66667 NA intron (NR_146919, intron 1 of 3) intron (NR_146919, intron 1 of 3) -8744 NM_182764 63916 Hs.210469 NM_022086 ENSG00000062598 ELMO2 CED-12|CED12|Ced-12A|ELMO-2|VMPI engulfment and cell motility 2 protein-coding 218.333-58 chr2 16569780 16570012 + 1.66667 NA intron (NM_030797, intron 3 of 11) L2b|LINE|L2 95938 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 267.667-76 chrX 4660962 4661218 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -27518 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 283.334-12 chr6 99847826 99848029 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -146111 NR_038384 728012 Hs.434366 NR_038384 ENSG00000229315 MCHR2-AS1 - MCHR2 antisense RNA 1 ncRNA 260.667-58 chr22 27023232 27023401 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 37202 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 270.667-6 chr1 229150377 229150555 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 24335 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 242.334-13 chr4 138560856 138561012 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 251223 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 267.333-56 chr2 214901615 214901924 + 1.66667 NA intron (NR_110292, intron 2 of 3) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 54822 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 312-21 chr17 38860290 38860547 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6697 NM_000978 9349 Hs.406300 NM_000978 ENSG00000125691 RPL23 L23|rpL17 ribosomal protein L23 protein-coding 228.667-8 chr10 31414791 31415007 + 1.66667 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) -15144 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 372.667-7 chr2 39204102 39204570 + 1.66667 NA intron (NR_144520, intron 4 of 8) intron (NR_144520, intron 4 of 8) 25252 NM_001009565 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 411.667-3 chr12 88741384 88741933 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -161185 NM_003994 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 271.001 chr2 175471135 175471314 + 1.66667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -289514 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 262-77 chr8 88719632 88719793 + 1.66667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -392229 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 373-2 chr1 100344799 100345142 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001319211) promoter-TSS (NM_001319211) -45 NM_001319211 8556 Hs.127411 NM_003672 ENSG00000079335 CDC14A DFNB105|DFNB32|DFNB35|cdc14|hCDC14 cell division cycle 14A protein-coding 408-4 chr22 26850214 26850735 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -9737 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 267.667-53 chr5 88525358 88525552 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -86365 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 324.667-29 chr5 104796687 104796973 + 1.66667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -302644 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 267.667-12 chr12 133034497 133034711 + 1.66667 NA intron (NR_110091, intron 1 of 2) L1MA9|LINE|L1 2618 NR_110091 101928597 Hs.638942 NR_110091 ENSG00000246394 ZNF84-DT - ZNF84 divergent transcript ncRNA 251-42 chr21 32523936 32524222 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 61444 NM_144659 140290 Hs.728804 NM_018277 ENSG00000242220 TCP10L C21orf77|PRED77|TCP10A-1|TCP10A-2 t-complex 10 like protein-coding 424.667-10 chr8 91061302 91061756 + 1.66667 NA non-coding (NR_110438, exon 3 of 3) non-coding (NR_110438, exon 3 of 3) 8660 NR_110438 100506365 Hs.153412 NR_110438 ENSG00000253738 OTUD6B-AS1 GS1-251I9.4 OTUD6B antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 171.667-152 chr7 32396801 32396983 + 1.66667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L1MC4a|LINE|L1 31332 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 247.667-11 chr10 57463539 57463735 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -159078 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 214.666-80 chr9 131565008 131565205 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 19583 NM_001365666 642515 NM_001365666 ENSG00000283526 PRRT1B DSPD2|IFITMD8 proline rich transmembrane protein 1B protein-coding 297-25 chr16 13581460 13581656 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -338599 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 251.333-30 chr14 32223038 32223384 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19942 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 316.001 chr1 164708373 164708618 + 1.66667 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) L1PA17|LINE|L1 66146 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 261-8 chr10 9702896 9703067 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -355741 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 313.334-3 chr14 79043283 79043632 + 1.66667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -156525 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 243.666-21 chr2 163606630 163606868 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001321825, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001321825, exon 2 of 2) 129259 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 286-18 chr14 71696044 71696367 + 1.66667 NA intron (NM_001354286, intron 14 of 24) intron (NM_001354286, intron 14 of 24) 109907 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 169.333-19 chr10 23250026 23250229 + 1.66667 NA intron (NM_001365862, intron 12 of 15) intron (NM_001365862, intron 12 of 15) 57815 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 495.334 chr20 45643130 45643581 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -12071 NM_147198 259240 Hs.249828 NM_147198 ENSG00000180205 WFDC9 WAP9|dJ688G8.2 WAP four-disulfide core domain 9 protein-coding 247.333-31 chr16 68062285 68062555 + 1.66667 NA intron (NM_017803, intron 8 of 16) MIRc|SINE|MIR -22950 NM_173165 4775 Hs.436585 NM_004555 ENSG00000072736 NFATC3 NF-AT4c|NFAT4|NFATX nuclear factor of activated T cells 3 protein-coding 134.667-69 chr15 56182671 56182830 + 1.66667 NA intron (NM_001370561, intron 4 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 7182 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 298.666-10 chr2 111111241 111111564 + 1.66667 NA intron (NR_122074, intron 2 of 3) intron (NR_122074, intron 2 of 3) 4186 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 241.333-72 chr3 190274574 190274826 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 47746 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 237-16 chr10 100567464 100567635 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 31606 NM_017902 55662 Hs.500788 NM_017902 ENSG00000166135 HIF1AN FIH1 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha inhibitor protein-coding 281.666-10 chr3 90329050 90329350 + 1.66667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1221579 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 299.666-12 chr21 30753109 30753452 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 2148 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 252.333-31 chr2 73059075 73059284 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_001330405) promoter-TSS (NM_001330405) -7 NR_138476 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 464.333-2 chr8 77232947 77233260 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -217594 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 158.667-105 chr15 54494483 54494642 + 1.66667 NA intron (NM_001329919, intron 18 of 31) intron (NM_001329919, intron 18 of 31) 481914 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 396.334 chr14 69720930 69721286 + 1.66667 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL -46034 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 356.667-2 chr1 113619760 113620023 + 1.66667 NA intron (NM_001142782, intron 8 of 20) intron (NM_001142782, intron 8 of 20) 139264 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 268.333-29 chr2 11486023 11486316 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19992 NM_001278277 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 264.667-13 chr10 31504499 31504734 + 1.66667 NA intron (NM_001323638, intron 8 of 12) L1MA4A|LINE|L1 -104861 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 421.001 chr8 126424178 126424655 + 1.66667 NA Intergenic MamGypLTR3|LTR|Gypsy 98921 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 234.667-60 chr2 206916974 206917132 + 1.66667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -22465 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 261.667-42 chr20 39773516 39773688 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -230859 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 362.001-2 chr10 27060551 27060856 + 1.66667 NA intron (NM_014915, intron 13 of 33) intron (NM_014915, intron 13 of 33) 39795 NM_001256053 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 242.667-102 chr8 18790932 18791126 + 1.66667 NA intron (NM_015310, intron 8 of 15) L1PA11|LINE|L1 17838 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 335.667-2 chr1 205151359 205151854 + 1.66667 NA intron (NM_199462, intron 10 of 11) AluJr|SINE|Alu -29628 NM_001193272 5929 Hs.519230 NM_005057 ENSG00000117222 RBBP5 RBQ3|SWD1 RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 251-6 chr1 226510698 226510875 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -37978 NM_001003665 375057 Hs.116827 NM_001003665 ENSG00000203685 STUM C1orf95 stum, mechanosensory transduction mediator homolog protein-coding 253-63 chr7 53986739 53986951 + 1.66667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -174914 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 267.667-67 chr8 47871738 47871982 + 1.66667 NA intron (NM_001081640, intron 40 of 84) AluSq|SINE|Alu 88276 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 274.333-52 chr4 55345880 55346186 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_024592) promoter-TSS (NM_024592) -209 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 274-50 chr5 120472329 120472642 + 1.66667 NA intron (NM_001308087, intron 1 of 1) intron (NM_001308087, intron 1 of 1) 6854 NM_001308087 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 173-10 chr10 114589015 114589181 + 1.66667 NA intron (NM_001352440, intron 2 of 20) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 24638 NM_001352442 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 220.667-63 chr3 88628200 88628451 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 289869 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 354.334-6 chr4 184799888 184800180 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_003542) promoter-TSS (NR_003542) -988 NR_003542 643036 Hs.689630 NR_003542 ENSG00000249138 SLED1 - proteoglycan 3, pro eosinophil major basic protein 2 pseudogene pseudo 198-147 chr5 12921537 12921735 + 1.66667 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 111250 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 344.667-3 chr14 86293700 86294097 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 359220 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 316.667-18 chr20 41346706 41347131 + 1.66667 NA intron (NM_001301860, intron 2 of 19) MIR|SINE|MIR 6097 NR_126051 64900 Hs.25897 NM_022896 ENSG00000132793 LPIN3 LIPN3L|SMP2 lipin 3 protein-coding 305-16 chr4 178173466 178173702 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -265648 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 281.666-4 chr15 92869952 92870317 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -12709 NR_037600 100507217 Hs.622504 NR_037600 LINC01578 - long intergenic non-protein coding RNA 1578 ncRNA 279.333-75 chrX 70590932 70591216 + 1.66667 NA intron (NM_001003811, intron 26 of 30) intron (NM_001003811, intron 26 of 30) -135080 NR_109801 100873930 Hs.571699 NR_046586 ENSG00000231651 DLG3-AS1 - DLG3 antisense RNA 1 ncRNA 256-52 chr2 239437051 239437344 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 35449 NR_135577 101928111 Hs.534680 NR_135575 ENSG00000222020 HDAC4-AS1 - HDAC4 antisense RNA 1 ncRNA 219-81 chr8 53893646 53893838 + 1.66667 NA intron (NR_104579, intron 1 of 3) intron (NR_104579, intron 1 of 3) 12870 NR_104578 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 214.667-114 chr8 76071562 76071713 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -335017 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 280.334-5 chr13 94634711 94634983 + 1.66667 NA TTS (NM_180989) TTS (NM_180989) 32990 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 263-41 chr3 47367568 47367839 + 1.66667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -13318 NM_001304482 25930 Hs.25524 NM_015466 ENSG00000076201 PTPN23 HD-PTP|HDPTP|PTP-TD14 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 23 protein-coding 307.334-12 chr6 101169384 101169587 + 1.66667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -229500 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 235-17 chr14 32120748 32121015 + 1.66667 NA intron (NM_001030055, intron 3 of 6) L1MC|LINE|L1 43577 NM_001030055 394 Hs.592313 NM_001173 ENSG00000100852 ARHGAP5 GFI2|RhoGAP5|p190-B|p190BRhoGAP Rho GTPase activating protein 5 protein-coding 317-19 chr4 30747896 30748282 + 1.66667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 27720 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 276-25 chr14 77207370 77207559 + 1.66667 NA intron (NM_020431, intron 1 of 23) intron (NM_020431, intron 1 of 23) 25666 NM_020431 57156 Hs.22452 NM_020431 ENSG00000165548 TMEM63C C14orf171|CSC1|hsCSC1 transmembrane protein 63C protein-coding 277.667-47 chr8 85505685 85505924 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -40889 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 275.667-69 chr9 87025068 87025362 + 1.66667 NA intron (NR_027471, intron 1 of 1) MER77B|LTR|ERVL 16911 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 265.334-12 chr17 28733658 28733924 + 1.66667 NA intron (NM_178170, intron 1 of 14) intron (NM_178170, intron 1 of 14) 5003 NM_178170 284086 Hs.448468 NM_178170 ENSG00000160602 NEK8 JCK|NEK12A|NPHP9|RHPD2 NIMA related kinase 8 protein-coding 173-79 chr5 117945580 117945798 + 1.66667 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) 215328 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 273.667-18 chr12 48287637 48287897 + 1.66667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -41213 NM_181788 341567 Hs.155833 NM_181788 ENSG00000187166 H1FNT H1.7|H1T2 H1 histone family member N, testis specific protein-coding 143-85 chr3 155600360 155600503 + 1.66667 NA intron (NM_001349252, intron 2 of 24) intron (NM_001349252, intron 2 of 24) 75912 NM_001130961 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 297.667-25 chr3 24466066 24466373 + 1.66667 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) HAL1|LINE|L1 -27868 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 293.001 chr10 51872967 51873149 + 1.66667 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) intron (NM_001098512, intron 4 of 17) -173463 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 274-53 chr6 51835557 51835766 + 1.66667 NA intron (NM_138694, intron 51 of 66) intron (NM_138694, intron 51 of 66) 213791 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 246.667-104 chr8 131091859 131092080 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -51060 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 447.667-3 chr4 87412213 87412650 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -10142 NM_024047 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 274-33 chr3 94119940 94120148 + 1.66667 NA intron (NM_022072, intron 5 of 5) intron (NM_022072, intron 5 of 5) 56983 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 236-24 chr14 57599996 57600148 + 1.66667 NA intron (NM_001306087, intron 1 of 7) intron (NM_001306087, intron 1 of 7) -106215 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 308.999-3 chr4 45958766 45959090 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 165126 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 261.333-71 chr4 32278318 32278548 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -72605 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 333.334-2 chr14 48881645 48882085 + 1.66667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 704515 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 258.334-18 chr4 128507490 128507650 + 1.66667 NA intron (NR_125882, intron 6 of 8) L1MEd|LINE|L1 79554 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 291.667-38 chr8 135799918 135800134 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 342570 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 403.334-5 chr8 87809603 87810038 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 64195 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 234-18 chr12 125994445 125994633 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11165 NR_034132 400084 Hs.156191 NR_034132 ENSG00000249267 LINC00939 - long intergenic non-protein coding RNA 939 ncRNA 337.667-13 chr2 68315940 68316341 + 1.66667 NA intron (NM_015463, intron 2 of 2) intron (NM_015463, intron 2 of 2) 3911 NM_001111101 25927 Hs.212885 NM_015463 ENSG00000119865 CNRIP1 C2orf32|CRIP1 cannabinoid receptor interacting protein 1 protein-coding 255.667-7 chr10 68430794 68430982 + 1.66667 NA intron (NM_001080449, intron 13 of 20) AluJo|SINE|Alu -23594 NM_001042417 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 404-3 chr12 1437469 1437778 + 1.66667 NA intron (NR_027948, intron 18 of 19) intron (NR_027948, intron 18 of 19) -62868 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 298.333-16 chr16 60020941 60021359 + 1.66667 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 165797 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 212.667-37 chr14 49207442 49207648 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 378835 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 181.667-102 chr3 161362685 161362863 + 1.66667 NA intron (NM_001040100, intron 1 of 2) intron (NM_001040100, intron 1 of 2) 9309 NM_001040100 165679 Hs.369104 NM_145035 ENSG00000196542 SPTSSB ADMP|C3orf57|SSSPTB serine palmitoyltransferase small subunit B protein-coding 312.334-5 chr8 52661936 52662204 + 1.66667 NA intron (NM_001083617, intron 8 of 23) intron (NM_001083617, intron 8 of 23) 52365 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 351.666-11 chr3 64005919 64006261 + 1.66667 NA intron (NR_038286, intron 1 of 2) intron (NR_038286, intron 1 of 2) 2068 NR_038286 100507062 Hs.152536 NR_038286 ENSG00000239653 PSMD6-AS2 - PSMD6 antisense RNA 2 ncRNA 282.667-19 chr2 66561393 66561734 + 1.66667 NA intron (NM_002398, intron 9 of 12) intron (NM_002398, intron 9 of 12) -12467 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 247-44 chr2 225965007 225965242 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -177670 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 317.667-29 chr22 27530407 27530633 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 219869 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 320-16 chr14 63378169 63378477 + 1.66667 NA intron (NM_001282180, intron 13 of 13) MER85|DNA|PiggyBac -59388 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 290-4 chr1 148356022 148356255 + 1.66667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 6395 NR_104082 101954273 NR_104082 ENSG00000207340 RNVU1-1 RNU1-10P|RNU1-53|RNU1P10|RNVU1-10|U1.4|U1P14|vU1.1|vU1.10 RNA, variant U1 small nuclear 1 snRNA 258.334-7 chr15 56090331 56090495 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_022841, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_022841, exon 10 of 10) -96801 NM_006154 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 140.667-115 chr2 50616575 50616722 + 1.66667 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) MIR3|SINE|MIR 79614 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 260.667-17 chr12 45826186 45826449 + 1.66667 NA intron (NM_152641, intron 6 of 20) intron (NM_152641, intron 6 of 20) 96608 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 348.667-25 chr7 82049804 82050188 + 1.66667 NA TTS (NM_001302890) TTS (NM_001302890) 40819 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 162.667-174 chr3 67925429 67925636 + 1.66667 NA intron (NR_109992, intron 6 of 6) L1ME2|LINE|L1 -66060 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 606.001 chr10 114397696 114398229 + 1.66667 NA intron (NM_001351073, intron 1 of 19) intron (NM_001351073, intron 1 of 19) 6540 NM_001001936 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 255-12 chr10 71789133 71789549 + 1.66667 NA intron (NM_022124, intron 43 of 67) intron (NM_022124, intron 43 of 67) -1406 NR_106974 102465689 NR_106974 ENSG00000274824 MIR7152 hsa-mir-7152 microRNA 7152 ncRNA 212-140 chr6 96469113 96469258 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -52621 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 497.333-3 chr20 53428626 53429155 + 1.66667 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -123880 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 185-29 chr18 4286530 4286762 + 1.66667 NA intron (NR_036489, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 22044 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 243.666-33 chr7 22600512 22600723 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 37280 NR_038393 100506178 Hs.668122 NR_038393 ENSG00000232759 LOC100506178 - uncharacterized LOC100506178 ncRNA 256-62 chr3 155869706 155869974 + 1.66667 NA promoter-TSS (NM_003875) promoter-TSS (NM_003875) -810 NM_003875 8833 Hs.591314 NM_003875 ENSG00000163655 GMPS GATD7 guanine monophosphate synthase protein-coding 340.334-5 chr2 206396517 206396821 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -46863 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 285.334-13 chr9 12646085 12646296 + 1.66667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -47195 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 242.334-7 chr17 42253693 42253935 + 1.66667 NA intron (NM_012448, intron 1 of 18) FRAM|SINE|Alu 22592 NM_012448 6777 Hs.595276 NM_012448 ENSG00000173757 STAT5B STAT5 signal transducer and activator of transcription 5B protein-coding 333.333-27 chr2 24395184 24395459 + 1.66667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -34785 NM_001348182 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 225-20 chr13 77208620 77208770 + 1.66667 NA intron (NM_015057, intron 23 of 82) intron (NM_015057, intron 23 of 82) 118399 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 222.333-65 chr3 132015356 132015601 + 1.66667 NA intron (NM_001289112, intron 1 of 15) intron (NM_001289112, intron 1 of 15) 19964 NM_130808 131034 Hs.199877 NM_130808 ENSG00000196353 CPNE4 COPN4|CPN4 copine 4 protein-coding 201.334-4 chr9 30623118 30623265 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -214737 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 236.667-61 chr4 107963289 107963541 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -26299 NM_001184705 3033 Hs.438289 NM_005327 ENSG00000138796 HADH HAD|HADH1|HADHSC|HCDH|HHF4|MSCHAD|SCHAD hydroxyacyl-CoA dehydrogenase protein-coding 257.334-15 chr8 83941259 83941418 + 1.66667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -241449 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 328.666-7 chr15 48105348 48105808 + 1.66667 NA Intergenic Helitron1Nb_Mam|RC|Helitron -15412 NM_205850 283652 Hs.710240 NM_205850 ENSG00000188467 SLC24A5 JSX|NCKX5|OCA6|SHEP4 solute carrier family 24 member 5 protein-coding 239.666-20 chr3 17603540 17603757 + 1.66667 NA intron (NM_001349088, intron 2 of 21) MER41B|LTR|ERV1 96372 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 184-125 chr9 130369343 130369492 + 1.66667 NA intron (NM_001291815, intron 44 of 97) intron (NM_001291815, intron 44 of 97) -75290 NM_000050 445 Hs.160786 NM_000050 ENSG00000130707 ASS1 ASS|CTLN1 argininosuccinate synthase 1 protein-coding 269.667-21 chr14 61333341 61333591 + 1.66667 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 12023 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 259-24 chr2 21186396 21186747 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 62585 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 186.667-28 chr11 118497959 118498082 + 1.66667 NA exon (NM_001197104, exon 21 of 36) exon (NM_001197104, exon 21 of 36) -29413 NM_001346097 143941 Hs.653449 NM_001080441 ENSG00000172425 TTC36 HBP21 tetratricopeptide repeat domain 36 protein-coding 221.667-27 chr14 33490267 33490482 + 1.66667 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -218563 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 191-57 chr5 161184156 161184306 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -245605 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 485 chr1 171204296 171204612 + 1.66667 NA intron (NR_160266, intron 5 of 8) intron (NR_160266, intron 5 of 8) 19154 NM_001460 2327 Hs.144912 NM_001460 ENSG00000094963 FMO2 FMO1B1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 2 protein-coding 307.334-9 chr3 182919445 182919793 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_014616, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_014616, exon 30 of 30) 60919 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 247.667-65 chr3 149391636 149391902 + 1.66667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 13991 NR_109810 100874091 Hs.549633 NR_046650 ENSG00000240541 TM4SF1-AS1 - TM4SF1 antisense RNA 1 ncRNA 263-49 chr5 23200628 23200869 + 1.66667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -306861 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 346.333-13 chr17 61972894 61973389 + 1.66667 NA intron (NM_005121, intron 16 of 29) (ATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -45159 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 266-76 chr6 43903173 43903412 + 1.66667 NA intron (NR_024478, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 12264 NR_024478 100132354 Hs.376232 NR_024478 LINC01512 HI-LNC77 long intergenic non-protein coding RNA 1512 ncRNA 241.333-6 chr1 100912245 100912407 + 1.66667 NA intron (NM_133496, intron 5 of 10) intron (NM_133496, intron 5 of 10) 16236 NM_133496 148867 Hs.533903 NM_133496 ENSG00000162695 SLC30A7 ZNT7|ZnT-7|ZnTL2 solute carrier family 30 member 7 protein-coding 317.334-7 chr7 136883653 136883946 + 1.66667 NA intron (NM_001006629, intron 1 of 1) intron (NM_001006629, intron 1 of 1) 14553 NM_001006628 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 184.667-32 chr14 64376378 64376511 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -11909 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 299-7 chr10 16951351 16951648 + 1.66667 NA intron (NM_001081, intron 33 of 66) intron (NM_001081, intron 33 of 66) -134045 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 275.667-58 chr7 101404770 101404966 + 1.66667 NA intron (NM_133457, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 41993 NM_001278563 136227 Hs.654854 NM_133457 ENSG00000160963 COL26A1 EMI6|EMID2|EMU2|SH2B collagen type XXVI alpha 1 chain protein-coding 250.666-11 chr12 86002296 86002552 + 1.66667 NA 5' UTR (NM_001351291, exon 5 of 8) 5' UTR (NM_001351291, exon 5 of 8) 128129 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 265.333-24 chr14 45670769 45671057 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 44689 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 251-38 chr2 192640332 192640599 + 1.66667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -109380 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 328.667-12 chr4 167700624 167700914 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -391768 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 334.667-18 chr3 85162340 85162680 + 1.66667 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -100246 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 400.333-10 chr20 52704352 52704919 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 83797 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 310.334-9 chr5 66628838 66629189 + 1.66667 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) intron (NM_001290228, intron 1 of 4) 32620 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 269-6 chr1 212838690 212839056 + 1.66667 NA intron (NM_001024601, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 8776 NM_001024601 149643 Hs.153274 NM_001024601 ENSG00000185523 SPATA45 C1orf227 spermatogenesis associated 45 protein-coding 371-9 chr17 62964904 62965332 + 1.66667 NA Intergenic L5|LINE|RTE-X -1117 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 256.334-22 chr8 94630653 94630919 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 8681 NR_034034 100288748 Hs.608210 NR_034034 ENSG00000261437 LOC100288748 - uncharacterized LOC100288748 ncRNA 309-18 chr18 11229019 11229350 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -80422 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 585.333-2 chr5 89919823 89920557 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 96530 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 183-37 chr14 58552146 58552363 + 1.66667 NA TTS (NM_001364701) TTS (NM_001364701) -81814 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 261.334-22 chr8 83595019 83595246 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 191374 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 242.667-14 chr10 59386339 59386610 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -23293 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 394-22 chr9 31417184 31417568 + 1.66667 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -35886 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 545 chr8 56408984 56409536 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -18550 NR_103832 442388 Hs.632065 NM_001145251 ENSG00000253542 SDR16C6P SDR16C6 short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, pseudogene pseudo 294.667-16 chr14 88117798 88118005 + 1.66667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -91589 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 149.334 chr12 64683186 64683279 + 1.66667 NA intron (NR_040718, intron 1 of 3) intron (NR_040718, intron 1 of 3) -60627 NR_037515 100500856 NR_037515 ENSG00000266016 MIR548Z - microRNA 548z ncRNA 393.334-2 chr11 10531934 10532295 + 1.66667 NA intron (NM_016422, intron 2 of 5) intron (NM_016422, intron 2 of 5) 9073 NM_016422 50862 Hs.44685 NM_016422 ENSG00000110315 RNF141 RFP141|ZFP26|ZNF230 ring finger protein 141 protein-coding 222.667-38 chr18 4623863 4624158 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -168703 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 419.667-6 chr5 62488609 62489029 + 1.66667 NA intron (NM_016338, intron 13 of 29) AluJb|SINE|Alu 69935 NM_001134779 51194 Hs.482269 NM_016338 ENSG00000086200 IPO11 RanBP11 importin 11 protein-coding 310-26 chr2 32192124 32192346 + 1.66667 NA intron (NM_001330476, intron 2 of 10) intron (NM_001330476, intron 2 of 10) 26371 NM_001330478 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 266.334-14 chr2 167921424 167921627 + 1.66667 NA intron (NR_131227, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 19619 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 158.667-174 chr2 204216178 204216329 + 1.66667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 279505 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 357.334 chr11 81575075 81575457 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 315570 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 360-27 chr8 133034793 133035175 + 1.66667 NA intron (NM_003235, intron 41 of 47) L1M5|LINE|L1 11597 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 263.333-42 chr2 47326245 47326530 + 1.66667 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu -8928 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 271.667-12 chr10 113050941 113051176 + 1.66667 NA intron (NM_001198528, intron 4 of 14) intron (NM_001198528, intron 4 of 14) 5703 NR_132769 106635520 NR_132769 SNORA87 - small nucleolar RNA, H/ACA box 87 snoRNA 296-40 chr21 29588435 29588670 + 1.66667 NA intron (NM_001320618, intron 8 of 13) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -7488 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 285.667-25 chr2 165828725 165829036 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -34633 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 291.667-5 chr1 183368165 183368440 + 1.66667 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) intron (NM_015039, intron 1 of 10) 50078 NM_015039 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 273.667-31 chr2 52292143 52292477 + 1.66667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -78338 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 250-65 chr5 95424850 95425111 + 1.66667 NA intron (NM_152548, intron 5 of 9) L1M7|LINE|L1 33614 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 379.667-6 chr20 24542949 24543377 + 1.66667 NA exon (NM_001323606, exon 3 of 5) exon (NM_001323606, exon 3 of 5) 73202 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 307.667-12 chr14 23212123 23212449 + 1.66667 NA intron (NM_001370218, intron 2 of 15) L1M4|LINE|L1 -25650 NM_001282322 100507650 NM_001282322 ENSG00000215277 RNF212B C14orf164 ring finger protein 212B protein-coding 344.667-13 chr4 59175481 59175777 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 162056 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 261.334-18 chr6 83984929 83985128 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -48744 NM_138409 112609 Hs.370055 NM_138409 ENSG00000135324 MRAP2 C6orf117|bA51G5.2 melanocortin 2 receptor accessory protein 2 protein-coding 364-5 chr14 59280680 59281046 + 1.66667 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) intron (NM_001270520, intron 2 of 24) 17422 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 260.667-56 chr21 32130808 32130984 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -44601 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 180.667-70 chr2 143949463 143949623 + 1.66667 NA intron (NM_001284238, intron 13 of 13) intron (NM_001284238, intron 13 of 13) 12476 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 260.667-43 chr2 36847204 36847399 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_003162, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_003162, exon 18 of 18) 119235 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 236.667-67 chr5 142375139 142375373 + 1.66667 NA intron (NR_120664, intron 3 of 3) intron (NR_120664, intron 3 of 3) 49963 NR_120664 101926941 Hs.658945 NR_120664 ENSG00000231185 SPRY4-AS1 THCAT68 SPRY4 antisense RNA 1 ncRNA 259.334-11 chr2 68456583 68456768 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 10619 NR_133923 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 210.334-3 chr15 100698429 100698615 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 95933 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 418-12 chr6 74303447 74303782 + 1.66667 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) L1P3|LINE|L1 234163 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 235.667-71 chr9 84740169 84740313 + 1.66667 NA intron (NM_001369534, intron 9 of 16) intron (NM_001369534, intron 9 of 16) 34340 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 393.667-12 chr8 32210890 32211278 + 1.66667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) L1ME4a|LINE|L1 184866 NR_104156 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 504.333-4 chr4 39860208 39860591 + 1.66667 NA intron (NM_001100399, intron 26 of 32) AluSz6|SINE|Alu 117512 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 291.334-6 chr18 58965019 58965426 + 1.66667 NA intron (NR_148459, intron 9 of 11) intron (NR_148459, intron 9 of 11) -70457 NR_024021 390858 Hs.716280 NR_024021 OACYLP ACYL3P O-acyltransferase like, pseudogene pseudo 450.667-5 chr6 105539502 105539826 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -136582 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 395.667-12 chr9 118491412 118491690 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -188120 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 662.667 chr12 117686708 117687487 + 1.66667 NA intron (NM_173598, intron 4 of 19) MIR3|SINE|MIR 281893 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 237-42 chr21 19940026 19940216 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -40366 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 382.667 chr1 69717258 69717547 + 1.66667 NA intron (NM_001366839, intron 3 of 25) intron (NM_001366839, intron 3 of 25) 148061 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 214.334 chr1 212882154 212882302 + 1.66667 NA intron (NM_014053, intron 3 of 9) L1ME3C|LINE|L1 23953 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 295.333-45 chr4 66135820 66136357 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -140736 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 283.666-11 chr8 99171435 99171815 + 1.66667 NA intron (NM_017890, intron 16 of 61) intron (NM_017890, intron 16 of 61) 158359 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 281.333-5 chr1 232911327 232911638 + 1.66667 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -39129 NM_032324 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 284-58 chr7 35501850 35502242 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 188191 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 227-34 chr3 17608776 17609037 + 1.66667 NA intron (NM_001349088, intron 2 of 21) intron (NM_001349088, intron 2 of 21) 91114 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 301.667-44 chr9 34204679 34204900 + 1.66667 NA intron (NM_001171203, intron 2 of 7) intron (NM_001171203, intron 2 of 7) 25746 NM_016525 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 310.334-7 chr4 128124710 128125040 + 1.66667 NA intron (NR_146772, intron 11 of 19) L2b|LINE|L2 63563 NM_018078 55132 Hs.654971 NM_018078 ENSG00000138709 LARP1B LARP2 La ribonucleoprotein domain family member 1B protein-coding 331-24 chr21 31502590 31502825 + 1.66667 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) intron (NM_003253, intron 1 of 28) 56380 NM_003253 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 226-2 chr1 36584735 36584921 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -101514 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 292.666-15 chr17 63388866 63389207 + 1.66667 NA intron (NM_025185, intron 15 of 25) intron (NM_025185, intron 15 of 25) 51231 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 297.333-53 chr8 59061479 59061847 + 1.66667 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 57484 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 259.333-33 chr14 61434948 61435314 + 1.66667 NA intron (NM_006255, intron 2 of 13) LTR16C|LTR|ERVL 113688 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 257.334-12 chr5 161060239 161060473 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -121730 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 259.334-15 chr21 27524358 27524541 + 1.66667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -197930 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 254.334-14 chr16 58727136 58727307 + 1.66667 NA intron (NM_001286220, intron 1 of 8) FRAM|SINE|Alu 7095 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 231-38 chr20 20926671 20926933 + 1.66667 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 179556 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 345.667-21 chr6 36610943 36611384 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 11349 NR_037491 100500885 NR_037491 ENSG00000263894 MIR3925 - microRNA 3925 ncRNA 278.667-55 chr9 36661312 36661569 + 1.66667 NA intron (NM_001256691, intron 11 of 15) L1M5|LINE|L1 88545 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 305.334-10 chr4 117296292 117296478 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 64254 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 354-11 chr17 914965 915316 + 1.66667 NA intron (NM_022463, intron 1 of 7) AluSx3|SINE|Alu 5508 NR_135633 101927727 Hs.666198 NR_135633 ENSG00000262003 LOC101927727 - uncharacterized LOC101927727 ncRNA 141.333-60 chr13 107380159 107380316 + 1.66667 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) -59274 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 163.333-202 chr4 79178594 79178859 + 1.66667 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 147335 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 333.667-16 chr5 78110966 78111230 + 1.66667 NA intron (NM_003664, intron 19 of 26) intron (NM_003664, intron 19 of 26) 152851 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 270.333-47 chr5 18461480 18461755 + 1.66667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 654343 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 346 chr1 60299201 60299630 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -225645 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 254.333-67 chr5 64877072 64877328 + 1.66667 NA intron (NM_005869, intron 10 of 13) L1MA4A|LINE|L1 108270 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 250.334-18 chr6 165541673 165541912 + 1.66667 NA intron (NM_006661, intron 3 of 22) intron (NM_006661, intron 3 of 22) 120308 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 311.666-9 chr21 17551446 17551740 + 1.66667 NA intron (NM_001207065, intron 2 of 2) intron (NM_001207065, intron 2 of 2) 38550 NM_001207063 1525 Hs.627078 NM_001338 ENSG00000154639 CXADR CAR|CAR4/6|HCAR CXADR Ig-like cell adhesion molecule protein-coding 239.334-12 chr6 54542498 54542713 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 234164 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 305.334-12 chr8 122198181 122198421 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 370343 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 314.667-24 chr2 132614692 132615087 + 1.66667 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) 55316 NM_001321234 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 338.667-26 chr5 84222647 84222861 + 1.66667 NA intron (NM_001278642, intron 2 of 9) L1MA9|LINE|L1 162113 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 265.667-60 chr5 149821284 149821504 + 1.66667 NA intron (NM_001172698, intron 2 of 10) L1MC5|LINE|L1 49454 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 373.001-3 chr17 48178843 48179154 + 1.66667 NA intron (NM_001075099, intron 9 of 12) intron (NM_001075099, intron 9 of 12) -22487 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 280.333-20 chr2 99572744 99573004 + 1.66667 NA intron (NM_001025108, intron 17 of 23) intron (NM_001025108, intron 17 of 23) -82857 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 370.333-12 chr18 64642666 64643086 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -382821 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 245-68 chr7 31903447 31903677 + 1.66667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 166845 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 262.667-79 chr8 85855734 85855994 + 1.66667 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger -27922 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 249.667-41 chr19 28934959 28935150 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -30077 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 273.667-39 chr3 29822644 29822969 + 1.66667 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) intron (NM_001003792, intron 6 of 13) 111350 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 270.667-3 chr1 160473904 160474148 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 49229 NM_001184714 114836 Hs.492348 NM_052931 ENSG00000162739 SLAMF6 CD352|KALI|KALIb|Ly108|NTB-A|NTBA|SF2000 SLAM family member 6 protein-coding 302 chr1 64205365 64205642 + 1.66667 NA intron (NM_001366232, intron 1 of 9) intron (NM_001366232, intron 1 of 9) 1880 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 326.667-32 chr5 86766239 86766544 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 19573 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 256.666-6 chr1 177745002 177745269 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 44611 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 249.667-83 chr6 96954045 96954304 + 1.66667 NA intron (NM_001323252, intron 2 of 11) HAL1|LINE|L1 29446 NM_052904 114792 Hs.45056 NM_052904 ENSG00000186231 KLHL32 BKLHD5|KIAA1900|UG0030H05|dJ21F7.1 kelch like family member 32 protein-coding 299-30 chr4 130354316 130354615 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -21896 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 285.666-11 chr8 122381993 122382346 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 186475 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 443-7 chr2 28915579 28916021 + 1.66667 NA intron (NM_015131, intron 5 of 17) intron (NM_015131, intron 5 of 17) 2138 NR_003074 692209 NR_003074 ENSG00000264994 SNORD92 HBII-316 small nucleolar RNA, C/D box 92 snoRNA 276-50 chr4 76825232 76825454 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 72801 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 374.333-19 chr8 118273479 118274046 + 1.66667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -161943 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 248.667-107 chr9 5166232 5166385 + 1.66667 NA intron (NM_007179, intron 1 of 1) intron (NM_007179, intron 1 of 1) 19331 NM_007179 11172 Hs.632648 NM_007179 ENSG00000120210 INSL6 RIF1 insulin like 6 protein-coding 306-48 chr7 32536572 32536844 + 1.66667 NA intron (NM_015060, intron 1 of 15) MER21C|LTR|ERVL 41219 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 250 chr1 70194856 70195076 + 1.66667 NA intron (NM_017768, intron 1 of 14) L1ME1|LINE|L1 10613 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 324-23 chr4 95944135 95944547 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 104248 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 193-94 chr8 140919279 140919445 + 1.66667 NA intron (NM_001352700, intron 1 of 34) intron (NM_001352700, intron 1 of 34) 81642 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 283-14 chr17 69564735 69565034 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -29103 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 235.334-6 chr4 43888914 43889081 + 1.66667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -127864 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 246.667-4 chr1 63845198 63845357 + 1.66667 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 71260 NM_005012 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 313.667-6 chr10 60044476 60044783 + 1.66667 NA intron (NM_001204403, intron 42 of 43) intron (NM_001204403, intron 42 of 43) -83716 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 195-41 chr15 46975338 46975496 + 1.66667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -208672 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 311.667-14 chr20 44801947 44802398 + 1.66667 NA intron (NM_001205317, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 8374 NM_182970 140730 Hs.517065 NM_182970 ENSG00000101098 RIMS4 C20orf190|RIM 4|RIM-4|RIM4|RIM4-gamma|RIM4gamma regulating synaptic membrane exocytosis 4 protein-coding 279.001-2 chr2 73994701 73994909 + 1.66667 NA intron (NM_001287491, intron 2 of 11) AluSx|SINE|Alu -7887 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 265.334-8 chr12 20878511 20878757 + 1.66667 NA intron (NM_019844, intron 10 of 15) intron (NM_019844, intron 10 of 15) 56086 NM_001349920 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 265.667 chr1 15806062 15806245 + 1.66667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 1546 NM_001089591 440567 Hs.568229 NM_001089591 ENSG00000233954 UQCRHL - ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein like protein-coding 232-77 chr6 38767422 38767680 + 1.66667 NA intron (NM_001371, intron 10 of 91) L1MB4|LINE|L1 52240 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 263.667-22 chr14 48363708 48363902 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -568791 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 244-87 chr5 144648528 144648761 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 443253 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 384.666-12 chr8 98646379 98646657 + 1.66667 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) intron (NM_001256313, intron 4 of 8) 179153 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 255-44 chr2 58892976 58893140 + 1.66667 NA intron (NR_033873, intron 3 of 13) AluSx1|SINE|Alu -324650 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 365.334 chr12 56800947 56801254 + 1.66667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 37776 NM_003725 8630 Hs.524513 NM_003725 ENSG00000025423 HSD17B6 HSE|RODH|SDR9C6 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 6 protein-coding 359.334-6 chr7 82958004 82958355 + 1.66667 NA intron (NM_033026, intron 4 of 24) LTR86A2|LTR|ERVL 204705 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 238.334-5 chr14 52492444 52492774 + 1.66667 NA intron (NM_001160047, intron 9 of 20) intron (NM_001160047, intron 9 of 20) 59896 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 233.667-61 chr5 39419118 39419305 + 1.66667 NA intron (NM_001343, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 5769 NM_001343 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 236.334-5 chr3 112170398 112170623 + 1.66667 NA intron (NM_001320531, intron 22 of 27).2 L1M2|LINE|L1 37087 NR_157393 112806053 NR_157393 TBILA - TGF-beta induced lncRNA ncRNA 204-35 chr11 16877071 16877253 + 1.66667 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) intron (NM_001329630, intron 3 of 26) 48860 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 186-27 chr13 53047837 53048023 + 1.66667 NA intron (NM_006418, intron 4 of 4) intron (NM_006418, intron 4 of 4) 19117 NM_006418 10562 Hs.508113 NM_006418 ENSG00000102837 OLFM4 GC1|GW112|OLM4|OlfD|UNQ362|bA209J19.1|hGC-1|hOLfD olfactomedin 4 protein-coding 251.333-36 chr14 63914543 63914800 + 1.66667 NA intron (NM_015180, intron 2 of 114) L2|LINE|L2 61667 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 246-7 chr1 219215144 219215300 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 40253 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 236.334-8 chr7 71070363 71070513 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -61706 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 246.667-70 chr5 59387701 59387961 + 1.66667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) L1MA8|LINE|L1 -30861 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 227-37 chr3 185713105 185713313 + 1.66667 NA promoter-TSS (NR_126326) promoter-TSS (NR_126326) -43 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 297-32 chr2 188462275 188462581 + 1.66667 NA intron (NM_016315, intron 2 of 11) L1MA2|LINE|L1 164936 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 261.333-120 chrX 98362492 98362721 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -798071 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 271-40 chr7 6520671 6520959 + 1.66667 NA intron (NM_001145118, intron 6 of 21) intron (NM_001145118, intron 6 of 21) 30621 NM_001145118 392862 Hs.512174 NM_001145118 ENSG00000215045 GRID2IP DELPHILIN Grid2 interacting protein protein-coding 308-12 chr11 111274998 111275409 + 1.66667 NA intron (NM_198498, intron 2 of 4) intron (NM_198498, intron 2 of 4) -23343 NM_001271458 120376 Hs.31409 NM_001136105 ENSG00000214290 COLCA2 C11orf93|CASC13|LOH11CR1G colorectal cancer associated 2 protein-coding 261.667-59 chr5 19023847 19024008 + 1.66667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 862345 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 246-36 chr16 11008929 11009273 + 1.66667 NA intron (NM_015226, intron 10 of 22) L1MB3|LINE|L1 64537 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 244 chr1 14510452 14510691 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -88114 NM_001370230 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 232-16 chr10 126748842 126749003 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -78412 NM_001350923 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 507.333-2 chr7 90855814 90856298 + 1.66667 NA intron (NM_012395, intron 4 of 13) intron (NM_012395, intron 4 of 13) 146240 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 139.333-38 chr11 83498859 83498949 + 1.66667 NA intron (NM_001142699, intron 21 of 27) L1M4|LINE|L1 183521 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 312-25 chr2 165396462 165396799 + 1.66667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -73068 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 231.333-42 chr14 66049821 66050054 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -436434 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 489.667-2 chr2 172076951 172077400 + 1.66667 NA intron (NM_001322279, intron 6 of 9) intron (NM_001322279, intron 6 of 9) -8332 NM_001038493 1745 Hs.407015 NM_178120 ENSG00000144355 DLX1 - distal-less homeobox 1 protein-coding 292.334-13 chr7 137519875 137520061 + 1.66667 NA intron (NM_001321710, intron 21 of 32) intron (NM_001321710, intron 21 of 32) -176235 NM_001321387 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 305.334-3 chr12 112385249 112385439 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2913 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 248.667-66 chr2 212241803 212242010 + 1.66667 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 184454 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 341.334 chr12 41903616 41904009 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 139623 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 311-20 chr22 32436783 32437163 + 1.66667 NA intron (NM_174932, intron 7 of 14) intron (NM_174932, intron 7 of 14) 20413 NM_174932 254240 Hs.372939 NM_174932 ENSG00000184459 BPIFC BPIL2 BPI fold containing family C protein-coding 477.667-2 chr4 30554249 30554695 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -165897 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 377.334-3 chr3 79573685 79574036 + 1.66667 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) 65973 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 244.667-95 chr8 62184608 62184889 + 1.66667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -64106 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 332.667-8 chr10 82322226 82322559 + 1.66667 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -89472 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 253.334-15 chr4 87852138 87852309 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 17520 NM_001291183 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 264.334-3 chr10 34709893 34710093 + 1.66667 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) L1M5|LINE|L1 105303 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 290.333-24 chr20 33804805 33805121 + 1.66667 NA intron (NR_110623, intron 1 of 3) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 6136 NR_110623 101929746 Hs.504633 NR_110623 ENSG00000230753 ZNF341-AS1 - ZNF341 antisense RNA 1 ncRNA 237.666-7 chr14 63113051 63113302 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -67718 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 164.667-158 chr4 35898889 35899042 + 1.66667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 344974 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 292.333-5 chr10 34621687 34622072 + 1.66667 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 193417 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 427.667-5 chr18 73113240 73113856 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 150950 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 209.334-2 chr1 218673938 218674110 + 1.66667 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) intron (NR_031644, intron 3 of 6) 163929 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 349.334-9 chr7 71028469 71028844 + 1.66667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -103488 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 224-81 chr5 105508747 105509056 + 1.66667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 409427 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 250-76 chr7 40074961 40075158 + 1.66667 NA intron (NM_003718, intron 9 of 13) intron (NM_003718, intron 9 of 13) 59563 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 302-21 chr16 10992602 10992887 + 1.66667 NA intron (NM_015226, intron 9 of 22) L2a|LINE|L2 48180 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 349.334-7 chr7 23692744 23692984 + 1.66667 NA intron (NM_001127365, intron 3 of 4) FLAM_A|SINE|Alu 12665 NM_001127364 340277 Hs.592178 NM_199136 ENSG00000188732 FAM221A C7orf46 family with sequence similarity 221 member A protein-coding 223.334-2 chr10 4532425 4532601 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -123643 NR_015425 338588 Hs.121365 NR_015425 LINC00705 - long intergenic non-protein coding RNA 705 ncRNA 257.334-18 chr9 26943655 26943914 + 1.66667 NA intron (NM_001321546, intron 1 of 12) AluJr|SINE|Alu -3206 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 310-8 chr10 33846897 33847176 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -74356 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 274.667-40 chr4 80041923 80042104 + 1.66667 NA intron (NM_001286781, intron 7 of 16) intron (NM_001286781, intron 7 of 16) 31216 NM_058172 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 169.334-2 chr7 4362759 4362932 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -228008 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 214.667-102 chr5 134203341 134203560 + 1.66667 NA intron (NM_001355019, intron 2 of 6) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 22104 NM_001355019 5515 Hs.105818 NM_002715 ENSG00000113575 PPP2CA NEDLBA|PP2Ac|PP2CA|PP2Calpha|RP-C protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha protein-coding 237-18 chr11 31291549 31291714 + 1.66667 NA intron (NM_181807, intron 6 of 8) intron (NM_181807, intron 6 of 8) 78108 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 348.667-2 chr1 197613374 197613790 + 1.66667 NA intron (NR_125340, intron 10 of 19) intron (NR_125340, intron 10 of 19) 161898 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 234.667-81 chr4 39583925 39584170 + 1.66667 NA intron (NM_174921, intron 2 of 4) intron (NM_174921, intron 2 of 4) 43074 NM_001317897 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 318.667-14 chr15 40433481 40433713 + 1.66667 NA intron (NR_148925, intron 13 of 13) intron (NR_148925, intron 13 of 13) -6160 NM_001301132 22893 Hs.22109 NM_014952 ENSG00000140320 BAHD1 - bromo adjacent homology domain containing 1 protein-coding 394-10 chr20 17919217 17919598 + 1.66667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 43539 NR_003045 692086 Hs.680747 NR_003045 ENSG00000212232 SNORD17 HBI-43 small nucleolar RNA, C/D box 17 snoRNA 217.333-71 chr2 179410180 179410422 + 1.66667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -145469 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 377.334-6 chr8 137192467 137192782 + 1.66667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 220964 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 262-57 chr3 115673605 115673848 + 1.66667 NA intron (NM_001130064, intron 2 of 3) intron (NM_001130064, intron 2 of 3) 50216 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 249.666-14 chr18 3370291 3370531 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -19852 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 217-17 chr13 83177386 83177573 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 704914 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 219.334 chr10 94128619 94128770 + 1.66667 NA intron (NM_001165979, intron 1 of 31) intron (NM_001165979, intron 1 of 31) -19900 NR_120616 101927049 Hs.144492 NR_120615 ENSG00000232913 PLCE1-AS2 - PLCE1 antisense RNA 2 ncRNA 311.333-47 chr5 67300388 67300781 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -103785 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 248.334-4 chr10 88442818 88442994 + 1.66667 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) L2c|LINE|L2 140412 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 273.333-59 chr5 36262174 36262487 + 1.66667 NA intron (NM_001323279, intron 5 of 12) intron (NM_001323279, intron 5 of 12) -20051 NM_001287341 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 467.667-7 chr2 15621986 15622483 + 1.66667 NA intron (NM_004939, intron 18 of 25) L1MB3|LINE|L1 30366 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 505.333-2 chr1 118676331 118676922 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 311717 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 279.334-4 chr17 82373056 82373317 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1091 NM_018949 2837 Hs.192720 NM_018949 ENSG00000181408 UTS2R GPR14|UR-2-R|UTR|UTR2 urotensin 2 receptor protein-coding 284.667-25 chr2 47391214 47391502 + 1.66667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -11709 NM_000251 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 212-100 chr22 27294673 27294831 + 1.66667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -15899 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 303-34 chr22 28520010 28520343 + 1.66667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 60307 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 314-16 chr19 29959607 29959936 + 1.66667 NA intron (NR_045557, intron 1 of 9) L1MEg|LINE|L1 17532 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 250-37 chr2 24253701 24253988 + 1.66667 NA intron (NM_001348182, intron 23 of 38) intron (NM_001348182, intron 23 of 38) 78791 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 292.334-16 chr8 141099155 141099391 + 1.66667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -29316 NM_001352891 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 240.334-6 chr2 122273703 122273938 + 1.66667 NA Intergenic L2|LINE|L2 518169 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 257.667-6 chr10 25800243 25800450 + 1.66667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 133364 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 359.667-7 chr3 52857288 52857704 + 1.66667 NA intron (NM_001198974, intron 1 of 9) intron (NM_001198974, intron 1 of 9) -10944 NR_107031 102465866 NR_107031 ENSG00000275789 MIR8064 hsa-mir-8064 microRNA 8064 ncRNA 201.667-15 chr11 63280546 63280740 + 1.66667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -9260 NR_134874 387775 Hs.188982 NM_001039752 ENSG00000184999 SLC22A10 OAT5|hOAT5 solute carrier family 22 member 10 protein-coding 254.667-6 chr10 31502346 31502553 + 1.66667 NA exon (NM_001174095, exon 3 of 8) exon (NM_001174095, exon 3 of 8) -102694 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 261-12 chr10 108392998 108393259 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -323835 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 229-19 chr14 54799476 54799690 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 44750 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 347.001 chr1 118235658 118235895 + 1.66667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -50548 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 298-56 chr3 43192630 43192998 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -86735 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 280-43 chr4 91763969 91764240 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 513198 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 219.666-23 chr19 31027981 31028135 + 1.66667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -139452 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 268.334-16 chr4 57124061 57124306 + 1.66667 NA intron (NR_034081, intron 1 of 4) intron (NR_034081, intron 1 of 4) -13798 NM_001253835 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 334.001-5 chr8 120324004 120324267 + 1.66667 NA intron (NM_021110, intron 40 of 47) L1PA15|LINE|L1 121015 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 311.333-58 chr8 123443704 123444002 + 1.66667 NA intron (NR_133926, intron 6 of 6) AluSz6|SINE|Alu 27079 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 272.334-12 chr17 31821481 31821701 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 37371 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 244.667-100 chr9 111705762 111705957 + 1.66667 NA intron (NM_173521, intron 18 of 25) L1ME3G|LINE|L1 44254 NM_001017998 2790 Hs.534196 NM_001017998 ENSG00000242616 GNG10 - G protein subunit gamma 10 protein-coding 279-28 chr5 93544391 93544613 + 1.66667 NA intron (NR_109819, intron 5 of 5) intron (NR_109819, intron 5 of 5) 26841 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 237-2 chr1 90347472 90347634 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -310197 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 251-44 chr3 39264141 39264329 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001171174, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001171174, exon 2 of 2) 15801 NM_001337 1524 Hs.78913 NM_001337 ENSG00000168329 CX3CR1 CCRL1|CMKBRL1|CMKDR1|GPR13|GPRV28|V28 C-X3-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 294.333-23 chr2 119796410 119796644 + 1.66667 NA intron (NM_002830, intron 1 of 26) L1ME1|LINE|L1 36605 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 352-24 chr6 22249071 22249534 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 47734 NM_000948 5617 Hs.1905 NM_000948 ENSG00000172179 PRL GHA1 prolactin protein-coding 269.667-55 chr8 81109741 81109991 + 1.66667 NA intron (NM_018440, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 2202 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 262.333-17 chr11 73209983 73210351 + 1.66667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -8114 NM_002564 5029 Hs.339 NM_002564 ENSG00000175591 P2RY2 HP2U|P2RU1|P2U|P2U1|P2UR|P2Y2|P2Y2R purinergic receptor P2Y2 protein-coding 234.667-92 chr5 88080647 88080844 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 188100 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 289.334-2 chr10 27929235 27929414 + 1.66667 NA intron (NM_001290021, intron 9 of 13) L1M7|LINE|L1 52547 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 339.666-13 chr6 77914727 77915035 + 1.66667 NA intron (NM_001282136, intron 4 of 4) L1PA16|LINE|L1 261842 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 234-56 chr5 39564128 39564288 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 43777 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 300.334 chr1 21885706 21885966 + 1.66667 NA intron (NM_005529, intron 9 of 96) intron (NM_005529, intron 9 of 96) 51474 NM_001291860 3339 Hs.562227 NM_005529 ENSG00000142798 HSPG2 HSPG|PLC|PRCAN|SJA|SJS|SJS1 heparan sulfate proteoglycan 2 protein-coding 231.333-37 chr12 103093247 103093470 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -58484 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 256.334-17 chr6 50395302 50395493 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -318147 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 252.666-25 chr21 32271937 32272219 + 1.66667 NA intron (NM_018944, intron 2 of 4) intron (NM_018944, intron 2 of 4) 6971 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 345.667-18 chr5 96124111 96124411 + 1.66667 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) FAM|SINE|Alu 45123 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 262-83 chr8 122304691 122305010 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 263794 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 379.667-8 chr3 193855193 193855604 + 1.66667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -11389 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 237.667-36 chr2 17664572 17664776 + 1.66667 NA 3' UTR (NM_001142286, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_001142286, exon 28 of 28) 89136 NM_001142286 79677 Hs.526728 NM_024624 ENSG00000163029 SMC6 SMC-6|SMC6L1|hSMC6 structural maintenance of chromosomes 6 protein-coding 368.667-14 chr9 79023334 79023642 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 122178 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 327-28 chr9 20860465 20860782 + 1.66667 NA intron (NM_017794, intron 17 of 45) AluSz|SINE|Alu 73696 NR_145762 109616992 NR_145762 ENSG00000202189 SNORA30B - small nucleolar RNA, H/ACA box 30B snoRNA 269-38 chr4 85800417 85800727 + 1.66667 NA intron (NM_001346093, intron 1 of 6) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 21774 NM_001346093 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 231.667-45 chr3 99833517 99833679 + 1.66667 NA intron (NM_001282794, intron 2 of 2) intron (NM_001282794, intron 2 of 2) -9733 NR_110821 101929357 Hs.741615 NR_110821 HP09053 - uncharacterized LOC101929357 ncRNA 398.334-5 chr9 23372671 23372945 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 299591 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 408.334 chr17 48307220 48307579 + 1.66667 NA non-coding (NR_131239, exon 3 of 3) non-coding (NR_131239, exon 3 of 3) 13052 NR_131239 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 403.334-4 chr6 115137429 115137751 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 506245 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 254-31 chr2 7558792 7558963 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 137616 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 313.667-12 chr14 55628486 55628694 + 1.66667 NA intron (NR_073129, intron 7 of 45) intron (NR_073129, intron 7 of 45) 48383 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 319.667-16 chr20 36452626 36452827 + 1.66667 NA intron (NM_001365621, intron 7 of 12) AluSz|SINE|Alu -8742 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 256.334-24 chr9 105597903 105598074 + 1.66667 NA intron (NM_001351502, intron 6 of 13) intron (NM_001351502, intron 6 of 13) 39857 NM_001351501 2218 Hs.55777 NM_006731 ENSG00000106692 FKTN CMD1X|FCMD|LGMD2M|LGMDR13|MDDGA4|MDDGB4|MDDGC4 fukutin protein-coding 210.334-2 chr14 28598670 28598853 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic 166558 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 258.334-15 chr3 50030658 50030856 + 1.66667 NA intron (NM_001349194, intron 3 of 17) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -58162 NR_036627 10181 Hs.439480 NM_005778 ENSG00000003756 RBM5 G15|H37|LUCA-15|LUCA15|RMB5 RNA binding motif protein 5 protein-coding 430.001-2 chr20 49772844 49773177 + 1.66667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -39703 NM_001260491 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 271.667-48 chr3 141022762 141022987 + 1.66667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -28473 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 205.334-5 chr7 16654290 16654426 + 1.66667 NA intron (NM_001362718, intron 1 of 10) intron (NM_001362718, intron 1 of 10) -6856 NM_001362717 28969 Hs.487635 NM_014038 ENSG00000136261 BZW2 HSPC028|MST017|MSTP017 basic leucine zipper and W2 domains 2 protein-coding 223-39 chr20 53363824 53364115 + 1.66667 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 178686 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 390.667-7 chr4 52124077 52124527 + 1.66667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 72998 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 254-45 chr20 4306359 4306712 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -57248 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 267-58 chr6 108243765 108243982 + 1.66667 NA intron (NM_001300929, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 17167 NM_001300929 8724 Hs.12102 NM_003795 ENSG00000112335 SNX3 Grd19|MCOPS8|SDP3 sorting nexin 3 protein-coding 234-17 chr12 90374714 90374912 + 1.66667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 81495 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 331-30 chr5 74305665 74305968 + 1.66667 NA TTS (NR_105009) TTS (NR_105009) 2509 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 316.334-5 chr3 130346931 130347313 + 1.66667 NA intron (NM_001278298, intron 1 of 40) intron (NM_001278298, intron 1 of 40) 1606 NM_153264 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 411.333-8 chr15 62649805 62650231 + 1.66667 NA intron (NM_015059, intron 1 of 55) intron (NM_015059, intron 1 of 55) 2707 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 586 chr11 7057365 7058058 + 1.66667 NA exon (NM_176822, exon 7 of 12) exon (NM_176822, exon 7 of 12) -31287 NM_014469 27288 Hs.121605 NM_014469 ENSG00000170748 RBMXL2 HNRNPG-T|HNRNPGT|HNRPGT RBMX like 2 protein-coding 277.334-17 chr8 123760664 123760936 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -7639 NM_001317918 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 320.667-23 chr3 22076493 22076830 + 1.66667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 119522 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 293.334-7 chr8 73673830 73674043 + 1.66667 NA intron (NM_001164382, intron 3 of 13) L1MC5a|LINE|L1 72904 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 242.333-3 chr1 93060888 93061142 + 1.66667 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -18220 NM_001164391 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 413.333-14 chr6 127082392 127082734 + 1.66667 NA Intergenic Intergenic -36108 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 398.667-2 chr12 9079714 9080128 + 1.66667 NA intron (NM_000014, intron 23 of 35) intron (NM_000014, intron 23 of 35) 14744 NR_137425 144571 Hs.592432 NR_026971 ENSG00000245105 A2M-AS1 - A2M antisense RNA 1 ncRNA 283.667-11 chr18 7225832 7226078 + 1.66667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -5149 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 329.667-8 chr15 64191944 64192205 + 1.66667 NA intron (NM_001329605, intron 10 of 12) intron (NM_001329605, intron 10 of 12) -28919 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 244-35 chr14 71538034 71538188 + 1.66667 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -48187 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 253.667-10 chr10 44527811 44528076 + 1.66667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -142846 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 206.666-120 chr8 137589323 137589508 + 1.33333 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -175827 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 271.666-18 chr9 28118685 28119012 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -544982 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 167.666-5 chr21 18371827 18372008 + 1.33333 NA intron (NM_002772, intron 6 of 24) intron (NM_002772, intron 6 of 24) 31868 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 205.333-203 chr6 54219434 54219704 + 1.33333 NA intron (NM_138569, intron 10 of 12) MER58B|DNA|hAT-Charlie -88872 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 194.666-34 chr2 30508576 30508775 + 1.33333 NA intron (NM_001304445, intron 3 of 7) L1PA13|LINE|L1 61429 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 196.666-75 chr4 30547909 30548108 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -172361 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 212.666-27 chr14 61531942 61532120 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 12 of 13) intron (NM_006255, intron 12 of 13) 38163 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 211.333-184 chr5 76653224 76653544 + 1.33333 NA intron (NM_006633, intron 18 of 35) intron (NM_006633, intron 18 of 35) -29981 NM_001256566 2151 Hs.42502 NM_004101 ENSG00000164220 F2RL2 PAR-3|PAR3 coagulation factor II thrombin receptor like 2 protein-coding 181.333-105 chr3 151336105 151336275 + 1.33333 NA TTS (NM_176876) TTS (NM_176876) 4632 NM_176876 64805 Hs.591281 NM_022788 ENSG00000169313 P2RY12 ADPG-R|BDPLT8|HORK3|P2T(AC)|P2Y(12)R|P2Y(AC)|P2Y(ADP)|P2Y(cyc)|P2Y12|SP1999 purinergic receptor P2Y12 protein-coding 202.333-149 chr5 124597494 124597788 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 147471 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 194.333-38 chr13 103916471 103916726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 491398 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 160.667-322 chr9 22643134 22643330 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2968 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 195.333-229 chr9 108482623 108482823 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 373263 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 343.333-24 chr5 18213882 18214331 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 406832 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 339.333-14 chr16 35439507 35439896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40895 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 243.333-111 chr7 111567887 111568125 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -5489 NM_001350959 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 220.666-81 chrX 85314488 85314702 + 1.33333 NA intron (NM_001307940, intron 8 of 15) intron (NM_001307940, intron 8 of 15) 65070 NM_024921 79983 Hs.267038 NM_024921 ENSG00000124429 POF1B POF|POF2B POF1B actin binding protein protein-coding 184.333-43 chr14 63978476 63978759 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 13 of 114) intron (NM_015180, intron 13 of 114) 116508 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 226.667-71 chr5 19850476 19850809 + 1.33333 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 35630 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 300.333-26 chr2 191784418 191784705 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8279 NR_157850 729254 NR_157850 LOC729254 - hCG2045843 ncRNA 185.333-43 chr14 25393874 25394056 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -343668 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 140.666-13 chr9 10180941 10181089 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) L1M5|LINE|L1 381623 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 229.999-6 chr2 104016512 104016687 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 391733 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 206-179 chr8 90308478 90308767 + 1.33333 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 87134 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 157-77 chr2 240208508 240208809 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68000 NM_148961 150677 Hs.148586 NM_148961 ENSG00000178602 OTOS OTOSP otospiralin protein-coding 229.333-94 chr5 19653698 19653934 + 1.33333 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 232456 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 206.666-15 chr10 15726536 15726704 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6285 NM_001291494 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 308.333-20 chr2 70012621 70013054 + 1.33333 NA intron (NR_033872, intron 7 of 10) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -50572 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 248-19 chr13 96633237 96633483 + 1.33333 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) 206131 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 220-25 chr11 93393967 93394306 + 1.33333 NA intron (NM_181645, intron 9 of 13) MIRc|SINE|MIR 63419 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 198-70 chr17 28249403 28249613 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 2064 NR_002181 23614 Hs.744962 NR_002181 ENSG00000265060 PPY2P PPY2 pancreatic polypeptide 2, pseudogene pseudo 249.999-3 chr2 42344361 42344664 + 1.33333 NA intron (NM_001319038, intron 2 of 2) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 15526 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 262-66 chr5 100485949 100486193 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49303 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 356.666-14 chr5 30215463 30215763 + 1.33333 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 335053 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 117.333-182 chr6 129233840 129233971 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 12 of 64) intron (NM_000426, intron 12 of 64) 350764 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 253.333-115 chr8 134120332 134120660 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 234000 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 177-73 chr7 85752227 85752468 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 331225 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 257.333-94 chr7 113351003 113351207 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -232523 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 196-9 chr1 186114583 186114891 + 1.33333 NA intron (NM_031935, intron 73 of 106) intron (NM_031935, intron 73 of 106) -181536 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 202.666-34 chr14 47073010 47073213 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) intron (NM_001113498, intron 6 of 16) 270135 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 203.333-40 chr10 116583824 116584065 + 1.33333 NA Intergenic Charlie13b|DNA|hAT-Charlie -7015 NM_006229 5407 Hs.73923 NM_006229 ENSG00000187021 PNLIPRP1 PLRP1 pancreatic lipase related protein 1 protein-coding 342.666-19 chr4 70510374 70510822 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7971 NM_001286731 401138 Hs.453069 NM_212557 ENSG00000187689 AMTN AI3B|UNQ689 amelotin protein-coding 331-29 chr5 19872816 19873158 + 1.33333 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 13285 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 156.667-340 chr8 106935912 106936124 + 1.33333 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL -165774 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 240-86 chr8 40191893 40192274 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 38601 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 181.333-70 chr19 44566109 44566312 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -9293 NR_027754 388550 Hs.446909 NR_027754 ENSG00000230666 CEACAM22P - carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 22, pseudogene pseudo 259-31 chr20 49144058 49144471 + 1.33333 NA intron (NM_004602, intron 5 of 13) Looper|DNA|PiggyBac 44106 NM_001322932 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 241-26 chr17 11907677 11908051 + 1.33333 NA intron (NM_001372, intron 61 of 68) intron (NM_001372, intron 61 of 68) 24962 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 224-35 chr18 6228145 6228351 + 1.33333 NA intron (NM_001365769, intron 10 of 16) L1MCc|LINE|L1 -28496 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 195.333-181 chr5 99279773 99280002 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254103 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 206-94 chr2 197334210 197334456 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23553 NR_160034 91526 Hs.432706 NM_153697 ENSG00000065413 ANKRD44 PP6-ARS-B ankyrin repeat domain 44 protein-coding 187.333-44 chr12 17277000 17277199 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 288352 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 227.667-81 chr9 35564382 35564737 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001099951) promoter-TSS (NM_001099951) -681 NM_001287238 730112 Hs.98959 NM_001099951 ENSG00000215187 FAM166B - family with sequence similarity 166 member B protein-coding 209.333-103 chr2 17792939 17793214 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23384 NM_001105569 343930 NM_001105569 ENSG00000151379 MSGN1 MSOG|pMsgn1 mesogenin 1 protein-coding 217-41 chr18 69362913 69363204 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37830 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 200-85 chr2 149747845 149748060 + 1.33333 NA intron (NR_110240, intron 2 of 2) intron (NR_110240, intron 2 of 2) 111239 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 433.666-4 chr20 17597838 17598401 + 1.33333 NA intron (NM_001011546, intron 2 of 4) L1MB7|LINE|L1 28044 NM_006870 11034 Hs.304192 NM_006870 ENSG00000125868 DSTN ACTDP|ADF|HEL32|bA462D18.2 destrin, actin depolymerizing factor protein-coding 229.666-3 chr11 28805901 28806230 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -328517 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 255-67 chr5 109408114 109408425 + 1.33333 NA intron (NM_014819, intron 1 of 9) intron (NM_014819, intron 1 of 9) 1705 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 340-21 chr4 44194110 44194403 + 1.33333 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 177194 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 139.667-140 chr4 99803499 99803649 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13253 NM_001306151 27071 Hs.436271 NM_014395 ENSG00000070190 DAPP1 BAM32 dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 protein-coding 230-53 chr5 27017366 27017626 + 1.33333 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) MER20B|DNA|hAT-Charlie 21090 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 179 chr1 36057116 36057329 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_024852, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_024852, exon 19 of 19) -26872 NM_014466 27285 Hs.127111 NM_014466 ENSG00000092850 TEKT2 TEKTB1|TEKTIN-T|h-tektin-t tektin 2 protein-coding 256.333-86 chr9 319138 319527 + 1.33333 NA intron (NM_001193536, intron 6 of 46) intron (NM_001193536, intron 6 of 46) 46284 NM_001193536 81704 Hs.132599 NM_203447 ENSG00000107099 DOCK8 HEL-205|MRD2|ZIR8 dedicator of cytokinesis 8 protein-coding 250-92 chr8 113496991 113497381 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -60247 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 212.333-23 chr10 120909439 120909642 + 1.33333 NA TTS (NM_018117) TTS (NM_018117) 58178 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 339.667-13 chr3 22233188 22233668 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 276289 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 194-81 chr2 148856444 148856626 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -18692 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 117.333-218 chr9 26776309 26776446 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 116425 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 292.666-21 chr2 188849058 188849329 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59070 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 196.666-52 chr2 179944302 179944492 + 1.33333 NA TTS (NM_020943) TTS (NM_020943) 62900 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 211.333-214 chr6 163786497 163786698 + 1.33333 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -115113 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 249.666-17 chr19 39847257 39847595 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1047 NM_001436 2091 Hs.299002 NM_001436 ENSG00000105202 FBL FIB|FLRN|Nop1|RNU3IP1 fibrillarin protein-coding 324.666-18 chr7 139697078 139697362 + 1.33333 NA intron (NM_001113239, intron 2 of 14) intron (NM_001113239, intron 2 of 14) 80778 NM_022740 28996 Hs.731417 NM_022740 ENSG00000064393 HIPK2 PRO0593 homeodomain interacting protein kinase 2 protein-coding 172.667-23 chr10 57128977 57129184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 175479 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 171.666-6 chr3 35530937 35531144 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -108485 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 280-4 chr11 112442364 112442808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39646 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 369.333-26 chr7 42159314 42159672 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) intron (NM_000168, intron 2 of 14) 77716 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 438.666-2 chr1 189803464 189803857 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 672350 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 193.333-3 chr1 80601002 80601271 + 1.33333 NA intron (NR_125940, intron 2 of 3) L1MB1|LINE|L1 -40151 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 186-35 chr14 63399456 63399720 + 1.33333 NA intron (NR_104104, intron 4 of 12) L1MB7|LINE|L1 -80653 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 244-5 chr1 88631655 88632072 + 1.33333 NA intron (NR_110682, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 -52281 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 273.667-6 chr1 171885331 171885814 + 1.33333 NA intron (NM_001278252, intron 1 of 14) MER115|DNA|hAT-Tip100 21380 NR_046845 100874284 NR_046845 ENSG00000233540 DNM3-IT1 - DNM3 intronic transcript 1 ncRNA 223.333-62 chr19 38979430 38979613 + 1.33333 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -3779 NM_024907 115290 Hs.531770 NM_024907 ENSG00000269190 FBXO17 FBG4|FBX26|FBXO26|Fbx17 F-box protein 17 protein-coding 192.666-9 chr10 62276648 62276866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7913 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 135.666-2 chr10 88583924 88584133 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001031709) promoter-TSS (NM_001031709) -703 NM_018363 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 333-2 chr1 63142370 63142730 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -130079 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 314-40 chr5 140057684 140058247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14666 NM_004883 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 206.666-39 chr14 53746026 53746195 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 202374 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 262.333-6 chr1 149948731 149949067 + 1.33333 NA intron (NM_020205, intron 10 of 11) intron (NM_020205, intron 10 of 11) -12020 NM_001145862 10903 Hs.425144 NM_006697 ENSG00000014914 MTMR11 CRA myotubularin related protein 11 protein-coding 346-34 chr7 10527775 10528173 + 1.33333 NA intron (NR_147499, intron 2 of 2) L1PA8A|LINE|L1 -174702 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 255.333-6 chr10 13818147 13818470 + 1.33333 NA intron (NM_001318336, intron 2 of 23) AluJr|SINE|Alu -110741 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 167-77 chr4 84394575 84394726 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -95481 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 183-8 chr1 179975380 179975549 + 1.33333 NA intron (NM_014810, intron 1 of 37) L2|LINE|L2 20654 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 203.666-60 chrX 67551421 67551671 + 1.33333 NA intron (NM_001348064, intron 1 of 2) intron (NM_001348064, intron 1 of 2) 6923 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 195.333-77 chr14 47075554 47075791 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) L1MC4|LINE|L1 267574 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 246.666-28 chr3 64609794 64610016 + 1.33333 NA intron (NM_001318781, intron 21 of 38) L1MB5|LINE|L1 48559 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 204-120 chr21 18597205 18597386 + 1.33333 NA intron (NR_109925, intron 2 of 3) intron (NR_109925, intron 2 of 3) 88869 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 223.333-85 chr2 161642307 161642492 + 1.33333 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) intron (NM_001354451, intron 1 of 25) 17983 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 238.667-87 chr8 58021038 58021390 + 1.33333 NA intron (NM_147189, intron 1 of 4) intron (NM_147189, intron 1 of 4) 26691 NM_147189 90362 Hs.154652 NM_147189 ENSG00000169122 FAM110B C8orf72 family with sequence similarity 110 member B protein-coding 314.667-39 chr9 11657167 11657595 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -1036004 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 184-46 chr19 52743491 52743695 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8539 NM_001161500 81856 Hs.143951 NM_030972 ENSG00000213020 ZNF611 - zinc finger protein 611 protein-coding 272.666-8 chr13 72710605 72710862 + 1.33333 NA intron (NM_001071775, intron 2 of 2) intron (NM_001071775, intron 2 of 2) 16896 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 261.333-101 chr8 80929034 80929372 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -54422 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 198-56 chr15 56126562 56126836 + 1.33333 NA intron (NM_001370561, intron 7 of 11) L1M4|LINE|L1 63233 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 226-82 chr6 130247424 130247704 + 1.33333 NA intron (NM_001258275, intron 2 of 13) L1MC5|LINE|L1 -24613 NM_001017373 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 195.333-98 chr18 33405734 33405917 + 1.33333 NA intron (NM_001308126, intron 3 of 23) L1M8|LINE|L1 34746 NM_001371121 212.667-2 chr1 35929310 35929610 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_012199, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_012199, exon 19 of 19) -1645 NM_024852 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 195.333-157 chr4 74619917 74620139 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 174495 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 241.666-2 chr10 89555720 89555917 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20224 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 186.333-148 chr7 26410336 26410581 + 1.33333 NA intron (NR_148503, intron 2 of 6) intron (NR_148503, intron 2 of 6) -11040 NR_136272 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 238-31 chr16 62720903 62721250 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -684638 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 246.666-22 chr2 174191627 174191951 + 1.33333 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) intron (NM_001011708, intron 3 of 9) 56743 NM_001011708 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 179.333-13 chr1 195022551 195022697 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 1066091 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 202-21 chr10 86510734 86510942 + 1.33333 NA intron (NM_001318328, intron 2 of 18) AluJo|SINE|Alu 10946 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 160.666-7 chr2 163924399 163924589 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -188486 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 377.332 chr14 77575746 77576068 + 1.33333 NA intron (NM_004863, intron 4 of 11) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 40860 NM_004863 9517 Hs.435661 NM_004863 ENSG00000100596 SPTLC2 HSN1C|LCB2|LCB2A|NSAN1C|SPT2|hLCB2a serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2 protein-coding 179-76 chr5 34817964 34818187 + 1.33333 NA intron (NM_015577, intron 12 of 17) intron (NM_015577, intron 12 of 17) -21089 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 195.666-23 chr2 164428346 164428510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 140067 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 344.666 chr1 9265242 9265623 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_004285, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_004285, exon 5 of 5) 25585 NM_001282587 9563 Hs.463511 NM_004285 ENSG00000049239 H6PD CORTRD1|G6PDH|GDH hexose-6-phosphate dehydrogenase/glucose 1-dehydrogenase protein-coding 230-66 chr7 26686269 26686496 + 1.33333 NA intron (NM_003930, intron 10 of 12) intron (NM_003930, intron 10 of 12) 48511 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 204.666-59 chr3 195231297 195231521 + 1.33333 NA intron (NM_152531, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 16511 NM_001308069 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 204.333-71 chr16 80742212 80742390 + 1.33333 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) intron (NM_152342, intron 1 of 6) 62297 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 262.333-40 chr19 32659941 32660274 + 1.33333 NA intron (NM_032139, intron 1 of 28) AluJo|SINE|Alu 15073 NM_032139 84079 Hs.59236 NM_032139 ENSG00000105186 ANKRD27 PP12899|VARP ankyrin repeat domain 27 protein-coding 198.333-57 chr14 51155107 51155291 + 1.33333 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -59495 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 136-64 chr3 88165448 88165666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15598 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 371.333-9 chr14 57736159 57736630 + 1.33333 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) intron (NR_159373, intron 1 of 10) 128605 NM_001352013 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 321.333-18 chr12 112123421 112123937 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -1866 NM_001143906 10906 Hs.5148 NM_006700 ENSG00000135148 TRAFD1 FLN29 TRAF-type zinc finger domain containing 1 protein-coding 273-3 chr1 111258800 111259210 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -21519 NR_003928 149620 Hs.736960 NM_001013621 ENSG00000203878 CHIAP2 - chitinase, acidic pseudogene 2 pseudo 204-188 chr7 136617891 136618051 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -250681 NM_001006630 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 358.333-34 chrX 70849462 70849769 + 1.33333 NA intron (NM_001003811, intron 8 of 30) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -3320 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 268-64 chr9 83748446 83748855 + 1.33333 NA intron (NM_025211, intron 9 of 12) intron (NM_025211, intron 9 of 12) 40319 NR_135840 105376114 Hs.9589 NR_135839 ENSG00000254473 LOC105376114 - uncharacterized LOC105376114 ncRNA 235.333-131 chr9 32556317 32556511 + 1.33333 NA intron (NM_182739, intron 2 of 2) intron (NM_182739, intron 2 of 2) -3786 NM_001195622 10210 Hs.589962 NM_005802 ENSG00000197579 TOPORS LUN|P53BP3|RP31|TP53BPL TOP1 binding arginine/serine rich protein protein-coding 254-54 chr4 4793871 4794124 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 32237 NR_125892 101928279 Hs.586152 NR_125892 LOC101928279 - uncharacterized LOC101928279 ncRNA 200-136 chr5 111134278 111134504 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42219 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 189.666-27 chr22 19852283 19852508 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_024627, exon 3 of 3) 5' UTR (NM_024627, exon 3 of 3) 2479 NM_053004 54584 Hs.105642 NM_053004 ENSG00000185838 GNB1L DGCRK3|FKSG1|GY2|WDR14|WDVCF G protein subunit beta 1 like protein-coding 270.999 chr12 46871187 46871570 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45381 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 204-81 chr17 70274095 70274287 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 104656 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 180.666-24 chr3 132310863 132311036 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6458 NM_001099 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 271.333-75 chrX 9907648 9908065 + 1.33333 NA intron (NM_001649, intron 5 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie -4516 NM_001320664 357 Hs.567236 NM_001649 ENSG00000146950 SHROOM2 APXL|HSAPXL shroom family member 2 protein-coding 350.333-21 chr5 144186000 144186317 + 1.33333 NA intron (NM_020768, intron 2 of 3) intron (NM_020768, intron 2 of 3) 15285 NM_020768 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 136.667-12 chr1 212424661 212424851 + 1.33333 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 -8164 NM_013349 29937 Hs.461787 NM_013349 ENSG00000117691 NENF CIR2|SCIRP10|SPUF neudesin neurotrophic factor protein-coding 268.333-51 chr6 61901522 61901845 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 327553 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 244.666-26 chr2 216039036 216039335 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018441, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_018441, exon 8 of 8) -25634 NM_018000 55686 Hs.620391 NM_018000 ENSG00000118242 MREG DSU|WDT2 melanoregulin protein-coding 219.333-135 chr4 184937155 184937373 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1176 NR_039660 100616111 NR_039660 ENSG00000263458 MIR4455 - microRNA 4455 ncRNA 221.666-39 chr4 129126032 129126200 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 29964 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 237.333-89 chr5 34670987 34671337 + 1.33333 NA intron (NM_001145520, intron 1 of 17) intron (NM_001145520, intron 1 of 17) -13345 NM_001145521 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 347.666-4 chr13 34454266 34454621 + 1.33333 NA intron (NR_047036, intron 2 of 2) intron (NR_047036, intron 2 of 2) 106400 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 161.666-2 chr1 235199549 235199709 + 1.33333 NA intron (NM_031371, intron 16 of 22) intron (NM_031371, intron 16 of 22) -9513 NR_039908 100616224 NR_039908 ENSG00000263439 MIR4753 mir-4753 microRNA 4753 ncRNA 198-116 chr3 30990692 30990864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -96117 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 272.666-25 chr7 132338460 132338691 + 1.33333 NA intron (NM_020911, intron 3 of 31) intron (NM_020911, intron 3 of 31) 77714 NR_134565 101928807 Hs.552131 NR_134565 LOC101928807 - uncharacterized LOC101928807 ncRNA 148-16 chr10 34437649 34437861 + 1.33333 NA intron (NM_001184791, intron 4 of 20) intron (NM_001184791, intron 4 of 20) 377541 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 321.333-34 chr18 60470101 60470427 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -97489 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 210.666-22 chr11 99437910 99438163 + 1.33333 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) intron (NM_001243271, intron 2 of 20) -118109 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 267-40 chr2 124970148 124970415 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 944994 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 254.666-22 chr3 84515162 84515374 + 1.33333 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 354307 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 212-85 chr2 54539393 54539667 + 1.33333 NA intron (NM_003128, intron 2 of 35) L1ME3G|LINE|L1 10308 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 196.666-18 chr12 85159634 85159783 + 1.33333 NA intron (NM_001079910, intron 23 of 26) intron (NM_001079910, intron 23 of 26) -120512 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 357.666-2 chr1 231403994 231404278 + 1.33333 NA intron (NM_022051, intron 1 of 4) intron (NM_022051, intron 1 of 4) 20908 NM_022051 54583 Hs.444450 NM_022051 ENSG00000135766 EGLN1 C1orf12|ECYT3|HALAH|HIF-PH2|HIFPH2|HPH-2|HPH2|PHD2|SM20|ZMYND6 egl-9 family hypoxia inducible factor 1 protein-coding 196-202 chrX 63680991 63681262 + 1.33333 NA intron (NM_001353922, intron 4 of 8) intron (NM_001353922, intron 4 of 8) -9624 NR_138419 100874355 Hs.671524 NR_138419 ENSG00000231729 ARHGEF9-IT1 - ARHGEF9 intronic transcript 1 ncRNA 194.333-80 chr20 41717039 41717192 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -98738 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 195-58 chr2 60631204 60631456 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -77676 NM_018014 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 153-83 chr20 36034423 36034611 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16443 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 204-176 chr6 71766876 71767063 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119734 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 238-21 chr14 44999702 45000028 + 1.33333 NA intron (NR_131765, intron 3 of 19) L1MA4|LINE|L1 37675 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 197.666-23 chr16 66827108 66827257 + 1.33333 NA intron (NM_001286500, intron 1 of 19) AluY|SINE|Alu 3794 NM_001018159 8883 Hs.460978 NM_003905 ENSG00000159593 NAE1 A-116A10.1|APPBP1|HPP1|ula-1 NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1 protein-coding 275-48 chr7 22792847 22793308 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 29772 NM_019059 54543 Hs.112318 NM_019059 ENSG00000196683 TOMM7 TOM7 translocase of outer mitochondrial membrane 7 protein-coding 302-25 chr18 5866745 5867243 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 26299 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 196.666-4 chr1 119959183 119959387 + 1.33333 NA intron (NM_001200001, intron 12 of 21) intron (NM_001200001, intron 12 of 21) -62770 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 310.667-29 chr3 117635812 117636266 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54886 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 182-53 chr2 165574785 165574983 + 1.33333 NA intron (NM_024969, intron 1 of 4) intron (NM_024969, intron 1 of 4) 2548 NM_024969 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 203.333-43 chr11 10234914 10235172 + 1.33333 NA intron (NM_030962, intron 1 of 39) intron (NM_030962, intron 1 of 39) 59164 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 216.667-115 chr9 114772741 114773045 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 19637 NM_001204344 9966 Hs.23349 NM_005118 ENSG00000181634 TNFSF15 TL1|TL1A|TNLG1B|VEGI|VEGI192A TNF superfamily member 15 protein-coding 485.333-5 chr3 178991784 178992439 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 79698 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 181.333-192 chr9 112207972 112208214 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -32796 NM_001282640 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 486-5 chr14 33562356 33563003 + 1.33333 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -146258 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 215-30 chr2 3783374 3783560 + 1.33333 NA intron (NM_001287444, intron 9 of 10) intron (NM_001287444, intron 9 of 10) 76625 NM_001365580 728597 Hs.304233 NM_001287444 ENSG00000214866 DCDC2C - doublecortin domain containing 2C protein-coding 269-10 chr10 83470743 83471085 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 206175 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 388.666-4 chr15 63791300 63791716 + 1.33333 NA intron (NM_003922, intron 1 of 77) intron (NM_003922, intron 1 of 77) 42440 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 214.333-31 chr12 31589842 31590114 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_046909) promoter-TSS (NR_046909) 55 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 301.333-12 chr11 72455189 72455558 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -20689 NM_001258394 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 369-12 chr5 149904061 149904574 + 1.33333 NA intron (NM_000440, intron 7 of 21) L1M5|LINE|L1 28660 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 151.333-167 chr16 79553275 79553483 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47358 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 136.667-189 chrX 74557820 74557970 + 1.33333 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 56729 NM_183353 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 216.666-70 chr8 138471988 138472231 + 1.33333 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 25152 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 171.333-87 chr2 115655552 115655702 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 311812 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 209.333-152 chr3 108587359 108587634 + 1.33333 NA intron (NM_020890, intron 1 of 20) L1ME3|LINE|L1 1942 NM_020890 57650 Hs.591308 NM_020890 ENSG00000163507 CIP2A KIAA1524|p90 cell proliferation regulating inhibitor of protein phosphatase 2A protein-coding 205-81 chr6 122152864 122153112 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -246563 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 245.333-131 chrX 47701480 47701807 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5548 NR_033924 392459 Hs.562045 NR_033924 ENSG00000187893 CXXC1P1 CXorf25|NCRNA00236 CXXC finger protein 1 pseudogene 1 pseudo 242.999-6 chr9 110818747 110819052 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy 90637 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 160.333-293 chr9 1877627 1877787 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137640 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 240-79 chr6 97774913 97775139 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -249505 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 212-64 chr16 8498504 8498817 + 1.33333 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 91178 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 217.999-3 chr14 70385166 70385342 + 1.33333 NA intron (NM_001202549, intron 2 of 4) L3b|LINE|CR1 -25571 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 162-119 chr8 71786661 71786851 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56367 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 142-78 chr22 32102685 32102892 + 1.33333 NA intron (NM_000343, intron 13 of 14) L1MA3|LINE|L1 -19189 NR_040114 23782 Hs.581098 NR_040114 ENSG00000234479 AP1B1P1 ADTB1L1|dJ127L4.2 AP1B1 pseudogene 1 pseudo 205.666-30 chr20 52980862 52981066 + 1.33333 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) 8606 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 260.333-22 chr14 85893150 85893390 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -41408 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 188-110 chr8 52153743 52153910 + 1.33333 NA intron (NM_014682, intron 15 of 25) MIRb|SINE|MIR -40536 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 390.999 chr18 14124813 14125279 + 1.33333 NA intron (NM_145287, intron 1 of 2) MER5A|DNA|hAT-Charlie 7389 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 214-29 chr12 39014662 39014887 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 -109183 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 202.333-101 chr2 214875428 214875599 + 1.33333 NA intron (NR_110292, intron 2 of 3) L1PB2|LINE|L1 28566 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 264.666-24 chr21 18818196 18818771 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58671 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 260-15 chr10 125801306 125801548 + 1.33333 NA TTS (NM_001324039) TTS (NM_001324039) -18313 NR_039704 100616327 NR_039704 ENSG00000265092 MIR4484 mir-4484 microRNA 4484 ncRNA 199-25 chr14 52830148 52830327 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -38630 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 280-19 chr18 72317514 72317907 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 226632 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 202.666-103 chr6 37960696 37960912 + 1.33333 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 141077 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 303.999-5 chr8 84654251 84654712 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1MA3|LINE|L1 -51446 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 231.333-67 chr22 27064733 27065138 + 1.33333 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 -4417 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 327.333-3 chr1 235283792 235284216 + 1.33333 NA intron (NR_135074, intron 2 of 24) AluSz6|SINE|Alu 43483 NM_001206794 51742 Hs.575782 NM_016374 ENSG00000054267 ARID4B BCAA|BRCAA1|RBBP1L1|RBP1L1|SAP180 AT-rich interaction domain 4B protein-coding 245.999-5 chr19 4755178 4755389 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -13822 NR_027148 284424 Hs.326728 NM_174947 ENSG00000176840 MIR7-3HG C19orf30|Huh7|LINC00306|NCRNA00306|PGSF1|uc002mbe.2 MIR7-3 host gene ncRNA 128.667-46 chr12 54325386 54325538 + 1.33333 NA intron (NM_001271734, intron 1 of 7) intron (NM_001271734, intron 1 of 7) 331 NM_016057 22818 Hs.505652 NM_016057 ENSG00000111481 COPZ1 CGI-120|COPZ|HSPC181|zeta-COP|zeta1-COP coatomer protein complex subunit zeta 1 protein-coding 247-29 chr16 12286679 12286969 + 1.33333 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) L1MC5|LINE|L1 310090 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 291.333-18 chr12 70507567 70507984 + 1.33333 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 102249 NM_002837 5787 Hs.201030 NM_002837 ENSG00000127329 PTPRB HPTP-BETA|HPTPB|PTPB|R-PTP-BETA|VEPTP protein tyrosine phosphatase receptor type B protein-coding 233.333-135 chr9 34950650 34950958 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -6683 NR_136307 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 343.333-30 chr6 133708527 133708865 + 1.33333 NA intron (NR_109982, intron 4 of 8) intron (NR_109982, intron 4 of 8) -112451 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 227.667-47 chr3 84026695 84027014 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 842721 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 182.667-138 chr5 127274097 127274355 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -16538 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 196-102 chr21 19113402 19113551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -353664 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 214-12 chr10 10138330 10138557 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 79721 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 245-50 chr4 5226073 5226422 + 1.33333 NA intron (NM_001306082, intron 4 of 12) intron (NM_001306082, intron 4 of 12) 174767 NM_001306082 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 169-73 chr4 55965668 55965893 + 1.33333 NA exon (NM_025009, exon 8 of 26) exon (NM_025009, exon 8 of 26) 16835 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 407.666-7 chr21 31943491 31943844 + 1.33333 NA intron (NM_014586, intron 3 of 10) intron (NM_014586, intron 3 of 10) 70647 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 207.333-165 chr20 58956466 58956640 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -24703 NM_198976 51497 Hs.517148 NM_016397 ENSG00000101158 NELFCD HSPC130|NELF-C|NELF-D|TH1|TH1L negative elongation factor complex member C/D protein-coding 152.666-6 chr2 48258446 48258591 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56164 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 222.666-27 chr20 51068160 51068397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45171 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 192.333-86 chr2 36160493 36160675 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 194986 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 225.333-122 chr7 27373953 27374148 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -126821 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 228.666-12 chr12 33242174 33242384 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 197540 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 258.666-28 chr4 64934421 64934761 + 1.33333 NA intron (NR_033976, intron 5 of 6) L1MB1|LINE|L1 69909 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 178-87 chr4 128969484 128969710 + 1.33333 NA intron (NM_144643, intron 10 of 20) (AAAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 123942 NM_001300897 132320 Hs.654690 NM_144643 ENSG00000151466 SCLT1 CAP-1A|CAP1A sodium channel and clathrin linker 1 protein-coding 200.666-69 chr2 225815977 225816147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -326732 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 205.999-4 chr21 27452729 27452885 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -269572 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 237-37 chr19 36463117 36463336 + 1.33333 NA intron (NM_001145345, intron 4 of 4) AluJo|SINE|Alu 26209 NM_032838 84924 Hs.533939 NM_032838 ENSG00000186017 ZNF566 - zinc finger protein 566 protein-coding 270-56 chr6 140038732 140039083 + 1.33333 NA intron (NR_121623, intron 1 of 1) intron (NR_121623, intron 1 of 1) -47646 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 186.666-49 chr8 30239379 30239529 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 83085 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 162-80 chr3 20506656 20506846 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 164283 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 333.333-56 chrX 153488045 153488352 + 1.33333 NA intron (NR_073156, intron 1 of 12) intron (NR_073156, intron 1 of 12) -6782 NM_001711 633 Hs.821 NM_001711 ENSG00000182492 BGN DSPG1|MRLS|PG-S1|PGI|SEMDX|SLRR1A biglycan protein-coding 199.333-262 chr7 67485024 67485273 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 149172 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 203.333-254 chr8 23680839 23681096 + 1.33333 NA non-coding (NR_046072, exon 2 of 2) non-coding (NR_046072, exon 2 of 2) 1922 NM_001256339 4824 Hs.55999 NM_006167 ENSG00000167034 NKX3-1 BAPX2|NKX3|NKX3.1|NKX3A NK3 homeobox 1 protein-coding 278.666-11 chr15 70919887 70920329 + 1.33333 NA intron (NM_017691, intron 7 of 15) intron (NM_017691, intron 7 of 15) 27665 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 321.666-6 chr2 159856506 159857073 + 1.33333 NA intron (NM_002349, intron 16 of 34) intron (NM_002349, intron 16 of 34) 47967 NM_001198760 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 201.333-305 chrX 22617633 22617894 + 1.33333 NA intron (NR_073010, intron 4 of 11) intron (NR_073010, intron 4 of 11) 344850 NM_152577 158506 Hs.132485 NM_152577 ENSG00000175809 CBLL2 CT138|HAKAIL|ZNF645 Cbl proto-oncogene like 2 protein-coding 412.332-2 chr5 176436814 176437140 + 1.33333 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger -11408 NM_014613 23197 Hs.484242 NM_014613 ENSG00000113194 FAF2 ETEA|UBXD8|UBXN3B Fas associated factor family member 2 protein-coding 366.333-15 chr4 33695062 33695557 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 344584 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 250.666-31 chr5 101858706 101859012 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 437425 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 185.333-64 chr17 34923426 34923646 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 37924 NM_001193529 10693 Hs.73072 NM_006584 ENSG00000132141 CCT6B CCT-zeta-2|CCTZ-2|Cctz2|TCP-1-zeta-2|TSA303 chaperonin containing TCP1 subunit 6B protein-coding 148-114 chr4 57417593 57417805 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8173 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 208.666-42 chr15 60255533 60255711 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 142364 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 156.666-3 chr11 29825669 29825818 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 156650 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 232-85 chr7 107532586 107532888 + 1.33333 NA intron (NM_181733, intron 5 of 20) HAL1M8|LINE|L1 -31220 NR_073004 11062 Hs.97627 NM_181581 ENSG00000105865 DUS4L DUS4|PP35 dihydrouridine synthase 4 like protein-coding 189.666-37 chr7 94081346 94081559 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -77097 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 222.666-26 chr2 168353144 168353372 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -103014 NM_001256126 253782 Hs.506829 NM_203463 ENSG00000172292 CERS6 CERS5|LASS6 ceramide synthase 6 protein-coding 225-26 chr15 61617843 61618230 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -111882 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 295.666-8 chr2 65506112 65506507 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -73710 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 366.333-21 chr7 81357576 81357963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 204050 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 439-2 chr15 68143629 68144081 + 1.33333 NA intron (NM_016166, intron 4 of 13) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 62255 NR_104583 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 285.333-39 chr3 8666724 8667083 + 1.33333 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL -14819 NM_001256749 51066 Hs.736935 NM_015931 ENSG00000125046 SSUH2 C3orf32|SSU-2|fls485 ssu-2 homolog protein-coding 328-16 chr18 48695186 48695577 + 1.33333 NA intron (NM_014772, intron 6 of 11) intron (NM_014772, intron 6 of 11) 24781 NR_039897 100616366 NR_039897 ENSG00000266276 MIR4743 - microRNA 4743 ncRNA 182.666-32 chr4 163638646 163638803 + 1.33333 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) L1MB2|LINE|L1 -25190 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 339-20 chr8 129211296 129211753 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29716 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 362.333 chr10 83048055 83048429 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 628847 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 189.666-5 chr11 6092399 6092571 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -15199 NM_001005181 196335 Hs.632154 NM_001005181 ENSG00000180919 OR56B4 OR11-67 olfactory receptor family 56 subfamily B member 4 protein-coding 232-7 chr1 95050215 95050441 + 1.33333 NA intron (NM_001305242, intron 2 of 4) intron (NM_001305242, intron 2 of 4) -11268 NR_132786 101928098 Hs.730090 NR_132786 ENSG00000230427 LOC101928098 - uncharacterized LOC101928098 ncRNA 282.666-10 chr2 37852805 37853109 + 1.33333 NA intron (NR_110012, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 22906 NR_110012 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 260.333-53 chr5 147374522 147374979 + 1.33333 NA intron (NM_001112724, intron 10 of 12) MER5A|DNA|hAT-Charlie 78942 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 335.333-22 chr2 52813356 52813713 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -110919 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 296.667-40 chr3 111555656 111556022 + 1.33333 NA intron (NM_001318889, intron 2 of 7) L1M4a1|LINE|L1 13642 NM_005816 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 348.333-27 chr5 80809471 80809770 + 1.33333 NA intron (NM_002439, intron 19 of 23) intron (NM_002439, intron 19 of 23) -150743 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 248.999-8 chr8 118119987 118120184 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8266 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 218.666-64 chr6 162444690 162444903 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) MIRc|SINE|MIR -282336 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 265-59 chr6 166110882 166111257 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 13349 NR_147704 729681 Hs.520550 NR_147704 LOC729681 - uncharacterized LOC729681 ncRNA 199.333-25 chr10 55220075 55220272 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -378869 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 206.667-92 chr3 174598550 174598867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -260626 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 199-54 chr2 151656660 151656821 + 1.33333 NA intron (NM_001271208, intron 48 of 182) MIRc|SINE|MIR 77736 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 240-20 chr14 36173349 36173644 + 1.33333 NA intron (NR_049735, intron 1 of 3) intron (NR_049735, intron 1 of 3) 3155 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 163-92 chr9 73161584 73161810 + 1.33333 NA intron (NM_000700, intron 6 of 12) intron (NM_000700, intron 6 of 12) 9832 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 197-118 chr8 117323014 117323260 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 188142 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 209.666-20 chr16 58394233 58394512 + 1.33333 NA intron (NM_001126130, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 1901 NM_001126129 64785 Hs.47125 NM_022770 ENSG00000181938 GINS3 PSF3 GINS complex subunit 3 protein-coding 217.333-56 chr17 80753725 80753948 + 1.33333 NA intron (NM_020761, intron 5 of 33) intron (NM_020761, intron 5 of 33) 51796 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 310.666 chr1 153375832 153376268 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_005621) promoter-TSS (NM_005621) -429 NM_005621 6283 Hs.19413 NM_005621 ENSG00000163221 S100A12 CAAF1|CAGC|CGRP|ENRAGE|MRP-6|MRP6|p6 S100 calcium binding protein A12 protein-coding 201.333-114 chr15 68780713 68780870 + 1.33333 NA intron (NM_006305, intron 5 of 6) intron (NM_006305, intron 5 of 6) 21134 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 266-8 chr10 44607792 44608074 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -222836 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 203.333-81 chr14 66772458 66772623 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 265133 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 210-30 chr12 25932629 25932822 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 24860 NR_038227 100506451 Hs.560092 NR_038227 RASSF8-AS1 - RASSF8 antisense RNA 1 ncRNA 217.333-33 chr11 67170619 67170830 + 1.33333 NA intron (NR_027473, intron 2 of 20) intron (NR_027473, intron 2 of 20) 51461 NM_012308 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 210.666-55 chr2 69596615 69596818 + 1.33333 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) intron (NM_014911, intron 2 of 21) 47023 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 225.333-24 chr11 34614820 34615077 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6145 NM_012153 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 160.666-16 chr5 135505305 135505450 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 30587 NM_006161 4762 Hs.248149 NM_006161 ENSG00000181965 NEUROG1 AKA|Math4C|NEUROD3|bHLHa6|ngn1 neurogenin 1 protein-coding 188-96 chr6 147561089 147561361 + 1.33333 NA intron (NM_001030060, intron 1 of 1) AluSc5|SINE|Alu 52535 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 256-37 chr2 25689355 25689664 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15835 NM_001256304 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 248.666-42 chrX 114948752 114948965 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 68758 NM_000640 3598 Hs.336046 NM_000640 ENSG00000123496 IL13RA2 CD213A2|CT19|IL-13R|IL13BP interleukin 13 receptor subunit alpha 2 protein-coding 240-47 chr2 118026563 118026898 + 1.33333 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -12660 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 265.666-11 chr15 59721595 59722025 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32490 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 208.666-100 chr7 28346323 28346487 + 1.33333 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 47084 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 168-34 chr15 59082772 59082970 + 1.33333 NA intron (NM_001270529, intron 8 of 13) intron (NM_001270529, intron 8 of 13) -22275 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 302-67 chr8 65403614 65403911 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 158904 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 201.333-70 chr12 14969588 14969846 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -3325 NM_006205 5149 Hs.54471 NM_006205 ENSG00000139053 PDE6H ACHM6|RCD3 phosphodiesterase 6H protein-coding 340.667-3 chr10 21989622 21990167 + 1.33333 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) L1MEi|LINE|L1 13836 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 285.333-42 chr3 103162665 103163133 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 361217 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 228.333-13 chr11 63446609 63446968 + 1.33333 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 44379 NM_001146728 117245 Hs.410316 NM_054108 ENSG00000168004 PLAAT5 HRASLS5|HRLP5|HRSL5|PLAAT-5|RLP1|iNAT phospholipase A and acyltransferase 5 protein-coding 206-160 chr6 133835137 133835339 + 1.33333 NA intron (NR_027030, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 14091 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 234.333-25 chr14 53707575 53707839 + 1.33333 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 240777 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 236-55 chr3 95914401 95914605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -231310 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 288.333 chr1 9755726 9755975 + 1.33333 NA intron (NM_014944, intron 2 of 17) intron (NM_014944, intron 2 of 17) 64383 NM_001350235 5293 Hs.518451 NM_005026 ENSG00000171608 PIK3CD APDS|IMD14|P110DELTA|PI3K|p110D phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta protein-coding 207.333-29 chr10 57519779 57519985 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -215323 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 240-50 chr2 142716510 142716823 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -160998 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 200.666-81 chr3 157268264 157268427 + 1.33333 NA intron (NM_024621, intron 12 of 13) intron (NM_024621, intron 12 of 13) -107585 NM_001308185 57018 Hs.4859 NM_020307 ENSG00000163660 CCNL1 ANIA6A|BM-001|PRO1073|ania-6a cyclin L1 protein-coding 214.333-126 chr6 53368527 53368693 + 1.33333 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -19431 NM_001242831 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 265.333-13 chr11 16230762 16231039 + 1.33333 NA intron (NM_033326, intron 4 of 15) L1ME4a|LINE|L1 125646 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 279-3 chr1 185775085 185775413 + 1.33333 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) intron (NM_031935, intron 1 of 106) 40858 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 405.333-9 chr7 98110545 98111005 + 1.33333 NA intron (NM_014916, intron 1 of 13) intron (NM_014916, intron 1 of 13) 3913 NM_014916 22853 Hs.444179 NM_014916 ENSG00000164715 LMTK2 AATYK2|BREK|KPI-2|KPI2|LMR2|PPP1R100|cprk|hBREK lemur tyrosine kinase 2 protein-coding 197.333-158 chr3 124924637 124924868 + 1.33333 NA intron (NM_033049, intron 2 of 11) L1ME4b|LINE|L1 9999 NM_033049 56667 Hs.5940 NM_033049 ENSG00000173702 MUC13 DRCC1|MUC-13 mucin 13, cell surface associated protein-coding 595.333 chr14 69801827 69802642 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4993 NM_003049 6554 Hs.952 NM_003049 ENSG00000100652 SLC10A1 NTCP solute carrier family 10 member 1 protein-coding 319.333-9 chr12 85745786 85746176 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90428 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 144.333-155 chr21 24286746 24286929 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 34540 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 186.667-45 chr16 8922833 8923070 + 1.33333 NA intron (NM_001286458, intron 4 of 31) intron (NM_001286458, intron 4 of 31) 13688 NM_001286458 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 391.999-2 chr20 57343099 57343428 + 1.33333 NA intron (NM_198265, intron 11 of 11) intron (NM_198265, intron 11 of 11) -7992 NM_003610 8480 Hs.371698 NM_003610 ENSG00000101146 RAE1 Gle2|MIG14|MRNP41|Mnrp41|dJ481F12.3|dJ800J21.1 ribonucleic acid export 1 protein-coding 393.667-5 chr14 52293393 52293968 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -20632 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 354.332 chr12 16286221 16286524 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -8687 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 198.666-98 chr9 80871381 80871537 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 818076 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 219.666-35 chr5 13973406 13973586 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -29016 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 209-54 chr2 13140011 13140212 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133098 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 210-64 chr2 82334636 82334847 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -522062 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 133.333-60 chr15 63766604 63766819 + 1.33333 NA intron (NM_003922, intron 2 of 77) AluSp|SINE|Alu 67237 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 192.666-65 chr9 30729933 30730091 + 1.33333 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -321558 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 142.667-65 chr15 57684191 57684387 + 1.33333 NA intron (NM_001018091, intron 12 of 12) intron (NM_001018091, intron 12 of 12) -22232 NM_001018102 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 203.333-99 chr16 77478838 77478994 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -43882 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 304.667-35 chr8 98987480 98987907 + 1.33333 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -25573 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 203.333-24 chr10 12398529 12398707 + 1.33333 NA intron (NM_001351032, intron 2 of 11) AluSq|SINE|Alu 9636 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 134.666-2 chr10 116956620 116956780 + 1.33333 NA intron (NM_001127211, intron 4 of 16) intron (NM_001127211, intron 4 of 16) 48487 NM_018330 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 205.333-69 chr14 50267379 50267577 + 1.33333 NA intron (NM_024884, intron 8 of 9) AluY|SINE|Alu 32468 NR_039726 100616261 NR_039726 ENSG00000264712 MIR4504 - microRNA 4504 ncRNA 222.666-13 chr12 49417900 49418085 + 1.33333 NA intron (NM_001293285, intron 3 of 14) AluYh3|SINE|Alu 28818 NR_033267 100335030 Hs.687044 NR_033267 LOC100335030 - FGFR1 oncogene partner 2 pseudogene pseudo 202.666-93 chr5 55341318 55341481 + 1.33333 NA intron (NM_015360, intron 6 of 26) intron (NM_015360, intron 6 of 26) 33410 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 266.333-37 chr3 118431879 118432185 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -209736 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 407.666 chr1 79278366 79278799 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -271852 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 538-3 chr2 162368099 162368916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 24139 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 213.333-20 chr10 22630221 22630484 + 1.33333 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 83756 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 288.666-34 chr6 72495609 72495939 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -126069 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 195.333-225 chr9 28688604 28688818 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 30594 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 228.666-18 chr19 50700413 50700637 + 1.33333 NA intron (NM_016148, intron 12 of 23) L2c|LINE|L2 19277 NM_016148 50944 Hs.274255 NM_016148 ENSG00000161681 SHANK1 SPANK-1|SSTRIP|synamon SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1 protein-coding 252.333-71 chr7 101007453 101007795 + 1.33333 NA intron (NM_001164462, intron 3 of 11) L1MA2|LINE|L1 9984 NR_120520 102724094 Hs.571256 NR_120519 ENSG00000227053 LOC102724094 - uncharacterized LOC102724094 ncRNA 266.666-18 chr2 42201215 42201586 + 1.33333 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) MIR|SINE|MIR -31169 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 500-8 chr9_GL383542v1_alt 24035 24801 + 1.33333 NA NA AluY|SINE|Alu NA NA 202.666-42 chr15 56639652 56639880 + 1.33333 NA intron (NM_001002843, intron 19 of 20) HAL1|LINE|L1 94320 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 196.667-173 chr9 86663672 86663928 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 283706 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 296-53 chr5 81010510 81011030 + 1.33333 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) intron (NM_006909, intron 1 of 26) -49863 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 173-75 chr5 65821217 65821399 + 1.33333 NA intron (NM_020726, intron 12 of 12) LTR37B|LTR|ERV1 99103 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 308.667-34 chr5 148652275 148652688 + 1.33333 NA intron (NR_104445, intron 1 of 7) intron (NR_104445, intron 1 of 7) 2046 NM_000870 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 266-36 chr2 21315647 21315986 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 191830 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 210.333-160 chr7 87678787 87679070 + 1.33333 NA intron (NM_001134406, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 34395 NM_000927 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 402.332 chr14 78141783 78142100 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28432 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 218.666-22 chr13 47022373 47022626 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -125423 NM_001165947 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 198.333-106 chr2 223875580 223875808 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_020830, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_020830, exon 12 of 12) -38112 NM_001039569 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 281.333-24 chr16 86939974 86940291 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -117652 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 193.333-79 chr18 3265457 3265657 + 1.33333 NA intron (NM_001144945, intron 1 of 3) intron (NM_001144945, intron 1 of 3) 2838 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 243.333-75 chr3 97446998 97447193 + 1.33333 NA intron (NM_001278300, intron 2 of 12) intron (NM_001278300, intron 2 of 12) 7488 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 209.666-41 chr4 64748599 64748779 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 255811 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 254.666-28 chr6 150642166 150642441 + 1.33333 NA intron (NM_001329804, intron 2 of 17) intron (NM_001329804, intron 2 of 17) 9339 NR_138140 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 197.667-100 chr3 183122246 183122506 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_014398, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_014398, exon 6 of 6) -22789 NR_120639 56922 Hs.47649 NM_020166 ENSG00000078070 MCCC1 MCC-B|MCCA methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1 protein-coding 152-159 chr9 17014521 17014667 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120446 NM_001286984 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 175.333-175 chr7 78816276 78816466 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -192617 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 363.333-24 chr6 110647693 110648210 + 1.33333 NA intron (NM_001300963, intron 5 of 13) L1ME3F|LINE|L1 -166670 NM_001287215 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 191-9 chr10 65899114 65899363 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 327813 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 356.666-18 chr7 112234304 112234615 + 1.33333 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 27764 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 210-91 chr3 97817270 97817551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4601 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 353.333-26 chr4 77430004 77430535 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -81484 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 219.666-28 chr20 14879515 14879797 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 49862 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 505.333-7 chr5 8077503 8078319 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 208763 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 153.667-20 chr1 157075230 157075468 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 24459 NM_001004341 440695 Hs.127138 NM_001004341 ENSG00000253831 ETV3L - ETS variant 3 like protein-coding 233-6 chr1 211241583 211241863 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17554 NR_146433 55758 Hs.356399 NM_018254 ENSG00000117625 RCOR3 - REST corepressor 3 protein-coding 243.333-73 chr3 94594910 94595216 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -343200 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 216.666-38 chr2 45488671 45488875 + 1.33333 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) intron (NM_018079, intron 14 of 20) 122494 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 352.667-21 chr3 197255123 197255576 + 1.33333 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) intron (NM_001366216, intron 4 of 23) 38599 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 222.666-32 chr3 95407680 95407891 + 1.33333 NA Intergenic MER61C|LTR|ERV1 275408 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 213.333-116 chr21 34241156 34241364 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 60583 NR_027266 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 201.667-38 chr15 60735140 60735555 + 1.33333 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 53778 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 229-14 chr12 27388857 27389130 + 1.33333 NA TTS (NR_109975) TTS (NR_109975) 56157 NM_001248002 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 222-99 chr8 111889754 111890032 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 513254 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 201.333-301 chr9 99495273 99495493 + 1.33333 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -120126 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 152-138 chr6 143995573 143995815 + 1.33333 NA intron (NM_001289040, intron 1 of 5) intron (NM_001289040, intron 1 of 5) 12565 NM_001080954 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 207.666-3 chr1 178017675 178017840 + 1.33333 NA intron (NR_151484, intron 3 of 3) L1ME1|LINE|L1 20219 NR_151492 111240474 NM_001356505 CRYZL2P-SEC16B - CRYZL2P-SEC16B readthrough protein-coding 257.333-77 chr5 20495720 20495984 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 79861 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 199.333-2 chr1 33222293 33222556 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -34068 NM_152493 149076 Hs.743358 NM_152493 ENSG00000160094 ZNF362 RN|lin-29 zinc finger protein 362 protein-coding 204-187 chr7 119443379 119443597 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 463887 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 212-26 chr11 31236460 31236667 + 1.33333 NA intron (NM_001367979, intron 9 of 38) intron (NM_001367979, intron 9 of 38) 133176 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 192.666-41 chr3 69686860 69687045 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52512 NM_001354605 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 214.667-49 chr16 23407185 23407496 + 1.33333 NA intron (NM_153603, intron 11 of 16) L2a|LINE|L2 45849 NM_153603 91949 Hs.185807 NM_153603 ENSG00000168434 COG7 CDG2E component of oligomeric golgi complex 7 protein-coding 195.333-86 chr15 38656772 38657048 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -39688 NR_160786 250-3 chr1 90039285 90039565 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44315 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 385.666-4 chr18 743461 744113 + 1.33333 NA intron (NM_005433, intron 6 of 11) AluSx4|SINE|Alu -31123 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 271.333-49 chr3 165789048 165789310 + 1.33333 NA intron (NR_137635, intron 1 of 2) intron (NR_137635, intron 1 of 2) 48244 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 179.333-146 chr4 156567569 156567734 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 404148 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 126.666 chr21 20550132 20550331 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 252877 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 181.333-23 chr11 47062342 47062556 + 1.33333 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) intron (NM_001003677, intron 3 of 8) 114430 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 212.333-6 chr1 84903428 84903732 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10374 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 227-14 chr11 119953763 119954039 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 174952 NM_001330382 23650 Hs.504115 NM_012101 ENSG00000137699 TRIM29 ATDC tripartite motif containing 29 protein-coding 154-141 chr8 103272672 103272894 + 1.33333 NA intron (NR_148215, intron 2 of 3) L1MB8|LINE|L1 -25711 NM_001164615 8323 Hs.591863 NM_003506 ENSG00000164930 FZD6 FZ-6|FZ6|HFZ6|NDNC10 frizzled class receptor 6 protein-coding 223.333-175 chrX 153215158 153215445 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 36017 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 225.333-15 chr10 57081892 57082197 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 222515 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 209.333-120 chr2 120079580 120079806 + 1.33333 NA intron (NM_001330307, intron 10 of 16) intron (NM_001330307, intron 10 of 16) 66616 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 194.666-65 chr7 89202188 89202362 + 1.33333 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -406538 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 198.666-19 chr12 119192282 119192461 + 1.33333 NA intron (NM_014365, intron 2 of 2) intron (NM_014365, intron 2 of 2) 13581 NM_014365 26353 Hs.400095 NM_014365 ENSG00000152137 HSPB8 CMT2L|DHMN2|E2IG1|H11|HMN2|HMN2A|HSP22 heat shock protein family B (small) member 8 protein-coding 233-58 chr6 137264714 137265023 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -45438 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 151.667-318 chr6 121482046 121482185 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46469 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 320.667-30 chr7 92335193 92335592 + 1.33333 NA intron (NM_019004, intron 5 of 19) L1MEf|LINE|L1 -89292 NM_001350677 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 377-3 chr14 48298019 48298511 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -503251 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 277.333-63 chr3 67240408 67240766 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15123 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 254.666-8 chr11 75038645 75038958 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 49868 NM_001367864 10825 Hs.191074 NM_006656 ENSG00000162139 NEU3 SIAL3 neuraminidase 3 protein-coding 250.999 chr1 77568846 77569145 + 1.33333 NA intron (NM_015534, intron 12 of 14) intron (NM_015534, intron 12 of 14) 113663 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 212.666-49 chr2 204649088 204649329 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) L1ME2|LINE|L1 103733 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 211.666-52 chr8 110288584 110288855 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -312948 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 176-72 chr5 54007170 54007336 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) L3|LINE|CR1 -55654 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 198.666-68 chr4 62472086 62472236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -310396 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 204-195 chr8 99916290 99916566 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -22721 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 224-109 chr8 130355285 130355488 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) -58853 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 202.333-25 chr10 67451556 67451765 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) -48250 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 421.667-5 chr19 33423479 33423981 + 1.33333 NA intron (NM_001166056, intron 7 of 12) L1ME3A|LINE|L1 49206 NM_001252296 1054 Hs.429666 NM_001806 ENSG00000153879 CEBPG GPE1BP|IG/EBP-1 CCAAT enhancer binding protein gamma protein-coding 259.333-80 chr5 59743732 59744131 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MamRep605|LTR?|LTR? 24917 NM_001364601 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 279.333-40 chr2 29774669 29775077 + 1.33333 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 146713 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 310.667-23 chr2 113835366 113835814 + 1.33333 NA intron (NR_110174, intron 3 of 4) L1MA9|LINE|L1 -54344 NR_102318 10096 Hs.433512 NM_005721 ENSG00000115091 ACTR3 ARP3 actin related protein 3 protein-coding 285.333-37 chr2 233641107 233641455 + 1.33333 NA intron (NM_019075, intron 1 of 4) MER83|LTR|ERV1 4804 NM_019075 54575 Hs.554822 NM_019075 ENSG00000242515 UGT1A10 GNT1|UDPGT|UGT-1A|UGT-1J|UGT1|UGT1-01|UGT1-10|UGT1.1|UGT1.10|UGT1A|UGT1A1|UGT1J|hUG-BR1 UDP glucuronosyltransferase family 1 member A10 protein-coding 207.667-17 chr11 39283541 39283828 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 634826 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 197.333-35 chr11 66400706 66400864 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -20219 NM_001318804 266743 Hs.256036 NM_178864 ENSG00000174576 NPAS4 Le-PAS|NXF|PASD10|bHLHe79 neuronal PAS domain protein 4 protein-coding 193.333-203 chrX 147535543 147535830 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -250958 NR_030240 574518 NR_030240 ENSG00000207867 MIR514A3 MIR514-3|MIRN514-3|hsa-mir-514a-3 microRNA 514a-3 ncRNA 204.333-54 chr14 61684476 61684691 + 1.33333 NA intron (NR_047116, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR -10930 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 123.333-19 chr1 193425459 193425621 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 120795 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 202.333-171 chr8 75348604 75348785 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -58955 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 410.666-3 chr14 86678845 86679203 + 1.33333 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -226754 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 265.333-16 chr12 2099633 2099859 + 1.33333 NA intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 46461 NM_199460 775 Hs.118262 NM_000719 ENSG00000151067 CACNA1C CACH2|CACN2|CACNL1A1|CCHL1A1|CaV1.2|LQT8|TS|TS. LQT8 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C protein-coding 223.333-72 chr2 84743982 84744165 + 1.33333 NA intron (NM_001370, intron 62 of 76) intron (NM_001370, intron 62 of 76) 137011 NM_001307978 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 467.667-6 chr18 45897604 45898325 + 1.33333 NA intron (NM_020964, intron 27 of 43) intron (NM_020964, intron 27 of 43) 69365 NM_020964 57724 Hs.514843 NM_020964 ENSG00000152223 EPG5 HEEW1|KIAA1632|VICIS ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog protein-coding 192-16 chr1 247444713 247444926 + 1.33333 NA exon (NM_183395, exon 6 of 7) exon (NM_183395, exon 6 of 7) 7163 NM_001004492 127623 Hs.446999 NM_001004492 ENSG00000177535 OR2B11 - olfactory receptor family 2 subfamily B member 11 protein-coding 285.333-41 chr3 34549717 34549988 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 751222 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 177-53 chr3 121728790 121729043 + 1.33333 NA intron (NM_001256486, intron 4 of 21) intron (NM_001256486, intron 4 of 21) 20825 NM_004487 2804 Hs.213389 NM_004487 ENSG00000173230 GOLGB1 GCP|GCP372|GOLIM1 golgin B1 protein-coding 264.333-49 chr3 103850916 103851280 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -326982 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 150.333-433 chr9 35953405 35953560 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 4672 NM_019897 56656 Hs.553540 NM_019897 ENSG00000278889 OR2S2 OR37A|OST715 olfactory receptor family 2 subfamily S member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 233.333-85 chr3 152752400 152752621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -82621 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 249-26 chr14 64574632 64574942 + 1.33333 NA intron (NM_172365, intron 8 of 11) intron (NM_172365, intron 8 of 11) 24826 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 231.333-111 chr7 48742786 48743025 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -181642 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 256.333-27 chr14 33023438 33023750 + 1.33333 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) intron (NM_001165893, intron 1 of 10) 84715 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 243-36 chr2 208723190 208723510 + 1.33333 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) intron (NR_136588, intron 3 of 5) 180708 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 229.666-31 chr8 16309049 16309243 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116355 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 319.666-11 chr2 7538669 7538998 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 117572 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 166-52 chr17 44932245 44932433 + 1.33333 NA intron (NM_001264573, intron 9 of 14) intron (NM_001264573, intron 9 of 14) 2342 NR_106841 102466734 NR_106841 ENSG00000278223 MIR6783 hsa-mir-6783 microRNA 6783 ncRNA 187.667-75 chr2 146628332 146628593 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 41405 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 225.333-123 chr7 31857268 31857460 + 1.33333 NA intron (NM_001191059, intron 8 of 18) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 170149 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 221.999-8 chr3 149754547 149754715 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -2132 NR_135149 51122 Hs.432729 NM_016094 ENSG00000114744 COMMD2 HSPC042 COMM domain containing 2 protein-coding 230.333-38 chr14 55491147 55491448 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50752 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 170-36 chr14 67841060 67841328 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 4 of 10) L1PA16|LINE|L1 17602 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 204-205 chr9 20319775 20320087 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 91307 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 337.666-15 chrX 87375585 87375870 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -142075 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 188-102 chr7 69590274 69590570 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 7202 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 227.333-5 chr1 112396991 112397232 + 1.33333 NA intron (NM_018704, intron 1 of 5) intron (NM_018704, intron 1 of 5) 897 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 147-99 chr4 48791420 48791657 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11239 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 212-93 chr2 188320872 188321113 + 1.33333 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 23500 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 240.333-11 chr10 58280809 58281115 + 1.33333 NA intron (NM_018464, intron 2 of 2) intron (NM_018464, intron 2 of 2) 11800 NM_018464 55847 Hs.370102 NM_018464 ENSG00000122873 CISD1 C10orf70|MDS029|ZCD1|mitoNEET CDGSH iron sulfur domain 1 protein-coding 238.666-32 chr4 94442258 94442528 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9464 NM_001256426 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 231.999-4 chr19 44766061 44766247 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 7497 NR_107052 102465879 NR_107052 ENSG00000284258 MIR8085 hsa-mir-8085 microRNA 8085 ncRNA 316.333-21 chr4 79042760 79043148 + 1.33333 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) intron (NR_038342, intron 2 of 5) 71206 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 199.333-273 chr8 79873743 79873959 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2114 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 205.333-205 chr6 55461075 55461282 + 1.33333 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) intron (NR_109869, intron 3 of 4) 118036 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 180-54 chr2 125796646 125796866 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 321229 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 230.999 chr3 42766893 42767089 + 1.33333 NA intron (NM_144719, intron 1 of 15) L1MC2|LINE|L1 -3621 NR_122070 729083 Hs.713395 NR_122070 ENSG00000225611 LINC02158 - long intergenic non-protein coding RNA 2158 ncRNA 384-14 chr5 33546093 33546627 + 1.33333 NA intron (NM_001324512, intron 19 of 21) intron (NM_001324512, intron 19 of 21) 105584 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 206-92 chr2 190645821 190646071 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -2949 NM_001321313 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 142.667-237 chr8 136246768 136246984 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -283922 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 273.333-61 chr5 56557965 56558246 + 1.33333 NA intron (NR_161255, intron 1 of 5) intron (NR_161255, intron 1 of 5) 48151 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 268.333-5 chr10 19379340 19379634 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 26 of 39) L1MEd|LINE|L1 330686 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 196.333-118 chr3 155934663 155934842 + 1.33333 NA intron (NM_003875, intron 13 of 15) intron (NM_003875, intron 13 of 15) 64102 NM_003875 8833 Hs.591314 NM_003875 ENSG00000163655 GMPS GATD7 guanine monophosphate synthase protein-coding 290-5 chr1 162027137 162027417 + 1.33333 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 -2812 NM_001297713 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 200.666-39 chr14 88663869 88664035 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 23 of 42) intron (NM_183387, intron 23 of 42) 69532 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 208-17 chr10 19271409 19271574 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 19 of 39) AluSc8|SINE|Alu 222690 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 240.333-56 chr20 58779383 58779611 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 6072 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 144.666-4 chr10 113475708 113475895 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -75030 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 161-93 chr7 46162465 46162597 + 1.33333 NA Intergenic MER61A|LTR|ERV1 -241259 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 361.666-5 chr2 150825503 150825827 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 196768 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 248-80 chr7 105247260 105247506 + 1.33333 NA intron (NM_182692, intron 2 of 15) intron (NM_182692, intron 2 of 15) 21694 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 214.666-46 chr3 138006291 138006497 + 1.33333 NA intron (NM_001002026, intron 1 of 4) intron (NM_001002026, intron 1 of 4) -3771 NM_016369 51208 Hs.655324 NM_016369 ENSG00000066405 CLDN18 SFTA5|SFTPJ claudin 18 protein-coding 253.333-59 chr2 189256955 189257282 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -77357 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 286.333-4 chr10 45583202 45583691 + 1.33333 NA intron (NM_145021, intron 1 of 6) L1ME3G|LINE|L1 11460 NM_145021 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 200.666-121 chr8 126122600 126122797 + 1.33333 NA Intergenic L1M3a|LINE|L1 -171501 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 167.333-91 chr15 62201411 62201562 + 1.33333 NA intron (NR_148210, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 1832 NR_148210 107984784 Hs.591131 NR_148210 ENSG00000259697 LOC107984784 - uncharacterized LOC107984784 ncRNA 179-63 chr22 27854024 27854194 + 1.33333 NA intron (NM_001284277, intron 10 of 10) intron (NM_001284277, intron 10 of 10) -52353 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 256.666-33 chr4 61395189 61395472 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 193158 NM_001371342 307.333-66 chr5 50343618 50344030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97464 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 255-80 chr7 70743039 70743342 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 6 of 18) AluSx|SINE|Alu -388954 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 255.333-120 chr9 29478078 29478379 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -264627 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 183.666-18 chr5 17043382 17043665 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -107235 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 183-104 chr9 133801480 133801707 + 1.33333 NA intron (NM_001134398, intron 9 of 29) intron (NM_001134398, intron 9 of 29) -61638 NM_007101 1757 Hs.198003 NM_007101 ENSG00000123453 SARDH BPR-2|DMGDHL1|SAR|SARD|SDH sarcosine dehydrogenase protein-coding 197.333-148 chr3 69839191 69839426 + 1.33333 NA intron (NM_001354608, intron 2 of 10) intron (NM_001354608, intron 2 of 10) -26916 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 185-28 chr17 80685448 80685742 + 1.33333 NA intron (NM_020761, intron 3 of 33) L1MC4|LINE|L1 120037 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 451.333-8 chr8 99328929 99329368 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 207582 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 321.333-49 chr6 46598151 46598512 + 1.33333 NA intron (NM_016593, intron 7 of 11) intron (NM_016593, intron 7 of 11) 54487 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 193.333-12 chr1 199844227 199844407 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183393 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 324.666-3 chr11 110979734 110980276 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 117313 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 246.333-58 chr3 50086112 50086391 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2668 NR_036627 10181 Hs.439480 NM_005778 ENSG00000003756 RBM5 G15|H37|LUCA-15|LUCA15|RMB5 RNA binding motif protein 5 protein-coding 352-20 chr5 19576981 19577360 + 1.33333 NA intron (NM_001349559, intron 7 of 12) L1MA6|LINE|L1 309102 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 216-6 chr1 193897683 193897941 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 593067 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 202-47 chr14 63778203 63778488 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -50280 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 377.666-5 chr10 68434869 68435193 + 1.33333 NA intron (NM_001080449, intron 10 of 20) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -27737 NM_001042417 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 298-74 chr6 169143066 169143318 + 1.33333 NA Intergenic LTR1B|LTR|ERV1 19109 NR_132622 101929484 Hs.364166 NR_132622 ENSG00000223485 LINC01615 - long intergenic non-protein coding RNA 1615 ncRNA 276-64 chr8 144953808 144954286 + 1.33333 NA Intergenic LTR7|LTR|ERV1 -3167 NM_001029976 7564 Hs.493225 NM_006958 ENSG00000170631 ZNF16 HZF1|KOX9 zinc finger protein 16 protein-coding 176.333-78 chr2 29829772 29829957 + 1.33333 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 91722 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 200.666-33 chr14 41302375 41302551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -304393 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 167.333-227 chr6 51328853 51329007 + 1.33333 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -292940 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 209-4 chr1 119418724 119419011 + 1.33333 NA intron (NM_000198, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 3717 NM_000198 3284 Hs.654399 NM_000198 ENSG00000203859 HSD3B2 HSD3B|HSDB|SDR11E2 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2 protein-coding 120.333-104 chr2 168939262 168939415 + 1.33333 NA intron (NM_003742, intron 21 of 27) intron (NM_003742, intron 21 of 27) 38047 NM_001081686 57818 Hs.283963 NM_021176 ENSG00000152254 G6PC2 IGRP glucose-6-phosphatase catalytic subunit 2 protein-coding 189.333-45 chr12 82319188 82319347 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39120 NM_014167 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 259.333-31 chr14 45158173 45158470 + 1.33333 NA intron (NM_001308133, intron 7 of 21) intron (NM_001308133, intron 7 of 21) 22382 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 329.333-14 chr14 80521719 80522148 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 23 of 24) intron (NM_152446, intron 23 of 24) -290876 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 194-118 chr6 49035049 49035245 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 428106 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 164.666-10 chr2 162083018 162083224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8264 NR_147697 100131604 NR_147697 LOC100131604 - uncharacterized LOC100131604 ncRNA 208-62 chr17 31505907 31506170 + 1.33333 NA intron (NM_001346748, intron 1 of 12) L1M5|LINE|L1 17930 NM_001346748 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 188.666-24 chr3 119804783 119804981 + 1.33333 NA intron (NM_022002, intron 1 of 8) L1MB8|LINE|L1 22172 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 240.666-21 chr2 168278693 168278921 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31212 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 213.333-50 chr12 94277745 94277924 + 1.33333 NA intron (NM_005761, intron 21 of 30) MIRb|SINE|MIR 15313 NR_037687 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 183.666-6 chr14 83116586 83116767 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 474044 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 174.666-7 chr13 46237344 46237494 + 1.33333 NA intron (NM_001282460, intron 5 of 9) L1MC2|LINE|L1 25491 NM_001282460 220416 Hs.267765 NM_001024609 ENSG00000173988 LRRC63 - leucine rich repeat containing 63 protein-coding 329-24 chr7 93336023 93336403 + 1.33333 NA intron (NM_001257998, intron 23 of 28) intron (NM_001257998, intron 23 of 28) 103847 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 491.333-3 chr6 109899444 109899955 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -78557 NM_001286099 2830 Hs.46332 NM_005284 ENSG00000146360 GPR6 - G protein-coupled receptor 6 protein-coding 316.667-3 chr10 69211377 69211778 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8755 NM_025130 80201 Hs.522988 NM_025130 ENSG00000156510 HKDC1 - hexokinase domain containing 1 protein-coding 249.333-38 chr15 83197446 83197823 + 1.33333 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) intron (NM_016073, intron 1 of 5) 10189 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 209.333-248 chr9 13446655 13446865 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15431 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 228.667-71 chr7 36011070 36011348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84101 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 176.667-51 chr13 87485235 87485443 + 1.33333 NA intron (NR_033829, intron 2 of 5) L1MA1|LINE|L1 133401 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 215.666 chr1 62679518 62679801 + 1.33333 NA intron (NM_001367561, intron 1 of 49) L1ME3B|LINE|L1 8709 NM_033407 85440 Hs.744927 NM_033407 ENSG00000116641 DOCK7 EIEE23|ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 protein-coding 198.667-44 chr12 8451659 8451931 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -4167 NM_001317999 93978 Hs.591147 NM_001007033 ENSG00000205846 CLEC6A CLEC4N|CLECSF10|dectin-2 C-type lectin domain containing 6A protein-coding 203.333-181 chr3 124918169 124918398 + 1.33333 NA intron (NM_033049, intron 5 of 11) intron (NM_033049, intron 5 of 11) 16468 NM_033049 56667 Hs.5940 NM_033049 ENSG00000173702 MUC13 DRCC1|MUC-13 mucin 13, cell surface associated protein-coding 198.667-144 chr5 12272451 12272710 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -302277 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 198.666-25 chr14 72405032 72405325 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -111642 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 188-15 chr1 210130603 210130877 + 1.33333 NA intron (NM_153262, intron 6 of 7) (CCATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -102056 NM_019605 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 174.666-22 chr7 2359573 2359748 + 1.33333 NA intron (NM_001037283, intron 1 of 18) MER21C|LTR|ERVL 4833 NM_001037283 8662 Hs.371001 NM_003751 ENSG00000106263 EIF3B EIF3-ETA|EIF3-P110|EIF3-P116|EIF3S9|PRT1 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B protein-coding 254.666-21 chr22 47728555 47728780 + 1.33333 NA intron (NR_122046, intron 7 of 8) intron (NR_122046, intron 7 of 8) 96993 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 462.999-2 chr2 28937120 28937673 + 1.33333 NA intron (NM_015131, intron 13 of 17) intron (NM_015131, intron 13 of 17) 9413 NR_145755 109617012 NR_145755 ENSG00000265706 SNORD53B - small nucleolar RNA, C/D box 53B snoRNA 218.666 chr1 33399682 33399975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24235 NM_198040 1912 Hs.524271 NM_004427 ENSG00000134686 PHC2 EDR2|HPH2|PH2 polyhomeotic homolog 2 protein-coding 204-179 chr6 153725376 153725674 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -284971 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 290.666-20 chr3 101018146 101018660 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24913 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 183-66 chr2 196781399 196781544 + 1.33333 NA intron (NM_012086, intron 8 of 17) MER2|DNA|TcMar-Tigger 18212 NM_001206774 9330 Hs.470996 NM_012086 ENSG00000119041 GTF3C3 TFIIIC102|TFIIICgamma|TFiiiC2-102 general transcription factor IIIC subunit 3 protein-coding 338.999 chr1 21917803 21918100 + 1.33333 NA intron (NM_005529, intron 1 of 96) L2c|LINE|L2 19359 NM_001291860 3339 Hs.562227 NM_005529 ENSG00000142798 HSPG2 HSPG|PLC|PRCAN|SJA|SJS|SJS1 heparan sulfate proteoglycan 2 protein-coding 204-73 chr16 58419753 58419926 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27368 NM_001126129 64785 Hs.47125 NM_022770 ENSG00000181938 GINS3 PSF3 GINS complex subunit 3 protein-coding 199.666-22 chr2 27740832 27740982 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 24784 NR_160725 105374378 NR_160725 LOC105374378 - uncharacterized LOC105374378 ncRNA 201.333-140 chr2 16337470 16337677 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 287146 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 288-24 chr17 11927508 11927897 + 1.33333 NA intron (NM_001372, intron 62 of 68) intron (NM_001372, intron 62 of 68) 44800 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 204-91 chr2 5346831 5347022 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 344192 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 260.333-6 chr11 111861427 111861671 + 1.33333 NA intron (NR_147984, intron 4 of 15) AluJo|SINE|Alu 9732 NM_001352415 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 158.333-204 chr3 85467725 85467867 + 1.33333 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) LTR16C|LTR|ERVL -37263 NM_001256504 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 300-44 chr3 145071544 145071875 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 997476 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 207.333-79 chr14 25039494 25039670 + 1.33333 NA intron (NM_001304476, intron 1 of 6) intron (NM_001304476, intron 1 of 6) 9418 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 199.333-29 chr10 90260321 90260482 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 280404 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 324.666-5 chr13 78661907 78662317 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2957 NM_024546 79596 Hs.567576 NM_024546 ENSG00000152193 OBI1 C13orf7|RNF219 ORC ubiquitin ligase 1 protein-coding 222-20 chr12 81425746 81426011 + 1.33333 NA intron (NM_001220478, intron 3 of 28) intron (NM_001220478, intron 3 of 28) -56464 NM_001220480 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 220.333-19 chr10 107749024 107749213 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 320175 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 409.666-9 chr7 112951303 112951882 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11717 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 130.667-58 chr12 80805391 80805595 + 1.33333 NA intron (NM_004664, intron 5 of 5) intron (NM_004664, intron 5 of 5) 27136 NR_030348 693202 NR_030348 ENSG00000207763 MIR617 MIRN617|hsa-mir-617 microRNA 617 ncRNA 179.666-5 chr18 32548044 32548194 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 36456 NR_003558 441818 Hs.549773 NR_003558 ENSG00000260389 WBP11P1 HsT3017 WW domain binding protein 11 pseudogene 1 pseudo 190-6 chr1 113442903 113443121 + 1.33333 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) L2c|LINE|L2 52497 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 205.333-132 chr2 206521664 206521957 + 1.33333 NA intron (NM_003812, intron 3 of 25) L1ME4a|LINE|L1 78278 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 220.333-56 chr18 67782094 67782388 + 1.33333 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) 32581 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 196-7 chr1 160767452 160767676 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 28317 NM_001282590 57823 Hs.517265 NM_021181 ENSG00000026751 SLAMF7 19A|CD319|CRACC|CS1 SLAM family member 7 protein-coding 207.333-102 chr15 70622855 70623091 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 7426 NR_126481 104548972 NR_126481 ENSG00000281264 SALRNA3 SAL-RNA3|XLOC_025918 senescence associated long non-coding RNA 3 ncRNA 246-98 chr7 22456242 22456504 + 1.33333 NA intron (NM_001164460, intron 4 of 4) intron (NM_001164460, intron 4 of 4) 43909 NM_001164460 256227 Hs.729825 NM_207342 ENSG00000105889 STEAP1B - STEAP family member 1B protein-coding 296.666-13 chr18 70303389 70303708 + 1.33333 NA intron (NM_004232, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 14503 NM_004232 9306 Hs.44439 NM_004232 ENSG00000170677 SOCS6 CIS-4|CIS4|HSPC060|SOCS-4|SOCS-6|SOCS4|SSI4|STAI4|STATI4 suppressor of cytokine signaling 6 protein-coding 222.666-35 chr4 28964152 28964471 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32473 NR_146499 102723764 NR_146499 LINC02364 - long intergenic non-protein coding RNA 2364 ncRNA 247.666-16 chr2 202892499 202892855 + 1.33333 NA exon (NM_018256, exon 8 of 13) exon (NM_018256, exon 8 of 13) -19541 NM_001282911 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 419.999 chr3 1363041 1363437 + 1.33333 NA intron (NM_001289080, intron 12 of 22) L1MA9|LINE|L1 270215 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 209-105 chr6 150410726 150410937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 41819 NR_134655 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 291-35 chr4 149410585 149410910 + 1.33333 NA intron (NM_001363507, intron 13 of 13) intron (NM_001363507, intron 13 of 13) 256452 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 153-35 chr12 109487881 109488092 + 1.33333 NA intron (NM_001270449, intron 6 of 8) intron (NM_001270449, intron 6 of 8) 10352 NM_130466 89910 Hs.374067 NM_130466 ENSG00000151148 UBE3B BPIDS|KOS ubiquitin protein ligase E3B protein-coding 207.666-12 chr11 65666059 65666352 + 1.33333 NA Intergenic MER87B|LTR|ERV1 -3233 NM_001243985 5970 Hs.502875 NM_021975 ENSG00000173039 RELA CMCU|NFKB3|p65 RELA proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 197.666-14 chr12 20057180 20057400 + 1.33333 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) intron (NR_040098, intron 2 of 2) 42605 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 298.667-28 chr8 90956311 90956725 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_022351, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_022351, exon 13 of 13) 28559 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 143.666-2 chr5 14612557 14612714 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_019018, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_019018, exon 8 of 8) 30843 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 211.333-229 chr8 29554566 29554818 + 1.33333 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 193417 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 192.666-70 chr9 107989959 107990147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -500284 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 189.333-131 chr3 107081024 107081187 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 159533 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 238.333-84 chr7 69467294 69467509 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 130223 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 183.666-4 chr10 28930185 28930398 + 1.33333 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 83883 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 214.666-7 chr1 115709050 115709216 + 1.33333 NA intron (NM_001232, intron 8 of 10) intron (NM_001232, intron 8 of 10) 59672 NM_001232 845 Hs.57975 NM_001232 ENSG00000118729 CASQ2 PDIB2 calsequestrin 2 protein-coding 434.666-7 chr12 49126822 49127406 + 1.33333 NA TTS (NM_006082) TTS (NM_006082) 4281 NM_006082 10376 Hs.524390 NM_006082 ENSG00000123416 TUBA1B K-ALPHA-1 tubulin alpha 1b protein-coding 221.333-38 chr14 50692805 50692975 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -24584 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 215.999-6 chr4 63763860 63764057 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 645492 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 226.333-81 chr3 134652987 134653179 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2061 NM_001366277 339855 Hs.146730 NM_178554 ENSG00000174611 KY MFM7 kyphoscoliosis peptidase protein-coding 296.333-24 chr2 219230075 219230615 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_104255) promoter-TSS (NR_104255) 539 NM_018089 55139 Hs.437647 NM_018089 ENSG00000163516 ANKZF1 Vms1|ZNF744 ankyrin repeat and zinc finger peptidyl tRNA hydrolase 1 protein-coding 263.333-59 chr3 96243730 96244059 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116070 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 236.667-83 chr7 43606152 43606451 + 1.33333 NA intron (NM_004760, intron 2 of 6) intron (NM_004760, intron 2 of 6) 23193 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 145.333-37 chr10 62321287 62321467 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52533 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 376.333 chr1 84428690 84429183 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 20585 NM_058248 58511 Hs.129142 NM_021233 ENSG00000137976 DNASE2B DLAD deoxyribonuclease 2 beta protein-coding 205.333-35 chr10 73199762 73199957 + 1.33333 NA intron (NM_173348, intron 5 of 13) intron (NM_173348, intron 5 of 13) 31740 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 301.333-36 chr4 30703067 30703414 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17129 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 169-94 chr7 15544740 15544937 + 1.33333 NA exon (NM_001004320, exon 3 of 13) exon (NM_001004320, exon 3 of 13) 17177 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 201.667-36 chr15 20418658 20418896 + 1.33333 NA intron (NR_036432, intron 25 of 25) AluSq10|SINE|Alu 21710 NR_036443 440248 Hs.531509 NM_199045 ENSG00000206149 HERC2P9 - hect domain and RLD 2 pseudogene 9 pseudo 214-137 chr8 115340673 115340947 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 327203 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 226.667-33 chr13 91155358 91155656 + 1.33333 NA intron (NR_047004, intron 2 of 3) intron (NR_047004, intron 2 of 3) 56191 NR_047004 100874150 Hs.711947 NR_047004 LINC00379 - long intergenic non-protein coding RNA 379 ncRNA 208.667-35 chr12 9950523 9950785 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001207010) promoter-TSS (NM_001207010) -614 NM_001207010 160364 Hs.190519 NM_138337 ENSG00000172322 CLEC12A CD371|CLL-1|CLL1|DCAL-2|MICL C-type lectin domain family 12 member A protein-coding 292.666-27 chr5 84466020 84466340 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -81300 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 309.666-13 chr4 62973599 62974080 + 1.33333 NA Intergenic LTR30|LTR|ERV1 -812074 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 247.333-72 chr6 138432719 138432997 + 1.33333 NA exon (NM_001144060, exon 6 of 8) exon (NM_001144060, exon 6 of 8) 2436 NR_036099 100423001 NR_036099 ENSG00000266555 MIR3145 mir-3145 microRNA 3145 ncRNA 258-40 chr2 163088362 163088796 + 1.33333 NA Intergenic MER73|LTR|ERVL -249812 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 241.999 chr1 20336370 20336600 + 1.33333 NA exon (NM_001039500, exon 13 of 22) exon (NM_001039500, exon 13 of 22) 45610 NM_001039500 127731 Hs.205178 NM_144623 ENSG00000158816 VWA5B1 - von Willebrand factor A domain containing 5B1 protein-coding 271.333-25 chr2 20933981 20934271 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109947 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 209.333-207 chr6 102662826 102663033 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 1263944 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 382.333 chr11 4585867 4586481 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001005170) promoter-TSS (NM_001005170) -617 NM_001005170 143502 Hs.553607 NM_001005170 ENSG00000226288 OR52I2 OR11-12|OR52I1 olfactory receptor family 52 subfamily I member 2 protein-coding 298.333-18 chr17 60432854 60433261 + 1.33333 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 10568 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 164.333-8 chr1 189682485 189682626 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 793455 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 225.333-139 chr9 76796827 76797133 + 1.33333 NA intron (NM_001308048, intron 6 of 17) MLT2B4|LTR|ERVL 32544 NR_132313 50652 Hs.663766 NR_015342 ENSG00000225937 PCA3 DD3|NCRNA00019|PCAT3|PRUNE2-AS1 prostate cancer associated 3 ncRNA 311.999-2 chr14 68172632 68173045 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 349246 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 213.333-52 chr13 29943141 29943411 + 1.33333 NA intron (NR_033889, intron 3 of 4) intron (NR_033889, intron 3 of 4) 6745 NR_033889 440131 Hs.132371 NM_001010918 LINC00544 - long intergenic non-protein coding RNA 544 ncRNA 155-123 chr8 13499965 13500111 + 1.33333 NA exon (NM_182643, exon 2 of 18) exon (NM_182643, exon 2 of 18) 14813 NM_182643 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 227.666-10 chr13 41865621 41865857 + 1.33333 NA exon (NM_015058, exon 12 of 45) exon (NM_015058, exon 12 of 45) 95346 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 188.333-62 chr18 63937989 63938138 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11238 NM_001123366 284293 Hs.721604 NM_001123366 ENSG00000221887 HMSD ACC-6|ACC6|C18orf53|HSMD-v histocompatibility minor serpin domain containing protein-coding 154.666-2 chr10 112768867 112769028 + 1.33333 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) L1MC4|LINE|L1 -54549 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 197.333-152 chr3 95176760 95176923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 238578 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 433.999-3 chr2 202145530 202145864 + 1.33333 NA intron (NM_001277372, intron 13 of 23) AluSx1|SINE|Alu -28639 NR_135244 729224 Hs.623895 NR_135243 KIAA2012-AS1 - KIAA2012 antisense RNA 1 ncRNA 159.667-16 chr1 89772277 89772555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48616 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 207.667-90 chr4 94621297 94621578 + 1.33333 NA intron (NM_006457, intron 8 of 12) intron (NM_006457, intron 8 of 12) 136096 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 210.333-91 chr20 34480086 34480253 + 1.33333 NA intron (NM_001257137, intron 19 of 25) AluSx|SINE|Alu 13844 NR_030374 693229 NR_030374 ENSG00000207997 MIR644A MIR644|MIRN644|hsa-mir-644|hsa-mir-644a microRNA 644a ncRNA 223-58 chr6 149982179 149982525 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 18409 NM_001317089 80329 Hs.653255 NM_025218 ENSG00000111981 ULBP1 N2DL-1|NKG2DL1|RAET1I UL16 binding protein 1 protein-coding 454.666-2 chr22 27319878 27320305 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9440 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 224.666-43 chrX 63573915 63574153 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -12939 NR_152609 92249 Hs.31532 NR_015353 ENSG00000235437 LINC01278 - long intergenic non-protein coding RNA 1278 ncRNA 220.333-26 chr11 28482619 28482938 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -5230 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 210-97 chr3 150761424 150761618 + 1.33333 NA intron (NM_005067, intron 1 of 1) L1ME3G|LINE|L1 1648 NM_005067 6478 Hs.477959 NM_005067 ENSG00000181788 SIAH2 hSiah2 siah E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 197.666-16 chr14 63786342 63786635 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -58423 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 209.333-117 chr2 107244849 107245075 + 1.33333 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 104563 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 223-21 chr14 84382308 84382654 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -889451 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 194.667-156 chr8 124813353 124813633 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -8492 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 382.667-7 chr17 59389141 59389708 + 1.33333 NA exon (NM_001005404, exon 4 of 5) exon (NM_001005404, exon 4 of 5) 23341 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 216-51 chr18 70198575 70198884 + 1.33333 NA intron (NM_001318520, intron 5 of 47) intron (NM_001318520, intron 5 of 47) 6958 NM_173630 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 211.667-88 chr4 65135611 65135886 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -131248 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 185.666-4 chr10 127161616 127161786 + 1.33333 NA intron (NM_001039762, intron 4 of 5) intron (NM_001039762, intron 4 of 5) 34890 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 207-100 chr5 152234960 152235142 + 1.33333 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 170228 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 144.666-13 chr6 348851 349030 + 1.33333 NA exon (NM_001286555, exon 7 of 7) exon (NM_001286555, exon 7 of 7) -42812 NM_002460 3662 Hs.401013 NM_002460 ENSG00000137265 IRF4 LSIRF|MUM1|NF-EM5|SHEP8 interferon regulatory factor 4 protein-coding 166-101 chr6 69668270 69668425 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128119 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 355.333-32 chr6 101989186 101989703 + 1.33333 NA intron (NM_001166247, intron 13 of 16) intron (NM_001166247, intron 13 of 16) 590459 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 199-71 chr3 107411846 107411999 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -19008 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 244-42 chr17 54446965 54447261 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -453578 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 258.666-49 chr9 92699125 92699433 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -29148 NM_022755 64768 Hs.459896 NM_022755 ENSG00000127080 IPPK C9orf12|INSP5K2|IP5K|IPK1|bA476B13.1 inositol-pentakisphosphate 2-kinase protein-coding 228-86 chr8 74135431 74135788 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 144217 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 158-146 chr9 77890900 77891103 + 1.33333 NA intron (NM_002072, intron 2 of 6) intron (NM_002072, intron 2 of 6) 140810 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 236-7 chr10 29018977 29019212 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 172686 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 163.333-40 chr10 80506877 80507142 + 1.33333 NA intron (NM_030927, intron 3 of 8) intron (NM_030927, intron 3 of 8) 28933 NR_120661 101929574 Hs.593663 NR_120661 ENSG00000226659 LOC101929574 - uncharacterized LOC101929574 ncRNA 177.333-140 chr6 62665565 62665855 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -379483 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 425.333-12 chr7 104821223 104821748 + 1.33333 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) intron (NM_199000, intron 2 of 2) -17393 NR_034141 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 169-111 chrX 80657263 80657419 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 152536 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 176.667-82 chr2 179619646 179619838 + 1.33333 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) intron (NR_148056, intron 3 of 9) -33836 NM_001282725 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 177.333-39 chr12 55081117 55081349 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48536 NM_001005243 441639 Hs.553827 NM_001005243 ENSG00000170605 OR9K2 OR12-2 olfactory receptor family 9 subfamily K member 2 protein-coding 198-152 chr5 39388669 39388896 + 1.33333 NA intron (NM_001343, intron 8 of 14) intron (NM_001343, intron 8 of 14) -24287 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 460.333-2 chr22 27964479 27964981 + 1.33333 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu -44118 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 266-56 chr3 70964632 70964976 + 1.33333 NA intron (NR_146142, intron 19 of 19) intron (NR_146142, intron 19 of 19) 100120 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 118-137 chr9 35838513 35838655 + 1.33333 NA intron (NM_001042589, intron 4 of 13) L2|LINE|L2 9356 NM_001363622 51754 Hs.9187 NM_016446 ENSG00000137103 TMEM8B C9orf127|FP588|LINC00950|NAG-5|NAG5|NGX6 transmembrane protein 8B protein-coding 244.667-49 chr18 6744858 6745169 + 1.33333 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -15151 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 374-14 chr4 141134973 141135620 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -1827 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 378.333-2 chr1 209380844 209381321 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9027 NR_146491 101929476 Hs.568721 NR_146491 LINC01698 - long intergenic non-protein coding RNA 1698 ncRNA 231.333-110 chr7 43367391 43367717 + 1.33333 NA intron (NM_001287059, intron 5 of 27) intron (NM_001287059, intron 5 of 27) 154988 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 250-50 chr3 80219320 80219617 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -451470 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 202-167 chr6 133941123 133941303 + 1.33333 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -10957 NM_001253676 9519 Hs.486507 NM_004865 ENSG00000028839 TBPL1 MGC:8389|MGC:9620|STUD|TLF|TLP|TRF2 TATA-box binding protein like 1 protein-coding 299.666-2 chr1 171443057 171443444 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -42280 NM_015172 23215 Hs.494614 NM_015172 ENSG00000117523 PRRC2C BAT2-iso|BAT2D1|BAT2L2|XTP2 proline rich coiled-coil 2C protein-coding 503.666 chr2 110856469 110857042 + 1.33333 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 124182 NM_001371254 304-38 chr20 55332238 55332622 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -90613 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 239.333-83 chr5 25494350 25494638 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 303541 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 334.333-3 chr10 81660822 81661265 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -214151 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 285.667-46 chr7 29391690 29392037 + 1.33333 NA intron (NM_001293072, intron 3 of 12) intron (NM_001293072, intron 3 of 12) -87849 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 180.667-110 chr5 27501339 27501550 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 29152 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 196-122 chr3 105419859 105420013 + 1.33333 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 53027 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 201.333-119 chr16 5955415 5955765 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63434 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 342-14 chr16 23413415 23414014 + 1.33333 NA intron (NM_153603, intron 9 of 16) 7SK|RNA|RNA 39475 NM_153603 91949 Hs.185807 NM_153603 ENSG00000168434 COG7 CDG2E component of oligomeric golgi complex 7 protein-coding 297.666-4 chr14 52308548 52308851 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5613 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 201-76 chr3 63206573 63206757 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71643 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 215.333-88 chr2 59732043 59732349 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 514488 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 307-26 chr4 30714316 30714647 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5888 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 185.666-26 chr8 82348592 82348808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -506414 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 331.666-5 chr13 28813201 28813665 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -6906 NM_001366650 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 150-94 chr3 45044180 45044375 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14134 NM_001308394 7123 Hs.476092 NM_003278 ENSG00000163815 CLEC3B TN|TNA C-type lectin domain family 3 member B protein-coding 198-40 chr13 38024052 38024296 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 119058 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 245.333-60 chr19 35185077 35185293 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 30450 NM_001164605 53827 Hs.333418 NM_014164 ENSG00000089327 FXYD5 DYSAD|HSPC113|IWU1|KCT1|OIT2|PRO6241|RIC FXYD domain containing ion transport regulator 5 protein-coding 175.333-22 chr11 38305079 38305320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 341157 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 139.333-185 chr5 117949937 117950084 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) L1MC4|LINE|L1 219649 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 248-63 chr4 72501284 72501572 + 1.33333 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) L1PA15-16|LINE|L1 67793 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 203-12 chr10 35440727 35440989 + 1.33333 NA intron (NM_001282853, intron 2 of 10) intron (NM_001282853, intron 2 of 10) 103984 NM_001282852 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 194-16 chr11 30157317 30157507 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -73602 NM_001018080 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 166.666-10 chr3 119937157 119937314 + 1.33333 NA intron (NM_002093, intron 3 of 11) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 147413 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 234.667 chr1 39227488 39227718 + 1.33333 NA intron (NM_012090, intron 1 of 92) L2c|LINE|L2 143436 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 182.333-108 chr3 127095426 127095628 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -97604 NM_001007534 285311 Hs.591284 NM_001007534 ENSG00000214324 C3orf56 - chromosome 3 open reading frame 56 protein-coding 230.333-127 chr9 72853277 72853532 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20705 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 271.333-44 chr3 17730086 17730443 + 1.33333 NA intron (NM_001349076, intron 1 of 22) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 10643 NM_014744 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 259.333-55 chr2 171581428 171581751 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 59115 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 195-105 chr8 83262426 83262611 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -141240 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 348.999-4 chr5 121324723 121325237 + 1.33333 NA intron (NR_104999, intron 2 of 2) intron (NR_104999, intron 2 of 2) 2430 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 275-33 chr21 29758159 29758600 + 1.33333 NA intron (NR_027021, intron 2 of 4) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 10204 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 367.666-6 chr9 30461980 30462426 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -53749 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 272.333-24 chr18 2451648 2451939 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 119712 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 237-60 chr5 41840311 41840631 + 1.33333 NA exon (NM_001364300, exon 7 of 17) exon (NM_001364300, exon 7 of 17) 3186 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 263.333-79 chr7 106735144 106735447 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -74137 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 353.666-12 chr8 144879157 144879565 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001363101, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001363101, exon 6 of 6) 20944 NM_001363103 58500 Hs.532277 NM_021061 ENSG00000196150 ZNF250 ZFP647|ZNF647 zinc finger protein 250 protein-coding 220.666-4 chr1 110056069 110056304 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14486 NM_006492 257 Hs.669953 NM_006492 ENSG00000156150 ALX3 FND|FND1 ALX homeobox 3 protein-coding 211.333-38 chr11 88183888 88184131 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 7507 NR_036124 100423040 NR_036124 ENSG00000266581 MIR3166 - microRNA 3166 ncRNA 290.333-23 chr2 171533306 171533547 + 1.33333 NA intron (NM_001127383, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 10952 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 209.333-255 chrX 99192895 99193128 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1217262 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 439.666-2 chr7 88696299 88696974 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63064 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 172.333-126 chr4 114267464 114267613 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -287891 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 180-33 chr14 42766375 42766593 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 1159628 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 298.333-8 chr12 53648845 53649347 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -22681 NM_001206682 11016 Hs.12286 NM_006856 ENSG00000170653 ATF7 ATFA activating transcription factor 7 protein-coding 373-3 chr14 55569920 55570565 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 9850 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 159-61 chr2 83726162 83726339 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 203436 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 179-52 chr2 44315886 44316119 + 1.33333 NA intron (NM_000341, intron 9 of 9) intron (NM_000341, intron 9 of 9) 40522 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 169.333-81 chr14 61984270 61984427 + 1.33333 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) intron (NM_001367657, intron 3 of 6) 56653 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 401.333-10 chr15 38261417 38261838 + 1.33333 NA intron (NM_152594, intron 1 of 6) AluYc|SINE|Alu 8791 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 259.999-6 chr2 48046957 48047173 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -141272 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 284-10 chr12 2206500 2206994 + 1.33333 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 16734 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 300.999-3 chr19 34129086 34129556 + 1.33333 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu -43183 NM_015578 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 173-16 chr11 58416723 58416944 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 6480 NM_001005566 390190 Hs.553753 NM_001005566 ENSG00000172365 OR5B2 OR11-240|OST073 olfactory receptor family 5 subfamily B member 2 protein-coding 220.666-39 chr2 201299423 201299657 + 1.33333 NA intron (NM_139163, intron 11 of 14) intron (NM_139163, intron 11 of 14) 39004 NM_033356 841 Hs.599762 NM_001228 ENSG00000064012 CASP8 ALPS2B|CAP4|Casp-8|FLICE|MACH|MCH5 caspase 8 protein-coding 250.666-17 chr17 66491395 66491603 + 1.33333 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) -74645 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 248-68 chr5 14753391 14753708 + 1.33333 NA intron (NM_054027, intron 4 of 11) intron (NM_054027, intron 4 of 11) 40855 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 176-7 chr1 114249168 114249378 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95404 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 261.333-51 chr2 146659596 146659903 + 1.33333 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 72692 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 231.666-20 chr3 116125983 116126196 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -220963 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 202.333-142 chr5 56874098 56874353 + 1.33333 NA intron (NM_005921, intron 9 of 19) intron (NM_005921, intron 9 of 19) -35035 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 478 chr11 101170052 101170621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40523 NM_001271162 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 218.333-79 chr20 52749760 52749973 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 129028 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 209-59 chr2 82713420 82713729 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -143229 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 265.333-80 chr7 115231922 115232219 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_126407) promoter-TSS (NR_126407) -715 NR_126407 104355291 NR_126407 ENSG00000233607 LINC01392 - long intergenic non-protein coding RNA 1392 ncRNA 325.666-10 chr2 38150579 38150888 + 1.33333 NA intron (NR_027252, intron 2 of 2) L1MA4A|LINE|L1 19628 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 183.333-172 chr9 73066303 73066570 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -85429 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 298.667-16 chr21 35306477 35306847 + 1.33333 NA Intergenic MER121|DNA|hAT? -257364 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 201.666-32 chr4 24629362 24629613 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44933 NM_001358 1665 Hs.696074 NM_001358 ENSG00000109606 DHX15 DBP1|DDX15|HRH2|PRP43|PRPF43|PrPp43p DEAH-box helicase 15 protein-coding 190-36 chr14 72762693 72762942 + 1.33333 NA intron (NM_001280544, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 129832 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 158.666-27 chr7 19550837 19551001 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 154517 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 160.666-10 chr21 45520261 45520421 + 1.33333 NA intron (NM_001352510, intron 5 of 5) L1MD1|LINE|L1 14415 NM_001205207 6573 Hs.84190 NM_003056 ENSG00000173638 SLC19A1 CHMD|FOLT|IFC-1|IFC1|REFC|RFC|RFC1 solute carrier family 19 member 1 protein-coding 201.333-235 chr6 28381593 28381769 + 1.33333 NA intron (NR_136512, intron 5 of 5) intron (NR_136512, intron 5 of 5) 924 NR_160527 9753 Hs.134816 NM_014724 ENSG00000158691 ZSCAN12 ZFP96|ZNF29K1|ZNF305|ZNF96|dJ29K1.2 zinc finger and SCAN domain containing 12 protein-coding 120-2 chr1 89131911 89132078 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_207398, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_207398, exon 11 of 11) -5880 NM_004120 2634 Hs.386567 NM_004120 ENSG00000162645 GBP2 - guanylate binding protein 2 protein-coding 352.667-18 chr22 47069023 47069546 + 1.33333 NA intron (NM_001284305, intron 11 of 12) intron (NM_001284305, intron 11 of 12) -153242 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 223.333-135 chr5 143414665 143414923 + 1.33333 NA intron (NM_001018075, intron 1 of 8) intron (NM_001018075, intron 1 of 8) -9439 NM_001364180 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 210.667-98 chr4 48414166 48414455 + 1.33333 NA intron (NM_020846, intron 6 of 7) intron (NM_020846, intron 6 of 7) -69033 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 300-27 chr18 65309364 65309758 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -440691 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 321-23 chr9 99764654 99765072 + 1.33333 NA intron (NR_109802, intron 2 of 6) intron (NR_109802, intron 2 of 6) 55026 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 222.666-3 chr1 93024172 93024415 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -54942 NM_001164391 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 128-87 chr4 119898591 119898777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40856 NR_121639 100996694 Hs.119926 NR_121639 ENSG00000250392 LINC02502 - long intergenic non-protein coding RNA 2502 ncRNA 199.666-59 chr8 122971064 122971242 + 1.33333 NA intron (NM_001362797, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR 54619 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 206.666-52 chr2 11350124 11350466 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4858 NM_001321643 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 193.666-26 chr20 205023 205224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15412 NM_001037732 245939 Hs.516818 NM_001037732 ENSG00000185982 DEFB128 DEFB-28|DEFB28|hBD-28 defensin beta 128 protein-coding 204.666-89 chr7 77926416 77926619 + 1.33333 NA intron (NM_001366085, intron 9 of 10) intron (NM_001366085, intron 9 of 10) 86387 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 324.333-6 chr10 108391602 108391874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -322445 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 207.333-246 chr6 129325608 129325778 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 28 of 64) MIR3|SINE|MIR 384484 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 245.666-21 chr4 182428256 182428752 + 1.33333 NA intron (NM_001080477, intron 3 of 27) intron (NM_001080477, intron 3 of 27) 185102 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 157.333-146 chr17 33124072 33124246 + 1.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 131308 NM_001317225 124912 Hs.434112 NM_173847 ENSG00000141316 SPACA3 ALLP17|CT54|LYC3|LYZC|LYZL3|SLLP1 sperm acrosome associated 3 protein-coding 320.333-31 chr9 28984853 28985125 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1MA7|LINE|L1 -96034 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 116.667-130 chr3 78735191 78735396 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 5 of 30) MIRc|SINE|MIR 284166 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 195.333-89 chr15 48226057 48226283 + 1.33333 NA intron (NM_001184832, intron 4 of 26) intron (NM_001184832, intron 4 of 26) 19868 NM_001184832 6557 Hs.123116 NM_000338 ENSG00000074803 SLC12A1 BSC1|NKCC2 solute carrier family 12 member 1 protein-coding 457.333-2 chr15 79342923 79343455 + 1.33333 NA intron (NM_001330376, intron 2 of 2) intron (NM_001330376, intron 2 of 2) 32077 NM_001301203 23423 Hs.71608 NM_007364 ENSG00000166557 TMED3 C15orf22|P24B|p24g4|p24gamma4|p26 transmembrane p24 trafficking protein 3 protein-coding 233.333-73 chr20 45712164 45712468 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -7136 NR_037411 100500897 NR_037411 ENSG00000266071 MIR3617 - microRNA 3617 ncRNA 151.333-336 chr5 59084314 59084474 + 1.33333 NA intron (NM_006203, intron 5 of 14) L1ME4a|LINE|L1 -44918 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 279.667-4 chr10 88175616 88176126 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 312246 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 487.333-4 chr22 35375109 35375775 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5654 NM_002133 3162 Hs.517581 NM_002133 ENSG00000100292 HMOX1 HMOX1D|HO-1|HSP32|bK286B10 heme oxygenase 1 protein-coding 427-4 chr20 55527766 55528349 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -100860 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 217.333-88 chr22 47099013 47099255 + 1.33333 NA intron (NM_001284305, intron 11 of 12) intron (NM_001284305, intron 11 of 12) -183092 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 285.333-33 chr2 138097496 138097801 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4236 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 271.333-53 chr4 54926562 54927044 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 198792 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 296.666-30 chr5 87735277 87735570 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 73381 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 210.666 chr1 32683526 32683770 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001135255, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001135255, exon 12 of 12) 19122 NM_001161708 81493 Hs.712631 NM_030786 ENSG00000162520 SYNC SYNC1|SYNCOILIN syncoilin, intermediate filament protein protein-coding 187.666-17 chr2 100915410 100915631 + 1.33333 NA intron (NM_002518, intron 2 of 20) L1ME1|LINE|L1 61641 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 162-71 chr2 173473913 173474107 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 119138 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 289.999-5 chr8 81338255 81338636 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57909 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 387-10 chr2 142178411 142178786 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -46897 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 134-24 chr13 56978197 56978496 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -162572 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 225.333-120 chr7 5418743 5418914 + 1.33333 NA intron (NM_001080495, intron 2 of 29) intron (NM_001080495, intron 2 of 29) 4718 NM_001080495 84629 Hs.520638 NM_001013722 ENSG00000182095 TNRC18 CAGL79|TNRC18A trinucleotide repeat containing 18 protein-coding 229-62 chr7 11854827 11855145 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22788 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 202.666-26 chr12 26004881 26005035 + 1.33333 NA intron (NM_001164747, intron 2 of 5) AluJr4|SINE|Alu 31203 NM_001164747 11228 Hs.696433 NM_007211 ENSG00000123094 RASSF8 C12orf2|HOJ1 Ras association domain family member 8 protein-coding 199.333-211 chr4 135724770 135724929 + 1.33333 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 163244 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 309.333-8 chr10 76618342 76618693 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -269527 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 201.333-15 chr1 174703231 174703473 + 1.33333 NA intron (NM_001366451, intron 2 of 12) L1PB4|LINE|L1 2357 NM_001366453 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 208.666-69 chr3 86197166 86197327 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -284697 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 334.333-7 chr11 113625893 113626341 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 80191 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 299-37 chr8 22311464 22311792 + 1.33333 NA intron (NM_001330480, intron 16 of 21) intron (NM_001330480, intron 16 of 21) 36061 NM_001135721 55124 Hs.614809 NM_018068 ENSG00000197181 PIWIL2 CT80|HILI|PIWIL1L|mili piwi like RNA-mediated gene silencing 2 protein-coding 203.333-152 chr2 214013384 214013572 + 1.33333 NA intron (NR_047660, intron 11 of 14) L1MA6|LINE|L1 255411 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 192-67 chr18 79993684 79993956 + 1.33333 NA intron (NM_001305564, intron 1 of 2) PRIMA4-int|LTR|ERV1 -5257 NR_131177 10907 Hs.465498 NM_006701 ENSG00000141759 TXNL4A BMKS|DIB1|DIM1|SNRNP15|TXNL4|U5-15kD thioredoxin like 4A protein-coding 340.666-20 chr8 110049677 110049981 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74058 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 230-17 chr13 27705553 27705817 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 83793 NM_015972 51082 Hs.507584 NM_015972 ENSG00000186184 POLR1D AC19|POLR1C|RPA16|RPA9|RPAC2|RPC16|RPO1-3|TCS2 RNA polymerase I and III subunit D protein-coding 400.666-9 chr9 78824248 78824747 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 321169 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 348.666-7 chr2 77388713 77389041 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 133499 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 200-108 chr3 181940975 181941219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11267 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 181-51 chr3 80790287 80790540 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 19709 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 195.667-22 chr11 131011681 131011983 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -95345 NM_001347926 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 298.333-29 chr3 160426606 160427038 + 1.33333 NA intron (NM_001002800, intron 17 of 23) intron (NM_001002800, intron 17 of 23) 22077 NR_029525 406951 NR_029525 ENSG00000198987 MIR16-2 MIRN16-2|mir-16-2|mir-16-3 microRNA 16-2 ncRNA 182.666-28 chr22 41459580 41459738 + 1.33333 NA TTS (NM_032758) TTS (NM_032758) 9033 NM_032758 84844 Hs.474980 NM_032758 ENSG00000100410 PHF5A INI|Rds3|SAP14b|SF3B7|SF3b14b|bK223H9.2 PHD finger protein 5A protein-coding 172.333-92 chr2 213281090 213281237 + 1.33333 NA intron (NR_161186, intron 1 of 2) intron (NR_161186, intron 1 of 2) 3046 NR_161186 100130451 Hs.608433 NR_144752 SPAG16-DT - SPAG16 divergent transcript ncRNA 204.666-26 chr13 34252408 34252574 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95552 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 249.666-19 chr2 46117780 46118086 + 1.33333 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) intron (NM_005400, intron 11 of 14) -179474 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 202.667-143 chr8 85943365 85943637 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -115559 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 163.333-182 chr3 90407465 90407625 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1299924 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 146-75 chr21 31148937 31149171 + 1.33333 NA intron (NM_001353684, intron 4 of 12) intron (NM_001353684, intron 4 of 12) 11886 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 168.667-41 chr12 25610640 25610854 + 1.33333 NA intron (NM_001352232, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 37831 NM_001145727 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 177-66 chr5 124895643 124895882 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -141069 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 237.666-11 chr2 197196207 197196436 + 1.33333 NA intron (NM_153697, intron 1 of 9) intron (NM_153697, intron 1 of 9) -1670 NR_135584 101927596 NR_135584 ENSG00000231621 LOC101927596 - uncharacterized LOC101927596 ncRNA 216 chr1 51506067 51506251 + 1.33333 NA intron (NM_001981, intron 1 of 24) AluSx1|SINE|Alu 13107 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 197.666-9 chr11 60724041 60724232 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001354471, exon 1 of 7) 5' UTR (NM_001354471, exon 1 of 7) 127 NM_001354471 728588 Hs.739039 NM_001310141 ENSG00000214782 MS4A18 - membrane spanning 4-domains A18 protein-coding 172.667-162 chr8 112676803 112677009 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 14 of 66) intron (NM_001363185, intron 14 of 66) 33413 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 162-23 chr11 14416939 14417120 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -52523 NM_001177314 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 290.666-8 chr12 60102538 60102812 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 413305 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 244.666-46 chr7 16988611 16988847 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106746 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 394.666-10 chr8 54329075 54329499 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -1399 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 126.667-8 chr1 97752827 97753002 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) intron (NM_000110, intron 3 of 22) -44007 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 201.667-122 chr8 117786645 117786860 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 134161 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 236-31 chr17 78765048 78765328 + 1.33333 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) intron (NM_004762, intron 1 of 12) 17020 NM_001365039 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 180.666-12 chr16 69622088 69622242 + 1.33333 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) intron (NM_138714, intron 2 of 15) 56199 NM_138713 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 202.333-61 chr14 80008504 80008737 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -202799 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 162.667-21 chr10 15793223 15793434 + 1.33333 NA intron (NM_024948, intron 11 of 14) intron (NM_024948, intron 11 of 14) 67179 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 211.333-52 chr13 76428256 76428472 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 458041 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 182.666-3 chr10 67733718 67733877 + 1.33333 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -37602 NM_013266 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 198-133 chr4 25162354 25162537 + 1.33333 NA intron (NR_037934, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 1773 NR_037934 285540 Hs.732278 NR_037934 SEPSECS-AS1 - SEPSECS antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 268.666-22 chr4 60614125 60614357 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -308378 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 211.666-51 chr8 95568504 95568751 + 1.33333 NA intron (NR_038207, intron 2 of 2) L1MA8|LINE|L1 -299426 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 195.333-105 chr2 14763537 14763737 + 1.33333 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 130920 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 203.333-23 chr10 12037576 12037761 + 1.33333 NA intron (NM_080599, intron 1 of 21) AluSz|SINE|Alu 5141 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 236.667-26 chr14 67760230 67760524 + 1.33333 NA intron (NM_015346, intron 35 of 41) intron (NM_015346, intron 35 of 41) 56213 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 201.666-25 chr2 138386850 138387054 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -114818 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 199.333-76 chr14 64528508 64528749 + 1.33333 NA intron (NM_014950, intron 2 of 2) intron (NM_014950, intron 2 of 2) 11740 NR_110550 102723809 Hs.667192 NR_110550 ENSG00000259116 LOC102723809 - uncharacterized LOC102723809 ncRNA 194-144 chr8 99231230 99231384 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) intron (NM_017890, intron 17 of 61) 218041 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 258.667-10 chr1 194528018 194528360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1223444 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 278.999-7 chr6 56231223 56231576 + 1.33333 NA intron (NM_001318751, intron 1 of 30) intron (NM_001318751, intron 1 of 30) 16181 NR_134849 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 477.333-5 chr6 127607595 127608203 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30725 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 149-100 chr4 41712464 41712644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 36416 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 278-51 chr6 78827861 78828135 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -39553 NM_001010844 134728 Hs.656212 NM_001010844 ENSG00000146243 IRAK1BP1 AIP70|SIMPL interleukin 1 receptor associated kinase 1 binding protein 1 protein-coding 233-14 chr11 77452365 77452667 + 1.33333 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) MIR3|SINE|MIR 21547 NM_001128620 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 208.666-66 chr22 26233590 26233773 + 1.33333 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 64207 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 275.666-11 chr2 215509078 215509535 + 1.33333 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 55599 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 193.333-17 chr10 18790833 18791000 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 131485 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 211.333-236 chr8 77210159 77210411 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -209241 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 180-70 chr3 132412905 132413085 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4507 NM_001329126 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 207-64 chr2 54349659 54349961 + 1.33333 NA intron (NM_001369403, intron 2 of 3) intron (NM_001369403, intron 2 of 3) 18926 NM_001369403 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 147 chr1 8559362 8559559 + 1.33333 NA intron (NM_001042681, intron 4 of 22) intron (NM_001042681, intron 4 of 22) -64547 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 297.333-54 chr8 65661211 65661515 + 1.33333 NA intron (NM_001145839, intron 1 of 6) L1MC1|LINE|L1 -8510 NM_001145838 9650 Hs.584788 NM_014637 ENSG00000066855 MTFR1 CHPPR|FAM54A2 mitochondrial fission regulator 1 protein-coding 264.333-76 chr8 88555356 88555689 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -228039 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 257.333-86 chr6 111986793 111987102 + 1.33333 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -67128 NM_003880 8838 Hs.558428 NM_003880 ENSG00000112761 CCN6 LIBC|PPAC|PPD|WISP-3|WISP3 cellular communication network factor 6 protein-coding 172.333-197 chr9 86317978 86318189 + 1.33333 NA intron (NM_001185074, intron 9 of 19) intron (NM_001185074, intron 9 of 19) -35545 NM_030940 81689 Hs.449291 NM_030940 ENSG00000135070 ISCA1 HBLD2|ISA1|MMDS5|hIscA iron-sulfur cluster assembly 1 protein-coding 223.666-18 chr2 15461171 15461359 + 1.33333 NA exon (NM_015909, exon 21 of 52) exon (NM_015909, exon 21 of 52) 100069 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 386.999-4 chr6 68231504 68232008 + 1.33333 NA intron (NR_125854, intron 3 of 3) intron (NR_125854, intron 3 of 3) 98143 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 344.999 chr2 236199549 236199861 + 1.33333 NA intron (NM_212556, intron 4 of 5) L1ME4a|LINE|L1 -31319 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 162.667-32 chr10 86196861 86197083 + 1.33333 NA intron (NM_017551, intron 3 of 15) L2a|LINE|L2 67816 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 230.667-73 chr6 152308313 152308616 + 1.33333 NA intron (NM_182961, intron 91 of 145) intron (NM_182961, intron 91 of 145) -72066 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 218-17 chr11 71507209 71507475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19925 NM_001012503 440050 Hs.710675 NM_001012503 ENSG00000244411 KRTAP5-7 KRTAP5-3|KRTAP5.7 keratin associated protein 5-7 protein-coding 283.333-11 chr12 9830792 9831102 + 1.33333 NA intron (NR_120305, intron 1 of 3) intron (NR_120305, intron 1 of 3) 3466 NM_016523 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 210.666-105 chr8 112762957 112763163 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) L1MA8|LINE|L1 119567 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 378-15 chr2 183925005 183925451 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -453747 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 260.666-14 chr18 1405264 1405565 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -45785 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 225.333-51 chr14 62957477 62957672 + 1.33333 NA intron (NM_139318, intron 6 of 10) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 87884 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 199.333-144 chr2 170122959 170123115 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -55110 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 218.666-9 chr10 28115447 28115666 + 1.33333 NA intron (NR_134518, intron 10 of 16) intron (NR_134518, intron 10 of 16) -42178 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 121.666 chr1 6381452 6381593 + 1.33333 NA intron (NM_007274, intron 1 of 8) L1MB3|LINE|L1 4246 NM_181864 11332 Hs.126137 NM_007274 ENSG00000097021 ACOT7 ACH1|ACT|BACH|CTE-II|LACH|LACH1|hBACH acyl-CoA thioesterase 7 protein-coding 181-15 chr12 64832326 64832489 + 1.33333 NA intron (NM_001364838, intron 5 of 11) intron (NM_001364838, intron 5 of 11) 7760 NM_015279 23329 Hs.192492 NM_015279 ENSG00000111490 TBC1D30 - TBC1 domain family member 30 protein-coding 205.333-99 chr17 65843457 65843749 + 1.33333 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) intron (NM_001353129, intron 21 of 26) -17060 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 182-81 chr4 80148015 80148195 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37165 NM_020226 56978 Hs.373642 NM_020226 ENSG00000152784 PRDM8 EPM10|KMT8D|PFM5 PR/SET domain 8 protein-coding 303.333-44 chr2 184202020 184202446 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -176742 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 338.666-11 chr4 80261889 80262354 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4467 NM_004464 2250 Hs.37055 NM_004464 ENSG00000138675 FGF5 HBGF-5|Smag-82|TCMGLY fibroblast growth factor 5 protein-coding 278.666 chr1 90482910 90483303 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -174644 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 204.333-108 chr2 194704532 194704748 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25955 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 190.667-44 chr14 77118333 77118596 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 20206 NM_033426 85457 Hs.709066 NM_033426 ENSG00000198894 CIPC KIAA1737 CLOCK interacting pacemaker protein-coding 236.666-5 chr10 33986013 33986285 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -213469 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 156-81 chr20 47340151 47340385 + 1.33333 NA intron (NM_001281774, intron 3 of 23) intron (NM_001281774, intron 3 of 23) 11629 NM_001363741 23613 Hs.446240 NM_012408 ENSG00000101040 ZMYND8 PRKCBP1|PRO2893|RACK7 zinc finger MYND-type containing 8 protein-coding 207.666-34 chr21 31290711 31290884 + 1.33333 NA intron (NM_001353686, intron 2 of 27) intron (NM_001353686, intron 2 of 27) 53557 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 162.333-48 chr12 19673824 19674013 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 233319 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 168.333-103 chr2 175087663 175087894 + 1.33333 NA intron (NM_001256092, intron 11 of 12) intron (NM_001256092, intron 11 of 12) 79931 NR_030630 100126350 NR_030630 ENSG00000215973 MIR933 MIRN933|hsa-mir-933|mir-933 microRNA 933 ncRNA 318.333-26 chr4 30834847 30835345 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 114727 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 291.666-6 chr16 74663180 74663532 + 1.33333 NA intron (NM_001370534, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 3521 NM_001370536 55159 Hs.567525 NM_018124 ENSG00000168411 RFWD3 FANCW|RNF201 ring finger and WD repeat domain 3 protein-coding 240-73 chr5 5819190 5819417 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 396626 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 183-34 chr14 31199327 31199541 + 1.33333 NA intron (NM_015382, intron 2 of 42) AluYc|SINE|Alu 8359 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 211.333-69 chr15 58178398 58178616 + 1.33333 NA intron (NM_001320635, intron 4 of 4) L1M5|LINE|L1 40126 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 332.666-15 chr2 69757604 69758028 + 1.33333 NA intron (NM_001320700, intron 1 of 12) AluSc|SINE|Alu 15682 NM_001365496 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 268.666-13 chr16 78180676 78180995 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 81181 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 221.666-41 chr5 8388213 8388384 + 1.33333 NA intron (NR_039984, intron 2 of 5) intron (NR_039984, intron 2 of 5) 69266 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 306.666-25 chr4 55485446 55485810 + 1.33333 NA intron (NM_004898, intron 3 of 22) intron (NM_004898, intron 3 of 22) 60304 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 190.333-100 chr3 189676072 189676229 + 1.33333 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) L1MA9|LINE|L1 44761 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 197.666-36 chr20 6326536 6326769 + 1.33333 NA Intergenic (TATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -100080 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 244.333-61 chr2 157595848 157596109 + 1.33333 NA intron (NM_145259, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 1582 NM_001111031 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 192.333-31 chr11 39509707 39509964 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 783295 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 276-9 chr10 72959580 72959882 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4925 NM_001318124 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 198-100 chr2 167165876 167166139 + 1.33333 NA intron (NM_152381, intron 3 of 10) L1MC1|LINE|L1 -21365 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 364-13 chr2 23542526 23542975 + 1.33333 NA intron (NM_052920, intron 2 of 13) intron (NM_052920, intron 2 of 13) 157571 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 203.333-177 chr3 116102964 116103153 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -197932 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 282-52 chr9 30602923 30603368 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -194691 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 156.667-239 chr4 37723442 37723659 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -37174 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 153.333-254 chr22 31050271 31050408 + 1.33333 NA Intergenic Alu|SINE|Alu -30979 NM_006932 6525 Hs.149098 NM_006932 ENSG00000183963 SMTN - smoothelin protein-coding 294.999-2 chr2 75671047 75671397 + 1.33333 NA intron (NM_001201334, intron 14 of 16) L2|LINE|L2 24439 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 297-37 chr4 80938609 80938989 + 1.33333 NA intron (NM_152770, intron 4 of 5) L1MA9|LINE|L1 -91909 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 210.666-29 chr14 51011763 51012003 + 1.33333 NA intron (NM_015163, intron 3 of 9) intron (NM_015163, intron 3 of 9) -67400 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 293.999-7 chr4 89434526 89434897 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -126911 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 358.667-23 chr5 11107914 11108437 + 1.33333 NA intron (NM_001288715, intron 13 of 20) intron (NM_001288715, intron 13 of 20) -346941 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 289.666-10 chr21 26603249 26603646 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -30161 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 217.333-117 chr5 23548102 23548365 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 40578 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 236-65 chr4 60933093 60933392 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 10623 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 205.333-33 chr10 58228105 58228289 + 1.33333 NA intron (NM_152230, intron 2 of 5) intron (NM_152230, intron 2 of 5) 39697 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 218.667-16 chr10 105964157 105964448 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -143969 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 562 chr2 19359659 19360396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1404 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 199.333-240 chr6 35610827 35611091 + 1.33333 NA intron (NM_001145775, intron 6 of 11) HAL1ME|LINE|L1 53830 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 349.666-14 chr8 117481152 117481814 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -39230 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 223.333-173 chrX 122915021 122915337 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -269064 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 174.667-93 chr2 142578939 142579139 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -298625 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 187.333-102 chr2 85200361 85200581 + 1.33333 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -13181 NR_136323 102724579 Hs.669216 NR_136323 LOC102724579 - uncharacterized LOC102724579 ncRNA 203-83 chr5 111179063 111179361 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -44371 NM_001323375 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 314.667-35 chr6 163154828 163155266 + 1.33333 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) intron (NM_001080379, intron 4 of 4) 36955 NR_122120 729658 Hs.728991 NR_122120 PACRG-AS3 - PACRG antisense RNA 3 ncRNA 251-89 chr9 86344635 86345063 + 1.33333 NA intron (NM_001185059, intron 5 of 26) intron (NM_001185059, intron 5 of 26) 9561 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 113.333-16 chr1 186107516 186107610 + 1.33333 NA intron (NM_031935, intron 70 of 106) L1ME4a|LINE|L1 -188710 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 192-154 chr9 100238477 100238722 + 1.33333 NA intron (NR_134606, intron 5 of 16) L1ME3E|LINE|L1 113972 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 228.666-19 chr2 14835045 14835271 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 202441 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 228.333-104 chr8 130594526 130594764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150971 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 242.666-39 chr8 42135880 42136093 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16960 NM_001134296 10947 Hs.654529 NM_006803 ENSG00000070718 AP3M2 AP47B|CLA20|P47B adaptor related protein complex 3 subunit mu 2 protein-coding 231.666-2 chr1 225286803 225287148 + 1.33333 NA intron (NM_001367479, intron 54 of 85) L1MD3|LINE|L1 141063 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 194-52 chr16 60315554 60315751 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44141 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 188-36 chr15 65724107 65724277 + 1.33333 NA intron (NM_005848, intron 11 of 31) AluJr|SINE|Alu -4860 NR_039736 100616379 NR_039736 ENSG00000264737 MIR4511 mir-4511 microRNA 4511 ncRNA 195.333-201 chr7 45326842 45327032 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 169146 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 142-62 chr2 54474595 54474742 + 1.33333 NA intron (NM_003128, intron 1 of 35) L1ME4a|LINE|L1 18341 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 221.333-83 chr21 18254942 18255133 + 1.33333 NA intron (NM_001204174, intron 1 of 5) intron (NM_001204174, intron 1 of 5) 9162 NM_001204174 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 185.333-97 chr2 125117804 125117993 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 1000087 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 379.333-10 chr5 78560543 78560957 + 1.33333 NA intron (NM_005779, intron 3 of 4) intron (NM_005779, intron 3 of 4) 88022 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 310.333-19 chr17 47116440 47116944 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 72603 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 282.333-10 chr13 96068351 96068756 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -15152 NM_020121 55757 Hs.193226 NM_020121 ENSG00000102595 UGGT2 HUGT2|UGCGL2|UGT2 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 2 protein-coding 228.333-34 chr17 59056967 59057160 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 12 of 23) intron (NR_148346, intron 12 of 23) 49817 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 213.333-136 chr3 137609948 137610118 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -154282 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 191.333-84 chr16 72339568 72339737 + 1.33333 NA intron (NR_126330, intron 9 of 13) intron (NR_126330, intron 9 of 13) -167202 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 201.333-105 chr14 73060309 73060528 + 1.33333 NA intron (NM_021239, intron 1 of 18) intron (NM_021239, intron 1 of 18) 1884 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 210.666-64 chr3 15230774 15230976 + 1.33333 NA intron (NM_014296, intron 9 of 20) intron (NM_014296, intron 9 of 20) -23309 NR_046084 100505696 Hs.745026 NR_046084 ENSG00000224660 SH3BP5-AS1 - SH3BP5 antisense RNA 1 ncRNA 194-38 chr14 79903267 79903470 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -308051 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 151-17 chr10 76709759 76709898 + 1.33333 NA Intergenic L1HS|LINE|L1 -178216 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 295.333-43 chr4 62909318 62909611 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -747699 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 209.666-8 chr1 212105640 212105803 + 1.33333 NA TTS (NM_016448) TTS (NM_016448) 28108 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 154.666-4 chr2 15621115 15621293 + 1.33333 NA intron (NM_004939, intron 18 of 25) intron (NM_004939, intron 18 of 25) 29336 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 474.333-2 chr3 106212338 106212989 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -343262 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 199.333-78 chr14 68562765 68563040 + 1.33333 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 65885 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 138-130 chrX 44241511 44241724 + 1.33333 NA intron (NM_025184, intron 8 of 14) MER58B|DNA|hAT-Charlie 102055 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 132-44 chr15 62420523 62420705 + 1.33333 NA Intergenic PABL_A|LTR|ERV1 77585 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 295.666-9 chr2 99903059 99903359 + 1.33333 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) MER104|DNA|TcMar-Tc2 202374 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 279.333 chr1 59575391 59575895 + 1.33333 NA intron (NM_001350794, intron 8 of 14) L1MA7|LINE|L1 60013 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 266.666-5 chr10 12800752 12801093 + 1.33333 NA intron (NM_001351032, intron 8 of 11) intron (NM_001351032, intron 8 of 11) -75569 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 191-39 chr3 4953479 4953688 + 1.33333 NA intron (NR_125915, intron 1 of 3) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -25854 NM_003670 8553 Hs.744856 NM_003670 ENSG00000134107 BHLHE40 BHLHB2|Clast5|DEC1|HLHB2|SHARP-2|SHARP2|STRA13|Stra14 basic helix-loop-helix family member e40 protein-coding 116-65 chr18 11406889 11407005 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -47531 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 198.333-146 chr4 93766061 93766324 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -62561 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 211-67 chr3 113606601 113606874 + 1.33333 NA intron (NR_136285, intron 11 of 20) intron (NR_136285, intron 11 of 20) 11861 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 134-88 chr5 151911923 151912085 + 1.33333 NA intron (NM_000171, intron 1 of 8) intron (NM_000171, intron 1 of 8) 12847 NM_000171 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 189.333-44 chr12 74724504 74724672 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 186753 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 135.333-195 chr8 108957920 108958082 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -128627 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 207-53 chr17 67102991 67103361 + 1.33333 NA intron (NM_001330447, intron 31 of 32) L1M4|LINE|L1 58622 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 231.666-11 chr16 83411968 83412269 + 1.33333 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -96228 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 179.333-184 chr8 58188706 58188981 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 83258 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 224.333-61 chr2 55405507 55405727 + 1.33333 NA intron (NM_001254943, intron 2 of 33) MER1B|DNA|hAT-Charlie 14239 NM_001135597 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 142.666-3 chr12 23162674 23162826 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -12886 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 255.999-8 chr6 75131031 75131294 + 1.33333 NA intron (NM_080645, intron 20 of 50) intron (NM_080645, intron 20 of 50) -2380 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 231.333-36 chr12 92131311 92131538 + 1.33333 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) intron (NR_132341, intron 1 of 4) 10289 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 291-4 chr1 232865463 232865839 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 60759 NM_019090 54627 Hs.160373 NM_019090 ENSG00000212916 MAP10 KIAA1383|MTR120 microtubule associated protein 10 protein-coding 208-89 chr20 39556468 39556747 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -331859 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 159.333-298 chr6 152586467 152586608 + 1.33333 NA intron (NM_182961, intron 3 of 145) intron (NM_182961, intron 3 of 145) 50314 NM_033071 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 275.333-39 chr2 224717516 224717912 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -132317 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 334-40 chrX 125560892 125561200 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 241175 NM_001195272 100129520 NM_001195272 ENSG00000282815 TEX13C - TEX13 family member C protein-coding 185.333-14 chr1 193907090 193907273 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 602436 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 139.333-164 chr4 55989383 55989575 + 1.33333 NA intron (NM_025009, intron 14 of 25) intron (NM_025009, intron 14 of 25) 40534 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 439.667-8 chr8 114678445 114679084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 989249 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 202.333-125 chr4 61628949 61629186 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) MER127|DNA|TcMar-Tigger 426895 NM_001371342 303.333-54 chr4 63684633 63684934 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 724667 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 212.666-20 chr12 45292007 45292171 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001142678) promoter-TSS (NM_001142678) -601 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 162.333-68 chr14 45678068 45678255 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37441 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 208.333-144 chr8 86785155 86785449 + 1.33333 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -41627 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 432.333 chr1 168291264 168291695 + 1.33333 NA intron (NM_005149, intron 2 of 7) intron (NM_005149, intron 2 of 7) 10602 NM_005149 9095 Hs.716656 NM_005149 ENSG00000143178 TBX19 TBS19|TPIT|dJ747L4.1 T-box transcription factor 19 protein-coding 198-102 chr2 183799088 183799284 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -579789 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 235-42 chr4 71573041 71573363 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 210877 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 364.666 chr12 9938532 9938912 + 1.33333 NA intron (NR_104634, intron 4 of 4) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 4773 NR_104634 100506159 Hs.282397 NR_104634 ENSG00000225231 LINC02470 - long intergenic non-protein coding RNA 2470 ncRNA 203-57 chr2 191971162 191971353 + 1.33333 NA intron (NM_001305134, intron 7 of 9) intron (NM_001305134, intron 7 of 9) -124169 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 182.333-170 chr9 98460249 98460462 + 1.33333 NA intron (NM_005458, intron 6 of 18) AluSx1|SINE|Alu -204706 NR_051978 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 166.666-3 chr10 62338053 62338244 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -36009 NM_199450 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 216.333-135 chr8 80179769 80180088 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -8364 NM_001025253 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 277.666-12 chr3 178356588 178356965 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -62425 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 194.666-24 chr14 88393443 88393636 + 1.33333 NA intron (NM_018418, intron 3 of 11) intron (NM_018418, intron 3 of 11) 7882 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 216.666-67 chr8 78924907 78925158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87503 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 213-80 chr7 27891275 27891438 + 1.33333 NA intron (NM_175061, intron 3 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie 151261 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 198-153 chr5 51719347 51719538 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -288589 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 481.333-3 chr18 13935343 13935894 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -19911 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 363.667-20 chr9 36090642 36091087 + 1.33333 NA intron (NM_021111, intron 9 of 20) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -45672 NR_104637 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 244.666-47 chr7 21098046 21098257 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 262720 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 226.667-2 chr1 75336849 75337144 + 1.33333 NA intron (NM_001320287, intron 4 of 24) intron (NM_001320287, intron 4 of 24) 202608 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 203.333-16 chr1 204204794 204204951 + 1.33333 NA intron (NM_198447, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 -8381 NM_002256 3814 Hs.95008 NM_002256 ENSG00000170498 KISS1 HH13|KiSS-1 KiSS-1 metastasis suppressor protein-coding 224-47 chr2 119570604 119570889 + 1.33333 NA intron (NR_073132, intron 6 of 24) L1MB8|LINE|L1 26297 NR_073132 200373 Hs.496753 NM_001029996 ENSG00000163075 CFAP221 FAP221|PCDP1 cilia and flagella associated protein 221 protein-coding 176.666-7 chr11 113793690 113793844 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 13971 NM_001101389 644672 Hs.705360 NM_001101389 ENSG00000228607 CLDN25 - claudin 25 protein-coding 248-44 chr20 24707688 24707928 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 237847 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 269.333-8 chr11 17619086 17619413 + 1.33333 NA intron (NM_001277269, intron 38 of 54) AluJb|SINE|Alu 71876 NM_001277269 340990 Hs.688380 NM_198497 ENSG00000188162 OTOG DFNB18B|MLEMP|OTGN otogelin protein-coding 253.667-42 chr3 95087931 95088274 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 149839 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 308.333-29 chr4 97921472 97921745 + 1.33333 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) L1M3c|LINE|L1 221868 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 260.666-24 chr3 117258596 117258957 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 337345 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 326.333-18 chr3 100553505 100553993 + 1.33333 NA intron (NM_001363876, intron 2 of 6) MIR3|SINE|MIR -55852 NM_032787 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 247-72 chr7 138383394 138383762 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -76681 NM_003852 8805 Hs.490287 NM_003852 ENSG00000122779 TRIM24 PTC6|RNF82|TF1A|TIF1|TIF1A|TIF1ALPHA|hTIF1 tripartite motif containing 24 protein-coding 213.333-177 chr6 27138745 27138987 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_003495) promoter-TSS (NM_003495) -443 NM_003495 8294 Hs.248172 NM_003495 ENSG00000276180 HIST1H4I H4/m|H4FM|H4M histone cluster 1 H4 family member i protein-coding 232-70 chr5 57444995 57445231 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37698 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 252.333-19 chr14 43311685 43312025 + 1.33333 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 1195428 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 198-117 chr3 31470096 31470361 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62697 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 229.999-3 chr12 18504921 18505202 + 1.33333 NA intron (NM_001288774, intron 23 of 32) intron (NM_001288774, intron 23 of 32) 232448 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 399.333-13 chr3 36993764 36994247 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_014805) promoter-TSS (NM_014805) 655 NM_001354622 4292 Hs.195364 NM_000249 ENSG00000076242 MLH1 COCA2|FCC2|HNPCC|HNPCC2|hMLH1 mutL homolog 1 protein-coding 276.333-52 chr6 37893830 37894280 + 1.33333 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 74328 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 199-74 chr4 47759178 47759377 + 1.33333 NA intron (NM_006587, intron 4 of 21) L1MA8|LINE|L1 -72068 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 319.667-6 chr14 80655879 80656252 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) intron (NM_152446, intron 19 of 24) 285673 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 127.333-175 chr7 71829449 71829565 + 1.33333 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 507884 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 334.333-24 chr3 96165809 96166204 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -193958 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 230.666-17 chr14 22251334 22251533 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 181320 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 201-49 chr19 37106331 37106504 + 1.33333 NA intron (NM_001329519, intron 4 of 4) L1PA5|LINE|L1 27984 NM_001329516 147923 Hs.444992 NM_144689 ENSG00000197050 ZNF420 APAK zinc finger protein 420 protein-coding 384.333-4 chr11 42493906 42494299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -240412 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 197.333-238 chr8 113998179 113998426 + 1.33333 NA Intergenic (ATATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -561363 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 341.667-17 chr4 51983192 51983630 + 1.33333 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 36952 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 274.333-16 chr14 72461214 72461693 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 6 of 16) intron (NM_001370288, intron 6 of 16) -55367 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 202.667-42 chr12 72622324 72622576 + 1.33333 NA intron (NM_013381, intron 15 of 18) intron (NM_013381, intron 15 of 18) -348941 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 262-85 chr8 131621109 131621498 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -282790 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 213.667-99 chrUn_GL000216v2 69608 69892 + 1.33333 NA NA (TTCCATTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 277.333-65 chr3 135839789 135840062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125803 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 257.333-27 chr12 118606671 118606997 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 154845 NR_134998 105370014 Hs.550870 NR_134998 ENSG00000256750 LINC02423 - long intergenic non-protein coding RNA 2423 ncRNA 214.333-16 chr1 236610219 236610576 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5881 NM_018072 55127 Hs.708114 NM_018072 ENSG00000119285 HEATR1 BAP28|UTP10 HEAT repeat containing 1 protein-coding 317.333-29 chr4 73427951 73428508 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7992 NM_001354717 174 Hs.518808 NM_001134 ENSG00000081051 AFP AFPD|FETA|HPAFP alpha fetoprotein protein-coding 184-73 chr4 34958405 34958607 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -688759 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 240.666-31 chr4 113215624 113215833 + 1.33333 NA intron (NM_001354275, intron 5 of 43) L2a|LINE|L2 63446 NR_107049 102465878 NR_107049 ENSG00000275810 MIR8082 hsa-mir-8082 microRNA 8082 ncRNA 223.999-7 chr22 41783677 41783859 + 1.33333 NA intron (NM_152513, intron 24 of 30) AluJb|SINE|Alu -16854 NM_001304797 79879 Hs.474991 NM_024821 ENSG00000100147 CCDC134 - coiled-coil domain containing 134 protein-coding 204.666-100 chr8 100620953 100621176 + 1.33333 NA intron (NM_152628, intron 4 of 13) AluSx1|SINE|Alu -2659 NM_001363720 169166 Hs.567758 NM_152628 ENSG00000174226 SNX31 - sorting nexin 31 protein-coding 193.333-35 chr11 39896648 39896875 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 396369 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 245.333-15 chr10 75673350 75673773 + 1.33333 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) 26052 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 201.333-107 chr14 74332928 74333196 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15409 NM_018228 55237 Hs.578167 NM_018228 ENSG00000133980 VRTN C14orf115|vertnin vertebrae development associated protein-coding 210.666-20 chr11 79577118 79577326 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -136192 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 174.666-9 chr15 66917272 66917439 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 39160 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 168.667-36 chr11 109708019 109708253 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 285946 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 240.667-4 chr1 180379160 180379450 + 1.33333 NA intron (NM_032360, intron 6 of 7) L1MA4A|LINE|L1 59085 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 274-44 chr5 10952223 10952606 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -191180 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 140.666-12 chr8 122129363 122129562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 439182 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 229.333-19 chr11 115801122 115801452 + 1.33333 NA Intergenic (ATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -41087 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 172.666-12 chr19 31614876 31615067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22690 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 197.666-41 chr3 98055469 98055725 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20293 NM_001105580 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 241-39 chr3 170142375 170142750 + 1.33333 NA intron (NM_024947, intron 6 of 14) intron (NM_024947, intron 6 of 14) 39171 NM_001308116 80012 Hs.529592 NM_024947 ENSG00000173889 PHC3 EDR3|HPH3 polyhomeotic homolog 3 protein-coding 214-48 chr17 60038916 60039097 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 4099 NR_039890 100616210 NR_039890 ENSG00000264049 MIR4737 - microRNA 4737 ncRNA 248.667-49 chr18 4857000 4857357 + 1.33333 NA Intergenic (ATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -224004 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 290.666-25 chr5 36447927 36448252 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -146187 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 287.333-68 chr8 137610354 137610643 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -196910 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 131.333-179 chr8 90079057 90079261 + 1.33333 NA intron (NM_004929, intron 2 of 10) intron (NM_004929, intron 2 of 10) 3720 NM_001366795 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 167.333-179 chr3 135988697 135988877 + 1.33333 NA intron (NM_001190447, intron 1 of 12) L1MC5a|LINE|L1 23059 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 224-68 chr4 104878574 104878832 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -267172 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 229-68 chr8 123866296 123866612 + 1.33333 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) L1MA7|LINE|L1 14467 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 261.333-95 chr6 114174119 114174431 + 1.33333 NA intron (NR_125845, intron 6 of 9) L2c|LINE|L2 -111398 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 231.333-75 chr4 30535676 30535968 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -184547 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 167.666-12 chr8 29218238 29218413 + 1.33333 NA intron (NM_015254, intron 2 of 39) intron (NM_015254, intron 2 of 39) 44745 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 208.666-94 chr6 27074321 27074552 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54130 NR_026776 100270746 Hs.590428 NR_026776 LOC100270746 - uncharacterized LOC100270746 ncRNA 224.999-5 chr6 137808330 137808527 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58831 NM_006290 7128 Hs.211600 NM_006290 ENSG00000118503 TNFAIP3 A20|AISBL|OTUD7C|TNFA1P2 TNF alpha induced protein 3 protein-coding 291-36 chr5 13017226 13017640 + 1.33333 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 15453 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 202-130 chr4 55277513 55277745 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -68613 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 193.333-140 chr4 91819199 91819441 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 457982 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 246.333-57 chr22 32551475 32551687 + 1.33333 NA intron (NM_003490, intron 7 of 13) L1MC5a|LINE|L1 76344 NM_001257990 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 344.666-12 chr17 35649307 35649673 + 1.33333 NA intron (NM_001030006, intron 12 of 21) AluSc8|SINE|Alu 62168 NM_001030006 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 126.333-30 chr11 110598242 110598378 + 1.33333 NA intron (NM_020809, intron 10 of 15) intron (NM_020809, intron 10 of 15) 113515 NM_001258415 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 271.333-27 chr2 61355419 61355767 + 1.33333 NA intron (NM_014709, intron 10 of 79) L1MB4|LINE|L1 61784 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 210.333-31 chr12 11860733 11860938 + 1.33333 NA intron (NM_001987, intron 4 of 7) intron (NM_001987, intron 4 of 7) -189026 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 266.667-46 chr3 24702625 24702999 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -126511 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 311.333-56 chr8 101421138 101421445 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 52398 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 234.333-16 chr11 112210850 112211139 + 1.33333 NA intron (NM_031938, intron 8 of 11) L1MB4|LINE|L1 -15434 NM_000317 5805 Hs.503860 NM_000317 ENSG00000150787 PTS PTPS 6-pyruvoyltetrahydropterin synthase protein-coding 200-10 chr1 176907641 176907829 + 1.33333 NA intron (NM_207108, intron 16 of 21) intron (NM_207108, intron 16 of 21) 121710 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 300-31 chr2 74865062 74865516 + 1.33333 NA intron (NM_000189, intron 2 of 17) intron (NM_000189, intron 2 of 17) 32634 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 252.666-8 chr12 98927749 98927955 + 1.33333 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) L1MB7|LINE|L1 -32561 NM_001352211 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 174-93 chr8 4940452 4940637 + 1.33333 NA intron (NM_033225, intron 1 of 69) intron (NM_033225, intron 1 of 69) 54370 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 302.666-20 chr5 56291016 56291413 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57884 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 206.333-53 chr14 49553090 49553388 + 1.33333 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 33141 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 158-102 chr5 32058785 32058928 + 1.33333 NA intron (NM_178140, intron 12 of 24) intron (NM_178140, intron 12 of 24) 115463 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 251.999-7 chr18 27191457 27191744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6292 NM_001256316 83539 Hs.44584 NM_031422 ENSG00000154080 CHST9 GALNAC4ST-2|GalNAc4ST2 carbohydrate sulfotransferase 9 protein-coding 205.666-29 chr20 14401536 14401693 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -63947 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 267.666-17 chr5 116172429 116172747 + 1.33333 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) intron (NM_001308080, intron 5 of 6) -83155 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 278.666-25 chr9 37492515 37492748 + 1.33333 NA intron (NM_001282766, intron 5 of 12) intron (NM_001282766, intron 5 of 12) 6683 NM_022490 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 213.333-140 chr3 185606041 185606221 + 1.33333 NA intron (NM_021627, intron 5 of 16) intron (NM_021627, intron 5 of 16) 19836 NM_021627 59343 Hs.401388 NM_021627 ENSG00000163904 SENP2 AXAM2|SMT3IP2 SUMO specific peptidase 2 protein-coding 139.333-187 chr5 148100938 148101092 + 1.33333 NA intron (NM_006846, intron 13 of 32) intron (NM_006846, intron 13 of 32) 37035 NM_001127699 11005 Hs.331555 NM_006846 ENSG00000133710 SPINK5 LEKTI|LETKI|NETS|NS|VAKTI serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 protein-coding 202.667-97 chr3 43651349 43651638 + 1.33333 NA intron (NM_001346469, intron 1 of 11) MER91B|DNA|hAT-Tip100 -29416 NM_001346464 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 198-188 chr8 137081421 137081581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 332087 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 215.666-34 chr6 119468279 119468472 + 1.33333 NA intron (NR_046100, intron 3 of 5) intron (NR_046100, intron 3 of 5) 22927 NR_046100 285762 Hs.571063 NR_046100 LOC285762 - uncharacterized LOC285762 ncRNA 181-58 chr5 32159463 32159615 + 1.33333 NA intron (NM_022130, intron 1 of 3) intron (NM_022130, intron 1 of 3) 14780 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 211.333-132 chr20 44624144 44624317 + 1.33333 NA exon (NM_000022, exon 6 of 12) exon (NM_000022, exon 6 of 12) 27469 NM_000022 100 Hs.654536 NM_000022 ENSG00000196839 ADA - adenosine deaminase protein-coding 179-89 chr6 166496534 166496747 + 1.33333 NA intron (NM_001006932, intron 9 of 21) intron (NM_001006932, intron 9 of 21) 12793 NR_031734 100302141 NR_031734 ENSG00000222958 MIR1913 MIRN1913|hsa-mir-1913 microRNA 1913 ncRNA 178.667-21 chr10 49533789 49534045 + 1.33333 NA intron (NM_001277059, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 5204 NM_000124 2074 Hs.49063 NM_000124 ENSG00000225830 ERCC6 ARMD5|CKN2|COFS|COFS1|CSB|CSB-PGBD3|POF11|RAD26|UVSS1 ERCC excision repair 6, chromatin remodeling factor protein-coding 195.333-46 chr11 42417079 42417344 + 1.33333 NA Intergenic MER106A|DNA|hAT-Charlie -163521 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 242.333-18 chr11 83204430 83204628 + 1.33333 NA intron (NM_001300975, intron 2 of 10) L1PA17|LINE|L1 10817 NR_125355 338699 Hs.503438 NM_182603 ENSG00000137494 ANKRD42 PPP1R79|SARP ankyrin repeat domain 42 protein-coding 339.667-9 chr18 76803149 76803645 + 1.33333 NA intron (NR_040024, intron 2 of 2) intron (NR_040024, intron 2 of 2) 18898 NR_040024 100131655 Hs.385806 NR_040024 ENSG00000264278 ZNF236-DT - ZNF236 divergent transcript ncRNA 342.333-29 chr8 143352146 143352545 + 1.33333 NA intron (NM_001258447, intron 1 of 13) L1MB5|LINE|L1 7632 NM_001258446 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 210.667-133 chr9 33839554 33839868 + 1.33333 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 22551 NM_017811 54926 Hs.643648 NM_017811 ENSG00000107341 UBE2R2 CDC34B|E2-CDC34B|UBC3B ubiquitin conjugating enzyme E2 R2 protein-coding 183.333-40 chr14 40407385 40407538 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -547250 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 158.333-173 chr20 41211913 41212181 + 1.33333 NA intron (NM_015035, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 43024 NR_106931 102466912 NR_106931 ENSG00000276169 MIR6871 hsa-mir-6871 microRNA 6871 ncRNA 220.333-66 chr2 141007439 141007637 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 14 of 90) intron (NM_018557, intron 14 of 90) -420853 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 221.333-39 chr14 64964914 64965145 + 1.33333 NA intron (NM_001330182, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 7307 NM_198686 376267 Hs.512492 NM_198686 ENSG00000139998 RAB15 - RAB15, member RAS oncogene family protein-coding 210.666-38 chr14 83958435 83958657 + 1.33333 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 -1313386 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 184-82 chr5 38318227 38318418 + 1.33333 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) (ATACT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -27336 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 196.666-48 chr2 60932846 60933077 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 51387 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 201.333-225 chr5 32691731 32691911 + 1.33333 NA intron (NM_001364458, intron 1 of 7) L1ME5|LINE|L1 949 NM_001364458 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 208.666-36 chr14 44755148 44755309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43898 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 155.667-62 chr12 1894699 1894926 + 1.33333 NA intron (NM_172364, intron 6 of 37).2 L1MA4A|LINE|L1 23840 NM_172364 93589 Hs.13768 NM_172364 ENSG00000151062 CACNA2D4 RCD4 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 4 protein-coding 223.333-29 chr11 105977238 105977405 + 1.33333 NA intron (NM_001077243, intron 16 of 16) intron (NM_001077243, intron 16 of 16) 44919 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 206.667-97 chr4 19620388 19620664 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -631379 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 208.666-76 chr3 180947625 180947825 + 1.33333 NA intron (NM_005087, intron 3 of 16) intron (NM_005087, intron 3 of 16) 35054 NM_001363882 8087 Hs.478407 NM_005087 ENSG00000114416 FXR1 FXR1P FMR1 autosomal homolog 1 protein-coding 206-46 chr12 120633069 120633368 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -7401 NM_001033677 9478 Hs.458482 NM_004276 ENSG00000157782 CABP1 CALBRAIN|HCALB_BR calcium binding protein 1 protein-coding 213.333-16 chr1 247102070 247102387 + 1.33333 NA intron (NM_001142572, intron 1 of 3) intron (NM_001142572, intron 1 of 3) 2144 NM_001142572 79862 Hs.163754 NM_024804 ENSG00000188295 ZNF669 - zinc finger protein 669 protein-coding 207-23 chr12 18238791 18239003 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -22643 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 126.666-5 chr7 49859380 49859565 + 1.33333 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) L1ME3E|LINE|L1 84139 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 196.333-144 chr5 104286137 104286294 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -723426 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 308.666-5 chr11 96480062 96480428 + 1.33333 NA intron (NR_047481, intron 1 of 4) intron (NR_047481, intron 1 of 4) 26632 NR_047481 100874053 Hs.742044 NR_047481 JRKL-AS1 - JRKL antisense RNA 1 ncRNA 219.333-79 chr17 81299069 81299302 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -3878 NM_138570 124565 Hs.352240 NM_138570 ENSG00000157637 SLC38A10 PP1744 solute carrier family 38 member 10 protein-coding 152.666-9 chr3 189660798 189661020 + 1.33333 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) L1PA16|LINE|L1 29520 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 223.666-19 chr2 23090947 23091377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -294017 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 208-54 chr15 58290544 58290865 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -141287 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 211.333-157 chr3 184132098 184132355 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3132 NM_003907 8893 Hs.283551 NM_003907 ENSG00000145191 EIF2B5 CACH|CLE|EIF-2B|EIF2Bepsilon|LVWM eukaryotic translation initiation factor 2B subunit epsilon protein-coding 317.333-27 chr2 224719605 224720140 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -134475 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 210-59 chr2 19462333 19462605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -103846 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 214.666-61 chr6 39118836 39119086 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -3775 NM_001304793 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 207.666-37 chr3 120153625 120153846 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -59288 NM_001146156 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 221.333-36 chr14 43035577 43035758 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1428811 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 236-11 chr11 28905592 28905927 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -428211 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 294-23 chr14 46333363 46333707 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) HAL1|LINE|L1 -137824 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 300.666-6 chr15 63589575 63589974 + 1.33333 NA intron (NR_034080, intron 2 of 2) intron (NR_034080, intron 2 of 2) -7613 NM_203373 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 161.666-11 chr9 16590824 16591005 + 1.33333 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) intron (NM_001317940, intron 2 of 5) -135900 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 322.667-7 chr11 94551889 94552355 + 1.33333 NA intron (NR_135094, intron 3 of 3) intron (NR_135094, intron 3 of 3) 8271 NM_002033 2526 Hs.390420 NM_002033 ENSG00000196371 FUT4 CD15|ELFT|FCT3A|FUC-TIV|FUTIV|LeX|SSEA-1 fucosyltransferase 4 protein-coding 217.666-31 chr4 100685643 100685887 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -10652 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 249.666-43 chr9 116456747 116457283 + 1.33333 NA intron (NM_014010, intron 19 of 21) L1MA3|LINE|L1 -47268 NR_033973 100128505 Hs.675821 NR_033973 ENSG00000229105 ASTN2-AS1 - ASTN2 antisense RNA 1 ncRNA 193.333-145 chr4 138940268 138940441 + 1.33333 NA intron (NR_133945, intron 2 of 2) intron (NR_133945, intron 2 of 2) 72292 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 179.333-103 chr2 151734407 151734553 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_004543) promoter-TSS (NM_004543) -4 NM_001271208 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 337.333-32 chr3 178128413 178128721 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -290634 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 242.666-15 chr14 96142966 96143180 + 1.33333 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -61725 NM_000623 624 Hs.654542 NM_000623 ENSG00000168398 BDKRB2 B2R|BK-2|BK2|BKR2|BRB2 bradykinin receptor B2 protein-coding 273.333-51 chr4 103484878 103485093 + 1.33333 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 59943 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 206-118 chr3 191736823 191737121 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 275809 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 430.666-4 chr2 123737813 123738321 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 287107 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 271.333-7 chr10 68905191 68905613 + 1.33333 NA intron (NM_024045, intron 1 of 14) intron (NM_024045, intron 1 of 14) 4087 NM_024045 79009 Hs.522984 NM_024045 ENSG00000107625 DDX50 GU2|GUB|RH-II/GuB|mcdrh DExD-box helicase 50 protein-coding 198-127 chr3 132257455 132257693 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -59833 NM_001099 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 230.666-39 chr3 119852609 119852808 + 1.33333 NA intron (NM_002093, intron 10 of 11) intron (NM_002093, intron 10 of 11) 69998 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 276.666-31 chr7 32296348 32296668 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) 2820 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 201.333-46 chr11 6139526 6139730 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 30698 NM_001004052 255725 Hs.690457 NM_001004052 ENSG00000255307 OR52B2 OR11-70 olfactory receptor family 52 subfamily B member 2 protein-coding 259.333-47 chr2 108812559 108812937 + 1.33333 NA intron (NM_144978, intron 8 of 14) intron (NM_144978, intron 8 of 14) 25977 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 220.666-58 chr5 57932342 57932571 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33294 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 204-139 chr3 191362896 191363131 + 1.33333 NA intron (NM_178335, intron 4 of 11) intron (NM_178335, intron 4 of 11) -32477 NM_198152 257313 Hs.518492 NM_198152 ENSG00000188958 UTS2B U2B|URP|UTS2D urotensin 2B protein-coding 253.333-108 chr8 81285396 81285749 + 1.33333 NA TTS (NM_001444) TTS (NM_001444) 5036 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 203.333-63 chr13 80428140 80428350 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87119 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 174.333-24 chr12 28677995 28678151 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -471205 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 281.333-36 chr21 31855945 31856267 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16914 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 258.333-23 chr15 76741800 76742095 + 1.33333 NA intron (NR_148227, intron 15 of 32) intron (NR_148227, intron 15 of 32) 119997 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 211.667-11 chr1 194453409 194453666 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 1148792 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 230.666-5 chr1 192914867 192915068 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33290 NR_126003 102724954 Hs.243488 NR_126003 LINC01032 - long intergenic non-protein coding RNA 1032 ncRNA 220.666-42 chr21 34209813 34209990 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 29224 NR_027266 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 242.667-75 chr4 65834878 65835196 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -164542 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 206.333-13 chr10 55480765 55480966 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1PA13|LINE|L1 -118177 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 233.666-6 chr11 103691835 103692047 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157965 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 225.999-8 chr5 19875959 19876143 + 1.33333 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 10221 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 170-90 chr4 47645072 47645205 + 1.33333 NA exon (NM_001278585, exon 12 of 20) exon (NM_001278585, exon 12 of 20) -7531 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 203.333-72 chr14 42115449 42115657 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 508697 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 202.666-52 chr18 1504359 1504627 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -144864 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 266.333-13 chr12 13999354 13999615 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19128 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 206.666-55 chr2 28103620 28103852 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) intron (NM_199193, intron 7 of 13) 103225 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 245-80 chrX 119227884 119228267 + 1.33333 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8170 NM_001282621 10857 Hs.90061 NM_006667 ENSG00000101856 PGRMC1 Dap1|HPR6.6|IZA|MPR progesterone receptor membrane component 1 protein-coding 199-61 chr2 232111109 232111286 + 1.33333 NA intron (NR_046477, intron 6 of 18) MIR3|SINE|MIR -61456 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 199.333-133 chr2 118174118 118174398 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12128 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 141.666-3 chr17 78041712 78041900 + 1.33333 NA intron (NM_018996, intron 3 of 20) intron (NM_018996, intron 3 of 20) 37569 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 272.667-22 chr17 47667792 47668127 + 1.33333 NA intron (NM_002265, intron 9 of 21) L1ME3A|LINE|L1 16894 NM_001276453 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 205.666-5 chr1 161057640 161057823 + 1.33333 NA intron (NM_001025598, intron 2 of 11) intron (NM_001025598, intron 2 of 11) -11754 NM_007122 7391 Hs.414880 NM_007122 ENSG00000158773 USF1 FCHL|FCHL1|HYPLIP1|MLTF|MLTFI|UEF|bHLHb11 upstream transcription factor 1 protein-coding 204.333-93 chr2 37935474 37935735 + 1.33333 NA intron (NM_001170792, intron 2 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 6845 NM_001170792 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 341.666-13 chr4 176449322 176449906 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 129648 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 146.666-13 chr7 46377878 46378030 + 1.33333 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 319168 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 290-12 chr11 127315071 127315345 + 1.33333 NA intron (NR_120580, intron 1 of 2) L1M2|LINE|L1 44138 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 458.333-4 chr4 98411621 98412106 + 1.33333 NA intron (NM_021159, intron 7 of 14) intron (NM_021159, intron 7 of 14) 150479 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 230.333-62 chr2 69911122 69911429 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3766 NM_001202514 4084 Hs.468908 NM_002357 ENSG00000059728 MXD1 BHLHC58|MAD|MAD1 MAX dimerization protein 1 protein-coding 238.999-8 chr9 125751757 125751939 + 1.33333 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) intron (NR_024122, intron 2 of 7) 3665 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 309-25 chr3 112570158 112570432 + 1.33333 NA intron (NM_001348909, intron 3 of 5) intron (NM_001348909, intron 3 of 5) 8250 NM_017945 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 262.333-65 chr4 115529178 115529523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -415730 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 224-50 chr2 174174073 174174356 + 1.33333 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) L1ME1|LINE|L1 74318 NM_001011708 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 190.666-53 chr8 70144384 70144562 + 1.33333 NA intron (NM_001321711, intron 12 of 21) intron (NM_001321711, intron 12 of 21) -73221 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 241.333-86 chr6 47162357 47162544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120118 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 204-36 chr11 24242133 24242303 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254835 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 287-12 chr18 72819026 72819492 + 1.33333 NA intron (NM_001354018, intron 4 of 11) intron (NM_001354018, intron 4 of 11) 34123 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 235.333-70 chr3 15895102 15895361 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21460 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 212.666-32 chr16 11006351 11006581 + 1.33333 NA intron (NM_015226, intron 10 of 22) intron (NM_015226, intron 10 of 22) 61902 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 198-120 chr3 54132055 54132220 + 1.33333 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 9585 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 209.333-124 chr2 189374985 189375145 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -66368 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 309.333-48 chr3 131598040 131598406 + 1.33333 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) MIR3|SINE|MIR -95252 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 223.333-163 chr8 53298410 53298626 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46821 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 203.333-142 chr2 125836223 125836523 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 281612 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 267.333-60 chr22 27870314 27870642 + 1.33333 NA intron (NM_001284278, intron 8 of 11) intron (NM_001284278, intron 8 of 11) 48736 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 184.666-32 chr6 41863608 41863771 + 1.33333 NA intron (NM_001286554, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 7948 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 207.333-73 chr13 38162312 38162580 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19214 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 279-32 chr6 120271387 120271875 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 256452 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 246.667-73 chr5 98865941 98866283 + 1.33333 NA intron (NM_001364113, intron 32 of 36) (AAAAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 60422 NM_001270 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 202.666-53 chr18 3964634 3964828 + 1.33333 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) intron (NR_102696, intron 1 of 4) 2378 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 136-42 chr16 87078154 87078352 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20469 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 236.333-53 chr21 23741460 23741716 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -356753 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 320.333-21 chr4 96586811 96587402 + 1.33333 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 276403 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 220.333-29 chr11 66765089 66765325 + 1.33333 NA intron (NM_024650, intron 4 of 16) intron (NM_024650, intron 4 of 16) 20438 NM_001302084 79703 Hs.292088 NM_024650 ENSG00000173715 C11orf80 HYDM4|TOP6BL|TOPOVIBL chromosome 11 open reading frame 80 protein-coding 244.999-4 chr6 167478374 167478557 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -5675 NR_134591 105378127 Hs.58456 NR_134591 LOC105378127 - uncharacterized LOC105378127 ncRNA 241.666-18 chr5 108253792 108254132 + 1.33333 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) AluJb|SINE|Alu 128136 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 212.666-79 chr6 123742374 123742698 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61310 NM_001300737 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 415.666-2 chr14 64763185 64763645 + 1.33333 NA intron (NM_001024858, intron 31 of 34) intron (NM_001024858, intron 31 of 34) 22271 NR_107009 102465841 NR_107009 ENSG00000284269 MIR7855 hsa-mir-7855 microRNA 7855 ncRNA 200.667-45 chr14 63061285 63061560 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15964 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 204.667-90 chr21 29774072 29774357 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 26039 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 411.333-7 chr14 71338727 71339223 + 1.33333 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) AluSz|SINE|Alu 18499 NM_001354289 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 304 chr1 57886036 57886545 + 1.33333 NA intron (NM_021080, intron 1 of 16) AluSg|SINE|Alu 25709 NR_104363 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 178.333-159 chr6 145149585 145149744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 537213 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 259.666-27 chr4 31950381 31950650 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46864 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 207-124 chr8 138694278 138694582 + 1.33333 NA intron (NM_152888, intron 34 of 64) intron (NM_152888, intron 34 of 64) -196700 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 340-28 chr8 67571178 67571520 + 1.33333 NA intron (NM_020361, intron 2 of 10) L1MA7|LINE|L1 175011 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 228-7 chr1 231929963 231930198 + 1.33333 NA intron (NR_126441, intron 1 of 3) intron (NR_126441, intron 1 of 3) 4246 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 221.667-78 chr7 141879102 141879374 + 1.33333 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -37753 NM_001370403 136242 Hs.98947 NM_001008270 ENSG00000165076 PRSS37 TRYX2 serine protease 37 protein-coding 229.333-57 chr2 12936595 12936829 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70301 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 230.667-76 chr7 5339869 5340201 + 1.33333 NA intron (NM_001080495, intron 18 of 29) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 57092 NM_153247 222962 Hs.4302 NM_153247 ENSG00000164638 SLC29A4 ENT4|PMAT solute carrier family 29 member 4 protein-coding 267.666-18 chr5 122653637 122654048 + 1.33333 NA intron (NR_109881, intron 8 of 11) L2c|LINE|L2 -69242 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 194.666-2 chr1 222654326 222654489 + 1.33333 NA exon (NM_001324062, exon 17 of 29) exon (NM_001324062, exon 17 of 29) 10104 NM_001300867 375056 Hs.118474 NM_198551 ENSG00000154305 MIA3 ARNT|D320|TANGO|TANGO1|UNQ6077 MIA SH3 domain ER export factor 3 protein-coding 200-80 chr2 45097542 45097762 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -88200 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 294.667-38 chr4 115303086 115303482 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -189664 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 462.333-5 chr4 32225597 32226109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125185 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 234-67 chr8 9895156 9895392 + 1.33333 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8055 NR_024281 157627 Hs.12513 NR_024281 ENSG00000253230 LINC00599 Rncr3 long intergenic non-protein coding RNA 599 ncRNA 230.333-119 chr8 79067697 79068044 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 230341 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 381-15 chr7 51321065 51321601 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -4472 NM_001346444 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 295-36 chr5 55964875 55965239 + 1.33333 NA intron (NM_001364277, intron 4 of 16) L1MC5|LINE|L1 29906 NM_001364276 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 112.333-134 chr2 141735304 141735456 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 396321 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 182-7 chr1 107222140 107222405 + 1.33333 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 74203 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 177.666-9 chr19 51056839 51057097 + 1.33333 NA intron (NR_145463, intron 4 of 4) intron (NR_145463, intron 4 of 4) 7951 NR_145466 26085 Hs.165296 NM_015596 ENSG00000167759 KLK13 KLK-L4|KLKL4 kallikrein related peptidase 13 protein-coding 201.333-190 chr3 89666082 89666281 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 558560 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 256.666-40 chr5 103116013 103116332 + 1.33333 NA intron (NR_134299, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 3966 NM_001317954 54826 Hs.24088 NM_017676 ENSG00000145723 GIN1 GIN-1|TGIN1|ZH2C2 gypsy retrotransposon integrase 1 protein-coding 226.333-75 chr3 23587097 23587342 + 1.33333 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) intron (NM_001370225, intron 5 of 5) -218736 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 233.333-94 chr4 71534143 71534371 + 1.33333 NA exon (NM_001134742, exon 18 of 25) exon (NM_001134742, exon 18 of 25) 195204 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 297.666-14 chr6 35287043 35287294 + 1.33333 NA intron (NM_001292032, intron 4 of 12) L2b|LINE|L2 -10650 NM_022047 50619 Hs.15476 NM_022047 ENSG00000023892 DEF6 IBP|SLAT|SWAP70L DEF6 guanine nucleotide exchange factor protein-coding 234.666-57 chrX 104535929 104536203 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -30133 NM_017416 26280 Hs.675519 NM_017416 ENSG00000189108 IL1RAPL2 IL-1R9|IL1R9|IL1RAPL-2|TIGIRR-1 interleukin 1 receptor accessory protein like 2 protein-coding 209.333-164 chr4 25408179 25408486 + 1.33333 NA intron (NM_013367, intron 20 of 28) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 31069 NM_001286756 29945 Hs.152173 NM_013367 ENSG00000053900 ANAPC4 APC4 anaphase promoting complex subunit 4 protein-coding 124-93 chr5 52392766 52392863 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 384783 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 159.333-245 chr4 155829443 155829608 + 1.33333 NA TTS (NM_017419) TTS (NM_017419) 36752 NM_017419 51802 Hs.381349 NM_017419 ENSG00000256394 ASIC5 ACCN5|HINAC|INAC acid sensing ion channel subunit family member 5 protein-coding 352-26 chr6 56776804 56777119 + 1.33333 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 66704 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 357.333-9 chr2 72700374 72700707 + 1.33333 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 125493 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 181.333-193 chr9 116030229 116030452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -105133 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 274.666-12 chr14 45530211 45530663 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 185165 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 200.333-101 chr4 30314122 30314369 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -406124 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 221.333-27 chr11 113238322 113238546 + 1.33333 NA intron (NM_001076682, intron 14 of 18) intron (NM_001076682, intron 14 of 18) 35467 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 280.999-4 chr15 81454931 81455362 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -80933 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 216-56 chr2 61032886 61033133 + 1.33333 NA intron (NM_002618, intron 2 of 3) intron (NM_002618, intron 2 of 3) -14750 NM_001322127 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 283.333-73 chr7 134526213 134526491 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1215 NM_020299 57016 Hs.116724 NM_020299 ENSG00000198074 AKR1B10 AKR1B11|AKR1B12|ALDRLn|ARL-1|ARL1|HIS|HSI aldo-keto reductase family 1 member B10 protein-coding 273.666-24 chr6 122461954 122462236 + 1.33333 NA intron (NM_020755, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 9712 NM_020755 57515 Hs.146668 NM_020755 ENSG00000111897 SERINC1 TDE1L|TDE2|TMS-2|TMS2 serine incorporator 1 protein-coding 224-6 chr10 10921906 10922120 + 1.33333 NA intron (NM_001326327, intron 2 of 14) intron (NM_001326327, intron 2 of 14) 30150 NR_024411 254312 Hs.498620 NR_015413 ENSG00000229240 LINC00710 - long intergenic non-protein coding RNA 710 ncRNA 187.666-20 chr3 104923320 104923508 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -443299 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 200.666-96 chr5 28275815 28275999 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 11758 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 229.333-29 chr12 78242075 78242252 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 117583 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 313.666-12 chr6 119206675 119207109 + 1.33333 NA intron (NM_005907, intron 6 of 12) intron (NM_005907, intron 6 of 12) -57699 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 279.333-64 chr5 5308646 5309006 + 1.33333 NA intron (NM_139056, intron 21 of 22) AluSx|SINE|Alu -113851 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 202.666-110 chr6 168020848 168021079 + 1.33333 NA intron (NM_005355, intron 1 of 7) L1MEc|LINE|L1 3090 NM_030615 3834 Hs.150013 NM_005355 ENSG00000125337 KIF25 KNSL3 kinesin family member 25 protein-coding 211-13 chr10 123195933 123196121 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 41625 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 190.666-18 chr14 61643361 61643542 + 1.33333 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -52062 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 294.333-34 chr5 37572179 37572640 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) intron (NM_001345998, intron 9 of 17) 193091 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 145.333-178 chr3 20813495 20813699 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 471129 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 217.333-85 chr22 31455819 31456002 + 1.33333 NA exon (NM_001164501, exon 8 of 19) exon (NM_001164501, exon 8 of 19) 33646 NM_001164501 56478 Hs.517559 NM_019843 ENSG00000184708 EIF4ENIF1 4E-T|Clast4 eukaryotic translation initiation factor 4E nuclear import factor 1 protein-coding 310-16 chr12 18306078 18306432 + 1.33333 NA intron (NM_001288774, intron 5 of 32) intron (NM_001288774, intron 5 of 32) 44715 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 176.333-105 chr22 35984749 35984920 + 1.33333 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 -23204 NM_001349994 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 278.333-51 chr9 113404126 113404423 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2936 NM_001003945 210 Hs.1227 NM_000031 ENSG00000148218 ALAD ALADH|PBGS aminolevulinate dehydratase protein-coding 229-66 chr8 62621894 62622247 + 1.33333 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) L1MD1|LINE|L1 -355791 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 212.666-24 chr14 24364286 24364485 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2526 NM_001136022 4776 Hs.77810 NM_004554 ENSG00000100968 NFATC4 NF-AT3|NF-ATC4|NFAT3 nuclear factor of activated T cells 4 protein-coding 252.666-30 chr4 122328998 122329407 + 1.33333 NA intron (NM_015312, intron 64 of 83) HAL1|LINE|L1 -49809 NM_139243 132612 Hs.518957 NM_139243 ENSG00000164113 ADAD1 Tenr adenosine deaminase domain containing 1 protein-coding 201-64 chr2 205280976 205281194 + 1.33333 NA intron (NM_057177, intron 16 of 21) intron (NM_057177, intron 16 of 21) -401415 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 291.666-14 chr7 14758411 14758751 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) intron (NM_001350717, intron 2 of 24) 82869 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 376.333-4 chr15 64901709 64902168 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -9964 NM_182703 348094 Hs.207157 NM_182703 ENSG00000166839 ANKDD1A - ankyrin repeat and death domain containing 1A protein-coding 210.667-130 chr8 91868529 91868814 + 1.33333 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 149009 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 212.666-19 chr12 15056008 15056200 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54271 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 200-38 chr11 130686549 130686709 + 1.33333 NA intron (NM_001271983, intron 1 of 2) L1MB4|LINE|L1 13673 NM_001271983 283171 Hs.376151 NM_001271983 C11orf44 - chromosome 11 open reading frame 44 protein-coding 462.333-3 chr13 38729759 38730321 + 1.33333 NA intron (NM_207361, intron 2 of 23) intron (NM_207361, intron 2 of 23) 42963 NM_207361 341640 Hs.253994 NM_207361 ENSG00000150893 FREM2 CRYPTOP|FRASRS2 FRAS1 related extracellular matrix 2 protein-coding 252.666 chr1 76186006 76186316 + 1.33333 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 111415 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 196-187 chr8 127930615 127930779 + 1.33333 NA intron (NR_003367, intron 2 of 8) intron (NR_003367, intron 2 of 8) 18026 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 149.333-370 chr7 64123678 64123846 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 78328 NM_001159522 442319 Hs.640774 NM_001159522 ENSG00000214652 ZNF727 ZNF727P zinc finger protein 727 protein-coding 327-17 chr21 30874442 30874790 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 6964 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 202.667-130 chr6 147648480 147648752 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 139926 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 361.999-4 chr18 9135061 9135368 + 1.33333 NA TTS (NM_021074) TTS (NM_021074) 1506 NR_110772 101927275 Hs.656442 NR_110771 ENSG00000266053 NDUFV2-AS1 - NDUFV2 antisense RNA 1 ncRNA 217.667-49 chr2 126627396 126627655 + 1.33333 NA Intergenic LTR45C|LTR|ERV1 -28410 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 205.333-29 chr10 26679353 26679533 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17981 NM_001321979 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 336.666-3 chr10 74612865 74613215 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) L1PA17|LINE|L1 -83716 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 215-34 chr2 67184750 67184942 + 1.33333 NA intron (NR_038844, intron 3 of 7) CR1-16_AMi|LINE|CR1 -28562 NR_110568 101927661 Hs.580508 NR_110568 ENSG00000235885 LOC101927661 - uncharacterized LOC101927661 ncRNA 204-155 chr4 89155772 89156080 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 43109 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 231-5 chr10 35673183 35673543 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31929 NM_031866 8325 Hs.302634 NM_031866 ENSG00000177283 FZD8 FZ-8|hFZ8 frizzled class receptor 8 protein-coding 200.666-101 chr5 84946757 84946912 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -561954 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 214.667-36 chr12 50485022 50485332 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -19808 NM_173602 57609 Hs.505516 NM_020849 ENSG00000066084 DIP2B - disco interacting protein 2 homolog B protein-coding 219.333-173 chr7 94062396 94062668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58177 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 200-13 chr1 219495226 219495437 + 1.33333 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) MER2|DNA|TcMar-Tigger 61993 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 355.333-22 chr4 96682410 96682878 + 1.33333 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 371941 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 314-52 chr8 127535897 127536299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53959 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 214-35 chr14 50130760 50130962 + 1.33333 NA intron (NM_006939, intron 19 of 22) intron (NM_006939, intron 19 of 22) -14289 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 179.333-186 chr8 89817159 89817309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59418 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 209.333-184 chr5 25619588 25619781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 428731 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 144.667-262 chr6 56136483 56136697 + 1.33333 NA intron (NM_030820, intron 12 of 29) intron (NM_030820, intron 12 of 29) -44928 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 190-128 chr8 129116287 129116439 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 124877 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 397.333-7 chr2 202195557 202195896 + 1.33333 NA intron (NM_001277372, intron 21 of 23) L1MA5|LINE|L1 42871 NM_001005781 7341 Hs.81424 NM_003352 ENSG00000116030 SUMO1 DAP1|GMP1|OFC10|PIC1|SENP2|SMT3|SMT3C|SMT3H3|UBL1 small ubiquitin like modifier 1 protein-coding 208.666-97 chr6 142509428 142509647 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 128299 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 173.333-108 chr21 29898503 29898654 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 41418 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 325.999-4 chr20 38711494 38711749 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12865 NM_080552 140679 Hs.179080 NM_080552 ENSG00000101438 SLC32A1 VGAT|VIAAT solute carrier family 32 member 1 protein-coding 191.666-6 chr18 21009893 21010097 + 1.33333 NA intron (NM_005406, intron 13 of 32) L1MD2|LINE|L1 101818 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 364.333-21 chr5 94223264 94223849 + 1.33333 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -111857 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 138-118 chr8 101509506 101509659 + 1.33333 NA intron (NM_001330593, intron 1 of 15) intron (NM_001330593, intron 1 of 15) 17143 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 213.333-70 chr16 20400848 20401139 + 1.33333 NA intron (NM_174924, intron 1 of 11) L1MC5|LINE|L1 3744 NM_174924 204474 Hs.376025 NM_174924 ENSG00000169340 PDILT PDIA7 protein disulfide isomerase like, testis expressed protein-coding 223.666-20 chr20 55447205 55447402 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20106 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 269.333-23 chr14 85597521 85597821 + 1.33333 NA intron (NM_001346143, intron 1 of 1) AluSp|SINE|Alu 64322 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 297.666-7 chr18 482889 483155 + 1.33333 NA intron (NM_130386, intron 1 of 9) intron (NM_130386, intron 1 of 9) 17679 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 208-3 chr1 56419240 56419461 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 4387 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 388.333-9 chr16 31257420 31257916 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2307 NM_001145808 3684 Hs.172631 NM_000632 ENSG00000169896 ITGAM CD11B|CR3A|MAC-1|MAC1A|MO1A|SLEB6 integrin subunit alpha M protein-coding 120.666 chr1 68137051 68137170 + 1.33333 NA intron (NM_001193334, intron 10 of 10) MIR3|SINE|MIR 46500 NR_031664 100302279 NR_031664 ENSG00000221203 MIR1262 MIRN1262|hsa-mir-1262|mir-1262 microRNA 1262 ncRNA 207.667-38 chr15 64797271 64797564 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -21828 NM_194272 348093 Hs.436518 NM_194272 ENSG00000166831 RBPMS2 - RNA binding protein, mRNA processing factor 2 protein-coding 332-5 chr11 34097545 34097876 + 1.33333 NA exon (NM_203364, exon 18 of 18) exon (NM_203364, exon 18 of 18) -7919 NM_024662 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 383.666-9 chr9 126535625 126535961 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -78650 NM_001174147 4010 Hs.129133 NM_002316 ENSG00000136944 LMX1B LMX1.2|NPS1 LIM homeobox transcription factor 1 beta protein-coding 252.333-40 chr2 224205662 224206003 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -166513 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 246-58 chr20 49499263 49499602 + 1.33333 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -16764 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 153.333-93 chr12 46979964 46980144 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99549 NM_001281429 91523 Hs.560100 NM_138371 ENSG00000179715 PCED1B FAM113B PC-esterase domain containing 1B protein-coding 246.666-43 chrX 96146432 96146796 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 191288 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 224.667-5 chr10 57858777 57859050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 408981 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 115.333-89 chr16 79819352 79819502 + 1.33333 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 24178 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 376-13 chr4 33948900 33949299 + 1.33333 NA intron (NR_125902, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 90794 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 260.333-2 chr1 246065704 246066070 + 1.33333 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 351525 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 212-45 chr12 128431718 128431943 + 1.33333 NA intron (NM_001136103, intron 2 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 137738 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 218.666-11 chr10 86530571 86530876 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -8931 NM_015045 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 198.666-20 chr13 24701137 24701306 + 1.33333 NA intron (NM_001676, intron 13 of 22) AluSq2|SINE|Alu 20810 NM_001185085 479 Hs.147111 NM_001676 ENSG00000075673 ATP12A ATP1AL1|HK ATPase H+/K+ transporting non-gastric alpha2 subunit protein-coding 213.666-47 chr9 3649077 3649279 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18908 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 362.666-9 chr3 59934159 59934587 + 1.33333 NA intron (NM_001320901, intron 5 of 6) intron (NM_001320901, intron 5 of 6) 146536 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 218.333-84 chr3 39785676 39785894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23129 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 179.333 chr1 14412546 14412702 + 1.33333 NA intron (NR_149058, intron 1 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 7349 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 276.333-47 chr5 28541443 28541814 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -253963 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 212.666-73 chr6 55611933 55612204 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -32854 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 195-22 chr11 24563532 24563799 + 1.33333 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 66612 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 291.333-25 chr15 52858569 52858850 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68373 NM_004498 3175 Hs.555318 NM_004498 ENSG00000169856 ONECUT1 HNF-6|HNF6|HNF6A one cut homeobox 1 protein-coding 168.667-229 chr8 129292655 129292856 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51515 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 210.666-78 chr4 98557637 98557829 + 1.33333 NA intron (NM_005723, intron 1 of 7) L1MC3|LINE|L1 100878 NM_005723 10098 Hs.118118 NM_005723 ENSG00000168785 TSPAN5 NET-4|NET4|TM4SF9|TSPAN-5 tetraspanin 5 protein-coding 215.333-41 chr12 9049403 9049766 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15486 NR_034140 253128 Hs.408739 NM_001039381 ENSG00000214851 LINC00612 C12orf33 long intergenic non-protein coding RNA 612 ncRNA 196.666-66 chr3 108817180 108817385 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -5504 NM_016388 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 184.666-9 chr12 120837043 120837197 + 1.33333 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) intron (NM_139015, intron 1 of 10) 67238 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 243.333-97 chr6 65359381 65359706 + 1.33333 NA intron (NM_198283, intron 7 of 9) intron (NM_198283, intron 7 of 9) 58125 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 219.333-121 chr3 190060246 190060458 + 1.33333 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 60545 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 204-136 chr3 163935950 163936223 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 235470 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 190.666-28 chr2 217380840 217380997 + 1.33333 NA intron (NR_026597, intron 8 of 12) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 98185 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-42 chr14 26569641 26569838 + 1.33333 NA intron (NM_001366391, intron 2 of 5) intron (NM_001366391, intron 2 of 5) -16309 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 176.666-9 chr14 58511691 58511863 + 1.33333 NA intron (NM_001329944, intron 28 of 31) intron (NM_001329944, intron 28 of 31) 72096 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 274.666-16 chr18 64613110 64613360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -353180 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 227.999-9 chr9 131992049 131992273 + 1.33333 NA intron (NM_001253881, intron 3 of 6) intron (NM_001253881, intron 3 of 6) 87706 NM_001253882 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 171.333-188 chr8 11046564 11046816 + 1.33333 NA intron (NM_173683, intron 1 of 2) L1MA9|LINE|L1 -11388 NR_030328 693183 NR_030328 ENSG00000207600 MIR598 MIRN598|hsa-mir-598|mir-598 microRNA 598 ncRNA 213.333-5 chr1 62996684 62996934 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 14116 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 222.666-48 chr6 38493187 38493359 + 1.33333 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) 11677 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 205.333-77 chr14 73297658 73297887 + 1.33333 NA intron (NM_001005745, intron 5 of 10) intron (NM_001005745, intron 5 of 10) -51771 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 268-14 chr11 113705526 113705917 + 1.33333 NA intron (NM_001288752, intron 1 of 10) intron (NM_001288752, intron 1 of 10) 587 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 219-52 chr20 32648655 32648920 + 1.33333 NA intron (NM_182584, intron 4 of 5) L1MD3|LINE|L1 25154 NM_182584 284805 Hs.353262 NM_182584 ENSG00000198547 C20orf203 - chromosome 20 open reading frame 203 protein-coding 284.333-42 chr8 104703983 104704491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -115213 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 222.333-58 chr22 34618674 34618927 + 1.33333 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 379116 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 323.333-14 chr2 7785005 7785512 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 114397 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 202.666-6 chr1 198726279 198726471 + 1.33333 NA intron (NM_002838, intron 15 of 32) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 87335 NM_001267798 5788 Hs.654514 NM_002838 ENSG00000081237 PTPRC B220|CD45|CD45R|GP180|L-CA|LCA|LY5|T200 protein tyrosine phosphatase receptor type C protein-coding 245.333-36 chr13 46788129 46788518 + 1.33333 NA intron (NM_001984, intron 3 of 9) intron (NM_001984, intron 3 of 9) 8838 NM_001984 2098 Hs.432491 NM_001984 ENSG00000139684 ESD FGH esterase D protein-coding 220.666-22 chr14 65556986 65557171 + 1.33333 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 85976 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 182.666-35 chr5 64782477 64782660 + 1.33333 NA intron (NM_001297645, intron 3 of 10) intron (NM_001297645, intron 3 of 10) 13638 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 343.333-18 chr3 186028950 186029262 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69163 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 252.666-23 chr2 153730771 153731171 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -140951 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 245.666-19 chr4 78085422 78085723 + 1.33333 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) intron (NM_001166133, intron 2 of 41) 28002 NM_001166133 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 248-43 chr2 216028369 216028855 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15061 NM_018000 55686 Hs.620391 NM_018000 ENSG00000118242 MREG DSU|WDT2 melanoregulin protein-coding 269.666-9 chr17 78116847 78117081 + 1.33333 NA intron (NM_001321185, intron 18 of 19) intron (NM_001321185, intron 18 of 19) -5165 NR_040071 100131096 Hs.635442 NR_040071 ENSG00000204282 TNRC6C-AS1 TMC6|lnc TNRC6C antisense RNA 1 ncRNA 189.666 chr1 67332651 67332932 + 1.33333 NA intron (NM_001319233, intron 8 of 15) intron (NM_001319233, intron 8 of 15) 25427 NM_001559 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 199-93 chr6 72254255 72254507 + 1.33333 NA intron (NM_001350444, intron 11 of 21) intron (NM_001350444, intron 11 of 21) 37440 NM_001350471 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 239-46 chr4 55465069 55465362 + 1.33333 NA intron (NM_004898, intron 8 of 22) MER2|DNA|TcMar-Tigger 69258 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 192-82 chr20 7719979 7720246 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 220346 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 249-25 chr14 60757326 60757593 + 1.33333 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 22698 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 210-98 chr3 160381345 160381556 + 1.33333 NA intron (NM_001190242, intron 2 of 18) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 2316 NM_001190242 57560 Hs.478095 NM_020800 ENSG00000068885 IFT80 ATD2|SRTD2|WDR56 intraflagellar transport 80 protein-coding 281-11 chr15 39622683 39622940 + 1.33333 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) intron (NM_152597, intron 10 of 11) 41732 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 256.999 chr10 8065982 8066278 + 1.33333 NA intron (NM_001002295, intron 4 of 5) intron (NM_001002295, intron 4 of 5) 11442 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 251.333-100 chr6 138109022 138109344 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1764 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 209.666-42 chr4 65382503 65382751 + 1.33333 NA intron (NM_001281767, intron 8 of 16) intron (NM_001281767, intron 8 of 16) 286861 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 245.333-62 chr2 10615356 10615636 + 1.33333 NA intron (NR_048552, intron 12 of 19) intron (NR_048552, intron 12 of 19) 74479 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 149.333-369 chr7 52890677 52890832 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -144879 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 269.333-17 chr12 58143017 58143252 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55242 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 205-109 chr9 37330268 37330528 + 1.33333 NA intron (NR_110317, intron 5 of 7) intron (NR_110317, intron 5 of 7) -92298 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 420.999 chr1 85207605 85207973 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6773 NM_032184 84144 Hs.533853 NM_032184 ENSG00000097096 SYDE2 - synapse defective Rho GTPase homolog 2 protein-coding 272.333-10 chr12 12332224 12332508 + 1.33333 NA intron (NM_001363613, intron 4 of 4) intron (NM_001363613, intron 4 of 4) 17876 NM_001363613 54682 Hs.591145 NM_018050 ENSG00000111261 MANSC1 9130403P13Rik|LOH12CR3 MANSC domain containing 1 protein-coding 265.667-15 chr11 90990379 90990699 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -121337 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 290.333-11 chr14 59462266 59462621 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_022571, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_022571, exon 1 of 1) 2937 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 180.667-62 chr2 53609242 53609484 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -158420 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 282-11 chr13 94082045 94082415 + 1.33333 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) intron (NM_005708, intron 4 of 8) 105761 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 220.999-8 chr9 76593103 76593303 + 1.33333 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 92570 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 191.333-204 chr8 101860744 101861011 + 1.33333 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) MER63D|DNA|hAT-Blackjack -69908 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 272-37 chr5 2796575 2796897 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44605 NM_178569 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 207.667-112 chr7 31316229 31316500 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 24362 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 232.999-4 chr4 108943792 108943981 + 1.33333 NA intron (NM_001256074, intron 6 of 31) intron (NM_001256074, intron 6 of 31) -180833 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 142.333-95 chr16 818625 818807 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13273 NM_001013638 388199 Hs.528461 NM_001013638 PRR25 gs64 proline rich 25 protein-coding 363.333-18 chr2 198423316 198423862 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -48492 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 184-61 chr20 58298537 58298752 + 1.33333 NA intron (NR_003505, intron 2 of 16) intron (NR_003505, intron 2 of 16) 10795 NR_003505 55370 Hs.473179 NM_018498 PPP4R1L C20orf192|PPP4R1P1|PRO1085 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 like (pseudogene) pseudo 341.333-25 chr5 127315430 127315849 + 1.33333 NA intron (NM_001308119, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu 24843 NM_001256545 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 175.666-14 chr3 87660193 87660352 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -132434 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 362.333-5 chr17 34092026 34092411 + 1.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 64588 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 206.667-128 chr7 19359764 19360013 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -214467 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 193.667-147 chrX 44387332 44387613 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43800 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 233.333-98 chr4 110181125 110181324 + 1.33333 NA intron (NM_001130721, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 17391 NM_001130721 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 228-11 chr10 45650564 45650850 + 1.33333 NA intron (NM_174890, intron 4 of 9) intron (NM_174890, intron 4 of 9) 22025 NM_001282905 93550 Hs.89029 NM_174890 ENSG00000172671 ZFAND4 ANUBL1 zinc finger AN1-type containing 4 protein-coding 201.333-149 chr2 100732871 100733064 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87172 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 319.666 chr1 58868340 58868863 + 1.33333 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) Charlie14a|DNA|hAT-Charlie 83450 NR_108106 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 246.666-10 chr12 54712912 54713129 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64655 NM_001300854 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 139.333-79 chr15 59015190 59015357 + 1.33333 NA intron (NM_001270530, intron 1 of 13) intron (NM_001270530, intron 1 of 13) 27127 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 265.666-20 chr5 62611628 62611876 + 1.33333 NA intron (NM_016338, intron 29 of 29) intron (NM_016338, intron 29 of 29) 32933 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 238-51 chr2 124380679 124380869 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) L2a|LINE|L2 355487 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 267.666-6 chr14 73639011 73639236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5863 NM_001201366 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 205-7 chr1 186049717 186049931 + 1.33333 NA intron (NM_031935, intron 42 of 106) intron (NM_031935, intron 42 of 106) -246449 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 211.333-245 chr8 112787282 112787505 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) L1MA3|LINE|L1 143900 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 297.666-17 chrX 102951726 102951949 + 1.33333 NA intron (NR_146589, intron 10 of 11) intron (NR_146589, intron 10 of 11) 14565 NM_001031834 282808 Hs.449517 NM_001031834 ENSG00000102128 RAB40AL MRXSMP|RAR2|RLGP RAB40A like protein-coding 171.333-72 chr2 22385488 22385688 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150891 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 185.333-116 chr3 14422995 14423340 + 1.33333 NA intron (NM_001134367, intron 2 of 14) intron (NM_001134367, intron 2 of 14) 20561 NR_103507 6533 Hs.529488 NM_003043 ENSG00000131389 SLC6A6 TAUT solute carrier family 6 member 6 protein-coding 475.666 chr17 7760903 7761528 + 1.33333 NA intron (NM_020877, intron 18 of 85) intron (NM_020877, intron 18 of 85) 6895 NR_002778 118432 Hs.658086 NR_002778 ENSG00000240480 RPL29P2 RPL29_10_1510 ribosomal protein L29 pseudogene 2 pseudo 221-55 chr4 168849500 168849677 + 1.33333 NA intron (NM_001367567, intron 1 of 11) intron (NM_001367567, intron 1 of 11) 17493 NM_001367570 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 194.666-76 chr9 9643156 9643305 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 7 of 45) intron (NM_002839, intron 7 of 45) -156162 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 209.666-33 chr2 173687075 173687279 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 276703 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 392-18 chr7 3694777 3695284 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) 393778 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 341.333-33 chr9 9407608 9407894 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) MIR|SINE|MIR -391641 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 215.333-29 chr10 113124625 113124883 + 1.33333 NA intron (NM_001146283, intron 5 of 12) intron (NM_001146283, intron 5 of 12) -1879 NM_001349871 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 191-5 chr1 190159444 190159695 + 1.33333 NA intron (NM_199051, intron 7 of 7) L1MB7|LINE|L1 316441 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 305.666-8 chr12 42871108 42871478 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 179077 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 243.666-3 chr1 187097460 187097743 + 1.33333 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) 4759 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 237.666-2 chr1 147151444 147151757 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 20870 NR_103871 5565 Hs.50732 NM_005399 ENSG00000131791 PRKAB2 - protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 2 protein-coding 220.666-55 chr5 10052944 10053289 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -149292 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 258.667-83 chr6 48445049 48445409 + 1.33333 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -376540 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 143.333-171 chr22 48729536 48729728 + 1.33333 NA intron (NM_001082967, intron 3 of 3) intron (NM_001082967, intron 3 of 3) -50663 NR_039761 100616415 NR_039761 ENSG00000266887 MIR4535 - microRNA 4535 ncRNA 205.999 chr1 53871229 53871393 + 1.33333 NA intron (NR_036639, intron 7 of 11) intron (NR_036639, intron 7 of 11) 18486 NR_036640 54432 Hs.11923 NM_018982 ENSG00000058799 YIPF1 DJ167A19.1|FinGER1 Yip1 domain family member 1 protein-coding 344-18 chr18 22680950 22681349 + 1.33333 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 105688 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 233.666-20 chr21 26786177 26786472 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59085 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 116.333-84 chr16 80368040 80368194 + 1.33333 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -172617 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 367.999 chr12 9832794 9833309 + 1.33333 NA intron (NM_001291823, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 5570 NM_016523 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 211-78 chr5 18847232 18847478 + 1.33333 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 1038917 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 208-2 chr1 22917823 22918115 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001309193, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001309193, exon 17 of 17) -54743 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 214-132 chr8 35147541 35147839 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87785 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 286.333-2 chr10 6575608 6575983 + 1.33333 NA intron (NM_001323265, intron 1 of 17) AluSc|SINE|Alu 4481 NM_001323266 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 222.666-54 chr8 76636593 76636802 + 1.33333 NA intron (NR_024360, intron 2 of 3) L1PA6|LINE|L1 -44550 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 339.666-14 chr6 140797330 140797662 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 113682 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 381.999-9 chr5 177124487 177124790 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8441 NM_172349 64324 Hs.106861 NM_022455 ENSG00000165671 NSD1 ARA267|KMT3B|SOTOS|SOTOS1|STO nuclear receptor binding SET domain protein 1 protein-coding 179.666-14 chr8 115505447 115505608 + 1.33333 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 162486 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 220.666-21 chr14 51581752 51581992 + 1.33333 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) intron (NM_001042481, intron 2 of 14) 18080 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 214.333-102 chr3 183912906 183913211 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26258 NR_039650 100616127 NR_039650 ENSG00000263932 MIR4448 - microRNA 4448 ncRNA 268-59 chr8 57511966 57512260 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 168326 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 333.999 chr2 140954194 140954806 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 18 of 90) intron (NM_018557, intron 18 of 90) -367815 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 241-41 chr5 14380801 14381100 + 1.33333 NA intron (NM_007118, intron 20 of 56) intron (NM_007118, intron 20 of 56) -83033 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 305.667-26 chr4 30759956 30760375 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 39796 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 208.333-133 chr6 145428416 145428680 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 258329 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 216.333-112 chr5 12924416 12924638 + 1.33333 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 108359 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 260-81 chr8 49933270 49933483 + 1.33333 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) L1MB7|LINE|L1 21969 NR_135796 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 192.667-3 chr1 32045263 32045456 + 1.33333 NA non-coding (NR_073499, exon 10 of 11) non-coding (NR_073499, exon 10 of 11) -26672 NM_001319677 55116 Hs.25544 NM_018056 ENSG00000121775 TMEM39B - transmembrane protein 39B protein-coding 201-66 chr20 34348209 34348482 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -14928 NM_031483 83737 Hs.632272 NM_031483 ENSG00000078747 ITCH ADMFD|AIF4|AIP4|NAPP1 itchy E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 220.666-82 chrX 100276789 100276989 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 133384 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 201-11 chr1 158723112 158723308 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5095 NM_001005327 391114 Hs.554488 NM_001005327 ENSG00000203757 OR6K3 OR1-18 olfactory receptor family 6 subfamily K member 3 protein-coding 301.333-45 chr6 44521042 44521521 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 30600 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 197.666-10 chr11 74966395 74966572 + 1.33333 NA intron (NM_014752, intron 3 of 4) intron (NM_014752, intron 3 of 4) 17217 NM_014752 9789 Hs.282700 NM_014752 ENSG00000118363 SPCS2 - signal peptidase complex subunit 2 protein-coding 369.666-12 chr7 53300339 53300728 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 264900 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 430.999 chr12 65342422 65343092 + 1.33333 NA intron (NM_001031679, intron 4 of 6) L1ME4a|LINE|L1 63770 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 251.333-59 chr2 160046712 160047015 + 1.33333 NA intron (NM_001007267, intron 1 of 26) intron (NM_001007267, intron 1 of 26) 15752 NM_001195641 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 189.333-56 chr14 97633388 97633531 + 1.33333 NA non-coding (NR_033943, exon 4 of 4) non-coding (NR_033943, exon 4 of 4) 53199 NR_033943 100129345 Hs.23632 NR_033943 ENSG00000197176 LINC02291 - long intergenic non-protein coding RNA 2291 ncRNA 206-111 chr3 88224839 88225032 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 74976 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 140-61 chr2 80254411 80254609 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 50242 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 362.666-4 chr11 19228497 19228816 + 1.33333 NA intron (NM_001256372, intron 10 of 12) intron (NM_001256372, intron 10 of 12) 12289 NM_024680 79733 Hs.523526 NM_024680 ENSG00000129173 E2F8 E2F-8 E2F transcription factor 8 protein-coding 211.333-91 chr17 78870481 78870674 + 1.33333 NA intron (NM_003255, intron 3 of 4) intron (NM_003255, intron 3 of 4) -30050 NM_001321291 57602 Hs.464243 NM_025090 ENSG00000055483 USP36 DUB1 ubiquitin specific peptidase 36 protein-coding 211.333-3 chr1 36000469 36000666 + 1.33333 NA intron (NM_024852, intron 5 of 18) intron (NM_024852, intron 5 of 18) 69462 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 225.333-138 chr9 27819345 27819557 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -245585 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 204-181 chr7 20973665 20973878 + 1.33333 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) intron (NR_126381, intron 2 of 5) 138340 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 230.333-104 chr6 88848888 88849168 + 1.33333 NA intron (NM_001286428, intron 9 of 13) intron (NM_001286428, intron 9 of 13) 114590 NM_001286428 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 204.333-195 chr8 75497174 75497429 + 1.33333 NA intron (NM_001330561, intron 3 of 11) intron (NM_001330561, intron 3 of 11) -42667 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 298.667-25 chr7 3419006 3419411 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) MIR|SINE|MIR 117956 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 195.333-5 chr1 48121835 48122059 + 1.33333 NA intron (NR_026749, intron 9 of 9) intron (NR_026749, intron 9 of 9) 60481 NR_026749 391037 Hs.585393 NR_026749 SKINT1L BTN12|SKINT1|SKINTL|SKINTP Skint1 like (pseudogene) pseudo 213.667-71 chr4 119567521 119567828 + 1.33333 NA intron (NM_033437, intron 3 of 20) intron (NM_033437, intron 3 of 20) 60063 NM_033430 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 280.667-45 chr6 88169271 88169608 + 1.33333 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -2090 NM_001370547 1268 Hs.75110 NM_016083 ENSG00000118432 CNR1 CANN6|CB-R|CB1|CB1A|CB1K5|CB1R|CNR cannabinoid receptor 1 protein-coding 219.333-178 chr7 117175670 117175845 + 1.33333 NA intron (NR_161419, intron 9 of 15) MIR|SINE|MIR -6924 NR_002332 93655 Hs.368131 NR_002332 ENSG00000004866 ST7-OT3 NCRNA00026|ST7|ST7OT3 ST7 overlapping transcript 3 ncRNA 407.666-10 chr8 90290623 90291221 + 1.33333 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 69434 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 215-70 chr6 46713108 46713307 + 1.33333 NA intron (NM_005084, intron 5 of 11) intron (NM_005084, intron 5 of 11) 22168 NM_005084 7941 Hs.584823 NM_005084 ENSG00000146070 PLA2G7 LDL-PLA2|LP-PLA2|PAFAD|PAFAH phospholipase A2 group VII protein-coding 206.666-94 chr5 17854360 17854585 + 1.33333 NA intron (NR_134286, intron 4 of 7) intron (NR_134286, intron 4 of 7) 47198 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 198.666-60 chr3 60795290 60795470 + 1.33333 NA intron (NR_148921, intron 4 of 4) intron (NR_148921, intron 4 of 4) -177510 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 277-55 chr9 100304876 100305118 + 1.33333 NA intron (NM_017746, intron 13 of 14) intron (NM_017746, intron 13 of 14) 47574 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 124-9 chr1 104945235 104945390 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 673623 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 218.667-67 chr3 62056295 62056623 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 4 of 29) MER30|DNA|hAT-Charlie 262488 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 142-70 chr2 223152251 223152411 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100401 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 141.333-98 chr19 19408510 19408646 + 1.33333 NA intron (NM_001359631, intron 1 of 10) intron (NM_001359631, intron 1 of 10) 22775 NM_001359631 54815 Hs.118964 NM_017660 ENSG00000167491 GATAD2A p66alpha GATA zinc finger domain containing 2A protein-coding 202-83 chr2 72322048 72322267 + 1.33333 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) L1ME1|LINE|L1 -174295 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 288.999-6 chr21 33904575 33904837 + 1.33333 NA intron (NM_001697, intron 5 of 6) intron (NM_001697, intron 5 of 6) 11098 NM_001697 539 Hs.409140 NM_001697 ENSG00000241837 ATP5PO ATP5O|ATPO|HMC08D05|OSCP ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP protein-coding 140.666-3 chr18 73357451 73357646 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 32607 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 275.333-43 chr21 27245610 27246002 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -278718 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 194.666-3 chr10 9059690 9060037 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 161874 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 131.667-204 chr8 126816436 126816556 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -196658 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 210-58 chr19 35935787 35936023 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_024509) promoter-TSS (NM_024509) -469 NM_024509 79414 Hs.143792 NM_024509 ENSG00000126243 LRFN3 FIGLER1|SALM4 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 3 protein-coding 172-3 chr1 59363854 59364000 + 1.33333 NA intron (NM_001350794, intron 4 of 14) intron (NM_001350794, intron 4 of 14) 53895 NM_001350794 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 117.667-153 chr5 74962900 74963084 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 89566 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 178.666 chr10 71934184 71934343 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30132 NM_004273 9469 Hs.158304 NM_004273 ENSG00000122863 CHST3 C6ST|C6ST1|HSD carbohydrate sulfotransferase 3 protein-coding 213-28 chr16 77180263 77180523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10797 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 293.667 chr1 66807677 66808221 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -6690 NM_005478 10022 Hs.251380 NM_005478 ENSG00000172410 INSL5 PRO182|UNQ156 insulin like 5 protein-coding 186.666-2 chr1 51107324 51107519 + 1.33333 NA intron (NM_001136508, intron 1 of 4) intron (NM_001136508, intron 1 of 4) 5193 NM_001136508 284546 Hs.176177 NM_001136508 ENSG00000204006 C1orf185 - chromosome 1 open reading frame 185 protein-coding 297.333-11 chr11 77870835 77871129 + 1.33333 NA intron (NR_133637, intron 3 of 4) intron (NR_133637, intron 3 of 4) 29844 NM_001363564 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 356.666-9 chr18 35077990 35078377 + 1.33333 NA intron (NM_001143827, intron 3 of 7) intron (NM_001143827, intron 3 of 7) 36770 NM_014268 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 220.667-69 chr3 191540770 191541069 + 1.33333 NA intron (NR_120606, intron 1 of 6) MER31B|LTR|ERV1 79756 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 263.666-3 chr14 86799256 86799691 + 1.33333 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -106305 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 202-61 chr16 88195199 88195407 + 1.33333 NA TTS (NR_110944) TTS (NR_110944) 1022 NR_110944 101928880 Hs.634835 NR_110944 ENSG00000260420 LINC02182 LA16c-444G7.2 long intergenic non-protein coding RNA 2182 ncRNA 212-81 chr2 24740224 24740517 + 1.33333 NA intron (NM_001362950, intron 18 of 23) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -52745 NM_024322 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 164.333-166 chr4 14469176 14469320 + 1.33333 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 357280 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 220.333-88 chr3 35690874 35691181 + 1.33333 NA intron (NM_016300, intron 9 of 19) intron (NM_016300, intron 9 of 19) 10087 NM_198399 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 177-37 chr2 139548811 139548988 + 1.33333 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 651575 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 208-154 chr7 6695024 6695216 + 1.33333 NA intron (NM_006956, intron 4 of 5) AluSx4|SINE|Alu 11827 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 283-37 chr8 78364738 78365029 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -151457 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 212-115 chr4 56109910 56110086 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -60197 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 238.666-27 chr2 151631913 151632175 + 1.33333 NA intron (NM_001271208, intron 65 of 182) intron (NM_001271208, intron 65 of 182) 102432 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 230.667-42 chr2 148866403 148866709 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8671 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 220.666-37 chr2 184010858 184011116 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -367988 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 182.666-27 chr22 33546889 33547089 + 1.33333 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) MIRb|SINE|MIR -110320 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 202.666-4 chr1 164434915 164435184 + 1.33333 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -124311 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 207-127 chr9 98239902 98240133 + 1.33333 NA intron (NR_051978, intron 2 of 11) L1M4|LINE|L1 -10800 NR_106913 102465514 NR_106913 ENSG00000278412 MIR6854 hsa-mir-6854 microRNA 6854 ncRNA 200-156 chr7 77811796 77811982 + 1.33333 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) intron (NM_001366088, intron 1 of 11) 12918 NM_001366086 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 194.666-61 chr6 63593924 63594083 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 21991 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 208.333-17 chr10 98632040 98632266 + 1.33333 NA intron (NM_021828, intron 7 of 11) MIRb|SINE|MIR -185190 NM_001322476 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 220.666-52 chr4 32729303 32729515 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 378371 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 287-3 chr1 184026912 184027357 + 1.33333 NA intron (NM_001303421, intron 1 of 11) intron (NM_001303421, intron 1 of 11) 10594 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 158.333-220 chr3 187721999 187722196 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001134738, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001134738, exon 8 of 8) 12810 NM_001134738 604 Hs.478588 NM_001706 ENSG00000113916 BCL6 BCL5|BCL6A|LAZ3|ZBTB27|ZNF51 BCL6 transcription repressor protein-coding 214.666-24 chr15 62675940 62676110 + 1.33333 NA intron (NM_015059, intron 8 of 55) intron (NM_015059, intron 8 of 55) 28714 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 267.333-52 chr2 154297869 154298118 + 1.33333 NA intron (NM_052917, intron 8 of 12) L2c|LINE|L2 159445 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 331-39 chr7 43477927 43478390 + 1.33333 NA intron (NM_001287059, intron 14 of 27) AluSp|SINE|Alu 44384 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 202.666-12 chr10 54480235 54480455 + 1.33333 NA intron (NM_001142773, intron 2 of 31) intron (NM_001142773, intron 2 of 31) -5885 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 314-22 chr2 180687718 180688034 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4228 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 187-86 chr8 81375454 81375696 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 71864 NM_002677 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 405.333-2 chr10 120302683 120303086 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 52339 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 189-25 chr14 46467868 46468024 + 1.33333 NA intron (NR_102701, intron 5 of 5) intron (NR_102701, intron 5 of 5) -3413 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 200.333 chr1 46268382 46268628 + 1.33333 NA intron (NM_001142548, intron 10 of 18) L1ME3A|LINE|L1 20742 NM_003579 8438 Hs.642042 NM_003579 ENSG00000085999 RAD54L HR54|RAD54A|hHR54|hRAD54 RAD54 like protein-coding 250.333-47 chr3 189296460 189296788 + 1.33333 NA intron (NM_198485, intron 4 of 5) L3|LINE|CR1 -56030 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 174.333-129 chr6 13520571 13520752 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -33024 NM_001242629 54438 Hs.484686 NM_018988 ENSG00000145990 GFOD1 ADG-90|C6orf114 glucose-fructose oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 209.667-94 chr5 64152558 64152877 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13126 NM_001113561 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 246.666-3 chr1 118491513 118491788 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -306422 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 228.667-54 chr3 35029594 35029981 + 1.33333 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 364236 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 200-49 chr13 105811857 105812142 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 105169 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 272.333-58 chr6 95533402 95533874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43813 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 276.666-10 chr14 47017143 47017354 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) intron (NM_001113498, intron 8 of 16) 325998 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 200.666-65 chr2 175308069 175308312 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -126480 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 219-28 chr15 63582974 63583209 + 1.33333 NA intron (NM_001256702, intron 10 of 13) intron (NM_001256702, intron 10 of 13) -14296 NM_203373 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 264.666-29 chr3 158590231 158590431 + 1.33333 NA intron (NM_001369784, intron 2 of 7) L1ME1|LINE|L1 19137 NM_001195433 4291 Hs.85195 NM_022443 ENSG00000178053 MLF1 - myeloid leukemia factor 1 protein-coding 244.666-34 chr4 115411379 115411650 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -297894 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 192.666-36 chr2 181571197 181571357 + 1.33333 NA intron (NM_001160277, intron 2 of 12) intron (NM_001160277, intron 2 of 12) 85828 NM_201548 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 244-14 chr1 236269902 236270278 + 1.33333 NA intron (NM_019891, intron 1 of 15) intron (NM_019891, intron 1 of 15) 11868 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 284-65 chr9 74111291 74111879 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -259946 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 274-24 chr2 84232607 84233069 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57844 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 385.333-6 chr10 60800480 60801060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22292 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 252-25 chr13 110282825 110283107 + 1.33333 NA intron (NM_001845, intron 1 of 51) L3|LINE|CR1 24191 NM_001845 1282 Hs.17441 NM_001845 ENSG00000187498 COL4A1 BSVD|BSVD1|RATOR collagen type IV alpha 1 chain protein-coding 221-36 chr2 105828363 105828642 + 1.33333 NA intron (NM_003581, intron 2 of 4) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -23345 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 192.667-30 chr10 92621743 92622002 + 1.33333 NA intron (NM_004523, intron 10 of 21) intron (NM_004523, intron 10 of 21) 28742 NM_004523 3832 Hs.8878 NM_004523 ENSG00000138160 KIF11 EG5|HKSP|KNSL1|MCLMR|TRIP5 kinesin family member 11 protein-coding 197.666-6 chr10 110246951 110247182 + 1.33333 NA intron (NM_005962, intron 3 of 5) intron (NM_005962, intron 3 of 5) 21070 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 188.667-30 chr11 100967566 100967842 + 1.33333 NA intron (NM_001367945, intron 19 of 25) L1M4b|LINE|L1 33430 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 274.667-55 chr8 52642118 52642458 + 1.33333 NA intron (NM_001083617, intron 18 of 23) intron (NM_001083617, intron 18 of 23) 72147 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 256.666-19 chr2 110893361 110893590 + 1.33333 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) L1M5|LINE|L1 160902 NM_001371254 248-67 chr5 8254884 8255118 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 202563 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 209.333-192 chr5 96458519 96458705 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) intron (NR_130776, intron 4 of 4) -25364 NM_000439 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 201.333-88 chr13 101165134 101165319 + 1.33333 NA intron (NM_001350749, intron 15 of 43) intron (NM_001350749, intron 15 of 43) -220862 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 202-20 chr10 67791868 67792099 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 46196 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 210-92 chr3 98827937 98828250 + 1.33333 NA intron (NM_080927, intron 3 of 15) L1ME3|LINE|L1 64786 NM_001323367 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 188.667-6 chr1 72348610 72348888 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -66210 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 130-99 chr5 107848863 107849009 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -177999 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 217-42 chr18 74397035 74397309 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12276 NR_131977 101927606 Hs.623809 NR_131977 ENSG00000259779 LINC01922 - long intergenic non-protein coding RNA 1922 ncRNA 332.666-12 chr15 71848673 71849022 + 1.33333 NA exon (NM_006901, exon 39 of 42) exon (NM_006901, exon 39 of 42) 38293 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 232.666-7 chr10 24046224 24046433 + 1.33333 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) MIR|SINE|MIR -162463 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 296.333-18 chr2 13988962 13989361 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 411797 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 166.666-6 chr12 95595236 95595384 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43834 NM_032147 84101 Hs.646421 NM_032147 ENSG00000136014 USP44 - ubiquitin specific peptidase 44 protein-coding 421.666-4 chr2 55644057 55644648 + 1.33333 NA intron (NM_033109, intron 23 of 27) intron (NM_033109, intron 23 of 27) -26730 NM_020463 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 231-33 chr2 137819971 137820318 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 107788 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 240-51 chr2 185923310 185923582 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -123295 NR_144454 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 378.666-2 chr14 59680426 59680835 + 1.33333 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) L1ME4a|LINE|L1 -33610 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 146-65 chr2 200354696 200354849 + 1.33333 NA intron (NM_001282743, intron 2 of 11) intron (NM_001282743, intron 2 of 11) 45822 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 156-25 chr11 25935424 25935606 + 1.33333 NA Intergenic MER92C|LTR|ERV1 -253608 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 201-40 chr15 61858756 61859057 + 1.33333 NA intron (NM_020821, intron 82 of 84) L2c|LINE|L2 128988 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 346.666-4 chr14 60574291 60574666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64738 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 288.666-29 chr4 67639527 67640100 + 1.33333 NA intron (NM_018227, intron 18 of 32) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 61342 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 248.666-32 chr5 129621340 129621661 + 1.33333 NA intron (NM_133638, intron 9 of 22) intron (NM_133638, intron 9 of 22) -126594 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 216.667-33 chr13 89835884 89836192 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -271625 NR_046991 100874139 Hs.742173 NR_046991 LINC00353 - long intergenic non-protein coding RNA 353 ncRNA 255.666-9 chr14 29032753 29033055 + 1.33333 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -247117 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 306-10 chr12 30223266 30223573 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -438660 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 228.666-10 chr11 74080629 74080833 + 1.33333 NA intron (NM_001286577, intron 22 of 32) intron (NM_001286577, intron 22 of 32) -71494 NM_022803 7352 Hs.101337 NM_003356 ENSG00000175564 UCP3 SLC25A9 uncoupling protein 3 protein-coding 232.666-13 chr14 51263823 51264061 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23695 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 201-70 chr22 22855772 22856014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30374 NR_049835 100847006 NR_049835 ENSG00000264824 MIR5571 - microRNA 5571 ncRNA 194-73 chr2 54563970 54564179 + 1.33333 NA intron (NM_178313, intron 1 of 30) intron (NM_178313, intron 1 of 30) 5680 NM_178313 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 151.666-3 chr2 129672046 129672308 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR 205314 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 179.333-65 chr14 56078562 56078812 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -39724 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 153.333-371 chr6 164441129 164441276 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 380861 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 185.333-96 chr2 119781055 119781219 + 1.33333 NA intron (NM_002830, intron 1 of 26) L1MC4|LINE|L1 21215 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 178.666-2 chr12 34463315 34463480 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 440901 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 227.666-35 chr8 139486035 139486310 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 216951 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 210-150 chr8 118153278 118153552 + 1.33333 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -41596 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 228-20 chr12 23664957 23665184 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 10 of 17) intron (NM_152989, intron 10 of 17) -80484 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 274.333-18 chr14 79357370 79357823 + 1.33333 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 78216 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 312.666-17 chr3 124859980 124860443 + 1.33333 NA intron (NM_001354766, intron 2 of 13) L1ME4c|LINE|L1 27154 NM_002213 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 218.667-108 chr8 91128848 91129135 + 1.33333 NA intron (NM_001129890, intron 3 of 7) LTR79|LTR|ERVL 26372 NM_001354470 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 204.666-75 chr5 123737607 123737788 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 192280 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 239.333-90 chr6 52694805 52695087 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 23833 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 304-30 chr2 139562926 139563324 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 665801 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 390-20 chr4 78137411 78137824 + 1.33333 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) intron (NM_001166133, intron 2 of 41) 80047 NM_001166133 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 307.333-84 chrX 99633755 99634083 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 776354 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 305.666-14 chr3 110447218 110447639 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 622531 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 217.333-53 chr16 61893620 61893793 + 1.33333 NA intron (NM_001796, intron 3 of 11) L1MC4|LINE|L1 142732 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 188.333-70 chr2 37643486 37643642 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001270437, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001270437, exon 2 of 2) 28635 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 238.666-11 chr11 129363561 129363873 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12131 NM_003658 8538 Hs.591944 NM_003658 ENSG00000043039 BARX2 - BARX homeobox 2 protein-coding 210-28 chr11 108827859 108828077 + 1.33333 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) L1MB2|LINE|L1 162899 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 364.333-17 chr20 58666784 58667359 + 1.33333 NA intron (NM_001001433, intron 2 of 8) intron (NM_001001433, intron 2 of 8) 15788 NM_001001433 8675 Hs.307913 NM_003763 ENSG00000124222 STX16 SYN16 syntaxin 16 protein-coding 256 chr1 6862609 6862856 + 1.33333 NA intron (NM_001349608, intron 2 of 21) intron (NM_001349608, intron 2 of 21) 77278 NR_146204 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 331.333-33 chr3 60656792 60657165 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 5 of 9) intron (NM_001320900, intron 5 of 9) -39108 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 190-14 chr10 60063572 60063770 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 38 of 43) intron (NM_001204403, intron 38 of 43) 77345 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 249.667-11 chr10 60094265 60094617 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 29 of 43) AluSz|SINE|Alu 46575 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 420.999-2 chr4 35714149 35714701 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 529514 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 203.333-131 chr2 63462717 63463014 + 1.33333 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) L2c|LINE|L2 -24858 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 275-5 chr10 64050060 64050360 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -528320 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 481.667-7 chr4 44579738 44580426 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 71559 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 191.333-30 chr11 42033166 42033450 + 1.33333 NA intron (NR_135065, intron 7 of 9) intron (NR_135065, intron 7 of 9) 52150 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 196.333-152 chr6 9847320 9847584 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F1-int|LTR|ERVL-MaLR -557050 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 207.333-193 chr4 20703823 20704125 + 1.33333 NA intron (NM_145048, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 3516 NM_001258345 133015 Hs.479298 NM_145048 ENSG00000163138 PACRGL C4orf28 parkin coregulated like protein-coding 197-49 chr19 11813355 11813507 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_152357) promoter-TSS (NM_152357) -842 NM_152357 126070 Hs.418192 NM_152357 ENSG00000171295 ZNF440 - zinc finger protein 440 protein-coding 186.666-28 chr2 84527730 84527904 + 1.33333 NA intron (NM_001370, intron 3 of 76) intron (NM_001370, intron 3 of 76) 11362 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 207-128 chr9 108944200 108944374 + 1.33333 NA intron (NM_003798, intron 15 of 18) intron (NM_003798, intron 15 of 18) 9887 NM_017832 54942 Hs.29276 NM_017832 ENSG00000119328 ABITRAM C9orf6|CG-8|FAM206A|Simiate actin binding transcription modulator protein-coding 275.333-60 chr6 42296835 42297171 + 1.33333 NA intron (NM_001297573, intron 4 of 17) intron (NM_001297573, intron 4 of 17) -79142 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 198-132 chr3 194111400 194111606 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -24645 NM_005524 3280 Hs.250666 NM_005524 ENSG00000114315 HES1 HES-1|HHL|HRY|bHLHb39 hes family bHLH transcription factor 1 protein-coding 137.666-5 chr3 175493518 175493672 + 1.33333 NA intron (NM_207015, intron 9 of 13) intron (NM_207015, intron 9 of 13) 124055 NR_039952 100616395 NR_039952 ENSG00000264974 MIR4789 - microRNA 4789 ncRNA 203.333-273 chr8 131001859 131002091 + 1.33333 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) MIRb|SINE|MIR 38934 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 328-11 chr13 92835033 92835400 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -113602 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 248-56 chr3 181239474 181239778 + 1.33333 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 7889 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 177.666-15 chr3 17981718 17981870 + 1.33333 NA intron (NR_161333, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 19242 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 275.666-3 chr14 43830121 43830408 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 677019 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 210.333-150 chr6 142447917 142448166 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 146034 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 320.666-20 chr9 31418938 31419212 + 1.33333 NA Intergenic LTR28B|LTR|ERV1 -37585 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 177-22 chr14 41119900 41120047 + 1.33333 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) L1MA2|LINE|L1 165262 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 208.333-139 chr7 42170973 42171194 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) intron (NM_000168, intron 2 of 14) 66126 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 549.666 chr14 62789596 62790491 + 1.33333 NA intron (NM_139318, intron 9 of 10) L1MA9|LINE|L1 255415 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 280-6 chr12 2827166 2827483 + 1.33333 NA intron (NM_031474, intron 5 of 5) intron (NM_031474, intron 5 of 5) 7711 NM_031474 83714 Hs.530816 NM_031474 ENSG00000053702 NRIP2 - nuclear receptor interacting protein 2 protein-coding 212-8 chr1 50022175 50022451 + 1.33333 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 1641 NR_136623 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 210-139 chr7 45303167 45303381 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 145483 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 425.999 chr13 53585941 53586336 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -229281 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 197.333-91 chr18 11736794 11736975 + 1.33333 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) L1MC4|LINE|L1 -14588 NM_001261443 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 197.333-41 chr11 125414875 125415049 + 1.33333 NA intron (NM_022062, intron 10 of 12) intron (NM_022062, intron 10 of 12) -80252 NM_001301851 403312 Hs.450611 NM_203452 LOC403312 - putative uncharacterized protein MGC39545 protein-coding 235.333-57 chr2 53753493 53753774 + 1.33333 NA intron (NM_145863, intron 1 of 8) L1MC3|LINE|L1 -14150 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 424.666-2 chr14 84142004 84142357 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -1129752 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 217.333-4 chr1 67992846 67993034 + 1.33333 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) SSU-rRNA_Hsa|rRNA|rRNA 58691 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 131-64 chr3 109930728 109930898 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 327985 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 267-50 chr4 16087263 16087601 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -3409 NM_001145848 8842 Hs.614734 NM_006017 ENSG00000007062 PROM1 AC133|CD133|CORD12|MCDR2|MSTP061|PROML1|RP41|STGD4 prominin 1 protein-coding 277.999-6 chr2 67956427 67956748 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 106417 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 196-179 chr8 76717243 76717469 + 1.33333 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) intron (NM_024721, intron 3 of 10) -34081 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 218.666-75 chr8 98884016 98884190 + 1.33333 NA intron (NM_001256312, intron 2 of 12) intron (NM_001256312, intron 2 of 12) -58415 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 164-62 chr2 132913774 132914015 + 1.33333 NA intron (NM_207481, intron 8 of 17) intron (NM_207481, intron 8 of 17) -1663 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 322.666-3 chr10 42379190 42379433 + 1.33333 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -11266 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 279.666-5 chr10 54436634 54436880 + 1.33333 NA intron (NM_001142773, intron 2 of 31) intron (NM_001142773, intron 2 of 31) -49473 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 210.333-170 chr8 113622177 113622336 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -185317 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 286.333-41 chr7 92518846 92519125 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001282678, exon 3 of 24) 5' UTR (NM_001282678, exon 3 of 24) 9535 NM_001282678 5189 Hs.164682 NM_000466 ENSG00000127980 PEX1 HMLR1|PBD1A|PBD1B|ZWS|ZWS1 peroxisomal biogenesis factor 1 protein-coding 275.333-62 chr6 48791414 48791820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 671636 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 199.333-217 chr5 2595221 2595507 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -117227 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 216.667-64 chr20 35776876 35777182 + 1.33333 NA intron (NM_016436, intron 1 of 17) intron (NM_016436, intron 1 of 17) 5014 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 132.333-191 chr9 104300876 104301054 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30736 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 370.666-21 chr7 4564481 4564844 + 1.33333 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -117633 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 188.667-114 chr4 65930772 65931031 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -260406 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 395.999-2 chr5 113107697 113108089 + 1.33333 NA intron (NM_001085377, intron 6 of 18) intron (NM_001085377, intron 6 of 18) 131095 NR_038352 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 260.999-2 chr16 86255193 86255400 + 1.33333 NA intron (NR_104139, intron 3 of 5) L1MDa|LINE|L1 30951 NR_104139 101154687 Hs.640512 NR_104139 LINC01081 TCONS00024764|TCONS_00024764 long intergenic non-protein coding RNA 1081 ncRNA 132.666-4 chr4 76574094 76574233 + 1.33333 NA TTS (NR_039654) TTS (NR_039654) 595 NR_039654 100616299 NR_039654 ENSG00000263445 MIR4450 mir-4450 microRNA 4450 ncRNA 235.667-33 chr2 68700483 68700855 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -34142 NM_001166277 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 234-46 chr20 22607959 22608270 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_109883) promoter-TSS (NR_109883) -597 NR_109883 101929685 Hs.563018 NR_109883 ENSG00000237396 LNCNEF LINC01384|lncRNA-NEF lncRNA neighboring enhancer of FOXA2 ncRNA 254-59 chr4 91281602 91281935 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 995534 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 210-127 chr5 160820901 160821170 + 1.33333 NA intron (NM_001366652, intron 1 of 24) L1MA3|LINE|L1 31176 NM_001366654 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 256.666-21 chr20 40498620 40498947 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 190453 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 328-40 chr8 121416088 121416548 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -223028 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 474.666-4 chr4 33275795 33276207 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 763892 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 266-79 chr7 112873420 112873662 + 1.33333 NA intron (NM_152556, intron 3 of 4) L1PA17|LINE|L1 66334 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 163.333-261 chr7 52209637 52209940 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -816532 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 193.333-110 chr20 10885255 10885473 + 1.33333 NA intron (NR_109866, intron 5 of 6) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 23908 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 210-35 chr14 47855460 47855741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -60586 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 171.333-140 chr4 177075973 177076125 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 200347 NR_149104 105377556 NR_149104 ENSG00000250263 LINC02509 - long intergenic non-protein coding RNA 2509 ncRNA 164-7 chr1 112530657 112530882 + 1.33333 NA TTS (NM_024494) TTS (NM_024494) 21804 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 194.333-71 chr2 107100361 107100587 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -213365 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 303.333 chr1 11831337 11831690 + 1.33333 NA intron (NM_001286, intron 13 of 22) MER58C|DNA|hAT-Charlie -8806 NR_037806 100379251 Hs.710015 NR_037806 NPPA-AS1 NPPA-AS|NPPAAS NPPA antisense RNA 1 ncRNA 153-137 chr7 150778507 150778668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21777 NM_001101312 28959 Hs.647090 NM_014020 ENSG00000106565 TMEM176B LR8|MS4B2 transmembrane protein 176B protein-coding 259.333-68 chr3 74763130 74763479 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -242164 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 296-28 chr2 38556370 38556659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40774 NR_110259 101929596 Hs.537341 NR_110259 LINC02613 - long intergenic non-protein coding RNA 2613 ncRNA 224-27 chr15 57069666 57069921 + 1.33333 NA intron (NM_207038, intron 4 of 19) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -149637 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 278-5 chr11 44721971 44722413 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4770 NM_130783 90139 Hs.385634 NM_130783 ENSG00000157570 TSPAN18 TSPAN tetraspanin 18 protein-coding 301.333-15 chr12 59653617 59653956 + 1.33333 NA intron (NM_001270623, intron 1 of 5) intron (NM_001270623, intron 1 of 5) -35584 NR_073055 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 209.667-11 chr1 182882960 182883241 + 1.33333 NA intron (NM_001357, intron 24 of 27) intron (NM_001357, intron 24 of 27) -43509 NR_148933 647070 Hs.191518 NR_148933 LOC647070 - uncharacterized LOC647070 ncRNA 190.666 chr1 9192950 9193122 + 1.33333 NA TTS (NR_132738) TTS (NR_132738) -10698 NR_132742 106614088 Hs.551837 NR_132742 ENSG00000228526 MIR34AHG - MIR34A host gene ncRNA 208.667-44 chr13 75456476 75456777 + 1.33333 NA intron (NM_001286658, intron 1 of 19) L1ME3|LINE|L1 25542 NM_001286659 9882 Hs.210891 NM_014832 ENSG00000136111 TBC1D4 AS160|NIDDM5 TBC1 domain family member 4 protein-coding 217.333-114 chr5 5832382 5832700 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 409864 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 408.666-4 chr5 66494623 66495036 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16775 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 160.666-19 chr9 78380872 78381046 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83834 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 198.667-162 chr6 68825047 68825316 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) L1MEd|LINE|L1 189899 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 204.333-69 chr16 78371172 78371531 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) L1M4|LINE|L1 271697 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 199-44 chr2 34106584 34106746 + 1.33333 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) L1MC1|LINE|L1 39439 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 206-99 chr22 25105548 25105795 + 1.33333 NA intron (NR_038941, intron 4 of 4) intron (NR_038941, intron 4 of 4) 7021 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 170.333-63 chr13 24643535 24643702 + 1.33333 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -36790 NM_001676 479 Hs.147111 NM_001676 ENSG00000075673 ATP12A ATP1AL1|HK ATPase H+/K+ transporting non-gastric alpha2 subunit protein-coding 227-25 chr2 64224686 64224985 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -3566 NR_120420 100507006 Hs.442789 NR_120420 LOC100507006 - uncharacterized LOC100507006 ncRNA 487.333-3 chr16 26716302 26716816 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -350368 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 237.333-115 chr8 22953637 22953954 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12718 NM_001363233 157310 Hs.491242 NM_144962 ENSG00000134020 PEBP4 CORK-1|CORK1|GWTM1933|HEL-S-300|PEBP-4|PRO4408|hPEBP4 phosphatidylethanolamine binding protein 4 protein-coding 183.666-8 chr18 46821929 46822091 + 1.33333 NA intron (NR_148699, intron 10 of 11) intron (NR_148699, intron 10 of 11) -64957 NM_001307987 29906 Hs.465025 NM_013305 ENSG00000101638 ST8SIA5 SIAT8-E|SIAT8E|ST8SiaV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 protein-coding 415.333-5 chr2 114087238 114087826 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107548 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 320-47 chr8 64004718 64005025 + 1.33333 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) L1MA7|LINE|L1 235441 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 199.667-62 chr18 1182449 1182715 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 177047 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 211-91 chr7 50053149 50053363 + 1.33333 NA intron (NM_001159878, intron 4 of 7) L1MD2|LINE|L1 39990 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 208.666-80 chr4 59522359 59522583 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 508898 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 172.666-18 chr4 35809874 35810045 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 433980 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 203.333-250 chr7 109060355 109060532 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -175856 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 292.999 chr10 28348177 28348474 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -45261 NR_134518 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 215.999 chr1 206666257 206666422 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18566 NM_032960 9261 Hs.643566 NM_004759 ENSG00000162889 MAPKAPK2 MAPKAP-K2|MK-2|MK2 MAPK activated protein kinase 2 protein-coding 290.666-27 chr6 41053035 41053314 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_006789) promoter-TSS (NM_006789) -27 NM_006789 10930 Hs.555915 NM_006789 ENSG00000124701 APOBEC2 ARCD1|ARP1 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2 protein-coding 306.666-7 chr14 69026216 69026551 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 46701 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 215.333-160 chr5 65914890 65915156 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11531 NM_001006600 55914 Hs.591774 NM_018695 ENSG00000112851 ERBIN ERBB2IP|HEL-S-78|LAP2 erbb2 interacting protein protein-coding 221.666-58 chr9 114355374 114355550 + 1.33333 NA intron (NM_001317950, intron 14 of 21) AluSx1|SINE|Alu 25673 NM_000608 5005 Hs.719954 NM_000608 ENSG00000228278 ORM2 AGP-B|AGP-B'|AGP2 orosomucoid 2 protein-coding 156-143 chr8 116707211 116707433 + 1.33333 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 48501 NM_003756 8667 Hs.492599 NM_003756 ENSG00000147677 EIF3H EIF3S3|eIF3-gamma|eIF3-p40 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H protein-coding 208-178 chr9 15923472 15923740 + 1.33333 NA intron (NM_001355547, intron 24 of 24) L1MA8|LINE|L1 329501 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 150-117 chr5 125563009 125563358 + 1.33333 NA intron (NR_109887, intron 3 of 3) intron (NR_109887, intron 3 of 3) 69922 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 275.666-7 chr18 67211029 67211448 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 129654 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 218.666-31 chr14 84815190 84815362 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -456656 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 217-12 chr11 75756687 75757050 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 11779 NR_046090 283214 Hs.591972 NR_046090 ENSG00000247867 LOC283214 - uncharacterized LOC283214 ncRNA 280.666-31 chr8 115332620 115332847 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 335280 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 252.333-34 chr2 105460406 105460724 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22052 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 209.333-46 chr12 47777555 47777729 + 1.33333 NA intron (NM_017842, intron 1 of 2) intron (NM_017842, intron 1 of 2) 4404 NM_017842 55652 Hs.438867 NM_017842 ENSG00000211584 SLC48A1 HRG-1|HRG1|hHRG-1 solute carrier family 48 member 1 protein-coding 197.667-74 chr20 9104820 9105082 + 1.33333 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) intron (NM_001172646, intron 1 of 37) 35897 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 180.666-5 chr10 95600943 95601118 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -39659 NM_015385 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 210.333-148 chr6 119963421 119963604 + 1.33333 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -51667 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 196.666-33 chr16 85173508 85173670 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34207 NR_162142 113219463 NR_162142 MIR12128 - microRNA 12128 ncRNA 234.333-18 chr12 22512558 22512779 + 1.33333 NA exon (NM_001286173, exon 10 of 28) exon (NM_001286173, exon 10 of 28) 31529 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 206.667-47 chr16 30796802 30797084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9738 NM_001080417 23361 Hs.301094 NM_001080417 ENSG00000102870 ZNF629 ZNF|ZNF65 zinc finger protein 629 protein-coding 172-38 chr13 30175175 30175522 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -22274 NR_138041 102157400 Hs.639879 NR_138041 LINC00384 - long intergenic non-protein coding RNA 384 ncRNA 220.333-74 chr20 53486243 53486444 + 1.33333 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) L1MB3|LINE|L1 -66427 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 236.666-26 chr2 2310329 2310576 + 1.33333 NA intron (NM_015025, intron 1 of 24) intron (NM_015025, intron 1 of 24) -8780 NR_024468 730811 Hs.629472 NR_024468 ENSG00000225619 MYT1L-AS1 - MYT1L antisense RNA 1 ncRNA 212.667-16 chr10 84385236 84385487 + 1.33333 NA intron (NM_018999, intron 3 of 10) L1PB4|LINE|L1 -39578 NM_001284243 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 225.666-30 chr8 22432935 22433172 + 1.33333 NA intron (NM_001135154, intron 8 of 8) AluJo|SINE|Alu -7917 NM_001243974 5533 Hs.731683 NM_005605 ENSG00000120910 PPP3CC CALNA3|CNA3|PP2Bgamma protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma protein-coding 211-76 chr4 133974456 133974741 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 227191 NM_001114734 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 260.333-21 chr14 69456138 69456497 + 1.33333 NA intron (NM_001252150, intron 6 of 6) intron (NM_001252150, intron 6 of 6) -28411 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 328.333-2 chr1 47858399 47858698 + 1.33333 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu 138837 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 198.666-2 chr1 91134841 91134995 + 1.33333 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -112663 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 273.333-17 chr12 105570289 105570634 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133742 NR_110108 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 226.666-23 chr2 108838031 108838287 + 1.33333 NA intron (NM_001351559, intron 10 of 11) MER74B|LTR|ERVL 51388 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 204-140 chr3 192725345 192725602 + 1.33333 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 2068 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 144-27 chr11 99465138 99465327 + 1.33333 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) intron (NM_001243271, intron 2 of 20) -90913 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 194.667-50 chr17 59716442 59716727 + 1.33333 NA intron (NM_001329394, intron 1 of 11) MIRc|SINE|MIR 8930 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 202-146 chr5 38672555 38672797 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47597 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 263.666 chr12 108008202 108008606 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -104633 NR_037629 728739 Hs.741995 NR_037629 LOC728739 - programmed cell death 2 pseudogene pseudo 248-60 chr4 55259381 55259610 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -86747 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 148.666-5 chr2 108008090 108008271 + 1.33333 NA intron (NM_021815, intron 7 of 8) intron (NM_021815, intron 7 of 8) 21656 NM_001305005 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 227.999-8 chr9 28296493 28296664 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) intron (NM_001354574, intron 4 of 5) 422727 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 292.333-30 chr3 106309241 106309594 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -440016 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 219-57 chr3 55701265 55701562 + 1.33333 NA intron (NR_132749, intron 14 of 17) intron (NR_132749, intron 14 of 17) -41944 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 220.333-27 chr11 31757646 31757982 + 1.33333 NA intron (NM_001288726, intron 10 of 11) intron (NM_001288726, intron 10 of 11) 42847 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 379.666-8 chr15 62561300 62561687 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83688 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 204.666-45 chr20 24520861 24521091 + 1.33333 NA intron (NM_001323606, intron 2 of 4) L1MB3|LINE|L1 51015 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 199.333-97 chr17 46955575 46955753 + 1.33333 NA intron (NM_001321133, intron 6 of 6) intron (NM_001321133, intron 6 of 6) -17353 NR_049812 100847067 NR_049812 ENSG00000264999 MIR5089 - microRNA 5089 ncRNA 184-25 chr14 51559801 51559960 + 1.33333 NA intron (NR_047477, intron 2 of 3) intron (NR_047477, intron 2 of 3) 40072 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 197.333-38 chr11 81983762 81984007 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -93048 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 222-58 chr3 59666305 59666548 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7929 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 243.333-72 chr3 83442952 83443264 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 1426467 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 133.333-130 chr4 71612100 71612250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 171904 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 214-15 chr10 41759675 41759959 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 608228 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 159.333-223 chr3 174777814 174777979 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81438 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 290.333-2 chr1 184355909 184356330 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30910 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 193-10 chr10 64820234 64820445 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5189 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 213.333-230 chrX 111888053 111888292 + 1.33333 NA intron (NM_001195577, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 6275 NM_001195577 100329135 Hs.247868 NM_001195576 ENSG00000204025 TRPC5OS TRPC5-AS1 TRPC5 opposite strand protein-coding 233.333-128 chr8 74087369 74087648 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 96116 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 299.666-7 chr15 67366634 67366931 + 1.33333 NA intron (NM_001031715, intron 8 of 20) intron (NM_001031715, intron 8 of 20) -111584 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 190-117 chr7 85453678 85453862 + 1.33333 NA intron (NR_134240, intron 2 of 3) intron (NR_134240, intron 2 of 3) 32648 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 118.333-8 chr1 93848841 93848967 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -1685 NM_001261408 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 288.666-38 chr8 53005371 53005671 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65613 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 304.666-21 chr4 33057546 33057888 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 706679 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 315.333-11 chr14 32926298 32926563 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -12449 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 156.667-184 chr2 85204450 85204654 + 1.33333 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) FLAM_A|SINE|Alu -9100 NR_136323 102724579 Hs.669216 NR_136323 LOC102724579 - uncharacterized LOC102724579 ncRNA 192.666-69 chr9 84548099 84548499 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120159 NM_006180 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 177.333-83 chr2 108873358 108873533 + 1.33333 NA intron (NR_147237, intron 13 of 14) intron (NR_147237, intron 13 of 14) 86674 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 220.666-80 chr9 82199169 82199394 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 210509 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 131.333-43 chr12 15729085 15729236 + 1.33333 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) L1MCa|LINE|L1 60228 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 355.999-4 chr3 72758014 72758316 + 1.33333 NA intron (NM_018130, intron 10 of 10) intron (NM_018130, intron 10 of 10) 90280 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 199.666-55 chr7 87112572 87112759 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39652 NR_136252 101927420 Hs.633960 NR_136252 ENSG00000224046 LOC101927420 - uncharacterized LOC101927420 ncRNA 197.333-125 chr2 203569463 203569660 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -34260 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 313.667-22 chr18 73509027 73509504 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 184324 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 196-89 chr2 74073280 74073536 + 1.33333 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) L1ME1|LINE|L1 70716 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 354.333-5 chr12 116347883 116348311 + 1.33333 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -70911 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 210.333-78 chr2 76768609 76768778 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -217272 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 195.666-33 chr4 79726937 79727179 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -100413 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 245.333-130 chr9 119910372 119910685 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24532 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 228-37 chr17 73980619 73980938 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -152241 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 234.333-87 chr8 129803118 129803352 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16611 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 218.666-16 chr11 84105868 84106048 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 9 of 27) intron (NM_001142699, intron 9 of 27) 167322 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 201.333-278 chr8 82686860 82687110 + 1.33333 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -225119 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 187.666-9 chr14 90863981 90864182 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001322234, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001322234, exon 17 of 17) -47651 NM_001010854 145567 Hs.655697 NM_001010854 ENSG00000165914 TTC7B TTC7L1|c14_5685 tetratricopeptide repeat domain 7B protein-coding 233.666-26 chr7 26778820 26779013 + 1.33333 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 78807 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 196.667-142 chr7 52666472 52666754 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F1-int|LTR|ERVL-MaLR -369020 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 197-108 chr7 14490364 14490624 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) intron (NM_001350717, intron 19 of 24) 350956 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 273.333-7 chr10 28044858 28045360 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 28269 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 341.333-13 chr2 105654245 105654588 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -43857 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 138-51 chr18 77842067 77842214 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 151587 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 224-110 chr8 140307384 140307670 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 10 of 22) intron (NM_001160372, intron 10 of 22) 150217 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 368-16 chr3 35912425 35912882 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 168177 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 253.333-11 chr10 110244836 110245159 + 1.33333 NA intron (NM_005962, intron 3 of 5) intron (NM_005962, intron 3 of 5) 19001 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 172.666-25 chr7 47784365 47784627 + 1.33333 NA intron (NM_138295, intron 56 of 56) AluSq2|SINE|Alu -10795 NR_161268 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 228-41 chr2 62848927 62849229 + 1.33333 NA intron (NM_001142615, intron 7 of 22) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 142181 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 284-43 chr4 65524637 65525056 + 1.33333 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 144642 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 225.333-14 chr10 50609706 50609878 + 1.33333 NA intron (NM_147156, intron 1 of 10) intron (NM_147156, intron 1 of 10) 14164 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 303-5 chr10 74270137 74270531 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 93571 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 382.666-12 chr2 227662526 227662925 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29405 NM_020161 56918 Hs.283092 NM_020161 ENSG00000042304 C2orf83 - chromosome 2 open reading frame 83 protein-coding 195.333-152 chr4 32248101 32248338 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102819 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 252-45 chr2 74433442 74433668 + 1.33333 NA intron (NM_001015055, intron 1 of 11) AluY|SINE|Alu 7028 NM_001015056 6242 Hs.192854 NM_033046 ENSG00000114993 RTKN - rhotekin protein-coding 242.666-33 chr6 138566295 138566584 + 1.33333 NA intron (NM_020464, intron 1 of 6) intron (NM_020464, intron 1 of 6) 6130 NM_020464 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 273.333-65 chr5 163841684 163842047 + 1.33333 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 336246 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 217.333-122 chr5 120740184 120740425 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 208840 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 235.333-117 chr7 124569823 124570176 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 195793 NM_005302 2861 Hs.406094 NM_005302 ENSG00000170775 GPR37 EDNRBL|PAELR|hET(B)R-LP G protein-coupled receptor 37 protein-coding 233.666-16 chr2 148401615 148401967 + 1.33333 NA intron (NM_018328, intron 5 of 14) L1MC4a|LINE|L1 -242960 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 181.333-43 chr14 46623793 46624037 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27866 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 262-62 chr4 161205321 161205589 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -817278 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 304.667-5 chr10 57033763 57034109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 270623 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 228.667-57 chr3 57592867 57593169 + 1.33333 NA intron (NM_001660, intron 1 of 5) AluJr4|SINE|Alu 4326 NM_001660 378 Hs.652183 NM_001660 ENSG00000168374 ARF4 ARF2 ADP ribosylation factor 4 protein-coding 370.333-16 chr2 182319850 182320374 + 1.33333 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) -78049 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 200.666-9 chr1 195850417 195850580 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 238217 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 420.333-7 chr5 31458015 31458423 + 1.33333 NA intron (NM_013235, intron 19 of 34) Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 73874 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 294.667-36 chr4 59606188 59606595 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 592818 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 198.666-37 chr2 12097384 12097611 + 1.33333 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 90381 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 200.666-113 chr7 52596546 52596697 + 1.33333 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -439012 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 199-41 chr2 10693755 10693929 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 3832 NR_144555 106479524 Hs.646340 NR_144555 ENSG00000243819 RN7SL832P - RNA, 7SL, cytoplasmic 832, pseudogene pseudo 494-3 chr2 225448249 225448760 + 1.33333 NA intron (NM_001371273, intron 3 of 7) intron (NM_001371273, intron 3 of 7) 47618 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 281.666-11 chr3 163058266 163058482 + 1.33333 NA Intergenic LTR25|LTR|ERV1 244927 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 267.999-3 chr2 28033259 28033621 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 6 of 13) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 37073 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 180-91 chr6 126374564 126374748 + 1.33333 NA intron (NR_104462, intron 2 of 3) intron (NR_104462, intron 2 of 3) 34541 NR_104462 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 247-57 chr4 76115346 76115740 + 1.33333 NA intron (NM_017426, intron 11 of 11) intron (NM_017426, intron 11 of 11) 32854 NM_017426 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 256.333-43 chr2 108428465 108428831 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -20558 NM_181453 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 190.666-19 chr14 74302030 74302179 + 1.33333 NA intron (NR_148472, intron 1 of 17) L1ME5|LINE|L1 830 NM_001353591 5826 Hs.94395 NM_005050 ENSG00000119688 ABCD4 ABC41|EST352188|MAHCJ|P70R|P79R|PMP69|PXMP1L ATP binding cassette subfamily D member 4 protein-coding 193.666-46 chr8 21203094 21203269 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95058 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 159.333-179 chr2 207598054 207598290 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_004379, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_004379, exon 8 of 8) 26816 NM_145280 151194 Hs.664764 NM_145280 ENSG00000144401 METTL21A FAM119A|HCA557b|HSPA-KMT methyltransferase like 21A protein-coding 299.999-9 chr8 29391794 29392152 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41289 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 433.999-4 chr22 49395547 49395998 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 147694 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 228.667-10 chr10 83512874 83513236 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 164034 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 319.666-16 chr6 129433733 129434217 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 41 of 64) MIRc|SINE|MIR 276202 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 299.999-6 chr4 59475278 59475745 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 461938 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 285.333-55 chr4 172529311 172529641 + 1.33333 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 159441 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 214.666-35 chr2 185235704 185235870 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -68715 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 340.666-3 chr10 74933033 74933535 + 1.33333 NA intron (NR_134476, intron 1 of 1) intron (NR_134476, intron 1 of 1) 20498 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 190.667-51 chr16 21571668 21571913 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -25431 NM_001288660 51108 Hs.279583 NM_016025 ENSG00000197006 METTL9 CGI-81|DREV|DREV1|PAP1 methyltransferase like 9 protein-coding 249.333-76 chr4 62199253 62199684 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37703 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 246.333-68 chr4 36251396 36251719 + 1.33333 NA intron (NR_122079, intron 3 of 4) L1PA16|LINE|L1 -4961 NR_122080 439933 Hs.591071 NR_122079 ENSG00000247193 LOC439933 - uncharacterized LOC439933 ncRNA 200-70 chr17 60888280 60888432 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 9 of 25) intron (NM_001330413, intron 9 of 25) 210505 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 335.999 chr1 70977599 70978181 + 1.33333 NA intron (NM_198719, intron 2 of 3) intron (NM_198719, intron 2 of 3) -68616 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 233.333-88 chr4 33871567 33871802 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 168209 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 141.333-263 chrX 99281137 99281313 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1129048 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 206.666-98 chr5 81504413 81504580 + 1.33333 NA intron (NM_001256734, intron 4 of 15) L2a|LINE|L2 -110362 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 346-11 chr16 55309842 55310258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14509 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 243.999-8 chr6 13505512 13505801 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18019 NM_001242629 54438 Hs.484686 NM_018988 ENSG00000145990 GFOD1 ADG-90|C6orf114 glucose-fructose oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 204.666-38 chr19 48012145 48012298 + 1.33333 NA intron (NM_022142, intron 2 of 6) AluJo|SINE|Alu 17589 NM_022142 64100 Hs.104894 NM_022142 ENSG00000169393 ELSPBP1 E12|EDDM12|EL149|HE12 epididymal sperm binding protein 1 protein-coding 327.333-35 chr5 17909550 17909926 + 1.33333 NA intron (NR_134286, intron 5 of 7) intron (NR_134286, intron 5 of 7) 102464 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 345.666 chr1 41908085 41908464 + 1.33333 NA intron (NR_038261, intron 2 of 3) intron (NR_038261, intron 2 of 3) 10648 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 152.333-262 chr4 25416408 25416604 + 1.33333 NA exon (NM_001286756, exon 27 of 29) exon (NM_001286756, exon 27 of 29) 39243 NM_001286756 29945 Hs.152173 NM_013367 ENSG00000053900 ANAPC4 APC4 anaphase promoting complex subunit 4 protein-coding 350.333-14 chr2 177928181 177928571 + 1.33333 NA intron (NM_001077197, intron 3 of 20) AluJr|SINE|Alu -5539 NM_001077358 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 150.667-41 chr10 65627421 65627687 + 1.33333 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 56129 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 290.999-2 chr2 183256911 183257324 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 132674 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 198.666-42 chr2 110784720 110784966 + 1.33333 NA intron (NM_001371254, intron 3 of 18) intron (NM_001371254, intron 3 of 18) 52270 NM_001371254 356.667-3 chr10 81357231 81357755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -517701 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 198.333-169 chr5 149073521 149073739 + 1.33333 NA intron (NR_122044, intron 2 of 2) intron (NR_122044, intron 2 of 2) 10313 NR_122044 255187 Hs.149321 NR_122044 ENSG00000250072 SH3TC2-DT - SH3TC2 divergent transcript ncRNA 235.667-3 chr1 95401842 95402167 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49897 NR_146486 101928169 NR_146486 LINC01650 - long intergenic non-protein coding RNA 1650 ncRNA 321.333-10 chr11 9424625 9425017 + 1.33333 NA intron (NM_006391, intron 10 of 24) intron (NM_006391, intron 10 of 24) -3945 NR_002962 677808 Hs.689720 NR_002962 ENSG00000201998 SNORA23 ACA23 small nucleolar RNA, H/ACA box 23 snoRNA 224-100 chr8 3672064 3672358 + 1.33333 NA intron (NM_033225, intron 7 of 69) intron (NM_033225, intron 7 of 69) -943760 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 222.333-36 chr17 41861084 41861261 + 1.33333 NA intron (NM_018143, intron 1 of 1) LTR49|LTR|ERV1 4251 NM_018143 55175 Hs.13268 NM_018143 ENSG00000178502 KLHL11 - kelch like family member 11 protein-coding 325.999 chr12 86573762 86574256 + 1.33333 NA intron (NM_001351285, intron 2 of 8) intron (NM_001351285, intron 2 of 8) 171140 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 345.999 chr1 173584132 173584423 + 1.33333 NA intron (NM_178527, intron 5 of 27) L1MB7|LINE|L1 18795 NM_178527 284525 Hs.494981 NM_178527 ENSG00000162753 SLC9C2 SLC9A11 solute carrier family 9 member C2 (putative) protein-coding 242.333-92 chr7 94580166 94580459 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 70503 NM_022900 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 178.333-120 chr4 37529131 37529287 + 1.33333 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) intron (NM_001104629, intron 1 of 3) -55024 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 204.333-3 chr1 32165253 32165430 + 1.33333 NA intron (NM_012316, intron 10 of 13) FLAM_A|SINE|Alu -14334 NM_175852 200081 Hs.17987 NM_175852 ENSG00000084652 TXLNA IL14|TXLN taxilin alpha protein-coding 204.999-3 chr7 38831206 38831376 + 1.33333 NA intron (NM_014396, intron 4 of 28) intron (NM_014396, intron 4 of 28) 77900 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 144.666-11 chr4 30576802 30576958 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -143489 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 402.333-15 chr8 104553191 104553700 + 1.33333 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) L1PB1|LINE|L1 35579 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 184.333-81 chr2 162391796 162392048 + 1.33333 NA intron (NM_033272, intron 12 of 15) L3b|LINE|CR1 47554 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 321-7 chr14 66907854 66908301 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1MC3|LINE|L1 -281363 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 134.333-31 chr11 105879310 105879541 + 1.33333 NA intron (NR_046356, intron 4 of 16) intron (NR_046356, intron 4 of 16) 142815 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 198-112 chr22 48996218 48996381 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 129529 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 154-84 chr20 44237181 44237362 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9828 NM_001256738 78997 Hs.517059 NM_024034 ENSG00000124194 GDAP1L1 dJ881L22.1|dJ995J12.1.1 ganglioside induced differentiation associated protein 1 like 1 protein-coding 198-44 chr13 97489712 97489931 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 55652 NM_021033 5911 Hs.508480 NM_021033 ENSG00000125249 RAP2A K-REV|KREV|RAP2|RbBP-30 RAP2A, member of RAS oncogene family protein-coding 407.333-2 chr1 73423454 73423822 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 117468 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 176.333-129 chr5 20314472 20314676 + 1.33333 NA intron (NR_146519, intron 1 of 1) intron (NR_146519, intron 1 of 1) 9023 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 199-104 chr7 28277810 28278102 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21365 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 238.666-12 chr12 14459085 14459392 + 1.33333 NA intron (NM_181352, intron 8 of 14) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 73957 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 258.999-4 chr18 54715362 54715619 + 1.33333 NA Intergenic MamGypsy2-LTR|LTR|Gypsy -112987 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 202.666-129 chr9 130148572 130148730 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4432 NR_135124 401554 Hs.522437 NR_135124 ENSG00000196979 GPRACR LncGPR107 GPR107 adjacent cis regulating lncRNA ncRNA 235.333-44 chr17 68539583 68539877 + 1.33333 NA intron (NM_017565, intron 9 of 10) intron (NM_017565, intron 9 of 10) 18697 NR_027751 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 218-72 chr22 34296164 34296437 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -373412 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 316.333-31 chrX 81296522 81296780 + 1.33333 NA intron (NM_003022, intron 3 of 3) intron (NM_003022, intron 3 of 3) 94549 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 302.333-31 chr7 95487375 95487783 + 1.33333 NA intron (NM_145872, intron 1 of 2) intron (NM_145872, intron 1 of 2) 1636 NM_016116 51666 Hs.602765 NM_016116 ENSG00000005981 ASB4 ASB-4 ankyrin repeat and SOCS box containing 4 protein-coding 260-35 chr2 62212178 62212626 + 1.33333 NA intron (NM_006577, intron 1 of 1) intron (NM_006577, intron 1 of 1) -3119 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 198.333-7 chr1 55354293 55354519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128765 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 218.667-89 chr6 45202713 45203015 + 1.33333 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) -5094 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 234.666-23 chr2 168308658 168308847 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -61157 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 247.666-23 chr3 189976843 189977195 + 1.33333 NA intron (NM_018192, intron 8 of 14) MER103C|DNA|hAT-Charlie 143878 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 294.667-43 chr5 103936226 103936644 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -373646 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 295.333-24 chr2 84923311 84923575 + 1.33333 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 17787 NM_021103 9168 Hs.446574 NM_021103 ENSG00000034510 TMSB10 MIG12|TB10 thymosin beta 10 protein-coding 240.333-43 chr16 3217098 3217436 + 1.33333 NA TTS (NR_002169) TTS (NR_002169) 1705 NR_002169 26184 Hs.651203 NR_002169 ENSG00000203581 OR1F2P OLFMF2|OR16-3|OR1F11|OR1F2|OR1F3P|hg91 olfactory receptor family 1 subfamily F member 2 pseudogene pseudo 284.333-12 chr13 31491171 31491505 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -248188 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 219.333-172 chr7 79538376 79538552 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84504 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 227-61 chr8 144108718 144109037 + 1.33333 NA exon (NM_001316309, exon 3 of 24) exon (NM_001316309, exon 3 of 24) 1138 NM_001316309 340390 Hs.98723 NM_032529 ENSG00000179698 WDR97 KIAA1875 WD repeat domain 97 protein-coding 225.666-8 chr14 67573924 67574225 + 1.33333 NA intron (NM_020715, intron 13 of 28) intron (NM_020715, intron 13 of 28) 26194 NM_004569 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 305.333-73 chr9 27605649 27605978 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31947 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 275.333-49 chr3 66146443 66146708 + 1.33333 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) intron (NM_173471, intron 1 of 10) 12965 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 190-41 chr15 25597024 25597231 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -158071 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 341-22 chr4 76169027 76169444 + 1.33333 NA intron (NM_001204255, intron 5 of 8) intron (NM_001204255, intron 5 of 8) -20720 NR_103781 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 174-25 chr13 59046087 59046249 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -813051 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 154-5 chr1 107889888 107890048 + 1.33333 NA intron (NM_006113, intron 1 of 26) intron (NM_006113, intron 1 of 26) -7255 NR_107006 102465839 NR_107006 ENSG00000275455 MIR7852 hsa-mir-7852 microRNA 7852 ncRNA 160.333-304 chr9 135887690 135887901 + 1.33333 NA intron (NM_015447, intron 1 of 16) intron (NM_015447, intron 1 of 16) 19751 NM_015447 157922 Hs.522493 NM_015447 ENSG00000130559 CAMSAP1 - calmodulin regulated spectrin associated protein 1 protein-coding 216.666-16 chr10 89185214 89185406 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22007 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 204.667-151 chr8 131385253 131385543 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -344489 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 141.333-119 chr2 147404675 147404906 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -439727 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 292-22 chr17 47186455 47186717 + 1.33333 NA intron (NM_001256, intron 1 of 18) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 2709 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 232.333-24 chr14 55889579 55889919 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93075 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 203.333-13 chr1 159152614 159152777 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -18920 NM_001346510 57863 Hs.365689 NM_021189 ENSG00000162706 CADM3 BIgR|IGSF4B|NECL1|Necl-1|TSLL1|synCAM3 cell adhesion molecule 3 protein-coding 202.333-88 chr2 58602196 58602485 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) MER5B|DNA|hAT-Charlie 81587 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 266.667-3 chr1 51270693 51271062 + 1.33333 NA intron (NM_014372, intron 2 of 2) intron (NM_014372, intron 2 of 2) 27084 NM_001297667 22996 Hs.112949 NM_001080494 ENSG00000085831 TTC39A C1orf34|DEME-6 tetratricopeptide repeat domain 39A protein-coding 191.333-138 chr3 196476063 196476405 + 1.33333 NA intron (NM_152617, intron 4 of 5) intron (NM_152617, intron 4 of 5) 27534 NM_152617 165918 Hs.250648 NM_152617 ENSG00000163961 RNF168 hRNF168 ring finger protein 168 protein-coding 261.999-5 chr14 47659402 47659633 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 15437 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 157.333-118 chr15 49180149 49180305 + 1.33333 NA intron (NM_002044, intron 1 of 9) intron (NM_002044, intron 1 of 9) 9980 NM_001289030 2585 Hs.122006 NM_002044 ENSG00000156958 GALK2 GK2 galactokinase 2 protein-coding 253.333-73 chr3 148874107 148874554 + 1.33333 NA intron (NM_001870, intron 3 of 10) intron (NM_001870, intron 3 of 10) 9034 NM_001870 1359 Hs.646 NM_001870 ENSG00000163751 CPA3 MC-CPA carboxypeptidase A3 protein-coding 216-59 chr2 100636272 100636554 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 32674 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 199.333-233 chr5 122568059 122568226 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16458 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 279.333-63 chr4 141952103 141952519 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 315728 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 221.333-79 chr20 35100482 35100759 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7805 NM_199368 26133 Hs.168073 NM_015638 ENSG00000100991 TRPC4AP C20orf188|PPP1R158|TRRP4AP|TRUSS transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein protein-coding 218.667-114 chr8 142859669 142859962 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 20005 NM_001026213 1584 Hs.184927 NM_000497 ENSG00000160882 CYP11B1 CPN1|CYP11B|FHI|P450C11 cytochrome P450 family 11 subfamily B member 1 protein-coding 313.333 chr1 168165259 168165541 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13562 NM_001031800 261726 Hs.209431 NM_152902 ENSG00000143155 TIPRL TIP|TIP41|TIPRL1 TOR signaling pathway regulator protein-coding 162-31 chr12 93259245 93259426 + 1.33333 NA intron (NR_040096, intron 2 of 4) LTR37-int|LTR|ERV1 84969 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 205-88 chr7 81517482 81517839 + 1.33333 NA intron (NR_136264, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 44159 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 146.667-338 chr8 119338550 119338792 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 13500 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 193.666-22 chr18 36196305 36196487 + 1.33333 NA intron (NM_017947, intron 2 of 14) MIR|SINE|MIR 8899 NM_017947 55034 Hs.405028 NM_017947 ENSG00000075643 MOCOS HMCS|MCS|MOS molybdenum cofactor sulfurase protein-coding 206.333-77 chr2 27491008 27491196 + 1.33333 NA TTS (NM_022823) TTS (NM_022823) -1359 NM_015662 26160 Hs.127401 NM_015662 ENSG00000138002 IFT172 BBS20|NPHP17|RP71|SLB|SRTD10|osm-1|wim intraflagellar transport 172 protein-coding 607.333 chr2 63897021 63897822 + 1.33333 NA intron (NM_001005739, intron 22 of 22) intron (NM_001005739, intron 22 of 22) 55541 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 311.666-4 chr11 70055027 70055371 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 8725 NR_120530 101928443 Hs.313468 NR_120529 ENSG00000248844 LINC02753 - long intergenic non-protein coding RNA 2753 ncRNA 190.333-154 chrX 35416508 35416805 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -381686 NM_001099921 139604 NM_001099921 ENSG00000189023 MAGEB16 - MAGE family member B16 protein-coding 202-198 chrX 73136684 73136970 + 1.33333 NA Intergenic MER68-int|LTR|ERVL -8747 NR_027291 645996 Hs.617486 NR_027291 ENSG00000204118 NAP1L6 - nucleosome assembly protein 1 like 6 pseudo 235.333-22 chr11 57880389 57880652 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118718 NM_001206890 1500 Hs.166011 NM_001331 ENSG00000198561 CTNND1 BCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN) catenin delta 1 protein-coding 205.333-225 chr7 72339974 72340204 + 1.33333 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) LTR39|LTR|ERV1 -2698 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 213.666-22 chr2 105522702 105522894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84285 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 168.333-183 chr6 136490036 136490199 + 1.33333 NA intron (NM_001198617, intron 1 of 15) intron (NM_001198617, intron 1 of 15) -23242 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 402.666-9 chr6 4242495 4243038 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -52737 NR_125874 102724096 Hs.571140 NR_125874 LOC102724096 - uncharacterized LOC102724096 ncRNA 198.667-130 chr3 149929404 149929669 + 1.33333 NA intron (NM_183383, intron 7 of 8) L1MB4|LINE|L1 41359 NM_002628 5217 Hs.91747 NM_002628 ENSG00000070087 PFN2 D3S1319E|PFL profilin 2 protein-coding 213.333-13 chr1 217910167 217910358 + 1.33333 NA intron (NR_048550, intron 1 of 3) intron (NR_048550, intron 1 of 3) 17362 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 241-50 chr6 125174952 125175283 + 1.33333 NA intron (NM_001292026, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 20871 NM_001003395 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 200-28 chr10 111073411 111073659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3494 NM_000681 150 Hs.249159 NM_000681 ENSG00000150594 ADRA2A ADRA2|ADRA2R|ADRAR|ALPHA2AAR|ZNF32 adrenoceptor alpha 2A protein-coding 204-39 chr11 82081195 82081415 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) intron (NR_120571, intron 5 of 7) -190469 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 176.666-13 chr19 29498046 29498211 + 1.33333 NA intron (NR_040029, intron 1 of 9) intron (NR_040029, intron 1 of 9) 27624 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 213.666-33 chr4 100519387 100519608 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1475 NM_001159694 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 175.333-208 chr9 109651407 109651549 + 1.33333 NA intron (NM_001037293, intron 1 of 6) LTR33|LTR|ERVL 10690 NM_001037293 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 190-130 chr9 4693700 4693990 + 1.33333 NA intron (NM_017913, intron 3 of 6) MIR|SINE|MIR 14276 NM_017913 55664 Hs.666439 NM_017913 ENSG00000106993 CDC37L1 CDC37B|HARC cell division cycle 37 like 1 protein-coding 200-144 chr6 102635869 102636098 + 1.33333 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 1236998 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 205.333-5 chr1 41848792 41848991 + 1.33333 NA non-coding (NR_038260, exon 2 of 3) non-coding (NR_038260, exon 2 of 3) 70031 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 408.667-7 chr6 67024307 67024813 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1030791 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 455.333-11 chr7 124290679 124291136 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 61189 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 328.666-20 chr7 30584638 30584940 + 1.33333 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 -7010 NR_038889 401320 Hs.561708 NR_038889 GARS-DT - GARS divergent transcript ncRNA 181-76 chr8 80435885 80436129 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -49586 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 152-36 chr11 104476327 104476489 + 1.33333 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 132894 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 190-37 chr14 73432566 73432740 + 1.33333 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) intron (NM_001005743, intron 1 of 12) 25927 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 271.666-11 chr5 83934168 83934535 + 1.33333 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 -213496 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 348.333-12 chr15 67245139 67245526 + 1.33333 NA intron (NM_001271885, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 9329 NM_024666 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 213.666-29 chr3 77173781 77173985 + 1.33333 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 75871 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 219.666-18 chr16 65301720 65301974 + 1.33333 NA intron (NR_027755, intron 8 of 8) L1MCa|LINE|L1 -125274 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 226.667-89 chr7 97196878 97197165 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 80428 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 206-139 chr5 60523590 60523817 + 1.33333 NA non-coding (NR_028509, exon 2 of 2) non-coding (NR_028509, exon 2 of 2) -27417 NM_001364599 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 284-59 chr7 83402630 83403001 + 1.33333 NA intron (NM_001178129, intron 9 of 16) intron (NM_001178129, intron 9 of 16) 238616 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 495.999-2 chr8 109065353 109065825 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -21039 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 341.999-9 chr7 106482118 106482611 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 178794 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 201.333-55 chr11 72215577 72215780 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -1116 NM_001113534 2350 Hs.433159 NM_000803 ENSG00000165457 FOLR2 BETA-HFR|FBP|FBP/PL-1|FR-BETA|FR-P3|FRbeta folate receptor beta protein-coding 250.333-50 chr4 73399732 73400037 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4403 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 268.666-5 chr10 73470633 73470904 + 1.33333 NA exon (NM_021132, exon 8 of 14) exon (NM_021132, exon 8 of 14) -24984 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 295-12 chr14 48860081 48860440 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 726120 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 282.333-39 chr4 69822882 69823130 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37139 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 204.333-47 chr12 107005523 107005785 + 1.33333 NA intron (NM_004075, intron 2 of 12) MIRc|SINE|MIR -18488 NM_025198 80298 Hs.5009 NM_025198 ENSG00000120832 MTERF2 MTERFD3|mTERFL mitochondrial transcription termination factor 2 protein-coding 337.333-12 chr13 23818896 23819269 + 1.33333 NA intron (NM_005932, intron 14 of 18) MER46C|DNA|TcMar-Tigger -69786 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 205.333-21 chr1 211987897 211988089 + 1.33333 NA exon (NM_001199809, exon 7 of 19) exon (NM_001199809, exon 7 of 19) -47560 NM_001286230 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 354-18 chr4 35280850 35281153 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 962938 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 271-35 chr5 12790618 12790925 + 1.33333 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) MER87B|LTR|ERV1 122912 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 202.666-118 chr7 42595412 42595617 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 110933 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 221-49 chr3 145202796 145202994 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 866290 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 175-61 chr4 95654799 95655014 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -105933 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 172-77 chr4 36169719 36169881 + 1.33333 NA intron (NR_146894, intron 9 of 32) AluSx3|SINE|Alu 74139 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 308.333-28 chr4 58802322 58802690 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -181776 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 241.667-89 chr8 103055024 103055350 + 1.33333 NA intron (NM_001695, intron 7 of 12) intron (NM_001695, intron 7 of 12) 34104 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 292.666-12 chr14 52442573 52442962 + 1.33333 NA intron (NM_001160047, intron 18 of 20) intron (NM_001160047, intron 18 of 20) 109738 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 201.667-18 chr11 98247928 98248189 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -772891 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 197.333-233 chr8 99934814 99934962 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -41181 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 253-49 chr4 149640189 149640556 + 1.33333 NA intron (NM_001363507, intron 7 of 13) intron (NM_001363507, intron 7 of 13) 175471 NM_001363509 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 388.333-5 chr13 97312863 97313307 + 1.33333 NA intron (NM_144778, intron 2 of 8) intron (NM_144778, intron 2 of 8) 90752 NM_144778 10150 Hs.657347 NM_144778 ENSG00000139793 MBNL2 MBLL|MBLL39|PRO2032 muscleblind like splicing regulator 2 protein-coding 255.333-123 chr9 128332350 128332663 + 1.33333 NA intron (NM_016035, intron 5 of 6) intron (NM_016035, intron 5 of 6) -8021 NM_005094 10999 Hs.656699 NM_005094 ENSG00000167114 SLC27A4 ACSVL4|FATP4|IPS solute carrier family 27 member 4 protein-coding 196-15 chr10 20922667 20922821 + 1.33333 NA intron (NM_001173484, intron 4 of 6) intron (NM_001173484, intron 4 of 6) -25142 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 347.333 chr1 118658649 118659015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 329511 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 174.666-25 chr8 128233494 128233724 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83493 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 176.333-189 chrX 138129003 138129198 + 1.33333 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 538693 NR_030229 574507 NR_030229 ENSG00000207800 MIR504 MIRN504|hsa-mir-504|mir-504 microRNA 504 ncRNA 208.666-28 chr12 15314110 15314288 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -8309 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 194-130 chr7 31429472 31429710 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84480 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 223-11 chr11 35681076 35681364 + 1.33333 NA intron (NM_017583, intron 1 of 4) intron (NM_017583, intron 1 of 4) 18445 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 244.666-27 chr20 49493730 49493930 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -11162 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 302.666-19 chr4 135662860 135663141 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 225093 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 401 chr1 35973180 35973571 + 1.33333 NA exon (NM_024852, exon 5 of 19) exon (NM_024852, exon 5 of 19) 42270 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 194-18 chr11 71960169 71960373 + 1.33333 NA intron (NM_018320, intron 2 of 8) intron (NM_018320, intron 2 of 8) 31225 NM_018320 55298 Hs.368554 NM_018320 ENSG00000137522 RNF121 - ring finger protein 121 protein-coding 242.666-17 chr15 66766585 66766858 + 1.33333 NA intron (NR_027654, intron 4 of 4) intron (NR_027654, intron 4 of 4) 64485 NR_027654 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 173-4 chr1 196310041 196310214 + 1.33333 NA intron (NM_001287820, intron 19 of 26) intron (NM_001287820, intron 19 of 26) -221412 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 246.666-12 chr13 114322969 114323194 + 1.33333 NA intron (NM_001164144, intron 2 of 2) intron (NM_001164144, intron 2 of 2) 8578 NM_001164144 283489 Hs.7542 NM_032436 ENSG00000198824 CHAMP1 C13orf8|CAMP|CHAMP|MRD40|ZNF828 chromosome alignment maintaining phosphoprotein 1 protein-coding 324.333-23 chr2 48876549 48876823 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -120962 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 230.666-25 chr18 60269388 60269644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 103259 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 135.333-106 chr22 26259621 26259779 + 1.33333 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 90226 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 196-123 chr3 108620566 108620743 + 1.33333 NA intron (NM_014648, intron 5 of 32) L1MD2|LINE|L1 30932 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 229.666-22 chr3 130583225 130583424 + 1.33333 NA intron (NM_001102608, intron 9 of 35) intron (NM_001102608, intron 9 of 35) 22990 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 199.333-163 chr20 13785577 13785823 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_016649) promoter-TSS (NM_016649) 672 NR_147982 79133 Hs.472165 NM_024120 ENSG00000101247 NDUFAF5 C20orf7|MC1DN16|bA526K24.2|dJ842G6.1 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5 protein-coding 160-120 chr8 88537315 88537502 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -209925 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 417-6 chr2 225078149 225078683 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35948 NM_014689 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 277-36 chr3 109536796 109537122 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65869 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 207.666-19 chr15 57714283 57714475 + 1.33333 NA intron (NM_015532, intron 3 of 3) intron (NM_015532, intron 3 of 3) 7665 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 326.667-2 chr1 46044850 46045323 + 1.33333 NA intron (NM_001328652, intron 8 of 8) MIR|SINE|MIR 85587 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 208-9 chr1 155153914 155154102 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -13477 NM_153741 54344 Hs.110477 NM_018973 ENSG00000179085 DPM3 CDG1O dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatory protein-coding 178.666-5 chr15 59645247 59645476 + 1.33333 NA intron (NM_001320930, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 11944 NM_001320929 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 302-66 chr8 52776133 52776440 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61820 NM_001083617 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 189-14 chr11 31150439 31150632 + 1.33333 NA intron (NM_001367979, intron 9 of 38) intron (NM_001367979, intron 9 of 38) -157849 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 208-81 chr2 77191784 77191989 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 205921 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 149.333-196 chr2 139830168 139830301 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 756451 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 213.333-227 chr9 95499848 95500081 + 1.33333 NA intron (NM_000264, intron 2 of 23) intron (NM_000264, intron 2 of 23) 7235 NM_001083607 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 231-22 chr18 2684386 2684596 + 1.33333 NA intron (NM_015295, intron 5 of 47) L1MEc|LINE|L1 28604 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 120.667-69 chr16 58352083 58352290 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40285 NM_001126130 64785 Hs.47125 NM_022770 ENSG00000181938 GINS3 PSF3 GINS complex subunit 3 protein-coding 174.667-144 chr5 109755765 109755998 + 1.33333 NA intron (NM_002372, intron 5 of 21) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 66515 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 201.333-29 chr10 33494994 33495208 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -160196 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 225.333-45 chr14 53867259 53867578 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 81066 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 193-35 chr18 6005912 6006101 + 1.33333 NA intron (NR_158609, intron 15 of 17) L1MB3|LINE|L1 -110052 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 209-47 chr15 40035152 40035390 + 1.33333 NA TTS (NM_003134) TTS (NM_003134) 3910 NM_003134 6727 Hs.533732 NM_003134 ENSG00000140319 SRP14 ALURBP signal recognition particle 14 protein-coding 303-16 chr14 50319540 50320024 + 1.33333 NA intron (NM_001370605, intron 2 of 5) intron (NM_001370605, intron 2 of 5) 7458 NM_001003803 27109 Hs.438489 NM_015684 ENSG00000125375 DMAC2L ATP5S|ATPW|FB|HSU79253 distal membrane arm assembly complex 2 like protein-coding 249.333-93 chr7 51866522 51866783 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -473396 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 149.666-6 chr2 44580157 44580278 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 218270 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 269-17 chr15 70421829 70422068 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 83980 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 205.333-119 chr2 40915421 40915580 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -403065 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 237.333-34 chr15 56625311 56625556 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 108653 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 422.666-3 chr19 7264497 7264835 + 1.33333 NA intron (NM_001079817, intron 2 of 20) intron (NM_001079817, intron 2 of 20) 29748 NM_001079817 3643 Hs.465744 NM_000208 ENSG00000171105 INSR CD220|HHF5 insulin receptor protein-coding 208.666-13 chr10 26344130 26344494 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -94029 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 135.666-5 chr20 49487939 49488087 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -5345 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 199.333-151 chr2 196721110 196721316 + 1.33333 NA intron (NM_001080539, intron 20 of 27) intron (NM_001080539, intron 20 of 27) 7675 NM_001353340 284992 Hs.132519 NM_173466 ENSG00000144395 CCDC150 - coiled-coil domain containing 150 protein-coding 246.999-4 chr4 162301330 162301656 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -137459 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 203.666-9 chr10 58641158 58641417 + 1.33333 NA intron (NM_001080512, intron 2 of 20) intron (NM_001080512, intron 2 of 20) -73728 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 202.666-8 chr1 209836095 209836269 + 1.33333 NA intron (NM_014388, intron 5 of 11) L1MD2|LINE|L1 8210 NM_014388 27042 Hs.194754 NM_014388 ENSG00000117597 UTP25 C1orf107|DEF|DIEXF|DJ434O14.5 UTP25 small subunit processor component protein-coding 230-74 chr8 104788126 104788444 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -199261 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 383.666-5 chr2 32893518 32894062 + 1.33333 NA intron (NR_027099, intron 7 of 10) MLT2B2|LTR|ERVL -33337 NR_027097 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 206.333-152 chr7 127722856 127723077 + 1.33333 NA intron (NM_014390, intron 10 of 23) Eulor9A|DNA|DNA 70772 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 226-37 chr2 55572716 55572994 + 1.33333 NA intron (NM_020463, intron 10 of 14) L1ME3G|LINE|L1 44767 NM_001282850 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 212.333-44 chr14 56449698 56449899 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -64533 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 134.333-166 chr8 35896263 35896447 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -186035 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 189.666-16 chr2 30444680 30444874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2469 NM_001304446 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 232.999-9 chr9 30976568 30976840 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR3|LTR|Gypsy 404786 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 196.667-163 chr8 109865452 109865730 + 1.33333 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL 110180 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 221-31 chr19 31923030 31923246 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102724 NR_110675 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 162.666-5 chr12 112477996 112478156 + 1.33333 NA intron (NM_001330437, intron 9 of 15) intron (NM_001330437, intron 9 of 15) 59129 NM_080601 5781 Hs.506852 NM_002834 ENSG00000179295 PTPN11 BPTP3|CFC|JMML|METCDS|NS1|PTP-1D|PTP2C|SH-PTP2|SH-PTP3|SHP2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11 protein-coding 238.667-79 chr6 54623556 54623880 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -223053 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 202.666-111 chr7 2790019 2790214 + 1.33333 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) intron (NM_007353, intron 2 of 3) 25114 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 199.333-185 chr3 96561329 96561603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 201502 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 204-111 chr2 222770397 222770663 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -90506 NM_004457 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 286-45 chr4 96165948 96166249 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -144605 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 209.333-19 chr10 35107557 35107718 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -17023 NM_001198777 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 189.666-10 chr14 46479104 46479306 + 1.33333 NA intron (NR_102700, intron 1 of 1) L1M5|LINE|L1 7846 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 291.333-11 chr10 117351676 117352089 + 1.33333 NA intron (NM_173791, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 23558 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 374.333-8 chr19 42536943 42537276 + 1.33333 NA intron (NR_073180, intron 2 of 2) L1M1|LINE|L1 -8628 NM_001184815 634 Hs.512682 NM_001712 ENSG00000079385 CEACAM1 BGP|BGP1|BGPI carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 1 protein-coding 214.667-86 chr3 189874934 189875219 + 1.33333 NA intron (NM_003722, intron 10 of 13) MER58B|DNA|hAT-Charlie 45154 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 410.999-2 chr15 86884797 86885270 + 1.33333 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -47847 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 204.333-94 chr2 44378003 44378211 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 2 of 10) intron (NM_024766, intron 2 of 10) 16160 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 288.333-29 chr4 95729133 95729401 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -110826 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 219-24 chr14 66946748 66946953 + 1.33333 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) intron (NM_020806, intron 8 of 22) -242590 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 366-8 chr14 92693869 92694350 + 1.33333 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 54518 NM_001363696 5641 Hs.18069 NM_005606 ENSG00000100600 LGMN AEP|LGMN1|PRSC1 legumain protein-coding 121.333-112 chr3 98572672 98572856 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20847 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 220.666-5 chr1 169981328 169981587 + 1.33333 NA intron (NM_014970, intron 15 of 19) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 87458 NM_001204517 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 320-29 chr2 223569205 223569659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32929 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 204-34 chr11 15356387 15356584 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 207383 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 197.333-29 chr11 12854783 12854933 + 1.33333 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) AluJo|SINE|Alu 134690 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 255.666-17 chr2 230232452 230232816 + 1.33333 NA intron (NM_001278453, intron 1 of 23) intron (NM_001278453, intron 1 of 23) 6898 NM_001005176 11262 Hs.632549 NM_007237 ENSG00000079263 SP140 LYSP100|LYSP100-A|LYSP100-B SP140 nuclear body protein protein-coding 236.666-49 chr8 136943355 136943572 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 412665 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 197-75 chr3 94690733 94690900 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -247447 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 198.666-12 chr12 5846072 5846243 + 1.33333 NA intron (NM_001278596, intron 4 of 25) intron (NM_001278596, intron 4 of 25) 99102 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 240.333-70 chr4 155728249 155728526 + 1.33333 NA intron (NM_001130685, intron 9 of 9) MER63A|DNA|hAT-Blackjack -30634 NM_000857 2983 Hs.77890 NM_000857 ENSG00000061918 GUCY1B1 GC-S-beta-1|GC-SB3|GUC1B3|GUCB3|GUCSB3|GUCY1B3 guanylate cyclase 1 soluble subunit beta 1 protein-coding 333.333-18 chr12 7617117 7617468 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48616 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 195.333-210 chr7 131398560 131398725 + 1.33333 NA intron (NM_001145354, intron 6 of 18) AluSx|SINE|Alu 70766 NM_013255 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 255.333-72 chr3 104758687 104758912 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -607914 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 135.333-99 chr2 221749413 221749590 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -175299 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 202.333-87 chr2 52947968 52948135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -245436 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 198.333-51 chr13 90194042 90194201 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -37061 NR_030754 693207 NR_030754 ENSG00000283783 MIR622 MIRN622|hsa-mir-622 microRNA 622 ncRNA 206.666-19 chr11 6803588 6803773 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7772 NM_003696 8590 Hs.652252 NM_003696 ENSG00000184933 OR6A2 I7|OR11-55|OR6A1|OR6A2P olfactory receptor family 6 subfamily A member 2 protein-coding 206-168 chr7 21596116 21596312 + 1.33333 NA intron (NM_001277115, intron 14 of 81) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 53175 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 195.333-85 chr15 34826086 34826371 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -30679 NM_005159 70 Hs.118127 NM_005159 ENSG00000159251 ACTC1 ACTC|ASD5|CMD1R|CMH11|LVNC4 actin alpha cardiac muscle 1 protein-coding 289.999-2 chr20 36412690 36413039 + 1.33333 NA intron (NM_001365621, intron 2 of 12) L1MB5|LINE|L1 -48604 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 200.666-72 chr21 21610710 21610884 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 126522 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 300-52 chr5 102370724 102371233 + 1.33333 NA TTS (NM_001308014) TTS (NM_001308014) -74694 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 203.333-62 chr13 53877892 53878086 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 62570 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 139-75 chr4 89970874 89971023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 76094 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 234-28 chr17 11813412 11813691 + 1.33333 NA intron (NM_001372, intron 45 of 68) intron (NM_001372, intron 45 of 68) -69351 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 334.333-28 chr7 79542358 79542662 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 88550 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 153.333-194 chr2 55187927 55188111 + 1.33333 NA intron (NR_148539, intron 1 of 3) L1ME3B|LINE|L1 -43884 NM_001135592 6233 Hs.311640 NM_002954 ENSG00000143947 RPS27A CEP80|HEL112|S27A|UBA80|UBC|UBCEP1|UBCEP80 ribosomal protein S27a protein-coding 208-164 chr8 60058906 60059083 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 222406 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 198.333-151 chr5 4241896 4242163 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -531452 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 216.667-52 chr2 19707484 19707788 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -161218 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 226.666-39 chr7 42726738 42727129 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20486 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 307.666-5 chr15 52585059 52585358 + 1.33333 NA intron (NM_001286495, intron 10 of 11) intron (NM_001286495, intron 10 of 11) -15762 NM_001306191 10776 Hs.512908 NM_006628 ENSG00000128989 ARPP19 ARPP-16|ARPP-19|ARPP16|ENSAL cAMP regulated phosphoprotein 19 protein-coding 194.667-139 chr6 148042962 148043238 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -229228 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 162-24 chr11 54701611 54701767 + 1.33333 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -5143 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 234.666-28 chr22 43259107 43259374 + 1.33333 NA intron (NM_173050, intron 5 of 21) intron (NM_173050, intron 5 of 21) -16702 NR_134582 101927447 Hs.621227 NR_134582 ENSG00000203527 LOC101927447 - uncharacterized LOC101927447 ncRNA 225.333-133 chr8 122855725 122856025 + 1.33333 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 74220 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 184.666-26 chr5 2340671 2340858 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -28563 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 165.333-258 chr9 16781203 16781334 + 1.33333 NA intron (NM_017637, intron 1 of 6) intron (NM_017637, intron 1 of 6) 54454 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 208-71 chr2 6777639 6777808 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -7412 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 230.666-15 chr12 66603445 66603674 + 1.33333 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 75517 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 198.667-57 chr14 27442849 27443082 + 1.33333 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -169623 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 248.666-31 chr5 26756024 26756402 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 282373 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 327.333-36 chr5 21034039 21034499 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -418734 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 152.333-123 chr15 60163705 60163879 + 1.33333 NA Intergenic ORSL|DNA|hAT-Tip100 159481 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 333-14 chr20 55397153 55397502 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -25716 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 327.333-8 chr11 41894996 41895362 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 180611 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 300.666-23 chr9 116818944 116819275 + 1.33333 NA intron (NM_014010, intron 11 of 21) intron (NM_014010, intron 11 of 21) 131804 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 218.666-26 chr14 56433112 56433377 + 1.33333 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 -81087 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 224.666-26 chr3 126950176 126950412 + 1.33333 NA intron (NM_032343, intron 6 of 7) intron (NM_032343, intron 6 of 7) -38300 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 229-59 chr6 40102448 40102743 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -168133 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 209.333-191 chr5 78677390 78677607 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28726 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 199.333-265 chr7 133668640 133668918 + 1.33333 NA intron (NM_021807, intron 10 of 17) intron (NM_021807, intron 10 of 17) 156109 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 172.666-16 chr22 19513803 19513953 + 1.33333 NA intron (NR_161281, intron 13 of 16) HAL1ME|LINE|L1 10532 NM_001363066 7122 Hs.505337 NM_003277 ENSG00000184113 CLDN5 AWAL|BEC1|CPETRL1|TMDVCF|TMVCF claudin 5 protein-coding 199.333-121 chr2 50238183 50238356 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) MLT2B1|LTR|ERVL 109485 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 204-84 chr18 9464439 9464678 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10955 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 301.333-49 chr7 27809080 27809481 + 1.33333 NA intron (NM_001362795, intron 13 of 14) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 69185 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 322-45 chr7 128897145 128897438 + 1.33333 NA intron (NM_001366122, intron 8 of 39) PABL_A-int|LTR|ERV1 13418 NM_199349 375616 Hs.371746 NM_199349 ENSG00000135253 KCP CRIM2|KCP1|NET67 kielin cysteine rich BMP regulator protein-coding 226.666-8 chr12 94173553 94173738 + 1.33333 NA intron (NM_005761, intron 2 of 30) intron (NM_005761, intron 2 of 30) 25068 NM_005761 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 299.333-72 chr8 85834913 85835260 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -7144 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 413.999-4 chr5 3029592 3029903 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 111893 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 191.333-60 chr14 55181646 55181889 + 1.33333 NA intron (NM_001146015, intron 4 of 19) L2a|LINE|L2 9818 NM_014750 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 349.666 chr1 62323344 62323732 + 1.33333 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -4104 NM_181712 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 197.333-77 chr16 54704906 54705161 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 143200 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 230.666-22 chr16 56549699 56549985 + 1.33333 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -15231 NM_032935 84560 Hs.567624 NM_032935 ENSG00000102891 MT4 MT-4|MT-IV|MTIV metallothionein 4 protein-coding 179.333-152 chr5 81753016 81753232 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1871 NM_001256734 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 256.667-31 chr15 46195038 46195373 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 490010 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 207.666-58 chr7 47462877 47463088 + 1.33333 NA intron (NM_022748, intron 4 of 30) intron (NM_022748, intron 4 of 30) 1821 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 315.333-20 chr2 115750076 115750454 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 11 of 25) intron (NM_001321912, intron 11 of 25) 406450 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 258.666-3 chr10 32771373 32771669 + 1.33333 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) L1PBa|LINE|L1 129951 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 158.667-290 chr6 86530046 86530237 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -407387 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 164-91 chr5 116458199 116458399 + 1.33333 NA intron (NR_109879, intron 2 of 2) intron (NR_109879, intron 2 of 2) 10801 NR_109879 101927233 Hs.732850 NR_109879 ENSG00000248445 SEMA6A-AS1 CTB-118N6.3 SEMA6A antisense RNA 1 ncRNA 364.667 chr1 191915999 191916407 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -242259 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 136.333-89 chr2 63906152 63906346 + 1.33333 NA intron (NM_001005739, intron 20 of 22) L1ME1|LINE|L1 64369 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 324.333-14 chr14 49828517 49828854 + 1.33333 NA exon (NM_004713, exon 14 of 33) exon (NM_004713, exon 14 of 33) 24103 NM_004713 9147 Hs.655964 NM_004713 ENSG00000165525 NEMF NY-CO-1|SDCCAG1 nuclear export mediator factor protein-coding 275.666-13 chr3 144488316 144488826 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 515490 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 251-50 chr4 46551184 46551628 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -161278 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 207.666-42 chr4 74404491 74404745 + 1.33333 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 39473 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 138-31 chr12 129082956 129083108 + 1.33333 NA intron (NM_133448, intron 6 of 8) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -26658 NR_104172 283352 Hs.665667 NR_104172 ENSG00000249196 TMEM132D-AS1 - TMEM132D antisense RNA 1 ncRNA 171.333-88 chr2 133725731 133725909 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -157357 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 296-43 chr3 61906421 61906858 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) AluJb|SINE|Alu 345068 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 219-33 chr16 88857847 88858135 + 1.33333 NA intron (NM_001318526, intron 1 of 4) intron (NM_001318526, intron 1 of 4) 864 NM_001318525 51693 Hs.461722 NM_016209 ENSG00000167515 TRAPPC2L HSPC176|PERRB trafficking protein particle complex 2 like protein-coding 244.333-108 chr8 131805803 131806171 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -98106 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 225.667-17 chr12 40677145 40677447 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -15143 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 393-2 chr10 89709359 89709765 + 1.33333 NA intron (NM_016195, intron 4 of 32) intron (NM_016195, intron 4 of 32) 7972 NM_001284259 9585 Hs.240 NM_016195 ENSG00000138182 KIF20B CT90|KRMP1|MPHOSPH1|MPP-1|MPP1 kinesin family member 20B protein-coding 290.333-45 chr7 104428559 104428993 + 1.33333 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 100120 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 198.667-16 chr10 10585999 10586243 + 1.33333 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) intron (NM_001326317, intron 1 of 14) 123571 NM_001326320 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 240.666-8 chr11 72567925 72568175 + 1.33333 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -2606 NR_126364 101928555 Hs.376950 NR_126364 ENSG00000227467 LINC01537 - long intergenic non-protein coding RNA 1537 ncRNA 189.666-8 chr12 105624005 105624157 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -80122 NR_110108 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 198.666-82 chr5 143679173 143679350 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_049829) promoter-TSS (NR_049829) -599 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 164-118 chr8 119850822 119850979 + 1.33333 NA intron (NM_024094, intron 2 of 8) L3|LINE|CR1 4994 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 267-38 chr2 83584048 83584508 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61464 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 191.666-17 chr5 8092181 8092561 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 223223 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 194-156 chrX 10658693 10658964 + 1.33333 NA intron (NM_033290, intron 1 of 9) intron (NM_033290, intron 1 of 9) 18911 NM_001098624 4281 Hs.27695 NM_000381 ENSG00000101871 MID1 BBBG1|FXY|GBBB1|MIDIN|OGS1|OS|OSX|RNF59|TRIM18|XPRF|ZNFXY midline 1 protein-coding 231.333-40 chr14 45150701 45150992 + 1.33333 NA intron (NM_001308133, intron 3 of 21) L2a|LINE|L2 14907 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 187.333-33 chr11 72028725 72029000 + 1.33333 NA intron (NR_104476, intron 4 of 24) intron (NR_104476, intron 4 of 24) 14571 NR_104178 100128494 Hs.713607 NR_104178 ENSG00000251143 LOC100128494 - uncharacterized LOC100128494 ncRNA 200.333-172 chrX 98462110 98462276 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -897658 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 262-45 chr2 170042057 170042434 + 1.33333 NA intron (NM_172070, intron 32 of 38) L1MB5|LINE|L1 -135902 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 209.333-204 chr6 73880640 73880849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184541 NM_133493 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 219.333-20 chr10 26207045 26207265 + 1.33333 NA intron (NM_017433, intron 34 of 34) L1MA8|LINE|L1 -9152 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 316-14 chr14 66453330 66453702 + 1.33333 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -32855 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 229.333-15 chr11 33146360 33146547 + 1.33333 NA intron (NM_001326, intron 1 of 20) AluJr|SINE|Alu 15027 NM_001326 1479 Hs.44402 NM_001326 ENSG00000176102 CSTF3 CSTF-77 cleavage stimulation factor subunit 3 protein-coding 232-87 chr8 82156202 82156448 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -314039 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 169.333-234 chr6 128887951 128888326 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 4997 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 337.999-3 chr9 137333977 137334439 + 1.33333 NA intron (NM_017820, intron 17 of 21) AluSx1|SINE|Alu -31937 NM_001004354 441478 Hs.535075 NM_001004354 ENSG00000198435 NRARP - NOTCH regulated ankyrin repeat protein protein-coding 245.333-87 chr4 64682418 64682741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -273119 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 196.666-28 chr15 55242365 55242557 + 1.33333 NA intron (NM_183234, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 27825 NM_183234 5873 Hs.654978 NM_004580 ENSG00000069974 RAB27A GS2|HsT18676|RAB27|RAM RAB27A, member RAS oncogene family protein-coding 319.666-5 chr14 30918704 30919017 + 1.33333 NA intron (NM_014574, intron 7 of 15) intron (NM_014574, intron 7 of 15) -29052 NR_038356 100506071 Hs.729195 NR_038356 ENSG00000258525 LOC100506071 - uncharacterized LOC100506071 ncRNA 198-26 chr11 3725070 3725318 + 1.33333 NA exon (NM_001365127, exon 15 of 33) exon (NM_001365127, exon 15 of 33) -53810 NM_001303034 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 233.333-78 chr21 32625063 32625318 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -12319 NM_001350335 56683 Hs.5811 NM_017835 ENSG00000159079 CFAP298 C21orf48|C21orf59|CILD26|FBB18|Kur cilia and flagella associated protein 298 protein-coding 196-182 chr8 99198205 99198366 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) L2a|LINE|L2 185019 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 242.667-88 chr5 128775836 128776169 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -189125 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 259.333-32 chr14 48393045 48393384 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -598200 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 198.667-196 chr9 74302515 74302815 + 1.33333 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -68866 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 205.333-175 chr4 106899952 106900136 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 136269 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 223.999 chr1 218722513 218722728 + 1.33333 NA intron (NR_031644, intron 4 of 6) L1MEd|LINE|L1 195891 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 314.666-20 chr2 127608574 127608894 + 1.33333 NA exon (NM_001080527, exon 22 of 47) exon (NM_001080527, exon 22 of 47) -37130 NM_001161415 2840 Hs.46453 NM_005291 ENSG00000144230 GPR17 - G protein-coupled receptor 17 protein-coding 202-51 chr15 58058231 58058464 + 1.33333 NA intron (NM_001206897, intron 1 of 13) intron (NM_001206897, intron 1 of 13) -6878 NR_147215 283665 Hs.638961 NR_147215 LOC283665 - uncharacterized LOC283665 ncRNA 225.667-13 chr11 9716097 9716428 + 1.33333 NA intron (NM_015055, intron 3 of 11) intron (NM_015055, intron 3 of 11) -42031 NR_036485 283104 Hs.632156 NR_036485 ENSG00000246273 SBF2-AS1 - SBF2 antisense RNA 1 ncRNA 286.667-18 chr2 74068659 74069093 + 1.33333 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) L1ME4b|LINE|L1 66184 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 249.666-10 chr11 76441559 76441812 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3333 NM_001300943 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 238.333-92 chr8 123857905 123858166 + 1.33333 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) LTR78B|LTR|ERV1 6048 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 204.999-2 chr2 64730327 64730497 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -76499 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 184.667-37 chr15 54730318 54730487 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -326345 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 210.666-5 chr1 163120933 163121132 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -40643 NR_110699 101928404 Hs.683933 NR_110699 ENSG00000232892 LOC101928404 - uncharacterized LOC101928404 ncRNA 214.333-49 chr14 72345256 72345464 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -171460 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 222-33 chr16 19492984 19493158 + 1.33333 NA intron (NM_024780, intron 15 of 17) AluSp|SINE|Alu 29027 NM_016641 51573 Hs.512607 NM_016641 ENSG00000006007 GDE1 363E6.2|MIR16 glycerophosphodiester phosphodiesterase 1 protein-coding 379.332 chr2 13352180 13352492 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -345323 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 214.666-33 chr2 54750997 54751187 + 1.33333 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) MamRep1527|LTR|LTR 26080 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 311-35 chr8 83678147 83678615 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 274623 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 202.666-21 chr11 40224378 40224567 + 1.33333 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) intron (NM_020929, intron 3 of 4) 68658 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 294.666-18 chr2 123262805 123263247 + 1.33333 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -189545 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 275.333-52 chr4 32125376 32125816 + 1.33333 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -103174 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 216-32 chr14 70776595 70776866 + 1.33333 NA intron (NM_001284231, intron 1 of 11) intron (NM_001284231, intron 1 of 11) 6722 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 225.333-18 chr10 74089851 74090095 + 1.33333 NA intron (NM_014000, intron 9 of 21) intron (NM_014000, intron 9 of 21) 60855 NR_135191 26985 Hs.500104 NM_012095 ENSG00000185009 AP3M1 - adaptor related protein complex 3 subunit mu 1 protein-coding 356.999-7 chr6 106209083 106209388 + 1.33333 NA intron (NR_104402, intron 4 of 5) L1MD2|LINE|L1 107031 NR_104403 9474 Hs.486063 NM_004849 ENSG00000057663 ATG5 APG5|APG5-LIKE|APG5L|ASP|SCAR25|hAPG5 autophagy related 5 protein-coding 188-62 chr2 238311921 238312083 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8516 NM_015650 26146 Hs.631898 NM_015650 ENSG00000204104 TRAF3IP1 IFT54|MIP-T3|MIPT3|SLSN9 TRAF3 interacting protein 1 protein-coding 170-77 chr3 86490969 86491219 + 1.33333 NA intron (NR_135563, intron 1 of 1) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 9151 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 206-107 chr3 9087165 9087327 + 1.33333 NA intron (NM_014850, intron 3 of 21) MIRb|SINE|MIR -105247 NR_121664 101927416 Hs.475364 NR_121663 ENSG00000228723 SRGAP3-AS2 - SRGAP3 antisense RNA 2 ncRNA 227.333-110 chr6 144913920 144914114 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 508362 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 299.999-3 chr15 88033334 88033578 + 1.33333 NA intron (NM_001007156, intron 13 of 15) AluSx1|SINE|Alu -87188 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 263.333-18 chr12 39233359 39233718 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 209582 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 236.666-36 chr4 110501976 110502239 + 1.33333 NA intron (NM_001977, intron 3 of 19) L1PA15|LINE|L1 25952 NM_001977 2028 Hs.435765 NM_001977 ENSG00000138792 ENPEP APA|CD249|gp160 glutamyl aminopeptidase protein-coding 213-66 chr4 152450073 152450345 + 1.33333 NA intron (NM_001349798, intron 2 of 13) intron (NM_001349798, intron 2 of 13) 39207 NR_036092 100422896 NR_036092 ENSG00000264678 MIR3140 mir-3140 microRNA 3140 ncRNA 273-20 chr2 52630980 52631347 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 71452 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 280.666-3 chr1 221855100 221855494 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14631 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 202-98 chr2 220346748 220347021 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -440319 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 206.666-48 chr18 375708 375872 + 1.33333 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 -107743 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 210.333-52 chr16 10835974 10836132 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17259 NR_134905 780776 Hs.371576 NM_001079512 ENSG00000166676 TVP23A FAM18A|YDR084C trans-golgi network vesicle protein 23 homolog A protein-coding 220-6 chr1 191766510 191766761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -391827 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 294.333-27 chr20 5989164 5989545 + 1.33333 NA intron (NM_182802, intron 17 of 18) AluSz|SINE|Alu 16467 NR_110101 101929225 Hs.635771 NR_110101 ENSG00000278719 MCM8-AS1 - MCM8 antisense RNA 1 ncRNA 265.333-18 chr12 42283709 42284056 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39977 NR_107005 102467003 NR_107005 ENSG00000278520 MIR7851 hsa-mir-7851 microRNA 7851 ncRNA 247.333-71 chr6 129337092 129337390 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 29 of 64) L3|LINE|CR1 372936 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 196.667-10 chr10 7676758 7677045 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9903 NM_001001851 80760 Hs.498586 NM_030569 ENSG00000123243 ITIH5 ITI-HC5|PP14776 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 5 protein-coding 267.666-22 chr9 37630226 37630536 + 1.33333 NA intron (NM_001371224, intron 2 of 16) AluSz|SINE|Alu -20573 NM_014907 22844 Hs.163990 NM_014907 ENSG00000070601 FRMPD1 FRMD2 FERM and PDZ domain containing 1 protein-coding 182-40 chr18 5208445 5208751 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10846 NM_001330553 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 144-145 chr7 36128558 36128718 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24616 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 158-37 chr12 123792170 123792374 + 1.33333 NA intron (NM_207437, intron 11 of 77) HAL1|LINE|L1 29777 NM_207437 196385 Hs.622654 NM_207437 ENSG00000197653 DNAH10 - dynein axonemal heavy chain 10 protein-coding 210.666-16 chr11 46843206 46843370 + 1.33333 NA intron (NM_001008938, intron 1 of 43) MER21-int|LTR|ERVL 2992 NM_001008938 9793 Hs.201253 NM_014756 ENSG00000175216 CKAP5 CHTOG|MSPS|TOG|TOGp|ch-TOG cytoskeleton associated protein 5 protein-coding 202-54 chr15 71980740 71981009 + 1.33333 NA intron (NM_006901, intron 11 of 41) intron (NM_006901, intron 11 of 41) -133384 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 455.666-4 chr18 403252 403607 + 1.33333 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 97272 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 330-8 chr11 5321361 5321738 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2803 NM_033180 79345 Hs.680163 NM_033180 ENSG00000279012 OR51B2 HOR5'Beta3|OR51B1P olfactory receptor family 51 subfamily B member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 192-112 chr5 42833983 42834259 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -22045 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 225-67 chr9 27341744 27342034 + 1.33333 NA intron (NM_024761, intron 3 of 3) MER58B|DNA|hAT-Charlie -44739 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 378.333-13 chr8 64220225 64220780 + 1.33333 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 148056 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 257.666-24 chr7 96738752 96739122 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29046 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 247-69 chr7 41498794 41499076 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -194984 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 308-25 chr2 52606792 52607135 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 95652 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 274.667-9 chr10 101516791 101517255 + 1.33333 NA intron (NM_001256856, intron 3 of 13) intron (NM_001256856, intron 3 of 13) 71234 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 260.666-10 chr15 26955135 26955469 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -15879 NM_001270873 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 203-7 chr1 162537644 162537910 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23663 NM_001324116 6675 Hs.492859 NM_003115 ENSG00000117143 UAP1 AGX|AGX1|AGX2|SPAG2 UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 protein-coding 278.333-50 chr9 87770111 87770556 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2582 NR_027917 392360 Hs.690450 NM_001023564 ENSG00000188029 CTSL3P CTSL3|HCTSL-s cathepsin L family member 3, pseudogene pseudo 294-64 chr8 85135140 85135463 + 1.33333 NA intron (NM_033402, intron 13 of 18) MER113A|DNA|hAT-Charlie 28063 NM_033402 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 259.333-3 chr1 98572966 98573315 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -88581 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 333.333-40 chr4 47962953 47963260 + 1.33333 NA intron (NR_125879, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 18427 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 203-59 chr20 18741480 18741703 + 1.33333 NA intron (NM_080820, intron 4 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 -42883 NR_109955 101929526 Hs.639402 NR_109955 ENSG00000233993 LOC101929526 - uncharacterized LOC101929526 ncRNA 218.667-55 chr2 140009499 140009799 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 577036 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 278.666-14 chr2 38574204 38574469 + 1.33333 NA intron (NM_138394, intron 7 of 12) intron (NM_138394, intron 7 of 12) 28592 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 293.999 chr1 113757361 113757612 + 1.33333 NA intron (NM_001323051, intron 2 of 12) MER102b|DNA|hAT-Charlie 1669 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 204.667-160 chrX 82126186 82126439 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 924210 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 215-39 chr2 125430347 125430584 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 687520 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 171.333-100 chr2 190129302 190129513 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8370 NM_001042521 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 300-24 chr16 60412446 60412849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52854 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 261-21 chr14 61361817 61362125 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 40528 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 374.666-8 chr7 20697480 20697831 + 1.33333 NA intron (NM_178559, intron 7 of 18) intron (NM_178559, intron 7 of 18) 50325 NM_178559 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 196.666-37 chr18 12919107 12919278 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28792 NM_031216 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 252.666-3 chr1 187258791 187259074 + 1.33333 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 166090 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 290.667-39 chr7 9089690 9090094 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -544378 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 194.667-155 chr8 116933543 116933785 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4543 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 196.333-172 chr9 90511144 90511399 + 1.33333 NA intron (NR_034157, intron 1 of 5) intron (NR_034157, intron 1 of 5) 71475 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 191.333-167 chr5 138311684 138311940 + 1.33333 NA intron (NM_001790, intron 7 of 13) L1MB2|LINE|L1 19992 NM_001790 995 Hs.656 NM_001790 ENSG00000158402 CDC25C CDC25|PPP1R60 cell division cycle 25C protein-coding 306-12 chr13 49202008 49202263 + 1.33333 NA intron (NM_001079673, intron 24 of 25) intron (NM_001079673, intron 24 of 25) -18203 NM_001507 2862 Hs.248126 NM_001507 ENSG00000102539 MLNR GPR38|MTLR1 motilin receptor protein-coding 313-13 chr14 47126624 47126992 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 5 of 16) intron (NM_001113498, intron 5 of 16) 216438 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 241-16 chr12 12252226 12252515 + 1.33333 NA intron (NM_002336, intron 1 of 22).2 MER92-int|LTR|ERV1 14674 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 174.667-138 chr5 21264062 21264266 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -195316 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 219.667-25 chr15 68477390 68477700 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -40828 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 250.666-20 chr20 31316174 31316452 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -7728 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 178.333-70 chr19 49680344 49680544 + 1.33333 NA intron (NR_033397, intron 3 of 11) intron (NR_033397, intron 3 of 11) -1673 NR_049811 100847074 NR_049811 ENSG00000274306 MIR5088 mir-5088 microRNA 5088 ncRNA 376.666-7 chr3 101313515 101314199 + 1.33333 NA intron (NM_016247, intron 2 of 18) L1ME1|LINE|L1 6718 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 244.333-86 chr5 166518712 166519062 + 1.33333 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 407483 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 274-13 chr13 20632021 20632325 + 1.33333 NA intron (NR_148465, intron 15 of 20) intron (NR_148465, intron 15 of 20) 65016 NM_001353575 8100 Hs.187376 NM_006531 ENSG00000032742 IFT88 D13S1056E|DAF19|TG737|TTC10|hTg737 intraflagellar transport 88 protein-coding 190-24 chr12 27938635 27938821 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31248 NM_198964 5744 Hs.591159 NM_002820 ENSG00000087494 PTHLH BDE2|HHM|PLP|PTHR|PTHRP parathyroid hormone like hormone protein-coding 228.666-14 chr13 49590705 49590923 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -5231 NM_001352504 55213 Hs.508021 NM_018191 ENSG00000136144 RCBTB1 CLLD7|CLLL7|GLP|RDEOA RCC1 and BTB domain containing protein 1 protein-coding 204.667-57 chr17 69048364 69048661 + 1.33333 NA intron (NM_080283, intron 3 of 38) HAL1M8|LINE|L1 12415 NM_080283 10350 Hs.131686 NM_080283 ENSG00000154258 ABCA9 EST640918 ATP binding cassette subfamily A member 9 protein-coding 368.666-3 chr10 112478187 112478600 + 1.33333 NA intron (NM_001365712, intron 3 of 8) MIRc|SINE|MIR -30790 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 199.667-156 chrX 76645751 76646050 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 218190 NM_020932 57692 Hs.8453 NM_020932 ENSG00000198934 MAGEE1 DAMAGE|HCA1 MAGE family member E1 protein-coding 184.666-13 chr15 96082584 96082733 + 1.33333 NA non-coding (NR_158193, exon 8 of 8) non-coding (NR_158193, exon 8 of 8) 45183 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 348.666-10 chr2 228827160 228827554 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -215962 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 188-49 chr18 41324406 41324605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 196172 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 259.666-18 chr17 59263069 59263311 + 1.33333 NA intron (NM_182569, intron 6 of 9) AluJr4|SINE|Alu 42679 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 199.666-31 chr21 10696564 10696750 + 1.33333 NA Intergenic (TTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 175143 NM_199260 7179 Hs.122986 NM_199259 ENSG00000274391 TPTE CT44|PTEN2 transmembrane phosphatase with tensin homology protein-coding 240.333-50 chr2 105263167 105263532 + 1.33333 NA intron (NM_001328646, intron 11 of 11) intron (NM_001328646, intron 11 of 11) 21606 NM_007227 11250 Hs.590903 NM_007227 ENSG00000135973 GPR45 PSP24|PSP24(ALPHA)|PSP24A G protein-coupled receptor 45 protein-coding 116.667-17 chr10 129579232 129579378 + 1.33333 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) intron (NM_002412, intron 2 of 4) 112064 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 252.666-50 chrX 99559943 99560235 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 850184 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 144.666-8 chr2 141788041 141788196 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 343583 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 197.666-15 chr12 86027988 86028155 + 1.33333 NA intron (NM_001351289, intron 2 of 5) intron (NM_001351289, intron 2 of 5) 153776 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 170.667-135 chr5 84264877 84265116 + 1.33333 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 119871 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 408.333-5 chr2 7731904 7732299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 167554 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 289-20 chr4 32652000 32652282 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 301103 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 230.666-52 chrX 79149441 79149645 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21429 NM_032553 84636 Hs.326713 NM_032553 ENSG00000147138 GPR174 FKSG79|GPCR17|LYPSR3 G protein-coupled receptor 174 protein-coding 289.333-45 chr4 172647757 172648171 + 1.33333 NA intron (NR_125894, intron 2 of 2) intron (NR_125894, intron 2 of 2) 40953 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 154.667-234 chr3 23473248 23473449 + 1.33333 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 270021 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 325.333-48 chr7 92491256 92491807 + 1.33333 NA intron (NM_001282677, intron 19 of 22) intron (NM_001282677, intron 19 of 22) -13585 NM_001130925 30816 NM_014590 ENSG00000242950 ERVW-1 ENV|ENVW|ERVWE1|HERV-7q|HERV-W-ENV|HERV7Q|HERVW|HERVWENV endogenous retrovirus group W member 1, envelope protein-coding 199.333-218 chr5 16083843 16084020 + 1.33333 NA intron (NM_001102562, intron 3 of 3) intron (NM_001102562, intron 3 of 3) 95860 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 305-13 chr21 16356442 16357024 + 1.33333 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -62470 NR_136546 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 179.333-142 chr4 84994012 84994253 + 1.33333 NA intron (NR_152782, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 26648 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 170-78 chr3 102737595 102737811 + 1.33333 NA Intergenic HERVL18-int|LTR|ERVL 302688 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 289.666-11 chr22 27746475 27746896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55071 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 129-88 chr3 109225641 109225877 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47594 NR_026767 677779 Hs.618669 NM_001040054 ENSG00000214381 LINC00488 C3orf66 long intergenic non-protein coding RNA 488 ncRNA 229.333-47 chr16 25835185 25835388 + 1.33333 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) intron (NM_006040, intron 1 of 1) 143327 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 167.333-282 chrX 93480257 93480454 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 193223 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 342.999-2 chr3 4890331 4890645 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16013 NR_125914 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 204.666-6 chr1 191408681 191408834 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -180259 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 178.667-124 chr5 11262974 11263205 + 1.33333 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 325828 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 211.666-8 chr11 78568445 78568691 + 1.33333 NA intron (NM_024678, intron 3 of 13) intron (NM_024678, intron 3 of 13) 6296 NM_024678 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 207.333-21 chr1 209957870 209958053 + 1.33333 NA intron (NM_001256006, intron 3 of 8) (TTTCTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19744 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 255-68 chr5 130767885 130768184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 397222 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 202.667-71 chr17 73940406 73940705 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -112018 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 204-14 chr1 115971201 115971455 + 1.33333 NA intron (NR_125970, intron 1 of 4) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -5185 NM_018420 55356 Hs.125482 NM_018420 ENSG00000163393 SLC22A15 FLIPT1|PRO34686 solute carrier family 22 member 15 protein-coding 225.333-30 chr12 952466 952722 + 1.33333 NA intron (NM_001297419, intron 1 of 11) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -2872 NR_123713 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 290.666-10 chr14 51276685 51277090 + 1.33333 NA Intergenic MER51B|LTR|ERV1 36640 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 348.333-6 chr10 58650438 58650849 + 1.33333 NA intron (NM_001080512, intron 2 of 20) intron (NM_001080512, intron 2 of 20) -64372 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 296-44 chr3 112890631 112891027 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44879 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 253.333-90 chr6 65335123 65335326 + 1.33333 NA intron (NM_198283, intron 9 of 9) LTR51|LTR|ERV1 33806 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 215.333-25 chr10 78607471 78607786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 340286 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 282.999-6 chr5 26606627 26606965 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 431790 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 178-25 chr11 56949171 56949396 + 1.33333 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -39631 NM_001005323 390181 Hs.554520 NM_001005323 ENSG00000181273 OR5AK2 - olfactory receptor family 5 subfamily AK member 2 protein-coding 269.333-28 chr16 84352662 84352964 + 1.33333 NA Intergenic (TGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15710 NM_001286527 9914 Hs.6168 NM_014861 ENSG00000064270 ATP2C2 SPCA2 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2 protein-coding 204.333-73 chr17 56454442 56454719 + 1.33333 NA intron (NM_001370326, intron 11 of 20) HAL1|LINE|L1 -139119 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 279.333-4 chr1 118484377 118484790 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -299355 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 283.666-8 chr5 131779907 131780241 + 1.33333 NA intron (NM_133372, intron 1 of 17) intron (NM_133372, intron 1 of 17) 16943 NM_001008738 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 228.666-26 chr22 22363722 22363903 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65714 NR_027293 96610 Hs.449601 NM_080926 BMS1P20 IGL|IGLV|IGLV1 BMS1 pseudogene 20 pseudo 195-64 chr2 161974201 161974424 + 1.33333 NA exon (NM_001354441, exon 25 of 28) exon (NM_001354441, exon 25 of 28) 99903 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 460.666 chr15 88052248 88052717 + 1.33333 NA intron (NM_001007156, intron 13 of 15) intron (NM_001007156, intron 13 of 15) -106214 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 207-29 chr13 76227899 76228173 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -292904 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 137.333-25 chr11 60630685 60630893 + 1.33333 NA intron (NR_026946, intron 3 of 6) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 15038 NR_026946 283197 Hs.372650 NM_174939 ENSG00000181995 LINC00301 C11orf64|NCRNA00301 long intergenic non-protein coding RNA 301 ncRNA 180.333-157 chrX 122901398 122901683 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -282703 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 295.333-13 chr14 62889783 62890070 + 1.33333 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 155532 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 224-97 chr7 27761030 27761251 + 1.33333 NA intron (NM_001206902, intron 3 of 15) intron (NM_001206902, intron 3 of 15) 21045 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 188.333-67 chr2 24142304 24142576 + 1.33333 NA intron (NM_001145710, intron 5 of 10) intron (NM_001145710, intron 5 of 10) 18971 NM_001145710 375190 Hs.710370 NM_198553 ENSG00000219626 FAM228B - family with sequence similarity 228 member B protein-coding 236.333-41 chr2 27959772 27960075 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) intron (NM_199193, intron 4 of 13) -36444 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 155.333-217 chr22 34911664 34911897 + 1.33333 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 86136 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 224-89 chr6 115787723 115787920 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -143986 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 189.333-115 chr21 18543835 18544005 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -140135 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 199.666-24 chr2 66532000 66532255 + 1.33333 NA intron (NM_002398, intron 8 of 12) intron (NM_002398, intron 8 of 12) -41903 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 196.333-117 chr3 142104669 142104834 + 1.33333 NA intron (NM_001178139, intron 1 of 12) intron (NM_001178139, intron 1 of 12) 44793 NM_001178138 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 321.666-3 chr10 59320325 59320775 + 1.33333 NA intron (NM_001347852, intron 4 of 12) MER57B1|LTR|ERV1 41999 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 250.666-6 chr11 33555945 33556204 + 1.33333 NA intron (NM_012194, intron 6 of 20) L1MB4|LINE|L1 144666 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 244.666-49 chr8 42130162 42130385 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -22673 NM_001134296 10947 Hs.654529 NM_006803 ENSG00000070718 AP3M2 AP47B|CLA20|P47B adaptor related protein complex 3 subunit mu 2 protein-coding 297.666-11 chr4 35539326 35539687 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 704433 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 192.666-30 chr18 52646644 52646846 + 1.33333 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) MER21C|LTR|ERVL 306548 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 217.333-121 chr5 100576578 100576784 + 1.33333 NA intron (NM_198507, intron 2 of 2) intron (NM_198507, intron 2 of 2) 41307 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 201-26 chr11 108327598 108327780 + 1.33333 NA exon (NM_000051, exon 48 of 63) exon (NM_000051, exon 48 of 63) 104160 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 198-180 chr8 68536857 68537080 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001195639, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001195639, exon 7 of 7) -205477 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 211-3 chr1 52764964 52765155 + 1.33333 NA intron (NM_024646, intron 2 of 13) FLAM_C|SINE|Alu 38606 NM_024646 79699 Hs.476280 NM_024646 ENSG00000162378 ZYG11B ZYG11 zyg-11 family member B, cell cycle regulator protein-coding 319-20 chr5 35765330 35765692 + 1.33333 NA intron (NM_024867, intron 26 of 36) intron (NM_024867, intron 26 of 36) -91380 NR_120485 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 194.667-13 chr1 188288142 188288387 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 844636 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 447.666-5 chr8 86601981 86602376 + 1.33333 NA intron (NM_019098, intron 15 of 17) MIR1_Amn|SINE|MIR 87743 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 218.666-27 chr14 57081034 57081218 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 187779 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 191.667-87 chr3 156386783 156387004 + 1.33333 NA intron (NM_172159, intron 1 of 13) intron (NM_172159, intron 1 of 13) 60043 NR_046618 100874084 Hs.131282 NR_046618 ENSG00000242370 KCNAB1-AS1 - KCNAB1 antisense RNA 1 ncRNA 215-83 chr9 11172076 11172253 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 558958 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 195.333-100 chr18 53187691 53187889 + 1.33333 NA intron (NM_005215, intron 9 of 28) intron (NM_005215, intron 9 of 28) -49311 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 240.333-93 chr8 65544777 65545189 + 1.33333 NA intron (NR_033893, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 17683 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 175.333-26 chr12 20840832 20841023 + 1.33333 NA intron (NM_001349920, intron 1 of 13) L1MCa|LINE|L1 18379 NM_001349920 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 473.999-4 chr6 149810985 149811413 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_005389, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_005389, exon 8 of 8) -52299 NR_045126 100652739 Hs.642734 NR_045126 ENSG00000223701 RAET1E-AS1 RAET1G-AS1 RAET1E antisense RNA 1 ncRNA 395-7 chr16 59055914 59056396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -321839 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 376-20 chr7 109410521 109411041 + 1.33333 NA Intergenic (ATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -526194 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 173.333-116 chr3 13362753 13362951 + 1.33333 NA intron (NM_024923, intron 14 of 39) L2a|LINE|L2 57470 NM_024923 23225 Hs.475525 NM_024923 ENSG00000132182 NUP210 GP210|POM210 nucleoporin 210 protein-coding 204-80 chr17 65301139 65301298 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -156323 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 147.333-159 chr2 11240502 11240802 + 1.33333 NA intron (NM_001321643, intron 4 of 32) L1MB7|LINE|L1 85185 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 210.666-73 chr3 193096558 193096761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -144563 NM_001366112 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 210-80 chr20 14034674 14034838 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 2 of 17) MIR|SINE|MIR 39240 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 342.333-11 chr18 10591094 10591382 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 35182 NR_146509 102724470 NR_146509 LINC01887 - long intergenic non-protein coding RNA 1887 ncRNA 200-3 chr1 53888555 53888715 + 1.33333 NA intron (NR_135075, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 1162 NR_036640 54432 Hs.11923 NM_018982 ENSG00000058799 YIPF1 DJ167A19.1|FinGER1 Yip1 domain family member 1 protein-coding 203.666-55 chr8 133028928 133029162 + 1.33333 NA intron (NM_003235, intron 40 of 47) L2|LINE|L2 17536 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 423.333-6 chr14 43925158 43925567 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 581921 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 284-37 chr3 159477182 159477647 + 1.33333 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) L1MA7|LINE|L1 194768 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 258.666-45 chr8 27657130 27657505 + 1.33333 NA intron (NM_182826, intron 4 of 5) L1PA16|LINE|L1 23257 NM_182826 51435 Hs.128856 NM_016240 ENSG00000168077 SCARA3 APC7|CSR|CSR1|MSLR1|MSRL1 scavenger receptor class A member 3 protein-coding 212-53 chr14 73638718 73638914 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6170 NM_001201366 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 144-13 chr10 25614064 25614261 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -37550 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 353.666-9 chr6 154986892 154987317 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -103185 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 150.333-60 chr11 46916746 46916988 + 1.33333 NA intron (NM_002334, intron 1 of 37) intron (NM_002334, intron 1 of 37) 1683 NM_002334 4038 Hs.4930 NM_002334 ENSG00000134569 LRP4 CLSS|CMS17|LRP-4|LRP10|MEGF7|SOST2 LDL receptor related protein 4 protein-coding 212.666-36 chr19 57640084 57640251 + 1.33333 NA intron (NM_001265599, intron 4 of 4) intron (NM_001265599, intron 4 of 4) 6999 NM_198855 10520 Hs.590977 NM_006385 ENSG00000121417 ZNF211 C2H2-25|CH2H2-25|ZNF-25 zinc finger protein 211 protein-coding 116.333-182 chr5 159741065 159741216 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 130244 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 238-55 chr2 209094966 209095242 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -328943 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 161-73 chr4 155390043 155390241 + 1.33333 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -13177 NM_001039580 79884 Hs.61271 NM_001039580 ENSG00000164114 MAP9 ASAP microtubule associated protein 9 protein-coding 168-26 chr13 32970096 32970252 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46249 NM_004795 9365 Hs.524953 NM_004795 ENSG00000133116 KL HFTC3 klotho protein-coding 160 chr1 40973497 40973739 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6078 NM_001905 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 232.999-6 chr5 142100991 142101218 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -7675 NM_030571 80762 Hs.9788 NM_030571 ENSG00000131507 NDFIP1 N4WBP5 Nedd4 family interacting protein 1 protein-coding 351.666-18 chr8 59151817 59152528 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32962 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 210-125 chr5 141605074 141605284 + 1.33333 NA intron (NM_005219, intron 1 of 27) intron (NM_005219, intron 1 of 27) 13821 NM_001079812 1729 Hs.529451 NM_005219 ENSG00000131504 DIAPH1 DFNA1|DIA1|DRF1|LFHL1|SCBMS|hDIA1 diaphanous related formin 1 protein-coding 233.333-126 chr7 113563056 113563340 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 355811 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 196-191 chr8 139560032 139560288 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 142963 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 191-61 chr7 6023642 6023828 + 1.33333 NA TTS (NM_001362787) TTS (NM_001362787) 6858 NR_145771 109616999 NR_145771 ENSG00000207217 SNORA80D - small nucleolar RNA, H/ACA box 80D snoRNA 253.333-67 chr21 29723806 29724145 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -24200 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 225-39 chr2 171566226 171566401 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43839 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 198.333-142 chr4 69458494 69458699 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37309 NM_001297615 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 222.666-56 chr8 126716556 126716755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -158177 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 358.333-19 chr22 27060070 27060576 + 1.33333 NA exon (NM_001318329, exon 1 of 2) exon (NM_001318329, exon 1 of 2) 195 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 173.333-78 chr18 50227268 50227469 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_145020, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_145020, exon 8 of 8) -32221 NM_001080467 4645 Hs.720076 NM_001080467 ENSG00000167306 MYO5B - myosin VB protein-coding 234.666-8 chr1 186335736 186335920 + 1.33333 NA intron (NM_003292, intron 33 of 50) intron (NM_003292, intron 33 of 50) 39425 NM_003292 7175 Hs.279640 NM_003292 ENSG00000047410 TPR - translocated promoter region, nuclear basket protein protein-coding 241.333-19 chr10 84861880 84862229 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 336851 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 301 chr1 31190950 31191361 + 1.33333 NA intron (NM_024522, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 48732 NM_024522 79570 Hs.470259 NM_024522 ENSG00000084628 NKAIN1 FAM77C sodium/potassium transporting ATPase interacting 1 protein-coding 131.333-89 chr2 85154277 85154487 + 1.33333 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) intron (NM_031283, intron 3 of 11) 20990 NM_031283 83439 Hs.516297 NM_031283 ENSG00000152284 TCF7L1 TCF-3|TCF3 transcription factor 7 like 1 protein-coding 225.666-33 chr9 30348564 30348822 + 1.33333 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 59761 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 146-88 chr3 105732302 105732553 + 1.33333 NA intron (NM_001321822, intron 9 of 19) intron (NM_001321822, intron 9 of 19) 135164 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 235.333-132 chr9 72656898 72657131 + 1.33333 NA intron (NM_138691, intron 5 of 23) L1ME1|LINE|L1 135213 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 397.666-4 chr22 25953390 25953985 + 1.33333 NA intron (NM_001318245, intron 38 of 43) intron (NM_001318245, intron 38 of 43) 211499 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 171.333-168 chr6 73349589 73349772 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 4596 NM_001025290 340168 Hs.125331 NM_001025290 ENSG00000203909 DPPA5 ESG1 developmental pluripotency associated 5 protein-coding 207.666-20 chr17 58348397 58348563 + 1.33333 NA intron (NR_073470, intron 2 of 4) intron (NR_073470, intron 2 of 4) 3721 NR_073470 6827 Hs.439481 NM_003168 ENSG00000213246 SUPT4H1 SPT4|SPT4H|SUPT4H|Supt4a SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit protein-coding 199-24 chr14 24813198 24813434 + 1.33333 NA intron (NM_001351943, intron 6 of 6) intron (NM_001351943, intron 6 of 6) -179126 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 203.666-32 chr2 126983770 126983939 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E2-int|LTR|ERVL-MaLR 84964 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 205.666-40 chr4 172787944 172788174 + 1.33333 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) -61181 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 189-68 chr4 70928658 70928835 + 1.33333 NA intron (NM_173468, intron 1 of 5) intron (NM_173468, intron 1 of 5) 26377 NM_173468 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 197.333-31 chr11 39399128 39399317 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 750364 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 242.667-31 chr14 21301106 21301463 + 1.33333 NA intron (NM_020366, intron 3 of 23) intron (NM_020366, intron 3 of 23) 13307 NM_020366 57096 Hs.126035 NM_020366 ENSG00000092200 RPGRIP1 CORD13|LCA6|RGI1|RGRIP|RPGRIP|RPGRIP1d RPGR interacting protein 1 protein-coding 338-33 chrUn_KI270590v1 4247 4586 + 1.33333 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 288-9 chr1 191181057 191181410 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47265 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 236.999-3 chr14 68293252 68293525 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 335399 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 204.666-2 chr1 42393069 42393275 + 1.33333 NA intron (NM_173642, intron 1 of 4) LTR16C|LTR|ERVL 12380 NM_173642 284716 Hs.420244 NM_173642 ENSG00000177181 RIMKLA FAM80A|NAAGS|NAAGS-II ribosomal modification protein rimK like family member A protein-coding 430.333-4 chr2 69474337 69474780 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_014911, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_014911, exon 22 of 22) -36930 NM_001002756 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 205.333-230 chr7 125023768 125024009 + 1.33333 NA intron (NR_125718, intron 4 of 10) L1MB7|LINE|L1 -93905 NR_003103 25913 Hs.31968 NM_015450 ENSG00000128513 POT1 CMM10|GLM9|HPOT1 protection of telomeres 1 protein-coding 254.666-15 chr2 17201808 17202157 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 316458 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 283.666-4 chr15 62959511 62959903 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83040 NM_001018004 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 201.333-68 chr12 7317353 7317544 + 1.33333 NA intron (NM_001080454, intron 4 of 12) L2|LINE|L2 13116 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 333.667-19 chr7 158956172 158956573 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51982 NR_024394 154822 Hs.544783 NM_198345 ENSG00000231419 LINC00689 - long intergenic non-protein coding RNA 689 ncRNA 313.333-37 chr6 51040893 51041325 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 222238 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 244.667-10 chr1 232943580 232943922 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6860 NM_032324 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 169.333-279 chr8 137052286 137052471 + 1.33333 NA Intergenic (AAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 361210 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 150.666-15 chr5 39921109 39921263 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -131105 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 428.666-6 chr3 114202264 114202760 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -3105 NM_001282563 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 174-12 chr10 72191593 72191772 + 1.33333 NA intron (NM_001369110, intron 5 of 8) AluSq2|SINE|Alu 24274 NM_001369088 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 223.333-8 chr1 113740511 113740692 + 1.33333 NA intron (NM_001323043, intron 3 of 18) L1MA5|LINE|L1 18554 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 310.333-23 chr2 103623152 103623657 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -638975 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 170-37 chr14 73328464 73328623 + 1.33333 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) L1ME1|LINE|L1 -82542 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 286.666-9 chr2 149056903 149057360 + 1.33333 NA intron (NM_001317006, intron 1 of 4) intron (NM_001317006, intron 1 of 4) 18432 NM_177964 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 206-4 chr1 41237259 41237484 + 1.33333 NA intron (NM_001172218, intron 1 of 15) intron (NM_001172218, intron 1 of 15) 4935 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 321.333-14 chr11 100300850 100301165 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 19 of 23) MIRb|SINE|MIR -386281 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 197-123 chr9 15896236 15896400 + 1.33333 NA intron (NM_001355547, intron 23 of 24) intron (NM_001355547, intron 23 of 24) 332340 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 211.333-63 chr14 71404413 71404608 + 1.33333 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) AluSx1|SINE|Alu 6173 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 205.333-118 chr2 38817626 38817808 + 1.33333 NA intron (NM_001329963, intron 19 of 23) AluJb|SINE|Alu 39507 NM_024775 79833 Hs.143818 NM_024775 ENSG00000152147 GEMIN6 - gem nuclear organelle associated protein 6 protein-coding 189-45 chr2 171346060 171346337 + 1.33333 NA intron (NM_001321158, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 87792 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 249.333-54 chr2 89780168 89780596 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -142475 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 210.667-22 chr10 68350211 68350481 + 1.33333 NA intron (NR_103476, intron 16 of 18) L1MC5a|LINE|L1 -17418 NM_022129 64081 Hs.198158 NM_022129 ENSG00000108187 PBLD HEL-S-306|MAWBP|MAWDBP phenazine biosynthesis like protein domain containing protein-coding 240.333-20 chr11 18997787 18998163 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 62042 NM_001303615 117194 Hs.350566 NM_054030 ENSG00000183695 MRGPRX2 MGRG3|MRGX2 MAS related GPR family member X2 protein-coding 200.333-98 chr3 133946395 133946548 + 1.33333 NA intron (NM_005630, intron 9 of 13) intron (NM_005630, intron 9 of 13) -16659 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 159.333-2 chr1 18495380 18495588 + 1.33333 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 14554 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 236.999-6 chr3 24665902 24666120 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -163312 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 163-60 chr4 87180446 87180705 + 1.33333 NA intron (NR_120447, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 39693 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 203.333-202 chr5 5007481 5007634 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -26802 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 218.667-8 chr1 168968576 168968866 + 1.33333 NA intron (NR_104091, intron 3 of 4) L1MC4a|LINE|L1 118284 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 275.666-14 chr3 163765299 163765708 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 406053 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 202-116 chr3 99636000 99636289 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2450 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 179.333-61 chr14 46282615 46282841 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -188631 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 259-52 chr8 116844834 116845288 + 1.33333 NA TTS (NM_006265) TTS (NM_006265) -29363 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 210.666-53 chr2 52060143 52060367 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) AluSx3|SINE|Alu -310393 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 296.333-5 chr1 165069945 165070371 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 286083 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 199.333-141 chr2 163681239 163681408 + 1.33333 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) MIR3|SINE|MIR 54685 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 369.333-27 chr8 114385461 114385950 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -948766 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 172-53 chr2 16591573 16591722 + 1.33333 NA intron (NM_030797, intron 2 of 11) intron (NM_030797, intron 2 of 11) 74187 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 231.666-13 chr18 7758178 7758370 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 190958 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 208.666-78 chr4 36398828 36399025 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27502 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 394-20 chr8 127762059 127762480 + 1.33333 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 26038 NM_002467 4609 Hs.202453 NM_002467 ENSG00000136997 MYC MRTL|MYCC|bHLHe39|c-Myc MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 202.333-80 chr18 72171744 72171995 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 372473 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 274.667-39 chr4 41854520 41854891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27906 NR_104143 101927074 Hs.611425 NR_104143 ENSG00000245870 LINC00682 - long intergenic non-protein coding RNA 682 ncRNA 218-25 chr13 92526807 92527088 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) L2b|LINE|L2 36784 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 207.333-192 chr4 19377180 19377397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -874617 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 200.666-74 chr21 30751805 30752031 + 1.33333 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 3510 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 190-69 chr2 221848169 221848382 + 1.33333 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -274073 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 295-40 chr6 20910932 20911332 + 1.33333 NA intron (NM_017774, intron 9 of 15) MIRb|SINE|MIR 376675 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 265.333-44 chr2 179174152 179174533 + 1.33333 NA intron (NM_178123, intron 4 of 17) intron (NM_178123, intron 4 of 17) 90490 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 210.667-38 chr14 44371955 44372248 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 135182 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 341-24 chr7 33499909 33500287 + 1.33333 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 370534 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 163.333-56 chr11 85643394 85643554 + 1.33333 NA Intergenic LTR42|LTR|ERVL -4445 NM_001244735 84233 Hs.533725 NM_032273 ENSG00000171202 TMEM126A OPA7 transmembrane protein 126A protein-coding 362.666-6 chr12 75244130 75244562 + 1.33333 NA intron (NR_149000, intron 1 of 1) intron (NR_149000, intron 1 of 1) 9606 NR_149000 100130268 Hs.524596 NR_149000 ENSG00000254451 LOC100130268 - uncharacterized LOC100130268 ncRNA 270.667-43 chr5 113403053 113403433 + 1.33333 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) intron (NM_001085377, intron 1 of 18) 31746 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 203.667-78 chr3 50876107 50876387 + 1.33333 NA intron (NM_004947, intron 3 of 52) intron (NM_004947, intron 3 of 52) 201167 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 172-102 chr7 25688752 25688976 + 1.33333 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) -18133 NR_157816 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 170.666-20 chr5 83694149 83694472 + 1.33333 NA intron (NM_001884, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 26545 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 218.666-29 chr14 62739277 62739474 + 1.33333 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) intron (NM_172375, intron 9 of 9) 306083 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 244.333-16 chr10 112727519 112727726 + 1.33333 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) 93452 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 311.333-22 chr17 59058462 59058905 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 12 of 23) AluJb|SINE|Alu 48197 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 246.333-45 chr2 8820529 8820936 + 1.33333 NA intron (NM_001348732, intron 2 of 28) intron (NM_001348732, intron 2 of 28) 16881 NM_001348742 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 214-78 chr20 34104117 34104462 + 1.33333 NA intron (NM_003908, intron 2 of 8) intron (NM_003908, intron 2 of 8) 7954 NM_001316363 8894 Hs.429180 NM_003908 ENSG00000125977 EIF2S2 EIF2|EIF2B|EIF2beta|PPP1R67|eIF-2-beta eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta protein-coding 283.333-48 chr3 65611763 65612097 + 1.33333 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) MIRb|SINE|MIR -281886 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 184.666-34 chr6 99045871 99046016 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -78666 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 195.333-38 chr10 102298502 102298699 + 1.33333 NA intron (NM_001199378, intron 3 of 39) intron (NM_001199378, intron 3 of 39) 53068 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 296.666 chr1 212036254 212036567 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001199809) promoter-TSS (NM_001199809) 662 NM_016448 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 188.667-122 chr5 37752042 37752304 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 17 of 17) intron (NM_001345998, intron 17 of 17) 82649 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 343.333-26 chr5 75973503 75973794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -109735 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 470.333-2 chr13 48656573 48657018 + 1.33333 NA intron (NM_001308471, intron 1 of 1) intron (NM_001308471, intron 1 of 1) 2866 NM_001308469 57105 Hs.253706 NM_020377 ENSG00000152207 CYSLTR2 CYSLT2|CYSLT2R|GPCR21|HG57|HPN321|KPG_011|PSEC0146|hGPCR21 cysteinyl leukotriene receptor 2 protein-coding 231.333-70 chr3 61697457 61697682 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 1 of 29) LTR48|LTR|ERV1 135998 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 174-18 chr11 110409037 110409265 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20797 NM_004109 2230 Hs.744 NM_004109 ENSG00000137714 FDX1 ADX|FDX|LOH11CR1D ferredoxin 1 protein-coding 210.333-155 chr7 14611894 14612148 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 15 of 24) intron (NM_001350717, intron 15 of 24) 229429 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 213-61 chr4 62134874 62135110 + 1.33333 NA intron (NR_110595, intron 3 of 7) L2c|LINE|L2 26773 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 208-78 chr2 46919841 46920079 + 1.33333 NA intron (NM_001288953, intron 2 of 20) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -3848 NM_001171507 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 223.333-26 chr11 83198462 83198750 + 1.33333 NA exon (NM_001300976, exon 2 of 6) exon (NM_001300976, exon 2 of 6) 4894 NR_125355 338699 Hs.503438 NM_182603 ENSG00000137494 ANKRD42 PPP1R79|SARP ankyrin repeat domain 42 protein-coding 138-110 chr7 54999376 54999577 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19541 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 302.666-15 chr3 61564438 61564685 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 1 of 29) intron (NM_002841, intron 1 of 29) 2990 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 341.666-4 chr17 59785006 59785327 + 1.33333 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) intron (NM_001329400, intron 5 of 9) -56100 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 200.666-6 chr1 107099868 107100048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40130 NM_014917 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 192-38 chr11 113779005 113779229 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001101389) promoter-TSS (NM_001101389) -679 NM_001101389 644672 Hs.705360 NM_001101389 ENSG00000228607 CLDN25 - claudin 25 protein-coding 214.666-76 chr9 36861911 36862081 + 1.33333 NA intron (NM_001280549, intron 6 of 7) intron (NM_001280549, intron 6 of 7) 2312 NR_039766 100616278 NR_039766 ENSG00000264922 MIR4540 - microRNA 4540 ncRNA 316.666-3 chr10 103980704 103981230 + 1.33333 NA intron (NM_001304743, intron 1 of 17) L1MB3|LINE|L1 13827 NM_001304743 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 163.333-115 chr16 77297541 77297712 + 1.33333 NA intron (NM_199355, intron 17 of 22) intron (NM_199355, intron 17 of 22) 98218 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 252-116 chr9 107680522 107680864 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -190924 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 197.666-20 chr15 101711332 101711510 + 1.33333 NA intron (NM_152334, intron 5 of 18) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 13052 NM_152334 123283 Hs.657163 NM_152334 ENSG00000185418 TARSL2 - threonyl-tRNA synthetase like 2 protein-coding 257.333-100 chr8 84455453 84455778 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 40131 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 176-106 chr8 137453100 137453265 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39594 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 175-36 chr19 30094212 30094439 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 152086 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 259.333-6 chr1 163202607 163202933 + 1.33333 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) intron (NM_001254748, intron 2 of 5) 146 NM_001254749 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 154.666-6 chr20 31780326 31780483 + 1.33333 NA intron (NM_012112, intron 10 of 17) intron (NM_012112, intron 10 of 17) -38971 NM_033118 85366 Hs.86092 NM_033118 ENSG00000101306 MYLK2 KMLC|MLCK|MLCK2|skMLCK myosin light chain kinase 2 protein-coding 201-56 chr2 88345298 88345469 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 107310 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 156-53 chr15 67840071 67840241 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_104080).5 promoter-TSS (NR_104080).5 -111 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 331.666-21 chr7 12545503 12545876 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -25031 NR_156701 85477 Hs.633359 NM_033128 ENSG00000006747 SCIN - scinderin protein-coding 248.666-36 chr7 105266231 105266444 + 1.33333 NA intron (NM_182692, intron 2 of 15) intron (NM_182692, intron 2 of 15) 2740 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 237.333-46 chr17 64183234 64183553 + 1.33333 NA intron (NM_018469, intron 5 of 11) L1MB8|LINE|L1 37054 NR_002995 677842 Hs.405444 NR_002995 ENSG00000277887 SNORA50C ACA62|SNORA76|SNORA76C small nucleolar RNA, H/ACA box 50C snoRNA 188.667-126 chr5 81842031 81842279 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -90902 NM_001256734 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 207-32 chr14 47353187 47353469 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) LTR43|LTR|ERV1 -10082 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 231.333-35 chr12 67891317 67891562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37796 NR_120456 101927922 Hs.450769 NR_120456 ENSG00000255772 LINC01479 HRAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1479 ncRNA 151.666-4 chr3 114325271 114325557 + 1.33333 NA non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) -8845 NR_030293 693153 NR_030293 ENSG00000284134 MIR568 MIRN568|hsa-mir-568 microRNA 568 ncRNA 204.333-117 chr21 18422052 18422343 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -18412 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 204-177 chr6 100146931 100147193 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -152824 NM_032503 84539 Hs.591342 NM_032503 ENSG00000152034 MCHR2 GPR145|GPRv17|MCH-2R|MCH-R2|MCH2|MCH2R|MCHR-2|SLT melanin concentrating hormone receptor 2 protein-coding 191.666-18 chr5 25296813 25296981 + 1.33333 NA intron (NR_136209, intron 1 of 3) intron (NR_136209, intron 1 of 3) 105944 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 239.333-56 chr2 115219323 115219606 + 1.33333 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) 57309 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 229.666-14 chr16 3321231 3321468 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15137 NM_001324041 7627 Hs.513292 NM_153028 ENSG00000162086 ZNF75A - zinc finger protein 75a protein-coding 134-112 chr8 136349138 136349266 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -181596 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 243.333-34 chr15 62412229 62412597 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69384 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 281.333-48 chr5 39697483 39697874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 177247 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 199.333-274 chr8 90871288 90871569 + 1.33333 NA intron (NM_022351, intron 3 of 12) L1M5|LINE|L1 79653 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 210.667-90 chr3 103706245 103706561 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -182287 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 217.333-149 chr8 85112504 85112672 + 1.33333 NA intron (NM_033402, intron 3 of 18) intron (NM_033402, intron 3 of 18) 5350 NM_033402 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 215-42 chr2 159288006 159288306 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -1453 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 173.333-33 chr11 25594444 25594604 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -594599 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 310.666-28 chrX 46045964 46046309 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -194646 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 212.999-5 chr6 22626120 22626317 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 56652 NM_138574 154150 Hs.629246 NM_138574 ENSG00000112273 HDGFL1 HRP-1|Hdgfrp1|PWWP1|dJ309H15.1 HDGF like 1 protein-coding 264.667-29 chr14 63061647 63062088 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -16409 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 189.333-108 chr2 196148485 196148698 + 1.33333 NA intron (NM_004226, intron 3 of 7) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 22987 NM_004226 9262 Hs.88297 NM_004226 ENSG00000081320 STK17B DRAK2 serine/threonine kinase 17b protein-coding 124.666-2 chr2 88722434 88722588 + 1.33333 NA intron (NM_144563, intron 3 of 8) LTR8|LTR|ERV1 30838 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 196.666-78 chr4 62866280 62866429 + 1.33333 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -704589 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 292-24 chr19 50907937 50908262 + 1.33333 NA intron (NR_126566, intron 4 of 4) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 2639 NM_001302961 9622 Hs.218366 NM_004917 ENSG00000167749 KLK4 AI2A1|ARM1|EMSP|EMSP1|KLK-L1|PRSS17|PSTS|kallikrein kallikrein related peptidase 4 protein-coding 200.666-117 chr8 52985742 52985963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45944 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 207.333-219 chr5 53263480 53263673 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 153734 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 166.666-2 chr1 166984454 166984621 + 1.33333 NA intron (NM_001286378, intron 1 of 12) L1MA8|LINE|L1 -4552 NM_001286377 84944 Hs.651245 NM_032858 ENSG00000143194 MAEL CT128|SPATA35 maelstrom spermatogenic transposon silencer protein-coding 323.666-10 chr6 51286089 51286382 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -335635 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 196.666-85 chr5 116962332 116962484 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -200199 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 197.333-142 chr22 25679887 25680059 + 1.33333 NA intron (NM_001362778, intron 8 of 19) intron (NM_001362778, intron 8 of 19) -62215 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 225.666-12 chr2 147505950 147506230 + 1.33333 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -338427 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 296.333-17 chr19 28618044 28618367 + 1.33333 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 11517 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 121-147 chrX 4608659 4608810 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 24838 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 283.333-4 chr1 165091188 165091646 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 264824 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 208.666-52 chr18 757606 757856 + 1.33333 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) AluSz|SINE|Alu -45067 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 201.666-9 chr12 45829122 45829300 + 1.33333 NA intron (NM_152641, intron 6 of 20) L1ME3A|LINE|L1 99502 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 594.333-2 chr12 124587532 124588072 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20190 NM_001206654 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 303.333-17 chr11 108368468 108368778 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_000051, exon 63 of 63) 3' UTR (NM_000051, exon 63 of 63) 98906 NM_152587 160140 Hs.653180 NM_152587 ENSG00000166323 C11orf65 - chromosome 11 open reading frame 65 protein-coding 189.333-87 chr2 12697153 12697422 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19585 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 351.333-26 chr5 87640094 87640436 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -21777 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 309.999-7 chr7 3868576 3868873 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -260961 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 242.333-68 chr3 65278454 65278822 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -590638 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 228.333-90 chr7 45393832 45394054 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -180197 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 204.333-147 chr4 166826737 166826987 + 1.33333 NA intron (NM_001040159, intron 6 of 10) intron (NM_001040159, intron 6 of 10) 407564 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 174.333-48 chr17 71117910 71118097 + 1.33333 NA intron (NR_104152, intron 3 of 3) intron (NR_104152, intron 3 of 3) 84176 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 309.666-15 chr7 7331385 7331795 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 76436 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 266-12 chr10 66142623 66142869 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) 571321 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 311.666-3 chr10 107775139 107775580 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 293934 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 208-152 chr6 141705257 141705548 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 383397 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 205.666-36 chr3 104372431 104372639 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -848419 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 352.333-4 chr10 86630418 86630759 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23959 NM_033282 94233 Hs.283922 NM_033282 ENSG00000122375 OPN4 MOP opsin 4 protein-coding 255-66 chr5 87795742 87796078 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 133868 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 202.666-105 chr6 105413594 105413792 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -10611 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 274.666-9 chr13 57287832 57288155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120796 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 276-42 chr21 29049415 29049788 + 1.33333 NA intron (NM_001032410, intron 16 of 18) AluJb|SINE|Alu 24047 NM_006585 10694 Hs.125113 NM_006585 ENSG00000156261 CCT8 C21orf112|Cctq|D21S246|PRED71 chaperonin containing TCP1 subunit 8 protein-coding 185.667-65 chr2 30951247 30951504 + 1.33333 NA intron (NM_024572, intron 6 of 14) L1MB5|LINE|L1 -143929 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 304-62 chr9 11387905 11388225 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 774859 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 122.666-2 chr5 147723996 147724112 + 1.33333 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) intron (NM_001270934, intron 1 of 20) 58674 NM_001282282 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 349.666-7 chr4 113340763 113341064 + 1.33333 NA intron (NM_001354275, intron 32 of 43) intron (NM_001354275, intron 32 of 43) 48074 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 203.333-164 chr22 35224763 35224981 + 1.33333 NA intron (NR_126356, intron 1 of 5) intron (NR_126356, intron 1 of 5) 6184 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 332.666-9 chr13 43079460 43079819 + 1.33333 NA intron (NM_013238, intron 4 of 5) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -33526 NR_047013 100874159 Hs.633241 NR_047013 LINC00400 - long intergenic non-protein coding RNA 400 ncRNA 203.667-93 chr5 56515606 56515903 + 1.33333 NA intron (NR_161255, intron 4 of 5) intron (NR_161255, intron 4 of 5) -33985 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 114.667-183 chr3 185589758 185589977 + 1.33333 NA intron (NM_021627, intron 1 of 16) AluJo|SINE|Alu 3572 NM_021627 59343 Hs.401388 NM_021627 ENSG00000163904 SENP2 AXAM2|SMT3IP2 SUMO specific peptidase 2 protein-coding 675.667 chr4 67158536 67159403 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 263031 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 193.666-24 chr2 39034693 39034885 + 1.33333 NA intron (NM_005633, intron 8 of 22) intron (NM_005633, intron 8 of 22) -74445 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 250-18 chr11 73110179 73110476 + 1.33333 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) L1MA3|LINE|L1 31991 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 203.666-59 chr9 86017753 86017999 + 1.33333 NA intron (NM_024635, intron 19 of 22) intron (NM_024635, intron 19 of 22) 76347 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 252-10 chr10 57158841 57159160 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 145559 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 231.333-84 chr4 163970467 163970667 + 1.33333 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) 227144 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 237.999-3 chr3 3163209 3163436 + 1.33333 NA intron (NM_001173482, intron 5 of 10) intron (NM_001173482, intron 5 of 10) 16395 NM_016302 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 244.666-15 chr13 105314404 105314778 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -151276 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 213.667-41 chr18 46794083 46794396 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -37186 NM_001307987 29906 Hs.465025 NM_013305 ENSG00000101638 ST8SIA5 SIAT8-E|SIAT8E|ST8SiaV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 protein-coding 280.333-15 chr17 64632159 64632584 + 1.33333 NA intron (NM_022739, intron 1 of 18) intron (NM_022739, intron 1 of 18) 29936 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 438.999-2 chr19 30293718 30294130 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -78460 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 184-95 chr6 90549056 90549321 + 1.33333 NA intron (NM_145331, intron 9 of 16) L2|LINE|L2 37884 NM_145332 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 203-110 chr8 117659290 117659595 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 138729 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 150.667-356 chr7 90715179 90715414 + 1.33333 NA intron (NM_001287136, intron 1 of 13) intron (NM_001287136, intron 1 of 13) 5480 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 209.333-79 chr15 92778309 92778498 + 1.33333 NA Intergenic (AATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17081 NR_033769 728619 Hs.684129 NR_033769 ASB9P1 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 pseudogene 1 pseudo 222-62 chr3 86869763 86870014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121261 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 135.333-182 chr7 90590511 90590692 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5720 NM_001287135 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 206-166 chr7 2597327 2597577 + 1.33333 NA intron (NM_001287501, intron 14 of 19) intron (NM_001287501, intron 14 of 19) -34534 NM_025250 80727 Hs.440899 NM_025250 ENSG00000136295 TTYH3 - tweety family member 3 protein-coding 251.333-21 chr12 11908631 11908894 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -141099 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 243.333-103 chr7 27568034 27568256 + 1.33333 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) L1ME1|LINE|L1 -47829 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 196.667-157 chr8 77154063 77154344 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -153159 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 255.333-92 chr7 1136482 1136791 + 1.33333 NA intron (NM_001134396, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 1611 NM_001318252 84310 Hs.653258 NM_032350 ENSG00000146540 C7orf50 YCR016W chromosome 7 open reading frame 50 protein-coding 280.666-11 chr2 98338543 98338824 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -7472 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 219.999-6 chr5 84029625 84029838 + 1.33333 NA intron (NM_001278642, intron 8 of 9) L3|LINE|CR1 -308876 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 194.667-157 chr8 130552956 130553237 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -109422 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 116.667-68 chr15 99708864 99709010 + 1.33333 NA intron (NM_001352615, intron 11 of 12) L2a|LINE|L2 24500 NM_001284417 145748 Hs.562568 NM_152449 ENSG00000183060 LYSMD4 - LysM domain containing 4 protein-coding 263.666-5 chr2 143368719 143369104 + 1.33333 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 239492 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 326-34 chr4 86205199 86205585 + 1.33333 NA intron (NM_001363657, intron 2 of 13) L1M5|LINE|L1 85586 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 156.667-101 chr14 46178911 46179097 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1PA3|LINE|L1 114845 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 178.666-17 chr5 133360187 133360338 + 1.33333 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) intron (NM_015082, intron 4 of 15) 67444 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 496-3 chr15 64190422 64191190 + 1.33333 NA intron (NM_001329605, intron 10 of 12) intron (NM_001329605, intron 10 of 12) -27651 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 189-84 chr7 8842629 8842801 + 1.33333 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 409106 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 197.333-95 chr18 30018792 30018992 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -280018 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 253.333-29 chr14 88318025 88318306 + 1.33333 NA intron (NM_021161, intron 1 of 6) intron (NM_021161, intron 1 of 6) 5104 NM_138317 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 200.666-23 chr11 82196112 82196289 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 207713 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 308.666-19 chr8 9711631 9712025 + 1.33333 NA intron (NM_003747, intron 11 of 26) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -29844 NR_030327 693182 NR_030327 ENSG00000207701 MIR597 MIRN597|hsa-mir-597|mir-597 microRNA 597 ncRNA 244.333-39 chr14 86918462 86918729 + 1.33333 NA intron (NR_038445, intron 3 of 4) intron (NR_038445, intron 3 of 4) 12817 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 214.999-11 chr8 87056180 87056365 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) MER91A|DNA|hAT-Tip100 189857 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 213-10 chr10 107412655 107412925 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -248084 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 153-126 chr7 31067102 31067339 + 1.33333 NA intron (NM_001199637, intron 3 of 13) intron (NM_001199637, intron 3 of 13) 14759 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 188.666-2 chr1 75008158 75008338 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120186 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 281.333-43 chr3 127880102 127880369 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -34997 NM_207335 166348 Hs.132087 NM_207335 ENSG00000187715 KBTBD12 KLHDC6 kelch repeat and BTB domain containing 12 protein-coding 219.999-2 chr1 184988822 184988987 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12623 NR_146489 101929069 Hs.497170 NR_146489 ENSG00000260976 LINC01633 GS1-120K12.4 long intergenic non-protein coding RNA 1633 ncRNA 336.333-4 chr1 246770882 246771335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18509 NR_015422 149134 Hs.720494 NM_207326 LINC01341 - long intergenic non-protein coding RNA 1341 ncRNA 196.333-36 chr14 38045630 38045781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -143581 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 344.666-23 chr5 51241341 51241701 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 141811 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 210.666-107 chr8 121329345 121329573 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -309887 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 240.333-91 chr8 62233095 62233302 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -15656 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 267.333-88 chr8 19243907 19244231 + 1.33333 NA intron (NR_038919, intron 1 of 4) intron (NR_038919, intron 1 of 4) 1453 NR_038919 100128993 Hs.697742 NR_038919 LOC100128993 - uncharacterized LOC100128993 ncRNA 202.666-43 chr15 67530945 67531124 + 1.33333 NA TTS (NM_001143936) TTS (NM_001143936) -9190 NR_040054 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 307.333-64 chr4 36063647 36064029 + 1.33333 NA intron (NR_146893, intron 32 of 36) intron (NR_146893, intron 32 of 36) 180101 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 293.667-28 chr2 118740073 118740526 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 107884 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 265.666-5 chr11 95658692 95658911 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 130981 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 272.667 chr1 7933371 7933851 + 1.33333 NA intron (NM_001561, intron 7 of 8) AluSx1|SINE|Alu 9554 NM_001561 3604 Hs.86447 NM_001561 ENSG00000049249 TNFRSF9 4-1BB|CD137|CDw137|ILA TNF receptor superfamily member 9 protein-coding 293-34 chr5 118888031 118888321 + 1.33333 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) L1ME1|LINE|L1 -86410 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 172-49 chr17 66501582 66501777 + 1.33333 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -84825 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 230.666-18 chr14 67299533 67299752 + 1.33333 NA intron (NM_001256550, intron 4 of 14) intron (NM_001256550, intron 4 of 14) 58207 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 293.333-73 chrX 54221241 54221629 + 1.33333 NA intron (NM_001002838, intron 21 of 22) L1M4|LINE|L1 -38181 NM_001300788 54954 Hs.86045 NM_017848 ENSG00000184083 FAM120C CXorf17|ORF34 family with sequence similarity 120C protein-coding 429.333-2 chr1 232424726 232425422 + 1.33333 NA intron (NM_020808, intron 16 of 20) intron (NM_020808, intron 16 of 20) 90534 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 329.999-3 chr13 98750372 98750635 + 1.33333 NA intron (NM_005073, intron 1 of 22) intron (NM_005073, intron 1 of 22) 2169 NM_005073 6564 Hs.436893 NM_005073 ENSG00000088386 SLC15A1 HPECT1|HPEPT1|PEPT1 solute carrier family 15 member 1 protein-coding 262-38 chr19 30342014 30342312 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30221 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 183-73 chr20 60072231 60072447 + 1.33333 NA non-coding (NR_161291, exon 4 of 4) non-coding (NR_161291, exon 4 of 4) -15347 NR_109918 729296 Hs.534781 NR_109916 LOC729296 - uncharacterized LOC729296 ncRNA 203.333-228 chr6 9407154 9407434 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 755085 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 199.333-160 chr20 7090299 7090471 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 163817 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 197.666-19 chr15 73675101 73675259 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9101 NM_025240 80381 Hs.744915 NM_025240 ENSG00000103855 CD276 4Ig-B7-H3|B7-H3|B7H3|B7RP-2 CD276 molecule protein-coding 335-7 chr14 55304696 55305065 + 1.33333 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 32726 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 269.333-15 chr12 23256146 23256377 + 1.33333 NA Intergenic LTR86C|LTR|ERVL 80625 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 224.666-41 chr9 101611183 101611378 + 1.33333 NA intron (NM_133445, intron 6 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -16311 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 130-48 chr17 64124920 64125078 + 1.33333 NA intron (NM_001433, intron 1 of 21) L1MB8|LINE|L1 5145 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 154.333-301 chr6 109365188 109365320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16485 NM_001346500 8763 Hs.520313 NM_006016 ENSG00000135535 CD164 DFNA66|MGC-24|MGC-24v|MUC-24|endolyn CD164 molecule protein-coding 208.666-14 chr10 28152621 28152793 + 1.33333 NA intron (NR_134518, intron 2 of 16) MER3|DNA|hAT-Charlie -79329 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 200.666-34 chr14 47910836 47911079 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -115943 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 326-30 chr3 181954673 181955047 + 1.33333 NA intron (NR_104146, intron 2 of 7) (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2496 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 479.333-8 chr5 171345905 171346439 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -19946 NR_145720 109616973 NR_145720 ENSG00000206909 SNORA70J - small nucleolar RNA, H/ACA box 70J snoRNA 360-25 chr5 157272297 157272783 + 1.33333 NA intron (NM_014376, intron 1 of 30) HAL1|LINE|L1 3216 NM_014376 26999 Hs.519702 NM_014376 ENSG00000055163 CYFIP2 EIEE65|PIR121 cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 protein-coding 118.667-165 chr6 25379609 25379731 + 1.33333 NA intron (NM_001173977, intron 2 of 36) intron (NM_001173977, intron 2 of 36) 100296 NM_001173977 55604 Hs.649550 NM_017640 ENSG00000079691 CARMIL1 CARMIL|CARMIL1a|LRRC16|LRRC16A|dJ501N12.1|dJ501N12.5 capping protein regulator and myosin 1 linker 1 protein-coding 262.333-25 chr14 65431972 65432364 + 1.33333 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) intron (NR_038170, intron 1 of 10) 19438 NR_038170 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 221.333-144 chr8 120412638 120412912 + 1.33333 NA intron (NM_014078, intron 6 of 6) L2a|LINE|L2 32375 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 186.666-20 chr14 70903463 70903667 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3894 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 198.666-59 chr3 41383492 41383665 + 1.33333 NA intron (NM_001322500, intron 35 of 35) intron (NM_001322500, intron 35 of 35) 184073 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 277.666-13 chr4 57496601 57497046 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70951 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 208-86 chr2 208315084 208315385 + 1.33333 NA exon (NM_015040, exon 15 of 42) exon (NM_015040, exon 15 of 42) -44458 NM_001309516 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 307.999-2 chr2 28230142 28230398 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 8 of 13) intron (NM_199193, intron 8 of 13) -23309 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 321.333-26 chr15 26994481 26995022 + 1.33333 NA intron (NM_001270873, intron 2 of 5) L1M4b|LINE|L1 23570 NM_033223 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 166.667-71 chr14 70987035 70987267 + 1.33333 NA intron (NM_001308160, intron 6 of 33) intron (NM_001308160, intron 6 of 33) 79692 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 205.333-223 chr7 52120963 52121187 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -727819 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 258.666-17 chr16 87122886 87123192 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65255 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 222-13 chr10 84389566 84389869 + 1.33333 NA intron (NM_018999, intron 3 of 10) intron (NM_018999, intron 3 of 10) -35222 NM_001284243 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 399.999-2 chr8 17122207 17122544 + 1.33333 NA non-coding (NR_146233, exon 16 of 16) non-coding (NR_146233, exon 16 of 16) -34107 NM_016353 51201 Hs.728241 NM_016353 ENSG00000104219 ZDHHC2 DHHC2|ZNF372 zinc finger DHHC-type containing 2 protein-coding 265.333-4 chr1 172739223 172739520 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 80268 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 203.333-68 chr14 28440750 28440902 + 1.33333 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 324493 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 144-36 chr12 24378106 24378245 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 2 of 17) MIR3|SINE|MIR 154904 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 197.666-11 chr11 114493950 114494102 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 54559 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 277.666-15 chr5 59147511 59147732 + 1.33333 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) intron (NM_001364603, intron 5 of 15) -108145 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 248.999-2 chr11 114039286 114039588 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20274 NM_001354750 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 185.333-126 chr3 175420497 175420700 + 1.33333 NA intron (NM_207015, intron 5 of 13) intron (NM_207015, intron 5 of 13) 51058 NR_039952 100616395 NR_039952 ENSG00000264974 MIR4789 - microRNA 4789 ncRNA 261.999-8 chr2 72852660 72852956 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -26775 NM_001321733 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 388-5 chr13 32936522 32936961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25089 NR_047020 100874167 Hs.406290 NR_047020 LINC00423 - long intergenic non-protein coding RNA 423 ncRNA 255-63 chr5 43354231 43354510 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -40958 NM_001324220 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 272-32 chr3 113112456 113112682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55162 NR_110823 101929717 Hs.638426 NR_110823 ENSG00000243795 LINC02044 - long intergenic non-protein coding RNA 2044 ncRNA 219.333-59 chr15 63676406 63676634 + 1.33333 NA intron (NM_003922, intron 37 of 77) AluSx1|SINE|Alu -75693 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 312-47 chr6 43333093 43333521 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -24481 NM_001366068 401262 Hs.653165 NM_206922 ENSG00000146215 CRIP3 CRP-3|TLP|TLP-A|h6LIMo cysteine rich protein 3 protein-coding 313.667-2 chr1 222990290 222990790 + 1.33333 NA intron (NM_001369594, intron 3 of 7) intron (NM_001369594, intron 3 of 7) 62116 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 234.667-106 chr8 14872865 14873160 + 1.33333 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) -19502 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 180.666-28 chr5 167888733 167888933 + 1.33333 NA intron (NM_001368145, intron 2 of 26) intron (NM_001368145, intron 2 of 26) 133904 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 233.666-8 chr12 44486679 44486980 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 388832 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 290.333-43 chr7 17226450 17226807 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -72024 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 298.333-40 chr8 56158226 56158594 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44428 NM_005372 4342 Hs.533432 NM_005372 ENSG00000172680 MOS MSV MOS proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 208.667-66 chr2 67243576 67243876 + 1.33333 NA intron (NR_110568, intron 3 of 3) intron (NR_110568, intron 3 of 3) -28407 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 163.333-258 chr7 34562828 34563062 + 1.33333 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -95273 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 205.333-53 chr12 22479953 22480178 + 1.33333 NA intron (NM_001286176, intron 14 of 26) intron (NM_001286176, intron 14 of 26) 64132 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 167.333-27 chr1 184161899 184162122 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 110280 NR_125335 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 212.666-56 chr3 123180972 123181132 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19258 NR_106960 102465667 NR_106960 ENSG00000284421 MIR7110 hsa-mir-7110 microRNA 7110 ncRNA 259.666-9 chr11 39795985 39796260 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 497008 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 205.333-101 chr18 2552642 2552813 + 1.33333 NA exon (NM_001308401, exon 5 of 8) exon (NM_001308401, exon 5 of 8) 18778 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 204.667-92 chr22 39741327 39741598 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 152298 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 170.333-18 chr1 218834750 218834983 + 1.33333 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) 83645 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 295.333-39 chr3 131656454 131656893 + 1.33333 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) L2a|LINE|L2 -153702 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 235.666-12 chr4 188956042 188956343 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 179535 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 360-18 chr22 34186777 34187184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -264092 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 196.666-93 chr6 137428364 137428551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65937 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 138.333-46 chr12 28700617 28700811 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -448564 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 193.666-30 chr3 34017538 34017732 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 219005 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 188.666-10 chr11 124413149 124413311 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11641 NM_001005196 283162 Hs.553671 NM_001005196 ENSG00000280090 OR8B4 OR11-315|OR8B4P olfactory receptor family 8 subfamily B member 4 (gene/pseudogene) protein-coding 158.666-14 chr14 66173544 66173708 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -312745 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 197.666-39 chr3 73974280 73974587 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165189 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 290.333-47 chr8 105773784 105774168 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 286527 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 348.666-12 chr21 33350361 33350653 + 1.33333 NA intron (NM_000629, intron 8 of 10) MER106A|DNA|hAT-Charlie 25537 NM_000629 3454 Hs.529400 NM_000629 ENSG00000142166 IFNAR1 AVP|IFN-alpha-REC|IFNAR|IFNBR|IFRC interferon alpha and beta receptor subunit 1 protein-coding 327.667-11 chr14 88630338 88630934 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 32 of 42) intron (NM_183387, intron 32 of 42) 36216 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 325.333-9 chr11 117309743 117310074 + 1.33333 NA intron (NM_138971, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 6348 NM_012104 23621 Hs.504003 NM_012104 ENSG00000186318 BACE1 ASP2|BACE|HSPC104 beta-secretase 1 protein-coding 255-89 chr9 90989207 90989596 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 85731 NR_033912 100129316 Hs.458154 NR_033912 LOC100129316 - uncharacterized LOC100129316 ncRNA 221.333-12 chr10 28996834 28997164 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 150591 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 258.333-39 chr21 27523619 27523937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -198601 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 192-90 chr22 29036946 29037220 + 1.33333 NA intron (NM_001206998, intron 2 of 8) intron (NM_001206998, intron 2 of 8) -5607 NR_046851 100874123 Hs.674708 NR_046851 ENSG00000177993 ZNRF3-AS1 - ZNRF3 antisense RNA 1 ncRNA 210.666-74 chr3 195426458 195426664 + 1.33333 NA intron (NM_012287, intron 1 of 22) intron (NM_012287, intron 1 of 22) 16459 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 232.999-8 chr8 51121187 51121468 + 1.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 688118 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 200.333-124 chr5 118526545 118526825 + 1.33333 NA intron (NR_104610, intron 1 of 9) intron (NR_104610, intron 1 of 9) 35432 NR_104610 101927280 Hs.543951 NR_104610 LINC02208 HRAT56 long intergenic non-protein coding RNA 2208 ncRNA 219-51 chr20 1238418 1238696 + 1.33333 NA intron (NM_001136566, intron 6 of 13) intron (NM_001136566, intron 6 of 13) 12437 NM_001136566 642636 Hs.713451 NM_001136566 ENSG00000244588 RAD21L1 RAD21L|dJ545L17.2 RAD21 cohesin complex component like 1 protein-coding 200-128 chr5 65758945 65759164 + 1.33333 NA intron (NM_020726, intron 2 of 12) L1ME4a|LINE|L1 36849 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 135.333-3 chr1 59272401 59272557 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24334 NM_001350798 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 329.333-41 chr4 145488771 145489105 + 1.33333 NA intron (NM_001354817, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 6133 NM_001354817 4086 Hs.604588 NM_005900 ENSG00000170365 SMAD1 BSP-1|BSP1|JV4-1|JV41|MADH1|MADR1 SMAD family member 1 protein-coding 209.333-137 chr21 22543560 22543775 + 1.33333 NA Intergenic MLT-int|LTR|ERVL-MaLR 445050 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 249.999-5 chr2 200188128 200188369 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -117631 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 205.667-124 chr7 42152613 42152895 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) intron (NM_000168, intron 2 of 14) 84455 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 208.333-90 chr21 42196899 42197177 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2651 NM_207627 9619 Hs.124649 NM_004915 ENSG00000160179 ABCG1 ABC8|WHITE1 ATP binding cassette subfamily G member 1 protein-coding 266.666-17 chr2 38706529 38706783 + 1.33333 NA intron (NM_138801, intron 4 of 6) AluJo|SINE|Alu 40542 NM_138801 130589 Hs.435012 NM_138801 ENSG00000143891 GALM BLOCK25|GLAT|HEL-S-63p|IBD1 galactose mutarotase protein-coding 158-48 chr15 55690262 55690462 + 1.33333 NA intron (NM_173814, intron 2 of 19) L2a|LINE|L2 52790 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 175-39 chr2 13514445 13514700 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -507559 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 169.333-260 chr7 146391539 146391700 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -382652 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 175.333-79 chr2 40889587 40889755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -377236 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 405.333-3 chr14 51281180 51281594 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 41140 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 494.333 chr12 41167655 41168261 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20362 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 182-27 chr13 72560613 72560799 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 166923 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 221.667-19 chr12 5298059 5298349 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55053 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 212-95 chr2 204350905 204351188 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -194429 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 236.667-71 chr6 70054367 70054635 + 1.33333 NA intron (NM_001858, intron 14 of 50) intron (NM_001858, intron 14 of 50) 187945 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 384.666-5 chr18 58024317 58024675 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19730 NM_015277 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 215.666-22 chr2 103543361 103543548 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -559025 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 205.333-89 chr16 36053606 36053768 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 307135 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 164.333-214 chr6 117703472 117703759 + 1.33333 NA exon (NM_138459, exon 4 of 5) exon (NM_138459, exon 4 of 5) 28146 NM_138459 116150 Hs.289008 NM_138459 ENSG00000153989 NUS1 C6orf68|CDG1AA|MGC:7199|MRD55|NgBR|TANGO14 NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit protein-coding 197.333-100 chr2 7559638 7559828 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 138472 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 302.999-7 chr2 33467604 33467981 + 1.33333 NA intron (NM_001349979, intron 1 of 17) intron (NM_001349979, intron 1 of 17) -8857 NM_001349981 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 169.666-3 chr12 127115173 127115399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54889 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 209.667-105 chr7 94542051 94542354 + 1.33333 NA intron (NM_001363428, intron 10 of 17) L3|LINE|CR1 32393 NM_022900 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 216-43 chr17 34190984 34191241 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -7480 NR_110748 101927239 Hs.603592 NR_110748 ENSG00000261156 LINC01989 - long intergenic non-protein coding RNA 1989 ncRNA 333.666-7 chr2 55498591 55498874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20863 NM_001282761 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 199.667-92 chr3 60264975 60265249 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -184203 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 212-34 chr12 26181853 26182084 + 1.33333 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -13368 NM_001135823 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 306.666-37 chr8 65511375 65511827 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 51065 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 270-52 chr5 85426023 85426278 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -856294 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 210.666-40 chr15 55846778 55847008 + 1.33333 NA intron (NM_198400, intron 11 of 21) intron (NM_198400, intron 11 of 21) 70238 NM_198400 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 195.333-219 chr8 127719716 127719877 + 1.33333 NA intron (NR_117102, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 14171 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 153.666-3 chr5 45082958 45083092 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 274078 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 196-49 chr14 62845319 62845498 + 1.33333 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) intron (NM_139318, intron 8 of 10) 200050 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 224.333-122 chr8 25955215 25955409 + 1.33333 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) intron (NM_022659, intron 6 of 15) 90101 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 226-88 chr7 104743530 104743733 + 1.33333 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 60461 NR_034142 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 211-50 chr2 52010356 52010517 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -360212 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 293.333-47 chr4 183099747 183100156 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_024008) promoter-TSS (NR_024008) 694 NM_024949 80014 Hs.333179 NM_024949 ENSG00000151718 WWC2 BOMB WW and C2 domain containing 2 protein-coding 233-52 chr4 74366380 74366825 + 1.33333 NA intron (NM_001432, intron 1 of 4) intron (NM_001432, intron 1 of 4) 1457 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 250-28 chr14 69715100 69715351 + 1.33333 NA TTS (NM_014734) TTS (NM_014734) -51917 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 192.666-42 chr3 105771084 105771265 + 1.33333 NA intron (NR_135806, intron 4 of 20) L1PB2|LINE|L1 96417 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 221.999-4 chr17 49541151 49541323 + 1.33333 NA intron (NR_103773, intron 1 of 2) L1MC3|LINE|L1 30420 NR_106751 102465141 NR_106751 ENSG00000277478 MIR6165 hsa-mir-6165 microRNA 6165 ncRNA 200-46 chr12 74969091 74969344 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 240531 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 200-59 chr14 83540407 83540618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 897880 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 206.666-128 chr9 97679364 97679540 + 1.33333 NA intron (NR_149094, intron 5 of 6) L1MC4|LINE|L1 17957 NR_149093 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 202.666-27 chr12 100207418 100207618 + 1.33333 NA intron (NR_048569, intron 3 of 10) MIR|SINE|MIR 6703 NR_048569 64431 Hs.115088 NM_022496 ENSG00000075089 ACTR6 ARP6|CDA12|HSPC281|MSTP136|hARP6|hARPX actin related protein 6 protein-coding 420.666-5 chr20 51102857 51103306 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -79974 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 188.333-121 chr5 115217391 115217611 + 1.33333 NA intron (NM_005023, intron 7 of 8) intron (NM_005023, intron 7 of 8) -36955 NM_001017398 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 227.333-135 chrX 67927290 67927488 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 382766 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 263-19 chr13 105187395 105187725 + 1.33333 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -278307 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 178.333-162 chr7 32321790 32322074 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) -22604 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 166.666-7 chr17 65939736 65939893 + 1.33333 NA intron (NM_001353129, intron 18 of 26) L1MA7|LINE|L1 -113271 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 211.333-206 chr6 64098962 64099256 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 292273 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 301-27 chr21 45522570 45522999 + 1.33333 NA intron (NM_001352510, intron 5 of 5) L1MD1|LINE|L1 11972 NM_001205207 6573 Hs.84190 NM_003056 ENSG00000173638 SLC19A1 CHMD|FOLT|IFC-1|IFC1|REFC|RFC|RFC1 solute carrier family 19 member 1 protein-coding 154-104 chr4 78425592 78425715 + 1.33333 NA intron (NM_001166133, intron 35 of 41) intron (NM_001166133, intron 35 of 41) -126117 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 287.333-13 chr11 100343028 100343304 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 22 of 23) MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -344122 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 155.666-3 chr2 157452257 157452534 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8306 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 209.333-53 chr14 26477933 26478213 + 1.33333 NA intron (NM_001366391, intron 4 of 5) intron (NM_001366391, intron 4 of 5) 75357 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 146.666-14 chr8 97580399 97580550 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -63710 NM_178812 92140 Hs.377155 NM_178812 ENSG00000147649 MTDH 3D3|AEG-1|AEG1|LYRIC|LYRIC/3D3 metadherin protein-coding 210-95 chr3 121753171 121753335 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -3486 NM_001256488 2804 Hs.213389 NM_004487 ENSG00000173230 GOLGB1 GCP|GCP372|GOLIM1 golgin B1 protein-coding 196-63 chr16 54643629 54643841 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 204498 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 199.666-49 chr6 41135435 41135585 + 1.33333 NA intron (NR_026938, intron 19 of 22) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 18839 NM_001271808 340205 Hs.117331 NM_178174 ENSG00000161911 TREML1 GLTL1825|PRO3438|TLT-1|TLT1|dJ238O23.3 triggering receptor expressed on myeloid cells like 1 protein-coding 441.334-3 chr8 125903175 125903863 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47678 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 208.333-80 chr2 166003341 166003574 + 1.33333 NA intron (NM_001353957, intron 21 of 26) intron (NM_001353957, intron 21 of 26) 46039 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 409.999 chr19 53743937 53744381 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 1647 NR_030215 574493 NR_030215 ENSG00000207861 MIR520H MIRN520H microRNA 520h ncRNA 293.333-43 chr3 140351327 140351807 + 1.33333 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) MER58A|DNA|hAT-Charlie 157222 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 261-41 chr22 32264640 32264998 + 1.33333 NA intron (NR_149072, intron 2 of 3) intron (NR_149072, intron 2 of 3) -9472 NM_014227 6527 Hs.130101 NM_014227 ENSG00000100191 SLC5A4 DJ90G24.4|SAAT1|SGLT3 solute carrier family 5 member 4 protein-coding 180.333-38 chr15 45381891 45382116 + 1.33333 NA intron (NM_001321015, intron 3 of 11) L1ME4b|LINE|L1 -3459 NM_001482 2628 Hs.75335 NM_001482 ENSG00000171766 GATM AGAT|AT|CCDS3 glycine amidinotransferase protein-coding 176.667-115 chr4 185921795 185922016 + 1.33333 NA intron (NM_001270771, intron 1 of 23) intron (NM_001270771, intron 1 of 23) 34467 NM_001270771 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 169-82 chr5 55631909 55632072 + 1.33333 NA intron (NM_001349385, intron 13 of 14) intron (NM_001349385, intron 13 of 14) 61063 NM_001258286 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 309-19 chr19 58221623 58221959 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6890 NM_014480 27300 Hs.438994 NM_014480 ENSG00000198131 ZNF544 - zinc finger protein 544 protein-coding 350.333-23 chrX 9470372 9470750 + 1.33333 NA intron (NM_005647, intron 1 of 17) intron (NM_005647, intron 1 of 17) 5503 NM_005647 6907 Hs.495656 NM_005647 ENSG00000101849 TBL1X EBI|SMAP55|TBL1 transducin beta like 1 X-linked protein-coding 192.666-24 chr14 81383316 81383527 + 1.33333 NA intron (NM_001366850, intron 4 of 7) intron (NM_001366850, intron 4 of 7) 44354 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 226-4 chr1 96030766 96031045 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 38837 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 282.666-28 chr9 10274925 10275225 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 337927 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 167.333-115 chr18 1688725 1688964 + 1.33333 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -329215 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 145.666-2 chr2 57369925 57370094 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -537642 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 286.666-4 chr13 81282968 81283260 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56131 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 230.666-8 chr10 96682981 96683207 + 1.33333 NA intron (NM_152309, intron 2 of 16) intron (NM_152309, intron 2 of 16) 37420 NM_152309 118788 Hs.310456 NM_152309 ENSG00000155629 PIK3AP1 BCAP phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 protein-coding 245.333-56 chr17 73320521 73320843 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8681 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 223.333-15 chr1 224437451 224437622 + 1.33333 NA intron (NM_001322303, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 2687 NR_136297 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 164-114 chr8 66374860 66375086 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54004 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 221.999-6 chr2 180823533 180823699 + 1.33333 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) intron (NR_104324, intron 3 of 4) 131512 NR_104323 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 278.667-50 chr8 99178136 99178515 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 16 of 61) intron (NM_017890, intron 16 of 61) 165059 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 186-34 chr14 61986006 61986252 + 1.33333 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) MIR3|SINE|MIR 58434 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 204.333-90 chr2 14357082 14357328 + 1.33333 NA intron (NR_103814, intron 1 of 3) L1MC3|LINE|L1 43753 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 217-59 chr3 71476528 71476818 + 1.33333 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) AluSq2|SINE|Alu 65416 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 182.333-19 chr10 41883919 41884138 + 1.33333 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 484017 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 197.333-99 chr18 75427022 75427201 + 1.33333 NA intron (NM_001037331, intron 1 of 2) intron (NM_001037331, intron 1 of 2) 592 NM_001037331 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 199.333-60 chr12 121459174 121459450 + 1.33333 NA intron (NM_001005366, intron 12 of 22) L1M4|LINE|L1 -14960 NR_106957 102465665 NR_106957 ENSG00000284402 MIR7107 hsa-mir-7107 microRNA 7107 ncRNA 193.666-40 chr5 118094816 118095022 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -187655 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 429.333-8 chr9 4375386 4375947 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -75598 NM_001042413 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 189.333-116 chr21 19574860 19575069 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 324791 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 407.666-11 chr9 80855834 80856334 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 833451 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 248-50 chr3 12622173 12622421 + 1.33333 NA intron (NR_148942, intron 1 of 16) intron (NR_148942, intron 1 of 16) 41211 NM_001354690 5894 Hs.159130 NM_002880 ENSG00000132155 RAF1 CMD1NN|CRAF|NS5|Raf-1|c-Raf Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 189.333-57 chr15 33663846 33664006 + 1.33333 NA intron (NM_001243996, intron 36 of 102) intron (NM_001243996, intron 36 of 102) -304571 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 201-102 chr7 37749941 37750239 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 66324 NM_001329993 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 311.666-7 chr2 37468517 37468797 + 1.33333 NA Intergenic (TCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 124027 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 309-15 chr14 81351415 81352029 + 1.33333 NA intron (NM_001366849, intron 5 of 8) intron (NM_001366849, intron 5 of 8) 76053 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 254.667-53 chr3 89053213 89053587 + 1.33333 NA Intergenic LTR53-int|LTR|ERVL -54221 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 211.333-237 chr8 78536064 78536264 + 1.33333 NA intron (NR_125389, intron 2 of 2) intron (NR_125389, intron 2 of 2) 19824 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 212.666-8 chr10 10145781 10146163 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87250 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 217.333-134 chr6 147767332 147767630 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 258791 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 223-19 chr14 59589495 59589739 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12805 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 288.666-30 chr5 81509140 81509555 + 1.33333 NA intron (NM_001256734, intron 4 of 15) intron (NM_001256734, intron 4 of 15) -115213 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 462-12 chr2 47230900 47231444 + 1.33333 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu -54236 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 176-104 chr8 125882659 125882816 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 68460 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 215.666-20 chr17 54362634 54362798 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -537975 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 289.666-8 chr2 181430231 181430652 + 1.33333 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -26451 NM_001316312 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 173.333-186 chr7 49764758 49764970 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -8774 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 189.666-38 chr8 114759089 114759290 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 908824 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 289-30 chr7 35667786 35668043 + 1.33333 NA intron (NM_022373, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR 27221 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 308.666-25 chr9 28217288 28217615 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 501854 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 219.333-184 chr8 108023263 108023568 + 1.33333 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) intron (NM_178565, intron 2 of 5) 58524 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 212.666-12 chr10 100085812 100086028 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4051 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 382.333-11 chr20 58109414 58109791 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -41300 NM_178456 128602 Hs.43977 NM_178456 ENSG00000124237 C20orf85 LLC1|bA196N14.1 chromosome 20 open reading frame 85 protein-coding 212-89 chr2 130346939 130347164 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001320304, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001320304, exon 9 of 9) -4370 NR_104471 84317 Hs.104203 NM_032357 ENSG00000136710 CCDC115 CDG2O|ccp1 coiled-coil domain containing 115 protein-coding 158-31 chr12 22727461 22727820 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 102469 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 131.667-88 chr2 38672325 38672528 + 1.33333 NA intron (NM_138801, intron 1 of 6) intron (NM_138801, intron 1 of 6) 6312 NM_138801 130589 Hs.435012 NM_138801 ENSG00000143891 GALM BLOCK25|GLAT|HEL-S-63p|IBD1 galactose mutarotase protein-coding 135.333-102 chr20 37697932 37698102 + 1.33333 NA intron (NM_030877, intron 1 of 15) intron (NM_030877, intron 1 of 15) 3987 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 265.333-29 chr17 49113563 49114048 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -18655 NM_001159388 124872 Hs.374679 NM_153446 ENSG00000167080 B4GALNT2 B4GALT|GALGT2 beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 2 protein-coding 211.333-180 chr5 20364172 20364464 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 58767 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 193.333-19 chr10 24646953 24647136 + 1.33333 NA intron (NM_001367447, intron 4 of 24) intron (NM_001367447, intron 4 of 24) -24201 NM_001367455 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 266.666-27 chr7 106404981 106405237 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120126 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 276.666-19 chr2 81886542 81886870 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -419760 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 167.333-53 chr11 30850984 30851233 + 1.33333 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 141578 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 263.999 chr10 78487699 78487989 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 220502 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 205.333-257 chr8 139092095 139092250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -178131 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 225.666-4 chr10 125711506 125711696 + 1.33333 NA intron (NR_033847, intron 1 of 4) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 7892 NR_033847 399821 Hs.535286 NR_033847 ENSG00000224023 EDRF1-DT - EDRF1 divergent transcript ncRNA 220-74 chr3 2151689 2151983 + 1.33333 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) MSTC|LTR|ERVL-MaLR -7595 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 225.333-63 chr16 8037972 8038188 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 551758 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 168.666-2 chr10 54257636 54257801 + 1.33333 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) intron (NM_001354411, intron 8 of 34) -228512 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 294-45 chr3 98347803 98348121 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -5892 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 211-29 chr13 83850656 83850932 + 1.33333 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack 31599 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 241.667-72 chr5 45470419 45470749 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 225796 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 191.333-148 chr4 95219758 95220025 + 1.33333 NA intron (NM_003728, intron 8 of 15) L2a|LINE|L2 128400 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 392.333-5 chr2 123122507 123122927 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49236 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 388.666-2 chr12 121303164 121303497 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5022 NM_006549 10645 Hs.297343 NM_006549 ENSG00000110931 CAMKK2 CAMKK|CAMKKB calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 protein-coding 272.666-27 chr8 80206445 80206824 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -34755 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 208.333-89 chr21 31883166 31883414 + 1.33333 NA intron (NM_014586, intron 1 of 10) L1ME4b|LINE|L1 10270 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 204.333-2 chr1 25697171 25697442 + 1.33333 NA intron (NM_020379, intron 2 of 11) L1MB8|LINE|L1 79838 NM_001289010 57134 Hs.197043 NM_020379 ENSG00000117643 MAN1C1 HMIC|MAN1A3|MAN1C|pp6318 mannosidase alpha class 1C member 1 protein-coding 227.666-37 chr9 36952961 36953207 + 1.33333 NA intron (NR_104000, intron 6 of 9) L1MCa|LINE|L1 -59553 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 418-4 chr14 69730970 69731566 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35874 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 192.666-26 chr15 55574150 55574297 + 1.33333 NA intron (NM_015617, intron 1 of 2) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 14122 NM_001330326 26108 Hs.87194 NM_015617 ENSG00000171016 PYGO1 - pygopus family PHD finger 1 protein-coding 169.333-125 chr2 115263455 115263641 + 1.33333 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) -45689 NM_020868 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 260.333 chr1 151432197 151432616 + 1.33333 NA intron (NM_001194938, intron 2 of 17) intron (NM_001194938, intron 2 of 17) 9799 NM_207171 23126 Hs.489873 NM_015100 ENSG00000143442 POGZ MRD37|WHSUS|ZNF280E|ZNF635|ZNF635m pogo transposable element derived with ZNF domain protein-coding 278-69 chr8 113665580 113665989 + 1.33333 NA Intergenic LTR77|LTR|ERV1 -228845 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 195.333-184 chr5 149166690 149166936 + 1.33333 NA intron (NM_001370418, intron 1 of 18) MER58A|DNA|hAT-Charlie 25082 NM_001370418 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 321.333-43 chr22 25299159 25299520 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18918 NR_029395 91353 Hs.651077 NM_001013618 IGLL3P 16.1|IGLL3 immunoglobulin lambda like polypeptide 3, pseudogene pseudo 157.333-104 chr14 35589548 35589688 + 1.33333 NA intron (NM_014990, intron 36 of 40) intron (NM_014990, intron 36 of 40) 55454 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 200.666-62 chr2 122538210 122538425 + 1.33333 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 535164 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 201.333-292 chr8 126484829 126485019 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 73554 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 559.999 chr6 103629895 103630437 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1229380 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 203.666-16 chr12 7635020 7635218 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 30789 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 170-68 chr20 20260982 20261191 + 1.33333 NA intron (NM_015585, intron 20 of 26) intron (NM_015585, intron 20 of 26) -107018 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 187-9 chr1 247206348 247206588 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4408 NR_037480 100500849 NR_037480 ENSG00000283881 MIR3916 mir-3916 microRNA 3916 ncRNA 198-87 chr2 43658359 43658536 + 1.33333 NA intron (NM_172069, intron 2 of 29) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 17982 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 208.666-3 chr1 65327343 65327509 + 1.33333 NA intron (NM_001256864, intron 1 of 18) intron (NM_001256864, intron 1 of 18) 17883 NM_001256864 9829 Hs.647643 NM_014787 ENSG00000116675 DNAJC6 DJC6|PARK19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 protein-coding 337.333-24 chr2 146938100 146938459 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 351222 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 248.333-39 chr18 68370229 68370574 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 344707 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 393.333-18 chr5 40592138 40592644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87524 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 392-4 chr14 44930744 44931182 + 1.33333 NA intron (NM_017658, intron 4 of 4) intron (NM_017658, intron 4 of 4) -19046 NR_110050 101927418 Hs.144809 NR_110050 ENSG00000258949 LOC101927418 - uncharacterized LOC101927418 ncRNA 272.667-21 chr15 64779193 64779570 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3792 NM_194272 348093 Hs.436518 NM_194272 ENSG00000166831 RBPMS2 - RNA binding protein, mRNA processing factor 2 protein-coding 134.333-135 chr5 20551204 20551326 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 24448 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 192-130 chr7 20259217 20259443 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -37378 NR_110117 101927769 Hs.256080 NR_110117 ENSG00000226097 LOC101927769 - uncharacterized LOC101927769 ncRNA 278-62 chr8 12911683 12912012 + 1.33333 NA Intergenic AluYa8|SINE|Alu -33826 NM_020844 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 186.333-155 chr7 135628584 135628831 + 1.33333 NA intron (NM_015135, intron 34 of 42) intron (NM_015135, intron 34 of 42) -33807 NM_001130929 647087 Hs.200022 NM_001130929 ENSG00000243317 STMP1 C7orf73|PL-5283 short transmembrane mitochondrial protein 1 protein-coding 414.666-14 chr6 75067220 75067789 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 61278 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 154.666-11 chr4 162462249 162462416 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -298298 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 203.333-272 chr8 120602119 120602347 + 1.33333 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) MER112|DNA|hAT-Charlie 156814 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 232.333-64 chr4 106499668 106499907 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 66163 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 287.666-11 chr6 93574781 93575067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -129093 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 317.333-9 chr12 96862121 96862386 + 1.33333 NA intron (NM_001306084, intron 67 of 67) intron (NM_001306084, intron 67 of 67) -45004 NM_001135177 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 327.333-34 chr5 8296173 8296576 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 161190 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 352.999 chr11 39202817 39203158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 554129 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 190.333-130 chr6 97802448 97802673 + 1.33333 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -221971 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 302.666-4 chr1 225825769 225826207 + 1.33333 NA intron (NM_000120, intron 1 of 8) intron (NM_000120, intron 1 of 8) 634 NM_000120 2052 Hs.89649 NM_000120 ENSG00000143819 EPHX1 EPHX|EPOX|HYL1|MEH epoxide hydrolase 1 protein-coding 200.667-159 chr8 121196696 121197033 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR -384818 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 370.333-27 chr8 85439204 85439653 + 1.33333 NA intron (NM_005181, intron 1 of 6) intron (NM_005181, intron 1 of 6) 569 NM_005181 761 Hs.82129 NM_005181 ENSG00000164879 CA3 CAIII|Car3 carbonic anhydrase 3 protein-coding 215.333-203 chr8 134893139 134893435 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 43352 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 203.666-8 chr10 31720925 31721100 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 187914 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 186.333-103 chr3 106747495 106747736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 493023 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 220-64 chr2 103054202 103054499 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -69921 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 204.333-167 chr5 107960408 107960631 + 1.33333 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) L1MA8|LINE|L1 -289582 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 204.666-44 chr20 21156395 21156548 + 1.33333 NA intron (NM_018474, intron 4 of 12) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 30389 NM_001352436 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 212.667-20 chr11 36654765 36655016 + 1.33333 NA intron (NR_077243, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 -56611 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 143.333-243 chr6 72175723 72175872 + 1.33333 NA intron (NM_014989, intron 4 of 33) intron (NM_014989, intron 4 of 33) -37096 NM_001350442 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 249-34 chr17 17182315 17182614 + 1.33333 NA intron (NM_201274, intron 23 of 23) intron (NM_201274, intron 23 of 23) 23869 NM_178836 201164 Hs.729079 NM_178836 ENSG00000179598 PLD6 ZUC phospholipase D family member 6 protein-coding 241.999-7 chr5 75752510 75752780 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35208 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 190.333-147 chr8 116763725 116763869 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2727 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 204-99 chr2 108186274 108186536 + 1.33333 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) intron (NR_131251, intron 1 of 4) 31436 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 276.333-65 chr9 136346861 136347226 + 1.33333 NA intron (NM_001145638, intron 9 of 13) intron (NM_001145638, intron 9 of 13) -6014 NM_001145639 26086 Hs.239370 NM_015597 ENSG00000160360 GPSM1 AGS3 G protein signaling modulator 1 protein-coding 234.666-5 chr1 115974907 115975171 + 1.33333 NA intron (NR_125970, intron 1 of 4) intron (NR_125970, intron 1 of 4) -1474 NM_018420 55356 Hs.125482 NM_018420 ENSG00000163393 SLC22A15 FLIPT1|PRO34686 solute carrier family 22 member 15 protein-coding 247-15 chr12 2538323 2538731 + 1.33333 NA intron (NM_199460, intron 9 of 49).2 (TTTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 133693 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 196-158 chr6 54615804 54616054 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -230842 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 220.666-74 chr8 121325541 121325821 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -313665 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 194-8 chr10 23093278 23093530 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -2175 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 238.667-60 chr4 56011608 56011922 + 1.33333 NA intron (NM_025009, intron 20 of 25) intron (NM_025009, intron 20 of 25) 62820 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 303.666-9 chr2 52574526 52574953 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 127876 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 264.333-67 chr6 83819775 83820114 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33322 NM_001009994 134701 Hs.149454 NM_001009994 ENSG00000203877 RIPPLY2 C6orf159|SCDO6|dJ237I15.1 ripply transcriptional repressor 2 protein-coding 202-184 chr8 112215804 112215963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -427610 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 200-53 chr14 53686647 53686869 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 261726 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 207-130 chr9 122450657 122450906 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 27145 NM_001004451 347168 Hs.632692 NM_001004451 ENSG00000136834 OR1J1 OR9-18|hg32 olfactory receptor family 1 subfamily J member 1 protein-coding 287.999-3 chr18 76354161 76354550 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137297 NR_136504 101927989 Hs.665186 NR_136504 ENSG00000265778 LOC101927989 - uncharacterized LOC101927989 ncRNA 171.333-105 chr20 52453453 52453605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -167309 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 216.667-5 chr1 74516946 74517251 + 1.33333 NA intron (NM_015978, intron 23 of 24) intron (NM_015978, intron 23 of 24) -4484 NM_001364666 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 216-42 chr17 9343890 9344168 + 1.33333 NA intron (NM_004853, intron 7 of 7) intron (NM_004853, intron 7 of 7) -164911 NR_110828 101928266 Hs.639880 NR_110828 ENSG00000262966 LOC101928266 - uncharacterized LOC101928266 ncRNA 203.333-57 chr12 99507230 99507522 + 1.33333 NA intron (NM_152788, intron 9 of 25) intron (NM_152788, intron 9 of 25) -140377 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 187-55 chr4 32750929 32751086 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 399969 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 206-29 chr11 9199183 9199398 + 1.33333 NA intron (NR_145966, intron 4 of 21) AluJb|SINE|Alu 66036 NR_145966 23258 Hs.501857 NM_015213 ENSG00000184014 DENND5A EIEE49|RAB6IP1 DENN domain containing 5A protein-coding 200-25 chr10 95713684 95713949 + 1.33333 NA intron (NM_001098175, intron 1 of 9) intron (NM_001098175, intron 1 of 9) 2052 NM_001098175 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 226.667-13 chr1 244011525 244011818 + 1.33333 NA intron (NR_033883, intron 6 of 11) intron (NR_033883, intron 6 of 11) -37268 NM_001278196 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 264.999-6 chr4 52026834 52027133 + 1.33333 NA intron (NM_000232, intron 5 of 5) intron (NM_000232, intron 5 of 5) -6620 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 183.666-17 chr5 9034191 9034368 + 1.33333 NA TTS (NM_003966) TTS (NM_003966) 19616 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 255-40 chr2 34606947 34607370 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70399 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 189-89 chr8 72740526 72740674 + 1.33333 NA intron (NR_110656, intron 1 of 2) intron (NR_110656, intron 1 of 2) 8555 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 214.667-119 chr8 103892320 103892604 + 1.33333 NA intron (NM_001282881, intron 2 of 20) AluJo|SINE|Alu 73242 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 403.666-3 chr3 89992898 89993418 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 885537 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 194.333-74 chr2 124385466 124385655 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) L2a|LINE|L2 360273 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 323-15 chr2 26419956 26420374 + 1.33333 NA intron (NM_145038, intron 2 of 16) intron (NM_145038, intron 2 of 16) 18245 NM_145038 92749 Hs.393714 NM_145038 ENSG00000157856 DRC1 C2orf39|CCDC164|CILD21 dynein regulatory complex subunit 1 protein-coding 331-22 chr2 227361717 227362120 + 1.33333 NA TTS (NM_024795) TTS (NM_024795) 17388 NM_024795 79853 Hs.156652 NM_024795 ENSG00000168955 TM4SF20 PRO994|SLI5|TCCE518 transmembrane 4 L six family member 20 protein-coding 231.666-29 chr7 92089888 92090149 + 1.33333 NA intron (NM_147185, intron 38 of 49) L1ME3B|LINE|L1 44459 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 181-57 chr4 86648732 86648867 + 1.33333 NA intron (NM_080685, intron 2 of 47) L1MA4|LINE|L1 54484 NM_006264 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 230.667-58 chr4 44525231 44525546 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -76579 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 198-111 chr22 45730940 45731114 + 1.33333 NA intron (NM_013236, intron 7 of 11) intron (NM_013236, intron 7 of 11) -29497 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 216.333-36 chr12 14947786 14947991 + 1.33333 NA exon (NM_001321423, exon 4 of 6) exon (NM_001321423, exon 4 of 6) 1008 NR_135637 397 Hs.504877 NM_001175 ENSG00000111348 ARHGDIB D4|GDIA2|GDID4|LYGDI|Ly-GDI|RAP1GN1|RhoGDI2 Rho GDP dissociation inhibitor beta protein-coding 197-56 chr2 33105136 33105350 + 1.33333 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -29354 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 284.666-23 chr7 65914801 65915071 + 1.33333 NA intron (NM_001284342, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 41862 NM_001284342 154807 Hs.427232 NM_173517 ENSG00000196715 VKORC1L1 - vitamin K epoxide reductase complex subunit 1 like 1 protein-coding 174.333-35 chr14 23672031 23672226 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35764 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 308.667-36 chr7 4195267 4195725 + 1.33333 NA intron (NM_001079653, intron 9 of 19) L2c|LINE|L2 -60659 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 204.666-93 chr7 122030117 122030359 + 1.33333 NA intron (NM_001206839, intron 14 of 28) intron (NM_001206839, intron 14 of 28) 114011 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 242.666-9 chr10 48633186 48633526 + 1.33333 NA intron (NM_001347738, intron 2 of 10) intron (NM_001347738, intron 2 of 10) 19146 NM_001256025 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 240-60 chr3 28816153 28816505 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 241051 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 197-76 chr3 118685793 118685947 + 1.33333 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) LTR85c|LTR|Gypsy? 44102 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 203.666-17 chr12 55315847 55316081 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4636 NM_001005182 390321 Hs.553763 NM_001005182 ENSG00000205330 OR6C1 OST267 olfactory receptor family 6 subfamily C member 1 protein-coding 187.333-198 chr8 88757682 88757926 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -430321 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 289.333-53 chr5 164436065 164436353 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31193 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 251.666-15 chr2 180146204 180146423 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -139016 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 242-2 chr1 55772052 55772504 + 1.33333 NA Intergenic MER101|LTR|ERV1 172685 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 261.666-6 chr14 56486255 56486522 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -27943 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 176-36 chr15 86775154 86775328 + 1.33333 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) L2c|LINE|L2 -157639 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 295.333-34 chr20 49801573 49801966 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -10944 NM_001260491 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 268-17 chr13 42964458 42964702 + 1.33333 NA intron (NM_033255, intron 3 of 10) intron (NM_033255, intron 3 of 10) 27661 NM_001330543 94240 Hs.546467 NM_033255 ENSG00000133106 EPSTI1 BRESI1 epithelial stromal interaction 1 protein-coding 212.666-45 chr2 98844943 98845114 + 1.33333 NA intron (NM_207362, intron 2 of 9) intron (NM_207362, intron 2 of 9) -73130 NR_126337 101927070 Hs.469395 NR_126337 LINC02611 - long intergenic non-protein coding RNA 2611 ncRNA 174.667-159 chr7 37766500 37766699 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81998 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 182.666-5 chr10 115196850 115197027 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) L1MEf|LINE|L1 103573 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 203.333-133 chr2 72097088 72097493 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 50572 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 203.333-49 chr12 8115758 8116034 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7736 NM_016184 50856 Hs.504657 NM_016184 ENSG00000111729 CLEC4A CD367|CLECSF6|DCIR|DDB27|HDCGC13P|LLIR C-type lectin domain family 4 member A protein-coding 158.333-144 chr2 58662140 58662355 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) L1ME3G|LINE|L1 141494 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 193.666-5 chr10 34112767 34112960 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 22 of 22) intron (NM_001184789, intron 22 of 22) -340183 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 323.667-13 chr2 124993365 124993755 + 1.33333 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 968273 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 228.333-85 chr6 165422973 165423154 + 1.33333 NA intron (NM_006661, intron 11 of 22) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -113458 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 306.666-3 chr11 13096809 13097313 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 87745 NM_001080521 644943 Hs.134650 NM_001080521 ENSG00000189431 RASSF10 - Ras association domain family member 10 protein-coding 201.666-10 chr12 54695578 54695795 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47321 NM_001300854 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 379.999-4 chr19 50905394 50905824 + 1.33333 NA TTS (NM_004917) TTS (NM_004917) 5129 NM_001302961 9622 Hs.218366 NM_004917 ENSG00000167749 KLK4 AI2A1|ARM1|EMSP|EMSP1|KLK-L1|PRSS17|PSTS|kallikrein kallikrein related peptidase 4 protein-coding 208-51 chr14 70387289 70387544 + 1.33333 NA intron (NM_001202549, intron 2 of 4) intron (NM_001202549, intron 2 of 4) -27733 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 161-14 chr11 110728785 110728975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15691 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 185.333-193 chr8 122971871 122972039 + 1.33333 NA intron (NM_001362797, intron 4 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 53817 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 186-56 chr20 57394764 57395045 + 1.33333 NA intron (NM_017495, intron 3 of 3) intron (NM_017495, intron 3 of 3) -1848 NR_149006 100291105 Hs.638423 NR_149006 ENSG00000218018 LOC100291105 - uncharacterized LOC100291105 ncRNA 198.666-70 chr4 72476413 72476563 + 1.33333 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) L1MD1|LINE|L1 92733 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 190.666-2 chr1 20836684 20836832 + 1.33333 NA intron (NM_003760, intron 25 of 31) intron (NM_003760, intron 25 of 31) -50070 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 252-94 chr6 129302191 129302445 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 22 of 64) L1ME2|LINE|L1 407859 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 321.333-45 chr3 30302426 30302737 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -216287 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 199.333-129 chr2 80798664 80798891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 485398 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 216.666-24 chr13 55668852 55669086 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 494515 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 352.333-3 chr10 64199752 64200299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -625503 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 223-71 chrX 10812514 10812803 + 1.33333 NA intron (NM_033290, intron 1 of 9) intron (NM_033290, intron 1 of 9) 21025 NM_033290 4281 Hs.27695 NM_000381 ENSG00000101871 MID1 BBBG1|FXY|GBBB1|MIDIN|OGS1|OS|OSX|RNF59|TRIM18|XPRF|ZNFXY midline 1 protein-coding 198-182 chr8 84381364 84381657 + 1.33333 NA intron (NM_001354319, intron 2 of 8) intron (NM_001354319, intron 2 of 8) -33974 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 239-23 chr16 8309890 8310163 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 279812 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 231.333-104 chr6 132201344 132201610 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 67499 NR_038981 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 475.999-2 chr2 54817711 54818194 + 1.33333 NA intron (NM_001039753, intron 3 of 40) intron (NM_001039753, intron 3 of 40) 92940 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 200.333-70 chr2 69093119 69093324 + 1.33333 NA intron (NM_032208, intron 9 of 17) intron (NM_032208, intron 9 of 17) -10461 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 214.666-13 chr10 125030891 125031097 + 1.33333 NA intron (NM_001290214, intron 3 of 10) intron (NM_001290214, intron 3 of 10) 1876 NR_036178 100423041 NR_036178 ENSG00000264572 MIR4296 - microRNA 4296 ncRNA 242.999-3 chr2 44692420 44692731 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 246313 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 368.666 chr1 161781371 161781789 + 1.33333 NA intron (NM_007348, intron 2 of 15) intron (NM_007348, intron 2 of 15) 15260 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 257-48 chr4 121741832 121742208 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22274 NM_001317839 132332 Hs.27524 NM_152399 ENSG00000164112 TMEM155 - transmembrane protein 155 protein-coding 202.667-105 chr3 180107629 180107923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70839 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 237-22 chr12 45335289 45335536 + 1.33333 NA intron (NM_001025356, intron 3 of 19) intron (NM_001025356, intron 3 of 19) 42722 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 181.333-64 chr18 11600362 11600585 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9085 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 194-99 chr4 38258257 38258518 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -108527 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 209.333-200 chr6 48200522 48200702 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -131923 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 199.333-136 chr2 146040358 146040610 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -546573 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 195.333-120 chr2 157787186 157787493 + 1.33333 NA intron (NM_001111067, intron 3 of 10) intron (NM_001111067, intron 3 of 10) 51291 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 204-114 chr20 21341506 21341662 + 1.33333 NA intron (NM_001317960, intron 15 of 29) intron (NM_001317960, intron 15 of 29) 38086 NM_001317960 22803 Hs.255932 NM_012255 ENSG00000088930 XRN2 - 5'-3' exoribonuclease 2 protein-coding 301.333-8 chr1 159466750 159467183 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27244 NM_012351 26476 Hs.532661 NM_012351 ENSG00000196184 OR10J1 HGMP07J|HSHGMP07J olfactory receptor family 10 subfamily J member 1 protein-coding 274.666-11 chr14 26721832 26722220 + 1.33333 NA intron (NR_147061, intron 2 of 6) intron (NR_147061, intron 2 of 6) -87322 NR_110557 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 220.667-16 chr10 105286398 105286678 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 533795 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 226-14 chr11 87971177 87971483 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 204113 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 200.667-59 chr17 61557556 61557827 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 33528 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 166.333-71 chr14 63184492 63184655 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19870 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 273.666-22 chr5 65962304 65962720 + 1.33333 NA intron (NM_001253697, intron 1 of 25) intron (NM_001253697, intron 1 of 25) -16939 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 149-58 chr18 1046222 1046395 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -118315 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 343.333-22 chr5 13117300 13117611 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84569 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 384-12 chr21 16752879 16753619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 163012 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 188.667-46 chr14 63641950 63642187 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001008726) promoter-TSS (NM_001008726) -197 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 204.333-120 chr3 29805066 29805286 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 128980 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 302-15 chr12 41483061 41483360 + 1.33333 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) (TTCATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 45471 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 214.667-16 chr10 74900270 74900558 + 1.33333 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) intron (NM_001370144, intron 3 of 15) -12372 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 546.666-2 chr20 46868700 46869349 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -25600 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 358.666-11 chr5 92699536 92699891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 871630 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 218.667-49 chr2 37496588 37496906 + 1.33333 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 152117 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 113.667-126 chr22 17464470 17464568 + 1.33333 NA intron (NM_001290047, intron 1 of 18) AluJr|SINE|Alu 95059 NM_001290047 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 167.333-239 chr7 25218506 25218653 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9907 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 347.666-18 chr8 39389347 39389753 + 1.33333 NA intron (NR_001448, intron 11 of 14) L1MDb|LINE|L1 74887 NR_001448 255926 Hs.369765 NM_001040073 ENSG00000196115 ADAM5 ADAM5P|TMDCII ADAM metallopeptidase domain 5 (pseudogene) pseudo 161-69 chr4 100167124 100167244 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -22849 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 258-81 chr7 115193489 115193781 + 1.33333 NA intron (NR_126407, intron 1 of 4) intron (NR_126407, intron 1 of 4) 37720 NR_126407 104355291 NR_126407 ENSG00000233607 LINC01392 - long intergenic non-protein coding RNA 1392 ncRNA 224.333-95 chr5 37625100 37625289 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) L1MA5A|LINE|L1 209628 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 212-17 chr1 235399694 235399961 + 1.33333 NA intron (NM_001287802, intron 2 of 15) MER21A|LTR|ERVL 32400 NM_001287801 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 347.333-21 chr4 84875975 84876576 + 1.33333 NA intron (NM_014991, intron 3 of 67) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -89341 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 215.666-30 chr3 184114133 184114406 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -9091 NR_133658 106478970 Hs.581159 NR_133658 ENSG00000238020 HTR3E-AS1 - HTR3E antisense RNA 1 ncRNA 179.333-44 chr11 115478648 115478836 + 1.33333 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) L1ME3G|LINE|L1 25673 NM_001098517 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 165.333-228 chr6 69545129 69545339 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 251232 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 270.666-20 chr4 30609150 30609532 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111028 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 201.667-9 chr10 60808937 60809201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30591 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 152.667-183 chr2 79931381 79931565 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -64890 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 396.666-3 chr20 10176602 10177018 + 1.33333 NA intron (NR_040710, intron 2 of 4) intron (NR_040710, intron 2 of 4) -41988 NM_003081 6616 Hs.167317 NM_003081 ENSG00000132639 SNAP25 CMS18|RIC-4|RIC4|SEC9|SNAP|SNAP-25|SUP|bA416N4.2|dJ1068F16.2 synaptosome associated protein 25 protein-coding 123.333-16 chr1 167934844 167935000 + 1.33333 NA intron (NM_001143674, intron 2 of 5) intron (NM_001143674, intron 2 of 5) 1074 NR_026550 25874 Hs.517768 NM_015415 ENSG00000143158 MPC2 BRP44|SLC54A2 mitochondrial pyruvate carrier 2 protein-coding 221.666-14 chr12 33434301 33434548 + 1.33333 NA intron (NM_198992, intron 1 of 6) intron (NM_198992, intron 1 of 6) 5395 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 152-47 chr12 127062947 127063091 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2622 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 164.667-211 chr6 140515004 140515244 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -168690 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 233-5 chr1 182469246 182469503 + 1.33333 NA intron (NM_001137669, intron 4 of 21) L1MB3|LINE|L1 19228 NM_001137669 353299 Hs.121200 NM_032267 ENSG00000121446 RGSL1 RGSL|RGSL2 regulator of G protein signaling like 1 protein-coding 200.667-65 chr18 74106922 74107191 + 1.33333 NA intron (NM_001142958, intron 8 of 9) intron (NM_001142958, intron 8 of 9) 40778 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 137.667-97 chr2 147781730 147781936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62684 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 189.333-159 chr5 77082703 77083054 + 1.33333 NA TTS (NR_138050) TTS (NR_138050) -2307 NR_003014 677828 Hs.693249 NR_003014 ENSG00000238961 SNORA47 HBI-115 small nucleolar RNA, H/ACA box 47 snoRNA 211.666-43 chr6 145076710 145076968 + 1.33333 NA Intergenic LTR1B|LTR|ERV1 610038 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 185-49 chr4 80083534 80083764 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -10177 NM_001286780 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 201.333-172 chr20 54734265 54734430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 258754 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 176.667-87 chr2 213877040 213877261 + 1.33333 NA intron (NR_047660, intron 10 of 14) L2c|LINE|L2 119083 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 164.666-9 chr2 62642386 62642533 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31419 NM_001142615 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 255.333-47 chr17 77123707 77124018 + 1.33333 NA intron (NM_001204410, intron 2 of 17) intron (NM_001204410, intron 2 of 17) -17107 NM_001039573 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 156-14 chr1 188972787 188973009 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1503112 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 206-153 chr6 47681182 47681353 + 1.33333 NA exon (NM_153839, exon 7 of 11) exon (NM_153839, exon 7 of 11) -17313 NM_153838 221393 Hs.150131 NM_153838 ENSG00000153294 ADGRF4 GPR115|PGR18 adhesion G protein-coupled receptor F4 protein-coding 193-88 chr7 99127510 99127787 + 1.33333 NA intron (NM_020429, intron 1 of 18) intron (NM_020429, intron 1 of 18) 16460 NM_001199847 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 196-185 chr8 112709462 112709739 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 66107 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 181.333-176 chr8 107869147 107869319 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 212706 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 199.666-53 chr7 6241677 6241835 + 1.33333 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) 30868 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 259.333-67 chr3 42931720 42932094 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -4435 NM_001205272 100506243 Hs.720172 NM_015673 ENSG00000240747 KRBOX1 - KRAB box domain containing 1 protein-coding 194-50 chr16 17874613 17874891 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -403792 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 243.333-3 chr1 63549260 63549580 + 1.33333 NA non-coding (NR_002771, exon 1 of 1) non-coding (NR_002771, exon 1 of 1) 440 NR_002771 79469 Hs.659291 NR_002771 DLEU2L BCMSUNL deleted in lymphocytic leukemia 2 like ncRNA 154.666-7 chr22 40472586 40472776 + 1.33333 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) intron (NM_020831, intron 3 of 14) -9241 NM_001282660 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 252-73 chr4 143655409 143655640 + 1.33333 NA intron (NM_001168235, intron 2 of 7) intron (NM_001168235, intron 2 of 7) 45151 NM_001168235 166752 Hs.252714 NM_001168235 ENSG00000183090 FREM3 - FRAS1 related extracellular matrix 3 protein-coding 207-65 chr2 62888495 62888654 + 1.33333 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) intron (NM_001142615, intron 10 of 22) 159137 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 197-31 chr13 43333183 43333397 + 1.33333 NA intron (NM_001347966, intron 10 of 17) intron (NM_001347966, intron 10 of 17) -115562 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 393-7 chr3 98441802 98442227 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -27466 NM_001004736 26339 Hs.621533 NM_001004736 ENSG00000232382 OR5K1 HSHTPCRX10|HTPCRX10|OR3-8 olfactory receptor family 5 subfamily K member 1 protein-coding 193.333-62 chr15 55123414 55123607 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 66763 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 216-114 chr7 19866551 19866733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93025 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 137.333-119 chr22 44557900 44558119 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -11331 NR_028409 388910 Hs.332685 NM_001012986 ENSG00000187012 LINC00207 NCRNA00207 long intergenic non-protein coding RNA 207 ncRNA 200.666 chr1 14312475 14312629 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 107421 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 223.333-143 chr6 63796943 63797255 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 37 of 43) intron (NM_001292009, intron 37 of 43) -9737 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 206.333-135 chr5 107131879 107132133 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -120992 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 196.666-15 chr12 43861915 43862083 + 1.33333 NA intron (NM_001286213, intron 2 of 6) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 25918 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 381-4 chr17 49437775 49438263 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -23114 NM_001281497 5245 Hs.514303 NM_002634 ENSG00000167085 PHB HEL-215|HEL-S-54e|PHB1 prohibitin protein-coding 200.666-68 chr2 211832278 211832431 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) intron (NM_001042599, intron 3 of 26) 594006 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 205-76 chr6 5623250 5623479 + 1.33333 NA intron (NM_006567, intron 6 of 6) intron (NM_006567, intron 6 of 6) 71908 NR_110842 101927950 Hs.571136 NR_110842 ENSG00000270174 LOC101927950 - uncharacterized LOC101927950 ncRNA 175.666-6 chr14 46457269 46457469 + 1.33333 NA intron (NR_102701, intron 5 of 5) L1ME2|LINE|L1 -13990 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 371-13 chr22 26332546 26333037 + 1.33333 NA intron (NM_001184776, intron 9 of 14) intron (NM_001184776, intron 9 of 14) -96469 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 281.333-62 chr7 77800290 77800557 + 1.33333 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) intron (NM_001366088, intron 1 of 11) 1452 NM_001366086 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 327.999-5 chr2 211055889 211056179 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 438463 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 364.666-15 chr8 26875760 26876111 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -8657 NM_000680 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 314-14 chr16 75104217 75104581 + 1.33333 NA intron (NM_032268, intron 2 of 4) intron (NM_032268, intron 2 of 4) 12373 NM_153486 197257 Hs.380929 NM_153486 ENSG00000166816 LDHD DLACD|DLD lactate dehydrogenase D protein-coding 230.666-21 chr16 21179072 21179362 + 1.33333 NA intron (NR_125971, intron 6 of 6) MIRc|SINE|MIR -19776 NM_017539 55567 Hs.526500 NM_017539 ENSG00000158486 DNAH3 DNAHC3-B|DNAHC3B|HDHC8|HEL-36|HSADHC3 dynein axonemal heavy chain 3 protein-coding 197.333-146 chr3 53531434 53531696 + 1.33333 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) intron (NM_001128840, intron 3 of 47) 36954 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 254.333-77 chr7 17504495 17504805 + 1.33333 NA intron (NR_110013, intron 1 of 3) intron (NR_110013, intron 1 of 3) 54259 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 219.333-51 chr14 57336536 57336809 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53914 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 180.666-30 chr6 100280413 100280559 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 183189 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 257.666-5 chr11 74155725 74156056 + 1.33333 NA intron (NM_001286577, intron 3 of 32) AluJb|SINE|Alu 15112 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 238.999-7 chr6 16624428 16624679 + 1.33333 NA intron (NM_000332, intron 4 of 8) intron (NM_000332, intron 4 of 8) 135631 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 197.666-51 chr5 62859282 62859431 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 280537 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 199.333-118 chr2 17783909 17784186 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001130009, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001130009, exon 14 of 14) 29909 NM_001130009 348654 Hs.467793 NM_182625 ENSG00000178295 GEN1 Gen GEN1 Holliday junction 5' flap endonuclease protein-coding 186.667-35 chr14 33834927 33835151 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 116035 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 295.333-28 chr2 163324209 163324609 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 411599 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 214.667-35 chr12 50161461 50161742 + 1.33333 NA intron (NM_001331069, intron 1 of 11) AluSz6|SINE|Alu 5768 NM_001331071 91012 Hs.270525 NM_147190 ENSG00000139624 CERS5 LASS5|Trh4 ceramide synthase 5 protein-coding 191.666-7 chr2 68200122 68200270 + 1.33333 NA intron (NM_000945, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 42308 NM_001329917 56902 Hs.262858 NM_020143 ENSG00000115946 PNO1 KHRBP1|RRP20 partner of NOB1 homolog protein-coding 165.333-165 chr3 52554666 52554814 + 1.33333 NA exon (NM_018313, exon 27 of 30) exon (NM_018313, exon 27 of 30) 18135 NM_001124767 440957 Hs.660577 NM_001124767 ENSG00000168273 SMIM4 C3orf78 small integral membrane protein 4 protein-coding 290.666-4 chr1 210502539 210502838 + 1.33333 NA intron (NM_001122834, intron 8 of 11) intron (NM_001122834, intron 8 of 11) 173322 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 263.666-2 chr14 69231133 69231508 + 1.33333 NA intron (NM_001193360, intron 5 of 9) HAL1|LINE|L1 -28838 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 187.333-171 chr5 172986044 172986229 + 1.33333 NA intron (NM_003945, intron 1 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 2365 NM_003945 8992 Hs.484188 NM_003945 ENSG00000113732 ATP6V0E1 ATP6H|ATP6V0E|M9.2|Vma21|Vma21p ATPase H+ transporting V0 subunit e1 protein-coding 204-174 chr6 39517707 39517886 + 1.33333 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) intron (NM_001289021, intron 12 of 21) -86406 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 204-13 chr1 114700461 114700630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4927 NM_001172626 270 Hs.89570 NM_000036 ENSG00000116748 AMPD1 MAD|MADA|MMDD adenosine monophosphate deaminase 1 protein-coding 217.333-51 chr16 59459188 59459476 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 295859 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 204.333-184 chr7 3895340 3895586 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -234222 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 142.667 chr1 6710959 6711155 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -9241 NM_018198 55735 Hs.462640 NM_018198 ENSG00000007923 DNAJC11 dJ126A5.1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C11 protein-coding 120-70 chr2 135857886 135858023 + 1.33333 NA exon (NM_005915, exon 10 of 17) exon (NM_005915, exon 10 of 17) 18489 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 138-43 chr17 29389767 29389968 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_039749) promoter-TSS (NR_039749) -795 NR_039749 100616122 NR_039749 ENSG00000284162 MIR4523 - microRNA 4523 ncRNA 198.666-31 chr17 59475124 59475285 + 1.33333 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) AluY|SINE|Alu 51653 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 255.999-9 chr7 41386486 41386705 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 284991 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 209-38 chr13 49583900 49584069 + 1.33333 NA intron (NR_148016, intron 1 of 13) intron (NR_148016, intron 1 of 13) 1574 NR_148015 55213 Hs.508021 NM_018191 ENSG00000136144 RCBTB1 CLLD7|CLLL7|GLP|RDEOA RCC1 and BTB domain containing protein 1 protein-coding 261-15 chr11 78256284 78256631 + 1.33333 NA intron (NM_012296, intron 2 of 9) L1MB8|LINE|L1 67538 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 188.666-20 chr2 162898270 162898424 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59580 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 206-33 chr11 85511388 85511550 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) intron (NM_001142699, intron 3 of 27) 115801 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 492.333-5 chr7 69343464 69344182 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 253801 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 197.333-115 chr2 99163580 99163746 + 1.33333 NA TTS (NR_037936) TTS (NR_037936) 8589 NM_001204830 51601 Hs.719172 NM_015929 ENSG00000144182 LIPT1 LIPT1D lipoyltransferase 1 protein-coding 250-29 chr15 82145484 82145819 + 1.33333 NA intron (NM_001040610, intron 16 of 17) AluSq2|SINE|Alu 57057 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 215.666-40 chr8 52997913 52998101 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58099 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 227.333-112 chr7 25770181 25770480 + 1.33333 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) 5869 NR_157811 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 205.666-51 chr7 84892857 84893077 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 228964 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 202.333-95 chr2 150452368 150452618 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 35202 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 178-93 chr5 101274331 101274495 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -371131 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 394 chr1 109368494 109368873 + 1.33333 NA intron (NM_001205228, intron 2 of 19) intron (NM_001205228, intron 2 of 19) 24674 NM_001205228 6272 Hs.485195 NM_002959 ENSG00000134243 SORT1 Gp95|LDLCQ6|NT3|NTR3 sortilin 1 protein-coding 242-78 chr8 121143804 121144041 + 1.33333 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -331876 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 198.667-185 chr8 121339472 121339710 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -299755 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 116.666-3 chr6 158692345 158692517 + 1.33333 NA intron (NM_001242394, intron 6 of 17) intron (NM_001242394, intron 6 of 17) 29028 NM_001318745 94120 Hs.436977 NM_001009991 ENSG00000164674 SYTL3 SLP3 synaptotagmin like 3 protein-coding 180-85 chr6 54628017 54628196 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -218665 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 277-2 chr1 45846190 45846633 + 1.33333 NA intron (NM_001324320, intron 3 of 29) intron (NM_001324320, intron 3 of 29) -17937 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 230-72 chr8 62636015 62636260 + 1.33333 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) intron (NM_001304533, intron 3 of 6) -341724 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 206.666-68 chr21 16859441 16859642 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 269304 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 245.333-107 chr7 20492777 20493145 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -122706 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 228-59 chr3 163677036 163677302 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -373868 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 212-124 chr5 24195590 24195889 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 244391 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 206-24 chr10 114996295 114996562 + 1.33333 NA intron (NR_120677, intron 2 of 2) intron (NR_120677, intron 2 of 2) 1771 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 206.333-126 chr4 128178839 128179148 + 1.33333 NA intron (NR_146772, intron 13 of 19) AluJo|SINE|Alu 108820 NM_006320 10424 Hs.507910 NM_006320 ENSG00000164040 PGRMC2 DG6|PMBP progesterone receptor membrane component 2 protein-coding 244.666-32 chr3 125333689 125334026 + 1.33333 NA intron (NM_001348436, intron 1 of 8) Tigger5|DNA|TcMar-Tigger 23423 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 205.333-245 chr8 102851787 102852006 + 1.33333 NA intron (NM_001363083, intron 2 of 12) Charlie10b|DNA|hAT-Charlie 12267 NM_001301668 51582 Hs.459106 NM_015878 ENSG00000155096 AZIN1 AZI|AZI1|AZIA1|OAZI|OAZIN|ODC1L antizyme inhibitor 1 protein-coding 324.667-27 chr4 60057535 60057950 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -864877 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 275.999 chr14 45692698 45692950 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 22778 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 348.333-17 chr2 76210579 76210998 + 1.33333 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -499873 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 114.667-254 chr8 140998104 140998239 + 1.33333 NA intron (NM_001352737, intron 1 of 32) intron (NM_001352737, intron 1 of 32) 2833 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 291.999-2 chr1 178818432 178818830 + 1.33333 NA intron (NM_152663, intron 6 of 19) intron (NM_152663, intron 6 of 19) 52446 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 194.333-61 chr19 55681478 55681657 + 1.33333 NA intron (NM_001321263, intron 2 of 10) MER58A|DNA|hAT-Charlie 4942 NM_001130071 29924 Hs.279953 NM_013333 ENSG00000063245 EPN1 - epsin 1 protein-coding 156-95 chr4 14344192 14344434 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 232345 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 337.333-31 chr3 168843026 168843393 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -58736 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 251.333-118 chr9 84424440 84424786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55886 NM_022127 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 190.666-11 chr10 86919098 86919255 + 1.33333 NA exon (NM_004329, exon 10 of 13) exon (NM_004329, exon 10 of 13) -36583 NM_001330120 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 206-127 chr4 72566856 72567056 + 1.33333 NA intron (NM_014243, intron 2 of 21) intron (NM_014243, intron 2 of 21) 2265 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 258.666-15 chr16 54114496 54115016 + 1.33333 NA TTS (NM_001363898) TTS (NM_001363898) 75363 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 318.333-9 chr13 67871134 67871711 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 499035 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 207-71 chr20 53488318 53488516 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001193421, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001193421, exon 3 of 3) -64353 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 263-16 chr13 24865690 24865966 + 1.33333 NA intron (NM_031277, intron 29 of 35) intron (NM_031277, intron 29 of 35) 57033 NR_047595 55835 Hs.513379 NM_018451 ENSG00000151849 CENPJ BM032|CENP-J|CPAP|LAP|LIP1|MCPH6|SASS4|SCKL4|Sas-4 centromere protein J protein-coding 383.666-6 chr2 121942468 121942803 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 186984 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 217.667-87 chr8 77723498 77723777 + 1.33333 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 272940 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 179.333-111 chr20 9731547 9731786 + 1.33333 NA intron (NM_177990, intron 1 of 9) intron (NM_177990, intron 1 of 9) 107410 NM_177990 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 209.333-122 chr2 165160334 165160593 + 1.33333 NA intron (NM_006922, intron 9 of 27) intron (NM_006922, intron 9 of 27) 43587 NM_006922 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 187.333-115 chr20 24540616 24540861 + 1.33333 NA intron (NM_001323606, intron 2 of 4) L1MB3|LINE|L1 70777 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 290-42 chr5 112332792 112333183 + 1.33333 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) intron (NM_001347887, intron 1 of 23) 86290 NM_001347887 64097 Hs.584954 NM_022140 ENSG00000129595 EPB41L4A EPB41L4|NBL4 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A protein-coding 250.999-5 chr7 15342408 15342717 + 1.33333 NA intron (NM_001004320, intron 12 of 12) intron (NM_001004320, intron 12 of 12) 219453 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 265-32 chr2 57579993 57580263 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -327523 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 164-23 chr11 106720684 106720833 + 1.33333 NA intron (NM_000855, intron 6 of 7) L1MC3|LINE|L1 297718 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 167.333-250 chr8 17490001 17490211 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6982 NM_001008539 6542 Hs.448520 NM_003046 ENSG00000003989 SLC7A2 ATRC2|CAT2|HCAT2 solute carrier family 7 member 2 protein-coding 113-60 chr14 68112631 68112814 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 289130 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 158.666-19 chr4 156548671 156548836 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 423046 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 210.666-82 chr5 9676323 9676490 + 1.33333 NA intron (NR_027112, intron 9 of 12) L1MC3|LINE|L1 -46055 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 313-38 chr6 142621559 142622097 + 1.33333 NA intron (NR_027311, intron 1 of 2) intron (NR_027311, intron 1 of 2) 16008 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 202.666-80 chr3 141612113 141612383 + 1.33333 NA intron (NM_006506, intron 23 of 23) intron (NM_006506, intron 23 of 23) -50951 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 255.333-124 chrX 93271676 93271972 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 401754 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 204.333-49 chr13 41225604 41225783 + 1.33333 NA intron (NM_001354074, intron 8 of 9) AluSc5|SINE|Alu -31124 NM_032138 84078 Hs.63841 NM_032138 ENSG00000120696 KBTBD7 - kelch repeat and BTB domain containing 7 protein-coding 197.667-140 chr7 71943979 71944237 + 1.33333 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 393283 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 467.333-2 chr10 44684693 44685400 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -226270 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 224-85 chr6 88989197 88989513 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25737 NM_001286426 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 174.667-59 chr15 67771911 67772153 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 20 of 21) intron (NM_001206804, intron 20 of 21) -53477 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 176-91 chr8 10037821 10038048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16358 NM_001135670 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 186.667-9 chr1 248615385 248615773 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 11549 NM_001001964 127077 Hs.626619 NM_001001964 ENSG00000279301 OR2T11 OR2T11Q olfactory receptor family 2 subfamily T member 11 (gene/pseudogene) protein-coding 195.667-153 chr9 32539739 32540042 + 1.33333 NA TTS (NM_005802) TTS (NM_005802) -11254 NM_001349118 100129250 Hs.664395 NM_001349118 ENSG00000235453 SMIM27 C9orf133|TOPORS-AS1 small integral membrane protein 27 protein-coding 212-116 chr4 62841517 62841788 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -679887 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 197-117 chr8 112625475 112625749 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 20 of 66) intron (NM_001363185, intron 20 of 66) -17881 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 207.333-30 chr10 60381272 60381520 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 8479 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 310-54 chr7 83508672 83509269 + 1.33333 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 132461 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 199.667-18 chr10 80935133 80935413 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 285476 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 164-40 chr15 94962748 94962900 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 107461 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 266.333-44 chr5 12009304 12009558 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -104985 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 206.666-44 chr15 67693696 67693888 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 15 of 21) intron (NM_001206804, intron 15 of 21) -131717 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 203.333-38 chr10 108397064 108397245 + 1.33333 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL -327861 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 190.666-30 chr20 23614459 23614632 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8572 NM_001008693 128822 Hs.698020 NM_001008693 ENSG00000173335 CST9 CLM|CTES7A cystatin 9 protein-coding 218.666-41 chr2 60931358 60931588 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001291746, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001291746, exon 10 of 10) 49899 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 211-38 chr14 78508061 78508234 + 1.33333 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 104428 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 205.333-68 chr14 47602596 47602894 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 72209 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 254-37 chr2 111926982 111927355 + 1.33333 NA intron (NM_006343, intron 1 of 18) intron (NM_006343, intron 1 of 18) 28561 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 198-135 chr4 41044740 41045006 + 1.33333 NA intron (NM_001330658, intron 3 of 15) HAL1M8|LINE|L1 169669 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 209-27 chr12 8931092 8931257 + 1.33333 NA intron (NM_004426, intron 7 of 14) intron (NM_004426, intron 7 of 14) 16665 NM_004426 1911 Hs.744902 NM_004426 ENSG00000111752 PHC1 EDR1|HPH1|MCPH11|RAE28 polyhomeotic homolog 1 protein-coding 253-58 chr5 155775891 155776151 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -550736 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 175.333-207 chr9 103673840 103674010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -325784 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 331-19 chr2 72278810 72279144 + 1.33333 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -131115 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 276-29 chr16 58789335 58789711 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -55207 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 173.333-171 chr6 54254863 54255115 + 1.33333 NA intron (NM_138569, intron 11 of 12) intron (NM_138569, intron 11 of 12) -53452 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 226-42 chr2 119313478 119313797 + 1.33333 NA intron (NM_001322332, intron 3 of 4) L1ME4b|LINE|L1 53105 NM_001322329 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 203.333-149 chr2 203240814 203241042 + 1.33333 NA intron (NM_177538, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 2487 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 244.333-72 chr3 111336411 111336717 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205633 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 439.333-12 chrX 20476480 20477001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -209831 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 268.666-15 chr17 59234686 59235143 + 1.33333 NA intron (NM_182569, intron 2 of 9) intron (NM_182569, intron 2 of 9) 14403 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 205-17 chr10 111527009 111527259 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 412843 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 252.333-73 chr8 30850957 30851308 + 1.33333 NA intron (NR_146525, intron 6 of 6) L1ME4b|LINE|L1 37574 NR_146525 56154 Hs.458316 NM_001350162 ENSG00000133863 TEX15 CT42|SPGF25 testis expressed 15, meiosis and synapsis associated protein-coding 221.333-16 chr10 72180034 72180215 + 1.33333 NA intron (NM_001369110, intron 5 of 8) AluSz|SINE|Alu 35832 NM_001369088 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 227-27 chr2 160193098 160193405 + 1.33333 NA intron (NM_001282390, intron 3 of 13) L1ME2|LINE|L1 7021 NM_000888 3694 Hs.470399 NM_000888 ENSG00000115221 ITGB6 AI1H integrin subunit beta 6 protein-coding 282.333-48 chr5 115734426 115734688 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61905 NR_104674 102467217 Hs.147738 NR_104674 LOC102467217 - uncharacterized LOC102467217 ncRNA 187.333-164 chr5 119468352 119468536 + 1.33333 NA intron (NM_000414, intron 2 of 23) L1MA5|LINE|L1 15947 NM_001292028 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 185.333-40 chr12 22559372 22559645 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14962 NM_001286177 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 170-65 chr2 144782213 144782415 + 1.33333 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) intron (NR_033870, intron 2 of 4) 114347 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 217.666-27 chr3 90364667 90364913 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1257169 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 180.666-20 chr21 30473929 30474137 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 6334 NM_181607 337882 Hs.61552 NM_181607 ENSG00000184351 KRTAP19-1 KAP19.1 keratin associated protein 19-1 protein-coding 237.333-58 chr2 122961022 122961351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 112295 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 366.666-8 chr20 18672322 18672662 + 1.33333 NA intron (NM_080820, intron 4 of 5) intron (NM_080820, intron 4 of 5) 26216 NR_109955 101929526 Hs.639402 NR_109955 ENSG00000233993 LOC101929526 - uncharacterized LOC101929526 ncRNA 141.333-34 chr11 47028918 47029102 + 1.33333 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) AluJb|SINE|Alu 92249 NM_024113 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 240.666 chr1 41275423 41275691 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -33251 NM_001172218 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 341.333-15 chr4 23275967 23276475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 562132 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 414.667 chr10 102499347 102499878 + 1.33333 NA intron (NM_005736, intron 1 of 10) intron (NM_005736, intron 1 of 10) 3100 NM_005736 10121 Hs.153961 NM_005736 ENSG00000138107 ACTR1A ARP1|Arp1A|CTRN1 actin related protein 1A protein-coding 253.666-15 chr22 32398578 32398896 + 1.33333 NA intron (NM_014306, intron 6 of 11) intron (NM_014306, intron 6 of 11) 13510 NM_014306 51493 Hs.474643 NM_014306 ENSG00000100220 RTCB C22orf28|DJ149A16.6|FAAP|HSPC117 RNA 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH ligase protein-coding 197.333-163 chr4 33815643 33815943 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 224100 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 315.666-3 chr1 180889214 180889584 + 1.33333 NA non-coding (NR_137330, exon 13 of 13) non-coding (NR_137330, exon 13 of 13) -23498 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 174.333-131 chr6 75275662 75275930 + 1.33333 NA intron (NM_018247, intron 1 of 6) MER21B|LTR|ERVL 8996 NM_018247 55754 Hs.108530 NM_018247 ENSG00000112697 TMEM30A C6orf67|CDC50A transmembrane protein 30A protein-coding 281.333-13 chr12 34539638 34540094 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 517370 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 210.666-75 chr4 26382499 26382735 + 1.33333 NA intron (NM_203284, intron 2 of 11) AluJo|SINE|Alu 61389 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 226.333-106 chr8 71983692 71983995 + 1.33333 NA intron (NR_033652, intron 4 of 4) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 91741 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 189.333-49 chr13 113568231 113568382 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -16382 NR_026580 7027 Hs.79353 NM_007111 ENSG00000198176 TFDP1 DILC|DP1|DRTF1|Dp-1 transcription factor Dp-1 protein-coding 358.666-4 chr19 6834222 6834602 + 1.33333 NA intron (NM_001258206, intron 19 of 25) AluSx|SINE|Alu -53167 NM_001256253 2015 Hs.2375 NM_001974 ENSG00000174837 ADGRE1 EMR1|TM7LN3 adhesion G protein-coupled receptor E1 protein-coding 256.333-47 chr2 172133068 172133491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30273 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 400.333-6 chr15 67716563 67716913 + 1.33333 NA intron (NM_002757, intron 16 of 20) MIRc|SINE|MIR -108771 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 189.666-29 chr3 60631862 60632028 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 5 of 9) intron (NM_001320900, intron 5 of 9) -14075 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 210-67 chr2 114476307 114476569 + 1.33333 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 14861 NM_001321912 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 196-98 chr20 31810275 31810509 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8983 NM_033118 85366 Hs.86092 NM_033118 ENSG00000101306 MYLK2 KMLC|MLCK|MLCK2|skMLCK myosin light chain kinase 2 protein-coding 192.333-58 chr15 64554040 64554238 + 1.33333 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 54719 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 289.666-9 chr20 46788040 46788290 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 78516 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 202-2 chr1 23098136 23098373 + 1.33333 NA intron (NM_001142546, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 53949 NR_036057 100422866 NR_036057 ENSG00000263793 MIR3115 mir-3115 microRNA 3115 ncRNA 267.333-79 chr6 75822501 75822799 + 1.33333 NA intron (NR_160539, intron 3 of 9) intron (NR_160539, intron 3 of 9) 73411 NM_001300899 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 196-140 chr5 10176919 10177196 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 72831 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 181.333-14 chr10 53211404 53211626 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -439815 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 210.333-179 chr9 77925845 77926229 + 1.33333 NA intron (NM_002072, intron 1 of 6) MER2|DNA|TcMar-Tigger 105774 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 329.666-5 chr15 72436719 72437031 + 1.33333 NA intron (NR_135678, intron 1 of 3) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 37364 NR_135678 105370888 Hs.540241 NR_135678 ENSG00000261423 TMEM202-AS1 - TMEM202 antisense RNA 1 ncRNA 200-50 chr14 45851975 45852142 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -136456 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 570.333 chr5 36113650 36114681 + 1.33333 NA intron (NM_001007527, intron 13 of 17) intron (NM_001007527, intron 13 of 17) 33823 NR_030306 693165 NR_030306 ENSG00000207756 MIR580 MIRN580|hsa-mir-580 microRNA 580 ncRNA 139.333-33 chr11 19404662 19404826 + 1.33333 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) intron (NM_001111018, intron 1 of 37) 54020 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 308-54 chr7 50095781 50096207 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001161834) promoter-TSS (NM_001161834) -92 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 204.333-7 chr1 66625482 66625720 + 1.33333 NA intron (NM_001350218, intron 1 of 22) intron (NM_001350218, intron 1 of 22) -2839 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 291.333-44 chr3 171085571 171085888 + 1.33333 NA intron (NM_001161563, intron 23 of 31) intron (NM_001161563, intron 23 of 31) 21030 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 190.666-36 chr3 136577724 136577913 + 1.33333 NA intron (NM_005862, intron 4 of 33) intron (NM_005862, intron 4 of 33) 174560 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 413.333-8 chr2 195837895 195838266 + 1.33333 NA intron (NM_018897, intron 47 of 64) L1MEf|LINE|L1 180854 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 153-136 chr7 144411590 144411781 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1458 NM_001080413 135935 Hs.558628 NM_001080413 ENSG00000106410 NOBOX OG-2|OG2|OG2X|POF5|TCAG_12042 NOBOX oogenesis homeobox protein-coding 219.666-24 chr2 70494978 70495213 + 1.33333 NA intron (NM_003236, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 -13455 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 201.333-86 chr13 90231895 90232087 + 1.33333 NA TTS (NR_030754) TTS (NR_030754) 809 NR_030754 693207 NR_030754 ENSG00000283783 MIR622 MIRN622|hsa-mir-622 microRNA 622 ncRNA 318.333-7 chr10 106141266 106141694 + 1.33333 NA intron (NR_134330, intron 1 of 4) intron (NR_134330, intron 1 of 4) 1315 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 219.333-134 chr4 179353787 179353954 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1445934 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 320-26 chr2 125785115 125785384 + 1.33333 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 332736 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 128.667-36 chr11 99199169 99199348 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 178309 NM_001243270 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 533.666-2 chr14 60969939 60970759 + 1.33333 NA TTS (NM_002431) TTS (NM_002431) 10730 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 270.333-68 chrX 78955099 78955356 + 1.33333 NA intron (NM_014499, intron 3 of 3) intron (NM_014499, intron 3 of 3) 9836 NM_001324221 27334 Hs.296433 NM_014499 ENSG00000078589 P2RY10 LYPSR2|P2Y10 P2Y receptor family member 10 protein-coding 204.333-173 chr6 49744635 49744848 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001190986) promoter-TSS (NM_001190986) -286 NM_001190986 10321 Hs.404466 NM_006061 ENSG00000096006 CRISP3 Aeg2|CRISP-3|CRS3|SGP28|dJ442L6.3 cysteine rich secretory protein 3 protein-coding 274.999-5 chr22 17371492 17371902 + 1.33333 NA intron (NM_001290047, intron 1 of 18) intron (NM_001290047, intron 1 of 18) 2237 NM_001290047 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 203.666-36 chr20 61779176 61779360 + 1.33333 NA intron (NM_001252339, intron 3 of 14) intron (NM_001252339, intron 3 of 14) -59520 NR_147702 100128310 Hs.683806 NR_147702 ENSG00000179253 LOC100128310 - uncharacterized LOC100128310 ncRNA 209.333-98 chr19 40557312 40557527 + 1.33333 NA intron (NM_025213, intron 9 of 9) intron (NM_025213, intron 9 of 9) -19454 NM_138392 92799 Hs.26506 NM_138392 ENSG00000160410 SHKBP1 PP203|Sb1 SH3KBP1 binding protein 1 protein-coding 202.333-162 chr7 29935231 29935477 + 1.33333 NA intron (NM_001145514, intron 6 of 7) intron (NM_001145514, intron 6 of 7) 54447 NM_001145515 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 258.333-41 chr22 44347952 44348234 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35142 NM_001099294 85352 Hs.6829 NM_001099294 ENSG00000138944 SHISAL1 KIAA1644 shisa like 1 protein-coding 282.666-5 chr14 40911996 40912274 + 1.33333 NA Intergenic (ATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -42576 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 256.333-22 chr12 63223441 63223706 + 1.33333 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -70763 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 257-52 chr5 62498543 62498833 + 1.33333 NA intron (NM_016338, intron 16 of 29) AluSx1|SINE|Alu 79804 NM_001134779 51194 Hs.482269 NM_016338 ENSG00000086200 IPO11 RanBP11 importin 11 protein-coding 273.666 chr1 114501257 114501638 + 1.33333 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 9756 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 193.333-8 chr1 118457512 118457786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -272421 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 222-73 chr5 74549821 74550076 + 1.33333 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -12972 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 300.667-47 chr9 60519523 60519915 + 1.33333 NA Intergenic CER|Satellite|Satellite -394688 NM_001113541 727905 Hs.645497 NM_001113541 ENSG00000276581 SPATA31A5 FAM75A5 SPATA31 subfamily A member 5 protein-coding 246-57 chr20 40465746 40466092 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 223317 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 293.999-6 chr3 8843423 8843848 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74021 NM_001354653 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 386.333-5 chr20 48184874 48185450 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -174749 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 179-65 chr3 34435777 34436036 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 637276 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 264-53 chr8 85187195 85187548 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001083589) promoter-TSS (NM_001083589) -294 NM_001083589 1875 Hs.445758 NM_001951 ENSG00000133740 E2F5 E2F-5 E2F transcription factor 5 protein-coding 213-76 chr6 129327159 129327448 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 28 of 64) intron (NM_000426, intron 28 of 64) 382874 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 327.333-44 chr7 78651917 78652287 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) 304860 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 346.667-7 chr2 228125686 228126108 + 1.33333 NA intron (NM_030623, intron 2 of 10) AluSz|SINE|Alu 55748 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 371-16 chr7 32344876 32345375 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) -45797 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 145.333-139 chr2 118294228 118294463 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -107959 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 174-20 chr12 24685995 24686213 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101936 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 192.667-28 chr10 74912481 74912713 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_134476) promoter-TSS (NR_134476) -189 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 251.333-13 chr10 88052584 88052881 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 189107 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 196-163 chr6 163560778 163560951 + 1.33333 NA intron (NM_206853, intron 4 of 6) intron (NM_206853, intron 4 of 6) 110620 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 388.666-3 chr14 58498385 58498912 + 1.33333 NA intron (NM_001329944, intron 26 of 31) intron (NM_001329944, intron 26 of 31) 58967 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 349.333-17 chr2 103390111 103390437 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -405845 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 174.333-69 chr2 141026863 141027049 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 11 of 90) intron (NM_018557, intron 11 of 90) -440271 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 329.999-6 chr2 42410312 42410634 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -41516 NM_001319036 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 182-92 chr6 48691721 48691871 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -623107 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 220.667-8 chr1 114945021 114945375 + 1.33333 NA intron (NM_001282542, intron 25 of 30) intron (NM_001282542, intron 25 of 30) -84626 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 309.333-47 chr3 99747789 99748151 + 1.33333 NA intron (NM_001850, intron 3 of 4) intron (NM_001850, intron 3 of 4) -69892 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 202.666-17 chr10 90589065 90589267 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48361 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 243.333-92 chr5 120910747 120911010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 379414 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 249.666-37 chr7 47049088 47049284 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -352064 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 384-7 chr14 87971882 87972299 + 1.33333 NA intron (NM_000153, intron 7 of 16) intron (NM_000153, intron 7 of 16) 21092 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 202.333-115 chr3 180587353 180587550 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14712 NM_133462 151613 Hs.43213 NM_133462 ENSG00000163728 TTC14 DRDL5813|PRO19630 tetratricopeptide repeat domain 14 protein-coding 142.667-181 chr5 110492394 110492569 + 1.33333 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) L1ME3E|LINE|L1 21434 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 338-28 chr8 28279530 28279898 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37554 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 198-172 chr7 71758612 71758805 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -450938 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 392.333-13 chrX 121649277 121649926 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 278629 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 197-122 chr8 140971803 140971988 + 1.33333 NA intron (NM_001352719, intron 1 of 32) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 29109 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 333-7 chr11 72443012 72443495 + 1.33333 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8569 NM_001258394 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 228.333-58 chr3 765216 765392 + 1.33333 NA intron (NR_110118, intron 2 of 3) MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR 173199 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 158.666-24 chr6 119154045 119154209 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4934 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 208-68 chr19 37863327 37863527 + 1.33333 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -8231 NR_040015 100631378 Hs.726940 NR_040015 ENSG00000225868 LOC100631378 - uncharacterized 100631378 ncRNA 160.666-3 chr13 103384784 103384945 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -40336 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 198.666-17 chr12 93541786 93542006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28073 NM_003877 8835 Hs.485572 NM_003877 ENSG00000120833 SOCS2 CIS2|Cish2|SOCS-2|SSI-2|SSI2|STATI2 suppressor of cytokine signaling 2 protein-coding 204.666-62 chr4 48121714 48121981 + 1.33333 NA intron (NM_003328, intron 1 of 14) L1MB3|LINE|L1 12403 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 230.666-12 chr12 40538617 40538892 + 1.33333 NA intron (NM_173600, intron 134 of 173) intron (NM_173600, intron 134 of 173) 145360 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 221.666-8 chr10 63474521 63474802 + 1.33333 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) AluJb|SINE|Alu -8684 NM_032776 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 204-100 chr2 123524393 123524572 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -451001 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 249.333-53 chr2 86388958 86389196 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -50994 NM_001164730 65055 Hs.368884 NM_022912 ENSG00000068615 REEP1 C2orf23|HMN5B|SPG31|Yip2a receptor accessory protein 1 protein-coding 215.333-144 chr4 69683273 69683555 + 1.33333 NA Intergenic (TTTGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -30167 NM_001252275 10941 Hs.225950 NM_006798 ENSG00000173610 UGT2A1 UDPGT2A1 UDP glucuronosyltransferase family 2 member A1 complex locus protein-coding 218.333 chr1 31145661 31146007 + 1.33333 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 -80117 NM_001020658 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 283.999-7 chr5 8383383 8383637 + 1.33333 NA intron (NR_039984, intron 3 of 5) intron (NR_039984, intron 3 of 5) 74054 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 133-75 chr5 64487537 64487753 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18370 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 329.333-6 chr10 76456110 76456566 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -431706 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 206.667-148 chrX 71124502 71124799 + 1.33333 NA intron (NM_005120, intron 13 of 44) intron (NM_005120, intron 13 of 44) 6054 NM_005120 9968 Hs.409226 NM_005120 ENSG00000184634 MED12 ARC240|CAGH45|FGS1|HOPA|MED12S|OHDOX|OKS|OPA1|TNRC11|TRAP230 mediator complex subunit 12 protein-coding 223.666-14 chr14 80503913 80504166 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 24 of 24) intron (NM_152446, intron 24 of 24) -272982 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 210.666-93 chr6 132436121 132436342 + 1.33333 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -34756 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 164-19 chr10 96920005 96920155 + 1.33333 NA intron (NM_001170766, intron 4 of 8) L1MB2|LINE|L1 87135 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 194.667-130 chr5 149461545 149461785 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 31019 NR_029686 406937 NR_029686 ENSG00000276365 MIR145 MIRN145|miR-145|miRNA145 microRNA 145 ncRNA 224.666-8 chr11 42224543 42224733 + 1.33333 NA intron (NR_038309, intron 4 of 5) intron (NR_038309, intron 4 of 5) 29052 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 198-170 chr7 35772730 35773012 + 1.33333 NA intron (NR_120511, intron 3 of 5) intron (NR_120511, intron 3 of 5) 27754 NR_120512 101928545 Hs.648103 NR_120511 SEPTIN7-AS1 SEPT7-AS1 SEPT7 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 119.333-167 chr5 25454500 25454606 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E2-int|LTR|ERVL-MaLR 263600 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 324.333-15 chr14 52458628 52459009 + 1.33333 NA intron (NM_001160047, intron 16 of 20) intron (NM_001160047, intron 16 of 20) 93687 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 287.333-14 chr12 27763144 27763418 + 1.33333 NA exon (NM_001146221, exon 3 of 3) exon (NM_001146221, exon 3 of 3) 8301 NM_001146221 100287284 NM_001146221 ENSG00000205693 MANSC4 - MANSC domain containing 4 protein-coding 258.333-44 chr3 71061064 71061415 + 1.33333 NA intron (NR_146142, intron 7 of 19) intron (NR_146142, intron 7 of 19) 3685 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 192.666-11 chr10 127454347 127454562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94895 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 223.333-150 chr7 1880482 1880806 + 1.33333 NA intron (NM_001013837, intron 18 of 18) intron (NM_001013837, intron 18 of 18) -36391 NR_039799 100616160 NR_039799 ENSG00000265089 MIR4655 - microRNA 4655 ncRNA 244.333-103 chr8 112762317 112762656 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 118993 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 296-30 chr2 64063033 64063577 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43877 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 225.333-119 chr6 167482101 167482276 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9398 NR_134591 105378127 Hs.58456 NR_134591 LOC105378127 - uncharacterized LOC105378127 ncRNA 194.333-99 chr4 78578519 78578756 + 1.33333 NA intron (NM_005139, intron 3 of 12) intron (NM_005139, intron 3 of 12) 26867 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 247.333-54 chr3 179011031 179011377 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 60605 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 216-96 chr5 72903875 72904134 + 1.33333 NA intron (NM_001364293, intron 23 of 24) intron (NM_001364293, intron 23 of 24) 25413 NR_039968 100616152 NR_039968 ENSG00000263593 MIR4804 - microRNA 4804 ncRNA 201.333-250 chr6 145628331 145628488 + 1.33333 NA intron (NR_153398, intron 2 of 2) intron (NR_153398, intron 2 of 2) 58468 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 296.333-16 chr18 3855164 3855590 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) L1PA15|LINE|L1 -10019 NM_001003809 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 186-29 chr13 99466927 99467121 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32282 NR_110731 102725509 Hs.648968 NR_110731 LINC01232 TCONS_00021520 long intergenic non-protein coding RNA 1232 ncRNA 181.333-123 chr4 64243342 64243568 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165995 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 249.333-97 chr8 48896258 48896510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25045 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 205.333-73 chr14 64112588 64112877 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 65 of 114) intron (NM_015180, intron 65 of 114) -17607 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 215.666-6 chr10 29635053 29635245 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_021738) promoter-TSS (NM_021738) -178 NM_021738 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 245.999-2 chr1 176254796 176255128 + 1.33333 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 -47676 NM_022457 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 188.666-11 chr12 42934249 42934465 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -220958 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 192.666-35 chr2 115539906 115540092 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 196184 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 200.666-88 chr4 87158805 87158971 + 1.33333 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 61380 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 282-39 chr4 52137640 52138034 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 86533 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 203.333-30 chr10 53626140 53626403 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -854571 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 206.333-89 chr2 125034891 125035051 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 1009684 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 170.667-77 chr2 33451883 33452112 + 1.33333 NA intron (NM_170672, intron 2 of 18) L1M3c|LINE|L1 -6058 NM_001349979 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 226.667-11 chr1 233094932 233095244 + 1.33333 NA intron (NM_014801, intron 22 of 33) intron (NM_014801, intron 22 of 33) 144246 NR_138027 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 198.333-132 chr3 155216929 155217103 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23929 NR_125399 101928190 Hs.121410 NR_125399 ENSG00000241336 LINC01487 - long intergenic non-protein coding RNA 1487 ncRNA 512.332 chr2 68899571 68900048 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -28412 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 254.666-29 chr7 8533075 8533398 + 1.33333 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 99627 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 201-110 chr8 117393082 117393315 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -127515 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 198.666-91 chr8 77927153 77927314 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 476536 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 195-39 chr14 61973114 61973325 + 1.33333 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) intron (NM_001367657, intron 3 of 6) 45524 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 231.999-9 chr4 20114612 20114790 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -137204 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 471.332 chr17 73586768 73587145 + 1.33333 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) MIRb|SINE|MIR 57489 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 199.666-23 chr2 53449914 53450133 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -317760 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 204-31 chr10 107265310 107265498 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -100698 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 490.667-2 chr6 119177221 119177858 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_005907, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_005907, exon 13 of 13) -28346 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 211.333-10 chr1 97263001 97263259 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 18 of 22) intron (NM_000110, intron 18 of 22) 167207 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 286-41 chr3 112475963 112476240 + 1.33333 NA intron (NM_181780, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 23371 NM_001085357 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 302-27 chr19 49626607 49626978 + 1.33333 NA TTS (NM_020719) TTS (NM_020719) 13351 NM_006270 6237 Hs.515536 NM_006270 ENSG00000126458 RRAS R-Ras RAS related protein-coding 198.333-118 chr22 19675902 19676160 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -38472 NM_002688 5413 Hs.728762 NM_002688 ENSG00000184702 SEPTIN5 CDCREL|CDCREL-1|CDCREL1|H5|HCDCREL-1|PNUTL1|SEPT5 septin 5 protein-coding 210.667-137 chr9 133620878 133621180 + 1.33333 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -15334 NM_000787 1621 Hs.591890 NM_000787 ENSG00000123454 DBH DBM|ORTHYP1 dopamine beta-hydroxylase protein-coding 248.666-23 chr2 211233107 211233392 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 615678 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 241.667-46 chr20 56656641 56657013 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 27521 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 237.333-90 chr5 55991900 55992100 + 1.33333 NA intron (NR_157112, intron 1 of 17) intron (NR_157112, intron 1 of 17) 2963 NM_001364276 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 240.666-22 chr2 177504555 177504770 + 1.33333 NA intron (NM_003659, intron 14 of 19) intron (NM_003659, intron 14 of 19) 48134 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 217.999 chr1 41064306 41064477 + 1.33333 NA intron (NM_001172218, intron 11 of 15) L1MC1|LINE|L1 -42636 NM_001168247 200172 Hs.194609 NM_144990 ENSG00000171790 SLFNL1 - schlafen like 1 protein-coding 483.333-2 chr15 64351274 64351832 + 1.33333 NA intron (NM_001329606, intron 1 of 11) intron (NM_001329606, intron 1 of 11) 4620 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 218.333-18 chr10 118229248 118229659 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 112871 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 195-100 chr7 110117684 110117937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157597 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 321.333-41 chr2 201605984 201606440 + 1.33333 NA intron (NM_001168221, intron 1 of 15) L1MC4|LINE|L1 12966 NM_001168216 151254 Hs.335788 NM_152525 ENSG00000155754 C2CD6 ALS2CR11 C2 calcium dependent domain containing 6 protein-coding 208.666-85 chr5 3942966 3943191 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 347246 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 179.333-175 chr7 87587919 87588130 + 1.33333 NA intron (NM_001348944, intron 5 of 29) intron (NM_001348944, intron 5 of 29) 12860 NM_001348946 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 327.333-38 chr5 162727078 162727505 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 659649 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 235.333-72 chr3 53173813 53174089 + 1.33333 NA intron (NM_001354679, intron 2 of 18) intron (NM_001354679, intron 2 of 18) 5248 NM_001354678 5580 Hs.155342 NM_006254 ENSG00000163932 PRKCD ALPS3|CVID9|MAY1|PKCD|nPKC-delta protein kinase C delta protein-coding 254.333-92 chr8 136250109 136250521 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -280483 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 334.667-15 chr2 75545161 75545605 + 1.33333 NA intron (NM_001369524, intron 2 of 5) intron (NM_001369524, intron 2 of 5) 15556 NM_001369525 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 375.333-33 chr8 29379401 29379818 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -28925 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 224.333-96 chr5 37731840 37732076 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 17 of 17) intron (NM_001345998, intron 17 of 17) 102864 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 468-7 chr2 49187359 49187997 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -33151 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 198.666-14 chr12 43465680 43465894 + 1.33333 NA intron (NM_025003, intron 9 of 38) intron (NM_025003, intron 9 of 38) 86416 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 198.667-51 chr12 106945338 106945618 + 1.33333 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -10244 NM_001319663 90488 Hs.257664 NM_152261 ENSG00000151135 TMEM263 C12orf23 transmembrane protein 263 protein-coding 119.333-172 chr5 42987575 42987704 + 1.33333 NA intron (NR_104643, intron 1 of 1) MER4-int|LTR|ERV1 5694 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 198.666-54 chr22 31301598 31301767 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9148 NM_001135911 113791 Hs.26670 NM_052880 ENSG00000100100 PIK3IP1 HGFL|TrIP|hHGFL(S) phosphoinositide-3-kinase interacting protein 1 protein-coding 198.666-5 chr10 82683540 82683739 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -450719 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 330.666-3 chr1 37023475 37023826 + 1.33333 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) L3|LINE|CR1 10865 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 145.666-6 chr7 34599232 34599359 + 1.33333 NA intron (NR_033664, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -58923 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 175-2 chr1 67310623 67310898 + 1.33333 NA intron (NM_001258215, intron 1 of 13) AluSc|SINE|Alu 3396 NM_001559 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 233.333-132 chr8 111214174 111214446 + 1.33333 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) 21893 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 240-64 chr3 185502690 185502972 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3796 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 260.666-16 chr2 47291311 47291558 + 1.33333 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) LTR37-int|LTR|ERV1 -43881 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 308.333-27 chr3 97824399 97824735 + 1.33333 NA intron (NM_153605, intron 1 of 21) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 2556 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 260.333-9 chr12 22789069 22789366 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 164046 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 208.666-44 chr15 78875059 78875239 + 1.33333 NA intron (NM_001265604, intron 1 of 11) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 2160 NM_001265605 10933 Hs.374503 NM_006791 ENSG00000185787 MORF4L1 Eaf3|FWP006|HsT17725|MEAF3|MORFRG15|MRG15|S863-6 mortality factor 4 like 1 protein-coding 249.333 chr1 9555934 9556254 + 1.33333 NA intron (NM_032315, intron 2 of 6) intron (NM_032315, intron 2 of 6) 16629 NM_032315 84275 Hs.568613 NM_032315 ENSG00000171612 SLC25A33 BMSC-MCP|PNC1 solute carrier family 25 member 33 protein-coding 274.999-2 chr1 205198725 205199057 + 1.33333 NA intron (NM_199462, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 12811 NM_199462 25778 Hs.6874 NM_015375 ENSG00000133059 DSTYK CAKUT1|DustyPK|HDCMD38P|RIP5|RIPK5|SPG23 dual serine/threonine and tyrosine protein kinase protein-coding 185.666-10 chr14 90654405 90654614 + 1.33333 NA intron (NM_001320421, intron 12 of 20) intron (NM_001320421, intron 12 of 20) 11880 NR_110134 101928909 Hs.662545 NR_110134 ENSG00000259163 LOC101928909 - uncharacterized LOC101928909 ncRNA 190.333-17 chr10 49087766 49087923 + 1.33333 NA intron (NM_001031746, intron 2 of 7) L1MC3|LINE|L1 27678 NM_001031746 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 234.666-6 chr1 164742922 164743208 + 1.33333 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 31576 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 249.333-58 chr2 149483692 149484006 + 1.33333 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -103509 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 206.666-97 chr5 34697563 34697791 + 1.33333 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) intron (NM_001145525, intron 4 of 19) 10118 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 373-11 chr3 88804136 88804619 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -303244 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 242.333-69 chr3 85431914 85432250 + 1.33333 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) 46372 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 149.666 chr10 75441239 75441396 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) LTR85c|LTR|Gypsy? 9693 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 208.666-51 chr17 63809455 63809650 + 1.33333 NA intron (NM_203499, intron 10 of 17) intron (NM_203499, intron 10 of 17) -17879 NM_002805 5705 Hs.79387 NM_002805 ENSG00000087191 PSMC5 S8|SUG-1|SUG1|TBP10|TRIP1|p45|p45/SUG proteasome 26S subunit, ATPase 5 protein-coding 259.333-56 chr2 186652394 186652729 + 1.33333 NA intron (NM_001145000, intron 13 of 27) intron (NM_001145000, intron 13 of 27) -41499 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 270.666-22 chr4 97978068 97978390 + 1.33333 NA intron (NM_174952, intron 6 of 10) L1PA13|LINE|L1 165247 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 204-92 chr2 12255903 12256083 + 1.33333 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 56863 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 151.333-299 chr4 37556588 37556802 + 1.33333 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) intron (NM_001104629, intron 1 of 3) -27538 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 184-21 chr12 65236171 65236412 + 1.33333 NA intron (NM_014319, intron 4 of 12) AluSz6|SINE|Alu -42392 NM_198080 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 285.333-23 chr17 34880779 34881038 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 80552 NM_001193529 10693 Hs.73072 NM_006584 ENSG00000132141 CCT6B CCT-zeta-2|CCTZ-2|Cctz2|TCP-1-zeta-2|TSA303 chaperonin containing TCP1 subunit 6B protein-coding 219.333-155 chr6 46702150 46702339 + 1.33333 NA non-coding (NR_144468, exon 4 of 4) non-coding (NR_144468, exon 4 of 4) -14079 NR_134643 101926934 Hs.664979 NR_134642 ENSG00000242973 LOC101926934 - uncharacterized LOC101926934 ncRNA 174.667-112 chr3 13050871 13051070 + 1.33333 NA intron (NM_001134382, intron 1 of 13) MIRc|SINE|MIR 22459 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 215-17 chr14 52992007 52992374 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -41093 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 302-23 chr17 40114236 40114747 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7480 NM_001365921 339287 Hs.532786 NM_001012241 ENSG00000188895 MSL1 MSL-1 MSL complex subunit 1 protein-coding 160.666-9 chr21 29829464 29829640 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 81377 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 175.333-163 chr6 135010440 135010633 + 1.33333 NA intron (NM_006620, intron 4 of 17) intron (NM_006620, intron 4 of 17) -31104 NR_037435 100500880 NR_037435 ENSG00000283409 MIR3662 mir-3662 microRNA 3662 ncRNA 151-7 chr1 168797281 168797459 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 10429 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 196-79 chr18 69630365 69630616 + 1.33333 NA intron (NM_152721, intron 3 of 7) (TTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 160559 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 221-18 chr13 32841703 32841971 + 1.33333 NA intron (NR_047020, intron 4 of 4) intron (NR_047020, intron 4 of 4) 69815 NR_047020 100874167 Hs.406290 NR_047020 LINC00423 - long intergenic non-protein coding RNA 423 ncRNA 246.666-35 chr7 80150458 80150732 + 1.33333 NA intron (NM_001256414, intron 1 of 7) L1ME3C|LINE|L1 14811 NM_001256414 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 307.333-25 chr14 25288164 25288472 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -238021 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 323-17 chr2 73475771 73476255 + 1.33333 NA intron (NM_015120, intron 9 of 22) L1MB2|LINE|L1 18910 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 340.333-20 chr7 3952124 3952415 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 7 of 44) intron (NM_152744, intron 7 of 44) -177416 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 210-60 chr2 43937238 43937516 + 1.33333 NA intron (NM_133259, intron 23 of 37) intron (NM_133259, intron 23 of 37) 58612 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 265.666-9 chr14 64833287 64833501 + 1.33333 NA intron (NM_001355436, intron 1 of 35) AluSx|SINE|Alu -10014 NM_001024858 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 260-34 chr2 25516801 25517254 + 1.33333 NA intron (NM_033147, intron 9 of 19) L1ME1|LINE|L1 133195 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 191-79 chr9 457521 457704 + 1.33333 NA intron (NM_001193536, intron 45 of 46) MIR3|SINE|MIR -12679 NM_001256876 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 372.999 chr15 62848878 62849438 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 25201 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 219.333-167 chr7 39337314 39337628 + 1.33333 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) intron (NM_001370959, intron 4 of 9) -8337 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 212-63 chr16 3316139 3316320 + 1.33333 NA intron (NM_001302109, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 10017 NM_001324041 7627 Hs.513292 NM_153028 ENSG00000162086 ZNF75A - zinc finger protein 75a protein-coding 204.666-115 chr9 91550731 91551023 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -85374 NR_037472 100500821 NR_037472 ENSG00000266855 MIR3910-1 mir-3910-1 microRNA 3910-1 ncRNA 236.666-45 chr7 112536126 112536399 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 55271 NM_182597 286006 Hs.396189 NM_182597 ENSG00000181016 LSMEM1 C7orf53 leucine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 252.666-7 chr12 13029949 13030285 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14264 NM_020853 57613 Hs.132660 NM_020853 ENSG00000084444 FAM234B KIAA1467 family with sequence similarity 234 member B protein-coding 371-7 chr14 72623311 72623896 + 1.33333 NA intron (NM_001280542, intron 9 of 10) L1MC5|LINE|L1 106783 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 276-47 chr3 110465443 110465718 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 604379 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 239 chr1 53052752 53053054 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -9149 NM_001199081 127435 Hs.586141 NM_153703 ENSG00000174348 PODN PCAN|SLRR5A podocan protein-coding 242.667-18 chr11 5799205 5799537 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10555 NM_001001913 79473 Hs.690209 NM_001001913 ENSG00000181001 OR52N1 OR11-61 olfactory receptor family 52 subfamily N member 1 protein-coding 141.333-148 chr3 24648243 24648418 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -152622 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 244.666 chr1 58660066 58660294 + 1.33333 NA intron (NM_001085487, intron 19 of 19) intron (NM_001085487, intron 19 of 19) 39882 NM_001085487 114803 Hs.744921 NM_001085487 ENSG00000162601 MYSM1 2A-DUB|2ADUB|BMFS4 Myb like, SWIRM and MPN domains 1 protein-coding 407.333-8 chr12 100479687 100480251 + 1.33333 NA intron (NR_135146, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 6103 NM_001206978 9971 Hs.282735 NM_005123 ENSG00000012504 NR1H4 BAR|FXR|HRR-1|HRR1|PFIC5|RIP14 nuclear receptor subfamily 1 group H member 4 protein-coding 196-200 chrX 55335680 55335863 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 55683 NR_130179 100421746 Hs.662612 NR_130179 ENSG00000232765 LOC100421746 - PAGE family member 5 pseudogene pseudo 327-25 chr5 155317945 155318279 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 304357 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 199.666-61 chr9 69721888 69722063 + 1.33333 NA intron (NM_001366939, intron 5 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 38036 NR_159517 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 161.333-56 chr11 130454570 130454758 + 1.33333 NA intron (NM_139055, intron 1 of 7) intron (NM_139055, intron 1 of 7) 5690 NM_139055 170689 Hs.534221 NM_139055 ENSG00000166106 ADAMTS15 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 15 protein-coding 221.666-20 chr16 50772202 50772431 + 1.33333 NA intron (NM_015247, intron 7 of 19) L1MD1|LINE|L1 30011 NR_130462 100422972 NR_130462 ENSG00000264947 MIR3181 - microRNA 3181 ncRNA 164.666-5 chr1 221313101 221313269 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 23111 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 217.333-116 chr5 22783161 22783419 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 70054 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 199-114 chr8 80158085 80158269 + 1.33333 NA intron (NR_105035, intron 1 of 6) intron (NR_105035, intron 1 of 6) 12944 NR_105037 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 219.333-194 chrX 104523976 104524146 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -42138 NM_017416 26280 Hs.675519 NM_017416 ENSG00000189108 IL1RAPL2 IL-1R9|IL1R9|IL1RAPL-2|TIGIRR-1 interleukin 1 receptor accessory protein like 2 protein-coding 234.666-37 chr4 149972051 149972318 + 1.33333 NA Intergenic (CATATCTGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -106261 NM_001040260 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 173-51 chr20 4788359 4788505 + 1.33333 NA intron (NM_014737, intron 8 of 11) intron (NM_014737, intron 8 of 11) 26691 NM_170774 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 196.666-68 chr3 176795499 176795653 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21425 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 135.333-168 chr7 17506957 17507131 + 1.33333 NA intron (NR_110013, intron 1 of 3) intron (NR_110013, intron 1 of 3) 51865 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 292.667-43 chr8 89003314 89003772 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -676060 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 284.333-43 chr8 137436185 137436568 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -22788 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 138-35 chr14 50486372 50486534 + 1.33333 NA intron (NM_198794, intron 3 of 31) intron (NM_198794, intron 3 of 31) 46116 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 173-46 chr2 42298144 42298418 + 1.33333 NA intron (NM_001145076, intron 12 of 21) intron (NM_001145076, intron 12 of 21) 61757 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 150.333-126 chr15 57488740 57489025 + 1.33333 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) intron (NM_032866, intron 8 of 18) -103022 NR_104370 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 206-132 chr4 124849777 124850110 + 1.33333 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -137211 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 228.666-16 chr15 62717476 62717739 + 1.33333 NA exon (NM_015059, exon 21 of 56) exon (NM_015059, exon 21 of 56) 70296 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 271.667-81 chr9 36235150 36235587 + 1.33333 NA intron (NM_001190384, intron 2 of 9) intron (NM_001190384, intron 2 of 9) 23080 NM_001190383 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 303.333-25 chr14 88365214 88365511 + 1.33333 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 -20282 NM_001040428 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 181.666-17 chr5 52919881 52920073 + 1.33333 NA intron (NM_181501, intron 16 of 28) intron (NM_181501, intron 16 of 28) -69375 NR_073103 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 201-65 chr20 20038390 20038633 + 1.33333 NA intron (NM_016652, intron 12 of 14) intron (NM_016652, intron 12 of 14) 13981 NM_001278628 51340 Hs.171342 NM_016652 ENSG00000101343 CRNKL1 CLF|CRN|Clf1|HCRN|MSTP021|SYF3 crooked neck pre-mRNA splicing factor 1 protein-coding 284-60 chr7 103694984 103695315 + 1.33333 NA intron (NM_005045, intron 10 of 64) intron (NM_005045, intron 10 of 64) -248942 NM_206885 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 205.333-41 chr10 103915316 103915499 + 1.33333 NA intron (NM_024928, intron 2 of 9) MER21C|LTR|ERVL 2777 NM_024928 79991 Hs.62314 NM_024928 ENSG00000107960 STN1 AAF-44|AAF44|OBFC1|RPA-32|bA541N10.2 STN1 subunit of CST complex protein-coding 284.333-16 chr14 83573844 83574248 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 931414 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 455-7 chr4 89160393 89161053 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 47906 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 213.333-225 chr9 76314305 76314506 + 1.33333 NA intron (NM_001190482, intron 29 of 36) intron (NM_001190482, intron 29 of 36) 80021 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 126.666-4 chr6 133166626 133166786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74651 NM_004100 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 209-80 chr4 38619599 38619797 + 1.33333 NA intron (NR_026804, intron 6 of 7) intron (NR_026804, intron 6 of 7) -44501 NM_016531 51274 Hs.298658 NM_016531 ENSG00000109787 KLF3 BKLF Kruppel like factor 3 protein-coding 253.333-117 chr9 30780772 30781164 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -372514 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 225.333-74 chr18 67207643 67207886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 126180 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 246.666-34 chr6 113442788 113443046 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -9470 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 207.333-180 chr3 55686056 55686212 + 1.33333 NA intron (NR_132749, intron 15 of 17) intron (NR_132749, intron 15 of 17) -26665 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 183.666-23 chr8 26921005 26921282 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53865 NM_000680 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 328-27 chr3 110941325 110941630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128482 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 258.667-4 chr1 51531825 51532193 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -12743 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 187.333-86 chr19 29410886 29411110 + 1.33333 NA intron (NR_040029, intron 3 of 9) intron (NR_040029, intron 3 of 9) 114754 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 216.667-54 chr2 33369166 33369447 + 1.33333 NA intron (NM_206943, intron 31 of 33) intron (NM_206943, intron 31 of 33) -49210 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 186-59 chr22 26755489 26755747 + 1.33333 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 82775 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 401-4 chr13 94495524 94496103 + 1.33333 NA intron (NM_001322184, intron 1 of 8) intron (NM_001322184, intron 1 of 8) -16131 NM_001922 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 159.333-227 chr3 197190257 197190397 + 1.33333 NA intron (NM_001290983, intron 5 of 25) MER8|DNA|TcMar-Tigger -6196 NM_001204388 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 228.333-45 chr2 60093461 60093637 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 289487 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 168.667-43 chr12 63753255 63753475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26544 NM_014254 10329 Hs.216386 NM_014254 ENSG00000118600 RXYLT1 HP10481|MDDGA10|TMEM5 ribitol xylosyltransferase 1 protein-coding 220.667-75 chr4 118926942 118927254 + 1.33333 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) 38244 NM_001128933 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 184-35 chr16 19440975 19441219 + 1.33333 NA intron (NM_001261841, intron 3 of 21) intron (NM_001261841, intron 3 of 21) -15364 NM_024780 79838 Hs.115838 NM_024780 ENSG00000103534 TMC5 - transmembrane channel like 5 protein-coding 267-22 chr14 62472310 62472745 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -332554 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 170.666 chr1 195905367 195905543 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 183260 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 198-2 chr1 44086861 44087141 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -31820 NM_173484 128209 Hs.567674 NM_173484 ENSG00000171872 KLF17 ZNF393|Zfp393 Kruppel like factor 17 protein-coding 324.666-13 chr4 34424161 34424719 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154693 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 225-66 chr8 126779962 126780146 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -221576 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 180.333-2 chr1 43948659 43948814 + 1.33333 NA intron (NM_014652, intron 1 of 19) intron (NM_014652, intron 1 of 19) 1786 NM_014652 9670 Hs.158497 NM_014652 ENSG00000117408 IPO13 IMP13|KAP13|LGL2|RANBP13 importin 13 protein-coding 326-39 chr6 156804404 156804801 + 1.33333 NA intron (NM_020732, intron 1 of 19) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -24871 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 163.333-275 chr8 16462612 16462798 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -269914 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 264.333-40 chr2 171763579 171763899 + 1.33333 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 75984 NM_001320884 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 355.999-2 chr10 74255034 74255499 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) MER101B|LTR|ERV1 78503 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 196.666-20 chr13 56208491 56208692 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -932327 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 382.667-2 chr1 83663663 83664226 + 1.33333 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) intron (NR_119375, intron 2 of 2) 196602 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 145.333-82 chr14 52216779 52217090 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -50764 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 284-33 chr3 83140186 83140527 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1154214 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 208.666-19 chr10 56276657 56276833 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84514 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 347.333-7 chr14 63018865 63019227 + 1.33333 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) L1M4a1|LINE|L1 26412 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 226.667-9 chr1 178882892 178883203 + 1.33333 NA intron (NM_152663, intron 10 of 19) intron (NM_152663, intron 10 of 19) -11970 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 464.666-2 chr10 26565504 26566036 + 1.33333 NA intron (NM_019043, intron 14 of 14) MER87B|LTR|ERV1 13537 NR_134472 101929117 Hs.127031 NR_134472 LOC101929117 - uncharacterized LOC101929117 ncRNA 294.666-4 chr13 61319997 61320271 + 1.33333 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 95388 NM_022843 64881 Hs.391781 NM_022843 ENSG00000280165 PCDH20 PCDH13 protocadherin 20 protein-coding 210-85 chr21 15868817 15868986 + 1.33333 NA intron (NM_001283042, intron 21 of 24) intron (NM_001283042, intron 21 of 24) 138919 NM_013396 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 244.666-11 chr11 25868028 25868393 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -320913 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 317.999-3 chr13 20009371 20009728 + 1.33333 NA intron (NM_197968, intron 6 of 24) L1MB4|LINE|L1 49735 NR_148365 7750 Hs.507433 NM_003453 ENSG00000121741 ZMYM2 FIM|MYM|RAMP|SCLL|ZNF198 zinc finger MYM-type containing 2 protein-coding 200.333-157 chr8 113230680 113231142 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 146241 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 187.333-165 chr5 130445168 130445424 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 540831 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 267.333-93 chr8 128009262 128009513 + 1.33333 NA TTS (NR_031611) TTS (NR_031611) 489 NR_031611 100302170 NR_031611 ENSG00000283200 MIR1206 MIRN1206|hsa-mir-1206 microRNA 1206 ncRNA 198.667-83 chr17 64011315 64011554 + 1.33333 NA intron (NM_001099788, intron 1 of 5) AluSc8|SINE|Alu -4511 NM_000873 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 199.666-35 chr3 71694629 71694778 + 1.33333 NA intron (NM_173359, intron 5 of 7) MIR|SINE|MIR 30699 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 138.667-169 chr5 94693751 94693929 + 1.33333 NA intron (NM_032290, intron 20 of 20) intron (NM_032290, intron 20 of 20) 75171 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 180-12 chr10 42370251 42370532 + 1.33333 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -2346 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 219-15 chr11 63719014 63719236 + 1.33333 NA exon (NM_001265590, exon 2 of 8) exon (NM_001265590, exon 2 of 8) 37625 NM_001265591 10313 Hs.743229 NM_006054 ENSG00000133318 RTN3 ASYIP|HAP|NSPL2|NSPLII|RTN3-A1 reticulon 3 protein-coding 218.666-62 chr6 131338599 131338788 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 88289 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 235.333-79 chr3 187320778 187321093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28913 NM_139125 5648 Hs.89983 NM_001879 ENSG00000127241 MASP1 3MC1|CRARF|CRARF1|MAP1|MASP|MASP3|MAp44|PRSS5|RaRF mannan binding lectin serine peptidase 1 protein-coding 336.333-24 chr3 193064660 193065086 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -147017 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 130-123 chr7 116156972 116157127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53490 NM_015641 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 160.667-210 chr3 178753605 178753818 + 1.33333 NA intron (NR_126561, intron 3 of 5) L1MA8|LINE|L1 106694 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 211.333-218 chr7 10156285 10156452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 522098 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 202-189 chr8 132745950 132746134 + 1.33333 NA intron (NM_144649, intron 5 of 9) L1PA16|LINE|L1 14540 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 322-3 chr1 66069423 66069915 + 1.33333 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 -18951 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 206-35 chr11 92187517 92187738 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -37407 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 352-10 chr17 17357237 17357701 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 54096 NM_020201 56953 Hs.513977 NM_020201 ENSG00000205309 NT5M dNT-2|dNT2|mdN 5',3'-nucleotidase, mitochondrial protein-coding 329.333-7 chr11 4520225 4520479 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -24839 NM_001004137 119772 Hs.553567 NM_001004137 ENSG00000197790 OR52M1 OR11-11|OR52M1P|OR52M3P olfactory receptor family 52 subfamily M member 1 protein-coding 226-24 chr15 66928336 66928596 + 1.33333 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 28049 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 152-111 chr4 20694227 20694402 + 1.33333 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -1968 NR_133933 133015 Hs.479298 NM_145048 ENSG00000163138 PACRGL C4orf28 parkin coregulated like protein-coding 273-6 chr1 211389967 211390378 + 1.33333 NA intron (NR_026761, intron 1 of 5) intron (NR_026761, intron 1 of 5) 7417 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 192-32 chr11 42127997 42128234 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -42657 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 208.667-57 chr18 2851063 2851338 + 1.33333 NA intron (NM_032048, intron 2 of 7) AluJo|SINE|Alu 4194 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 286-62 chr8 60367854 60368231 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 45776 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 229.333-18 chr11 90260570 90260823 + 1.33333 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 9464 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 192.333-132 chr4 130406470 130406692 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 30220 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 178-106 chr7 30977373 30977530 + 1.33333 NA intron (NM_000823, intron 12 of 12) intron (NM_000823, intron 12 of 12) 13498 NM_000823 2692 Hs.767 NM_000823 ENSG00000106128 GHRHR GHRFR|GRFR|IGHD1B|IGHD4 growth hormone releasing hormone receptor protein-coding 321.333-56 chr7 89847564 89848135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -271551 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 401.666-5 chr3 76944217 76944691 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95645 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 170.667-14 chr1 233374653 233374870 + 1.33333 NA intron (NM_032435, intron 6 of 9) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 47037 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 210-81 chr20 15203088 15203323 + 1.33333 NA intron (NM_001033087, intron 1 of 13) intron (NM_001033087, intron 1 of 13) 6365 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 184-11 chr10 58399249 58399427 + 1.33333 NA TTS (NM_003201) TTS (NM_003201) 13928 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 200.666-105 chr6 141517669 141517913 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 571008 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 213.333-184 chr6 145670255 145670542 + 1.33333 NA intron (NM_001368131, intron 2 of 3) UCON29|DNA|PiggyBac? 16479 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 296.667-57 chr8 36538905 36539331 + 1.33333 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -245256 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 232-47 chr2 77908509 77908812 + 1.33333 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -7274 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 243.666-28 chr4 109881434 109881717 + 1.33333 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -31308 NM_001963 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 199.333-64 chr13 89794185 89794391 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -229875 NR_046991 100874139 Hs.742173 NR_046991 LINC00353 - long intergenic non-protein coding RNA 353 ncRNA 204-11 chr1 101911486 101911660 + 1.33333 NA intron (NM_058170, intron 1 of 5) intron (NM_058170, intron 1 of 5) 39561 NR_033424 94236 Hs.606193 NR_033424 DNAJA1P5 HEJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A1 pseudogene 5 pseudo 201.333-163 chr2 222143842 222144029 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -154212 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 223.333-70 chr2 69097004 69097220 + 1.33333 NA intron (NM_032208, intron 9 of 17) intron (NM_032208, intron 9 of 17) -6570 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 157.333-271 chr4 133472323 133472488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 323111 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 198-185 chr8 115079963 115080191 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 587936 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 217-91 chr8 130448295 130448476 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4711 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 278-49 chr5 104415590 104415945 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -683707 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 180-114 chr8 121178010 121178224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -366071 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 188.666-15 chr14 71962041 71962248 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) MIR|SINE|MIR 28617 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 377.666-11 chr5 159474476 159474921 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -8422 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 245.333-84 chr4 44454167 44454422 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5485 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 288.667-30 chr6 122778851 122779241 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001319039) promoter-TSS (NM_001319039) -429 NM_001319039 2173 Hs.26770 NM_001446 ENSG00000164434 FABP7 B-FABP|BLBP|FABPB|MRG fatty acid binding protein 7 protein-coding 220-67 chr2 181807013 181807248 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -84600 NM_001287503 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 197.666-8 chr11 13195906 13196147 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -80626 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 196.666-35 chr17 59443261 59443465 + 1.33333 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) MER58A|DNA|hAT-Charlie 77280 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 328.333-29 chr3 106846079 106846345 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 394426 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 207.333-19 chr1 192276963 192277263 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39879 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 199-22 chr13 23038072 23038287 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -121810 NR_138043 100996930 Hs.380803 NR_138043 LINC00621 - long intergenic non-protein coding RNA 621 ncRNA 255.333-16 chr11 77161164 77161458 + 1.33333 NA intron (NM_001127180, intron 12 of 48) intron (NM_001127180, intron 12 of 48) 33065 NM_000260 4647 Hs.370421 NM_000260 ENSG00000137474 MYO7A DFNA11|DFNB2|MYOVIIA|MYU7A|NSRD2|USH1B myosin VIIA protein-coding 217-69 chr4 131210786 131210961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -553965 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 346-4 chr10 51368336 51368697 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 68943 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 208.667-65 chr2 66221044 66221342 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 137135 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 227-28 chr2 228075538 228075850 + 1.33333 NA intron (NM_030623, intron 3 of 10) intron (NM_030623, intron 3 of 10) 105951 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 139.333-160 chr4 85172 85360 + 1.33333 NA intron (NM_001286054, intron 4 of 4) intron (NM_001286054, intron 4 of 4) 31945 NM_182524 152687 Hs.709469 NM_182524 ENSG00000272602 ZNF595 - zinc finger protein 595 protein-coding 251.666-28 chr7 3271030 3271301 + 1.33333 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -30087 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 220.333-8 chr1 211395292 211395598 + 1.33333 NA intron (NR_026761, intron 3 of 5) L1MB7|LINE|L1 12690 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 286.333-27 chr3 61689097 61689586 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 1 of 29) intron (NM_002841, intron 1 of 29) 127770 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 252.666-15 chr16 86363066 86363347 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17527 NR_024406 732275 Hs.558087 NR_024406 ENSG00000168367 LINC00917 - long intergenic non-protein coding RNA 917 ncRNA 452.332 chr8 106274899 106275250 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) intron (NM_018002, intron 1 of 15) 4896 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 529.333-3 chr15 73828224 73828867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45019 NM_001286434 161514 Hs.124512 NM_153356 ENSG00000167139 TBC1D21 MgcRabGAP TBC1 domain family member 21 protein-coding 219.333-179 chr7 121875082 121875363 + 1.33333 NA intron (NM_001206839, intron 1 of 28) L1MB7|LINE|L1 2061 NM_001369395 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 232.666-47 chr6 152761246 152761433 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 10542 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 211.333-126 chr2 204759509 204759753 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 214156 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 315.666-5 chr11 27053474 27053785 + 1.33333 NA intron (NR_125768, intron 3 of 3) intron (NR_125768, intron 3 of 3) 12814 NM_003986 8424 Hs.591996 NM_003986 ENSG00000129151 BBOX1 BBH|BBOX|G-BBH|gamma-BBH gamma-butyrobetaine hydroxylase 1 protein-coding 532.999 chr8 78969852 78970541 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 132667 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 206-55 chr14 105224413 105224601 + 1.33333 NA intron (NM_001242788, intron 9 of 16) intron (NM_001242788, intron 9 of 16) 23378 NM_145685 2972 Hs.424484 NM_001519 ENSG00000185024 BRF1 BRF|BRF-1|CFDS|GTF3B|HEL-S-76p|TAF3B2|TAF3C|TAFIII90|TF3B90|TFIIIB90|hBRF BRF1 RNA polymerase III transcription initiation factor subunit protein-coding 220.666-45 chr3 40592407 40592627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67557 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 178-58 chr18 61234225 61234483 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99076 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 310.333-2 chr1 58671478 58671899 + 1.33333 NA intron (NM_001085487, intron 12 of 19) intron (NM_001085487, intron 12 of 19) 28374 NM_001085487 114803 Hs.744921 NM_001085487 ENSG00000162601 MYSM1 2A-DUB|2ADUB|BMFS4 Myb like, SWIRM and MPN domains 1 protein-coding 376-21 chr7 117380324 117380816 + 1.33333 NA intron (NM_001301821, intron 9 of 12) intron (NM_001301821, intron 9 of 12) 46923 NM_001301821 136991 Hs.352412 NM_130768 ENSG00000154438 ASZ1 ALP1|ANKL1|C7orf7|CT1.19|GASZ|Orf3 ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain containing 1 protein-coding 231.333-117 chr8 68725147 68725439 + 1.33333 NA intron (NM_001349479, intron 9 of 11) intron (NM_001349479, intron 9 of 11) 378897 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 308.666-20 chr8 93806003 93806261 + 1.33333 NA intron (NR_024522, intron 23 of 28) L1MC5a|LINE|L1 51238 NR_024522 91147 Hs.116240 NM_153704 ENSG00000164953 TMEM67 JBTS6|MECKELIN|MKS3|NPHP11|TNEM67 transmembrane protein 67 protein-coding 306.666-11 chr17 70259839 70260127 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 90448 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 202-122 chr3 195276161 195276424 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_012287, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_012287, exon 23 of 23) -5133 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 358.333-27 chr8 66711758 66712364 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001033578) promoter-TSS (NM_001033578) -720 NM_001033578 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 218.333-82 chr3 24797486 24797744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31708 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 301.333-38 chr4 148357757 148358122 + 1.33333 NA intron (NM_000901, intron 2 of 8) intron (NM_000901, intron 2 of 8) 84475 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 208-43 chr13 86608815 86608992 + 1.33333 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy -303017 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 191.667-94 chr4 77143798 77144054 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13281 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 185.666-15 chr5 4083173 4083328 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 487418 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 204.667-154 chr9 8012122 8012362 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -212464 NM_001318058 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 170.667-112 chr3 88431099 88431373 + 1.33333 NA intron (NM_001368168, intron 2 of 2) HY1|scRNA|scRNA 92780 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 221.666-45 chr5 41480485 41480704 + 1.33333 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) intron (NM_001005473, intron 1 of 2) 30007 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 224.666-21 chr20 50701203 50701399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9759 NR_110890 140876 Hs.372578 NM_080829 ENSG00000042062 RIPOR3 C20orf175|C20orf176|FAM65C RIPOR family member 3 protein-coding 233.333-125 chr7 88489120 88489348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -182340 NM_001205316 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 280-23 chr2 100710543 100710824 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 106944 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 169.667-102 chr2 31663114 31663316 + 1.33333 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -82277 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 257.333-113 chr9 95403671 95404125 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -59711 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 405.332 chr2 210940200 210940530 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 322794 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 186.666-51 chr8 105015665 105015832 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -302690 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 184.333-90 chr20 52132994 52133211 + 1.33333 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) L1M1|LINE|L1 -27618 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 204.666-69 chr5 81485039 81485203 + 1.33333 NA intron (NM_001256733, intron 5 of 15) intron (NM_001256733, intron 5 of 15) -90987 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 266-6 chr1 191249839 191250161 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -21502 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 261.666 chr1 33452523 33452817 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -19975 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 207.666-60 chr7 89242445 89242609 + 1.33333 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) intron (NM_181646, intron 2 of 3) -446790 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 202-106 chr3 7821789 7822039 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 194393 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 353.333-11 chr12 38573987 38574303 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 257371 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 204-27 chr10 71768504 71768793 + 1.33333 NA intron (NM_022153, intron 1 of 6) AluJr4|SINE|Alu 4872 NM_022153 64115 Hs.47382 NM_022153 ENSG00000107738 VSIR B7-H5|B7H5|C10orf54|DD1alpha|Dies1|GI24|PD-1H|PP2135|SISP1|VISTA V-set immunoregulatory receptor protein-coding 216.667-80 chr4 64836424 64836698 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 167939 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 213-60 chr4 31303451 31303615 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 132389 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 360.999-4 chr5 161203948 161204342 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -265519 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 246.666-2 chr1 44993669 44993947 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -7086 NM_001261418 8891 Hs.533549 NM_020365 ENSG00000070785 EIF2B3 EIF-2B|EIF2Bgamma eukaryotic translation initiation factor 2B subunit gamma protein-coding 218.666-14 chr11 41246905 41247090 + 1.33333 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 212639 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 216.666-31 chr16 8483986 8484198 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 105746 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 255.333-87 chr5 151192287 151192605 + 1.33333 NA intron (NM_015621, intron 4 of 8) L1ME1|LINE|L1 -19688 NR_160730 105378230 NR_160730 LOC105378230 - uncharacterized LOC105378230 ncRNA 222.333-100 chr9 107224761 107225068 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58365 NM_002874 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 307.333-35 chr18 7900577 7900889 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 3 of 30) MIRb|SINE|MIR 333417 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 183-23 chr11 121689196 121689442 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 237005 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 150.666-19 chr9 5735074 5735238 + 1.33333 NA intron (NM_001206557, intron 7 of 24) L1MC5a|LINE|L1 97961 NM_024896 79956 Hs.591078 NM_024896 ENSG00000099219 ERMP1 FXNA|KIAA1815|bA207C16.3 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 protein-coding 446.999 chr10 51500504 51500948 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 198869 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 260-77 chr7 52543123 52543574 + 1.33333 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -492285 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 206.333-139 chr6 54398630 54398793 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90270 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 181.666-22 chr8 131051037 131051251 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10235 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 221.333-45 chr16 66081134 66081314 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -285467 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 203.333-85 chr15 57736715 57736935 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 30111 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 162-54 chr17 66846369 66846585 + 1.33333 NA intron (NM_145811, intron 1 of 5) L1MB5|LINE|L1 11360 NM_145811 27091 Hs.278907 NM_014404 ENSG00000075429 CACNG5 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5 protein-coding 200.666-24 chr11 126672534 126672809 + 1.33333 NA intron (NR_120533, intron 1 of 1) intron (NR_120533, intron 1 of 1) 16585 NR_120533 101929427 Hs.600341 NR_120532 ENSG00000254607 LOC101929427 - uncharacterized LOC101929427 ncRNA 207.666-50 chr5 30282107 30282350 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 401668 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 260.666-12 chr16 46534571 46535018 + 1.33333 NA intron (NR_026556, intron 6 of 16) intron (NR_026556, intron 6 of 16) 34303 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 323.333-5 chr11 43716707 43717166 + 1.33333 NA intron (NM_016142, intron 1 of 10) intron (NM_016142, intron 1 of 10) 36198 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 202-95 chr2 184706818 184706981 + 1.33333 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 108370 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 184.666-15 chr17 69770403 69770605 + 1.33333 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1PA16|LINE|L1 176517 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 212.333-48 chr14 71825218 71825396 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -106864 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 185.333-35 chr11 111697100 111697288 + 1.33333 NA intron (NM_015191, intron 4 of 14) MIR|SINE|MIR 69195 NM_181699 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 283.999-4 chr17 32313837 32314069 + 1.33333 NA intron (NM_001363836, intron 7 of 8) AluY|SINE|Alu 28220 NM_022344 64149 Hs.655257 NM_022344 ENSG00000108666 C17orf75 NJMU-R1|SRI2 chromosome 17 open reading frame 75 protein-coding 292.333-25 chr2 173951393 173951659 + 1.33333 NA intron (NM_003111, intron 4 of 6) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 12354 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 328.666-12 chr3 146067062 146067554 + 1.33333 NA intron (NR_146297, intron 1 of 1) intron (NR_146297, intron 1 of 1) 1877 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 219.666-2 chr1 39191137 39191455 + 1.33333 NA intron (NM_012090, intron 1 of 92) intron (NM_012090, intron 1 of 92) 107129 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 197.666-45 chr3 161483781 161483936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12950 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 294-16 chr12 26667416 26667712 + 1.33333 NA intron (NM_002223, intron 13 of 56) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 165630 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 232.666-43 chr6 56941404 56941681 + 1.33333 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) AluJb|SINE|Alu 13288 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 232.333-47 chr2 173051309 173051600 + 1.33333 NA intron (NM_001282901, intron 24 of 24) intron (NM_001282901, intron 24 of 24) -24392 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 385.333-9 chr12 24763286 24763781 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 138689 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 178.333-33 chr12 23834066 23834266 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) L2b|LINE|L2 115504 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 332-39 chrX 153200449 153200785 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 21333 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 262.333-18 chr11 73304411 73304866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3638 NM_014786 9828 Hs.533719 NM_014786 ENSG00000110237 ARHGEF17 P164RHOGEF|RHOGEF17|TEM4|p164-RhoGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 17 protein-coding 212.666-26 chr14 55545287 55545501 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 34698 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 266.666-12 chr12 129816292 129816598 + 1.33333 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) intron (NM_133448, intron 1 of 8) 87580 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 410.667-10 chr3 42604052 42604631 + 1.33333 NA intron (NM_001349126, intron 2 of 18) L1MEh|LINE|L1 -3263 NM_001201572 9117 Hs.445892 NM_004206 ENSG00000093183 SEC22C SEC22L3 SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein protein-coding 221.333-65 chr2 99931987 99932154 + 1.33333 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 173513 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 420.332 chr21 28605491 28605844 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 66349 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 202.667-51 chr14 59588552 59588801 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11864 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 332.333-23 chr7 4050428 4050732 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 18 of 44) intron (NM_152744, intron 18 of 44) -79105 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 207.333-199 chr4 72306295 72306505 + 1.33333 NA intron (NM_014243, intron 15 of 21) intron (NM_014243, intron 15 of 21) 262821 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 286.667-45 chr9 74947639 74947998 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_017998, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_017998, exon 2 of 2) 5094 NM_017998 55071 Hs.532296 NM_017998 ENSG00000135045 C9orf40 - chromosome 9 open reading frame 40 protein-coding 208.333-44 chr15 77697106 77697319 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001301199) promoter-TSS (NM_001301199) -717 NM_001301199 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 204.666-25 chr12 64485440 64485610 + 1.33333 NA intron (NM_013254, intron 10 of 20) intron (NM_013254, intron 10 of 20) 33405 NM_013254 29110 Hs.505874 NM_013254 ENSG00000183735 TBK1 FTDALS4|IIAE8|NAK|T2K TANK binding kinase 1 protein-coding 145.333-152 chr2 218259979 218260191 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_170699) promoter-TSS (NM_170699) 589 NM_001321950 151306 Hs.160954 NM_170699 ENSG00000179921 GPBAR1 BG37|GPCR19|GPR131|M-BAR|TGR5 G protein-coupled bile acid receptor 1 protein-coding 204-74 chr16 72667414 72667582 + 1.33333 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -2528 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 211-73 chr4 97029988 97030219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -336823 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 210.667-46 chr14 85818775 85819067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -115757 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 191.333-37 chr11 92813093 92813277 + 1.33333 NA intron (NM_001008781, intron 12 of 24) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 102443 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 232.666-18 chr16 74764459 74764703 + 1.33333 NA intron (NM_024306, intron 1 of 6) L1PREC2|LINE|L1 10239 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 323.333-16 chr2 127351896 127352207 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8822 NM_006609 10746 Hs.145605 NM_006609 ENSG00000169967 MAP3K2 MEKK2|MEKK2B mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 protein-coding 185.666-25 chr8 16203595 16203750 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -10881 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 198.666-49 chr2 198917988 198918164 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 539863 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 363-12 chr20 59120016 59120611 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70707 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 222.666-60 chr9 87603393 87603586 + 1.33333 NA intron (NM_004938, intron 2 of 25) intron (NM_004938, intron 2 of 25) 50035 NR_146781 100506897 Hs.656160 NR_146781 ENSG00000236709 DAPK1-IT1 - DAPK1 intronic transcript 1 ncRNA 287.666-5 chr14 45067160 45067487 + 1.33333 NA intron (NR_131765, intron 17 of 19) L2c|LINE|L2 -16793 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 244.666-35 chr5 10680655 10681102 + 1.33333 NA exon (NM_001291963, exon 3 of 3) exon (NM_001291963, exon 3 of 3) 80356 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 329.333-12 chr14 71754166 71754623 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 168096 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 422-2 chr10 76181253 76181717 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 398724 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 415.667-4 chr4 71476384 71476954 + 1.33333 NA intron (NM_003759, intron 11 of 22) intron (NM_003759, intron 11 of 22) 137616 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 325-14 chr17 67142618 67142943 + 1.33333 NA intron (NM_001330447, intron 21 of 32) AluSx1|SINE|Alu 98226 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 267.333-74 chr5 32903151 32903390 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44173 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 266-83 chr8 132660920 132661142 + 1.33333 NA intron (NR_135913, intron 2 of 10) intron (NR_135913, intron 2 of 10) 14514 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 224.666-4 chr10 56310648 56310833 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 50519 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 302-29 chr2 48237538 48237870 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -76978 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 301.333-9 chr10 80562292 80562625 + 1.33333 NA intron (NM_001145719, intron 1 of 6) MER6B|DNA|TcMar-Tigger 21639 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 198.666-41 chr2 98326613 98326807 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19445 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 199.333-287 chr8 131898591 131898874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5361 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 321.666-10 chr3 100280678 100280949 + 1.33333 NA intron (NM_001199198, intron 2 of 18) L1MC5a|LINE|L1 19821 NM_001199198 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 204.667-104 chr4 36916270 36916554 + 1.33333 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -85367 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 256.999-4 chr5 19778756 19779034 + 1.33333 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) intron (NM_001349559, intron 3 of 12) 107377 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 220.666-36 chr2 146751484 146751694 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 164532 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 372-7 chr14 72296877 72297273 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L1ME2|LINE|L1 -219745 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 328.333-13 chr14 32104775 32105321 + 1.33333 NA intron (NM_001173, intron 2 of 6) MER20|DNA|hAT-Charlie 27744 NM_001030055 394 Hs.592313 NM_001173 ENSG00000100852 ARHGAP5 GFI2|RhoGAP5|p190-B|p190BRhoGAP Rho GTPase activating protein 5 protein-coding 237.333-25 chr12 25272389 25272672 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -21601 NM_001369786 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 206.667-120 chr6 69380013 69380289 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 30 of 31) intron (NM_001704, intron 30 of 31) 416315 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 187.333-196 chr8 67808990 67809201 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -62735 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 208-175 chr8 143355603 143355860 + 1.33333 NA intron (NM_001258447, intron 1 of 13) intron (NM_001258447, intron 1 of 13) 4246 NM_001258446 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 440.333-9 chr8 107772128 107772693 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -274492 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 243-42 chr3 132676089 132676372 + 1.33333 NA intron (NM_198329, intron 11 of 11) intron (NM_198329, intron 11 of 11) 15533 NM_001321238 79876 Hs.170737 NM_024818 ENSG00000081307 UBA5 EIEE44|SCAR24|THIFP1|UBE1DC1 ubiquitin like modifier activating enzyme 5 protein-coding 187.333-158 chr5 69167888 69168125 + 1.33333 NA exon (NM_031966, exon 2 of 9) exon (NM_031966, exon 2 of 9) 856 NM_031966 891 Hs.23960 NM_031966 ENSG00000134057 CCNB1 CCNB cyclin B1 protein-coding 199.333-24 chr10 49159638 49159820 + 1.33333 NA intron (NM_001288742, intron 4 of 4) L1MC4|LINE|L1 -25709 NM_001164484 170370 Hs.646291 NM_001164484 ENSG00000172538 FAM170B C10orf73 family with sequence similarity 170 member B protein-coding 198.333-197 chr8 112027317 112027566 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -616052 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 283.333-35 chr2 108005424 108005890 + 1.33333 NA intron (NM_021815, intron 6 of 8) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 19133 NM_001305005 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 254.333-96 chrX 64965017 64965430 + 1.33333 NA intron (NM_001178032, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 11227 NM_018684 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 192.666-16 chr12 40901682 40902033 + 1.33333 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) -6500 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 208.667-19 chr10 31842440 31842730 + 1.33333 NA intron (NM_001270695, intron 7 of 18) intron (NM_001270695, intron 7 of 18) 66341 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 197.333-227 chr8 32360114 32360264 + 1.33333 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -80557 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 207.333-215 chr5 33220065 33220300 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9553 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 313-7 chr11 57422176 57422636 + 1.33333 NA intron (NM_017611, intron 5 of 13) MER113|DNA|hAT-Charlie 4715 NM_014096 29015 Hs.99962 NM_014096 ENSG00000134802 SLC43A3 EEG1|ENBT1|FOAP-13|PRO1659|SEEEG-1 solute carrier family 43 member 3 protein-coding 322.667-20 chr4 55638304 55638760 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1739 NR_120489 10874 Hs.418367 NM_006681 ENSG00000109255 NMU - neuromedin U protein-coding 180.333-119 chr7 95191364 95191589 + 1.33333 NA intron (NM_017650, intron 5 of 15) L1MA5A|LINE|L1 133056 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 213-46 chr20 44038112 44038426 + 1.33333 NA intron (NM_001098797, intron 3 of 8) AluJr|SINE|Alu 92373 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 241.333-47 chr18 2761474 2761798 + 1.33333 NA intron (NM_015295, intron 35 of 47) AluSz|SINE|Alu -85370 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 211-97 chr8 134213041 134213245 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 326647 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 211.666-21 chr19 27612725 27612924 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -180607 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 209.666-2 chr1 52402299 52402611 + 1.33333 NA intron (NM_004153, intron 1 of 16) intron (NM_004153, intron 1 of 16) 1968 NM_004153 4998 Hs.17908 NM_004153 ENSG00000085840 ORC1 HSORC1|ORC1L|PARC1 origin recognition complex subunit 1 protein-coding 220-84 chr5 14363720 14363905 + 1.33333 NA non-coding (NR_134469, exon 14 of 57) non-coding (NR_134469, exon 14 of 57) -100171 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 217.333-16 chr1 222825786 222826048 + 1.33333 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) AluJo|SINE|Alu 10878 NM_001350630 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 244-58 chr2 144025182 144025448 + 1.33333 NA intron (NM_001354355, intron 7 of 13) intron (NM_001354355, intron 7 of 13) 88248 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 198-177 chr7 102834424 102834737 + 1.33333 NA intron (NM_001287150, intron 16 of 18) MIR|SINE|MIR -78420 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 125-27 chr12 15638295 15638396 + 1.33333 NA intron (NM_004447, intron 17 of 20) intron (NM_004447, intron 17 of 20) 91734 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 181.333-139 chr5 66084630 66084883 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59544 NM_001323534 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 246-65 chr3 11446278 11446665 + 1.33333 NA intron (NM_001349238, intron 17 of 17) intron (NM_001349238, intron 17 of 17) 122327 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 307.333-54 chr3 30076357 30076687 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -142366 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 208.333-13 chr10 9643601 9643763 + 1.33333 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -348089 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 204.333-144 chr4 124932649 124932923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -220054 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 229.667-83 chr9 80447142 80447378 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 472237 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 202-62 chr17 42885220 42885503 + 1.33333 NA intron (NR_027254, intron 2 of 5) intron (NR_027254, intron 2 of 5) 13373 NR_027254 388387 Hs.632257 NM_207388 ENSG00000213373 LINC00671 - long intergenic non-protein coding RNA 671 ncRNA 219.666-3 chr1 91845430 91845642 + 1.33333 NA intron (NR_036634, intron 2 of 17) intron (NR_036634, intron 2 of 17) 40615 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 209.333-9 chr1 115096470 115096759 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -7111 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 259-17 chr16 53982209 53982549 + 1.33333 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) intron (NM_001363988, intron 9 of 9) -57014 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 186-8 chr1 209806921 209807180 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001206696) promoter-TSS (NM_001206696) -875 NM_001206696 3664 Hs.591415 NM_006147 ENSG00000117595 IRF6 LPS|OFC6|PIT|PPS|PPS1|VWS|VWS1 interferon regulatory factor 6 protein-coding 271-49 chr8 117228763 117229052 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 93912 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 214.667-43 chr15 36864688 36865003 + 1.33333 NA non-coding (NR_024264, exon 7 of 7) non-coding (NR_024264, exon 7 of 7) 21688 NR_024264 145845 Hs.302693 NM_001101327 LOC145845 - uncharacterized LOC145845 ncRNA 304-56 chr7 41053395 41053877 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47968 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 253.333-37 chr16 63195252 63195552 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1158964 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 230-23 chr14 66092005 66092287 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -394225 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 334.666-17 chr8 40741649 40742004 + 1.33333 NA intron (NM_024645, intron 3 of 6) L1ME4a|LINE|L1 156000 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 240-11 chr10 113658735 113659152 + 1.33333 NA intron (NM_001322945, intron 3 of 40) intron (NM_001322945, intron 3 of 40) 5098 NM_198060 4892 Hs.268788 NM_006175 ENSG00000197893 NRAP N-RAP nebulin related anchoring protein protein-coding 320.666-10 chr21 22674591 22675023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -404477 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 220.999-5 chr4 66928345 66928528 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 493564 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 359.999-3 chr3 44989882 44990209 + 1.33333 NA intron (NM_015004, intron 3 of 7) intron (NM_015004, intron 3 of 7) 13796 NR_023353 23016 Hs.719958 NM_015004 ENSG00000075914 EXOSC7 EAP1|RRP42|Rrp42p|hRrp42p|p8 exosome component 7 protein-coding 250.666-21 chr20 49716083 49716369 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2348 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 146-83 chr3 57661156 57661336 + 1.33333 NA intron (NM_152678, intron 6 of 19) intron (NM_152678, intron 6 of 19) 31831 NM_152678 201627 Hs.91085 NM_152678 ENSG00000174839 DENND6A AFI1A|FAM116A DENN domain containing 6A protein-coding 201-35 chr14 47022019 47022250 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) AluJb|SINE|Alu 321112 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 511.333-4 chr21 27832536 27833133 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 110455 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 187.333-8 chr1 150309615 150309859 + 1.33333 NA TTS (NM_018997) TTS (NM_018997) -11731 NR_146767 9129 Hs.11776 NM_004698 ENSG00000117360 PRPF3 HPRP3|HPRP3P|PRP3|Prp3p|RP18|SNRNP90 pre-mRNA processing factor 3 protein-coding 214-38 chr15 56826880 56827045 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -91128 NM_001322151 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 204.333-176 chr6 62214694 62214856 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 71450 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 165.667-15 chr10 25593011 25593210 + 1.33333 NA intron (NM_020752, intron 8 of 10) intron (NM_020752, intron 8 of 10) -58602 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 134-107 chr8 86799003 86799214 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55433 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 392.667-9 chr5 42547528 42547982 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001242402) promoter-TSS (NM_001242402) -288 NM_001242402 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 214.333-21 chr10 87826513 87826675 + 1.33333 NA intron (NR_028492, intron 2 of 3) intron (NR_028492, intron 2 of 3) 8281 NR_028492 142913 Hs.369431 NR_028492 ENSG00000223820 CFL1P1 CFLP1 cofilin 1 pseudogene 1 pseudo 278.666-21 chr5 57455812 57456210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26800 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 212-104 chr3 56546879 56547131 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10151 NR_024460 285331 Hs.476399 NM_001012506 ENSG00000180376 CCDC66 - coiled-coil domain containing 66 protein-coding 217.333-143 chr7 146241172 146241380 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -532995 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 208-106 chr3 80878577 80878882 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 108025 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 290.666-29 chr9 120473650 120473936 + 1.33333 NA intron (NR_073558, intron 15 of 37) intron (NR_073558, intron 15 of 37) 106374 NM_001011649 55755 Hs.269560 NM_018249 ENSG00000136861 CDK5RAP2 C48|Cep215|MCPH3 CDK5 regulatory subunit associated protein 2 protein-coding 280.333-11 chr14 55878061 55878390 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81551 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 354.333-20 chr8 119314073 119314395 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -10937 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 230.666-47 chr7 48501044 48501450 + 1.33333 NA intron (NM_152701, intron 48 of 61) intron (NM_152701, intron 48 of 61) 329789 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 420.333-2 chr10 43611562 43612126 + 1.33333 NA intron (NM_145312, intron 4 of 4) L1ME4b|LINE|L1 5406 NM_145312 220992 Hs.147440 NM_145312 ENSG00000198298 ZNF485 - zinc finger protein 485 protein-coding 370.666-15 chr4 117968356 117968827 + 1.33333 NA Intergenic (TTTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -64731 NR_146513 9348 Hs.480596 NM_004784 ENSG00000164100 NDST3 HSST3 N-deacetylase and N-sulfotransferase 3 protein-coding 211.333-40 chr11 112081814 112082084 + 1.33333 NA intron (NR_103469, intron 4 of 5) intron (NR_103469, intron 4 of 5) 4807 NM_012459 26521 Hs.279915 NM_012459 ENSG00000150779 TIMM8B DDP2|TIM8B translocase of inner mitochondrial membrane 8 homolog B protein-coding 151-46 chr18 6636718 6637026 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92844 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 327.333-37 chr5 138692557 138692872 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 60595 NR_134245 105379194 Hs.445981 NR_134244 ENSG00000253404 LOC105379194 - uncharacterized LOC105379194 ncRNA 280-30 chr20 54376550 54376824 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -98906 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 182-18 chr10 83834746 83834995 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -157781 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 190-123 chr8 104497399 104497589 + 1.33333 NA exon (NM_001135703, exon 4 of 6) exon (NM_001135703, exon 4 of 6) -13029 NR_030330 693127 NR_030330 ENSG00000208032 MIR548A3 MIRN548A3 microRNA 548a-3 ncRNA 198.666-53 chr22 26926417 26926604 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 23218 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 208.666-57 chr2 43610306 43610553 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -14383 NM_001345923 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 196-145 chr5 56127595 56127838 + 1.33333 NA intron (NM_024669, intron 7 of 11) MER45C|DNA|hAT-Tip100 105614 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 264-34 chr21 29718704 29719052 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -29297 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 239.666-21 chr3 151824967 151825177 + 1.33333 NA intron (NM_001086, intron 4 of 4) intron (NM_001086, intron 4 of 4) 10956 NM_001086 13 Hs.506908 NM_001086 ENSG00000114771 AADAC CES5A1|DAC arylacetamide deacetylase protein-coding 229.666-11 chr13 108963010 108963189 + 1.33333 NA intron (NM_015011, intron 19 of 34) MIRb|SINE|MIR 204204 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 197.333-116 chr2 107675408 107675619 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -78599 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 304.333-20 chr2 222339049 222339484 + 1.33333 NA intron (NR_136642, intron 1 of 3) intron (NR_136642, intron 1 of 3) 18605 NR_136640 440934 Hs.732732 NR_136638 ENSG00000237732 CT75 - cancer/testis associated transcript 75 ncRNA 199.666-62 chr9 70586561 70586719 + 1.33333 NA intron (NM_001366143, intron 21 of 25) intron (NM_001366143, intron 21 of 25) -171983 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 208.333-135 chr7 4038850 4039029 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) Charlie17|DNA|hAT-Charlie -90746 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 193.333-45 chr12 130254588 130254754 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83216 NM_001190971 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 183.666-13 chr20 3481364 3481553 + 1.33333 NA intron (NM_001323332, intron 1 of 25) AluJo|SINE|Alu 10440 NM_001207047 8455 Hs.276252 NM_012070 ENSG00000088812 ATRN DPPT-L|MGCA attractin protein-coding 196.666-32 chr16 12505544 12505733 + 1.33333 NA intron (NM_032167, intron 19 of 20) L1MB8|LINE|L1 -214683 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 258-86 chr8 105425715 105426051 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 2 of 7) intron (NM_001362837, intron 2 of 7) 106340 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 165.666-2 chr15 44408457 44408617 + 1.33333 NA intron (NM_138423, intron 9 of 9) intron (NM_138423, intron 9 of 9) -19092 NM_016396 51496 Hs.497967 NM_016396 ENSG00000137770 CTDSPL2 HSPC058|HSPC129 CTD small phosphatase like 2 protein-coding 309.999-9 chr8 124418519 124418861 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -32130 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 284.666-24 chr8 128471159 128471455 + 1.33333 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 93372 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 169.333-32 chr10 103961586 103961777 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5459 NM_014720 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 232.666-16 chr15 83894853 83895064 + 1.33333 NA intron (NM_207517, intron 13 of 29) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -185229 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 186-73 chr4 58342431 58342621 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 193802 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 238.667-18 chr12 51493487 51493820 + 1.33333 NA intron (NM_001039960, intron 19 of 24) intron (NM_001039960, intron 19 of 24) 68536 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 268.333-37 chr3 80320063 80320507 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -444612 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 291.666-9 chr3 87526619 87527076 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -250263 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 299.333-34 chr19 11330173 11330497 + 1.33333 NA intron (NM_004283, intron 4 of 4) intron (NM_004283, intron 4 of 4) 9322 NM_004283 9545 Hs.744916 NM_004283 ENSG00000105514 RAB3D D2-2|GOV|RAB16|RAD3D RAB3D, member RAS oncogene family protein-coding 148.333-213 chr2 221745995 221746142 + 1.33333 NA Intergenic MER106A|DNA|hAT-Charlie -171866 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 228.666-3 chr1 116033940 116034213 + 1.33333 NA intron (NM_018420, intron 6 of 11) intron (NM_018420, intron 6 of 11) -56800 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 215.333-63 chr15 78880004 78880218 + 1.33333 NA intron (NM_006791, intron 2 of 11) intron (NM_006791, intron 2 of 11) 7122 NM_001265605 10933 Hs.374503 NM_006791 ENSG00000185787 MORF4L1 Eaf3|FWP006|HsT17725|MEAF3|MORFRG15|MRG15|S863-6 mortality factor 4 like 1 protein-coding 189-2 chr1 94573815 94573964 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 30187 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 230.666-26 chr2 38483808 38484081 + 1.33333 NA intron (NR_110259, intron 2 of 4) intron (NR_110259, intron 2 of 4) 31796 NR_110259 101929596 Hs.537341 NR_110259 LINC02613 - long intergenic non-protein coding RNA 2613 ncRNA 136-21 chr12 86469965 86470111 + 1.33333 NA intron (NM_013244, intron 1 of 6) L1MB1|LINE|L1 -212739 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 227.333-12 chr1 203711637 203711928 + 1.33333 NA intron (NM_001001396, intron 12 of 21) intron (NM_001001396, intron 12 of 21) -17799 NR_003019 677843 Hs.676135 NR_003019 ENSG00000221643 SNORA77 ACA63|SNORA77A small nucleolar RNA, H/ACA box 77 snoRNA 269.333-87 chr8 79196038 79196359 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -135990 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 347-19 chr2 150568914 150569268 + 1.33333 NA intron (NR_110241, intron 4 of 5) intron (NR_110241, intron 4 of 5) 3130 NR_110241 101929260 Hs.732324 NR_110241 ENSG00000236049 LINC01920 - long intergenic non-protein coding RNA 1920 ncRNA 319.333-15 chr2 25820810 25821107 + 1.33333 NA intron (NM_018263, intron 2 of 11) AluSp|SINE|Alu 9943 NM_001369346 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 280.666-29 chr8 30432208 30432556 + 1.33333 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) intron (NM_001008710, intron 1 of 8) -46981 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 245-36 chr2 69838893 69839190 + 1.33333 NA intron (NM_178439, intron 2 of 13) intron (NM_178439, intron 2 of 13) 9381 NM_178439 64395 Hs.293971 NM_178439 ENSG00000087338 GMCL1 BTBD13|GCL|GCL1|SPATA29 germ cell-less 1, spermatogenesis associated protein-coding 211.333-175 chr4 143237828 143238133 + 1.33333 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 53063 NM_032557 84640 Hs.480848 NM_032557 ENSG00000170185 USP38 HP43.8KD ubiquitin specific peptidase 38 protein-coding 205.333-13 chr1 87911081 87911294 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -539532 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 263-52 chr5 36029929 36030279 + 1.33333 NA Intergenic MER70-int|LTR|ERVL -29082 NM_001171873 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 263-29 chr2 30216964 30217351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14377 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 287.666-10 chr5 38382680 38382910 + 1.33333 NA intron (NM_152403, intron 6 of 21) intron (NM_152403, intron 6 of 21) 20676 NR_102750 100506475 Hs.662304 NR_102749 ENSG00000248572 EGFLAM-AS2 - EGFLAM antisense RNA 2 ncRNA 254.666-33 chr8 134910003 134910346 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 60239 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 398-6 chr18 56201195 56201772 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10221 NR_148972 642484 NR_148972 ENSG00000206129 LOC642484 - uncharacterized LOC642484 ncRNA 265-62 chr8 51778336 51778552 + 1.33333 NA intron (NM_144651, intron 1 of 22) intron (NM_144651, intron 1 of 22) 31001 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 187.666-27 chr8 138649403 138649581 + 1.33333 NA intron (NM_152888, intron 46 of 64) intron (NM_152888, intron 46 of 64) -151762 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 129.333-27 chr10 108294289 108294463 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -225083 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 285.333-70 chr8 89122272 89122657 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 635247 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 270.333-19 chr13 99552997 99553379 + 1.33333 NA intron (NM_004800, intron 13 of 16) intron (NM_004800, intron 13 of 16) -23924 NR_126390 104355149 Hs.639387 NR_126390 LINC01039 - long intergenic non-protein coding RNA 1039 ncRNA 206.333-15 chr10 62546606 62546834 + 1.33333 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 26272 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 198.666-63 chr3 106363521 106363736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -494227 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 199.667-148 chr8 142116585 142116861 + 1.33333 NA Intergenic (CTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -59616 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 205.333-9 chr1 49417786 49417967 + 1.33333 NA intron (NR_046839, intron 3 of 3) intron (NR_046839, intron 3 of 3) 54209 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 149.333-273 chr4 40180105 40180300 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -10878 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 320-6 chr12 5355475 5355858 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -76442 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 219-82 chr8 123393390 123393714 + 1.33333 NA intron (NM_014109, intron 1 of 27) L2a|LINE|L2 2895 NM_014109 29028 Hs.370834 NM_014109 ENSG00000156802 ATAD2 ANCCA|CT137|PRO2000 ATPase family AAA domain containing 2 protein-coding 205.333-249 chr8 110579368 110579566 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 447966 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 182-83 chr4 105654339 105654536 + 1.33333 NA intron (NM_001242729, intron 8 of 13) intron (NM_001242729, intron 8 of 13) 54252 NM_020395 57117 Hs.480454 NM_020395 ENSG00000138785 INTS12 INT12|PHF22|SBBI22 integrator complex subunit 12 protein-coding 203-18 chr11 56642460 56642742 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001002925) promoter-TSS (NM_001002925) -162 NM_001002925 338675 Hs.449692 NM_001002925 ENSG00000172464 OR5AP2 OR9J1 olfactory receptor family 5 subfamily AP member 2 protein-coding 231.666-10 chr14 88080343 88080522 + 1.33333 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) intron (NR_046094, intron 2 of 3) -54120 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 240-3 chr1 62618664 62618855 + 1.33333 NA exon (NM_001272001, exon 14 of 48) exon (NM_001272001, exon 14 of 48) 21239 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 276.667-12 chr10 89455995 89456378 + 1.33333 NA non-coding (NR_120614, exon 1 of 3) non-coding (NR_120614, exon 1 of 3) 195 NR_120614 101926906 Hs.568874 NR_120614 ENSG00000234452 SLC16A12-AS1 - SLC16A12 antisense RNA 1 ncRNA 212-101 chr22 44581168 44581439 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 11963 NR_028411 388910 Hs.332685 NM_001012986 ENSG00000187012 LINC00207 NCRNA00207 long intergenic non-protein coding RNA 207 ncRNA 198.667-94 chr19 46990830 46991069 + 1.33333 NA intron (NM_004491, intron 5 of 6) intron (NM_004491, intron 5 of 6) -28888 NM_002517 4861 Hs.79564 NM_002517 ENSG00000130751 NPAS1 MOP5|PASD5|bHLHe11 neuronal PAS domain protein 1 protein-coding 277.666-8 chr14 58082490 58082821 + 1.33333 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) intron (NM_001001872, intron 5 of 7) 69558 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 176.333-190 chrX 138473213 138473353 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 194510 NR_030229 574507 NR_030229 ENSG00000207800 MIR504 MIRN504|hsa-mir-504|mir-504 microRNA 504 ncRNA 320.999-2 chr4 108127542 108128068 + 1.33333 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) intron (NM_001130713, intron 3 of 10) 38992 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 202-50 chr15 41275364 41275567 + 1.33333 NA intron (NM_007236, intron 5 of 6) intron (NM_007236, intron 5 of 6) -8525 NR_152822 729082 Hs.380164 NR_026757 ENSG00000247556 OIP5-AS1 cyrano|linc-OIP5 OIP5 antisense RNA 1 ncRNA 208.333-63 chr18 74853810 74854112 + 1.33333 NA intron (NM_017757, intron 3 of 7) L2|LINE|L2 222998 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 216.333-122 chr6 41448929 41449110 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -53425 NR_120347 103106903 Hs.563396 NR_120347 ENSG00000226917 LINC01276 - long intergenic non-protein coding RNA 1276 ncRNA 323.333-2 chr10 79480923 79481373 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 29834 NR_136625 729815 Hs.564060 NR_136624 ENSG00000235705 LOC729815 - uncharacterized LOC729815 ncRNA 310.667-9 chr13 78294382 78294769 + 1.33333 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) 239720 NR_047001 100874222 Hs.493062 NR_047001 ENSG00000234377 OBI1-AS1 POU4F1-AS1|RNF219-AS1 OBI1 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-196 chr2 134547841 134547977 + 1.33333 NA intron (NM_030923, intron 4 of 7) intron (NM_030923, intron 4 of 7) 171091 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 248.333-7 chr1 185939058 185939422 + 1.33333 NA intron (NM_031935, intron 11 of 106) intron (NM_031935, intron 11 of 106) 204849 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 196.333-26 chr12 38450640 38451045 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 134068 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 207.333-236 chr6 36473267 36473500 + 1.33333 NA intron (NM_001286579, intron 2 of 4) MIRc|SINE|MIR 30383 NM_173562 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 196.333-103 chr3 6503194 6503400 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 302152 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 207.666-54 chr5 147732335 147732601 + 1.33333 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) intron (NM_001270934, intron 1 of 20) 50260 NM_001282282 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 267.999-2 chr16 26862989 26863330 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -203768 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 144-154 chr8 125549432 125549582 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 117298 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 193-75 chr5 100322090 100322293 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 66063 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 245.333-8 chr1 185979190 185979468 + 1.33333 NA intron (NM_031935, intron 16 of 106) intron (NM_031935, intron 16 of 106) 244938 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 246.999 chr12 22467661 22467910 + 1.33333 NA intron (NM_001286176, intron 22 of 26) intron (NM_001286176, intron 22 of 26) 76412 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 156.667-18 chr1 102720537 102720708 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 387874 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 203.333-26 chr10 21821344 21821641 + 1.33333 NA intron (NM_022365, intron 8 of 11) L2c|LINE|L2 182238 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 244-76 chr4 19932578 19932772 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -319230 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 175.667-63 chr2 6835437 6835697 + 1.33333 NA intron (NR_126359, intron 1 of 3) L1MEb|LINE|L1 4897 NR_126359 104326052 Hs.7155 NR_126359 NRIR lncRNA-CMPK2 negative regulator of interferon response ncRNA 318.666-7 chr14 55164030 55164351 + 1.33333 NA intron (NM_001146015, intron 12 of 19) intron (NM_001146015, intron 12 of 19) 27207 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 252.666-28 chr3 113769634 113769929 + 1.33333 NA intron (NM_001690, intron 1 of 14) intron (NM_001690, intron 1 of 14) 22746 NM_001690 523 Hs.477155 NM_001690 ENSG00000114573 ATP6V1A ARCL2D|ATP6A1|ATP6V1A1|HO68|IECEE3|VA68|VPP2|Vma1 ATPase H+ transporting V1 subunit A protein-coding 199.333-266 chr7 139242043 139242214 + 1.33333 NA intron (NM_173569, intron 2 of 17) intron (NM_173569, intron 2 of 17) 10891 NM_173569 254048 Hs.153458 NM_173569 ENSG00000157741 UBN2 - ubinuclein 2 protein-coding 305.666-18 chr5 31411228 31411549 + 1.33333 NA intron (NM_013235, intron 29 of 34) intron (NM_013235, intron 29 of 34) 120705 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 172-7 chr1 107791829 107792024 + 1.33333 NA intron (NM_006113, intron 2 of 26) MIRb|SINE|MIR -103427 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 182.667-40 chr14 21433697 21433902 + 1.33333 NA intron (NM_001170629, intron 1 of 37) intron (NM_001170629, intron 1 of 37) 3476 NM_020920 57680 Hs.530698 NM_020920 ENSG00000100888 CHD8 AUTS18|HELSNF1 chromodomain helicase DNA binding protein 8 protein-coding 322-49 chr8 88241500 88241829 + 1.33333 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) L1MA8|LINE|L1 85819 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 197.333-154 chr3 101118488 101118657 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -125082 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 192.666-62 chr8 64416434 64416639 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 37387 NR_029669 406908 NR_029669 ENSG00000207816 MIR124-2 MIRN124-2|MIRN124A2|mir-124-2 microRNA 124-2 ncRNA 246.333-92 chr7 48099342 48099752 + 1.33333 NA intron (NM_001287430, intron 3 of 5) intron (NM_001287430, intron 3 of 5) 10282 NM_001287429 7378 Hs.488240 NM_003364 ENSG00000183696 UPP1 UDRPASE|UP|UPASE|UPP uridine phosphorylase 1 protein-coding 273.666-10 chr14 84200296 84200675 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1071447 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 431.333-8 chr3 117999860 118000324 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -309167 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 298.666-2 chr11 66330534 66330857 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001363560, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001363560, exon 10 of 10) 5739 NM_004292 9610 Hs.1030 NM_004292 ENSG00000174791 RIN1 - Ras and Rab interactor 1 protein-coding 353.333-2 chr1 212890758 212891143 + 1.33333 NA intron (NM_014053, intron 8 of 9) intron (NM_014053, intron 8 of 9) 32675 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 250.667-39 chr2 161629990 161630298 + 1.33333 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) L1MC1|LINE|L1 5728 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 145.333-294 chr8 54782328 54782525 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 166330 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 251-70 chr5 106434626 106434881 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 576261 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 446-4 chr12 99284545 99285176 + 1.33333 NA intron (NM_152788, intron 12 of 25) L2a|LINE|L2 -129770 NM_001352189 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 207.333-11 chr1 100247332 100247512 + 1.33333 NA intron (NM_001918, intron 1 of 10) AluSx|SINE|Alu 2412 NM_001918 1629 Hs.709187 NM_001918 ENSG00000137992 DBT BCATE2|BCKAD-E2|BCKADE2|BCOADC-E2|E2|E2B dihydrolipoamide branched chain transacylase E2 protein-coding 214.666-49 chr4 84358276 84358485 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -59211 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 170.666-11 chr18 78021942 78022219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28353 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 314.333-24 chr5 97588951 97589431 + 1.33333 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) L1MA7|LINE|L1 84495 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 246-110 chrX 84128171 84128509 + 1.33333 NA intron (NM_014496, intron 8 of 21) L1MA3|LINE|L1 59595 NM_001330512 27330 Hs.234478 NM_014496 ENSG00000072133 RPS6KA6 PP90RSK4|RSK-4|RSK4|S6K-alpha-6|p90RSK6 ribosomal protein S6 kinase A6 protein-coding 213-33 chr17 62639629 62639928 + 1.33333 NA intron (NM_006039, intron 1 of 29) FRAM|SINE|Alu 12108 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 305.333-20 chr14 45036749 45037032 + 1.33333 NA intron (NR_131765, intron 11 of 19) THE1A|LTR|ERVL-MaLR -47226 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 222.667-105 chrX 143450453 143450758 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 66870 NM_001009609 139067 Hs.447320 NM_001009609 ENSG00000189252 SPANXN3 CT11.8|SPANX-N3 SPANX family member N3 protein-coding 218-110 chr8 82025513 82025789 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183365 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 344.333-27 chr8 86107006 86107316 + 1.33333 NA intron (NM_152565, intron 1 of 7) intron (NM_152565, intron 1 of 7) 8251 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 288.666-2 chr1 64347401 64347672 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -122593 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 190-40 chr14 98361497 98361736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -349997 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 202.666-86 chr4 33048482 33048656 + 1.33333 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 697531 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 199.333-298 chr9 78212567 78212810 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23387 NM_001330691 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 215.666-11 chr12 26341328 26341578 + 1.33333 NA intron (NM_002223, intron 55 of 56) intron (NM_002223, intron 55 of 56) 145880 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 282-21 chr17 58196614 58196897 + 1.33333 NA intron (NM_000502, intron 6 of 12) MIR3|SINE|MIR 4029 NM_000502 8288 Hs.279259 NM_000502 ENSG00000121053 EPX EPO|EPP|EPX-PEN|EPXD eosinophil peroxidase protein-coding 178.666-4 chr14 63111745 63111967 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66398 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 209.333-257 chrX 140075820 140076092 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15711 NM_001271560 389895 Hs.127679 NM_001271560 LOC389895 - chromosome 16 open reading frame 72-like protein-coding 204-42 chr11 90208286 90208487 + 1.33333 NA intron (NM_012124, intron 6 of 10) AluSq2|SINE|Alu 14663 NM_012124 26973 Hs.22857 NM_012124 ENSG00000110172 CHORDC1 CHP1 cysteine and histidine rich domain containing 1 protein-coding 199.333-104 chr17 82548235 82548507 + 1.33333 NA intron (NM_004514, intron 1 of 8) L1ME1|LINE|L1 28639 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 217.333-27 chr10 98363693 98363878 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31522 NR_031619 100302133 NR_031619 ENSG00000284415 MIR1287 MIRN1287|hsa-mir-1287|mir-1287 microRNA 1287 ncRNA 152.333-111 chr14 68049385 68049502 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 225851 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 211.333-41 chr12 26767549 26767709 + 1.33333 NA intron (NM_002223, intron 2 of 56) L1ME4a|LINE|L1 65565 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 251.333-35 chr14 57874798 57875028 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8821 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 357.333-24 chr8 31980696 31981086 + 1.33333 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -44845 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 306.667-35 chr5 26370438 26371021 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 667857 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 303.999-2 chr17 59560421 59560783 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5008 NM_024612 79665 Hs.29403 NM_024612 ENSG00000108406 DHX40 ARG147|DDX40|PAD DEAH-box helicase 40 protein-coding 208.333-49 chr16 11408124 11408357 + 1.33333 NA intron (NM_001370704, intron 46 of 66) AluSx|SINE|Alu -57020 NR_110907 101927131 Hs.569654 NR_110907 ENSG00000262999 LOC101927131 - uncharacterized LOC101927131 ncRNA 303.333-70 chr7 92689013 92689405 + 1.33333 NA intron (NM_001259, intron 4 of 7) L1PA12|LINE|L1 -98819 NR_109929 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 318-10 chr11 47954300 47954617 + 1.33333 NA Intergenic Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 -26101 NM_002843 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 179-69 chr4 43872090 43872253 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -144690 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 204.666-29 chr14 26538757 26539028 + 1.33333 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 14538 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 239-37 chr2 192522186 192522375 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -227565 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 255.333-66 chr21 27676391 27676861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45753 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 245-14 chr13 35578654 35578988 + 1.33333 NA intron (NM_001204197, intron 5 of 17) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 102072 NM_001204197 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 294.667-28 chr2 235413587 235413974 + 1.33333 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -80263 NM_014914 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 179.666-13 chr8 104494713 104494975 + 1.33333 NA intron (NM_013437, intron 6 of 6) intron (NM_013437, intron 6 of 6) -10379 NR_030330 693127 NR_030330 ENSG00000208032 MIR548A3 MIRN548A3 microRNA 548a-3 ncRNA 210.666-113 chrX 40696741 40696966 + 1.33333 NA intron (NM_004229, intron 13 of 30) intron (NM_004229, intron 13 of 30) -38543 NM_001289773 100873985 Hs.460579 NM_001289773 MED14OS MED14-AS1 MED14 opposite strand protein-coding 171.333-164 chr6 62980668 62980877 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 339205 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 316-22 chr2 20889515 20889975 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -66615 NM_001282719 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 279.999-9 chr9 34768111 34768500 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38817 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 204.666-19 chr11 82975637 82975847 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001286060, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001286060, exon 5 of 5) 58532 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 219.333-133 chr4 171427271 171427572 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 211342 NR_147157 105377536 Hs.550719 NR_147157 ENSG00000249297 LINC02174 - long intergenic non-protein coding RNA 2174 ncRNA 315.333-49 chr7 97500610 97501012 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -231275 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 255.333-83 chr5 53473684 53473956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6809 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 218-76 chr3 112052870 112053124 + 1.33333 NA intron (NR_026734, intron 8 of 16) intron (NR_026734, intron 8 of 16) 10019 NM_001366279 344805 Hs.435490 NM_001042575 ENSG00000176040 TMPRSS7 - transmembrane serine protease 7 protein-coding 183-53 chr2 16730818 16731056 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -65103 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 147.333-239 chr4 72229087 72229265 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 190044 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 192.667-66 chr15 97458874 97459115 + 1.33333 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 62817 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 213.333-170 chr5 136328921 136329164 + 1.33333 NA intron (NM_020389, intron 2 of 11) intron (NM_020389, intron 2 of 11) -27186 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 275.333-42 chr20 57041168 57041451 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -172387 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 178.666-10 chr2 17237893 17238039 + 1.33333 NA Intergenic LTR55|LTR|ERVL? 280474 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 148.333-256 chr3 100268933 100269086 + 1.33333 NA intron (NM_001199198, intron 1 of 18) Charlie11|DNA|hAT-Charlie 8017 NM_001199198 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 199.333-205 chr4 85379436 85379620 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -95622 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 204.666-52 chr22 33980876 33981034 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58067 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 407.666-4 chr12 14327983 14328457 + 1.33333 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL -37412 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 204-109 chr2 188652456 188652663 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 137564 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 198-109 chr22 20946487 20946737 + 1.33333 NA intron (NR_156180, intron 2 of 3) intron (NR_156180, intron 2 of 3) -10480 NR_110537 101928891 Hs.648264 NR_110537 ENSG00000237476 LINC01637 - long intergenic non-protein coding RNA 1637 ncRNA 238-57 chr20 44818975 44819172 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -8527 NM_001205317 140730 Hs.517065 NM_182970 ENSG00000101098 RIMS4 C20orf190|RIM 4|RIM-4|RIM4|RIM4-gamma|RIM4gamma regulating synaptic membrane exocytosis 4 protein-coding 191.667-6 chr1 114989852 114990044 + 1.33333 NA intron (NR_104211, intron 31 of 32) L1M4c|LINE|L1 -39876 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 503.999-5 chr8 82431276 82431712 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -480610 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 295.333-27 chr2 149940601 149940892 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81555 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 236.333-84 chr7 26963331 26963648 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -98899 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 309.333-24 chr15 94829617 94829897 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -25606 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 312-16 chr12 13422484 13422863 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45928 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 158-132 chr7 85391293 85391462 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -29745 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 190.666-31 chr20 58880214 58880371 + 1.33333 NA intron (NR_126334, intron 3 of 4) intron (NR_126334, intron 3 of 4) -8121 NR_132273 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 300-5 chr10 21015061 21015530 + 1.33333 NA intron (NM_001173484, intron 3 of 6) intron (NM_001173484, intron 3 of 6) -117693 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 199.333-15 chr1 94860553 94860740 + 1.33333 NA intron (NM_001258340, intron 10 of 14) HAL1|LINE|L1 36153 NM_001350223 126969 Hs.483423 NM_152369 ENSG00000143036 SLC44A3 CTL3 solute carrier family 44 member 3 protein-coding 198.333-47 chr12 64916328 64916547 + 1.33333 NA intron (NR_033988, intron 2 of 2) MER5B|DNA|hAT-Charlie 32663 NR_033988 400046 Hs.591032 NR_033988 ENSG00000255693 LINC02389 - long intergenic non-protein coding RNA 2389 ncRNA 226.333-48 chr18 2631746 2632008 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23518 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 304.333-18 chr2 27846987 27847242 + 1.33333 NA intron (NM_022128, intron 3 of 7) intron (NM_022128, intron 3 of 7) -41595 NM_001329112 9577 Hs.258314 NM_004899 ENSG00000158019 BABAM2 BRCC4|BRCC45|BRE BRISC and BRCA1 A complex member 2 protein-coding 285.333-32 chr2 108544279 108544660 + 1.33333 NA intron (NM_001193483, intron 1 of 9) L1MC5|LINE|L1 10114 NM_001193483 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 274.333-28 chr16 64735798 64736033 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 386148 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 217-80 chr6 71133591 71133873 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -155079 NM_024576 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 234.666-3 chr1 69396441 69396781 + 1.33333 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger -36644 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 208.666-11 chr1 172215715 172215871 + 1.33333 NA intron (NR_146559, intron 15 of 20) intron (NR_146559, intron 15 of 20) -70958 NR_038397 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 219.333-75 chr17 61720805 61721015 + 1.33333 NA intron (NM_032043, intron 16 of 19) AluSx1|SINE|Alu -129691 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 203.333-92 chr15 93786546 93786777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69899 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 218-107 chr7 129239469 129239659 + 1.33333 NA intron (NM_001130720, intron 1 of 16) FRAM|SINE|Alu 14534 NM_015328 23382 Hs.600789 NM_015328 ENSG00000158467 AHCYL2 ADOHCYASE3|IRBIT2 adenosylhomocysteinase like 2 protein-coding 175.666-11 chr2 64206841 64207013 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1442 NR_033837 150992 Hs.272318 NR_033837 ENSG00000230923 LINC00309 NCRNA00309 long intergenic non-protein coding RNA 309 ncRNA 193.667-151 chrX 64429021 64429309 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -33713 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 295.666-3 chr12 17125982 17126295 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 137391 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 209.333-142 chr22 29513506 29513751 + 1.33333 NA intron (NM_001002879, intron 17 of 19) AluSz|SINE|Alu 33410 NM_021076 4744 Hs.198760 NM_021076 ENSG00000100285 NEFH CMT2CC|NFH neurofilament heavy protein-coding 212.333-96 chr3 109548192 109548429 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54518 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 210.333-77 chr2 74177748 74177961 + 1.33333 NA intron (NM_001317112, intron 1 of 4) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 460 NM_001317111 55233 Hs.602092 NM_018221 ENSG00000114978 MOB1A C2orf6|MATS1|MOB1|MOBK1B|MOBKL1B|Mob4B MOB kinase activator 1A protein-coding 193.666-45 chr7 106172010 106172193 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59525 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 291.333-54 chr5 55883333 55883728 + 1.33333 NA intron (NM_001297572, intron 5 of 10) intron (NM_001297572, intron 5 of 10) 30208 NM_001242639 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 195.333-64 chr12 88015330 88015597 + 1.33333 NA intron (NM_001363616, intron 3 of 11) intron (NM_001363616, intron 3 of 11) 13938 NM_001363616 160419 Hs.112930 NM_152589 ENSG00000165805 C12orf50 - chromosome 12 open reading frame 50 protein-coding 267.333-90 chr8 38092927 38093210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12425 NM_001282272 9070 Hs.521530 NM_004674 ENSG00000129691 ASH2L ASH2|ASH2L1|ASH2L2|Bre2 ASH2 like, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 192-62 chr17 32134594 32134750 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7782 NM_001288755 55288 Hs.655325 NM_018307 ENSG00000126858 RHOT1 ARHT1|MIRO-1|MIRO1 ras homolog family member T1 protein-coding 205.333-242 chr8 80184754 80184953 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -13289 NM_001025253 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 191.666-20 chr6 88941260 88941423 + 1.33333 NA intron (NM_001286426, intron 1 of 14) AluSz|SINE|Alu 22277 NM_001286428 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 345.333-37 chr7 103430489 103430986 + 1.33333 NA intron (NR_135802, intron 2 of 17) intron (NR_135802, intron 2 of 17) 12474 NR_120443 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 178-67 chr2 164848523 164848675 + 1.33333 NA intron (NR_110574, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR -6523 NM_001365670 22837 Hs.470457 NM_014900 ENSG00000082438 COBLL1 COBLR1 cordon-bleu WH2 repeat protein like 1 protein-coding 272.333-9 chr12 1053982 1054405 + 1.33333 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) intron (NR_027949, intron 2 of 15) 26445 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 297.666-6 chr17 64424308 64424898 + 1.33333 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -24512 NM_001291317 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 317.667-19 chr17 41744886 41745282 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -10438 NM_001079871 9001 Hs.158300 NM_003949 ENSG00000173805 HAP1 HAP2|HIP5|HLP|hHLP1 huntingtin associated protein 1 protein-coding 175.333-43 chr14 53064674 53064969 + 1.33333 NA intron (NM_030637, intron 6 of 11) intron (NM_030637, intron 6 of 11) 88502 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 168-37 chr15 96685321 96685501 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 96243 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 232.666-19 chr17 30897065 30897296 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9058 NM_024683 79736 Hs.317340 NM_024683 ENSG00000172171 TEFM C17orf42 transcription elongation factor, mitochondrial protein-coding 192.667-163 chr7 71971028 71971265 + 1.33333 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 366245 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 282.667 chr1 176972592 176973006 + 1.33333 NA intron (NM_207108, intron 8 of 21) intron (NM_207108, intron 8 of 21) 56646 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 202-119 chr3 140998036 140998207 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -53226 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 305.333-69 chr7 108291939 108292428 + 1.33333 NA intron (NM_001371171, intron 3 of 28) intron (NM_001371171, intron 3 of 28) 36343 NM_001371178 186.667-91 chr3 89520923 89521182 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 413431 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 197-90 chr5 24575669 24575904 + 1.33333 NA intron (NM_001362460, intron 2 of 9) intron (NM_001362460, intron 2 of 9) 69192 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 329.333-22 chr2 72806909 72807294 + 1.33333 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) L1PA16|LINE|L1 18932 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 210-46 chr15 98128914 98129220 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40314 NR_120325 101927332 NR_120325 LINC01582 - long intergenic non-protein coding RNA 1582 ncRNA 335.333-9 chr11 79467855 79468211 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27003 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 188.333-76 chr2 116295731 116295900 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 952000 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 332.666-29 chr7 85170325 85170741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48602 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 224.666-7 chr11 9047969 9048162 + 1.33333 NA exon (NM_001330199, exon 14 of 22) exon (NM_001330199, exon 14 of 22) 42314 NR_049874 100847015 NR_049874 ENSG00000264984 MIR5691 - microRNA 5691 ncRNA 160.667-46 chr10 90644717 90644972 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -104039 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 303.333-13 chr11 22224555 22224842 + 1.33333 NA intron (NM_001142649, intron 5 of 21) L1MA4|LINE|L1 31522 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 169.333-3 chr1 45450994 45451147 + 1.33333 NA intron (NM_001320800, intron 1 of 9) intron (NM_001320800, intron 1 of 9) 40093 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 215.333-125 chr3 36388792 36389005 + 1.33333 NA intron (NM_001292049, intron 1 of 8) L1ME4a|LINE|L1 8411 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 201.667-49 chr18 59185790 59186033 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -34247 NM_001012513 2922 Hs.153444 NM_002091 ENSG00000134443 GRP BN|GRP-10|preproGRP|proGRP gastrin releasing peptide protein-coding 173.666-10 chr21 29926578 29926736 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 13339 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 244.333-74 chr3 122615104 122615464 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001308321) promoter-TSS (NM_001308321) -331 NM_001308321 165631 Hs.120250 NM_152615 ENSG00000173200 PARP15 ARTD7|BAL3|pART7 poly(ADP-ribose) polymerase family member 15 protein-coding 302.666-16 chr3 104291959 104292398 + 1.33333 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -768062 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 137-105 chr8 120944926 120945130 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -132982 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 344.333-14 chr22 21773847 21774284 + 1.33333 NA intron (NM_002745, intron 6 of 8) intron (NM_002745, intron 6 of 8) -38271 NM_013313 29799 Hs.517436 NM_013313 ENSG00000100027 YPEL1 FKSG3 yippee like 1 protein-coding 176.667-151 chr8 129269258 129269473 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -28125 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 275.999-5 chr4 183864100 183864425 + 1.33333 NA intron (NR_132761, intron 1 of 2) MER103C|DNA|hAT-Charlie -41045 NM_020225 56977 Hs.21958 NM_020225 ENSG00000173320 STOX2 - storkhead box 2 protein-coding 209-14 chr10 94971849 94972065 + 1.33333 NA intron (NM_000771, intron 5 of 8) intron (NM_000771, intron 5 of 8) 33299 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 158-84 chr22 27342290 27342491 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 31739 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 224.333-87 chr4 61928851 61929159 + 1.33333 NA intron (NM_001322246, intron 12 of 25) L2c|LINE|L2 232760 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 320-4 chr11 10484541 10484929 + 1.33333 NA intron (NM_001025389, intron 4 of 14) L2a|LINE|L2 23591 NR_039705 100616263 NR_039705 ENSG00000283813 MIR4485 mir-4485 microRNA 4485 ncRNA 253.333-106 chr8 49176824 49177064 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 104600 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 305.333-71 chr8 66747786 66748193 + 1.33333 NA intron (NM_001033578, intron 1 of 16) MIRb|SINE|MIR 20045 NR_002734 26255 Hs.647156 NR_002734 ENSG00000213005 PTTG3P PTTG3|rcPTTG1 pituitary tumor-transforming 3, pseudogene pseudo 344.333-19 chr5 66036552 66036928 + 1.33333 NA intron (NM_001253697, intron 14 of 25) L2c|LINE|L2 -91167 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 196.333-49 chr15 57214723 57215003 + 1.33333 NA intron (NM_207038, intron 8 of 19) intron (NM_207038, intron 8 of 19) -4567 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 170-3 chr1 99892732 99892949 + 1.33333 NA intron (NM_000028, intron 24 of 33) intron (NM_000028, intron 24 of 33) 41865 NM_000646 178 Hs.904 NM_000028 ENSG00000162688 AGL GDE amylo-alpha-1, 6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase protein-coding 184.666-44 chrUn_KI270442v1 19928 20094 + 1.33333 NA NA (GAATG)n|Satellite|Satellite NA NA 243.333-22 chr12 121844907 121845101 + 1.33333 NA intron (NM_002150, intron 11 of 13) AluSz|SINE|Alu 13855 NM_002150 3242 Hs.2899 NM_002150 ENSG00000158104 HPD 4-HPPD|4HPPD|GLOD3|HPPDASE|PPD 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase protein-coding 209.666 chr1 40114314 40114564 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -16969 NM_000310 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 221.333-35 chr14 42857367 42857604 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 1250629 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 195.667-106 chr5 26349928 26350192 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 688526 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 129-21 chr11 15840751 15840929 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128781 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 115.333-112 chr2 75332351 75332487 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -132899 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 169-8 chr10 22496130 22496383 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -58327 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 197-9 chr1 183781305 183781589 + 1.33333 NA intron (NM_001297669, intron 3 of 18) intron (NM_001297669, intron 3 of 18) -23673 NM_001297671 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 134-96 chr7 22923117 22923275 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 66583 NR_003075 692210 NR_003075 ENSG00000221740 SNORD93 HBII-336 small nucleolar RNA, C/D box 93 snoRNA 175.666-12 chr2 105057494 105057703 + 1.33333 NA intron (NM_182640, intron 2 of 10) intron (NM_182640, intron 2 of 10) -19102 NR_110603 102724691 Hs.606390 NR_110603 ENSG00000224509 LOC102724691 - uncharacterized LOC102724691 ncRNA 259.999-3 chr15 74549713 74549929 + 1.33333 NA intron (NM_001307939, intron 2 of 8) MER20|DNA|hAT-Charlie 8601 NM_006465 10620 Hs.647642 NM_006465 ENSG00000179361 ARID3B BDP|DRIL2 AT-rich interaction domain 3B protein-coding 269.333-77 chr6 169931902 169932151 + 1.33333 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -30597 NR_027434 100131532 Hs.703417 NR_027434 LOC100131532 - uncharacterized LOC100131532 ncRNA 195-34 chr12 126127834 126128137 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31993 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 333.333-10 chr10 79121244 79121777 + 1.33333 NA intron (NM_020338, intron 2 of 24) intron (NM_020338, intron 2 of 24) 52544 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 278.333-41 chr7 48713622 48713997 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -210738 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 207.999-6 chr7 84963221 84963391 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 158625 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 114.333-119 chr2 173131393 173131543 + 1.33333 NA intron (NM_133646, intron 2 of 11) intron (NM_133646, intron 2 of 11) 55622 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 406.333-14 chr5 78214440 78214818 + 1.33333 NA intron (NM_003664, intron 7 of 26) intron (NM_003664, intron 7 of 26) 80069 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 171.333-175 chr6 160434782 160434977 + 1.33333 NA intron (NM_021977, intron 5 of 10) intron (NM_021977, intron 5 of 10) 76245 NR_028092 80350 Hs.654503 NM_024492 ENSG00000213071 LPAL2 APOA2|APOAL|APOARGC|apo(a)rg-C lipoprotein(a) like 2, pseudogene pseudo 187.333-142 chr4 87463634 87463820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 41130 NM_198038 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 210.667-28 chr11 130489171 130489455 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 40339 NM_139055 170689 Hs.534221 NM_139055 ENSG00000166106 ADAMTS15 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 15 protein-coding 343.999-3 chr5 126030662 126031099 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -148697 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 241-35 chr20 2373018 2373354 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -7715 NM_198994 343641 Hs.452039 NM_198994 ENSG00000166948 TGM6 SCA35|TG6|TGM3L|TGY|dJ734P14.3 transglutaminase 6 protein-coding 321-9 chr14 83208712 83209229 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 566338 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 343.667-14 chr8 118738502 118739016 + 1.33333 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -116796 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 390-10 chr12 69265049 69265469 + 1.33333 NA intron (NM_007007, intron 9 of 9) intron (NM_007007, intron 9 of 9) 7959 NR_031692 100302182 NR_031692 ENSG00000283476 MIR1279 MIRN1279|hsa-mir-1279 microRNA 1279 ncRNA 295-47 chr7 89656791 89657167 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -462421 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 245.667 chr1 64206729 64207071 + 1.33333 NA intron (NM_001366233, intron 3 of 9) intron (NM_001366233, intron 3 of 9) 3277 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 257-45 chr4 59455709 59456088 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 442325 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 199.666-33 chr3 32857831 32858010 + 1.33333 NA intron (NM_001039111, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 39923 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 213.333-12 chr1 163057268 163057581 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -11182 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 193.333-162 chr6 135462088 135462314 + 1.33333 NA intron (NM_017651, intron 7 of 27) intron (NM_017651, intron 7 of 27) 35539 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 227.333-19 chr10 67070640 67070814 + 1.33333 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) AluSc|SINE|Alu 58461 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 202.667-129 chr6 147146074 147146320 + 1.33333 NA intron (NR_034115, intron 3 of 10) intron (NR_034115, intron 3 of 10) -12728 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 197.333-88 chr17 61806036 61806212 + 1.33333 NA intron (NM_032043, intron 7 of 19) intron (NM_032043, intron 7 of 19) 57435 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 133.333-112 chr3 135709479 135709686 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -256146 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 204.667-7 chr1 96505207 96505489 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -131223 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 342.666-16 chr21 25532413 25532774 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29552 NR_001458 114614 Hs.697120 NR_001458 ENSG00000234883 MIR155HG BIC|MIRHG2|NCRNA00172 MIR155 host gene ncRNA 231.666-27 chr6 38188511 38188841 + 1.33333 NA intron (NM_052893, intron 11 of 11) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -292920 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 248.333-37 chr18 14018337 14018721 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102822 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 297.333-3 chr1 64180809 64181141 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_005012, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_005012, exon 9 of 9) -22648 NM_152489 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 203.666-5 chr1 108807792 108807981 + 1.33333 NA intron (NM_007269, intron 18 of 18) intron (NM_007269, intron 18 of 18) 49208 NM_152763 254268 Hs.729441 NM_152763 ENSG00000162641 AKNAD1 C1orf62 AKNA domain containing 1 protein-coding 257.666-13 chr2 228475807 228476165 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 135409 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 226.666-43 chr7 104393248 104393593 + 1.33333 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 64764 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 174.666-15 chr2 153859843 153860038 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11982 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 176.667-162 chrX 74685247 74685472 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -70735 NM_016120 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 172-13 chr1 185213622 185213775 + 1.33333 NA intron (NM_017673, intron 13 of 18) intron (NM_017673, intron 13 of 18) 56531 NM_017673 54823 Hs.134183 NM_017673 ENSG00000116668 SWT1 C1orf26|HsSwt1 SWT1 RNA endoribonuclease homolog protein-coding 253.666-8 chr19 28102194 28102398 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -308356 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 165.333-247 chr8 77860008 77860163 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 409388 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 158.666-16 chr2 195699805 195699955 + 1.33333 NA intron (NM_020342, intron 3 of 9) L1M4c|LINE|L1 42654 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 197-66 chr20 55302293 55302491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120651 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 215-72 chr6 53891718 53891982 + 1.33333 NA intron (NM_018214, intron 4 of 13) AluSx|SINE|Alu -38132 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 177.666 chr1 113564308 113564479 + 1.33333 NA intron (NM_001142782, intron 2 of 20) intron (NM_001142782, intron 2 of 20) 173878 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 192.667-116 chr4 16601764 16602072 + 1.33333 NA intron (NM_001304435, intron 2 of 7) intron (NM_001304435, intron 2 of 7) 296727 NM_001130834 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 334.333-6 chr11 81302006 81302285 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -539342 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 155.667-183 chr2 183460511 183460741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 336183 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 197.666-56 chr6 83390079 83390251 + 1.33333 NA intron (NM_002395, intron 3 of 13) intron (NM_002395, intron 3 of 13) 40886 NM_002395 4199 Hs.21160 NM_002395 ENSG00000065833 ME1 HUMNDME|MES malic enzyme 1 protein-coding 418.666-2 chr20 20699185 20699657 + 1.33333 NA intron (NM_020343, intron 1 of 39) intron (NM_020343, intron 1 of 39) 13223 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 407.333-15 chr2 144023640 144024091 + 1.33333 NA intron (NM_001354355, intron 7 of 13) intron (NM_001354355, intron 7 of 13) 86798 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 209-73 chr22 27760266 27760505 + 1.33333 NA intron (NM_002430, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 41371 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 205.333-104 chr18 3655942 3656193 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 7 of 11) intron (NM_001242761, intron 7 of 11) 52330 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 196-114 chr3 25843189 25843426 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 30388 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 175-76 chr6 160274770 160275007 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16067 NM_003058 6582 Hs.436385 NM_003058 ENSG00000112499 SLC22A2 OCT2 solute carrier family 22 member 2 protein-coding 198.666-45 chr2 137702134 137702373 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 225679 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 202.333-41 chr11 122606425 122606607 + 1.33333 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -49206 NM_032873 84959 Hs.444075 NM_032873 ENSG00000154127 UBASH3B STS-1|STS1|TULA-2|TULA2|p70 ubiquitin associated and SH3 domain containing B protein-coding 307.666-14 chr8 116919725 116920154 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18268 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 277.333-18 chr11 109694790 109695226 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 272818 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 178-62 chr2 47983796 47984055 + 1.33333 NA Intergenic (GAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -78132 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 153.667-52 chr10 90246676 90246923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -289426 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 191-45 chr4 59561583 59561820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 548128 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 208.667-86 chr3 6092942 6093215 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 712371 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 143.333-298 chr8 138297940 138298123 + 1.33333 NA intron (NM_015912, intron 3 of 19) MIR|SINE|MIR 199230 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 211-60 chr3 24150211 24150502 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_121667) promoter-TSS (NR_121667) -968 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 182.666-21 chr2 37109234 37109412 + 1.33333 NA intron (NM_002759, intron 14 of 16) intron (NM_002759, intron 14 of 16) 24872 NM_001278505 253635 Hs.595250 NM_174931 ENSG00000152133 GPATCH11 CCDC75|CENP-Y|CENPY G-patch domain containing 11 protein-coding 291.333-33 chr18 4029034 4029346 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) L1MA8|LINE|L1 66837 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 233.333-97 chr4 109911761 109912049 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001178130) promoter-TSS (NM_001178130) -978 NM_001963 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 198.666-40 chr2 86136954 86137116 + 1.33333 NA exon (NM_017952, exon 23 of 24) exon (NM_017952, exon 23 of 24) 1165 NR_004378 692225 Hs.723087 NR_004378 ENSG00000208772 SNORD94 U94 small nucleolar RNA, C/D box 94 snoRNA 220-80 chr4 32576676 32576910 + 1.33333 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 225755 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 252-104 chr8 67150013 67150386 + 1.33333 NA intron (NM_024790, intron 16 of 28) intron (NM_024790, intron 16 of 28) 66351 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 249-7 chr10 8630402 8630822 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36221 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 232-18 chr11 18359690 18359935 + 1.33333 NA intron (NM_001142307, intron 14 of 15) AluJb|SINE|Alu -27975 NR_036116 100423016 NR_036116 ENSG00000264603 MIR3159 - microRNA 3159 ncRNA 205.333-79 chr14 89232044 89232340 + 1.33333 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 185041 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 212.333-36 chr12 130663892 130664077 + 1.33333 NA intron (NM_001351226, intron 1 of 21) L1MC4|LINE|L1 -30064 NM_001351231 23504 Hs.657441 NM_015347 ENSG00000060709 RIMBP2 PPP1R133|RBP2|RIM-BP2 RIMS binding protein 2 protein-coding 215.333-93 chr2 117210358 117210642 + 1.33333 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -604191 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 247.333-60 chr5 338511 338772 + 1.33333 NA intron (NM_020731, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 34465 NM_020731 57491 Hs.50823 NM_020731 ENSG00000286169 AHRR AHH|AHHR|bHLHe77 aryl-hydrocarbon receptor repressor protein-coding 318-43 chr4 104694518 104694814 + 1.33333 NA intron (NR_125926, intron 9 of 9) intron (NR_125926, intron 9 of 9) -199772 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 231.333-80 chr4 71888412 71888763 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -83067 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 201-57 chr2 99058311 99058511 + 1.33333 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) L1M5|LINE|L1 82769 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 220.666-41 chr2 239801541 239801728 + 1.33333 NA TTS (NR_037808) TTS (NR_037808) 38774 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 225.666-28 chr7 26477145 26477374 + 1.33333 NA intron (NR_148500, intron 2 of 5) intron (NR_148500, intron 2 of 5) 61566 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 238.666-10 chr11 102577189 102577445 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_004771, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_004771, exon 10 of 10) -46570 NM_002423 4316 Hs.2256 NM_002423 ENSG00000137673 MMP7 MMP-7|MPSL1|PUMP-1 matrix metallopeptidase 7 protein-coding 212-59 chr15 59757483 59757687 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -68265 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 326-41 chr7 1214625 1215020 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18050 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 445.333 chr1 76421439 76422046 + 1.33333 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) intron (NM_001349109, intron 3 of 3) 346996 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 189.333-141 chr4 37040671 37040830 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 38971 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 237.666-9 chr2 52873425 52873612 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -170903 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 183.333-120 chr4 127556865 127557030 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -76010 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 345.666-6 chr2 49841998 49842377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 132016 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 333.666-4 chr12 16930787 16931259 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57724 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 328.333-9 chr10 98913251 98913682 + 1.33333 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 11102 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 194.333-102 chr4 97406843 97407102 + 1.33333 NA intron (NR_102713, intron 1 of 5) MER4CL34|LTR|ERV1 40046 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 258.667-11 chr10 47280908 47281248 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -19119 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 241-60 chr8 132622090 132622338 + 1.33333 NA intron (NR_135913, intron 6 of 10) intron (NR_135913, intron 6 of 10) 53331 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 214.667-22 chr11 43773717 43774022 + 1.33333 NA intron (NM_016142, intron 3 of 10) intron (NM_016142, intron 3 of 10) 93131 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 237.333-26 chr14 27330273 27330529 + 1.33333 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -282187 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 214.666-67 chr7 76059956 76060121 + 1.33333 NA intron (NM_001282403, intron 4 of 7) intron (NM_001282403, intron 4 of 7) 11932 NM_005918 4191 Hs.520967 NM_005918 ENSG00000146701 MDH2 EIEE51|M-MDH|MDH|MGC:3559|MOR1 malate dehydrogenase 2 protein-coding 204.667-153 chr8 140784451 140784707 + 1.33333 NA intron (NR_148036, intron 14 of 34) intron (NR_148036, intron 14 of 34) -51926 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 201.667-99 chr6 28308376 28308646 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 26974 NM_001184743 84547 Hs.144527 NM_032507 ENSG00000137338 PGBD1 HUCEP-4|SCAND4|dJ874C20.4 piggyBac transposable element derived 1 protein-coding 212.666-61 chr4 63795787 63795996 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 613559 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 219.666-21 chr17 47375619 47375838 + 1.33333 NA intron (NM_001195192, intron 10 of 21) intron (NM_001195192, intron 10 of 21) 51773 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 238.333-9 chr10 108082806 108083171 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13695 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 192.666-60 chr7 42157917 42158120 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) intron (NM_000168, intron 2 of 14) 79191 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 214-140 chr8 137262345 137262610 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 151111 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 353-11 chr2 123933030 123933486 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 91916 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 218.666-17 chr12 15411419 15411611 + 1.33333 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) 89007 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 244.666-51 chr8 80024886 80025276 + 1.33333 NA intron (NM_014018, intron 1 of 2) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 5178 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 212.333-100 chr3 141030822 141031030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20421 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 210.999-6 chr2 239981619 239981810 + 1.33333 NA intron (NM_001322019, intron 9 of 9) intron (NM_001322019, intron 9 of 9) -38620 NR_039949 100616417 NR_039949 ENSG00000264279 MIR4786 mir-4786 microRNA 4786 ncRNA 307-36 chr7 30629522 30629855 + 1.33333 NA intron (NM_002047, intron 14 of 16) intron (NM_002047, intron 14 of 16) 34810 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 197-4 chr1 82369162 82369319 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -533943 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 190-135 chrX 101180320 101180557 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -39506 NM_001939 1821 Hs.159291 NM_001939 ENSG00000102385 DRP2 DRP-2 dystrophin related protein 2 protein-coding 441.666-2 chr21 25866538 25866930 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -131080 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 194.667-153 chr8 100368727 100368987 + 1.33333 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -13906 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 164-123 chr9 10161143 10161385 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) L1MA4|LINE|L1 361872 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 262-33 chr18 806131 806412 + 1.33333 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) intron (NM_005433, intron 1 of 11) 5971 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 197-60 chr2 150799302 150799542 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 170525 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 333.333-5 chr10 11844587 11845133 + 1.33333 NA intron (NM_153256, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu 21504 NM_153256 254427 Hs.435775 NM_153256 ENSG00000148426 PROSER2 C10orf47 proline and serine rich 2 protein-coding 224-84 chr6 50221288 50221602 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -171516 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 398.666-8 chr7 49524919 49525590 + 1.33333 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -248384 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 278.666-2 chr1 170700956 170701361 + 1.33333 NA intron (NM_022716, intron 1 of 3) intron (NM_022716, intron 1 of 3) 37027 NM_022716 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 245-24 chr16 48195728 48196028 + 1.33333 NA intron (NM_001370497, intron 18 of 29) intron (NM_001370497, intron 18 of 29) 36393 NM_033151 85320 Hs.652267 NM_032583 ENSG00000121270 ABCC11 EWWD|MRP8|WW ATP binding cassette subfamily C member 11 protein-coding 503-6 chr8 79765788 79766276 + 1.33333 NA intron (NM_001040708, intron 4 of 4) intron (NM_001040708, intron 4 of 4) 443 NM_001282851 23462 Hs.234434 NM_012258 ENSG00000164683 HEY1 BHLHb31|CHF2|HERP2|HESR1|HRT-1|NERP2|OAF1|hHRT1 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1 protein-coding 260-82 chr8 52523739 52523961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 41580 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 176.333-141 chr5 145351018 145351261 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 484203 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 124.666 chr14 42555810 42556006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 949052 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 224.333-40 chr14 62082615 62082829 + 1.33333 NA intron (NM_001367661, intron 7 of 8) intron (NM_001367661, intron 7 of 8) -34635 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 268.666-12 chr15 67650149 67650494 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 11 of 21) L1MB7|LINE|L1 101227 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 285.999 chr12 12853256 12853660 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -22019 NR_003932 387841 Hs.631728 NR_003932 ENSG00000234498 RPL13AP20 RPL13A_9_1211 ribosomal protein L13a pseudogene 20 pseudo 223.667-48 chr3 99271564 99271898 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -366863 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 262.666-17 chr3 113670056 113670296 + 1.33333 NA non-coding (NR_111981, exon 5 of 7) non-coding (NR_111981, exon 5 of 7) 26466 NM_001009899 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 306-61 chrX 82483177 82483525 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -1024939 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 203-106 chr8 58364812 58365055 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -46331 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 135.333-98 chr2 195112183 195112323 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 381658 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 276.999 chr1 58008404 58008716 + 1.33333 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) intron (NM_001353980, intron 1 of 5) 147979 NR_104363 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 221-54 chr4 139137310 139137553 + 1.33333 NA intron (NM_001371339, intron 3 of 9) intron (NM_001371339, intron 3 of 9) 39787 NM_001371337 189.666-4 chr10 67991248 67991398 + 1.33333 NA intron (NM_001278185, intron 11 of 23) intron (NM_001278185, intron 11 of 23) 19560 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 267.333-41 chr17 71121875 71122294 + 1.33333 NA intron (NR_104152, intron 3 of 3) intron (NR_104152, intron 3 of 3) 80095 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 141-53 chr3 64709170 64709330 + 1.33333 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) intron (NR_038264, intron 1 of 5) -21250 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 191.333-206 chr8 107120344 107120593 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 216047 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 264.999-9 chr8 111570255 111570532 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 193754 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 195.333-122 chr2 174478817 174479051 + 1.33333 NA intron (NM_001267051, intron 2 of 14) intron (NM_001267051, intron 2 of 14) 8095 NM_152529 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 265.666-18 chr3 135434983 135435364 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -530555 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 213.666-39 chr5 80995927 80996112 + 1.33333 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) intron (NM_006909, intron 1 of 26) -35112 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 239.666-29 chr8 29052123 29052358 + 1.33333 NA non-coding (NR_136758, exon 11 of 11) non-coding (NR_136758, exon 11 of 11) 160926 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 209-51 chr17 63042871 63043178 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) intron (NM_025185, intron 2 of 25) 76789 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 190.333-25 chr10 128693559 128693794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -219157 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 248.667-99 chr7 64470829 64471153 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37298 NR_029404 649395 Hs.728871 NR_029404 YWHAEP1 - tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein epsilon pseudogene 1 pseudo 201.666-40 chr7 131522881 131523123 + 1.33333 NA intron (NM_001018111, intron 1 of 8) L1MB8|LINE|L1 33626 NM_005397 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 201.666-31 chr3 38420254 38420529 + 1.33333 NA intron (NR_146068, intron 15 of 16) L1MB4|LINE|L1 -33499 NM_001106 93 Hs.174273 NM_001106 ENSG00000114739 ACVR2B ACTRIIB|ActR-IIB|HTX4 activin A receptor type 2B protein-coding 344.333-29 chrX 55825584 55826068 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -82297 NM_001324105 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 330.333-7 chr13 39909115 39909563 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -245204 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 247.333-8 chr10 60478455 60478666 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -88685 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 196.666-40 chr19 14071372 14071551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1548 NM_001291291 113230 Hs.372775 NM_001291291 ENSG00000141854 MISP3 - MISP family member 3 protein-coding 328.333-5 chr10 25903116 25903635 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 30335 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 204-96 chr2 72026008 72026174 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121771 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 163-41 chr2 67033234 67033456 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53101 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 288-56 chr8 86334685 86335142 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7634 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 209.666-56 chr9 123919513 123919761 + 1.33333 NA intron (NM_001352968, intron 1 of 18) AluSz|SINE|Alu 10489 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 194-37 chr14 70073232 70073454 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) 6874 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 306-32 chr3 18967218 18967567 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -181118 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 270.333 chr1 43210072 43210468 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001167965, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001167965, exon 11 of 11) -37700 NM_001159936 10969 Hs.346868 NM_006824 ENSG00000117395 EBNA1BP2 EBP2|NOBP|P40 EBNA1 binding protein 2 protein-coding 220.666-33 chr2 49282700 49282871 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -128258 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 197.333-220 chr7 119226471 119226662 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 680809 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 129.333-77 chr17 35621058 35621190 + 1.33333 NA intron (NM_001030006, intron 5 of 21) intron (NM_001030006, intron 5 of 21) 33802 NM_001030006 163 Hs.514819 NM_001282 ENSG00000006125 AP2B1 ADTB2|AP105B|AP2-BETA|CLAPB1 adaptor related protein complex 2 subunit beta 1 protein-coding 313.666-4 chr14 51675577 51675902 + 1.33333 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) intron (NM_001267046, intron 1 of 13) 23829 NM_152330 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 176-27 chr13 83639700 83639900 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 242593 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 211.666-15 chr15 42950248 42950498 + 1.33333 NA intron (NM_174916, intron 45 of 46) intron (NM_174916, intron 45 of 46) -29595 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 273.333-21 chr16 2945062 2945324 + 1.33333 NA intron (NM_032296, intron 9 of 9) AluSz|SINE|Alu -19082 NM_172229 79412 Hs.661128 NM_024507 ENSG00000131650 KREMEN2 KRM2 kringle containing transmembrane protein 2 protein-coding 235.333-12 chr10 89552653 89552864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17164 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 210.666-115 chrX 99218540 99218752 + 1.33333 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 1191627 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 193.333-105 chr2 186451113 186451315 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35046 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 403.999-4 chr5 31989803 31990131 + 1.33333 NA intron (NM_178140, intron 3 of 24) MIR3|SINE|MIR -53808 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 161.333-49 chr11 23582843 23583039 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -163751 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 254.333-73 chr6 112068293 112068650 + 1.33333 NA intron (NR_125354, intron 6 of 6) intron (NR_125354, intron 6 of 6) 14303 NR_125353 8838 Hs.558428 NM_003880 ENSG00000112761 CCN6 LIBC|PPAC|PPD|WISP-3|WISP3 cellular communication network factor 6 protein-coding 204-158 chr5 28565161 28565439 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -277635 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 180-75 chr4 93865634 93865857 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 36992 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 277-16 chr14 78618170 78618506 + 1.33333 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 214619 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 199.666-17 chr16 7949593 7949848 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 616875 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 274-16 chr14 65415315 65415619 + 1.33333 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) intron (NR_038170, intron 1 of 10) 2737 NR_038170 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 212-9 chr1 60165939 60166140 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -92269 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 184.666-38 chr7 95661863 95662033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65432 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 386.666-6 chr2 21383366 21383708 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 259551 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 155.333-147 chr18 47384828 47385035 + 1.33333 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) L1PA16|LINE|L1 4435 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 211.999-3 chr10 121718048 121718210 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -119671 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 205.333-109 chr19 16821429 16821592 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -7888 NM_015260 23309 Hs.13999 NM_015260 ENSG00000127511 SIN3B - SIN3 transcription regulator family member B protein-coding 449-2 chr18 3017805 3018363 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6137 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 218.666-56 chr4 30741633 30741835 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 21365 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 305.999-6 chr5 90728112 90728567 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 48 of 89) intron (NR_003149, intron 48 of 89) 169542 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 264.666-34 chr6 129411306 129411726 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 40 of 64) intron (NM_000426, intron 40 of 64) 298661 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 145.333-194 chr3 101147625 101147842 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154243 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 242.333-29 chr14 40875880 40876179 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -78682 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 242.333-105 chr9 94862436 94862835 + 1.33333 NA intron (NM_032823, intron 5 of 14) intron (NM_032823, intron 5 of 14) 52673 NR_031755 100313780 NR_031755 ENSG00000252153 MIR2278 mir-2278 microRNA 2278 ncRNA 182-103 chr7 83438020 83438210 + 1.33333 NA intron (NM_001178129, intron 4 of 16) intron (NM_001178129, intron 4 of 16) 203316 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 351.333-25 chr5 52111406 52111899 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 103621 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 172-96 chr6 68873409 68873630 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 238237 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 238.666-38 chr7 83734170 83734373 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -85132 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 150.333-132 chr15 67430811 67431046 + 1.33333 NA intron (NR_040052, intron 3 of 5) intron (NR_040052, intron 3 of 5) 90045 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 293.667-56 chr8 61770814 61771337 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 56287 NR_039680 100616484 NR_039680 ENSG00000264408 MIR4470 mir-4470 microRNA 4470 ncRNA 274.999-4 chr2 39622319 39622678 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -43000 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 306.333-16 chr12 108296039 108296323 + 1.33333 NA intron (NM_001142344, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 24481 NM_001142345 1240 Hs.197143 NM_004072 ENSG00000174600 CMKLR1 CHEMERINR|ChemR23|DEZ|RVER1 chemerin chemokine-like receptor 1 protein-coding 211.333-32 chr10 127644744 127644906 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -92360 NM_207426 399823 Hs.449674 NM_207426 ENSG00000186766 FOXI2 - forkhead box I2 protein-coding 253.333-81 chr5 14085818 14086032 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57417 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 197.666-27 chr18 1368646 1368829 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -9108 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 205.666-21 chr17 68668667 68668860 + 1.33333 NA intron (NR_110825, intron 2 of 4) L1M2|LINE|L1 40609 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 208-63 chr17 65011128 65011403 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001282425, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001282425, exon 4 of 4) -35680 NR_026903 201283 Hs.396447 NM_153032 ENSG00000214174 AMZ2P1 - archaelysin family metallopeptidase 2 pseudogene 1 pseudo 309.666-5 chr14 71987901 71988245 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 54546 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 206-31 chr11 41015892 41016056 + 1.33333 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) AluYh3|SINE|Alu 443662 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 229-69 chr8 128128155 128128553 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21762 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 124-64 chr2 99254303 99254457 + 1.33333 NA intron (NM_175735, intron 1 of 5) intron (NM_175735, intron 1 of 5) 727 NM_175735 254773 Hs.436468 NM_175735 ENSG00000185674 LYG2 LYGH|LYSG2 lysozyme g2 protein-coding 180-81 chr5 127495379 127495577 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -22162 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 350.666-11 chr17 65978359 65978735 + 1.33333 NA intron (NM_001353129, intron 17 of 26) MIRc|SINE|MIR -152004 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 142-87 chr3 67369030 67369188 + 1.33333 NA intron (NM_001177599, intron 10 of 10) HAL1b|LINE|L1 143645 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 336.333-32 chr6 66338055 66338449 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 550373 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 279.666-12 chr5 94434976 94435238 + 1.33333 NA intron (NM_001145678, intron 14 of 20) intron (NM_001145678, intron 14 of 20) 183497 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 288-18 chr13 106283363 106283760 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -93003 NR_034119 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 184-13 chr11 83215139 83215378 + 1.33333 NA TTS (NM_001300976) TTS (NM_001300976) 21546 NR_125355 338699 Hs.503438 NM_182603 ENSG00000137494 ANKRD42 PPP1R79|SARP ankyrin repeat domain 42 protein-coding 248.333-71 chr4 75414364 75414661 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60436 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 213.333-117 chr21 43888181 43888400 + 1.33333 NA intron (NM_001369878, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 23067 NM_020132 56894 Hs.248785 NM_020132 ENSG00000160216 AGPAT3 1-AGPAT 3|LPAAT-GAMMA1|LPAAT3 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3 protein-coding 382-6 chr14 75131289 75131757 + 1.33333 NA TTS (NM_006827) TTS (NM_006827) -4475 NM_001329237 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 223.666-26 chr4 115269186 115269355 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -155650 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 206-57 chr15 64201852 64202073 + 1.33333 NA intron (NM_001329605, intron 10 of 12) intron (NM_001329605, intron 10 of 12) -38807 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 281.666-3 chr15 35480243 35480575 + 1.33333 NA intron (NM_080650, intron 3 of 8) intron (NM_080650, intron 3 of 8) 65756 NM_001141972 89978 Hs.107196 NM_080650 ENSG00000134146 DPH6 ATPBD4 diphthamine biosynthesis 6 protein-coding 223-55 chr6 40255203 40255425 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 100692 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 340.666-18 chr7 50444457 50444904 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001346564, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001346564, exon 4 of 4) 5670 NM_001042762 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 189.333-60 chr15 81886553 81886749 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 159367 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 294-66 chr9 28706113 28706460 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 13019 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 190-65 chr2 118341404 118341630 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -155131 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 207.333-112 chr16 79071158 79071437 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 529440 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 201.333-217 chr5 4262534 4262807 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -510811 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 290-30 chr22 27786657 27786988 + 1.33333 NA intron (NM_002430, intron 1 of 1) intron (NM_002430, intron 1 of 1) 14934 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 210.333-163 chr8 26204928 26205208 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -86440 NM_002717 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 272.666-13 chr20 44197526 44197758 + 1.33333 NA exon (NM_016470, exon 4 of 4) exon (NM_016470, exon 4 of 4) -10064 NM_020433 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 299.666-14 chr4 65361806 65362181 + 1.33333 NA intron (NM_001281767, intron 12 of 16) intron (NM_001281767, intron 12 of 16) 307495 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 196-92 chr2 158245335 158245485 + 1.33333 NA intron (NM_138803, intron 10 of 13) intron (NM_138803, intron 10 of 13) 78760 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 208.666-59 chr2 99410018 99410205 + 1.33333 NA intron (NR_135652, intron 14 of 21) AluSz|SINE|Alu 72722 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 262.666-29 chr9 35431388 35431813 + 1.33333 NA intron (NR_003582, intron 2 of 10) L1MB7|LINE|L1 24845 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 293.333-62 chr8 63628015 63628449 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -141198 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 265.667-9 chr10 65762870 65763148 + 1.33333 NA intron (NR_120647, intron 5 of 5) L1ME4c|LINE|L1 191584 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 262.666-22 chr6 125375895 125376196 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74078 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 186.666-54 chr9 95834832 95835010 + 1.33333 NA intron (NR_023390, intron 2 of 2) intron (NR_023390, intron 2 of 2) -40770 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 196-3 chr1 20173487 20173697 + 1.33333 NA intron (NM_001367969, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 3847 NM_001316722 391013 Hs.512512 NM_001105572 ENSG00000187980 PLA2G2C - phospholipase A2 group IIC protein-coding 200.333-49 chr16 56952045 56952222 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9817 NM_000078 1071 Hs.89538 NM_000078 ENSG00000087237 CETP BPIFF|HDLCQ10 cholesteryl ester transfer protein protein-coding 240.666-5 chr10 29130397 29130656 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -158544 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 280-27 chr2 118587259 118587621 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 15526 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 275.999-7 chr6 65485119 65485441 + 1.33333 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 94524 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 232-39 chr18 59631919 59632164 + 1.33333 NA intron (NM_133459, intron 2 of 10) intron (NM_133459, intron 2 of 10) 65382 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 205.333-103 chr18 3558810 3558980 + 1.33333 NA intron (NM_001242762, intron 6 of 9) MER75|DNA|PiggyBac -35219 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 148.666-11 chr7 83767790 83768076 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -118794 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 205.333-102 chr18 2595855 2596035 + 1.33333 NA intron (NM_006101, intron 11 of 16) L2b|LINE|L2 24388 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 238-14 chr11 103153291 103153511 + 1.33333 NA exon (NM_001080463, exon 22 of 90) exon (NM_001080463, exon 22 of 90) 43975 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 233.333-58 chr2 46363797 46364048 + 1.33333 NA intron (NM_001430, intron 6 of 15) intron (NM_001430, intron 6 of 15) 30245 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 194-25 chr12 10536357 10536569 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -16916 NR_146456 101060038 NR_146455 LINC02446 - long intergenic non-protein coding RNA 2446 ncRNA 234.666-17 chr17 29659749 29659964 + 1.33333 NA intron (NM_033389, intron 10 of 14) AluSc5|SINE|Alu -38433 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 203.333-47 chr11 117241916 117242164 + 1.33333 NA intron (NM_001077239, intron 4 of 14) L3|LINE|CR1 9304 NM_001077239 257160 Hs.591934 NM_207343 ENSG00000167257 RNF214 - ring finger protein 214 protein-coding 199.333-294 chr9 26184875 26185062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118293 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 237.666-8 chr17 19477176 19477364 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -56584 NM_018242 55244 Hs.232054 NM_018242 ENSG00000142494 SLC47A1 MATE1 solute carrier family 47 member 1 protein-coding 292-15 chr14 69661984 69662308 + 1.33333 NA intron (NM_014734, intron 2 of 5) intron (NM_014734, intron 2 of 5) 50550 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 363.999-4 chr3 70064347 70064946 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 64902 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 134-70 chr3 119572310 119572462 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7106 NM_001291949 141 Hs.99884 NM_001125 ENSG00000144843 ADPRH ARH1|hARH1 ADP-ribosylarginine hydrolase protein-coding 223.333-12 chr1 173105212 173105399 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -54342 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 189.333-117 chr21 19580048 19580312 + 1.33333 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR 319575 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 269-44 chr5 165872606 165872997 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1053569 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 207-81 chr3 132753636 132753820 + 1.33333 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) MIRc|SINE|MIR -31269 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 220-62 chr2 77878215 77878464 + 1.33333 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -37595 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 125.333-138 chr5 61284445 61284617 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19602 NR_146624 105378992 Hs.621682 NR_146624 ENSG00000249279 LINC02057 - long intergenic non-protein coding RNA 2057 ncRNA 212-58 chr15 59302798 59303030 + 1.33333 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) intron (NM_004998, intron 1 of 27) 69957 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 210.666-58 chr2 154932399 154932586 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 233797 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 404.333-4 chr12 52478430 52479067 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -4943 NM_173086 286887 Hs.709234 NM_173086 ENSG00000170465 KRT6C K6E|KRT6E|PPKNEFD keratin 6C protein-coding 210-39 chr14 61868662 61868964 + 1.33333 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 56110 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 417.333-15 chr8 16269548 16269975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -76970 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 292-27 chr2 113904646 113904925 + 1.33333 NA intron (NM_001277140, intron 1 of 11) L1M5|LINE|L1 -13793 NR_110174 101060091 Hs.741753 NR_110174 ACTR3-AS1 - ACTR3 antisense RNA 1 ncRNA 199-109 chr8 16286806 16287069 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94146 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 200.666-47 chr17 30386655 30386824 + 1.33333 NA intron (NM_001304, intron 2 of 20) L1MB4|LINE|L1 6261 NM_001199775 1362 Hs.446079 NM_001304 ENSG00000108582 CPD GP180 carboxypeptidase D protein-coding 257.333-87 chr6 133193834 133194167 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47357 NM_004100 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 221.333-119 chr5 133270677 133270847 + 1.33333 NA intron (NM_015082, intron 6 of 15) intron (NM_015082, intron 6 of 15) 156944 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 244.666-5 chr1 208305281 208305547 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -61030 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 182.333-113 chr4 52496320 52496627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 160066 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 165.333-51 chr11 101393839 101394082 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 125945 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 146.666-4 chr16 52417408 52417525 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 129677 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 147-53 chr17 28174465 28174640 + 1.33333 NA intron (NM_016231, intron 7 of 10) intron (NM_016231, intron 7 of 10) -52011 NR_003064 23615 Hs.157195 NM_021093 ENSG00000237575 PYY2 - peptide YY 2 (pseudogene) pseudo 195-38 chr14 51339696 51339909 + 1.33333 NA intron (NR_038358, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 6409 NR_038358 283553 Hs.325752 NR_038358 ENSG00000258479 LINC00640 - long intergenic non-protein coding RNA 640 ncRNA 321.666-9 chr3 100155465 100155880 + 1.33333 NA intron (NM_001167924, intron 2 of 9) HAL1|LINE|L1 -30152 NR_028357 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 204.666-56 chr3 35318771 35318976 + 1.33333 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) intron (NR_110817, intron 1 of 3) 75150 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 318.666-4 chr11 24577785 24578128 + 1.33333 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 80903 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 215.333-161 chr5 80591160 80591432 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21016 NM_001004441 340120 Hs.519404 NM_001004441 ENSG00000189127 ANKRD34B DP58 ankyrin repeat domain 34B protein-coding 204.333-141 chr4 81452744 81452903 + 1.33333 NA intron (NM_152545, intron 4 of 13) intron (NM_152545, intron 4 of 13) 19084 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 364.666-7 chr22 43558588 43558953 + 1.33333 NA intron (NM_198856, intron 24 of 29) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 42516 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 142.667-171 chr5 2422595 2422759 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -110476 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 251-46 chr3 130897529 130897852 + 1.33333 NA intron (NM_001001485, intron 2 of 27) intron (NM_001001485, intron 2 of 27) 3100 NM_001001486 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 258.666-31 chr4 183969689 183969897 + 1.33333 NA intron (NM_020225, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 64486 NM_020225 56977 Hs.21958 NM_020225 ENSG00000173320 STOX2 - storkhead box 2 protein-coding 425.333-5 chr15 64826776 64827274 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -1378 NM_001286499 80119 Hs.112160 NM_025049 ENSG00000140451 PIF1 C15orf20|PIF PIF1 5'-to-3' DNA helicase protein-coding 331.666-9 chr2 13511049 13511328 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -504175 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 266.666-7 chr11 14535829 14536154 + 1.33333 NA intron (NM_148976, intron 2 of 10) intron (NM_148976, intron 2 of 10) -15546 NM_002786 5682 Hs.102798 NM_002786 ENSG00000129084 PSMA1 HC2|HEL-S-275|NU|PROS30 proteasome subunit alpha 1 protein-coding 178.333-100 chr3 61938085 61938229 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 376586 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 200.667-125 chr4 144411902 144412201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 233968 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 198-158 chr5 151866663 151866907 + 1.33333 NA intron (NM_000171, intron 3 of 8) intron (NM_000171, intron 3 of 8) 58066 NM_000171 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 299.667-13 chr17 70708361 70708703 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 493647 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 211.666-19 chr16 85813941 85814125 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 14338 NM_001318794 1327 Hs.433419 NM_001861 ENSG00000131143 COX4I1 COX IV-1|COX4|COX4-1|COXIV|COXIV-1 cytochrome c oxidase subunit 4I1 protein-coding 206.333-60 chr15 85584728 85584882 + 1.33333 NA intron (NM_007200, intron 7 of 36) intron (NM_007200, intron 7 of 36) -35145 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 238.666-16 chr12 115088096 115088304 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -404025 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 258.666-20 chr2 81995772 81996050 + 1.33333 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -528965 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 207.333-141 chr2 158636125 158636327 + 1.33333 NA intron (NM_001005476, intron 9 of 20) L1MEf|LINE|L1 98776 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 262.333-41 chr19 56756967 56757210 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -8234 NR_110744 101929059 Hs.607132 NR_110744 ENSG00000286125 ZIM2-AS1 ZIM2as ZIM2 antisense RNA 1 ncRNA 327.333-11 chr12 87428911 87429271 + 1.33333 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 98352 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 130.333-98 chr2 24135161 24135273 + 1.33333 NA intron (NR_111929, intron 4 of 5) intron (NR_111929, intron 4 of 5) 11748 NM_001145710 375190 Hs.710370 NM_198553 ENSG00000219626 FAM228B - family with sequence similarity 228 member B protein-coding 227-29 chr20 1563813 1564110 + 1.33333 NA TTS (NM_001083910) TTS (NM_001083910) -6256 NM_178460 128646 Hs.729560 NM_178460 ENSG00000125900 SIRPD PTPNS1L2|dJ576H24.4 signal regulatory protein delta protein-coding 329-8 chr16 80911221 80911667 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -18848 NR_131947 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 259.333-17 chr10 105083818 105084121 + 1.33333 NA intron (NM_014978, intron 5 of 26) MIR|SINE|MIR -417753 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-310 chr4 103180774 103180921 + 1.33333 NA intron (NM_001813, intron 12 of 48) intron (NM_001813, intron 12 of 48) 17496 NM_001813 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 188-50 chr19 29222370 29222563 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9315 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 196.333-160 chr7 67996735 67997005 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23383 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 211.666-12 chr14 43419893 43420120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1087277 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 264.666-31 chr4 89625001 89625430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -211186 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 295.999-2 chr10 65878002 65878361 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 306756 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 226.333-90 chr4 95186004 95186208 + 1.33333 NA intron (NM_003728, intron 12 of 15) intron (NM_003728, intron 12 of 15) 94615 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 244-7 chr1 102252325 102252667 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -255262 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 341.666-21 chr9 80680732 80681172 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 705929 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 124.333-90 chr2 120143822 120143930 + 1.33333 NA intron (NM_001330310, intron 19 of 24) MIR|SINE|MIR 79524 NM_024121 79134 Hs.376722 NM_024121 ENSG00000226479 TMEM185B FAM11B transmembrane protein 185B protein-coding 204-166 chr5 122646384 122646618 + 1.33333 NA intron (NR_109881, intron 8 of 11) L1MA4|LINE|L1 -61901 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 209.333-162 chr4 18706637 18706938 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -684912 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 253-15 chr12 21628909 21629258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24236 NM_021957 2998 Hs.82614 NM_021957 ENSG00000111713 GYS2 - glycogen synthase 2 protein-coding 200-81 chr2 55623472 55623738 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -5983 NM_020463 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 208.667-120 chr6 100666851 100667127 + 1.33333 NA intron (NM_006828, intron 14 of 41) L2c|LINE|L2 -203314 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 210-55 chr18 63842073 63842273 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45532 NM_002575 5055 Hs.594481 NM_002575 ENSG00000197632 SERPINB2 HsT1201|PAI|PAI-2|PAI2|PLANH2 serpin family B member 2 protein-coding 210.666-50 chr19 29335622 29335810 + 1.33333 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) L1M3|LINE|L1 -122565 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 216.333-58 chr17 30369797 30370076 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -8991 NM_001304 1362 Hs.446079 NM_001304 ENSG00000108582 CPD GP180 carboxypeptidase D protein-coding 214.666-57 chr6 10052183 10052348 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -352237 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 213-59 chr4 27050119 27050356 + 1.33333 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL -167242 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 214-25 chr11 108258697 108258978 + 1.33333 NA intron (NM_001351834, intron 16 of 63) intron (NM_001351834, intron 16 of 63) 35308 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 265.333 chr1 93521219 93521561 + 1.33333 NA intron (NM_001024948, intron 2 of 13) intron (NM_001024948, intron 2 of 13) 63772 NM_001308251 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 190-57 chr19 37690563 37690769 + 1.33333 NA intron (NM_152605, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 1649 NM_152605 163115 Hs.722657 NM_152605 ENSG00000196381 ZNF781 - zinc finger protein 781 protein-coding 195.667-112 chr5 161175776 161176001 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -237262 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 208.666-9 chr1 104227034 104227225 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 154106 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 203.333-115 chr18 21501743 21501951 + 1.33333 NA intron (NM_001142966, intron 23 of 32) intron (NM_001142966, intron 23 of 32) 98857 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 216.666-35 chr17 49051234 49051449 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_006546, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_006546, exon 15 of 15) 53956 NM_001160423 10642 Hs.144936 NM_006546 ENSG00000159217 IGF2BP1 CRD-BP|CRDBP|IMP-1|IMP1|VICKZ1|ZBP1 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 protein-coding 397.666-2 chr10 32358586 32359274 + 1.33333 NA intron (NR_104163, intron 1 of 1) MER103C|DNA|hAT-Charlie 11566 NR_104163 102031319 Hs.128132 NR_104163 ENSG00000229327 LOC102031319 - uncharacterized LOC102031319 ncRNA 190.666-38 chr3 180901699 180901867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10887 NM_001013439 8087 Hs.478407 NM_005087 ENSG00000114416 FXR1 FXR1P FMR1 autosomal homolog 1 protein-coding 173.666-9 chr20 37059745 37059956 + 1.33333 NA intron (NM_002895, intron 9 of 21) intron (NM_002895, intron 9 of 21) 36147 NM_001323282 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 270-12 chr14 48289012 48289340 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -494162 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 446.666-4 chr21 21098829 21099326 + 1.33333 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) -48085 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 190.667-34 chr13 75871779 75871996 + 1.33333 NA intron (NM_001257995, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 849 NM_001257995 729420 Hs.586820 NM_001257995 LMO7DN C13orf45 LMO7 downstream neighbor protein-coding 284-20 chr17 72435090 72435393 + 1.33333 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 92430 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 247.333-75 chr7 80227244 80227552 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 91614 NM_001256414 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 263.333-75 chr7 17256621 17256924 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41880 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 163.666-12 chr4 25227066 25227217 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -6892 NM_018323 55300 Hs.191701 NM_018323 ENSG00000038210 PI4K2B PI4KIIB|PIK42B phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta protein-coding 228-65 chr5 7121201 7121395 + 1.33333 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger 148056 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 350.333-3 chr11 107518074 107518532 + 1.33333 NA intron (NM_138775, intron 10 of 11) (TATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 47432 NM_001301010 91801 Hs.503763 NM_138775 ENSG00000137760 ALKBH8 ABH8|TRM9|TRMT9|TRMT9A alkB homolog 8, tRNA methyltransferase protein-coding 243.999-3 chr11 109034920 109035207 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 369994 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 160.333-94 chr14 29945591 29945838 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -17867 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 386.333-6 chr21 29398745 29399086 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 26414 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 182.666-11 chr14 39976470 39976644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -544057 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 226-87 chr7 77482013 77482271 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55153 NM_002835 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 187.333-67 chr14 101694471 101694705 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -35849 NR_026774 145200 Hs.150840 NR_026774 ENSG00000258512 LINC00239 C14orf72|NCRNA00239 long intergenic non-protein coding RNA 239 ncRNA 224.667-26 chr15 65890930 65891192 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001206836, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001206836, exon 5 of 5) 21570 NM_004663 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 210.999-7 chr8 82858656 82858845 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53354 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 213.666 chr1 25522781 25522950 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -20720 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 204-16 chr1 160756789 160757043 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 17669 NM_001282590 57823 Hs.517265 NM_021181 ENSG00000026751 SLAMF7 19A|CD319|CRACC|CS1 SLAM family member 7 protein-coding 178.667-140 chr6 10934533 10934797 + 1.33333 NA intron (NR_125851, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 19424 NR_125851 101928191 Hs.638939 NR_125851 LOC101928191 - uncharacterized LOC101928191 ncRNA 221.333-117 chr5 128472853 128473085 + 1.33333 NA intron (NM_001999, intron 5 of 64) MamRep1151|LTR?|LTR? 65276 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 196.666-69 chr3 178150523 178150687 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -268596 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 198-11 chr1 214108858 214109120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120456 NM_002763 5629 Hs.741808 NM_002763 ENSG00000117707 PROX1 - prospero homeobox 1 protein-coding 252-58 chr20 15661984 15662211 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 261217 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 181-13 chr12 30815938 30816196 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 20386 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 222-54 chr22 38585653 38585946 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001291030, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001291030, exon 17 of 17) 15299 NR_134627 105373031 Hs.144041 NR_134627 LOC105373031 - uncharacterized LOC105373031 ncRNA 201.333-106 chr14 73364189 73364459 + 1.33333 NA intron (NM_001320114, intron 3 of 11) AluSx|SINE|Alu 94256 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 162.666-12 chr7 8427491 8427642 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -6043 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 170.333-166 chr4 174918638 174918904 + 1.33333 NA intron (NM_001278127, intron 1 of 1) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 413 NM_001278127 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 292.999-3 chr7 93197138 93197431 + 1.33333 NA intron (NM_001288810, intron 4 of 7) intron (NM_001288810, intron 4 of 7) 22287 NM_001288810 253012 Hs.443169 NM_198151 ENSG00000188175 HEPACAM2 MIKI HEPACAM family member 2 protein-coding 395-9 chr18 8217281 8217752 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 14 of 30) intron (NM_002845, intron 14 of 30) 149518 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 294.999-3 chr2 211702974 211703420 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 11 of 26) intron (NM_001042599, intron 11 of 26) 723163 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 203.333-144 chr2 166465940 166466168 + 1.33333 NA intron (NR_045628, intron 6 of 25) intron (NR_045628, intron 6 of 25) 20917 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 153-89 chr3 3925799 3925933 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -124991 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 207.666-61 chr7 90603386 90603614 + 1.33333 NA intron (NM_001287135, intron 1 of 14) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 7179 NM_001287135 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 213-71 chr5 172949433 172949614 + 1.33333 NA intron (NM_001031711, intron 9 of 9) intron (NM_001031711, intron 9 of 9) -9206 NM_001317981 51121 Hs.546390 NM_016093 ENSG00000037241 RPL26L1 RPL26P1 ribosomal protein L26 like 1 protein-coding 137.333-179 chr7 46760508 46760661 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63462 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 331-2 chr1 94692673 94693002 + 1.33333 NA intron (NR_160779, intron 2 of 5) L1ME4a|LINE|L1 53063 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 262.999-5 chr2 95196471 95196764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30808 NM_001291604 7549 Hs.590916 NM_021088 ENSG00000275111 ZNF2 A1-5|ZNF661|Zfp661 zinc finger protein 2 protein-coding 196.667-97 chr3 80020763 80021041 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR -252904 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 380.666 chr1 151110951 151111370 + 1.33333 NA intron (NM_001323912, intron 6 of 7) AluJb|SINE|Alu 35471 NM_001178061 10500 Hs.516316 NM_030913 ENSG00000143434 SEMA6C SEMAY|m-SemaY|m-SemaY2 semaphorin 6C protein-coding 363.999-7 chr7 41089014 41089379 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -12408 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 425.999-3 chr4 36728210 36728568 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -86489 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 201-116 chr9 70684157 70684420 + 1.33333 NA intron (NM_001366143, intron 8 of 25) intron (NM_001366143, intron 8 of 25) 125796 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 223-69 chr9 29523880 29524161 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -310419 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 312.666-26 chr8 132850388 132850760 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -16384 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 200.666-61 chr2 118443489 118443673 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 159385 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 249.666-39 chr7 140437157 140437480 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33260 NM_001008749 401409 Hs.583545 NM_001008749 ENSG00000146955 RAB19 RAB19B RAB19, member RAS oncogene family protein-coding 204.666-20 chr11 97014062 97014248 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 505730 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 201.333-299 chr9 73884519 73884787 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -486878 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 244.666-52 chr8 96217361 96217765 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18071 NM_001254752 7381 Hs.131255 NM_006294 ENSG00000156467 UQCRB MC3DN3|QCR7|QP-C|QPC|UQBC|UQBP|UQCR6|UQPC ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein protein-coding 224.666-33 chr7 8788090 8788265 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 354568 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 152.667-104 chr14 54109051 54109235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -152252 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 200.667-164 chr9 29170847 29171121 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1MC|LINE|L1 41315 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 136.333-224 chr9 132553908 132554064 + 1.33333 NA intron (NM_207417, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR -28620 NM_020064 56751 Hs.283809 NM_020064 ENSG00000125492 BARHL1 - BarH like homeobox 1 protein-coding 274.666-20 chr21 35065676 35065967 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -16523 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 209.666-36 chr3 84904325 84904493 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 22319 NR_147147 105377192 NR_147147 ENSG00000242339 LINC02025 - long intergenic non-protein coding RNA 2025 ncRNA 162.667-120 chr2 5584331 5584571 + 1.33333 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 106667 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 241.333-2 chr1 78091257 78091554 + 1.33333 NA intron (NM_001304725, intron 2 of 5) intron (NM_001304725, intron 2 of 5) 45439 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 221.333-76 chr2 230144554 230144725 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 75345 NM_004510 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 227.666-25 chr4 63503777 63504076 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 905524 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 206.667-61 chr2 81437167 81437475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29625 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 274.333-59 chr6 145013507 145013866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 608031 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 211-100 chr9 31239766 31239929 + 1.33333 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 141643 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 180.667-64 chr2 82394996 82395251 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -461680 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 352.333-15 chr3 56180214 56180578 + 1.33333 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) L1MB2|LINE|L1 288071 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 377.666-3 chr10 5920436 5920753 + 1.33333 NA intron (NM_178150, intron 13 of 20) L1MC3|LINE|L1 26208 NM_032807 84893 Hs.498543 NM_032807 ENSG00000134452 FBH1 FBXO18|Fbx18|hFBH1 F-box DNA helicase 1 protein-coding 198.333-147 chr4 94603704 94603890 + 1.33333 NA intron (NM_006457, intron 7 of 12) LTR57|LTR|ERVL 151855 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 189.333-177 chr6 132146691 132146917 + 1.33333 NA non-coding (NR_146223, exon 2 of 2) non-coding (NR_146223, exon 2 of 2) 12826 NR_038981 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 241.333-25 chr10 118224037 118224232 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 118190 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 395.333-14 chr19 35042942 35043376 + 1.33333 NA intron (NM_002151, intron 3 of 13) intron (NM_002151, intron 3 of 13) 2653 NM_002151 3249 Hs.182385 NM_002151 ENSG00000105707 HPN TMPRSS1 hepsin protein-coding 277-6 chr10 33208583 33209059 + 1.33333 NA intron (NM_001244973, intron 9 of 16) intron (NM_001244973, intron 9 of 16) -92014 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 192.666-51 chr5 26483129 26483328 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 555358 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 140-31 chr12 119808175 119808354 + 1.33333 NA intron (NM_007174, intron 9 of 46) intron (NM_007174, intron 9 of 46) 69056 NM_007174 11113 Hs.119594 NM_007174 ENSG00000122966 CIT CITK|CRIK|MCPH17|STK21 citron rho-interacting serine/threonine kinase protein-coding 250.666-14 chr16 61372907 61373214 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -317294 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 166-20 chr10 24703054 24703243 + 1.33333 NA intron (NM_001367447, intron 2 of 24) intron (NM_001367447, intron 2 of 24) 19600 NM_001367454 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 266-64 chr4 79024107 79024365 + 1.33333 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) intron (NR_038342, intron 2 of 5) 52488 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 210.333-80 chr2 103988833 103989053 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 419389 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 260-85 chr8 111242094 111242423 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6055 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 290.666-3 chr1 158222895 158223218 + 1.33333 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -25280 NM_001320652 909 Hs.1309 NM_001763 ENSG00000158477 CD1A CD1|FCB6|HTA1|R4|T6 CD1a molecule protein-coding 262-56 chr3 114206761 114207003 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -7475 NM_001282563 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 333.333-8 chr10 52549948 52550277 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -79579 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 206.667-129 chr7 35802362 35802622 + 1.33333 NA intron (NM_001788, intron 1 of 12) intron (NM_001788, intron 1 of 12) 1273 NM_001363715 989 Hs.191346 NM_001788 ENSG00000122545 SEPTIN7 CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A septin 7 protein-coding 310.333-8 chr10 72545289 72545650 + 1.33333 NA intron (NM_006077, intron 4 of 11) MER4D1|LTR|ERV1 -21483 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 208-119 chr4 45194155 45194330 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -467608 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 196-22 chr10 74273479 74273650 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) AluSq10|SINE|Alu 96801 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 196-31 chr11 76988189 76988435 + 1.33333 NA intron (NM_001300953, intron 4 of 9) intron (NM_001300953, intron 4 of 9) -46086 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 210.333-151 chr7 3395830 3396106 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MB4|LINE|L1 94716 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 256.666-12 chr14 38771752 38771977 + 1.33333 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) MER94|DNA|hAT-Blackjack -110732 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 360.666-5 chr14 67210578 67210904 + 1.33333 NA intron (NM_173526, intron 6 of 8) AluJb|SINE|Alu 21301 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 440.666-10 chr3 30744828 30745353 + 1.33333 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) MIRb|SINE|MIR 138489 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 234-24 chr15 38237968 38238252 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14726 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 224.333-42 chr14 69494350 69494629 + 1.33333 NA intron (NM_001161498, intron 1 of 12) MIRb|SINE|MIR 9761 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 206-116 chr3 121141921 121142220 + 1.33333 NA intron (NR_145517, intron 7 of 8) L1MB1|LINE|L1 92430 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 153.667-371 chr8 35267774 35268007 + 1.33333 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 32415 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 219.333-52 chr14 79288597 79288798 + 1.33333 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 9317 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 206-25 chr10 115605634 115605850 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) intron (NM_207303, intron 26 of 28) 512377 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 116.333-69 chr14 73140551 73140698 + 1.33333 NA intron (NM_000021, intron 1 of 11) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 4117 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 193.333-135 chr4 52482296 52482496 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 174143 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 359.333-14 chr2 180121697 180122173 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -114638 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 218.666-78 chr9 73731362 73731530 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 579581 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 311.333-21 chr15 92770539 92770843 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -24793 NR_033769 728619 Hs.684129 NR_033769 ASB9P1 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 pseudogene 1 pseudo 212.333-74 chr2 151272921 151273219 + 1.33333 NA intron (NM_004688, intron 6 of 7) L1MB3|LINE|L1 -11207 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 252.666-44 chr7 53435556 53435975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 376166 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 205.667-37 chr12 87086663 87086964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -243926 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 162.666-11 chr6 131066275 131066449 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -3040 NM_001350303 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 208.666-64 chr20 6441191 6441352 + 1.33333 NA intron (NR_109953, intron 1 of 3) intron (NR_109953, intron 1 of 3) 14539 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 179.333-33 chr11 3687169 3687351 + 1.33333 NA intron (NR_157590, intron 27 of 31) L1MD|LINE|L1 -15876 NM_001303034 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 202.333-164 chr7 62768923 62769118 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 535036 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 364.333-6 chr12 1843389 1843700 + 1.33333 NA intron (NM_172364, intron 25 of 37).2 intron (NM_172364, intron 25 of 37).2 22979 NM_001163926 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 253-69 chr8 63791010 63791435 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 21792 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 209.333-18 chr10 30278056 30278269 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 66310 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 322-12 chr13 95548117 95548462 + 1.33333 NA intron (NM_182848, intron 1 of 4) intron (NM_182848, intron 1 of 4) -4431 NM_006984 9071 Hs.534377 NM_006984 ENSG00000134873 CLDN10 CPETRL3|HELIX|OSP-L|OSPL claudin 10 protein-coding 273-40 chr8 77266813 77267194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183694 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 238-8 chr11 14885002 14885204 + 1.33333 NA intron (NM_024514, intron 2 of 4) intron (NM_024514, intron 2 of 4) 7102 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 195.666-14 chr12 45486221 45486447 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 193644 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 242-48 chr20 8068609 8068944 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49015 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 214-22 chr11 5338772 5339045 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12600 NM_001004750 390058 Hs.553730 NM_001004750 ENSG00000176239 OR51B6 HOR5'Beta6 olfactory receptor family 51 subfamily B member 6 protein-coding 190.333-134 chr6 162726240 162726487 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_152410) promoter-TSS (NM_152410) -769 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 185.667-114 chr7 29811798 29812071 + 1.33333 NA intron (NM_001080529, intron 1 of 8) intron (NM_001080529, intron 1 of 8) 5380 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 224.333-123 chr8 52646065 52646429 + 1.33333 NA intron (NM_001083617, intron 15 of 23) FLAM_C|SINE|Alu 68188 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 192.666-43 chr3 133147862 133148027 + 1.33333 NA intron (NM_001282865, intron 1 of 3) intron (NM_001282865, intron 1 of 3) 23123 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 247.333-63 chr5 51499873 51500239 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 116608 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 215.333-59 chr14 82775339 82775623 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 132849 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 181.666-20 chr8 79577275 79577452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33754 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 225.333-143 chrX 40465557 40465842 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -115271 NM_005765 10159 Hs.495960 NM_005765 ENSG00000182220 ATP6AP2 APT6M8-9|ATP6IP2|ATP6M8-9|ELDF10|HT028|M8-9|MRXE|MRXSH|MSTP009|PRR|RENR|XMRE|XPDS ATPase H+ transporting accessory protein 2 protein-coding 135.333-42 chr12 32315375 32315538 + 1.33333 NA intron (NR_148725, intron 4 of 9) L1MB8|LINE|L1 -84102 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 208-22 chr10 70180036 70180211 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -9609 NM_001142648 56681 Hs.499960 NM_020150 ENSG00000079332 SAR1A SAR1|SARA1|Sara|masra2 secretion associated Ras related GTPase 1A protein-coding 436.666-10 chr7 5656822 5657351 + 1.33333 NA intron (NM_207111, intron 13 of 16) intron (NM_207111, intron 13 of 16) 23375 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 182-34 chr15 101682240 101682408 + 1.33333 NA intron (NM_152334, intron 12 of 18) L1M5|LINE|L1 -29933 NM_025141 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 210.667-113 chr6 113004893 113005147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 428427 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 229.999-7 chr20 18124124 18124308 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -13647 NM_001164811 100303755 Hs.488051 NM_001164811 ENSG00000232838 PET117 CSRP2BP PET117 cytochrome c oxidase chaperone protein-coding 170.333-9 chr1 112919910 112920214 + 1.33333 NA intron (NM_003051, intron 3 of 4).2 L2a|LINE|L2 -3288 NR_002796 246182 Hs.647691 NR_002796 AKR7A2P1 AFARP1 aldo-keto reductase family 7 member A2 pseudogene 1 pseudo 274-36 chr4 36347605 36347871 + 1.33333 NA TTS (NR_160267) TTS (NR_160267) 66122 NM_001136536 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 290.333-26 chr22 39872078 39872463 + 1.33333 NA intron (NM_152512, intron 2 of 6) intron (NM_152512, intron 2 of 6) 21490 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 204.666-50 chr21 45631248 45631494 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -12354 NM_001348238 54039 Hs.474049 NM_020528 ENSG00000183570 PCBP3 ALPHA-CP3|PCBP3-OT1|PCBP3OT poly(rC) binding protein 3 protein-coding 208.666-43 chr15 68051626 68051833 + 1.33333 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -2450 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 227-64 chr9 134014698 134014903 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10676 NR_149319 266655 Hs.654869 NM_001355256 ENSG00000235106 BRD3OS LINC00094|LP2477|NCRNA00094 BRD3 opposite strand protein-coding 376-24 chr9 80407904 80408383 + 1.33333 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 433120 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 212.333-60 chr2 9973356 9973660 + 1.33333 NA intron (NM_198182, intron 8 of 15) intron (NM_198182, intron 8 of 15) 21815 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 132.333-144 chr5 180746828 180747045 + 1.33333 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -6878 NM_001001657 134083 Hs.554719 NM_001001657 ENSG00000174339 OR2Y1 OR5-2 olfactory receptor family 2 subfamily Y member 1 protein-coding 188.666-22 chr20 34647928 34648169 + 1.33333 NA intron (NM_080476, intron 2 of 11) AluJb|SINE|Alu 29237 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 211-102 chr9 136936789 136937055 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7816 NM_018998 54461 Hs.522507 NM_018998 ENSG00000159069 FBXW5 Fbw5 F-box and WD repeat domain containing 5 protein-coding 247.667-36 chr15 79510797 79511194 + 1.33333 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 78479 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 255.666-13 chr17 62035136 62035627 + 1.33333 NA intron (NM_005121, intron 4 of 29) intron (NM_005121, intron 4 of 29) 29897 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 166.667-59 chr13 78185306 78185502 + 1.33333 NA intron (NR_047001, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 130549 NR_047001 100874222 Hs.493062 NR_047001 ENSG00000234377 OBI1-AS1 POU4F1-AS1|RNF219-AS1 OBI1 antisense RNA 1 ncRNA 332.333-19 chr4 95238280 95238622 + 1.33333 NA intron (NM_003728, intron 7 of 15) L1ME4c|LINE|L1 146960 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 222-53 chr20 54791994 54792232 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 316520 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 409.667-7 chr5 79890821 79891377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45480 NR_131226 105616916 Hs.590325 NR_131226 ENSG00000250888 LINC01455 MDONA|TCONS_00009433 long intergenic non-protein coding RNA 1455 ncRNA 201-41 chr15 73040850 73041006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11535 NM_002499 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 262.999-8 chr8 100911908 100912210 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 38512 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 209.333-186 chr5 35291952 35292157 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -61567 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 184-80 chr5 18007437 18007615 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 200252 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 290-56 chr8 129572801 129573085 + 1.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 2075 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 158.333-282 chr6 140491684 140491853 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -192046 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 156.667-50 chr10 101741620 101741806 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34401 NM_006119 2253 Hs.57710 NM_006119 ENSG00000107831 FGF8 AIGF|FGF-8|HBGF-8|HH6|KAL6 fibroblast growth factor 8 protein-coding 144-125 chr4 77751553 77751699 + 1.33333 NA intron (NM_001365006, intron 5 of 11) L1ME2|LINE|L1 67438 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 403.333-4 chr18 40381496 40382251 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 315587 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 251.333-40 chr15 83483973 83484314 + 1.33333 NA intron (NM_003027, intron 1 of 8) intron (NM_003027, intron 1 of 8) -6471 NM_001324187 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 352.666-7 chr7 48326820 48327195 + 1.33333 NA intron (NM_152701, intron 27 of 61) intron (NM_152701, intron 27 of 61) 155549 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 147.333-144 chr17 64428562 64428745 + 1.33333 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -20462 NM_001291317 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 242.666-11 chr11 60090248 60090466 + 1.33333 NA exon (NM_000139, exon 3 of 7) exon (NM_000139, exon 3 of 7) 1693 NM_000139 2206 Hs.386748 NM_000139 ENSG00000149534 MS4A2 APY|ATOPY|FCER1B|FCERI|IGEL|IGER|IGHER|MS4A1 membrane spanning 4-domains A2 protein-coding 208.666-39 chr14 80908887 80909122 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 4 of 24) L1MEg|LINE|L1 32734 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 288.999-3 chr13 26585941 26586177 + 1.33333 NA intron (NM_006646, intron 1 of 9) intron (NM_006646, intron 1 of 9) 28356 NM_001291965 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 240-42 chr2 13742466 13742880 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 658285 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 193.333-102 chr2 140822071 140822300 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 31 of 90) intron (NM_018557, intron 31 of 90) -235500 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 185.333-191 chr8 110973956 110974281 + 1.33333 NA intron (NR_125417, intron 5 of 5) intron (NR_125417, intron 5 of 5) 53315 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 214-122 chr6 169035442 169035624 + 1.33333 NA intron (NR_134622, intron 1 of 1) intron (NR_134622, intron 1 of 1) 110 NR_134622 101929460 Hs.355225 NR_134622 ENSG00000229720 LOC101929460 - uncharacterized LOC101929460 ncRNA 247-2 chr1 111521750 111521977 + 1.33333 NA intron (NM_001081976, intron 1 of 5) L1ME1|LINE|L1 -17742 NM_000677 140 Hs.281342 NM_000677 ENSG00000282608 ADORA3 A3AR adenosine A3 receptor protein-coding 270.333-26 chr16 82391030 82391489 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -221035 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 199.333-130 chr2 86211181 86211394 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_016622, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_016622, exon 4 of 4) 11830 NM_016622 51318 Hs.433439 NM_016622 ENSG00000132313 MRPL35 L35mt|MRP-L35 mitochondrial ribosomal protein L35 protein-coding 154-87 chr3 1489477 1489597 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 396513 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 342-40 chr8 140380688 140381159 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 7 of 22) AluSz|SINE|Alu 76821 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 219-38 chr17 64588519 64588758 + 1.33333 NA intron (NM_022739, intron 5 of 18) AluSg|SINE|Alu 73669 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 184.333-87 chr2 238064091 238064308 + 1.33333 NA intron (NM_016510, intron 1 of 11) intron (NM_016510, intron 1 of 11) 3198 NM_016510 51540 Hs.731909 NM_016510 ENSG00000132330 SCLY SCL|hSCL selenocysteine lyase protein-coding 391.333-11 chr2 97003388 97003702 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16965 NM_001122646 51252 Hs.107922 NM_016490 ENSG00000168754 FAM178B - family with sequence similarity 178 member B protein-coding 347.333-22 chr5 23327870 23328193 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -179578 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 205.333-95 chr17 59699912 59700133 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001015509, exon 2 of 3) 5' UTR (NM_001015509, exon 2 of 3) 7576 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 180-121 chr9 110874356 110874538 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001401, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001401, exon 4 of 4) 146185 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 172-68 chr20 54667099 54667300 + 1.33333 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 191606 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 411-8 chr5 30132606 30133200 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 252343 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 285.999-6 chr6 144801037 144801486 + 1.33333 NA intron (NM_007124, intron 63 of 73) intron (NM_007124, intron 63 of 73) 395606 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 213.333-124 chr3 26051739 26051907 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -178128 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 226.666-45 chr8 130201433 130201672 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) intron (NM_001362925, intron 5 of 29) 94981 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 221-23 chr15 47825700 47825936 + 1.33333 NA intron (NR_120336, intron 3 of 4) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 20418 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 203.333-207 chr5 44369425 44369708 + 1.33333 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) intron (NM_004465, intron 1 of 2) -19166 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-56 chr11 26854322 26854519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -132360 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 434.333-6 chr7 45473534 45473917 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -100415 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 256.333-78 chr8 76028791 76029058 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -377730 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 189.333-208 chr8 113111373 113111626 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) L1MA7|LINE|L1 265653 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 325.666-11 chr2 164097842 164098509 + 1.33333 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -362167 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 221-69 chr8 135600910 135601231 + 1.33333 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) intron (NM_006558, intron 6 of 8) 143614 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 400.333-3 chr11 72344547 72344939 + 1.33333 NA intron (NM_030813, intron 6 of 16) intron (NM_030813, intron 6 of 16) 89788 NM_001258393 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 259.333-69 chr4 29752431 29752754 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 538300 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 219.667-50 chr21 30983398 30983679 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 54938 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 301.333-25 chr2 19958307 19958795 + 1.33333 NA intron (NM_001006657, intron 12 of 27) L2b|LINE|L2 31554 NM_001006657 57539 Hs.205427 NM_020779 ENSG00000118965 WDR35 CED2|IFT121|IFTA1|SRTD7 WD repeat domain 35 protein-coding 140.333-93 chr19 48402154 48402307 + 1.33333 NA intron (NM_000836, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 7355 NM_000836 2906 Hs.445015 NM_000836 ENSG00000105464 GRIN2D EB11|EIEE46|GluN2D|NMDAR2D|NR2D glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2D protein-coding 169.333-33 chr10 112584627 112584798 + 1.33333 NA intron (NM_001365712, intron 6 of 8) MIRb|SINE|MIR -49458 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 232.333-74 chr6 44944023 44944219 + 1.33333 NA intron (NM_181356, intron 11 of 12) L1MEf|LINE|L1 253649 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 353.333-10 chr12 18170852 18171230 + 1.33333 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 -80848 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 228.333-79 chr5 64046076 64046371 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -83931 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 201.666-22 chr2 113231217 113231451 + 1.33333 NA intron (NM_013953, intron 7 of 9) intron (NM_013953, intron 7 of 9) -4193 NR_047570 654433 Hs.656660 NR_015377 ENSG00000189223 PAX8-AS1 - PAX8 antisense RNA 1 ncRNA 263.333-68 chr5 14974757 14975108 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -103154 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 409.333-10 chr3 15839770 15840328 + 1.33333 NA intron (NM_001349279, intron 1 of 28) L1MA2|LINE|L1 19765 NM_001349279 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 216.667-101 chr7 157141483 157141774 + 1.33333 NA intron (NM_014671, intron 1 of 22) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 2702 NM_014671 9690 Hs.118351 NM_014671 ENSG00000009335 UBE3C HECTH2 ubiquitin protein ligase E3C protein-coding 304-42 chr3 130823541 130823893 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26878 NM_001199181 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 261.333-35 chr16 8311982 8312345 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 277675 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 388.333-18 chr6 42618722 42619133 + 1.33333 NA intron (NM_001363705, intron 11 of 46) L2a|LINE|L2 54898 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 220-75 chr3 35767724 35768013 + 1.33333 NA intron (NM_016300, intron 18 of 19) intron (NM_016300, intron 18 of 19) 23392 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 194-40 chr14 95091685 95091877 + 1.33333 NA intron (NM_001291628, intron 24 of 26) L1ME3G|LINE|L1 41722 NM_001195573 23405 Hs.87889 NM_030621 ENSG00000100697 DICER1 DCR1|Dicer|Dicer1e|GLOW|HERNA|K12H4.8-LIKE|MNG1|RMSE2 dicer 1, ribonuclease III protein-coding 263.333-35 chr18 3843779 3844223 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) intron (NM_001242761, intron 4 of 11) 1357 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 214.666-32 chr2 41129963 41130201 + 1.33333 NA Intergenic UCON2|DNA?|DNA? -617647 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 244.666-30 chr3 2203987 2204181 + 1.33333 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) intron (NM_175607, intron 2 of 24) -34745 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 176.333-101 chr21 28584227 28584488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45039 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 177-60 chr5 8952458 8952760 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 101286 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 329.666-4 chr12 22912358 22912913 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -263001 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 384.666-6 chr2 234329092 234329510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 125294 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 214.667-47 chr15 58923440 58923754 + 1.33333 NA intron (NR_135043, intron 1 of 18) intron (NR_135043, intron 1 of 18) 10082 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 122.333-93 chr2 68758278 68758462 + 1.33333 NA intron (NM_001364821, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 -16540 NM_001166276 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 221.333-9 chr1 179081136 179081335 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_022371) promoter-TSS (NM_022371) -835 NM_022371 64222 Hs.584957 NM_022371 ENSG00000186283 TOR3A ADIR|ADIR2 torsin family 3 member A protein-coding 213.333-126 chr3 59605507 59605741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 52873 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 188 chr1 35519752 35519902 + 1.33333 NA intron (NM_024874, intron 2 of 20) L2c|LINE|L2 37576 NM_024874 79932 Hs.456507 NM_024874 ENSG00000142687 KIAA0319L AAVR|AAVRL KIAA0319 like protein-coding 175.333-114 chr22 45707674 45707849 + 1.33333 NA intron (NM_013236, intron 5 of 11) intron (NM_013236, intron 5 of 11) 35927 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 189.666-13 chr15 61137086 61137233 + 1.33333 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 92143 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 232-62 chr3 109866993 109867238 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 264287 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 516.667-7 chr9 92682993 92683640 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13185 NM_022755 64768 Hs.459896 NM_022755 ENSG00000127080 IPPK C9orf12|INSP5K2|IP5K|IPK1|bA476B13.1 inositol-pentakisphosphate 2-kinase protein-coding 215.333-64 chr15 84972563 84972770 + 1.33333 NA intron (NM_001321721, intron 16 of 16) intron (NM_001321721, intron 16 of 16) -7801 NM_001243137 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 182.666-8 chr11 97531790 97531963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1023451 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 317.666-8 chr2 26053436 26053696 + 1.33333 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) intron (NM_016131, intron 1 of 5) 19482 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 217-64 chr3 190108103 190108342 + 1.33333 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) AluJr|SINE|Alu 12675 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 365-13 chr2 139165245 139165576 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 268086 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 149.333-292 chr4 127910752 127910909 + 1.33333 NA Intergenic LTR43|LTR|ERV1 29586 NM_001190801 10733 Hs.172052 NM_014264 ENSG00000142731 PLK4 MCCRP2|SAK|STK18 polo like kinase 4 protein-coding 269.333-97 chrX 100942647 100942935 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13874 NM_212559 402415 Hs.364911 NM_212559 ENSG00000182489 XKRX XKR2|XPLAC|XRG2 XK related X-linked protein-coding 352-29 chr8 130098864 130099255 + 1.33333 NA intron (NM_018482, intron 24 of 29) AluJb|SINE|Alu -14291 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 133-5 chr10 12682831 12682976 + 1.33333 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -29706 NR_039701 100616320 NR_039701 ENSG00000283699 MIR4481 - microRNA 4481 ncRNA 200.333-31 chr12 45444210 45444377 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 151603 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 223.333-11 chr1 163503831 163504060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -80754 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 364.666-17 chrX 39163489 39163905 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 163665 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 296.666-33 chr6 140544997 140545315 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -138658 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 204-90 chr19 57341263 57341418 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -9934 NM_001290319 57343 Hs.287374 NM_020657 ENSG00000131845 ZNF304 - zinc finger protein 304 protein-coding 298-34 chr17 56057929 56058265 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -95378 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 346-18 chr20 8270225 8270637 + 1.33333 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) 21727 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 202.666-76 chr3 102663275 102663465 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 228355 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 119.666 chr15 45733431 45733589 + 1.33333 NA intron (NR_135680, intron 1 of 4) intron (NR_135680, intron 1 of 4) 28315 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 200.666-77 chr3 56352303 56352532 + 1.33333 NA intron (NR_132749, intron 2 of 17) L2b|LINE|L2 116050 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 180-51 chr2 29163907 29164131 + 1.33333 NA intron (NM_001287528, intron 13 of 14) intron (NM_001287528, intron 13 of 14) 48604 NM_001287527 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 210.333-12 chr10 20971954 20972150 + 1.33333 NA intron (NM_001173484, intron 3 of 6) intron (NM_001173484, intron 3 of 6) -74450 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 187.666 chr1 205387507 205387668 + 1.33333 NA TTS (NR_038425) TTS (NR_038425) 14335 NR_038425 284576 Hs.585440 NR_038425 ENSG00000226235 LEMD1-AS1 - LEMD1 antisense RNA 1 ncRNA 215-8 chr10 83721433 83721664 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -44459 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 311-4 chr10 56378649 56379140 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17621 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 287.333-42 chr4 95231607 95232094 + 1.33333 NA intron (NM_003728, intron 7 of 15) intron (NM_003728, intron 7 of 15) 140359 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 157.333-59 chr10 110076136 110076357 + 1.33333 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) intron (NM_001121, intron 1 of 13) -67865 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 189.333-191 chr7 69944732 69944908 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 346345 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 182.333-41 chr14 49516595 49516764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69701 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 218.333-126 chr9 36201653 36201869 + 1.33333 NA intron (NM_001076677, intron 3 of 5) intron (NM_001076677, intron 3 of 5) 10840 NM_001184760 1211 Hs.522114 NM_001833 ENSG00000122705 CLTA LCA clathrin light chain A protein-coding 207.666-39 chr3 190481136 190481304 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -31344 NM_207316 131920 Hs.335321 NM_207316 ENSG00000198398 TMEM207 UNQ846 transmembrane protein 207 protein-coding 247.333-3 chr1 110132410 110132724 + 1.33333 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -17927 NM_001010898 388662 Hs.128382 NM_001010898 ENSG00000197106 SLC6A17 MRT48|NTT4 solute carrier family 6 member 17 protein-coding 136.667-3 chr1 58202182 58202342 + 1.33333 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) intron (NM_001353980, intron 1 of 5) 48241 NM_021080 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 446.333-3 chr17 70608406 70608991 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 439163 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 204.667-107 chr4 48449695 48449944 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33524 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 168.666-17 chr5 89233881 89234118 + 1.33333 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) MER63C|DNA|hAT-Blackjack -329894 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 200.666-50 chr18 4957287 4957493 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -123792 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 222-26 chr14 50608820 50609062 + 1.33333 NA intron (NM_015915, intron 6 of 13) intron (NM_015915, intron 6 of 13) 48916 NM_181598 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 154.333-190 chr21 19672206 19672362 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 227471 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 357.666-10 chr8 121660943 121661559 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19811 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 253.999-8 chr3 84419559 84419891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 449850 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 216-102 chr5 122869115 122869391 + 1.33333 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) intron (NM_014035, intron 1 of 6) 23640 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 243.666-17 chr17 61758588 61758925 + 1.33333 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) AluJr4|SINE|Alu 104803 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 202.667-144 chr8 90219943 90220184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1425 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 145-116 chr8 58387516 58387680 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23666 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 187-54 chr4 31044547 31044740 + 1.33333 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -126501 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 164.666-19 chr8 134492348 134492493 + 1.33333 NA intron (NM_001174158, intron 13 of 13) intron (NM_001174158, intron 13 of 13) -105651 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 188-75 chr3 174717840 174718100 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -141364 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 211.333-254 chr9 75094128 75094324 + 1.33333 NA intron (NM_012383, intron 1 of 9) intron (NM_012383, intron 1 of 9) 5712 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 197.333-130 chr20 31322474 31322732 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14018 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 205.666-56 chr9 95586525 95586771 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69591 NM_001354919 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 150.666-16 chr5 171597195 171597350 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 177625 NM_003862 8817 Hs.87191 NM_003862 ENSG00000156427 FGF18 FGF-18|ZFGF5 fibroblast growth factor 18 protein-coding 196-73 chr17 77862316 77862552 + 1.33333 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 21653 NR_028337 400624 Hs.514521 NM_001001685 ENSG00000204283 LINC01973 - long intergenic non-protein coding RNA 1973 ncRNA 236.666-14 chr14 46756565 46756785 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -104894 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 194.333-44 chr14 73499462 73499625 + 1.33333 NA intron (NM_001220484, intron 12 of 17) intron (NM_001220484, intron 12 of 17) 8610 NM_024644 79697 Hs.509916 NM_024644 ENSG00000170468 RIOX1 C14orf169|JMJD9|MAPJD|NO66|ROX|URLC2|hsNO66 ribosomal oxygenase 1 protein-coding 164-76 chr3 63094259 63094416 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8351 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 272-40 chr5 44058139 44058624 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -330351 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 164.666-3 chr1 108498405 108498557 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 48199 NM_001143987 653149 Hs.712226 NM_001143987 ENSG00000186086 NBPF6 - NBPF member 6 protein-coding 214.666-58 chr6 25799129 25799359 + 1.33333 NA intron (NM_005074, intron 11 of 12) L1MEd|LINE|L1 32808 NM_005074 6568 Hs.205816 NM_005074 ENSG00000124568 SLC17A1 NAPI-1|NPT-1|NPT1 solute carrier family 17 member 1 protein-coding 320.999-3 chr5 176648146 176648688 + 1.33333 NA intron (NM_001366492, intron 1 of 6) intron (NM_001366492, intron 1 of 6) 933 NM_001366491 26262 Hs.532129 NM_012171 ENSG00000048140 TSPAN17 FBX23|FBXO23|TM4SF17 tetraspanin 17 protein-coding 135.333-72 chr18 6294890 6295008 + 1.33333 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) intron (NM_001365769, intron 4 of 16) 38205 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 203.333-188 chr4 16536226 16536437 + 1.33333 NA intron (NM_001304435, intron 5 of 7) intron (NM_001304435, intron 5 of 7) 309668 NR_027697 202020 Hs.445315 NM_152684 ENSG00000263327 TAPT1-AS1 - TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 191.333-178 chr6 115376594 115376874 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 267101 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 218-9 chr10 35052270 35052535 + 1.33333 NA intron (NM_003591, intron 5 of 20) intron (NM_003591, intron 5 of 20) 21881 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 200.333-45 chr15 68091956 68092209 + 1.33333 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 37506 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 214-87 chr3 81189874 81190124 + 1.33333 NA Intergenic MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 196131 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 327.666-9 chr7 2371782 2372243 + 1.33333 NA intron (NM_001037283, intron 11 of 18) AluJr|SINE|Alu 17185 NM_001037283 8662 Hs.371001 NM_003751 ENSG00000106263 EIF3B EIF3-ETA|EIF3-P110|EIF3-P116|EIF3S9|PRT1 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B protein-coding 218.333-105 chr6 50761488 50761744 + 1.33333 NA intron (NM_172238, intron 7 of 7) intron (NM_172238, intron 7 of 7) 48072 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 338.333-16 chr6 136430977 136431338 + 1.33333 NA intron (NM_001198617, intron 1 of 15) intron (NM_001198617, intron 1 of 15) 35718 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 206.333-171 chr9 76557960 76558142 + 1.33333 NA Intergenic L2-1_AMi|LINE|L2 57418 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 136.666-5 chr7 12739664 12739830 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 52114 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 191.333-147 chr4 60542771 60542960 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -379754 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 154.666-16 chr7 12639129 12639270 + 1.33333 NA intron (NR_156701, intron 10 of 14) intron (NR_156701, intron 10 of 14) -47628 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 206-100 chr22 29931861 29932023 + 1.33333 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) intron (NM_153051, intron 1 of 18) 48768 NM_021090 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 227-31 chr21 34249350 34249652 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 68824 NR_027266 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 158-113 chr5 155418401 155418630 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 404760 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 220-27 chr12 14936643 14936849 + 1.33333 NA intron (NM_152321, intron 2 of 6) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 1791 NM_152321 121506 Hs.162143 NM_152321 ENSG00000139055 ERP27 C12orf46|PDIA8 endoplasmic reticulum protein 27 protein-coding 156-90 chr3 95858201 95858485 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -175150 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 307.999-5 chr7 7720930 7721433 + 1.33333 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -2574 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 190.666-10 chr1 246631969 246632166 + 1.33333 NA intron (NM_152609, intron 4 of 10) L1ME2|LINE|L1 65611 NM_152609 163882 Hs.368353 NM_152609 ENSG00000162852 CNST C1orf71|PPP1R64 consortin, connexin sorting protein protein-coding 232-6 chr1 82453236 82453463 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -449834 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 455.333-6 chr3 110532019 110532425 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 537737 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 230.666-32 chr20 40800655 40800902 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -86155 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 282.667-45 chr7 98019827 98020208 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -29913 NM_006188 4951 Hs.510456 NM_006188 ENSG00000135175 OCM2 OCM|OM oncomodulin 2 protein-coding 212.666-66 chr5 18190406 18190577 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 383217 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 397.333-3 chr12 111815584 111815981 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001204889, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001204889, exon 12 of 12) 15948 NR_106819 102465456 NR_106819 ENSG00000274697 MIR6761 hsa-mir-6761 microRNA 6761 ncRNA 201.333-261 chr7 40287644 40287843 + 1.33333 NA intron (NM_024728, intron 8 of 14) AluJo|SINE|Alu 152767 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 208-167 chr8 84222493 84222654 + 1.33333 NA intron (NM_001354323, intron 1 of 7) intron (NM_001354323, intron 1 of 7) 37907 NM_001100391 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 149.333-403 chr8 115007279 115007494 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 660627 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 266.333-22 chr15 87886818 87887019 + 1.33333 NA intron (NM_001012338, intron 17 of 19) intron (NM_001012338, intron 17 of 19) 59350 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 397.333-5 chr17 3721296 3721789 + 1.33333 NA intron (NM_002208, intron 28 of 30) AluJo|SINE|Alu -2361 NM_031965 83903 Hs.534059 NM_031965 ENSG00000177602 HASPIN GSG2 histone H3 associated protein kinase protein-coding 182.333-140 chr6 93955451 93955599 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 237222 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 358-19 chr5 56913651 56914166 + 1.33333 NA non-coding (NR_136555, exon 3 of 5) non-coding (NR_136555, exon 3 of 5) 3846 NR_136557 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 278.666-3 chr1 200703572 200703871 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33723 NM_001349803 83479 Hs.497332 NM_031306 ENSG00000118197 DDX59 OFD5|ZNHIT5 DEAD-box helicase 59 protein-coding 254.667-68 chr5 93126805 93127165 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 444358 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 213.666-37 chr5 42587209 42587441 + 1.33333 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 21461 NM_001242462 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 207.666-13 chr12 13159020 13159241 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -37596 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 502.666 chr10 68290091 68290630 + 1.33333 NA intron (NM_001033083, intron 6 of 8) intron (NM_001033083, intron 6 of 8) -41333 NM_001322445 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 237.333-52 chr2 12068865 12069080 + 1.33333 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) L1ME1|LINE|L1 61856 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 196-61 chr16 6160003 6160165 + 1.33333 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) intron (NM_018723, intron 1 of 15) 140381 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 175.333-127 chr3 154609455 154609594 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -179334 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 142.666-7 chr14 31016394 31016570 + 1.33333 NA intron (NM_001083893, intron 1 of 17) MER2|DNA|TcMar-Tigger -1740 NR_030354 693209 NR_030354 ENSG00000207952 MIR624 MIRN624|hsa-mir-624|mir-624 microRNA 624 ncRNA 303.333-61 chr5 59136526 59136889 + 1.33333 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) intron (NM_001364603, intron 5 of 15) -97231 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 442-3 chr20 44750895 44751592 + 1.33333 NA TTS (NM_001205317) TTS (NM_001205317) -5016 NR_132377 106144538 Hs.255479 NR_132377 KCNK15-AS1 - KCNK15 and WISP2 antisense RNA 1 ncRNA 142.333-35 chr11 9407618 9407759 + 1.33333 NA intron (NM_006391, intron 2 of 24) intron (NM_006391, intron 2 of 24) -21078 NR_002962 677808 Hs.689720 NR_002962 ENSG00000201998 SNORA23 ACA23 small nucleolar RNA, H/ACA box 23 snoRNA 195.667-146 chr8 104236852 104237080 + 1.33333 NA intron (NR_145710, intron 25 of 29) L1MC3|LINE|L1 13631 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 306.333-45 chr9 35873452 35873822 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3236 NM_001004487 392309 Hs.527480 NM_001004487 ENSG00000168828 OR13J1 OR9-2 olfactory receptor family 13 subfamily J member 1 protein-coding 361.333-32 chr9 69078430 69078837 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_181425, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_181425, exon 5 of 5) -42631 NM_001170414 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 276.333-43 chr4 97576990 97577439 + 1.33333 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) L1PA16|LINE|L1 210288 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 150-82 chr2 210415927 210416172 + 1.33333 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) L1PA15|LINE|L1 60656 NM_001136574 10314 Hs.13351 NM_006055 ENSG00000115365 LANCL1 GPR69A|p40 LanC like 1 protein-coding 250-21 chr11 115366636 115366969 + 1.33333 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -29954 NR_135102 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 184-38 chr16 54768242 54768415 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 79905 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 295.999-3 chr21 14797725 14798006 + 1.33333 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 120803 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 337.333-46 chr8 131564868 131565257 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -339031 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 233.666-4 chr10 50859462 50859655 + 1.33333 NA intron (NM_138933, intron 2 of 12) intron (NM_138933, intron 2 of 12) 26069 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 305.333-65 chr6 145071953 145072280 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 614761 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 164.667-65 chr13 94177727 94177939 + 1.33333 NA intron (NR_046535, intron 3 of 3) intron (NR_046535, intron 3 of 3) 10158 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 406.667-9 chr8 140780502 140781004 + 1.33333 NA intron (NR_148036, intron 14 of 34) L1MC5a|LINE|L1 -48100 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 202-96 chr2 195841289 195841582 + 1.33333 NA intron (NM_018897, intron 47 of 64) intron (NM_018897, intron 47 of 64) 184209 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 208.333-18 chr11 66992294 66992611 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17148 NM_001353554 254439 Hs.232604 NM_001136485 ENSG00000173237 C11orf86 - chromosome 11 open reading frame 86 protein-coding 252-16 chr11 65492629 65492864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4992 NR_002819 378938 Hs.621695 NR_002819 ENSG00000251562 MALAT1 HCN|LINC00047|NCRNA00047|NEAT2|PRO2853 metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1 ncRNA 204.666-113 chr9 28119342 28119598 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) MIR|SINE|MIR -545604 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 217.333-151 chr8 89949968 89950192 + 1.33333 NA intron (NM_001024688, intron 12 of 16) intron (NM_001024688, intron 12 of 16) 34591 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 351.333-6 chr12 12210377 12210750 + 1.33333 NA intron (NM_002336, intron 2 of 22).2 intron (NM_002336, intron 2 of 22).2 56481 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 163.333-41 chr10 81625837 81626009 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -249271 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 200-151 chr7 33035911 33036136 + 1.33333 NA intron (NM_001002009, intron 1 of 9) intron (NM_001002009, intron 1 of 9) 4883 NM_016489 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 339.333 chr1 57866412 57866830 + 1.33333 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 6040 NR_104363 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 139-34 chr14 60324227 60324424 + 1.33333 NA TTS (NR_146481) TTS (NR_146481) 1129 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 176.333-71 chr18 7708167 7708348 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 140941 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 205.333-18 chr1 168032213 168032410 + 1.33333 NA intron (NM_001198956, intron 12 of 21) intron (NM_001198956, intron 12 of 21) 33651 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 157.666 chr1 11546276 11546427 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63180 NR_104624 101929181 Hs.568616 NR_104624 ENSG00000235643 LINC01647 - long intergenic non-protein coding RNA 1647 ncRNA 214-28 chr12 27691834 27692151 + 1.33333 NA intron (NM_003622, intron 28 of 29) intron (NM_003622, intron 28 of 29) -4455 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 280.666-14 chr2 124389237 124389500 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 364081 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 201.333-287 chr8 117217078 117217327 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 82207 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 188-54 chr2 50633821 50634064 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) L2a|LINE|L2 62320 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 142-52 chr16 89203356 89203544 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -2913 NM_001366322 146429 Hs.447544 NM_001242757 ENSG00000259803 SLC22A31 - solute carrier family 22 member 31 protein-coding 455.333-12 chr8 137786462 137787272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 296678 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 300-16 chr12 97297394 97297719 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -165220 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 255-82 chr7 83202629 83203007 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39934 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 368.333-10 chr8 65016922 65017269 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 163245 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 248.667-26 chr12 41357986 41358357 + 1.33333 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -79568 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 204.666-72 chr5 105386185 105386437 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 286837 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 239.333-67 chr3 21513301 21513512 + 1.33333 NA intron (NM_024697, intron 3 of 7) (AAAATGC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29383 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 190.333-20 chr10 74465259 74465484 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) L2a|LINE|L2 63953 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 252-56 chr2 240860331 240860619 + 1.33333 NA Intergenic MER84-int|LTR|ERV1 -8349 NM_000030 189 Hs.144567 NM_000030 ENSG00000172482 AGXT AGT|AGT1|AGXT1|PH1|SPAT|SPT|TLH6 alanine--glyoxylate and serine--pyruvate aminotransferase protein-coding 189-60 chr3 20408173 20408409 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65823 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 391.666-2 chr15 63260767 63261108 + 1.33333 NA intron (NM_016530, intron 6 of 7) intron (NM_016530, intron 6 of 7) -16613 NM_001145646 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 156-47 chr14 66883181 66883388 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1MEf|LINE|L1 -306156 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 197.333-50 chr12 75045906 75046156 + 1.33333 NA intron (NM_001260497, intron 4 of 4) intron (NM_001260497, intron 4 of 4) 163717 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 248-49 chr3 3358488 3358916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -178985 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 247.666-14 chr2 85485595 85485863 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 53157 NR_038942 100630918 Hs.66049 NR_038942 PARTICL PARTICLE promoter of MAT2A antisense radiation-induced circulating long non-coding RNA ncRNA 210.333-55 chr17 48066898 48067067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18623 NM_003204 4779 Hs.514284 NM_003204 ENSG00000082641 NFE2L1 LCR-F1|NRF1|TCF11 nuclear factor, erythroid 2 like 1 protein-coding 317-8 chr12 6515216 6515520 + 1.33333 NA intron (NM_014865, intron 9 of 31) AluJr|SINE|Alu 5146 NR_004387 692148 NR_004387 ENSG00000239002 SCARNA10 U85 small Cajal body-specific RNA 10 ncRNA 329.333-55 chr7 47108765 47109053 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 355894 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 208.666-25 chr11 100277417 100277617 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 17 of 23) L1MA2|LINE|L1 -409771 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 200.666-12 chr1 242798432 242798583 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -273810 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 297.333-33 chr2 99920660 99920948 + 1.33333 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) L1ME2|LINE|L1 184779 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 246.333-31 chr14 65663750 65664109 + 1.33333 NA intron (NM_004480, intron 5 of 9) intron (NM_004480, intron 5 of 9) 192827 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 177.333-129 chr5 9796955 9797101 + 1.33333 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) intron (NR_027112, intron 4 of 12) -57349 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 275.666-16 chr5 167661449 167661813 + 1.33333 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) 87972 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 174.333-140 chr7 80838191 80838471 + 1.33333 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) intron (NM_006379, intron 2 of 17) 80720 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 220.333-45 chr16 53782560 53782820 + 1.33333 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) MIR3|SINE|MIR 78534 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 519.666-2 chr5 32121108 32121597 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 52967 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 212.666-80 chr6 161760361 161760626 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) MER61A|LTR|ERV1 289516 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 192-46 chr12 110314391 110314621 + 1.33333 NA intron (NM_170665, intron 5 of 19) intron (NM_170665, intron 5 of 19) 33259 NM_170665 488 Hs.506759 NM_001681 ENSG00000174437 ATP2A2 ATP2B|DAR|DD|SERCA2 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 2 protein-coding 294-33 chr2 182921307 182921741 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_205842, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_205842, exon 32 of 32) -54887 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 138-76 chr3 78574392 78574544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 444991 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 263.666-4 chr18 10344662 10344935 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69572 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 193.333-87 chr2 47282295 47282469 + 1.33333 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -52933 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 288.666-13 chr18 709997 710309 + 1.33333 NA intron (NM_001318760, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 2477 NM_017512 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 267.333-40 chr17 56033989 56034351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119305 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 224.667-67 chr6 56766945 56767352 + 1.33333 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 76517 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 219.333-62 chr15 80762736 80763036 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -16484 NM_001293304 57214 Hs.459088 NM_018689 ENSG00000103888 CEMIP CCSP1|HYBID|KIAA1199|TMEM2L cell migration inducing hyaluronidase 1 protein-coding 197.333-9 chr1 179374888 179375076 + 1.33333 NA intron (NR_073544, intron 4 of 25) L1PA6|LINE|L1 8938 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 232.666-5 chr1 226102903 226103127 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 19440 NR_146920 105373113 Hs.149726 NR_146920 LINC01703 lncPARP1 long intergenic non-protein coding RNA 1703 ncRNA 227.666-3 chr10 7417277 7417501 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5903 NM_001029880 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 204.333-41 chr11 117006783 117007077 + 1.33333 NA intron (NM_001366687, intron 1 of 4) intron (NM_001366687, intron 1 of 4) 91498 NM_001281748 23387 Hs.167451 NM_025164 ENSG00000160584 SIK3 L19|QSK|SEMDK|SIK-3 SIK family kinase 3 protein-coding 194.333-36 chr13 30501744 30501990 + 1.33333 NA intron (NM_001370340, intron 1 of 4) intron (NM_001370340, intron 1 of 4) -35890 NM_001363661 3146 Hs.434102 NM_002128 ENSG00000189403 HMGB1 HMG-1|HMG1|HMG3|SBP-1 high mobility group box 1 protein-coding 123-136 chrX 27616024 27616187 + 1.33333 NA intron (NM_001353450, intron 1 of 4) intron (NM_001353450, intron 1 of 4) 25761 NM_001353449 347442 Hs.720885 NM_001136533 ENSG00000189186 DCAF8L2 WDR42C DDB1 and CUL4 associated factor 8 like 2 protein-coding 218-51 chr2 102961621 102961890 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22674 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 237.667-72 chr6 56811580 56811903 + 1.33333 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 31924 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 256-21 chr12 27616661 27617026 + 1.33333 NA intron (NM_001198915, intron 2 of 26) L2|LINE|L2 -79604 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 180-20 chr11 94693884 94694125 + 1.33333 NA intron (NR_135094, intron 1 of 3) intron (NR_135094, intron 1 of 3) 46351 NR_135094 105369438 Hs.568921 NR_135093 ENSG00000255929 LOC105369438 - uncharacterized LOC105369438 ncRNA 207-90 chr4 89743943 89744127 + 1.33333 NA intron (NM_001146054, intron 4 of 5) intron (NM_001146054, intron 4 of 5) -92366 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 158.666-10 chr12 9789078 9789235 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -10896 NR_159359 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 220.333-63 chr2 47441305 47441572 + 1.33333 NA intron (NM_000251, intron 7 of 15) AluSz6|SINE|Alu 38371 NM_001258281 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 200.667-22 chr10 76076931 76077182 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 294295 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 183.667-82 chr2 198844583 198844811 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -469600 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 220-94 chr5 145049872 145050156 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 785328 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 180.666-32 chr8 73409085 73409236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10914 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 210-6 chr1 86692551 86692732 + 1.33333 NA intron (NR_135837, intron 4 of 4) LTR9B|LTR|ERV1 11852 NR_135838 105378828 Hs.175285 NR_135837 ENSG00000261737 CLCA4-AS1 - CLCA4 antisense RNA 1 ncRNA 176.666-15 chr20 10495746 10495924 + 1.33333 NA intron (NM_001009608, intron 2 of 7) intron (NM_001009608, intron 2 of 7) 60530 NM_001009608 128710 Hs.668782 NM_001009608 ENSG00000149346 SLX4IP C20orf94|bA204H22.1|bA254M13.1|dJ1099D15.3 SLX4 interacting protein protein-coding 253.333-68 chr3 15861457 15861845 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1837 NM_015199 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 236.666-28 chr2 104595239 104595478 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84849 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 181.667-138 chr7 77913009 77913222 + 1.33333 NA intron (NM_001366085, intron 7 of 10) AluSx1|SINE|Alu 72985 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 197.666-46 chr3 179769119 179769279 + 1.33333 NA intron (NM_003940, intron 19 of 20) intron (NM_003940, intron 19 of 20) 116159 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 251-88 chr9 27982047 27982482 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) intron (NM_001354574, intron 5 of 5) -408398 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 164.333-119 chr2 80229874 80230087 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 74772 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 201.333-100 chr14 62154169 62154380 + 1.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -14301 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 244.667-89 chr7 38877267 38877605 + 1.33333 NA intron (NM_014396, intron 2 of 28) intron (NM_014396, intron 2 of 28) 31755 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 203.333-51 chr12 28702397 28702589 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -446785 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 217.666-3 chr10 44401598 44401815 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -16609 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 214.333-4 chr1 73351589 73351800 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45524 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 208-132 chr5 20171432 20171611 + 1.33333 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L1PREC2|LINE|L1 -134030 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 216-67 chr20 42913485 42913771 + 1.33333 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -55115 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 193-45 chr2 51626672 51626863 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 594166 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 211-39 chr15 38995722 38995938 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254839 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 291.333-53 chr5 45635677 45635957 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 60563 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 208-26 chr11 30982961 30983273 + 1.33333 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) intron (NM_001367979, intron 20 of 38) 9569 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 250-98 chrX 85264023 85264250 + 1.33333 NA intron (NM_001330574, intron 5 of 10) intron (NM_001330574, intron 5 of 10) 20145 NM_001330574 7552 Hs.326801 NM_021998 ENSG00000147180 ZNF711 CMPX1|MRX97|ZNF4|ZNF5|ZNF6|Zfp711|dJ75N13.1 zinc finger protein 711 protein-coding 181-49 chr3 51418267 51418414 + 1.33333 NA intron (NR_146065, intron 15 of 25) intron (NR_146065, intron 15 of 25) 27055 NM_013286 29890 Hs.118738 NM_013286 ENSG00000259956 RBM15B HUMAGCGB|HsOTT3|OTT3 RNA binding motif protein 15B protein-coding 176.333-98 chr20 37707916 37708154 + 1.33333 NA intron (NM_030877, intron 1 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 14005 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 132-40 chr14 42909580 42909744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1302806 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 329-9 chr17 52803044 52803466 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -58866 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 210.333-56 chr17 61916037 61916322 + 1.33333 NA intron (NM_001351695, intron 5 of 24) AluY|SINE|Alu 11803 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 276.666-26 chr4 156307559 156307809 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -353818 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 209.666-55 chr9 29325463 29325675 + 1.33333 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -111968 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 205.333 chr1 19279628 19279891 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -5637 NR_040288 246181 Hs.662342 NM_001145289 ENSG00000211454 AKR7L AFAR3|AFB1-AR 3|AFB1-AR3|AKR7A4 aldo-keto reductase family 7 like (gene/pseudogene) protein-coding 287.333-2 chr1 108943482 108943762 + 1.33333 NA intron (NM_001048210, intron 5 of 11) intron (NM_001048210, intron 5 of 11) 6826 NM_001278202 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 216-87 chr3 178736296 178736573 + 1.33333 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 123971 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 167.333-120 chr18 41343732 41343887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176868 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 230.333-42 chr15 100496024 100496321 + 1.33333 NA intron (NM_001290341, intron 5 of 13) intron (NM_001290341, intron 5 of 13) 48114 NM_001290342 204219 Hs.662371 NM_178842 ENSG00000154227 CERS3 ARCI9|LASS3 ceramide synthase 3 protein-coding 329.666-10 chr5 107846960 107847313 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -176199 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 333.999-8 chr8 129016900 129017181 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51039 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 194.666-58 chr6 12130279 12130438 + 1.33333 NA intron (NM_002114, intron 5 of 8) intron (NM_002114, intron 5 of 8) 118046 NM_002114 3096 Hs.567284 NM_002114 ENSG00000095951 HIVEP1 CIRIP|CRYBP1|GAAP|MBP-1|PRDII-BF1|Schnurri-1|ZAS1|ZNF40|ZNF40A human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 protein-coding 183.333-48 chr14 72427181 72427332 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -89564 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 209-120 chr8 88721646 88721840 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -394260 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 325.666-5 chr14 25160392 25160791 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -110294 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 292.666-13 chr16 4096402 4096651 + 1.33333 NA intron (NM_001116, intron 2 of 10) intron (NM_001116, intron 2 of 10) 19916 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 235.667-18 chr14 51274696 51275078 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 34640 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 191.333-79 chr15 71082762 71083185 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58476 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 322.333-14 chr2 237962097 237962579 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4607 NM_001278308 140739 Hs.471785 NM_080678 ENSG00000184182 UBE2F NCE2 ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) protein-coding 315.333-55 chr9 27883805 27884107 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -310090 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 224.666-5 chr10 60483599 60483833 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 89240 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 172-18 chr10 22342083 22342319 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3244 NM_001253855 9576 Hs.655170 NM_012443 ENSG00000077327 SPAG6 CT141|Repro-SA-1|pf16 sperm associated antigen 6 protein-coding 367.999-3 chr2 102392927 102393336 + 1.33333 NA intron (NM_003855, intron 9 of 10) intron (NM_003855, intron 9 of 10) -25659 NM_003853 8807 Hs.158315 NM_003853 ENSG00000115607 IL18RAP ACPL|CD218b|CDw218b|IL-18R-beta|IL-18RAcP|IL-18Rbeta|IL-1R-7|IL-1R7|IL-1RAcPL|IL18RB interleukin 18 receptor accessory protein protein-coding 219-74 chr6 143283042 143283389 + 1.33333 NA intron (NM_001366354, intron 3 of 4) intron (NM_001366354, intron 3 of 4) 118433 NM_001366361 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 142-18 chr10 99294507 99294678 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -34507 NR_144311 26507 Hs.274579 NM_020348 ENSG00000119946 CNNM1 ACDP1|CLP-1 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1 protein-coding 259.667-48 chr3 120076992 120077311 + 1.33333 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) L1MA9|LINE|L1 7497 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 236.666-40 chr6 46441996 46442231 + 1.33333 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) intron (NM_001251973, intron 2 of 4) 49210 NM_001251974 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 265.666-10 chr14 97171206 97171697 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16594 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 369.332 chr4 113374934 113375218 + 1.33333 NA intron (NM_001354257, intron 44 of 44) intron (NM_001354257, intron 44 of 44) 82237 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 193.666-27 chr20 20765665 20765852 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53114 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 167.667-75 chr16 82442059 82442330 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy -184775 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 224.999-3 chr3 126861067 126861238 + 1.33333 NA intron (NM_032343, intron 5 of 7) intron (NM_032343, intron 5 of 7) -127442 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 238.333 chr1 75805774 75806142 + 1.33333 NA intron (NM_002440, intron 2 of 19) L1M5|LINE|L1 9076 NM_002440 4438 Hs.216639 NM_002440 ENSG00000057468 MSH4 - mutS homolog 4 protein-coding 246.666-27 chr3 38376475 38376875 + 1.33333 NA intron (NR_146068, intron 10 of 16) intron (NR_146068, intron 10 of 16) 29890 NM_001349178 9942 Hs.659985 NM_005108 ENSG00000093217 XYLB - xylulokinase protein-coding 333.666-10 chr3 157487247 157487577 + 1.33333 NA intron (NM_024621, intron 2 of 13) L1ME3C|LINE|L1 8094 NM_001167917 79674 Hs.658046 NM_024621 ENSG00000197415 VEPH1 MELT|VEPH ventricular zone expressed PH domain containing 1 protein-coding 181-72 chr7 94741220 94741366 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 84923 NM_001184962 23089 Hs.147492 NM_015068 ENSG00000242265 PEG10 EDR|HB-1|MEF3L|Mar2|Mart2|RGAG3|RTL2|SIRH1 paternally expressed 10 protein-coding 200-77 chr18 59750628 59750913 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53347 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 345.999-2 chr10 120180065 120180586 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 174898 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 199.333-301 chr9 88930521 88930806 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -60200 NM_001001938 286223 Hs.585118 NM_001001938 ENSG00000213694 C9orf47 C9orf108|bA791O21.3 chromosome 9 open reading frame 47 protein-coding 208.666-105 chr8 47215842 47216005 + 1.33333 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 26616 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 183-79 chr4 69599585 69599756 + 1.33333 NA intron (NM_001301239, intron 1 of 4) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 39972 NM_001105677 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 198.333-3 chr1 40122251 40122487 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24899 NM_000310 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 204-62 chr14 86533948 86534193 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -371708 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 202.667-88 chr2 224186939 224187235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -147768 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 258-6 chr10 54069915 54070301 + 1.33333 NA intron (NM_001354411, intron 18 of 34) intron (NM_001354411, intron 18 of 34) -416122 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 302-47 chr4 86565344 86565782 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23011 NR_039657 100616463 NR_039657 ENSG00000266515 MIR4452 - microRNA 4452 ncRNA 171-6 chr1 87214881 87215053 + 1.33333 NA intron (NM_001290053, intron 1 of 3) MamTip3|DNA|hAT-Tip100 2298 NM_001290053 101927844 Hs.694591 NM_001290053 LINC02801 - long intergenic non-protein coding RNA 2801 protein-coding 221.666-17 chr14 60618697 60618955 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -20390 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 186-97 chr7 85257252 85257464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -135427 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 237.333-119 chr8 92261840 92262074 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -158572 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 406-2 chr11 21942914 21943271 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -249993 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 233.333-3 chr1 86726445 86726796 + 1.33333 NA intron (NM_016009, intron 5 of 8) intron (NM_016009, intron 5 of 8) 22044 NM_001206652 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 168-9 chr10 31356986 31357240 + 1.33333 NA intron (NM_001323658, intron 2 of 8) intron (NM_001323658, intron 2 of 8) 35453 NM_001323673 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 224-55 chr21 25828689 25829037 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93209 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 208.666-109 chr8 79775894 79776095 + 1.33333 NA intron (NR_110954, intron 4 of 5) L1PB4|LINE|L1 7852 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 238.666-35 chr7 69144621 69144943 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 452842 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 217.666-26 chr3 42090725 42090976 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001265608) promoter-TSS (NM_001265608) -507 NM_001349247 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 243.333-50 chr2 70216311 70216551 + 1.33333 NA TTS (NM_001351518) TTS (NM_001351518) -25412 NM_001348762 54980 Hs.720049 NM_017880 ENSG00000115998 C2orf42 - chromosome 2 open reading frame 42 protein-coding 194-101 chr4 69920121 69920354 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -10831 NM_001890 1446 Hs.3155 NM_001890 ENSG00000126545 CSN1S1 CASA|CSN1 casein alpha s1 protein-coding 421.999-3 chr16 60126877 60127305 + 1.33333 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL 232702 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 254-8 chr10 24539702 24540145 + 1.33333 NA intron (NM_001282768, intron 16 of 17) intron (NM_001282768, intron 16 of 17) 73392 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 233.666-17 chr2 213975279 213975458 + 1.33333 NA intron (NR_047660, intron 11 of 14) L1M5|LINE|L1 217301 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 207-39 chr14 70954108 70954361 + 1.33333 NA intron (NM_014982, intron 2 of 35) L1ME3D|LINE|L1 46775 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 169.333-175 chr4 46886155 46886367 + 1.33333 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) L1MA4|LINE|L1 22984 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 179-94 chr7 47952802 47952963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4391 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 335.666-11 chr6 142755641 142755989 + 1.33333 NA intron (NM_006734, intron 9 of 9) intron (NM_006734, intron 9 of 9) -117926 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 246.333-22 chr12 18248859 18249243 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12489 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 207.666-9 chr10 100991559 100991754 + 1.33333 NA intron (NR_160742, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 4113 NR_160740 56652 Hs.22678 NM_021830 ENSG00000107815 TWNK ATXN8|C10orf2|IOSCA|MTDPS7|PEO|PEO1|PEOA3|PRLTS5|SANDO|SCA8|TWINL twinkle mtDNA helicase protein-coding 186.667-105 chr4 59520268 59520535 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 506828 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 146-85 chr3 95040650 95040797 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 102460 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 219.333-38 chr12 12402238 12402521 + 1.33333 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 45301 NM_001330356 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 121-146 chr9 112026910 112027104 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 94907 NR_039814 100616114 NR_039814 ENSG00000266315 MIR4668 mir-4668 microRNA 4668 ncRNA 215.333-73 chr17 61658826 61659158 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -67773 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 220-24 chr11 83837239 83837491 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 16 of 27) L1MDa|LINE|L1 -154940 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 257-49 chr4 130821531 130821737 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 445273 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 251.666-10 chr15 57082894 57083369 + 1.33333 NA intron (NM_001322158, intron 5 of 20) L1ME3Cz|LINE|L1 -136299 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 190-125 chr8 121320111 121320316 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -319133 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 196-19 chr10 44640278 44640536 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -255310 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 193-4 chr1 41205666 41205823 + 1.33333 NA intron (NM_001172218, intron 1 of 15) L1PA6|LINE|L1 36562 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 141.333-235 chr8 61537708 61537878 + 1.33333 NA intron (NM_004318, intron 21 of 24) intron (NM_004318, intron 21 of 24) 152018 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 209.666-24 chr18 29804424 29804602 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -494397 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 396-15 chr6 138590232 138590719 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17906 NM_020464 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 227.333-66 chr2 133718188 133718511 + 1.33333 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -149886 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 192-107 chr5 6226444 6226682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 110729 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 196-101 chr20 59870422 59870617 + 1.33333 NA intron (NM_014258, intron 35 of 44) L1M5|LINE|L1 63118 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 132.666-5 chr4 86668249 86668412 + 1.33333 NA intron (NM_080685, intron 2 of 47) intron (NM_080685, intron 2 of 47) 74015 NM_006264 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 195-37 chr14 44823715 44823902 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -24682 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 191-58 chr6 6961751 6961959 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -145888 NM_001168344 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 223.333 chr1 11607782 11607979 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1651 NR_104624 101929181 Hs.568616 NR_104624 ENSG00000235643 LINC01647 - long intergenic non-protein coding RNA 1647 ncRNA 216-40 chr16 75164393 75164565 + 1.33333 NA intron (NM_001318471, intron 3 of 4) intron (NM_001318471, intron 3 of 4) 15428 NM_001318475 162239 Hs.388813 NM_153688 ENSG00000184517 ZFP1 ZNF475 ZFP1 zinc finger protein protein-coding 283.333-80 chr9 105347248 105347565 + 1.33333 NA intron (NM_001330731, intron 4 of 15) intron (NM_001330731, intron 4 of 15) -100628 NM_001287191 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 194.333-84 chr22 30093564 30093824 + 1.33333 NA intron (NM_001329457, intron 2 of 11) intron (NM_001329457, intron 2 of 11) 13230 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 210.667-84 chr3 23934179 23934456 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10969 NM_005126 9975 Hs.37288 NM_005126 ENSG00000174738 NR1D2 BD73|EAR-1R|REVERBB|REVERBbeta|RVR nuclear receptor subfamily 1 group D member 2 protein-coding 215-79 chr8 8254089 8254349 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25649 NR_024363 286042 Hs.656318 NR_024361 ENSG00000173295 FAM86B3P - family with sequence similarity 86, member A pseudogene pseudo 163.333-260 chr7 50054455 50054602 + 1.33333 NA intron (NM_001159878, intron 4 of 7) intron (NM_001159878, intron 4 of 7) 38718 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 352.667-28 chr8 83360131 83360523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43431 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 257-34 chr22 31898417 31898852 + 1.33333 NA intron (NR_146296, intron 40 of 42) intron (NR_146296, intron 40 of 42) 39820 NM_001302819 25775 Hs.627602 NM_015372 ENSG00000128254 C22orf24 HSN44A4A chromosome 22 open reading frame 24 protein-coding 196.666-82 chr5 25301908 25302100 + 1.33333 NA intron (NR_136209, intron 3 of 3) intron (NR_136209, intron 3 of 3) 111051 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 150-24 chr11 27677598 27677777 + 1.33333 NA non-coding (NR_002832, exon 8 of 8) non-coding (NR_002832, exon 8 of 8) -18038 NM_001143816 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 240.333-41 chr15 70333892 70334290 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 171837 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 244-30 chr14 28433401 28433630 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 331804 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 223.333-112 chr4 75666347 75666624 + 1.33333 NA intron (NM_203504, intron 1 of 10) intron (NM_203504, intron 1 of 10) 6674 NM_012297 9908 Hs.303676 NM_012297 ENSG00000138757 G3BP2 - G3BP stress granule assembly factor 2 protein-coding 205.333-236 chr8 64853015 64853277 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -54409 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 204.666-101 chr8 109429314 109429505 + 1.33333 NA exon (NM_177531, exon 26 of 78) exon (NM_177531, exon 26 of 78) 66948 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 215.333-67 chr16 9339044 9339207 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16463 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 213.666-42 chr7 2801529 2801738 + 1.33333 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) intron (NM_001293092, intron 1 of 2) 13597 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 194.333-40 chr14 61692541 61692688 + 1.33333 NA intron (NR_047116, intron 1 of 1) intron (NR_047116, intron 1 of 1) -2899 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 211.333-60 chr14 54381585 54381812 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -15170 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 498.999-4 chr6 63655761 63656275 + 1.33333 NA intron (NM_001370350, intron 2 of 14) intron (NM_001370350, intron 2 of 14) 9492 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 230.666-33 chr21 18144309 18144661 + 1.33333 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -100348 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 280-33 chr3 16993620 16993988 + 1.33333 NA intron (NM_015184, intron 1 of 5) intron (NM_015184, intron 1 of 5) 60608 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 187.333-109 chr2 150071284 150071576 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 185577 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 206.666-60 chr2 174860705 174860933 + 1.33333 NA intron (NR_038133, intron 5 of 11) intron (NR_038133, intron 5 of 11) -13201 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 228-6 chr1 219616043 219616303 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -3028 NM_001355457 643136 Hs.647764 NM_001085394 ENSG00000215817 ZC3H11B ZC3HDC11B zinc finger CCCH-type containing 11B protein-coding 191.333-143 chr4 37264012 37264277 + 1.33333 NA intron (NM_001144990, intron 1 of 6) intron (NM_001144990, intron 1 of 6) 19401 NM_001144990 57495 Hs.4280 NM_001144990 ENSG00000174145 NWD2 KIAA1239 NACHT and WD repeat domain containing 2 protein-coding 212-154 chr8 125416498 125416724 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13747 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 192-100 chr4 41722272 41722488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26590 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 202.333-65 chr15 67745567 67745720 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 17 of 21) intron (NM_001206804, intron 17 of 21) -79866 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 197.666-47 chr3 192438164 192438430 + 1.33333 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) -29248 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 215.333-126 chr3 41413480 41413648 + 1.33333 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 214059 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 301.999-5 chr7 79454901 79455225 + 1.33333 NA intron (NR_038344, intron 2 of 4) intron (NR_038344, intron 2 of 4) 1103 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 162.333-127 chr2 173176740 173176930 + 1.33333 NA intron (NM_133646, intron 3 of 11) L1MB7|LINE|L1 100989 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 211.333-204 chr6 55664569 55664767 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -85454 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 213.333-189 chr7 6090368 6090591 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -14470 NM_001365764 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 281-7 chr12 45097668 45098119 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -32482 NR_026583 83956 Hs.650500 NM_032032 RACGAP1P FKSG42 Rac GTPase activating protein 1 pseudogene pseudo 253.333-51 chr2 44183909 44184112 + 1.33333 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) AluY|SINE|Alu 15135 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 283.333-20 chr14 87830413 87830875 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 162538 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 372.666-6 chr19 13314382 13314703 + 1.33333 NA intron (NM_023035, intron 11 of 46) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 164131 NM_004907 9592 Hs.501629 NM_004907 ENSG00000160888 IER2 ETR101 immediate early response 2 protein-coding 200-148 chr7 1867108 1867308 + 1.33333 NA intron (NM_001013837, intron 18 of 18) intron (NM_001013837, intron 18 of 18) -22955 NR_039799 100616160 NR_039799 ENSG00000265089 MIR4655 - microRNA 4655 ncRNA 202-114 chr3 70205954 70206171 + 1.33333 NA intron (NM_001364677, intron 3 of 3) intron (NM_001364677, intron 3 of 3) 106576 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 202.666-50 chr17 53718652 53718870 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -104166 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 230-12 chr10 126667247 126667468 + 1.33333 NA intron (NM_001350922, intron 1 of 8) intron (NM_001350922, intron 1 of 8) 3153 NR_146939 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 198-8 chr1 180244295 180244573 + 1.33333 NA intron (NM_033343, intron 1 of 5) intron (NM_033343, intron 1 of 5) 14170 NM_033343 89884 Hs.658487 NM_033343 ENSG00000121454 LHX4 CPHD4 LIM homeobox 4 protein-coding 204-70 chr15 99276595 99276761 + 1.33333 NA intron (NR_135754, intron 3 of 9) intron (NR_135754, intron 3 of 9) 19153 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 207.666-5 chr10 28761655 28761828 + 1.33333 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) intron (NR_120652, intron 2 of 3) 18091 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 184-75 chr4 68127680 68127903 + 1.33333 NA intron (NM_207407, intron 1 of 9) intron (NM_207407, intron 1 of 9) 2078 NM_207407 389208 Hs.677557 NM_207407 ENSG00000198092 TMPRSS11F - transmembrane serine protease 11F protein-coding 404-18 chr8 5699550 5700006 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -704864 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 215.333-36 chr11 81003464 81003730 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -240794 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 220.666-54 chr4 79219705 79219923 + 1.33333 NA intron (NR_038342, intron 4 of 5) L1MC4|LINE|L1 106247 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 347.999 chr8 18427100 18427371 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 35953 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 296-68 chr9 110727693 110728005 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001369398) promoter-TSS (NM_001369398) -413 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 318.667-13 chr14 82937444 82937841 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 295010 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 239.333-37 chr16 9461457 9461744 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -6095 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 414.999-2 chr8 86484039 86484402 + 1.33333 NA intron (NM_001286719, intron 4 of 8) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 24466 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 201-60 chr2 109187941 109188238 + 1.33333 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -46501 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 221.666-7 chr10 56173892 56174103 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 187262 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 194.666-40 chr20 58657223 58657429 + 1.33333 NA intron (NM_001134772, intron 1 of 7) intron (NM_001134772, intron 1 of 7) 6043 NM_001001433 8675 Hs.307913 NM_003763 ENSG00000124222 STX16 SYN16 syntaxin 16 protein-coding 202.666-3 chr1 152337914 152338075 + 1.33333 NA non-coding (NR_103778, exon 5 of 7) non-coding (NR_103778, exon 5 of 7) 926 NR_103779 339400 Hs.23783 NR_103778 ENSG00000237975 FLG-AS1 - FLG antisense RNA 1 ncRNA 303.333-53 chr4 52043528 52043891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1096 NR_147189 105377652 Hs.298335 NR_147189 ENSG00000251040 LINC02480 - long intergenic non-protein coding RNA 2480 ncRNA 224.999-2 chr12 13944846 13945073 + 1.33333 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 35397 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 212.333-5 chr1 44588452 44588731 + 1.33333 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) 43098 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 223-70 chr9 35105200 35105433 + 1.33333 NA non-coding (NR_134455, exon 10 of 10) non-coding (NR_134455, exon 10 of 10) -2121 NM_001287033 30968 Hs.3439 NM_013442 ENSG00000165283 STOML2 HSPC108|SLP-2 stomatin like 2 protein-coding 136.333-85 chr19 3134407 3134586 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1537 NM_002068 2769 Hs.73797 NM_002068 ENSG00000060558 GNA15 GNA16 G protein subunit alpha 15 protein-coding 214.666-79 chr9 128899975 128900140 + 1.33333 NA intron (NM_001127244, intron 2 of 3) intron (NM_001127244, intron 2 of 3) -17534 NM_001352989 883 Hs.495250 NM_004059 ENSG00000171097 KYAT1 CCBL1|GTK|KAT1|KATI kynurenine aminotransferase 1 protein-coding 265.333-81 chr7 134380147 134380512 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -63399 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 209.666-28 chr2 49089518 49089702 + 1.33333 NA intron (NM_000145, intron 1 of 9) intron (NM_000145, intron 1 of 9) 30007 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 228-51 chr21 39113347 39113628 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69964 NM_003720 8624 Hs.473838 NM_003720 ENSG00000183527 PSMG1 C21LRP|DSCR2|LRPC21|PAC-1|PAC1 proteasome assembly chaperone 1 protein-coding 160.666-14 chr5 36173354 36173553 + 1.33333 NA intron (NM_032637, intron 7 of 9) intron (NM_032637, intron 7 of 9) 21342 NM_032637 6502 Hs.23348 NM_005983 ENSG00000145604 SKP2 FBL1|FBXL1|FLB1|p45 S-phase kinase associated protein 2 protein-coding 298 chr1 24419022 24419386 + 1.33333 NA intron (NM_001322855, intron 2 of 12) intron (NM_001322855, intron 2 of 12) 3179 NM_001322857 57185 Hs.523442 NM_020448 ENSG00000001461 NIPAL3 DJ462O23.2|NPAL3 NIPA like domain containing 3 protein-coding 220.666-75 chr8 128177379 128177551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27349 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 209-37 chr13 49481121 49481343 + 1.33333 NA intron (NM_001320727, intron 8 of 19) intron (NM_001320727, intron 8 of 19) -14721 NM_001040443 51131 Hs.369039 NM_001040443 ENSG00000136147 PHF11 APY|BCAP|IGEL|IGER|IGHER|NY-REN-34|NYREN34 PHD finger protein 11 protein-coding 312-50 chr6 70112387 70112827 + 1.33333 NA intron (NM_001858, intron 16 of 50) intron (NM_001858, intron 16 of 50) 170590 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 217.333-156 chr8 119029971 119030197 + 1.33333 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) -37163 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 238.667-63 chr4 139843565 139843871 + 1.33333 NA intron (NM_018717, intron 2 of 4) intron (NM_018717, intron 2 of 4) 177899 NM_001204368 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 264.666-13 chr17 16593686 16593987 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -24624 NM_001346167 57336 Hs.99724 NM_020653 ENSG00000141040 ZNF287 ZKSCAN13|ZSCAN45 zinc finger protein 287 protein-coding 199-103 chr7 22169119 22169317 + 1.33333 NA intron (NM_001367603, intron 1 of 5) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 24527 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 203.667-83 chr4 30419292 30419556 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -300945 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 281.666-6 chr16 9508118 9508503 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52805 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 377.333-10 chr2 119738921 119739292 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20816 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 213.333-159 chr5 42239191 42239371 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63936 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 444.999 chr17 69269951 69270356 + 1.33333 NA intron (NM_018672, intron 21 of 37) intron (NM_018672, intron 21 of 37) -25338 NM_080282 10349 Hs.25377 NM_080282 ENSG00000154263 ABCA10 EST698739 ATP binding cassette subfamily A member 10 protein-coding 178-34 chr12 24053788 24053953 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) MIRb|SINE|MIR -102838 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 258-75 chr6 162998337 162998692 + 1.33333 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) intron (NM_001080379, intron 2 of 4) 55647 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 186-92 chr7 10976058 10976273 + 1.33333 NA intron (NR_033436, intron 2 of 16) intron (NR_033436, intron 2 of 16) 2293 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 215.666-31 chr4 53858387 53858629 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 128774 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 202-8 chr1 168360745 168361028 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14638 NR_030284 693142 NR_030284 ENSG00000207974 MIR557 MIRN557|hsa-mir-557 microRNA 557 ncRNA 175-78 chr8 111639002 111639172 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 262448 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 186.667-123 chr6 5679351 5679603 + 1.33333 NA intron (NR_110842, intron 2 of 3) LTR85c|LTR|Gypsy? 15795 NR_110842 101927950 Hs.571136 NR_110842 ENSG00000270174 LOC101927950 - uncharacterized LOC101927950 ncRNA 196.666-98 chr7 40745085 40745272 + 1.33333 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) intron (NM_024728, intron 13 of 14) 234761 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 200-164 chr8 25200560 25200782 + 1.33333 NA intron (NM_024940, intron 1 of 51) L1ME4b|LINE|L1 15982 NM_024940 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 198.667-189 chr8 129440066 129440320 + 1.33333 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 43949 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 228.667-70 chr7 32021317 32021644 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 48927 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 170.667-60 chr15 98432038 98432272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11157 NR_146567 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 166-102 chr6 72696000 72696187 + 1.33333 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) L1ME3Cz|LINE|L1 65598 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 214.666-6 chr1 114580632 114580812 + 1.33333 NA intron (NM_005872, intron 2 of 6) intron (NM_005872, intron 2 of 6) 893 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 119.667-192 chr9 104242993 104243160 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -27153 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 235.666-21 chr8 82043956 82044240 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -201812 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 256.333-74 chr7 47511015 47511340 + 1.33333 NA intron (NM_022748, intron 2 of 30) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -46374 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 330.666-9 chr14 75477553 75477977 + 1.33333 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -44704 NM_006399 10538 Hs.509964 NM_006399 ENSG00000156127 BATF B-ATF|BATF1|SFA-2|SFA2 basic leucine zipper ATF-like transcription factor protein-coding 378-27 chr7 104928289 104928748 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -1873 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 198.333-128 chr3 95388920 95389091 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 294188 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 279.333-60 chr4 71041706 71042096 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 48252 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 283.667-8 chr13 34774011 34774541 + 1.33333 NA Intergenic UCON107|DNA|hAT-Tag1 -133591 NR_047036 100874179 Hs.569253 NR_047036 ENSG00000225179 LINC00457 - long intergenic non-protein coding RNA 457 ncRNA 323.333-7 chr12 124590221 124590628 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -22812 NM_001206654 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 239-60 chr7 12134276 12134475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -76919 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 318.666 chr1 151991649 151991953 + 1.33333 NA intron (NM_002966, intron 1 of 2) intron (NM_002966, intron 1 of 2) 2058 NM_002966 6281 Hs.143873 NM_002966 ENSG00000197747 S100A10 42C|ANX2L|ANX2LG|CAL1L|CLP11|Ca[1]|GP11|P11|p10 S100 calcium binding protein A10 protein-coding 249.333-62 chr2 214192041 214192434 + 1.33333 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -218817 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 205.333-26 chr1 233422752 233423014 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 95159 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 194.666-49 chr4 37356520 37356678 + 1.33333 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -97326 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 264-13 chr11 37188028 37188294 + 1.33333 NA Intergenic (TAGC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -589882 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 234.333-74 chr7 26698993 26699280 + 1.33333 NA intron (NM_003930, intron 9 of 12) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 61265 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 270-15 chr16 9713968 9714383 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -258670 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 186.333-137 chr6 40336449 40336604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19480 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 368.333-9 chr6 89276125 89276434 + 1.33333 NA intron (NM_002043, intron 2 of 8) L1MEg|LINE|L1 39020 NM_002043 2570 Hs.379330 NM_002043 ENSG00000111886 GABRR2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho2 subunit protein-coding 235.333-3 chr1 70945081 70945295 + 1.33333 NA intron (NR_028293, intron 2 of 4) intron (NR_028293, intron 2 of 4) -101318 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 287.667 chr1 182050865 182051234 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 10663 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 292-9 chr13 31510156 31510445 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -229226 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 209.333-226 chr8 35150428 35150695 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84914 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 202-118 chr3 119416575 119416869 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_020754, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_020754, exon 12 of 12) 46893 NM_018266 55254 Hs.594171 NM_018266 ENSG00000176142 TMEM39A - transmembrane protein 39A protein-coding 408.999 chr16 6039748 6040375 + 1.33333 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) L1MC2|LINE|L1 20358 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 234.666-40 chr5 52053036 52053323 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 45148 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 208.666-33 chr12 122360198 122360364 + 1.33333 NA intron (NM_198240, intron 5 of 23) (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -35261 NR_045382 100507066 Hs.624253 NR_045382 CLIP1-AS1 - CLIP1 antisense RNA 1 ncRNA 176-71 chr5 13694697 13694875 + 1.33333 NA intron (NM_001369, intron 78 of 78) intron (NM_001369, intron 78 of 78) 249694 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 277.999-3 chr12 20869450 20869697 + 1.33333 NA intron (NM_019844, intron 8 of 15) LTR13|LTR|ERVK 47025 NM_001349920 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 187.333-25 chr10 107838138 107838373 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 231038 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 195-59 chr2 77245957 77246199 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 260113 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 213-70 chr5 76401418 76401670 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -1741 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 194.666-17 chr12 124787446 124787609 + 1.33333 NA intron (NM_001367987, intron 7 of 9) LTR64|LTR|ERV1 52144 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 274.666-31 chr8 129265803 129266148 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -24735 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 182-71 chr3 177430695 177430866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11141 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 338-24 chr5 75816043 75816465 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -98817 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 209-63 chr2 171546111 171546301 + 1.33333 NA intron (NM_001256909, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 23732 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 187.333-74 chr15 70912019 70912210 + 1.33333 NA intron (NM_017691, intron 6 of 15) L1ME3F|LINE|L1 19671 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 263.333-10 chr11 9735674 9735971 + 1.33333 NA intron (NM_015055, intron 7 of 11) L1M4b|LINE|L1 -22471 NR_036485 283104 Hs.632156 NR_036485 ENSG00000246273 SBF2-AS1 - SBF2 antisense RNA 1 ncRNA 196.666-30 chr15 91999597 91999839 + 1.33333 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) AluJo|SINE|Alu 145414 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 190.667-92 chr4 95937177 95937445 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 97218 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 400.333-4 chr14 50308732 50309269 + 1.33333 NA intron (NM_024884, intron 1 of 9) L1MD2|LINE|L1 3229 NM_024884 79944 Hs.256034 NM_024884 ENSG00000087299 L2HGDH C14orf160|L2HGA L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase protein-coding 215.333-116 chr21 29542130 29542313 + 1.33333 NA intron (NM_001330993, intron 15 of 16) intron (NM_001330993, intron 15 of 16) 46174 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 153.333-16 chr1 113317465 113317642 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -72962 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 226.666-46 chr9 27301616 27301848 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4582 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 195.333-155 chr4 52141337 52141612 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 90170 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 678.665 chr11 45947789 45948409 + 1.33333 NA intron (NR_147890, intron 13 of 18) intron (NR_147890, intron 13 of 18) 25443 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 268-49 chr6 93930692 93931036 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 212561 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 411.333-18 chr8 73352936 73353409 + 1.33333 NA intron (NR_125388, intron 1 of 5) intron (NR_125388, intron 1 of 5) 3289 NR_125388 101926926 Hs.640090 NR_125388 ENSG00000250295 RDH10-AS1 - RDH10 antisense RNA 1 ncRNA 224-18 chr12 32574056 32574366 + 1.33333 NA intron (NM_001370297, intron 2 of 14) intron (NM_001370297, intron 2 of 14) 39918 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 196.666-112 chr9 88649946 88650124 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 95870 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 202.333-105 chr3 362741 363014 + 1.33333 NA TTS (NR_110739) TTS (NR_110739) 22918 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 287-7 chr10 111183256 111183496 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69085 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 252-85 chr5 131930708 131931035 + 1.33333 NA intron (NM_001303622, intron 5 of 12) L1MB1|LINE|L1 14792 NM_001303622 728637 Hs.631802 NM_001278059 ENSG00000239642 MEIKIN - meiotic kinetochore factor protein-coding 216-72 chr22 27246436 27246689 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21883 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 135.666-3 chr14 23274358 23274541 + 1.33333 NA TTS (NM_001282322) TTS (NM_001282322) 11683 NM_020834 57594 Hs.632332 NM_020834 ENSG00000215271 HOMEZ KIAA1443 homeobox and leucine zipper encoding protein-coding 173.333-66 chr16 23940474 23940674 + 1.33333 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 104591 NM_212535 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 188.333-160 chr8 130460605 130460868 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -17062 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 336.666-8 chr13 30557660 30558080 + 1.33333 NA intron (NM_001370340, intron 1 of 4) intron (NM_001370340, intron 1 of 4) 59717 NM_001370340 3146 Hs.434102 NM_002128 ENSG00000189403 HMGB1 HMG-1|HMG1|HMG3|SBP-1 high mobility group box 1 protein-coding 353.333-20 chr2 99388236 99388769 + 1.33333 NA intron (NM_015904, intron 14 of 23) L1ME1|LINE|L1 51113 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 277.333-3 chr1 114216047 114216468 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62388 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 185.333-110 chr20 33688033 33688183 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1723 NM_005225 1869 Hs.654393 NM_005225 ENSG00000101412 E2F1 E2F-1|RBAP1|RBBP3|RBP3 E2F transcription factor 1 protein-coding 325.667-6 chr14 60359474 60359961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 36521 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 302.999-6 chr14 70427973 70428295 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -11044 NM_018373 55333 Hs.443661 NM_018373 ENSG00000213463 SYNJ2BP ARIP2|OMP25 synaptojanin 2 binding protein protein-coding 207.333-94 chr14 70376197 70376420 + 1.33333 NA intron (NM_001202549, intron 2 of 4) intron (NM_001202549, intron 2 of 4) -16625 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 164-70 chr20 49857187 49857420 + 1.33333 NA intron (NR_048539, intron 7 of 13) intron (NR_048539, intron 7 of 13) -6556 NR_162136 113219455 NR_162136 MIR12122 - microRNA 12122 ncRNA 201.333-182 chr3 43612185 43612348 + 1.33333 NA intron (NM_001346469, intron 1 of 11) intron (NM_001346469, intron 1 of 11) 9660 NM_001346466 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 222-41 chr19 44979303 44979606 + 1.33333 NA intron (NM_001282175, intron 5 of 13) intron (NM_001282175, intron 5 of 13) -22010 NM_006509 5971 Hs.654402 NM_006509 ENSG00000104856 RELB I-REL|IMD53|IREL|REL-B RELB proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 222.666-22 chr19 35508584 35508798 + 1.33333 NA intron (NM_001190348, intron 7 of 12) intron (NM_001190348, intron 7 of 12) 1779 NM_001126059 93099 Hs.417795 NM_033317 ENSG00000161249 DMKN UNQ729|ZD52F10 dermokine protein-coding 188-79 chr4 45333919 45334081 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -607366 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 262.333-64 chr4 74608139 74608445 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 163156 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 214-139 chr8 127077499 127077756 + 1.33333 NA intron (NR_119373, intron 2 of 3) L1MA10|LINE|L1 -2247 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 378.333-6 chr2 103583678 103583999 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -599409 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 197.333-10 chr1 180630494 180630720 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1d|LTR|Gypsy -1415 NM_001328662 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 231-58 chr7 28807528 28807741 + 1.33333 NA intron (NM_001011666, intron 4 of 6) intron (NM_001011666, intron 4 of 6) 121501 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 194.667-136 chr6 116952768 116953005 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 75644 NM_173560 222546 Hs.352276 NM_173560 ENSG00000185002 RFX6 MTCHRS|MTFS|RFXDC1|dJ955L16.1 regulatory factor X6 protein-coding 264.333-37 chr2 75758071 75758449 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -47345 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 207.333-2 chr1 16390260 16390515 + 1.33333 NA intron (NR_073501, intron 2 of 4) intron (NR_073501, intron 2 of 4) 23145 NR_073502 26099 Hs.252967 NM_001114600 ENSG00000055070 SZRD1 C1orf144 SUZ RNA binding domain containing 1 protein-coding 277-3 chr1 199245651 199245910 + 1.33333 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 97182 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 311.666-8 chr2 115729575 115730027 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 9 of 25) (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 385986 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 223.666-7 chr11 92215498 92215761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9405 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 222-14 chr10 85585779 85585991 + 1.33333 NA intron (NR_038986, intron 2 of 2) L1MCa|LINE|L1 8154 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 263-58 chr6 49334391 49334848 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128634 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 141.667-32 chr10 73381265 73381527 + 1.33333 NA intron (NM_004034, intron 10 of 13) intron (NM_004034, intron 10 of 13) -22532 NM_001367801 118491 Hs.591367 NM_145170 ENSG00000156042 CFAP70 TTC18 cilia and flagella associated protein 70 protein-coding 186.333-112 chr4 44841052 44841218 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -114501 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 199.333-21 chr1 231436696 231436955 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -11781 NM_022051 54583 Hs.444450 NM_022051 ENSG00000135766 EGLN1 C1orf12|ECYT3|HALAH|HIF-PH2|HIFPH2|HPH-2|HPH2|PHD2|SM20|ZMYND6 egl-9 family hypoxia inducible factor 1 protein-coding 223.333-2 chr1 21529590 21529910 + 1.33333 NA intron (NM_001177520, intron 1 of 9) L1MEh|LINE|L1 20327 NM_000478 249 Hs.75431 NM_000478 ENSG00000162551 ALPL AP-TNAP|APTNAP|HOPS|TNALP|TNAP|TNSALP alkaline phosphatase, biomineralization associated protein-coding 156.667-68 chr11 101521875 101522122 + 1.33333 NA intron (NM_004621, intron 1 of 12) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -2093 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 184.666-24 chr4 91487469 91487631 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 789752 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 238.999-2 chr2 205365609 205365893 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) intron (NM_205863, intron 18 of 21) -316749 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 385.333-5 chr10 34149001 34149535 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -376588 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 285.333 chr1 105870245 105870690 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 157786 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 363.333-9 chr15 56649299 56649611 + 1.33333 NA intron (NM_001002843, intron 18 of 20) intron (NM_001002843, intron 18 of 20) 84631 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 202.333-89 chr2 64593217 64593476 + 1.33333 NA TTS (NM_203437) TTS (NM_203437) -13966 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 182.333-124 chr5 44025228 44025391 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -363423 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 258.999-8 chr6 116154287 116154631 + 1.33333 NA intron (NM_152729, intron 6 of 11) intron (NM_152729, intron 6 of 11) -28327 NM_000493 1300 Hs.520339 NM_000493 ENSG00000123500 COL10A1 - collagen type X alpha 1 chain protein-coding 404.999 chr7 34378522 34378873 + 1.33333 NA intron (NR_033665, intron 3 of 3) MER57A-int|LTR|ERV1 -279521 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 338-22 chr4 75493727 75494113 + 1.33333 NA intron (NM_015436, intron 4 of 8) intron (NM_015436, intron 4 of 8) 15376 NR_103725 25898 Hs.48297 NM_015436 ENSG00000163743 RCHY1 ARNIP|CHIMP|PIRH2|PRO1996|RNF199|ZCHY|ZNF363 ring finger and CHY zinc finger domain containing 1 protein-coding 338.666-14 chr5 16447103 16447609 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6254 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 220.333-120 chr7 24553133 24553592 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20090 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 134-19 chr11 5499310 5499490 + 1.33333 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) L2|LINE|L2 6252 NM_001005567 282763 Hs.690458 NM_001005567 ENSG00000167355 OR51B5 HOR5'Beta5|OR11-37 olfactory receptor family 51 subfamily B member 5 protein-coding 173.333-27 chr10 53037351 53037540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -265745 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 147-91 chr3 64156503 64156723 + 1.33333 NA intron (NM_001370528, intron 5 of 7) intron (NM_001370528, intron 5 of 7) -30931 NR_046702 100874243 Hs.670840 NR_046702 ENSG00000226017 PRICKLE2-AS3 - PRICKLE2 antisense RNA 3 ncRNA 382.333-12 chr22 30306437 30306930 + 1.33333 NA intron (NM_001204240, intron 1 of 8) intron (NM_001204240, intron 1 of 8) -17056 NM_001037666 652968 Hs.444950 NM_001037666 ENSG00000239282 CASTOR1 GATSL3 cytosolic arginine sensor for mTORC1 subunit 1 protein-coding 210-157 chr9 104294643 104294826 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 24505 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 212-27 chr11 33196548 33196789 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35011 NR_034027 338739 Hs.423476 NR_034027 ENSG00000247151 CSTF3-DT CSTF3-AS1 CSTF3 divergent transcript ncRNA 152.333-138 chr16 80122714 80123011 + 1.33333 NA Intergenic LTR90A|LTR|LTR 327613 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 162-74 chr2 212733284 212733501 + 1.33333 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -61939 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 268-29 chr2 55255008 55255374 + 1.33333 NA intron (NM_001005369, intron 6 of 16) intron (NM_001005369, intron 6 of 16) 13988 NM_001005369 4528 Hs.149894 NM_002453 ENSG00000085760 MTIF2 - mitochondrial translational initiation factor 2 protein-coding 175.333-55 chr15 47024122 47024272 + 1.33333 NA Intergenic L1P2|LINE|L1 -159892 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 382.666-6 chr2 25288256 25288676 + 1.33333 NA intron (NR_135490, intron 3 of 23) AluSg7|SINE|Alu -36151 NM_153759 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 269.333-46 chr2 122267562 122267877 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 512068 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 202.666-61 chr2 48306718 48306916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7865 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 425-3 chr4 73577725 73578100 + 1.33333 NA intron (NM_001270391, intron 7 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie 42524 NM_001270391 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 190-121 chr8 89331967 89332181 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 425637 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 128-5 chr1 191896421 191896563 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -261970 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 193.666-55 chrX 91386228 91386389 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -48531 NM_080832 140886 Hs.246590 NM_080832 ENSG00000174740 PABPC5 PABP5 poly(A) binding protein cytoplasmic 5 protein-coding 195-77 chr4 58825446 58825732 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -158693 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 252.333-2 chr1 111344079 111344291 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -2375 NM_001300831 128344 Hs.172510 NM_181643 ENSG00000173947 PIFO C1orf88|pitchfork primary cilia formation protein-coding 200.333-89 chr22 45715354 45715644 + 1.33333 NA intron (NM_013236, intron 5 of 11) MER30|DNA|hAT-Charlie 43665 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 337.667 chr10 83814602 83815003 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1a|LTR|Gypsy -137713 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 260-9 chr1 235869701 235869932 + 1.33333 NA intron (NR_102436, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 -2889 NM_000081 1130 Hs.532411 NM_000081 ENSG00000143669 LYST CHS|CHS1 lysosomal trafficking regulator protein-coding 199-102 chr7 20701691 20701840 + 1.33333 NA intron (NM_178559, intron 10 of 18) intron (NM_178559, intron 10 of 18) 54435 NM_178559 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 321.666-14 chr7 62837726 62838165 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 466111 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 464.667-5 chr9 137232103 137232647 + 1.33333 NA intron (NM_001177316, intron 3 of 12) intron (NM_001177316, intron 3 of 12) 1442 NM_080877 142680 Hs.432442 NM_080877 ENSG00000198569 SLC34A3 HHRH|NPTIIc solute carrier family 34 member 3 protein-coding 255.999-6 chr4 56307354 56307577 + 1.33333 NA intron (NM_020722, intron 4 of 10) intron (NM_020722, intron 4 of 10) 80026 NM_001323890 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 180-68 chr3 101821033 101821255 + 1.33333 NA intron (NR_145993, intron 6 of 6) intron (NR_145993, intron 6 of 6) -6846 NM_001005474 64332 Hs.319171 NM_031419 ENSG00000144802 NFKBIZ IKBZ|INAP|MAIL NFKB inhibitor zeta protein-coding 334-8 chr14 54010350 54010809 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -53688 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 160-128 chr9 27366313 27366535 + 1.33333 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -69274 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 218.333-104 chr6 43005021 43005243 + 1.33333 NA intron (NM_006245, intron 2 of 15) intron (NM_006245, intron 2 of 15) 8814 NM_014623 4201 Hs.278362 NM_014623 ENSG00000124733 MEA1 HYS|MEA male-enhanced antigen 1 protein-coding 212.333-24 chr11 24182597 24182797 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -314356 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 126-53 chr2 57836422 57836570 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -71155 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 206.333-19 chr10 100070600 100070787 + 1.33333 NA intron (NM_001308, intron 2 of 8) intron (NM_001308, intron 2 of 8) 11176 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 258.333-15 chr12 41715238 41715470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48835 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 191-60 chr6 117611129 117611406 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8756 NM_020399 57120 Hs.191539 NM_020399 ENSG00000047932 GOPC CAL|FIG|GOPC1|PIST|dJ94G16.2 golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing protein-coding 246.333-33 chr14 72478012 72478240 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 11 of 16) intron (NM_001370288, intron 11 of 16) -38694 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 208.667-49 chr15 67384308 67384556 + 1.33333 NA intron (NM_001031715, intron 10 of 20) intron (NM_001031715, intron 10 of 20) -129234 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 374-11 chr2 17514797 17515260 + 1.33333 NA intron (NM_001099218, intron 1 of 2) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3412 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 217-3 chr1 47190936 47191140 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1002 NM_005764 10158 Hs.431099 NM_005764 ENSG00000162366 PDZK1IP1 DD96|MAP17|SPAP PDZK1 interacting protein 1 protein-coding 154-133 chr7 73838438 73838602 + 1.33333 NA intron (NM_152559, intron 5 of 5) intron (NM_152559, intron 5 of 5) 3996 NM_152559 155368 Hs.647042 NM_152559 ENSG00000165171 METTL27 WBSCR27 methyltransferase like 27 protein-coding 198-47 chr14 52224560 52224828 + 1.33333 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -43004 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 248.333-95 chr7 54953923 54954202 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64955 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 219.333-114 chr3 35575854 35576115 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -63541 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 241-43 chr5 65274077 65274382 + 1.33333 NA intron (NM_197941, intron 11 of 24) intron (NM_197941, intron 11 of 24) 207691 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 206-85 chr2 108631047 108631208 + 1.33333 NA intron (NM_001193484, intron 1 of 9) intron (NM_001193484, intron 1 of 9) 9876 NM_001193484 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 257-20 chr17 30329698 30330067 + 1.33333 NA intron (NM_001319942, intron 2 of 5) AluJo|SINE|Alu 4175 NM_001319942 388364 Hs.371005 NM_206832 ENSG00000182271 TMIGD1 TMIGD|UNQ9372 transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 protein-coding 210.666-79 chr4 118945385 118945595 + 1.33333 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) 56636 NM_001128933 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 204-87 chr18 55333100 55333261 + 1.33333 NA intron (NM_001243228, intron 8 of 19) MER131|DNA?|DNA? -11339 NM_001348214 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 191.333-221 chrX 45390706 45390868 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -114601 NR_104645 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 162-127 chr8 121328630 121328856 + 1.33333 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -310603 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 190.667-148 chr8 82036524 82036763 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -194357 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 226.333-100 chr7 4221168 4221450 + 1.33333 NA exon (NM_152744, exon 40 of 45) exon (NM_152744, exon 40 of 45) -86472 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 207.666-33 chr21 28703043 28703258 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 163832 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 198-129 chr3 161461635 161461825 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -35078 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 300-19 chr14 32056818 32057157 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19712 NR_027263 84837 Hs.496755 NM_032751 ARHGAP5-AS1 C14orf128 ARHGAP5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 322.666-4 chr10 44153586 44153868 + 1.33333 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -139023 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 239.666-19 chr20 4363291 4363481 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -114099 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 212.666-5 chr1 194974193 194974362 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 1114438 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 202.333-104 chr21 14553168 14553397 + 1.33333 NA intron (NM_001256370, intron 2 of 8) L1MEh|LINE|L1 -6922 NM_001286523 64092 Hs.473341 NM_022136 ENSG00000155307 SAMSN1 HACS1|NASH1|SASH2|SH3D6B|SLy2 SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 protein-coding 256-3 chr1 41832349 41832610 + 1.33333 NA intron (NM_024503, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu 86443 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 204-178 chr6 117381558 117381764 + 1.33333 NA intron (NM_002944, intron 16 of 42) L1PB3|LINE|L1 44194 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 177.667-49 chr14 71863051 71863296 + 1.33333 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -68998 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 216.666-73 chr9 89403447 89403666 + 1.33333 NA intron (NM_001371200, intron 5 of 20) intron (NM_001371200, intron 5 of 20) 76334 NM_001371200 355.333-29 chr5 121391061 121391367 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 68664 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 195.666-32 chr4 68240065 68240269 + 1.33333 NA intron (NM_182502, intron 2 of 9) intron (NM_182502, intron 2 of 9) 5527 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 250-60 chr5 2469506 2469762 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157433 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 207.666-65 chr8 84775469 84775712 + 1.33333 NA intron (NM_001354322, intron 3 of 6) Plat_L3|LINE|CR1 69663 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 136.666-3 chr4 24964271 24964433 + 1.33333 NA intron (NM_173463, intron 1 of 12) L1MDa|LINE|L1 15852 NM_173463 91050 Hs.106432 NM_173463 ENSG00000181982 CCDC149 - coiled-coil domain containing 149 protein-coding 238.666-25 chr2 104781280 104781503 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -23672 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 291.333-27 chr16 19083347 19083628 + 1.33333 NA Intergenic MSTA1|LTR|ERVL-MaLR 14840 NM_001370489 10229 Hs.157113 NM_016138 ENSG00000167186 COQ7 CAT5|CLK-1|CLK1|COQ10D8 coenzyme Q7, hydroxylase protein-coding 204-206 chr9 26541644 26541836 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 351062 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 148-126 chr5 33268970 33269157 + 1.33333 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 39328 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 230.333-22 chr11 24449430 24449717 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47480 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 305.333-26 chr16 65800752 65801072 + 1.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -224612 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 333.999-4 chr5 166261054 166261326 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 665180 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 190.666-6 chr1 188379320 188379488 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 935776 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 201-122 chrX 105554048 105554263 + 1.33333 NA intron (NM_017416, intron 6 of 10) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -268384 NM_198465 203447 Hs.209527 NM_198465 ENSG00000123572 NRK NESK Nik related kinase protein-coding 335.999-2 chr2 9244847 9245130 + 1.33333 NA intron (NM_003887, intron 1 of 27) intron (NM_003887, intron 1 of 27) 38176 NM_003887 8853 Hs.555902 NM_003887 ENSG00000151693 ASAP2 AMAP2|CENTB3|DDEF2|PAG3|PAP|Pap-alpha|SHAG1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 249.333-41 chr16 57618524 57618804 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1074 NM_001290142 9289 Hs.513633 NM_005682 ENSG00000205336 ADGRG1 BFPP|BPPR|GPR56|TM7LN4|TM7XN1 adhesion G protein-coupled receptor G1 protein-coding 453.333-6 chr7 121550519 121551075 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154429 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 157.333-226 chr3 41631365 41631526 + 1.33333 NA intron (NR_136342, intron 28 of 34) intron (NR_136342, intron 28 of 34) 330658 NM_001322501 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 283-22 chr3 94956734 94957004 + 1.33333 NA intron (NR_015400, intron 1 of 7) intron (NR_015400, intron 1 of 7) 18606 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 204-125 chr22 22936954 22937235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49278 NM_001256296 100423062 Hs.449574 NM_001178126 ENSG00000254709 IGLL5 IGL|IGLV|VL-MAR immunoglobulin lambda like polypeptide 5 protein-coding 199.333-30 chr10 93107409 93107682 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 33652 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 187.333-148 chr4 126238607 126238911 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 731500 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 239.333-18 chr11 86248171 86248515 + 1.33333 NA intron (NM_001330334, intron 1 of 9) intron (NM_001330334, intron 1 of 9) 3590 NM_003797 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 350.666-9 chr14 89806162 89806544 + 1.33333 NA intron (NM_001284269, intron 5 of 5) intron (NM_001284269, intron 5 of 5) 148183 NM_001284269 90141 Hs.123232 NM_145231 ENSG00000140025 EFCAB11 C14orf143 EF-hand calcium binding domain 11 protein-coding 299.666-16 chr4 166362328 166362784 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 489319 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 178-122 chrX 142694937 142695115 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -330902 NM_001009613 441525 Hs.535082 NM_001009613 ENSG00000189326 SPANXN4 CT11.9 SPANX family member N4 protein-coding 204-131 chr3 110261765 110261924 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 659016 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 208.333-158 chr9 75531801 75531969 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -358759 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 467.667-4 chr14 62337959 62338411 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -198212 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 262-9 chr11 16753882 16754135 + 1.33333 NA intron (NM_014267, intron 4 of 4) intron (NM_014267, intron 4 of 4) 15361 NM_014267 10944 Hs.368226 NM_014267 ENSG00000110696 C11orf58 IMAGE145052|SMAP chromosome 11 open reading frame 58 protein-coding 249.667-24 chr12 39928588 39928935 + 1.33333 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) HAL1|LINE|L1 177320 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 387.999-2 chr12 30359727 30360251 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 317255 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 195-2 chr1 46465488 46465649 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15864 NR_121680 101929651 Hs.638707 NR_121680 ENSG00000224863 LINC01398 - long intergenic non-protein coding RNA 1398 ncRNA 195-35 chr13 51593198 51593423 + 1.33333 NA intron (NM_052950, intron 1 of 11) intron (NM_052950, intron 1 of 11) 8848 NM_052950 115825 Hs.46506 NM_052950 ENSG00000139668 WDFY2 PROF|WDF2|ZFYVE22 WD repeat and FYVE domain containing 2 protein-coding 219.666-52 chrX 53908432 53908628 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 134617 NM_001184898 23133 Hs.133352 NM_015107 ENSG00000172943 PHF8 JHDM1F|KDM7B|MRXSSD|ZNF422 PHD finger protein 8 protein-coding 500 chr1 14354702 14355381 + 1.33333 NA intron (NR_149058, intron 3 of 4) L1ME2|LINE|L1 64932 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 163.667-181 chr4 90808512 90808773 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 7 of 10) L1PB3|LINE|L1 573611 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 224.667-13 chr11 59534787 59535054 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20007 NM_001004711 390199 Hs.553757 NM_001004711 ENSG00000172742 OR4D9 OR11-253 olfactory receptor family 4 subfamily D member 9 protein-coding 256.666-35 chr4 155560003 155560249 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106584 NM_001130687 2982 Hs.24258 NM_000856 ENSG00000164116 GUCY1A1 GC-SA3|GUC1A3|GUCA3|GUCSA3|GUCY1A3|MYMY6 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 1 protein-coding 206.666-5 chr1 59305003 59305175 + 1.33333 NA intron (NM_018291, intron 1 of 15) L1MA9|LINE|L1 -4943 NM_001350799 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 238-95 chr7 30102055 30102349 + 1.33333 NA intron (NM_001350973, intron 13 of 13) L1MB4|LINE|L1 -32784 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 196.333-121 chr3 168057690 168057914 + 1.33333 NA intron (NM_001308155, intron 1 of 14) intron (NM_001308155, intron 1 of 14) 38122 NM_014498 27333 Hs.143600 NM_014498 ENSG00000173905 GOLIM4 GIMPC|GOLPH4|GPP130|P138 golgi integral membrane protein 4 protein-coding 230.333-122 chr8 122100374 122100715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -459104 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 282.666-13 chr2 177965703 177966042 + 1.33333 NA intron (NM_001077197, intron 3 of 20) L1PA15|LINE|L1 -43035 NM_001077358 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 201.333-272 chr7 132479518 132479805 + 1.33333 NA intron (NM_001105543, intron 3 of 3) AluSz6|SINE|Alu 96809 NM_001105543 91584 Hs.511454 NM_020911 ENSG00000221866 PLXNA4 FAYV2820|PLEXA4|PLXNA4A|PLXNA4B|PRO34003 plexin A4 protein-coding 371.333-5 chr1 246135931 246136489 + 1.33333 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 281202 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 199.333-286 chr8 129677770 129678042 + 1.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 2333 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 261.333-42 chr19 2491107 2491497 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15175 NM_015675 4616 Hs.110571 NM_015675 ENSG00000099860 GADD45B GADD45BETA|MYD118 growth arrest and DNA damage inducible beta protein-coding 255.666 chr1 84129809 84130137 + 1.33333 NA intron (NM_002731, intron 1 of 9) AluYj4|SINE|Alu -14298 NM_001300916 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 171-3 chr1 45868582 45868793 + 1.33333 NA intron (NM_001324321, intron 1 of 28) intron (NM_001324321, intron 1 of 28) 4339 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 164-77 chr3 79185584 79185742 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) LFSINE_Vert|SINE|tRNA -166204 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 210.333-54 chr16 83107020 83107281 + 1.33333 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) L1MEf|LINE|L1 -116852 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 384-23 chr8 99763491 99763944 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 39 of 61) L2c|LINE|L2 129990 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 164-117 chr8 79907792 79907963 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -36140 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 211.667-27 chr11 69845181 69845469 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -25909 NM_005247 2248 Hs.37092 NM_005247 ENSG00000186895 FGF3 HBGF-3|INT2 fibroblast growth factor 3 protein-coding 190.333-8 chr1 174800764 174801012 + 1.33333 NA intron (NM_001366454, intron 1 of 8) intron (NM_001366454, intron 1 of 8) 1150 NM_001366454 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 242.333-70 chr3 85793900 85794102 + 1.33333 NA intron (NM_001256504, intron 3 of 10) intron (NM_001256504, intron 3 of 10) 34049 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 149.333-170 chr2 31219981 31220152 + 1.33333 NA intron (NM_001321270, intron 2 of 21) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -2551 NM_001145122 440854 Hs.468059 NM_001145122 ENSG00000214711 CAPN14 - calpain 14 protein-coding 341.666-6 chr20 20114860 20115455 + 1.33333 NA intron (NM_015585, intron 8 of 26) L1M5|LINE|L1 58511 NM_001167816 26074 Hs.729168 NM_015585 ENSG00000089101 CFAP61 C20orf26|CaM-IP3|dJ1002M8.3|dJ1178H5.4 cilia and flagella associated protein 61 protein-coding 334.666-2 chr10 107879736 107880056 + 1.33333 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) L1MA3|LINE|L1 189397 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 281 chr1 53962763 53963189 + 1.33333 NA intron (NM_001256409, intron 7 of 8) intron (NM_001256409, intron 7 of 8) 16626 NM_052940 115353 Hs.40094 NM_052940 ENSG00000116212 LRRC42 dJ167A19.4 leucine rich repeat containing 42 protein-coding 199.666-41 chr4 62076301 62076497 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001322402, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001322402, exon 26 of 26) 85366 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 145.333-46 chr10 106511264 106511396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 371165 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 199.333-159 chr20 2354167 2354379 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -26628 NM_198994 343641 Hs.452039 NM_198994 ENSG00000166948 TGM6 SCA35|TG6|TGM3L|TGY|dJ734P14.3 transglutaminase 6 protein-coding 220-95 chr5 146883515 146883746 + 1.33333 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) intron (NM_001271900, intron 2 of 10) -4703 NR_073527 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 199-88 chr5 98740582 98740827 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -27928 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 217.666-20 chr2 67929894 67930114 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -104442 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 223.333-6 chr1 80437414 80437683 + 1.33333 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -98207 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 182.666-15 chr15 58038082 58038256 + 1.33333 NA intron (NM_170696, intron 1 of 11) intron (NM_170696, intron 1 of 11) -24146 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 208.666-114 chr9 71898109 71898308 + 1.33333 NA intron (NM_001025780, intron 1 of 3) intron (NM_001025780, intron 1 of 3) 13037 NM_001025780 51104 Hs.380389 NM_016014 ENSG00000107362 ABHD17B C9orf77|CGI-67|FAM108B1 abhydrolase domain containing 17B protein-coding 197.333-144 chr3 28361250 28361561 + 1.33333 NA intron (NM_001324170, intron 1 of 6) L1MB1|LINE|L1 12256 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 195-70 chr22 31544438 31544711 + 1.33333 NA intron (NM_001007467, intron 4 of 32) AluJb|SINE|Alu 48038 NM_014775 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 190-88 chr4 53260036 53260295 + 1.33333 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) L1PB1|LINE|L1 105896 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 301.333-52 chr7 74370648 74371096 + 1.33333 NA intron (NM_032421, intron 8 of 15) intron (NM_032421, intron 8 of 15) 81397 NM_003388 7461 Hs.647018 NM_003388 ENSG00000106665 CLIP2 CLIP|CLIP-115|CYLN2|WBSCR3|WBSCR4|WSCR3|WSCR4 CAP-Gly domain containing linker protein 2 protein-coding 238-91 chr6 144130545 144130797 + 1.33333 NA Intergenic (GAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -19846 NM_003764 8676 Hs.118958 NM_003764 ENSG00000135604 STX11 FHL4|HLH4|HPLH4 syntaxin 11 protein-coding 280.667-42 chr5 108079079 108079450 + 1.33333 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 302834 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 138-20 chr10 123338556 123338697 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 184224 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 297.333-38 chr22 45438081 45438378 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 24536 NM_015653 26150 Hs.475110 NM_015653 ENSG00000128408 RIBC2 C22orf11|TRIB RIB43A domain with coiled-coils 2 protein-coding 406-8 chr20 58016572 58017324 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 13044 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 223-18 chr14 57479843 57480115 + 1.33333 NA intron (NM_001283060, intron 5 of 5) intron (NM_001283060, intron 5 of 5) 13878 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 185.333-69 chr17 76504432 76504635 + 1.33333 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -3106 NM_024599 79651 Hs.464157 NM_024599 ENSG00000129667 RHBDF2 RHBDL5|RHBDL6|TEC|TOC|TOCG|iRhom2 rhomboid 5 homolog 2 protein-coding 224.666-27 chr3 163017434 163017622 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 285773 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 163.333-19 chr1 182461457 182461667 + 1.33333 NA intron (NM_001137669, intron 4 of 21) L1PA4|LINE|L1 11416 NM_001137669 353299 Hs.121200 NM_032267 ENSG00000121446 RGSL1 RGSL|RGSL2 regulator of G protein signaling like 1 protein-coding 160.666 chr10 62396787 62396935 + 1.33333 NA intron (NM_199451, intron 3 of 7) intron (NM_199451, intron 3 of 7) -21734 NR_104162 283045 NR_104162 LOC283045 - uncharacterized LOC283045 ncRNA 268.333-26 chr17 40216870 40217182 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2278 NM_133264 147179 Hs.421622 NM_133264 ENSG00000171475 WIPF2 WICH|WIRE WAS/WASL interacting protein family member 2 protein-coding 200.667-8 chr1 105899107 105899398 + 1.33333 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 129001 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 188.667-128 chr5 100424781 100425043 + 1.33333 NA Intergenic HERV9N-int|LTR|ERV1 -36658 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 244-33 chr14 67880001 67880305 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 5 of 10) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 56561 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 238-39 chr19 5099380 5099641 + 1.33333 NA intron (NM_001370094, intron 9 of 10) LTR47A|LTR|ERVL 130397 NM_001370094 23030 Hs.654816 NM_015015 ENSG00000127663 KDM4B JMJD2B|TDRD14B lysine demethylase 4B protein-coding 267.666-19 chr7 3892581 3892945 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -236922 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 231-54 chr5 148736350 148736832 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -82064 NR_104445 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 238.666-17 chr14 20793636 20793921 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 8586 NM_198232 6035 Hs.78224 NM_002933 ENSG00000129538 RNASE1 RAC1|RIB1|RNS1 ribonuclease A family member 1, pancreatic protein-coding 225.333-27 chr11 46604159 46604466 + 1.33333 NA intron (NM_173811, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu -10289 NM_001367470 55626 Hs.654644 NM_017749 ENSG00000110497 AMBRA1 DCAF3|WDR94 autophagy and beclin 1 regulator 1 protein-coding 217-16 chr13 22680041 22680233 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 218044 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 340.666 chr1 37144523 37144822 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -16891 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 139.333-64 chr13 82779293 82779458 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1103018 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 164.333-106 chr19 28655647 28655816 + 1.33333 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1M2|LINE|L1 49043 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 198.666-58 chr3 30814150 30814319 + 1.33333 NA intron (NM_207359, intron 11 of 14) MIRb|SINE|MIR 80427 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 231.666-14 chr2 39611351 39611595 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54025 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 389.667-5 chr21 28830933 28831473 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 54164 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 210.666-48 chr18 1504801 1504997 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -145270 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 204.666-65 chr5 19224939 19225108 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 661249 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 459.333-5 chr12 64384375 64384784 + 1.33333 NA intron (NM_001099676, intron 1 of 10) intron (NM_001099676, intron 1 of 10) 6179 NM_001170633 115749 Hs.535190 NM_001099676 ENSG00000185306 C12orf56 - chromosome 12 open reading frame 56 protein-coding 312.667-20 chr2 84603856 84604288 + 1.33333 NA intron (NM_001370, intron 18 of 76) L1ME1|LINE|L1 87617 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 381.333-23 chr8 110056195 110056605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -80629 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 265-13 chr12 8737505 8737914 + 1.33333 NA intron (NR_147950, intron 2 of 8) AluSp|SINE|Alu 39718 NR_147949 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 199-75 chr4 118372055 118372225 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -19137 NM_003619 8492 Hs.445857 NM_003619 ENSG00000164099 PRSS12 BSSP-3|BSSP3|MRT1 serine protease 12 protein-coding 257.666-21 chr6 143121443 143121799 + 1.33333 NA intron (NM_001366344, intron 2 of 6) intron (NM_001366344, intron 2 of 6) -4518 NM_001366358 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 214-136 chr8 105759373 105759676 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 300979 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 278-59 chr7 82990507 82990779 + 1.33333 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 172241 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 191-23 chr17 61068938 61069158 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 20 of 25) intron (NM_001330413, intron 20 of 25) 298656 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 295-9 chr12 61008260 61008547 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1184436 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 230.666-19 chr15 64473374 64473689 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25889 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 151.666-2 chr2 19766201 19766454 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -102527 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 168.666-9 chr2 155502260 155502423 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 752590 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 201.333-279 chr8 83573695 83573963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 170071 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 212.666-75 chr6 56928597 56928773 + 1.33333 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) L1M3|LINE|L1 26145 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 114-116 chr5 52791963 52792094 + 1.33333 NA intron (NM_181501, intron 1 of 28) intron (NM_181501, intron 1 of 28) 4112 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 261-62 chr9 115740729 115741031 + 1.33333 NA intron (NR_109805, intron 2 of 2) L3|LINE|CR1 3359 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 237-53 chr4 47518038 47518355 + 1.33333 NA intron (NM_020453, intron 3 of 22) intron (NM_020453, intron 3 of 22) 32921 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 226.333-109 chr8 108187112 108187339 + 1.33333 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 61492 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 187.333-76 chr15 80982559 80982813 + 1.33333 NA intron (NR_126327, intron 1 of 4) L1ME2|LINE|L1 7133 NM_015154 23184 Hs.578450 NM_015154 ENSG00000117899 MESD BOCA|MESDC2 mesoderm development LRP chaperone protein-coding 228-64 chr4 94722344 94722564 + 1.33333 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 35079 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 232.666-38 chr4 37174740 37175009 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67117 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 201.333-7 chr1 51760527 51760767 + 1.33333 NA intron (NM_001350210, intron 7 of 21) intron (NM_001350210, intron 7 of 21) 30797 NM_148907 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 346-13 chr18 6798602 6799025 + 1.33333 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) L1PB2|LINE|L1 -35672 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 247.999-5 chr2 163043981 163044262 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205354 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 248.666-18 chr16 82232150 82232430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62066 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 201.333-173 chr21 14731996 14732219 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -89000 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 261.666-8 chr18 65101668 65102061 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -648388 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 226-54 chr21 26172197 26172386 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1163 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 246.999-5 chr5 118748110 118748390 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 152062 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 155-58 chr2 21224053 21224233 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100157 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 167.333-244 chr7 54868436 54868592 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 109201 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 343-7 chr16 35873263 35873766 + 1.33333 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger 126962 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 219.333-99 chr2 157603944 157604176 + 1.33333 NA intron (NM_145259, intron 1 of 8) intron (NM_145259, intron 1 of 8) -6500 NM_001111031 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 204-28 chr10 73451538 73451739 + 1.33333 NA intron (NM_001142353, intron 10 of 13) FLAM_C|SINE|Alu -18077 NM_001024593 118490 Hs.631823 NM_001024593 ENSG00000166343 MSS51 ZMYND17 MSS51 mitochondrial translational activator protein-coding 229-64 chr7 41678994 41679179 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14833 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 217.333-106 chr4 55627870 55628096 + 1.33333 NA intron (NR_120489, intron 2 of 8) intron (NR_120489, intron 2 of 8) 8315 NM_006681 10874 Hs.418367 NM_006681 ENSG00000109255 NMU - neuromedin U protein-coding 245.333-128 chr9 32622863 32623206 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 12635 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 451.333-4 chr18 73331611 73332242 + 1.33333 NA intron (NR_038340, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 6985 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 210-24 chr11 45405879 45406166 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34625 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 187.666-4 chr12 34662172 34662332 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 639756 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 190.667-117 chr6 98120242 98120489 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 95834 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 244.666-42 chr5 178692670 178693019 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 37815 NM_005649 6940 Hs.484324 NM_005649 ENSG00000169131 ZNF354A EZNF|HEL104|HKL1|KID-1|KID1|TCF17 zinc finger protein 354A protein-coding 212.666-25 chr14 31180832 31181011 + 1.33333 NA intron (NM_015382, intron 2 of 42) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 26872 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 303.666-5 chr11 33537343 33537639 + 1.33333 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) intron (NM_012194, intron 1 of 20) 161383 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 275.333-68 chr7 18395643 18395914 + 1.33333 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) -99932 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 206-150 chr5 167392727 167393022 + 1.33333 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -180785 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 176.666-21 chr4 125945066 125945214 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 437881 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 212.666-6 chr1 195408928 195409105 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 679699 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 210.999-4 chr15 74565365 74565537 + 1.33333 NA intron (NM_001307939, intron 2 of 8) intron (NM_001307939, intron 2 of 8) 24231 NM_006465 10620 Hs.647642 NM_006465 ENSG00000179361 ARID3B BDP|DRIL2 AT-rich interaction domain 3B protein-coding 242.666-35 chr7 40235047 40235313 + 1.33333 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) intron (NM_024728, intron 6 of 14) 100204 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 210.666-11 chr10 93965213 93965424 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3403 NR_002319 266971 Hs.149255 NR_002319 ENSG00000180764 PIPSL PIP5K1L1|PIP5K1P3|PSMD4P2|bA429H9.1 PIP5K1A and PSMD4 like (pseudogene) pseudo 157.667-295 chr7 31369832 31370116 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29248 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 247.999-11 chr6 53291293 53291484 + 1.33333 NA intron (NM_001242828, intron 3 of 8) intron (NM_001242828, intron 3 of 8) 14395 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 152-29 chr11 20833882 20834133 + 1.33333 NA intron (NM_001288714, intron 3 of 18) L2b|LINE|L2 164421 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 175.666-18 chr6 10834222 10834448 + 1.33333 NA intron (NR_134935, intron 1 of 14) intron (NR_134935, intron 1 of 14) -3458 NM_001242957 4117 Hs.446125 NM_005906 ENSG00000111837 MAK RP62 male germ cell associated kinase protein-coding 277.666-9 chr16 78590676 78591189 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 491278 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 331-11 chr12 28453641 28454241 + 1.33333 NA intron (NM_001352082, intron 12 of 13) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -263203 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 170.333-111 chr2 76424551 76424718 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -561331 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 197.333-182 chr5 77190122 77190351 + 1.33333 NA intron (NM_001349752, intron 1 of 21) intron (NM_001349752, intron 1 of 21) 9932 NM_001349750 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 371.333-21 chr7 124389207 124389529 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37272 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 203.333-76 chr14 51347741 51347919 + 1.33333 NA intron (NR_038358, intron 1 of 4) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 14437 NR_038358 283553 Hs.325752 NR_038358 ENSG00000258479 LINC00640 - long intergenic non-protein coding RNA 640 ncRNA 265.333-55 chr3 97100478 97100694 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) MIRb|SINE|MIR 285992 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 600-2 chr11 82220042 82220763 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 183511 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 271-19 chr17 64319264 64319605 + 1.33333 NA TTS (NM_000442) TTS (NM_000442) -56174 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 347.666-3 chr10 97662999 97663426 + 1.33333 NA intron (NM_018425, intron 5 of 8) MER103C|DNA|hAT-Charlie 22526 NM_018425 55361 Hs.25300 NM_018425 ENSG00000155252 PI4K2A PI4KII|PIK42A phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha protein-coding 129.333-97 chr2 88070408 88070586 + 1.33333 NA intron (NM_001330364, intron 1 of 8) L1ME3F|LINE|L1 2672 NM_001330364 150572 Hs.516176 NM_198274 ENSG00000115593 SMYD1 BOP|KMT3D|ZMYND18|ZMYND22 SET and MYND domain containing 1 protein-coding 226-78 chr5 150757889 150758133 + 1.33333 NA intron (NM_001135643, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 509 NM_001135644 51164 Hs.675564 NM_016221 ENSG00000132912 DCTN4 DYN4|P62 dynactin subunit 4 protein-coding 310.333-3 chr1 75142342 75142820 + 1.33333 NA intron (NM_001001933, intron 5 of 9) intron (NM_001001933, intron 5 of 9) 8193 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 202-81 chr2 68856623 68856779 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 14696 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 254.333-19 chr14 55588974 55589235 + 1.33333 NA intron (NM_004986, intron 1 of 41) intron (NM_004986, intron 1 of 41) 8897 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 182.666-12 chr14 53093581 53093758 + 1.33333 NA intron (NM_030637, intron 2 of 11) intron (NM_030637, intron 2 of 11) 59654 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 193.333-88 chr2 48643242 48643494 + 1.33333 NA intron (NM_172311, intron 6 of 10) intron (NM_172311, intron 6 of 10) 25512 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 184-121 chr9 28365003 28365280 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 354164 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 233-8 chr10 64794912 64795203 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -30471 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 231-67 chr8 142420822 142421061 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -17759 NM_001363740 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 189.333-214 chr8 144883979 144884232 + 1.33333 NA intron (NM_001363105, intron 4 of 4) L1ME3D|LINE|L1 16200 NM_001363103 58500 Hs.532277 NM_021061 ENSG00000196150 ZNF250 ZFP647|ZNF647 zinc finger protein 250 protein-coding 226.667-6 chr1 111060354 111060766 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -78823 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 232-13 chr10 83912688 83912967 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -226682 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 204.333-115 chr20 35145334 35145642 + 1.33333 NA intron (NM_001145025, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 1848 NM_018217 55741 Hs.720177 NM_018217 ENSG00000088298 EDEM2 C20orf31|C20orf49|bA4204.1 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 2 protein-coding 200.666-100 chr5 77686571 77686805 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47991 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 209-81 chr4 63550693 63550963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 858622 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 263.666-9 chr21 30027807 30028184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87943 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 416.333-2 chr1 247585686 247586158 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -2438 NM_001001915 81470 Hs.690208 NM_001001915 ENSG00000177489 OR2G2 OR1-32 olfactory receptor family 2 subfamily G member 2 protein-coding 235.333-83 chr4 55073775 55074043 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 51686 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 345.333-2 chr10 71518772 71519121 + 1.33333 NA intron (NM_052836, intron 6 of 12) intron (NM_052836, intron 6 of 12) -7026 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 259.666-3 chr1 63710586 63710978 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -63235 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 335.333-39 chr5 65594914 65595237 + 1.33333 NA intron (NM_001656, intron 9 of 10) L3|LINE|CR1 29258 NM_033227 373 Hs.792 NM_001656 ENSG00000113595 TRIM23 ARD1|ARFD1|RNF46 tripartite motif containing 23 protein-coding 196.333-47 chr15 41065317 41065584 + 1.33333 NA intron (NM_017553, intron 14 of 35) AluSx|SINE|Alu 50796 NR_104038 54617 Hs.292949 NM_017553 ENSG00000128908 INO80 INO80A|INOC1 INO80 complex ATPase subunit protein-coding 198-30 chr11 73798272 73798482 + 1.33333 NA intron (NR_134660, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu 10503 NM_016055 51642 Hs.503239 NM_016055 ENSG00000175581 MRPL48 CGI-118|HSPC290|L48MT|MRP-L48 mitochondrial ribosomal protein L48 protein-coding 294-37 chr21 23084501 23084899 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5416 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 235.666-13 chr5 36217387 36217595 + 1.33333 NA intron (NM_001085411, intron 6 of 11) intron (NM_001085411, intron 6 of 11) 23900 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 184.666-16 chr17 70558426 70558632 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 388994 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 176-6 chr1 99356551 99356768 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 92367 NM_014839 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 222.666-16 chr16 3236729 3236950 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -1681 NM_198087 7752 Hs.632222 NM_003454 ENSG00000010539 ZNF200 - zinc finger protein 200 protein-coding 320.666-6 chr15 99330917 99331250 + 1.33333 NA intron (NM_001321676, intron 6 of 10) intron (NM_001321676, intron 6 of 10) 73558 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 137.666-4 chr22 24579634 24579773 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -4047 NM_013430 2678 Hs.595809 NM_005265 ENSG00000100031 GGT1 CD224|D22S672|D22S732|GGT|GGT 1|GGTD|GTG gamma-glutamyltransferase 1 protein-coding 218.666-23 chr13 93198608 93198814 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -28096 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 198-89 chr2 55243822 55243988 + 1.33333 NA intron (NM_001005369, intron 12 of 16) intron (NM_001005369, intron 12 of 16) 9741 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 196-198 chr9 113203135 113203369 + 1.33333 NA intron (NM_015258, intron 4 of 27) intron (NM_015258, intron 4 of 27) 18025 NM_015258 23307 Hs.522351 NM_015258 ENSG00000119321 FKBP15 FKBP133|KIAA0674|PPP1R76 FKBP prolyl isomerase 15 protein-coding 160.333-261 chr7 28990445 28990585 + 1.33333 NA intron (NR_038965, intron 1 of 4) intron (NR_038965, intron 1 of 4) 10548 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 209.333-181 chr5 5813281 5813569 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 390748 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 196-16 chr10 34096166 34096399 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -323602 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 198.666-15 chr12 44714297 44714488 + 1.33333 NA intron (NM_006159, intron 11 of 20) intron (NM_006159, intron 11 of 20) 161269 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 226-59 chr3 23078713 23078910 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 123767 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 231.333-11 chr1 218419200 218419535 + 1.33333 NA intron (NR_138148, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 -18266 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 196-39 chr12 61352366 61352540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 840386 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 232.667-51 chr3 96730127 96730459 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -84301 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 227.666-17 chr2 204322137 204322382 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -223216 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 242.666-16 chr15 63226619 63226830 + 1.33333 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) MER41A|LTR|ERV1 37118 NM_016530 51762 Hs.389733 NM_016530 ENSG00000166128 RAB8B - RAB8B, member RAS oncogene family protein-coding 538.666-2 chr22 44184142 44184613 + 1.33333 NA intron (NM_022141, intron 3 of 13) AluSx1|SINE|Alu 3452 NM_022141 64098 Hs.658995 NM_022141 ENSG00000138964 PARVG - parvin gamma protein-coding 294-63 chr8 78929900 78930191 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 92516 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 195.333-220 chr8 132232018 132232210 + 1.33333 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR -126849 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 323.333-10 chr15 68947228 68947664 + 1.33333 NA TTS (NM_145658) TTS (NM_145658) 16921 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 246-35 chr15 85634532 85634787 + 1.33333 NA intron (NM_001270546, intron 1 of 28) L1ME1|LINE|L1 14709 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 227.333-3 chr1 74355529 74355810 + 1.33333 NA intron (NM_015978, intron 11 of 24) intron (NM_015978, intron 11 of 24) 120282 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 202.666-94 chr5 64052342 64052554 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -90156 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 354.666-4 chr12 20914153 20914547 + 1.33333 NA intron (NM_001371097, intron 13 of 15) L1MC1|LINE|L1 91802 NM_001349920 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 249.333-34 chr15 34374738 34375187 + 1.33333 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 7188 NR_036261 100422845 NR_036261 ENSG00000221065 MIR1233-2 - microRNA 1233-2 ncRNA 264-51 chr8 60144607 60144939 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 136627 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 187-12 chr10 81248299 81248509 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 598607 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 214.666-62 chr6 65741685 65741857 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34545 NM_001142800 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 203.666-45 chr4 172391778 172392010 + 1.33333 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 297023 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 225.666-29 chr7 86145176 86145351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -498646 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 162-28 chr12 9992567 9992781 + 1.33333 NA TTS (NM_016509) TTS (NM_016509) 6626 NM_016509 51266 Hs.409794 NM_016509 ENSG00000165682 CLEC1B 1810061I13Rik|CLEC2|CLEC2B|PRO1384|QDED721 C-type lectin domain family 1 member B protein-coding 211.666-27 chr20 42942560 42942797 + 1.33333 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) MIR|SINE|MIR -26065 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 259.999 chr10 67491601 67491924 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) L2c|LINE|L2 -88352 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 217.666-4 chr10 72445667 72445854 + 1.33333 NA intron (NM_001195519, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 78226 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 251.333-19 chr11 32894683 32895083 + 1.33333 NA intron (NM_001076786, intron 1 of 12) intron (NM_001076786, intron 1 of 12) 2072 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 253.333-71 chr3 106487959 106488335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -618746 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 281.666 chr10 14896128 14896473 + 1.33333 NA intron (NM_001193427, intron 2 of 5) MER33|DNA|hAT-Charlie 17400 NM_024670 79723 Hs.554883 NM_024670 ENSG00000152455 SUV39H2 KMT1B suppressor of variegation 3-9 homolog 2 protein-coding 194-77 chr2 99064291 99064452 + 1.33333 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) L1ME3Cz|LINE|L1 76809 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 293.333-16 chr15 46024434 46024674 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 319359 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 325.333-44 chr7 27288316 27288687 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41272 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 244.666-4 chr1 207136143 207136421 + 1.33333 NA intron (NM_000715, intron 9 of 11) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 32049 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 202-124 chr4 14693418 14693579 + 1.33333 NA intron (NR_126435, intron 3 of 6) LTR33A|LTR|ERVL 194671 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 306-50 chr7 55546291 55546785 + 1.33333 NA intron (NM_030796, intron 1 of 4) L1MD3|LINE|L1 6228 NM_001284282 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 171-33 chr2 42777470 42777729 + 1.33333 NA intron (NM_012205, intron 4 of 9) LTR8|LTR|ERV1 -13338 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 284-4 chr1 175489465 175489786 + 1.33333 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) 253970 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 338-11 chr15 57271123 57271467 + 1.33333 NA intron (NM_001322152, intron 18 of 20) L1P2|LINE|L1 7362 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 200.333-169 chr9 82245279 82245561 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 256648 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 374.333-3 chr12 2844056 2844446 + 1.33333 NA intron (NR_147202, intron 14 of 15) AluJb|SINE|Alu -9216 NM_031474 83714 Hs.530816 NM_031474 ENSG00000053702 NRIP2 - nuclear receptor interacting protein 2 protein-coding 187-42 chr20 6961363 6961603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193797 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 216.667 chr1 23481903 23482174 + 1.33333 NA intron (NM_001143778, intron 1 of 23).2 intron (NM_001143778, intron 1 of 23).2 2141 NM_017707 55616 Hs.437379 NM_017707 ENSG00000088280 ASAP3 ACAP4|CENTB6|DDEFL1|UPLC1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 3 protein-coding 225.666-2 chr10 79117064 79117315 + 1.33333 NA intron (NM_020338, intron 1 of 24) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 48223 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 413-4 chr14 67982624 67983219 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) AluJo|SINE|Alu 159329 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 266.333-61 chr7 93865427 93865822 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 25129 NM_001271004 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 189-38 chr18 13126514 13126778 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92114 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 281.333-41 chr3 102428726 102429084 + 1.33333 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -6110 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 167.333-190 chr4 76932378 76932575 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -17276 NM_018243 55752 Hs.128199 NM_018243 ENSG00000138758 SEPTIN11 SEPT11 septin 11 protein-coding 193.667-51 chr16 77553410 77553668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -118505 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 308.333-14 chr16 10300129 10300444 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -85775 NR_045815 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 207.667-101 chr5 112327979 112328273 + 1.33333 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) AluSc8|SINE|Alu 91151 NM_001347887 64097 Hs.584954 NM_022140 ENSG00000129595 EPB41L4A EPB41L4|NBL4 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A protein-coding 193.333-107 chr2 193508141 193508388 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 758419 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 286.666-11 chr21 14283028 14283309 + 1.33333 NA intron (NR_003087, intron 2 of 5) intron (NR_003087, intron 2 of 5) 9369 NR_003087 150000 Hs.366575 NM_138726 ENSG00000243064 ABCC13 ABCC13P|C21orf73|PRED6 ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) pseudo 399-8 chr22 35455030 35455540 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 55145 NM_006739 4174 Hs.517582 NM_006739 ENSG00000100297 MCM5 CDC46|MGORS8|P1-CDC46 minichromosome maintenance complex component 5 protein-coding 240.667-57 chr3 186461701 186462048 + 1.33333 NA intron (NR_033844, intron 3 of 7) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 21529 NR_151708 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 229.333-44 chr15 93995693 93996003 + 1.33333 NA intron (NR_120320, intron 3 of 8) intron (NR_120320, intron 3 of 8) 95147 NR_120323 101927129 Hs.652658 NR_120322 ENSG00000258785 LINC01580 - long intergenic non-protein coding RNA 1580 ncRNA 171-12 chr12 12219714 12219860 + 1.33333 NA intron (NM_002336, intron 2 of 22).2 MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 47257 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 128.667-59 chr14 85078672 85078810 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -193191 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 277.666-10 chr2 128931118 128931395 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 66656 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 197.667-134 chr6 95513346 95513736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63910 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 207.666-69 chr9 26053682 26053885 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12892 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 204.667-108 chr4 84421962 84422269 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 76119 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 245-28 chr17 70219557 70219956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50221 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 206.666-47 chr17 57446965 57447186 + 1.33333 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 76522 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 242.667-92 chr6 124041165 124041479 + 1.33333 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) 237457 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 262.333-55 chr3 2456544 2456904 + 1.33333 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) L1MB5|LINE|L1 217895 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 198.666-81 chr5 126849718 126849879 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 72662 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 217.333-87 chr22 43000628 43000926 + 1.33333 NA intron (NM_001184970, intron 1 of 10) intron (NM_001184970, intron 1 of 10) 14372 NM_001184970 11252 Hs.162877 NM_007229 ENSG00000100266 PACSIN2 SDPII protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2 protein-coding 127-29 chr13 106027800 106027978 + 1.33333 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 321059 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 293.333-60 chr7 96698251 96698508 + 1.33333 NA intron (NR_163953, intron 1 of 5) L1PA8|LINE|L1 11467 NR_163952 198.667-195 chr9 36072002 36072273 + 1.33333 NA intron (NM_001316345, intron 8 of 22) intron (NM_001316345, intron 8 of 22) 35224 NM_001316345 8434 Hs.388918 NM_021111 ENSG00000122707 RECK ST15 reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs protein-coding 200.666-99 chr5 52515609 52515776 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -272224 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 280.667-17 chr11 86418540 86418925 + 1.33333 NA intron (NM_001156474, intron 13 of 14) L1MB2|LINE|L1 43845 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 199-60 chr2 188213075 188213246 + 1.33333 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) L1MC1|LINE|L1 74531 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 145.666 chr1 89461132 89461262 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 53518 NR_003133 400759 Hs.661968 NR_003133 ENSG00000225492 GBP1P1 - guanylate binding protein 1 pseudogene 1 pseudo 203-94 chr6 39532281 39532558 + 1.33333 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) (GAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -101029 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 242-33 chr17 70761950 70762273 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 440068 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 313.333-33 chr5 29265697 29266033 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 122362 NR_130777 101929660 Hs.171348 NR_130777 LINC02109 - long intergenic non-protein coding RNA 2109 ncRNA 194-68 chr2 22367124 22367338 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -169248 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 238.667-11 chr10 68118907 68119195 + 1.33333 NA intron (NM_001256268, intron 2 of 23) intron (NM_001256268, intron 2 of 23) 9563 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 162-11 chr10 17157424 17157587 + 1.33333 NA exon (NM_001351220, exon 8 of 11) exon (NM_001351220, exon 8 of 11) -27688 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 212.667-3 chr1 69635888 69636191 + 1.33333 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) intron (NM_001366842, intron 1 of 7) 66698 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 243.666-12 chr14 63855360 63855737 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) L2a|LINE|L2 2544 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 286.667-32 chr5 77424339 77424706 + 1.33333 NA intron (NM_001349751, intron 20 of 20) intron (NM_001349751, intron 20 of 20) 67794 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 200-32 chr11 70356911 70357093 + 1.33333 NA intron (NR_045286, intron 20 of 28) intron (NR_045286, intron 20 of 28) -41504 NM_138565 2017 Hs.596164 NM_005231 ENSG00000085733 CTTN EMS1 cortactin protein-coding 295.333-52 chr6 54754715 54755006 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -91911 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 219.666-10 chr12 124269566 124269836 + 1.33333 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR -19463 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 166-25 chr10 82866069 82866253 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) intron (NR_163253, intron 6 of 10) -633241 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 190-53 chr17 63323174 63323403 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 10 of 25) intron (NM_025185, intron 10 of 25) 116979 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 206.666-10 chr1 207181277 207181529 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 77170 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 280.666-25 chr5 82797415 82797673 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -42611 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 208-183 chr9 88458997 88459278 + 1.33333 NA intron (NM_006717, intron 3 of 5) intron (NM_006717, intron 3 of 5) 70693 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 185-80 chr8 131557634 131557877 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -346338 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 185.667-130 chr8 108419150 108419378 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -24319 NM_001329495 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 180.667-102 chr4 27487707 27487969 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 270359 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 160.667-190 chr3 32286990 32287187 + 1.33333 NA intron (NM_001320308, intron 1 of 2) intron (NM_001320308, intron 1 of 2) 48408 NM_178868 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 156-69 chr2 42785416 42785567 + 1.33333 NA intron (NM_012205, intron 2 of 9) L1ME4a|LINE|L1 7092 NM_012205 23498 Hs.368805 NM_012205 ENSG00000162882 HAAO 3-HAO|HAO|VCRL1|h3HAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase protein-coding 257-32 chr22 24455011 24455323 + 1.33333 NA intron (NR_028483, intron 4 of 7) AluSz|SINE|Alu 23048 NM_001278497 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 193-69 chr4 65903963 65904230 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -233601 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 258.666-40 chr6 21091306 21091622 + 1.33333 NA intron (NM_017774, intron 12 of 15) HAL1|LINE|L1 420428 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 488.333-6 chr8 114104897 114105426 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -668222 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 250-81 chr7 122467918 122468159 + 1.33333 NA intron (NM_001167940, intron 14 of 29) intron (NM_001167940, intron 14 of 29) -163288 NM_001024613 389549 Hs.553970 NM_001024613 ENSG00000128610 FEZF1 FEZ|HH22|ZNF312B FEZ family zinc finger 1 protein-coding 199.333-184 chr3 90577984 90578225 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1470483 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 209-43 chr14 44272424 44272729 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 234707 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 255.333-3 chr1 181949985 181950296 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 111572 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 192-120 chr6 38777308 38777570 + 1.33333 NA intron (NM_001371, intron 12 of 91) intron (NM_001371, intron 12 of 91) 62128 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 187-64 chr5 54051842 54052044 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) L1MC3|LINE|L1 -100344 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 159.666-3 chr18 9110695 9110876 + 1.33333 NA intron (NM_021074, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 8086 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 182-23 chr13 42863475 42863675 + 1.33333 NA intron (NR_126388, intron 1 of 2) intron (NR_126388, intron 1 of 2) 9169 NR_126388 104355147 Hs.633967 NR_126388 LINC00428 - long intergenic non-protein coding RNA 428 ncRNA 247-77 chr8 137338192 137338515 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 75235 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 307-15 chr2 161191004 161191286 + 1.33333 NA intron (NM_001199135, intron 2 of 7) intron (NM_001199135, intron 2 of 7) 30717 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 355.666-6 chr20 49815669 49815969 + 1.33333 NA intron (NR_048539, intron 2 of 13) intron (NR_048539, intron 2 of 13) 2991 NR_048539 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 210.666-63 chr21 29679435 29679668 + 1.33333 NA intron (NM_001320621, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 -68624 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 236.333-91 chr8 92152189 92152666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49042 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 379.666-6 chr13 83368119 83368579 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 514044 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 438-2 chr11 128079932 128080583 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -128509 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 243.333-67 chr22 20892086 20892448 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -25140 NM_005207 1399 Hs.5613 NM_005207 ENSG00000099942 CRKL - CRK like proto-oncogene, adaptor protein protein-coding 187.333-90 chr2 24003213 24003461 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_181713, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_181713, exon 7 of 7) -6748 NM_001346880 388931 Hs.407482 NM_001080473 ENSG00000205639 MFSD2B - major facilitator superfamily domain containing 2B protein-coding 325.666-17 chr8 93362342 93362666 + 1.33333 NA intron (NR_033858, intron 10 of 10) intron (NR_033858, intron 10 of 10) -195654 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 393.333-11 chr2 47351406 47351961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6609 NR_110208 101927043 Hs.515976 NR_110207 ENSG00000234690 EPCAM-DT - EPCAM divergent transcript ncRNA 284.333-47 chr9 108274411 108274936 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 581313 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 341.999 chr1 107386774 107387357 + 1.33333 NA intron (NM_001113226, intron 2 of 6) L1MB7|LINE|L1 238996 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 200.666-91 chr4 124200937 124201100 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 357416 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 196.666-51 chr2 179138028 179138270 + 1.33333 NA intron (NM_178123, intron 9 of 17) intron (NM_178123, intron 9 of 17) -88012 NM_173648 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 202-142 chr5 11836873 11837165 + 1.33333 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 67427 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 217-98 chr9 117224539 117224779 + 1.33333 NA intron (NM_014010, intron 2 of 21) intron (NM_014010, intron 2 of 21) -43458 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 224-14 chr10 111655616 111655827 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 528044 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 184-12 chr10 89300069 89300227 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -1898 NM_001547 3433 Hs.437609 NM_001547 ENSG00000119922 IFIT2 G10P2|GARG-39|IFI-54|IFI-54K|IFI54|IFIT-2|ISG-54 K|ISG-54K|ISG54|P54|cig42 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 2 protein-coding 216-28 chr14 46719468 46719683 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67794 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 313-36 chr5 169439025 169439418 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -138082 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 263-64 chr7 31186059 31186346 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 133741 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 320.333-29 chr8 123079885 123080303 + 1.33333 NA intron (NM_001363156, intron 2 of 19) MER34A1|LTR|ERV1 6845 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 254.333-30 chr17 64556455 64556848 + 1.33333 NA intron (NM_022739, intron 13 of 18) intron (NM_022739, intron 13 of 18) 49674 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 132.667-85 chr2 77628716 77628893 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106371 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 145-42 chr17 58087564 58087722 + 1.33333 NA intron (NM_080677, intron 2 of 2) intron (NM_080677, intron 2 of 2) 4224 NM_080677 140735 Hs.720595 NM_080677 ENSG00000264364 DYNLL2 DNCL1B|Dlc2|RSPH22 dynein light chain LC8-type 2 protein-coding 364.666-4 chr16 75778736 75779289 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -52522 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 256.666-26 chr3 32546649 32546891 + 1.33333 NA intron (NM_016141, intron 2 of 12) intron (NM_016141, intron 2 of 12) 24088 NM_016141 51143 Hs.529495 NM_016141 ENSG00000144635 DYNC1LI1 DLC-A|DNCLI1|LIC1 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 protein-coding 137.333-75 chr18 3454645 3454813 + 1.33333 NA intron (NM_173211, intron 1 of 2) intron (NM_173211, intron 1 of 2) 955 NM_173211 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 286.666-10 chr20 28930281 28930610 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -149945 NR_132316 102723316 NR_132316 FRG1DP - FSHD region gene 1 family member D, pseudogene pseudo 293.666-2 chr1 99716975 99717324 + 1.33333 NA intron (NM_001013660, intron 11 of 16) intron (NM_001013660, intron 11 of 16) -4196 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 210.667-112 chr6 44014202 44014469 + 1.33333 NA intron (NR_125864, intron 1 of 4) L1MEg|LINE|L1 -10685 NR_125865 101929705 Hs.670378 NR_125864 ENSG00000237686 LOC101929705 - uncharacterized LOC101929705 ncRNA 253-27 chr16 68601460 68601815 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43673 NM_001317195 1001 Hs.191842 NM_001793 ENSG00000062038 CDH3 CDHP|HJMD|PCAD cadherin 3 protein-coding 199.333-169 chr21 33098427 33098733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25120 NR_109961 101928107 Hs.382669 NR_109961 ENSG00000226527 LOC101928107 - uncharacterized LOC101928107 ncRNA 246.333-89 chr6 99489211 99489590 + 1.33333 NA intron (NR_144348, intron 5 of 12) L1MC4|LINE|L1 25976 NM_001346033 85015 Hs.143410 NM_032929 ENSG00000123552 USP45 - ubiquitin specific peptidase 45 protein-coding 321.333-11 chr11 24967227 24967556 + 1.33333 NA intron (NM_001009909, intron 7 of 11) L1M5|LINE|L1 470338 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 199.333-164 chr20 18575572 18575823 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 8277 NM_001348958 388789 Hs.349092 NM_001348957 ENSG00000232388 SMIM26 LINC00493 small integral membrane protein 26 protein-coding 174-49 chr2 36013896 36014071 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 341587 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 140.666 chr14 83487700 83487837 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 845136 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 188-24 chr10 102299292 102299459 + 1.33333 NA intron (NM_001199378, intron 3 of 39) L1MD2|LINE|L1 53843 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 400.666-8 chr8 124388948 124389509 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -16529 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 353.333-19 chr2 32172198 32172548 + 1.33333 NA intron (NM_001330478, intron 2 of 9) L2|LINE|L2 6509 NM_001330478 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 153.333-238 chr20 21966299 21966454 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87714 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 140-51 chr18 7593068 7593255 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 25845 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 305-21 chr5 126439242 126439857 + 1.33333 NA intron (NR_146196, intron 1 of 14) AluSz|SINE|Alu 16140 NM_001349541 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 261.667-27 chr18 2739332 2739753 + 1.33333 NA intron (NM_015295, intron 27 of 47) intron (NM_015295, intron 27 of 47) 83655 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 240.667-70 chr6 83258624 83259049 + 1.33333 NA intron (NM_002395, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR -64936 NM_001199917 5238 Hs.661665 NM_015599 ENSG00000013375 PGM3 AGM1|IMD23|PAGM|PGM 3 phosphoglucomutase 3 protein-coding 141.666-4 chr2 158657440 158657603 + 1.33333 NA TTS (NR_135242) TTS (NR_135242) 77481 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 272.333-3 chr10 13453094 13453422 + 1.33333 NA intron (NM_001370075, intron 5 of 8) intron (NM_001370075, intron 5 of 8) 49718 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 248.666-4 chr1 173766790 173767088 + 1.33333 NA intron (NM_014458, intron 8 of 11) L1MA8|LINE|L1 51958 NM_014458 27252 Hs.495035 NM_014458 ENSG00000076321 KLHL20 KHLHX|KLEIP|KLHLX kelch like family member 20 protein-coding 198-174 chr7 85259324 85259474 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -137468 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 302-60 chr6 156698370 156698764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -79288 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 189.333-41 chr12 31379246 31379454 + 1.33333 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -10049 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 297.333-20 chr14 67960959 67961355 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) AluJo|SINE|Alu 137565 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 229 chr1 42790826 42791042 + 1.33333 NA intron (NM_001354602, intron 2 of 5) intron (NM_001354602, intron 2 of 5) 5902 NM_001354602 100129924 Hs.720780 NM_001242750 ENSG00000274386 TMEM269 - transmembrane protein 269 protein-coding 274-34 chr3 103847119 103847450 + 1.33333 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -323168 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 183-14 chr10 73029655 73029904 + 1.33333 NA intron (NM_001017962, intron 10 of 14) intron (NM_001017962, intron 10 of 14) 67195 NM_001142595 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 238.666-18 chr14 43912666 43913051 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 594425 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 299.333-17 chr12 117108883 117109453 + 1.33333 NA intron (NR_120464, intron 2 of 2) L1MA4|LINE|L1 9701 NR_120464 101928244 Hs.742266 NR_120464 TESC-AS1 - TESC antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 164.666-4 chr1 112951047 112951199 + 1.33333 NA intron (NM_003051, intron 1 of 4).2 intron (NM_003051, intron 1 of 4).2 4940 NM_001166496 6566 Hs.75231 NM_003051 ENSG00000155380 SLC16A1 HHF7|MCT|MCT1|MCT1D solute carrier family 16 member 1 protein-coding 302.667-32 chr7 49084250 49084634 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 159895 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 225-23 chr14 26611687 26611996 + 1.33333 NA intron (NR_147061, intron 1 of 6) intron (NR_147061, intron 1 of 6) 13194 NR_147061 102725045 Hs.143441 NR_147061 LINC02588 C14orf22|NOVA1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2588 ncRNA 251.999 chr11 27245532 27245750 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -25528 NR_125767 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 158.333-272 chr6 52896493 52896667 + 1.33333 NA TTS (NM_000847) TTS (NM_000847) 13118 NM_000847 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 129.333-89 chr2 34995836 34995952 + 1.33333 NA Intergenic MER75B|DNA|PiggyBac 318337 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 150-105 chr4 105753481 105753698 + 1.33333 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) MER2|DNA|TcMar-Tigger 42776 NM_001031720 79807 Hs.161429 NM_024751 ENSG00000138780 GSTCD - glutathione S-transferase C-terminal domain containing protein-coding 161-18 chr12 65012508 65012714 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20320 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 138.333 chr1 23363205 23363471 + 1.33333 NA intron (NM_001370652, intron 2 of 2) AluSx4|SINE|Alu 5048 NM_030634 80818 Hs.293798 NM_030634 ENSG00000125945 ZNF436 ZNF|Zfp46 zinc finger protein 436 protein-coding 171.333-162 chr6 61658721 61658941 + 1.33333 NA intron (NR_146873, intron 10 of 11) intron (NR_146873, intron 10 of 11) 84701 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 194.667-22 chr10 58814294 58814555 + 1.33333 NA intron (NM_001080512, intron 18 of 20) L2b|LINE|L2 99409 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 208-165 chr8 65682601 65682846 + 1.33333 NA intron (NM_001145839, intron 3 of 6) intron (NM_001145839, intron 3 of 6) 12850 NM_001145838 9650 Hs.584788 NM_014637 ENSG00000066855 MTFR1 CHPPR|FAM54A2 mitochondrial fission regulator 1 protein-coding 290.666-2 chr1 102677423 102677776 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 430897 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 232.666-3 chr1 152911225 152911473 + 1.33333 NA exon (NM_005547, exon 2 of 2) exon (NM_005547, exon 2 of 2) 2804 NM_005547 3713 Hs.516439 NM_005547 ENSG00000163207 IVL - involucrin protein-coding 207.333-264 chr8 37887744 37887935 + 1.33333 NA intron (NM_001002814, intron 1 of 5) intron (NM_001002814, intron 1 of 5) 11658 NM_001002814 80223 Hs.191179 NM_025151 ENSG00000156675 RAB11FIP1 NOEL1A|RCP|rab11-FIP1 RAB11 family interacting protein 1 protein-coding 336.666-12 chr15 71204459 71204801 + 1.33333 NA intron (NM_024817, intron 2 of 16) MIR3|SINE|MIR -15571 NR_120350 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 278.333-36 chr5 90751999 90752230 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 53 of 89) MER58A|DNA|hAT-Charlie 193317 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 203.333-151 chr2 210567521 210567791 + 1.33333 NA intron (NR_161225, intron 2 of 38) intron (NR_161225, intron 2 of 38) 11057 NM_001875 1373 Hs.149252 NM_001875 ENSG00000021826 CPS1 CPSASE1|PHN carbamoyl-phosphate synthase 1 protein-coding 292-46 chr6 26490276 26490617 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -7937 NR_038992 285819 Hs.575357 NR_038992 LOC285819 - uncharacterized LOC285819 ncRNA 207-26 chr12 76700652 76700894 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -63301 NM_015336 23390 Hs.4014 NM_015336 ENSG00000186908 ZDHHC17 DHHC-17|HIP14|HIP3|HSPC294|HYPH zinc finger DHHC-type containing 17 protein-coding 164.666-15 chr7 30628816 30628964 + 1.33333 NA intron (NM_002047, intron 14 of 16) intron (NM_002047, intron 14 of 16) 34012 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 207-125 chr9 34958585 34958797 + 1.33333 NA intron (NM_015297, intron 1 of 7) intron (NM_015297, intron 1 of 7) 406 NM_001347983 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 208.667-103 chr4 141076655 141076956 + 1.33333 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) intron (NM_020724, intron 1 of 6) 56664 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 252-21 chr12 41057272 41057625 + 1.33333 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) intron (NM_001843, intron 23 of 23) -130872 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 278-40 chr4 64527001 64527453 + 1.33333 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -117767 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 144.333-113 chr19 45467990 45468179 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_006732) promoter-TSS (NM_006732) 88 NM_001114171 2354 Hs.590958 NM_006732 ENSG00000125740 FOSB AP-1|G0S3|GOS3|GOSB FosB proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 222.999-2 chr18 599323 599553 + 1.33333 NA intron (NM_014410, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 2440 NM_001289036 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 208-172 chr8 123502742 123502949 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001242463, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001242463, exon 7 of 7) 29298 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 255.333-64 chr20 52349213 52349539 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -157391 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 207.333-231 chr5 164227296 164227549 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 239980 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 204.666-112 chr8 138846125 138846358 + 1.33333 NA intron (NM_152888, intron 3 of 64) intron (NM_152888, intron 3 of 64) 67800 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 145.333-60 chr11 114471858 114472005 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32464 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 182-114 chr8 142627576 142627749 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10934 NR_134305 101928087 Hs.126101 NR_134305 ENSG00000277332 LOC101928087 - uncharacterized LOC101928087 ncRNA 184.333-67 chr19 28515369 28515629 + 1.33333 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) -91189 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 272.333-55 chr5 61658137 61658456 + 1.33333 NA intron (NR_126524, intron 2 of 3) intron (NR_126524, intron 2 of 3) 20515 NR_126525 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 207.333-200 chr4 77620628 77620794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 108958 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 217.666 chr1 23029923 23030142 + 1.33333 NA intron (NM_015013, intron 1 of 18) intron (NM_015013, intron 1 of 18) 10564 NM_015013 23028 Hs.591518 NM_015013 ENSG00000004487 KDM1A AOF2|BHC110|CPRF|KDM1|LSD1 lysine demethylase 1A protein-coding 207.333-214 chr5 25955145 25955302 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 764270 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 245.333-18 chr11 36540137 36540445 + 1.33333 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -27722 NM_000448 5896 Hs.73958 NM_000448 ENSG00000166349 RAG1 RAG-1|RNF74 recombination activating 1 protein-coding 216.333-13 chr1 187242561 187242758 + 1.33333 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) 149817 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 267.333-15 chr10 81109880 81110117 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 460201 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 234-21 chr14 19875541 19875813 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001005501) promoter-TSS (NM_001005501) -591 NM_001005501 390431 Hs.551345 NM_001005501 ENSG00000165762 OR4K2 OR14-15 olfactory receptor family 4 subfamily K member 2 protein-coding 221.999-12 chrX 72732842 72733018 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18624 NM_002637 5255 Hs.201379 NM_002637 ENSG00000067177 PHKA1 PHKA phosphorylase kinase regulatory subunit alpha 1 protein-coding 326-2 chr1 40923793 40924273 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -55663 NM_001905 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 192.666-17 chr12 87926232 87926419 + 1.33333 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 103076 NM_001363616 160419 Hs.112930 NM_152589 ENSG00000165805 C12orf50 - chromosome 12 open reading frame 50 protein-coding 205.666-9 chr1 232713766 232713920 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -4228 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 268.333-45 chr4 123399631 123399947 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_005841, exon 1 of 2) 5' UTR (NM_005841, exon 1 of 2) 249 NM_005841 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 221.667-72 chr6 125513783 125514080 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -160422 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 210.667-75 chr2 223670972 223671274 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68762 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 170.667-172 chr9 28652117 28652273 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 67110 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 206.333-5 chr1 112422276 112422521 + 1.33333 NA intron (NM_018704, intron 3 of 5) L1ME1|LINE|L1 26184 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 192-26 chr10 115825067 115825223 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) L1PA7|LINE|L1 369644 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 379.999-6 chr2 188339896 188340218 + 1.33333 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 42565 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 205.333-178 chr4 175829461 175829677 + 1.33333 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) intron (NR_048571, intron 1 of 5) -16455 NM_201591 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 296.666-7 chr11 123643065 123643356 + 1.33333 NA intron (NM_001040151, intron 3 of 6) intron (NM_001040151, intron 3 of 6) 11397 NM_018400 55800 Hs.4865 NM_018400 ENSG00000166257 SCN3B ATFB16|BRGDA7|HSA243396|SCNB3 sodium voltage-gated channel beta subunit 3 protein-coding 247.333-36 chr18 79130655 79130989 + 1.33333 NA intron (NR_148360, intron 5 of 31) L1MB5|LINE|L1 61428 NM_001306085 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 258.333-17 chr13 26253396 26253882 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001260) promoter-TSS (NM_001260) -490 NM_001318368 1024 Hs.382306 NM_001260 ENSG00000132964 CDK8 K35 cyclin dependent kinase 8 protein-coding 345.333-17 chr2 6676190 6676603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25877 NR_110497 102800314 Hs.258100 NR_110497 ENSG00000236172 MIR7515HG - MIR7515 host gene ncRNA 295.666-4 chr13 40294562 40294809 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74183 NR_033877 400123 Hs.577960 NR_033877 ENSG00000215483 LINC00548 - long intergenic non-protein coding RNA 548 ncRNA 240.333-13 chr10 67062823 67063075 + 1.33333 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) LTR33B|LTR|ERVL 50683 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 257.999 chr1 197434652 197434856 + 1.33333 NA exon (NM_001257965, exon 12 of 15) exon (NM_001257965, exon 12 of 15) 166502 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 221.333-142 chr8 107024534 107024830 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254438 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 230.666-29 chr2 123809465 123809689 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 215597 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 227.666-30 chr6 114751609 114751805 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -688830 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 256.666-32 chr4 59072032 59072270 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58578 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 288.333-11 chr15 67269934 67270414 + 1.33333 NA intron (NM_001031715, intron 3 of 20) L1MA4|LINE|L1 -14976 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 217.333-43 chr14 75501936 75502197 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20403 NM_006399 10538 Hs.509964 NM_006399 ENSG00000156127 BATF B-ATF|BATF1|SFA-2|SFA2 basic leucine zipper ATF-like transcription factor protein-coding 218.667-61 chr21 24104408 24104700 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 216823 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 199.333-37 chr11 4020318 4020497 + 1.33333 NA intron (NM_001277962, intron 2 of 12) L1MA6|LINE|L1 -74278 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 396.667-4 chr17 73319308 73319879 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7592 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 226.333-77 chr3 78764120 78764328 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) MIR3|SINE|MIR 255235 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 298-11 chr10 45492486 45492823 + 1.33333 NA intron (NM_001282866, intron 2 of 7) intron (NM_001282866, intron 2 of 7) -39533 NR_120674 102724323 Hs.559151 NR_120674 ENSG00000231964 LOC102724323 - uncharacterized LOC102724323 ncRNA 198-136 chr4 52385499 52385657 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 270961 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 190.667-28 chr12 26368347 26368597 + 1.33333 NA intron (NM_002223, intron 55 of 56) MIR|SINE|MIR 172899 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 199.333-35 chr10 113920053 113920286 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65508 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 244.666-53 chr9 10042880 10043163 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) MIR3|SINE|MIR 243629 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 157-86 chr3 60129994 60130268 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -49222 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 270.666-11 chr17 42832327 42832547 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_176863) promoter-TSS (NM_176863) -960 NM_005789 10197 Hs.152978 NM_005789 ENSG00000131467 PSME3 HEL-S-283|Ki|PA28-gamma|PA28G|PA28gamma|REG-GAMMA proteasome activator subunit 3 protein-coding 334-15 chr17 57984499 57984782 + 1.33333 NA intron (NM_007146, intron 1 of 5) intron (NM_007146, intron 1 of 5) 3614 NM_001330393 7716 Hs.463569 NM_007146 ENSG00000136451 VEZF1 DB1|ZNF161 vascular endothelial zinc finger 1 protein-coding 219-43 chr19 49827291 49827579 + 1.33333 NA intron (NM_030973, intron 3 of 17) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -4583 NR_106858 102465480 NR_106858 ENSG00000284114 MIR6800 hsa-mir-6800 microRNA 6800 ncRNA 356.333-5 chr10 58491938 58492428 + 1.33333 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -20689 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 419.999-2 chr6 105370855 105371298 + 1.33333 NA intron (NM_002726, intron 5 of 14) L1MC1|LINE|L1 32006 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 140.667-111 chr2 40817248 40817454 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -304916 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 473.333-3 chr2 55500247 55500789 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -19077 NM_001282761 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 337.333-5 chr10 68273368 68273816 + 1.33333 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -41479 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 143.333-191 chr3 123252913 123253042 + 1.33333 NA intron (NM_012430, intron 5 of 6) intron (NM_012430, intron 5 of 6) 51034 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 189.333-196 chr7 109610000 109610153 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 350137 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 272-34 chr3 169492165 169492548 + 1.33333 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) intron (NM_001366473, intron 1 of 15) 44489 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 214.333-70 chr19 30370041 30370263 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2232 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 308.666-4 chr11 96291542 96291896 + 1.33333 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -49719 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 179.333-163 chr6 68033306 68033570 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21913 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 211.333-238 chr8 82267000 82267323 + 1.33333 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -424875 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 345.333-16 chr19 45689825 45690167 + 1.33333 NA intron (NM_177542, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 1957 NM_001369752 6633 Hs.515472 NM_004597 ENSG00000125743 SNRPD2 SMD2|SNRPD1|Sm-D2 small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide protein-coding 354.333-7 chr18 7486801 7487095 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25942 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 318.666-2 chr10 82238094 82238631 + 1.33333 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -5442 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 215.333-4 chr1 50603318 50603504 + 1.33333 NA intron (NM_007051, intron 8 of 18) MIRb|SINE|MIR -179968 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 214.666-45 chr3 108853211 108853414 + 1.33333 NA intron (NM_001317747, intron 4 of 4) intron (NM_001317747, intron 4 of 4) 30526 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 236.666-34 chr3 36493588 36493788 + 1.33333 NA intron (NM_001292049, intron 4 of 8) intron (NM_001292049, intron 4 of 8) 113201 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 270.667-31 chr21 31028382 31028696 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 9937 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 329.333-13 chr14 73410371 73410912 + 1.33333 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 47939 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 162.667-51 chr11 124642962 124643172 + 1.33333 NA intron (NM_001199922, intron 9 of 11) MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 20203 NM_032811 84897 Hs.436410 NM_032811 ENSG00000154144 TBRG1 NIAM|TB-5 transforming growth factor beta regulator 1 protein-coding 201.333-183 chr3 64773646 64773919 + 1.33333 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -85782 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 140.333-203 chr6 99131659 99131818 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7129 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 249.666-4 chr1 75789847 75790145 + 1.33333 NA TTS (NR_002748) TTS (NR_002748) 519 NR_002748 26804 NR_002748 ENSG00000201487 SNORD45B RNU45B|U45b small nucleolar RNA, C/D box 45B snoRNA 216-48 chr18 7209399 7209698 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -21556 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 236.667-53 chr3 114769515 114769862 + 1.33333 NA intron (NM_001164343, intron 4 of 11) L1PB1|LINE|L1 -10581 NM_001164344 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 208.666-118 chrX 145907844 145908060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84874 NR_106783 102466721 NR_106783 ENSG00000252219 MIR892C hsa-mir-892c microRNA 892c ncRNA 162-70 chr2 164356423 164356642 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 211963 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 200.333-165 chr9 5520136 5520288 + 1.33333 NA intron (NM_025239, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 9681 NM_025239 80380 Hs.532279 NM_025239 ENSG00000197646 PDCD1LG2 B7DC|Btdc|CD273|PD-L2|PDCD1L2|PDL2|bA574F11.2 programmed cell death 1 ligand 2 protein-coding 389.666 chr10 61595951 61596285 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66811 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 398-15 chr5 140885286 140885770 + 1.33333 NA TTS (NM_031865) TTS (NM_031865) 3259 NM_031865 56136 Hs.199343 NM_018904 ENSG00000239389 PCDHA13 CNR5|CNRN5|CNRS5|CRNR5|PCDH-ALPHA13 protocadherin alpha 13 protein-coding 198-77 chr17 71834341 71834610 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 191504 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 211.333-67 chr14 102681096 102681358 + 1.33333 NA intron (NM_015156, intron 2 of 11) intron (NM_015156, intron 2 of 11) 88578 NM_015156 23186 Hs.510521 NM_015156 ENSG00000089902 RCOR1 COREST|RCOR REST corepressor 1 protein-coding 162.333-206 chr5 145441296 145441474 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 393957 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 381.333-8 chr17 60335427 60335987 + 1.33333 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) intron (NM_032582, intron 2 of 33) 56426 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 194-141 chr8 80938840 80938990 + 1.33333 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -64134 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 221-56 chr5 7178025 7178218 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 91233 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 202.333-59 chr14 69961794 69962067 + 1.33333 NA intron (NM_001034852, intron 3 of 11) L1MB7|LINE|L1 -16203 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 191.333-54 chr13 77278667 77278834 + 1.33333 NA intron (NM_015057, intron 4 of 82) intron (NM_015057, intron 4 of 82) 48344 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 170-15 chr10 120584852 120584998 + 1.33333 NA intron (NR_134516, intron 4 of 4) intron (NR_134516, intron 4 of 4) -13024 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 322-26 chr3 94512565 94513026 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -425468 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 201.333-146 chr2 52516013 52516335 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 145526 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 240-54 chr2 222810829 222811191 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50026 NM_004457 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 210.666-114 chrX 40764179 40764371 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -28733 NM_004229 9282 Hs.407604 NM_004229 ENSG00000180182 MED14 CRSP150|CRSP2|CSRP|CXorf4|DRIP150|EXLM1|RGR1|TRAP170 mediator complex subunit 14 protein-coding 175-72 chr5 119144845 119145022 + 1.33333 NA intron (NM_001290321, intron 15 of 43) intron (NM_001290321, intron 15 of 43) -9704 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 407.333-20 chr7 74181056 74181655 + 1.33333 NA intron (NM_031992, intron 1 of 5) intron (NM_031992, intron 1 of 5) 6999 NM_031992 7458 Hs.520943 NM_022170 ENSG00000106682 EIF4H WBSCR1|WSCR1|eIF-4H eukaryotic translation initiation factor 4H protein-coding 236.667-7 chr1 205006631 205006988 + 1.33333 NA intron (NM_001005388, intron 27 of 29) intron (NM_001005388, intron 27 of 29) -36140 NM_001346083 6900 Hs.519220 NM_005076 ENSG00000184144 CNTN2 AXT|FAME5|TAG-1|TAX|TAX1 contactin 2 protein-coding 207.333-146 chr2 196150548 196150832 + 1.33333 NA intron (NM_004226, intron 3 of 7) intron (NM_004226, intron 3 of 7) 20888 NM_004226 9262 Hs.88297 NM_004226 ENSG00000081320 STK17B DRAK2 serine/threonine kinase 17b protein-coding 211.333-92 chr18 5912507 5912709 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16654 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 147.333-300 chr7 70131276 70131426 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 3 of 18) AluJr4|SINE|Alu 532876 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 208.333-70 chr2 36756855 36757030 + 1.33333 NA intron (NM_001177969, intron 5 of 14) intron (NM_001177969, intron 5 of 14) 60235 NM_053276 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 213.333-156 chr5 10371424 10371715 + 1.33333 NA intron (NM_001270661, intron 1 of 22) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 17874 NM_001270660 10299 Hs.432862 NM_005885 ENSG00000145495 MARCH6 DOA10|MARCH-VI|RNF176|TEB4 membrane associated ring-CH-type finger 6 protein-coding 241.333-60 chr20 44819226 44819456 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -8795 NM_001205317 140730 Hs.517065 NM_182970 ENSG00000101098 RIMS4 C20orf190|RIM 4|RIM-4|RIM4|RIM4-gamma|RIM4gamma regulating synaptic membrane exocytosis 4 protein-coding 193.333-175 chr7 96828355 96828695 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -118634 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 411.999-2 chr11 58283924 58284275 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -15839 NM_207374 81341 Hs.531507 NM_207374 ENSG00000172772 OR10W1 OR10W1P|OR10W1Q|OR11-236|UNQ6469 olfactory receptor family 10 subfamily W member 1 protein-coding 344.666-11 chr17 14876638 14876953 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -138010 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 247.999-7 chr20 1376866 1377129 + 1.33333 NA non-coding (NR_040047, exon 3 of 3) non-coding (NR_040047, exon 3 of 3) 15964 NR_106929 102465524 NR_106929 ENSG00000284436 MIR6869 hsa-mir-6869 microRNA 6869 ncRNA 218-48 chr2 57894879 57895083 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12670 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 181.333-17 chr10 115434364 115434584 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 21 of 28) MIR|SINE|MIR 341109 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 221-72 chr9 111548163 111548356 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_133464, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_133464, exon 6 of 6) 23080 NM_001007169 158399 Hs.584864 NM_133464 ENSG00000173258 ZNF483 ZKSCAN16|ZSCAN48 zinc finger protein 483 protein-coding 144-17 chr10 83481866 83482019 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 195147 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 220-79 chr3 194042859 194043177 + 1.33333 NA intron (NR_136179, intron 1 of 2) intron (NR_136179, intron 1 of 2) 26511 NR_136181 285389 Hs.157102 NR_136179 ENSG00000230102 LINC02028 - long intergenic non-protein coding RNA 2028 ncRNA 280.333-35 chr5 149721751 149722201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8334 NM_133263 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 224-74 chr5 45992702 45993017 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -296479 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 202.667-9 chr1 110665378 110665630 + 1.33333 NA intron (NR_109845, intron 2 of 2) intron (NR_109845, intron 2 of 2) 6271 NR_109846 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 324.999-6 chr19 47836329 47836874 + 1.33333 NA intron (NM_000554, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 14664 NM_000554 1406 Hs.617342 NM_000554 ENSG00000105392 CRX CORD2|CRD|LCA7|OTX3 cone-rod homeobox protein-coding 231.333-62 chr2 171817887 171818070 + 1.33333 NA intron (NR_047549, intron 8 of 16) intron (NR_047549, intron 8 of 16) 76266 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 130-11 chr10 34468773 34468888 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 4 of 22) intron (NM_001184789, intron 4 of 22) 346466 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 252-82 chr5 106131740 106132170 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 879059 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 252-74 chr5 4916498 4916728 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -117746 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 302-62 chr6 169946560 169946863 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -15912 NR_027434 100131532 Hs.703417 NR_027434 LOC100131532 - uncharacterized LOC100131532 ncRNA 168.667-106 chr2 102692098 102692315 + 1.33333 NA intron (NM_003048, intron 5 of 11) Helitron2Na_Mam|RC?|Helitron? 44682 NR_136174 84804 Hs.590898 NM_032718 ENSG00000135953 MFSD9 - major facilitator superfamily domain containing 9 protein-coding 204.333-116 chr20 35490304 35490671 + 1.33333 NA intron (NM_007186, intron 20 of 34) MIRc|SINE|MIR 30504 NM_001318219 11190 Hs.443976 NM_007186 ENSG00000126001 CEP250 C-NAP1|CEP2|CNAP1|CRDHL2 centrosomal protein 250 protein-coding 177-24 chr14 59547480 59547629 + 1.33333 NA intron (NM_001164399, intron 8 of 19) L1MEd|LINE|L1 29258 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 186.333-138 chr6 41327140 41327411 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -8333 NM_004828 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 161-92 chr7 41644779 41644937 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -49061 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 255.666-8 chr13 40953853 40954253 + 1.33333 NA intron (NM_001370329, intron 4 of 9) intron (NM_001370329, intron 4 of 9) 28229 NM_001145353 1997 Hs.135646 NM_172373 ENSG00000120690 ELF1 EFTUD1|RIA1 E74 like ETS transcription factor 1 protein-coding 175.333-193 chr8 131912472 131912651 + 1.33333 NA intron (NM_001323555, intron 1 of 22) L1M5|LINE|L1 -4212 NM_001323556 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 350.666-7 chr13 96345822 96346261 + 1.33333 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) MER1B|DNA|hAT-Charlie -81188 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 232-25 chr14 31697766 31697953 + 1.33333 NA intron (NR_120408, intron 6 of 9) intron (NR_120408, intron 6 of 9) -16710 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 165.333-172 chr3 98740069 98740208 + 1.33333 NA intron (NM_001323366, intron 1 of 11) intron (NM_001323366, intron 1 of 11) 6682 NM_001323365 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 254.333-65 chr5 59655930 59656317 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 47580 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 270.666-6 chr13 99373679 99374011 + 1.33333 NA intron (NR_026644, intron 8 of 8) intron (NR_026644, intron 8 of 8) 17714 NR_030353 693208 NR_030353 ENSG00000207719 MIR623 MIRN623|hsa-mir-623 microRNA 623 ncRNA 223.999-8 chrX 128276295 128276474 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -223981 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 279.999-6 chr2 211328229 211328449 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 710768 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 192.666-39 chr21 26160971 26161131 + 1.33333 NA intron (NM_001136131, intron 1 of 15) intron (NM_001136131, intron 1 of 15) 9719 NM_001204303 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 155.333-248 chr3 190242339 190242501 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 80026 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 195.333-169 chr5 19320215 19320445 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 565942 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 195.667-117 chr6 64454108 64454374 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) L1M1|LINE|L1 647405 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 236.667-24 chr14 54866781 54867141 + 1.33333 NA intron (NM_001024071, intron 1 of 5) intron (NM_001024071, intron 1 of 5) 11232 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 218.667-110 chr8 114698254 114698545 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 969614 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 200-64 chr15 79471747 79471988 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_015206, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_015206, exon 4 of 4) 39351 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 186.666-7 chr1 217870275 217870509 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_138796, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_138796, exon 11 of 11) -22508 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 301.999-2 chr18 7959925 7960311 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 392802 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 280.333-32 chr5 64111905 64112274 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -53754 NM_001113561 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 202-89 chr2 121422915 121423132 + 1.33333 NA intron (NM_015282, intron 22 of 38) (ATATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -107857 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 224.667-52 chr21 24780252 24780512 + 1.33333 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -60168 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 167.333-142 chr2 144605070 144605271 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62797 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 205.666-8 chr1 213702390 213702651 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -222229 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 197.333-219 chr7 107278517 107278679 + 1.33333 NA intron (NM_181733, intron 14 of 20) L1PA7|LINE|L1 109595 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 183.666-20 chr6 18919385 18919549 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 261013 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 211.333-58 chr14 31877026 31877275 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67703 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 303.333-8 chr1 192760750 192761032 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44563 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 206-188 chr8 124641499 124641670 + 1.33333 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 86889 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 190-95 chr4 138831276 138831451 + 1.33333 NA intron (NR_133945, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 181283 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 326.333-15 chr2 215681811 215682208 + 1.33333 NA intron (NR_037195, intron 5 of 9) intron (NR_037195, intron 5 of 9) -36034 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 116.667-170 chr5 164198764 164198907 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 268567 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 200.667-24 chr10 98567843 98568112 + 1.33333 NA intron (NM_021828, intron 9 of 11) intron (NM_021828, intron 9 of 11) -121014 NM_001322476 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 277.999-2 chr10 133319611 133319867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7402 NR_046330 10844 Hs.523370 NM_006659 ENSG00000130640 TUBGCP2 ALP4|GCP-2|GCP2|Grip103|SPBC97|SPC97|Spc97p|h103p|hGCP2|hSpc97 tubulin gamma complex associated protein 2 protein-coding 329.333-17 chr19 42573247 42573629 + 1.33333 NA intron (NR_073180, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 21486 NM_001816 1088 Hs.41 NM_001816 ENSG00000124469 CEACAM8 CD66b|CD67|CGM6|NCA-95 carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 8 protein-coding 238-79 chr5 111144930 111145249 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 52917 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 342-41 chr9 30701281 30701656 + 1.33333 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -293014 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 214.333-45 chr14 52888908 52889176 + 1.33333 NA intron (NM_006832, intron 4 of 14) MIRc|SINE|MIR 62008 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 207.333-203 chr4 94377752 94377975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35027 NM_014485 27306 Hs.128433 NM_014485 ENSG00000163106 HPGDS GSTS|GSTS1|GSTS1-1|PGD2|PGDS hematopoietic prostaglandin D synthase protein-coding 288.333-33 chr5 164633447 164633955 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 163422 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 289.333-3 chr1 162114586 162114991 + 1.33333 NA intron (NM_014697, intron 1 of 9) intron (NM_014697, intron 1 of 9) -42319 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 212-149 chr7 146891930 146892188 + 1.33333 NA intron (NM_014141, intron 2 of 22) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 117788 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 195.333-90 chr15 61119992 61120154 + 1.33333 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 109229 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 262.333-36 chr17 62018027 62018321 + 1.33333 NA intron (NM_005121, intron 8 of 29) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 47104 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 174.333-47 chr17 65208382 65208567 + 1.33333 NA intron (NM_003835, intron 16 of 18) intron (NM_003835, intron 16 of 18) 71104 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 250-99 chrX 88734443 88734783 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12612 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 212.666-65 chr4 167452675 167452857 + 1.33333 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR -218176 NM_001204352 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 204-108 chr2 183593929 183594120 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 469581 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 373-10 chr21 20427037 20427368 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -168517 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 212.666-17 chr11 34380583 34380795 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22679 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 195-60 chr2 79298456 79298631 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -138790 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 193.666-7 chr10 89046873 89047114 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -16343 NR_039826 100616128 NR_039826 ENSG00000283664 MIR4679-1 - microRNA 4679-1 ncRNA 236-77 chr6 40708527 40708805 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -121302 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 219.666-25 chr2 85092543 85092750 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -25299 NR_146453 100996478 Hs.434398 NR_146453 ENSG00000260840 LINC01964 - long intergenic non-protein coding RNA 1964 ncRNA 362.333-14 chr6 54569526 54569914 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 261279 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 171-62 chr4 183451019 183451209 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 6478 NM_001317343 55602 Hs.592508 NM_017632 ENSG00000168564 CDKN2AIP CARF CDKN2A interacting protein protein-coding 135.333-201 chr8 129690580 129690778 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -10440 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 152-30 chr11 27583919 27584078 + 1.33333 NA intron (NR_033315, intron 2 of 6) L1M7|LINE|L1 50629 NR_102708 101410541 Hs.471439 NR_102708 ENSG00000254934 LINC00678 - long intergenic non-protein coding RNA 678 ncRNA 362.333-6 chr17 65051253 65051887 + 1.33333 NA intron (NM_006572, intron 2 of 3) AluSp|SINE|Alu 4204 NM_001282425 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 314-36 chr4 176645005 176645377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 147731 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 199.333-52 chr12 26997060 26997292 + 1.33333 NA intron (NM_016551, intron 3 of 11) MER58A|DNA|hAT-Charlie 17208 NM_016551 51768 Hs.438641 NM_016551 ENSG00000064115 TM7SF3 - transmembrane 7 superfamily member 3 protein-coding 136.667-5 chr1 78893662 78893860 + 1.33333 NA intron (NM_022159, intron 12 of 14) intron (NM_022159, intron 12 of 14) 112969 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 497.332 chr6 61420713 61421147 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -153200 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 209.666-40 chr4 49144537 49144805 + 1.33333 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 158029 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 211.333-232 chr8 70405472 70405640 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1339 NM_001321703 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 278.667-47 chr6 130307170 130307520 + 1.33333 NA intron (NM_001258275, intron 2 of 13) MER45A|DNA|hAT-Tip100 58523 NM_001258275 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 248.666-40 chr9 30256955 30257182 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 151386 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 246.666 chr1 20428619 20428880 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_033887) promoter-TSS (NR_033887) 45 NR_033887 339505 Hs.633269 NR_033887 LINC01141 - long intergenic non-protein coding RNA 1141 ncRNA 479.333-4 chr14 52470332 52470905 + 1.33333 NA exon (NM_020784, exon 15 of 21) exon (NM_020784, exon 15 of 21) 81887 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 213.333-201 chr7 115483931 115484181 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97385 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 252.666-33 chr5 41242303 41242600 + 1.33333 NA intron (NM_001115131, intron 1 of 17) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 19018 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 254.667-80 chr8 101276979 101277357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71104 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 183.333-175 chrX 33731276 33731457 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -391978 NM_000109 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 196-99 chr20 45608131 45608396 + 1.33333 NA intron (NM_147198, intron 4 of 4) intron (NM_147198, intron 4 of 4) -21476 NM_080753 140832 Hs.199380 NM_080753 ENSG00000180305 WFDC10A C20orf146|WAP10|dJ688G8.3 WAP four-disulfide core domain 10A protein-coding 404-16 chr6 69148348 69148790 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) L1M1|LINE|L1 513287 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 284.666-17 chr3 99170217 99170542 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -268684 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 208.333-33 chr13 96599327 96599595 + 1.33333 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L1PB3|LINE|L1 172232 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 243.666-23 chr3 21220541 21220894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -185009 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 114.667-92 chr15 62688743 62688923 + 1.33333 NA intron (NM_015059, intron 9 of 55) L1MDa|LINE|L1 41522 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 199-67 chr3 72452893 72453135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6391 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 143-31 chr12 32614510 32614668 + 1.33333 NA intron (NM_001370297, intron 8 of 14) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -64611 NM_012063 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 207.333-218 chr5 44324310 44324615 + 1.33333 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) intron (NM_004465, intron 1 of 2) -64270 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 375.333-19 chr4 30786830 30787289 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 66690 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 185.666-12 chr2 44542799 44543010 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 180957 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 255.333-97 chr7 53888398 53888836 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -76686 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 310-2 chr1 111155891 111156150 + 1.33333 NA intron (NM_001007794, intron 2 of 8) L1MA5|LINE|L1 15797 NR_138483 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 240.333 chr1 1808321 1808575 + 1.33333 NA intron (NM_001282538, intron 3 of 9) intron (NM_001282538, intron 3 of 9) -28417 NM_001353641 65220 Hs.654792 NM_023018 ENSG00000008130 NADK dJ283E3.1 NAD kinase protein-coding 180.667-133 chr7 7358346 7358604 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001037763, exon 35 of 35) 3' UTR (NM_001037763, exon 35 of 35) 103321 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 229.333-42 chr15 66905329 66905665 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 51018 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 319.999-2 chr22 36655175 36655696 + 1.33333 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 47423 NM_006078 10369 Hs.146766 NM_006078 ENSG00000166862 CACNG2 MRD10 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2 protein-coding 327.999-9 chr4 139553483 139554031 + 1.33333 NA intron (NR_131339, intron 1 of 3) intron (NR_131339, intron 1 of 3) 3012 NR_131339 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 202.666-46 chr15 87765877 87766033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 180313 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 297.333-57 chrX 96355977 96356274 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -18223 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 276.667-32 chr16 14032364 14032721 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -11465 NR_110915 101927348 Hs.569621 NR_110915 ENSG00000261856 LINC02186 - long intergenic non-protein coding RNA 2186 ncRNA 361.333-13 chr2 150698868 150699375 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70224 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 247.999-6 chr2 221487882 221488198 + 1.33333 NA intron (NM_001363748, intron 4 of 17) MER58A|DNA|hAT-Charlie 84264 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 206.667-113 chr5 60223298 60223633 + 1.33333 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) 149198 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 255.333-30 chr14 45198208 45198564 + 1.33333 NA intron (NM_001308133, intron 20 of 21) intron (NM_001308133, intron 20 of 21) 54816 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 192-101 chr4 44031811 44032074 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14880 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 221.333-87 chr22 35294181 35294617 + 1.33333 NA non-coding (NR_027780, exon 12 of 12) non-coding (NR_027780, exon 12 of 12) -4876 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 293.667-12 chr12 24665647 24666106 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -81708 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 204-202 chr8 141727441 141727650 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 58768 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 201.333-104 chr14 72259008 72259310 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MER102c|DNA|hAT-Charlie -257661 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 210.666-87 chr5 111333420 111333611 + 1.33333 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 109131 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 204-175 chr6 67284332 67284498 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -770936 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 208.333-104 chr4 52705127 52705339 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7161 NR_145130 57291 Hs.744077 NR_024031 ENSG00000226950 DANCR AGU2|ANCR|KIAA0114|SNHG13|lncRNA-ANCR differentiation antagonizing non-protein coding RNA ncRNA 207.333-22 chr1 215102174 215102385 + 1.33333 NA intron (NM_001017424, intron 2 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 19542 NM_001017425 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 240-14 chr11 109463740 109464035 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 41697 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 287.333-65 chr8 85570786 85571179 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 84694 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 368.666-15 chr5 43021544 43022090 + 1.33333 NA intron (NR_104651, intron 2 of 2) LTR8A|LTR|ERV1 -2174 NR_104650 648987 Hs.649468 NR_034085 ENSG00000177738 LOC648987 - uncharacterized LOC648987 ncRNA 208-14 chr1 202573107 202573285 + 1.33333 NA intron (NM_002481, intron 23 of 23) intron (NM_002481, intron 23 of 23) 33082 NM_001197131 4660 Hs.444403 NM_002481 ENSG00000077157 PPP1R12B MYPT2|PP1bp55 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B protein-coding 306.333-37 chr5 120936165 120936480 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -386228 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 146.667-43 chr10 92250453 92250615 + 1.33333 NA intron (NM_014912, intron 1 of 9) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -7255 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 276.667-53 chr4 114619976 114620342 + 1.33333 NA intron (NM_001322112, intron 2 of 6) intron (NM_001322112, intron 2 of 6) -2208 NM_003360 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 394-3 chr11 21435956 21436485 + 1.33333 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) AluSc|SINE|Alu -756865 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 138-18 chr10 84219888 84220027 + 1.33333 NA TTS (NM_001171971) TTS (NM_001171971) 5587 NM_001017924 340745 Hs.450425 NM_001017924 ENSG00000204033 LRIT2 LRRC22 leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 2 protein-coding 146.666-3 chr12 77699942 77700095 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -130876 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 326.666-14 chr8 126537758 126538217 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 20491 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 274.666-23 chr3 193078601 193078910 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -160899 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 219.333-81 chr18 9387012 9387179 + 1.33333 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) L1MEi|LINE|L1 52322 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 204.666-105 chr8 118508987 118509160 + 1.33333 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger -111928 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 182.333-96 chr20 32654344 32654543 + 1.33333 NA intron (NM_182584, intron 1 of 5) L1MB8|LINE|L1 19498 NM_182584 284805 Hs.353262 NM_182584 ENSG00000198547 C20orf203 - chromosome 20 open reading frame 203 protein-coding 244.666-25 chr2 108007789 108008049 + 1.33333 NA intron (NM_021815, intron 7 of 8) intron (NM_021815, intron 7 of 8) 21395 NM_001305005 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 237.999 chr1 45522196 45522468 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_002574) promoter-TSS (NM_002574) -394 NM_181696 5052 Hs.180909 NM_002574 ENSG00000117450 PRDX1 MSP23|NKEF-A|NKEFA|PAG|PAGA|PAGB|PRX1|PRXI|TDPX2 peroxiredoxin 1 protein-coding 188-76 chr3 192394710 192394864 + 1.33333 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 14262 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 187-91 chr9 9142376 9142624 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 10 of 45) intron (NM_002839, intron 10 of 45) 284482 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 177.667-29 chr11 83820412 83820637 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) intron (NM_001142699, intron 17 of 27) -138099 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 247.333-89 chr8 132364404 132364781 + 1.33333 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 82670 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 258.999-9 chr9 81308400 81308714 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 380978 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 210.333-19 chr10 115745272 115745466 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) L1ME1|LINE|L1 449420 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 207.666-71 chr9 88914427 88914641 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -76329 NM_001001938 286223 Hs.585118 NM_001001938 ENSG00000213694 C9orf47 C9orf108|bA791O21.3 chromosome 9 open reading frame 47 protein-coding 417.999-5 chr7 40680327 40680659 + 1.33333 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 299446 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 281.333-11 chr12 4756483 4756803 + 1.33333 NA intron (NM_017417, intron 6 of 10) intron (NM_017417, intron 6 of 10) 36243 NM_017417 26290 Hs.511985 NM_017417 ENSG00000130035 GALNT8 GALNAC-T8 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 8 protein-coding 203.333-223 chr5 157461535 157461827 + 1.33333 NA intron (NM_001099287, intron 1 of 5) intron (NM_001099287, intron 1 of 5) -1581 NR_136204 102724404 Hs.570889 NR_136204 LOC102724404 - uncharacterized LOC102724404 ncRNA 235.999-2 chr22 28116648 28116911 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -196167 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 395.333-6 chr11 39265743 39266197 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 617112 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 161.333-284 chr8 80774990 80775191 + 1.33333 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) L1MD1|LINE|L1 99378 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 211.333-183 chr5 75241281 75241475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4500 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 241.333-91 chr6 156997227 156997477 + 1.33333 NA intron (NM_020732, intron 5 of 19) intron (NM_020732, intron 5 of 19) -39075 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 282.333-42 chr4 89159999 89160287 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47326 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 281.333-69 chr8 101709507 101709788 + 1.33333 NA intron (NM_001040624, intron 6 of 7) intron (NM_001040624, intron 6 of 7) 81322 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 172.666-14 chr2 136586638 136586778 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -178837 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 220.666-17 chr12 111339669 111339887 + 1.33333 NA intron (NM_015267, intron 20 of 21) intron (NM_015267, intron 20 of 21) 29317 NM_001177997 144717 Hs.173088 NM_144671 ENSG00000198324 PHETA1 FAM109A|IPIP27A|SES1 PH domain containing endocytic trafficking adaptor 1 protein-coding 209.667-98 chr6 66192463 66192721 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 404713 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 237.333-83 chr4 104760382 104760781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -265687 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 200.333-53 chr17 48315138 48315348 + 1.33333 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) 20896 NR_131239 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 241.999-6 chr4 157078503 157078693 + 1.33333 NA intron (NM_000824, intron 2 of 9) intron (NM_000824, intron 2 of 9) 2195 NM_001166060 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 221.333-71 chr2 191125135 191125348 + 1.33333 NA intron (NM_003151, intron 3 of 23) intron (NM_003151, intron 3 of 23) 25753 NM_003151 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 241.333-99 chr8 27595797 27596130 + 1.33333 NA TTS (NR_045494) TTS (NR_045494) 14788 NR_106902 102465508 NR_106902 ENSG00000284280 MIR6843 hsa-mir-6843 microRNA 6843 ncRNA 325.666-7 chr17 52543350 52543676 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 152991 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 221.999-7 chr20 7508122 7508322 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 136614 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 142.333-183 chr4 78167871 78168069 + 1.33333 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) intron (NM_001166133, intron 2 of 41) 110400 NM_001166133 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 200.333-19 chr11 76568724 76569015 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 101069 NM_001370188 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 245.333-102 chr6 162238543 162238812 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 3 of 11) MIRb|SINE|MIR -488455 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 213-25 chr15 90038800 90039074 + 1.33333 NA intron (NM_198526, intron 1 of 4) intron (NM_198526, intron 1 of 4) 32182 NR_036135 100422841 NR_036135 ENSG00000265871 MIR3174 - microRNA 3174 ncRNA 207-121 chr8 118324469 118324743 + 1.33333 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 -212787 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 267.333-32 chr15 34069463 34069700 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -30377 NM_020371 57099 Hs.555966 NM_020371 ENSG00000169857 AVEN PDCD12 apoptosis and caspase activation inhibitor protein-coding 327.333-40 chr6 140660106 140660460 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23531 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 207.666-24 chr2 81736358 81736568 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -269517 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 168-70 chr3 114774205 114774459 + 1.33333 NA intron (NM_001164343, intron 4 of 11) intron (NM_001164343, intron 4 of 11) -15225 NM_001164344 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 195.666-20 chr2 59589479 59589627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 371845 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 222-39 chr18 46205340 46205533 + 1.33333 NA intron (NM_001008239, intron 1 of 3) intron (NM_001008239, intron 1 of 3) 31402 NM_145055 147339 Hs.116486 NM_145055 ENSG00000152242 C18orf25 ARKL1|Ark2N|RNF111L1 chromosome 18 open reading frame 25 protein-coding 202.999 chr2 66835196 66835354 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69161 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 161.666 chr1 95268078 95268368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34013 NM_015485 25950 Hs.483512 NM_015485 ENSG00000122481 RWDD3 RSUME RWD domain containing 3 protein-coding 262.333-21 chr13 53099549 53099939 + 1.33333 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL 52156 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 204-47 chr12 15055112 15055373 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53409 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 277.666-18 chr7 53756980 53757351 + 1.33333 NA intron (NR_038371, intron 4 of 5) LTR16E2|LTR|ERVL 54766 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 200.333-133 chr6 93972239 93972499 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 254066 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 206.333-29 chr11 106675005 106675238 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_000855, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_000855, exon 8 of 8) 343355 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 196.666-12 chr12 26527001 26527243 + 1.33333 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 306072 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 298.667-6 chr10 80968371 80968803 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 318790 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 181.333-174 chr8 101877800 101877968 + 1.33333 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) -86915 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 212.333-124 chr6 20966868 20967030 + 1.33333 NA intron (NM_017774, intron 10 of 15) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 432492 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 221.999-10 chr5 133772072 133772243 + 1.33333 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -141520 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 201.333-237 chr6 41022568 41022764 + 1.33333 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) intron (NR_110873, intron 1 of 5) 614 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 193.666-14 chr14 31632741 31632928 + 1.33333 NA intron (NM_001201573, intron 2 of 8) intron (NM_001201573, intron 2 of 8) 54918 NM_001201573 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 217.667-9 chr10 15702426 15702741 + 1.33333 NA intron (NM_001291494, intron 2 of 28) AluSq2|SINE|Alu 17339 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 194.666-25 chr16 30161919 30162130 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21386 NM_001193333 11151 Hs.415067 NM_007074 ENSG00000102879 CORO1A CLABP|CLIPINA|HCORO1|IMD8|TACO|p57 coronin 1A protein-coding 453 chr1 35861463 35861871 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8141 NM_001317123 26523 Hs.22867 NM_012199 ENSG00000092847 AGO1 EIF2C|EIF2C1|GERP95|Q99|hAgo1 argonaute RISC component 1 protein-coding 197.666-59 chr7 28869028 28869205 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 89214 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 221.667-59 chr4 66392824 66393212 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 116194 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 235-48 chr6 135449700 135449965 + 1.33333 NA intron (NM_017651, intron 10 of 27) MER3|DNA|hAT-Charlie 47908 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 200.666-122 chr8 127038148 127038321 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25080 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 194.666-51 chr4 74673575 74673790 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 120841 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 348.666-6 chr17 60970284 60970817 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) L1MEf|LINE|L1 292699 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 346.333-10 chr14 55865312 55865831 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -68897 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 300-68 chr8 103648316 103648701 + 1.33333 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1PA10|LINE|L1 -146598 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 174.333-5 chr1 158403950 158404134 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4576 NM_001004475 128360 Hs.553588 NM_001004475 ENSG00000186306 OR10T2 OR1-3 olfactory receptor family 10 subfamily T member 2 protein-coding 211.333-241 chr8 91054111 91054347 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -13370 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 170-112 chr7 88916289 88916520 + 1.33333 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -120667 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 183-3 chr1 58797218 58797361 + 1.33333 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) MER113|DNA|hAT-Charlie 12138 NR_108106 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 211.333-23 chr10 31301196 31301387 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -17126 NM_001323638 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 184-114 chr8 124269834 124270080 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22559 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 413.333-10 chr4 32881330 32881854 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 530554 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 187.333-208 chr9 4222854 4223105 + 1.33333 NA intron (NM_001042413, intron 2 of 10) intron (NM_001042413, intron 2 of 10) -70796 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 186.666-32 chr22 28714245 28714543 + 1.33333 NA intron (NM_001349956, intron 4 of 13) L1MB5|LINE|L1 27426 NM_001005735 11200 Hs.291363 NM_007194 ENSG00000183765 CHEK2 CDS1|CHK2|HuCds1|LFS2|PP1425|RAD53|hCds1 checkpoint kinase 2 protein-coding 323.999-2 chr12 24755292 24755578 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 146787 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 193.333-134 chr4 47189213 47189416 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 157747 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 265.666-4 chr11 34803815 34804123 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -112161 NM_001135024 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 280.666-2 chr1 194188066 194188335 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 883455 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 318.666-13 chr2 144461077 144461382 + 1.33333 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -58385 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 320.333 chr1 68698303 68698708 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -201423 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 311.333-34 chr3 28110407 28110783 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -131024 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 197-59 chr2 130329731 130329897 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12294 NM_001321119 84317 Hs.104203 NM_032357 ENSG00000136710 CCDC115 CDG2O|ccp1 coiled-coil domain containing 115 protein-coding 114.666-4 chr5 80450008 80450159 + 1.33333 NA intron (NR_146172, intron 11 of 20) intron (NR_146172, intron 11 of 20) -38017 NM_205548 167555 Hs.338182 NM_205548 ENSG00000152380 FAM151B UNQ9217 family with sequence similarity 151 member B protein-coding 322.667-5 chr11 59915473 59915904 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -27191 NR_130719 255649 Hs.722773 NR_130719 OOSP1 - oocyte secreted protein 1 pseudo 232-90 chr8 120961028 120961263 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -149099 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 387.333-15 chr6 164761392 164761953 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 60391 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 389.999 chr2 68133597 68133909 + 1.33333 NA TTS (NM_001256476) TTS (NM_001256476) 23774 NR_046234 116143 Hs.631877 NM_138458 ENSG00000243667 WDR92 - WD repeat domain 92 protein-coding 179-54 chr2 164835431 164835658 + 1.33333 NA intron (NM_001278458, intron 2 of 16) L1MB3|LINE|L1 -5205 NR_110574 101929633 Hs.570267 NR_110574 LOC101929633 - uncharacterized LOC101929633 ncRNA 369.333-11 chr18 25210578 25210964 + 1.33333 NA intron (NM_001308225, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 141395 NM_015461 25925 Hs.116935 NM_015461 ENSG00000198795 ZNF521 EHZF|Evi3 zinc finger protein 521 protein-coding 277.333-80 chr7 37142100 37142359 + 1.33333 NA intron (NM_001206480, intron 13 of 21) intron (NM_001206480, intron 13 of 21) 144433 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 396.999-2 chr17 28782623 28782966 + 1.33333 NA intron (NM_001288636, intron 3 of 5) FLAM_A|SINE|Alu 29677 NM_001288634 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 224.667-83 chr8 116941375 116941682 + 1.33333 NA intron (NM_001025357, intron 1 of 1) intron (NM_001025357, intron 1 of 1) 3321 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 277-12 chr14 59493591 59493965 + 1.33333 NA intron (NM_016475, intron 3 of 6) L1ME3F|LINE|L1 9261 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 188-41 chr17 52728968 52729150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133062 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 224.667-76 chr7 109112994 109113297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -228558 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 235.666-9 chr3 4290238 4290496 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12937 NM_001320677 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 273.333-6 chr10 24865869 24866217 + 1.33333 NA intron (NM_020200, intron 4 of 8) intron (NM_020200, intron 4 of 8) 86563 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 292-28 chr2 116482829 116483338 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 1139268 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 210.333-38 chr13 53715597 53715916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99663 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 199.667-71 chr2 50478325 50478640 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 15 of 22) intron (NM_001330093, intron 15 of 22) -130726 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 197.333-193 chr5 171041456 171041624 + 1.33333 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 179522 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 191.333-122 chr20 52460907 52461230 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -159770 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 118-41 chr14 73624771 73624885 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 7984 NM_001037162 641372 Hs.122038 NM_001037162 ENSG00000205669 ACOT6 C14orf42|c14_5530 acyl-CoA thioesterase 6 protein-coding 306.666-34 chr7 29805002 29805529 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1289 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 186.333-156 chr7 145892067 145892258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -882109 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 168.333-117 chr20 43637104 43637255 + 1.33333 NA exon (NM_001303459, exon 12 of 13) exon (NM_001303459, exon 12 of 13) -29840 NM_001278610 4605 Hs.179718 NM_002466 ENSG00000101057 MYBL2 B-MYB|BMYB MYB proto-oncogene like 2 protein-coding 264.666-11 chr11 100150560 100150939 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) intron (NM_001243270, intron 12 of 23) -536539 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 204-167 chr5 123604075 123604232 + 1.33333 NA intron (NM_001044723, intron 10 of 12) L2a|LINE|L2 58736 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 278-47 chr5 95699068 95699531 + 1.33333 NA intron (NM_001349303, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR -16289 NR_125328 83890 Hs.50499 NM_031952 ENSG00000145757 SPATA9 NYD-SP16 spermatogenesis associated 9 protein-coding 379.999-5 chr2 86755302 86755664 + 1.33333 NA intron (NM_022780, intron 4 of 8) intron (NM_022780, intron 4 of 8) -34361 NM_001198954 100526767 Hs.591582 NM_001198954 ENSG00000249884 RNF103-CHMP3 CGI149|CHMP3|NEDF|RNF103-VPS24|VPS24|hVps24 RNF103-CHMP3 readthrough protein-coding 262.666-19 chr4 128885476 128885767 + 1.33333 NA intron (NM_144643, intron 20 of 20) L1ME4b|LINE|L1 73777 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 212.333-85 chr20 40296529 40296817 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 292212 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 210.333-147 chr6 79898621 79898852 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48817 NM_022726 6785 Hs.101915 NM_022726 ENSG00000118402 ELOVL4 ADMD|CT118|ISQMR|SCA34|STGD2|STGD3 ELOVL fatty acid elongase 4 protein-coding 212-29 chr11 98532666 98532920 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -488156 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 208.667-99 chr4 48361042 48361325 + 1.33333 NA intron (NM_020846, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 19654 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 208.666-2 chr1 62516931 62517092 + 1.33333 NA intron (NM_001367561, intron 31 of 49) L2|LINE|L2 79962 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 260.999-4 chr7 28568297 28568570 + 1.33333 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) intron (NM_182899, intron 3 of 9) -117700 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 224-46 chr2 98423248 98423468 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -21229 NM_001351424 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 288.666-18 chr2 155384718 155385186 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 686257 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 195.333-127 chr2 202298689 202298873 + 1.33333 NA intron (NM_015934, intron 12 of 14) intron (NM_015934, intron 12 of 14) 5730 NR_003031 692058 NR_003031 ENSG00000238317 SNORD11 HBII-95 small nucleolar RNA, C/D box 11 snoRNA 124.333-123 chr3 144984115 144984337 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 1011145 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 318-48 chr7 5506696 5507163 + 1.33333 NA intron (NM_024963, intron 1 of 4) intron (NM_024963, intron 1 of 4) 6880 NM_001367780 80028 Hs.623974 NM_024963 ENSG00000155034 FBXL18 Fbl18 F-box and leucine rich repeat protein 18 protein-coding 273.333-66 chr6 37572679 37572949 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17392 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 247.666-27 chr5 55625588 55625866 + 1.33333 NA TTS (NM_173514) TTS (NM_173514) 67326 NM_001258286 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 158.666-22 chr5 44003532 44003689 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -385122 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-153 chr8 52398823 52398978 + 1.33333 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) L1MA9|LINE|L1 10856 NM_001352884 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 194-31 chr13 80800866 80801039 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -217439 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 215.999-5 chr20 13331266 13331487 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -91689 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 305.999 chr12 116295262 116295541 + 1.33333 NA Intergenic (ATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18215 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 218.333-74 chr2 173795524 173795724 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 168256 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 201.333-262 chr7 46239644 46239887 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -318493 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 307.999-7 chr8 91180862 91181314 + 1.33333 NA intron (NR_148895, intron 7 of 10) intron (NR_148895, intron 7 of 10) -24397 NR_039805 100616245 NR_039805 ENSG00000266194 MIR4661 - microRNA 4661 ncRNA 183.667-14 chr1 177161070 177161304 + 1.33333 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) intron (NM_207108, intron 1 of 21) 3525 NM_001364856 460 Hs.495897 NM_004319 ENSG00000152092 ASTN1 ASTN astrotactin 1 protein-coding 252.666-16 chr2 7579448 7579770 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 158348 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 308.667-6 chr10 56835636 56836000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 468741 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 269.667-8 chr10 106053005 106053354 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -86986 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 213.333-97 chr2 96623820 96624111 + 1.33333 NA intron (NR_047654, intron 3 of 20) intron (NR_047654, intron 3 of 20) 14026 NR_047658 55683 Hs.516341 NM_017991 ENSG00000114982 KANSL3 KIAA1310|NSL3|Rcd1 KAT8 regulatory NSL complex subunit 3 protein-coding 355.333-18 chr21 28540664 28540970 + 1.33333 NA TTS (NR_026553) TTS (NR_026553) 1499 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 271.333-35 chr2 204641576 204641834 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) intron (NM_205863, intron 1 of 21) 96230 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 153-47 chr14 69175164 69175327 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -16232 NR_034164 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 252.999 chr1 237869543 237869775 + 1.33333 NA intron (NR_027247, intron 3 of 11) L1M5|LINE|L1 7484 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 293.333-46 chr4 89935340 89935744 + 1.33333 NA exon (NM_007351, exon 6 of 8) exon (NM_007351, exon 6 of 8) 40688 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 238.999-3 chr3 31301378 31301632 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -139718 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 384.666-10 chr5 24461323 24461962 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 183336 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 200-150 chr7 10123320 10123572 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 489176 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 212.333-69 chr2 86453107 86453303 + 1.33333 NA intron (NM_018433, intron 4 of 25) intron (NM_018433, intron 4 of 25) 11744 NM_001146688 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 245.333-125 chr8 132980100 132980364 + 1.33333 NA intron (NM_003235, intron 34 of 47) MER21C|LTR|ERVL 66349 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 312.999 chr2 42959289 42959576 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 80111 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 256.333-85 chr8 134422785 134423004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -175177 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 191-15 chr12 121336520 121336744 + 1.33333 NA intron (NM_001137559, intron 6 of 16) AluSq|SINE|Alu 15779 NM_016237 51433 Hs.7101 NM_016237 ENSG00000089053 ANAPC5 APC5 anaphase promoting complex subunit 5 protein-coding 154.667-323 chr5 143211158 143211361 + 1.33333 NA intron (NR_146198, intron 21 of 22) MER53|DNA|hAT 18759 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 229.999-9 chr6 42387535 42387722 + 1.33333 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) intron (NM_001297573, intron 2 of 17) 64423 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 334.666-5 chr15 87815877 87816222 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 130219 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 233-59 chr8 28303260 28303509 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -13884 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 172.333-161 chr6 150318415 150318555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50527 NM_203395 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 242-3 chr1 86117166 86117507 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 3 of 59) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 39135 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 122.667-137 chr4 63820548 63820736 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 588808 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 284.667-57 chr8 126307110 126307489 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -18196 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 136-107 chr8 139119865 139120064 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205923 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 248-76 chr7 34386452 34386800 + 1.33333 NA intron (NR_033665, intron 3 of 3) MER57A-int|LTR|ERV1 -271592 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 445.333-2 chr1 212865211 212865821 + 1.33333 NA intron (NM_014053, intron 2 of 9) AluSz|SINE|Alu 7241 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 204.333-21 chr10 14305448 14305638 + 1.33333 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 25341 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 211.999-4 chr12 43284094 43284255 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128859 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 235.333-39 chr16 82690412 82690630 + 1.33333 NA intron (NM_001220488, intron 2 of 14) CR1_Mam|LINE|CR1 1590 NR_107025 102465863 NR_107025 ENSG00000277387 MIR8058 hsa-mir-8058 microRNA 8058 ncRNA 194-62 chr18 68302737 68302941 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 412269 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 198.333-137 chr4 29421741 29421936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 207546 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 190.666-54 chr8 119815485 119815692 + 1.33333 NA intron (NM_003184, intron 3 of 25) intron (NM_003184, intron 3 of 25) 17253 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 203.666-10 chr10 64767300 64767476 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -58140 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 139.667-212 chr9 91861564 91861768 + 1.33333 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) L1MB8|LINE|L1 88562 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 250.666-12 chr12 133009890 133010110 + 1.33333 NA intron (NM_001256279, intron 4 of 4) intron (NM_001256279, intron 4 of 4) 23633 NM_019591 7574 Hs.489608 NM_019591 ENSG00000198393 ZNF26 HEL-179|KOX20 zinc finger protein 26 protein-coding 215.333-86 chr2 40315977 40316180 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 114226 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 174-48 chr2 28305973 28306154 + 1.33333 NA intron (NM_001261840, intron 11 of 11) L1ME2|LINE|L1 4396 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 202.666-41 chr15 24075497 24075834 + 1.33333 NA intron (NR_126392, intron 4 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 94283 NR_152824 791115 Hs.560378 NR_026647 ENSG00000260551 PWRN2 NCRNA00199 Prader-Willi region non-protein coding RNA 2 ncRNA 209-70 chr20 53283022 53283264 + 1.33333 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 97860 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 285.333-65 chr7 30306289 30306666 + 1.33333 NA intron (NM_147128, intron 1 of 4) intron (NM_147128, intron 1 of 4) -16587 NR_037513 100500883 NR_037513 ENSG00000283237 MIR550B1 - microRNA 550b-1 ncRNA 204.667-120 chr5 61118826 61119115 + 1.33333 NA intron (NM_174889, intron 3 of 3) intron (NM_174889, intron 3 of 3) -43346 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 253.999-7 chr22 47268293 47268574 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -77138 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 203.333-176 chr3 101447167 101447372 + 1.33333 NA intron (NM_020654, intron 4 of 23) AluJo|SINE|Alu 65943 NM_020654 57337 Hs.529551 NM_020654 ENSG00000138468 SENP7 - SUMO specific peptidase 7 protein-coding 178.333-102 chr3 84968948 84969145 + 1.33333 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) 10057 NM_001167675 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 211.333-111 chr2 61350932 61351255 + 1.33333 NA intron (NM_014709, intron 10 of 79) AluJo|SINE|Alu 66284 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 249.666-25 chr20 60498324 60498579 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20340 NR_039758 100616362 NR_039758 ENSG00000266140 MIR4533 - microRNA 4533 ncRNA 159.667-283 chr6 71734699 71734956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -151876 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 243.333-93 chr5 167018787 167019007 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -54345 NM_001122679 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 200.667-38 chr13 57654432 57654724 + 1.33333 NA intron (NM_001040429, intron 1 of 3) intron (NM_001040429, intron 1 of 3) 22834 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 253-55 chr5 79961219 79961510 + 1.33333 NA intron (NR_131226, intron 2 of 2) intron (NR_131226, intron 2 of 2) 24785 NR_131226 105616916 Hs.590325 NR_131226 ENSG00000250888 LINC01455 MDONA|TCONS_00009433 long intergenic non-protein coding RNA 1455 ncRNA 348-25 chr8 140895912 140896400 + 1.33333 NA intron (NM_001352700, intron 1 of 34) L1MEg1|LINE|L1 104848 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 210.667-124 chr8 73784852 73785128 + 1.33333 NA intron (NM_001271015, intron 5 of 5) intron (NM_001271015, intron 5 of 5) -37282 NM_001164384 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 386.667-11 chr7 75792009 75792570 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -2543 NM_006072 10344 Hs.131342 NM_006072 ENSG00000006606 CCL26 IMAC|MIP-4a|MIP-4alpha|SCYA26|TSC-1 C-C motif chemokine ligand 26 protein-coding 215-28 chr18 33302865 33303074 + 1.33333 NA intron (NM_001308126, intron 11 of 23) L1MA5A|LINE|L1 137602 NM_001371121 337.333-35 chr5 81602303 81602780 + 1.33333 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) MLT1G-int|LTR|ERVL-MaLR 148712 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 209.333 chr1 17925612 17925840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -139931 NR_125946 101927876 Hs.522954 NR_125946 ENSG00000261781 LINC01654 - long intergenic non-protein coding RNA 1654 ncRNA 233.999-5 chr7 49598890 49599150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -174618 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 213-17 chr13 53390689 53390912 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -238900 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 190.666-23 chr18 55421145 55421310 + 1.33333 NA intron (NM_001348217, intron 4 of 18) intron (NM_001348217, intron 4 of 18) 1070 NM_001348212 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 205.333-97 chr17 60573063 60573344 + 1.33333 NA intron (NR_126009, intron 2 of 3) intron (NR_126009, intron 2 of 3) 8657 NR_126009 388406 Hs.368309 NR_126009 ENSG00000267772 LINC01999 - long intergenic non-protein coding RNA 1999 ncRNA 248.999-5 chr6 98937464 98937724 + 1.33333 NA intron (NM_001278716, intron 1 of 9) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 10352 NM_001278716 26235 Hs.536850 NM_012160 ENSG00000112234 FBXL4 FBL4|FBL5|MTDPS13 F-box and leucine rich repeat protein 4 protein-coding 177.666-6 chr14 72066796 72066992 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 133367 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 224 chr1 14318892 14319090 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 100982 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 184.666-25 chr4 120993120 120993343 + 1.33333 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -70365 NM_001300823 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 252.333-13 chr11 66032879 66033143 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -6532 NM_053054 117144 Hs.189105 NM_053054 ENSG00000175294 CATSPER1 CATSPER|SPGF7 cation channel sperm associated 1 protein-coding 227.666-32 chr7 6535921 6536138 + 1.33333 NA intron (NM_001145118, intron 2 of 21) intron (NM_001145118, intron 2 of 21) 15407 NM_001145118 392862 Hs.512174 NM_001145118 ENSG00000215045 GRID2IP DELPHILIN Grid2 interacting protein protein-coding 258.333-62 chr8 71802010 71802286 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -40975 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 160.666-11 chr22 27220442 27220594 + 1.33333 NA TTS (NM_001350812) TTS (NM_001350812) 4161 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 198-35 chr12 45157461 45157624 + 1.33333 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite 58464 NR_037144 51054 Hs.233495 NM_015899 ENSG00000134297 PLEKHA8P1 FAPP-2|FAPP2|PLEKHA8|PLEKHA9|hFAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 pseudogene 1 pseudo 148.666-6 chr2 219861084 219861240 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 43727 NR_146975 105373889 Hs.570066 NR_146975 ENSG00000228909 LINC01803 - long intergenic non-protein coding RNA 1803 ncRNA 298-23 chr13 57779157 57779504 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 147586 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 341.666-11 chr4 39301583 39302067 + 1.33333 NA intron (NM_001204747, intron 19 of 24) intron (NM_001204747, intron 19 of 24) 64537 NM_001204747 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 257.333-79 chr5 36798179 36798563 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 78323 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 420.666-11 chrX 54618007 54618398 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 87983 NM_001184819 54552 Hs.654677 NM_019067 ENSG00000130119 GNL3L GNL3B G protein nucleolar 3 like protein-coding 495.666 chr3 99439001 99439771 + 1.33333 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -199208 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 187.666-18 chr20 34211007 34211197 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -49263 NM_001672 434 Hs.659995 NM_001672 ENSG00000101440 ASIP AGSW|AGTI|AGTIL|ASP|SHEP9 agouti signaling protein protein-coding 194-127 chr6 162848392 162848672 + 1.33333 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) intron (NM_001080379, intron 2 of 4) 120562 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 212.666-95 chr8 116842640 116842818 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31695 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 201.333-202 chr3 179107701 179108032 + 1.33333 NA intron (NR_125401, intron 2 of 2) MER1A|DNA|hAT-Charlie -36057 NM_152240 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 195.333-165 chr4 187352360 187352515 + 1.33333 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) intron (NR_038931, intron 1 of 4) -18211 NR_149103 105377602 Hs.582096 NR_149103 ENSG00000250042 LINC02514 - long intergenic non-protein coding RNA 2514 ncRNA 226.666-29 chr4 157376741 157377003 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 156144 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 236.333-20 chr11 113983786 113984048 + 1.33333 NA intron (NR_046363, intron 5 of 7) L2b|LINE|L2 6417 NM_001161772 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 265-60 chr7 39234846 39235337 + 1.33333 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) intron (NM_001370959, intron 4 of 9) 94043 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 275-30 chr20 41158767 41159220 + 1.33333 NA intron (NM_182811, intron 1 of 31) intron (NM_182811, intron 1 of 31) -10030 NR_106931 102466912 NR_106931 ENSG00000276169 MIR6871 hsa-mir-6871 microRNA 6871 ncRNA 166.667-180 chr5 53325487 53325704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -155034 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 262.999 chr10 52306966 52307256 + 1.33333 NA intron (NR_038277, intron 3 of 5) intron (NR_038277, intron 3 of 5) 7017 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 158.666-15 chr14 75508393 75508558 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -13994 NM_006399 10538 Hs.509964 NM_006399 ENSG00000156127 BATF B-ATF|BATF1|SFA-2|SFA2 basic leucine zipper ATF-like transcription factor protein-coding 152-112 chr4 30306530 30306734 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -413737 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 200-178 chr9 97895010 97895250 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 27440 NM_001330725 51531 Hs.9196 NM_016481 ENSG00000136932 TRMO C9orf156|HSPC219|NAP1 tRNA methyltransferase O protein-coding 191.333-20 chr10 19705902 19706067 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 38 of 39) intron (NM_001142308, intron 38 of 39) 22566 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 239.333-12 chr10 42649011 42649255 + 1.33333 NA Intergenic HERV1_I-int|LTR|ERV1 -10296 NR_130949 7582 Hs.435774 NM_006955 ENSG00000196693 ZNF33B KOX2|KOX31|ZNF11B zinc finger protein 33B protein-coding 213-82 chr8 32017013 32017188 + 1.33333 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -8636 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 255-18 chr11 28537614 28537977 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -60247 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 221.333-88 chr22 49561808 49562034 + 1.33333 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) MER131|DNA?|DNA? -18455 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 208.667-78 chr20 34532846 34533134 + 1.33333 NA intron (NM_001281729, intron 3 of 4) intron (NM_001281729, intron 3 of 4) -13854 NM_181509 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 483-2 chr17 48356603 48357224 + 1.33333 NA intron (NM_001075099, intron 3 of 12) L1ME4b|LINE|L1 62566 NR_131239 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 273.333-24 chr17 52209629 52209919 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49757 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 399.666-2 chr12 25906393 25906852 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32543 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 196-117 chr3 82652776 82653050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 666771 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 162.667-169 chr22 38005674 38005892 + 1.33333 NA intron (NM_001301130, intron 5 of 5) MER5C1|DNA|hAT-Charlie 16989 NR_039759 100616146 NR_039759 ENSG00000284266 MIR4534 - microRNA 4534 ncRNA 285.333-46 chr3 175009807 175010192 + 1.33333 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) intron (NM_207015, intron 1 of 13) 105243 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 187-67 chr5 123360945 123361211 + 1.33333 NA intron (NM_153223, intron 19 of 20) intron (NM_153223, intron 19 of 20) 62514 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 190-111 chr6 125768676 125768855 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -12350 NM_001199620 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 292-54 chr8 8469875 8470156 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -83576 NR_163138 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 193.333-98 chr2 123125671 123125894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52301 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 203.333-7 chr1 90774215 90774435 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57023 NM_020063 343472 Hs.451956 NM_020063 ENSG00000143032 BARHL2 - BarH like homeobox 2 protein-coding 201-62 chr2 145680205 145680397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -906756 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 191.333 chr1 42087353 42087609 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -51547 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 180.333-20 chr11 110951707 110952029 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 145450 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 146.666-12 chr6 61708423 61708579 + 1.33333 NA intron (NR_146872, intron 7 of 9) intron (NR_146872, intron 7 of 9) 134371 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 342.667-2 chr1 194236624 194237153 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 932143 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 188-19 chr10 60852818 60853038 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 74450 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 289.666 chr1 116070049 116070389 + 1.33333 NA TTS (NM_018420) TTS (NM_018420) -41536 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 192-3 chr1 56512804 56513046 + 1.33333 NA intron (NM_003713, intron 4 of 5) intron (NM_003713, intron 4 of 5) 66638 NM_003713 8613 Hs.405156 NM_003713 ENSG00000162407 PLPP3 Dri42|LPP3|PAP2B|PPAP2B|VCIP phospholipid phosphatase 3 protein-coding 238-69 chr4 74387787 74388103 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001432, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001432, exon 5 of 5) 22800 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 213.333-221 chr8 140662893 140663123 + 1.33333 NA intron (NM_001352724, intron 33 of 33) L1MC4|LINE|L1 -27375 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 169.333-253 chr7 92705026 92705185 + 1.33333 NA intron (NM_001259, intron 4 of 7) L1ME3F|LINE|L1 -114715 NR_109929 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 308.333-18 chr2 41852952 41853296 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24431 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 217-46 chr2 122116658 122116843 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 361099 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 204.333-114 chr20 23459338 23459586 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6586 NM_080830 140880 Hs.128100 NM_080830 ENSG00000125831 CST11 CST8L|CTES2|SC13|dJ322G13.6 cystatin 11 protein-coding 204.667-133 chr6 108405707 108405970 + 1.33333 NA intron (NM_145315, intron 7 of 12) L1MB3|LINE|L1 110784 NM_145315 246269 Hs.259666 NM_145315 ENSG00000135537 AFG1L AFG1|LACE1|c222389 AFG1 like ATPase protein-coding 171.333-16 chr1 215651459 215651662 + 1.33333 NA intron (NM_206933, intron 64 of 71) intron (NM_206933, intron 64 of 71) 84256 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 191.666 chr1 60826653 60826813 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -1149 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 204.666-31 chr14 51969101 51969357 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_053064, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_053064, exon 4 of 4) -20317 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 270-46 chr4 114543136 114543519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55075 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 296.666-11 chr18 7888843 7889142 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 3 of 30) L1PA16|LINE|L1 321676 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 169.667-110 chr2 116640940 116641210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1173616 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 182-87 chr5 62637263 62637498 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58561 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 191.666-25 chr8 103212162 103212325 + 1.33333 NA intron (NM_001364874, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu -40103 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 177.666-30 chr7 54653609 54653786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 96727 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 212-54 chr14 73860551 73860858 + 1.33333 NA intron (NM_001371328, intron 3 of 8) intron (NM_001371328, intron 3 of 8) 8757 NM_001371328 346.999-2 chr18 35169727 35170163 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71089 NM_032347 84307 Hs.591061 NM_032347 ENSG00000186812 ZNF397 ZNF47|ZSCAN15 zinc finger protein 397 protein-coding 206.666-114 chr7 105935632 105935905 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -27496 NM_001301161 222256 Hs.150120 NM_152750 ENSG00000128536 CDHR3 CDH28 cadherin related family member 3 protein-coding 192-6 chr1 92741076 92741350 + 1.33333 NA intron (NM_001308248, intron 1 of 18) MIR|SINE|MIR 43895 NM_001350197 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 257.999-5 chr5 85680592 85680912 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -601692 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 156.666-17 chr9 80435531 80435666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 460575 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 272.666 chr1 88380297 88380658 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -303667 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 201-5 chr1 73387424 73387622 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 81353 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 198-121 chr3 67732478 67732752 + 1.33333 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) MIR3|SINE|MIR 77918 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 150.333-49 chr10 133352918 133353098 + 1.33333 NA TTS (NM_145202) TTS (NM_145202) 5011 NM_001098483 282969 Hs.155823 NM_198472 ENSG00000148803 FUOM C10orf125|FUCU|FucM fucose mutarotase protein-coding 122.667-132 chr3 191814809 191814991 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 353737 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 177.333-96 chr20 31781065 31781249 + 1.33333 NA intron (NM_012112, intron 10 of 17) AluJr|SINE|Alu -38218 NM_033118 85366 Hs.86092 NM_033118 ENSG00000101306 MYLK2 KMLC|MLCK|MLCK2|skMLCK myosin light chain kinase 2 protein-coding 281.333-59 chr7 31225419 31225660 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 115187 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 193.666-43 chr7 85406261 85406446 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14769 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 153.333-391 chr7 117172593 117172746 + 1.33333 NA intron (NR_161419, intron 9 of 15) intron (NR_161419, intron 9 of 15) -10012 NR_002332 93655 Hs.368131 NR_002332 ENSG00000004866 ST7-OT3 NCRNA00026|ST7|ST7OT3 ST7 overlapping transcript 3 ncRNA 314.333-30 chr8 107814783 107815079 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 267008 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 283.999-9 chr5 68321439 68321843 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 29064 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 201.333-194 chr3 117064707 117064898 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 143371 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 201.333-78 chr12 56744999 56745299 + 1.33333 NA intron (NM_000946, intron 5 of 12) AluJo|SINE|Alu 7174 NM_000946 5557 Hs.534339 NM_000946 ENSG00000198056 PRIM1 p49 DNA primase subunit 1 protein-coding 201.333-215 chr4 161543296 161543461 + 1.33333 NA intron (NM_001128428, intron 8 of 14) L1MB5|LINE|L1 -479355 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 272.333-65 chr8 136736580 136736933 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MER74A|LTR|ERVL 205958 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 125.666 chr4 71440935 71441078 + 1.33333 NA intron (NM_003759, intron 5 of 22) MIR|SINE|MIR 101953 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 361.333-22 chr4 148096888 148097445 + 1.33333 NA intron (NM_000901, intron 8 of 8) intron (NM_000901, intron 8 of 8) 314571 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 236.667-36 chr2 11282524 11282744 + 1.33333 NA intron (NM_001321643, intron 3 of 32) L1MC1|LINE|L1 62002 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 186.667-85 chr21 31511517 31511775 + 1.33333 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) intron (NM_003253, intron 1 of 28) 47441 NM_003253 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 340.666-14 chr3 196854461 196854945 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -13153 NM_001308045 205564 Hs.240770 NM_152699 ENSG00000119231 SENP5 - SUMO specific peptidase 5 protein-coding 203.333-22 chr10 8396519 8396736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -128322 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 186.666-42 chr6 42550844 42551013 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -13094 NM_015255 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 272-53 chr8 112753407 112753828 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 110124 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 220.666 chr1 44253511 44253789 + 1.33333 NA intron (NM_001301698, intron 6 of 7) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -1091 NR_132966 106635545 NR_132966 SNORA110 - small nucleolar RNA, H/ACA box 110 snoRNA 145.333-229 chr4 179654716 179654897 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 1504343 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 247.999-2 chr10 55704179 55704504 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -76399 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 202-6 chr1 110007245 110007492 + 1.33333 NA intron (NM_001242675, intron 1 of 16) intron (NM_001242675, intron 1 of 16) 3420 NM_001242676 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 268-4 chr1 196239737 196240228 + 1.33333 NA intron (NM_001287820, intron 25 of 26) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -151267 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 221.666-38 chr4 30809236 30809419 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 88958 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 404-9 chr2 72929535 72930008 + 1.33333 NA intron (NM_004097, intron 2 of 2) intron (NM_004097, intron 2 of 2) 12252 NM_004097 2016 Hs.516090 NM_004097 ENSG00000135638 EMX1 - empty spiracles homeobox 1 protein-coding 515.333-2 chr14 56918706 56919483 + 1.33333 NA intron (NR_029385, intron 3 of 3) intron (NR_029385, intron 3 of 3) 105936 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 169-80 chr5 18621578 18621808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 814419 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 207.333-163 chr20 48189800 48190060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -169981 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 394.666-7 chr20 44903788 44904293 + 1.33333 NA exon (NM_139323, exon 3 of 6) exon (NM_139323, exon 3 of 6) -6020 NR_134983 80336 Hs.641481 NM_001124756 ENSG00000101104 PABPC1L C20orf119|EPAB|PABPC1L1|dJ1069P2.3 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 like protein-coding 238.999-6 chr3 193237128 193237379 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3969 NM_001366112 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 198-140 chr4 101337427 101337587 + 1.33333 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) Plat_L3|LINE|CR1 -7093 NR_031656 100302193 NR_031656 ENSG00000221265 MIR1255A MIRN1255A|hsa-mir-1255a microRNA 1255a ncRNA 162-116 chr7 134705889 134706051 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59117 NM_001724 669 Hs.198365 NM_001724 ENSG00000172331 BPGM DPGM|ECYT8 bisphosphoglycerate mutase protein-coding 204.333-6 chr1 64145081 64145300 + 1.33333 NA intron (NM_005012, intron 7 of 8) intron (NM_005012, intron 7 of 8) -31399 NR_110665 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 223-46 chr4 63712965 63713228 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 696354 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 230.666-7 chr10 88997036 88997249 + 1.33333 NA intron (NR_135314, intron 1 of 8) intron (NR_135314, intron 1 of 8) -4167 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 178.667-17 chr10 14017846 14018063 + 1.33333 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) -9404 NM_001318336 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 202-44 chr14 46827230 46827448 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -175558 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 182.333-33 chr12 93122932 93123094 + 1.33333 NA intron (NR_040096, intron 3 of 4) intron (NR_040096, intron 3 of 4) -51353 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 142-125 chr6 42989026 42989211 + 1.33333 NA intron (NM_180977, intron 1 of 13) MER20B|DNA|hAT-Charlie 4548 NM_180976 5528 Hs.533308 NM_006245 ENSG00000112640 PPP2R5D B56D|B56delta|MRD35 protein phosphatase 2 regulatory subunit B'delta protein-coding 282-29 chr2 134686692 134687097 + 1.33333 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) LTR40a|LTR|ERVL 32106 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 205.333-168 chr4 48087577 48087793 + 1.33333 NA intron (NM_003328, intron 9 of 14) AluSx|SINE|Alu 46565 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 330.333-11 chr3 51476268 51476557 + 1.33333 NA intron (NR_146065, intron 2 of 25) intron (NR_146065, intron 2 of 25) 23590 NM_001171904 9730 Hs.716623 NM_014703 ENSG00000145041 DCAF1 RIP|VPRBP DDB1 and CUL4 associated factor 1 protein-coding 299-22 chr2 40740791 40741124 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -228522 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 214.667-78 chr22 26998150 26998413 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 62237 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 245.333-82 chr3 185439816 185440116 + 1.33333 NA intron (NM_004721, intron 3 of 13) intron (NM_004721, intron 3 of 13) 59069 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 276.666-20 chr2 123266676 123266988 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -193351 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 257.333-76 chr5 19689138 19689465 + 1.33333 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) L1MA4A|LINE|L1 196971 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 268.333-61 chrX 88983879 88984230 + 1.33333 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 236829 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 239-41 chr22 27449251 27449623 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 138786 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 157-70 chr2 148502169 148502304 + 1.33333 NA intron (NM_018328, intron 12 of 14) intron (NM_018328, intron 12 of 14) -142515 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 312.667-28 chr4 40464610 40465053 + 1.33333 NA intron (NM_001098634, intron 3 of 6) AluYc|SINE|Alu 37288 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 204.667-149 chr8 89844516 89844819 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -57201 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 282-35 chr3 15724676 15725024 + 1.33333 NA intron (NM_001349280, intron 5 of 26) AluJb|SINE|Alu -27479 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 206.333-51 chr14 29189514 29189774 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -403857 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 358.666-8 chr4 9975188 9975622 + 1.33333 NA intron (NM_001001290, intron 6 of 12) L1PA16|LINE|L1 46092 NM_020041 56606 Hs.444612 NM_020041 ENSG00000109667 SLC2A9 GLUT9|GLUTX|UAQTL2|URATv1 solute carrier family 2 member 9 protein-coding 201-25 chr11 74481423 74481635 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -11856 NM_001319240 100287896 Hs.591971 NM_198519 LOC100287896 - uncharacterized LOC100287896 protein-coding 214-11 chr1 239858827 239859029 + 1.33333 NA intron (NM_001347716, intron 7 of 7) L1MB5|LINE|L1 40944 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 433.333-9 chr4 70115403 70115767 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18019 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 378.999-2 chr1 231828306 231828655 + 1.33333 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) intron (NM_001164541, intron 9 of 9) -9963 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 286.666-20 chr8 78610266 78610544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51902 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 215.333-81 chr19 5502182 5502375 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 46861 NM_181710 148066 Hs.126496 NM_181710 ENSG00000105428 ZNRF4 RNF204|SPERIZIN|Ssrzf1|spzn zinc and ring finger 4 protein-coding 274.666-28 chr7 40694877 40695142 + 1.33333 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) intron (NM_024728, intron 13 of 14) 284930 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 205.333-148 chr21 33577346 33577503 + 1.33333 NA TTS (NM_017613) TTS (NM_017613) 11260 NM_017613 29980 Hs.436341 NM_017613 ENSG00000159147 DONSON B17|C21orf60|MIMIS|MISSLA downstream neighbor of SON protein-coding 150-69 chr2 41354571 41354719 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -522910 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 229-12 chr11 28833347 28833682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -355966 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 224-33 chr17 61857606 61857851 + 1.33333 NA intron (NM_032043, intron 3 of 19) AluSz|SINE|Alu 5831 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 181.667-72 chr2 132482417 132482593 + 1.33333 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 48794 NR_162099 113218485 NR_162099 MIR9986 - microRNA 9986 ncRNA 232-67 chr5 32737358 32737626 + 1.33333 NA intron (NM_001363652, intron 2 of 7) intron (NM_001363652, intron 2 of 7) 26171 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 206.666-119 chr8 131275483 131275663 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -234664 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 305.666-21 chr9 34251286 34251569 + 1.33333 NA TTS (NM_194313) TTS (NM_194313) 72384 NM_016525 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 204.333-9 chr1 98487081 98487308 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -174527 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 212.666-10 chr10 57424920 57425110 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -120456 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 237-29 chr14 61503660 61503875 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 66427 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 138-29 chr12 70004945 70005119 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 179805 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 199.666-15 chr14 71562092 71562252 + 1.33333 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -24126 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 265-45 chr20 58751930 58752243 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21339 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 296.333-40 chr8 58645937 58646319 + 1.33333 NA intron (NM_003580, intron 1 of 30) intron (NM_003580, intron 1 of 30) 13279 NM_001144772 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 237.333-53 chr2 40398161 40398533 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 31957 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 355.333-9 chr15 67176111 67176484 + 1.33333 NA intron (NM_001145103, intron 5 of 8) intron (NM_001145103, intron 5 of 8) 10142 NM_001145104 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 233.666-23 chr5 37629813 37630093 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) L1MA5A|LINE|L1 204869 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 324-10 chr19 14790474 14791030 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 9384 NM_198944 26664 Hs.466053 NM_198944 ENSG00000127530 OR7C1 CIT-HSP-146E8|HSTPCR86P|OR19-5|OR7C4|TPCR86 olfactory receptor family 7 subfamily C member 1 protein-coding 207.333-151 chr2 214693582 214693846 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 115969 NM_001282545 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 162-109 chr7 11646807 11647037 + 1.33333 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) LTR16E2|LTR|ERVL 185276 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 606 chr17 68536826 68537745 + 1.33333 NA non-coding (NR_027751, exon 11 of 11) non-coding (NR_027751, exon 11 of 11) 21142 NR_027751 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 156.666-11 chr3 171059601 171059770 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001161562, exon 31 of 31) 3' UTR (NM_001161562, exon 31 of 31) -32965 NM_000340 6514 Hs.167584 NM_000340 ENSG00000163581 SLC2A2 GLUT2 solute carrier family 2 member 2 protein-coding 196-175 chr8 24742913 24743103 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -170753 NM_005382 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 284.666-11 chr17 51936272 51936555 + 1.33333 NA intron (NM_001082533, intron 3 of 9) L2a|LINE|L2 222301 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 255.333-75 chr4 40806040 40806386 + 1.33333 NA intron (NM_001330648, intron 10 of 10) AluSq2|SINE|Alu 50942 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 195-25 chr11 68665615 68665765 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18854 NM_015973 51083 Hs.278959 NM_015973 ENSG00000069482 GAL ETL8|GAL-GMAP|GALN|GLNN|GMAP galanin and GMAP prepropeptide protein-coding 214.999-13 chr9 133447777 133447939 + 1.33333 NA intron (NM_139027, intron 21 of 28).2 AluSx|SINE|Alu -12107 NM_001242369 11094 Hs.62003 NM_017586 ENSG00000160325 CACFD1 C9orf7|D9S2135|FLOWER calcium channel flower domain containing 1 protein-coding 230.667-43 chr2 187265201 187265516 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 182894 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 155.333-241 chr3 158309694 158309908 + 1.33333 NA intron (NM_001271838, intron 5 of 9) intron (NM_001271838, intron 5 of 9) 199712 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 164.667-55 chr12 61691183 61691382 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 501557 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 174.333-74 chr20 40552708 40552937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 136414 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 189.333-166 chr5 170890676 170890869 + 1.33333 NA intron (NM_022897, intron 3 of 27) intron (NM_022897, intron 3 of 27) 28754 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 183.667-87 chr20 55874571 55874810 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 130829 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 187-56 chr4 32802735 32802948 + 1.33333 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 451803 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 331.666-11 chr20 4283042 4283319 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -33893 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 342-17 chr17 71344210 71344709 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -142280 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 260.666-32 chr7 45977712 45978051 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56609 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 214.333-156 chr8 123324450 123324740 + 1.33333 NA intron (NM_014109, intron 26 of 27) intron (NM_014109, intron 26 of 27) -23439 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 214-110 chr5 133571760 133571996 + 1.33333 NA intron (NM_015082, intron 2 of 15) L1ME3A|LINE|L1 40663 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 190-90 chr4 58782105 58782313 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -202073 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 327.999 chr1 110273273 110273541 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63093 NM_004978 3749 Hs.153521 NM_004978 ENSG00000116396 KCNC4 C1orf30|HKSHIIIC|KSHIIIC|KV3.4 potassium voltage-gated channel subfamily C member 4 protein-coding 207-44 chr15 60635091 60635377 + 1.33333 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -7704 NM_134260 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 242.333-86 chr5 123045704 123046003 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -9128 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 176.667-152 chr8 139438362 139438564 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 264660 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 216.666-72 chr9 72895978 72896197 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21978 NR_121120 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 283.333-16 chr14 53755254 53755586 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193064 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 253.333-118 chr9 73334979 73335463 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 183356 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 242.333-25 chr12 131088643 131088916 + 1.33333 NA intron (NM_198827, intron 15 of 24) intron (NM_198827, intron 15 of 24) -76232 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 219.333-86 chr19 35369640 35369945 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -1303 NM_001348195 2866 NM_005305 ENSG00000126251 GPR42 FFAR1L|FFAR3L|GPR41L|GPR42P G protein-coupled receptor 42 (gene/pseudogene) protein-coding 219.333-185 chr8 109317190 109317408 + 1.33333 NA intron (NM_032869, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu 12634 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 186.666-33 chr22 36173602 36173750 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7499 NM_145642 80833 Hs.474737 NM_014349 ENSG00000128284 APOL3 APOLIII|CG121|CG12_1|apoL-III apolipoprotein L3 protein-coding 227.333-113 chr7 32130056 32130395 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -58789 NM_001322057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 360.666-10 chr19 43312912 43313299 + 1.33333 NA Intergenic HERVIP10F-int|LTR|ERV1 -35951 NR_026881 23574 Hs.721578 NR_026881 PRG1 - p53-responsive gene 1 ncRNA 239-38 chr2 226249701 226250025 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 107069 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 211-30 chr14 19887588 19887778 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 11415 NM_001005501 390431 Hs.551345 NM_001005501 ENSG00000165762 OR4K2 OR14-15 olfactory receptor family 4 subfamily K member 2 protein-coding 289.666-3 chr14 27909535 27909905 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -236499 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 482.666 chr14 68489245 68489748 + 1.33333 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 139291 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 431.333-9 chr4 135367294 135367674 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -243925 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 339-7 chr14 73354180 73354471 + 1.33333 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) AluSz|SINE|Alu 104255 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 231.333-69 chr3 2270623 2270985 + 1.33333 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) intron (NM_001206955, intron 1 of 23) 31975 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 225.333-116 chr6 47998922 47999113 + 1.33333 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) intron (NM_207499, intron 2 of 2) 69672 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 187.666-6 chr12 122816596 122816781 + 1.33333 NA intron (NR_027918, intron 11 of 12) AluJb|SINE|Alu -18060 NM_001303099 9026 Hs.524815 NM_003959 ENSG00000130787 HIP1R HIP12|HIP3|ILWEQ huntingtin interacting protein 1 related protein-coding 156-18 chr10 52176307 52176492 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) L1MA5A|LINE|L1 137729 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 211.333-110 chr2 58935589 58935941 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 6 of 13) intron (NR_033873, intron 6 of 13) -281943 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 207.333-188 chr3 149034404 149034590 + 1.33333 NA intron (NM_001318935, intron 24 of 25) L1MB3|LINE|L1 43089 NM_001184721 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 206.333-91 chr2 157146404 157146663 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111172 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 193.667-49 chr16 61926964 61927179 + 1.33333 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 109367 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 310.667-13 chr16 9491093 9491508 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35795 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 142-79 chr3 3570420 3570605 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -228919 NM_001324189 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 207.333-107 chr16 6948132 6948306 + 1.33333 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) FLAM_C|SINE|Alu 174410 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 263.333-78 chr7 106410197 106410513 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125372 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 242.666 chr1 8709308 8709711 + 1.33333 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) intron (NM_001042681, intron 1 of 22) 108131 NM_012102 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 216.667-41 chr17 4622919 4623257 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 12639 NR_145431 400568 Hs.434312 NR_145431 ENSG00000261863 LINC01996 - long intergenic non-protein coding RNA 1996 ncRNA 259.666-11 chr12 18662492 18662802 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 74862 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 244-21 chr11 29775814 29776053 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 157131 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 161-79 chr5 60006692 60007044 + 1.33333 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) intron (NM_001349243, intron 2 of 16) -113142 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 377-10 chr20 48655468 48656100 + 1.33333 NA intron (NM_020820, intron 18 of 39) intron (NM_020820, intron 18 of 39) 172215 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 151.667-115 chr14 75343020 75343268 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48740 NR_038421 731223 Hs.534624 NR_038421 LINC01220 - long intergenic non-protein coding RNA 1220 ncRNA 150.333-255 chr22 38562130 38562364 + 1.33333 NA intron (NM_001363017, intron 5 of 11) intron (NM_001363017, intron 5 of 11) 6162 NM_001278208 11144 Hs.339396 NM_007068 ENSG00000100206 DMC1 DMC1H|LIM15|dJ199H16.1 DNA meiotic recombinase 1 protein-coding 282.333-56 chr7 112891169 112891635 + 1.33333 NA intron (NM_152556, intron 3 of 4) intron (NM_152556, intron 3 of 4) 48473 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 220.666-78 chr9 32884249 32884477 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100823 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 153.333-40 chr10 13802072 13802232 + 1.33333 NA intron (NM_001318336, intron 3 of 23) intron (NM_001318336, intron 3 of 23) -94585 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 258.333-70 chr8 127532968 127533301 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -50995 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 201.333-214 chr4 157980881 157981111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -189756 NR_147408 285505 NR_147407 ENSG00000248429 FAM198B-AS1 - FAM198B antisense RNA 1 ncRNA 157 chr1 7752593 7752742 + 1.33333 NA intron (NM_001349624, intron 11 of 11) intron (NM_001349624, intron 11 of 11) -18629 NM_004781 9341 Hs.66708 NM_004781 ENSG00000049245 VAMP3 CEB vesicle associated membrane protein 3 protein-coding 215.666-41 chr8 53030499 53030745 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90714 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 281.333-28 chr18 37068747 37069063 + 1.33333 NA intron (NM_001353919, intron 6 of 8) FLAM_C|SINE|Alu -145091 NR_134585 105372069 Hs.666765 NR_134585 ENSG00000267039 LOC105372069 - uncharacterized LOC105372069 ncRNA 245-71 chr8 27898884 27899216 + 1.33333 NA intron (NM_173833, intron 7 of 8) MER21C|LTR|ERVL -12934 NR_036249 100422828 NR_036249 ENSG00000265847 MIR4287 - microRNA 4287 ncRNA 297-35 chr4 38692263 38692788 + 1.33333 NA intron (NM_016531, intron 4 of 5) intron (NM_016531, intron 4 of 5) -27897 NR_026804 79667 Hs.29725 NM_024614 ENSG00000231160 KLF3-AS1 - KLF3 antisense RNA 1 ncRNA 211.666-47 chr7 42609634 42609833 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 96714 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 163-34 chr17 50235076 50235253 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 20470 NR_110806 101927230 Hs.514326 NR_110806 LINC01969 - long intergenic non-protein coding RNA 1969 ncRNA 184.667-75 chr22 50239754 50240006 + 1.33333 NA intron (NM_020461, intron 2 of 24) intron (NM_020461, intron 2 of 24) 5143 NM_020461 85378 Hs.336431 NM_020461 ENSG00000128159 TUBGCP6 GCP-6|GCP6|MCCRP|MCCRP1|MCPHCR tubulin gamma complex associated protein 6 protein-coding 228-74 chr6 109822903 109823102 + 1.33333 NA intron (NM_014845, intron 22 of 22) intron (NM_014845, intron 22 of 22) 131781 NM_014845 9896 Hs.529959 NM_014845 ENSG00000112367 FIG4 ALS11|BTOP|CMT4J|KIAA0274|SAC3|YVS|dJ249I4.1 FIG4 phosphoinositide 5-phosphatase protein-coding 216.666-60 chr6 35967525 35967726 + 1.33333 NA intron (NM_001193476, intron 11 of 19) intron (NM_001193476, intron 11 of 19) -46445 NR_034069 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 303.999-4 chr6 53452771 53453148 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 92142 NM_001498 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 339.999-5 chr18 79200809 79201095 + 1.33333 NA intron (NR_148360, intron 9 of 31) intron (NR_148360, intron 9 of 31) 131558 NM_001306085 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 345-9 chr20 33879588 33880146 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 68519 NM_176812 128866 Hs.472471 NM_176812 ENSG00000101421 CHMP4B C20orf178|CHMP4A|CTPP3|CTRCT31|SNF7|SNF7-2|Shax1|VPS32B|Vps32-2|dJ553F4.4 charged multivesicular body protein 4B protein-coding 211.666-45 chr7 32614641 32614847 + 1.33333 NA intron (NR_036680, intron 12 of 16) intron (NR_036680, intron 12 of 16) 104424 NR_036680 100129460 Hs.633705 NR_036680 DPY19L1P1 - DPY19L1 pseudogene 1 pseudo 226-5 chr1 113932792 113933045 + 1.33333 NA intron (NM_001369807, intron 1 of 15) intron (NM_001369807, intron 1 of 15) 3074 NM_001369806 204851 Hs.532363 NM_152696 ENSG00000163349 HIPK1 Myak|Nbak2 homeodomain interacting protein kinase 1 protein-coding 201.667-23 chr12 37865250 37865516 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -451391 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 129.666-4 chr9 119664672 119664820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -270314 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 163-25 chr14 98550144 98550305 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -161389 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 194.333-79 chr2 201762229 201762461 + 1.33333 NA intron (NM_020919, intron 3 of 33) intron (NM_020919, intron 3 of 33) 18588 NM_001135745 57679 Hs.471096 NM_020919 ENSG00000003393 ALS2 ALS2CR6|ALSJ|IAHSP|PLSJ alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2 protein-coding 361.333-30 chr8 88884128 88884598 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -556880 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 275.333-8 chr10 107990457 107990773 + 1.33333 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) L1ME3A|LINE|L1 78678 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 217-40 chr18 52816632 52816800 + 1.33333 NA intron (NM_005215, intron 2 of 28) intron (NM_005215, intron 2 of 28) -420385 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 190.333-9 chr1 176626310 176626566 + 1.33333 NA intron (NM_021936, intron 3 of 4) intron (NM_021936, intron 3 of 4) 163263 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 158.666 chr1 41142572 41142737 + 1.33333 NA intron (NM_001172218, intron 7 of 15) intron (NM_001172218, intron 7 of 15) 18778 NM_001031694 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 176.666-19 chr3 136021913 136022160 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_181897) promoter-TSS (NM_181897) -706 NM_181897 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 216.667-4 chr1 67799974 67800326 + 1.33333 NA intron (NM_018841, intron 1 of 3) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -32138 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 197.333-71 chr14 73796569 73796776 + 1.33333 NA intron (NR_109995, intron 2 of 2) intron (NR_109995, intron 2 of 2) 9312 NR_109995 100506476 Hs.287299 NR_109995 LOC100506476 - uncharacterized LOC100506476 ncRNA 196.666-16 chr12 51690201 51690358 + 1.33333 NA intron (NM_001369788, intron 6 of 25) intron (NM_001369788, intron 6 of 25) 99043 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 327.333-32 chr4 82078619 82078983 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 295190 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 287.333-36 chr3 7080472 7080753 + 1.33333 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -186595 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 201.333-263 chr7 55846346 55846573 + 1.33333 NA intron (NM_207366, intron 3 of 9) intron (NM_207366, intron 3 of 9) 16293 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 242-27 chr14 79730805 79731047 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 18 of 20) MIR3|SINE|MIR 451546 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 245-29 chr18 21569514 21569878 + 1.33333 NA intron (NM_052911, intron 4 of 11) AluSq2|SINE|Alu 31008 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 324.666-10 chr2 68531178 68531514 + 1.33333 NA intron (NM_173545, intron 6 of 9) intron (NM_173545, intron 6 of 9) 63761 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 235.999 chr10 116710868 116711061 + 1.33333 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) intron (NM_001330164, intron 2 of 12) 31602 NM_025015 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 357.666-5 chr21 30059536 30059840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 107117 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 268.666-18 chr22 34770103 34770446 + 1.33333 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 227642 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 236.333-86 chr7 41125775 41126054 + 1.33333 NA intron (NR_110832, intron 4 of 5) L2a|LINE|L2 24310 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 312.333-6 chr12 120561203 120561689 + 1.33333 NA intron (NM_014868, intron 7 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 19952 NM_198202 51367 Hs.279913 NM_015918 ENSG00000167272 POP5 HSPC004|RPP2|RPP20|hPop5 POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 197.666-31 chr2 31464097 31464317 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -49465 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 246-69 chr3 88373991 88374337 + 1.33333 NA intron (NM_001368167, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 35708 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 175.333-84 chr2 49966563 49966823 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) 7510 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 227.333-84 chr3 194839149 194839469 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70600 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 164-32 chr13 91470709 91470857 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) intron (NM_004466, intron 2 of 7) 72162 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 196.666-104 chr8 71299160 71299332 + 1.33333 NA intron (NM_001370336, intron 9 of 17) intron (NM_001370336, intron 9 of 17) 57460 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 200.666-79 chr3 102373610 102373795 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61313 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 227.333-61 chr2 57942979 57943206 + 1.33333 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) intron (NM_001288838, intron 1 of 15) 35441 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 218.999-2 chr2 14845911 14846090 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 213283 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 204.666-87 chr7 51352437 51352638 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35676 NM_001346444 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 188-119 chr9 12010896 12011097 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -682389 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 179.333-136 chr4 70654584 70654771 + 1.33333 NA TTS (NM_144646) TTS (NM_144646) 11831 NM_144646 3512 Hs.643431 NM_144646 ENSG00000132465 JCHAIN IGCJ|IGJ|JCH joining chain of multimeric IgA and IgM protein-coding 196.333-53 chr15 70783370 70783545 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -19899 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 216.333-50 chr15 65693130 65693383 + 1.33333 NA intron (NM_005848, intron 21 of 31) intron (NM_005848, intron 21 of 31) 3680 NR_145750 109617020 NR_145750 ENSG00000238311 SNORD13E - small nucleolar RNA, C/D box 13E snoRNA 400.333-5 chr15 57477130 57477672 + 1.33333 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) intron (NM_032866, intron 8 of 18) 100896 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 221.666-52 chr7 67576476 67576662 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 240593 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 218.666-6 chr1 232310873 232311203 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 204570 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 178.667-3 chr1 48311205 48311439 + 1.33333 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) L1M4|LINE|L1 88606 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 277.667-21 chr2 73660410 73660811 + 1.33333 NA intron (NR_003683, intron 1 of 6) L1PA16|LINE|L1 15691 NR_003683 200420 Hs.739204 NM_145300 ENSG00000163016 ALMS1P1 ALMS1L|ALMS1P ALMS1 pseudogene 1 pseudo 147.333-22 chr1 161693421 161693575 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -8246 NR_002595 641311 Hs.625293 NR_002595 ENSG00000213075 RPL31P11 RPL31_1_108 ribosomal protein L31 pseudogene 11 pseudo 286-61 chr8 58817673 58817982 + 1.33333 NA intron (NM_014729, intron 6 of 8) intron (NM_014729, intron 6 of 8) -157974 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 207.333-42 chr11 17128717 17128903 + 1.33333 NA intron (NM_001321380, intron 12 of 31) intron (NM_001321380, intron 12 of 31) -51143 NM_001017 6207 Hs.446588 NM_001017 ENSG00000110700 RPS13 S13 ribosomal protein S13 protein-coding 200.333-137 chr7 16172675 16172885 + 1.33333 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) intron (NM_001101426, intron 9 of 9) -37706 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 164-71 chr20 50750767 50750916 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_032521, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_032521, exon 3 of 3) 19261 NM_032521 84612 Hs.589848 NM_032521 ENSG00000124171 PARD6B PAR6B par-6 family cell polarity regulator beta protein-coding 256-64 chr4 39014972 39015283 + 1.33333 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) L1MEd|LINE|L1 17282 NM_024943 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 124.333-26 chr11 45115507 45115680 + 1.33333 NA intron (NM_001359633, intron 2 of 7) L1MEf|LINE|L1 21580 NM_001359633 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 219.333-18 chr1 246327289 246327464 + 1.33333 NA intron (NM_022743, intron 4 of 11) intron (NM_022743, intron 4 of 11) 90036 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 210.333-171 chr8 113844022 113844281 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -407212 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 228.666-31 chr3 129114295 129114564 + 1.33333 NA intron (NM_001204890, intron 11 of 12) MIRc|SINE|MIR 7375 NM_001204886 339122 Hs.381132 NM_198490 ENSG00000172780 RAB43 RAB11B|RAB41 RAB43, member RAS oncogene family protein-coding 266.333-28 chr19 27816391 27816816 + 1.33333 NA intron (NR_146736, intron 2 of 2) L1PA12|LINE|L1 -22663 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 315.666-13 chr4 75784942 75785280 + 1.33333 NA intron (NM_003715, intron 9 of 23) intron (NM_003715, intron 9 of 23) 60589 NM_001290049 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 220.999-2 chr12 42845391 42845571 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 153265 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 255-49 chr20 52159257 52159664 + 1.33333 NA intron (NM_199426, intron 5 of 5) intron (NM_199426, intron 5 of 5) 32319 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 198.666-6 chr10 106322942 106323137 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 182874 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 204.333-38 chr11 80730650 80730934 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 32011 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 215.333-132 chr3 66121929 66122106 + 1.33333 NA Intergenic Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -11593 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 183.666-22 chr7 2804294 2804482 + 1.33333 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) intron (NM_001293092, intron 1 of 2) 10842 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 301.333-7 chr1 119911160 119911578 + 1.33333 NA TTS (NM_024408) TTS (NM_024408) -14854 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 214-107 chr5 38419052 38419317 + 1.33333 NA intron (NM_182798, intron 7 of 16) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 15643 NM_182798 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 203.333-31 chr10 65852682 65852905 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 281368 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 189.333-16 chr1 103317679 103317878 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 207733 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 173-84 chr6 70746897 70747050 + 1.33333 NA intron (NM_001044305, intron 2 of 10) intron (NM_001044305, intron 2 of 10) 78443 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 250.333-37 chr21 14828173 14828372 + 1.33333 NA intron (NR_146322, intron 2 of 3) intron (NR_146322, intron 2 of 3) 90396 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 468.999-2 chr4 45289930 45290334 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -563498 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 207.666-23 chr2 73530090 73530318 + 1.33333 NA intron (NM_015120, intron 11 of 22) THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 73101 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 165-82 chr6 705152 705457 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12163 NR_073064 55770 Hs.484412 NM_018303 ENSG00000112685 EXOC2 SEC5|SEC5L1|Sec5p exocyst complex component 2 protein-coding 205.667-109 chr5 18964463 18964756 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 921663 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 334.666-6 chr2 144057295 144057622 + 1.33333 NA intron (NM_001354355, intron 7 of 13) intron (NM_001354355, intron 7 of 13) 120391 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 217.333-81 chr20 14058021 14058200 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 2 of 17) L1ME3A|LINE|L1 62594 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 235.666-24 chr9 115046245 115046603 + 1.33333 NA exon (NM_002160, exon 17 of 28) exon (NM_002160, exon 17 of 28) 71733 NM_002160 3371 Hs.143250 NM_002160 ENSG00000041982 TNC 150-225|DFNA56|GMEM|GP|HXB|JI|TN|TN-C tenascin C protein-coding 248.667-105 chr8 127483197 127483541 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1230 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 318.333-23 chr3 125025810 125026071 + 1.33333 NA intron (NM_020733, intron 3 of 16) intron (NM_020733, intron 3 of 16) 30057 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 205.666-23 chr2 161957879 161958096 + 1.33333 NA intron (NM_001354443, intron 20 of 25) intron (NM_001354443, intron 20 of 25) 116228 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 280.333-24 chr3 57347219 57347510 + 1.33333 NA intron (NM_001366028, intron 60 of 73) L1MC1|LINE|L1 -54679 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 152.667-329 chr6 69620224 69620492 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176108 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 229.666-23 chr3 151407184 151407376 + 1.33333 NA intron (NM_053002, intron 37 of 42) intron (NM_053002, intron 37 of 42) -22468 NM_022788 64805 Hs.591281 NM_022788 ENSG00000169313 P2RY12 ADPG-R|BDPLT8|HORK3|P2T(AC)|P2Y(12)R|P2Y(AC)|P2Y(ADP)|P2Y(cyc)|P2Y12|SP1999 purinergic receptor P2Y12 protein-coding 272.667-49 chr4 160565826 160566084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -788171 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 181.667-88 chr21 27774689 27774876 + 1.33333 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 52403 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 212-130 chr5 65684906 65685093 + 1.33333 NA intron (NM_019072, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 37110 NM_019072 54557 Hs.482301 NM_019072 ENSG00000197860 SGTB SGT2 small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing beta protein-coding 212.667-137 chr8 117029682 117029975 + 1.33333 NA intron (NM_001172813, intron 2 of 10) intron (NM_001172813, intron 2 of 10) 78853 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 234.333-6 chr1 186434346 186434640 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_126002) promoter-TSS (NR_126002) -668 NR_126002 102724919 Hs.576493 NR_126002 ENSG00000229739 LOC102724919 - uncharacterized LOC102724919 ncRNA 210.667-57 chr16 85896914 85897198 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2106 NM_002163 3394 Hs.137427 NM_002163 ENSG00000140968 IRF8 H-ICSBP|ICSBP|ICSBP1|IMD32A|IMD32B|IRF-8 interferon regulatory factor 8 protein-coding 212-41 chr12 73444681 73444959 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 285630 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 330.666-5 chr12 22619504 22619845 + 1.33333 NA intron (NR_135031, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 5372 NR_135031 105369691 Hs.556287 NR_135030 LOC105369691 - uncharacterized LOC105369691 ncRNA 263-24 chr16 58711441 58711674 + 1.33333 NA intron (NM_001286220, intron 7 of 8) intron (NM_001286220, intron 7 of 8) 22759 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 409.333-12 chr4 138427844 138428325 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118373 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 244.666-45 chr7 6064450 6064682 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -5337 NM_001134335 27102 Hs.520205 NM_014413 ENSG00000086232 EIF2AK1 HCR|HRI eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 protein-coding 344-20 chr2 40166460 40167010 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 5 of 8) intron (NM_001351483, intron 5 of 8) 249101 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 178.666-11 chr2 151401816 151401976 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8006 NM_001177665 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 273.999-4 chr4 13966606 13966840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -145245 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 196-70 chr17 68011576 68011837 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -18100 NM_181655 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 275.333-36 chr2 148167003 148167455 + 1.33333 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -145625 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 237.333-71 chr22 30088353 30088649 + 1.33333 NA intron (NM_001329457, intron 2 of 11) intron (NM_001329457, intron 2 of 11) 8037 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 209-55 chr2 36588486 36588662 + 1.33333 NA intron (NM_005102, intron 2 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 9594 NM_005102 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 212-44 chr12 123648522 123648725 + 1.33333 NA intron (NM_001271866, intron 4 of 10) L2|LINE|L2 14794 NM_001271867 2967 Hs.355348 NM_001516 ENSG00000111358 GTF2H3 BTF2|P34|TFB4|TFIIH general transcription factor IIH subunit 3 protein-coding 249.666-9 chr10 106212934 106213252 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 72928 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 183-50 chr18 2143883 2144095 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 427516 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 130-72 chr22 26054587 26054733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -114802 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 197.666-21 chr16 11548836 11549033 + 1.33333 NA non-coding (NR_024320, exon 4 of 4) non-coding (NR_024320, exon 4 of 4) -21687 NM_001370704 400499 Hs.459937 NM_001370704 ENSG00000188897 LOC400499 - putative uncharacterized protein LOC400499 protein-coding 177.333-78 chr2 37266965 37267194 + 1.33333 NA intron (NM_005813, intron 13 of 17) intron (NM_005813, intron 13 of 17) 35421 NM_001350027 55471 Hs.433466 NM_018607 ENSG00000003509 NDUFAF7 C2orf56|MidA|PRO1853 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 7 protein-coding 195-40 chr14 63080382 63080794 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -35130 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 314-39 chr5 117811620 117811936 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) MER58C|DNA|hAT-Charlie 81417 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 198.667-127 chr3 95378031 95378303 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 305026 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 245.333-45 chr15 48791006 48791221 + 1.33333 NA intron (NM_014985, intron 8 of 25) intron (NM_014985, intron 8 of 25) 19956 NM_014985 22995 Hs.443005 NM_014985 ENSG00000103995 CEP152 MCPH4|MCPH9|SCKL5 centrosomal protein 152 protein-coding 348.999 chr2 37104861 37105183 + 1.33333 NA TTS (NM_001135652) TTS (NM_001135652) 20571 NM_001278505 253635 Hs.595250 NM_174931 ENSG00000152133 GPATCH11 CCDC75|CENP-Y|CENPY G-patch domain containing 11 protein-coding 261.666-10 chr2 77298707 77299056 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 223495 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 200-176 chr9 24549021 24549213 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3220 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 216.667-23 chr11 87675367 87675646 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 43905 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 256.333-71 chr6 123869130 123869397 + 1.33333 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) 65398 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 240.333-3 chr1 69665544 69665796 + 1.33333 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) L1MA3|LINE|L1 96329 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 224.666-14 chr17 66545036 66545259 + 1.33333 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) AluY|SINE|Alu -128293 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 248-86 chr8 76245535 76245862 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -160956 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 165.333-212 chr5 113770414 113770656 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 256841 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 176.666-31 chr7 105115801 105115966 + 1.33333 NA TTS (NM_001350738) TTS (NM_001350738) 101678 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 190.666-32 chr22 38696367 38696575 + 1.33333 NA intron (NM_001360236, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu 4472 NM_001360236 9929 Hs.3094 NM_014876 ENSG00000100221 JOSD1 dJ508I15.2 Josephin domain containing 1 protein-coding 299.667-2 chr1 80987246 80987680 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -318729 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 364.666-6 chr2 216868865 216869303 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1275 NR_135525 105373876 Hs.149762 NR_135525 ENSG00000237479 LOC105373876 - uncharacterized LOC105373876 ncRNA 224-103 chr8 17437863 17438177 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -24669 NM_004686 9108 Hs.625674 NM_004686 ENSG00000003987 MTMR7 - myotubularin related protein 7 protein-coding 275-35 chr3 137562862 137563300 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -201234 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 238.333-65 chr4 27130569 27130913 + 1.33333 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -86738 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 287.666-6 chr2 35443761 35444189 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27430 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 223.333-67 chr2 44734371 44734588 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 7 of 10) AluSz|SINE|Alu 204409 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 329-26 chr9 123017660 123017954 + 1.33333 NA intron (NM_012197, intron 12 of 25) MIRb|SINE|MIR -15836 NM_005294 2844 Hs.722039 NM_005294 ENSG00000011454 GPR21 - G protein-coupled receptor 21 protein-coding 200-44 chr12 62792600 62792883 + 1.33333 NA intron (NM_020700, intron 3 of 9) intron (NM_020700, intron 3 of 9) 142409 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 196.333-89 chr2 145292931 145293138 + 1.33333 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 625067 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 217.667-22 chr11 104271949 104272180 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -107917 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 166-69 chr2 212383183 212383330 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 43104 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 406.333-12 chr3 57382150 57382728 + 1.33333 NA intron (NM_001366028, intron 49 of 73) intron (NM_001366028, intron 49 of 73) -89754 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 176-11 chr1 183112797 183112987 + 1.33333 NA intron (NM_002293, intron 4 of 27) intron (NM_002293, intron 4 of 27) 28378 NR_149048 110841583 Hs.604063 NR_149048 ENSG00000224468 LAMC1-AS1 lnc-LAMC2-1:1 LAMC1 antisense RNA 1 ncRNA 293.333-33 chr2 141553473 141553940 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 577995 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 238-76 chr5 76700019 76700267 + 1.33333 NA intron (NM_006633, intron 33 of 35) intron (NM_006633, intron 33 of 35) -12260 NR_028375 100302746 NR_028375 NCRUPAR NCRNA00193|ncR-uPAR non-protein coding RNA, upstream of F2R/PAR1 ncRNA 230.666-35 chr22 28309371 28309643 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -150362 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 301.333-16 chr14 87826233 87826521 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 166805 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 309.333-7 chr10 65614010 65614414 + 1.33333 NA intron (NR_120647, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 42787 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 358-18 chr5 17220558 17220973 + 1.33333 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 3134 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 203.333-182 chr3 130251684 130251905 + 1.33333 NA intron (NR_027898, intron 19 of 22) intron (NR_027898, intron 19 of 22) 38974 NR_027898 646300 Hs.170475 NR_027898 COL6A4P2 COL6A4 collagen type VI alpha 4 pseudogene 2 pseudo 225.333-11 chr10 21945197 21945505 + 1.33333 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) L2|LINE|L2 58379 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 229.333-33 chr14 21682719 21682897 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11791 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 154-94 chr3 102084459 102084603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -79174 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 219.999-5 chr3 39761285 39761453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47545 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 322.333-11 chr18 4069740 4070172 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 107603 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 214-42 chr15 87061008 87061275 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -72715 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 128.666-4 chr18 5882400 5882572 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13468 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 193-84 chr6 79501800 79502006 + 1.33333 NA intron (NM_001122769, intron 3 of 7) (ATATACT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 35527 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 320.333-12 chr2 69843052 69843451 + 1.33333 NA exon (NM_178439, exon 5 of 14) exon (NM_178439, exon 5 of 14) 13591 NM_178439 64395 Hs.293971 NM_178439 ENSG00000087338 GMCL1 BTBD13|GCL|GCL1|SPATA29 germ cell-less 1, spermatogenesis associated protein-coding 212.333-116 chr5 78277579 78277755 + 1.33333 NA intron (NM_003664, intron 1 of 26) intron (NM_003664, intron 1 of 26) 17031 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 197.666-17 chr14 70648100 70648278 + 1.33333 NA intron (NM_015351, intron 1 of 2) intron (NM_015351, intron 1 of 2) 6273 NM_015351 23508 Hs.79170 NM_015351 ENSG00000133985 TTC9 TTC9A tetratricopeptide repeat domain 9 protein-coding 190-104 chr5 146202326 146202501 + 1.33333 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -1192 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 170.666-13 chr21 33968707 33968864 + 1.33333 NA intron (NR_134558, intron 2 of 2) intron (NR_134558, intron 2 of 2) -7597 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 288-17 chr12 75628522 75628907 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -117105 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 138.666-6 chr6 118186762 118186940 + 1.33333 NA intron (NM_001029858, intron 2 of 7) intron (NM_001029858, intron 2 of 7) 100948 NR_134601 105377967 Hs.692865 NR_134601 LOC105377967 - uncharacterized LOC105377967 ncRNA 259.333-93 chr7 94593146 94593458 + 1.33333 NA intron (NM_001346717, intron 8 of 9) intron (NM_001346717, intron 8 of 9) 62831 NM_001362808 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 341.333-11 chr15 78493183 78493505 + 1.33333 NA intron (NM_001354994, intron 18 of 21) MER8|DNA|TcMar-Tigger -14220 NM_001083612 123688 Hs.307962 NM_001013619 ENSG00000188266 HYKK AGPHD1 hydroxylysine kinase protein-coding 216.666-26 chr14 49301340 49301629 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 284896 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 472-6 chr3 106629554 106630163 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 610780 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 212.333-87 chr20 47925435 47925769 + 1.33333 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -57624 NR_109942 101060004 Hs.129970 NR_109942 LINC01523 - long intergenic non-protein coding RNA 1523 ncRNA 158.666-6 chr11 11790045 11790211 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -6906 NR_107037 102465870 NR_107037 ENSG00000278529 MIR8070 hsa-mir-8070 microRNA 8070 ncRNA 176.666-23 chr5 32514183 32514336 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -69519 NM_016107 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 208-44 chr14 20522005 20522246 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 11653 NM_001012975 338879 Hs.451057 NM_001012975 ENSG00000182545 RNASE10 RAH1|RNASE9 ribonuclease A family member 10 (inactive) protein-coding 202-66 chr18 2746159 2746334 + 1.33333 NA intron (NM_015295, intron 29 of 47) intron (NM_015295, intron 29 of 47) 90359 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 217.333-23 chr10 69460319 69460543 + 1.33333 NA intron (NM_001351263, intron 1 of 5) intron (NM_001351263, intron 1 of 5) 8964 NR_147091 23555 Hs.499941 NM_012339 ENSG00000099282 TSPAN15 2700063A19Rik|NET-7|NET7|TM4SF15 tetraspanin 15 protein-coding 194.333-62 chr2 28222781 28223031 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 8 of 13) intron (NM_199193, intron 8 of 13) -15945 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 350-15 chr2 117182340 117182827 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -632108 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 325.666-15 chr7 6455675 6456184 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -7917 NM_001142936 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 215.333-31 chr11 21680320 21680564 + 1.33333 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -512643 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 117.333-41 chr12 807424 807587 + 1.33333 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) intron (NM_001184985, intron 1 of 27) 54582 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 281.999-2 chr9 36706793 36707015 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 116695 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 223.666-24 chr3 182964387 182964565 + 1.33333 NA intron (NM_020640, intron 2 of 6) intron (NM_020640, intron 2 of 6) 16062 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 198.666-26 chr14 88714808 88714983 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 9 of 42) intron (NM_183387, intron 9 of 42) 78058 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 199.333-297 chr9 68774962 68775187 + 1.33333 NA intron (NM_003558, intron 2 of 15) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -4991 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 192.666-50 chr5 22517076 22517233 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) -303304 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 325.333-25 chr3 38762780 38763182 + 1.33333 NA intron (NM_006514, intron 5 of 26) intron (NM_006514, intron 5 of 26) 31029 NM_006514 6336 Hs.250443 NM_006514 ENSG00000185313 SCN10A FEPS2|Nav1.8|PN3|SNS|hPN3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 protein-coding 246.333-27 chr13 112908701 112908963 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 59806 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 256.333-20 chr11 94022604 94022807 + 1.33333 NA intron (NM_001098672, intron 1 of 19) intron (NM_001098672, intron 1 of 19) 1351 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 274.333-17 chr14 72968867 72969090 + 1.33333 NA TTS (NM_001281734) TTS (NM_001281734) 17978 NM_178441 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 262.333-84 chr9 13138968 13139213 + 1.33333 NA intron (NM_003829, intron 28 of 45) intron (NM_003829, intron 28 of 45) 140474 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 203-60 chr20 23401682 23401855 + 1.33333 NA intron (NM_001283018, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu 19720 NR_104266 63908 Hs.269471 NM_022080 ENSG00000125814 NAPB SNAP-BETA|SNAPB NSF attachment protein beta protein-coding 198-144 chr4 150320714 150320971 + 1.33333 NA intron (NM_001367550, intron 50 of 56) intron (NM_001367550, intron 50 of 56) 242397 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 192-128 chr6 142114999 142115201 + 1.33333 NA intron (NM_001324308, intron 1 of 2) intron (NM_001324308, intron 1 of 2) -18059 NM_001358410 100126572 NM_001358410 ENSG00000203733 GJE1 CX23 gap junction protein epsilon 1 protein-coding 229.666-6 chr12 7677449 7677678 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6964 NM_001304566 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 254.666-17 chr2 159808771 159809038 + 1.33333 NA intron (NM_002349, intron 32 of 34) MIRc|SINE|MIR -10649 NM_001198764 9936 Hs.130014 NM_014880 ENSG00000241399 CD302 BIMLEC|CLEC13A|DCL-1|DCL1 CD302 molecule protein-coding 255.667-48 chr2 179613134 179613481 + 1.33333 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) L1MA3|LINE|L1 -27401 NM_001282725 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 183-4 chr1 64001514 64001756 + 1.33333 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 110570 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 215.333-61 chr15 67127913 67128154 + 1.33333 NA intron (NM_001145102, intron 1 of 8) intron (NM_001145102, intron 1 of 8) 2317 NM_001145102 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 259.999-2 chr14 23797925 23798137 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -155739 NM_001282991 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 318-24 chr2 56229101 56229530 + 1.33333 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -43545 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 210-161 chrX 154067760 154068040 + 1.33333 NA intron (NM_001316337, intron 2 of 4) L1M4|LINE|L1 29069 NM_001369394 4204 Hs.200716 NM_004992 ENSG00000169057 MECP2 AUTSX3|MRX16|MRX79|MRXS13|MRXSL|PPMX|RS|RTS|RTT methyl-CpG binding protein 2 protein-coding 239.333-14 chr10 61133325 61133605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 117190 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 203.667-127 chr8 121197744 121198051 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -385851 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 250-73 chr6 125187209 125187524 + 1.33333 NA intron (NR_149043, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 10451 NR_149043 100126584 Hs.640031 NR_149043 LOC100126584 - uncharacterized LOC100126584 ncRNA 206.666-53 chr2 16414028 16414224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 251708 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 196.666-60 chr20 41297146 41297326 + 1.33333 NA intron (NM_015035, intron 1 of 3) intron (NM_015035, intron 1 of 3) 2884 NM_015035 23051 Hs.380133 NM_015035 ENSG00000174306 ZHX3 TIX1 zinc fingers and homeoboxes 3 protein-coding 209-83 chr4 98112272 98112577 + 1.33333 NA intron (NM_174952, intron 3 of 10) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 31052 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 144.666-12 chr4 70073304 70073498 + 1.33333 NA intron (NR_003720, intron 6 of 12) MER5A|DNA|hAT-Charlie 6015 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 208.333-45 chr15 80524021 80524202 + 1.33333 NA intron (NM_014862, intron 8 of 18) L1ME4a|LINE|L1 38833 NR_120363 101929586 Hs.569426 NR_120363 ENSG00000259175 LOC101929586 - uncharacterized LOC101929586 ncRNA 203.333-200 chr4 178747851 178748055 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -840017 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 172.667-100 chr3 176956874 176957130 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -140001 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 134.667-95 chr2 35028889 35029041 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 351408 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 223.666-32 chr6 155040861 155041046 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49336 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 206.666-88 chr4 61493120 61493309 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 291042 NM_001371342 198.667-134 chr4 5577411 5577655 + 1.33333 NA intron (NM_147127, intron 17 of 21) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 52377 NR_126518 10141 Hs.177972 NM_005750 ENSG00000082929 LINC01587 C4orf6|aC1 long intergenic non-protein coding RNA 1587 ncRNA 248-65 chr4 176874809 176875029 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_149104) promoter-TSS (NR_149104) -783 NR_149104 105377556 NR_149104 ENSG00000250263 LINC02509 - long intergenic non-protein coding RNA 2509 ncRNA 193.333-21 chr10 34284433 34284589 + 1.33333 NA intron (NM_001184790, intron 18 of 22) intron (NM_001184790, intron 18 of 22) -511831 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 248.333-15 chr11 46633853 46634175 + 1.33333 NA intron (NM_001346351, intron 3 of 17) intron (NM_001346351, intron 3 of 17) 16738 NM_001346326 9776 Hs.127403 NM_014741 ENSG00000175224 ATG13 KIAA0652|PARATARG8 autophagy related 13 protein-coding 231.666 chr1 102315741 102315921 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -318597 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 199.666-13 chr12 108498680 108498952 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16461 NM_007076 11153 Hs.661891 NM_007076 ENSG00000198855 FICD HIP13|HYPE|UNQ3041 FIC domain containing protein-coding 242.333-42 chr2 29850457 29850730 + 1.33333 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 70993 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 263.666-13 chr5 131859805 131860237 + 1.33333 NA intron (NM_001303622, intron 9 of 12) L1M2|LINE|L1 -63004 NM_001346114 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 140.333-156 chr4 34325192 34325318 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -55508 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 180.667-85 chr21 19940443 19940657 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40795 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 220-9 chr1 240513669 240513989 + 1.33333 NA intron (NM_022469, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 98326 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 203-3 chr1 87226261 87226545 + 1.33333 NA intron (NM_001290053, intron 2 of 3) intron (NM_001290053, intron 2 of 3) 13734 NM_001290053 101927844 Hs.694591 NM_001290053 LINC02801 - long intergenic non-protein coding RNA 2801 protein-coding 220-16 chr10 112377392 112377705 + 1.33333 NA intron (NM_016234, intron 1 of 20) AluSx|SINE|Alu 1350 NM_016234 51703 Hs.11638 NM_016234 ENSG00000197142 ACSL5 ACS2|ACS5|FACL5 acyl-CoA synthetase long chain family member 5 protein-coding 329.999-8 chr2 213218687 213219231 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -51249 NR_146974 105373863 Hs.258045 NR_146974 LINC01953 - long intergenic non-protein coding RNA 1953 ncRNA 157-125 chr7 88746478 88746682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13120 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 452-10 chr4 37391009 37391586 + 1.33333 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -62628 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 149.666-8 chr7 77805197 77805351 + 1.33333 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) L1MEc|LINE|L1 6303 NM_001366086 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 253.333-64 chr20 34821995 34822281 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001318240) promoter-TSS (NM_001318240) -499 NM_001318240 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 127.333-78 chr2 60026124 60026268 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 356840 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 217.333-92 chr3 45289655 45289863 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63472 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 194.667-51 chr17 59742852 59743122 + 1.33333 NA intron (NM_001329401, intron 4 of 9) MER1B|DNA|hAT-Charlie 35333 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 167.333-189 chr4 73883979 73884221 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 14707 NR_046035 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 249.333-9 chr1 162763935 162764334 + 1.33333 NA intron (NM_006182, intron 9 of 17) intron (NM_006182, intron 9 of 17) -26568 NM_016371 51478 Hs.492925 NM_016371 ENSG00000132196 HSD17B7 PRAP|SDR37C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 7 protein-coding 202.666-96 chr5 90690109 90690367 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 30 of 89) intron (NR_003149, intron 30 of 89) 131441 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 206-63 chr18 68735727 68736011 + 1.33333 NA intron (NM_001093729, intron 3 of 9) intron (NM_001093729, intron 3 of 9) 20653 NM_001093729 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 290.666-7 chr12 12700570 12700832 + 1.33333 NA Intergenic Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger -4518 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 219-76 chr7 55984098 55984390 + 1.33333 NA intron (NM_001202469, intron 4 of 7) intron (NM_001202469, intron 4 of 7) 19659 NM_001202469 2631 Hs.591069 NM_001483 ENSG00000146729 NIPSNAP2 GBAS nipsnap homolog 2 protein-coding 200.666-78 chr3 62286153 62286375 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 28 of 29) intron (NM_002841, intron 28 of 29) 32683 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 210.333-71 chr2 48757176 48757476 + 1.33333 NA intron (NM_001198593, intron 10 of 10) L2c|LINE|L2 -1602 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 355-25 chrX 40438437 40438852 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -142326 NM_005765 10159 Hs.495960 NM_005765 ENSG00000182220 ATP6AP2 APT6M8-9|ATP6IP2|ATP6M8-9|ELDF10|HT028|M8-9|MRXE|MRXSH|MSTP009|PRR|RENR|XMRE|XPDS ATPase H+ transporting accessory protein 2 protein-coding 237.666-5 chr12 13297774 13298142 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 78787 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 294.666-13 chr16 13537503 13537741 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -382535 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 283-32 chr6 62248408 62248777 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu 37633 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 410.666-12 chr8 140057778 140058138 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) 42577 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 152-86 chr2 100541698 100541875 + 1.33333 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -21207 NM_024065 79031 Hs.469459 NM_024065 ENSG00000115539 PDCL3 HTPHLP|PHLP2A|PHLP3|VIAF|VIAF1 phosducin like 3 protein-coding 168-45 chr18 52052504 52052675 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -287608 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 238-10 chr11 18036777 18037135 + 1.33333 NA intron (NM_004179, intron 1 of 9) intron (NM_004179, intron 1 of 9) 3832 NM_004179 7166 Hs.591999 NM_004179 ENSG00000129167 TPH1 TPRH|TRPH tryptophan hydroxylase 1 protein-coding 175.666-7 chr14 53431690 53431841 + 1.33333 NA Intergenic Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 278411 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 216-97 chr5 91374106 91374278 + 1.33333 NA exon (NM_001329670, exon 6 of 8) exon (NM_001329670, exon 6 of 8) 5905 NM_001329670 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 206.667-98 chr4 21233608 21233904 + 1.33333 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 70150 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 194.666-18 chr13 86860881 86861037 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -50961 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 207.333-275 chr8 134767489 134767645 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 33040 NR_029666 407030 NR_029666 ENSG00000207582 MIR30B MIRN30B|mir-30b microRNA 30b ncRNA 247.333-61 chr5 3660560 3660867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 64881 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 263.333-28 chr15 65670516 65670819 + 1.33333 NA intron (NM_005848, intron 24 of 31) intron (NM_005848, intron 24 of 31) 26269 NR_145750 109617020 NR_145750 ENSG00000238311 SNORD13E - small nucleolar RNA, C/D box 13E snoRNA 209.333-243 chr8 116871421 116871721 + 1.33333 NA intron (NM_006265, intron 1 of 13) L1ME4b|LINE|L1 -2853 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 238-58 chr22 37458018 37458350 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 28200 NM_002405 4242 Hs.517603 NM_002405 ENSG00000100060 MFNG - MFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 198.667-67 chr15 33422962 33423218 + 1.33333 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) L1MB4|LINE|L1 112123 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 206.666-40 chr14 70887149 70887336 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20217 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 277.333-39 chr18 6261243 6261687 + 1.33333 NA TTS (NR_110765) TTS (NR_110765) 4721 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 210-72 chr2 137814405 137814629 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113415 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 257.333-13 chr10 69431799 69432101 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15032 NM_001057 6865 Hs.88372 NM_001057 ENSG00000075073 TACR2 NK2R|NKNAR|SKR|TAC2R tachykinin receptor 2 protein-coding 149.333-314 chr5 106800094 106800215 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 210860 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 204.333-112 chr2 229183697 229183873 + 1.33333 NA intron (NM_001100818, intron 1 of 2) MLT2B4|LTR|ERVL 48307 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 365.999 chr11 90338794 90339092 + 1.33333 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 87711 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 199.666-63 chr9 98750620 98750798 + 1.33333 NA intron (NM_173551, intron 13 of 14) intron (NM_173551, intron 13 of 14) -41774 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 139-40 chr17 68769697 68769845 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 141617 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 247.666-18 chr2 211014101 211014354 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 396656 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 205.666-15 chr14 50709647 50709857 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -41446 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 185-54 chr5 20034692 20034842 + 1.33333 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) MLT2B4|LTR|ERVL -46567 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 337-26 chr7 30503856 30504248 + 1.33333 NA intron (NM_001199816, intron 1 of 2) intron (NM_001199816, intron 1 of 2) 777 NM_001199815 79017 Hs.530024 NM_024051 ENSG00000006625 GGCT C7orf24|CRF21|GCTG|GGC gamma-glutamylcyclotransferase protein-coding 164-99 chr6 74844711 74844930 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 283962 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 194-82 chr2 178518069 178518261 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4662 NR_038272 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 216-38 chr15 97498724 97498961 + 1.33333 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) ERVL-E-int|LTR|ERVL 22969 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 167.333-34 chr10 8090047 8090259 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35465 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 335.666-9 chr3 27177572 27177879 + 1.33333 NA intron (NM_001304384, intron 5 of 16) intron (NM_001304384, intron 5 of 16) 38798 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 255.333-24 chr12 26158786 26159018 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33865 NM_030762 79365 Hs.177841 NM_030762 ENSG00000123095 BHLHE41 BHLHB3|DEC2|SHARP1|hDEC2 basic helix-loop-helix family member e41 protein-coding 326-10 chr11 114639848 114640126 + 1.33333 NA Intergenic (ATATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -38540 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 202-53 chr15 63635957 63636215 + 1.33333 NA exon (NM_003922, exon 65 of 78) exon (NM_003922, exon 65 of 78) -35259 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 205.333-83 chr15 71824598 71824768 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_006901, exon 42 of 42) 3' UTR (NM_006901, exon 42 of 42) 14129 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 246-10 chr1 240197271 240197558 + 1.33333 NA intron (NM_001348094, intron 4 of 14) MER21B|LTR|ERVL 105531 NM_001305424 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 342.666-10 chr15 95629776 95630101 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 196845 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 304-23 chr18 32730051 32730349 + 1.33333 NA intron (NM_020805, intron 3 of 8) intron (NM_020805, intron 3 of 8) 42823 NM_020805 57565 Hs.446164 NM_020805 ENSG00000197705 KLHL14 - kelch like family member 14 protein-coding 388.666-6 chr3 187172210 187172596 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -25083 NM_153708 132112 Hs.518480 NM_153708 ENSG00000175077 RTP1 Z3CXXC1 receptor transporter protein 1 protein-coding 173.666-5 chr18 866159 866292 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38646 NM_001099733 116 Hs.531719 NM_001117 ENSG00000141433 ADCYAP1 PACAP adenylate cyclase activating polypeptide 1 protein-coding 317.333-46 chr9 87238276 87238620 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 89804 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 264-30 chr2 174505721 174505970 + 1.33333 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -18757 NM_001267051 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 225.333-47 chr14 55974397 55974583 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -143921 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 215.333-54 chr14 31900519 31900703 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44242 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 201.333-210 chr4 65792952 65793140 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -122551 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 226-67 chr4 70462791 70463063 + 1.33333 NA intron (NM_001145006, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu -9031 NM_001145007 4589 Hs.631946 NM_152291 ENSG00000171195 MUC7 MG2 mucin 7, secreted protein-coding 315.999-4 chr7 111690714 111691190 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -117553 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 253.666-30 chrX 46093358 46093728 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 234131 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 232.666-9 chr13 41158181 41158417 + 1.33333 NA intron (NR_120423, intron 2 of 3) HERV35I-int|LTR|ERV1 25371 NR_120423 101929140 Hs.663088 NR_120423 ENSG00000278390 LOC101929140 - uncharacterized LOC101929140 ncRNA 198-86 chr2 42330934 42331115 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_019063, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_019063, exon 23 of 23) 29014 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 316.333-2 chr1 108998637 108999063 + 1.33333 NA intron (NM_014969, intron 7 of 14) intron (NM_014969, intron 7 of 14) -35351 NM_001048210 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 220.333-50 chr17 80916070 80916341 + 1.33333 NA intron (NM_020761, intron 21 of 33) MER52A|LTR|ERV1 55008 NR_148968 400627 Hs.591201 NR_148968 ENSG00000261924 LOC400627 - uncharacterized LOC400627 ncRNA 123.333-206 chr8 35626556 35626735 + 1.33333 NA intron (NM_001322818, intron 4 of 16) intron (NM_001322818, intron 4 of 16) 82253 NM_001322818 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 294.666-36 chr8 10355928 10356306 + 1.33333 NA intron (NM_001199729, intron 6 of 6) intron (NM_001199729, intron 6 of 6) -118448 NR_120604 101929191 Hs.595262 NR_120604 ENSG00000253641 LINCR-0001 - uncharacterized LINCR-0001 ncRNA 200.333-13 chr10 61446036 61446220 + 1.33333 NA intron (NR_134508, intron 1 of 6) intron (NR_134508, intron 1 of 6) -6511 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 170.333-164 chr4 163059771 163060122 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33682 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 223.333-166 chr8 84153149 84153339 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29543 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 176.666-8 chr12 121882393 121882592 + 1.33333 NA intron (NM_001171993, intron 1 of 15) intron (NM_001171993, intron 1 of 15) 6119 NM_001171993 3242 Hs.2899 NM_002150 ENSG00000158104 HPD 4-HPPD|4HPPD|GLOD3|HPPDASE|PPD 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase protein-coding 286-48 chr5 42901047 42901318 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89106 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 338.333-14 chr4 67371792 67372233 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49988 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 146.667-249 chr5 13825290 13825483 + 1.33333 NA intron (NM_001369, intron 38 of 78) L1MB2|LINE|L1 119094 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 256.666-36 chr5 64061415 64061649 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99240 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 213.333-22 chr10 24670839 24671013 + 1.33333 NA intron (NM_001367447, intron 2 of 24) L2|LINE|L2 -48083 NM_001367455 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 284.667-21 chr17 77113212 77113572 + 1.33333 NA intron (NM_001204410, intron 2 of 17) intron (NM_001204410, intron 2 of 17) 23975 NR_106997 102466864 NR_106997 ENSG00000284250 MIR6516 hsa-mir-6516 microRNA 6516 ncRNA 181.667-114 chr4 103559875 103560127 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 134959 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 243.666-31 chr5 133417519 133417796 + 1.33333 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) L1ME2|LINE|L1 10049 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 195.666-48 chr9 72119998 72120192 + 1.33333 NA intron (NM_001242507, intron 1 of 13) intron (NM_001242507, intron 1 of 13) 5500 NM_001242507 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 253.666-3 chr11 11850732 11851014 + 1.33333 NA intron (NM_017944, intron 1 of 26) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 9450 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 216-74 chr22 29525155 29525467 + 1.33333 NA intron (NM_001002879, intron 12 of 19) intron (NM_001002879, intron 12 of 19) 28344 NM_001002878 8563 Hs.75361 NM_003678 ENSG00000100296 THOC5 C22orf19|Fmip|PK1.3|fSAP79 THO complex 5 protein-coding 248.333-53 chr20 15265985 15266368 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 6 of 17) intron (NM_001351663, intron 6 of 17) 69336 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 242-59 chr5 74125336 74125582 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 182866 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 194.667-121 chr5 53592647 53592874 + 1.33333 NA intron (NR_134475, intron 2 of 5) L1MC|LINE|L1 32121 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 223.999-2 chr10 19283266 19283448 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 21 of 39) intron (NM_001142308, intron 21 of 39) 234556 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 286.667-14 chr16 22127736 22128128 + 1.33333 NA intron (NM_173615, intron 17 of 33) L2c|LINE|L2 -34599 NM_001365288 100288072 NM_001365288 SDR42E2 - short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 2 protein-coding 182.666-16 chr15 69508405 69508575 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53230 NR_026979 145837 Hs.410126 NR_026979 DRAIC - downregulated RNA in cancer, inhibitor of cell invasion and migration ncRNA 317.999-2 chr12 55223699 55224010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2829 NM_001005280 121364 Hs.554557 NM_001005280 ENSG00000179919 OR10A7 OR12-6 olfactory receptor family 10 subfamily A member 7 protein-coding 265.333-49 chr21 30648247 30648547 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 5533 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 156.666-9 chr20 52828608 52828734 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -143687 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 233.666-11 chr16 52430032 52430310 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 116972 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 199-69 chr3 97308601 97308750 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) L2c|LINE|L2 -130932 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 240-89 chr8 88736090 88736348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -408736 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 284 chr1 40937121 40937474 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42399 NM_001905 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 217.666-24 chr3 7165000 7165166 + 1.33333 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) -271066 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 287-34 chr7 94858474 94858848 + 1.33333 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -48933 NM_001166160 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 232.999-3 chr4 101046307 101046516 + 1.33333 NA intron (NM_001130691, intron 10 of 12) intron (NM_001130691, intron 10 of 12) 194461 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 166-23 chr10 73717252 73717397 + 1.33333 NA intron (NR_160427, intron 8 of 17) intron (NR_160427, intron 8 of 17) 13182 NR_160425 113939925 NR_160425 BMS1P4-AGAP5 - BMS1P4-AGAP5 readthough pseudo 254.333-5 chr10 69463330 69463644 + 1.33333 NA intron (NM_001351263, intron 1 of 5) intron (NM_001351263, intron 1 of 5) 12020 NR_147091 23555 Hs.499941 NM_012339 ENSG00000099282 TSPAN15 2700063A19Rik|NET-7|NET7|TM4SF15 tetraspanin 15 protein-coding 339-10 chr19 37492149 37492534 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -14598 NM_001013659 390927 Hs.568010 NM_001013659 ENSG00000188227 ZNF793 - zinc finger protein 793 protein-coding 192.333-61 chr16 12667960 12668156 + 1.33333 NA intron (NM_001099455, intron 2 of 2) L1MEi|LINE|L1 -52263 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 372.666-10 chr3 182884928 182885256 + 1.33333 NA intron (NM_014616, intron 22 of 29) intron (NM_014616, intron 22 of 29) 91588 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 245.999-4 chr13 43775943 43776224 + 1.33333 NA intron (NM_001347966, intron 1 of 17) intron (NM_001347966, intron 1 of 17) 10889 NM_001347970 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 212-150 chr8 49225864 49226027 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 153601 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 338 chr1 73460256 73460687 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 154301 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 228.333-31 chr16 7497272 7497569 + 1.33333 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 164575 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 201-97 chr6 46210351 46210571 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -39451 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 225.333-80 chr2 107973707 107973964 + 1.33333 NA Intergenic MER107|DNA|hAT-Charlie -12689 NM_001305006 60482 Hs.287758 NM_021815 ENSG00000115665 SLC5A7 CHT|CHT1|CMS20|HMN7A solute carrier family 5 member 7 protein-coding 208-23 chr10 116302001 116302299 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -22298 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 257.666 chr1 86775239 86775502 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70794 NM_001206652 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 214-144 chr9 76837095 76837280 + 1.33333 NA intron (NM_001308048, intron 4 of 17) AluSc|SINE|Alu 68900 NM_001308047 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 296-49 chr4 142864401 142864720 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -18025 NM_001101669 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 199.666-32 chr3 17411237 17411407 + 1.33333 NA intron (NM_001349091, intron 2 of 19) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 288698 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 161.333-185 chr3 78825904 78826127 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 193444 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 212-148 chr7 98248580 98248788 + 1.33333 NA intron (NM_015395, intron 2 of 25) AluSx|SINE|Alu 3548 NM_015395 25851 Hs.592281 NM_015395 ENSG00000205356 TECPR1 - tectonin beta-propeller repeat containing 1 protein-coding 272.667-11 chr11 24543153 24543510 + 1.33333 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 46278 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 161.333-5 chr1 80076097 80076235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -459589 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 144-93 chr21 29702846 29702998 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -45253 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 210-133 chr6 64886007 64886287 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) LTR90A|LTR|LTR -415271 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 251-10 chr11 29169035 29169322 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -425235 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 148.666-4 chr18 1861500 1861708 + 1.33333 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -501975 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 336.333-5 chr10 23626283 23626572 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -68300 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 184-76 chr4 119812247 119812421 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -7819 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 310.333-14 chr13 28960386 28960716 + 1.33333 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) L1MB7|LINE|L1 -63906 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 147.333-19 chr1 150708299 150708452 + 1.33333 NA exon (NM_001199829, exon 8 of 14) exon (NM_001199829, exon 8 of 14) -11221 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 256.666-41 chr5 112960882 112961091 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -15812 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 352.667-27 chr7 83598465 83598972 + 1.33333 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 42713 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 196.333-54 chr15 92024315 92024471 + 1.33333 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) intron (NR_135775, intron 2 of 10) 170089 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 374.333-5 chr13 92289872 92290247 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 62148 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 207.333-62 chr12 52496335 52496520 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3170 NM_005554 3853 Hs.700779 NM_005554 ENSG00000205420 KRT6A CK-6C|CK-6E|CK6A|CK6C|CK6D|K6A|K6C|K6D|KRT6C|KRT6D|PC3 keratin 6A protein-coding 190.666-24 chr2 14760641 14760856 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128031 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 419.332 chr2 165225504 165225856 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -13734 NM_001371246 217.333-98 chr3 125324364 125324618 + 1.33333 NA intron (NM_001348426, intron 1 of 7) intron (NM_001348426, intron 1 of 7) 32789 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 333.333-33 chr20 17947733 17948166 + 1.33333 NA intron (NM_014426, intron 10 of 12) intron (NM_014426, intron 10 of 12) 14997 NR_003045 692086 Hs.680747 NR_003045 ENSG00000212232 SNORD17 HBI-43 small nucleolar RNA, C/D box 17 snoRNA 205.667-141 chr9 121669342 121669640 + 1.33333 NA intron (NM_032552, intron 1 of 16) MER90|LTR|ERV1 -73294 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 299.333-2 chr1 99888279 99888550 + 1.33333 NA intron (NM_000028, intron 21 of 33) intron (NM_000028, intron 21 of 33) 37439 NM_000646 178 Hs.904 NM_000028 ENSG00000162688 AGL GDE amylo-alpha-1, 6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase protein-coding 255.666-33 chrX 47152061 47152353 + 1.33333 NA intron (NM_152856, intron 2 of 22) AluSz|SINE|Alu 6986 NM_001204467 8241 Hs.401509 NM_005676 ENSG00000182872 RBM10 DXS8237E|GPATC9|GPATCH9|S1-1|TARPS|ZRANB5 RNA binding motif protein 10 protein-coding 499.332 chr21 29814211 29814723 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) LTR89|LTR|ERVL? 66292 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 285.333-38 chr20 15632215 15632636 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) L2b|LINE|L2 290889 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 232.666-35 chr3 103641623 103641823 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -117607 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 262-84 chr8 124661052 124661308 + 1.33333 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 67293 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 145.333-199 chr3 123173199 123173386 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 11498 NR_106960 102465667 NR_106960 ENSG00000284421 MIR7110 hsa-mir-7110 microRNA 7110 ncRNA 177-25 chr14 70273988 70274307 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -26346 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 345.333-15 chr18 3448172 3448462 + 1.33333 NA intron (NM_173207, intron 1 of 2) CpG 775 NM_173207 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 258.666 chr1 96314425 96314750 + 1.33333 NA intron (NR_110693, intron 3 of 5) intron (NR_110693, intron 3 of 5) 59538 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 222-52 chr20 25619586 25619999 + 1.33333 NA intron (NM_152667, intron 1 of 1) intron (NM_152667, intron 1 of 1) 4222 NM_152667 140838 Hs.143137 NM_152667 ENSG00000170191 NANP C20orf147|HDHD4|dJ694B14.3 N-acetylneuraminic acid phosphatase protein-coding 196-131 chr4 30990458 30990712 + 1.33333 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -180559 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 282.667-12 chr17 71179363 71179814 + 1.33333 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) intron (NR_104152, intron 2 of 3) 22591 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 186.666-13 chr11 29102077 29102217 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -492266 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 178.333-74 chr2 68986426 68986592 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 11936 NM_019617 56287 Hs.69319 NM_019617 ENSG00000169605 GKN1 AMP18|BRICD1|CA11|FOV|foveolin gastrokine 1 protein-coding 351.333-15 chr2 143281543 143281906 + 1.33333 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 152305 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 177-56 chr4 52617745 52617946 + 1.33333 NA intron (NM_001286768, intron 5 of 9) intron (NM_001286768, intron 5 of 9) 38694 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 226.333-97 chr5 33419032 33419250 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -21555 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 188.333-68 chr2 28956886 28957071 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -24320 NM_001321538 165186 Hs.525977 NM_199280 ENSG00000189350 TOGARAM2 FAM179A TOG array regulator of axonemal microtubules 2 protein-coding 196-137 chr4 115502783 115502964 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger -389253 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 136-50 chr2 79496234 79496399 + 1.33333 NA intron (NR_110289, intron 4 of 4) intron (NR_110289, intron 4 of 4) 4528 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 299.333-35 chr19 47335135 47335401 + 1.33333 NA intron (NM_001271749, intron 1 of 1) intron (NM_001271749, intron 1 of 1) -1827 NM_018485 27202 Hs.534412 NM_018485 ENSG00000134830 C5AR2 C5L2|GPF77|GPR77 complement component 5a receptor 2 protein-coding 187.333-153 chr5 44077076 44077331 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -311529 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 185.666 chr1 194761364 194761563 + 1.33333 NA Intergenic (AGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1327252 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 200-79 chr2 18550902 18551103 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9651 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 213.333-149 chr4 105266415 105266689 + 1.33333 NA intron (NM_001127208, intron 8 of 10) L1ME1|LINE|L1 86329 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 127.333-152 chr6 4101030 4101185 + 1.33333 NA intron (NM_001085401, intron 3 of 5) intron (NM_001085401, intron 3 of 5) 21898 NR_104463 404220 Hs.716731 NM_206834 ENSG00000185689 C6orf201 dJ1013A10.5 chromosome 6 open reading frame 201 protein-coding 214.666-18 chr12 114121499 114121701 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120170 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 288.333-18 chr18 30130034 30130505 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -168641 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 270.667-62 chr9 102761314 102761656 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -233848 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 206.666-25 chr12 16468388 16468583 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 115068 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 202-64 chr17 48465860 48466060 + 1.33333 NA TTS (NR_110804) TTS (NR_110804) 21127 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 218.666-24 chr14 36552364 36552536 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 30164 NM_014360 26257 Hs.234763 NM_014360 ENSG00000136327 NKX2-8 NKX2.8|NKX2H|Nkx2-9 NK2 homeobox 8 protein-coding 316.999 chr10 80878106 80878623 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 228567 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 363.333-20 chr22 19894049 19894409 + 1.33333 NA TTS (NM_001352303) TTS (NM_001352303) 38324 NM_001352301 10587 Hs.443430 NM_006440 ENSG00000184470 TXNRD2 GCCD5|SELZ|TR|TR-BETA|TR3|TRXR2 thioredoxin reductase 2 protein-coding 194-26 chr12 12679451 12679648 + 1.33333 NA intron (NM_006143, intron 3 of 3) AluJr|SINE|Alu 16634 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 237.667-11 chr10 110702552 110702848 + 1.33333 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 58364 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 353.333-9 chr12 17569623 17570011 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19261 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 249.999-9 chr7 70031343 70031624 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 433008 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 465.333-2 chr10 16338477 16338957 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -98226 NM_001001484 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 175-55 chr3 143002564 143002875 + 1.33333 NA intron (NM_001080415, intron 1 of 27) intron (NM_001080415, intron 1 of 27) 1149 NM_001080415 23350 Hs.596572 NM_001080415 ENSG00000163714 U2SURP SR140|fSAPa U2 snRNP associated SURP domain containing protein-coding 211.333-53 chr13 78649610 78649894 + 1.33333 NA intron (NM_024546, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 9403 NM_024546 79596 Hs.567576 NM_024546 ENSG00000152193 OBI1 C13orf7|RNF219 ORC ubiquitin ligase 1 protein-coding 189.333-142 chr4 38548178 38548353 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15738 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 253.333-63 chr20 14262939 14263206 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L2c|LINE|L2 74540 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 221.666-37 chr3 182475632 182475882 + 1.33333 NA intron (NR_040105, intron 1 of 3) intron (NR_040105, intron 1 of 3) 10605 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 210.333-109 chr3 164493122 164493419 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -321714 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 266-23 chr14 67630210 67630499 + 1.33333 NA intron (NM_001172, intron 2 of 7) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 10434 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 430.667-10 chr6 139445430 139446050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 28856 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 294.333-49 chr9 92434734 92435143 + 1.33333 NA intron (NM_001286969, intron 4 of 6) AluSx|SINE|Alu -10384 NM_005014 4958 Hs.94070 NM_005014 ENSG00000127083 OMD OSAD|SLRR2C osteomodulin protein-coding 271.333-66 chr7 107270299 107270626 + 1.33333 NA intron (NM_181733, intron 14 of 20) AluJo|SINE|Alu 101459 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 342.333 chr1 106046816 106047134 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18722 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 211.666-23 chr2 22639103 22639261 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 102703 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 200-99 chr22 41123279 41123483 + 1.33333 NA intron (NM_001429, intron 2 of 30) intron (NM_001429, intron 2 of 30) 30789 NM_001429 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 180.333-155 chrX 56225181 56225444 + 1.33333 NA intron (NM_001324104, intron 2 of 6) intron (NM_001324104, intron 2 of 6) -7044 NM_007250 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 242.333-38 chr18 75216159 75216570 + 1.33333 NA intron (NM_001308210, intron 1 of 1) intron (NM_001308210, intron 1 of 1) 4835 NM_001308210 10194 Hs.284217 NM_005786 ENSG00000179981 TSHZ1 CAA|NY-CO-33|SDCCAG33|TSH1 teashirt zinc finger homeobox 1 protein-coding 247.333-67 chr5 174324207 174324531 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -11985 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 145.333-128 chr2 43468118 43468348 + 1.33333 NA intron (NM_001083953, intron 26 of 37) intron (NM_001083953, intron 26 of 37) 127741 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 205.667-104 chr4 30590344 30590668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -129863 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 192.333-127 chr4 78508371 78508562 + 1.33333 NA intron (NM_025074, intron 62 of 73) intron (NM_025074, intron 62 of 73) -43304 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 161.333-117 chr17 61750842 61751030 + 1.33333 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) L1MB4|LINE|L1 112623 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 171.333-159 chr5 150373263 150373431 + 1.33333 NA intron (NM_001008657, intron 7 of 17) intron (NM_001008657, intron 7 of 17) 15650 NM_001135245 6949 Hs.519672 NM_000356 ENSG00000070814 TCOF1 MFD1|TCS|TCS1|treacle treacle ribosome biogenesis factor 1 protein-coding 331-43 chr9 28910965 28911271 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -22163 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 215.666-44 chr9 27185139 27185344 + 1.33333 NA intron (NM_001290077, intron 7 of 21) intron (NM_001290077, intron 7 of 21) 76100 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 172.666-4 chr12 81142853 81143037 + 1.33333 NA intron (NM_024560, intron 4 of 15) intron (NM_024560, intron 4 of 15) -15443 NR_039848 100616133 NR_039848 ENSG00000265227 MIR4699 - microRNA 4699 ncRNA 208-129 chr4 146917027 146917230 + 1.33333 NA intron (NR_133922, intron 4 of 13) intron (NR_133922, intron 4 of 13) 28736 NR_133922 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 206-137 chr5 5434977 5435152 + 1.33333 NA intron (NM_015325, intron 1 of 18) intron (NM_015325, intron 1 of 18) 12387 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 166.667-234 chr8 114666139 114666374 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1001757 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 215-9 chr10 89614699 89614982 + 1.33333 NA intron (NM_148977, intron 1 of 6) L1ME3G|LINE|L1 -22013 NR_029524 406901 NR_029524 ENSG00000198997 MIR107 MIRN107|miR-107 microRNA 107 ncRNA 318.666-3 chr10 115538323 115538675 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 25 of 28) L1ME1|LINE|L1 445134 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 379-6 chr22 25669455 25669881 + 1.33333 NA intron (NM_001362778, intron 5 of 19) intron (NM_001362778, intron 5 of 19) -72520 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 194-56 chr18 641831 642019 + 1.33333 NA intron (NM_199167, intron 7 of 8) MIRb|SINE|MIR -15728 NM_001354867 7298 Hs.369762 NM_001071 ENSG00000176890 TYMS HST422|TMS|TS thymidylate synthetase protein-coding 172-4 chr1 65533806 65533984 + 1.33333 NA intron (NM_001198687, intron 1 of 18) L1ME3B|LINE|L1 8206 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 244.667-48 chr18 3625743 3626091 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 7 of 11) intron (NM_001242761, intron 7 of 11) 22180 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 162.333-103 chr19 34551877 34552045 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -6575 NR_146880 100129800 NR_146880 ZNF807 ZNF181P1|ZNF807P zinc finger protein 807 pseudo 192-78 chr2 170230966 170231178 + 1.33333 NA intron (NM_001083615, intron 6 of 33) intron (NM_001083615, intron 6 of 33) 52925 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 212.333-99 chr3 127739935 127740139 + 1.33333 NA intron (NM_001003794, intron 3 of 7) MER102c|DNA|hAT-Charlie 67085 NM_172027 80325 Hs.107812 NM_032548 ENSG00000114626 ABTB1 BPOZ|BTB3|BTBD21|EF1ABP|PP2259 ankyrin repeat and BTB domain containing 1 protein-coding 195-15 chr10 29194393 29194642 + 1.33333 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -94553 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 400.666-3 chr17 59530620 59531023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3964 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 199.666-58 chr8 115699617 115699811 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30739 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 155.333-247 chr3 187585902 187586043 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84422 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 208-70 chr19 40616179 40616399 + 1.33333 NA intron (NM_003573, intron 22 of 32) AluJb|SINE|Alu 14920 NM_001042545 8425 Hs.466766 NM_003573 ENSG00000090006 LTBP4 ARCL1C|LTBP-4|LTBP4L|LTBP4S latent transforming growth factor beta binding protein 4 protein-coding 214.666-22 chr14 50184037 50184254 + 1.33333 NA intron (NM_006939, intron 5 of 22) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 47433 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 168-36 chr15 63666856 63667058 + 1.33333 NA intron (NM_003922, intron 40 of 77) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -66130 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 319.333-18 chr2 133817719 133817986 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -249389 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 256-92 chr8 121221319 121221692 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -409459 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 205-97 chr8 74008900 74009208 + 1.33333 NA intron (NM_015364, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 17662 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 249-33 chr16 82946437 82946836 + 1.33333 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) AluSz6|SINE|Alu 43662 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 343.333-35 chr8 65336611 65337203 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -156567 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 198.666-30 chr17 7999801 8000046 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2747 NM_000180 3000 Hs.592109 NM_000180 ENSG00000132518 GUCY2D CACD1|CORD5|CORD6|CYGD|GUC1A4|GUC2D|LCA|LCA1|RCD2|RETGC-1|ROS-GC1|ROSGC|retGC guanylate cyclase 2D, retinal protein-coding 210-63 chr2 69775608 69775876 + 1.33333 NA intron (NM_001365496, intron 2 of 13) LTR35B|LTR|ERV1 33608 NM_001365496 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 197.666-12 chr11 114792166 114792335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113723 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 251-67 chr5 84710691 84710986 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -325958 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 266-30 chr17 63798388 63798851 + 1.33333 NA intron (NM_203499, intron 4 of 17) MER8|DNA|TcMar-Tigger 24430 NM_007372 11325 Hs.702010 NM_007372 ENSG00000198231 DDX42 DDX42P|RHELP|RNAHP|SF3B8|SF3b125 DEAD-box helicase 42 protein-coding 252.666-42 chr6 126999112 126999415 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -119408 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 253.666-9 chr2 67390810 67391095 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6381 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 155.333-308 chr5 128522531 128522690 + 1.33333 NA intron (NM_001999, intron 4 of 64) intron (NM_001999, intron 4 of 64) 15635 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 216.667-82 chr4 179277186 179277482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1369398 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 170.666-21 chr8 99648808 99648999 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 34 of 61) L1MEf|LINE|L1 -112042 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 205-4 chr1 42576995 42577285 + 1.33333 NA exon (NM_001355224, exon 14 of 23) exon (NM_001355224, exon 14 of 23) 44120 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 146-39 chr15 93576348 93576525 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -280124 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 246.666-19 chr2 27915694 27915952 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 3 of 13) intron (NM_199193, intron 3 of 13) -24709 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 205.333-135 chr2 211274658 211274926 + 1.33333 NA Intergenic MER34A1|LTR|ERV1 657221 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 171.333-46 chr14 49588227 49588391 + 1.33333 NA intron (NM_001351375, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 1729 NR_002715 6029 NR_002715 ENSG00000276168 RN7SL1 7L1a|7SL|RN7SL|RNSRP1 RNA component of signal recognition particle 7SL1 scRNA 307-6 chr11 113735462 113735831 + 1.33333 NA intron (NM_004724, intron 15 of 15) intron (NM_004724, intron 15 of 15) -29273 NR_110047 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 443.333-12 chr9 32471732 32472373 + 1.33333 NA intron (NM_014314, intron 14 of 17) intron (NM_014314, intron 14 of 17) 54144 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 193.333-99 chr2 123400847 123401006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -327445 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 248.333-11 chr10 68538736 68538934 + 1.33333 NA Intergenic ERVL47-int|LTR|ERVL -11312 NM_001324312 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 408.666-5 chr5 131198210 131198657 + 1.33333 NA intron (NM_181705, intron 4 of 4) L1MC4|LINE|L1 27489 NM_181705 90624 Hs.115467 NM_181705 ENSG00000186687 LYRM7 C5orf31|MC3DN8|MZM1L LYR motif containing 7 protein-coding 344-34 chr5 30971530 30972032 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -221905 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 142.333-130 chr2 179811225 179811398 + 1.33333 NA intron (NR_148056, intron 1 of 9) L1PA16|LINE|L1 49597 NR_031659 100302172 NR_031659 ENSG00000221240 MIR1258 MIRN1258|hsa-mir-1258|mir-1258 microRNA 1258 ncRNA 218-35 chr17 26982863 26983085 + 1.33333 NA Intergenic (CTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 106267 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 221.333-122 chr6 39113031 39113233 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001304793, exon 2 of 3) 5' UTR (NM_001304793, exon 2 of 3) 2054 NM_018322 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 219.333-152 chr6 38389386 38389710 + 1.33333 NA intron (NM_052893, intron 7 of 11) intron (NM_052893, intron 7 of 11) -92048 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 231.667-17 chr14 72124359 72124676 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 190990 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 340.666-16 chr5 94052431 94052821 + 1.33333 NA intron (NM_032042, intron 3 of 10) intron (NM_032042, intron 3 of 10) 59037 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 201.333-270 chr7 96806717 96806957 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -96946 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 274.667-20 chr15 81314058 81314440 + 1.33333 NA TTS (NM_001352684) TTS (NM_001352684) 9892 NM_181900 80765 Hs.513075 NM_030574 ENSG00000172345 STARD5 - StAR related lipid transfer domain containing 5 protein-coding 309.999-5 chr5 164728575 164728835 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 258426 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 290.999-3 chr4 62280480 62280930 + 1.33333 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -118940 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 276-13 chr11 101410738 101411118 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 108977 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 315.333-26 chr20 10408364 10408691 + 1.33333 NA intron (NR_072977, intron 3 of 4) intron (NR_072977, intron 3 of 4) 23398 NM_018848 8195 Hs.472119 NM_018848 ENSG00000125863 MKKS BBS6|HMCS|KMS|MKS McKusick-Kaufman syndrome protein-coding 187.333-180 chr6 152647801 152648004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10540 NM_182961 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 185.333-28 chr11 50533354 50533515 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 124287 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 222.667-20 chr13 35348315 35348642 + 1.33333 NA intron (NM_015678, intron 36 of 57) intron (NM_015678, intron 36 of 57) 128211 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 203.333-84 chr14 81764684 81764941 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -21674 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 230.333-97 chr5 126793772 126794125 + 1.33333 NA intron (NR_134488, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 16812 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 245.666-18 chr4 33233564 33233780 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 806221 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 288.666-24 chr3 15692919 15693330 + 1.33333 NA intron (NM_001349280, intron 16 of 26) L1MB2|LINE|L1 4247 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 246.333-98 chr8 93605042 93605337 + 1.33333 NA intron (NR_033858, intron 5 of 10) intron (NR_033858, intron 5 of 10) 95244 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 241.333-83 chr5 25841914 25842120 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 651064 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 241.333-42 chr15 83760406 83760765 + 1.33333 NA intron (NM_207517, intron 3 of 29) L1MEg|LINE|L1 106462 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 259.666-25 chr3 69120698 69121121 + 1.33333 NA intron (NM_001304418, intron 2 of 3) intron (NM_001304418, intron 2 of 3) 1686 NM_001304418 56203 Hs.350621 NM_198271 ENSG00000163380 LMOD3 NEM10 leiomodin 3 protein-coding 220.666-79 chr9 79163945 79164162 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18387 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 196-181 chr8 92827678 92827882 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41720 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 142-9 chr1 160738798 160738929 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_021181) promoter-TSS (NM_021181) -194 NM_001282594 57823 Hs.517265 NM_021181 ENSG00000026751 SLAMF7 19A|CD319|CRACC|CS1 SLAM family member 7 protein-coding 338.667-17 chr18 33756327 33756789 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 178339 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 191.333-162 chr5 108152334 108152566 + 1.33333 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 229648 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 205.333-122 chr2 58085623 58085852 + 1.33333 NA intron (NM_001130483, intron 4 of 13) intron (NM_001130483, intron 4 of 13) 39025 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 338-32 chr8 133924958 133925489 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 38727 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 208.333-147 chr8 105946459 105946700 + 1.33333 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L1MEd|LINE|L1 113924 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 242-9 chr1 211238192 211238507 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -20928 NR_146433 55758 Hs.356399 NM_018254 ENSG00000117625 RCOR3 - REST corepressor 3 protein-coding 202-38 chr13 63714461 63714626 + 1.33333 NA intron (NR_047011, intron 3 of 3) intron (NR_047011, intron 3 of 3) -22892 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 199.333-65 chr14 29271641 29271791 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -485929 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 209-122 chr8 102453250 102453530 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40690 NM_015902 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 248.666-37 chr7 150463124 150463349 + 1.33333 NA intron (NM_175571, intron 1 of 4) L1M2|LINE|L1 12606 NM_175571 155038 Hs.647121 NM_175571 ENSG00000171115 GIMAP8 IAN-9|IAN6|IAN9|IANT GTPase, IMAP family member 8 protein-coding 309.666-16 chr7 112548907 112549301 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 68113 NM_182597 286006 Hs.396189 NM_182597 ENSG00000181016 LSMEM1 C7orf53 leucine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 243.333-12 chr11 89517356 89517682 + 1.33333 NA intron (NM_001143837, intron 2 of 20) AluJr|SINE|Alu -25300 NM_001300995 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 196.333-161 chr7 83195354 83195517 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32551 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 171.333-161 chr6 16904366 16904587 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -142986 NM_001128164 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 178.667-166 chr8 116363640 116363897 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38709 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 222-15 chr10 93215683 93215886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 141891 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 213-69 chr5 55261193 55261481 + 1.33333 NA intron (NR_144323, intron 25 of 26) intron (NR_144323, intron 25 of 26) -27620 NR_125347 10309 Hs.3041 NM_021147 ENSG00000152669 CCNO CCNU|CILD29|UDG2 cyclin O protein-coding 291.666-11 chr4 32692027 32692463 + 1.33333 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 341207 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 187.333-118 chr21 22766650 22766833 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -312543 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 178.333-68 chr18 77931107 77931275 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 62536 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 222-55 chr3 6074127 6074520 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 731126 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 245.333-3 chr1 82680046 82680322 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -222999 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 257.333-67 chr3 163978072 163978332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193354 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 256.333-84 chr8 123653461 123653845 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001081675, exon 1 of 4) 5' UTR (NM_001081675, exon 1 of 4) 148 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 210.666-66 chr3 28897570 28897745 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 322379 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 202.333-126 chr4 62113864 62114097 + 1.33333 NA intron (NR_110595, intron 6 of 7) L1MEd|LINE|L1 47785 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 188.666-44 chrX 47609739 47609921 + 1.33333 NA intron (NM_006950, intron 1 of 12) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 10027 NM_006950 6853 Hs.225936 NM_006950 ENSG00000008056 SYN1 SYN1a|SYN1b|SYNI synapsin I protein-coding 223.666-28 chr5 19362968 19363291 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 523143 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 366.333-26 chr8 123498820 123499238 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001242463, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001242463, exon 7 of 7) 33114 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 209.333-52 chr13 93767375 93767573 + 1.33333 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) intron (NM_005708, intron 2 of 8) 90999 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 253.666-23 chr5 148623364 148623566 + 1.33333 NA intron (NM_001040172, intron 1 of 5) intron (NM_001040172, intron 1 of 5) 13596 NM_001286410 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 195-36 chr13 114214978 114215251 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -19731 NM_003903 8881 Hs.374127 NM_003903 ENSG00000130177 CDC16 ANAPC6|APC6|CDC16Hs|CUT9 cell division cycle 16 protein-coding 212.666-50 chr2 232059092 232059320 + 1.33333 NA intron (NR_046477, intron 5 of 18) intron (NR_046477, intron 5 of 18) 97493 NR_046477 129563 Hs.732236 NM_152383 ENSG00000144535 DIS3L2 FAM6A|PRLMNS|hDIS3L2 DIS3 like 3'-5' exoribonuclease 2 protein-coding 223.666-13 chr14 63920298 63920504 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 2 of 114) L2c|LINE|L2 67397 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 229-60 chr6 61505934 61506192 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -68067 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 208-147 chr6 75259443 75259620 + 1.33333 NA intron (NM_001143958, intron 3 of 5) intron (NM_001143958, intron 3 of 5) -9233 NM_001865 1347 Hs.70312 NM_001865 ENSG00000112695 COX7A2 COX7AL|COX7AL1|COXVIIAL|COXVIIa-L|VIIAL cytochrome c oxidase subunit 7A2 protein-coding 427.333-6 chr2 223283284 223283833 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 231628 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 186.667-42 chr15 67748943 67749188 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 19 of 21) intron (NM_001206804, intron 19 of 21) -76444 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 255-46 chr2 109373523 109373796 + 1.33333 NA intron (NM_001099289, intron 3 of 9) L1ME3|LINE|L1 -60034 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 293.667-48 chr4 53465836 53466248 + 1.33333 NA intron (NM_001126328, intron 9 of 10) Charlie10|DNA|hAT-Charlie -34035 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 250.333-67 chr6 138300750 138300995 + 1.33333 NA intron (NM_020340, intron 22 of 33) L1MEg|LINE|L1 -76771 NM_001368163 110806279 NM_001368163 ENSG00000262543 SMIM28 - small integral membrane protein 28 protein-coding 172.333-200 chrX 81395034 81395219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193024 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 242.667-87 chr5 113906727 113907133 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 393236 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 242.667-96 chr7 105262600 105262919 + 1.33333 NA intron (NM_182692, intron 2 of 15) intron (NM_182692, intron 2 of 15) 6318 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 443.999-2 chr6 118540856 118541348 + 1.33333 NA intron (NM_001042475, intron 3 of 12) intron (NM_001042475, intron 3 of 12) -7194 NM_002667 5350 Hs.170839 NM_002667 ENSG00000198523 PLN CMD1P|CMH18|PLB phospholamban protein-coding 200-135 chr5 108459070 108459266 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -77070 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 211-61 chr3 30349235 30349464 + 1.33333 NA Intergenic (TTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -169519 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 263.667-53 chr20 34773669 34774047 + 1.33333 NA intron (NM_001242539, intron 2 of 11) intron (NM_001242539, intron 2 of 11) 8546 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 161-94 chr7 75711106 75711312 + 1.33333 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) intron (NM_005338, intron 1 of 30) 27732 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 218.666-65 chr7 28875930 28876109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 82311 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 207.333-84 chr14 43904042 43904197 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 603164 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 198-169 chr7 31886128 31886349 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 184169 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 326-18 chr17 79430334 79430669 + 1.33333 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 85647 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 292.666-20 chr2 180946549 180946897 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -33662 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 188-83 chr4 97207895 97208080 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -158939 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 221.333-100 chr4 65206688 65206961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -202324 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 200.333-33 chr12 83667622 83667870 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 980591 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 194-96 chr3 167684198 167684394 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_145860, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_145860, exon 8 of 8) -26373 NM_001348951 151790 Hs.213762 NM_178824 ENSG00000174776 WDR49 - WD repeat domain 49 protein-coding 207.333-133 chr2 70090162 70090376 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2792 NM_006196 5093 Hs.2853 NM_006196 ENSG00000169564 PCBP1 HEL-S-85|HNRPE1|HNRPX|hnRNP-E1|hnRNP-X poly(rC) binding protein 1 protein-coding 359 chr1 163354298 163354606 + 1.33333 NA intron (NM_145697, intron 13 of 13) intron (NM_145697, intron 13 of 13) 32498 NM_031423 83540 Hs.651950 NM_031423 ENSG00000143228 NUF2 CDCA1|CT106|NUF2R NUF2 component of NDC80 kinetochore complex protein-coding 400.666 chr10 97023564 97024013 + 1.33333 NA intron (NM_003061, intron 25 of 36) AluSq2|SINE|Alu -78968 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 249.333-68 chr3 99184393 99184836 + 1.33333 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -282919 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 302-10 chr11 9620489 9620864 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -43401 NM_001297714 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 233.333-2 chr1 69479891 69480171 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 46776 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 269.333-35 chr18 23915704 23915980 + 1.33333 NA intron (NM_001127717, intron 58 of 73) AluSz6|SINE|Alu 42822 NM_000227 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 218.666-20 chr12 48318922 48319188 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9925 NM_181788 341567 Hs.155833 NM_181788 ENSG00000187166 H1FNT H1.7|H1T2 H1 histone family member N, testis specific protein-coding 170-119 chr8 84375385 84375534 + 1.33333 NA intron (NM_001354319, intron 2 of 8) intron (NM_001354319, intron 2 of 8) -40025 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 127-60 chr3 112630758 112630880 + 1.33333 NA intron (NM_199512, intron 2 of 7) intron (NM_199512, intron 2 of 7) 10324 NM_199511 151887 Hs.477128 NM_199511 ENSG00000091986 CCDC80 CL2|DRO1|SSG1|URB|okuribin coiled-coil domain containing 80 protein-coding 250.333-17 chr12 64642126 64642394 + 1.33333 NA intron (NR_040718, intron 1 of 3) intron (NR_040718, intron 1 of 3) -19655 NR_037515 100500856 NR_037515 ENSG00000266016 MIR548Z - microRNA 548z ncRNA 195.333-161 chr4 94585279 94585444 + 1.33333 NA intron (NM_001011516, intron 7 of 9) AluSc8|SINE|Alu 133419 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 195-97 chr7 33960064 33960349 + 1.33333 NA intron (NM_133468, intron 4 of 15) intron (NM_133468, intron 4 of 15) 54667 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 215.333-206 chr9 28452184 28452428 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 266999 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 185.333-173 chr7 13424076 13424233 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 562360 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 160-20 chr10 107417869 107418068 + 1.33333 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -253262 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 436.999-2 chr5 72814441 72814914 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1914 NM_002270 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 174-67 chr3 156335641 156335872 + 1.33333 NA intron (NM_172159, intron 1 of 13) intron (NM_172159, intron 1 of 13) 44719 NM_001308222 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 213.333-3 chr1 34366170 34366461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 189408 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 179-36 chr16 27523185 27523514 + 1.33333 NA intron (NM_001520, intron 6 of 36) intron (NM_001520, intron 6 of 36) 26564 NM_001520 2975 Hs.371718 NM_001520 ENSG00000077235 GTF3C1 TFIIIC|TFIIIC220|TFIIICalpha general transcription factor IIIC subunit 1 protein-coding 225.666-20 chr3 89854433 89854659 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 746925 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 346.667-11 chr4 135903691 135904124 + 1.33333 NA intron (NR_103763, intron 1 of 2) AluSq4|SINE|Alu 9773 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 286-37 chr22 46716811 46717094 + 1.33333 NA intron (NM_022766, intron 3 of 12) AluSz6|SINE|Alu 21300 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 119.333-10 chr1 85699890 85700039 + 1.33333 NA intron (NM_017953, intron 5 of 9) intron (NM_017953, intron 5 of 9) 8469 NM_001170670 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 347-7 chr12 58850187 58850616 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68685 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 162-32 chr12 111573400 111573573 + 1.33333 NA intron (NM_001310121, intron 1 of 25) AluSx1|SINE|Alu 25829 NM_002973 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 244.999-5 chr9 23148475 23148765 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 502420 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 274.999-3 chr10 63353091 63353492 + 1.33333 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) intron (NM_001322258, intron 2 of 24) 19757 NR_031566 100302150 NR_031566 ENSG00000221063 MIR1296 MIRN1296|hsa-mir-1296|mir-1296 microRNA 1296 ncRNA 156.333-252 chr3 174300772 174300929 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -380054 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 362-17 chr3 76694246 76694634 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -345659 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 247.666-38 chr8 91440629 91440984 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 191487 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 194.666-15 chr12 70332383 70332549 + 1.33333 NA intron (NM_001199302, intron 7 of 16) intron (NM_001199302, intron 7 of 16) -33824 NM_014505 27345 Hs.525529 NM_014505 ENSG00000135643 KCNMB4 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 protein-coding 453-2 chr1 84950667 84951142 + 1.33333 NA intron (NM_153259, intron 6 of 13) intron (NM_153259, intron 6 of 13) 46209 NM_153259 255231 Hs.591446 NM_153259 ENSG00000153898 MCOLN2 TRP-ML2|TRPML2 mucolipin 2 protein-coding 237.666-6 chr14 19838633 19838916 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 30399 NM_001348266 283617 NM_001348266 ENSG00000176290 OR4K3 OR14-10|OR4K3P olfactory receptor family 4 subfamily K member 3 (gene/pseudogene) protein-coding 177.333-154 chr7 80748043 80748223 + 1.33333 NA intron (NM_006379, intron 17 of 17) intron (NM_006379, intron 17 of 17) 101480 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 401.333-6 chr12 48472465 48472801 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_012404) promoter-TSS (NM_012404) -32 NM_012404 23519 Hs.532658 NM_012404 ENSG00000139223 ANP32D PP32R2 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member D protein-coding 144-46 chr13 28430661 28430783 + 1.33333 NA intron (NM_002019, intron 7 of 29) intron (NM_002019, intron 7 of 29) 64406 NM_001159920 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 234-27 chr16 85559038 85559364 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -52208 NM_001134473 23199 Hs.461647 NM_014615 ENSG00000131149 GSE1 CRHSP24|KIAA0182 Gse1 coiled-coil protein protein-coding 177-2 chr1 42519229 42519411 + 1.33333 NA intron (NM_001355227, intron 6 of 18) L1MB3|LINE|L1 -13700 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 184-106 chr7 117029597 117029762 + 1.33333 NA intron (NR_161419, intron 1 of 15) L1M4|LINE|L1 9461 NM_001369599 7982 Hs.368131 NM_018412 ENSG00000004866 ST7 ETS7q|FAM4A|FAM4A1|HELG|RAY1|SEN4|TSG7 suppression of tumorigenicity 7 protein-coding 441-3 chr4 55608605 55609006 + 1.33333 NA intron (NR_120489, intron 4 of 8) intron (NR_120489, intron 4 of 8) -16560 NM_152401 132954 Hs.223712 NM_152401 ENSG00000163440 PDCL2 GCPHLP phosducin like 2 protein-coding 326.667-33 chr5 127694602 127695054 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8561 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 223.333-123 chr5 22250698 22250879 + 1.33333 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) L2|LINE|L2 -36938 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 184-59 chr20 32050710 32050954 + 1.33333 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -1410 NM_002110 3055 Hs.655210 NM_002110 ENSG00000101336 HCK JTK9|p59Hck|p61Hck HCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 282.666-19 chr5 152188005 152188466 + 1.33333 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) intron (NR_109876, intron 1 of 2) 217044 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 295.666-7 chr18 32081838 32082182 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9864 NM_016271 51444 Hs.302408 NM_016271 ENSG00000134758 RNF138 HSD-4|NARF|STRIN|hNARF ring finger protein 138 protein-coding 288.666-12 chr17 72090953 72091298 + 1.33333 NA intron (NR_110827, intron 5 of 5) intron (NR_110827, intron 5 of 5) 18792 NR_110827 101928205 Hs.620808 NR_110827 ENSG00000226101 LINC02097 - long intergenic non-protein coding RNA 2097 ncRNA 130.333-192 chr7 42503397 42503585 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 202956 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 200-138 chr5 157674933 157675189 + 1.33333 NA intron (NM_001145132, intron 1 of 2) intron (NM_001145132, intron 1 of 2) 3528 NM_001145132 100190949 Hs.720862 NM_001145132 ENSG00000187658 C5orf52 - chromosome 5 open reading frame 52 protein-coding 252-106 chr8 82549679 82549896 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -362317 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 187-32 chr2 53714681 53714949 + 1.33333 NA intron (NM_001201965, intron 5 of 8) intron (NM_001201965, intron 5 of 8) -52968 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 300-38 chr22 30117089 30117478 + 1.33333 NA intron (NM_001329457, intron 8 of 11) intron (NM_001329457, intron 8 of 11) 36819 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 263.666-11 chr3 125665080 125665564 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -69825 NM_022776 114885 Hs.477440 NM_022776 ENSG00000144909 OSBPL11 ORP-11|ORP11|OSBP12|TCCCIA00292 oxysterol binding protein like 11 protein-coding 412-7 chr4 49026624 49027080 + 1.33333 NA intron (NM_001286791, intron 9 of 15) L1PB2|LINE|L1 40210 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 370.666-22 chr7 13018875 13019363 + 1.33333 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 331486 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 265.333-17 chr12 21505119 21505367 + 1.33333 NA intron (NM_016072, intron 1 of 4) intron (NM_016072, intron 1 of 4) 3454 NM_016072 51026 Hs.62275 NM_016072 ENSG00000111711 GOLT1B CGI-141|GCT2|GOT1|GOT1B|YMR292W golgi transport 1B protein-coding 289-26 chr5 105575016 105575537 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 475802 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 191.333-21 chr10 26285288 26285550 + 1.33333 NA intron (NM_000818, intron 12 of 16) intron (NM_000818, intron 12 of 16) 68645 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 215.666-3 chr1 209792594 209792858 + 1.33333 NA intron (NM_006147, intron 5 of 8) intron (NM_006147, intron 5 of 8) -8167 NM_152485 148304 Hs.497642 NM_152485 ENSG00000162757 C1orf74 URLC4 chromosome 1 open reading frame 74 protein-coding 346.333-6 chr10 116876830 116877305 + 1.33333 NA intron (NM_001242699, intron 11 of 13) intron (NM_001242699, intron 11 of 13) -27345 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 298-15 chr10 118880604 118880953 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -125808 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 203.333-45 chr11 31687026 31687309 + 1.33333 NA intron (NM_001288726, intron 10 of 11) L2c|LINE|L2 113494 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 214-120 chr6 153726612 153726923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -283729 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 180.333-129 chr8 53581497 53581727 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -57647 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 347.666-9 chr22 27851436 27851992 + 1.33333 NA TTS (NM_001284277) TTS (NM_001284277) -49958 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 266-67 chr5 43705109 43705536 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_182977, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_182977, exon 22 of 22) -102092 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 192.666-2 chr1 73644832 73645042 + 1.33333 NA Intergenic LTR42|LTR|ERVL -29742 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 340-26 chr7 29342736 29343026 + 1.33333 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) intron (NM_001293070, intron 2 of 13) -133911 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 313.999-2 chr3 34343748 34344098 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 545293 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 293.333-21 chr18 3002841 3003372 + 1.33333 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) MIRb|SINE|MIR 8841 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 201.333-246 chr6 128963067 128963232 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 80008 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 344.333-13 chr21 30656467 30656854 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 13796 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 192.666-53 chr5 96260208 96260497 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 171807 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 195.333-160 chr4 94518605 94518891 + 1.33333 NA intron (NM_001256428, intron 2 of 11) intron (NM_001256428, intron 2 of 11) 66806 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 124.333-146 chr5 67355622 67355728 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -158876 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 213.333-41 chr12 44083923 44084293 + 1.33333 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 248027 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 196-24 chr10 84575345 84575522 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 150264 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 344.666-17 chr2 100709575 100710031 + 1.33333 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 106064 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 215.333-129 chr3 59963408 59963592 + 1.33333 NA intron (NM_001320901, intron 5 of 6) (GA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 117409 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 215.333-166 chr5 106657975 106658232 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 352911 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 248.666-34 chr7 3306552 3306907 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 5477 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 176.667-25 chr10 25566424 25566648 + 1.33333 NA intron (NM_020752, intron 6 of 10) (CCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -85176 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 207.333-183 chr3 95936192 95936387 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -253096 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 290.667-8 chr10 119937239 119937622 + 1.33333 NA intron (NM_007190, intron 18 of 18) AluSx1|SINE|Alu -21083 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 212-15 chr1 180031347 180031516 + 1.33333 NA exon (NM_014810, exon 15 of 38) exon (NM_014810, exon 15 of 38) 76621 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 248-77 chr7 37322993 37323405 + 1.33333 NA intron (NM_001206480, intron 2 of 21) UCON74|DNA?|DNA? 30469 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 138-12 chr10 28618566 28618716 + 1.33333 NA intron (NM_100486, intron 12 of 12) intron (NM_100486, intron 12 of 12) -58880 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 227.333-32 chr12 95042481 95042665 + 1.33333 NA intron (NM_001127362, intron 9 of 11) intron (NM_001127362, intron 9 of 11) 31045 NM_003297 7181 Hs.108301 NM_003297 ENSG00000120798 NR2C1 TR2 nuclear receptor subfamily 2 group C member 1 protein-coding 195.333-138 chr22 19793140 19793320 + 1.33333 NA intron (NM_053004, intron 7 of 7) L1MEf|LINE|L1 36527 NM_080647 6899 Hs.173984 NM_005992 ENSG00000184058 TBX1 CAFS|CATCH22|CTHM|DGCR|DGS|DORV|TBX1C|TGA|VCF|VCFS T-box transcription factor 1 protein-coding 142-168 chrX 155670085 155670242 + 1.33333 NA intron (NM_001304990, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR -57211 NM_018196 55217 Hs.133321 NM_018196 ENSG00000185973 TMLHE AUTSX6|BBOX2|TMLD|TMLH|TMLHED|XAP130 trimethyllysine hydroxylase, epsilon protein-coding 227.666-8 chr11 131039422 131039707 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -123077 NM_001347926 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 238.667 chr1 100645368 100645716 + 1.33333 NA intron (NR_038914, intron 1 of 4) intron (NR_038914, intron 1 of 4) 1462 NR_038914 100128787 Hs.536050 NR_038914 LINC01349 - long intergenic non-protein coding RNA 1349 ncRNA 180.333-85 chr3 119225040 119225321 + 1.33333 NA intron (NM_003778, intron 4 of 7) intron (NM_003778, intron 4 of 7) -1306 NR_046574 100874201 Hs.721307 NR_046574 ENSG00000240254 B4GALT4-AS1 - B4GALT4 antisense RNA 1 ncRNA 351.666-13 chr4 93140752 93141102 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 3 of 14) intron (NM_001286838, intron 3 of 14) -687826 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 213.333-7 chr1 82520595 82520893 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -382439 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 149-17 chr10 41859817 41859999 + 1.33333 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 508137 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 340-13 chr17 33991939 33992329 + 1.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 164672 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 179.333-156 chr5 105546625 105546893 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 447285 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 203.333-243 chr7 33012432 33012656 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 28362 NM_016489 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 209-22 chr11 80232379 80232685 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 530271 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 365.666-3 chr1 194092396 194092778 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 787842 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 193.667-78 chr21 24483644 24483902 + 1.33333 NA intron (NR_135520, intron 4 of 5) intron (NR_135520, intron 4 of 5) 55033 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 198.333-180 chr6 167783130 167783380 + 1.33333 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -12274 NR_149041 441179 Hs.192711 NR_149041 ENSG00000269155 LOC441179 - uncharacterized LOC441179 ncRNA 163.333-22 chr1 186505316 186505554 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44321 NM_002597 5132 Hs.654381 NM_002597 ENSG00000116703 PDC MEKA|PHD|PhLOP|PhLP phosducin protein-coding 186.667-62 chr2 23650432 23650679 + 1.33333 NA intron (NM_052920, intron 5 of 13) intron (NM_052920, intron 5 of 13) 265376 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 219.333-54 chr15 39681837 39682027 + 1.33333 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 100853 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 220-108 chr6 161713265 161713472 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) MER21B|LTR|ERVL 242391 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 309.333-56 chr7 25226104 25226489 + 1.33333 NA intron (NM_022150, intron 2 of 2) intron (NM_022150, intron 2 of 2) 2190 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 347.333-27 chr7 150362939 150363271 + 1.33333 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -4991 NM_001362746 29803 Hs.647086 NM_013400 ENSG00000214022 REPIN1 AP4|RIP60|ZNF464|Zfp464 replication initiator 1 protein-coding 196.666-44 chr2 37499127 37499277 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 154572 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 276.333-7 chr10 109013663 109014003 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 909413 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 299.333-26 chr14 62697282 62697722 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 347956 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 314.333-15 chr3 45929657 45930135 + 1.33333 NA intron (NM_024513, intron 16 of 17) intron (NM_024513, intron 16 of 17) -13568 NM_006564 10663 Hs.34526 NM_006564 ENSG00000172215 CXCR6 BONZO|CD186|STRL33|TYMSTR C-X-C motif chemokine receptor 6 protein-coding 372.666-5 chr16 3437590 3438016 + 1.33333 NA intron (NM_152457, intron 3 of 3) intron (NM_152457, intron 3 of 3) 5701 NM_152457 146434 Hs.88630 NM_152457 ENSG00000167981 ZNF597 HIT-4 zinc finger protein 597 protein-coding 282.666-26 chr8 121630709 121630981 + 1.33333 NA intron (NM_005328, intron 1 of 3) intron (NM_005328, intron 1 of 3) -8501 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 242.667-81 chr5 20482524 20482962 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) L1MA3|LINE|L1 92970 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 440.666-14 chr8 116917508 116918154 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20376 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 129.333-113 chr22 45728792 45728976 + 1.33333 NA intron (NM_013236, intron 6 of 11) MIR|SINE|MIR -31640 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 212.667-79 chr2 156007952 156008222 + 1.33333 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 246844 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 154.667-367 chr7 46753497 46753646 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -56449 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 236-44 chr2 118757273 118757487 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90803 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 181-44 chr2 217419394 217419588 + 1.33333 NA intron (NR_026597, intron 8 of 12) intron (NR_026597, intron 8 of 12) 136758 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 223-64 chr8 86203289 86203582 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26946 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 205.333-65 chr13 65172190 65172417 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -693744 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 258.666-10 chr12 13069508 13069867 + 1.33333 NA intron (NM_020853, intron 9 of 12) intron (NM_020853, intron 9 of 12) 25306 NM_020853 57613 Hs.132660 NM_020853 ENSG00000084444 FAM234B KIAA1467 family with sequence similarity 234 member B protein-coding 227.666-27 chr5 39066202 39066418 + 1.33333 NA intron (NM_001285439, intron 2 of 38) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 8089 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 246.666-8 chr11 129107127 129107462 + 1.33333 NA intron (NM_001142685, intron 4 of 21) L1M4|LINE|L1 -83106 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 197.333-26 chr10 111067507 111067695 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -9428 NM_000681 150 Hs.249159 NM_000681 ENSG00000150594 ADRA2A ADRA2|ADRA2R|ADRAR|ALPHA2AAR|ZNF32 adrenoceptor alpha 2A protein-coding 371.333-10 chr14 68135045 68135578 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 311719 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 311.333-54 chr7 84816156 84816478 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 283841 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 228.333 chr1 34402867 34403165 + 1.33333 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 226109 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 335.333-37 chr5 20357668 20358064 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) L1PA16|LINE|L1 52315 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 204-106 chr2 171557584 171557891 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001127383, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001127383, exon 3 of 3) 35263 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 114.667-210 chr5 66769466 66769666 + 1.33333 NA intron (NM_001290228, intron 2 of 4) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -59207 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 209.666-9 chr10 17961048 17961298 + 1.33333 NA intron (NM_001145195, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 9255 NM_001145195 221074 Hs.350895 NM_152725 ENSG00000148482 SLC39A12 LZT-Hs8|ZIP-12|bA570F3.1 solute carrier family 39 member 12 protein-coding 200.333-75 chr2 139427160 139427447 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 529979 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 150.666-17 chr7 85525724 85525878 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 104679 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 231-26 chr2 44187966 44188358 + 1.33333 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) intron (NM_177969, intron 1 of 4) 19287 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 189.333-127 chr3 29748940 29749152 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 5 of 13) LTR49-int|LTR|ERV1 185110 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 212-158 chr9 35001163 35001355 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 10969 NM_001135005 25822 Hs.237506 NM_012266 ENSG00000137094 DNAJB5 Hsc40 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B5 protein-coding 250-20 chr11 109719156 109719486 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 297131 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 305.666-6 chr11 99489935 99490341 + 1.33333 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) intron (NM_001243271, intron 2 of 20) -66007 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 177-69 chr6 80707004 80707176 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 600419 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 219.666-17 chr15 64375327 64375548 + 1.33333 NA intron (NM_001029989, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 6004 NM_001029989 9768 Hs.81892 NM_014736 ENSG00000166803 PCLAF KIAA0101|L5|NS5ATP9|OEATC|OEATC-1|OEATC1|PAF|PAF15|p15(PAF)|p15/PAF|p15PAF PCNA clamp associated factor protein-coding 356.333-12 chr15 58407232 58407607 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24572 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 216-50 chr18 36871744 36871974 + 1.33333 NA intron (NR_136303, intron 4 of 13) intron (NR_136303, intron 4 of 13) -42643 NM_001271950 25941 Hs.436636 NM_015476 ENSG00000134779 TPGS2 C18orf10|HMFN0601|L17|PGs2 tubulin polyglutamylase complex subunit 2 protein-coding 198.667-183 chr8 91629483 91629734 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 380289 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 193.333-126 chr3 113394696 113394874 + 1.33333 NA intron (NM_001164496, intron 15 of 34) MER30|DNA|hAT-Charlie -9213 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 203.666-7 chr1 232265268 232265477 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 250236 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 208-87 chr2 231705239 231705494 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3159 NM_001099285 5757 Hs.459927 NM_002823 ENSG00000187514 PTMA TMSA prothymosin alpha protein-coding 364.333-8 chr12 104681866 104682298 + 1.33333 NA intron (NM_018413, intron 2 of 2) AluY|SINE|Alu 90449 NR_037487 100500843 NR_037487 ENSG00000264295 MIR3922 - microRNA 3922 ncRNA 212-75 chr18 40660154 40660397 + 1.33333 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 593989 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 214.667-54 chr17 74926606 74926954 + 1.33333 NA intron (NM_178160, intron 3 of 6) AluSz|SINE|Alu 2505 NM_178160 92736 Hs.352515 NM_178160 ENSG00000183034 OTOP2 - otopetrin 2 protein-coding 193.667-22 chr10 121819235 121819511 + 1.33333 NA intron (NM_001001976, intron 10 of 11) intron (NM_001001976, intron 10 of 11) 108658 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 163.666-10 chr3 21080818 21080981 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -324827 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 276-30 chr17 58904225 58904700 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 148593 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 205.333-213 chr7 3847349 3847642 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) MIRb|SINE|MIR -282190 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 203.667-31 chr14 83151451 83151741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 508964 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 294.666-35 chr7 114156780 114157134 + 1.33333 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) 70630 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 294-8 chr1 181785738 181786095 + 1.33333 NA intron (NM_001205293, intron 43 of 47) intron (NM_001205293, intron 43 of 47) 275796 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 240.666-14 chr14 20052077 20052353 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -7830 NM_001004717 122742 Hs.553574 NM_001004717 ENSG00000176246 OR4L1 OR14-28|OR4L2P olfactory receptor family 4 subfamily L member 1 protein-coding 190-134 chrX 82990974 82991216 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -517195 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 413.333-15 chr8 20675816 20676342 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61153 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 152.666 chr10 32627819 32627973 + 1.33333 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) L1MA7|LINE|L1 181756 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 411.333-20 chr8 114343634 114344092 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -906924 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 175.667-103 chr3 146449673 146449940 + 1.33333 NA intron (NM_001199978, intron 7 of 9) intron (NM_001199978, intron 7 of 9) 19495 NM_001199978 57047 Hs.744414 NM_020359 ENSG00000163746 PLSCR2 - phospholipid scramblase 2 protein-coding 210.666-69 chr3 119213894 119214053 + 1.33333 NA intron (NM_003778, intron 7 of 7) AluJo|SINE|Alu -12513 NR_046574 100874201 Hs.721307 NR_046574 ENSG00000240254 B4GALT4-AS1 - B4GALT4 antisense RNA 1 ncRNA 240.666-35 chr6 43459277 43459562 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -2787 NM_001286655 65989 Hs.337251 NM_023932 ENSG00000171462 DLK2 DLK-2|EGFL9 delta like non-canonical Notch ligand 2 protein-coding 201.333-73 chr12 24147518 24147786 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) L1ME2|LINE|L1 -64769 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 193.333-33 chr11 11096515 11096773 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 238427 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 226-23 chr14 53207538 53207821 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 54325 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 241.333-82 chr5 20329359 20329579 + 1.33333 NA intron (NR_146519, intron 1 of 1) intron (NR_146519, intron 1 of 1) 23918 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 202-74 chr19 16866231 16866500 + 1.33333 NA intron (NM_001297595, intron 11 of 18) intron (NM_001297595, intron 11 of 18) 3091 NM_001297597 23309 Hs.13999 NM_015260 ENSG00000127511 SIN3B - SIN3 transcription regulator family member B protein-coding 196-74 chr18 2508047 2508211 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 63376 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 242.667-30 chr13 112513774 112514199 + 1.33333 NA intron (NM_006322, intron 17 of 21) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 74167 NM_001286278 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 196-36 chr12 38613841 38614082 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 291630 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 195-23 chr11 37446781 37447031 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -491695 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 230.999-3 chr4 79789548 79789779 + 1.33333 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -37808 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 247.666-39 chr9 72140018 72140316 + 1.33333 NA intron (NM_001242507, intron 1 of 13) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -9184 NM_001242505 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 228.666-34 chr4 36117180 36117374 + 1.33333 NA intron (NR_146894, intron 24 of 32) intron (NR_146894, intron 24 of 32) 126662 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 484.999 chr6 74334440 74334838 + 1.33333 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 265188 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 215.666-12 chr13 44794402 44794646 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15106 NR_038433 144817 Hs.585616 NR_038433 ENSG00000235097 LINC00330 NCRNA00330 long intergenic non-protein coding RNA 330 ncRNA 223.333-159 chr7 120633097 120633421 + 1.33333 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 224885 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 238-73 chr5 14627861 14628202 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 24351 NR_132980 106635683 NR_132980 SNORD141A - small nucleolar RNA, C/D box 141A snoRNA 209.333-230 chr8 69239768 69239973 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -135680 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 265.666-16 chr3 66966762 66967106 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31373 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 197.333-135 chr21 21635819 21636102 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 101359 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 259.666-13 chr13 100906018 100906318 + 1.33333 NA intron (NR_047687, intron 2 of 7) L1MB7|LINE|L1 38196 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 197.333-112 chr2 74969424 74969718 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_019896, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_019896, exon 4 of 4) 10928 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 243.333-99 chr6 123738851 123739121 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -64860 NM_001300737 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 235.666-11 chr4 28320876 28321150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -498569 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 150.333-278 chr3 162614712 162614901 + 1.33333 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 688495 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 363 chr1 99721616 99722109 + 1.33333 NA intron (NM_001013660, intron 9 of 16) AluSg4|SINE|Alu -8909 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 196.333-122 chr3 177771323 177771506 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45451 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 201.333-127 chr18 3051717 3051915 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -39869 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 326.667-27 chr4 88458803 88459190 + 1.33333 NA intron (NM_016323, intron 1 of 22) intron (NM_016323, intron 1 of 22) 1877 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 204.666-114 chr9 69798889 69799100 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 21745 NR_038833 494558 Hs.130722 NR_038833 ENSG00000225626 C9orf135-DT C9orf135-AS1 C9orf135 divergent transcript ncRNA 228.666-42 chr6 49784735 49785132 + 1.33333 NA TTS (NM_138733) TTS (NM_138733) 2352 NM_138733 5232 Hs.367727 NM_138733 ENSG00000170950 PGK2 HEL-S-272|PGKB|PGKPS|dJ417L20.2 phosphoglycerate kinase 2 protein-coding 190-94 chr4 124093762 124093955 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 319594 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 244.666-7 chr10 25054443 25054772 + 1.33333 NA intron (NM_001270383, intron 2 of 5) intron (NM_001270383, intron 2 of 5) 7672 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 216-27 chr14 44008783 44009102 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 498341 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 220.666-56 chr5 18801913 18802131 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 994748 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 204-52 chr13 22277456 22277616 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 67251 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 276.333-9 chr11 47557924 47558315 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -4987 NM_006560 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 276.333-46 chr4 154249028 154249403 + 1.33333 NA intron (NM_001358235, intron 16 of 19) L1PA16|LINE|L1 242584 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 208.999-2 chr19 17785484 17785645 + 1.33333 NA intron (NM_001161357, intron 26 of 28) AluY|SINE|Alu -9574 NM_014256 10331 Hs.69009 NM_014256 ENSG00000179913 B3GNT3 B3GAL-T8|B3GN-T3|B3GNT-3|HP10328|TMEM3|beta3Gn-T3 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3 protein-coding 123.666 chr1 245247310 245247467 + 1.33333 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) AluSz|SINE|Alu -12871 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 175.667-110 chr4 107914460 107914692 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001136258, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001136258, exon 7 of 7) -16973 NM_183075 113612 Hs.109087 NM_183075 ENSG00000155016 CYP2U1 P450TEC|SPG49|SPG56 cytochrome P450 family 2 subfamily U member 1 protein-coding 382.333-13 chr3 29624447 29624915 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 309475 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 192.667-111 chr3 119762747 119762971 + 1.33333 NA intron (NM_033364, intron 17 of 17) L1MA8|LINE|L1 -17625 NM_033013 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 159.667-249 chr5 13767793 13767937 + 1.33333 NA intron (NM_001369, intron 58 of 78) intron (NM_001369, intron 58 of 78) 176615 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 201.333-289 chr8 121890621 121890797 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -249269 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 294-55 chr5 167473528 167473812 + 1.33333 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -99989 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 296-20 chr15 72111807 72112109 + 1.33333 NA intron (NM_006901, intron 1 of 41) MIRb|SINE|MIR -2300 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 256.666-17 chr17 64112564 64112949 + 1.33333 NA intron (NM_001433, intron 1 of 21) MER21B|LTR|ERVL 17388 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 322.667-10 chr13 52829969 52830394 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18459 NM_002590 5100 Hs.19492 NM_002590 ENSG00000136099 PCDH8 ARCADLIN|PAPC protocadherin 8 protein-coding 155.333-77 chr12 44150999 44151143 + 1.33333 NA intron (NM_001286213, intron 3 of 6) intron (NM_001286213, intron 3 of 6) 314990 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 253.666-10 chr2 81753002 81753330 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -286220 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 241.333-53 chr2 74992430 74992636 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 33890 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 216.667-16 chr11 7478949 7479238 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -6413 NM_001370498 283298 Hs.503500 NM_198474 ENSG00000183801 OLFML1 MVAL564|UNQ564 olfactomedin like 1 protein-coding 215.666-15 chr14 67808683 67808883 + 1.33333 NA intron (NM_015346, intron 4 of 41) intron (NM_015346, intron 4 of 41) 7807 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 232-34 chr16 13490692 13490891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -429366 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 294.333-13 chr14 71335730 71335995 + 1.33333 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) 15386 NM_001354289 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 344.333-17 chr4 108862074 108862547 + 1.33333 NA intron (NM_001256074, intron 19 of 31) intron (NM_001256074, intron 19 of 31) -99257 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 267.999-4 chr5 51859817 51860076 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -148085 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 256.666-10 chr11 50505681 50506060 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 96723 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 178.666-24 chr8 112765345 112765555 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 121957 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 267.333-81 chr6 132722885 132723210 + 1.33333 NA exon (NM_001291702, exon 7 of 7) exon (NM_001291702, exon 7 of 7) -8992 NM_004666 8876 Hs.12114 NM_004666 ENSG00000112299 VNN1 HDLCQ8|Tiff66 vanin 1 protein-coding 244-12 chr1 202311513 202311841 + 1.33333 NA intron (NM_001017403, intron 16 of 17) AluSz|SINE|Alu 30259 NM_014176 29089 Hs.5199 NM_014176 ENSG00000077152 UBE2T FANCT|HSPC150|PIG50 ubiquitin conjugating enzyme E2 T protein-coding 290.667 chr1 50686779 50687141 + 1.33333 NA intron (NM_007051, intron 7 of 18) AluSz6|SINE|Alu -263517 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 242.667-25 chr12 40889107 40889438 + 1.33333 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) -19085 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 309.333-19 chr14 70082473 70082889 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -2464 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 203.333-232 chr6 68928175 68928343 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) AluJr4|SINE|Alu 292977 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 205-73 chr5 145053104 145053391 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 782095 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 285.666-7 chr4 76310587 76310986 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003943, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_003943, exon 2 of 2) 4760 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 224.333-90 chr4 113320346 113320514 + 1.33333 NA intron (NM_001354275, intron 27 of 43) AluSg|SINE|Alu 27591 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 202-163 chr6 106297293 106297576 + 1.33333 NA intron (NR_104403, intron 1 of 4) Looper|DNA|PiggyBac 18832 NR_104403 9474 Hs.486063 NM_004849 ENSG00000057663 ATG5 APG5|APG5-LIKE|APG5L|ASP|SCAR25|hAPG5 autophagy related 5 protein-coding 399.666-4 chr20 53481029 53481438 + 1.33333 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -71537 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 196.666-13 chr12 27397277 27397469 + 1.33333 NA intron (NR_109975, intron 1 of 3) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 49261 NR_109975 101928646 Hs.434269 NR_109975 ENSG00000245311 ARNTL2-AS1 - ARNTL2 antisense RNA 1 ncRNA 199-51 chr2 101294240 101294512 + 1.33333 NA intron (NM_173647, intron 2 of 6) intron (NM_173647, intron 2 of 6) 14325 NM_173647 284996 Hs.142074 NM_173647 ENSG00000163162 RNF149 DNAPTP2 ring finger protein 149 protein-coding 193.666-49 chr8 118726206 118726367 + 1.33333 NA TTS (NR_038210) TTS (NR_038210) -104323 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 194.666-57 chr5 144712557 144712792 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 507283 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 296.666-14 chr2 22512213 22512508 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -24119 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 311-37 chr8 125963335 125963711 + 1.33333 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -12326 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 194.666-68 chr8 4536443 4536660 + 1.33333 NA intron (NM_033225, intron 2 of 69) L1MC5|LINE|L1 458363 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 340.666-15 chr4 53045248 53045567 + 1.33333 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 183090 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 198-76 chr17 71088978 71089242 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113069 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 199.333-200 chr4 65548939 65549191 + 1.33333 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) LTR40b|LTR|ERVL 120423 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 189.333-58 chr15 58736980 58737149 + 1.33333 NA intron (NM_001320570, intron 1 of 14) intron (NM_001320570, intron 1 of 14) 12643 NM_001110 102 Hs.172028 NM_001110 ENSG00000137845 ADAM10 AD10|AD18|CD156c|CDw156|HsT18717|MADM|RAK|kuz ADAM metallopeptidase domain 10 protein-coding 196.333-134 chr4 131052652 131052921 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 676425 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 153-44 chr14 47366600 47366843 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -23475 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 189.666-25 chr20 3987707 3987897 + 1.33333 NA intron (NM_001134338, intron 1 of 6) intron (NM_001134338, intron 1 of 6) 27756 NM_001134338 11237 Hs.547576 NM_007219 ENSG00000101236 RNF24 G1L ring finger protein 24 protein-coding 165.333-194 chr4 136168259 136168443 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254671 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 172.666-13 chr2 98084532 98084718 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2542 NR_144298 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 214-33 chr12 96359830 96360123 + 1.33333 NA intron (NM_002595, intron 1 of 16) intron (NM_002595, intron 1 of 16) 40463 NM_001170464 5128 Hs.506415 NM_002595 ENSG00000059758 CDK17 PCTAIRE2|PCTK2 cyclin dependent kinase 17 protein-coding 236.666-15 chr14 64220091 64220347 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 109 of 114) intron (NM_015180, intron 109 of 114) 4265 NM_182910 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 183-89 chr5 160046257 160046407 + 1.33333 NA intron (NM_003314, intron 5 of 7) L2a|LINE|L2 37193 NM_003314 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 285.333-11 chr10 43723963 43724236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54726 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 270.333-43 chr4 77135731 77136049 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21317 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 201.333-192 chr3 111625608 111625906 + 1.33333 NA intron (NR_134917, intron 10 of 14) L1ME3F|LINE|L1 -30411 NM_024508 79413 Hs.136912 NM_024508 ENSG00000177494 ZBED2 - zinc finger BED-type containing 2 protein-coding 216-119 chr8 12760147 12760401 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4748 NM_001329976 91694 Hs.180178 NM_152271 ENSG00000154359 LONRF1 RNF191 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 1 protein-coding 272.333-34 chr2 126158945 126159169 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41072 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 322.666-21 chr5 37702424 37702796 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 12 of 17) intron (NM_001345998, intron 12 of 17) 132212 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 234.999-3 chr12 21177071 21177337 + 1.33333 NA intron (NM_006446, intron 5 of 14) intron (NM_006446, intron 5 of 14) 46010 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 332-15 chr2 32621912 32622296 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5946 NM_001193509 55622 Hs.468125 NM_017735 ENSG00000018699 TTC27 - tetratricopeptide repeat domain 27 protein-coding 201-90 chr5 38026629 38026796 + 1.33333 NA intron (NR_147009, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 1015 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 335-20 chr3 102195565 102195858 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32006 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 225-52 chr5 114370473 114370762 + 1.33333 NA intron (NM_001278204, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 8298 NM_001278204 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 216.667-3 chr1 49127830 49128114 + 1.33333 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) L1ME1|LINE|L1 -129439 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 219-86 chrX 39113412 39113671 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 213821 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 383.333-18 chr8 118160304 118160715 + 1.33333 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) L1ME2|LINE|L1 -48690 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 198-184 chr8 106085929 106086078 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25500 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 243.999-2 chr1 186233006 186233302 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -63119 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 175.333-160 chr6 88486109 88486419 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53105 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 160-35 chr12 93417967 93418158 + 1.33333 NA intron (NM_003348, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 23885 NM_003348 7334 Hs.524630 NM_003348 ENSG00000177889 UBE2N HEL-S-71|UBC13|UBCHBEN; UBC13|UbcH-ben|UbcH13 ubiquitin conjugating enzyme E2 N protein-coding 407.333-19 chr6 155694123 155694627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 179531 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 318.666-16 chr4 36927256 36927656 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74323 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 283.666-6 chr3 54931308 54931657 + 1.33333 NA intron (NM_001304389, intron 1 of 2) intron (NM_001304389, intron 1 of 2) -3423 NM_020678 57408 Hs.591668 NM_020678 ENSG00000144771 LRTM1 HT017 leucine rich repeats and transmembrane domains 1 protein-coding 296-8 chr10 52700620 52701049 + 1.33333 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 54570 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 277.333-23 chr13 82736942 82737197 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 1145324 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 118.667-194 chr8 104091795 104091950 + 1.33333 NA intron (NR_145711, intron 17 of 21) intron (NR_145711, intron 17 of 21) -131463 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 183-55 chr2 36058225 36058464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 297226 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 421.666-3 chr14 60924357 60924830 + 1.33333 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) intron (NM_001177963, intron 6 of 6) 56486 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 256-84 chr6 34634310 34634724 + 1.33333 NA intron (NM_022758, intron 2 of 3) L1M4a2|LINE|L1 -61637 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 179-5 chr1 106079126 106079440 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -51030 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 364-3 chr12 119576201 119576667 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17340 NM_001136534 387890 Hs.530965 NM_001136534 ENSG00000224982 TMEM233 DSPB2|IFITMD2 transmembrane protein 233 protein-coding 196-41 chr12 118358275 118358559 + 1.33333 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) intron (NM_001346490, intron 1 of 21) 1288 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 226.999-2 chr16 3955232 3955405 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4874 NR_120311 102724927 Hs.364739 NR_120311 ENSG00000262185 LOC102724927 - uncharacterized LOC102724927 ncRNA 337.333-48 chrX 146985226 146985581 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -170659 NM_001244892 100133053 NM_001244892 ENSG00000235699 CXorf51B CXorf51A chromosome X open reading frame 51B protein-coding 236-2 chr1 83766818 83767137 + 1.33333 NA intron (NR_119375, intron 1 of 2) intron (NR_119375, intron 1 of 2) 93569 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 302-7 chr1 205084637 205085007 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_203376) promoter-TSS (NM_203376) -362 NM_203376 388730 Hs.146928 NM_203376 ENSG00000174529 TMEM81 HC3107|KVLA2788|UNQ2788 transmembrane protein 81 protein-coding 174.333-21 chr12 6109354 6109563 + 1.33333 NA intron (NM_000552, intron 5 of 51) intron (NM_000552, intron 5 of 51) 15217 NM_000552 7450 Hs.440848 NM_000552 ENSG00000110799 VWF F8VWF|VWD von Willebrand factor protein-coding 122-109 chr6 146992901 146993079 + 1.33333 NA intron (NR_034115, intron 6 of 10) intron (NR_034115, intron 6 of 10) -165935 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 194.333-87 chr3 99558764 99558936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -79744 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 372.666-8 chr21 31349690 31350199 + 1.33333 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) intron (NM_001353690, intron 1 of 27) -5590 NM_001353687 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 211.333-106 chr2 34746683 34746912 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69240 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 215.333-134 chr3 119837610 119837815 + 1.33333 NA intron (NM_001354596, intron 9 of 9) intron (NM_001354596, intron 9 of 9) 55002 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 181-33 chr18 7921814 7922021 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 4 of 30) L1MA4|LINE|L1 354601 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 193.333-173 chr7 90959344 90959584 + 1.33333 NA intron (NM_012395, intron 8 of 13) intron (NM_012395, intron 8 of 13) 249648 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 201.333-198 chr3 124157196 124157413 + 1.33333 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) MIR3|SINE|MIR 24375 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 232.333-67 chr5 32746280 32746512 + 1.33333 NA intron (NM_001364460, intron 2 of 6) intron (NM_001364460, intron 2 of 6) 35075 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 347.666 chr1 110818328 110818652 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -52709 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 190-72 chr20 33277987 33278235 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5103 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 190-102 chr5 136984236 136984437 + 1.33333 NA intron (NM_004598, intron 9 of 10) intron (NM_004598, intron 9 of 10) -143861 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 273-25 chr3 97318280 97318634 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -121150 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 212-103 chr3 39988278 39988457 + 1.33333 NA intron (NM_001284424, intron 2 of 15) L1PA10|LINE|L1 -111644 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 223.999-3 chr12 124059781 124059956 + 1.33333 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) L1PA13|LINE|L1 86653 NM_001204298 144348 Hs.524828 NM_152437 ENSG00000179195 ZNF664 ZFOC1|ZNF176 zinc finger protein 664 protein-coding 269.333-48 chr2 148066957 148067232 + 1.33333 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -45490 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 210.333-24 chr11 42854968 42855128 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 414321 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 288-31 chr20 12467298 12467629 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 469500 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 256.666-34 chr4 65874230 65874627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -203933 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 503-3 chr5 161980862 161981386 + 1.33333 NA intron (NR_126372, intron 1 of 2) intron (NR_126372, intron 1 of 2) 20072 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 183-42 chr14 84311582 84311732 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -960275 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 220.333-109 chr4 152336112 152336291 + 1.33333 NA intron (NM_018315, intron 4 of 10) intron (NM_018315, intron 4 of 10) -1454 NR_104273 102191832 Hs.712524 NR_104273 ENSG00000270751 FBXW7-AS1 DEAR|DEspR FBXW7 antisense RNA 1 ncRNA 238-52 chr2 136066527 136066877 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49533 NM_001008540 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 250-89 chr8 82876872 82877256 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -35040 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 311.333-6 chr10 29551992 29552438 + 1.33333 NA intron (NM_001323599, intron 7 of 38) intron (NM_001323599, intron 7 of 38) -7118 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 207.333-117 chr17 62930484 62930707 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13620 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 211-85 chr5 169827398 169827656 + 1.33333 NA intron (NR_156756, intron 26 of 52) intron (NR_156756, intron 26 of 52) 152968 NM_001129891 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 291.999-6 chr21 16899120 16899408 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 309027 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 329.333-38 chr4 34501831 34502139 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -232238 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 202-194 chr9 35282639 35282804 + 1.33333 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) AluSx|SINE|Alu -59175 NM_001371188 267.333-50 chr2 133227230 133227593 + 1.33333 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -38784 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 202.333-156 chr6 99784364 99784602 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 177709 NM_021620 59336 Hs.287386 NM_021620 ENSG00000112238 PRDM13 MU-MB-20.220|PFM10 PR/SET domain 13 protein-coding 368.333-6 chr5 55486619 55487155 + 1.33333 NA intron (NM_003711, intron 1 of 5) AluSg|SINE|Alu 22039 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 292.666 chr1 163320753 163321139 + 1.33333 NA intron (NR_045630, intron 1 of 3) intron (NR_045630, intron 1 of 3) 845 NR_045630 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 220-91 chr5 91891386 91891665 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -508208 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 221-33 chr2 11736699 11736974 + 1.33333 NA intron (NM_001261427, intron 1 of 20) MamRep38|DNA|hAT -9796 NM_145693 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 302.667-3 chr10 8830830 8831206 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66971 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 240.333-67 chr4 67007176 67007551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 414637 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 172.333-63 chr16 84571221 84571461 + 1.33333 NA intron (NM_021149, intron 3 of 3) intron (NM_021149, intron 3 of 3) 46737 NM_021149 23406 Hs.289092 NM_021149 ENSG00000103187 COTL1 CLP coactosin like F-actin binding protein 1 protein-coding 203-64 chr22 37406892 37407082 + 1.33333 NA intron (NM_052906, intron 2 of 2) intron (NM_052906, intron 2 of 2) 20483 NR_110512 114794 Hs.344170 NM_052906 ENSG00000166897 ELFN2 LRRC62|PPP1R29 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 209-92 chr5 109062949 109063251 + 1.33333 NA intron (NR_146155, intron 16 of 19) intron (NR_146155, intron 16 of 19) 138494 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 284.333-14 chr14 50613981 50614445 + 1.33333 NA intron (NM_015915, intron 7 of 13) intron (NM_015915, intron 7 of 13) 54093 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 244.333-48 chr16 73429652 73430072 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43057 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 215-61 chr4 27907198 27907437 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 689838 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 286.333-46 chr8 129966131 129966384 + 1.33333 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) L1ME4b|LINE|L1 -26446 NM_001353244 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 200.666-87 chr4 86714154 86714314 + 1.33333 NA intron (NM_080685, intron 7 of 47) intron (NM_080685, intron 7 of 47) 119919 NM_006264 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 205.333-259 chr9 28330334 28330491 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) L1MC2|LINE|L1 388893 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 166.667-146 chr3 7223149 7223348 + 1.33333 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) 312036 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 273.666-5 chr10 60709885 60710301 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 23435 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 350.666-22 chr9 80554368 80554737 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 579529 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 260-65 chr5 110858062 110858348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 119198 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 197.333-113 chr2 76871050 76871230 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -114825 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 230.667-27 chr17 77161349 77161710 + 1.33333 NA intron (NM_001143999, intron 3 of 16) intron (NM_001143999, intron 3 of 16) 20560 NM_001143998 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 174.333-29 chr12 62350233 62350443 + 1.33333 NA intron (NR_147079, intron 7 of 21) intron (NR_147079, intron 7 of 21) 89934 NM_001351163 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 346-29 chr5 152653591 152653905 + 1.33333 NA intron (NR_109877, intron 4 of 4) L1MB7|LINE|L1 -248469 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 205.333-93 chr17 43501750 43501976 + 1.33333 NA intron (NR_136228, intron 11 of 23) L2b|LINE|L2 17888 NM_001322219 1659 Hs.463105 NM_004941 ENSG00000067596 DHX8 DDX8|Dhr2|HRH1|PRP22|PRPF22 DEAH-box helicase 8 protein-coding 296.666-12 chr18 50244740 50245057 + 1.33333 NA intron (NM_145020, intron 5 of 7) AluSz|SINE|Alu 21597 NM_145020 220136 Hs.658630 NM_145020 ENSG00000172361 CFAP53 CCDC11|HTX6 cilia and flagella associated protein 53 protein-coding 252.666-5 chr11 59623329 59623695 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7738 NM_002556 5007 Hs.597091 NM_002556 ENSG00000110048 OSBP OSBP1 oxysterol binding protein protein-coding 186.666-23 chr18 2913201 2913378 + 1.33333 NA exon (NM_032048, exon 8 of 8) exon (NM_032048, exon 8 of 8) 33334 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 242.333-33 chr16 14319235 14319493 + 1.33333 NA intron (NR_132983, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 10079 NR_029854 100126355 NR_029854 ENSG00000199130 MIR365A MIR365-1|MIRN365-1|hsa-mir-365a|mir-365a microRNA 365a ncRNA 204.667-138 chr7 6230424 6230703 + 1.33333 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) 42061 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 197-67 chr20 58601439 58601602 + 1.33333 NA intron (NR_034147, intron 6 of 6) L1MB8|LINE|L1 -33252 NR_125359 79160 Hs.280135 NR_125359 ENSG00000268941 LINC01711 - long intergenic non-protein coding RNA 1711 ncRNA 222.666-2 chr1 44903970 44904260 + 1.33333 NA intron (NM_001166588, intron 5 of 9) intron (NM_001166588, intron 5 of 9) -60862 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 200-5 chr1 63527910 63528070 + 1.33333 NA intron (NM_032437, intron 2 of 13) L1MA2|LINE|L1 4465 NM_032437 84455 Hs.652324 NM_032437 ENSG00000203965 EFCAB7 - EF-hand calcium binding domain 7 protein-coding 381.333 chr1 200644132 200644534 + 1.33333 NA exon (NM_001349804, exon 5 of 5) exon (NM_001349804, exon 5 of 5) 22418 NM_001320182 83479 Hs.497332 NM_031306 ENSG00000118197 DDX59 OFD5|ZNHIT5 DEAD-box helicase 59 protein-coding 172-19 chr10 59193373 59193532 + 1.33333 NA intron (NM_001143774, intron 1 of 4) intron (NM_001143774, intron 1 of 4) 15985 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 135.333-85 chr2 50028164 50028431 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) -54094 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 251.333-55 chr2 55679059 55679375 + 1.33333 NA intron (NM_033109, intron 8 of 27) intron (NM_033109, intron 8 of 27) 14627 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 196.333-166 chr8 100443922 100444126 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61261 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 198-178 chr8 30419850 30420100 + 1.33333 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu -34574 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 198-21 chr10 110233613 110233886 + 1.33333 NA intron (NM_001008541, intron 2 of 4) intron (NM_001008541, intron 2 of 4) 7753 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 357.999-5 chr8 137362658 137362965 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 50777 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 253.333-25 chr14 58450522 58450866 + 1.33333 NA exon (NM_001364701, exon 8 of 31) exon (NM_001364701, exon 8 of 31) 11013 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 217-61 chr3 105084002 105084244 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -282590 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 290.666 chr1 61250003 61250453 + 1.33333 NA intron (NR_104180, intron 2 of 3) intron (NR_104180, intron 2 of 3) 3290 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 143-25 chr11 82502749 82502938 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -98930 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 281-21 chr2 194716705 194717181 + 1.33333 NA Intergenic LTR86C|LTR|ERVL -13652 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 224.333-111 chr6 154292491 154292756 + 1.33333 NA intron (NM_015553, intron 1 of 11) intron (NM_015553, intron 1 of 11) 37458 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 231.333-48 chr17 8969215 8969504 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -3647 NM_001251853 23533 Hs.278901 NM_014308 ENSG00000141506 PIK3R5 F730038I15Rik|FOAP-2|P101-PI3K|p101 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 5 protein-coding 205-15 chr10 68148055 68148255 + 1.33333 NA intron (NR_045663, intron 4 of 17) L2c|LINE|L2 38667 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 199.333-267 chr8 14357158 14357349 + 1.33333 NA intron (NM_001322881, intron 2 of 6) intron (NM_001322881, intron 2 of 6) 496257 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 219-72 chr6 100605189 100605466 + 1.33333 NA intron (NM_006828, intron 33 of 41) MIR|SINE|MIR -141652 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 197-82 chr4 47084132 47084294 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 52646 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 195.333-44 chr11 29956956 29957118 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25356 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 381.333-16 chr3 73910442 73910864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 101409 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 308.667-45 chr9 79724152 79724584 + 1.33333 NA intron (NM_001351563, intron 17 of 17) intron (NM_001351563, intron 17 of 17) -100162 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 185.333-135 chr4 60644589 60644761 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -277944 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 394.333 chr1 108758745 108759192 + 1.33333 NA intron (NM_007269, intron 5 of 18) intron (NM_007269, intron 5 of 18) 12294 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 192-57 chr14 96383146 96383343 + 1.33333 NA intron (NM_016472, intron 3 of 3) AluJr4|SINE|Alu -8884 NM_001350888 122481 Hs.667462 NM_152327 ENSG00000140057 AK7 AK 7|SPGF27 adenylate kinase 7 protein-coding 191-66 chr7 84480914 84481159 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51440 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 291.333-71 chr9 70351026 70351461 + 1.33333 NA intron (NM_015110, intron 24 of 24) AluJb|SINE|Alu 63414 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 119 chr1 51890153 51890262 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -11270 NM_002525 4898 Hs.584782 NM_002525 ENSG00000078618 NRDC NRD1|hNRD1|hNRD2 nardilysin convertase protein-coding 213.666-7 chr10 99617049 99617227 + 1.33333 NA intron (NM_031212, intron 1 of 3) intron (NM_031212, intron 1 of 3) 3301 NM_031212 81894 Hs.403790 NM_031212 ENSG00000155287 SLC25A28 MFRN2|MRS3/4|MRS4L|NPD016 solute carrier family 25 member 28 protein-coding 339.333-43 chr7 67407966 67408370 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 72192 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 310.333-13 chr12 114103619 114104017 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137493 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 165.333-33 chr10 90130167 90130333 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -172877 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 202.666-31 chr14 32910540 32910777 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -28221 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 258.666-39 chr5 145121024 145121255 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 714203 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 238.667-75 chr6 19125320 19125606 + 1.33333 NA intron (NR_110860, intron 6 of 10) intron (NR_110860, intron 6 of 10) 55017 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 239.666-4 chr10 112532984 112533282 + 1.33333 NA intron (NM_001365710, intron 4 of 7) intron (NM_001365710, intron 4 of 7) -85530 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 280.333-12 chr14 72389459 72389926 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -127128 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 192.333-70 chr17 71386608 71386764 + 1.33333 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -184507 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 205.333-243 chr8 83121631 83121812 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 209617 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 296.667-48 chr5 143598612 143599056 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -81026 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 218-20 chr12 60361879 60362224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 672681 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 206.333-103 chr21 27346745 27346964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -375525 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 211.666-41 chr5 124862912 124863168 + 1.33333 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -117928 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 197.667-56 chr18 5971942 5972231 + 1.33333 NA intron (NR_158609, intron 15 of 17) intron (NR_158609, intron 15 of 17) -76132 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 296.666-2 chr10 42861584 42861827 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -9816 NR_134479 101929445 Hs.376403 NR_134479 ENSG00000234944 LINC02623 - long intergenic non-protein coding RNA 2623 ncRNA 133-80 chr5 118201042 118201208 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) L1MB4|LINE|L1 -81449 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 199-86 chr5 63220847 63221033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 642121 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 304.666-8 chr11 33170263 33170578 + 1.33333 NA intron (NR_034027, intron 1 of 3) intron (NR_034027, intron 1 of 3) 8763 NR_034027 338739 Hs.423476 NR_034027 ENSG00000247151 CSTF3-DT CSTF3-AS1 CSTF3 divergent transcript ncRNA 306-34 chr3 112943026 112943282 + 1.33333 NA intron (NM_138940, intron 1 of 2) L1MC1|LINE|L1 31949 NM_170780 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 230.666-28 chr2 69490041 69490258 + 1.33333 NA intron (NM_014911, intron 17 of 21) intron (NM_014911, intron 17 of 21) 30022 NR_003705 100124535 Hs.693447 NR_003705 ENSG00000207016 SNORA36C - small nucleolar RNA, H/ACA box 36C snoRNA 196.666-21 chr14 55082572 55082760 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 31019 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 163.333-265 chr7 89804151 89804328 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -315161 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 284.333-6 chr10 77622814 77623207 + 1.33333 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 14798 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 290-2 chr1 102259399 102259768 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -262349 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 233.333-41 chr15 27576649 27576923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -415467 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 232.333-21 chr14 44715096 44715279 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 83939 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 391-3 chr14 41900487 41901103 + 1.33333 NA intron (NM_001330106, intron 4 of 4) intron (NM_001330106, intron 4 of 4) 293939 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 275.666-19 chrX 44124263 44124551 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -151017 NM_000266 4693 Hs.522615 NM_000266 ENSG00000124479 NDP EVR2|FEVR|ND norrin cystine knot growth factor NDP protein-coding 211.333-118 chr2 105146954 105147129 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2928 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 333.666 chr1 183847248 183847857 + 1.33333 NA intron (NM_001297671, intron 2 of 17) intron (NM_001297671, intron 2 of 17) 42432 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 168.667-102 chr2 62230878 62231095 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15465 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 250-91 chr8 100775064 100775364 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -53126 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 119-74 chr2 47042710 47042910 + 1.33333 NA intron (NM_001288951, intron 15 of 20) intron (NM_001288951, intron 15 of 20) -100955 NM_001171511 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 220.667-99 chr7 117822183 117822491 + 1.33333 NA intron (NM_001363351, intron 2 of 22) L1M6|LINE|L1 49883 NM_001363350 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 242.666-30 chr4 96124735 96125002 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -185835 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 286-63 chr8 77122572 77123034 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -121759 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 201.666-33 chr4 32418658 32418926 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 67754 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 202.666-20 chr11 33984254 33984549 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67330 NM_005898 4076 Hs.471818 NM_005898 ENSG00000135387 CAPRIN1 GPIAP1|GPIP137|GRIP137|M11S1|RNG105|p137GPI cell cycle associated protein 1 protein-coding 438.999 chr1 174495732 174496098 + 1.33333 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) FLAM_C|SINE|Alu 47951 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 210.667-8 chr1 118872996 118873254 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 115218 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 199-127 chr9 33272143 33272387 + 1.33333 NA intron (NM_001195536, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 7216 NM_016410 51510 Hs.635313 NM_016410 ENSG00000086065 CHMP5 C9orf83|CGI-34|HSPC177|PNAS-2|SNF7DC2|Vps60 charged multivesicular body protein 5 protein-coding 215.999-7 chr4 90942967 90943130 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) intron (NM_001145065, intron 9 of 10) 708017 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 247.333-33 chr18 2122196 2122525 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 449145 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 232.666-50 chr8 70911137 70911443 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 241951 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 375.333-34 chr8 37152779 37153291 + 1.33333 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 340878 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 288.999 chr1 240455616 240456011 + 1.33333 NA intron (NM_020066, intron 16 of 17) AluSx1|SINE|Alu 156342 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 282.666-20 chr6 64542304 64542587 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 735609 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 205.333-123 chr2 64748592 64748775 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -94770 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 196.666-54 chr2 202284869 202285024 + 1.33333 NA intron (NM_015934, intron 5 of 14) FLAM_C|SINE|Alu -6371 NR_003694 100113392 Hs.693442 NR_003694 ENSG00000271852 SNORD11B - small nucleolar RNA, C/D box 11B snoRNA 338.667 chr1 45637846 45638405 + 1.33333 NA intron (NM_021639, intron 8 of 12) intron (NM_021639, intron 8 of 12) 8560 NR_026768 728963 Hs.675157 NR_026768 RPS15AP10 RPS15A_4_42 ribosomal protein S15a pseudogene 10 pseudo 212.666-76 chr6 65259497 65259917 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -41711 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 288-4 chr1 63404341 63404646 + 1.33333 NA exon (NM_013339, exon 5 of 15) exon (NM_013339, exon 5 of 15) 36866 NM_013339 29929 Hs.258501 NM_013339 ENSG00000088035 ALG6 CDG1C ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase protein-coding 215.333-113 chr20 57761528 57761802 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -50129 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 217.333-102 chr3 197050987 197051221 + 1.33333 NA intron (NM_001366216, intron 23 of 23) AluSx1|SINE|Alu -21287 NM_033316 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 128.667 chr1 7878463 7878598 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -25039 NM_021995 10911 Hs.715862 NM_006786 ENSG00000049247 UTS2 PRO1068|U-II|UCN2|UII urotensin 2 protein-coding 243.333-116 chr8 128950678 128950923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15201 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 236-33 chr19 36041670 36041985 + 1.33333 NA intron (NM_001331104, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu -8954 NM_015526 25999 Hs.466539 NM_015526 ENSG00000105270 CLIP3 CLIPR-59|CLIPR59|RSNL1 CAP-Gly domain containing linker protein 3 protein-coding 204-21 chr1 218374131 218374307 + 1.33333 NA intron (NR_138149, intron 2 of 7) intron (NR_138149, intron 2 of 7) -28541 NR_046268 728463 Hs.568469 NR_046268 ENSG00000232480 TGFB2-AS1 - TGFB2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 240-78 chr6 45149692 45149986 + 1.33333 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) 47931 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 185.333-49 chr14 67827079 67827322 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 3 of 10) intron (NM_133509, intron 3 of 10) 3608 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 298.333-44 chr8 131633562 131633968 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -270328 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 176-31 chr14 61531644 61531796 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 12 of 13) intron (NM_006255, intron 12 of 13) 38474 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 292-25 chr2 41801545 41801878 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -75844 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 273-19 chr2 27744152 27744519 + 1.33333 NA Intergenic LTR75|LTR|ERVL -27382 NM_145330 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 177.666-7 chr15 95182798 95183030 + 1.33333 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 144186 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 174.666-5 chr10 85575590 85575733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2070 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 209.333-82 chr16 11960578 11960777 + 1.33333 NA intron (NM_001355514, intron 2 of 8) intron (NM_001355514, intron 2 of 8) 3761 NM_001355514 729978 Hs.730028 NM_001355514 ENSG00000234719 NPIPB2 - nuclear pore complex interacting protein family, member B2 protein-coding 254.666-11 chr11 131816751 131816963 + 1.33333 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) intron (NM_001352006, intron 2 of 9) -93067 NM_001352009 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 172.666-19 chr4 61547616 61547770 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) L1PA15|LINE|L1 345521 NM_001371342 218-68 chr20 58059829 58060022 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 56021 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 146-43 chr17 40773863 40774035 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1790 NM_181539 353288 Hs.592133 NM_181539 ENSG00000186393 KRT26 CK26|K25|K25IRS2|K26|KRT25B keratin 26 protein-coding 371.666-11 chr3 185950424 185951023 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -9220 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 219.333-3 chr1 34199131 34199458 + 1.33333 NA intron (NM_032884, intron 2 of 6) intron (NM_032884, intron 2 of 6) 22387 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 296.667-37 chr22 28762906 28763316 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9563 NM_001284263 150275 Hs.406460 NM_173510 ENSG00000159873 CCDC117 dJ366L4.1 coiled-coil domain containing 117 protein-coding 261.333-113 chr9 29644547 29644799 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -431072 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 185.666-2 chr10 27474306 27474489 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29777 NM_001256415 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 208-143 chr6 52936819 52937067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27245 NM_001363542 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 228-94 chr8 129332219 129332429 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -91084 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 213.333-6 chr1 63490600 63490776 + 1.33333 NA intron (NM_001347148, intron 1 of 7) intron (NM_001347148, intron 1 of 7) 32585 NM_001347145 23421 Hs.166539 NM_014288 ENSG00000142856 ITGB3BP CENP-R|CENPR|HSU37139|NRIF3|TAP20 integrin subunit beta 3 binding protein protein-coding 210-131 chr6 62471549 62471800 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -185447 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 416.999-4 chr5 54700067 54700470 + 1.33333 NA intron (NR_104658, intron 1 of 2) L1MEg|LINE|L1 3056 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 196-100 chr20 59212913 59213146 + 1.33333 NA intron (NM_178457, intron 3 of 4) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 22009 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 194-13 chr10 129087056 129087335 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 174362 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 209.666-19 chr15 69049677 69049854 + 1.33333 NA intron (NM_024505, intron 14 of 15) MER5A|DNA|hAT-Charlie -31085 NR_026949 283673 Hs.177927 NM_173610 ENSG00000212766 EWSAT1 LINC00277|NCRNA00277|TMEM84 Ewing sarcoma associated transcript 1 ncRNA 407.999-3 chr7 105524994 105525348 + 1.33333 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -2900 NM_019042 54517 Hs.520619 NM_019042 ENSG00000091127 PUS7 IDDABS pseudouridine synthase 7 protein-coding 274-4 chr10 123110911 123111304 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -24863 NM_001105574 340784 Hs.531194 NM_001105574 ENSG00000188620 HMX3 NKX-5.1|NKX5.1|Nkx5-1 H6 family homeobox 3 protein-coding 167.333-238 chr7 10656189 10656341 + 1.33333 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 -46411 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 176-2 chr1 35681587 35681801 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 35217 NM_001348691 127703 Hs.112023 NM_152374 ENSG00000142686 C1orf216 - chromosome 1 open reading frame 216 protein-coding 198.333-66 chr15 56177036 56177251 + 1.33333 NA intron (NM_001368073, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 12789 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 220.667-80 chr5 36025449 36025756 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -24580 NM_001171873 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 218-100 chr6 164886907 164887206 + 1.33333 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -64993 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 213.333-102 chr2 151387753 151388051 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8531 NR_110248 101929319 Hs.639241 NR_110248 LOC101929319 - uncharacterized LOC101929319 ncRNA 197.666-4 chr10 44786106 44786428 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125049 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 254.999-7 chr9 111536331 111536630 + 1.33333 NA intron (NM_001007169, intron 5 of 5) AluY|SINE|Alu 11301 NM_001007169 158399 Hs.584864 NM_133464 ENSG00000173258 ZNF483 ZKSCAN16|ZSCAN48 zinc finger protein 483 protein-coding 241.666-7 chr19 15837949 15838134 + 1.33333 NA Intergenic LTR10C|LTR|ERV1 9094 NR_015379 652995 Hs.644234 NR_015379 ENSG00000214049 UCA1 CUDR|LINC00178|NCRNA00178|UCAT1|onco-lncRNA-36 urothelial cancer associated 1 ncRNA 221.666-24 chr18 6752490 6752742 + 1.33333 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -22754 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 212.667-7 chr1 118956025 118956286 + 1.33333 NA intron (NM_152380, intron 1 of 7) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 32188 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 133.333-45 chr12 114320945 114321135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -79270 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 218.666-60 chr5 112560761 112561024 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -67544 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 306-55 chr8 85271136 85271470 + 1.33333 NA intron (NM_198584, intron 6 of 6) L1MC3|LINE|L1 25845 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 223.666-10 chr13 46800926 46801176 + 1.33333 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR -3890 NM_001984 2098 Hs.432491 NM_001984 ENSG00000139684 ESD FGH esterase D protein-coding 294-48 chr4 89983067 89983346 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 88352 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 187.333-92 chr2 44190463 44190719 + 1.33333 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) intron (NM_177969, intron 1 of 4) 21716 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 201-67 chr20 46455644 46455872 + 1.33333 NA TTS (NR_045983) TTS (NR_045983) 1885 NR_045983 100130934 Hs.712133 NM_173643 ZNF663P ZNF663 zinc finger protein 663, pseudogene pseudo 126-119 chr8 125529282 125529491 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 97177 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 196-86 chr2 54018949 54019221 + 1.33333 NA intron (NM_001320587, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 47972 NM_001320586 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 468.666-6 chrX 52309940 52310379 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 26483 NR_107055 102466880 NR_107055 ENSG00000275335 MIR8088 hsa-mir-8088 microRNA 8088 ncRNA 257.333-4 chr1 62297720 62298141 + 1.33333 NA intron (NM_181712, intron 1 of 9) MER131|DNA?|DNA? 21504 NM_001320269 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 215-59 chr3 197722275 197722558 + 1.33333 NA intron (NM_001145642, intron 1 of 20) L1MA6|LINE|L1 14488 NM_014687 9711 Hs.478868 NM_014687 ENSG00000145016 RUBCN KIAA0226|RUBICON|SCAR15 rubicon autophagy regulator protein-coding 209-125 chr9 132643833 132644179 + 1.33333 NA intron (NR_136309, intron 13 of 18) intron (NR_136309, intron 13 of 18) 19320 NM_001322343 64794 Hs.660767 NM_022779 ENSG00000125485 DDX31 PPP1R25 DEAD-box helicase 31 protein-coding 450.333-8 chr5 51984811 51985206 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -23023 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 202.666-101 chr5 154537062 154537234 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -58921 NM_004821 9421 Hs.152531 NM_004821 ENSG00000113196 HAND1 Hxt|Thing1|bHLHa27|eHand heart and neural crest derivatives expressed 1 protein-coding 304.666-16 chr22 26150218 26150540 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -19083 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 375.333-31 chr7 53374313 53374654 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 338850 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 364-9 chr15 98804756 98805317 + 1.33333 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) 20610 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 254-55 chr4 29801442 29801788 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 587323 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 310.667-7 chr12 64445057 64445467 + 1.33333 NA intron (NM_007235, intron 24 of 24) intron (NM_007235, intron 24 of 24) -6858 NM_013254 29110 Hs.505874 NM_013254 ENSG00000183735 TBK1 FTDALS4|IIAE8|NAK|T2K TANK binding kinase 1 protein-coding 260.333-43 chr4 109095191 109095500 + 1.33333 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 207313 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 304.667-4 chr10 51893295 51893780 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) MER91A|DNA|hAT-Tip100 -193942 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 232.333-95 chrUn_KI270756v1 2492 2810 + 1.33333 NA NA (CCATTCCATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 341.666-7 chr3 19241023 19241600 + 1.33333 NA intron (NM_144633, intron 1 of 15) MIR3|SINE|MIR 73620 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 285.333-27 chr18 1287249 1287541 + 1.33333 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) L1MB8|LINE|L1 72234 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 216-64 chr2 183227904 183228196 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 103607 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 271.666-5 chr2 198560060 198560414 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -185140 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 209.333-102 chr2 17498478 17498682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19860 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 209.333-155 chr3 113364932 113365134 + 1.33333 NA intron (NM_001164496, intron 19 of 34) intron (NM_001164496, intron 19 of 34) -38965 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 183-56 chr2 72607606 72607870 + 1.33333 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 218295 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 298-82 chr9 100851269 100851540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -177323 NM_207299 54886 Hs.382683 NM_017753 ENSG00000148123 PLPPR1 LPPR1|PRG-3 phospholipid phosphatase related 1 protein-coding 151.666 chr10 11997602 11997886 + 1.33333 NA exon (NM_015542, exon 8 of 22) exon (NM_015542, exon 8 of 22) 45065 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 320.667-32 chr8 123594355 123594840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53391 NM_001242463 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 201.666-18 chr15 90903783 90904008 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_135504) promoter-TSS (NR_135504) -295 NR_135504 4122 Hs.116459 NM_006122 ENSG00000196547 MAN2A2 MANA2X mannosidase alpha class 2A member 2 protein-coding 189-65 chr3 164358372 164358523 + 1.33333 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -186891 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 175.333-73 chr18 58151398 58151554 + 1.33333 NA intron (NM_001144965, intron 1 of 30) intron (NM_001144965, intron 1 of 30) 2156 NM_001144968 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 179.333-107 chr2 216002028 216002181 + 1.33333 NA intron (NM_018000, intron 1 of 4) intron (NM_018000, intron 1 of 4) 11447 NM_018000 55686 Hs.620391 NM_018000 ENSG00000118242 MREG DSU|WDT2 melanoregulin protein-coding 159.333-209 chr3 70243304 70243517 + 1.33333 NA intron (NM_001364676, intron 2 of 4) intron (NM_001364676, intron 2 of 4) 69228 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 203-40 chr16 51290981 51291255 + 1.33333 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) intron (NR_039672, intron 6 of 6) -139846 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 292-34 chr20 44688262 44688661 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -16722 NR_034104 79015 Hs.671450 NM_024049 ENSG00000283440 LINC01260 - long intergenic non-protein coding RNA 1260 ncRNA 384.333-13 chr6 54869776 54870380 + 1.33333 NA intron (NM_001010872, intron 1 of 4) intron (NM_001010872, intron 1 of 4) 23307 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 201.333-170 chr20 39941665 39941876 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62691 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 273.333-12 chr11 82288626 82289012 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1MEb|LINE|L1 115094 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 244-99 chr8 105381835 105382142 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 62445 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 200.666-116 chr8 18661559 18661792 + 1.33333 NA intron (NM_015310, intron 9 of 15) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 147192 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 162-60 chr2 11311944 11312110 + 1.33333 NA intron (NM_001321643, intron 1 of 32) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 32609 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 296-16 chr13 93438138 93438543 + 1.33333 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 211533 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 150-100 chr3 112920849 112920998 + 1.33333 NA TTS (NM_170780) TTS (NM_170780) 54180 NM_170780 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 141.667-41 chr10 126864955 126865167 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -40348 NM_001380 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 185.666-17 chr5 84787273 84787421 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -402467 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 230.333-8 chr10 9332440 9332697 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36975 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 195.666-21 chr2 111916207 111916409 + 1.33333 NA intron (NM_006343, intron 1 of 18) L1MDa|LINE|L1 17701 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 197.333-140 chr21 35358169 35358363 + 1.33333 NA Intergenic MADE2|DNA|TcMar-Mariner 222498 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 305.333-2 chr1 204757315 204757786 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -71102 NM_001005389 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 184-87 chr5 78186634 78186842 + 1.33333 NA intron (NM_003664, intron 7 of 26) intron (NM_003664, intron 7 of 26) 107960 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 205.667-57 chr17 2353932 2354207 + 1.33333 NA intron (NM_001346700, intron 2 of 22) AluJr4|SINE|Alu 16568 NM_001098509 9905 Hs.513861 NM_014853 ENSG00000141258 SGSM2 RUTBC1 small G protein signaling modulator 2 protein-coding 335.666-6 chr19 28154619 28155004 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -360871 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 210.333-34 chr12 121139936 121140208 + 1.33333 NA intron (NR_033953, intron 1 of 10) intron (NR_033953, intron 1 of 10) 7196 NR_033950 5027 Hs.439682 NM_002562 ENSG00000089041 P2RX7 P2X7 purinergic receptor P2X 7 protein-coding 325.333-2 chr1 93888775 93889243 + 1.33333 NA exon (NM_002061, exon 7 of 7) exon (NM_002061, exon 7 of 7) -9803 NM_014597 30836 Hs.85769 NM_014597 ENSG00000067334 DNTTIP2 ERBP|FCF2|HSU15552|LPTS-RP2|TdIF2 deoxynucleotidyltransferase terminal interacting protein 2 protein-coding 214.999-2 chr12 37676582 37676743 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -640112 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 199.333-47 chr11_GL383547v1_alt 53394 53633 + 1.33333 NA NA L1PA16|LINE|L1 NA NA 220.333-104 chr4 58081632 58081908 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 454558 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 338.666-17 chr8 122581321 122581715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12874 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 116.333-64 chr14 51017386 51017516 + 1.33333 NA intron (NM_015163, intron 3 of 9) intron (NM_015163, intron 3 of 9) -72968 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 284-64 chr9 36583501 36583970 + 1.33333 NA intron (NM_001256688, intron 3 of 15) intron (NM_001256688, intron 3 of 15) 10840 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 137.333-177 chr7 45516589 45516767 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -57462 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 182.666-34 chr5 30565809 30565960 + 1.33333 NA Intergenic MER34A1|LTR|ERV1 -627802 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 171.666-4 chr18 9821772 9821920 + 1.33333 NA intron (NM_006868, intron 5 of 6) L1MD2|LINE|L1 -64127 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 176.666-26 chr5 121286210 121286356 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36267 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 214.666-11 chr10 79477573 79477747 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -32036 NM_153367 219654 Hs.523080 NM_153367 ENSG00000165424 ZCCHC24 C10orf56|Z3CXXC8 zinc finger CCHC-type containing 24 protein-coding 141.333-192 chr5 77928678 77928883 + 1.33333 NA intron (NR_105012, intron 1 of 1) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29467 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 233.666-24 chr5 133033032 133033247 + 1.33333 NA Intergenic MER92C|LTR|ERV1 -6590 NM_001308128 54819 Hs.29700 NM_017665 ENSG00000155329 ZCCHC10 - zinc finger CCHC-type containing 10 protein-coding 286-5 chr11 29473450 29473867 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -120755 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 255.333-13 chr11 3369955 3370158 + 1.33333 NA intron (NR_046381, intron 4 of 6) L1MA4|LINE|L1 9090 NM_001242843 7748 Hs.386294 NM_007152 ENSG00000005801 ZNF195 HRF1|ZNFP104 zinc finger protein 195 protein-coding 194.667-8 chr1 95070771 95071051 + 1.33333 NA intron (NM_144988, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 2040 NM_144988 199857 Hs.408927 NM_144988 ENSG00000172339 ALG14 CMS15 ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit protein-coding 268.667-14 chr14 52462019 52462331 + 1.33333 NA intron (NM_001160047, intron 16 of 20) MER57A-int|LTR|ERV1 90330 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 207.333-9 chr1 85935463 85935675 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 24 of 59) intron (NM_152890, intron 24 of 59) 220902 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 204.666-104 chr8 117186943 117187097 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 52025 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 208.666-56 chr2 30531315 30531541 + 1.33333 NA intron (NM_182551, intron 3 of 6) intron (NM_182551, intron 3 of 6) 84182 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 287.999-2 chr16 84904937 84905363 + 1.33333 NA intron (NM_031476, intron 14 of 14) AluJb|SINE|Alu 85165 NM_031476 83716 Hs.513779 NM_031476 ENSG00000103196 CRISPLD2 CRISP11|LCRISP2|LGL1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 protein-coding 413.333-4 chr15 35503273 35503680 + 1.33333 NA intron (NM_080650, intron 3 of 8) intron (NM_080650, intron 3 of 8) 42689 NM_001141972 89978 Hs.107196 NM_080650 ENSG00000134146 DPH6 ATPBD4 diphthamine biosynthesis 6 protein-coding 203-39 chr16 28532979 28533222 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_012385, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_012385, exon 3 of 3) 5874 NM_012385 26471 Hs.513463 NM_012385 ENSG00000176046 NUPR1 COM1|P8 nuclear protein 1, transcriptional regulator protein-coding 298-6 chr1 96226431 96226932 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 147444 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 200.333-122 chr5 84547053 84547260 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -162276 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 343.333-15 chr2 206009529 206009919 + 1.33333 NA exon (NM_017759, exon 9 of 11) exon (NM_017759, exon 9 of 11) 76450 NM_017759 54891 Hs.445036 NM_017759 ENSG00000114933 INO80D - INO80 complex subunit D protein-coding 221.333-129 chr6 154494978 154495265 + 1.33333 NA intron (NM_001368117, intron 1 of 12) intron (NM_001368117, intron 1 of 12) 15125 NM_001368116 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 321.667 chr10 18872498 18872928 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -176088 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 179.333-191 chr8 140610364 140610616 + 1.33333 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) AluSx1|SINE|Alu 25143 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 247-51 chr3 73876846 73877066 + 1.33333 NA intron (NR_146637, intron 3 of 3) intron (NR_146637, intron 3 of 3) 67712 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 194-116 chr6 28111999 28112148 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -12483 NM_001320558 80345 Hs.656641 NM_025231 ENSG00000196812 ZSCAN16 ZNF392|ZNF435|dJ265C24.3 zinc finger and SCAN domain containing 16 protein-coding 232-52 chr2 99136078 99136340 + 1.33333 NA intron (NM_001349013, intron 1 of 16) intron (NM_001349013, intron 1 of 16) 4971 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 285.333-58 chr6 40011088 40011354 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -76759 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 292.667-45 chr8 103432730 103433102 + 1.33333 NA intron (NM_015420, intron 7 of 10) intron (NM_015420, intron 7 of 10) 17530 NM_015420 25879 Hs.532265 NM_015420 ENSG00000164934 DCAF13 GM83|HSPC064|Sof1|WDSOF1 DDB1 and CUL4 associated factor 13 protein-coding 205-90 chr7 117007879 117008134 + 1.33333 NA intron (NR_161423, intron 1 of 13) intron (NR_161423, intron 1 of 13) -6906 NM_001369602 7982 Hs.368131 NM_018412 ENSG00000004866 ST7 ETS7q|FAM4A|FAM4A1|HELG|RAY1|SEN4|TSG7 suppression of tumorigenicity 7 protein-coding 197.667-126 chr5 117934793 117934999 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) 204535 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 228-4 chr1 193739362 193739566 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 434719 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 224.333-5 chr1 113280146 113280429 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74034 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 193.666-35 chr4 76859375 76859641 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 38636 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 282-22 chr17 65172138 65172497 + 1.33333 NA intron (NM_003835, intron 8 of 18) AluSx1|SINE|Alu 34947 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 206-151 chr5 178923095 178923359 + 1.33333 NA intron (NM_030613, intron 4 of 4) L1MB3|LINE|L1 -17971 NM_001323306 285676 Hs.259441 NM_182594 ENSG00000178187 ZNF454 - zinc finger protein 454 protein-coding 227.333-119 chr7 112833444 112833781 + 1.33333 NA intron (NM_152556, intron 3 of 4) intron (NM_152556, intron 3 of 4) -43189 NR_109840 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 216-18 chr12 7246732 7246978 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 56493 NM_000319 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 112-148 chr4 26485458 26485629 + 1.33333 NA intron (NM_000730, intron 3 of 4) intron (NM_000730, intron 3 of 4) 4941 NM_000730 886 Hs.129 NM_000730 ENSG00000163394 CCKAR CCK-A|CCK1-R|CCK1R|CCKRA cholecystokinin A receptor protein-coding 215.667-38 chr14 79800398 79800695 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 18 of 20) intron (NR_073547, intron 18 of 20) -410873 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 203.667-11 chr10 33907912 33908155 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -135353 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 205.333-183 chr5 51544770 51544987 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 161430 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 207.333-149 chr2 212281519 212281683 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 144759 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 245.333-42 chr14 71198503 71198690 + 1.33333 NA Intergenic LTR34|LTR|ERV1 -121880 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 216.666-43 chr2 134264771 134265003 + 1.33333 NA intron (NM_001371457, intron 2 of 16) intron (NM_001371457, intron 2 of 16) 10815 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 208-7 chr1 85783380 85783551 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 51 of 59) intron (NM_152890, intron 51 of 59) -75032 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 136.333-25 chr10 106411901 106412105 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 271838 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 259.333-35 chr15 76750276 76750585 + 1.33333 NA intron (NR_148227, intron 15 of 32) L1MB3|LINE|L1 111514 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 191-56 chr5 160912244 160912635 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 26187 NR_027111 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 178.667-31 chr11 99702929 99703203 + 1.33333 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 146921 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 256.666-42 chr6 36712974 36713170 + 1.33333 NA intron (NM_001257357, intron 2 of 13) LTR37-int|LTR|ERV1 15246 NM_001257357 401258 Hs.485258 NM_207498 ENSG00000255587 RAB44 RASD3|RASL13|dJ431A14.3 RAB44, member RAS oncogene family protein-coding 206.666-95 chr5 19450384 19450553 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 435804 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 356.999-2 chr10 121250330 121250669 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 280815 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 201.666-12 chr12 118298607 118298765 + 1.33333 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) intron (NM_001346490, intron 1 of 21) 61019 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 192-143 chr8 33728833 33729010 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -128815 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 352.666-2 chr10 61812287 61812587 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -89262 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 211.333-59 chr14 32501620 32501817 + 1.33333 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) intron (NM_004274, intron 2 of 13) 172420 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 278.666-16 chr22 24061495 24061767 + 1.33333 NA intron (NM_012295, intron 12 of 36) MIRb|SINE|MIR 50261 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 158.333-94 chr14 102054018 102054148 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001376, exon 78 of 78) 3' UTR (NM_001376, exon 78 of 78) 32961 NM_005348 3320 Hs.525600 NM_005348 ENSG00000080824 HSP90AA1 EL52|HEL-S-65p|HSP86|HSP89A|HSP90A|HSP90N|HSPC1|HSPCA|HSPCAL1|HSPCAL4|HSPN|Hsp103|Hsp89|Hsp90|LAP-2|LAP2 heat shock protein 90 alpha family class A member 1 protein-coding 209.333-28 chr11 14749212 14749427 + 1.33333 NA intron (NM_000922, intron 1 of 15) L3|LINE|CR1 105515 NM_000922 5140 Hs.445711 NM_000922 ENSG00000152270 PDE3B HcGIP1|cGIPDE1 phosphodiesterase 3B protein-coding 179.333-187 chr8 113666293 113666455 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -229435 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 234.666 chr1 20988297 20988490 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_031657) promoter-TSS (NR_031657) 39 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 267-7 chr10 67334212 67334626 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 68991 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 115-72 chr17 30442685 30442837 + 1.33333 NA intron (NM_001304, intron 10 of 20) intron (NM_001304, intron 10 of 20) -34647 NM_001007025 9527 Hs.462680 NM_004871 ENSG00000108587 GOSR1 GOLIM2|GOS-28|GOS28|GOS28/P28|GS28|P28 golgi SNAP receptor complex member 1 protein-coding 227.666-28 chr5 128853383 128853591 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111640 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 243.333-82 chr4 182118129 182118408 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 26247 NR_125905 90768 Hs.175465 NR_027107 TENM3-AS1 - TENM3 antisense RNA 1 ncRNA 222.666-7 chr1 189201767 189202025 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 1274114 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 213.333-186 chr6 149308220 149308390 + 1.33333 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) L1ME4a|LINE|L1 -9407 NM_001369506 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 355.666-2 chr12 46882228 46882625 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -56429 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 180-100 chr7 52550609 52550764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -484947 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 161.333-167 chr20 32892101 32892321 + 1.33333 NA intron (NM_001143967, intron 7 of 26) intron (NM_001143967, intron 7 of 26) 33288 NM_001143967 388795 NM_001143967 ENSG00000215529 EFCAB8 - EF-hand calcium binding domain 8 protein-coding 145.333-255 chr6 53211814 53211967 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -63049 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 214-142 chr9 697553 697869 + 1.33333 NA intron (NM_001354337, intron 1 of 10) L1MC4|LINE|L1 4372 NM_001354337 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 228.333-99 chr8 117098365 117098614 + 1.33333 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -36506 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 216-41 chr16 77470994 77471183 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36054 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 245.666-11 chr15 77195067 77195454 + 1.33333 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) intron (NM_024776, intron 4 of 7) 30144 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 227-12 chr10 111001534 111001718 + 1.33333 NA intron (NM_007373, intron 4 of 8) intron (NM_007373, intron 4 of 8) 12700 NR_031614 100313921 NR_031614 ENSG00000221214 MIR548E MIRN548E|hsa-mir-548e microRNA 548e ncRNA 215-20 chr14 61403163 61403433 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 2 of 13) intron (NM_006255, intron 2 of 13) 81855 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 236-3 chr1 203313410 203313643 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 8007 NM_006763 7832 Hs.519162 NM_006763 ENSG00000159388 BTG2 APRO1|PC3|TIS21 BTG anti-proliferation factor 2 protein-coding 233.666-14 chr19 28654063 28654316 + 1.33333 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) MIRb|SINE|MIR 47501 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 187-41 chr2 226672267 226672461 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13571 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 363.333-7 chr12 51654529 51655037 + 1.33333 NA intron (NM_001369788, intron 1 of 25) AluJr|SINE|Alu 63547 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 221.667-29 chr14 41693734 41694023 + 1.33333 NA intron (NM_001346173, intron 1 of 4) L1ME2|LINE|L1 87022 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 395.666-3 chr5 26002271 26002774 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 811569 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 217.333-19 chr1 234820929 234821217 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61017 NR_148962 100130249 Hs.617350 NR_148962 ENSG00000279261 PP2672 - uncharacterized LOC100130249 ncRNA 199-99 chr6 147576350 147576605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67787 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 212.667-55 chr17 53398504 53398762 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 413128 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 181.333-167 chr8 19797025 19797325 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -19974 NM_001353516 55174 Hs.512627 NM_018142 ENSG00000104613 INTS10 C8orf35|INT10 integrator complex subunit 10 protein-coding 209.333-42 chr12 2276156 2276417 + 1.33333 NA intron (NR_046769, intron 1 of 2) intron (NR_046769, intron 1 of 2) 6510 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 208-88 chr20 10043798 10044017 + 1.33333 NA intron (NM_022096, intron 4 of 10) AluSz6|SINE|Alu 8920 NM_001303472 63926 Hs.70903 NM_022096 ENSG00000132623 ANKEF1 ANKRD5 ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 protein-coding 173-67 chr4 166174838 166175045 + 1.33333 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 301704 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 193.333-129 chr3 169394499 169394749 + 1.33333 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) intron (NM_001366473, intron 1 of 15) -53243 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 224-12 chr10 67276637 67276890 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) L1MC5|LINE|L1 126647 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 166-27 chr10 115545376 115545549 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 25 of 28) intron (NM_207303, intron 25 of 28) 452097 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 289.333-62 chr8 78765782 78766126 + 1.33333 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L1MC1|LINE|L1 39509 NM_000880 3574 Hs.591873 NM_000880 ENSG00000104432 IL7 IL-7 interleukin 7 protein-coding 387.999-3 chr15 96830271 96830597 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46999 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 343.999-2 chr5 112594085 112594374 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34207 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 202-91 chr2 138945862 138946156 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48685 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 254.999-2 chr18 2486372 2486722 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84958 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 206.333-114 chr3 117654402 117654706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 36371 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 249.666-41 chr8 77587837 77588126 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 137284 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 247.666-35 chr8 62696255 62696608 + 1.33333 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) intron (NM_001304533, intron 3 of 6) -281430 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 184.667-43 chr17 60351904 60352138 + 1.33333 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) L2b|LINE|L2 40112 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 142-69 chr2 199709674 199709861 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 101699 NR_110270 101927641 Hs.549598 NR_110270 ENSG00000238217 LINC01877 - long intergenic non-protein coding RNA 1877 ncRNA 204.666-80 chr6 50915152 50915337 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 96373 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 253.667-81 chr8 144034106 144034411 + 1.33333 NA intron (NM_198572, intron 1 of 4) intron (NM_198572, intron 1 of 4) -15140 NR_158554 392275 NR_158554 SMPD5 MA-nSMase sphingomyelin phosphodiesterase 5 pseudo 202.666-35 chr14 50202366 50202529 + 1.33333 NA intron (NM_006939, intron 2 of 22) intron (NM_006939, intron 2 of 22) 29131 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 120-105 chr5 44165751 44165874 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -222920 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 207-91 chr4 96419150 96419338 + 1.33333 NA intron (NR_147149, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 108541 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 434.666-5 chr11 35748479 35748992 + 1.33333 NA intron (NM_017583, intron 4 of 4) intron (NM_017583, intron 4 of 4) 85960 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 210.333-103 chr3 96894990 96895148 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 80475 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 204.666-71 chr5 96487832 96488052 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) intron (NR_130776, intron 4 of 4) -54694 NM_000439 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 273.667-7 chr1 216451126 216451537 + 1.33333 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger -27883 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 429.999 chr10 51342386 51342770 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 43005 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 202-140 chr4 180543490 180543713 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 615548 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 176-84 chr7 23197123 23197383 + 1.33333 NA intron (NM_001370443, intron 6 of 7) intron (NM_001370443, intron 6 of 7) 15205 NM_001370443 11097 Hs.408241 NM_007342 ENSG00000136243 NUP42 CG1|NLP-1|NLP_1|NUPL2|hCG1 nucleoporin 42 protein-coding 263.667-17 chr12 60917366 60917928 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 1228277 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 260-43 chr2 200825575 200825882 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001321693, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001321693, exon 11 of 11) 13342 NM_001207068 9689 Hs.355983 NM_014670 ENSG00000082153 BZW1 BZAP45|Nbla10236 basic leucine zipper and W2 domains 1 protein-coding 246-85 chr5 77222744 77223031 + 1.33333 NA intron (NM_001029853, intron 1 of 20) intron (NM_001029853, intron 1 of 20) 12207 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 197.333-20 chr10 46034985 46035246 + 1.33333 NA intron (NM_138634, intron 2 of 2) intron (NM_138634, intron 2 of 2) -4401 NM_001145263 8031 Hs.643658 NM_005437 ENSG00000266412 NCOA4 ARA70|ELE1|PTC3|RFG nuclear receptor coactivator 4 protein-coding 233.333-121 chr7 49419517 49419721 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -354019 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 275.666-17 chr8 119326444 119326748 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1425 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 217.666-42 chr9 94717534 94717706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9049 NM_032823 84909 Hs.434253 NM_032823 ENSG00000148120 AOPEP AP-O|APO|C90RF3|C9orf3|ONPEP aminopeptidase O (putative) protein-coding 135.333-120 chr3 138640553 138640728 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31591 NM_018147 55179 Hs.173438 NM_018147 ENSG00000158234 FAIM FAIM1 Fas apoptotic inhibitory molecule protein-coding 204.333-79 chr18 6468006 6468249 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -43289 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 280.666-10 chr17 71115944 71116246 + 1.33333 NA intron (NR_104152, intron 3 of 3) intron (NR_104152, intron 3 of 3) 86084 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 286-10 chr12 57395853 57396237 + 1.33333 NA intron (NM_001351204, intron 1 of 25) intron (NM_001351204, intron 1 of 25) 34998 NM_001351218 22864 Hs.443673 NM_014925 ENSG00000179912 R3HDM2 CAG6|PR01365 R3H domain containing 2 protein-coding 259.333-57 chr2 186928132 186928399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -79095 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 201.333-282 chr8 91091117 91091333 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -11394 NR_148895 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 258.666-46 chr8 78279219 78279450 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -237006 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 316-47 chr6 147307738 147308070 + 1.33333 NA intron (NM_139244, intron 9 of 25) intron (NM_139244, intron 9 of 25) -103290 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 208.333-39 chr14 65149620 65149820 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -47025 NR_073137 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 190.333-104 chr4 56202788 56202967 + 1.33333 NA intron (NM_020722, intron 2 of 10) intron (NM_020722, intron 2 of 10) 32682 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 203-53 chr2 126386686 126386902 + 1.33333 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -268809 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 192-102 chr4 53608446 53608662 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 15598 NR_046827 100873955 Hs.351074 NR_046827 LNX1-AS2 - LNX1 antisense RNA 2 ncRNA 125.333-117 chr4 44298607 44298725 + 1.33333 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 150143 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 140.333-244 chr9 1278307 1278461 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 226897 NM_001370532 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 130.333-95 chr18 39784067 39784244 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32160 NR_024391 647946 Hs.649350 NR_024391 ENSG00000267374 MIR924HG LINC00669 MIR924 host gene ncRNA 360.332 chr2 27046093 27046410 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 4013 NR_046730 100874031 Hs.132725 NR_046730 ENSG00000231636 AGBL5-AS1 - AGBL5 antisense RNA 1 ncRNA 213.666-25 chr2 215662652 215662856 + 1.33333 NA intron (NR_037195, intron 5 of 9) intron (NR_037195, intron 5 of 9) -55289 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 163-69 chr5 122881203 122881366 + 1.33333 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) intron (NM_014035, intron 1 of 6) 35671 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 278-17 chr2 101910107 101910338 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -73243 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 373.333-24 chr6 9048269 9048701 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 396276 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 199.333-54 chr12 49288554 49288840 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -6450 NM_006262 5630 Hs.37044 NM_006262 ENSG00000135406 PRPH NEF4|PRPH1 peripherin protein-coding 203.667-7 chr1 195700571 195700861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 387999 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 324.666 chr1 106058373 106058925 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30396 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 226.667-35 chr14 57762907 57763245 + 1.33333 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) LTR37B|LTR|ERV1 101923 NM_001352013 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 203.333-270 chr8 118182616 118182793 + 1.33333 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) intron (NR_146234, intron 4 of 5) -70885 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 521.334 chr1 82108894 82109592 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 306790 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 238.333-40 chr19 52264931 52265247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4498 NM_001010851 90321 Hs.439662 NM_001010851 ENSG00000196214 ZNF766 - zinc finger protein 766 protein-coding 290-14 chr13 42052176 42052525 + 1.33333 NA intron (NM_178009, intron 1 of 29) intron (NM_178009, intron 1 of 29) 3702 NM_178009 160851 Hs.630380 NM_152910 ENSG00000102780 DGKH DGKeta diacylglycerol kinase eta protein-coding 212.666-100 chr9 106728572 106728817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 112636 NR_104145 100996590 Hs.147110 NR_104145 ENSG00000234323 LINC01505 - long intergenic non-protein coding RNA 1505 ncRNA 294.667-30 chr21 28266848 28267180 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38347 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 234.333-23 chr13 58268927 58269191 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35942 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 274.333-66 chr8 26576481 26577001 + 1.33333 NA intron (NM_001197293, intron 1 of 13) intron (NM_001197293, intron 1 of 13) -1204 NM_001386 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 454-3 chr12 37902695 37903341 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -413756 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 233.333-32 chr12 33703723 33704234 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -264159 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 280.333-28 chr4 63257155 63257602 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -1095613 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 206-91 chr2 162573461 162573643 + 1.33333 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -195384 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 192.333-179 chr9 119634827 119635014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -265485 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 262-27 chr15 69763284 69763630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71777 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 337.333-34 chr5 9645203 9645650 + 1.33333 NA intron (NR_027112, intron 11 of 12) intron (NR_027112, intron 11 of 12) -15075 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 196.666-111 chr9 32243924 32244110 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -140586 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 215.333-118 chr22 28427806 28428050 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MER103C|DNA|hAT-Charlie -31941 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 191.333-201 chr8 85434673 85434835 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4105 NM_005181 761 Hs.82129 NM_005181 ENSG00000164879 CA3 CAIII|Car3 carbonic anhydrase 3 protein-coding 122-130 chr9 35505218 35505393 + 1.33333 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) intron (NM_001330740, intron 1 of 10) 15194 NM_001330740 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 199.333-168 chr21 31248768 31249019 + 1.33333 NA intron (NM_001353686, intron 5 of 27) intron (NM_001353686, intron 5 of 27) -87953 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 280.333-37 chr6 37266436 37266823 + 1.33333 NA intron (NR_130108, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu -8474 NR_104442 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 197.333-45 chr12 4587654 4587892 + 1.33333 NA intron (NM_001371301, intron 2 of 14) intron (NM_001371301, intron 2 of 14) -2299 NM_003845 8798 Hs.439530 NM_003845 ENSG00000010219 DYRK4 - dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4 protein-coding 256-56 chr22 39110937 39111256 + 1.33333 NA Intergenic LTR4|LTR|ERV1 13852 NM_001166003 164668 Hs.440515 NM_181773 ENSG00000100298 APOBEC3H A3H|ARP-10|ARP10 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3H protein-coding 184.666-23 chr4 70985373 70985536 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001244766, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001244766, exon 7 of 7) -8195 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 200-75 chr18 6215059 6215247 + 1.33333 NA intron (NM_001365769, intron 11 of 16) intron (NM_001365769, intron 11 of 16) -41591 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 328-3 chr10 64303285 64303775 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -521998 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 235-29 chr19 18746191 18746446 + 1.33333 NA intron (NM_015321, intron 3 of 13) intron (NM_015321, intron 3 of 13) 44987 NM_000095 1311 Hs.1584 NM_000095 ENSG00000105664 COMP EDM1|EPD1|MED|PSACH|THBS5|TSP5 cartilage oligomeric matrix protein protein-coding 346-7 chr14 26366356 26366779 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 186863 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 218.666-25 chr14 50998754 50998928 + 1.33333 NA intron (NM_015163, intron 6 of 9) intron (NM_015163, intron 6 of 9) -54358 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 252-51 chr2 181470543 181470903 + 1.33333 NA intron (NM_000885, intron 2 of 27) intron (NM_000885, intron 2 of 27) 13337 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 254-75 chr7 104110647 104110996 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97192 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 191.333-170 chr6 17010014 17010161 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92171 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 224.999-4 chr5 72095953 72096123 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -11437 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 223.333-94 chr20 59885218 59885477 + 1.33333 NA intron (NM_014258, intron 26 of 44) intron (NM_014258, intron 26 of 44) 48290 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 215.666-32 chr6 22764759 22764944 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46927 NR_134614 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 232-86 chr8 31067279 31067499 + 1.33333 NA intron (NM_000553, intron 6 of 34) intron (NM_000553, intron 6 of 34) -34033 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 198.666-95 chr8 120231803 120231969 + 1.33333 NA intron (NM_021110, intron 19 of 47) intron (NM_021110, intron 19 of 47) 106784 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 170.666-9 chr16 83332512 83332661 + 1.33333 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) intron (NM_001220489, intron 4 of 12) -175760 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 237-45 chr22 23584943 23585276 + 1.33333 NA Intergenic (TTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4819 NM_001369906 3543 Hs.348935 NM_020070 ENSG00000128322 IGLL1 14.1|AGM2|CD179b|IGL1|IGL5|IGLJ14.1|IGLL|IGO|IGVPB|VPREB2 immunoglobulin lambda like polypeptide 1 protein-coding 319-5 chr10 95028834 95029203 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 40479 NM_001198854 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 247.333-53 chr3 132507169 132507537 + 1.33333 NA exon (NM_015268, exon 43 of 56) exon (NM_015268, exon 43 of 56) 89851 NM_015268 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 210.333-128 chr5 33217163 33217377 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -12465 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 265.666-27 chr9 99591261 99591619 + 1.33333 NA intron (NR_109802, intron 4 of 6) intron (NR_109802, intron 4 of 6) -216183 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 238-5 chr10 20054989 20055195 + 1.33333 NA intron (NM_032812, intron 3 of 13) intron (NM_032812, intron 3 of 13) 238660 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 223.667-5 chr1 86337254 86337586 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20267 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 331.999-4 chr3 82295835 82296384 + 1.33333 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 309967 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 285.333-76 chr9 34500295 34500811 + 1.33333 NA intron (NM_001281428, intron 10 of 19) MIR|SINE|MIR 22437 NM_198573 375704 Hs.522085 NM_198573 ENSG00000168913 ENHO C9orf165|UNQ470 energy homeostasis associated protein-coding 264-31 chr2 189746103 189746469 + 1.33333 NA TTS (NM_001354347) TTS (NM_001354347) -16494 NR_102429 101409258 Hs.738558 NR_102429 OSGEPL1-AS1 - OSGEPL1 antisense RNA 1 ncRNA 215.666-43 chr8 120140111 120140284 + 1.33333 NA intron (NM_021110, intron 1 of 47) intron (NM_021110, intron 1 of 47) 15095 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 422.666-5 chr5 32974284 32974838 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 27118 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 268.666-8 chr12 46826960 46827251 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1108 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 187.333-105 chr2 126712754 126713031 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 56734 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 307.333-6 chr1 189748745 189749102 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 727087 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 215.333-204 chr8 135183374 135183679 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -50605 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 266.666-26 chr7 37117926 37118250 + 1.33333 NA intron (NM_001206480, intron 14 of 21) intron (NM_001206480, intron 14 of 21) 120292 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-181 chr3 63349571 63349864 + 1.33333 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) L1PB4|LINE|L1 71409 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 225.333-72 chr18 44905543 44905737 + 1.33333 NA intron (NM_015559, intron 3 of 5) intron (NM_015559, intron 3 of 5) 64526 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 505.333 chr1 92107249 92107681 + 1.33333 NA intron (NM_183242, intron 3 of 8) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 27120 NM_183242 284697 Hs.676102 NM_183242 ENSG00000189195 BTBD8 - BTB domain containing 8 protein-coding 494.999 chr7 23672459 23672975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7482 NM_199136 340277 Hs.592178 NM_199136 ENSG00000188732 FAM221A C7orf46 family with sequence similarity 221 member A protein-coding 463-8 chr8 118955344 118956032 + 1.33333 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) 3425 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 366.666-6 chr2 7457250 7457660 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 36194 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 356.333-9 chr12 6454321 6454904 + 1.33333 NA intron (NR_147129, intron 3 of 7) intron (NR_147129, intron 3 of 7) 2570 NM_001351355 55080 Hs.504597 NM_018009 ENSG00000139192 TAPBPL TAPBP-R|TAPBPR TAP binding protein like protein-coding 452-5 chr20 36905220 36905805 + 1.33333 NA intron (NM_015474, intron 11 of 15) intron (NM_015474, intron 11 of 15) 29374 NM_080628 140711 Hs.472630 NM_080628 ENSG00000101342 TLDC2 C20orf118 TBC/LysM-associated domain containing 2 protein-coding 398.666 chr1 199298635 199299091 + 1.33333 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 150265 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 235.333-21 chr11 39369972 39370247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 721251 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 348-14 chr2 199068266 199068667 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 389473 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 205-8 chr1 197353183 197353364 + 1.33333 NA intron (NM_001257966, intron 4 of 9) L2c|LINE|L2 85021 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 311.333-60 chr8 129103025 129103350 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137186 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 223.333-73 chr2 86752412 86752688 + 1.33333 NA intron (NM_022780, intron 3 of 8) MIRb|SINE|MIR -31428 NM_001198954 100526767 Hs.591582 NM_001198954 ENSG00000249884 RNF103-CHMP3 CGI149|CHMP3|NEDF|RNF103-VPS24|VPS24|hVps24 RNF103-CHMP3 readthrough protein-coding 329.333-8 chr11 86048464 86048838 + 1.33333 NA intron (NM_001206947, intron 1 of 18) AluSg|SINE|Alu 20433 NM_001206946 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 178.667-12 chr1 167421251 167421472 + 1.33333 NA non-coding (NR_037163, exon 17 of 17) non-coding (NR_037163, exon 17 of 17) 92291 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 334.333-33 chr8 118366022 118366629 + 1.33333 NA intron (NM_001363274, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 -254506 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 322.667-35 chr9 1925054 1925472 + 1.33333 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -90084 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 281-36 chr5 91282737 91283006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31531 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 206.666-126 chr9 96744262 96744451 + 1.33333 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 18535 NR_026792 441455 Hs.229613 NR_026792 LOC441455 - makorin ring finger protein 1 pseudogene pseudo 209.666-3 chr1 153002204 153002392 + 1.33333 NA intron (NM_001097589, intron 1 of 1) intron (NM_001097589, intron 1 of 1) 549 NM_001097589 6707 Hs.139322 NM_005416 ENSG00000163209 SPRR3 - small proline rich protein 3 protein-coding 179-78 chr5 51080650 51080833 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -110554 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 308.666-8 chr16 53823660 53824030 + 1.33333 NA intron (NM_001363905, intron 3 of 9) AluSp|SINE|Alu 119689 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 179.333-150 chr5 59702980 59703207 + 1.33333 NA TTS (NR_030308) TTS (NR_030308) 610 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 234-33 chr2 51062868 51063117 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 30391 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 215-37 chr2 108471762 108472055 + 1.33333 NA exon (NM_181453, exon 6 of 23) exon (NM_181453, exon 6 of 23) 22702 NR_028063 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 211.666-3 chr1 153201520 153201777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1782 NM_001010857 149018 Hs.125785 NM_001010857 ENSG00000203784 LELP1 - late cornified envelope like proline rich 1 protein-coding 242.666-36 chr7 79985329 79985538 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -149398 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 207-46 chr15 67615388 67615595 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 8 of 21) intron (NM_001206804, intron 8 of 21) 66397 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 205.667-108 chr4 173827080 173827392 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70037 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 225.666-25 chr6 132749424 132749713 + 1.33333 NA intron (NM_004665, intron 6 of 6) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 8336 NM_004665 8875 Hs.293130 NM_004665 ENSG00000112303 VNN2 FOAP-4|GPI-80 vanin 2 protein-coding 204-77 chr17 17674244 17674419 + 1.33333 NA intron (NR_131243, intron 3 of 3) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 3357 NR_131243 105371564 Hs.369680 NR_131243 ENSG00000223979 SMCR2 TCONS_00025215 Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 2 ncRNA 235-21 chr14 76000930 76001230 + 1.33333 NA intron (NM_001102564, intron 2 of 8) intron (NM_001102564, intron 2 of 8) 15317 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 184-64 chr22 34578955 34579112 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 418883 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 197.333-15 chr10 8477394 8477604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 116892 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 247.667-6 chr1 199184786 199185232 + 1.33333 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 36411 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 307.333-12 chr10 52717353 52717827 + 1.33333 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 37814 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 207.666-18 chr15 44142572 44142729 + 1.33333 NA intron (NM_001286490, intron 1 of 15) intron (NM_001286490, intron 1 of 15) 51796 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 232-10 chr1 152753099 152753335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4808 NM_001025231 448834 Hs.149386 NM_001025231 ENSG00000203786 KPRP C1orf45 keratinocyte proline rich protein protein-coding 227.333-70 chr2 241419523 241419786 + 1.33333 NA intron (NM_014808, intron 8 of 26) HAL1|LINE|L1 -58251 NR_036083 100422942 NR_036083 ENSG00000263752 MIR3133 - microRNA 3133 ncRNA 207.333-220 chr5 71626115 71626393 + 1.33333 NA intron (NM_001363147, intron 6 of 15) intron (NM_001363147, intron 6 of 15) 38914 NM_001363147 64087 Hs.604789 NM_022132 ENSG00000131844 MCCC2 MCCB methylcrotonoyl-CoA carboxylase 2 protein-coding 207.333-128 chr19 28383298 28383470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -223304 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 207.333-210 chr4 156304618 156304820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -350853 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 208.666-23 chr11 40646294 40646504 + 1.33333 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -353269 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 184.667-45 chr18 10747272 10747503 + 1.33333 NA intron (NM_022068, intron 28 of 51) intron (NM_022068, intron 28 of 51) 12262 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 428.666-8 chr5 106021906 106022569 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 922763 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 393.333-13 chr3 4734545 4734982 + 1.33333 NA intron (NM_001168272, intron 42 of 60) intron (NM_001168272, intron 42 of 60) 16827 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 253-66 chr8 14194637 14195056 + 1.33333 NA intron (NM_139167, intron 4 of 7) L1ME1|LINE|L1 565156 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 229.333-58 chr2 17823392 17823588 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7030 NM_001105569 343930 NM_001105569 ENSG00000151379 MSGN1 MSOG|pMsgn1 mesogenin 1 protein-coding 366-6 chr14 45003907 45004242 + 1.33333 NA exon (NM_015091, exon 4 of 19) exon (NM_015091, exon 4 of 19) 41884 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 277.333-70 chr5 26156514 26156901 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 881879 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 238-65 chr4 27660490 27660860 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 443196 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 253.333-75 chr3 190165363 190165673 + 1.33333 NA Intergenic U6|snRNA|snRNA -43081 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 200-160 chr7 97424918 97425149 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -307053 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 249.333-98 chr8 78251726 78252109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -264423 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 231.666-12 chr17 42011109 42011414 + 1.33333 NA intron (NM_003315, intron 1 of 13) intron (NM_003315, intron 1 of 13) 5904 NM_001144766 7266 Hs.500156 NM_003315 ENSG00000168259 DNAJC7 DJ11|DJC7|TPR2|TTC2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C7 protein-coding 420-8 chr14 81913403 81913972 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -170549 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 509.333 chr12 43276943 43277723 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 122018 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 247.666-26 chr5 37870089 37870401 + 1.33333 NA intron (NR_103441, intron 1 of 3) intron (NR_103441, intron 1 of 3) 29807 NR_103441 100861519 Hs.536820 NM_001278094 GDNF-AS1 GDNFOS GDNF antisense RNA 1 ncRNA 503.999-2 chr15 85038758 85039428 + 1.33333 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) AluSp|SINE|Alu 57119 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 363.999 chr10 91494323 91494677 + 1.33333 NA intron (NM_182765, intron 14 of 20) intron (NM_182765, intron 14 of 20) 84215 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 341-27 chr8 120707959 120708437 + 1.33333 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 -53055 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 236-87 chr8 71015988 71016317 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 340554 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 212-51 chr14 69509021 69509227 + 1.33333 NA intron (NM_001161498, intron 6 of 12) AluJo|SINE|Alu 24396 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 176.666-3 chr10 57122347 57122491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 182140 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 160.333-182 chr3 35178182 35178319 + 1.33333 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L1MA10|LINE|L1 215773 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 310-27 chr2 61051202 61051606 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_002618, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_002618, exon 4 of 4) -14466 NM_001330432 84542 Hs.468653 NM_032506 ENSG00000162929 KIAA1841 - KIAA1841 protein-coding 185.333-151 chr5 29637163 29637369 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -241290 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 352.999-4 chr7 116887650 116888004 + 1.33333 NA intron (NM_006136, intron 1 of 9) AluSz|SINE|Alu 25240 NM_006136 830 Hs.446123 NM_006136 ENSG00000198898 CAPZA2 CAPPA2|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 2 protein-coding 292.333-38 chr6 118206619 118206975 + 1.33333 NA intron (NM_001029858, intron 2 of 7) intron (NM_001029858, intron 2 of 7) 120894 NR_134601 105377967 Hs.692865 NR_134601 LOC105377967 - uncharacterized LOC105377967 ncRNA 414.667-9 chr2 122536154 122536720 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 537044 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 201.666-16 chr15 58708486 58708676 + 1.33333 NA intron (NM_001320570, intron 2 of 14) AluJr|SINE|Alu -14974 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 241.999-4 chr15 58547327 58547545 + 1.33333 NA intron (NM_000236, intron 5 of 8) intron (NM_000236, intron 5 of 8) -48701 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 198.666-7 chr11 44211508 44211695 + 1.33333 NA intron (NM_207122, intron 10 of 13) L1MA7|LINE|L1 98538 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 211.666-46 chr7 35614252 35614484 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 80767 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 211-52 chr2 143756914 143757086 + 1.33333 NA intron (NM_018460, intron 13 of 13) MIRc|SINE|MIR -180067 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 155.333-312 chr5 155631115 155631326 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 617465 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 191.333-56 chr14 37101246 37101492 + 1.33333 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -70657 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 354.666-16 chr5 4751859 4752140 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -21482 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 205.666-39 chr4 150527603 150527828 + 1.33333 NA intron (NM_001367550, intron 40 of 56) LTR33B|LTR|ERVL -51374 NR_149035 729558 Hs.647978 NR_149035 ENSG00000249690 LOC729558 - uncharacterized LOC729558 ncRNA 184-124 chr9 119682105 119682329 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -252843 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 227.333-87 chr4 58609402 58609627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -73186 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 200.333-14 chr10 63701751 63701994 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -179982 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 256-59 chr3 47935137 47935545 + 1.33333 NA intron (NM_002375, intron 3 of 18) intron (NM_002375, intron 3 of 18) 85786 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 220-50 chr17 62102719 62103012 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37587 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 475.333-5 chr8 132996622 132997391 + 1.33333 NA intron (NM_003235, intron 35 of 47) intron (NM_003235, intron 35 of 47) 49575 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 232-53 chr2 187360178 187360548 + 1.33333 NA intron (NM_001369434, intron 11 of 15) intron (NM_001369434, intron 11 of 15) 87889 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 232.333-43 chr2 63572780 63573081 + 1.33333 NA intron (NR_148704, intron 1 of 18) intron (NR_148704, intron 1 of 18) 15547 NM_015910 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 177-42 chr2 204562514 204562692 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) intron (NM_205863, intron 1 of 21) 17128 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 265.333-9 chr10 72065860 72066163 + 1.33333 NA intron (NM_014767, intron 9 of 11) intron (NM_014767, intron 9 of 11) 22540 NM_001244950 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 205-25 chr12 96781848 96782018 + 1.33333 NA intron (NM_001306084, intron 60 of 67) intron (NM_001306084, intron 60 of 67) -125324 NM_001135177 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 377.666-4 chr10 17210649 17210996 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8751 NM_001351223 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 244.666-29 chr22 25330582 25330850 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 12459 NR_029395 91353 Hs.651077 NM_001013618 IGLL3P 16.1|IGLL3 immunoglobulin lambda like polypeptide 3, pseudogene pseudo 217-62 chr3 110252127 110252416 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 649443 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 220.666-32 chr2 46911746 46911936 + 1.33333 NA intron (NM_001171506, intron 1 of 4) AluY|SINE|Alu 3965 NM_001171509 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 197.666-57 chr6 149365981 149366146 + 1.33333 NA intron (NM_001369506, intron 2 of 7) L1MEf|LINE|L1 -34199 NM_001002255 387082 Hs.657168 NM_001002255 ENSG00000177688 SUMO4 IDDM5|SMT3H4|SUMO-4|dJ281H8.4 small ubiquitin like modifier 4 protein-coding 206.666-130 chrX 38755328 38755545 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -45996 NM_021242 58526 Hs.522605 NM_021242 ENSG00000165175 MID1IP1 G12-like|MIG12|S14R|STRAIT11499|THRSPL MID1 interacting protein 1 protein-coding 232-45 chr2 62905240 62905438 + 1.33333 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) L2b|LINE|L2 142372 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 281.333-37 chr3 17495333 17495822 + 1.33333 NA intron (NM_001349081, intron 2 of 21) intron (NM_001349081, intron 2 of 21) 204443 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 198-148 chr5 23632232 23632480 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 124701 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 239.333-51 chr2 50875292 50875487 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 156743 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 289.333-5 chr1 246087593 246087995 + 1.33333 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 329618 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 209.333-168 chr4 39911855 39912154 + 1.33333 NA intron (NM_001100399, intron 9 of 32) intron (NM_001100399, intron 9 of 32) 65907 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 201.333-249 chr6 141173014 141173240 + 1.33333 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 489313 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 171.333-80 chr2 69132618 69132823 + 1.33333 NA intron (NM_032208, intron 12 of 17) intron (NM_032208, intron 12 of 17) 29038 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 282.333-50 chr6 47600947 47601423 + 1.33333 NA intron (NM_012120, intron 13 of 17) intron (NM_012120, intron 13 of 17) -55287 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 211.666-14 chr14 62109404 62109816 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) -7747 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 190.666-59 chr9 27137563 27137711 + 1.33333 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) intron (NM_001290078, intron 1 of 20) 28496 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 359.666-10 chr3 89323311 89323743 + 1.33333 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 215906 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 346.666-3 chr12 42829410 42829787 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 137382 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 126.333-44 chr14 28348656 28348797 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 416593 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 392-2 chr12 33268676 33269095 + 1.33333 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL 170934 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 375.666-4 chr5 60776159 60776600 + 1.33333 NA intron (NM_024930, intron 3 of 8) L1PA17|LINE|L1 67890 NM_001297617 79993 Hs.274256 NM_024930 ENSG00000164181 ELOVL7 - ELOVL fatty acid elongase 7 protein-coding 209.666-48 chr6 153514692 153514867 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -383497 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 214.666-10 chr1 222074132 222074382 + 1.33333 NA Intergenic LTR72B|LTR|ERV1 -95737 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 201.333-298 chr9 24560985 24561351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15271 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 216.667-56 chr2 60167279 60167570 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 215612 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 210.666-7 chr1 204759067 204759247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69495 NM_001005389 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 207.333-277 chr9 16724670 16724946 + 1.33333 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) intron (NM_001317940, intron 2 of 5) -2006 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-220 chr5 34020130 34020326 + 1.33333 NA non-coding (NR_146599, exon 12 of 12) non-coding (NR_146599, exon 12 of 12) -12178 NM_001167595 23600 Hs.508343 NM_014324 ENSG00000242110 AMACR AMACRD|CBAS4|P504S|RACE|RM alpha-methylacyl-CoA racemase protein-coding 216.666-14 chr10 59561878 59562068 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 147918 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 185.667-42 chr16 68205579 68205807 + 1.33333 NA intron (NM_173165, intron 9 of 9) L1ME4b|LINE|L1 27806 NR_106831 102466194 NR_106831 ENSG00000284259 MIR6773 hsa-mir-6773 microRNA 6773 ncRNA 223.666-9 chr12 88654245 88654488 + 1.33333 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -73893 NM_003994 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 186-62 chr3 77659621 77659814 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 389246 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 179.333-154 chr5 90561402 90561642 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 1 of 89) intron (NR_003149, intron 1 of 89) 2725 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 362.999-2 chr2 102350355 102350713 + 1.33333 NA intron (NM_016232, intron 10 of 10) intron (NM_016232, intron 10 of 10) -5262 NM_001371423 273-39 chr8 63337178 63337553 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -128484 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 206-98 chr21 29128681 29128882 + 1.33333 NA intron (NM_001371376, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR -1863 NM_001371373 220.667-60 chr3 31302689 31303061 + 1.33333 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? -141088 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 324-4 chr11 102641434 102641844 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16307 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 130.333-147 chr4 62921909 62922103 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -760241 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 593.332 chr12 46921010 46921761 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -95388 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 275.333-37 chr2 154242738 154243005 + 1.33333 NA exon (NM_001301627, exon 4 of 12) exon (NM_001301627, exon 4 of 12) 214567 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 164-96 chr5 159130213 159130422 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29834 NR_109890 101927740 Hs.738721 NR_109890 ENSG00000245812 LINC02202 - long intergenic non-protein coding RNA 2202 ncRNA 200-51 chr14 49806789 49807082 + 1.33333 NA intron (NM_001301732, intron 17 of 31) L1MB7|LINE|L1 38782 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 297.333-25 chr16 7033846 7034262 + 1.33333 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 260245 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 192.666-56 chr6 99112295 99112659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12132 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 201.333-195 chr3 119927476 119927635 + 1.33333 NA intron (NM_002093, intron 3 of 11) intron (NM_002093, intron 3 of 11) 144845 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 279-12 chr17 18361987 18362298 + 1.33333 NA intron (NM_004169, intron 1 of 11).2 MIRb|SINE|MIR 1408 NM_004169 6470 Hs.513987 NM_004169 ENSG00000176974 SHMT1 CSHMT|SHMT serine hydroxymethyltransferase 1 protein-coding 212.333-65 chr2 38993498 38993756 + 1.33333 NA intron (NM_005633, intron 20 of 22) intron (NM_005633, intron 20 of 22) -33283 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 206.333-160 chr8 75256768 75257040 + 1.33333 NA intron (NR_103849, intron 1 of 1) intron (NR_103849, intron 1 of 1) 21577 NR_103850 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 265.333-37 chr2 108476823 108477189 + 1.33333 NA intron (NR_028063, intron 8 of 21) L1M5|LINE|L1 27800 NR_028063 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 307.333-10 chr10 15790815 15791118 + 1.33333 NA intron (NM_024948, intron 11 of 14) intron (NM_024948, intron 11 of 14) 69541 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 198.666-61 chr3 64187794 64187989 + 1.33333 NA intron (NR_046702, intron 1 of 3) intron (NR_046702, intron 1 of 3) 347 NR_046702 100874243 Hs.670840 NR_046702 ENSG00000226017 PRICKLE2-AS3 - PRICKLE2 antisense RNA 3 ncRNA 226-57 chr22 24370725 24371034 + 1.33333 NA intron (NM_001254732, intron 13 of 14) L1MB3|LINE|L1 28771 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 153.666-4 chr5 166684025 166684223 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 242246 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 140.667-134 chr21 22579669 22579822 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 481128 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 202-37 chr13 62790780 62790985 + 1.33333 NA intron (NR_120403, intron 2 of 2) HUERS-P1-int|LTR|ERV1 5810 NR_120404 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 194-111 chr5 118517582 118517872 + 1.33333 NA intron (NR_104610, intron 3 of 9) L1MA4|LINE|L1 44390 NR_104610 101927280 Hs.543951 NR_104610 LINC02208 HRAT56 long intergenic non-protein coding RNA 2208 ncRNA 435-2 chr10 4747952 4748337 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70074 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 214.666-74 chr8 127173692 127173883 + 1.33333 NA Intergenic MER96|DNA|hAT-Tip100 23840 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 206-163 chr6 152474932 152475131 + 1.33333 NA intron (NM_182961, intron 14 of 145) L1MEd|LINE|L1 94501 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 274.333-72 chr8 131714062 131714484 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -189820 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 191-62 chr7 39654725 39654889 + 1.33333 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 31235 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 200.667-90 chr2 203036326 203036592 + 1.33333 NA intron (NM_001114132, intron 2 of 54) MIRb|SINE|MIR 21580 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 273-41 chr8 87602907 87603359 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 270882 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 228.667-18 chr12 43215786 43216058 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60607 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 496-2 chr10 94314451 94315035 + 1.33333 NA intron (NM_001165979, intron 27 of 31) L3|LINE|CR1 -27673 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 207-98 chr5 107695491 107695706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24661 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 198.666-28 chr16 73987064 73987267 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 228356 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 208.666-83 chr4 154218999 154219179 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 272710 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 235.666-18 chr8 51482982 51483223 + 1.33333 NA intron (NM_144651, intron 6 of 22) intron (NM_144651, intron 6 of 22) 326343 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 243.666-18 chr19 43995818 43996021 + 1.33333 NA TTS (NR_110727) TTS (NR_110727) 6951 NR_110727 101928063 Hs.502127 NR_110727 ENSG00000266921 LOC101928063 - uncharacterized LOC101928063 ncRNA 203-25 chr12 43695062 43695352 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63583 NM_001271826 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 185.333-41 chr12 45982780 45982974 + 1.33333 NA intron (NM_004719, intron 1 of 14) intron (NM_004719, intron 1 of 14) 7697 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 298-27 chr14 86406718 86407007 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 472184 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 198-62 chr15 85321927 85322120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58573 NR_106993 102465803 NR_106993 ENSG00000284160 MIR7706 hsa-mir-7706 microRNA 7706 ncRNA 170-63 chr2 117402226 117402461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -412348 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 233.999 chr10 69937865 69938058 + 1.33333 NA intron (NM_080802, intron 31 of 36) intron (NM_080802, intron 31 of 36) -114885 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 186.333-126 chr5 83537983 83538183 + 1.33333 NA exon (NM_004385, exon 8 of 15) exon (NM_004385, exon 8 of 15) 24231 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 259.333-77 chr5 27376924 27377325 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -95168 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 182-70 chr3 173781927 173782154 + 1.33333 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) intron (NM_001365928, intron 3 of 6) 138756 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 209.666-50 chr7 43629954 43630158 + 1.33333 NA intron (NR_163918, intron 8 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie 46948 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 277.666-2 chr1 212376630 212377019 + 1.33333 NA intron (NM_001198862, intron 7 of 8) intron (NM_001198862, intron 7 of 8) 24006 NR_004389 692157 Hs.707958 NR_004389 ENSG00000201544 SNORA16B U98b small nucleolar RNA, H/ACA box 16B snoRNA 251.333-47 chr18 12632780 12633099 + 1.33333 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 23793 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 151.333-151 chr15 67197658 67197899 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31623 NM_001145104 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 222-27 chr14 52517999 52518292 + 1.33333 NA intron (NM_001160047, intron 7 of 20) L2a|LINE|L2 34360 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 213.333-182 chr6 141158230 141158402 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 474502 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 274.666-10 chr13 65391582 65392025 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -474244 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 215.999-4 chr19 32710020 32710187 + 1.33333 NA intron (NM_001105570, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu -9664 NM_001110822 91646 Hs.646351 NM_001015890 ENSG00000173809 TDRD12 ECAT8 tudor domain containing 12 protein-coding 170-89 chr4 46144962 46145105 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -20979 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 235.333-118 chr7 139306062 139306354 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_173569, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_173569, exon 18 of 18) -34151 NM_001244585 51631 Hs.731488 NM_016019 ENSG00000146963 LUC7L2 CGI-59|CGI-74|LUC7B2 LUC7 like 2, pre-mRNA splicing factor protein-coding 309.999-6 chr6 74421658 74421916 + 1.33333 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) L1MA2|LINE|L1 352336 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 190.666-27 chr2 78861046 78861219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -164570 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 205.333-265 chrX 41918952 41919251 + 1.33333 NA intron (NM_003688, intron 1 of 26) L2c|LINE|L2 3933 NM_003688 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 296.333-29 chr3 51014580 51014973 + 1.33333 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) L1M1|LINE|L1 339696 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 210.666-54 chr2 62013375 62013754 + 1.33333 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 107922 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 206.333-124 chr4 114504461 114504744 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -93800 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 144.667-94 chr15 54612136 54612334 + 1.33333 NA intron (NM_001329919, intron 29 of 31) intron (NM_001329919, intron 29 of 31) -444512 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 161.333-148 chr2 102752163 102752391 + 1.33333 NA intron (NM_001321346, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR -9754 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 189.333-66 chr16 54647997 54648198 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 200136 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 224.333-117 chr7 24578671 24578902 + 1.33333 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) intron (NM_001303037, intron 1 of 11) 5334 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 157.333-54 chr10 100099614 100099890 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17883 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 277.333-59 chr22 27206925 27207311 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 17561 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 217-96 chr9 76573066 76573339 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 72569 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 302.333-5 chr1 205612019 205612431 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001973, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001973, exon 5 of 5) 20647 NM_001973 2005 Hs.497520 NM_001973 ENSG00000158711 ELK4 SAP1 ETS transcription factor ELK4 protein-coding 200.333-52 chr17 8535663 8535836 + 1.33333 NA intron (NM_001256012, intron 15 of 42) intron (NM_001256012, intron 15 of 42) 94976 NM_001256012 4628 Hs.16355 NM_005964 ENSG00000133026 MYH10 NMMHC-IIB|NMMHCB myosin heavy chain 10 protein-coding 253.333-47 chr18 21180809 21181154 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61261 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 211.999-12 chr9 36103439 36103636 + 1.33333 NA intron (NM_021111, intron 12 of 20) intron (NM_021111, intron 12 of 20) -32999 NR_104637 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 168-75 chr3 190466298 190466493 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -16519 NM_207316 131920 Hs.335321 NM_207316 ENSG00000198398 TMEM207 UNQ846 transmembrane protein 207 protein-coding 198-29 chr11 73413909 73414065 + 1.33333 NA intron (NM_015159, intron 4 of 7) AluJo|SINE|Alu 37319 NM_032871 84957 Hs.533720 NM_032871 ENSG00000054967 RELT AI3C|TNFRSF19L|TRLT RELT TNF receptor protein-coding 204-170 chr5 152983431 152983630 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11181 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 206.666-79 chr3 148651183 148651429 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46565 NM_009585 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 203.333-175 chr3 97385353 97385596 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -54133 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 202.666-121 chr7 104198033 104198187 + 1.33333 NA intron (NM_181747, intron 3 of 8) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 9903 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 239.333-44 chr17 81672986 81673251 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_199287, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_199287, exon 6 of 6) 6381 NM_199287 339230 Hs.744125 NM_199287 ENSG00000185298 CCDC137 RaRF coiled-coil domain containing 137 protein-coding 186.666-10 chr10 66264179 66264380 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L2a|LINE|L2 -661757 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 237.333-28 chr14 46478058 46478511 + 1.33333 NA intron (NR_102700, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 6925 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 270.667-45 chr6 55546042 55546478 + 1.33333 NA intron (NR_109867, intron 1 of 3) intron (NR_109867, intron 1 of 3) 32954 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 130.333-28 chr10 54694115 54694287 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) -86244 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 288.666-16 chr2 110717038 110717342 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15383 NM_001365487 55289 Hs.253320 NM_018308 ENSG00000153093 ACOXL - acyl-CoA oxidase like protein-coding 219.333-108 chr21 16101560 16101771 + 1.33333 NA intron (NR_111005, intron 1 of 6) L1M2|LINE|L1 30551 NR_111005 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 249.666-24 chr2 205427246 205427523 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 19 of 21) L1MC5a|LINE|L1 -255116 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 222-78 chr6 2350857 2351083 + 1.33333 NA intron (NR_046229, intron 4 of 6) intron (NR_046229, intron 4 of 6) 105217 NR_046229 100508120 Hs.188825 NR_046229 GMDS-DT GMDS-AS1 GMDS divergent transcript ncRNA 162-92 chr4 75407160 75407307 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53157 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 444.333-9 chr8 123842954 123843494 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8763 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 258-28 chr18 73602848 73603194 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 278080 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 208.667-144 chr8 82238143 82238397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -395984 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 291-28 chr3 7090520 7090836 + 1.33333 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -196661 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 358.333-24 chr7 83573030 83573339 + 1.33333 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) L1P4a|LINE|L1 68247 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 187.333-66 chr14 92217084 92217312 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 95229 NM_001322270 53981 Hs.657632 NM_017437 ENSG00000165934 CPSF2 CPSF100 cleavage and polyadenylation specific factor 2 protein-coding 209.333-185 chr5 30374475 30374633 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 493994 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 191.333-2 chr1 42617152 42617386 + 1.33333 NA intron (NM_001080850, intron 11 of 16) AluJo|SINE|Alu -41154 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 263.667-25 chr14 73343742 73344040 + 1.33333 NA intron (NM_001005743, intron 4 of 12) intron (NM_001005743, intron 4 of 12) -97890 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 189.666-18 chr2 70576341 70576521 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -22605 NM_001099691 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 247.333-30 chr15 97211961 97212190 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 309736 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 214.999-7 chr20 54393038 54393244 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -82452 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 259-19 chr16 57013890 57014461 + 1.33333 NA intron (NM_001330552, intron 1 of 47) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -2899 NM_032206 84166 Hs.528836 NM_032206 ENSG00000140853 NLRC5 CLR16.1|NOD27|NOD4 NLR family CARD domain containing 5 protein-coding 208.666-73 chr3 113710589 113710804 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -14050 NR_111981 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 193.333-196 chr9 80471037 80471213 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 496102 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 172-65 chr20 46853163 46853441 + 1.33333 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger -41322 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 200-58 chr14 82594419 82594589 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48128 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 171.333-142 chr5 8386798 8386983 + 1.33333 NA intron (NR_039984, intron 3 of 5) intron (NR_039984, intron 3 of 5) 70674 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 160.667-12 chr1 84720713 84720921 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30349 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 212.666-93 chr8 87939821 87940050 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G-int|LTR|ERVL-MaLR -65920 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 240.666-23 chr2 211244234 211244505 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 626798 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 220.333-129 chr8 88351430 88351700 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -24082 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 332-13 chr15 66494026 66494529 + 1.33333 NA non-coding (NR_138061, exon 3 of 4) non-coding (NR_138061, exon 3 of 4) 2757 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 260.333-62 chr7 46795129 46795432 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -98158 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 194.666-77 chr9 19721707 19721924 + 1.33333 NA intron (NM_020344, intron 1 of 9) intron (NM_020344, intron 1 of 9) 65204 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 284.999-4 chr7 13076383 13076790 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 388953 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 272.666-31 chrX 45249228 45249520 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -48498 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 251.666-19 chr3 96648151 96648430 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -166304 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 199.333-225 chr5 67465607 67465836 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 181068 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 250.999-2 chr11 21867881 21868159 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -325065 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 150.666-4 chr1 187472754 187472914 + 1.33333 NA intron (NR_132374, intron 2 of 2) intron (NR_132374, intron 2 of 2) 29206 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 230-50 chr4 48022694 48022955 + 1.33333 NA intron (NM_207330, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 6052 NM_207330 152519 Hs.134190 NM_207330 ENSG00000163293 NIPAL1 NPAL1 NIPA like domain containing 1 protein-coding 191.333-16 chr1 235696944 235697155 + 1.33333 NA intron (NM_000081, intron 46 of 52) intron (NM_000081, intron 46 of 52) -46295 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 200-24 chr10 88907715 88907867 + 1.33333 NA intron (NM_020799, intron 3 of 10) MIRc|SINE|MIR -24893 NR_125373 100132116 NR_125373 ENSG00000180139 ACTA2-AS1 UC001kfo|ZXF1|uc001kfo.1 ACTA2 antisense RNA 1 ncRNA 160.667-279 chr7 42218838 42219029 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) intron (NM_000168, intron 2 of 14) 18276 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 172-90 chr5 96760993 96761213 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001349244, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001349244, exon 20 of 20) 17501 NR_104285 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 226.666 chr1 18774936 18775111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84638 NM_152232 80834 Hs.553548 NM_152232 ENSG00000179002 TAS1R2 GPR71|T1R2|TR2 taste 1 receptor member 2 protein-coding 190.666-26 chr2 76046041 76046237 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -335224 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 216.333-30 chr11 78431976 78432168 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2236 NR_120564 101928865 Hs.407574 NR_120564 ENSG00000251323 LINC02728 - long intergenic non-protein coding RNA 2728 ncRNA 359.666-3 chr12 83346048 83346526 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 659132 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 194-46 chr15 80585016 80585238 + 1.33333 NA intron (NM_014862, intron 17 of 18) intron (NM_014862, intron 17 of 18) 4024 NR_049837 100847042 NR_049837 ENSG00000284059 MIR5572 - microRNA 5572 ncRNA 211.333-256 chrX 53199928 53200148 + 1.33333 NA intron (NR_148673, intron 14 of 26) MIR|SINE|MIR -1093 NR_106954 102466759 NR_106954 ENSG00000277474 MIR6894 hsa-mir-6894 microRNA 6894 ncRNA 381.333-9 chr2 15470327 15470655 + 1.33333 NA intron (NR_052013, intron 16 of 50) L2b|LINE|L2 90843 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 170.666-12 chr20 2768090 2768243 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32461 NM_019609 56265 Hs.659346 NM_019609 ENSG00000088882 CPXM1 CPX1|CPXM carboxypeptidase X, M14 family member 1 protein-coding 254.333-80 chr7 96336389 96336747 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14421 NM_001160210 10165 Hs.489190 NM_014251 ENSG00000004864 SLC25A13 ARALAR2|CITRIN|CTLN2 solute carrier family 25 member 13 protein-coding 213-24 chr15 88893298 88893765 + 1.33333 NA intron (NM_001307952, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 2013 NM_178232 145864 Hs.447530 NM_178232 ENSG00000140511 HAPLN3 EXLD1|HsT19883 hyaluronan and proteoglycan link protein 3 protein-coding 218.666-13 chr11 39938808 39939025 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 354214 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 208-76 chr2 31874770 31875003 + 1.33333 NA intron (NR_126032, intron 5 of 6) intron (NR_126032, intron 5 of 6) -70906 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 303.333-78 chr8 116955707 116955991 + 1.33333 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 4874 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 164-84 chr4 38274733 38275000 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -92048 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 195.333-23 chr1 226238863 226239125 + 1.33333 NA exon (NM_001366241, exon 12 of 15) exon (NM_001366241, exon 12 of 15) 15330 NM_001282402 83881 Hs.282079 NM_031944 ENSG00000185155 MIXL1 MILD1|MIX|MIXL Mix paired-like homeobox protein-coding 135.666-7 chr8 10276247 10276416 + 1.33333 NA intron (NM_001199729, intron 4 of 6) intron (NM_001199729, intron 4 of 6) 180680 NM_001135671 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 335.333-36 chr5 4225383 4225739 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -547920 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 204.667-99 chr3 123896708 123897000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12522 NM_053027 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 310-12 chr11 43859244 43859546 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -21436 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 204.666-98 chr8 79632783 79632992 + 1.33333 NA intron (NM_007029, intron 1 of 4) intron (NM_007029, intron 1 of 4) 21770 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 172.666-8 chr15 49963034 49963187 + 1.33333 NA intron (NR_073597, intron 13 of 26) L1PA11|LINE|L1 150269 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 369.667-13 chr7 112476856 112477380 + 1.33333 NA TTS (NM_001197079) TTS (NM_001197079) -3735 NM_001134468 286006 Hs.396189 NM_182597 ENSG00000181016 LSMEM1 C7orf53 leucine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 304.333-27 chr5 168921744 168922136 + 1.33333 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) intron (NM_003062, intron 4 of 35) -91287 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 204.667-111 chr4 94136290 94136569 + 1.33333 NA intron (NR_125922, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu 71127 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 199.333-83 chr14 86477125 86477302 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -428565 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 281.333-33 chr2 150884929 150885234 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 256184 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 212.333-154 chr9 90864024 90864330 + 1.33333 NA intron (NM_001174167, intron 4 of 13) intron (NM_001174167, intron 4 of 13) 36757 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 202-41 chr14 32481654 32481839 + 1.33333 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) L2a|LINE|L2 152448 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 199.333-9 chr1 71837209 71837426 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_046218) promoter-TSS (NR_046218) -305 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 198-145 chr5 4131846 4132123 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 536152 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 166.333-10 chr1 111782735 111782884 + 1.33333 NA intron (NM_172198, intron 3 of 6) intron (NM_172198, intron 3 of 6) 26908 NM_007204 11218 Hs.591405 NM_007204 ENSG00000064703 DDX20 DP103|GEMIN3 DEAD-box helicase 20 protein-coding 117.333-175 chr5 122547200 122547354 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 37323 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 232.666-23 chr2 104310584 104310809 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97636 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 347.333-4 chr12 104248792 104249446 + 1.33333 NA intron (NM_001093771, intron 1 of 16) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 33340 NM_001093771 7296 Hs.654922 NM_003330 ENSG00000198431 TXNRD1 GRIM-12|TR|TR1|TRXR1|TXNR thioredoxin reductase 1 protein-coding 368-6 chr11 115672990 115673397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61569 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 197.666-22 chr16 51181159 51181334 + 1.33333 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) MIRc|SINE|MIR -29974 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 397.667 chr11 115807779 115808231 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47805 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 201.333-8 chr1 94079751 94079928 + 1.33333 NA intron (NM_000350, intron 8 of 49) intron (NM_000350, intron 8 of 49) 41309 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 281.667-8 chr10 113709344 113709750 + 1.33333 NA intron (NM_001267058, intron 1 of 5) intron (NM_001267058, intron 1 of 5) 202 NM_001267058 840 Hs.9216 NM_001227 ENSG00000165806 CASP7 CASP-7|CMH-1|ICE-LAP3|LICE2|MCH3 caspase 7 protein-coding 288 chr1 17699273 17699808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55793 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 327.666-11 chr8 129948733 129949109 + 1.33333 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu -9110 NM_001353244 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 201.333-148 chr2 76351515 76351704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -634356 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 229.333-3 chr1 85410482 85410749 + 1.33333 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) AluSp|SINE|Alu -6109 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 325.333-38 chr5 105283303 105283907 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184131 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 193.667-16 chr1 224866110 224866351 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -63424 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 214-148 chr9 123538154 123538330 + 1.33333 NA intron (NM_001352968, intron 12 of 18) L1MC5|LINE|L1 -52620 NR_106972 102465688 NR_106972 ENSG00000274932 MIR7150 hsa-mir-7150 microRNA 7150 ncRNA 213.333-57 chr14 62102844 62103103 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) -14384 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 229.333-34 chr14 48104690 48104933 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -309797 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 212-65 chr16 17367562 17367815 + 1.33333 NA intron (NM_022166, intron 1 of 11) intron (NM_022166, intron 1 of 11) 103272 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 278.666-19 chr4 72967957 72968217 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 101629 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 212.666-54 chr3 25311106 25311500 + 1.33333 NA intron (NM_001290216, intron 4 of 10) intron (NM_001290216, intron 4 of 10) -29499 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 360-24 chr5 120151325 120151925 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -312653 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 244-25 chr11 113064854 113065074 + 1.33333 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) L1MC3|LINE|L1 -101504 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 199.333-38 chr11 7473090 7473349 + 1.33333 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -7384 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 299.333-32 chr18 524974 525239 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9812 NR_136505 105376854 NR_136505 ENSG00000264265 LINC01925 - long intergenic non-protein coding RNA 1925 ncRNA 345.333-20 chr20 40365769 40366280 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 323212 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 226-45 chr2 159933092 159933367 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001195641, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_001195641, exon 30 of 30) -28473 NM_002349 4065 Hs.153563 NM_002349 ENSG00000054219 LY75 CD205|CLEC13B|DEC-205|GP200-MR6|LY-75 lymphocyte antigen 75 protein-coding 248.333-4 chr1 71308390 71308684 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 227213 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 205.666-10 chr10 50213590 50213830 + 1.33333 NA intron (NM_001143974, intron 8 of 18) intron (NM_001143974, intron 8 of 18) 34900 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 250.333-60 chr5 122467293 122467585 + 1.33333 NA intron (NR_051996, intron 2 of 5) MER5B|DNA|hAT-Charlie 11648 NR_051996 153163 Hs.679757 NR_051996 ENSG00000250328 MGC32805 - uncharacterized LOC153163 ncRNA 214-24 chr11 81829967 81830236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60735 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 175.333-130 chr3 190631040 190631244 + 1.33333 NA TTS (NM_001167930) TTS (NM_001167930) 117057 NM_001364879 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 225.333-84 chr2 195891797 195892193 + 1.33333 NA intron (NM_018897, intron 30 of 64) L1M5|LINE|L1 176842 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 275.333-81 chr9 30097288 30097599 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 311011 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 210.333-8 chr1 221500184 221500372 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -163982 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 189.333-109 chr20 33726835 33727192 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4747 NM_001282935 84905 Hs.516989 NM_032819 ENSG00000131061 ZNF341 HIES3 zinc finger protein 341 protein-coding 256.333-81 chr8 85395689 85396086 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -17774 NM_001128830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 147.333-223 chr3 128959331 128959525 + 1.33333 NA intron (NM_001348520, intron 8 of 14) HAL1|LINE|L1 32469 NM_001348523 57501 Hs.518247 NM_020741 ENSG00000114656 KIAA1257 - KIAA1257 protein-coding 196.333-100 chr20 50612140 50612394 + 1.33333 NA intron (NM_001290268, intron 4 of 21) intron (NM_001290268, intron 4 of 21) 2518 NR_031634 100302146 NR_031634 ENSG00000221091 MIR1302-5 MIRN1302-5|hsa-mir-1302-5 microRNA 1302-5 ncRNA 206.333-161 chr8 82605594 82605831 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -306392 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 256-20 chr12 13513259 13513510 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -136639 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 208-142 chr6 49008075 49008323 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 455054 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 192.667-115 chr3 171226235 171226496 + 1.33333 NA intron (NM_001161563, intron 3 of 31) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -119606 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 131.666-3 chr5 113932634 113932853 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 419049 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 200-152 chr7 38447742 38448013 + 1.33333 NA intron (NM_001635, intron 11 of 20) intron (NM_001635, intron 11 of 20) 106300 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 214.666-15 chr11 84576398 84576656 + 1.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 144415 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 203.333-264 chr8 84785406 84785560 + 1.33333 NA intron (NM_001354322, intron 3 of 6) intron (NM_001354322, intron 3 of 6) 79556 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 137.333-71 chr17 68998466 68998612 + 1.33333 NA intron (NM_080283, intron 25 of 38) intron (NM_080283, intron 25 of 38) -6175 NR_126414 104355297 Hs.569827 NR_126414 ENSG00000231749 ABCA9-AS1 - ABCA9 antisense RNA 1 ncRNA 266.667-48 chr3 109708095 109708441 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 105440 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 182.667-88 chr3 23404881 23405123 + 1.33333 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 201675 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 249.333-16 chr11 31408940 31409232 + 1.33333 NA intron (NM_181706, intron 2 of 4) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 39226 NM_181706 120526 Hs.187269 NM_181706 ENSG00000170946 DNAJC24 DPH4|JJJ3|ZCSL3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C24 protein-coding 192-13 chr1 212300491 212300688 + 1.33333 NA intron (NM_006243, intron 1 of 12) intron (NM_006243, intron 1 of 12) -1269 NM_001199756 5525 Hs.744012 NM_006243 ENSG00000066027 PPP2R5A B56A|B56alpha|PR61A protein phosphatase 2 regulatory subunit B'alpha protein-coding 328.333-8 chr10 75237021 75237464 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1285 NM_144589 118881 Hs.355333 NM_144589 ENSG00000165644 COMTD1 - catechol-O-methyltransferase domain containing 1 protein-coding 172-28 chr11 101973954 101974183 + 1.33333 NA intron (NM_001363543, intron 7 of 11) intron (NM_001363543, intron 7 of 11) -57546 NM_178127 253935 Hs.318370 NM_178127 ENSG00000187151 ANGPTL5 - angiopoietin like 5 protein-coding 230-76 chr9 8731041 8731371 + 1.33333 NA intron (NM_130392, intron 1 of 30) intron (NM_130392, intron 1 of 30) 2740 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 204.333-187 chr7 66223106 66223322 + 1.33333 NA intron (NM_003596, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 17880 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 293.333 chr1 64429694 64430005 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -40280 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 201-39 chr15 42930654 42930883 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -9990 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 206.666-33 chr12 112980738 112981000 + 1.33333 NA intron (NM_002535, intron 1 of 9) L1MA4|LINE|L1 2350 NM_002535 4939 Hs.414332 NM_002535 ENSG00000111335 OAS2 - 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2 protein-coding 225.333-21 chr10 82905080 82905328 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) intron (NR_163253, intron 6 of 10) -672284 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 252.667-69 chr4 30552964 30553307 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -167234 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 255.666-12 chr16 67220239 67220667 + 1.33333 NA intron (NM_001365159, intron 2 of 6) intron (NM_001365159, intron 2 of 6) 6349 NM_001365158 26231 Hs.461000 NM_012163 ENSG00000125122 LRRC29 FBL9|FBXL9 leucine rich repeat containing 29 protein-coding 176.666-29 chr6 121918973 121919136 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -480497 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 204.666-18 chr11 38058894 38059147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120419 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 262.999-7 chr5 151285647 151286024 + 1.33333 NA intron (NM_181774, intron 6 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 17931 NM_181774 285641 Hs.720893 NM_181774 ENSG00000186334 SLC36A3 PAT3|TRAMD2|tramdorin2 solute carrier family 36 member 3 protein-coding 306.666-16 chr2 28863960 28864319 + 1.33333 NA intron (NM_017910, intron 2 of 6) intron (NM_017910, intron 2 of 6) 6170 NM_017910 55006 Hs.468026 NM_017910 ENSG00000171103 TRMT61B - tRNA methyltransferase 61B protein-coding 300-65 chr8 50786087 50786516 + 1.33333 NA intron (NR_135797, intron 20 of 20) L1MB7|LINE|L1 622170 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 340.666-10 chr19 40139101 40139515 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -48365 NM_001142579 284323 Hs.115140 NM_001010880 ENSG00000197782 ZNF780A ZNF780 zinc finger protein 780A protein-coding 212.333-148 chr8 106478914 106479137 + 1.33333 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 31101 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 261.666-14 chr3 112435918 112436207 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 63410 NM_001085357 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 242.333-9 chr1 227008460 227008690 + 1.33333 NA intron (NM_001366019, intron 34 of 36) intron (NM_001366019, intron 34 of 36) 68281 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 210.333-73 chr2 59650744 59650943 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 433135 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 183-12 chr10 60103265 60103534 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 29 of 43) intron (NM_001204403, intron 29 of 43) 37617 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 206-135 chr5 3164528 3164725 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -13209 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 242.333-44 chr2 44831674 44831991 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 107056 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 203.667-95 chr5 66456973 66457258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54489 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 182.666 chr1 88544171 88544369 + 1.33333 NA intron (NR_110682, intron 3 of 3) intron (NR_110682, intron 3 of 3) -139874 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 130-60 chr2 196718205 196718355 + 1.33333 NA intron (NM_001353340, intron 1 of 10) intron (NM_001353340, intron 1 of 10) 4742 NM_001353340 284992 Hs.132519 NM_173466 ENSG00000144395 CCDC150 - coiled-coil domain containing 150 protein-coding 208.666-50 chr17 59502991 59503254 + 1.33333 NA intron (NR_110813, intron 1 of 2) ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 23735 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 161-31 chr15 81240834 81241074 + 1.33333 NA intron (NM_001352686, intron 2 of 18) L1ME3E|LINE|L1 41478 NM_001352686 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 213.333 chr1 12851090 12851268 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2423 NM_001013631 343069 Hs.502617 NM_001013631 ENSG00000179172 HNRNPCL1 HNRPCL1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C like 1 protein-coding 198-18 chr10 63229780 63230072 + 1.33333 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 39297 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 184-4 chr1 61130590 61130760 + 1.33333 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 48114 NM_005595 4774 Hs.740757 NM_005595 ENSG00000162599 NFIA BRMUTD|CTF|NF-I/A|NF1-A|NFI-A|NFI-L nuclear factor I A protein-coding 155.333-149 chr18 69695559 69695751 + 1.33333 NA intron (NM_152721, intron 4 of 7) intron (NM_152721, intron 4 of 7) 225724 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 212.333-112 chr5 32520160 32520334 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -65310 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 242-67 chr7 68015564 68015839 + 1.33333 NA Intergenic UCON78|DNA|DNA -4552 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 171-69 chr6 15620795 15621001 + 1.33333 NA intron (NR_036448, intron 6 of 9) MIRb|SINE|MIR 42130 NR_036448 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 342.333-10 chr18 10117345 10117784 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 203548 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 198-67 chr16 60038929 60039220 + 1.33333 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) L1PB4|LINE|L1 183721 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 203.333-286 chrX 70339822 70340103 + 1.33333 NA intron (NM_012310, intron 10 of 30) intron (NM_012310, intron 10 of 30) 49858 NM_012310 24137 Hs.648326 NM_012310 ENSG00000090889 KIF4A KIF4|KIF4G1|MRX100 kinesin family member 4A protein-coding 259.666-8 chr11 24483744 24484060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13151 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 125-36 chr14 52639661 52639842 + 1.33333 NA TTS (NM_014584) TTS (NM_014584) 55807 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 383.333-16 chr7 30039054 30039553 + 1.33333 NA intron (NM_001363473, intron 1 of 12) AluSq2|SINE|Alu -5782 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 137-28 chr14 51562916 51563061 + 1.33333 NA intron (NR_047477, intron 2 of 3) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 36964 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 220-110 chr7 39571796 39572022 + 1.33333 NA intron (NM_001282446, intron 2 of 2) intron (NM_001282446, intron 2 of 2) 5505 NM_001282446 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 289.666-20 chr9 69121158 69121477 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001170414) promoter-TSS (NM_001170414) 53 NM_001170414 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 241.666-19 chr6 9571237 9571691 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -833038 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 210.333-180 chr9 96322195 96322353 + 1.33333 NA intron (NR_104627, intron 10 of 12) AluJr|SINE|Alu -20098 NM_000197 3293 Hs.477 NM_000197 ENSG00000130948 HSD17B3 EDH17B3|SDR12C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3 protein-coding 208.333-52 chr17 11647801 11647970 + 1.33333 NA intron (NM_001372, intron 12 of 68) MER20|DNA|hAT-Charlie 49415 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 156-49 chr14 72808632 72808775 + 1.33333 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 83946 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 172.667-24 chr10 99948095 99948297 + 1.33333 NA intron (NR_024130, intron 2 of 4) intron (NR_024130, intron 2 of 4) -17289 NM_001318326 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 256.333-42 chr2 81243723 81244066 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 223052 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 339.999-8 chr6 124395789 124396270 + 1.33333 NA intron (NM_153355, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 113024 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 371.999 chr10 74067521 74067934 + 1.33333 NA intron (NM_014000, intron 2 of 21) L1MB5|LINE|L1 69611 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 399-5 chr12 112660518 112660965 + 1.33333 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) MIR|SINE|MIR 34435 NR_031631 100302227 NR_031631 ENSG00000283507 MIR1302-1 MIRN1302-1|hsa-mir-1302-1 microRNA 1302-1 ncRNA 289.999-3 chr22 21659954 21660187 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -5914 NM_001317996 23759 Hs.438587 NM_014337 ENSG00000100023 PPIL2 CYC4|CYP60|Cyp-60|UBOX7|hCyP-60 peptidylprolyl isomerase like 2 protein-coding 196-139 chr5 8798905 8799057 + 1.33333 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -40751 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 197.333-101 chr2 21476537 21476799 + 1.33333 NA Intergenic LTR42|LTR|ERVL 233984 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 211.333-131 chr20 11256931 11257225 + 1.33333 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 16305 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 347.333-26 chr7 48134808 48135320 + 1.33333 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -36394 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 251.333-66 chr2 209570321 209570684 + 1.33333 NA intron (NM_001039538, intron 2 of 14) intron (NM_001039538, intron 2 of 14) -8834 NM_001363913 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 203.667-87 chr4 48546669 48546958 + 1.33333 NA intron (NM_015030, intron 41 of 63) intron (NM_015030, intron 41 of 63) 56561 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 205.666-38 chr4 115470774 115470959 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -357246 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 275-26 chr2 148128882 148129183 + 1.33333 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -107428 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 191.666-14 chr3 193038523 193038725 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -120768 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 185.333-148 chr5 10507224 10507412 + 1.33333 NA intron (NR_134289, intron 1 of 2) L1MC4a|LINE|L1 1876 NR_134290 389273 Hs.519206 NR_134289 ENSG00000249160 LINC02213 - long intergenic non-protein coding RNA 2213 ncRNA 218.666-53 chr3 89484573 89484898 + 1.33333 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 377114 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 298-81 chr8 117183266 117183648 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48462 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 314-46 chr7 97142275 97142562 + 1.33333 NA intron (NM_020186, intron 1 of 1) intron (NM_020186, intron 1 of 1) 25825 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 206.666-113 chr7 104366505 104366756 + 1.33333 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 37974 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 146.667-296 chr6 161349127 161349287 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_013988, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_013988, exon 9 of 9) -75146 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 243-35 chr2 200416551 200416932 + 1.33333 NA intron (NM_001100423, intron 5 of 12) intron (NM_001100423, intron 5 of 12) 93327 NM_001321547 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 192.666-49 chr4 178629369 178629526 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -721511 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 165.333-53 chr11 115705739 115705964 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 28911 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 202.333-11 chr1 78074195 78074351 + 1.33333 NA intron (NM_017655, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 28307 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 205.333-163 chr3 182084020 182084178 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 131735 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 181-22 chr14 53777966 53778185 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 170409 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 462.333 chr1 116564225 116564706 + 1.33333 NA intron (NM_001779, intron 1 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -4354 NR_039621 100616384 NR_039621 ENSG00000264419 MIR548AC - microRNA 548ac ncRNA 248.666-20 chr17 76468874 76469074 + 1.33333 NA intron (NM_001088, intron 2 of 3) intron (NM_001088, intron 2 of 3) 1371 NM_001088 15 Hs.431417 NM_001088 ENSG00000129673 AANAT DSPS|SNAT aralkylamine N-acetyltransferase protein-coding 208-66 chr19 13528331 13528585 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21979 NM_001174080 773 Hs.501632 NM_000068 ENSG00000141837 CACNA1A APCA|BI|CACNL1A4|CAV2.1|EA2|EIEE42|FHM|HPCA|MHP|MHP1|SCA6 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A protein-coding 210.666-10 chr10 49562440 49562625 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -22994 NM_001277059 2074 Hs.49063 NM_000124 ENSG00000225830 ERCC6 ARMD5|CKN2|COFS|COFS1|CSB|CSB-PGBD3|POF11|RAD26|UVSS1 ERCC excision repair 6, chromatin remodeling factor protein-coding 196.666-106 chr8 119611860 119612078 + 1.33333 NA intron (NM_001330600, intron 8 of 25) AluSz|SINE|Alu -18961 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 235-15 chr13 61487299 61487517 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59462 NR_134946 101926951 Hs.732367 NR_134946 ENSG00000279797 LINC02339 - long intergenic non-protein coding RNA 2339 ncRNA 200.666-64 chr2 148671084 148671244 + 1.33333 NA intron (NM_015630, intron 1 of 13) intron (NM_015630, intron 1 of 13) 26413 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 202-160 chr6 61665564 61665717 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 10 of 13) intron (NR_146874, intron 10 of 13) 91510 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 375-8 chr2 73845056 73845593 + 1.33333 NA intron (NR_148670, intron 5 of 12) intron (NR_148670, intron 5 of 12) 16357 NM_006463 10617 Hs.469018 NM_006463 ENSG00000124356 STAMBP AMSH|MICCAP STAM binding protein protein-coding 187-8 chr1 213868070 213868282 + 1.33333 NA intron (NR_037850, intron 4 of 5) intron (NR_037850, intron 4 of 5) -56573 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 195.333 chr1 31604472 31604764 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -13082 NM_001525 3061 Hs.388226 NM_001525 ENSG00000121764 HCRTR1 OX1R hypocretin receptor 1 protein-coding 173.333-202 chr8 86063939 86064206 + 1.33333 NA exon (NM_033126, exon 2 of 3) exon (NM_033126, exon 2 of 3) 5596 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 256.333-60 chr4 62947401 62947726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -785798 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 200.667-18 chr10 32971044 32971318 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12951 NM_002211 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 248.667-45 chr16 62239082 62239386 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -202796 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 264.666 chr1 13663661 13663982 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -36367 NM_001135610 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 239.333-74 chr4 36212622 36212982 + 1.33333 NA intron (NR_146894, intron 4 of 32) intron (NR_146894, intron 4 of 32) 31137 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 199-56 chr2 167092396 167092670 + 1.33333 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) intron (NM_152381, intron 2 of 10) 48422 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-180 chr18 12097418 12097620 + 1.33333 NA intron (NM_001277333, intron 4 of 13) intron (NM_001277333, intron 4 of 13) 3676 NM_001277333 342850 Hs.448906 NM_001277333 ENSG00000181626 ANKRD62 DKFZp779B1634 ankyrin repeat domain 62 protein-coding 261.999-6 chr2 4845049 4845399 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -189002 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 195.333-111 chr2 74064809 74065003 + 1.33333 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 62214 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 214.666-21 chr14 33225660 33225873 + 1.33333 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) MER58B|DNA|hAT-Charlie 286887 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 238.333-3 chr1 192032920 192033246 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -125379 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 320.666-13 chr6 35543249 35543576 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -30516 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 284.666-14 chr2 20730677 20731040 + 1.33333 NA intron (NR_104233, intron 3 of 4) L1MD1|LINE|L1 63714 NM_182828 151449 Hs.447688 NM_182828 ENSG00000143869 GDF7 BMP12 growth differentiation factor 7 protein-coding 371.666-12 chr4 148563339 148563667 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -118805 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 243.333-89 chr5 69103543 69103798 + 1.33333 NA intron (NM_022902, intron 3 of 15) intron (NM_022902, intron 3 of 15) 9656 NM_022902 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 199.333-212 chr4 148385375 148385537 + 1.33333 NA intron (NM_000901, intron 2 of 8) intron (NM_000901, intron 2 of 8) 56958 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 221-50 chr3 172097272 172097464 + 1.33333 NA intron (NM_001135095, intron 1 of 25) intron (NM_001135095, intron 1 of 25) 56837 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 186-58 chr21 36159629 36159771 + 1.33333 NA intron (NM_001320714, intron 1 of 36) intron (NM_001320714, intron 1 of 36) 2918 NM_001320714 9980 Hs.204575 NM_005128 ENSG00000142197 DOP1B 21orf5|C21orf5|DOPEY2 DOP1 leucine zipper like protein B protein-coding 207.333-185 chr3 118130202 118130438 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -439395 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 149.333-167 chr2 24607888 24608096 + 1.33333 NA intron (NM_001362950, intron 3 of 23) intron (NM_001362950, intron 3 of 23) 23515 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 247-56 chr3 173030276 173030703 + 1.33333 NA intron (NM_031955, intron 3 of 10) L1MB2|LINE|L1 110746 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 256.667-7 chr10 71904130 71904456 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53042 NM_001042465 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 241-8 chr11 42991364 42991686 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 277844 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 269.333-63 chr3 120413296 120413691 + 1.33333 NA intron (NM_007085, intron 3 of 10) intron (NM_007085, intron 3 of 10) -17764 NR_029584 406975 NR_029584 ENSG00000284121 MIR198 MIRN198|miR-198 microRNA 198 ncRNA 240-58 chr22 39603671 39603962 + 1.33333 NA intron (NM_001003406, intron 3 of 35) LTR37B|LTR|ERV1 33063 NM_001003406 8911 Hs.125116 NM_021096 ENSG00000100346 CACNA1I Cav3.3|ca(v)3.3 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 I protein-coding 202.666-115 chr7 30517684 30517908 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -12955 NM_001199816 79017 Hs.530024 NM_024051 ENSG00000006625 GGCT C7orf24|CRF21|GCTG|GGC gamma-glutamylcyclotransferase protein-coding 200.333-62 chr19 44330691 44330871 + 1.33333 NA intron (NM_001348282, intron 3 of 3) intron (NM_001348282, intron 3 of 3) -25756 NM_004234 9310 Hs.613424 NM_004234 ENSG00000159917 ZNF235 ANF270|HZF6|ZFP93|ZNF270 zinc finger protein 235 protein-coding 157.333-164 chr18 13401411 13401645 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 3 of 5) intron (NM_181482, intron 3 of 5) 26006 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 240.666-11 chr12 27729041 27729369 + 1.33333 NA intron (NM_001190864, intron 5 of 6) L1MC5a|LINE|L1 18373 NM_021821 60488 Hs.714076 NM_021821 ENSG00000061794 MRPS35 HDCMD11P|MDS023|MRP-S28|MRPS28 mitochondrial ribosomal protein S35 protein-coding 172.667-19 chr10 31371308 31371529 + 1.33333 NA intron (NM_001368169, intron 1 of 1) intron (NM_001368169, intron 1 of 1) 28337 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 285.333-47 chr4 24896578 24896905 + 1.33333 NA intron (NM_173463, intron 1 of 12) intron (NM_173463, intron 1 of 12) 16237 NM_001330643 91050 Hs.106432 NM_173463 ENSG00000181982 CCDC149 - coiled-coil domain containing 149 protein-coding 200.666-107 chr6 167225291 167225520 + 1.33333 NA Intergenic LTR44|LTR|ERV1 -2895 NR_157263 112590798 NR_157263 HPAT5 - human pluripotency-associated transcript 5 ncRNA 226.333-72 chr22 27813779 27813948 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -12107 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 216.333-75 chr2 47548166 47548476 + 1.33333 NA intron (NM_022055, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 20784 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 233.667-58 chr4 182728435 182728707 + 1.33333 NA intron (NM_001080477, intron 13 of 27) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 188682 NM_001351744 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 222-74 chr5 85347231 85347536 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -935061 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 306.666-38 chr8 71281102 71281417 + 1.33333 NA intron (NM_001370336, intron 10 of 17) intron (NM_001370336, intron 10 of 17) 75447 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 192-153 chr9 27400710 27400915 + 1.33333 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -103662 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 238-15 chr12 13285259 13285609 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 88708 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 255.999-5 chr20 9997611 9997907 + 1.33333 NA intron (NR_109861, intron 1 of 1) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 11426 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 172-73 chr3 110438075 110438275 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 631784 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 137.333-12 chr1 240820239 240820458 + 1.33333 NA intron (NM_001350116, intron 10 of 16) intron (NM_001350116, intron 10 of 16) -208193 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 201.333-69 chr12 7687064 7687262 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 8612 NM_020634 9573 Hs.86232 NM_020634 ENSG00000184344 GDF3 KFS3|MCOP7|MCOPCB6 growth differentiation factor 3 protein-coding 177.333-171 chr8 88230378 88230623 + 1.33333 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 96983 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 245.666-10 chr14 67575507 67575740 + 1.33333 NA intron (NM_020715, intron 15 of 28) intron (NM_020715, intron 15 of 28) 24645 NM_004569 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 268.999-5 chr8 98602592 98602817 + 1.33333 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) HAL1|LINE|L1 175746 NM_020697 3788 Hs.388045 NM_020697 ENSG00000156486 KCNS2 KV9.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 2 protein-coding 402.333-14 chr8 80939568 80939909 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64957 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 238.333-49 chr2 166369360 166369608 + 1.33333 NA intron (NM_001365536, intron 1 of 26) intron (NM_001365536, intron 1 of 26) 6460 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 201.666-34 chr5 118192106 118192280 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -90381 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 292.667-14 chr17 61225898 61226269 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) FLAM_C|SINE|Alu 141621 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 284.999-2 chr3 30160618 30160944 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -226625 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 483.332 chr7 6122173 6122704 + 1.33333 NA intron (NM_032172, intron 3 of 17) AluJr|SINE|Alu 17489 NM_032172 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 232.333-5 chr10 32281172 32281399 + 1.33333 NA intron (NM_001272004, intron 10 of 13) AluSx1|SINE|Alu 65873 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 239.333-33 chr14 40885886 40886086 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68725 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 193.666-18 chr16 8259094 8259329 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 330627 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 291.333-36 chr2 9898178 9898588 + 1.33333 NA intron (NM_001318977, intron 7 of 13) intron (NM_001318977, intron 7 of 13) -53310 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 247.666-12 chr18 41083821 41084084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 436725 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 137-48 chr2 113251603 113251863 + 1.33333 NA intron (NR_015377, intron 2 of 5) intron (NR_015377, intron 2 of 5) 15464 NR_015377 654433 Hs.656660 NR_015377 ENSG00000189223 PAX8-AS1 - PAX8 antisense RNA 1 ncRNA 444.333-6 chr4 41564657 41565259 + 1.33333 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 26801 NM_001330786 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 170-60 chr2 72297000 72297240 + 1.33333 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -149258 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 296-38 chr20 42180870 42181157 + 1.33333 NA intron (NM_133170, intron 17 of 31) MIRb|SINE|MIR -504470 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 193.667-69 chr2 210142722 210142967 + 1.33333 NA intron (NM_001307976, intron 2 of 13) L1ME5|LINE|L1 28565 NM_152519 151050 Hs.282260 NM_152519 ENSG00000144445 KANSL1L C2orf67|MSL1v2 KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 like protein-coding 225-7 chr1 237278724 237278935 + 1.33333 NA intron (NM_001035, intron 2 of 104) intron (NM_001035, intron 2 of 104) -192290 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 356.999-8 chr6 121798284 121798752 + 1.33333 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 362872 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 248.333-23 chr12 52515692 52516002 + 1.33333 NA intron (NM_000424, intron 7 of 8) intron (NM_000424, intron 7 of 8) 4547 NM_000424 3852 Hs.433845 NM_000424 ENSG00000186081 KRT5 CK5|DDD|DDD1|EBS2|K5|KRT5A keratin 5 protein-coding 207.333-13 chr1 109132112 109132272 + 1.33333 NA intron (NM_001284352, intron 1 of 20) AluSx1|SINE|Alu 18077 NM_001267048 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 212.999-2 chr20 13774442 13774601 + 1.33333 NA intron (NM_001276380, intron 4 of 13) MIR|SINE|MIR 10365 NM_016649 51575 Hs.369284 NM_016649 ENSG00000089048 ESF1 ABTAP|C20orf6|HDCMC28P|bA526K24.1 ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog protein-coding 359-2 chr10 22922411 22922897 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -5370 NM_001282747 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 261.999-3 chr11 115326179 115326515 + 1.33333 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -7230 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 230.666-23 chr17 61013086 61013309 + 1.33333 NA intron (NM_001353144, intron 16 of 25) intron (NM_001353144, intron 16 of 25) 335346 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 167.666-8 chr4 68244621 68244778 + 1.33333 NA intron (NM_182502, intron 1 of 9) intron (NM_182502, intron 1 of 9) 995 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 306.333-32 chr4 61689515 61690089 + 1.33333 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) intron (NM_001371342, intron 4 of 20) 471963 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 255-74 chr7 4701947 4702288 + 1.33333 NA intron (NM_001037165, intron 1 of 8) L1ME3Cz|LINE|L1 19822 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 234.333-19 chr12 39285335 39285635 + 1.33333 NA Intergenic LTR84a|LTR|ERVL 157635 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 200.666-94 chr5 15034960 15035173 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -163288 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 184-101 chr7 31490394 31490560 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23594 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 118-59 chr18 3213292 3213439 + 1.33333 NA intron (NM_019856, intron 2 of 36) intron (NM_019856, intron 2 of 36) 6603 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 280.999 chr1 5140775 5141065 + 1.33333 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie 486311 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 140-96 chr6 53623981 53624160 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -4310 NR_125841 101927171 Hs.334005 NR_125841 ENSG00000235899 LINC01564 TCONS_00011314|XLOC_005327 long intergenic non-protein coding RNA 1564 ncRNA 183.667-52 chr15 71108376 71108581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32971 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 207.999-8 chrX 82813983 82814139 + 1.33333 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -694229 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 215.333-127 chr3 47658534 47658738 + 1.33333 NA intron (NM_003074, intron 21 of 27) L1MB7|LINE|L1 3058 NR_145791 109623484 NR_145791 SNORD146 - small nucleolar RNA, C/D box 146 snoRNA 172-56 chr2 111211231 111211471 + 1.33333 NA intron (NR_015395, intron 5 of 6) AluSz6|SINE|Alu 90437 NM_138626 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 202.999-2 chr2 142736564 142736725 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -141020 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 165-93 chr7 117516395 117516544 + 1.33333 NA intron (NM_000492, intron 3 of 26) intron (NM_000492, intron 3 of 26) 36506 NM_000492 1080 Hs.489786 NM_000492 ENSG00000001626 CFTR ABC35|ABCC7|CF|CFTR/MRP|MRP7|TNR-CFTR|dJ760C5.1 CF transmembrane conductance regulator protein-coding 190-7 chr1 114733865 114734141 + 1.33333 NA exon (NM_001242892, exon 7 of 19) exon (NM_001242892, exon 7 of 19) -17232 NM_002524 4893 Hs.486502 NM_002524 ENSG00000213281 NRAS ALPS4|CMNS|N-ras|NCMS|NRAS1|NS6 NRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 274.667-44 chr5 65296147 65296545 + 1.33333 NA intron (NM_197941, intron 10 of 24) intron (NM_197941, intron 10 of 24) 185574 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 365-5 chr12 5639423 5639871 + 1.33333 NA intron (NM_001278596, intron 16 of 25) L2a|LINE|L2 145515 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 216.333-107 chr4 53703796 53704066 + 1.33333 NA intron (NR_125918, intron 1 of 2) intron (NR_125918, intron 1 of 2) 8030 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 194.333-56 chr18 9695882 9696033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12344 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 155.333-376 chr8 15564019 15564174 + 1.33333 NA intron (NM_001356429, intron 1 of 10) intron (NM_001356429, intron 1 of 10) 23833 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 301.333-31 chr20 63205128 63205391 + 1.33333 NA intron (NM_017798, intron 3 of 4) intron (NM_017798, intron 3 of 4) 10872 NM_017798 54915 Hs.744852 NM_017798 ENSG00000149658 YTHDF1 C20orf21 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1 protein-coding 317.333-10 chr12 115380789 115381115 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -696777 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 218-54 chr2 120425296 120425596 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40903 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 311.333-51 chr7 25445519 25445832 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -217189 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 179.333-59 chr13 106596974 106597175 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -20736 NR_051977 283483 Hs.651365 NR_051977 ENSG00000272274 LINC00551 - long intergenic non-protein coding RNA 551 ncRNA 213-77 chr6 150837185 150837488 + 1.33333 NA intron (NM_001329803, intron 13 of 13) intron (NM_001329803, intron 13 of 13) -28343 NM_015440 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 221.333-107 chr5 2792011 2792329 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 40039 NM_178569 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 247.333-27 chr14 65566570 65566855 + 1.33333 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) intron (NM_178156, intron 2 of 9) 95610 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 205.333-219 chr7 42061909 42062174 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 4 of 14) intron (NM_000168, intron 4 of 14) 175168 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 114-165 chr8 54321567 54321724 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -9041 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 280.666-17 chr2 229776010 229776289 + 1.33333 NA intron (NM_001348330, intron 37 of 41) MIR|SINE|MIR -61594 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 341-10 chr14 76041156 76041560 + 1.33333 NA intron (NR_045664, intron 3 of 7) intron (NR_045664, intron 3 of 7) 55595 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 344-8 chr12 57082385 57082897 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3850 NM_015257 23306 Hs.591040 NM_015257 ENSG00000166881 NEMP1 TMEM194|TMEM194A nuclear envelope integral membrane protein 1 protein-coding 193.333-115 chr20 57862189 57862477 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -141571 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 265.667-18 chr14 45674359 45674817 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 41014 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 496.666 chr10 92903836 92904564 + 1.33333 NA intron (NM_001319195, intron 5 of 21) L1MC2|LINE|L1 55680 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 178.333-122 chr4 56241106 56241257 + 1.33333 NA intron (NM_020722, intron 2 of 10) intron (NM_020722, intron 2 of 10) 70986 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 123-10 chr1 110339079 110339248 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_036595) promoter-TSS (NR_036595) 8 NR_036595 440600 Hs.649375 NR_036595 ENSG00000227963 RBM15-AS1 AS-RBM15 RBM15 antisense RNA 1 ncRNA 228-60 chr3 186414170 186414460 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26030 NR_151710 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 199.666-47 chr5 92668717 92668907 + 1.33333 NA Intergenic LTR41C|LTR|ERVL 902531 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 269.333-76 chr6 68477514 68477898 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -147807 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 156-85 chr3 3234738 3234912 + 1.33333 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -55108 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 136.333-178 chr6 21657610 21657760 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8728 NR_015410 401237 Hs.712707 NR_015410 CASC15 CANT|LINC00340|lnc-SOX4-1 cancer susceptibility 15 ncRNA 238.999-5 chr3 123691810 123692034 + 1.33333 NA intron (NR_046629, intron 2 of 2) MIR3|SINE|MIR 2278 NR_046629 100873940 Hs.667316 NR_046629 ENSG00000250174 MYLK-AS2 - MYLK antisense RNA 2 ncRNA 228-23 chr12 112284255 112284552 + 1.33333 NA intron (NM_001109662, intron 7 of 75) intron (NM_001109662, intron 7 of 75) 98028 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 230.999-2 chr3 47994157 47994336 + 1.33333 NA intron (NM_002375, intron 2 of 18) intron (NM_002375, intron 2 of 18) 94602 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 146.333-24 chr10 44258253 44258447 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34400 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 184-79 chr5 9735372 9735528 + 1.33333 NA intron (NR_027112, intron 5 of 12) intron (NR_027112, intron 5 of 12) -105099 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 168.333-128 chr3 78503070 78503263 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -454203 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 383.333-9 chr3 153592105 153592513 + 1.33333 NA intron (NR_146713, intron 4 of 6) intron (NR_146713, intron 4 of 6) 107814 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 196-170 chr7 68264995 68265241 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 244865 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 233.333-86 chr4 17492963 17493262 + 1.33333 NA intron (NM_001306140, intron 3 of 5) MER21C|LTR|ERVL 18978 NM_000320 5860 Hs.75438 NM_000320 ENSG00000151552 QDPR DHPR|HDHPR|PKU2|SDR33C1 quinoid dihydropteridine reductase protein-coding 305.666-9 chr14 30133345 30133670 + 1.33333 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -205660 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 235.333-9 chr10 21406254 21406573 + 1.33333 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -33463 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 248.666-24 chr21 29184934 29185227 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8414 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 190-73 chr20 60742926 60743107 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 178454 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 265.667-64 chr6 152945302 152945630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37575 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 428.666-2 chr10 76433320 76433761 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -454504 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 197.333-12 chr1 189745289 189745532 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 730600 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 194.333-143 chr7 47963297 47963463 + 1.33333 NA TTS (NM_001363683) TTS (NM_001363683) -14889 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 209.333-211 chr6 152325436 152325677 + 1.33333 NA intron (NM_182961, intron 80 of 145) intron (NM_182961, intron 80 of 145) -54974 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 224-57 chr3 26555274 26555499 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -67420 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 285.666-2 chr16 66950436 66950746 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10675 NM_001185177 23491 Hs.268700 NM_012122 ENSG00000172828 CES3 ES31 carboxylesterase 3 protein-coding 150-88 chr22 39907437 39907583 + 1.33333 NA intron (NM_004810, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 6426 NM_004810 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 214.666-44 chr3 21851190 21851411 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -100090 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 191-68 chr7 111080224 111080483 + 1.33333 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) -10653 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 228.666-8 chr10 88359983 88360173 + 1.33333 NA intron (NM_018363, intron 5 of 6) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 223240 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 229-56 chr5 177601741 177602059 + 1.33333 NA intron (NM_007255, intron 1 of 5) intron (NM_007255, intron 1 of 5) 1768 NM_007255 11285 Hs.455109 NM_007255 ENSG00000027847 B4GALT7 EDSP1|EDSSLA|EDSSPD1|XGALT1|XGPT|XGPT1 beta-1,4-galactosyltransferase 7 protein-coding 192-43 chr12 25893732 25893924 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -19749 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 145.333-224 chr4 121462047 121462244 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -81127 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 314.333-25 chr6 122137176 122137466 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -262230 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 284.666-26 chr9 77471668 77472182 + 1.33333 NA intron (NR_121184, intron 2 of 4) intron (NR_121184, intron 2 of 4) 24276 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 306.666-2 chr11 6174966 6175281 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4797 NM_001004052 255725 Hs.690457 NM_001004052 ENSG00000255307 OR52B2 OR11-70 olfactory receptor family 52 subfamily B member 2 protein-coding 178-86 chr4 89344474 89344651 + 1.33333 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -36762 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 201-43 chr16 18031741 18031983 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 300800 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 214-36 chr14 61067806 61068038 + 1.33333 NA intron (NR_033344, intron 15 of 16) L3|LINE|CR1 -86232 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 225-32 chr2 30037498 30037747 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -109385 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 186.666-47 chr7 48033010 48033192 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2410 NM_001267865 136288 Hs.258357 NM_001100159 ENSG00000164746 C7orf57 - chromosome 7 open reading frame 57 protein-coding 217-75 chr5 105787451 105787651 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 688077 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 186-14 chr10 53351196 53351356 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -579576 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 216.333-59 chr17 64205112 64205277 + 1.33333 NA intron (NM_018469, intron 2 of 11) AluSx|SINE|Alu 25540 NM_001288733 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 206.333-170 chr9 31925635 31925935 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -458818 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 222-44 chr2 56169744 56169930 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14153 NM_001080433 114800 Hs.117136 NM_001080433 ENSG00000055813 CCDC85A - coiled-coil domain containing 85A protein-coding 282.333-49 chr6 33551090 33551387 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 29038 NM_001188 578 Hs.485139 NM_001188 ENSG00000030110 BAK1 BAK|BAK-LIKE|BCL2L7|CDN1 BCL2 antagonist/killer 1 protein-coding 187.333-173 chr6 48224889 48225155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -156333 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 198.667-158 chr5 178572734 178573008 + 1.33333 NA intron (NM_173465, intron 1 of 28) L1ME1|LINE|L1 17522 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 219.333-87 chr2 4343293 4343540 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 312806 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 165-4 chr1 118444867 118445130 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -259770 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 204.333-97 chr2 72861142 72861396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26139 NM_003124 6697 Hs.301540 NM_003124 ENSG00000116096 SPR SDR38C1 sepiapterin reductase protein-coding 330.666-23 chr8 137833856 137834142 + 1.33333 NA intron (NR_161374, intron 3 of 7) L2c|LINE|L2 249546 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 162.333-54 chr12 44916754 44917007 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -2952 NM_001145110 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 191.666-27 chr8 139435275 139435434 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 267769 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 379.999-8 chr3 177632267 177632716 + 1.33333 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) intron (NR_047568, intron 3 of 3) -184374 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 211.999-5 chr15 25510885 25511051 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71912 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 202.666-40 chr14 70387931 70388084 + 1.33333 NA intron (NM_001202549, intron 2 of 4) intron (NM_001202549, intron 2 of 4) -28324 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 193-14 chr11 31096625 31096807 + 1.33333 NA intron (NM_001367979, intron 15 of 38) UCON1|Unknown|Unknown -104030 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 283.333-70 chr6 162352727 162352999 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) intron (NM_004562, intron 2 of 11) -374269 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 238.666-3 chr1 113903528 113903819 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001319947) promoter-TSS (NM_001319947) -946 NM_001319947 64858 Hs.591412 NM_022836 ENSG00000118655 DCLRE1B APOLLO|SNM1B|SNMIB DNA cross-link repair 1B protein-coding 207-88 chr4 74950233 74950407 + 1.33333 NA intron (NM_015393, intron 1 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 17204 NM_015393 25849 Hs.105460 NM_015393 ENSG00000169116 PARM1 Cipar1|DKFZP564O0823|PARM-1|WSC4 prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 protein-coding 151.667-279 chr5 74432207 74432405 + 1.33333 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) intron (NR_126354, intron 2 of 2) 104670 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 291-24 chr2 66398672 66399058 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15559 NR_130931 729348 Hs.723595 NR_130931 ENSG00000232164 LINC01873 - long intergenic non-protein coding RNA 1873 ncRNA 258.666-11 chr12 13489038 13489381 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -112464 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 342.666-14 chr2 104245649 104246071 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 162472 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 416.333-11 chr9 21674515 21675037 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -114978 NR_027054 554202 Hs.458096 NR_027054 MIR31HG LncHIFCAR|hsa-lnc-31 MIR31 host gene ncRNA 248-10 chr10 111600046 111600369 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 485916 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 198-57 chr15 57076997 57077263 + 1.33333 NA intron (NM_001322158, intron 5 of 20) L1M5|LINE|L1 -142300 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 344.666-15 chr17 71245163 71245599 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -43202 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 194.666-4 chr10 22171403 22171560 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 38502 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 131.333-189 chr9 28009501 28009688 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) L1MB8|LINE|L1 -435728 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 261.333-17 chr10 99081055 99081348 + 1.33333 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) MER45B|DNA|hAT-Tip100 154674 NM_001166246 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 190.333-124 chr5 135807077 135807254 + 1.33333 NA intron (NM_001349335, intron 3 of 10) intron (NM_001349335, intron 3 of 10) -4090 NR_049867 100847082 NR_049867 ENSG00000265924 MIR5692C1 - microRNA 5692c-1 ncRNA 339.333-11 chr14 49985110 49985532 + 1.33333 NA intron (NR_126498, intron 3 of 3) AluSz|SINE|Alu 7813 NR_126499 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 279.333-51 chr21 25424773 25425132 + 1.33333 NA intron (NR_024027, intron 2 of 4) intron (NR_024027, intron 2 of 4) 6749 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 212.666-68 chr5 45814987 45815263 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -118745 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 164.666-7 chr12 82143388 82143537 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 189743 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 211-21 chr11 84416477 84416736 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) MIRb|SINE|MIR -99267 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 196-23 chr10 83989064 83989229 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150363 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 243.333-25 chr13 27709763 27710069 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -82567 NM_145657 219409 Hs.351785 NM_145657 ENSG00000169840 GSX1 GSH1|Gsh-1 GS homeobox 1 protein-coding 221.333-50 chr18 4111984 4112232 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) L1M4|LINE|L1 149755 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 254.667-9 chr11 9037421 9037852 + 1.33333 NA intron (NM_001367977, intron 16 of 22) intron (NM_001367977, intron 16 of 22) -33635 NM_020645 56675 Hs.523467 NM_020645 ENSG00000175352 NRIP3 C11orf14|NY-SAR-105 nuclear receptor interacting protein 3 protein-coding 140-91 chr5 88504841 88505000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65830 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 196-46 chr14 46775179 46775345 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -123481 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 176-12 chr1 185561706 185561930 + 1.33333 NA intron (NR_110793, intron 3 of 3) intron (NR_110793, intron 3 of 3) 66670 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 281.333-14 chr12 45230463 45230740 + 1.33333 NA intron (NM_001025356, intron 1 of 19) intron (NM_001025356, intron 1 of 19) 14506 NM_001142679 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 180.667-92 chr3 30850157 30850408 + 1.33333 NA intron (NM_207359, intron 5 of 14) intron (NM_207359, intron 5 of 14) 44379 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 224.333-58 chr18 65481786 65481962 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -268378 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 201.333-65 chr12 2907167 2907381 + 1.33333 NA intron (NM_003324, intron 1 of 10) AluSc8|SINE|Alu 16383 NM_001160408 7289 Hs.655333 NM_003324 ENSG00000078246 TULP3 TUBL3 TUB like protein 3 protein-coding 306.666-22 chr3 143837051 143837350 + 1.33333 NA intron (NM_173653, intron 1 of 15) intron (NM_173653, intron 1 of 15) 11268 NM_173653 285195 Hs.302257 NM_173653 ENSG00000181804 SLC9A9 AUTS16|NHE9 solute carrier family 9 member A9 protein-coding 221-71 chr9 104366664 104366889 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 96547 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 197-55 chr2 31093479 31093660 + 1.33333 NA intron (NM_001329095, intron 1 of 15) intron (NM_001329095, intron 1 of 15) 36071 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 247.333-74 chr7 27322058 27322414 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -75007 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 215-19 chr14 60571920 60572146 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 62887 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 185-36 chr2 129354787 129354941 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -80973 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 222.667-41 chr2 75640263 75640537 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -6383 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 205.667-139 chr9 104755935 104756221 + 1.33333 NA intron (NM_015469, intron 4 of 5) intron (NM_015469, intron 4 of 5) -7663 NR_130759 55335 Hs.429294 NM_018376 ENSG00000165028 NIPSNAP3B FP944|NIPSNAP3|SNAP1 nipsnap homolog 3B protein-coding 398.999 chr5 37611905 37612340 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 222700 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 234.333-85 chr8 86333218 86333414 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -9231 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 187.333-160 chr5 93732941 93733101 + 1.33333 NA TTS (NM_153216) TTS (NM_153216) 8579 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 213.333-75 chr17 42342012 42342184 + 1.33333 NA intron (NM_001369512, intron 4 of 23) intron (NM_001369512, intron 4 of 23) 46344 NM_001369514 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 184-34 chr16 13232008 13232268 + 1.33333 NA intron (NM_001145204, intron 4 of 4) intron (NM_001145204, intron 4 of 4) 330540 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 341.333-4 chr10 59892201 59892633 + 1.33333 NA intron (NM_005436, intron 1 of 8) intron (NM_005436, intron 1 of 8) 14139 NM_005436 8030 Hs.591360 NM_005436 ENSG00000108091 CCDC6 D10S170|H4|PTC|TPC|TST1 coiled-coil domain containing 6 protein-coding 288-46 chr6 95842896 95843342 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -172855 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 215-52 chr22 29933337 29933695 + 1.33333 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) intron (NM_153051, intron 1 of 18) 50342 NM_021090 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 296.666-36 chr7 52497809 52498153 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -537652 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 206.667-8 chr1 180813742 180814015 + 1.33333 NA intron (NR_137330, intron 7 of 12) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -99019 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 207.333-267 chr8 83733846 83734100 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 330215 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 206-110 chr3 42843415 42843646 + 1.33333 NA intron (NM_001296, intron 2 of 2) MER112|DNA|hAT-Charlie 32349 NM_004391 1582 Hs.447793 NM_004391 ENSG00000180432 CYP8B1 CP8B|CYP12 cytochrome P450 family 8 subfamily B member 1 protein-coding 177-40 chr2 201431081 201431232 + 1.33333 NA intron (NM_015049, intron 1 of 15) intron (NM_015049, intron 1 of 15) 20302 NM_015049 66008 Hs.152774 NM_015049 ENSG00000115993 TRAK2 ALS2CR3|CALS-C|GRIF-1|GRIF1|MILT2|OIP98 trafficking kinesin protein 2 protein-coding 143.666 chr2 28077434 28077597 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) intron (NM_199193, intron 7 of 13) 81148 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 329.666-8 chr22 25074521 25074963 + 1.33333 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) 37950 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 287.667-37 chr8 80025870 80026270 + 1.33333 NA intron (NM_014018, intron 1 of 2) intron (NM_014018, intron 1 of 2) 4189 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 184-66 chr3 42574546 42574796 + 1.33333 NA intron (NM_001201572, intron 1 of 6) L1MD2|LINE|L1 -7169 NM_016305 51188 Hs.534454 NM_016305 ENSG00000008324 SS18L2 KIAA-iso SS18 like 2 protein-coding 219.333-163 chr7 9380803 9381120 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -253309 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 199.333-253 chr7 13710829 13711064 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 275568 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 259.333-87 chr6 130470080 130470437 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33141 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 207-108 chr7 25693213 25693471 + 1.33333 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -22611 NR_157816 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 295-29 chr22 20086512 20086987 + 1.33333 NA TTS (NR_037412) TTS (NR_037412) 691 NR_031706 100302197 NR_031706 ENSG00000284464 MIR1306 MIRN1306|hsa-mir-1306|mir-1306 microRNA 1306 ncRNA 133-22 chr12 39294140 39294357 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001173463, exon 34 of 34) 3' UTR (NM_001173463, exon 34 of 34) 148872 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 208.666-63 chr2 216870126 216870326 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_130782) promoter-TSS (NR_130782) -546 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 209-15 chr10 110290121 110290340 + 1.33333 NA TTS (NM_005871) TTS (NM_005871) 14690 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 187.666-25 chr7 96929999 96930144 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -75482 NM_005222 1750 Hs.249196 NM_005222 ENSG00000006377 DLX6 - distal-less homeobox 6 protein-coding 174.667-25 chr10 61741140 61741347 + 1.33333 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 78282 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 326-33 chr4 62826266 62826595 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -664665 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 202-154 chr5 149285278 149285436 + 1.33333 NA intron (NM_152406, intron 1 of 18) MIR|SINE|MIR 13498 NM_001323062 134265 Hs.62930 NM_152406 ENSG00000157510 AFAP1L1 - actin filament associated protein 1 like 1 protein-coding 231.999-11 chr9 70681435 70681625 + 1.33333 NA exon (NM_024971, exon 9 of 26) exon (NM_024971, exon 9 of 26) 128554 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 218-53 chr2 115886014 115886197 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 542290 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 197.333-40 chr11 95871986 95872138 + 1.33333 NA intron (NM_201281, intron 3 of 15) L1PA4|LINE|L1 52045 NM_201281 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 181.333-125 chr4 70834593 70834757 + 1.33333 NA intron (NM_001098477, intron 2 of 9) AluSc8|SINE|Alu 4828 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 338.666-10 chr4 51942426 51942750 + 1.33333 NA Intergenic LTR81C|LTR|Gypsy 77775 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 233-46 chr3 61788349 61788542 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 226874 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 206.999-3 chr6 73593508 73593681 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_012434, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_012434, exon 11 of 11) 60398 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 244.333-76 chr4 88937731 88937925 + 1.33333 NA intron (NM_014883, intron 5 of 23) intron (NM_014883, intron 5 of 23) -114467 NM_001265579 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 194-125 chr6 154728437 154728708 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -4806 NM_001286189 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 200.667-126 chr4 167069646 167069899 + 1.33333 NA intron (NM_016950, intron 2 of 11) intron (NM_016950, intron 2 of 11) 164654 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 281-40 chr7 101929069 101929514 + 1.33333 NA intron (NM_001202544, intron 2 of 21) intron (NM_001202544, intron 2 of 21) 111665 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 152-160 chr9 105295222 105295433 + 1.33333 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) MIR3|SINE|MIR 50676 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 204.666-27 chr13 45924291 45924448 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -72616 NM_198849 283514 Hs.368483 NM_198849 ENSG00000215475 SIAH3 - siah E3 ubiquitin protein ligase family member 3 protein-coding 363.666-7 chr5 55602541 55602946 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67665 NR_103485 8611 Hs.696231 NM_003711 ENSG00000067113 PLPP1 LLP1a|LPP1|PAP-2a|PAP2|PPAP2A phospholipid phosphatase 1 protein-coding 234.666-51 chr8 84516330 84516562 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 100962 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 230-63 chr6 137343373 137343638 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -124075 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 206.667-39 chr14 82223312 82223597 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -419178 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 270.666-17 chr2 159876862 159877262 + 1.33333 NA intron (NM_002349, intron 11 of 34) intron (NM_002349, intron 11 of 34) 27694 NM_001198760 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 220-47 chr17 50409993 50410288 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -12617 NM_018509 55379 Hs.370927 NM_018509 ENSG00000108829 LRRC59 PRO1855|p34 leucine rich repeat containing 59 protein-coding 186.667-119 chr5 126241677 126241893 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43390 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 201.333-97 chr14 59268794 59268980 + 1.33333 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) intron (NM_001270520, intron 2 of 24) 5446 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 207.333-204 chr4 101344401 101344624 + 1.33333 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) 3014 NM_000944 5530 Hs.435512 NM_000944 ENSG00000138814 PPP3CA ACCIID|CALN|CALNA|CALNA1|CCN1|CNA1|IECEE|IECEE1|PPP2B protein phosphatase 3 catalytic subunit alpha protein-coding 251.333-99 chr6 131809840 131810121 + 1.33333 NA intron (NM_006208, intron 1 of 24) intron (NM_006208, intron 1 of 24) 1960 NM_006208 5167 Hs.527295 NM_006208 ENSG00000197594 ENPP1 ARHR2|COLED|M6S1|NPP1|NPPS|PC-1|PCA1|PDNP1 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 protein-coding 152-133 chr5 169315349 169315532 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -14301 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 381.666-9 chr4 173771678 173772047 + 1.33333 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy -125411 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 214-129 chr7 128383012 128383312 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3520 NR_148338 107986845 Hs.592261 NR_148338 LOC107986845 - uncharacterized LOC107986845 ncRNA 353.667-12 chr22 40960451 40960884 + 1.33333 NA intron (NM_014248, intron 2 of 4) intron (NM_014248, intron 2 of 4) 9289 NM_014248 9978 Hs.474949 NM_014248 ENSG00000100387 RBX1 BA554C12.1|RNF75|ROC1 ring-box 1 protein-coding 203.333-15 chr1 197398364 197398609 + 1.33333 NA intron (NM_001193640, intron 3 of 9) intron (NM_001193640, intron 3 of 9) 130234 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 258.333-28 chr2 10849006 10849250 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -11416 NM_001282705 10130 Hs.212102 NM_005742 ENSG00000143870 PDIA6 ERP5|P5|TXNDC7 protein disulfide isomerase family A member 6 protein-coding 201.666-7 chr12 31945751 31946030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13525 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 200.666-22 chr11 14550459 14550655 + 1.33333 NA intron (NM_148976, intron 2 of 10) intron (NM_148976, intron 2 of 10) -30112 NM_002786 5682 Hs.102798 NM_002786 ENSG00000129084 PSMA1 HC2|HEL-S-275|NU|PROS30 proteasome subunit alpha 1 protein-coding 218-16 chr11 62236917 62237100 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -5231 NM_006551 10647 Hs.204096 NM_006551 ENSG00000124935 SCGB1D2 LIPB|LPHB|LPNB secretoglobin family 1D member 2 protein-coding 188.666-31 chr5 109042538 109042711 + 1.33333 NA intron (NR_146155, intron 14 of 19) intron (NR_146155, intron 14 of 19) 118018 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 212.666-94 chr8 114752609 114752843 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 915287 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 302.333-19 chr20 9637831 9638328 + 1.33333 NA intron (NM_020341, intron 4 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie -123081 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 236.666-39 chr6 44806248 44806438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254462 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 234.999-2 chr1 234431773 234432015 + 1.33333 NA intron (NM_005646, intron 14 of 29) AluSq|SINE|Alu 47285 NM_005646 6894 Hs.498115 NM_005646 ENSG00000059588 TARBP1 TRM3|TRMT3|TRP-185|TRP185 TAR (HIV-1) RNA binding protein 1 protein-coding 157.333-72 chr11 107620203 107620342 + 1.33333 NA intron (NM_018712, intron 2 of 11) intron (NM_018712, intron 2 of 11) 29125 NM_018712 55531 Hs.495779 NM_018712 ENSG00000110675 ELMOD1 - ELMO domain containing 1 protein-coding 306-24 chr2 143197773 143198094 + 1.33333 NA intron (NM_018460, intron 2 of 13) intron (NM_018460, intron 2 of 13) 68514 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 135.333-22 chr10 72488776 72488923 + 1.33333 NA intron (NM_001195519, intron 1 of 6) intron (NM_001195519, intron 1 of 6) 35137 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 174.666-3 chr1 205382702 205382894 + 1.33333 NA intron (NR_038425, intron 3 of 3) intron (NR_038425, intron 3 of 3) 9546 NR_038425 284576 Hs.585440 NR_038425 ENSG00000226235 LEMD1-AS1 - LEMD1 antisense RNA 1 ncRNA 211.666-44 chr6 153559949 153560205 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -428795 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 182-112 chr8 127017339 127017506 + 1.33333 NA intron (NR_045262, intron 1 of 1) intron (NR_045262, intron 1 of 1) 4268 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 185-13 chr12 2869082 2869315 + 1.33333 NA intron (NM_202003, intron 3 of 7) intron (NM_202003, intron 3 of 7) -7067 NR_046433 83695 Hs.198853 NM_001252499 ENSG00000171792 RHNO1 C12orf32|HKMT1188|RHINO RAD9-HUS1-RAD1 interacting nuclear orphan 1 protein-coding 201.333-238 chr6 41144806 41145098 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 9397 NM_001271808 340205 Hs.117331 NM_178174 ENSG00000161911 TREML1 GLTL1825|PRO3438|TLT-1|TLT1|dJ238O23.3 triggering receptor expressed on myeloid cells like 1 protein-coding 181.666-19 chr7 136469327 136469493 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -399242 NM_001006630 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 418.666 chr12 10047082 10047558 + 1.33333 NA intron (NM_207345, intron 2 of 8) intron (NM_207345, intron 2 of 8) 16638 NM_207345 283420 Hs.531189 NM_207345 ENSG00000197992 CLEC9A CD370|DNGR-1|DNGR1|UNQ9341 C-type lectin domain containing 9A protein-coding 207-79 chr3 104252655 104252940 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -728681 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 227.333-15 chr10 15808158 15808352 + 1.33333 NA intron (NM_024948, intron 10 of 14) intron (NM_024948, intron 10 of 14) 52252 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 157.333-180 chr2 57543792 57543970 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -363770 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 192.333-55 chr15 50931999 50932290 + 1.33333 NA intron (NM_001252127, intron 7 of 20) AluSx|SINE|Alu -11985 NR_027642 100132724 Hs.730493 NR_027642 DCAF13P3 - DDB1 and CUL4 associated factor 13 pseudogene 3 pseudo 174-81 chr5 137632768 137632954 + 1.33333 NA intron (NM_017415, intron 12 of 14) L1PB4|LINE|L1 14788 NR_030588 100126343 NR_030588 ENSG00000216009 MIR874 MIRN874|hsa-mir-874|mir-874 microRNA 874 ncRNA 262-72 chr7 19274130 19274532 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -128910 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 219-31 chr16 64848546 64848725 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 273428 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 326.666-9 chr20 50919075 50919461 + 1.33333 NA intron (NM_001347511, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu -9477 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 348.666-14 chr5 54120117 54120533 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 3 of 4) intron (NM_019087, intron 3 of 4) -168726 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 208-134 chr5 28281542 28281744 + 1.33333 NA Intergenic LTR80B|LTR|ERVL 6022 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 334.666-13 chr6 100958621 100958904 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -77390 NM_022091 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 182.333-84 chr2 98093931 98094110 + 1.33333 NA intron (NR_144297, intron 2 of 18) L1MA8|LINE|L1 6853 NR_144296 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 183-49 chr17 47320651 47320806 + 1.33333 NA intron (NR_110880, intron 1 of 2) AluSx3|SINE|Alu 2885 NR_110881 102724508 Hs.661005 NR_110880 ENSG00000263293 THCAT158 - thyroid cancer-associated transcript 158 ncRNA 131.666-2 chr3 119618883 119619087 + 1.33333 NA intron (NM_015900, intron 7 of 10) intron (NM_015900, intron 7 of 10) 18714 NM_001293225 51365 Hs.437451 NM_015900 ENSG00000144837 PLA1A PS-PLA1|PSPLA1 phospholipase A1 member A protein-coding 288.666-25 chr3 37177457 37177742 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1239 NM_001348299 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 190-11 chr1 221173980 221174233 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 162190 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 233.333-95 chr4 84336814 84337018 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -37747 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 193.666-31 chr3 61142710 61142927 + 1.33333 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 108634 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 149-93 chr3 117988671 117988824 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -297822 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 197.666-61 chr7 55327966 55328158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37386 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 258.999-2 chr10 101892952 101893281 + 1.33333 NA intron (NM_024541, intron 23 of 25) intron (NM_024541, intron 23 of 25) -49196 NM_173197 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 239.999-2 chr12 44673798 44673998 + 1.33333 NA intron (NM_006159, intron 13 of 20) MER103C|DNA|hAT-Charlie 201763 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 257.999-3 chr2 61392324 61392635 + 1.33333 NA intron (NM_014709, intron 5 of 79) AluSx|SINE|Alu 24898 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 178.666-15 chr3 187123548 187123693 + 1.33333 NA intron (NM_052969, intron 2 of 2) intron (NM_052969, intron 2 of 2) 15876 NM_052969 116832 Hs.647900 NM_052969 ENSG00000163923 RPL39L L39-2|RPL39L1 ribosomal protein L39 like protein-coding 205.666-25 chr2 209586147 209586315 + 1.33333 NA intron (NM_001039538, intron 3 of 14) intron (NM_001039538, intron 3 of 14) 6552 NM_031845 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 182-115 chr9 30488425 30488570 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -80043 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 236-42 chr2 78998213 78998595 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27298 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 207.666-15 chr12 122486774 122486980 + 1.33333 NA intron (NM_001350936, intron 4 of 12) MIRc|SINE|MIR 14055 NM_017612 55596 Hs.37706 NM_017612 ENSG00000033030 ZCCHC8 - zinc finger CCHC-type containing 8 protein-coding 271.666 chr10 113251280 113251500 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 122119 NM_001349870 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 238.666-24 chr2 61527023 61527222 + 1.33333 NA intron (NM_003400, intron 2 of 24) intron (NM_003400, intron 2 of 24) 11234 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 211.667-79 chr3 72795276 72795585 + 1.33333 NA intron (NM_018130, intron 9 of 10) intron (NM_018130, intron 9 of 10) 53015 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 289.333-16 chr14 51940767 51941007 + 1.33333 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) -22316 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 206.666-110 chr7 41488260 41488480 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205549 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 212-16 chr1 217204903 217205211 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -67355 NM_001243510 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 167.333-83 chr14 67138604 67138822 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 16 of 21) intron (NM_001024218, intron 16 of 21) -50727 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 208-148 chr6 108523711 108523888 + 1.33333 NA non-coding (NR_136553, exon 9 of 9) non-coding (NR_136553, exon 9 of 9) -36026 NM_201559 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 310-19 chr15 23954504 23955108 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -20341 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 204.333-154 chr5 39566086 39566294 + 1.33333 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 45759 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 203.333-247 chr7 82481749 82481927 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37882 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 179.333-2 chr1 30954975 30955136 + 1.33333 NA intron (NM_001020658, intron 14 of 21) AluJo|SINE|Alu -5850 NR_033295 692235 NR_033295 SNORD103B U103B small nucleolar RNA, C/D box 103B snoRNA 294.666-25 chr4 67126737 67127028 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 295118 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 365.333-10 chr15 84992437 84992854 + 1.33333 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) intron (NM_173454, intron 1 of 20) 10671 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 278.667-32 chr22 21455418 21455874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11524 NM_001207052 645426 Hs.376511 NM_001207052 ENSG00000206140 TMEM191C - transmembrane protein 191C protein-coding 200.666-5 chr1 100471538 100471705 + 1.33333 NA intron (NM_001319212, intron 9 of 13) L1M5|LINE|L1 -66518 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 237.333-6 chr1 151423498 151423720 + 1.33333 NA intron (NM_001194938, intron 8 of 17) intron (NM_001194938, intron 8 of 17) 18596 NM_207171 23126 Hs.489873 NM_015100 ENSG00000143442 POGZ MRD37|WHSUS|ZNF280E|ZNF635|ZNF635m pogo transposable element derived with ZNF domain protein-coding 231.666-4 chr10 65303334 65303663 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -267927 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 231.666-6 chr11 4017600 4017875 + 1.33333 NA intron (NM_001277962, intron 2 of 12) intron (NM_001277962, intron 2 of 12) -76948 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 163.333-215 chr5 23185675 23185922 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -321811 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 160.333-7 chr1 52457940 52458218 + 1.33333 NA intron (NM_001009881, intron 20 of 29) intron (NM_001009881, intron 20 of 29) 53477 NM_032864 84950 Hs.5301 NM_032284 ENSG00000134748 PRPF38A PRP38A|Prp38 pre-mRNA processing factor 38A protein-coding 230.667-36 chr2 34409457 34409749 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -267954 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 189.666-21 chr2 145631814 145632021 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -955140 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 113.666 chr21 33761921 33762084 + 1.33333 NA intron (NM_001001132, intron 9 of 29) intron (NM_001001132, intron 9 of 29) 119501 NM_001331011 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 245.333-118 chr8 106960847 106961074 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -190716 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 219.333-193 chr9 131190208 131190586 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001318325, exon 1 of 11) 5' UTR (NM_001318325, exon 1 of 11) 258 NM_001318325 8021 Hs.654530 NM_005085 ENSG00000126883 NUP214 CAIN|CAN nucleoporin 214 protein-coding 213.333-103 chr2 155047915 155048114 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 349319 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 475.333-2 chr14 89647902 89648437 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -29004 NM_001085471 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 270-57 chr7 7494034 7494402 + 1.33333 NA intron (NM_001037763, intron 11 of 34) MIR|SINE|MIR 41655 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 232.666-33 chr3 28704131 28704409 + 1.33333 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 128992 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 196.666-17 chr12 71201764 71201979 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43872 NM_004616 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 183.667-94 chr3 162877969 162878256 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 425189 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 358.333-18 chr20 47488597 47489093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13042 NM_001174088 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 261.999-2 chr11 59955250 59955508 + 1.33333 NA intron (NR_130719, intron 3 of 8) intron (NR_130719, intron 3 of 8) 12500 NR_130719 255649 Hs.722773 NR_130719 OOSP1 - oocyte secreted protein 1 pseudo 183.333-28 chr12 40893992 40894201 + 1.33333 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 -14261 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 162.666-3 chr12 40951995 40952269 + 1.33333 NA intron (NM_001256064, intron 14 of 15) intron (NM_001256064, intron 14 of 15) 43775 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 187-28 chr17 77673792 77673979 + 1.33333 NA Intergenic (CTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 54674 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 372-18 chr5 110230972 110231471 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 282694 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 330-4 chr1 107909354 107909840 + 1.33333 NA intron (NM_006113, intron 1 of 26) intron (NM_006113, intron 1 of 26) 12374 NR_107006 102465839 NR_107006 ENSG00000275455 MIR7852 hsa-mir-7852 microRNA 7852 ncRNA 315.333-56 chr9 85231061 85231312 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 510843 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 252-32 chr14 77209232 77209659 + 1.33333 NA intron (NM_020431, intron 1 of 23) intron (NM_020431, intron 1 of 23) 27647 NM_020431 57156 Hs.22452 NM_020431 ENSG00000165548 TMEM63C C14orf171|CSC1|hsCSC1 transmembrane protein 63C protein-coding 180-6 chr1 150401161 150401313 + 1.33333 NA intron (NM_015203, intron 1 of 10) AluSx|SINE|Alu 37126 NM_001297674 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 162.667-222 chr5 85947768 85947958 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -334581 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 200.667-39 chr14 33361102 33361344 + 1.33333 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) -347714 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 299-10 chr10 105721418 105721676 + 1.33333 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 98786 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 198.667-38 chr11 100041031 100041283 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 8 of 23) L2c|LINE|L2 485012 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 207.333-249 chr7 16314293 16314510 + 1.33333 NA intron (NM_001101417, intron 2 of 8) L1MC1|LINE|L1 103915 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 198.333-179 chr6 140577666 140577816 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -106073 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 196.333-44 chr14 81268652 81268882 + 1.33333 NA intron (NM_001366850, intron 7 of 7) L2c|LINE|L2 -47377 NM_201595 2957 Hs.592334 NM_015859 ENSG00000165417 GTF2A1 TF2A1|TFIIA|TFIIA-42|TFIIAL general transcription factor IIA subunit 1 protein-coding 316-56 chr9 100557985 100558476 + 1.33333 NA intron (NM_001198812, intron 7 of 9) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -19849 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 206.667-84 chr3 28466815 28467083 + 1.33333 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) L1M5|LINE|L1 -108329 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 154.667-211 chr2 221102568 221102734 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 469653 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 192.333-17 chr10 68880202 68880351 + 1.33333 NA intron (NM_152709, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu -21039 NM_024045 79009 Hs.522984 NM_024045 ENSG00000107625 DDX50 GU2|GUB|RH-II/GuB|mcdrh DExD-box helicase 50 protein-coding 151.666-7 chr5 163806256 163806464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 300741 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 208-39 chr12 119336437 119336596 + 1.33333 NA intron (NM_178499, intron 1 of 13) intron (NM_178499, intron 1 of 13) 1787 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 231.667-34 chr2 182354521 182354812 + 1.33333 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 72382 NM_001258313 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 209-97 chr5 165601543 165601781 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 1131383 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 244.666-24 chr2 80381160 80381414 + 1.33333 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) intron (NM_001282599, intron 1 of 11) 67908 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 216.333-91 chr21 30716913 30717100 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1771 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 204.667-136 chr6 133789181 133789454 + 1.33333 NA intron (NR_109982, intron 2 of 8) intron (NR_109982, intron 2 of 8) -31830 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 208.667-141 chr8 65965192 65965438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49663 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 183.333-24 chr11 74605137 74605394 + 1.33333 NA intron (NM_001363597, intron 3 of 11) intron (NM_001363597, intron 3 of 11) 12683 NR_046410 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 240-49 chr2 129661667 129661929 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 215693 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 233.667-16 chr12 66141753 66142031 + 1.33333 NA intron (NM_016056, intron 5 of 6) L1MEc|LINE|L1 11141 NR_125724 103625681 Hs.504820 NR_125724 ENSG00000239335 LLPH-DT LLPH-AS1 LLPH divergent transcript ncRNA 200.666-114 chr7 79853389 79853638 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -281318 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 317.333-28 chr4 41735185 41735620 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13568 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 204.666-106 chr8 119265830 119266066 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19091 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 210.666-84 chr5 28140130 28140297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 147452 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 211-31 chr14 29764401 29764693 + 1.33333 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 162549 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 355-15 chr2 65636579 65637071 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -204226 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 187.333-37 chr11 126923791 126923989 + 1.33333 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 -16856 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 260-59 chr5 11711971 11712221 + 1.33333 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) MIRc|SINE|MIR -123030 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 190.333-128 chr6 48070262 48070456 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1670 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 159.666-4 chr2 202577605 202577869 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -57232 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 132.667-112 chr3 144391670 144391858 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 418683 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 210.667-33 chr12 54460592 54460853 + 1.33333 NA intron (NM_144594, intron 6 of 8) intron (NM_144594, intron 6 of 8) 12880 NM_144594 121355 Hs.524476 NM_144594 ENSG00000170627 GTSF1 Cue110|FAM112B gametocyte specific factor 1 protein-coding 164-98 chr6 51541717 51541904 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -80060 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 341.666 chr1 57752868 57753195 + 1.33333 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -107550 NR_104362 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 329.666-9 chr5 13179039 13179554 + 1.33333 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -146410 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 265.333-85 chr8 99881262 99881712 + 1.33333 NA intron (NM_004374, intron 3 of 3) L1MB2|LINE|L1 12220 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 211.667-16 chr10 46029652 46029963 + 1.33333 NA intron (NM_001145261, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 907 NM_001145260 8031 Hs.643658 NM_005437 ENSG00000266412 NCOA4 ARA70|ELE1|PTC3|RFG nuclear receptor coactivator 4 protein-coding 209.666-43 chr4 137258654 137258854 + 1.33333 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -45955 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 186.666-46 chr7 47984371 47984596 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4868 NM_004507 3364 Hs.152983 NM_004507 ENSG00000136273 HUS1 hHUS1 HUS1 checkpoint clamp component protein-coding 308-30 chr20 1725659 1725988 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53923 NR_037142 100289473 Hs.641525 NR_037142 ENSG00000232528 LOC100289473 - cytoskeleton associated protein 2-like pseudogene pseudo 182-116 chr9 36932481 36932663 + 1.33333 NA intron (NR_104000, intron 6 of 9) L1MB8|LINE|L1 -39041 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 309-13 chr11 47665862 47666378 + 1.33333 NA intron (NM_024783, intron 17 of 18).2 AluSx1|SINE|Alu -23466 NM_001317232 23788 Hs.269944 NM_014342 ENSG00000109919 MTCH2 HSPC032|MIMP|SLC25A50 mitochondrial carrier 2 protein-coding 224-36 chr18 11096586 11096851 + 1.33333 NA intron (NM_022068, intron 1 of 51) intron (NM_022068, intron 1 of 51) 52044 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 188-30 chr12 9744395 9744666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11231 NM_001267701 160365 Hs.560087 NM_172004 ENSG00000184293 CLECL1 DCAL-1|DCAL1 C-type lectin like 1 protein-coding 205.333-100 chr17 74269271 74269554 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4822 NR_148379 64446 Hs.147472 NM_023036 ENSG00000171595 DNAI2 CILD9|DIC2 dynein axonemal intermediate chain 2 protein-coding 167.666-10 chr5 87678850 87678997 + 1.33333 NA non-coding (NR_149089, exon 2 of 2) non-coding (NR_149089, exon 2 of 2) 16881 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 272-7 chr11 64714443 64714700 + 1.33333 NA intron (NM_015080, intron 1 of 22) intron (NM_015080, intron 1 of 22) 8617 NM_015080 9379 Hs.372938 NM_015080 ENSG00000110076 NRXN2 - neurexin 2 protein-coding 219.666-29 chr20 22415144 22415317 + 1.33333 NA intron (NR_027089, intron 1 of 3) MER110|LTR|ERV1 5413 NR_027089 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 199.333-234 chr5 132960079 132960267 + 1.33333 NA intron (NM_014423, intron 1 of 20) intron (NM_014423, intron 1 of 20) 3461 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 129.333-121 chr3 34579707 34579863 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 781155 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 249.666-34 chr5 62734046 62734364 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 155386 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 193.666-36 chr4 103968835 103969056 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -248960 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 420.666-3 chr2 39895032 39895690 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -22273 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 182-113 chr8 136374656 136374869 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -156036 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 268.333-27 chr17 59079310 59079648 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 7 of 23) L3b|LINE|CR1 27401 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 292.666-30 chr6 53604964 53605252 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23272 NR_125841 101927171 Hs.334005 NR_125841 ENSG00000235899 LINC01564 TCONS_00011314|XLOC_005327 long intergenic non-protein coding RNA 1564 ncRNA 216-110 chr6 141813544 141813724 + 1.33333 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 275165 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 335.333-5 chr10 60007620 60008158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46976 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 217-83 chr6 150820352 150820599 + 1.33333 NA intron (NM_001329802, intron 12 of 14) L2c|LINE|L2 -45204 NM_015440 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 281-10 chr14 71348828 71349143 + 1.33333 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) MER39|LTR|ERV1 28509 NM_001354289 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 209.666-18 chr14 31700081 31700357 + 1.33333 NA intron (NR_120408, intron 6 of 9) intron (NR_120408, intron 6 of 9) -14350 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 447.666-4 chr6 49478176 49478580 + 1.33333 NA intron (NM_018132, intron 5 of 8) MER103C|DNA|hAT-Charlie 15008 NM_018132 55166 Hs.88663 NM_018132 ENSG00000031691 CENPQ C6orf139|CENP-Q centromere protein Q protein-coding 196-134 chr4 74306548 74306831 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1781 NM_001270993 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 224.666-20 chr20 11326180 11326378 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -52896 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 216-47 chr18 3975477 3975650 + 1.33333 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 13210 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 234-35 chr2 68510396 68510806 + 1.33333 NA intron (NM_173545, intron 3 of 9) L1MB7|LINE|L1 43016 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 142-6 chr1 109050452 109050611 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8303 NM_001142551 22911 Hs.570055 NM_014969 ENSG00000085433 WDR47 - WD repeat domain 47 protein-coding 303.333-28 chr15 80805090 80805710 + 1.33333 NA intron (NM_018689, intron 1 of 28) intron (NM_018689, intron 1 of 28) 26030 NM_018689 57214 Hs.459088 NM_018689 ENSG00000103888 CEMIP CCSP1|HYBID|KIAA1199|TMEM2L cell migration inducing hyaluronidase 1 protein-coding 302.666-17 chr3 122225052 122225360 + 1.33333 NA intron (NM_001178065, intron 1 of 6) L1PA16|LINE|L1 40879 NM_001178065 846 Hs.435615 NM_000388 ENSG00000036828 CASR CAR|EIG8|FHH|FIH|GPRC2A|HHC|HHC1|HYPOC1|NSHPT|PCAR1|hCasR calcium sensing receptor protein-coding 241.333-22 chr10 89981578 89981804 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24318 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 142-149 chr7 99145197 99145351 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1166 NM_181349 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 216.667-24 chr11 90205356 90205658 + 1.33333 NA exon (NM_001144073, exon 7 of 10) exon (NM_001144073, exon 7 of 10) 17542 NM_012124 26973 Hs.22857 NM_012124 ENSG00000110172 CHORDC1 CHP1 cysteine and histidine rich domain containing 1 protein-coding 186.333-104 chr3 112082688 112082857 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3563 NM_024616 79669 Hs.434247 NM_024616 ENSG00000114529 C3orf52 TTMP chromosome 3 open reading frame 52 protein-coding 265.666-22 chr6 138390419 138390798 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -12923 NM_001326380 23593 Hs.486589 NM_014320 ENSG00000051620 HEBP2 C6ORF34B|C6orf34|PP23|SOUL heme binding protein 2 protein-coding 200.333-112 chr5 9365059 9365298 + 1.33333 NA intron (NM_003966, intron 3 of 22) intron (NM_003966, intron 3 of 22) -146155 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 205.666-11 chr10 115416174 115416418 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 20 of 28) intron (NM_207303, intron 20 of 28) 322931 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 215.333-57 chr14 64582844 64583056 + 1.33333 NA intron (NM_172365, intron 8 of 11) AluJb|SINE|Alu 32989 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 185.333-143 chr4 136370555 136370790 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -456992 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 202.333-26 chr10 68801011 68801279 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26386 NM_152709 219736 Hs.37636 NM_152709 ENSG00000165730 STOX1 C10orf24 storkhead box 1 protein-coding 275.666-8 chr19 52415914 52416229 + 1.33333 NA exon (NM_032423, exon 7 of 7) exon (NM_032423, exon 7 of 7) -13077 NM_001291369 147658 Hs.447583 NM_182512 ENSG00000198633 ZNF534 KRBO3 zinc finger protein 534 protein-coding 226.667-69 chr4 123896554 123896831 + 1.33333 NA intron (NR_027105, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 122428 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 267.333-72 chr5 25557406 25557635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 366567 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 229-11 chr10 102300198 102300432 + 1.33333 NA intron (NM_001199378, intron 3 of 39) intron (NM_001199378, intron 3 of 39) 54783 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 284-55 chr6 169436007 169436317 + 1.33333 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -182048 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 188.666-19 chr18 66848680 66848833 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -232828 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 228.333-57 chr22 37093179 37093355 + 1.33333 NA intron (NM_153609, intron 6 of 17) intron (NM_153609, intron 6 of 17) 10386 NM_153609 164656 Hs.370885 NM_153609 ENSG00000187045 TMPRSS6 IRIDA transmembrane serine protease 6 protein-coding 148-77 chr2 53219819 53219970 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -517279 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 205.333-149 chr3 30081296 30081581 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -147282 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 445.332 chr11 25745921 25746304 + 1.33333 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -443011 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 288-2 chr1 42323036 42323274 + 1.33333 NA intron (NM_001198851, intron 2 of 14) intron (NM_001198851, intron 2 of 14) 11800 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 184.666-33 chr6 42469685 42469841 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -17539 NM_033502 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 206.666-11 chr1 210340455 210340641 + 1.33333 NA intron (NM_001170580, intron 1 of 11) intron (NM_001170580, intron 1 of 11) 11182 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 206-42 chr12 37905264 37905437 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -411424 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 250.666-41 chr8 124813862 124814228 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -7940 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 291.333-15 chr12 15025124 15025466 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 23462 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 191-53 chr5 88831400 88831621 + 1.33333 NA intron (NM_001131005, intron 2 of 10) intron (NM_001131005, intron 2 of 10) -4322 NM_001364341 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 204.666-64 chr5 12864201 12864371 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 168600 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 157.333-374 chrX 95557428 95557578 + 1.33333 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -494277 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 266-48 chr20 24795395 24795648 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -153748 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 249.333-103 chr9 11040176 11040494 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 427129 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 214.666 chr1 51679764 51679995 + 1.33333 NA intron (NM_148906, intron 2 of 22) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -49971 NM_148905 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 529.666-4 chr8 85413267 85413686 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25383 NM_005181 761 Hs.82129 NM_005181 ENSG00000164879 CA3 CAIII|Car3 carbonic anhydrase 3 protein-coding 202.666-18 chr11 6798803 6799005 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2996 NM_003696 8590 Hs.652252 NM_003696 ENSG00000184933 OR6A2 I7|OR11-55|OR6A1|OR6A2P olfactory receptor family 6 subfamily A member 2 protein-coding 261.333-69 chr3 173876582 173876902 + 1.33333 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) L1MC4a|LINE|L1 44054 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 204.666-91 chr7 113220416 113220648 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101950 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 293.667-59 chr8 131908945 131909356 + 1.33333 NA intron (NM_001323555, intron 1 of 22) L1MA4A|LINE|L1 5057 NR_136615 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 276.666-2 chr1 201426259 201426474 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4636 NM_003281 7135 Hs.320890 NM_003281 ENSG00000159173 TNNI1 SSTNI|TNN1 troponin I1, slow skeletal type protein-coding 305.333-62 chr6 34813204 34813507 + 1.33333 NA intron (NM_017754, intron 1 of 20) MIR3|SINE|MIR 21272 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 289.333-60 chr8 17044073 17044484 + 1.33333 NA intron (NR_146233, intron 1 of 15) intron (NR_146233, intron 1 of 15) 17040 NM_001349810 286097 Hs.403594 NM_181723 ENSG00000155970 MICU3 EFHA2 mitochondrial calcium uptake family member 3 protein-coding 185.333-118 chr3 28411911 28412145 + 1.33333 NA intron (NM_001040432, intron 2 of 9) L1ME4c|LINE|L1 62879 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 198.667-45 chr12 18744214 18744498 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 6237 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 305.333-37 chr2 190706336 190706689 + 1.33333 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 47354 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 202-183 chr8 60798854 60799143 + 1.33333 NA intron (NM_017780, intron 4 of 37) intron (NM_017780, intron 4 of 37) 57739 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 158.666-21 chr5 36604967 36605096 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1324 NM_001166696 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 181.666-4 chr11 34326018 34326198 + 1.33333 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) intron (NM_145804, intron 1 of 16) 31902 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 232.666-37 chr3 178283618 178283882 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -135451 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 435.333-7 chr8 88549960 88550411 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -222702 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 248.333-80 chr5 40921461 40921741 + 1.33333 NA intron (NM_000587, intron 1 of 17) L1M1|LINE|L1 12104 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 227.333-28 chr11 127617843 127618126 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 346914 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 212.666-59 chr4 36489389 36489610 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63071 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 166.667-129 chr20 3155411 3155599 + 1.33333 NA intron (NM_021826, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 4360 NM_021826 60493 Hs.741168 NM_021826 ENSG00000215251 FASTKD5 dJ1187M17.5 FAST kinase domains 5 protein-coding 206.333-163 chr8 98659488 98659698 + 1.33333 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) intron (NM_001256313, intron 4 of 8) 166078 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 199-79 chr5 15808359 15808519 + 1.33333 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -126743 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 196-26 chr10 104736000 104736180 + 1.33333 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -69874 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-24 chr1 218613613 218613818 + 1.33333 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) intron (NR_031644, intron 3 of 6) 103620 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 202-147 chr5 55022573 55022733 + 1.33333 NA non-coding (NR_104662, exon 2 of 3) non-coding (NR_104662, exon 2 of 3) 1516 NR_104662 102467081 NR_104662 LOC102467081 - uncharacterized LOC102467081 ncRNA 165.666-7 chr8 108520564 108520778 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 77047 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 227.667-22 chr15 66911850 66912216 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44482 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 195.333-148 chr3 94176663 94176837 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113689 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 210-94 chr3 98984132 98984415 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -82578 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 348.667-18 chr4 40958272 40958696 + 1.33333 NA intron (NM_004307, intron 6 of 17) intron (NM_004307, intron 6 of 17) -101292 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 266-13 chr11 5138888 5139202 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6403 NM_001005160 390054 Hs.546593 NM_001005160 ENSG00000171944 OR52A5 OR11-33 olfactory receptor family 52 subfamily A member 5 protein-coding 245-39 chr2 145878106 145878393 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -708808 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 140.666-10 chr7 67882588 67882783 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -137568 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 195.333-150 chr3 148740413 148740636 + 1.33333 NA intron (NM_032049, intron 2 of 2) intron (NM_032049, intron 2 of 2) 10344 NM_032049 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 331-5 chr1 212263928 212264312 + 1.33333 NA intron (NR_125984, intron 1 of 3) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 20901 NR_125984 101929541 Hs.632493 NR_125982 ENSG00000226251 LINC02608 - long intergenic non-protein coding RNA 2608 ncRNA 157-95 chr4 72616878 72617106 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -47771 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 318.999-3 chr3 166761042 166761383 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137471 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 208.666-12 chr1 198822818 198823125 + 1.33333 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) 36011 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 301.333-33 chr22 40055759 40056153 + 1.33333 NA intron (NM_001024843, intron 1 of 23) intron (NM_001024843, intron 1 of 23) 11139 NM_001024843 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 226.333-101 chr7 83819570 83819776 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -170534 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 140-92 chr5 152236140 152236297 + 1.33333 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 169061 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 198.666-38 chr2 19491999 19492235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133494 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 176-20 chr11 77247335 77247502 + 1.33333 NA intron (NM_182833, intron 11 of 16) intron (NM_182833, intron 11 of 16) 54248 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 180.333-14 chr10 83389566 83389831 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 287391 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 142.666-13 chr20 17252866 17253068 + 1.33333 NA intron (NM_001201529, intron 1 of 10) L1ME3G|LINE|L1 25927 NM_001201529 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 242.666-24 chr2 223356422 223356653 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 245824 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 267.333-61 chr3 116241831 116242153 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -118032 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 207.333-153 chr2 220347834 220348121 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -441412 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 251-8 chr10 58984545 58984834 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -14829 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 200.666-21 chr11 10320069 10320267 + 1.33333 NA intron (NR_103765, intron 1 of 3) intron (NR_103765, intron 1 of 3) 11855 NR_103765 100130460 Hs.501890 NR_103765 CAND1.11 - uncharacterized LOC100130460 ncRNA 338.666-12 chr4 121351020 121351411 + 1.33333 NA intron (NM_198179, intron 1 of 5) HAL1ME|LINE|L1 29803 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 200.667-118 chr4 42427945 42428196 + 1.33333 NA intron (NM_001105529, intron 32 of 35) intron (NM_001105529, intron 32 of 35) 30582 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 290-25 chr2 204907983 204908286 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 362659 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 413.333-2 chr10 102996590 102997180 + 1.33333 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) intron (NM_199076, intron 1 of 6) -78550 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 423-2 chr15 64299702 64300219 + 1.33333 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 56213 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 135-59 chr22 30390951 30391111 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -3620 NM_001017981 200312 Hs.592194 NM_001017981 ENSG00000099999 RNF215 - ring finger protein 215 protein-coding 119.667-16 chr1 231949133 231949336 + 1.33333 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) intron (NM_001164541, intron 9 of 9) 23400 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 308.667-21 chr2 240717916 240718333 + 1.33333 NA exon (NM_001244008, exon 48 of 49) exon (NM_001244008, exon 48 of 49) 26258 NM_198998 375318 Hs.534650 NM_198998 ENSG00000184945 AQP12A AQP-12|AQP12|AQPX2 aquaporin 12A protein-coding 281.333-17 chr13 97287466 97287883 + 1.33333 NA intron (NM_144778, intron 2 of 8) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 65341 NM_144778 10150 Hs.657347 NM_144778 ENSG00000139793 MBNL2 MBLL|MBLL39|PRO2032 muscleblind like splicing regulator 2 protein-coding 219-69 chr5 55209227 55209418 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 17993 NM_001190787 345643 Hs.394578 NM_001190787 ENSG00000234602 MCIDAS IDAS|MCI|MCIN multiciliate differentiation and DNA synthesis associated cell cycle protein protein-coding 214.666-77 chr9 91910632 91910865 + 1.33333 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) AluSx|SINE|Alu 39480 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 378.667-3 chr1 212339438 212339943 + 1.33333 NA intron (NM_006243, intron 3 of 12) intron (NM_006243, intron 3 of 12) -13128 NR_004389 692157 Hs.707958 NR_004389 ENSG00000201544 SNORA16B U98b small nucleolar RNA, H/ACA box 16B snoRNA 190.333-88 chr22 26979303 26979488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 76103 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 313.666-6 chr2 56111274 56111555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21032 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 306.666-35 chr7 91415659 91416000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 151396 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 199.333-33 chr10 103125486 103125644 + 1.33333 NA intron (NM_001351176, intron 2 of 17) intron (NM_001351176, intron 2 of 17) 28256 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 375-3 chr10 119912782 119913143 + 1.33333 NA intron (NM_007190, intron 6 of 18) L1MA4|LINE|L1 20232 NR_037771 11196 Hs.435004 NM_007190 ENSG00000107651 SEC23IP MSTP053|P125|P125A SEC23 interacting protein protein-coding 193.333-85 chr2 38401944 38402220 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23498 NM_001330462 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 176.333-21 chr10 70178200 70178400 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7786 NM_001142648 56681 Hs.499960 NM_020150 ENSG00000079332 SAR1A SAR1|SARA1|Sara|masra2 secretion associated Ras related GTPase 1A protein-coding 140-71 chr22 48930804 48930971 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 64117 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 218.333-19 chr10 123628720 123628980 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -37505 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 262.333-14 chr10 63260221 63260751 + 1.33333 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 8737 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 265-2 chr1 71492094 71492364 + 1.33333 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) intron (NM_173808, intron 6 of 6) 344783 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 200.667-17 chr1 231298223 231298466 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39508 NM_175876 149371 Hs.356198 NM_175876 ENSG00000116903 EXOC8 EXO84|Exo84p|SEC84 exocyst complex component 8 protein-coding 232.666-27 chr2 175177397 175177613 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001689, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001689, exon 5 of 5) 4205 NM_001689 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 182-59 chr2 234224129 234224371 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 173548 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 142-42 chr14 35273582 35273720 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001256681, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001256681, exon 6 of 6) -4907 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 224.666-42 chrX 20430505 20430730 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -163708 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 232-57 chr21 44689994 44690293 + 1.33333 NA intron (NM_144991, intron 1 of 11) HAL1ME|LINE|L1 -7029 NM_198699 386685 Hs.297526 NM_198699 ENSG00000189169 KRTAP10-12 KAP10.12|KRTAP18-12|KRTAP18.12 keratin associated protein 10-12 protein-coding 281.666-13 chr4 185898718 185899007 + 1.33333 NA intron (NM_001270771, intron 1 of 23) intron (NM_001270771, intron 1 of 23) 57510 NM_001270771 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 212.333-139 chr7 54987873 54988164 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -30999 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 195.333-121 chr2 159879451 159879598 + 1.33333 NA intron (NM_002349, intron 8 of 34) intron (NM_002349, intron 8 of 34) 25232 NM_001198760 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 253-33 chr19 48150952 48151319 + 1.33333 NA intron (NM_001289064, intron 5 of 25) intron (NM_001289064, intron 5 of 25) 19209 NR_135497 3978 Hs.1770 NM_000234 ENSG00000105486 LIG1 - DNA ligase 1 protein-coding 224.333-37 chr14 55114638 55114963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14452 NM_001357678 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 172.667-163 chr8 132996168 132996417 + 1.33333 NA intron (NM_003235, intron 35 of 47) intron (NM_003235, intron 35 of 47) 50289 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 144.667-295 chr8 83076158 83076349 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 164149 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 203.333-93 chr15 97798135 97798408 + 1.33333 NA intron (NR_024172, intron 1 of 2) intron (NR_024172, intron 1 of 2) 76158 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 294-58 chr7 19830860 19831277 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57451 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 209.333-92 chr17 67646926 67647186 + 1.33333 NA intron (NM_181671, intron 6 of 9) intron (NM_181671, intron 6 of 9) -70777 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 273-14 chr14 62670313 62670690 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 374957 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 258.333-16 chr12 65876381 65876699 + 1.33333 NA intron (NR_120478, intron 2 of 2) intron (NR_120478, intron 2 of 2) 5038 NR_120478 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 120-13 chr10 43130296 43130426 + 1.33333 NA TTS (NM_020975) TTS (NM_020975) -8084 NR_135077 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 413.999-2 chr11 17851289 17851937 + 1.33333 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) intron (NR_104040, intron 11 of 11) 115665 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 213.333-219 chr8 136253228 136253529 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -277420 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 285-6 chr14 31108273 31108632 + 1.33333 NA intron (NM_015382, intron 36 of 42) intron (NM_015382, intron 36 of 42) 81809 NM_001254728 11154 Hs.293411 NM_007077 ENSG00000100478 AP4S1 AP47B|CLA20|CLAPS4|CPSQ6|SPG52 adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1 protein-coding 167.333-39 chr10 41818947 41819179 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 548982 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 187-27 chr17 48373436 48373639 + 1.33333 NA intron (NM_001075099, intron 2 of 12) intron (NM_001075099, intron 2 of 12) 56677 NM_003726 8631 Hs.316931 NM_003726 ENSG00000141293 SKAP1 HEL-S-81p|SCAP1|SKAP55 src kinase associated phosphoprotein 1 protein-coding 406.333-4 chr14 70755534 70756111 + 1.33333 NA intron (NM_033141, intron 3 of 12) intron (NM_033141, intron 3 of 12) 27630 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 268.999-2 chr11 41418387 41418603 + 1.33333 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 41141 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 195.333-182 chr5 125032674 125032866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4061 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 220-28 chr12 24857553 24857824 + 1.33333 NA intron (NM_001178091, intron 4 of 9) MER41-int|LTR|ERV1 44534 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 192.333-121 chr4 40537191 40537427 + 1.33333 NA intron (NM_001098634, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu -21324 NM_019027 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 204.667-112 chr4 109884067 109884334 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -28683 NM_001963 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 264-42 chr5 73777283 73777613 + 1.33333 NA intron (NM_001177693, intron 6 of 35) intron (NM_001177693, intron 6 of 35) -36098 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 313.666-11 chr6 62176688 62177040 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) intron (NR_146874, intron 2 of 13) 109361 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 229-50 chr5 23097741 23097993 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -244523 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 262.666-28 chr9 35195699 35195946 + 1.33333 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) intron (NM_006377, intron 1 of 38) 33813 NM_001330653 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 195-102 chr7 144882146 144882319 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -46179 NM_001350887 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 188-74 chr3 146312491 146312756 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -61444 NM_001128306 57088 Hs.477869 NM_020353 ENSG00000114698 PLSCR4 TRA1 phospholipid scramblase 4 protein-coding 345.999-6 chr5 31291868 31292213 + 1.33333 NA intron (NM_001362435, intron 2 of 10) MIR3|SINE|MIR 98354 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 148-163 chr8 135120301 135120516 + 1.33333 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -113723 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 165.333-150 chr21 29897114 29897368 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 42755 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 460.333-6 chr8 80192957 80193514 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21671 NM_001025253 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 256.666-20 chr20 38102925 38103205 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 62205 NM_001323318 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 216.999-5 chr2 65801982 65802179 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -369481 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 137.667-172 chr7 26539022 26539189 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_022006) promoter-TSS (NR_022006) -280 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 259.666 chr1 21118133 21118416 + 1.33333 NA intron (NM_001198803, intron 1 of 12) intron (NM_001198803, intron 1 of 12) -6891 NM_003760 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 203.333-106 chr17 71823876 71824041 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 202021 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 213.333-115 chr21 26684751 26685003 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111591 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 140-95 chr5 170941400 170941630 + 1.33333 NA intron (NM_022897, intron 12 of 27) intron (NM_022897, intron 12 of 27) 79497 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 259.666-14 chr15 34744688 34744986 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 10161 NM_020660 57369 Hs.283816 NM_020660 ENSG00000159248 GJD2 CX36|GJA9 gap junction protein delta 2 protein-coding 293.333-25 chr19 34534878 34535136 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 10379 NR_146880 100129800 NR_146880 ZNF807 ZNF181P1|ZNF807P zinc finger protein 807 pseudo 195.333-93 chr16 69453129 69453347 + 1.33333 NA intron (NM_030579, intron 3 of 4) intron (NM_030579, intron 3 of 4) 28643 NM_030579 80777 Hs.461131 NM_030579 ENSG00000103018 CYB5B CYB5-M|CYPB5M|OMB5 cytochrome b5 type B protein-coding 201-77 chr3 116014146 116014336 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) L2c|LINE|L2 -109115 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 339.999-2 chr10 93998523 93998845 + 1.33333 NA intron (NM_001288989, intron 1 of 32) intron (NM_001288989, intron 1 of 32) 4753 NM_016341 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 262.333-35 chr17 31151913 31152368 + 1.33333 NA intron (NM_001042492, intron 1 of 57) L1M8|LINE|L1 57163 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 202-69 chr18 21740646 21740813 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_020774) promoter-TSS (NM_020774) -600 NM_020774 57534 Hs.140903 NM_020774 ENSG00000101752 MIB1 DIP-1|DIP1|LVNC7|MIB|ZZANK2|ZZZ6 mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 203.333-206 chr5 37179856 37180080 + 1.33333 NA intron (NM_023073, intron 28 of 51) intron (NM_023073, intron 28 of 51) -69078 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 217.666-11 chr14 40341961 40342244 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -612609 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 192.667-126 chr4 84839960 84840230 + 1.33333 NA intron (NM_014991, intron 6 of 67) intron (NM_014991, intron 6 of 67) -125521 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 204.666-48 chr20 59247096 59247311 + 1.33333 NA intron (NM_178457, intron 3 of 4) intron (NM_178457, intron 3 of 4) -53408 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 208.666-92 chr5 154876357 154876520 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001301073, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001301073, exon 7 of 7) 17811 NM_001301077 9337 Hs.26703 NM_004779 ENSG00000155508 CNOT8 CAF1|CALIF|Caf1b|POP2|hCAF1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 protein-coding 221.333-81 chr20 56953845 56954082 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -259733 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 293.999-5 chr20 10753336 10753686 + 1.33333 NA intron (NR_110611, intron 1 of 1) intron (NR_110611, intron 1 of 1) 421 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 215.333-173 chr6 65544324 65544555 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 35365 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 395.999 chr10 64968420 64969040 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44212 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 252-50 chr2 123015238 123015509 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58108 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 227.333-60 chr2 36738914 36739148 + 1.33333 NA intron (NM_001177969, intron 3 of 14) intron (NM_001177969, intron 3 of 14) 42324 NM_053276 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 171-68 chr5 181215055 181215251 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 7480 NR_039781 100616342 NR_039781 ENSG00000264732 MIR4638 mir-4638 microRNA 4638 ncRNA 328.999 chr15 44280563 44280839 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -8018 NM_177974 113201 Hs.512867 NM_138423 ENSG00000166734 CASC4 H63 cancer susceptibility 4 protein-coding 190.667-60 chr2 19503412 19503614 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -144890 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 193-87 chr7 29000524 29000727 + 1.33333 NA intron (NR_038965, intron 2 of 4) intron (NR_038965, intron 2 of 4) 20658 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 304-44 chr4 71163743 71164042 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23367 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 131-48 chr2 44636531 44636637 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 274637 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 272.333-54 chr5 37053443 37053764 + 1.33333 NA intron (NM_015384, intron 42 of 45) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 176834 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 200.666-41 chr15 52075185 52075373 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 37496 NM_020396 10017 Hs.283672 NM_020396 ENSG00000137875 BCL2L10 BCL-B|Boo|Diva|bcl2-L-10 BCL2 like 10 protein-coding 210-137 chr7 22693815 22694055 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -28402 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 221.333-123 chr6 54379599 54379786 + 1.33333 NA intron (NM_014464, intron 9 of 10) intron (NM_014464, intron 9 of 10) 71251 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 272.666-22 chr5 109473380 109473653 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63542 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 207.333-181 chr3 57244721 57244907 + 1.33333 NA intron (NM_012096, intron 7 of 21) L2b|LINE|L2 17085 NM_012096 26060 Hs.476415 NM_012096 ENSG00000157500 APPL1 APPL|DIP13alpha|MODY14 adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 1 protein-coding 215.333-122 chr22 38583738 38583967 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001291030, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001291030, exon 17 of 17) 13352 NR_134627 105373031 Hs.144041 NR_134627 LOC105373031 - uncharacterized LOC105373031 ncRNA 291 chr1 69509083 69509576 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -58005 NM_001330635 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 309.666-7 chr19 28295248 28295711 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -311209 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 254-12 chr11 30308119 30308427 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -14831 NM_152316 120534 Hs.502208 NM_152316 ENSG00000152219 ARL14EP ARF7EP|C11orf46|dJ299F11.1 ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein protein-coding 138-123 chr8 126811827 126811943 + 1.33333 NA Intergenic L1P5|LINE|L1 -201269 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 164.333-96 chr17 73221264 73221451 + 1.33333 NA intron (NM_001098832, intron 2 of 3) intron (NM_001098832, intron 2 of 3) 6360 NM_001289412 84923 Hs.741276 NM_032837 ENSG00000133193 FAM104A - family with sequence similarity 104 member A protein-coding 257.666-19 chr6 47948898 47949281 + 1.33333 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 119600 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 148-122 chr4 169491612 169491820 + 1.33333 NA intron (NM_001199400, intron 20 of 32) L1M2a|LINE|L1 120867 NM_001199400 4750 Hs.481181 NM_012224 ENSG00000137601 NEK1 ALS24|NY-REN-55|SRPS2|SRPS2A|SRTD6 NIMA related kinase 1 protein-coding 215-32 chr2 42574628 42574891 + 1.33333 NA intron (NM_001330443, intron 2 of 16) AluJb|SINE|Alu 6127 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 190.666-21 chr15 100021291 100021500 + 1.33333 NA intron (NM_139057, intron 18 of 21) intron (NM_139057, intron 18 of 21) 214372 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 291.333-47 chr4 62037286 62037631 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 21 of 23) intron (NM_001371343, intron 21 of 23) 124307 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 222.666-15 chr15 55912945 55913161 + 1.33333 NA intron (NM_001329212, intron 5 of 28) intron (NM_001329212, intron 5 of 28) 4078 NM_198400 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 208-48 chr14 64497254 64497430 + 1.33333 NA intron (NM_001354685, intron 2 of 4) intron (NM_001354685, intron 2 of 4) 650 NM_001354687 7597 Hs.654571 NM_006977 ENSG00000089775 ZBTB25 C14orf51|KUP|ZNF46 zinc finger and BTB domain containing 25 protein-coding 255.999-7 chr5 180973056 180973346 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -15645 NM_197975 10917 Hs.225949 NM_006707 ENSG00000168903 BTNL3 BTN9.1|BTNLR butyrophilin like 3 protein-coding 258.333-65 chr8 99607859 99608134 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -71135 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 246.333-49 chr2 75079331 75079551 + 1.33333 NA intron (NM_015727, intron 2 of 3) intron (NM_015727, intron 2 of 3) -11371 NR_049796 100846995 NR_049796 ENSG00000263909 MIR5000 - microRNA 5000 ncRNA 146-91 chr3 152316571 152316689 + 1.33333 NA intron (NM_207296, intron 1 of 7) intron (NM_207296, intron 1 of 7) 17225 NM_207295 4154 Hs.201858 NM_021038 ENSG00000152601 MBNL1 EXP|MBNL muscleblind like splicing regulator 1 protein-coding 204.666-54 chr3 28474158 28474371 + 1.33333 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) L1ME4b|LINE|L1 -101014 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 163.333-68 chr12 75579876 75580146 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -68402 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 206-59 chr15 75056524 75056700 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13326 NM_001301104 60490 Hs.458922 NM_021823 ENSG00000138621 PPCDC MDS018|PPC-DC|coaC phosphopantothenoylcysteine decarboxylase protein-coding 195.333-80 chr14 67252763 67252934 + 1.33333 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) intron (NM_001256550, intron 1 of 14) 11413 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 201.333-22 chr1 204918263 204918424 + 1.33333 NA intron (NM_001160332, intron 1 of 27) MER30|DNA|hAT-Charlie -25883 NM_001160331 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 275-19 chr18 37173196 37173545 + 1.33333 NA intron (NR_136303, intron 10 of 13) intron (NR_136303, intron 10 of 13) -101090 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 198.666-51 chr20 2379938 2380176 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001254734) promoter-TSS (NM_001254734) -844 NM_198994 343641 Hs.452039 NM_198994 ENSG00000166948 TGM6 SCA35|TG6|TGM3L|TGY|dJ734P14.3 transglutaminase 6 protein-coding 251.333-101 chr6 145769202 145769626 + 1.33333 NA intron (NR_038246, intron 1 of 2) intron (NR_038246, intron 1 of 2) -33391 NR_153398 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 423.332 chr11 5999903 6000256 + 1.33333 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 3113 NM_001005179 120793 Hs.553571 NM_001005179 ENSG00000183389 OR56A4 OR11-49 olfactory receptor family 56 subfamily A member 4 protein-coding 507.332-2 chr2 16383844 16384280 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 281772 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 201-8 chr1 105354616 105354769 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 264243 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 341.666-16 chr7 65255389 65256044 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 114686 NR_146905 285905 Hs.567827 NM_182596 ENSG00000164669 INTS4P1 INTS4L1 integrator complex subunit 4 pseudogene 1 pseudo 237.333-139 chrX 88894368 88894584 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 147251 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 210.666-99 chr8 60682320 60682526 + 1.33333 NA intron (NM_017780, intron 1 of 37) intron (NM_017780, intron 1 of 37) 3683 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 177.666-22 chr5 104561773 104561947 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -537614 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 219.333-41 chr12 80502794 80503095 + 1.33333 NA intron (NM_001145026, intron 14 of 44) L2a|LINE|L2 58709 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 302.999 chr1 44923275 44923604 + 1.33333 NA intron (NM_001166588, intron 5 of 9) L1MA2|LINE|L1 63156 NM_020365 8891 Hs.533549 NM_020365 ENSG00000070785 EIF2B3 EIF-2B|EIF2Bgamma eukaryotic translation initiation factor 2B subunit gamma protein-coding 341.667-18 chr5 44457305 44457754 + 1.33333 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 52753 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 189.333-26 chr10 21249067 21249325 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 74894 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 192-14 chr1 217121681 217121973 + 1.33333 NA intron (NM_001134285, intron 1 of 8) intron (NM_001134285, intron 1 of 8) 15875 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 250.666-10 chr12 58440438 58440646 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -151160 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 189.333-35 chr11 47506411 47506608 + 1.33333 NA intron (NM_001330272, intron 1 of 15) MER30|DNA|hAT-Charlie -11988 NM_198700 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 376.666-3 chr19 53069429 53069750 + 1.33333 NA exon (NM_001322136, exon 5 of 5) exon (NM_001322136, exon 5 of 5) 17448 NM_001322136 90338 Hs.655967 NM_033288 ENSG00000170949 ZNF160 F11|HKr18|HZF5|KR18 zinc finger protein 160 protein-coding 330-10 chr12 3717823 3718202 + 1.33333 NA intron (NM_001144958, intron 2 of 19) MIRb|SINE|MIR 35097 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 218.333-54 chr18 13149329 13149633 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -69279 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 214.999-10 chr5 68676903 68677100 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 352926 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 278.667-24 chr2 72747192 72747601 + 1.33333 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 78637 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 364.666-10 chr5 22602218 22602641 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 250915 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 428.667-8 chr2 182355778 182356293 + 1.33333 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 71013 NM_001258313 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 154.666 chr10 51509949 51510103 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 189569 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 331.333-11 chr11 16668357 16668700 + 1.33333 NA intron (NM_001367872, intron 2 of 16) L1M1|LINE|L1 69949 NM_001367872 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 258.999-3 chr15 87327058 87327390 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -249705 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 189-37 chr18 8719003 8719208 + 1.33333 NA intron (NM_015210, intron 3 of 16) intron (NM_015210, intron 3 of 16) 1724 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 238.666-31 chr4 73534241 73534511 + 1.33333 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 25573 NR_046377 728040 Hs.640574 NR_046377 ENSG00000250436 LINC02499 - long intergenic non-protein coding RNA 2499 ncRNA 233.333-61 chr2 66557690 66558024 + 1.33333 NA intron (NM_002398, intron 9 of 12) intron (NM_002398, intron 9 of 12) -16173 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 259.999-12 chr8 137571333 137571638 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157897 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 351.333-16 chr2 168070004 168070315 + 1.33333 NA intron (NM_013233, intron 12 of 17) intron (NM_013233, intron 12 of 17) -129015 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 175.666 chr1 69636324 69636490 + 1.33333 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) intron (NM_001366842, intron 1 of 7) 67066 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 263-60 chr6 125479339 125479751 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -177578 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 130-61 chr2 205484476 205484663 + 1.33333 NA intron (NM_057177, intron 19 of 21) intron (NM_057177, intron 19 of 21) -197931 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 193.333-131 chr3 183551472 183551666 + 1.33333 NA intron (NR_046687, intron 1 of 1) HAL1|LINE|L1 2834 NR_046687 100874019 NR_046687 ENSG00000242522 KLHL6-AS1 - KLHL6 antisense RNA 1 ncRNA 284.333-22 chr2 15559367 15559697 + 1.33333 NA intron (NR_052013, intron 1 of 50) intron (NR_052013, intron 1 of 50) 1802 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 200.667-158 chr8 115876632 115876868 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -207775 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 150.667-66 chr11 47079488 47079721 + 1.33333 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) L1ME4a|LINE|L1 97275 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 300.333-12 chr14 50266671 50267131 + 1.33333 NA intron (NM_024884, intron 8 of 9) intron (NM_024884, intron 8 of 9) 33045 NR_039726 100616261 NR_039726 ENSG00000264712 MIR4504 - microRNA 4504 ncRNA 399-14 chr9 86405442 86406057 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51339 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 198.666-10 chr11 97255484 97255665 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 747149 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 205-69 chr5 26292640 26292959 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 745787 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 198.666-76 chr5 72331992 72332159 + 1.33333 NA intron (NM_001284405, intron 4 of 8) intron (NM_001284405, intron 4 of 8) 11702 NM_001284403 79810 Hs.126906 NM_024754 ENSG00000049883 PTCD2 - pentatricopeptide repeat domain 2 protein-coding 114.333-47 chr11 110671783 110671915 + 1.33333 NA intron (NM_020809, intron 3 of 15) L1ME1|LINE|L1 39976 NM_001258415 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 194.666-78 chr9 75190283 75190440 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 101847 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 223.333-122 chr5 13864340 13864569 + 1.33333 NA exon (NM_001369, exon 28 of 79) exon (NM_001369, exon 28 of 79) 80026 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 282-44 chr6 147276886 147277274 + 1.33333 NA intron (NM_139244, intron 7 of 25) Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger -72466 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 203.333-179 chr3 120635761 120635997 + 1.33333 NA intron (NM_000187, intron 12 of 13) intron (NM_000187, intron 12 of 13) 39543 NM_001168331 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 134.333-65 chr15 89160964 89161128 + 1.33333 NA intron (NM_007011, intron 9 of 14) intron (NM_007011, intron 9 of 14) 60533 NM_000326 6017 Hs.1933 NM_000326 ENSG00000140522 RLBP1 CRALBP retinaldehyde binding protein 1 protein-coding 211.333-145 chr22 41140027 41140237 + 1.33333 NA intron (NM_001429, intron 8 of 30) intron (NM_001429, intron 8 of 30) 47540 NM_001429 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 189.333-97 chr2 118281456 118281607 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95145 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 253-70 chr8 79234963 79235258 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -97078 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 234.333-2 chr1 42318197 42318520 + 1.33333 NA intron (NM_001198851, intron 2 of 14) AluSq2|SINE|Alu 16597 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 370.333-10 chr17 55509114 55509449 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87446 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 233.333-89 chr4 35278346 35278660 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 965436 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 268.666-17 chr2 101433599 101433861 + 1.33333 NA intron (NM_001367509, intron 4 of 13) intron (NM_001367509, intron 4 of 13) 41382 NM_001367510 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 187.667-18 chr10 118705907 118706126 + 1.33333 NA intron (NM_153810, intron 4 of 8) intron (NM_153810, intron 4 of 8) 48954 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 297.999-3 chr14 73833724 73834185 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3819 NR_135238 100506498 Hs.569330 NR_135238 ENSG00000258586 LINC02274 - long intergenic non-protein coding RNA 2274 ncRNA 269.333-18 chr12 80615198 80615538 + 1.33333 NA intron (NM_001145026, intron 29 of 44) intron (NM_001145026, intron 29 of 44) -92266 NM_002469 4618 Hs.35937 NM_002469 ENSG00000111046 MYF6 CNM3|MRF4|bHLHc4|myf-6 myogenic factor 6 protein-coding 224-86 chr6 95913648 95913858 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102221 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 190-81 chr3 113303701 113303860 + 1.33333 NA intron (NM_001164496, intron 32 of 34) intron (NM_001164496, intron 32 of 34) 91664 NM_001301861 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 257.666-11 chr2 44994650 44995042 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 14606 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 342.666-24 chr8 112253258 112253622 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 59 of 66) intron (NM_001363185, intron 59 of 66) -390053 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 233.999-3 chr2 233158878 233159053 + 1.33333 NA intron (NM_001017915, intron 10 of 26).2 AluJo|SINE|Alu -92606 NM_198890 55054 Hs.529322 NM_017974 ENSG00000085978 ATG16L1 APG16L|ATG16A|ATG16L|IBD10|WDR30 autophagy related 16 like 1 protein-coding 209-64 chr2 174871381 174871562 + 1.33333 NA intron (NR_038133, intron 5 of 11) intron (NR_038133, intron 5 of 11) -23853 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 213.333-222 chr9 6074128 6074417 + 1.33333 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -58648 NM_001243202 26953 Hs.167496 NM_012416 ENSG00000137040 RANBP6 - RAN binding protein 6 protein-coding 222-16 chr11 43464733 43465028 + 1.33333 NA intron (NM_018259, intron 21 of 23) L1MEg|LINE|L1 -94776 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 111.666-3 chr8 122999944 123000104 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 25748 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 206.667-94 chr3 180668657 180668953 + 1.33333 NA intron (NM_181426, intron 1 of 19) L2a|LINE|L2 10684 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 262.333-16 chr11 70576063 70576313 + 1.33333 NA intron (NM_133266, intron 2 of 10) intron (NM_133266, intron 2 of 10) -54906 NR_046567 100874198 Hs.656610 NR_046567 ENSG00000226627 SHANK2-AS1 - SHANK2 antisense RNA 1 ncRNA 245.333-50 chr15 76034505 76034846 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L-int|LTR|ERVL-MaLR -22251 NM_138573 145957 Hs.732438 NM_138573 ENSG00000169752 NRG4 HRG4 neuregulin 4 protein-coding 403.666-6 chr4 109190032 109190493 + 1.33333 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) L1M6|LINE|L1 112396 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 232.666-53 chrX 83798036 83798307 + 1.33333 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 -62955 NM_001271680 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 215.333-211 chr9 84552117 84552312 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -116244 NM_006180 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 210.667-25 chr11 36851315 36851627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -253192 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 211.333-26 chr10 82906822 82906997 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) intron (NR_163253, intron 6 of 10) -673989 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 208.666-38 chr14 68457476 68457714 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) intron (NM_133509, intron 9 of 10) 171192 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 182.333-157 chr8 94262100 94262354 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_181702) promoter-TSS (NM_181702) 92 NM_005261 2669 Hs.654463 NM_005261 ENSG00000164949 GEM KIR GTP binding protein overexpressed in skeletal muscle protein-coding 164.666-6 chr11 11111431 11111593 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 241738 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 156.666-7 chr2 89836381 89836585 + 1.33333 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -198576 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 223-62 chr8 34446064 34446351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -337714 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 197-107 chr7 7339249 7339458 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 84199 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 214.333-46 chr14 56620018 56620322 + 1.33333 NA intron (NM_017799, intron 10 of 15) L1PREC2|LINE|L1 40372 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 235.333-127 chr8 136330994 136331191 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -199706 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 256.667-95 chrX 12917513 12917894 + 1.33333 NA intron (NM_016610, intron 2 of 2) intron (NM_016610, intron 2 of 2) 11083 NM_016610 51311 Hs.660543 NM_016610 ENSG00000101916 TLR8 CD288 toll like receptor 8 protein-coding 220.333-15 chr10 61637827 61638011 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -25010 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 203-68 chr3 106948707 106948882 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 291844 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 197.666-49 chr4 83827045 83827221 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 291025 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 142-136 chr6 150139249 150139431 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3704 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 243.666-6 chr12 32947649 32947972 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50964 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 253.667-74 chr8 58754058 58754489 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94420 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 305.666-10 chr14 45370338 45370634 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -117284 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 333.333-22 chr16 9239981 9240292 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -115452 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 239.333-46 chr18 13841511 13841850 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17531 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 284.333-35 chr4 78016381 78016828 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -40719 NM_025074 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 211.667-93 chr5 116229595 116229892 + 1.33333 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) intron (NM_001308080, intron 5 of 6) -26000 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 214-117 chr6 118955775 118956029 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -20740 NM_153255 254394 Hs.279008 NM_017696 ENSG00000111877 MCM9 C6orf61|MCMDC1|ODG4|dJ329L24.1|dJ329L24.3 minichromosome maintenance 9 homologous recombination repair factor protein-coding 200.333-4 chr1 214589819 214590104 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -13234 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 340.666-22 chr9 25281257 25281635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 397412 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 252-47 chr2 88542020 88542370 + 1.33333 NA intron (NR_110236, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 3475 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 215.333-42 chr12 19278101 19278417 + 1.33333 NA intron (NM_001256787, intron 8 of 25) intron (NM_001256787, intron 8 of 25) 72934 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 176.667-83 chr2 207315920 207316178 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46625 NR_031633 100302130 NR_031633 ENSG00000221628 MIR1302-4 MIRN1302-4|hsa-mir-1302-4 microRNA 1302-4 ncRNA 174-99 chr8 121961017 121961166 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -319651 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 217.333-107 chr4 70335946 70336250 + 1.33333 NA exon (NM_033122, exon 1 of 2) exon (NM_033122, exon 1 of 2) 1117 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 310.999-3 chr8 83194869 83195360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -208644 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 203-98 chr6 170565423 170565624 + 1.33333 NA intron (NM_003194, intron 4 of 7) intron (NM_003194, intron 4 of 7) 11154 NM_003194 6908 Hs.590872 NM_003194 ENSG00000112592 TBP GTF2D|GTF2D1|HDL4|SCA17|TFIID TATA-box binding protein protein-coding 332.333-21 chr5 36228287 36228612 + 1.33333 NA intron (NM_001287341, intron 1 of 12) FLAM_A|SINE|Alu 12942 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 121.667-65 chr15 52339227 52339332 + 1.33333 NA intron (NM_001142495, intron 31 of 39) intron (NM_001142495, intron 31 of 39) -43475 NM_018728 55930 Hs.487036 NM_018728 ENSG00000128833 MYO5C - myosin VC protein-coding 205.333-31 chr10 45019414 45019575 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18571 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 174-6 chr10 21971484 21971737 + 1.33333 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) intron (NM_022365, intron 1 of 11) 32120 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 198-134 chr4 30728530 30728706 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 8249 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 230.999-4 chr7 1416484 1416722 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 42867 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 266.666-20 chr22 50007077 50007394 + 1.33333 NA intron (NM_001371416, intron 2 of 14) L1MEc|LINE|L1 5530 NM_001001694 400935 Hs.526712 NM_001001694 ENSG00000188263 IL17REL - interleukin 17 receptor E like protein-coding 207.333-85 chr14 46506206 46506377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34932 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 171.333-33 chr12 12981294 12981446 + 1.33333 NA TTS (NR_149063) TTS (NR_149063) 1533 NR_038920 100506314 Hs.127718 NR_038920 ENSG00000247498 GPRC5D-AS1 - GPRC5D and HEBP1 antisense RNA 1 ncRNA 239.666-26 chr7 45959430 45959710 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -38298 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 258.667-23 chr11 113010262 113010637 + 1.33333 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -46989 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 181.666-9 chr15 27431235 27431395 + 1.33333 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) L1MB7|LINE|L1 -269996 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 256.667-23 chr13 36044871 36045283 + 1.33333 NA intron (NM_001330071, intron 3 of 16) intron (NM_001330071, intron 3 of 16) 86305 NM_001330071 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 196.333-79 chr2 19703809 19704036 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -164932 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 262.666-20 chr5 76604773 76605071 + 1.33333 NA intron (NM_006633, intron 11 of 35) intron (NM_006633, intron 11 of 35) 4047 NR_134278 101929109 Hs.665172 NR_134278 ENSG00000249713 LOC101929109 - uncharacterized LOC101929109 ncRNA 348.666-16 chr6 79479701 79480084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57538 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 502.999-2 chr3 47491629 47492206 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -15976 NM_001320044 22937 Hs.531789 NM_012235 ENSG00000114650 SCAP - SREBF chaperone protein-coding 198-128 chr3 138145870 138146128 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -13609 NM_016161 51146 Hs.278960 NM_016161 ENSG00000118017 A4GNT alpha4GnT alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 444.666 chr15 53390240 53390752 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 150356 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 215.333-14 chr1 204583965 204584201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67677 NM_002393 4194 Hs.497492 NM_002393 ENSG00000198625 MDM4 HDMX|MDMX|MRP1 MDM4 regulator of p53 protein-coding 169.333-182 chr4 70492734 70492932 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20636 NM_152291 4589 Hs.631946 NM_152291 ENSG00000171195 MUC7 MG2 mucin 7, secreted protein-coding 284.666-19 chr4 71933248 71933642 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -98359 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 279.333-2 chr1 66701532 66701837 + 1.33333 NA intron (NM_001350218, intron 16 of 22) intron (NM_001350218, intron 16 of 22) -50775 NM_152665 200132 Hs.479226 NM_152665 ENSG00000152760 TCTEX1D1 - Tctex1 domain containing 1 protein-coding 448.999-2 chr8 116701564 116701929 + 1.33333 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) L1MD3|LINE|L1 49646 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 220-127 chr9 73088599 73088894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63119 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 198.666-22 chr13 70089006 70089158 + 1.33333 NA intron (NM_020866, intron 1 of 10) intron (NM_020866, intron 1 of 10) -18131 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 295.333-57 chr8 80971798 80972128 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018440, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_018440, exon 9 of 9) -97182 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 200.667-13 chr1 200802076 200802333 + 1.33333 NA intron (NM_001297707, intron 2 of 17) intron (NM_001297707, intron 2 of 17) 62632 NM_001297708 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 200.666-20 chr10 117156313 117156490 + 1.33333 NA intron (NR_121651, intron 2 of 2) L1ME3B|LINE|L1 11373 NR_037436 100500893 NR_037436 ENSG00000266782 MIR3663 - microRNA 3663 ncRNA 274.333-75 chrX 153196703 153197036 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 17585 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 292.333-17 chr15 67380348 67380655 + 1.33333 NA intron (NM_001031715, intron 10 of 20) intron (NM_001031715, intron 10 of 20) -125303 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 355.333-25 chr5 55513573 55514016 + 1.33333 NA intron (NR_103485, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu -4868 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 418.333 chr10 90906165 90906715 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001104546, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001104546, exon 14 of 14) 14835 NM_014391 27063 Hs.448589 NM_014391 ENSG00000148677 ANKRD1 ALRP|C-193|CARP|CVARP|MCARP|bA320F15.2 ankyrin repeat domain 1 protein-coding 378.666-4 chr17 60833331 60833759 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 155694 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 253-40 chr2 138479555 138479963 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -22011 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 176.666-25 chr5 76674232 76674568 + 1.33333 NA intron (NM_006633, intron 26 of 35) intron (NM_006633, intron 26 of 35) -38003 NR_028375 100302746 NR_028375 NCRUPAR NCRNA00193|ncR-uPAR non-protein coding RNA, upstream of F2R/PAR1 ncRNA 346-17 chr2 182463777 182464153 + 1.33333 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) -36917 NM_001363871 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 304-55 chr6 158113119 158113425 + 1.33333 NA intron (NM_032861, intron 16 of 16) intron (NM_032861, intron 16 of 16) 54990 NR_073096 84947 Hs.154706 NM_032861 ENSG00000122335 SERAC1 - serine active site containing 1 protein-coding 221.333-54 chr19 32662541 32662752 + 1.33333 NA intron (NM_032139, intron 1 of 28) AluJr|SINE|Alu 12534 NM_032139 84079 Hs.59236 NM_032139 ENSG00000105186 ANKRD27 PP12899|VARP ankyrin repeat domain 27 protein-coding 284.333-30 chr3 142730384 142730654 + 1.33333 NA intron (NM_001251845, intron 1 of 12) Charlie9|DNA|hAT-Charlie 6095 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 186.333-5 chr1 95249288 95249470 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 15169 NM_015485 25950 Hs.483512 NM_015485 ENSG00000122481 RWDD3 RSUME RWD domain containing 3 protein-coding 267.333-87 chr7 91429852 91430179 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 165582 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 203.666-33 chr2 127033314 127033594 + 1.33333 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 48611 NM_001320634 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 272.333-25 chr18 2635545 2635899 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19673 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 317-7 chr11 46790201 46790611 + 1.33333 NA intron (NM_001008938, intron 14 of 43) intron (NM_001008938, intron 14 of 43) -27907 NR_003056 692108 Hs.693252 NR_003056 ENSG00000212135 SNORD67 HBII-166 small nucleolar RNA, C/D box 67 snoRNA 236.667-73 chr6 110785997 110786367 + 1.33333 NA intron (NM_001300963, intron 1 of 13) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -28439 NM_001287215 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 352.667-23 chr5 124534876 124535418 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -96627 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 172-50 chr17 76260777 76260942 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4489 NM_182565 283991 Hs.744981 NM_182565 ENSG00000185262 UBALD2 FAM100B UBA like domain containing 2 protein-coding 197.333-62 chr14 47230109 47230371 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 113006 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 148.667-245 chr3 40321228 40321440 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11627 NM_005875 10289 Hs.315230 NM_005875 ENSG00000114784 EIF1B GC20 eukaryotic translation initiation factor 1B protein-coding 201.333-136 chr19 27361897 27362167 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -431399 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 194-32 chr14 40971404 40971632 + 1.33333 NA intron (NR_109758, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 16807 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 223.333-132 chr5 130768657 130768880 + 1.33333 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 396488 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 199.333-222 chr5 38675775 38676066 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 44353 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 207.333-12 chr1 101489720 101489969 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 166007 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 309.999 chr15 57318162 57318599 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_120337) promoter-TSS (NR_120337) -758 NR_120337 101928611 Hs.569495 NR_120337 LINC01413 - long intergenic non-protein coding RNA 1413 ncRNA 314-48 chr8 88054603 88055073 + 1.33333 NA intron (NM_005941, intron 8 of 9) intron (NM_005941, intron 8 of 9) -180823 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 304-31 chr2 148557177 148557623 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87351 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 378-24 chr5 128303960 128304416 + 1.33333 NA intron (NM_001999, intron 45 of 64) intron (NM_001999, intron 45 of 64) 220422 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 183.667-64 chr18 35342066 35342351 + 1.33333 NA intron (NM_001308123, intron 1 of 3) AluSc|SINE|Alu 2212 NM_001308123 7572 Hs.514802 NM_006965 ENSG00000172466 ZNF24 KOX17|RSG-A|ZNF191|ZSCAN3|Zfp191 zinc finger protein 24 protein-coding 140.333-179 chr5 56478313 56478557 + 1.33333 NA intron (NR_104664, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 3334 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 386.666-4 chr16 74507984 74508381 + 1.33333 NA intron (NR_027264, intron 3 of 26) intron (NR_027264, intron 3 of 26) -86712 NM_001011880 497190 Hs.454670 NM_001011880 ENSG00000140839 CLEC18B MRCL2 C-type lectin domain family 18 member B protein-coding 149.666-7 chr5 43599725 43600010 + 1.33333 NA intron (NR_073113, intron 1 of 2) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -2808 NM_012343 23530 Hs.482043 NM_012343 ENSG00000112992 NNT GCCD4 nicotinamide nucleotide transhydrogenase protein-coding 202.666-130 chrX 72599388 72599599 + 1.33333 NA intron (NM_001122670, intron 27 of 30) MER5A|DNA|hAT-Charlie -26390 NM_001166420 55869 Hs.310536 NM_018486 ENSG00000147099 HDAC8 CDA07|CDLS5|HD8|HDACL1|KDAC8|MRXS6|RPD3|WTS histone deacetylase 8 protein-coding 400.666-6 chr22 32473530 32474076 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -1008 NM_012179 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 290-32 chr3 12620864 12621402 + 1.33333 NA intron (NR_148942, intron 1 of 16) MIRb|SINE|MIR 42375 NM_001354690 5894 Hs.159130 NM_002880 ENSG00000132155 RAF1 CMD1NN|CRAF|NS5|Raf-1|c-Raf Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 220.666-29 chr17 44918986 44919205 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -3543 NM_001363846 2670 Hs.514227 NM_002055 ENSG00000131095 GFAP ALXDRD glial fibrillary acidic protein protein-coding 282.333-47 chr5 95990436 95990901 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 28667 NR_130776 101929710 NR_130776 ENSG00000251314 LOC101929710 - uncharacterized LOC101929710 ncRNA 444.667-3 chr14 74096249 74096750 + 1.33333 NA intron (NM_001024674, intron 3 of 5) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11546 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 232.666-49 chr7 50166446 50166744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70509 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 151.333-326 chr5 14394747 14394913 + 1.33333 NA intron (NM_007118, intron 28 of 56) intron (NM_007118, intron 28 of 56) -69153 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 214-18 chr10 71198092 71198275 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -14387 NM_170744 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 565.666 chr1 211420044 211420627 + 1.33333 NA intron (NR_026761, intron 4 of 5) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 37580 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 270.999-3 chr6 125109826 125110101 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -43810 NM_003287 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 218.333-24 chr11 76755680 76755961 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -26493 NM_001258210 25987 Hs.8361 NM_015516 ENSG00000182704 TSKU E2IG4|LRRC54|TSK tsukushi, small leucine rich proteoglycan protein-coding 376.667-3 chr11 74448153 74448619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19169 NM_005472 10008 Hs.523899 NM_005472 ENSG00000175538 KCNE3 BRGDA6|HOKPP|HYPP|MiRP2 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 3 protein-coding 266.333-15 chr14 56730699 56731053 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 74791 NM_172337 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 271-46 chr8 80375386 80375780 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -110010 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 199.333-256 chr7 22771913 22772174 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44423 NR_131935 541472 Hs.512234 NR_131935 ENSG00000179428 LOC541472 - uncharacterized LOC541472 ncRNA 190-120 chr8 89328653 89328888 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 428941 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 285.999-2 chr12 84814918 84815155 + 1.33333 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 97763 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 202-12 chr1 190957445 190957733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 270909 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 240.666-28 chr4 10700238 10700446 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -15574 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 210.666-57 chr2 124731418 124731681 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) intron (NM_130773, intron 13 of 23) 706262 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 194-148 chr8 122025511 122025709 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -384170 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 238.999 chr17 33272263 33272484 + 1.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 20615 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 207.333-43 chr11 23231530 23231704 + 1.33333 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 187573 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 389-4 chr20 32402137 32402823 + 1.33333 NA intron (NM_015338, intron 3 of 11) L1MD2|LINE|L1 43415 NM_001363734 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 216.666-47 chr21 24495297 24495499 + 1.33333 NA intron (NR_135519, intron 1 of 2) (TTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 66658 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 205.333-108 chr18 66226569 66226744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 377434 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 218-89 chr5 39888974 39889211 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -163199 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 207.667-92 chr4 125654693 125654995 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 147585 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 260.666-20 chr20 49274028 49274338 + 1.33333 NA intron (NM_021035, intron 2 of 13) MER3|DNA|hAT-Charlie 3874 NM_021035 57169 Hs.371794 NM_021035 ENSG00000124201 ZNFX1 - zinc finger NFX1-type containing 1 protein-coding 218-119 chr9 123181407 123181759 + 1.33333 NA intron (NM_001171137, intron 2 of 18) AluSp|SINE|Alu -66106 NR_026677 81571 Hs.708072 NM_030814 ENSG00000236901 MIR600HG C9orf45|GL012|NCRNA00287 MIR600 host gene ncRNA 195-3 chr1 47704442 47704648 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -267228 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 221.666-23 chr18 1061417 1061606 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -133518 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 507.999 chr5 39092786 39093373 + 1.33333 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -18680 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 206-14 chr1 209860271 209860429 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32378 NM_014388 27042 Hs.194754 NM_014388 ENSG00000117597 UTP25 C1orf107|DEF|DIEXF|DJ434O14.5 UTP25 small subunit processor component protein-coding 176-50 chr2 178541004 178541171 + 1.33333 NA intron (NM_001256850, intron 300 of 312) L1ME1|LINE|L1 17896 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 199.333-112 chr18 37320716 37320928 + 1.33333 NA intron (NM_001353741, intron 3 of 13) intron (NM_001353741, intron 3 of 13) 46362 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 176.666-34 chr9 100128678 100128880 + 1.33333 NA intron (NR_134606, intron 3 of 16) L1MEd|LINE|L1 29536 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 205.333-164 chr4 31028360 31028534 + 1.33333 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) AluJr4|SINE|Alu -142697 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 158-109 chr5 104492084 104492283 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -607291 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 258.666-12 chr14 52177005 52177350 + 1.33333 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -90521 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 201.333-18 chr1 189213137 189213331 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1262776 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 138-112 chr7 103336162 103336299 + 1.33333 NA intron (NM_001362668, intron 3 of 17) intron (NM_001362668, intron 3 of 17) 8537 NM_014377 27000 Hs.558476 NM_014377 ENSG00000105821 DNAJC2 MPHOSPH11|MPP11|ZRF1|ZUO1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2 protein-coding 219.333-192 chr9 106291072 106291285 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -309750 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 206.666-12 chr1 217679632 217679803 + 1.33333 NA intron (NM_138796, intron 4 of 10) intron (NM_138796, intron 4 of 10) 48373 NM_138796 128153 Hs.171130 NM_138796 ENSG00000162814 SPATA17 IQCH|MSRG-11|MSRG11 spermatogenesis associated 17 protein-coding 165-100 chr9 72232423 72232694 + 1.33333 NA intron (NM_001351573, intron 10 of 14) intron (NM_001351573, intron 10 of 14) -72878 NR_110953 100507540 Hs.54957 NR_110952 ENSG00000225434 LINC01504 - long intergenic non-protein coding RNA 1504 ncRNA 173.666-7 chr2 110158803 110159019 + 1.33333 NA intron (NM_207181, intron 11 of 19) L1M5|LINE|L1 -42345 NM_005434 7851 Hs.185055 NM_005434 ENSG00000144063 MALL BENE mal, T cell differentiation protein like protein-coding 233.333-52 chr18 66378298 66378561 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 225661 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 338-10 chr14 70104986 70105537 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) AluY|SINE|Alu -25044 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 228.333-37 chr17 70996906 70997203 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 205125 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 177.333-8 chr1 79663704 79663961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -657102 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 224.333-118 chr7 24612063 24612370 + 1.33333 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) HAL1|LINE|L1 38764 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 184-43 chr18 5516546 5516703 + 1.33333 NA intron (NM_001330557, intron 1 of 21) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 23932 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 250.667-14 chr12 62571849 62572184 + 1.33333 NA intron (NM_001278469, intron 30 of 35) intron (NM_001278469, intron 30 of 35) 31418 NR_121682 283416 Hs.375881 NM_175895 ENSG00000221949 LINC01465 C12orf61 long intergenic non-protein coding RNA 1465 ncRNA 302.333-11 chr11 30573700 30574187 + 1.33333 NA intron (NM_001584, intron 1 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 6550 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 351-19 chr7 77936890 77937537 + 1.33333 NA intron (NM_001366082, intron 10 of 11) intron (NM_001366082, intron 10 of 11) 97083 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 173.333-181 chr7 16967704 16967931 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -85834 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 205.666-49 chr6 162299753 162299924 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) intron (NM_004562, intron 2 of 11) -427294 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 200-52 chr14 51513341 51513657 + 1.33333 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) intron (NM_001042481, intron 1 of 14) 24371 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 290.333-41 chr6 128574407 128574867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54038 NM_002844 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 141.333-39 chr11 93584042 93584324 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -40792 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 210.333-69 chr2 41827070 41827355 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -50343 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 214.666-20 chr14 21741936 21742188 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71045 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 190.333-95 chr3 130341808 130342082 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3571 NR_022012 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 256.333-44 chr2 111179577 111179814 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58781 NM_138626 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 204.333-111 chr2 208045155 208045373 + 1.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -19737 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 175.333-2 chr1 50391507 50391659 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 31860 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 214.667-87 chr4 41865253 41865575 + 1.33333 NA Intergenic CpG 17197 NR_104143 101927074 Hs.611425 NR_104143 ENSG00000245870 LINC00682 - long intergenic non-protein coding RNA 682 ncRNA 221.333-55 chr19 46894680 46894858 + 1.33333 NA intron (NM_004491, intron 1 of 6) intron (NM_004491, intron 1 of 6) 33772 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 252.333-69 chr7 4281119 4281357 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -146401 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 243.333-81 chr4 79466233 79466492 + 1.33333 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -26231 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 287.333-28 chr2 43479984 43480262 + 1.33333 NA intron (NM_001083953, intron 26 of 37) MIRb|SINE|MIR 115851 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 275.333-64 chr6 104449005 104449537 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 410275 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 186.666-40 chr5 99000425 99000594 + 1.33333 NA intron (NR_151718, intron 3 of 3) intron (NR_151718, intron 3 of 3) -70795 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 250.999-3 chr12 65043932 65044264 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51807 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 329.999-11 chr8 61277841 61278394 + 1.33333 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 -9853 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 234-75 chr9 121235956 121236181 + 1.33333 NA intron (NM_001353053, intron 6 of 25) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -32094 NM_001127666 2934 Hs.522373 NM_000177 ENSG00000148180 GSN ADF|AGEL gelsolin protein-coding 158.666-28 chr7 34217450 34217634 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 312003 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 219.333-106 chr20 62679004 62679258 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -12510 NR_024470 100127888 Hs.671273 NR_024470 ENSG00000232803 SLCO4A1-AS1 - SLCO4A1 antisense RNA 1 ncRNA 208.667-94 chr3 193408289 193408481 + 1.33333 NA intron (NM_032279, intron 28 of 29) L1ME4b|LINE|L1 -29632 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 376.667-11 chr6 73853860 73854363 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 157908 NM_133493 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 264-48 chr7 71848083 71848342 + 1.33333 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 489179 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 435.333 chr10 51010459 51010867 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) MER20B|DNA|hAT-Charlie 19775 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 166.333-233 chr8 109027636 109027918 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58851 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 246-53 chr2 188317346 188317603 + 1.33333 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 19982 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 275.333-2 chr1 79234905 79235245 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -228345 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 216.666-17 chr11 5273186 5273438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3367 NM_005330 3046 Hs.655195 NM_005330 ENSG00000213931 HBE1 HBE hemoglobin subunit epsilon 1 protein-coding 210.667-92 chr3 112355581 112355835 + 1.33333 NA intron (NR_158642, intron 6 of 6) intron (NR_158642, intron 6 of 6) 22552 NR_158642 4345 Hs.79015 NM_005944 ENSG00000091972 CD200 MOX1|MOX2|MRC|OX-2 CD200 molecule protein-coding 415-6 chr19 44142618 44143215 + 1.33333 NA intron (NM_006630, intron 2 of 5) intron (NM_006630, intron 2 of 5) 1362 NM_001144824 10780 Hs.235992 NM_006630 ENSG00000263002 ZNF234 HZF4|ZNF269 zinc finger protein 234 protein-coding 194-103 chr4 70969382 70969648 + 1.33333 NA intron (NM_173468, intron 2 of 5) L1M7|LINE|L1 -24134 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 245.667-8 chr11 4512992 4513360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 24297 NM_001005171 390036 Hs.553726 NM_001005171 ENSG00000196778 OR52K1 OR11-8 olfactory receptor family 52 subfamily K member 1 protein-coding 176.667-23 chr1 231382539 231382808 + 1.33333 NA intron (NM_022051, intron 1 of 4) LTR82B|LTR|ERVL 42371 NM_022051 54583 Hs.444450 NM_022051 ENSG00000135766 EGLN1 C1orf12|ECYT3|HALAH|HIF-PH2|HIFPH2|HPH-2|HPH2|PHD2|SM20|ZMYND6 egl-9 family hypoxia inducible factor 1 protein-coding 247.666-22 chr3 116836622 116836929 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 13592 NR_039649 100616485 NR_039649 ENSG00000265433 MIR4447 - microRNA 4447 ncRNA 218.666-55 chr3 96134251 96134423 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -225627 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 178-59 chr19 28238772 28238926 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -367839 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 213.666-46 chr8 97139636 97139862 + 1.33333 NA intron (NM_016134, intron 7 of 7) L1ME3D|LINE|L1 138179 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 307-29 chr4 95702499 95703052 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137318 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 145.333-6 chr1 91166094 91166300 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -143942 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 229.333-122 chr8 136709772 136710054 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 179115 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 204-129 chr3 40861467 40861737 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 336642 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 279.333-55 chr3 97454666 97454971 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 7 of 17) intron (NM_001080448, intron 7 of 17) 15211 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 187-15 chr11 125000769 125001050 + 1.33333 NA intron (NM_025004, intron 11 of 15) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 46707 NM_025004 80071 Hs.287555 NM_025004 ENSG00000149548 CCDC15 - coiled-coil domain containing 15 protein-coding 404.332 chr6 36280020 36280575 + 1.33333 NA intron (NM_001145717, intron 1 of 7) L1ME3Cz|LINE|L1 9837 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 203.333-101 chr17 9440107 9440370 + 1.33333 NA intron (NM_004853, intron 6 of 7) intron (NM_004853, intron 6 of 7) 135582 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 270-14 chr14 67091333 67091627 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 11 of 21) MER126|DNA|DNA -97960 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 337.333-11 chr12 88168725 88169032 + 1.33333 NA intron (NM_181783, intron 7 of 13) L2|LINE|L2 26571 NM_001366579 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 207.667-55 chr2 72211559 72211848 + 1.33333 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -63841 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 316-49 chr7 34536437 34536764 + 1.33333 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) intron (NR_033665, intron 2 of 3) -121618 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 290-11 chr11 114704556 114704920 + 1.33333 NA intron (NM_182495, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 26211 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 214-88 chr3 82632767 82633172 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 646827 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 275.333-54 chr5 37362800 37363076 + 1.33333 NA intron (NM_001278312, intron 3 of 33) AluSx|SINE|Alu 8168 NM_001278312 9631 Hs.547696 NM_004298 ENSG00000113569 NUP155 ATFB15|N155 nucleoporin 155 protein-coding 259.999-4 chr17 79178417 79178725 + 1.33333 NA intron (NM_001350453, intron 3 of 13) MIR|SINE|MIR 103634 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 220.333-9 chr1 218343852 218344178 + 1.33333 NA TTS (NR_046268) TTS (NR_046268) -1269 NR_138148 7042 Hs.133379 NM_003238 ENSG00000092969 TGFB2 G-TSF|LDS4|TGF-beta2 transforming growth factor beta 2 protein-coding 152.333-306 chr5 90980070 90980226 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 84 of 89) intron (NR_003149, intron 84 of 89) 334254 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 252-53 chr2 205243261 205243485 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 15 of 21) MIR|SINE|MIR -439127 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 166-29 chr11 68091768 68091977 + 1.33333 NA intron (NM_001277, intron 2 of 11) intron (NM_001277, intron 2 of 11) 29516 NM_001277 1119 Hs.77221 NM_001277 ENSG00000110721 CHKA CHK|CK|CKI|EK choline kinase alpha protein-coding 207.666-64 chr8 80498440 80498649 + 1.33333 NA intron (NM_001105539, intron 1 of 5) intron (NM_001105539, intron 1 of 5) 12318 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 187.666-19 chr21 31128561 31128726 + 1.33333 NA intron (NM_001353684, intron 10 of 12) intron (NM_001353684, intron 10 of 12) 32297 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 208.333-115 chr5 32171918 32172184 + 1.33333 NA intron (NM_022130, intron 1 of 3) intron (NM_022130, intron 1 of 3) 2268 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 198-14 chr10 28117165 28117313 + 1.33333 NA intron (NR_134518, intron 10 of 16) intron (NR_134518, intron 10 of 16) -43861 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 320.333-15 chr2 138689979 138690245 + 1.33333 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) L2|LINE|L2 90278 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 197.333-138 chr21 31710743 31710968 + 1.33333 NA intron (NM_020706, intron 1 of 19) intron (NM_020706, intron 1 of 19) 21263 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 170-113 chr7 129073079 129073291 + 1.33333 NA Intergenic LTR45B|LTR|ERV1 17962 NR_002187 286016 Hs.369665 NR_002187 ENSG00000230359 TPI1P2 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 2 pseudo 537.333-2 chr12 24612950 24613484 + 1.33333 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -29049 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 235.333-73 chr3 96787636 96787921 + 1.33333 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -26816 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 228.333-92 chr7 89689462 89689678 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -429830 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 167.333-178 chr3 109206684 109206910 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 28632 NR_026767 677779 Hs.618669 NM_001040054 ENSG00000214381 LINC00488 C3orf66 long intergenic non-protein coding RNA 488 ncRNA 300.999 chr11 21238681 21239145 + 1.33333 NA intron (NM_201551, intron 14 of 18) MIR|SINE|MIR 569327 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 212.666-18 chr11 108870377 108870559 + 1.33333 NA intron (NM_004398, intron 16 of 17) L2a|LINE|L2 205399 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 335.333-27 chr2 216538384 216538781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39738 NM_000998 6168 Hs.433701 NM_000998 ENSG00000197756 RPL37A L37A ribosomal protein L37a protein-coding 222.667-24 chr14 39065497 39065794 + 1.33333 NA intron (NM_006364, intron 10 of 19) intron (NM_006364, intron 10 of 19) -37495 NR_146545 105370458 NR_146545 ENSG00000258651 SEC23A-AS1 - SEC23A antisense RNA 1 ncRNA 382.666-16 chr5 66488902 66489232 + 1.33333 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 22537 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 206.333-47 chr13 96514812 96515097 + 1.33333 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie 87725 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 221.666-26 chr2 62301693 62301975 + 1.33333 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 86313 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 248-42 chr2 181509481 181509823 + 1.33333 NA intron (NM_000885, intron 15 of 27) intron (NM_000885, intron 15 of 27) 52266 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 268.666-9 chr12 52398642 52398979 + 1.33333 NA intron (NM_033033, intron 5 of 8) intron (NM_033033, intron 5 of 8) 7582 NM_033033 3888 Hs.134640 NM_033033 ENSG00000161850 KRT82 HB2|Hb-2|KRTHB2 keratin 82 protein-coding 211.666-4 chr10 22000378 22000647 + 1.33333 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 3218 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 380-13 chr4 111981106 111981503 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -164150 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 251.333-72 chr22 29987306 29987580 + 1.33333 NA intron (NM_153051, intron 5 of 18) intron (NM_153051, intron 5 of 18) -19606 NR_106876 102466742 NR_106876 ENSG00000275818 MIR6818 hsa-mir-6818 microRNA 6818 ncRNA 256.333-39 chr2 21745132 21745462 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR -34645 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 274.666-14 chr15 65081798 65082105 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5135 NM_001101362 390594 Hs.586890 NM_001101362 ENSG00000234438 KBTBD13 HCG1645727|NEM6 kelch repeat and BTB domain containing 13 protein-coding 341.999-6 chr2 17802458 17802802 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13830 NM_001105569 343930 NM_001105569 ENSG00000151379 MSGN1 MSOG|pMsgn1 mesogenin 1 protein-coding 186.666-52 chr8 130065357 130065599 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 27 of 29) MER21A|LTR|ERVL 19290 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 189-93 chr8 105576423 105576627 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 256982 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 209.333-208 chr6 128973371 128973575 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 90332 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 199-126 chr9 32762610 32762850 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -20810 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 204-198 chr8 113475290 113475522 + 1.33333 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 -38467 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 215.666-21 chr18 6991908 6992176 + 1.33333 NA intron (NM_005559, intron 36 of 62) intron (NM_005559, intron 36 of 62) 37365 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 294.667-19 chr17 47199387 47199721 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -9508 NM_001002841 4635 Hs.463300 NM_002476 ENSG00000198336 MYL4 ALC1|AMLC|GT1|PRO1957 myosin light chain 4 protein-coding 297.333 chr1 39529767 39530058 + 1.33333 NA TTS (NM_181809) TTS (NM_181809) 15046 NR_132962 192217 Hs.472491 NR_132962 ENSG00000237624 OXCT2P1 OXCT2P 3-oxoacid CoA-transferase 2 pseudogene 1 pseudo 208-36 chr12 38594044 38594348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 277422 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 315-17 chr21 15303833 15304122 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -238977 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 244.333-40 chr14 92877773 92878057 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 29567 NR_135253 101929002 Hs.639356 NR_135253 ENSG00000258499 LINC02287 - long intergenic non-protein coding RNA 2287 ncRNA 187.333-214 chr9 88005981 88006155 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -31288 NM_012119 23552 Hs.522274 NM_012119 ENSG00000156345 CDK20 CCRK|CDCH|P42|PNQALRE cyclin dependent kinase 20 protein-coding 223.333-60 chr19 28995489 28995671 + 1.33333 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -6975 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 322.999-2 chr3 9693820 9694232 + 1.33333 NA intron (NM_001077526, intron 17 of 17) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -9807 NM_153635 151835 Hs.121335 NM_153635 ENSG00000144550 CPNE9 - copine family member 9 protein-coding 292-26 chr2 80890618 80890920 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 576177 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 197.333-22 chr10 82381656 82381833 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) MER94|DNA|hAT-Blackjack -148824 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 175.666-9 chr19 29471791 29471941 + 1.33333 NA intron (NR_040029, intron 1 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 53886 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 202.333-24 chr10 57227090 57227392 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 77318 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 283-26 chr3 197117042 197117319 + 1.33333 NA intron (NM_001366216, intron 11 of 23) L1MB4|LINE|L1 66692 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 210.666-97 chr7 79350114 79350297 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) -102752 NR_038346 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 279.333-36 chr18 71856270 71856556 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -74187 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 325.999-6 chr7 92746079 92746406 + 1.33333 NA intron (NM_001259, intron 3 of 7) L1ME3G|LINE|L1 87717 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 247.333-51 chr3 56929112 56929373 + 1.33333 NA intron (NM_001128615, intron 3 of 12) intron (NM_001128615, intron 3 of 12) -10798 NR_046572 100874200 Hs.549631 NR_046572 ENSG00000240198 ARHGEF3-AS1 - ARHGEF3 antisense RNA 1 ncRNA 318-47 chr5 53962943 53963407 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -11576 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 223.667-65 chr5 19275134 19275483 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 610964 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 161.333-301 chr9 110410040 110410221 + 1.33333 NA intron (NM_153366, intron 37 of 47) intron (NM_153366, intron 37 of 47) -72246 NM_001286947 255220 Hs.147064 NM_001003936 ENSG00000204193 TXNDC8 SPTRX-3|SPTRX3|TRX6|bA427L11.2 thioredoxin domain containing 8 protein-coding 207-62 chr2 50695249 50695503 + 1.33333 NA TTS (NR_130470) TTS (NR_130470) 886 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 181-40 chr2 112172259 112172417 + 1.33333 NA intron (NM_001128165, intron 3 of 6) intron (NM_001128165, intron 3 of 6) 33953 NM_001128165 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 343.333-32 chr7 4665109 4665578 + 1.33333 NA Intergenic (ATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -16952 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 201.333-155 chr2 150399395 150399637 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 88179 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 202-178 chr7 144077780 144078062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 3701 NM_001004488 392138 Hs.553787 NM_001004488 ENSG00000221933 OR2A25 OR2A24P|OR2A25P|OR2A27 olfactory receptor family 2 subfamily A member 25 protein-coding 200.333-125 chr5 121133112 121133264 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -189362 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 276-18 chr14 45194490 45194773 + 1.33333 NA intron (NM_001308133, intron 19 of 21) L1MC5|LINE|L1 58571 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 275.333-56 chr5 75728466 75728933 + 1.33333 NA intron (NR_149046, intron 2 of 2) intron (NR_149046, intron 2 of 2) -11262 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 240-48 chr2 121921899 121922321 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 166459 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 172-104 chr7 53635855 53636042 + 1.33333 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 175983 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 258-67 chr5 95490825 95491126 + 1.33333 NA exon (NM_014639, exon 37 of 43) exon (NM_014639, exon 37 of 43) 64030 NM_014639 9652 Hs.482868 NM_014639 ENSG00000198677 TTC37 KIAA0372|Ski3|THES tetratricopeptide repeat domain 37 protein-coding 201-44 chr16 66832551 66832835 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1717 NM_003905 8883 Hs.460978 NM_003905 ENSG00000159593 NAE1 A-116A10.1|APPBP1|HPP1|ula-1 NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1 protein-coding 205.333-250 chr8 121588296 121588479 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50959 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 280-32 chr3 5886290 5886605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -636192 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 298.666-18 chr7 26923521 26923854 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -59097 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 195-111 chr8 118897081 118897258 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 54716 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 240-2 chr1 52608740 52608973 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_015696, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_015696, exon 3 of 3) 6485 NM_015696 2882 Hs.43728 NM_015696 ENSG00000116157 GPX7 CL683|GPX6|GPx-7|GSHPx-7|NPGPx glutathione peroxidase 7 protein-coding 353.333-18 chr2 9526581 9526928 + 1.33333 NA intron (NM_003183, intron 5 of 18) AluSq2|SINE|Alu 29076 NM_003183 6868 Hs.404914 NM_003183 ENSG00000151694 ADAM17 ADAM18|CD156B|CSVP|NISBD|NISBD1|TACE ADAM metallopeptidase domain 17 protein-coding 202.666-56 chr18 57505872 57506086 + 1.33333 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner 70605 NM_004852 9480 Hs.194725 NM_004852 ENSG00000119547 ONECUT2 OC-2|OC2 one cut homeobox 2 protein-coding 174.666-18 chr5 158406399 158406572 + 1.33333 NA intron (NR_109888, intron 1 of 6) intron (NR_109888, intron 1 of 6) 3288 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 251.333-32 chr14 45936883 45937145 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -127145 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 305.333-63 chr6 51759943 51760375 + 1.33333 NA intron (NM_138694, intron 55 of 66) intron (NM_138694, intron 55 of 66) 138289 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 383.333 chr1 209521590 209521921 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -61959 NM_020439 57172 Hs.199068 NM_020439 ENSG00000008118 CAMK1G CLICK3|CLICKIII|VWS1|dJ272L16.1 calcium/calmodulin dependent protein kinase IG protein-coding 174-31 chr14 54611396 54611611 + 1.33333 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 43891 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 185-34 chr2 68288238 68288468 + 1.33333 NA intron (NM_001111101, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 31698 NM_001111101 25927 Hs.212885 NM_015463 ENSG00000119865 CNRIP1 C2orf32|CRIP1 cannabinoid receptor interacting protein 1 protein-coding 231.333-82 chr4 142545407 142545679 + 1.33333 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) intron (NM_003866, intron 2 of 26) 300992 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 254.333-37 chr2 24640793 24641230 + 1.33333 NA intron (NM_001362950, intron 3 of 23) L1M4a1|LINE|L1 56534 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 350.333-6 chr14 72450455 72450863 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -66161 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 210.666-31 chr14 62019082 62019260 + 1.33333 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) intron (NM_001367661, intron 4 of 8) 91476 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 256.333-11 chr10 29198842 29199153 + 1.33333 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -90073 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 206.666-35 chr13 71725734 71725952 + 1.33333 NA intron (NM_080759, intron 1 of 10) intron (NM_080759, intron 1 of 10) 141349 NM_004392 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 361-5 chr11 73556669 73557162 + 1.33333 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) AluSz6|SINE|Alu 41197 NM_015159 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 499.333-5 chr3 99084105 99084698 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -182706 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 259.667-78 chr7 81648221 81648663 + 1.33333 NA intron (NR_126025, intron 1 of 10) intron (NR_126025, intron 1 of 10) -22226 NR_126026 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 189.333-169 chr6 56380753 56380966 + 1.33333 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 13269 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 207.666-68 chr9 21558614 21558840 + 1.33333 NA intron (NR_152877, intron 1 of 3) intron (NR_152877, intron 1 of 3) 1071 NR_152878 554202 Hs.458096 NR_027054 MIR31HG LncHIFCAR|hsa-lnc-31 MIR31 host gene ncRNA 286.333-39 chr6 140635574 140635958 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48048 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 449.666 chr3 118660177 118660822 + 1.33333 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 18731 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 427.666 chr8 64146714 64147133 + 1.33333 NA intron (NR_125826, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 221635 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 181.333-67 chr19 17148021 17148232 + 1.33333 NA intron (NM_001130065, intron 3 of 39) intron (NM_001130065, intron 3 of 39) 55891 NR_145784 109623483 NR_145784 SNORA118 - small nucleolar RNA, H/ACA box 118 snoRNA 256-73 chr5 8053477 8053811 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184496 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 199.333-269 chr8 38310481 38310639 + 1.33333 NA intron (NM_023034, intron 12 of 23) AluJb|SINE|Alu -41328 NM_001354454 84513 Hs.567619 NM_032483 ENSG00000147535 PLPP5 DPPL1|HTPAP|PPAPDC1B phospholipid phosphatase 5 protein-coding 204.667-35 chr12 75135549 75135832 + 1.33333 NA intron (NM_001260499, intron 2 of 3) intron (NM_001260499, intron 2 of 3) 74058 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 268-6 chr10 29134983 29135365 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -153896 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 243.667-26 chr15 56194611 56195005 + 1.33333 NA intron (NM_001370561, intron 4 of 11) L1MB5|LINE|L1 -4876 NM_001370554 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 199.333-22 chr10 30571027 30571224 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 58628 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 148.333-5 chr1 56240881 56241034 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -174006 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 207.333-142 chr2 160027364 160027563 + 1.33333 NA intron (NM_001007267, intron 6 of 26) intron (NM_001007267, intron 6 of 26) 35152 NM_001195641 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 182.667-17 chr10 55414147 55414397 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -184770 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 232.667 chr1 73559709 73560025 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -114812 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 243.999-6 chr5 138614548 138614755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39250 NM_004134 3313 Hs.184233 NM_004134 ENSG00000113013 HSPA9 CRP40|CSA|EVPLS|GRP-75|GRP75|HEL-S-124m|HSPA9B|MOT|MOT2|MTHSP75|PBP74|SAAN|SIDBA4 heat shock protein family A (Hsp70) member 9 protein-coding 273.333-33 chr2 67678670 67678937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 146759 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 226.666-9 chr13 33271670 33271992 + 1.33333 NA intron (NM_001243476, intron 5 of 17) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -5723 NR_046693 100874241 Hs.662433 NR_046693 ENSG00000236581 STARD13-AS STARD13-AS2 STARD13 antisense RNA ncRNA 178.666-19 chr6 46499165 46499341 + 1.33333 NA intron (NR_125837, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR -7186 NM_001251973 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 293.333-11 chr13 97971542 97971826 + 1.33333 NA intron (NM_002271, intron 3 of 28) FLAM_C|SINE|Alu 18009 NM_002271 3843 Hs.712598 NM_002271 ENSG00000065150 IPO5 IMB3|KPNB3|Pse1|RANBP5|imp5 importin 5 protein-coding 203.333-35 chr10 82970162 82970331 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 8 of 10) intron (NR_163253, intron 8 of 10) 706843 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 198.333-165 chr5 83456324 83456474 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -15275 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 308-56 chr8 88427247 88427640 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -99960 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 276-54 chr5 146495571 146495987 + 1.33333 NA intron (NM_006706, intron 15 of 21) intron (NM_006706, intron 15 of 21) 20334 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 339.666-4 chr12 23118471 23118863 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -56969 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 200-119 chr4 118147516 118147706 + 1.33333 NA intron (NM_004784, intron 6 of 13) intron (NM_004784, intron 6 of 13) 113125 NM_004784 9348 Hs.480596 NM_004784 ENSG00000164100 NDST3 HSST3 N-deacetylase and N-sulfotransferase 3 protein-coding 285.667-19 chr2 10745789 10746273 + 1.33333 NA intron (NM_001039362, intron 3 of 13) L1MB3|LINE|L1 24401 NM_144583 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 199.333-300 chr9 86954318 86954615 + 1.33333 NA intron (NR_049794, intron 2 of 6) AluSx1|SINE|Alu 5768 NR_049794 100506834 Hs.553987 NR_049794 ENSG00000226237 GAS1RR LncRNA-Hh GAS1 adjacent regulatory RNA ncRNA 203.333-239 chr7 4558238 4558424 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -123964 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 230.666-38 chr3 104664558 104664736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -702066 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 168-40 chr16 77421675 77421868 + 1.33333 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) intron (NM_199355, intron 3 of 22) 13263 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 193-25 chr15 86598248 86598479 + 1.33333 NA intron (NM_152336, intron 22 of 24) MER89-int|LTR|ERV1 -281395 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 353-4 chr14 48106648 48107111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -311865 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 199.666-28 chr2 239428430 239428613 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26773 NR_135577 101928111 Hs.534680 NR_135575 ENSG00000222020 HDAC4-AS1 - HDAC4 antisense RNA 1 ncRNA 181.333-88 chr2 223285877 223286042 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 234029 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 211.333-35 chr11 40448027 40448316 + 1.33333 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -155041 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 188.333-163 chr9 12881119 12881366 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66853 NR_125775 101929467 Hs.586443 NR_125775 ENSG00000235448 LURAP1L-AS1 - LURAP1L antisense RNA 1 ncRNA 172.667-5 chr1 45423547 45423764 + 1.33333 NA intron (NM_001320800, intron 1 of 9) intron (NM_001320800, intron 1 of 9) 67508 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 323.333-32 chr8 83519457 83519875 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 115908 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 248.999-6 chr6 113941211 113941486 + 1.33333 NA intron (NM_001527, intron 13 of 13) intron (NM_001527, intron 13 of 13) -28353 NR_125845 101927768 Hs.129280 NR_125845 ENSG00000228624 HDAC2-AS2 - HDAC2 and HS3ST5 antisense RNA 2 ncRNA 278-54 chr7 7740094 7740522 + 1.33333 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -21701 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 215.666-4 chr1 224893931 224894095 + 1.33333 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 -35641 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 188.667-102 chr3 73535866 73536123 + 1.33333 NA intron (NR_121660, intron 1 of 1) intron (NR_121660, intron 1 of 1) 14672 NR_121660 101927296 Hs.662049 NR_121660 LOC101927296 - uncharacterized LOC101927296 ncRNA 213.333-105 chr2 159024086 159024249 + 1.33333 NA intron (NM_001350063, intron 2 of 24) L1MA9|LINE|L1 55527 NR_146421 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 160-72 chr22 29913422 29913572 + 1.33333 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) intron (NM_153051, intron 1 of 18) 30323 NM_021090 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 222-102 chr9 16827884 16828062 + 1.33333 NA intron (NM_017637, intron 1 of 6) intron (NM_017637, intron 1 of 6) 42697 NM_017637 54796 Hs.656581 NM_017637 ENSG00000173068 BNC2 BSN2 basonuclin 2 protein-coding 274.999-6 chr6 113928661 113929023 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 24455 NR_027060 285759 Hs.376634 NM_173673 ENSG00000175967 FLJ34503 - uncharacterized FLJ34503 ncRNA 186.666-21 chr14 72509627 72509767 + 1.33333 NA intron (NM_001370280, intron 13 of 17) intron (NM_001370280, intron 13 of 17) -7123 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 206-112 chr3 95728966 95729262 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -45921 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 158.666-7 chr11 27344627 27344777 + 1.33333 NA intron (NM_030771, intron 3 of 5) L1ME1|LINE|L1 18513 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 200.333-107 chr4 97895305 97895483 + 1.33333 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) intron (NM_174952, intron 8 of 10) 248082 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 206-187 chr8 121426808 121427041 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -212422 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 196.667-110 chr4 95967889 95968139 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 127921 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 184.667-27 chr13 70917078 70917341 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -97932 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 262-29 chr16 68937468 68937807 + 1.33333 NA intron (NM_024562, intron 14 of 17) L1MB7|LINE|L1 94106 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 377.333-5 chr16 6349178 6349685 + 1.33333 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) 329728 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 217-23 chr14 87963762 87964053 + 1.33333 NA intron (NM_000153, intron 9 of 16) intron (NM_000153, intron 9 of 16) 29275 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 262-15 chr13 94942722 94942961 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -17200 NR_047487 100861544 Hs.48706 NR_047487 ENSG00000260962 LINC00557 - long intergenic non-protein coding RNA 557 ncRNA 321.666-4 chr14 73671216 73671537 + 1.33333 NA intron (NM_001201366, intron 5 of 8) intron (NM_001201366, intron 5 of 8) 26390 NM_031427 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 201.333-168 chr20 3485148 3485371 + 1.33333 NA intron (NM_001323332, intron 1 of 25) L1ME3C|LINE|L1 14241 NM_001207047 8455 Hs.276252 NM_012070 ENSG00000088812 ATRN DPPT-L|MGCA attractin protein-coding 305.666-4 chr10 51036580 51037086 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) MIR|SINE|MIR 31719 NR_120678 102724719 NR_120678 ENSG00000223502 LOC102724719 - uncharacterized LOC102724719 ncRNA 225.666-3 chr10 121651974 121652229 + 1.33333 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -53643 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 308-20 chr17 56994656 56994978 + 1.33333 NA intron (NM_021626, intron 6 of 12) intron (NM_021626, intron 6 of 12) 16710 NM_021626 59342 Hs.514950 NM_021626 ENSG00000121064 SCPEP1 HSCP1|RISC serine carboxypeptidase 1 protein-coding 194-133 chr7 92068662 92068876 + 1.33333 NA intron (NM_147185, intron 26 of 49) intron (NM_147185, intron 26 of 49) 65708 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 253.333-46 chr18 9665051 9665332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43110 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 199.333-127 chr2 66387693 66387988 + 1.33333 NA intron (NR_130931, intron 1 of 2) MER113|DNA|hAT-Charlie 4534 NR_130931 729348 Hs.723595 NR_130931 ENSG00000232164 LINC01873 - long intergenic non-protein coding RNA 1873 ncRNA 302-64 chr7 24874976 24875442 + 1.33333 NA intron (NR_104111, intron 1 of 21) MER20B|DNA|hAT-Charlie 17412 NM_145320 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 265-68 chr9 25874674 25875119 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 94840 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 247-61 chr5 38664113 38664564 + 1.33333 NA intron (NR_103554, intron 8 of 8) AluSq2|SINE|Alu 55935 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 177-29 chr16 13760331 13760574 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -159705 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 193-47 chr2 75509148 75509434 + 1.33333 NA intron (NM_032181, intron 3 of 3) intron (NM_032181, intron 3 of 3) -14777 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 225-47 chr4 107050517 107050715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14303 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 222.666 chr1 41368935 41369209 + 1.33333 NA intron (NM_001291281, intron 1 of 2) intron (NM_001291281, intron 1 of 2) 6597 NR_135817 101929901 NR_135817 ENSG00000229901 LOC101929901 - uncharacterized LOC101929901 ncRNA 224-9 chr10 30917122 30917364 + 1.33333 NA intron (NM_182755, intron 3 of 7) L1ME2z|LINE|L1 82274 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 228.667-5 chr1 80008299 80008613 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -527299 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 154.667-370 chr7 93899545 93899729 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6930 NM_021955 2792 Hs.732212 NM_021955 ENSG00000127928 GNGT1 GNG1 G protein subunit gamma transducin 1 protein-coding 118-101 chr5 10388049 10388213 + 1.33333 NA intron (NM_001270660, intron 4 of 24) intron (NM_001270660, intron 4 of 24) -14233 NR_162106 113218502 NR_162106 MIR10397 - microRNA 10397 ncRNA 244.999-3 chr2 137567437 137567748 + 1.33333 NA intron (NM_001316349, intron 16 of 27) L2a|LINE|L2 360340 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 158.333-10 chr1 79154826 79154998 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -148182 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 284.667-54 chr8 81236595 81236943 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -43767 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 347-14 chr18 2223251 2223774 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 347993 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 312.333-21 chr4 182334658 182334970 + 1.33333 NA intron (NM_001080477, intron 2 of 27) L1M5|LINE|L1 91412 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 301.666 chr1 15193761 15194195 + 1.33333 NA intron (NR_135082, intron 1 of 2) intron (NR_135082, intron 1 of 2) -22354 NM_001278502 727684 Hs.667584 NM_001278501 C1orf195 - chromosome 1 open reading frame 195 protein-coding 197-112 chr7 55528093 55528278 + 1.33333 NA intron (NM_030796, intron 1 of 4) L1MC5|LINE|L1 -1305 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 427.333 chr15 71715804 71716359 + 1.33333 NA intron (NM_001286429, intron 2 of 11) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -24542 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 343.666-7 chr6 53707610 53708107 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42102 NM_001003760 401265 Hs.131064 NM_001003760 ENSG00000124743 KLHL31 BKLHD6|KBTBD1|KLHL|bA345L23.2 kelch like family member 31 protein-coding 208.666-75 chr3 153180549 153180741 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 18419 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 201.333-294 chr8 140807447 140807697 + 1.33333 NA intron (NR_148037, intron 11 of 34) MER33|DNA|hAT-Charlie -74919 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 280.666-22 chr5 17195255 17195587 + 1.33333 NA intron (NR_027253, intron 1 of 2) intron (NR_027253, intron 1 of 2) -21402 NM_001271606 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 177.667-110 chr5 55411332 55411533 + 1.33333 NA intron (NM_015360, intron 23 of 26) intron (NM_015360, intron 23 of 26) 97494 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 222.666-21 chr19 29614994 29615175 + 1.33333 NA intron (NR_027368, intron 5 of 5) intron (NR_027368, intron 5 of 5) 8801 NR_027368 10775 Hs.412870 NM_006627 ENSG00000105171 POP4 RPP29 POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 232.666-10 chr13 49532013 49532425 + 1.33333 NA non-coding (NR_148015, exon 14 of 14) non-coding (NR_148015, exon 14 of 14) 35163 NM_001040444 51131 Hs.369039 NM_001040443 ENSG00000136147 PHF11 APY|BCAP|IGEL|IGER|IGHER|NY-REN-34|NYREN34 PHD finger protein 11 protein-coding 167.333-79 chr14 53795303 53795523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 153071 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 212.333-130 chr6 141812819 141813188 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 275796 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 170.333-219 chr8 101417224 101417420 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 48429 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 262.666-3 chr11 63897670 63898098 + 1.33333 NA intron (NM_001163296, intron 3 of 16) intron (NM_001163296, intron 3 of 16) 9347 NM_017490 2011 Hs.567261 NM_004954 ENSG00000072518 MARK2 EMK-1|EMK1|PAR-1|Par-1b|Par1b microtubule affinity regulating kinase 2 protein-coding 193-8 chr1 183562857 183563045 + 1.33333 NA intron (NM_001190794, intron 12 of 13) intron (NM_001190794, intron 12 of 13) 27653 NM_000433 4688 Hs.587558 NM_000433 ENSG00000116701 NCF2 NCF-2|NOXA2|P67-PHOX|P67PHOX neutrophil cytosolic factor 2 protein-coding 200-170 chr8 119402372 119402569 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13976 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 200.666-97 chr5 37360931 37361082 + 1.33333 NA intron (NM_001278312, intron 3 of 33) AluSx4|SINE|Alu 10100 NM_001278312 9631 Hs.547696 NM_004298 ENSG00000113569 NUP155 ATFB15|N155 nucleoporin 155 protein-coding 201.333-255 chr7 10185269 10185544 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -517270 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 174.666 chr1 16312055 16312238 + 1.33333 NA intron (NM_018994, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu 40334 NM_018994 54455 Hs.522384 NM_018994 ENSG00000037637 FBXO42 Fbx42|JFK F-box protein 42 protein-coding 255.333-15 chr11 70382306 70382550 + 1.33333 NA intron (NR_045286, intron 28 of 28) intron (NR_045286, intron 28 of 28) -16078 NM_138565 2017 Hs.596164 NM_005231 ENSG00000085733 CTTN EMS1 cortactin protein-coding 286.333-20 chr2 78663583 78663971 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 118246 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 207-49 chr17 17435516 17435681 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41402 NM_018019 55090 Hs.244595 NM_018019 ENSG00000141026 MED9 MED25 mediator complex subunit 9 protein-coding 248.999-7 chr7 22321412 22321612 + 1.33333 NA intron (NM_012294, intron 1 of 25) intron (NM_012294, intron 1 of 25) 35642 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 209.666-15 chr11 108893665 108893878 + 1.33333 NA intron (NM_004398, intron 16 of 17) intron (NM_004398, intron 16 of 17) 228702 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 257-50 chr4 172131506 172131915 + 1.33333 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) intron (NM_001034845, intron 2 of 12) -318103 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 191.333-27 chr10 73169477 73169624 + 1.33333 NA intron (NM_173348, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 1431 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 273.666-23 chr5 117052370 117052592 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -290272 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 207.667-109 chr6 165114664 165114967 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 194790 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 354.666-19 chr7 88954235 88954531 + 1.33333 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -158646 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 222.333-74 chr5 93576035 93576239 + 1.33333 NA intron (NR_109818, intron 1 of 6) intron (NR_109818, intron 1 of 6) -4794 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 248.666-9 chr11 35505841 35506068 + 1.33333 NA intron (NM_015430, intron 1 of 11) L1MA4|LINE|L1 19662 NM_015430 25891 Hs.55044 NM_015430 ENSG00000149090 PAMR1 DKFZP586H2123|FP938|RAMP peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1 protein-coding 469-3 chr15 58554050 58554708 + 1.33333 NA intron (NM_000236, intron 6 of 8) intron (NM_000236, intron 6 of 8) -55644 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 349.999-7 chr5 123565819 123566277 + 1.33333 NA intron (NM_001044723, intron 3 of 12) intron (NM_001044723, intron 3 of 12) 20631 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 321.667-2 chr11 29042925 29043437 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -551232 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 216.333-33 chr11 108142655 108142888 + 1.33333 NA intron (NM_000019, intron 9 of 11) AluJo|SINE|Alu 21204 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 218-109 chr8 47944913 47945172 + 1.33333 NA intron (NM_001081640, intron 7 of 84) L2b|LINE|L2 15094 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 211-75 chr4 105745400 105745626 + 1.33333 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) intron (NM_001370181, intron 5 of 11) 34700 NM_001031720 79807 Hs.161429 NM_024751 ENSG00000138780 GSTCD - glutathione S-transferase C-terminal domain containing protein-coding 201.333-209 chr4 61910488 61910667 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 12 of 23) intron (NM_001371343, intron 12 of 23) 251188 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-194 chr4 36113596 36113791 + 1.33333 NA intron (NR_146894, intron 26 of 32) intron (NR_146894, intron 26 of 32) 130246 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 220-100 chr6 11326465 11326739 + 1.33333 NA intron (NR_073131, intron 1 of 9) intron (NR_073131, intron 1 of 9) 55746 NM_001142393 4739 Hs.37982 NM_006403 ENSG00000111859 NEDD9 CAS-L|CAS2|CASL|CASS2|HEF1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 protein-coding 402.667-5 chr21 31673465 31673976 + 1.33333 NA intron (NM_020706, intron 19 of 19) intron (NM_020706, intron 19 of 19) 14098 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 354.333-22 chr9 26506984 26507305 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 385658 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 274-18 chr15 25323095 25323721 + 1.33333 NA intron (NR_146177, intron 146 of 147) intron (NR_146177, intron 146 of 147) 45065 NR_001295 338428 NR_001295 ENSG00000274640 SNORD109A HBII-438A small nucleolar RNA, C/D box 109A snoRNA 154-142 chr8 119318131 119318350 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6931 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 191-64 chr7 68762596 68762830 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 742460 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 288.666-31 chr5 83666952 83667262 + 1.33333 NA intron (NM_001884, intron 2 of 4) L2b|LINE|L2 53748 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 219.333-143 chr5 53376990 53377217 + 1.33333 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -103526 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 210.333-44 chr14 42845285 42845513 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 1238543 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 212.333-40 chr14 34120884 34121088 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -169912 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 229.666-5 chr11 70014436 70014623 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 49395 NR_120530 101928443 Hs.313468 NR_120529 ENSG00000248844 LINC02753 - long intergenic non-protein coding RNA 2753 ncRNA 194.667-167 chrX 42949765 42950047 + 1.33333 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -171743 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 225.999 chr11 43081524 43081706 + 1.33333 NA Intergenic (ATTCTGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 187754 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 195.333-61 chr12 66252172 66252356 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001142523, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001142523, exon 11 of 11) 1182 NR_106757 102465249 NR_106757 ENSG00000284011 MIR6502 hsa-mir-6502 microRNA 6502 ncRNA 224.666-24 chr3 61937337 61937591 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 375893 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 224.333-74 chr21 28068486 28068657 + 1.33333 NA intron (NR_126010, intron 1 of 4) LTR78B|LTR|ERV1 20157 NR_126010 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 282.333-40 chr4 71845849 71846199 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -40504 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 223.333-140 chr6 19571545 19571776 + 1.33333 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 121839 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 269.333-60 chr3 87477472 87477820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -201062 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 196-109 chr22 31779810 31780015 + 1.33333 NA intron (NR_146296, intron 8 of 42) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 25889 NM_001369901 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 203-93 chr6 28054689 28054980 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18482 NM_001355425 442179 NM_001355425 OR1F12 OR1F12P|OR1F12Q|OR6-12|hs6M1-35P olfactory receptor family 1 subfamily F member 12 protein-coding 164.667-48 chr12 19613811 19614031 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 173322 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 192-141 chr7 93624677 93624823 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -50020 NM_001164737 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 247.999-4 chr16 8719153 8719351 + 1.33333 NA intron (NM_000663, intron 1 of 15) intron (NM_000663, intron 1 of 15) -1461 NM_001127448 18 Hs.336768 NM_000663 ENSG00000183044 ABAT GABA-AT|GABAT|NPD009 4-aminobutyrate aminotransferase protein-coding 127-74 chr5 135119754 135119970 + 1.33333 NA intron (NR_161235, intron 2 of 5) intron (NR_161235, intron 2 of 5) -79815 NR_105049 101927953 Hs.436898 NR_105049 ENSG00000249082 C5orf66-AS1 Epist C5orf66 antisense RNA 1 ncRNA 220-128 chr9 74115378 74115563 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -256061 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 230-16 chr12 116772662 116772904 + 1.33333 NA intron (NM_001109903, intron 6 of 11) intron (NM_001109903, intron 6 of 11) 34468 NM_032814 84900 Hs.437195 NM_032814 ENSG00000135119 RNFT2 TMEM118 ring finger protein, transmembrane 2 protein-coding 219.999-3 chr17 51523691 51523858 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 88347 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 312-22 chr17 81604131 81604421 + 1.33333 NA intron (NM_001369698, intron 8 of 16) L1MC5|LINE|L1 -26843 NR_130139 55666 Hs.464333 NM_017921 ENSG00000182446 NPLOC4 NPL4 NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor protein-coding 192.333-56 chr15 53929289 53929510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49042 NM_001329919 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 318-52 chr8 32521168 32521649 + 1.33333 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) MIR1_Amn|SINE|MIR -26802 NM_013958 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 254.333-23 chr15 26431045 26431295 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 197920 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 201.666-17 chr15 68758232 68758418 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 43600 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 316.666-2 chr1 162560364 162560681 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001324115) promoter-TSS (NM_001324115) -918 NM_001324116 6675 Hs.492859 NM_003115 ENSG00000117143 UAP1 AGX|AGX1|AGX2|SPAG2 UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 protein-coding 208.666-115 chr9 91791048 91791208 + 1.33333 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -154783 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 182.667-132 chr5 61013795 61013986 + 1.33333 NA intron (NM_174889, intron 1 of 3) intron (NM_174889, intron 1 of 3) 68685 NM_174889 91942 Hs.591757 NM_174889 ENSG00000164182 NDUFAF2 B17.2L|MC1DN10|MMTN|NDUFA12L|mimitin NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 protein-coding 301.333-43 chr5 83008055 83008389 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 56115 NR_003139 677765 Hs.693283 NR_003139 ENSG00000238835 SCARNA18 SCARNA18A|U109 small Cajal body-specific RNA 18 ncRNA 255.333-44 chr17 48200561 48200872 + 1.33333 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -44205 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 156-19 chr10 52333620 52333809 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19433 NM_012242 22943 Hs.40499 NM_012242 ENSG00000107984 DKK1 DKK-1|SK dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 1 protein-coding 232.666-46 chr6 133041904 133042171 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46043 NR_026969 285735 Hs.407549 NM_001037231 LINC00326 NCRNA00326 long intergenic non-protein coding RNA 326 ncRNA 197.333-177 chr5 19597127 19597306 + 1.33333 NA intron (NM_001349559, intron 6 of 12) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 289056 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 222.666-33 chr3 134132220 134132405 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -74664 NR_135574 100507210 Hs.669052 NR_135574 ENSG00000243832 LINC02000 - long intergenic non-protein coding RNA 2000 ncRNA 251.666-18 chr22 40704534 40704749 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25463 NM_005297 2847 Hs.248122 NM_005297 ENSG00000128285 MCHR1 GPR24|MCH-1R|MCH1R|SLC-1|SLC1 melanin concentrating hormone receptor 1 protein-coding 234.666-20 chr18 32954604 32954783 + 1.33333 NA intron (NM_001308126, intron 23 of 23) intron (NM_001308126, intron 23 of 23) -181670 NM_020805 57565 Hs.446164 NM_020805 ENSG00000197705 KLHL14 - kelch like family member 14 protein-coding 148-35 chr12 93229366 93229594 + 1.33333 NA intron (NR_040096, intron 2 of 4) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 55114 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 385.666-6 chr3 105444432 105444991 + 1.33333 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 77802 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 259-23 chr19 47368528 47368866 + 1.33333 NA intron (NM_014681, intron 7 of 16) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19382 NM_014681 9704 Hs.151706 NM_014681 ENSG00000134815 DHX34 DDX34|HRH1 DExH-box helicase 34 protein-coding 200-133 chr5 106495566 106495766 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 515348 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 222.666-41 chr4 138250203 138250495 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -8000 NM_014331 23657 Hs.390594 NM_014331 ENSG00000151012 SLC7A11 CCBR1|xCT solute carrier family 7 member 11 protein-coding 341.666-8 chr3 121417045 121417604 + 1.33333 NA intron (NM_001348343, intron 26 of 27) L1MB7|LINE|L1 128664 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 139.333-44 chr11 124504308 124504606 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 39197 NM_001005195 219858 Hs.553634 NM_001005195 ENSG00000170953 OR8B12 OR11-317 olfactory receptor family 8 subfamily B member 12 protein-coding 233.333-120 chr7 35785820 35786125 + 1.33333 NA intron (NR_120511, intron 2 of 5) AluSg4|SINE|Alu 14653 NR_120512 101928545 Hs.648103 NR_120511 SEPTIN7-AS1 SEPT7-AS1 SEPT7 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 184.333-127 chr6 53593746 53593972 + 1.33333 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 -20584 NR_110840 101927136 Hs.509788 NR_110840 ENSG00000231683 LOC101927136 - uncharacterized LOC101927136 ncRNA 209.333-128 chr2 217394765 217395029 + 1.33333 NA intron (NR_026597, intron 8 of 12) MIRb|SINE|MIR 112164 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 318.666-5 chr12 57828069 57828635 + 1.33333 NA intron (NM_005730, intron 2 of 7) AluSp|SINE|Alu -3660 NR_029847 407016 NR_029847 ENSG00000207789 MIR26A2 MIRN26A2|mir-26a-2 microRNA 26a-2 ncRNA 260-4 chr1 179189372 179189693 + 1.33333 NA intron (NM_007314, intron 1 of 11) intron (NM_007314, intron 1 of 11) 40145 NM_007314 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 194.667-150 chr8 71649018 71649293 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101061 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 122.333-20 chr10 48515314 48515486 + 1.33333 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) L1MB7|LINE|L1 -3811 NR_146782 100689073 Hs.667964 NR_146782 ARHGAP22-IT1 - ARHGAP22 intronic transcript 1 ncRNA 254-7 chr10 16139018 16139453 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -278702 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 210-158 chr9 111922633 111922926 + 1.33333 NA intron (NM_003358, intron 2 of 8) intron (NM_003358, intron 2 of 8) -9321 NR_039814 100616114 NR_039814 ENSG00000266315 MIR4668 mir-4668 microRNA 4668 ncRNA 206-50 chr14 36566245 36566492 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 16246 NM_014360 26257 Hs.234763 NM_014360 ENSG00000136327 NKX2-8 NKX2.8|NKX2H|Nkx2-9 NK2 homeobox 8 protein-coding 199.333-239 chr6 35375884 35376077 + 1.33333 NA intron (NM_001171819, intron 2 of 6) intron (NM_001171819, intron 2 of 6) 33422 NM_006238 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 294.666 chr1 187048766 187049102 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43908 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 328-6 chr10 117726970 117727416 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -182125 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 165.666-5 chr7 54732291 54732490 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26821 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 234-11 chr11 55607416 55607669 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3144 NM_001004700 219429 Hs.553620 NM_001004700 ENSG00000172188 OR4C11 OR11-136|OR4C11P olfactory receptor family 4 subfamily C member 11 protein-coding 207.333-115 chr17 53983717 53983896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 160879 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 223.333-33 chr12 43834124 43834426 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1586 NM_001286212 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 200.333-23 chr11 94320789 94321015 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 15265 NM_001199206 390243 Hs.553758 NM_001080486 ENSG00000183560 IZUMO1R FOLR4|Folbp3|JUNO IZUMO1 receptor, JUNO protein-coding 308.666-2 chr1 113435030 113435363 + 1.33333 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) MIR|SINE|MIR 44681 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 223-61 chr7 82420318 82420620 + 1.33333 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) intron (NM_000722, intron 1 of 38) 23308 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 115.333-20 chr1 229191551 229191686 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -16817 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 227.333-54 chr18 31138752 31138990 + 1.33333 NA intron (NM_024421, intron 11 of 15) intron (NM_024421, intron 11 of 15) 23985 NM_024421 1823 Hs.567260 NM_004948 ENSG00000134765 DSC1 CDHF1|DG2/DG3 desmocollin 1 protein-coding 186-60 chr22 47673509 47673701 + 1.33333 NA intron (NR_122046, intron 2 of 8) LTR33B|LTR|ERVL 41931 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 217.666-34 chr6 169560446 169560646 + 1.33333 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) intron (NR_146875, intron 19 of 20) 141483 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 237.333-86 chr5 11386188 11386453 + 1.33333 NA intron (NM_001288715, intron 5 of 20) intron (NM_001288715, intron 5 of 20) 202597 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 238-61 chr3 120035835 120036203 + 1.33333 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) L1MB8|LINE|L1 48629 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 228-24 chr12 114459145 114459525 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50893 NM_000192 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 208.667-6 chr1 88063644 88063942 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -620351 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 329.333-31 chr22 25639316 25639641 + 1.33333 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) L1ME2|LINE|L1 74803 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 379.666-13 chr7 51115585 51116116 + 1.33333 NA intron (NM_015198, intron 6 of 12) L1MEf|LINE|L1 200959 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 213.666-36 chr5 39342588 39342778 + 1.33333 NA intron (NM_001737, intron 1 of 10) intron (NM_001737, intron 1 of 10) 21812 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 187.666-10 chr16 78294510 78294744 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) L2b|LINE|L2 194973 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 219-21 chr14 40137514 40137685 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -705099 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 161-105 chr9 6632195 6632450 + 1.33333 NA intron (NM_000170, intron 2 of 24) intron (NM_000170, intron 2 of 24) 13370 NM_000170 2731 Hs.584238 NM_000170 ENSG00000178445 GLDC GCE|GCSP|HYGN1 glycine decarboxylase protein-coding 324.666-11 chr3 86616544 86616818 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 134738 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 206.333-64 chr16 69029206 69029435 + 1.33333 NA intron (NM_024562, intron 16 of 17) MIRc|SINE|MIR -76333 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 200-104 chr3 69893751 69893943 + 1.33333 NA intron (NM_198159, intron 2 of 9) intron (NM_198159, intron 2 of 9) 27623 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 188.333-156 chr8 102315221 102315438 + 1.33333 NA intron (NM_001282873, intron 14 of 58) intron (NM_001282873, intron 14 of 58) 75878 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 276-3 chr1 40136829 40137283 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -24331 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 209.333-238 chr8 91827690 91827873 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 189899 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 353-18 chr4 184692426 184692886 + 1.33333 NA intron (NR_144313, intron 12 of 12) intron (NR_144313, intron 12 of 12) 41440 NR_104593 79682 Hs.575032 NM_024629 ENSG00000151725 CENPU CENP50|CENPU50|KLIP1|MLF1IP|PBIP1 centromere protein U protein-coding 186-16 chr10 57435307 57435467 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -130828 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 342.666-6 chr10 98074729 98075069 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -44071 NM_001206528 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 213.666-12 chr13 102837395 102837661 + 1.33333 NA intron (NM_001159596, intron 7 of 8) L1PB2|LINE|L1 -8313 NM_000123 2073 Hs.258429 NM_000123 ENSG00000134899 ERCC5 COFS3|ERCC5-201|ERCM2|UVDR|XPG|XPGC ERCC excision repair 5, endonuclease protein-coding 228-54 chr22 49912980 49913189 + 1.33333 NA intron (NM_024105, intron 3 of 9) intron (NM_024105, intron 3 of 9) 5354 NM_024105 79087 Hs.526711 NM_024105 ENSG00000182858 ALG12 CDG1G|ECM39|PP14673|hALG12 ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferase protein-coding 160-96 chr5 60238525 60238681 + 1.33333 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) L1ME3E|LINE|L1 134060 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 172-109 chr8 48043355 48043589 + 1.33333 NA intron (NM_003350, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 35041 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 384.667-5 chr2 54294330 54295011 + 1.33333 NA intron (NM_001320589, intron 4 of 4) AluJr|SINE|Alu -36214 NM_001100396 129852 Hs.732626 NM_173486 ENSG00000177994 C2orf73 - chromosome 2 open reading frame 73 protein-coding 176-95 chr8 47571754 47571939 + 1.33333 NA intron (NM_001352958, intron 10 of 21) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -82242 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 199.333-204 chr4 79758467 79758633 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68921 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 216.666-69 chr8 136685034 136685238 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 154338 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 208.667-75 chr2 213266922 213267206 + 1.33333 NA Intergenic MER87B|LTR|ERV1 17145 NR_161186 100130451 Hs.608433 NR_144752 SPAG16-DT - SPAG16 divergent transcript ncRNA 414.667-13 chr4 112892057 112892554 + 1.33333 NA intron (NM_001354271, intron 1 of 42) intron (NM_001354271, intron 1 of 42) 31318 NM_001354267 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 268.666-21 chr3 173867794 173868046 + 1.33333 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) 52876 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 146.666-2 chr1 117985678 117985805 + 1.33333 NA intron (NM_206996, intron 40 of 48) MIRb|SINE|MIR 56002 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 220.667-30 chr15 55902351 55902674 + 1.33333 NA intron (NM_001329212, intron 5 of 28) L1MC5a|LINE|L1 14619 NM_198400 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 207-93 chr4 156443656 156443960 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -489942 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 210.666-14 chr11 20955149 20955324 + 1.33333 NA intron (NM_201551, intron 11 of 18) intron (NM_201551, intron 11 of 18) 285650 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 194-75 chr2 74756638 74756952 + 1.33333 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -75860 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 182-111 chr8 126903079 126903236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -109997 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 264.333-51 chr4 61127114 61127448 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -16375 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 173-58 chr3 37341219 37341396 + 1.33333 NA intron (NM_001172713, intron 20 of 22) intron (NM_001172713, intron 20 of 22) -44962 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 214.667-99 chr5 108841227 108841571 + 1.33333 NA intron (NR_146155, intron 4 of 19) intron (NR_146155, intron 4 of 19) -83207 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 199.667-141 chr8 108451757 108452044 + 1.33333 NA intron (NR_138033, intron 3 of 9) intron (NR_138033, intron 3 of 9) 8276 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 138-111 chr7 95597183 95597331 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_002612) promoter-TSS (NM_002612) -741 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 202.333-19 chr1 238834290 238834483 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -348369 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 212.667-124 chr6 155988760 155989025 + 1.33333 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 42095 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 244.666-40 chr5 97437088 97437301 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67502 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 234.666-25 chr22 20553859 20554173 + 1.33333 NA intron (NM_001293236, intron 4 of 15) intron (NM_001293236, intron 4 of 15) 45969 NM_001293237 51586 Hs.517421 NM_015889 ENSG00000099917 MED15 ARC105|CAG7A|CTG7A|PCQAP|TIG-1|TIG1|TNRC7 mediator complex subunit 15 protein-coding 326-11 chr11 121086704 121087014 + 1.33333 NA exon (NM_001130047, exon 8 of 8) exon (NM_001130047, exon 8 of 8) -15807 NM_005422 7007 Hs.248162 NM_005422 ENSG00000109927 TECTA DFNA12|DFNA8|DFNB21 tectorin alpha protein-coding 223.666-33 chr8 103155503 103155699 + 1.33333 NA TTS (NR_036106) TTS (NR_036106) 987 NR_036106 100422992 NR_036106 ENSG00000265657 MIR3151 mir-3151 microRNA 3151 ncRNA 309.666-9 chr2 104894347 104894857 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22007 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 215.333-82 chr19 29152219 29152431 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 60826 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 189-80 chr6 55524998 55525172 + 1.33333 NA intron (NM_001287746, intron 4 of 9) intron (NM_001287746, intron 4 of 9) 54129 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 199.667-64 chr18 37460257 37460533 + 1.33333 NA intron (NM_001353724, intron 2 of 12) intron (NM_001353724, intron 2 of 12) 6109 NR_132967 106635546 NR_132967 SNORA111 - small nucleolar RNA, H/ACA box 111 snoRNA 328-44 chr9 116974601 116975198 + 1.33333 NA intron (NM_014010, intron 9 of 21) intron (NM_014010, intron 9 of 21) 206302 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 331.666-7 chr14 60432128 60432482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53758 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 207.667-108 chr6 143562781 143563086 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_110149) promoter-TSS (NR_110149) -882 NR_027114 285740 Hs.432656 NR_027113 ENSG00000235740 PHACTR2-AS1 - PHACTR2 antisense RNA 1 ncRNA 282.333-45 chr5 43385667 43386161 + 1.33333 NA intron (NM_001301874, intron 2 of 3) intron (NM_001301874, intron 2 of 3) 11223 NM_001301875 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 195-67 chr2 202592066 202592347 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42763 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 209.667-97 chr6 16488285 16488550 + 1.33333 NA intron (NM_000332, intron 6 of 8) intron (NM_000332, intron 6 of 8) 249830 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 267.666-7 chr15 74753883 74754087 + 1.33333 NA intron (NM_000761, intron 6 of 6) MER94|DNA|hAT-Blackjack 5140 NM_000761 1544 Hs.1361 NM_000761 ENSG00000140505 CYP1A2 CP12|CYPIA2|P3-450|P450(PA) cytochrome P450 family 1 subfamily A member 2 protein-coding 195-114 chr9 36340862 36341174 + 1.33333 NA intron (NM_194328, intron 11 of 11) intron (NM_194328, intron 11 of 11) 59251 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 354-24 chr8 87397907 87398256 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 475934 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 301.333 chr1 9043930 9044327 + 1.33333 NA intron (NM_001328621, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu -17783 NM_207420 155184 Hs.531239 NM_207420 ENSG00000197241 SLC2A7 GLUT-7|GLUT7 solute carrier family 2 member 7 protein-coding 253.666-28 chr8 60839884 60840191 + 1.33333 NA intron (NM_017780, intron 19 of 37) L1MB7|LINE|L1 98778 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 390-6 chr11 25569167 25569790 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -619645 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 219.666-5 chr10 124934754 124935048 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7222 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 209.667-109 chr8 39963798 39964078 + 1.33333 NA intron (NM_194294, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 28983 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 229.333-70 chr20 61225318 61225602 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26801 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 178-7 chr1 99942966 99943138 + 1.33333 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 -26944 NM_001271684 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 272.667-8 chr10 60406708 60407043 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -17000 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 176-22 chr11 112702333 112702500 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -146614 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 297.333-49 chr6 143228899 143229303 + 1.33333 NA intron (NM_001366354, intron 3 of 4) intron (NM_001366354, intron 3 of 4) 64319 NM_001366361 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 253.333-54 chr2 122969845 122970197 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 103460 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 211.333-44 chr12 62521360 62521592 + 1.33333 NA intron (NM_001278469, intron 8 of 35) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 54650 NM_001278471 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 320-33 chr3 86813935 86814446 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176959 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 246.333-70 chr4 154749293 154749585 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_004744, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_004744, exon 3 of 3) 5439 NM_004744 9227 Hs.658427 NM_004744 ENSG00000121207 LRAT LCA14 lecithin retinol acyltransferase protein-coding 168-79 chr4 41205238 41205386 + 1.33333 NA intron (NM_173075, intron 1 of 16) intron (NM_173075, intron 1 of 16) 9230 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 197.666-42 chr3 108864931 108865146 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 42252 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 211.333-213 chr6 151828194 151828498 + 1.33333 NA intron (NM_001328100, intron 1 of 6) intron (NM_001328100, intron 1 of 6) 19239 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 138-4 chr1 110029853 110030043 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1629 NM_001270768 85369 Hs.584996 NM_033088 ENSG00000143093 STRIP1 FAM40A|FAR11A striatin interacting protein 1 protein-coding 205.333-22 chr1 217932359 217932541 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39550 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 380.666-14 chr6 93882585 93882889 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 164434 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 217.333-158 chr8 122778973 122779153 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2592 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 342-5 chr12 48380628 48380943 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -29539 NM_001172682 121274 Hs.23492 NM_152320 ENSG00000167528 ZNF641 - zinc finger protein 641 protein-coding 248.333-68 chr4 47972272 47972545 + 1.33333 NA intron (NM_001142564, intron 1 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 9125 NM_001142564 1259 Hs.1323 NM_000087 ENSG00000198515 CNGA1 CNCG|CNCG1|CNG-1|CNG1|RCNC1|RCNCa|RCNCalpha|RP49 cyclic nucleotide gated channel alpha 1 protein-coding 234-22 chr14 45921212 45921552 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -142777 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 302.666 chr1 10007475 10007938 + 1.33333 NA exon (NM_052960, exon 2 of 4) exon (NM_052960, exon 2 of 4) 10478 NM_052960 116362 Hs.422688 NM_052960 ENSG00000162444 RBP7 CRABP4|CRBP4|CRBPIV retinol binding protein 7 protein-coding 132.667-23 chr10 64893666 64893836 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 30767 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 248.333-77 chr5 12218756 12219191 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -314527 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 219.999-7 chr8 88068474 88068650 + 1.33333 NA intron (NM_005941, intron 7 of 9) L1ME1|LINE|L1 -194547 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 213-75 chr6 106495125 106495330 + 1.33333 NA intron (NM_001371242, intron 2 of 21) intron (NM_001371242, intron 2 of 21) -16628 NM_001624 202 Hs.724262 NM_001624 ENSG00000112297 CRYBG1 AIM1|ST4 crystallin beta-gamma domain containing 1 protein-coding 226.666-38 chr7 31736679 31736916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49582 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 228-70 chr5 129653417 129653684 + 1.33333 NA intron (NM_133638, intron 13 of 22) intron (NM_133638, intron 13 of 22) -94544 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 172.666-24 chr7 42620714 42620894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 85643 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 258-36 chr2 107179652 107180061 + 1.33333 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 169669 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 218-111 chr8 82295241 82295430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -453049 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 416.666-7 chr4 44353973 44354420 + 1.33333 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 94613 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 327.999-7 chr22 23544271 23544547 + 1.33333 NA intron (NR_109832, intron 3 of 3) HERVK-int|LTR|ERVK 6307 NR_109832 101978785 Hs.575107 NR_109832 PCAT14 - prostate cancer associated transcript 14 ncRNA 240-17 chr11 127819072 127819328 + 1.33333 NA Intergenic (ATTTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -389566 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 227-23 chr18 6277345 6277719 + 1.33333 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) intron (NM_001365769, intron 4 of 16) 20788 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 201-109 chr8 106746655 106746819 + 1.33333 NA intron (NM_181354, intron 13 of 13) intron (NM_181354, intron 13 of 13) 20630 NM_001198535 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 291.333-6 chr10 33296120 33296382 + 1.33333 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 38416 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 223.333-96 chr21 29432170 29432380 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59774 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 140.666-11 chr8 99578350 99578495 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) intron (NM_017890, intron 33 of 61) -41561 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 124-105 chr6 158102818 158102964 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 65371 NR_073096 84947 Hs.154706 NM_032861 ENSG00000122335 SERAC1 - serine active site containing 1 protein-coding 192-17 chr10 22773504 22773712 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -59030 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 349.666-8 chr5 27458002 27458358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14112 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 203.333-10 chr1 116800957 116801144 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46620 NM_001328609 914 Hs.523500 NM_001767 ENSG00000116824 CD2 LFA-2|SRBC|T11 CD2 molecule protein-coding 216.333-80 chr2 96678856 96679133 + 1.33333 NA intron (NM_001293083, intron 19 of 52) L1MB8|LINE|L1 36230 NM_001293083 90342 Hs.534025 NM_001077400 ENSG00000249715 FER1L5 - fer-1 like family member 5 protein-coding 301.333-2 chr1 64166430 64166737 + 1.33333 NA intron (NM_005012, intron 8 of 8) intron (NM_005012, intron 8 of 8) -37040 NM_152489 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 356.333-14 chr15 98222914 98223416 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 108393 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 202-9 chr1 184449745 184450000 + 1.33333 NA intron (NM_030806, intron 1 of 5) intron (NM_030806, intron 1 of 5) 62843 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 220-70 chr20 50158500 50158708 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4806 NR_027889 387521 Hs.744839 NM_199129 ENSG00000240849 TMEM189 KUA transmembrane protein 189 protein-coding 212-114 chr4 55800009 55800190 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -19904 NM_001351574 644145 Hs.570825 NM_001351574 ENSG00000250821 EXOC1L - exocyst complex component 1 like protein-coding 286.666-22 chr8 109468479 109468750 + 1.33333 NA intron (NM_177531, intron 50 of 77) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -71086 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 350-37 chr8 88833729 88834138 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -506450 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 215.667-106 chr6 65245366 65245715 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -55878 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 205.333-59 chr12 55203747 55203905 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -17199 NM_001005280 121364 Hs.554557 NM_001005280 ENSG00000179919 OR10A7 OR12-6 olfactory receptor family 10 subfamily A member 7 protein-coding 170.667-98 chr20 33832535 33832690 + 1.33333 NA intron (NM_176812, intron 1 of 4) intron (NM_176812, intron 1 of 4) 21264 NM_176812 128866 Hs.472471 NM_176812 ENSG00000101421 CHMP4B C20orf178|CHMP4A|CTPP3|CTRCT31|SNF7|SNF7-2|Shax1|VPS32B|Vps32-2|dJ553F4.4 charged multivesicular body protein 4B protein-coding 229.667-59 chr3 80560621 80560978 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -204098 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 258.333-66 chr8 105784947 105785219 + 1.33333 NA non-coding (NR_125796, exon 6 of 8) non-coding (NR_125796, exon 6 of 8) 275420 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 190.333-126 chr5 170456924 170457107 + 1.33333 NA intron (NM_001034838, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 -47005 NM_001278340 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 264 chr1 999503 999894 + 1.33333 NA exon (NM_001142467, exon 1 of 3) exon (NM_001142467, exon 1 of 3) 399 NM_021170 57801 Hs.154029 NM_021170 ENSG00000188290 HES4 bHLHb42 hes family bHLH transcription factor 4 protein-coding 214.667-50 chr16 64655567 64655847 + 1.33333 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 466356 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 226.667-28 chr12 520410 520765 + 1.33333 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) intron (NM_173593, intron 1 of 19) 60648 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 291.999-3 chr12 75574020 75574250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62526 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 206-106 chr22 45509143 45509420 + 1.33333 NA intron (NM_006487, intron 1 of 14) intron (NM_006487, intron 1 of 14) 6398 NM_006487 2192 Hs.24601 NM_001996 ENSG00000077942 FBLN1 FBLN|FIBL1 fibulin 1 protein-coding 132.666 chr10 57768152 57768261 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -463647 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 147.333-316 chr8 62550358 62550507 + 1.33333 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 301578 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 200.333-74 chr2 133359495 133359708 + 1.33333 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 93406 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 278.666-23 chr7 38107933 38108157 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70200 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 218.333-91 chr4 21351532 21351872 + 1.33333 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -47796 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 171.333-123 chr3 114022499 114022667 + 1.33333 NA intron (NR_148531, intron 5 of 14) intron (NR_148531, intron 5 of 14) 33943 NM_001353766 57577 Hs.477159 NM_020817 ENSG00000163617 CCDC191 KIAA1407 coiled-coil domain containing 191 protein-coding 345.666-8 chr3 59111830 59112203 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -61984 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 317.333-2 chr1 235734371 235734688 + 1.33333 NA exon (NM_001301365, exon 32 of 53) exon (NM_001301365, exon 32 of 53) -83775 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 352-11 chr17 28555299 28555620 + 1.33333 NA intron (NM_033198, intron 10 of 11) MER117|DNA|hAT-Charlie -2831 NM_005148 9094 Hs.410455 NM_005148 ENSG00000109103 UNC119 HRG4|IMD13|POC7|POC7A unc-119 lipid binding chaperone protein-coding 223.667-21 chr14 72958311 72958609 + 1.33333 NA intron (NM_001352448, intron 13 of 13) intron (NM_001352448, intron 13 of 13) 28496 NM_178441 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 140-4 chr1 55312815 55313013 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87273 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 196.666-49 chr2 61309542 61309745 + 1.33333 NA intron (NM_014709, intron 27 of 79) intron (NM_014709, intron 27 of 79) 107734 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 177-80 chr9 28161416 28161553 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 557821 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 154.333-216 chr3 72941824 72941977 + 1.33333 NA intron (NM_001080393, intron 3 of 6) L1MC4a|LINE|L1 53854 NR_138564 727936 Hs.710275 NM_001080393 ENSG00000172986 GXYLT2 GLT8D4 glucoside xylosyltransferase 2 protein-coding 368 chr1 17677703 17678148 + 1.33333 NA intron (NR_137287, intron 27 of 29) intron (NR_137287, intron 27 of 29) 59612 NM_001319838 55160 Hs.443460 NM_018125 ENSG00000074964 ARHGEF10L GrinchGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like protein-coding 254-52 chr3 148325334 148325711 + 1.33333 NA intron (NR_146712, intron 3 of 4) L1PREC2|LINE|L1 44631 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 238.333-32 chr17 60682961 60683320 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 2 of 25) intron (NM_001330413, intron 2 of 25) 5289 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 183.333-2 chr1 44750786 44751038 + 1.33333 NA intron (NM_001297655, intron 5 of 19) intron (NM_001297655, intron 5 of 19) 4518 NM_001297657 11004 Hs.720061 NM_006845 ENSG00000142945 KIF2C CT139|KNSL6|MCAK kinesin family member 2C protein-coding 295.333-41 chr4 36333118 36333471 + 1.33333 NA intron (NM_001170700, intron 8 of 9) intron (NM_001170700, intron 8 of 9) 51678 NM_001136536 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 189.666-11 chr14 85461531 85461682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67691 NR_102738 100996280 Hs.135735 NR_102737 ENSG00000259107 LINC00911 - long intergenic non-protein coding RNA 911 ncRNA 276.333-2 chr1 168802077 168802569 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15382 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 260-27 chr16 2714193 2714535 + 1.33333 NA intron (NM_001318395, intron 2 of 4) intron (NM_001318395, intron 2 of 4) 5860 NM_001318395 83886 Hs.332878 NM_031948 ENSG00000172382 PRSS27 CAPH2|MPN serine protease 27 protein-coding 135.667-176 chr7 109439535 109439656 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 520618 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 201.333-220 chr5 19732319 19732498 + 1.33333 NA intron (NM_001349559, intron 4 of 12) AluJo|SINE|Alu 153864 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 294.667-41 chr5 42043350 42043657 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 118222 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 199.333-36 chr11 3613186 3613335 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -13200 NR_002720 7221 Hs.131910 NR_002720 ENSG00000182048 TRPC2 - transient receptor potential cation channel subfamily C member 2 (pseudogene) pseudo 381.333-24 chr8 110221476 110221896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -245915 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 150.666-18 chr8 112154524 112154691 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -488886 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 290.333-4 chr10 50466055 50466445 + 1.33333 NA intron (NM_147156, intron 4 of 10) HAL1|LINE|L1 157706 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 260-23 chr13 25072895 25073128 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -23127 NM_030979 5042 Hs.458280 NM_030979 ENSG00000151846 PABPC3 PABP3|PABPL3|tPABP poly(A) binding protein cytoplasmic 3 protein-coding 300.666-20 chr7 64983457 64984025 + 1.33333 NA intron (NM_001348050, intron 1 of 3) intron (NM_001348050, intron 1 of 3) 7295 NM_015852 51351 Hs.250693 NM_015852 ENSG00000152926 ZNF117 H-plk|HPF9 zinc finger protein 117 protein-coding 216.666-8 chr1 168433007 168433207 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10451 NR_037851 100505918 Hs.568494 NR_037851 LOC100505918 - uncharacterized LOC100505918 ncRNA 219-66 chr4 168307119 168307291 + 1.33333 NA intron (NM_017631, intron 4 of 37) intron (NM_017631, intron 4 of 37) 11547 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 249.333-42 chr16 73227308 73227527 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -82970 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 355-4 chr14 61024554 61025028 + 1.33333 NA intron (NR_033344, intron 5 of 16) intron (NR_033344, intron 5 of 16) -43101 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 264.333-17 chr14 35379173 35379446 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25445 NM_020529 4792 Hs.81328 NM_020529 ENSG00000100906 NFKBIA EDAID2|IKBA|MAD-3|NFKBI NFKB inhibitor alpha protein-coding 201-104 chr7 103629783 103630061 + 1.33333 NA intron (NM_005045, intron 20 of 64) intron (NM_005045, intron 20 of 64) -183715 NM_206885 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 140.333-64 chr14 63040587 63040731 + 1.33333 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) intron (NM_139318, intron 1 of 10) 4799 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 230.666-30 chr20 4993398 4993580 + 1.33333 NA intron (NM_203327, intron 1 of 16) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 8021 NM_005116 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 210.667-111 chr5 149807218 149807517 + 1.33333 NA intron (NM_001172699, intron 1 of 10) intron (NM_001172699, intron 1 of 10) 35427 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 204.333-166 chr5 91975899 91976132 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -592698 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 221.666-11 chr10 93057149 93057426 + 1.33333 NA intron (NM_001319195, intron 21 of 21) intron (NM_001319195, intron 21 of 21) -3511 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 303.333-38 chr2 67253311 67253725 + 1.33333 NA intron (NR_110564, intron 1 of 4) intron (NR_110564, intron 1 of 4) -38199 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 211-96 chr8 117617943 117618230 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97373 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 242-68 chr7 80363580 80363936 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 10681 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 260.999 chr10 60556222 60556539 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 16576 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 334.667-8 chr10 111678333 111678815 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 505191 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 198.667-110 chr2 168089901 168090159 + 1.33333 NA intron (NM_013233, intron 10 of 17) intron (NM_013233, intron 10 of 17) -148886 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 234-37 chr2 103643317 103643631 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -659045 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 166.667-85 chr17 5285440 5285639 + 1.33333 NA intron (NM_001291581, intron 1 of 16) intron (NM_001291581, intron 1 of 16) 3255 NM_001291582 9135 Hs.584784 NM_004703 ENSG00000029725 RABEP1 RAB5EP|RABPT5 rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 protein-coding 167.333-113 chr18 783231 783476 + 1.33333 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) intron (NM_005433, intron 1 of 11) 28889 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 335.666-12 chr8 127816284 127816804 + 1.33333 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) AluSq2|SINE|Alu 20582 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 191.333-125 chr22 24291275 24291494 + 1.33333 NA intron (NM_015330, intron 2 of 16) MIR3|SINE|MIR 20553 NM_015330 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 196.667-93 chr22 39402975 39403241 + 1.33333 NA intron (NM_153497, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 3328 NM_153497 10454 Hs.507681 NM_006116 ENSG00000100324 TAB1 3'-Tab1|MAP3K7IP1 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 1 protein-coding 394-15 chr5 119715779 119716282 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 86471 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 194-44 chr15 69537692 69537902 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -23923 NR_026979 145837 Hs.410126 NR_026979 DRAIC - downregulated RNA in cancer, inhibitor of cell invasion and migration ncRNA 370.666-18 chr6 54903092 54903417 + 1.33333 NA intron (NM_001010872, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 56483 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 188.666-43 chr9 119452926 119453129 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -83592 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 215.333-111 chr20 35454482 35454753 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_031620) promoter-TSS (NR_031620) 132 NM_001319138 8200 Hs.1573 NM_000557 ENSG00000125965 GDF5 BDA1C|BMP-14|BMP14|CDMP1|LAP-4|LAP4|OS5|SYM1B|SYNS2 growth differentiation factor 5 protein-coding 276.999-3 chr17 44705273 44705563 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -3247 NR_036623 80174 Hs.369998 NM_025104 ENSG00000161692 DBF4B ASKL1|CHIFB|DRF1|ZDBF1B DBF4 zinc finger B protein-coding 222.666-36 chr4 33629163 33629448 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 410588 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 376-4 chr12 14730459 14730900 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -34080 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 332.666-30 chr8 60808550 60808948 + 1.33333 NA intron (NM_017780, intron 7 of 37) intron (NM_017780, intron 7 of 37) 67490 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 294-26 chr14 79576328 79576610 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 297089 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 230.333-67 chr2 167348477 167348740 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 161236 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 226-53 chr21 17519298 17519654 + 1.33333 NA intron (NM_001207066, intron 1 of 7) intron (NM_001207066, intron 1 of 7) 6433 NM_001207063 1525 Hs.627078 NM_001338 ENSG00000154639 CXADR CAR|CAR4/6|HCAR CXADR Ig-like cell adhesion molecule protein-coding 175.666-21 chr6 61847288 61847442 + 1.33333 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) MER67C|LTR|ERV1 273235 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 325-13 chr17 59723029 59723467 + 1.33333 NA intron (NM_001329394, intron 1 of 11) intron (NM_001329394, intron 1 of 11) 15594 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 271-30 chr2 213637744 213637968 + 1.33333 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) AluY|SINE|Alu -120211 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 207-104 chr6 84994159 84994455 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -229709 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 194.666-21 chr14 63226606 63226784 + 1.33333 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) L1M7|LINE|L1 22252 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 195.666-31 chr3 60650703 60650935 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 5 of 9) intron (NM_001320900, intron 5 of 9) -32949 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 209.333-161 chr3 185409661 185409911 + 1.33333 NA intron (NM_004721, intron 1 of 13) L1MA5A|LINE|L1 46650 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 212-52 chr14 70363225 70363520 + 1.33333 NA intron (NM_001202548, intron 3 of 5) intron (NM_001202548, intron 3 of 5) -3689 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 335-16 chr2 134565729 134566036 + 1.33333 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) L1ME3A|LINE|L1 153118 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 207.666-30 chr2 220511398 220511606 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -604937 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 203.333-240 chr7 9765997 9766160 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 131808 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 190.333-139 chr7 125445011 125445178 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -180803 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 273-5 chr1 160294925 160295166 + 1.33333 NA intron (NM_001098398, intron 23 of 32) intron (NM_001098398, intron 23 of 32) -9894 NR_036493 5824 Hs.517232 NM_002857 ENSG00000162735 PEX19 D1S2223E|HK33|PBD12A|PMP1|PMPI|PXF|PXMP1 peroxisomal biogenesis factor 19 protein-coding 213.333-122 chr3 5305144 5305314 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -54974 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 227.333-6 chr1 114642459 114642688 + 1.33333 NA intron (NM_198459, intron 1 of 17) MIR|SINE|MIR 27476 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 239.667-78 chr8 134819542 134819877 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14764 NR_029599 407033 NR_029599 ENSG00000199153 MIR30D MIRN30D|mir-30d microRNA 30d ncRNA 149-107 chr5 10945149 10945377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -184029 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 150.333-422 chr8 131389745 131389892 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -348909 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 289.333-40 chr4 32707022 32707404 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 356175 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 169-77 chr4 114137034 114137174 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157457 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 248.666-3 chr1 63967369 63967646 + 1.33333 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) FLAM_A|SINE|Alu 144698 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 138-120 chr8 117046506 117046733 + 1.33333 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -88376 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 201-61 chr2 140226818 140227021 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 359766 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 436-11 chr5 154792387 154792883 + 1.33333 NA exon (NM_001367718, exon 4 of 19) exon (NM_001367718, exon 4 of 19) 35481 NM_001367719 23367 Hs.292078 NM_015315 ENSG00000155506 LARP1 LARP La ribonucleoprotein domain family member 1 protein-coding 422.333 chr10 108619538 108619995 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -550473 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 228.333-83 chr6 81298882 81299060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 453710 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 304.666-20 chr3 97153113 97153468 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) -286317 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 241-52 chr7 31432283 31432531 + 1.33333 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -81664 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 216.666-65 chr8 21689829 21689999 + 1.33333 NA TTS (NM_001165038) TTS (NM_001165038) 98961 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 204.666-22 chr12 53457718 53457965 + 1.33333 NA intron (NM_001128912, intron 5 of 14) intron (NM_001128912, intron 5 of 14) 5739 NM_005016 5094 Hs.546271 NM_005016 ENSG00000197111 PCBP2 HNRNPE2|HNRPE2|hnRNP-E2 poly(rC) binding protein 2 protein-coding 271.333-58 chr5 143115431 143115858 + 1.33333 NA intron (NR_146198, intron 17 of 22) intron (NR_146198, intron 17 of 22) -76856 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 295.666-12 chr2 167044926 167045216 + 1.33333 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) L1PA15|LINE|L1 95884 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 264.667-39 chr2 7130538 7130924 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52851 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 203.666-31 chr2 63177030 63177220 + 1.33333 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) L1MB2|LINE|L1 -57583 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 229.333-51 chr17 64002142 64002595 + 1.33333 NA TTS (NM_001099788) TTS (NM_001099788) -2469 NR_126169 400612 Hs.591170 NR_126169 ENSG00000264954 PRR29-AS1 - PRR29 antisense RNA 1 ncRNA 272.666-18 chr4 93870824 93871138 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42228 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 246.666-36 chr7 91980229 91980455 + 1.33333 NA intron (NM_147185, intron 3 of 49) intron (NM_147185, intron 3 of 49) 39467 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 220.667-73 chr4 81852432 81852705 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -380661 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 182.333-93 chr2 237965509 237965648 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1367 NM_001278308 140739 Hs.471785 NM_080678 ENSG00000184182 UBE2F NCE2 ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) protein-coding 257.333-104 chr8 130632582 130633033 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -189133 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 207.333-93 chr14 69138786 69138954 + 1.33333 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 13729 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 202.667-18 chr10 28605213 28605512 + 1.33333 NA intron (NM_100264, intron 7 of 13) MER5B|DNA|hAT-Charlie -72159 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 200.666-67 chr2 202907384 202907555 + 1.33333 NA intron (NM_018256, intron 2 of 12) intron (NM_018256, intron 2 of 12) -4749 NM_001282911 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 227.667-7 chr10 21346747 21347057 + 1.33333 NA intron (NR_155751, intron 4 of 4) intron (NR_155751, intron 4 of 4) 26048 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 198.667-61 chr14 68749422 68749689 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44359 NM_001244698 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 200-112 chr4 47421195 47421382 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 8 of 8) intron (NM_000812, intron 8 of 8) 42414 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 327.333-28 chr3 96976211 96976535 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) intron (NM_001080448, intron 2 of 17) 161779 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 195.667-126 chr6 163722043 163722245 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50660 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 241.667-78 chr6 41519802 41520144 + 1.33333 NA TTS (NR_120347) TTS (NR_120347) 17529 NR_120347 103106903 Hs.563396 NR_120347 ENSG00000226917 LINC01276 - long intergenic non-protein coding RNA 1276 ncRNA 362.666-2 chr10 21806563 21806912 + 1.33333 NA intron (NM_022365, intron 8 of 11) intron (NM_022365, intron 8 of 11) 196993 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 214.666-8 chr1 152715986 152716194 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -3432 NM_001024679 100129271 Hs.601077 NM_001024679 ENSG00000198854 C1orf68 LEP7|XP32 chromosome 1 open reading frame 68 protein-coding 236.666-2 chr1 108650603 108650874 + 1.33333 NA intron (NM_001102592, intron 6 of 7) intron (NM_001102592, intron 6 of 7) 10355 NM_001102592 113802 Hs.7962 NM_144584 ENSG00000162639 HENMT1 C1orf59|HEN1 HEN methyltransferase 1 protein-coding 197.667-118 chr5 14276900 14277180 + 1.33333 NA intron (NM_007118, intron 2 of 56) intron (NM_007118, intron 2 of 56) 133698 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 215.333-39 chr12 3859902 3860104 + 1.33333 NA intron (NM_020367, intron 1 of 7) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 13396 NR_104461 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 181-23 chr14 67165875 67166136 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 19 of 21) intron (NM_001024218, intron 19 of 21) -23435 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 216-101 chr5 120289935 120290159 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -174231 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 159-30 chr12 62455988 62456170 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10747 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 352.333-6 chr11 79407267 79407727 + 1.33333 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) MIRb|SINE|MIR -5388 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 217-53 chr2 237040705 237040953 + 1.33333 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 15338 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 346-23 chr3 44020820 44021228 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93188 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 197.666-55 chr6 64554871 64555087 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) L1MA8|LINE|L1 -746439 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 266.666 chr1 47298207 47298641 + 1.33333 NA intron (NM_001282938, intron 8 of 18) intron (NM_001282938, intron 8 of 18) 15723 NM_003035 6491 Hs.525198 NM_003035 ENSG00000123473 STIL MCPH7|SIL STIL centriolar assembly protein protein-coding 185.333-68 chr17 69311845 69312027 + 1.33333 NA intron (NM_018672, intron 2 of 37) intron (NM_018672, intron 2 of 37) 3697 NM_018672 23461 Hs.731824 NM_018672 ENSG00000154265 ABCA5 ABC13|EST90625|HTC3 ATP binding cassette subfamily A member 5 protein-coding 312-27 chr22 30796760 30797067 + 1.33333 NA intron (NM_001282740, intron 1 of 12) L1MB3|LINE|L1 -25603 NM_001282741 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 217.666-10 chr13 59263590 59263907 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -748970 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 198.666-94 chr8 98855622 98855778 + 1.33333 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) L1MB8|LINE|L1 -30012 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 414.667-12 chr3 106558836 106559315 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 681563 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 223.333-84 chr2 147026165 147026343 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 439197 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 307-35 chr6 157030484 157030888 + 1.33333 NA intron (NM_020732, intron 5 of 19) intron (NM_020732, intron 5 of 19) -5741 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 280-34 chr3 47221829 47222124 + 1.33333 NA intron (NR_033373, intron 2 of 6) MER5B|DNA|hAT-Charlie 28633 NR_145712 109617025 NR_145712 SNORD13J - small nucleolar RNA, C/D box 13J snoRNA 213.333-187 chr6 154018623 154018865 + 1.33333 NA intron (NM_001145280, intron 1 of 3) intron (NM_001145280, intron 1 of 3) 8248 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 240-5 chr1 163193961 163194297 + 1.33333 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) intron (NM_001254748, intron 2 of 5) 8787 NM_001254749 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 229-20 chr15 50482308 50482488 + 1.33333 NA intron (NM_001283049, intron 9 of 16) intron (NM_001283049, intron 9 of 16) 57993 NM_001128610 9101 Hs.443731 NM_005154 ENSG00000138592 USP8 HumORF8|PITA4|SPG59|UBPY ubiquitin specific peptidase 8 protein-coding 174.666-20 chr6 85655358 85655506 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12510 NM_001159673 10492 Hs.571177 NM_006372 ENSG00000135316 SYNCRIP GRY-RBP|GRYRBP|HNRNPQ|HNRPQ1|NSAP1|PP68|hnRNP-Q synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein protein-coding 205.333-60 chr12 59994157 59994322 + 1.33333 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 304869 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 224-94 chr7 8513639 8513938 + 1.33333 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 80179 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 379.333-16 chr9 31177154 31177620 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 204103 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 220.667-31 chr15 59515209 59515477 + 1.33333 NA intron (NM_152450, intron 7 of 8) intron (NM_152450, intron 7 of 8) 77157 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 179.333-193 chr9 16496074 16496303 + 1.33333 NA intron (NM_001317939, intron 4 of 6) AluSq2|SINE|Alu -219875 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 359.666-9 chr22 47516549 47517011 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29669 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 226.667-67 chr4 74196482 74196759 + 1.33333 NA intron (NM_001351314, intron 5 of 9) intron (NM_001351314, intron 5 of 9) 38502 NM_001004346 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 184.333-124 chr5 108315607 108315796 + 1.33333 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) intron (NM_001163315, intron 4 of 8) 66397 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 283-23 chr3 97639653 97639893 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -124748 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 211-16 chr11 22597611 22597819 + 1.33333 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 28126 NM_022725 2188 Hs.632151 NM_022725 ENSG00000183161 FANCF FAF FA complementation group F protein-coding 212.666-46 chr2 104115574 104115777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 292657 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 138.666-5 chr3 113625942 113626090 + 1.33333 NA intron (NR_136285, intron 19 of 20) intron (NR_136285, intron 19 of 20) 31140 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 300.333-31 chr3 88340091 88340663 + 1.33333 NA intron (NM_001368165, intron 1 of 1) intron (NM_001368165, intron 1 of 1) 1921 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 214.666-38 chr2 235864067 235864232 + 1.33333 NA intron (NM_001037131, intron 9 of 17) intron (NM_001037131, intron 9 of 17) 304237 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 276.999-6 chr5 61013376 61013756 + 1.33333 NA intron (NM_174889, intron 1 of 3) intron (NM_174889, intron 1 of 3) 68361 NM_174889 91942 Hs.591757 NM_174889 ENSG00000164182 NDUFAF2 B17.2L|MC1DN10|MMTN|NDUFA12L|mimitin NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 protein-coding 220.333-58 chr19 56454252 56454648 + 1.33333 NA intron (NM_001321355, intron 4 of 5) L1MA5|LINE|L1 22895 NM_001321356 63934 Hs.676605 NM_022103 ENSG00000198046 ZNF667 MIPU1 zinc finger protein 667 protein-coding 266.666-33 chrX 38550181 38550597 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -11089 NM_004615 7102 Hs.441664 NM_004615 ENSG00000156298 TSPAN7 A15|CCG-B7|CD231|DXS1692E|MRX58|MXS1|TALLA-1|TM4SF2|TM4SF2b tetraspanin 7 protein-coding 286-39 chr3 68358159 68358524 + 1.33333 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR -142296 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 218.333-48 chr16 71224192 71224485 + 1.33333 NA intron (NM_001198543, intron 1 of 18) L1PB2|LINE|L1 6384 NM_001198542 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 336.333-15 chr14 75056121 75056606 + 1.33333 NA intron (NR_126394, intron 1 of 1) intron (NR_126394, intron 1 of 1) -4831 NM_001040108 27030 Hs.436650 NM_014381 ENSG00000119684 MLH3 HNPCC7 mutL homolog 3 protein-coding 211.666-24 chr2 55686341 55686563 + 1.33333 NA intron (NM_033109, intron 2 of 27) intron (NM_033109, intron 2 of 27) 7392 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 233.333-15 chr10 43506031 43506454 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 62217 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 194.667-144 chr7 41237037 41237271 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 135550 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 214-131 chr8 17250222 17250417 + 1.33333 NA intron (NM_001145152, intron 1 of 10) intron (NM_001145152, intron 1 of 10) 3361 NM_001363172 137492 Hs.343873 NM_152415 ENSG00000155975 VPS37A HCRP1|PQBP2|SPG53 VPS37A subunit of ESCRT-I protein-coding 261.666-5 chr14 42961649 42961946 + 1.33333 NA Intergenic MER90|LTR|ERV1 1354941 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 168-107 chr7 105858799 105859009 + 1.33333 NA intron (NM_152749, intron 2 of 3) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 17681 NM_020725 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 202.666-58 chr18 78257396 78257558 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -263750 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 232.333-88 chr8 87819287 87819511 + 1.33333 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 54616 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 219.666-34 chr5 10829096 10829267 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -67947 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 294.666-34 chr7 105461475 105461780 + 1.33333 NA intron (NM_001318164, intron 14 of 15) intron (NM_001318164, intron 14 of 15) 46893 NM_001318163 54517 Hs.520619 NM_019042 ENSG00000091127 PUS7 IDDABS pseudouridine synthase 7 protein-coding 178.667-88 chr2 219317282 219317531 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8005 NM_001199763 5798 Hs.89655 NM_002846 ENSG00000054356 PTPRN IA-2|IA-2/PTP|IA2|ICA512|R-PTP-N protein tyrosine phosphatase receptor type N protein-coding 203.333-163 chr22 32502214 32502417 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27078 NM_001257990 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 199-91 chr6 67055236 67055466 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -1000000 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 239.333-88 chr5 91138393 91138706 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 87 of 89) intron (NR_003149, intron 87 of 89) 175853 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 213.333-111 chr20 50591962 50592184 + 1.33333 NA intron (NM_001290268, intron 19 of 21) AluSg|SINE|Alu 6287 NR_030375 693230 NR_030375 ENSG00000208018 MIR645 MIRN645|hsa-mir-645 microRNA 645 ncRNA 184-23 chr14 26270327 26270527 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 283003 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 139.333 chr1 43865938 43866085 + 1.33333 NA intron (NR_073021, intron 6 of 9) intron (NR_073021, intron 6 of 9) 27389 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 160.667-72 chr12 44333930 44334124 + 1.33333 NA intron (NM_001286211, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR 497946 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 229-15 chr12 53109219 53109511 + 1.33333 NA intron (NM_003578, intron 5 of 14) PABL_A-int|LTR|ERV1 5879 NM_003578 8435 Hs.656544 NM_003578 ENSG00000167780 SOAT2 ACACT2|ACAT2|ARGP2 sterol O-acyltransferase 2 protein-coding 501.333-2 chr1 114830996 114831575 + 1.33333 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -23518 NM_001282542 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 249.333-71 chr3 120349795 120350130 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001099678) promoter-TSS (NM_001099678) -608 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 268-2 chr1 98420874 98421236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 210344 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 208.333-7 chr1 169066401 169066599 + 1.33333 NA intron (NR_104091, intron 1 of 4) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 20505 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 310.666-24 chr8 114896834 114897300 + 1.33333 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 770946 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 340-11 chr14 53577484 53577958 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 370763 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 353-15 chr3 160423315 160423825 + 1.33333 NA exon (NM_005496, exon 13 of 23) exon (NM_005496, exon 13 of 23) 18825 NR_029525 406951 NR_029525 ENSG00000198987 MIR16-2 MIRN16-2|mir-16-2|mir-16-3 microRNA 16-2 ncRNA 210.666-76 chr4 46697302 46697469 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 211860 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 303.667-11 chr2 49640766 49641096 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 333272 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 196-25 chr10 104304081 104304240 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_183239, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_183239, exon 7 of 7) -19204 NR_120622 101927472 Hs.670333 NR_120622 ITPRIP-AS1 - ITPRIP antisense RNA 1 ncRNA 212.667-33 chr13 47880638 47880923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 51842 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 259.666-29 chr5 27597825 27598104 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 125672 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 185.333-199 chr9 34978734 34978932 + 1.33333 NA non-coding (NR_136307, exon 8 of 9) non-coding (NR_136307, exon 8 of 9) 10546 NR_109756 101926900 Hs.545814 NR_109756 ENSG00000281491 DNAJB5-DT DNAJB5-AS1 DNAJB5 divergent transcript ncRNA 252.667-68 chr3 166761767 166762125 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -136737 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 160.666-5 chr14 72987864 72988013 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001281735) promoter-TSS (NM_001281735) -982 NM_001281735 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 423.999 chr2 25171756 25172319 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -3186 NM_001035256 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 196-128 chr3 160346246 160346422 + 1.33333 NA intron (NM_001190242, intron 7 of 18) L1MA7|LINE|L1 37432 NM_001190242 57560 Hs.478095 NM_020800 ENSG00000068885 IFT80 ATD2|SRTD2|WDR56 intraflagellar transport 80 protein-coding 258-26 chr18 23692663 23693001 + 1.33333 NA intron (NM_001127717, intron 1 of 73) L1M4|LINE|L1 3379 NM_198129 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 239.333-95 chr6 120454570 120454874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 439543 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 252.666-46 chr8 42059329 42059568 + 1.33333 NA intron (NR_136589, intron 1 of 1) L1MEc|LINE|L1 -7461 NM_006766 7994 Hs.491577 NM_006766 ENSG00000083168 KAT6A MOZ|MRD32|MYST-3|MYST3|RUNXBP2|ZC2HC6A|ZNF220 lysine acetyltransferase 6A protein-coding 222.667-78 chr6 17949655 17949948 + 1.33333 NA TTS (NM_001243423) TTS (NM_001243423) 37834 NM_001105568 63971 Hs.94499 NM_022113 ENSG00000137177 KIF13A RBKIN|bA500C11.2 kinesin family member 13A protein-coding 212.666-67 chr5 20332455 20332675 + 1.33333 NA TTS (NR_146519) TTS (NR_146519) 27014 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 242.666-31 chr5 76586630 76586878 + 1.33333 NA intron (NM_006633, intron 5 of 35) LTR87|LTR|ERVL? 22215 NR_134278 101929109 Hs.665172 NR_134278 ENSG00000249713 LOC101929109 - uncharacterized LOC101929109 ncRNA 210.333-58 chr17 71279857 71280171 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -77835 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 320.666-11 chr3 197564882 197565296 + 1.33333 NA intron (NM_203315, intron 1 of 6) AluSp|SINE|Alu 8234 NM_203315 622 Hs.274539 NM_004051 ENSG00000161267 BDH1 BDH|SDR9C1 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 1 protein-coding 262-71 chr7 16975723 16976017 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93887 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 208-85 chr2 192169741 192169948 + 1.33333 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) intron (NM_001305134, intron 4 of 9) 25089 NM_016192 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 215.333-150 chr4 177369151 177369364 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 59383 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 115-66 chr15 85457583 85457753 + 1.33333 NA intron (NM_007200, intron 1 of 36) intron (NM_007200, intron 1 of 36) 77065 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 259.667-27 chr18 77809253 77809686 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184258 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 222.667-102 chr9 80293102 80293419 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 318237 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 386-14 chr8 16655248 16655730 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 346856 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 211.667-83 chr3 113899843 113900100 + 1.33333 NA intron (NM_001172105, intron 1 of 12) intron (NM_001172105, intron 1 of 12) 2471 NM_001172105 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 256-55 chr21 30657052 30657378 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 14351 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 185-44 chr3 137469732 137469900 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -294499 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 421.667-3 chr17 60689843 60690353 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 4 of 25) intron (NM_001330413, intron 4 of 25) 12247 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 168-7 chr1 220104722 220104970 + 1.33333 NA intron (NM_018060, intron 8 of 22) intron (NM_018060, intron 8 of 22) 10714 NM_018060 55699 Hs.262823 NM_018060 ENSG00000067704 IARS2 CAGSSS|ILERS isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 119-15 chr10 29012320 29012490 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165997 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 202-156 chr5 159182674 159182878 + 1.33333 NA intron (NM_001199383, intron 3 of 10) intron (NM_001199383, intron 3 of 10) 24872 NM_001199382 153830 Hs.349306 NM_144726 ENSG00000145860 RNF145 - ring finger protein 145 protein-coding 323-8 chr10 132979204 132979492 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13814 NR_046231 399829 Hs.252872 NR_046231 ENSG00000240707 LINC01168 - long intergenic non-protein coding RNA 1168 ncRNA 324.999 chr1 173343452 173343730 + 1.33333 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 117771 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 200.667-81 chr2 117935740 117936056 + 1.33333 NA intron (NM_019044, intron 21 of 23) intron (NM_019044, intron 21 of 23) 78172 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 242.333-66 chr3 24377450 24377767 + 1.33333 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -116479 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 377.333-6 chr18 4710287 4710807 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -255240 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 179.666-8 chr4 100592183 100592349 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74244 NM_001159694 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 256.333-62 chr4 113466344 113466616 + 1.33333 NA intron (NM_001221, intron 14 of 18) intron (NM_001221, intron 14 of 18) 173641 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 257.333-48 chr18 67907462 67907801 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92809 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 204.666 chr1 41127353 41127557 + 1.33333 NA intron (NM_001172218, intron 7 of 15) L1MC4a|LINE|L1 33977 NM_001031694 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 274.999 chr1 116337791 116338162 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -35268 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 222.333-10 chr10 22502212 22502469 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -64411 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 191.333-85 chr16 81075013 81075228 + 1.33333 NA intron (NM_152337, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 2147 NM_152337 123775 Hs.658684 NM_152337 ENSG00000166455 C16orf46 - chromosome 16 open reading frame 46 protein-coding 236-92 chr9 12724820 12725024 + 1.33333 NA intron (NR_125775, intron 3 of 3) intron (NR_125775, intron 3 of 3) 31537 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 209-65 chr2 178232445 178232726 + 1.33333 NA intron (NM_001201480, intron 1 of 25) intron (NM_001201480, intron 1 of 25) 38073 NM_001201480 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 244-16 chr10 65221484 65221730 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -297089 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 200.666-30 chr13 78260077 78260260 + 1.33333 NA intron (NR_047001, intron 2 of 5) intron (NR_047001, intron 2 of 5) 205313 NR_047001 100874222 Hs.493062 NR_047001 ENSG00000234377 OBI1-AS1 POU4F1-AS1|RNF219-AS1 OBI1 antisense RNA 1 ncRNA 309.667-32 chr9 115893042 115893522 + 1.33333 NA intron (NR_024032, intron 2 of 2) L1MEf|LINE|L1 31925 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 203.333-69 chr14 29059153 29059328 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -273453 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 200-137 chr5 122773319 122773591 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1541 NM_001278199 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 324.333-3 chr1 116094000 116094350 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -17580 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 210-100 chr4 10569782 10570111 + 1.33333 NA intron (NM_052964, intron 5 of 18) intron (NM_052964, intron 5 of 18) -112520 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 244.333-95 chr7 52645909 52646283 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -389537 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 274.666-2 chr1 202145396 202145805 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001256129) promoter-TSS (NM_001256129) -857 NM_001256129 127829 Hs.497399 NM_138795 ENSG00000143862 ARL8A ARL10B|GIE2 ADP ribosylation factor like GTPase 8A protein-coding 213.333-130 chr3 85806982 85807197 + 1.33333 NA intron (NR_046752, intron 1 of 3) intron (NR_046752, intron 1 of 3) 20961 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 200.666-42 chr15 60234854 60235062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 163028 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 222.666-17 chr16 13370661 13370946 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 469205 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 204.333-181 chr6 167934431 167934593 + 1.33333 NA intron (NM_001207008, intron 21 of 31) intron (NM_001207008, intron 21 of 31) 42427 NM_001129895 100128124 Hs.448059 NM_001129895 HGC6.3 - uncharacterized LOC100128124 protein-coding 202.333-175 chr8 83214638 83214922 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -188978 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 193.666-34 chr3 166184435 166184619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -347104 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 213.666-10 chr11 105478128 105478377 + 1.33333 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -131821 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 183.667-96 chr3 185833370 185833589 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -8437 NM_006548 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 259.666-32 chr7 15887208 15887559 + 1.33333 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL 199005 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 206-54 chr14 101081793 101082008 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 11989 NR_047664 100507257 Hs.301755 NR_047664 ENSG00000223403 MEG9 LINC00584 maternally expressed 9 ncRNA 209.666-17 chr12 83175251 83175430 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 488185 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 364.333-20 chr3 143441900 143442356 + 1.33333 NA intron (NM_173653, intron 12 of 15) intron (NM_173653, intron 12 of 15) 99882 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 211-98 chr9 27492545 27492904 + 1.33333 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) Charlie13b|DNA|hAT-Charlie -31590 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 174.667-13 chr1 179859273 179859524 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001349933, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001349933, exon 2 of 2) 9442 NM_001349933 163590 Hs.571797 NM_022347 ENSG00000169905 TOR1AIP2 IFRG15|LULL1|NET9 torsin 1A interacting protein 2 protein-coding 200-66 chr17 16487185 16487352 + 1.33333 NA intron (NM_207387, intron 1 of 2) intron (NM_207387, intron 1 of 2) 4925 NM_001113567 388341 Hs.25425 NM_207387 ENSG00000181350 LRRC75A C17orf76|FAM211A leucine rich repeat containing 75A protein-coding 189-39 chr2 39934854 39935057 + 1.33333 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) L1ME3A|LINE|L1 17321 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 255.333-31 chr14 56716686 56716922 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 88863 NM_172337 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 211-19 chr11 68606636 68606903 + 1.33333 NA intron (NR_147971, intron 23 of 24) L1M5|LINE|L1 -77775 NM_015973 51083 Hs.278959 NM_015973 ENSG00000069482 GAL ETL8|GAL-GMAP|GALN|GLNN|GMAP galanin and GMAP prepropeptide protein-coding 164-34 chr14 51622736 51622890 + 1.33333 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu -22861 NR_047477 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 301-45 chr5 91364783 91365144 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15134 NM_001329670 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 239.333-112 chr9 31722436 31722713 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -341084 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 425.333-7 chr22 27264505 27264993 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40070 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 312.333-31 chr9 27108982 27109441 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001290078) promoter-TSS (NM_001290078) 70 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 220-76 chr3 73361152 73361349 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 72745 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 226-48 chr2 209967942 209968132 + 1.33333 NA intron (NM_032504, intron 51 of 63) intron (NM_032504, intron 51 of 63) -34528 NM_001318927 6120 Hs.282260 NM_006916 ENSG00000197713 RPE RPE2-1 ribulose-5-phosphate-3-epimerase protein-coding 134-113 chr9 37205956 37206096 + 1.33333 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) L1MEf|LINE|L1 85428 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 240.666-25 chr21 29632124 29632422 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 7 of 16) L2a|LINE|L2 36233 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 274.333-26 chr16 54750144 54750450 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97936 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 249.333-61 chr2 212512360 212512653 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) (TGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26122 NM_001042599 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 225-9 chr10 51799144 51799380 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -99667 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 336.667-22 chr6 130846845 130847256 + 1.33333 NA intron (NM_001350320, intron 15 of 15) intron (NM_001350320, intron 15 of 15) 19645 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 333.333-50 chr8 29906537 29906916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14787 NR_024473 286135 Hs.376840 NR_024473 ENSG00000253279 LINC02209 FAM183CP long intergenic non-protein coding RNA 2209 ncRNA 300-53 chr5 105093837 105094135 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -5488 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 208.667-64 chr2 54128048 54128353 + 1.33333 NA intron (NM_001320588, intron 1 of 3) Ricksha|DNA|MULE-MuDR 4917 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 230.333-3 chr1 92057468 92057774 + 1.33333 NA intron (NM_173567, intron 6 of 6) AluSx|SINE|Alu 17851 NM_001287737 646817 NM_001287737 ENSG00000230667 SETSIP SETP18 SET like protein protein-coding 260-44 chr2 206526446 206526844 + 1.33333 NA intron (NM_003812, intron 3 of 25) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 83113 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 207.333-35 chr10 90674926 90675114 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -134215 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 358.333-12 chr14 60350120 60350429 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27078 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 385.999-3 chr8 126657766 126658204 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99507 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 197.666-68 chr8 133278352 133278530 + 1.33333 NA intron (NM_001258432, intron 1 of 13) intron (NM_001258432, intron 1 of 13) 18811 NM_001258432 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 202.667-45 chr13 108378868 108379156 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 109383 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 189.333-34 chr11 39093619 39093775 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 444839 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 374.333-18 chr8 100933157 100933891 + 1.33333 NA intron (NM_001135700, intron 2 of 5) L1MA9|LINE|L1 17047 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 294.666-11 chr14 68156855 68157125 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) AluJb|SINE|Alu 333398 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 322.333-12 chr1_KI270760v1_alt 55030 55537 + 1.33333 NA NA Intergenic NA NA 240-80 chr6 129439408 129439732 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 42 of 64) intron (NM_000426, intron 42 of 64) 270607 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 223.333-124 chr5 22729600 22730010 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 123539 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 129.333-76 chr17 29469641 29469766 + 1.33333 NA intron (NM_025142, intron 3 of 17) L1MB3|LINE|L1 78778 NM_020791 57551 Hs.597434 NM_020791 ENSG00000160551 TAOK1 KFC-B|MAP3K16|MARKK|PSK-2|PSK2|TAO1|hKFC-B|hTAOK1 TAO kinase 1 protein-coding 251.333-75 chr3 36736687 36737016 + 1.33333 NA intron (NM_033403, intron 2 of 4) intron (NM_033403, intron 2 of 4) 3010 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 248-13 chr11 81692897 81693237 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 197769 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 163.667-102 chr2 38747839 38748068 + 1.33333 NA intron (NM_001363802, intron 5 of 7) intron (NM_001363802, intron 5 of 7) 3408 NM_001031684 6432 Hs.309090 NM_006276 ENSG00000115875 SRSF7 9G8|AAG3|SFRS7 serine and arginine rich splicing factor 7 protein-coding 242.666-2 chr1 62616807 62617061 + 1.33333 NA intron (NM_001367561, intron 14 of 49) HAL1|LINE|L1 19414 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 207-120 chr8 112749859 112750034 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 106453 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 226-16 chr12 18391072 18391263 + 1.33333 NA exon (NM_004570, exon 14 of 32) exon (NM_004570, exon 14 of 32) 129627 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 214.666-70 chr8 4418777 4418964 + 1.33333 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 576044 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 255.333-34 chr14 104061861 104062150 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -23695 NM_001080464 374569 Hs.146239 NM_001080464 ENSG00000166183 ASPG C14orf76|GPA/WT|LYSOLP asparaginase protein-coding 288.667-16 chr3 77534981 77535316 + 1.33333 NA intron (NM_001290039, intron 7 of 26) intron (NM_001290039, intron 7 of 26) 437136 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 223.667-30 chr17 48806873 48807116 + 1.33333 NA intron (NM_001130918, intron 1 of 15) AluSz|SINE|Alu 10096 NM_001366314 284076 Hs.91930 NM_173623 ENSG00000170703 TTLL6 TTL.6 tubulin tyrosine ligase like 6 protein-coding 333-5 chr10 120535185 120535606 + 1.33333 NA intron (NM_001030059, intron 5 of 6) L1M4|LINE|L1 -62554 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 390-2 chr1 218670476 218670908 + 1.33333 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) intron (NR_031644, intron 3 of 6) 160597 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 195.666-17 chr14 52223522 52223776 + 1.33333 NA Intergenic MER83A-int|LTR|ERV1 -44049 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 337.666-8 chr5 52458868 52459380 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -328792 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 202-145 chr5 30029180 30029346 + 1.33333 NA Intergenic UCON5|Unknown|Unknown 148703 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 226.666-37 chr6 88479867 88480053 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59409 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 316.667 chr1 2286395 2286822 + 1.33333 NA intron (NM_003036, intron 1 of 6) MER45B|DNA|hAT-Tip100 58289 NM_003036 6497 Hs.656507 NM_003036 ENSG00000157933 SKI SGS|SKV SKI proto-oncogene protein-coding 154.666-13 chr5 79325586 79325795 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_152405, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_152405, exon 11 of 11) 89559 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 164.667-125 chr20 47240408 47240586 + 1.33333 NA intron (NM_001281774, intron 15 of 23) AluSx1|SINE|Alu 73530 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 349.666-2 chr1 197761234 197761543 + 1.33333 NA intron (NM_001195216, intron 2 of 2) intron (NM_001195216, intron 2 of 2) 14092 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 226.666-12 chr14 52462613 52462847 + 1.33333 NA intron (NM_001160047, intron 16 of 20) MER57A-int|LTR|ERV1 89775 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 204-4 chr1 56662716 56663042 + 1.33333 NA intron (NM_006252, intron 1 of 8) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -17561 NR_135111 101929935 NR_135111 LOC101929935 - uncharacterized LOC101929935 ncRNA 314-26 chr21 27651459 27652048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70626 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 190-126 chr8 122458633 122458799 + 1.33333 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 109928 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 255.999 chr1 23234076 23234309 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -39463 NM_000864 3352 Hs.121482 NM_000864 ENSG00000179546 HTR1D 5-HT1D|HT1DA|HTR1DA|HTRL|RDC4 5-hydroxytryptamine receptor 1D protein-coding 211-14 chr11 3851458 3851644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4113 NM_001277962 6786 Hs.501735 NM_003156 ENSG00000167323 STIM1 D11S4896E|GOK|IMD10|STRMK|TAM|TAM1 stromal interaction molecule 1 protein-coding 236.666-16 chr14 70516754 70516991 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 18132 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 196-180 chr8 83612695 83612872 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 209025 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 197.666-52 chr5 64652107 64652297 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -38301 NM_001164442 100132916 Hs.591776 NM_001164442 ENSG00000145642 SHISAL2B FAM159B shisa like 2B protein-coding 315.666-11 chr3 111772540 111772799 + 1.33333 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) 40173 NM_001134437 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 419.333-5 chr17 57409126 57409600 + 1.33333 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 114234 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 204.666-51 chr22 28515877 28516035 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluSq2|SINE|Alu 56087 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 279.666-13 chr6 53712018 53712258 + 1.33333 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy -46382 NM_001003760 401265 Hs.131064 NM_001003760 ENSG00000124743 KLHL31 BKLHD6|KBTBD1|KLHL|bA345L23.2 kelch like family member 31 protein-coding 292-8 chr12 32642290 32642628 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001304484, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001304484, exon 18 of 18) -36741 NM_012063 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 194-131 chr7 46631384 46631566 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65647 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 232-11 chr10 55421538 55421829 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -177359 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 212.666-82 chr7 19521814 19522043 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 183508 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 199.667-7 chr1 166739393 166739677 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -99940 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 251.333-76 chr3 45834068 45834289 + 1.33333 NA intron (NM_001276379, intron 5 of 9) intron (NM_001276379, intron 5 of 9) 7941 NM_020347 54585 Hs.30824 NM_020347 ENSG00000163818 LZTFL1 BBS17 leucine zipper transcription factor like 1 protein-coding 383.999-5 chr4 163651121 163651460 + 1.33333 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) intron (NM_001166373, intron 4 of 7) -37756 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 204-3 chr1 51726514 51726756 + 1.33333 NA intron (NM_148906, intron 3 of 22) intron (NM_148906, intron 3 of 22) -3215 NM_148905 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 263.333-16 chr12 23247401 23247693 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 71911 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 196.333-125 chr3 193307057 193307433 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_046758) promoter-TSS (NR_046758) 1 NR_046758 100874218 Hs.407490 NR_046758 ATP13A5-AS1 - ATP13A5 antisense RNA 1 ncRNA 202.333-32 chr11 19022694 19022905 + 1.33333 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 37218 NM_001303615 117194 Hs.350566 NM_054030 ENSG00000183695 MRGPRX2 MGRG3|MRGX2 MAS related GPR family member X2 protein-coding 251.999-10 chr5 173079921 173080250 + 1.33333 NA intron (NM_001168393, intron 1 of 3) intron (NM_001168393, intron 1 of 3) 23733 NM_001168393 153222 Hs.484195 NM_153607 ENSG00000164463 CREBRF C5orf41|LRF CREB3 regulatory factor protein-coding 183.333-140 chr6 40605488 40605704 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -18232 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 280.333-44 chrX 132478049 132478279 + 1.33333 NA intron (NM_001170704, intron 1 of 8) intron (NM_001170704, intron 1 of 8) 11871 NM_001170704 55796 Hs.105134 NM_018388 ENSG00000076770 MBNL3 CHCR|MBLX|MBLX39|MBXL muscleblind like splicing regulator 3 protein-coding 270.666-15 chr2 82445644 82445931 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -411016 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 339.666-12 chr5 38385300 38385702 + 1.33333 NA intron (NM_152403, intron 6 of 21) MER2|DNA|TcMar-Tigger 17970 NR_102750 100506475 Hs.662304 NR_102749 ENSG00000248572 EGFLAM-AS2 - EGFLAM antisense RNA 2 ncRNA 287.333-21 chr14 69173032 69173447 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18238 NR_034164 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 197.333-235 chr8 102471755 102471919 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -59137 NM_015902 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 177.333-82 chr2 62614210 62614562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59492 NM_001142615 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 212.667-71 chr2 49156991 49157249 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -2593 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 305.333-21 chr14 46285503 46285818 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -185699 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 186.666-53 chr8 135891232 135891400 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 433860 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 251.333-80 chr3 118979631 118979988 + 1.33333 NA intron (NM_001353325, intron 1 of 7) L1MA4A|LINE|L1 36733 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 297.333-30 chr2 13717846 13718093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 682989 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 289.333-63 chr8 89341257 89341611 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 416277 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 194.666-54 chr4 133804664 133804831 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 397042 NM_001114734 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 223.333-98 chr22 27608461 27608750 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193151 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 249.666-32 chr4 182632456 182632780 + 1.33333 NA intron (NM_001080477, intron 5 of 27) L1ME4a|LINE|L1 284635 NM_001351744 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 207.333-33 chr10 69987283 69987513 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -65448 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 187.333-55 chr13 83937726 83937971 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55374 NM_001281503 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 168.333-125 chr22 31024557 31024705 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 55420 NR_152871 55000 Hs.554829 NR_002323 ENSG00000253352 TUG1 LINC00080|NCRNA00080|TI-227H taurine up-regulated 1 ncRNA 204.666-35 chr16 47290275 47290497 + 1.33333 NA intron (NM_030790, intron 10 of 17) L1MA5|LINE|L1 146318 NR_110903 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 299.333-46 chr20 9122318 9122772 + 1.33333 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) intron (NM_001172646, intron 1 of 37) 53491 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 295-46 chr7 68662164 68662636 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 642147 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 198.667-129 chr3 136756875 136757164 + 1.33333 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -4641 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 228.333-112 chrX 73480033 73480226 + 1.33333 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 32875 NM_005193 1046 Hs.553488 NM_005193 ENSG00000131264 CDX4 - caudal type homeobox 4 protein-coding 200-109 chr3 182765025 182765175 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28404 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 240.333-5 chr1 167075252 167075513 + 1.33333 NA intron (NM_005814, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 14995 NM_005814 10223 Hs.651244 NM_005814 ENSG00000143167 GPA33 A33 glycoprotein A33 protein-coding 200-183 chrX 126312824 126312985 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -146615 NM_001013628 340578 Hs.181867 NM_001013628 ENSG00000198354 DCAF12L2 WDR40C DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 2 protein-coding 252.333-20 chr14 60520586 60520920 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11607 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 187-76 chr6 150501713 150501920 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -98069 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 133.333-157 chr5 165139588 165139730 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 669380 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 277.333-64 chr3 120672562 120672839 + 1.33333 NA intron (NM_000187, intron 3 of 13) MIRb|SINE|MIR 9539 NM_000187 3081 Hs.368254 NM_000187 ENSG00000113924 HGD AKU|HGO homogentisate 1,2-dioxygenase protein-coding 332.666-27 chr6 100097592 100097999 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -103557 NM_032503 84539 Hs.591342 NM_032503 ENSG00000152034 MCHR2 GPR145|GPRv17|MCH-2R|MCH-R2|MCH2|MCH2R|MCHR-2|SLT melanin concentrating hormone receptor 2 protein-coding 215.333-151 chr4 183580630 183580951 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 74708 NM_001291959 3622 Hs.107153 NM_001564 ENSG00000168556 ING2 ING1L|p33ING2 inhibitor of growth family member 2 protein-coding 237.333-40 chr17 39524929 39525250 + 1.33333 NA intron (NM_015083, intron 12 of 13) intron (NM_015083, intron 12 of 13) 63603 NM_016507 51755 Hs.345028 NM_015083 ENSG00000167258 CDK12 CRK7|CRKR|CRKRS cyclin dependent kinase 12 protein-coding 207.333-39 chr10 110858490 110858671 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 12324 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 294.666-19 chr2 210397252 210397575 + 1.33333 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 72701 NR_110606 102724820 Hs.659232 NR_110604 LANCL1-AS1 LANCLOT LANCL1 antisense RNA 1 ncRNA 220.666-77 chr9 5028363 5028598 + 1.33333 NA intron (NM_004972, intron 3 of 24) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -13213 NM_001322204 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 203.333-29 chr10 49778339 49778546 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -16063 NM_001347826 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 199.333-6 chr1 60202913 60203081 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -129227 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 215.666-5 chr10 29173597 29173884 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -115330 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 204-142 chr3 196791354 196791609 + 1.33333 NA intron (NM_002577, intron 2 of 14) intron (NM_002577, intron 2 of 14) 51624 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 253-21 chr14 61578854 61579229 + 1.33333 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 -8388 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 324.333-19 chr17 61259791 61260294 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) MIRb|SINE|MIR 107662 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 210-109 chr4 147431734 147431980 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -49060 NM_001166055 1909 Hs.183713 NM_001957 ENSG00000151617 EDNRA ET-A|ETA|ETA-R|ETAR|ETRA|MFDA|hET-AR endothelin receptor type A protein-coding 218.667-3 chr1 99300978 99301282 + 1.33333 NA intron (NM_001166252, intron 5 of 5) intron (NM_001166252, intron 5 of 5) 36838 NM_014839 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 432.333-9 chr4 62452115 62452692 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -290638 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 225.666 chr1 231885465 231885672 + 1.33333 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) intron (NM_001164541, intron 9 of 9) -40266 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 261.333-65 chr3 67483420 67483723 + 1.33333 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) L2a|LINE|L2 171043 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 192.666-3 chr1 170723729 170723906 + 1.33333 NA intron (NM_022716, intron 2 of 3) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 59686 NM_022716 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 226-40 chr2 62122399 62122711 + 1.33333 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) intron (NM_001321781, intron 2 of 2) -73560 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 213.333-24 chr10 28308489 28308727 + 1.33333 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -5544 NR_134518 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 231.999-10 chr5 34652155 34652395 + 1.33333 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -4053 NM_015577 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 213.333-147 chr4 77698215 77698381 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120766 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 213.666-13 chr14 43710436 43710626 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 796752 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 248.333-69 chr4 60931341 60931625 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8864 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 230-2 chr1 53040465 53040787 + 1.33333 NA intron (NM_001193600, intron 13 of 14) AluY|SINE|Alu -21426 NM_001199081 127435 Hs.586141 NM_153703 ENSG00000174348 PODN PCAN|SLRR5A podocan protein-coding 187-93 chr9 132099965 132100180 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -20205 NM_001253881 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 306-6 chr10 79011174 79011495 + 1.33333 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) LTR33|LTR|ERVL 56114 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 382-7 chr3 61200753 61201191 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 1 of 9) intron (NM_001320900, intron 1 of 9) 50480 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 162-98 chr4 163984023 163984221 + 1.33333 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) 213589 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 196.333-22 chr11 105417635 105417898 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -192307 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 247.666-20 chr3 21805682 21805926 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54594 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 315.666-4 chr10 24190939 24191354 + 1.33333 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) AluJb|SINE|Alu -17645 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 221.666-15 chr12 51356573 51356743 + 1.33333 NA intron (NM_007210, intron 10 of 11) AluJo|SINE|Alu -9979 NM_001971 1990 Hs.348395 NM_001971 ENSG00000139610 CELA1 ELA1 chymotrypsin like elastase 1 protein-coding 206.333-46 chr13 91432289 91432535 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 1 of 7) intron (NM_004466, intron 1 of 7) 33791 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 132-22 chr10 81299583 81299740 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -575533 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 146-15 chr11 15723757 15723874 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 79930 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 151.333-62 chr10 83634084 83634298 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42898 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 196.666-57 chr2 216180656 216180813 + 1.33333 NA intron (NM_021141, intron 16 of 20) intron (NM_021141, intron 16 of 20) -36155 NR_037701 150967 Hs.56876 NM_001199924 ENSG00000260804 LINC01963 PKI55 long intergenic non-protein coding RNA 1963 ncRNA 317.666-9 chr2 109719044 109719581 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -73446 NM_032260 84220 Hs.469630 NM_005054 ENSG00000015568 RGPD5 BS-63|BS63|HEL161|RGP5 RANBP2 like and GRIP domain containing 5 protein-coding 202-46 chr14 51357868 51358160 + 1.33333 NA intron (NR_038358, intron 4 of 4) intron (NR_038358, intron 4 of 4) 24621 NR_038358 283553 Hs.325752 NR_038358 ENSG00000258479 LINC00640 - long intergenic non-protein coding RNA 640 ncRNA 154.667-88 chr12 115199477 115199653 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -515390 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 339-11 chr2 120160188 120160597 + 1.33333 NA intron (NM_001330310, intron 20 of 24) intron (NM_001330310, intron 20 of 24) 63008 NM_024121 79134 Hs.376722 NM_024121 ENSG00000226479 TMEM185B FAM11B transmembrane protein 185B protein-coding 120.333-153 chr5 45522392 45522629 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 173870 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 198.333-99 chr2 123557926 123558205 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 467109 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 245.333-22 chr11 77638227 77638554 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001311199) promoter-TSS (NM_001311199) -584 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 190.667-63 chr2 40483880 40484124 + 1.33333 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 28433 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 172.666-3 chr10 20697794 20698017 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 145935 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 254.666-2 chr1 115442841 115443123 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -104746 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 201-74 chr3 24170848 24171147 + 1.33333 NA intron (NM_001354708, intron 4 of 9) intron (NM_001354708, intron 4 of 9) 19673 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 316-45 chr6 50058370 50058689 + 1.33333 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -8600 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 184.666-22 chr3 47175002 47175199 + 1.33333 NA intron (NR_033373, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu 10730 NR_033373 285352 Hs.570631 NR_033373 KIF9-AS1 - KIF9 antisense RNA 1 ncRNA 139.666-2 chr8 129679706 129679856 + 1.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 458 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 252.333-33 chr2 86414280 86414604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26929 NM_018433 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 324.999-2 chr10 23104224 23104589 + 1.33333 NA intron (NM_012228, intron 2 of 4) intron (NM_012228, intron 2 of 4) 8827 NM_012228 22921 Hs.461420 NM_012228 ENSG00000148450 MSRB2 CBS-1|CBS1|CGI-131|MSRB|PILB methionine sulfoxide reductase B2 protein-coding 216.666-9 chr1 213200821 213201022 + 1.33333 NA intron (NM_001349659, intron 9 of 16) L1PA13|LINE|L1 149680 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 198-88 chr2 48158956 48159111 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -155649 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 257.333-42 chr16 61209560 61209960 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -153994 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 224.666-29 chr4 71731538 71731764 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 52428 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 248.667-61 chr2 134886775 134887101 + 1.33333 NA intron (NR_036549, intron 1 of 4) L1MC4|LINE|L1 29118 NR_049856 100847069 NR_049856 ENSG00000263783 MIR5590 - microRNA 5590 ncRNA 199.333-92 chr16 74498549 74498838 + 1.33333 NA intron (NR_027264, intron 4 of 26) AluSq|SINE|Alu -77223 NM_001011880 497190 Hs.454670 NM_001011880 ENSG00000140839 CLEC18B MRCL2 C-type lectin domain family 18 member B protein-coding 526.666-2 chr3 83039399 83039874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1053494 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 159-70 chr2 236475835 236475963 + 1.33333 NA intron (NR_073043, intron 5 of 19) L1MA4|LINE|L1 27798 NM_001270585 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 152.333-45 chr10 53712208 53712363 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -773945 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 207.666-67 chr8 138378199 138378463 + 1.33333 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 118930 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 170-18 chr11 98873527 98873685 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -147343 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 411.333-19 chr8 103014532 103015054 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6290 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 311.666-12 chr4 61461370 61461678 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 259352 NM_001371342 261.333-91 chr5 144664686 144665081 + 1.33333 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 459492 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 201.666-19 chr15 97659875 97660182 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99330 NR_110756 101927310 Hs.560324 NR_110756 ENSG00000259582 LOC101927310 - uncharacterized LOC101927310 ncRNA 362-23 chr5 97808790 97809251 + 1.33333 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -31738 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 214.333-84 chr20 8715181 8715414 + 1.33333 NA intron (NM_182734, intron 12 of 32) intron (NM_182734, intron 12 of 32) -115888 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 229-44 chr3 182197240 182197633 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 245072 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 231-43 chr3 137058627 137058898 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 100779 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 215.333-58 chr14 73426497 73426723 + 1.33333 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu 31970 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 175.667-129 chr6 159643858 159644056 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49284 NM_000636 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 365.666-4 chr10 75437924 75438297 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 1 of 6) intron (NM_001305581, intron 1 of 6) 6486 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 161.333-307 chrX 83763410 83763570 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -97636 NM_001271680 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 251.667-76 chr5 19063316 19063664 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 822782 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 448.333-6 chr5 5053575 5053995 + 1.33333 NA intron (NR_026994, intron 2 of 6) intron (NR_026994, intron 2 of 6) 19426 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 151-130 chr8 129032524 129032730 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66626 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 255-88 chr9 32758507 32758828 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -24873 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 254.666-24 chr4 17532438 17532713 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17410 NM_001079827 645104 Hs.631526 NM_001079827 ENSG00000249581 CLRN2 - clarin 2 protein-coding 160.666-17 chr6 124540292 124540491 + 1.33333 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 257386 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 239.666 chr1 97064510 97064890 + 1.33333 NA Intergenic UCON31|Unknown|Unknown -31223 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 174.333-87 chr3 47331697 47331884 + 1.33333 NA intron (NM_025010, intron 4 of 9) L2|LINE|L2 48846 NM_025010 23276 Hs.517946 NM_025010 ENSG00000114648 KLHL18 - kelch like family member 18 protein-coding 240.333-32 chr13 56021625 56021975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 847346 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 172.333-59 chr15 93602592 93602799 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -253865 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 200.333-2 chr1 49317193 49317412 + 1.33333 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR 59891 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 289.666-4 chr15 46521971 46522245 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -661981 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 204-8 chr1 90300424 90300676 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 305440 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 230-9 chr10 73494920 73495233 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_132103) promoter-TSS (NR_132103) -676 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 247.999-12 chr7 81823406 81823700 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53506 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 211.333-133 chr20 50279371 50279636 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001278655, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001278655, exon 4 of 4) 12017 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 211.333-138 chr21 44033412 44033658 + 1.33333 NA intron (NM_003274, intron 2 of 22) intron (NM_003274, intron 2 of 22) 21226 NM_003274 7109 Hs.126221 NM_003274 ENSG00000160218 TRAPPC10 EHOC-1|EHOC1|GT334|TMEM1|TRS130|TRS30 trafficking protein particle complex 10 protein-coding 208.666-48 chr16 78492664 78492846 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 393101 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 160.666-12 chr3 151148064 151148189 + 1.33333 NA intron (NM_053002, intron 4 of 42) L1MB7|LINE|L1 55090 NM_013308 29909 Hs.549152 NM_013308 ENSG00000174946 GPR171 H963 G protein-coupled receptor 171 protein-coding 210.333-27 chr11 84664698 84665020 + 1.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 56083 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 222.666-8 chr10 67681395 67681565 + 1.33333 NA intron (NM_013266, intron 1 of 17) L1M5|LINE|L1 14715 NM_013266 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 382-16 chr9 86416790 86417533 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -62751 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 335.666-4 chr10 112535212 112535551 + 1.33333 NA intron (NM_001365712, intron 5 of 8) intron (NM_001365712, intron 5 of 8) -87778 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 245-16 chr14 26458855 26459174 + 1.33333 NA intron (NM_006489, intron 3 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 94416 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 196.666-103 chr8 22350926 22351075 + 1.33333 NA intron (NM_001330480, intron 20 of 21) AluSz6|SINE|Alu -16278 NM_001351656 23516 Hs.491232 NM_015359 ENSG00000104635 SLC39A14 HCIN|HMNDYT2|LZT-Hs4|NET34|ZIP14|cig19 solute carrier family 39 member 14 protein-coding 187.666-13 chr18 68982000 68982218 + 1.33333 NA intron (NM_001093729, intron 8 of 9) intron (NM_001093729, intron 8 of 9) 184029 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 366.999-6 chr5 8486094 8486408 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 25326 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 249.666-18 chr2 37955019 37955379 + 1.33333 NA intron (NM_144713, intron 2 of 10) L1MB3|LINE|L1 4735 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 426.333-5 chr15 85005968 85006550 + 1.33333 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) L1PA3|LINE|L1 24285 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 176.667-110 chr4 54729900 54730159 + 1.33333 NA intron (NM_000222, intron 14 of 20) intron (NM_000222, intron 14 of 20) 72101 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 199.333-143 chr2 167871037 167871282 + 1.33333 NA TTS (NM_020981) TTS (NM_020981) 52487 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 287-13 chr19 37808027 37808443 + 1.33333 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -9176 NR_040013 644554 Hs.683930 NR_040013 LOC644554 - uncharacterized LOC644554 ncRNA 221-64 chr7 102821730 102821955 + 1.33333 NA intron (NR_105043, intron 20 of 20) intron (NR_105043, intron 20 of 20) 72843 NR_146982 222234 Hs.202543 NM_147194 ENSG00000222011 FAM185A - family with sequence similarity 185 member A protein-coding 332-2 chr10 13560232 13560661 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26519 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 251.999-9 chr5 80328859 80329078 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8966 NM_032567 84654 Hs.519403 NM_032567 ENSG00000164299 SPZ1 CILD38|NYD-TSP1|PPP1R148 spermatogenic leucine zipper 1 protein-coding 309.333-51 chr5 16557281 16557593 + 1.33333 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) intron (NM_001034850, intron 3 of 8) -48439 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 211.333-51 chr13 68666166 68666393 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 219046 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 266.666-28 chr7 134035396 134035680 + 1.33333 NA intron (NM_021807, intron 17 of 17) intron (NM_021807, intron 17 of 17) -91802 NM_001365700 136332 Hs.149774 NM_144648 ENSG00000155530 LRGUK CFAP246 leucine rich repeats and guanylate kinase domain containing protein-coding 201.333-27 chr10 8688546 8688717 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94240 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 194-7 chr10 15544592 15544839 + 1.33333 NA intron (NM_001291494, intron 26 of 28) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -173426 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 206.666-7 chr1 104355715 104355906 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 282787 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 210-12 chr1 195977703 195977887 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 110920 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 212.333-32 chr12 33490785 33491078 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -51112 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 214.667-66 chr2 75166865 75167185 + 1.33333 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) intron (NM_015727, intron 1 of 3) 32495 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 209.666-4 chr1 172462235 172462423 + 1.33333 NA intron (NM_139240, intron 5 of 6) intron (NM_139240, intron 5 of 6) 9436 NM_001300760 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 219.666-12 chr13 82371252 82371477 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -1144381 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 264-37 chr4 21286827 21287044 + 1.33333 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 16971 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 214.666-23 chr15 45955027 45955265 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 249951 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 226.999-5 chr21 15565598 15565798 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -164236 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 198.666-100 chrX 114246450 114246631 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -308322 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 295.666-13 chr3 24462144 24462447 + 1.33333 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR -31792 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 186.333-52 chr14 73678284 73678486 + 1.33333 NA intron (NM_001201366, intron 6 of 8) intron (NM_001201366, intron 6 of 8) 33399 NM_031427 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 195.666-5 chr10 31794497 31794712 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 114322 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 246.333-71 chr5 14799899 14800257 + 1.33333 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 25934 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 172-47 chr16 74861173 74861334 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -86433 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 214-56 chr18 22949875 22950106 + 1.33333 NA intron (NM_002894, intron 4 of 18) intron (NM_002894, intron 4 of 18) 16114 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 179.333-149 chr5 25025434 25025653 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 165113 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 355.333-39 chr9 99323998 99324382 + 1.33333 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack 51067 NR_102270 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 204.666-111 chr8 131535450 131535668 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -368534 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 261.333-49 chr2 123154358 123154799 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -81097 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 204-75 chr16 87376869 87377077 + 1.33333 NA intron (NM_001282683, intron 2 of 9) intron (NM_001282683, intron 2 of 9) 6803 NM_024735 79791 Hs.567582 NM_024735 ENSG00000103264 FBXO31 FBX14|FBXO14|Fbx31|MRT45|pp2386 F-box protein 31 protein-coding 276-45 chr3 45066213 45066572 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 36249 NM_001308394 7123 Hs.476092 NM_003278 ENSG00000163815 CLEC3B TN|TNA C-type lectin domain family 3 member B protein-coding 143.333-155 chr20 46817939 46818086 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -76612 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 205.333-121 chr2 53684143 53684332 + 1.33333 NA intron (NM_001201965, intron 8 of 8) intron (NM_001201965, intron 8 of 8) -83546 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 191.333-63 chr14 64039281 64039508 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 45 of 114) intron (NM_015180, intron 45 of 114) 55731 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 315.333-47 chr7 90355270 90355528 + 1.33333 NA intron (NM_033107, intron 4 of 9) intron (NM_033107, intron 4 of 9) 8683 NM_033107 85865 Hs.593547 NM_033107 ENSG00000105793 GTPBP10 ObgH2|UG0751c10 GTP binding protein 10 protein-coding 261.666-13 chr3 6045101 6045375 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 760211 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 219.333-100 chr2 197878977 197879245 + 1.33333 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) MER102b|DNA|hAT-Charlie 74518 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 330.333-5 chr10 124941724 124942154 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_017580) promoter-TSS (NM_017580) -184 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 334.666-3 chr11 19398007 19398419 + 1.33333 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 47489 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 188.333-142 chr7 47802884 47803161 + 1.33333 NA intron (NM_138295, intron 53 of 56) intron (NM_138295, intron 53 of 56) 7731 NR_161269 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 364.333-24 chr6 74087754 74088208 + 1.33333 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 18530 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 246-78 chr4 37980331 37980561 + 1.33333 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) intron (NM_001253912, intron 2 of 20) 20048 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 208.666-67 chr22 28003086 28003304 + 1.33333 NA TTS (NR_026963) TTS (NR_026963) -82583 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 205.666-35 chr3 406196 406422 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_006614, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_006614, exon 28 of 28) -20514 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 396-12 chr5 117888472 117888904 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 158327 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 253.666-27 chr7 46192131 46192330 + 1.33333 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL -270958 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 274.333-42 chr2 180384754 180385215 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -307120 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 228.333-108 chr9 94465261 94465447 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -89691 NR_121569 101928099 Hs.674409 NR_121566 PCAT7 PCAN-R2 prostate cancer associated transcript 7 ncRNA 372.666-11 chr8 82628781 82629353 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -283037 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 273.667-25 chr15 64392467 64392849 + 1.33333 NA intron (NM_001321924, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 4822 NM_016213 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 186.666-18 chr13 94245980 94246192 + 1.33333 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) L1MA9|LINE|L1 -58095 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 209.333-22 chr10 66326971 66327182 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -598960 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 192-126 chr6 129903891 129904042 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -42651 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 211.667-117 chr9 99083084 99083340 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21901 NM_004612 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 256-6 chr1 153413675 153413986 + 1.33333 NA intron (NM_001319198, intron 1 of 2) AluSq|SINE|Alu -2690 NM_176823 338324 Hs.442337 NM_176823 ENSG00000184330 S100A7A NICE-2|NICE2|S100A15|S100A7L1|S100A7f S100 calcium binding protein A7A protein-coding 327.666-3 chr14 60069345 60069951 + 1.33333 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -22263 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 380.667-4 chr17 76201813 76202364 + 1.33333 NA intron (NM_052916, intron 2 of 18) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 38405 NM_052916 114804 Hs.500643 NM_052916 ENSG00000141576 RNF157 - ring finger protein 157 protein-coding 176-82 chr6 70864417 70864657 + 1.33333 NA intron (NM_080742, intron 2 of 3) intron (NM_080742, intron 2 of 3) 92523 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 196-14 chr10 18516694 18516849 + 1.33333 NA intron (NM_201597, intron 7 of 13) intron (NM_201597, intron 7 of 13) 116196 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 264.333-43 chr20 61185319 61185659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66772 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 319.999 chr2 122722053 122722336 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 351287 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 374-17 chr5 38889495 38889999 + 1.33333 NA intron (NM_003999, intron 7 of 17) L1ME3F|LINE|L1 43735 NM_003999 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 224.333-59 chr2 15448806 15449087 + 1.33333 NA intron (NR_052013, intron 21 of 50) intron (NR_052013, intron 21 of 50) 112388 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 297.333-10 chr11 71254729 71255027 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30082 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 313.333-9 chr12 88493946 88494244 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003994, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_003994, exon 9 of 9) 86376 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 202-159 chr6 37908724 37908986 + 1.33333 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) L1MC4|LINE|L1 89128 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 258 chr1 92152506 92152856 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16243 NM_015237 23285 Hs.21554 NM_015237 ENSG00000189195 KIAA1107 - KIAA1107 protein-coding 222.666-10 chr11 73915652 73915853 + 1.33333 NA intron (NM_001267803, intron 9 of 12) intron (NM_001267803, intron 9 of 12) 26971 NM_001363556 80227 Hs.525017 NM_025155 ENSG00000175575 PAAF1 PAAF|Rpn14|WDR71 proteasomal ATPase associated factor 1 protein-coding 171.333-191 chr8 56157984 56158147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44083 NM_005372 4342 Hs.533432 NM_005372 ENSG00000172680 MOS MSV MOS proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 161.333-138 chr2 14706930 14707168 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 74332 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 269.666-17 chr8 13205460 13205787 + 1.33333 NA intron (NM_001348082, intron 5 of 16) MER30|DNA|hAT-Charlie 70898 NM_001316668 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 147.666-3 chr10 93874455 93874648 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19427 NR_144337 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 182-72 chr3 189595642 189595845 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1003 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 332-24 chr3 37295441 37295808 + 1.33333 NA intron (NM_001172713, intron 7 of 22) intron (NM_001172713, intron 7 of 22) -51429 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 211-82 chr5 41976166 41976461 + 1.33333 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 51032 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 260-55 chr4 87627491 87627806 + 1.33333 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 19119 NM_014208 1834 Hs.678914 NM_014208 ENSG00000152591 DSPP DFNA39|DGI1|DMP3|DPP|DSP dentin sialophosphoprotein protein-coding 198.666-86 chr6 165361663 165361872 + 1.33333 NA intron (NM_006661, intron 19 of 22) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -52162 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 318.333-5 chr10 32125687 32126106 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -69471 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 311.333-28 chr19 47523908 47524191 + 1.33333 NA intron (NM_001277075, intron 14 of 16) L1ME1|LINE|L1 -8986 NR_038457 8775 Hs.126938 NM_003827 ENSG00000105402 NAPA SNAPA NSF attachment protein alpha protein-coding 229-30 chr2 35942677 35942915 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 412774 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 236-51 chr22 25574911 25575232 + 1.33333 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) intron (NM_001362778, intron 1 of 19) 10396 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 131.333-35 chr11 60832388 60832554 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9642 NM_024098 79080 Hs.4253 NM_024098 ENSG00000110104 CCDC86 - coiled-coil domain containing 86 protein-coding 126.667-48 chr14 52962953 52963108 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11933 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 205.667-29 chr11 92306165 92306449 + 1.33333 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) intron (NM_001367949, intron 1 of 27) -45789 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 379.999-10 chr6 38843343 38843707 + 1.33333 NA intron (NM_001371, intron 34 of 91) L1MC5|LINE|L1 109582 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 239.333-49 chr2 4528065 4528314 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128033 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 202.333-108 chr3 29300038 29300277 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) L1ME4a|LINE|L1 18845 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 338.333-3 chr1 186351361 186351651 + 1.33333 NA intron (NM_003292, intron 19 of 50) intron (NM_003292, intron 19 of 50) 23747 NM_003292 7175 Hs.279640 NM_003292 ENSG00000047410 TPR - translocated promoter region, nuclear basket protein protein-coding 389.666-5 chr21 44846489 44846926 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26983 NM_004339 754 Hs.474010 NM_004339 ENSG00000183255 PTTG1IP C21orf1|C21orf3|PBF PTTG1 interacting protein protein-coding 166-49 chr16 64530025 64530188 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 591957 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 332.666-26 chr5 150448999 150449495 + 1.33333 NA intron (NM_005617, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 492 NM_005617 6208 Hs.744846 NM_005617 ENSG00000164587 RPS14 EMTB|S14 ribosomal protein S14 protein-coding 246-89 chr5 164026490 164026704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 440805 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 316.667-30 chr8 24925312 24925745 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 10541 NM_001105541 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 244.667-76 chr4 154980154 154980502 + 1.33333 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 198823 NM_001277173 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 216.667-34 chr14 41119227 41119521 + 1.33333 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) L1MA2|LINE|L1 164663 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 170.667-122 chr4 62188380 62188575 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -26712 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 421.333-5 chr21 28570864 28571282 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31755 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 296-37 chr20 38799968 38800438 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5494 NM_015568 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 204.333-158 chr5 59425741 59426002 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -68901 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 173-18 chr12 10332708 10332894 + 1.33333 NA TTS (NR_159946) TTS (NR_159946) 5491 NR_159946 113523642 Hs.539490 NR_159946 LINC02617 - long intergenic non-protein coding RNA 2617 ncRNA 232.333-22 chr14 50604201 50604643 + 1.33333 NA intron (NM_015915, intron 6 of 13) L2c|LINE|L2 44397 NM_181598 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 255.333-69 chr22 28468744 28469014 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 9010 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 240-6 chr1 172931110 172931451 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 119683 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 219.666-45 chr8 129286246 129286537 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -45151 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 182.333-78 chr2 37680412 37680636 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -7989 NM_001270436 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 228-81 chr7 81488604 81488924 + 1.33333 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 73055 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 158.667-262 chr5 25497711 25497932 + 1.33333 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 306868 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 156-113 chr5 44755176 44755368 + 1.33333 NA intron (NR_109865, intron 1 of 2) intron (NR_109865, intron 1 of 2) 53521 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 286.666-5 chr14 80881106 80881396 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 8 of 24) L1MA2|LINE|L1 60487 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 193.667-24 chr11 22965762 22966007 + 1.33333 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -105410 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 195.333-33 chr10 76787872 76788122 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -100047 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 336.333-8 chr10 62609268 62609750 + 1.33333 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 89061 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 155.667-99 chr14 68892399 68892543 + 1.33333 NA intron (NM_001102, intron 9 of 20) intron (NM_001102, intron 9 of 20) 86831 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 210.333-116 chr4 67547045 67547305 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1672 NM_001812 1060 Hs.479867 NM_001812 ENSG00000145241 CENPC CENP-C|CENPC1|MIF2|hcp-4 centromere protein C protein-coding 219.333-46 chr13 36007684 36007919 + 1.33333 NA intron (NM_001330071, intron 3 of 16) intron (NM_001330071, intron 3 of 16) 123581 NM_001330071 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 259.667-16 chr12 8687945 8688386 + 1.33333 NA intron (NR_123740, intron 1 of 8) intron (NR_123740, intron 1 of 8) 6488 NM_001352267 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 234.666-42 chr6 145992059 145992294 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27818 NM_001370328 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 214.666-69 chr7 112894748 112894932 + 1.33333 NA intron (NM_152556, intron 3 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 45035 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 176.333-154 chr7 29337297 29337493 + 1.33333 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) intron (NM_001293070, intron 2 of 13) -128425 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 214-64 chr2 41538307 41538592 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -339106 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 218-42 chr19 33806934 33807178 + 1.33333 NA intron (NM_001129994, intron 5 of 6) intron (NM_001129994, intron 5 of 6) 10186 NM_024076 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 188-78 chr4 35379375 35379619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 864442 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 299.999 chr15 35817999 35818269 + 1.33333 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) intron (NR_038251, intron 2 of 2) -108722 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 240-55 chr20 31546087 31546408 + 1.33333 NA intron (NM_178580, intron 4 of 12) AluY|SINE|Alu 27016 NR_046853 100874042 Hs.373741 NR_046853 ENSG00000230613 HM13-AS1 - HM13 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-275 chr4 97683494 97683694 + 1.33333 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) L1MC2|LINE|L1 316668 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 210.666-109 chr8 122064024 122064250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -422697 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 298-53 chr22 24996250 24996687 + 1.33333 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -31506 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 140.666-6 chr3 87704199 87704388 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -88413 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 417.332-3 chr4 20965708 20966062 + 1.33333 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 18124 NM_001363504 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 556.666-2 chr8 80370108 80370796 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -115141 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 158.333-45 chr10 116904457 116904639 + 1.33333 NA intron (NM_001127211, intron 15 of 16) intron (NM_001127211, intron 15 of 16) -54826 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 206.666-112 chr7 54165327 54165521 + 1.33333 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -165273 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 209-124 chr9 95153788 95153967 + 1.33333 NA intron (NM_001243744, intron 6 of 13) intron (NM_001243744, intron 6 of 13) -67783 NR_036109 100422842 NR_036109 ENSG00000207617 MIR3074 mir-3074 microRNA 3074 ncRNA 310.666-12 chr2 217174957 217175242 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -107634 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 415.666-4 chr4 61460377 61460824 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 258428 NM_001371342 244.333-27 chr11 115372997 115373191 + 1.33333 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -23662 NR_135102 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 191.333-132 chr3 40982402 40982574 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -217017 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 164.666-17 chr7 111607739 111607942 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45323 NM_001350959 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 193.333-125 chr3 112555122 112555359 + 1.33333 NA intron (NM_001278712, intron 2 of 10) intron (NM_001278712, intron 2 of 10) -6080 NM_001348906 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 136-62 chr3 71493604 71493756 + 1.33333 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) intron (NR_146142, intron 2 of 19) 48409 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 190-86 chr4 30563782 30563972 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -156492 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 294-53 chr5 115525903 115526185 + 1.33333 NA intron (NM_020177, intron 2 of 2) FLAM_C|SINE|Alu 18731 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 262.333-49 chr2 150174199 150174642 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 82587 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 192.333-54 chr14 70849772 70850010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40378 NM_033141 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 249.333-19 chr11 60599145 60599406 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -16476 NR_026946 283197 Hs.372650 NM_174939 ENSG00000181995 LINC00301 C11orf64|NCRNA00301 long intergenic non-protein coding RNA 301 ncRNA 266.333-4 chr10 15423915 15424245 + 1.33333 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -52791 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 143.333-170 chr22 47939588 47939742 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 307991 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 235.333-78 chr3 179272395 179272590 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5442 NM_001163677 27094 Hs.591285 NM_014407 ENSG00000171121 KCNMB3 BKBETA3|HBETA3|K(VCA)BETA-3|KCNMB2|KCNMBL|SLO-BETA-3|SLOBETA3 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 3 protein-coding 199.333-250 chr6 159613665 159613821 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 79498 NM_000636 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 200.666-8 chr1 113099531 113099719 + 1.33333 NA intron (NM_014813, intron 9 of 17) intron (NM_014813, intron 9 of 17) 26427 NM_001312686 9860 Hs.448972 NM_014813 ENSG00000198799 LRIG2 LIG-2|LIG2|UFS2 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 protein-coding 273-7 chr10 69349500 69349805 + 1.33333 NA intron (NM_033496, intron 2 of 17) intron (NM_033496, intron 2 of 17) 30805 NM_000188 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 139.333-47 chr12 4727136 4727336 + 1.33333 NA intron (NM_017417, intron 2 of 10) intron (NM_017417, intron 2 of 10) 6836 NM_017417 26290 Hs.511985 NM_017417 ENSG00000130035 GALNT8 GALNAC-T8 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 8 protein-coding 269.999-6 chr3 13051605 13051847 + 1.33333 NA intron (NM_001134382, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 21703 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 419.666-6 chr8 77718481 77718959 + 1.33333 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack 268023 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 244.666-38 chr5 78418833 78419115 + 1.33333 NA intron (NR_110885, intron 5 of 7) intron (NR_110885, intron 5 of 7) 58357 NR_110885 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 142-37 chr13 54674767 54674928 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -362799 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 138-64 chr2 232940760 232940866 + 1.33333 NA intron (NM_019850, intron 3 of 14) L1ME4a|LINE|L1 -12662 NM_001114090 25791 Hs.97316 NM_019850 ENSG00000066248 NGEF ARHGEF27|EPHEXIN neuronal guanine nucleotide exchange factor protein-coding 234.666-53 chr8 129912291 129912673 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001353247, exon 3 of 15) 5' UTR (NM_001353247, exon 3 of 15) 27329 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 193.666-29 chr3 2265662 2265828 + 1.33333 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) L1MA4|LINE|L1 26916 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 189.333-149 chr4 123266948 123267111 + 1.33333 NA intron (NM_001345856, intron 15 of 15) intron (NM_001345856, intron 15 of 15) -129766 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 180-73 chr4 45975033 45975219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 148928 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 184-91 chr5 149176027 149176198 + 1.33333 NA intron (NM_001370418, intron 1 of 18) intron (NM_001370418, intron 1 of 18) 34381 NM_001370418 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 183.333-15 chr10 74390359 74390565 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) L1MC4|LINE|L1 138862 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 211.333-127 chr2 215515387 215515682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61827 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 328.666-15 chr4 136643757 136644097 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -549829 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 294-51 chr5 65419851 65420239 + 1.33333 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 61875 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 193.333-40 chr11 98481836 98482088 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -538987 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 226-26 chr16 71274740 71275043 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 14511 NM_001324378 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 225-21 chr13 77970315 77970545 + 1.33333 NA intron (NM_000115, intron 1 of 7) LTR2|LTR|ERV1 5097 NM_000115 1910 Hs.82002 NM_000115 ENSG00000136160 EDNRB ABCDS|ET-B|ET-BR|ETB|ETB1|ETBR|ETRB|HSCR|HSCR2|WS4A endothelin receptor type B protein-coding 200.666-35 chr14 76055491 76055652 + 1.33333 NA intron (NR_045664, intron 3 of 7) MER112|DNA|hAT-Charlie 69808 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 211-2 chr1 48052044 48052219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54746 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 206-2 chr1 21016046 21016204 + 1.33333 NA intron (NM_003760, intron 2 of 31) L1M4|LINE|L1 -27693 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 209.333-136 chr21 21592105 21592352 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 145091 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 210-48 chr16 62013973 62014254 + 1.33333 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 22325 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 238.666-39 chr7 106264071 106264395 + 1.33333 NA intron (NM_005746, intron 6 of 10) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 20750 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 235.333-85 chr4 72759499 72759772 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -190414 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 281.333-49 chr5 75572381 75572673 + 1.33333 NA intron (NM_016218, intron 4 of 14) (TACTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -38949 NM_001276713 728780 Hs.370455 NM_001271529 ENSG00000189045 ANKDD1B - ankyrin repeat and death domain containing 1B protein-coding 257-74 chr8 114753173 114753566 + 1.33333 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 914644 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 170-9 chr10 61559633 61559857 + 1.33333 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 79704 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 210.666-72 chr3 179685296 179685512 + 1.33333 NA intron (NM_003940, intron 2 of 20) intron (NM_003940, intron 2 of 20) 32364 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 214.333-148 chr7 112884166 112884338 + 1.33333 NA intron (NM_152556, intron 3 of 4) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 55623 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 197-24 chr11 99411841 99412107 + 1.33333 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) intron (NM_001243271, intron 2 of 20) -144171 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 214.667-73 chr2 176038515 176038794 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -35834 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 155.333-50 chr11 19276925 19277091 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35353 NM_001256372 79733 Hs.523526 NM_024680 ENSG00000129173 E2F8 E2F-8 E2F transcription factor 8 protein-coding 392-13 chr20 20898885 20899583 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -186590 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 279.999-3 chr11 78571695 78571979 + 1.33333 NA intron (NM_001243251, intron 1 of 13) intron (NM_001243251, intron 1 of 13) 3027 NM_024678 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 197-120 chr8 127610720 127610976 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 123119 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 252.333-59 chr5 98056678 98057013 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 104394 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 364.333-13 chr15 58897473 58897994 + 1.33333 NA intron (NR_135042, intron 6 of 18) intron (NR_135042, intron 6 of 18) 35946 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 194.666-48 chr4 10394900 10395134 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 62409 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 312.333-2 chr11 47571679 47572019 + 1.33333 NA TTS (NM_001318716) TTS (NM_001318716) 6250 NM_175732 114971 Hs.656205 NM_175732 ENSG00000110536 PTPMT1 DUSP23|MOSP|PLIP|PNAS-129 protein tyrosine phosphatase mitochondrial 1 protein-coding 153.333-424 chr8 114087821 114088047 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -650995 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 220-83 chr4 145504182 145504422 + 1.33333 NA intron (NM_001354817, intron 1 of 6) intron (NM_001354817, intron 1 of 6) -1322 NR_108077 101927659 Hs.519005 NR_108077 ENSG00000250582 SMAD1-AS2 - SMAD1 antisense RNA 2 ncRNA 446.333-8 chr5 18727211 18727755 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 920209 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 349-4 chr11 38993128 38993500 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 344456 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 458-7 chr8 74847747 74848281 + 1.33333 NA intron (NM_015886, intron 5 of 5) intron (NM_015886, intron 5 of 5) 23480 NM_001324403 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 200-142 chr6 89143392 89143626 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2546 NM_001010853 135293 Hs.356247 NM_001010853 ENSG00000146281 PM20D2 ACY1L2 peptidase M20 domain containing 2 protein-coding 218-60 chr2 196290153 196290397 + 1.33333 NA intron (NM_020760, intron 14 of 28) intron (NM_020760, intron 14 of 28) 30251 NR_110226 101927482 Hs.191841 NR_110225 HECW2-AS1 - HECW2 antisense RNA 1 ncRNA 250.666-39 chr8 53578492 53578818 + 1.33333 NA Intergenic MER66C|LTR|ERV1 -54690 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 299.999-8 chr7 39472518 39472802 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66314 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 209-8 chr10 11841340 11841631 + 1.33333 NA intron (NM_153256, intron 1 of 3) L1MEd|LINE|L1 18129 NM_153256 254427 Hs.435775 NM_153256 ENSG00000148426 PROSER2 C10orf47 proline and serine rich 2 protein-coding 193.333-6 chr1 107188214 107188438 + 1.33333 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) UCON28a|Unknown|Unknown 40257 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 225 chr1 12355942 12356227 + 1.33333 NA exon (NM_018156, exon 47 of 69) exon (NM_018156, exon 47 of 69) 126054 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 303.333-41 chr2 119758454 119758789 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -1301 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 203.666-42 chr4 67245140 67245322 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 176769 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 190-59 chr2 19542919 19543139 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -184406 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 185.333-23 chr10 86642125 86642366 + 1.33333 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -12302 NM_033282 94233 Hs.283922 NM_033282 ENSG00000122375 OPN4 MOP opsin 4 protein-coding 213-22 chr14 96173104 96173286 + 1.33333 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -31603 NM_000623 624 Hs.654542 NM_000623 ENSG00000168398 BDKRB2 B2R|BK-2|BK2|BKR2|BRB2 bradykinin receptor B2 protein-coding 192-129 chr6 165329116 165329280 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001130690, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_001130690, exon 22 of 22) -19593 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 276.333-51 chr6 22762842 22763152 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45073 NR_134614 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 223.333-40 chr15 26065273 26065470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50442 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 257-58 chr5 146669909 146670242 + 1.33333 NA intron (NM_181678, intron 6 of 10) intron (NM_181678, intron 6 of 10) -153962 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 233.666-13 chr16 71283200 71283603 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001099642, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001099642, exon 3 of 3) 6001 NM_001324378 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 143.333-131 chr2 29151618 29151768 + 1.33333 NA intron (NM_001287528, intron 8 of 14) intron (NM_001287528, intron 8 of 14) 36278 NM_001287527 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 259.666-24 chr21 29516864 29517243 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21006 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 280.667-24 chr15 34173198 34173622 + 1.33333 NA intron (NM_024713, intron 1 of 9) L1M6|LINE|L1 36686 NM_024713 79768 Hs.633566 NM_024713 ENSG00000134152 KATNBL1 C15orf29 katanin regulatory subunit B1 like 1 protein-coding 213.333-61 chr14 81712225 81712523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30764 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 342.333-4 chr12 121039826 121040158 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_003733) promoter-TSS (NM_003733) -750 NM_001261825 8638 Hs.118633 NM_003733 ENSG00000135114 OASL OASL1|OASLd|TRIP-14|TRIP14|p59 OASL|p59-OASL|p59OASL 2'-5'-oligoadenylate synthetase like protein-coding 206.333-54 chr14 54694529 54694759 + 1.33333 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) -60189 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 242.666-8 chr1 229316093 229316424 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 11876 NM_006542 10638 Hs.296169 NM_006542 ENSG00000213029 SPHAR - S-phase response (cyclin related) protein-coding 208.666-70 chr3 90464581 90464754 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1357046 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 184-96 chr6 112659028 112659225 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 311796 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 218.333-72 chr2 146012655 146012892 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -574284 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 195-110 chr8 116765165 116765438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1223 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 374.333 chr1 112459819 112460236 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018704, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_018704, exon 6 of 6) 1806 NR_036210 100422976 NR_036210 ENSG00000283296 MIR4256 - microRNA 4256 ncRNA 138.666 chr12 23649347 23649639 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 10 of 17) intron (NM_152989, intron 10 of 17) -64907 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 234.333-15 chr11 78273647 78273937 + 1.33333 NA intron (NM_012296, intron 2 of 9) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 68088 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 208-50 chr14 67766606 67766846 + 1.33333 NA intron (NM_015346, intron 31 of 41) AluJb|SINE|Alu 49864 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 192.666-10 chr10 74664657 74664873 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) AluSz|SINE|Alu -135441 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 112.666-2 chr8 134140654 134140786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 254224 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 203.333-110 chr18 1660169 1660347 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -300629 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 238.666-26 chr2 134123910 134124172 + 1.33333 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) intron (NM_001371457, intron 1 of 16) -3084 NR_037450 100500878 NR_037450 ENSG00000263813 MIR3679 mir-3679 microRNA 3679 ncRNA 221.333-22 chr11 28295867 28296184 + 1.33333 NA intron (NM_001297775, intron 5 of 6) intron (NM_001297775, intron 5 of 6) 181523 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 239.333-72 chr3 171990645 171991036 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -48738 NM_022763 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 238.333-69 chr4 141292551 141292845 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39919 NR_121625 100507639 Hs.535010 NR_121625 LINC02432 - long intergenic non-protein coding RNA 2432 ncRNA 288.666-9 chr15 44296285 44296746 + 1.33333 NA intron (NR_157849, intron 1 of 9) intron (NR_157849, intron 1 of 9) 7796 NM_138423 113201 Hs.512867 NM_138423 ENSG00000166734 CASC4 H63 cancer susceptibility 4 protein-coding 247.333-41 chr2 45977267 45977627 + 1.33333 NA intron (NM_005400, intron 3 of 14) AluSz|SINE|Alu -319960 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 204.333-103 chr2 146675134 146675301 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 88160 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 205.333-166 chr4 36123880 36124042 + 1.33333 NA intron (NR_146894, intron 22 of 32) intron (NR_146894, intron 22 of 32) 119978 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 199.666-57 chr8 113295073 113295262 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) L1MA3|LINE|L1 81985 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 195-44 chr16 4831690 4831967 + 1.33333 NA intron (NM_001324097, intron 4 of 14) FRAM|SINE|Alu 15460 NR_136695 84656 Hs.387255 NM_032569 ENSG00000140632 GLYR1 BM045|HIBDL|N-PAC|NP60 glyoxylate reductase 1 homolog protein-coding 195-42 chr15 52201320 52201593 + 1.33333 NA intron (NM_018728, intron 38 of 40) L1MEf|LINE|L1 -10064 NM_016194 10681 Hs.155090 NM_006578 ENSG00000069966 GNB5 GB5|IDDCA|LADCI G protein subunit beta 5 protein-coding 195.333-28 chr10 32444549 32444712 + 1.33333 NA intron (NR_120660, intron 1 of 2) intron (NR_120660, intron 1 of 2) 1426 NR_120660 101929431 Hs.639819 NR_120660 LOC101929431 - uncharacterized LOC101929431 ncRNA 164-95 chr5 140941985 140942161 + 1.33333 NA intron (NM_018898, intron 1 of 3) intron (NM_018898, intron 1 of 3) 15356 NM_031882 56135 Hs.199343 NM_018898 ENSG00000248383 PCDHAC1 PCDH-ALPHA-C1 protocadherin alpha subfamily C, 1 protein-coding 197.666-43 chr3 117676837 117677022 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13996 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 223-52 chr5 16700091 16700341 + 1.33333 NA intron (NM_012334, intron 25 of 40) intron (NM_012334, intron 25 of 40) -83158 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 264.666-32 chr5 157580473 157580720 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR -4821 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 206-21 chr10 89512052 89512275 + 1.33333 NA intron (NM_213606, intron 2 of 7) L1MB3|LINE|L1 23431 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 163-61 chr4 107569200 107569493 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 150888 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 219.666-13 chr14 61578449 61578617 + 1.33333 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) L1MC4|LINE|L1 -7880 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 182.333-102 chr22 27706749 27707052 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 94856 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 196.666-97 chr7 36798079 36798290 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -73635 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 180.667-93 chr3 39216557 39216765 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -24066 NM_001198621 165904 Hs.447868 NM_194293 ENSG00000168334 XIRP1 CMYA1|Xin xin actin binding repeat containing 1 protein-coding 293.333-72 chrX 24333457 24333786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20228 NM_001136233 170067 Hs.716893 NM_001136233 SUPT20HL2 FAM48B1|FAM48B2 SUPT20H like 2 protein-coding 214-91 chr3 169481297 169481590 + 1.33333 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) AluSz|SINE|Alu 33576 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 331.333-9 chr1 194865948 194866381 + 1.33333 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1222551 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 201.333-188 chr3 80939759 80939957 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54010 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 210-18 chr10 66700568 66700795 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -225355 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 177.333-17 chr10 61210174 61210428 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 194026 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 170.666-19 chr5 83255409 83255570 + 1.33333 NA intron (NM_001318012, intron 6 of 7) LTR82A|LTR|ERVL 177942 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 382.333-3 chr14 63946119 63946582 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 6 of 114) AluJb|SINE|Alu 93346 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 276.666-3 chr1 205301696 205302009 + 1.33333 NA TTS (NM_030952) TTS (NM_030952) 19893 NM_030952 81788 Hs.497512 NM_030952 ENSG00000163545 NUAK2 SNARK NUAK family kinase 2 protein-coding 251.666-3 chr10 13579683 13579931 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7158 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 210.667-132 chr9 27168339 27168611 + 1.33333 NA intron (NM_001290077, intron 2 of 21) intron (NM_001290077, intron 2 of 21) 59334 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 413.334-8 chr9 105280236 105280848 + 1.33333 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) intron (NM_001330731, intron 1 of 15) 35891 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 205.667-90 chr22 40265582 40265871 + 1.33333 NA exon (NM_001162501, exon 5 of 23) exon (NM_001162501, exon 5 of 23) -80774 NR_134256 158 Hs.75527 NM_000026 ENSG00000239900 ADSL AMPS|ASASE|ASL adenylosuccinate lyase protein-coding 326-47 chr8 88028520 88028869 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154679 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 221.666-31 chr2 119153954 119154235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 4657 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 165.333-21 chr10 6670848 6671048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35878 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 255.333-114 chr8 117504546 117504794 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -16043 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 236-70 chr5 52717236 52717521 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -70538 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 194.666-12 chr12 23836952 23837104 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) 112642 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 286-19 chr15 72234356 72234712 + 1.33333 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL -2910 NM_182470 5315 Hs.534770 NM_002654 ENSG00000067225 PKM CTHBP|HEL-S-30|OIP3|PK3|PKM2|TCB|THBP1 pyruvate kinase M1/2 protein-coding 217.666-6 chr11 30823730 30824001 + 1.33333 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 168821 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 135.333-208 chrX 39932415 39932609 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 94951 NR_039763 100616251 NR_039763 ENSG00000263972 MIR1587 - microRNA 1587 ncRNA 216-117 chr7 80834517 80834778 + 1.33333 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) intron (NM_006379, intron 2 of 17) 84404 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 164-105 chr7 33025580 33025798 + 1.33333 NA intron (NM_001356996, intron 4 of 10) intron (NM_001356996, intron 4 of 10) 15217 NM_016489 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 182-48 chr2 86563240 86563501 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001005753) promoter-TSS (NM_001005753) 73 NR_036454 51652 Hs.591582 NM_016079 ENSG00000115561 CHMP3 CGI-149|NEDF|VPS24 charged multivesicular body protein 3 protein-coding 243.666-5 chr10 73804475 73804839 + 1.33333 NA intron (NR_160744, intron 9 of 14) AluSz|SINE|Alu -3258 NR_038357 100507331 Hs.631828 NR_038357 ENSG00000272589 ZSWIM8-AS1 - ZSWIM8 antisense RNA 1 ncRNA 243.333-31 chr14 61507985 61508305 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 62049 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 251.333-9 chr10 12870603 12870945 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 130939 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 132-17 chr10 36153141 36153262 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 374899 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 123.333-195 chr7 44843210 44843356 + 1.33333 NA exon (NM_201517, exon 2 of 4) exon (NM_201517, exon 2 of 4) 4843 NM_201436 94239 Hs.488189 NM_012412 ENSG00000105968 H2AFV H2A.Z-2|H2AV H2A histone family member V protein-coding 199.333-278 chr8 100221151 100221301 + 1.33333 NA intron (NM_003114, intron 13 of 18) intron (NM_003114, intron 13 of 18) 62891 NM_003114 6674 Hs.591866 NM_003114 ENSG00000104450 SPAG1 CILD28|CT140|HEL-S-268|HSD-3.8|SP75|TPIS sperm associated antigen 1 protein-coding 200.666-106 chr6 150634662 150634852 + 1.33333 NA intron (NR_138140, intron 1 of 2) intron (NR_138140, intron 1 of 2) 1793 NR_138140 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 245.667-43 chr3 95084251 95084581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 146153 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 197.333-187 chr5 105796588 105796867 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 697253 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 367.666 chr1 38829204 38829518 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 30411 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 211-45 chr19 34456923 34457163 + 1.33333 NA intron (NM_005499, intron 12 of 16) intron (NM_005499, intron 12 of 16) -24715 NM_001080436 126374 Hs.585010 NM_001080436 ENSG00000142279 WTIP - WT1 interacting protein protein-coding 207.667-46 chr18 3281581 3281894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19018 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 262-32 chr17 77333454 77333744 + 1.33333 NA intron (NM_006640, intron 1 of 10) L1ME2z|LINE|L1 14084 NM_006640 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 259.999-8 chr3 30876714 30877025 + 1.33333 NA intron (NM_207359, intron 1 of 14) LTR16C|LTR|ERVL 17792 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 212.666-64 chr4 147918750 147918943 + 1.33333 NA intron (NM_024605, intron 13 of 22) intron (NM_024605, intron 13 of 22) 136251 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 286.333-47 chr8 131835637 131835964 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -68293 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 281-35 chr5 36796663 36797149 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 79788 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 181.333-163 chr7 53232535 53232743 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 197006 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 204.667-5 chr1 83082951 83083211 + 1.33333 NA intron (NR_147074, intron 6 of 10) intron (NR_147074, intron 6 of 10) -96873 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 237.999-5 chrX 80416918 80417110 + 1.33333 NA intron (NM_001170574, intron 3 of 4) L1PA14|LINE|L1 -3433 NM_152630 169966 Hs.367959 NM_152630 ENSG00000174016 TENT5D CT1.26|CT112|FAM46D terminal nucleotidyltransferase 5D protein-coding 188-52 chr2 33438155 33438346 + 1.33333 NA intron (NM_170672, intron 1 of 18) intron (NM_170672, intron 1 of 18) 1902 NM_001349975 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 141.333-167 chr4 30311289 30311517 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -408966 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 187.666-15 chr2 43591904 43592104 + 1.33333 NA exon (NM_001271643, exon 3 of 18) exon (NM_001271643, exon 3 of 18) 3970 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 192.333-46 chr13 69854463 69854709 + 1.33333 NA intron (NM_001286725, intron 4 of 9) intron (NM_001286725, intron 4 of 9) -252627 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 214-96 chr4 47085297 47085481 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 53822 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 218.666-21 chr12 64920743 64921046 + 1.33333 NA TTS (NR_146276) TTS (NR_146276) 37120 NR_033988 400046 Hs.591032 NR_033988 ENSG00000255693 LINC02389 - long intergenic non-protein coding RNA 2389 ncRNA 214.666-27 chr17 40082283 40082507 + 1.33333 NA intron (NM_001190919, intron 4 of 9) AluSq2|SINE|Alu 18194 NM_021724 9572 Hs.724 NM_021724 ENSG00000126368 NR1D1 EAR1|REVERBA|REVERBalpha|THRA1|THRAL|ear-1|hRev nuclear receptor subfamily 1 group D member 1 protein-coding 280.666-5 chr14 50116003 50116303 + 1.33333 NA TTS (NM_006939) TTS (NM_006939) 419 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 340.333-24 chr9 96143746 96144034 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -27479 NR_132344 158434 Hs.381771 NM_001256408 ENSG00000275465 LOC158434 - uncharacterized LOC158434 ncRNA 198-146 chr5 8737445 8737699 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102160 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 221.666-43 chr5 29839083 29839362 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41338 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 248.666-14 chr14 34045173 34045475 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -94250 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 284.666-6 chr12 17776912 17777139 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 103726 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 206.333 chr1 29073305 29073552 + 1.33333 NA intron (NM_001166007, intron 13 of 17) intron (NM_001166007, intron 13 of 17) 49073 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 311.333-23 chr17 63651434 63651796 + 1.33333 NA intron (NM_203351, intron 4 of 16) L1MC5a|LINE|L1 29198 NM_001330431 4215 Hs.29282 NM_002401 ENSG00000198909 MAP3K3 MAPKKK3|MEKK3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 protein-coding 168.666-19 chr5 177275774 177275985 + 1.33333 NA intron (NM_172349, intron 18 of 23) Looper|DNA|PiggyBac 27840 NM_001031677 53917 Hs.16258 NM_130781 ENSG00000169228 RAB24 - RAB24, member RAS oncogene family protein-coding 199.333-57 chr12 77561990 77562179 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -268810 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 479.332 chr2 96281352 96281783 + 1.33333 NA intron (NM_014014, intron 35 of 44) MIR3|SINE|MIR 15342 NM_004804 9391 Hs.12109 NM_004804 ENSG00000144021 CIAO1 CIA1|WDR39 cytosolic iron-sulfur assembly component 1 protein-coding 207.333-270 chr8 111765335 111765557 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 388807 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 141-90 chr8 87319652 87319832 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) intron (NM_173538, intron 8 of 10) 453327 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 184.667-38 chr16 9205127 9205382 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 113610 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 421.666 chr12 107298590 107299023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19628 NM_001018072 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 215-43 chr2 194373469 194373741 + 1.33333 NA intron (NR_110222, intron 2 of 5) L1M6|LINE|L1 29336 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 324-29 chr7 94597004 94597339 + 1.33333 NA intron (NM_001346717, intron 8 of 9) intron (NM_001346717, intron 8 of 9) 58962 NM_001362808 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 368.666-4 chr11 96779513 96779898 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 271280 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 165.667-26 chr11 26777102 26777356 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -55169 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 245.666-25 chrX 47055537 47055887 + 1.33333 NA intron (NM_001077445, intron 9 of 10) intron (NM_001077445, intron 9 of 10) -22643 NM_004683 9104 Hs.77854 NM_004683 ENSG00000130988 RGN GNL|HEL-S-41|RC|SMP30 regucalcin protein-coding 209.333-90 chr17 63266965 63267175 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 7 of 25) AluJb|SINE|Alu 173197 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 165.333-153 chr21 40645179 40645387 + 1.33333 NA intron (NR_073202, intron 3 of 32) intron (NR_073202, intron 3 of 32) -14516 NR_046774 100874326 Hs.679746 NR_046774 ENSG00000233756 DSCAM-IT1 zag4 DSCAM intronic transcript 1 ncRNA 236.333-68 chr4 56030060 56030250 + 1.33333 NA intron (NM_025009, intron 25 of 25) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 81210 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 240.667-24 chr13 77826620 77826938 + 1.33333 NA intron (NR_103853, intron 1 of 6) HAL1|LINE|L1 7842 NR_103853 100505518 Hs.742215 NR_103853 EDNRB-AS1 - EDNRB antisense RNA 1 ncRNA 215-54 chr3 2578857 2579135 + 1.33333 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) intron (NM_175607, intron 4 of 24) -313219 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 184.666-28 chr5 12923395 12923601 + 1.33333 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 109388 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 213.666-43 chr7 22547920 22548128 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -15313 NR_038393 100506178 Hs.668122 NR_038393 ENSG00000232759 LOC100506178 - uncharacterized LOC100506178 ncRNA 271.333-32 chr2 125325298 125325687 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 792493 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 217.666-2 chr1 158587906 158588073 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -8090 NM_001004477 128367 Hs.553589 NM_001004477 ENSG00000279111 OR10X1 OR1-13|OR1-14|OR10X1P olfactory receptor family 10 subfamily X member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 204-57 chr14 44904532 44904768 + 1.33333 NA intron (NM_001017923, intron 4 of 4) intron (NM_001017923, intron 4 of 4) 7267 NR_110050 101927418 Hs.144809 NR_110050 ENSG00000258949 LOC101927418 - uncharacterized LOC101927418 ncRNA 392-12 chr2 238317719 238318169 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2574 NM_015650 26146 Hs.631898 NM_015650 ENSG00000204104 TRAF3IP1 IFT54|MIP-T3|MIPT3|SLSN9 TRAF3 interacting protein 1 protein-coding 211.333-73 chr15 70895147 70895470 + 1.33333 NA intron (NM_001363732, intron 3 of 15) intron (NM_001363732, intron 3 of 15) 2865 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 158-34 chr12 39985564 39985777 + 1.33333 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) intron (NM_052885, intron 3 of 9) 120411 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 186.667-11 chr10 15130072 15130297 + 1.33333 NA exon (NM_004808, exon 7 of 12) exon (NM_004808, exon 7 of 12) 25163 NR_036506 100192204 Hs.714691 NR_036506 ENSG00000206448 PPIAP30 - peptidylprolyl isomerase A pseudogene 30 pseudo 239.999-4 chr2 55535389 55535627 + 1.33333 NA intron (NM_001282761, intron 6 of 10) L2c|LINE|L2 15913 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 168.666-8 chr19 3904430 3904575 + 1.33333 NA intron (NM_033064, intron 3 of 12) MLT2D|LTR|ERVL 23817 NM_033064 85300 Hs.418055 NM_033064 ENSG00000167654 ATCAY BNIP-H|CLAC ATCAY kinesin light chain interacting caytaxin protein-coding 274-14 chr14 20464031 20464345 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2576 NM_144568 90809 Hs.7001 NM_144568 ENSG00000165782 PIP4P1 C14orf9|TMEM55B phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 1 protein-coding 168-114 chr8 84084082 84084225 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -98634 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 212-120 chr4 93137388 93137558 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 3 of 14) intron (NM_001286838, intron 3 of 14) -691280 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 243.666-24 chr3 55758934 55759300 + 1.33333 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) intron (NR_132749, intron 13 of 17) 93477 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 140-20 chr10 61790505 61790704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111095 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 198.666-66 chr4 53618045 53618253 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25193 NR_046827 100873955 Hs.351074 NR_046827 LNX1-AS2 - LNX1 antisense RNA 2 ncRNA 266-75 chr6 21990636 21991080 + 1.33333 NA intron (NR_015410, intron 6 of 11) intron (NR_015410, intron 6 of 11) 156335 NR_034143 729177 Hs.730673 NR_034143 ENSG00000260455 NBAT1 CASC14|NBAT-1 neuroblastoma associated transcript 1 ncRNA 240.333-10 chr10 55041068 55041421 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) intron (NM_001354404, intron 3 of 34) -239953 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 209-90 chr5 36927644 36927856 + 1.33333 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) L2-1_AMi|LINE|L2 50981 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 207-82 chr3 144760088 144760384 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 787155 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 190.333-3 chr1 35676877 35677166 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -35495 NM_001199779 5690 Hs.471441 NM_002794 ENSG00000126067 PSMB2 HC7-I proteasome subunit beta 2 protein-coding 195.333-153 chr4 40540953 40541240 + 1.33333 NA intron (NM_001098634, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu -25111 NM_019027 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 260.666-30 chr6 45875390 45875676 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 62064 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 261.333-44 chr2 39226878 39227220 + 1.33333 NA intron (NM_001009565, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu 2539 NM_001009565 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 314.666-4 chr1 96284268 96284733 + 1.33333 NA intron (NR_110693, intron 5 of 5) L1PA13|LINE|L1 89625 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 215-62 chr4 98346953 98347173 + 1.33333 NA intron (NM_021159, intron 3 of 14) intron (NM_021159, intron 3 of 14) 85679 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 227.333-77 chr22 26270536 26270860 + 1.33333 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 101224 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 213.667-15 chr10 61723350 61723566 + 1.33333 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) intron (NM_173554, intron 4 of 6) 60497 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 280.666-21 chr5 12182495 12182779 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -278191 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 216-92 chr4 121194231 121194452 + 1.33333 NA intron (NM_001128843, intron 2 of 12) intron (NM_001128843, intron 2 of 12) 22286 NM_001128843 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 287.333-33 chr2 151543589 151543993 + 1.33333 NA intron (NM_001271208, intron 135 of 182) intron (NM_001271208, intron 135 of 182) 133889 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 216.333-2 chr1 8543046 8543341 + 1.33333 NA intron (NM_001042681, intron 6 of 22) intron (NM_001042681, intron 6 of 22) -48280 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 280.666-4 chr10 80960529 80960783 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 310859 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 229.666-19 chr20 54666214 54666451 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 190739 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 197.666-69 chr9 37611744 37611984 + 1.33333 NA intron (NM_001371225, intron 1 of 15) intron (NM_001371225, intron 1 of 15) 8635 NM_001371225 204-59 chr14 62176856 62177022 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36966 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 196.333-27 chr12 57332847 57333037 + 1.33333 NA intron (NM_001351217, intron 1 of 21) intron (NM_001351217, intron 1 of 21) 8832 NM_001351206 22864 Hs.443673 NM_014925 ENSG00000179912 R3HDM2 CAG6|PR01365 R3H domain containing 2 protein-coding 144-119 chr3 194424179 194424368 + 1.33333 NA intron (NM_001367549, intron 30 of 33) intron (NM_001367549, intron 30 of 33) -25007 NM_004488 2814 Hs.73734 NM_004488 ENSG00000178732 GP5 CD42d|GPV glycoprotein V platelet protein-coding 272.666-19 chr4 111145915 111146333 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -285477 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 392.666-8 chr5 98365601 98366273 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -204698 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 196-155 chr6 39668220 39668480 + 1.33333 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) intron (NM_001289020, intron 3 of 21) 57058 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 209.333-29 chr11 16347327 16347526 + 1.33333 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) intron (NM_001367872, intron 3 of 16) 9120 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 238-34 chr17 62896677 62897027 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47363 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 248.333-92 chr6 65218094 65218310 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -83216 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 126.667-154 chr6 72702341 72702486 + 1.33333 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 71918 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 323.667 chr1 72149735 72150169 + 1.33333 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) 132587 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 210-68 chr2 123538014 123538183 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -464617 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 238.666-43 chr9 5756602 5756841 + 1.33333 NA intron (NM_001206557, intron 15 of 24) intron (NM_001206557, intron 15 of 24) 76396 NM_024896 79956 Hs.591078 NM_024896 ENSG00000099219 ERMP1 FXNA|KIAA1815|bA207C16.3 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 protein-coding 426.666-5 chr16 74130808 74131320 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 84457 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 240.999 chr12 47605328 47605618 + 1.33333 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 100557 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 336.666-6 chr12 50694973 50695387 + 1.33333 NA intron (NM_173602, intron 14 of 37) L1ME3G|LINE|L1 -68921 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 143.333-76 chr13 46022007 46022240 + 1.33333 NA intron (NM_001330566, intron 5 of 19) intron (NM_001330566, intron 5 of 19) 30623 NM_001076788 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 228-99 chr9 121860858 121861054 + 1.33333 NA intron (NM_001139442, intron 7 of 8) intron (NM_001139442, intron 7 of 8) 118171 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 205.333-179 chr5 9485388 9485694 + 1.33333 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -25792 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 190.667-109 chr6 43010384 43010662 + 1.33333 NA TTS (NM_014623) TTS (NM_014623) 3423 NM_014623 4201 Hs.278362 NM_014623 ENSG00000124733 MEA1 HYS|MEA male-enhanced antigen 1 protein-coding 341.666-9 chr3 159128203 159128736 + 1.33333 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) 59150 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 219.666-46 chr8 132802381 132802678 + 1.33333 NA intron (NM_016018, intron 6 of 20) L2c|LINE|L2 27141 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 232-23 chr12 68698484 68698750 + 1.33333 NA intron (NM_020401, intron 6 of 27) L1MC1|LINE|L1 11639 NM_001330192 57122 Hs.524574 NM_020401 ENSG00000111581 NUP107 NPHS11|NUP84|ODG6|ODG6; GAMOS7 nucleoporin 107 protein-coding 346.333-3 chr1 85710658 85711236 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -2514 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 409.666-10 chr8 128057112 128057778 + 1.33333 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) intron (NR_003367, intron 5 of 8) 8293 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 449.333 chr1 86338455 86339092 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 18914 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 184.333-38 chr14 59603233 59603483 + 1.33333 NA intron (NM_021136, intron 6 of 8) intron (NM_021136, intron 6 of 8) 6781 NM_001363702 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 226.333-86 chr4 13244753 13245006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 239461 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 205.666-12 chr11 127617024 127617189 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 346036 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 225-64 chr8 106338253 106338506 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) AluSx|SINE|Alu 68201 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 298-75 chr7 45958375 45958900 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -37365 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 148-145 chr6 119390603 119390761 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -40921 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 209.333-55 chr14 41959340 41959580 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 352604 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 203-47 chr18 78758599 78758829 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -221561 NM_171999 27164 Hs.700557 NM_171999 ENSG00000256463 SALL3 ZNF796 spalt like transcription factor 3 protein-coding 384.666-9 chr21 28223503 28224077 + 1.33333 NA intron (NR_126012, intron 2 of 5) intron (NR_126012, intron 2 of 5) 4877 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 225.999-5 chr15 74718285 74718491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7140 NM_001319216 1543 Hs.72912 NM_000499 ENSG00000140465 CYP1A1 AHH|AHRR|CP11|CYP1|CYPIA1|P1-450|P450-C|P450DX cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1 protein-coding 188.667-20 chr10 51712062 51712340 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) MER39|LTR|ERV1 -12606 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 191.333-106 chr2 58754357 58754602 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 233726 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 311.333-42 chr4 171119453 171119765 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR -66575 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 218.666-74 chr8 70211311 70211496 + 1.33333 NA intron (NM_001321711, intron 4 of 21) AluSg|SINE|Alu -140151 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 285.999-5 chr5 38099120 38099352 + 1.33333 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) -49244 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 189-41 chr2 64038161 64038443 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -18874 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 160-2 chr1 46658434 46658592 + 1.33333 NA intron (NM_022745, intron 3 of 8) intron (NM_022745, intron 3 of 8) 7365 NM_001243728 64756 Hs.100874 NM_022745 ENSG00000123472 ATPAF1 ATP11|ATP11p ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 protein-coding 284.333-15 chr14 72285461 72285785 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L1MA10|LINE|L1 -231197 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 139.333-25 chr10 107540127 107540362 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -375538 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 225.667-26 chr14 66742430 66742730 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 235173 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 319-28 chr7 94532314 94532582 + 1.33333 NA intron (NM_001363427, intron 6 of 17) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 22639 NM_022900 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 205.333-81 chr15 59775947 59776213 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -86760 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 247.333-76 chr7 87153271 87153607 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_136253) promoter-TSS (NR_136253) 885 NM_021145 9988 Hs.196129 NM_021145 ENSG00000135164 DMTF1 DMP1|DMTF|MRUL|hDMP1 cyclin D binding myb like transcription factor 1 protein-coding 194-27 chr12 12780554 12780727 + 1.33333 NA intron (NM_001130415, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu -5019 NM_030817 81575 Hs.23388 NM_030817 ENSG00000178878 APOLD1 VERGE apolipoprotein L domain containing 1 protein-coding 199.667-19 chr10 86359842 86360153 + 1.33333 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) intron (NM_017551, intron 2 of 15) 6798 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 262-86 chr8 135910446 135910905 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 453219 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 194.666-37 chr2 147390394 147390557 + 1.33333 NA Intergenic MER97a|DNA|hAT-Tip100 -454042 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 425.333-9 chr5 34713102 34713881 + 1.33333 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) intron (NM_001145525, intron 4 of 19) 25932 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 261.333-23 chr12 74218194 74218576 + 1.33333 NA intron (NR_038300, intron 3 of 6) LTR49-int|LTR|ERV1 74246 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 186.333-175 chr9 99931519 99931837 + 1.33333 NA intron (NM_017919, intron 3 of 7) MER58A|DNA|hAT-Charlie 25024 NM_017919 55014 Hs.704031 NM_017919 ENSG00000136874 STX17 - syntaxin 17 protein-coding 236.666-13 chr14 35455576 35455806 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -50937 NM_020529 4792 Hs.81328 NM_020529 ENSG00000100906 NFKBIA EDAID2|IKBA|MAD-3|NFKBI NFKB inhibitor alpha protein-coding 253.333-99 chr7 28301680 28302073 + 1.33333 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) 2555 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 223.666-3 chr1 92611364 92611657 + 1.33333 NA intron (NM_001350198, intron 16 of 19) AluY|SINE|Alu -124585 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 151-106 chr5 32819601 32819885 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 108422 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 282-33 chr21 14678865 14679256 + 1.33333 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger -35953 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 213.666-35 chr4 162431146 162431332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -267205 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 201-46 chr17 29027237 29027504 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15771 NM_016518 51268 Hs.462585 NM_016518 ENSG00000179761 PIPOX LPIPOX pipecolic acid and sarcosine oxidase protein-coding 192.667-43 chr12 5522671 5522920 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 28663 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 171.667-183 chr9 98982468 98982635 + 1.33333 NA intron (NM_001855, intron 2 of 41) intron (NM_001855, intron 2 of 41) 38644 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 198.667-186 chr8 123506833 123507110 + 1.33333 NA intron (NM_001242463, intron 4 of 6) intron (NM_001242463, intron 4 of 6) 25172 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 303.666-6 chr15 47204806 47205257 + 1.33333 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) intron (NM_001198999, intron 1 of 19) 20942 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 206.333-131 chr5 84810215 84810394 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -425424 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 194-108 chr5 66130334 66130611 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13828 NM_001323534 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 286-24 chr2 58449391 58449716 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71200 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 158.333-169 chr2 195551810 195551984 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -105061 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 219.333-78 chr17 72025509 72025776 + 1.33333 NA intron (NR_110876, intron 1 of 2) intron (NR_110876, intron 1 of 2) 337 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 379.666-3 chr1 228316908 228317315 + 1.33333 NA intron (NM_052843, intron 51 of 80) intron (NM_052843, intron 51 of 80) 79998 NR_106800 102465444 NR_106800 ENSG00000284311 MIR6742 hsa-mir-6742 microRNA 6742 ncRNA 168-78 chr4 40805146 40805317 + 1.33333 NA intron (NM_001330648, intron 10 of 10) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 51924 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 314-27 chr3 47312372 47312733 + 1.33333 NA intron (NM_025010, intron 1 of 9) intron (NM_025010, intron 1 of 9) 29608 NM_025010 23276 Hs.517946 NM_025010 ENSG00000114648 KLHL18 - kelch like family member 18 protein-coding 164-48 chr17 73435673 73435891 + 1.33333 NA intron (NM_001144952, intron 8 of 44) intron (NM_001144952, intron 8 of 44) -77901 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 205-70 chr5 39543909 39544120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23583 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 205.333-263 chr9 111762861 111763092 + 1.33333 NA intron (NM_173521, intron 3 of 25) L1M5|LINE|L1 -3440 NM_001080551 158401 Hs.428209 NM_173521 ENSG00000165181 SHOC1 C9orf84|ZIP2|ZIP2H shortage in chiasmata 1 protein-coding 270.666-23 chr5 8129480 8129747 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 260465 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 180.667-151 chr8 131325913 131326129 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -285112 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 189-87 chr8 48610556 48610711 + 1.33333 NA intron (NR_105002, intron 2 of 3) L1MD1|LINE|L1 -9770 NR_105004 101929217 Hs.547790 NR_105004 ENSG00000253455 LOC101929217 - uncharacterized LOC101929217 ncRNA 255.666-14 chr18 22520336 22520606 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -102556 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 111.666-2 chr21 30089186 30089334 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 77545 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 344-42 chr7 110216960 110217420 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -256977 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 120.333-163 chr6 55246593 55246762 + 1.33333 NA intron (NM_001526, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR -80792 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 209.666-5 chr1 175834737 175834990 + 1.33333 NA Intergenic MER83C|LTR|ERV1 -42480 NR_125964 101928751 NR_125964 ENSG00000224718 LINC01657 - long intergenic non-protein coding RNA 1657 ncRNA 197.333-183 chr5 82112721 82112930 + 1.33333 NA intron (NM_031482, intron 3 of 7) intron (NM_031482, intron 3 of 7) 140802 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 243.333-55 chr2 164903299 164903535 + 1.33333 NA intron (NM_001199148, intron 10 of 10) intron (NM_001199148, intron 10 of 10) 52108 NM_001351539 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 180-49 chr18 68834808 68835011 + 1.33333 NA intron (NM_024781, intron 1 of 7) intron (NM_024781, intron 1 of 7) 36829 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 341-17 chr21 14671282 14671866 + 1.33333 NA Intergenic (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28467 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 261.333-87 chr5 73842863 73843108 + 1.33333 NA intron (NM_001177693, intron 11 of 35) AluSx|SINE|Alu 29439 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 296.666-23 chr4 2968858 2969234 + 1.33333 NA intron (NM_001350173, intron 1 of 13) intron (NM_001350173, intron 1 of 13) 5475 NM_001004056 2868 Hs.32959 NM_005307 ENSG00000125388 GRK4 GPRK2L|GPRK4|GRK4a|IT11 G protein-coupled receptor kinase 4 protein-coding 424.666-5 chr6 156737863 156738238 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39805 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 158-12 chr10 75136634 75136813 + 1.33333 NA intron (NM_144660, intron 1 of 4) LTR67B|LTR|ERVL 25067 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 219-65 chr4 85948100 85948290 + 1.33333 NA intron (NM_031305, intron 2 of 6) intron (NM_031305, intron 2 of 6) 18179 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 155.666-6 chr5 102408197 102408334 + 1.33333 NA intron (NM_173488, intron 9 of 13) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 90736 NM_001289002 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 237.667-34 chr2 5309050 5309332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 381927 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 214.666-9 chr1 167907510 167907679 + 1.33333 NA intron (NM_018417, intron 1 of 32) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 6540 NM_001167749 55811 Hs.320892 NM_018417 ENSG00000143199 ADCY10 HCA2|HEL-S-7a|SAC|SACI|Sacy|hsAC adenylate cyclase 10 protein-coding 316.333-3 chr1 156546599 156547051 + 1.33333 NA intron (NM_178229, intron 19 of 37) intron (NM_178229, intron 19 of 37) 25740 NM_178229 128239 Hs.591495 NM_178229 ENSG00000183856 IQGAP3 - IQ motif containing GTPase activating protein 3 protein-coding 208.666-20 chr10 74873485 74873657 + 1.33333 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) L2|LINE|L2 -39215 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 242.666-4 chr1 103162952 103163135 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -54521 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 180.666-26 chr4 90420629 90420785 + 1.33333 NA intron (NM_207491, intron 4 of 7) intron (NM_207491, intron 4 of 7) 185676 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 248-89 chr8 98841797 98842039 + 1.33333 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) MER5A|DNA|hAT-Charlie -16230 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 216-124 chr8 138357126 138357435 + 1.33333 NA intron (NM_015912, intron 2 of 19) L1ME4a|LINE|L1 139981 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 298-39 chr2 5091676 5092239 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -435735 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 199.333-132 chr2 110649581 110649740 + 1.33333 NA intron (NM_001278616, intron 17 of 23) intron (NM_001278616, intron 17 of 23) 8589 NR_132975 106635550 NR_132975 SNORD132 - small nucleolar RNA, C/D box 132 snoRNA 268.333-32 chr2 175199037 175199350 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -17483 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 367.999-4 chr21 17513649 17513984 + 1.33333 NA intron (NM_001207066, intron 1 of 7) intron (NM_001207066, intron 1 of 7) 773 NM_001207063 1525 Hs.627078 NM_001338 ENSG00000154639 CXADR CAR|CAR4/6|HCAR CXADR Ig-like cell adhesion molecule protein-coding 312-60 chr9 36634118 36634424 + 1.33333 NA intron (NM_001256691, intron 8 of 15) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 61376 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 200-171 chr8 121395953 121396113 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -243313 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 300.333-40 chr7 19094166 19094577 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23265 NR_149001 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 210.667-115 chr7 4044494 4044809 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) AluJr4|SINE|Alu -85034 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 218-43 chr2 16487997 16488216 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 177728 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 220.666-73 chr8 120451621 120451834 + 1.33333 NA intron (NM_022045, intron 4 of 21) AluJb|SINE|Alu 6308 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 419.333-4 chr15 85657161 85657636 + 1.33333 NA intron (NM_001270546, intron 4 of 28) intron (NM_001270546, intron 4 of 28) 37448 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 186-88 chr5 162202154 162202355 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 134612 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 212-36 chr12 32223782 32224023 + 1.33333 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 117055 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 127.333-47 chr14 43877568 43877707 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 629646 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 178.667-154 chr7 84795128 84795388 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 262782 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 312.666-7 chr13 41100940 41101257 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_036127) promoter-TSS (NR_036127) 2 NR_036127 100422878 NR_036127 ENSG00000264226 MIR3168 - microRNA 3168 ncRNA 417-5 chr2 215429850 215430350 + 1.33333 NA intron (NM_212482, intron 5 of 45) intron (NM_212482, intron 5 of 45) 5968 NM_001365519 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 197-96 chr5 142521457 142521681 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 99765 NM_001144892 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 217.333-30 chr11 27334295 27334497 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 28819 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 391.999-5 chr4_GL000008v2_random 2332 2922 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 175544 NR_046228 100874392 Hs.648245 NR_046228 ANKRD20A12P - ankyrin repeat domain 20 family member A12, pseudogene pseudo 199.666-54 chr7 36246105 36246334 + 1.33333 NA intron (NM_030636, intron 3 of 7) intron (NM_030636, intron 3 of 7) 92965 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 371.666-2 chr11 35649372 35649819 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -13180 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 352.666-8 chr9 102528218 102528608 + 1.33333 NA intron (NR_103830, intron 1 of 4) intron (NR_103830, intron 1 of 4) 8776 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 206.666-66 chr20 33101532 33101710 + 1.33333 NA intron (NM_182519, intron 12 of 15) AluJb|SINE|Alu 20109 NM_182519 149954 Hs.38961 NM_182519 ENSG00000186191 BPIFB4 C20orf186|LPLUNC4|RY2G5|dJ726C3.5 BPI fold containing family B member 4 protein-coding 181.333-156 chr7 7719955 7720196 + 1.33333 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -1468 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 223.333-149 chr6 168247254 168247466 + 1.33333 NA intron (NR_110870, intron 1 of 4) intron (NR_110870, intron 1 of 4) 4422 NR_110870 101929420 Hs.571211 NR_110870 ENSG00000234647 LOC101929420 - uncharacterized LOC101929420 ncRNA 216.666-39 chr2 55387316 55387565 + 1.33333 NA intron (NM_001254943, intron 3 of 33) L1MEd|LINE|L1 32416 NM_001135597 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 167.333-121 chr19 24277062 24277208 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -113688 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 205.333-11 chr1 58751470 58751628 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32498 NM_002228 3725 Hs.696684 NM_002228 ENSG00000177606 JUN AP-1|AP1|c-Jun|p39 Jun proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 212.333-143 chr7 107880340 107880597 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -10639 NM_001289752 1738 Hs.131711 NM_000108 ENSG00000091140 DLD DLDD|DLDH|E3|GCSL|LAD|PHE3 dihydrolipoamide dehydrogenase protein-coding 183.333-53 chr15 57466540 57466756 + 1.33333 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) L2c|LINE|L2 90143 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 205.666-52 chr7 105212520 105212704 + 1.33333 NA intron (NM_182692, intron 2 of 15) intron (NM_182692, intron 2 of 15) 56465 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 203.667-55 chr2 80762889 80763143 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 449637 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 200.667-153 chr8 80750828 80751118 + 1.33333 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) Charlie26a|DNA|hAT-Charlie 123495 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 214-50 chr17 62382980 62383219 + 1.33333 NA intron (NM_001144933, intron 4 of 11) intron (NM_001144933, intron 4 of 11) 2546 NM_173503 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 264.666-33 chr5 165961778 165962181 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 964391 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 202-110 chr3 54199173 54199352 + 1.33333 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) L1MC5|LINE|L1 76710 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 232-51 chr2 84243223 84243471 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47335 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 125-116 chr8 114361109 114361315 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -924273 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 231.333-103 chr6 112735010 112735207 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 387778 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 283.666-7 chr5 57191049 57191395 + 1.33333 NA intron (NM_001331037, intron 2 of 12) AluSz6|SINE|Alu 15774 NM_001127235 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 302-37 chr3 40162707 40163061 + 1.33333 NA intron (NM_001284424, intron 5 of 15) intron (NM_001284424, intron 5 of 15) 62873 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 186.333-142 chr6 128701748 128701968 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -181259 NM_002844 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 200.666-38 chr14 88063369 88063616 + 1.33333 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) intron (NR_046094, intron 2 of 3) -37180 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 207.667-122 chr8 122457422 122457720 + 1.33333 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 111073 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 222.666-38 chr4 55218793 55219073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93338 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 301.333-20 chr16 4125113 4125494 + 1.33333 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -8861 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 232.666-30 chr20 51672996 51673208 + 1.33333 NA intron (NM_006045, intron 11 of 27) AluSx1|SINE|Alu 95288 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 250.333-8 chr10 85835711 85836176 + 1.33333 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) L1MD2|LINE|L1 258212 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-83 chr2 187750867 187751140 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -196498 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 322.666-14 chr17 44666674 44667013 + 1.33333 NA exon (NM_001145080, exon 5 of 8) exon (NM_001145080, exon 5 of 8) 10375 NM_001145080 284071 Hs.349758 NM_001033659 ENSG00000180336 MEIOC C17orf104 meiosis specific with coiled-coil domain protein-coding 265.666-26 chr8 99544613 99544908 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 30 of 61) intron (NM_017890, intron 30 of 61) -7899 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 322-24 chr2 235826062 235826425 + 1.33333 NA intron (NM_001037131, intron 9 of 17) intron (NM_001037131, intron 9 of 17) -308322 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 315.666-8 chr2 152402728 152402996 + 1.33333 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) L1MC3|LINE|L1 67688 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 260.666-18 chr2 136876633 136876920 + 1.33333 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) intron (NM_001316349, intron 1 of 27) 111231 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 185.333-37 chr12 1897799 1897967 + 1.33333 NA intron (NM_172364, intron 6 of 37).2 L1MEd|LINE|L1 20769 NM_172364 93589 Hs.13768 NM_172364 ENSG00000151062 CACNA2D4 RCD4 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 4 protein-coding 210-112 chr5 4392924 4393221 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -380409 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 281-19 chr2 23811737 23812249 + 1.33333 NA intron (NM_017552, intron 17 of 27) intron (NM_017552, intron 17 of 27) 115130 NM_017552 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 237.333-21 chr11 95769024 95769253 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_144664, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_144664, exon 10 of 10) 20644 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 154-118 chr5 174240714 174240902 + 1.33333 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie -95546 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 212.666 chr1 9662729 9662923 + 1.33333 NA intron (NM_005026, intron 1 of 23) AluSx|SINE|Alu -8240 NR_027045 644997 Hs.568595 NM_001045478 ENSG00000179840 PIK3CD-AS1 C1orf200 PIK3CD antisense RNA 1 ncRNA 180-7 chr1 158064708 158064860 + 1.33333 NA intron (NM_001286349, intron 1 of 12) intron (NM_001286349, intron 1 of 12) 39234 NR_145471 100505785 Hs.664656 NR_145471 KIRREL1-IT1 KIRREL-IT1 KIRREL1 intronic transcript 1 ncRNA 267.333-29 chr14 27209610 27209952 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 301139 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 234.666-56 chrX 79874681 79875066 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -139880 NM_001109879 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 202-25 chr11 11993595 11993849 + 1.33333 NA intron (NM_015881, intron 4 of 7) intron (NM_015881, intron 4 of 7) 14917 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 166.333-234 chr8 122198635 122198839 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 369907 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 205.333-193 chr5 142274434 142274711 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43750 NR_131221 100642175 Hs.684549 NR_131221 SPRY4-IT1 SPRIGHTLY SPRY4 intronic transcript 1 ncRNA 227.999-7 chr6 168961024 168961211 + 1.33333 NA non-coding (NR_136248, exon 2 of 2) non-coding (NR_136248, exon 2 of 2) 3265 NR_136248 105378146 Hs.343631 NR_136248 LOC105378146 - uncharacterized LOC105378146 ncRNA 166-97 chr5 146118681 146118849 + 1.33333 NA intron (NM_016460, intron 30 of 30) L1MB3|LINE|L1 -13188 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 487.333-2 chr14 74905562 74906068 + 1.33333 NA non-coding (NR_163406, exon 12 of 12) non-coding (NR_163406, exon 12 of 12) 16627 NM_031464 83694 Hs.414481 NM_031464 ENSG00000198208 RPS6KL1 RSKL2 ribosomal protein S6 kinase like 1 protein-coding 172.667-124 chr5 99161108 99161347 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -231513 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 132.333-10 chr1 190126148 190126324 + 1.33333 NA intron (NM_199051, intron 7 of 7) intron (NM_199051, intron 7 of 7) 349774 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 209-57 chr2 51576044 51576321 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 543581 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 211.333-86 chr17 56267585 56267881 + 1.33333 NA intron (NM_001370326, intron 3 of 20) L1PA15|LINE|L1 114258 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 174-32 chr14 66882426 66882577 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) intron (NM_001024218, intron 5 of 21) -306939 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 200.666-3 chr1 79511021 79511224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -504392 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 264.333-14 chr12 79851837 79852080 + 1.33333 NA intron (NM_001244990, intron 3 of 24) L1MDa|LINE|L1 61953 NM_001143886 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 200-16 chr1 238638836 238639040 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -152921 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 204.333-96 chr2 61607401 61607695 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69192 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 232-50 chr2 81006115 81006427 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 460675 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 319.333-29 chr6 105132861 105133183 + 1.33333 NA intron (NM_147147, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 3324 NM_147147 11149 Hs.221660 NM_007073 ENSG00000112276 BVES CARICK|HBVES|LGMD2X|LGMDR25|POP1|POPDC1 blood vessel epicardial substance protein-coding 206.667-17 chr10 66146037 66146341 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 574764 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 317.667-12 chr15 26962463 26962960 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -8470 NM_001270873 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 162.666-9 chr3 143505276 143505461 + 1.33333 NA intron (NM_173653, intron 9 of 15) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 163122 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 203-38 chr15 78586321 78586561 + 1.33333 NA intron (NM_001307945, intron 2 of 5) intron (NM_001307945, intron 2 of 5) 20921 NM_000745 1138 Hs.1614 NM_000745 ENSG00000169684 CHRNA5 LNCR2 cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit protein-coding 274.667-23 chr16 61010822 61011224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44743 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 213.666-4 chr10 24567166 24567359 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55581 NR_160024 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 184.333-143 chr7 110131547 110131799 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -171460 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 125.666-2 chr5 26195488 26195636 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 843024 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 195.666-4 chr10 23630257 23630409 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -64394 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 215.666-8 chr10 65564629 65564895 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6663 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 207.666-26 chr2 122633760 122634015 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 439594 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 226.666-22 chr2 69188881 69189082 + 1.33333 NA intron (NM_032208, intron 16 of 17) intron (NM_032208, intron 16 of 17) 85299 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 332.666-7 chr11 96769209 96769605 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 260982 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 310.666-17 chr4 74762850 74763178 + 1.33333 NA intron (NM_001316963, intron 2 of 4) intron (NM_001316963, intron 2 of 4) 31509 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 294.667-33 chr3 58888070 58888525 + 1.33333 NA intron (NR_147234, intron 5 of 10) L2a|LINE|L2 63826 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 441-5 chr5 42200871 42201430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25805 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 174.666-12 chr18 37126493 37126645 + 1.33333 NA intron (NR_136303, intron 8 of 13) L1ME1|LINE|L1 -147891 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 162-27 chr11 117845302 117845451 + 1.33333 NA intron (NM_001164832, intron 1 of 8) L1MB7|LINE|L1 -17287 NM_021603 486 Hs.731865 NM_001680 ENSG00000137731 FXYD2 ATP1G1|HOMG2 FXYD domain containing ion transport regulator 2 protein-coding 265.333-89 chr8 131382152 131382530 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -341432 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 338-29 chr8 101028305 101028769 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -23517 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 174.333-76 chr21 14901813 14901966 + 1.33333 NA intron (NR_146322, intron 1 of 3) intron (NR_146322, intron 1 of 3) 16779 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 236.999-8 chr8 138477892 138478073 + 1.33333 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 19279 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 219.666-38 chr5 165825470 165825711 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 1100780 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 196.666-27 chr14 99006687 99006914 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 265397 NM_022898 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 213.333-72 chr16 50760884 50761110 + 1.33333 NA intron (NM_015247, intron 7 of 19) L1ME4b|LINE|L1 18692 NR_130462 100422972 NR_130462 ENSG00000264947 MIR3181 - microRNA 3181 ncRNA 190.666-5 chr1 74833694 74833995 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -100436 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 172-11 chr1 171615119 171615293 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4557 NM_001368164 110806290 NM_001368164 MYOCOS - myocilin opposite strand protein-coding 193.333-197 chr9 94005342 94005652 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25316 NM_001253830 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 359.666-5 chr14 64927041 64927539 + 1.33333 NA intron (NM_001202559, intron 3 of 13) intron (NM_001202559, intron 3 of 13) 12835 NM_001202558 100529261 Hs.325531 NM_001202558 ENSG00000125954 CHURC1-FNTB FNTB|FTase-beta CHURC1-FNTB readthrough protein-coding 207.666-44 chr4 78010179 78010337 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47065 NM_025074 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 198.666-73 chr4 169122506 169122742 + 1.33333 NA intron (NM_020870, intron 6 of 11) intron (NM_020870, intron 6 of 11) -112369 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 113.333-36 chr10 108223007 108223100 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -153760 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 256-65 chr4 76025463 76025858 + 1.33333 NA intron (NM_001130017, intron 1 of 9) L1ME2z|LINE|L1 -2163 NM_001565 3627 Hs.632586 NM_001565 ENSG00000169245 CXCL10 C7|IFI10|INP10|IP-10|SCYB10|crg-2|gIP-10|mob-1 C-X-C motif chemokine ligand 10 protein-coding 209.333-199 chr6 39837689 39837963 + 1.33333 NA intron (NM_015345, intron 1 of 24) intron (NM_015345, intron 1 of 24) 44829 NM_015345 23500 Hs.357128 NM_015345 ENSG00000146122 DAAM2 dJ90A20A.1 dishevelled associated activator of morphogenesis 2 protein-coding 205.333-55 chr12 25592088 25592306 + 1.33333 NA intron (NM_001352232, intron 1 of 10) L1PBa1|LINE|L1 -38914 NM_001145729 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 221.999-5 chr17 52132285 52132479 + 1.33333 NA intron (NM_001082533, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 26332 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 205.666-24 chr2 180790498 180790829 + 1.33333 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) (TCTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 98559 NR_104323 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 160-130 chr9 111678896 111679065 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 17375 NM_001017998 2790 Hs.534196 NM_001017998 ENSG00000242616 GNG10 - G protein subunit gamma 10 protein-coding 436.666-9 chr7 2899266 2899646 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55148 NM_007353 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 170-93 chr4 138284608 138284778 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25018 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 204.666-13 chr10 59437654 59437886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74589 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 175-30 chr16 20786514 20786727 + 1.33333 NA TTS (NM_202000) TTS (NM_202000) 19852 NM_001142725 112479 Hs.248437 NM_080663 ENSG00000196678 ERI2 EXOD1|ZGRF5 ERI1 exoribonuclease family member 2 protein-coding 168.333-53 chr13 93178128 93178371 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -48558 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 206.333-59 chr14 86868078 86868255 + 1.33333 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -37612 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 200.667-63 chr18 59532855 59533123 + 1.33333 NA intron (NM_133459, intron 2 of 10) intron (NM_133459, intron 2 of 10) 164434 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 185.333-71 chr18 7342009 7342226 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 111013 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 159.333-286 chr6 67073530 67073734 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -981719 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 196.666-94 chr6 166861806 166862026 + 1.33333 NA intron (NM_001006932, intron 1 of 21) intron (NM_001006932, intron 1 of 21) 609 NM_001006932 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 208-12 chr1 178107902 178108100 + 1.33333 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) L1MB4|LINE|L1 13897 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 280.999-5 chr17 47934867 47935094 + 1.33333 NA intron (NR_103857, intron 1 of 2) intron (NR_103857, intron 1 of 2) 6424 NR_103857 100506325 Hs.656008 NR_103856 ENSG00000234494 SP2-AS1 - SP2 antisense RNA 1 ncRNA 195.333-15 chr1 152803342 152803554 + 1.33333 NA Intergenic (ATATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3203 NM_178351 353133 NM_178351 ENSG00000197084 LCE1C LEP3 late cornified envelope 1C protein-coding 119-35 chr12 40208039 40208134 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16911 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 229.666-25 chr4 37187803 37188080 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 54050 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 214.333-15 chr1 232618178 232618343 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99811 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 195.667-67 chr2 30554474 30554734 + 1.33333 NA intron (NM_001304446, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 107358 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 188-117 chr8 133895232 133895417 + 1.33333 NA intron (NR_125424, intron 1 of 3) intron (NR_125424, intron 1 of 3) 8828 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 159-87 chr4 37106850 37107034 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 105163 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 446.333-5 chr22 32229567 32230196 + 1.33333 NA intron (NM_014227, intron 10 of 14) intron (NM_014227, intron 10 of 14) 24766 NR_149072 110806273 Hs.382171 NR_149072 ENSG00000242082 SLC5A4-AS1 - SLC5A4 antisense RNA 1 ncRNA 209.333-169 chr4 42013580 42014005 + 1.33333 NA intron (NM_006345, intron 2 of 17) L1MA3|LINE|L1 23262 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 361.999-8 chr5 94353653 94354177 + 1.33333 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -242216 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 177.333-127 chr4 164612900 164613086 + 1.33333 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -141138 NM_001352885 100505989 Hs.328236 NM_001352885 ENSG00000248771 SMIM31 LINC01207 small integral membrane protein 31 protein-coding 205.333-220 chr7 43437406 43437573 + 1.33333 NA intron (NM_001287059, intron 7 of 27) L1ME4b|LINE|L1 85053 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 362.667-9 chr14 51224639 51225165 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15345 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 256-51 chr2 224816133 224816509 + 1.33333 NA intron (NM_001290263, intron 30 of 55) intron (NM_001290263, intron 30 of 55) 130728 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 169.333-190 chr4 117695922 117696141 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -138370 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 192.666-28 chr17 61567502 61567676 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23630 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 350.666-5 chr12 14394120 14394539 + 1.33333 NA intron (NM_181352, intron 1 of 14) intron (NM_181352, intron 1 of 14) 9048 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 272.666-5 chr12 27894234 27894560 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 75579 NM_198964 5744 Hs.591159 NM_002820 ENSG00000087494 PTHLH BDE2|HHM|PLP|PTHR|PTHRP parathyroid hormone like hormone protein-coding 241.666-23 chr9 119848339 119848816 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -86483 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 207-122 chr8 118767345 118767553 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -145486 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 293.333-63 chr8 88133963 88134331 + 1.33333 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) intron (NM_005941, intron 4 of 9) 193336 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 244-88 chr6 45903231 45903486 + 1.33333 NA intron (NM_001114086, intron 5 of 5) intron (NM_001114086, intron 5 of 5) 34239 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 218.666-54 chr3 89812931 89813164 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 705426 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 185.333-36 chr11 115876271 115876523 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -116197 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 353.333-16 chr17 20241763 20242210 + 1.33333 NA intron (NM_001033553, intron 7 of 14) intron (NM_001033553, intron 7 of 14) -79188 NR_023380 348254 Hs.462475 NR_023380 CCDC144CP CCDC144C coiled-coil domain containing 144C, pseudogene pseudo 255 chr1 45996846 45997262 + 1.33333 NA intron (NM_001324320, intron 5 of 29) intron (NM_001324320, intron 5 of 29) 132706 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 243.666-26 chr4 31192456 31192738 + 1.33333 NA intron (NR_125935, intron 2 of 4) intron (NR_125935, intron 2 of 4) 21453 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 190.666-37 chr3 160834655 160834842 + 1.33333 NA intron (NM_139245, intron 1 of 3) L1MD2|LINE|L1 -7401 NM_001317911 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 173.333-74 chr17 61942601 61942812 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_005121, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_005121, exon 30 of 30) -14724 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 170.333-157 chr4 61620235 61620451 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) HAL1|LINE|L1 418171 NM_001371342 215.667-98 chr5 62595224 62595551 + 1.33333 NA intron (NM_016338, intron 28 of 29) intron (NM_016338, intron 28 of 29) 16568 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 219.333-80 chr18 1723974 1724294 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -364505 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 152.667-86 chr12 78196248 78196427 + 1.33333 NA intron (NM_001024383, intron 34 of 39) intron (NM_001024383, intron 34 of 39) 163409 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 201-51 chr2 60415838 60416059 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -24573 NR_132992 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 350-39 chr9 35541403 35541819 + 1.33333 NA intron (NM_001135999, intron 1 of 11) AluSc|SINE|Alu 2979 NM_001135999 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 328-9 chr12 44163162 44163649 + 1.33333 NA intron (NM_001286213, intron 3 of 6) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 327324 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 199-124 chr8 137818757 137819002 + 1.33333 NA intron (NR_161374, intron 7 of 7) intron (NR_161374, intron 7 of 7) 264666 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 192-10 chr1 160834706 160834871 + 1.33333 NA intron (NM_001166664, intron 5 of 7) MIRc|SINE|MIR 28099 NM_016382 51744 Hs.157872 NM_016382 ENSG00000122223 CD244 2B4|NAIL|NKR2B4|Nmrk|SLAMF4 CD244 molecule protein-coding 223.333-61 chr19 37673236 37673459 + 1.33333 NA intron (NM_152605, intron 3 of 3) L1MA10|LINE|L1 -17086 NM_001320668 22835 Hs.668737 NM_014898 ENSG00000120784 ZFP30 ZNF745 ZFP30 zinc finger protein protein-coding 328.333-32 chr5 130041764 130042289 + 1.33333 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 137561 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 205-49 chr2 77436518 77436773 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) X7A_LINE|LINE|CR1 85731 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 289.666-17 chr6 37206230 37206484 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 36205 NM_001243186 5292 Hs.81170 NM_002648 ENSG00000137193 PIM1 PIM Pim-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 371-22 chr8 106591545 106591993 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -66039 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 218-102 chr7 16622178 16622398 + 1.33333 NA intron (NM_020319, intron 4 of 9) L1ME3G|LINE|L1 23466 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 364-20 chr4 47901081 47901479 + 1.33333 NA intron (NR_103795, intron 5 of 23) intron (NR_103795, intron 5 of 23) -12947 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 182.666-23 chr2 72506566 72506786 + 1.33333 NA intron (NR_135774, intron 11 of 19) intron (NR_135774, intron 11 of 19) 319357 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 289.333-25 chr18 77863962 77864188 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 129652 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 202.666-106 chr6 129743376 129743532 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33277 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 169.333-134 chr2 204659118 204659345 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) intron (NM_205863, intron 1 of 21) 113756 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 186.667-27 chr11 107131871 107132090 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -113504 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 220-71 chr20 52506890 52507228 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -113779 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 226.666-33 chr5 79278187 79278451 + 1.33333 NA intron (NM_152405, intron 2 of 10) intron (NM_152405, intron 2 of 10) 42188 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 208-185 chr9 127840800 127841027 + 1.33333 NA intron (NM_001114753, intron 2 of 14) intron (NM_001114753, intron 2 of 14) 6254 NM_001278138 2022 Hs.76753 NM_000118 ENSG00000106991 ENG END|HHT1|ORW1 endoglin protein-coding 214-104 chr5 15839477 15839681 + 1.33333 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -95603 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 198.667-69 chr15 43920996 43921260 + 1.33333 NA intron (NM_001322951, intron 1 of 14) intron (NM_001322951, intron 1 of 14) -42957 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 286-58 chr7 107464637 107464950 + 1.33333 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) LTR40c|LTR|ERVL -5264 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 215.666-10 chr11 26119993 26120221 + 1.33333 NA Intergenic (GAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -69016 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 215.333-171 chr6 12058581 12058793 + 1.33333 NA intron (NM_002114, intron 2 of 8) intron (NM_002114, intron 2 of 8) 46375 NM_002114 3096 Hs.567284 NM_002114 ENSG00000095951 HIVEP1 CIRIP|CRYBP1|GAAP|MBP-1|PRDII-BF1|Schnurri-1|ZAS1|ZNF40|ZNF40A human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 protein-coding 227.333-65 chr2 102832333 102832577 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63267 NR_135562 105373518 Hs.738351 NR_135562 ENSG00000277527 LINC01796 - long intergenic non-protein coding RNA 1796 ncRNA 238-20 chr14 37371541 37371851 + 1.33333 NA intron (NM_138731, intron 11 of 13) intron (NM_138731, intron 11 of 13) 173759 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 252-75 chr5 12592256 12592601 + 1.33333 NA intron (NR_033383, intron 1 of 3) intron (NR_033383, intron 1 of 3) 17571 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 209.999-2 chr11 112640570 112640749 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -84857 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 253.666-16 chr3 42077445 42077689 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9633 NR_146089 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 200.666-56 chr2 50492504 50492719 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 15 of 22) intron (NM_001330093, intron 15 of 22) -144855 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 225.333-132 chr8 114090525 114090793 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -653720 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 352.333 chr1 33886272 33886746 + 1.33333 NA intron (NM_052896, intron 5 of 69) intron (NM_052896, intron 5 of 69) 17553 NR_038372 402779 Hs.666207 NR_038372 ENSG00000231163 CSMD2-AS1 - CSMD2 antisense RNA 1 ncRNA 222 chr1 42587719 42588007 + 1.33333 NA intron (NM_001080850, intron 9 of 16) LOR1b|LTR|ERV1 54843 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 320.333-20 chr4 74887437 74887764 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -45516 NM_015393 25849 Hs.105460 NM_015393 ENSG00000169116 PARM1 Cipar1|DKFZP564O0823|PARM-1|WSC4 prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 protein-coding 226.666-40 chr7 61046606 61046862 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2257322 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 191.333-93 chr17 82502343 82502545 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -17288 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 238-44 chr2 45454560 45454838 + 1.33333 NA intron (NM_018079, intron 16 of 20) intron (NM_018079, intron 16 of 20) 156568 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 195.666-18 chr14 61273988 61274331 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7179 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 191.333-214 chr8 144075756 144075979 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -2805 NM_019037 54512 Hs.632041 NM_019037 ENSG00000178896 EXOSC4 RRP41|RRP41A|Rrp41p|SKI6|Ski6p|hRrp41p|p12A exosome component 4 protein-coding 151.333-402 chr7 124442761 124442970 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -90769 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 239-32 chr2 111075610 111075917 + 1.33333 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) L1MD2|LINE|L1 39825 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 233.333-44 chr15 99511349 99511652 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53917 NM_001352617 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 204.667-55 chr17 27892018 27892306 + 1.33333 NA intron (NM_001076680, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 1203 NM_001076680 201229 Hs.687951 NM_001076680 ENSG00000232859 LYRM9 C17orf108|HSD24 LYR motif containing 9 protein-coding 196.667-24 chr10 124405758 124406189 + 1.33333 NA intron (NM_001322971, intron 2 of 7) intron (NM_001322971, intron 2 of 7) 12950 NM_001322969 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 199.333-275 chr8 94858034 94858236 + 1.33333 NA intron (NR_073445, intron 15 of 27) intron (NR_073445, intron 15 of 27) 34845 NR_073445 55656 Hs.727669 NM_017864 ENSG00000164941 INTS8 C8orf52|INT8 integrator complex subunit 8 protein-coding 392.666-10 chr8 109449645 109449947 + 1.33333 NA intron (NM_177531, intron 40 of 77) intron (NM_177531, intron 40 of 77) 87335 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 155-90 chr3 94515263 94515421 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -422921 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 216.333-150 chr9 78049934 78050136 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -18224 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 192.666-23 chr14 50639420 50639637 + 1.33333 NA intron (NM_021818, intron 4 of 4) intron (NM_021818, intron 4 of 4) 28778 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 280-35 chr3 108870590 108870940 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 47979 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 375 chr1 28761260 28761598 + 1.33333 NA intron (NM_001173128, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu 24489 NM_016258 51441 Hs.532286 NM_016258 ENSG00000198492 YTHDF2 CAHL|HGRG8|NY-REN-2 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2 protein-coding 298.333-34 chr5 6909410 6909824 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81696 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 245-12 chr12 13487108 13487416 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -110517 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 168.333-215 chr8 131276321 131276544 + 1.33333 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -235523 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 180-22 chr12 794771 794947 + 1.33333 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) AluJr4|SINE|Alu 41936 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 225.333-137 chr9 22638379 22638680 + 1.33333 NA Intergenic (AACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -7671 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 158-105 chr5 49659737 49659941 + 1.33333 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 781449 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 294-25 chr14 65139675 65140081 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -37183 NR_073137 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 209.333-68 chr14 88690027 88690242 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 17 of 42) L2a|LINE|L2 95714 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 356.333-22 chr21 32153830 32154291 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67765 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 200.333-85 chr21 28846918 28847144 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 38336 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 275.333-74 chr8 60055380 60055886 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 225767 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 324.333-33 chr5 86835360 86835665 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 88694 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 215.333-189 chr7 102807203 102807512 + 1.33333 NA intron (NR_146989, intron 7 of 7) L1ME1|LINE|L1 58358 NR_146982 222234 Hs.202543 NM_147194 ENSG00000222011 FAM185A - family with sequence similarity 185 member A protein-coding 335-21 chr4 56416822 56417192 + 1.33333 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) AluSx|SINE|Alu 18608 NR_156493 5471 Hs.331420 NM_002703 ENSG00000128059 PPAT ATASE|GPAT|PRAT phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase protein-coding 249.333-88 chr6 44302336 44302563 + 1.33333 NA exon (NM_020745, exon 18 of 22) exon (NM_020745, exon 18 of 22) -4751 NM_182539 202500 Hs.189183 NM_182539 ENSG00000146221 TCTE1 D6S46|DRC5|FAP155 t-complex-associated-testis-expressed 1 protein-coding 258.666-48 chr9 68744954 68745246 + 1.33333 NA intron (NM_003558, intron 2 of 15) LTR78|LTR|ERV1 -34965 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 188-103 chr7 82626492 82626744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -182662 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 175-45 chr2 188927205 188927452 + 1.33333 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -47045 NM_000090 1281 Hs.443625 NM_000090 ENSG00000168542 COL3A1 EDS4A|EDSVASC|PMGEDSV collagen type III alpha 1 chain protein-coding 236.666-24 chr19 18967478 18967683 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26363 NM_004838 9454 Hs.720208 NM_004838 ENSG00000051128 HOMER3 HOMER-3|VESL3 homer scaffold protein 3 protein-coding 229.333-56 chr19 51637024 51637320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6698 NM_003830 8778 Hs.310333 NM_003830 ENSG00000105501 SIGLEC5 CD170|CD33L2|OB-BP2|OBBP2|SIGLEC-5 sialic acid binding Ig like lectin 5 protein-coding 246-108 chr9 106751113 106751362 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111929 NM_021224 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 260-76 chr7 50718980 50719367 + 1.33333 NA intron (NM_001350816, intron 2 of 17) L2a|LINE|L2 13180 NM_001001549 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 207.333-55 chr11 113278368 113278628 + 1.33333 NA TTS (NM_001242607) TTS (NM_001242607) -4597 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 202.666-14 chr10 68977638 68977797 + 1.33333 NA intron (NM_001256910, intron 12 of 14) intron (NM_001256910, intron 12 of 14) -11086 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 247.666-4 chr10 66663100 66663392 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) L2a|LINE|L2 -262790 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 178.666-21 chr6 158900612 158900754 + 1.33333 NA intron (NR_160979, intron 2 of 2) L1M1|LINE|L1 12206 NR_160979 100130967 Hs.32804 NM_001195032 C6orf99 - chromosome 6 open reading frame 99 ncRNA 258-46 chr3 88842969 88843280 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -264497 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 204.666-14 chr10 66541111 66541478 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) CR1_Mam|LINE|CR1 -384742 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 259.333-104 chr9 6352742 6353068 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 24530 NM_001001875 89882 Hs.351815 NM_033516 ENSG00000170777 TPD52L3 D55|NYDSP25|hD55 TPD52 like 3 protein-coding 218.666-30 chr14 82822050 82822295 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 179540 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 166-81 chr3 178846730 178846883 + 1.33333 NA intron (NR_126561, intron 2 of 5) L3|LINE|CR1 13599 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 371.333 chr1 147738989 147739309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21453 NM_181703 2702 Hs.447968 NM_005266 ENSG00000265107 GJA5 ATFB11|CX40 gap junction protein alpha 5 protein-coding 295.333-44 chr4 63755073 63755369 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 654229 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 201.333-39 chr10 101721088 101721349 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -25923 NM_001323541 6468 Hs.500822 NM_022039 ENSG00000107829 FBXW4 DAC|FBW4|FBWD4|SHFM3|SHSF3 F-box and WD repeat domain containing 4 protein-coding 216.666-4 chr1 102924074 102924307 + 1.33333 NA intron (NM_001854, intron 46 of 66) AluY|SINE|Alu 184306 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 705.666 chr14 62715190 62716140 + 1.33333 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) intron (NM_172375, intron 9 of 9) 329793 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 174.666-8 chr15 40226525 40226722 + 1.33333 NA intron (NM_001128629, intron 1 of 9) intron (NM_001128629, intron 1 of 9) 9195 NM_001128629 106821730 Hs.732375 NM_001128628 ENSG00000259288 BUB1B-PAK6 PAK-5|PAK-6|PAK5|PAK6 BUB1B-PAK6 readthrough protein-coding 205.666 chr1 65017347 65017516 + 1.33333 NA intron (NM_001321853, intron 2 of 26) AluSx|SINE|Alu -14955 NR_119383 101927084 Hs.734218 NR_119383 ENSG00000226891 LINC01359 - long intergenic non-protein coding RNA 1359 ncRNA 220.666-16 chr12 85576306 85576501 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 260006 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 252.667-18 chr11 81336108 81336444 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 554560 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 348.333-34 chr8 109509777 109510161 + 1.33333 NA intron (NM_177531, intron 70 of 77) intron (NM_177531, intron 70 of 77) -29731 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 194.666-63 chr6 135873103 135873308 + 1.33333 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) intron (NM_018945, intron 1 of 12) 21504 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 222.666-37 chr4 41835972 41836228 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46511 NR_104143 101927074 Hs.611425 NR_104143 ENSG00000245870 LINC00682 - long intergenic non-protein coding RNA 682 ncRNA 336.333-29 chr5 89724012 89724368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 292530 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 408-3 chr14 72457765 72458230 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 4 of 16) intron (NM_001370288, intron 4 of 16) -58823 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 240.333-102 chr9 82841807 82842157 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 221160 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 296-39 chr20 46919467 46919771 + 1.33333 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 24776 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 211-66 chr3 106014084 106014386 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -144834 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 278-21 chr20 3001728 3002123 + 1.33333 NA intron (NM_080841, intron 8 of 22) intron (NM_080841, intron 8 of 22) -41697 NM_178332 2797 Hs.129715 NM_001501 ENSG00000125787 GNRH2 GnRH-II|LH-RHII gonadotropin releasing hormone 2 protein-coding 323.666-7 chr20 33537717 33538039 + 1.33333 NA intron (NM_001032999, intron 1 of 10) L1ME1|LINE|L1 -24487 NM_001039709 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 199.666-9 chr11 21207488 21207673 + 1.33333 NA intron (NM_201551, intron 13 of 18) intron (NM_201551, intron 13 of 18) 537994 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 188-11 chr1 185994441 185994761 + 1.33333 NA intron (NM_031935, intron 23 of 106) MIRb|SINE|MIR 260210 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 185.333-45 chr14 45317438 45317621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64327 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 264.666-26 chr22 48281408 48281763 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 7221 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 205-91 chr7 139595142 139595375 + 1.33333 NA intron (NM_001113239, intron 12 of 14) intron (NM_001113239, intron 12 of 14) 71573 NM_001080511 154790 Hs.57806 NM_001080511 ENSG00000236279 CLEC2L - C-type lectin domain family 2 member L protein-coding 199-17 chr11 88601878 88602033 + 1.33333 NA intron (NM_001143831, intron 4 of 8) intron (NM_001143831, intron 4 of 8) 97379 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 265-58 chr5 95688013 95688377 + 1.33333 NA intron (NM_001349303, intron 5 of 8) L1PB4|LINE|L1 -5185 NR_125328 83890 Hs.50499 NM_031952 ENSG00000145757 SPATA9 NYD-SP16 spermatogenesis associated 9 protein-coding 212-131 chr5 75361685 75361913 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_000859, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_000859, exon 20 of 20) 24579 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 203.333-216 chr5 87124528 87124750 + 1.33333 NA intron (NR_105018, intron 1 of 3) L1ME4b|LINE|L1 4491 NR_105018 101929380 NR_105018 LOC101929380 - uncharacterized LOC101929380 ncRNA 328.333-27 chr3 18917126 18917562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -231166 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 246-107 chr9 98526866 98527188 + 1.33333 NA intron (NM_005458, intron 3 of 18) L1M5|LINE|L1 181908 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 286.999-2 chr12 40630336 40630569 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61987 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 252.333-77 chr8 127561699 127562029 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -79725 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 210.333-152 chr7 4580972 4581153 + 1.33333 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -101233 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 172-30 chr12 12043848 12044055 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -5910 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 192.333-21 chr10 90555765 90556005 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15080 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 224-2 chr1 26791599 26791856 + 1.33333 NA intron (NM_001202554, intron 2 of 3) intron (NM_001202554, intron 2 of 3) 3539 NM_001202554 55650 Hs.259605 NM_017837 ENSG00000060642 PIGV GPI-MT-II|HPMRS1|PIG-V phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V protein-coding 241.333-88 chr6 125407062 125407376 + 1.33333 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -105252 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 195.333-143 chr3 44309579 44309770 + 1.33333 NA intron (NM_001145030, intron 15 of 19) intron (NM_001145030, intron 15 of 19) -28445 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 253.666-18 chr3 114185019 114185396 + 1.33333 NA intron (NM_001282563, intron 1 of 7) L1M4c|LINE|L1 -6155 NM_033663 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 116.666 chr1 20969559 20969728 + 1.33333 NA intron (NM_003760, intron 6 of 31) intron (NM_003760, intron 6 of 31) 18789 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 207.333-286 chrX 53135363 53135581 + 1.33333 NA intron (NR_145973, intron 3 of 3) intron (NR_145973, intron 3 of 3) 41315 NR_145976 102723508 Hs.633244 NR_110456 KANTR LINC01155|Spasm KDM5C adjacent transcript ncRNA 288.666-7 chr14 57564138 57564453 + 1.33333 NA non-coding (NR_159373, exon 11 of 11) non-coding (NR_159373, exon 11 of 11) -70438 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 316-46 chr6 61908695 61908962 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) intron (NR_146874, intron 4 of 13) 334698 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 228-71 chr5 175049320 175049544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53701 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 303.999-6 chr8 117804640 117805062 + 1.33333 NA exon (NM_000127, exon 10 of 11) exon (NM_000127, exon 10 of 11) 116062 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 218-118 chr9 25725636 25725822 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46871 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 306.333-33 chr4 145569913 145570358 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -49250 NM_172250 166785 Hs.452864 NM_172250 ENSG00000151611 MMAA cblA metabolism of cobalamin associated A protein-coding 197.333-214 chr7 55954121 55954356 + 1.33333 NA intron (NM_015969, intron 2 of 2) intron (NM_015969, intron 2 of 2) 2361 NM_015969 51373 Hs.44298 NM_015969 ENSG00000239789 MRPS17 HSPC011|MRP-S17|RPMS17|S17mt mitochondrial ribosomal protein S17 protein-coding 254.333-15 chr12 98777395 98777680 + 1.33333 NA intron (NM_001352221, intron 7 of 9) intron (NM_001352221, intron 7 of 9) 117237 NM_001352220 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 204.333-20 chr1 224864686 224864841 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -64891 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 299.333-20 chr13 49191845 49192128 + 1.33333 NA intron (NM_001079673, intron 19 of 25) MIRb|SINE|MIR -28352 NM_001507 2862 Hs.248126 NM_001507 ENSG00000102539 MLNR GPR38|MTLR1 motilin receptor protein-coding 220.333-138 chr9 102080827 102081065 + 1.33333 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -342366 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 200-71 chr17 69219340 69219576 + 1.33333 NA intron (NM_080282, intron 7 of 39) intron (NM_080282, intron 7 of 39) 15554 NR_130736 100133319 NR_130736 ENSG00000278873 PRO1804 - uncharacterized LOC100133319 ncRNA 381.333-17 chr5 21120088 21120502 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -339185 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 258.333-52 chr6 15333114 15333437 + 1.33333 NA intron (NM_001267040, intron 1 of 17) L1MB7|LINE|L1 84420 NM_001267040 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 206.333-17 chr10 86878135 86878331 + 1.33333 NA intron (NM_004329, intron 3 of 12) MIRc|SINE|MIR -77526 NM_001330120 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 219.666-6 chr11 19680415 19680626 + 1.33333 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) intron (NM_001111018, intron 1 of 37) -32317 NM_145117 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 214.667-116 chr8 87759719 87760049 + 1.33333 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL 114131 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 313.333-40 chr7 3467718 3468028 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 166621 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 199-87 chr5 77224748 77224957 + 1.33333 NA intron (NM_001029853, intron 1 of 20) L1MC5|LINE|L1 14172 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 196-76 chr18 3911650 3911854 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 26399 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 270.666-27 chr8 107293424 107293673 + 1.33333 NA intron (NM_001199859, intron 6 of 8) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 42967 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 198-125 chr3 116137008 116137164 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -222938 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 166.667-94 chr18 3275582 3275738 + 1.33333 NA intron (NM_001144944, intron 2 of 3) intron (NM_001144944, intron 2 of 3) 12941 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 183.666-14 chr22 30817819 30818061 + 1.33333 NA intron (NM_001282740, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu -4576 NM_001282741 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 269.333-24 chr15 42276770 42277163 + 1.33333 NA intron (NM_001301410, intron 2 of 4) L1ME4b|LINE|L1 2798 NM_001301410 2595 Hs.730806 NM_198141 ENSG00000214013 GANC - glucosidase alpha, neutral C protein-coding 210.666-71 chr3 153371002 153371201 + 1.33333 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -113394 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 185.333-183 chr8 61657131 61657284 + 1.33333 NA intron (NM_032468, intron 4 of 14) L2a|LINE|L2 32604 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 211.333-135 chr20 59916093 59916309 + 1.33333 NA intron (NM_014258, intron 8 of 44) intron (NM_014258, intron 8 of 44) 17436 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 391-12 chr6 45137727 45138247 + 1.33333 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1MB7|LINE|L1 59783 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 206.666-123 chr9 27665228 27665387 + 1.33333 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -91441 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 214.333-53 chr16 26160573 26160804 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 135451 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 203.999-4 chr3 183025993 183026160 + 1.33333 NA intron (NM_001293273, intron 12 of 16) AluJb|SINE|Alu -40158 NM_001308101 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 246-18 chr11 112381322 112381615 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -100764 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 337-25 chr7 24747628 24748001 + 1.33333 NA intron (NM_001127454, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 9650 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 230-26 chr15 95421948 95422188 + 1.33333 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -11025 NR_027133 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 284.333-4 chr10 17646488 17646813 + 1.33333 NA intron (NM_001324286, intron 1 of 10) intron (NM_001324286, intron 1 of 10) 2499 NM_001324287 8027 Hs.335391 NM_003473 ENSG00000136738 STAM STAM-1|STAM1 signal transducing adaptor molecule protein-coding 139-110 chr8 137878578 137878806 + 1.33333 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 204853 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 294.333-48 chr8 102235813 102236278 + 1.33333 NA intron (NM_015713, intron 1 of 8) intron (NM_015713, intron 1 of 8) 2786 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 371.666 chr10 66522882 66523335 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -402928 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 327.667-25 chr5 32448309 32448823 + 1.33333 NA Intergenic Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger -3826 NM_016107 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 234.666-44 chr7 67553534 67553736 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 217659 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 218.666-18 chr12 21944793 21945018 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -8211 NM_020297 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 236.333-97 chrX 56006938 56007302 + 1.33333 NA intron (NM_001324105, intron 1 of 5) intron (NM_001324105, intron 1 of 5) 98835 NM_001324104 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 178-108 chr8 11520755 11520955 + 1.33333 NA intron (NM_001330465, intron 1 of 11).2 intron (NM_001330465, intron 1 of 11).2 26468 NM_001715 640 Hs.146591 NM_001715 ENSG00000136573 BLK MODY11 BLK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 465.667-6 chr2 896797 897415 + 1.33333 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 8345 NR_110179 101060385 Hs.385965 NR_110179 ENSG00000228799 LINC01939 - long intergenic non-protein coding RNA 1939 ncRNA 287.333-43 chr4 110004719 110005007 + 1.33333 NA intron (NM_001357021, intron 19 of 19) intron (NM_001357021, intron 19 of 19) 91980 NM_001178131 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 253-32 chr19 35657718 35658245 + 1.33333 NA intron (NM_001863, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu -8535 NM_001281443 11045 Hs.159309 NM_007000 ENSG00000105668 UPK1A TSPAN21|UP1A|UPIA|UPKA uroplakin 1A protein-coding 206.333-70 chr18 3922295 3922494 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 37041 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 273.999-3 chr19 52347335 52347682 + 1.33333 NA intron (NM_173530, intron 1 of 5) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 2079 NM_173530 162963 Hs.147025 NM_173530 ENSG00000167554 ZNF610 - zinc finger protein 610 protein-coding 379.666-14 chr7 105339022 105339475 + 1.33333 NA intron (NM_001350746, intron 2 of 14) intron (NM_001350746, intron 2 of 14) -40469 NM_001278273 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 227-51 chr6 162468371 162468620 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) L3|LINE|CR1 -258637 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 184.666-2 chr1 107934361 107934598 + 1.33333 NA intron (NM_006113, intron 1 of 26) intron (NM_006113, intron 1 of 26) -29964 NR_046653 100873946 Hs.568676 NR_046653 ENSG00000230489 VAV3-AS1 - VAV3 antisense RNA 1 ncRNA 156.666-5 chr14 42735677 42735828 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1128896 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 197.333-108 chr2 58629327 58629510 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) intron (NR_033873, intron 1 of 13) 108665 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 229.333-75 chr3 27718485 27718698 + 1.33333 NA exon (NM_001278182, exon 5 of 6) exon (NM_001278182, exon 5 of 6) 3732 NM_005442 8320 Hs.591663 NM_005442 ENSG00000163508 EOMES TBR2 eomesodermin protein-coding 211-8 chr1 231466073 231466282 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 10348 NR_033826 645339 Hs.382049 NR_033826 SNRPD2P2 - small nuclear ribonucleoprotein D2 pseudogene 2 pseudo 202.666-25 chr11 107290720 107290885 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 167044 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 259.666-20 chr2 11891834 11892066 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54964 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 198-106 chr20 32956262 32956495 + 1.33333 NA intron (NM_001143967, intron 23 of 26) L1ME1|LINE|L1 48055 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 233.333-70 chr2 183501966 183502178 + 1.33333 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 377629 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 203.666-11 chr10 71098908 71099224 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -113504 NM_170744 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 170.333-174 chr5 81736832 81737068 + 1.33333 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) intron (NM_012446, intron 1 of 16) 14303 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 174.333-118 chr5 59516414 59516568 + 1.33333 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 70007 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 182-110 chr8 125234673 125234866 + 1.33333 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 142909 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 363.666-6 chr4 48598085 48598503 + 1.33333 NA intron (NM_015030, intron 13 of 63) L1MA1|LINE|L1 108042 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 216-39 chr16 10571953 10572232 + 1.33333 NA intron (NM_001424, intron 1 of 4) intron (NM_001424, intron 1 of 4) 8506 NM_001424 2013 Hs.531561 NM_001424 ENSG00000213853 EMP2 XMP epithelial membrane protein 2 protein-coding 202-70 chr18 49090761 49090932 + 1.33333 NA intron (NM_001353210, intron 16 of 16) UCON54|Unknown|Unknown -41078 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 214-102 chr4 159321605 159321882 + 1.33333 NA intron (NM_001351727, intron 3 of 24) intron (NM_001351727, intron 3 of 24) 53934 NM_014247 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 559.666 chr14 71118205 71118981 + 1.33333 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 -201883 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 227.999-3 chr14 68068191 68068363 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MB7|LINE|L1 244685 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 201.333-3 chr1 14381954 14382137 + 1.33333 NA intron (NR_149058, intron 3 of 4) L1MA3|LINE|L1 37928 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 198.667-138 chr4 79458356 79458610 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34110 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 419.333-16 chr8 78457658 78458222 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -58400 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 172-113 chr9 85216111 85216310 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 510309 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 192.666-22 chr14 41394661 41394830 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -212111 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 186.667-78 chr2 210794046 210794283 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176593 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 204.667-15 chr10 50967057 50967317 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23701 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 320.333-13 chr2 98058137 98058515 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -28841 NR_144298 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 272.333-33 chr2 89827092 89827456 + 1.33333 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -189367 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 409.666-2 chr10 73759225 73759945 + 1.33333 NA intron (NM_198597, intron 3 of 22) intron (NM_198597, intron 3 of 22) -12691 NM_173540 170384 Hs.588854 NM_173540 ENSG00000196968 FUT11 FUCTXI fucosyltransferase 11 protein-coding 218.667-106 chr8 84778219 84778491 + 1.33333 NA intron (NM_001354322, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 72428 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 218-57 chr2 164011462 164011769 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -275607 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 421.333-3 chr15 61357617 61358172 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -128592 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 198-98 chr2 137477983 137478147 + 1.33333 NA intron (NM_001316349, intron 15 of 27) L1MA4A|LINE|L1 449867 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 211.333-21 chr1 244655150 244655350 + 1.33333 NA intron (NM_016076, intron 1 of 4) intron (NM_016076, intron 1 of 4) 2124 NM_016076 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 154.666-12 chr5 45143644 45143788 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 334769 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 204-196 chr8 105002805 105003001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -315535 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 263.333-60 chr3 110030212 110030594 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 427575 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 219.333-120 chr3 148731570 148731899 + 1.33333 NA intron (NM_004835, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 1554 NM_032049 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 126-25 chr13 24050875 24051062 + 1.33333 NA intron (NM_001286792, intron 3 of 14) intron (NM_001286792, intron 3 of 14) 71166 NM_001286792 221178 Hs.434298 NM_153023 ENSG00000182957 SPATA13 ARHGEF29|ASEF2 spermatogenesis associated 13 protein-coding 304-21 chr15 59649711 59650156 + 1.33333 NA intron (NM_001320930, intron 4 of 5) intron (NM_001320930, intron 4 of 5) 7372 NM_001320929 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 205.666-28 chr20 8743920 8744125 + 1.33333 NA intron (NM_182734, intron 23 of 32) intron (NM_182734, intron 23 of 32) -87163 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 208.667-54 chr17 54987121 54987426 + 1.33333 NA intron (NM_178509, intron 3 of 17) intron (NM_178509, intron 3 of 17) -18488 NM_001321518 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 267-24 chr14 76004207 76004526 + 1.33333 NA intron (NM_001102564, intron 2 of 8) L1MEf|LINE|L1 18603 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 195.666-27 chr2 222486943 222487136 + 1.33333 NA intron (NM_152386, intron 2 of 4) intron (NM_152386, intron 2 of 4) 62496 NM_001320833 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 284.667-23 chr18 41872311 41872689 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -82734 NM_002647 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 262.667-28 chr15 73864784 73865143 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -8601 NM_001286434 161514 Hs.124512 NM_153356 ENSG00000167139 TBC1D21 MgcRabGAP TBC1 domain family member 21 protein-coding 193-52 chr20 53259836 53260079 + 1.33333 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) 74674 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 201.333-43 chr10 128766849 128767024 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -145897 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 221.333-57 chr2 26002190 26002424 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19810 NM_002254 3797 Hs.21611 NM_002254 ENSG00000084731 KIF3C - kinesin family member 3C protein-coding 171.333-20 chr10 59598252 59598475 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 111528 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 199-26 chr14 64170275 64170505 + 1.33333 NA exon (NM_182914, exon 94 of 116) exon (NM_182914, exon 94 of 116) -43754 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 223-68 chr8 129481497 129481815 + 1.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 2486 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 241.666 chr1 225987789 225987988 + 1.33333 NA intron (NM_152608, intron 6 of 6) intron (NM_152608, intron 6 of 6) 11455 NM_152608 163859 Hs.520192 NM_152608 ENSG00000143751 SDE2 C1orf55|dJ671D7.1 SDE2 telomere maintenance homolog protein-coding 205.333-210 chr6 167129008 167129180 + 1.33333 NA intron (NM_031409, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 6341 NM_031409 1235 Hs.46468 NM_004367 ENSG00000112486 CCR6 BN-1|C-C CKR-6|CC-CKR-6|CCR-6|CD196|CKR-L3|CKRL3|CMKBR6|DCR2|DRY6|GPR29|GPRCY4|STRL22 C-C motif chemokine receptor 6 protein-coding 225.333-65 chr16 77051068 77051364 + 1.33333 NA Intergenic (TTAATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -139974 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 211.333-201 chr6 34368321 34368548 + 1.33333 NA intron (NM_001202470, intron 5 of 8) intron (NM_001202470, intron 5 of 8) 24235 NM_006703 11165 Hs.188882 NM_006703 ENSG00000272325 NUDT3 DIPP|DIPP-1|DIPP1 nudix hydrolase 3 protein-coding 211.333-93 chr18 7442039 7442306 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 18834 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 208.667-116 chr5 177197716 177198008 + 1.33333 NA intron (NM_172349, intron 4 of 23) intron (NM_172349, intron 4 of 23) 63633 NM_001365684 64324 Hs.106861 NM_022455 ENSG00000165671 NSD1 ARA267|KMT3B|SOTOS|SOTOS1|STO nuclear receptor binding SET domain protein 1 protein-coding 152-150 chr8 24459919 24460135 + 1.33333 NA intron (NM_003817, intron 3 of 21) L1ME2z|LINE|L1 19001 NM_003817 8756 Hs.116147 NM_003817 ENSG00000069206 ADAM7 ADAM 7|ADAM-7|EAPI|GP-83|GP83 ADAM metallopeptidase domain 7 protein-coding 253.333-24 chr14 51520196 51520428 + 1.33333 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) L1ME1|LINE|L1 31184 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 283.333-29 chr2 39464435 39464665 + 1.33333 NA intron (NR_037875, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 27134 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 206.666-115 chr8 18301592 18301825 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 80040 NM_001160174 9 Hs.591847 NM_000662 ENSG00000171428 NAT1 AAC1|MNAT|NAT-1|NATI N-acetyltransferase 1 protein-coding 296-29 chr2 63317033 63317461 + 1.33333 NA intron (NR_148704, intron 13 of 18) intron (NR_148704, intron 13 of 18) 120760 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 179.333-199 chr9 109081921 109082183 + 1.33333 NA intron (NM_032012, intron 7 of 17) intron (NM_032012, intron 7 of 17) -35754 NR_029506 407036 NR_029506 ENSG00000207698 MIR32 MIRN32|hsa-mir-32|miR-32|miRNA32 microRNA 32 ncRNA 278 chr1 22321490 22321838 + 1.33333 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 55425 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 318-7 chr10 31628542 31628923 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -228977 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 196-54 chr15 50331568 50331826 + 1.33333 NA intron (NM_016654, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 -22477 NR_024490 100129387 Hs.659360 NR_024490 GABPB1-AS1 - GABPB1 antisense RNA 1 ncRNA 179-41 chr17 64128810 64129055 + 1.33333 NA intron (NM_001433, intron 1 of 21) intron (NM_001433, intron 1 of 21) 1212 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 207-59 chr18 56942795 56943089 + 1.33333 NA intron (NM_015285, intron 25 of 27) intron (NM_015285, intron 25 of 27) 129177 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 318.666-14 chr3 177938601 177938948 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121909 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 212.666-55 chr3 76279369 76279620 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -493945 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 226.666-3 chr10 63074374 63074567 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58777 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 194-49 chr16 8257836 8258034 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 331903 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 190-25 chr12 31527772 31527993 + 1.33333 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) L1MC4|LINE|L1 -62041 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 216-109 chr6 130062138 130062364 + 1.33333 NA intron (NM_001007102, intron 9 of 21) intron (NM_001007102, intron 9 of 21) 42607 NM_001346550 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 276-22 chr14 67054653 67054922 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 9 of 21) L1PA10|LINE|L1 -134653 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 204.667-156 chr9 32003876 32004212 + 1.33333 NA Intergenic Helitron1Na_Mam|RC|Helitron -380559 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 123.666-5 chr8 130160554 130160702 + 1.33333 NA intron (NM_018482, intron 11 of 29) intron (NM_018482, intron 11 of 29) -75860 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 220-118 chr8 38120202 38120404 + 1.33333 NA intron (NM_004674, intron 9 of 15) intron (NM_004674, intron 9 of 15) 14510 NM_001261832 9070 Hs.521530 NM_004674 ENSG00000129691 ASH2L ASH2|ASH2L1|ASH2L2|Bre2 ASH2 like, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 297-51 chrX 75405158 75405538 + 1.33333 NA intron (NM_001146256, intron 9 of 10) L1PA14|LINE|L1 117689 NM_001146257 158866 Hs.253211 NM_144969 ENSG00000102383 ZDHHC15 DHHC15|MRX91 zinc finger DHHC-type containing 15 protein-coding 245.333-93 chr5 9327902 9328249 + 1.33333 NA intron (NM_003966, intron 4 of 22) intron (NM_003966, intron 4 of 22) -183258 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 267-66 chr7 111729147 111729542 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 52 of 52) AluSz6|SINE|Alu -79161 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 178-38 chr12 79631172 79631376 + 1.33333 NA intron (NM_001354732, intron 2 of 6) L1MEc|LINE|L1 59306 NM_001354732 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 148.333-240 chr22 29535765 29535986 + 1.33333 NA intron (NM_001002879, intron 7 of 19) AluJb|SINE|Alu 17780 NM_001002878 8563 Hs.75361 NM_003678 ENSG00000100296 THOC5 C22orf19|Fmip|PK1.3|fSAP79 THO complex 5 protein-coding 124.667-9 chr1 101139975 101140145 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 96468 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 200.666-102 chr5 94689965 94690195 + 1.33333 NA intron (NM_032290, intron 18 of 20) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 71411 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 256-28 chr14 76990533 76990843 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 31050 NR_133913 105370578 Hs.574184 NR_133913 ENSG00000258602 LINC01629 linc-KIAA1737-2 long intergenic non-protein coding RNA 1629 ncRNA 524 chr1 174644119 174644740 + 1.33333 NA intron (NM_001366446, intron 14 of 25) intron (NM_001366446, intron 14 of 25) -56110 NM_001366450 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 260-5 chr1 181080219 181080454 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -8364 NM_016545 51278 Hs.15725 NM_016545 ENSG00000162783 IER5 SBBI48 immediate early response 5 protein-coding 182.666-4 chr10 80783034 80783271 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 133355 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 203.666-3 chr1 61421674 61421933 + 1.33333 NA intron (NM_005595, intron 9 of 9) intron (NM_005595, intron 9 of 9) -168285 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 195.666-41 chr6 100140576 100140778 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -146439 NM_032503 84539 Hs.591342 NM_032503 ENSG00000152034 MCHR2 GPR145|GPRv17|MCH-2R|MCH-R2|MCH2|MCH2R|MCHR-2|SLT melanin concentrating hormone receptor 2 protein-coding 174.667-149 chr6 16948839 16949088 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -153295 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 206.333-162 chr8 86200995 86201262 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29253 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 243.333-17 chr12 37906585 37906940 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -410012 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 235.667-64 chr8 130529152 130529396 + 1.33333 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger -85600 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 234.667-3 chr1 91033629 91033968 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11543 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 204.666-70 chr5 87359542 87359748 + 1.33333 NA intron (NM_022650, intron 9 of 24) intron (NM_022650, intron 9 of 24) -36017 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 198-115 chr3 29398606 29398813 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 117397 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 272.666-10 chr2 24259703 24259958 + 1.33333 NA intron (NM_001348182, intron 21 of 38) L2c|LINE|L2 84777 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 216.667-103 chr8 54033705 54033989 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -11399 NM_201437 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 222.666-59 chr9 30123416 30123639 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 284927 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 344.333-20 chr6 3120239 3120773 + 1.33333 NA intron (NR_026648, intron 2 of 8) intron (NR_026648, intron 2 of 8) 1795 NM_004332 670 Hs.10136 NM_004332 ENSG00000137274 BPHL BPH-RP|MCNAA|VACVASE biphenyl hydrolase like protein-coding 200.666-63 chr2 146562776 146562929 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24205 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 236-73 chr5 126797348 126797634 + 1.33333 NA intron (NR_134488, intron 1 of 11) intron (NR_134488, intron 1 of 11) 20355 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 259.999-5 chr2 17491734 17492102 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 26522 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 329.333-34 chr3 104116463 104116948 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -592589 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 224.333-4 chr1 109560997 109561174 + 1.33333 NA intron (NM_006496, intron 1 of 8) intron (NM_006496, intron 1 of 8) 12470 NM_006496 2773 Hs.73799 NM_006496 ENSG00000065135 GNAI3 87U6|ARCND1 G protein subunit alpha i3 protein-coding 206-75 chr2 45492166 45492324 + 1.33333 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) intron (NM_018079, intron 14 of 20) 119022 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 206.666-77 chr3 119875023 119875183 + 1.33333 NA intron (NM_002093, intron 8 of 11) intron (NM_002093, intron 8 of 11) 92393 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 192.333-7 chr1 109779134 109779324 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -15306 NM_133181 79574 Hs.485352 NM_024526 ENSG00000198758 EPS8L3 EPS8R3 EPS8 like 3 protein-coding 189.333-171 chr6 65707846 65708072 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001142801) promoter-TSS (NM_001142801) -733 NM_001142800 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 282.666-4 chr12 112676565 112676831 + 1.33333 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) intron (NM_001347952, intron 1 of 21) 18478 NR_031631 100302227 NR_031631 ENSG00000283507 MIR1302-1 MIRN1302-1|hsa-mir-1302-1 microRNA 1302-1 ncRNA 193.333-14 chr1 219988372 219988672 + 1.33333 NA intron (NM_004446, intron 19 of 31) L2c|LINE|L2 57983 NM_004446 2058 Hs.497788 NM_004446 ENSG00000136628 EPRS EARS|GLUPRORS|HLD15|PARS|PIG32|QARS|QPRS glutamyl-prolyl-tRNA synthetase protein-coding 275.333-80 chr9 29837385 29837711 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 570906 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 210.666-23 chr12 30852525 30852919 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57041 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 213.666-9 chr11 97371834 97371998 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 863491 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 120.666-2 chr14 40651370 40651521 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -303266 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 313-41 chr8 127407047 127407472 + 1.33333 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) intron (NR_117100, intron 5 of 5) 6860 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 210-141 chr7 87521320 87521577 + 1.33333 NA intron (NM_001348944, intron 23 of 29) intron (NM_001348944, intron 23 of 29) -45745 NM_018850 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 340.666-17 chr6 49311456 49311769 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 151641 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 214-95 chr4 39189654 39189929 + 1.33333 NA intron (NM_001317924, intron 4 of 35) intron (NM_001317924, intron 4 of 35) 7262 NM_025132 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 239.333-102 chr7 139600483 139600802 + 1.33333 NA intron (NM_001113239, intron 10 of 14) intron (NM_001113239, intron 10 of 14) 76957 NM_001080511 154790 Hs.57806 NM_001080511 ENSG00000236279 CLEC2L - C-type lectin domain family 2 member L protein-coding 335.333-35 chr4 95112806 95113151 + 1.33333 NA intron (NM_001256792, intron 2 of 10) intron (NM_001256792, intron 2 of 10) 21487 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 281.333-58 chr6 79683896 79684305 + 1.33333 NA intron (NM_031469, intron 2 of 3) intron (NM_031469, intron 2 of 3) 52771 NM_031469 83699 Hs.302772 NM_031469 ENSG00000198478 SH3BGRL2 - SH3 domain binding glutamate rich protein like 2 protein-coding 248.666-21 chr2 190523475 190523807 + 1.33333 NA intron (NR_136298, intron 2 of 8) L1MC4|LINE|L1 11081 NM_001142645 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 172.666-23 chr6 68703883 68704075 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 68697 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 169.666-6 chr8 87019942 87020164 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 153638 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 197.333-204 chr6 142042018 142042297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46642 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 316.666-13 chr2 141014992 141015293 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 13 of 90) intron (NM_018557, intron 13 of 90) -428457 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 260.666-7 chr11 68169038 68169348 + 1.33333 NA intron (NR_161380, intron 10 of 10) MIRb|SINE|MIR 44103 NM_001369433 51111 Hs.632120 NM_016028 ENSG00000110066 KMT5B CGI-85|CGI85|MRD51|SUV420H1 lysine methyltransferase 5B protein-coding 207.666-52 chr5 104381760 104382008 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -717590 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 204.666-12 chr10 46260772 46260946 + 1.33333 NA intron (NR_103828, intron 1 of 2) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 8749 NR_103828 100996567 Hs.546758 NR_103827 ANTXRLP1 - ANTXR like pseudogene 1 pseudo 246-49 chr2 21068828 21069250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24966 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 236-90 chr8 135212735 135213021 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21253 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 125.666-5 chr9 29232004 29232185 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -18493 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 203.333-279 chr9 33460023 33460303 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7772 NR_106910 102465512 NR_106910 ENSG00000275651 MIR6851 hsa-mir-6851 microRNA 6851 ncRNA 215.666-7 chr10 51520416 51520655 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) L2a|LINE|L2 179060 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 244.667-19 chr10 118100160 118100497 + 1.33333 NA TTS (NR_026941) TTS (NR_026941) -53387 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 194.667-63 chr2 43638921 43639169 + 1.33333 NA intron (NM_172069, intron 1 of 29) intron (NM_172069, intron 1 of 29) 1785 NM_172069 130271 Hs.164162 NM_172069 ENSG00000152527 PLEKHH2 PLEKHH1L pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H2 protein-coding 210.666-13 chr11 19907337 19907565 + 1.33333 NA intron (NM_182964, intron 6 of 37) intron (NM_182964, intron 6 of 37) -115105 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 192.333-140 chr5 126122331 126122519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57152 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 275-28 chr2 226185785 226186183 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43190 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 237.666-13 chr3 23406915 23407123 + 1.33333 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 203692 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 213.667-43 chr2 25880806 25881090 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2461 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 256-68 chr4 119503375 119503673 + 1.33333 NA intron (NM_033437, intron 18 of 20) intron (NM_033437, intron 18 of 20) 48741 NR_037630 645513 Hs.677546 NR_037630 ENSG00000245958 LOC645513 - septin 7 pseudogene pseudo 237.333-104 chr6 131743714 131744030 + 1.33333 NA intron (NR_133007, intron 23 of 23) intron (NR_133007, intron 23 of 23) -32855 NM_001145659 643854 Hs.632613 NM_001145659 ENSG00000236761 CTAGE9 - CTAGE family member 9 protein-coding 177.333-152 chr7 35561309 35561502 + 1.33333 NA Intergenic L1M|LINE|L1 133730 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 200-15 chr1 236091555 236091719 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26547 NM_002508 4811 Hs.356624 NM_002508 ENSG00000116962 NID1 NID nidogen 1 protein-coding 253-45 chr21 35280579 35280876 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -231429 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 194.666-31 chr18 78219089 78219270 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -225452 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 225-28 chr16 61445669 61445845 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -389991 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 200.333-41 chr14 49653609 49653865 + 1.33333 NA intron (NM_001348385, intron 15 of 18) AluJb|SINE|Alu -18507 NM_018139 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 239.667-28 chr16 81880610 81880942 + 1.33333 NA intron (NM_002661, intron 7 of 32) intron (NM_002661, intron 7 of 32) 101485 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 292-36 chr3 125059630 125060158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3897 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 380.666-8 chr3 2854914 2855277 + 1.33333 NA intron (NM_175607, intron 7 of 24) intron (NM_175607, intron 7 of 24) -37120 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 218-98 chr6 71794295 71794558 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92277 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 195.333-215 chr8 103942317 103942550 + 1.33333 NA intron (NR_145711, intron 10 of 21) intron (NR_145711, intron 10 of 21) 123213 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 596.333 chr21 29727109 29727699 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -20771 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 185-52 chr4 113941932 113942175 + 1.33333 NA intron (NM_001354211, intron 4 of 6) intron (NM_001354211, intron 4 of 6) 37594 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 167.333-22 chr1 166792136 166792319 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47248 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 201.333-165 chr2 229659781 229659945 + 1.33333 NA intron (NM_139072, intron 1 of 12) intron (NM_139072, intron 1 of 12) 54692 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 283.333-82 chrX 65882120 65882493 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -136564 NR_029637 407008 NR_029637 ENSG00000284567 MIR223 MIRN223|miRNA223|mir-223 microRNA 223 ncRNA 174-37 chr15 47719991 47720242 + 1.33333 NA intron (NM_153618, intron 1 of 18) intron (NM_153618, intron 1 of 18) 1627 NM_153619 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 262.333-33 chr16 51050427 51050768 + 1.33333 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) MER81|DNA|hAT-Blackjack 32839 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 282.333-14 chr14 63953717 63954079 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 7 of 114) L1MB3|LINE|L1 100894 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 244.666-36 chr5 14758893 14759114 + 1.33333 NA intron (NM_054027, intron 2 of 11) L1M5|LINE|L1 46309 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 196.333-32 chr13 32126200 32126471 + 1.33333 NA intron (NM_023037, intron 7 of 60) intron (NM_023037, intron 7 of 60) 94561 NM_023037 10129 Hs.507669 NM_023037 ENSG00000073910 FRY 13CDNA73|214K23.2|C13orf14|CG003|bA207N4.2|bA37E23.1 FRY microtubule binding protein protein-coding 165.333-119 chr2 11959168 11959364 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47850 NR_110196 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 122.666-3 chr7 2426503 2426663 + 1.33333 NA intron (NM_018641, intron 1 of 1) L1MDa|LINE|L1 22972 NM_018641 55501 Hs.288853 NM_018641 ENSG00000136213 CHST12 C4S-2|C4ST-2|C4ST2 carbohydrate sulfotransferase 12 protein-coding 201.333-154 chr2 149105529 149105801 + 1.33333 NA intron (NM_001317004, intron 1 of 6) L1ME1|LINE|L1 -12509 NM_001317002 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 421.999-4 chr2 160357327 160357740 + 1.33333 NA intron (NM_002897, intron 2 of 13) intron (NM_002897, intron 2 of 13) 50349 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 324-17 chr3 95215425 95215891 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 277395 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 208.333-121 chr5 162184202 162184457 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 116687 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 257-41 chr3 96995414 96995732 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 180979 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 212.333-75 chr2 177208524 177208792 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 3753 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 172-6 chr1 99362316 99362487 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 98109 NM_014839 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 210.667-93 chr3 150442019 150442336 + 1.33333 NA intron (NR_130136, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 33879 NM_014779 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 206.666-17 chr10 28835486 28835675 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10828 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 194-84 chr20 13449755 13449957 + 1.33333 NA intron (NM_017714, intron 11 of 13) intron (NM_017714, intron 11 of 13) 189076 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 213.333-123 chr3 12218630 12218793 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -59799 NM_003256 7079 Hs.591665 NM_003256 ENSG00000157150 TIMP4 TIMP-4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 protein-coding 192.666-8 chr10 18661365 18661517 + 1.33333 NA intron (NM_178815, intron 1 of 5) intron (NM_178815, intron 1 of 5) 2010 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 175.333-40 chr14 46966786 46967026 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) intron (NM_001113498, intron 8 of 16) -315125 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 329.666-6 chr20 717908 718202 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -42253 NM_033129 85508 Hs.355284 NM_033129 ENSG00000215397 SCRT2 ZNF898B scratch family transcriptional repressor 2 protein-coding 209.333-143 chr22 33172325 33172577 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 63922 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 196.667-107 chr4 76142237 76142522 + 1.33333 NA intron (NM_001278603, intron 2 of 10) intron (NM_001278603, intron 2 of 10) 6018 NM_017426 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 240.333-48 chr2 11008476 11008807 + 1.33333 NA Intergenic L1P2|LINE|L1 96707 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 163-76 chr6 53007203 53007329 + 1.33333 NA intron (NM_014920, intron 12 of 13) intron (NM_014920, intron 12 of 13) 11646 NR_001445 125050 NR_001445 ENSG00000202198 RN7SK 7SK RNA component of 7SK nuclear ribonucleoprotein snRNA 265.666-17 chr3 130518039 130518358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42136 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 214.333-66 chr18 14060125 14060399 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 72173 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 262-47 chr2 187866463 187866761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -312107 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 300-12 chr11 73869942 73870247 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6605 NM_001267806 80227 Hs.525017 NM_025155 ENSG00000175575 PAAF1 PAAF|Rpn14|WDR71 proteasomal ATPase associated factor 1 protein-coding 209.666-31 chr2 142826504 142826719 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -51053 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 210-111 chr4 168126278 168126552 + 1.33333 NA intron (NM_007193, intron 1 of 11) intron (NM_007193, intron 1 of 11) 33878 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 417.332-4 chr6 38706089 38706443 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -3121 NM_006708 2739 Hs.268849 NM_006708 ENSG00000124767 GLO1 GLOD1|GLYI|HEL-S-74 glyoxalase I protein-coding 334.666-11 chr4 89872415 89872699 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6954 NM_001371403 347.333-17 chr22 46234271 46234760 + 1.33333 NA intron (NM_001001928, intron 7 of 7) intron (NM_001001928, intron 7 of 7) 15778 NM_207327 150383 Hs.103110 NM_207327 ENSG00000205643 CDPF1 C22orf40 cysteine rich DPF motif domain containing 1 protein-coding 203-29 chr14 20843055 20843211 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40289 NM_198234 6035 Hs.78224 NM_002933 ENSG00000129538 RNASE1 RAC1|RIB1|RNS1 ribonuclease A family member 1, pancreatic protein-coding 310.999 chr11 12396816 12397187 + 1.33333 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) intron (NM_018222, intron 1 of 12) 19430 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 202.666-107 chr6 143387546 143387777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55016 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 145.333-263 chr6 137898625 137898782 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -30470 NR_049793 100130476 Hs.598050 NR_049793 ENSG00000237499 WAKMAR2 lnc-TNFAIP3 wound and keratinocyte migration associated lncRNA 2 ncRNA 304.666-18 chr22 43723620 43723995 + 1.33333 NA intron (NM_198856, intron 6 of 29) MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR 88498 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 227.666-24 chr4 60797327 60797617 + 1.33333 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL -125147 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 198-84 chr2 36530050 36530233 + 1.33333 NA intron (NM_016441, intron 13 of 16) intron (NM_016441, intron 13 of 16) 68027 NM_005102 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 231.333-22 chr11 28875301 28875584 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -397894 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 214-19 chr10 104991011 104991184 + 1.33333 NA intron (NM_014978, intron 4 of 26) intron (NM_014978, intron 4 of 26) -324881 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 306.666-15 chr2 10420375 10420738 + 1.33333 NA intron (NM_001258359, intron 3 of 4) intron (NM_001258359, intron 3 of 4) 26293 NR_028374 100302743 Hs.730525 NR_028374 ENSG00000206633 SNORA80B ACA67B small nucleolar RNA, H/ACA box 80B snoRNA 307-13 chr2 88577588 88578041 + 1.33333 NA intron (NM_004836, intron 11 of 16) L2c|LINE|L2 39094 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 211.333-96 chr18 73473487 73473802 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 148703 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 203-65 chr3 25798498 25798744 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 8531 NM_017897 54995 Hs.55781 NM_017897 ENSG00000151093 OXSM CEM1|FASN2D|KASI|KS 3-oxoacyl-ACP synthase, mitochondrial protein-coding 198-75 chr17 69976195 69976478 + 1.33333 NA intron (NR_110875, intron 2 of 4) intron (NR_110875, intron 2 of 4) 14629 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 157.333-281 chr5 57984060 57984224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84980 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 274.667-43 chr5 45620894 45621293 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 75287 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 194.666-64 chr7 71504563 71504737 + 1.33333 NA intron (NM_022479, intron 5 of 10) intron (NM_022479, intron 5 of 10) -196880 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 241.666-17 chr5 66662825 66663016 + 1.33333 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) AluSq|SINE|Alu 66527 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 472-7 chr4 30766178 30766920 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 46180 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 199.666-30 chr20 55337129 55337313 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -85822 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 225.333-66 chr17 42974851 42975110 + 1.33333 NA intron (NM_001142653, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu 5023 NM_025267 100885850 Hs.317403 NM_025267 ENSG00000108825 PTGES3L-AARSD1 - PTGES3L-AARSD1 readthrough protein-coding 210.666-100 chr8 61557018 61557258 + 1.33333 NA intron (NM_004318, intron 18 of 24) L2a|LINE|L2 132673 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 261.333-40 chr18 1268100 1268443 + 1.33333 NA TTS (NR_023925) TTS (NR_023925) 91358 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 186-30 chr13 103229416 103229628 + 1.33333 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -163105 NM_000452 6555 Hs.194783 NM_000452 ENSG00000125255 SLC10A2 ASBT|IBAT|ISBT|NTCP2|PBAM solute carrier family 10 member 2 protein-coding 201.333-58 chr11 105557362 105557592 + 1.33333 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -52596 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 145.666-3 chr2 216551132 216551313 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 52378 NM_000998 6168 Hs.433701 NM_000998 ENSG00000197756 RPL37A L37A ribosomal protein L37a protein-coding 193.667-17 chr10 25843067 25843332 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 90511 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 123.666-3 chr4 163894323 163894433 + 1.33333 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) -280844 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 178.333-161 chr6 168597520 168597713 + 1.33333 NA intron (NM_001166412, intron 7 of 12) intron (NM_001166412, intron 7 of 12) 156432 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 195.333-136 chr21 16432040 16432262 + 1.33333 NA intron (NR_136550, intron 1 of 3) intron (NR_136550, intron 1 of 3) 11856 NR_136550 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 196-136 chr4 114565100 114565315 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33195 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 255.333-12 chr10 119832267 119832680 + 1.33333 NA intron (NM_024834, intron 14 of 15) L1M4|LINE|L1 13216 NM_001243194 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 217.333-28 chr10 116468440 116468608 + 1.33333 NA intron (NM_001011709, intron 8 of 11) MER95|LTR|ERV1 40677 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 174-35 chr14 85663902 85664120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 130662 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 207.333-81 chr14 28615620 28615889 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 149565 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 194.333-110 chr5 4450143 4450575 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -323122 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 321.333-24 chr14 67180625 67180988 + 1.33333 NA exon (NM_020806, exon 23 of 23) exon (NM_020806, exon 23 of 23) -8634 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 194-123 chr6 110864142 110864335 + 1.33333 NA intron (NM_001287215, intron 1 of 8) AluSq2|SINE|Alu -10546 NR_109768 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 206.667-30 chr12 40579714 40579950 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -112607 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 332.666-31 chr8 76051343 76051666 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -355150 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 286.333-35 chr5 32743538 32743952 + 1.33333 NA intron (NM_001364460, intron 2 of 6) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 32424 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 178-64 chr2 66938446 66938745 + 1.33333 NA intron (NR_110169, intron 3 of 4) intron (NR_110169, intron 3 of 4) -16105 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 386-12 chr5 69196526 69196946 + 1.33333 NA intron (NM_022909, intron 4 of 8) intron (NM_022909, intron 4 of 8) 7153 NM_022909 64946 Hs.631967 NM_022909 ENSG00000153044 CENPH - centromere protein H protein-coding 282.333-19 chr15 97024287 97024564 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 240990 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 288.333-2 chr1 172783739 172784022 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 124777 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 396.666-4 chr5 23217203 23217693 + 1.33333 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -290161 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 287.999-5 chr2 164360092 164360396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 208251 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 284-36 chr3 131686771 131687040 + 1.33333 NA intron (NM_130808, intron 5 of 15) L1MEg|LINE|L1 -183934 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 183-27 chr12 39876216 39876466 + 1.33333 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) intron (NM_052885, intron 4 of 9) 229740 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 202.666-55 chr18 9817605 9817767 + 1.33333 NA intron (NM_006868, intron 5 of 6) intron (NM_006868, intron 5 of 6) -68287 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 223.333-174 chrX 143542994 143543172 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -25608 NM_001009609 139067 Hs.447320 NM_001009609 ENSG00000189252 SPANXN3 CT11.8|SPANX-N3 SPANX family member N3 protein-coding 244.333-91 chr6 123779778 123780042 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23936 NM_001300737 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 192-118 chr5 143304325 143304570 + 1.33333 NA intron (NM_001024094, intron 4 of 8) L1PA16|LINE|L1 98836 NM_001364182 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 234-2 chr1 48485501 48485689 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13387 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 174 chr1 8631364 8631579 + 1.33333 NA intron (NM_001042681, intron 2 of 22) intron (NM_001042681, intron 2 of 22) -136558 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 232.999-5 chr5 76596437 76596691 + 1.33333 NA intron (NM_006633, intron 9 of 35) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 12405 NR_134278 101929109 Hs.665172 NR_134278 ENSG00000249713 LOC101929109 - uncharacterized LOC101929109 ncRNA 284-40 chr4 493026 493396 + 1.33333 NA intron (NM_133474, intron 1 of 2) LTR8|LTR|ERV1 5945 NM_133474 170960 Hs.428360 NM_133474 ENSG00000182903 ZNF721 - zinc finger protein 721 protein-coding 430.999-2 chr2 148283581 148284126 + 1.33333 NA intron (NM_018328, intron 4 of 14) intron (NM_018328, intron 4 of 14) -262249 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 212-38 chr12 50222886 50223054 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001113547) promoter-TSS (NM_001113547) -312 NM_001113547 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 221.666-32 chr2 171688256 171688446 + 1.33333 NA intron (NM_001271787, intron 1 of 15) intron (NM_001271787, intron 1 of 15) 596 NM_001320884 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 344-51 chr9 10114190 10114584 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) intron (NM_002839, intron 3 of 45) 314995 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 197.333-239 chr8 118847958 118848176 + 1.33333 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie 103818 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 347.333-6 chr14 29252819 29253153 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -467199 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 181.666-2 chr10 102721221 102721392 + 1.33333 NA intron (NM_001350989, intron 2 of 12) AluJr|SINE|Alu 6670 NM_178858 118980 Hs.44070 NM_178858 ENSG00000156398 SFXN2 SLC56A2 sideroflexin 2 protein-coding 277.666-17 chr7 7608351 7608616 + 1.33333 NA non-coding (NR_163250, exon 12 of 12) non-coding (NR_163250, exon 12 of 12) -32269 NM_001302349 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 256.333-10 chr10 9340892 9341198 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -45452 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 393.334-5 chr4 82972697 82973283 + 1.33333 NA intron (NR_110253, intron 2 of 10) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 37833 NM_194282 132660 Hs.96952 NM_194282 ENSG00000189308 LIN54 CXCDC1|JC8.6|MIP120|TCX1 lin-54 DREAM MuvB core complex component protein-coding 200.666-4 chr1 96790989 96791205 + 1.33333 NA intron (NM_001300986, intron 8 of 13) intron (NM_001300986, intron 8 of 13) 68459 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 229.333-54 chr19 13283516 13283713 + 1.33333 NA intron (NM_023035, intron 21 of 46) intron (NM_023035, intron 21 of 46) 133203 NM_004907 9592 Hs.501629 NM_004907 ENSG00000160888 IER2 ETR101 immediate early response 2 protein-coding 142.333-259 chr9 35624868 35625045 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -6543 NM_001782 971 Hs.116481 NM_001782 ENSG00000137101 CD72 CD72b|LYB2 CD72 molecule protein-coding 229.999 chr10 21193718 21193915 + 1.33333 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 19514 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 263.333-84 chr8 102254365 102254623 + 1.33333 NA exon (NM_015902, exon 59 of 59) exon (NM_015902, exon 59 of 59) 15043 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 218-4 chr1 87190558 87190871 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21955 NM_001290053 101927844 Hs.694591 NM_001290053 LINC02801 - long intergenic non-protein coding RNA 2801 protein-coding 221.333-134 chr7 77970205 77970528 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 130236 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 278-19 chr2 155179413 155179679 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 480851 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 404.666-8 chr2 84542399 84542749 + 1.33333 NA intron (NM_001370, intron 4 of 76) intron (NM_001370, intron 4 of 76) 26119 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 205.667-120 chr6 141773594 141773845 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 315080 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 247.999-3 chr12 118337314 118337518 + 1.33333 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) L1MD2|LINE|L1 22289 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 275.667-4 chr1 168032793 168033132 + 1.33333 NA intron (NM_001198956, intron 12 of 21) intron (NM_001198956, intron 12 of 21) 34302 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 222.333-38 chr18 934916 935282 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7106 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 200-19 chr10 61514635 61514933 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 34743 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 202-111 chr3 61227127 61227325 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 1 of 9) intron (NM_001320900, intron 1 of 9) 24226 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 344.666-26 chr8 31476326 31476746 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -163216 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 257.333-53 chr2 61975681 61975989 + 1.33333 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) L1MC|LINE|L1 70193 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 194.333-60 chr19 51638560 51638816 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 8191 NM_001098612 100049587 Hs.707374 NM_001098612 ENSG00000254415 SIGLEC14 - sialic acid binding Ig like lectin 14 protein-coding 174.666-17 chr5 18402918 18403063 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 595716 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 365.333-14 chr2 40129750 40130250 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 8 of 8) intron (NM_001351483, intron 8 of 8) 212366 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 132.333-148 chr6 37651085 37651186 + 1.33333 NA intron (NM_153487, intron 7 of 16) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 46748 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 322.666-15 chr17 51936701 51937062 + 1.33333 NA intron (NM_001082533, intron 3 of 9) intron (NM_001082533, intron 3 of 9) 221833 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 199-19 chr11 114735199 114735359 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 56752 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 190.333-76 chr2 143404114 143404393 + 1.33333 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 274834 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 333.667-5 chr11 84747768 84748278 + 1.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -27081 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 245.333-44 chr14 99250421 99250636 + 1.33333 NA intron (NM_001282237, intron 2 of 3) intron (NM_001282237, intron 2 of 3) 21669 NM_022898 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 158.667-81 chr12 122556997 122557244 + 1.33333 NA intron (NM_014708, intron 16 of 63) L1MA7|LINE|L1 29871 NM_014708 9735 Hs.300559 NM_014708 ENSG00000184445 KNTC1 ROD kinetochore associated 1 protein-coding 218.667-62 chr22 27001015 27001309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59356 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 212.666-43 chr2 65647659 65647859 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -215160 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 217.333-13 chr1 176464345 176464593 + 1.33333 NA intron (NM_021936, intron 1 of 4) MER45A|DNA|hAT-Tip100 1294 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 301.333-4 chr1 71345005 71345381 + 1.33333 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 263869 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 213.999-6 chr6 138105396 138105564 + 1.33333 NA intron (NM_022121, intron 1 of 2) intron (NM_022121, intron 1 of 2) 1939 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 237.333-103 chr6 108154695 108154892 + 1.33333 NA intron (NR_145458, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu -11229 NM_003269 7101 Hs.157688 NM_003269 ENSG00000112333 NR2E1 TLL|TLX|XTLL nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 protein-coding 208.333-95 chr3 54339057 54339235 + 1.33333 NA intron (NM_018398, intron 3 of 37) intron (NM_018398, intron 3 of 37) 216594 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 191.333-78 chr15 69853939 69854093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18782 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 256.333-36 chr19 28743281 28743593 + 1.33333 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -15743 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 232.667-78 chr9 71162310 71162644 + 1.33333 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -40856 NM_001366148 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 255.333-122 chr9 92237456 92237817 + 1.33333 NA intron (NR_073446, intron 29 of 32) L1MDa|LINE|L1 -46480 NM_001350291 138652 Hs.742918 NM_001350291 PRSS47 - serine protease 47 protein-coding 205.666-13 chr12 70024235 70024473 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 199127 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 232.666-39 chr4 67641971 67642270 + 1.33333 NA intron (NM_018227, intron 17 of 32) intron (NM_018227, intron 17 of 32) 59035 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 205.333-169 chr4 48607485 48607703 + 1.33333 NA intron (NM_015030, intron 9 of 63) intron (NM_015030, intron 9 of 63) 117342 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 180.666-11 chr15 25345559 25345743 + 1.33333 NA intron (NM_001354542, intron 10 of 11) L1M8|LINE|L1 67308 NR_001295 338428 NR_001295 ENSG00000274640 SNORD109A HBII-438A small nucleolar RNA, C/D box 109A snoRNA 205.333-23 chr1 220352631 220352836 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -80280 NM_012414 25782 Hs.654849 NM_012414 ENSG00000118873 RAB3GAP2 RAB3-GAP150|RAB3GAP150|SPG69|WARBM2|p150 RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2 protein-coding 321.666-5 chr2 21153744 21154132 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29952 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 218.666-49 chr21 19646808 19647069 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 252817 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 431-6 chr2 161097312 161097865 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39367 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 187-87 chr8 83274416 83274626 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -129237 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 192-81 chr20 7080922 7081107 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 173188 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 275.333-33 chr2 100974175 100974535 + 1.33333 NA intron (NR_110213, intron 2 of 2) intron (NR_110213, intron 2 of 2) 2806 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 201-121 chrX 103851587 103851745 + 1.33333 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -19384 NR_146558 51209 Hs.522736 NM_016370 ENSG00000123570 RAB9B RAB9L|Rab-9L RAB9B, member RAS oncogene family protein-coding 239-54 chr5 52378597 52378877 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 370706 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 210.333-139 chr5 163241056 163241222 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -196432 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 318.666-15 chr4 14772536 14772820 + 1.33333 NA intron (NR_126435, intron 2 of 6) intron (NR_126435, intron 2 of 6) 115491 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 205.666-43 chr5 90624059 90624223 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 5 of 89) intron (NR_003149, intron 5 of 89) 65344 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 224-28 chr15 69494721 69494925 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 42005 NM_213725 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 263.666-12 chr5 20438645 20438955 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 133249 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 336.666-25 chr9 90295479 90295849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 137825 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 233.666-33 chr9 74469000 74469340 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28165 NM_006914 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 200.666-28 chr13 42365618 42365772 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59197 NR_135319 105370177 NR_135319 ENSG00000283554 LINC02341 - long intergenic non-protein coding RNA 2341 ncRNA 236-69 chr5 16418304 16418562 + 1.33333 NA intron (NR_104625, intron 7 of 8) intron (NR_104625, intron 7 of 8) 22669 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 184-24 chr14 29364720 29364943 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 562265 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 304.666-9 chr11 91475329 91475620 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -606272 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 291.333-3 chr1 94309731 94310059 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -62149 NM_001328664 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 195.666-45 chr8 129167768 129168045 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 73334 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 206.666-82 chr3 196918641 196918831 + 1.33333 NA intron (NM_001308045, intron 6 of 8) L1M1|LINE|L1 -21141 NR_046630 100874001 Hs.591671 NR_046630 NCBP2-AS1 - NCBP2 antisense RNA 1 ncRNA 222.667-37 chr17 78008409 78008760 + 1.33333 NA intron (NM_018996, intron 2 of 20) intron (NM_018996, intron 2 of 20) 4347 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 291.667-28 chr5 63266664 63267162 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 688094 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 234-49 chr3 67912411 67912595 + 1.33333 NA intron (NR_109992, intron 6 of 6) intron (NR_109992, intron 6 of 6) -79089 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 357.999-3 chr5 4783707 4784133 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 10439 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 244-11 chr1 189459145 189459412 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1016732 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 236.333-43 chr2 47068466 47068712 + 1.33333 NA intron (NM_001288951, intron 20 of 20) intron (NM_001288951, intron 20 of 20) 86719 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 236-23 chr14 54696048 54696253 + 1.33333 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) -58683 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 247.333-82 chr8 79565459 79565694 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -45541 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 207.333-14 chr1 115559120 115559362 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -82729 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 131-94 chr7 93241701 93241862 + 1.33333 NA intron (NM_024553, intron 2 of 11) intron (NM_024553, intron 2 of 11) 9415 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 269-34 chr3 179436701 179437137 + 1.33333 NA intron (NM_021629, intron 1 of 9) intron (NM_021629, intron 1 of 9) 14551 NM_021629 59345 Hs.173030 NM_021629 ENSG00000114450 GNB4 CMTD1F G protein subunit beta 4 protein-coding 152-28 chr11 19809813 19809962 + 1.33333 NA intron (NM_182964, intron 1 of 37) L1MC3|LINE|L1 -49804 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 169.333-15 chr1 196964728 196964881 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -12733 NM_030787 81494 Hs.282594 NM_030787 ENSG00000134389 CFHR5 CFHL5|CFHR5D|FHR-5|FHR5 complement factor H related 5 protein-coding 268-11 chr11 35677055 35677308 + 1.33333 NA intron (NM_017583, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 14406 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 279-13 chr18 1792720 1793185 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -433323 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 260.333-4 chr11 6483911 6484326 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_012192, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_012192, exon 3 of 3) 2617 NM_012192 26515 Hs.54943 NM_012192 ENSG00000132286 TIMM10B FXC1|TIM10B|Tim9b translocase of inner mitochondrial membrane 10B protein-coding 184.333-107 chr3 99481644 99481922 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -156811 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 200 chr1 41288583 41288830 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -46400 NM_001172218 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 311-34 chr7 110588455 110588740 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -502409 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 189.333-111 chr20 44089443 44089711 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97611 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 399.333-11 chr22 26523297 26523786 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001362922, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001362922, exon 6 of 6) 11009 NR_144529 100507599 Hs.405877 NR_144529 LOC100507599 - uncharacterized LOC100507599 ncRNA 226.333-2 chr1 51765897 51766112 + 1.33333 NA intron (NM_148906, intron 11 of 22) intron (NM_148906, intron 11 of 22) 36154 NM_148907 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 224-65 chr4 44403941 44404234 + 1.33333 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 44722 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 214.666-4 chr1 76337087 76337267 + 1.33333 NA intron (NM_001349111, intron 3 of 5) intron (NM_001349111, intron 3 of 5) 262431 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 209-126 chrX 8724989 8725148 + 1.33333 NA intron (NM_000216, intron 1 of 13) intron (NM_000216, intron 1 of 13) 7069 NM_000216 3730 Hs.521869 NM_000216 ENSG00000011201 ANOS1 ADMLX|HH1|HHA|KAL|KAL1|KALIG-1|KMS|WFDC19 anosmin 1 protein-coding 148-71 chr2 22580657 22580814 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44256 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 209-53 chr19 29580688 29581001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25439 NM_006627 10775 Hs.412870 NM_006627 ENSG00000105171 POP4 RPP29 POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 247.666-8 chr12 55872481 55872789 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29699 NM_001272101 4327 Hs.591033 NM_002429 ENSG00000123342 MMP19 CODA|MMP18|RASI-1 matrix metallopeptidase 19 protein-coding 168.666-10 chr20 20264450 20264598 + 1.33333 NA intron (NM_015585, intron 21 of 26) intron (NM_015585, intron 21 of 26) -103580 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 198.333-39 chr12 7611424 7611688 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 54352 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 203.333-274 chr8 136613987 136614215 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 83303 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 219 chr1 9890550 9890981 + 1.33333 NA intron (NM_020248, intron 1 of 5) intron (NM_020248, intron 1 of 5) 19504 NM_001012329 56998 Hs.463759 NM_020248 ENSG00000178585 CTNNBIP1 ICAT catenin beta interacting protein 1 protein-coding 374.999-2 chr12 79725816 79726121 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34871 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 290.666-19 chr3 73915700 73916035 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 106623 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 314.666-9 chr1 195324939 195325216 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 763638 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 218.333-14 chr10 37803187 37803378 + 1.33333 NA non-coding (NR_148003, exon 7 of 7) non-coding (NR_148003, exon 7 of 7) -8107 NR_051997 100419868 Hs.741719 NR_051997 ZNF33BP1 - zinc finger protein 33B pseudogene 1 pseudo 193.666-47 chr8 24374522 24374688 + 1.33333 NA intron (NR_125808, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 -9680 NM_001145271 27299 Hs.521459 NM_014479 ENSG00000134028 ADAMDEC1 M12.219 ADAM like decysin 1 protein-coding 222.666-18 chr16 48732026 48732250 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -121958 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 213.333-171 chr5 154284384 154284682 + 1.33333 NA intron (NM_198321, intron 1 of 11) intron (NM_198321, intron 1 of 11) -62573 NR_031626 100302181 NR_031626 ENSG00000221430 MIR1294 MIRN1294|hsa-mir-1294|mir-1294 microRNA 1294 ncRNA 415.667 chr1 200855044 200855644 + 1.33333 NA intron (NM_001297707, intron 15 of 17) intron (NM_001297707, intron 15 of 17) -17637 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 289-23 chr4 93197351 93197667 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 3 of 14) MIR|SINE|MIR -631244 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 146.333-172 chr2 221275001 221275202 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 297203 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 407.333-17 chr5 5816077 5816730 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 393726 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 216-106 chr6 50556025 50556217 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157423 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 205.333-198 chr6 35671629 35671853 + 1.33333 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) -6952 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 286-20 chr15 72931643 72931956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120664 NM_002499 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 243.333-52 chr2 96295381 96295579 + 1.33333 NA intron (NM_014014, intron 14 of 44) intron (NM_014014, intron 14 of 44) 10066 NM_014014 23020 Hs.246112 NM_014014 ENSG00000144028 SNRNP200 ASCC3L1|BRR2|HELIC2|RP33|U5-200KD small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200 protein-coding 218.666-38 chr2 30192574 30192761 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 5233 NR_145719 109616960 NR_145719 ENSG00000207187 SNORA10B - small nucleolar RNA, H/ACA box 10B snoRNA 150-32 chr12 45560304 45560533 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 167503 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 212-147 chr7 85238135 85238446 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -116359 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 233.333-13 chr10 21960492 21960737 + 1.33333 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 43116 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 174.667-11 chr1 155858432 155858641 + 1.33333 NA intron (NM_001282856, intron 1 of 31) intron (NM_001282856, intron 1 of 31) 864 NM_001282856 54856 Hs.656361 NM_032292 ENSG00000116580 GON4L GON-4|GON4|YARP gon-4 like protein-coding 293.333-17 chr16 60657356 60657666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -297718 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 231.666-32 chr8 129913646 129913854 + 1.33333 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR 26061 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 179.333-173 chr7 79595402 79595593 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 141537 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 226.333-12 chr10 123161578 123161805 + 1.33333 NA intron (NM_004725, intron 5 of 7) intron (NM_004725, intron 5 of 7) 7289 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 207.333-134 chr2 80597807 80597980 + 1.33333 NA intron (NM_001282599, intron 9 of 11) L1PA8|LINE|L1 284514 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 359-18 chr5 174254582 174254972 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -81577 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 225.667-79 chr8 131828022 131828356 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -75904 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 305.333-27 chr16 66592499 66592846 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -11324 NM_001363918 123920 Hs.298198 NM_144601 ENSG00000140931 CMTM3 BNAS2|CKLFSF3 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3 protein-coding 251.666-27 chr6 132448108 132448421 + 1.33333 NA non-coding (NR_137169, exon 9 of 9) non-coding (NR_137169, exon 9 of 9) -46789 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 114-10 chr10 64373455 64373610 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -451996 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 210-99 chr3 182377202 182377399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109062 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 220-35 chr14 40562198 40562381 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -392422 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 203.666-23 chr14 78390160 78390429 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 4 of 20) MER58A|DNA|hAT-Charlie -13425 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 193.666-52 chr9 118573349 118573564 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -106215 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 227.333 chr1 20940752 20940988 + 1.33333 NA TTS (NM_001198803) TTS (NM_001198803) 47562 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 335-3 chr1 184742744 184743105 + 1.33333 NA intron (NM_025191, intron 2 of 19) intron (NM_025191, intron 2 of 19) 11934 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 407.666-9 chr6 124557301 124557653 + 1.33333 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 274472 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 174-98 chr8 104950256 104950513 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -361360 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 383.333-6 chr18 2498730 2499109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 72586 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 198.667-77 chr16 84685990 84686274 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13868 NM_001272075 9100 Hs.136778 NM_005153 ENSG00000103194 USP10 UBPO ubiquitin specific peptidase 10 protein-coding 357.667-7 chr4 47420002 47420476 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 8 of 8) intron (NM_000812, intron 8 of 8) 43463 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 207.666-29 chr2 186540615 186540824 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -49337 NM_002210 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 167-100 chr8 83026984 83027133 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 114954 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 266.333-10 chr10 96027436 96027775 + 1.33333 NA intron (NM_001349008, intron 34 of 34) L1MA2|LINE|L1 -15978 NM_019084 54619 Hs.596479 NM_019084 ENSG00000107443 CCNJ bA690P14.1 cyclin J protein-coding 173-9 chr10 105639622 105639827 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 180609 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 387.667 chr1 231756895 231757379 + 1.33333 NA intron (NM_001164540, intron 4 of 10) intron (NM_001164540, intron 4 of 10) 61380 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 172.333-130 chr4 137805987 137806167 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 260346 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 207.333-136 chr2 119699631 119699889 + 1.33333 NA intron (NR_148341, intron 8 of 16) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 20559 NM_030577 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 216.333-146 chr9 28062953 28063164 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -489192 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 182.666-29 chr3 119738821 119738972 + 1.33333 NA intron (NM_033364, intron 11 of 17) intron (NM_033364, intron 11 of 17) 35874 NM_001320316 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 261.999 chr11 46011739 46012071 + 1.33333 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 89249 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 200.666-13 chr10 19273411 19273588 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 19 of 39) L1MC1|LINE|L1 224698 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 287.333-61 chr6 159752387 159752663 + 1.33333 NA intron (NM_001322817, intron 1 of 7) intron (NM_001322817, intron 1 of 7) -9520 NM_005891 39 Hs.571037 NM_005891 ENSG00000120437 ACAT2 - acetyl-CoA acetyltransferase 2 protein-coding 300.667-3 chr10 33450350 33450767 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -115653 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 217.333-64 chr2 77813812 77814078 + 1.33333 NA intron (NR_110288, intron 3 of 3) intron (NR_110288, intron 3 of 3) -101989 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 189.333-54 chr14 63807415 63807638 + 1.33333 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -45439 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 214.333-57 chr16 76957034 76957316 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 88239 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 321.666-12 chr5 180824338 180824783 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -6397 NR_045678 729678 Hs.348292 NR_027183 ENSG00000245060 LINC00847 - long intergenic non-protein coding RNA 847 ncRNA 195-6 chr1 99988010 99988269 + 1.33333 NA intron (NM_001271685, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 17622 NM_001271685 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 197-110 chr7 44505768 44506005 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -15228 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 194-45 chr15 69978388 69978547 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 101001 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 145.333-154 chr2 224539013 224539173 + 1.33333 NA intron (NM_001257197, intron 1 of 14) L1MC1|LINE|L1 30862 NM_001257198 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 272.333-4 chr10 72469843 72470174 + 1.33333 NA intron (NM_001195519, intron 3 of 6) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 53978 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 172.666-9 chr17 48288242 48288386 + 1.33333 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -6033 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 469.666-2 chr17 4175418 4175917 + 1.33333 NA intron (NR_047571, intron 18 of 23) intron (NR_047571, intron 18 of 23) 31970 NM_001254755 124936 Hs.513871 NM_144611 ENSG00000167740 CYB5D2 - cytochrome b5 domain containing 2 protein-coding 185.333-160 chr5 169307590 169307763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6537 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 188.667-154 chr8 126174919 126175164 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150454 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 213.999 chr10 93493537 93493698 + 1.33333 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -2995 NM_001127182 55165 Hs.14559 NM_018131 ENSG00000138180 CEP55 C10orf3|CT111|MARCH|URCC6 centrosomal protein 55 protein-coding 257.333-68 chr3 178765512 178765716 + 1.33333 NA intron (NR_126560, intron 2 of 7) intron (NR_126560, intron 2 of 7) 94791 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 181.666-14 chr4 41618055 41618215 + 1.33333 NA intron (NM_001330786, intron 4 of 22) intron (NM_001330786, intron 4 of 22) 5233 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 257.333-20 chr11 8551970 8552248 + 1.33333 NA intron (NM_030906, intron 1 of 13) L1M3b|LINE|L1 41867 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 207.999 chr1 76756380 76756547 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22804 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 152.333-100 chr14 27069920 27070070 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 161353 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 278-34 chr3 84079097 84079341 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 790356 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 253.666-4 chr11 90224351 90224637 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1130 NM_001144073 26973 Hs.22857 NM_012124 ENSG00000110172 CHORDC1 CHP1 cysteine and histidine rich domain containing 1 protein-coding 214-39 chr15 60622512 60622824 + 1.33333 NA intron (NM_002943, intron 1 of 10) intron (NM_002943, intron 1 of 10) 4862 NM_002943 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 202.333-137 chr5 20372940 20373119 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 67478 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 193.333-200 chr9 132648705 132648946 + 1.33333 NA intron (NR_136309, intron 9 of 18) L3|LINE|CR1 14501 NM_001322343 64794 Hs.660767 NM_022779 ENSG00000125485 DDX31 PPP1R25 DEAD-box helicase 31 protein-coding 366.667-10 chr22 26707624 26708225 + 1.33333 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 35081 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 245.999-6 chr4 78590462 78590656 + 1.33333 NA intron (NM_005139, intron 6 of 12) intron (NM_005139, intron 6 of 12) 38789 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 232-3 chr1 60475947 60476277 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 146573 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 225-4 chr1 113335324 113335584 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -55061 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 318-20 chr15 49348798 49349236 + 1.33333 NA intron (NM_152647, intron 13 of 15) intron (NM_152647, intron 13 of 15) -74225 NM_002009 2252 Hs.567268 NM_002009 ENSG00000140285 FGF7 HBGF-7|KGF fibroblast growth factor 7 protein-coding 272.333-14 chr14 57898179 57898551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32273 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 214-92 chr3 185696495 185696769 + 1.33333 NA exon (NM_001291874, exon 3 of 14) exon (NM_001291874, exon 3 of 14) -16620 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 160-41 chr14 56353517 56353695 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -160725 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 322.333-29 chr8 112208169 112208431 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -435193 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 240-98 chr9 96113610 96113822 + 1.33333 NA intron (NR_132344, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 2695 NR_132344 158434 Hs.381771 NM_001256408 ENSG00000275465 LOC158434 - uncharacterized LOC158434 ncRNA 244.667-52 chr19 34082731 34083025 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89626 NM_015578 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 171.333-60 chr15 65599096 65599353 + 1.33333 NA intron (NR_045106, intron 4 of 11) intron (NR_045106, intron 4 of 11) 11907 NR_045106 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 191.333-104 chr2 31734400 31734642 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 69459 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 251.333-27 chr13 106671396 106671852 + 1.33333 NA non-coding (NR_047026, exon 3 of 3) non-coding (NR_047026, exon 3 of 3) 17744 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 296.333-36 chr6 120145838 120146115 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 130797 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 306.666-5 chr13 66088662 66088957 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -122380 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 200-132 chr5 105828027 105828309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 728694 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 218.333-2 chr1 45642599 45642908 + 1.33333 NA intron (NM_021639, intron 6 of 12) intron (NM_021639, intron 6 of 12) 3932 NR_026768 728963 Hs.675157 NR_026768 RPS15AP10 RPS15A_4_42 ribosomal protein S15a pseudogene 10 pseudo 349.333-25 chr4 156479583 156479924 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 492046 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 166-124 chr9 93089182 93089383 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6935 NR_134468 84270 Hs.434213 NM_032310 ENSG00000165233 CARD19 BinCARD|C9orf89 caspase recruitment domain family member 19 protein-coding 229-38 chr3 8738784 8739194 + 1.33333 NA intron (NM_001234, intron 1 of 2) intron (NM_001234, intron 1 of 2) 5187 NM_001234 859 Hs.98303 NM_001234 ENSG00000182533 CAV3 LGMD1C|LQT9|MPDT|RMD2|VIP-21|VIP21 caveolin 3 protein-coding 211.333-56 chr14 20484062 20484241 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 14772 NM_000270 4860 Hs.75514 NM_000270 ENSG00000198805 PNP NP|PRO1837|PUNP purine nucleoside phosphorylase protein-coding 252-2 chr1 45694522 45694760 + 1.33333 NA TTS (NM_016486) TTS (NM_016486) 6460 NM_016486 51249 Hs.699548 NM_016486 ENSG00000159596 TMEM69 C1orf154 transmembrane protein 69 protein-coding 356-19 chr16 83241204 83241574 + 1.33333 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) L1MB2|LINE|L1 -251091 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 190.666-57 chr8 131373963 131374165 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -333155 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 278-16 chr2 56336405 56336772 + 1.33333 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -150818 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 199.333-23 chr10 39219578 39219733 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 523059 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 416-2 chr12 63758816 63759558 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20722 NM_014254 10329 Hs.216386 NM_014254 ENSG00000118600 RXYLT1 HP10481|MDDGA10|TMEM5 ribitol xylosyltransferase 1 protein-coding 256-40 chr2 78489311 78489640 + 1.33333 NA Intergenic MER45R|DNA|hAT-Tip100 -56056 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 125.333-67 chr15 64779857 64779970 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4324 NM_194272 348093 Hs.436518 NM_194272 ENSG00000166831 RBPMS2 - RNA binding protein, mRNA processing factor 2 protein-coding 140.666-8 chr4 185967203 185967504 + 1.33333 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -10981 NM_021069 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 161-68 chr4 65587652 65587804 + 1.33333 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 81760 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 197.333-167 chr4 64060085 64060314 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 349251 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 188-42 chr17 69684142 69684309 + 1.33333 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1PA15|LINE|L1 90238 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 218-90 chr5 43989007 43989263 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -385905 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 197-97 chr5 159002510 159002661 + 1.33333 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 95371 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 193-64 chr3 193632008 193632288 + 1.33333 NA intron (NM_130831, intron 5 of 27) intron (NM_130831, intron 5 of 27) -4816 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 230.333-78 chr3 80824902 80825103 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 54298 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 200.667-132 chr6 22476584 22476870 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92839 NM_138574 154150 Hs.629246 NM_138574 ENSG00000112273 HDGFL1 HRP-1|Hdgfrp1|PWWP1|dJ309H15.1 HDGF like 1 protein-coding 248-78 chr7 52352584 52352847 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -682918 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 259.333-43 chr2 42658633 42658975 + 1.33333 NA intron (NM_001330443, intron 7 of 16) AluJo|SINE|Alu 90172 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 194-94 chr3 116257745 116258032 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -102136 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 205.666-37 chr4 70763991 70764151 + 1.33333 NA intron (NM_001130709, intron 3 of 11) intron (NM_001130709, intron 3 of 11) 29661 NM_001345840 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 322.333-28 chr7 102943969 102944472 + 1.33333 NA exon (NM_001031692, exon 4 of 4) exon (NM_001031692, exon 4 of 4) -29210 NM_001085386 58160 Hs.621233 NM_001085386 ENSG00000230257 NFE4 NF-E4 nuclear factor, erythroid 4 protein-coding 130-16 chr10 92042383 92042505 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 118674 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 240.333-85 chr7 70743502 70743771 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 6 of 18) intron (NM_015570, intron 6 of 18) -388508 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 197.666-54 chr5 145021395 145021570 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 813860 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 197.667-13 chr1 215554338 215554613 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -12829 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 306.667-3 chr1 220197895 220198332 + 1.33333 NA intron (NM_012414, intron 9 of 34) L2|LINE|L2 2506 NR_031705 100302234 NR_031705 ENSG00000281696 MIR664A MIR664|MIRN664|hsa-mir-664|hsa-mir-664a|mir-664a microRNA 664a ncRNA 156.667-148 chr18 5135073 5135301 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54005 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 282-18 chr15 99306953 99307358 + 1.33333 NA intron (NM_001321677, intron 5 of 8) intron (NM_001321677, intron 5 of 8) 49630 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 264.333-56 chr4 112380408 112380705 + 1.33333 NA intron (NM_001253884, intron 3 of 14) intron (NM_001253884, intron 3 of 14) 83187 NM_025144 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 169.333-133 chr2 193587891 193588050 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -756299 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 170.333-29 chr10 34092349 34092506 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -319747 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 218.667-2 chr1 86064212 86064491 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 7 of 59) intron (NM_152890, intron 7 of 59) 92120 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 226.333-45 chr17 66385052 66385337 + 1.33333 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 31660 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 141.333-217 chr6 160056298 160056459 + 1.33333 NA intron (NM_000876, intron 19 of 47) intron (NM_000876, intron 19 of 47) -36704 NR_003288 729603 Hs.674810 NR_003288 ENSG00000213073 LOC729603 - calcineurin like EF-hand protein 1 pseudogene pseudo 203-37 chr15 75189925 75190090 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11875 NM_015492 56905 Hs.17936 NM_015492 ENSG00000167173 C15orf39 - chromosome 15 open reading frame 39 protein-coding 136.666-4 chr4 40256131 40256260 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50990 NR_121641 101060498 Hs.351492 NR_121640 ENSG00000249241 LINC02265 - long intergenic non-protein coding RNA 2265 ncRNA 377.999 chr18 3934598 3934990 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -27559 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 232.666-42 chr6 14769696 14769890 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -476276 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 370.666-19 chr6 154703923 154704268 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -29283 NM_001286189 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 370.333-14 chr2 12958195 12958649 + 1.33333 NA Intergenic (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 48591 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 384.666 chr10 22987852 22988463 + 1.33333 NA intron (NM_001282745, intron 10 of 18) intron (NM_001282745, intron 10 of 18) 60104 NM_001282746 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 183-90 chr6 17336692 17336847 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 54068 NM_153020 221662 Hs.519904 NM_153020 ENSG00000112183 RBM24 RNPC6|dJ259A10.1 RNA binding motif protein 24 protein-coding 196.666-26 chr14 97709159 97709411 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22627 NR_033943 100129345 Hs.23632 NR_033943 ENSG00000197176 LINC02291 - long intergenic non-protein coding RNA 2291 ncRNA 172.667-114 chr4 96226163 96226391 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -84426 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 279.666-15 chr7 80802815 80803263 + 1.33333 NA intron (NM_006379, intron 8 of 17) intron (NM_006379, intron 8 of 17) 116012 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 285.667-48 chr7 108753624 108753975 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 130788 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 272-41 chr5 55999304 55999616 + 1.33333 NA intron (NR_102755, intron 1 of 1) AluSg|SINE|Alu 4293 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 348.333-28 chr5 110674678 110675182 + 1.33333 NA intron (NM_001039763, intron 1 of 13) Charlie10|DNA|hAT-Charlie 51741 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 217-43 chr2 17954121 17954363 + 1.33333 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 75575 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 160.667-15 chr1 100769454 100769692 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 49831 NM_001078 7412 Hs.109225 NM_001078 ENSG00000162692 VCAM1 CD106|INCAM-100 vascular cell adhesion molecule 1 protein-coding 244-72 chr3 124961158 124961577 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -26616 NM_033049 56667 Hs.5940 NM_033049 ENSG00000173702 MUC13 DRCC1|MUC-13 mucin 13, cell surface associated protein-coding 154.666-15 chr6 119100468 119100630 + 1.33333 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) intron (NM_001288576, intron 1 of 15) -21885 NM_024581 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 158.333-353 chrX 81551744 81551897 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 349718 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 256-38 chr2 26058309 26058696 + 1.33333 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) FLAM_C|SINE|Alu 24418 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 237.667-28 chr16 75056245 75056626 + 1.33333 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) (ATGTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 57411 NM_032268 84937 Hs.427284 NM_032268 ENSG00000186187 ZNRF1 NIN283 zinc and ring finger 1 protein-coding 205.333-171 chr4 70589586 70589850 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2538 NM_016519 258 Hs.272396 NM_016519 ENSG00000178522 AMBN AI1F ameloblastin protein-coding 243.333-98 chr6 117821172 117821389 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -85984 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 249.333-23 chr12 12691235 12691498 + 1.33333 NA intron (NM_006143, intron 2 of 3) intron (NM_006143, intron 2 of 3) 4817 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 403.333-15 chr7 36799377 36799988 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -75133 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 198-159 chr6 43647499 43647794 + 1.33333 NA intron (NM_001193341, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 2610 NM_152732 221421 Hs.534585 NM_152732 ENSG00000172426 RSPH9 C6orf206|CILD12|MRPS18AL1 radial spoke head 9 homolog protein-coding 282.666-24 chr7 18408829 18409104 + 1.33333 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) -86744 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 306-46 chr6 133954207 133954626 + 1.33333 NA intron (NM_004865, intron 1 of 6) intron (NM_004865, intron 1 of 6) 1192 NM_004865 9519 Hs.486507 NM_004865 ENSG00000028839 TBPL1 MGC:8389|MGC:9620|STUD|TLF|TLP|TRF2 TATA-box binding protein like 1 protein-coding 172.666-15 chr2 144474592 144474768 + 1.33333 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -44934 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 224-90 chr6 126294536 126294715 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -45164 NM_001286525 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 260-28 chr16 72678791 72679207 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -14029 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 275-47 chr6 73859759 73860124 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 163738 NM_133493 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 200.666-54 chr2 26718613 26718764 + 1.33333 NA intron (NM_002246, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 25966 NM_002246 3777 Hs.24040 NM_002246 ENSG00000171303 KCNK3 K2p3.1|OAT1|PPH4|TASK|TASK-1|TBAK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 3 protein-coding 172.667-40 chr12 44807164 44807404 + 1.33333 NA intron (NM_006159, intron 4 of 20) intron (NM_006159, intron 4 of 20) 68377 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 196.666-45 chr2 45670383 45670611 + 1.33333 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) MER112|DNA|hAT-Charlie 18822 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 239.666-31 chr8 106609129 106609421 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -48533 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 216.666-18 chr11 25388694 25388870 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -800341 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 125.333-59 chr14 71109188 71109338 + 1.33333 NA intron (NM_014982, intron 34 of 35) intron (NM_014982, intron 34 of 35) 201804 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 215-38 chr2 113141949 113142233 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14493 NM_173842 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 422.667-4 chr2 212985319 212985894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59270 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 205-86 chr7 50089019 50089223 + 1.33333 NA intron (NM_001159878, intron 2 of 7) L1MB7|LINE|L1 4125 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 207.666-6 chr10 58507104 58507313 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5664 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 169.333-85 chr14 72768417 72768557 + 1.33333 NA intron (NM_001280544, intron 2 of 9) L1MD2|LINE|L1 124162 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 170.667-151 chr6 169514355 169514591 + 1.33333 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 187556 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 195.333-158 chr4 76157359 76157561 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8945 NR_103781 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 280.666-26 chr5 128128956 128129183 + 1.33333 NA intron (NM_001046, intron 4 of 26) intron (NM_001046, intron 4 of 26) 45303 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 222-83 chr6 101946829 101947029 + 1.33333 NA intron (NM_001166247, intron 13 of 16) MER67C|LTR|ERV1 547944 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 224.333-109 chr6 38056503 38056744 + 1.33333 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 236896 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 150-143 chr8 79059400 79059572 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 221957 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 216-30 chr14 60871396 60871628 + 1.33333 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) L1MB8|LINE|L1 109567 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 209-69 chr20 31761579 31761922 + 1.33333 NA intron (NM_012112, intron 4 of 17) L1MA5|LINE|L1 22460 NM_012112 22974 Hs.244580 NM_012112 ENSG00000088325 TPX2 C20orf1|C20orf2|DIL-2|DIL2|FLS353|GD:C20orf1|HCA519|HCTP4|REPP86|p100 TPX2 microtubule nucleation factor protein-coding 139.667-41 chr12 62245117 62245343 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger -15110 NM_001252079 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 174.667-49 chr14 56583162 56583353 + 1.33333 NA intron (NM_017799, intron 1 of 15) intron (NM_017799, intron 1 of 15) 3459 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 203.666-29 chr17 72787072 72787241 + 1.33333 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -146684 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 134.666-3 chr21 27200722 27200878 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -233712 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 199.333-109 chr18 9054374 9054577 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48224 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 214.333-122 chr5 147573190 147573445 + 1.33333 NA intron (NR_038902, intron 1 of 3) intron (NR_038902, intron 1 of 3) 13323 NR_038902 153469 Hs.184323 NR_038902 ENSG00000280780 JAKMIP2-AS1 - JAKMIP2 antisense RNA 1 ncRNA 209.666-23 chr18 1058308 1058544 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -130433 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 237.333-131 chr9 36179395 36179637 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 10128 NM_005893 881 Hs.115460 NM_005893 ENSG00000185972 CCIN BTBD20|KBTBD14 calicin protein-coding 271.666-7 chr3 121930402 121930682 + 1.33333 NA intron (NM_021082, intron 17 of 21) intron (NM_021082, intron 17 of 21) 36141 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 274.666-30 chr8 98215900 98216204 + 1.33333 NA intron (NR_135745, intron 6 of 11) intron (NR_135745, intron 6 of 11) 78183 NM_001321635 79815 Hs.309489 NM_024759 ENSG00000104361 NIPAL2 NPAL2 NIPA like domain containing 2 protein-coding 202-166 chr6 126952823 126953042 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -165739 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 224.666-15 chr17 71033635 71033886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 168419 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 209.333-167 chr4 39905302 39905613 + 1.33333 NA intron (NM_001100399, intron 11 of 32) AluSx|SINE|Alu 72454 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 230.666-36 chr22 29134926 29135113 + 1.33333 NA intron (NM_001039570, intron 5 of 8) L1MCc|LINE|L1 61984 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 208.333-151 chr8 122676707 122676931 + 1.33333 NA intron (NR_126348, intron 2 of 3) MER58A|DNA|hAT-Charlie 17287 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 207.333-67 chr12 100431935 100432137 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -41830 NM_001206977 9971 Hs.282735 NM_005123 ENSG00000012504 NR1H4 BAR|FXR|HRR-1|HRR1|PFIC5|RIP14 nuclear receptor subfamily 1 group H member 4 protein-coding 202-43 chr14 45989300 45989527 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -74746 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 216.333-46 chr14 56547373 56547633 + 1.33333 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) intron (NR_135241, intron 1 of 1) -32295 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 265.333-21 chr13 64239827 64240104 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -163954 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 246.666-24 chr2 222580432 222580671 + 1.33333 NA intron (NR_130154, intron 17 of 17) intron (NR_130154, intron 17 of 17) 75541 NR_130154 10056 Hs.471452 NM_005687 ENSG00000116120 FARSB FARSLB|FRSB|HSPC173|NEDBLLA|PheHB|PheRS|RILDBC phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta protein-coding 152.667-275 chr4 72779891 72780076 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -210762 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 209.333-217 chr7 50172011 50172282 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 76060 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 185-59 chr6 22009585 22009819 + 1.33333 NA intron (NR_015410, intron 6 of 11) intron (NR_015410, intron 6 of 11) 137491 NR_034143 729177 Hs.730673 NR_034143 ENSG00000260455 NBAT1 CASC14|NBAT-1 neuroblastoma associated transcript 1 ncRNA 207.333-106 chr15 96710730 96710985 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70797 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 183.333-114 chr4 58620811 58621038 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84596 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 234.666-15 chr14 36274786 36275052 + 1.33333 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 45718 NM_016586 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 138.667-186 chr6 135915197 135915393 + 1.33333 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) L1ME1|LINE|L1 63594 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 212.666-9 chr10 35621157 35621319 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15897 NM_153368 219770 Hs.638922 NM_153368 ENSG00000177291 GJD4 CX40.1 gap junction protein delta 4 protein-coding 201-75 chr3 60885158 60885309 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 4 of 9) L1MA4|LINE|L1 -267363 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 217.666-19 chr2 61056183 61056508 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9525 NM_001330432 84542 Hs.468653 NM_032506 ENSG00000162929 KIAA1841 - KIAA1841 protein-coding 246.999-3 chr21 14255943 14256230 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -17713 NR_003088 150000 Hs.366575 NM_138726 ENSG00000243064 ABCC13 ABCC13P|C21orf73|PRED6 ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) pseudo 170.333-97 chr18 12286803 12286988 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -20774 NM_001303524 84617 Hs.193491 NM_032525 ENSG00000176014 TUBB6 FPVEPD|HsT1601|TUBB-5 tubulin beta 6 class V protein-coding 257.333-39 chr16 21305235 21305535 + 1.33333 NA intron (NR_026675, intron 1 of 2) L1ME2|LINE|L1 -2323 NM_001888 1428 Hs.924 NM_001888 ENSG00000103316 CRYM DFNA40|THBP crystallin mu protein-coding 213.333-121 chr22 40471295 40471591 + 1.33333 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) L1M4|LINE|L1 -8003 NM_001282660 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 249.333-4 chr1 58871353 58871817 + 1.33333 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) intron (NR_108106, intron 1 of 1) 86434 NR_108106 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 217.333-129 chr6 69786791 69787037 + 1.33333 NA intron (NM_001367272, intron 2 of 15) intron (NM_001367272, intron 2 of 15) 9552 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 193.333-155 chr5 130511391 130511609 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 607035 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 201.666-14 chr14 60739732 60739937 + 1.33333 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 5073 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 186.666-22 chr15 34123146 34123331 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 21155 NM_152595 161779 Hs.156317 NM_152595 ENSG00000182405 PGBD4 - piggyBac transposable element derived 4 protein-coding 297.666-13 chr4 130464151 130464395 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87912 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 205-10 chr1 221378212 221378520 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42070 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 322.333-19 chr3 67168068 67168442 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -57209 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 238-78 chr5 88129693 88129910 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 139044 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 322.666-11 chr14 39990004 39990277 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -557640 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 186-25 chr13 25400980 25401186 + 1.33333 NA intron (NM_016529, intron 1 of 36) intron (NM_016529, intron 1 of 36) 29109 NM_016529 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 119-33 chr12 4665993 4666139 + 1.33333 NA intron (NM_005002, intron 6 of 10) AluJr|SINE|Alu 16952 NM_005002 4704 Hs.75227 NM_005002 ENSG00000139180 NDUFA9 CC6|CI-39k|CI39k|COQ11|MC1DN26|NDUFS2L|SDR22E1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 protein-coding 143.666-3 chr5 124479318 124479469 + 1.33333 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -40873 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 194-90 chr22 34508605 34508889 + 1.33333 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 489169 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 218.333-123 chr8 129224575 129224824 + 1.33333 NA intron (NR_033916, intron 1 of 2) intron (NR_033916, intron 1 of 2) 16541 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 254.667-41 chr2 211059237 211059676 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 441885 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 267.333-70 chr4 140474521 140474771 + 1.33333 NA intron (NM_001277353, intron 4 of 10) intron (NM_001277353, intron 4 of 10) 23647 NM_001277353 152586 Hs.189067 NM_001034840 ENSG00000205301 MGAT4D GnT1IP MGAT4 family member D protein-coding 233-45 chr22 44777879 44778223 + 1.33333 NA intron (NM_181335, intron 1 of 11) L1PB1|LINE|L1 25493 NM_001198726 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 194-92 chr3 15370804 15371025 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -29534 NM_001018009 9467 Hs.257761 NM_004844 ENSG00000131370 SH3BP5 SAB|SH3BP-5 SH3 domain binding protein 5 protein-coding 268.666-30 chr8 110692454 110692696 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 334858 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 185.666-23 chr7 28839676 28839889 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118548 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 212-47 chr13 83607950 83608133 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 274352 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 208.333-69 chr2 31963642 31963935 + 1.33333 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) intron (NR_126034, intron 1 of 6) 46876 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 239.333-111 chr9 28722012 28722355 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -2878 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 136.666-2 chr13 41590803 41591035 + 1.33333 NA intron (NM_015058, intron 40 of 44) intron (NM_015058, intron 40 of 44) -22524 NR_049803 100847026 NR_049803 ENSG00000284584 MIR5006 - microRNA 5006 ncRNA 228.667-49 chr20 8074912 8075194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55292 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 194.666-50 chr4 57460603 57460817 + 1.33333 NA intron (NR_125907, intron 4 of 5) intron (NR_125907, intron 4 of 5) 34838 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 117.333-55 chr14 56860673 56860817 + 1.33333 NA intron (NR_146411, intron 2 of 2) intron (NR_146411, intron 2 of 2) 47587 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 173.333-196 chr8 17366168 17366316 + 1.33333 NA intron (NM_004686, intron 3 of 13) intron (NM_004686, intron 3 of 13) 47109 NM_004686 9108 Hs.625674 NM_004686 ENSG00000003987 MTMR7 - myotubularin related protein 7 protein-coding 142-27 chr12 45266473 45266618 + 1.33333 NA intron (NM_001025356, intron 1 of 19) intron (NM_001025356, intron 1 of 19) -26145 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 351.666-8 chr20 12500786 12501183 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 435979 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 231.666-17 chr2 192795890 192796108 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 46154 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 226.333-56 chr2 38977781 38978068 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17580 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 239.333-62 chr20 34887040 34887327 + 1.33333 NA intron (NM_001076552, intron 2 of 18) MIR3|SINE|MIR 10571 NM_018677 55902 Hs.517034 NM_018677 ENSG00000131069 ACSS2 ACAS2|ACECS|ACS|ACSA|dJ1161H23.1 acyl-CoA synthetase short chain family member 2 protein-coding 216.666-19 chr11 35940485 35940723 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -3377 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 304.666-13 chr17 67716837 67717138 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_015462) promoter-TSS (NM_015462) -846 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 211.333-258 chrX 83626340 83626592 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 118176 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 202-132 chr4 59488955 59489249 + 1.33333 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 475529 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 226-65 chr4 42745758 42746059 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -88803 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 253-34 chr2 47842731 47843037 + 1.33333 NA intron (NM_001190274, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 45835 NM_025133 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 186.667-37 chr14 60126612 60126863 + 1.33333 NA intron (NM_001330177, intron 10 of 10) L1MB7|LINE|L1 34814 NM_001330177 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 236.667-65 chr5 91003902 91004228 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 85 of 89) L3|LINE|CR1 310337 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 245-66 chr7 6911056 6911457 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -84961 NM_198097 221960 Hs.567779 NM_198097 ENSG00000146574 CCZ1B C7orf28A|C7orf28B|CCZ1|H_NH0577018.2 CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated protein-coding 244-57 chr2 119876484 119876760 + 1.33333 NA intron (NM_002830, intron 3 of 26) intron (NM_002830, intron 3 of 26) 116700 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 320.666 chr1 26820884 26821246 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5623 NM_032283 84243 Hs.523710 NM_032283 ENSG00000204160 ZDHHC18 DHHC-18|DHHC18 zinc finger DHHC-type containing 18 protein-coding 296.666-27 chr4 170065421 170065851 + 1.33333 NA intron (NM_182662, intron 11 of 13) AluSq2|SINE|Alu 24320 NM_016228 51166 Hs.529735 NM_016228 ENSG00000109576 AADAT KAT2|KATII|KYAT2 aminoadipate aminotransferase protein-coding 214.666-65 chr7 52206501 52206725 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -813357 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 257.333-30 chr13 60161753 60162019 + 1.33333 NA intron (NM_001258369, intron 1 of 26) L1MEd|LINE|L1 2042 NM_001042517 81624 Hs.283127 NM_030932 ENSG00000139734 DIAPH3 AN|AUNA1|DIA2|DRF3|NSDAN|diap3|mDia2 diaphanous related formin 3 protein-coding 206-20 chr10 64033223 64033427 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -511435 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 123.333-161 chr4 74155790 74155939 + 1.33333 NA intron (NM_001351311, intron 2 of 7) intron (NM_001351311, intron 2 of 7) -2244 NM_001144978 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 247.666-17 chr2 207563752 207563980 + 1.33333 NA intron (NM_001371426, intron 4 of 8) AluSz6|SINE|Alu 4744 NM_001371428 151-14 chr10 43250942 43251175 + 1.33333 NA intron (NM_145313, intron 1 of 12) intron (NM_145313, intron 1 of 12) 16007 NM_145313 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 402.333-6 chr2 175854666 175855042 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 147413 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 299.666-18 chr5 104324978 104325353 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -762376 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 290.333-15 chr16 72687997 72688325 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -23191 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 480.333-2 chr4 94673570 94674211 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83643 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 190.667-9 chr1 93157136 93157406 + 1.33333 NA intron (NM_001167830, intron 2 of 4) MER106B|DNA|hAT-Charlie 23142 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 189-71 chr5 10165786 10165998 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83996 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 185.667-117 chr7 92288367 92288583 + 1.33333 NA intron (NM_019004, intron 1 of 19) L1MC|LINE|L1 -42375 NM_001350677 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 250-43 chr2 189425307 189425650 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -15955 NM_001303096 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 142.333-131 chr2 182986401 182986649 + 1.33333 NA intron (NM_013436, intron 9 of 30) intron (NM_013436, intron 9 of 30) 51932 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 350-11 chr2 58932514 58932930 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 6 of 13) intron (NR_033873, intron 6 of 13) -284986 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 310 chr1 77575187 77575613 + 1.33333 NA intron (NM_015534, intron 12 of 14) L1MC5|LINE|L1 107258 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 289.667-14 chr17 58874382 58874712 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 118678 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 207.333-225 chr5 107891007 107891295 + 1.33333 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) L2a|LINE|L2 -220214 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 376.333-13 chr7 96730996 96731391 + 1.33333 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger -21302 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 308-41 chr4 116448244 116448595 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 148694 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 254.666-25 chr4 43921255 43921555 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -95456 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 215.333-56 chr14 52600426 52600620 + 1.33333 NA intron (NM_001099652, intron 3 of 6) FAM|SINE|Alu 47687 NR_148417 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 211.333-68 chr15 51733460 51733752 + 1.33333 NA intron (NM_001143917, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 3456 NM_001363969 256586 Hs.603629 NM_153374 ENSG00000140280 LYSMD2 - LysM domain containing 2 protein-coding 213.666-20 chr2 4641916 4642242 + 1.33333 NA intron (NR_034134, intron 3 of 4) intron (NR_034134, intron 3 of 4) 14143 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 237.333-92 chr5 118749048 118749289 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 152980 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 163-85 chr8 59933619 59933767 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 347707 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 220-53 chr2 16441499 16441721 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 224224 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 123.667-113 chr22 28580314 28580550 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluSx|SINE|Alu 99433 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 344.333-9 chr2 70699943 70700462 + 1.33333 NA intron (NM_017482, intron 4 of 12) L1ME4a|LINE|L1 67513 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 271.333-74 chr9 92859139 92859399 + 1.33333 NA intron (NM_001007101, intron 1 of 3) L1MEf|LINE|L1 18699 NM_001354536 83744 Hs.668378 NM_031486 ENSG00000127081 ZNF484 BA526D8.4 zinc finger protein 484 protein-coding 283.667-37 chr8 144213363 144213837 + 1.33333 NA TTS (NM_001099280) TTS (NM_001099280) 49137 NR_107057 102465906 NR_107057 ENSG00000284054 MIR7112 MIR7112-1|MIR7112-2|hsa-mir-7112|hsa-mir-7112-1|hsa-mir-7112-2 microRNA 7112 ncRNA 338.333-5 chr11 10525070 10525449 + 1.33333 NA exon (NM_016422, exon 4 of 6) exon (NM_016422, exon 4 of 6) 15928 NM_016422 50862 Hs.44685 NM_016422 ENSG00000110315 RNF141 RFP141|ZFP26|ZNF230 ring finger protein 141 protein-coding 282.666-8 chr16 80305743 80306013 + 1.33333 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -234856 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 213.666-34 chr4 113501941 113502241 + 1.33333 NA intron (NM_001221, intron 13 of 18) intron (NM_001221, intron 13 of 18) 209252 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 289.666-2 chr11 91354608 91355105 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -485654 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 198.666-36 chr18 80204986 80205201 + 1.33333 NA intron (NM_032510, intron 1 of 2) intron (NM_032510, intron 1 of 2) 42421 NM_032510 84552 Hs.654920 NM_032510 ENSG00000178184 PARD6G PAR-6G|PAR6gamma par-6 family cell polarity regulator gamma protein-coding 342.333-28 chr7 41445311 41445746 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -248391 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 188.666-13 chr14 56210870 56211079 + 1.33333 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 92563 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 203.666-34 chr2 188544183 188544437 + 1.33333 NA intron (NM_016315, intron 7 of 11) L1MD2|LINE|L1 245813 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 251.666-13 chr18 72826003 72826331 + 1.33333 NA intron (NM_001354018, intron 4 of 11) L1MD|LINE|L1 27215 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 150.666-11 chr2 126347466 126347583 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -229539 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 315.333-14 chr14 54455357 54455688 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -14148 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 265.333-92 chr9 19869667 19869994 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -82811 NM_001193288 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 266.666-10 chr12 86609145 86609366 + 1.33333 NA intron (NM_001351285, intron 2 of 8) intron (NM_001351285, intron 2 of 8) 135894 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 193.666-37 chr5 19983932 19984166 + 1.33333 NA intron (NM_001291956, intron 3 of 14) intron (NM_001291956, intron 3 of 14) 4151 NM_001349560 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 198.666-65 chr4 35466469 35466627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 777391 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 217-33 chr17 63161219 63161523 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) AluSx3|SINE|Alu 195136 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 286-14 chr14 46338557 46338971 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -132595 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 344-46 chr8 90263004 90263473 + 1.33333 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 41750 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 202.666-70 chr21 32212397 32212598 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 66552 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 240.666-26 chr3 69877299 69877481 + 1.33333 NA intron (NM_198177, intron 1 of 9) intron (NM_198177, intron 1 of 9) 11166 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 197-71 chr3 44282361 44282556 + 1.33333 NA intron (NM_001145030, intron 9 of 19) L2b|LINE|L2 40572 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 335.333-31 chr22 27705022 27705496 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 96497 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 206.667-24 chr11 110258929 110259209 + 1.33333 NA intron (NM_001260494, intron 3 of 11) AluSz|SINE|Alu 37643 NM_001260494 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 340.666-7 chr12 12681138 12681474 + 1.33333 NA intron (NM_006143, intron 3 of 3) intron (NM_006143, intron 3 of 3) 14877 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 190-76 chr22 39336549 39336732 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13309 NM_145731 9145 Hs.216226 NM_004711 ENSG00000100321 SYNGR1 - synaptogyrin 1 protein-coding 182.667-113 chr4 24218744 24219042 + 1.33333 NA intron (NR_148982, intron 1 of 13) MamTip3|DNA|hAT-Tip100 254012 NM_001354826 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 211.999-7 chr2 166555505 166555705 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68634 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 453.333-7 chr8 131013067 131013604 + 1.33333 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) L2c|LINE|L2 27574 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 179-3 chr1 85045660 85045811 + 1.33333 NA intron (NM_018298, intron 1 of 12) intron (NM_018298, intron 1 of 12) 2765 NM_018298 55283 Hs.535239 NM_018298 ENSG00000055732 MCOLN3 TRP-ML3|TRPML3 mucolipin 3 protein-coding 349.333-15 chr19 50350587 50351010 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -6050 NR_002798 256236 Hs.636624 NR_002798 ENSG00000131401 NAPSB NAP1L|NAP2|NAPB|NAPSBP napsin B aspartic peptidase, pseudogene pseudo 262.666-11 chr2 171883090 171883319 + 1.33333 NA intron (NR_047549, intron 2 of 16) intron (NR_047549, intron 2 of 16) 11040 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 240.666-9 chr12 19987812 19988091 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26734 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 217-39 chr18 47277311 47277579 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -8279 NR_147192 110175910 Hs.639112 NR_147192 ENSG00000267761 MIR4527HG - MIR4527 host gene ncRNA 169.667-6 chr1 88192609 88192782 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -491449 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 338.666-7 chr2 97929526 97929929 + 1.33333 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) intron (NM_015348, intron 1 of 40) 66221 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 167-36 chr14 25496909 25497083 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -446699 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 275.667-24 chr17 27194156 27194610 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 99613 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 206-171 chr7 44301875 44302038 + 1.33333 NA intron (NM_172081, intron 1 of 18) L1MC2|LINE|L1 23638 NM_172078 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 361.667-15 chr5 75327325 75327925 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -9543 NM_001130996 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 120.333-8 chr1 93173414 93173620 + 1.33333 NA intron (NM_001167830, intron 1 of 4) L1MEd|LINE|L1 6896 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 271.666-12 chr5 149559112 149559452 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -7843 NM_001025105 1452 Hs.529862 NM_001892 ENSG00000113712 CSNK1A1 CK1|CK1a|CKIa|HEL-S-77p|HLCDGP1|PRO2975 casein kinase 1 alpha 1 protein-coding 194.666-28 chr17 82018754 82018916 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_144998, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_144998, exon 4 of 4) 4043 NM_001271006 201254 Hs.37616 NM_144998 ENSG00000169689 CENPX CENP-X|D9|FAAP10|MHF2|STRA13 centromere protein X protein-coding 205-74 chr5 161909678 161909853 + 1.33333 NA TTS (NR_126372) TTS (NR_126372) 59040 NM_001127648 2554 Hs.175934 NM_000806 ENSG00000022355 GABRA1 ECA4|EIEE19|EJM|EJM5 gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit protein-coding 148-102 chr3 79613480 79613694 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) L1MEc|LINE|L1 105700 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 204-132 chr3 124304268 124304505 + 1.33333 NA intron (NM_001024660, intron 6 of 59) MER5B|DNA|hAT-Charlie -69946 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 339.667-18 chr3 100702149 100702593 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -6919 NM_001007565 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 312-28 chr22 32586389 32586724 + 1.33333 NA intron (NM_003490, intron 7 of 13) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 111319 NM_001257990 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 218.333-60 chr2 21289671 21290011 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165855 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 348.666-5 chr17 60619624 60619935 + 1.33333 NA intron (NM_003620, intron 1 of 5) AluJr4|SINE|Alu 19596 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 253-75 chr8 121591978 121592181 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -47267 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 169.333-140 chr20 9916398 9916546 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69861 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 174.666-26 chr8 142052857 142053008 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -123407 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 396.666 chr10 112496902 112497398 + 1.33333 NA intron (NM_001365712, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu -49547 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 365.333-2 chr11 35844014 35844511 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -99719 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 193.333-89 chr2 51574925 51575209 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 542466 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 199.333-101 chr17 65119198 65119420 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -18029 NM_001165933 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 279-33 chr6 139111933 139112456 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22886 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 185-35 chr2 112098546 112098741 + 1.33333 NA exon (NM_032824, exon 14 of 19) exon (NM_032824, exon 14 of 19) -39742 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 370.333-21 chr4 129101747 129102200 + 1.33333 NA intron (NM_001099783, intron 1 of 5) intron (NM_001099783, intron 1 of 5) 5821 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 272-3 chr10 97506761 97507016 + 1.33333 NA intron (NM_024954, intron 1 of 2) L1MB3|LINE|L1 7964 NM_024954 80019 Hs.500724 NM_024954 ENSG00000165886 UBTD1 - ubiquitin domain containing 1 protein-coding 206-128 chr4 76702151 76702446 + 1.33333 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) MIR|SINE|MIR 126747 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 196.333-9 chr1 229484831 229485033 + 1.33333 NA intron (NM_018230, intron 11 of 25) intron (NM_018230, intron 11 of 25) 23409 NM_018230 55746 Hs.12457 NM_018230 ENSG00000069248 NUP133 GAMOS8|NPHS18|hNUP133 nucleoporin 133 protein-coding 212.666-30 chr15 59651378 59651556 + 1.33333 NA intron (NM_001320930, intron 3 of 5) AluSp|SINE|Alu 5838 NM_001320929 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 440.666-11 chr3 95774428 95774952 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -91497 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 321-15 chr20 6612563 6613014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 123348 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 185.333-50 chr14 69514891 69515035 + 1.33333 NA intron (NM_001161498, intron 6 of 12) AluSx|SINE|Alu 30235 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 160-26 chr11 84411193 84411380 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -93947 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 133-43 chr2 115398910 115399104 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) intron (NM_001321912, intron 4 of 25) 55192 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 364-21 chr4 70691328 70691697 + 1.33333 NA TTS (NM_020368) TTS (NM_020368) 2980 NM_020368 57050 Hs.322901 NM_020368 ENSG00000132467 UTP3 CRL1|CRLZ1|SAS10 UTP3 small subunit processome component protein-coding 309.333-45 chr3 72341156 72341576 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 105257 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 195.333-137 chr21 22554830 22555005 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 456300 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 200.333-164 chr8 144419200 144419395 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -2453 NM_130849 55630 Hs.521934 NM_017767 ENSG00000147804 SLC39A4 AEZ|AWMS2|ZIP4 solute carrier family 39 member 4 protein-coding 198-114 chr3 26839938 26840179 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 145501 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 200-180 chr9 99954850 99955090 + 1.33333 NA intron (NM_017919, intron 4 of 7) intron (NM_017919, intron 4 of 7) 48316 NM_017919 55014 Hs.704031 NM_017919 ENSG00000136874 STX17 - syntaxin 17 protein-coding 288.333-22 chr2 102091562 102091910 + 1.33333 NA intron (NM_001320978, intron 1 of 11) L1MA4A|LINE|L1 -12868 NM_001320986 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 191.666-13 chr3 189295890 189296051 + 1.33333 NA intron (NM_198485, intron 4 of 5) intron (NM_198485, intron 4 of 5) -55376 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 134-43 chr18 46824654 46824811 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001324055, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001324055, exon 13 of 13) -67679 NM_001307987 29906 Hs.465025 NM_013305 ENSG00000101638 ST8SIA5 SIAT8-E|SIAT8E|ST8SiaV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 protein-coding 517.333 chr11 24174773 24175247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -322043 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 297-14 chr11 68560055 68560301 + 1.33333 NA intron (NR_147971, intron 9 of 24) L1MC|LINE|L1 99426 NM_001164164 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 172-63 chr20 22881811 22882036 + 1.33333 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy -153497 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 267.333-54 chr2 180880105 180880456 + 1.33333 NA intron (NR_104324, intron 4 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -100105 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 207-31 chr14 39326106 39326280 + 1.33333 NA intron (NM_001354150, intron 19 of 23) intron (NM_001354150, intron 19 of 23) 58808 NM_203355 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 208.333-145 chr8 99640669 99640904 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) intron (NM_017890, intron 33 of 61) -103925 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 393.999-3 chr7 46754359 46754965 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -57540 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 212.666-69 chr5 60150523 60150712 + 1.33333 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) intron (NM_001349243, intron 2 of 16) 222046 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 215.999-8 chr8 86622840 86623016 + 1.33333 NA intron (NM_019098, intron 13 of 17) L3|LINE|CR1 108493 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 436.666 chr1 108710391 108710831 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2297 NM_001144937 163479 Hs.258253 NM_173532 ENSG00000143107 FNDC7 - fibronectin type III domain containing 7 protein-coding 282-5 chr11 21835384 21835715 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -357536 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 200-43 chr12 55735814 55736001 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6234 NM_001257389 967 Hs.445570 NM_001780 ENSG00000135404 CD63 LAMP-3|ME491|MLA1|OMA81H|TSPAN30 CD63 molecule protein-coding 196-168 chr7 47221601 47221769 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 243118 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 369.333-7 chr14 54081562 54081944 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -124862 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 308.666-12 chr22 22163113 22163417 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81521 NM_007128 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 321.333-15 chr12 14390796 14391275 + 1.33333 NA intron (NM_181352, intron 1 of 14) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 5754 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 146.667-72 chr12 45731779 45731947 + 1.33333 NA intron (NM_152641, intron 3 of 20) intron (NM_152641, intron 3 of 20) 2154 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 181.333-170 chr8 68681971 68682242 + 1.33333 NA intron (NR_146187, intron 8 of 13) L1MA3|LINE|L1 -350615 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 198-193 chr9 28077358 28077594 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) (TTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -503610 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 278.999-4 chr11 26565275 26565676 + 1.33333 NA exon (NM_145650, exon 2 of 4) exon (NM_145650, exon 2 of 4) 6788 NM_001135091 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 224-10 chr10 58394553 58394760 + 1.33333 NA intron (NR_073073, intron 7 of 7) intron (NR_073073, intron 7 of 7) 9246 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 200-172 chr8 125621071 125621325 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 188989 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 189.333-202 chr8 22523174 22523322 + 1.33333 NA intron (NM_005605, intron 8 of 13) MIR3|SINE|MIR -28679 NM_005775 10174 Hs.528572 NM_005775 ENSG00000120896 SORBS3 SCAM-1|SCAM1|SH3D4 sorbin and SH3 domain containing 3 protein-coding 203-36 chr15 74454260 74454510 + 1.33333 NA intron (NM_032907, intron 3 of 10) MER90|LTR|ERV1 6775 NM_032907 84993 Hs.334713 NM_032907 ENSG00000138629 UBL7 BMSC-UbP|TCBA1 ubiquitin like 7 protein-coding 209.999-3 chr17 49421406 49421568 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -6582 NM_001281497 5245 Hs.514303 NM_002634 ENSG00000167085 PHB HEL-215|HEL-S-54e|PHB1 prohibitin protein-coding 174.666-11 chr15 80129022 80129241 + 1.33333 NA intron (NM_001242918, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 -23868 NM_000137 2184 Hs.73875 NM_000137 ENSG00000103876 FAH - fumarylacetoacetate hydrolase protein-coding 229.333-28 chr12 76958107 76958510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -79289 NM_001300965 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 246-40 chr17 3189326 3189647 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8031 NM_012352 26189 Hs.532660 NM_012352 ENSG00000172150 OR1A2 OR17-6 olfactory receptor family 1 subfamily A member 2 protein-coding 196-116 chr3 60248715 60248864 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) MER34|LTR|ERV1 -167880 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 180-118 chr9 328214 328543 + 1.33333 NA intron (NM_001193536, intron 8 of 46) MIRb|SINE|MIR 55330 NM_001193536 81704 Hs.132599 NM_203447 ENSG00000107099 DOCK8 HEL-205|MRD2|ZIR8 dedicator of cytokinesis 8 protein-coding 276.999-5 chr3 172607544 172607849 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12089 NR_146714 105374219 Hs.186269 NR_146714 ENSG00000223387 LINC02068 - long intergenic non-protein coding RNA 2068 ncRNA 250.333-22 chr14 52706673 52707023 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001366414) promoter-TSS (NM_001366414) -352 NR_158967 5706 Hs.156171 NM_002806 ENSG00000100519 PSMC6 SUG2|p42 proteasome 26S subunit, ATPase 6 protein-coding 454-11 chr7 15034406 15034943 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59816 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 156.666-13 chr4 109383433 109383580 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50209 NM_001318086 10427 Hs.292472 NM_006323 ENSG00000138802 SEC24B SEC24 SEC24 homolog B, COPII coat complex component protein-coding 355.333-3 chr10 107353683 107354153 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -189212 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 218-80 chr4 57284114 57284307 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -141662 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 135.666-4 chr14 63479837 63480045 + 1.33333 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 28297 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 335.333-26 chr2 202290178 202290600 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_003694) promoter-TSS (NR_003694) -928 NR_003694 100113392 Hs.693442 NR_003694 ENSG00000271852 SNORD11B - small nucleolar RNA, C/D box 11B snoRNA 234.667-112 chr8 127336074 127336386 + 1.33333 NA intron (NR_117099, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR -64169 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 220-39 chr15 68903844 68904168 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -26494 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 200.666-59 chr2 108602225 108602375 + 1.33333 NA intron (NM_001193488, intron 1 of 9) L1MA2|LINE|L1 -4847 NM_001193482 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 248-38 chr2 116371922 116372241 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1028266 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 132.667-125 chr4 41655458 41655625 + 1.33333 NA intron (NM_001330786, intron 10 of 22) intron (NM_001330786, intron 10 of 22) 42639 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 228-79 chr7 29615276 29615532 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 49871 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 517.999-3 chr5 67458533 67459141 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 187952 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 250.333-73 chr8 80011618 80011968 + 1.33333 NA intron (NM_014018, intron 1 of 2) intron (NM_014018, intron 1 of 2) 18466 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 201.333-277 chr8 80856644 80856814 + 1.33333 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) L1M5|LINE|L1 17739 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 162.666-6 chr12 120746138 120746297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20391 NM_000017 35 Hs.507076 NM_000017 ENSG00000122971 ACADS ACAD3|SCAD acyl-CoA dehydrogenase short chain protein-coding 449.999-3 chr5 114606120 114606522 + 1.33333 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) L1MC4|LINE|L1 30280 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 204.333-194 chr8 59674460 59674626 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 555333 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 276-19 chr14 52103367 52103777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34513 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 195-30 chr12 42102228 42102395 + 1.33333 NA intron (NM_173601, intron 5 of 7) L3|LINE|CR1 42563 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 134.333-51 chr14 66567960 66568161 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 60653 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 190.666-51 chr7 95966867 95967072 + 1.33333 NA intron (NM_004411, intron 6 of 16) intron (NM_004411, intron 6 of 16) 194463 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 381.333-18 chr5 22777163 22777531 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 75997 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 208.666-45 chr15 100052560 100052783 + 1.33333 NA intron (NM_139057, intron 16 of 21) intron (NM_139057, intron 16 of 21) 245648 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 270.666-18 chr21 35618001 35618329 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -37401 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 204.666-55 chr3 30258417 30258612 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -260354 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 199-59 chr2 187349960 187350142 + 1.33333 NA intron (NM_001369434, intron 15 of 15) intron (NM_001369434, intron 15 of 15) 98201 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 246.333-66 chr3 183871610 183871896 + 1.33333 NA intron (NM_001324437, intron 1 of 7) L1ME2|LINE|L1 13127 NM_001324438 55486 Hs.478469 NM_018622 ENSG00000175193 PARL PRO2207|PSARL|PSARL1|PSENIP2|RHBDS1 presenilin associated rhomboid like protein-coding 170.666-5 chr10 100369481 100369629 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -4021 NR_026762 90271 Hs.628088 NR_026762 ENSG00000235823 OLMALINC C10orf75|HI-LNC80|LINC00263|NCRNA00263|OLMALINCAS oligodendrocyte maturation-associated long intergenic non-coding RNA ncRNA 304.666-2 chr10 5563548 5563893 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32398 NR_134491 105376382 Hs.460282 NR_134491 ENSG00000242147 LINC02657 - long intergenic non-protein coding RNA 2657 ncRNA 222.667-15 chr11 115790316 115790618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30267 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 228.666-47 chrX 116271987 116272192 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 101345 NM_000686 186 Hs.405348 NM_000686 ENSG00000180772 AGTR2 AT2|ATGR2|MRX88 angiotensin II receptor type 2 protein-coding 445.333-7 chr5 118199990 118200465 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -82347 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 239.333-84 chr5 42552272 42552574 + 1.33333 NA intron (NM_001242405, intron 1 of 9) intron (NM_001242405, intron 1 of 9) 2343 NM_001242405 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 246.666-39 chr8 90036823 90037103 + 1.33333 NA intron (NM_001330575, intron 8 of 11) intron (NM_001330575, intron 8 of 11) 35486 NM_001359 1666 Hs.492212 NM_001359 ENSG00000104325 DECR1 DECR|NADPH|SDR18C1 2,4-dienoyl-CoA reductase 1 protein-coding 274.333-67 chr8 77537869 77538348 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 87411 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 242-21 chr12 104288277 104288605 + 1.33333 NA intron (NM_001261445, intron 1 of 14) intron (NM_001261445, intron 1 of 14) 1409 NM_001261446 7296 Hs.654922 NM_003330 ENSG00000198431 TXNRD1 GRIM-12|TR|TR1|TRXR1|TXNR thioredoxin reductase 1 protein-coding 208.666-106 chr8 66696972 66697188 + 1.33333 NA intron (NM_001204173, intron 3 of 18) intron (NM_001204173, intron 3 of 18) -15701 NM_001033578 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 219-3 chr1 52569717 52569910 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16721 NM_001009881 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 581.999 chr3 100085827 100086664 + 1.33333 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 28268 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 189-28 chr14 67627814 67628076 + 1.33333 NA intron (NM_001172, intron 2 of 7) intron (NM_001172, intron 2 of 7) 8025 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 207.333-250 chr7 33289531 33289734 + 1.33333 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) intron (NM_198428, intron 9 of 22) 160068 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 263-9 chr10 37813867 37814302 + 1.33333 NA intron (NM_001352493, intron 5 of 6) L1M4c|LINE|L1 -18909 NR_051997 100419868 Hs.741719 NR_051997 ZNF33BP1 - zinc finger protein 33B pseudogene 1 pseudo 331.333-20 chr17 30056249 30056614 + 1.33333 NA intron (NR_026738, intron 12 of 15) intron (NR_026738, intron 12 of 15) -60376 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 233.666-29 chr7 129137369 129137623 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7211 NM_178562 340348 Hs.27267 NM_178562 ENSG00000158457 TSPAN33 PEN|PEN.|TSPAN-33 tetraspanin 33 protein-coding 182.666-40 chr9 73294286 73294480 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 142518 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 226.666-31 chr5 34518687 34518870 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -137550 NM_015577 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 238.667-54 chr21 30476222 30476568 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 3972 NM_181607 337882 Hs.61552 NM_181607 ENSG00000184351 KRTAP19-1 KAP19.1 keratin associated protein 19-1 protein-coding 207.333-32 chr10 65604969 65605160 + 1.33333 NA intron (NR_120647, intron 2 of 5) L1MC4|LINE|L1 33639 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 250.666-19 chr2 144148259 144148574 + 1.33333 NA intron (NM_001284234, intron 2 of 9) intron (NM_001284234, intron 2 of 9) 63163 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 203.666-12 chr10 72476643 72476864 + 1.33333 NA intron (NM_001195519, intron 2 of 6) intron (NM_001195519, intron 2 of 6) 47233 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 298-55 chr3 40689850 40690372 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165151 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 321.333 chr1 60262962 60263306 + 1.33333 NA Intergenic Charlie16a|DNA|hAT-Charlie -189364 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 201.333-85 chr13 76560917 76561137 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 325378 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 222.333-9 chr10 9466067 9466283 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -170582 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 191.666-15 chr4 99737650 99737803 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -79101 NM_001306151 27071 Hs.436271 NM_014395 ENSG00000070190 DAPP1 BAM32 dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 protein-coding 211-103 chrX 127777042 127777347 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 275209 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 278.333-21 chr16 55306885 55307272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17481 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 244-27 chr12 39519902 39520282 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -76972 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 149-157 chr9 94200983 94201147 + 1.33333 NA intron (NR_046163, intron 1 of 3) L1M4a2|LINE|L1 3501 NR_046165 158257 Hs.652626 NR_046163 ENSG00000230262 LINC02603 MIRLET7DHG long intergenic non-protein coding RNA 2603 ncRNA 165.333-46 chr11 82941461 82941607 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -39794 NM_001319214 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 158-55 chr15 99128187 99128435 + 1.33333 NA intron (NM_145728, intron 3 of 3) intron (NM_145728, intron 3 of 3) 23231 NM_015286 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 255.333-108 chr8 82334871 82335150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -492724 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 363.333-11 chr15 87388071 87388430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -188679 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 228-72 chr6 56960287 56960629 + 1.33333 NA intron (NM_001318539, intron 1 of 3) intron (NM_001318539, intron 1 of 3) 5351 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 208.666-29 chr12 40294052 40294244 + 1.33333 NA intron (NM_198578, intron 21 of 50) (ATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 69151 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 310.667-24 chr2 117138721 117139173 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -675744 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 359.333-11 chr2 52859215 52859527 + 1.33333 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -156756 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 184-74 chr4 48379985 48380132 + 1.33333 NA intron (NM_020846, intron 4 of 7) intron (NM_020846, intron 4 of 7) 38529 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 234-40 chr2 124556975 124557263 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 10 of 23) intron (NM_130773, intron 10 of 23) 531832 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 232.667-13 chr12 23582401 23582772 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 12 of 17) intron (NM_152989, intron 12 of 17) 2000 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 198.666-9 chr11 73888401 73888612 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001363556) promoter-TSS (NM_001363556) -275 NM_001363556 80227 Hs.525017 NM_025155 ENSG00000175575 PAAF1 PAAF|Rpn14|WDR71 proteasomal ATPase associated factor 1 protein-coding 261.333-77 chr4 95119181 95119532 + 1.33333 NA intron (NM_001256792, intron 4 of 10) intron (NM_001256792, intron 4 of 10) 27865 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 222.333-59 chr3 23611223 23611537 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -194575 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 112-177 chr5 124144018 124144122 + 1.33333 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1MD1|LINE|L1 294450 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 210-77 chr2 178855522 178855755 + 1.33333 NA intron (NM_173648, intron 18 of 23) intron (NM_173648, intron 18 of 23) -48215 NM_133432 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 206.666-13 chr1 227666122 227666307 + 1.33333 NA intron (NR_102302, intron 5 of 5) intron (NR_102302, intron 5 of 5) 31493 NR_036753 401983 Hs.681816 NR_036753 ZNF847P gm127 zinc finger protein 847, pseudogene pseudo 368.666-5 chr12 75843135 75843501 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 188458 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 190.667-156 chr8 135166122 135166402 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67869 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 211.333-27 chr10 91594489 91594724 + 1.33333 NA intron (NR_024467, intron 1 of 4) intron (NR_024467, intron 1 of 4) 16854 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 183.333-21 chr11 41465700 41465943 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -6169 NM_001258419 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 290.667-14 chr14 44819457 44819827 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20516 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 145.333-297 chr8 65567489 65567635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4896 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 343-10 chr19 35381041 35381407 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 10129 NM_001348195 2866 NM_005305 ENSG00000126251 GPR42 FFAR1L|FFAR3L|GPR41L|GPR42P G protein-coupled receptor 42 (gene/pseudogene) protein-coding 214 chr1 35426116 35426399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -60180 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 280.667-33 chr4 62460516 62460888 + 1.33333 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 -298937 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 366.333-9 chr18 78837868 78838182 + 1.33333 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -142250 NM_171999 27164 Hs.700557 NM_171999 ENSG00000256463 SALL3 ZNF796 spalt like transcription factor 3 protein-coding 267.333-22 chr12 30247297 30247654 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 429769 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 297.333-40 chr3 89051746 89052162 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55667 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 198.666-16 chr12 61622633 61623006 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 570020 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 284.666-22 chr5 159126131 159126425 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 25795 NR_109890 101927740 Hs.738721 NR_109890 ENSG00000245812 LINC02202 - long intergenic non-protein coding RNA 2202 ncRNA 253.999-3 chr17 57476836 57477151 + 1.33333 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 46604 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 216.666-51 chr4 39363532 39363722 + 1.33333 NA intron (NM_001204747, intron 1 of 24) AluSz6|SINE|Alu 2735 NM_001204747 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 340.666-4 chr10 94089722 94090166 + 1.33333 NA intron (NM_001165979, intron 1 of 31) intron (NM_001165979, intron 1 of 31) 918 NM_001165979 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 428.667-7 chr2 99610507 99611062 + 1.33333 NA intron (NM_001025108, intron 12 of 23) L1MD2|LINE|L1 -120767 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 134.667-57 chr14 51951065 51951214 + 1.33333 NA intron (NM_001243773, intron 3 of 3) intron (NM_001243773, intron 3 of 3) -32568 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 149-78 chr20 40181055 40181187 + 1.33333 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 176660 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 220.666-10 chr10 32974192 32974440 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16086 NM_002211 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 202-97 chr2 198540621 198540855 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -165641 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 262.667-76 chr7 81502523 81502865 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59125 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 195-50 chr17 43857523 43857669 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001168324, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001168324, exon 6 of 6) 10420 NM_145273 146894 Hs.147313 NM_145273 ENSG00000161649 CD300LG CLM-9|CLM9|NEPMUCIN|TREM-4|TREM4 CD300 molecule like family member g protein-coding 267.667-38 chr22 21665336 21665735 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_014337) promoter-TSS (NM_014337) -449 NM_001317996 23759 Hs.438587 NM_014337 ENSG00000100023 PPIL2 CYC4|CYP60|Cyp-60|UBOX7|hCyP-60 peptidylprolyl isomerase like 2 protein-coding 223.333-39 chr14 64212449 64212728 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 104 of 114) intron (NM_015180, intron 104 of 114) -1556 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 426.666-4 chr11 67191521 67191893 + 1.33333 NA intron (NR_027473, intron 5 of 20) L1M4c|LINE|L1 -48307 NM_001256405 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 316-4 chr10 53179654 53179999 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -408126 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 235.333-111 chr7 2026247 2026494 + 1.33333 NA intron (NM_001013837, intron 12 of 18) L1MEg|LINE|L1 62682 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 204-126 chr22 46953590 46953778 + 1.33333 NA intron (NR_104292, intron 10 of 13) L1MEf|LINE|L1 -37642 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 202-79 chr2 45788532 45788767 + 1.33333 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 136974 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 202-36 chr12 98494347 98494618 + 1.33333 NA intron (NR_038383, intron 2 of 3) AluSq|SINE|Alu 9373 NR_038383 643770 Hs.129589 NR_038383 ENSG00000245017 LINC02453 - long intergenic non-protein coding RNA 2453 ncRNA 177.333-85 chr2 113968550 113968742 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_148507) promoter-TSS (NR_148507) -676 NR_148507 440900 Hs.662205 NR_034128 ENSG00000234199 LINC01191 VIN|lnc-ACTR3 long intergenic non-protein coding RNA 1191 ncRNA 283.333-18 chr14 71006369 71006715 + 1.33333 NA intron (NM_014982, intron 8 of 35) intron (NM_014982, intron 8 of 35) 99083 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 312.667-36 chr6 157880327 157880721 + 1.33333 NA intron (NM_016224, intron 4 of 17) intron (NM_016224, intron 4 of 17) 57278 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 160-122 chr8 103278679 103278833 + 1.33333 NA intron (NR_148213, intron 2 of 3) intron (NR_148213, intron 2 of 3) -19738 NM_001164615 8323 Hs.591863 NM_003506 ENSG00000164930 FZD6 FZ-6|FZ6|HFZ6|NDNC10 frizzled class receptor 6 protein-coding 184.333-24 chr12 41095758 41096004 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -92439 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 164-124 chr9 19136431 19136618 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -8918 NR_038064 123 Hs.3416 NM_001122 ENSG00000147872 PLIN2 ADFP|ADRP perilipin 2 protein-coding 234.667-105 chr7 100851058 100851402 + 1.33333 NA intron (NR_146550, intron 1 of 1) MER31B|LTR|ERV1 1384 NR_146550 105375430 Hs.638778 NR_146550 ENSG00000236305 SLC12A9-AS1 - SLC12A9 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-68 chr17 61291416 61291726 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 76133 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 229.333-37 chr14 78835903 78836193 + 1.33333 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -363934 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 279.999 chr1 222257147 222257402 + 1.33333 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -278754 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 402.333-5 chr2 27965597 27965933 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) L1MC5|LINE|L1 -30602 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 162-48 chr16 14202937 14203164 + 1.33333 NA intron (NM_001365411, intron 1 of 14) intron (NM_001365411, intron 1 of 14) 16364 NM_001365416 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 196.333-52 chr15 68178557 68178843 + 1.33333 NA intron (NM_016166, intron 11 of 13) intron (NM_016166, intron 11 of 13) 27410 NR_104583 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 186.666-48 chr7 82118565 82118719 + 1.33333 NA intron (NM_000722, intron 5 of 38) intron (NM_000722, intron 5 of 38) 109465 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 166.666-15 chr7 83011355 83011534 + 1.33333 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 151440 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 194-15 chr11 11932423 11932592 + 1.33333 NA intron (NM_001282659, intron 14 of 27) intron (NM_001282659, intron 14 of 27) 76132 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 192-4 chr1 79948031 79948224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -587628 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 251.666-4 chr10 35377114 35377406 + 1.33333 NA intron (NM_001282852, intron 1 of 8) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 40386 NM_001282852 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 210.666-67 chr3 29046753 29046976 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 234075 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 354-22 chr6 63349514 63349896 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -29722 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 244-54 chr2 70340952 70341292 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -39055 NM_001329755 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 217.333-60 chr18 62913153 62913419 + 1.33333 NA intron (NM_194449, intron 8 of 16) intron (NM_194449, intron 8 of 16) 197745 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 233-61 chr8 105340353 105340739 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 21003 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 215.667-49 chr18 9202793 9203102 + 1.33333 NA intron (NM_001204056, intron 3 of 11) intron (NM_001204056, intron 3 of 11) 65384 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 171.333-74 chr2 37070104 37070272 + 1.33333 NA intron (NM_019024, intron 7 of 35) AluSx|SINE|Alu 14184 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 426.666 chr1 18371653 18372427 + 1.33333 NA intron (NM_032880, intron 6 of 9) L1ME2|LINE|L1 -108890 NM_152375 127707 Hs.406913 NM_152375 ENSG00000179023 KLHDC7A - kelch domain containing 7A protein-coding 218-122 chrX 78395913 78396148 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -68339 NM_001282186 10800 Hs.733809 NM_006639 ENSG00000173198 CYSLTR1 CYSLT1|CYSLT1R|CYSLTR|HMTMF81 cysteinyl leukotriene receptor 1 protein-coding 168.333-51 chr13 59183073 59183273 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -829545 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 470.333-3 chr14 20574911 20575462 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -13038 NR_122043 254028 Hs.652569 NR_122043 ENSG00000258573 LOC254028 - uncharacterized LOC254028 ncRNA 207.666-2 chr1 111146028 111146349 + 1.33333 NA intron (NR_138484, intron 1 of 9) intron (NR_138484, intron 1 of 9) 5965 NR_138483 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 246.666-7 chr11 47015521 47015770 + 1.33333 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) L1M5|LINE|L1 78884 NM_024113 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 200.667-116 chr4 30388607 30388904 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -331614 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 193.333-52 chr14 38524766 38524979 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -268779 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 245-48 chr3 150452853 150453237 + 1.33333 NA intron (NR_130136, intron 3 of 4) intron (NR_130136, intron 3 of 4) 44747 NM_014779 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 314.666-22 chr3 42625868 42626126 + 1.33333 NA intron (NR_125400, intron 1 of 2) intron (NR_125400, intron 1 of 2) -24919 NM_001201572 9117 Hs.445892 NM_004206 ENSG00000093183 SEC22C SEC22L3 SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein protein-coding 225.666-13 chr2 162893443 162893671 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -54790 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 200.666-118 chr8 54246209 54246452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84356 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 318.999 chr1 147432908 147433173 + 1.33333 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) intron (NR_038423, intron 3 of 3) 84835 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 222.333-15 chr11 26247400 26247574 + 1.33333 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) 40520 NR_132968 105376599 Hs.125537 NR_132968 ENSG00000254819 ANO3-AS1 - ANO3 antisense RNA 1 ncRNA 202.666-102 chr5 163372231 163372392 + 1.33333 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -65260 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 205.666-34 chr22 26025427 26025634 + 1.33333 NA intron (NM_001318245, intron 42 of 43) intron (NM_001318245, intron 42 of 43) -143932 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 223.666-25 chr4 111981931 111982184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -163397 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 212.666-84 chr7 51810965 51811143 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -417798 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 324-12 chr2 7758551 7758834 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 140963 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 177.333-124 chr4 105475852 105476050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1881 NM_006903 27068 Hs.654957 NM_006903 ENSG00000138777 PPA2 HSPC124|SCFAI|SCFI|SID6-306 pyrophosphatase (inorganic) 2 protein-coding 314-21 chr2 99555532 99555974 + 1.33333 NA intron (NM_001025108, intron 21 of 23) intron (NM_001025108, intron 21 of 23) -65736 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 469.666-3 chr2 10869180 10869769 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8793 NR_110575 101929733 Hs.736697 NR_110575 ENSG00000271952 LINC01954 - long intergenic non-protein coding RNA 1954 ncRNA 221.333-155 chr9 108223335 108223520 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 632559 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 177.333-33 chr12 19932626 19932781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81982 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 233.666-12 chr16 60192023 60192222 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 167671 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 186-108 chrX 97159114 97159264 + 1.33333 NA intron (NM_007309, intron 22 of 26) MER131|DNA?|DNA? 275281 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 211.333-109 chr2 58788873 58789071 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) FLAM_A|SINE|Alu 268219 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 199.333-182 chr3 77487246 77487419 + 1.33333 NA intron (NM_001290039, intron 4 of 26) L2a|LINE|L2 389320 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 197.666-3 chr1 170130522 170130823 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15375 NM_001136107 149281 Hs.553612 NM_001136107 ENSG00000203740 METTL11B C1orf184|HOMT1B|NTM1B methyltransferase like 11B protein-coding 273.333-32 chr2 39259222 39259493 + 1.33333 NA intron (NM_003618, intron 29 of 33) MER5A|DNA|hAT-Charlie -15374 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 331-38 chr6 167034518 167034803 + 1.33333 NA intron (NM_001278690, intron 10 of 10) intron (NM_001278690, intron 10 of 10) 35263 NM_007045 11116 Hs.487175 NM_007045 ENSG00000213066 FGFR1OP FOP FGFR1 oncogene partner protein-coding 213.333-207 chr8 64988358 64988555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -189719 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 299.666-8 chr15 96377838 96378117 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44212 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 281.667-52 chr8 79502698 79503150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -108193 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 196.666-71 chr3 185358372 185358592 + 1.33333 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -4654 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 182.333-120 chr5 24855867 24856078 + 1.33333 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -15389 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 230.333-80 chr3 176246470 176246689 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2028 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 397.666-3 chr11 107988662 107989166 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -19984 NM_003478 8065 Hs.440320 NM_003478 ENSG00000166266 CUL5 CUL-5|VACM-1|VACM1 cullin 5 protein-coding 214.666-42 chr21 16287925 16288176 + 1.33333 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -3282 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 211.333-163 chr4 42365643 42365828 + 1.33333 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 25533 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 160.333-99 chr14 53932059 53932377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16266 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 337.333-30 chr3 132581508 132582001 + 1.33333 NA intron (NM_032169, intron 13 of 19) intron (NM_032169, intron 13 of 19) -15516 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 227.666-9 chr12 3375501 3375679 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5759 NM_001256536 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 302.667 chr1 150147086 150147404 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2189 NM_001304722 51177 Hs.438824 NM_016274 ENSG00000023902 PLEKHO1 CKIP-1|CKIP1|JBP|OC120 pleckstrin homology domain containing O1 protein-coding 189-51 chr20 12054219 12054494 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 136463 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 206.333-145 chr7 28231237 28231431 + 1.33333 NA intron (NR_034097, intron 3 of 3) intron (NR_034097, intron 3 of 3) -50539 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 192.333-19 chr10 78806208 78806352 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 261168 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 121.666-3 chr11 91305160 91305320 + 1.33333 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -436038 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 220.667-29 chr14 98982210 98982484 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 270734 NR_161367 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 295.333-16 chr15 55284437 55284813 + 1.33333 NA intron (NM_183235, intron 1 of 6) intron (NM_183235, intron 1 of 6) 5188 NM_183235 5873 Hs.654978 NM_004580 ENSG00000069974 RAB27A GS2|HsT18676|RAB27|RAM RAB27A, member RAS oncogene family protein-coding 271.666-9 chr5 16779190 16779441 + 1.33333 NA intron (NM_012334, intron 9 of 40) intron (NM_012334, intron 9 of 40) 156973 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 282.666-11 chr2 61126203 61126474 + 1.33333 NA intron (NM_001330435, intron 20 of 21) L2a|LINE|L2 18637 NR_036496 339803 Hs.252433 NR_036496 ENSG00000212978 LOC339803 - uncharacterized LOC339803 ncRNA 294.667-25 chr2 162209266 162209637 + 1.33333 NA intron (NM_004460, intron 12 of 25) intron (NM_004460, intron 12 of 25) 33994 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 208.333-138 chr7 39698799 39699089 + 1.33333 NA intron (NM_005402, intron 4 of 4) L1ME4b|LINE|L1 -34624 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 199.333-284 chr8 127624177 127624434 + 1.33333 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 109662 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 299.333-28 chr15 89381509 89381860 + 1.33333 NA intron (NR_133001, intron 3 of 6) intron (NR_133001, intron 3 of 6) 3642 NR_015411 254559 Hs.136313 NR_015411 ENSG00000255571 MIR9-3HG LINC00925 MIR9-3 host gene ncRNA 201.333-52 chr11 54869869 54870092 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 163148 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 197-22 chr10 115810673 115810922 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) L1MEc|LINE|L1 383992 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 182.666-7 chr11 58225049 58225229 + 1.33333 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger 3779 NM_001004471 219960 Hs.553646 NM_001004471 ENSG00000180475 OR10Q1 OR11-233 olfactory receptor family 10 subfamily Q member 1 protein-coding 162-35 chr13 77824577 77824748 + 1.33333 NA intron (NR_103853, intron 1 of 6) intron (NR_103853, intron 1 of 6) 5725 NR_103853 100505518 Hs.742215 NR_103853 EDNRB-AS1 - EDNRB antisense RNA 1 ncRNA 274.666-17 chr18 79791567 79791876 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71947 NM_012283 26251 Hs.247905 NM_012283 ENSG00000178342 KCNG2 KCNF2|KV6.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 2 protein-coding 220-96 chr5 155349285 155349504 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 335639 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 208.666-31 chr12 79247582 79247740 + 1.33333 NA intron (NM_001291901, intron 3 of 9) L2a|LINE|L2 -171596 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 136.333-20 chr10 52677251 52677467 + 1.33333 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 78045 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 242.666-25 chr21 26773324 26773603 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 71946 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 148-14 chr1 228193123 228193288 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -14839 NM_052843 84033 Hs.650039 NM_052843 ENSG00000154358 OBSCN ARHGEF30|UNC89 obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF protein-coding 172.666-2 chr1 236055665 236055811 + 1.33333 NA intron (NM_002508, intron 1 of 19) intron (NM_002508, intron 1 of 19) 9352 NM_002508 4811 Hs.356624 NM_002508 ENSG00000116962 NID1 NID nidogen 1 protein-coding 170.666-17 chr3 137016232 137016413 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 58339 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 260.666-21 chr21 18670815 18671043 + 1.33333 NA intron (NR_109925, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 15235 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 210-115 chr5 13273728 13273963 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -240959 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 186.666-37 chr3 161361803 161361945 + 1.33333 NA intron (NM_001040100, intron 1 of 2) intron (NM_001040100, intron 1 of 2) 10209 NM_001040100 165679 Hs.369104 NM_145035 ENSG00000196542 SPTSSB ADMP|C3orf57|SSSPTB serine palmitoyltransferase small subunit B protein-coding 202.666-124 chr8 90623213 90623446 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001146273, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001146273, exon 2 of 2) -17266 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 199.667-109 chr5 19830122 19830437 + 1.33333 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) L1PA15|LINE|L1 55993 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 213.333-162 chr5 108808118 108808297 + 1.33333 NA intron (NM_001308028, intron 3 of 17) L1PA16|LINE|L1 59259 NM_001308038 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 211.666-28 chr20 44669372 44669564 + 1.33333 NA intron (NR_034104, intron 1 of 4) MER101-int|LTR|ERV1 2271 NR_034104 79015 Hs.671450 NM_024049 ENSG00000283440 LINC01260 - long intergenic non-protein coding RNA 1260 ncRNA 161-63 chr3 186205404 186205574 + 1.33333 NA intron (NM_001346, intron 21 of 24) AluSx1|SINE|Alu -96400 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 180-78 chr5 14012032 14012340 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67706 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 422.666-2 chr17 52858839 52859261 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -3071 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 195.333-125 chr2 188101678 188101850 + 1.33333 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) intron (NR_126396, intron 2 of 2) 185927 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 198.333-201 chr8 143972456 143972724 + 1.33333 NA intron (NM_000445, intron 2 of 32) intron (NM_000445, intron 2 of 32) 939 NM_201378 5339 Hs.434248 NM_000445 ENSG00000178209 PLEC EBS1|EBSMD|EBSND|EBSO|EBSOG|EBSPA|HD1|LGMD2Q|LGMDR17|PCN|PLEC1|PLEC1b|PLTN plectin protein-coding 326.666-15 chr9 16238773 16239101 + 1.33333 NA intron (NM_001364979, intron 1 of 3) intron (NM_001364979, intron 1 of 3) 14170 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 300.667-20 chr2 121217115 121217614 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_014553, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_014553, exon 15 of 15) 67838 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 296-51 chr5 58529563 58529865 + 1.33333 NA TTS (NR_039639) TTS (NR_039639) 395 NR_039639 100616339 NR_039639 ENSG00000265699 MIR548AE2 - microRNA 548ae-2 ncRNA 297.333-32 chr2 18476763 18477065 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83739 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 290.666-6 chr10 91650741 91651035 + 1.33333 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -17817 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 192.666-64 chr9 25497562 25497735 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 181210 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 207.666 chr1 51620089 51620283 + 1.33333 NA intron (NM_148906, intron 1 of 22) intron (NM_148906, intron 1 of 22) 3094 NR_036662 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 302-8 chr1 244441639 244441950 + 1.33333 NA intron (NM_001365073, intron 1 of 12) AluY|SINE|Alu 10115 NM_001126 159 Hs.498313 NM_001126 ENSG00000035687 ADSS ADEH|ADSS 2|ADSS2 adenylosuccinate synthase protein-coding 171.333-23 chr10 91874979 91875180 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34407 NM_152429 143282 Hs.466120 NM_152429 ENSG00000174721 FGFBP3 C10orf13|FGF-BP3 fibroblast growth factor binding protein 3 protein-coding 187.333-70 chr15 38358254 38358450 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95775 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 212.667-59 chr18 3805225 3805491 + 1.33333 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) intron (NM_001242762, intron 2 of 9) 40000 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 283-25 chr3 161404068 161404592 + 1.33333 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -22097 NR_102265 101243545 Hs.737526 NR_102265 ENSG00000240567 LINC02067 - long intergenic non-protein coding RNA 2067 ncRNA 190.333-68 chr2 54989853 54990115 + 1.33333 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) intron (NM_153828, intron 1 of 6) 20288 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 292.333-6 chr10 45651077 45651445 + 1.33333 NA intron (NM_174890, intron 4 of 9) L2a|LINE|L2 21471 NM_001282905 93550 Hs.89029 NM_174890 ENSG00000172671 ZFAND4 ANUBL1 zinc finger AN1-type containing 4 protein-coding 212.666-62 chr4 69707127 69707334 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 53390 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 198-60 chr15 76222080 76222233 + 1.33333 NA intron (NM_000126, intron 11 of 11) intron (NM_000126, intron 11 of 11) 37996 NR_028510 7302 Hs.684881 NR_002721 TYRO3P - TYRO3P protein tyrosine kinase pseudogene pseudo 296.666-32 chr6 139977909 139978204 + 1.33333 NA TTS (NR_121624) TTS (NR_121624) 1737 NR_121623 100507477 Hs.179213 NR_121622 ENSG00000236013 LOC100507477 - uncharacterized LOC100507477 ncRNA 340.999-3 chr12 40102982 40103271 + 1.33333 NA intron (NM_052885, intron 1 of 9) intron (NM_052885, intron 1 of 9) 2955 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 186-32 chr14 43813994 43814235 + 1.33333 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 693169 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 224.666-18 chr2 58023263 58023575 + 1.33333 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) L1MB3|LINE|L1 -23223 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 149.333-397 chr8 91057341 91057581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12728 NR_110438 100506365 Hs.153412 NR_110438 ENSG00000253738 OTUD6B-AS1 GS1-251I9.4 OTUD6B antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 165.333-221 chr6 51903240 51903415 + 1.33333 NA intron (NM_138694, intron 43 of 66) MER30|DNA|hAT-Charlie 184286 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 204.333-142 chr4 107867006 107867289 + 1.33333 NA non-coding (NR_125929, exon 6 of 7) non-coding (NR_125929, exon 6 of 7) -26117 NM_001136257 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 118.333-72 chr15 57494745 57494874 + 1.33333 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) intron (NM_032866, intron 8 of 18) -97095 NR_104370 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 192-87 chr21 28385162 28385356 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -154059 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 213.333-150 chr4 112367515 112367756 + 1.33333 NA intron (NM_001102406, intron 2 of 15) MER2|DNA|TcMar-Tigger 70266 NM_025144 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 173.333-19 chr1 208009551 208009715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -98508 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 187.333-108 chr2 144545831 144546077 + 1.33333 NA intron (NR_110570, intron 1 of 2) MIR3|SINE|MIR -21510 NR_136320 105373656 Hs.734683 NR_136320 LOC105373656 - uncharacterized LOC105373656 ncRNA 311.333-39 chr4 41500652 41501181 + 1.33333 NA intron (NM_001289122, intron 2 of 25) intron (NM_001289122, intron 2 of 25) -37241 NM_001330672 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 204.666-57 chr3 103702735 103702943 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -178723 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 249.333-101 chr8 117709159 117709490 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 188611 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 272.667-26 chr2 30262163 30262627 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 30861 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 263.999-2 chr12 92086613 92086882 + 1.33333 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) intron (NR_132341, intron 1 of 4) 54966 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 244-53 chr2 68455014 68455345 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 12115 NR_133923 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 228.333-63 chr3 89978661 89978938 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 871178 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 243.666-40 chr8 28345261 28345460 + 1.33333 NA TTS (NM_018660) TTS (NM_018660) 6713 NM_001284244 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 191.333-156 chr5 42461682 42461912 + 1.33333 NA intron (NM_001242401, intron 1 of 10) intron (NM_001242401, intron 1 of 10) 36816 NM_001242401 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 278.333-30 chr22 19107488 19107715 + 1.33333 NA intron (NM_001184781, intron 1 of 9) intron (NM_001184781, intron 1 of 9) 14811 NM_001184781 9993 Hs.517357 NM_005137 ENSG00000070413 DGCR2 DGS-C|IDD|LAN|SEZ-12 DiGeorge syndrome critical region gene 2 protein-coding 223.333-37 chr14 27403431 27403675 + 1.33333 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -209035 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 193.666-15 chr14 44528275 44528612 + 1.33333 NA intron (NR_135257, intron 2 of 2) intron (NR_135257, intron 2 of 2) 21034 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 175-13 chr11 80107343 80107492 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 655386 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 201.666-15 chr15 46021848 46022039 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 316748 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 121.333-137 chr4 125494010 125494154 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13177 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 182-65 chr3 15761499 15761652 + 1.33333 NA intron (NM_001349279, intron 4 of 28) intron (NM_001349279, intron 4 of 28) -5028 NM_001195099 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 189.666-33 chr4 79458700 79458874 + 1.33333 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -33806 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 202-168 chr6 139419949 139420189 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -45421 NM_006079 10370 Hs.82071 NM_006079 ENSG00000164442 CITED2 ASD8|MRG-1|MRG1|P35SRJ|VSD2 Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2 protein-coding 173.333-109 chr21 32026712 32026960 + 1.33333 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 59459 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 205.666-26 chr2 225110387 225110603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68027 NM_014689 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 205.666-27 chr2 233895226 233895402 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22059 NM_024080 79054 Hs.366053 NM_024080 ENSG00000144481 TRPM8 LTRPC6|LTrpC-6|TRPP8|trp-p8 transient receptor potential cation channel subfamily M member 8 protein-coding 177 chr1 31461294 31461498 + 1.33333 NA Intergenic HERVIP10F-int|LTR|ERV1 -38689 NR_034112 149086 Hs.729905 NR_034112 ENSG00000260386 LDC1P LINC01225 leucine decarboxylase 1, pseudogene pseudo 411.666-4 chr2 40853460 40853876 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -341233 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 150.333-119 chr14 71201754 71202054 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -118572 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 240.666-16 chr15 64903304 64903550 + 1.33333 NA Intergenic (TTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8475 NM_182703 348094 Hs.207157 NM_182703 ENSG00000166839 ANKDD1A - ankyrin repeat and death domain containing 1A protein-coding 232-33 chr15 75058723 75058984 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15567 NM_001301104 60490 Hs.458922 NM_021823 ENSG00000138621 PPCDC MDS018|PPC-DC|coaC phosphopantothenoylcysteine decarboxylase protein-coding 256.666-38 chr5 69044184 69044469 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14399 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 219.333-56 chr15 42528031 42528336 + 1.33333 NA intron (NM_130798, intron 5 of 6) intron (NM_130798, intron 5 of 6) 20610 NM_153260 255252 Hs.234681 NM_153260 ENSG00000180979 LRRC57 - leucine rich repeat containing 57 protein-coding 185.333-60 chr16 54393640 54393794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23018 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 141.666 chr11 23834711 23834841 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -415586 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 282.333-41 chr4 75490605 75491002 + 1.33333 NA intron (NM_001009922, intron 6 of 7) intron (NM_001009922, intron 6 of 7) 18493 NR_103725 25898 Hs.48297 NM_015436 ENSG00000163743 RCHY1 ARNIP|CHIMP|PIRH2|PRO1996|RNF199|ZCHY|ZNF363 ring finger and CHY zinc finger domain containing 1 protein-coding 445.667-2 chr10 29887352 29888009 + 1.33333 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -150744 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 256-54 chr21 15258706 15258994 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -193850 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 199.333-195 chr4 43250574 43250772 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 241870 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 202.666-45 chr15 82744983 82745227 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -5325 NR_036446 283693 Hs.560399 NR_036446 ACTG1P17 - actin gamma 1 pseudogene 17 pseudo 278.333-37 chr6 75150652 75151022 + 1.33333 NA intron (NM_080645, intron 6 of 50) intron (NM_080645, intron 6 of 50) -22055 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 248-34 chr18 79310689 79310917 + 1.33333 NA intron (NR_148360, intron 16 of 31) intron (NR_148360, intron 16 of 31) -85127 NM_006162 4772 Hs.534074 NM_006162 ENSG00000131196 NFATC1 NF-ATC|NF-ATc1.2|NFAT2|NFATc nuclear factor of activated T cells 1 protein-coding 318.333-30 chr7 30928618 30929079 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16995 NM_001329872 358 Hs.76152 NM_000385 ENSG00000240583 AQP1 AQP-CHIP|CHIP28|CO aquaporin 1 (Colton blood group) protein-coding 266.666-23 chr5 23846803 23847091 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -104401 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 151-104 chr5 30370568 30370790 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 490119 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 206.333-10 chr10 27807774 27807956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62046 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 201.333-241 chr6 60717449 60717620 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -856596 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 301.667-43 chr8 126045195 126045606 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -94203 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 378.999-3 chr2 59653237 59653564 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 435692 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 196.333-158 chr6 132362201 132362384 + 1.33333 NA intron (NM_015529, intron 4 of 11) intron (NM_015529, intron 4 of 11) 39183 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 221.333-40 chr14 67269028 67269344 + 1.33333 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) L1MB8|LINE|L1 27751 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 204-213 chrX 91473434 91473743 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -38589 NR_110659 102724167 Hs.571694 NR_110659 ENSG00000234161 PABPC5-AS1 CXorf46 PABPC5 antisense RNA 1 ncRNA 270-16 chr16 25855728 25856079 + 1.33333 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) L1MCb|LINE|L1 163944 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 192.666-21 chr14 39350526 39350715 + 1.33333 NA non-coding (NR_148723, exon 24 of 24) non-coding (NR_148723, exon 24 of 24) 81880 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 222.667-70 chr5 2726294 2726604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13858 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 179.666-15 chr8 122448476 122448800 + 1.33333 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 120006 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 210-90 chr3 45536457 45536685 + 1.33333 NA intron (NM_001368263, intron 19 of 20) intron (NM_001368263, intron 19 of 20) -27026 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 271.999-4 chr6 87268851 87269074 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -53626 NM_001042493 57150 Hs.70769 NM_020425 ENSG00000111850 SMIM8 C6orf162|dJ102H19.2 small integral membrane protein 8 protein-coding 211.333-253 chr9 73739358 73739610 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 587619 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 193-41 chr2 30699102 30699384 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 108203 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 260.666-3 chr10 26428855 26429177 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -9325 NM_019043 54518 Hs.310421 NM_019043 ENSG00000077420 APBB1IP INAG1|PREL1|RARP1|RIAM amyloid beta precursor protein binding family B member 1 interacting protein protein-coding 208.333-16 chr10 39128271 39128449 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 431764 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 203-67 chr3 73457524 73457752 + 1.33333 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 16994 NM_001303141 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 196.666-39 chr18 71435625 71435796 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 143246 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 143.333-300 chr9 11958662 11958824 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -734642 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 201.333-288 chr8 120523298 120523552 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_022045, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_022045, exon 22 of 22) 78006 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 211-64 chr3 66324846 66325097 + 1.33333 NA intron (NR_028475, intron 5 of 9) MER34A1|LTR|ERV1 103968 NM_001350992 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 354.666-17 chr6 47846046 47846345 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59127 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 426-8 chr2 63133454 63134146 + 1.33333 NA intron (NR_148704, intron 18 of 18) L1MB3|LINE|L1 -14258 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 218-21 chr12 130107362 130107585 + 1.33333 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac 36138 NR_146538 105370078 NR_146538 LINC02419 - long intergenic non-protein coding RNA 2419 ncRNA 223.333-13 chr1 194023137 194023404 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 718525 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 297.333-4 chr1 150133694 150134006 + 1.33333 NA intron (NR_103998, intron 13 of 13) intron (NR_103998, intron 13 of 13) -15584 NM_001304722 51177 Hs.438824 NM_016274 ENSG00000023902 PLEKHO1 CKIP-1|CKIP1|JBP|OC120 pleckstrin homology domain containing O1 protein-coding 323.333-8 chr13 49532799 49533244 + 1.33333 NA non-coding (NR_148015, exon 14 of 14) non-coding (NR_148015, exon 14 of 14) 35965 NM_001040444 51131 Hs.369039 NM_001040443 ENSG00000136147 PHF11 APY|BCAP|IGEL|IGER|IGHER|NY-REN-34|NYREN34 PHD finger protein 11 protein-coding 146-86 chr3 96066238 96066461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -293615 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 353.333 chr1 118185969 118186277 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_206996) promoter-TSS (NM_206996) -895 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 329-25 chr8 94014729 94015068 + 1.33333 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 97951 NM_001161779 54704 Hs.22265 NM_018444 ENSG00000164951 PDP1 PDH|PDP|PDPC|PPM2A|PPM2C pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 protein-coding 136.667-88 chr2 29855388 29855573 + 1.33333 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 66106 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 272.666-6 chr12 57785081 57785398 + 1.33333 NA intron (NM_001172697, intron 2 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 2452 NM_005726 10102 Hs.632704 NM_005726 ENSG00000123297 TSFM EFTS|EFTSMT Ts translation elongation factor, mitochondrial protein-coding 284-26 chr2 71058561 71058904 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9564 NM_001330426 55577 Hs.7036 NM_017567 ENSG00000124357 NAGK GNK|HSA242910 N-acetylglucosamine kinase protein-coding 214.333-152 chr8 34054285 34054504 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -454288 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 324.333-27 chr22 38224256 38224659 + 1.33333 NA TTS (NR_132774) TTS (NR_132774) 263 NR_132774 106635525 NR_132774 SNORA92 - small nucleolar RNA, H/ACA box 92 snoRNA 198.666-67 chr4 60533048 60533248 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -389471 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 146-29 chr14 57599273 57599457 + 1.33333 NA intron (NM_001306087, intron 1 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie -105508 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 217.666-16 chr17 48306576 48306826 + 1.33333 NA intron (NR_131239, intron 2 of 2) intron (NR_131239, intron 2 of 2) 12354 NR_131239 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 331.666 chr1 52840417 52840698 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2203 NM_001004339 440590 Hs.658458 NM_001004339 ENSG00000203995 ZYG11A ZYG11 zyg-11 family member A, cell cycle regulator protein-coding 185-79 chr8 128996554 128996901 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30726 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 241.333-35 chr13 53574077 53574334 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -241214 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 137.333-32 chr11 132731518 132731680 + 1.33333 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) intron (NM_001319104, intron 1 of 6) 212038 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 206.666-26 chr12 17549347 17549607 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 39601 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 201.333-131 chr18 9361748 9361977 + 1.33333 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) intron (NM_020648, intron 3 of 4) 27089 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 243.999-9 chr7 38966356 38966658 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -11402 NM_007252 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 296.333-7 chr11 36195591 36195982 + 1.33333 NA intron (NM_001304264, intron 4 of 5) intron (NM_001304264, intron 4 of 5) 93638 NM_001307932 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 261.667-20 chr15 68784454 68784840 + 1.33333 NA intron (NM_006305, intron 3 of 6) intron (NM_006305, intron 3 of 6) 17278 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 148-39 chr14 50112443 50112583 + 1.33333 NA intron (NM_001040662, intron 4 of 4) intron (NM_001040662, intron 4 of 4) 4059 NR_049739 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 352-3 chr1 233696991 233697417 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 73052 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 210-123 chr5 133540421 133540695 + 1.33333 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 71983 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 260.333-57 chr6 103271045 103271348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1588350 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 308.666-3 chr1 214817518 214817830 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -187868 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 150.666-3 chr1 115798485 115798615 + 1.33333 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -29745 NM_001232 845 Hs.57975 NM_001232 ENSG00000118729 CASQ2 PDIB2 calsequestrin 2 protein-coding 213.333-46 chr12 70728814 70729069 + 1.33333 NA intron (NM_130846, intron 2 of 9) L5|LINE|RTE-X 25667 NR_073474 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 239-34 chr2 156445048 156445419 + 1.33333 NA intron (NM_000408, intron 1 of 16) MIRb|SINE|MIR 8854 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 166.667-12 chr1 100894126 100894343 + 1.33333 NA intron (NM_001439, intron 1 of 4) intron (NM_001439, intron 1 of 4) 608 NM_001033025 2135 Hs.357637 NM_001439 ENSG00000162694 EXTL2 EXTR2 exostosin like glycosyltransferase 2 protein-coding 252.333-30 chr2 51037386 51037833 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 1 of 10) intron (NR_135237, intron 1 of 10) 5008 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 323-22 chr5 61864225 61864618 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -128723 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 195.333-213 chr8 54863788 54863943 + 1.33333 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -238163 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 283.333-22 chr17 27060661 27060941 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 28440 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 175-35 chr17 67185720 67185950 + 1.33333 NA intron (NM_001330447, intron 12 of 32) intron (NM_001330447, intron 12 of 32) -58941 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 357.333-10 chr2 100730992 100731367 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -88960 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 196.667-61 chr17 67100262 67100530 + 1.33333 NA intron (NM_001330447, intron 31 of 32) intron (NM_001330447, intron 31 of 32) 55842 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 213.666-15 chr15 67571700 67571955 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 3 of 21) MIRc|SINE|MIR 22733 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 331.667-13 chr3 34738271 34738707 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 655534 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 148-4 chr1 34273978 34274129 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 97146 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 234.667-12 chr10 96958056 96958398 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_032440, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_032440, exon 8 of 8) 125282 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 142.666-10 chr2 35022859 35023031 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 345388 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 391.333-18 chr7 40297403 40297866 + 1.33333 NA intron (NM_024728, intron 8 of 14) intron (NM_024728, intron 8 of 14) 162658 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 161.333-253 chr6 156310171 156310360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68485 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 319.666-7 chr14 47868545 47868902 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -73709 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 197.333-121 chr2 151051540 151051756 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 210215 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 202.333-163 chr7 51961670 51961930 + 1.33333 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -568544 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 202-155 chr5 154660950 154661112 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21948 NM_001367714 23367 Hs.292078 NM_015315 ENSG00000155506 LARP1 LARP La ribonucleoprotein domain family member 1 protein-coding 214.666-75 chr8 127758485 127758737 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 22380 NM_002467 4609 Hs.202453 NM_002467 ENSG00000136997 MYC MRTL|MYCC|bHLHe39|c-Myc MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 209.333-57 chr14 44516569 44516733 + 1.33333 NA intron (NR_135257, intron 2 of 2) L1M1|LINE|L1 9242 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 333.333-35 chr22 27125360 27125840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61916 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 216.666-56 chr5 106482322 106482582 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 528562 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 179-71 chr4 71873764 71874023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68373 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 152-91 chr2 191319158 191319292 + 1.33333 NA intron (NM_012223, intron 3 of 28) intron (NM_012223, intron 3 of 28) 73821 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 195.333-76 chr14 42903503 42903679 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 1296735 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 199.666-4 chr1 187935693 187935899 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 492168 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 200.667-37 chr13 44136360 44136608 + 1.33333 NA intron (NR_104065, intron 1 of 4) intron (NR_104065, intron 1 of 4) -5844 NR_104064 101929212 Hs.534877 NR_104064 ENSG00000227258 SMIM2-AS1 C13orf44-AS1|C3orf81-AS1 SMIM2 antisense RNA 1 ncRNA 249-21 chr12 71134183 71134524 + 1.33333 NA intron (NM_001369760, intron 5 of 7) L3|LINE|CR1 23456 NM_001369760 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 179.333-168 chr6 152804757 152804904 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54033 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 228-89 chr8 89593870 89594189 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 163682 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 289.999-4 chr8 31119140 31119545 + 1.33333 NA intron (NM_000553, intron 20 of 34) HAL1|LINE|L1 -85986 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 195-55 chr18 66172188 66172350 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 421257 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 233.333-137 chr9 95201652 95201963 + 1.33333 NA intron (NM_001243744, intron 4 of 13) intron (NM_001243744, intron 4 of 13) 115447 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 246.333-97 chr8 93515460 93515785 + 1.33333 NA intron (NR_033858, intron 7 of 10) L2c|LINE|L2 184811 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 312.333-15 chr2 237077952 237078306 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -7312 NM_198189 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 325.667-22 chr6 50929917 50930332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 111253 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 142-121 chr5 145175388 145175573 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 659862 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 228-98 chr9 116132966 116133167 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20725 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 262.667-29 chr15 79058585 79058910 + 1.33333 NA intron (NM_001145648, intron 2 of 26) intron (NM_001145648, intron 2 of 26) 32033 NM_002891 5923 Hs.459035 NM_002891 ENSG00000058335 RASGRF1 CDC25|CDC25L|GNRP|GRF1|GRF55|H-GRF55|PP13187|ras-GRF1 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1 protein-coding 197-64 chr20 34679614 34679769 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2406 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 178.333-4 chr1 58516854 58517052 + 1.33333 NA intron (NM_145243, intron 7 of 8) MamRep605|LTR?|LTR? 29773 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 275.667-29 chr2 13822905 13823282 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 577865 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 241.666-5 chr16 80421668 80421896 + 1.33333 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -118952 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 180-36 chr14 62039899 62040064 + 1.33333 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -77376 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 211.333-230 chr8 60861109 60861271 + 1.33333 NA intron (NM_017780, intron 35 of 37) L3|LINE|CR1 106558 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 591.333 chr3 197965210 197966213 + 1.33333 NA intron (NM_033029, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu 5494 NR_026787 89782 Hs.518540 NM_033029 ENSG00000185621 LMLN GP63|INV|IX14|LMNL1|MSP leishmanolysin like peptidase protein-coding 161.333-153 chr2 120055882 120056030 + 1.33333 NA intron (NM_001330307, intron 3 of 16) L1MB7|LINE|L1 42879 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 249-42 chr2 169024469 169024791 + 1.33333 NA intron (NM_003742, intron 1 of 27) L1MC3|LINE|L1 6694 NM_003742 8647 Hs.158316 NM_003742 ENSG00000073734 ABCB11 ABC16|BRIC2|BSEP|PFIC-2|PFIC2|PGY4|SPGP ATP binding cassette subfamily B member 11 protein-coding 196.333-2 chr1 46107472 46107713 + 1.33333 NA intron (NM_001303427, intron 1 of 9) intron (NM_001303427, intron 1 of 9) 23081 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 257.333-54 chr2 108097154 108097526 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -44585 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 209.333-224 chr7 91739480 91739642 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 141141 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 372-25 chrX 77910639 77911042 + 1.33333 NA intron (NM_001282224, intron 1 of 21) intron (NM_001282224, intron 1 of 21) 147 NM_000052 538 Hs.496414 NM_000052 ENSG00000165240 ATP7A DSMAX|MK|MNK|SMAX3 ATPase copper transporting alpha protein-coding 223-43 chr3 88034951 88035213 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 23914 NM_003663 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 212-32 chr12 12050872 12051161 + 1.33333 NA intron (NM_001370269, intron 1 of 7) intron (NM_001370269, intron 1 of 7) 1155 NM_001370269 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 208.666-112 chr8 111739483 111739709 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 362957 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 228.666-38 chr5 6883760 6884005 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55961 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 307.666-3 chr12 61979678 61980207 + 1.33333 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 212897 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 237-49 chr3 100436026 100436274 + 1.33333 NA intron (NM_001085451, intron 2 of 3) MER49|LTR|ERV1 34611 NM_001085451 348801 Hs.591294 NM_001085451 ENSG00000206535 LNP1 NP3 leukemia NUP98 fusion partner 1 protein-coding 292.666-18 chr2 28404967 28405242 + 1.33333 NA intron (NM_005253, intron 2 of 3) intron (NM_005253, intron 2 of 3) -10432 NR_103831 403150 Hs.562970 NR_103831 ENSG00000229951 FLJ31356 - uncharacterized protein FLJ31356 ncRNA 269.999-9 chr4 61086371 61086654 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -57144 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 234.666-52 chr8 127837413 127837606 + 1.33333 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 41547 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 157.666-3 chr4 33302298 33302512 + 1.33333 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR 737488 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 199.666-6 chr10 84504339 84504571 + 1.33333 NA intron (NM_001351290, intron 10 of 11) intron (NM_001351290, intron 10 of 11) 79286 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 175.333-51 chr14 88575968 88576126 + 1.33333 NA intron (NM_001326306, intron 8 of 12) intron (NM_001326306, intron 8 of 12) 12700 NM_207661 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 191-69 chr7 114246703 114246989 + 1.33333 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) 160519 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 200.666-10 chr1 198980958 198981144 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35082 NR_126351 104266961 Hs.576501 NR_126351 ENSG00000235492 LINC01221 TCONS_00000366 long intergenic non-protein coding RNA 1221 ncRNA 304.666-29 chr9 107926944 107927253 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -437329 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 219.666-50 chr9 100641619 100641894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63677 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 492.666-3 chr12 39216280 39216878 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 226541 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 274-20 chr16 79324417 79324729 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 276164 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 319.666-2 chr1 157010842 157011237 + 1.33333 NA intron (NM_014784, intron 1 of 39) L1MB8|LINE|L1 34703 NM_198236 9826 Hs.516954 NM_014784 ENSG00000132694 ARHGEF11 GTRAP48|PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 11 protein-coding 403.999-7 chrX 104861415 104861838 + 1.33333 NA intron (NM_017416, intron 2 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger 295427 NM_017416 26280 Hs.675519 NM_017416 ENSG00000189108 IL1RAPL2 IL-1R9|IL1R9|IL1RAPL-2|TIGIRR-1 interleukin 1 receptor accessory protein like 2 protein-coding 408-8 chr6 139975211 139975642 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_121622) promoter-TSS (NR_121622) -893 NR_121622 100507477 Hs.179213 NR_121622 ENSG00000236013 LOC100507477 - uncharacterized LOC100507477 ncRNA 210-47 chr16 46937813 46938005 + 1.33333 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 35765 NM_005880 10294 Hs.368078 NM_005880 ENSG00000069345 DNAJA2 CPR3|DJ3|DJA2|DNAJ|DNJ3|HIRIP4|PRO3015|RDJ2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A2 protein-coding 264.667-59 chr4 55856092 55856442 + 1.33333 NA intron (NM_001024924, intron 1 of 18) intron (NM_001024924, intron 1 of 18) 2617 NM_178237 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 206.333-71 chr18 4296289 4296721 + 1.33333 NA TTS (NR_036489) TTS (NR_036489) 31903 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 338.333-4 chr10 85343809 85344308 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 88714 NR_120669 101929646 Hs.116129 NR_120669 LINC02647 - long intergenic non-protein coding RNA 2647 ncRNA 356 chr1 9939036 9939505 + 1.33333 NA intron (NM_001316974, intron 2 of 7) AluSz|SINE|Alu -3653 NM_001297778 64802 Hs.633762 NM_022787 ENSG00000173614 NMNAT1 LCA9|NMNAT|PNAT1 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 protein-coding 200-20 chr10 62667489 62667685 + 1.33333 NA intron (NM_199451, intron 7 of 7) intron (NM_199451, intron 7 of 7) -137133 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 150-150 chr8 125293642 125293835 + 1.33333 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -136620 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 153.333-396 chr8 24723185 24723326 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -174637 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 152-23 chr10 73812424 73812571 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001330107) promoter-TSS (NM_001330107) -677 NR_160744 8509 Hs.654758 NM_003635 ENSG00000166507 NDST2 HSST2|N-HSST 2|NST2 N-deacetylase and N-sulfotransferase 2 protein-coding 200-63 chr15 78013315 78013499 + 1.33333 NA intron (NM_144572, intron 8 of 12) L1M5|LINE|L1 -19182 NR_026998 91450 Hs.406766 NR_026998 LOC91450 - uncharacterized LOC91450 ncRNA 254-33 chr2 37651431 37651678 + 1.33333 NA intron (NM_001270436, intron 1 of 1) intron (NM_001270436, intron 1 of 1) 20645 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 208.666-91 chr5 150311747 150311924 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8930 NM_001012301 340075 Hs.591252 NM_001012301 ENSG00000183876 ARSI ASI|SPG66 arylsulfatase family member I protein-coding 120.333-61 chr15 67883755 67883887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43776 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 370-12 chr18 1107263 1107676 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -179476 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 197.333-74 chr15 66405544 66405699 + 1.33333 NA intron (NM_002755, intron 1 of 10) intron (NM_002755, intron 1 of 10) 18748 NM_002755 5604 Hs.145442 NM_002755 ENSG00000169032 MAP2K1 CFC3|MAPKK1|MEK1|MKK1|PRKMK1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 protein-coding 193.333-101 chr2 137644066 137644349 + 1.33333 NA intron (NM_001316349, intron 21 of 27) intron (NM_001316349, intron 21 of 27) 283725 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 202.666-112 chr7 5623780 5624030 + 1.33333 NA intron (NM_207111, intron 16 of 16) intron (NM_207111, intron 16 of 16) 31089 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 224.666-35 chr7 56033182 56033384 + 1.33333 NA intron (NM_001370510, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 18161 NM_001370509 5723 Hs.512656 NM_004577 ENSG00000146733 PSPH PSP|PSPHD phosphoserine phosphatase protein-coding 223.667-56 chr4 103151575 103151891 + 1.33333 NA intron (NM_001813, intron 25 of 48) intron (NM_001813, intron 25 of 48) 46610 NM_001813 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 237.333-76 chr3 36932672 36933046 + 1.33333 NA intron (NM_001329998, intron 1 of 23) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 12195 NM_014831 9881 Hs.170999 NM_014831 ENSG00000168016 TRANK1 LBA1 tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 protein-coding 134.333-5 chr1 116362208 116362367 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10957 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 250-19 chr11 94940219 94940495 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33199 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 222.333-49 chr2 142956458 142956749 + 1.33333 NA intron (NM_001199241, intron 7 of 14) intron (NM_001199241, intron 7 of 14) 78939 NM_003937 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 207-43 chr15 60217625 60217910 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 180219 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 276-20 chr14 64070621 64070890 + 1.33333 NA exon (NM_182914, exon 52 of 116) exon (NM_182914, exon 52 of 116) 24370 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 201.333-103 chr14 70540997 70541258 + 1.33333 NA Intergenic LTR19-int|LTR|ERV1 -6123 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 177.333-115 chr3 172362882 172363035 + 1.33333 NA intron (NM_001135095, intron 23 of 25) intron (NM_001135095, intron 23 of 25) 85498 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 234.666-13 chr12 43693931 43694212 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 64719 NM_001271826 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 202.333-81 chr18 73213249 73213487 + 1.33333 NA intron (NR_034133, intron 2 of 5) intron (NR_034133, intron 2 of 5) 51130 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 339.333-23 chr2 140659799 140660100 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 41 of 90) intron (NM_018557, intron 41 of 90) -73264 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 206-148 chr5 145991695 145991968 + 1.33333 NA intron (NM_152550, intron 2 of 9) (AGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 55253 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 212.999 chr2 174050553 174050713 + 1.33333 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 25353 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 248-15 chr12 9112845 9113125 + 1.33333 NA intron (NM_001347424, intron 2 of 35) intron (NM_001347424, intron 2 of 35) 3244 NM_001347425 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 193-34 chr18 2069511 2069669 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 501915 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 212.666-97 chr9 36367496 36367710 + 1.33333 NA intron (NM_194328, intron 4 of 11) intron (NM_194328, intron 4 of 11) 32666 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 204.666-117 chr9 102562744 102563010 + 1.33333 NA intron (NR_103830, intron 1 of 4) intron (NR_103830, intron 1 of 4) 43240 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 134.667-87 chr18 31444211 31444372 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3450 NM_001944 1830 Hs.1925 NM_001944 ENSG00000134757 DSG3 CDHF6|PVA desmoglein 3 protein-coding 207-48 chr16 83305718 83306013 + 1.33333 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) MIR|SINE|MIR -202481 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 258-45 chr3 60884613 60884947 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 4 of 9) AluJb|SINE|Alu -266910 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 414.666-9 chr19 49118357 49118782 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_003660) promoter-TSS (NM_003660) 574 NM_018111 55150 Hs.458310 NM_018111 ENSG00000221916 C19orf73 - chromosome 19 open reading frame 73 protein-coding 255.666-23 chr6 75351600 75352011 + 1.33333 NA intron (NM_001300866, intron 4 of 6) intron (NM_001300866, intron 4 of 6) -31381 NR_125859 101928540 Hs.526972 NR_125859 LOC101928540 - uncharacterized LOC101928540 ncRNA 214.333-13 chr1 199730337 199730579 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -297252 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 418.333-5 chr2 62906929 62907280 + 1.33333 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) L1MD1|LINE|L1 140607 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 426-14 chr8 22667419 22667914 + 1.33333 NA intron (NM_018688, intron 1 of 8) intron (NM_018688, intron 1 of 8) 1455 NM_018688 55909 Hs.433722 NM_018688 ENSG00000147439 BIN3 - bridging integrator 3 protein-coding 229-5 chr10 6434451 6434765 + 1.33333 NA intron (NM_001242413, intron 15 of 16) intron (NM_001242413, intron 15 of 16) 84292 NR_148966 399716 Hs.737229 NR_148966 LINC02656 - long intergenic non-protein coding RNA 2656 ncRNA 196.667-138 chr7 6510869 6511156 + 1.33333 NA exon (NM_001145118, exon 9 of 22) exon (NM_001145118, exon 9 of 22) -26860 NM_006854 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 276.333-21 chr18 7829321 7829820 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 262254 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 190-9 chr1 187495034 187495259 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 51518 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 188-4 chr1 53156077 53156299 + 1.33333 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -13550 NM_006671 6512 Hs.104637 NM_006671 ENSG00000162383 SLC1A7 AAAT|EAAT5 solute carrier family 1 member 7 protein-coding 198.666-13 chr12 24151933 24152095 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -60407 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 193.666 chr1 86440822 86441006 + 1.33333 NA intron (NM_006536, intron 8 of 13) intron (NM_006536, intron 8 of 13) 16743 NM_006536 9635 Hs.241551 NM_006536 ENSG00000137975 CLCA2 CACC|CACC3|CLCRG2|CaCC-3 chloride channel accessory 2 protein-coding 172-105 chr7 73628800 73629053 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4404 NM_032953 51085 Hs.647055 NM_032951 ENSG00000009950 MLXIPL CHREBP|MIO|MLX|MONDOB|WBSCR14|WS-bHLH|bHLHd14 MLX interacting protein like protein-coding 120.333-143 chr4 84052529 84052691 + 1.33333 NA intron (NR_125909, intron 7 of 8) intron (NR_125909, intron 7 of 8) 246559 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 218-50 chr2 99015628 99015837 + 1.33333 NA intron (NR_146001, intron 18 of 18) L1PB1|LINE|L1 -79507 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 240.667-85 chr8 132836009 132836326 + 1.33333 NA intron (NM_001277196, intron 14 of 19) MER63A|DNA|hAT-Blackjack -30791 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 190-49 chr17 34000675 34000848 + 1.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L1M3c|LINE|L1 156045 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 235.666-16 chr5 146682848 146683079 + 1.33333 NA intron (NM_181678, intron 6 of 10) intron (NM_181678, intron 6 of 10) -166850 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 213.666-5 chr10 28906983 28907161 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 60664 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 135.333-62 chr16 55149499 55149692 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -174964 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 235.666-23 chr9 27947194 27947461 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001258282, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001258282, exon 7 of 7) -373461 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 272.666-14 chr3 87495153 87495517 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -218751 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 171-47 chr21 19269112 19269390 + 1.33333 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -509439 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 389.999-6 chr9 119553190 119553551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183935 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 210-52 chr18 12855150 12855321 + 1.33333 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) intron (NM_080423, intron 2 of 8) -14273 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 200.667-138 chr6 133729440 133729711 + 1.33333 NA intron (NR_109982, intron 4 of 8) intron (NR_109982, intron 4 of 8) -91572 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 205-40 chr16 78813154 78813409 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 713627 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 196.666-23 chr14 74900360 74900521 + 1.33333 NA intron (NR_045209, intron 12 of 13) intron (NR_045209, intron 12 of 13) 18524 NM_001244883 1743 Hs.525459 NM_001933 ENSG00000119689 DLST DLTS dihydrolipoamide S-succinyltransferase protein-coding 187.333-53 chr13 72330648 72330823 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 396894 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 221.666-16 chr13 77226945 77227145 + 1.33333 NA intron (NM_015057, intron 18 of 82) intron (NM_015057, intron 18 of 82) 100049 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 187.667-73 chr2 127113359 127113577 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6314 NM_139351 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 225.999-6 chr18 8771235 8771415 + 1.33333 NA intron (NM_015210, intron 4 of 16) intron (NM_015210, intron 4 of 16) 53944 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 215.333-87 chr2 46917359 46917548 + 1.33333 NA intron (NM_001288953, intron 2 of 20) intron (NM_001288953, intron 2 of 20) -1341 NM_001171507 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 234-20 chr13 80485057 80485302 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -144053 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 195.333-109 chr2 64932103 64932362 + 1.33333 NA intron (NR_036586, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 215 NR_036586 400958 Hs.591565 NR_036586 LINC02245 - long intergenic non-protein coding RNA 2245 ncRNA 159.333-197 chr21 32911316 32911472 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47494 NR_135522 102724502 Hs.130572 NR_135522 ENSG00000228961 LINC01690 - long intergenic non-protein coding RNA 1690 ncRNA 336.666-17 chr3 15167026 15167315 + 1.33333 NA intron (NR_027927, intron 4 of 4) intron (NR_027927, intron 4 of 4) 38789 NR_027927 344875 Hs.722756 NR_027927 ENSG00000230524 COL6A4P1 COL6A4|COL6A4P|DIVA|DVWA|VWA6 collagen type VI alpha 4 pseudogene 1 pseudo 142.333-172 chr4 44861896 44862046 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -135337 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 233.999-4 chr20 35793483 35793696 + 1.33333 NA intron (NM_016436, intron 1 of 17) AluSx1|SINE|Alu 21574 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 212-13 chr1 95345764 95346034 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 6208 NR_146486 101928169 NR_146486 LINC01650 - long intergenic non-protein coding RNA 1650 ncRNA 203.333-231 chr6 63413069 63413320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93211 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 365.333 chr1 232320543 232320932 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 194871 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 238.666-29 chr20 14399883 14400085 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1MEc|LINE|L1 -62317 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 258.333-31 chr2 46558249 46558600 + 1.33333 NA intron (NM_012249, intron 2 of 4) HAL1|LINE|L1 -15847 NM_001371282 273.333-52 chr4 112253720 112254063 + 1.33333 NA intron (NM_018569, intron 2 of 9) intron (NM_018569, intron 2 of 9) 22104 NM_018569 55435 Hs.435991 NM_018569 ENSG00000138660 AP1AR 2C18|C4orf16|GBAR|PRO0971|gamma-BAR adaptor related protein complex 1 associated regulatory protein protein-coding 219.666-32 chr4 94439383 94439628 + 1.33333 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -12352 NM_001256426 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 322.333-17 chr22 40133148 40133643 + 1.33333 NA intron (NM_001024843, intron 3 of 23) L2c|LINE|L2 -44530 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 264.666-3 chr1 99915175 99915498 + 1.33333 NA intron (NM_000028, intron 30 of 33) intron (NM_000028, intron 30 of 33) -54660 NM_001271684 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 180.667-116 chr5 153545535 153545788 + 1.33333 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) MER58A|DNA|hAT-Charlie 53489 NM_001258021 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 192-84 chr20 44571342 44571548 + 1.33333 NA intron (NM_007066, intron 1 of 3) intron (NM_007066, intron 1 of 3) -11134 NM_001281445 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 229.333-106 chr6 54494495 54494709 + 1.33333 NA Intergenic LTR42|LTR|ERVL 186161 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 204.666-21 chr12 50799093 50799270 + 1.33333 NA intron (NM_005171, intron 3 of 6) AluJo|SINE|Alu 35080 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 277.666-16 chr5 128056293 128056737 + 1.33333 NA TTS (NR_152799) TTS (NR_152799) 26660 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 295.333-6 chr11 95979304 95979572 + 1.33333 NA exon (NM_032427, exon 5 of 5) exon (NM_032427, exon 5 of 5) -55231 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 236.333-40 chr2 15495561 15495893 + 1.33333 NA intron (NR_052013, intron 11 of 50) L1ME3B|LINE|L1 65607 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 356-35 chr8 138522642 138522947 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -25064 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 260.667-39 chr19 28991764 28992110 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -10618 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 195.667-118 chr6 65134896 65135177 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -166382 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 216-66 chr20 18068993 18069210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9913 NM_001303462 58495 Hs.661013 NM_021220 ENSG00000125850 OVOL2 CHED|CHED1|CHED2|EUROIMAGE566589|PPCD1|ZNF339 ovo like zinc finger 2 protein-coding 205-34 chr15 61395703 61395992 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -166545 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 367.333-7 chr18 27208138 27208659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23090 NM_001256316 83539 Hs.44584 NM_031422 ENSG00000154080 CHST9 GALNAC4ST-2|GalNAc4ST2 carbohydrate sulfotransferase 9 protein-coding 211.333-8 chr1 95129396 95129562 + 1.33333 NA intron (NM_001199691, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 11556 NM_001199691 100527978 Hs.483512 NM_001199691 ENSG00000271092 TLCD4-RWDD3 TMEM56-RWDD3 TLCD4-RWDD3 readthrough protein-coding 184-72 chr4 34100273 34100544 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -60515 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 221.666-12 chr10 121913227 121913506 + 1.33333 NA intron (NM_001288734, intron 3 of 10) intron (NM_001288734, intron 3 of 10) 14665 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 212-74 chr18 10043269 10043560 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 129398 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 210-119 chr5 78322632 78322828 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27975 NM_003664 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 151.667-40 chr10 24043760 24043962 + 1.33333 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -164930 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 163.666-14 chr8 134513721 134513861 + 1.33333 NA intron (NM_020863, intron 13 of 15) intron (NM_020863, intron 13 of 15) -84280 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 178.667-4 chr1 58212379 58212621 + 1.33333 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) intron (NM_001353980, intron 1 of 5) 38003 NM_021080 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 517-7 chr8 136958198 136958876 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 427739 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 241.666-16 chr5 59267664 59267984 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 8291 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 158.333-44 chr10 112696455 112696653 + 1.33333 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) 62384 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 210-122 chr5 130990492 130990772 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 174624 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 189.333-174 chr6 92136697 92136925 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -446383 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 224-23 chr14 66632919 66633184 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 125644 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 182.333-20 chr10 78644055 78644351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 376861 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 275.333-61 chr6 45262498 45262822 + 1.33333 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1PA16|LINE|L1 -64890 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 212.667-72 chr2 62145526 62145837 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50434 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 264.333-19 chr14 70973870 70974127 + 1.33333 NA intron (NM_014982, intron 5 of 35) L1MB7|LINE|L1 66539 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 156.667-69 chr11 112054234 112054463 + 1.33333 NA intron (NM_001931, intron 11 of 13) intron (NM_001931, intron 11 of 13) 19823 NM_138789 120379 Hs.420662 NM_138789 ENSG00000150773 PIH1D2 - PIH1 domain containing 2 protein-coding 360.333-8 chr18 27125174 27125561 + 1.33333 NA intron (NM_001256316, intron 2 of 4) intron (NM_001256316, intron 2 of 4) 59941 NM_031422 83539 Hs.44584 NM_031422 ENSG00000154080 CHST9 GALNAC4ST-2|GalNAc4ST2 carbohydrate sulfotransferase 9 protein-coding 210.333-156 chr7 29796157 29796354 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10299 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 239.666-22 chr4 53424643 53424948 + 1.33333 NA intron (NM_001134937, intron 10 of 17) intron (NM_001134937, intron 10 of 17) 47142 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 198.666-46 chr2 151281426 151281621 + 1.33333 NA intron (NM_004688, intron 3 of 7) L1ME3A|LINE|L1 8145 NM_004688 9111 Hs.54483 NM_004688 ENSG00000123609 NMI - N-myc and STAT interactor protein-coding 190-10 chr1 214499078 214499242 + 1.33333 NA intron (NM_005401, intron 1 of 18) L1ME4b|LINE|L1 52442 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 303.333-5 chr1 109895519 109895941 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15119 NM_172210 1435 Hs.173894 NM_000757 ENSG00000184371 CSF1 CSF-1|MCSF colony stimulating factor 1 protein-coding 276.666-32 chr7 40100589 40100853 + 1.33333 NA Intergenic (ATATGTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 33901 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 221.333-135 chr7 118457784 118458177 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 233276 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 321.333-55 chr7 85704958 85705227 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 283970 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 246.667-20 chr12 9655296 9655707 + 1.33333 NA intron (NR_046444, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 7454 NR_046444 374443 Hs.569124 NR_002814 ENSG00000256594 LOC374443 - C-type lectin domain family 2 member D pseudogene pseudo 150.667-339 chr6 128750928 128751099 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -132125 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 193.666-21 chr18 27831954 27832129 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 204600 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 198-73 chr17 59256873 59257035 + 1.33333 NA intron (NM_182569, intron 4 of 9) L1ME4a|LINE|L1 36443 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 208-181 chr9 82033682 82033917 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45027 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 333.333-2 chr1 113933347 113933697 + 1.33333 NA intron (NM_001369807, intron 1 of 15) intron (NM_001369807, intron 1 of 15) 3678 NM_001369806 204851 Hs.532363 NM_152696 ENSG00000163349 HIPK1 Myak|Nbak2 homeodomain interacting protein kinase 1 protein-coding 197.333-157 chr3 111010064 111010346 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 59754 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 170-72 chr22 34256643 34256888 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -333877 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 196-141 chr5 20240370 20240618 + 1.33333 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -65057 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 260.333-39 chr3 110922125 110922428 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 147683 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 300.999-4 chr2 147134042 147134357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 547142 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 188.666-38 chr8 114426129 114426322 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -989286 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 216.666-64 chr7 36952679 36952918 + 1.33333 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) intron (NM_001206480, intron 16 of 21) 32314 NM_001039459 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 387.999 chr1 188445540 188445923 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 1002103 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 233.333-18 chr10 58735442 58735782 + 1.33333 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) MIRb|SINE|MIR 20597 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 260-17 chr11 83817581 83817870 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) AluJr4|SINE|Alu -135300 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 216.666-68 chr8 83806199 83806422 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -376477 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 242.666-26 chr22 39412661 39412881 + 1.33333 NA intron (NM_153497, intron 1 of 10) intron (NM_153497, intron 1 of 10) 12991 NM_153497 10454 Hs.507681 NM_006116 ENSG00000100324 TAB1 3'-Tab1|MAP3K7IP1 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 1 protein-coding 322.666-12 chr14 71705844 71706139 + 1.33333 NA intron (NM_001354286, intron 17 of 24) intron (NM_001354286, intron 17 of 24) 119693 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 180.666-18 chr2 117184419 117184573 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -630195 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 168-5 chr1 112963668 112963877 + 1.33333 NA intron (NR_103744, intron 2 of 2) L1M2|LINE|L1 7357 NR_103744 100506392 Hs.418285 NR_103743 ENSG00000226419 SLC16A1-AS1 - SLC16A1 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-179 chr3 42047932 42048130 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -39169 NR_146089 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 195.333-228 chr9 103223757 103224017 + 1.33333 NA intron (NR_121578, intron 7 of 9) L1PA13|LINE|L1 101146 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 221.666-19 chr15 65556593 65556999 + 1.33333 NA exon (NM_016395, exon 4 of 11) exon (NM_016395, exon 4 of 11) 26333 NM_016395 51495 Hs.512973 NM_016395 ENSG00000074696 HACD3 B-IND1|BIND1|HSPC121|PTPLAD1 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 protein-coding 260-89 chr9 32182020 32182260 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -202463 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 142.666-9 chr17 70129546 70129682 + 1.33333 NA intron (NM_001291622, intron 4 of 5) intron (NM_001291622, intron 4 of 5) 24769 NM_001291623 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 345.666-10 chr4 72496439 72496918 + 1.33333 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 72543 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 172-100 chr6 159293326 159293490 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -90123 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 190.333-89 chr3 16481273 16481434 + 1.33333 NA intron (NM_015150, intron 2 of 9) intron (NM_015150, intron 2 of 9) 32346 NM_015150 23180 Hs.98910 NM_015150 ENSG00000131378 RFTN1 MIG2|PIB10|PIG9|RAFTLIN raftlin, lipid raft linker 1 protein-coding 204-50 chr12 55321966 55322231 + 1.33333 NA TTS (NM_001005182) TTS (NM_001005182) 1498 NM_001005182 390321 Hs.553763 NM_001005182 ENSG00000205330 OR6C1 OST267 olfactory receptor family 6 subfamily C member 1 protein-coding 476.999 chr2 58565518 58565937 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 44974 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 216.667-78 chr4 60583827 60584143 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -338634 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 161.333-190 chr3 97146498 97146678 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) L2c|LINE|L2 -293019 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 287.666 chr1 12518476 12518896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11440 NR_003025 677885 Hs.658450 NR_003025 ENSG00000239149 SNORA59A ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59A snoRNA 155.333-76 chr12 39847346 39847537 + 1.33333 NA intron (NM_052885, intron 6 of 9) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 221258 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 242-26 chr14 75531625 75531941 + 1.33333 NA intron (NM_006399, intron 2 of 2) intron (NM_006399, intron 2 of 2) 9314 NM_006399 10538 Hs.509964 NM_006399 ENSG00000156127 BATF B-ATF|BATF1|SFA-2|SFA2 basic leucine zipper ATF-like transcription factor protein-coding 322.667-17 chr3 57599390 57599801 + 1.33333 NA intron (NR_132370, intron 1 of 1) intron (NR_132370, intron 1 of 1) 1806 NR_132370 106144532 Hs.667207 NR_132369 ENSG00000272146 ARF4-AS1 - ARF4 antisense RNA 1 ncRNA 202 chr1 8667081 8667276 + 1.33333 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) intron (NM_001042681, intron 1 of 22) 150462 NM_012102 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 141-96 chr9 22276227 22276363 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -170529 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 179-13 chr10 89564498 89564643 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 28257 NR_029524 406901 NR_029524 ENSG00000198997 MIR107 MIRN107|miR-107 microRNA 107 ncRNA 328.333-6 chr10 53898302 53898864 + 1.33333 NA intron (NM_001354411, intron 27 of 34) intron (NM_001354411, intron 27 of 34) -587647 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 202-68 chr18 12387950 12388152 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -10775 NM_006796 10939 Hs.726355 NM_006796 ENSG00000141385 AFG3L2 SCA28|SPAX5 AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2 protein-coding 257.666-23 chr7 69680171 69680514 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) intron (NM_015570, intron 1 of 18) 81867 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 186.667-71 chr2 105103923 105104289 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1162 NR_110227 101927492 Hs.469537 NR_110227 ENSG00000231851 UTAT33 - uncharacterized LOC101927492 ncRNA 225.666-14 chr2 176682725 176683011 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45114 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 196.333-163 chr7 119839716 119839990 + 1.33333 NA intron (NR_131960, intron 1 of 4) L1MB1|LINE|L1 67522 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 210.666-98 chr7 82066867 82067069 + 1.33333 NA intron (NM_000722, intron 7 of 38) intron (NM_000722, intron 7 of 38) 57791 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 210.666-77 chr4 71404394 71404657 + 1.33333 NA intron (NM_003759, intron 4 of 22) intron (NM_003759, intron 4 of 22) 65472 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 327.666-7 chr4 30496832 30497376 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -223265 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 371.333-3 chr1 186552378 186552767 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -91458 NM_002597 5132 Hs.654381 NM_002597 ENSG00000116703 PDC MEKA|PHD|PhLOP|PhLP phosducin protein-coding 304-3 chr1 107109622 107110085 + 1.33333 NA Intergenic UCON2|DNA?|DNA? -30235 NM_014917 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 142-116 chr5 52552761 52552963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -235054 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 258.333-72 chr8 140433647 140434102 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 4 of 22) MER51A|LTR|ERV1 23870 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 378-26 chr7 103348662 103349210 + 1.33333 NA intron (NM_001204453, intron 1 of 4) L1ME4b|LINE|L1 1293 NM_002803 5701 Hs.437366 NM_002803 ENSG00000161057 PSMC2 MSS1|Nbla10058|S7 proteasome 26S subunit, ATPase 2 protein-coding 212.333-110 chr4 162305120 162305402 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -141227 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 209.333-134 chr21 20365025 20365282 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -106468 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 238.666-30 chr3 180889364 180889752 + 1.33333 NA Intergenic LTR10G|LTR|ERV1 -19380 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 186.667-140 chr7 78796473 78796718 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) L1MA4|LINE|L1 -212393 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 200.666-57 chr2 76068864 76069089 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -358061 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 200.667-143 chr7 2159295 2159539 + 1.33333 NA intron (NM_001013837, intron 10 of 18) L2a|LINE|L2 -70365 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 204.666-11 chr10 43830429 43830586 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -14799 NR_033923 414260 Hs.351856 NR_033923 ENSG00000226808 LINC00619 C10orf136|bA168P8.1 long intergenic non-protein coding RNA 619 ncRNA 222.666-44 chr5 13729621 13729810 + 1.33333 NA intron (NM_001369, intron 68 of 78) intron (NM_001369, intron 68 of 78) 214765 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 243.333-104 chr7 46064190 46064563 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -143104 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 203.333-156 chr20 44173162 44173441 + 1.33333 NA intron (NM_020433, intron 1 of 5) LTR8B|LTR|ERV1 13887 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 170.666-10 chr18 13684477 13684666 + 1.33333 NA intron (NM_152352, intron 1 of 3) L1MC2|LINE|L1 41987 NM_152352 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 195.333-106 chr2 38003683 38003834 + 1.33333 NA intron (NM_001170793, intron 7 of 9) intron (NM_001170793, intron 7 of 9) 32583 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 270.666-25 chr5 104342777 104343066 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -756553 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 223.666-31 chr6 104608456 104608659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 250989 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 220.333-90 chr3 67248389 67248621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23041 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 209-24 chr11 107086963 107087128 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68569 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 358.333-13 chr14 72007390 72007871 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MER30|DNA|hAT-Charlie 74103 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 322.333-7 chr12 25550008 25550536 + 1.33333 NA intron (NM_001352234, intron 1 of 8) intron (NM_001352234, intron 1 of 8) 3011 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 286.333-21 chr2 134914354 134914704 + 1.33333 NA intron (NR_036549, intron 1 of 4) L1MA1|LINE|L1 4077 NR_036549 100129961 Hs.729028 NR_036549 CCNT2-AS1 - CCNT2 antisense RNA 1 ncRNA 116-134 chr6 60650642 60650793 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -923413 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 212.666-90 chr8 64689729 64689959 + 1.33333 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu -107952 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 203-80 chr5 54617417 54617644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 85794 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 160.666-6 chr15 48933812 48934063 + 1.33333 NA intron (NM_203349, intron 1 of 11) L1MB8|LINE|L1 29982 NM_203349 399694 Hs.642615 NM_203349 ENSG00000185634 SHC4 RaLP|SHCD SHC adaptor protein 4 protein-coding 230.333-30 chr12 85226266 85226496 + 1.33333 NA intron (NM_001079910, intron 24 of 26) intron (NM_001079910, intron 24 of 26) -53839 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 208-174 chr8 132757788 132758088 + 1.33333 NA intron (NM_144649, intron 2 of 9) intron (NM_144649, intron 2 of 9) 2644 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 219.666-47 chr8 140523063 140523264 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_012154, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_012154, exon 19 of 19) 11167 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 202.667-85 chr2 200994606 200994859 + 1.33333 NA intron (NM_001321619, intron 8 of 11) AluJr|SINE|Alu -31072 NM_006190 4999 Hs.444870 NM_006190 ENSG00000115942 ORC2 ORC2L origin recognition complex subunit 2 protein-coding 181.333-86 chr2 198497113 198497302 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -122110 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 196-82 chr2 22617436 22617726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 81102 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 286.333-31 chr4 12728985 12729220 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 505651 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 218-7 chr1 193743704 193743938 + 1.33333 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 439076 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 216-14 chr11 11912920 11913213 + 1.33333 NA intron (NM_001282659, intron 8 of 27) L1MD2|LINE|L1 71643 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 168-69 chr3 102187053 102187210 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 23426 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 173.333-150 chr4 148204920 148205120 + 1.33333 NA intron (NM_000901, intron 3 of 8) intron (NM_000901, intron 3 of 8) 237394 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 237.333-31 chr14 68289274 68289562 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 339369 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 234.333-63 chr5 143190938 143191225 + 1.33333 NA intron (NM_001349547, intron 20 of 21) L1MB7|LINE|L1 -1419 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 293.333-22 chr18 4433431 4433813 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 21644 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 119-142 chr8 86897862 86897954 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 2 of 10) L1ME3G|LINE|L1 31493 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 240 chr1 31451369 31451657 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 37700 NM_001199039 347735 Hs.270655 NM_018565 ENSG00000168528 SERINC2 FKSG84|PRO0899|TDE2|TDE2L serine incorporator 2 protein-coding 217-67 chr4 56302080 56302313 + 1.33333 NA intron (NM_020722, intron 4 of 10) intron (NM_020722, intron 4 of 10) 85295 NM_001323890 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 199.667-80 chr2 219134322 219134595 + 1.33333 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) L2|LINE|L2 26407 NM_024782 79840 Hs.225988 NM_024782 ENSG00000187736 NHEJ1 XLF non-homologous end joining factor 1 protein-coding 236-54 chr3 58114807 58115046 + 1.33333 NA intron (NM_001164318, intron 18 of 45) L1MB3|LINE|L1 55709 NR_135534 105377105 Hs.613914 NR_135534 ENSG00000244161 FLNB-AS1 - FLNB antisense RNA 1 ncRNA 202-33 chr12 27651763 27651926 + 1.33333 NA intron (NM_003622, intron 7 of 29) intron (NM_003622, intron 7 of 29) -44603 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 172.333-149 chr5 158956126 158956313 + 1.33333 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 141737 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 176.666-10 chr14 76131751 76131932 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20044 NM_001322031 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 237.667-84 chr9 87173259 87173655 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 24813 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 456.333-12 chr8 123064211 123064958 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8123 NM_001145088 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 208-151 chr6 140056205 140056482 + 1.33333 NA intron (NR_121623, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR -65082 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 315.333-4 chr1 115535446 115535779 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106358 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 227.333-35 chr13 109615967 109616206 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -112188 NR_103846 101409253 Hs.578072 NR_103846 ENSG00000234854 LINC00676 - long intergenic non-protein coding RNA 676 ncRNA 296.667-27 chr2 64589105 64589477 + 1.33333 NA intron (NM_001002243, intron 8 of 8) L1MB7|LINE|L1 -18021 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 145.667-305 chr9 4098366 4098610 + 1.33333 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) intron (NM_001042413, intron 4 of 10) 53695 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 234-7 chr10 58830223 58830464 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001080512, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001080512, exon 21 of 21) 115328 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 775.333 chr21 27387465 27388573 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -334360 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 158.333-352 chrX 79952506 79952649 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -62176 NM_001109879 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 246-63 chr22 26908609 26908836 + 1.33333 NA intron (NR_110540, intron 2 of 2) intron (NR_110540, intron 2 of 2) 5430 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 211-46 chr19 42227697 42227926 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001314033, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001314033, exon 3 of 3) 7499 NM_001314033 116115 Hs.137282 NM_133444 ENSG00000167625 ZNF526 - zinc finger protein 526 protein-coding 231.666-15 chr2 45056896 45057224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47608 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 256.667-32 chr15 67330077 67330413 + 1.33333 NA intron (NM_001322475, intron 3 of 17) intron (NM_001322475, intron 3 of 17) -75047 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 208-33 chr11 112766565 112766743 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -194766 NM_001242607 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 222.333-25 chr12 84645371 84645757 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 267235 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 210.333-21 chr10 132315766 132316083 + 1.33333 NA intron (NM_001318878, intron 1 of 11) L1ME1|LINE|L1 -7974 NM_173575 282974 Hs.469002 NM_173575 ENSG00000165752 STK32C PKE|YANK3 serine/threonine kinase 32C protein-coding 238-110 chrX 115938792 115939136 + 1.33333 NA intron (NR_130730, intron 2 of 2) MER101-int|LTR|ERV1 30147 NR_132337 642776 Hs.634316 NR_130730 ENSG00000235244 DANT2 - DXZ4 associated non-coding transcript 2, distal ncRNA 296.666-28 chr5 22084053 22084339 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 4 of 14) intron (NM_004061, intron 4 of 14) -58156 NR_003921 5369 Hs.247975 NM_031887 ENSG00000168967 PMCHL1 - pro-melanin concentrating hormone like 1 (pseudogene) pseudo 261.333-96 chr6 141030613 141030845 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 346915 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 215-45 chr2 240071079 240071285 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -25110 NM_173351 150681 Hs.626616 NM_173351 ENSG00000178586 OR6B3 OR6B3P|OR6B3Q olfactory receptor family 6 subfamily B member 3 protein-coding 142-101 chr4 47421457 47421564 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 8 of 8) MIR3|SINE|MIR 42192 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 243-45 chr4 77053162 77053411 + 1.33333 NA intron (NM_006835, intron 6 of 6) intron (NM_006835, intron 6 of 6) 21624 NM_001348133 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 353.333-5 chr11 69315089 69315526 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21152 NM_001293294 26579 Hs.523848 NM_138768 ENSG00000172927 MYEOV OCIM myeloma overexpressed protein-coding 230.667-97 chrX 148392091 148392373 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -108385 NM_001169125 2334 Hs.496911 NM_002025 ENSG00000155966 AFF2 FMR2|FMR2P|FRAXE|MRX2|OX19 AF4/FMR2 family member 2 protein-coding 239.333-47 chr18 70152327 70152542 + 1.33333 NA intron (NM_001318520, intron 14 of 47) MIR|SINE|MIR 53253 NM_173630 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 264.666-25 chr22 40105621 40105871 + 1.33333 NA intron (NM_001024843, intron 1 of 23) L1ME3B|LINE|L1 60929 NM_001024843 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 191.333-32 chr11 46500216 46500460 + 1.33333 NA intron (NR_160027, intron 8 of 18) intron (NR_160027, intron 8 of 18) -48449 NR_036117 100422827 NR_036117 ENSG00000265014 MIR3160-1 mir-3160-1 microRNA 3160-1 ncRNA 157.333-364 chr9 99132202 99132389 + 1.33333 NA intron (NM_001130916, intron 2 of 7) intron (NM_001130916, intron 2 of 7) 27182 NM_001130916 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 342.333-5 chr14 37259164 37259578 + 1.33333 NA intron (NM_138731, intron 4 of 13) AluJb|SINE|Alu 61434 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 208.666 chr1 59032716 59032883 + 1.33333 NA intron (NR_110626, intron 2 of 2) intron (NR_110626, intron 2 of 2) 12323 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 266.999 chr11 126821120 126821434 + 1.33333 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) -119469 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 183.333-165 chr8 122164195 122164356 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 404369 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 269.666-11 chr21 21214072 21214337 + 1.33333 NA intron (NM_001352592, intron 2 of 18) intron (NM_001352592, intron 2 of 18) 67042 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 298.666-15 chr5 39826126 39826436 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -226010 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 266-16 chr12 8490693 8491027 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22643 NM_080387 338339 Hs.351811 NM_080387 ENSG00000166527 CLEC4D CD368|CLEC-6|CLEC6|CLECSF8|Dectin-3|MCL|MPCL C-type lectin domain family 4 member D protein-coding 385-10 chr3 46325099 46325576 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28407 NM_001123041 729230 Hs.511794 NM_001123041 ENSG00000121807 CCR2 CC-CKR-2|CCR-2|CCR2A|CCR2B|CD192|CKR2|CKR2A|CKR2B|CMKBR2|MCP-1-R C-C motif chemokine receptor 2 protein-coding 237-59 chr5 30638113 30638473 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -555393 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 287-22 chr3 100816342 100816660 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001365643, exon 39 of 39) 3' UTR (NM_001365643, exon 39 of 39) 106959 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 242.667-40 chr16 69501869 69502198 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 63835 NR_031719 100302119 NR_031719 ENSG00000223109 MIR1538 MIRN1538|hsa-mir-1538 microRNA 1538 ncRNA 133-20 chr12 25713917 25714063 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -65412 NM_001352234 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 286-54 chr7 16476565 16476913 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -11001 NM_015464 25928 Hs.648106 NM_015464 ENSG00000171243 SOSTDC1 CDA019|DAND7|ECTODIN|USAG1 sclerostin domain containing 1 protein-coding 199-81 chr5 43492749 43492956 + 1.33333 NA exon (NM_198566, exon 9 of 13) exon (NM_198566, exon 9 of 13) -8987 NM_022483 64417 Hs.732093 NM_022483 ENSG00000151881 TMEM267 C5orf28 transmembrane protein 267 protein-coding 209-119 chr8 76825470 76825653 + 1.33333 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) 141289 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 260-29 chr17 5448510 5448859 + 1.33333 NA intron (NM_001199699, intron 10 of 10) intron (NM_001199699, intron 10 of 10) -9529 NM_001212 708 Hs.555866 NM_001212 ENSG00000108561 C1QBP COXPD33|GC1QBP|HABP1|SF2AP32|SF2p32|gC1Q-R|gC1qR|p32 complement C1q binding protein protein-coding 206.333-151 chr7 100906079 100906274 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -9182 NR_160407 43 Hs.154495 NM_000665 ENSG00000087085 ACHE ACEE|ARACHE|N-ACHE|YT acetylcholinesterase (Cartwright blood group) protein-coding 204-121 chr21 27179056 27179315 + 1.33333 NA Intergenic (CCATGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -212097 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 180.333-21 chr12 1331468 1331619 + 1.33333 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) L1MEi|LINE|L1 -168948 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 205.333-96 chr17 59907864 59908065 + 1.33333 NA intron (NM_001272044, intron 2 of 15) intron (NM_001272044, intron 2 of 15) 14843 NR_161460 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 217-25 chr16 6635560 6635851 + 1.33333 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -138104 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 338.667-16 chr18 1882533 1883034 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -523154 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 173.666-12 chr3 131302514 131302789 + 1.33333 NA intron (NM_001353043, intron 17 of 17) L1PA15|LINE|L1 -59194 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 219.333-94 chr2 67341264 67341588 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55907 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 202.666-67 chr2 235561745 235561908 + 1.33333 NA intron (NM_001037131, intron 1 of 17) intron (NM_001037131, intron 1 of 17) -43905 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 238-60 chr3 14935875 14936127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11504 NR_046252 100505641 Hs.517821 NR_046251 ENSG00000225733 FGD5-AS1 - FGD5 antisense RNA 1 ncRNA 250.667-80 chr8 98890510 98890877 + 1.33333 NA intron (NM_001256312, intron 1 of 12) intron (NM_001256312, intron 1 of 12) 51917 NM_001256312 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 276.999-4 chr2 11127500 11127829 + 1.33333 NA intron (NR_040080, intron 3 of 8) L1ME4b|LINE|L1 4512 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 204.667-117 chr5 27100630 27100892 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62175 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 246.666-33 chr5 158301103 158301562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 108441 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 254.666-10 chr11 110128183 110128414 + 1.33333 NA intron (NM_033390, intron 1 of 5) intron (NM_033390, intron 1 of 5) 34906 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 163.333-85 chr14 59048713 59048944 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -139839 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 186-109 chrX 115653237 115653477 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59806 NM_001172335 5358 Hs.496622 NM_005032 ENSG00000102024 PLS3 BMND18|T-plastin plastin 3 protein-coding 240.666-36 chr6 104643125 104643358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 216305 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 237-21 chr12 27511318 27511625 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12735 NM_001198915 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 359.333-15 chr20 49823400 49823951 + 1.33333 NA intron (NR_048539, intron 3 of 13) intron (NR_048539, intron 3 of 13) 10847 NR_048539 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 188-63 chr20 10312638 10312790 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93208 NR_040710 100131208 Hs.658178 NR_040710 ENSG00000227906 SNAP25-AS1 - SNAP25 antisense RNA 1 ncRNA 279.333-59 chr4 54383718 54383977 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 50955 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 251.333-60 chr2 173684528 173684873 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 279180 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 215.333-33 chr11 50558084 50558273 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 149031 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 183-60 chr2 114971889 114972125 + 1.33333 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -92566 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 169-75 chr4 107343720 107343909 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -307501 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 189.666-22 chr2 146205369 146205517 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -381614 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 239.333-45 chr18 6965686 6965920 + 1.33333 NA intron (NM_005559, intron 49 of 62) intron (NM_005559, intron 49 of 62) 11126 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 479.333-11 chr8 117215996 117216538 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 81272 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 172.333-110 chr3 63335432 63335679 + 1.33333 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) intron (NM_001130003, intron 2 of 5) 57247 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 328.666 chr1 168939195 168939494 + 1.33333 NA intron (NR_104091, intron 3 of 4) intron (NR_104091, intron 3 of 4) 147661 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 267-75 chr8 122348274 122348664 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 220175 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 308-49 chr6 156239027 156239462 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -139506 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 268.333-39 chr3 107689421 107689880 + 1.33333 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) intron (NM_001276286, intron 3 of 16) 166688 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 236.333-35 chr17 43360098 43360386 + 1.33333 NA Intergenic MER41C|LTR|ERV1 28656 NR_027412 100130581 Hs.546897 NR_027412 ENSG00000188825 LINC00910 - long intergenic non-protein coding RNA 910 ncRNA 181-4 chr10 24859529 24859778 + 1.33333 NA intron (NM_020200, intron 4 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 92953 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 137-40 chr18 73890598 73890819 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 257126 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 142.666-2 chr10 116302868 116303024 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -21502 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 176.333-25 chr10 103822932 103823104 + 1.33333 NA intron (NM_014631, intron 1 of 13) L1ME4b|LINE|L1 32388 NM_014631 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 202.333-36 chr11 74567368 74567536 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25130 NM_006591 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 158.666-11 chr12 13985325 13985532 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -5072 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 215.333-131 chr3 65896502 65896706 + 1.33333 NA intron (NR_046575, intron 1 of 2) AluJr4|SINE|Alu 2788 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 196.333-155 chr6 114793084 114793343 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -730336 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 138-74 chr3 44939973 44940126 + 1.33333 NA intron (NR_146162, intron 3 of 6) intron (NR_146162, intron 3 of 6) 36125 NR_146162 51304 Hs.61430 NM_016598 ENSG00000163812 ZDHHC3 DHHC-3|DHHC3|GODZ|ZNF373 zinc finger DHHC-type containing 3 protein-coding 299.333-74 chr8 107962812 107963108 + 1.33333 NA intron (NM_001282863, intron 2 of 4) intron (NM_001282863, intron 2 of 4) 118979 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 202.333-56 chr14 42604858 42605045 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 998095 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 213-13 chr12 10036333 10036529 + 1.33333 NA intron (NM_207345, intron 1 of 8) intron (NM_207345, intron 1 of 8) 5749 NM_207345 283420 Hs.531189 NM_207345 ENSG00000197992 CLEC9A CD370|DNGR-1|DNGR1|UNQ9341 C-type lectin domain containing 9A protein-coding 204-144 chr4 30599371 30599572 + 1.33333 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -120898 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 214.333-38 chr13 104765638 104765829 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -700134 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 250-27 chr14 46595957 46596186 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 55710 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 228.667-52 chr21 17080469 17080780 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -358266 NR_037585 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 253.333-61 chr2 207522283 207522631 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7505 NR_135473 1385 Hs.516646 NM_004379 ENSG00000118260 CREB1 CREB|CREB-1 cAMP responsive element binding protein 1 protein-coding 209.333-16 chr10 15892274 15892558 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31883 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 138.666-7 chr8 76988551 76988717 + 1.33333 NA intron (NM_001172086, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 11444 NM_000318 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 294-65 chr8 89923425 89923733 + 1.33333 NA intron (NM_001126111, intron 5 of 5) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 21009 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 147.667-46 chr10 112613004 112613243 + 1.33333 NA intron (NM_001365712, intron 6 of 8) intron (NM_001365712, intron 6 of 8) -21047 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 201.333-6 chr1 49367957 49368128 + 1.33333 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) L1MB5|LINE|L1 104043 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 192.667-132 chr4 161642357 161642628 + 1.33333 NA intron (NM_001128428, intron 7 of 14) L1M4c|LINE|L1 -380241 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 295.333-42 chr4 57924967 57925315 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 499269 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 188.333-148 chr7 91932491 91932668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8283 NM_147185 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 201.333-35 chr10 81054980 81055194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 405290 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 259.333-49 chr2 139197235 139197552 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 300069 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 129.333-59 chr13 84807331 84807483 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23753 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 344.666-25 chr6 157785519 157785891 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -37541 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 171-10 chr11 97656818 97657010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1148489 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 158-52 chr15 76415585 76415775 + 1.33333 NA intron (NR_148227, intron 27 of 32) L1ME3Cz|LINE|L1 78907 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 166.666 chr1 79307990 79308142 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -301336 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 220.333-79 chr21 30060028 30060285 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 106649 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 212.666-48 chr2 170179042 170179291 + 1.33333 NA intron (NM_001083615, intron 1 of 33) L1PA8|LINE|L1 1019 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 154.666-18 chr8 80556526 80556683 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70378 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 199.667-116 chr5 71648938 71649213 + 1.33333 NA intron (NM_022132, intron 13 of 16) intron (NM_022132, intron 13 of 16) 61735 NM_001363147 64087 Hs.604789 NM_022132 ENSG00000131844 MCCC2 MCCB methylcrotonoyl-CoA carboxylase 2 protein-coding 185.333-167 chr6 80393856 80394103 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 287308 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 253.666-11 chr2 124433216 124433569 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 4 of 23) intron (NM_130773, intron 4 of 23) 408105 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 296-54 chr5 94128196 94128515 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -16656 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 176.666-28 chr6 35863016 35863167 + 1.33333 NA intron (NM_003137, intron 12 of 15) AluJo|SINE|Alu 57739 NM_182548 222662 Hs.367947 NM_182548 ENSG00000197753 LHFPL5 DFNB67|TMHS|dJ510O8.8 LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein-coding 250.667-21 chr14 74758417 74758761 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -4727 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 280.999-7 chr5 21247986 21248360 + 1.33333 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -211307 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 227-53 chr7 1215139 1215450 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -17578 NM_001080461 340260 NM_001080461 ENSG00000164853 UNCX UNCX4.1 UNC homeobox protein-coding 234-68 chr8 50340411 50340661 + 1.33333 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) L1MCa|LINE|L1 176405 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 164-36 chr14 58117744 58117895 + 1.33333 NA intron (NM_001320173, intron 4 of 4) AluJr|SINE|Alu 34394 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 666.332 chr11 77540484 77541531 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30082 NR_130930 646029 Hs.609654 NM_001039908 LOC646029 - uncharacterized LOC646029 ncRNA 214-81 chr20 52094624 52094811 + 1.33333 NA intron (NM_199427, intron 7 of 8) AluJr|SINE|Alu 10767 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 291.333-20 chr13 80901596 80901887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116650 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 181.333-63 chr18 3271855 3272020 + 1.33333 NA intron (NM_001144945, intron 1 of 3) FLAM_C|SINE|Alu 9218 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 185.333-89 chr2 64132262 64132532 + 1.33333 NA intron (NM_020651, intron 1 of 6) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 12023 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 288.666-39 chr8 76566190 76566491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -114907 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 501.332-2 chr7 5035766 5036386 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9784 NM_001204513 100533952 NM_001204513 ENSG00000272968 RBAK-RBAKDN RBAK|RBAK-LOC389458|ZNF769|hRBaK RBAK-RBAKDN readthrough protein-coding 207.333-54 chr11 82893165 82893359 + 1.33333 NA intron (NM_199418, intron 1 of 9) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 7168 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 208-34 chr12 3124441 3124730 + 1.33333 NA intron (NM_006675, intron 2 of 8) AluSp|SINE|Alu 47206 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 183-77 chr3 122377514 122377748 + 1.33333 NA intron (NM_001017928, intron 1 of 4) AluJr4|SINE|Alu 5600 NM_001308326 131076 Hs.220594 NM_001017928 ENSG00000160124 CCDC58 - coiled-coil domain containing 58 protein-coding 293.333-18 chr17 35044703 35045003 + 1.33333 NA intron (NR_037713, intron 1 of 6) intron (NR_037713, intron 1 of 6) 18854 NM_001017368 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 324.333-20 chr17 78867052 78867420 + 1.33333 NA intron (NM_003255, intron 3 of 4) AluSx|SINE|Alu -26709 NM_001321291 57602 Hs.464243 NM_025090 ENSG00000055483 USP36 DUB1 ubiquitin specific peptidase 36 protein-coding 260.666-11 chr15 89027008 89027255 + 1.33333 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -61325 NM_152924 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 186-26 chr13 26283079 26283250 + 1.33333 NA intron (NM_001318368, intron 1 of 12) L1PB3|LINE|L1 29035 NM_001260 1024 Hs.382306 NM_001260 ENSG00000132964 CDK8 K35 cyclin dependent kinase 8 protein-coding 201.667-58 chr2 134374597 134374860 + 1.33333 NA intron (NM_001371457, intron 11 of 16) AluJb|SINE|Alu 120656 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 164.333-91 chr17 56030054 56030315 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -123291 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 230.333-88 chr5 4100251 4100550 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 504568 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 248-28 chr15 94960625 94960885 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 105392 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 301.999-4 chr7 6344679 6344968 + 1.33333 NA intron (NM_001037163, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 4144 NM_001037163 84792 Hs.696146 NM_001037163 ENSG00000286075 FAM220A ACPIN1|C7orf70|SIPAR family with sequence similarity 220 member A protein-coding 315.333-7 chr12 71565088 71565539 + 1.33333 NA intron (NR_110596, intron 8 of 19) MIRb|SINE|MIR 98535 NM_144982 196441 Hs.245798 NM_144982 ENSG00000133858 ZFC3H1 CCDC131|CSRC2|PSRC2 zinc finger C3H1-type containing protein-coding 206.666-58 chr2 75805334 75805547 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -94525 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 217.667-11 chr10 51952874 51953207 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) intron (NM_001098512, intron 5 of 17) -253445 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 203.666-56 chr9 22900468 22900711 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 254389 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 228.333-49 chr2 103399302 103399572 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -415008 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 227-59 chr8 104416991 104417345 + 1.33333 NA intron (NM_001385, intron 7 of 9) intron (NM_001385, intron 7 of 9) 49887 NM_001385 1807 Hs.443161 NM_001385 ENSG00000147647 DPYS DHP|DHPase dihydropyrimidinase protein-coding 300.667-34 chr5 26763430 26763864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 274939 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 206.666-65 chr2 229115457 229115648 + 1.33333 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) intron (NM_001330157, intron 1 of 1) 116540 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 457.666 chr2 77378815 77379244 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1MEd|LINE|L1 143347 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 204-189 chr8 28597157 28597420 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92106 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 177-16 chr12 47687697 47687850 + 1.33333 NA intron (NM_024604, intron 8 of 16) intron (NM_024604, intron 8 of 16) 18257 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 233.333-12 chr1 235346686 235347021 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18283 NR_036605 9453 Hs.730768 NM_004837 ENSG00000152904 GGPS1 GGPPS|GGPPS1 geranylgeranyl diphosphate synthase 1 protein-coding 146-107 chr5 77240760 77240950 + 1.33333 NA intron (NM_001029853, intron 1 of 20) intron (NM_001029853, intron 1 of 20) 30175 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 360.666-15 chr7 68970281 68970587 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 627190 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 196.333-57 chr16 52554262 52554514 + 1.33333 NA intron (NR_033920, intron 3 of 3) intron (NR_033920, intron 3 of 3) -6586 NM_001146188 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 165.333-41 chr11 24156484 24156707 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -340458 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 223-37 chr2 140764296 140764648 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 35 of 90) MIR3|SINE|MIR -177787 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 215-44 chr2 237070405 237070625 + 1.33333 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -14348 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 201.667-3 chr1 177259535 177259801 + 1.33333 NA intron (NM_021165, intron 4 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 88710 NM_021165 57795 Hs.495918 NM_021165 ENSG00000198797 BRINP2 DBCCR1L2|FAM5B BMP/retinoic acid inducible neural specific 2 protein-coding 211.666-48 chr7 46493169 46493429 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 203823 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 200.667-30 chr11 33953340 33953609 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -61398 NM_005574 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 244.999-2 chr2 98737313 98737612 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6330 NM_012214 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 274.667-47 chr6 56963418 56963768 + 1.33333 NA intron (NM_001318539, intron 1 of 3) intron (NM_001318539, intron 1 of 3) 8486 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 412.333 chr1 14179848 14180276 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 239911 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 207.999-7 chr8 110329818 110329975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -354125 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 378.333-5 chr2 77810211 77810663 + 1.33333 NA intron (NR_110288, intron 3 of 3) intron (NR_110288, intron 3 of 3) -105497 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 206.666-99 chr5 97730027 97730182 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -110654 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 453.666 chr2 196626928 196627368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12567 NM_001080539 284992 Hs.132519 NM_173466 ENSG00000144395 CCDC150 - coiled-coil domain containing 150 protein-coding 333-4 chr1 174860699 174861239 + 1.33333 NA intron (NM_001366446, intron 19 of 25) L1MA9|LINE|L1 -13417 NM_001243763 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 169-26 chr14 58489940 58490089 + 1.33333 NA intron (NM_001329944, intron 24 of 31) L1ME4a|LINE|L1 50333 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 220-46 chr17 15167227 15167559 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61206 NR_103559 94151 Hs.98684 NR_103559 CDRT8 - CMT1A duplicated region transcript 8 ncRNA 302-11 chr11 29633911 29634257 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15282 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 272.666-28 chr8 112801714 112801960 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 10 of 66) intron (NM_001363185, intron 10 of 66) 158344 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 204.666-108 chr8 126845085 126845302 + 1.33333 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -167961 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 200.333-127 chr5 122894441 122894772 + 1.33333 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) intron (NM_014035, intron 1 of 6) 48993 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 324-8 chr14 78156067 78156425 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14127 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 227.666-6 chr10 126989252 126989526 + 1.33333 NA intron (NM_001290223, intron 5 of 51) AluJr|SINE|Alu 83980 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 264.333-27 chr16 48690312 48690538 + 1.33333 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -80245 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 224.333-71 chr20 37098660 37098897 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2781 NM_002895 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 219.999 chr1 181069882 181070061 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18729 NM_016545 51278 Hs.15725 NM_016545 ENSG00000162783 IER5 SBBI48 immediate early response 5 protein-coding 283.667-15 chr2 29060179 29060671 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_199280, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_199280, exon 20 of 20) 14098 NM_001029883 388939 Hs.354243 NM_001029883 ENSG00000179270 PCARE C2orf71|RP54 photoreceptor cilium actin regulator protein-coding 154-40 chr12 66964032 66964244 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 132146 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 150.666-9 chr18 12806358 12806508 + 1.33333 NA intron (NM_080423, intron 7 of 8) L1MA6|LINE|L1 34529 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 208-52 chr14 70702709 70702976 + 1.33333 NA intron (NR_125769, intron 2 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 4144 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 269.999-3 chr11 78150867 78151184 + 1.33333 NA intron (NR_102281, intron 2 of 2) intron (NR_102281, intron 2 of 2) 11232 NR_102280 100289388 Hs.628183 NM_203432 ENSG00000246174 KCTD21-AS1 - KCTD21 antisense RNA 1 ncRNA 361.999-3 chr17 17768060 17768524 + 1.33333 NA intron (NM_030665, intron 2 of 5) MER45A|DNA|hAT-Tip100 -1990 NR_130894 100861516 Hs.624874 NR_130894 ENSG00000237328 RAI1-AS1 - RAI1 antisense RNA 1 ncRNA 297.667-8 chr11 87234023 87234455 + 1.33333 NA intron (NR_033149, intron 4 of 13) L2a|LINE|L2 196305 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 232.666-4 chr1 212864837 212865047 + 1.33333 NA intron (NM_014053, intron 2 of 9) intron (NM_014053, intron 2 of 9) 6667 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 188.333-115 chr4 181342382 181342628 + 1.33333 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -77476 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 267-60 chr7 21459386 21459696 + 1.33333 NA intron (NM_003112, intron 3 of 5) intron (NM_003112, intron 3 of 5) -11517 NR_031594 100302122 NR_031594 ENSG00000221783 MIR1183 MIRN1183|hsa-mir-1183 microRNA 1183 ncRNA 198.666-88 chr7 109914626 109914786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45507 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 240-62 chr3 35079313 35079638 + 1.33333 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 314548 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 167.333-139 chr2 121657871 121658059 + 1.33333 NA intron (NR_037857, intron 2 of 3) L1M4|LINE|L1 7976 NR_037856 254128 Hs.712685 NR_037856 ENSG00000236859 NIFK-AS1 - NIFK antisense RNA 1 ncRNA 195.333-177 chr5 68810810 68810979 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 219033 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 200.333-3 chr1 74488933 74489216 + 1.33333 NA intron (NM_001364666, intron 1 of 3) intron (NM_001364666, intron 1 of 3) -5634 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 216.666-32 chr16 60661858 60662027 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -302149 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 257-24 chr18 21180271 21180556 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61829 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 257.666-12 chr2 212456419 212456735 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) -30217 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 347-2 chr10 74839842 74840441 + 1.33333 NA intron (NM_001370137, intron 2 of 17) L3|LINE|CR1 13541 NM_001370142 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 217.666-30 chr3 148527398 148527618 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -170363 NM_009585 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 196-164 chr7 2856201 2856378 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11981 NM_007353 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 184-127 chrX 73992448 73992681 + 1.33333 NA intron (NR_024582, intron 2 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 48240 NR_024582 554203 Hs.648316 NR_024582 ENSG00000225470 JPX DCBALD06|ENOX|LINC00183|NCRNA00183 JPX transcript, XIST activator ncRNA 211.666-36 chr3 114951702 114951891 + 1.33333 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) L1MEf|LINE|L1 -51171 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 205.666-4 chr1 118680851 118681047 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 307394 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 200.666-43 chr15 60308381 60308607 + 1.33333 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL 89492 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 259.666-28 chr5 11313172 11313586 + 1.33333 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 275538 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 135.333-119 chr3 108594157 108594308 + 1.33333 NA intron (NM_014648, intron 1 of 32) L1MD|LINE|L1 4510 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 240-75 chr5 105892798 105893043 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 793446 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 300-26 chr17 48516699 48517042 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 14141 NM_002144 3211 Hs.99992 NM_002144 ENSG00000120094 HOXB1 HCFP3|HOX2|HOX2I|Hox-2.9 homeobox B1 protein-coding 243.666-10 chr14 45378191 45378468 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125127 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 210.666-92 chr6 126898841 126899009 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -219746 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 214.666-66 chr7 62657268 62657449 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 646698 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 236.666-48 chr8 105065628 105065916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -252666 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 197.333-151 chr3 94021215 94021365 + 1.33333 NA intron (NM_001001850, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 7307 NM_001001850 415117 Hs.679768 NM_001001850 ENSG00000178750 STX19 - syntaxin 19 protein-coding 199.667-100 chr4 6808425 6808674 + 1.33333 NA intron (NM_014743, intron 2 of 9) intron (NM_014743, intron 2 of 9) 25817 NM_001100590 9778 Hs.79276 NM_014743 ENSG00000170871 KIAA0232 - KIAA0232 protein-coding 233.666-9 chr14 61542364 61542573 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 12 of 13) FLAM_A|SINE|Alu 27726 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 116-35 chr14 46837714 46837852 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -186002 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 381-12 chr5 8191790 8192274 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 265532 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 309.666-10 chr2 226830943 226831199 + 1.33333 NA intron (NM_001349069, intron 3 of 8) L1ME2z|LINE|L1 -4983 NM_001167608 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 200.333-96 chr3 117481938 117482115 + 1.33333 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 208899 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 205.333-226 chr7 105416451 105416610 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -27140 NM_001350742 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 196.666-87 chr5 144128207 144128445 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 42333 NM_001271732 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 344-41 chr7 82729175 82729522 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -285392 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 202.666-2 chr1 86718932 86719094 + 1.33333 NA intron (NM_016009, intron 2 of 8) intron (NM_016009, intron 2 of 8) 14437 NM_001206652 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 167-31 chr12 50143091 50143361 + 1.33333 NA intron (NR_138536, intron 3 of 10) intron (NR_138536, intron 3 of 10) 24143 NM_001331071 91012 Hs.270525 NM_147190 ENSG00000139624 CERS5 LASS5|Trh4 ceramide synthase 5 protein-coding 158-13 chr10 82948859 82949081 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) L1ME1|LINE|L1 -716050 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 288.667-27 chr5 130368659 130369010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 464369 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 322-30 chr4 116601752 116602093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 302197 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 232 chr1 40379155 40379476 + 1.33333 NA intron (NM_001198978, intron 1 of 9) L1ME4b|LINE|L1 4682 NM_001198978 64744 Hs.15200 NM_022733 ENSG00000084070 SMAP2 SMAP1L small ArfGAP2 protein-coding 211.666-50 chr8 82761256 82761500 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -150726 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 204-6 chr1 71102958 71103135 + 1.33333 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) intron (NR_046217, intron 2 of 3) 21722 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 206.667-40 chr14 83279840 83280135 + 1.33333 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL 637355 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 206.333-4 chr1 82421554 82421736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -481538 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 235-37 chr21 29123658 29124001 + 1.33333 NA intron (NM_001371376, intron 1 of 3) L1MC5|LINE|L1 1839 NM_001371370 224.333-107 chr6 4574913 4575090 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -35564 NR_122107 497048 Hs.591355 NM_001011540 ENSG00000205444 KU-MEL-3 - uncharacterized LOC497048 ncRNA 265.333-45 chr2 200384224 200384608 + 1.33333 NA intron (NM_001282743, intron 2 of 11) AluY|SINE|Alu 75466 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 370-23 chr7 3816485 3816978 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -312954 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 231.666-16 chr2 184863179 184863454 + 1.33333 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 264787 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 286.666-19 chr8 67460695 67461002 + 1.33333 NA intron (NR_136224, intron 2 of 4) intron (NR_136224, intron 2 of 4) 117014 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 302.666-23 chr7 41563917 41564374 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -129774 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 194.666 chr1 168307737 168307892 + 1.33333 NA intron (NM_005149, intron 6 of 7) L1MA9|LINE|L1 26937 NM_005149 9095 Hs.716656 NM_005149 ENSG00000143178 TBX19 TBS19|TPIT|dJ747L4.1 T-box transcription factor 19 protein-coding 177.333-116 chr3 189399059 189399251 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -158561 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 310.666-9 chr18 32679056 32679366 + 1.33333 NA intron (NM_020805, intron 7 of 8) intron (NM_020805, intron 7 of 8) 93812 NM_020805 57565 Hs.446164 NM_020805 ENSG00000197705 KLHL14 - kelch like family member 14 protein-coding 240-46 chr2 82435544 82435870 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -421096 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 165.333-230 chr6 99814583 99814785 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -179354 NR_038384 728012 Hs.434366 NR_038384 ENSG00000229315 MCHR2-AS1 - MCHR2 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-16 chr10 72649099 72649330 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -23023 NM_001363513 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 305.333-54 chr4 172681730 172681996 + 1.33333 NA intron (NR_125894, intron 1 of 2) intron (NR_125894, intron 1 of 2) 7054 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 482.999 chr2 64929241 64929877 + 1.33333 NA intron (NR_036586, intron 1 of 2) intron (NR_036586, intron 1 of 2) 2888 NR_036586 400958 Hs.591565 NR_036586 LINC02245 - long intergenic non-protein coding RNA 2245 ncRNA 318-28 chr2 114967590 114967953 + 1.33333 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -96802 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 234.667-69 chr3 98051256 98051584 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -16116 NM_001105580 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 294.666-24 chr3 188475739 188475983 + 1.33333 NA intron (NM_001167672, intron 2 of 9) AluY|SINE|Alu 92805 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 215.333-195 chr8 77279576 77279878 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -170970 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 268-28 chr19 1676559 1676960 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24144 NM_001351779 6929 Hs.371282 NM_003200 ENSG00000071564 TCF3 AGM8|E2A|E47|ITF1|TCF-3|VDIR|bHLHb21|p75 transcription factor 3 protein-coding 197.666-37 chr20 39075832 39076016 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 113580 NM_021931 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 208.999-4 chr2 19471566 19471724 + 1.33333 NA Intergenic X2_LINE|LINE|CR1 -113022 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 385.666-5 chr3 34247761 34248233 + 1.33333 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR 449367 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 206.666-69 chr21 23450004 23450178 + 1.33333 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -65256 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 183.666-7 chr18 43154171 43154357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38572 NM_001272077 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 278.666-7 chr12 14490350 14490729 + 1.33333 NA intron (NM_181352, intron 13 of 14) HERVL-int|LTR|ERVL -77193 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 224-20 chr13 48398758 48399010 + 1.33333 NA intron (NM_000321, intron 17 of 26) intron (NM_000321, intron 17 of 26) 14229 NM_001162498 10161 Hs.123464 NM_005767 ENSG00000139679 LPAR6 ARWH1|HYPT8|LAH3|P2RY5|P2Y5 lysophosphatidic acid receptor 6 protein-coding 459.999-2 chr2 74066018 74066411 + 1.33333 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) L1MC5a|LINE|L1 63522 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 203.333-59 chr12 118205659 118205921 + 1.33333 NA intron (NM_001346490, intron 12 of 21) AluSx|SINE|Alu -15255 NM_001346497 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 185-30 chr18 6627246 6627455 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102366 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 198.666-18 chr12 98494144 98494304 + 1.33333 NA intron (NR_038383, intron 2 of 3) AluSq|SINE|Alu 9631 NR_038383 643770 Hs.129589 NR_038383 ENSG00000245017 LINC02453 - long intergenic non-protein coding RNA 2453 ncRNA 196.333-51 chr15 67371180 67371365 + 1.33333 NA intron (NM_001031715, intron 8 of 20) intron (NM_001031715, intron 8 of 20) -116074 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 152.667-74 chr12 13906837 13907036 + 1.33333 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 73420 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 207-117 chr8 79001184 79001353 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 163739 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 230.333-61 chr2 59105324 59105566 + 1.33333 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL -112263 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 152.667-95 chr13 47233846 47234064 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -336879 NM_001165947 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 299.667-27 chr5 34681540 34681928 + 1.33333 NA intron (NM_001145520, intron 1 of 17) AluJr|SINE|Alu -2773 NM_001145521 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 191.333-131 chr3 31376270 31376540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -156520 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 243.666-41 chr8 48733694 48733919 + 1.33333 NA intron (NM_024593, intron 1 of 5) intron (NM_024593, intron 1 of 5) 1462 NM_001363974 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 159.333-31 chr1 235829363 235829574 + 1.33333 NA intron (NR_102436, intron 3 of 3) intron (NR_102436, intron 3 of 3) 23592 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 295.333-9 chr13 53892631 53893026 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 77409 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 185.333-83 chr2 49954607 49954933 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) 19433 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 436-13 chr8 121866408 121867024 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -225276 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 243.333-105 chr7 50839737 50840076 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46453 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 254.333-46 chr2 176686778 176687176 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49223 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 185.666-11 chr15 86096324 86096581 + 1.33333 NA intron (NR_120368, intron 3 of 5) MER113|DNA|hAT-Charlie 16832 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 315-2 chr10 32903542 32903869 + 1.33333 NA intron (NM_002211, intron 15 of 15) intron (NM_002211, intron 15 of 15) -2233 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 252.666-41 chr6 124701344 124701616 + 1.33333 NA intron (NM_001040214, intron 4 of 6) intron (NM_001040214, intron 4 of 6) -261065 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 188.666-8 chr11 41000509 41000700 + 1.33333 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) MER102c|DNA|hAT-Charlie 459032 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 134-79 chr4 51977689 51977900 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 42569 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 391.333-13 chr3 1540364 1541123 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 447719 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 294.666-12 chr15 63114081 63114534 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7554 NM_001288585 114294 Hs.410388 NM_032857 ENSG00000103642 LACTB G24|MRPL56 lactamase beta protein-coding 219.333-63 chr15 101814177 101814371 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3913 NM_001001674 390649 Hs.554589 NM_001001674 ENSG00000182854 OR4F15 - olfactory receptor family 4 subfamily F member 15 protein-coding 312.667-31 chr5 40395182 40395582 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -284533 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 209.667-68 chr2 122541877 122542156 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 531465 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 231-70 chr9 106858948 106859275 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4055 NM_021224 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 180-101 chr7 52828731 52829096 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -206720 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 186.333-124 chr5 61582628 61582884 + 1.33333 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -55004 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 206.666-4 chr1 56606278 56606442 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -26797 NM_003713 8613 Hs.405156 NM_003713 ENSG00000162407 PLPP3 Dri42|LPP3|PAP2B|PPAP2B|VCIP phospholipid phosphatase 3 protein-coding 292-43 chr5 140991324 140991796 + 1.33333 NA intron (NM_018911, intron 3 of 3) MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR 24793 NM_031883 56134 Hs.199343 NM_018899 ENSG00000243232 PCDHAC2 PCDH-ALPHA-C2 protocadherin alpha subfamily C, 2 protein-coding 206.666-101 chr5 117347191 117347389 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68222 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 197-63 chr2 216173135 216173369 + 1.33333 NA intron (NM_021141, intron 16 of 20) L1M4|LINE|L1 -43637 NR_037701 150967 Hs.56876 NM_001199924 ENSG00000260804 LINC01963 PKI55 long intergenic non-protein coding RNA 1963 ncRNA 176-16 chr10 129853649 129853810 + 1.33333 NA intron (NM_001005463, intron 10 of 15) intron (NM_001005463, intron 10 of 15) -10355 NR_036179 100422873 NR_036179 ENSG00000266676 MIR4297 - microRNA 4297 ncRNA 225-65 chr8 110384927 110385163 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -409274 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 253.333-53 chr2 74287740 74288027 + 1.33333 NA intron (NM_133478, intron 7 of 30) intron (NM_133478, intron 7 of 30) 27142 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 313-23 chr22 39406976 39407366 + 1.33333 NA intron (NM_153497, intron 1 of 10) L3|LINE|CR1 7391 NM_153497 10454 Hs.507681 NM_006116 ENSG00000100324 TAB1 3'-Tab1|MAP3K7IP1 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 1 protein-coding 358.666-19 chr8 120618151 120618557 + 1.33333 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 -142899 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 216.666-30 chr15 37555846 37556014 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -378677 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 194.666-9 chr11 99259762 99260060 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) L1ME3G|LINE|L1 238962 NM_001243270 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 195-83 chr5 36399950 36400131 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -98138 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 165-36 chr2 55674632 55674848 + 1.33333 NA intron (NM_033109, intron 8 of 27) L1MDa|LINE|L1 19104 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 257-59 chr6 47573040 47573383 + 1.33333 NA intron (NM_012120, intron 5 of 17) intron (NM_012120, intron 5 of 17) -83261 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 163.666-7 chr2 45715865 45716103 + 1.33333 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 64309 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 213.666-18 chr15 85397240 85397458 + 1.33333 NA intron (NM_007200, intron 1 of 36) intron (NM_007200, intron 1 of 36) 16746 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 199.333-303 chr9 93637793 93637986 + 1.33333 NA intron (NM_005392, intron 3 of 21) L1MB8|LINE|L1 43048 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 243.333-7 chr1 199911999 199912223 + 1.33333 NA Intergenic Charlie17|DNA|hAT-Charlie -115599 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 134-44 chr19 8347732 8347877 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -4542 NM_198471 256949 Hs.745036 NM_198471 ENSG00000186994 KANK3 ANKRD47 KN motif and ankyrin repeat domains 3 protein-coding 216-63 chr2 156700956 156701128 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 264663 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 132-124 chr9 84972451 84972646 + 1.33333 NA intron (NM_001018064, intron 16 of 17) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 266647 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 375.333-8 chr15 94636693 94637135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -218449 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 196.667-174 chr9 97897821 97898098 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 24611 NM_001330725 51531 Hs.9196 NM_016481 ENSG00000136932 TRMO C9orf156|HSPC219|NAP1 tRNA methyltransferase O protein-coding 162-52 chr17 39853367 39853515 + 1.33333 NA intron (NM_012481, intron 1 of 7) intron (NM_012481, intron 1 of 7) 10747 NM_001284514 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 178-29 chr11 88376009 88376217 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -38377 NM_001814 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 172.666-22 chr5 44029185 44029334 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -359473 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 215.999-2 chr13 85038611 85038777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109363 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 202.333-176 chr8 85020976 85021282 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -86109 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 217-49 chr2 186055097 186055302 + 1.33333 NA intron (NR_110218, intron 3 of 5) intron (NR_110218, intron 3 of 5) 31118 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 208-157 chr7 33008781 33008992 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 29412 NM_001284343 11328 Hs.103934 NM_007270 ENSG00000122642 FKBP9 FKBP60|FKBP63|PPIase FKBP prolyl isomerase 9 protein-coding 310.999-4 chr9 35032218 35032628 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -8672 NM_001040412 138724 Hs.148250 NM_203299 ENSG00000174038 C9orf131 - chromosome 9 open reading frame 131 protein-coding 380.333-3 chr14 31652173 31652504 + 1.33333 NA intron (NM_001201573, intron 2 of 8) L1MA8|LINE|L1 -62231 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 330.666-24 chr8 139440223 139440521 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 262751 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 113.333-47 chr11 70373179 70373346 + 1.33333 NA intron (NR_045286, intron 24 of 28) AluJo|SINE|Alu -25244 NM_138565 2017 Hs.596164 NM_005231 ENSG00000085733 CTTN EMS1 cortactin protein-coding 193-80 chr6 9935356 9935630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -469009 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 252.666-13 chr14 69530280 69530612 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001161498, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001161498, exon 13 of 13) 44425 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 205.333-71 chr14 51814880 51815155 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -45595 NM_001243773 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 201-2 chr1 59028639 59028924 + 1.33333 NA intron (NR_110626, intron 2 of 2) intron (NR_110626, intron 2 of 2) 8305 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 282.667-51 chr8 144205198 144205606 + 1.33333 NA intron (NM_001288814, intron 11 of 41) L1M8|LINE|L1 56757 NM_001288814 727957 Hs.443139 NM_032450 ENSG00000179832 MROH1 HEATR7A maestro heat like repeat family member 1 protein-coding 203.666-57 chr9 31117779 31118000 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 263601 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 164.333-72 chr15 23995437 23995590 + 1.33333 NA intron (NR_126392, intron 3 of 5) LTR10B1|LTR|ERV1 20366 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 226.333-103 chr8 29323193 29323462 + 1.33333 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite 25478 NM_057158 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 193.666-51 chr9 115884885 115885127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40201 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 202.666-65 chr2 187149317 187149516 + 1.33333 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 298836 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 200.333-148 chr8 46493211 46493458 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 124309 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 224.333-26 chr11 78837846 78838163 + 1.33333 NA intron (NM_001098816, intron 12 of 33) L1ME4c|LINE|L1 -263140 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 168.666-18 chr5 148313636 148313809 + 1.33333 NA intron (NM_032566, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 1299 NM_032566 84651 Hs.244569 NM_032566 ENSG00000145879 SPINK7 ECG2|ECRG2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 7 (putative) protein-coding 363.333-13 chr16 81758515 81759055 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -20506 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 232.333-31 chr16 67776707 67777030 + 1.33333 NA intron (NM_001320238, intron 1 of 12) L1M3|LINE|L1 29692 NM_001320239 57610 Hs.368569 NM_020850 ENSG00000141084 RANBP10 - RAN binding protein 10 protein-coding 200.666-111 chr7 13942523 13942730 + 1.33333 NA intron (NM_001163148, intron 5 of 12) L1PREC2|LINE|L1 43888 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 400.333-18 chr6 112992526 112993017 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 440676 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 197.666-7 chr10 112679997 112680203 + 1.33333 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) 45930 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 207.666-40 chr4 29113198 29113355 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101016 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 160.333-306 chrX 78063669 78063882 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40473 NM_000291 5230 Hs.78771 NM_000291 ENSG00000102144 PGK1 HEL-S-68p|MIG10|PGKA phosphoglycerate kinase 1 protein-coding 322.666-22 chr7 67908557 67908821 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -111564 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 178.666-22 chr7 2114417 2114601 + 1.33333 NA intron (NM_001013837, intron 11 of 18) intron (NM_001013837, intron 11 of 18) -25457 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 201.333-253 chr6 163292608 163292764 + 1.33333 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) AluSx1|SINE|Alu 31787 NR_028390 285796 Hs.668693 NR_028390 ENSG00000281692 PACRG-AS1 - PACRG antisense RNA 1 ncRNA 219.667-41 chr2 84036941 84037217 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -253603 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 209.333-179 chr4 162123865 162124022 + 1.33333 NA intron (NM_001128428, intron 1 of 14) intron (NM_001128428, intron 1 of 14) 40057 NM_020116 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 194.666-42 chr3 79072039 79072248 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) -52684 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 189.333-76 chr17 69277541 69277787 + 1.33333 NA exon (NM_172232, exon 19 of 39) exon (NM_172232, exon 19 of 39) -32849 NM_080282 10349 Hs.25377 NM_080282 ENSG00000154263 ABCA10 EST698739 ATP binding cassette subfamily A member 10 protein-coding 201.333-260 chr7 32200073 32200249 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 2 of 17) L1MEd|LINE|L1 99167 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 216-93 chr5 24281609 24281920 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 330416 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 205.333-251 chr8 124769197 124769358 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40770 NM_001282974 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 124.667-105 chr2 124968306 124968510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 943121 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 198.666-55 chr22 42364853 42365065 + 1.33333 NA non-coding (NR_120595, exon 2 of 2) non-coding (NR_120595, exon 2 of 2) 4249 NR_120597 102723775 Hs.335413 NR_120595 ENSG00000229891 LINC01315 C22orf32-1|lnc-C22orf32-1 long intergenic non-protein coding RNA 1315 ncRNA 386-8 chr3 36687121 36687594 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 52504 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 177.667-92 chr3 132928552 132928751 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -109637 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 182-30 chr14 65479397 65479550 + 1.33333 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) L1M5|LINE|L1 8371 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 165.333-225 chr6 64384530 64384713 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 577785 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 205.667-114 chr5 109044953 109045245 + 1.33333 NA intron (NR_146155, intron 15 of 19) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 120493 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 230.666-41 chr4 99828817 99829025 + 1.33333 NA intron (NM_001306151, intron 1 of 9) intron (NM_001306151, intron 1 of 9) 12094 NM_014395 27071 Hs.436271 NM_014395 ENSG00000070190 DAPP1 BAM32 dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 protein-coding 209.667-83 chr3 59142423 59142773 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92566 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 368.666-18 chr8 100496340 100496643 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63268 NM_198401 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 279-16 chr2 96229882 96230269 + 1.33333 NA intron (NR_046322, intron 1 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 15436 NR_145789 109623481 NR_145789 SNORA112 - small nucleolar RNA, H/ACA box 112 snoRNA 289.333-61 chr8 69739731 69740149 + 1.33333 NA intron (NM_030958, intron 4 of 9) intron (NM_030958, intron 4 of 9) 93229 NM_001146009 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 221.333-11 chr10 28457504 28457817 + 1.33333 NA intron (NR_134496, intron 1 of 2) L1MB1|LINE|L1 38153 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 243.666 chr1 95575641 95575995 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65702 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 205.333-7 chr1 43887140 43887304 + 1.33333 NA intron (NR_073018, intron 6 of 10) intron (NR_073018, intron 6 of 10) -46098 NM_057090 9048 Hs.632404 NM_003976 ENSG00000117407 ARTN ART|ENOVIN|EVN|NBN artemin protein-coding 177.333-97 chr20 32299123 32299312 + 1.33333 NA intron (NM_004798, intron 1 of 8) MER58A|DNA|hAT-Charlie 21566 NM_004798 9371 Hs.369670 NM_004798 ENSG00000101350 KIF3B FLA8|HH0048|KLP-11 kinesin family member 3B protein-coding 200-9 chr1 112952092 112952254 + 1.33333 NA intron (NM_003051, intron 1 of 4).2 L1MC5|LINE|L1 3890 NM_001166496 6566 Hs.75231 NM_003051 ENSG00000155380 SLC16A1 HHF7|MCT|MCT1|MCT1D solute carrier family 16 member 1 protein-coding 259.333-63 chr22 19521261 19521626 + 1.33333 NA TTS (NM_001178011) TTS (NM_001178011) 2967 NM_001363066 7122 Hs.505337 NM_003277 ENSG00000184113 CLDN5 AWAL|BEC1|CPETRL1|TMDVCF|TMVCF claudin 5 protein-coding 161.333-63 chr12 33720669 33720946 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -280988 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 344.667-10 chr3 42603457 42603935 + 1.33333 NA intron (NM_001349126, intron 2 of 18) intron (NM_001349126, intron 2 of 18) -2618 NM_001201572 9117 Hs.445892 NM_004206 ENSG00000093183 SEC22C SEC22L3 SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein protein-coding 226.666-14 chr15 62059585 62059783 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_135690) promoter-TSS (NR_135690) 763 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 218.666-8 chr10 22969679 22969910 + 1.33333 NA intron (NM_001282745, intron 8 of 18) X7C_LINE|LINE|CR1 41741 NM_001282746 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 164.667-130 chr21 23763458 23763608 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -378698 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 204-37 chr11 27965985 27966262 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -90692 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 210.666-91 chr6 124402065 124402276 + 1.33333 NA intron (NM_153355, intron 3 of 5) MER20|DNA|hAT-Charlie 119165 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 202-29 chr11 56526101 56526484 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16965 NM_001005245 219487 Hs.553632 NM_001005245 ENSG00000255223 OR5M11 OR11-199 olfactory receptor family 5 subfamily M member 11 protein-coding 182.667-152 chr7 26396595 26396815 + 1.33333 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) intron (NR_136272, intron 1 of 1) -1864 NR_148503 441204 Hs.587432 NR_015364 ENSG00000214870 LOC441204 - uncharacterized LOC441204 ncRNA 199.333-116 chr2 13709342 13709578 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 691498 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 184.333-12 chr10 55659110 55659258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31242 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 243-25 chr2 46224621 46224984 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -72605 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 304.666-14 chr2 30572130 30572593 + 1.33333 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) intron (NM_182551, intron 6 of 6) 125115 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 185-58 chr5 126757691 126757933 + 1.33333 NA intron (NR_134485, intron 2 of 3) intron (NR_134485, intron 2 of 3) 18674 NR_134485 102723557 Hs.582207 NR_134485 ENSG00000251072 LMNB1-DT - LMNB1 divergent transcript ncRNA 239.667-42 chr2 232425515 232425950 + 1.33333 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 18888 NM_031313 251 Hs.333509 NM_031313 ENSG00000163286 ALPG ALPPL|ALPPL2|GCAP alkaline phosphatase, germ cell protein-coding 190-55 chr18 6363710 6363862 + 1.33333 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) MIR|SINE|MIR 3897 NM_001365770 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 127-67 chr4 84679477 84679633 + 1.33333 NA intron (NM_014991, intron 64 of 67) intron (NM_014991, intron 64 of 67) 96428 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 131.333-114 chr3 76956101 76956299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83899 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 244.667-86 chr6 125890073 125890410 + 1.33333 NA intron (NM_001199621, intron 8 of 14) intron (NM_001199621, intron 8 of 14) -29014 NM_001199622 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 173.333-26 chr10 52185688 52185920 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 128324 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 113.666-4 chr8 128997006 128997181 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -31092 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 227.666-15 chr19 31227175 31227436 + 1.33333 NA intron (NR_138036, intron 2 of 4) intron (NR_138036, intron 2 of 4) 59795 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 168.333-188 chr7 10838379 10838636 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58563 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 240-94 chr8 140877902 140878180 + 1.33333 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) FLAM_A|SINE|Alu 122963 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 176.666-14 chr2 13936622 13936768 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 464263 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 168-67 chr3 97311800 97311938 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) L1M5|LINE|L1 -127738 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 426-2 chr1 104690634 104691272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 617930 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 236.333-77 chr5 29717218 29717525 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -163189 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 277.333-61 chr22 44935467 44935800 + 1.33333 NA intron (NM_001284296, intron 2 of 13) AluY|SINE|Alu 67986 NR_147506 101927551 Hs.683911 NR_147506 ENSG00000230922 LOC101927551 - uncharacterized LOC101927551 ncRNA 241.666-3 chr10 115339227 115339492 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 19 of 28) L1MA1|LINE|L1 245994 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 361.333 chr1 63186418 63186800 + 1.33333 NA intron (NR_038252, intron 6 of 11) AluSz|SINE|Alu 130648 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 200-76 chr18 21774469 21774647 + 1.33333 NA intron (NM_020774, intron 4 of 20) AluSz|SINE|Alu 33229 NM_020774 57534 Hs.140903 NM_020774 ENSG00000101752 MIB1 DIP-1|DIP1|LVNC7|MIB|ZZANK2|ZZZ6 mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 283.333-74 chr8 105146618 105146843 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -171708 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 306.666-18 chr2 121216205 121216516 + 1.33333 NA TTS (NM_014553) TTS (NM_014553) 68842 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 197-11 chr1 192811135 192811342 + 1.33333 NA intron (NM_002923, intron 4 of 4) intron (NM_002923, intron 4 of 4) 2199 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 300.667-22 chr2 135044475 135044908 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -7601 NM_001172435 22930 Hs.306327 NM_012233 ENSG00000115839 RAB3GAP1 P130|RAB3GAP|RAB3GAP130|WARBM1 RAB3 GTPase activating protein catalytic subunit 1 protein-coding 232.666-31 chr22 44948898 44949085 + 1.33333 NA intron (NM_001284296, intron 2 of 13) Charlie3|DNA|hAT-Charlie 54628 NR_147506 101927551 Hs.683911 NR_147506 ENSG00000230922 LOC101927551 - uncharacterized LOC101927551 ncRNA 183-85 chr5 90379807 90380051 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29857 NM_001297765 1070 Hs.591767 NM_004365 ENSG00000153140 CETN3 CDC31|CEN3 centrin 3 protein-coding 142-21 chr10 115009990 115010140 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15408 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 204.333-28 chr10 90517452 90517715 + 1.33333 NA intron (NR_110657, intron 2 of 6) L1PA13|LINE|L1 23222 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 237.333-19 chr11 44532359 44532573 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -33197 NM_001024844 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 191.333-180 chr6 129058176 129058360 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 2 of 64) intron (NM_000426, intron 2 of 64) 175127 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 402.666-4 chr12 19367147 19367488 + 1.33333 NA intron (NM_001256787, intron 24 of 25) AluSx1|SINE|Alu -72175 NM_001363736 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 194-9 chr10 102689217 102689398 + 1.33333 NA intron (NM_004311, intron 4 of 5) AluSq2|SINE|Alu 25090 NM_004311 403 Hs.182215 NM_004311 ENSG00000138175 ARL3 ARFL3|JBTS35|RP83 ADP ribosylation factor like GTPase 3 protein-coding 288.666-17 chr2 137961862 137962121 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -2482 NM_001024074 3176 Hs.42151 NM_006895 ENSG00000150540 HNMT HMT|HNMT-S1|HNMT-S2|MRT51 histamine N-methyltransferase protein-coding 406.333-8 chr2 160732084 160732714 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -238592 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 211.666-31 chr22 28316598 28316796 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MD2|LINE|L1 -143172 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 220.666-26 chr16 13273623 13273797 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 372112 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 210.666-68 chr3 105670239 105670420 + 1.33333 NA exon (NM_001321820, exon 19 of 20) exon (NM_001321820, exon 19 of 20) 197262 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 201.333-95 chr14 47934002 47934193 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -139083 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 259.666-7 chr10 82610395 82610652 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -377603 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 174-105 chr9 12283708 12283855 + 1.33333 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -409604 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 333.999-2 chr4 56409682 56409964 + 1.33333 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) intron (NR_156493, intron 1 of 10) -22315 NM_001286672 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 190-114 chr7 46664506 46664706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32516 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 238.667-84 chr7 31224429 31224783 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 116120 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 129-132 chr8 125816667 125816780 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 134474 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 456.333-5 chr18 21073293 21073834 + 1.33333 NA intron (NM_005406, intron 1 of 32) intron (NM_005406, intron 1 of 32) 38250 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 218-101 chr7 4033033 4033252 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) L1MC5a|LINE|L1 -96543 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 194.667-168 chrX 88390526 88390798 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -356563 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 160-65 chr20 47975462 47975632 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -7679 NR_109942 101060004 Hs.129970 NR_109942 LINC01523 - long intergenic non-protein coding RNA 1523 ncRNA 214.666-14 chr11 35877338 35877527 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66549 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 192-136 chr7 41164640 41164866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63149 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 191-52 chr5 83444550 83444716 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -27041 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 364.666-8 chr3 80629172 80629623 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -135500 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 173.666-15 chr5 55395807 55395952 + 1.33333 NA intron (NM_015360, intron 19 of 26) L1MC4|LINE|L1 87890 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 216.333-89 chr20 4683063 4683229 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3310 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 204-209 chr9 77505351 77505527 + 1.33333 NA intron (NR_121184, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 57790 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 196-18 chr10 44283775 44283975 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -8875 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 200.333-61 chr19 38449283 38449527 + 1.33333 NA intron (NM_001042723, intron 11 of 104) AluSq2|SINE|Alu 15705 NM_000540 6261 Hs.466664 NM_000540 ENSG00000196218 RYR1 CCO|MHS|MHS1|PPP1R137|RYDR|RYR|RYR-1|SKRR ryanodine receptor 1 protein-coding 253.333-79 chr4 100731675 100732023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56736 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 248.667-102 chr7 118996486 118996786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 771932 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 211-23 chr11 115353154 115353484 + 1.33333 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) MER3|DNA|hAT-Charlie 19742 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 206.666-86 chr4 60045863 60046033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -876671 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 202.999-4 chr5 103227902 103228054 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -30785 NM_033211 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 196.667-153 chr8 35726986 35727230 + 1.33333 NA intron (NM_001322818, intron 10 of 16) intron (NM_001322818, intron 10 of 16) -16788 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 166.666-14 chr5 125513153 125513290 + 1.33333 NA intron (NR_109887, intron 2 of 3) intron (NR_109887, intron 2 of 3) 19960 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 257.333-62 chr3 22698073 22698417 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 504333 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 307.666 chr1 24733675 24734159 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -11530 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 278.666-22 chr5 83479378 83479701 + 1.33333 NA intron (NM_001164098, intron 1 of 13) intron (NM_001164098, intron 1 of 13) 7795 NM_001126336 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 189-67 chr4 67684315 67684489 + 1.33333 NA intron (NM_018227, intron 2 of 32) intron (NM_018227, intron 2 of 32) 16753 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 291-12 chr13 76612301 76612696 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 273907 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 508.999-4 chr6 126816869 126817444 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -301515 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 210.333-146 chr6 72627087 72627350 + 1.33333 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 -3277 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 168-24 chr12 99451064 99451264 + 1.33333 NA intron (NM_152788, intron 10 of 25) intron (NM_152788, intron 10 of 25) -196589 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 198.666-39 chr2 33586656 33586810 + 1.33333 NA intron (NM_015475, intron 5 of 7) intron (NM_015475, intron 5 of 7) 12566 NM_015475 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 256.333-76 chr8 61397540 61397946 + 1.33333 NA intron (NM_173519, intron 3 of 5) L1MB8|LINE|L1 109773 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 326.666-12 chr5 136670949 136671272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -305634 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 255-15 chr10 91838490 91838780 + 1.33333 NA intron (NM_025235, intron 13 of 26) MER5A|DNA|hAT-Charlie 40209 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 303.333-3 chr1 93159728 93159978 + 1.33333 NA intron (NR_030761, intron 2 of 4) intron (NR_030761, intron 2 of 4) 20560 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 264.666-6 chr10 32635861 32636164 + 1.33333 NA intron (NM_001321115, intron 21 of 43) intron (NM_001321115, intron 21 of 43) 189872 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 257-57 chr5 133380231 133380573 + 1.33333 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) L1M4b|LINE|L1 47304 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 171-17 chr14 20735382 20735523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10435 NM_006683 10876 Hs.304757 NM_006683 ENSG00000181562 EDDM3A EP3A|FAM12A|HE3-ALPHA|HE3A|HE3ALPHA|RAM1 epididymal protein 3A protein-coding 280.666-27 chr5 164703906 164704343 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 233845 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 158-106 chr5 59122654 59122794 + 1.33333 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) L1MB5|LINE|L1 -83248 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 314.666-25 chr3 141080889 141081234 + 1.33333 NA intron (NM_080862, intron 2 of 2) MIR3|SINE|MIR 29714 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 298-42 chr2 26850552 26850898 + 1.33333 NA intron (NM_001253724, intron 1 of 12) intron (NM_001253724, intron 1 of 12) 2301 NM_001253724 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 324.333-12 chr12 64013435 64013924 + 1.33333 NA intron (NM_001346201, intron 3 of 21) intron (NM_001346201, intron 3 of 21) 168979 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 205.333-248 chr8 110550042 110550201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 477312 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 170.667-33 chr12 106331954 106332204 + 1.33333 NA intron (NM_152772, intron 6 of 9) intron (NM_152772, intron 6 of 9) -25669 NM_018082 55703 Hs.62696 NM_018082 ENSG00000013503 POLR3B C128|HLD8|INMAP|RPC2 RNA polymerase III subunit B protein-coding 168.333-59 chr14 61773045 61773201 + 1.33333 NA intron (NM_003082, intron 4 of 9) MIRc|SINE|MIR 10703 NM_003082 6617 Hs.179312 NM_003082 ENSG00000023608 SNAPC1 PTFgamma|SNAP43 small nuclear RNA activating complex polypeptide 1 protein-coding 328.666-5 chr14 26194453 26194913 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 358747 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 311.333-33 chr3 4453717 4454048 + 1.33333 NA intron (NM_001164674, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 13387 NM_182760 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 373.999 chr10 8099270 8099697 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44795 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 228-15 chr11 19966289 19966498 + 1.33333 NA intron (NM_182964, intron 10 of 37) L2b|LINE|L2 -56163 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 139.333-228 chr9 76119435 76119582 + 1.33333 NA intron (NR_120409, intron 9 of 19) intron (NR_120409, intron 9 of 19) 228835 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 368.666-16 chr5 52915919 52916313 + 1.33333 NA intron (NM_181501, intron 15 of 28) intron (NM_181501, intron 15 of 28) -73236 NR_073103 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 173.667-89 chr2 140363819 140364001 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 72 of 90) intron (NM_018557, intron 72 of 90) 222775 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 198-22 chr10 111849884 111850114 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 333766 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 209.333-215 chr7 28515101 28515397 + 1.33333 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) intron (NM_182899, intron 3 of 9) 79634 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 580.332 chr5 104274104 104274627 + 1.33333 NA Intergenic Eulor8|DNA|TcMar? -711576 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 199.333-99 chr17 64224291 64224450 + 1.33333 NA intron (NM_018469, intron 1 of 11) intron (NM_018469, intron 1 of 11) 6364 NM_001288733 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 195.333-113 chr2 96099215 96099441 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17243 NM_000682 151 Hs.247686 NM_000682 ENSG00000274286 ADRA2B ADRA2L1|ADRA2RL1|ADRARL1|ALPHA2BAR|FAME2|alpha-2BAR adrenoceptor alpha 2B protein-coding 264.999-4 chr2 88408316 88408726 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 44172 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 181.333-177 chr8 109240084 109240282 + 1.33333 NA TTS (NM_001128211) TTS (NM_001128211) 89750 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 341.333-3 chr1 214944122 214944399 + 1.33333 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -61282 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 158-126 chr7 38811858 38812051 + 1.33333 NA intron (NM_014396, intron 7 of 28) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 97237 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 255-20 chr11 44075922 44076255 + 1.33333 NA intron (NM_032592, intron 6 of 14) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 9818 NM_001127219 84680 Hs.126706 NM_032592 ENSG00000110455 ACCS ACS|PHACS 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase homolog (inactive) protein-coding 202.333-7 chr1 54882809 54883028 + 1.33333 NA intron (NM_014762, intron 2 of 8) L1ME1|LINE|L1 4277 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 124.667-12 chr1 160674826 160674991 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27597 NM_001330754 6504 Hs.523660 NM_003037 ENSG00000117090 SLAMF1 CD150|CDw150|SLAM signaling lymphocytic activation molecule family member 1 protein-coding 246.666-29 chr3 77228953 77229310 + 1.33333 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 131119 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 198.667-192 chr9 11331367 11331630 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 718292 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 254.333-44 chr2 162200160 162200413 + 1.33333 NA intron (NM_004460, intron 15 of 25) intron (NM_004460, intron 15 of 25) 43159 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 280-50 chr7 3448453 3448802 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1ME3G|LINE|L1 147375 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 222.666-28 chr21 26957142 26957309 + 1.33333 NA intron (NM_007038, intron 1 of 7) intron (NM_007038, intron 1 of 7) 3264 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 196.666-38 chr18 21525163 21525351 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001142966, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_001142966, exon 33 of 33) 75447 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 381.333-26 chr9 103988382 103989113 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10962 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 115.333-97 chr17 70800866 70801071 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 401211 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 229-39 chr3 21554489 21554700 + 1.33333 NA intron (NR_046731, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 11805 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 164.667-108 chr2 63921342 63921561 + 1.33333 NA intron (NM_001005739, intron 12 of 22) intron (NM_001005739, intron 12 of 22) 79571 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 217.999-4 chr3 125413954 125414133 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -38689 NM_001348429 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 161-11 chr11 10428025 10428236 + 1.33333 NA intron (NR_103765, intron 3 of 3) intron (NR_103765, intron 3 of 3) -22191 NM_001172431 272 Hs.501890 NM_000480 ENSG00000133805 AMPD3 - adenosine monophosphate deaminase 3 protein-coding 168.333-105 chr2 181909562 181909708 + 1.33333 NA intron (NM_006751, intron 8 of 16) intron (NM_006751, intron 8 of 16) 17905 NM_001130445 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 158.667-51 chr10 114844162 114844373 + 1.33333 NA intron (NM_001135051, intron 7 of 16) intron (NM_001135051, intron 7 of 16) 22487 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 192-88 chr22 25676520 25676685 + 1.33333 NA intron (NM_001362778, intron 7 of 19) AluSc8|SINE|Alu -65586 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 255-79 chr7 55359547 55359902 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5724 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 213-39 chr2 83868632 83868867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 345935 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 225.667-24 chr14 60620980 60621309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18072 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 198.333-181 chr7 30613478 30613731 + 1.33333 NA intron (NM_002047, intron 8 of 16) intron (NM_002047, intron 8 of 16) 18726 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 290-13 chr12 7520825 7521113 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -17151 NM_203416 9332 Hs.504641 NM_004244 ENSG00000177575 CD163 M130|MM130|SCARI1 CD163 molecule protein-coding 335.999-3 chr2 44533318 44533594 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) AluSq2|SINE|Alu 171509 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 215.333-158 chr5 55244164 55244431 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -10580 NR_125347 10309 Hs.3041 NM_021147 ENSG00000152669 CCNO CCNU|CILD29|UDG2 cyclin O protein-coding 209-2 chr1 67351065 67351261 + 1.33333 NA intron (NM_001319233, intron 10 of 15) intron (NM_001319233, intron 10 of 15) 43799 NM_001559 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 337.666-4 chr17 28400043 28400506 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_015077, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_015077, exon 9 of 9) 5938 NM_080669 113235 Hs.446689 NM_080669 ENSG00000076351 SLC46A1 G21|HCP1|PCFT solute carrier family 46 member 1 protein-coding 305.333-66 chr6 153552032 153552318 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -420893 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 209-123 chr8 105167443 105167721 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150856 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 188-106 chr7 125949204 125949386 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -685004 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 317.333-14 chr16 17994949 17995509 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 337433 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 284-8 chr11 37439737 37440089 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -498688 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 275.666-10 chr2 98003822 98004304 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -8115 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 218.667-57 chr2 146672994 146673269 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 86074 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 160-31 chr12 27292270 27292422 + 1.33333 NA intron (NM_015000, intron 1 of 13) intron (NM_015000, intron 1 of 13) -40490 NM_020183 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 218-24 chr13 34216468 34216715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -131452 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 248.333-70 chr4 63136942 63137263 + 1.33333 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -975337 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 436.666-3 chr18 47058743 47059186 + 1.33333 NA intron (NM_001367621, intron 5 of 15) intron (NM_001367621, intron 5 of 15) -23347 NM_016427 51224 Hs.375035 NM_016427 ENSG00000206181 ELOA2 HsT832|TCEB3B|TCEB3L elongin A2 protein-coding 191.666-10 chr22 24080436 24080593 + 1.33333 NA intron (NM_012295, intron 19 of 36) L1ME3Cz|LINE|L1 69144 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 148.667-365 chr7 131969388 131969550 + 1.33333 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 59249 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 180-105 chr7 102896663 102896896 + 1.33333 NA intron (NR_105043, intron 12 of 20) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -16221 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 299.333-59 chr5 41249022 41249417 + 1.33333 NA intron (NM_001115131, intron 1 of 17) L1PA16|LINE|L1 12250 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 137.333-90 chr2 37445740 37445884 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 101182 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 226.333-67 chr2 225226993 225227241 + 1.33333 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL -172593 NM_001371273 185.333-12 chr1 180466121 180466365 + 1.33333 NA intron (NM_032360, intron 3 of 7) intron (NM_032360, intron 3 of 7) -27853 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 237.333-23 chr11 99562184 99562424 + 1.33333 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) MER34C_|LTR|ERV1 6159 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 202-165 chr6 126006429 126006680 + 1.33333 NA intron (NM_001031712, intron 7 of 12) intron (NM_001031712, intron 7 of 12) 20014 NR_146803 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 191.667-102 chr5 110516506 110516750 + 1.33333 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) intron (NM_001039763, intron 12 of 13) -2713 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 514.666-2 chr2 146993814 146994393 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 407046 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 211.333-190 chr5 115864708 115864876 + 1.33333 NA intron (NM_001002924, intron 2 of 6) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 22305 NR_157087 1176 Hs.406191 NM_001284 ENSG00000177879 AP3S1 CLAPS3|Sigma3A adaptor related protein complex 3 subunit sigma 1 protein-coding 202.666-131 chrX 100943738 100943893 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -14898 NM_212559 402415 Hs.364911 NM_212559 ENSG00000182489 XKRX XKR2|XPLAC|XRG2 XK related X-linked protein-coding 177.666-24 chr5 150939267 150939433 + 1.33333 NA intron (NR_026867, intron 4 of 4) L1MB8|LINE|L1 7234 NR_026867 134466 Hs.661876 NR_026867 ZNF300P1 - zinc finger protein 300 pseudogene 1 pseudo 207-21 chr11 55786778 55787070 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8632 NM_001004735 219436 Hs.553622 NM_001004735 ENSG00000186113 OR5D14 OR11-141|OR11-150 olfactory receptor family 5 subfamily D member 14 protein-coding 241.333-27 chr11 12654943 12655313 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -19293 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 214-114 chr6 56086068 56086277 + 1.33333 NA intron (NM_030820, intron 17 of 29) intron (NM_030820, intron 17 of 29) 5490 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 172.666-7 chr15 43970176 43970325 + 1.33333 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) -92079 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 188.667-151 chr8 109076687 109076960 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9805 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 316-32 chr3 98491793 98492092 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -5739 NM_001004737 402135 Hs.632558 NM_001004737 ENSG00000231861 OR5K2 OR3-9 olfactory receptor family 5 subfamily K member 2 protein-coding 204.666-34 chr16 13527916 13528132 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -392133 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 183.666-10 chr2 139064749 139064985 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 167543 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 225.666-18 chr3 5449065 5449272 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -198913 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 142-7 chr1 112566573 112566725 + 1.33333 NA intron (NM_017744, intron 11 of 14) L1ME2|LINE|L1 52492 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 175.333-38 chr14 25230930 25231136 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -180736 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 393-16 chr8 119801766 119802250 + 1.33333 NA exon (NM_003184, exon 6 of 26) exon (NM_003184, exon 6 of 26) 30833 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 185.333-94 chr2 105919251 105919478 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67517 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 214-69 chr2 83524873 83525145 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2195 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 203.333-36 chr10 93227264 93227532 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 153505 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 199.666-29 chr20 46265636 46265793 + 1.33333 NA intron (NM_021248, intron 1 of 11) L1ME3B|LINE|L1 42784 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 380.666-3 chr11 112228032 112228479 + 1.33333 NA intron (NM_000317, intron 1 of 5) intron (NM_000317, intron 1 of 5) 1827 NM_000317 5805 Hs.503860 NM_000317 ENSG00000150787 PTS PTPS 6-pyruvoyltetrahydropterin synthase protein-coding 224.666-13 chr17 61060094 61060341 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 20 of 25) AluY|SINE|Alu 307487 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 129.333-71 chr15 93400576 93400758 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 194601 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 396.999-5 chr6 50086487 50087015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36822 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 200-91 chr20 22363263 22363531 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 57246 NR_027089 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 214-112 chr6 9744363 9744668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -659987 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 133.667-95 chr3 63428900 63429119 + 1.33333 NA intron (NR_046677, intron 2 of 4) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -14303 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 210-105 chr4 67211139 67211387 + 1.33333 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 210737 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 198-171 chr7 54963001 54963160 + 1.33333 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -55937 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 269.666-7 chr15 34272064 34272410 + 1.33333 NA intron (NM_001042497, intron 1 of 23) AluSg4|SINE|Alu 46583 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 230.333-124 chr8 131893811 131894082 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10147 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 167.666-2 chr10 24761058 24761334 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37309 NM_020824 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 215.666-33 chr6 72419858 72420067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53216 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 218-93 chr5 159005768 159005957 + 1.33333 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 92094 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 251-83 chr7 153072331 153072763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 312795 NM_020445 57180 Hs.647117 NM_020445 ENSG00000133627 ACTR3B ARP11|ARP3BETA actin related protein 3B protein-coding 250-69 chr5 153679393 153679762 + 1.33333 NA intron (NM_000827, intron 7 of 15) intron (NM_000827, intron 7 of 15) 187405 NM_001258021 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 265.666-19 chr5 22454245 22454609 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -240577 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 281-24 chr20 34657030 34657529 + 1.33333 NA intron (NM_080476, intron 1 of 11) intron (NM_080476, intron 1 of 11) 20006 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 226-34 chr18 71660277 71660548 + 1.33333 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -81456 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 234-59 chr5 104426153 104426401 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -673197 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 217.666-12 chr14 77733259 77733527 + 1.33333 NA intron (NM_001318844, intron 8 of 12) intron (NM_001318844, intron 8 of 12) 25290 NR_052025 81892 Hs.655105 NM_031210 ENSG00000119705 SLIRP C14orf156|DC50|PD04872 SRA stem-loop interacting RNA binding protein protein-coding 226-70 chr4 99604521 99604811 + 1.33333 NA intron (NM_001300785, intron 10 of 17) intron (NM_001300785, intron 10 of 17) 40588 NM_001300785 4547 Hs.195799 NM_000253 ENSG00000138823 MTTP ABL|MTP microsomal triglyceride transfer protein protein-coding 206-181 chr8 111101640 111101807 + 1.33333 NA intron (NR_125418, intron 3 of 3) L1MB8|LINE|L1 -74290 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 220.666-3 chr1 104714717 104714989 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 641830 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 155.333-405 chr8 133701715 133701856 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -17719 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 239-63 chr8 113420733 113421080 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) AluSx1|SINE|Alu 16033 NM_052900 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 294.667-18 chr16 75742380 75742799 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -16099 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 245.333-20 chr11 58583376 58583634 + 1.33333 NA intron (NM_001197051, intron 1 of 10) intron (NM_001197051, intron 1 of 10) 4391 NR_024091 386607 Hs.524920 NM_170768 ZFP91-CNTF ZFP91|ZNF757|Zfp-91 ZFP91-CNTF readthrough (NMD candidate) ncRNA 295.666-6 chr14 66500622 66501127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6533 NM_020806 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 215.667-120 chr8 78893729 78894055 + 1.33333 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 56363 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 265.999-8 chr8 114968488 114968694 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 699422 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 202-162 chr6 105728044 105728286 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -325083 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 234.666-14 chr13 89919368 89919639 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 200214 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 210-118 chr5 72523113 72523404 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -15848 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 204.333-36 chr11 47453151 47453358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4118 NM_032645 5913 Hs.81218 NM_005055 ENSG00000165917 RAPSN CMS11|CMS4C|FADS|FADS2|RAPSYN|RNF205 receptor associated protein of the synapse protein-coding 335.333-50 chr7 43608167 43608451 + 1.33333 NA TTS (NR_146945) TTS (NR_146945) 25201 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 113.666-2 chr3 17330209 17330316 + 1.33333 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) L2|LINE|L2 369758 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 373.666-9 chr3 97503786 97504110 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 10 of 17) intron (NM_001080448, intron 10 of 17) 64341 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 305.333-7 chr10 58954491 58954879 + 1.33333 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -44833 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 115-46 chr12 66957406 66957617 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 138773 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 177.666-17 chr3 84502093 84502248 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 367405 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 206.333-132 chr5 88150046 88150209 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118718 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 210.666-59 chr2 198861333 198861513 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -486326 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 224-73 chr5 37560838 37561023 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) AluJo|SINE|Alu 181612 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 193-32 chr17 13487374 13487571 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 56174 NR_031679 100302287 NR_031679 ENSG00000221698 MIR548H3 MIR548H-3|MIRN548H3|hsa-mir-548h-3 microRNA 548h-3 ncRNA 214.666-47 chr4 14584912 14585088 + 1.33333 NA intron (NR_126435, intron 4 of 6) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 303169 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 449-5 chr7 52994466 52995113 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -40844 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 348.333-26 chr5 36117962 36118403 + 1.33333 NA intron (NM_001007527, intron 9 of 17) L1MC4|LINE|L1 29806 NR_030306 693165 NR_030306 ENSG00000207756 MIR580 MIRN580|hsa-mir-580 microRNA 580 ncRNA 246.666-40 chr9 19184382 19184776 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46114 NM_017925 55667 Hs.249591 NM_017925 ENSG00000137145 DENND4C C9orf55|C9orf55B|RAB10GEF|bA513M16.3 DENN domain containing 4C protein-coding 214-68 chr2 58711420 58711611 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 190762 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 208.666-24 chr11 46600798 46601021 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6886 NM_001367470 55626 Hs.654644 NM_017749 ENSG00000110497 AMBRA1 DCAF3|WDR94 autophagy and beclin 1 regulator 1 protein-coding 475.999-4 chr6 129484583 129485004 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 55 of 64) L1ME3F|LINE|L1 225384 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 171.666-5 chr2 236059348 236059487 + 1.33333 NA intron (NM_001037131, intron 16 of 17) L1MB7|LINE|L1 108969 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 200.666-104 chr6 54396357 54396556 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 88015 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 218-39 chr18 6444206 6444504 + 1.33333 NA Intergenic LTR51|LTR|ERV1 -29096 NM_001365765 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 204-49 chr12 49308033 49308322 + 1.33333 NA intron (NR_120449, intron 2 of 7) L1M3|LINE|L1 13030 NM_006262 5630 Hs.37044 NM_006262 ENSG00000135406 PRPH NEF4|PRPH1 peripherin protein-coding 171.667-15 chr10 12843473 12843753 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -118260 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 212-155 chr8 134263178 134263490 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -334737 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 192.667-13 chr1 190137144 190137391 + 1.33333 NA intron (NM_199051, intron 7 of 7) L2|LINE|L2 338743 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 205.333-116 chr2 28709281 28709574 + 1.33333 NA non-coding (NR_145832, exon 2 of 2) non-coding (NR_145832, exon 2 of 2) 26778 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 397-5 chr4 96362021 96362692 + 1.33333 NA intron (NR_147149, intron 1 of 3) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 51653 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 233.666-10 chr15 27790852 27791090 + 1.33333 NA intron (NM_001300984, intron 22 of 22) AluJr|SINE|Alu 308344 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 168-123 chr9 125323164 125323351 + 1.33333 NA intron (NM_001282680, intron 10 of 27) AluSp|SINE|Alu 61431 NM_001354293 26130 Hs.42376 NM_015635 ENSG00000165219 GAPVD1 GAPEX5|GAPex-5|RAP6 GTPase activating protein and VPS9 domains 1 protein-coding 437.666-3 chr12 97841141 97841524 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -84815 NR_077240 643711 Hs.585557 NR_077240 ENSG00000257501 LOC643711 - platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 pseudogene pseudo 176.666-24 chr5 54153414 54153671 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 3 of 4) intron (NM_019087, intron 3 of 4) 157031 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 171-2 chr1 42551993 42552190 + 1.33333 NA intron (NM_001355227, intron 9 of 18) intron (NM_001355227, intron 9 of 18) 19071 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 303.333-6 chr1 165837210 165837689 + 1.33333 NA intron (NM_012474, intron 1 of 6) intron (NM_012474, intron 1 of 6) 9835 NM_012474 7371 Hs.458360 NM_012474 ENSG00000143179 UCK2 TSA903|UK|UMPK uridine-cytidine kinase 2 protein-coding 146-117 chr6 54161150 54161330 + 1.33333 NA intron (NM_001281746, intron 8 of 11) intron (NM_001281746, intron 8 of 11) 49797 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 196-188 chr8 131669778 131670032 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -234188 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 331.333-15 chr13 23918249 23918618 + 1.33333 NA intron (NR_073430, intron 3 of 4) L1PA16|LINE|L1 -20931 NR_104426 387911 Hs.740810 NM_001007537 ENSG00000205863 C1QTNF9B CTRP9B C1q and TNF related 9B protein-coding 196.333-24 chr12 15493064 15493346 + 1.33333 NA intron (NM_030667, intron 2 of 26) L1MEi|LINE|L1 -53406 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 285.333-3 chr1 164084916 164085200 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -474302 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 255.333-58 chr2 171282549 171282840 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -51401 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 290.667-18 chr17 59621325 59621719 + 1.33333 NA intron (NM_001288653, intron 1 of 31) intron (NM_001288653, intron 1 of 31) 1627 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 189-33 chr15 97498999 97499212 + 1.33333 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) ERVL-E-int|LTR|ERVL 22706 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 199.333-4 chr1 50200027 50200215 + 1.33333 NA intron (NM_001144774, intron 6 of 6) intron (NM_001144774, intron 6 of 6) 90288 NM_001294348 1996 Hs.213050 NM_021952 ENSG00000162374 ELAVL4 HUD|PNEM ELAV like RNA binding protein 4 protein-coding 215.333-24 chr10 76305410 76305582 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 522735 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 265.666-8 chr14 55818247 55818609 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -21754 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 320.333-25 chr5 90636469 90636932 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 10 of 89) intron (NR_003149, intron 10 of 89) 77903 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 205.333-256 chr8 136756486 136756727 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 225808 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 277-24 chr18 44129745 44130048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 401801 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 291.333-2 chr1 77088999 77089299 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_005482, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_005482, exon 11 of 11) 29006 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 218.666-33 chr15 59094779 59095001 + 1.33333 NA exon (NM_001330331, exon 14 of 14) exon (NM_001330331, exon 14 of 14) -10256 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 174.333-7 chr1 193081006 193081267 + 1.33333 NA intron (NM_001042370, intron 5 of 9) intron (NM_001042370, intron 5 of 9) -21060 NM_001350852 51377 Hs.145469 NM_015984 ENSG00000116750 UCHL5 CGI-70|INO80R|UCH-L5|UCH37 ubiquitin C-terminal hydrolase L5 protein-coding 209-13 chr10 81985906 81986149 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) Charlie9|DNA|hAT-Charlie 108340 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 204-85 chr18 28704550 28704811 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -527550 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 208-107 chr3 88056666 88056845 + 1.33333 NA intron (NM_001195308, intron 3 of 3) intron (NM_001195308, intron 3 of 3) 2241 NM_003663 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 228.666-11 chr11 116570111 116570311 + 1.33333 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -69211 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 327.333-30 chr3 150132885 150133309 + 1.33333 NA intron (NR_136187, intron 2 of 2) MER30|DNA|hAT-Charlie 36654 NR_136187 105374313 Hs.151216 NR_136187 LOC105374313 - uncharacterized LOC105374313 ncRNA 206.333-94 chr2 165939540 165939823 + 1.33333 NA intron (NR_038983, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 5824 NR_038984 100506134 Hs.672319 NR_038983 TTC21B-AS1 - TTC21B antisense RNA 1 ncRNA 272.666-17 chr4 87632115 87632335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18055 NM_004407 1758 Hs.652366 NM_004407 ENSG00000152592 DMP1 ARHP|ARHR|DMP-1 dentin matrix acidic phosphoprotein 1 protein-coding 261.333-110 chr8 134044753 134045050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 158405 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 202-86 chr2 108796886 108797116 + 1.33333 NA intron (NM_144978, intron 5 of 14) L1MA4|LINE|L1 10230 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 294.666-27 chr5 79777051 79777405 + 1.33333 NA intron (NM_153610, intron 9 of 12) L1ME4b|LINE|L1 87392 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 196-183 chr8 103016083 103016274 + 1.33333 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? -4905 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 289.333-30 chr2 161436803 161437108 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20658 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 218-2 chr1 71362838 71363059 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 281624 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 208-141 chr5 123583988 123584167 + 1.33333 NA intron (NM_001044723, intron 5 of 12) L1M5|LINE|L1 38660 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 201-12 chr1 203394151 203394304 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -43105 NM_002023 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 159.333-169 chr2 143467652 143467839 + 1.33333 NA intron (NM_018460, intron 8 of 13) intron (NM_018460, intron 8 of 13) 338326 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 243.333-16 chr12 31478384 31478650 + 1.33333 NA intron (NM_001366891, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu -109216 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 217-76 chr5 128967606 128967825 + 1.33333 NA intron (NM_001017372, intron 1 of 9) intron (NM_001017372, intron 1 of 9) 2227 NM_001017372 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 180-86 chr6 62833668 62834000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 486143 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 198.667-84 chr17 68562234 68562506 + 1.33333 NA intron (NM_017565, intron 1 of 10) intron (NM_017565, intron 1 of 10) -3943 NR_027751 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 202.666-128 chr9 118303354 118303561 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -376214 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 229.667-23 chr13 49821133 49821447 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -28608 NM_002267 3839 Hs.527919 NM_002267 ENSG00000102753 KPNA3 IPOA4|SRP1|SRP1gamma|SRP4|hSRP1 karyopherin subunit alpha 3 protein-coding 229.333-17 chr11 83369982 83370211 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -83689 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 196.666-11 chr12 13143354 13143599 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39809 NM_001367364 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 208-145 chr6 64880134 64880358 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) intron (NM_001292009, intron 19 of 43) -421172 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 445-9 chr5 78090089 78090693 + 1.33333 NA intron (NM_003664, intron 21 of 26) intron (NM_003664, intron 21 of 26) 132144 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 145.333-320 chr9 81517312 81517489 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 172135 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 219.333-115 chr3 63209770 63210051 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -68398 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 349-6 chr14 68695908 68696383 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -67358 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 211-28 chr13 76050640 76050873 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -115624 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 153.333-39 chr10 10340036 10340248 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 122207 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 253.333-77 chr4 56775462 56775714 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45885 NR_073419 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 199.666-12 chr12 62779963 62780150 + 1.33333 NA intron (NM_020700, intron 4 of 9) MIR|SINE|MIR 155094 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 274-22 chr18 73186513 73186782 + 1.33333 NA intron (NR_034133, intron 3 of 5) intron (NR_034133, intron 3 of 5) 77851 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 273.666-27 chr8 138369904 138370263 + 1.33333 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 127178 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 211.333-220 chr7 34731100 34731276 + 1.33333 NA intron (NR_015356, intron 2 of 4) intron (NR_015356, intron 2 of 4) 27084 NR_033664 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 207-109 chr7 35417436 35417717 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 103721 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 262.667-13 chr11 17235188 17235576 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27396 NM_001321380 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 443.333-10 chr8 139300070 139300521 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -386254 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 224-99 chr7 52493504 52493807 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -541978 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 153-18 chr11 56485582 56485788 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 5685 NM_001005282 219484 Hs.554522 NM_001005282 ENSG00000181371 OR5M8 OR11-194 olfactory receptor family 5 subfamily M member 8 protein-coding 164.666-14 chr5 152357677 152357848 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47517 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 225-50 chr4 183199296 183199510 + 1.33333 NA intron (NM_024949, intron 2 of 22) intron (NM_024949, intron 2 of 22) 41231 NR_126473 101928734 Hs.570713 NR_126473 ENSG00000251128 WWC2-AS1 - WWC2 antisense RNA 1 ncRNA 191.666-12 chr3 109569586 109569787 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33142 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 221.333-70 chr2 177533566 177533734 + 1.33333 NA intron (NM_003659, intron 19 of 19) intron (NM_003659, intron 19 of 19) 19146 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 230-52 chr5 8548616 8548867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87816 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 236.333-78 chr5 127640232 127640494 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -8658 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 217-51 chr2 216145762 216146181 + 1.33333 NA intron (NM_021141, intron 13 of 20) intron (NM_021141, intron 13 of 20) 36623 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 214.999-6 chr20 52098231 52098394 + 1.33333 NA intron (NM_199427, intron 6 of 8) intron (NM_199427, intron 6 of 8) 7172 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 173.333-126 chr3 101656438 101656693 + 1.33333 NA intron (NM_014415, intron 6 of 10) intron (NM_014415, intron 6 of 10) -19865 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 330.666-20 chr8 28148944 28149335 + 1.33333 NA intron (NM_018091, intron 10 of 14) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 56000 NM_001284220 55140 Hs.491336 NM_018091 ENSG00000134014 ELP3 KAT9 elongator acetyltransferase complex subunit 3 protein-coding 171-74 chr8 30078399 30078559 + 1.33333 NA intron (NM_016127, intron 1 of 5) HAL1|LINE|L1 4585 NM_016127 51669 Hs.521487 NM_016127 ENSG00000133872 SARAF FOAP-7|HSPC035|TMEM66|XTP3 store-operated calcium entry associated regulatory factor protein-coding 387.999-6 chr7 7133676 7134068 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37086 NR_034022 100131257 Hs.551110 NR_034022 LOC100131257 - zinc finger protein 655 pseudogene pseudo 263.333-83 chr8 84463513 84463756 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) MIRc|SINE|MIR 48150 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 161.666-8 chr4 30897839 30898138 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 177619 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 146.666-6 chr22 27556527 27556678 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 245154 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 229.333-41 chr15 26560251 26560497 + 1.33333 NA intron (NM_001191320, intron 6 of 6) intron (NM_001191320, intron 6 of 6) 68716 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 217.333-69 chr2 172069305 172069559 + 1.33333 NA intron (NM_001322279, intron 5 of 9) intron (NM_001322279, intron 5 of 9) -16075 NM_001038493 1745 Hs.407015 NM_178120 ENSG00000144355 DLX1 - distal-less homeobox 1 protein-coding 186.667-86 chr21 35781834 35782073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61238 NR_030414 768219 NR_030414 ENSG00000211590 MIR802 MIRN802|hsa-mir-802 microRNA 802 ncRNA 193.666-44 chr7 91123144 91123493 + 1.33333 NA intron (NM_012395, intron 13 of 13) intron (NM_012395, intron 13 of 13) -141115 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 225.333-26 chr11 39574679 39574873 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 718354 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 365.333-4 chr12 10282169 10282574 + 1.33333 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) AluSp|SINE|Alu -22075 NM_001114396 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 300-47 chr3 191584875 191585173 + 1.33333 NA intron (NR_120606, intron 6 of 6) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 123861 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 195.333-39 chr10 118231789 118232033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 110413 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 487.666-6 chrX 152455945 152456384 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -4849 NM_000808 2556 Hs.123024 NM_000808 ENSG00000011677 GABRA3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha3 subunit protein-coding 220.333-102 chr4 53978960 53979286 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8159 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 150.333-296 chr4 37620123 37620269 + 1.33333 NA intron (NM_001085400, intron 6 of 6) Charlie26a|DNA|hAT-Charlie 35963 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 248.667-88 chr6 27191978 27192273 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 44499 NR_036096 100422934 NR_036096 ENSG00000265565 MIR3143 mir-3143 microRNA 3143 ncRNA 228-50 chr20 32595192 32595378 + 1.33333 NA intron (NR_034152, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 7806 NR_034152 149950 Hs.516980 NM_001010976 ENSG00000204393 NOL4L-DT - NOL4L divergent transcript ncRNA 238-108 chr9 37455129 37455464 + 1.33333 NA intron (NM_014872, intron 1 of 1) LTR1F1|LTR|ERV1 10154 NM_014872 9925 Hs.161276 NM_014872 ENSG00000168795 ZBTB5 - zinc finger and BTB domain containing 5 protein-coding 266-73 chr5 146474909 146475226 + 1.33333 NA intron (NM_006706, intron 9 of 21) intron (NM_006706, intron 9 of 21) 27734 NM_006706 10915 Hs.443465 NM_006706 ENSG00000113649 TCERG1 CA150|TAF2S|Urn1 transcription elongation regulator 1 protein-coding 396.333-10 chr5 14548716 14549163 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -32853 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 206.333-86 chr2 114878396 114878660 + 1.33333 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) L1MA4|LINE|L1 -44980 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 200.333-76 chr2 146626453 146626722 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39530 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 175.333-213 chrX 137711295 137711477 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 145259 NM_003413 7547 Hs.111227 NM_003413 ENSG00000156925 ZIC3 HTX|HTX1|VACTERLX|ZNF203 Zic family member 3 protein-coding 392.332 chr5 142166896 142167370 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 58354 NM_030571 80762 Hs.9788 NM_030571 ENSG00000131507 NDFIP1 N4WBP5 Nedd4 family interacting protein 1 protein-coding 220.333-123 chr7 67892549 67892898 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -127530 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 141.333-242 chr8 100532069 100532303 + 1.33333 NA intron (NM_001270377, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 27573 NM_198401 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 199.333-44 chr11 110226765 110226934 + 1.33333 NA intron (NM_001260493, intron 14 of 15) intron (NM_001260493, intron 14 of 15) 69863 NM_001260494 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 184-97 chr6 137127275 137127523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46245 NM_181310 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 158.667-119 chr16 83595476 83595622 + 1.33333 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 87203 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 238.666-34 chr5 98355984 98356213 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -194859 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 185-20 chr15 44138213 44138464 + 1.33333 NA intron (NM_001286490, intron 1 of 15) L1MEi|LINE|L1 56108 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 212-135 chr5 153824639 153824907 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 74214 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 202-34 chr12 40301085 40301252 + 1.33333 NA intron (NM_198578, intron 25 of 50) intron (NM_198578, intron 25 of 50) 76171 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 212.666-77 chr6 66329520 66329777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 541769 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 185.667-16 chr10 119525800 119526055 + 1.33333 NA intron (NM_001005339, intron 3 of 4) intron (NM_001005339, intron 3 of 4) 10606 NM_002925 6001 Hs.501200 NM_002925 ENSG00000148908 RGS10 - regulator of G protein signaling 10 protein-coding 360-23 chr4 85196896 85197274 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 229601 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 229-47 chr4 127976031 127976343 + 1.33333 NA intron (NM_001366044, intron 2 of 11) intron (NM_001366044, intron 2 of 11) -10224 NM_152778 256471 Hs.480701 NM_152778 ENSG00000164073 MFSD8 CCMD|CLN7 major facilitator superfamily domain containing 8 protein-coding 231.333-87 chr5 60199492 60199708 + 1.33333 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) 173063 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 186.667-158 chrX 149454655 149454919 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50519 NM_000202 3423 Hs.6795 NM_000202 ENSG00000010404 IDS MPS2|SIDS iduronate 2-sulfatase protein-coding 198.666-8 chr11 72635433 72635632 + 1.33333 NA intron (NM_001243784, intron 1 of 30) intron (NM_001243784, intron 1 of 30) 6911 NM_001143839 5138 Hs.503163 NM_002599 ENSG00000186642 PDE2A CGS-PDE|PDE2A1|PED2A4|cGSPDE phosphodiesterase 2A protein-coding 204.333-30 chr11 10112807 10113057 + 1.33333 NA intron (NM_030962, intron 2 of 39) intron (NM_030962, intron 2 of 39) 181275 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 183.666-3 chr10 24601034 24601186 + 1.33333 NA intron (NM_001367447, intron 12 of 24) intron (NM_001367447, intron 12 of 24) 21733 NR_160024 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 191.666-19 chr5 89650643 89650811 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 365993 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 185.666-24 chr7 107609708 107609856 + 1.33333 NA intron (NR_163929, intron 6 of 7) intron (NR_163929, intron 6 of 7) 29536 NR_163938 346.999 chr10 110138230 110138525 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69228 NM_130439 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 368.666-9 chr14 54826031 54826340 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 52008 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 147-3 chr1 66987409 66987635 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001146111, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001146111, exon 16 of 16) 57266 NM_001077701 57708 Hs.605432 NM_020948 ENSG00000198160 MIER1 ER1|MI-ER1 MIER1 transcriptional regulator protein-coding 204-12 chr1 109283835 109284112 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001350242) promoter-TSS (NM_001350242) -805 NM_001350242 84722 Hs.405925 NM_032636 ENSG00000134222 PSRC1 DDA3|FP3214 proline and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 246.666-15 chr16 81713800 81714008 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48550 NR_045112 100129617 Hs.657151 NR_045112 LOC100129617 - uncharacterized LOC100129617 ncRNA 219.333-153 chr6 43880618 43880891 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -10274 NR_024478 100132354 Hs.376232 NR_024478 LINC01512 HI-LNC77 long intergenic non-protein coding RNA 1512 ncRNA 277.333-50 chr20 11515307 11515547 + 1.33333 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -242044 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 409.666-8 chr5 17698052 17698621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42698 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 210.666-90 chr6 107976924 107977193 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18850 NM_007214 11231 Hs.26904 NM_007214 ENSG00000025796 SEC63 DNAJC23|ERdj2|PCLD2|PRO2507|SEC63L SEC63 homolog, protein translocation regulator protein-coding 203-85 chr5 118409518 118409779 + 1.33333 NA intron (NR_104610, intron 9 of 9) intron (NR_104610, intron 9 of 9) 127074 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 248.667-8 chr10 32843707 32844066 + 1.33333 NA intron (NM_001321115, intron 34 of 43) intron (NM_001321115, intron 34 of 43) 57586 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 302.666-22 chr7 34647367 34647672 + 1.33333 NA intron (NR_033664, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -10699 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 181.666-3 chr11 21469498 21469675 + 1.33333 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) -723499 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 233.666-19 chr20 48660914 48661092 + 1.33333 NA intron (NM_020820, intron 15 of 39) MER58A|DNA|hAT-Charlie 166996 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 380.666-6 chr17 77308646 77309052 + 1.33333 NA intron (NM_001113491, intron 2 of 11) MER115|DNA|hAT-Tip100 -10666 NM_006640 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 265.999-7 chr8 107679943 107680173 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -182140 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 235.667-10 chr11 82238087 82238378 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1PA10|LINE|L1 165681 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 384-10 chr2 64655800 64656225 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2099 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 271.333-45 chr3 64193996 64194404 + 1.33333 NA non-coding (NR_046702, exon 3 of 4) non-coding (NR_046702, exon 3 of 4) 6656 NR_046702 100874243 Hs.670840 NR_046702 ENSG00000226017 PRICKLE2-AS3 - PRICKLE2 antisense RNA 3 ncRNA 194.667-97 chr3 99112745 99113107 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -211231 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 205.666-33 chr21 30216862 30217057 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_199328) promoter-TSS (NM_199328) -862 NM_199328 9073 Hs.162209 NM_012132 ENSG00000156284 CLDN8 HEL-S-79 claudin 8 protein-coding 405.333-13 chr9 131812678 131813131 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -72960 NM_001304275 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 301.666-3 chr10 63971929 63972445 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -450297 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 158.666-13 chr14 42248858 42249070 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 642108 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 603.667 chr14 45028756 45029722 + 1.33333 NA intron (NR_131765, intron 10 of 19) intron (NR_131765, intron 10 of 19) -54877 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 273.666-7 chr13 36807698 36808044 + 1.33333 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -11331 NM_000538 5994 Hs.24422 NM_000538 ENSG00000133111 RFXAP - regulatory factor X associated protein protein-coding 276.666-22 chr20 62161734 62162047 + 1.33333 NA intron (NR_125980, intron 5 of 12) intron (NR_125980, intron 5 of 12) 18121 NM_198935 26039 Hs.154429 NM_015558 ENSG00000184402 SS18L1 CREST|LP2261 SS18L1 subunit of BAF chromatin remodeling complex protein-coding 208-103 chr3 47516309 47516611 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2748 NM_001031703 54859 Hs.311100 NM_017713 ENSG00000163832 ELP6 C3orf75|TMEM103 elongator acetyltransferase complex subunit 6 protein-coding 332.667-13 chr2 27470366 27470723 + 1.33333 NA intron (NM_015662, intron 16 of 47) intron (NM_015662, intron 16 of 47) 19199 NM_015662 26160 Hs.127401 NM_015662 ENSG00000138002 IFT172 BBS20|NPHP17|RP71|SLB|SRTD10|osm-1|wim intraflagellar transport 172 protein-coding 205-106 chr9 31393310 31393580 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -11955 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 273.333-4 chr1 112555030 112555376 + 1.33333 NA intron (NM_017744, intron 12 of 14) intron (NM_017744, intron 12 of 14) 46238 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 356-14 chr13 89922828 89923346 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 196630 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 213-49 chr3 38959410 38959603 + 1.33333 NA intron (NM_001349253, intron 3 of 29) intron (NM_001349253, intron 3 of 29) -8945 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 217-81 chr6 90280121 90280416 + 1.33333 NA intron (NM_021813, intron 1 of 8) intron (NM_021813, intron 1 of 8) 16575 NM_021813 60468 Hs.269764 NM_021813 ENSG00000112182 BACH2 BTBD25|IMD60 BTB domain and CNC homolog 2 protein-coding 289.333-18 chr14 103354403 103354682 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 16693 NR_002964 677811 Hs.658237 NR_002964 ENSG00000272533 SNORA28 ACA28 small nucleolar RNA, H/ACA box 28 snoRNA 369.999-3 chr7 30383839 30384217 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -6857 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 260.333-23 chr17 5063065 5063518 + 1.33333 NA Intergenic Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger -15176 NM_153018 124961 Hs.48832 NM_153018 ENSG00000180787 ZFP3 ZNF752 ZFP3 zinc finger protein protein-coding 250.666-40 chr8 124531884 124532237 + 1.33333 NA intron (NM_001317889, intron 1 of 12) ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 7025 NM_032026 83940 Hs.170568 NM_032026 ENSG00000147687 TATDN1 CDA11 TatD DNase domain containing 1 protein-coding 269-29 chr20 52810652 52810977 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -161544 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 215.333-45 chr12 84967648 84967887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54938 NM_018057 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 143.333-299 chr8 139753398 139753588 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -50370 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 170.666-15 chr3 34940191 34940340 + 1.33333 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 453758 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 200.666-73 chr21 28919898 28920102 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34627 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 180-46 chr18 46903074 46903233 + 1.33333 NA intron (NM_001324049, intron 3 of 16) L1MD1|LINE|L1 14354 NM_173206 9063 Hs.57769 NM_004671 ENSG00000078043 PIAS2 ARIP3|DIP|MIZ1|PIASX|SIZ2|ZMIZ4 protein inhibitor of activated STAT 2 protein-coding 216-121 chr8 67463333 67463568 + 1.33333 NA intron (NR_136224, intron 2 of 4) intron (NR_136224, intron 2 of 4) 119616 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 187.333-34 chr11 102533014 102533176 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -2348 NM_002423 4316 Hs.2256 NM_002423 ENSG00000137673 MMP7 MMP-7|MPSL1|PUMP-1 matrix metallopeptidase 7 protein-coding 172-8 chr1 114509603 114509787 + 1.33333 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) intron (NM_015906, intron 1 of 19) 1508 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 198-50 chr14 59259318 59259579 + 1.33333 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) -3993 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 256.666-47 chr7 46735974 46736299 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -39014 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 199.667-44 chr14 59116650 59116926 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -71879 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 218.333-20 chr11 18003116 18003416 + 1.33333 NA intron (NR_104040, intron 4 of 11) intron (NR_104040, intron 4 of 11) 9781 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 261.667-33 chr2 22408585 22409018 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -127678 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 198.667-79 chr17 17948067 17948303 + 1.33333 NA intron (NM_001288787, intron 1 of 13) intron (NM_001288787, intron 1 of 13) 24215 NM_001350333 146691 Hs.462379 NM_144678 ENSG00000175662 TOM1L2 - target of myb1 like 2 membrane trafficking protein protein-coding 204.333-161 chr5 67922494 67922725 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 129396 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 208.333-77 chr2 124100178 124100435 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 75019 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 236-45 chr2 131587999 131588270 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -3908 NR_033885 440915 Hs.631267 NM_001017421 POTEKP ACT|ACTBL3|POTE2delta|POTEK POTE ankyrin domain family member K, pseudogene pseudo 322.333-6 chr12 16739478 16739792 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -131421 NM_001243609 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 241.667-85 chr7 50954818 50955148 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -161530 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 309.666-4 chr12 25145253 25145627 + 1.33333 NA intron (NR_147909, intron 7 of 14) intron (NR_147909, intron 7 of 14) 49720 NM_001204101 55259 Hs.407771 NM_018272 ENSG00000118307 CASC1 LAS1|PPP1R54 cancer susceptibility 1 protein-coding 208.667-46 chr14 30711094 30711352 + 1.33333 NA intron (NM_016106, intron 19 of 24) L1MC5|LINE|L1 88904 NM_001257376 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 304.666-19 chr3 84342772 84343073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 526653 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 286.333-40 chr7 11852413 11852835 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -20426 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 628.666-2 chr15 66520658 66521667 + 1.33333 NA exon (NM_001287822, exon 6 of 18) exon (NM_001287822, exon 6 of 18) 15836 NM_001287823 55055 Hs.21331 NM_017975 ENSG00000174442 ZWILCH KNTC1AP|hZwilch zwilch kinetochore protein protein-coding 276.333-20 chr17 45090890 45091144 + 1.33333 NA intron (NM_021079, intron 3 of 11) intron (NM_021079, intron 3 of 11) 23416 NR_106842 102465470 NR_106842 ENSG00000277249 MIR6784 hsa-mir-6784 microRNA 6784 ncRNA 241-21 chr14 58835849 58836179 + 1.33333 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) (TTCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 7726 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 201-32 chr13 66490808 66490964 + 1.33333 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) intron (NM_001318373, intron 3 of 3) 272636 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 186-61 chr3 2996552 2996814 + 1.33333 NA intron (NM_175607, intron 14 of 24) intron (NM_175607, intron 14 of 24) 64462 NR_046554 100873975 Hs.581502 NR_046554 CNTN4-AS1 - CNTN4 antisense RNA 1 ncRNA 200.666-125 chr9 24087656 24087832 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -237143 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 504.666 chr1 174883538 174884355 + 1.33333 NA intron (NM_001366451, intron 5 of 12) intron (NM_001366451, intron 5 of 12) 8428 NM_001035230 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 202.666-33 chr14 41251360 41251567 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 296752 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 303.666-11 chr3 145441625 145441902 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 627422 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 212.333-151 chr8 141158232 141158517 + 1.33333 NA intron (NM_001362798, intron 8 of 21) intron (NM_001362798, intron 8 of 21) 29785 NR_148197 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 200.333-152 chr8 79086190 79086411 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -245888 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 178.333-111 chr3 121922469 121922619 + 1.33333 NA intron (NM_021082, intron 8 of 21) intron (NM_021082, intron 8 of 21) 28143 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 286-21 chr18 6828980 6829398 + 1.33333 NA intron (NM_001366230, intron 2 of 17) intron (NM_001366230, intron 2 of 17) -5296 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 192.666-61 chr7 120805792 120805941 + 1.33333 NA intron (NM_012338, intron 7 of 7) intron (NM_012338, intron 7 of 7) 52278 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 179.333-62 chr14 48212071 48212227 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -417135 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 338.667-18 chr2 68790568 68790989 + 1.33333 NA intron (NM_014882, intron 3 of 9) L2a|LINE|L2 15868 NM_014882 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 213.667-22 chr11 83406199 83406478 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119931 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 219-12 chr10 115432525 115432837 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 21 of 28) intron (NM_207303, intron 21 of 28) 339316 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 284-53 chr6 63189954 63190236 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 129882 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 260.333-15 chr13 81762236 81762583 + 1.33333 NA Intergenic LTR87|LTR|ERVL? -535426 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 195.333-129 chr2 206820709 206820917 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -37505 NR_036077 100422993 NR_036077 ENSG00000283469 MIR3130-1 MIR3130-3|mir-3130-1 microRNA 3130-1 ncRNA 167-22 chr11 33535071 33535318 + 1.33333 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 159086 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 189.333-145 chr4 65697303 65697510 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -26911 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 257-12 chr13 48083162 48083530 + 1.33333 NA intron (NM_014166, intron 4 of 6) intron (NM_014166, intron 4 of 6) 6209 NR_046511 100873965 Hs.616241 NR_046511 ENSG00000229111 MED4-AS1 MED4-AS MED4 antisense RNA 1 ncRNA 216.667-18 chr11 20217013 20217305 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -56684 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 203.667-22 chr11 107882424 107882734 + 1.33333 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -23792 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 191.333-150 chr4 99420707 99420863 + 1.33333 NA exon (NM_000673, exon 6 of 9) exon (NM_000673, exon 6 of 9) 14349 NM_001166504 131 Hs.389 NM_000673 ENSG00000196344 ADH7 ADH4 alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide protein-coding 158.667-147 chr2 708056 708269 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30756 NM_001352680 129787 Hs.6729 NM_152834 ENSG00000151353 TMEM18 lncND transmembrane protein 18 protein-coding 209-75 chr3 19338059 19338325 + 1.33333 NA intron (NM_144633, intron 3 of 15) L2|LINE|L2 -23261 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 162-34 chr12 122208896 122209046 + 1.33333 NA TTS (NM_001330492) TTS (NM_001330492) 5262 NM_030765 79369 Hs.363315 NM_030765 ENSG00000176383 B3GNT4 B3GN-T4|beta3Gn-T4 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4 protein-coding 167.667-95 chr19 49383766 49384031 + 1.33333 NA intron (NR_110729, intron 1 of 2) L1MEg|LINE|L1 4183 NR_110729 101928295 Hs.640180 NR_110729 ENSG00000268686 LOC101928295 - uncharacterized LOC101928295 ncRNA 416-13 chr8 127647279 127647824 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 86416 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 161-88 chr6 113919581 113919821 + 1.33333 NA intron (NR_027060, intron 3 of 3) intron (NR_027060, intron 3 of 3) 15314 NR_027060 285759 Hs.376634 NM_173673 ENSG00000175967 FLJ34503 - uncharacterized FLJ34503 ncRNA 146.333-128 chr18 13062558 13062786 + 1.33333 NA intron (NM_032142, intron 21 of 44) L1MA1|LINE|L1 71310 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 206.333-35 chr12 49066695 49066974 + 1.33333 NA intron (NR_130123, intron 2 of 6) intron (NR_130123, intron 2 of 6) 3145 NM_144593 121268 Hs.159013 NM_144593 ENSG00000167550 RHEBL1 RHEBL1c RHEB like 1 protein-coding 300.666 chr1 232073306 232073569 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 147603 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 209.666-49 chr7 42232634 42232794 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 1 of 14) intron (NM_000168, intron 1 of 14) 4495 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 228-91 chr8 101887322 101887557 + 1.33333 NA intron (NM_001040624, intron 4 of 7) intron (NM_001040624, intron 4 of 7) -96470 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 232-82 chr7 47981969 47982222 + 1.33333 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -2480 NM_004507 3364 Hs.152983 NM_004507 ENSG00000136273 HUS1 hHUS1 HUS1 checkpoint clamp component protein-coding 239.333-78 chr4 97460941 97461197 + 1.33333 NA intron (NR_102713, intron 3 of 5) L1ME3A|LINE|L1 94143 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 206.666-49 chr18 1091207 1091387 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -163304 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 280.666-23 chr5 46121126 46121567 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -424966 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 186.666-9 chr10 52829221 52829427 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -57624 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 196-111 chr22 40191931 40192198 + 1.33333 NA intron (NM_015088, intron 1 of 20) AluJr4|SINE|Alu 14139 NM_015088 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 286.666-17 chr5 147154521 147154837 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -73159 NM_001271900 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 257.333-84 chr5 124245193 124245497 + 1.33333 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1PB3|LINE|L1 193175 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 212-125 chr5 31899374 31899634 + 1.33333 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) intron (NM_178140, intron 2 of 24) 36655 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 328.666-22 chr8 122638807 122639281 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55062 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 203.333-269 chr8 117496726 117497012 + 1.33333 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie -23844 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 376-19 chr7 86701197 86701592 + 1.33333 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 57480 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 310.666-7 chr14 22714655 22714953 + 1.33333 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -51884 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 171-38 chr2 237841022 237841228 + 1.33333 NA intron (NM_001080504, intron 15 of 15) L1PA15|LINE|L1 -18498 NM_001308353 10267 Hs.471783 NM_005855 ENSG00000132329 RAMP1 - receptor activity modifying protein 1 protein-coding 182-109 chr8 121894470 121894661 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -253125 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 197.333-150 chr3 88987756 88988028 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -119729 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 202-100 chr20 24993059 24993231 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_020531) promoter-TSS (NM_020531) -394 NM_020531 57136 Hs.472330 NM_020531 ENSG00000101474 APMAP BSCv|C20orf3 adipocyte plasma membrane associated protein protein-coding 223.333-86 chr2 186608241 186608480 + 1.33333 NA intron (NM_001145000, intron 2 of 27) intron (NM_001145000, intron 2 of 27) 8155 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 244.333-23 chr11 59152156 59152368 + 1.33333 NA exon (NM_001312911, exon 4 of 4) exon (NM_001312911, exon 4 of 4) 7400 NM_001312911 63901 Hs.150651 NM_022074 ENSG00000166801 FAM111A GCLEB|KCS2 family with sequence similarity 111 member A protein-coding 428.999-3 chr8 88734321 88734698 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -407026 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 171.333-125 chr3 130993483 130993631 + 1.33333 NA intron (NM_001001485, intron 21 of 27) MER20|DNA|hAT-Charlie 33297 NM_014065 28990 Hs.100878 NM_014065 ENSG00000034533 ASTE1 HT001 asteroid homolog 1 protein-coding 213.333-215 chr8 130240116 130240362 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 56294 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 123.333-116 chr2 165842327 165842504 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 29526 NR_045375 100506124 Hs.709870 NR_045375 LOC100506124 - uncharacterized LOC100506124 ncRNA 305.333-18 chr13 20842815 20843106 + 1.33333 NA exon (NM_022459, exon 6 of 23) exon (NM_022459, exon 6 of 23) 59814 NM_022459 64328 Hs.507452 NM_022459 ENSG00000132953 XPO4 exp4 exportin 4 protein-coding 431.333-2 chr10 119708970 119709655 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16735 NM_001243195 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 174-83 chr6 50435159 50435353 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -278288 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 232.666-26 chr2 170838423 170838705 + 1.33333 NA intron (NM_000817, intron 6 of 16) intron (NM_000817, intron 6 of 16) 21677 NM_000817 2571 Hs.420036 NM_000817 ENSG00000128683 GAD1 CPSQ1|GAD|SCP glutamate decarboxylase 1 protein-coding 403.333-14 chr6 121608251 121608706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 172832 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 204.333-197 chr8 82120795 82121120 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -278671 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 198.333-119 chr22 20096676 20096934 + 1.33333 NA intron (NM_022720, intron 9 of 13) L1M4|LINE|L1 10747 NR_031706 100302197 NR_031706 ENSG00000284464 MIR1306 MIRN1306|hsa-mir-1306|mir-1306 microRNA 1306 ncRNA 220.666-50 chr3 111077359 111077644 + 1.33333 NA intron (NM_001243288, intron 1 of 8) intron (NM_001243288, intron 1 of 8) 5685 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 215.666-36 chr7 28855476 28855725 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 102730 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 282.666-6 chr14 58308632 58308940 + 1.33333 NA intron (NM_002892, intron 5 of 23) intron (NM_002892, intron 5 of 23) 10231 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 235.666-8 chr2 189799592 189799903 + 1.33333 NA intron (NM_001289408, intron 3 of 11) LTR16|LTR|ERVL 15297 NM_001321048 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 234.666-29 chr22 45457854 45458080 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44274 NM_015653 26150 Hs.475110 NM_015653 ENSG00000128408 RIBC2 C22orf11|TRIB RIB43A domain with coiled-coils 2 protein-coding 252.333-23 chr15 90649794 90650192 + 1.33333 NA intron (NR_120372, intron 2 of 3) HAL1b|LINE|L1 -10241 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 308-38 chr4 56955920 56956275 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21509 NM_032313 84273 Hs.8715 NM_032313 ENSG00000084092 NOA1 C4orf14|MTG3|hAtNOS1|hNOA1|mAtNOS1 nitric oxide associated 1 protein-coding 193.666-6 chr10 57360768 57360943 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56296 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 234.667-89 chr5 17116603 17116888 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 39247 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 231.333-83 chr4 148730110 148730413 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 212117 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 216.333-102 chr3 177932413 177932611 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 115647 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 352.999-2 chr12 41602732 41603059 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -161294 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 246-26 chr14 63402180 63402499 + 1.33333 NA intron (NR_104104, intron 4 of 12) HAL1|LINE|L1 -83404 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 205-14 chr10 53148974 53149257 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -377415 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 191.333-59 chr14 54852720 54852900 + 1.33333 NA intron (NM_001024071, intron 3 of 5) intron (NM_001024071, intron 3 of 5) 25383 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 292.666-14 chr17 58816827 58817134 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 61111 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 284.667-20 chr17 49611376 49611838 + 1.33333 NA intron (NM_001007230, intron 7 of 11) intron (NM_001007230, intron 7 of 11) 14982 NM_001370732 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 202-172 chr7 11660147 11660319 + 1.33333 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L2b|LINE|L2 171965 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 163.667-52 chr13 39474381 39474657 + 1.33333 NA intron (NM_005780, intron 2 of 3) intron (NM_005780, intron 2 of 3) 128674 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 227.333-25 chr11 104680051 104680322 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -70884 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 192.666-59 chr7 38054484 38054668 + 1.33333 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -123669 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 184-113 chr8 121153707 121153885 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -341750 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 325-30 chr8 135766721 135767128 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 309468 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 304.333-37 chr8 137196089 137196636 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 217226 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 167.666-6 chr3 77160028 77160191 + 1.33333 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 62097 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 251.333-48 chr18 12696990 12697318 + 1.33333 NA intron (NM_001271989, intron 4 of 10) intron (NM_001271989, intron 4 of 10) 5569 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 210.666-9 chr10 11620094 11620326 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -8421 NR_125732 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 252.666-6 chr12 10000009 10000373 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_016509) promoter-TSS (NM_016509) -891 NM_001099431 51266 Hs.409794 NM_016509 ENSG00000165682 CLEC1B 1810061I13Rik|CLEC2|CLEC2B|PRO1384|QDED721 C-type lectin domain family 1 member B protein-coding 171.333-69 chr18 9655362 9655578 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40206 NR_110774 101927323 Hs.151204 NR_110773 ENSG00000263627 PPP4R1-AS1 - PPP4R1 antisense RNA 1 ncRNA 198.333-89 chr2 18982504 18982749 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44345 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 196.666-63 chr3 5986585 5986747 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -736411 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 222.666-52 chr7 77895806 77896064 + 1.33333 NA intron (NM_001127357, intron 3 of 17) HY1|scRNA|scRNA 55805 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 174-10 chr10 62264384 62264659 + 1.33333 NA intron (NM_001282941, intron 1 of 4) intron (NM_001282941, intron 1 of 4) 4323 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 353.666-6 chr4 30452972 30453566 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -267100 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 139.333-23 chr10 66632078 66632231 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) L1M5|LINE|L1 -293882 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 144.667-261 chr6 49728215 49728383 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001190986, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001190986, exon 8 of 8) -14709 NM_001261822 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 328.666-11 chr2 238077100 238077623 + 1.33333 NA intron (NM_016510, intron 4 of 11) L1MB7|LINE|L1 16360 NM_016510 51540 Hs.731909 NM_016510 ENSG00000132330 SCLY SCL|hSCL selenocysteine lyase protein-coding 176-68 chr4 165317906 165318160 + 1.33333 NA intron (NM_001161522, intron 13 of 13) intron (NM_001161522, intron 13 of 13) -9633 NM_001017369 6307 Hs.105269 NM_006745 ENSG00000052802 MSMO1 DESP4|ERG25|MCCPD|SC4MOL methylsterol monooxygenase 1 protein-coding 194.666-74 chr8 124817075 124817250 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4823 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 312-46 chr5 142721342 142721728 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23465 NM_001257205 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 242-22 chr13 72241932 72242142 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -374833 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 435.333-4 chr6 120019901 120020350 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 4946 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 190.666-15 chr13 23565821 23566014 + 1.33333 NA Intergenic MER101|LTR|ERV1 -4453 NM_001204459 55504 Hs.149168 NM_018647 ENSG00000127863 TNFRSF19 TAJ|TAJ-alpha|TRADE|TROY TNF receptor superfamily member 19 protein-coding 220.666-48 chr3 63486092 63486318 + 1.33333 NA intron (NM_001130003, intron 3 of 5) AluSz|SINE|Alu 42893 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 350-9 chr14 63561787 63562148 + 1.33333 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -18572 NM_001354926 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 217.333-77 chr2 226986254 226986478 + 1.33333 NA intron (NM_001349069, intron 8 of 8) L1MD3|LINE|L1 150312 NM_032276 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 191.333-193 chr7 106264870 106265013 + 1.33333 NA intron (NM_005746, intron 6 of 10) intron (NM_005746, intron 6 of 10) 20042 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 197.666-62 chr7 79622121 79622378 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 168289 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 212.667-98 chr4 42414088 42414393 + 1.33333 NA intron (NM_001105529, intron 35 of 35) intron (NM_001105529, intron 35 of 35) 16752 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 112-54 chr13 92778145 92778359 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -56638 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 418.667-5 chr2 186045620 186046180 + 1.33333 NA intron (NR_110218, intron 3 of 5) intron (NR_110218, intron 3 of 5) 40417 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 202.666-114 chr7 14748966 14749209 + 1.33333 NA intron (NM_001350724, intron 3 of 24) intron (NM_001350724, intron 3 of 24) 92363 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 282-19 chr16 60692798 60693116 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -333164 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 295-4 chr10 68254197 68254685 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -22328 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 253 chr1 38887629 38887946 + 1.33333 NA intron (NM_001304746, intron 7 of 7) intron (NM_001304746, intron 7 of 7) -6161 NR_037635 100527950 Hs.591506 NR_037633 GJA9-MYCBP Cx58|Cx59|GJA10|GJA9 GJA9-MYCBP readthrough ncRNA 362.333-7 chr18 2869941 2870266 + 1.33333 NA intron (NM_032048, intron 2 of 7) AluJb|SINE|Alu 23097 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 177.667-100 chr4 73997870 73998067 + 1.33333 NA intron (NM_002994, intron 3 of 3) intron (NM_002994, intron 3 of 3) 709 NM_002994 6374 Hs.89714 NM_002994 ENSG00000163735 CXCL5 ENA-78|SCYB5 C-X-C motif chemokine ligand 5 protein-coding 325-19 chr2 47485175 47485651 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -42124 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 285-30 chr6 55067532 55067910 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -38739 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 233.333-63 chr2 81932624 81932971 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -465851 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 294.333-18 chr17 57203908 57204165 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51815 NM_001322250 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 188-35 chr14 84679416 84679562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -592443 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 220.666-63 chr6 122189373 122189605 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -210062 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 363.333-16 chr2 68567999 68568381 + 1.33333 NA intron (NM_173545, intron 9 of 9) intron (NM_173545, intron 9 of 9) -75398 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 139.333-198 chr7 16271770 16271895 + 1.33333 NA intron (NM_001101426, intron 6 of 9) L2c|LINE|L2 61346 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 350-24 chr5 11799962 11800432 + 1.33333 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 104249 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 148.333-378 chr8 52204335 52204542 + 1.33333 NA intron (NM_001352863, intron 9 of 27) intron (NM_001352863, intron 9 of 27) 10076 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 282.667-48 chr8 115888480 115888923 + 1.33333 NA Intergenic Penelope1_Vert|LINE|Penelope -219726 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 238.666-8 chr10 94451608 94451789 + 1.33333 NA intron (NM_015188, intron 2 of 12) L1MEg|LINE|L1 49157 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 212-10 chr1 74906007 74906199 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -172695 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 207.333-154 chr2 220579401 220579619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -672945 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 266-5 chr1 178762746 178763107 + 1.33333 NA intron (NM_152663, intron 1 of 19) L1PA15|LINE|L1 37682 NM_152663 55103 Hs.632485 NM_018037 ENSG00000116191 RALGPS2 dJ595C2.1 Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2 protein-coding 205.333-127 chr2 83226800 83227097 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -295866 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 174-41 chr16 10268023 10268170 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -85188 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 285.333-6 chr1 209665752 209666121 + 1.33333 NA intron (NR_134510, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 9313 NR_134511 101930114 Hs.663934 NR_134509 ENSG00000227591 HSD11B1-AS1 - HSD11B1 antisense RNA 1 ncRNA 229.333-125 chr9 70422751 70423112 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8274 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 164.333-237 chr8 104235493 104235653 + 1.33333 NA intron (NR_145710, intron 25 of 29) intron (NR_145710, intron 25 of 29) 12238 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 167.333-230 chr6 65331977 65332218 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001142801, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001142801, exon 12 of 12) 30679 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 154.333-140 chr19 48924494 48924672 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -5692 NR_046633 100874085 Hs.569933 NR_046633 ENSG00000235191 NUCB1-AS1 - NUCB1 antisense RNA 1 ncRNA 305.333-64 chr6 141675869 141676165 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 412782 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 322.667-23 chr5 31420722 31421199 + 1.33333 NA intron (NM_013235, intron 29 of 34) L2c|LINE|L2 111133 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 168-30 chr14 69940974 69941151 + 1.33333 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) -37071 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 223.666-12 chr14 54008105 54008332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51327 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 320-21 chr18 9520212 9520634 + 1.33333 NA intron (NM_006788, intron 3 of 9) intron (NM_006788, intron 3 of 9) 44910 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 207.333-90 chr14 63456249 63456486 + 1.33333 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 51871 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 264.666-23 chr20 60678459 60678807 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 114071 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 145-76 chr3 185798200 185798410 + 1.33333 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) 22826 NM_001291873 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 262-25 chr15 67068754 67069027 + 1.33333 NA intron (NM_005902, intron 1 of 8) intron (NM_005902, intron 1 of 8) 3288 NM_005902 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 202.666-57 chr18 67103474 67103745 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22025 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 170-22 chr11 112999217 112999411 + 1.33333 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -35854 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 197.667-92 chr3 151425391 151425663 + 1.33333 NA intron (NM_053002, intron 41 of 42) AluJr|SINE|Alu 15253 NM_001178146 285313 Hs.58561 NM_178822 ENSG00000152580 IGSF10 CMF608 immunoglobulin superfamily member 10 protein-coding 250.333-26 chr17 78707261 78707558 + 1.33333 NA intron (NM_001365041, intron 3 of 12) intron (NM_001365041, intron 3 of 12) 9623 NM_001292019 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 371-21 chr8 103736492 103736832 + 1.33333 NA intron (NM_001348496, intron 3 of 23) intron (NM_001348496, intron 3 of 23) -82558 NR_145711 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 218-104 chr7 84865182 84865427 + 1.33333 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL 256627 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 211.333-227 chr7 135041652 135041829 + 1.33333 NA intron (NR_160300, intron 8 of 16) L1ME1|LINE|L1 55232 NM_001367812 340351 Hs.648616 NM_178563 ENSG00000146856 AGBL3 CCP3 ATP/GTP binding protein like 3 protein-coding 169.333-244 chr7 52495988 52496208 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -539535 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 303.666-3 chr10 96532837 96533143 + 1.33333 NA intron (NM_020123, intron 10 of 14) intron (NM_020123, intron 10 of 14) -19064 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 290.666-17 chr22 28556230 28556565 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEd|LINE|L1 96528 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 263.999-6 chr6 24984273 24984504 + 1.33333 NA intron (NM_001286446, intron 1 of 13) LTR7B|LTR|ERV1 -48428 NM_001286445 9750 Hs.559459 NM_014722 ENSG00000111913 RIPOR2 C6orf32|DFNB104|DIFF40|DIFF48|FAM65B|MYONAP|PL48 RHO family interacting cell polarization regulator 2 protein-coding 184.666-3 chr1 116266707 116266876 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106453 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 313.333-46 chr8 114180037 114180360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -743259 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 278-71 chr9 3716663 3717159 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 48825 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 235.999-4 chr9 29168382 29168562 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 43827 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 209.666-47 chr6 122374308 122374536 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25129 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 246.333-69 chr4 67468962 67469311 + 1.33333 NA non-coding (NR_155754, exon 19 of 19) non-coding (NR_155754, exon 19 of 19) -47136 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 199-37 chr18 56300241 56300539 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -109128 NR_148972 642484 NR_148972 ENSG00000206129 LOC642484 - uncharacterized LOC642484 ncRNA 215-29 chr18 47262607 47262885 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11086 NM_001037802 652991 Hs.585834 NM_001037802 ENSG00000215474 SKOR2 CH18515|CORL2|FUSSEL18 SKI family transcriptional corepressor 2 protein-coding 174-57 chr2 179561160 179561410 + 1.33333 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) intron (NR_148056, intron 3 of 9) 1303 NM_001113398 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 384-18 chr7 67966341 67966849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53658 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 262-73 chr7 42690195 42690480 + 1.33333 NA intron (NR_110833, intron 1 of 2) L1ME2|LINE|L1 16110 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 294-11 chr10 93674634 93674923 + 1.33333 NA intron (NM_145246, intron 12 of 13) intron (NM_145246, intron 12 of 13) 27794 NM_001347713 118924 Hs.586650 NM_145246 ENSG00000148690 FRA10AC1 C10orf4|F26C11.1-like|FRA10A FRA10A associated CGG repeat 1 protein-coding 114-170 chr8 114079415 114079568 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -642552 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 212-127 chr5 43771056 43771224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -167910 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 196-30 chr11 66540768 66540968 + 1.33333 NA intron (NM_207340, intron 2 of 2) L1MB7|LINE|L1 5180 NM_207340 254359 Hs.209587 NM_207340 ENSG00000174165 ZDHHC24 - zinc finger DHHC-type containing 24 protein-coding 203.333-32 chr10 75706551 75706707 + 1.33333 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) -5826 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 250.666-23 chr3 129824415 129824749 + 1.33333 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) intron (NM_001349271, intron 2 of 4) -29970 NM_001349273 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 202-88 chr2 115814338 115814503 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 20 of 25) intron (NM_001321912, intron 20 of 25) 470605 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 199-128 chr9 96474730 96475027 + 1.33333 NA intron (NM_014282, intron 5 of 7) intron (NM_014282, intron 5 of 7) 24709 NM_014282 22927 Hs.494567 NM_014282 ENSG00000130956 HABP4 IHABP-4|IHABP4|Ki-1/57|SERBP1L hyaluronan binding protein 4 protein-coding 258.667-72 chr4 91870565 91870944 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 406548 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 229.666-7 chr12 126843445 126843743 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31096 NR_033970 440117 Hs.127100 NR_033970 ENSG00000249873 LINC02372 - long intergenic non-protein coding RNA 2372 ncRNA 204-145 chr4 30634130 30634313 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -86148 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 257.333-10 chr10 61406875 61407203 + 1.33333 NA non-coding (NR_134507, exon 7 of 7) non-coding (NR_134507, exon 7 of 7) -45600 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 214.333-134 chr7 825388 825619 + 1.33333 NA intron (NM_001367651, intron 2 of 21) intron (NM_001367651, intron 2 of 21) -6973 NM_001130965 23353 Hs.438072 NM_025154 ENSG00000164828 SUN1 UNC84A Sad1 and UNC84 domain containing 1 protein-coding 237.333-97 chr6 39332269 39332542 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_145027, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_145027, exon 23 of 23) -9437 NM_001363784 83795 Hs.287765 NM_032115 ENSG00000095981 KCNK16 K2p16.1|TALK-1|TALK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 16 protein-coding 243-64 chr7 49258486 49258710 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 334051 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 274.666-22 chr3 103104217 103104515 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 419750 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 202.666-13 chr10 67052869 67053067 + 1.33333 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) Tigger8|DNA|TcMar-Tigger 40702 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 204.333-212 chrX 84164287 84164453 + 1.33333 NA exon (NM_001330512, exon 4 of 24) exon (NM_001330512, exon 4 of 24) 23565 NM_001330512 27330 Hs.234478 NM_014496 ENSG00000072133 RPS6KA6 PP90RSK4|RSK-4|RSK4|S6K-alpha-6|p90RSK6 ribosomal protein S6 kinase A6 protein-coding 219.333-159 chr6 116517187 116517368 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_153711, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_153711, exon 2 of 2) 5638 NM_153711 254228 Hs.105081 NM_153711 ENSG00000178033 CALHM5 C6orf188|FAM26E|dJ493F7.3 calcium homeostasis modulator family member 5 protein-coding 247.333-91 chr8 135400186 135400431 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -57148 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 269.333-49 chr2 150142974 150143220 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113910 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 266.333-53 chr6 35258690 35259051 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_003427) promoter-TSS (NM_003427) -865 NM_001292032 7629 Hs.388024 NM_003427 ENSG00000065029 ZNF76 D6S229E|ZNF523|Zfp523 zinc finger protein 76 protein-coding 198-64 chr16 13925012 13925205 + 1.33333 NA intron (NM_005236, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 4951 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 179.333-50 chr12 14073841 14074016 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93572 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 140.667-72 chr14 29040597 29040765 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254894 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 174.667-36 chr12 72554181 72554426 + 1.33333 NA intron (NM_013381, intron 7 of 18) MIRb|SINE|MIR -280794 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 197.333-199 chr6 69986338 69986553 + 1.33333 NA intron (NM_001858, intron 11 of 50) MER5A|DNA|hAT-Charlie 119889 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 189.666-6 chr12 487402 487559 + 1.33333 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) AluSz|SINE|Alu 27541 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 182.666-10 chr13 106160462 106160622 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -216022 NR_034119 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 290-35 chr3 193134541 193134891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106506 NM_001366112 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 214-20 chr10 105456048 105456291 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 364164 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 410.332 chr4 86630258 86630763 + 1.33333 NA intron (NM_080685, intron 1 of 47) MamRep1151|LTR?|LTR? 36195 NM_006264 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 232.333-3 chr1 110598998 110599325 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_004974, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_004974, exon 3 of 3) 7197 NM_004974 3737 Hs.248139 NM_004974 ENSG00000177301 KCNA2 EIEE32|HBK5|HK4|HUKIV|KV1.2|MK2|NGK1|RBK2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 protein-coding 196.666-9 chr10 29286703 29286891 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -2273 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 367.667-4 chr12 38855811 38856317 + 1.33333 NA intron (NM_153634, intron 3 of 19) L1MB1|LINE|L1 49527 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 256.666-15 chr15 70038218 70038540 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 41089 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 258.667-68 chr3 196057839 196058156 + 1.33333 NA intron (NM_001313966, intron 14 of 16) MER65A|LTR|ERV1 24093 NM_003234 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 334-4 chr10 89703794 89704120 + 1.33333 NA intron (NM_016195, intron 1 of 32) AluSc8|SINE|Alu 2367 NM_001284259 9585 Hs.240 NM_016195 ENSG00000138182 KIF20B CT90|KRMP1|MPHOSPH1|MPP-1|MPP1 kinesin family member 20B protein-coding 302.666-14 chr22 36671099 36671461 + 1.33333 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) intron (NM_006078, intron 1 of 3) 31578 NM_006078 10369 Hs.146766 NM_006078 ENSG00000166862 CACNG2 MRD10 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2 protein-coding 141-71 chr5 139779816 139780058 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -15871 NM_032289 84249 Hs.21963 NM_032289 ENSG00000146005 PSD2 EFA6C pleckstrin and Sec7 domain containing 2 protein-coding 191-37 chr20 39793053 39793211 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -211329 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 308.667-46 chr9 105430789 105431153 + 1.33333 NA intron (NM_001330731, intron 15 of 15) L1MB7|LINE|L1 -17063 NM_001287191 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 419.666 chr1 81668971 81669486 + 1.33333 NA intron (NM_001366008, intron 3 of 26) intron (NM_001366008, intron 3 of 26) -30542 NM_001297704 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 291.333-24 chr14 85455033 85455303 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61253 NR_102738 100996280 Hs.135735 NR_102737 ENSG00000259107 LINC00911 - long intergenic non-protein coding RNA 911 ncRNA 206.333-147 chr7 39446947 39447156 + 1.33333 NA intron (NM_001370959, intron 7 of 9) intron (NM_001370959, intron 7 of 9) -40705 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 134.667-13 chr10 8575751 8575972 + 1.33333 NA intron (NR_134492, intron 1 of 1) MIRc|SINE|MIR 18530 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 200-86 chr2 152299409 152299678 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -35631 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 145.333-103 chr16 17823643 17823847 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -352785 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 211.333-167 chr4 63213217 63213522 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -1051604 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 322.666-24 chr8 99788552 99788916 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 43 of 61) MER58B|DNA|hAT-Charlie 104973 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 142.667-124 chr20 54325655 54325824 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 117652 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 203.333-198 chr4 127379377 127379579 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -253479 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 291.666-10 chr4 19926995 19927339 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -324738 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 300-49 chr5 46237241 46237701 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -541091 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 208.667-146 chr8 112231191 112231485 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 65 of 66) intron (NM_001363185, intron 65 of 66) -412155 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 191.333-134 chr3 74744624 74744846 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -223595 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 191.333-72 chr15 44153218 44153445 + 1.33333 NA intron (NM_001286490, intron 1 of 15) L1MB3|LINE|L1 41115 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 358.666-16 chr6 147592868 147593266 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84377 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 305-2 chr10 76480725 76481124 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -407120 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 205.333-155 chr3 106907017 106907297 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR 333481 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 355.999-5 chr4 101229281 101229565 + 1.33333 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) 11449 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 197-29 chr12 81401352 81401516 + 1.33333 NA intron (NM_001282536, intron 5 of 29) MIRc|SINE|MIR -32020 NM_001220480 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 278-61 chr7 90440659 90441058 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -28781 NM_001365443 102723899 Hs.731917 NM_001365443 LOC102723899 - uncharacterized LOC102723899 protein-coding 360.666-2 chr12 85096007 85096416 + 1.33333 NA intron (NM_001079910, intron 11 of 26) L1PA16|LINE|L1 59860 NM_001079910 84125 Hs.402200 NM_032165 ENSG00000133640 LRRIQ1 - leucine rich repeats and IQ motif containing 1 protein-coding 203-16 chr11 3236597 3236788 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4275 NM_001039165 116534 Hs.745512 NM_001039165 ENSG00000184350 MRGPRE GPR167|MGRF|MRGE MAS related GPR family member E protein-coding 192.667-183 chr9 6961256 6961525 + 1.33333 NA intron (NR_148680, intron 8 of 21) intron (NR_148680, intron 8 of 21) 204040 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 158-42 chr14 44327481 44327678 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 179704 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 138.667-22 chr10 95898655 95898863 + 1.33333 NA intron (NR_038444, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu -9206 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 245.333-101 chr6 139923959 139924218 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -52231 NR_121622 100507477 Hs.179213 NR_121622 ENSG00000236013 LOC100507477 - uncharacterized LOC100507477 ncRNA 426.333 chr1 167813737 167814190 + 1.33333 NA intron (NM_018417, intron 31 of 32) L1M4c|LINE|L1 91981 NM_024569 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 335-12 chr17 70674415 70674861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 505103 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 366.666-12 chr5 36351610 36351921 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49863 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 271.333-37 chr2 234611273 234611635 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -71214 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 196.667-35 chr12 11852239 11852500 + 1.33333 NA intron (NM_001987, intron 3 of 7) intron (NM_001987, intron 3 of 7) -197492 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 205.667 chr1 28574750 28575070 + 1.33333 NA intron (NM_017846, intron 8 of 8) MIRc|SINE|MIR 3912 NR_003077 692212 NR_003077 ENSG00000221539 SNORD99 HBII-420 small nucleolar RNA, C/D box 99 snoRNA 240-33 chr16 73381987 73382315 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -4654 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 209.333-159 chr3 142640137 142640308 + 1.33333 NA intron (NM_002670, intron 1 of 15) intron (NM_002670, intron 1 of 15) -16675 NM_001172312 5357 Hs.203637 NM_002670 ENSG00000120756 PLS1 - plastin 1 protein-coding 202.666-77 chr3 109858634 109858793 + 1.33333 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 255885 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 167.333-256 chr8 82764012 82764165 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -148016 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 347.333-2 chr1 232139732 232140111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 214087 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 316-39 chr4 98873007 98873359 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001130679, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001130679, exon 8 of 8) 55950 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 214.667-45 chr15 56602262 56602532 + 1.33333 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 131689 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 309.666 chr1 24801448 24802064 + 1.33333 NA intron (NM_013943, intron 2 of 5) intron (NM_013943, intron 2 of 5) 56309 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 392-5 chr14 50154647 50155448 + 1.33333 NA intron (NM_006939, intron 12 of 22) L1ME2z|LINE|L1 -38475 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 310-4 chr1 180973774 180974161 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001286210, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001286210, exon 6 of 6) -19080 NR_145481 103344928 Hs.665319 NR_145481 ENSG00000232586 KIAA1614-AS1 - KIAA1614 antisense RNA 1 ncRNA 394.333-4 chr14 52260079 52260424 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7447 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 337.333-40 chr6 55670261 55670673 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -91253 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 135.667-188 chr8 121182480 121182604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -370496 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 208.333-149 chr8 118039326 118039539 + 1.33333 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) AluSx|SINE|Alu 72387 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 223-40 chr22 25676092 25676293 + 1.33333 NA intron (NM_001362778, intron 7 of 19) intron (NM_001362778, intron 7 of 19) -65996 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 212.667-82 chr20 55032799 55033094 + 1.33333 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -390097 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 212-3 chr1 29494466 29494655 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -144446 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 300.666-8 chr2 162034970 162035412 + 1.33333 NA exon (NM_001935, exon 9 of 26) exon (NM_001935, exon 9 of 26) 39024 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 154.666-3 chr17 19973548 19973675 + 1.33333 NA intron (NM_007202, intron 1 of 14) intron (NM_007202, intron 1 of 14) 4217 NM_007202 11216 Hs.642676 NM_007202 ENSG00000108599 AKAP10 AKAP-10|D-AKAP-2|D-AKAP2|PRKA10 A-kinase anchoring protein 10 protein-coding 223.333-24 chr11 66152955 66153196 + 1.33333 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) L1M4a2|LINE|L1 82803 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 175.666-25 chr8 130902445 130902602 + 1.33333 NA intron (NM_001115, intron 7 of 17) intron (NM_001115, intron 7 of 17) 138386 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 233.333-69 chr2 171410581 171410912 + 1.33333 NA intron (NM_024770, intron 1 of 9) intron (NM_024770, intron 1 of 9) 23244 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 204.667-14 chr1 244875512 244875785 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11105 NM_031844 3192 Hs.106212 NM_004501 ENSG00000153187 HNRNPU EIEE54|GRIP120|HNRNPU-AS1|HNRPU|SAF-A|SAFA|U21.1|hnRNP U|pp120 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U protein-coding 352.667-26 chr7 9046610 9047096 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -587417 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 209.666-44 chr5 18404871 18405052 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 597687 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 212.666-2 chr1 76749171 76749369 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 29997 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 234.666-49 chr7 131527376 131527619 + 1.33333 NA intron (NM_001018111, intron 1 of 8) intron (NM_001018111, intron 1 of 8) 29131 NM_005397 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 183.666-5 chr12 33329999 33330165 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109737 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 182.333-137 chr5 180911735 180911887 + 1.33333 NA intron (NM_001159710, intron 2 of 6) intron (NM_001159710, intron 2 of 6) 2247 NM_001159710 79908 Hs.189109 NM_024850 ENSG00000113303 BTNL8 BTN9.2 butyrophilin like 8 protein-coding 188.666 chr1 49924570 49924712 + 1.33333 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 99313 NR_136623 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 211-41 chr16 12350882 12351080 + 1.33333 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) intron (NM_032167, intron 15 of 20) -369340 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 198.667-152 chr5 103480024 103480280 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61833 NR_104670 102467212 Hs.641885 NR_104670 ENSG00000248757 LINC02115 - long intergenic non-protein coding RNA 2115 ncRNA 184.666 chr1 71101391 71101557 + 1.33333 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) intron (NR_046217, intron 2 of 3) 20150 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 203.333-11 chr1 117501398 117501651 + 1.33333 NA intron (NM_006699, intron 11 of 12) intron (NM_006699, intron 11 of 12) 104246 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 186-17 chr10 60952115 60952368 + 1.33333 NA intron (NM_001350906, intron 2 of 12) intron (NM_001350906, intron 2 of 12) -7515 NM_001350911 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 345.999-3 chr12 15680200 15680772 + 1.33333 NA intron (NM_004447, intron 3 of 20) MIR|SINE|MIR 108902 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 486-9 chr22 45282419 45283145 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -2167 NM_001167574 7380 Hs.632787 NM_006953 ENSG00000100373 UPK3A UP3A|UPIII|UPIIIA|UPK3 uroplakin 3A protein-coding 223.333-100 chr3 11177747 11178074 + 1.33333 NA intron (NM_001098212, intron 1 of 1) intron (NM_001098212, intron 1 of 1) 23417 NM_001098212 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 214.333-91 chr3 6193540 6193818 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 611770 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 271.333-39 chr20 52597819 52598153 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -22852 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 194-10 chr10 109290968 109291222 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 632151 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 208-41 chr13 46275340 46275537 + 1.33333 NA intron (NM_001282460, intron 9 of 9) L1MA5|LINE|L1 22406 NR_047493 100861554 Hs.90866 NR_047493 ENSG00000261097 LINC00563 - long intergenic non-protein coding RNA 563 ncRNA 476.332 chr4 58645159 58645774 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -109138 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 218.666-48 chr20 32297535 32297735 + 1.33333 NA intron (NM_004798, intron 1 of 8) intron (NM_004798, intron 1 of 8) 19984 NM_004798 9371 Hs.369670 NM_004798 ENSG00000101350 KIF3B FLA8|HH0048|KLP-11 kinesin family member 3B protein-coding 139.333-97 chr18 1814966 1815111 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -455409 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 201.666-37 chr6 63298562 63298721 + 1.33333 NA intron (NM_001143940, intron 1 of 4) MER57A-int|LTR|ERV1 21336 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 316.666-4 chr10 106331637 106331951 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 191629 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 358.666-6 chr2 167984926 167985268 + 1.33333 NA intron (NM_013233, intron 16 of 17) intron (NM_013233, intron 16 of 17) -43953 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 127.667-29 chr11 92117329 92117509 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -107615 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 446.333-6 chr3 193661625 193662406 + 1.33333 NA intron (NM_130831, intron 22 of 27) intron (NM_130831, intron 22 of 27) -34683 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 285.333-14 chr10 102707078 102707484 + 1.33333 NA intron (NM_004311, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 7116 NM_004311 403 Hs.182215 NM_004311 ENSG00000138175 ARL3 ARFL3|JBTS35|RP83 ADP ribosylation factor like GTPase 3 protein-coding 249.333-94 chr7 107984868 107985135 + 1.33333 NA intron (NM_002291, intron 7 of 33) intron (NM_002291, intron 7 of 33) 18160 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 185-81 chr8 138815571 138815768 + 1.33333 NA intron (NM_152888, intron 7 of 64) intron (NM_152888, intron 7 of 64) 98372 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 193.666-48 chr8 84600196 84600356 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) -105651 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 227.333-73 chr20 35224214 35224549 + 1.33333 NA intron (NM_001355008, intron 3 of 14) AluSz6|SINE|Alu -2309 NM_006690 10893 Hs.715494 NM_006690 ENSG00000125966 MMP24 MMP-24|MMP25|MT-MMP 5|MT-MMP5|MT5-MMP|MT5MMP|MTMMP5 matrix metallopeptidase 24 protein-coding 302.667-6 chr12 25813976 25814420 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 59881 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 187.333-211 chr9 72978727 72978967 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25794 NM_000689 216 Hs.76392 NM_000689 ENSG00000165092 ALDH1A1 ALDC|ALDH-E1|ALDH1|ALDH11|HEL-9|HEL-S-53e|HEL12|PUMB1|RALDH1 aldehyde dehydrogenase 1 family member A1 protein-coding 225.666-22 chr4 47388705 47388973 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) L3|LINE|CR1 74863 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 186.667-109 chr4 129062706 129062955 + 1.33333 NA intron (NM_001300898, intron 2 of 5) L1M2|LINE|L1 30709 NM_001300897 132320 Hs.654690 NM_144643 ENSG00000151466 SCLT1 CAP-1A|CAP1A sodium channel and clathrin linker 1 protein-coding 206.666-3 chr1 41302690 41302933 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -58623 NM_001291281 100132074 Hs.559677 NM_001291281 FOXO6 - forkhead box O6 protein-coding 236.666-23 chr18 7415686 7415887 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 45220 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 210.666-3 chr1 63132791 63132990 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120419 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 256.667-18 chr12 29152967 29153292 + 1.33333 NA intron (NM_001271783, intron 1 of 11) L2b|LINE|L2 3851 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 441.332 chr13 36082044 36082430 + 1.33333 NA intron (NM_001330071, intron 3 of 16) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 49145 NM_001330071 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 140.666-7 chr3 197784255 197784403 + 1.33333 NA non-coding (NR_027840, exon 9 of 9) non-coding (NR_027840, exon 9 of 9) -6897 NM_001363887 84859 Hs.518414 NM_032773 ENSG00000186001 LRCH3 - leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3 protein-coding 196.333-63 chr17 54349979 54350156 + 1.33333 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 527140 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 290-34 chr3 123595954 123596264 + 1.33333 NA intron (NR_121654, intron 2 of 3) intron (NR_121654, intron 2 of 3) 10596 NR_038266 100506826 Hs.556600 NR_038266 ENSG00000239523 MYLK-AS1 - MYLK antisense RNA 1 ncRNA 211.333-47 chr12 115680206 115680521 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 468291 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 395-11 chr2 111017565 111017964 + 1.33333 NA intron (NM_001371254, intron 15 of 18) intron (NM_001371254, intron 15 of 18) 97824 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 190-47 chr16 76558067 76558211 + 1.33333 NA intron (NR_136210, intron 24 of 24) intron (NR_136210, intron 24 of 24) -76859 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 520 chr14 61771115 61771736 + 1.33333 NA intron (NM_003082, intron 4 of 9) intron (NM_003082, intron 4 of 9) 9005 NM_003082 6617 Hs.179312 NM_003082 ENSG00000023608 SNAPC1 PTFgamma|SNAP43 small nuclear RNA activating complex polypeptide 1 protein-coding 291.333-31 chr18 559526 559961 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -20637 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 248.666-28 chr3 123024432 123024745 + 1.33333 NA intron (NR_046079, intron 1 of 22) intron (NR_046079, intron 1 of 22) 3175 NM_001031702 54437 Hs.210870 NM_018987 ENSG00000082684 SEMA5B SEMAG|SemG semaphorin 5B protein-coding 176.333-176 chr8 140373683 140373835 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 7 of 22) L1M5|LINE|L1 83985 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 203.666-39 chr3 61038840 61039048 + 1.33333 NA intron (NR_148922, intron 3 of 3) MER45A|DNA|hAT-Tip100 212508 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 182-107 chr8 15725426 15725593 + 1.33333 NA intron (NM_001356429, intron 6 of 10) intron (NM_001356429, intron 6 of 10) 185246 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 357-4 chr1 225993282 225993632 + 1.33333 NA intron (NM_152608, intron 2 of 6) AluY|SINE|Alu 5886 NM_152608 163859 Hs.520192 NM_152608 ENSG00000143751 SDE2 C1orf55|dJ671D7.1 SDE2 telomere maintenance homolog protein-coding 189-27 chr14 61247126 61247302 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34124 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 231.333-25 chr11 84754295 84754552 + 1.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -33481 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 148-12 chr1 204856879 204856997 + 1.33333 NA intron (NM_001160332, intron 1 of 27) L1MB5|LINE|L1 28284 NM_001160332 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 218.333-32 chr13 65955902 65956219 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 10369 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 185-67 chr7 46884721 46884936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -187706 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 173.333-175 chr6 87839957 87840308 + 1.33333 NA intron (NR_110869, intron 2 of 4) intron (NR_110869, intron 2 of 4) 55272 NR_110869 101928911 Hs.571178 NR_110869 LOC101928911 - uncharacterized LOC101928911 ncRNA 204-88 chr19 24074236 24074480 + 1.33333 NA intron (NM_001278677, intron 3 of 5) BSR/Beta|Satellite|Satellite -12802 NM_001278664 9534 Hs.434406 NM_004876 ENSG00000213096 ZNF254 BMZF-5|HD-ZNF1|ZNF539|ZNF91L zinc finger protein 254 protein-coding 208-156 chr7 30748347 30748615 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -3654 NM_001199219 11185 Hs.632629 NM_006774 ENSG00000241644 INMT TEMT indolethylamine N-methyltransferase protein-coding 230-80 chrX 77943655 77943866 + 1.33333 NA intron (NM_001282224, intron 1 of 21) L1ME3G|LINE|L1 25878 NM_001029891 441531 Hs.632822 NM_001029891 ENSG00000226784 PGAM4 PGAM-B|PGAM1|PGAM3|dJ1000K24.1 phosphoglycerate mutase family member 4 protein-coding 204.333-136 chr4 13467405 13467661 + 1.33333 NA intron (NM_001017979, intron 3 of 6) L1MCb|LINE|L1 16807 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 214-106 chr5 27601295 27601545 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 129128 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 198.666-32 chr17 61535234 61535392 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 55906 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 196-176 chr8 27014790 27015010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34063 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 280.333-14 chr15 96504537 96504861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 170934 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 192.667-53 chr12 115074647 115074921 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -390609 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 209-103 chr6 130363712 130363968 + 1.33333 NA intron (NM_001258275, intron 1 of 13) intron (NM_001258275, intron 1 of 13) 2028 NM_001258275 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 198-176 chr7 97833896 97834091 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 38172 NM_133436 440 Hs.489207 NM_001673 ENSG00000070669 ASNS ASNSD|TS11 asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing) protein-coding 220.666-7 chr1 237684635 237684862 + 1.33333 NA intron (NM_001035, intron 62 of 104) L2c|LINE|L2 -177427 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 265.666-15 chr22 49501519 49501776 + 1.33333 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) MER20|DNA|hAT-Charlie 41819 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 162.667-24 chr10 31225526 31225761 + 1.33333 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 37760 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 233.666-34 chrX 52995204 52995462 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001242489, exon 1 of 3) 5' UTR (NM_001242489, exon 1 of 3) 139 NM_001242495 29057 Hs.6451 NM_014138 ENSG00000268350 FAM156A PRO0659|TMEM29 family with sequence similarity 156 member A protein-coding 205.333-217 chr7 27132294 27132556 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1668 NM_002141 3201 Hs.533357 NM_002141 ENSG00000197576 HOXA4 HOX1|HOX1D homeobox A4 protein-coding 206.667-5 chr1 115209815 115210120 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -73067 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 258-72 chr6 111176798 111177105 + 1.33333 NA intron (NM_018593, intron 2 of 5) intron (NM_018593, intron 2 of 5) 63117 NR_145796 109623478 NR_145796 SNORD166 - small nucleolar RNA, C/D box 166 snoRNA 198-168 chr7 21326942 21327116 + 1.33333 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -101054 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 188.333-133 chr6 129155752 129155987 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 8 of 64) L1MEf|LINE|L1 272728 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 174.333-132 chr6 89590742 89590947 + 1.33333 NA intron (NM_001242809, intron 2 of 15) MIR|SINE|MIR 24006 NM_001242814 22881 Hs.702213 NM_014942 ENSG00000135299 ANKRD6 - ankyrin repeat domain 6 protein-coding 288-34 chr3 96485246 96485621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 125469 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 222.666-51 chr7 31371518 31371725 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30895 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 288-13 chr10 91493438 91493842 + 1.33333 NA intron (NM_182765, intron 14 of 20) intron (NM_182765, intron 14 of 20) 83355 NR_145526 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 230.666-43 chr5 20971523 20971793 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -356123 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 182-106 chr7 112592525 112592836 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -25385 NR_110160 100996249 Hs.561749 NR_110159 LOC100996249 - uncharacterized LOC100996249 ncRNA 160.666-20 chr9 135832546 135832722 + 1.33333 NA intron (NM_015447, intron 7 of 16) L1MA9|LINE|L1 74912 NM_015447 157922 Hs.522493 NM_015447 ENSG00000130559 CAMSAP1 - calmodulin regulated spectrin associated protein 1 protein-coding 236.666-46 chr8 17095939 17096220 + 1.33333 NA intron (NM_001349810, intron 8 of 14) intron (NM_001349810, intron 8 of 14) -60403 NM_016353 51201 Hs.728241 NM_016353 ENSG00000104219 ZDHHC2 DHHC2|ZNF372 zinc finger DHHC-type containing 2 protein-coding 158.333-229 chr4 56347048 56347199 + 1.33333 NA intron (NM_001286669, intron 10 of 13) L1M4|LINE|L1 40368 NM_001323890 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 384.667-2 chr12 33899816 33900403 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -122387 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 141.333-111 chr2 97911167 97911321 + 1.33333 NA intron (NM_015348, intron 2 of 40) L1ME1|LINE|L1 84704 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 285.333-72 chr8 90243995 90244347 + 1.33333 NA intron (NR_051989, intron 1 of 3) L1ME3A|LINE|L1 22683 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 199.666-38 chr3 117068190 117068344 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 146836 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 200-48 chr13 104188187 104188428 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 763107 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 406.333-16 chr8 61654134 61654510 + 1.33333 NA intron (NM_032468, intron 4 of 14) intron (NM_032468, intron 4 of 14) 35489 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 255-51 chr22 44630397 44630642 + 1.33333 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 -5100 NR_044991 414351 Hs.572878 NR_044991 LINC00229 C22orf10|NCRNA00229|dJ474I12.C22.2 long intergenic non-protein coding RNA 229 ncRNA 208.667-77 chr2 227168547 227168794 + 1.33333 NA intron (NM_000091, intron 1 of 51) L1ME3Cz|LINE|L1 4105 NM_000091 1285 Hs.570065 NM_000091 ENSG00000169031 COL4A3 ATS2|ATS3 collagen type IV alpha 3 chain protein-coding 263.667-12 chr10 94511842 94512230 + 1.33333 NA intron (NM_015188, intron 9 of 12) HAL1|LINE|L1 -33731 NM_001289067 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 193.666-41 chr6 56867006 56867237 + 1.33333 NA intron (NM_001144769, intron 3 of 96) intron (NM_001144769, intron 3 of 96) -15205 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 196-186 chr8 116663270 116663514 + 1.33333 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 11292 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 122.667-179 chr7 93357112 93357282 + 1.33333 NA intron (NM_001257998, intron 28 of 28) intron (NM_001257998, intron 28 of 28) 124831 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 219.666-30 chr3 119893987 119894266 + 1.33333 NA intron (NM_002093, intron 7 of 11) L1MB7|LINE|L1 111416 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 150-83 chr20 512696 512870 + 1.33333 NA intron (NM_001362771, intron 1 of 13) intron (NM_001362771, intron 1 of 13) 31007 NM_001362770 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 238.333-97 chrX 82720058 82720351 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -788086 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 310.666-22 chr8 83020371 83020638 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 108400 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 515.999-2 chr2 83592404 83592982 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 69879 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 222-70 chr5 2767774 2767997 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 15754 NM_178569 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 207.333-173 chr3 5677341 5677503 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -427167 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 303-35 chr3 4569970 4570288 + 1.33333 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) intron (NM_001168272, intron 4 of 60) 76781 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 212.333-73 chr2 148035573 148035902 + 1.33333 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) MIR|SINE|MIR -14133 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 174-9 chr10 52243969 52244188 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) intron (NM_001098512, intron 9 of 17) 70050 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 310-40 chr4 43631139 43631505 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -138779 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 288-5 chr1 81380378 81380758 + 1.33333 NA intron (NM_001366003, intron 2 of 27) L1M5|LINE|L1 74173 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 207-19 chr11 26868558 26868796 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -125435 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 279.333-58 chr3 178879457 178879675 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19161 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 205-50 chr2 122791209 122791452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 282151 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 342-32 chr5 123276113 123276565 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 147253 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 209.667-96 chr5 118144893 118145195 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -137530 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 204.333-159 chr5 62215348 62215615 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -90681 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 203.333-222 chr5 157231036 157231276 + 1.33333 NA intron (NM_005546, intron 7 of 16) MIR3|SINE|MIR -34967 NM_001037333 26999 Hs.519702 NM_014376 ENSG00000055163 CYFIP2 EIEE65|PIR121 cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 protein-coding 262.666-12 chr20 44422169 44422525 + 1.33333 NA intron (NM_001287183, intron 8 of 10) intron (NM_001287183, intron 8 of 10) 14227 NR_037419 100500813 NR_037419 ENSG00000266151 MIR3646 - microRNA 3646 ncRNA 206.999 chr16 3799269 3799435 + 1.33333 NA intron (NM_004380, intron 3 of 30) L1ME4a|LINE|L1 80768 NM_001079846 1387 Hs.459759 NM_004380 ENSG00000005339 CREBBP CBP|KAT3A|MKHK1|RSTS|RSTS1 CREB binding protein protein-coding 258.666-6 chr10 110538489 110538869 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -29012 NM_005445 9126 Hs.24485 NM_005445 ENSG00000108055 SMC3 BAM|BMH|CDLS3|CSPG6|HCAP|SMC3L1 structural maintenance of chromosomes 3 protein-coding 163.666-13 chr5 130575634 130575865 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 589507 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 156.667-140 chr17 71220262 71220550 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18227 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 209.666-46 chr6 120883924 120884156 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 450440 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 210.666-51 chr2 30998480 30998716 + 1.33333 NA intron (NM_024572, intron 1 of 14) intron (NM_024572, intron 1 of 14) 131042 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 250-82 chr8 21573743 21574091 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 214958 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 159.333-122 chr16 89928985 89929114 + 1.33333 NA intron (NM_006086, intron 1 of 3) AluSz6|SINE|Alu 5707 NM_006086 10381 Hs.511743 NM_006086 ENSG00000258947 TUBB3 CDCBM|CDCBM1|CFEOM3|CFEOM3A|FEOM3|TUBB4|beta-4 tubulin beta 3 class III protein-coding 258-27 chr18 68111465 68111676 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -296748 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 220-65 chr2 135028824 135029055 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4261 NM_001018047 80122 Hs.659395 NM_025052 ENSG00000176601 MAP3K19 RCK|YSK4 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 protein-coding 210-96 chr3 150019231 150019419 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35959 NM_001079809 653659 Hs.652908 NM_001079809 TMEM183B C1ORF37DUP|C1orf37-DUP transmembrane protein 183B protein-coding 364-27 chr7 105792673 105793070 + 1.33333 NA intron (NM_152749, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 83714 NM_020725 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 332.333-18 chr4 52453009 52453383 + 1.33333 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 203343 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 156-122 chr6 54919195 54919401 + 1.33333 NA intron (NM_001010872, intron 2 of 4) intron (NM_001010872, intron 2 of 4) 72527 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 189.333-217 chr9 92844309 92844481 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_031486, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_031486, exon 5 of 5) 33573 NM_001354536 83744 Hs.668378 NM_031486 ENSG00000127081 ZNF484 BA526D8.4 zinc finger protein 484 protein-coding 520-3 chr8 121455268 121455941 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183742 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 166.333-14 chr1 200209496 200209669 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 164210 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 313.333-22 chr22 34692633 34693056 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 305072 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 287-6 chr1 242526238 242526706 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1775 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 212-98 chr21 22774185 22774443 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -304970 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 210.666-24 chr12 42448196 42448401 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001364831, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001364831, exon 12 of 12) 35317 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 170-108 chr6 89510072 89510234 + 1.33333 NA intron (NM_001242809, intron 1 of 15) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -52165 NM_001242811 22881 Hs.702213 NM_014942 ENSG00000135299 ANKRD6 - ankyrin repeat domain 6 protein-coding 198.333-12 chr1 112940778 112941010 + 1.33333 NA intron (NM_003051, intron 1 of 4).2 L1PA16|LINE|L1 15169 NM_001166496 6566 Hs.75231 NM_003051 ENSG00000155380 SLC16A1 HHF7|MCT|MCT1|MCT1D solute carrier family 16 member 1 protein-coding 144-159 chr9 38016142 38016299 + 1.33333 NA intron (NM_003028, intron 1 of 5) intron (NM_003028, intron 1 of 5) 53007 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 281.666-9 chr3 53309430 53309781 + 1.33333 NA intron (NM_018403, intron 5 of 9) AluJb|SINE|Alu 23522 NR_145715 109617024 NR_145715 ENSG00000207109 SNORD38C - small nucleolar RNA, C/D box 38C snoRNA 272-50 chr8 66836151 66836406 + 1.33333 NA intron (NM_001204173, intron 12 of 18) intron (NM_001204173, intron 12 of 18) -34493 NM_173518 157777 Hs.437006 NM_173518 ENSG00000178460 MCMDC2 C8orf45 minichromosome maintenance domain containing 2 protein-coding 221.999-3 chr15 98717423 98717629 + 1.33333 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) -66305 NR_126453 104472848 Hs.349049 NR_126453 IRAIN IGF1R-AS IGF1R antisense imprinted non-protein coding RNA ncRNA 238.666-42 chr8 88548067 88548365 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -220733 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 175.333-98 chr2 195349029 195349225 + 1.33333 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -307831 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 336.666-20 chr5 107765865 107766209 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95100 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 280-48 chr6 38962491 38962797 + 1.33333 NA intron (NM_001371, intron 81 of 91) intron (NM_001371, intron 81 of 91) -9537 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 256.666-48 chr7 110725070 110725389 + 1.33333 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -365777 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 180-50 chr19 31145894 31146080 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21523 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 311.333-18 chr14 90224655 90224986 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -31733 NM_002802 5700 Hs.356654 NM_002802 ENSG00000100764 PSMC1 P26S4|S4|p56 proteasome 26S subunit, ATPase 1 protein-coding 270.666-4 chr12 57582471 57582847 + 1.33333 NA intron (NM_004984, intron 27 of 28) intron (NM_004984, intron 27 of 28) -8533 NM_024779 79837 Hs.745011 NM_024779 ENSG00000166908 PIP4K2C PIP5K2C phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 gamma protein-coding 230.666-48 chr7 138157530 138157809 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33911 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 186.333-171 chr8 130247628 130247888 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 48775 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 224-62 chr3 140742463 140742651 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 64493 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 197.666-64 chr8 78246523 78246758 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -269700 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 202.666-88 chr4 80548523 80548755 + 1.33333 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) intron (NM_152770, intron 2 of 5) 212919 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 405.666-3 chr6 69351159 69351595 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 26 of 31) AluSq2|SINE|Alu 445089 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 179-43 chr18 5518625 5518777 + 1.33333 NA intron (NM_001330557, intron 1 of 21) intron (NM_001330557, intron 1 of 21) 21855 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 163-45 chr2 198756096 198756235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -381068 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 209.333-105 chr2 25362173 25362439 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19716 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 307.667-14 chr14 75145122 75145553 + 1.33333 NA intron (NM_006827, intron 3 of 4) intron (NM_006827, intron 3 of 4) -18289 NM_001329237 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 246-103 chr8 58380094 58380295 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31070 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 314-31 chr3 125331945 125332269 + 1.33333 NA intron (NM_001348436, intron 1 of 8) intron (NM_001348436, intron 1 of 8) 25173 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 452.666-5 chr9 101775839 101776565 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -37622 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 300.666-10 chr3 81057854 81058119 + 1.33333 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) intron (NR_132411, intron 1 of 1) 64118 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 202-84 chr2 101636437 101636755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61107 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 163.666-2 chr10 121765549 121765692 + 1.33333 NA intron (NM_001001976, intron 11 of 11) intron (NM_001001976, intron 11 of 11) 162411 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 273.333-29 chr18 72471623 72472004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 72529 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 202-19 chr10 66514415 66514666 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) intron (NM_001127384, intron 11 of 17) -411496 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 204-156 chr4 102702521 102702725 + 1.33333 NA intron (NM_005908, intron 5 of 16) L1PA3|LINE|L1 58345 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 215.333-188 chr7 87253052 87253223 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32550 NR_138030 79161 Hs.619593 NM_024315 ENSG00000135185 TMEM243 C7orf23|MM-TRAG|MMTRAG transmembrane protein 243 protein-coding 254.333-48 chr20 4559293 4559699 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -126960 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 272.667-65 chr8 136399113 136399476 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -131504 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 270.667-11 chr12 63974924 63975328 + 1.33333 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) MIRc|SINE|MIR 130426 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 184.666-8 chr11 82208732 82208939 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1MA8|LINE|L1 195078 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 352.999-3 chr3 81614327 81614625 + 1.33333 NA intron (NM_000158, intron 7 of 15) AluJr|SINE|Alu 147169 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 327-11 chr18 56900793 56901206 + 1.33333 NA intron (NM_015285, intron 21 of 27) LTR41C|LTR|ERVL 171120 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 210.666-43 chr16 76739035 76739209 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 104124 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 381.666-8 chr4 39877573 39877996 + 1.33333 NA intron (NM_001100399, intron 18 of 32) AluJo|SINE|Alu 100127 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 253.333-105 chr8 29530976 29531249 + 1.33333 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -180428 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 212.666-23 chr13 20018001 20018200 + 1.33333 NA intron (NM_197968, intron 6 of 24) L1MDa|LINE|L1 58286 NR_148365 7750 Hs.507433 NM_003453 ENSG00000121741 ZMYM2 FIM|MYM|RAMP|SCLL|ZNF198 zinc finger MYM-type containing 2 protein-coding 242.666-5 chr1 112267490 112267746 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -128596 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 209.999-5 chr21 32239244 32239406 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39724 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 214.333-93 chr3 45892718 45893077 + 1.33333 NA intron (NM_006641, intron 1 of 1) intron (NM_006641, intron 1 of 1) 6354 NM_006641 10803 Hs.225946 NM_006641 ENSG00000173585 CCR9 CC-CKR-9|CDw199|GPR-9-6|GPR28 C-C motif chemokine receptor 9 protein-coding 196.666-77 chr4 53584419 53584636 + 1.33333 NA intron (NM_001126328, intron 1 of 10) intron (NM_001126328, intron 1 of 10) 6959 NM_001126328 84708 Hs.518760 NM_032622 ENSG00000072201 LNX1 LNX|MPDZ|PDZRN2 ligand of numb-protein X 1 protein-coding 196.333-153 chr6 46038845 46039025 + 1.33333 NA intron (NM_001370649, intron 1 of 5) intron (NM_001370649, intron 1 of 5) -23046 NM_001256023 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 164.667-76 chr14 83381181 83381401 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 738659 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 220.667-74 chr4 105505168 105505457 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31242 NM_006903 27068 Hs.654957 NM_006903 ENSG00000138777 PPA2 HSPC124|SCFAI|SCFI|SID6-306 pyrophosphatase (inorganic) 2 protein-coding 203.666-47 chr5 104310574 104310737 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -747866 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 324.667-12 chr17 48261082 48261619 + 1.33333 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -32997 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 198-37 chr12 88493002 88493297 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003994, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_003994, exon 9 of 9) 87322 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 287.666-7 chr2 107135087 107135520 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 214222 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 220-123 chr8 119466434 119466747 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 50144 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 209-36 chr13 37412895 37413305 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 71684 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 166-8 chr1 92022112 92022258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7800 NM_173567 253152 Hs.201555 NM_173567 ENSG00000172031 EPHX4 ABHD7|EH4|EPHXRP epoxide hydrolase 4 protein-coding 209.333-44 chr12 27587710 27588010 + 1.33333 NA intron (NM_001198915, intron 2 of 26) intron (NM_001198915, intron 2 of 26) 63654 NM_001198916 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 190.666-8 chr1 211090199 211090396 + 1.33333 NA intron (NM_002238, intron 4 of 10) intron (NM_002238, intron 4 of 10) 43077 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 162.667-158 chr20 46543512 46543688 + 1.33333 NA intron (NM_080721, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 7054 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 152.667-397 chr9 111446959 111447160 + 1.33333 NA intron (NM_001363756, intron 2 of 48) intron (NM_001363756, intron 2 of 48) 36503 NM_001364930 23392 Hs.368255 NM_001080398 ENSG00000136813 ECPAS ECM29|KIAA0368 Ecm29 proteasome adaptor and scaffold protein-coding 204.333-59 chr14 82106678 82106909 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -363655 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 327.999-6 chr20 35398119 35398388 + 1.33333 NA intron (NM_001184977, intron 1 of 7) intron (NM_001184977, intron 1 of 7) 13720 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 262-65 chr5 39696402 39696729 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176134 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 169-64 chr3 84930927 84931190 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -27931 NM_001167674 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 285-25 chr4 62245521 62245849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83920 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 184.666-19 chr2 117014065 117014277 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -800520 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 272.666-24 chr7 54888105 54888326 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128902 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 191.333-157 chr5 44393561 44393831 + 1.33333 NA intron (NR_108034, intron 1 of 2) intron (NR_108034, intron 1 of 2) -4276 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 214.666-64 chr6 109355251 109355545 + 1.33333 NA TTS (NR_152435) TTS (NR_152435) 26341 NM_001346500 8763 Hs.520313 NM_006016 ENSG00000135535 CD164 DFNA66|MGC-24|MGC-24v|MUC-24|endolyn CD164 molecule protein-coding 218-79 chr4 45345345 45345558 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -618817 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 292.999-2 chr14 22280478 22280856 + 1.33333 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 152086 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 335.333-51 chr7 94175571 94175942 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -171401 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 200-87 chr2 157559187 157559457 + 1.33333 NA intron (NM_001111031, intron 2 of 8) intron (NM_001111031, intron 2 of 8) 38238 NM_001111031 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 264.333 chr1 43433660 43433872 + 1.33333 NA intron (NM_015284, intron 39 of 70) AluSx1|SINE|Alu -14773 NR_106793 102465440 NR_106793 ENSG00000274975 MIR6735 hsa-mir-6735 microRNA 6735 ncRNA 267.333-92 chr8 99500028 99500364 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 25 of 61) intron (NM_017890, intron 25 of 61) 36534 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 226-9 chr10 65217260 65217476 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -292850 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 223-15 chr13 75281111 75281397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40666 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 331.333-37 chr4 35910231 35910515 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 333566 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 210.333-88 chr2 236263496 236263746 + 1.33333 NA intron (NM_212556, intron 1 of 5) L1ME4c|LINE|L1 724 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 232.667-22 chr13 103668720 103669050 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 243685 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 216-98 chr5 105770848 105771130 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 671515 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 342.333-8 chr15 56640884 56641335 + 1.33333 NA intron (NM_001002843, intron 19 of 20) intron (NM_001002843, intron 19 of 20) 92977 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 243.666-19 chr2 12586791 12587149 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -129902 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 191.666-5 chr17 18333800 18334215 + 1.33333 NA intron (NM_148918, intron 7 of 10) AluSz|SINE|Alu 6879 NR_106836 102466733 NR_106836 ENSG00000283772 MIR6778 hsa-mir-6778 microRNA 6778 ncRNA 277-13 chr14 61076286 61076617 + 1.33333 NA intron (NR_033344, intron 15 of 16) MIR|SINE|MIR -94761 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 173.333-59 chr15 25601553 25601727 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -162584 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 395.333-11 chr16 7780068 7780643 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 447510 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 202-121 chr3 190640644 190640940 + 1.33333 NA intron (NM_001364881, intron 9 of 11) intron (NM_001364881, intron 9 of 11) 126707 NM_001364879 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 220.666-38 chr2 194493831 194494028 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 149660 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 200.666-2 chr1 78516101 78516267 + 1.33333 NA intron (NM_001039585, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 25210 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 201.333-213 chr4 91779328 91779602 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 497837 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 196.667-88 chr21 19933796 19934035 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -34160 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 288.666-3 chr1 118006807 118007175 + 1.33333 NA intron (NM_206996, intron 31 of 48) L1MB7|LINE|L1 77252 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 199.333-198 chr4 53015445 53015654 + 1.33333 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 153232 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 415.999-2 chr19 21454037 21454511 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29441 NR_037194 400680 Hs.710554 NR_037194 ENSG00000268658 LINC00664 - long intergenic non-protein coding RNA 664 ncRNA 229-41 chr3 115869504 115869764 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 35492 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 462-15 chr5 22601170 22601609 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) L1PA13|LINE|L1 251955 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 112.667-74 chr15 55717538 55717714 + 1.33333 NA intron (NM_173814, intron 2 of 19) intron (NM_173814, intron 2 of 19) 25526 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 195.333-154 chr4 45922026 45922241 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 201921 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 145.666-5 chr4 87062312 87062475 + 1.33333 NA intron (NM_005935, intron 3 of 19) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 55392 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 215-27 chr17 57670474 57670743 + 1.33333 NA intron (NM_138962, intron 11 of 13) Plat_L3|LINE|CR1 -62196 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 151.667-46 chr10 37462863 37463037 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 139981 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 298.333-32 chr4 61720466 61720731 + 1.33333 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) intron (NM_001371342, intron 4 of 20) 441167 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 208-21 chr10 63540795 63541081 + 1.33333 NA intron (NM_001001330, intron 1 of 7) HAL1b|LINE|L1 -19048 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 461.333-2 chr21 25956271 25956869 + 1.33333 NA intron (NM_001136131, intron 9 of 15) intron (NM_001136131, intron 9 of 15) 183820 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 287.333-11 chr11 16083544 16083838 + 1.33333 NA intron (NM_017508, intron 8 of 14) MIR3|SINE|MIR -114070 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 208.333-143 chr8 40198253 40198424 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44856 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 141.333-175 chr4 79172548 79172710 + 1.33333 NA intron (NR_038342, intron 3 of 5) intron (NR_038342, intron 3 of 5) 153432 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 293.333-19 chr17 56154302 56154662 + 1.33333 NA intron (NM_153228, intron 1 of 16) (TTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1007 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 225.666-16 chr22 32086029 32086231 + 1.33333 NA intron (NM_000343, intron 9 of 14) AluY|SINE|Alu 26960 NM_001256314 6523 Hs.1964 NM_000343 ENSG00000100170 SLC5A1 D22S675|NAGT|SGLT1 solute carrier family 5 member 1 protein-coding 207.333-241 chr6 68633725 68633902 + 1.33333 NA intron (NR_125872, intron 1 of 1) intron (NR_125872, intron 1 of 1) 511 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 217.333-44 chr15 35798139 35798477 + 1.33333 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) L1MCa|LINE|L1 -128548 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 197.333-64 chr14 54067131 54067386 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -110367 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 187.333-106 chr2 126713469 126713687 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 57420 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 199.333-282 chr8 123091491 123091653 + 1.33333 NA intron (NM_001363149, intron 4 of 21) intron (NM_001363149, intron 4 of 21) 18323 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 218-29 chr15 79663189 79663473 + 1.33333 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 230815 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 405-12 chr4 59151259 59151869 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 137991 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 211-77 chr5 4351108 4351338 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -422258 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 209.666-34 chr20 11128307 11128550 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 101884 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 214.666-17 chr12 12172754 12172961 + 1.33333 NA intron (NM_002336, intron 7 of 22).2 intron (NM_002336, intron 7 of 22).2 60905 NR_128710 103504734 NR_128710 ENSG00000283475 MIR1244-4 hsa-mir-1244-4 microRNA 1244-4 ncRNA 198.333-11 chr1 102603381 102603644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 504984 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 256.666-30 chr3 107769031 107769264 + 1.33333 NA intron (NM_001276286, intron 10 of 16) AluJr|SINE|Alu 108921 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 375.333-16 chr22 34337677 34338083 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -414992 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 211.333-43 chr12 61985622 61986105 + 1.33333 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 206976 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 165.333-8 chr1 82771271 82771422 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -131837 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 210.666-33 chr14 66052224 66052387 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -434066 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 265.666-14 chr21 21309621 21309934 + 1.33333 NA intron (NM_001352592, intron 6 of 18) L1ME1|LINE|L1 162615 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 251.666-6 chr11 28483326 28483656 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -5943 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 198-6 chr1 150642933 150643093 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13391 NM_207044 2029 Hs.632456 NM_004436 ENSG00000143420 ENSA ARPP-19e endosulfine alpha protein-coding 195-49 chr17 29022932 29023105 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16578 NM_001290202 124925 Hs.21837 NM_178860 ENSG00000063015 SEZ6 BSRPC seizure related 6 homolog protein-coding 130-70 chr21 22082993 22083123 + 1.33333 NA intron (NR_109959, intron 2 of 5) MER91A|DNA|hAT-Tip100 15401 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 201.333-25 chr1 239448373 239448569 + 1.33333 NA intron (NM_001347716, intron 1 of 7) intron (NM_001347716, intron 1 of 7) 61903 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 217.333-48 chr15 96526947 96527209 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193313 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 288-41 chr5 64193500 64193835 + 1.33333 NA intron (NM_001113561, intron 1 of 7) intron (NM_001113561, intron 1 of 7) 27824 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 306.666-33 chr6 131030208 131030511 + 1.33333 NA intron (NM_001135554, intron 1 of 14) intron (NM_001135554, intron 1 of 14) -16750 NM_001350309 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 277.999-5 chr19 47095915 47096164 + 1.33333 NA intron (NM_015168, intron 2 of 14) intron (NM_015168, intron 2 of 14) 17737 NM_015168 23211 Hs.104661 NM_015168 ENSG00000130749 ZC3H4 C19orf7 zinc finger CCCH-type containing 4 protein-coding 184-116 chr8 131854783 131855015 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -49194 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 259.666-19 chr17 68480959 68481300 + 1.33333 NA intron (NM_001278433, intron 1 of 10) L1MEd|LINE|L1 -23605 NM_001320772 55062 Hs.463964 NM_017983 ENSG00000070540 WIPI1 ATG18|ATG18A|WIPI49 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 protein-coding 275-27 chr2 183476861 183477266 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 352620 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 196.333-76 chr18 69411276 69411560 + 1.33333 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 10530 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 333.666-5 chr14 61043159 61043589 + 1.33333 NA intron (NR_033344, intron 9 of 16) intron (NR_033344, intron 9 of 16) -61684 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 288.333-43 chr9 104481276 104481604 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -22823 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 224-101 chr8 4028361 4028622 + 1.33333 NA intron (NM_033225, intron 4 of 69) intron (NM_033225, intron 4 of 69) 966423 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 138.667-181 chr6 69294957 69295116 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 20 of 31) intron (NM_001704, intron 20 of 31) 501430 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 211.333-174 chr4 104632487 104632662 + 1.33333 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) intron (NR_125926, intron 1 of 9) -137680 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 200.333-150 chr8 69116343 69116622 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -12292 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 247.333-40 chr2 31603134 31603382 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -22320 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 161.333-124 chr18 2580419 2580581 + 1.33333 NA intron (NM_006101, intron 6 of 16) intron (NM_006101, intron 6 of 16) 8943 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 208-31 chr11 97887924 97888099 + 1.33333 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -1132938 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 288.666-11 chr17 6124083 6124395 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_015253, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_015253, exon 9 of 9) 53625 NM_015253 23302 Hs.370166 NM_015253 ENSG00000179314 WSCD1 - WSC domain containing 1 protein-coding 288.666-27 chr4 44362834 44363275 + 1.33333 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 85755 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 200.333-149 chr8 68099842 68100089 + 1.33333 NA intron (NM_024870, intron 23 of 39) intron (NM_024870, intron 23 of 39) 147919 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 208.666-61 chr2 163699755 163699965 + 1.33333 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 36148 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 198.666-62 chr3 64722023 64722177 + 1.33333 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) intron (NR_038264, intron 1 of 5) -34100 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 223.333-153 chr7 27885999 27886252 + 1.33333 NA intron (NM_175061, intron 3 of 4) intron (NM_175061, intron 3 of 4) 146030 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 152.667-272 chr4 44743382 44743565 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16839 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 216.333-129 chr6 165787233 165787455 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125064 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 196.333-116 chr3 135202167 135202366 + 1.33333 NA intron (NM_004441, intron 12 of 15) L2|LINE|L2 407006 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 326.667-7 chr10 102947164 102947627 + 1.33333 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) intron (NM_199076, intron 1 of 6) -29060 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 256.333-48 chr2 241146959 241147247 + 1.33333 NA intron (NM_001252120, intron 2 of 18) HAL1ME|LINE|L1 2369 NM_001252119 23178 Hs.397891 NM_015148 ENSG00000115687 PASK PASKIN|STK37 PAS domain containing serine/threonine kinase protein-coding 236.667-60 chr4 87734385 87734739 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -64992 NM_004967 3381 Hs.518726 NM_004967 ENSG00000029559 IBSP BNSP|BSP|BSP-II|SP-II integrin binding sialoprotein protein-coding 415-4 chr10 122025400 122026122 + 1.33333 NA intron (NM_206862, intron 2 of 22) AluY|SINE|Alu 36598 NM_206862 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 328.333-4 chr1 184261125 184261436 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125749 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 457.333 chr14 71624690 71625241 + 1.33333 NA intron (NM_001354286, intron 8 of 24) intron (NM_001354286, intron 8 of 24) 38667 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 221-51 chr4 36141547 36141868 + 1.33333 NA intron (NR_146894, intron 19 of 32) intron (NR_146894, intron 19 of 32) 102232 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 229.333-9 chr1 218275973 218276170 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -9222 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 204.667-144 chr8 43710470 43710754 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 418170 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 204-124 chr21 35522609 35522784 + 1.33333 NA intron (NR_073512, intron 1 of 2) intron (NR_073512, intron 1 of 2) 58068 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 213-54 chr3 125036563 125036748 + 1.33333 NA intron (NM_020733, intron 1 of 16) L1ME4a|LINE|L1 19342 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 252-109 chr8 120519032 120519258 + 1.33333 NA intron (NM_022045, intron 20 of 21) MER2|DNA|TcMar-Tigger 73726 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 385.666 chr1 83886321 83886939 + 1.33333 NA intron (NM_001350215, intron 18 of 19) intron (NM_001350215, intron 18 of 19) -25634 NR_119375 101927587 Hs.621230 NR_119375 ENSG00000233008 LINC01725 - long intergenic non-protein coding RNA 1725 ncRNA 199-97 chr6 123361554 123361823 + 1.33333 NA intron (NM_001251987, intron 20 of 20) intron (NM_001251987, intron 20 of 20) -77916 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 382.333-8 chr2 51001951 51002441 + 1.33333 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) MER39|LTR|ERV1 29936 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 251.333-41 chr16 5176391 5176730 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -78740 NM_001289029 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 198.333-121 chr3 21390430 21390678 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15172 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 249.333-25 chr12 41951158 41951461 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 187120 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 202-171 chr7 10132496 10132655 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 498305 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 249.666-31 chr4 127329757 127330013 + 1.33333 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -303072 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 239.666-11 chr14 63260257 63260549 + 1.33333 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 55960 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 149.333-240 chr3 58499877 58500029 + 1.33333 NA intron (NM_153331, intron 1 of 1) intron (NM_153331, intron 1 of 1) 1588 NM_153331 200845 Hs.13982 NM_153331 ENSG00000168301 KCTD6 KCASH3 potassium channel tetramerization domain containing 6 protein-coding 165.666-3 chr21 33777643 33777953 + 1.33333 NA intron (NM_001001132, intron 14 of 29) L1ME2|LINE|L1 135297 NM_001331011 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 287-10 chr12 108476643 108477000 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3132 NR_120483 102723562 Hs.455693 NR_120483 ENSG00000247213 LINC01498 - long intergenic non-protein coding RNA 1498 ncRNA 358.999 chr3 46497920 46498231 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_031440) promoter-TSS (NM_031440) 99 NM_031440 83597 Hs.196584 NM_031440 ENSG00000163825 RTP3 LTM1|TMEM7|Z3CXXC3 receptor transporter protein 3 protein-coding 348.666-2 chr1 214632478 214632773 + 1.33333 NA intron (NM_016343, intron 10 of 19) intron (NM_016343, intron 10 of 19) 29430 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 245.333-53 chr17 61597293 61597587 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6221 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 178.333-134 chr5 14657463 14657662 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5180 NR_132981 106635684 NR_132981 SNORD141B - small nucleolar RNA, C/D box 141B snoRNA 216.333-133 chr8 76160170 76160373 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -246383 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 200.666-40 chr15 32985468 32985669 + 1.33333 NA intron (NM_001277313, intron 7 of 20) intron (NM_001277313, intron 7 of 20) 82606 NM_001103184 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 204.667-73 chr2 76538747 76539003 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -447090 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 313.333-48 chr8 140116139 140116562 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -15815 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 190-109 chr6 48662605 48662781 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -594004 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 161.333-73 chr12 116012317 116012479 + 1.33333 NA intron (NM_015335, intron 9 of 30) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 136256 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 263.333-55 chr22 48876061 48876475 + 1.33333 NA intron (NR_038944, intron 1 of 6) L1MCa|LINE|L1 9498 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 209.666-45 chr5 62192127 62192330 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -113934 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 161.333-281 chr8 70733466 70733705 + 1.33333 NA intron (NM_001287259, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR 64246 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 266.333-32 chr2 212236887 212237279 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) L1PA7|LINE|L1 189277 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 243-51 chr5 66042686 66042897 + 1.33333 NA intron (NM_001253697, intron 15 of 25) intron (NM_001253697, intron 15 of 25) -97218 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 332.666-20 chr22 26236815 26237186 + 1.33333 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 67526 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 319.666-17 chr8 78058604 78058895 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -457591 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 262.667-45 chr2 210236006 210236368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10740 NM_001608 33 Hs.471277 NM_001608 ENSG00000115361 ACADL ACAD4|LCAD acyl-CoA dehydrogenase long chain protein-coding 274-17 chr14 78699548 78699886 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 6 of 20) intron (NR_073547, intron 6 of 20) 295998 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 272-16 chr15 80478814 80479284 + 1.33333 NA intron (NM_014862, intron 5 of 18) intron (NM_014862, intron 5 of 18) 74667 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 294-24 chr14 48129857 48130251 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -335040 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 183-18 chr11 21877536 21877699 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -315468 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 216.666-7 chr1 164853636 164853851 + 1.33333 NA intron (NM_001353131, intron 7 of 7) intron (NM_001353131, intron 7 of 7) -79102 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 385.333-24 chr6 49709594 49709944 + 1.33333 NA intron (NM_001261822, intron 2 of 8) intron (NM_001261822, intron 2 of 8) 3774 NM_001142408 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 222.666-58 chr9 6757719 6757893 + 1.33333 NA non-coding (NR_130707, exon 1 of 15) non-coding (NR_130707, exon 1 of 15) 456 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 223.333-138 chr5 165523573 165523849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1053432 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 203.666-58 chr9 71761708 71761940 + 1.33333 NA intron (NM_013390, intron 1 of 23) intron (NM_013390, intron 1 of 23) 6689 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 263.333-51 chr20 46813466 46813796 + 1.33333 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -80993 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 145.666-4 chr22 27660416 27660552 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 141272 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 189-49 chr2 195910736 195911036 + 1.33333 NA intron (NM_018897, intron 24 of 64) intron (NM_018897, intron 24 of 64) 157951 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 297.333-55 chr9 36392555 36392865 + 1.33333 NA intron (NM_194330, intron 1 of 11) AluJr4|SINE|Alu 7559 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 207.666-62 chr7 93693643 93693861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23176 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 116-155 chr8 90603539 90603700 + 1.33333 NA intron (NR_104062, intron 1 of 2) intron (NR_104062, intron 1 of 2) 2444 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 238-30 chr16 53772840 53773049 + 1.33333 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) intron (NM_001363897, intron 1 of 7) 68788 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 222.667-28 chr14 66634924 66635241 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 127675 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 218-58 chr2 183903919 183904146 + 1.33333 NA Intergenic MER90|LTR|ERV1 -474943 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 189.333-211 chr8 124952213 124952382 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 10289 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 145.333-153 chr2 219943707 219943916 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -37246 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 231-31 chr2 61387318 61387512 + 1.33333 NA intron (NM_014709, intron 5 of 79) AluSx1|SINE|Alu 29962 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 205.333-16 chr1 113643437 113643672 + 1.33333 NA intron (NM_001142782, intron 10 of 20) MIRb|SINE|MIR 115601 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 362.667-4 chr10 74034956 74035462 + 1.33333 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) intron (NM_014000, intron 1 of 21) 37093 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 380-6 chr12 57548878 57549389 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001354705) promoter-TSS (NM_001354705) -911 NM_001354705 3798 Hs.151219 NM_004984 ENSG00000155980 KIF5A ALS25|D12S1889|MY050|NEIMY|NKHC|SPG10 kinesin family member 5A protein-coding 179.333-14 chr1 198972675 198972914 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35365 NR_040073 100131234 Hs.711077 NR_040073 MIR181A1HG - MIR181A1 host gene ncRNA 213-35 chr19 11754531 11754775 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -12347 NM_152355 126068 Hs.675132 NM_152355 ENSG00000197044 ZNF441 - zinc finger protein 441 protein-coding 193-60 chr3 156922714 156922894 + 1.33333 NA intron (NM_001004316, intron 4 of 12) intron (NM_001004316, intron 4 of 12) 96451 NM_001193283 389170 Hs.478048 NM_001004316 ENSG00000197980 LEKR1 - leucine, glutamate and lysine rich 1 protein-coding 308-44 chr5 126581138 126581584 + 1.33333 NA intron (NM_001202404, intron 5 of 15) AluJb|SINE|Alu 13858 NM_001201377 501 Hs.483239 NM_001182 ENSG00000164904 ALDH7A1 ATQ1|EPD|PDE aldehyde dehydrogenase 7 family member A1 protein-coding 211-17 chr11 32596749 32597067 + 1.33333 NA intron (NM_006360, intron 8 of 10) AluSz|SINE|Alu 13077 NM_006360 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 288.667-33 chr8 18431495 18431770 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 40350 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 150-20 chr10 112094641 112094832 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 89029 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 300.666-22 chr8 138727326 138727644 + 1.33333 NA intron (NM_152888, intron 23 of 64) intron (NM_152888, intron 23 of 64) 186556 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 271.667-27 chr14 74114300 74114634 + 1.33333 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) L2c|LINE|L2 29514 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 212.666-35 chr18 62670487 62670671 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -44962 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 205.333-37 chr10 78879086 78879386 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 188212 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 206.333-20 chr10 106586149 106586388 + 1.33333 NA intron (NM_001206569, intron 24 of 25) MER94|DNA|hAT-Blackjack 446103 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 344-30 chr4 37434614 37434980 + 1.33333 NA intron (NM_001144990, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 -19128 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 330-31 chr5 142400676 142401065 + 1.33333 NA intron (NR_120664, intron 3 of 3) intron (NR_120664, intron 3 of 3) 75577 NR_120664 101926941 Hs.658945 NR_120664 ENSG00000231185 SPRY4-AS1 THCAT68 SPRY4 antisense RNA 1 ncRNA 228.333-11 chr11 42251831 42252047 + 1.33333 NA intron (NR_038309, intron 1 of 5) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 1751 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 259.999-10 chr5 10242381 10242683 + 1.33333 NA intron (NM_199133, intron 1 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 7356 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 209-34 chr12 125896497 125896760 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 86746 NR_034132 400084 Hs.156191 NR_034132 ENSG00000249267 LINC00939 - long intergenic non-protein coding RNA 939 ncRNA 460.666-4 chr8 129730928 129731492 + 1.33333 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL -50971 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 198.666-64 chr3 157588713 157588889 + 1.33333 NA intron (NM_001130002, intron 4 of 4) intron (NM_001130002, intron 4 of 4) 45457 NM_001099777 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 206.333-73 chr18 22376949 22377206 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 40838 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 126-52 chr2 24239498 24239622 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001348186, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_001348186, exon 29 of 29) 64507 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 146.667-19 chr1 169453763 169454010 + 1.33333 NA intron (NM_001300968, intron 2 of 6) intron (NM_001300968, intron 2 of 6) 6783 NM_001300968 57821 Hs.567557 NM_021179 ENSG00000117477 CCDC181 C1orf114 coiled-coil domain containing 181 protein-coding 393.333-14 chr3 29239103 29239659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 41558 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 378-25 chr7 30279200 30279719 + 1.33333 NA intron (NR_136267, intron 1 of 3) intron (NR_136267, intron 1 of 3) -5138 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 190-22 chr11 124970577 124970843 + 1.33333 NA intron (NM_025004, intron 4 of 15) intron (NM_025004, intron 4 of 15) 16508 NM_025004 80071 Hs.287555 NM_025004 ENSG00000149548 CCDC15 - coiled-coil domain containing 15 protein-coding 232.333-55 chr22 29839108 29839357 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001369923) promoter-TSS (NM_001369923) -958 NM_001369927 84164 Hs.731754 NM_032204 ENSG00000100325 ASCC2 ASC1p100|p100 activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 protein-coding 144.666-2 chr1 209290087 209290230 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 -35298 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 230-4 chr1 109584103 109584439 + 1.33333 NA intron (NM_006496, intron 5 of 8) intron (NM_006496, intron 5 of 8) -14622 NR_029583 406974 NR_029583 ENSG00000284443 MIR197 MIRN197|miR-197|miRNA197 microRNA 197 ncRNA 262.666-16 chr3 18040168 18040452 + 1.33333 NA intron (NR_161333, intron 3 of 4) intron (NR_161333, intron 3 of 4) 77758 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 338.666 chr10 117986186 117986528 + 1.33333 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -60464 NR_026940 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 224-15 chr10 117664415 117664703 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119491 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 198-91 chr2 76100514 76100809 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -389746 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 473.999-2 chr12 38730503 38731252 + 1.33333 NA intron (NM_153634, intron 10 of 19) intron (NM_153634, intron 10 of 19) 174714 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 158.667-278 chr5 157639419 157639628 + 1.33333 NA intron (NM_001308165, intron 4 of 5) intron (NM_001308165, intron 4 of 5) 12897 NM_007017 11063 Hs.529462 NM_007017 ENSG00000039600 SOX30 - SRY-box transcription factor 30 protein-coding 217.333-99 chr3 148709238 148709412 + 1.33333 NA intron (NM_000685, intron 2 of 2) intron (NM_000685, intron 2 of 2) 11454 NM_000685 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 234.333-69 chr6 64233359 64233701 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) intron (NM_001292009, intron 30 of 43) 426694 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 362.666-14 chr6 144792751 144793153 + 1.33333 NA intron (NM_007124, intron 61 of 73) intron (NM_007124, intron 61 of 73) 387297 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 329.333-15 chr17 49304450 49304879 + 1.33333 NA intron (NM_014897, intron 5 of 5) intron (NM_014897, intron 5 of 5) -16210 NR_106745 102465137 NR_106745 ENSG00000273500 MIR6129 hsa-mir-6129 microRNA 6129 ncRNA 133.333-204 chrX 26463927 26464075 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94336 NR_001559 139538 Hs.447377 NR_001559 ENSG00000259849 VENTXP1 CT18|NA88A|VENTX2P1 VENT homeobox pseudogene 1 pseudo 202.666-109 chr6 167535226 167535438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62542 NR_134591 105378127 Hs.58456 NR_134591 LOC105378127 - uncharacterized LOC105378127 ncRNA 213.666-27 chr20 44386627 44386880 + 1.33333 NA intron (NR_109949, intron 2 of 3) MER20|DNA|hAT-Charlie 8953 NR_109949 101927219 Hs.655919 NR_109949 ENSG00000229005 HNF4A-AS1 uc002xlx HNF4A antisense RNA 1 ncRNA 240-77 chr6 21065358 21065603 + 1.33333 NA intron (NM_017774, intron 12 of 15) intron (NM_017774, intron 12 of 15) 446412 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 194.333-88 chr3 111086777 111087003 + 1.33333 NA intron (NM_001243288, intron 1 of 8) L1ME3A|LINE|L1 15074 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 215.666-29 chr3 143296896 143297062 + 1.33333 NA intron (NM_173653, intron 14 of 15) L1MB1|LINE|L1 -45267 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 165.333-227 chr6 67803968 67804109 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -251313 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 360.333-13 chr2 168351489 168352020 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -104159 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 251.666-24 chr4 148047058 148047305 + 1.33333 NA intron (NM_024605, intron 20 of 22) intron (NM_024605, intron 20 of 22) 264586 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 186-54 chr20 47304708 47304892 + 1.33333 NA intron (NM_001281774, intron 4 of 23) intron (NM_001281774, intron 4 of 23) -13702 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 255-28 chr14 32827101 32827424 + 1.33333 NA intron (NM_004274, intron 13 of 13) intron (NM_004274, intron 13 of 13) -111617 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 315-23 chr4 101850958 101851236 + 1.33333 NA intron (NM_017935, intron 2 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 37255 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 269.666-12 chr21 29201422 29201820 + 1.33333 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) L1M4|LINE|L1 8127 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 208-104 chr3 55862932 55863224 + 1.33333 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) intron (NR_132749, intron 13 of 17) -10484 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 200.333-64 chr2 30546588 30546843 + 1.33333 NA intron (NM_182551, intron 4 of 6) intron (NM_182551, intron 4 of 6) 99469 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 534-2 chr12 126225782 126226400 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 130099 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 319-19 chr4 52625476 52625959 + 1.33333 NA intron (NM_001286768, intron 5 of 9) intron (NM_001286768, intron 5 of 9) 30822 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 300.666-11 chr5 4362130 4362488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -411172 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 198.666-4 chr10 61521007 61521199 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 41062 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 200.333-166 chr9 14291265 14291552 + 1.33333 NA intron (NR_161383, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu 8856 NM_001369480 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 136-61 chr3 64834404 64834610 + 1.33333 NA intron (NR_038264, intron 3 of 5) intron (NR_038264, intron 3 of 5) -146507 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 154.666-17 chr7 39736882 39737052 + 1.33333 NA intron (NR_026999, intron 1 of 11) intron (NR_026999, intron 1 of 11) 3399 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 326.333-14 chr2 144752346 144752772 + 1.33333 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) intron (NR_033870, intron 1 of 4) 84592 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 246.333-77 chr5 104196921 104197231 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -634287 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 210.666-81 chr4 181097859 181098088 + 1.33333 NA intron (NR_033918, intron 2 of 2) (ATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 61176 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 297.666-12 chr4 44310379 44310717 + 1.33333 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 138261 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 368.999 chr8 77633816 77634213 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 183317 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 208-94 chr21 28282600 28282891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54078 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 320-9 chr12 32710395 32710857 + 1.33333 NA intron (NM_001330380, intron 5 of 18) AluJo|SINE|Alu 31325 NM_012062 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 142.333-218 chr6 63750144 63750295 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 41 of 43) L1M3d|LINE|L1 -56617 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 223.333-115 chr4 85736346 85736570 + 1.33333 NA intron (NM_001025616, intron 3 of 9) intron (NM_001025616, intron 3 of 9) 13990 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 218.667-17 chr10 122854254 122854568 + 1.33333 NA intron (NM_152644, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR -8554 NR_037912 50624 Hs.647182 NM_022034 ENSG00000138161 CUZD1 ERG-1|ERG1|ITMAP1|UO-44 CUB and zona pellucida like domains 1 protein-coding 221.667-66 chr5 52193482 52193781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 185600 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 177.667-59 chr16 78267495 78267723 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 167955 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 218.999 chr18 44493879 44494046 + 1.33333 NA intron (NR_110792, intron 2 of 4) intron (NR_110792, intron 2 of 4) 37735 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 258-33 chr2 67006519 67006819 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -79777 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 262.666-26 chr8 94544990 94545233 + 1.33333 NA intron (NM_015496, intron 1 of 23) AluJr4|SINE|Alu 8358 NM_015496 25962 Hs.202238 NM_015496 ENSG00000164944 VIRMA KIAA1429|MSTP054|fSAP121 vir like m6A methyltransferase associated protein-coding 229.333-111 chr6 146246469 146246732 + 1.33333 NA intron (NM_001278065, intron 3 of 9) intron (NM_001278065, intron 3 of 9) 217402 NM_001278067 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 211-6 chr1 192287477 192287643 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -29432 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 200.666-93 chr4 188799346 188799582 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 22807 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 217.333-104 chr4 35790785 35790977 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 453058 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 349.333-33 chr9 70789477 70789836 + 1.33333 NA intron (NM_001366143, intron 6 of 25) intron (NM_001366143, intron 6 of 25) 20428 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 248.333-60 chr3 43137385 43137700 + 1.33333 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -31463 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 279.667-25 chr2 34059509 34059974 + 1.33333 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) -7485 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 321.999-3 chr15 73498569 73498918 + 1.33333 NA intron (NM_001348772, intron 2 of 4) intron (NM_001348772, intron 2 of 4) 55579 NM_001042367 283677 Hs.743574 NM_001042367 ENSG00000183324 REC114 C15orf60|CT147 REC114 meiotic recombination protein protein-coding 334.999 chr12 26968109 26968392 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 29780 NM_015633 26127 Hs.591162 NM_015633 ENSG00000111790 FGFR1OP2 HSPC123-like|WIT3.0 FGFR1 oncogene partner 2 protein-coding 239.667-36 chr2 60656565 60656891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99540 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 163.333-271 chr7 132195678 132195894 + 1.33333 NA intron (NM_020911, intron 13 of 31) intron (NM_020911, intron 13 of 31) -65075 NR_134565 101928807 Hs.552131 NR_134565 LOC101928807 - uncharacterized LOC101928807 ncRNA 214.333-135 chr7 4893047 4893329 + 1.33333 NA intron (NR_072989, intron 8 of 8) MER41B|LTR|ERV1 -9472 NM_018059 55698 Hs.667336 NM_018059 ENSG00000157927 RADIL RASIP2 Rap associating with DIL domain protein-coding 235.333-42 chr17 61663876 61664166 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -72802 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 189-86 chr7 122931255 122931515 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44626 NM_001167940 93664 Hs.649459 NM_017954 ENSG00000081803 CADPS2 CAPS2 calcium dependent secretion activator 2 protein-coding 275.333-10 chr10 121145290 121145554 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 294060 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 360.333-5 chr12 96697751 96698275 + 1.33333 NA intron (NM_001306084, intron 45 of 67) L2a|LINE|L2 208436 NM_001306084 144535 Hs.382121 NM_198520 ENSG00000188596 CFAP54 C12orf55|C12orf63 cilia and flagella associated protein 54 protein-coding 234.333-65 chr6 40282699 40283079 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 73117 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 145.333-327 chrX 74346422 74346640 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42351 NM_203303 389874 Hs.157231 NM_203303 ENSG00000187969 ZCCHC13 CNBP2|ZNF9L zinc finger CCHC-type containing 13 protein-coding 248.667-72 chr22 27041548 27041869 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18810 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 474.667-7 chr6 64268773 64269666 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) LTR83|LTR|ERVL 462383 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 171-48 chr21 29521657 29521815 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 25689 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 277.666-14 chr5 11825347 11825681 + 1.33333 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) L1ME1|LINE|L1 78932 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 206-73 chr2 43260749 43260922 + 1.33333 NA intron (NM_001083953, intron 36 of 37) L1M5|LINE|L1 33624 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 242-77 chr8 118962286 118962630 + 1.33333 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) L1MA10|LINE|L1 10195 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 276-4 chr1 52052343 52052676 + 1.33333 NA non-coding (NR_126385, exon 3 of 3) non-coding (NR_126385, exon 3 of 3) 1591 NR_126385 104355143 Hs.603708 NR_126385 ENSG00000228369 TXNDC12-AS1 - TXNDC12 antisense RNA 1 ncRNA 435.333-5 chr7 28176063 28176648 + 1.33333 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 -4102 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 164-55 chr2 72264394 72264592 + 1.33333 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) AluSq2|SINE|Alu -116631 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 255.333-40 chr16 80652841 80653209 + 1.33333 NA intron (NM_152342, intron 2 of 6) L1MC3|LINE|L1 -80217 NR_104666 101928276 Hs.149769 NR_104665 ENSG00000260737 LINC01227 - long intergenic non-protein coding RNA 1227 ncRNA 317-22 chr6 129784438 129784722 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74403 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 245.333-122 chr8 120536824 120537179 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_021021, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_021021, exon 7 of 7) 91582 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 190.666-41 chr4 106027415 106027596 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -5027 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 206-109 chr3 37075364 37075636 + 1.33333 NA intron (NM_006309, intron 19 of 27) L1MC5|LINE|L1 82150 NM_001354622 4292 Hs.195364 NM_000249 ENSG00000076242 MLH1 COCA2|FCC2|HNPCC|HNPCC2|hMLH1 mutL homolog 1 protein-coding 279.333-9 chr10 23415419 23415735 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -23692 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 178.666-8 chr18 36486917 36487100 + 1.33333 NA intron (NM_001281740, intron 3 of 28) L1ME1|LINE|L1 176410 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 290-10 chr10 54731925 54732206 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) L1MA4|LINE|L1 69166 NM_001142763 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 191.667-110 chr6 65516320 65516580 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) 63354 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 211.999-6 chr2 154469417 154469578 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -12059 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 261.333-68 chr3 106496812 106497176 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -627593 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 245.333-66 chr2 118926327 118926613 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15699 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 181.333-183 chr8 119747595 119747804 + 1.33333 NA intron (NM_003184, intron 22 of 25) intron (NM_003184, intron 22 of 25) -74309 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 226-6 chr1 219188773 219189078 + 1.33333 NA intron (NM_001350629, intron 3 of 5) intron (NM_001350629, intron 3 of 5) 13956 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 222-106 chr9 118284480 118284776 + 1.33333 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -395043 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 261.999-7 chr2 47517442 47517846 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9893 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 244.667-70 chr4 26958142 26958493 + 1.33333 NA intron (NM_001169118, intron 3 of 12) intron (NM_001169118, intron 3 of 12) 97476 NM_001169118 57620 Hs.744950 NM_020860 ENSG00000109689 STIM2 - stromal interaction molecule 2 protein-coding 329.333-24 chr2 118661505 118661984 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -58778 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 216-94 chr5 33178118 33178284 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -51534 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 265.667-63 chr6 120015362 120015706 + 1.33333 NA TTS (NR_036098) TTS (NR_036098) 355 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 237-38 chr2 27531480 27531667 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 34734 NM_001486 2646 Hs.89771 NM_001486 ENSG00000084734 GCKR FGQTL5|GKRP glucokinase regulator protein-coding 240.667-22 chr12 113901710 113902018 + 1.33333 NA intron (NM_001146698, intron 21 of 24) L3|LINE|CR1 64461 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 239-19 chr14 67945185 67945444 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 121722 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 198.333-4 chr1 41231619 41231838 + 1.33333 NA intron (NM_001172218, intron 1 of 15) L1MC3|LINE|L1 10578 NM_001172219 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 248.333-50 chr2 229507989 229508224 + 1.33333 NA intron (NM_139072, intron 6 of 12) L1ME3F|LINE|L1 206449 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 236.666-8 chr12 65198904 65199113 + 1.33333 NA intron (NM_001167614, intron 1 of 12) intron (NM_001167614, intron 1 of 12) 29425 NM_001167614 23592 Hs.744150 NM_014319 ENSG00000174106 LEMD3 MAN1 LEM domain containing 3 protein-coding 249.333-91 chr7 11341858 11342145 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 368129 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 173.666-14 chr5 14223847 14224078 + 1.33333 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 80620 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 208-166 chr8 69061315 69061484 + 1.33333 NA intron (NR_039986, intron 2 of 4) MLT2F|LTR|ERVL 42791 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 242-52 chr4 56740129 56740345 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -58531 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 201.333-53 chr11 63024454 63024675 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -8719 NM_001184732 9376 Hs.266223 NM_004254 ENSG00000149452 SLC22A8 OAT3 solute carrier family 22 member 8 protein-coding 183-63 chr2 145301674 145301837 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 633788 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 197.666-58 chr6 159002810 159003135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2770 NM_031924 83861 Hs.154628 NM_031924 ENSG00000130363 RSPH3 CILD32|RSHL2|RSP3|dJ111C20.1 radial spoke head 3 protein-coding 226.666-21 chr2 39705729 39705930 + 1.33333 NA intron (NM_152390, intron 2 of 3) intron (NM_152390, intron 2 of 3) 39912 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 194.333-32 chr11 97153241 97153473 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 644932 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 205.666-54 chr8 119097026 119097276 + 1.33333 NA intron (NM_001324095, intron 5 of 7) L1ME3A|LINE|L1 -28369 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 293.333-50 chr5 41037530 41038016 + 1.33333 NA intron (NM_173489, intron 21 of 41) MER5A|DNA|hAT-Charlie 33569 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 190.666-47 chr6 72024065 72024232 + 1.33333 NA intron (NM_001350411, intron 2 of 3) intron (NM_001350411, intron 2 of 3) 137445 NM_001350411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 195.333-51 chr11 84447431 84447697 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -130225 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 259.666-33 chr7 93941773 93942099 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 20201 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 190-97 chr5 13217221 13217485 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -184467 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 218.666-34 chr15 60322841 60323099 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 75016 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 226-28 chr16 84061211 84061558 + 1.33333 NA intron (NM_003791, intron 19 of 22) intron (NM_003791, intron 19 of 22) -19227 NM_001080442 146167 NM_001080442 ENSG00000166558 SLC38A8 FVH2 solute carrier family 38 member 8 protein-coding 154.666-9 chr4 115983988 115984141 + 1.33333 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -315661 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 186.333-152 chr7 94378076 94378359 + 1.33333 NA intron (NR_147206, intron 5 of 5) L2c|LINE|L2 13975 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 208.666-72 chr3 107298695 107298885 + 1.33333 NA intron (NR_028302, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 58098 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 332.333-13 chr17 76300356 76300764 + 1.33333 NA intron (NM_032134, intron 3 of 18) intron (NM_032134, intron 3 of 18) 7120 NM_032134 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 197-15 chr10 32341815 32342045 + 1.33333 NA intron (NM_001282391, intron 1 of 13) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 5228 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 182.666-33 chr5 23591027 23591225 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 83471 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 267 chr1 91986893 91987262 + 1.33333 NA intron (NM_001726, intron 12 of 18) AluSz6|SINE|Alu 34925 NM_001726 676 Hs.482520 NM_001726 ENSG00000137948 BRDT BRD6|CT9|SPGF21 bromodomain testis associated protein-coding 353.333-31 chr6 87430507 87430854 + 1.33333 NA intron (NM_001031743, intron 9 of 12) intron (NM_001031743, intron 9 of 12) 22708 NM_001031743 154313 Hs.82921 NM_178823 ENSG00000272514 CFAP206 C6orf165|dJ382I10.1 cilia and flagella associated protein 206 protein-coding 203.333-118 chr18 73033810 73034052 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 164891 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 309.333-23 chr15 58929284 58929598 + 1.33333 NA intron (NR_135043, intron 1 of 18) AluSp|SINE|Alu 4238 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 228.666-15 chr14 29617672 29617963 + 1.33333 NA intron (NM_001330069, intron 14 of 18) AluJr|SINE|Alu 309279 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 252.333-43 chr21 14237998 14238295 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21989 NR_135308 54033 Hs.283828 NM_144770 ENSG00000185272 RBM11 - RNA binding motif protein 11 protein-coding 211-58 chr22 24820580 24820824 + 1.33333 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) intron (NM_001098498, intron 2 of 23) 14481 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 162-36 chr13 94302453 94302616 + 1.33333 NA intron (NM_005708, intron 5 of 8) intron (NM_005708, intron 5 of 8) -114543 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 330.666-4 chr1 191869207 191869592 + 1.33333 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 -289063 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 280.333-39 chr7 6220714 6221136 + 1.33333 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu -48788 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 188.667-54 chr17 2993075 2993329 + 1.33333 NA intron (NM_001330058, intron 12 of 24) AluSx3|SINE|Alu -27307 NR_110818 101927911 Hs.626373 NR_110818 ENSG00000262884 LOC101927911 - uncharacterized LOC101927911 ncRNA 203.333-61 chr12 126611260 126611466 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 78955 NR_110036 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 243-77 chr9 34839643 34840040 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1255 NR_024481 389715 Hs.713965 NM_001126494 FAM205BP C9orf144|C9orf144A|FAM205B transmembrane protein C9orf144B pseudogene pseudo 207.333-162 chr20 47658409 47658850 + 1.33333 NA intron (NM_198596, intron 20 of 20) intron (NM_198596, intron 20 of 20) 127435 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 388-16 chr5 36571272 36571880 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -34779 NM_001166696 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 196-43 chr13 62421847 62422010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 98271 NR_047038 100874180 Hs.7415 NR_047038 ENSG00000229307 LINC00459 - long intergenic non-protein coding RNA 459 ncRNA 421.666-5 chr4 89869218 89869588 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10108 NM_001371403 183.333-131 chr5 96470027 96470252 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie -36891 NM_000439 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 227.333-68 chr2 187743463 187743796 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -189124 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 249-28 chr15 59763632 59764063 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -74527 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 153.667-252 chr3 78454653 78454864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -405795 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 330.666-2 chr1 30712900 30713216 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_002379, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_002379, exon 8 of 8) -5714 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 186-31 chr14 38802163 38802399 + 1.33333 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu -80315 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 247.333-10 chr10 78881469 78881820 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 185804 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 348-24 chr8 51077269 51077704 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 731959 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 365.333-19 chr5 10696999 10697580 + 1.33333 NA intron (NM_004394, intron 2 of 3) intron (NM_004394, intron 2 of 3) 63945 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 211-72 chr4 62836154 62836461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -674542 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 194.667-172 chrX 111510756 111511009 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001354473) promoter-TSS (NM_001354473) -763 NM_001354473 401613 Hs.98581 NM_001354473 ENSG00000260802 SERTM2 DKFZp686D0853|LINC00890 serine rich and transmembrane domain containing 2 protein-coding 395-5 chr15 83150561 83151103 + 1.33333 NA intron (NM_016073, intron 5 of 5) intron (NM_016073, intron 5 of 5) 43187 NR_148560 53346 Hs.513094 NM_023003 ENSG00000136404 TM6SF1 - transmembrane 6 superfamily member 1 protein-coding 279.333-50 chr21 17583424 17583748 + 1.33333 NA intron (NM_001207066, intron 7 of 7) intron (NM_001207066, intron 7 of 7) -28100 NR_149073 110806272 Hs.607138 NR_149073 ENSG00000280594 BTG3-AS1 ASBEL BTG3 antisense RNA 1 ncRNA 182.333-76 chr2 19815215 19815378 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53558 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 163.333-121 chr17 29833300 29833470 + 1.33333 NA intron (NM_033389, intron 1 of 14) L1M1|LINE|L1 -71953 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 230.666-49 chr8 105457032 105457369 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 137657 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 261.667-75 chr9 27934206 27934565 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -360519 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 248.666-6 chr10 13736583 13736887 + 1.33333 NA intron (NM_001318336, intron 11 of 23) intron (NM_001318336, intron 11 of 23) -29168 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 382.666-13 chr20 55198276 55198836 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -224487 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 244-44 chr17 59001862 59002146 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 22 of 23) intron (NR_148346, intron 22 of 23) 104876 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 154-49 chr14 24635073 24635268 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_144343) promoter-TSS (NR_144343) -980 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 214.333-62 chr17 52188671 52188845 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -28741 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 259-37 chr3 139603289 139603501 + 1.33333 NA intron (NM_001320510, intron 3 of 6) intron (NM_001320510, intron 3 of 6) -63653 NM_001130993 5947 Hs.529571 NM_002899 ENSG00000114115 RBP1 CRABP-I|CRBP|CRBP1|CRBPI|RBPC retinol binding protein 1 protein-coding 240-41 chr19 57125095 57125513 + 1.33333 NA intron (NM_020903, intron 3 of 3) L1PA10|LINE|L1 5163 NM_020903 57663 Hs.515632 NM_020903 ENSG00000131864 USP29 HOM-TES-84/86 ubiquitin specific peptidase 29 protein-coding 338.333-20 chr8 106315891 106316296 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) intron (NM_018002, intron 1 of 15) 45915 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 206.999-2 chr3 150437700 150437856 + 1.33333 NA intron (NM_014779, intron 2 of 3) AluSc8|SINE|Alu 29480 NM_014779 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 188.333-6 chr1 90056658 90056900 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61669 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 231.666-5 chr10 84146570 84146850 + 1.33333 NA intron (NM_014394, intron 5 of 8) intron (NM_014394, intron 5 of 8) 7201 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 203.333-173 chr3 86140146 86140368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -312207 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 203.333-169 chr3 23595129 23595428 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -210677 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 157.333-51 chr10 82124249 82124407 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 108592 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 202.333-27 chr10 73754432 73754628 + 1.33333 NA intron (NM_198597, intron 3 of 22) MER2|DNA|TcMar-Tigger 10158 NM_198597 9632 Hs.81964 NM_004922 ENSG00000176986 SEC24C - SEC24 homolog C, COPII coat complex component protein-coding 337.333-19 chr17 39368068 39368446 + 1.33333 NA intron (NM_001370209, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 33369 NM_001184906 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 189-9 chr10 25327913 25328160 + 1.33333 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -151760 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 299.333-49 chr20 48711940 48712222 + 1.33333 NA intron (NM_020820, intron 5 of 39) intron (NM_020820, intron 5 of 39) 115918 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 346.666-13 chr4 22959635 22960061 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 245759 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 164-65 chr2 191473072 191473241 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -204916 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 169.666 chr1 116130673 116130868 + 1.33333 NA intron (NM_152367, intron 6 of 6) intron (NM_152367, intron 6 of 6) 19015 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 188.666-18 chr17 65157223 65157378 + 1.33333 NA intron (NM_003835, intron 2 of 18) intron (NM_003835, intron 2 of 18) 19930 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 185.333-20 chr10 64741729 64741908 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -83710 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 392-14 chr4 115436904 115437288 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -323476 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 121.667-119 chr22 45362237 45362391 + 1.33333 NA intron (NM_148674, intron 16 of 24) intron (NM_148674, intron 16 of 24) 43871 NM_001349913 55007 Hs.265018 NM_017911 ENSG00000100376 FAM118A C22orf8 family with sequence similarity 118 member A protein-coding 169.333-204 chr5 45337705 45337933 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 5 of 7) L2c|LINE|L2 358561 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 194.333-127 chr5 132891642 132891797 + 1.33333 NA intron (NM_014423, intron 13 of 20) intron (NM_014423, intron 13 of 20) 18051 NM_052971 116842 Hs.337588 NM_052971 ENSG00000164406 LEAP2 LEAP-2 liver enriched antimicrobial peptide 2 protein-coding 401.332 chr2 133829045 133829376 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -260747 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 164.666 chr1 8755653 8755954 + 1.33333 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) AluJo|SINE|Alu 61837 NM_012102 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 250-23 chr13 49237752 49238050 + 1.33333 NA intron (NR_135318, intron 1 of 1) MER4B|LTR|ERV1 9939 NR_135318 105370203 Hs.569238 NR_135318 LOC105370203 - uncharacterized LOC105370203 ncRNA 203-20 chr11 76008308 76008605 + 1.33333 NA intron (NM_003369, intron 10 of 14) intron (NM_003369, intron 10 of 14) 193246 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 398.333-3 chr10 74071362 74071897 + 1.33333 NA intron (NM_014000, intron 4 of 21) intron (NM_014000, intron 4 of 21) 73513 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 190.333-150 chr9 32807136 32807351 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 23703 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 163-53 chr22 28710958 28711200 + 1.33333 NA intron (NM_001257387, intron 7 of 15) intron (NM_001257387, intron 7 of 15) 30741 NM_001005735 11200 Hs.291363 NM_007194 ENSG00000183765 CHEK2 CDS1|CHK2|HuCds1|LFS2|PP1425|RAD53|hCds1 checkpoint kinase 2 protein-coding 205-79 chr6 51918803 51919009 + 1.33333 NA intron (NM_138694, intron 37 of 66) L1PA8|LINE|L1 168707 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 158.333-347 chr9 116050506 116050748 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -103164 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 202.333-188 chr9 118798651 118798934 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 119121 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 280-11 chr14 54574109 54574378 + 1.33333 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 6631 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 222.333-5 chr1 91031043 91031328 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8930 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 130-100 chr5 122955141 122955290 + 1.33333 NA intron (NM_014035, intron 3 of 6) L1MDa|LINE|L1 81510 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 410-12 chr22 28472635 28473050 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) HAL1|LINE|L1 12973 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 244.333-35 chr14 69988628 69988821 + 1.33333 NA intron (NM_001034852, intron 5 of 11) L1MB7|LINE|L1 10591 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 316.666-8 chr18 2770010 2770583 + 1.33333 NA intron (NM_015295, intron 39 of 47) intron (NM_015295, intron 39 of 47) -76710 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 328.999-3 chr5 162556953 162557227 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 489448 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 296-52 chr5 62100205 62100532 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205794 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 186.333-37 chr12 7400466 7400705 + 1.33333 NA intron (NM_001297650, intron 6 of 19) FAM|SINE|Alu 43600 NM_174941 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 256.667-66 chr4 51837161 51837488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5676 NM_001287757 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 332.333-17 chr21 16064260 16064543 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -6087 NR_136541 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 145.333-104 chr16 21020884 21021061 + 1.33333 NA intron (NM_001347886, intron 40 of 61) L1MB3|LINE|L1 119710 NM_001369644 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 200.333-15 chr10 102734066 102734313 + 1.33333 NA intron (NM_178858, intron 10 of 11) intron (NM_178858, intron 10 of 11) -9759 NM_001083913 54838 Hs.500897 NM_017787 ENSG00000166272 WBP1L C10orf26|OPA1L|OPAL1 WW domain binding protein 1 like protein-coding 158.333-210 chr3 114576775 114576908 + 1.33333 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 47365 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 182-51 chr2 127750753 127750951 + 1.33333 NA intron (NM_001006623, intron 7 of 7) intron (NM_001006623, intron 7 of 7) 49355 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 134-13 chr10 35688043 35688262 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -46718 NM_031866 8325 Hs.302634 NM_031866 ENSG00000177283 FZD8 FZ-8|hFZ8 frizzled class receptor 8 protein-coding 199-2 chr1 104197445 104197685 + 1.33333 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 124542 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 217.999-2 chr11 111046700 111046871 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50533 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 141-78 chr6 123519659 123519764 + 1.33333 NA intron (NM_001256020, intron 5 of 8) intron (NM_001256020, intron 5 of 8) 80107 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 331.333-18 chr14 21050717 21050998 + 1.33333 NA intron (NM_001282211, intron 1 of 14) L1MC4|LINE|L1 -6965 NM_138331 122665 Hs.553572 NM_138331 ENSG00000173431 RNASE8 RAE2 ribonuclease A family member 8 protein-coding 373.333-2 chr11 50407398 50407854 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -1521 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 255.333-25 chr12 28303744 28303949 + 1.33333 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) MIR|SINE|MIR -113108 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 235.333-54 chr2 35020006 35020270 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 342581 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 194.666-13 chr12 26078873 26079021 + 1.33333 NA intron (NM_007211, intron 5 of 5) intron (NM_007211, intron 5 of 5) 26383 NM_001164746 11228 Hs.696433 NM_007211 ENSG00000123094 RASSF8 C12orf2|HOJ1 Ras association domain family member 8 protein-coding 164.666-18 chr8 74434257 74434409 + 1.33333 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) 83930 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 201.333-230 chr5 74085305 74085498 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 222924 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 188.667-82 chr2 167812539 167812764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6021 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 234.666-39 chr5 37353403 37353635 + 1.33333 NA intron (NM_001278312, intron 4 of 33) AluSx|SINE|Alu 17587 NM_001278312 9631 Hs.547696 NM_004298 ENSG00000113569 NUP155 ATFB15|N155 nucleoporin 155 protein-coding 160-84 chr4 52720012 52720187 + 1.33333 NA non-coding (NR_145130, exon 3 of 3) non-coding (NR_145130, exon 3 of 3) 6850 NR_003016 677810 Hs.635034 NR_003016 ENSG00000212588 SNORA26 HBI-6 small nucleolar RNA, H/ACA box 26 snoRNA 228-63 chr4 81245404 81245659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30309 NM_001363401 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 215.333-143 chr4 42343056 42343348 + 1.33333 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) L1MC|LINE|L1 48066 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 265.666-28 chr9 115869833 115870279 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55151 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 223-10 chr10 100838661 100838940 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -74163 NM_001243770 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 333.667-3 chr10 29270063 29270472 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18803 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 153.666 chr14 81444253 81444416 + 1.33333 NA intron (NR_109999, intron 1 of 2) intron (NR_109999, intron 1 of 2) 5823 NR_109999 100506700 Hs.116304 NR_109999 ENSG00000258675 LINC02308 - long intergenic non-protein coding RNA 2308 ncRNA 216-115 chr7 54253812 54254118 + 1.33333 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -76732 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 197.333-246 chr9 102645691 102645868 + 1.33333 NA intron (NR_103830, intron 4 of 4) LTR24C|LTR|ERV1 126142 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 224.666-17 chr2 54245420 54245657 + 1.33333 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) L1MA5A|LINE|L1 10691 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 328.999-2 chr16 76477529 76478066 + 1.33333 NA intron (NR_136213, intron 11 of 23) intron (NR_136213, intron 11 of 23) -157201 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 276.666-33 chr8 38411721 38412074 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_023110, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_023110, exon 18 of 18) 24766 NM_001199660 137994 Hs.696457 NM_144652 ENSG00000165046 LETM2 SLC55A2 leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 2 protein-coding 276.666 chr1 151487495 151487774 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -23753 NM_020770 57530 Hs.591464 NM_020770 ENSG00000143375 CGN - cingulin protein-coding 233-22 chr13 95560186 95560483 + 1.33333 NA intron (NM_001160100, intron 2 of 4) intron (NM_001160100, intron 2 of 4) 7614 NM_006984 9071 Hs.534377 NM_006984 ENSG00000134873 CLDN10 CPETRL3|HELIX|OSP-L|OSPL claudin 10 protein-coding 216-104 chr6 9834147 9834373 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -570242 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 361-10 chr18 2821645 2822272 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -25048 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 175.333-113 chr22 44909515 44909712 + 1.33333 NA intron (NR_134535, intron 5 of 11) L2c|LINE|L2 94006 NR_147506 101927551 Hs.683911 NR_147506 ENSG00000230922 LOC101927551 - uncharacterized LOC101927551 ncRNA 216.666-11 chr10 32373433 32373646 + 1.33333 NA intron (NR_104163, intron 1 of 1) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 5230 NM_001282391 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 167.333-217 chr5 131256080 131256263 + 1.33333 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -7838 NM_020240 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 206.333-9 chr10 11019681 11019912 + 1.33333 NA intron (NM_001326345, intron 1 of 13) intron (NM_001326345, intron 1 of 13) 1040 NM_001326345 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 189.333-200 chr7 136626842 136626998 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -241732 NM_001006630 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 477.333-6 chr8 92154366 92154865 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -51230 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 286.667-25 chr4 19018841 19019222 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -997156 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 295.333-32 chr2 197771702 197772243 + 1.33333 NA exon (NM_001284362, exon 6 of 11) exon (NM_001284362, exon 6 of 11) 13347 NM_033030 66037 Hs.169797 NM_033030 ENSG00000152430 BOLL BOULE boule homolog, RNA binding protein protein-coding 260.999-5 chr9 35337608 35337949 + 1.33333 NA intron (NM_006377, intron 10 of 38) intron (NM_006377, intron 10 of 38) -4118 NM_001371188 221.333-2 chr1 22654653 22654868 + 1.33333 NA intron (NM_001371184, intron 2 of 3) intron (NM_001371184, intron 2 of 3) 1524 NM_001371184 201.333-221 chr5 22593987 22594141 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 259280 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 211-88 chr6 143571623 143571885 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -2415 NR_027113 285740 Hs.432656 NR_027113 ENSG00000235740 PHACTR2-AS1 - PHACTR2 antisense RNA 1 ncRNA 201-113 chr8 126213483 126213745 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -111881 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 150-125 chr6 101040498 101040678 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -159216 NM_022091 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 218.667-91 chr6 50872134 50872417 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53404 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 331.333-35 chr3 85935672 85936154 + 1.33333 NA intron (NM_001256502, intron 7 of 10) intron (NM_001256502, intron 7 of 10) -107863 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 216-16 chr11 73126918 73127187 + 1.33333 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) AluSz6|SINE|Alu 15266 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 146.333-118 chr16 50844386 50844680 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34240 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 214-105 chr5 23936202 23936447 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -15024 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 356.333-18 chr2 80328015 80328344 + 1.33333 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) intron (NM_001282599, intron 1 of 11) 14800 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 334.333-22 chr20 49178332 49178612 + 1.33333 NA intron (NM_001319135, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu 9898 NM_001322932 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 225.999-10 chr5 125674787 125674965 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 181615 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 195.667 chr1 20843524 20843803 + 1.33333 NA intron (NM_003760, intron 24 of 31) L1PA12|LINE|L1 -56975 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 176-24 chr12 31384245 31384439 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001308339, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_001308339, exon 23 of 23) -15041 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 314.666-33 chr7 43260346 43260842 + 1.33333 NA intron (NM_001287059, intron 2 of 27) L2b|LINE|L2 109699 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 158-74 chr2 124328534 124328722 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 303341 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 195.666-36 chr4 141046397 141046549 + 1.33333 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) intron (NM_020724, intron 1 of 6) 86996 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 371.333-24 chr9 94209004 94209416 + 1.33333 NA intron (NR_160773, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 -4644 NR_046163 158257 Hs.652626 NR_046163 ENSG00000230262 LINC02603 MIRLET7DHG long intergenic non-protein coding RNA 2603 ncRNA 213.333-210 chr8 106962250 106962486 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -192124 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 195.333-11 chr1 79433890 79434059 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -427244 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 194-121 chr6 100716691 100716931 + 1.33333 NA intron (NM_006828, intron 12 of 41) intron (NM_006828, intron 12 of 41) 164518 NM_006828 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 385.333-7 chr11 13679805 13680232 + 1.33333 NA intron (NM_032228, intron 1 of 11) intron (NM_032228, intron 1 of 11) 11350 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 229.333-108 chr6 92986255 92986431 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 433216 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 328.333-20 chr2 74931923 74932274 + 1.33333 NA intron (NR_125792, intron 2 of 4) L2b|LINE|L2 22967 NR_125792 102724515 Hs.708649 NR_125792 ENSG00000204792 LINC01291 - long intergenic non-protein coding RNA 1291 ncRNA 331.666-23 chr8 86976413 86976694 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MA7|LINE|L1 110138 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 411.666-2 chr14 73162850 73163319 + 1.33333 NA intron (NM_000021, intron 3 of 11) intron (NM_000021, intron 3 of 11) 26577 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 222.333-84 chr6 121837235 121837402 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 401672 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 193.333-114 chr20 51368388 51368577 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84495 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 205-23 chr12 62095992 62096224 + 1.33333 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) LTR89|LTR|ERVL? 96731 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 240-61 chr3 30974804 30975120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -80301 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 205-65 chr4 62364505 62364704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -202839 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-309 chr5 93885511 93885648 + 1.33333 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) intron (NR_028080, intron 4 of 8) -143979 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 219-41 chr18 3866816 3867103 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) AluSx3|SINE|Alu 7343 NM_001242764 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 222.333-77 chr5 131110789 131111095 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54314 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 200.666-83 chr3 189949529 189949688 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 119686 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 561.333 chr9 33152936 33153658 + 1.33333 NA intron (NM_001497, intron 1 of 5) L1M4|LINE|L1 -13651 NR_108110 101929639 Hs.545818 NR_108108 ENSG00000233554 B4GALT1-AS1 - B4GALT1 antisense RNA 1 ncRNA 240-83 chr7 39157329 39157623 + 1.33333 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -143909 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 126.666-2 chr4 59743864 59744009 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 730363 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 192-122 chr6 67952558 67952768 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102688 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 220.667-38 chr17 79017650 79017977 + 1.33333 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -5121 NM_153372 114897 Hs.201398 NM_030968 ENSG00000173918 C1QTNF1 CTRP1|GIP|ZSIG37 C1q and TNF related 1 protein-coding 247.333-80 chr7 116468919 116469178 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -30690 NM_001233 858 Hs.212332 NM_001233 ENSG00000105971 CAV2 CAV caveolin 2 protein-coding 242.666-37 chr7 99439645 99439863 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_015545) promoter-TSS (NM_015545) 378 NM_001318162 10898 Hs.489287 NM_006693 ENSG00000160917 CPSF4 CPSF30|NAR|NEB-1|NEB1 cleavage and polyadenylation specific factor 4 protein-coding 121.666-6 chr6 105707127 105707302 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -304132 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 207.999-2 chr16 78902814 78902972 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 697844 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 346.666-7 chr18 22954410 22954767 + 1.33333 NA intron (NM_002894, intron 4 of 18) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 20712 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 126-99 chr6 38069680 38069813 + 1.33333 NA intron (NM_021943, intron 3 of 5) intron (NM_021943, intron 3 of 5) 250019 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 190.667-159 chr9 89578883 89579130 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -26006 NM_006705 10912 Hs.9701 NM_006705 ENSG00000130222 GADD45G CR6|DDIT2|GADD45gamma|GRP17 growth arrest and DNA damage inducible gamma protein-coding 136.333-34 chr11 99459134 99459286 + 1.33333 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) L2a|LINE|L2 -96935 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 196.666-24 chr14 78814646 78814820 + 1.33333 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -385249 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 168-55 chr2 117708607 117708762 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106007 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 217-90 chr8 125541519 125541762 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109431 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 199.666-26 chr2 173131642 173131866 + 1.33333 NA intron (NM_133646, intron 2 of 11) intron (NM_133646, intron 2 of 11) 55908 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 202-144 chr5 26003349 26003616 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 812529 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 207-33 chr14 47772821 47773113 + 1.33333 NA intron (NR_039996, intron 2 of 2) L1MC1|LINE|L1 -11863 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 218-65 chr20 10233054 10233222 + 1.33333 NA intron (NM_001322907, intron 3 of 9) intron (NM_001322907, intron 3 of 9) -13632 NR_040710 100131208 Hs.658178 NR_040710 ENSG00000227906 SNAP25-AS1 - SNAP25 antisense RNA 1 ncRNA 303.999 chr16 9901516 9901970 + 1.33333 NA intron (NM_001134408, intron 3 of 13) AluSz6|SINE|Alu 280324 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 264-33 chr2 231478247 231478531 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -13905 NM_005381 4691 Hs.79110 NM_005381 ENSG00000115053 NCL C23|Nsr1 nucleolin protein-coding 166.333-146 chr3 29407831 29408014 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 126610 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 171.333-34 chr12 13195324 13195489 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1320 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 140.333-199 chr6 35853385 35853552 + 1.33333 NA intron (NM_003137, intron 13 of 15) MER2|DNA|TcMar-Tigger 48116 NM_182548 222662 Hs.367947 NM_182548 ENSG00000197753 LHFPL5 DFNB67|TMHS|dJ510O8.8 LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein-coding 224-105 chr8 90756232 90756445 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -35437 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 140.666-5 chr2 123226226 123226376 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -152820 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 271.666-15 chr8 125273390 125273664 + 1.33333 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -156831 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 233-44 chr21 29262270 29262531 + 1.33333 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -36522 NM_001186 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 308.667-32 chr5 24042088 24042511 + 1.33333 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR 90951 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 327.333-25 chr21 23172752 23173075 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 93629 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 246.666-32 chr5 33606435 33606627 + 1.33333 NA intron (NM_001324512, intron 14 of 21) intron (NM_001324512, intron 14 of 21) 165755 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 232-32 chr15 56395892 56396141 + 1.33333 NA intron (NM_198524, intron 9 of 12) L1MB8|LINE|L1 30592 NM_198524 374618 Hs.511476 NM_198524 ENSG00000151575 TEX9 - testis expressed 9 protein-coding 164-57 chr2 82143213 82143439 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -676380 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 298-10 chr10 30026321 30026663 + 1.33333 NA exon (NM_001350001, exon 4 of 5) exon (NM_001350001, exon 4 of 5) 33094 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 304.999 chr7 51996131 51996418 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -603018 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 276.333-23 chr2 103005096 103005397 + 1.33333 NA Intergenic (TTTGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -20817 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 194-30 chr12 122760862 122761095 + 1.33333 NA intron (NM_003677, intron 2 of 7) AluJr|SINE|Alu 8154 NM_003677 8562 Hs.22393 NM_003677 ENSG00000139726 DENR DRP|DRP1|SMAP-3 density regulated re-initiation and release factor protein-coding 235.333-114 chr7 106400304 106400636 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -115487 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 138.667-50 chr12 91848753 91848925 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 292874 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 254.333-91 chr8 129454512 129454904 + 1.33333 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 29434 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 204.333-70 chr16 79718041 79718219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52341 NR_104660 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 198.333-173 chr6 14609799 14610034 + 1.33333 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -324462 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 214.666-5 chr1 79160790 79160952 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154141 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 240.333-62 chr3 15834328 15834658 + 1.33333 NA intron (NM_001349279, intron 1 of 28) L1PB4|LINE|L1 25321 NM_001349279 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 204.333-198 chr8 88842980 88843253 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -515633 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 203.333-162 chr22 28559467 28559690 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L2c|LINE|L2 99709 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 474-4 chr6 148410636 148411373 + 1.33333 NA intron (NM_001346506, intron 2 of 20) AluSp|SINE|Alu 68166 NM_015278 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 171.333-120 chr3 101651470 101651661 + 1.33333 NA exon (NM_014415, exon 11 of 11) exon (NM_014415, exon 11 of 11) -24865 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 356-16 chr15 38395620 38396127 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -58254 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 319-9 chr17 78019089 78019526 + 1.33333 NA intron (NM_018996, intron 2 of 20) intron (NM_018996, intron 2 of 20) 15070 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 207-92 chr4 106348591 106348819 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_004757, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_004757, exon 7 of 7) 18730 NM_001195138 100507096 Hs.722750 NM_001195138 ENSG00000250298 GIMD1 - GIMAP family P-loop NTPase domain containing 1 protein-coding 315.666-6 chr2 5441633 5441966 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 249319 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 223-13 chr12 119995313 119995603 + 1.33333 NA intron (NM_001367886, intron 1 of 9) intron (NM_001367886, intron 1 of 9) 5614 NR_147892 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 244.667-40 chr14 27652252 27652581 + 1.33333 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 -19138 NR_130461 100422830 NR_130461 ENSG00000264657 MIR3171 - microRNA 3171 ncRNA 200.667-106 chr3 45882544 45882795 + 1.33333 NA intron (NM_001276379, intron 2 of 9) intron (NM_001276379, intron 2 of 9) -3835 NM_001256369 10803 Hs.225946 NM_006641 ENSG00000173585 CCR9 CC-CKR-9|CDw199|GPR-9-6|GPR28 C-C motif chemokine receptor 9 protein-coding 226-92 chr8 78369258 78369596 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -146913 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 231.333-76 chr4 32868650 32869030 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 517802 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 174.666-4 chr1 207896891 207897064 + 1.33333 NA intron (NM_001025109, intron 4 of 7) intron (NM_001025109, intron 4 of 7) 14148 NM_001025109 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 303.333-56 chr4 79437767 79438123 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -29717 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 219.666-26 chr2 101762174 101762473 + 1.33333 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 64616 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 233.333-20 chr10 75905987 75906198 + 1.33333 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 123331 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 194.666-79 chr9 95470231 95470433 + 1.33333 NA TTS (NR_038982) TTS (NR_038982) 6723 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 164-93 chr5 122945344 122945532 + 1.33333 NA intron (NM_014035, intron 2 of 6) intron (NM_014035, intron 2 of 6) 91287 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 175.666-10 chr2 57800341 57800483 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107239 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 260-74 chr7 42997470 42997912 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65315 NR_156497 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 437.667-2 chr12 120562980 120563506 + 1.33333 NA intron (NM_014868, intron 8 of 16) intron (NM_014868, intron 8 of 16) 18155 NM_198202 51367 Hs.279913 NM_015918 ENSG00000167272 POP5 HSPC004|RPP2|RPP20|hPop5 POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 208-20 chr10 34230461 34230660 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -457880 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 251.667-77 chr5 32391770 32392067 + 1.33333 NA intron (NM_016107, intron 11 of 19) AluJb|SINE|Alu 2557 NR_030305 693164 NR_030305 ENSG00000207956 MIR579 MIRN579|hsa-mir-579 microRNA 579 ncRNA 220.333-47 chr16 75173416 75173617 + 1.33333 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL 24465 NM_001318475 162239 Hs.388813 NM_153688 ENSG00000184517 ZFP1 ZNF475 ZFP1 zinc finger protein protein-coding 181-55 chr4 48566603 48566802 + 1.33333 NA intron (NM_015030, intron 28 of 63) intron (NM_015030, intron 28 of 63) 76450 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 160.667-256 chr5 175424270 175424459 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 19818 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 255.666-20 chr4 140683699 140683988 + 1.33333 NA intron (NM_015130, intron 3 of 20) intron (NM_015130, intron 3 of 20) -40763 NR_077215 644962 Hs.676500 NR_077215 TNRC18P1 - trinucleotide repeat containing 18 pseudogene 1 pseudo 227.333-20 chr10 69639067 69639381 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 8977 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 267-36 chr2 50986555 50987047 + 1.33333 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 45331 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 237.333-68 chr21 21782341 21782537 + 1.33333 NA intron (NR_109958, intron 2 of 4) L1MA2|LINE|L1 35454 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 240.667-69 chr6 44373284 44373709 + 1.33333 NA intron (NM_145026, intron 7 of 8) intron (NM_145026, intron 7 of 8) -14210 NM_001253 988 Hs.485471 NM_001253 ENSG00000096401 CDC5L CDC5|CDC5-LIKE|CEF1|PCDC5RP|dJ319D22.1 cell division cycle 5 like protein-coding 219.333-8 chr1 115592548 115592801 + 1.33333 NA Intergenic MER61B|LTR|ERV1 -49296 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 199.333-137 chr2 148031649 148031801 + 1.33333 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -10121 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 200.666-29 chr13 69791983 69792134 + 1.33333 NA intron (NM_001286725, intron 6 of 9) L1PA10|LINE|L1 -315155 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 197.333-175 chr4 173820675 173820891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -76490 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 312.333-28 chr8 49912404 49912669 + 1.33333 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) 1129 NR_135796 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 221.333-86 chr22 35255812 35256102 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1536 NM_001362972 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 234.667-96 chr6 55849714 55850033 + 1.33333 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) L3|LINE|CR1 25717 NM_001329754 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 294-68 chrX 21889851 21890239 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34058 NM_206923 404281 Hs.673601 NM_206923 ENSG00000230797 YY2 ZNF631 YY2 transcription factor protein-coding 112-22 chr10 111052009 111052189 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -24930 NM_000681 150 Hs.249159 NM_000681 ENSG00000150594 ADRA2A ADRA2|ADRA2R|ADRAR|ALPHA2AAR|ZNF32 adrenoceptor alpha 2A protein-coding 209-42 chr14 34774295 34774553 + 1.33333 NA exon (NM_182648, exon 18 of 26) exon (NM_182648, exon 18 of 26) -59601 NR_028130 1073 Hs.180141 NM_021914 ENSG00000165410 CFL2 NEM7 cofilin 2 protein-coding 402-9 chr5 95793189 95793667 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_014899, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_014899, exon 12 of 12) 29298 NM_001118890 2745 Hs.28988 NM_002064 ENSG00000173221 GLRX GRX|GRX1 glutaredoxin protein-coding 195.667-80 chr21 35906762 35907039 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20455 NR_144547 54036 Hs.228809 NR_144547 PPP1R2P2 - protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 pseudogene 2 pseudo 235.333-110 chr6 150593875 150594154 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5871 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 167-103 chr8 94049449 94049655 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 132605 NM_001161779 54704 Hs.22265 NM_018444 ENSG00000164951 PDP1 PDH|PDP|PDPC|PPM2A|PPM2C pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 protein-coding 308-8 chr10 60608492 60608944 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -35762 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 184.666-31 chr6 737408 737632 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44379 NR_073064 55770 Hs.484412 NM_018303 ENSG00000112685 EXOC2 SEC5|SEC5L1|Sec5p exocyst complex component 2 protein-coding 220.666-68 chr8 21120289 21120466 + 1.33333 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 146391 NR_033894 286114 Hs.651884 NR_033894 ENSG00000253199 LINC02153 - long intergenic non-protein coding RNA 2153 ncRNA 356-6 chr10 63069638 63070363 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63247 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 230-40 chr21 28075323 28075553 + 1.33333 NA intron (NR_126010, intron 1 of 4) intron (NR_126010, intron 1 of 4) -14965 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 306.333-23 chr19 30362724 30362976 + 1.33333 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -9534 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 402.333-10 chr4 168080339 168080696 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12020 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 296-56 chr6 50217399 50217896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -167718 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 401.666-4 chr17 68023371 68023975 + 1.33333 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -12062 NM_002266 3838 Hs.594238 NM_002266 ENSG00000182481 KPNA2 IPOA1|QIP2|RCH1|SRP1-alpha|SRP1alpha karyopherin subunit alpha 2 protein-coding 250-74 chr7 2807059 2807385 + 1.33333 NA intron (NM_001293092, intron 1 of 2) intron (NM_001293092, intron 1 of 2) 8008 NM_001282441 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 246.666-13 chr14 55596819 55597029 + 1.33333 NA intron (NM_004986, intron 1 of 41) intron (NM_004986, intron 1 of 41) 16717 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 118-3 chr1 108751572 108751723 + 1.33333 NA intron (NM_007269, intron 1 of 18) intron (NM_007269, intron 1 of 18) 4973 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 335.666-2 chr1 84929011 84929482 + 1.33333 NA intron (NM_153259, intron 13 of 13) intron (NM_153259, intron 13 of 13) -36040 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 245.666-6 chr12 20509191 20509492 + 1.33333 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -62523 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 387-7 chr15 67373995 67374472 + 1.33333 NA TTS (NM_001284349) TTS (NM_001284349) -119035 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 210-31 chr13 26867473 26867731 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106816 NM_005288 2835 Hs.123034 NM_005288 ENSG00000132975 GPR12 GPCR12|GPCR21|PPP1R84 G protein-coupled receptor 12 protein-coding 189-20 chr12 125392875 125393169 + 1.33333 NA intron (NM_052907, intron 2 of 8) intron (NM_052907, intron 2 of 8) 66406 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 235.333-26 chr12 6862197 6862467 + 1.33333 NA intron (NM_001098536, intron 13 of 19) intron (NM_001098536, intron 13 of 19) -5088 NM_001159287 7167 Hs.524219 NM_000365 ENSG00000111669 TPI1 HEL-S-49|TIM|TPI|TPID triosephosphate isomerase 1 protein-coding 142.666-14 chr4 44273004 44273176 + 1.33333 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 175719 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 326-31 chr4 41368552 41368881 + 1.33333 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 7909 NM_001330787 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 302.999-2 chr10 33994001 33994329 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -221485 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 399.333-2 chr10 17187531 17187902 + 1.33333 NA intron (NM_004412, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 13956 NM_001321006 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 245-31 chr2 26306595 26306977 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 12263 NM_001145168 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 246.667-66 chr5 25037602 25037951 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 152880 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 269.666-6 chr12 21055009 21055424 + 1.33333 NA intron (NM_001009562, intron 10 of 12) intron (NM_001009562, intron 10 of 12) 39520 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 199.333-32 chr10 102874659 102874874 + 1.33333 NA intron (NM_020682, intron 6 of 10) intron (NM_020682, intron 6 of 10) 5296 NM_020682 57412 Hs.720370 NM_020682 ENSG00000214435 AS3MT CYT19 arsenite methyltransferase protein-coding 327.666-12 chr8 133425360 133425889 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -128320 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 166.667-220 chr7 85716188 85716409 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 295176 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 221.666-57 chr9 19090680 19090871 + 1.33333 NA intron (NM_001270890, intron 4 of 16) intron (NM_001270890, intron 4 of 16) 12129 NM_001270890 54801 Hs.533468 NM_017645 ENSG00000147874 HAUS6 Dgt6|FAM29A HAUS augmin like complex subunit 6 protein-coding 265.999-2 chr10 35802035 35802252 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 23841 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 274-48 chr5 107197903 107198256 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -187065 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 293-12 chr11 99329452 99329789 + 1.33333 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) intron (NM_001243271, intron 2 of 20) -226525 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 175.666-26 chr8 132947854 132948033 + 1.33333 NA intron (NM_003235, intron 26 of 47) intron (NM_003235, intron 26 of 47) 80985 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 213-8 chr10 73535599 73535867 + 1.33333 NA intron (NR_146997, intron 11 of 21) FLAM_A|SINE|Alu 17607 NR_135250 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 195.666 chr1 104082325 104082537 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 9408 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 195-33 chr12 118197035 118197225 + 1.33333 NA intron (NM_001346488, intron 14 of 21) intron (NM_001346488, intron 14 of 21) -6595 NM_001346497 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 283.333-12 chr12 16215085 16215375 + 1.33333 NA intron (NM_001170798, intron 7 of 8) intron (NM_001170798, intron 7 of 8) 62455 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 478.999 chr8 65261891 65262567 + 1.33333 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -81889 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 195.333-214 chr8 100049234 100049383 + 1.33333 NA intron (NM_015668, intron 10 of 27) L1ME1|LINE|L1 44726 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 215 chr1 43052969 43053184 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 94027 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 256.666-3 chr1 66044777 66045133 + 1.33333 NA intron (NR_123718, intron 2 of 2) intron (NR_123718, intron 2 of 2) 5763 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 200-17 chr10 27761877 27762046 + 1.33333 NA intron (NR_121652, intron 1 of 1) intron (NR_121652, intron 1 of 1) -16142 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 252.667-52 chr2 157785274 157785611 + 1.33333 NA intron (NM_001111067, intron 3 of 10) intron (NM_001111067, intron 3 of 10) 53188 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 199-62 chr20 47013269 47013441 + 1.33333 NA intron (NM_172110, intron 4 of 13) L2b|LINE|L2 118512 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 207.333-280 chr9 102276710 102276949 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -242808 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 176.333-45 chr14 21407792 21408045 + 1.33333 NA intron (NM_001170629, intron 13 of 37) intron (NM_001170629, intron 13 of 37) -10517 NR_002916 319103 Hs.680078 NR_002916 ENSG00000200785 SNORD8 RNU6C|mgU6-53 small nucleolar RNA, C/D box 8 snoRNA 216.667-30 chr12 56560761 56561042 + 1.33333 NA intron (NM_002898, intron 1 of 13) L1PA13|LINE|L1 39081 NM_002898 5939 Hs.505729 NM_002898 ENSG00000076067 RBMS2 SCR3 RNA binding motif single stranded interacting protein 2 protein-coding 206-86 chr2 112676921 112677132 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 31087 NM_005415 6574 Hs.187946 NM_005415 ENSG00000144136 SLC20A1 GLVR1|Glvr-1|PIT1|PiT-1 solute carrier family 20 member 1 protein-coding 217.333-70 chr2 178025049 178025277 + 1.33333 NA intron (NM_001077197, intron 2 of 20) intron (NM_001077197, intron 2 of 20) 47614 NM_016953 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 158.667-36 chr10 31670279 31670478 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 238548 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 198.666-89 chr7 154464834 154464986 + 1.33333 NA intron (NR_157196, intron 2 of 25) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 159751 NM_001290252 1804 Hs.490684 NM_001936 ENSG00000130226 DPP6 DPL1|DPPX|MRD33|VF2 dipeptidyl peptidase like 6 protein-coding 206.666-8 chr1 114627785 114627987 + 1.33333 NA intron (NM_198459, intron 1 of 17) intron (NM_198459, intron 1 of 17) 42163 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 185.333-197 chr9 26739672 26739860 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 153036 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 340.667-17 chr6 3646615 3647195 + 1.33333 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 105107 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 195-117 chrX 73491010 73491256 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 43879 NM_005193 1046 Hs.553488 NM_005193 ENSG00000131264 CDX4 - caudal type homeobox 4 protein-coding 196.333-147 chr5 154992119 154992349 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21521 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 203-4 chr1 94019797 94020042 + 1.33333 NA intron (NM_000350, intron 35 of 49) intron (NM_000350, intron 35 of 49) 101229 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 288.333-15 chr16 66103660 66104033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -262845 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 340.666-11 chr2 47177301 47177860 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001305624) promoter-TSS (NM_001305624) -644 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 205.999-3 chr2 186886425 186886581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37333 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 114.667-142 chr2 161380537 161380682 + 1.33333 NA intron (NM_005805, intron 7 of 11) intron (NM_005805, intron 7 of 11) -35688 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 202.333-127 chr4 62285445 62285696 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -123805 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 318.667-33 chr8 6690706 6691137 + 1.33333 NA intron (NR_125386, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 17288 NR_125386 100507530 Hs.490892 NR_125386 MCPH1-AS1 - MCPH1 antisense RNA 1 ncRNA 230-70 chr8 31809444 31809675 + 1.33333 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 169807 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 203.333-233 chr6 79263444 79263660 + 1.33333 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -28870 NM_001318884 9324 Hs.77558 NM_004242 ENSG00000118418 HMGN3 PNAS-24|PNAS-25|TRIP7 high mobility group nucleosomal binding domain 3 protein-coding 212-134 chr5 151051048 151051247 + 1.33333 NA intron (NM_001258454, intron 7 of 17) intron (NM_001258454, intron 7 of 17) 13984 NM_001258456 10318 Hs.355141 NM_006058 ENSG00000145901 TNIP1 ABIN-1|NAF1|VAN|nip40-1 TNFAIP3 interacting protein 1 protein-coding 247-65 chr5 153620477 153620815 + 1.33333 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) MIRb|SINE|MIR 128474 NM_001258021 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 299.333-6 chr10 66201165 66201489 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) 629902 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 217.333-171 chrX 93326469 93326740 + 1.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 346974 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 358-17 chr4 151226219 151226634 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001128923) promoter-TSS (NM_001128923) -6 NM_001128923 152503 Hs.744983 NM_001009555 ENSG00000109686 SH3D19 EBP|EVE1|Eve-1|Kryn|SH3P19 SH3 domain containing 19 protein-coding 222.999-5 chr8 141173107 141173286 + 1.33333 NA intron (NM_001362798, intron 13 of 21) intron (NM_001362798, intron 13 of 21) 44607 NR_148197 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 174.333-151 chr8 124456573 124456768 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5850 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 120.333-82 chr18 10980631 10980788 + 1.33333 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) L1M5|LINE|L1 168053 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 332.333-27 chr9 31369880 31370258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11421 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 381.999-3 chr15 90074248 90074605 + 1.33333 NA TTS (NR_146321) TTS (NR_146321) 7781 NR_146321 109729181 Hs.655249 NR_146321 ENSG00000259291 ZNF710-AS1 - ZNF710 antisense RNA 1 ncRNA 210.666-52 chr2 44793863 44794027 + 1.33333 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 144943 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 335.333-49 chr7 10379328 10379602 + 1.33333 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -323211 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 191-20 chr14 71140316 71140494 + 1.33333 NA Intergenic PABL_A|LTR|ERV1 -180071 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 312.666-16 chr3 107885018 107885278 + 1.33333 NA intron (NR_015394, intron 1 of 2) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 1943 NR_015394 285205 Hs.134882 NR_015394 ENSG00000240423 LINC00636 - long intergenic non-protein coding RNA 636 ncRNA 275.333-38 chr2 185401235 185401541 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -234316 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 358.666-7 chr20 31298575 31298946 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 9825 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 331.666-4 chr12 12642197 12642484 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001310, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001310, exon 4 of 4) 30464 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 267.333-16 chr10 96755654 96756023 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 5572 NR_026712 728658 Hs.645344 NR_026712 ENSG00000236552 RPL13AP5 RPL13A_8_1086|bA196N24.2 ribosomal protein L13a pseudogene 5 pseudo 198-68 chr16 87346086 87346296 + 1.33333 NA intron (NM_024735, intron 3 of 8) intron (NM_024735, intron 3 of 8) 28682 NR_135180 101928659 Hs.667450 NR_135180 ENSG00000270006 LOC101928659 - uncharacterized LOC101928659 ncRNA 206-142 chr5 77334653 77334894 + 1.33333 NA intron (NM_001029851, intron 5 of 18) MIRb|SINE|MIR 124093 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 543.333-4 chr7 21885245 21885932 + 1.33333 NA intron (NM_001277115, intron 76 of 81) L1MA6|LINE|L1 60311 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 377-12 chr5 18436840 18437295 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 629793 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 159-37 chr14 65018051 65018225 + 1.33333 NA intron (NM_002028, intron 4 of 11) AluJo|SINE|Alu -26550 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 208-69 chr19 38262358 38262610 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -2089 NM_021102 10653 Hs.31439 NM_021102 ENSG00000167642 SPINT2 DIAR3|HAI-2|HAI2|Kop|PB serine peptidase inhibitor, Kunitz type 2 protein-coding 278.999-3 chr1 248330797 248331165 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -6413 NM_001004691 391196 Hs.530570 NM_001004691 ENSG00000177186 OR2M7 OR1-58 olfactory receptor family 2 subfamily M member 7 protein-coding 168-87 chr4 150308437 150308590 + 1.33333 NA intron (NM_001367550, intron 52 of 56) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 230068 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 257.333-65 chr3 117504438 117504706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 186353 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 218.667-22 chr11 127616396 127616700 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 345478 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 191.333-149 chr4 96202793 96202962 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107826 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 230.333-59 chr2 50967589 50967892 + 1.33333 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) MIR3|SINE|MIR 64392 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 199.667-138 chr8 79924316 79924603 + 1.33333 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -52722 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 222-71 chr5 23581888 23582091 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 74334 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 200.666-126 chrX 28276433 28276660 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 219117 NR_106750 102465140 NR_106750 ENSG00000277569 MIR6134 hsa-mir-6134 microRNA 6134 ncRNA 165.333-116 chr19 37617355 37617635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22619 NM_001172225 163255 Hs.728927 NM_152606 ENSG00000171817 ZNF540 Nbla10512 zinc finger protein 540 protein-coding 203.667-39 chr17 53738463 53738752 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84320 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 253.999-5 chr2 48568716 48568931 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_172311) promoter-TSS (NM_172311) 45 NM_172311 286749 Hs.732016 NM_172311 ENSG00000068781 STON1-GTF2A1L ALF|GTF2A1L|GTF2A1LF|SALF STON1-GTF2A1L readthrough protein-coding 183.333-123 chr5 16289543 16289731 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109396 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 327-4 chr11 25420190 25420587 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -768735 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 211.333-82 chr17 21067593 21067762 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -7879 NR_110895 101060544 Hs.585812 NR_110895 ENSG00000236819 LINC01563 HP08942 long intergenic non-protein coding RNA 1563 ncRNA 252.666-4 chr1 202959265 202959731 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001290629) promoter-TSS (NM_001290629) -926 NM_001290629 51094 Hs.5298 NM_015999 ENSG00000159346 ADIPOR1 ACDCR1|CGI-45|CGI45|PAQR1|TESBP1A adiponectin receptor 1 protein-coding 220-109 chr7 14772243 14772509 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) intron (NM_001350717, intron 2 of 24) 69074 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 291.333-59 chr6 119024022 119024292 + 1.33333 NA exon (NM_001100411, exon 2 of 17) exon (NM_001100411, exon 2 of 17) 44986 NR_030315 693128 NR_030315 ENSG00000207982 MIR548B MIRN548B microRNA 548b ncRNA 376.666-2 chr13 66657608 66657949 + 1.33333 NA intron (NM_020403, intron 2 of 3) intron (NM_020403, intron 2 of 3) -167391 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 243.333-61 chr20 38648538 38648853 + 1.33333 NA exon (NM_001164431, exon 14 of 15) exon (NM_001164431, exon 14 of 15) 46886 NM_001164431 343578 NM_001164431 ENSG00000124143 ARHGAP40 C20orf95|dJ1100H13.4 Rho GTPase activating protein 40 protein-coding 246.666-38 chr8 80128974 80129184 + 1.33333 NA intron (NR_105035, intron 1 of 6) intron (NR_105035, intron 1 of 6) 42042 NR_105037 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 224-93 chr7 5336925 5337166 + 1.33333 NA intron (NM_001080495, intron 18 of 29) L1MEf|LINE|L1 54102 NM_153247 222962 Hs.4302 NM_153247 ENSG00000164638 SLC29A4 ENT4|PMAT solute carrier family 29 member 4 protein-coding 228-25 chr13 38001726 38002020 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -131448 NM_001135955 7223 Hs.262960 NM_003306 ENSG00000133107 TRPC4 HTRP-4|HTRP4|TRP4 transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 protein-coding 167.666-7 chr3 99588058 99588263 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50434 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 377.999-3 chr3 86165164 86165473 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -316625 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 297-31 chr2 147038398 147038899 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 451591 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 201.333-285 chr8 113041621 113041830 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 335427 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 211.666-13 chr14 53761884 53762143 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 186471 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 213.333-167 chr5 131754509 131754762 + 1.33333 NA intron (NM_133372, intron 1 of 17) intron (NM_133372, intron 1 of 17) 42382 NM_001008738 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 134-74 chr4 30726766 30726918 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 6473 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 199.333-28 chr10 77047307 77047569 + 1.33333 NA intron (NM_001271519, intron 14 of 28) intron (NM_001271519, intron 14 of 28) -93393 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 264.333-25 chr15 67386056 67386354 + 1.33333 NA intron (NM_001031715, intron 11 of 20) intron (NM_001031715, intron 11 of 20) -131007 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 397.333-2 chr1 145709430 145709856 + 1.33333 NA Intergenic Charlie17a|DNA|hAT-Charlie -2243 NM_002614 5174 Hs.444751 NM_002614 ENSG00000174827 PDZK1 CAP70|CLAMP|NHERF-3|NHERF3|PDZD1 PDZ domain containing 1 protein-coding 336.333-21 chr22 40530657 40531074 + 1.33333 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) intron (NM_020831, intron 3 of 14) 2962 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 223.333-139 chr6 15732600 15732857 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -69670 NM_001271669 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 249.666-8 chr10 25727885 25728185 + 1.33333 NA intron (NR_108068, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 76323 NR_108069 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 261-49 chr6 70861629 70861968 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001281439, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001281439, exon 11 of 11) 95262 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 238-4 chr1 231064837 231065073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24701 NM_198552 375061 Hs.38516 NM_198552 ENSG00000182118 FAM89A C1orf153 family with sequence similarity 89 member A protein-coding 286.333-49 chr9 38752714 38752936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 131737 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 199-92 chr6 70032667 70032849 + 1.33333 NA intron (NM_001858, intron 12 of 50) intron (NM_001858, intron 12 of 50) 166202 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 218.667-99 chr7 34402568 34402884 + 1.33333 NA intron (NR_033665, intron 3 of 3) intron (NR_033665, intron 3 of 3) -255492 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 352.666 chr10 44088901 44089279 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176688 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 247.666-15 chr2 146965244 146965540 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 378335 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 248.667-112 chr9 88841315 88841661 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95583 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 278.999-8 chr8 122049619 122049917 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -408328 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 255.333-71 chr3 72427055 72427295 + 1.33333 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) intron (NM_012234, intron 1 of 3) 19448 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 254-65 chr5 87947972 87948338 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 286113 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 272.999-2 chr16 86051153 86051530 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 132994 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 208.666-18 chr10 55665816 55665977 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -37954 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 218-97 chr6 69192743 69192911 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) L2a|LINE|L2 557545 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 182.333-65 chr18 4424378 4424585 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 30785 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 334.333-11 chr13 41870518 41871131 + 1.33333 NA intron (NM_001009814, intron 9 of 25) intron (NM_001009814, intron 9 of 25) 90261 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 288.333-8 chr12 33651355 33651819 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -211768 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 216.666-44 chr2 160351847 160352012 + 1.33333 NA intron (NM_002897, intron 2 of 13) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 55953 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 200.333-100 chr3 182509917 182510070 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2869 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 310.666-2 chr1 227099228 227099706 + 1.33333 NA intron (NM_001366019, intron 15 of 36) Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger 159173 NM_020247 56997 Hs.118241 NM_020247 ENSG00000163050 COQ8A ADCK3|ARCA2|CABC1|COQ10D4|COQ8|SCAR9 coenzyme Q8A protein-coding 310.666-21 chr7 14792823 14793190 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) intron (NM_001350717, intron 2 of 24) 48444 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 340 chr1 64424913 64425379 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44983 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 169-105 chr8 132104796 132105076 + 1.33333 NA intron (NM_001145095, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 329 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 168.333-211 chr8 118286811 118287023 + 1.33333 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -175098 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 363.333-27 chrX 11514990 11515356 + 1.33333 NA intron (NR_109776, intron 1 of 14) intron (NR_109776, intron 1 of 14) -87355 NM_001287242 395 Hs.435291 NM_001174 ENSG00000047648 ARHGAP6 RHOGAP6|RHOGAPX-1 Rho GTPase activating protein 6 protein-coding 328.667 chr1 64221516 64221963 + 1.33333 NA intron (NR_158769, intron 6 of 8) intron (NR_158769, intron 6 of 8) 18116 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 203.333-77 chr14 53150543 53150724 + 1.33333 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) CR1_Mam|LINE|CR1 2690 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 166-126 chrX 45427051 45427210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -78258 NR_104645 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 234-38 chr2 122658089 122658392 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 415241 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 314-17 chr2 34743471 34743866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 66111 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 317.333-47 chr9 91549459 91549844 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -86600 NR_037472 100500821 NR_037472 ENSG00000266855 MIR3910-1 mir-3910-1 microRNA 3910-1 ncRNA 336.666-21 chr5 169176561 169176914 + 1.33333 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) MER58A|DNA|hAT-Charlie 86957 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 204-191 chr8 79343606 79343894 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 11562 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 200-61 chr14 88648041 88648295 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 28 of 42) L3|LINE|CR1 53748 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 323.333-27 chr5 139840690 139841176 + 1.33333 NA intron (NM_032289, intron 14 of 14) L1MB2|LINE|L1 45125 NM_032289 84249 Hs.21963 NM_032289 ENSG00000146005 PSD2 EFA6C pleckstrin and Sec7 domain containing 2 protein-coding 201-99 chr6 130993732 130994000 + 1.33333 NA intron (NM_001135554, intron 1 of 14) HERVH48-int|LTR|ERV1 6901 NM_001252660 2037 Hs.486470 NM_001431 ENSG00000079819 EPB41L2 4.1-G|4.1G erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2 protein-coding 172-16 chr1 208808109 208808294 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 79513 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 454-6 chr18 22775623 22776090 + 1.33333 NA intron (NR_110782, intron 1 of 1) L3|LINE|CR1 10981 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 162.667-209 chr5 27228223 27228420 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -189735 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 216.666-49 chr3 183935352 183935539 + 1.33333 NA intron (NM_001320032, intron 26 of 29) AluSx4|SINE|Alu 48645 NR_039650 100616127 NR_039650 ENSG00000263932 MIR4448 - microRNA 4448 ncRNA 210.999-5 chr2 230884117 230884294 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -2341 NR_038238 151484 Hs.559309 NR_038238 ENSG00000232520 LOC151484 - uncharacterized LOC151484 ncRNA 192.667-6 chr1 103987724 103987964 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -85179 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 208.333-20 chr11 84419334 84419549 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -102102 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 235.333-7 chr1 219826949 219827219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 101567 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 227-16 chr12 25510484 25510671 + 1.33333 NA intron (NM_152590, intron 7 of 8) L1ME3A|LINE|L1 42706 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 203.333-201 chr4 181004138 181004352 + 1.33333 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 154904 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 257.666-2 chr1 150844204 150844571 + 1.33333 NA intron (NM_001286036, intron 4 of 21) intron (NM_001286036, intron 4 of 21) 32212 NM_001350224 405 Hs.632446 NM_001668 ENSG00000143437 ARNT HIF-1-beta|HIF-1beta|HIF1-beta|HIF1B|HIF1BETA|TANGO|bHLHe2 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein-coding 231.333-88 chr5 78420056 78420274 + 1.33333 NA intron (NR_110885, intron 5 of 7) AluSz6|SINE|Alu 59548 NR_110885 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 344.999-2 chr21 22356537 22356830 + 1.33333 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 258066 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 238-86 chr6 49266320 49266650 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 196768 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 292.333-37 chr5 176959143 176959422 + 1.33333 NA intron (NM_001317961, intron 6 of 14) intron (NM_001317961, intron 6 of 14) 47160 NM_016290 51720 Hs.232721 NM_016290 ENSG00000087206 UIMC1 RAP80|X2HRIP110 ubiquitin interaction motif containing 1 protein-coding 252-111 chr8 125275535 125275891 + 1.33333 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR -154645 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 218.333-75 chr2 191152033 191152283 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001243835) promoter-TSS (NM_001243835) -562 NM_001243835 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 275.333-73 chr7 99916578 99916827 + 1.33333 NA exon (NM_033017, exon 2 of 7) exon (NM_033017, exon 2 of 7) 2828 NM_033091 89122 Hs.50749 NM_033017 ENSG00000146833 TRIM4 RNF87 tripartite motif containing 4 protein-coding 283.333-61 chr5 90653024 90653320 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 19 of 89) intron (NR_003149, intron 19 of 89) 94375 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 234-29 chr17 32788054 32788293 + 1.33333 NA intron (NM_015194, intron 1 of 21) L1PB2|LINE|L1 88951 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 348.333-22 chr3 106397997 106398483 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -528839 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 236-49 chr2 227486278 227486553 + 1.33333 NA intron (NM_004504, intron 1 of 12) intron (NM_004504, intron 1 of 12) 14243 NM_001135187 3267 Hs.352962 NM_004504 ENSG00000173744 AGFG1 HRB|RAB|RIP ArfGAP with FG repeats 1 protein-coding 213.333-143 chr3 193725498 193725799 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -98316 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 265.666-13 chr2 22108161 22108385 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -397621 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 227-60 chr8 126890129 126890542 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -122819 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 481-3 chr21 29803276 29804152 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 55539 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 202.666-87 chr4 60990532 60990684 + 1.33333 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 67989 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 180.667-95 chr3 80725547 80725798 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -39225 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 301.999-3 chr21 19380939 19381239 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 518666 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 312.666-9 chr2 25734465 25735028 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018263, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_018263, exon 12 of 12) 59945 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 164-56 chr2 78904825 78905015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120782 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 439.999 chr1 219803119 219803553 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 125315 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 141.333-109 chr2 76898979 76899131 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -86910 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 186.667-67 chr2 78193206 78193429 + 1.33333 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MA6|LINE|L1 97414 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 224-52 chr2 208176117 208176300 + 1.33333 NA intron (NM_001099334, intron 6 of 8) AluSx1|SINE|Alu -12619 NM_014617 1418 Hs.122566 NM_014617 ENSG00000168582 CRYGA CRY-g-A|CRYG1|CRYG5 crystallin gamma A protein-coding 247.333-94 chr9 11608241 11608517 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 995173 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 208.666-111 chr8 107103274 107103507 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 233125 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 194.667-43 chr15 58892867 58893105 + 1.33333 NA non-coding (NR_135043, exon 12 of 19) non-coding (NR_135043, exon 12 of 19) 40693 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 208.666-98 chr6 145033045 145033204 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 627469 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 337.333-36 chr5 102144388 102144710 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 151735 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 245.333-98 chr6 23188189 23188499 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -470420 NR_134614 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 187.333-135 chr4 32591033 32591244 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 240100 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 337.666-7 chr5 37475779 37476379 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 7 of 17) AluSp|SINE|Alu 96761 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 125.667-18 chr10 25669661 25669842 + 1.33333 NA intron (NR_108069, intron 3 of 3) intron (NR_108069, intron 3 of 3) 18039 NR_108069 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 291.333-35 chr2 5778595 5779006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33796 NR_146954 105373400 Hs.97467 NR_146954 ENSG00000237266 LINC01810 - long intergenic non-protein coding RNA 1810 ncRNA 198-138 chr4 88103182 88103408 + 1.33333 NA intron (NM_001257386, intron 10 of 15) intron (NM_001257386, intron 10 of 15) 55344 NM_004827 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 197.666-5 chr10 67133027 67133185 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) L1MA4A|LINE|L1 120840 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 212-88 chr2 112556859 112557157 + 1.33333 NA intron (NM_001282774, intron 7 of 12) AluJo|SINE|Alu -14796 NR_136321 105373562 Hs.599548 NR_136321 LOC105373562 - uncharacterized LOC105373562 ncRNA 203-112 chr8 138919826 138920245 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -5994 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 219-70 chr6 3842418 3842711 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6809 NM_012135 26240 Hs.140944 NM_012135 ENSG00000145945 FAM50B D6S2654E|X5L family with sequence similarity 50 member B protein-coding 258.667-24 chr11 116069638 116070020 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -309629 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 188-28 chr11 91366890 91367079 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -497782 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 111.667-190 chr4 152875265 152875364 + 1.33333 NA intron (NM_001025595, intron 5 of 8) intron (NM_001025595, intron 5 of 8) -61009 NM_001371116 269.666 chr1 82695085 82695290 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -207996 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 206-144 chr5 97409262 97409457 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -95337 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 156-135 chr7 113800709 113800941 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118184 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 284-57 chr7 12975824 12976160 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 288359 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 214-101 chr4 142567714 142567879 + 1.33333 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) intron (NM_003866, intron 2 of 26) 278739 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 354-27 chr9 35510819 35511210 + 1.33333 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) intron (NM_001330740, intron 1 of 10) 20903 NM_001330740 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 210.333-98 chr3 37305842 37306065 + 1.33333 NA intron (NM_001172713, intron 11 of 22) intron (NM_001172713, intron 11 of 22) -61758 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 284-62 chr8 103900443 103900764 + 1.33333 NA intron (NM_001282881, intron 2 of 20) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 81383 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 318.666-8 chr15 70888732 70889056 + 1.33333 NA intron (NM_020147, intron 1 of 2) L1ME3A|LINE|L1 3539 NM_020147 56906 Hs.591123 NM_020147 ENSG00000129028 THAP10 - THAP domain containing 10 protein-coding 185.333-104 chr2 213964436 213964727 + 1.33333 NA intron (NR_047660, intron 11 of 14) L1M4b|LINE|L1 206514 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 257-9 chr12 15222252 15222614 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1016 NM_032918 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 403.666-2 chr3 65030700 65031012 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -342856 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 369.666-5 chr18 9773341 9773774 + 1.33333 NA intron (NM_006868, intron 1 of 6) intron (NM_006868, intron 1 of 6) 65256 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 178.333-41 chr12 87867336 87867516 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -82715 NR_033410 400058 Hs.572212 NR_033410 MKRN9P MKRN5|MKRN9|MKRNP6|RNF65|ZNF127L3 makorin ring finger protein 9, pseudogene pseudo 185-75 chr8 70841855 70842017 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 172597 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 210.666-102 chr8 84816957 84817165 + 1.33333 NA intron (NM_001287244, intron 3 of 7) intron (NM_001287244, intron 3 of 7) 111134 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 171-50 chr22 36047458 36047714 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18762 NM_001082578 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 215.666-9 chr10 82624623 82624842 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -391812 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 302-44 chr4 48039469 48039903 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_207330, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_207330, exon 6 of 6) 22914 NM_207330 152519 Hs.134190 NM_207330 ENSG00000163293 NIPAL1 NPAL1 NIPA like domain containing 1 protein-coding 203.333-108 chr17 80783162 80783332 + 1.33333 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) intron (NM_020761, intron 6 of 33) 22385 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 337.666-16 chrX 127816047 127816320 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 236220 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 245.333-26 chr12 12541330 12541715 + 1.33333 NA intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 21341 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 333.333-26 chr19 28362284 28362606 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -244243 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 197.333-43 chr11 134120166 134120434 + 1.33333 NA intron (NM_001205329, intron 1 of 7) intron (NM_001205329, intron 1 of 7) 31063 NR_145790 109623486 NR_145790 SNORD153 - small nucleolar RNA, C/D box 153 snoRNA 208-46 chr14 38244638 38244917 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11316 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 336.333-6 chr10 54094896 54095273 + 1.33333 NA intron (NM_001354411, intron 16 of 34) intron (NM_001354411, intron 16 of 34) -391146 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 198.333-97 chr2 88094914 88095062 + 1.33333 NA intron (NM_198274, intron 5 of 9) intron (NM_198274, intron 5 of 9) -12389 NR_039940 100616447 NR_039940 ENSG00000265003 MIR4780 - microRNA 4780 ncRNA 302.333-29 chr5 96314435 96314875 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 117504 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 199.333-140 chr2 156474923 156475182 + 1.33333 NA intron (NM_000408, intron 1 of 16) AluJo|SINE|Alu 38673 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 251.333-16 chr10 122410271 122410516 + 1.33333 NA intron (NM_001330178, intron 6 of 13) intron (NM_001330178, intron 6 of 13) -6572 NR_037506 100500866 NR_037506 ENSG00000265442 MIR3941 - microRNA 3941 ncRNA 254-41 chr2 205453866 205454140 + 1.33333 NA intron (NM_057177, intron 19 of 21) (TCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -228497 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 339.333-9 chr12 66468375 66468659 + 1.33333 NA intron (NM_001366722, intron 7 of 24) intron (NM_001366722, intron 7 of 24) 165972 NR_135081 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 304.667-14 chr2 11686294 11686728 + 1.33333 NA intron (NM_001349207, intron 1 of 20) intron (NM_001349207, intron 1 of 20) 8967 NM_001349207 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 376.333-14 chr8 29870523 29871072 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42293 NR_125817 101929470 Hs.204721 NR_125817 ENSG00000248964 LOC101929470 - uncharacterized LOC101929470 ncRNA 215.666-23 chr20 55740744 55740972 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 264661 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 235.333-20 chr11 38306804 38307027 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 339441 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 207.333-122 chr18 7057208 7057376 + 1.33333 NA intron (NM_005559, intron 3 of 62) MIR|SINE|MIR 60505 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 212.666-13 chr10 105236060 105236229 + 1.33333 NA intron (NM_014978, intron 20 of 26) intron (NM_014978, intron 20 of 26) -569928 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 186.333-144 chr6 140842699 140842858 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 158964 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 255.333-94 chr7 6318955 6319176 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29902 NM_001037163 84792 Hs.696146 NM_001037163 ENSG00000286075 FAM220A ACPIN1|C7orf70|SIPAR family with sequence similarity 220 member A protein-coding 203.333-235 chr6 111468420 111468574 + 1.33333 NA intron (NM_001286431, intron 3 of 34) L1ME4b|LINE|L1 -14975 NR_034110 643749 Hs.486228 NR_034108 ENSG00000231889 TRAF3IP2-AS1 C6UAS|C6orf3|NCRNA00248|TRAF3IP2-AS2 TRAF3IP2 antisense RNA 1 ncRNA 196-161 chr6 95086965 95087161 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 490388 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 232-44 chr2 58017489 58017747 + 1.33333 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) L1M6B|LINE|L1 -29024 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 360.333-15 chr3 26252504 26253024 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -370042 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 206.666-108 chr7 14633125 14633346 + 1.33333 NA intron (NM_001350722, intron 13 of 25) intron (NM_001350722, intron 13 of 25) 208215 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 214.667-3 chr1 83793631 83793894 + 1.33333 NA intron (NR_119375, intron 1 of 2) intron (NR_119375, intron 1 of 2) 66784 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 253.666-13 chr20 46984381 46984728 + 1.33333 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) L1ME5|LINE|L1 89711 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 192.333-112 chr22 45765937 45766112 + 1.33333 NA intron (NM_013236, intron 9 of 11) L1MC5a|LINE|L1 5500 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 243.666-42 chr8 110264822 110265128 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -289204 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 412.667-10 chr20 13660140 13660693 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21480 NR_136630 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 272.333-50 chr4 89021868 89022278 + 1.33333 NA intron (NM_014883, intron 2 of 23) intron (NM_014883, intron 2 of 23) 35112 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 239.666-14 chr18 73555525 73556009 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 230826 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 316-3 chr10 49347037 49347427 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 48062 NM_001135196 118461 Hs.585480 NM_199459 ENSG00000177354 C10orf71 CEFIP chromosome 10 open reading frame 71 protein-coding 187.333-82 chr17 70774433 70774664 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 427631 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 273.333-47 chr3 115070854 115071313 + 1.33333 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) MIRc|SINE|MIR 331 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 225-22 chr13 84629166 84629434 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154354 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 354.667-19 chr5 131806583 131807129 + 1.33333 NA TTS (NM_001303622) TTS (NM_001303622) -9839 NM_001346114 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 292-40 chr5 15857531 15857900 + 1.33333 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -77467 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 224-38 chr18 55040430 55040654 + 1.33333 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -81081 NM_025214 80323 Hs.120790 NM_025214 ENSG00000166510 CCDC68 SE57-1 coiled-coil domain containing 68 protein-coding 154-143 chr8 121059481 121059654 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -247521 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 290.666-16 chr20 59333753 59334128 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33329 NM_207033 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 206.666-109 chr7 23434648 23434851 + 1.33333 NA intron (NM_006547, intron 2 of 14) intron (NM_006547, intron 2 of 14) 35742 NM_006547 10643 Hs.700696 NM_006547 ENSG00000136231 IGF2BP3 CT98|IMP-3|IMP3|KOC|KOC1|VICKZ3 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 3 protein-coding 604.333 chr7 28896844 28897767 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 61025 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 195-53 chr18 1442231 1442431 + 1.33333 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -82702 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 298.666-8 chr17 67929928 67930224 + 1.33333 NA intron (NM_182641, intron 17 of 27) AluJb|SINE|Alu 63530 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 221.333-152 chr8 140856162 140856397 + 1.33333 NA intron (NR_148037, intron 6 of 34) L1ME2z|LINE|L1 -123626 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 160.667-147 chr2 82432696 82432912 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -423999 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 301.333-6 chr1 102382665 102382958 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -385577 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 347.666-12 chr4 30400887 30401261 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -319295 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 192.666-54 chr5 148200511 148200684 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2197 NM_001195290 404203 Hs.334274 NM_205841 ENSG00000178172 SPINK6 BUSI2|UNQ844 serine peptidase inhibitor, Kazal type 6 protein-coding 232-75 chr6 36022191 36022421 + 1.33333 NA intron (NM_052961, intron 1 of 19) intron (NM_052961, intron 1 of 19) 2194 NM_138718 116369 Hs.435836 NM_052961 ENSG00000112053 SLC26A8 SPGF3|TAT1 solute carrier family 26 member 8 protein-coding 273.666-13 chr2 122228643 122229091 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 473216 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 197.667-61 chr2 9978202 9978475 + 1.33333 NA intron (NM_198182, intron 8 of 15) intron (NM_198182, intron 8 of 15) 26645 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 189.333-2 chr1 51214434 51214660 + 1.33333 NA intron (NR_147076, intron 1 of 1) LTR37A|LTR|ERV1 20549 NR_147076 105378716 NR_147076 ENSG00000203356 LINC01562 - long intergenic non-protein coding RNA 1562 ncRNA 288-21 chr16 47653130 47653475 + 1.33333 NA intron (NM_001031835, intron 21 of 31) HAL1|LINE|L1 191971 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 134.667-141 chr3 143755916 143756106 + 1.33333 NA intron (NM_173653, intron 4 of 15) intron (NM_173653, intron 4 of 15) 92457 NM_173653 285195 Hs.302257 NM_173653 ENSG00000181804 SLC9A9 AUTS16|NHE9 solute carrier family 9 member A9 protein-coding 424-6 chr17 17920540 17920992 + 1.33333 NA intron (NM_001288787, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu 51634 NM_001350333 146691 Hs.462379 NM_144678 ENSG00000175662 TOM1L2 - target of myb1 like 2 membrane trafficking protein protein-coding 198-7 chr1 167261401 167261696 + 1.33333 NA intron (NM_001365848, intron 2 of 17) intron (NM_001365848, intron 2 of 17) 40662 NR_037163 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 192.666-52 chr5 60484347 60484504 + 1.33333 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) -3288 NR_024617 25859 Hs.146312 NM_001039499 ENSG00000152931 PART1 NCRNA00206 prostate androgen-regulated transcript 1 ncRNA 215.666-28 chr3 139530491 139530679 + 1.33333 NA intron (NM_001130992, intron 2 of 2) intron (NM_001130992, intron 2 of 2) 9051 NM_001365940 5947 Hs.529571 NM_002899 ENSG00000114115 RBP1 CRABP-I|CRBP|CRBP1|CRBPI|RBPC retinol binding protein 1 protein-coding 282.333-58 chr8 82615850 82616228 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -296065 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 206-41 chr12 29825785 29826003 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -41135 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 166-103 chr6 118745015 118745252 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35058 NM_001178035 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 242.666-34 chr6 139091967 139092320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42937 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 355-16 chr2 220158727 220159267 + 1.33333 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -252432 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 219.333-181 chr8 77668036 77668311 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 217476 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 244.667-77 chr5 6512385 6512742 + 1.33333 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 63704 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 244-70 chr3 73472628 73472963 + 1.33333 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) intron (NM_015009, intron 3 of 9) 1837 NM_001303141 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 188-92 chr5 129588459 129588604 + 1.33333 NA intron (NM_133638, intron 7 of 22) L1MEd|LINE|L1 -127842 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 145.333-167 chr21 25446382 25446555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14767 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 192.666-6 chr1 236072000 236072153 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -6986 NM_002508 4811 Hs.356624 NM_002508 ENSG00000116962 NID1 NID nidogen 1 protein-coding 195.333-145 chr3 49322174 49322432 + 1.33333 NA intron (NM_001251877, intron 6 of 6) L1ME3B|LINE|L1 17750 NM_001251877 7375 Hs.77500 NM_003363 ENSG00000114316 USP4 UNP|Unph ubiquitin specific peptidase 4 protein-coding 232.999-7 chr7 111277768 111277954 + 1.33333 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) L1PB4|LINE|L1 186734 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 212.666-44 chr2 73325686 73325929 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32259 NM_001965 1961 Hs.3052 NM_001965 ENSG00000135625 EGR4 AT133|NGFI-C|NGFIC|PAT133 early growth response 4 protein-coding 307-10 chr14 66920075 66920466 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 6 of 21) intron (NM_001024218, intron 6 of 21) -269170 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 264-28 chr2 31152715 31153006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14420 NM_024572 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 208.666-81 chr4 67583316 67583537 + 1.33333 NA intron (NM_012108, intron 5 of 8) intron (NM_012108, intron 5 of 8) 24699 NM_001317769 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 203.999-2 chr2 69134990 69135143 + 1.33333 NA intron (NM_032208, intron 12 of 17) intron (NM_032208, intron 12 of 17) 31384 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 220.333-114 chr5 126889575 126889838 + 1.33333 NA intron (NM_178450, intron 3 of 4) intron (NM_178450, intron 3 of 4) 112570 NM_001198557 4001 Hs.89497 NM_005573 ENSG00000113368 LMNB1 ADLD|LMN|LMN2|LMNB lamin B1 protein-coding 382.333-7 chr2 29699676 29700159 + 1.33333 NA intron (NM_004304, intron 2 of 28) MIR3|SINE|MIR 221669 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 234.667-120 chrX 58044875 58045151 + 1.33333 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -134380 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 211.333-115 chr2 82800818 82801105 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55842 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 194.667-72 chr2 129003233 129003484 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 138758 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 312-38 chr4 84356807 84357186 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57827 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 169.333-43 chr12 1437930 1438146 + 1.33333 NA intron (NR_027948, intron 18 of 19) intron (NR_027948, intron 18 of 19) -62453 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 616 chr8 89113478 89114288 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 643828 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 210-113 chr5 7135284 7135516 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 133954 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 192.667-26 chr10 55322505 55322715 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -276432 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 281.333-16 chr13 37530170 37530589 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -4561 NR_040244 400121 Hs.558894 NR_040244 ENSG00000275226 LINC00547 - long intergenic non-protein coding RNA 547 ncRNA 151.333-200 chr2 37659155 37659372 + 1.33333 NA intron (NM_001270436, intron 1 of 1) intron (NM_001270436, intron 1 of 1) 12936 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 203.333-266 chr8 89174063 89174263 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 583548 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 216-52 chr18 74751226 74751410 + 1.33333 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 120355 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 244.333-80 chr5 16292173 16292467 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 112079 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 424.333-4 chr17 76960007 76960420 + 1.33333 NA intron (NR_136417, intron 2 of 2) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 8986 NR_136416 105371899 Hs.634683 NR_136416 ENSG00000267568 LOC105371899 - uncharacterized LOC105371899 ncRNA 210.666-12 chr10 99492531 99492756 + 1.33333 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie 38534 NR_120618 101927324 Hs.642588 NR_120618 ENSG00000257582 LINC01475 - long intergenic non-protein coding RNA 1475 ncRNA 261.666-4 chr13 41396525 41396835 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -45884 NR_002163 100506759 Hs.507861 NR_002163 OR7E37P OR7E48P|OST193|hg533 olfactory receptor family 7 subfamily E member 37 pseudogene pseudo 212-160 chrX 21519738 21519944 + 1.33333 NA intron (NM_001168648, intron 9 of 20) intron (NM_001168648, intron 9 of 20) 138489 NM_153270 257240 Hs.448572 NM_153270 ENSG00000185915 KLHL34 - kelch like family member 34 protein-coding 398-2 chr12 62757517 62757894 + 1.33333 NA intron (NM_020700, intron 4 of 9) intron (NM_020700, intron 4 of 9) 154019 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 200.666-123 chr8 131941667 131941906 + 1.33333 NA intron (NM_001323557, intron 2 of 22) L2c|LINE|L2 25013 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 364.667-14 chr8 59058665 59059179 + 1.33333 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 60225 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 209.333-221 chr7 77818342 77818535 + 1.33333 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) L1MA5A|LINE|L1 19467 NM_001366086 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 200.333-120 chr5 81311679 81311854 + 1.33333 NA intron (NM_001131035, intron 5 of 5) intron (NM_001131035, intron 5 of 5) 10179 NM_001131035 84240 Hs.15536 NM_032280 ENSG00000131732 ZCCHC9 PPP1R41 zinc finger CCHC-type containing 9 protein-coding 224-3 chr1 48458098 48458397 + 1.33333 NA intron (NM_019073, intron 1 of 12) L1M4|LINE|L1 13957 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 393.999 chr4 106134013 106134483 + 1.33333 NA intron (NM_001290768, intron 24 of 26) intron (NM_001290768, intron 24 of 26) -111770 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 186-94 chr7 18670519 18670755 + 1.33333 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) MIR|SINE|MIR 161367 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 312.333-23 chr5 72668669 72669131 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8231 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 167-65 chr20 55357704 55357935 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65224 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 281.666-17 chr8 60888178 60888579 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 79370 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 234.666-38 chr5 27250452 27250717 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -211998 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 370-11 chr17 62879333 62879806 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -64646 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 391.332 chr8 109547384 109547699 + 1.33333 NA intron (NM_001278938, intron 1 of 6) AluY|SINE|Alu 6915 NM_001278938 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 200-159 chr7 95686089 95686412 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -86256 NM_001278422 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 224.666-16 chr2 41300009 41300250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -577426 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 244.666-28 chr21 27184637 27184922 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -217691 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 201.333-276 chr8 70958756 70959058 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 289568 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 308.333-2 chr1 64669849 64670316 + 1.33333 NA intron (NM_020925, intron 16 of 26) intron (NM_020925, intron 16 of 26) -74891 NM_001366165 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 194.333-78 chr2 187738741 187738987 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -184359 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 305.666-3 chr10 30291003 30291411 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 58131 NM_018109 55149 Hs.173946 NM_018109 ENSG00000107951 MTPAP PAPD1|SPAX4|TENT6 mitochondrial poly(A) polymerase protein-coding 180-60 chr2 229464204 229464360 + 1.33333 NA intron (NM_139072, intron 7 of 12) intron (NM_139072, intron 7 of 12) -192995 NM_017933 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 213-86 chr8 134875514 134875799 + 1.33333 NA intron (NR_125427, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 25721 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 282.666-27 chr8 133845827 133846134 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -40516 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 246-29 chr14 80485357 80485719 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254481 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 209.333-119 chr2 116369220 116369466 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1025528 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 219-16 chr11 68959539 68959737 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21348 NM_198923 116512 Hs.527802 NM_198923 ENSG00000172938 MRGPRD MRGD|TGR7 MAS related GPR family member D protein-coding 277-41 chr4 86754615 86755043 + 1.33333 NA intron (NM_080685, intron 20 of 47) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 94555 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 239.333-71 chr3 128171584 128171781 + 1.33333 NA intron (NM_021937, intron 1 of 6) intron (NM_021937, intron 1 of 6) -17768 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 291.666-5 chr15 60276599 60277019 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 121177 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 186-28 chr13 62176304 62176455 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -35903 NR_125787 103752583 Hs.578048 NR_125787 LINC01075 - long intergenic non-protein coding RNA 1075 ncRNA 251.667-17 chr11 115825426 115825730 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -65378 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 196.667-83 chr2 199559568 199559858 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48355 NR_110270 101927641 Hs.549598 NR_110270 ENSG00000238217 LINC01877 - long intergenic non-protein coding RNA 1877 ncRNA 231.666-30 chr7 98587589 98587873 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -29554 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 156-6 chr1 65370575 65370805 + 1.33333 NA intron (NM_001256864, intron 4 of 18) intron (NM_001256864, intron 4 of 18) -49962 NM_001003679 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 206.666-62 chr2 197671181 197671385 + 1.33333 NA intron (NM_144629, intron 1 of 8) intron (NM_144629, intron 1 of 8) 4304 NM_144629 130132 Hs.591615 NM_144629 ENSG00000162944 RFTN2 C2orf11|Raftlin-2 raftlin family member 2 protein-coding 318.333-2 chr1 100398576 100398854 + 1.33333 NA intron (NM_001319212, intron 4 of 13) intron (NM_001319212, intron 4 of 13) 46209 NM_003672 8556 Hs.127411 NM_003672 ENSG00000079335 CDC14A DFNB105|DFNB32|DFNB35|cdc14|hCDC14 cell division cycle 14A protein-coding 197.333-207 chr7 14589410 14589665 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 16 of 24) L1ME3F|LINE|L1 251913 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 215.333-68 chr16 52162265 52162561 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 77132 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 218-86 chr4 153245050 153245231 + 1.33333 NA intron (NM_001302693, intron 1 of 2) intron (NM_001302693, intron 1 of 2) -12219 NM_001302694 23321 Hs.435711 NM_015271 ENSG00000109654 TRIM2 CMT2R|RNF86 tripartite motif containing 2 protein-coding 220.667-23 chr12 60337298 60337608 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 648083 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 267.333-19 chr11 80914480 80914780 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -151827 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 398.666-4 chr13 49110977 49111384 + 1.33333 NA intron (NM_014923, intron 1 of 23) intron (NM_014923, intron 1 of 23) 863 NM_014923 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 143.333-274 chr7 100610218 100610341 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1883 NM_001040097 64598 Hs.521086 NM_023948 ENSG00000106330 MOSPD3 CDS3|NET30 motile sperm domain containing 3 protein-coding 218.666-57 chr4 59313802 59313971 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 300313 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 337.666-14 chr8 139174167 139174588 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -260336 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 168-62 chr22 19698770 19698960 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -15638 NM_002688 5413 Hs.728762 NM_002688 ENSG00000184702 SEPTIN5 CDCREL|CDCREL-1|CDCREL1|H5|HCDCREL-1|PNUTL1|SEPT5 septin 5 protein-coding 143.333-48 chr11 22358876 22359103 + 1.33333 NA intron (NM_020346, intron 3 of 11) L2a|LINE|L2 20608 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 202.667-15 chr10 16041377 16041628 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -180969 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 324-27 chr6 66068108 66068589 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 280469 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 215.333-11 chr1 184016935 184017214 + 1.33333 NA intron (NM_001303421, intron 1 of 11) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 20654 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 184.666-41 chr8 121386145 121386299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -253124 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 346-6 chr12 58685451 58685940 + 1.33333 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 93993 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 244.333-42 chr15 38401208 38401529 + 1.33333 NA Intergenic X9_LINE|LINE|L1 -52759 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 274-29 chr21 39234031 39234367 + 1.33333 NA intron (NM_018963, intron 23 of 41) L2c|LINE|L2 -50685 NR_049728 8624 Hs.473838 NM_003720 ENSG00000183527 PSMG1 C21LRP|DSCR2|LRPC21|PAC-1|PAC1 proteasome assembly chaperone 1 protein-coding 210-86 chr21 25141265 25141471 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 290333 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 217.333-73 chr2 181849151 181849447 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42431 NM_001287503 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 200.333-78 chr2 170045670 170045854 + 1.33333 NA intron (NM_172070, intron 32 of 38) L1MC5|LINE|L1 -132385 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 204.667-3 chr1 42010200 42010472 + 1.33333 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) L1M6B|LINE|L1 25598 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 226-75 chr5 118754842 118755111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 158788 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 142.667-118 chr2 228126452 228126670 + 1.33333 NA intron (NM_030623, intron 2 of 10) intron (NM_030623, intron 2 of 10) 55084 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 159-11 chr10 15192549 15192736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23949 NM_004808 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 307-11 chr16 73967267 73967673 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 248051 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 279.667-42 chr7 54903002 54903351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -115841 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 292.333-10 chr11 25527812 25528081 + 1.33333 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -661177 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 328-32 chr5 38215569 38216076 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42737 NM_152403 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 182.333-85 chr2 98721932 98722084 + 1.33333 NA intron (NM_012214, intron 2 of 15) L1M4b|LINE|L1 9124 NM_012214 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 304-4 chr1 156358166 156358474 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10891 NM_020407 57127 Hs.131835 NM_020407 ENSG00000132677 RHBG SLC42A2 Rh family B glycoprotein (gene/pseudogene) protein-coding 464-6 chr9 33952063 33952635 + 1.33333 NA TTS (NR_003685) TTS (NR_003685) 505 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 197.666-53 chr5 73473693 73473880 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_126410) promoter-TSS (NR_126410) -820 NR_126410 104355294 Hs.127927 NR_126410 ENSG00000251324 LINC01386 - long intergenic non-protein coding RNA 1386 ncRNA 241-47 chr5 169590653 169590950 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001329642, exon 3 of 12) 5' UTR (NM_001329642, exon 3 of 12) 6721 NM_001329641 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 214.999-4 chr17 59132938 59133109 + 1.33333 NA intron (NM_182620, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 4849 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 224.666-19 chr2 58346040 58346252 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 70269 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 179.333-167 chr6 140463247 140463432 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -220475 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 190.666-34 chr3 70158061 70158212 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 154502 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 545.666 chr20 22759723 22760461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74748 NR_146528 105372566 Hs.555065 NR_146527 LINC01747 - long intergenic non-protein coding RNA 1747 ncRNA 173.666-4 chr11 9328302 9328453 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -13784 NM_015012 440026 Hs.594563 NM_015012 ENSG00000166471 TMEM41B - transmembrane protein 41B protein-coding 205.667-133 chr8 122749928 122750171 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31606 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 287.333-46 chr5 17328177 17328497 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58973 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 176.333-17 chr10 34703926 34704075 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) HAL1|LINE|L1 111296 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 196.666-88 chr6 54090430 54090630 + 1.33333 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) -20913 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 310-55 chr7 108202125 108202446 + 1.33333 NA intron (NM_001371137, intron 10 of 25) intron (NM_001371137, intron 10 of 25) 41100 NM_001371181 131.333-116 chr3 164176156 164176327 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4685 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 255.333-28 chr13 92265048 92265290 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 87038 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 151-11 chr10 24071398 24071612 + 1.33333 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -137286 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 215.333-175 chr6 124859813 124860027 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -102625 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 224.999 chr10 81445463 81445645 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -429640 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 271.333-55 chr4 149482944 149483202 + 1.33333 NA intron (NM_001363507, intron 12 of 13) L1MA2|LINE|L1 328778 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 180.666-10 chr14 67156002 67156205 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 17 of 21) L1MEg|LINE|L1 -33337 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 211.333-179 chr5 18499033 18499244 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 691864 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 218.333-89 chr3 163587025 163587297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -283860 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 244-80 chr4 119986260 119986618 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 46899 NR_121639 100996694 Hs.119926 NR_121639 ENSG00000250392 LINC02502 - long intergenic non-protein coding RNA 2502 ncRNA 163.333-262 chr7 55460991 55461116 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 65827 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 185.667-128 chr8 87063351 87063569 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MEg|LINE|L1 197045 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 253.667-54 chr5 39425197 39425552 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001244871) promoter-TSS (NM_001244871) -141 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 209.666-6 chr1 207385305 207385504 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 63726 NM_001114752 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 391.333-2 chr1 186690194 186690692 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 9789 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 175.333-67 chr17 64288116 64288272 + 1.33333 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -24934 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 194-28 chr12 87074773 87074995 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -235884 NM_001351285 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 177-14 chr11 83809165 83809350 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) intron (NM_001142699, intron 17 of 27) -126832 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 197.333-203 chr6 137449569 137449771 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 44724 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 237.333-84 chr4 107881293 107881496 + 1.33333 NA intron (NR_125929, intron 3 of 6) MIR|SINE|MIR -11870 NM_001136257 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 403.999-2 chr3 96539888 96540231 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 180095 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 248.333-42 chr2 39678308 39678622 + 1.33333 NA intron (NM_152390, intron 1 of 3) L1MB5|LINE|L1 12548 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 271.666-8 chr4 109491729 109492141 + 1.33333 NA intron (NM_001300813, intron 6 of 24) intron (NM_001300813, intron 6 of 24) 3237 NR_030302 693161 NR_030302 ENSG00000207988 MIR576 MIRN576|hsa-mir-576 microRNA 576 ncRNA 324.333 chr1 86618999 86619382 + 1.33333 NA intron (NR_135837, intron 4 of 4) intron (NR_135837, intron 4 of 4) -15086 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 297.666-15 chr7 6386299 6386756 + 1.33333 NA intron (NM_006908, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 12000 NM_006908 5879 Hs.413812 NM_006908 ENSG00000136238 RAC1 MIG5|MRD48|Rac-1|TC-25|p21-Rac1 Rac family small GTPase 1 protein-coding 217.333-17 chr1 223166923 223167182 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -23804 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 224-104 chr8 22478847 22479161 + 1.33333 NA intron (NM_005605, intron 3 of 13) intron (NM_005605, intron 3 of 13) 38034 NM_001243975 5533 Hs.731683 NM_005605 ENSG00000120910 PPP3CC CALNA3|CNA3|PP2Bgamma protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma protein-coding 212.666-51 chr20 48045338 48045538 + 1.33333 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -55321 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 236-91 chr8 137203969 137204321 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 209443 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 277.666 chr1 108957697 108958125 + 1.33333 NA intron (NM_015127, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 5588 NM_015127 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 399-7 chr2 158711229 158711852 + 1.33333 NA intron (NR_135242, intron 1 of 3) L1MD1|LINE|L1 23462 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 265.666-29 chr9 134200401 134200810 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -36041 NR_023344 100151684 Hs.545589 NR_023344 ENSG00000221676 RNU6ATAC RNU6ATAC1|U6ATAC RNA, U6atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 200-93 chr20 32994125 32994324 + 1.33333 NA intron (NM_080675, intron 8 of 12) L1MEg|LINE|L1 10209 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 186.666-29 chr2 118094927 118095082 + 1.33333 NA intron (NM_001321331, intron 2 of 5) intron (NM_001321331, intron 2 of 5) 6454 NM_001321332 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 227.333-9 chr1 153870880 153871100 + 1.33333 NA intron (NM_020699, intron 1 of 10) AluSx3|SINE|Alu 51982 NM_020699 57459 Hs.4779 NM_020699 ENSG00000143614 GATAD2B MRD18|P66beta|p68 GATA zinc finger domain containing 2B protein-coding 214.666-54 chr5 56439175 56439342 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 42511 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 141.333-68 chr14 67731644 67731799 + 1.33333 NA intron (NM_152443, intron 8 of 8) L1ME3G|LINE|L1 29835 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 200-11 chr1 193951492 193951657 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 646829 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 209.333-237 chr8 91009125 91009411 + 1.33333 NA intron (NM_018710, intron 4 of 6) intron (NM_018710, intron 4 of 6) -24030 NM_001190972 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 195.667-79 chr21 29159958 29160233 + 1.33333 NA intron (NM_001286620, intron 4 of 4) intron (NM_001286620, intron 4 of 4) 14518 NM_001286624 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 220-21 chr11 30801430 30801730 + 1.33333 NA Intergenic (CAAAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 191106 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 148.333-114 chr14 29401207 29401433 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 525776 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 222-80 chr6 62213347 62213617 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 72743 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 214.666-31 chr2 16837697 16837869 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -171949 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 374.333-17 chr7 77705879 77706215 + 1.33333 NA intron (NM_198467, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu -8702 NR_038361 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 247.333-59 chr4 119725149 119725514 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 79184 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 220.666-30 chr17 60799831 60800081 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) L1MD2|LINE|L1 122105 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 343.666-3 chr12 103995809 103996140 + 1.33333 NA intron (NM_031302, intron 9 of 11) MIR|SINE|MIR 30102 NM_003211 6996 Hs.584809 NM_003211 ENSG00000139372 TDG hTDG thymine DNA glycosylase protein-coding 384.333-9 chr4 69611087 69611570 + 1.33333 NA intron (NM_001301239, intron 1 of 4) intron (NM_001301239, intron 1 of 4) 28314 NM_001105677 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 147.666-4 chr15 54582884 54583059 + 1.33333 NA intron (NM_001329919, intron 29 of 31) MER5A|DNA|hAT-Charlie -473776 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 204.666-73 chr5 110069648 110069805 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 186544 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 243.333-33 chr14 76842092 76842372 + 1.33333 NA intron (NM_194287, intron 5 of 13) L1M5|LINE|L1 15824 NM_194287 145497 Hs.147276 NM_194287 ENSG00000100565 LRRC74A C14orf166B|LRRC74 leucine rich repeat containing 74A protein-coding 323.333-25 chr5 36721211 36721545 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 114772 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 212-142 chr6 144092807 144093030 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 2655 NM_031287 83443 Hs.110695 NM_031287 ENSG00000169976 SF3B5 SF3b10|Ysf3 splicing factor 3b subunit 5 protein-coding 400-7 chr2 14934573 14935149 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 302144 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 122-67 chr21 32640876 32641092 + 1.33333 NA intron (NM_203446, intron 29 of 32) intron (NM_203446, intron 29 of 32) -28113 NM_001350335 56683 Hs.5811 NM_017835 ENSG00000159079 CFAP298 C21orf48|C21orf59|CILD26|FBB18|Kur cilia and flagella associated protein 298 protein-coding 192-56 chr14 84580937 84581222 + 1.33333 NA Intergenic (TTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -690853 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 297.999 chr1 154530437 154530834 + 1.33333 NA intron (NM_182499, intron 6 of 12) L1MDa|LINE|L1 -22974 NR_046668 100874097 NR_046668 ENSG00000229780 UBE2Q1-AS1 - UBE2Q1 antisense RNA 1 ncRNA 155-9 chr1 237727736 237727928 + 1.33333 NA intron (NM_001035, intron 76 of 104) intron (NM_001035, intron 76 of 104) -134343 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 190.333-149 chr9 28195979 28196253 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1M5|LINE|L1 523189 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 195.333-45 chr11 33483195 33483397 + 1.33333 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) intron (NM_012194, intron 1 of 20) 107188 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 255.666-26 chr8 48002112 48002415 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -6168 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 271.666-4 chr17 65779155 65779586 + 1.33333 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) intron (NM_001353129, intron 21 of 26) 47081 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 348.999-5 chrX 57509694 57510051 + 1.33333 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -81964 NM_007157 158586 Hs.156257 NM_007157 ENSG00000198455 ZXDB ZNF905|dJ83L6.1 zinc finger X-linked duplicated B protein-coding 202.667-122 chr5 115751081 115751395 + 1.33333 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 65419 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 210.999 chr1 89775302 89775460 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -45651 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 182.666-14 chr15 38944341 38944509 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 247827 NR_160786 172.333-29 chr10 121856785 121857013 + 1.33333 NA intron (NM_001001976, intron 8 of 11) LTR37-int|LTR|ERV1 71132 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 212.333-132 chr6 166503056 166503287 + 1.33333 NA intron (NM_001006932, intron 7 of 21) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 6262 NR_031734 100302141 NR_031734 ENSG00000222958 MIR1913 MIRN1913|hsa-mir-1913 microRNA 1913 ncRNA 247.999-8 chr3 39603885 39604074 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 101913 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 316.333-11 chr16 4240615 4241002 + 1.33333 NA intron (NM_001323667, intron 1 of 6) intron (NM_001323667, intron 1 of 6) 1272 NM_001323667 6345 Hs.10041 NM_001098814 ENSG00000185739 SRL SAR sarcalumenin protein-coding 311.999-4 chr7 15980521 15980778 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -229837 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 157.667-322 chr8 62831776 62832023 + 1.33333 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) L1PA16|LINE|L1 -145962 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 160.333-247 chr6 64952598 64952748 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 14 of 43) intron (NM_001292009, intron 14 of 43) -348745 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 187.333-114 chr2 215804556 215804777 + 1.33333 NA intron (NR_037195, intron 1 of 9) intron (NR_037195, intron 1 of 9) 38870 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 188.666-7 chr11 29833610 29833802 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 148687 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 358.666-3 chr17 60912546 60912928 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 12 of 25) intron (NM_001330413, intron 12 of 25) 234886 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 215.333-176 chr6 128861589 128861777 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -21455 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 330.666-10 chr2 19419626 19420005 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -61192 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 215.333-117 chr21 30906167 30906423 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -24715 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 239.999-7 chr4 33603621 33603893 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 436136 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 329.666-3 chr11 122631839 122632158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23724 NM_032873 84959 Hs.444075 NM_032873 ENSG00000154127 UBASH3B STS-1|STS1|TULA-2|TULA2|p70 ubiquitin associated and SH3 domain containing B protein-coding 260-8 chr1 233708201 233708600 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84248 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 198.333-60 chr14 67153605 67153792 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 17 of 21) intron (NM_001024218, intron 17 of 21) -35742 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 205.333-216 chr7 24752629 24752831 + 1.33333 NA intron (NM_004403, intron 1 of 9) intron (NM_004403, intron 1 of 9) 4734 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 213.333-223 chr9 22548980 22549205 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -97108 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 262-64 chr5 15974595 15974848 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 39539 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 206.333-136 chr5 125837055 125837287 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -342406 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 137.333-191 chr8 62098700 62098868 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150070 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 220.333-139 chrX 109061836 109062068 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 325412 NR_110652 101928358 Hs.722300 NR_110652 ENSG00000237863 LOC101928358 - uncharacterized LOC101928358 ncRNA 170.666-14 chr22 42275644 42275831 + 1.33333 NA TTS (NR_036498) TTS (NR_036498) 5984 NR_036498 388906 Hs.730075 NR_036498 OGFRP1 - opioid growth factor receptor pseudogene 1 pseudo 277-37 chr3 116820789 116821080 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 29433 NR_039649 100616485 NR_039649 ENSG00000265433 MIR4447 - microRNA 4447 ncRNA 139-59 chr3 37496466 37496684 + 1.33333 NA intron (NM_002207, intron 5 of 27) L2|LINE|L2 44434 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 146.333-249 chr5 28146696 28146852 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 140891 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 264.666-36 chr8 29029333 29029632 + 1.33333 NA intron (NM_001324384, intron 6 of 10) intron (NM_001324384, intron 6 of 10) 138168 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 274.666-4 chr10 125990518 125990742 + 1.33333 NA intron (NM_001350939, intron 4 of 11) intron (NM_001350939, intron 4 of 11) -17357 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 203.667-49 chr2 35363503 35363802 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -107753 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 231-71 chr9 117136174 117136591 + 1.33333 NA intron (NM_014010, intron 3 of 21) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 44819 NR_003708 100124538 Hs.693445 NR_003708 ENSG00000207268 SNORA70C U70C small nucleolar RNA, H/ACA box 70C snoRNA 286-12 chr13 106155008 106155371 + 1.33333 NA Intergenic UCON33|DNA|TcMar-Tigger -221375 NR_034119 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 198-123 chr3 98915564 98915726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13950 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 202.667-149 chr8 125316237 125316530 + 1.33333 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -113975 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 176.666-17 chr22 34668170 34668450 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 329606 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 311.999 chr10 110308035 110308334 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3264 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 254-6 chr10 9113294 9113646 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -162143 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 381.333-6 chr14 73838941 73839301 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8986 NR_135238 100506498 Hs.569330 NR_135238 ENSG00000258586 LINC02274 - long intergenic non-protein coding RNA 2274 ncRNA 248.333-41 chr2 21743919 21744271 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33443 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 343-13 chr2 102608237 102608785 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11042 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 196-142 chr5 29384630 29384848 + 1.33333 NA intron (NR_104628, intron 2 of 4) MER31A|LTR|ERV1 11237 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 255.333-101 chr7 116175354 116175630 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -35047 NM_015641 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 270.667-21 chr18 49402396 49402754 + 1.33333 NA intron (NM_001353210, intron 2 of 16) Charlie13b|DNA|hAT-Charlie 58070 NM_001353211 54808 Hs.162996 NM_017653 ENSG00000141627 DYM DMC|SMC dymeclin protein-coding 154.666-5 chr2 95068803 95068964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43175 NM_002371 4118 Hs.80395 NM_002371 ENSG00000172005 MAL MVP17|VIP17 mal, T cell differentiation protein protein-coding 194.666-59 chr6 15698319 15698561 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35382 NM_001271669 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 231.333-31 chr12 33024208 33024502 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -127509 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 171.333-59 chr15 62681310 62681497 + 1.33333 NA intron (NM_015059, intron 8 of 55) intron (NM_015059, intron 8 of 55) 34092 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 592.332 chr8 81514657 81515150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16487 NR_144370 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 277.333-60 chr22 30742154 30742437 + 1.33333 NA intron (NM_030758, intron 2 of 13) AluSx3|SINE|Alu 10738 NR_036171 100422912 NR_036171 ENSG00000264661 MIR3200 mir-3200 microRNA 3200 ncRNA 237-78 chr9 7976003 7976249 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -176348 NM_001318058 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 235-43 chr4 112889275 112889559 + 1.33333 NA intron (NM_001354271, intron 1 of 42) intron (NM_001354271, intron 1 of 42) 28430 NM_001354267 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 235-9 chr12 2316358 2316666 + 1.33333 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 46736 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 203.666-27 chr16 10085697 10085930 + 1.33333 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) MER72|LTR|ERV1 96254 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 287-25 chr4 162073457 162073916 + 1.33333 NA intron (NM_020116, intron 2 of 15) intron (NM_020116, intron 2 of 15) 50953 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 188.666-9 chr11 112105178 112105335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18383 NM_001276504 6392 Hs.356270 NM_003002 ENSG00000204370 SDHD CBT1|CII-4|CWS3|PGL|PGL1|QPs3|SDH4|cybS succinate dehydrogenase complex subunit D protein-coding 215.333-77 chr18 30159860 30160035 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -138963 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 350.666-17 chr22 20084165 20084507 + 1.33333 NA intron (NM_022720, intron 1 of 13) (GCATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1410 NR_037412 100500860 NR_037412 ENSG00000284140 MIR3618 - microRNA 3618 ncRNA 326.999-2 chr3 45563538 45563912 + 1.33333 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -31026 NM_014240 8994 Hs.193370 NM_014240 ENSG00000144791 LIMD1 - LIM domains containing 1 protein-coding 266.333-11 chr11 26125647 26125901 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63349 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 211-25 chr12 59859986 59860276 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 170761 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 310.333-22 chr2 73441946 73442265 + 1.33333 NA intron (NM_015120, intron 7 of 22) (ATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14998 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 218.333-28 chr12 11583688 11583945 + 1.33333 NA Intergenic (GAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 35786 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 192-29 chr11 20813686 20813840 + 1.33333 NA intron (NM_001288714, intron 3 of 18) intron (NM_001288714, intron 3 of 18) 144177 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 197.667-42 chr14 73716950 73717247 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_194278, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_194278, exon 12 of 12) -2714 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 272.333-5 chr10 87807666 87808038 + 1.33333 NA intron (NM_001321967, intron 2 of 9) intron (NM_001321967, intron 2 of 9) 10379 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 220.333-85 chr22 48186744 48187141 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87422 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 223.666-21 chr22 26559696 26560009 + 1.33333 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) intron (NM_001362923, intron 1 of 7) -4529 NR_031615 100313914 NR_031615 ENSG00000221760 MIR548J MIRN548J|hsa-mir-548j microRNA 548j ncRNA 167.667-192 chr7 14399698 14399941 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -408394 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 204.666-67 chr5 39485464 39485687 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34856 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 213.667-74 chr5 45500993 45501267 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 195250 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 271.333-42 chr22 30011196 30011501 + 1.33333 NA intron (NR_110541, intron 4 of 4) intron (NR_110541, intron 4 of 4) 4299 NR_106876 102466742 NR_106876 ENSG00000275818 MIR6818 hsa-mir-6818 microRNA 6818 ncRNA 201.333-64 chr12 843142 843314 + 1.33333 NA intron (NM_001184985, intron 4 of 27) AluSx1|SINE|Alu 89848 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 350-10 chr2 22869980 22870430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 333726 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 132.667-172 chr8 26098876 26099064 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -53557 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 232-74 chr6 34993283 34993572 + 1.33333 NA intron (NM_015245, intron 9 of 23) intron (NM_015245, intron 9 of 23) 104172 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 171.333-76 chr2 48220582 48220821 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93981 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 400.999 chr3 86436714 86437200 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -44986 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 206.666-118 chr8 112457338 112457516 + 1.33333 NA intron (NM_052900, intron 31 of 68) intron (NM_052900, intron 31 of 68) -186066 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 178.666-3 chr13 38559709 38559881 + 1.33333 NA intron (NR_126377, intron 2 of 2) intron (NR_126377, intron 2 of 2) -7929 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 245.333-49 chr15 70596604 70596825 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10108 NR_135691 101929151 Hs.434703 NR_135691 ENSG00000280639 LINC02204 - long intergenic non-protein coding RNA 2204 ncRNA 197-68 chr22 47886798 47887042 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 255246 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 210.666-86 chr5 90323504 90323706 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -33534 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 225.333 chr1 34462598 34462879 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 206956 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 194.333-39 chr14 47993544 47993770 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -198643 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 215.333-187 chr7 83190308 83190497 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27518 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 293-36 chr6 118683608 118683893 + 1.33333 NA intron (NM_001178035, intron 1 of 13) intron (NM_001178035, intron 1 of 13) 26325 NM_001178035 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 192.333-57 chr15 63658850 63659081 + 1.33333 NA intron (NM_003922, intron 47 of 77) intron (NM_003922, intron 47 of 77) -58138 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 178-66 chr2 138697990 138698240 + 1.33333 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) L1ME4c|LINE|L1 82275 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 331.333-26 chr2 62143845 62144313 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -52036 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 213-30 chr17 44496780 44497034 + 1.33333 NA intron (NM_001002909, intron 1 of 7) intron (NM_001002909, intron 1 of 7) 6499 NM_001002909 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 278-56 chr7 52912355 52912754 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -123079 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 280.667-55 chr7 153281223 153281555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 130845 NR_125776 103724390 Hs.614280 NR_125776 ENSG00000234722 LINC01287 TCONS_l2_00027522 long intergenic non-protein coding RNA 1287 ncRNA 275-7 chr11 1490297 1490649 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3694 NM_001172223 81532 Hs.370360 NM_053005 ENSG00000182208 MOB2 HCCA2 MOB kinase activator 2 protein-coding 268.666-24 chr4 121840413 121840641 + 1.33333 NA intron (NM_176824, intron 12 of 18) L2b|LINE|L2 -16644 NM_001237 890 Hs.58974 NM_001237 ENSG00000145386 CCNA2 CCN1|CCNA cyclin A2 protein-coding 216-8 chr1 224385871 224386143 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001115113, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001115113, exon 14 of 14) 12304 NR_039896 100616468 NR_039896 ENSG00000266618 MIR4742 mir-4742 microRNA 4742 ncRNA 205.333-221 chr7 46814019 46814259 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -117017 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 156.666-4 chr12 12501044 12501227 + 1.33333 NA intron (NM_030640, intron 3 of 6).2 intron (NM_030640, intron 3 of 6).2 61728 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 207.333-132 chr2 67407272 67407435 + 1.33333 NA intron (NM_019002, intron 5 of 5) MER30|DNA|hAT-Charlie 10020 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 196.333-42 chr14 70074757 70075003 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) 5337 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 162-132 chr9 76874506 76874671 + 1.33333 NA intron (NM_001308048, intron 1 of 17) intron (NM_001308048, intron 1 of 17) 31499 NM_001308047 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 211-37 chr14 73794298 73794530 + 1.33333 NA intron (NR_109995, intron 2 of 2) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 7054 NR_109995 100506476 Hs.287299 NR_109995 LOC100506476 - uncharacterized LOC100506476 ncRNA 209.333-76 chr15 71694109 71694395 + 1.33333 NA intron (NM_001286429, intron 2 of 11) intron (NM_001286429, intron 2 of 11) -2713 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 256.333-12 chr10 50826346 50826551 + 1.33333 NA intron (NM_001370131, intron 6 of 11) L1P1|LINE|L1 59179 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 304.667-19 chr2 65236062 65236494 + 1.33333 NA intron (NM_001005386, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 8583 NM_005722 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 205.666-55 chr8 129607429 129607583 + 1.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1PA4|LINE|L1 -32488 NR_130920 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 389.333-5 chr12 42583436 42583938 + 1.33333 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) 6059 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 207.333-211 chr5 12778274 12778482 + 1.33333 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) intron (NR_033383, intron 3 of 3) 110519 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 172-34 chr12 49444041 49444181 + 1.33333 NA intron (NM_001293285, intron 3 of 14) L1M4a2|LINE|L1 54937 NR_033267 100335030 Hs.687044 NR_033267 LOC100335030 - FGFR1 oncogene partner 2 pseudogene pseudo 207.666-41 chr4 43189193 43189378 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 296019 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 370-27 chr8 59658210 59658715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 539252 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 318.666-23 chr8 125215918 125216221 + 1.33333 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) AluJo|SINE|Alu 124209 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 204.666-110 chr8 127806632 127806853 + 1.33333 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) L1ME1|LINE|L1 10780 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 321.333-2 chr1 72974364 72974709 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -331634 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 229.666-13 chr15 71979613 71979814 + 1.33333 NA intron (NM_006901, intron 11 of 41) MER58B|DNA|hAT-Charlie -134545 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 216.667-55 chr2 37919266 37919565 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5872 NM_001322212 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 604.999 chr3 82538914 82539538 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 553084 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 170.333-220 chr8 109802878 109803081 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111188 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 175.667-78 chr2 152344258 152344436 + 1.33333 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 9173 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 356-9 chr11 73488363 73488796 + 1.33333 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 109533 NM_015159 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 197.667-39 chr14 54729768 54730047 + 1.33333 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) intron (NM_001161576, intron 2 of 10) -24926 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 187.333-159 chr5 79235178 79235330 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_152405) promoter-TSS (NM_152405) -877 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 160-114 chr8 53472833 53473009 + 1.33333 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 51044 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 371.666-5 chr14 76144209 76144731 + 1.33333 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -7415 NM_001322031 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 269.333-12 chr12 14952148 14952449 + 1.33333 NA intron (NM_001175, intron 1 of 5) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -1147 NM_001321422 397 Hs.504877 NM_001175 ENSG00000111348 ARHGDIB D4|GDIA2|GDID4|LYGDI|Ly-GDI|RAP1GN1|RhoGDI2 Rho GDP dissociation inhibitor beta protein-coding 211-43 chr18 11925249 11925479 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17047 NR_040242 65258 Hs.712666 NM_023075 ENSG00000154889 MPPE1 PGAP5 metallophosphoesterase 1 protein-coding 423.333-2 chr12 44571569 44572073 + 1.33333 NA intron (NM_006159, intron 16 of 20) intron (NM_006159, intron 16 of 20) 303840 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 255.333-88 chr5 163246547 163246799 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -190898 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 273-44 chr9 80226417 80226855 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 251613 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 207.333-59 chr12 29267242 29267489 + 1.33333 NA intron (NM_001271784, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 43699 NM_018099 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 261.333-10 chr10 8070264 8070577 + 1.33333 NA intron (NM_001002295, intron 5 of 5) intron (NM_001002295, intron 5 of 5) 15732 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 260.333-17 chr14 47285464 47285835 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 57597 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 190.666-14 chr11 99819601 99819819 + 1.33333 NA exon (NM_014361, exon 4 of 25) exon (NM_014361, exon 4 of 25) 263565 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 209-113 chr7 51876474 51876741 + 1.33333 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -483351 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 267.666 chr1 111258028 111258582 + 1.33333 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -22219 NR_003928 149620 Hs.736960 NM_001013621 ENSG00000203878 CHIAP2 - chitinase, acidic pseudogene 2 pseudo 356.666-11 chr2 177444458 177444959 + 1.33333 NA intron (NM_003659, intron 7 of 19) intron (NM_003659, intron 7 of 19) 51935 NM_003659 8540 Hs.516543 NM_003659 ENSG00000018510 AGPS ADAP-S|ADAS|ADHAPS|ADPS|ALDHPSY|RCDP3 alkylglycerone phosphate synthase protein-coding 219.333-89 chr2 11523801 11524116 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10087 NM_014668 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 287.666-4 chr14 25552137 25552590 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -502066 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 241.333-44 chr16 24061260 24061587 + 1.33333 NA intron (NM_002738, intron 5 of 16) intron (NM_002738, intron 5 of 16) -141693 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 191-29 chr2 46350079 46350246 + 1.33333 NA intron (NM_001430, intron 2 of 15) intron (NM_001430, intron 2 of 15) 44005 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 207-15 chr10 98811352 98811640 + 1.33333 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 113072 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 212.999-6 chr8 85471448 85471607 + 1.33333 NA intron (NM_001293675, intron 2 of 5) intron (NM_001293675, intron 2 of 5) -6612 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 301-47 chr5 119145347 119145726 + 1.33333 NA intron (NM_001290321, intron 15 of 43) intron (NM_001290321, intron 15 of 43) -9101 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 217.333-140 chr7 73652699 73653001 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -14981 NM_001077621 155382 Hs.647037 NM_152560 ENSG00000176428 VPS37D WBSCR24 VPS37D subunit of ESCRT-I protein-coding 242.666-22 chr2 23851906 23852100 + 1.33333 NA intron (NR_125717, intron 13 of 28) L1MEc|LINE|L1 75120 NM_017552 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 468-4 chr12 31556536 31556989 + 1.33333 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) intron (NM_001308339, intron 1 of 22) -33161 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 333.333-7 chr10 34850226 34850708 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34699 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-31 chr10 68205258 68205474 + 1.33333 NA intron (NR_045663, intron 16 of 17) intron (NR_045663, intron 16 of 17) 26747 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 177.667-127 chr7 102398596 102398871 + 1.33333 NA intron (NR_038967, intron 5 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 2370 NM_024653 79706 Hs.722104 NM_024653 ENSG00000128563 PRKRIP1 C114|KRBOX3 PRKR interacting protein 1 protein-coding 181-2 chr1 237730359 237730602 + 1.33333 NA intron (NM_001035, intron 77 of 104) intron (NM_001035, intron 77 of 104) -131695 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 222-67 chr4 55581180 55581440 + 1.33333 NA intron (NM_152401, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 10935 NM_152401 132954 Hs.223712 NM_152401 ENSG00000163440 PDCL2 GCPHLP phosducin like 2 protein-coding 226-90 chr7 111513979 111514256 + 1.33333 NA intron (NM_032549, intron 2 of 5) L1MA9|LINE|L1 48174 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 198-59 chr15 63778988 63779228 + 1.33333 NA intron (NM_003922, intron 1 of 77) L1MC4|LINE|L1 54840 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 202-101 chr20 46800165 46800409 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90638 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 288-36 chr3 137108014 137108343 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 150195 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 283.333-64 chr5 120512615 120512929 + 1.33333 NA intron (NM_016644, intron 2 of 2) MER41E|LTR|ERV1 -18692 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 256.666-44 chr6 54304796 54305041 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -3523 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 177.666-11 chr2 123180440 123180711 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -107094 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 234.333-89 chr9 6857398 6857751 + 1.33333 NA intron (NR_148680, intron 5 of 21) intron (NR_148680, intron 5 of 21) 100224 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 154.333-220 chr3 103494294 103494554 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29692 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 196-29 chr11 39595652 39595881 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 697364 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 314.333-28 chr8 80136609 80136980 + 1.33333 NA intron (NR_105035, intron 1 of 6) intron (NR_105035, intron 1 of 6) 34327 NR_105037 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 228.999 chr1 117781254 117781437 + 1.33333 NA Intergenic CR1-16_AMi|LINE|CR1 148276 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 121.333-152 chr5 136975729 136975869 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_004598, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_004598, exon 11 of 11) -152398 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 241-59 chr8 102207203 102207567 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001172478, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001172478, exon 8 of 8) 31446 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 155-118 chr7 34698069 34698309 + 1.33333 NA intron (NM_001300934, intron 2 of 6) L1ME3A|LINE|L1 39950 NM_001300935 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 212-157 chr9 242514 242723 + 1.33333 NA intron (NM_203447, intron 1 of 47) MIRb|SINE|MIR -26868 NR_160804 157983 Hs.190877 NM_152569 ENSG00000183784 DOCK8-AS1 C9orf66 DOCK8 antisense RNA 1 ncRNA 197.667-45 chr15 56335886 56336152 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29405 NM_001286449 374618 Hs.511476 NM_198524 ENSG00000151575 TEX9 - testis expressed 9 protein-coding 262.333-78 chr8 115724958 115725326 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56167 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 274.333-54 chr5 110627874 110628212 + 1.33333 NA intron (NM_001039763, intron 5 of 13) intron (NM_001039763, intron 5 of 13) 98628 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 258.333-13 chr11 78000595 78000999 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6129 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 205.333-91 chr16 69245842 69246108 + 1.33333 NA intron (NM_006750, intron 2 of 6) L1ME3G|LINE|L1 58828 NM_006750 6645 Hs.461117 NM_006750 ENSG00000168807 SNTB2 D16S2531E|EST25263|SNT2B2|SNT3|SNTL syntrophin beta 2 protein-coding 173.333-143 chr4 46280845 46281031 + 1.33333 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 108441 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 350.999-3 chr5 81440074 81440380 + 1.33333 NA intron (NM_012446, intron 14 of 16) intron (NM_012446, intron 14 of 16) -46093 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 195.333-97 chr17 52835182 52835375 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -26843 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 198-189 chr8 141808209 141808443 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22013 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 236.666-42 chr7 42010767 42010960 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 10 of 14) intron (NM_000168, intron 10 of 14) 226346 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 228.333-64 chr3 131894563 131894953 + 1.33333 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) L1MA6|LINE|L1 91173 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 154-74 chr19 31058249 31058515 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -109128 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 254-71 chr6 142366644 142366958 + 1.33333 NA intron (NM_198569, intron 2 of 24) L2a|LINE|L2 64794 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 218-15 chr11 26297369 26297686 + 1.33333 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) -9520 NR_132968 105376599 Hs.125537 NR_132968 ENSG00000254819 ANO3-AS1 - ANO3 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-324 chr5 32580496 32580631 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4994 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 167.333-26 chr1 180057551 180057688 + 1.33333 NA intron (NM_014810, intron 25 of 37) L1MEg|LINE|L1 -97214 NM_001004128 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 191-12 chr12 444479 444714 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -15343 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 299.333-11 chr11 86614373 86614625 + 1.33333 NA intron (NM_001014811, intron 1 of 13) intron (NM_001014811, intron 1 of 13) 57699 NM_001014811 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 403.333-13 chr6 95764544 95764996 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 187235 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 266-28 chr17 18175334 18175589 + 1.33333 NA intron (NM_016239, intron 64 of 64) AluSz|SINE|Alu -8367 NM_017758 54890 Hs.744130 NM_017758 ENSG00000091542 ALKBH5 ABH5|OFOXD|OFOXD1 alkB homolog 5, RNA demethylase protein-coding 197-19 chr10 64401382 64401617 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -424029 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 155.333-200 chr20 47094210 47094342 + 1.33333 NA intron (NM_172110, intron 8 of 13) intron (NM_172110, intron 8 of 13) -72691 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 154.667-2 chr1 39484623 39484822 + 1.33333 NA exon (NM_012090, exon 92 of 93) exon (NM_012090, exon 92 of 93) -6914 NM_181809 353500 Hs.472497 NM_181809 ENSG00000183682 BMP8A - bone morphogenetic protein 8a protein-coding 253.333-50 chr2 21194058 21194481 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70283 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 193-65 chr4 30454122 30454385 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -266116 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 156.667-34 chr1 214526411 214526641 + 1.33333 NA intron (NM_005401, intron 1 of 18) intron (NM_005401, intron 1 of 18) 25076 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 202.666-32 chr14 37334667 37334876 + 1.33333 NA intron (NM_138731, intron 10 of 13) L1MB8|LINE|L1 136834 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 264.333-62 chr5 132281220 132281436 + 1.33333 NA Intergenic LTR57|LTR|ERVL -13066 NM_003059 6583 Hs.310591 NM_003059 ENSG00000197208 SLC22A4 DFNB60|OCTN1 solute carrier family 22 member 4 protein-coding 211.666 chr1 102849334 102849589 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 259035 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 285.333-25 chr17 58886529 58886853 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1MB8|LINE|L1 130822 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 185-33 chr2 55948960 55949112 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25254 NM_001039348 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 136-25 chr13 94378754 94378901 + 1.33333 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) intron (NM_005708, intron 6 of 8) 100855 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 158-22 chr11 26718936 26719063 + 1.33333 NA intron (NM_178498, intron 1 of 14) intron (NM_178498, intron 1 of 14) 3061 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 315.666-15 chr7 91012149 91012609 + 1.33333 NA intron (NM_012395, intron 9 of 13) L1ME1|LINE|L1 -252054 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 237-50 chr3 187708043 187708314 + 1.33333 NA intron (NR_034062, intron 1 of 2) intron (NR_034062, intron 1 of 2) -5621 NM_001004312 344892 Hs.567872 NM_001004312 ENSG00000198471 RTP2 Z3CXXC2 receptor transporter protein 2 protein-coding 160-111 chr7 95170621 95170768 + 1.33333 NA intron (NM_017650, intron 5 of 15) L1ME1|LINE|L1 153838 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 268.999-4 chr5 31435586 31435934 + 1.33333 NA intron (NM_013235, intron 24 of 34) intron (NM_013235, intron 24 of 34) 96333 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 193.666-12 chr12 55577557 55577817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 3272 NM_001258285 121129 Hs.742584 NM_001258285 ENSG00000179615 OR2AP1 OR2AP1P olfactory receptor family 2 subfamily AP member 1 protein-coding 158-44 chr14 68264256 68264471 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 364424 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 212.666-88 chr8 28612744 28612915 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 88635 NR_126027 101929402 Hs.667366 NR_126027 ENSG00000246339 EXTL3-AS1 C8orf50 EXTL3 antisense RNA 1 ncRNA 198.333-199 chr8 125876325 125876525 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 74772 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 156-119 chr5 130726285 130726537 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 438845 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 265-55 chr5 8678433 8678763 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -161134 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 213.333-91 chr2 47095173 47095535 + 1.33333 NA intron (NM_001163561, intron 5 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 59954 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 257.333-33 chr14 52037927 52038179 + 1.33333 NA intron (NM_007361, intron 9 of 21) L1MB8|LINE|L1 31006 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 235-14 chr12 83029041 83029260 + 1.33333 NA intron (NM_152588, intron 8 of 11) intron (NM_152588, intron 8 of 11) 341995 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 198-167 chr6 157329621 157329777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5440 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 201.333-16 chr1 178068395 178068691 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25450 NR_027982 100302401 Hs.736117 NR_027982 ENSG00000224687 RASAL2-AS1 - RASAL2 antisense RNA 1 ncRNA 208-177 chr9 15532349 15532555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20591 NM_001348002 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 202-164 chr6 115985957 115986166 + 1.33333 NA intron (NM_002031, intron 2 of 7) intron (NM_002031, intron 2 of 7) -52670 NR_027338 728402 Hs.729953 NR_027338 TPI1P3 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 3 pseudo 226.666-4 chr10 116709627 116709853 + 1.33333 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) L1MB4|LINE|L1 32826 NM_025015 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 213-16 chr12 116149007 116149276 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_030351) promoter-TSS (NR_030351) -487 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 218.333-61 chr2 32339694 32339916 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -17223 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 140.667-2 chr1 45536941 45537194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13716 NM_001202413 10327 Hs.474584 NM_006066 ENSG00000117448 AKR1A1 ALDR1|ALR|ARM|DD3|HEL-S-6 aldo-keto reductase family 1 member A1 protein-coding 267.666-20 chr7 8905029 8905310 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 471560 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 350.999-4 chr6 136951527 136952054 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29489 NM_001008783 340146 Hs.369703 NM_001008783 ENSG00000182747 SLC35D3 FRCL1 solute carrier family 35 member D3 protein-coding 150-145 chr8 99315046 99315203 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 221606 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 160-33 chr12 65945734 65945903 + 1.33333 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -63493 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 125.333-101 chr20 34782368 34782543 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001242539) promoter-TSS (NM_001242539) -51 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 194.333-20 chr10 55474147 55474356 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -124791 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 366.666-14 chr7 41460231 41460536 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -233536 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 199.333-117 chr2 17133122 17133414 + 1.33333 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 385172 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 234.333-86 chr8 109096265 109096620 + 1.33333 NA intron (NM_003301, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 9814 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 175.333-201 chr9 32666501 32666676 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -30919 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 194-91 chr3 6174167 6174331 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 631200 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 265.333-39 chr2 117104700 117105068 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -709807 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 175-44 chr2 80091755 80091944 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 212903 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 192.333-80 chr19 28521328 28521521 + 1.33333 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L2a|LINE|L2 -85264 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 244.333-37 chr14 77404554 77404930 + 1.33333 NA intron (NM_001113475, intron 5 of 5) L2|LINE|L2 18314 NM_001113475 122945 Hs.97556 NM_138791 ENSG00000165555 NOXRED1 C14orf148 NADP dependent oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 334.667-26 chr6 63279741 63280216 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_016571, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_016571, exon 4 of 4) 39999 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 254.333-64 chr5 39029940 39030237 + 1.33333 NA intron (NM_001285439, intron 2 of 38) MIRc|SINE|MIR 44311 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 256.666-4 chr1 67300793 67301149 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -6393 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 237.333-138 chrX 68129060 68129321 + 1.33333 NA intron (NM_002547, intron 15 of 24) intron (NM_002547, intron 15 of 24) 304305 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 467.667-3 chr14 50394172 50394725 + 1.33333 NA intron (NM_001282236, intron 2 of 8) intron (NM_001282236, intron 2 of 8) 2433 NM_001367065 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 195.333-55 chr12 15290694 15290858 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -31732 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 229.333-52 chr18 3128320 3128583 + 1.33333 NA intron (NM_019856, intron 17 of 36) intron (NM_019856, intron 17 of 36) 91517 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 206.666-117 chr8 87152776 87152971 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 286458 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 339.333-10 chr13 104380975 104381272 + 1.33333 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy 955923 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 194-6 chr1 237879949 237880221 + 1.33333 NA intron (NR_027247, intron 3 of 11) intron (NR_027247, intron 3 of 11) 10837 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 120.667-31 chr11 105332536 105332704 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -192851 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 175-19 chr12 38675459 38675607 + 1.33333 NA intron (NM_153634, intron 18 of 19) intron (NM_153634, intron 18 of 19) 230058 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 220.666-6 chr1 229659777 229659949 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001314021, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001314021, exon 10 of 10) 33616 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 220.666-61 chr5 149797990 149798226 + 1.33333 NA intron (NM_001172699, intron 1 of 10) MIRc|SINE|MIR 26168 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 248.666 chr1 45300395 45300627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3399 NR_024270 400752 Hs.334348 NR_024270 ENSG00000281912 LINC01144 - long intergenic non-protein coding RNA 1144 ncRNA 126.667-36 chr12 54847820 54848060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6576 NM_058173 118430 Hs.348419 NM_058173 ENSG00000172551 MUCL1 SBEM mucin like 1 protein-coding 194.333-81 chr20 51943785 51944052 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81005 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 211.666-22 chr2 15475622 15475898 + 1.33333 NA exon (NM_015909, exon 14 of 52) exon (NM_015909, exon 14 of 52) 85574 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 330.333-20 chr7 52971600 52971966 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63850 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 255.666-16 chr2 150573016 150573219 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_110241) promoter-TSS (NR_110241) -896 NR_110241 101929260 Hs.732324 NR_110241 ENSG00000236049 LINC01920 - long intergenic non-protein coding RNA 1920 ncRNA 185.333-105 chr2 221042124 221042307 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 530089 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 133-10 chr10 80367772 80367927 + 1.33333 NA non-coding (NR_070308, exon 6 of 6) non-coding (NR_070308, exon 6 of 6) 11068 NM_032372 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 177.666-32 chr8 87830333 87830517 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43590 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 355.333-20 chr22 27495339 27495815 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 184926 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 198-49 chr14 56757562 56757817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47978 NM_172337 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 306.666-12 chr17 74574642 74574953 + 1.33333 NA Intergenic MER87|LTR|ERV1 -7454 NM_001324073 100130520 NM_001324073 ENSG00000284690 CD300H CD300Hs CD300H molecule (gene/pseudogene) protein-coding 177.333-149 chr7 8796097 8796247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 362563 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 291.333-63 chr8 19096003 19096407 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -82502 NM_015310 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 213-18 chr13 68694718 68694978 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 190477 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 167.333-161 chr22 22049702 22049891 + 1.33333 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -5862 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 278-31 chr3 64841670 64842062 + 1.33333 NA intron (NR_038264, intron 3 of 5) AluSz|SINE|Alu -153866 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 226-25 chr15 89490928 89491221 + 1.33333 NA intron (NM_001321041, intron 1 of 10) intron (NM_001321041, intron 1 of 10) 5509 NR_110261 51458 Hs.459284 NM_016321 ENSG00000140519 RHCG C15orf6|PDRC2|RHGK|SLC42A3 Rh family C glycoprotein protein-coding 191-63 chr7 43516840 43517061 + 1.33333 NA intron (NR_038276, intron 1 of 2) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 5592 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 217.333-3 chr1 58739309 58739575 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -39380 NM_001085487 114803 Hs.744921 NM_001085487 ENSG00000162601 MYSM1 2A-DUB|2ADUB|BMFS4 Myb like, SWIRM and MPN domains 1 protein-coding 265.999-3 chr2 200148192 200148554 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157506 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 202.667-70 chr17 70131515 70131780 + 1.33333 NA intron (NM_001270422, intron 5 of 5) intron (NM_001270422, intron 5 of 5) 26802 NM_001291623 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 434.666 chr1 69604924 69605464 + 1.33333 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 35853 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 196.666-61 chr20 47991607 47991756 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1564 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 175.333-48 chr14 73062701 73062910 + 1.33333 NA intron (NM_021239, intron 1 of 18) L1ME1|LINE|L1 4271 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 293.333-12 chr14 39360549 39360960 + 1.33333 NA intron (NM_001354155, intron 22 of 22) L1MA4A|LINE|L1 71746 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 199-100 chr6 167000155 167000386 + 1.33333 NA intron (NM_001278690, intron 2 of 10) intron (NM_001278690, intron 2 of 10) 873 NM_007045 11116 Hs.487175 NM_007045 ENSG00000213066 FGFR1OP FOP FGFR1 oncogene partner protein-coding 169-12 chr11 25774855 25775029 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -414181 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 499.999-3 chr8 134266803 134267313 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -331013 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 202.333-90 chr2 66862589 66862862 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41711 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 267.666-13 chr3 7506303 7506724 + 1.33333 NA intron (NM_000844, intron 7 of 9) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 28771 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 204.666-86 chr7 34557354 34557570 + 1.33333 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) L1PREC2|LINE|L1 -100756 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 312.333-3 chr11 72429567 72429912 + 1.33333 NA intron (NM_001258394, intron 2 of 17) intron (NM_001258394, intron 2 of 17) 4792 NM_001258393 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 164.667-14 chr1 187896143 187896327 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 452607 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 252.333-5 chr1 208607631 208608039 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -120853 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 197.666-30 chr2 13948602 13948793 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 452261 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 204-192 chr8 81839012 81839313 + 1.33333 NA intron (NM_001348189, intron 4 of 9) L1ME3A|LINE|L1 3023 NR_145472 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 127.333-45 chr14 33621574 33621722 + 1.33333 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -87289 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 135.666-6 chr5 163710385 163710630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 204888 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 243.333-46 chr19 29775935 29776140 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35954 NM_001322259 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 225.666-7 chr14 43738221 43738394 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 768976 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 203.333-214 chr5 80231735 80231914 + 1.33333 NA intron (NR_126061, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 24224 NM_001174072 256987 Hs.288232 NM_178276 ENSG00000164300 SERINC5 C5orf12|TPO1 serine incorporator 5 protein-coding 216.667-37 chr15 41327878 41328146 + 1.33333 NA intron (NM_007280, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 4579 NM_007280 11339 Hs.661645 NM_007280 ENSG00000104147 OIP5 5730547N13Rik|CT86|LINT-25|MIS18B|MIS18beta|hMIS18beta Opa interacting protein 5 protein-coding 118.667-167 chr6 52315393 52315591 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30750 NM_001366370 4172 Hs.179565 NM_002388 ENSG00000112118 MCM3 HCC5|P1-MCM3|P1.h|RLFB minichromosome maintenance complex component 3 protein-coding 201-105 chr7 131371284 131371517 + 1.33333 NA intron (NM_001321316, intron 1 of 17) L2|LINE|L2 43524 NM_013255 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 432.667-11 chr6 53654782 53655356 + 1.33333 NA exon (NM_001003760, exon 2 of 3) exon (NM_001003760, exon 2 of 3) 10687 NM_001003760 401265 Hs.131064 NM_001003760 ENSG00000124743 KLHL31 BKLHD6|KBTBD1|KLHL|bA345L23.2 kelch like family member 31 protein-coding 258-25 chr18 12788604 12788940 + 1.33333 NA intron (NM_080423, intron 8 of 8) intron (NM_080423, intron 8 of 8) -39350 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 221.666-21 chr16 80263881 80264052 + 1.33333 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -276768 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 194.667-127 chr5 127283974 127284251 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6652 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 199.333-139 chr2 152143577 152143828 + 1.33333 NA intron (NM_005843, intron 7 of 13) intron (NM_005843, intron 7 of 13) 32061 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 232.667-8 chr10 130923501 130923800 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39018 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 142-124 chr6 10263245 10263475 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -141142 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 161.666-7 chr3 164692713 164692940 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 138654 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 212-62 chr15 86741566 86741764 + 1.33333 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -191215 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 195.333-222 chr8 144111617 144111789 + 1.33333 NA exon (NM_001316309, exon 12 of 24) exon (NM_001316309, exon 12 of 24) 3964 NM_001316309 340390 Hs.98723 NM_032529 ENSG00000179698 WDR97 KIAA1875 WD repeat domain 97 protein-coding 267-21 chr14 37708067 37708311 + 1.33333 NA intron (NM_001310135, intron 7 of 32) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -64194 NM_001368142 319089 Hs.659936 NM_001007795 ENSG00000139865 TTC6 C14orf25|NCRNA00291 tetratricopeptide repeat domain 6 protein-coding 188-17 chr10 51189085 51189258 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -110402 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 202.666-15 chr10 74078309 74078484 + 1.33333 NA intron (NM_014000, intron 6 of 21) intron (NM_014000, intron 6 of 21) 72432 NR_135191 26985 Hs.500104 NM_012095 ENSG00000185009 AP3M1 - adaptor related protein complex 3 subunit mu 1 protein-coding 357.333-21 chr7 7795544 7796020 + 1.33333 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) MER41B|LTR|ERV1 -77175 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 326.333-31 chr7 36234496 36234834 + 1.33333 NA intron (NM_030636, intron 2 of 7) AluJb|SINE|Alu 81411 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 201.333-273 chr8 18339948 18340121 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -51248 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 200.333-90 chr3 3957763 3958030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157021 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 204-169 chr5 127441397 127441650 + 1.33333 NA intron (NM_001256545, intron 18 of 24) intron (NM_001256545, intron 18 of 24) -76117 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 168-43 chr18 13438946 13439135 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -11506 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 168.667-101 chr2 58402389 58402559 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -118279 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 199-6 chr10 20607836 20608106 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 56001 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 218.666-37 chr18 44884220 44884439 + 1.33333 NA intron (NM_015559, intron 3 of 5) MIRb|SINE|MIR 85837 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 228-100 chrX 44346639 44346906 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -3100 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 199-78 chr5 15456606 15456792 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -43481 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 518.333-2 chr22 28132076 28132876 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) MIR3|SINE|MIR -211864 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 339.999-6 chr2 83180650 83180977 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 324010 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 270.333-5 chr1 163028503 163028944 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39883 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 212.667-26 chr12 12039801 12040113 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9904 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 243.333-78 chr4 35836367 35836601 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 407455 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 180.666-25 chr4 65595214 65595384 + 1.33333 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 74189 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 195.333-131 chr20 31300107 31300304 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8380 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 159.333-215 chr3 102699470 102699639 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 264539 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 167.333-277 chrX 17586950 17587109 + 1.33333 NA non-coding (NR_135631, exon 2 of 2) non-coding (NR_135631, exon 2 of 2) -27902 NR_046632 100873920 Hs.584577 NR_046632 NHS-AS1 - NHS antisense RNA 1 ncRNA 255.666-32 chr9 118257447 118257650 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -422123 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 195-24 chr11 62010768 62011010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43255 NM_002032 2495 Hs.524910 NM_002032 ENSG00000167996 FTH1 FHC|FTH|FTHL6|HFE5|PIG15|PLIF ferritin heavy chain 1 protein-coding 190-68 chr2 192642471 192642635 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -107292 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 210.666-49 chr19 27350542 27350760 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -442780 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 214.666-51 chr4 123865208 123865481 + 1.33333 NA non-coding (NR_027106, exon 3 of 3) non-coding (NR_027106, exon 3 of 3) 91080 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 377.666-6 chr10 83504865 83505154 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 172080 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 258.666-2 chr1 102946404 102946700 + 1.33333 NA intron (NM_001854, intron 42 of 66) intron (NM_001854, intron 42 of 66) 161944 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 185-12 chr11 111964214 111964452 + 1.33333 NA intron (NM_001037954, intron 1 of 19) intron (NM_001037954, intron 1 of 19) -12976 NM_033425 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 316-8 chr11 124173820 124174280 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11166 NM_001355213 26497 Hs.538726 NM_001355213 ENSG00000197309 OR10D3 HTPCRX09|OR10D3P olfactory receptor family 10 subfamily D member 3 (putative) protein-coding 237.666-10 chr2 135354904 135355113 + 1.33333 NA intron (NM_001286569, intron 3 of 21) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 175577 NM_001286568 84083 Hs.658422 NM_032143 ENSG00000121988 ZRANB3 4933425L19Rik|AH2 zinc finger RANBP2-type containing 3 protein-coding 189.666-2 chr1 87325157 87325331 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3636 NM_006769 8543 Hs.436792 NM_006769 ENSG00000143013 LMO4 - LIM domain only 4 protein-coding 196-199 chr9 120751773 120751979 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -37406 NM_001080497 1955 Hs.744903 NM_001080497 ENSG00000106780 MEGF9 EGFL5 multiple EGF like domains 9 protein-coding 266.666-9 chr12 16208853 16209160 + 1.33333 NA intron (NM_001170798, intron 7 of 8) intron (NM_001170798, intron 7 of 8) 68679 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 305.333-55 chr5 23865895 23866264 + 1.33333 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -85269 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 204-7 chr1 73746107 73746275 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 71512 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 281-41 chr8 27173686 27174056 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 84533 NM_001283053 81551 Hs.201058 NM_030795 ENSG00000015592 STMN4 RB3 stathmin 4 protein-coding 250-16 chr10 100072664 100072999 + 1.33333 NA intron (NM_001308, intron 2 of 8) L2b|LINE|L2 9038 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 173.667-97 chr20 46536150 46536391 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 14384 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 293.666-12 chr7 3667701 3668012 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1ME1|LINE|L1 366604 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 353.333-8 chr12 4478477 4478787 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33018 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 309-32 chr6 128768854 128769145 + 1.33333 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -114139 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 285.666-4 chr20 22837318 22837726 + 1.33333 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -152178 NR_146528 105372566 Hs.555065 NR_146527 LINC01747 - long intergenic non-protein coding RNA 1747 ncRNA 218.666-67 chr7 83788684 83788992 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -139699 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 265.333-38 chr2 115872460 115872817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 528823 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 329.666 chr10 81153810 81154104 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 504160 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 286.666-6 chr17 68912525 68912876 + 1.33333 NA intron (NM_001288985, intron 17 of 39) L1MA3|LINE|L1 42692 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 193.333-111 chr20 13796511 13796659 + 1.33333 NA intron (NR_147981, intron 5 of 11) intron (NR_147981, intron 5 of 11) 11557 NR_147982 79133 Hs.472165 NM_024120 ENSG00000101247 NDUFAF5 C20orf7|MC1DN16|bA526K24.2|dJ842G6.1 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5 protein-coding 179-14 chr10 112651063 112651218 + 1.33333 NA intron (NM_001365712, intron 6 of 8) intron (NM_001365712, intron 6 of 8) 16970 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 168.667-76 chr16 77846992 77847164 + 1.33333 NA intron (NM_020927, intron 3 of 8) intron (NM_020927, intron 3 of 8) 58514 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 193.333-123 chr3 84603873 84604041 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 265618 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 185.666-7 chr11 91744953 91745147 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -479984 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 168.667-187 chr6 53955419 53955625 + 1.33333 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) L1ME3D|LINE|L1 25540 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 386.333-2 chr11 77740725 77741148 + 1.33333 NA exon (NM_016578, exon 4 of 16) exon (NM_016578, exon 4 of 16) 79898 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 198.333-100 chr2 132598851 132599088 + 1.33333 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) (AAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 71236 NM_001321234 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 218 chr1 35179087 35179300 + 1.33333 NA intron (NR_136703, intron 9 of 11) intron (NR_136703, intron 9 of 11) 13952 NM_005066 6421 Hs.355934 NM_005066 ENSG00000116560 SFPQ POMP100|PPP1R140|PSF splicing factor proline and glutamine rich protein-coding 281.333-7 chr10 98814127 98814623 + 1.33333 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 110193 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 216.333-82 chr2 120696198 120696423 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39558 NM_001371271 212-25 chr10 112533466 112533780 + 1.33333 NA intron (NM_001365712, intron 5 of 8) intron (NM_001365712, intron 5 of 8) -86020 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 141.667-80 chr15 26801150 26801335 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -27479 NM_021912 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 277-56 chr9 132970670 132971017 + 1.33333 NA intron (NM_004188, intron 1 of 10) intron (NM_004188, intron 1 of 10) -7851 NM_001135031 8328 Hs.553160 NM_004188 ENSG00000165702 GFI1B BDPLT17|ZNF163B growth factor independent 1B transcriptional repressor protein-coding 147.666-2 chr10 61212641 61212831 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 196461 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 196.333-8 chr1 214315535 214315827 + 1.33333 NA intron (NM_020197, intron 3 of 11) LTR47A|LTR|ERVL 34522 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 209.333-202 chr6 67191919 67192163 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -863310 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 324.666-9 chr16 2914780 2915083 + 1.33333 NA intron (NM_020912, intron 2 of 8) AluSx|SINE|Alu 2952 NM_032296 84256 Hs.655321 NM_020912 ENSG00000059122 FLYWCH1 - FLYWCH-type zinc finger 1 protein-coding 296-9 chr10 67659535 67659946 + 1.33333 NA intron (NM_001291133, intron 1 of 8) intron (NM_001291133, intron 1 of 8) 5920 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 207.666-43 chr4 74674283 74674475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120144 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 225-43 chr3 94537512 94537733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -400641 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 210-5 chr1 83833824 83834053 + 1.33333 NA intron (NR_119374, intron 2 of 2) intron (NR_119374, intron 2 of 2) 26608 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 152.667-97 chr13 60398276 60398498 + 1.33333 NA intron (NM_001146070, intron 1 of 13) intron (NM_001146070, intron 1 of 13) 1167 NM_001146070 81550 Hs.525061 NM_030794 ENSG00000083544 TDRD3 - tudor domain containing 3 protein-coding 256-43 chr2 117325287 117325635 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -489230 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 226.999 chr12 55069561 55069734 + 1.33333 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 49673 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 178.333-77 chr2 78350878 78351147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -60281 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 252.667-27 chr14 33330225 33330535 + 1.33333 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) -378557 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 190.333-103 chr4 33632536 33632707 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 407272 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 307.333-5 chr1 104370237 104370688 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 297439 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 204.666-4 chr1 163891201 163891408 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -468113 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 195.333-178 chr5 77301650 77301924 + 1.33333 NA intron (NM_001349749, intron 2 of 22) intron (NM_001349749, intron 2 of 22) 91107 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 523.333-6 chr7 46046230 46046755 + 1.33333 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -125220 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 401.333-8 chr14 43861506 43861954 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 645553 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 241-49 chr6 54580014 54580318 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -266605 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 242.333-49 chr2 111958264 111958455 + 1.33333 NA intron (NM_006343, intron 4 of 18) intron (NM_006343, intron 4 of 18) 59752 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 284.667-30 chr3 24393700 24394210 + 1.33333 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -100132 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 194.666-45 chr3 145987314 145987467 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 81795 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 197.333-159 chr3 125465932 125466273 + 1.33333 NA intron (NM_003794, intron 9 of 13) L1M5|LINE|L1 54100 NM_003794 8723 Hs.507243 NM_003794 ENSG00000114520 SNX4 ATG24B sorting nexin 4 protein-coding 197.333-47 chr12 13844812 13845028 + 1.33333 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) intron (NM_000834, intron 2 of 12) 135436 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 249.666-27 chr22 27948243 27948656 + 1.33333 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1MEf|LINE|L1 -27837 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 212.666-11 chr10 84435378 84435579 + 1.33333 NA intron (NM_018999, intron 5 of 10) intron (NM_018999, intron 5 of 10) 10309 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 228.666-25 chr20 56006661 56006902 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1262 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 190.667-116 chr6 79977347 79977621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27121 NM_001166691 7272 Hs.169840 NM_003318 ENSG00000112742 TTK CT96|ESK|MPH1|MPS1|MPS1L1|PYT TTK protein kinase protein-coding 149.333-190 chr2 116703149 116703350 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1111442 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 382.666-3 chr14 57511296 57511927 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17754 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 323.667-8 chr14 34142334 34142748 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -191467 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 405.999 chr3 197710040 197710736 + 1.33333 NA intron (NM_001346873, intron 2 of 21) AluSp|SINE|Alu 26516 NM_014687 9711 Hs.478868 NM_014687 ENSG00000145016 RUBCN KIAA0226|RUBICON|SCAR15 rubicon autophagy regulator protein-coding 186.666-36 chr3 149740835 149741016 + 1.33333 NA non-coding (NR_135149, exon 5 of 5) non-coding (NR_135149, exon 5 of 5) 11564 NM_016094 51122 Hs.432729 NM_016094 ENSG00000114744 COMMD2 HSPC042 COMM domain containing 2 protein-coding 296.667-46 chr5 94319744 94320179 + 1.33333 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) L2a|LINE|L2 -208262 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 253.666-24 chr6 36507177 36507549 + 1.33333 NA intron (NM_007271, intron 8 of 13) intron (NM_007271, intron 8 of 13) 40116 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 282-3 chr1 217092906 217093156 + 1.33333 NA intron (NM_001134285, intron 1 of 8) intron (NM_001134285, intron 1 of 8) -2463 NM_001350122 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 313-5 chr10 51249178 51249651 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -50159 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 190-107 chr6 8552178 8552355 + 1.33333 NA intron (NR_038980, intron 2 of 4) intron (NR_038980, intron 2 of 4) -99943 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 211.333-2 chr1 34933388 34933562 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -3825 NM_001080418 58512 Hs.436393 NM_001080418 ENSG00000116544 DLGAP3 DAP3|SAPAP3 DLG associated protein 3 protein-coding 231.333-78 chr4 56904757 56905066 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2989 NM_005612 5978 Hs.307836 NM_005612 ENSG00000084093 REST DFNA27|GINGF5|HGF5|NRSF|WT6|XBR RE1 silencing transcription factor protein-coding 202-179 chr8 19894089 19894264 + 1.33333 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -45077 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 208-16 chr10 17576690 17576975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40542 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 132-30 chr12 69614180 69614335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3350 NM_201550 376132 Hs.448708 NM_201550 ENSG00000198812 LRRC10 HRLRRP|LRRC10A leucine rich repeat containing 10 protein-coding 177-47 chr22 44060656 44060952 + 1.33333 NA intron (NM_001243386, intron 1 of 11) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -8313 NM_001243385 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 200-114 chr4 61205168 61205458 + 1.33333 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 3141 NM_001371342 220.666-72 chr8 114747802 114748055 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 920085 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 131-28 chr14 63169504 63169667 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -34858 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 155-136 chr9 131205201 131205410 + 1.33333 NA intron (NM_001318324, intron 30 of 35) L1MEd|LINE|L1 15166 NM_001318325 8021 Hs.654530 NM_005085 ENSG00000126883 NUP214 CAIN|CAN nucleoporin 214 protein-coding 201-59 chr2 108847070 108847332 + 1.33333 NA intron (NM_001351549, intron 12 of 13) intron (NM_001351549, intron 12 of 13) 60430 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 216.333-94 chr3 52460587 52460816 + 1.33333 NA intron (NM_007184, intron 3 of 20) intron (NM_007184, intron 3 of 20) 5097 NM_001276294 11188 Hs.435290 NM_007184 ENSG00000010322 NISCH I-1|IR1|IRAS|hIRAS nischarin protein-coding 248.667-106 chr8 136559269 136559699 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 28686 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 215.333-210 chr9 81555668 81555853 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 133775 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 278-72 chr9 32046526 32047045 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -337818 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 339.333-7 chr10 43023997 43024399 + 1.33333 NA Intergenic (ATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26635 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 204.667-161 chrX 82353890 82354179 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 1151932 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 262.333-66 chr5 11691558 11691947 + 1.33333 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) AluJo|SINE|Alu -102686 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 267-65 chr7 110164691 110164961 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -204613 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 146.333-66 chr12 116097638 116097805 + 1.33333 NA intron (NM_015335, intron 3 of 30) Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 50933 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 221-3 chr1 60014321 60014513 + 1.33333 NA intron (NM_152377, intron 8 of 11) L1M6|LINE|L1 59353 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 300.333-19 chr17 67638801 67639119 + 1.33333 NA intron (NM_181671, intron 6 of 9) AluJr|SINE|Alu -78873 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 286.999 chr12 4825608 4825994 + 1.33333 NA intron (NM_002235, intron 1 of 1) intron (NM_002235, intron 1 of 1) 16625 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 209.333-180 chr4 164424073 164424308 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40935 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 210.666-37 chr14 73174501 73174728 + 1.33333 NA intron (NM_000021, intron 5 of 11) Tigger12A|DNA|TcMar-Tigger 38107 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 284.667-19 chr14 70800524 70800891 + 1.33333 NA exon (NM_001284230, exon 2 of 12) exon (NM_001284230, exon 2 of 12) 8464 NM_001284230 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 196-127 chr3 148614628 148614896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83109 NM_009585 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 291-20 chr17 42474762 42475166 + 1.33333 NA intron (NM_005177, intron 5 of 20) intron (NM_005177, intron 5 of 20) 16086 NM_005177 535 Hs.463074 NM_005177 ENSG00000033627 ATP6V0A1 ATP6N1|ATP6N1A|Stv1|VPP1|Vph1|a1 ATPase H+ transporting V0 subunit a1 protein-coding 267.666-4 chr12 27872615 27872854 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 92501 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 216.333-38 chr12 19523461 19523632 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 82947 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 204-98 chr2 107663955 107664114 + 1.33333 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -90078 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 174.666-14 chr2 108265765 108265981 + 1.33333 NA TTS (NM_001008743) TTS (NM_001008743) -23022 NM_176825 6819 Hs.436123 NM_001056 ENSG00000198203 SULT1C2 ST1C1|ST1C2|SULT1C1|humSULTC2 sulfotransferase family 1C member 2 protein-coding 341.667-4 chr11 112128616 112129143 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35215 NM_001243211 3606 Hs.83077 NM_001562 ENSG00000150782 IL18 IGIF|IL-18|IL-1g|IL1F4 interleukin 18 protein-coding 340-7 chr12 15133855 15134278 + 1.33333 NA intron (NM_032918, intron 2 of 4) L1MC1|LINE|L1 -17857 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 207.333-63 chr12 60582571 60582727 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 893279 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 297.333-6 chr1 237131130 237131493 + 1.33333 NA intron (NM_001035, intron 1 of 104) L1MCc|LINE|L1 89127 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 230.333-10 chr10 19188956 19189355 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 14 of 39) L1MB1|LINE|L1 140354 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 205-2 chr1 32504223 32504385 + 1.33333 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -35123 NM_001040441 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 281.333-35 chr2 193696810 193697106 + 1.33333 NA Intergenic Charlie17|DNA|hAT-Charlie -647311 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 277.333-72 chr5 37954936 37955343 + 1.33333 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 6648 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 349.333-16 chr2 101813194 101813665 + 1.33333 NA intron (NM_145686, intron 3 of 30) intron (NM_145686, intron 3 of 30) 115722 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 182.333-161 chr8 120514175 120514419 + 1.33333 NA intron (NM_022045, intron 17 of 21) L1MA9|LINE|L1 68878 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 241.666-9 chr20 46497979 46498256 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 15455 NM_001353823 55713 Hs.147041 NM_018102 ENSG00000198185 ZNF334 - zinc finger protein 334 protein-coding 272-45 chr6 66255229 66255517 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 467494 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 199.333-170 chr21 36598114 36598317 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -21646 NM_001146077 23562 Hs.660278 NM_012130 ENSG00000159261 CLDN14 DFNB29 claudin 14 protein-coding 211.333-80 chr16 71596113 71596321 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -19125 NM_000353 6898 Hs.161640 NM_000353 ENSG00000198650 TAT - tyrosine aminotransferase protein-coding 303.333-42 chr2 124194381 124194646 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 169226 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 203.666-48 chr5 113219661 113219964 + 1.33333 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 75126 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 313.333-4 chr10 32340671 32340993 + 1.33333 NA intron (NM_001282391, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 6326 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 209.333-129 chr2 232632317 232632548 + 1.33333 NA intron (NM_001243252, intron 1 of 3) intron (NM_001243252, intron 1 of 3) -1172 NM_001308395 80303 Hs.516769 NM_025202 ENSG00000115468 EFHD1 MST133|MSTP133|PP3051|SWS2 EF-hand domain family member D1 protein-coding 188-72 chr3 82067070 82067221 + 1.33333 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 81003 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 182.333-56 chr15 68903126 68903323 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27276 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 257.667-10 chr10 84148085 84148461 + 1.33333 NA intron (NM_014394, intron 5 of 8) (TTTTTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8764 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 308-18 chr15 40361039 40361395 + 1.33333 NA intron (NM_033510, intron 1 of 7) intron (NM_033510, intron 1 of 7) 2998 NM_033510 85455 Hs.355645 NM_033510 ENSG00000140323 DISP2 C15orf36|DISPB|HsT16908|LINC00594 dispatched RND transporter family member 2 protein-coding 182-39 chr17 77732387 77732634 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -3951 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 254.667-32 chr18 10072332 10072662 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 158481 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 196.667-78 chr2 187622689 187622965 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68322 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 146-76 chr22 21764792 21764948 + 1.33333 NA intron (NM_002745, intron 8 of 8) intron (NM_002745, intron 8 of 8) -29076 NM_013313 29799 Hs.517436 NM_013313 ENSG00000100027 YPEL1 FKSG3 yippee like 1 protein-coding 187.333-127 chr3 52541656 52541818 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001124767, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001124767, exon 2 of 2) 5132 NM_001124767 440957 Hs.660577 NM_001124767 ENSG00000168273 SMIM4 C3orf78 small integral membrane protein 4 protein-coding 205.333-142 chr20 52608355 52608543 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12389 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 303.666 chr1 37919275 37919527 + 1.33333 NA intron (NR_158630, intron 7 of 24) intron (NR_158630, intron 7 of 24) 12338 NM_001350227 3633 Hs.449942 NM_005540 ENSG00000204084 INPP5B 5PTase inositol polyphosphate-5-phosphatase B protein-coding 126.667-74 chr2 23934393 23934544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5995 NM_181713 165324 Hs.591576 NM_181713 ENSG00000173960 UBXN2A UBXD4 UBX domain protein 2A protein-coding 212.666-85 chr7 121432890 121433094 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36624 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 207.999-3 chr17 44292332 44292490 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 16020 NR_110802 101926996 Hs.666688 NR_110802 RUNDC3A-AS1 - RUNDC3A antisense RNA 1 ncRNA 262-14 chr13 64800560 64800947 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -724742 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 206-108 chr3 31599514 31599786 + 1.33333 NA intron (NM_178862, intron 4 of 15) intron (NM_178862, intron 4 of 15) 66725 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 199.333-81 chr14 71849703 71849918 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -82361 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 250.333-38 chr21 22840195 22840488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -238943 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 242.666-32 chr6 50608475 50608665 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -104974 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 312.666-2 chr11 32721946 32722473 + 1.33333 NA intron (NM_001008391, intron 2 of 17) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 72449 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 194.666-16 chr12 88271110 88271328 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128912 NM_001366579 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 285.333-28 chr19 23447014 23447281 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -31073 NR_126448 104472717 Hs.162105 NR_126448 ENSG00000269416 LINC01224 - long intergenic non-protein coding RNA 1224 ncRNA 375.666-5 chr7 12192794 12193172 + 1.33333 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -18311 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 296.333-39 chr7 77601229 77601559 + 1.33333 NA intron (NM_001131009, intron 7 of 16) AluJr4|SINE|Alu 63351 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 260-24 chr13 89971517 89971766 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 148076 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 155.333-372 chr7 132533244 132533392 + 1.33333 NA intron (NM_181775, intron 2 of 4) intron (NM_181775, intron 2 of 4) 43152 NM_001105543 91584 Hs.511454 NM_020911 ENSG00000221866 PLXNA4 FAYV2820|PLEXA4|PLXNA4A|PLXNA4B|PRO34003 plexin A4 protein-coding 240.666-13 chr13 71159775 71160130 + 1.33333 NA intron (NR_047699, intron 2 of 3) intron (NR_047699, intron 2 of 3) 144811 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 283.333-83 chrX 100945294 100945744 + 1.33333 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -16602 NM_212559 402415 Hs.364911 NM_212559 ENSG00000182489 XKRX XKR2|XPLAC|XRG2 XK related X-linked protein-coding 277.333-84 chr8 103879946 103880372 + 1.33333 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) intron (NR_145711, intron 1 of 21) 60939 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 177.667-51 chr14 92037101 92037277 + 1.33333 NA intron (NM_004239, intron 1 of 20) L2c|LINE|L2 2870 NM_004239 9321 Hs.632339 NM_004239 ENSG00000100815 TRIP11 ACG1A|CEV14|GMAP-210|GMAP210|ODCD|TRIP-11|TRIP230 thyroid hormone receptor interactor 11 protein-coding 168.666-11 chr22 30958373 30958517 + 1.33333 NA intron (NM_001303257, intron 2 of 25) intron (NM_001303257, intron 2 of 25) 9842 NM_001303257 22880 Hs.555918 NM_014941 ENSG00000133422 MORC2 CMT2Z|ZCW3|ZCWCC1 MORC family CW-type zinc finger 2 protein-coding 302.999-4 chr13 26570581 26570988 + 1.33333 NA intron (NM_006646, intron 1 of 9) L1MC4a|LINE|L1 13081 NM_001291965 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 265.333-66 chr5 31940458 31940841 + 1.33333 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) intron (NM_178140, intron 2 of 24) -4490 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 214-125 chr7 33241256 33241509 + 1.33333 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) L1ME4a|LINE|L1 111818 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 177.333-34 chr12 21291637 21291811 + 1.33333 NA intron (NM_021094, intron 11 of 13) MIRc|SINE|MIR 43193 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 262.667-3 chr1 105235766 105236230 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 382937 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 201.333-223 chr5 26134099 26134265 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 904404 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 278-12 chr15 84921411 84921790 + 1.33333 NA intron (NM_001287761, intron 10 of 14) intron (NM_001287761, intron 10 of 14) 36938 NM_001287762 9154 Hs.459187 NM_004213 ENSG00000156222 SLC28A1 CNT1|HCNT1 solute carrier family 28 member 1 protein-coding 226.667-95 chrX 88649477 88649795 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -97589 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 116.667-112 chr21 20192931 20193138 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65651 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 301.667-29 chr3 99728945 99729409 + 1.33333 NA intron (NM_001850, intron 2 of 4) intron (NM_001850, intron 2 of 4) -88685 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 184-44 chr18 11819679 11819857 + 1.33333 NA intron (NM_001369387, intron 4 of 11) intron (NM_001369387, intron 4 of 11) -31645 NM_020412 57132 Hs.656244 NM_020412 ENSG00000255112 CHMP1B C10orf2|C18-ORF2|C18orf2|CHMP1.5|Vps46-2|Vps46B|hVps46-2 charged multivesicular body protein 1B protein-coding 417.332 chr12 129276858 129277201 + 1.33333 NA intron (NM_133448, intron 4 of 8) intron (NM_133448, intron 4 of 8) 68428 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 189.333-61 chr15 86549972 86550149 + 1.33333 NA intron (NM_152336, intron 20 of 24) L1M4a1|LINE|L1 -233092 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 289.333-8 chr10 34011506 34011920 + 1.33333 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -239033 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 273.666-26 chr8 107674029 107674347 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -176270 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 180.333-158 chrX 152515489 152515642 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -64250 NM_000808 2556 Hs.123024 NM_000808 ENSG00000011677 GABRA3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha3 subunit protein-coding 158-135 chr8 6912330 6912506 + 1.33333 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 13658 NM_001926 1671 Hs.711 NM_001926 ENSG00000164822 DEFA6 DEF6|HD-6 defensin alpha 6 protein-coding 279.666 chr1 87867714 87868069 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -496236 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 227.333-115 chr7 38060142 38060312 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -118018 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 226.999-3 chr17 60664154 60664360 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003620, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_003620, exon 6 of 6) -13594 NM_001099432 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 229.333-127 chr9 125288604 125288804 + 1.33333 NA intron (NM_001354297, intron 3 of 27) L2a|LINE|L2 26878 NM_001354293 26130 Hs.42376 NM_015635 ENSG00000165219 GAPVD1 GAPEX5|GAPex-5|RAP6 GTPase activating protein and VPS9 domains 1 protein-coding 256-79 chr5 98058634 98058893 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 102476 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 204-43 chr11 92378822 92379027 + 1.33333 NA intron (NM_001008781, intron 1 of 24) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 26828 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 292.666-36 chr9 128975624 128976095 + 1.33333 NA intron (NM_015354, intron 12 of 43) AluSz|SINE|Alu -28126 NM_014908 22845 Hs.531563 NM_014908 ENSG00000175283 DOLK CDG1M|DK|DK1|SEC59|TMEM15 dolichol kinase protein-coding 368.666-6 chr13 77636655 77637045 + 1.33333 NA intron (NM_003843, intron 28 of 31) intron (NM_003843, intron 28 of 31) 25953 NM_001310140 100129307 NM_001310140 LOC100129307 - putative UPF0607 protein ENSP00000383144 protein-coding 196-80 chr2 13229280 13229464 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -222359 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 276.333-54 chr6 50774083 50774412 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44624 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 383.333-4 chr15 72151106 72151485 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 32892 NM_145204 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 216.333-97 chr3 90535925 90536148 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1428415 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 146-62 chr2 130360991 130361176 + 1.33333 NA intron (NM_014369, intron 5 of 14) L1MEc|LINE|L1 5027 NM_014369 26469 Hs.516390 NM_014369 ENSG00000072135 PTPN18 BDP1|PTP-HSCF protein tyrosine phosphatase non-receptor type 18 protein-coding 240.666-18 chr16 53501737 53502083 + 1.33333 NA intron (NM_022476, intron 1 of 9) intron (NM_022476, intron 1 of 9) 1299 NM_022476 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 251.999-4 chr16 80460106 80460441 + 1.33333 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR -80461 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 389.666-2 chr11 69908277 69908751 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -89098 NM_005247 2248 Hs.37092 NM_005247 ENSG00000186895 FGF3 HBGF-3|INT2 fibroblast growth factor 3 protein-coding 206-10 chr1 110003739 110004017 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001242676) promoter-TSS (NM_001242676) -70 NM_001242675 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 309.666-2 chr1 88691522 88691819 + 1.33333 NA intron (NM_001320708, intron 1 of 20) L1ME3F|LINE|L1 -6466 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 413.333-5 chr16 10637875 10638331 + 1.33333 NA intron (NM_144674, intron 5 of 6) AluJr|SINE|Alu 56827 NM_144674 146279 Hs.143519 NM_144674 ENSG00000153060 TEKT5 CT149 tektin 5 protein-coding 189-22 chr13 85879621 85879808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -80295 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 363.666-4 chr2 66681912 66682363 + 1.33333 NA intron (NR_110156, intron 4 of 5) intron (NR_110156, intron 4 of 5) 21090 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 218-62 chr2 204581905 204582215 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) intron (NM_205863, intron 1 of 21) 36585 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 270.666-24 chr5 50656593 50656817 + 1.33333 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -9226 NM_001178055 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 220.666-27 chr16 24881059 24881233 + 1.33333 NA intron (NR_147940, intron 7 of 14) AluSx1|SINE|Alu 34915 NM_052944 115584 Hs.164118 NM_052944 ENSG00000158865 SLC5A11 KST1|RKST1|SGLT6|SMIT2 solute carrier family 5 member 11 protein-coding 195.666-8 chr11 3777689 3777920 + 1.33333 NA intron (NR_157590, intron 4 of 31) intron (NR_157590, intron 4 of 31) 19742 NR_157591 4928 Hs.524750 NM_005387 ENSG00000110713 NUP98 ADIR2|NUP196|NUP96 nucleoporin 98 protein-coding 210.666-60 chr2 224895236 224895423 + 1.33333 NA intron (NM_001290263, intron 4 of 55) intron (NM_001290263, intron 4 of 55) 51720 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 147-5 chr1 91052765 91052962 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30608 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 189.333-39 chr12 9182145 9182338 + 1.33333 NA intron (NM_002864, intron 13 of 35) intron (NM_002864, intron 13 of 35) 26154 NM_002864 5858 Hs.707491 NM_002864 ENSG00000126838 PZP CPAMD6 PZP alpha-2-macroglobulin like protein-coding 274-38 chr4 47407846 47408140 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 8 of 8) AluJb|SINE|Alu 55709 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 331.333-5 chr1 110286566 110286922 + 1.33333 NA non-coding (NR_036595, exon 4 of 4) non-coding (NR_036595, exon 4 of 4) 52427 NR_036595 440600 Hs.649375 NR_036595 ENSG00000227963 RBM15-AS1 AS-RBM15 RBM15 antisense RNA 1 ncRNA 223.666-27 chr4 123254879 123255129 + 1.33333 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) AluSz6|SINE|Alu -141791 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 273.666-8 chr13 74812579 74812921 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 259907 NR_034025 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 194-149 chr8 127279795 127279979 + 1.33333 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) LTR82B|LTR|ERVL 35250 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 260.333-45 chr4 141767451 141767801 + 1.33333 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 131043 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 191.333-51 chr13 36661898 36662054 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -12044 NM_203451 400120 Hs.422375 NM_203451 ENSG00000180440 SERTM1 C13orf36 serine rich and transmembrane domain containing 1 protein-coding 162-38 chr14 49346659 49346791 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 239655 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 246-73 chr3 189692516 189692878 + 1.33333 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) intron (NM_003722, intron 1 of 13) 61308 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 213.333-4 chr1 36229067 36229236 + 1.33333 NA intron (NM_001321471, intron 2 of 12) AluSc8|SINE|Alu 4708 NM_005119 9967 Hs.744057 NM_005119 ENSG00000054118 THRAP3 BCLAF2|TRAP150 thyroid hormone receptor associated protein 3 protein-coding 359.333-26 chr8 58213465 58213774 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 58482 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 317.666-5 chr16 75128698 75129232 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -12193 NM_194436 197257 Hs.380929 NM_153486 ENSG00000166816 LDHD DLACD|DLD lactate dehydrogenase D protein-coding 250.333-5 chr1 164740466 164740793 + 1.33333 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) L2b|LINE|L2 34012 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 184.667-97 chr5 64207588 64207837 + 1.33333 NA intron (NM_001113561, intron 2 of 7) intron (NM_001113561, intron 2 of 7) 41869 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 200-84 chr2 84251070 84251336 + 1.33333 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -39479 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 219.666-20 chr17 39113428 39113636 + 1.33333 NA intron (NM_020405, intron 2 of 13) intron (NM_020405, intron 2 of 13) 38105 NM_020405 57125 Hs.125036 NM_020405 ENSG00000161381 PLXDC1 TEM3|TEM7 plexin domain containing 1 protein-coding 157.333-305 chr6 54472961 54473123 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 164601 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 276.666-14 chr17 54364559 54364807 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -536008 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 236.666-29 chr2 134208551 134208793 + 1.33333 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) intron (NM_001371457, intron 1 of 16) -45400 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 176-49 chr2 160619274 160619490 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125575 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 200.666-119 chr8 114033319 114033501 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -596471 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 228.666-33 chr3 185857105 185857292 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -32156 NM_006548 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 203-23 chr12 23867231 23867451 + 1.33333 NA intron (NM_001330785, intron 2 of 14) intron (NM_001330785, intron 2 of 14) 82329 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 157.333-11 chr1 77643380 77643565 + 1.33333 NA intron (NM_001308237, intron 1 of 13) intron (NM_001308237, intron 1 of 13) 39186 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 191.333-210 chr8 126117703 126117856 + 1.33333 NA Intergenic (TCTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -166582 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 129.667-46 chr13 26763145 26763274 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -2423 NM_005288 2835 Hs.123034 NM_005288 ENSG00000132975 GPR12 GPCR12|GPCR21|PPP1R84 G protein-coupled receptor 12 protein-coding 266.666-11 chr12 129378175 129378458 + 1.33333 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) intron (NM_133448, intron 3 of 8) 169715 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 217-9 chr10 10230935 10231221 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 172356 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 333.333-30 chr2 163512938 163513332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 222873 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 198.666-97 chr8 125907364 125907583 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43724 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 214.667-37 chr12 120335049 120335369 + 1.33333 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -7430 NM_000928 5319 Hs.992 NM_000928 ENSG00000170890 PLA2G1B PLA2|PLA2A|PPLA2 phospholipase A2 group IB protein-coding 252.333-60 chr5 112796232 112796570 + 1.33333 NA intron (NM_001354895, intron 7 of 15) intron (NM_001354895, intron 7 of 15) 58516 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 126.667-160 chr6 155797031 155797182 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -149691 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 179.667-94 chr3 181759399 181759666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47607 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 204.666-90 chr7 87554603 87554802 + 1.33333 NA intron (NM_001348944, intron 10 of 29) intron (NM_001348944, intron 10 of 29) 46182 NM_001348946 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 252.999-5 chr6 53342579 53342887 + 1.33333 NA intron (NM_001242830, intron 1 of 6) intron (NM_001242830, intron 1 of 6) -5116 NR_046241 647190 Hs.520189 NR_046241 RPS16P5 RPS16_3_702 ribosomal protein S16 pseudogene 5 pseudo 253.333-33 chr15 83438302 83438568 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8793 NR_136711 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 185.666-20 chr5 166198842 166199065 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 727417 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 194.666-75 chr8 130700114 130700361 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -256563 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 296.667-20 chr16 77415153 77415567 + 1.33333 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) intron (NM_199355, intron 3 of 22) 19674 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 218-66 chr20 11595384 11595599 + 1.33333 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 275224 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 258.666-51 chrX 79571943 79572299 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -204569 NM_001171581 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 290.666-11 chr15 56676748 56677154 + 1.33333 NA intron (NM_001002843, intron 11 of 20) intron (NM_001002843, intron 11 of 20) 57135 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 210.333-145 chr6 62181268 62181546 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) L1MA10|LINE|L1 104818 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 208-80 chr2 70973509 70973732 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -4825 NM_001369683 79998 Hs.512744 NM_024933 ENSG00000144031 ANKRD53 - ankyrin repeat domain 53 protein-coding 292-38 chr4 123104722 123105124 + 1.33333 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 181845 NM_145207 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 272.333-39 chr21 28996143 28996477 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3433 NM_001320766 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 194.667-111 chr4 76495883 76496146 + 1.33333 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) L2|LINE|L2 60785 NM_020859 57619 Hs.683808 NM_020859 ENSG00000138771 SHROOM3 APXL3|MSTP013|SHRM|ShrmL shroom family member 3 protein-coding 196.666-86 chr5 134394167 134394337 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17629 NM_080656 91368 Hs.156506 NM_080656 ENSG00000237190 CDKN2AIPNL C2AIL CDKN2A interacting protein N-terminal like protein-coding 197-16 chr10 37592947 37593157 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9879 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 213.666-48 chr9 27518408 27518698 + 1.33333 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) intron (NM_024761, intron 1 of 3) -5761 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 201.666-47 chr8 139584871 139585061 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 118157 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 235.333-129 chr8 142956248 142956462 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38512 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 203.666-50 chr6 90107862 90108026 + 1.33333 NA intron (NM_021813, intron 4 of 8) intron (NM_021813, intron 4 of 8) 188899 NM_021813 60468 Hs.269764 NM_021813 ENSG00000112182 BACH2 BTBD25|IMD60 BTB domain and CNC homolog 2 protein-coding 204-32 chr10 114828161 114828460 + 1.33333 NA intron (NM_001135051, intron 1 of 16) intron (NM_001135051, intron 1 of 16) 6530 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 182-101 chr7 71844064 71844253 + 1.33333 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 493233 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 289.333-43 chr4 98923556 98923940 + 1.33333 NA intron (NM_001331017, intron 1 of 7) intron (NM_001331017, intron 1 of 7) 5385 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 303.333-71 chr7 111813088 111813585 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 27 of 52) intron (NM_001363540, intron 27 of 52) 4831 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 256.666-2 chr1 63228348 63228554 + 1.33333 NA intron (NR_038252, intron 4 of 11) intron (NR_038252, intron 4 of 11) 88806 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 277.333-55 chr20 51919487 51919747 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56704 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 205 chr1 10965005 10965265 + 1.33333 NA intron (NM_001366227, intron 2 of 10) intron (NM_001366227, intron 2 of 10) 1552 NM_001366227 148345 Hs.127026 NM_173507 ENSG00000175262 C1orf127 - chromosome 1 open reading frame 127 protein-coding 205.333-115 chr2 22828977 22829165 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 292592 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 231.667-47 chr4 30527509 30527828 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -192701 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 251-11 chr11 107571869 107572224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6311 NM_138775 91801 Hs.503763 NM_138775 ENSG00000137760 ALKBH8 ABH8|TRM9|TRMT9|TRMT9A alkB homolog 8, tRNA methyltransferase protein-coding 300.333-2 chr1 189735464 189735786 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 740385 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 124-84 chr4 32580888 32581051 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 229931 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 292.667-21 chr20 57036121 57036490 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -177391 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 158.667-261 chr5 19267099 19267298 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 619074 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 371.667-5 chr2 165689170 165689526 + 1.33333 NA TTS (NM_001172173) TTS (NM_001172173) 104899 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 205.333-106 chr18 13050967 13051132 + 1.33333 NA intron (NM_032142, intron 17 of 44) L1M7|LINE|L1 59687 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 227.333-88 chr4 62757547 62757727 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -595872 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 197.333-30 chr11 27189418 27189635 + 1.33333 NA intron (NR_125767, intron 2 of 4) intron (NR_125767, intron 2 of 4) 29242 NR_125768 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 307.333-62 chr4 31281941 31282315 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 110984 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 189.667-142 chr8 86713045 86713288 + 1.33333 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) L1M5|LINE|L1 30509 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 314-51 chr8 118079827 118080185 + 1.33333 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 31813 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 203-52 chr2 52480889 52481156 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 110374 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 130.333-51 chr12 17574077 17574233 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14923 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 245-40 chr2 188815009 188815530 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -25146 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 267-51 chr4 80666450 80666808 + 1.33333 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) 330909 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 142-73 chr20 42082601 42082785 + 1.33333 NA intron (NM_133170, intron 30 of 31) intron (NM_133170, intron 30 of 31) -464316 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 367.667-13 chr4 31279872 31280309 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 108946 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 297-10 chr10 33648833 33649288 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 123620 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 203.333-280 chr9 86713271 86713563 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 234089 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 246.667-99 chr8 109232900 109233315 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 96826 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 204-119 chr21 17956978 17957179 + 1.33333 NA intron (NM_001204177, intron 1 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 39738 NM_001204175 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 195.333-124 chr2 187717274 187717546 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -162905 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 239-27 chr18 25023150 25023388 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -35290 NR_146903 105372030 NR_146903 LINC01894 - long intergenic non-protein coding RNA 1894 ncRNA 238.666-7 chr10 76067723 76067930 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 285065 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 380-5 chr11 81161078 81161498 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -398485 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 150.333-298 chr4 45399159 45399306 + 1.33333 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -672598 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 202.666-116 chr7 32930534 32930811 + 1.33333 NA intron (NR_003500, intron 2 of 5) intron (NR_003500, intron 2 of 5) 12498 NR_003500 441212 Hs.648086 NM_001039754 ENSG00000205763 RP9P - RP9 pseudogene pseudo 208-160 chr7 85411942 85412250 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9026 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 121.666-5 chr3 151110673 151110815 + 1.33333 NA intron (NM_053002, intron 1 of 42) intron (NM_053002, intron 1 of 42) 23946 NM_053002 116931 Hs.744234 NM_053002 ENSG00000144893 MED12L NOPAR|TNRC11L|TRALP|TRALPUSH mediator complex subunit 12L protein-coding 213.333-180 chr6 119439167 119439389 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 52024 NR_046100 285762 Hs.571063 NR_046100 LOC285762 - uncharacterized LOC285762 ncRNA 192.333-28 chr11 28432329 28432507 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45130 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 252.333-8 chr10 24375037 24375453 + 1.33333 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) -74169 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 188-82 chr4 81673324 81673588 + 1.33333 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -201549 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 201.333-37 chr10 82769611 82769835 + 1.33333 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -536803 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 132-86 chr3 159370631 159370733 + 1.33333 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) MLT2B3|LTR|ERVL 88036 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 281.667-57 chr9 27561409 27561762 + 1.33333 NA exon (NM_018325, exon 5 of 11) exon (NM_018325, exon 5 of 11) 11896 NM_018325 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 199.666-20 chr2 12022445 12022650 + 1.33333 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) intron (NR_110196, intron 2 of 5) 15431 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 176.333-151 chr7 7240911 7241103 + 1.33333 NA intron (NM_020156, intron 3 of 3) intron (NM_020156, intron 3 of 3) -14147 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 184-6 chr1 81572714 81572942 + 1.33333 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) MER103C|DNA|hAT-Charlie -15126 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 220.666-34 chr2 76376188 76376489 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -609627 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 169.333-268 chr8 83236049 83236237 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -167615 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 197.333-117 chr2 129325459 129325706 + 1.33333 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -51691 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 231.666-25 chr4 123351389 123351760 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -45221 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 238-19 chr14 22502654 22502993 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19864 NR_148361 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 253.667-30 chr2 100758490 100758758 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -61515 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 292-30 chr2 146169445 146169789 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -417440 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 130-122 chr7 87707168 87707277 + 1.33333 NA intron (NM_001348945, intron 1 of 31) L1MEg|LINE|L1 6101 NM_000927 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 248-2 chr1 75900055 75900418 + 1.33333 NA intron (NM_002440, intron 19 of 19) MIRb|SINE|MIR 32168 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 245-53 chr5 25717481 25717813 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 526694 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 322.333-26 chr5 123901768 123902238 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 356586 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 215.667-13 chr10 25419800 25420106 + 1.33333 NA intron (NM_020752, intron 4 of 10) L1MC1|LINE|L1 -231759 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 167.333-201 chr4 179732527 179732661 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1426555 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 200.333-132 chr6 51208298 51208543 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 389549 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 198-113 chr3 6420416 6420658 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 384912 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 209-40 chr13 68215178 68215473 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 670000 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 144.667-24 chr10 29051450 29051616 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 205125 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 180-43 chr17 67530463 67530711 + 1.33333 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -59002 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 283.333-47 chr3 44612305 44612628 + 1.33333 NA intron (NM_001351734, intron 2 of 6).2 L1MA5|LINE|L1 12331 NR_046658 100874094 NR_046658 ENSG00000233509 ZNF197-AS1 - ZNF197 antisense RNA 1 ncRNA 219.333-58 chr15 62832157 62832407 + 1.33333 NA intron (NM_015059, intron 51 of 55) L1MB4|LINE|L1 8325 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 202-92 chr2 153758001 153758190 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -113827 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 253.333-57 chr2 173749316 173749613 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 214416 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 203-118 chr9 101662826 101663017 + 1.33333 NA intron (NM_133445, intron 3 of 8) intron (NM_133445, intron 3 of 8) -67952 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 213.333-181 chr6 137935679 137936057 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 9932 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 210-61 chr2 50903480 50903789 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 128498 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 210.667-135 chr9 86934427 86934706 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 12940 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 129.333-154 chr5 66265434 66265576 + 1.33333 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -56059 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 190.667-101 chr5 58942577 58942828 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 57196 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 212-43 chr12 113222672 113222940 + 1.33333 NA intron (NM_017901, intron 1 of 27) MER30B|DNA|hAT-Charlie 1342 NM_001143819 53373 Hs.524763 NM_017901 ENSG00000186815 TPCN1 TPC1 two pore segment channel 1 protein-coding 266.666-4 chr1 202991887 202992297 + 1.33333 NA intron (NR_036557, intron 1 of 4) intron (NR_036557, intron 1 of 4) 15173 NR_036557 100506747 Hs.642024 NR_036557 LOC100506747 - alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog pseudo 415.333-10 chr5 20690903 20691533 + 1.33333 NA intron (NR_149120, intron 3 of 11) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -75683 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 393.333-2 chr1 192069733 192070256 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR -88468 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 185.333-188 chr8 103383981 103384206 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 11586 NM_001256099 115908 Hs.405614 NM_138455 ENSG00000164932 CTHRC1 - collagen triple helix repeat containing 1 protein-coding 134.667-38 chr11 93225719 93225849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27793 NM_152313 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 218.333-76 chr20 5632315 5632497 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -21400 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 323.666 chr10 17473557 17473965 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -19166 NR_144322 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 174-94 chr8 21818362 21818514 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -29563 NM_001495 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 220-18 chr10 117515449 117515765 + 1.33333 NA intron (NR_002791, intron 2 of 3) intron (NR_002791, intron 2 of 3) -26838 NM_001165924 2018 Hs.202095 NM_004098 ENSG00000170370 EMX2 - empty spiracles homeobox 2 protein-coding 180.666-4 chr10 64326206 64326374 + 1.33333 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -499238 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 415.333-7 chr4 53012160 53012690 + 1.33333 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 150108 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 238.333-5 chr1 215807966 215808369 + 1.33333 NA intron (NM_206933, intron 49 of 71) intron (NM_206933, intron 49 of 71) 240863 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 284.666-9 chr16 55997675 55998063 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -41838 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 202.666-63 chr2 100969650 100969886 + 1.33333 NA intron (NM_002518, intron 11 of 20) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 7393 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 175-4 chr1 86082981 86083130 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 7 of 59) AluY|SINE|Alu 73416 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 196-91 chr2 158079192 158079483 + 1.33333 NA intron (NM_001135098, intron 2 of 8) intron (NM_001135098, intron 2 of 8) -22533 NM_173355 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 272.333-32 chr2 70379516 70379814 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -77598 NM_001329755 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 219.333-156 chr6 55302900 55303080 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -24479 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 337.666-11 chr7 16283774 16284156 + 1.33333 NA intron (NR_160656, intron 3 of 7) intron (NR_160656, intron 3 of 7) 73479 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 142.666-8 chr14 63175962 63176120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28402 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 192.667-47 chr12 20232426 20232684 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -104654 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 164.667-237 chr8 89013082 89013325 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -685720 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 218.333-93 chr4 54549459 54549637 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57583 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 238.666-22 chr2 32143339 32143610 + 1.33333 NA intron (NM_001363875, intron 13 of 15) (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -22367 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 192-152 chr8 138433699 138433859 + 1.33333 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 63482 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 342.333-27 chr7 19760877 19761234 + 1.33333 NA intron (NM_001366627, intron 1 of 4) intron (NM_001366627, intron 1 of 4) 11726 NM_152774 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 304.333-22 chr22 24105664 24106114 + 1.33333 NA intron (NM_012295, intron 26 of 36) intron (NM_012295, intron 26 of 36) -75598 NM_019601 56241 Hs.131819 NM_019601 ENSG00000099994 SUSD2 BK65A6.2|W5C5 sushi domain containing 2 protein-coding 199-113 chr8 61669582 61669818 + 1.33333 NA intron (NM_020164, intron 4 of 5) intron (NM_020164, intron 4 of 5) 20111 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 287.333-48 chr5 29481876 29482195 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -86059 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 209.333-77 chr15 73525294 73525504 + 1.33333 NA intron (NM_001348772, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 44144 NR_103844 101241892 Hs.656678 NR_103844 ENSG00000281183 NPTN-IT1 lncRNA-LET NPTN intronic transcript 1 ncRNA 382-10 chr5 42041801 42042357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 116798 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 184.666-11 chr14 89150171 89150373 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 266961 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 336.999-3 chr5 22430488 22430985 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) intron (NM_004061, intron 2 of 14) -216886 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 196.333-139 chr5 25504071 25504232 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 313198 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 330.333-12 chr4 140456567 140456991 + 1.33333 NA intron (NM_001277353, intron 8 of 10) intron (NM_001277353, intron 8 of 10) -29118 NM_001130675 1047 Hs.86368 NM_004362 ENSG00000153132 CLGN - calmegin protein-coding 190.666-33 chr3 38122585 38122734 + 1.33333 NA TTS (NM_001607) TTS (NM_001607) 14468 NM_001607 30 Hs.643487 NM_001607 ENSG00000060971 ACAA1 ACAA|PTHIO|THIO acetyl-CoA acyltransferase 1 protein-coding 187-72 chr6 89851456 89851839 + 1.33333 NA intron (NM_012115, intron 2 of 9) L1MEb|LINE|L1 21747 NM_012115 9994 Hs.558218 NM_012115 ENSG00000118412 CASP8AP2 CED-4|FLASH|RIP25 caspase 8 associated protein 2 protein-coding 199.333-124 chr2 53154736 53154969 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -452237 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 201-84 chr4 90991526 90991808 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 756636 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 191.666-24 chr8 87496944 87497132 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 376977 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 197.333-16 chr10 17169786 17169999 + 1.33333 NA intron (NM_001321007, intron 2 of 11) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 31780 NM_001321006 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 138.333-192 chr8 18503685 18503877 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 112499 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 269.333-85 chr8 33068953 33069227 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 347255 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 215.666-24 chr21 16743989 16744195 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 153855 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 278.667-56 chr9 112015744 112016086 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83815 NR_039814 100616114 NR_039814 ENSG00000266315 MIR4668 mir-4668 microRNA 4668 ncRNA 190-85 chr4 30489396 30489554 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -230894 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 268.666-7 chr11 76879076 76879509 + 1.33333 NA intron (NM_001300953, intron 1 of 9) L1ME2z|LINE|L1 18374 NM_001300953 55331 Hs.23862 NM_018367 ENSG00000078124 ACER3 APHC|PHCA|PLDECO alkaline ceramidase 3 protein-coding 173.333-223 chrX 85043154 85043344 + 1.33333 NA intron (NM_198450, intron 1 of 8) intron (NM_198450, intron 1 of 8) 39372 NM_198450 139322 Hs.512181 NM_198450 ENSG00000155008 APOOL CXorf33|FAM121A|MICOS27|Mic27|UNQ8193 apolipoprotein O like protein-coding 284-18 chr15 51967137 51967491 + 1.33333 NA intron (NM_001323904, intron 1 of 11) AluSz6|SINE|Alu 4464 NM_001323904 123169 Hs.567662 NM_138792 ENSG00000166477 LEO1 RDL LEO1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 269.666-18 chr9 70385112 70385524 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001206, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001206, exon 2 of 2) 29339 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 126-96 chr5 164543275 164543396 + 1.33333 NA TTS (NR_105065) TTS (NR_105065) 73056 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 172-108 chr8 29802430 29802682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25948 NR_125817 101929470 Hs.204721 NR_125817 ENSG00000248964 LOC101929470 - uncharacterized LOC101929470 ncRNA 189.333-42 chr12 47940325 47940543 + 1.33333 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -23113 NM_024056 79022 Hs.596726 NM_024056 ENSG00000134291 TMEM106C - transmembrane protein 106C protein-coding 193.333-9 chr1 154486813 154487089 + 1.33333 NA intron (NM_001010846, intron 3 of 5) intron (NM_001010846, intron 3 of 5) -15268 NM_001098475 126668 Hs.387671 NM_182499 ENSG00000163239 TDRD10 - tudor domain containing 10 protein-coding 168.333-64 chr15 70678936 70679186 + 1.33333 NA intron (NM_018003, intron 10 of 18) intron (NM_018003, intron 10 of 18) 23221 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 347.666-6 chr2 187936395 187936978 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 351005 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 297.333-12 chr11 113030920 113031187 + 1.33333 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -67593 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 314-2 chr1 166520051 166520459 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30216 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 314.999-5 chr8 93988297 93988761 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 71582 NM_001161779 54704 Hs.22265 NM_018444 ENSG00000164951 PDP1 PDH|PDP|PDPC|PPM2A|PPM2C pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 protein-coding 412.332 chr10 64491429 64491756 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -333936 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 170-121 chr8 111951269 111951486 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 574738 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 226.333-50 chr18 9567791 9568007 + 1.33333 NA intron (NR_052003, intron 10 of 19) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 46660 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 144-84 chr20 16760275 16760439 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12004 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 206.666-89 chr4 72767075 72767238 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -197935 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 122.333-52 chr13 101284364 101284485 + 1.33333 NA intron (NM_001350749, intron 9 of 43) intron (NM_001350749, intron 9 of 43) 132084 NM_001350748 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 251.666-26 chr6 109698999 109699270 + 1.33333 NA intron (NM_014845, intron 1 of 22) L1M5|LINE|L1 7913 NM_014845 9896 Hs.529959 NM_014845 ENSG00000112367 FIG4 ALS11|BTOP|CMT4J|KIAA0274|SAC3|YVS|dJ249I4.1 FIG4 phosphoinositide 5-phosphatase protein-coding 351.999 chr4 112256023 112256327 + 1.33333 NA intron (NM_018569, intron 3 of 9) intron (NM_018569, intron 3 of 9) 24388 NM_018569 55435 Hs.435991 NM_018569 ENSG00000138660 AP1AR 2C18|C4orf16|GBAR|PRO0971|gamma-BAR adaptor related protein complex 1 associated regulatory protein protein-coding 385.333-13 chr14 62573096 62573579 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -433364 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 329.333-26 chr2 191778830 191779360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13745 NR_157850 729254 NR_157850 LOC729254 - hCG2045843 ncRNA 307.333-15 chr10 125317124 125317646 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -156355 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 185.333-166 chr6 66058256 66058511 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 270504 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 589-2 chr3 17667274 17668135 + 1.33333 NA intron (NM_001134381, intron 1 of 23) AluJb|SINE|Alu 32316 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 114.333-55 chr12 55015295 55015451 + 1.33333 NA Intergenic (TGTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4601 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 200.666-49 chr18 2681957 2682161 + 1.33333 NA intron (NM_015295, intron 5 of 47) intron (NM_015295, intron 5 of 47) 26172 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 202-5 chr1 90969484 90969701 + 1.33333 NA intron (NM_201269, intron 2 of 5) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 51916 NM_016620 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 140.666-9 chr7 29206730 29206849 + 1.33333 NA intron (NR_120522, intron 1 of 2) L1MB8|LINE|L1 2181 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 115.333-168 chr5 28422668 28422842 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -135090 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 212.666-70 chr5 82524461 82524653 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 245095 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 236.666-4 chr10 32078053 32078339 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21771 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 206.666-57 chr2 55288170 55288347 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018084, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_018084, exon 32 of 32) 5939 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 200.667-54 chr16 61245142 61245444 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -189527 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 222.333-44 chr2 65145817 65146039 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15627 NM_015543 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 232.666-11 chr13 104582724 104582940 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -883035 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 201-68 chr20 53425529 53425772 + 1.33333 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) MER58B|DNA|hAT-Charlie -127120 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 234.667-17 chr11 69367577 69367918 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57908 NM_001319657 102724265 Hs.448669 NM_001319657 LOC102724265 - uncharacterized LOC102724265 protein-coding 221.333-34 chr13 96702417 96702688 + 1.33333 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) 275323 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 223.333-107 chr3 106483134 106483416 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -613874 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 160-21 chr10 108983174 108983399 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -913993 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 212.333-14 chr10 8113900 8114066 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59295 NM_001002295 2625 Hs.524134 NM_002051 ENSG00000107485 GATA3 HDR|HDRS GATA binding protein 3 protein-coding 332-27 chr4 105603470 105603821 + 1.33333 NA intron (NM_001242729, intron 2 of 13) LTR78|LTR|ERV1 42054 NR_046840 100874374 Hs.668908 NR_046840 ENSG00000249885 ARHGEF38-IT1 - ARHGEF38 intronic transcript 1 ncRNA 204.666-9 chr1 230078189 230078409 + 1.33333 NA intron (NM_004481, intron 1 of 15) L1MC5a|LINE|L1 11061 NM_004481 2590 Hs.743964 NM_004481 ENSG00000143641 GALNT2 GalNAc-T2 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 203.333-196 chr4 105498166 105498334 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -24180 NM_006903 27068 Hs.654957 NM_006903 ENSG00000138777 PPA2 HSPC124|SCFAI|SCFI|SID6-306 pyrophosphatase (inorganic) 2 protein-coding 227.333-40 chr15 78191035 78191228 + 1.33333 NA intron (NM_015162, intron 5 of 13) L1MEf|LINE|L1 41769 NM_005530 3419 Hs.591110 NM_005530 ENSG00000166411 IDH3A - isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 alpha protein-coding 290.666-14 chr2 28003627 28003893 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 5 of 13) intron (NM_199193, intron 5 of 13) 7393 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 227.333-31 chr12 65411968 65412227 + 1.33333 NA intron (NM_001031679, intron 5 of 6) intron (NM_001031679, intron 5 of 6) 133110 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 332.333 chr1 66609451 66609753 + 1.33333 NA intron (NM_001350218, intron 1 of 22) intron (NM_001350218, intron 1 of 22) -18838 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 246.333-86 chr6 14312445 14312661 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27099 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 219.666-8 chr11 86712234 86712478 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -39720 NM_001161586 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 171.667-140 chr5 164109382 164109558 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 357932 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 213.667-10 chr1 220772854 220773165 + 1.33333 NA intron (NM_001331042, intron 4 of 4) MER21C|LTR|ERVL -13904 NM_022746 64757 Hs.497816 NM_022746 ENSG00000186205 MARC1 MOSC1 mitochondrial amidoxime reducing component 1 protein-coding 266-81 chr8 79502133 79502543 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -108779 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 159.333-58 chr11 22576205 22576349 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49564 NM_022725 2188 Hs.632151 NM_022725 ENSG00000183161 FANCF FAF FA complementation group F protein-coding 204.666-40 chr2 138432219 138432432 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -69445 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 238.666-15 chr12 91007282 91007556 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -2447 NM_004950 1833 Hs.435680 NM_004950 ENSG00000083782 EPYC DSPG3|PGLB|Pg-Lb|SLRR3B epiphycan protein-coding 470.333 chr10 57609108 57609600 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -304795 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 392.333-11 chr7 51096773 51097286 + 1.33333 NA intron (NM_015198, intron 6 of 12) L1MB2|LINE|L1 219780 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 212-91 chr2 149867321 149867620 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -8279 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 296.333-4 chr1 158356652 158356975 + 1.33333 NA exon (NM_001042585, exon 6 of 6) exon (NM_001042585, exon 6 of 6) 2919 NM_001185108 913 Hs.249217 NM_030893 ENSG00000158488 CD1E CD1A|R2 CD1e molecule protein-coding 223.333-42 chr15 57567380 57567618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24405 NR_104370 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 263.667-76 chr7 87425665 87426010 + 1.33333 NA intron (NM_018849, intron 16 of 27) AluJb|SINE|Alu 49843 NM_018849 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 312.667-37 chr7 4530391 4530815 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -151692 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 189.666-3 chr10 30115201 30115368 + 1.33333 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) intron (NM_001350022, intron 1 of 4) 210 NM_001350021 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 208.666-17 chr10 55213888 55214079 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1M5|LINE|L1 -385059 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 261.333-75 chr4 73048164 73048407 + 1.33333 NA Intergenic LTR47B3|LTR|ERVL 21431 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 230.333-86 chr4 143613691 143613972 + 1.33333 NA intron (NM_001168235, intron 5 of 7) intron (NM_001168235, intron 5 of 7) 54359 NR_003675 441046 Hs.135705 NM_001011539 ENSG00000236296 GUSBP5 GYPELOC441046 GUSB pseudogene 5 pseudo 354.999-3 chr7 20020506 20020798 + 1.33333 NA intron (NR_110114, intron 3 of 5) HAL1|LINE|L1 119774 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 282-9 chr12 78590862 78591185 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -231277 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 204-26 chr10 56372934 56373161 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11774 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 229.333-36 chr14 63172719 63173044 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -31562 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 331.999-3 chr2 224296463 224296764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 105381 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 198.666-78 chr5 88399484 88399713 + 1.33333 NA intron (NR_105020, intron 1 of 2) intron (NR_105020, intron 1 of 2) 7403 NR_105020 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 183-76 chr3 80017281 80017476 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -249380 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 287.333-56 chr5 104798514 104798830 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -300802 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 237.333-133 chr9 104612855 104613084 + 1.33333 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 5235 NM_001001956 286362 Hs.553682 NM_001001956 ENSG00000136839 OR13C9 OR37L|OR9-13 olfactory receptor family 13 subfamily C member 9 protein-coding 211.333-192 chr5 118198929 118199112 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -83554 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 273.333-40 chr22 28497496 28497895 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) HAL1|LINE|L1 37826 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 292.667-39 chr6 155720235 155720611 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 205579 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 233.333-116 chr7 1847309 1847523 + 1.33333 NA intron (NM_001013837, intron 18 of 18) intron (NM_001013837, intron 18 of 18) -3163 NR_039799 100616160 NR_039799 ENSG00000265089 MIR4655 - microRNA 4655 ncRNA 221.333-131 chr7 29853681 29853883 + 1.33333 NA intron (NM_001080529, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 47228 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 307.333-8 chr1 244337921 244338341 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -14504 NM_001012970 200159 Hs.442703 NM_001012970 ENSG00000173728 C1orf100 - chromosome 1 open reading frame 100 protein-coding 167-6 chr1 186384051 186384410 + 1.33333 NA intron (NM_001164246, intron 3 of 12) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 8392 NM_017847 54953 Hs.371210 NM_017847 ENSG00000157181 ODR4 C1orf27|TTG1|odr-4 odr-4 GPCR localization factor homolog protein-coding 310.667-18 chr2 99156215 99156598 + 1.33333 NA non-coding (NR_037935, exon 3 of 4) non-coding (NR_037935, exon 3 of 4) 1332 NM_001204830 51601 Hs.719172 NM_015929 ENSG00000144182 LIPT1 LIPT1D lipoyltransferase 1 protein-coding 203.333-283 chr9 109239772 109240075 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018424, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_018424, exon 16 of 16) -72632 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 288.666-10 chr15 85669354 85669676 + 1.33333 NA intron (NM_007200, intron 13 of 36) MIRb|SINE|MIR 49565 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 328-8 chr12 12423601 12423946 + 1.33333 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 AluSx1|SINE|Alu 66695 NM_001330356 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 190.667-52 chr16 29013132 29013370 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 28199 NM_001014988 27040 Hs.632179 NM_014387 ENSG00000213658 LAT IMD52|LAT1|pp36 linker for activation of T cells protein-coding 146.667-178 chr2 153738775 153738956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133057 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 360.333-4 chr10 89678510 89678870 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 19238 NR_026835 283011 Hs.679445 NR_026835 FLJ37201 - tigger transposable element derived 2 pseudogene pseudo 244-90 chr6 97788643 97788991 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -235714 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 220-105 chr6 139103672 139103982 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -31253 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 196.667-112 chr4 155350826 155351117 + 1.33333 NA intron (NM_001039580, intron 13 of 13) L1M5|LINE|L1 -3245 NR_125937 102724776 Hs.61271 NR_125937 ENSG00000250910 LOC102724776 - uncharacterized LOC102724776 ncRNA 351.666-5 chr2 12102666 12102957 + 1.33333 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) intron (NR_110196, intron 2 of 5) 95695 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 259.667-87 chr8 114992349 114992736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 675471 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 314.666-6 chr1 110308501 110308878 + 1.33333 NA intron (NR_036595, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 30482 NR_036595 440600 Hs.649375 NR_036595 ENSG00000227963 RBM15-AS1 AS-RBM15 RBM15 antisense RNA 1 ncRNA 133.667-83 chr2 237235104 237235314 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 149320 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 178-21 chr10 130140509 130140814 + 1.33333 NA intron (NM_006541, intron 1 of 10) intron (NM_006541, intron 1 of 10) 4252 NM_001321980 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 206.666-104 chr6 69757605 69757868 + 1.33333 NA intron (NM_001367272, intron 3 of 15) intron (NM_001367272, intron 3 of 15) 38730 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 229-73 chr9 27051660 27051919 + 1.33333 NA intron (NM_025103, intron 16 of 19) L1MB2|LINE|L1 -46117 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 195-86 chr5 74088806 74088978 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 219433 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 201.333-54 chr11 71960968 71961251 + 1.33333 NA intron (NM_018320, intron 3 of 8) intron (NM_018320, intron 3 of 8) 32063 NM_018320 55298 Hs.368554 NM_018320 ENSG00000137522 RNF121 - ring finger protein 121 protein-coding 272.333-13 chr13 75872786 75873243 + 1.33333 NA intron (NM_001257995, intron 1 of 3) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 1976 NM_001257995 729420 Hs.586820 NM_001257995 LMO7DN C13orf45 LMO7 downstream neighbor protein-coding 198.667-153 chr5 127847389 127847657 + 1.33333 NA intron (NM_001317938, intron 5 of 6) intron (NM_001317938, intron 5 of 6) 144134 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 267.333-21 chr12 28422237 28422609 + 1.33333 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) intron (NM_001352082, intron 9 of 13) -231685 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 303.333-74 chr8 99120481 99120733 + 1.33333 NA intron (NR_047582, intron 8 of 8) intron (NR_047582, intron 8 of 8) 107341 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 196-6 chr1 99567838 99568036 + 1.33333 NA intron (NR_031666, intron 1 of 4) L1MDa|LINE|L1 -78176 NM_017734 54873 Hs.483993 NM_017734 ENSG00000099260 PALMD C1orf11|PALML palmdelphin protein-coding 390.666 chr10 28809272 28809789 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -13480 NR_038374 100507605 Hs.119207 NR_038374 ENSG00000235824 LINC00837 - long intergenic non-protein coding RNA 837 ncRNA 187.333-121 chr22 41028433 41028773 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 45118 NR_132979 106635682 NR_132979 SNORD140 - small nucleolar RNA, C/D box 140 snoRNA 177.333-160 chr8 10208418 10208562 + 1.33333 NA intron (NM_001135670, intron 2 of 4) intron (NM_001135670, intron 2 of 4) 112839 NM_001135671 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 268.333-8 chr10 58279300 58279663 + 1.33333 NA intron (NM_018464, intron 2 of 2) intron (NM_018464, intron 2 of 2) 10319 NM_018464 55847 Hs.370102 NM_018464 ENSG00000122873 CISD1 C10orf70|MDS029|ZCD1|mitoNEET CDGSH iron sulfur domain 1 protein-coding 316.666-9 chr18 73027223 73027858 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 158500 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 204-116 chr20 48440290 48440532 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 80500 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 182.667-63 chr17 75331368 75331616 + 1.33333 NA intron (NM_002086, intron 3 of 5) intron (NM_002086, intron 3 of 5) -42043 NM_021734 60386 Hs.514470 NM_021734 ENSG00000125454 SLC25A19 DNC|MCPHA|MUP1|THMD3|THMD4|TPC solute carrier family 25 member 19 protein-coding 303.666-4 chr10 109408575 109409135 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 514391 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 199.333-120 chr2 50107571 50107764 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) -133464 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 171.666-9 chrX 20501390 20501538 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -234555 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 249.333-46 chr18 33647442 33647758 + 1.33333 NA intron (NM_030632, intron 4 of 11) intron (NM_030632, intron 4 of 11) 69381 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 242.666-6 chr1 146031857 146032173 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10193 NM_213653 148738 Hs.632436 NM_145277 ENSG00000168509 HJV HFE2|HFE2A|JH|RGMC hemojuvelin BMP co-receptor protein-coding 198.666-87 chr7 86463635 86463875 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -180154 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 248.333-27 chr13 71643348 71643682 + 1.33333 NA intron (NM_080759, intron 2 of 10) intron (NM_080759, intron 2 of 10) 223677 NM_004392 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 209.333-20 chr10 38132947 38133227 + 1.33333 NA intron (NM_001324258, intron 6 of 6) L1MB4|LINE|L1 38750 NM_001324245 7587 Hs.292575 NM_003421 ENSG00000075407 ZNF37A KOX21|ZNF37 zinc finger protein 37A protein-coding 250.333-76 chr8 111383869 111384115 + 1.33333 NA intron (NR_146282, intron 1 of 3) L1PB3|LINE|L1 7353 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 226.667-14 chr10 7167396 7167689 + 1.33333 NA intron (NM_001029880, intron 20 of 20) intron (NM_001029880, intron 20 of 20) 19242 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 301.333-54 chr8 101530583 101531048 + 1.33333 NA intron (NM_001330593, intron 1 of 15) intron (NM_001330593, intron 1 of 15) 38376 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 317-17 chr3 105934395 105934665 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65129 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 151.666-5 chr4 31481993 31482172 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -24462 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 201-92 chr5 64779123 64779334 + 1.33333 NA intron (NM_001297645, intron 2 of 10) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 10298 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 209-26 chr12 1983171 1983418 + 1.33333 NA intron (NM_152640, intron 3 of 8) L1MEf|LINE|L1 21163 NM_001319292 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 372.667-8 chr2 50246309 50246810 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 101195 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 208.667-21 chr10 63920374 63920668 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -398631 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 205.333-240 chr8 76746708 76746978 + 1.33333 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) intron (NM_024721, intron 3 of 10) -63568 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 275-22 chr19 54003032 54003525 + 1.33333 NA intron (NM_145814, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 10990 NM_145814 59285 Hs.631560 NM_031897 ENSG00000130433 CACNG6 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 6 protein-coding 329.999-5 chr16 23620305 23620581 + 1.33333 NA intron (NM_024675, intron 10 of 12) L1MEb|LINE|L1 20914 NM_024675 79728 Hs.444664 NM_024675 ENSG00000083093 PALB2 FANCN|PNCA3 partner and localizer of BRCA2 protein-coding 341.333-29 chr8 43387542 43387935 + 1.33333 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 95296 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 168-61 chr21 30786598 30786791 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26580 NM_175857 337879 Hs.407655 NM_175857 ENSG00000183640 KRTAP8-1 KAP8.1 keratin associated protein 8-1 protein-coding 215.333-37 chr12 2838771 2838936 + 1.33333 NA intron (NR_147202, intron 14 of 15) intron (NR_147202, intron 14 of 15) -3818 NM_031474 83714 Hs.530816 NM_031474 ENSG00000053702 NRIP2 - nuclear receptor interacting protein 2 protein-coding 204.333-199 chr8 91690184 91690337 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 327420 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 299.333-64 chr6 38380539 38380868 + 1.33333 NA intron (NM_052893, intron 7 of 11) AluJr|SINE|Alu -100893 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 233.333-56 chr2 26979063 26979402 + 1.33333 NA intron (NM_012326, intron 1 of 6) intron (NM_012326, intron 1 of 6) 8595 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 243.333-118 chr9 91636093 91636369 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_037472) promoter-TSS (NR_037472) -20 NR_037472 100500821 NR_037472 ENSG00000266855 MIR3910-1 mir-3910-1 microRNA 3910-1 ncRNA 225-46 chr4 48369897 48370098 + 1.33333 NA exon (NM_020846, exon 2 of 8) exon (NM_020846, exon 2 of 8) 28468 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 161.666-9 chr5 136436135 136436281 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -70732 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 188.666-12 chr14 48472740 48472913 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -677812 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 322-34 chr5 111557841 111558224 + 1.33333 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) L1PA8|LINE|L1 -45435 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 330.666-21 chr8 90983968 90984245 + 1.33333 NA intron (NM_001190972, intron 1 of 5) intron (NM_001190972, intron 1 of 5) 971 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 204-182 chr7 34294787 34294973 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -363338 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 211.333-136 chr21 24193987 24194206 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 127281 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 193.666-28 chr22 36734669 36734911 + 1.33333 NA intron (NR_134623, intron 2 of 3) intron (NR_134623, intron 2 of 3) 30914 NR_134623 105373021 Hs.401697 NR_134623 LOC105373021 - uncharacterized LOC105373021 ncRNA 297-6 chr1 248039302 248039567 + 1.33333 NA TTS (NM_001004686) TTS (NM_001004686) 1262 NM_001004686 26246 Hs.684888 NM_001004686 ENSG00000203663 OR2L2 HSHTPCRH07|HTPCRH07|OR1-48|OR2L12|OR2L4P olfactory receptor family 2 subfamily L member 2 protein-coding 156-40 chr12 120868313 120868483 + 1.33333 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie 35960 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 265.333-59 chr4 54818569 54818808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 160760 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 243.333-80 chr4 75783640 75783886 + 1.33333 NA intron (NM_003715, intron 9 of 23) MER94|DNA|hAT-Blackjack 59241 NM_001290049 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 176-28 chr13 113639318 113639506 + 1.33333 NA intron (NM_007111, intron 11 of 11) intron (NM_007111, intron 11 of 11) 18786 NM_000705 496 Hs.434202 NM_000705 ENSG00000186009 ATP4B ATP6B ATPase H+/K+ transporting subunit beta protein-coding 227.333-8 chr1 150085506 150085782 + 1.33333 NA intron (NR_103998, intron 8 of 13) intron (NR_103998, intron 8 of 13) 17868 NM_007259 11311 Hs.443750 NM_007259 ENSG00000136631 VPS45 H1|H1VPS45|SCN5|VPS45A|VPS45B|VPS54A|VSP45|VSP45A vacuolar protein sorting 45 homolog protein-coding 344-31 chr4 52890425 52890783 + 1.33333 NA intron (NM_152540, intron 7 of 8) intron (NM_152540, intron 7 of 8) 28287 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 191.333-220 chrX 16188794 16188981 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 21406 NM_001277307 645864 Hs.632792 NM_001277307 ENSG00000182798 MAGEB17 - MAGE family member B17 protein-coding 249.666-6 chr1 103807544 103807817 + 1.33333 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 57839 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 189.333-198 chr7 124875206 124875365 + 1.33333 NA intron (NM_015450, intron 6 of 18) Looper|DNA|PiggyBac 54540 NM_015450 25913 Hs.31968 NM_015450 ENSG00000128513 POT1 CMM10|GLM9|HPOT1 protection of telomeres 1 protein-coding 293.999-4 chr18 36090575 36090846 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23116 NM_001303413 55197 Hs.464912 NM_018170 ENSG00000141425 RPRD1A HsT3101|P15RS regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A protein-coding 236.333-36 chr17 47655297 47655567 + 1.33333 NA intron (NM_002265, intron 3 of 21) intron (NM_002265, intron 3 of 21) 4367 NM_001276453 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 195.333-114 chr2 101744818 101745087 + 1.33333 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 47245 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 327.333-4 chr10 44887991 44888462 + 1.33333 NA intron (NR_033842, intron 2 of 7) intron (NR_033842, intron 2 of 7) -23090 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 176.667-111 chr4 58526554 58526774 + 1.33333 NA intron (NR_133943, intron 2 of 2) intron (NR_133943, intron 2 of 2) 9664 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 138-90 chr5 65981486 65981671 + 1.33333 NA intron (NM_001253697, intron 1 of 25) L1ME2|LINE|L1 -36005 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 292-53 chr7 124810520 124810984 + 1.33333 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -19942 NM_001024603 154872 Hs.444163 NM_001024603 ENSG00000275356 C7orf77 - chromosome 7 open reading frame 77 protein-coding 253.666-29 chr9 73248779 73249146 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97097 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 185-39 chr2 195706698 195706869 + 1.33333 NA exon (NM_001127257, exon 4 of 10) exon (NM_001127257, exon 4 of 10) 49557 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 290.667-35 chr5 129379041 129379431 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17911 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 274-41 chr4 80036110 80036373 + 1.33333 NA intron (NM_001286781, intron 7 of 16) intron (NM_001286781, intron 7 of 16) 36988 NM_058172 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 368-11 chr17 67942783 67943178 + 1.33333 NA intron (NM_182641, intron 19 of 27) intron (NM_182641, intron 19 of 27) 50626 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 207.333-256 chr7 89014567 89014847 + 1.33333 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) L1MA5A|LINE|L1 -218970 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 188-25 chr10 105153911 105154147 + 1.33333 NA intron (NM_014978, intron 9 of 26) AluSx3|SINE|Alu -487813 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 171-42 chr20 38125899 38126107 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 39267 NM_001323318 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 492.666-2 chr10 55486040 55486931 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -112557 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 188-122 chr9 130060934 130061133 + 1.33333 NA intron (NM_020960, intron 1 of 17) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 7127 NM_020960 57720 Hs.512461 NM_020960 ENSG00000148358 GPR107 GCDRP|LUSTR1|bA138E2.2 G protein-coupled receptor 107 protein-coding 257-42 chr4 30732373 30732700 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_002589, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_002589, exon 2 of 2) 12167 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 218.666-28 chr14 61382272 61382501 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 60943 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 346.667-18 chr9 22243921 22244414 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -202657 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 204.666-32 chr14 75749972 75750162 + 1.33333 NA intron (NM_015072, intron 17 of 31) MIRb|SINE|MIR 88821 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 208-118 chr4 43432481 43432782 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 59912 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 172-42 chr14 71360340 71360565 + 1.33333 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) MIR3|SINE|MIR -37885 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 190-5 chr1 108715375 108715547 + 1.33333 NA intron (NM_001144937, intron 2 of 12) intron (NM_001144937, intron 2 of 12) 2553 NM_001144937 163479 Hs.258253 NM_173532 ENSG00000143107 FNDC7 - fibronectin type III domain containing 7 protein-coding 172.333-72 chr18 13329665 13329934 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 51694 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 284-3 chr1 110525558 110525974 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6591 NM_005549 3744 Hs.248140 NM_005549 ENSG00000143105 KCNA10 Kcn1|Kv1.8 potassium voltage-gated channel subfamily A member 10 protein-coding 236.666-7 chr12 17953933 17954150 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 136152 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 168-118 chr8 133126888 133127041 + 1.33333 NA intron (NM_003235, intron 45 of 47) intron (NM_003235, intron 45 of 47) -24362 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 213.333-211 chr8 120917577 120917791 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -105638 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 308-48 chr6 141107835 141108277 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 424242 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 196.666-90 chr6 61960796 61960972 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) L1MD2|LINE|L1 325341 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 215.333-138 chr3 187542146 187542318 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 95186 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 172.666-21 chr5 34805142 34805356 + 1.33333 NA intron (NM_015577, intron 5 of 17) intron (NM_015577, intron 5 of 17) -33915 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 176.666-32 chr8 117150362 117150524 + 1.33333 NA intron (NM_173851, intron 2 of 7) intron (NM_173851, intron 2 of 7) 15448 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 220.333-128 chr8 83956534 83956977 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -226032 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 196-48 chr14 62007071 62007350 + 1.33333 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) intron (NM_001367661, intron 4 of 8) 79515 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 211-92 chr7 77801475 77801645 + 1.33333 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 2589 NM_001366086 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 186.666-30 chr2 159351346 159351511 + 1.33333 NA intron (NM_001329858, intron 27 of 36) L1ME4a|LINE|L1 -64725 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 219.333-169 chr7 48270919 48271239 + 1.33333 NA intron (NM_152701, intron 16 of 61) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 99621 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 173.333-34 chr11 37458479 37458695 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -480014 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 310-63 chr8 139948845 139949294 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) AluSx1|SINE|Alu 151466 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 226.333-55 chr2 13962997 13963259 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 437830 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 241.666-22 chr7 49112192 49112446 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 187772 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 171-78 chr9 4389688 4389851 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89701 NM_001042413 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 199-94 chr6 73613796 73613999 + 1.33333 NA intron (NM_012434, intron 8 of 10) FLAM_C|SINE|Alu 40095 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 347.666-5 chr17 58789963 58790259 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 34242 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 200.666-48 chr18 1322420 1322599 + 1.33333 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) intron (NR_023926, intron 2 of 5) 37120 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 254.666-26 chr6 52242908 52243297 + 1.33333 NA intron (NM_052872, intron 1 of 2) intron (NM_052872, intron 1 of 2) 1398 NM_052872 112744 Hs.272295 NM_052872 ENSG00000112116 IL17F CANDF6|IL-17F|ML-1|ML1 interleukin 17F protein-coding 244.333-58 chr2 68094632 68094937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31780 NM_173177 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 275.667-51 chr6 164608375 164608791 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 213480 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 169.667-4 chr1 71698288 71698477 + 1.33333 NA intron (NM_173808, intron 3 of 6) intron (NM_173808, intron 3 of 6) 138630 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 154.667-292 chr5 3809818 3810011 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 214082 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 220.333-34 chr12 41747587 41747798 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16497 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 176.667-57 chr14 70118374 70118582 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -38261 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 144.333-210 chr5 57480752 57480928 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001017992, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_001017992, exon 1 of 1) 1971 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 185.333-186 chr8 82593233 82593406 + 1.33333 NA Intergenic LTR108e_Mam|LTR|ERVL -318785 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 198.333-28 chr10 110244517 110244667 + 1.33333 NA intron (NM_001008541, intron 2 of 4) intron (NM_001008541, intron 2 of 4) 18596 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 200-97 chr20 62632091 62632354 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -10281 NM_016354 28231 Hs.235782 NM_016354 ENSG00000101187 SLCO4A1 OATP-E|OATP1|OATP4A1|OATPE|OATPRP1|POAT|SLC21A12 solute carrier organic anion transporter family member 4A1 protein-coding 185.333-163 chr6 18567252 18567558 + 1.33333 NA intron (NR_149116, intron 3 of 7) L1M5|LINE|L1 -4379 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 211-62 chr3 42403277 42403448 + 1.33333 NA intron (NM_001304386, intron 4 of 4) AluSx|SINE|Alu 7248 NM_144634 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 192.333-90 chr2 67446324 67446588 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49123 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 212.667-116 chr5 172802154 172802434 + 1.33333 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -31099 NM_004417 1843 Hs.171695 NM_004417 ENSG00000120129 DUSP1 CL100|HVH1|MKP-1|MKP1|PTPN10 dual specificity phosphatase 1 protein-coding 199.333-236 chr5 157816360 157816639 + 1.33333 NA intron (NM_014666, intron 3 of 11) intron (NM_014666, intron 3 of 11) 42646 NM_014666 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 182.666-36 chr6 136125267 136125452 + 1.33333 NA intron (NM_018945, intron 3 of 12) AluJr|SINE|Alu -52532 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 166-21 chr10 49085327 49085476 + 1.33333 NA intron (NM_001031746, intron 3 of 7) intron (NM_001031746, intron 3 of 7) 30121 NM_001031746 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 322.666-16 chr17 60532956 60533246 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -6859 NM_006380 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 341.666-14 chr6 55382050 55382351 + 1.33333 NA intron (NM_207410, intron 6 of 8) intron (NM_207410, intron 6 of 8) 54731 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 194.666-55 chr5 25687943 25688121 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 497079 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 208.333-119 chr5 123757252 123757529 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 211973 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 155-49 chr17 19802037 19802222 + 1.33333 NA intron (NM_014683, intron 15 of 26) L1ME4b|LINE|L1 -53831 NM_001330150 218 Hs.531682 NM_000691 ENSG00000108602 ALDH3A1 ALDH3|ALDHIII aldehyde dehydrogenase 3 family member A1 protein-coding 252.333-46 chr3 26692203 26692655 + 1.33333 NA intron (NM_001317810, intron 2 of 2) intron (NM_001317810, intron 2 of 2) -2128 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 244-69 chr3 62725109 62725453 + 1.33333 NA intron (NM_003716, intron 3 of 29) MER3|DNA|hAT-Charlie 150135 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 219.333-116 chr3 64607831 64608030 + 1.33333 NA intron (NM_001318781, intron 21 of 38) L1MB5|LINE|L1 46584 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 195.666-44 chr8 108445717 108445890 + 1.33333 NA intron (NR_138033, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 2179 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 139.333-151 chr3 86037793 86037901 + 1.33333 NA intron (NM_001256502, intron 9 of 10) L1PA8|LINE|L1 -209797 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 337.666-9 chr6 42692780 42693158 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001363705, exon 47 of 47) 3' UTR (NM_001363705, exon 47 of 47) 29628 NM_000322 5961 Hs.654489 NM_000322 ENSG00000112619 PRPH2 AOFMD|AVMD|CACD2|DS|MDBS1|PRPH|RDS|RP7|TSPAN22|rd2 peripherin 2 protein-coding 168.666-3 chr12 14086017 14086202 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -105753 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 215-48 chr21 14111936 14112208 + 1.33333 NA intron (NM_001303001, intron 7 of 7) L1MA8|LINE|L1 94877 NM_198996 149998 Hs.139907 NM_145317 ENSG00000188992 LIPI CT17|LPDL|PLA1C|PRED5|mPA-PLA1 beta lipase I protein-coding 177.666-18 chr3 125365937 125366084 + 1.33333 NA intron (NM_001348427, intron 1 of 9) intron (NM_001348427, intron 1 of 9) 8699 NM_001348432 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 202.666-127 chr9 37135492 37135723 + 1.33333 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 15009 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 258.999 chr1 231441384 231441695 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16495 NM_022051 54583 Hs.444450 NM_022051 ENSG00000135766 EGLN1 C1orf12|ECYT3|HALAH|HIF-PH2|HIFPH2|HPH-2|HPH2|PHD2|SM20|ZMYND6 egl-9 family hypoxia inducible factor 1 protein-coding 171.333-184 chr7 77945522 77945665 + 1.33333 NA intron (NM_001366081, intron 14 of 16) intron (NM_001366081, intron 14 of 16) 105463 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 218-3 chr1 85083177 85083410 + 1.33333 NA intron (NM_001288563, intron 5 of 21) AluJb|SINE|Alu 20966 NM_145172 126820 Hs.97933 NM_145172 ENSG00000162643 WDR63 DIC3|NYD-SP29 WD repeat domain 63 protein-coding 311.333-46 chr5 50304971 50305314 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 136146 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 327.333-18 chr18 43339473 43339793 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -62143 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 212.333-120 chr5 131549752 131550028 + 1.33333 NA intron (NM_016340, intron 5 of 27) L1PA13|LINE|L1 85339 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 275.666-4 chr14 87515789 87516048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 139376 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 148.667-33 chr1 239658693 239658871 + 1.33333 NA intron (NM_001347716, intron 4 of 7) AluSz|SINE|Alu 29709 NM_000740 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 346.666-12 chr3 188251522 188251905 + 1.33333 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) L1MC4|LINE|L1 26308 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 222-96 chr8 84765831 84766104 + 1.33333 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 60040 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 247.666-30 chr5 131194101 131194382 + 1.33333 NA intron (NM_181705, intron 4 of 4) intron (NM_181705, intron 4 of 4) 23297 NM_181705 90624 Hs.115467 NM_181705 ENSG00000186687 LYRM7 C5orf31|MC3DN8|MZM1L LYR motif containing 7 protein-coding 289.666-16 chr5 109215685 109216048 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 110503 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 189-6 chr10 14361016 14361256 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 22141 NR_036181 100422843 NR_036181 ENSG00000266321 MIR4293 - microRNA 4293 ncRNA 199.333-224 chr5 59128312 59128575 + 1.33333 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) intron (NM_001364603, intron 5 of 15) -88967 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 378.667-10 chr17 72685349 72685912 + 1.33333 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) intron (NM_001352692, intron 7 of 9) -45158 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 174-19 chr12 17542771 17542933 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 46226 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 216.666-3 chr1 85962725 85962946 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 23 of 59) intron (NM_152890, intron 23 of 59) 193636 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 228-76 chr6 140447694 140447900 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -236017 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 197-35 chr14 63604476 63604729 + 1.33333 NA intron (NM_080666, intron 2 of 2) intron (NM_080666, intron 2 of 2) 37269 NM_080666 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 396.333 chr10 70331047 70331395 + 1.33333 NA intron (NR_103467, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 45558 NM_001278213 55222 Hs.7778 NM_018205 ENSG00000172731 LRRC20 - leucine rich repeat containing 20 protein-coding 174.666-23 chr8 29560742 29560891 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 187293 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 238-84 chr6 36019665 36019982 + 1.33333 NA intron (NM_052961, intron 1 of 19) MIRc|SINE|MIR 4677 NM_138718 116369 Hs.435836 NM_052961 ENSG00000112053 SLC26A8 SPGF3|TAT1 solute carrier family 26 member 8 protein-coding 201.333-283 chr8 97609427 97609618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34662 NM_178812 92140 Hs.377155 NM_178812 ENSG00000147649 MTDH 3D3|AEG-1|AEG1|LYRIC|LYRIC/3D3 metadherin protein-coding 209-118 chr8 67415748 67415944 + 1.33333 NA intron (NR_136224, intron 1 of 4) intron (NR_136224, intron 1 of 4) 72012 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 296.667-16 chr14 56383379 56383710 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -130787 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 180-72 chr4 30868617 30868844 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 148361 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 173-95 chr8 90252567 90252719 + 1.33333 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 31155 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 196.333-137 chr5 22409029 22409255 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) intron (NM_004061, intron 2 of 14) -195292 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 178.333-118 chr3 196859298 196859445 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -8485 NM_001308045 205564 Hs.240770 NM_152699 ENSG00000119231 SENP5 - SUMO specific peptidase 5 protein-coding 222-47 chr2 97904644 97904885 + 1.33333 NA intron (NM_015348, intron 3 of 40) L1MEc|LINE|L1 91184 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 251.333-104 chr8 28461709 28462065 + 1.33333 NA intron (NM_001258211, intron 3 of 7) intron (NM_001258211, intron 3 of 7) 28342 NM_172366 157574 Hs.741522 NM_172366 ENSG00000214050 FBXO16 FBX16 F-box protein 16 protein-coding 208.667-51 chr16 52412753 52413089 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 134222 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 208-133 chr5 25326296 25326507 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 135448 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 201.333-42 chr10 122512254 122512435 + 1.33333 NA intron (NM_002775, intron 8 of 8) intron (NM_002775, intron 8 of 8) -48321 NM_004406 1755 Hs.279611 NM_004406 ENSG00000187908 DMBT1 GP340|SAG|SALSA|muclin deleted in malignant brain tumors 1 protein-coding 130-58 chr2 161216322 161216515 + 1.33333 NA intron (NM_001199135, intron 4 of 7) intron (NM_001199135, intron 4 of 7) -28321 NR_110164 100996579 Hs.660929 NR_110163 ENSG00000227403 LINC01806 - long intergenic non-protein coding RNA 1806 ncRNA 193.333-30 chr10 114988685 114988848 + 1.33333 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -5891 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 292.667-49 chr9 99236657 99237068 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 14580 NM_006808 10952 Hs.191887 NM_006808 ENSG00000106803 SEC61B - SEC61 translocon beta subunit protein-coding 182-73 chr3 197225639 197225830 + 1.33333 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) intron (NM_001366216, intron 4 of 23) -41603 NM_001204388 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 204.333-51 chr14 57458956 57459110 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34824 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 207-36 chr14 64379241 64379459 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9003 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 339.999-3 chr12 51412901 51413189 + 1.33333 NA intron (NM_001258401, intron 1 of 24) L1MA4|LINE|L1 -11786 NR_047672 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 223.333-133 chr5 139991439 139991673 + 1.33333 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) AluSx|SINE|Alu 51743 NM_013982 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 136-17 chr12 16829164 16829390 + 1.33333 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -159470 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 211.333-248 chr8 125852952 125853202 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 98120 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 232.667-65 chr5 38949510 38949801 + 1.33333 NA intron (NM_001285439, intron 31 of 38) intron (NM_001285439, intron 31 of 38) 103643 NM_003999 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 269.999-7 chr3 138109037 138109255 + 1.33333 NA intron (NM_173543, intron 1 of 15) intron (NM_173543, intron 1 of 15) 4334 NM_001170538 199221 Hs.351403 NM_173543 ENSG00000158163 DZIP1L DZIP2|PKD5 DAZ interacting zinc finger protein 1 like protein-coding 289.666-5 chr17 44332554 44332885 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7849 NM_001321240 51629 Hs.744880 NM_016016 ENSG00000013306 SLC25A39 CGI-69|CGI69 solute carrier family 25 member 39 protein-coding 333.666-9 chr20 1228087 1228406 + 1.33333 NA intron (NM_001136566, intron 1 of 13) intron (NM_001136566, intron 1 of 13) 2126 NM_001136566 642636 Hs.713451 NM_001136566 ENSG00000244588 RAD21L1 RAD21L|dJ545L17.2 RAD21 cohesin complex component like 1 protein-coding 343.333-7 chr11 90885992 90886316 + 1.33333 NA intron (NR_104190, intron 6 of 6) intron (NR_104190, intron 6 of 6) -16952 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 274.333-36 chr18 65469321 65469761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -280711 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 233-56 chr5 59990941 59991267 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 2 of 16) intron (NM_001165899, intron 2 of 16) -97378 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 207.666-45 chr4 97015887 97016133 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -350916 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 157.666-2 chr3 12369828 12370040 + 1.33333 NA intron (NM_015869, intron 1 of 6) HAL1|LINE|L1 18432 NM_015869 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 212.667-43 chr15 46802988 46803276 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -380957 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 323-20 chr3 13741649 13742214 + 1.33333 NA intron (NR_027103, intron 5 of 5) L1MEg|LINE|L1 91210 NR_027103 285375 Hs.319969 NR_027103 ENSG00000224514 LINC00620 - long intergenic non-protein coding RNA 620 ncRNA 275.333-57 chr5 80439027 80439435 + 1.33333 NA intron (NR_146172, intron 4 of 20) intron (NR_146172, intron 4 of 20) 31167 NM_001105251 9765 Hs.482660 NM_014733 ENSG00000039319 ZFYVE16 PPP1R69 zinc finger FYVE-type containing 16 protein-coding 196.666-73 chr3 188779283 188779532 + 1.33333 NA intron (NM_001167672, intron 7 of 9) intron (NM_001167672, intron 7 of 9) 90626 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 203.333-197 chr4 113238669 113238888 + 1.33333 NA intron (NM_001354275, intron 8 of 43) intron (NM_001354275, intron 8 of 43) -54061 NM_001354282 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 259.333-45 chr2 64854686 64855090 + 1.33333 NA intron (NR_110224, intron 1 of 4) intron (NR_110224, intron 1 of 4) 8743 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 192.667-89 chr2 73911184 73911463 + 1.33333 NA intron (NM_001615, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu -15503 NR_134895 1716 Hs.469022 NM_001929 ENSG00000114956 DGUOK MTDPS3|NCPH|PEOB4|dGK deoxyguanosine kinase protein-coding 205.333-228 chr7 110139070 110139233 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -178938 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 160.667-243 chr5 42044105 42044274 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 118908 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 320.333-5 chr10 116140252 116140574 + 1.33333 NA intron (NM_145793, intron 3 of 8) intron (NM_145793, intron 3 of 8) 54376 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 182-10 chr1 152452743 152452997 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -38607 NM_016190 49860 Hs.242057 NM_016190 ENSG00000143536 CRNN C1orf10|DRC1|PDRC1|SEP53 cornulin protein-coding 197.333-195 chr6 22127933 22128193 + 1.33333 NA intron (NR_015410, intron 9 of 11) L1PA15|LINE|L1 19130 NR_034143 729177 Hs.730673 NR_034143 ENSG00000260455 NBAT1 CASC14|NBAT-1 neuroblastoma associated transcript 1 ncRNA 173-61 chr4 30807197 30807424 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 86941 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 172.667-55 chr14 57479444 57479698 + 1.33333 NA intron (NM_001283060, intron 5 of 5) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 14286 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 210.666-88 chr5 167259791 167259971 + 1.33333 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) intron (NM_001122679, intron 1 of 29) -91480 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 163.333-4 chr1 40233425 40233635 + 1.33333 NA intron (NM_012421, intron 7 of 7) intron (NM_012421, intron 7 of 7) -14407 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 133.333-62 chr17 56546321 56546465 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -47306 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 189-48 chr2 183785742 183785938 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -593135 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 427.333-8 chr4 67049560 67050203 + 1.33333 NA Intergenic LTR53B|LTR|ERVL 372119 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 237.667-8 chr10 77078338 77078657 + 1.33333 NA intron (NM_001271519, intron 13 of 28) intron (NM_001271519, intron 13 of 28) -62334 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 201.333-142 chr2 25668988 25669266 + 1.33333 NA intron (NM_033147, intron 1 of 19) L1MB3|LINE|L1 4450 NM_001351391 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 199.333-135 chr2 138521552 138521799 + 1.33333 NA intron (NM_001001664, intron 1 of 10) intron (NM_001001664, intron 1 of 10) 19905 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 301.667-4 chr1 171848331 171848776 + 1.33333 NA intron (NM_001278252, intron 1 of 14) intron (NM_001278252, intron 1 of 14) 7055 NR_146559 26052 Hs.654775 NM_015569 ENSG00000197959 DNM3 Dyna III dynamin 3 protein-coding 204.333-128 chr3 111985980 111986160 + 1.33333 NA intron (NM_001272069, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 7044 NR_073570 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 280-24 chr2 102273209 102273503 + 1.33333 NA Intergenic Charlie14a|DNA|hAT-Charlie -38146 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 203.666-35 chr2 231165608 231165827 + 1.33333 NA intron (NM_001191037, intron 21 of 23) intron (NM_001191037, intron 21 of 23) -32914 NR_148040 80210 Hs.162411 NM_025139 ENSG00000135931 ARMC9 ARM|JBTS30|KU-MEL-1|NS21 armadillo repeat containing 9 protein-coding 124.666-3 chr7 23478340 23478491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7924 NM_006547 10643 Hs.700696 NM_006547 ENSG00000136231 IGF2BP3 CT98|IMP-3|IMP3|KOC|KOC1|VICKZ3 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 3 protein-coding 191.333-68 chr14 79077621 79077780 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -122282 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 227.333-81 chr3 119440454 119440667 + 1.33333 NA intron (NM_018266, intron 5 of 8) intron (NM_018266, intron 5 of 8) 23055 NM_018266 55254 Hs.594171 NM_018266 ENSG00000176142 TMEM39A - transmembrane protein 39A protein-coding 470.332 chr5 116552302 116552783 + 1.33333 NA intron (NM_001300780, intron 1 of 19) intron (NM_001300780, intron 1 of 19) -21876 NR_147170 105379132 NR_147170 SEMA6A-AS2 - SEMA6A antisense RNA 2 ncRNA 208.333-96 chr3 77991858 77992062 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 57003 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 197-34 chr14 55386197 55386376 + 1.33333 NA intron (NM_014924, intron 4 of 9) intron (NM_014924, intron 4 of 9) 25572 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 196.333-140 chr5 36971964 36972212 + 1.33333 NA intron (NM_015384, intron 8 of 45) intron (NM_015384, intron 8 of 45) 95319 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 283.999-10 chrX 113521213 113521436 + 1.33333 NA TTS (NR_110399) TTS (NR_110399) 416894 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 205.333-246 chr8 103108997 103109208 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11930 NR_145429 379034 Hs.591862 NR_145429 LINC01181 - long intergenic non-protein coding RNA 1181 ncRNA 202.333-128 chr4 70414277 70414573 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -16067 NM_001145006 4589 Hs.631946 NM_152291 ENSG00000171195 MUC7 MG2 mucin 7, secreted protein-coding 151.333-57 chr10 68574579 68574741 + 1.33333 NA intron (NM_030625, intron 2 of 11) intron (NM_030625, intron 2 of 11) 14323 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 174-13 chr10 102378938 102379093 + 1.33333 NA intron (NM_004193, intron 33 of 39) MER113|DNA|hAT-Charlie -15095 NM_001288724 4791 Hs.73090 NM_002502 ENSG00000077150 NFKB2 CVID10|H2TF1|LYT-10|LYT10|NF-kB2|p100|p49/p100|p52 nuclear factor kappa B subunit 2 protein-coding 210.666-27 chr12 105286187 105286399 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 40724 NR_131986 105369954 Hs.368938 NR_131986 ENSG00000257642 KCCAT198 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 198 ncRNA 224.333-121 chr8 24507812 24508007 + 1.33333 NA intron (NM_003817, intron 21 of 21) intron (NM_003817, intron 21 of 21) 6959 NR_125809 101929315 Hs.125562 NR_125809 ENSG00000253643 LOC101929315 - uncharacterized LOC101929315 ncRNA 118.667-148 chr4 40706884 40707101 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42963 NM_001330648 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 407.333-5 chr10 95626701 95627051 + 1.33333 NA intron (NM_001323414, intron 9 of 17) intron (NM_001323414, intron 9 of 17) 29835 NM_001323418 5832 Hs.500645 NM_002860 ENSG00000059573 ALDH18A1 ADCL3|ARCL3A|GSAS|P5CS|PYCS|SPG9|SPG9A|SPG9B aldehyde dehydrogenase 18 family member A1 protein-coding 349.999-3 chr17 67782616 67783071 + 1.33333 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 42173 NR_003706 100124536 Hs.693446 NR_003706 ENSG00000200394 SNORA38B - small nucleolar RNA, H/ACA box 38B snoRNA 212.667-122 chr6 52024246 52024527 + 1.33333 NA intron (NM_138694, intron 32 of 66) intron (NM_138694, intron 32 of 66) 63227 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 258-15 chr14 54544694 54544936 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -22797 NM_001161576 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 279.333-56 chr3 117008564 117008972 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87337 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 220-2 chr1 80013450 80013720 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -522170 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 273.666-9 chr14 69093144 69093497 + 1.33333 NA intron (NM_003861, intron 5 of 8) intron (NM_003861, intron 5 of 8) 59279 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 155.667-156 chr2 35430647 35430896 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -40634 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 227.333-92 chr4 84513097 84513368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14998 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 201.667-6 chr10 28587161 28587398 + 1.33333 NA intron (NM_100486, intron 4 of 12) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 54161 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 203.333-192 chr4 33279377 33279560 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 760425 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 244.333-83 chr5 63694464 63694674 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 267723 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 229-33 chr2 195753864 195754077 + 1.33333 NA intron (NM_018897, intron 63 of 64) intron (NM_018897, intron 63 of 64) 96744 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 266.667-71 chr8 96722768 96723117 + 1.33333 NA intron (NM_016134, intron 1 of 7) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 77700 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 236-34 chr2 10947880 10948181 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 36096 NM_002236 3754 Hs.23735 NM_002236 ENSG00000162975 KCNF1 IK8|KCNF|KV5.1|kH1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily F member 1 protein-coding 203-101 chr7 79849013 79849177 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -285736 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 204-20 chr1 213765882 213766101 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -158758 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 129-120 chr6 168693881 168694065 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 252789 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 497 chr14 80720282 80721094 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) intron (NM_152446, intron 19 of 24) 221050 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 136.667-70 chr15 65183892 65184102 + 1.33333 NA intron (NM_006660, intron 1 of 13) MIRc|SINE|MIR 1345 NR_133680 10845 Hs.113823 NM_006660 ENSG00000166855 CLPX EPP2 caseinolytic mitochondrial matrix peptidase chaperone subunit protein-coding 308-32 chr3 51922216 51922600 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -19055 NM_152397 132141 Hs.671210 NM_152397 ENSG00000173389 IQCF1 - IQ motif containing F1 protein-coding 172-111 chr8 132006039 132006272 + 1.33333 NA intron (NR_136616, intron 23 of 23) L1ME2|LINE|L1 53227 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 166.666-13 chr5 114975610 114975825 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 194191 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 150-17 chr10 91915380 91915530 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -5969 NM_152429 143282 Hs.466120 NM_152429 ENSG00000174721 FGFBP3 C10orf13|FGF-BP3 fibroblast growth factor binding protein 3 protein-coding 286.666-21 chr8 87438495 87438925 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 435305 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 159.333-352 chr9 68919442 68919658 + 1.33333 NA exon (NM_001278253, exon 9 of 14) exon (NM_001278253, exon 9 of 14) 56291 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 323.333-37 chr9 34439806 34440154 + 1.33333 NA intron (NM_001184942, intron 1 of 5) intron (NM_001184942, intron 1 of 5) 18590 NM_001184940 203259 Hs.493771 NM_147202 ENSG00000164970 FAM219A C9orf25 family with sequence similarity 219 member A protein-coding 332.667-4 chr10 13850259 13850690 + 1.33333 NA intron (NM_001318336, intron 2 of 23) intron (NM_001318336, intron 2 of 23) 121422 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 220-102 chr6 62466706 62466936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -180594 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 189.333-63 chr15 99311582 99311830 + 1.33333 NA intron (NM_001321677, intron 5 of 8) MER58C|DNA|hAT-Charlie 54181 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 252-89 chr6 42297231 42297536 + 1.33333 NA intron (NM_001297573, intron 4 of 17) L1MEd|LINE|L1 -79522 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 194.333-15 chr1 235682665 235682966 + 1.33333 NA intron (NM_000081, intron 48 of 52) intron (NM_000081, intron 48 of 52) -32061 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 382.666-7 chr2 27291071 27291731 + 1.33333 NA intron (NM_187841, intron 1 of 8) MER113A|DNA|hAT-Charlie 8972 NM_032546 57159 Hs.516036 NM_032546 ENSG00000138100 TRIM54 MURF|MURF-3|RNF30|muRF3 tripartite motif containing 54 protein-coding 193.333-178 chr7 112165947 112166148 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 40352 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 181.667-96 chr3 131114688 131114936 + 1.33333 NA intron (NM_001353036, intron 5 of 14) intron (NM_001353036, intron 5 of 14) 87084 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 214.333-42 chr14 45166087 45166270 + 1.33333 NA intron (NM_001308133, intron 9 of 21) AluSx3|SINE|Alu 30239 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 279.666-18 chr9 14628206 14628640 + 1.33333 NA intron (NR_148717, intron 9 of 11) intron (NR_148717, intron 9 of 11) 65009 NM_001354126 340481 Hs.649522 NM_178566 ENSG00000175893 ZDHHC21 DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097 zinc finger DHHC-type containing 21 protein-coding 163-14 chr12 74138140 74138287 + 1.33333 NA intron (NR_038300, intron 6 of 6) L1MC4|LINE|L1 154418 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 213.333-209 chr8 80608733 80608982 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 122631 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 251.333-5 chr1 218611797 218612103 + 1.33333 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) intron (NR_031644, intron 3 of 6) 101855 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 224.667-23 chr14 64567090 64567419 + 1.33333 NA intron (NM_172365, intron 6 of 11) intron (NM_172365, intron 6 of 11) 17293 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 288-32 chr20 18419714 18420129 + 1.33333 NA intron (NM_001367611, intron 10 of 20) L1ME1|LINE|L1 40872 NR_034167 440757 Hs.120399 NM_001004344 ENSG00000237282 LINC00851 DZANK1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 851 ncRNA 209.333-158 chr3 136425317 136425565 + 1.33333 NA intron (NM_005862, intron 16 of 33) L1MC5a|LINE|L1 175101 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 197.666-35 chr2 228456410 228456562 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 154909 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 194.667-129 chr5 145162214 145162476 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 672997 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 295.333-25 chr2 127703075 127703471 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018383, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_018383, exon 22 of 22) 1776 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 214-119 chr6 137581523 137581726 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -84022 NR_125867 102723649 Hs.129235 NR_125867 LOC102723649 - uncharacterized LOC102723649 ncRNA 364.333-30 chrUn_KI270515v1 1253 1575 + 1.33333 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 293-37 chr7 21678730 21678979 + 1.33333 NA intron (NM_001277115, intron 30 of 81) L1MA9|LINE|L1 135815 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 168.667-21 chr10 63026288 63026530 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -106838 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 259.333-19 chr10 120701984 120702364 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 104225 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 181.333-161 chr7 31838063 31838223 + 1.33333 NA intron (NM_001191059, intron 10 of 18) intron (NM_001191059, intron 10 of 18) 150928 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 200-73 chr17 80873439 80873722 + 1.33333 NA intron (NM_001163034, intron 13 of 29) intron (NM_001163034, intron 13 of 29) -67948 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 225.333-48 chr14 60115585 60115897 + 1.33333 NA exon (NM_022495, exon 4 of 10) exon (NM_022495, exon 4 of 10) 23818 NM_001330177 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 160.333-162 chr20 9390264 9390457 + 1.33333 NA intron (NM_000933, intron 13 of 35) intron (NM_000933, intron 13 of 35) 82560 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 190-39 chr14 74800632 74800912 + 1.33333 NA intron (NM_019589, intron 5 of 20) intron (NM_019589, intron 5 of 20) 37456 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 215-50 chr22 22974788 22975076 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 87116 NM_001256296 100423062 Hs.449574 NM_001178126 ENSG00000254709 IGLL5 IGL|IGLV|VL-MAR immunoglobulin lambda like polypeptide 5 protein-coding 245.333-47 chr15 62726490 62726734 + 1.33333 NA intron (NM_015059, intron 24 of 55) intron (NM_015059, intron 24 of 55) 79301 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 133.666 chr20 44857752 44857882 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -27888 NM_003404 7529 Hs.643544 NM_003404 ENSG00000166913 YWHAB GW128|HEL-S-1|HS1|KCIP-1|YWHAA tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta protein-coding 332.666-22 chr4 36771396 36771785 + 1.33333 NA Intergenic LTR53|LTR|ERVL -129690 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 224-113 chr9 29315077 29315414 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101644 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 155.333-403 chr8 127766394 127766544 + 1.33333 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -28064 NR_003367 5820 Hs.133107 NR_003367 ENSG00000249859 PVT1 LINC00079|MIR1204HG|NCRNA00079|onco-lncRNA-100 Pvt1 oncogene ncRNA 204.333-125 chr3 99623901 99624125 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -14581 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 290-52 chr8 113954457 113954911 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -517745 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 208.666-102 chr7 74627113 74627333 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -30442 NM_001280800 2969 Hs.647041 NM_001518 ENSG00000263001 GTF2I BAP135|BTKAP1|DIWS|GTFII-I|IB291|SPIN|TFII-I|WBS|WBSCR6 general transcription factor IIi protein-coding 235.666-20 chr8 70985811 70986116 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 316624 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 273-16 chr17 52886959 52887396 + 1.33333 NA intron (NR_146899, intron 1 of 2) MER58B|DNA|hAT-Charlie 25056 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 345.333-19 chr20 13016701 13017101 + 1.33333 NA intron (NM_001349945, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR 7929 NM_001349945 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 173.333-104 chr2 234244984 234245181 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 194380 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 173-85 chr6 119542652 119542808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7078 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 204-208 chr9 71725752 71725995 + 1.33333 NA intron (NM_013390, intron 10 of 23) intron (NM_013390, intron 10 of 23) 42640 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 177-13 chr11 81817439 81817674 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 73280 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 325-27 chr7 35688959 35689621 + 1.33333 NA intron (NM_022373, intron 2 of 8) intron (NM_022373, intron 2 of 8) 5845 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 246.666-18 chr17 77143098 77143411 + 1.33333 NA intron (NM_001143999, intron 2 of 16) MIR3|SINE|MIR 2285 NM_001143998 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 268.333-21 chr15 33346407 33346832 + 1.33333 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 35652 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 222.666-55 chr8 118857429 118857673 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 94334 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 313.333-38 chr6 63808019 63808394 + 1.33333 NA intron (NR_157848, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 1370 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 251-61 chr5 29729436 29729763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150961 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 393.999-4 chr7 112073994 112074311 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 132247 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 199-68 chr3 94491073 94491317 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 428134 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 169.333-135 chr2 210684304 210684520 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 66841 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 149.333-275 chr4 44669914 44670094 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8391 NM_001345868 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 333.333-16 chr11 126861189 126861452 + 1.33333 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) -79426 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 258-32 chr2 39740926 39741198 + 1.33333 NA intron (NR_135664, intron 11 of 11) Charlie14a|DNA|hAT-Charlie 38196 NM_025264 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 171.667-110 chr3 22341337 22341688 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 384373 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 211.999-9 chr3 49350721 49350885 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 7550 NM_001329502 2876 Hs.76686 NM_000581 ENSG00000233276 GPX1 GPXD|GSHPX1 glutathione peroxidase 1 protein-coding 218.666-71 chr8 26389033 26389247 + 1.33333 NA intron (NM_004331, intron 1 of 5) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -1273 NM_001330491 665 Hs.131226 NM_004331 ENSG00000104765 BNIP3L BNIP3a|NIX BCL2 interacting protein 3 like protein-coding 162.666-13 chr8 136546061 136546227 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1ME2|LINE|L1 15346 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 295.666-10 chr2 102339592 102339936 + 1.33333 NA intron (NR_104167, intron 3 of 8) MIR|SINE|MIR 2507 NM_003856 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 220-44 chr16 66610866 66611070 + 1.33333 NA intron (NM_181553, intron 4 of 4) intron (NM_181553, intron 4 of 4) 6237 NR_037619 123920 Hs.298198 NM_144601 ENSG00000140931 CMTM3 BNAS2|CKLFSF3 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3 protein-coding 177.333-37 chr12 40319245 40319425 + 1.33333 NA intron (NM_198578, intron 33 of 50) MIR|SINE|MIR -74059 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 244.333-45 chr15 73645856 73646203 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -12640 NM_017455 27020 Hs.744867 NM_012428 ENSG00000156642 NPTN GP55|GP65|SDFR1|SDR1|np55|np65 neuroplastin protein-coding 238.666-5 chr10 7790020 7790263 + 1.33333 NA intron (NM_001320886, intron 1 of 8) intron (NM_001320886, intron 1 of 8) 1964 NM_001001973 509 Hs.271135 NM_005174 ENSG00000165629 ATP5F1C ATP5C|ATP5C1|ATP5CL1 ATP synthase F1 subunit gamma protein-coding 210.667-53 chr16 75533646 75533909 + 1.33333 NA intron (NM_024533, intron 1 of 2) AluSq2|SINE|Alu 1393 NM_024533 23563 Hs.745424 NM_012126 ENSG00000135702 CHST5 I-GlcNAc-6-ST|I-GlcNAc6ST|glcNAc6ST-3|gn6st-3|hIGn6ST carbohydrate sulfotransferase 5 protein-coding 234.333-31 chr15 69004268 69004685 + 1.33333 NA intron (NR_033672, intron 2 of 16) MER57A-int|LTR|ERV1 -10219 NM_001184779 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 213.333-27 chr10 47086140 47086367 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 174531 NM_001352524 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 194-58 chr18 9236159 9236380 + 1.33333 NA intron (NM_001204056, intron 7 of 11) intron (NM_001204056, intron 7 of 11) -98504 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 181.666-7 chr12 89609537 89609686 + 1.33333 NA intron (NM_001001323, intron 15 of 21) intron (NM_001001323, intron 15 of 21) -83349 NM_001199782 100528030 Hs.25130 NM_001199781 ENSG00000259075 POC1B-GALNT4 GALNT4|GalNAc-T4 POC1B-GALNT4 readthrough protein-coding 236.333-94 chr9 2771693 2771932 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 54302 NM_133497 169522 Hs.622675 NM_133497 ENSG00000168263 KCNV2 KV11.1|Kv8.2|RCD3B potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 2 protein-coding 364.333-26 chr7 33138335 33138670 + 1.33333 NA intron (NM_001348044, intron 1 of 18) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 8938 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 222.333-41 chr2 30052128 30052296 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94795 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 191-18 chr14 50569518 50569709 + 1.33333 NA intron (NM_015915, intron 1 of 13) L1ME3Cz|LINE|L1 9588 NM_181598 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 220.666-13 chr10 102721728 102721898 + 1.33333 NA intron (NM_001350989, intron 2 of 12) intron (NM_001350989, intron 2 of 12) 7177 NM_178858 118980 Hs.44070 NM_178858 ENSG00000156398 SFXN2 SLC56A2 sideroflexin 2 protein-coding 250.333-78 chr8 126661992 126662310 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -103673 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 214.333-106 chr4 94062837 94063120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 144578 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 210.333-181 chr9 125061933 125062243 + 1.33333 NA intron (NM_001144877, intron 2 of 17) L1MEg|LINE|L1 81440 NM_173690 286205 Hs.59504 NM_173690 ENSG00000173611 SCAI C9orf126|NET40 suppressor of cancer cell invasion protein-coding 311.333-27 chr18 71786160 71786444 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -4076 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 223-63 chr8 60352537 60352774 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 61163 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 183.666-2 chr1 174011134 174011350 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18170 NM_001300852 149041 Hs.30258 NM_172071 ENSG00000135870 RC3H1 RNF198|ROQUIN ring finger and CCCH-type domains 1 protein-coding 213-72 chr6 41089169 41089478 + 1.33333 NA intron (NM_021705, intron 3 of 8) L1MC5|LINE|L1 8464 NM_001329684 221443 Hs.227457 NM_145063 ENSG00000124596 OARD1 C6orf130|TARG1|dJ34B21.3 O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 protein-coding 209-19 chr11 28672214 28672476 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -194797 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 206-79 chr2 67765775 67765987 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59681 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 236-78 chr6 50397550 50397804 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -315867 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 332.666-5 chr11 32315662 32316292 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84423 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 153.667-273 chr3 187689782 187689938 + 1.33333 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 -12506 NR_034062 100131635 Hs.434448 NR_034062 ENSG00000228804 LOC100131635 - hCG1645011-like ncRNA 206-120 chr4 20068763 20069010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183019 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 376.667 chr1 217825511 217825973 + 1.33333 NA intron (NM_138796, intron 9 of 10) intron (NM_138796, intron 9 of 10) -40622 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 343-18 chr5 173923973 173924302 + 1.33333 NA intron (NM_001308193, intron 2 of 7) intron (NM_001308193, intron 2 of 7) 31086 NM_001308192 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 242.333-55 chr2 204248890 204249173 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -296444 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 202-93 chr2 162036295 162036466 + 1.33333 NA intron (NM_001935, intron 8 of 25) MIR|SINE|MIR 37835 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 220.666-43 chr21 35034142 35034328 + 1.33333 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) intron (NM_001754, intron 2 of 8) 5191 NR_026812 80215 Hs.672131 NM_025143 RUNX1-IT1 C21orf96 RUNX1 intronic transcript 1 ncRNA 303.999-3 chr22 35176980 35177416 + 1.33333 NA intron (NR_126356, intron 2 of 5) intron (NR_126356, intron 2 of 5) 53858 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 301.333-50 chr7 40496042 40496393 + 1.33333 NA intron (NM_024728, intron 11 of 14) intron (NM_024728, intron 11 of 14) 361241 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 284.999 chr2 121824449 121824694 + 1.33333 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 68920 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 222-50 chr2 202101504 202101705 + 1.33333 NA intron (NM_001277372, intron 7 of 23) intron (NM_001277372, intron 7 of 23) 15454 NR_135243 729224 Hs.623895 NR_135243 KIAA2012-AS1 - KIAA2012 antisense RNA 1 ncRNA 202.333-46 chr12 43264628 43264865 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 109431 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 212.667-11 chr10 21969243 21969565 + 1.33333 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 34326 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 322.666-6 chr10 115464996 115465495 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 22 of 28) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 371880 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 320.666-4 chr11 114738493 114738928 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60183 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 405-16 chr8 87286378 87286945 + 1.33333 NA exon (NM_173538, exon 8 of 11) exon (NM_173538, exon 8 of 11) 420246 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 208.666-82 chr4 121580526 121580707 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 116364 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 358.333-3 chr1 114478486 114478881 + 1.33333 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) L1M4a1|LINE|L1 32520 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 290.333 chr1 55103522 55103756 + 1.33333 NA intron (NM_015306, intron 42 of 67) intron (NM_015306, intron 42 of 67) 63417 NR_110451 255738 Hs.18844 NM_174936 ENSG00000169174 PCSK9 FH3|HCHOLA3|LDLCQ1|NARC-1|NARC1|PC9 proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 protein-coding 170.333-233 chr9 106656699 106656919 + 1.33333 NA intron (NR_104145, intron 3 of 6) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 40751 NR_104145 100996590 Hs.147110 NR_104145 ENSG00000234323 LINC01505 - long intergenic non-protein coding RNA 1505 ncRNA 248.333-8 chr1 214387233 214387509 + 1.33333 NA intron (NM_005401, intron 11 of 18) AluSx|SINE|Alu 106212 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 303.333-30 chr16 31038852 31039152 + 1.33333 NA intron (NM_004604, intron 8 of 10) intron (NM_004604, intron 8 of 10) 5444 NM_004604 6810 Hs.83734 NM_004604 ENSG00000103496 STX4 STX4A|p35-2 syntaxin 4 protein-coding 255.667-83 chr8 117122534 117122898 + 1.33333 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -12279 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 208-182 chr9 83506390 83506606 + 1.33333 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 31903 NM_001244959 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 255.999-2 chr11 27413553 27413753 + 1.33333 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) intron (NM_018490, intron 1 of 17) -50405 NM_080654 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 214.333-55 chr16 73214015 73214244 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69682 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 475.667 chr14 45155705 45156238 + 1.33333 NA intron (NM_001308133, intron 7 of 21) intron (NM_001308133, intron 7 of 21) 20032 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 305.333-3 chr10 21731109 21731490 + 1.33333 NA intron (NM_001195626, intron 17 of 22) MIR|SINE|MIR 197127 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 204.666-83 chr6 78492938 78493099 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46291 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 253.333-43 chr17 58775155 58775414 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 19415 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 225-12 chr11 91176806 91177052 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -307727 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 230.666-13 chr12 52091219 52091436 + 1.33333 NA intron (NR_120438, intron 2 of 2) intron (NR_120438, intron 2 of 2) -2242 NR_120440 26628 Hs.524431 NR_120438 ENSG00000257542 OR7E47P OR7E141 olfactory receptor family 7 subfamily E member 47 pseudogene pseudo 325.333-43 chr6 165419770 165420119 + 1.33333 NA intron (NM_006661, intron 11 of 22) intron (NM_006661, intron 11 of 22) -110339 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 264.999-3 chr18 58446399 58446755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4497 NR_029667 406906 NR_029667 ENSG00000284440 MIR122 MIR122A|MIRN122|MIRN122A|hsa-mir-122|miRNA122|miRNA122A|mir-122 microRNA 122 ncRNA 342-39 chr8 118266086 118266481 + 1.33333 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -154464 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 199.333-122 chr2 50412370 50412655 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -64756 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 180.666-33 chr8 127284837 127284983 + 1.33333 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 40273 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 315-6 chr12 14823225 14823629 + 1.33333 NA exon (NM_175874, exon 2 of 2) exon (NM_175874, exon 2 of 2) -9245 NM_001013698 440087 Hs.220931 NM_001013698 ENSG00000179256 SMCO3 C12orf69 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 3 protein-coding 183.333-176 chrX 47600429 47600669 + 1.33333 NA intron (NM_006950, intron 5 of 12) L1M4|LINE|L1 13120 NR_039926 100616147 NR_039926 ENSG00000263858 MIR4769 - microRNA 4769 ncRNA 206.666-37 chr14 24973885 24974059 + 1.33333 NA intron (NM_001351943, intron 3 of 6) intron (NM_001351943, intron 3 of 6) 75028 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 175.333-30 chr12 42050182 42050444 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 94561 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 224.333-128 chr8 133747854 133748057 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 29397 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 199.667-38 chr13 70037895 70038192 + 1.33333 NA intron (NM_020866, intron 1 of 10) L1MD2|LINE|L1 -69170 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 211-44 chr18 28720979 28721147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -543933 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 212.666-16 chr10 122682633 122682809 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9839 NM_001364461 112577516 NM_001364461 LOC112577516 - carbohydrate-binding protein AQN-1-like protein-coding 135-66 chr3 77427471 77427634 + 1.33333 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 329540 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 291.999-9 chr7 108511922 108512332 + 1.33333 NA intron (NM_001256010, intron 3 of 9) intron (NM_001256010, intron 3 of 9) 14008 NM_001256009 50640 Hs.617340 NM_015723 ENSG00000135241 PNPLA8 IPLA2-2|IPLA2G|MMLA|PNPLA-gamma|iPLA2gamma patatin like phospholipase domain containing 8 protein-coding 291.999-4 chr16 13685172 13685425 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -234859 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 318-14 chr12 5008854 5009239 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34833 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 201.333-151 chr2 108426448 108426645 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -22660 NM_181453 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 266.333-3 chr1 186208760 186209109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87339 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 205.333-231 chr7 125670609 125670853 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -406440 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 197.333-61 chr13 102942300 102942467 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 62284 NR_026965 121952 Hs.660773 NR_026965 ENSG00000250878 METTL21EP METTL21CP1 methyltransferase like 21E, pseudogene pseudo 252-99 chr7 83587346 83587607 + 1.33333 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 53955 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 242-23 chr14 64487433 64487776 + 1.33333 NA exon (NM_001354687, exon 4 of 4) exon (NM_001354687, exon 4 of 4) 10388 NM_001354687 7597 Hs.654571 NM_006977 ENSG00000089775 ZBTB25 C14orf51|KUP|ZNF46 zinc finger and BTB domain containing 25 protein-coding 238.667-44 chr2 81740243 81740547 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -273449 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 259.999-11 chr6 113303343 113303551 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 130000 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 286-55 chr7 28685705 28686087 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001011666) promoter-TSS (NM_001011666) -237 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 223.999-5 chr15 45520870 45521038 + 1.33333 NA intron (NR_022014, intron 3 of 5) L2b|LINE|L2 1801 NM_001321036 7782 Hs.162989 NM_013309 ENSG00000104154 SLC30A4 ZNT4|znT-4 solute carrier family 30 member 4 protein-coding 228-31 chr17 10855069 10855267 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -17081 NM_001101387 644139 Hs.553909 NM_001101387 ENSG00000233670 PIRT - phosphoinositide interacting regulator of transient receptor potential channels protein-coding 130.667-65 chr14 51380446 51380590 + 1.33333 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 16617 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 167.333-271 chr9 31598786 31598994 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -217400 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 299.333-42 chr2 158379264 158379811 + 1.33333 NA intron (NM_138803, intron 1 of 13) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 77216 NM_001301685 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 256-8 chr10 33488119 33488516 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -153412 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 174.333-36 chr14 41402742 41402994 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -203988 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 202.666-95 chr5 73560727 73560954 + 1.33333 NA intron (NM_023039, intron 3 of 8) L1MA7|LINE|L1 4799 NM_023039 57763 Hs.239154 NM_023039 ENSG00000164331 ANKRA2 ANKRA ankyrin repeat family A member 2 protein-coding 284-45 chr4 122713582 122713870 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18732 NR_024041 729338 Hs.647968 NR_024041 CETN4P - centrin 4, pseudogene pseudo 153-109 chr5 26678308 26678561 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 360152 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 273.666-18 chr3 150338949 150339341 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -15398 NR_110186 101928022 Hs.555199 NR_110186 LINC01214 - long intergenic non-protein coding RNA 1214 ncRNA 203.333-281 chr9 87309365 87309547 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 160812 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 251.333-15 chr10 112465110 112465389 + 1.33333 NA intron (NM_001365712, intron 3 of 8) intron (NM_001365712, intron 3 of 8) -17646 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 250-56 chr4 69476850 69477216 + 1.33333 NA Intergenic L1M|LINE|L1 18872 NM_001297615 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 201.333-307 chrX 70167102 70167315 + 1.33333 NA TTS (NM_001551) TTS (NM_001551) -10275 NM_198512 347516 Hs.454355 NM_198512 ENSG00000184210 DGAT2L6 DC3 diacylglycerol O-acyltransferase 2 like 6 protein-coding 207.333-113 chr16 82832221 82832507 + 1.33333 NA intron (NM_001220488, intron 2 of 14) intron (NM_001220488, intron 2 of 14) 59045 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 309.333-32 chr2 28923174 28923677 + 1.33333 NA intron (NM_015131, intron 7 of 17) intron (NM_015131, intron 7 of 17) -3642 NR_002741 26796 NR_002741 ENSG00000265145 SNORD53 RNU53|SNORD53A|U53 small nucleolar RNA, C/D box 53 snoRNA 163-56 chr3 77423724 77423876 + 1.33333 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 325788 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 208.666-93 chr5 169689767 169689952 + 1.33333 NA intron (NR_156756, intron 9 of 52) intron (NR_156756, intron 9 of 52) 52584 NM_004946 1794 Hs.586174 NM_004946 ENSG00000134516 DOCK2 IMD40 dedicator of cytokinesis 2 protein-coding 180-111 chr8 88949660 88949940 + 1.33333 NA Intergenic Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger -622317 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 422.666 chr14 48772040 48772455 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 814133 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 294.666-26 chr5 44322641 44322958 + 1.33333 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) Charlie3|DNA|hAT-Charlie -65933 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 215.667-64 chr2 152384885 152385195 + 1.33333 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 49866 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 298.333-33 chr4 148703546 148704028 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 238591 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 180-3 chr1 51458267 51458440 + 1.33333 NA intron (NM_001981, intron 8 of 24) intron (NM_001981, intron 8 of 24) -36258 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 366.999 chr10 81156758 81157070 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 507117 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 206.666-16 chr10 15826279 15826537 + 1.33333 NA intron (NM_024948, intron 8 of 14) intron (NM_024948, intron 8 of 14) 34099 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 206-105 chr22 41519341 41519641 + 1.33333 NA intron (NM_001098, intron 8 of 17) intron (NM_001098, intron 8 of 17) 24979 NM_001018050 171568 Hs.712617 NM_138338 ENSG00000100413 POLR3H RPC22.9|RPC8 RNA polymerase III subunit H protein-coding 239.333-61 chr20 3490696 3490942 + 1.33333 NA intron (NM_001323332, intron 1 of 25) intron (NM_001323332, intron 1 of 25) 19801 NM_001207047 8455 Hs.276252 NM_012070 ENSG00000088812 ATRN DPPT-L|MGCA attractin protein-coding 215.666-14 chr14 21056125 21056319 + 1.33333 NA intron (NM_001282211, intron 1 of 14) intron (NM_001282211, intron 1 of 14) -1600 NM_138331 122665 Hs.553572 NM_138331 ENSG00000173431 RNASE8 RAE2 ribonuclease A family member 8 protein-coding 208-155 chr7 15845886 15846138 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 157634 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 243.666-39 chr7 152294491 152294717 + 1.33333 NA intron (NM_170606, intron 6 of 58) AluJr|SINE|Alu 141399 NM_170606 58508 Hs.647120 NM_021230 ENSG00000055609 KMT2C HALR|KLEFS2|MLL3 lysine methyltransferase 2C protein-coding 253.333-42 chr17 27246983 27247275 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 46867 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 228.333-17 chr12 5255381 5255653 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -12366 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 340-18 chr2 219965721 219966292 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59441 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 290-22 chr2 149426231 149426743 + 1.33333 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) intron (NM_194317, intron 1 of 4) 95900 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 186-24 chr12 118329111 118329325 + 1.33333 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) intron (NM_001346490, intron 1 of 21) 30487 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 176-85 chr7 30631077 30631333 + 1.33333 NA intron (NM_002047, intron 14 of 16) MIRc|SINE|MIR 36327 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 148.667-389 chr8 126176024 126176268 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -149349 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 286.999-9 chr3 171471242 171471618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11022 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 200.666-108 chr7 4543679 4543888 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -138512 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 212.666-99 chr9 95778916 95779124 + 1.33333 NA Intergenic UCON55|DNA|TcMar-Tigger -96671 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 210.333-178 chr9 38206188 38206421 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137077 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 210.666-30 chr14 51602743 51602993 + 1.33333 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) intron (NM_001042481, intron 2 of 14) -2916 NR_047477 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 338.333-11 chr2 37472150 37472435 + 1.33333 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 127662 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 198-85 chr2 39292722 39293003 + 1.33333 NA intron (NM_003618, intron 17 of 33) intron (NM_003618, intron 17 of 33) -48879 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 373.333-25 chr6 126790117 126790531 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 305693 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 344.666-6 chr13 24781337 24781826 + 1.33333 NA intron (NM_031277, intron 5 of 35) AluJr4|SINE|Alu 17412 NM_001184993 56163 Hs.97464 NM_031277 ENSG00000132972 RNF17 Mmip-2|SPATA23|TDRD4 ring finger protein 17 protein-coding 361.666-6 chr2 210555106 210555428 + 1.33333 NA intron (NR_161225, intron 1 of 38) L2c|LINE|L2 -1332 NM_001875 1373 Hs.149252 NM_001875 ENSG00000021826 CPS1 CPSASE1|PHN carbamoyl-phosphate synthase 1 protein-coding 175.667-38 chr14 67285199 67285370 + 1.33333 NA intron (NM_001256550, intron 3 of 14) intron (NM_001256550, intron 3 of 14) 43849 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 198-12 chr1 214538085 214538330 + 1.33333 NA intron (NM_005401, intron 1 of 18) (AAGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 13395 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 366-16 chr3 97137212 97137612 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) MIR|SINE|MIR -302195 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 201.333-87 chr13 96749739 96749894 + 1.33333 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L1M5|LINE|L1 234356 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 221.666-49 chr6 61964568 61964822 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) intron (NR_146874, intron 4 of 13) 321530 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 218-34 chr16 26465842 26466084 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 440726 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 240-23 chr14 54649778 54650080 + 1.33333 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 82317 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 212-86 chr2 58100367 58100540 + 1.33333 NA intron (NM_001130483, intron 7 of 13) intron (NM_001130483, intron 7 of 13) 53741 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 261.333-61 chr22 17476737 17477038 + 1.33333 NA intron (NM_001290047, intron 1 of 18) intron (NM_001290047, intron 1 of 18) -86552 NM_001303484 83733 Hs.282982 NM_031481 ENSG00000182902 SLC25A18 GC2 solute carrier family 25 member 18 protein-coding 425.333-11 chr7 18698368 18698948 + 1.33333 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) intron (NM_058176, intron 11 of 22) 189388 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 366.333-5 chr10 92374516 92374832 + 1.33333 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -43987 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 370.333-19 chr3 155235409 155235786 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -5348 NR_125399 101928190 Hs.121410 NR_125399 ENSG00000241336 LINC01487 - long intergenic non-protein coding RNA 1487 ncRNA 119.333-234 chr9 29034928 29035099 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -146058 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 198.666-24 chr14 44900148 44900319 + 1.33333 NA intron (NR_110050, intron 1 of 2) intron (NR_110050, intron 1 of 2) 2958 NM_001017923 122525 Hs.82098 NM_001017923 ENSG00000179476 C14orf28 DRIP-1|DRIP1|c14_5270 chromosome 14 open reading frame 28 protein-coding 204.333-191 chr7 106839536 106839766 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25631 NM_001282426 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 242-46 chr2 173174840 173175202 + 1.33333 NA intron (NM_133646, intron 3 of 11) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 99175 NM_016653 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 162.333-50 chr12 27574879 27575030 + 1.33333 NA intron (NM_003622, intron 1 of 29) intron (NM_003622, intron 1 of 29) 50748 NM_001198916 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 206-36 chr11 101098216 101098386 + 1.33333 NA intron (NM_000926, intron 2 of 7) intron (NM_000926, intron 2 of 7) 30762 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 171.666-3 chr12 119221195 119221375 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 42495 NM_014365 26353 Hs.400095 NM_014365 ENSG00000152137 HSPB8 CMT2L|DHMN2|E2IG1|H11|HMN2|HMN2A|HSP22 heat shock protein family B (small) member 8 protein-coding 199.666-2 chr1 85911140 85911313 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 25 of 59) intron (NM_152890, intron 25 of 59) -202793 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 168-10 chr10 52330959 52331147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16772 NM_012242 22943 Hs.40499 NM_012242 ENSG00000107984 DKK1 DKK-1|SK dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 1 protein-coding 202.666-78 chr3 116003431 116003659 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -98419 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 164.667-62 chr13 60752029 60752252 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 79185 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 176.333-61 chr16 51091604 51091753 + 1.33333 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) intron (NR_039672, intron 2 of 6) 58919 NM_001127892 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 209.333-147 chr3 20229730 20230000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43632 NM_001199255 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 381.999-7 chr3 176052616 176052976 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -191755 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 219.333-139 chr5 22876277 22876477 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23033 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 184-62 chr21 27681345 27681535 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40939 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 156-54 chr15 90267222 90267451 + 1.33333 NA intron (NM_001033088, intron 2 of 2) intron (NM_001033088, intron 2 of 2) -1577 NR_102428 10519 Hs.715556 NM_006384 ENSG00000185043 CIB1 CIB|CIBP|KIP1|PRKDCIP|SIP2-28 calcium and integrin binding 1 protein-coding 226-38 chr2 56644794 56644982 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -459118 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 236-22 chr14 45347622 45347940 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -94579 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 186.666-3 chr1 97902265 97902436 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 1 of 22) intron (NM_000110, intron 1 of 22) 18709 NM_000110 1806 Hs.335034 NM_000110 ENSG00000188641 DPYD DHP|DHPDHASE|DPD dihydropyrimidine dehydrogenase protein-coding 146.667-288 chr6 141085439 141085654 + 1.33333 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 401732 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 307.333-39 chr2 11530117 11530432 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3771 NM_014668 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 456.333 chr11 43245365 43245904 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 23735 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 205.667-46 chr14 50825623 50825862 + 1.33333 NA intron (NM_016350, intron 2 of 28) intron (NM_016350, intron 2 of 28) 3945 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 248.333-20 chr12 39754803 39755093 + 1.33333 NA TTS (NM_052885) TTS (NM_052885) 128765 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 246.666-6 chr11 2412269 2412525 + 1.33333 NA intron (NM_014555, intron 15 of 23) intron (NM_014555, intron 15 of 23) 10648 NM_014555 29850 Hs.272287 NM_014555 ENSG00000070985 TRPM5 LTRPC5|MTR1 transient receptor potential cation channel subfamily M member 5 protein-coding 222.333-37 chr17 76499700 76499984 + 1.33333 NA intron (NM_024599, intron 1 of 18) intron (NM_024599, intron 1 of 18) 1585 NM_024599 79651 Hs.464157 NM_024599 ENSG00000129667 RHBDF2 RHBDL5|RHBDL6|TEC|TOC|TOCG|iRhom2 rhomboid 5 homolog 2 protein-coding 114.333-241 chr9 95903566 95903722 + 1.33333 NA intron (NM_020207, intron 3 of 18) intron (NM_020207, intron 3 of 18) 27636 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 181.333-171 chr8 76508529 76508754 + 1.33333 NA intron (NR_105006, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 101987 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 253.333-87 chr5 116296247 116296585 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 40673 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 301.333-18 chr15 68132891 68133443 + 1.33333 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) L1MC4a|LINE|L1 72943 NR_104583 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 209.666-52 chr8 33470801 33470964 + 1.33333 NA intron (NM_032664, intron 1 of 4) intron (NM_032664, intron 1 of 4) 2264 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 208.333-87 chr20 34744955 34745264 + 1.33333 NA intron (NM_001318240, intron 11 of 15) intron (NM_001318240, intron 11 of 15) 37295 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 259-34 chr3 5094407 5094690 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27744 NM_018184 55207 Hs.250009 NM_018184 ENSG00000134108 ARL8B ARL10C|Gie1 ADP ribosylation factor like GTPase 8B protein-coding 367.333 chr1 153521096 153521478 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14704 NM_014624 6277 Hs.275243 NM_014624 ENSG00000197956 S100A6 2A9|5B10|CABP|CACY|PRA|S10A6 S100 calcium binding protein A6 protein-coding 214-99 chr4 115497462 115497647 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -383934 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 328.333-16 chr16 75012656 75013115 + 1.33333 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) intron (NM_032268, intron 1 of 4) 13861 NM_032268 84937 Hs.427284 NM_032268 ENSG00000186187 ZNRF1 NIN283 zinc and ring finger 1 protein-coding 191-30 chr2 78476599 78476857 + 1.33333 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -68803 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 203.666-14 chr10 119581786 119581990 + 1.33333 NA intron (NM_001323964, intron 5 of 12) intron (NM_001323964, intron 5 of 12) 15141 NM_001033925 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 257.666-28 chr9 35384291 35384563 + 1.33333 NA intron (NM_006377, intron 21 of 38) intron (NM_006377, intron 21 of 38) -22328 NR_003581 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 174-24 chr13 55692635 55692891 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 518309 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 223.667-7 chr1 104634372 104634660 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 561493 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 250.666-4 chr10 95736811 95737038 + 1.33333 NA intron (NM_001098175, intron 1 of 9) intron (NM_001098175, intron 1 of 9) -18728 NM_001164181 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 269.667-18 chr12 56395418 56395824 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -32764 NM_001638 319 Hs.534302 NM_001638 ENSG00000175336 APOF Apo-F|LTIP apolipoprotein F protein-coding 219-67 chr5 2395509 2395781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83444 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 196-178 chr8 62507133 62507381 + 1.33333 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 258403 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 255.666-28 chr8 79398248 79398558 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 66215 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 271.667-18 chr12 17040373 17040733 + 1.33333 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac 51806 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 266-20 chr12 120322630 120323049 + 1.33333 NA intron (NM_000928, intron 3 of 3) AluSq2|SINE|Alu 4940 NM_000928 5319 Hs.992 NM_000928 ENSG00000170890 PLA2G1B PLA2|PLA2A|PPLA2 phospholipase A2 group IB protein-coding 153-28 chr12 24046035 24046201 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -95086 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 323.333 chr10 73474526 73474894 + 1.33333 NA intron (NM_001142353, intron 4 of 13) AluSx|SINE|Alu -21042 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 220.333-131 chr8 112543405 112543702 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 25 of 66) L1MB1|LINE|L1 -99940 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 170-53 chr18 52250113 52250309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89986 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 253.333-9 chr10 74961293 74961526 + 1.33333 NA intron (NM_001370135, intron 4 of 9) intron (NM_001370135, intron 4 of 9) 48623 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 233.333-117 chr7 16195361 16195636 + 1.33333 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) intron (NM_001101426, intron 9 of 9) -14988 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 203.666-54 chr8 124566466 124566669 + 1.33333 NA intron (NM_001282971, intron 9 of 14) intron (NM_001282971, intron 9 of 14) 27444 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 345.667-2 chr10 8904472 8904982 + 1.33333 NA intron (NR_131944, intron 2 of 3) intron (NR_131944, intron 2 of 3) 6738 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 300-50 chr5 54307459 54307769 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 1 of 4) intron (NM_019087, intron 1 of 4) 2959 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 192-124 chr6 83264256 83264472 + 1.33333 NA intron (NM_002395, intron 6 of 13) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -70464 NM_001199917 5238 Hs.661665 NM_015599 ENSG00000013375 PGM3 AGM1|IMD23|PAGM|PGM 3 phosphoglucomutase 3 protein-coding 207-35 chr14 57259744 57260028 + 1.33333 NA intron (NM_006544, intron 1 of 17) intron (NM_006544, intron 1 of 17) 9019 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 344.333-28 chr8 117536439 117536794 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001363182, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001363182, exon 4 of 4) 15903 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 266.999-3 chr2 139792220 139792534 + 1.33333 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 794308 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 191.667-88 chr3 183351234 183351515 + 1.33333 NA intron (NM_015078, intron 3 of 29) intron (NM_015078, intron 3 of 29) 76895 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 193.333-143 chr4 114761389 114761636 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 104753 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 256.333-37 chr19 31138882 31139135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28502 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 320.667-6 chr10 75031218 75031667 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_012330, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_012330, exon 18 of 18) 9709 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 138.666-4 chr18 4828516 4828651 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -252599 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 222.666-45 chr5 34593358 34593686 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -62806 NM_015577 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 279.999-5 chr2 15379015 15379246 + 1.33333 NA intron (NR_052013, intron 30 of 50) intron (NR_052013, intron 30 of 50) 182204 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 245-62 chr6 111518808 111519162 + 1.33333 NA intron (NR_034109, intron 1 of 1) intron (NR_034109, intron 1 of 1) -35270 NM_001286432 5980 Hs.232021 NM_002912 ENSG00000009413 REV3L POLZ|REV3 REV3 like, DNA directed polymerase zeta catalytic subunit protein-coding 239-58 chr6 107034344 107034651 + 1.33333 NA intron (NM_001142470, intron 2 of 4) intron (NM_001142470, intron 2 of 4) 6298 NM_016487 51250 Hs.486084 NM_016487 ENSG00000130349 C6orf203 HSPC230|PRED31 chromosome 6 open reading frame 203 protein-coding 194-21 chr11 103130893 103131129 + 1.33333 NA intron (NM_001377, intron 13 of 88) intron (NM_001377, intron 13 of 88) 21585 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 184.666-27 chr5 4852015 4852180 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 78616 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 228-48 chr2 179003979 179004300 + 1.33333 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) intron (NM_001316745, intron 2 of 11) 45998 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 201.333-245 chr6 113268899 113269214 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 164391 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 131-72 chr4 104053740 104053919 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -333844 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 446.666-3 chr2 78648180 78648763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 102940 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 198.666-69 chr4 67199074 67199287 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 222820 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 213.999-3 chr15 67637391 67637555 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 9 of 21) L1MEc|LINE|L1 88379 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 321.333-8 chr1 228737793 228738070 + 1.33333 NA intron (NM_021205, intron 2 of 2) intron (NM_021205, intron 2 of 2) 2452 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 268-30 chr2 152777434 152777803 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58981 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 372-3 chr10 56608526 56608952 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -247466 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 335-33 chr8 137024493 137024874 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 388905 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 377.333-11 chr2 126752929 126753272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 96942 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 205-26 chr13 45499110 45499379 + 1.33333 NA intron (NM_031431, intron 13 of 22) L1MC5|LINE|L1 34305 NM_031431 83548 Hs.507948 NM_031431 ENSG00000136152 COG3 SEC34 component of oligomeric golgi complex 3 protein-coding 310.666-25 chr8 118034584 118034898 + 1.33333 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 77078 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 241-65 chrX 99825428 99825634 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 584742 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 301-33 chr4 20443807 20444355 + 1.33333 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) intron (NM_001289135, intron 4 of 35) 51892 NR_037876 100505893 Hs.665305 NR_037876 ENSG00000248228 SLIT2-IT1 - SLIT2 intronic transcript 1 ncRNA 204.333-188 chr7 78556149 78556417 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 3 of 20) intron (NM_001301128, intron 3 of 20) 209041 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 206.333-42 chr12 122900844 122901043 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4819 NM_024667 79720 Hs.507162 NM_024667 ENSG00000139722 VPS37B - VPS37B subunit of ESCRT-I protein-coding 205-54 chr20 53283368 53283560 + 1.33333 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 98181 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 234.667-6 chr1 241758667 241758989 + 1.33333 NA intron (NM_001367482, intron 15 of 27) L1MC5|LINE|L1 -89363 NM_001319224 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 239-57 chr6 53193197 53193561 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -44538 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 200.667 chr1 17068177 17068438 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_007365, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_007365, exon 16 of 16) -14137 NM_003000 6390 Hs.465924 NM_003000 ENSG00000117118 SDHB CWS2|IP|PGL4|SDH|SDH1|SDH2|SDHIP succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B protein-coding 198-24 chr10 118212940 118213135 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 129287 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 204.667-70 chr2 40479779 40480022 + 1.33333 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) intron (NM_001112802, intron 1 of 7) -27810 NM_001351491 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 212-6 chr1 44379979 44380201 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -24811 NM_001301699 79033 Hs.731413 NM_024066 ENSG00000117419 ERI3 PINT1|PRNPIP ERI1 exoribonuclease family member 3 protein-coding 530.666-2 chr8 3188433 3189479 + 1.33333 NA exon (NM_033225, exon 35 of 70) exon (NM_033225, exon 35 of 70) -460505 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 182-90 chr5 157209576 157209784 + 1.33333 NA intron (NM_005546, intron 2 of 16) intron (NM_005546, intron 2 of 16) 28784 NM_005546 3702 Hs.558348 NM_005546 ENSG00000113263 ITK EMT|LPFS1|LYK|PSCTK2 IL2 inducible T cell kinase protein-coding 214-46 chr16 57641666 57641893 + 1.33333 NA intron (NM_001370454, intron 2 of 13) AluSz6|SINE|Alu 2287 NM_001290144 9289 Hs.513633 NM_005682 ENSG00000205336 ADGRG1 BFPP|BPPR|GPR56|TM7LN4|TM7XN1 adhesion G protein-coupled receptor G1 protein-coding 211.667-84 chr3 115244877 115245155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -97728 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 228.333-9 chr10 95618702 95618888 + 1.33333 NA intron (NM_001323414, intron 12 of 17) intron (NM_001323414, intron 12 of 17) 37916 NM_001323418 5832 Hs.500645 NM_002860 ENSG00000059573 ALDH18A1 ADCL3|ARCL3A|GSAS|P5CS|PYCS|SPG9|SPG9A|SPG9B aldehyde dehydrogenase 18 family member A1 protein-coding 212.666-58 chr4 16289228 16289426 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 62664 NR_027697 202020 Hs.445315 NM_152684 ENSG00000263327 TAPT1-AS1 - TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 260.333-29 chr19 45389106 45389457 + 1.33333 NA intron (NM_006663, intron 8 of 12) intron (NM_006663, intron 8 of 12) 15788 NM_006663 10848 Hs.466937 NM_006663 ENSG00000104881 PPP1R13L IASPP|NKIP1|RAI|RAI4 protein phosphatase 1 regulatory subunit 13 like protein-coding 374-13 chr3 79167366 79167800 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -148124 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 120.333-118 chr20 35355243 35355407 + 1.33333 NA intron (NM_001184977, intron 4 of 7) intron (NM_001184977, intron 4 of 7) 56648 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 178.667-73 chr2 5209001 5209205 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 482015 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 206-198 chrX 124545998 124546247 + 1.33333 NA intron (NM_014253, intron 15 of 30) intron (NM_014253, intron 15 of 30) 199840 NM_002351 4068 Hs.349094 NM_002351 ENSG00000183918 SH2D1A DSHP|EBVS|IMD5|LYP|MTCP1|SAP|SAP/SH2D1A|XLP|XLPD|XLPD1 SH2 domain containing 1A protein-coding 286.333-44 chr8 113315738 113316187 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) AluSx|SINE|Alu 61190 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 223.333-69 chr2 67703093 67703296 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 122368 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 214-59 chr2 9344321 9344539 + 1.33333 NA intron (NM_003887, intron 9 of 27) intron (NM_003887, intron 9 of 27) 78161 NM_001319068 9270 Hs.467662 NM_004763 ENSG00000119185 ITGB1BP1 ICAP-1A|ICAP-1B|ICAP-1alpha|ICAP1|ICAP1A|ICAP1B integrin subunit beta 1 binding protein 1 protein-coding 200.666-36 chr14 78765942 78766142 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) intron (NR_073547, intron 8 of 20) 362323 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 283.666-16 chrX 83851900 83852296 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -9028 NM_001271680 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 252.666-10 chr14 51560693 51561004 + 1.33333 NA intron (NR_047477, intron 2 of 3) intron (NR_047477, intron 2 of 3) 39104 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 317.333-36 chr6 151792172 151792517 + 1.33333 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -13329 NM_001291241 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 197-84 chr4 102362277 102362455 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -16884 NM_001135146 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 216-7 chr1 210809696 210809994 + 1.33333 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) MER72|LTR|ERV1 323529 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 155-32 chr14 65503028 65503306 + 1.33333 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 32065 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 248-82 chr7 132322659 132323012 + 1.33333 NA intron (NM_020911, intron 3 of 31) intron (NM_020911, intron 3 of 31) 61974 NR_134565 101928807 Hs.552131 NR_134565 LOC101928807 - uncharacterized LOC101928807 ncRNA 176.333-132 chr5 31596407 31596653 + 1.33333 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -42601 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 189.333-95 chr2 81522309 81522462 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55439 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 223.333-154 chr7 38033237 38033407 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 112003 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 296.666-31 chr6 122888293 122888537 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 99157 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 278.667-52 chr8 122671726 122672189 + 1.33333 NA intron (NR_126348, intron 2 of 3) HAL1|LINE|L1 22149 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 188-37 chr15 66349319 66349536 + 1.33333 NA exon (NM_017858, exon 5 of 8) exon (NM_017858, exon 5 of 8) -2085 NR_004388 692149 NR_004388 ENSG00000252712 SCARNA14 U100 small Cajal body-specific RNA 14 ncRNA 220-34 chr14 20049865 20050109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10058 NM_001004717 122742 Hs.553574 NM_001004717 ENSG00000176246 OR4L1 OR14-28|OR4L2P olfactory receptor family 4 subfamily L member 1 protein-coding 232.333-58 chr3 109462376 109462644 + 1.33333 NA intron (NR_109841, intron 3 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 52520 NR_109842 401082 Hs.477089 NM_001145553 ENSG00000228980 LINC01205 - long intergenic non-protein coding RNA 1205 ncRNA 325-23 chr4 53284621 53285180 + 1.33333 NA intron (NM_152540, intron 3 of 8) intron (NM_152540, intron 3 of 8) 81161 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 182-100 chr7 27700793 27701007 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38017 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 193.333-170 chr7 83474168 83474368 + 1.33333 NA intron (NM_001178129, intron 2 of 16) intron (NM_001178129, intron 2 of 16) 167163 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 217-72 chr5 20570544 20570840 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 5021 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 216.333-134 chr8 77035239 77035469 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34310 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 130.333-143 chr4 17125880 17126042 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60096 NR_125919 101929123 Hs.638913 NR_125919 ENSG00000250819 LINC02493 - long intergenic non-protein coding RNA 2493 ncRNA 341.333-9 chr14 62571956 62572317 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -432163 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 216-60 chr2 101273838 101274103 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_003070) promoter-TSS (NR_003070) -921 NR_003070 692205 Hs.656503 NR_003070 ENSG00000212283 SNORD89 HBII-289 small nucleolar RNA, C/D box 89 snoRNA 274.666-21 chr3 99844420 99844738 + 1.33333 NA intron (NM_001282794, intron 2 of 2) intron (NM_001282794, intron 2 of 2) -20714 NR_110821 101929357 Hs.741615 NR_110821 HP09053 - uncharacterized LOC101929357 ncRNA 194-65 chr2 10576659 10576811 + 1.33333 NA intron (NR_048552, intron 19 of 19) L1MB7|LINE|L1 113240 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 198-103 chr2 197869515 197869697 + 1.33333 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 65013 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 190.667-8 chr1 91951627 91951880 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001726) promoter-TSS (NM_001726) -399 NM_001726 676 Hs.482520 NM_001726 ENSG00000137948 BRDT BRD6|CT9|SPGF21 bromodomain testis associated protein-coding 235.333-33 chr14 71504933 71505163 + 1.33333 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) (CATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 17187 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 331.999-2 chr11 57759819 57760324 + 1.33333 NA intron (NR_037646, intron 2 of 20) AluSq2|SINE|Alu -1731 NM_001085462 1500 Hs.166011 NM_001331 ENSG00000198561 CTNND1 BCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN) catenin delta 1 protein-coding 293.333-71 chr9 119246606 119246953 + 1.33333 NA intron (NM_014618, intron 3 of 7) MIRb|SINE|MIR 122656 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 179.333-67 chr15 25873350 25873536 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -10241 NM_024490 57194 Hs.638517 NM_024490 ENSG00000206190 ATP10A ATP10C|ATPVA|ATPVC ATPase phospholipid transporting 10A (putative) protein-coding 183.333-113 chr4 45906844 45907051 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 217107 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 230-5 chr1 188794685 188794887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1351158 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 192-24 chr10 80871945 80872182 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 222266 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 191.333-119 chr2 216313415 216313652 + 1.33333 NA intron (NM_020814, intron 1 of 3) intron (NM_020814, intron 1 of 3) 58950 NM_020814 57574 Hs.170388 NM_020814 ENSG00000144583 MARCH4 MARCH-IV|RNF174 membrane associated ring-CH-type finger 4 protein-coding 208-92 chr20 53671446 53671638 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 63188 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 263.333-40 chr2 29587125 29587440 + 1.33333 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -111905 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 283.666-12 chr8 120752005 120752410 + 1.33333 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) -9046 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 244.666-50 chr8 43848272 43848483 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 555935 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 280.666-12 chr2 118166037 118166508 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 20114 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 263-8 chr1 221646577 221646905 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90159 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 409.333-4 chr10 68771910 68772648 + 1.33333 NA intron (NR_104262, intron 17 of 23) AluJb|SINE|Alu 17107 NR_003076 692211 NR_003076 ENSG00000283551 SNORD98 HBII-419 small nucleolar RNA, C/D box 98 snoRNA 198-151 chr5 30676704 30676864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -516902 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 241.333-59 chr20 35980981 35981173 + 1.33333 NA intron (NR_130714, intron 4 of 8) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 12487 NM_001304367 140894 Hs.732697 NM_080834 ENSG00000149646 CNBD2 C20orf152|CNMPD1 cyclic nucleotide binding domain containing 2 protein-coding 195.333-88 chr15 43774673 43774869 + 1.33333 NA exon (NM_025165, exon 7 of 11) exon (NM_025165, exon 7 of 11) 2195 NM_025165 80237 Hs.706346 NM_025165 ENSG00000128886 ELL3 - elongation factor for RNA polymerase II 3 protein-coding 185.667-64 chr2 21305805 21305976 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 181904 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 148.667-147 chr16 48202862 48203027 + 1.33333 NA intron (NM_001370497, intron 14 of 29) intron (NM_001370497, intron 14 of 29) 29327 NM_033151 85320 Hs.652267 NM_032583 ENSG00000121270 ABCC11 EWWD|MRP8|WW ATP binding cassette subfamily C member 11 protein-coding 228-5 chr1 210031912 210032243 + 1.33333 NA intron (NM_153262, intron 4 of 7) intron (NM_153262, intron 4 of 7) 93860 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 184-77 chr4 161091529 161091770 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -931084 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 221.999 chr11 110844538 110844708 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -131434 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 188-18 chr10 54114287 54114515 + 1.33333 NA intron (NM_001354411, intron 16 of 34) intron (NM_001354411, intron 16 of 34) -371829 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 444.667-8 chr9 71846584 71847216 + 1.33333 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 64345 NM_001025780 51104 Hs.380389 NM_016014 ENSG00000107362 ABHD17B C9orf77|CGI-67|FAM108B1 abhydrolase domain containing 17B protein-coding 221.667-85 chr8 126079605 126079931 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -128571 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 244.333-106 chr8 125895975 125896382 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55019 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 433-4 chr17 58019240 58019960 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12254 NR_034041 6426 Hs.68714 NM_006924 ENSG00000136450 SRSF1 ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a serine and arginine rich splicing factor 1 protein-coding 207.333-191 chr3 196516676 196516833 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1408 NM_001320473 255798 Hs.631933 NM_001077657 ENSG00000214097 SMCO1 C3orf43 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 1 protein-coding 154.333-121 chr17 59236661 59236884 + 1.33333 NA intron (NM_182569, intron 2 of 9) AluSx1|SINE|Alu 16261 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 375.333-25 chr5 41592232 41592759 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -81894 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 161.667-258 chr8 108858131 108858384 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -70663 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 335-13 chr18 6876555 6877070 + 1.33333 NA intron (NM_001010000, intron 9 of 16) intron (NM_001010000, intron 9 of 16) 42327 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 246-56 chr20 33940441 33940743 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -53319 NM_016732 22913 Hs.136947 NM_007367 ENSG00000125970 RALY HNRPCL2|P542 RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein-coding 204.666-96 chr8 16374030 16374195 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -181321 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 219.333-22 chr10 34457382 34457550 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 4 of 22) intron (NM_001184789, intron 4 of 22) 357830 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 278.333-2 chr1 13915434 13915869 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 166236 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 200-35 chr11 100362126 100362403 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -325024 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 326.999-4 chr5 167439383 167439657 + 1.33333 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) MIRb|SINE|MIR -134139 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 210-54 chr18 34721013 34721214 + 1.33333 NA intron (NM_032978, intron 1 of 16) MIRc|SINE|MIR 10815 NM_032978 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 270-19 chr17 19548803 19549173 + 1.33333 NA intron (NM_018242, intron 4 of 16) MER20|DNA|hAT-Charlie -8572 NR_003025 677885 Hs.658450 NR_003025 ENSG00000239149 SNORA59A ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59A snoRNA 122.333-197 chr7 106744161 106744311 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83078 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 184-5 chr1 77416227 77416478 + 1.33333 NA intron (NM_012093, intron 7 of 13) intron (NM_012093, intron 7 of 13) 133265 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 343.666-8 chr6 143858068 143858373 + 1.33333 NA intron (NM_001329953, intron 6 of 10) intron (NM_001329953, intron 6 of 10) -6254 NM_001013623 153918 Hs.121188 NM_001013623 ENSG00000118491 ZC2HC1B C6orf94|FAM164B|dJ468K18.5 zinc finger C2HC-type containing 1B protein-coding 164-29 chr12 73489626 73489850 + 1.33333 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 330548 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 180.667-147 chr8 113162888 113163123 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) intron (NM_001363185, intron 4 of 66) 214147 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 214.666-19 chr13 110893662 110893850 + 1.33333 NA intron (NM_017664, intron 3 of 5) intron (NM_017664, intron 3 of 5) 21313 NM_001286721 55608 Hs.525163 NM_017664 ENSG00000088448 ANKRD10 - ankyrin repeat domain 10 protein-coding 235.333 chr1 1196403 1196617 + 1.33333 NA intron (NM_001130045, intron 13 of 15) intron (NM_001130045, intron 13 of 15) 10082 NM_148902 8784 Hs.212680 NM_004195 ENSG00000186891 TNFRSF18 AITR|CD357|ENERGEN|GITR|GITR-D TNF receptor superfamily member 18 protein-coding 339.333-27 chr2 182514234 182514645 + 1.33333 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) L1PA13|LINE|L1 8087 NM_005019 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 246-67 chr3 51624587 51624809 + 1.33333 NA intron (NM_001322253, intron 4 of 23) MIR|SINE|MIR -46477 NM_001243727 51368 Hs.517864 NM_015926 ENSG00000164081 TEX264 ZSIG11 testis expressed 264, ER-phagy receptor protein-coding 216.333-116 chr5 75934226 75934481 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -149030 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 178-80 chr3 118887518 118887722 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -55456 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 216.666-12 chr10 36038006 36038172 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 259787 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 242-58 chr5 56880086 56880314 + 1.33333 NA intron (NM_005921, intron 11 of 19) intron (NM_005921, intron 11 of 19) -29060 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 204.333-133 chr3 179213100 179213380 + 1.33333 NA intron (NM_006218, intron 9 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 38375 NM_014407 27094 Hs.591285 NM_014407 ENSG00000171121 KCNMB3 BKBETA3|HBETA3|K(VCA)BETA-3|KCNMB2|KCNMBL|SLO-BETA-3|SLOBETA3 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 3 protein-coding 415.667-3 chr4 39888761 39889160 + 1.33333 NA intron (NM_001100399, intron 17 of 32) L1MA4|LINE|L1 88951 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 255.667-67 chr5 19897613 19897936 + 1.33333 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) L1ME3A|LINE|L1 -11502 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 293.333-49 chr5 24062164 24062527 + 1.33333 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 110997 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 207.667-19 chr11 108104945 108105250 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003478, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_003478, exon 19 of 19) -16470 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 276.333-33 chr22 27403397 27403812 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 92953 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 199.333-111 chr18 13749997 13750263 + 1.33333 NA intron (NM_003799, intron 9 of 11) intron (NM_003799, intron 9 of 11) 23457 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 394-12 chr3 142735454 142736031 + 1.33333 NA intron (NM_001251845, intron 1 of 12) intron (NM_001251845, intron 1 of 12) 11318 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 174.333-15 chr10 65990260 65990410 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) L1MA4A|LINE|L1 418910 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 203.667-124 chr8 108094403 108094680 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -10921 NM_178565 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 196.666-31 chr15 98743313 98743539 + 1.33333 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) -41000 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 197.333-118 chr2 142774921 142775123 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -102642 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 152.666-11 chr9 30538224 30538379 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -129847 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 191.667-40 chr12 46264067 46264336 + 1.33333 NA intron (NM_001278387, intron 1 of 17) intron (NM_001278387, intron 1 of 17) 2315 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 238.333-7 chr10 37675137 37675353 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -72314 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 187.333-193 chr8 13816998 13817209 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 187413 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 331-26 chr3 13500139 13500565 + 1.33333 NA intron (NM_001136041, intron 5 of 9) intron (NM_001136041, intron 5 of 9) 20046 NM_001136041 79885 Hs.744132 NM_024827 ENSG00000163517 HDAC11 HD11 histone deacetylase 11 protein-coding 283.666-3 chr14 73933401 73933792 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_152445, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_152445, exon 9 of 9) -16338 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 250.333-33 chr20 9563803 9564177 + 1.33333 NA intron (NM_020341, intron 6 of 10) intron (NM_020341, intron 6 of 10) -48992 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 195-43 chr15 99153402 99153646 + 1.33333 NA intron (NR_109947, intron 11 of 12) intron (NR_109947, intron 11 of 12) 48444 NM_015286 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 223-50 chr5 2873951 2874221 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43768 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 300.333-30 chr22 41107087 41107386 + 1.33333 NA intron (NM_001429, intron 1 of 30) intron (NM_001429, intron 1 of 30) 14644 NM_001429 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 242.666-21 chr19 14629260 14629478 + 1.33333 NA intron (NM_032571, intron 14 of 15) intron (NM_032571, intron 14 of 15) 7156 NR_132784 106635534 NR_132784 SNORA104 - small nucleolar RNA, H/ACA box 104 snoRNA 199.333-259 chr7 38310307 38310526 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31161 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 350.666-13 chr18 60451437 60451833 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -78860 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 217.333-83 chr21 33254316 33254608 + 1.33333 NA intron (NM_001289128, intron 7 of 7) MER4D1|LTR|ERV1 11798 NR_038974 100288432 Hs.709795 NR_038974 IL10RB-DT IFNAR2-AS1|IL10RB-AS1 IL10RB divergent transcript ncRNA 192.333-26 chr11 5818689 5818908 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1538 NM_001005174 390077 Hs.553737 NM_001005174 ENSG00000180988 OR52N2 OR11-57 olfactory receptor family 52 subfamily N member 2 protein-coding 323.666-8 chr21 29526222 29526766 + 1.33333 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 30447 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 214.666-48 chr4 45651400 45651568 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 472570 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 205.666-45 chr5 113205890 113206110 + 1.33333 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 88938 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 200.667-41 chr14 43528117 43528388 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 979031 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 206-131 chr4 98410311 98410516 + 1.33333 NA intron (NM_021159, intron 7 of 14) L1ME3B|LINE|L1 149029 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 348-21 chr5 118932380 118932795 + 1.33333 NA intron (NM_001308081, intron 3 of 5) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -41999 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 200.333-113 chr5 32904241 32904393 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -43126 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 177.667-143 chr9 29582698 29582926 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -369211 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 192.666-25 chr15 44338795 44338959 + 1.33333 NA intron (NM_177974, intron 6 of 8) intron (NM_177974, intron 6 of 8) 50158 NM_138423 113201 Hs.512867 NM_138423 ENSG00000166734 CASC4 H63 cancer susceptibility 4 protein-coding 161-13 chr11 38119341 38119532 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 180835 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 202-94 chr2 174265477 174265713 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -17063 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 295-33 chr4 52679415 52679819 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20211 NR_125363 643783 Hs.631514 NR_125363 ENSG00000248866 USP46-AS1 - USP46 antisense RNA 1 ncRNA 246-9 chr1 236389608 236389966 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4499 NM_145861 128178 Hs.352224 NM_080738 ENSG00000186197 EDARADD ECTD11A|ECTD11B|ED3|EDA3 EDAR associated death domain protein-coding 208.666-99 chr7 16870998 16871167 + 1.33333 NA intron (NM_176813, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 10901 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 161.666-5 chr16 22649249 22649465 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 103659 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 199.333-50 chr12 17386012 17386317 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 202914 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 301-16 chr16 11642718 11643110 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -25541 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 226.667-79 chr6 57037963 57038270 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8416 NM_001286275 57691 Hs.709521 NM_020931 ENSG00000168116 KIAA1586 - KIAA1586 protein-coding 312.666-25 chr8 69069496 69069914 + 1.33333 NA intron (NR_039986, intron 1 of 4) intron (NR_039986, intron 1 of 4) 34485 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 284.333-37 chr5 95498339 95498618 + 1.33333 NA exon (NM_014639, exon 33 of 43) exon (NM_014639, exon 33 of 43) 56527 NM_014639 9652 Hs.482868 NM_014639 ENSG00000198677 TTC37 KIAA0372|Ski3|THES tetratricopeptide repeat domain 37 protein-coding 188.333-118 chr5 19281636 19281860 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 604524 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 188-87 chr5 12423723 12423880 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -151056 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 289.333-17 chr14 87719847 87720089 + 1.33333 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -64674 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 204.666-103 chr8 116002515 116002685 + 1.33333 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) L1MC1|LINE|L1 322459 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 226-11 chr10 102016344 102016619 + 1.33333 NA intron (NM_024541, intron 8 of 25) intron (NM_024541, intron 8 of 25) 39692 NM_024541 79591 Hs.16004 NM_024541 ENSG00000120029 ARMH3 C10orf76 armadillo like helical domain containing 3 protein-coding 190.666-3 chr1 43844052 43844272 + 1.33333 NA intron (NM_001270466, intron 4 of 4) MER21C|LTR|ERVL 5540 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 204.333-137 chr4 16207933 16208095 + 1.33333 NA intron (NM_153365, intron 2 of 13) intron (NM_153365, intron 2 of 13) 18457 NM_153365 202018 Hs.479223 NM_153365 ENSG00000169762 TAPT1 CMVFR|OCLSBG transmembrane anterior posterior transformation 1 protein-coding 225.333-69 chr18 818667 818850 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -6516 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 170-107 chr6 41875032 41875239 + 1.33333 NA intron (NM_018561, intron 2 of 6) intron (NM_018561, intron 2 of 6) -3498 NM_001286554 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 230.666-11 chr11 94893212 94893398 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 80251 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 122-98 chr5 116505570 116505749 + 1.33333 NA intron (NM_001300780, intron 1 of 19) intron (NM_001300780, intron 1 of 19) 58161 NR_109879 101927233 Hs.732850 NR_109879 ENSG00000248445 SEMA6A-AS1 CTB-118N6.3 SEMA6A antisense RNA 1 ncRNA 283.333-65 chr5 169389280 169389550 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -88276 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 182-91 chr6 38889379 38889534 + 1.33333 NA intron (NM_001371, intron 56 of 91) L1ME3D|LINE|L1 63651 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 356.666-6 chr14 57197856 57198278 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70838 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 310-11 chr11 19574081 19574597 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_039706) promoter-TSS (NR_039706) -971 NR_039706 100616118 NR_039706 ENSG00000265210 MIR4486 - microRNA 4486 ncRNA 400.666-5 chr2 32126946 32127288 + 1.33333 NA intron (NM_001363875, intron 7 of 15) intron (NM_001363875, intron 7 of 15) -38724 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 277.666-5 chr11 55358635 55358915 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -9109 NM_001005275 81328 Hs.554529 NM_001005275 ENSG00000181958 OR4A15 OR11-118 olfactory receptor family 4 subfamily A member 15 protein-coding 152.666-8 chr22 30137775 30137940 + 1.33333 NA intron (NM_001329457, intron 11 of 11) L1MB5|LINE|L1 57393 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 265.333-58 chr4 33649801 33650229 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 389878 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 271.333-72 chr9 38182736 38183096 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -113689 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 224-59 chr3 99364376 99364609 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -274102 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 331-32 chr5 123368808 123369185 + 1.33333 NA intron (NM_153223, intron 18 of 20) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 54596 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 501.333-6 chr5 38279210 38279839 + 1.33333 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) L1MA8|LINE|L1 11462 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 234.666-19 chr17 48310710 48310990 + 1.33333 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) 16503 NR_131239 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 148-6 chr1 78496974 78497126 + 1.33333 NA intron (NM_000959, intron 2 of 2) L1MC2|LINE|L1 6076 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 199.333-5 chr1 53049721 53049885 + 1.33333 NA intron (NM_001193600, intron 14 of 14) intron (NM_001193600, intron 14 of 14) -12249 NM_001199081 127435 Hs.586141 NM_153703 ENSG00000174348 PODN PCAN|SLRR5A podocan protein-coding 190-33 chr14 54665211 54665361 + 1.33333 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) -89547 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 465.333-6 chr19 29346533 29347355 + 1.33333 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) L1MB3|LINE|L1 -133793 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 202.667-161 chrX 58129784 58130092 + 1.33333 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -219305 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 321.333-44 chr22 28624559 28625047 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEa|LINE|L1 55062 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 216-82 chr3 108334309 108334480 + 1.33333 NA intron (NM_001370244, intron 2 of 9) intron (NM_001370244, intron 2 of 9) 22609 NM_001282557 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 214-58 chr18 77997802 77998115 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4231 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 185.333-21 chr10 77075422 77075593 + 1.33333 NA intron (NM_001271519, intron 13 of 28) intron (NM_001271519, intron 13 of 28) -65324 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 185.666-5 chr10 133449152 133449320 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -4692 NR_149718 619207 Hs.659384 NM_001033584 ENSG00000214279 SCART1 - scavenger receptor family member expressed on T cells 1 pseudo 236-50 chr21 30255342 30255619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27470 NM_001085455 643803 Hs.580883 NM_001085455 ENSG00000188694 KRTAP24-1 KAP24.1 keratin associated protein 24-1 protein-coding 510.333-3 chr11 114460721 114461390 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 21588 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 431.667 chr1 179724118 179724595 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -3420 NM_001329714 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 172-94 chr6 40229503 40229657 + 1.33333 NA Intergenic MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR 126426 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 199.333-235 chr5 150706629 150706898 + 1.33333 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -5701 NM_018047 55696 Hs.713564 NM_018047 ENSG00000086589 RBM22 Cwc2|ZC3H16|fSAP47 RNA binding motif protein 22 protein-coding 207.333-184 chr3 105155926 105156135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -210683 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 230.666-10 chr11 7225403 7225679 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9225 NR_031683 100313774 NR_031683 ENSG00000221703 MIR302E MIRN302E microRNA 302e ncRNA 191.667-47 chr14 34873192 34873456 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_160776) promoter-TSS (NR_160776) -867 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 144-120 chr4 26260193 26260432 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59398 NM_005349 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 143.333-258 chr7 23334824 23334967 + 1.33333 NA intron (NM_006547, intron 10 of 14) intron (NM_006547, intron 10 of 14) 35556 NM_138446 115416 Hs.87385 NM_138446 ENSG00000156928 MALSU1 C7orf30|mtRsfA mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1 protein-coding 277.667-41 chr5 123752983 123753399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 207774 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 215.333-177 chr6 134278969 134279189 + 1.33333 NA intron (NM_001143676, intron 1 of 13) AluJr4|SINE|Alu 38979 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 400.666-7 chr4 104263571 104264020 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -227170 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 220-89 chr5 54358707 54358898 + 1.33333 NA intron (NR_126379, intron 1 of 4) intron (NR_126379, intron 1 of 4) 37858 NR_126379 104355136 Hs.559024 NR_126379 ENSG00000249069 LINC01033 - long intergenic non-protein coding RNA 1033 ncRNA 313.333-51 chr9 72198841 72199297 + 1.33333 NA intron (NM_001242506, intron 3 of 14) intron (NM_001242506, intron 3 of 14) 49629 NM_001351571 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 288.999-7 chr4 157072149 157072425 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3838 NM_001166061 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 251.333-106 chr8 79226410 79226692 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -105637 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 201.666-24 chr2 119911919 119912070 + 1.33333 NA intron (NM_002830, intron 10 of 26) L1ME1|LINE|L1 -101083 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 182.666-26 chr20 52652212 52652362 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31449 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 189.667-96 chr3 94371904 94372119 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 308950 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 203.333-262 chr8 81480560 81480767 + 1.33333 NA intron (NM_001442, intron 1 of 3) intron (NM_001442, intron 1 of 3) 2570 NM_001442 2167 Hs.391561 NM_001442 ENSG00000170323 FABP4 A-FABP|AFABP|ALBP|HEL-S-104|aP2 fatty acid binding protein 4 protein-coding 353.333-30 chr6 69822065 69822423 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -25234 NM_018368 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 202.666-62 chr2 61946456 61946731 + 1.33333 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) MER92-int|LTR|ERV1 40951 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 224.333-135 chrX 101679148 101679445 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -19446 NM_001282231 9823 Hs.48924 NM_014782 ENSG00000184867 ARMCX2 ALEX2|GASP9 armadillo repeat containing X-linked 2 protein-coding 298-66 chr5 179045228 179045511 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15004 NM_014594 30832 Hs.272328 NM_014594 ENSG00000177932 ZNF354C KID3 zinc finger protein 354C protein-coding 254-3 chr1 223033214 223033550 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 104958 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 216-90 chr4 76041672 76041847 + 1.33333 NA intron (NM_001130017, intron 1 of 9) MER33|DNA|hAT-Charlie -5689 NM_001302123 6373 Hs.632592 NM_005409 ENSG00000169248 CXCL11 H174|I-TAC|IP-9|IP9|SCYB11|SCYB9B|b-R1 C-X-C motif chemokine ligand 11 protein-coding 225-3 chr1 110654541 110654839 + 1.33333 NA non-coding (NR_109846, exon 3 of 3) non-coding (NR_109846, exon 3 of 3) 17085 NR_109846 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 244.333-69 chr22 34882159 34882575 + 1.33333 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 115549 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 167.666-11 chr7 121843050 121843198 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30037 NM_001369396 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 266.667-43 chr2 211666690 211667141 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 14 of 26) intron (NM_001042599, intron 14 of 26) 759445 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 161.333-246 chr6 102470108 102470251 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 1071194 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 258.333-11 chr10 106663577 106663785 + 1.33333 NA intron (NM_001206569, intron 17 of 25) intron (NM_001206569, intron 17 of 25) 501025 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 245.666-23 chr6 57330014 57330312 + 1.33333 NA intron (NM_000947, intron 5 of 13) L1MB5|LINE|L1 12533 NM_000947 5558 Hs.654580 NM_000947 ENSG00000146143 PRIM2 PRIM2A|p58 DNA primase subunit 2 protein-coding 202-136 chr4 100153646 100153900 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -36260 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 202-127 chr4 42987857 42988050 + 1.33333 NA intron (NM_001080476, intron 2 of 3) intron (NM_001080476, intron 2 of 3) 94687 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 289.333-10 chr10 71530454 71530774 + 1.33333 NA intron (NM_052836, intron 6 of 12) intron (NM_052836, intron 6 of 12) -18694 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 183-97 chr7 77326531 77326777 + 1.33333 NA intron (NR_146938, intron 21 of 29) intron (NR_146938, intron 21 of 29) -88544 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 302-54 chr5 39834499 39835020 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -217532 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 186-100 chr8 129469126 129469334 + 1.33333 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 14912 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 227.999-4 chr2 20064514 20064691 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12974 NM_014713 9741 Hs.467807 NM_014713 ENSG00000068697 LAPTM4A HUMORF13|LAPTM4|MBNT|Mtrp lysosomal protein transmembrane 4 alpha protein-coding 202.666-122 chr7 111784566 111784765 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 32 of 52) intron (NM_001363540, intron 32 of 52) -23840 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 283.333-33 chr2 67284269 67284630 + 1.33333 NA intron (NR_110564, intron 3 of 4) intron (NR_110564, intron 3 of 4) -69130 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 214.666-60 chr6 38775314 38775489 + 1.33333 NA intron (NM_001371, intron 11 of 91) intron (NM_001371, intron 11 of 91) 60090 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 206-165 chr7 1423937 1424242 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35381 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 170.666-22 chr9 88673891 88674065 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 71927 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 111.666 chr2 98335881 98336038 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10196 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 206-145 chr5 112899530 112899740 + 1.33333 NA intron (NM_005669, intron 3 of 4) L1ME3G|LINE|L1 22592 NM_005669 7905 Hs.429608 NM_005669 ENSG00000129625 REEP5 C5orf18|D5S346|DP1|TB2|YOP1|Yip2e receptor accessory protein 5 protein-coding 167.333-61 chr12 16540783 16541016 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 64480 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 290.333-35 chr4 83126463 83126965 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -11985 NM_001130715 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 334.666-15 chr7 30161289 30161868 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_152793, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_152793, exon 3 of 3) 26592 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 379.999-2 chr11 80373019 80373307 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 389640 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 209.999-4 chr2 208015841 208016002 + 1.33333 NA intron (NM_001080475, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 9606 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 224-40 chr19 48774343 48774667 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 18981 NM_019113 26291 Hs.283015 NM_019113 ENSG00000105550 FGF21 - fibroblast growth factor 21 protein-coding 186.333-7 chr1 178832413 178832627 + 1.33333 NA intron (NM_152663, intron 7 of 19) MIRc|SINE|MIR 38557 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 415.666 chr14 27605135 27605486 + 1.33333 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -7278 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 194-120 chr6 91708441 91708632 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18108 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 184.666-14 chr16 72409532 72409685 + 1.33333 NA intron (NR_126330, intron 7 of 13) AluJb|SINE|Alu -237158 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 209.333-252 chr9 100585496 100585750 + 1.33333 NA intron (NM_001018116, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 7544 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 191.333-102 chr2 14730552 14730720 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97919 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 173.666 chr1 114845520 114845768 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9159 NM_001282542 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 184.333-121 chr5 52362944 52363181 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 355031 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 320-48 chr8 70067590 70067892 + 1.33333 NA intron (NM_024504, intron 4 of 7) L1M5|LINE|L1 3511 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 191.333-189 chr7 47846218 47846494 + 1.33333 NA intron (NM_138295, intron 32 of 56) intron (NM_138295, intron 32 of 56) 51065 NR_161269 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 214.666-36 chr2 191043702 191043868 + 1.33333 NA intron (NM_003151, intron 14 of 23) L1ME3E|LINE|L1 22259 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 273.333-39 chr22 22811121 22811568 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11432 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 209.333-35 chr11 71921040 71921204 + 1.33333 NA intron (NR_029192, intron 3 of 6) AluJr|SINE|Alu 7325 NR_029192 100133315 Hs.150324 NR_029192 LOC100133315 - transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2-like pseudo 196.333-108 chr3 72302398 72302619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 144115 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 312.333-26 chr7 79190597 79190851 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 181736 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 304.333-28 chr6 64504997 64505341 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 698333 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 199-32 chr16 60092470 60092632 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 237198 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 220 chr1 39425998 39426260 + 1.33333 NA intron (NM_012090, intron 55 of 92) intron (NM_012090, intron 55 of 92) 17056 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 180-59 chr2 212622362 212622532 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -83645 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 209.333-110 chr2 48798966 48799146 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43332 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 273.666-17 chr3 108405285 108405639 + 1.33333 NA intron (NM_014981, intron 33 of 41) intron (NM_014981, intron 33 of 41) 93677 NM_001282557 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 240.666-3 chr1 237450970 237451314 + 1.33333 NA intron (NM_001035, intron 14 of 104) AluSz6|SINE|Alu -19977 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 163.333-133 chr18 72275446 72275647 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 268796 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 255.667-61 chr4 35473266 35473742 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 770435 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 202-174 chr7 52922235 52922509 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -113261 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 232-42 chr2 51269470 51269723 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 236995 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 303.333-64 chr5 153987974 153988306 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50770 NM_018691 10827 Hs.166551 NM_018691 ENSG00000055147 FAM114A2 133K02|C5orf3 family with sequence similarity 114 member A2 protein-coding 189.333-92 chr2 54870681 54870873 + 1.33333 NA intron (NM_001039753, intron 14 of 40) intron (NM_001039753, intron 14 of 40) 139495 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 196-90 chr2 157287597 157287777 + 1.33333 NA intron (NM_001329868, intron 4 of 10) intron (NM_001329868, intron 4 of 10) 29982 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 135.333-69 chr17 65910294 65910469 + 1.33333 NA intron (NM_001353129, intron 19 of 26) HAL1b|LINE|L1 -83838 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 320.333-8 chr14 57261720 57262103 + 1.33333 NA intron (NM_006544, intron 1 of 17) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 6994 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 203-54 chr2 130288986 130289150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53040 NM_001321119 84317 Hs.104203 NM_032357 ENSG00000136710 CCDC115 CDG2O|ccp1 coiled-coil domain containing 115 protein-coding 184.666-43 chr9 69908588 69908783 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87868 NM_001308084 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 205.333-58 chr12 42550803 42550958 + 1.33333 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) 38866 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 329-19 chr5 44412258 44412554 + 1.33333 NA non-coding (NR_108034, exon 3 of 3) non-coding (NR_108034, exon 3 of 3) -22986 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 406.332 chr2 137117849 137118209 + 1.33333 NA intron (NM_001316349, intron 5 of 27) intron (NM_001316349, intron 5 of 27) 352484 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 210.666-61 chr2 236679822 236680010 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 110091 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 155.333-352 chr7 6685952 6686084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20929 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 196.333-105 chr3 61823648 61823868 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 262187 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 201.333-302 chr9 102772014 102772196 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -223228 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 198.667-156 chr5 167205269 167205552 + 1.33333 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) intron (NM_001122679, intron 1 of 29) -37009 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 242-15 chr10 57568345 57568558 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -263892 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 231-65 chr8 125875558 125875857 + 1.33333 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner 75490 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 596 chr12 32378969 32379682 + 1.33333 NA non-coding (NR_148725, exon 10 of 10) non-coding (NR_148725, exon 10 of 10) -20233 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 251-36 chr2 71392424 71392744 + 1.33333 NA intron (NM_001252613, intron 10 of 27) HERVK22-int|LTR|ERVK 60802 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 455.333 chr10 58346882 58347282 + 1.33333 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) intron (NM_003338, intron 1 of 6) 12076 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 287-30 chr6 48789761 48790108 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 673319 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 263.666-8 chr20 18682701 18683003 + 1.33333 NA intron (NR_109955, intron 2 of 3) MER21-int|LTR|ERVL 15856 NR_109955 101929526 Hs.639402 NR_109955 ENSG00000233993 LOC101929526 - uncharacterized LOC101929526 ncRNA 473.999-3 chr4 59443386 59443985 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 430112 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 199-129 chr9 98654766 98655002 + 1.33333 NA intron (NM_005458, intron 1 of 18) L1MC1|LINE|L1 54051 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 171-41 chr20 18717527 18717788 + 1.33333 NA intron (NM_080820, intron 4 of 5) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -18949 NR_109955 101929526 Hs.639402 NR_109955 ENSG00000233993 LOC101929526 - uncharacterized LOC101929526 ncRNA 237-35 chr18 4593420 4593717 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -138261 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 206.666-51 chr18 74015100 74015323 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 132623 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 217-77 chr6 23931808 23932095 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -194264 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 207-116 chr8 74460796 74461042 + 1.33333 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) -87624 NR_049860 100847058 NR_049860 ENSG00000266502 MIR5681A - microRNA 5681a ncRNA 249.333-31 chr14 79812134 79812456 + 1.33333 NA intron (NM_138970, intron 5 of 5) L2a|LINE|L2 -399124 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 208.333-91 chr22 25073359 25073567 + 1.33333 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) L1MA9|LINE|L1 39229 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 199.333-14 chr1 93546598 93546855 + 1.33333 NA intron (NM_001024948, intron 10 of 13) intron (NM_001024948, intron 10 of 13) 38436 NM_001308251 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 196.666-80 chr4 91301382 91301581 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 975821 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 206.333-32 chr12 42492808 42492987 + 1.33333 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) -8887 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 205.666-7 chr1 210084299 210084546 + 1.33333 NA intron (NM_153262, intron 4 of 7) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 146205 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 225.333-125 chr7 42080116 42080418 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 3 of 14) intron (NM_000168, intron 3 of 14) 156942 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 200.667-64 chr18 60667805 60668098 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -295176 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 245.333-2 chr1 72925338 72925695 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -380654 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 144-152 chr8 99016831 99016977 + 1.33333 NA intron (NR_047582, intron 2 of 8) L1ME3|LINE|L1 3638 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 207-6 chr1 151042049 151042283 + 1.33333 NA intron (NM_138278, intron 4 of 9) AluJr|SINE|Alu 5580 NM_138278 149428 Hs.591473 NM_138278 ENSG00000163141 BNIPL BNIP-S|BNIP-Salpha|BNIP-Sbeta|BNIPL-1|BNIPL-2|BNIPL1|BNIPL2|BNIPS|PP753 BCL2 interacting protein like protein-coding 248.666-26 chr3 54325829 54326197 + 1.33333 NA intron (NM_018398, intron 3 of 37) intron (NM_018398, intron 3 of 37) 203461 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 214.333-150 chr7 130052574 130052910 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1291 NM_001282191 51530 Hs.194157 NM_016478 ENSG00000091732 ZC3HC1 HSPC216|NIPA zinc finger C3HC-type containing 1 protein-coding 207.333-178 chr3 38324729 38324967 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 18912 NM_004803 9389 Hs.165559 NM_004803 ENSG00000144671 SLC22A14 OCTL2|OCTL4|ORCTL4 solute carrier family 22 member 14 protein-coding 312-23 chr19 47799427 47799886 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 3948 NM_198479 284355 Hs.629812 NM_198479 ENSG00000178928 TPRX1 TPRX tetrapeptide repeat homeobox 1 protein-coding 294.333-17 chr17 10314296 10314737 + 1.33333 NA intron (NM_003802, intron 29 of 40) intron (NM_003802, intron 29 of 40) 58490 NM_003802 8735 Hs.711142 NM_003802 ENSG00000006788 MYH13 MyHC-IIL|MyHC-eo myosin heavy chain 13 protein-coding 227.666-20 chr21 25851673 25851892 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116128 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 244-96 chr8 28659074 28659432 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42211 NR_126027 101929402 Hs.667366 NR_126027 ENSG00000246339 EXTL3-AS1 C8orf50 EXTL3 antisense RNA 1 ncRNA 198-141 chr4 118728323 118728550 + 1.33333 NA intron (NM_014822, intron 22 of 22) intron (NM_014822, intron 22 of 22) 43044 NM_020961 57721 Hs.596872 NM_020961 ENSG00000145388 METTL14 hMETTL14 methyltransferase like 14 protein-coding 120-58 chr19 28065318 28065463 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -271450 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 362.333-17 chr8 138305100 138305509 + 1.33333 NA intron (NM_015912, intron 3 of 19) intron (NM_015912, intron 3 of 19) 191957 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 227-7 chr1 235754028 235754231 + 1.33333 NA intron (NM_000081, intron 25 of 52) intron (NM_000081, intron 25 of 52) 98931 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 210-71 chr2 137575719 137575924 + 1.33333 NA intron (NM_001316349, intron 17 of 27) intron (NM_001316349, intron 17 of 27) 352111 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 271.666-3 chr16 11117678 11118132 + 1.33333 NA intron (NM_015226, intron 18 of 22) intron (NM_015226, intron 18 of 22) 138277 NM_003745 8651 Hs.50640 NM_003745 ENSG00000185338 SOCS1 CIS1|CISH1|JAB|SOCS-1|SSI-1|SSI1|TIP-3|TIP3 suppressor of cytokine signaling 1 protein-coding 209.333-21 chr10 56593709 56593881 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -232522 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 306-7 chr11 9955553 9955984 + 1.33333 NA intron (NM_030962, intron 16 of 39) L1ME3D|LINE|L1 116626 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 201.333-206 chr4 39128784 39128960 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -53657 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 237.333-107 chr6 164118532 164118848 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -447206 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 418.333-7 chr2 214351949 214352374 + 1.33333 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -58893 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 249.666-28 chr3 122277678 122277970 + 1.33333 NA intron (NM_000388, intron 5 of 6) intron (NM_000388, intron 5 of 6) -47424 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 265-16 chr12 59363142 59363619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -232649 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 200.666-53 chr19 27715958 27716135 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -77385 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 448.667 chr11 14009247 14009829 + 1.33333 NA intron (NM_006108, intron 2 of 15) L2b|LINE|L2 46815 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 253.333-32 chr15 79181593 79181923 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -28030 NR_029705 406960 NR_029705 ENSG00000207695 MIR184 EDICT|MIRN184|miR-184 microRNA 184 ncRNA 222.667-81 chr6 66745969 66746256 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 958233 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 198.667-140 chr4 120735377 120735656 + 1.33333 NA intron (NM_001300824, intron 12 of 13) intron (NM_001300824, intron 12 of 13) 187350 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 196.666-81 chr4 129139607 129139801 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43552 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 382.666-17 chr8 61079750 61080107 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -112180 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 218.666-7 chr10 18305336 18305604 + 1.33333 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) intron (NM_000724, intron 1 of 12) -35239 NM_201590 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 243.999-10 chr9 80622815 80623102 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 647935 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 205.333-86 chr15 86950108 86950371 + 1.33333 NA intron (NR_135683, intron 1 of 2) L1ME3A|LINE|L1 17359 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 274.333-22 chr15 60353447 60353949 + 1.33333 NA intron (NM_001002857, intron 9 of 13) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 44288 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 199.333-270 chr8 42227616 42227850 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -20168 NM_001319189 5327 Hs.491582 NM_000930 ENSG00000104368 PLAT T-PA|TPA plasminogen activator, tissue type protein-coding 208.667-140 chr8 65849773 65850050 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -7847 NM_001242318 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 273.333-49 chr4 55249836 55250129 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -96260 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 142-114 chr5 41829597 41829770 + 1.33333 NA intron (NM_001364301, intron 7 of 16) intron (NM_001364301, intron 7 of 16) 13974 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 213.666-41 chr6 109954569 109954762 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -23591 NM_001286099 2830 Hs.46332 NM_005284 ENSG00000146360 GPR6 - G protein-coupled receptor 6 protein-coding 239-2 chr1 53499558 53499827 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40293 NM_033067 63948 Hs.131654 NM_033067 ENSG00000143006 DMRTB1 - DMRT like family B with proline rich C-terminal 1 protein-coding 373-6 chr17 69793675 69794057 + 1.33333 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) L1ME3G|LINE|L1 -167841 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 152-101 chr22 27333822 27333968 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 23244 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 200-41 chr12 16472800 16472987 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 119476 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 221.666-50 chr6 62700003 62700248 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -413898 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 328.667-7 chr15 55662844 55663266 + 1.33333 NA intron (NM_173814, intron 11 of 19) L2|LINE|L2 -74084 NM_015617 26108 Hs.87194 NM_015617 ENSG00000171016 PYGO1 - pygopus family PHD finger 1 protein-coding 254-13 chr11 38142546 38142995 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 204169 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 226.667-83 chr7 11266723 11267038 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 293008 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 247.666-29 chr5 120254287 120254587 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -209841 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 162-53 chr17 49349650 49349875 + 1.33333 NA intron (NR_135579, intron 1 of 7) intron (NR_135579, intron 1 of 7) -11403 NR_110884 102724596 Hs.559253 NR_110882 ENSG00000248714 LOC102724596 - uncharacterized LOC102724596 ncRNA 230.666-24 chr18 1681686 1681880 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -322154 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 332.667-26 chr9 31107914 31108368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 273349 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 191.333-121 chr20 33425961 33426218 + 1.33333 NA intron (NM_003098, intron 2 of 7) AluSx|SINE|Alu 17803 NM_003098 6640 Hs.31121 NM_003098 ENSG00000101400 SNTA1 LQT12|SNT1|TACIP1|dJ1187J4.5 syntrophin alpha 1 protein-coding 192.666-19 chr12 105555000 105555233 + 1.33333 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -149087 NR_110108 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 264.666-5 chr1 229870082 229870384 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15585 NR_146476 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 205.333-129 chr2 134300962 134301230 + 1.33333 NA intron (NM_001371457, intron 3 of 16) L1ME2|LINE|L1 47024 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 212-14 chr1 119324309 119324482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3857 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 257.666-7 chr14 45092906 45093166 + 1.33333 NA intron (NM_017922, intron 1 of 13) intron (NM_017922, intron 1 of 13) 8920 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 120.666-3 chr16 82401258 82401371 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -225655 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 146.666-8 chr3 188680603 188680755 + 1.33333 NA intron (NM_005578, intron 6 of 10) intron (NM_005578, intron 6 of 10) -8102 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 201.333-26 chr10 1012779 1013060 + 1.33333 NA intron (NM_012341, intron 14 of 16) intron (NM_012341, intron 14 of 16) -9718 NR_027708 55853 Hs.728538 NM_018470 ENSG00000232656 IDI2-AS1 C10orf110|HT009|IDI2-AS IDI2 antisense RNA 1 ncRNA 210.666-35 chr14 69633925 69634086 + 1.33333 NA intron (NM_014734, intron 1 of 5) intron (NM_014734, intron 1 of 5) 22409 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 206.333-138 chr6 44829639 44829937 + 1.33333 NA non-coding (NR_146633, exon 11 of 12) non-coding (NR_146633, exon 11 of 12) -277907 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 232-73 chr5 163898479 163898716 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 392978 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 254.666-18 chr20 48416042 48416311 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 56265 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 199-34 chr17 33452833 33453091 + 1.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 80798 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 297.666-16 chrX 79715153 79715420 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -299467 NM_001109879 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 211.333-172 chr4 85315851 85316036 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -159207 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 240.667-45 chr2 86682678 86682987 + 1.33333 NA intron (NM_001198954, intron 2 of 7) L1MC2|LINE|L1 -37459 NM_022780 64795 Hs.75277 NM_022780 ENSG00000153561 RMND5A CTLH|GID2|GID2A|RMD5|p44CTLH required for meiotic nuclear division 5 homolog A protein-coding 264.666-35 chr7 39028018 39028268 + 1.33333 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 -14576 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 181.333-7 chr1 205837203 205837415 + 1.33333 NA intron (NM_152491, intron 10 of 12) L3|LINE|CR1 12823 NR_135186 148811 Hs.177744 NM_152491 ENSG00000162877 PM20D1 Cps1 peptidase M20 domain containing 1 protein-coding 380.333-4 chr15 70927048 70927573 + 1.33333 NA intron (NM_017691, intron 7 of 15) L1ME2|LINE|L1 34867 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 369.666-10 chr5 17263158 17263757 + 1.33333 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 45826 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 158.666-2 chr1 62545610 62545764 + 1.33333 NA intron (NM_001367561, intron 22 of 49) intron (NM_001367561, intron 22 of 49) -51833 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 243.666-36 chr7 48960748 48960985 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 36319 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 193-58 chr3 127314296 127314540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26372 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 229.333-73 chr22 35006447 35006794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8704 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 228.333-39 chr18 10990305 10990540 + 1.33333 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) intron (NM_022068, intron 2 of 51) 158340 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 206.666-32 chr12 109895496 109895728 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4662 NM_001143852 84260 Hs.410924 NM_032300 ENSG00000139437 TCHP TpMs trichoplein keratin filament binding protein-coding 279.333-44 chr2 85521684 85521990 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 17049 NR_038942 100630918 Hs.66049 NR_038942 PARTICL PARTICLE promoter of MAT2A antisense radiation-induced circulating long non-coding RNA ncRNA 221.333-62 chr2 52895955 52896147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -193436 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 196.333-37 chr14 50433612 50433768 + 1.33333 NA intron (NM_198794, intron 27 of 31) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -36392 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 240.666-24 chr20 8411003 8411327 + 1.33333 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) MER33|DNA|hAT-Charlie 162461 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 260-7 chr1 200918349 200918665 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10437 NR_147176 647215 Hs.576504 NR_147176 ENSG00000233217 MROH3P C1orf81 maestro heat like repeat family member 3, pseudogene pseudo 179.666-17 chrX 76333596 76333774 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -94025 NM_020932 57692 Hs.8453 NM_020932 ENSG00000198934 MAGEE1 DAMAGE|HCA1 MAGE family member E1 protein-coding 213-14 chr12 32990474 32990749 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -93765 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 155-62 chr2 44693953 44694216 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 244804 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 253.667-11 chr10 93042341 93042798 + 1.33333 NA intron (NM_001319195, intron 20 of 21) intron (NM_001319195, intron 20 of 21) -18229 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 176.667-6 chr1 45859747 45859953 + 1.33333 NA intron (NM_001324320, intron 3 of 29) intron (NM_001324320, intron 3 of 29) -4498 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 228.666-17 chr15 81053620 81053856 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 52815 NM_022566 59274 Hs.513071 NM_022566 ENSG00000140406 TLNRD1 MESDC1 talin rod domain containing 1 protein-coding 342.999-3 chr3 88346386 88346689 + 1.33333 NA intron (NM_001368167, intron 2 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 8081 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 255.666-30 chr9 21476908 21477212 + 1.33333 NA intron (NR_152877, intron 2 of 3) LTR16|LTR|ERVL 5253 NM_176891 338376 Hs.682604 NM_176891 ENSG00000184995 IFNE IFN-E|IFNE1|IFNT1|INFE1|PRO655 interferon epsilon protein-coding 213.999-7 chr8 81827734 81827919 + 1.33333 NA intron (NR_145475, intron 3 of 6) intron (NR_145475, intron 3 of 6) 14359 NR_145472 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 200.333-59 chr18 5093336 5093519 + 1.33333 NA intron (NR_146900, intron 2 of 3) intron (NR_146900, intron 2 of 3) 12245 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 339.333-30 chr3 56869918 56870425 + 1.33333 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) L1ME3G|LINE|L1 46265 NM_001289698 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 432-4 chr11 64325036 64325578 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 7065 NM_001358516 25824 Hs.502823 NM_012094 ENSG00000126432 PRDX5 ACR1|AOEB166|B166|HEL-S-55|PLP|PMP20|PRDX6|PRXV|SBBI10|prx-V peroxiredoxin 5 protein-coding 205.666-16 chr14 71733810 71734041 + 1.33333 NA intron (NM_001354286, intron 22 of 24) MIRb|SINE|MIR 147627 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 175.666-15 chr3 142821030 142821197 + 1.33333 NA intron (NM_013363, intron 7 of 8) intron (NM_013363, intron 7 of 8) 67970 NM_013363 26577 Hs.8944 NM_013363 ENSG00000163710 PCOLCE2 PCPE2 procollagen C-endopeptidase enhancer 2 protein-coding 213-44 chr2 183753453 183753656 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -625421 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 272-19 chr19 30017470 30017806 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 75399 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 278.666-12 chr16 73357837 73358132 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28821 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 209.667-103 chr7 48584731 48585003 + 1.33333 NA intron (NM_152701, intron 56 of 61) MER6A|DNA|TcMar-Tigger -339680 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 226 chr1 20898225 20898463 + 1.33333 NA intron (NM_003760, intron 11 of 31) intron (NM_003760, intron 11 of 31) 90088 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 343.666-5 chr17 29662515 29662804 + 1.33333 NA intron (NM_033389, intron 10 of 14) L1PA13|LINE|L1 -41236 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 436-12 chr8 88155443 88155989 + 1.33333 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) intron (NM_005941, intron 4 of 9) 171767 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 217.333-76 chr2 211041456 211041781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 424047 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 309.333-28 chr18 41096772 41097231 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 423676 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 380.333-5 chr15 86469360 86469753 + 1.33333 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) L1MA9|LINE|L1 -152588 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 194-22 chr11 111675469 111675644 + 1.33333 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) intron (NM_015191, intron 3 of 14) 73107 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 182-99 chr7 17625084 17625238 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -66252 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 186.333-77 chr2 101873944 101874164 + 1.33333 NA intron (NM_145686, intron 23 of 30) intron (NM_145686, intron 23 of 30) -109411 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 214-65 chr2 44476251 44476461 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 114409 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 199.333-106 chr18 5569273 5569462 + 1.33333 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) intron (NM_001281535, intron 3 of 21) -25028 NM_001330557 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 197.666-48 chr4 24362980 24363392 + 1.33333 NA intron (NM_001330752, intron 1 of 13) intron (NM_001330752, intron 1 of 13) 109719 NM_001354826 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 248.333-85 chr5 114130200 114130448 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -231746 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 162-47 chr15 64083378 64083601 + 1.33333 NA intron (NM_032231, intron 2 of 4) intron (NM_032231, intron 2 of 4) 10349 NM_032231 84191 Hs.439548 NM_032231 ENSG00000166797 CIAO2A CIA2A|FAM96A cytosolic iron-sulfur assembly component 2A protein-coding 208.333-22 chr12 3101227 3101447 + 1.33333 NA intron (NM_006675, intron 2 of 8) L3|LINE|CR1 23958 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 269.666-4 chr11 107781995 107782365 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70124 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 200.999 chr6 119851556 119851706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -163548 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 228-14 chr10 120503260 120503578 + 1.33333 NA intron (NR_134516, intron 2 of 4) intron (NR_134516, intron 2 of 4) 46465 NM_001318169 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 203.333-285 chrUn_KI270519v1 62880 63061 + 1.33333 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 215-57 chr3 46458802 46459039 + 1.33333 NA intron (NM_001321122, intron 5 of 19) intron (NM_001321122, intron 5 of 19) 4734 NM_001199149 4057 Hs.529517 NM_002343 ENSG00000012223 LTF GIG12|HEL110|HLF2|LF lactotransferrin protein-coding 237.333-127 chr8 135649573 135649874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 192267 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 149.333-440 chrX 56745683 56746013 + 1.33333 NA intron (NM_001348129, intron 2 of 2) L1MC4|LINE|L1 -8264 NR_002308 442454 Hs.663220 NR_002308 UQCRBP1 - ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein pseudogene 1 pseudo 203.333-193 chr4 63640915 63641093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 768446 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 170.667-84 chr2 99907100 99907357 + 1.33333 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 198355 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 375.999-3 chr8 22746673 22747054 + 1.33333 NA intron (NM_001363233, intron 4 of 6) intron (NM_001363233, intron 4 of 6) -53383 NM_004430 1960 Hs.534313 NM_004430 ENSG00000179388 EGR3 EGR-3|PILOT early growth response 3 protein-coding 222.333-79 chr6 49636229 49636440 + 1.33333 NA intron (NM_000324, intron 1 of 9) intron (NM_000324, intron 1 of 9) 540 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 203.333-168 chr3 19570608 19570761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -255753 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 225.333-126 chr7 94361205 94361528 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 30826 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 195.666-39 chr6 73193597 73193795 + 1.33333 NA intron (NM_001160132, intron 13 of 13) intron (NM_001160132, intron 13 of 13) 31800 NM_001126063 100129128 Hs.663639 NM_001126063 ENSG00000256980 KHDC1L - KH domain containing 1 like protein-coding 177.333-80 chr2 49476841 49477019 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -322403 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 255-8 chr1 170757824 170758088 + 1.33333 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 93825 NM_022716 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 283.999 chr1 23267133 23267531 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 18186 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 273.666-4 chr10 25807699 25808043 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 125839 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 279.333-30 chr14 61936875 61937166 + 1.33333 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) intron (NM_001367663, intron 1 of 7) 9325 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 203.666-13 chr10 86336535 86336701 + 1.33333 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) intron (NM_017551, intron 2 of 15) 30177 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 225.333-102 chr4 85958155 85958458 + 1.33333 NA intron (NM_031305, intron 2 of 6) intron (NM_031305, intron 2 of 6) 28290 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 292.666-26 chr4 47140260 47140806 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 108966 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 348.333-31 chr8 8740709 8741153 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 38994 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 113.333-152 chr20 31688826 31688931 + 1.33333 NA intron (NR_134257, intron 1 of 2) L1ME4b|LINE|L1 -32629 NR_131907 103021294 NR_131907 ENSG00000281376 ABALON INXS apoptotic BCL2L1-antisense long non-coding RNA ncRNA 404.667-2 chr17 61752181 61752732 + 1.33333 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) LTR37B|LTR|ERV1 111103 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 191-44 chr4 30342642 30342921 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -377588 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 224.666-2 chr1 157392480 157392702 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 159924 NM_031281 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 208.666-68 chr3 40973969 40974188 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -225427 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 269.333-45 chr2 121503448 121503701 + 1.33333 NA intron (NM_015282, intron 7 of 38) intron (NM_015282, intron 7 of 38) -27306 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 207-103 chr6 54206692 54206951 + 1.33333 NA intron (NM_138569, intron 10 of 12) intron (NM_138569, intron 10 of 12) 95378 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 217-95 chr9 68464228 68464480 + 1.33333 NA intron (NM_021965, intron 6 of 10) LTR16A|LTR|ERVL 76513 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 245-56 chr5 104989872 104990278 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -109399 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 226-50 chr20 45019849 45020109 + 1.33333 NA intron (NM_001352385, intron 9 of 11) intron (NM_001352385, intron 9 of 11) 53467 NM_006282 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 331.333-17 chr13 97200261 97200535 + 1.33333 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -20776 NR_125725 103625683 Hs.679591 NR_125725 ENSG00000233124 LINC00456 - long intergenic non-protein coding RNA 456 ncRNA 232.333-23 chr14 51560002 51560319 + 1.33333 NA intron (NR_047477, intron 2 of 3) intron (NR_047477, intron 2 of 3) 39792 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 225.667-68 chr6 131747454 131747740 + 1.33333 NA TTS (NM_005021) TTS (NM_005021) -36580 NM_001145659 643854 Hs.632613 NM_001145659 ENSG00000236761 CTAGE9 - CTAGE family member 9 protein-coding 224.333-133 chr9 130397964 130398139 + 1.33333 NA intron (NM_001291815, intron 74 of 97) AluJo|SINE|Alu -46656 NM_000050 445 Hs.160786 NM_000050 ENSG00000130707 ASS1 ASS|CTLN1 argininosuccinate synthase 1 protein-coding 213.333-195 chr7 88722880 88723130 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36695 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 197-124 chr9 22037994 22038228 + 1.33333 NA intron (NR_003529, intron 3 of 18) intron (NR_003529, intron 3 of 18) -28798 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 188-56 chr2 71768241 71768489 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 301666 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 502.667-3 chr9 28972986 28973654 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1M1|LINE|L1 -84365 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 202.666-48 chr16 75323274 75323491 + 1.33333 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -55375 NM_001170715 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 220.666-19 chr13 40441955 40442203 + 1.33333 NA intron (NR_024506, intron 5 of 5) intron (NR_024506, intron 5 of 5) 38927 NR_024505 646982 Hs.287664 NR_024505 ENSG00000215483 LINC00598 lncFOXO1 long intergenic non-protein coding RNA 598 ncRNA 220-124 chr8 125919168 125919452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31887 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 239.333-104 chr8 82183780 82184093 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -341650 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 184.666-21 chr22 19590763 19591016 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24050 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 159.666 chr10 34032687 34032852 + 1.33333 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 -260089 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 232.333-34 chr17 30497036 30497258 + 1.33333 NA intron (NM_004871, intron 6 of 8) AluJr|SINE|Alu 19739 NM_004871 9527 Hs.462680 NM_004871 ENSG00000108587 GOSR1 GOLIM2|GOS-28|GOS28|GOS28/P28|GS28|P28 golgi SNAP receptor complex member 1 protein-coding 251.333-57 chr2 79233073 79233280 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -73423 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 155.333-294 chr5 71821123 71821371 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 101972 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 260.333-38 chr3 106982153 106982579 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 258272 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 266.666-31 chr8 114598676 114599004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1069173 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 197.333-230 chr8 68072854 68073129 + 1.33333 NA intron (NM_024870, intron 14 of 39) intron (NM_024870, intron 14 of 39) 120945 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 539.667-2 chr5 33449948 33450596 + 1.33333 NA intron (NR_047677, intron 3 of 17) intron (NR_047677, intron 3 of 17) 9496 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 352.667-14 chr18 34306101 34306609 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -82804 NM_003787 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 218.333-70 chr2 103727275 103727473 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 680958 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 236-82 chr7 27469521 27469778 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -146325 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 221.666-10 chr10 92358960 92359141 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -59611 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 152-65 chr15 99290530 99290773 + 1.33333 NA intron (NM_001321677, intron 5 of 8) intron (NM_001321677, intron 5 of 8) 33126 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 207.666-35 chr3 39894942 39895112 + 1.33333 NA intron (NM_001284424, intron 1 of 15) intron (NM_001284424, intron 1 of 15) 85367 NM_001284425 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 259.333-61 chr21 33872225 33872542 + 1.33333 NA intron (NM_001331010, intron 32 of 38) intron (NM_001331010, intron 32 of 38) 43421 NM_001697 539 Hs.409140 NM_001697 ENSG00000241837 ATP5PO ATP5O|ATPO|HMC08D05|OSCP ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP protein-coding 339.666-2 chr11 59436607 59437027 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6352 NM_001004728 219982 Hs.553649 NM_001004728 ENSG00000172320 OR5A1 OR11-249|OR5A1P|OST181 olfactory receptor family 5 subfamily A member 1 protein-coding 216.666-27 chr14 50457062 50457291 + 1.33333 NA intron (NM_198794, intron 13 of 31) L2c|LINE|L2 -59878 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 254.999-5 chr5 127162370 127162654 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -89020 NM_001164478 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 229.666-4 chr11 37918544 37918725 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -19967 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 225.333-128 chr7 99668715 99668960 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001190484, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001190484, exon 5 of 5) 11159 NM_001291830 1577 Hs.571258 NM_000777 ENSG00000106258 CYP3A5 CP35|CYPIIIA5|P450PCN3|PCN3 cytochrome P450 family 3 subfamily A member 5 protein-coding 285.999-4 chr22 20905368 20905709 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11869 NM_005207 1399 Hs.5613 NM_005207 ENSG00000099942 CRKL - CRK like proto-oncogene, adaptor protein protein-coding 210-159 chrX 96523828 96524134 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -160682 NM_007309 1730 Hs.226483 NM_006729 ENSG00000147202 DIAPH2 DIA|DIA2|DRF2|POF|POF2|POF2A diaphanous related formin 2 protein-coding 180-103 chr7 83505300 83505546 + 1.33333 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 136008 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 216-99 chr5 116600883 116601176 + 1.33333 NA intron (NR_147170, intron 2 of 2) intron (NR_147170, intron 2 of 2) -26206 NM_001300780 57556 Hs.156967 NM_020681 ENSG00000092421 SEMA6A HT018|SEMA|SEMA6A1|SEMAQ|VIA semaphorin 6A protein-coding 205.667-39 chr13 35134986 35135269 + 1.33333 NA intron (NM_015678, intron 17 of 57) intron (NM_015678, intron 17 of 57) 192840 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 122-86 chr4 73882263 73882361 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12919 NR_046035 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 267-6 chr10 19626374 19626623 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 36 of 39) L1M5|LINE|L1 102052 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 140-82 chr5 17055569 17055768 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100324 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 140.666-2 chr17 60891086 60891231 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 10 of 25) intron (NM_001330413, intron 10 of 25) 213307 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 234.333-70 chr6 133214057 133214316 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27171 NM_004100 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 294.333-6 chr11 16724655 16724905 + 1.33333 NA intron (NM_001367872, intron 1 of 16) intron (NM_001367872, intron 1 of 16) 13697 NM_001367872 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 144.333-121 chr2 41825295 41825466 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -52175 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 240.666-17 chr15 67516760 67516960 + 1.33333 NA intron (NR_040054, intron 2 of 2) intron (NR_040054, intron 2 of 2) 4113 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 225.333-118 chr6 157788682 157788864 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -34473 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 398.999-2 chr5 180849943 180850279 + 1.33333 NA exon (NM_152283, exon 3 of 3) exon (NM_152283, exon 3 of 3) 11175 NM_152283 643836 Hs.509227 NM_152283 ENSG00000196670 ZFP62 ZET|ZNF755 ZFP62 zinc finger protein protein-coding 234.666-27 chr22 35622509 35622700 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001362846) promoter-TSS (NM_001362846) -75 NM_001362846 4151 Hs.517586 NM_005368 ENSG00000198125 MB PVALB|myoglobgin myoglobin protein-coding 161.333-41 chr10 90694018 90694200 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -153304 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 311.667-16 chr4 30561134 30561508 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -159048 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 156-34 chr12 20130812 20131008 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3009 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 132.667-165 chr7 81109556 81109737 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -187257 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 212-113 chr4 30557947 30558229 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -162281 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 215.333-137 chr3 141680154 141680340 + 1.33333 NA intron (NR_136190, intron 2 of 7) AluSc5|SINE|Alu 17048 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 376.666-12 chr8 126228305 126228763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -96961 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 214-32 chr12 77021092 77021338 + 1.33333 NA TTS (NM_203394) TTS (NM_203394) 44354 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 270.333-57 chr7 52868882 52869292 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -166546 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 199.333-12 chr1 74262095 74262305 + 1.33333 NA intron (NM_015978, intron 4 of 24) MER20|DNA|hAT-Charlie 26813 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 209.333-62 chr14 70755276 70755440 + 1.33333 NA intron (NM_033141, intron 3 of 12) intron (NM_033141, intron 3 of 12) 28094 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 173.333-195 chr8 13776676 13776827 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 147061 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 175.667-120 chr5 130963514 130963705 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 201647 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 350.999-2 chr10 43982252 43982574 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70011 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 223.333-114 chr4 85705877 85706234 + 1.33333 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) L3|LINE|CR1 -16413 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 370-13 chr18 11835792 11836265 + 1.33333 NA intron (NM_001369387, intron 5 of 11) AluJr|SINE|Alu -15385 NM_020412 57132 Hs.656244 NM_020412 ENSG00000255112 CHMP1B C10orf2|C18-ORF2|C18orf2|CHMP1.5|Vps46-2|Vps46B|hVps46-2 charged multivesicular body protein 1B protein-coding 358-8 chr15 33642744 33643118 + 1.33333 NA intron (NM_001243996, intron 27 of 102) intron (NM_001243996, intron 27 of 102) -325566 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 217-7 chr1 199577137 199577332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 428636 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 207.333-109 chr16 11278829 11279072 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2380 NM_002761 5619 Hs.2909 NM_002761 ENSG00000175646 PRM1 CT94.1|P1 protamine 1 protein-coding 234.666-31 chr3 117346145 117346516 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 344595 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 132-89 chr4 52191915 52192027 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 140667 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 344-17 chr18 11506528 11506916 + 1.33333 NA intron (NR_110778, intron 2 of 2) intron (NR_110778, intron 2 of 2) 16674 NR_110778 101927433 Hs.331210 NR_110778 ENSG00000267252 LINC01255 - long intergenic non-protein coding RNA 1255 ncRNA 320.667-26 chr4 32416834 32417274 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 66016 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 205.666-2 chr1 74270612 74270775 + 1.33333 NA intron (NM_015978, intron 4 of 24) intron (NM_015978, intron 4 of 24) 35306 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 215.666-13 chr13 69402197 69402655 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 180080 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 172.333-8 chr1 233356654 233356832 + 1.33333 NA intron (NM_032435, intron 4 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 29019 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 200.666-14 chr10 26019884 26020044 + 1.33333 NA intron (NM_001368265, intron 7 of 7) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 85735 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 347-20 chr2 226209990 226210287 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67344 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 198.333-193 chr8 82317801 82318090 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -475659 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 196.333-70 chr17 76118690 76118924 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15020 NM_001145299 23265 Hs.514496 NM_015219 ENSG00000182473 EXOC7 2-5-3p|BLOM4|EX070|EXO70|EXOC1|Exo70p|YJL085W exocyst complex component 7 protein-coding 314.666-34 chr7 49088023 49088605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 163767 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 307.666-10 chr20 11194134 11194640 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 78996 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 204-93 chr2 35171459 35171738 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -299807 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 280-7 chr12 18609562 18609929 + 1.33333 NA intron (NM_001288774, intron 31 of 32) intron (NM_001288774, intron 31 of 32) 127764 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 175.666-22 chr6 161460040 161460219 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 9 of 11) intron (NM_004562, intron 9 of 11) -10848 NR_134594 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 274.667-45 chr5 75583378 75583787 + 1.33333 NA intron (NM_016218, intron 8 of 14) intron (NM_016218, intron 8 of 14) -27894 NM_001276713 728780 Hs.370455 NM_001271529 ENSG00000189045 ANKDD1B - ankyrin repeat and death domain containing 1B protein-coding 153.333-421 chr8 110639893 110640079 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 387447 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 219.333-4 chr1 37528289 37528528 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13642 NM_022756 64769 Hs.17118 NM_022756 ENSG00000163875 MEAF6 C1orf149|CENP-28|EAF6|NY-SAR-91 MYST/Esa1 associated factor 6 protein-coding 219.666-31 chr4 56727687 56727892 + 1.33333 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger -46083 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 202-133 chr4 67168652 67168854 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 253247 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 173.667-72 chr2 47603587 47603778 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -33351 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 244-73 chr3 126869820 126870038 + 1.33333 NA intron (NM_032343, intron 5 of 7) intron (NM_032343, intron 5 of 7) -118665 NM_032242 5361 Hs.432329 NM_032242 ENSG00000114554 PLXNA1 NOV|NOVP|PLEXIN-A1|PLXN1 plexin A1 protein-coding 241.333-79 chr4 173233130 173233409 + 1.33333 NA intron (NM_017423, intron 1 of 11) L1MA4|LINE|L1 -34891 NR_036093 100422849 NR_036093 ENSG00000221296 MIR548T - microRNA 548t ncRNA 204-163 chr5 84588733 84588887 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -203930 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 127.333-30 chr10 116842107 116842325 + 1.33333 NA intron (NM_001330164, intron 1 of 12) intron (NM_001330164, intron 1 of 12) -7283 NM_001242699 387712 Hs.693248 NM_001242699 ENSG00000188316 ENO4 C10orf134 enolase 4 protein-coding 250.666-25 chr3 169383145 169383445 + 1.33333 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) intron (NM_001366473, intron 1 of 15) -64572 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 304-2 chr1 80308783 80309087 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -226820 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 330-20 chr2 153895727 153896139 + 1.33333 NA intron (NM_052917, intron 1 of 12) intron (NM_052917, intron 1 of 12) 24011 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 474.999 chr22 46500426 46500986 + 1.33333 NA intron (NM_014246, intron 1 of 34) intron (NM_014246, intron 1 of 34) 36914 NM_014246 9620 Hs.252387 NM_014246 ENSG00000075275 CELSR1 ADGRC1|CDHF9|FMI2|HFMI2|ME2 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 protein-coding 202.333-13 chr1 106571544 106571751 + 1.33333 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 -246592 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 293-45 chr8 111942368 111942752 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 565921 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 211.333-243 chr8 100219772 100220059 + 1.33333 NA intron (NM_003114, intron 12 of 18) intron (NM_003114, intron 12 of 18) 61580 NM_003114 6674 Hs.591866 NM_003114 ENSG00000104450 SPAG1 CILD28|CT140|HEL-S-268|HSD-3.8|SP75|TPIS sperm associated antigen 1 protein-coding 201.666-21 chr2 106547821 106547987 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 60540 NM_001349727 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 208-49 chr14 67264041 67264214 + 1.33333 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) intron (NM_001256550, intron 1 of 14) 22692 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 310-44 chr5 88662326 88662640 + 1.33333 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) intron (NR_152235, intron 2 of 3) 4456 NR_030741 407047 NR_030741 ENSG00000284447 MIR9-2 MIRN9-2|hsa-mir-9-2|miRNA9-2|mir-9-2 microRNA 9-2 ncRNA 197.667-78 chr21 24988653 24988932 + 1.33333 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 148242 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 275.999-3 chr2 69693689 69694069 + 1.33333 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) MER45A|DNA|hAT-Tip100 -48255 NM_001320702 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 273-2 chr1 40994497 40994896 + 1.33333 NA intron (NR_125440, intron 7 of 17) L1M4|LINE|L1 6177 NM_001301237 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 213.333-188 chr6 156741513 156741686 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -36256 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 208.999-6 chr6 127443249 127443406 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001012279, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001012279, exon 12 of 12) 16062 NM_014702 9729 Hs.319247 NM_014702 ENSG00000189367 KIAA0408 - KIAA0408 protein-coding 234.333-60 chr5 74972003 74972213 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 80450 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 182.667-133 chr5 73720216 73720455 + 1.33333 NA intron (NM_001177693, intron 2 of 35) intron (NM_001177693, intron 2 of 35) -93211 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 204.667-100 chr3 152112663 152112911 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 92642 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 241-33 chr2 107034302 107034622 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -147353 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 166.667-84 chr16 86581486 86581696 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_005250, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_005250, exon 1 of 1) 3082 NM_005250 2300 Hs.533830 NM_005250 ENSG00000176678 FOXL1 FKH6|FKHL11|FREAC7 forkhead box L1 protein-coding 267.333-5 chr1 73398839 73399202 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 92850 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 199.667-135 chr8 21381555 21381831 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 83454 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 186.333-49 chr14 55681659 55681894 + 1.33333 NA intron (NR_073129, intron 45 of 45) intron (NR_073129, intron 45 of 45) -84469 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 243.333 chr1 18218574 18218781 + 1.33333 NA intron (NM_032880, intron 1 of 9) L1MDa|LINE|L1 110879 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 258.667-14 chr10 92304203 92304659 + 1.33333 NA intron (NM_017824, intron 1 of 5) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 13264 NM_017824 54708 Hs.573490 NM_017824 ENSG00000198060 MARCH5 MARCH-V|MITOL|RNF153 membrane associated ring-CH-type finger 5 protein-coding 214-128 chr7 111856945 111857143 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 23 of 52) intron (NM_001363540, intron 23 of 52) 48539 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 276.666-28 chr5 37632674 37632972 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 201999 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 206-70 chr2 35141892 35142210 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -329354 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 197-25 chr12 4922486 4922670 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12673 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 207.333-255 chr7 82667269 82667574 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -223465 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 192-5 chr1 90944096 90944342 + 1.33333 NA intron (NM_201269, intron 2 of 5) intron (NM_201269, intron 2 of 5) 77289 NM_016620 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 291.333-38 chr2 127977764 127978197 + 1.33333 NA intron (NM_001330303, intron 14 of 19) intron (NM_001330303, intron 14 of 19) 49315 NM_001145928 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 250-9 chr10 13277626 13277984 + 1.33333 NA TTS (NM_001323084) TTS (NM_001323084) 21941 NM_001037537 5264 Hs.498732 NM_006214 ENSG00000107537 PHYH LN1|LNAP1|PAHX|PHYH1|RD phytanoyl-CoA 2-hydroxylase protein-coding 241-58 chr8 82765393 82765693 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -146561 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 216.666-46 chr2 198066561 198066748 + 1.33333 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 262061 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 238-87 chr6 56847614 56847875 + 1.33333 NA intron (NR_125866, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 3758 NR_125866 101930010 Hs.650232 NR_125866 LOC101930010 - uncharacterized LOC101930010 ncRNA 198-131 chr3 193475099 193475354 + 1.33333 NA intron (NM_032279, intron 8 of 29) L1MC5|LINE|L1 -77987 NR_121666 101929198 Hs.450092 NR_046726 ATP13A4-AS1 - ATP13A4 antisense RNA 1 ncRNA 322.666-5 chr10 103058947 103059313 + 1.33333 NA intron (NM_199076, intron 4 of 6) AluSz|SINE|Alu 94691 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 379.333-14 chr8 138533797 138534342 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36339 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 230-32 chr19 27726928 27727230 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -66352 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 212.666-53 chr21 33098164 33098332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25452 NR_109961 101928107 Hs.382669 NR_109961 ENSG00000226527 LOC101928107 - uncharacterized LOC101928107 ncRNA 247-25 chr14 80577502 80577843 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 20 of 24) L2a|LINE|L2 -346615 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 328.666-18 chr5 53552080 53552516 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -8341 NR_134474 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 254.666-16 chr2 101704822 101705145 + 1.33333 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 7276 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 299.666-11 chr2 105704299 105704731 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -40397 NM_003581 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 423-9 chr5 130016235 130016732 + 1.33333 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu 112018 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 226.667-45 chr19 34799184 34799462 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -26108 NM_001007248 148103 Hs.590961 NM_001007247 ENSG00000153896 ZNF599 - zinc finger protein 599 protein-coding 183.666-21 chr6 89434462 89434685 + 1.33333 NA intron (NM_001242809, intron 1 of 15) AluJr|SINE|Alu 1395 NM_014942 22881 Hs.702213 NM_014942 ENSG00000135299 ANKRD6 - ankyrin repeat domain 6 protein-coding 204.666-109 chr8 127550236 127550522 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68240 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 202-173 chr7 50343648 50343807 + 1.33333 NA intron (NM_001291840, intron 2 of 2) intron (NM_001291840, intron 2 of 2) 24679 NM_001291841 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 192.333-171 chr8 111573413 111573588 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 196861 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 156.667-333 chr8 80504197 80504383 + 1.33333 NA intron (NM_001105539, intron 2 of 5) intron (NM_001105539, intron 2 of 5) 18064 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 270.333-12 chr10 84452515 84452988 + 1.33333 NA intron (NM_018999, intron 6 of 10) intron (NM_018999, intron 6 of 10) 27582 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 146-64 chr2 182891823 182891998 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25273 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 204.667-6 chr1 95069018 95069288 + 1.33333 NA intron (NM_144988, intron 1 of 3) intron (NM_144988, intron 1 of 3) 3798 NM_144988 199857 Hs.408927 NM_144988 ENSG00000172339 ALG14 CMS15 ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit protein-coding 206.666-67 chr20 45502762 45502975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12754 NM_006652 10816 Hs.370724 NM_006652 ENSG00000101446 SPINT3 HKIB9 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 3 protein-coding 214-130 chr7 152466466 152466643 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2430 NR_027387 100128822 Hs.647112 NR_027387 ENSG00000261455 LINC01003 - long intergenic non-protein coding RNA 1003 ncRNA 139.333-99 chr18 13328657 13328864 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1ME4b|LINE|L1 50655 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 149.333-330 chr6 12349956 12350116 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59675 NM_001955 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 267.333-33 chr15 69434994 69435400 + 1.33333 NA intron (NM_138555, intron 10 of 22) L3|LINE|CR1 -17621 NM_001003 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 236-6 chr10 7223856 7224173 + 1.33333 NA intron (NM_001029880, intron 10 of 20) L1MEb|LINE|L1 -37230 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 323.666-2 chr10 81039939 81040434 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 390389 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 312.666 chr1 215354867 215355173 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -212284 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 253-16 chr12 56648751 56649046 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2914 NM_001686 506 Hs.406510 NM_001686 ENSG00000110955 ATP5F1B ATP5B|ATPMB|ATPSB|HEL-S-271 ATP synthase F1 subunit beta protein-coding 270-4 chr10 68411166 68411513 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -4045 NM_001042417 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 200.667-42 chr14 45944522 45944783 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119507 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 376 chr10 43677502 43677912 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -28826 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 153.333-80 chr12 2597422 2597595 + 1.33333 NA intron (NM_199460, intron 22 of 49).2 intron (NM_199460, intron 22 of 49).2 74712 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 188.333-147 chr7 80840310 80840493 + 1.33333 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) AluJb|SINE|Alu 78650 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 265.333-48 chr21 20071663 20072011 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -172082 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 395.666 chr12 74083524 74083864 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 208937 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 370.332 chr8 88986542 88986829 + 1.33333 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -659202 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 203.333-217 chr5 89831843 89832050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184774 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 217.333-148 chr8 80628811 80629024 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 142691 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 407.667-4 chr11 99558852 99559349 + 1.33333 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 2955 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 361.333-33 chrX 88229581 88229955 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -517457 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 235.333-133 chr9 83616283 83616540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6638 NM_001256915 414328 Hs.530261 NM_001001551 ENSG00000148057 IDNK C9orf103|bA522I20.2|hGntK IDNK gluconokinase protein-coding 114.333-73 chr14 58327365 58327468 + 1.33333 NA intron (NM_002892, intron 8 of 23) intron (NM_002892, intron 8 of 23) 28861 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 204.333-26 chr10 62129047 62129260 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 79796 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 264-52 chr8 81062609 81062942 + 1.33333 NA intron (NM_018440, intron 2 of 8) FRAM|SINE|Alu 49293 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 202.666-29 chr13 25354139 25354328 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -17741 NM_016529 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 207.333-229 chr5 137820422 137820638 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 19337 NR_002713 4888 Hs.643466 NR_002713 ENSG00000226306 NPY6R NPY1RL|NPY6RP|PP2|Y2B neuropeptide Y receptor Y6 (pseudogene) pseudo 437.666-6 chr4 63071146 63071717 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -909666 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 194.666-10 chr12 12634530 12634697 + 1.33333 NA intron (NM_001310, intron 1 of 3) intron (NM_001310, intron 1 of 3) 22737 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 246.666-44 chrX 112426211 112426521 + 1.33333 NA intron (NM_001004308, intron 2 of 2) L1MC1|LINE|L1 253572 NM_178175 340596 Hs.297420 NM_178175 ENSG00000182508 LHFPL1 - LHFPL tetraspan subfamily member 1 protein-coding 220-42 chr15 99162581 99162879 + 1.33333 NA intron (NR_109947, intron 9 of 12) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 57650 NM_015286 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 196.667-154 chr8 41419612 41419847 + 1.33333 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -6926 NR_145746 109616980 NR_145746 ENSG00000238936 SNORD65B - small nucleolar RNA, C/D box 65B snoRNA 195.666-10 chr11 41347088 41347294 + 1.33333 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 112445 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 224-70 chr4 142688397 142688623 + 1.33333 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) intron (NM_003866, intron 2 of 26) 158025 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 156-35 chr12 32870796 32870976 + 1.33333 NA intron (NM_001005242, intron 3 of 12) intron (NM_001005242, intron 3 of 12) 25960 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 202-102 chr20 53034842 53035099 + 1.33333 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 62612 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 217.333-36 chr11 90206555 90206828 + 1.33333 NA intron (NM_012124, intron 6 of 10) intron (NM_012124, intron 6 of 10) 16358 NM_012124 26973 Hs.22857 NM_012124 ENSG00000110172 CHORDC1 CHP1 cysteine and histidine rich domain containing 1 protein-coding 210-11 chr1 172859487 172859755 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 191342 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 119.333-160 chr4 74339064 74339221 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26003 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 276.999-2 chr1 175713951 175714310 + 1.33333 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 29465 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 202-120 chr3 160081819 160081991 + 1.33333 NA intron (NR_108088, intron 3 of 9) MER11C|LTR|ERVK 61256 NR_104132 730109 Hs.99333 NR_104132 LINC01100 - long intergenic non-protein coding RNA 1100 ncRNA 165.333-55 chr12 30211982 30212135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -427299 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 212.666-71 chr5 144578151 144578559 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 372964 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 289.333-51 chr5 130486126 130486367 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 581781 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 262.333-85 chrX 78425700 78426055 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -98186 NM_001282186 10800 Hs.733809 NM_006639 ENSG00000173198 CYSLTR1 CYSLT1|CYSLT1R|CYSLTR|HMTMF81 cysteinyl leukotriene receptor 1 protein-coding 209.333-113 chr2 74899279 74899481 + 1.33333 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -9751 NR_125792 102724515 Hs.708649 NR_125792 ENSG00000204792 LINC01291 - long intergenic non-protein coding RNA 1291 ncRNA 324-28 chr6 138607179 138607636 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34838 NM_020464 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 216.333-72 chr2 34103125 34103404 + 1.33333 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 36038 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 390-7 chr11 43623895 43624346 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42726 NR_029697 406918 NR_029697 ENSG00000199077 MIR129-2 MIR-129b|MIRN129-2|mir-129-2 microRNA 129-2 ncRNA 299.666-3 chr10 63879442 63879849 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -357755 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 188.666-42 chr9 75676674 75676865 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -213875 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 314.666-32 chr7 26842766 26843059 + 1.33333 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 14811 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 212-92 chr2 185614868 185615089 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 123741 NR_110216 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 159.333-327 chr8 90939250 90939403 + 1.33333 NA intron (NM_022351, intron 9 of 12) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 45751 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 210.666-96 chr7 29360311 29360584 + 1.33333 NA intron (NM_001293071, intron 2 of 11) AluSp|SINE|Alu -119265 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 245-60 chr6 50605487 50605726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107938 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 219.333-70 chr16 81466640 81466839 + 1.33333 NA intron (NM_198390, intron 1 of 20) intron (NM_198390, intron 1 of 20) 21569 NM_198390 80790 Hs.594095 NM_030629 ENSG00000153815 CMIP TCMIP c-Maf inducing protein protein-coding 162-134 chrX 5539718 5539901 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -686549 NR_136577 105373156 Hs.21107 NR_136577 LOC105373156 - uncharacterized LOC105373156 ncRNA 192.333-89 chr2 67101677 67101839 + 1.33333 NA intron (NR_110564, intron 1 of 4) L1ME4b|LINE|L1 15312 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 272.667-47 chr4 76839034 76839377 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 58939 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 345.666-16 chr8 115581429 115581723 + 1.33333 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 86437 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 411.333-2 chr10 29713485 29713928 + 1.33333 NA intron (NM_001323599, intron 1 of 38) MER58A|DNA|hAT-Charlie 22095 NM_003174 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 206.667-142 chr8 130084812 130085078 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_045385) promoter-TSS (NR_045385) -177 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 245.667-7 chr10 63429481 63429794 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_134312) promoter-TSS (NR_134312) -938 NR_134312 105378330 Hs.602852 NR_134312 LOC105378330 - uncharacterized LOC105378330 ncRNA 220.333-39 chr14 68812879 68813197 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16795 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 173-29 chr15 67328497 67328648 + 1.33333 NA intron (NM_001322475, intron 3 of 17) L2c|LINE|L2 -73374 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 210.667-123 chr8 31560124 31560398 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -79491 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 251.666-16 chr2 184404511 184404894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25727 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 222.333-6 chr1 164433622 164433907 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125596 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 219-22 chr14 43500604 43500855 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 1006554 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 215.333-135 chr3 136404637 136404864 + 1.33333 NA intron (NM_005862, intron 21 of 33) intron (NM_005862, intron 21 of 33) 154410 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 315.333-6 chr11 92574893 92575271 + 1.33333 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) intron (NM_001008781, intron 2 of 24) 222986 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 195.667-38 chr14 23027557 23027853 + 1.33333 NA intron (NM_001130725, intron 2 of 2) intron (NM_001130725, intron 2 of 2) 7195 NM_002797 5693 Hs.422990 NM_002797 ENSG00000100804 PSMB5 LMPX|MB1|X proteasome subunit beta 5 protein-coding 250.666-9 chr12 26222001 26222378 + 1.33333 NA intron (NM_005086, intron 1 of 2) intron (NM_005086, intron 1 of 2) 26616 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 419.333-11 chr3 196582287 196582893 + 1.33333 NA intron (NM_001105573, intron 2 of 2) intron (NM_001105573, intron 2 of 2) -13916 NM_001345911 348793 Hs.385865 NM_182627 ENSG00000185798 WDR53 - WD repeat domain 53 protein-coding 242.333-2 chr1 90857046 90857395 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5461 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 212.333-146 chr8 62813126 62813404 + 1.33333 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) L1M2|LINE|L1 -164596 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 249.333-85 chr5 93017740 93017958 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 553494 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 209.333-71 chr15 35766274 35766598 + 1.33333 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) intron (NR_038251, intron 2 of 2) -160420 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 203.333-241 chr7 18165895 18166173 + 1.33333 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) intron (NM_001321872, intron 2 of 11) -38725 NR_031635 100302140 NR_031635 ENSG00000221393 MIR1302-6 MIRN1302-6|hsa-mir-1302-6 microRNA 1302-6 ncRNA 206-97 chr21 29109322 29109484 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001286623, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001286623, exon 7 of 7) -12587 NM_001371376 363.667-18 chr8 131000556 131001037 + 1.33333 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) intron (NM_001115, intron 1 of 17) 40113 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 206.666-63 chr2 200974554 200974713 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_173822, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_173822, exon 12 of 12) -10973 NM_006190 4999 Hs.444870 NM_006190 ENSG00000115942 ORC2 ORC2L origin recognition complex subunit 2 protein-coding 234.666-12 chr12 12232724 12232925 + 1.33333 NA intron (NM_002336, intron 2 of 22).2 intron (NM_002336, intron 2 of 22).2 34220 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 158.333-292 chr7 28441535 28441761 + 1.33333 NA intron (NM_004904, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 6033 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 355.999-6 chr5 161964684 161965103 + 1.33333 NA intron (NR_126372, intron 1 of 2) intron (NR_126372, intron 1 of 2) 36303 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 193.333-24 chr10 89228095 89228240 + 1.33333 NA intron (NM_001127605, intron 4 of 9) intron (NM_001127605, intron 4 of 9) -20850 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 114-160 chr8 26970973 26971149 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 77902 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 330.666-22 chr8 106615146 106615570 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) AluSz|SINE|Alu -42450 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 237.333-57 chr2 110911769 110912049 + 1.33333 NA intron (NM_001371254, intron 11 of 18) L1MB7|LINE|L1 179336 NM_001371254 254.333-42 chr2 116773209 116773517 + 1.33333 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -1041328 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 231.333-39 chr13 36664828 36665113 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -9050 NM_203451 400120 Hs.422375 NM_203451 ENSG00000180440 SERTM1 C13orf36 serine rich and transmembrane domain containing 1 protein-coding 438.666-9 chr9 29224469 29224863 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11065 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 303.333-58 chr5 19651884 19652123 + 1.33333 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 234269 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 233-48 chr3 98397937 98398171 + 1.33333 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 7388 NM_001005516 403277 Hs.554709 NM_001005516 ENSG00000206536 OR5K3 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 3 protein-coding 182-105 chr7 109530719 109530919 + 1.33333 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 429394 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 186-12 chr10 14291633 14291828 + 1.33333 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) L1ME3B|LINE|L1 39154 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 276.666-12 chr15 67407171 67407559 + 1.33333 NA non-coding (NR_040051, exon 6 of 6) non-coding (NR_040051, exon 6 of 6) 113608 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 268.666-32 chr9 122900563 122900871 + 1.33333 NA intron (NM_001100588, intron 1 of 20) intron (NM_001100588, intron 1 of 20) 4642 NM_001100588 54542 Hs.533499 NM_018835 ENSG00000056586 RC3H2 MNAB|RNF164 ring finger and CCCH-type domains 2 protein-coding 333.666-8 chr2 85982122 85982590 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 93076 NR_110569 101928113 Hs.625888 NR_110569 ST3GAL5-AS1 - ST3GAL5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 464-4 chr18 61409332 61409924 + 1.33333 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 76198 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 200.333-20 chr11 83653605 83653858 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) AluSz|SINE|Alu 28694 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 274.333-70 chr8 117698331 117698696 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 177800 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 220-11 chr10 46070042 46070338 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -23921 NM_002443 4477 Hs.255462 NM_002443 ENSG00000263639 MSMB HPC13|IGBF|MSP|MSPB|PN44|PRPS|PSP|PSP-94|PSP57|PSP94 microseminoprotein beta protein-coding 320.333-16 chr2 149807101 149807398 + 1.33333 NA intron (NR_145421, intron 2 of 4) intron (NR_145421, intron 2 of 4) 51942 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 304.666-17 chr22 31406894 31407199 + 1.33333 NA intron (NM_004147, intron 3 of 8) L1MC4a|LINE|L1 7442 NM_004147 4733 Hs.115242 NM_004147 ENSG00000185721 DRG1 NEDD3 developmentally regulated GTP binding protein 1 protein-coding 167.333-192 chr4 94334407 94334596 + 1.33333 NA exon (NM_014485, exon 2 of 6) exon (NM_014485, exon 2 of 6) 8335 NM_014485 27306 Hs.128433 NM_014485 ENSG00000163106 HPGDS GSTS|GSTS1|GSTS1-1|PGD2|PGDS hematopoietic prostaglandin D synthase protein-coding 223.999-4 chr14 83457448 83457620 + 1.33333 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 814902 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 326-52 chr9 115598736 115599218 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 145262 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 244.333-4 chr1 71027180 71027390 + 1.33333 NA intron (NM_198719, intron 1 of 3) AluJr4|SINE|Alu -19221 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 278.333-13 chr10 91294282 91294754 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 73855 NM_032373 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 190-78 chr22 40904463 40904660 + 1.33333 NA intron (NM_022098, intron 4 of 9) intron (NM_022098, intron 4 of 9) -42448 NM_145174 150353 Hs.585042 NM_145174 ENSG00000172404 DNAJB7 DJ5|HSC3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B7 protein-coding 164.333-172 chr4 40440214 40440398 + 1.33333 NA intron (NM_001098634, intron 3 of 6) intron (NM_001098634, intron 3 of 6) 61813 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 188-89 chr5 33229901 33230052 + 1.33333 NA intron (NR_147008, intron 1 of 3) intron (NR_147008, intron 1 of 3) 241 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 286.667-2 chr1 47288089 47288435 + 1.33333 NA intron (NM_001282938, intron 11 of 18) intron (NM_001282938, intron 11 of 18) 25885 NM_003035 6491 Hs.525198 NM_003035 ENSG00000123473 STIL MCPH7|SIL STIL centriolar assembly protein protein-coding 178-48 chr14 83470628 83470926 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 828145 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 216.667-100 chr7 137128062 137128367 + 1.33333 NA intron (NR_046103, intron 1 of 3) intron (NR_046103, intron 1 of 3) 36127 NR_046103 349160 Hs.660713 NR_046103 ENSG00000234352 LOC349160 - uncharacterized LOC349160 ncRNA 172-81 chr4 64557690 64557845 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -148307 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 258-8 chr10 98052327 98052700 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21685 NM_001206528 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 297.333-52 chr7 100088494 100088916 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_006833) promoter-TSS (NM_006833) -264 NM_006833 10980 Hs.15591 NM_006833 ENSG00000168090 COPS6 CSN6|MOV34-34KD COP9 signalosome subunit 6 protein-coding 210.666-15 chr11 27002885 27003110 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8885 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 204-128 chr3 32216007 32216211 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22570 NM_001320308 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 231.333-125 chr9 86778141 86778401 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 169235 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 213.333-220 chr8 136884871 136885071 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) L1MB1|LINE|L1 354173 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 218-59 chr2 189702547 189702726 + 1.33333 NA intron (NM_144708, intron 7 of 22) L1MCa|LINE|L1 26651 NM_144708 150709 Hs.60772 NM_144708 ENSG00000151687 ANKAR - ankyrin and armadillo repeat containing protein-coding 209.666-39 chr4 31116681 31116846 + 1.33333 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -54381 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 238.666-14 chr12 45110404 45110630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45106 NR_026583 83956 Hs.650500 NM_032032 RACGAP1P FKSG42 Rac GTPase activating protein 1 pseudogene pseudo 398.667-4 chr15 98293781 98294353 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37491 NR_146566 105371011 NR_146566 LINC02351 - long intergenic non-protein coding RNA 2351 ncRNA 191.667-25 chr11 63719656 63719904 + 1.33333 NA exon (NM_001265590, exon 2 of 8) exon (NM_001265590, exon 2 of 8) 38280 NM_001265591 10313 Hs.743229 NM_006054 ENSG00000133318 RTN3 ASYIP|HAP|NSPL2|NSPLII|RTN3-A1 reticulon 3 protein-coding 278.333-14 chr11 84405509 84405824 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) L2a|LINE|L2 -88327 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 254.333-21 chr14 70090842 70091291 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -10849 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 251.666-21 chr4 33896003 33896312 + 1.33333 NA TTS (NR_125902) TTS (NR_125902) 143736 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 245.333-132 chrX 110279399 110279694 + 1.33333 NA intron (NM_001171689, intron 3 of 7) intron (NM_001171689, intron 3 of 7) 38539 NM_015365 9949 Hs.656243 NM_015365 ENSG00000101935 AMMECR1 AMMERC1|MFHIEN Alport syndrome, mental retardation, midface hypoplasia and elliptocytosis chromosomal region gene 1 protein-coding 246.333-75 chr5 81130119 81130489 + 1.33333 NA intron (NM_006909, intron 17 of 26) intron (NM_006909, intron 17 of 26) -103016 NM_001099736 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 198.333-110 chr20 34600589 34600777 + 1.33333 NA intron (NM_080476, intron 7 of 11) intron (NM_080476, intron 7 of 11) 41965 NM_032514 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 211.333-62 chr14 61034210 61034463 + 1.33333 NA intron (NR_033344, intron 6 of 16) intron (NR_033344, intron 6 of 16) -52646 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 287.666-3 chr12 125027768 125028160 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_110375) promoter-TSS (NR_110375) -541 NR_110375 102659353 Hs.596464 NR_110375 ENSG00000280634 THRIL BRI3BP-AS1|BRI3BPAS1|Linc1992|TCONS_00020260 TNF and HNRNPL related immunoregulatory long non-coding RNA ncRNA 201.333-259 chr7 28394929 28395103 + 1.33333 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) -17502 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 318-22 chr18 74883630 74883969 + 1.33333 NA intron (NM_017757, intron 5 of 7) intron (NM_017757, intron 5 of 7) 252836 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 209-17 chr10 126036658 126036854 + 1.33333 NA intron (NM_003474, intron 20 of 22) intron (NM_003474, intron 20 of 22) -63483 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 229-6 chr10 31651718 31652018 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -252113 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 204.666-3 chr1 69738617 69738798 + 1.33333 NA intron (NM_001366839, intron 3 of 25) LTR85c|LTR|Gypsy? 169366 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 212.666-15 chr10 122166105 122166289 + 1.33333 NA intron (NM_001291878, intron 1 of 16) intron (NM_001291878, intron 1 of 16) 2567 NM_006997 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 232.666-48 chr7 3827893 3828154 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) AluSx1|SINE|Alu -301662 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 201.666-43 chr8 15854965 15855128 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 314783 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 184-122 chr9 74035577 74035930 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -335778 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 198.333-200 chr8 135369186 135369418 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -88154 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 323.333-24 chr4 32018882 32019165 + 1.33333 NA intron (NR_134682, intron 1 of 3) intron (NR_134682, intron 1 of 3) 3399 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 292-19 chr16 86139543 86139923 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -56448 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 162-111 chr7 44439827 44439986 + 1.33333 NA intron (NM_015332, intron 2 of 5) L1MD3|LINE|L1 50752 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 278.666-18 chr4 30399928 30400197 + 1.33333 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -320307 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 275.333-12 chr11 123689381 123689680 + 1.33333 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -34923 NM_001040151 55800 Hs.4865 NM_018400 ENSG00000166257 SCN3B ATFB16|BRGDA7|HSA243396|SCNB3 sodium voltage-gated channel beta subunit 3 protein-coding 195.666-15 chr12 113907319 113907530 + 1.33333 NA intron (NM_001146698, intron 21 of 24) intron (NM_001146698, intron 21 of 24) 58901 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 182.333-116 chr4 111540709 111540936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -604632 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 311.999-3 chr17 39222141 39222566 + 1.33333 NA intron (NM_001351360, intron 1 of 10) intron (NM_001351360, intron 1 of 10) 3592 NM_198993 342667 Hs.145068 NM_198993 ENSG00000141750 STAC2 24b2|24b2/STAC2 SH3 and cysteine rich domain 2 protein-coding 308.999 chr3 52184678 52185145 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13172 NM_001304443 211 Hs.476308 NM_000688 ENSG00000023330 ALAS1 ALAS|ALAS-H|ALAS3|ALASH|MIG4 5'-aminolevulinate synthase 1 protein-coding 237.333-79 chr3 83446474 83446735 + 1.33333 NA Intergenic Tigger12A|DNA|TcMar-Tigger 1422971 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 207.333-96 chr14 99794784 99795008 + 1.33333 NA intron (NM_004434, intron 1 of 21) intron (NM_004434, intron 1 of 21) 1483 NM_004434 2009 Hs.12451 NM_004434 ENSG00000066629 EML1 BH|ELP79|EMAP|EMAPL|HuEMAP EMAP like 1 protein-coding 276.333 chr1 162948630 162949000 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -80000 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 216.666-37 chr2 6932815 6933057 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001349183) promoter-TSS (NM_001349183) -148 NM_001349183 9781 Hs.22146 NM_014746 ENSG00000151692 RNF144A RNF144|UBCE7IP4|hUIP4 ring finger protein 144A protein-coding 375.667-8 chr16 83656586 83657104 + 1.33333 NA intron (NM_001220489, intron 7 of 12) intron (NM_001220489, intron 7 of 12) 147131 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 240-66 chr4 48849427 48849712 + 1.33333 NA intron (NM_001079839, intron 5 of 8) intron (NM_001079839, intron 5 of 8) 10634 NR_146806 100861517 Hs.661065 NR_146806 ENSG00000248256 OCIAD1-AS1 - OCIAD1 antisense RNA 1 ncRNA 124-8 chr1 101651295 101651457 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 195704 NM_001288821 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 252.333-57 chr5 87780121 87780569 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118303 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 335.333-12 chr12 72395279 72395675 + 1.33333 NA intron (NM_013381, intron 3 of 18) L2a|LINE|L2 -121968 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 164.667-28 chr10 97054737 97054952 + 1.33333 NA intron (NM_003061, intron 13 of 36) L1MC5|LINE|L1 -47912 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 259.666-5 chr10 15805164 15805513 + 1.33333 NA intron (NM_024948, intron 10 of 14) intron (NM_024948, intron 10 of 14) 55169 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 211.333-151 chr3 68158559 68158770 + 1.33333 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 154417 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 223-44 chr4 14205133 14205544 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 93370 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 202-153 chr5 142538570 142538751 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 82674 NM_001144892 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 198.333-81 chr17 63366535 63366750 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 13 of 25) intron (NM_025185, intron 13 of 25) 73625 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 442.667-4 chr4 21453342 21453934 + 1.33333 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 11120 NR_107018 102465859 NR_107018 ENSG00000283281 MIR7978 hsa-mir-7978 microRNA 7978 ncRNA 200.666-98 chr5 39491572 39491801 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -28745 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 199.666 chr1 26123157 26123392 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001243532, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001243532, exon 3 of 3) 11450 NM_152835 149420 Hs.468801 NM_152835 ENSG00000175087 PDIK1L CLIK1L|STK35L2 PDLIM1 interacting kinase 1 like protein-coding 360.666 chr10 87520311 87520751 + 1.33333 NA intron (NM_001178118, intron 3 of 4) L1ME3G|LINE|L1 12698 NM_001178118 9562 Hs.121260 NM_004897 ENSG00000107789 MINPP1 HIPER1|MINPP2|MIPP multiple inositol-polyphosphate phosphatase 1 protein-coding 218.333-55 chr18 35096526 35096848 + 1.33333 NA intron (NM_001143827, intron 3 of 7) intron (NM_001143827, intron 3 of 7) 55274 NM_014268 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 210-40 chr14 64500128 64500393 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001354684, exon 1 of 4) 5' UTR (NM_001354684, exon 1 of 4) 193 NM_001354683 7597 Hs.654571 NM_006977 ENSG00000089775 ZBTB25 C14orf51|KUP|ZNF46 zinc finger and BTB domain containing 25 protein-coding 257.333-37 chr15 65607950 65608191 + 1.33333 NA intron (NR_045104, intron 1 of 11) Tigger8|DNA|TcMar-Tigger 3061 NR_045106 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 186.666-4 chr1 118787768 118787955 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 200482 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 123-44 chr15 57305727 57305876 + 1.33333 NA non-coding (NR_024433, exon 2 of 3) non-coding (NR_024433, exon 2 of 3) 5436 NR_024433 283663 Hs.181297 NR_024433 ENSG00000247982 LINC00926 - long intergenic non-protein coding RNA 926 ncRNA 181.333-61 chr17 63191120 63191353 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 225001 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 240-91 chr8 99982432 99982807 + 1.33333 NA intron (NM_015668, intron 21 of 27) L2c|LINE|L2 -21963 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 192.666-55 chr5 164125450 164125698 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 341828 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 195.666-30 chr3 37348836 37349084 + 1.33333 NA intron (NM_001172713, intron 21 of 22) intron (NM_001172713, intron 21 of 22) -37309 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 211.999-11 chr5 89683232 89683393 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 333408 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 186-47 chr2 75227138 75227377 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -27737 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 281-39 chr6 165864177 165864561 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -123182 NR_027284 441177 Hs.708964 NM_001013720 ENSG00000281832 LINC00602 - long intergenic non-protein coding RNA 602 ncRNA 224-77 chr5 56964077 56964373 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -12095 NM_001297598 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 235.333-109 chr6 150561377 150561685 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -38354 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 290.666-18 chr3 35791978 35792335 + 1.33333 NA intron (NM_016300, intron 18 of 19) intron (NM_016300, intron 18 of 19) 47680 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 312.333-19 chr4 56556680 56557166 + 1.33333 NA intron (NM_001256475, intron 3 of 8) intron (NM_001256475, intron 3 of 8) 26317 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 154.666-14 chr5 111422178 111422334 + 1.33333 NA intron (NM_001744, intron 5 of 10) HAL1b|LINE|L1 -89970 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 192.667-141 chr5 146379352 146379627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40650 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 143.333-69 chr12 80636663 80636797 + 1.33333 NA intron (NM_001145026, intron 35 of 44) intron (NM_001145026, intron 35 of 44) -70904 NM_002469 4618 Hs.35937 NM_002469 ENSG00000111046 MYF6 CNM3|MRF4|bHLHc4|myf-6 myogenic factor 6 protein-coding 222.333-24 chr12 32770000 32770246 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14226 NM_001040436 51067 Hs.505231 NM_015936 ENSG00000139131 YARS2 CGI-04|MLASA2|MT-TYRRS|TYRRS tyrosyl-tRNA synthetase 2 protein-coding 258-66 chr5 86240547 86240930 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -41706 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 356.333-25 chr8 85986993 85987293 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 82525 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 321.333-47 chr4 99638853 99639137 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001354435, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001354435, exon 2 of 2) 15684 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 220.666-12 chr10 100903218 100903394 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -9657 NM_001243770 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 115.333-41 chr12 2387573 2387733 + 1.33333 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 L2c|LINE|L2 117877 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 175.666-4 chr11 47891844 47892003 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -43379 NM_015231 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 230.333-91 chr5 22707553 22707884 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 145626 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 206-40 chr12 24090823 24091064 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) MER126|DNA|DNA -121478 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 140.667-17 chr1 150708836 150708994 + 1.33333 NA exon (NM_001199829, exon 7 of 14) exon (NM_001199829, exon 7 of 14) -11761 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 216.333-87 chr2 197104810 197105069 + 1.33333 NA intron (NM_153697, intron 9 of 9) intron (NM_153697, intron 9 of 9) -93052 NR_135584 101927596 NR_135584 ENSG00000231621 LOC101927596 - uncharacterized LOC101927596 ncRNA 257.333-90 chr7 38307015 38307344 + 1.33333 NA Intergenic (GCTGAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -33532 NM_001003806 445347 Hs.534032 NM_001003799 TARP CD3G|TCRG|TCRGC1|TCRGC2|TCRGV TCR gamma alternate reading frame protein protein-coding 325.666-6 chr15 65707012 65707491 + 1.33333 NA intron (NM_005848, intron 14 of 31) intron (NM_005848, intron 14 of 31) -10315 NR_145750 109617020 NR_145750 ENSG00000238311 SNORD13E - small nucleolar RNA, C/D box 13E snoRNA 211.333-130 chr2 237241831 237242083 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 156068 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 229.666-18 chr20 49094289 49094519 + 1.33333 NA intron (NM_001362762, intron 23 of 24) intron (NM_001362762, intron 23 of 24) 48092 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 182-35 chr16 8495038 8495202 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 94718 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 251-29 chr17 62301898 62302112 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -26350 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 169.333-14 chr1 192479250 192479397 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -96450 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 344.333-26 chr8 86061057 86061475 + 1.33333 NA intron (NM_033126, intron 2 of 2) LTR16A2|LTR|ERVL 8402 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 231-46 chr4 30383624 30383950 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -336582 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 188.667-120 chr5 17421482 17421742 + 1.33333 NA intron (NR_134274, intron 1 of 1) MamRep1151|LTR?|LTR? -15125 NR_134273 101929544 Hs.23725 NR_134273 ENSG00000248455 LINC02217 - long intergenic non-protein coding RNA 2217 ncRNA 290-21 chr2 102196745 102197060 + 1.33333 NA intron (NM_003854, intron 4 of 11) L2c|LINE|L2 9588 NM_001351446 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 210.666-94 chr6 132916083 132916246 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 98945 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 198-124 chr3 103843590 103843991 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -319674 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 144.666-9 chr2 220726777 220726922 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -820284 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 262-2 chr1 80972893 80973156 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 331737 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 198-161 chr6 120212644 120212939 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 197612 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 206.666-122 chr9 27017955 27018181 + 1.33333 NA intron (NM_001099224, intron 11 of 13) intron (NM_001099224, intron 11 of 13) -12396 NM_022901 64922 Hs.128071 NM_022901 ENSG00000184434 LRRC19 - leucine rich repeat containing 19 protein-coding 200.667-10 chr1 115918818 115919083 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_125969) promoter-TSS (NR_125969) -426 NR_125969 101928995 Hs.559119 NR_125969 ENSG00000228127 LINC01649 - long intergenic non-protein coding RNA 1649 ncRNA 162.666-10 chr4 31776810 31776963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -220493 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 206-191 chr8 136503105 136503308 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27592 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 300.667-27 chr3 90242394 90242772 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 1134962 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 217-34 chr18 6713056 6713350 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -16513 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 362-21 chr5 51745829 51746229 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -262002 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 218.666-10 chr10 34196788 34197026 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -424227 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 196.333-75 chr18 22961283 22961479 + 1.33333 NA intron (NM_002894, intron 4 of 18) intron (NM_002894, intron 4 of 18) 27505 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 292.666-2 chr1 197430944 197431224 + 1.33333 NA intron (NM_001193640, intron 6 of 9) (AAAATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 162832 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 203-21 chr11 84163734 84163988 + 1.33333 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) intron (NM_001142700, intron 1 of 19) 109419 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 351.666-4 chr16 14389626 14389909 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -19501 NR_131191 105447648 Hs.554151 NR_131191 ENSG00000260009 LINC02130 - long intergenic non-protein coding RNA 2130 ncRNA 144.333-230 chr6 45266438 45266555 + 1.33333 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -61821 NM_001015051 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 173.666-11 chr3 82669683 82669872 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 683635 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 241.333-75 chr4 91469024 91469366 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 808107 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 378.667-12 chr2 14599271 14599753 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33205 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 215.333-79 chr18 59203254 59203511 + 1.33333 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -16776 NM_001012513 2922 Hs.153444 NM_002091 ENSG00000134443 GRP BN|GRP-10|preproGRP|proGRP gastrin releasing peptide protein-coding 198-25 chr10 120073902 120074093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 115484 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 228-78 chr7 26387130 26387395 + 1.33333 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) intron (NR_136272, intron 1 of 1) -10561 NR_136270 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 206.999-4 chr8 100266336 100266491 + 1.33333 NA intron (NM_001353837, intron 5 of 9) intron (NM_001353837, intron 5 of 9) 35780 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 190.333-138 chr7 108859146 108859314 + 1.33333 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 25357 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 405.333-7 chr5 91802179 91802750 + 1.33333 NA Intergenic LTR28C|LTR|ERV1 -419147 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 309.333-63 chr9 17052168 17052472 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -82720 NM_001286984 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 197.333-173 chr4 133517873 133518104 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 368694 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 250-6 chr1 187341985 187342425 + 1.33333 NA intron (NR_126347, intron 3 of 3) intron (NR_126347, intron 3 of 3) -101423 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 126.667-179 chr8 129234402 129234548 + 1.33333 NA intron (NR_033916, intron 1 of 2) intron (NR_033916, intron 1 of 2) 6765 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 215.666-26 chr22 38532761 38532976 + 1.33333 NA intron (NM_001363017, intron 10 of 11) AluJo|SINE|Alu -26557 NM_006386 10521 Hs.528305 NM_006386 ENSG00000100201 DDX17 P72|RH70 DEAD-box helicase 17 protein-coding 299.999-5 chr2 53155167 53155415 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -452676 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 198-175 chr7 93234695 93234851 + 1.33333 NA intron (NM_001257998, intron 1 of 28) intron (NM_001257998, intron 1 of 28) 2407 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 238-13 chr11 97052065 97052273 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 543744 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 215.333-162 chr5 92872773 92872991 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 698461 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 213-9 chr10 95372454 95372750 + 1.33333 NA intron (NM_001034955, intron 17 of 30) intron (NM_001034955, intron 17 of 30) 68578 NM_001034956 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 192-89 chr22 27450740 27450951 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 140194 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 224-76 chr5 55820936 55821136 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30321 NM_001297572 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 198.666-23 chr13 113282629 113282860 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -14495 NM_005561 3916 Hs.494419 NM_005561 ENSG00000185896 LAMP1 CD107a|LAMPA|LGP120 lysosomal associated membrane protein 1 protein-coding 234.666-30 chr3 11567878 11568140 + 1.33333 NA intron (NM_001128219, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 789 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 232.666-28 chr2 224118626 224118867 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -79427 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 208.666-15 chr10 29294459 29294649 + 1.33333 NA intron (NM_032517, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 5484 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 206.666-14 chr1 232593205 232593464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -77726 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 188.666-23 chr21 27214547 27214824 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -247597 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 275.999-2 chr2 69400802 69401179 + 1.33333 NA intron (NM_001002756, intron 5 of 6) intron (NM_001002756, intron 5 of 6) -13736 NM_001244710 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 188-88 chr5 32707364 32707530 + 1.33333 NA intron (NM_001364458, intron 1 of 7) intron (NM_001364458, intron 1 of 7) -3190 NM_001204376 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 268-41 chr4 31276634 31276955 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 105650 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 343.333-4 chr11 41162352 41163033 + 1.33333 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 296944 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 216.333-86 chr2 190954466 190954782 + 1.33333 NA exon (NM_014905, exon 16 of 18) exon (NM_014905, exon 16 of 18) 59626 NM_139266 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 229.333-55 chr19 14891374 14891639 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10151 NM_030901 26333 Hs.247717 NM_030901 ENSG00000185385 OR7A17 BC85395_4|HTPCRX19 olfactory receptor family 7 subfamily A member 17 protein-coding 191.333-108 chr2 63849995 63850177 + 1.33333 NA intron (NM_006759, intron 1 of 9) intron (NM_006759, intron 1 of 9) 8206 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 184.666-35 chr6 108402816 108402985 + 1.33333 NA intron (NM_145315, intron 7 of 12) intron (NM_145315, intron 7 of 12) 107846 NM_145315 246269 Hs.259666 NM_145315 ENSG00000135537 AFG1L AFG1|LACE1|c222389 AFG1 like ATPase protein-coding 321.333-54 chr7 81384584 81384952 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 177051 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 361.666-3 chr11 83716727 83717029 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) L2c|LINE|L2 -34453 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 192.666-37 chr2 192533365 192533523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -216401 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 196.333-87 chr2 136678838 136679014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -86619 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 249.666-12 chr13 50059609 50059928 + 1.33333 NA intron (NR_152566, intron 5 of 13) intron (NR_152566, intron 5 of 13) -10567 NR_029485 406948 NR_029485 ENSG00000283785 MIR15A MIRN15A|hsa-mir-15a|miRNA15A|mir-15a microRNA 15a ncRNA 201.666-26 chr2 138401202 138401402 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -100468 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 411.666-10 chr9 27460189 27460678 + 1.33333 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) intron (NM_024761, intron 1 of 3) -63881 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 194-119 chr6 57248042 57248374 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15138 NR_109774 100506188 Hs.485640 NR_109774 LOC100506188 - uncharacterized LOC100506188 ncRNA 202.666-66 chr2 217493523 217493687 + 1.33333 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) L1PA12|LINE|L1 210872 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 184.333-63 chr18 70210025 70210171 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4411 NM_001318520 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 250.666-36 chr6 150766095 150766454 + 1.33333 NA intron (NM_001329803, intron 2 of 13) intron (NM_001329803, intron 2 of 13) 45175 NM_001329801 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 122-49 chr2 57244261 57244384 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -663329 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 130.667-130 chr20 43255529 43255688 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65702 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 161.333-298 chr9 72551075 72551238 + 1.33333 NA intron (NM_138691, intron 1 of 23) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 29355 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 312-35 chr3 167407282 167407592 + 1.33333 NA intron (NR_126353, intron 3 of 3) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 14641 NR_126353 104310350 Hs.581631 NR_126353 ENSG00000241669 LINC01327 TCONS_00005644 long intergenic non-protein coding RNA 1327 ncRNA 139.333-115 chr2 124732164 124732346 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) intron (NM_130773, intron 13 of 23) 706968 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 231.333-71 chr3 71180212 71180520 + 1.33333 NA intron (NR_146142, intron 6 of 19) intron (NR_146142, intron 6 of 19) -48169 NM_001349342 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 163.666-5 chr13 75364588 75364732 + 1.33333 NA intron (NM_001286658, intron 1 of 19) intron (NM_001286658, intron 1 of 19) 117508 NM_001286659 9882 Hs.210891 NM_014832 ENSG00000136111 TBC1D4 AS160|NIDDM5 TBC1 domain family member 4 protein-coding 178-77 chr3 52808083 52808340 + 1.33333 NA exon (NM_002217, exon 21 of 22) exon (NM_002217, exon 21 of 22) 13443 NM_002217 3699 Hs.76716 NM_002217 ENSG00000162267 ITIH3 H3P|ITI-HC3|SHAP inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 3 protein-coding 174-42 chr17 31957492 31957739 + 1.33333 NA intron (NM_015355, intron 4 of 15) AluSq|SINE|Alu 20608 NM_015355 23512 Hs.462732 NM_015355 ENSG00000178691 SUZ12 CHET9|JJAZ1 SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit protein-coding 209.666-21 chr16 86840752 86840971 + 1.33333 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 118770 NR_135183 102724344 Hs.585769 NR_135182 ENSG00000261175 LINC02188 - long intergenic non-protein coding RNA 2188 ncRNA 226.666-41 chr7 80927438 80927814 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5237 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 232.666-45 chr6 126796775 126797004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 312258 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 202.666-100 chr5 124103724 124103966 + 1.33333 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR 334675 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 186.333-58 chr16 82718270 82718440 + 1.33333 NA intron (NM_001220488, intron 2 of 14) intron (NM_001220488, intron 2 of 14) 29424 NR_107025 102465863 NR_107025 ENSG00000277387 MIR8058 hsa-mir-8058 microRNA 8058 ncRNA 230.666-46 chr7 4320703 4320888 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -185958 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 244.666-6 chr1 245165812 245166154 + 1.33333 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) intron (NM_018012, intron 2 of 14) 10998 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 207.666-49 chr5 8661002 8661241 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -178611 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 192-131 chr7 23979964 23980108 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 269817 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 177.333-134 chr5 142490126 142490279 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 131132 NM_001144892 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 212-117 chr4 63737339 63737546 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 672008 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 179-4 chr1 98873328 98873517 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -130854 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 181.666 chr1 46706956 46707116 + 1.33333 NA intron (NM_014774, intron 3 of 10) intron (NM_014774, intron 3 of 10) 12078 NM_014774 9813 Hs.707688 NM_014774 ENSG00000159658 EFCAB14 KIAA0494 EF-hand calcium binding domain 14 protein-coding 244.667-28 chr12 2914771 2915093 + 1.33333 NA intron (NM_003324, intron 2 of 10) intron (NM_003324, intron 2 of 10) 24041 NM_001160408 7289 Hs.655333 NM_003324 ENSG00000078246 TULP3 TUBL3 TUB like protein 3 protein-coding 196.667-30 chr11 88795806 88796047 + 1.33333 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) intron (NM_001143831, intron 2 of 8) 252146 NM_001143831 2915 Hs.147361 NM_000842 ENSG00000168959 GRM5 GPRC1E|MGLUR5|PPP1R86|mGlu5 glutamate metabotropic receptor 5 protein-coding 202.667-86 chr2 204900156 204900464 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) L1M1|LINE|L1 354835 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 206-115 chr3 120890190 120890415 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17903 NM_014980 9515 Hs.477315 NM_014980 ENSG00000145087 STXBP5L LLGL4 syntaxin binding protein 5 like protein-coding 228-46 chr2 139125590 139125778 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 228360 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 288.666-22 chr20 40705281 40705689 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9138 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 221.333-101 chr4 70166156 70166470 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_214711, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_214711, exon 5 of 5) 12076 NM_214711 401137 Hs.518795 NM_214711 ENSG00000187533 PRR27 C4orf40 proline rich 27 protein-coding 227-52 chr6 166002588 166003066 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14788 NR_026861 90632 Hs.31917 NR_026860 ENSG00000112541 LINC00473 C6orf176|LNC473|bA142J11.1 long intergenic non-protein coding RNA 473 ncRNA 208.999 chr18 37737996 37738163 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 80944 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 206-28 chr10 129628034 129628226 + 1.33333 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) intron (NM_002412, intron 2 of 4) 160889 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 298-29 chr15 68530113 68530484 + 1.33333 NA intron (NM_001324014, intron 1 of 12) AluY|SINE|Alu 11925 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 295.666-11 chr2 158403308 158403637 + 1.33333 NA intron (NM_138803, intron 1 of 13) intron (NM_138803, intron 1 of 13) 53281 NM_001301685 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 218.666-4 chr1 97271633 97271835 + 1.33333 NA intron (NR_046590, intron 2 of 4) intron (NR_046590, intron 2 of 4) 175811 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 123.666-4 chr6 144254682 144254854 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -36969 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 285-20 chr3 84773576 84774062 + 1.33333 NA intron (NR_033860, intron 10 of 20) L1MA4|LINE|L1 95756 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 351.666-7 chr2 183090095 183090389 + 1.33333 NA intron (NR_135688, intron 2 of 2) intron (NR_135688, intron 2 of 2) 11495 NM_080876 142679 Hs.132237 NM_080876 ENSG00000162999 DUSP19 DUSP17|LMWDSP3|SKRP1|TS-DSP1 dual specificity phosphatase 19 protein-coding 154.333-211 chr3 43800358 43800693 + 1.33333 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -108931 NM_001346468 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 186.667-148 chr8 71491277 71491511 + 1.33333 NA intron (NM_001370334, intron 2 of 19) intron (NM_001370334, intron 2 of 19) 56310 NM_001370334 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 184-100 chr6 169999699 169999867 + 1.33333 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 37160 NR_027434 100131532 Hs.703417 NR_027434 LOC100131532 - uncharacterized LOC100131532 ncRNA 190.333-105 chr4 58318575 58318783 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 217649 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 211.667-32 chr12 40417578 40417843 + 1.33333 NA intron (NM_173600, intron 11 of 173) intron (NM_173600, intron 11 of 173) 24316 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 411.333 chr1 51798199 51798652 + 1.33333 NA intron (NM_001101662, intron 21 of 30) intron (NM_001101662, intron 21 of 30) 37977 NR_031580 100313892 NR_031580 ENSG00000283899 MIR761 hsa-mir-761 microRNA 761 ncRNA 174.667-119 chr3 183526369 183526600 + 1.33333 NA intron (NM_130446, intron 2 of 6) intron (NM_130446, intron 2 of 6) -22251 NR_046687 100874019 NR_046687 ENSG00000242522 KLHL6-AS1 - KLHL6 antisense RNA 1 ncRNA 272.333-64 chr8 112763266 112763488 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 119884 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 202.666-5 chr1 175947758 175948003 + 1.33333 NA intron (NM_022457, intron 18 of 19) intron (NM_022457, intron 18 of 19) 20599 NR_162097 113839518 NR_162097 MIR1843 - microRNA 1843 ncRNA 253.333-88 chr5 156275392 156275620 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51251 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 198.666-83 chr5 151904936 151905094 + 1.33333 NA intron (NM_000171, intron 1 of 8) intron (NM_000171, intron 1 of 8) 19836 NM_000171 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 130-124 chr7 144676364 144676510 + 1.33333 NA intron (NM_001350884, intron 2 of 7) intron (NM_001350884, intron 2 of 7) 62461 NR_146936 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 202.666-28 chr12 117177379 117177587 + 1.33333 NA intron (NM_015002, intron 4 of 11) intron (NM_015002, intron 4 of 11) 12987 NM_015002 23014 Hs.740376 NM_015002 ENSG00000135108 FBXO21 FBX21 F-box protein 21 protein-coding 251.666-11 chr17 59603729 59604076 + 1.33333 NA intron (NM_024612, intron 15 of 17) L1MC4|LINE|L1 -15787 NM_001288653 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 151.333-13 chr1 76469386 76469540 + 1.33333 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) intron (NM_001349109, intron 3 of 3) 309804 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 207-129 chr9 110841836 110842047 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113679 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 210.333-165 chr8 66116634 66116920 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -10352 NM_184085 84675 Hs.85524 NM_033058 ENSG00000147573 TRIM55 MURF-2|RNF29|muRF2 tripartite motif containing 55 protein-coding 161.666-4 chr14 52289807 52289970 + 1.33333 NA Intergenic Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 22190 NM_000953 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 330.333-29 chrX 44306367 44306638 + 1.33333 NA intron (NM_025184, intron 2 of 14) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 37170 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 151.333-2 chr1 20124358 20124597 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4911 NM_001271814 26279 Hs.189507 NM_012400 ENSG00000117215 PLA2G2D PLA2IID|SPLASH|sPLA2-IID|sPLA2S phospholipase A2 group IID protein-coding 284.333-2 chr1 108854722 108855155 + 1.33333 NA intron (NM_152763, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 2156 NM_152763 254268 Hs.729441 NM_152763 ENSG00000162641 AKNAD1 C1orf62 AKNA domain containing 1 protein-coding 256.666-46 chr7 6567521 6567816 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9766 NM_001134388 55146 Hs.5268 NM_018106 ENSG00000136247 ZDHHC4 ZNF374 zinc finger DHHC-type containing 4 protein-coding 155-35 chr14_GL000225v1_random 92685 92903 + 1.33333 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 194-78 chr2 104798400 104798593 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40777 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 177.333-58 chr14 86250449 86250677 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 315885 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 200-6 chr1 92629483 92629667 + 1.33333 NA intron (NM_001350198, intron 14 of 19) L3|LINE|CR1 -142650 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 217.333-169 chrX 77169035 77169269 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -154620 NR_110406 101928469 Hs.640805 NR_110400 ENSG00000280870 MIR325HG MIR384HG MIR325 host gene ncRNA 179-61 chr21 16327893 16328050 + 1.33333 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -43203 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 253.333-113 chr8 126762772 126763237 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -204526 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 371.333-14 chr2 137199711 137200333 + 1.33333 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 434477 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 234.333-13 chr11 34443091 34443422 + 1.33333 NA intron (NM_001752, intron 1 of 12) intron (NM_001752, intron 1 of 12) 4322 NM_001752 847 Hs.502302 NM_001752 ENSG00000121691 CAT - catalase protein-coding 233.666 chr1 50498914 50499299 + 1.33333 NA intron (NM_007051, intron 15 of 18) L1MB4|LINE|L1 -75663 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 209.667-21 chr10 65444777 65445068 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -126503 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 417-4 chr18 3703864 3704312 + 1.33333 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 100351 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 286.666-14 chr3 163075173 163075450 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 227990 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 309.333-62 chr8 133516090 133516516 + 1.33333 NA intron (NM_003033, intron 2 of 8) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 55584 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 206-136 chr5 5070006 5070204 + 1.33333 NA TTS (NR_026994) TTS (NR_026994) 8206 NR_134266 105374631 Hs.570964 NR_134266 ENSG00000250529 LINC02121 - long intergenic non-protein coding RNA 2121 ncRNA 455.666-6 chr5 22690909 22691701 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 162039 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 180-117 chr8 142968418 142968670 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -27284 NR_102426 100128627 NR_102426 CDC42P3 - cell division cycle 42 pseudogene 3 pseudo 131.666 chr17 53107466 53107620 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 122038 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 194-146 chr8 113648121 113648405 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -211324 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 183.333-153 chr8 8813689 8813857 + 1.33333 NA intron (NM_004225, intron 1 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 79857 NM_004225 9258 Hs.379414 NM_004225 ENSG00000147324 MFHAS1 LRRC65|MASL1|ROCO4 malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 protein-coding 321.333-32 chr18 2439103 2439417 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 132245 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 203.666-28 chr17 64564258 64564509 + 1.33333 NA intron (NM_022739, intron 10 of 18) L1ME1|LINE|L1 57406 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 171.333-28 chr11 83894505 83894727 + 1.33333 NA intron (NM_001142700, intron 7 of 19) L1MA4|LINE|L1 -212191 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 142.667-27 chr11 19824659 19824814 + 1.33333 NA intron (NM_182964, intron 1 of 37) intron (NM_182964, intron 1 of 37) -64653 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 273.333-20 chr14 73799091 73799396 + 1.33333 NA intron (NR_109995, intron 2 of 2) FAM|SINE|Alu 11883 NR_109995 100506476 Hs.287299 NR_109995 LOC100506476 - uncharacterized LOC100506476 ncRNA 220-12 chr10 64028772 64028958 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -506975 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 278.666-20 chr5 28298996 28299262 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11464 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 243.333-21 chr12 118302050 118302402 + 1.33333 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) intron (NM_001346490, intron 1 of 21) 57479 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 198.333-13 chr1 119319155 119319305 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9022 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 206.333-21 chr11 9874819 9875183 + 1.33333 NA intron (NM_030962, intron 17 of 39) intron (NM_030962, intron 17 of 39) 35859 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 218-49 chr2 79939191 79939417 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -72721 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 199.666-36 chr3 90276154 90276314 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1168613 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 300.333-23 chr2 76890297 76890605 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -95514 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 268.666-14 chr17 58144810 58145167 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -10166 NM_012374 26689 Hs.531188 NM_012374 ENSG00000141194 OR4D1 OR17-23|OR4D3|OR4D4P|TPCR16 olfactory receptor family 4 subfamily D member 1 protein-coding 232-63 chr3 154469073 154469267 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38980 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 229.999-4 chr12 122969830 122970009 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -3410 NM_019624 23457 Hs.511951 NM_019624 ENSG00000150967 ABCB9 EST122234|TAPL ATP binding cassette subfamily B member 9 protein-coding 196-97 chr20 12947029 12947259 + 1.33333 NA intron (NR_109868, intron 2 of 11) MER90a|LTR|ERV1 -3196 NR_109870 100505515 Hs.407172 NR_109870 ENSG00000234265 LINC01723 - long intergenic non-protein coding RNA 1723 ncRNA 198-163 chr6 135039491 135039671 + 1.33333 NA exon (NM_001145207, exon 4 of 5) exon (NM_001145207, exon 4 of 5) 15241 NM_001145207 10767 Hs.378532 NM_006620 ENSG00000112339 HBS1L EF-1a|ERFS|HBS1|HSPC276|eRF3c HBS1 like translational GTPase protein-coding 199.333-213 chr4 149421735 149421887 + 1.33333 NA intron (NM_001363507, intron 13 of 13) intron (NM_001363507, intron 13 of 13) 267516 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 195.666-3 chr1 226246058 226246204 + 1.33333 NA intron (NM_001366237, intron 10 of 13) L1MEg|LINE|L1 22467 NM_001282402 83881 Hs.282079 NM_031944 ENSG00000185155 MIXL1 MILD1|MIX|MIXL Mix paired-like homeobox protein-coding 203.333-113 chr18 11154846 11155001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6161 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 139.333-15 chr1 199277673 199277837 + 1.33333 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 129157 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 172-54 chr2 51267838 51268077 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 235356 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 200.667-96 chr21 16332761 16333023 + 1.33333 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) L1MB3|LINE|L1 -48124 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 310-62 chr8 134020584 134020888 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 134240 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 135.333-173 chr7 43671119 43671269 + 1.33333 NA intron (NR_163914, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 58329 NM_001371317 188-84 chr4 167206280 167206528 + 1.33333 NA intron (NM_001204352, intron 2 of 11) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 28022 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 186-2 chr1 63451956 63452192 + 1.33333 NA intron (NM_001347147, intron 7 of 7) intron (NM_001347147, intron 7 of 7) 71199 NM_001347145 23421 Hs.166539 NM_014288 ENSG00000142856 ITGB3BP CENP-R|CENPR|HSU37139|NRIF3|TAP20 integrin subunit beta 3 binding protein protein-coding 302-71 chr8 125668142 125668497 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 236110 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 234.666-18 chr17 32403852 32404073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40548 NM_001270482 5717 Hs.443379 NM_002815 ENSG00000108671 PSMD11 Rpn6|S9|p44.5 proteasome 26S subunit, non-ATPase 11 protein-coding 196-112 chr22 43377548 43377723 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22696 NR_146918 105373054 NR_146918 ENSG00000236117 LINC01639 - long intergenic non-protein coding RNA 1639 ncRNA 206-133 chr4 163935384 163935635 + 1.33333 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 262202 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 144.666-6 chr11 105135164 105135352 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 4511 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 280-5 chr12 2290650 2291020 + 1.33333 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 21059 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 210.333-168 chr8 82663657 82663890 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -248331 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 273.333-75 chr9 101803667 101803958 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65232 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 166-64 chr2 120027423 120027568 + 1.33333 NA intron (NM_001330307, intron 2 of 16) L1MB8|LINE|L1 14418 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 185.667-151 chrX 84627802 84628017 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -125456 NM_001177479 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 139-88 chr6 93697051 93697218 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6883 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 213.666-3 chr1 51120171 51120377 + 1.33333 NA intron (NM_001136508, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 18046 NM_001136508 284546 Hs.176177 NM_001136508 ENSG00000204006 C1orf185 - chromosome 1 open reading frame 185 protein-coding 267.333-44 chr18 33457067 33457461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16224 NM_001371120 173-54 chr20 55302942 55303102 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -120021 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 170.667-160 chr7 139351026 139351319 + 1.33333 NA intron (NM_001244584, intron 2 of 10) L2b|LINE|L2 -8674 NM_001270643 51631 Hs.731488 NM_016019 ENSG00000146963 LUC7L2 CGI-59|CGI-74|LUC7B2 LUC7 like 2, pre-mRNA splicing factor protein-coding 206-185 chr8 117643988 117644211 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 123386 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 227.666-14 chr18 11346832 11347166 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -107479 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 454-2 chr12 30682627 30683030 + 1.33333 NA intron (NM_006390, intron 3 of 24) intron (NM_006390, intron 3 of 24) -5584 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 206-39 chr11 126750272 126750576 + 1.33333 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) 94338 NR_120533 101929427 Hs.600341 NR_120532 ENSG00000254607 LOC101929427 - uncharacterized LOC101929427 ncRNA 168.667-2 chr1 41958456 41958665 + 1.33333 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -39638 NM_001127714 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 210.666-4 chr1 155594651 155594846 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -15422 NM_001350783 55154 Hs.656547 NM_018116 ENSG00000125459 MSTO1 LST005|MMYAT|MST misato mitochondrial distribution and morphology regulator 1 protein-coding 283.999-2 chr14 73372864 73373205 + 1.33333 NA intron (NM_001005743, intron 2 of 12) intron (NM_001005743, intron 2 of 12) 85546 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 150-134 chr7 100941428 100941622 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8009 NM_005960 4584 Hs.703577 NM_005960 ENSG00000169894 MUC3A MUC-3A|MUC3 mucin 3A, cell surface associated protein-coding 218-120 chrX 68231247 68231460 + 1.33333 NA intron (NM_002547, intron 6 of 24) L1MC2|LINE|L1 202142 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 327.333-43 chr7 19140896 19141276 + 1.33333 NA Intergenic MER131|DNA?|DNA? 4335 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 242.999-4 chr20 56852186 56852455 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 223014 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 262.999-3 chr11 29549974 29550263 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -44295 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 201.333-171 chr20 50660431 50660722 + 1.33333 NA TTS (NR_111906) TTS (NR_111906) 15105 NR_111906 100506175 Hs.658270 NR_111906 ENSG00000234693 LOC100506175 - uncharacterized LOC100506175 ncRNA 218-92 chr5 66772898 66773081 + 1.33333 NA intron (NM_001290228, intron 2 of 4) intron (NM_001290228, intron 2 of 4) -55784 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 203-13 chr10 75880324 75880592 + 1.33333 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 97697 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 190-83 chr3 181023954 181024131 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -32638 NR_075091 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 285.333-8 chr1 226714253 226714544 + 1.33333 NA intron (NM_002221, intron 2 of 7) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 24777 NM_002221 3707 Hs.528087 NM_002221 ENSG00000143772 ITPKB IP3-3KB|IP3K|IP3K-B|IP3KB|PIG37 inositol-trisphosphate 3-kinase B protein-coding 383.333-13 chr5 10626402 10626930 + 1.33333 NA intron (NM_001164440, intron 2 of 3) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 62596 NM_001164440 651746 Hs.26039 NM_001164440 ENSG00000164236 ANKRD33B - ankyrin repeat domain 33B protein-coding 179.666-10 chr5 148340117 148340300 + 1.33333 NA TTS (NM_001040433) TTS (NM_001040433) 4649 NM_001040433 643394 Hs.631798 NM_001040433 ENSG00000204909 SPINK9 LEKTI2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 9 protein-coding 179-66 chr3 67323613 67323891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 98288 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 209-29 chr12 38917688 38917877 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12191 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 172.667-126 chr5 137453560 137453791 + 1.33333 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) intron (NM_004598, intron 2 of 10) 45651 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 137.666-3 chr2 191791170 191791348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1581 NR_157850 729254 NR_157850 LOC729254 - hCG2045843 ncRNA 226.333-71 chr22 22048664 22048958 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4877 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 185.666-13 chr3 87239445 87239622 + 1.33333 NA intron (NM_001244644, intron 1 of 4) intron (NM_001244644, intron 1 of 4) 12224 NM_001244644 25978 Hs.476930 NM_014043 ENSG00000083937 CHMP2B ALS17|CHMP2.5|DMT1|VPS2-2|VPS2B charged multivesicular body protein 2B protein-coding 203.667-58 chr2 101489428 101489697 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -14450 NM_001145664 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 291.333-13 chr11 36479100 36479461 + 1.33333 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 30992 NM_004620 7189 Hs.444172 NM_004620 ENSG00000175104 TRAF6 MGC:3310|RNF85 TNF receptor associated factor 6 protein-coding 216.333-9 chr1 169847547 169847781 + 1.33333 NA intron (NM_001366772, intron 18 of 22) intron (NM_001366772, intron 18 of 22) 46232 NM_020423 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 312-32 chr3 69877711 69878123 + 1.33333 NA intron (NM_198177, intron 1 of 9) intron (NM_198177, intron 1 of 9) 11693 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 232.333-39 chr2 39227934 39228128 + 1.33333 NA intron (NM_001009565, intron 1 of 7) intron (NM_001009565, intron 1 of 7) 1557 NM_001009565 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 376.999-2 chr16 78230706 78231206 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 131302 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 222-11 chr10 33596688 33596886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 175893 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 222.666-14 chr14 24626497 24626693 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7595 NR_144343 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 282.333-2 chr1 207243231 207243751 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -78187 NR_125349 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 234.333-42 chr2 169378122 169378422 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15738 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 144.667-85 chr14 58808165 58808367 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20022 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 221.667-8 chr10 125333361 125333682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -172491 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 364.333-9 chr12 112374046 112374430 + 1.33333 NA intron (NM_001109662, intron 1 of 75) AluJr|SINE|Alu 8193 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 238-62 chr3 133885663 133885947 + 1.33333 NA intron (NM_001363953, intron 1 of 8) intron (NM_001363953, intron 1 of 8) 10042 NM_001363953 51560 Hs.715344 NM_016577 ENSG00000154917 RAB6B - RAB6B, member RAS oncogene family protein-coding 192-61 chr17 10506891 10507090 + 1.33333 NA intron (NM_005963, intron 17 of 39) intron (NM_005963, intron 17 of 39) 11552 NM_005963 4619 Hs.689619 NM_005963 ENSG00000109061 MYH1 HEL71|MYHSA1|MYHa|MyHC-2X/D|MyHC-2x myosin heavy chain 1 protein-coding 245.999-8 chr5 130113612 130113884 + 1.33333 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 209283 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 163.666-15 chr9 95066379 95066569 + 1.33333 NA intron (NM_032823, intron 12 of 14) intron (NM_032823, intron 12 of 14) 1124 NR_106729 102466518 NR_106729 ENSG00000274115 MIR6081 hsa-mir-6081 microRNA 6081 ncRNA 216.666-5 chr1 114288167 114288384 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -134406 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 211.333-120 chr2 126114251 126114495 + 1.33333 NA intron (NR_146970, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 3612 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 167.333-8 chr1 65969736 65969878 + 1.33333 NA intron (NM_002600, intron 3 of 16) intron (NM_002600, intron 3 of 16) -22809 NM_001037340 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 317.333-21 chr2 49577621 49577941 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 396422 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 236-68 chr5 4465520 4465805 + 1.33333 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -307819 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 210-129 chr6 35591116 35591402 + 1.33333 NA intron (NM_001145775, intron 7 of 11) intron (NM_001145775, intron 7 of 11) 73530 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 270.333-4 chr1 159875310 159875618 + 1.33333 NA intron (NM_012337, intron 10 of 11) intron (NM_012337, intron 10 of 11) -12807 NM_001013661 391123 Hs.647718 NM_001013661 ENSG00000243284 VSIG8 - V-set and immunoglobulin domain containing 8 protein-coding 229.666-30 chr7 78874436 78874772 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) L1MA6|LINE|L1 -134384 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 239.333-4 chr1 74573740 74573958 + 1.33333 NA intron (NM_001002912, intron 13 of 14) (CT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3581 NR_121671 101927320 Hs.662589 NR_121670 ENSG00000234497 ERICH3-AS1 - ERICH3 antisense RNA 1 ncRNA 394.666-4 chr17 59191680 59192098 + 1.33333 NA intron (NM_018304, intron 4 of 9) intron (NM_018304, intron 4 of 9) -18121 NM_018149 55181 Hs.7296 NM_018149 ENSG00000167447 SMG8 C17orf71 SMG8 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 161.333-168 chr20 33553558 33553724 + 1.33333 NA intron (NM_001032999, intron 1 of 10) MER58A|DNA|hAT-Charlie -8724 NM_001039709 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 405.666 chr14 91530079 91530648 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19883 NM_001284281 55671 Hs.533887 NM_017936 ENSG00000100796 PPP4R3A FLFL1|KIAA2010|MSTP033|PP4R3|PP4R3A|SMEK1|smk-1|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A protein-coding 222.333-97 chr8 137150679 137150859 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 262819 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 205.333-113 chr2 9020510 9020731 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -16936 NM_001321267 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 207.333-159 chr20 6323888 6324097 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -102740 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 253.333-97 chr7 21292592 21293037 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -135269 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 194-48 chr16 7038311 7038482 + 1.33333 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 264587 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 306.666-4 chr12 19094488 19094822 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35078 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 221.333-52 chr18 66797052 66797355 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -193113 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 239.666-12 chr17 53265907 53266172 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 280534 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 210.666-47 chr18 1260612 1260795 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 98926 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 266.667-52 chr4 41897699 41898077 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -15277 NR_104143 101927074 Hs.611425 NR_104143 ENSG00000245870 LINC00682 - long intergenic non-protein coding RNA 682 ncRNA 413.999-6 chr8 128369146 128369622 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 195295 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 150-119 chr5 137440832 137440971 + 1.33333 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) MER135|DNA|DNA 58425 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 204-18 chr1 171316598 171316760 + 1.33333 NA intron (NM_002022, intron 2 of 9) intron (NM_002022, intron 2 of 9) 2496 NM_002022 2329 Hs.386502 NM_002022 ENSG00000076258 FMO4 FMO2 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 4 protein-coding 256-30 chr15 67901659 67901986 + 1.33333 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -61777 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 197.333-53 chr12 89761820 89762032 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52560 NM_001366531 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 213.333-28 chr10 108686140 108686391 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -616972 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 226-3 chr1 42909998 42910204 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 48767 NM_006516 6513 Hs.473721 NM_006516 ENSG00000117394 SLC2A1 CSE|DYT17|DYT18|DYT9|EIG12|GLUT|GLUT-1|GLUT1|GLUT1DS|HTLVR|PED|SDCHCN solute carrier family 2 member 1 protein-coding 191.333-192 chr7 97279801 97279961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 163288 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 220.666-40 chr2 229176716 229176891 + 1.33333 NA intron (NM_001100818, intron 1 of 2) intron (NM_001100818, intron 1 of 2) 55289 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 137.667-104 chr2 208931719 208931934 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 389184 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 248.333-65 chr4 38741023 38741306 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 41826 NM_030956 81793 Hs.120551 NM_030956 ENSG00000174123 TLR10 CD290 toll like receptor 10 protein-coding 178.333-26 chr11 67571153 67571311 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -12363 NM_000852 2950 Hs.523836 NM_000852 ENSG00000084207 GSTP1 DFN7|FAEES3|GST3|GSTP|HEL-S-22|PI glutathione S-transferase pi 1 protein-coding 268.666-2 chr1 77374017 77374329 + 1.33333 NA intron (NM_012093, intron 6 of 13) intron (NM_012093, intron 6 of 13) 91086 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 266 chr1 85477227 85477498 + 1.33333 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) -12203 NM_012137 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 183-91 chr6 28459587 28459824 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -16214 NM_001012455 222696 Hs.721841 NM_001012455 ENSG00000187987 ZSCAN23 ZNF390|ZNF453|dJ29K1.3|dJ29K1.3.1 zinc finger and SCAN domain containing 23 protein-coding 288-44 chr5 134641534 134641902 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7067 NM_021982 10802 Hs.595540 NM_021982 ENSG00000113615 SEC24A - SEC24 homolog A, COPII coat complex component protein-coding 210.666-44 chr16 77390840 77391067 + 1.33333 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) intron (NM_199355, intron 3 of 22) 44081 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 179.666-7 chr20 32232334 32232570 + 1.33333 NA intron (NM_015352, intron 6 of 6) MIR3|SINE|MIR -5343 NR_031726 100302183 NR_031726 ENSG00000284125 MIR1825 MIRN1825|hsa-mir-1825 microRNA 1825 ncRNA 194.333-139 chr7 39957975 39958128 + 1.33333 NA intron (NM_003718, intron 1 of 13) intron (NM_003718, intron 1 of 13) 7691 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 193-19 chr12 124235955 124236234 + 1.33333 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) intron (NM_001347902, intron 3 of 4) -53070 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 326.333-22 chr4 64083047 64083414 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 326220 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 195.333-142 chr3 41543612 41543830 + 1.33333 NA intron (NR_136342, intron 30 of 34) L1M4|LINE|L1 344216 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 199.666-46 chr5 60084111 60084275 + 1.33333 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -190467 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 284-66 chrX 18079443 18079822 + 1.33333 NA intron (NR_133641, intron 1 of 4) intron (NR_133641, intron 1 of 4) 25012 NR_133641 105373144 NR_133641 ENSG00000225882 LINC01456 - long intergenic non-protein coding RNA 1456 ncRNA 346.667-3 chr16 72232453 72233035 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -60294 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 275.666-12 chr3 44069522 44069918 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44492 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 156.666-6 chr15 39551122 39551339 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29849 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 204.333-48 chr12 116309684 116309845 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32578 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 190.666-50 chr7 47492448 47492648 + 1.33333 NA intron (NM_022748, intron 3 of 30) intron (NM_022748, intron 3 of 30) -27745 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 312-12 chr11 46026364 46026673 + 1.33333 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 94301 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 197.667-63 chr2 34365221 34365450 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 298109 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 222-75 chr5 87545825 87546077 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116091 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 307.333-17 chr11 27823877 27824187 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -102002 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 237-6 chr1 179298887 179299242 + 1.33333 NA intron (NR_045530, intron 1 of 13) intron (NR_045530, intron 1 of 13) 5267 NM_003101 6646 Hs.445588 NM_003101 ENSG00000057252 SOAT1 ACACT|ACAT|ACAT-1|ACAT1|SOAT|STAT sterol O-acyltransferase 1 protein-coding 142 chr1 36944452 36944650 + 1.33333 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) intron (NM_000831, intron 1 of 15) 89964 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 211.333-171 chr4 73278622 73278846 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -19936 NM_198889 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 178-46 chr14 75976627 75976836 + 1.33333 NA intron (NM_001329938, intron 1 of 4) intron (NM_001329938, intron 1 of 4) 5264 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 253.666-20 chr4 117630194 117630633 + 1.33333 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) intron (NR_125757, intron 2 of 3) 202015 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 246.333 chr1 34991328 34991604 + 1.33333 NA intron (NM_007167, intron 15 of 15) intron (NM_007167, intron 15 of 15) -6119 NM_001195156 100506144 Hs.533986 NM_001195156 ENSG00000243749 TMEM35B ZMYM6NB transmembrane protein 35B protein-coding 214.666-3 chr1 68012952 68013146 + 1.33333 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) intron (NR_040077, intron 1 of 9) 38582 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 217.333-62 chr2 26218393 26218660 + 1.33333 NA intron (NM_000182, intron 7 of 19) L1ME1|LINE|L1 26106 NM_000182 3030 Hs.516032 NM_000182 ENSG00000084754 HADHA ECHA|GBP|HADH|LCEH|LCHAD|MTPA|TP-ALPHA hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alpha protein-coding 161.333-256 chr7 23151859 23152039 + 1.33333 NA intron (NM_001031710, intron 6 of 10) intron (NM_001031710, intron 6 of 10) -30099 NM_001370444 11097 Hs.408241 NM_007342 ENSG00000136243 NUP42 CG1|NLP-1|NLP_1|NUPL2|hCG1 nucleoporin 42 protein-coding 222.333-14 chr10 115595823 115595996 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) intron (NM_207303, intron 26 of 28) 502544 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 168.667-87 chr19 27865929 27866140 + 1.33333 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) HSAT4|Satellite|centr -72094 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 307.333-24 chr13 93000397 93000751 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44767 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 240-35 chr17 33205059 33205378 + 1.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 87770 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 375-5 chr15 83183466 83184118 + 1.33333 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) intron (NM_016073, intron 1 of 5) 24031 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 202.667-152 chr8 142704626 142704920 + 1.33333 NA TTS (NM_001160354) TTS (NM_001160354) 4662 NM_001160354 54742 Hs.69517 NM_017527 ENSG00000160886 LY6K CT97|HSJ001348|URLC10|ly-6K lymphocyte antigen 6 family member K protein-coding 208.666-37 chr14 66318665 66318884 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -167597 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 194.333-31 chr11 93338656 93338898 + 1.33333 NA intron (NM_181645, intron 2 of 13) intron (NM_181645, intron 2 of 13) 8060 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 203.666-24 chr14 104057391 104057580 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -28215 NM_001080464 374569 Hs.146239 NM_001080464 ENSG00000166183 ASPG C14orf76|GPA/WT|LYSOLP asparaginase protein-coding 230.333-17 chr10 74332323 74332595 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) intron (NM_001369124, intron 4 of 9) 155696 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 298-17 chr11 84465306 84465620 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -148124 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 232.333-94 chr9 76140369 76140592 + 1.33333 NA intron (NM_006200, intron 10 of 20) intron (NM_006200, intron 10 of 20) 249807 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 205.333-222 chr7 48280128 48280336 + 1.33333 NA intron (NM_152701, intron 18 of 61) intron (NM_152701, intron 18 of 61) 108774 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 314-15 chr17 50740231 50740697 + 1.33333 NA intron (NM_006107, intron 3 of 10) intron (NM_006107, intron 3 of 10) 20861 NM_001330330 51747 Hs.130293 NM_006107 ENSG00000108848 LUC7L3 CRA|CREAP-1|CROP|LUC7A|OA48-18|hLuc7A LUC7 like 3 pre-mRNA splicing factor protein-coding 198.666-33 chr18 3528086 3528243 + 1.33333 NA intron (NM_001242762, intron 7 of 9) intron (NM_001242762, intron 7 of 9) 61914 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 373-7 chr2 22859910 22860250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 323601 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 155.333-12 chr1 183191011 183191232 + 1.33333 NA intron (NM_005562, intron 1 of 22) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 4857 NM_005562 3918 Hs.591484 NM_005562 ENSG00000058085 LAMC2 B2T|BM600|CSF|EBR2|EBR2A|LAMB2T|LAMNB2 laminin subunit gamma 2 protein-coding 210.333-64 chr2 5302809 5303069 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 388179 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 226-69 chr4 90334717 90334947 + 1.33333 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) intron (NM_207491, intron 3 of 7) 99801 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 343.333-14 chr2 147708068 147708477 + 1.33333 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -136245 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 308-46 chr6 56831460 56831939 + 1.33333 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 11966 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 378.333 chr1 77964386 77964922 + 1.33333 NA non-coding (NR_146539, exon 10 of 23) non-coding (NR_146539, exon 10 of 23) 14418 NR_130152 8880 Hs.567380 NM_003902 ENSG00000162613 FUBP1 FBP|FUBP|hDH V far upstream element binding protein 1 protein-coding 168-63 chr22 28606656 28606843 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 73116 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 327-13 chr2 153905588 153906056 + 1.33333 NA intron (NM_052917, intron 2 of 12) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 33900 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 394.333-6 chr17 13514218 13514814 + 1.33333 NA intron (NM_006042, intron 1 of 1) intron (NM_006042, intron 1 of 1) 29130 NR_031679 100302287 NR_031679 ENSG00000221698 MIR548H3 MIR548H-3|MIRN548H3|hsa-mir-548h-3 microRNA 548h-3 ncRNA 178-110 chr8 78254886 78255112 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -261341 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 224.666-28 chr3 181734960 181735236 + 1.33333 NA intron (NR_075091, intron 7 of 7) intron (NR_075091, intron 7 of 7) 23173 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 188-13 chr1 202213805 202213986 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001017404) promoter-TSS (NM_001017404) -260 NM_001017404 59352 Hs.497402 NM_021636 ENSG00000133067 LGR6 GPCR|VTS20631 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 6 protein-coding 114-119 chr5 84106866 84107013 + 1.33333 NA intron (NM_001278642, intron 4 of 9) intron (NM_001278642, intron 4 of 9) 277928 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 220.666-69 chr8 30289530 30289839 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -94817 NM_001008712 11030 Hs.334587 NM_006867 ENSG00000157110 RBPMS HERMES RNA binding protein, mRNA processing factor protein-coding 197-119 chr8 121061302 121061499 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -249354 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 199.666-52 chr6 142584273 142584499 + 1.33333 NA intron (NR_027312, intron 1 of 2) MER41-int|LTR|ERV1 53450 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 401.333-13 chr17 60751004 60751545 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) intron (NM_001330413, intron 6 of 25) 73423 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 200-26 chr10 95786945 95787112 + 1.33333 NA intron (NR_038444, intron 4 of 5) MIRc|SINE|MIR 30865 NM_001776 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 213.333-68 chr15 95719802 95720014 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 286815 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 147.333-210 chr3 47067940 47068120 + 1.33333 NA intron (NM_014159, intron 12 of 20) intron (NM_014159, intron 12 of 20) 56488 NR_024046 100129354 Hs.201522 NR_024046 NRADDP - neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene pseudo 225.333-9 chr10 8888360 8888559 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -9530 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 357.333-23 chr7 110645576 110646086 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -445175 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 190.666-49 chr7 40076434 40076644 + 1.33333 NA intron (NM_003718, intron 9 of 13) intron (NM_003718, intron 9 of 13) 58083 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 156.666-16 chr7 41486424 41486590 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -207412 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 328.333-12 chr13 59976119 59976620 + 1.33333 NA intron (NM_001258369, intron 14 of 26) MER3|DNA|hAT-Charlie -36349 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 195.666-34 chr4 83838281 83838470 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 302267 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 389.999-2 chr4 142901918 142902255 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -55551 NM_001101669 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 219.333-161 chr6 138191940 138192169 + 1.33333 NA intron (NM_020340, intron 2 of 33) L2c|LINE|L2 26436 NM_021635 59351 Hs.302016 NM_021635 ENSG00000254440 PBOV1 UC28|UROC28|dJ171N11.2 prostate and breast cancer overexpressed 1 protein-coding 329.333-25 chr2 166657126 166657505 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -170344 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 291.666-15 chr8 37168115 37168394 + 1.33333 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 325659 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 213.666-44 chr8 84936316 84936577 + 1.33333 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -170792 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 233.333-82 chr22 33933027 33933222 + 1.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -10236 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 178-41 chr14 45868206 45868363 + 1.33333 NA Intergenic Charlie3|DNA|hAT-Charlie -152682 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 322.667-9 chr12 39223379 39223859 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 219501 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 298.333-19 chr17 67613291 67613628 + 1.33333 NA intron (NM_181671, intron 5 of 9) L1M5|LINE|L1 -104374 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 204.333-209 chr9 73678857 73679031 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 527079 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 267.333-18 chr10 115033791 115034023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39250 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 195.666-16 chr13 108983666 108983857 + 1.33333 NA intron (NM_015011, intron 20 of 34) intron (NM_015011, intron 20 of 34) 183542 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 267-34 chr17 62086955 62087348 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -21873 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 298.666-9 chr18 41684572 41684946 + 1.33333 NA Intergenic LTR83|LTR|ERVL -164082 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 453-8 chr2 124719358 124719911 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) intron (NM_130773, intron 13 of 23) 694347 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 313.999 chr20 9268043 9268351 + 1.33333 NA intron (NM_182797, intron 1 of 35) intron (NM_182797, intron 1 of 35) -39603 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 331.333-39 chr4 114936417 114936742 + 1.33333 NA intron (NM_022569, intron 5 of 13) intron (NM_022569, intron 5 of 13) 177041 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 314.999-2 chr22 43588020 43588397 + 1.33333 NA intron (NM_198856, intron 22 of 29) HAL1|LINE|L1 71954 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 132-20 chr10 67465643 67465854 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) -62338 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 304.333-9 chr12 38445913 38446380 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 129372 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 203.333-56 chr12 68660961 68661187 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001251917, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001251917, exon 6 of 6) 25785 NR_038930 100507250 Hs.600731 NR_038930 ENSG00000247363 LOC100507250 - uncharacterized LOC100507250 ncRNA 199.333-156 chr2 221542700 221542897 + 1.33333 NA intron (NM_001363748, intron 3 of 17) intron (NM_001363748, intron 3 of 17) 29506 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 246.666-16 chr17 47403141 47403486 + 1.33333 NA intron (NM_001195192, intron 16 of 21) MIRb|SINE|MIR 79358 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 292.666-7 chr10 87847588 87847851 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 15718 NM_001126049 100144748 Hs.559820 NM_001126049 ENSG00000227268 KLLN CWS4|KILLIN killin, p53 regulated DNA replication inhibitor protein-coding 247.333-23 chr13 43093040 43093295 + 1.33333 NA intron (NM_013238, intron 5 of 5) L1MEg1|LINE|L1 -19998 NR_047013 100874159 Hs.633241 NR_047013 LINC00400 - long intergenic non-protein coding RNA 400 ncRNA 202.666-98 chr5 94657087 94657321 + 1.33333 NA intron (NM_032290, intron 9 of 20) L1M2b|LINE|L1 38535 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 149.333-271 chr4 285826 286014 + 1.33333 NA intron (NM_001137608, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu 19554 NM_001137608 654254 Hs.698668 NM_001137608 ENSG00000186777 ZNF732 - zinc finger protein 732 protein-coding 267.333-10 chr10 32470636 32471029 + 1.33333 NA intron (NR_109827, intron 6 of 8) intron (NR_109827, intron 6 of 8) 24692 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 207-99 chr5 147554922 147555218 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4924 NR_038902 153469 Hs.184323 NR_038902 ENSG00000280780 JAKMIP2-AS1 - JAKMIP2 antisense RNA 1 ncRNA 211.333-188 chr5 98631425 98631647 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137096 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 220-93 chr5 132098881 132099098 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 25200 NM_000758 1437 Hs.1349 NM_000758 ENSG00000164400 CSF2 CSF|GMCSF colony stimulating factor 2 protein-coding 181.666-16 chr4 121173469 121173620 + 1.33333 NA intron (NM_001128843, intron 3 of 12) intron (NM_001128843, intron 3 of 12) -9223 NM_024873 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 173.333-10 chr1 89773374 89773596 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47547 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 197.333-153 chr3 98579659 98579866 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_000097, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_000097, exon 7 of 7) 13849 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 197.333-14 chr1 233840373 233840547 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -64216 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 260.667-32 chr16 75366547 75366878 + 1.33333 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) L1MB8|LINE|L1 66791 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 128-54 chr2 182194068 182194207 + 1.33333 NA intron (NM_005019, intron 10 of 14) intron (NM_005019, intron 10 of 14) 47926 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 168.666-16 chr5 82874682 82874830 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -14920 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 192-144 chr8 49081052 49081241 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8802 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 290.666-26 chr6 39409942 39410220 + 1.33333 NA intron (NM_001289024, intron 2 of 9) intron (NM_001289024, intron 2 of 9) 21309 NM_001289024 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 415-11 chr8 116990053 116990560 + 1.33333 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) L1MD3|LINE|L1 39331 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 326.666-13 chr5 141015810 141016292 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35325 NM_013340 29930 Hs.278950 NM_013340 ENSG00000171815 PCDHB1 PCDH-BETA1 protocadherin beta 1 protein-coding 212.333-76 chr2 180178282 180178569 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -171128 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 207.333-253 chr7 65316673 65316915 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57005 NM_001287532 168374 Hs.9521 NM_007139 ENSG00000146757 ZNF92 HEL-203|HPF12|HTF12|TF12 zinc finger protein 92 protein-coding 166-3 chr1 31254098 31254247 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -14285 NM_024522 79570 Hs.470259 NM_024522 ENSG00000084628 NKAIN1 FAM77C sodium/potassium transporting ATPase interacting 1 protein-coding 305.333-39 chr20 40198029 40198430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193768 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 186.666-14 chr11 105385560 105385712 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -224437 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 174.667-131 chr4 109666003 109666256 + 1.33333 NA intron (NM_017918, intron 4 of 7) L1MC1|LINE|L1 37316 NM_032992 839 Hs.654616 NM_001226 ENSG00000138794 CASP6 MCH2 caspase 6 protein-coding 214.667-113 chr8 37579640 37579900 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -58384 NR_121621 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 198-99 chr2 146635204 146635438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48264 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 318.667-20 chr2 77272746 77273180 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 249413 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 341.999-3 chr13 36121686 36121976 + 1.33333 NA intron (NM_001330071, intron 2 of 16) AluJo|SINE|Alu 9551 NM_001330071 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 220.666-14 chr11 25973928 25974131 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -215094 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 326-32 chr4 61040582 61040942 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -102894 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 180.666-15 chr2 56844926 56845092 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -659239 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 206.666-31 chr12 89005177 89005415 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14396 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 212.666-78 chr6 114289520 114289755 + 1.33333 NA intron (NR_125845, intron 9 of 9) intron (NR_125845, intron 9 of 9) -226760 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 207.333-80 chr14 27906809 27906966 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -233666 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 218-67 chr20 37081477 37081790 + 1.33333 NA intron (NM_002895, intron 2 of 21) AluJo|SINE|Alu 14364 NM_001323282 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 184.333-82 chr2 163692022 163692235 + 1.33333 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 43880 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 208-180 chr9 24171329 24171511 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -320819 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 200.666-124 chr8 133858474 133858913 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27803 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 356-21 chr2 77064152 77064637 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 78429 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 214-8 chr1 164434590 164434839 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -124646 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 215.333-213 chr9 95000149 95000318 + 1.33333 NA intron (NM_032823, intron 9 of 14) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -54679 NR_147614 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 311.333-55 chr8 81681484 81681762 + 1.33333 NA intron (NM_005536, intron 1 of 8) intron (NM_005536, intron 1 of 8) 4702 NM_005536 3612 Hs.656694 NM_005536 ENSG00000133731 IMPA1 IMP|IMPA|MRT59 inositol monophosphatase 1 protein-coding 202-134 chr4 83058532 83058770 + 1.33333 NA intron (NM_001258006, intron 6 of 8) L1ME4b|LINE|L1 23468 NM_016129 51138 Hs.190384 NM_016129 ENSG00000138663 COPS4 CSN4|SGN4 COP9 signalosome subunit 4 protein-coding 207.333-213 chr5 18240955 18241258 + 1.33333 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 433832 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 269-51 chr8 118918165 118918493 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 33556 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 209.666-22 chr17 60084545 60084770 + 1.33333 NA intron (NR_030732, intron 2 of 2) L1ME4a|LINE|L1 3810 NR_030732 645638 Hs.463652 NR_030732 ENSG00000261040 WFDC21P LNCDC|linc-DC|lnc-DC WAP four-disulfide core domain 21, pseudogene pseudo 350.333-22 chr7 3463591 3463919 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 162503 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 208.667-29 chr11 31031441 31031720 + 1.33333 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) intron (NM_001367979, intron 20 of 38) -38894 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 176-92 chr8 16200582 16200877 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -7938 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 214.333-166 chrX 108568350 108568563 + 1.33333 NA intron (NM_033380, intron 4 of 50) intron (NM_033380, intron 4 of 50) 128618 NM_033380 1287 Hs.369089 NM_000495 ENSG00000188153 COL4A5 ASLN|ATS|ATS1|CA54 collagen type IV alpha 5 chain protein-coding 209.333-160 chr3 179564929 179565219 + 1.33333 NA intron (NM_178042, intron 1 of 13) MER104|DNA|TcMar-Tc2 2148 NM_004301 86 Hs.435326 NM_004301 ENSG00000136518 ACTL6A ACTL6|ARPN-BETA|Arp4|BAF53A|INO80K actin like 6A protein-coding 254-25 chr17 42931601 42931877 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 30940 NM_001270397 2538 Hs.212293 NM_000151 ENSG00000131482 G6PC G6PC1|G6PT|G6Pase|GSD1|GSD1a glucose-6-phosphatase catalytic subunit protein-coding 235.333-53 chr2 32236651 32236905 + 1.33333 NA intron (NM_001199138, intron 6 of 8) intron (NM_001199138, intron 6 of 8) 28108 NM_001199138 58484 Hs.574741 NM_021209 ENSG00000091106 NLRC4 AIFEC|CARD12|CLAN|CLAN1|CLANA|CLANB|CLANC|CLAND|CLR2.1|FCAS4|IPAF NLR family CARD domain containing 4 protein-coding 280.333-36 chr6 33727773 33728258 + 1.33333 NA intron (NM_001142883, intron 4 of 6) intron (NM_001142883, intron 4 of 6) -16315 NM_032340 84300 Hs.732448 NM_032340 ENSG00000137288 UQCC2 C6orf125|C6orf126|Cbp6|M19|MC3DN7|MNF1|bA6B20.2 ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 2 protein-coding 253.333-31 chr15 38538975 38539295 + 1.33333 NA intron (NM_001306086, intron 2 of 14) MIRc|SINE|MIR 25679 NM_005739 10125 Hs.591127 NM_005739 ENSG00000172575 RASGRP1 CALDAG-GEFI|CALDAG-GEFII|RASGRP RAS guanyl releasing protein 1 protein-coding 358.666-12 chr5 155509971 155510379 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 496420 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 585.334 chrX 84471159 84471978 + 1.33333 NA intron (NM_001177478, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 30885 NM_144657 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 199.333-110 chr18 11857712 11857871 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001261444) promoter-TSS (NM_001261444) 38 NM_001261444 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 195-10 chr1 237374938 237375122 + 1.33333 NA intron (NM_001035, intron 7 of 104) intron (NM_001035, intron 7 of 104) -96089 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 201.666-45 chr8 101464048 101464285 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -28273 NM_024915 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 384-25 chr9 29064330 29064953 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 147658 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 238.333-90 chr8 86319222 86319492 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23190 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 201-101 chr7 30021756 30022009 + 1.33333 NA intron (NR_046478, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 4820 NR_046478 55033 Hs.390838 NM_017946 ENSG00000106080 FKBP14 EDSKMH|EDSKSCL2|FKBP22|IPBP12 FKBP prolyl isomerase 14 protein-coding 254.999 chr15 74744277 74744597 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -4408 NM_000761 1544 Hs.1361 NM_000761 ENSG00000140505 CYP1A2 CP12|CYPIA2|P3-450|P450(PA) cytochrome P450 family 1 subfamily A member 2 protein-coding 307.333-57 chr3 125481528 125481875 + 1.33333 NA intron (NM_003794, intron 6 of 13) AluSp|SINE|Alu 38501 NM_003794 8723 Hs.507243 NM_003794 ENSG00000114520 SNX4 ATG24B sorting nexin 4 protein-coding 198.667-104 chr2 124198819 124199088 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) L1ME3E|LINE|L1 173666 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 198-48 chr14 55719892 55720165 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46217 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 200-29 chr11 10871489 10871650 + 1.33333 NA intron (NR_034137, intron 2 of 2) intron (NR_034137, intron 2 of 2) 13352 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 222-66 chr4 30580317 30580497 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -139962 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 393.333-5 chr10 98672553 98673085 + 1.33333 NA intron (NM_021828, intron 6 of 11) intron (NM_021828, intron 6 of 11) -225856 NM_001322476 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 253.333-22 chr14 45216231 45216449 + 1.33333 NA intron (NM_018353, intron 13 of 16) L1ME4c|LINE|L1 36862 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 245-7 chr10 64916207 64916641 + 1.33333 NA intron (NR_134456, intron 1 of 1) L1M2|LINE|L1 8094 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 267.666-5 chr12 112629008 112629449 + 1.33333 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) intron (NM_001347952, intron 1 of 21) 53992 NM_001347952 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 272.666-11 chr2 38309012 38309302 + 1.33333 NA intron (NM_001135673, intron 9 of 12) intron (NM_001135673, intron 9 of 12) 67373 NM_001330459 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 374.999 chr10 115781572 115781977 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) L1ME3A|LINE|L1 413015 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 196.666-8 chr1 211105687 211105841 + 1.33333 NA intron (NM_002238, intron 2 of 10) intron (NM_002238, intron 2 of 10) 27610 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 183.333-38 chr14 25233044 25233207 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -182828 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 216.666-52 chr4 41674392 41674647 + 1.33333 NA intron (NM_001330789, intron 17 of 24) intron (NM_001330789, intron 17 of 24) 61617 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 169.333-55 chr12 69486604 69486813 + 1.33333 NA intron (NM_001278355, intron 2 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 16320 NM_006654 10818 Hs.593446 NM_006654 ENSG00000166225 FRS2 FRS1A|FRS2A|FRS2alpha|SNT|SNT-1|SNT1 fibroblast growth factor receptor substrate 2 protein-coding 168-93 chr5 131841895 131842108 + 1.33333 NA intron (NM_001303622, intron 11 of 12) L1M1|LINE|L1 -44984 NM_001346114 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 203-105 chr8 32601299 32601562 + 1.33333 NA intron (NM_001160001, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 5604 NM_001322201 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 259.333-18 chr10 112752960 112753230 + 1.33333 NA TTS (NM_001365714) TTS (NM_001365714) -70401 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 240.333-16 chr10 105385374 105385630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 434831 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 215.666-49 chr9 103120707 103120960 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 125500 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 193-82 chr6 65080801 65081050 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -220493 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 200.667-16 chr1 213226976 213227247 + 1.33333 NA intron (NM_001349662, intron 9 of 15) MIR|SINE|MIR 175870 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 303.333-57 chr5 8360275 8360588 + 1.33333 NA intron (NR_039984, intron 3 of 5) L1MA10|LINE|L1 97133 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 323.333-21 chr3 81735256 81735909 + 1.33333 NA intron (NM_000158, intron 1 of 15) ERVL-E-int|LTR|ERVL 26063 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 209.333-101 chr2 17209286 17209460 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 309067 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 211-15 chr11 12487985 12488292 + 1.33333 NA intron (NM_018222, intron 4 of 12) L1M5|LINE|L1 110567 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 232.666-25 chr2 138560182 138560364 + 1.33333 NA intron (NM_001001664, intron 7 of 10) intron (NM_001001664, intron 7 of 10) 58503 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 148.333-367 chr7 48997068 48997234 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 72604 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 276.667-39 chr2 88521425 88521861 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -3006 NM_152670 200523 Hs.132104 NM_152670 ENSG00000172073 TEX37 C2orf51|TSC21 testis expressed 37 protein-coding 162-26 chr11 108819008 108819182 + 1.33333 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) intron (NM_004398, intron 13 of 17) 154026 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 208.667-14 chr1 225603431 225603715 + 1.33333 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) intron (NM_001008493, intron 1 of 14) 49550 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 201.333-152 chr2 113118886 113119048 + 1.33333 NA intron (NM_000577, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 996 NM_000577 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 128.666-2 chr14 25568317 25568439 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -518081 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 278.666-17 chr3 17121915 17122237 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 188880 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 231.333-7 chr1 163921982 163922287 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -498943 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 194.666-53 chr4 122823154 122823372 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3445 NM_002006 2247 Hs.284244 NM_002006 ENSG00000138685 FGF2 BFGF|FGF-2|FGFB|HBGF-2 fibroblast growth factor 2 protein-coding 307.666-6 chr17 47207641 47207974 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1255 NM_001002841 4635 Hs.463300 NM_002476 ENSG00000198336 MYL4 ALC1|AMLC|GT1|PRO1957 myosin light chain 4 protein-coding 150.666-2 chr1 67184934 67185079 + 1.33333 NA intron (NM_144701, intron 4 of 10) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 18552 NM_144701 149233 Hs.677426 NM_144701 ENSG00000162594 IL23R - interleukin 23 receptor protein-coding 214.666-63 chr6 92256384 92256605 + 1.33333 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -566066 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 292.666-29 chr6 50846368 50846725 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003221, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_003221, exon 7 of 7) 27675 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 217.333-79 chr2 237599857 237600192 + 1.33333 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -9290 NR_033308 64284 Hs.44278 NM_022449 ENSG00000124839 RAB17 - RAB17, member RAS oncogene family protein-coding 240-52 chr2 221617926 221618272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43897 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 181-38 chr2 58489657 58489803 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -31023 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 198-52 chr14 72009834 72010138 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 76459 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 256.667-40 chr2 42751377 42751706 + 1.33333 NA intron (NM_001330443, intron 16 of 16) intron (NM_001330443, intron 16 of 16) 12720 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 252.667-106 chr9 88769131 88769500 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -23410 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 215-31 chr2 18293795 18294059 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 266726 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 183-41 chr14 82072874 82073047 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -329822 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 294-27 chr17 29956432 29956786 + 1.33333 NA intron (NR_026738, intron 3 of 15) MER57B2|LTR|ERV1 14975 NM_198529 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 211-55 chr21 18205987 18206282 + 1.33333 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) L1M1|LINE|L1 -38699 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 269.333-86 chr8 67995998 67996379 + 1.33333 NA intron (NM_024870, intron 1 of 39) L1M5|LINE|L1 44142 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 211.333-185 chr5 91319232 91319453 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4940 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 234-25 chr16 14137646 14137887 + 1.33333 NA intron (NM_001365418, intron 3 of 5) L1MEf|LINE|L1 -48920 NM_001365411 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 199.333-223 chr5 42746439 42746667 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10265 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 271-17 chr16 51749972 51750204 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -12431 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 260-11 chr10 19183160 19183539 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 14 of 39) intron (NM_001142308, intron 14 of 39) 134548 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 250.666-18 chr2 37253602 37253834 + 1.33333 NA non-coding (NR_146406, exon 11 of 11) non-coding (NR_146406, exon 11 of 11) 22060 NM_001350027 55471 Hs.433466 NM_018607 ENSG00000003509 NDUFAF7 C2orf56|MidA|PRO1853 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 7 protein-coding 193.333-38 chr11 96022058 96022329 + 1.33333 NA intron (NM_032427, intron 2 of 4) intron (NM_032427, intron 2 of 4) -97986 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 183.333-173 chr9 84562436 84562658 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -105911 NM_006180 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 205.333-80 chr15 44624352 44624618 + 1.33333 NA intron (NM_025137, intron 11 of 39) L1MA9|LINE|L1 39177 NM_001160227 80208 Hs.656271 NM_025137 ENSG00000104133 SPG11 ALS5|CMT2X|KIAA1840 SPG11 vesicle trafficking associated, spatacsin protein-coding 208-91 chr20 50442964 50443194 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -67242 NM_001278618 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 229.333-118 chr8 88314306 88314581 + 1.33333 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 13040 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 302-35 chr22 28199569 28199975 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) MER20|DNA|hAT-Charlie -260097 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 162.666-14 chr8 144608657 144608828 + 1.33333 NA intron (NM_001308207, intron 1 of 11) L1MEc|LINE|L1 -3047 NM_025251 80728 Hs.148988 NM_025251 ENSG00000147799 ARHGAP39 CrGAP|Vilse Rho GTPase activating protein 39 protein-coding 194.333-83 chr21 31563034 31563220 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 3894 NM_001321023 150051 Hs.708976 NM_001321023 LOC150051 - uncharacterized LOC150051 protein-coding 323.333-23 chr4 14848091 14848470 + 1.33333 NA intron (NR_126435, intron 2 of 6) MER103C|DNA|hAT-Charlie 39889 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 286.333-8 chr12 98026696 98027001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31400 NR_036189 100422924 NR_036189 ENSG00000263890 MIR4303 - microRNA 4303 ncRNA 250.666-7 chr11 125297976 125298242 + 1.33333 NA intron (NM_022062, intron 2 of 12) intron (NM_022062, intron 2 of 12) 133358 NM_022062 63876 Hs.278564 NM_022062 ENSG00000165495 PKNOX2 PREP2 PBX/knotted 1 homeobox 2 protein-coding 254-18 chr13 40253318 40253767 + 1.33333 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 -33040 NR_033877 400123 Hs.577960 NR_033877 ENSG00000215483 LINC00548 - long intergenic non-protein coding RNA 548 ncRNA 409.333-3 chr10 27702734 27703213 + 1.33333 NA intron (NM_001242702, intron 5 of 6) intron (NM_001242702, intron 5 of 6) -41642 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 255.333-118 chr8 136840577 136840846 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) L1MEg|LINE|L1 309913 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 215.333-156 chr5 44276121 44276291 + 1.33333 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -112526 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 197.666-44 chr3 147995964 147996139 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -82108 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 253.333-30 chr15 25520788 25521088 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81882 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 304-39 chr22 30147762 30148179 + 1.33333 NA intron (NM_001329457, intron 11 of 11) L1ME2|LINE|L1 67506 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 228.667-67 chr6 37987939 37988264 + 1.33333 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 168374 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 273.666-2 chr1 177078665 177079046 + 1.33333 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) intron (NM_207108, intron 1 of 21) -49410 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 344-49 chr8 123081222 123081726 + 1.33333 NA intron (NM_001363156, intron 2 of 19) MER33|DNA|hAT-Charlie 8225 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 243.666-25 chr3 141406661 141406937 + 1.33333 NA intron (NM_001080412, intron 7 of 7) intron (NM_001080412, intron 7 of 7) 4450 NM_001350100 253461 Hs.518301 NM_152535 ENSG00000177311 ZBTB38 CIBZ|PPP1R171|ZNF921 zinc finger and BTB domain containing 38 protein-coding 252.333-55 chr5 31652756 31653026 + 1.33333 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) AluSz|SINE|Alu 13760 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 265.666-12 chr17 57061079 57061374 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 15748 NR_002818 376412 Hs.132299 NR_002818 ENSG00000261192 RNF126P1 - ring finger protein 126 pseudogene 1 pseudo 183.667-114 chr5 17429559 17429849 + 1.33333 NA intron (NR_134274, intron 1 of 1) FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 -7033 NR_134273 101929544 Hs.23725 NR_134273 ENSG00000248455 LINC02217 - long intergenic non-protein coding RNA 2217 ncRNA 223.666-29 chr5 25802898 25803103 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 612047 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 187.333-183 chr6 156647449 156647657 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -130302 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 137.667-92 chr2 49578105 49578290 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 396006 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 218.666-12 chr10 106501294 106501583 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 361273 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 166.667-198 chr6 52138933 52139175 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5295 NR_029713 406989 NR_029713 ENSG00000207604 MIR206 MIRN206|miRNA206|mir-206 microRNA 206 ncRNA 216-57 chr2 62902399 62902772 + 1.33333 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) intron (NM_001142615, intron 10 of 22) 145126 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 380 chr1 45421268 45421812 + 1.33333 NA intron (NM_007170, intron 3 of 10) intron (NM_007170, intron 3 of 10) 69623 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 166.667-33 chr11 11366467 11366709 + 1.33333 NA intron (NM_198516, intron 6 of 10) intron (NM_198516, intron 6 of 10) -13338 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 165.333-103 chr17 30165126 30165279 + 1.33333 NA intron (NM_032141, intron 2 of 6) L1MD2|LINE|L1 -48042 NR_036149 100423003 NR_036149 ENSG00000284399 MIR3184 - microRNA 3184 ncRNA 244.666-55 chr9 73269227 73269427 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 117462 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 226.666-32 chr5 44720721 44720962 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 87952 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 242.999-5 chr21 31709973 31710224 + 1.33333 NA intron (NM_020706, intron 1 of 19) intron (NM_020706, intron 1 of 19) 22020 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 334.666-8 chr3 150956028 150956385 + 1.33333 NA intron (NR_046380, intron 1 of 4) intron (NR_046380, intron 1 of 4) -11970 NM_052995 7401 Hs.745448 NM_052995 ENSG00000163646 CLRN1 RP61|USH3|USH3A clarin 1 protein-coding 190.666-43 chr5 22484514 22484675 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) intron (NM_004061, intron 2 of 14) -270744 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 219.666-19 chr16 80753698 80753925 + 1.33333 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) L1MEg|LINE|L1 50787 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 254.666-6 chr10 124928454 124928771 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13511 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 197-100 chr6 95526472 95526737 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50847 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 195-118 chrX 121339505 121339700 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31370 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 153.333-17 chr1 113547184 113547353 + 1.33333 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 156753 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 146-73 chr21 23156305 23156488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 77112 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 168.333-167 chr5 113831893 113832070 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 318287 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 439.333-9 chr4 56613362 56613750 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42966 NM_139211 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 196.667-155 chr8 66209122 66209357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17125 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 249-18 chr12 7268451 7268847 + 1.33333 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -35683 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 198.667-124 chr22 19404554 19404846 + 1.33333 NA intron (NM_003325, intron 5 of 24) intron (NM_003325, intron 5 of 24) 27033 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 273.666-20 chr4 53391007 53391357 + 1.33333 NA intron (NM_001134938, intron 7 of 14) intron (NM_001134938, intron 7 of 14) 13529 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 200.667-121 chr4 100462694 100462979 + 1.33333 NA intron (NM_016242, intron 4 of 11) intron (NM_016242, intron 4 of 11) 55186 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 196.666-79 chr4 73420847 73421021 + 1.33333 NA intron (NM_000477, intron 14 of 14) intron (NM_000477, intron 14 of 14) -15287 NM_001354717 174 Hs.518808 NM_001134 ENSG00000081051 AFP AFPD|FETA|HPAFP alpha fetoprotein protein-coding 236.666-9 chr12 113490670 113490917 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 18790 NR_126425 104355219 Hs.641707 NR_126425 LHX5-AS1 locus 4010|locus4010 LHX5 antisense RNA 1 ncRNA 185-83 chr9 121366387 121366585 + 1.33333 NA intron (NR_073037, intron 1 of 7) intron (NR_073037, intron 1 of 7) 3764 NR_073037 2040 Hs.253903 NM_004099 ENSG00000148175 STOM BND7|EPB7|EPB72 stomatin protein-coding 240.666-27 chr3 115484869 115485201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -138475 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 185.333-174 chr7 33358254 33358446 + 1.33333 NA intron (NM_198428, intron 16 of 22) intron (NM_198428, intron 16 of 22) 228786 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 206-103 chr22 34986644 34986921 + 1.33333 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) L1MEg|LINE|L1 11134 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 217.333-165 chr9 98307885 98308177 + 1.33333 NA intron (NM_005458, intron 14 of 18) AluSx|SINE|Alu -52382 NR_051978 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 213.666-28 chr3 42399999 42400282 + 1.33333 NA intron (NM_001304386, intron 4 of 4) intron (NM_001304386, intron 4 of 4) 10470 NM_144634 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 201.333-242 chr6 63288071 63288231 + 1.33333 NA intron (NM_001143940, intron 2 of 4) AluSg|SINE|Alu 31826 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 206-77 chr2 48461537 48461705 + 1.33333 NA intron (NR_024188, intron 7 of 21) intron (NR_024188, intron 7 of 21) 20852 NM_001193475 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 211-42 chr17 65874636 65874880 + 1.33333 NA intron (NM_001353129, intron 20 of 26) intron (NM_001353129, intron 20 of 26) -48215 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 329.333-49 chr5 172613114 172613445 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -27984 NM_001142651 54492 Hs.91521 NM_001142651 ENSG00000214357 NEURL1B NEURL3|RNF67B|hNeur2|neur2 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B protein-coding 210-36 chr14 51738217 51738402 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 21026 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 265.333-61 chr4 109885902 109886166 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26849 NM_001963 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 232-14 chr10 97664832 97665026 + 1.33333 NA exon (NM_018425, exon 6 of 9) exon (NM_018425, exon 6 of 9) 22312 NM_021732 60370 Hs.23918 NM_021732 ENSG00000119986 AVPI1 PP5395|VIP32|VIT32 arginine vasopressin induced 1 protein-coding 146-124 chr7 19399948 19400120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254613 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 275.667-38 chr3 57123995 57124419 + 1.33333 NA intron (NM_001318864, intron 2 of 13) intron (NM_001318864, intron 2 of 13) 41146 NM_017563 54756 Hs.150725 NM_017563 ENSG00000144730 IL17RD HH18|IL-17RD|IL17RLM|SEF interleukin 17 receptor D protein-coding 194.667-40 chr14 63671925 63672200 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30191 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 298.666 chr10 59460082 59460470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -97095 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 212.333-115 chr5 59980479 59980690 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -86858 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 245.333-55 chr17 68516360 68516664 + 1.33333 NA intron (NM_212472, intron 2 of 10) intron (NM_212472, intron 2 of 10) 1118 NM_001276290 5573 Hs.280342 NM_002734 ENSG00000108946 PRKAR1A ACRDYS1|ADOHR|CAR|CNC|CNC1|PKR1|PPNAD1|PRKAR1|TSE1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha protein-coding 202-117 chr3 114348593 114348885 + 1.33333 NA intron (NR_121662, intron 6 of 6) intron (NR_121662, intron 6 of 6) -3072 NR_038993 100131117 Hs.122417 NR_038993 ENSG00000241560 ZBTB20-AS1 - ZBTB20 antisense RNA 1 ncRNA 212.333-4 chr1 43788295 43788535 + 1.33333 NA intron (NM_001270465, intron 2 of 7) intron (NM_001270465, intron 2 of 7) -50207 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 219-75 chr7 42060909 42061197 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 4 of 14) intron (NM_000168, intron 4 of 14) 176156 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 268.333-59 chr9 81460225 81460444 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 229201 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 216.666-62 chr6 129633822 129633990 + 1.33333 NA intron (NM_033515, intron 4 of 14) intron (NM_033515, intron 4 of 14) 76271 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 203.333-227 chr6 4759175 4759477 + 1.33333 NA intron (NM_001368125, intron 3 of 8) L1ME4b|LINE|L1 -17078 NM_001368126 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 355.666-5 chr2 193897747 193898062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -446365 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 187-7 chr1 179345013 179345198 + 1.33333 NA intron (NM_001252512, intron 10 of 14) intron (NM_001252512, intron 10 of 14) -20866 NM_144696 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 234.666-24 chr2 217185022 217185275 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -97585 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 200.333-12 chr10 56894924 56895090 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 409552 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 164.333-9 chr1 198074566 198074838 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -82296 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 265.666-24 chr7 7957383 7957630 + 1.33333 NA intron (NR_110018, intron 2 of 4) intron (NR_110018, intron 2 of 4) 11246 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 264.333-16 chr14 31837068 31837431 + 1.33333 NA intron (NM_001201573, intron 6 of 8) AluJr|SINE|Alu -107604 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 151-29 chr12 76265990 76266274 + 1.33333 NA intron (NR_146531, intron 1 of 3) MLT2C1|LTR|ERVL 6249 NR_146531 105369848 NR_146531 LNCOG LINC02407|lncRNA-OG lncRNA osteogenesis associated ncRNA 215.333-104 chr2 197653902 197654171 + 1.33333 NA intron (NM_144629, intron 1 of 8) MER113|DNA|hAT-Charlie 21551 NM_144629 130132 Hs.591615 NM_144629 ENSG00000162944 RFTN2 C2orf11|Raftlin-2 raftlin family member 2 protein-coding 211.666-11 chr12 103848152 103848363 + 1.33333 NA intron (NR_027249, intron 14 of 15) intron (NR_027249, intron 14 of 15) -7023 NM_001031701 51559 Hs.48428 NM_016575 ENSG00000111696 NT5DC3 TU12B1-TY|TU12B1TY 5'-nucleotidase domain containing 3 protein-coding 221.333-151 chr8 139197048 139197234 + 1.33333 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -283100 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 296.333-44 chr8 127363932 127364349 + 1.33333 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) intron (NR_117099, intron 3 of 3) -36259 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 471.333-5 chr2 76583264 76583857 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -402405 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 192-50 chr13 101317736 101317992 + 1.33333 NA intron (NM_001350749, intron 7 of 43) intron (NM_001350749, intron 7 of 43) 98644 NM_001350748 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 412.999-2 chr2 35489006 35489398 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 17797 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 198.667-198 chr9 88340699 88340930 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47630 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 373.666-4 chr2 14006928 14007267 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 393861 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 178-24 chr11 34994384 34994689 + 1.33333 NA intron (NM_003477, intron 10 of 10) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 52699 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 204-197 chr8 110569588 110569828 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 457725 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 259.333 chr1 20321136 20321419 + 1.33333 NA intron (NM_001039500, intron 7 of 21) L2c|LINE|L2 30402 NM_001039500 127731 Hs.205178 NM_144623 ENSG00000158816 VWA5B1 - von Willebrand factor A domain containing 5B1 protein-coding 127.333-24 chr10 58788469 58788672 + 1.33333 NA intron (NM_001080512, intron 6 of 20) intron (NM_001080512, intron 6 of 20) 73555 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 215.667-96 chr5 29709087 29709397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -171318 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 260.666-25 chr3 189673439 189673765 + 1.33333 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) L1M5|LINE|L1 42213 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 216.666-57 chr5 131524764 131524984 + 1.33333 NA intron (NM_016340, intron 6 of 27) AluSx|SINE|Alu 110355 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 209.667-58 chr18 7836430 7836709 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) L1MA2|LINE|L1 269253 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 245.666-4 chr11 11187092 11187436 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165986 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 204.666-85 chr6 155885443 155885684 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -61234 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 398-12 chr4 52435869 52436439 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 220385 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 198-198 chrX 102968949 102969154 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31779 NM_001031834 282808 Hs.449517 NM_001031834 ENSG00000102128 RAB40AL MRXSMP|RAR2|RLGP RAB40A like protein-coding 177.666-2 chr1 151966070 151966240 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 27704 NM_002966 6281 Hs.143873 NM_002966 ENSG00000197747 S100A10 42C|ANX2L|ANX2LG|CAL1L|CLP11|Ca[1]|GP11|P11|p10 S100 calcium binding protein A10 protein-coding 172 chr1 34882892 34883118 + 1.33333 NA intron (NM_001080418, intron 8 of 11) L2c|LINE|L2 -23256 NM_001320261 113444 Hs.27160 NM_138428 ENSG00000163866 SMIM12 C1orf212 small integral membrane protein 12 protein-coding 234.667-82 chr4 56063719 56064041 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -106315 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 199.666-19 chr17 4184771 4185026 + 1.33333 NA exon (NM_001330063, exon 12 of 25) exon (NM_001330063, exon 12 of 25) 41201 NM_001254755 124936 Hs.513871 NM_144611 ENSG00000167740 CYB5D2 - cytochrome b5 domain containing 2 protein-coding 208.666-79 chr4 53800016 53800218 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 104216 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 142.667-37 chr12 41511783 41511951 + 1.33333 NA intron (NM_001164595, intron 5 of 9) intron (NM_001164595, intron 5 of 9) 74128 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 210-136 chr6 143841724 143841938 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1442 NM_001329953 84946 Hs.185675 NM_032860 ENSG00000135521 LTV1 C6orf93|dJ468K18.4 LTV1 ribosome biogenesis factor protein-coding 167.333-136 chr2 118375080 118375235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -188771 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 218.333-40 chr14 70638469 70638796 + 1.33333 NA intron (NR_110071, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 2666 NR_110071 101928075 Hs.737532 NR_110071 ENSG00000245466 LOC101928075 - uncharacterized LOC101928075 ncRNA 246-19 chr12 1532308 1532734 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_160736) promoter-TSS (NR_160736) -329 NR_160736 107984507 NR_160736 LOC107984507 - uncharacterized LOC107984507 ncRNA 259.333-52 chr2 144750549 144750856 + 1.33333 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 82735 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 160.667-247 chr5 65816080 65816309 + 1.33333 NA intron (NM_020726, intron 12 of 12) AluSq2|SINE|Alu 93989 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 321.666 chr1 152364467 152364817 + 1.33333 NA non-coding (NR_103778, exon 7 of 7) non-coding (NR_103778, exon 7 of 7) -4636 NM_001014342 388698 Hs.156124 NM_001014342 ENSG00000143520 FLG2 IFPS|PSS6 filaggrin family member 2 protein-coding 177.666-16 chr3 45981515 45981660 + 1.33333 NA exon (NM_024513, exon 3 of 18) exon (NM_024513, exon 3 of 18) 14237 NM_024513 79443 Hs.200227 NM_024513 ENSG00000163820 FYCO1 CATC2|CTRCT18|RUFY3|ZFYVE7 FYVE and coiled-coil domain containing 1 protein-coding 191.666-9 chr2 128938785 128938962 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 74273 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 183.667-32 chr11 91451479 91451759 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -582417 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 197.333-23 chr10 88180828 88181017 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 317297 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 243.333-112 chr7 128819551 128819762 + 1.33333 NA intron (NM_001367763, intron 12 of 12) MIR|SINE|MIR -10750 NM_001127487 2318 Hs.58414 NM_001458 ENSG00000128591 FLNC ABP-280|ABP280A|ABPA|ABPL|CMH26|FLN2|MFM5|MPD4|RCM5 filamin C protein-coding 264.666-20 chr2 180553293 180553597 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL -138659 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 290.667-11 chr12 80737438 80737772 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 20693 NM_005593 4617 Hs.178023 NM_005593 ENSG00000111049 MYF5 EORVA|bHLHc2 myogenic factor 5 protein-coding 198-191 chr9 7181779 7181997 + 1.33333 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 424538 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 365.333-12 chr18 1683125 1683513 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -323690 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 277.999-7 chr2 210943111 210943327 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 325648 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 446-9 chr4 117586463 117587048 + 1.33333 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) L1ME3|LINE|L1 158357 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 330-29 chr4 92839778 92840198 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) L1M1|LINE|L1 535589 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 238-93 chr6 158870073 158870426 + 1.33333 NA non-coding (NR_160976, exon 1 of 3) non-coding (NR_160976, exon 1 of 3) 220 NR_160976 100130967 Hs.32804 NM_001195032 C6orf99 - chromosome 6 open reading frame 99 ncRNA 197.333-8 chr1 162401108 162401286 + 1.33333 NA intron (NM_053282, intron 2 of 3) intron (NM_053282, intron 2 of 3) 10939 NM_053282 117157 Hs.350581 NM_053282 ENSG00000198574 SH2D1B EAT2 SH2 domain containing 1B protein-coding 224-17 chr11 115207473 115207739 + 1.33333 NA intron (NM_001301045, intron 7 of 10) intron (NM_001301045, intron 7 of 10) -125971 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 186.666-16 chr12 14997139 14997332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4598 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 283.666-13 chr8 123110830 123111177 + 1.33333 NA intron (NM_001363156, intron 9 of 19) L1MC5|LINE|L1 37754 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 274.333-65 chr8 9051051 9051372 + 1.33333 NA intron (NM_001354638, intron 6 of 7) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 2766 NR_039804 100616350 NR_039804 ENSG00000263407 MIR4660 - microRNA 4660 ncRNA 206-134 chr4 175136931 175137201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 218708 NM_001278127 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 197.333-210 chr7 34062663 34062896 + 1.33333 NA intron (NM_133468, intron 12 of 15) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 157240 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 299-11 chr12 30623026 30623301 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 54081 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 330-18 chr18 68514108 68514533 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 200788 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 196.666-53 chr2 197935033 197935229 + 1.33333 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) L1PA15|LINE|L1 130538 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 183-102 chr9 95071803 95072068 + 1.33333 NA intron (NM_032823, intron 12 of 14) intron (NM_032823, intron 12 of 14) 6585 NR_106729 102466518 NR_106729 ENSG00000274115 MIR6081 hsa-mir-6081 microRNA 6081 ncRNA 261.666-16 chr5 99639792 99640173 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 105992 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 269.999-8 chr4 46291050 46291265 + 1.33333 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) L1MB5|LINE|L1 98222 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 327.999-2 chr18 415791 416065 + 1.33333 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) 84773 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 381.333-25 chr9 36629724 36630306 + 1.33333 NA intron (NM_001256691, intron 6 of 15) AluSx1|SINE|Alu 57120 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 228-18 chr11 103007170 103007450 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -51578 NM_002427 4322 Hs.2936 NM_002427 ENSG00000137745 MMP13 CLG3|MANDP1|MDST|MMP-13 matrix metallopeptidase 13 protein-coding 241.333-36 chr14 25568001 25568258 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -517832 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 141.333-101 chr2 37983877 37984026 + 1.33333 NA intron (NM_001170793, intron 4 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie 33487 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 392.333-9 chr7 1140640 1141100 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -2613 NM_001350970 84310 Hs.653258 NM_032350 ENSG00000146540 C7orf50 YCR016W chromosome 7 open reading frame 50 protein-coding 208.666-117 chrX 65544941 65545099 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7401 NR_033742 83957 Hs.652967 NR_033742 ENSG00000227942 FRMD8P1 - FERM domain containing 8 pseudogene 1 pseudo 196.666-91 chr6 73550216 73550441 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29296 NM_001402 1915 Hs.535192 NM_001402 ENSG00000156508 EEF1A1 CCS-3|CCS3|EE1A1|EEF-1|EEF1A|EF-Tu|EF1A|GRAF-1EF|HNGC:16303|LENG7|PTI1|eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 protein-coding 168.666-6 chr15 44236049 44236232 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40846 NR_104455 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 280-54 chr8 79038162 79038465 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 200784 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 185-15 chr12 6254031 6254300 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 53765 NM_001769 928 Hs.114286 NM_001769 ENSG00000010278 CD9 BTCC-1|DRAP-27|MIC3|MRP-1|TSPAN-29|TSPAN29 CD9 molecule protein-coding 174-11 chr10 63594423 63594578 + 1.33333 NA intron (NM_001001330, intron 2 of 7) intron (NM_001001330, intron 2 of 7) -72610 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 268-52 chr6 161102325 161102760 + 1.33333 NA intron (NM_005922, intron 18 of 26) intron (NM_005922, intron 18 of 26) 59440 NR_024277 79992 Hs.664873 NM_024929 ENSG00000279355 AGPAT4-IT1 C6orf59|NCRNA00241 AGPAT4 intronic transcript 1 ncRNA 196-96 chr2 241536585 241536846 + 1.33333 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -22030 NM_032515 666 Hs.293753 NM_032515 ENSG00000176720 BOK BCL2L9|BOKL BCL2 family apoptosis regulator BOK protein-coding 312.333-30 chr8 106651305 106651656 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) L1M4|LINE|L1 -6328 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 156-110 chr5 27354898 27355239 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -117224 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 221.333-93 chr3 65396455 65396945 + 1.33333 NA intron (NM_001365904, intron 13 of 24) intron (NM_001365904, intron 13 of 24) -497116 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 223.333-93 chr20 40484839 40485010 + 1.33333 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 204312 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 192-40 chr11 119608144 119608323 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 120967 NM_203286 5818 Hs.334846 NM_002855 ENSG00000110400 NECTIN1 CD111|CLPED1|ED4|HIgR|HV1S|HVEC|OFC7|PRR|PRR1|PVRL1|PVRR|PVRR1|SK-12|nectin-1 nectin cell adhesion molecule 1 protein-coding 238.666-28 chr2 153549301 153549582 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -70679 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 204-48 chr12 25752033 25752406 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -103641 NM_001352234 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 231.999-6 chr2 70007849 70008054 + 1.33333 NA intron (NR_033872, intron 7 of 10) AluSz|SINE|Alu -45686 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 206.666-27 chr12 59956860 59957084 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 267602 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 185-23 chr15 81833734 81834015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 212144 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 268.666-19 chr3 28643651 28643970 + 1.33333 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 68532 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 230.667-28 chr17 82536226 82536501 + 1.33333 NA intron (NM_004514, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 16631 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 251.999-8 chr5 57950898 57951173 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -51873 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 285.666-13 chr9 103850593 103850839 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -148993 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 215.333-212 chr9 86826296 86826523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121097 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 247.666-6 chr11 86896164 86896495 + 1.33333 NA intron (NR_120592, intron 2 of 2) intron (NR_120592, intron 2 of 2) -38375 NR_045004 8587 Hs.741959 NR_045004 ENSG00000255203 OR7E2P OR11-6|OR7E143P|OR7E51P|OR7E52P|OR7F2P|OST245|hg94 olfactory receptor family 7 subfamily E member 2 pseudogene pseudo 196.666-6 chr1 171877815 171877979 + 1.33333 NA intron (NM_001278252, intron 1 of 14) intron (NM_001278252, intron 1 of 14) 13705 NR_046845 100874284 NR_046845 ENSG00000233540 DNM3-IT1 - DNM3 intronic transcript 1 ncRNA 273.333-71 chr8 106625960 106626234 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -31711 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 190-124 chr8 118599805 118600058 + 1.33333 NA intron (NR_109794, intron 1 of 4) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -21070 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 181.333-132 chr5 9603960 9604181 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26281 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 195.666-2 chr1 219555463 219555623 + 1.33333 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) intron (NR_135822, intron 1 of 3) 1781 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 222.666-43 chr5 13290013 13290244 + 1.33333 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -257242 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 276.666-15 chr18 8941915 8942260 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -160612 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 131.667-125 chr3 28616863 28617040 + 1.33333 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 41673 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 191.333-83 chr16 59483706 59483863 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 271407 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 185.667-40 chr16 66554341 66554640 + 1.33333 NA intron (NM_001202509, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 1914 NM_001204098 100529251 Hs.698621 NM_001202509 ENSG00000254788 CKLF-CMTM1 - CKLF-CMTM1 readthrough protein-coding 200.666-19 chr10 76237352 76237584 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) MIR3|SINE|MIR 454707 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 308.666-6 chr12 82108693 82109126 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 155190 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 272.333-2 chr1 222067473 222067726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89079 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 192-115 chr5 110196926 110197175 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 313868 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 112.333-282 chr9 118213076 118213283 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -466492 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 282-45 chr7 30620787 30621195 + 1.33333 NA intron (NM_002047, intron 10 of 16) intron (NM_002047, intron 10 of 16) 26113 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 305.333-5 chr10 27559415 27559907 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 55357 NM_021252 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 176-76 chr5 91227918 91228093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 86397 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 267.333-11 chr10 55498560 55498924 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -100300 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 205.333-88 chr16 9466930 9467085 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11502 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 292.667-7 chr11 123740401 123740830 + 1.33333 NA intron (NM_001301779, intron 1 of 7) intron (NM_001301779, intron 1 of 7) 1045 NM_001301779 7753 Hs.112556 NM_003455 ENSG00000166261 ZNF202 ZKSCAN10|ZSCAN42 zinc finger protein 202 protein-coding 309.333-41 chr21 20739765 20740210 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 63121 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 410.666-9 chr7 6151331 6151692 + 1.33333 NA intron (NM_032172, intron 14 of 17) AluSz|SINE|Alu 20626 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 210.666-65 chr3 23858688 23858931 + 1.33333 NA intron (NM_003341, intron 3 of 5) intron (NM_003341, intron 3 of 5) 48355 NM_001202476 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 199.333-134 chr2 119355103 119355348 + 1.33333 NA intron (NM_001322329, intron 1 of 6) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 11517 NM_001322329 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 158.333-168 chr2 182524891 182525107 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2154 NM_001003683 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 186-57 chr20 61408689 61408954 + 1.33333 NA intron (NM_001794, intron 2 of 15) intron (NM_001794, intron 2 of 15) -90600 NM_001252338 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 293.333-45 chr4 32812590 32813033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 461773 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 203.333-102 chr17 10569055 10569357 + 1.33333 NA intron (NR_125367, intron 3 of 10) intron (NR_125367, intron 3 of 10) -19548 NM_017534 4620 Hs.667534 NM_017534 ENSG00000125414 MYH2 IBM3|MYH2A|MYHSA2|MYHas8|MYPOP|MyHC-2A|MyHC-IIa myosin heavy chain 2 protein-coding 279-14 chr18 3097817 3098227 + 1.33333 NA intron (NM_019856, intron 24 of 36) intron (NM_019856, intron 24 of 36) -86075 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 321.333-42 chr2 205260152 205260423 + 1.33333 NA intron (NM_057177, intron 16 of 21) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -422213 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 265.333-46 chr21 17851203 17851577 + 1.33333 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) intron (NR_024354, intron 1 of 2) -32034 NM_017447 54149 Hs.293811 NM_017447 ENSG00000154642 C21orf91 C21orf14|C21orf38|CSSG1|EURL|YG81 chromosome 21 open reading frame 91 protein-coding 258.333-7 chr10 73198034 73198360 + 1.33333 NA intron (NM_173348, intron 5 of 13) L1M3|LINE|L1 30078 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 327.666-2 chr11 94435823 94436123 + 1.33333 NA intron (NM_001330347, intron 17 of 19) intron (NM_001330347, intron 17 of 19) 30607 NR_031630 100302275 NR_031630 ENSG00000221230 MIR548L MIRN548L|hsa-mir-548l microRNA 548l ncRNA 335.999-5 chr8 113863403 113863875 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -426700 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 165.333-164 chr3 48556928 48557145 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_004567) promoter-TSS (NM_004567) -233 NM_001317137 5210 Hs.476217 NM_004567 ENSG00000114268 PFKFB4 - 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 4 protein-coding 272-15 chr15 79618689 79618973 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 186315 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 192.667-161 chr7 53460682 53460917 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 351132 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 188.667-149 chr8 98681199 98681454 + 1.33333 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) intron (NM_001256313, intron 4 of 8) 144345 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 182.667-134 chr5 85578947 85579156 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -703393 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 168-21 chr12 30718007 30718196 + 1.33333 NA intron (NM_023925, intron 12 of 16) intron (NM_023925, intron 12 of 16) -22232 NM_006390 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 344.666-13 chr17 64369319 64369722 + 1.33333 NA intron (NM_000442, intron 5 of 15) MIR|SINE|MIR 21340 NM_000442 5175 Hs.376675 NM_000442 ENSG00000261371 PECAM1 CD31|CD31/EndoCAM|GPIIA'|PECA1|PECAM-1|endoCAM platelet and endothelial cell adhesion molecule 1 protein-coding 303.333-69 chr7 34082705 34083020 + 1.33333 NA intron (NM_133468, intron 13 of 15) intron (NM_133468, intron 13 of 15) 177323 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 281.666-2 chr11 104147811 104148208 + 1.33333 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) intron (NM_025208, intron 1 of 6) 16138 NM_025208 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 284.666 chr1 95421793 95422087 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52797 NR_033966 440594 Hs.514123 NR_033966 ENSG00000233907 LINC01761 - long intergenic non-protein coding RNA 1761 ncRNA 291.333-46 chr4 47209755 47210139 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 178380 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 541.666 chr3 178627899 178628523 + 1.33333 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 69361 NM_005832 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 236.666-37 chr5 88383463 88383661 + 1.33333 NA intron (NR_105019, intron 6 of 7) intron (NR_105019, intron 6 of 7) -8633 NR_105020 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 187.667-99 chr3 158524185 158524431 + 1.33333 NA intron (NM_001271838, intron 7 of 9) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -2400 NR_148407 110599565 NR_148407 UC.134 - long non-coding RNA uc.134 ncRNA 164-6 chr1 77111994 77112177 + 1.33333 NA intron (NM_005482, intron 10 of 10) intron (NM_005482, intron 10 of 10) 51942 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 265.999-6 chr7 26728009 26728369 + 1.33333 NA intron (NM_003930, intron 6 of 12) intron (NM_003930, intron 6 of 12) 90318 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 262.666-15 chr22 25447411 25447811 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_033733) promoter-TSS (NR_033733) -476 NR_033734 1416 Hs.571835 NR_033733 ENSG00000100058 CRYBB2P1 CRYB2B crystallin beta B2 pseudogene 1 pseudo 213.333-14 chr1 221331948 221332151 + 1.33333 NA non-coding (NR_024236, exon 2 of 2) non-coding (NR_024236, exon 2 of 2) 4247 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 188-32 chr14 21133997 21134157 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 21986 NM_001004731 390445 Hs.553768 NM_001004731 ENSG00000169327 OR5AU1 OR14-38 olfactory receptor family 5 subfamily AU member 1 protein-coding 294-6 chr1 173170472 173170813 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 34890 NM_001297562 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 300.666-16 chr5 132189818 132190131 + 1.33333 NA TTS (NM_001365678) TTS (NM_001365678) 5098 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 278.999-5 chr11 108073864 108074184 + 1.33333 NA intron (NM_003478, intron 10 of 18) intron (NM_003478, intron 10 of 18) -47543 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 210.666-18 chr11 63093623 63093903 + 1.33333 NA intron (NM_001136506, intron 6 of 9) L1PA13|LINE|L1 50458 NM_173586 283238 Hs.375139 NM_173586 ENSG00000197658 SLC22A24 NET46 solute carrier family 22 member 24 protein-coding 140.333-152 chr3 156652199 156652383 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22299 NM_015508 25976 Hs.744050 NM_015508 ENSG00000163659 TIPARP ARTD14|PARP7|pART14 TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase protein-coding 234-73 chr8 129544548 129544842 + 1.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 30323 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 321.667-13 chr4 92953896 92954403 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 649750 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 140.333-237 chr8 121446576 121446844 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -192636 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 200-181 chr9 125048252 125048409 + 1.33333 NA intron (NM_173690, intron 4 of 18) intron (NM_173690, intron 4 of 18) 95198 NM_173690 286205 Hs.59504 NM_173690 ENSG00000173611 SCAI C9orf126|NET40 suppressor of cancer cell invasion protein-coding 200-129 chr5 74674910 74675107 + 1.33333 NA intron (NM_001292004, intron 1 of 13) MER31B|LTR|ERV1 -10225 NM_000521 3074 Hs.69293 NM_000521 ENSG00000049860 HEXB ENC-1AS|HEL-248|HEL-S-111 hexosaminidase subunit beta protein-coding 187.666-23 chr5 59419102 59419247 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -62204 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 220.333 chr1 1120789 1120973 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4792 NM_001330306 54991 Hs.235095 NM_017891 ENSG00000131591 C1orf159 - chromosome 1 open reading frame 159 protein-coding 184.333-142 chr7 87440170 87440356 + 1.33333 NA exon (NM_018850, exon 13 of 27) exon (NM_018850, exon 13 of 27) 35417 NM_018849 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 213-21 chr14 61249225 61249414 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32019 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 167.333-4 chr1 40164352 40164558 + 1.33333 NA intron (NM_012421, intron 1 of 7) intron (NM_012421, intron 1 of 7) 3068 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 186-91 chr6 100334953 100335109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128644 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 221.333-121 chr5 153375073 153375391 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -115292 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 303-14 chr14 24797038 24797474 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -163066 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 200-174 chr8 137363193 137363354 + 1.33333 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 50315 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 302-13 chr11 61470639 61471010 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10296 NM_001170753 220004 Hs.729003 NM_145017 ENSG00000162148 PPP1R32 C11orf66|IIIG9 protein phosphatase 1 regulatory subunit 32 protein-coding 247.333-84 chr8 85411691 85411996 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -27016 NM_005181 761 Hs.82129 NM_005181 ENSG00000164879 CA3 CAIII|Car3 carbonic anhydrase 3 protein-coding 401.667-9 chr5 156400018 156400551 + 1.33333 NA intron (NM_001128209, intron 2 of 7) intron (NM_001128209, intron 2 of 7) 73120 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 185.667-133 chr8 121413848 121414113 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -225366 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 223.333-31 chr12 13852568 13852910 + 1.33333 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR 127617 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 196-32 chr12 19560465 19560734 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120000 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 200.666-55 chr2 27865709 27865878 + 1.33333 NA intron (NM_022128, intron 1 of 7) L1MEf|LINE|L1 -22916 NM_001329112 9577 Hs.258314 NM_004899 ENSG00000158019 BABAM2 BRCC4|BRCC45|BRE BRISC and BRCA1 A complex member 2 protein-coding 274.333-20 chr15 23590203 23590653 + 1.33333 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 24754 NM_005664 7681 Hs.72964 NM_005664 ENSG00000179455 MKRN3 CPPB2|D15S9|RNF63|ZFP127|ZNF127 makorin ring finger protein 3 protein-coding 309.333-55 chr7 12491782 12492270 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4403 NR_136261 102725191 Hs.602382 NR_136261 ENSG00000226690 LOC102725191 - uncharacterized LOC102725191 ncRNA 208-74 chr2 26364780 26364955 + 1.33333 NA exon (NM_033505, exon 3 of 10) exon (NM_033505, exon 3 of 10) -18078 NR_135916 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 208.333-38 chr14 60484166 60484366 + 1.33333 NA intron (NM_174978, intron 3 of 17) intron (NM_174978, intron 3 of 17) 1797 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 488.666 chr1 223830877 223831435 + 1.33333 NA intron (NM_005426, intron 1 of 18) AluJr4|SINE|Alu 14791 NM_001031685 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 133.666-3 chr5 63907319 63907459 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54903 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 168.333-160 chr5 61808893 61809094 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -73295 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 226.999-4 chr2 41844432 41844623 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -33028 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 225.666-31 chr8 77618441 77618615 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 167831 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 220-15 chr10 87633773 87634059 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -25962 NM_004670 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 176.333-178 chr9 71359621 71359766 + 1.33333 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 87278 NM_001366141 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 290.333-32 chr4 47577493 47577852 + 1.33333 NA intron (NM_020453, intron 19 of 22) intron (NM_020453, intron 19 of 22) -74997 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 119.666-2 chr2 189839567 189839748 + 1.33333 NA intron (NR_110332, intron 6 of 12) L2c|LINE|L2 55207 NM_001321048 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 264-12 chr11 9582088 9582336 + 1.33333 NA intron (NM_003390, intron 6 of 10) L1MC5a|LINE|L1 7525 NM_001143976 7465 Hs.249441 NM_003390 ENSG00000166483 WEE1 WEE1A|WEE1hu WEE1 G2 checkpoint kinase protein-coding 198.667-71 chr15 69320302 69320585 + 1.33333 NA intron (NM_001104554, intron 1 of 8) intron (NM_001104554, intron 1 of 8) 6040 NM_001104554 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 257.333-107 chr8 136609706 136610040 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 79075 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 211.666-7 chr11 32864670 32864896 + 1.33333 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -28028 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 184.666-40 chr8 117381389 117381627 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -139205 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 439.333-7 chr20 34854487 34854981 + 1.33333 NA intron (NM_178026, intron 9 of 14) intron (NM_178026, intron 9 of 14) 18122 NM_178026 2686 Hs.433738 NM_178026 ENSG00000131067 GGT7 D20S101|GGT4|GGTL3|GGTL5 gamma-glutamyltransferase 7 protein-coding 212.333-93 chr3 18294339 18294635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 130852 NM_002971 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 252-72 chr4 109153787 109154025 + 1.33333 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) MIRb|SINE|MIR 148752 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 358.667-17 chr20 21439461 21439890 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42149 NM_033176 644524 NM_033176 ENSG00000125816 NKX2-4 NKX2.4|NKX2D NK2 homeobox 4 protein-coding 215.333-130 chr3 62753348 62753541 + 1.33333 NA exon (NM_183394, exon 3 of 28) exon (NM_183394, exon 3 of 28) 121972 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 193.666-13 chr13 107167077 107167311 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001080396, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001080396, exon 3 of 3) 153769 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 209.666-11 chr10 92581106 92581266 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -7091 NM_001322793 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 319.666-10 chr19 6823454 6823864 + 1.33333 NA intron (NM_001258206, intron 6 of 25) intron (NM_001258206, intron 6 of 25) 50951 NM_001258206 7409 Hs.116237 NM_005428 ENSG00000141968 VAV1 VAV vav guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 302.333-15 chr17 13554419 13554857 + 1.33333 NA intron (NM_006042, intron 1 of 1) intron (NM_006042, intron 1 of 1) -10992 NR_031679 100302287 NR_031679 ENSG00000221698 MIR548H3 MIR548H-3|MIRN548H3|hsa-mir-548h-3 microRNA 548h-3 ncRNA 176.666-12 chr18 70928825 70929119 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -278018 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 178.333-95 chr21 30570008 30570152 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8767 NM_181614 337974 Hs.553696 NM_181614 ENSG00000244362 KRTAP19-7 KAP19.7 keratin associated protein 19-7 protein-coding 286-26 chr2 82710928 82711289 + 1.33333 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -145695 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 331.333-43 chr7 11364661 11364923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 390920 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 428-5 chr20 13049597 13050003 + 1.33333 NA intron (NM_001349945, intron 3 of 12) L1PBa|LINE|L1 40828 NM_001349945 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 218-19 chr12 30352256 30352448 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 324892 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 282.666-12 chr2 118387759 118388028 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -201507 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 197.667-12 chr1 209025956 209026192 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 53620 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 223.333-89 chr20 14905642 14905961 + 1.33333 NA non-coding (NR_072988, exon 2 of 2) non-coding (NR_072988, exon 2 of 2) 23717 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 219.667-13 chr11 34967963 34968240 + 1.33333 NA intron (NM_003477, intron 6 of 10) AluJo|SINE|Alu 26264 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 175-73 chr5 125614637 125614782 + 1.33333 NA Intergenic (TATATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 121448 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 292.333-23 chr2 50988052 50988517 + 1.33333 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 43848 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 220.666-51 chr3 142083088 142083254 + 1.33333 NA intron (NM_001178138, intron 3 of 13) L1MA3|LINE|L1 -54545 NM_001178142 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 262 chr1 21570197 21570474 + 1.33333 NA exon (NM_001127501, exon 7 of 11) exon (NM_001127501, exon 7 of 11) 19065 NM_001369803 249 Hs.75431 NM_000478 ENSG00000162551 ALPL AP-TNAP|APTNAP|HOPS|TNALP|TNAP|TNSALP alkaline phosphatase, biomineralization associated protein-coding 242-37 chr19 45057772 45058290 + 1.33333 NA intron (NR_103529, intron 7 of 20) intron (NR_103529, intron 7 of 20) -17596 NM_001319055 79760 Hs.466919 NM_024707 ENSG00000142252 GEMIN7 SIP3 gem nuclear organelle associated protein 7 protein-coding 197-104 chr6 141076171 141076439 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 392491 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 260.666-26 chr4 32249406 32249712 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101479 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 270-36 chr3 4082720 4083040 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -220424 NM_001320677 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 185.333-182 chr8 52624904 52625058 + 1.33333 NA intron (NM_001083617, intron 22 of 23) intron (NM_001083617, intron 22 of 23) -59551 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 215.333-99 chr2 176008246 176008508 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -5557 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 370.333-28 chr9 36253665 36254193 + 1.33333 NA intron (NM_001128227, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 4519 NM_001190383 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 251-75 chr6 140398067 140398453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193008 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 267.666-11 chr2 126854226 126854562 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -44496 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 170-32 chr14 35470939 35471111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63139 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 359.666-13 chr8 83616623 83617035 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 213071 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 219.333-16 chr1 218496222 218496503 + 1.33333 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) intron (NR_031644, intron 2 of 6) -13733 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 202.333-69 chr16 24699798 24700033 + 1.33333 NA intron (NM_001351850, intron 2 of 23) MIRb|SINE|MIR -28853 NR_122072 400511 Hs.592028 NR_122072 ENSG00000224310 LINC01567 LOCCS long intergenic non-protein coding RNA 1567 ncRNA 189-19 chr12 65709809 65710080 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -67572 NR_120432 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 279-22 chr4 41774518 41774878 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -25728 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 581.334 chr8 144344824 144345666 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -8763 NM_031309 83482 Hs.31746 NM_031309 ENSG00000261678 SCRT1 SCRT|ZNF898 scratch family transcriptional repressor 1 protein-coding 207.333-176 chr3 22651634 22651818 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 550852 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 211.666-29 chr20 55596947 55597113 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -169833 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 236.667-43 chr2 171589170 171589516 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 66869 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 252.666-36 chr5 60940209 60940415 + 1.33333 NA intron (NM_001007234, intron 1 of 5) L1ME1|LINE|L1 4758 NM_001007234 1161 Hs.435237 NM_000082 ENSG00000049167 ERCC8 CKN1|CSA|UVSS2 ERCC excision repair 8, CSA ubiquitin ligase complex subunit protein-coding 208.333-9 chr1 205209055 205209242 + 1.33333 NA intron (NM_199462, intron 1 of 11) intron (NM_199462, intron 1 of 11) 2554 NM_199462 25778 Hs.6874 NM_015375 ENSG00000133059 DSTYK CAKUT1|DustyPK|HDCMD38P|RIP5|RIPK5|SPG23 dual serine/threonine and tyrosine protein kinase protein-coding 196-135 chr4 74652920 74653101 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 141513 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 213.333-118 chr22 22084891 22085082 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41052 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 289.667-20 chr2 123342708 123343144 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -269445 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 212-82 chr2 38223339 38223605 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 92367 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 282-15 chr14 61823836 61824215 + 1.33333 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) intron (NM_001367656, intron 1 of 7) 11322 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 298-8 chr1 175915077 175915370 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 37880 NR_125964 101928751 NR_125964 ENSG00000224718 LINC01657 - long intergenic non-protein coding RNA 1657 ncRNA 154.667-50 chr10 93611680 93611868 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_006204) promoter-TSS (NM_006204) -763 NM_006204 5146 Hs.658121 NM_006204 ENSG00000095464 PDE6C ACHM5|COD4|PDEA2 phosphodiesterase 6C protein-coding 165.333-3 chr1 43845083 43845295 + 1.33333 NA intron (NM_001270466, intron 4 of 4) AluSz6|SINE|Alu 6567 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 340.999 chr1 117694664 117694953 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 88760 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 157.667-208 chr4 38770116 38770348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12758 NM_030956 81793 Hs.120551 NM_030956 ENSG00000174123 TLR10 CD290 toll like receptor 10 protein-coding 316.667-5 chr10 99882552 99882945 + 1.33333 NA intron (NM_015221, intron 15 of 16) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 31344 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 179.333-143 chr4 107779809 107780000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44661 NM_001136258 166929 Hs.595423 NM_152621 ENSG00000164023 SGMS2 SMS2 sphingomyelin synthase 2 protein-coding 455.666-2 chr16 58472369 58472772 + 1.33333 NA intron (NM_022910, intron 1 of 15) intron (NM_022910, intron 1 of 15) 7748 NM_022910 65009 Hs.322430 NM_020465 ENSG00000103034 NDRG4 BDM1|SMAP-8|SMAP8 NDRG family member 4 protein-coding 192.666-63 chr8 84904582 84904821 + 1.33333 NA intron (NM_001287244, intron 7 of 7) intron (NM_001287244, intron 7 of 7) 198774 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 197.333-171 chr4 108586096 108586377 + 1.33333 NA intron (NR_026968, intron 1 of 3) intron (NR_026968, intron 1 of 3) 29003 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 209.333-178 chr4 152583720 152583888 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47376 NR_039658 100616193 NR_039658 ENSG00000283792 MIR4453 - microRNA 4453 ncRNA 418.333-3 chr2 27899997 27900398 + 1.33333 NA intron (NM_199193, intron 3 of 13) intron (NM_199193, intron 3 of 13) -9083 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 162.667-195 chr4 62064282 62064428 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 23 of 23) intron (NM_001371343, intron 23 of 23) 97410 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 322.999 chr22 36094069 36094403 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -65412 NM_001082578 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 283-20 chr3 38044508 38044966 + 1.33333 NA intron (NM_007335, intron 1 of 36) intron (NM_007335, intron 1 of 36) 5529 NM_007335 9940 Hs.714499 NM_007335 ENSG00000008226 DLEC1 CFAP81|DLC-1|DLC1|F56 DLEC1 cilia and flagella associated protein protein-coding 226.666-5 chr11 31248890 31249129 + 1.33333 NA intron (NM_001367979, intron 8 of 38) intron (NM_001367979, intron 8 of 38) 120730 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 309.333-10 chr10 90558743 90559112 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -18122 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 326-8 chr10 62217126 62217453 + 1.33333 NA intron (NM_145307, intron 8 of 11) intron (NM_145307, intron 8 of 11) 51555 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 244-20 chr11 25448875 25449135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -740118 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 248-16 chr12 32598242 32598477 + 1.33333 NA intron (NM_001370298, intron 4 of 16) intron (NM_001370298, intron 4 of 16) 64066 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 244-59 chr2 170962070 170962482 + 1.33333 NA intron (NM_001201428, intron 8 of 9) intron (NM_001201428, intron 8 of 9) 33023 NM_015530 26003 Hs.431317 NM_015530 ENSG00000115806 GORASP2 GOLPH6|GRASP55|GRS2|p59 golgi reassembly stacking protein 2 protein-coding 341.999-8 chr4 53988543 53988852 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1415 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 221-46 chr3 78824492 78824833 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) MIRb|SINE|MIR 194797 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 160-51 chr18 54267532 54267672 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1877 NM_001351616 11201 Hs.438533 NM_007195 ENSG00000101751 POLI RAD30B|RAD3OB|eta2 DNA polymerase iota protein-coding 182-52 chr2 155979095 155979355 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie 275706 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 247.333-48 chr3 7993849 7994116 + 1.33333 NA intron (NR_110131, intron 1 of 3) intron (NR_110131, intron 1 of 3) 22325 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 384.999-3 chr4 77692123 77692440 + 1.33333 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 126783 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 294.333-19 chr17 74705637 74706044 + 1.33333 NA intron (NR_110298, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 7083 NM_001289084 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 226-95 chr8 131284283 131284490 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -243477 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 387-9 chr2 54207602 54208118 + 1.33333 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 48369 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 222-19 chr11 134317130 134317362 + 1.33333 NA intron (NM_001080407, intron 18 of 19) L1M4c|LINE|L1 -14628 NM_138342 89944 Hs.436178 NM_138342 ENSG00000149328 GLB1L2 MST114|MSTP114 galactosidase beta 1 like 2 protein-coding 281.333-22 chr15 98498600 98499025 + 1.33333 NA intron (NM_182562, intron 2 of 6) L1MA5|LINE|L1 15524 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 187.666-5 chr12 43242437 43242598 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87202 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 221.999-11 chrX 45966471 45966689 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -115090 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 267-30 chr16 53756768 53757115 + 1.33333 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) intron (NM_001363897, intron 1 of 7) 52785 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 356-10 chr12 15274138 15274527 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48176 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 158-67 chr19 24357520 24357651 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -194138 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 137-5 chr1 111915193 111915385 + 1.33333 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) L1MEc|LINE|L1 5632 NR_046619 100873995 Hs.535274 NR_046619 ENSG00000237556 KCND3-AS1 - KCND3 antisense RNA 1 ncRNA 224.333-39 chr14 61330943 61331157 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) MER30|DNA|hAT-Charlie 9607 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 207.666-31 chr2 229905633 229905889 + 1.33333 NA intron (NM_001348335, intron 1 of 5) intron (NM_001348335, intron 1 of 5) 15918 NM_001348334 9320 Hs.572642 NM_004238 ENSG00000153827 TRIP12 MRD49|TRIP-12|ULF thyroid hormone receptor interactor 12 protein-coding 491.666 chr11 132286942 132287495 + 1.33333 NA intron (NR_046820, intron 2 of 2) intron (NR_046820, intron 2 of 2) 2916 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 160-100 chr5 98578753 98578897 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -189807 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 225.333-32 chr12 28937218 28937519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -211910 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 194-89 chr22 26443150 26443524 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001349904, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001349904, exon 14 of 14) 14077 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 371.666-3 chr11 85933450 85933914 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 78581 NM_173556 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 222.333-72 chr5 33141155 33141444 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -88436 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 216.333-43 chr13 109070929 109071108 + 1.33333 NA intron (NM_015011, intron 27 of 34) intron (NM_015011, intron 27 of 34) 96285 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 264.666-37 chr8 119652036 119652328 + 1.33333 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -13343 NM_001040092 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 351.667-17 chr7 87377200 87377717 + 1.33333 NA intron (NM_021151, intron 10 of 17) intron (NM_021151, intron 10 of 17) 31794 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 250.666-27 chr4 113464479 113464869 + 1.33333 NA intron (NM_001221, intron 15 of 18) intron (NM_001221, intron 15 of 18) 171835 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 169.667-54 chr14 28592312 28592468 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 172929 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 289.666-7 chr2 102630856 102631089 + 1.33333 NA intron (NM_003048, intron 1 of 11) L1MEd|LINE|L1 11419 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 199.666-16 chr14 80648728 80648896 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) intron (NM_152446, intron 19 of 24) 292926 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 142-115 chr5 45992208 45992352 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -295900 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 316-2 chr1 89814919 89815414 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5866 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 306.666-13 chr18 1811273 1811716 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -451865 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 192.667-149 chr6 62150535 62150807 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) intron (NR_146874, intron 2 of 13) 135554 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 193-67 chr4 58740394 58740618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -204178 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 199.333-261 chr7 62705256 62705538 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 598659 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 191.333-205 chr8 106447278 106447440 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001198532) promoter-TSS (NM_001198532) -565 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 306.999 chr12 40422432 40422743 + 1.33333 NA intron (NM_173600, intron 17 of 173) L1MA9|LINE|L1 29193 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 203.333-67 chr14 25988025 25988207 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 565314 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 175.667-46 chr15 55547565 55547773 + 1.33333 NA intron (NM_001367806, intron 2 of 2) intron (NM_001367806, intron 2 of 2) -39435 NM_001033560 161582 Hs.126403 NM_130810 ENSG00000256061 DNAAF4 CILD25|DYX1|DYX1C1|DYXC1|EKN1|RD dynein axonemal assembly factor 4 protein-coding 238.666-20 chr16 72252256 72252659 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -80007 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 222.333-87 chr7 6694396 6694890 + 1.33333 NA intron (NM_006956, intron 4 of 5) intron (NM_006956, intron 4 of 5) 12304 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 303.333-16 chr11 95633046 95633409 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 156555 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 283-34 chr7 41821200 41821608 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -118314 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 182.666-31 chr4 80792856 80793046 + 1.33333 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -237757 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 341.333-6 chr12 60262967 60263329 + 1.33333 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 573778 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 247.333-50 chr3 13330038 13330351 + 1.33333 NA intron (NM_024923, intron 30 of 39) MIR3|SINE|MIR 90128 NM_024923 23225 Hs.475525 NM_024923 ENSG00000132182 NUP210 GP210|POM210 nucleoporin 210 protein-coding 339.667-19 chr5 23355228 23355606 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -152192 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 230.333-34 chr13 106372480 106372666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3991 NR_034119 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 275.999-6 chr5 111235999 111236276 + 1.33333 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 11753 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 230-42 chr3 1988347 1988624 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -110318 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 207.666-47 chr4 118776460 118776684 + 1.33333 NA intron (NM_014822, intron 8 of 22) intron (NM_014822, intron 8 of 22) 59554 NM_001318066 9871 Hs.189641 NM_014822 ENSG00000150961 SEC24D CLCRP2 SEC24 homolog D, COPII coat complex component protein-coding 218-96 chr6 67491003 67491184 + 1.33333 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -564258 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 198.667-137 chr4 68011629 68011901 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14326 NR_033737 644759 Hs.646883 NR_033737 ENSG00000229009 TMPRSS11GP - transmembrane serine protease 11G, pseudogene pseudo 214.333-101 chr3 131487925 131488283 + 1.33333 NA intron (NM_007208, intron 5 of 9) intron (NM_007208, intron 5 of 9) -8871 NR_002985 677836 Hs.735762 NR_002985 SNORA58 ACA58|SNORA58B small nucleolar RNA, H/ACA box 58 snoRNA 194.333-146 chr7 133702566 133702775 + 1.33333 NA intron (NM_021807, intron 10 of 17) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 122218 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 295.333-3 chr10 57881474 57881778 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 386268 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 228.333-74 chr5 23037176 23037502 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183995 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 179.333-117 chr22 28602047 28602223 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 77730 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 204.333-201 chr8 125811826 125812098 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 139235 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 249-45 chr21 25911245 25911553 + 1.33333 NA intron (NM_001136131, intron 12 of 15) intron (NM_001136131, intron 12 of 15) -175745 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 225.999-4 chr14 59929838 59930017 + 1.33333 NA intron (NR_075071, intron 3 of 32) L1PA13|LINE|L1 10214 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 199-70 chr3 103460354 103460606 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63636 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 285.333-13 chr10 69239998 69240305 + 1.33333 NA intron (NM_025130, intron 5 of 17) intron (NM_025130, intron 5 of 17) -7661 NR_120648 101928994 Hs.562925 NR_120648 ENSG00000229261 LOC101928994 - uncharacterized LOC101928994 ncRNA 294.333-22 chr2 43820238 43820666 + 1.33333 NA intron (NM_022436, intron 10 of 12) intron (NM_022436, intron 10 of 12) 18387 NM_022436 64240 Hs.132992 NM_022436 ENSG00000138075 ABCG5 STSL ATP binding cassette subfamily G member 5 protein-coding 292.333-19 chr18 32446353 32446587 + 1.33333 NA intron (NM_001242409, intron 1 of 5) MER94|DNA|hAT-Blackjack 24412 NM_022751 64762 Hs.444314 NM_022751 ENSG00000141441 GAREM1 C18orf11|FAM59A|GAREM|Gm944 GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 1 protein-coding 258.666-9 chr11 120270596 120270848 + 1.33333 NA intron (NM_001244682, intron 3 of 12) AluJb|SINE|Alu -4790 NR_038829 649133 Hs.568902 NR_038829 ENSG00000259541 LOC649133 - uncharacterized LOC649133 ncRNA 178.667-106 chr3 115953229 115953473 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) -48225 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 130.333-5 chr1 33594737 33594901 + 1.33333 NA intron (NM_052896, intron 45 of 69) L1M6|LINE|L1 122174 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 193-66 chr4 40676728 40676984 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -46262 NM_001371114 377-9 chr2 124484586 124485004 + 1.33333 NA intron (NM_001367498, intron 7 of 23) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 459508 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 243-47 chr5 2791229 2791604 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 39285 NM_178569 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 196.666-25 chr14 88683768 88683980 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 20 of 42) L1M4b|LINE|L1 89454 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 206.333-11 chr10 33664800 33664971 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 107795 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 246-93 chr6 103663759 103664121 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1195606 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 158.666-18 chr4 98377112 98377258 + 1.33333 NA intron (NM_001100430, intron 4 of 12) intron (NM_001100430, intron 4 of 12) 115801 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 191-70 chr7 131325289 131325509 + 1.33333 NA intron (NR_125364, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 2380 NR_125364 100506881 Hs.660830 NR_125364 ENSG00000236753 MKLN1-AS MKLN1-AS2 MKLN1 antisense RNA ncRNA 164.667-153 chr4 23599784 23600004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 281398 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 188.666-25 chr3 168898081 168898244 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -3783 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 430.666-2 chr14 62915489 62915891 + 1.33333 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 129768 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 170.333-84 chr16 6709971 6710217 + 1.33333 NA intron (NM_018723, intron 3 of 15) intron (NM_018723, intron 3 of 15) -63715 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 179.333-148 chr5 7469226 7469417 + 1.33333 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) L1ME4a|LINE|L1 73183 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 117.333-57 chr14 63500409 63500521 + 1.33333 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 7773 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 217.333-84 chr22 25725381 25725571 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_005160, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_005160, exon 21 of 21) -16712 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 189.333-53 chr14 63587559 63587826 + 1.33333 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -44297 NM_001354926 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 159-38 chr14 85898367 85898507 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -36241 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 159-93 chr4 157226670 157226851 + 1.33333 NA intron (NM_001083620, intron 2 of 15) intron (NM_001083620, intron 2 of 15) 6032 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 266.667-73 chr8 142717373 142717703 + 1.33333 NA intron (NR_038925, intron 1 of 2) L1MEg|LINE|L1 9435 NR_038925 100288181 Hs.716823 NR_038925 ENSG00000253741 LNCOC1 Lnc-OC1 lncRNA associated with ovarian cancer 1 ncRNA 367.999-5 chr7 40754971 40755267 + 1.33333 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 224820 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 256-67 chr4 112184015 112184256 + 1.33333 NA intron (NM_152400, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 38681 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 411-10 chr6 111320630 111321068 + 1.33333 NA intron (NM_001286431, intron 29 of 34) AluJr|SINE|Alu 61510 NM_153369 91749 Hs.400572 NM_153369 ENSG00000173214 MFSD4B KIAA1919|NaGLT1 major facilitator superfamily domain containing 4B protein-coding 145-79 chr4 61988297 61988422 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 18 of 23) intron (NM_001371343, intron 18 of 23) 173406 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 130.667-199 chr8 121942288 121942474 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -300941 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 239-66 chrX 13540804 13540993 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28703 NM_015507 25975 Hs.12844 NM_015507 ENSG00000198759 EGFL6 MAEG|W80 EGF like domain multiple 6 protein-coding 271.666-6 chr3 38212168 38212437 + 1.33333 NA intron (NM_005109, intron 4 of 17) intron (NM_005109, intron 4 of 17) 46765 NM_005109 9943 Hs.475970 NM_005109 ENSG00000172939 OXSR1 OSR1 oxidative stress responsive kinase 1 protein-coding 206.333-115 chr3 171462115 171462482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1890 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 349.667-17 chr4 59406483 59406853 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 393095 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 202.333-43 chr12 18966964 18967156 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -162673 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 340.666-19 chr8 88546442 88546861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -219168 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 241.333-48 chr18 61361873 61362172 + 1.33333 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 28592 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 313.333-20 chr2 168808925 168809327 + 1.33333 NA intron (NM_052946, intron 1 of 14) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 6529 NM_052946 115677 Hs.189780 NM_052946 ENSG00000163072 NOSTRIN DaIP2 nitric oxide synthase trafficking protein-coding 212.666-91 chr8 73421783 73421962 + 1.33333 NA intron (NM_001164383, intron 9 of 9) intron (NM_001164383, intron 9 of 9) 1798 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-108 chr5 40246590 40246774 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 194391 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 289.333-36 chr3 30818861 30819233 + 1.33333 NA intron (NM_207359, intron 11 of 14) intron (NM_207359, intron 11 of 14) 75614 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 261.999-4 chr12 81327153 81327414 + 1.33333 NA intron (NM_001282536, intron 18 of 29) intron (NM_001282536, intron 18 of 29) 42086 NM_001220479 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 222.666-30 chr3 66066841 66067027 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28016 NM_001365905 9223 Hs.476636 NM_004742 ENSG00000151276 MAGI1 AIP-3|AIP3|BAIAP1|BAP-1|BAP1|MAGI-1|MAGI-1b|Magi1d|TNRC19|WWP3 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 1 protein-coding 279.666-9 chr4 117354590 117354873 + 1.33333 NA intron (NR_147151, intron 2 of 6) intron (NR_147151, intron 2 of 6) 5908 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 176.667-84 chr2 208929255 208929546 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 386758 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 255.333-26 chr12 40697161 40697469 + 1.33333 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) L1M5|LINE|L1 4873 NM_001256063 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 185-32 chr2 21560075 21560346 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 150442 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 170.333-123 chr2 229352401 229352547 + 1.33333 NA Intergenic MER58D|DNA|hAT-Charlie -81187 NM_017933 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 185-17 chr12 125833027 125833242 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 150240 NR_034132 400084 Hs.156191 NR_034132 ENSG00000249267 LINC00939 - long intergenic non-protein coding RNA 939 ncRNA 204.666-76 chr5 148699973 148700184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45551 NR_104445 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 181.667-157 chrX 99370180 99370390 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 1039988 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 284.666-16 chr3 47139109 47139407 + 1.33333 NA intron (NR_146158, intron 1 of 21) intron (NR_146158, intron 1 of 21) 24719 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 145.667-78 chr14 61022195 61022407 + 1.33333 NA intron (NR_033344, intron 5 of 16) intron (NR_033344, intron 5 of 16) -40611 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 208.666-49 chr17 28874885 28875066 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -13245 NR_039885 100616385 NR_039885 ENSG00000284085 MIR4732 mir-4732 microRNA 4732 ncRNA 252.666-18 chr2 24711013 24711317 + 1.33333 NA intron (NM_001362950, intron 14 of 23) intron (NM_001362950, intron 14 of 23) -81950 NM_024322 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 189.666-19 chr2 77922482 77922646 + 1.33333 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1MC3|LINE|L1 6630 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 163.666 chr1 62545262 62545433 + 1.33333 NA intron (NM_001367561, intron 22 of 49) intron (NM_001367561, intron 22 of 49) -52173 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 191.666-11 chr22 26479419 26479641 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_073136) promoter-TSS (NR_073136) -42 NR_073136 89781 Hs.474436 NM_022081 ENSG00000100099 HPS4 BLOC3S2|LE HPS4 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2 protein-coding 201.333-137 chr19 35520922 35521096 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 7302 NM_001166035 374897 Hs.433484 NM_198538 ENSG00000189001 SBSN UNQ698 suprabasin protein-coding 177.666-10 chr2 113716600 113716748 + 1.33333 NA intron (NM_001330316, intron 14 of 14) HAL1|LINE|L1 4694 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 190.333-92 chr3 105720758 105720919 + 1.33333 NA intron (NR_135809, intron 9 of 18) intron (NR_135809, intron 9 of 18) 146753 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 235-24 chr15 42318573 42318902 + 1.33333 NA intron (NM_198141, intron 10 of 23) AluJo|SINE|Alu -40763 NM_173087 825 Hs.143261 NM_000070 ENSG00000092529 CAPN3 CANP3|CANPL3|LGMD2|LGMD2A|LGMDD4|LGMDR1|nCL-1|p94 calpain 3 protein-coding 180-83 chr6 16982752 16983013 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119376 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 199.333-26 chr10 56707084 56707372 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -345955 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 146-131 chr7 117264506 117264676 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58467 NR_024047 7472 Hs.567356 NM_003391 ENSG00000105989 WNT2 INT1L1|IRP Wnt family member 2 protein-coding 188.666-27 chr4 14838184 14838363 + 1.33333 NA intron (NR_126435, intron 2 of 6) intron (NR_126435, intron 2 of 6) 49896 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 362.666-5 chr11 70249578 70250030 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -20886 NR_045286 8500 Hs.530749 NM_003626 ENSG00000131626 PPFIA1 LIP.1|LIP1|LIPRIN PTPRF interacting protein alpha 1 protein-coding 184-92 chr5 151500060 151500258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21989 NR_106752 102465246 NR_106752 ENSG00000276622 MIR6499 hsa-mir-6499|mir-6499 microRNA 6499 ncRNA 358.666-10 chr4 121058153 121058652 + 1.33333 NA intron (NM_024574, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 14133 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 283.999-3 chr14 82410493 82410919 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -231926 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 306.333-31 chr3 62068852 62069287 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 4 of 29) intron (NM_002841, intron 4 of 29) 249878 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 199-29 chr15 58559962 58560193 + 1.33333 NA intron (NM_000236, intron 6 of 8) intron (NM_000236, intron 6 of 8) -61342 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 337.333-17 chr16 28165690 28166058 + 1.33333 NA intron (NM_001270940, intron 7 of 24) intron (NM_001270940, intron 7 of 24) 46091 NM_015171 23214 Hs.460468 NM_015171 ENSG00000169180 XPO6 EXP6|RANBP20 exportin 6 protein-coding 155.333-35 chr10 74981821 74981979 + 1.33333 NA exon (NM_012330, exon 11 of 18) exon (NM_012330, exon 11 of 18) -39833 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 195.666-9 chr11 19921741 19921947 + 1.33333 NA intron (NM_182964, intron 6 of 37) MIR|SINE|MIR -100712 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 337.333-4 chr10 56285843 56286155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 75260 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 196.667-121 chr5 60566045 60566307 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69890 NM_001364599 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 196.667-94 chr3 20201421 20201677 + 1.33333 NA Intergenic MER90|LTR|ERV1 -15316 NM_001199255 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 221.333-156 chr9 128595993 128596224 + 1.33333 NA intron (NM_003127, intron 24 of 55) AluJb|SINE|Alu 43521 NM_001130438 6709 Hs.372331 NM_003127 ENSG00000197694 SPTAN1 EIEE5|NEAS|SPTA2 spectrin alpha, non-erythrocytic 1 protein-coding 366.666-11 chr4 93049708 93050160 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 745535 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 368-10 chr17 61983452 61983907 + 1.33333 NA intron (NM_005121, intron 15 of 29) intron (NM_005121, intron 15 of 29) -55697 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 287-29 chr6 21244583 21244964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 267119 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 256.666-11 chr12 25011067 25011368 + 1.33333 NA intron (NM_001321724, intron 3 of 17) MIRb|SINE|MIR 13642 NM_001321724 645177 Hs.569157 NM_001321724 LOC645177 - uncharacterized LOC645177 protein-coding 346.666-9 chr2 152796420 152796815 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 77980 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 265.667-70 chr7 128214597 128215013 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 6933 NR_029596 406917 NR_029596 ENSG00000207705 MIR129-1 MIR-129b|MIRN129-1|mir-129-1 microRNA 129-1 ncRNA 163.333-248 chr6 134219351 134219544 + 1.33333 NA intron (NM_001143676, intron 2 of 13) intron (NM_001143676, intron 2 of 13) -41586 NM_001143677 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 233.666-3 chr10 23281679 23281862 + 1.33333 NA intron (NM_001365862, intron 8 of 15) intron (NM_001365862, intron 8 of 15) -62187 NR_155752 105376453 NR_155752 LOC105376453 - uncharacterized LOC105376453 ncRNA 154.666-10 chr4 133795829 133796000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 405875 NM_001114734 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 192-33 chr11 57096234 57096410 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 58788 NR_036445 219525 Hs.554519 NR_036445 ENSG00000283307 OR5AK4P PJCG3 olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene pseudo 350-34 chr6 124652893 124653219 + 1.33333 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) L1MC|LINE|L1 -309489 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 238-9 chr11 15789737 15790060 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 146013 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 205.333-189 chr5 97775733 97775984 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -64900 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 179.666-4 chr17 78010183 78010411 + 1.33333 NA intron (NM_018996, intron 2 of 20) intron (NM_018996, intron 2 of 20) 6060 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 157.667-40 chr10 105107997 105108212 + 1.33333 NA intron (NM_014978, intron 7 of 26) L2a|LINE|L2 -441888 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 230.666-45 chr6 126564652 126564854 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 80122 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 332.666-11 chr15 26977527 26977871 + 1.33333 NA intron (NM_001270873, intron 2 of 5) L1MD2|LINE|L1 6518 NM_033223 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 360.667-11 chr3 26998140 26998628 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 218139 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 270.333-17 chr12 114618952 114619280 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 65059 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 210.333-53 chr16 46391731 46391986 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 177239 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 209.333-5 chr1 60188945 60189153 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -115279 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 236-59 chr3 187126904 187127114 + 1.33333 NA intron (NM_052969, intron 2 of 2) intron (NM_052969, intron 2 of 2) 12487 NM_052969 116832 Hs.647900 NM_052969 ENSG00000163923 RPL39L L39-2|RPL39L1 ribosomal protein L39 like protein-coding 183.333-73 chr17 73669100 73669301 + 1.33333 NA Intergenic (TAATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -24755 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 175.666-2 chr10 83697266 83697444 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20266 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 206.333-31 chr12 24057350 24057635 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -106460 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 279-7 chr10 108849431 108849842 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -780343 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 222-65 chr3 183015089 183015386 + 1.33333 NA TTS (NM_020166) TTS (NM_020166) -29319 NM_001308101 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 199.666-10 chr11 91159978 91160258 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -290916 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 174-30 chr14 45173103 45173282 + 1.33333 NA exon (NM_020937, exon 13 of 23) exon (NM_020937, exon 13 of 23) 37253 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 201-48 chr18 25544913 25545196 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -192888 NM_001308225 25925 Hs.116935 NM_015461 ENSG00000198795 ZNF521 EHZF|Evi3 zinc finger protein 521 protein-coding 254.666-20 chr22 39904844 39905122 + 1.33333 NA intron (NM_004810, intron 1 of 7) L1MC5|LINE|L1 3899 NM_004810 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 191.333-176 chr6 73562401 73562584 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41460 NM_001402 1915 Hs.535192 NM_001402 ENSG00000156508 EEF1A1 CCS-3|CCS3|EE1A1|EEF-1|EEF1A|EF-Tu|EF1A|GRAF-1EF|HNGC:16303|LENG7|PTI1|eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 protein-coding 223.333-92 chr20 35416488 35416720 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -4462 NM_199487 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 187.333-181 chr6 155626529 155626767 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 111804 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 166.667-72 chr14 82570486 82570710 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -72034 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 324.666-7 chr15 67754363 67754791 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 19 of 21) L2c|LINE|L2 -70932 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 201-52 chr2 63899781 63899993 + 1.33333 NA intron (NM_001005739, intron 20 of 22) MIR|SINE|MIR 58007 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 306.333-44 chr9 34309962 34310468 + 1.33333 NA intron (NM_194313, intron 2 of 12) intron (NM_194313, intron 2 of 12) 19053 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 221.333-124 chr6 66226323 66226637 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 438601 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 181.333-42 chr14 30412892 30413073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -146141 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 223.333-23 chr11 63943960 63944149 + 1.33333 NA intron (NM_001300800, intron 1 of 7) intron (NM_001300800, intron 1 of 7) 4723 NM_001300800 79829 Hs.523753 NM_024771 ENSG00000110583 NAA40 NAT11|NatD|PATT1|hNatD N(alpha)-acetyltransferase 40, NatD catalytic subunit protein-coding 215.333-198 chr8 88748182 88748355 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -420785 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 244-63 chr20 39880448 39880653 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -123911 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 194.333-16 chr1 239356065 239356424 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30324 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 206-147 chr5 144636960 144637251 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 431714 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 284-7 chr11 24812479 24812890 + 1.33333 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 315631 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 236-52 chr3 25018679 25018959 + 1.33333 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) intron (NM_001290216, intron 2 of 10) 189496 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 320-11 chr13 25048070 25048416 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -47895 NM_030979 5042 Hs.458280 NM_030979 ENSG00000151846 PABPC3 PABP3|PABPL3|tPABP poly(A) binding protein cytoplasmic 3 protein-coding 212.333-118 chr5 89985654 89985817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30985 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 204.333-170 chr6 19813790 19814034 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9153 NR_134651 100506885 Hs.346489 NR_134649 ENSG00000228412 LOC100506885 - uncharacterized LOC100506885 ncRNA 210.667-37 chr13 88017659 88017956 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -125060 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 333-11 chr2 44852104 44852687 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 86493 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 224-88 chr6 108122928 108123155 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_145458) promoter-TSS (NR_145458) -592 NR_145458 100287366 Hs.221513 NR_145458 ENSG00000225174 OSTM1-AS1 - OSTM1 antisense RNA 1 ncRNA 220.333-62 chr2 47216659 47216969 + 1.33333 NA intron (NR_110207, intron 2 of 2) LTR32|LTR|ERVL -39878 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 356.666-19 chr8 107977198 107977831 + 1.33333 NA intron (NM_001282863, intron 2 of 4) intron (NM_001282863, intron 2 of 4) 104425 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 178-98 chr5 165826397 165826532 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 1099906 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 328.666-2 chr10 58772741 58773081 + 1.33333 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) intron (NM_001080512, intron 3 of 20) 57896 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 221.666-33 chr2 182974600 182974810 + 1.33333 NA intron (NM_013436, intron 15 of 30) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 63752 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 331.666-3 chr10 72760100 72760559 + 1.33333 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) AluJo|SINE|Alu 39300 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 176-79 chr5 169847019 169847200 + 1.33333 NA intron (NR_156756, intron 27 of 52) L1PB3|LINE|L1 133386 NM_001129891 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 213.333-18 chr10 18452244 18452415 + 1.33333 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) AluJr|SINE|Alu 51754 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 270.333-15 chr12 10359205 10359647 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -4343 NR_120430 101928100 Hs.638425 NR_120430 ENSG00000245648 LOC101928100 - uncharacterized LOC101928100 ncRNA 237.333-20 chr11 65520888 65521114 + 1.33333 NA Intergenic AluSq10|SINE|Alu -4082 NM_001048218 57410 Hs.238839 NM_020680 ENSG00000142186 SCYL1 GKLP|HT019|NKTL|NTKL|P105|SCAR21|TAPK|TEIF|TRAP SCY1 like pseudokinase 1 protein-coding 224.666-31 chr5 128081626 128081828 + 1.33333 NA intron (NR_152805, intron 1 of 3) intron (NR_152805, intron 1 of 3) 1448 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 116.333-55 chr13 30291640 30291734 + 1.33333 NA intron (NM_032116, intron 1 of 10) L1MD|LINE|L1 15324 NM_001014380 84056 Hs.243596 NM_032116 ENSG00000102781 KATNAL1 - katanin catalytic subunit A1 like 1 protein-coding 215.333-107 chr2 211928835 211929148 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) intron (NM_001042599, intron 3 of 26) 497369 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 215.333-2 chr1 46632632 46632959 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15904 NM_201403 148932 Hs.632401 NM_145279 ENSG00000142961 MOB3C MOB1E|MOBKL2C MOB kinase activator 3C protein-coding 211.333-231 chr8 69616962 69617156 + 1.33333 NA intron (NR_156414, intron 12 of 20) (AGAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 24159 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 248.666-33 chr5 133166343 133166645 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 114481 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 180-64 chr3 24509008 24509247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13419 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 185.666-9 chr14 85869331 85869540 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -65243 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 234.666-16 chr14 50149636 50149930 + 1.33333 NA intron (NM_006939, intron 14 of 22) intron (NM_006939, intron 14 of 22) -33211 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 226-97 chrX 88120714 88121050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 603080 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 321.999 chr11 99590885 99591148 + 1.33333 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 34871 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 235-54 chr9 102275750 102276038 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -243743 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 248-12 chr11 56547059 56547309 + 1.33333 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 -3927 NM_001005245 219487 Hs.553632 NM_001005245 ENSG00000255223 OR5M11 OR11-199 olfactory receptor family 5 subfamily M member 11 protein-coding 199-20 chr12 58526885 58527198 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -64661 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 275-14 chr16 23039593 23039968 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109490 NM_020718 57478 Hs.183817 NM_020718 ENSG00000103404 USP31 - ubiquitin specific peptidase 31 protein-coding 268.333 chr1 61536216 61536433 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -117918 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 250-2 chr1 81344708 81344931 + 1.33333 NA intron (NM_001366003, intron 2 of 27) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 38424 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 121.666-4 chr2 63029356 63029455 + 1.33333 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) L2c|LINE|L2 18306 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 263.333-81 chr8 74200462 74200673 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120794 NM_001363050 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 293.333-40 chr22 27182473 27182943 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4808 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 233-41 chr2 234796024 234796377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113532 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 205.333-191 chr5 128755030 128755189 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -210018 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 344.666-2 chr1 79470769 79471193 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -464251 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 292.333-21 chr2 34426514 34426952 + 1.33333 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -250824 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 214-37 chr14 83553021 83553213 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 910485 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 168.666-13 chr3 35351151 35351294 + 1.33333 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) intron (NR_110817, intron 1 of 3) 42801 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 200-163 chr8 23701000 23701172 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5512 NM_001136271 137814 Hs.532654 NM_001136271 ENSG00000180053 NKX2-6 CSX2|CTHM|NKX2F|NKX4-2 NK2 homeobox 6 protein-coding 188.333-34 chr12 37303467 37303622 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -1013230 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 209.333-138 chr21 27229183 27229369 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -262188 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 134.667-102 chr2 99591978 99592171 + 1.33333 NA intron (NM_001025108, intron 14 of 23) intron (NM_001025108, intron 14 of 23) -102057 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 209.999 chr11 58689151 58689339 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42698 NM_201648 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 370-18 chr3 174184530 174184849 + 1.33333 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) -263893 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 227.666-26 chr5 37226022 37226264 + 1.33333 NA intron (NM_023073, intron 12 of 51) L1MB7|LINE|L1 -22903 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 222.667-62 chr4 37369324 37369672 + 1.33333 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -84427 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 222-38 chr18 12373800 12373994 + 1.33333 NA intron (NM_006796, intron 1 of 16) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 3379 NM_006796 10939 Hs.726355 NM_006796 ENSG00000141385 AFG3L2 SCA28|SPAX5 AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2 protein-coding 143.333-89 chr14 66949779 66949983 + 1.33333 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) intron (NM_020806, intron 8 of 22) -239559 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 204.666-58 chr3 122310006 122310200 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -15145 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 153-78 chr2 161384469 161384743 + 1.33333 NA intron (NM_005805, intron 7 of 11) intron (NM_005805, intron 7 of 11) -31691 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 253.333-19 chr12 120884843 120885141 + 1.33333 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) intron (NM_139015, intron 1 of 10) 19366 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 169.333-157 chr3 29545107 29545260 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) L1ME4a|LINE|L1 263871 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 333.333 chr1 14538273 14538751 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -60173 NM_001370230 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 244.667-75 chr4 131327335 131327642 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -437350 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 219-39 chr17 67693383 67693697 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_012417, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_012417, exon 9 of 9) -24293 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 187.333-58 chr14 23177937 23178109 + 1.33333 NA intron (NM_012244, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 5637 NM_012244 23428 Hs.596643 NM_012244 ENSG00000092068 SLC7A8 LAT2|LPI-PC1 solute carrier family 7 member 8 protein-coding 140.667-251 chr9 95135366 95135517 + 1.33333 NA exon (NM_000136, exon 8 of 15) exon (NM_000136, exon 8 of 15) -49347 NR_036109 100422842 NR_036109 ENSG00000207617 MIR3074 mir-3074 microRNA 3074 ncRNA 440.666 chr1 59481964 59482465 + 1.33333 NA intron (NM_001350794, intron 6 of 14) intron (NM_001350794, intron 6 of 14) -33416 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 319-32 chr8 124551686 124552085 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001363302, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001363302, exon 13 of 13) 12762 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 187-70 chr6 39755745 39755953 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -30426 NM_001351503 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 146.667-342 chr8 133155019 133155172 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35944 NM_080838 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 310.666-10 chr2 64871231 64871545 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7757 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 320.333-6 chr13 105600642 105601204 + 1.33333 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -95242 NR_040247 282706 Hs.558713 NR_040247 ENSG00000232307 DAOA-AS1 DAOA-AS|DAOAAS|G30 DAOA antisense RNA 1 ncRNA 218-46 chr2 42251574 42251776 + 1.33333 NA intron (NM_001145076, intron 2 of 21) intron (NM_001145076, intron 2 of 21) -81444 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 153.333-78 chr12 942097 942284 + 1.33333 NA intron (NR_123713, intron 1 of 13) L1M5|LINE|L1 7504 NM_134424 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 145.333-123 chr18 72151279 72151481 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -369154 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 375.333-14 chr2 205002567 205003081 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 3 of 21) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 457349 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 205.333-207 chr6 86036893 86037115 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -358271 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 220-121 chr8 90103366 90103642 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -20625 NM_004929 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 128.666 chr12 1158816 1158931 + 1.33333 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) HAL1b|LINE|L1 131125 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 262.333-59 chr3 136265038 136265248 + 1.33333 NA intron (NM_000532, intron 5 of 14) AluSg7|SINE|Alu 14803 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 147.333-165 chr2 41486567 41486792 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -390876 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 246-5 chr1 166946589 166946847 + 1.33333 NA intron (NM_199351, intron 3 of 9) MIR3|SINE|MIR 28822 NM_199351 387597 Hs.444835 NM_199351 ENSG00000143195 ILDR2 C1orf32|dJ782G3.1 immunoglobulin like domain containing receptor 2 protein-coding 211-57 chr21 37089694 37089861 + 1.33333 NA intron (NM_003316, intron 5 of 45) AluSx1|SINE|Alu 6830 NM_003316 7267 Hs.368214 NM_003316 ENSG00000182670 TTC3 DCRR1|RNF105|TPRDIII tetratricopeptide repeat domain 3 protein-coding 197.333-76 chr16 11664390 11664603 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3959 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 176.667-144 chr8 78451646 78451860 + 1.33333 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -64587 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 201-30 chr12 62750731 62750983 + 1.33333 NA intron (NM_020700, intron 4 of 9) intron (NM_020700, intron 4 of 9) 147171 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 242.333-104 chr9 82725188 82725449 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 337824 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 208-162 chr8 18545652 18545913 + 1.33333 NA intron (NM_015310, intron 15 of 15) intron (NM_015310, intron 15 of 15) 154500 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 213.333-26 chr10 43004508 43004810 + 1.33333 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL 7096 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 202-40 chr13 108349403 108349648 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 79896 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 318.333-13 chr14 69959849 69960304 + 1.33333 NA intron (NM_001034852, intron 3 of 11) intron (NM_001034852, intron 3 of 11) -18057 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 309.999-3 chr2 234536973 234537236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40023 NM_001282431 10123 Hs.111554 NM_005737 ENSG00000188042 ARL4C ARL7|LAK ADP ribosylation factor like GTPase 4C protein-coding 214-90 chr3 114659846 114660014 + 1.33333 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) -34985 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 252.667-81 chr5 62380365 62380698 + 1.33333 NA intron (NM_001098511, intron 19 of 20) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 23374 NM_014473 27292 Hs.731665 NM_014473 ENSG00000086189 DIMT1 DIM1|DIMT1L|HSA9761|HUSSY5 DIMT1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor protein-coding 203-11 chr10 30931661 30931867 + 1.33333 NA intron (NM_001143771, intron 2 of 7) intron (NM_001143771, intron 2 of 7) 67753 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 219-61 chr3 111217109 111217323 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 145400 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 200-67 chr17 38980870 38981062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13563 NM_001008777 494188 Hs.549536 NM_001008777 ENSG00000204952 FBXO47 - F-box protein 47 protein-coding 203.666-44 chr4 94283105 94283347 + 1.33333 NA exon (NM_020159, exon 22 of 24) exon (NM_020159, exon 22 of 24) 29917 NM_001254949 56916 Hs.410406 NM_020159 ENSG00000163104 SMARCAD1 ADERM|BASNS|ETL1|HEL1|HRZ SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 protein-coding 198.666-75 chr5 31980132 31980311 + 1.33333 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) L1MB7|LINE|L1 -44062 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 212-20 chr10 10837252 10837488 + 1.33333 NA intron (NM_001326327, intron 1 of 14) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 38645 NM_001326326 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 336.333-17 chr2 20788411 20788818 + 1.33333 NA intron (NM_001282722, intron 1 of 4) intron (NM_001282722, intron 1 of 4) 34487 NM_021925 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 189.666-34 chr4 113347895 113348089 + 1.33333 NA intron (NM_001354274, intron 34 of 42) intron (NM_001354274, intron 34 of 42) 55153 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 212.333-129 chr6 131244530 131244863 + 1.33333 NA intron (NM_016377, intron 7 of 7) intron (NM_016377, intron 7 of 7) -5708 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 195-74 chr3 114935072 114935237 + 1.33333 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) intron (NM_001348805, intron 3 of 10) -34529 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 307.333-11 chr10 30436703 30437008 + 1.33333 NA intron (NM_001320961, intron 1 of 7) intron (NM_001320961, intron 1 of 7) 2209 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 203.333-242 chr7 25926139 25926367 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23733 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 395.333-2 chr1 116519752 116520227 + 1.33333 NA intron (NR_026665, intron 4 of 5) intron (NR_026665, intron 4 of 5) 40122 NR_039621 100616384 NR_039621 ENSG00000264419 MIR548AC - microRNA 548ac ncRNA 297.333-46 chr6 44144868 44145145 + 1.33333 NA intron (NM_001318792, intron 10 of 23) AluSg4|SINE|Alu -13814 NM_007058 11131 Hs.225953 NM_007058 ENSG00000137225 CAPN11 calpain11 calpain 11 protein-coding 143.333-8 chr1 71828321 71828531 + 1.33333 NA intron (NR_046218, intron 1 of 2) intron (NR_046218, intron 1 of 2) 8586 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 208-55 chr15 67328224 67328459 + 1.33333 NA intron (NM_001322475, intron 3 of 17) intron (NM_001322475, intron 3 of 17) -73143 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 205.333-43 chr11 16985897 16986054 + 1.33333 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) L2c|LINE|L2 28439 NM_175058 144100 Hs.12332 NM_175058 ENSG00000166689 PLEKHA7 - pleckstrin homology domain containing A7 protein-coding 231.333-53 chr18 62249504 62249787 + 1.33333 NA intron (NR_144409, intron 12 of 31) intron (NR_144409, intron 12 of 31) 62390 NR_144406 57614 Hs.465323 NM_020854 ENSG00000134444 RELCH HsT3308|HsT885|KIAA1468 RAB11 binding and LisH domain, coiled-coil and HEAT repeat containing protein-coding 428-7 chr3 158250672 158251273 + 1.33333 NA intron (NM_001271838, intron 4 of 9) L1MA3|LINE|L1 140883 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 239.666-18 chr2 112236268 112236532 + 1.33333 NA intron (NM_032494, intron 4 of 8) intron (NM_032494, intron 4 of 8) 18642 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 162.667-210 chr5 27395301 27395452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -76916 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 181-61 chr5 116604044 116604226 + 1.33333 NA intron (NR_147170, intron 2 of 2) intron (NR_147170, intron 2 of 2) -29312 NM_001300780 57556 Hs.156967 NM_020681 ENSG00000092421 SEMA6A HT018|SEMA|SEMA6A1|SEMAQ|VIA semaphorin 6A protein-coding 236-56 chr3 98748424 98748648 + 1.33333 NA intron (NM_001323366, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu -14771 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 191-76 chr8 98775017 98775211 + 1.33333 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) intron (NM_001256312, intron 3 of 12) 50557 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 280.333-34 chr5 88197224 88197614 + 1.33333 NA intron (NM_001349403, intron 10 of 10) intron (NM_001349403, intron 10 of 10) 71426 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 342-3 chr11 104261218 104261697 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -97310 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 221.333-51 chr18 62476176 62476474 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -46700 NM_017742 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 235.666-6 chr17 29236557 29236798 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10180 NM_005208 1411 Hs.46275 NM_005208 ENSG00000108255 CRYBA1 CRYB1|CTRCT10 crystallin beta A1 protein-coding 163-91 chr9 31732320 31732535 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -350937 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 352-16 chr2 64794350 64794758 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 69077 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 381.666-6 chr2 123454080 123454720 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -380919 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 346.333-15 chr17 73962794 73963304 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -134512 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 188.333-79 chr2 139656348 139656576 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 759138 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 336-11 chr15 90691536 90691827 + 1.33333 NA intron (NR_120372, intron 2 of 3) intron (NR_120372, intron 2 of 3) 25459 NR_120372 101926895 Hs.564760 NR_120372 ENSG00000259736 CRTC3-AS1 - CRTC3 antisense RNA 1 ncRNA 410.333-3 chr14 55044943 55045295 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_080867, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_080867, exon 2 of 2) -6528 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 209.333-8 chr1 109449088 109449424 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17290 NM_001040709 284612 Hs.528366 NM_001006603 ENSG00000143028 SYPL2 MG29 synaptophysin like 2 protein-coding 249.333-36 chr15 71870549 71870848 + 1.33333 NA intron (NM_006901, intron 32 of 41) MER2B|DNA|TcMar-Tigger 60144 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 211-34 chr14 62035697 62036003 + 1.33333 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) intron (NM_001367661, intron 4 of 8) -81507 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 281.999 chr17 61374820 61375215 + 1.33333 NA intron (NM_001099432, intron 24 of 24) intron (NM_001099432, intron 24 of 24) -7313 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 220-115 chr7 156474250 156474487 + 1.33333 NA intron (NR_103858, intron 1 of 1) intron (NR_103858, intron 1 of 1) -28780 NR_038232 285889 Hs.407095 NR_038232 ENSG00000182648 LOC285889 - uncharacterized LOC285889 ncRNA 234-64 chr7 26960276 26960488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95792 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 162.666-15 chrX 78968060 78968213 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 22745 NM_001324221 27334 Hs.296433 NM_014499 ENSG00000078589 P2RY10 LYPSR2|P2Y10 P2Y receptor family member 10 protein-coding 194.666-46 chr3 186112514 186112726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3531 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 345-15 chr5 116468789 116469221 + 1.33333 NA intron (NM_020796, intron 17 of 18) intron (NM_020796, intron 17 of 18) 21507 NR_109879 101927233 Hs.732850 NR_109879 ENSG00000248445 SEMA6A-AS1 CTB-118N6.3 SEMA6A antisense RNA 1 ncRNA 221.666-51 chr6 127324447 127324661 + 1.33333 NA intron (NM_001002030, intron 3 of 5) L1MC3|LINE|L1 17853 NM_001139510 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 350-21 chr4 46852980 46853384 + 1.33333 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 56063 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 356-4 chr10 31002463 31002927 + 1.33333 NA intron (NM_001143766, intron 1 of 7) intron (NM_001143766, intron 1 of 7) -3178 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 263-63 chr7 20758622 20758975 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 28088 NM_182700 221833 Hs.195922 NM_182700 ENSG00000164651 SP8 BTD Sp8 transcription factor protein-coding 151-115 chr6 62671984 62672147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -385838 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 198-20 chr10 82612685 82612964 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -379904 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 289.333-65 chr8 120112464 120112804 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12468 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 206.666-111 chr7 48658271 48658452 + 1.33333 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL -266186 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 218.667-31 chr14 87407371 87407678 + 1.33333 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 247770 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 206-49 chr13 60543574 60543810 + 1.33333 NA intron (NM_030794, intron 12 of 13) intron (NM_030794, intron 12 of 13) -129263 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 210-3 chr1 62837154 62837402 + 1.33333 NA intron (NM_178221, intron 9 of 10) intron (NM_178221, intron 9 of 10) 53146 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 299.333-30 chr17 60371655 60371929 + 1.33333 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) intron (NM_032582, intron 1 of 33) 20341 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 165.333-45 chr11 81474346 81474492 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 416417 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 184.666-30 chr5 173074355 173074506 + 1.33333 NA intron (NM_001168393, intron 1 of 3) intron (NM_001168393, intron 1 of 3) 18078 NM_001168393 153222 Hs.484195 NM_153607 ENSG00000164463 CREBRF C5orf41|LRF CREB3 regulatory factor protein-coding 364-19 chr4 44540733 44541332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92223 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 340.667-11 chr2 138526568 138527030 + 1.33333 NA intron (NM_001001664, intron 1 of 10) AluSx1|SINE|Alu 25029 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 357.333-22 chr7 93052609 93053281 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65034 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 144.333-236 chr6 124294216 124294424 + 1.33333 NA intron (NM_001040214, intron 2 of 6) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 11315 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 239.999-3 chr17 76366055 76366244 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -11951 NM_001366236 5635 Hs.77498 NM_002766 ENSG00000161542 PRPSAP1 PAP39 phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 1 protein-coding 207.333-98 chr15 43934498 43934773 + 1.33333 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) -56464 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 333.333-53 chr9 111496473 111497006 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12356 NM_001363756 23392 Hs.368255 NM_001080398 ENSG00000136813 ECPAS ECM29|KIAA0368 Ecm29 proteasome adaptor and scaffold protein-coding 214.666-56 chr6 4686443 4686703 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -19565 NM_001368125 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 306-21 chr17 3353023 3353467 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 43000 NR_024128 390756 Hs.632245 NM_001005334 ENSG00000180068 OR3A4P OLFRA05|OLFRA06|OR17-13|OR17-16|OR17-24|OR17-25|OR24|OR25|OR3A4|OR3A5P olfactory receptor family 3 subfamily A member 4 pseudogene pseudo 205.333-46 chr11 74352472 74352743 + 1.33333 NA intron (NM_173582, intron 5 of 13) intron (NM_173582, intron 5 of 13) -40967 NM_182904 283208 Hs.660541 NM_182904 ENSG00000149380 P4HA3 - prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 3 protein-coding 180-107 chr8 48777192 48777391 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41980 NR_157026 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 380.999-2 chr2 128171375 128171788 + 1.33333 NA intron (NR_027671, intron 28 of 40) AluSz|SINE|Alu 80381 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 202-67 chr18 3264798 3264976 + 1.33333 NA intron (NM_001144945, intron 1 of 3) L1ME2|LINE|L1 2168 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 415.666-7 chr7 110005692 110006084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45675 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 184.666-36 chr6 132092899 132093093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22267 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 218.333-17 chr10 118039249 118039555 + 1.33333 NA exon (NM_001330167, exon 3 of 6) exon (NM_001330167, exon 3 of 6) -7419 NR_026940 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 116.333-34 chr10 65795718 65795887 + 1.33333 NA Intergenic LTR24C|LTR|ERV1 224377 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 230.666-16 chr13 94366665 94367062 + 1.33333 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) intron (NM_005708, intron 6 of 8) 112819 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 183-30 chr13 25193359 25193520 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12107 NR_120427 102723318 Hs.549877 NR_120427 LINC01053 - long intergenic non-protein coding RNA 1053 ncRNA 239.333-48 chr19 50863048 50863340 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 8279 NM_001648 354 Hs.171995 NM_001648 ENSG00000142515 KLK3 APS|KLK2A1|PSA|hK3 kallikrein related peptidase 3 protein-coding 194.666-11 chr12 13170236 13170670 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -26273 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 205.666-18 chr14 87644681 87644837 + 1.33333 NA intron (NR_146551, intron 1 of 2) intron (NR_146551, intron 1 of 2) 10535 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 161.667-145 chr2 202658275 202658529 + 1.33333 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu 23433 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 147.333-337 chrX 37411677 37411863 + 1.33333 NA intron (NM_000950, intron 3 of 4) intron (NM_000950, intron 3 of 4) 62406 NM_001142395 5638 Hs.190341 NM_000950 ENSG00000130962 PRRG1 PRGP1 proline rich and Gla domain 1 protein-coding 125.333-153 chr6 40139700 40139927 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205351 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 150.333-287 chr4 5087248 5087472 + 1.33333 NA intron (NM_001306082, intron 1 of 12) L1MB7|LINE|L1 35880 NM_001306082 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 150.667-237 chr3 39564790 39564988 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 62823 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 212-90 chr2 134567966 134568266 + 1.33333 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 150884 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 195.333-200 chr7 43543184 43543438 + 1.33333 NA intron (NM_001287059, intron 24 of 27) intron (NM_001287059, intron 24 of 27) -20769 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 192.666-57 chr6 131191383 131191581 + 1.33333 NA intron (NM_016377, intron 5 of 7) intron (NM_016377, intron 5 of 7) 56015 NM_016377 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 290-53 chr8 117466165 117466546 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54358 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 394.999 chr13 87169508 87170014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 257841 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 231.666-9 chr14 50460605 50461002 + 1.33333 NA intron (NM_198794, intron 13 of 31) MIR|SINE|MIR -63505 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 536.333-2 chr5 18422922 18423467 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 615920 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 173.333-107 chr21 21189137 21189315 + 1.33333 NA intron (NM_001352597, intron 1 of 10) intron (NM_001352597, intron 1 of 10) 42064 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 194.666-39 chr20 15875152 15875377 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 9 of 17) intron (NM_001351663, intron 9 of 17) 48050 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 217.666-35 chr7 20856197 20856578 + 1.33333 NA intron (NR_126381, intron 1 of 5) intron (NR_126381, intron 1 of 5) 20956 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 361.666-9 chr8 137976375 137976951 + 1.33333 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) L1MEf|LINE|L1 106882 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 381.333-14 chr20 41380786 41381197 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14173 NM_052846 90187 Hs.726525 NM_052846 ENSG00000183798 EMILIN3 C20orf130|EMILIN5|dJ620E11.4 elastin microfibril interfacer 3 protein-coding 179.333-182 chr8 13528502 13528810 + 1.33333 NA intron (NM_001348082, intron 1 of 16) UCON84|Unknown|Unknown -13805 NM_024767 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 207-96 chr5 36452850 36453087 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -151066 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 231.333-57 chr2 48577157 48577426 + 1.33333 NA intron (NM_172311, intron 1 of 10) L1MB1|LINE|L1 -3296 NM_001198594 286749 Hs.732016 NM_172311 ENSG00000068781 STON1-GTF2A1L ALF|GTF2A1L|GTF2A1LF|SALF STON1-GTF2A1L readthrough protein-coding 272-52 chr8 84149878 84150223 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -32737 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 200-18 chr10 48767255 48767489 + 1.33333 NA intron (NM_020945, intron 13 of 61) intron (NM_020945, intron 13 of 61) 81909 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 213.666-24 chr2 215250861 215251116 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61071 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 295-23 chr2 74295838 74296131 + 1.33333 NA intron (NM_133478, intron 7 of 30) LTR85b|LTR|Gypsy? 19041 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 164.333-81 chr16 3707412 3707588 + 1.33333 NA intron (NM_016292, intron 1 of 17) intron (NM_016292, intron 1 of 17) 10024 NM_001272049 10131 Hs.30345 NM_016292 ENSG00000126602 TRAP1 HSP 75|HSP75|HSP90L|TRAP-1 TNF receptor associated protein 1 protein-coding 326-6 chr1 201980624 201980987 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1843 NM_020216 6051 Hs.497391 NM_020216 ENSG00000176393 RNPEP AP-B|APB arginyl aminopeptidase protein-coding 355.333-14 chr2 88288611 88289015 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 115674 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 312-29 chr3 2393102 2393563 + 1.33333 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 154503 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 207.666-63 chr8 22173717 22173924 + 1.33333 NA intron (NR_033404, intron 2 of 15) intron (NR_033404, intron 2 of 15) 8448 NR_033404 649 Hs.1274 NM_001199 ENSG00000168487 BMP1 OI13|PCOLC|PCP|PCP2|TLD bone morphogenetic protein 1 protein-coding 194.666-30 chr18 23258029 23258258 + 1.33333 NA non-coding (NR_023359, exon 7 of 7) non-coding (NR_023359, exon 7 of 7) 102318 NM_138375 91768 Hs.11108 NM_138375 ENSG00000134508 CABLES1 CABL1|CABLES|HsT2563|IK3-1 Cdk5 and Abl enzyme substrate 1 protein-coding 362.666-10 chr3 178033506 178033887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 216831 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 213.333-38 chr12 15628523 15628691 + 1.33333 NA intron (NM_004447, intron 18 of 20) intron (NM_004447, intron 18 of 20) 81996 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 203.666-38 chr3 8889025 8889285 + 1.33333 NA intron (NM_020165, intron 12 of 12) intron (NM_020165, intron 12 of 12) 74317 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 158-130 chr7 72173278 72173434 + 1.33333 NA intron (NM_001363460, intron 2 of 5) L1ME1|LINE|L1 164035 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 216-78 chr3 79441902 79442210 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) 30329 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 209-41 chr14 31512603 31512884 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -24704 NM_001197184 2856 Hs.727479 NM_001197184 ENSG00000214943 GPR33 - G protein-coupled receptor 33 (gene/pseudogene) protein-coding 146.667-15 chr1 107156907 107157096 + 1.33333 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) MER112|DNA|hAT-Charlie 8932 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 207.333-226 chr5 130885796 130886091 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 279313 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 213-34 chr18 77808240 77808407 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 185404 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 171.333-98 chr2 181551522 181551702 + 1.33333 NA intron (NM_001030312, intron 2 of 9) L1PA8A|LINE|L1 94226 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 197.333-114 chr2 83653633 83653837 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 130921 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 197.333-186 chr5 94996306 94996517 + 1.33333 NA intron (NM_001297777, intron 2 of 19) intron (NM_001297777, intron 2 of 19) 85455 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 268.667-56 chr5 179763030 179763395 + 1.33333 NA intron (NM_014757, intron 1 of 4).2 intron (NM_014757, intron 1 of 4).2 30390 NM_014757 9794 Hs.631951 NM_014757 ENSG00000161021 MAML1 Mam-1|Mam1 mastermind like transcriptional coactivator 1 protein-coding 244.333-50 chr17 34833717 34833962 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 127621 NM_001193529 10693 Hs.73072 NM_006584 ENSG00000132141 CCT6B CCT-zeta-2|CCTZ-2|Cctz2|TCP-1-zeta-2|TSA303 chaperonin containing TCP1 subunit 6B protein-coding 293.333-39 chr21 28191110 28191383 + 1.33333 NA intron (NR_126012, intron 3 of 5) L1M6|LINE|L1 37421 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 234-70 chr8 84519879 84520145 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 104528 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 244-92 chr7 32484253 32484547 + 1.33333 NA TTS (NM_001130710) TTS (NM_001130710) 5980 NR_024466 23658 Hs.424908 NM_012322 ENSG00000106355 LSM5 YER146W LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 222.333-55 chr21 34104363 34104643 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_006933, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_006933, exon 2 of 2) 30925 NM_006933 6526 Hs.302742 NM_006933 ENSG00000198743 SLC5A3 BCW2|SMIT|SMIT1|SMIT2 solute carrier family 5 member 3 protein-coding 221.333-47 chr17 64056613 64056789 + 1.33333 NA intron (NM_001433, intron 12 of 21) intron (NM_001433, intron 12 of 21) -36067 NM_001099788 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 336-2 chr1 73997425 73997911 + 1.33333 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 200508 NM_001105659 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 300.333-32 chr3 88686577 88686842 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 348253 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 192-49 chr13 88008732 88008977 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -134013 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 252.333-9 chr10 65200513 65200887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -276182 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 209.667-92 chr5 26627017 26627313 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 411421 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 435-4 chr4 30282136 30282607 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -437998 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 208-58 chr15 99392983 99393266 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 135599 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 188.667-107 chr3 178097195 178097454 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 280459 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 141.666-5 chr3 14013791 14013967 + 1.33333 NA intron (NR_002223, intron 1 of 2) L1PB1|LINE|L1 76572 NR_002223 348825 Hs.529180 NR_002223 ENSG00000180438 TPRXL TPRX3P tetrapeptide repeat homeobox like pseudo 202.667-121 chr5 112176336 112176600 + 1.33333 NA intron (NM_001347887, intron 18 of 23) L2|LINE|L2 14983 NR_002922 654322 Hs.689709 NR_002922 ENSG00000238363 SNORA13 ACA13 small nucleolar RNA, H/ACA box 13 snoRNA 375.333-17 chr3 79751879 79752343 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 15887 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 273.333-53 chr4 129467162 129467381 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 304207 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 184.667-35 chr15 47492215 47492456 + 1.33333 NA intron (NM_001198999, intron 3 of 19) intron (NM_001198999, intron 3 of 19) -225170 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 241.333-76 chr4 101493307 101493623 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 145688 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 339.667-22 chr6 70361493 70361903 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32504 NR_125857 101928353 NR_125857 EVADR - uncharacterized LOC101928353 ncRNA 302.333-27 chr4 70987300 70987854 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001244766, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001244766, exon 7 of 7) -6072 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 180.666-23 chr3 119885454 119885686 + 1.33333 NA intron (NM_002093, intron 7 of 11) L1PA16|LINE|L1 102860 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 211.666-54 chrX 14118834 14119052 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89051 NM_017856 54960 Hs.592237 NM_017856 ENSG00000046647 GEMIN8 FAM51A1 gem nuclear organelle associated protein 8 protein-coding 215-56 chr3 37327319 37327603 + 1.33333 NA exon (NM_002078, exon 14 of 24) exon (NM_002078, exon 14 of 24) -58808 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 248-79 chr7 96017214 96017516 + 1.33333 NA intron (NM_004411, intron 10 of 16) intron (NM_004411, intron 10 of 16) 202391 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 186.666-45 chr6 62323886 62324066 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37749 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 208.666-104 chr8 16311944 16312128 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119245 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 266.999-4 chr5 3089845 3090156 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -87835 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 200-162 chr7 109763751 109764081 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 196297 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 247-67 chr6 102330596 102330980 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 931803 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 249.333-81 chr5 14900310 14900627 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -28690 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 251.333-105 chr8 41986664 41987030 + 1.33333 NA intron (NM_001305878, intron 3 of 13) AluSx1|SINE|Alu -64903 NR_136589 105379393 Hs.742878 NR_136589 LOC105379393 - uncharacterized LOC105379393 ncRNA 265.333-78 chr7 81625530 81625793 + 1.33333 NA intron (NR_126025, intron 1 of 10) intron (NR_126025, intron 1 of 10) 555 NR_126026 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 253.333-112 chr8 116862481 116862816 + 1.33333 NA intron (NM_006265, intron 3 of 13) intron (NM_006265, intron 3 of 13) -11776 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 204-79 chr17 58802795 58803090 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1M3|LINE|L1 47073 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 316 chr1 82194622 82195035 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 392375 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 328.666-10 chr2 133455388 133455692 + 1.33333 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 112923 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 185.333-38 chr12 5006701 5006918 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -37070 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 364.333-3 chr1 153126807 153127269 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -13522 NM_001014450 6705 Hs.490252 NM_001014450 ENSG00000244094 SPRR2F - small proline rich protein 2F protein-coding 296.333-20 chr2 38573700 38574160 + 1.33333 NA intron (NM_138394, intron 7 of 12) intron (NM_138394, intron 7 of 12) 28998 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 404-17 chr6 163563607 163564125 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_206855, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_206855, exon 6 of 6) 107618 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 201.666-44 chr8 87452545 87452718 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 421384 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 245.666-15 chr3 56049992 56050227 + 1.33333 NA intron (NR_132749, intron 7 of 17) L1ME1|LINE|L1 -197515 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 211.666-18 chr16 84723973 84724253 + 1.33333 NA intron (NM_001272075, intron 2 of 14) intron (NM_001272075, intron 2 of 14) 24113 NM_005153 9100 Hs.136778 NM_005153 ENSG00000103194 USP10 UBPO ubiquitin specific peptidase 10 protein-coding 360.999 chr1 13538035 13538438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24233 NM_001010847 126755 Hs.657356 NM_001010847 ENSG00000162494 LRRC38 - leucine rich repeat containing 38 protein-coding 255.333-57 chr2 122577027 122577242 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 496347 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 163.333-286 chr8 113930524 113930857 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -493751 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 223.333-4 chr1 67203653 67203822 + 1.33333 NA intron (NM_144701, intron 5 of 10) intron (NM_144701, intron 5 of 10) 37283 NM_144701 149233 Hs.677426 NM_144701 ENSG00000162594 IL23R - interleukin 23 receptor protein-coding 218.667-109 chr8 106536776 106537084 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) 89006 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 197.666-18 chr14 84769616 84769804 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -502222 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 201.667-82 chr4 34069651 34069928 + 1.33333 NA Intergenic SVA_E|Retroposon|SVA -29896 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 197.666-24 chr16 80069371 80069535 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 274204 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 231.333-94 chr5 125860224 125860475 + 1.33333 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -319228 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 175-59 chr4 41445925 41446119 + 1.33333 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 85215 NM_001330787 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 351.666-16 chr6 158871387 158871709 + 1.33333 NA intron (NR_160976, intron 1 of 2) MER30|DNA|hAT-Charlie 1519 NR_160976 100130967 Hs.32804 NM_001195032 C6orf99 - chromosome 6 open reading frame 99 ncRNA 219.333-43 chr12 117908465 117908671 + 1.33333 NA intron (NM_173598, intron 1 of 19) intron (NM_173598, intron 1 of 19) 60422 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 218.333-43 chr15 70101702 70101903 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3885 NM_001282980 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 271.999-2 chr5 178252226 178252562 + 1.33333 NA intron (NM_173465, intron 17 of 28) intron (NM_173465, intron 17 of 28) -19572 NR_103508 85007 Hs.248746 NM_153373 ENSG00000175309 PHYKPL AGXT2L2|PHLU 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase protein-coding 297.999-2 chr10 103001718 103002062 + 1.33333 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -83555 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 276.333-27 chr2 171947042 171947382 + 1.33333 NA intron (NM_003642, intron 3 of 10) intron (NM_003642, intron 3 of 10) 24751 NM_003642 8520 Hs.632532 NM_003642 ENSG00000128708 HAT1 KAT1 histone acetyltransferase 1 protein-coding 126.667-13 chr10 25141422 25141583 + 1.33333 NA intron (NR_120649, intron 6 of 7) L1ME4a|LINE|L1 28444 NR_120649 101929025 Hs.553324 NR_120649 ENSG00000231422 LINC01516 - long intergenic non-protein coding RNA 1516 ncRNA 247-60 chr5 37791680 37792129 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 42918 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 240-34 chr16 89873055 89873322 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_014972) promoter-TSS (NM_014972) -404 NM_014972 22980 Hs.415342 NM_014972 ENSG00000141002 TCF25 FKSG26|Hulp1|NULP1|PRO2620|hKIAA1049 transcription factor 25 protein-coding 201.333-232 chr5 166065810 166066011 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 860460 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 202.666-113 chr7 14087168 14087394 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95856 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 262.666-5 chr14 80814688 80814998 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 13 of 24) AluSx3|SINE|Alu 126895 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 204.666-47 chr20 58270968 58271166 + 1.33333 NA intron (NR_003505, intron 4 of 16) L1MC5a|LINE|L1 38372 NR_003505 55370 Hs.473179 NM_018498 PPP4R1L C20orf192|PPP4R1P1|PRO1085 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 like (pseudogene) pseudo 212-7 chr1 48349228 48349451 + 1.33333 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) L1MC4a|LINE|L1 122865 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 298-67 chr5 179797038 179797492 + 1.33333 NA TTS (NM_145867) TTS (NM_145867) 1081 NR_031598 100302156 NR_031598 ENSG00000221394 MIR1229 MIRN1229|hsa-mir-1229 microRNA 1229 ncRNA 192-151 chr8 132641731 132641918 + 1.33333 NA intron (NR_135908, intron 1 of 7) L1ME4c|LINE|L1 33721 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 192.333-164 chr8 63448419 63448586 + 1.33333 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -17347 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 240.666-15 chr14 88072497 88072840 + 1.33333 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) L1MC1|LINE|L1 -46356 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 295.333-5 chr10 119589951 119590219 + 1.33333 NA intron (NM_001323964, intron 1 of 12) intron (NM_001323964, intron 1 of 12) 6944 NM_001033925 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 248-18 chr12 115792590 115792875 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 355922 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 192-65 chr18 7631360 7631590 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 64159 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 196-10 chr1 212435320 212435481 + 1.33333 NA intron (NR_026598, intron 1 of 2) FAM|SINE|Alu 2480 NR_026598 29937 Hs.461787 NM_013349 ENSG00000117691 NENF CIR2|SCIRP10|SPUF neudesin neurotrophic factor protein-coding 251-90 chr9 87139307 87139585 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9198 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 311.666 chr1 232921994 232922321 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -28454 NM_032324 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 194.333-112 chr5 10358928 10359098 + 1.33333 NA intron (NM_001270661, intron 1 of 22) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 5318 NM_001270660 10299 Hs.432862 NM_005885 ENSG00000145495 MARCH6 DOA10|MARCH-VI|RNF176|TEB4 membrane associated ring-CH-type finger 6 protein-coding 206.667-29 chr12 33364156 33364411 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 75536 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 146.666-7 chr3 132277209 132277336 + 1.33333 NA Intergenic LTR10E|LTR|ERV1 -40135 NM_001099 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 160.333-265 chr7 77852190 77852414 + 1.33333 NA intron (NM_001366085, intron 2 of 10) AluSz|SINE|Alu 12172 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 176.667-127 chr6 55698832 55699040 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119722 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 455.666-7 chr5 41301666 41302160 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -40444 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 290.667-26 chr20 56642691 56643115 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 13597 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 197-106 chr7 5152792 5152964 + 1.33333 NA Intergenic (TATTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8332 NR_034163 645700 Hs.690815 NR_034163 ENSG00000159904 ZNF890P - zinc finger protein 890, pseudogene pseudo 288-6 chr1 82768472 82768853 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -134521 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 203.333-6 chr1 85895438 85895704 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 31 of 59) intron (NM_152890, intron 31 of 59) -187138 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 219.333-96 chr2 96140251 96140572 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1975 NM_001002036 431705 Hs.447993 NM_001002036 ENSG00000188886 ASTL SAS1B astacin like metalloendopeptidase protein-coding 273.999-2 chr13 45927011 45927233 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -75369 NM_198849 283514 Hs.368483 NM_198849 ENSG00000215475 SIAH3 - siah E3 ubiquitin protein ligase family member 3 protein-coding 179-28 chr14 55462169 55462380 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -21729 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 195.667-94 chr3 125277264 125277531 + 1.33333 NA intron (NM_001348436, intron 8 of 8) intron (NM_001348436, intron 8 of 8) -64632 NM_024628 84561 Hs.658514 NM_024628 ENSG00000221955 SLC12A8 CCC9 solute carrier family 12 member 8 protein-coding 243.333-74 chr3 94995869 94996203 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57773 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 153.333-418 chr8 107905759 107905923 + 1.33333 NA intron (NM_001282863, intron 4 of 4) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 176098 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 424.666-3 chr2 33504384 33505055 + 1.33333 NA intron (NM_001349975, intron 3 of 19) intron (NM_001349975, intron 3 of 19) -9156 NM_015376 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 307.333-29 chr14 63516264 63516600 + 1.33333 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) -8194 NM_001282181 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 254-40 chr2 180602955 180603161 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89046 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 193.333-171 chr7 83813141 83813382 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -164122 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 214.666-37 chr2 211291658 211291897 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 674206 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 236-14 chr11 102467207 102467407 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_135076) promoter-TSS (NR_135076) 52 NR_135076 102723838 Hs.738066 NR_135076 ENSG00000255482 LOC102723838 - uncharacterized LOC102723838 ncRNA 303.666-15 chr8 103989854 103990220 + 1.33333 NA intron (NR_145711, intron 14 of 21) intron (NR_145711, intron 14 of 21) 170817 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 226.667-40 chr17 20012373 20012695 + 1.33333 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) L1MB2|LINE|L1 3175 NM_001243439 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 197.333-248 chr9 123106247 123106427 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5306 NR_030331 693185 NR_030331 ENSG00000283941 MIR600 MIRN600|hsa-mir-600 microRNA 600 ncRNA 239.666-30 chr8 80718290 80718513 + 1.33333 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 156067 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 208.666-16 chr10 43768844 43769003 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 9902 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 397.666 chr1 210397916 210398314 + 1.33333 NA intron (NM_001170564, intron 4 of 9).2 intron (NM_001170564, intron 4 of 9).2 68749 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 216.999-2 chr11 42290010 42290210 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -36420 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 250.666-45 chrX 141355821 141356055 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -113421 NM_022661 64663 Hs.375036 NM_022661 ENSG00000198573 SPANXC CT11.3|CTp11|SPANX-C|SPANX-E|SPANXE SPANX family member C protein-coding 219.666-7 chr11 84520232 84520505 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) L3|LINE|CR1 200574 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 247.666-36 chr8 66676754 66676948 + 1.33333 NA non-coding (NR_161218, exon 2 of 4) non-coding (NR_161218, exon 2 of 4) 9255 NR_161217 56260 Hs.661238 NM_019607 ENSG00000213865 C8orf44 - chromosome 8 open reading frame 44 ncRNA 230-25 chr15 91518062 91518489 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 54936 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 208.666-4 chr1 67427432 67427652 + 1.33333 NA intron (NM_001018068, intron 1 of 7) intron (NM_001018068, intron 1 of 7) 2860 NM_001018067 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 216.333-34 chr12 2502542 2502751 + 1.33333 NA intron (NM_199460, intron 7 of 49).2 intron (NM_199460, intron 7 of 49).2 169574 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 253-50 chr5 20096066 20096349 + 1.33333 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L1MEg|LINE|L1 -108007 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 192.666-47 chr4 90200693 90200851 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) intron (NM_001145065, intron 1 of 10) -34259 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 359-5 chr14 53159362 53159925 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 6289 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 222.667-26 chr14 53308111 53308436 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 154919 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 245.333-106 chr7 7647726 7647999 + 1.33333 NA intron (NM_002947, intron 4 of 7) AluJo|SINE|Alu 7110 NM_001302348 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 200.666-89 chr4 92579488 92579732 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) MIRc|SINE|MIR 275211 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 157.333-313 chr7 3600164 3600382 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MD1|LINE|L1 299021 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 340.667-4 chr10 52281423 52281776 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 13 of 17) intron (NM_001098512, intron 13 of 17) 32529 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 204.333-66 chr15 79984420 79984601 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13314 NM_001114735 597 Hs.227817 NM_004049 ENSG00000140379 BCL2A1 ACC-1|ACC-2|ACC1|ACC2|BCL2L5|BFL1|GRS|HBPA1 BCL2 related protein A1 protein-coding 168.333-195 chr7 54172737 54172884 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -157887 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 230.667-72 chr6 150929288 150929590 + 1.33333 NA intron (NM_001350486, intron 11 of 27) intron (NM_001350486, intron 11 of 27) 62953 NM_001350491 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 271.666-13 chr6 56404521 56404915 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10590 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 327.999-10 chr9 37555918 37556194 + 1.33333 NA intron (NM_012166, intron 1 of 10) L1ME2z|LINE|L1 20324 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 202-73 chr19 11935378 11935589 + 1.33333 NA intron (NM_144566, intron 1 of 3) AluSg|SINE|Alu 10376 NM_144566 90592 Hs.528486 NM_144566 ENSG00000196757 ZNF700 - zinc finger protein 700 protein-coding 365.333-15 chr2 170739201 170739509 + 1.33333 NA intron (NR_110185, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 24018 NM_001003845 389058 Hs.368802 NM_001003845 ENSG00000204335 SP5 - Sp5 transcription factor protein-coding 237-72 chr8 37653938 37654232 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -41697 NM_025069 80139 Hs.288042 NM_025069 ENSG00000183779 ZNF703 NLZ1|ZEPPO1|ZNF503L|ZPO1 zinc finger protein 703 protein-coding 261.333-100 chr7 114012769 114013090 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -73398 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 272.333-29 chr2 39115484 39115758 + 1.33333 NA intron (NM_005633, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 4842 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 390.666-2 chr14 47210041 47210532 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 132960 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 163-20 chr14 60156726 60156924 + 1.33333 NA intron (NM_001322280, intron 1 of 6) intron (NM_001322280, intron 1 of 6) 8573 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 246-77 chr4 36497884 36498267 + 1.33333 NA intron (NR_149124, intron 4 of 4) intron (NR_149124, intron 4 of 4) -71647 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 149-25 chr11 10013612 10013845 + 1.33333 NA intron (NM_030962, intron 6 of 39) L1MC4|LINE|L1 174586 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 188-16 chr10 19531348 19531534 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 32 of 39) intron (NM_001142308, intron 32 of 39) 197109 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 194.333-148 chr8 18560557 18560702 + 1.33333 NA intron (NM_015310, intron 14 of 15) intron (NM_015310, intron 14 of 15) 169347 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 242-57 chr5 2883343 2883619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34373 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 144.666-3 chr10 77230304 77230464 + 1.33333 NA intron (NM_001322838, intron 3 of 29) L1MB5|LINE|L1 89553 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 287.333-34 chr20 46703944 46704308 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5523 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 253.666-12 chr2 207926811 207927163 + 1.33333 NA intron (NM_001080475, intron 5 of 7) intron (NM_001080475, intron 5 of 7) 98540 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 201.666-6 chr10 114176342 114176599 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2250 NM_153249 55088 Hs.159066 NM_018017 ENSG00000165813 CCDC186 C10orf118|CCCP-1|golgin104 coiled-coil domain containing 186 protein-coding 196.333-142 chr5 71858898 71859139 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 139743 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 205.333-39 chr10 90713180 90713472 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 144713 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 243.333-28 chr14 47277889 47278234 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 65185 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 201.333-99 chr14 61853256 61853436 + 1.33333 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) intron (NM_001367656, intron 1 of 7) 40643 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 332.666-8 chr12 67184961 67185302 + 1.33333 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -84227 NM_018448 55832 Hs.546407 NM_018448 ENSG00000111530 CAND1 TIP120|TIP120A cullin associated and neddylation dissociated 1 protein-coding 289-12 chr2 221956713 221957001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -341290 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 457.667-2 chr2 102549044 102549596 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -70233 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 205.333-157 chr3 107664158 107664361 + 1.33333 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) L1ME3E|LINE|L1 141297 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 325.666-12 chr2 194260808 194261166 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83282 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 215-46 chr20 18608085 18608276 + 1.33333 NA intron (NM_080820, intron 3 of 5) L1MC1|LINE|L1 20126 NM_080820 92675 Hs.659442 NM_080820 ENSG00000125821 DTD1 C20orf88|DTD|DUE-B|DUEB|HARS2|pqn-68 D-aminoacyl-tRNA deacylase 1 protein-coding 344.333-21 chr7 11798373 11798784 + 1.33333 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 33620 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 239.333-26 chr12 108281866 108282079 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 38690 NM_001142345 1240 Hs.197143 NM_004072 ENSG00000174600 CMKLR1 CHEMERINR|ChemR23|DEZ|RVER1 chemerin chemokine-like receptor 1 protein-coding 289.333-39 chr3 165235103 165235710 + 1.33333 NA intron (NR_125764, intron 1 of 5) L1MD2|LINE|L1 28446 NR_125764 103695433 Hs.570689 NR_125764 LINC01322 - long intergenic non-protein coding RNA 1322 ncRNA 214.999-9 chr4 59716710 59716878 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 703221 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 271.666-17 chr8 138748301 138748649 + 1.33333 NA intron (NM_152888, intron 22 of 64) intron (NM_152888, intron 22 of 64) 165566 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 189.333-173 chr6 77871756 77871996 + 1.33333 NA intron (NM_001282136, intron 4 of 4) intron (NM_001282136, intron 4 of 4) 218837 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 168.667-205 chr7 85420435 85420647 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_134240) promoter-TSS (NR_134240) -581 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 208-56 chr15 76776329 76776553 + 1.33333 NA intron (NM_001353011, intron 9 of 32) L1MDa|LINE|L1 85503 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 186.333-135 chr6 36176815 36177033 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -19820 NM_015695 27154 Hs.520096 NM_015695 ENSG00000096070 BRPF3 - bromodomain and PHD finger containing 3 protein-coding 325-3 chr1 49017608 49018037 + 1.33333 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) intron (NM_001323575, intron 5 of 12) -239589 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 194-12 chr10 117909578 117909861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137102 NR_026940 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 234-74 chr8 129992780 129993098 + 1.33333 NA intron (NM_001353245, intron 1 of 13) intron (NM_001353245, intron 1 of 13) 15514 NR_049826 100847051 NR_049826 ENSG00000264653 MIR5194 mir-5194 microRNA 5194 ncRNA 134.333-18 chr10 49608551 49608745 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_020984) promoter-TSS (NM_020984) -447 NM_020984 1103 Hs.302002 NM_020549 ENSG00000070748 CHAT CHOACTASE|CMS1A|CMS1A2|CMS6 choline O-acetyltransferase protein-coding 214.333-140 chr7 32426526 32426725 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) MIRc|SINE|MIR 1599 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 207.333-152 chr2 217048636 217048823 + 1.33333 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL 177957 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 212.333-79 chr2 206371688 206371995 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -71691 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 393.333-15 chr4 70932269 70932743 + 1.33333 NA intron (NM_173468, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 30137 NM_173468 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 280-55 chr8 126988973 126989323 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24006 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 237.333-114 chr7 112703951 112704162 + 1.33333 NA intron (NR_110158, intron 7 of 7) L1MCa|LINE|L1 81675 NR_110158 101928012 Hs.521131 NR_110158 ENSG00000223646 LOC101928012 - uncharacterized LOC101928012 ncRNA 142.333-220 chr6 123940670 123940892 + 1.33333 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 136916 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 207.666-22 chr2 17276979 17277229 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 241336 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 448.333-4 chr17 61962641 61963032 + 1.33333 NA exon (NM_005121, exon 21 of 30) exon (NM_005121, exon 21 of 30) -34854 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 236.666-3 chr10 18786500 18786747 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 127192 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 271.333-16 chr16 62521618 62521999 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -485370 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 238-47 chr2 102821427 102821772 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 59568 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 181-79 chr8 108517334 108517550 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 73818 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 424.333-3 chr15 43964793 43965293 + 1.33333 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) -86872 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 165.333-266 chr9 90434429 90434599 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1025 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 213.333-2 chr1 23904707 23904976 + 1.33333 NA intron (NM_001841, intron 1 of 1) intron (NM_001841, intron 1 of 1) 8521 NM_001841 1269 Hs.73037 NM_001841 ENSG00000188822 CNR2 CB-2|CB2|CX5 cannabinoid receptor 2 protein-coding 258-63 chr5 60716312 60716637 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16308 NM_001145208 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 315.333-8 chr12 112996273 112996721 + 1.33333 NA intron (NM_002535, intron 3 of 9) L1ME3|LINE|L1 17978 NM_002535 4939 Hs.414332 NM_002535 ENSG00000111335 OAS2 - 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2 protein-coding 192.666-15 chr12 11905450 11905596 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -144338 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 216.667-20 chr11 77607939 77608248 + 1.33333 NA intron (NM_173039, intron 2 of 2) intron (NM_173039, intron 2 of 2) 18140 NM_173039 282679 Hs.503345 NM_173039 ENSG00000178301 AQP11 AQPX1 aquaporin 11 protein-coding 206-58 chr15 72079599 72079773 + 1.33333 NA intron (NM_006901, intron 1 of 41) intron (NM_006901, intron 1 of 41) -34572 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 392.666-6 chr3 186609411 186609783 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3463 NM_001354572 197 Hs.324746 NM_001622 ENSG00000145192 AHSG A2HS|AHS|APMR1|FETUA|HSGA alpha 2-HS glycoprotein protein-coding 177.333-121 chr4 44632865 44633014 + 1.33333 NA intron (NM_182592, intron 3 of 5) MER1B|DNA|hAT-Charlie 18702 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 339.333-44 chr7 70398851 70399142 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) AluJo|SINE|Alu -733148 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 236-17 chr12 110508010 110508259 + 1.33333 NA intron (NM_001286536, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR 5803 NM_001368051 144715 Hs.97794 NM_152442 ENSG00000151164 RAD9B - RAD9 checkpoint clamp component B protein-coding 240.666-33 chr5 55215352 55215632 + 1.33333 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 11823 NM_001190787 345643 Hs.394578 NM_001190787 ENSG00000234602 MCIDAS IDAS|MCI|MCIN multiciliate differentiation and DNA synthesis associated cell cycle protein protein-coding 213.333-204 chr8 33122141 33122316 + 1.33333 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 350918 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 205.333-174 chr4 86627963 86628266 + 1.33333 NA intron (NM_080685, intron 1 of 47) L1ME1|LINE|L1 33799 NM_006264 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 174.666-19 chr5 166613395 166613573 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 312886 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 260-61 chr5 43184327 43184563 + 1.33333 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 -7780 NM_153361 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 199.666-27 chr2 199677187 199677426 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69238 NR_110270 101927641 Hs.549598 NR_110270 ENSG00000238217 LINC01877 - long intergenic non-protein coding RNA 1877 ncRNA 195.333-132 chr20 31375604 31375842 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7122 NM_054112 117285 Hs.274124 NM_054112 ENSG00000131068 DEFB118 C20orf63|DEFB-18|ESC42|ESP13.6 defensin beta 118 protein-coding 211-95 chr8 110117282 110117480 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -141610 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 213.999-4 chr2 34421008 34421174 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -256466 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 230.333-114 chr8 4137492 4137787 + 1.33333 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 857275 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 197-39 chr15 70950994 70951234 + 1.33333 NA intron (NM_017691, intron 8 of 15) L1PA16|LINE|L1 58671 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 220-17 chr10 113907951 113908322 + 1.33333 NA intron (NM_198514, intron 10 of 10) L2c|LINE|L2 53475 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 205-87 chr7 78677113 78677354 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) 329991 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 306-59 chr9 126300492 126300907 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -24784 NR_121584 101929116 Hs.382124 NR_121584 ENSG00000228392 LOC101929116 - uncharacterized LOC101929116 ncRNA 184.333-113 chr4 67620209 67620403 + 1.33333 NA intron (NM_018227, intron 32 of 32) intron (NM_018227, intron 32 of 32) 61579 NM_001317769 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 215.333-120 chr22 31794856 31795043 + 1.33333 NA intron (NR_146296, intron 12 of 42) intron (NR_146296, intron 12 of 42) 40926 NM_001369901 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 234-57 chr5 43544077 43544391 + 1.33333 NA intron (NM_006451, intron 3 of 10) intron (NM_006451, intron 3 of 10) 12843 NM_006451 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 401.999 chr10 115183764 115184159 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) intron (NM_207303, intron 8 of 28) 90596 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 220.666-53 chr4 36092275 36092447 + 1.33333 NA intron (NR_146894, intron 27 of 32) AluSp|SINE|Alu 151578 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 279.333-24 chr12 9942659 9943025 + 1.33333 NA intron (NR_104634, intron 1 of 4) intron (NR_104634, intron 1 of 4) 653 NR_104634 100506159 Hs.282397 NR_104634 ENSG00000225231 LINC02470 - long intergenic non-protein coding RNA 2470 ncRNA 241.333-41 chr15 56283650 56283859 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38672 NM_001370561 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 160.666-2 chr10 108946422 108946590 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -877213 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 221.666-25 chr2 59955417 59955698 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 427479 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 227.666-31 chr6 156844649 156845058 + 1.33333 NA intron (NM_017519, intron 2 of 18) HAL1|LINE|L1 -65122 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 304-13 chr10 80620592 80621046 + 1.33333 NA intron (NM_207372, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR -28978 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 159-42 chr16 53645022 53645158 + 1.33333 NA intron (NM_001127897, intron 17 of 24) L1M4a2|LINE|L1 58769 NM_015272 23322 Hs.298382 NM_015272 ENSG00000103494 RPGRIP1L CORS3|FTM|JBTS7|MKS5|NPHP8|PPP1R134 RPGRIP1 like protein-coding 245.333-117 chr8 71154400 71154624 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 202194 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 220-86 chr5 24417111 24417363 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 227741 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 224-92 chr7 3086561 3086886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42856 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 139.333-118 chr2 139012219 139012333 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 114952 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 210-148 chr8 109050148 109050406 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -36351 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 181-19 chr13 69135920 69136291 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -86241 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 223.333-130 chr5 89078679 89078892 + 1.33333 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -174680 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 390.999-2 chr3 95630256 95630813 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 52659 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 200.666-66 chr2 192495535 192495773 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -254191 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 324.333-30 chr4 63897761 63898081 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 511529 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 206.666-56 chr2 28569191 28569420 + 1.33333 NA intron (NR_138141, intron 1 of 35) intron (NR_138141, intron 1 of 35) 2948 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 216-103 chr5 171715011 171715270 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70732 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 211-18 chr11 47729636 47729871 + 1.33333 NA intron (NM_001318339, intron 12 of 16) intron (NM_001318339, intron 12 of 16) -14384 NM_024783 79841 Hs.147377 NM_024783 ENSG00000165923 AGBL2 CCP2 ATP/GTP binding protein like 2 protein-coding 351.666 chr1 245758064 245758380 + 1.33333 NA intron (NM_022743, intron 11 of 11) L1MDa|LINE|L1 -523705 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 250-94 chr9 13017335 13017733 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -44901 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 122.667-111 chr22 29544239 29544410 + 1.33333 NA intron (NM_001002879, intron 3 of 19) intron (NM_001002879, intron 3 of 19) 9331 NM_001002878 8563 Hs.75361 NM_003678 ENSG00000100296 THOC5 C22orf19|Fmip|PK1.3|fSAP79 THO complex 5 protein-coding 317.666-7 chr19 52275021 52275418 + 1.33333 NA intron (NM_001010851, intron 1 of 3) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 5632 NM_001010851 90321 Hs.439662 NM_001010851 ENSG00000196214 ZNF766 - zinc finger protein 766 protein-coding 204.667-78 chr2 206831637 206831956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48488 NR_036077 100422993 NR_036077 ENSG00000283469 MIR3130-1 MIR3130-3|mir-3130-1 microRNA 3130-1 ncRNA 246-74 chr4 30579244 30579513 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -140991 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 145-113 chr8 38414038 38414319 + 1.33333 NA exon (NM_023110, exon 16 of 18) exon (NM_023110, exon 16 of 18) 27047 NM_001199660 137994 Hs.696457 NM_144652 ENSG00000165046 LETM2 SLC55A2 leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 2 protein-coding 232-66 chr4 79415048 79415362 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6977 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 252-27 chr14 51725566 51725936 + 1.33333 NA intron (NM_001042481, intron 13 of 14) intron (NM_001042481, intron 13 of 14) 8468 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 265.666-3 chr1 167969160 167969582 + 1.33333 NA intron (NM_001017977, intron 3 of 18) intron (NM_001017977, intron 3 of 18) -29289 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 304.333-10 chr12 55990712 55991200 + 1.33333 NA intron (NM_001252036, intron 4 of 5) intron (NM_001252036, intron 4 of 5) -6320 NM_001032386 6821 Hs.558403 NM_000456 ENSG00000139531 SUOX - sulfite oxidase protein-coding 277.333-87 chr9 136526823 136527080 + 1.33333 NA intron (NM_017617, intron 2 of 33) CpG -7325 NR_039820 100616242 NR_039820 ENSG00000263403 MIR4673 - microRNA 4673 ncRNA 202-199 chrX 81847996 81848244 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 646018 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 214.666-53 chr5 26504424 26504635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 534057 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 199.333-138 chr2 150604519 150604802 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -24237 NR_110245 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 221.666-4 chr1 84702035 84702315 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11707 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 420.666-4 chr2 121990035 121990469 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 234601 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 386.666-9 chr3 85544259 85544561 + 1.33333 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) AluY|SINE|Alu 39351 NM_001256505 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 241.333-30 chr12 7428385 7428790 + 1.33333 NA intron (NM_001297650, intron 4 of 19) intron (NM_001297650, intron 4 of 19) 15598 NM_174941 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 324.333-22 chr18 74689447 74690024 + 1.33333 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) intron (NM_001146190, intron 2 of 3) 58772 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 202.667-118 chr5 99976779 99977055 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 411337 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 217.333-7 chr1 91916394 91916664 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10527 NM_001195684 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 259.999-7 chr2 184473931 184474233 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 95107 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 172-86 chr4 121668797 121668940 + 1.33333 NA intron (NM_001154, intron 12 of 12) intron (NM_001154, intron 12 of 12) 28112 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 262.666-4 chr13 31257497 31257761 + 1.33333 NA intron (NM_194318, intron 6 of 14) intron (NM_194318, intron 6 of 14) 57654 NM_194318 145173 Hs.13205 NM_194318 ENSG00000187676 B3GLCT B3GALTL|B3GTL|B3Glc-T|Gal-T|beta3Glc-T beta 3-glucosyltransferase protein-coding 184.333-110 chr3 144876999 144877210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 904023 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 225.333-105 chr5 4488507 4488713 + 1.33333 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -284871 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 222.666-34 chr3 154045990 154046207 + 1.33333 NA intron (NR_037901, intron 2 of 3) intron (NR_037901, intron 2 of 3) -74905 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 209.666-35 chr21 29557416 29557665 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 15 of 16) intron (NM_000830, intron 15 of 16) -38500 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 170-11 chr10 90110278 90110429 + 1.33333 NA Intergenic L1P5|LINE|L1 -152980 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 472.333 chr2 158519796 158520473 + 1.33333 NA intron (NM_001005476, intron 1 of 20) intron (NM_001005476, intron 1 of 20) 63182 NM_001304969 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 201-82 chr4 27544078 27544252 + 1.33333 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 326686 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 203.333-100 chr16 86172990 86173162 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -23105 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 197.666 chr1 66184469 66184665 + 1.33333 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) -133849 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 224.666-39 chr8 142269029 142269294 + 1.33333 NA TTS (NM_001291931) TTS (NM_001291931) 70805 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 202-161 chr6 73381246 73381470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11566 NM_001080507 441161 Hs.671212 NM_001080507 ENSG00000203907 OOEP C6orf156|FLOPED|HOEP19|KHDC2 oocyte expressed protein protein-coding 235.333-46 chr18 67129383 67129566 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 47890 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 200.666-37 chr14 83040053 83040211 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 397500 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 142.333-81 chr14 46289104 46289328 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) LTR78|LTR|ERV1 -182143 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 248-74 chr5 176903259 176903591 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4079 NM_002115 3101 Hs.411695 NM_002115 ENSG00000160883 HK3 HKIII|HXK3 hexokinase 3 protein-coding 244.333-30 chr12 47339392 47339575 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 24786 NR_039715 100616478 NR_039715 ENSG00000264906 MIR4494 - microRNA 4494 ncRNA 195.666-25 chr2 198494542 198494691 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119519 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 272.333-21 chr15 88341408 88341777 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -84853 NM_002530 4916 Hs.185701 NM_002530 ENSG00000140538 NTRK3 GP145-TrkC|TRKC|gp145(trkC) neurotrophic receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 123.333-225 chr9 4441025 4441182 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -49365 NM_004170 6505 Hs.444915 NM_004170 ENSG00000106688 SLC1A1 DCBXA|EAAC1|EAAT3|SCZD18 solute carrier family 1 member 1 protein-coding 203.333-5 chr1 79267037 79267260 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -260418 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 306-22 chr2 9815685 9816068 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27566 NM_001318976 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 211.333-19 chr1 213901014 213901215 + 1.33333 NA intron (NR_037850, intron 2 of 5) intron (NR_037850, intron 2 of 5) -23635 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 182.333-92 chr2 199934861 199935044 + 1.33333 NA intron (NM_001039693, intron 7 of 7) intron (NM_001039693, intron 7 of 7) -20365 NR_161377 79568 Hs.154494 NM_024520 ENSG00000162972 MAIP1 C2orf47 matrix AAA peptidase interacting protein 1 protein-coding 297.333-29 chr2 2812662 2813019 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 313186 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 363.666-3 chr18 844215 844772 + 1.33333 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -32251 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 230.667-64 chr5 34009590 34009877 + 1.33333 NA intron (NR_037951, intron 6 of 8) L1MA4A|LINE|L1 -1683 NM_001167595 23600 Hs.508343 NM_014324 ENSG00000242110 AMACR AMACRD|CBAS4|P504S|RACE|RM alpha-methylacyl-CoA racemase protein-coding 191-74 chr8 59733255 59733515 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 548015 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 301.666-11 chrX 81858907 81859355 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 657029 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 227.666-5 chr10 78436232 78436519 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 169033 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 177.333-131 chr5 30522871 30523049 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 642400 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 364.666-13 chr6 34596587 34596936 + 1.33333 NA intron (NM_022758, intron 3 of 3) intron (NM_022758, intron 3 of 3) -40428 NM_001252294 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 178.667-70 chr19 30298432 30298672 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -73832 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 197.333-81 chr17 49629570 49629749 + 1.33333 NA intron (NM_001007228, intron 1 of 9) intron (NM_001007228, intron 1 of 9) -3070 NM_001370732 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 226-76 chr5 119227598 119227924 + 1.33333 NA intron (NM_001290321, intron 38 of 43) MER31-int|LTR|ERV1 -40998 NM_001286815 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 200.667-35 chr12 73678900 73679144 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 519832 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 244.666-19 chr15 91025596 91025801 + 1.33333 NA intron (NR_110104, intron 2 of 3) AluSx3|SINE|Alu 3076 NR_110104 101926911 Hs.459366 NR_110104 ENSG00000214432 VPS33B-DT - VPS33B divergent transcript ncRNA 185.666-3 chr10 93480838 93480987 + 1.33333 NA intron (NM_013451, intron 1 of 53) intron (NM_013451, intron 1 of 53) 1422 NM_133337 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 211-35 chr14 67297135 67297383 + 1.33333 NA intron (NM_001256550, intron 4 of 14) L1M5|LINE|L1 55824 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 329.666-11 chr5 125070484 125070762 + 1.33333 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) intron (NR_109882, intron 2 of 5) 33792 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 201 chr1 44666922 44667113 + 1.33333 NA intron (NM_001300748, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 4039 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 264.333-59 chr5 31024858 31025177 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -168669 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 375-9 chr20 57175493 57175944 + 1.33333 NA intron (NM_001719, intron 4 of 6) L2a|LINE|L2 -37978 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 201-50 chr2 33270761 33270953 + 1.33333 NA intron (NM_206943, intron 15 of 33) intron (NM_206943, intron 15 of 33) 136260 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 176.333-116 chr4 32398863 32399043 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47915 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 190-26 chr12 87733765 87733920 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34970 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 261-20 chr14 30852005 30852325 + 1.33333 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR -22370 NM_001135058 1690 Hs.21016 NM_004086 ENSG00000100473 COCH COCH-5B2|COCH5B2|DFNA9|DFNB110 cochlin protein-coding 196-126 chr3 131379961 131380163 + 1.33333 NA intron (NR_038976, intron 1 of 3) intron (NR_038976, intron 1 of 3) 1413 NR_038976 339874 Hs.718930 NR_038976 ENSG00000250608 LOC339874 - uncharacterized LOC339874 ncRNA 200.667-154 chr8 105052579 105052864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -265717 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 209.333-123 chr2 182839993 182840271 + 1.33333 NA intron (NM_001463, intron 3 of 5) intron (NM_001463, intron 3 of 5) 26505 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 268.667-30 chr2 38928558 38929006 + 1.33333 NA intron (NM_001145451, intron 2 of 15) intron (NM_001145451, intron 2 of 15) 9419 NM_001145451 100271715 Hs.99841 NM_001145451 ENSG00000214694 ARHGEF33 - Rho guanine nucleotide exchange factor 33 protein-coding 238-27 chr15 87792079 87792408 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 154025 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 188.667-25 chr11 55725171 55725414 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48146 NM_001001967 390142 Hs.553743 NM_001001967 ENSG00000279761 OR5D13 - olfactory receptor family 5 subfamily D member 13 (gene/pseudogene) protein-coding 237.667-55 chr3 95421120 95421442 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 261912 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 273.333-16 chr12 48682037 48682313 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_017822) promoter-TSS (NM_017822) 63 NM_017822 54934 Hs.505412 NM_017822 ENSG00000139620 KANSL2 C12orf41|NSL2 KAT8 regulatory NSL complex subunit 2 protein-coding 194-33 chr14 44094262 44094437 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 412934 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 203.333-189 chr4 30110824 30111115 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -609400 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 249.666-13 chr17 50308014 50308320 + 1.33333 NA Intergenic MER34A1|LTR|ERV1 -20312 NR_125805 103752589 Hs.612913 NR_125805 ENSG00000251179 TMEM92-AS1 TCONS_00025237|lncRNA-508851 TMEM92 antisense RNA 1 ncRNA 385-14 chrX 98608198 98608758 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1043943 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 181.667-36 chr14 41229319 41229550 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 274723 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 196-88 chr2 68666799 68667091 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 23357 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 219-42 chr18 69156954 69157250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -243786 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 192.666-34 chr2 78255840 78256033 + 1.33333 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 34795 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 504.333-2 chr11 29540758 29541250 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -53409 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 323.999-3 chr8 84514772 84515080 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 99442 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 202.666-23 chr11 91635606 91635765 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -589349 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 194.666-26 chr17 51433738 51433942 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -1587 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 208.667-131 chr7 85812003 85812290 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 391024 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 195.333-34 chr10 88106801 88107084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 243317 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 195.333-112 chr2 75188565 75188821 + 1.33333 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 10827 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 185.333-109 chr20 33181743 33181913 + 1.33333 NA TTS (NM_080574) TTS (NM_080574) -11777 NR_026760 317716 Hs.434194 NM_173859 ENSG00000183566 BPIFA4P BASE BPI fold containing family A member 4, pseudogene pseudo 197.333-240 chr8 121290652 121290806 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -348617 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-2 chr1 50503639 50503884 + 1.33333 NA intron (NM_007051, intron 15 of 18) L1ME1|LINE|L1 -80318 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 306.333-3 chr1 161300939 161301397 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 8800 NM_001315491 4359 Hs.591486 NM_000530 ENSG00000158887 MPZ CHM|CHN2|CMT1|CMT1B|CMT2I|CMT2J|CMT4E|CMTDI3|CMTDID|DSS|HMSNIB|MPP|P0 myelin protein zero protein-coding 454.999-2 chr2 76308187 76308622 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -597489 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 154-35 chr12 26614973 26615109 + 1.33333 NA intron (NM_002223, intron 26 of 56) L1MC2|LINE|L1 218153 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 212-72 chr17 59061651 59061902 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 11 of 23) L2c|LINE|L2 45104 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 203-33 chr14 79025142 79025404 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -174709 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 366-14 chr3 38866345 38866754 + 1.33333 NA intron (NM_014139, intron 23 of 25) intron (NM_014139, intron 23 of 25) -72539 NM_001293306 6336 Hs.250443 NM_006514 ENSG00000185313 SCN10A FEPS2|Nav1.8|PN3|SNS|hPN3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 protein-coding 182-77 chr4 52316077 52316246 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 264857 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 113.333-150 chr20 12790084 12790212 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 146815 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 249-60 chr5 56396404 56396716 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 85209 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 200-169 chr8 116661496 116661698 + 1.33333 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 9497 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 389.666-3 chr2 37237669 37238006 + 1.33333 NA exon (NM_144736, exon 4 of 10) exon (NM_144736, exon 4 of 10) 6179 NM_001350027 55471 Hs.433466 NM_018607 ENSG00000003509 NDUFAF7 C2orf56|MidA|PRO1853 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 7 protein-coding 191.333-166 chr5 137276771 137276985 + 1.33333 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) intron (NM_004598, intron 2 of 10) 148681 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 267.666-21 chr8 78942532 78942865 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 105169 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 264.666-27 chr3 97740837 97741067 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 16 of 17) intron (NM_001080448, intron 16 of 17) -23569 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 190-77 chr22 40845104 40845260 + 1.33333 NA intron (NM_003932, intron 3 of 11) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 11457 NM_003932 6767 Hs.712713 NM_003932 ENSG00000100380 ST13 AAG2|FAM10A1|FAM10A4|HIP|HOP|HSPABP|HSPABP1|P48|PRO0786|SNC6 ST13 Hsp70 interacting protein protein-coding 229.333-109 chr6 124010288 124010603 + 1.33333 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) 206580 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 232.667-53 chr3 129755333 129755659 + 1.33333 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) L1MC3|LINE|L1 -31383 NM_001349274 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 190.666-4 chr1 63628635 63628810 + 1.33333 NA intron (NM_001172818, intron 1 of 10) intron (NM_001172818, intron 1 of 10) 5506 NM_001172818 5236 Hs.1869 NM_002633 ENSG00000079739 PGM1 CDG1T|GSD14 phosphoglucomutase 1 protein-coding 175.666-8 chr18 1151665 1151891 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 207851 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 218-87 chr4 177990255 177990541 + 1.33333 NA intron (NR_028342, intron 5 of 5) intron (NR_028342, intron 5 of 5) -82462 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 261.333-98 chr7 8377992 8378326 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55450 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 241.333-77 chr4 115984522 115984765 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -315082 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 177.666-25 chr6 53460143 53460329 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 84865 NM_001498 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 158-25 chr11 65959062 65959235 + 1.33333 NA intron (NM_152762, intron 6 of 7) intron (NM_152762, intron 6 of 7) -2586 NM_005146 9092 Hs.502883 NM_005146 ENSG00000175467 SART1 Ara1|HAF|HOMS1|SART1259|SNRNP110|Snu66 spliceosome associated factor 1, recruiter of U4/U6.U5 tri-snRNP protein-coding 188.667-45 chr14 55575947 55576206 + 1.33333 NA TTS (NR_027123) TTS (NR_027123) 4016 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 187.333-24 chr10 84559428 84559688 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 134389 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 262-50 chr20 52275453 52275840 + 1.33333 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -83661 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 233.333-50 chr18 24816795 24817001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 91117 NR_134604 105372028 Hs.569901 NR_134604 ENSG00000266573 LOC105372028 - uncharacterized LOC105372028 ncRNA 246-106 chr9 38366841 38367183 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25690 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 207-105 chr6 109739109 109739418 + 1.33333 NA intron (NM_014845, intron 7 of 22) intron (NM_014845, intron 7 of 22) 48042 NM_014845 9896 Hs.529959 NM_014845 ENSG00000112367 FIG4 ALS11|BTOP|CMT4J|KIAA0274|SAC3|YVS|dJ249I4.1 FIG4 phosphoinositide 5-phosphatase protein-coding 216-34 chr14 73856326 73856502 + 1.33333 NA intron (NM_001371328, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 4467 NM_001371328 210-25 chr11 78528821 78529083 + 1.33333 NA intron (NM_024678, intron 5 of 13) intron (NM_024678, intron 5 of 13) -4224 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 176.333-72 chr18 42752061 42752212 + 1.33333 NA intron (NM_002930, intron 4 of 4) intron (NM_002930, intron 4 of 4) 363549 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 186.333-131 chr5 120838114 120838343 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 306764 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 192-95 chr3 59115369 59115562 + 1.33333 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -65433 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 209-108 chr7 16110144 16110420 + 1.33333 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) L1MA7|LINE|L1 -100204 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 208.667-114 chr5 129099962 129100206 + 1.33333 NA intron (NM_016048, intron 1 of 4) intron (NM_016048, intron 1 of 4) 2396 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 429.666-2 chr5 119075986 119076833 + 1.33333 NA intron (NM_001290321, intron 1 of 43) intron (NM_001290321, intron 1 of 43) 5322 NM_001290322 1657 Hs.181042 NM_005509 ENSG00000172869 DMXL1 - Dmx like 1 protein-coding 196.666-56 chr2 206205347 206205518 + 1.33333 NA intron (NR_104359, intron 1 of 5).2 AluJo|SINE|Alu 2056 NR_104359 101669764 Hs.574781 NR_104359 GPR1-AS GPR1-AS1|GPR1AS GPR1 antisense RNA ncRNA 218-5 chr1 165564159 165564402 + 1.33333 NA TTS (NM_001005214) TTS (NM_001005214) 17875 NR_026744 400794 Hs.374847 NR_026744 ENSG00000237463 LRRC52-AS1 - LRRC52 antisense RNA 1 ncRNA 327.667-15 chr17 71528094 71528540 + 1.33333 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -326138 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 255.333-11 chr10 111015692 111015968 + 1.33333 NA Intergenic MER91B|DNA|hAT-Tip100 26904 NR_031614 100313921 NR_031614 ENSG00000221214 MIR548E MIRN548E|hsa-mir-548e microRNA 548e ncRNA 136-97 chr7 83066528 83066693 + 1.33333 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 96274 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 368.666-8 chr13 87584038 87584489 + 1.33333 NA intron (NR_033829, intron 1 of 5) intron (NR_033829, intron 1 of 5) 34477 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 244.666-10 chr10 92553736 92553948 + 1.33333 NA intron (NR_136399, intron 1 of 25) L1M1|LINE|L1 19664 NM_001322796 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 158-35 chr12 40247063 40247227 + 1.33333 NA intron (NM_198578, intron 7 of 50) intron (NM_198578, intron 7 of 50) 22148 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 138.333-148 chr5 64873596 64873797 + 1.33333 NA intron (NM_005869, intron 10 of 13) L1M2|LINE|L1 104766 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 158.666-29 chr7 37048926 37049076 + 1.33333 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) intron (NM_001206480, intron 15 of 21) 51205 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 137.333-114 chr21 25404256 25404415 + 1.33333 NA intron (NR_024027, intron 4 of 4) L1M1|LINE|L1 27366 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 221.333-153 chr8 144847567 144847855 + 1.33333 NA TTS (NM_001330623) TTS (NM_001330623) 5337 NM_001081004 28991 Hs.493218 NM_014066 ENSG00000170619 COMMD5 HCARG|HT002 COMM domain containing 5 protein-coding 385.999 chr14 61587891 61588428 + 1.33333 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -17506 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 131.333-60 chr16 75460963 75461147 + 1.33333 NA intron (NM_001304998, intron 1 of 2) intron (NM_001304998, intron 1 of 2) 3388 NM_001304997 124491 Hs.487510 NM_145254 ENSG00000166822 TMEM170A TMEM170 transmembrane protein 170A protein-coding 384.333-11 chr5 143846159 143846573 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34205 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 240.666-38 chr8 58953370 58953748 + 1.33333 NA intron (NM_014729, intron 2 of 8) intron (NM_014729, intron 2 of 8) 165588 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 207.333-15 chr1 121444662 121444876 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -46864 NR_104189 100873165 Hs.568525 NR_104189 ENSG00000230806 SRGAP2-AS1 - SRGAP2 antisense RNA 1 ncRNA 241.333-46 chr17 58971581 58971918 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 4 of 6) intron (NM_014906, intron 4 of 6) 135131 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 166.667-19 chr1 203908478 203908709 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46746 NM_001328637 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 195-91 chr6 54417601 54417760 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 109239 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 213.666-23 chr2 163246607 163246823 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -407948 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 207.333-287 chrX 95877248 95877449 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 460554 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 206.666-71 chr22 39342155 39342348 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -7698 NM_145731 9145 Hs.216226 NM_004711 ENSG00000100321 SYNGR1 - synaptogyrin 1 protein-coding 212-73 chr18 7215936 7216241 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -15016 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 254-29 chr19 16673886 16674285 + 1.33333 NA intron (NM_024074, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 12946 NM_024074 79041 Hs.436068 NM_024074 ENSG00000072954 TMEM38A TRIC-A|TRICA transmembrane protein 38A protein-coding 248-57 chr3 183584731 183585061 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29190 NM_130446 89857 Hs.659147 NM_130446 ENSG00000172578 KLHL6 - kelch like family member 6 protein-coding 206-17 chr10 23213398 23213589 + 1.33333 NA intron (NM_001365862, intron 15 of 15) L1ME3C|LINE|L1 21181 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 182.666-20 chr19 6515527 6515702 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12766 NM_001289129 10382 Hs.110837 NM_006087 ENSG00000104833 TUBB4A DYT4|TUBB4|beta-5 tubulin beta 4A class IVa protein-coding 401.333-18 chr8 119173832 119174293 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -34301 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 268-31 chr2 165087633 165088037 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001081676, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_001081676, exon 28 of 28) 116215 NM_006922 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 321.999-5 chr20 2479874 2480216 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9256 NM_198216 6628 Hs.83753 NM_003091 ENSG00000125835 SNRPB CCMS|COD|SNRPB1|Sm-B/B'|SmB/B'|SmB/SmB'|snRNP-B small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 protein-coding 211.666-39 chr5 16178045 16178271 + 1.33333 NA intron (NM_001102562, intron 1 of 3) intron (NM_001102562, intron 1 of 3) 1633 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 534.999 chr4 60849033 60849576 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -73315 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 224-13 chr10 69260054 69260333 + 1.33333 NA intron (NM_025130, intron 15 of 17) intron (NM_025130, intron 15 of 17) -9807 NM_001322365 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 196.333-14 chr10 91059605 91059838 + 1.33333 NA intron (NR_047467, intron 3 of 3) intron (NR_047467, intron 3 of 3) 13913 NR_047467 100874184 Hs.512240 NR_047467 LINC00502 - long intergenic non-protein coding RNA 502 ncRNA 189-46 chr2 171468750 171468980 + 1.33333 NA intron (NM_001164821, intron 8 of 11) intron (NM_001164821, intron 8 of 11) -34062 NM_024770 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 229.333-30 chr12 91777740 91778024 + 1.33333 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 363831 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 174.666-2 chr1 39417839 39417995 + 1.33333 NA intron (NM_012090, intron 52 of 92) L2a|LINE|L2 8844 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 178-73 chr20 41106989 41107184 + 1.33333 NA intron (NM_003286, intron 13 of 20) L1MEi|LINE|L1 -30457 NM_002660 5335 Hs.268177 NM_002660 ENSG00000124181 PLCG1 NCKAP3|PLC-II|PLC1|PLC148|PLCgamma1 phospholipase C gamma 1 protein-coding 429.332 chr11 45752077 45752572 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19108 NR_027134 374387 Hs.632142 NM_199137 ENSG00000205106 LINC02716 DKFZp779M0652 long intergenic non-protein coding RNA 2716 ncRNA 201-55 chr2 79507021 79507210 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -5819 NM_004389 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 290.666-22 chr4 13580565 13580898 + 1.33333 NA intron (NM_148894, intron 21 of 25) intron (NM_148894, intron 21 of 25) -32907 NR_015450 285548 Hs.529284 NR_015450 LINC01096 - long intergenic non-protein coding RNA 1096 ncRNA 399.333-8 chr11 76586212 76586716 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 83474 NM_001370188 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 226.666-36 chr6 50494215 50494495 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -219189 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 204-54 chr13 60535063 60535292 + 1.33333 NA exon (NM_001146070, exon 12 of 14) exon (NM_001146070, exon 12 of 14) -137778 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 176.666-5 chr10 105406619 105406846 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 413601 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 214-61 chr2 27441022 27441252 + 1.33333 NA exon (NM_013392, exon 15 of 18) exon (NM_013392, exon 15 of 18) -1229 NM_001168364 200634 Hs.59509 NM_173853 ENSG00000157992 KRTCAP3 KCP3 keratinocyte associated protein 3 protein-coding 227.333-124 chr8 28096581 28096912 + 1.33333 NA intron (NM_001284225, intron 1 of 12) intron (NM_001284225, intron 1 of 12) 3607 NM_001284220 55140 Hs.491336 NM_018091 ENSG00000134014 ELP3 KAT9 elongator acetyltransferase complex subunit 3 protein-coding 280.667-30 chr20 49723112 49723459 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -9407 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 248.333-6 chr1 114737686 114737969 + 1.33333 NA intron (NM_001007553, intron 4 of 19) intron (NM_001007553, intron 4 of 19) 20157 NM_001130523 7812 Hs.69855 NM_007158 ENSG00000009307 CSDE1 D1S155E|UNR cold shock domain containing E1 protein-coding 208-60 chr16 26523347 26523625 + 1.33333 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 498249 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 275.333-40 chr2 230239858 230240204 + 1.33333 NA TTS (NM_001005176) TTS (NM_001005176) 14295 NM_001005176 11262 Hs.632549 NM_007237 ENSG00000079263 SP140 LYSP100|LYSP100-A|LYSP100-B SP140 nuclear body protein protein-coding 202-90 chr2 122826151 122826312 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 247250 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 207-75 chr22 42395027 42395311 + 1.33333 NA intron (NM_145912, intron 4 of 5) AluJb|SINE|Alu -25961 NR_120595 102723775 Hs.335413 NR_120595 ENSG00000229891 LINC01315 C22orf32-1|lnc-C22orf32-1 long intergenic non-protein coding RNA 1315 ncRNA 261.667-68 chr7 31633930 31634301 + 1.33333 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) intron (NM_194300, intron 8 of 12) -52902 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 205.333-224 chr7 61910997 61911294 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1392911 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 187.333-175 chr6 68925818 68925993 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 290623 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 222.333-69 chr4 185098756 185099014 + 1.33333 NA intron (NR_147059, intron 8 of 8) intron (NR_147059, intron 8 of 8) -44381 NM_001151 291 Hs.246506 NM_001151 ENSG00000151729 SLC25A4 AAC1|ANT|ANT 1|ANT1|MTDPS12|MTDPS12A|PEO2|PEO3|PEOA2|T1 solute carrier family 25 member 4 protein-coding 276-21 chr14 66747064 66747307 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) L1MD2|LINE|L1 239778 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 256.666-18 chr2 36408414 36408743 + 1.33333 NA intron (NM_016441, intron 2 of 16) intron (NM_016441, intron 2 of 16) 52800 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 206.333-37 chr12 62193108 62193273 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_178539) promoter-TSS (NM_178539) -351 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 214.667-124 chr8 137746036 137746311 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -332585 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 180-38 chr14 73032837 73033075 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5850 NM_001281734 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 228-43 chr2 68104273 68104602 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -41433 NM_173177 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 215.333-145 chr4 74308779 74309031 + 1.33333 NA intron (NR_073117, intron 1 of 2) intron (NR_073117, intron 1 of 2) 435 NR_073114 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 196.667-172 chr9 71522066 71522327 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -75225 NM_001366144 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 294.666-20 chr22 40128192 40128476 + 1.33333 NA intron (NM_001024843, intron 3 of 23) intron (NM_001024843, intron 3 of 23) -49591 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 196-125 chr3 114127625 114127772 + 1.33333 NA TTS (NM_033663) TTS (NM_033663) 51078 NM_001290809 1814 Hs.121478 NM_000796 ENSG00000151577 DRD3 D3DR|ETM1|FET1 dopamine receptor D3 protein-coding 210.333-121 chr4 107937247 107937546 + 1.33333 NA intron (NM_183075, intron 1 of 4) intron (NM_183075, intron 1 of 4) -5277 NR_125929 101929595 Hs.678014 NR_125929 ENSG00000245293 LOC101929595 - uncharacterized LOC101929595 ncRNA 288.999-5 chr2 39534698 39535042 + 1.33333 NA intron (NR_037875, intron 5 of 5) intron (NR_037875, intron 5 of 5) 97454 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 223.666-4 chr10 57507647 57507937 + 1.33333 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -203233 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 163.666-8 chr2 59596868 59597083 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 379267 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 290.666-13 chr2 14280602 14280915 + 1.33333 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 120200 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 154.667-260 chr3 171098814 171098990 + 1.33333 NA intron (NM_001161563, intron 21 of 31) (ATATAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 7857 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 348-8 chr12 19760146 19760650 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -254287 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 244-77 chr4 44563445 44563815 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 88011 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 197-62 chr2 209256085 209256285 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -167862 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 175.333-192 chr8 127023424 127023611 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 10363 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 204.666-102 chr8 113887742 113887972 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -450918 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 374.333-20 chr8 134287053 134287510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -310790 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 258.999-5 chr2 86415199 86415506 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26019 NM_018433 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 258.333-36 chr20 358865 359314 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 11184 NM_001323685 80023 Hs.416024 NM_024958 ENSG00000125841 NRSN2 C20orf98|dJ1103G7.6 neurensin 2 protein-coding 224.666-25 chr3 76935956 76936146 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -104048 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 207-113 chr7 121207873 121208163 + 1.33333 NA intron (NM_001105533, intron 15 of 17) L2|LINE|L2 -117349 NM_016087 51384 Hs.272375 NM_016087 ENSG00000002745 WNT16 - Wnt family member 16 protein-coding 201.333-45 chr11 4805010 4805275 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001005177) promoter-TSS (NM_001005177) -762 NM_001005177 119695 Hs.553563 NM_001005177 ENSG00000279270 OR52R1 OR11-22 olfactory receptor family 52 subfamily R member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 158-77 chr2 181770427 181770589 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89843 NM_002500 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 230-58 chr5 167930234 167930562 + 1.33333 NA intron (NM_001368145, intron 2 of 26) intron (NM_001368145, intron 2 of 26) 175469 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 196-162 chr6 117435681 117435934 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -9952 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 170-5 chr1 231752622 231752865 + 1.33333 NA intron (NM_001164540, intron 4 of 10) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 65774 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 186.666-11 chr10 67766539 67766861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70505 NM_013266 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 125.333-127 chr4 101078570 101078714 + 1.33333 NA intron (NM_001130691, intron 8 of 12) intron (NM_001130691, intron 8 of 12) 162230 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 310.333-10 chr11 33341842 33342413 + 1.33333 NA intron (NM_001278162, intron 8 of 15) AluSz|SINE|Alu -33981 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 238-28 chr15 95838014 95838360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 289654 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 261.666-15 chr4 79505150 79505399 + 1.33333 NA intron (NR_038826, intron 2 of 3) intron (NR_038826, intron 2 of 3) 12681 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 207.333-36 chr10 92762116 92762397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64575 NM_001013848 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 194-107 chr5 61330208 61330479 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1915 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 345.666-15 chr7 77769476 77769784 + 1.33333 NA intron (NM_198467, intron 5 of 7) intron (NM_198467, intron 5 of 7) 28804 NM_032936 85025 Hs.19025 NM_032936 ENSG00000135211 TMEM60 C7orf35|DC32 transmembrane protein 60 protein-coding 300.667-36 chr5 78703164 78703582 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -54601 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 250.667-67 chr5 140500501 140500809 + 1.33333 NA intron (NM_020690, intron 15 of 35) AluSz|SINE|Alu -47007 NM_003732 8637 Hs.594084 NM_003732 ENSG00000243056 EIF4EBP3 4E-BP3|4EBP3 eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 3 protein-coding 275.333-22 chr14 57476345 57476724 + 1.33333 NA intron (NM_001283056, intron 5 of 6) intron (NM_001283056, intron 5 of 6) 17323 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 210.666-103 chr8 87133204 87133433 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MEf|LINE|L1 266903 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 244.666-54 chr9 15097920 15098115 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 104690 NR_003920 389705 Hs.431257 NR_003920 LOC389705 - histone PARylation factor 1 pseudogene pseudo 180-29 chr13 84651233 84651484 + 1.33333 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -132296 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 276.666-9 chr13 66054410 66054801 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -88176 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 229.333-63 chr2 49950532 49950751 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) 23562 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 218-30 chr15 97360859 97361104 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 160830 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 212.666-89 chr8 32501824 32502015 + 1.33333 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu -46291 NM_013958 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 195.666-29 chr3 29653338 29653572 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 280701 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 223.666 chr1 16303526 16303724 + 1.33333 NA intron (NM_018994, intron 3 of 9) AluSq|SINE|Alu 48855 NM_018994 54455 Hs.522384 NM_018994 ENSG00000037637 FBXO42 Fbx42|JFK F-box protein 42 protein-coding 196.666-55 chr2 205338681 205338856 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) intron (NM_205863, intron 18 of 21) -343732 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 147.333-189 chr20 35347490 35347748 + 1.33333 NA intron (NM_001184977, intron 4 of 7) MIR3|SINE|MIR -55194 NM_178468 128876 Hs.592149 NM_178468 ENSG00000125998 FAM83C C20orf128|dJ614O4.7 family with sequence similarity 83 member C protein-coding 224-49 chr2 134315721 134316029 + 1.33333 NA intron (NM_001371457, intron 3 of 16) intron (NM_001371457, intron 3 of 16) 61803 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 240.667-35 chr17 49830582 49830916 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001199158, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001199158, exon 12 of 12) -15161 NM_001242791 729220 Hs.434138 NM_001242791 FLJ45513 - uncharacterized LOC729220 protein-coding 208.666-116 chr9 125854067 125854270 + 1.33333 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) AluJo|SINE|Alu 105985 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 265-52 chr4 59101688 59102132 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 88337 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 175-80 chr8 134047986 134048132 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 161563 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 266.667-59 chr5 44564663 44565041 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -54570 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 188.666-6 chr11 11697678 11697832 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -41033 NR_036184 100423026 NR_036184 ENSG00000266645 MIR4299 - microRNA 4299 ncRNA 384.667-9 chr7 10569697 10570271 + 1.33333 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) -132692 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 196-174 chr8 16581570 16581764 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -388876 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 304.666-22 chr4 173866139 173866468 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -30970 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 166-50 chr16 86570272 86570437 + 1.33333 NA TTS (NM_005251) TTS (NM_005251) -2593 NR_125795 103752587 Hs.609366 NR_125795 ENSG00000260944 FOXC2-AS1 ODRUL FOXC2 antisense RNA 1 ncRNA 286-42 chr3 151254506 151254817 + 1.33333 NA intron (NM_014879, intron 1 of 2) intron (NM_014879, intron 1 of 2) -5670 NM_001081455 9934 Hs.2465 NM_014879 ENSG00000174944 P2RY14 BPR105|GPR105|P2Y14 purinergic receptor P2Y14 protein-coding 182.666-25 chr2 123585770 123585916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 439331 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 190.667-74 chr20 44110709 44111028 + 1.33333 NA TTS (NM_020433) TTS (NM_020433) 76320 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 314 chr1 78374460 78374929 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116280 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 198-33 chr12 29074123 29074360 + 1.33333 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner -75037 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 217.667-77 chr6 62933701 62934060 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 386097 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 206-5 chr1 45338233 45338444 + 1.33333 NA intron (NM_012222, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 1619 NM_001048174 4595 Hs.271353 NM_012222 ENSG00000132781 MUTYH MYH mutY DNA glycosylase protein-coding 231.666-23 chr4 32945055 32945235 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 594107 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 382-15 chr9 73670033 73670523 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 518413 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 200-68 chr17 53106870 53107130 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121495 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 251.333-38 chr14 73804482 73804803 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 17282 NR_109995 100506476 Hs.287299 NR_109995 LOC100506476 - uncharacterized LOC100506476 ncRNA 186-41 chr16 60224315 60224567 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 135352 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 227-32 chr22 27639087 27639305 + 1.33333 NA Intergenic CpG 162560 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 237-44 chr21 31703100 31703465 + 1.33333 NA intron (NM_020706, intron 4 of 19) intron (NM_020706, intron 4 of 19) 28836 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 178.333-80 chr2 103589334 103589530 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -605003 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 218-61 chr2 198141031 198141200 + 1.33333 NA intron (NM_006226, intron 5 of 5) intron (NM_006226, intron 5 of 5) 233982 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 191.667-101 chr5 36135605 36135877 + 1.33333 NA intron (NM_001007527, intron 6 of 17) intron (NM_001007527, intron 6 of 17) 12247 NR_030306 693165 NR_030306 ENSG00000207756 MIR580 MIRN580|hsa-mir-580 microRNA 580 ncRNA 380.999 chr11 109758255 109758599 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -334965 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 310.666-26 chr9 30950741 30951097 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 430571 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 202.333-20 chr1 239863821 239863973 + 1.33333 NA intron (NM_001347716, intron 7 of 7) L1M5|LINE|L1 35975 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 270-25 chr2 14043061 14043332 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 357762 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 199.333-18 chr1 178656328 178656589 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21291 NR_039622 100616328 NR_039622 ENSG00000266417 MIR4424 - microRNA 4424 ncRNA 215.667-65 chr2 178161382 178161687 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32947 NM_001201482 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 226.667-60 chr3 97446400 97446678 + 1.33333 NA intron (NM_001278300, intron 2 of 12) intron (NM_001278300, intron 2 of 12) 6932 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 257.333-28 chr13 43540772 43541063 + 1.33333 NA intron (NM_001347965, intron 1 of 15) L2|LINE|L2 88560 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 240.666-6 chr10 50996927 50997222 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) intron (NM_001098512, intron 1 of 17) 6186 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 199-84 chr5 61072239 61072436 + 1.33333 NA intron (NM_174889, intron 1 of 3) intron (NM_174889, intron 1 of 3) -89979 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 296.666-19 chr3 96379497 96379861 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 19715 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 200-149 chr7 9058953 9059140 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -575224 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 218.666-70 chr7 130573350 130573530 + 1.33333 NA intron (NM_001290033, intron 9 of 19) L1MB7|LINE|L1 29987 NR_024086 53844 Hs.6421 NR_024086 COPG2IT1 CIT1|COPG2AS|DKFZP761N09121|NCRNA00170 COPG2 imprinted transcript 1 ncRNA 206.666-72 chr22 47460062 47460231 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26965 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 218.666-68 chr7 89447129 89447313 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -651484 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 204.667-27 chr11 109474556 109474856 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 52516 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 197-89 chr5 22583893 22584040 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 269378 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 206-158 chr6 115024899 115025073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 618849 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 244.666-33 chr4 83325584 83325804 + 1.33333 NA intron (NM_001098540, intron 1 of 11) L2b|LINE|L2 9119 NM_001199830 10855 Hs.44227 NM_006665 ENSG00000173083 HPSE HPA|HPA1|HPR1|HPSE1|HSE1 heparanase protein-coding 212-33 chr12 19182739 19182922 + 1.33333 NA intron (NM_019012, intron 3 of 25) intron (NM_019012, intron 3 of 25) -22495 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 284-67 chrX 94720158 94720558 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 342868 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 291.666-13 chr6 84746907 84747271 + 1.33333 NA intron (NM_001080508, intron 5 of 7) intron (NM_001080508, intron 5 of 7) 17509 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 291.999-5 chr2 170252839 170253276 + 1.33333 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) L2a|LINE|L2 74910 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 204-56 chr14 28731586 28731824 + 1.33333 NA intron (NR_125758, intron 4 of 6) intron (NR_125758, intron 4 of 6) 33614 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 313.667-4 chr10 16938135 16938506 + 1.33333 NA intron (NM_001081, intron 38 of 66) intron (NM_001081, intron 38 of 66) -120866 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 203-86 chr5 118858915 118859154 + 1.33333 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) L1MC5a|LINE|L1 -115552 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 230.667-16 chr14 68228535 68228812 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 400114 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 320.667-21 chr20 48965024 48965563 + 1.33333 NA intron (NM_006420, intron 7 of 38) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 43582 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 183-61 chr2 128814332 128814533 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -50168 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 261.667-70 chr8 79235308 79235733 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -96668 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 150.666-14 chr3 36047895 36048046 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 303494 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 254.333-32 chr18 13250631 13250873 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) L1MA5A|LINE|L1 11209 NR_146617 147276 Hs.675872 NR_146617 ENSG00000279020 C18orf15 HsT3231 chromosome 18 open reading frame 15 (putative) ncRNA 221.999-2 chr13 25918934 25919182 + 1.33333 NA intron (NM_016529, intron 33 of 36) intron (NM_016529, intron 33 of 36) 132002 NM_001007538 387914 Hs.433791 NM_001007538 ENSG00000180730 SHISA2 C13orf13|PRO28631|TMEM46|WGAR9166|bA398O19.2|hShisa shisa family member 2 protein-coding 214.666-81 chrX 93357937 93358113 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 315553 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 196-52 chr14 80196568 80196720 + 1.33333 NA TTS (NM_000793) TTS (NM_000793) -14775 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 204-25 chr10 55663889 55664169 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -36087 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 288.999-8 chr5 73588230 73588643 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22693 NM_032175 84135 Hs.406703 NM_032175 ENSG00000164338 UTP15 NET21 UTP15 small subunit processome component protein-coding 211.333-249 chr8 132112398 132112577 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7222 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 239.667-16 chr12 117213411 117213833 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001204218, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_001204218, exon 30 of 30) -23152 NM_033624 23014 Hs.740376 NM_015002 ENSG00000135108 FBXO21 FBX21 F-box protein 21 protein-coding 180-11 chr10 29978426 29978646 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 81050 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 440.666-15 chr9 31867082 31867528 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -485815 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 214.667-100 chr5 112276607 112276905 + 1.33333 NA intron (NM_001347887, intron 3 of 23) intron (NM_001347887, intron 3 of 23) 48473 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 212.333-8 chr1 95120313 95120480 + 1.33333 NA intron (NM_001199691, intron 1 of 7) intron (NM_001199691, intron 1 of 7) 2473 NM_001199691 100527978 Hs.483512 NM_001199691 ENSG00000271092 TLCD4-RWDD3 TMEM56-RWDD3 TLCD4-RWDD3 readthrough protein-coding 203.333-204 chr5 27179667 27179957 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -141226 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 223.333-78 chr2 112104597 112104899 + 1.33333 NA intron (NM_001329914, intron 15 of 18) L1ME2|LINE|L1 -33637 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 454.333-5 chr8 78525266 78526065 + 1.33333 NA intron (NM_181839, intron 1 of 2) intron (NM_181839, intron 1 of 2) 9325 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 232-15 chr10 118935330 118935620 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -94239 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 230.333-54 chr2 5732463 5732765 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40230 NM_003108 6664 Hs.432638 NM_003108 ENSG00000176887 SOX11 MRD27 SRY-box transcription factor 11 protein-coding 257-15 chr14 45705074 45705395 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 10368 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 337.666-6 chr4 77838722 77839034 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18609 NM_001365006 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 206-80 chr2 76158528 76158787 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -447742 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 182.666-6 chr11 17946050 17946243 + 1.33333 NA intron (NR_104040, intron 9 of 11) MIR3|SINE|MIR 66901 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 315.333-2 chr1 113380598 113380865 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9784 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 312.666-20 chr4 33762325 33762642 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 277410 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 286-4 chr10 99724774 99725149 + 1.33333 NA intron (NM_004376, intron 4 of 8) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -7273 NM_015960 51076 Hs.16606 NM_015960 ENSG00000119929 CUTC CGI-32 cutC copper transporter protein-coding 188-34 chr14 60275223 60275479 + 1.33333 NA intron (NM_177951, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR 26130 NM_177951 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 248.667-74 chr22 44375018 44375330 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -62223 NM_001099294 85352 Hs.6829 NM_001099294 ENSG00000138944 SHISAL1 KIAA1644 shisa like 1 protein-coding 234-12 chr11 79535180 79535461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94290 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 240-4 chr1 81891406 81891620 + 1.33333 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 89060 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 201-47 chr18 11248692 11248867 + 1.33333 NA Intergenic LTR12F|LTR|ERV1 -100017 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 341-19 chr3 3581268 3581581 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -218007 NM_001324189 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 357.666-6 chr21 30709944 30710320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8645 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 278.666-9 chr13 106810952 106811242 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 157217 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 207.333-52 chr11 81918736 81918957 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) (ATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28010 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 188.667-8 chr1 85916233 85916489 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 24 of 59) intron (NM_152890, intron 24 of 59) -207928 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 197.333-51 chr12 77214608 77214855 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -149162 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 196.666-74 chr4 6539674 6539880 + 1.33333 NA intron (NM_001206994, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 15838 NM_001206995 5522 Hs.479069 NM_020416 ENSG00000074211 PPP2R2C B55-GAMMA|B55gamma|IMYPNO|IMYPNO1|PR52|PR55G protein phosphatase 2 regulatory subunit Bgamma protein-coding 223.333-146 chr6 85059444 85059754 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -295001 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 226.666-13 chr15 59250101 59250314 + 1.33333 NA intron (NM_004998, intron 4 of 27) MER77|LTR|ERVL 43364 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 257.333-72 chr4 167163424 167163831 + 1.33333 NA intron (NM_001204352, intron 2 of 11) L1MA3|LINE|L1 70799 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 194.666-19 chr14 59300965 59301142 + 1.33333 NA intron (NM_001270520, intron 3 of 24) intron (NM_001270520, intron 3 of 24) 37612 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 131.333-146 chr5 141107251 141107385 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7076 NM_018937 56132 Hs.508987 NM_018937 ENSG00000113205 PCDHB3 PCDH-BETA3 protocadherin beta 3 protein-coding 226-30 chr17 44985856 44986161 + 1.33333 NA Intergenic LTR1A2|LTR|ERV1 -17705 NM_006688 10882 Hs.134012 NM_006688 ENSG00000131094 C1QL1 C1QRF|C1QTNF14|CRF|CTRP14 complement C1q like 1 protein-coding 210-79 chr2 208333904 208334205 + 1.33333 NA intron (NM_015040, intron 24 of 41) intron (NM_015040, intron 24 of 41) -25638 NM_001309516 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 208-116 chr4 35499761 35500014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 744052 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 206-104 chr22 38053877 38054164 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3235 NM_001039584 9463 Hs.180871 NM_012407 ENSG00000100151 PICK1 PICK|PRKCABP protein interacting with PRKCA 1 protein-coding 183-5 chr1 85365179 85365540 + 1.33333 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) 39147 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 246.333-72 chr5 18795398 18795629 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 988239 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 216-76 chr22 38309743 38310025 + 1.33333 NA intron (NM_001894, intron 2 of 10) intron (NM_001894, intron 2 of 10) 7549 NM_152221 1454 Hs.474833 NM_001894 ENSG00000213923 CSNK1E CKIe|CKIepsilon|HCKIE casein kinase 1 epsilon protein-coding 215-41 chr2 137689886 137690131 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 237924 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 200.333-146 chr7 140758095 140758325 + 1.33333 NA intron (NR_148928, intron 14 of 17) intron (NR_148928, intron 14 of 17) -61133 NR_024454 100134713 Hs.534141 NR_024454 ENSG00000240889 NDUFB2-AS1 - NDUFB2 antisense RNA 1 ncRNA 256.333-66 chr5 120362530 120362900 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101563 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 315.333-48 chr7 93985336 93985692 + 1.33333 NA intron (NR_133909, intron 3 of 4) intron (NR_133909, intron 3 of 4) 18841 NM_005868 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 284.666-20 chr5 26407518 26407760 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 630947 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 311.666-5 chr13 63866614 63867099 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -22731 NR_130763 102723968 Hs.551671 NR_130763 ENSG00000219926 LOC102723968 - uncharacterized LOC102723968 ncRNA 207.666-70 chr9 31536066 31536361 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154723 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 217.999-6 chr5 107989466 107989635 + 1.33333 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) L1MA4|LINE|L1 -318613 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 196.667-25 chr11 18532016 18532251 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001261385, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001261385, exon 11 of 11) -5191 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 192.666 chr1 40222035 40222242 + 1.33333 NA intron (NM_012421, intron 5 of 7) intron (NM_012421, intron 5 of 7) -25799 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 293.666-8 chr2 62515346 62515587 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -9271 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 197-116 chr8 104716481 104716725 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -127579 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 146.333-3 chr1 44535754 44535979 + 1.33333 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) -9627 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 212-126 chr5 33043405 33043637 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 96078 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 375-12 chr5 68889257 68889824 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 140387 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 208.666-113 chr8 129136991 129137207 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 104141 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 231-24 chr2 11331960 11332226 + 1.33333 NA intron (NM_001321643, intron 1 of 32) FRAM|SINE|Alu 12543 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 382.666-8 chr2 108488499 108488838 + 1.33333 NA intron (NR_028063, intron 16 of 21) intron (NR_028063, intron 16 of 21) 39462 NR_028063 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 236-28 chr16 47240453 47240660 + 1.33333 NA intron (NM_030790, intron 12 of 17) L1MB2|LINE|L1 96488 NR_110903 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 233-37 chr2 42471485 42471825 + 1.33333 NA intron (NM_172344, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 22327 NM_133329 170850 Hs.352633 NM_133329 ENSG00000171126 KCNG3 KV10.1|KV6.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 3 protein-coding 234-14 chr11 112274597 112274909 + 1.33333 NA intron (NR_126004, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 4004 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 222.667 chr1 27954770 27955070 + 1.33333 NA intron (NM_001009568, intron 5 of 6) intron (NM_001009568, intron 5 of 6) -4542 NM_018053 55113 Hs.55024 NM_018053 ENSG00000158156 XKR8 XRG8|hXkr8 XK related 8 protein-coding 330.666-13 chr21 18186927 18187513 + 1.33333 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -57613 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 213.333-10 chr1 111664831 111665137 + 1.33333 NA intron (NM_001370217, intron 1 of 7) intron (NM_001370217, intron 1 of 7) 190 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 214.333-2 chr1 30182335 30182533 + 1.33333 NA Intergenic LTR41C|LTR|ERVL -144822 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 280-39 chr4 30367251 30367630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -352929 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 185.666-22 chr7 21066021 21066256 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 230707 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 204.666-107 chr8 126252539 126252782 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -72835 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 138.333-34 chr10 105558345 105558519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 261901 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 211.667-23 chr10 122659473 122659755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13268 NM_001364461 112577516 NM_001364461 LOC112577516 - carbohydrate-binding protein AQN-1-like protein-coding 246-59 chr21 17050518 17050849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -388207 NR_037585 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 212-83 chr2 40300688 40300921 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 129500 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 193-71 chr5 35582993 35583295 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34719 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 189-82 chr6 119483498 119483739 + 1.33333 NA intron (NR_046100, intron 1 of 5) L1ME4a|LINE|L1 7684 NR_046100 285762 Hs.571063 NR_046100 LOC285762 - uncharacterized LOC285762 ncRNA 209.667-38 chr12 116150528 116150818 + 1.33333 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) intron (NM_015335, intron 2 of 30) -2019 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 211-90 chr7 17926513 17926762 + 1.33333 NA intron (NM_001350862, intron 1 of 25) AluJb|SINE|Alu 13857 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 257.667-26 chr15 59732088 59732472 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42960 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 208.666-41 chr15 55451350 55451518 + 1.33333 NA intron (NM_001033560, intron 5 of 8) L1M6|LINE|L1 -42924 NM_001204450 9236 Hs.285051 NM_004748 ENSG00000260916 CCPG1 CPR8 cell cycle progression 1 protein-coding 208.666-101 chr7 30803825 30804024 + 1.33333 NA intron (NR_037598, intron 7 of 19) intron (NR_037598, intron 7 of 19) 32507 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 198-118 chr3 31788507 31788748 + 1.33333 NA intron (NM_001174060, intron 3 of 10) intron (NM_001174060, intron 3 of 10) 84414 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 293.333-4 chr11 25772623 25773023 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -416300 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 210.333-23 chr11 38854660 38854883 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 205913 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 260.666 chr1 77396009 77396293 + 1.33333 NA intron (NM_012093, intron 6 of 13) intron (NM_012093, intron 6 of 13) 113064 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 289.666-18 chr6 70526135 70526459 + 1.33333 NA exon (NM_001351607, exon 16 of 23) exon (NM_001351607, exon 16 of 23) -40633 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 146.333-162 chr2 167246523 167246764 + 1.33333 NA exon (NM_152381, exon 9 of 11) exon (NM_152381, exon 9 of 11) 59271 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 174-107 chr9 74512284 74512448 + 1.33333 NA intron (NM_006914, intron 1 of 9) intron (NM_006914, intron 1 of 9) -13813 NR_125791 103752585 Hs.635501 NR_125791 RORB-AS1 - RORB antisense RNA 1 ncRNA 206-60 chr15 99258444 99258747 + 1.33333 NA non-coding (NR_073383, exon 1 of 1) non-coding (NR_073383, exon 1 of 1) 1070 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 238.666-40 chr8 49109832 49110037 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37590 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 211.333-181 chr5 31701895 31702208 + 1.33333 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) intron (NM_178140, intron 1 of 24) 62920 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 214-51 chr17 66927205 66927504 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -37353 NM_014405 27092 Hs.514423 NM_014405 ENSG00000075461 CACNG4 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 4 protein-coding 194.667-79 chr20 4831385 4831684 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7926 NM_014737 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 394.333-15 chr4 162525112 162525668 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -361356 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 202.667-12 chr1 200705502 200705801 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -33921 NM_001297707 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 277.999-12 chr7 119098473 119098821 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 808728 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 276.333-11 chr12 76274405 76274720 + 1.33333 NA intron (NR_146531, intron 1 of 3) FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 14679 NR_146531 105369848 NR_146531 LNCOG LINC02407|lncRNA-OG lncRNA osteogenesis associated ncRNA 193.333-74 chr17 67215996 67216211 + 1.33333 NA intron (NM_001330447, intron 4 of 32) intron (NM_001330447, intron 4 of 32) -28673 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 184-48 chr2 47988795 47989003 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -83106 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 258-3 chr1 113163843 113164247 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 42208 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 202.667-43 chr12 97764698 97764947 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8305 NR_077240 643711 Hs.585557 NR_077240 ENSG00000257501 LOC643711 - platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 pseudogene pseudo 349.333-5 chr10 46516731 46517147 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 39132 NM_014696 9721 Hs.523375 NM_014696 ENSG00000204175 GPRIN2 GRIN2|KIAA0514 G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 protein-coding 201.666-42 chr8 12993837 12994024 + 1.33333 NA intron (NM_020844, intron 2 of 4) intron (NM_020844, intron 2 of 4) -18334 NM_001099677 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 296-15 chr12 15664698 15665032 + 1.33333 NA intron (NM_004447, intron 8 of 20) intron (NM_004447, intron 8 of 20) 118254 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 440.666-13 chr7 55164411 55164846 + 1.33333 NA intron (NM_201284, intron 14 of 15) intron (NM_201284, intron 14 of 15) 24321 NR_047551 100507500 Hs.720489 NR_047551 ENSG00000224057 EGFR-AS1 - EGFR antisense RNA 1 ncRNA 198.333-161 chr5 63839981 63840249 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 122177 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 196-13 chr1 233808248 233808431 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -96337 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 146.667-259 chr5 72683073 72683241 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -22488 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 262-87 chr8 138031619 138032001 + 1.33333 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 51735 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 213-41 chr2 129420643 129420910 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -146885 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 210-87 chr21 26662126 26662431 + 1.33333 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -88992 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 235-3 chr1 70565231 70565609 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -141033 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 331.333-22 chr17 59921374 59921861 + 1.33333 NA intron (NR_161455, intron 4 of 13) intron (NR_161455, intron 4 of 13) 28496 NR_161460 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 178-90 chr5 37024128 37024338 + 1.33333 NA intron (NM_015384, intron 29 of 45) intron (NM_015384, intron 29 of 45) 147464 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 157.333-263 chr4 76543039 76543182 + 1.33333 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) intron (NM_020859, intron 1 of 10) -30458 NR_039654 100616299 NR_039654 ENSG00000263445 MIR4450 mir-4450 microRNA 4450 ncRNA 326.333-27 chr6 114472313 114472835 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -409697 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 254.666-4 chr1 202677146 202677394 + 1.33333 NA intron (NM_177402, intron 1 of 8) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 33184 NM_177402 127833 Hs.25422 NM_177402 ENSG00000143858 SYT2 CMS7|MYSPC|SytII synaptotagmin 2 protein-coding 299.333-65 chr6 46666052 46666366 + 1.33333 NA intron (NM_001204051, intron 5 of 8) L2c|LINE|L2 13234 NM_004277 9481 Hs.40510 NM_004277 ENSG00000153291 SLC25A27 UCP4 solute carrier family 25 member 27 protein-coding 316.999-2 chr3 77933120 77933357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 115725 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 270-53 chr5 109369209 109369510 + 1.33333 NA intron (NM_014819, intron 4 of 9) intron (NM_014819, intron 4 of 9) 40615 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 203.667-107 chr6 114043962 114044233 + 1.33333 NA intron (NR_125845, intron 4 of 9) MIR3|SINE|MIR 18780 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 266.667-21 chr14 58905533 58905936 + 1.33333 NA intron (NR_110547, intron 2 of 5) L1PB4|LINE|L1 77446 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 206-124 chr4 49050286 49050455 + 1.33333 NA intron (NM_001286791, intron 14 of 15) intron (NM_001286791, intron 14 of 15) 63728 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 248.333-51 chr2 234709956 234710303 + 1.33333 NA intron (NR_132376, intron 2 of 2) intron (NR_132376, intron 2 of 2) 27461 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 236.333-14 chr10 61863747 61863931 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37860 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 296.666-22 chr3 136443559 136443839 + 1.33333 NA intron (NM_005862, intron 14 of 33) intron (NM_005862, intron 14 of 33) 193359 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 182.667-23 chr11 23670881 23671065 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -251783 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 238.333-35 chr18 8388179 8388562 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 29 of 30) intron (NM_002845, intron 29 of 30) -21336 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 227.333-26 chr11 109624221 109624448 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 202144 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 180-110 chr8 86858012 86858249 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8285 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 232.666-17 chr16 59639013 59639260 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 116055 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 243-66 chr7 113633625 113633960 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 285217 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 771 chr2 212421154 212422063 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 4752 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 196-42 chr13 25297367 25297566 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4159 NM_014089 9818 Hs.507537 NM_014089 ENSG00000139496 NUP58 NUP45|NUPL1|PRO2463 nucleoporin 58 protein-coding 197.333-229 chr8 60148521 60148752 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 132764 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 211.666-17 chr16 71204947 71205108 + 1.33333 NA intron (NM_001198543, intron 1 of 18) L1ME3B|LINE|L1 25695 NM_001198542 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 182.666-17 chr16 61679119 61679290 + 1.33333 NA intron (NM_001796, intron 10 of 11) intron (NM_001796, intron 10 of 11) 357234 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 195.666-40 chr6 84589695 84589880 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99671 NR_125875 102724201 Hs.667523 NR_125875 ENSG00000228290 TBX18-AS1 - TBX18 antisense RNA 1 ncRNA 114-55 chr17 68448830 68448998 + 1.33333 NA intron (NM_001320772, intron 2 of 11) intron (NM_001320772, intron 2 of 11) 8582 NM_017983 55062 Hs.463964 NM_017983 ENSG00000070540 WIPI1 ATG18|ATG18A|WIPI49 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 protein-coding 206.666-93 chr5 11326552 11326736 + 1.33333 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 262273 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 170.667-110 chr3 41146891 41147097 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -52511 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 203-108 chr8 109478787 109479080 + 1.33333 NA intron (NM_177531, intron 53 of 77) intron (NM_177531, intron 53 of 77) -60767 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 182.667-68 chr19 28535882 28536100 + 1.33333 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MD3|LINE|L1 -70697 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 152-59 chr14 87770187 87770390 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -114994 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 204.333-88 chr19 33193946 33194105 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_002333) promoter-TSS (NM_002333) -305 NM_002333 4037 Hs.515340 NM_002333 ENSG00000130881 LRP3 - LDL receptor related protein 3 protein-coding 273.333-45 chr3 48282700 48283205 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 8726 NR_134638 101060195 Hs.670746 NR_134638 FCF1P2 - FCF1 pseudogene 2 pseudo 199.333-74 chr14 50438621 50438903 + 1.33333 NA intron (NM_198794, intron 23 of 31) intron (NM_198794, intron 23 of 31) -41464 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 213.333-196 chr7 93241401 93241567 + 1.33333 NA intron (NM_024553, intron 2 of 11) intron (NM_024553, intron 2 of 11) 9118 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 289-9 chr14 66643802 66644101 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 136544 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 357.333-11 chr2 206892888 206893421 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -46364 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 204.666-30 chr14 28900712 28900960 + 1.33333 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -115049 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 230-44 chr3 130876851 130877112 + 1.33333 NA intron (NM_001199181, intron 1 of 26) L1MA5|LINE|L1 -17034 NM_001001485 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 299.666-13 chr4 54823696 54823928 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165884 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 178.666-7 chr16 63301417 63301596 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -1265068 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 204.666-39 chr2 86131873 86132112 + 1.33333 NA intron (NM_017952, intron 16 of 23) intron (NM_017952, intron 16 of 23) -3878 NR_004378 692225 Hs.723087 NR_004378 ENSG00000208772 SNORD94 U94 small nucleolar RNA, C/D box 94 snoRNA 151-62 chr2 125809622 125809789 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 308280 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 149.333-138 chr17 27859133 27859308 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34145 NM_001076680 201229 Hs.687951 NM_001076680 ENSG00000232859 LYRM9 C17orf108|HSD24 LYR motif containing 9 protein-coding 334.333 chr1 118257183 118257464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -72095 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 257.666-26 chr8 109019789 109020110 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66679 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 293.333-30 chr2 71336480 71336821 + 1.33333 NA intron (NM_001252613, intron 1 of 27) MIRb|SINE|MIR 4868 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 203.333-194 chr4 72561901 72562145 + 1.33333 NA intron (NM_014243, intron 2 of 21) intron (NM_014243, intron 2 of 21) 7198 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 168.666 chr1 174849587 174849784 + 1.33333 NA intron (NM_001366446, intron 19 of 25) intron (NM_001366446, intron 19 of 25) -24701 NM_001243763 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 262.667-47 chr20 32424453 32424801 + 1.33333 NA intron (NM_015338, intron 3 of 11) L1ME4a|LINE|L1 58863 NM_001351680 140688 Hs.516978 NM_080616 ENSG00000197183 NOL4L C20orf112|C20orf113 nucleolar protein 4 like protein-coding 193.667-31 chr12 9384943 9385159 + 1.33333 NA intron (NR_120479, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 -3629 NR_120481 101928030 Hs.201719 NR_120481 LOC101928030 - uncharacterized LOC101928030 ncRNA 218.667-12 chr10 29930195 29930527 + 1.33333 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 129225 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 216.666-45 chr2 178426092 178426284 + 1.33333 NA intron (NR_110206, intron 1 of 2) L1M3f|LINE|L1 12529 NR_110205 101927027 Hs.715694 NR_110204 ENSG00000223960 CHROMR CHROME|PRKRA-AS1 cholesterol induced regulator of metabolism RNA ncRNA 207-20 chr11 48790852 48791049 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -240650 NM_001206626 283116 Hs.448644 NM_001206626 ENSG00000182053 TRIM49B - tripartite motif containing 49B protein-coding 247.666-34 chr7 143897369 143897571 + 1.33333 NA intron (NM_001206938, intron 1 of 8) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 4706 NM_014719 9747 Hs.735149 NM_014719 ENSG00000198420 TCAF1 FAM115A TRPM8 channel associated factor 1 protein-coding 327.666-5 chr2 77309025 77309466 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 213131 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 204-5 chr1 67644398 67644580 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -40712 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 272.333-51 chr4 118850652 118851030 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001286754, exon 1 of 5) 5' UTR (NM_001286754, exon 1 of 5) 160 NM_001286754 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 196-27 chr11 13927076 13927308 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2329 NR_135052 101928132 Hs.568970 NR_135052 ENSG00000254438 LINC02683 - long intergenic non-protein coding RNA 2683 ncRNA 218-108 chr8 26735620 26735817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 129937 NM_033304 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 151.667-324 chr6 142830040 142830276 + 1.33333 NA intron (NM_006734, intron 2 of 9) intron (NM_006734, intron 2 of 9) 115018 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 400.999-2 chr5 120190611 120191008 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -273469 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 221.333-116 chr5 123709452 123709838 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 164228 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 477 chr14 72856704 72857318 + 1.33333 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 35638 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 184-17 chr12 26651902 26652061 + 1.33333 NA intron (NM_002223, intron 21 of 56) L1MC4|LINE|L1 181213 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 226.333-111 chr8 126590624 126590908 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -32288 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 194-93 chr3 31286389 31286604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -124709 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 224.666-38 chr8 132880467 132880684 + 1.33333 NA intron (NM_003235, intron 5 of 47) intron (NM_003235, intron 5 of 47) 13617 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 260.666-15 chr2 21682282 21682641 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 28191 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 220-19 chr11 10839241 10839458 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18704 NM_021211 58486 Hs.655066 NM_021211 ENSG00000236287 ZBED5 Buster1 zinc finger BED-type containing 5 protein-coding 341-5 chr12 20073850 20074236 + 1.33333 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 53858 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 115-14 chr1 163489055 163489201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65937 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 517.999-2 chr3 99410163 99410693 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -228166 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 207-38 chr14 70172695 70172910 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 -14306 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 206.666-28 chr12 62540109 62540277 + 1.33333 NA intron (NM_001278469, intron 19 of 35) intron (NM_001278469, intron 19 of 35) 63241 NR_121682 283416 Hs.375881 NM_175895 ENSG00000221949 LINC01465 C12orf61 long intergenic non-protein coding RNA 1465 ncRNA 264.666-12 chr13 48169177 48169453 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -63891 NM_021999 9445 Hs.643683 NM_021999 ENSG00000136156 ITM2B ABRI|BRI|BRI2|BRICD2B|E25B|E3-16|FBD|RDGCA|imBRI2 integral membrane protein 2B protein-coding 310.666-18 chr5 4449291 4449607 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -324032 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 261.333-6 chr1 105960319 105960531 + 1.33333 NA intron (NR_146609, intron 5 of 5) L1MA6|LINE|L1 67828 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 200.667-76 chr2 80319847 80320121 + 1.33333 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) intron (NM_001282599, intron 1 of 11) 6605 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 273.667-10 chr10 24913966 24914274 + 1.33333 NA intron (NM_020200, intron 3 of 8) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 38486 NM_001282786 56952 Hs.405619 NM_020200 ENSG00000099256 PRTFDC1 HHGP phosphoribosyl transferase domain containing 1 protein-coding 324-20 chr4 38679888 38680287 + 1.33333 NA intron (NM_016531, intron 1 of 5) intron (NM_016531, intron 1 of 5) -15459 NR_026804 79667 Hs.29725 NM_024614 ENSG00000231160 KLF3-AS1 - KLF3 antisense RNA 1 ncRNA 224.666-22 chr3 16669477 16669679 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -64155 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 208.999-5 chr4 95550806 95550976 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1918 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 286.666-12 chr3 4031885 4032243 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -231189 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 213-3 chr1 86885413 86885601 + 1.33333 NA intron (NR_144512, intron 2 of 4) intron (NR_144512, intron 2 of 4) 28619 NM_004261 9403 Hs.362728 NM_004261 ENSG00000183291 SELENOF SEP15 selenoprotein F protein-coding 250-4 chr1 96309932 96310349 + 1.33333 NA intron (NR_110693, intron 3 of 5) MER3|DNA|hAT-Charlie 63985 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 333.667-7 chr12 30483429 30483992 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193534 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 325.666-13 chr3 4929406 4929701 + 1.33333 NA intron (NR_125916, intron 1 of 2) intron (NR_125916, intron 1 of 2) -23052 NR_125914 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 202.333-31 chr10 118252862 118253042 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 89372 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 322-35 chr5 136231575 136231908 + 1.33333 NA intron (NM_020389, intron 7 of 11) AluJo|SINE|Alu 5086 NR_133682 106478968 Hs.637713 NR_133682 ENSG00000250947 TRPC7-AS2 CTB-28J9.2 TRPC7 antisense RNA 2 ncRNA 228.666-30 chr3 106733428 106733633 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 507108 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 194.333-66 chr2 70040953 70041134 + 1.33333 NA intron (NR_033872, intron 6 of 10) intron (NR_033872, intron 6 of 10) 45972 NR_033872 400960 Hs.683864 NR_033872 ENSG00000179818 PCBP1-AS1 - PCBP1 antisense RNA 1 ncRNA 145.667-262 chr7 3642892 3643111 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) 341749 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 226-84 chr7 3046148 3046492 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2453 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 233.333-131 chr8 105642359 105642549 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 322911 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 209.666-30 chr2 121207426 121207601 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 77689 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 234.333-27 chr14 62727833 62728233 + 1.33333 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 317425 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 128-52 chr2 175573378 175573540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -391749 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 306.333-40 chr7 77404999 77405455 + 1.33333 NA intron (NR_146937, intron 2 of 31) AluJo|SINE|Alu -9971 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 216.666-13 chr10 54582216 54582389 + 1.33333 NA intron (NR_134503, intron 2 of 5) L1PA15-16|LINE|L1 25655 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 265.667-46 chr3 32359432 32359797 + 1.33333 NA intron (NM_178868, intron 2 of 3) MER58A|DNA|hAT-Charlie -32239 NM_181472 112616 Hs.440494 NM_138410 ENSG00000153551 CMTM7 CKLFSF7 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 7 protein-coding 206.666-2 chr1 40283031 40283219 + 1.33333 NA intron (NM_005857, intron 7 of 9) intron (NM_005857, intron 7 of 9) 24889 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 182.333-15 chr10 24392746 24392985 + 1.33333 NA intron (NM_019590, intron 3 of 20) intron (NM_019590, intron 3 of 20) -56549 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 207.333-48 chr11 41463460 41463755 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -3955 NM_001258419 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 208-173 chr8 132464326 132464542 + 1.33333 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 16661 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 205.666-50 chr7 47157242 47157422 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 307471 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 192.666-68 chr9 78354080 78354281 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 57055 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 146.667-143 chr18 12672431 12672687 + 1.33333 NA TTS (NM_024899) TTS (NM_024899) 13820 NM_147163 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 196-119 chr3 97812017 97812289 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9858 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 190.333-81 chr20 20265911 20266088 + 1.33333 NA intron (NM_015585, intron 21 of 26) intron (NM_015585, intron 21 of 26) -102105 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 360.666-3 chr14 49181917 49182230 + 1.33333 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 404307 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 226.333-16 chr11 31059669 31059844 + 1.33333 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) intron (NM_001367979, intron 20 of 38) -67070 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 296.666-4 chr11 100646086 100646361 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -41065 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 208.333-118 chr5 111904273 111904483 + 1.33333 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) L1MC2|LINE|L1 -8130 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 230.667-44 chr2 188093281 188093604 + 1.33333 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) intron (NR_126396, intron 2 of 2) 194249 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 203.666 chr1 46607762 46608133 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_145279, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_145279, exon 4 of 4) -3679 NR_024176 8569 Hs.371594 NM_003684 ENSG00000079277 MKNK1 MNK1 MAPK interacting serine/threonine kinase 1 protein-coding 250.666-22 chr3 3039013 3039252 + 1.33333 NA TTS (NR_046554) TTS (NR_046554) 22013 NR_046554 100873975 Hs.581502 NR_046554 CNTN4-AS1 - CNTN4 antisense RNA 1 ncRNA 213.333-84 chr19 29306478 29306750 + 1.33333 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) L1ME3C|LINE|L1 -93463 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 213.333-200 chr7 112101320 112101614 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 104932 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 323.666-3 chr10 88860327 88860684 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8661 NM_144590 118932 Hs.217484 NM_144590 ENSG00000152766 ANKRD22 - ankyrin repeat domain 22 protein-coding 220.666-28 chr17 28113514 28113689 + 1.33333 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) MER41A|LTR|ERV1 70924 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 250.333-56 chr5 30535967 30536224 + 1.33333 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 655535 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 214-7 chr1 156313557 156313811 + 1.33333 NA intron (NM_001008800, intron 8 of 11) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -14047 NM_001004319 391104 Hs.532378 NM_001004319 ENSG00000189030 VHLL VHLP|VLP VHL like protein-coding 203.333-46 chr11 95650947 95651106 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 138756 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 205.666-57 chrX 98017245 98017420 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -452797 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 224-91 chr6 151314058 151314356 + 1.33333 NA intron (NM_005100, intron 3 of 4) AluSz6|SINE|Alu -11324 NM_144497 9590 Hs.371240 NM_005100 ENSG00000131016 AKAP12 AKAP250|SSeCKS A-kinase anchoring protein 12 protein-coding 342.666-5 chr10 52921434 52921828 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -149931 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 268.333-54 chr8 118827099 118827552 + 1.33333 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 124560 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 235-51 chr8 80499089 80499404 + 1.33333 NA intron (NM_001105539, intron 1 of 5) intron (NM_001105539, intron 1 of 5) 13020 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 254.333-20 chr14 67519437 67519744 + 1.33333 NA intron (NM_001348546, intron 1 of 2) intron (NM_001348546, intron 1 of 2) -4105 NM_001348548 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 167.333-60 chr12 14790616 14790910 + 1.33333 NA intron (NM_016312, intron 9 of 11) intron (NM_016312, intron 9 of 11) 12715 NM_016312 51729 Hs.655138 NM_016312 ENSG00000084463 WBP11 NPWBP|PPP1R165|SIPP1|WBP-11 WW domain binding protein 11 protein-coding 376.666 chr1 103183148 103183567 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74835 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 258.666-50 chrX 51435806 51436027 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 28968 NM_203407 340602 Hs.97053 NM_203407 ENSG00000187690 EZHIP CXorf67 EZH inhibitory protein protein-coding 192.333-133 chr4 169422808 169423127 + 1.33333 NA intron (NM_001199400, intron 28 of 32) intron (NM_001199400, intron 28 of 32) -152011 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 165.333-123 chr2 52597688 52597868 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 104837 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 205.333-152 chr3 71650807 71651026 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66927 NM_001244810 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 212.666-98 chr9 84326424 84326772 + 1.33333 NA intron (NM_022127, intron 2 of 18) intron (NM_022127, intron 2 of 18) 14160 NR_037638 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 235.666-7 chr2 88571428 88571613 + 1.33333 NA intron (NM_004836, intron 13 of 16) MIR|SINE|MIR 32800 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 266-22 chr14 62674396 62674641 + 1.33333 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 370940 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 226.333-99 chr7 3005091 3005415 + 1.33333 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) FLAM_A|SINE|Alu 38614 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 191.666-2 chr11 55233252 55233416 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -28821 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 297 chr1 16425411 16425669 + 1.33333 NA non-coding (NR_148413, exon 4 of 16) non-coding (NR_148413, exon 4 of 16) 11884 NM_198546 374955 Hs.705501 NM_198546 ENSG00000187144 SPATA21 spergen-2|spergen2 spermatogenesis associated 21 protein-coding 230-6 chr1 199241853 199242199 + 1.33333 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) intron (NR_147896, intron 3 of 3) 93428 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 396.999 chr1 159503912 159504300 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31901 NM_001004469 127385 Hs.553587 NM_001004469 ENSG00000184155 OR10J5 OR1-28 olfactory receptor family 10 subfamily J member 5 protein-coding 201.333-177 chr22 42837993 42838259 + 1.33333 NA intron (NM_014570, intron 3 of 15) MER106B|DNA|hAT-Charlie 19147 NM_014570 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 197.666-70 chr9 121194742 121194949 + 1.33333 NA intron (NM_016322, intron 1 of 7) intron (NM_016322, intron 1 of 7) -6638 NM_001353053 2934 Hs.522373 NM_000177 ENSG00000148180 GSN ADF|AGEL gelsolin protein-coding 332.666-28 chr7 53671672 53671951 + 1.33333 NA intron (NR_038371, intron 5 of 5) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 140120 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 196-110 chr22 36988085 36988351 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 19633 NM_001163857 339669 Hs.124502 NM_178552 ENSG00000185264 TEX33 C22orf33|EAN57|cE81G9.2 testis expressed 33 protein-coding 189.333-62 chr15 87289254 87289404 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -287600 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 292.666-25 chr4 13308829 13309182 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 175335 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 303.333-20 chr13 77520436 77521008 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14952 NM_001160706 8796 Hs.534699 NM_003843 ENSG00000136155 SCEL - sciellin protein-coding 199.666-50 chr6 67110407 67110660 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -944818 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 203.333-172 chr3 57002519 57002711 + 1.33333 NA intron (NM_001128615, intron 2 of 12) L1PA13|LINE|L1 -58049 NM_181727 353324 Hs.129794 NM_181727 ENSG00000186451 SPATA12 SRG5 spermatogenesis associated 12 protein-coding 246.667-62 chr4 55143061 55143418 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -17644 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 213.333-31 chr11 12529472 12529651 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018222, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_018222, exon 13 of 13) -144860 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 204-104 chr2 167463896 167464092 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 276622 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 312.666-12 chr2 103569257 103569574 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -584986 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 198.333-34 chr11 90827366 90827593 + 1.33333 NA intron (NR_104190, intron 4 of 6) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 41723 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 276.333-50 chr5 148161606 148161882 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6802 NM_001001325 408187 Hs.553815 NM_001001325 ENSG00000196800 SPINK14 SPINK5L2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (putative) protein-coding 280-12 chr14 60596128 60596405 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -42950 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 302-24 chr18 3010272 3010829 + 1.33333 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) 1397 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 195-88 chr5 77559711 77559904 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67491 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 181.333-148 chr6 2074665 2074821 + 1.33333 NA intron (NM_001253846, intron 4 of 10) AluJr|SINE|Alu 101248 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 213-79 chr7 3007242 3007554 + 1.33333 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) intron (NM_001324281, intron 1 of 25) 36469 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 248.666-5 chr1 212597081 212597409 + 1.33333 NA intron (NM_001030287, intron 1 of 3) intron (NM_001030287, intron 1 of 3) -11516 NM_001040619 467 Hs.460 NM_001674 ENSG00000162772 ATF3 - activating transcription factor 3 protein-coding 236-61 chr4 43735067 43735321 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -242651 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 304.333-14 chr17 59801612 59802110 + 1.33333 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) AluSq2|SINE|Alu -39405 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 196.666-96 chr7 35490484 35490734 + 1.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 176754 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 200.333-27 chr12 19278724 19278923 + 1.33333 NA intron (NM_001256787, intron 8 of 25) intron (NM_001256787, intron 8 of 25) 73498 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 366.667-17 chr6 123090175 123090678 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 94191 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 132.333-97 chr2 205693615 205693806 + 1.33333 NA intron (NM_018534, intron 1 of 15) intron (NM_018534, intron 1 of 15) 11209 NM_018534 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 222.667-74 chr5 41394608 41394885 + 1.33333 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) L1MA1|LINE|L1 115855 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 249.666-7 chr1 151103806 151104060 + 1.33333 NA intron (NM_001323913, intron 5 of 7) intron (NM_001323913, intron 5 of 7) 33172 NM_001323911 126626 Hs.15671 NM_144618 ENSG00000143458 GABPB2 GABPB-2 GA binding protein transcription factor subunit beta 2 protein-coding 233.333-65 chr2 116167310 116167487 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 823583 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 374.667-15 chr7 132700617 132701168 + 1.33333 NA intron (NR_046323, intron 3 of 4) intron (NR_046323, intron 3 of 4) 52098 NR_046323 286023 Hs.671875 NM_173682 ENSG00000183470 FLJ40288 - uncharacterized FLJ40288 ncRNA 205-78 chr6 37935804 37935972 + 1.33333 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 116161 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 242.333-103 chr9 21618824 21619094 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -59161 NR_027054 554202 Hs.458096 NR_027054 MIR31HG LncHIFCAR|hsa-lnc-31 MIR31 host gene ncRNA 114-105 chr4 87737451 87737603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62027 NM_004967 3381 Hs.518726 NM_004967 ENSG00000029559 IBSP BNSP|BSP|BSP-II|SP-II integrin binding sialoprotein protein-coding 153.333-134 chr15 40505161 40505363 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 27288 NR_002208 359821 Hs.678598 NR_002208 MRPL42P5 - mitochondrial ribosomal protein L42 pseudogene 5 pseudo 358.333-4 chr1 173491214 173491793 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14168 NM_004905 9588 Hs.120 NM_004905 ENSG00000117592 PRDX6 1-Cys|AOP2|HEL-S-128m|NSGPx|PRX|aiPLA2|p29 peroxiredoxin 6 protein-coding 226-49 chr2 225969165 225969456 + 1.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -173484 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 214-43 chr15 95037340 95037556 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 182085 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 304.666-23 chr5 142094465 142094785 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14154 NM_030571 80762 Hs.9788 NM_030571 ENSG00000131507 NDFIP1 N4WBP5 Nedd4 family interacting protein 1 protein-coding 311.333-24 chr17 82037478 82037934 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001195218) promoter-TSS (NM_001195218) -9 NM_016286 51181 Hs.9857 NM_016286 ENSG00000169738 DCXR DCR|HCR2|HCRII|KIDCR|P34H|PNTSU|SDR20C1|XR dicarbonyl and L-xylulose reductase protein-coding 171-16 chr13 28702407 28702561 + 1.33333 NA intron (NM_001347960, intron 5 of 5) L1ME4c|LINE|L1 16486 NM_001135919 283537 Hs.117167 NM_181785 ENSG00000139508 SLC46A3 FKSG16 solute carrier family 46 member 3 protein-coding 203.333-180 chr3 124701779 124701986 + 1.33333 NA intron (NM_007064, intron 23 of 26) intron (NM_007064, intron 23 of 26) -28484 NR_033437 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 205.333-162 chr3 167900870 167901088 + 1.33333 NA intron (NR_145443, intron 1 of 6) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 5031 NR_145443 646168 Hs.390443 NR_033843 ENSG00000244227 LRRC77P LINC01330 leucine rich repeat containing 77, pseudogene pseudo 320-35 chr4 43822972 43823474 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -193638 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 285.333-24 chr17 34978560 34978925 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1756 NM_002311 3980 Hs.100299 NM_002311 ENSG00000005156 LIG3 LIG2|LIG3alpha DNA ligase 3 protein-coding 201.333-207 chr4 39398808 39399071 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7991 NM_175737 152831 Hs.90756 NM_175737 ENSG00000134962 KLB BKL klotho beta protein-coding 155.667-272 chr5 30632718 30632958 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -560848 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 177-7 chr10 70044370 70044547 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -8388 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 269.666-10 chr2 181485433 181485774 + 1.33333 NA intron (NM_000885, intron 9 of 27) L2b|LINE|L2 28217 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 155.333-153 chr19 34326384 34326604 + 1.33333 NA intron (NM_014686, intron 3 of 13) intron (NM_014686, intron 3 of 13) -38246 NM_001184722 2821 Hs.466471 NM_000175 ENSG00000105220 GPI AMF|GNPI|NLK|PGI|PHI|SA-36|SA36 glucose-6-phosphate isomerase protein-coding 201.667-60 chr2 222407698 222407967 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -16156 NM_001320834 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 174.333-86 chr3 37872326 37872496 + 1.33333 NA intron (NM_001008392, intron 1 of 7) L1MD1|LINE|L1 10531 NM_001008392 10217 Hs.475963 NM_005808 ENSG00000144677 CTDSPL C3orf8|HYA22|PSR1|RBSP3|SCP3 CTD small phosphatase like protein-coding 256.333-72 chr6 143360860 143361226 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 81634 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 240.999-2 chr2 99423630 99423935 + 1.33333 NA intron (NR_135652, intron 10 of 21) intron (NR_135652, intron 10 of 21) 66235 NM_001037872 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 275-54 chr9 126459889 126460250 + 1.33333 NA intron (NM_033446, intron 7 of 9) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron -49565 NR_045006 641373 Hs.742606 NR_045006 NRON NCRNA00194 non-coding repressor of NFAT ncRNA 198-101 chr2 175254044 175254210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -72417 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 205-103 chr8 125425260 125425462 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4997 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 216.333-27 chr11 33036682 33036906 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2778 NM_018393 55346 Hs.655341 NM_018393 ENSG00000176148 TCP11L1 dJ85M6.3 t-complex 11 like 1 protein-coding 210.333-149 chr6 125632836 125633040 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41415 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 256-72 chr4 169093927 169094247 + 1.33333 NA TTS (NM_020870) TTS (NM_020870) -83832 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 243-34 chr2 197044661 197044880 + 1.33333 NA intron (NM_001367496, intron 16 of 27) intron (NM_001367496, intron 16 of 27) -118063 NM_001321099 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 140.667-85 chr15 55317180 55317331 + 1.33333 NA TTS (NM_001308423) TTS (NM_001308423) 1868 NM_001308421 101928527 Hs.493512 NM_001308421 ENSG00000225973 PIGBOS1 HP06981 PIGB opposite strand 1 protein-coding 340-15 chr2 31221590 31222053 + 1.33333 NA intron (NM_001321270, intron 2 of 21) intron (NM_001321270, intron 2 of 21) -4306 NM_001145122 440854 Hs.468059 NM_001145122 ENSG00000214711 CAPN14 - calpain 14 protein-coding 194.666-14 chr12 41343993 41344181 + 1.33333 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -93652 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 182.333-64 chr17 63153294 63153482 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 187153 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 197-8 chr1 173530152 173530425 + 1.33333 NA intron (NM_178527, intron 17 of 27) MER5A|DNA|hAT-Charlie 52953 NM_004905 9588 Hs.120 NM_004905 ENSG00000117592 PRDX6 1-Cys|AOP2|HEL-S-128m|NSGPx|PRX|aiPLA2|p29 peroxiredoxin 6 protein-coding 208.333-74 chr2 109015178 109015396 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -26067 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 224.333-35 chr14 30313740 30313953 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -245277 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 227-50 chr6 120219254 120219622 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 204259 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 295.667-15 chr2 46439586 46440060 + 1.33333 NA intron (NR_103805, intron 1 of 3) intron (NR_103805, intron 1 of 3) 10633 NR_103805 101805491 Hs.304781 NR_103805 ENSG00000187600 LINC02583 - long intergenic non-protein coding RNA 2583 ncRNA 191.333-33 chr11 46631171 46631435 + 1.33333 NA intron (NM_001346360, intron 2 of 16) AluJr|SINE|Alu 14027 NM_001346326 9776 Hs.127403 NM_014741 ENSG00000175224 ATG13 KIAA0652|PARATARG8 autophagy related 13 protein-coding 272.999-3 chr2 64056094 64056304 + 1.33333 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -36771 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 370.666-8 chr2 232638594 232638903 + 1.33333 NA intron (NM_001308395, intron 2 of 4) intron (NM_001308395, intron 2 of 4) 5144 NM_025202 80303 Hs.516769 NM_025202 ENSG00000115468 EFHD1 MST133|MSTP133|PP3051|SWS2 EF-hand domain family member D1 protein-coding 162-42 chr14 61645442 61645639 + 1.33333 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -49973 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 188-57 chr2 99346247 99346507 + 1.33333 NA intron (NM_015904, intron 1 of 23) intron (NM_015904, intron 1 of 23) 8988 NM_015904 9669 Hs.158688 NM_015904 ENSG00000158417 EIF5B IF2 eukaryotic translation initiation factor 5B protein-coding 152.666-12 chr9 110537382 110537541 + 1.33333 NA intron (NM_153366, intron 3 of 47) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 42280 NM_153366 79987 Hs.522334 NM_153366 ENSG00000165124 SVEP1 C9orf13|CCP22|POLYDOM|SEL-OB|SELOB sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 protein-coding 158-75 chr2 145463391 145463533 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 795495 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 214.666-39 chr20 8932976 8933146 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 101876 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 186.666-41 chr5 175607563 175607734 + 1.33333 NA Intergenic MER97b|DNA|hAT-Tip100 -50423 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 198.333-18 chr1 212090920 212091173 + 1.33333 NA intron (NM_001286229, intron 11 of 12) intron (NM_001286229, intron 11 of 12) 13433 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 167.667-66 chr15 62047896 62048064 + 1.33333 NA intron (NM_001018088, intron 1 of 81) intron (NM_001018088, intron 1 of 81) 12467 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 428-4 chr2 22544225 22544726 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 7996 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 195.666-13 chr12 18226626 18226823 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -34816 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 200.667-146 chr7 52300695 52300994 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -734789 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 186.666-50 chr8 72142967 72143198 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67498 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 131-51 chr2 83103752 83103937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 247041 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 270.333-11 chr10 74261592 74261808 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) HAL1|LINE|L1 84937 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 264-6 chr1 162415258 162415615 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3300 NM_053282 117157 Hs.350581 NM_053282 ENSG00000198574 SH2D1B EAT2 SH2 domain containing 1B protein-coding 164.666-13 chr4 187366152 187366395 + 1.33333 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) L1MD2|LINE|L1 -4375 NR_149103 105377602 Hs.582096 NR_149103 ENSG00000250042 LINC02514 - long intergenic non-protein coding RNA 2514 ncRNA 202-170 chr7 2390801 2391026 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12698 NM_001243795 55501 Hs.288853 NM_018641 ENSG00000136213 CHST12 C4S-2|C4ST-2|C4ST2 carbohydrate sulfotransferase 12 protein-coding 260.667-11 chr10 66666545 66666980 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) MER106A|DNA|hAT-Charlie -259274 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 234.667-83 chr4 98831816 98832127 + 1.33333 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 97162 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 208.667-152 chrX 20160740 20161000 + 1.33333 NA intron (NM_004586, intron 20 of 21) intron (NM_004586, intron 20 of 21) -19032 NM_001412 1964 Hs.522590 NM_001412 ENSG00000173674 EIF1AX EIF1A|EIF1AP1|EIF4C|eIF-1A|eIF-4C eukaryotic translation initiation factor 1A X-linked protein-coding 189.333-195 chr7 103316052 103316307 + 1.33333 NA intron (NM_001362668, intron 14 of 17) intron (NM_001362668, intron 14 of 17) 18744 NM_004279 9512 Hs.184211 NM_004279 ENSG00000105819 PMPCB Beta-MPP|MPP11|MPPB|MPPP52|P-52 peptidase, mitochondrial processing beta subunit protein-coding 264.667-86 chr8 84330441 84330767 + 1.33333 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) -84880 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 421.666-2 chr14 59945642 59946109 + 1.33333 NA intron (NR_075071, intron 8 of 32) L1ME4a|LINE|L1 26162 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 242-8 chr1 188275086 188275434 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 831632 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 160.667-25 chr1 225811981 225812214 + 1.33333 NA intron (NM_001291163, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 1963 NM_001291163 2052 Hs.89649 NM_000120 ENSG00000143819 EPHX1 EPHX|EPOX|HYL1|MEH epoxide hydrolase 1 protein-coding 215.333-205 chr8 139777751 139777932 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) L1MC1|LINE|L1 -74718 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 185-26 chr17 57342095 57342338 + 1.33333 NA intron (NM_001322250, intron 5 of 13) intron (NM_001322250, intron 5 of 13) 85197 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 282-13 chr14 59586312 59586644 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9666 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 222.333-33 chr15 67239314 67239529 + 1.33333 NA intron (NM_001271885, intron 1 of 9) intron (NM_001271885, intron 1 of 9) 15240 NM_024666 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 219.333-137 chr5 1224364 1224608 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_182632) promoter-TSS (NM_182632) -895 NM_182632 348932 Hs.213284 NM_182632 ENSG00000164363 SLC6A18 Xtrp2 solute carrier family 6 member 18 protein-coding 237.333-116 chr8 55406975 55407206 + 1.33333 NA intron (NM_052898, intron 2 of 2) intron (NM_052898, intron 2 of 2) 48231 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 193-24 chr15 59914661 59914835 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89563 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 168-19 chr12 27308412 27308568 + 1.33333 NA intron (NM_015000, intron 4 of 13) intron (NM_015000, intron 4 of 13) -24346 NM_020183 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 358-21 chr5 119592940 119593473 + 1.33333 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -36352 NM_001367956 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 199.666-42 chr4 75637721 75637881 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -7273 NM_003948 8999 Hs.591698 NM_003948 ENSG00000138769 CDKL2 KKIAMRE|P56 cyclin dependent kinase like 2 protein-coding 202.666-73 chr3 57108029 57108184 + 1.33333 NA intron (NM_001318864, intron 6 of 13) AluSg|SINE|Alu -28838 NM_001128615 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 156.333-264 chr4 45754597 45754733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 369389 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 305.666 chr1 183677688 183677987 + 1.33333 NA intron (NM_001297670, intron 1 of 17) MIR|SINE|MIR -24521 NM_203454 403314 Hs.97335 NM_203454 ENSG00000173627 APOBEC4 C1orf169 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4 protein-coding 199.666-48 chr5 111606154 111606326 + 1.33333 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) L1MB8|LINE|L1 -93643 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 209-84 chr4 157096455 157096614 + 1.33333 NA intron (NM_000824, intron 2 of 9) intron (NM_000824, intron 2 of 9) 20131 NM_001166060 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 251-2 chr1 74370079 74370444 + 1.33333 NA intron (NM_015978, intron 16 of 24) intron (NM_015978, intron 16 of 24) 113179 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 204.333-119 chr3 20724829 20725022 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 382457 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 256.333-32 chr15 71061985 71062489 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -79212 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 210.333-18 chr10 101780226 101780439 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001206389) promoter-TSS (NM_001206389) 37 NM_001206389 2253 Hs.57710 NM_006119 ENSG00000107831 FGF8 AIGF|FGF-8|HBGF-8|HH6|KAL6 fibroblast growth factor 8 protein-coding 349.333-22 chr22 39910099 39910548 + 1.33333 NA intron (NM_004810, intron 1 of 7) CR1-3_Croc|LINE|CR1 9239 NM_004810 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 198.666-74 chr5 28440070 28440223 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -152481 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 190.666-29 chr20 7191806 7191993 + 1.33333 NA intron (NR_110609, intron 3 of 7) intron (NR_110609, intron 3 of 7) 62303 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 286.999-4 chr12 122738689 122738916 + 1.33333 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -7958 NM_032554 27198 Hs.610873 NM_032554 ENSG00000196917 HCAR1 FKSG80|GPR104|GPR81|HCA1|LACR1|TA-GPCR|TAGPCR hydroxycarboxylic acid receptor 1 protein-coding 286.999-7 chr2 105863352 105863597 + 1.33333 NA intron (NM_001004722, intron 3 of 3) intron (NM_001004722, intron 3 of 3) 11627 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 238.666-4 chr1 185609744 185610011 + 1.33333 NA intron (NR_110793, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 18611 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 176.666-18 chr3 45268331 45268491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42124 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 213-5 chr1 175800902 175801153 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57432 NM_001328635 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 200-102 chr3 51167351 51167532 + 1.33333 NA intron (NM_004947, intron 12 of 52) L1MA9|LINE|L1 -217850 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 233.667-53 chr3 134171831 134172071 + 1.33333 NA intron (NM_001005861, intron 13 of 14) intron (NM_001005861, intron 13 of 14) 78793 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 207.333-64 chr12 67880565 67880770 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -48568 NR_120456 101927922 Hs.450769 NR_120456 ENSG00000255772 LINC01479 HRAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1479 ncRNA 292.333-41 chr7 41427563 41427886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -266195 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 178-89 chr5 34024692 34024847 + 1.33333 NA intron (NR_037951, intron 4 of 8) intron (NR_037951, intron 4 of 8) -16719 NM_001167595 23600 Hs.508343 NM_014324 ENSG00000242110 AMACR AMACRD|CBAS4|P504S|RACE|RM alpha-methylacyl-CoA racemase protein-coding 217.333-21 chr10 60418276 60418521 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) L2c|LINE|L2 -28523 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 398.333-2 chr1 168826303 168826852 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39636 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 206-190 chr8 126468360 126468653 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 89972 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 290.333-13 chr15 83213512 83214014 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -5940 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 501-4 chr4 49711180 49711747 + 1.33333 NA Intergenic SAR|Satellite|Satellite 724821 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 300.666-5 chr15 61487824 61488127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -241943 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 191.333-190 chr7 78130050 78130208 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 17 of 20) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -217113 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 156.333-231 chr3 46084204 46084437 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56837 NM_005283 2829 Hs.128375 NM_005283 ENSG00000173578 XCR1 CCXCR1|GPR5 X-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 260.666-34 chr9 130696318 130696684 + 1.33333 NA intron (NR_104230, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 2721 NM_014285 23404 Hs.654643 NM_014285 ENSG00000130713 EXOSC2 RRP4|Rrp4p|SHRF|hRrp4p|p7 exosome component 2 protein-coding 218.333-85 chr3 97919816 97920069 + 1.33333 NA intron (NM_153605, intron 17 of 21) AluJb|SINE|Alu 52489 NM_153182 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 122.666 chr17 61662035 61662216 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70906 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 183.333-106 chr3 122571004 122571154 + 1.33333 NA intron (NM_138287, intron 4 of 4) intron (NM_138287, intron 4 of 4) -6295 NM_031458 83666 Hs.518200 NM_031458 ENSG00000138496 PARP9 ARTD9|BAL|BAL1|MGC:7868 poly(ADP-ribose) polymerase family member 9 protein-coding 245.666-20 chr4 131559600 131559895 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205091 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 214-146 chr9 96544675 96544868 + 1.33333 NA intron (NR_147239, intron 5 of 14) AluJb|SINE|Alu 22060 NM_001351569 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 197.333-65 chr14 54695169 54695368 + 1.33333 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -59565 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 409.666-7 chr4 47634106 47634651 + 1.33333 NA intron (NM_006587, intron 16 of 21) AluSq2|SINE|Alu -18291 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 286.333-6 chr12 40325529 40325763 + 1.33333 NA intron (NM_198578, intron 38 of 50) intron (NM_198578, intron 38 of 50) -67748 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 188.666-17 chr15 49245085 49245258 + 1.33333 NA intron (NM_001289030, intron 6 of 10) HAL1|LINE|L1 74924 NM_001289030 2585 Hs.122006 NM_002044 ENSG00000156958 GALK2 GK2 galactokinase 2 protein-coding 130.667-90 chr17 75925549 75925696 + 1.33333 NA intron (NM_001319193, intron 11 of 28) intron (NM_001319193, intron 11 of 28) 12610 NM_001319193 85302 Hs.720068 NM_001080542 ENSG00000188878 FBF1 Alb|FBF-1 Fas binding factor 1 protein-coding 241.333-57 chr2 206890518 206890724 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -48897 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 377.333-3 chr14 69451482 69451905 + 1.33333 NA intron (NM_001252148, intron 3 of 5) intron (NM_001252148, intron 3 of 5) -33035 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 213.666-8 chr11 4138880 4139139 + 1.33333 NA TTS (NM_001318065) TTS (NM_001318065) 22931 NM_001318065 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 129-29 chr12 80628275 80628435 + 1.33333 NA intron (NM_001145026, intron 33 of 44) intron (NM_001145026, intron 33 of 44) -79279 NM_002469 4618 Hs.35937 NM_002469 ENSG00000111046 MYF6 CNM3|MRF4|bHLHc4|myf-6 myogenic factor 6 protein-coding 336.333-28 chr5 45184392 45184892 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 375695 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 228-19 chr12 10019211 10019547 + 1.33333 NA TTS (NM_001129998) TTS (NM_001129998) 8752 NR_135049 387837 Hs.127937 NM_205852 ENSG00000256660 CLEC12B UNQ5782 C-type lectin domain family 12 member B protein-coding 155-87 chr3 57256776 57256915 + 1.33333 NA intron (NM_012096, intron 13 of 21) intron (NM_012096, intron 13 of 21) -12721 NR_135535 105377102 Hs.745243 NR_135535 LOC105377102 - uncharacterized LOC105377102 ncRNA 192-142 chr7 104324963 104325210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3570 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 214-143 chr9 26904132 26904410 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001031689, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001031689, exon 14 of 14) -11443 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 210.666-95 chr6 157470125 157470486 + 1.33333 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu -58827 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 120.333-129 chr3 89820317 89820460 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 712767 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 183.333-70 chr17 71175513 71175728 + 1.33333 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) L1MEd|LINE|L1 26559 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 263.333-47 chr2 206605260 206605643 + 1.33333 NA intron (NM_003812, intron 24 of 25) intron (NM_003812, intron 24 of 25) -38776 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 317.666-13 chr8 78663158 78663454 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2783 NM_016010 51101 Hs.271876 NM_016010 ENSG00000104427 ZC2HC1A C8orf70|CGI-62|FAM164A zinc finger C2HC-type containing 1A protein-coding 209.333-188 chr5 41600165 41600369 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89666 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 293-17 chr14 43629257 43629595 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 877857 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 203.333-17 chr1 207168149 207168355 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 64019 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 194-106 chr5 59958296 59958565 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -64704 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 197.333-145 chr3 39079098 39079482 + 1.33333 NA intron (NR_144401, intron 10 of 19) intron (NR_144401, intron 10 of 19) 26998 NM_001346228 57599 Hs.109778 NM_020839 ENSG00000114742 WDR48 P80|SPG60|UAF1 WD repeat domain 48 protein-coding 213.333-92 chr2 49344597 49344840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -190191 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 246-52 chr2 177096912 177097206 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 115352 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 276-58 chr6 116483569 116484009 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22414 NM_001276460 441168 Hs.381220 NM_001010919 ENSG00000188820 CALHM6 C6orf187|FAM26F|INAM|dJ93H18.5 calcium homeostasis modulator family member 6 protein-coding 191.333-123 chr20 58683572 58683725 + 1.33333 NA intron (NR_037945, intron 8 of 22) AluY|SINE|Alu -5483 NM_001204873 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 271.666-16 chr8 127129859 127130090 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47753 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 286-50 chr5 64287442 64287713 + 1.33333 NA intron (NM_001113561, intron 5 of 7) L1PA10|LINE|L1 121734 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 198.667-112 chr2 189730846 189731144 + 1.33333 NA intron (NM_144708, intron 16 of 22) intron (NM_144708, intron 16 of 22) -31785 NR_102429 101409258 Hs.738558 NR_102429 OSGEPL1-AS1 - OSGEPL1 antisense RNA 1 ncRNA 202-15 chr10 29273216 29273413 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -15756 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 266.666-8 chr11 80981604 80981901 + 1.33333 NA Intergenic LTR1D1|LTR|ERV1 -218949 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 209.333-253 chr9 105524489 105524650 + 1.33333 NA non-coding (NR_104269, exon 1 of 1) non-coding (NR_104269, exon 1 of 1) 4745 NR_104269 26134 Hs.113150 NR_104269 ENSG00000229419 RALGAPA1P1 GARNL2|GARNL2P|RALGAPA1P|bA235C23.1 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1 pseudogene 1 pseudo 437.333-11 chr7 1435216 1435687 + 1.33333 NA intron (NM_182924, intron 15 of 16) intron (NM_182924, intron 15 of 16) 24019 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 212.666-28 chr14 71069719 71069998 + 1.33333 NA intron (NM_014982, intron 26 of 35) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 162399 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 351.667-6 chr14 20000320 20000806 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1499 NM_001348271 390432 NM_001348271 ENSG00000196383 OR4Q2 OR4Q2P olfactory receptor family 4 subfamily Q member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 172.666-26 chr8 66669168 66669315 + 1.33333 NA intron (NR_161217, intron 1 of 1) intron (NR_161217, intron 1 of 1) 1645 NR_161217 56260 Hs.661238 NM_019607 ENSG00000213865 C8orf44 - chromosome 8 open reading frame 44 ncRNA 228.333-22 chr12 121300190 121300376 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1975 NM_006549 10645 Hs.297343 NM_006549 ENSG00000110931 CAMKK2 CAMKK|CAMKKB calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 protein-coding 218.666-2 chr1 79793926 79794132 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -741726 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 207.333-121 chr18 775953 776189 + 1.33333 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) L1ME3A|LINE|L1 36171 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 191-26 chr18 67555888 67556083 + 1.33333 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) L1MC1|LINE|L1 -39265 NM_032160 92126 Hs.124673 NM_032160 ENSG00000171451 DSEL C18orf4|DE-epi2 dermatan sulfate epimerase like protein-coding 343.666-9 chr8 28176915 28177266 + 1.33333 NA intron (NM_018091, intron 14 of 14) intron (NM_018091, intron 14 of 14) 83951 NM_001284220 55140 Hs.491336 NM_018091 ENSG00000134014 ELP3 KAT9 elongator acetyltransferase complex subunit 3 protein-coding 197-42 chr16 72256372 72256548 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84010 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 213-87 chr8 139720261 139720513 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17264 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 240.666-37 chr7 10189657 10190000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -512848 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 177.666-5 chr13 113499540 113499692 + 1.33333 NA intron (NM_001349742, intron 3 of 11) intron (NM_001349742, intron 3 of 11) 8595 NM_017905 55002 Hs.317593 NM_017905 ENSG00000150403 TMCO3 C13orf11 transmembrane and coiled-coil domains 3 protein-coding 144.333-36 chr11 58736327 58736510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4444 NM_005838 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 178-14 chr10 9055000 9055224 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 157123 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 187.333-12 chr1 191208426 191208596 + 1.33333 NA Intergenic MADE2|DNA|TcMar-Mariner 19987 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 208.666-32 chr12 83774434 83774636 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 1087380 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 200-90 chr2 235197227 235197385 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 169571 NM_001371306 126.333-93 chr2 118470896 118471069 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 131984 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 210.333-9 chr1 222434189 222434364 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113828 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 163.333-213 chr5 13212748 13212910 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -179943 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 196-149 chr5 76136168 76136445 + 1.33333 NA intron (NM_014979, intron 2 of 12) L2b|LINE|L2 52923 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 299.333-54 chr3 910774 911161 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -182057 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 284-42 chr4 47772948 47773378 + 1.33333 NA intron (NM_001278585, intron 2 of 19) intron (NM_001278585, intron 2 of 19) -58182 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 443.666-2 chr17 22738849 22739241 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 215934 NM_001190452 100462977 Hs.740185 NM_001190452 ENSG00000256618 MTRNR2L1 HN1 MT-RNR2 like 1 protein-coding 213.667-2 chr1 56239251 56239538 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -175569 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 262-48 chr2 195150185 195150462 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 419728 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 228.667-50 chr20 46083315 46083662 + 1.33333 NA intron (NM_001348150, intron 1 of 8) LTR54|LTR|ERV1 6474 NM_001348149 57727 Hs.654991 NM_020967 ENSG00000124160 NCOA5 CIA|bA465L10.6 nuclear receptor coactivator 5 protein-coding 164.666-2 chr1 31356916 31357056 + 1.33333 NA intron (NM_001282571, intron 6 of 6) intron (NM_001282571, intron 6 of 6) 16090 NM_004102 2170 Hs.576372 NM_004102 ENSG00000121769 FABP3 FABP11|H-FABP|M-FABP|MDGI|O-FABP fatty acid binding protein 3 protein-coding 475.333 chr10 62687884 62688355 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116601 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 190.666-35 chr3 100368025 100368269 + 1.33333 NA exon (NM_014820, exon 11 of 12) exon (NM_014820, exon 11 of 12) 32942 NM_014820 9868 Hs.227253 NM_014820 ENSG00000154174 TOMM70 TOMM70A|Tom70 translocase of outer mitochondrial membrane 70 protein-coding 201.333-178 chr3 12346228 12346397 + 1.33333 NA intron (NM_001330615, intron 1 of 5) intron (NM_001330615, intron 1 of 5) -5105 NM_001354668 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 181.333-85 chr2 194299423 194299666 + 1.33333 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -44725 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 220.666-66 chr7 17882833 17883009 + 1.33333 NA exon (NM_001350870, exon 6 of 6) exon (NM_001350870, exon 6 of 6) 57573 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 168-35 chr15 60158537 60158770 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 154342 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 366.333-14 chr3 42471906 42472323 + 1.33333 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -17185 NM_001251882 7433 Hs.348500 NM_004624 ENSG00000114812 VIPR1 HVR1|II|PACAP-R-2|PACAP-R2|RDC1|V1RG|VAPC1|VIP-R-1|VIPR|VIRG|VPAC1|VPAC1R|VPCAP1R vasoactive intestinal peptide receptor 1 protein-coding 276.333-56 chr6 81889648 81889996 + 1.33333 NA intron (NR_149135, intron 3 of 3) intron (NR_149135, intron 3 of 3) 43658 NR_149136 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 297.333-23 chr14 81152253 81152655 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50380 NR_003021 677845 Hs.693251 NR_003021 ENSG00000221303 SNORA79 ACA65|SNORA79A small nucleolar RNA, H/ACA box 79 snoRNA 247-59 chr4 88147843 88148234 + 1.33333 NA intron (NM_001257386, intron 1 of 15) intron (NM_001257386, intron 1 of 15) 10601 NM_004827 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 263.333-50 chr2 234933411 234933738 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18443 NM_014521 23677 Hs.516777 NM_014521 ENSG00000130147 SH3BP4 BOG25|TTP SH3 domain binding protein 4 protein-coding 205.333-10 chr1 57141507 57141800 + 1.33333 NA intron (NM_001365793, intron 3 of 14) LTR33|LTR|ERVL -175513 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 150.666-5 chr12 19409895 19410070 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29510 NM_001363736 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 150-135 chr7 107301385 107301520 + 1.33333 NA intron (NM_181733, intron 11 of 20) L1ME1|LINE|L1 132449 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 202.666-85 chr4 32503191 32503427 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 152271 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 213.333-39 chr12 20427592 20427842 + 1.33333 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 58472 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 204.666-41 chr2 146273426 146273723 + 1.33333 NA Intergenic UCON55|DNA|TcMar-Tigger -313483 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 223.666-35 chrX 39206201 39206475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121024 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 283.333-36 chr2 182291755 182292088 + 1.33333 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) -49858 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 320-50 chr8 83172515 83172848 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -231077 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 207.333-281 chr9 111404852 111405119 + 1.33333 NA intron (NM_001363756, intron 23 of 48) L1MA4|LINE|L1 -74761 NM_205859 26248 Hs.381312 NM_205859 ENSG00000171133 OR2K2 HSHTPCRH06|HTPCRH06|OR2AN1P|OR2AR1P olfactory receptor family 2 subfamily K member 2 protein-coding 255.666-4 chr1 211762424 211762810 + 1.33333 NA intron (NM_014873, intron 6 of 7) intron (NM_014873, intron 6 of 7) -67020 NR_135818 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 242.666-27 chr3 19026879 19027101 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -121520 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 304.667-8 chr11 83250330 83250704 + 1.33333 NA intron (NM_001300972, intron 11 of 11) MIRc|SINE|MIR 35890 NM_021825 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 249-41 chr2 160969251 160969558 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -167551 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 275.667-46 chr5 122870219 122870635 + 1.33333 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) intron (NM_014035, intron 1 of 6) 24814 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 190-87 chr4 52069378 52069602 + 1.33333 NA intron (NM_001297608, intron 4 of 11) intron (NM_001297608, intron 4 of 11) 18186 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 162-73 chr2 180660322 180660509 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31689 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 161.333-72 chr12 109350048 109350240 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9344 NR_120462 101928138 Hs.143843 NR_120462 ENSG00000256560 LINC01486 - long intergenic non-protein coding RNA 1486 ncRNA 243.999-4 chr16 47382720 47383007 + 1.33333 NA intron (NM_030790, intron 6 of 17) intron (NM_030790, intron 6 of 17) 78200 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 194.666-52 chr4 113578745 113578943 + 1.33333 NA intron (NM_001221, intron 4 of 18) intron (NM_001221, intron 4 of 18) 182894 NM_001321592 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 260.666-5 chr10 75144328 75144632 + 1.33333 NA intron (NM_144660, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 32824 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 227.333-129 chr8 123791381 123791601 + 1.33333 NA intron (NM_144963, intron 15 of 23) intron (NM_144963, intron 15 of 23) 23052 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 148.333-350 chr6 167741181 167741408 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -54235 NR_149041 441179 Hs.192711 NR_149041 ENSG00000269155 LOC441179 - uncharacterized LOC441179 ncRNA 208-117 chr4 37082993 37083258 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 81346 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 191.333-198 chr8 50767183 50767441 + 1.33333 NA intron (NR_135797, intron 20 of 20) intron (NR_135797, intron 20 of 20) 603181 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 168-51 chr2 67790153 67790361 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35305 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 258-39 chr2 161159861 161160070 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001199135) promoter-TSS (NM_001199135) -463 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 200-39 chr12 9697521 9697816 + 1.33333 NA non-coding (NR_036693, exon 4 of 4) non-coding (NR_036693, exon 4 of 4) 27955 NM_001197319 29121 Hs.268326 NM_013269 ENSG00000069493 CLEC2D CLAX|LLT1|OCIL C-type lectin domain family 2 member D protein-coding 184-102 chr7 33349812 33350023 + 1.33333 NA intron (NM_001348040, intron 13 of 20) MIRb|SINE|MIR 220353 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 197-109 chr7 22159670 22159943 + 1.33333 NA intron (NM_001367603, intron 4 of 5) intron (NM_001367603, intron 4 of 5) 33939 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 135.666 chr10 33559533 33559674 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 213077 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 182.667-22 chr10 125292959 125293171 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -132035 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 232-46 chr2 73255901 73256124 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001080410, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001080410, exon 17 of 17) 21704 NM_006429 10574 Hs.368149 NM_006429 ENSG00000135624 CCT7 CCTETA|CCTH|NIP7-1|TCP1ETA chaperonin containing TCP1 subunit 7 protein-coding 348.667-27 chr8 140777600 140778030 + 1.33333 NA intron (NR_148036, intron 14 of 34) LTR31|LTR|ERV1 -45162 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 186-10 chr1 242093501 242093665 + 1.33333 NA intron (NM_001320272, intron 10 of 10) MIRb|SINE|MIR -94485 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 226.666-24 chr20 12623924 12624179 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 312912 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 266-45 chr2 135428761 135429075 + 1.33333 NA intron (NM_001286569, intron 2 of 21) L1PA15|LINE|L1 101667 NM_001286568 84083 Hs.658422 NM_032143 ENSG00000121988 ZRANB3 4933425L19Rik|AH2 zinc finger RANBP2-type containing 3 protein-coding 200.666-85 chr4 67823643 67823833 + 1.33333 NA intron (NM_004262, intron 9 of 9) intron (NM_004262, intron 9 of 9) 60264 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 272.666-23 chr7 13661236 13661550 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 325121 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 239.333-34 chr14 64559539 64559916 + 1.33333 NA intron (NM_172365, intron 3 of 11) L2c|LINE|L2 9766 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 188.667-74 chr2 71519529 71519770 + 1.33333 NA intron (NM_001130985, intron 10 of 54) AluSq2|SINE|Alu 52950 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 239.999-9 chr8 118190730 118190914 + 1.33333 NA non-coding (NR_109794, exon 5 of 5) non-coding (NR_109794, exon 5 of 5) -79003 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 403.333-10 chr3 35933939 35934468 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 189727 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 213.333-56 chr14 61230302 61230491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50942 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 207.666-25 chr2 106867364 106867599 + 1.33333 NA intron (NM_032528, intron 1 of 5) intron (NM_032528, intron 1 of 5) 18547 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 369.333 chr1 79769904 79770228 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -763336 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 307.333-72 chr7 30667322 30667618 + 1.33333 NA intron (NM_001202481, intron 4 of 13) intron (NM_001202481, intron 4 of 13) 14986 NM_001883 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 222.667-55 chr3 34012403 34012710 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 213926 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 213.333-71 chr16 50125641 50125894 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -27144 NM_001365323 64282 Hs.514342 NM_022447 ENSG00000121274 TENT4B PAPD5|TRF4-2|TUT3 terminal nucleotidyltransferase 4B protein-coding 383.999-6 chr5 35834478 35834802 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -22251 NR_120485 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 194-85 chr20 24959898 24960139 + 1.33333 NA TTS (NM_003650) TTS (NM_003650) 10749 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 208.666-5 chr1 68542666 68542907 + 1.33333 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -45704 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 231.667-65 chr8 140105014 140105329 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -4636 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 209-30 chr12 39056262 39056512 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150796 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 256.667-90 chr9 30375375 30375724 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 32905 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 565.666-2 chr4 54645658 54646466 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11866 NM_001093772 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 194.667-53 chr18 1587203 1587489 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -227717 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 187.666-28 chr9 27851941 27852200 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -278204 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 209.333-100 chr2 543228 543440 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2471 NR_146470 101927362 Hs.385749 NR_146470 ENSG00000225942 LINC01875 - long intergenic non-protein coding RNA 1875 ncRNA 174.667-110 chr22 47507791 47508010 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -20789 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 190-44 chr16 6199133 6199401 + 1.33333 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) intron (NM_018723, intron 1 of 15) 179564 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 201.666-4 chr10 74303003 74303169 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) intron (NM_001369124, intron 3 of 9) 126323 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 204-130 chr3 76512548 76512797 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -527427 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 315-14 chr2 88230734 88231205 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 57830 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 183.333-42 chr14 48678426 48678575 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -883486 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 290.333-20 chr2 52707883 52708311 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5482 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 171.333-178 chr7 25164470 25164637 + 1.33333 NA intron (NM_138811, intron 3 of 9) ERVL-E-int|LTR|ERVL 15801 NM_001371351 204-118 chr20 56144417 56144596 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -104226 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 210.666-2 chr1 42394414 42394676 + 1.33333 NA intron (NM_173642, intron 1 of 4) intron (NM_173642, intron 1 of 4) 13753 NM_173642 284716 Hs.420244 NM_173642 ENSG00000177181 RIMKLA FAM80A|NAAGS|NAAGS-II ribosomal modification protein rimK like family member A protein-coding 213.333-214 chr8 129786640 129786917 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_031415) promoter-TSS (NM_031415) -154 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 206-51 chr14 56266899 56267194 + 1.33333 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) L1ME4b|LINE|L1 148635 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 335.333-42 chr5 123990697 123991163 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 445513 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 240-43 chr2 16694381 16694658 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -28685 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 197.333-87 chr17 61422860 61423048 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 11203 NR_160788 388407 Hs.434459 NM_203425 C17orf82 - chromosome 17 open reading frame 82 ncRNA 129.666-2 chr3 117226751 117226933 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 305411 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 222.666-11 chr12 3099586 3099832 + 1.33333 NA intron (NM_006675, intron 2 of 8) L1MEc|LINE|L1 22330 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 266-58 chr3 106081417 106081668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -212141 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 208.667-73 chr2 113035319 113035629 + 1.33333 NA intron (NM_173178, intron 1 of 4) intron (NM_173178, intron 1 of 4) 17393 NM_014438 27177 Hs.278909 NM_014438 ENSG00000136696 IL36B FIL1|FIL1-(ETA)|FIL1H|FILI-(ETA)|IL-1F8|IL-1H2|IL1-ETA|IL1F8|IL1H2 interleukin 36 beta protein-coding 202.667-23 chr10 113925970 113926216 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 71432 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 226.667-31 chr12 39866268 39866591 + 1.33333 NA intron (NM_052885, intron 5 of 9) MIRc|SINE|MIR 239652 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 508.999-2 chr18 12786459 12786913 + 1.33333 NA intron (NM_080423, intron 8 of 8) intron (NM_080423, intron 8 of 8) -37264 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 200.333-115 chr5 37048091 37048301 + 1.33333 NA intron (NM_015384, intron 38 of 45) MIRc|SINE|MIR 171427 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 216.666-74 chr9 91789649 91789827 + 1.33333 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 -153393 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 305.333-42 chr22 40555913 40556256 + 1.33333 NA intron (NM_020831, intron 2 of 14) intron (NM_020831, intron 2 of 14) -22257 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 251.666-25 chr4 167937909 167938214 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154476 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 225.333-76 chr19 44097763 44098099 + 1.33333 NA intron (NM_013398, intron 3 of 5) intron (NM_013398, intron 3 of 5) 3570 NM_013398 7767 Hs.585869 NM_013398 ENSG00000267680 ZNF224 BMZF-2|BMZF2|KOX22|ZNF233|ZNF255|ZNF27 zinc finger protein 224 protein-coding 266-37 chr2 27440377 27440618 + 1.33333 NA exon (NM_013392, exon 12 of 18) exon (NM_013392, exon 12 of 18) -1869 NM_001168364 200634 Hs.59509 NM_173853 ENSG00000157992 KRTCAP3 KCP3 keratinocyte associated protein 3 protein-coding 214-70 chr2 108902741 108902932 + 1.33333 NA intron (NM_022336, intron 11 of 11) L1MD1|LINE|L1 86384 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 475.999-5 chr6 141452241 141452632 + 1.33333 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 636363 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 178.666-12 chr20 5397654 5397825 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48009 NR_038239 100507629 Hs.121383 NR_038239 ENSG00000226995 LINC00658 - long intergenic non-protein coding RNA 658 ncRNA 407-3 chr14 49666232 49666855 + 1.33333 NA intron (NM_001348385, intron 6 of 18) intron (NM_001348385, intron 6 of 18) 21671 NM_001197331 5427 Hs.162777 NM_002692 ENSG00000100479 POLE2 DPE2 DNA polymerase epsilon 2, accessory subunit protein-coding 262-36 chr18 71569320 71569673 + 1.33333 NA intron (NR_038326, intron 1 of 4) intron (NR_038326, intron 1 of 4) 9460 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 175-60 chr4 58048533 58048742 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 487691 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 204-112 chr2 228407958 228408163 + 1.33333 NA Intergenic MER126|DNA|DNA 203335 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 230.333-50 chr18 10415554 10415782 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1298 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 248.667-111 chr9 79836576 79836903 + 1.33333 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 12209 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 234.333-58 chr5 72167071 72167344 + 1.33333 NA intron (NM_005909, intron 2 of 6) intron (NM_005909, intron 2 of 6) -2260 NR_039967 100616377 NR_039967 ENSG00000264099 MIR4803 - microRNA 4803 ncRNA 204-9 chr1 94770628 94770865 + 1.33333 NA intron (NR_160783, intron 1 of 3) intron (NR_160783, intron 1 of 3) -24846 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 198.333-103 chr2 166469219 166469378 + 1.33333 NA intron (NR_045628, intron 6 of 25) intron (NR_045628, intron 6 of 25) 17673 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 207.667-66 chr20 51846501 51846783 + 1.33333 NA intron (NR_110016, intron 1 of 2) L1ME4b|LINE|L1 16271 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 288.333-9 chr14 43040006 43040256 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 1433275 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 373.666-7 chr2 185787657 185788237 + 1.33333 NA TTS (NR_144454) TTS (NR_144454) 12203 NR_144453 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 209.666-12 chr11 12908958 12909153 + 1.33333 NA intron (NM_021961, intron 10 of 12) intron (NM_021961, intron 10 of 12) 80493 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 192.667-135 chr5 55993735 55993978 + 1.33333 NA intron (NR_157112, intron 1 of 17) intron (NR_157112, intron 1 of 17) 1107 NM_001364276 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 189.333-4 chr1 56292018 56292244 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -122832 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 194.333-49 chr15 93308840 93309098 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 102903 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 266.667-30 chr16 57913979 57914304 + 1.33333 NA intron (NM_001297, intron 23 of 32) intron (NM_001297, intron 23 of 32) 56987 NM_001297 1258 Hs.147062 NM_001297 ENSG00000070729 CNGB1 CNCG2|CNCG3L|CNCG4|CNG4|CNGB1B|GAR1|GARP|GARP2|RCNC2|RCNCb|RCNCbeta|RP45 cyclic nucleotide gated channel beta 1 protein-coding 197.333-221 chr7 134516479 134516697 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10979 NM_020299 57016 Hs.116724 NM_020299 ENSG00000198074 AKR1B10 AKR1B11|AKR1B12|ALDRLn|ARL-1|ARL1|HIS|HSI aldo-keto reductase family 1 member B10 protein-coding 186.666-24 chr18 10675336 10675496 + 1.33333 NA intron (NM_022068, intron 49 of 51) intron (NM_022068, intron 49 of 51) 13483 NR_110777 101927410 Hs.436902 NR_110777 ENSG00000260779 LOC101927410 - uncharacterized LOC101927410 ncRNA 208.333-129 chr6 79502295 79502468 + 1.33333 NA intron (NM_001122769, intron 3 of 7) L3|LINE|CR1 35049 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 329.999-2 chr10 125868145 125868615 + 1.33333 NA intron (NM_018180, intron 1 of 10) intron (NM_018180, intron 1 of 10) 12912 NM_018180 55760 Hs.370292 NM_018180 ENSG00000089876 DHX32 DDX32|DHLP1 DEAH-box helicase 32 (putative) protein-coding 295 chr1 158229896 158230267 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -18255 NM_001320652 909 Hs.1309 NM_001763 ENSG00000158477 CD1A CD1|FCB6|HTA1|R4|T6 CD1a molecule protein-coding 407.333-12 chr15 61446922 61447405 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -217861 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 210.666-26 chr12 91773316 91773503 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 368304 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 198.666-35 chr18 43435949 43436122 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -158545 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 231-64 chr8 110741368 110741604 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 285947 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 192-7 chr1 96367379 96367607 + 1.33333 NA intron (NR_110693, intron 1 of 5) AluSz6|SINE|Alu 6632 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 219.333-112 chr22 28097381 28097596 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 10 of 22) intron (NM_001145418, intron 10 of 22) -176876 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 198.666-50 chr2 206459077 206459238 + 1.33333 NA intron (NM_003812, intron 2 of 25) intron (NM_003812, intron 2 of 25) 15625 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 134.333-139 chr5 69191710 69191932 + 1.33333 NA exon (NM_022909, exon 2 of 9) exon (NM_022909, exon 2 of 9) 2238 NM_022909 64946 Hs.631967 NM_022909 ENSG00000153044 CENPH - centromere protein H protein-coding 234-58 chr5 45579299 45579570 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 116946 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 152-87 chr2 117981693 117981917 + 1.33333 NA intron (NM_019044, intron 7 of 23) MER3|DNA|hAT-Charlie 32265 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 205-85 chr7 28598806 28599071 + 1.33333 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -87195 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 224.333-86 chr4 54998249 54998468 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 127237 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 254.666-19 chr20 49183035 49183409 + 1.33333 NA intron (NM_004602, intron 1 of 13) intron (NM_004602, intron 1 of 13) 5148 NM_001322932 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 250.666-29 chr5 16961727 16961938 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -25544 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 338.333-13 chr3 80633877 80634422 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -130748 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 209-71 chr21 17856653 17856856 + 1.33333 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) intron (NR_024354, intron 1 of 2) 28854 NR_024354 54075 Hs.404306 NR_024354 CHODL-AS1 C21orf39|NCRNA00157 CHODL antisense RNA 1 ncRNA 276-37 chr2 157015594 157015916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -241950 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 388-15 chr3 135462509 135462965 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -502991 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 212.666-31 chr15 70333564 70333791 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 172251 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 374.333-16 chr7 3373301 3373822 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 72309 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 261.666-17 chr5 149861945 149862279 + 1.33333 NA intron (NM_000440, intron 21 of 21) L3|LINE|CR1 70865 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 171.666-7 chr7 22151008 22151270 + 1.33333 NA intron (NM_001367601, intron 7 of 13) MIRb|SINE|MIR 42606 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 329 chr1 86876543 86877026 + 1.33333 NA intron (NR_144512, intron 3 of 4) L2|LINE|L2 37342 NM_004261 9403 Hs.362728 NM_004261 ENSG00000183291 SELENOF SEP15 selenoprotein F protein-coding 215.999-3 chr14 67755287 67755460 + 1.33333 NA intron (NM_015346, intron 36 of 41) intron (NM_015346, intron 36 of 41) 53487 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 199-101 chr7 12476672 12476828 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19679 NR_136261 102725191 Hs.602382 NR_136261 ENSG00000226690 LOC102725191 - uncharacterized LOC102725191 ncRNA 145.667-185 chr3 178108436 178108630 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 291668 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 301.666-10 chr8 5059301 5059572 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64522 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 243-33 chr2 134887921 134888144 + 1.33333 NA intron (NR_036549, intron 1 of 4) L1MC4|LINE|L1 30212 NR_049856 100847069 NR_049856 ENSG00000263783 MIR5590 - microRNA 5590 ncRNA 227.999 chr10 104277469 104277678 + 1.33333 NA intron (NM_001191013, intron 3 of 5) AluSq|SINE|Alu 2407 NM_001191015 119391 Hs.107384 NM_183239 ENSG00000065621 GSTO2 GSTO 2-2|bA127L20.1 glutathione S-transferase omega 2 protein-coding 388.667-14 chr8 141136387 141136894 + 1.33333 NA exon (NM_001352890, exon 2 of 23) exon (NM_001352890, exon 2 of 23) 8051 NR_148197 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 236-46 chr2 135136446 135136657 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_145723) promoter-TSS (NR_145723) -77 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 195.333-173 chr5 29951155 29951324 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 70679 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 287.667-32 chr5 127308986 127309393 + 1.33333 NA intron (NM_001308119, intron 2 of 14) intron (NM_001308119, intron 2 of 14) 18393 NM_001256545 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 224-78 chr5 67001721 67001919 + 1.33333 NA non-coding (NR_111908, exon 2 of 2) non-coding (NR_111908, exon 2 of 2) 2334 NR_111908 101928794 Hs.672435 NR_111908 MAST4-AS1 - MAST4 antisense RNA 1 ncRNA 217.333-15 chr1 191072428 191072644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 155962 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 240.666-29 chr4 67021429 67021634 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 400469 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 303.333-22 chr14 55198182 55198525 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6768 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 351.666-12 chr4 48574057 48574356 + 1.33333 NA intron (NM_015030, intron 25 of 63) intron (NM_015030, intron 25 of 63) 83954 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 150-53 chr16 23086567 23086773 + 1.33333 NA intron (NM_020718, intron 9 of 15) L2c|LINE|L2 62600 NM_020718 57478 Hs.183817 NM_020718 ENSG00000103404 USP31 - ubiquitin specific peptidase 31 protein-coding 298.666-7 chr16 72768807 72769202 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -104034 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 326.333-19 chr3 103354534 103354926 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 169386 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 272-22 chr2 33099436 33099686 + 1.33333 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) MIR3|SINE|MIR -35036 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 204-46 chr12 10073354 10073608 + 1.33333 NA intron (NM_001297750, intron 5 of 6) intron (NM_001297750, intron 5 of 6) 25504 NM_001297750 51267 Hs.29549 NM_016511 ENSG00000150048 CLEC1A CLEC-1|CLEC1 C-type lectin domain family 1 member A protein-coding 211.333-37 chr11 84550717 84550890 + 1.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L2a|LINE|L2 170139 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 285.333-4 chr1 166760876 166761248 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -78413 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 179.333-12 chr1 187392433 187392605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51109 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 148 chr1 8863401 8863532 + 1.33333 NA intron (NM_001353346, intron 9 of 11) intron (NM_001353346, intron 9 of 11) 3124 NR_106786 102465436 NR_106786 ENSG00000274258 MIR6728 hsa-mir-6728 microRNA 6728 ncRNA 216.333-20 chr10 72964835 72965109 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -10166 NM_001318124 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 254.333-52 chr3 9523755 9523971 + 1.33333 NA intron (NM_198560, intron 2 of 3) L1MCa|LINE|L1 29959 NM_198560 375323 Hs.56782 NM_198560 ENSG00000156959 LHFPL4 GARLH4 LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein-coding 190.666-60 chr9 28221459 28221656 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 497748 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 249.333-65 chr22 39898898 39899225 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2023 NM_004810 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 179.333-132 chr3 184957386 184957553 + 1.33333 NA exon (NM_015303, exon 36 of 47) exon (NM_015303, exon 36 of 47) 144962 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 306.999-3 chr8 25236128 25236381 + 1.33333 NA intron (NM_024940, intron 1 of 51) intron (NM_024940, intron 1 of 51) 51565 NM_024940 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 322-20 chr18 3030705 3031046 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18928 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 201.333-11 chr1 116019150 116019341 + 1.33333 NA intron (NM_018420, intron 2 of 11) L2c|LINE|L2 -41969 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 204.666-23 chr12 56140069 56140224 + 1.33333 NA intron (NM_001184796, intron 24 of 30) AluJo|SINE|Alu 11944 NM_015292 23344 Hs.632729 NM_015292 ENSG00000139641 ESYT1 FAM62A|MBC2 extended synaptotagmin 1 protein-coding 328.333-31 chr4 59962991 59963355 + 1.33333 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 949600 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 329.999-9 chr20 58385500 58385818 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -3460 NM_004738 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 216.333-147 chr9 31925374 31925578 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -459127 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 201.333-144 chr2 32789133 32789357 + 1.33333 NA intron (NM_017735, intron 16 of 19) intron (NM_017735, intron 16 of 19) -36188 NR_027099 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 214-150 chrX 113318522 113318759 + 1.33333 NA intron (NR_110399, intron 3 of 3) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 275913 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 190-58 chr2 9460445 9460678 + 1.33333 NA intron (NM_016207, intron 15 of 17) intron (NM_016207, intron 15 of 17) -13990 NM_001320859 285148 Hs.667226 NM_001039613 ENSG00000134330 IAH1 - isoamyl acetate hydrolyzing esterase 1 (putative) protein-coding 322.666-27 chr9 111407914 111408308 + 1.33333 NA intron (NM_001363756, intron 23 of 48) intron (NM_001363756, intron 23 of 48) 75451 NM_001364930 23392 Hs.368255 NM_001080398 ENSG00000136813 ECPAS ECM29|KIAA0368 Ecm29 proteasome adaptor and scaffold protein-coding 209.333-236 chr8 90994223 90994401 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018710, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_018710, exon 7 of 7) -9074 NM_001190972 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 171-79 chr9 25697852 25698030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19083 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 175.333-78 chr2 32179613 32179848 + 1.33333 NA intron (NM_001193513, intron 5 of 14) L1ME4b|LINE|L1 13866 NM_001330478 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 269.999 chr1 9559235 9559528 + 1.33333 NA intron (NM_032315, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 19916 NM_032315 84275 Hs.568613 NM_032315 ENSG00000171612 SLC25A33 BMSC-MCP|PNC1 solute carrier family 25 member 33 protein-coding 294.333-4 chr10 22060094 22060378 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -56506 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 355.333-23 chr5 26369135 26369516 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 669261 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 202-30 chr12 5595385 5595561 + 1.33333 NA intron (NM_001278596, intron 21 of 25) AluJr|SINE|Alu 101341 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 222.333-93 chr8 105479456 105479775 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 160072 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 270.333-63 chr8 117202861 117203348 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 68109 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 218.666-19 chr12 22991241 22991525 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -184253 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 169.333-67 chr13 63591751 63591953 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -145583 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 312-33 chr3 107672105 107672518 + 1.33333 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) intron (NM_001276286, intron 3 of 16) 149349 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 231.999 chr1 111624994 111625191 + 1.33333 NA intron (NM_001291896, intron 1 of 7) intron (NM_001291896, intron 1 of 7) -4694 NR_160737 107985184 NR_160737 LOC107985184 - uncharacterized LOC107985184 ncRNA 299.333-31 chr17 80972137 80972435 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1073 NR_148968 400627 Hs.591201 NR_148968 ENSG00000261924 LOC400627 - uncharacterized LOC400627 ncRNA 226.666-30 chr5 25708423 25708637 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 517577 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 329.333-59 chr8 115761437 115761885 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92686 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 229.666-12 chr14 70069922 70070148 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) 10182 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 412.666-8 chr8 117604074 117604490 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 83569 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 305-31 chr7 111821171 111821637 + 1.33333 NA non-coding (NR_103806, exon 2 of 2) non-coding (NR_103806, exon 2 of 2) 12899 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 204-194 chr8 87648096 87648276 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 225829 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 148.666-10 chr7 15146654 15146798 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -171868 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 191-72 chr8 22429274 22429427 + 1.33333 NA intron (NM_001135154, intron 8 of 8) MIRc|SINE|MIR -11620 NM_001243974 5533 Hs.731683 NM_005605 ENSG00000120910 PPP3CC CALNA3|CNA3|PP2Bgamma protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma protein-coding 187-4 chr1 151440420 151440694 + 1.33333 NA intron (NM_001194938, intron 2 of 17) intron (NM_001194938, intron 2 of 17) 1648 NM_207171 23126 Hs.489873 NM_015100 ENSG00000143442 POGZ MRD37|WHSUS|ZNF280E|ZNF635|ZNF635m pogo transposable element derived with ZNF domain protein-coding 189.666-30 chr3 86198087 86198269 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -283765 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 195-69 chr21 34728566 34728926 + 1.33333 NA intron (NR_024351, intron 4 of 5) intron (NR_024351, intron 4 of 5) 8436 NR_024351 54064 Hs.436868 NR_024351 ENSG00000230978 LINC00160 C21orf52|NCRNA00160 long intergenic non-protein coding RNA 160 ncRNA 197.333-57 chr13 57694792 57694972 + 1.33333 NA intron (NM_001040429, intron 3 of 3) intron (NM_001040429, intron 3 of 3) 63138 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 196.666-83 chr5 50722979 50723131 + 1.33333 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) intron (NM_024615, intron 2 of 25) 55641 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 214.333-88 chr21 31102840 31103033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58004 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 193.667-41 chr14 43899895 43900163 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 607254 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 146.667-37 chr10 55563350 55563534 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1MB3|LINE|L1 -35600 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 187.666-12 chr17 63263607 63263778 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 7 of 25) intron (NM_025185, intron 7 of 25) 176575 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 294.666-37 chr8 83613285 83613584 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 209676 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 164.333-32 chr10 101429140 101429285 + 1.33333 NA intron (NM_003939, intron 1 of 13) intron (NM_003939, intron 1 of 13) 75047 NM_033637 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 252.666-45 chr7 110234926 110235195 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -274847 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 215.999-9 chr8 123300597 123300759 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -25137 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 227-15 chr11 128090977 128091277 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -117639 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 134-34 chr16 31850942 31851128 + 1.33333 NA Intergenic HERVIP10FH-int|LTR|ERV1 -22723 NR_049749 10308 Hs.460645 NM_003414 ENSG00000185947 ZNF267 HZF2 zinc finger protein 267 protein-coding 193.666-9 chr11 119222136 119222371 + 1.33333 NA intron (NM_005188, intron 1 of 15) intron (NM_005188, intron 1 of 15) 15977 NM_005188 867 Hs.504096 NM_005188 ENSG00000110395 CBL C-CBL|CBL2|FRA11B|NSLL|RNF55 Cbl proto-oncogene protein-coding 228.666-44 chr7 90388238 90388480 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_033107, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_033107, exon 10 of 10) -7933 NR_102424 101409256 NR_102424 LOC101409256 - cell division cycle 42 pseudogene pseudo 189-69 chr4 91428123 91428320 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 849081 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 223-30 chr2 4166823 4166996 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 192748 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 220-38 chr15 67560146 67560322 + 1.33333 NA intron (NM_001206804, intron 2 of 21) intron (NM_001206804, intron 2 of 21) 11140 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 204.667-132 chr6 83667296 83667529 + 1.33333 NA intron (NM_001242792, intron 2 of 28) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 41147 NM_001363677 9892 Hs.368046 NM_014841 ENSG00000065609 SNAP91 AP180|CALM synaptosome associated protein 91 protein-coding 114-34 chr14 58107195 58107341 + 1.33333 NA intron (NM_001001872, intron 4 of 7) intron (NM_001001872, intron 4 of 7) 44945 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 203-30 chr14 37578798 37579058 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 16321 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 211.333-197 chr5 162918322 162918646 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -519087 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 344-28 chr3 29808579 29808903 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) intron (NM_001003792, intron 6 of 13) 125415 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 252-33 chr15 65578754 65579189 + 1.33333 NA TTS (NM_016395) TTS (NM_016395) 32160 NR_045106 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 188-23 chr10 100178620 100178787 + 1.33333 NA intron (NR_144760, intron 4 of 10) MIRb|SINE|MIR 7326 NM_001100626 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 203.333-14 chr1 160922842 160923009 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -9540 NR_110695 101928372 NR_110695 ENSG00000198358 LOC101928372 - uncharacterized LOC101928372 ncRNA 314.666-30 chr6 104796497 104796848 + 1.33333 NA exon (NM_001350559, exon 7 of 22) exon (NM_001350559, exon 7 of 22) 62874 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 231.333-54 chr19 9535266 9535509 + 1.33333 NA intron (NM_001318056, intron 3 of 6) intron (NM_001318056, intron 3 of 6) 3258 NM_001300883 79088 Hs.386476 NM_024106 ENSG00000130818 ZNF426 K-RBP zinc finger protein 426 protein-coding 187.333-168 chr5 159980169 159980438 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -28797 NM_001282500 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 249.667-10 chr10 30315493 30315900 + 1.33333 NA intron (NM_018109, intron 8 of 8) intron (NM_018109, intron 8 of 8) 33642 NM_018109 55149 Hs.173946 NM_018109 ENSG00000107951 MTPAP PAPD1|SPAX4|TENT6 mitochondrial poly(A) polymerase protein-coding 192-106 chr4 150711900 150712103 + 1.33333 NA intron (NM_001367550, intron 36 of 56) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 129850 NM_006439 10586 Hs.584852 NM_006439 ENSG00000181541 MAB21L2 MCOPS14|MCSKS14 mab-21 like 2 protein-coding 251.333-39 chr15 34845561 34845927 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -50195 NM_005159 70 Hs.118127 NM_005159 ENSG00000159251 ACTC1 ACTC|ASD5|CMD1R|CMH11|LVNC4 actin alpha cardiac muscle 1 protein-coding 357.666-7 chr4 159795575 159796114 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -18060 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 229-40 chr3 103727096 103727280 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -203072 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 223.667-23 chr15 38696772 38697079 + 1.33333 NA intron (NR_160786, intron 1 of 1) intron (NR_160786, intron 1 of 1) 327 NR_160786 145.333-39 chr10 66368541 66368674 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -557429 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 330.666-12 chr2 152201180 152201617 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25635 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 202.333-109 chr3 64491532 64491729 + 1.33333 NA Intergenic MER87B|LTR|ERV1 -69716 NR_110150 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 211.333-203 chr6 44137445 44137652 + 1.33333 NA intron (NM_001318792, intron 5 of 23) intron (NM_001318792, intron 5 of 23) 9994 NM_018426 55362 Hs.414473 NM_018426 ENSG00000137216 TMEM63B C6orf110 transmembrane protein 63B protein-coding 246.333-42 chr17 60281962 60282307 + 1.33333 NA intron (NM_032582, intron 5 of 33) intron (NM_032582, intron 5 of 33) -50489 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 282.333-8 chr11 133384575 133384881 + 1.33333 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) 147773 NM_001319104 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 204-153 chr4 74357958 74358184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7074 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 253.999-9 chr5 24243472 24243692 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 292234 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 213-23 chr15 63589109 63589425 + 1.33333 NA intron (NR_034080, intron 2 of 2) intron (NR_034080, intron 2 of 2) -8120 NM_203373 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 222.666-20 chr19 28286010 28286192 + 1.33333 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -320587 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 281-20 chr2 144134478 144134842 + 1.33333 NA intron (NM_001354350, intron 6 of 14) intron (NM_001354350, intron 6 of 14) 76919 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 258.667-52 chr2 225500591 225501039 + 1.33333 NA intron (NM_001371273, intron 3 of 7) intron (NM_001371273, intron 3 of 7) 99929 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 281.666-8 chr2 237712401 237712890 + 1.33333 NA intron (NM_001137551, intron 2 of 11) (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 20440 NM_001137552 9208 Hs.471779 NM_004735 ENSG00000124831 LRRFIP1 FLAP-1|FLAP1|FLIIAP1|GCF-2|GCF2|HUFI-1|TRIP LRR binding FLII interacting protein 1 protein-coding 243.333-41 chr17 11407485 11407710 + 1.33333 NA intron (NM_001173462, intron 3 of 4) intron (NM_001173462, intron 3 of 4) 166174 NM_001173461 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 215.333-66 chr15 99293658 99293845 + 1.33333 NA intron (NM_001321677, intron 5 of 8) FLAM_C|SINE|Alu 36226 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 255.666-19 chr3 103046990 103047261 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 476991 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 198-61 chr15 83738147 83738385 + 1.33333 NA intron (NM_207517, intron 3 of 29) L1ME4b|LINE|L1 84143 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 280.999-3 chr14 63572542 63572901 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -29326 NM_001354926 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 215.333-26 chr10 83753306 83753468 + 1.33333 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -76298 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 186.667-75 chr2 142996549 142996811 + 1.33333 NA intron (NM_001199241, intron 11 of 14) intron (NM_001199241, intron 11 of 14) 119016 NM_003937 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 199.666-8 chr10 128902860 128903018 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -9894 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 191.666-26 chr8 130065731 130065946 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 27 of 29) intron (NM_001362925, intron 27 of 29) 18930 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 164-15 chr10 66203423 66203580 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) 632076 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 226.666-42 chr7 92906464 92906753 + 1.33333 NA intron (NR_110086, intron 4 of 4) L1ME3A|LINE|L1 -69981 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 321.333-7 chr1 219095201 219095512 + 1.33333 NA intron (NR_038845, intron 3 of 4) L1ME3F|LINE|L1 78432 NR_038845 643723 Hs.519774 NR_038845 LYPLAL1-DT LYPLAL1-AS1 LYPLAL1 divergent transcript ncRNA 193.333-23 chr10 58354129 58354357 + 1.33333 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 19237 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 367.333-4 chr12 80689557 80689879 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -17916 NM_002469 4618 Hs.35937 NM_002469 ENSG00000111046 MYF6 CNM3|MRF4|bHLHc4|myf-6 myogenic factor 6 protein-coding 414-3 chr12 22374859 22375407 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40419 NM_003034 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 158.666-9 chr11 65406971 65407171 + 1.33333 NA intron (NM_001300832, intron 9 of 9) L1MD3|LINE|L1 -15727 NR_028272 283131 Hs.523789 NR_002802 ENSG00000245532 NEAT1 LINC00084|NCRNA00084|TncRNA|VINC nuclear paraspeckle assembly transcript 1 ncRNA 147-108 chr5 30794270 30794416 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -399343 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 435.666-6 chr9 75961010 75961455 + 1.33333 NA intron (NR_120409, intron 2 of 19) intron (NR_120409, intron 2 of 19) 70559 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 205.333-78 chr14 79085175 79085338 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -114726 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 221.333-75 chr2 213019749 213020005 + 1.33333 NA intron (NM_001371274, intron 6 of 7) intron (NM_001371274, intron 6 of 7) -93541 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 277-54 chr8 122905836 122906071 + 1.33333 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) intron (NM_001362797, intron 3 of 4) 119819 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 310.666-29 chrX 83733959 83734244 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -127025 NM_001271680 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 346-8 chr14 36166731 36167057 + 1.33333 NA intron (NR_049735, intron 1 of 3) intron (NR_049735, intron 1 of 3) 9757 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 196.333-4 chr1 81206848 81207197 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -99170 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 428.666 chr1 86129362 86129846 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 2 of 59) L1M8|LINE|L1 26867 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 252-62 chr3 79717920 79718144 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 49966 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 222-40 chr19 39472890 39473129 + 1.33333 NA intron (NM_001111020, intron 22 of 29) intron (NM_001111020, intron 22 of 29) 4787 NR_145805 109623469 NR_145805 SNORD175 - small nucleolar RNA, C/D box 175 snoRNA 204.333-62 chr15 63326248 63326478 + 1.33333 NA intron (NR_135511, intron 9 of 9) intron (NR_135511, intron 9 of 9) 48758 NM_031301 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 218-23 chr13 32043069 32043370 + 1.33333 NA intron (NM_023037, intron 1 of 60) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 11445 NM_023037 10129 Hs.507669 NM_023037 ENSG00000073910 FRY 13CDNA73|214K23.2|C13orf14|CG003|bA207N4.2|bA37E23.1 FRY microtubule binding protein protein-coding 431.333-4 chr2 16031930 16032494 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -18215 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 272.333-43 chr3 97478113 97478464 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 8 of 17) intron (NM_001080448, intron 8 of 17) 38681 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 131.333-76 chr2 15238611 15238802 + 1.33333 NA intron (NR_052013, intron 44 of 50) intron (NR_052013, intron 44 of 50) 322628 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 201.333-274 chr8 25740188 25740417 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 281069 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 129.333-84 chr18 38184792 38184955 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 527738 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 197.666-60 chr7 49557558 49557723 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -215998 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 265-15 chr12 15776417 15776762 + 1.33333 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) intron (NM_004447, intron 1 of 20) 12799 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 171.667-75 chr2 30794659 30794948 + 1.33333 NA intron (NM_144575, intron 1 of 22) L1ME1|LINE|L1 12643 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 291.333-41 chr2 220314602 220314902 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -408187 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 204.333-106 chr2 167324340 167324510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 137053 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 208.333-93 chr22 41470063 41470353 + 1.33333 NA intron (NM_001098, intron 1 of 17) intron (NM_001098, intron 1 of 17) 1091 NM_001098 50 Hs.643610 NM_001098 ENSG00000100412 ACO2 ACONM|HEL-S-284|ICRD|OCA8|OPA9 aconitase 2 protein-coding 224-66 chr4 44450604 44450790 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1888 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 287-40 chr9 70345838 70346279 + 1.33333 NA intron (NM_015110, intron 18 of 24) L2a|LINE|L2 68599 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 244.333-56 chr2 43147614 43147970 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -45347 NR_151714 100506047 Hs.127112 NR_151714 LINC02580 - long intergenic non-protein coding RNA 2580 ncRNA 230.333-92 chr5 54147366 54147666 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 3 of 4) intron (NM_019087, intron 3 of 4) 163057 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 200-157 chr7 78873989 78874155 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) L1M5|LINE|L1 -134916 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 202.666-10 chr10 45502243 45502397 + 1.33333 NA intron (NM_001282866, intron 2 of 7) L1MD1|LINE|L1 33051 NM_001282866 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 197-7 chr1 173469424 173469611 + 1.33333 NA intron (NR_037845, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu 7638 NR_037845 100506023 Hs.731284 NR_037845 LOC100506023 - uncharacterized LOC100506023 ncRNA 334-38 chr9 12541547 12541932 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -151646 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 242.333-82 chr5 4529959 4530187 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -243408 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 421.999-5 chr4 48277202 48277615 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -7570 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 243.666-11 chr14 50198035 50198374 + 1.33333 NA intron (NM_006939, intron 4 of 22) L1MC4|LINE|L1 33374 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 401-7 chr2 72920623 72921079 + 1.33333 NA intron (NM_004097, intron 1 of 2) CpG-16147 3332 NM_004097 2016 Hs.516090 NM_004097 ENSG00000135638 EMX1 - empty spiracles homeobox 1 protein-coding 203.333-257 chr8 58312509 58312692 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -40499 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 202.666-51 chr18 1391535 1391690 + 1.33333 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -31983 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 198.666-3 chr10 56385517 56385717 + 1.33333 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -24344 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 234.667-102 chr7 17924504 17924812 + 1.33333 NA intron (NM_001350862, intron 1 of 25) L1MB8|LINE|L1 15836 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 404.666-11 chr3 122393484 122393899 + 1.33333 NA intron (NM_014367, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 9509 NM_014367 26355 Hs.584881 NM_014367 ENSG00000114023 FAM162A C3orf28|E2IG5|HGTD-P family with sequence similarity 162 member A protein-coding 350.666-23 chr9 131958588 131958960 + 1.33333 NA intron (NM_001253881, intron 3 of 6) intron (NM_001253881, intron 3 of 6) 121093 NM_001253882 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 219-25 chr14 75775482 75775755 + 1.33333 NA exon (NM_015072, exon 22 of 32) exon (NM_015072, exon 22 of 32) 114372 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 202-182 chr8 56954864 56955034 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 38918 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 216.666-59 chr6 16470101 16470320 + 1.33333 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) L1MB3|LINE|L1 231623 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 290-44 chr5 156586261 156586632 + 1.33333 NA intron (NM_001128209, intron 3 of 7) L1MC3|LINE|L1 259282 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 141.667-179 chr5 54111447 54111601 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -159925 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 224-58 chr3 43716090 43716264 + 1.33333 NA intron (NM_001365650, intron 5 of 5) intron (NM_001365650, intron 5 of 5) -24583 NM_001346468 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 194-79 chr2 113151493 113151640 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -22405 NM_012455 23550 Hs.516306 NM_012455 ENSG00000125637 PSD4 EFA6B|TIC pleckstrin and Sec7 domain containing 4 protein-coding 236.999-5 chr3 17347884 17348178 + 1.33333 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) intron (NM_014744, intron 13 of 21) 351989 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 252.666-38 chr6 48557872 48558163 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -489328 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 173.333-166 chr5 160883182 160883325 + 1.33333 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -31042 NM_001366652 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 195.333-171 chr5 27197305 27197547 + 1.33333 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -158840 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 215.666-37 chr7 47985745 47986013 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -6264 NM_004507 3364 Hs.152983 NM_004507 ENSG00000136273 HUS1 hHUS1 HUS1 checkpoint clamp component protein-coding 126.667-53 chr14 102270519 102270743 + 1.33333 NA intron (NM_001330234, intron 2 of 11) L1M5|LINE|L1 -30016 NR_073541 5891 Hs.36859 NM_014226 ENSG00000080823 MOK RAGE|RAGE-1|RAGE1|STK30 MOK protein kinase protein-coding 194-129 chr7 26664314 26664517 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26544 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 279.333-23 chr11 122433744 122434016 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11009 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 265.667-14 chr10 119593662 119594069 + 1.33333 NA intron (NM_001323970, intron 1 of 12) intron (NM_001323970, intron 1 of 12) 3164 NM_001033925 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 204-152 chr4 74021010 74021250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17559 NM_002090 2921 Hs.89690 NM_002090 ENSG00000163734 CXCL3 CINC-2b|GRO3|GROg|MIP-2b|MIP2B|SCYB3 C-X-C motif chemokine ligand 3 protein-coding 207-86 chr4 52102230 52102450 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 51036 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 206.667-60 chr2 77554672 77554980 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32393 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 200.666-17 chr10 67176224 67176389 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001291133, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001291133, exon 9 of 9) 164040 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 380.666-12 chr5 100836105 100836442 + 1.33333 NA intron (NM_005668, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR -19708 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 491.999 chr5 19204883 19205323 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 681169 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 196.666-10 chr11 79775776 79775961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -334838 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 144.667-321 chr9 37792395 37792622 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -7416 NM_001002269 51010 Hs.602571 NM_016042 ENSG00000107371 EXOSC3 CGI-102|PCH1B|RRP40|Rrp40p|bA3J10.7|hRrp-40|p10 exosome component 3 protein-coding 178.667-8 chr1 93907418 93907667 + 1.33333 NA intron (NM_002061, intron 1 of 6) intron (NM_002061, intron 1 of 6) 1888 NM_002061 2730 Hs.315562 NM_002061 ENSG00000023909 GCLM GLCLR glutamate-cysteine ligase modifier subunit protein-coding 171.333-85 chr2 94922556 94922711 + 1.33333 NA intron (NR_037597, intron 5 of 9) AluSx|SINE|Alu 24709 NR_037597 442028 Hs.611545 NR_037597 ENSG00000259848 LOC442028 - uncharacterized LOC442028 ncRNA 328.667-15 chr6 92340433 92340966 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -650271 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 453.999 chr3 177731310 177731985 + 1.33333 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) intron (NR_047568, intron 3 of 3) -85218 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 216.333-10 chr1 169954366 169954676 + 1.33333 NA intron (NM_014970, intron 18 of 19) intron (NM_014970, intron 18 of 19) -60562 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 218-27 chr15 49633365 49633608 + 1.33333 NA intron (NM_020234, intron 4 of 5) AluJo|SINE|Alu 12438 NM_020234 56986 Hs.127432 NM_020234 ENSG00000104047 DTWD1 MDS009 DTW domain containing 1 protein-coding 132.666-2 chr11 108906117 108906300 + 1.33333 NA intron (NM_004398, intron 16 of 17) intron (NM_004398, intron 16 of 17) 241139 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 477.666-2 chr2 220791483 220791937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 780594 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 381.999-8 chr3 197250065 197250447 + 1.33333 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) L1M3f|LINE|L1 43692 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 272.666-7 chr12 77540266 77540643 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -290440 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 197.666-40 chr3 79973892 79974106 + 1.33333 NA Intergenic (TAATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -206001 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 158.666-23 chr6 73636741 73636894 + 1.33333 NA intron (NM_012434, intron 4 of 10) AluJb|SINE|Alu 17175 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 218.666-39 chr2 34143879 34144076 + 1.33333 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 76751 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 279-11 chr14 83586078 83586491 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 943652 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 218-88 chr4 178049619 178049933 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -141840 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 210-88 chr21 33911056 33911220 + 1.33333 NA intron (NM_001697, intron 3 of 6) intron (NM_001697, intron 3 of 6) 4666 NM_001697 539 Hs.409140 NM_001697 ENSG00000241837 ATP5PO ATP5O|ATPO|HMC08D05|OSCP ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP protein-coding 287-36 chr8 84741994 84742544 + 1.33333 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 36342 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 224.666-34 chr7 31394124 31394300 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -53486 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 279.333-32 chr14 83655232 83655604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1012786 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 319.333-27 chr6 52577195 52577558 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_012288) promoter-TSS (NM_012288) 78 NR_103447 401264 Hs.544586 NR_103446 ENSG00000225791 TRAM2-AS1 - TRAM2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 246-109 chrX 46652970 46653389 + 1.33333 NA intron (NM_001257291, intron 8 of 16) AluJr4|SINE|Alu 79414 NM_019886 56548 Hs.129955 NM_019886 ENSG00000147119 CHST7 C6ST-2|GST-5 carbohydrate sulfotransferase 7 protein-coding 312.666-23 chr6 40474436 40474684 + 1.33333 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 96223 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 196.667-75 chr2 80619304 80619572 + 1.33333 NA intron (NM_001320810, intron 12 of 12) intron (NM_001320810, intron 12 of 12) 306059 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 445.333-3 chr10 82834475 82834954 + 1.33333 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -601794 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 238.333-47 chr2 66458595 66458928 + 1.33333 NA intron (NM_002398, intron 6 of 12) intron (NM_002398, intron 6 of 12) -18431 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 193.333 chr1 30982221 30982370 + 1.33333 NA intron (NM_001020658, intron 7 of 21) L2a|LINE|L2 -14058 NR_003066 692200 NR_003066 SNORD103C HBII-251|SNORD85 small nucleolar RNA, C/D box 103C snoRNA 138-28 chr12 65934046 65934196 + 1.33333 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger -51796 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 184.667-100 chr5 76490337 76490589 + 1.33333 NA intron (NM_006633, intron 2 of 35) intron (NM_006633, intron 2 of 35) -56946 NM_001285460 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 302.333-6 chr1 221301804 221302293 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 34248 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 224.667-39 chr2 34785030 34785305 + 1.33333 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 107610 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 180.666-21 chr22 39767061 39767233 + 1.33333 NA intron (NM_152512, intron 5 of 6) L2c|LINE|L2 126613 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 196.666-36 chr17 63964985 63965160 + 1.33333 NA intron (NM_000334, intron 8 of 23) AluSz|SINE|Alu 7846 NM_000334 6329 Hs.46038 NM_000334 ENSG00000007314 SCN4A CMS16|HOKPP2|HYKPP|HYPP|NAC1A|Na(V)1.4|Nav1.4|SkM1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 4 protein-coding 153.333-201 chr2 79377286 79377455 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 123474 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 189.333-158 chr5 75029081 75029287 + 1.33333 NA exon (NM_001366737, exon 4 of 4) exon (NM_001366737, exon 4 of 4) 23374 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 332.666-6 chr11 38623527 38623864 + 1.33333 NA intron (NR_120554, intron 3 of 4) intron (NR_120554, intron 3 of 4) 22661 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 179-74 chr4 129579542 129579781 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 191817 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 147.333-198 chr21 37075221 37075388 + 1.33333 NA intron (NM_001353936, intron 1 of 36) L1ME3Cz|LINE|L1 2050 NM_001353937 7267 Hs.368214 NM_003316 ENSG00000182670 TTC3 DCRR1|RNF105|TPRDIII tetratricopeptide repeat domain 3 protein-coding 271-37 chr5 111531164 111531688 + 1.33333 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) AluYc|SINE|Alu -18829 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 179-79 chr5 90523849 90523998 + 1.33333 NA intron (NM_198273, intron 2 of 2) intron (NM_198273, intron 2 of 2) 5661 NM_001286812 116068 Hs.136235 NM_198273 ENSG00000176018 LYSMD3 - LysM domain containing 3 protein-coding 182-61 chr20 53512481 53512633 + 1.33333 NA Intergenic MER106A|DNA|hAT-Charlie -40213 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 368.999-2 chr8 124151174 124151830 + 1.33333 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) L1MEg|LINE|L1 20020 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 208.666-86 chr5 68516511 68516687 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 224022 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 206-52 chr14 61821215 61821512 + 1.33333 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 8660 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 203.333-154 chr20 32293907 32294094 + 1.33333 NA intron (NM_004798, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 16349 NM_004798 9371 Hs.369670 NM_004798 ENSG00000101350 KIF3B FLA8|HH0048|KLP-11 kinesin family member 3B protein-coding 192-93 chr3 35543651 35543927 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95736 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 300-36 chr20 49642798 49643097 + 1.33333 NA intron (NM_004776, intron 4 of 8) intron (NM_004776, intron 4 of 8) 70931 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 397.666-6 chr8 119890717 119891158 + 1.33333 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 17215 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 150.333-93 chr13 41775208 41775378 + 1.33333 NA intron (NM_001009814, intron 20 of 25) intron (NM_001009814, intron 20 of 25) 185792 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 218.667-75 chr4 36468636 36468933 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42356 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 256-70 chr4 140851872 140852162 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -95632 NM_015130 23158 Hs.480819 NM_015130 ENSG00000109436 TBC1D9 GRAMD9|MDR1 TBC1 domain family member 9 protein-coding 170-118 chr8 82369585 82369861 + 1.33333 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -527437 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 214-14 chr10 32048944 32049152 + 1.33333 NA intron (NM_004521, intron 1 of 25) AluJb|SINE|Alu 7377 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 401-5 chr14 61355772 61356188 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 34537 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 182.666-22 chr2 60021786 60021953 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 361167 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 293.333-55 chr6 124844811 124845103 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -117588 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 132.333-15 chr10 29182022 29182247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106936 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 203-88 chr5 142996072 142996362 + 1.33333 NA intron (NR_146198, intron 11 of 22) AluSx|SINE|Alu -127307 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 237.333-60 chr2 159614012 159614240 + 1.33333 NA intron (NM_001329857, intron 1 of 36) intron (NM_001329857, intron 1 of 36) -1168 NR_110587 643072 Hs.632541 NR_110587 LOC643072 - uncharacterized LOC643072 ncRNA 248.667-7 chr1 197490643 197491012 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 222575 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 188.667-127 chr5 94160548 94160782 + 1.33333 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -48966 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 216.666-71 chr9 36094517 36094791 + 1.33333 NA intron (NM_021111, intron 10 of 20) L1MA8|LINE|L1 -41882 NR_104637 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 253.333-23 chr14 50122769 50122997 + 1.33333 NA intron (NM_006939, intron 21 of 22) intron (NM_006939, intron 21 of 22) -6311 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 193.666-4 chr10 29391990 29392142 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17468 NR_110923 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 230-18 chr13 36381527 36381745 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11456 NM_001142294 23111 Hs.440414 NM_015087 ENSG00000133104 SPART SPG20|TAHCCP1 spartin protein-coding 344.333-16 chr4 89577380 89577904 + 1.33333 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -258759 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 212.666-101 chrX 33822652 33822858 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 309575 NM_203408 158724 Hs.143268 NM_203408 ENSG00000185448 FAM47A - family with sequence similarity 47 member A protein-coding 182.666-24 chr2 85321086 85321271 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_006464, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_006464, exon 4 of 4) 6811 NM_001368096 10618 Hs.593382 NM_006464 ENSG00000152291 TGOLN2 TGN38|TGN46|TGN48|TGN51|TTGN2 trans-golgi network protein 2 protein-coding 244.666-17 chr15 60355351 60355693 + 1.33333 NA intron (NM_001002857, intron 8 of 13) intron (NM_001002857, intron 8 of 13) 42464 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 229.666-15 chr18 3149660 3149938 + 1.33333 NA intron (NM_019856, intron 12 of 36) intron (NM_019856, intron 12 of 36) 70169 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 388.666-7 chr6 156579784 156580220 + 1.33333 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -197853 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 230-14 chr11 79648793 79649048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -207890 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 208-15 chr1 213697100 213697324 + 1.33333 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -227537 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 249-3 chr1 161286455 161286808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23337 NM_001315491 4359 Hs.591486 NM_000530 ENSG00000158887 MPZ CHM|CHN2|CMT1|CMT1B|CMT2I|CMT2J|CMT4E|CMTDI3|CMTDID|DSS|HMSNIB|MPP|P0 myelin protein zero protein-coding 359-9 chr2 199513567 199513975 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -42505 NM_015265 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 239.666-13 chr18 13988675 13988955 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -73108 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 144-72 chr2 27535863 27536021 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 39103 NM_001486 2646 Hs.89771 NM_001486 ENSG00000084734 GCKR FGQTL5|GKRP glucokinase regulator protein-coding 182.666-9 chr13 101303956 101304158 + 1.33333 NA intron (NM_001350749, intron 7 of 43) intron (NM_001350749, intron 7 of 43) 112451 NM_001350748 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 232-30 chr14 84308469 84308668 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -963364 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 117.333-66 chr15 44024839 44024990 + 1.33333 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) -146743 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 205.333-67 chr14 42793662 42793887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1186918 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 184-115 chr8 128189602 128189772 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 39571 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 202-131 chr4 58446913 58447124 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 89310 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 114.667-86 chr14 81158844 81158988 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 43918 NR_003021 677845 Hs.693251 NR_003021 ENSG00000221303 SNORA79 ACA65|SNORA79A small nucleolar RNA, H/ACA box 79 snoRNA 219.666-42 chr7 109964286 109964513 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -4186 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 200.666-27 chr12 99765593 99765798 + 1.33333 NA intron (NM_152788, intron 8 of 25) L3|LINE|CR1 117942 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 192.333-27 chr11 23135223 23135392 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -274833 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 309-23 chr22 27153943 27154460 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -33315 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 308-24 chr2 40228993 40229474 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 201071 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 311.333-11 chr11 25039450 25039916 + 1.33333 NA intron (NM_001009909, intron 9 of 11) L1PA16|LINE|L1 542630 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 229-13 chr12 16711706 16712043 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -103660 NM_001243609 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 365.333-25 chr9 36671254 36671837 + 1.33333 NA intron (NM_001256691, intron 14 of 15) intron (NM_001256691, intron 14 of 15) 98650 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 277.333-25 chr13 113477272 113477640 + 1.33333 NA intron (NM_001014283, intron 3 of 6) L1ME3B|LINE|L1 13255 NM_001014283 55208 Hs.682987 NM_018185 ENSG00000150401 DCUN1D2 C13orf17 defective in cullin neddylation 1 domain containing 2 protein-coding 192.333-122 chr4 41786493 41786749 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37651 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 204.333-109 chr2 202967079 202967286 + 1.33333 NA intron (NR_136331, intron 8 of 13) L1ME4b|LINE|L1 -47697 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 165.333-105 chr17 59168707 59168881 + 1.33333 NA intron (NM_018304, intron 1 of 9) intron (NM_018304, intron 1 of 9) 13048 NM_018304 55771 Hs.631750 NM_018304 ENSG00000068489 PRR11 - proline rich 11 protein-coding 246-45 chr18 10364539 10364753 + 1.33333 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 49724 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 175.333-177 chr7 102987334 102987502 + 1.33333 NA intron (NR_105043, intron 7 of 20) MIRb|SINE|MIR 13988 NM_001085386 58160 Hs.621233 NM_001085386 ENSG00000230257 NFE4 NF-E4 nuclear factor, erythroid 4 protein-coding 205.666-6 chr1 192468354 192468523 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -107335 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 319.333-30 chr6 107481497 107481836 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -8451 NM_018013 55084 Hs.445244 NM_018013 ENSG00000112320 SOBP JXC1|MRAMS sine oculis binding protein homolog protein-coding 288.666-6 chr13 58866020 58866272 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -633029 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 328-22 chr22 19894881 19895392 + 1.33333 NA exon (NM_001352303, exon 12 of 12) exon (NM_001352303, exon 12 of 12) 37417 NM_001352301 10587 Hs.443430 NM_006440 ENSG00000184470 TXNRD2 GCCD5|SELZ|TR|TR-BETA|TR3|TRXR2 thioredoxin reductase 2 protein-coding 174.667 chr1 33606692 33606912 + 1.33333 NA intron (NM_052896, intron 41 of 69) intron (NM_052896, intron 41 of 69) 134157 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 228.666-37 chr4 149248779 149248989 + 1.33333 NA intron (NR_125887, intron 9 of 12) intron (NR_125887, intron 9 of 12) 94589 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 161.333-132 chr19 19522685 19522896 + 1.33333 NA intron (NM_015965, intron 1 of 4) L1MB8|LINE|L1 -6121 NM_001190328 374887 Hs.729508 NM_198537 ENSG00000250067 YJEFN3 - YjeF N-terminal domain containing 3 protein-coding 200-83 chr2 81018298 81018505 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 448545 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 196-56 chr15 86907482 86907701 + 1.33333 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -25289 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 233.333-59 chr2 59659228 59659608 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 441710 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 211.666-55 chrX 128299900 128300101 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -247597 NM_138289 139741 Hs.680125 NM_138289 ENSG00000123165 ACTRT1 AIP1|ARIP1|ARPT1|HSD27 actin related protein T1 protein-coding 276.666-35 chrX 87568653 87569100 + 1.33333 NA intron (NM_057162, intron 1 of 10) L1MB5|LINE|L1 51074 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 173-38 chr18 21596097 21596266 + 1.33333 NA intron (NM_052911, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 4523 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 250.333-72 chr7 124140629 124140929 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -107712 NM_001136002 730130 Hs.450249 NM_001136002 ENSG00000234224 TMEM229A - transmembrane protein 229A protein-coding 213.333-228 chrX 50399893 50400092 + 1.33333 NA intron (NM_001013742, intron 8 of 27) intron (NM_001013742, intron 8 of 27) 70833 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 301.333-14 chr12 33726656 33726964 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -286991 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 257.666-25 chr8 83085688 83085890 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 173685 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 169.333-68 chr13 101896284 101896432 + 1.33333 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) intron (NM_175929, intron 1 of 4) 20287 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 222-68 chr4 72459892 72460221 + 1.33333 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 109165 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 205.666-48 chr6 50776695 50776929 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -42059 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 354.666-14 chr4 60842358 60842695 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -80093 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 250-55 chr4 65617926 65618372 + 1.33333 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) intron (NM_001281767, intron 2 of 16) 51339 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 209.666-27 chr2 20028860 20029032 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -16278 NM_002381 4148 Hs.656199 NM_002381 ENSG00000132031 MATN3 DIPOA|EDM5|HOA|OADIP|OS2 matrilin 3 protein-coding 211.333-121 chr2 127916875 127917166 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -31080 NM_001199140 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 311-32 chr6 84402434 84402869 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 72278 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 254.333-7 chr11 40285670 40286142 + 1.33333 NA intron (NM_001258419, intron 4 of 6) MIRb|SINE|MIR 7224 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 269.999-2 chr1 42084432 42084649 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -48606 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 202.667-92 chr22 19841095 19841335 + 1.33333 NA intron (NM_053004, intron 2 of 7) intron (NM_053004, intron 2 of 7) 13659 NM_053004 54584 Hs.105642 NM_053004 ENSG00000185838 GNB1L DGCRK3|FKSG1|GY2|WDR14|WDVCF G protein subunit beta 1 like protein-coding 201.333-258 chr7 25714785 25714978 + 1.33333 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) 36151 NR_157815 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 180.666-9 chr12 103120776 103120964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30972 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 208.666-54 chr18 12234234 12234475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20007 NM_001279 1149 Hs.249129 NM_001279 ENSG00000176194 CIDEA CIDE-A cell death inducing DFFA like effector a protein-coding 313.333-29 chr4 62542196 62542584 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -380625 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 246.666-4 chr1 197715270 197715545 + 1.33333 NA intron (NR_125340, intron 2 of 19) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 60073 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 197.333-7 chr1 116125922 116126209 + 1.33333 NA intron (NM_152367, intron 4 of 6) intron (NM_152367, intron 4 of 6) 14310 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 230.666-31 chr20 9588159 9588496 + 1.33333 NA intron (NM_020341, intron 4 of 10) intron (NM_020341, intron 4 of 10) -73329 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 215.333-97 chr2 150388720 150389019 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 98826 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 327-20 chr3 79043582 79043941 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) -24302 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 296.333-37 chr6 147041823 147042174 + 1.33333 NA intron (NR_034115, intron 5 of 10) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -116927 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 311.333-40 chr4 66295507 66295817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18838 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 210-135 chr6 140988238 140988405 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 304507 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 239.666-9 chr14 26499766 26500022 + 1.33333 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) intron (NM_001366393, intron 2 of 4) 53536 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 254-30 chr19 29112642 29113035 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100313 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 232.666-20 chr17 80424838 80425111 + 1.33333 NA intron (NR_148042, intron 3 of 7) intron (NR_148042, intron 3 of 7) 5556 NR_039883 100616359 NR_039883 ENSG00000264961 MIR4730 - microRNA 4730 ncRNA 213.333-21 chr10 22646892 22647092 + 1.33333 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 67116 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 139.333-190 chr6 47812735 47812885 + 1.33333 NA intron (NR_033806, intron 6 of 6) intron (NR_033806, intron 6 of 6) 25742 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 194.667-114 chr4 102841666 102841935 + 1.33333 NA intron (NR_131185, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 12486 NR_131185 105377348 Hs.661187 NR_131185 ENSG00000246560 UBE2D3-AS1 - UBE2D3 antisense RNA 1 ncRNA 338.667-2 chr1 100068421 100068924 + 1.33333 NA intron (NM_033055, intron 7 of 11) intron (NM_033055, intron 7 of 11) 30577 NM_033055 64645 Hs.124156 NM_033055 ENSG00000156875 MFSD14A HIAT1 major facilitator superfamily domain containing 14A protein-coding 467.666 chr10 56932760 56933189 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 371585 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 221.333-136 chr8 9008967 9009191 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001354636, exon 3 of 8) 5' UTR (NM_001354636, exon 3 of 8) 5953 NM_001354635 90459 Hs.20000 NM_153332 ENSG00000104626 ERI1 3'HEXO|HEXO|THEX1 exoribonuclease 1 protein-coding 204-76 chr17 15165119 15165339 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59042 NR_103559 94151 Hs.98684 NR_103559 CDRT8 - CMT1A duplicated region transcript 8 ncRNA 229.333-59 chr2 27584552 27584870 + 1.33333 NA intron (NM_001271286, intron 2 of 12) L2c|LINE|L2 1669 NM_032434 84450 Hs.529178 NM_032434 ENSG00000243943 ZNF512 - zinc finger protein 512 protein-coding 209-116 chr7 83115405 83115609 + 1.33333 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 47377 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 268.666-31 chr8 123792501 123792718 + 1.33333 NA intron (NM_144963, intron 15 of 23) intron (NM_144963, intron 15 of 23) 24170 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 204-138 chr3 181683987 181684181 + 1.33333 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 -27841 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 243.999-5 chr4 22088995 22089273 + 1.33333 NA Intergenic MER61A|LTR|ERV1 -140383 NM_147182 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 351.666-17 chr8 57905736 57906103 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -72439 NR_130934 100505477 Hs.434693 NR_130934 ENSG00000205293 LINC01602 T1560 long intergenic non-protein coding RNA 1602 ncRNA 196.666-76 chr4 30792708 30792871 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 72420 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 166.667-183 chr5 84452838 84453034 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -68056 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 186.666-26 chr2 41410344 41410545 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -467111 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 381.667-11 chr8 102638713 102639193 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 15011 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 234-72 chr8 115835225 115835430 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -166352 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 144.333-163 chr3 28949257 28949383 + 1.33333 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 331619 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 241-32 chr2 49658516 49658871 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 315510 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 219-56 chr3 20090827 20091163 + 1.33333 NA intron (NM_003884, intron 2 of 17) AluJo|SINE|Alu -46570 NR_036086 100422901 NR_036086 ENSG00000266745 MIR3135A MIR3135|hsa-mir-3135a microRNA 3135a ncRNA 209-44 chr14 60147966 60148265 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001330177, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001330177, exon 11 of 11) 17283 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 273.666-15 chr2 167792340 167792564 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -26220 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 209.333-94 chr18 54207372 54207632 + 1.33333 NA intron (NM_015832, intron 1 of 2) intron (NM_015832, intron 1 of 2) 14910 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 213.666-14 chr14 102448376 102448622 + 1.33333 NA intron (NM_014844, intron 13 of 19) intron (NM_014844, intron 13 of 19) 61277 NM_001348651 122416 Hs.432945 NM_152326 ENSG00000156381 ANKRD9 - ankyrin repeat domain 9 protein-coding 114.666 chr10 22610735 22610898 + 1.33333 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 103292 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 188.667-105 chr3 153445638 153445902 + 1.33333 NA intron (NR_146713, intron 5 of 6) intron (NR_146713, intron 5 of 6) -38725 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 196.333-10 chr10 31367246 31367501 + 1.33333 NA intron (NM_001368169, intron 1 of 1) MER5A|DNA|hAT-Charlie 32382 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 211.666-30 chr22 20174694 20174861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23722 NM_001365892 388849 Hs.454905 NM_001243537 ENSG00000234409 CCDC188 - coiled-coil domain containing 188 protein-coding 213-68 chr5 54441308 54441595 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14248 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 189.333-203 chr8 37759149 37759315 + 1.33333 NA TTS (NM_001362878) TTS (NM_001362878) -3314 NM_001349349 11212 Hs.304792 NM_007198 ENSG00000147471 PLPBP EPVB6D|PROSC pyridoxal phosphate binding protein protein-coding 343.333-13 chr2 69650663 69651027 + 1.33333 NA intron (NM_001320698, intron 1 of 14) intron (NM_001320698, intron 1 of 14) 7037 NM_001320698 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 204-24 chr10 52831981 52832260 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -60420 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 224.666-36 chr8 112548960 112549191 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 25 of 66) intron (NM_001363185, intron 25 of 66) -94418 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 210.666-28 chr13 91610219 91610451 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) (TTGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 211714 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 246.666-30 chr3 183215070 183215362 + 1.33333 NA intron (NM_015078, intron 22 of 29) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -38037 NM_032047 84002 Hs.718506 NM_032047 ENSG00000176597 B3GNT5 B3GN-T5|beta3Gn-T5 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 protein-coding 179.666-6 chr2 155037006 155037211 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 338413 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 214-83 chr21 27009517 27009819 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42580 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 166.667-53 chr13 19038897 19039103 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 30741 NR_026852 348021 Hs.314114 NR_026852 ENSG00000232685 LINC00442 - long intergenic non-protein coding RNA 442 ncRNA 134.667-66 chr14 84902404 84902627 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -369417 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 199-28 chr15 41679854 41680076 + 1.33333 NA intron (NM_001164273, intron 2 of 23) L1M2|LINE|L1 -11620 NR_030356 693211 NR_030356 ENSG00000207766 MIR626 MIRN626|hsa-mir-626 microRNA 626 ncRNA 293.333-13 chr14 67255236 67255593 + 1.33333 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) intron (NM_001256550, intron 1 of 14) 13979 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 360.333-12 chr2 84639830 84640226 + 1.33333 NA intron (NM_001370, intron 31 of 76) LTR86A1|LTR|ERVL 123573 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 319.666-14 chr6 52615440 52615963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 38403 NR_103447 401264 Hs.544586 NR_103446 ENSG00000225791 TRAM2-AS1 - TRAM2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 274.666-25 chr5 4353631 4353892 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -419720 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 200.666-75 chr3 3983907 3984085 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183121 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 148.667-7 chr1 70157140 70157313 + 1.33333 NA intron (NM_017768, intron 10 of 14) intron (NM_017768, intron 10 of 14) 48353 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 289.666-14 chr4 90041969 90042241 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -85428 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 206.667-33 chr13 31010203 31010483 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 77687 NM_001353390 122046 Hs.124463 NM_152325 ENSG00000175664 TEX26 C13orf26 testis expressed 26 protein-coding 276.666-17 chr2 40517403 40517692 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -5112 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 226-36 chr2 38781770 38782057 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_024775, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_024775, exon 3 of 3) 3703 NM_024775 79833 Hs.143818 NM_024775 ENSG00000152147 GEMIN6 - gem nuclear organelle associated protein 6 protein-coding 194-51 chr16 56935943 56936199 + 1.33333 NA intron (NM_001010989, intron 3 of 7) intron (NM_001010989, intron 3 of 7) 3929 NM_014685 9709 Hs.146393 NM_014685 ENSG00000051108 HERPUD1 HERP|Mif1|SUP homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1 protein-coding 162.667-15 chr1 207070400 207070631 + 1.33333 NA intron (NM_006212, intron 12 of 14) intron (NM_006212, intron 12 of 14) 17240 NM_006212 5208 Hs.282702 NM_006212 ENSG00000123836 PFKFB2 PFK-2/FBPase-2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 2 protein-coding 283.333-50 chr3 105564705 105565069 + 1.33333 NA intron (NM_001243280, intron 13 of 14) AluSz6|SINE|Alu 197978 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 274.333-7 chr10 100958429 100958793 + 1.33333 NA intron (NM_018121, intron 18 of 19) intron (NM_018121, intron 18 of 19) -13918 NM_017893 57715 Hs.591923 NM_017893 ENSG00000095539 SEMA4G - semaphorin 4G protein-coding 219.333-61 chr15 76411871 76412154 + 1.33333 NA intron (NR_148227, intron 27 of 32) L1ME2|LINE|L1 75239 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 278-36 chr3 100315871 100316132 + 1.33333 NA intron (NM_001199198, intron 15 of 18) intron (NM_001199198, intron 15 of 18) -18756 NM_020202 56954 Hs.439152 NM_020202 ENSG00000114021 NIT2 HEL-S-8a nitrilase family member 2 protein-coding 454.666-3 chr3 114568744 114569352 + 1.33333 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 55158 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 169.333-167 chr3 108661810 108661961 + 1.33333 NA exon (NM_014648, exon 20 of 33) exon (NM_014648, exon 20 of 33) 72163 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 183-26 chr12 39144344 39144587 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -238874 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 199-53 chr2 121462740 121462920 + 1.33333 NA intron (NM_015282, intron 9 of 38) intron (NM_015282, intron 9 of 38) -68050 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 174-14 chr10 121013749 121013941 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 162483 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 251-41 chr21 16941847 16942208 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 351790 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 203.666-49 chr5 165145334 165145548 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 675162 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 214-89 chr3 113893578 113893808 + 1.33333 NA intron (NM_017577, intron 6 of 17) MER94|DNA|hAT-Blackjack -3807 NM_001172105 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 319.333-2 chr10 71281711 71282117 + 1.33333 NA intron (NM_001244889, intron 2 of 15) intron (NM_001244889, intron 2 of 15) -37339 NR_033413 55315 Hs.438419 NM_018344 ENSG00000198246 SLC29A3 ENT3|HCLAP|HJCD|PHID solute carrier family 29 member 3 protein-coding 360.667-12 chr3 46208484 46209006 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001295) promoter-TSS (NM_001295) -432 NM_001295 1230 Hs.301921 NM_001295 ENSG00000163823 CCR1 CD191|CKR-1|CKR1|CMKBR1|HM145|MIP1aR|SCYAR1 C-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 156-9 chr1 74978843 74979067 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -149479 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 212.667-130 chr7 136025329 136025645 + 1.33333 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -48128 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 223-5 chr1 204554354 204554691 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001278519, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001278519, exon 5 of 5) 38116 NM_002393 4194 Hs.497492 NM_002393 ENSG00000198625 MDM4 HDMX|MDMX|MRP1 MDM4 regulator of p53 protein-coding 322-51 chr9 81046091 81046538 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 643221 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 203.333-236 chr6 133390313 133390556 + 1.33333 NA intron (NM_172103, intron 3 of 18) AluSx1|SINE|Alu 148935 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 177.666-28 chr6 131665301 131665493 + 1.33333 NA intron (NR_133007, intron 6 of 23) L1MB1|LINE|L1 28095 NM_005021 5169 Hs.486489 NM_005021 ENSG00000154269 ENPP3 B10|CD203c|NPP3|PD-IBETA|PDNP3 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 3 protein-coding 204.666-79 chr6 36952472 36952724 + 1.33333 NA intron (NM_001199159, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 -2140 NM_153370 221476 Hs.25391 NM_153370 ENSG00000164530 PI16 CD364|CRISP9|MSMBBP|PSPBP peptidase inhibitor 16 protein-coding 163.333-54 chr11 77772657 77772844 + 1.33333 NA intron (NM_016578, intron 1 of 15) MIR3|SINE|MIR 48084 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 205.333-181 chr5 19355388 19355551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 530803 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 208.666-71 chr3 96645022 96645195 + 1.33333 NA Intergenic (ATACAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -169486 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 183-65 chr2 182382187 182382347 + 1.33333 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 44781 NM_001258313 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 205.666-42 chr5 67482991 67483271 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 163658 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 298.333-31 chr4 52395603 52395973 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 260751 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 173.333-149 chr4 108500836 108501075 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56278 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 176.666-20 chr4 61959245 61959402 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 16 of 23) intron (NM_001371343, intron 16 of 23) 202442 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 251.333-90 chr5 153917463 153917747 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -18618 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 251.666-31 chr9 69774979 69775309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15133 NR_159516 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 202.667-44 chr13 57442922 57443185 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -188691 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 273.333-48 chr4 31870300 31870689 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -126885 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 236.666-31 chr2 221198443 221198700 + 1.33333 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 373733 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 246.667-56 chr3 66262306 66262623 + 1.33333 NA intron (NM_001350992, intron 3 of 8) intron (NM_001350992, intron 3 of 8) 41461 NM_001350992 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 215-3 chr1 81942821 81943082 + 1.33333 NA intron (NM_001366006, intron 5 of 23) intron (NM_001366006, intron 5 of 23) 140498 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 204.333-89 chr19 47166546 47166765 + 1.33333 NA intron (NM_005500, intron 5 of 8) intron (NM_005500, intron 5 of 8) 35820 NM_001145714 10055 Hs.515500 NM_005500 ENSG00000142230 SAE1 AOS1|HSPC140|SUA1|UBLE1A SUMO1 activating enzyme subunit 1 protein-coding 220.333-7 chr1 191894040 191894351 + 1.33333 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -264267 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 392-22 chr8 103987107 103987782 + 1.33333 NA intron (NR_145711, intron 13 of 21) L1M5|LINE|L1 168224 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 250-8 chr1 240449803 240450105 + 1.33333 NA intron (NM_020066, intron 16 of 17) L1MA9|LINE|L1 162201 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 181.333-73 chr2 32504772 32504953 + 1.33333 NA intron (NM_016252, intron 49 of 73) intron (NM_016252, intron 49 of 73) -27291 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 218.667-73 chr3 194982686 194982988 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -111751 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 219.333-165 chr7 18654387 18654605 + 1.33333 NA intron (NM_058176, intron 10 of 22) MIRb|SINE|MIR 145226 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 285.999-3 chr2 193822037 193822459 + 1.33333 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -522021 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 217.666-21 chr2 112558140 112558383 + 1.33333 NA intron (NM_019014, intron 8 of 14) intron (NM_019014, intron 8 of 14) -16049 NR_136321 105373562 Hs.599548 NR_136321 LOC105373562 - uncharacterized LOC105373562 ncRNA 271.667-73 chr8 102250607 102250936 + 1.33333 NA intron (NR_125415, intron 2 of 2) intron (NR_125415, intron 2 of 2) 11320 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 233.999-6 chr8 120364721 120364944 + 1.33333 NA intron (NM_021110, intron 45 of 47) AluSz|SINE|Alu 80318 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 289.333 chr1 37586522 37586793 + 1.33333 NA intron (NM_001323624, intron 4 of 14) L1ME4a|LINE|L1 9280 NM_013285 29889 Hs.75528 NM_013285 ENSG00000134697 GNL2 HUMAUANTIG|NGP1|Ngp-1|Nog2|Nug2 G protein nucleolar 2 protein-coding 207.666-28 chr2 161173827 161174072 + 1.33333 NA intron (NM_001199135, intron 1 of 7) intron (NM_001199135, intron 1 of 7) 13521 NM_001199135 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 221.333-84 chr21 30430099 30430381 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_181600) promoter-TSS (NM_181600) -14 NM_181600 284827 Hs.553677 NM_181600 ENSG00000186971 KRTAP13-4 KAP13.4 keratin associated protein 13-4 protein-coding 274.333-3 chr1 189418343 189418682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1057498 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 225.999-12 chr8 130608954 130609127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -165366 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 144-109 chr3 85014763 85014951 + 1.33333 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 47407 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 189.333-50 chr14 22075674 22075858 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 356987 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 228.999-3 chr16 63053288 63053539 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1016975 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 253.666-5 chr14 52872877 52873217 + 1.33333 NA intron (NM_006832, intron 9 of 14) intron (NM_006832, intron 9 of 14) 78003 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 220.999-7 chr7 88918077 88918301 + 1.33333 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -122452 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 199.333-272 chr8 73663741 73663943 + 1.33333 NA intron (NM_001164383, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 82998 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 268.667-28 chr2 29308519 29308860 + 1.33333 NA intron (NM_004304, intron 8 of 28) MIRb|SINE|MIR -84789 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 218-13 chr10 103959136 103959418 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7863 NM_014720 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 186-82 chr5 68157288 68157464 + 1.33333 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -32500 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 202-107 chr3 22495022 22495299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 538021 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 237.333-101 chr6 72951537 72951888 + 1.33333 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) (TTTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16041 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 313.666-8 chr21 27244704 27245063 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -277795 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 449.332 chr14 40298817 40299261 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -655672 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 332.333-9 chr10 125280868 125281145 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -119976 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 193.333-187 chr8 73702739 73702897 + 1.33333 NA intron (NM_001164385, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 44022 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 204.667-119 chr5 58760400 58760656 + 1.33333 NA intron (NM_138453, intron 3 of 4) intron (NM_138453, intron 3 of 4) 177453 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 180-71 chr3 190111669 190111868 + 1.33333 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 9129 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 185.333-19 chr10 61700151 61700409 + 1.33333 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) L1ME4a|LINE|L1 37319 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 308-21 chr17 77628274 77628697 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 81544 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 249.999-6 chr20 42129500 42129816 + 1.33333 NA intron (NM_133170, intron 19 of 31) intron (NM_133170, intron 19 of 31) -511281 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 223-54 chr5 162672192 162672470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 604689 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 204.666-82 chr6 69650616 69650854 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 145731 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 134-38 chr17 52983386 52983523 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2051 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 190.666-13 chr11 76221898 76222134 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -15514 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 163-4 chr1 174659357 174659500 + 1.33333 NA intron (NM_001366446, intron 14 of 25) L2a|LINE|L2 -41111 NM_001366450 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 271-54 chr9 37313550 37314040 + 1.33333 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -108901 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 303.333-35 chr18 3370637 3370952 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20235 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 199.667-74 chr2 64107214 64107509 + 1.33333 NA intron (NM_020651, intron 2 of 6) intron (NM_020651, intron 2 of 6) 37059 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 212.666-52 chr21 31483961 31484155 + 1.33333 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 75029 NM_003253 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 503-5 chr7 64641815 64642470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23941 NM_001282359 51427 Hs.50216 NM_016220 ENSG00000196247 ZNF107 Y8|ZFD25|ZNF588|smap-7 zinc finger protein 107 protein-coding 204.333-84 chr18 67324210 67324367 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -192258 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 232.333-7 chr10 81231413 81231748 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 581783 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 199.333-148 chr2 177125033 177125287 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87251 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 454.666-4 chr5 68987925 68988374 + 1.33333 NA intron (NR_130778, intron 1 of 3) intron (NR_130778, intron 1 of 3) 41778 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 249.666-30 chr4 74020129 74020460 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18395 NM_002090 2921 Hs.89690 NM_002090 ENSG00000163734 CXCL3 CINC-2b|GRO3|GROg|MIP-2b|MIP2B|SCYB3 C-X-C motif chemokine ligand 3 protein-coding 170-28 chr12 42029386 42029557 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 115403 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 287.999-4 chr2 120907861 120908148 + 1.33333 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) intron (NM_005270, intron 2 of 13) 115723 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 249.333-106 chr9 77227254 77227506 + 1.33333 NA intron (NM_001018038, intron 15 of 68) intron (NM_001018038, intron 15 of 68) -49463 NR_026668 100286938 Hs.662256 NR_026668 ENSG00000232998 VPS13A-AS1 - VPS13A antisense RNA 1 ncRNA 483.999-2 chr10 61030779 61031155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14692 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 204-199 chr8 116798767 116798957 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 32338 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 207.333-260 chr7 129543041 129543207 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 40593 NM_001195243 100287482 Hs.178144 NM_001195243 ENSG00000240204 SMKR1 - small lysine rich protein 1 protein-coding 273.667-20 chr13 78455634 78455960 + 1.33333 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -140325 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 271-12 chr12 80293459 80293880 + 1.33333 NA intron (NM_001368062, intron 31 of 62) intron (NM_001368062, intron 31 of 62) 84216 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 376.666-14 chr9 28480365 28480771 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 238737 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 201.333-139 chr19 52985037 52985232 + 1.33333 NA intron (NR_003578, intron 2 of 3) HERVK3-int|LTR|ERVK 8397 NR_003578 79986 Hs.714428 NM_024924 ENSG00000242779 ZNF702P ZNF702 zinc finger protein 702, pseudogene pseudo 294.667-22 chr2 125967812 125968186 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 149986 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 233.666-2 chr1 189698671 189699029 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 777160 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 221.333-21 chr11 17264072 17264318 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL -12519 NM_001352663 4925 Hs.654599 NM_005013 ENSG00000070081 NUCB2 HEL-S-109|NEFA nucleobindin 2 protein-coding 261-35 chr2 61876370 61876822 + 1.33333 NA intron (NM_001256721, intron 6 of 12) FAM|SINE|Alu 12060 NM_006430 10575 Hs.421509 NM_006430 ENSG00000115484 CCT4 CCT-DELTA|Cctd|SRB chaperonin containing TCP1 subunit 4 protein-coding 155.333-344 chr6 140741469 140741623 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57732 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 228.666-9 chr10 92008173 92008518 + 1.33333 NA intron (NM_003972, intron 26 of 37) intron (NM_003972, intron 26 of 37) 84575 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 323.999 chr1 80251312 80251773 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -284213 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 411.666-6 chr4 102633867 102634310 + 1.33333 NA intron (NM_005908, intron 16 of 16) intron (NM_005908, intron 16 of 16) 126880 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 324.666-16 chr5 125859430 125859730 + 1.33333 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -319997 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 211.333-153 chr3 105706764 105706999 + 1.33333 NA intron (NR_135808, intron 10 of 19) intron (NR_135808, intron 10 of 19) 160710 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 199-58 chr2 182846136 182846313 + 1.33333 NA intron (NM_001463, intron 2 of 5) intron (NM_001463, intron 2 of 5) 20413 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 272-13 chr14 58626879 58627253 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -7002 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 623.999 chr5 124872445 124873235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -127728 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 205.666-32 chr20 57324473 57324695 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -2993 NR_036219 100422883 NR_036219 ENSG00000266666 MIR4325 - microRNA 4325 ncRNA 317.666 chr11 6657347 6657618 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1673 NM_003737 8642 Hs.199850 NM_003737 ENSG00000166341 DCHS1 CDH19|CDH25|CDHR6|FIB1|MVP2|PCDH16|VMLDS1 dachsous cadherin-related 1 protein-coding 222.666-39 chr4 94126091 94126467 + 1.33333 NA intron (NR_125922, intron 6 of 8) intron (NR_125922, intron 6 of 8) 81277 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 207.333-86 chr14 49378505 49378666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 207795 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 215.333-19 chr10 19525779 19526024 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 31 of 39) intron (NM_001142308, intron 31 of 39) 202649 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 223.667-38 chr2 89832464 89832794 + 1.33333 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -194722 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 200.667-66 chr19 20823337 20823620 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47174 NM_001355197 7617 Hs.658748 NM_001009883 ENSG00000160229 ZNF66 ZNF66P zinc finger protein 66 protein-coding 295.333-20 chr17 58162834 58163293 + 1.33333 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 6104 NR_002307 55545 Hs.381329 NR_002307 MSX2P1 HPX5|HSHPX5|MSX2P msh homeobox 2 pseudogene 1 pseudo 216.667-85 chr5 96289133 96289446 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 142870 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 256.666-43 chr6 48992426 48992664 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 470708 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 201-81 chr3 192034414 192034586 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -204130 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 373 chr1 90935212 90935837 + 1.33333 NA intron (NM_032186, intron 2 of 3) intron (NM_032186, intron 2 of 3) 83765 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 223-4 chr1 192039665 192039972 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -118644 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 233-19 chr12 103880307 103880628 + 1.33333 NA intron (NR_027249, intron 9 of 15) intron (NR_027249, intron 9 of 15) -39233 NM_001031701 51559 Hs.48428 NM_016575 ENSG00000111696 NT5DC3 TU12B1-TY|TU12B1TY 5'-nucleotidase domain containing 3 protein-coding 209.333-171 chr4 55483123 55483431 + 1.33333 NA intron (NM_004898, intron 3 of 22) L2c|LINE|L2 62655 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 247.333-85 chr8 91927260 91927626 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90237 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 204-68 chr15 69406476 69406758 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_017705, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_017705, exon 9 of 9) -7732 NM_138555 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 328.666-24 chr9 131746503 131746828 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -6721 NM_001304275 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 248.333-78 chr5 18311050 18311426 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 503964 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 313.333-6 chr11 72827818 72828131 + 1.33333 NA intron (NM_001318766, intron 14 of 17) intron (NM_001318766, intron 14 of 17) 13563 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 205-102 chr8 123790673 123790900 + 1.33333 NA intron (NM_144963, intron 15 of 23) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 22347 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 186.333-141 chr6 120205175 120205418 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 190117 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 354.666-9 chr2 30578921 30579214 + 1.33333 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) intron (NM_182551, intron 6 of 6) 131821 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 357.666-4 chr18 9670718 9671026 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -37429 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 246-33 chr15 67248034 67248330 + 1.33333 NA intron (NM_001271885, intron 1 of 9) intron (NM_001271885, intron 1 of 9) 6479 NM_024666 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 139-108 chr8 123140723 123140918 + 1.33333 NA exon (NM_001145088, exon 17 of 20) exon (NM_001145088, exon 17 of 20) -38227 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 203.666-46 chr5 26343515 26343784 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 694937 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 233.666-22 chr4 113572255 113572517 + 1.33333 NA intron (NM_001221, intron 4 of 18) intron (NM_001221, intron 4 of 18) 189352 NM_001321592 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 203.333-212 chr5 73072046 73072247 + 1.33333 NA intron (NM_001146032, intron 18 of 24) AluJr|SINE|Alu -48429 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 296-17 chr14 29038155 29038540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -252560 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 176-5 chr1 87630211 87630460 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -258680 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 264.999-2 chr13 34214077 34214385 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133812 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 340-8 chr12 30579738 30580045 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97353 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 204.666-99 chr8 90912212 90912378 + 1.33333 NA intron (NM_022351, intron 5 of 12) intron (NM_022351, intron 5 of 12) 72782 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 431-10 chr4 48425148 48425566 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_020846, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_020846, exon 8 of 8) -57986 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 265.999-4 chr4 47675969 47676206 + 1.33333 NA intron (NM_006587, intron 9 of 21) L2c|LINE|L2 23418 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 202-78 chr2 41349657 41349892 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -527781 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 208.666-58 chr2 67210122 67210309 + 1.33333 NA intron (NR_038844, intron 1 of 7) intron (NR_038844, intron 1 of 7) -3193 NR_110568 101927661 Hs.580508 NR_110568 ENSG00000235885 LOC101927661 - uncharacterized LOC101927661 ncRNA 159.333-176 chr2 198494783 198495012 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119800 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 165.333-30 chr10 72767519 72767712 + 1.33333 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) AluJo|SINE|Alu 46586 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 176.666-6 chr11 74430433 74430630 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 31294 NR_039710 100616215 NR_039710 ENSG00000264402 MIR548AL - microRNA 548al ncRNA 331.333-31 chr3 16905581 16905999 + 1.33333 NA intron (NM_001144382, intron 1 of 5).2 intron (NM_001144382, intron 1 of 5).2 20835 NM_001144382 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 156-96 chr4 28748692 28748866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70803 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 251.333-26 chr13 75278243 75278621 + 1.33333 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 37844 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 213.666-6 chr10 71911130 71911297 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -53182 NM_004273 9469 Hs.158304 NM_004273 ENSG00000122863 CHST3 C6ST|C6ST1|HSD carbohydrate sulfotransferase 3 protein-coding 226-74 chr5 103122283 103122500 + 1.33333 NA intron (NM_001345878, intron 1 of 28) L2b|LINE|L2 2090 NM_001281471 23262 Hs.212046 NM_015216 ENSG00000145725 PPIP5K2 CFAP160|DFNB100|HISPPD1|IP7K2|VIP2 diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 2 protein-coding 230-78 chr9 37980907 37981141 + 1.33333 NA intron (NM_003028, intron 2 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -76671 NR_024873 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 269.333-82 chr7 55308402 55308714 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52923 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 204-23 chr10 12931265 12931566 + 1.33333 NA intron (NM_001282658, intron 6 of 6) LTR67B|LTR|ERVL 70298 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 341.666-20 chr9 77075288 77075664 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55821 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 226-91 chr8 54654525 54654787 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 38560 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 263.999-5 chr5 4106931 4107217 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 511242 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 346.666-6 chr17 61327697 61327991 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 39860 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 246.333-9 chr1 224149269 224149554 + 1.33333 NA intron (NM_001136115, intron 3 of 3) AluJr|SINE|Alu -33829 NM_003676 8560 Hs.299878 NM_003676 ENSG00000143753 DEGS1 DEGS|DEGS-1|DES1|Des-1|FADS7|HLD18|MIG15|MLD delta 4-desaturase, sphingolipid 1 protein-coding 379.666-2 chr1 223549250 223549680 + 1.33333 NA intron (NM_001143962, intron 15 of 20) intron (NM_001143962, intron 15 of 20) 116236 NM_001143962 388743 Hs.291487 NM_001143962 ENSG00000203697 CAPN8 nCL-2 calpain 8 protein-coding 297.333-35 chr2 186623056 186623352 + 1.33333 NA intron (NM_001145000, intron 3 of 27) L2b|LINE|L2 22999 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 156-149 chr9 132695281 132695476 + 1.33333 NA TTS (NM_012204) TTS (NM_012204) 24914 NM_012204 9329 Hs.22302 NM_012204 ENSG00000125484 GTF3C4 KAT12|TF3C-delta|TFIII90|TFIIIC290|TFIIIC90|TFIIICDELTA general transcription factor IIIC subunit 4 protein-coding 250.333-52 chr4 102769255 102769558 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -7631 NR_125932 102723704 Hs.638374 NR_125932 LOC102723704 - uncharacterized LOC102723704 ncRNA 165.333-20 chr1 245163633 245163864 + 1.33333 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) L1MD|LINE|L1 8763 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 199.666-37 chr3 95086473 95086672 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 148309 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 215.333-9 chr1 171389428 171389631 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 50633 NR_002719 7151 Hs.661092 NR_002719 TOP1P1 - DNA topoisomerase I pseudogene 1 pseudo 262.666-14 chr21 33994859 33995141 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 18618 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 273.333-43 chr3 7625473 7625826 + 1.33333 NA intron (NM_000844, intron 8 of 9) AluJo|SINE|Alu -90365 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 172.666-5 chr14 39978733 39978878 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -546305 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 197.667-2 chr1 53436879 53437153 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 3004 NR_002314 163742 Hs.99394 NR_002314 ENSG00000236253 SLC25A3P1 - solute carrier family 25 member 3 pseudogene 1 pseudo 238-40 chr19 40209799 40210098 + 1.33333 NA intron (NM_002446, intron 6 of 9) AluJo|SINE|Alu 8451 NM_152479 148014 Hs.631572 NM_152479 ENSG00000174521 TTC9B - tetratricopeptide repeat domain 9B protein-coding 294-28 chr18 2681486 2681849 + 1.33333 NA intron (NM_015295, intron 5 of 47) intron (NM_015295, intron 5 of 47) 25780 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 245.666-8 chr12 83567962 83568226 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 880939 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 118.667-170 chr6 119744682 119744833 + 1.33333 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 194949 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 249.666-23 chr2 151208158 151208563 + 1.33333 NA Intergenic LTR24B|LTR|ERV1 53503 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 203-69 chr3 125293843 125294010 + 1.33333 NA intron (NM_001348436, intron 5 of 8) L1MC4a|LINE|L1 63354 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 195.333-66 chr12 121081271 121081489 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -42138 NM_001261825 8638 Hs.118633 NM_003733 ENSG00000135114 OASL OASL1|OASLd|TRIP-14|TRIP14|p59 OASL|p59-OASL|p59OASL 2'-5'-oligoadenylate synthetase like protein-coding 274.666-29 chr8 9172909 9173216 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15937 NR_125431 101929128 NR_125431 ENSG00000248538 LOC101929128 - uncharacterized LOC101929128 ncRNA 269.333-3 chr10 45476739 45476948 + 1.33333 NA intron (NM_001282866, intron 3 of 7) L1MA4A|LINE|L1 -23722 NR_120674 102724323 Hs.559151 NR_120674 ENSG00000231964 LOC102724323 - uncharacterized LOC102724323 ncRNA 246.667-27 chr14 26426538 26426890 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 126716 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 375-13 chr8 111452837 111453432 + 1.33333 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) Charlie3|DNA|hAT-Charlie 76495 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 113.333-183 chr3 152816612 152816780 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -18435 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 370-26 chr7 36071662 36072115 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -23422 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 225.333-106 chr5 21615394 21615622 + 1.33333 NA Intergenic LTR17|LTR|ERV1 156028 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 238-25 chr14 72499857 72500067 + 1.33333 NA intron (NM_001370280, intron 13 of 17) intron (NM_001370280, intron 13 of 17) -16858 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 210.667-110 chr5 110419213 110419506 + 1.33333 NA TTS (NM_001039763) TTS (NM_001039763) 94556 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 322-32 chr5 13786053 13786376 + 1.33333 NA exon (NM_001369, exon 52 of 79) exon (NM_001369, exon 52 of 79) 158266 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 224-61 chr3 119022581 119022789 + 1.33333 NA intron (NM_001353319, intron 1 of 7) L1M5|LINE|L1 12161 NM_001353319 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 253.666-17 chr3 86256233 86256552 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -225551 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 144.666-7 chr11 115100079 115100232 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -233422 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 209.333-37 chr11 78710541 78710736 + 1.33333 NA intron (NM_001098816, intron 26 of 33) intron (NM_001098816, intron 26 of 33) -135774 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 223.333-160 chr8 36566118 36566383 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -218124 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 275-32 chr20 53682097 53682503 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 73946 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 284.333-18 chr15 42898389 42898649 + 1.33333 NA intron (NM_173500, intron 1 of 14) AluSz6|SINE|Alu 22259 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 238-35 chr18 820840 821127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8741 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 214.666-28 chr17 80752684 80752933 + 1.33333 NA intron (NM_020761, intron 5 of 33) intron (NM_020761, intron 5 of 33) 52824 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 158-104 chr5 37495235 37495451 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 8 of 17) intron (NM_001345998, intron 8 of 17) 116025 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 231.666-24 chr4 67087885 67088154 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 333981 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 180.333-58 chr2 175361741 175361956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -180138 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 313.333-44 chr8 74011196 74011702 + 1.33333 NA intron (NM_001195797, intron 2 of 3) L1PB4|LINE|L1 20057 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 361 chr10 79597818 79598247 + 1.33333 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 -12907 NM_001164647 653509 Hs.535295 NM_005411 ENSG00000122852 SFTPA1 COLEC4|PSAP|PSP-A|PSPA|SFTP1|SFTPA1B|SP-A|SP-A1|SPA|SPA1 surfactant protein A1 protein-coding 211.333-30 chr10 114968589 114968852 + 1.33333 NA intron (NM_139169, intron 4 of 7) intron (NM_139169, intron 4 of 7) -25937 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 327-2 chr10 22020141 22020516 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -16598 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 290-33 chr3 62828658 62828956 + 1.33333 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) intron (NM_003716, intron 1 of 29) 46609 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 274-6 chr11 69260416 69260693 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -33601 NM_138768 26579 Hs.523848 NM_138768 ENSG00000172927 MYEOV OCIM myeloma overexpressed protein-coding 159-116 chr8 49444058 49444372 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67965 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 206.666-18 chr10 48674489 48674687 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -10285 NM_001370153 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 288-26 chr2 40991541 40991838 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -479254 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 188.333-53 chr16 9692343 9692570 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -236951 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 251-20 chr14 33863347 33863703 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87549 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 177.333-60 chr15 57136025 57136253 + 1.33333 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -83291 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 189.333-168 chr6 53038462 53038614 + 1.33333 NA intron (NM_014920, intron 2 of 13) MER58B|DNA|hAT-Charlie 23264 NM_016513 22858 Hs.417022 NM_014920 ENSG00000112144 ICK ECO|EJM10|LCK2|MRK intestinal cell kinase protein-coding 378-28 chr8 50147747 50148162 + 1.33333 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) L1MD3|LINE|L1 -16177 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 163.666-11 chr3 58461603 58461775 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -27837 NM_001173468 5162 Hs.161357 NM_000925 ENSG00000168291 PDHB PDHBD|PDHE1-B|PDHE1B|PHE1B pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit protein-coding 205.333-200 chr6 51773668 51773930 + 1.33333 NA intron (NM_138694, intron 54 of 66) intron (NM_138694, intron 54 of 66) 151929 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 185.333-85 chr2 55795821 55796031 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -102082 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 120-92 chr4 19498326 19498501 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -753492 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 216.333-103 chr3 192460101 192460361 + 1.33333 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) -51182 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 177.666-21 chr5 13489898 13490115 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 454474 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 306.333-27 chr21 19624257 19624511 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 275371 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 388.333-16 chr5 99850758 99851259 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 317018 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 206.333-109 chr3 37041543 37041807 + 1.33333 NA intron (NM_001167617, intron 14 of 18) MIRc|SINE|MIR 48325 NM_001354622 4292 Hs.195364 NM_000249 ENSG00000076242 MLH1 COCA2|FCC2|HNPCC|HNPCC2|hMLH1 mutL homolog 1 protein-coding 284.666-15 chr2 96320680 96320913 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4528 NM_001008949 150771 Hs.65009 NM_178495 ENSG00000198885 ITPRIPL1 KIAA1754L ITPRIP like 1 protein-coding 196-194 chr9 25234360 25234512 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 444422 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 213.333-165 chr5 123557445 123557636 + 1.33333 NA exon (NM_001364141, exon 6 of 15) exon (NM_001364141, exon 6 of 15) 12123 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 213-63 chr4 89996511 89996747 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 101775 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 200.333-130 chr5 166626768 166626952 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 299510 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 195.333-7 chr1 60077137 60077385 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -3491 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 211-53 chr20 24425968 24426204 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -43113 NM_001323606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 318.999-2 chr2 40226917 40227432 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 203130 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 177.666-8 chr16 17937706 17937860 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 394879 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 274.667-26 chr2 48048287 48048679 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -142690 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 273.666-11 chr18 58359305 58359695 + 1.33333 NA intron (NM_001144965, intron 19 of 30) L1MEd|LINE|L1 -91574 NR_029667 406906 NR_029667 ENSG00000284440 MIR122 MIR122A|MIRN122|MIRN122A|hsa-mir-122|miRNA122|miRNA122A|mir-122 microRNA 122 ncRNA 288.666-14 chr18 12688382 12688618 + 1.33333 NA intron (NM_001271989, intron 6 of 10) intron (NM_001271989, intron 6 of 10) 14223 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 220.666-65 chr6 125882720 125882965 + 1.33333 NA intron (NM_001199621, intron 6 of 14) MIR|SINE|MIR -36413 NM_001199622 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 167.333-262 chr8 103156430 103156595 + 1.33333 NA TTS (NR_109954) TTS (NR_109954) 1898 NR_036106 100422992 NR_036106 ENSG00000265657 MIR3151 mir-3151 microRNA 3151 ncRNA 181-54 chr3 181849585 181849733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102705 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 211.333-50 chr13 45720818 45721108 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18494 NM_001286342 220082 Hs.186363 NM_152719 ENSG00000174015 SPERT CBY2|NURIT spermatid associated protein-coding 339.666-6 chr2 83300837 83301288 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -221752 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 119.333-195 chr6 142243522 142243618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58349 NM_001032394 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 186.666-6 chr1 173576360 173576520 + 1.33333 NA intron (NM_178527, intron 8 of 27) intron (NM_178527, intron 8 of 27) 26632 NM_178527 284525 Hs.494981 NM_178527 ENSG00000162753 SLC9C2 SLC9A11 solute carrier family 9 member C2 (putative) protein-coding 201.333-212 chr4 90214578 90214870 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) intron (NM_001145065, intron 1 of 10) -20307 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 362.666-8 chr3 6938286 6938618 + 1.33333 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -44435 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 262.666-6 chr15 26876856 26877205 + 1.33333 NA intron (NM_001165037, intron 3 of 10) intron (NM_001165037, intron 3 of 10) 9904 NM_001165037 2558 Hs.24969 NM_000810 ENSG00000186297 GABRA5 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit protein-coding 207.333-53 chr11 82679876 82680062 + 1.33333 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 53895 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 207.333-156 chr2 237900871 237901029 + 1.33333 NA intron (NM_001308353, intron 3 of 3) intron (NM_001308353, intron 3 of 3) 41327 NM_005855 10267 Hs.471783 NM_005855 ENSG00000132329 RAMP1 - receptor activity modifying protein 1 protein-coding 171.333-52 chr14 68485668 68485844 + 1.33333 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 143031 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 144.666-14 chr6 10051544 10051751 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -352855 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 410.667-7 chr2 31421674 31422249 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -7219 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 369.666-9 chr3 110856517 110856851 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 213275 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 202-52 chr15 59167658 59167838 + 1.33333 NA intron (NM_004998, intron 22 of 27) AluSz|SINE|Alu 3514 NR_031750 100313886 NR_031750 ENSG00000253030 MIR2116 mir-2116 microRNA 2116 ncRNA 160.666-13 chr4 79949914 79950077 + 1.33333 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 122524 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 225.333-62 chr15 69377497 69377712 + 1.33333 NA intron (NM_001104554, intron 3 of 8) intron (NM_001104554, intron 3 of 8) -36745 NM_138555 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 276.333-60 chr8 67888805 67889224 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -63032 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 182.667-124 chr4 132674354 132674610 + 1.33333 NA intron (NR_126401, intron 3 of 3) intron (NR_126401, intron 3 of 3) 83393 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 251.333-23 chr12 53013104 53013524 + 1.33333 NA intron (NM_001330654, intron 1 of 13) intron (NM_001330654, intron 1 of 13) 6858 NM_001417 1975 Hs.648394 NM_001417 ENSG00000063046 EIF4B EIF-4B|PRO1843 eukaryotic translation initiation factor 4B protein-coding 285.333-77 chrX 71047995 71048430 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 20122 NM_013346 29934 Hs.260750 NM_013346 ENSG00000147164 SNX12 - sorting nexin 12 protein-coding 166-36 chr12 69429953 69430169 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -40327 NM_001042555 10818 Hs.593446 NM_006654 ENSG00000166225 FRS2 FRS1A|FRS2A|FRS2alpha|SNT|SNT-1|SNT1 fibroblast growth factor receptor substrate 2 protein-coding 139.333-173 chr4 119250284 119250416 + 1.33333 NA intron (NM_001371399, intron 5 of 16) intron (NM_001371399, intron 5 of 16) 37637 NM_001371396 197.333-75 chr16 9307359 9307551 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48133 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 314.667-34 chr6 45343664 45343999 + 1.33333 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) L3|LINE|CR1 15501 NR_103533 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 258.666-27 chr4 48930908 48931221 + 1.33333 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -24236 NM_001286773 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 230-22 chr14 25987042 25987381 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 566219 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 258.667-47 chr2 102901353 102901734 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5821 NR_135562 105373518 Hs.738351 NR_135562 ENSG00000277527 LINC01796 - long intergenic non-protein coding RNA 1796 ncRNA 170-38 chr14 82758483 82758674 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 115946 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 128.333-177 chr6 123432853 123433079 + 1.33333 NA intron (NM_001251987, intron 12 of 20) L2a|LINE|L2 -6638 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 357.999-4 chr8 80144201 80144561 + 1.33333 NA intron (NR_105035, intron 1 of 6) intron (NR_105035, intron 1 of 6) 26740 NR_105037 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 206.666-127 chr9 97442381 97442583 + 1.33333 NA intron (NM_001302884, intron 5 of 15) intron (NM_001302884, intron 5 of 15) 30386 NM_014290 23424 Hs.193842 NM_014290 ENSG00000196116 TDRD7 CATC4|PCTAIRE2BP|TRAP tudor domain containing 7 protein-coding 381.333-7 chr16 11135031 11135567 + 1.33333 NA intron (NM_015226, intron 21 of 22) intron (NM_015226, intron 21 of 22) 120883 NM_003745 8651 Hs.50640 NM_003745 ENSG00000185338 SOCS1 CIS1|CISH1|JAB|SOCS-1|SSI-1|SSI1|TIP-3|TIP3 suppressor of cytokine signaling 1 protein-coding 199-122 chr8 125555253 125555487 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 123161 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 214-76 chr20 6255102 6255373 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -131693 NM_017671 55612 Hs.472054 NM_017671 ENSG00000101311 FERMT1 C20orf42|DTGCU2|KIND1|UNC112A|URP1 fermitin family member 1 protein-coding 296-24 chr19 43932296 43932783 + 1.33333 NA intron (NM_003425, intron 3 of 9) intron (NM_003425, intron 3 of 9) 2743 NM_003425 7596 Hs.381285 NM_003425 ENSG00000124459 ZNF45 KOX5|ZNF13 zinc finger protein 45 protein-coding 437.333-8 chr2 232303742 232304197 + 1.33333 NA intron (NR_046476, intron 14 of 20) intron (NR_046476, intron 14 of 20) -74782 NM_001632 250 Hs.284255 NM_001632 ENSG00000163283 ALPP ALP|ALPI|IAP|PALP|PLAP|PLAP-1 alkaline phosphatase, placental protein-coding 167-66 chr21 15300088 15300316 + 1.33333 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -235202 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 398.666-3 chr11 88122250 88122826 + 1.33333 NA intron (NM_022337, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 52905 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 206.333-123 chr4 107507785 107507942 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 212371 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 157.333-56 chr10 103968029 103968227 + 1.33333 NA intron (NM_001304743, intron 1 of 17) intron (NM_001304743, intron 1 of 17) 988 NM_001304743 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 206-88 chr2 134094956 134095155 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -24880 NM_001371457 404.666-5 chr16 74670288 74670639 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -3586 NM_001370542 55159 Hs.567525 NM_018124 ENSG00000168411 RFWD3 FANCW|RNF201 ring finger and WD repeat domain 3 protein-coding 184.667-127 chr8 6023010 6023230 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 383428 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 246-23 chr13 37748089 37748362 + 1.33333 NA intron (NM_003306, intron 2 of 10) intron (NM_003306, intron 2 of 10) 122200 NM_001354799 7223 Hs.262960 NM_003306 ENSG00000133107 TRPC4 HTRP-4|HTRP4|TRP4 transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 protein-coding 287.333-40 chr4 47334567 47334879 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 128979 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 224.333-34 chr13 108546567 108546843 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49200 NM_015011 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 230.667-32 chr18 27991829 27992118 + 1.33333 NA intron (NM_001308176, intron 8 of 14) intron (NM_001308176, intron 8 of 14) 44668 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 201.333-197 chr3 123053209 123053501 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -13670 NM_006810 10954 Hs.477352 NM_006810 ENSG00000065485 PDIA5 PDIR protein disulfide isomerase family A member 5 protein-coding 335.333-40 chr5 93101081 93101498 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 470054 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 180.666-7 chr11 24427163 24427311 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69816 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 197.333-190 chr5 146249840 146250125 + 1.33333 NA intron (NM_018989, intron 8 of 20) intron (NM_018989, intron 8 of 20) 46377 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 230.333-33 chr13 87886626 87886804 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -76195 NR_104059 101930749 Hs.539610 NR_104059 ENSG00000223404 LINC00397 - long intergenic non-protein coding RNA 397 ncRNA 268.666-26 chr6 51458220 51458557 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -163482 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 171-43 chr20 41477055 41477228 + 1.33333 NA intron (NM_032221, intron 16 of 36) AluJr|SINE|Alu -110323 NM_052846 90187 Hs.726525 NM_052846 ENSG00000183798 EMILIN3 C20orf130|EMILIN5|dJ620E11.4 elastin microfibril interfacer 3 protein-coding 255-7 chr1 112377080 112377414 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -18967 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 212-68 chr16 55520776 55520945 + 1.33333 NA intron (NM_017839, intron 1 of 13) L1ME2|LINE|L1 11788 NM_017839 54947 Hs.460857 NM_017839 ENSG00000087253 LPCAT2 AGPAT11|AYTL1|LysoPAFAT lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 protein-coding 136.666 chr12 8992971 8993145 + 1.33333 NA intron (NR_137426, intron 2 of 3) intron (NR_137426, intron 2 of 3) 3433 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 218-114 chr8 100489051 100489257 + 1.33333 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 70605 NM_198401 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 415.666-9 chr8 121132835 121133233 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -320988 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 193.333-77 chr17 72643181 72643416 + 1.33333 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -2826 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 197.667-83 chr3 63395965 63396217 + 1.33333 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) intron (NM_001130003, intron 2 of 5) -47221 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 406.667-4 chr18 68888193 68888789 + 1.33333 NA intron (NM_001093729, intron 7 of 9) MER20|DNA|hAT-Charlie 90411 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 205.333-107 chr18 56879606 56879878 + 1.33333 NA intron (NM_015285, intron 20 of 27) L1MB7|LINE|L1 192377 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 377.666-7 chr10 89228490 89228921 + 1.33333 NA intron (NM_001288979, intron 1 of 7) intron (NM_001288979, intron 1 of 7) -21388 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 354.667-25 chrX 113322441 113322820 + 1.33333 NA intron (NR_110399, intron 3 of 3) L1MB1|LINE|L1 279903 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 205.333-126 chr2 77293717 77293901 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 228567 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 150-122 chr6 54311817 54311993 + 1.33333 NA intron (NM_014464, intron 1 of 10) L1M5|LINE|L1 3464 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 206.666-129 chr9 125925209 125925414 + 1.33333 NA intron (NM_001330782, intron 3 of 7) MER33|DNA|hAT-Charlie 177128 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 240.333-79 chr5 142696750 142697015 + 1.33333 NA intron (NM_001354954, intron 1 of 4) intron (NM_001354954, intron 1 of 4) 1139 NM_033137 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 282.666-18 chr5 76519952 76520328 + 1.33333 NA intron (NM_006633, intron 2 of 35) L1ME1|LINE|L1 -27269 NM_001285460 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 193.333-57 chr14 75940606 75940758 + 1.33333 NA intron (NM_015072, intron 31 of 31) intron (NM_015072, intron 31 of 31) 41313 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 207.333-51 chr11 81450459 81450723 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 440245 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 259.333-14 chr10 53329774 53330173 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -558273 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 158.333-315 chr8 62603329 62603554 + 1.33333 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) intron (NM_001304533, intron 3 of 6) 354587 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 181-45 chr20 32685024 32685228 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11185 NM_182584 284805 Hs.353262 NM_182584 ENSG00000198547 C20orf203 - chromosome 20 open reading frame 203 protein-coding 228-2 chr1 83617361 83617762 + 1.33333 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) intron (NR_119375, intron 2 of 2) 171507 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 286.666-8 chr2 141945154 141945445 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 186402 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 226-63 chr3 172023990 172024182 + 1.33333 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -15492 NM_022763 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 156-114 chr5 63946392 63946588 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 15802 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 233.333-46 chr17 71952110 71952320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 73764 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 309.666-12 chr3 191337958 191338470 + 1.33333 NA intron (NM_178335, intron 1 of 11) intron (NM_178335, intron 1 of 11) -7678 NM_198152 257313 Hs.518492 NM_198152 ENSG00000188958 UTS2B U2B|URP|UTS2D urotensin 2B protein-coding 204-115 chr20 33390965 33391245 + 1.33333 NA intron (NM_001365728, intron 5 of 14) AluJo|SINE|Alu 10414 NM_016408 51654 Hs.435952 NM_016082 ENSG00000101391 CDK5RAP1 C20orf34|C42|CGI-05|HSPC167 CDK5 regulatory subunit associated protein 1 protein-coding 190.667-126 chr6 157868731 157868974 + 1.33333 NA intron (NM_016224, intron 2 of 17) intron (NM_016224, intron 2 of 17) 45606 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 208.333-152 chr8 124595176 124595532 + 1.33333 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 56231 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 216.666-23 chr12 93405041 93405286 + 1.33333 NA TTS (NM_003348) TTS (NM_003348) 26585 NM_001301024 11163 Hs.506325 NM_019094 ENSG00000173598 NUDT4 DIPP-2B|DIPP2|DIPP2alpha|DIPP2beta|HDCMB47P|NUDT4B nudix hydrolase 4 protein-coding 158.666-20 chr5 26540124 26540275 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 498387 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 209-79 chr3 73871920 73872121 + 1.33333 NA intron (NR_146637, intron 3 of 3) L1MC5|LINE|L1 62776 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 220.333-4 chr1 48488456 48488676 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16358 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 245.999-10 chr6 27950223 27950433 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6913 NM_012367 26212 Hs.532145 NM_012367 ENSG00000124657 OR2B6 OR2B1|OR2B1P|OR2B5|OR2B6P|OR5-40|OR5-41|OR6-31|dJ408B20.2 olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 protein-coding 196.667-149 chr7 109350210 109350475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -465755 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 270.666-8 chr14 86359213 86359460 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 424658 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 372.333-2 chr10 53617116 53617817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -845766 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 403.333-2 chr14 19862907 19863544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5948 NM_001348266 283617 NM_001348266 ENSG00000176290 OR4K3 OR14-10|OR4K3P olfactory receptor family 4 subfamily K member 3 (gene/pseudogene) protein-coding 212.999-3 chr20 20477348 20477512 + 1.33333 NA intron (NM_020343, intron 36 of 39) MER58B|DNA|hAT-Charlie 109326 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 228-88 chr8 85141650 85141863 + 1.33333 NA intron (NM_033402, intron 18 of 18) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 34518 NM_033402 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 112.667-148 chr20 21474579 21474812 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 39369 NM_002509 4821 Hs.516922 NM_002509 ENSG00000125820 NKX2-2 NKX2.2|NKX2B NK2 homeobox 2 protein-coding 342-30 chr5 57230488 57230780 + 1.33333 NA intron (NM_001127236, intron 2 of 10) intron (NM_001127236, intron 2 of 10) 16560 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 315-3 chr10 75847161 75847545 + 1.33333 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) L1MB2|LINE|L1 64592 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 171.333-139 chr4 172880789 172880949 + 1.33333 NA intron (NM_001034845, intron 7 of 12) intron (NM_001034845, intron 7 of 12) -153991 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 254-53 chr3 175179485 175179756 + 1.33333 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) -64378 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 338-26 chr5 178842549 178842971 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -17193 NM_058230 117608 Hs.724051 NM_058230 ENSG00000178338 ZNF354B KID2 zinc finger protein 354B protein-coding 222.667-57 chr3 82897127 82897496 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 911169 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 218.666-51 chr3 79801824 79802012 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33920 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 206-146 chr5 132633645 132633898 + 1.33333 NA intron (NR_132124, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 8019 NR_132124 101927761 Hs.598812 NR_132124 ENSG00000223442 TH2LCRR TH2-LCR T helper type 2 locus control region associated RNA ncRNA 203-107 chr8 85940312 85940492 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -112460 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 318-17 chr14 21216883 21217259 + 1.33333 NA intron (NM_031314, intron 5 of 8) intron (NM_031314, intron 5 of 8) -10171 NR_038971 283624 Hs.525210 NR_038970 ENSG00000258441 LINC00641 - long intergenic non-protein coding RNA 641 ncRNA 191.666-8 chr2 96602590 96602756 + 1.33333 NA intron (NR_047656, intron 17 of 19) intron (NR_047656, intron 17 of 19) 35318 NR_047658 55683 Hs.516341 NM_017991 ENSG00000114982 KANSL3 KIAA1310|NSL3|Rcd1 KAT8 regulatory NSL complex subunit 3 protein-coding 344.666-24 chr5 112734920 112735388 + 1.33333 NA intron (NM_001354902, intron 1 of 14) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -2731 NM_001354898 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 196.667-151 chr8 18268041 18268280 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46492 NM_001160174 9 Hs.591847 NM_000662 ENSG00000171428 NAT1 AAC1|MNAT|NAT-1|NATI N-acetyltransferase 1 protein-coding 194.667-9 chr1 95843165 95843381 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -148795 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 322.333-8 chr13 95488707 95489162 + 1.33333 NA intron (NR_046533, intron 3 of 3) L1PB1|LINE|L1 44976 NR_046533 100874194 Hs.569229 NR_046533 ENSG00000223392 CLDN10-AS1 - CLDN10 antisense RNA 1 ncRNA 207.333-268 chr8 105207552 105207721 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -110802 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 217.666-8 chr12 30672635 30672837 + 1.33333 NA intron (NM_006390, intron 8 of 24) intron (NM_006390, intron 8 of 24) 4508 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 284.666-5 chr11 15530183 15530477 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -113555 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 363.999-5 chr6 127418130 127418406 + 1.33333 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger 41121 NM_014702 9729 Hs.319247 NM_014702 ENSG00000189367 KIAA0408 - KIAA0408 protein-coding 202.666-24 chr11 100849661 100849844 + 1.33333 NA intron (NM_001367945, intron 5 of 25) intron (NM_001367945, intron 5 of 25) -84522 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 260.666-22 chr21 23038426 23038820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40661 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 221-26 chr16 13932288 13932503 + 1.33333 NA intron (NM_005236, intron 6 of 10) intron (NM_005236, intron 6 of 10) 12238 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 259.333-107 chrX 55956347 55956744 + 1.33333 NA intron (NM_001324105, intron 1 of 5) L1M3|LINE|L1 48260 NM_001324104 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 244-37 chr14 79095261 79095539 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -104582 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 214-63 chr2 40211759 40211997 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 218426 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 229.333-35 chr14 53535992 53536281 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 382782 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 244.666-22 chr2 19678395 19678589 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -190362 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 315.999 chr10 64054261 64054567 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -532524 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 341.666-12 chr4 68613960 68614357 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -45631 NM_001077 7367 Hs.575083 NM_001077 ENSG00000197888 UGT2B17 BMND12|UDPGT2B17 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B17 protein-coding 194-57 chr18 4375775 4376034 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 79362 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 190.333-114 chr5 41958761 41958936 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 33567 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 468-11 chr9 83089031 83089494 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -26120 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 309.333-39 chr2 88035831 88036144 + 1.33333 NA intron (NM_016618, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR 19796 NM_001304526 51315 Hs.469254 NM_016618 ENSG00000172086 KRCC1 CHBP2 lysine rich coiled-coil 1 protein-coding 260.666-6 chr11 33876977 33877298 + 1.33333 NA intron (NM_005574, intron 2 of 5) intron (NM_005574, intron 2 of 5) -7259 NM_001142315 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 201.666-20 chr19 51218669 51218910 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -6291 NM_001177608 945 Hs.83731 NM_001772 ENSG00000105383 CD33 SIGLEC-3|SIGLEC3|p67 CD33 molecule protein-coding 318.666-12 chr2 32312883 32313195 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_032312, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_032312, exon 6 of 6) 35135 NM_032312 84272 Hs.468099 NM_032312 ENSG00000119820 YIPF4 FinGER4|Nbla11189 Yip1 domain family member 4 protein-coding 198.666 chr1 78521019 78521173 + 1.33333 NA intron (NM_001039585, intron 3 of 3) intron (NM_001039585, intron 3 of 3) 30122 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 314-34 chr4 77029555 77029870 + 1.33333 NA intron (NM_001306147, intron 10 of 11) intron (NM_001306147, intron 10 of 11) 45198 NM_001348133 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 290-7 chr1 213166936 213167357 + 1.33333 NA intron (NM_001136138, intron 5 of 13) intron (NM_001136138, intron 5 of 13) 115905 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 221.666-55 chr8 47373818 47374065 + 1.33333 NA intron (NR_104581, intron 5 of 16) intron (NR_104581, intron 5 of 16) 113003 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 222.667-31 chr15 56832329 56832608 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -85622 NM_001322151 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 175.333-187 chr8 87815596 87815771 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58332 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 202-32 chr12 27551324 27551524 + 1.33333 NA intron (NM_003622, intron 1 of 29) intron (NM_003622, intron 1 of 29) 27218 NM_001198916 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 280.666-30 chr8 107101885 107102358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 234394 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 200-125 chr5 34436742 34436979 + 1.33333 NA Intergenic MER57E1|LTR|ERV1 -192136 NR_146599 114899 Hs.171929 NM_030945 ENSG00000082196 C1QTNF3 C1ATNF3|CORCS|CORS|CORS-26|CORS26|CTRP3 C1q and TNF related 3 protein-coding 217.333-172 chrX 97600174 97600433 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_006729, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_006729, exon 27 of 27) -35768 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 322.667-2 chr1 178689722 178690326 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12275 NR_039622 100616328 NR_039622 ENSG00000266417 MIR4424 - microRNA 4424 ncRNA 127.333-61 chr16 82012815 82012959 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1417 NM_145168 93517 Hs.87779 NM_145168 ENSG00000184860 SDR42E1 HSPC105 short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 protein-coding 269.999-11 chrX 80804051 80804465 + 1.33333 NA intron (NM_153252, intron 4 of 40) AluSz6|SINE|Alu 5619 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 140.333-202 chr6 95001275 95001459 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 576084 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 267.333-51 chr2 148465893 148466321 + 1.33333 NA intron (NM_018328, intron 8 of 14) intron (NM_018328, intron 8 of 14) -178644 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 153-94 chr3 82200946 82201110 + 1.33333 NA intron (NR_147146, intron 2 of 8) intron (NR_147146, intron 2 of 8) 214886 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 175.333-202 chr9 33861667 33861853 + 1.33333 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) intron (NM_017811, intron 1 of 4) 44600 NM_017811 54926 Hs.643648 NM_017811 ENSG00000107341 UBE2R2 CDC34B|E2-CDC34B|UBC3B ubiquitin conjugating enzyme E2 R2 protein-coding 192.333-111 chr22 37834439 37834672 + 1.33333 NA intron (NM_001349853, intron 3 of 7) AluJb|SINE|Alu 9293 NM_001363839 129138 Hs.135259 NM_138797 ENSG00000100124 ANKRD54 LIAR ankyrin repeat domain 54 protein-coding 199.333-11 chr1 72957970 72958158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -348106 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 292.666-23 chr2 220527531 220527886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -621143 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 220-106 chr6 158629892 158630097 + 1.33333 NA intron (NM_020823, intron 15 of 16) intron (NM_020823, intron 15 of 16) 14749 NM_001291602 6993 Hs.445999 NM_006519 ENSG00000146425 DYNLT1 CW-1|TCTEL1|tctex-1 dynein light chain Tctex-type 1 protein-coding 195.333-29 chr10 34665136 34665304 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 150076 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 171.333-43 chr14 45835427 45835600 + 1.33333 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -119911 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 176.333-39 chr12 118439383 118439587 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 62930 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 362.333-11 chr4 95148588 95148976 + 1.33333 NA exon (NM_001203, exon 11 of 13) exon (NM_001203, exon 11 of 13) 57291 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 229.333-62 chr2 33026428 33026660 + 1.33333 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) MIRc|SINE|MIR 79591 NM_206943 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 204.999 chr12 38791579 38791740 + 1.33333 NA intron (NM_153634, intron 6 of 19) L1M3|LINE|L1 113932 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 194-102 chr4 70109278 70109442 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24244 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 309.333-17 chr14 55643515 55643830 + 1.33333 NA intron (NR_073129, intron 19 of 45) intron (NR_073129, intron 19 of 45) 63465 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 207-95 chr5 6890700 6890933 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62895 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 206.666-124 chr9 29200696 29200929 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1MC3|LINE|L1 11487 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 222.333-54 chr2 231666654 231667023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41687 NM_001099285 5757 Hs.459927 NM_002823 ENSG00000187514 PTMA TMSA prothymosin alpha protein-coding 189-10 chr10 68507500 68507698 + 1.33333 NA intron (NM_001324314, intron 3 of 9) intron (NM_001324314, intron 3 of 9) 10619 NR_136737 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 173.333-217 chr9 104286050 104286215 + 1.33333 NA intron (NR_135141, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 15903 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 154-134 chr7 85532079 85532260 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 111047 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 260.666-13 chr17 66908809 66909155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55725 NM_014405 27092 Hs.514423 NM_014405 ENSG00000075461 CACNG4 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 4 protein-coding 328.666-9 chr2 50930364 50930905 + 1.33333 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 101498 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 187.666-16 chr2 86233212 86233393 + 1.33333 NA intron (NM_001164732, intron 3 of 4) intron (NM_001164732, intron 3 of 4) 33845 NM_016622 51318 Hs.433439 NM_016622 ENSG00000132313 MRPL35 L35mt|MRP-L35 mitochondrial ribosomal protein L35 protein-coding 319.333-23 chr3 30068580 30068980 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -134624 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 232-19 chr11 114370622 114370857 + 1.33333 NA intron (NR_120567, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 9300 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 180.666-22 chr3 39322915 39323087 + 1.33333 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 -6708 NM_005201 1237 Hs.113222 NM_005201 ENSG00000179934 CCR8 CC-CKR-8|CCR-8|CDw198|CKRL1|CMKBR8|CMKBRL2|CY6|GPRCY6|TER1 C-C motif chemokine receptor 8 protein-coding 170.666-4 chr10 99116187 99116334 + 1.33333 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 119615 NM_001166246 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 301.667-11 chr14 47026842 47027184 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) AluJr|SINE|Alu 316233 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 404.666-6 chr18 38928228 38928582 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 693770 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 408.333-6 chr2 39560598 39561078 + 1.33333 NA intron (NR_037875, intron 5 of 5) AluJr|SINE|Alu -104660 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 271.999-3 chr6 62657820 62658189 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -371777 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 159.667-229 chr4 46742627 46742795 + 1.33333 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) intron (NM_130902, intron 2 of 2) 166534 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 199.333-210 chr4 122733577 122733739 + 1.33333 NA intron (NM_152618, intron 1 of 1) intron (NM_152618, intron 1 of 1) 954 NM_152618 166379 Hs.400698 NM_152618 ENSG00000181004 BBS12 C4orf24 Bardet-Biedl syndrome 12 protein-coding 282.333-17 chr14 70112596 70112968 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -32565 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 213.333-83 chr18 69995481 69995739 + 1.33333 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -38811 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 289.333-55 chr6 40695215 40695666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -108076 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 144-149 chr8 77893829 77894074 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 443254 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 405-7 chr2 71202699 71203201 + 1.33333 NA intron (NM_020459, intron 1 of 3) intron (NM_020459, intron 1 of 3) 24153 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 338.666-13 chr4 155470886 155471252 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94104 NM_001039580 79884 Hs.61271 NM_001039580 ENSG00000164114 MAP9 ASAP microtubule associated protein 9 protein-coding 210-126 chr5 159871856 159872093 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_109891) promoter-TSS (NR_109891) -590 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 229.333-4 chr1 92059147 92059394 + 1.33333 NA intron (NM_173567, intron 6 of 6) AluSx1|SINE|Alu 16202 NM_001287737 646817 NM_001287737 ENSG00000230667 SETSIP SETP18 SET like protein protein-coding 113.667-82 chr17 54502650 54502842 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -397945 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 182.667-131 chr5 55525762 55525990 + 1.33333 NA intron (NR_103485, intron 1 of 6) intron (NR_103485, intron 1 of 6) 8666 NR_001575 379013 Hs.745164 NR_001575 RNF138P1 - ring finger protein 138 pseudogene 1 pseudo 196.666-62 chr22 27248341 27248554 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23768 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 180-88 chr6 103729588 103729777 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 1129864 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 249.666-11 chr12 54740479 54740759 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -92254 NM_001300854 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 227.333-100 chr5 28594445 28594715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -306915 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 194.667-145 chr7 47093397 47093663 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 371273 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 271-36 chr5 59815759 59816261 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -47162 NM_001364603 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 294.666-6 chr14 45847280 45847515 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -131795 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 485.333-4 chr22 32439168 32439726 + 1.33333 NA intron (NM_174932, intron 6 of 14) intron (NM_174932, intron 6 of 14) 17939 NM_174932 254240 Hs.372939 NM_174932 ENSG00000184459 BPIFC BPIL2 BPI fold containing family C protein-coding 361.333-29 chr7 41841856 41842335 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -139005 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 298-20 chr12 107048282 107048572 + 1.33333 NA intron (NM_004075, intron 1 of 12) L1MEg|LINE|L1 45122 NM_004075 1407 Hs.151573 NM_004075 ENSG00000008405 CRY1 DSPD|PHLL1 cryptochrome circadian regulator 1 protein-coding 233.666-15 chr2 59945310 59945524 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 437619 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 197.333-228 chr8 52666679 52666910 + 1.33333 NA intron (NM_001083617, intron 8 of 23) L1MEg|LINE|L1 47641 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 172-89 chr5 90945821 90945994 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 83 of 89) AluJb|SINE|Alu 368495 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 317.666-14 chr9 97592938 97593342 + 1.33333 NA intron (NM_001166116, intron 9 of 9) intron (NM_001166116, intron 9 of 9) 40228 NM_139246 158427 Hs.723236 NM_139246 ENSG00000136925 TSTD2 C9orf97 thiosulfate sulfurtransferase like domain containing 2 protein-coding 214-53 chr17 80849717 80849886 + 1.33333 NA intron (NM_020761, intron 11 of 33) AluSg7|SINE|Alu -44169 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 237-43 chr21 31100631 31100962 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 60144 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 225.333-59 chr15 61223496 61223803 + 1.33333 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 5653 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 203-111 chr8 125931868 125932046 + 1.33333 NA intron (NR_038447, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 19240 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 204.667-34 chr12 74480451 74480698 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57261 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 422.666-8 chr8 59127858 59128506 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 8972 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 215-88 chrX 147608211 147608493 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 303465 NR_024501 100126270 Hs.561999 NR_024499 ENSG00000268066 FMR1-AS1 ASFMR1|FMR1-AS|FMR1AS|FMR4 FMR1 antisense RNA 1 ncRNA 222-23 chr12 123816758 123817077 + 1.33333 NA intron (NM_207437, intron 20 of 77) L1M5|LINE|L1 54422 NM_207437 196385 Hs.622654 NM_207437 ENSG00000197653 DNAH10 - dynein axonemal heavy chain 10 protein-coding 198-149 chr5 24046523 24046761 + 1.33333 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 95294 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 201.333-113 chr15 42220004 42220162 + 1.33333 NA exon (NM_001286487, exon 15 of 19) exon (NM_001286487, exon 15 of 19) -11779 NM_015289 23339 Hs.88025 NM_015289 ENSG00000166887 VPS39 TLP|VAM6|hVam6p VPS39 subunit of HOPS complex protein-coding 209.333-65 chr14 77695988 77696152 + 1.33333 NA intron (NM_006020, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu 11953 NM_006020 8846 Hs.94542 NM_006020 ENSG00000100601 ALKBH1 ABH|ABH1|ALKBH|alkB|hABH alkB homolog 1, histone H2A dioxygenase protein-coding 216.666-34 chr17 48214964 48215129 + 1.33333 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) AluJo|SINE|Alu -58535 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 286-27 chr2 82867801 82868179 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C-int|LTR|ERVL-MaLR 11187 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 342-43 chr9 131947006 131947435 + 1.33333 NA intron (NM_001253881, intron 3 of 6) intron (NM_001253881, intron 3 of 6) 132647 NM_001253882 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 180-90 chr6 125560402 125560650 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -113827 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 242.333-90 chr7 79789041 79789292 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 335206 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 333.333-38 chr3 95319160 95319535 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 363846 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 228.666-39 chr5 26446269 26446509 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 592197 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 246.333-28 chr14 51279942 51280223 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 39835 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 491.333-4 chr7 39312399 39312902 + 1.33333 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 16484 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 156.333-244 chr3 112050866 112051049 + 1.33333 NA intron (NR_026734, intron 8 of 16) intron (NR_026734, intron 8 of 16) 7979 NM_001366279 344805 Hs.435490 NM_001042575 ENSG00000176040 TMPRSS7 - transmembrane serine protease 7 protein-coding 175.333-11 chr10 6658931 6659083 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 23937 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 256-58 chr3 12604616 12604963 + 1.33333 NA intron (NM_001354695, intron 4 of 14) intron (NM_001354695, intron 4 of 14) 47702 NM_014160 23609 Hs.591666 NM_014160 ENSG00000075975 MKRN2 HSPC070|RNF62 makorin ring finger protein 2 protein-coding 233.333-7 chr1 160587990 160588396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8677 NM_001184882 8832 Hs.398093 NM_003874 ENSG00000066294 CD84 LY9B|SLAMF5|hCD84|mCD84 CD84 molecule protein-coding 165.333-191 chr4 92243206 92243440 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33979 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 341.333-10 chr14 72210578 72210874 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 277199 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 241.333-69 chr3 80752440 80752703 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -12326 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 200.333-162 chr8 136542706 136542860 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 11985 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 312-56 chr8 60576992 60577377 + 1.33333 NA intron (NM_002865, intron 3 of 7) AluJb|SINE|Alu 60197 NM_002865 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 278.666-15 chr20 52888412 52888787 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -83759 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 479 chr10 52058016 52058809 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 6 of 17) L1ME1|LINE|L1 255716 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 224-24 chr14 89250309 89250631 + 1.33333 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 166763 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 206.666-30 chr12 71632813 71633039 + 1.33333 NA exon (NM_144982, exon 14 of 35) exon (NM_144982, exon 14 of 35) 30922 NM_144982 196441 Hs.245798 NM_144982 ENSG00000133858 ZFC3H1 CCDC131|CSRC2|PSRC2 zinc finger C3H1-type containing protein-coding 324 chr1 182772317 182772645 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16968 NM_001200050 80896 Hs.496969 NM_030769 ENSG00000135838 NPL C112|C1orf13|NAL|NPL1 N-acetylneuraminate pyruvate lyase protein-coding 170.333-205 chr7 80673979 80674114 + 1.33333 NA exon (NM_001001547, exon 14 of 14) exon (NM_001001547, exon 14 of 14) 27393 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 289.666-13 chr4 60339322 60339709 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -583104 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 373.666-11 chr5 150334096 150334503 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23340 NM_001135243 6949 Hs.519672 NM_000356 ENSG00000070814 TCOF1 MFD1|TCS|TCS1|treacle treacle ribosome biogenesis factor 1 protein-coding 198.667-18 chr10 32765657 32765949 + 1.33333 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 135669 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 181.333-31 chr12 10797670 10797865 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 4860 NM_023919 50837 Hs.533754 NM_023919 ENSG00000121377 TAS2R7 T2R7|TRB4 taste 2 receptor member 7 protein-coding 203.333-225 chr5 166635657 166635852 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 290616 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 339.333-41 chr6 62641719 62642025 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -355645 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 272-17 chr16 74132404 74132675 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 82982 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 192-91 chr3 2712406 2712555 + 1.33333 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) MER39|LTR|ERV1 -179735 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 371.333-16 chr22 40228841 40229161 + 1.33333 NA intron (NM_015088, intron 1 of 20) intron (NM_015088, intron 1 of 20) 51076 NM_015088 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 331.333-10 chr1 247878386 247878719 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_015431, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_015431, exon 6 of 6) -17035 NM_001001957 343171 Hs.269151 NM_001001957 ENSG00000238243 OR2W3 OR2W3P|OR2W8P|OST718 olfactory receptor family 2 subfamily W member 3 protein-coding 217.667-54 chr22 20855544 20855813 + 1.33333 NA intron (NM_058004, intron 1 of 54) MER68B|LTR|ERVL 3133 NM_058004 5297 Hs.529438 NM_002650 ENSG00000241973 PI4KA PI4K-ALPHA|PIK4CA|PMGYCHA|pi4K230 phosphatidylinositol 4-kinase alpha protein-coding 176-73 chr5 62374636 62374844 + 1.33333 NA intron (NM_001098511, intron 18 of 20) AluSz|SINE|Alu 29165 NM_014473 27292 Hs.731665 NM_014473 ENSG00000086189 DIMT1 DIM1|DIMT1L|HSA9761|HUSSY5 DIMT1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor protein-coding 267.333-63 chr3 185251672 185251938 + 1.33333 NA intron (NM_001966, intron 1 of 6) intron (NM_001966, intron 1 of 6) 1467 NR_106712 100847054 NR_106712 ENSG00000264614 MIR5588 - microRNA 5588 ncRNA 195-79 chr4 76743596 76743799 + 1.33333 NA intron (NM_020859, intron 5 of 10) intron (NM_020859, intron 5 of 10) 154447 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 274.667-25 chr18 61865203 61865586 + 1.33333 NA intron (NM_173557, intron 1 of 1) intron (NM_173557, intron 1 of 1) 27613 NM_173557 220441 Hs.165062 NM_173557 ENSG00000176641 RNF152 - ring finger protein 152 protein-coding 338.999-5 chr6 154215360 154215645 + 1.33333 NA intron (NM_015553, intron 7 of 11) AluSq|SINE|Alu 114579 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 354-28 chr9 37257343 37257859 + 1.33333 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 137003 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 220.667-84 chr5 67597107 67597382 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 49545 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 291.333-12 chr11 16938197 16938482 + 1.33333 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) intron (NM_001329630, intron 3 of 26) -12317 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 181.667-11 chr10 31981545 31981719 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52756 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 209.333-75 chr15 68244327 68244628 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -14749 NM_017882 54982 Hs.584921 NM_017882 ENSG00000128973 CLN6 CLN4A|HsT18960|nclf CLN6 transmembrane ER protein protein-coding 199.667-152 chr9 101661889 101662152 + 1.33333 NA intron (NM_133445, intron 3 of 8) L1ME4a|LINE|L1 -67051 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 185.333-90 chr2 78713697 78713849 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 168242 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 247.333-25 chr14 38098389 38098766 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -109327 NM_001049 6751 Hs.248160 NM_001049 ENSG00000139874 SSTR1 SRIF-2|SS-1-R|SS1-R|SS1R somatostatin receptor 1 protein-coding 331.666-12 chr20 44189824 44190138 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2403 NM_020433 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 414-5 chr2 34548835 34549383 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -128448 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 390.667-11 chr6 127009806 127010324 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -108606 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 379.666-7 chr14 65755092 65755409 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 284148 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 203.666-30 chr2 53762721 53762955 + 1.33333 NA intron (NM_145863, intron 1 of 8) intron (NM_145863, intron 1 of 8) -4945 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 249.667-60 chr3 10256754 10257173 + 1.33333 NA intron (NM_014760, intron 2 of 7) intron (NM_014760, intron 2 of 7) 8504 NM_014760 9797 Hs.475401 NM_014760 ENSG00000157014 TATDN2 - TatD DNase domain containing 2 protein-coding 167-16 chr10 114580230 114580445 + 1.33333 NA intron (NM_001352440, intron 2 of 20) AluJr4|SINE|Alu 33399 NM_001352442 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 255.666-18 chr3 69695542 69695920 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43733 NM_001354605 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 123-11 chr1 178481016 178481168 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_170692, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_170692, exon 18 of 18) -32017 NM_032126 84066 Hs.534501 NM_032126 ENSG00000240021 TEX35 C1orf49|TSC24 testis expressed 35 protein-coding 268.333-38 chr3 87031491 87031792 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40492 NM_001320493 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 220.999-3 chr15 34226765 34226973 + 1.33333 NA intron (NR_147140, intron 2 of 3) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 1853 NM_001286420 51234 Hs.250905 NM_016454 ENSG00000128463 EMC4 PIG17|TMEM85 ER membrane protein complex subunit 4 protein-coding 342.999-4 chr8 100921865 100922164 + 1.33333 NA intron (NM_001135700, intron 5 of 5) intron (NM_001135700, intron 5 of 5) 28557 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 207-18 chr10 120929480 120929764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 78260 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 180.666-3 chr10 60838146 60838327 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 59758 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 175-10 chr10 59167473 59167799 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8828 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 412.333-5 chr18 10830373 10831002 + 1.33333 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) L1MA3|LINE|L1 -71038 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 189.333-74 chr17 60641121 60641310 + 1.33333 NA intron (NM_003620, intron 3 of 5) L1PA16|LINE|L1 -36636 NM_001099432 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 207.333-161 chr20 46409879 46410058 + 1.33333 NA intron (NR_146919, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu -2917 NM_182764 63916 Hs.210469 NM_022086 ENSG00000062598 ELMO2 CED-12|CED12|Ced-12A|ELMO-2|VMPI engulfment and cell motility 2 protein-coding 235-46 chr6 35754154 35754440 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17265 NM_145028 221481 Hs.533066 NM_145028 ENSG00000157343 ARMC12 C6orf81 armadillo repeat containing 12 protein-coding 199.667-2 chr1 26794643 26794916 + 1.33333 NA exon (NM_017837, exon 3 of 4) exon (NM_017837, exon 3 of 4) 6591 NM_001202554 55650 Hs.259605 NM_017837 ENSG00000060642 PIGV GPI-MT-II|HPMRS1|PIG-V phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V protein-coding 240-72 chr5 3094450 3094856 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83182 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 220.666-15 chr11 29687266 29687470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 68566 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 441.333-11 chr8 138416199 138416622 + 1.33333 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 80851 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 273.666-14 chr2 152871673 152871955 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 153177 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 226-17 chr12 39091071 39091327 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -185608 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 295.333-36 chr3 2318904 2319328 + 1.33333 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) intron (NM_001206955, intron 1 of 23) 80287 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 345-8 chr20 32312807 32313192 + 1.33333 NA intron (NM_004798, intron 2 of 8) L1ME3E|LINE|L1 35348 NM_004798 9371 Hs.369670 NM_004798 ENSG00000101350 KIF3B FLA8|HH0048|KLP-11 kinesin family member 3B protein-coding 187.667-54 chr16 5146571 5146839 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -48885 NM_001289029 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 298-16 chr11 9734931 9735286 + 1.33333 NA intron (NM_015055, intron 7 of 11) intron (NM_015055, intron 7 of 11) -23185 NR_036485 283104 Hs.632156 NR_036485 ENSG00000246273 SBF2-AS1 - SBF2 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-213 chr20 12854162 12854312 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 82726 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 191.667-126 chr8 94667322 94667554 + 1.33333 NA intron (NM_017697, intron 9 of 15) L1MC5a|LINE|L1 26264 NM_001122825 54845 Hs.487471 NM_017697 ENSG00000104413 ESRP1 DFNB109|RBM35A|RMB35A epithelial splicing regulatory protein 1 protein-coding 282 chr1 39062581 39062977 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -21388 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 256-18 chr11 111252468 111252769 + 1.33333 NA intron (NM_198498, intron 1 of 4) intron (NM_198498, intron 1 of 4) 6893 NM_198498 341032 Hs.298685 NM_198498 ENSG00000150750 C11orf53 - chromosome 11 open reading frame 53 protein-coding 294-56 chr6 124591732 124592111 + 1.33333 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 308916 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 282.333-4 chr10 11146669 11146971 + 1.33333 NA intron (NM_001326334, intron 2 of 13) intron (NM_001326334, intron 2 of 13) -18061 NM_001326346 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 196.666-58 chr2 222095536 222095755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -202502 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 212-39 chr12 61490685 61490998 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 701998 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 351.666-3 chr12 50897441 50897898 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -27346 NM_014033 25840 Hs.711113 NM_014033 ENSG00000185432 METTL7A AAM-B|AAMB methyltransferase like 7A protein-coding 282-25 chr2 51555576 51555896 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1PA4|LINE|L1 523135 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 158-27 chr11 74263566 74263731 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -47714 NR_120556 101928580 Hs.569025 NR_120556 ENSG00000246211 P4HA3-AS1 - P4HA3 antisense RNA 1 ncRNA 271.999-5 chr7 770097 770318 + 1.33333 NA intron (NR_075098, intron 8 of 12) AluSx|SINE|Alu -42531 NM_001164759 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 336.667-14 chr2 217684237 217684651 + 1.33333 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 72149 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 255.333-84 chr5 96857461 96857718 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -18350 NR_137637 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 210-130 chr6 48110665 48110965 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -42126 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 211.333-235 chr8 75441269 75441486 + 1.33333 NA intron (NM_001330561, intron 1 of 11) AluSz6|SINE|Alu 33728 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 208-29 chr11 88163818 88163995 + 1.33333 NA intron (NM_022337, intron 1 of 2) intron (NM_022337, intron 1 of 2) 11537 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 239-29 chr2 44154462 44154824 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -14160 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 226.666-19 chr18 30432933 30433173 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 134143 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 202-125 chr4 22981266 22981511 + 1.33333 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 267299 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 389.333-24 chr9 112607179 112607613 + 1.33333 NA intron (NM_133465, intron 2 of 3) L1M7|LINE|L1 110721 NM_021218 58493 Hs.658575 NM_021218 ENSG00000148153 INIP C9orf80|HSPC043|MISE|SOSSC|SSBIP1|hSSBIP1 INTS3 and NABP interacting protein protein-coding 168.666-5 chr13 37838595 37838763 + 1.33333 NA intron (NM_003306, intron 1 of 10) intron (NM_003306, intron 1 of 10) 31746 NM_001354799 7223 Hs.262960 NM_003306 ENSG00000133107 TRPC4 HTRP-4|HTRP4|TRP4 transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 protein-coding 196-62 chr16 19534372 19534631 + 1.33333 NA intron (NM_014711, intron 4 of 14) intron (NM_014711, intron 4 of 14) 10559 NM_014711 9738 Hs.279912 NM_014711 ENSG00000103540 CCP110 CP110|Cep110 centriolar coiled-coil protein 110 protein-coding 206-193 chr9 85355588 85355780 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 386345 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 224-16 chr11 42042760 42042972 + 1.33333 NA intron (NR_135065, intron 6 of 9) intron (NR_135065, intron 6 of 9) 42592 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 248-69 chr5 22266415 22266759 + 1.33333 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) intron (NM_001364104, intron 2 of 13) -52737 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 192.666-33 chr2 76120658 76120876 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -409852 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 307.333-81 chr8 136043895 136044281 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -486710 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 198.333-2 chr1 23250929 23251204 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 34452 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 270-21 chr18 13268721 13269052 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) intron (NM_181482, intron 1 of 5) -9219 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 439.333-4 chr15 69243400 69243786 + 1.33333 NA intron (NM_001324092, intron 2 of 3) intron (NM_001324092, intron 2 of 3) -55319 NM_017705 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 197-14 chr10 14651706 14651926 + 1.33333 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) intron (NM_001282695, intron 2 of 5) -47415 NM_001282697 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 155-94 chr3 104065981 104066195 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -541972 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 196.666-2 chr1 96991644 96991838 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -104182 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 197.333-224 chr8 6950396 6950653 + 1.33333 NA TTS (NR_073407) TTS (NR_073407) 1075 NR_073407 449491 Hs.627154 NR_073407 ENSG00000223629 DEFA8P DEFAP1 defensin alpha 8, pseudogene pseudo 228.667-64 chr5 134419177 134419489 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7452 NM_080656 91368 Hs.156506 NM_080656 ENSG00000237190 CDKN2AIPNL C2AIL CDKN2A interacting protein N-terminal like protein-coding 377.667-8 chr22 28329039 28329524 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -130588 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 178.333-119 chr4 34043192 34043517 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3461 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 296.666-6 chr11 106624065 106624380 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 372815 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 248.666-39 chr8 97558431 97558818 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -85560 NM_178812 92140 Hs.377155 NM_178812 ENSG00000147649 MTDH 3D3|AEG-1|AEG1|LYRIC|LYRIC/3D3 metadherin protein-coding 320.666-19 chr9 31081176 31081512 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 300146 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 189.333-43 chr12 66404223 66404426 + 1.33333 NA intron (NM_001366722, intron 16 of 24) intron (NM_001366722, intron 16 of 24) 101779 NR_135081 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 210.666-106 chr8 119519428 119519657 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 73466 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 281.333-23 chr16 60607385 60607733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -247766 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 133.333-100 chr22 34787805 34788002 + 1.33333 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 210013 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 583.666 chr22 34738365 34739178 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 259145 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 214-71 chr2 119335426 119335745 + 1.33333 NA intron (NM_001322330, intron 2 of 5) L1MC3|LINE|L1 31157 NM_001322329 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 236.333-56 chr21 31195223 31195620 + 1.33333 NA intron (NM_001353686, intron 12 of 27) intron (NM_001353686, intron 12 of 27) -34481 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 206-71 chr2 35880353 35880579 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 409061 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 195.333-147 chr3 88402222 88402392 + 1.33333 NA intron (NM_001368168, intron 2 of 2) L1ME3Cz|LINE|L1 63851 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 232.666 chr1 21182810 21183036 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6026 NM_001198801 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 199.666-7 chr10 109311485 109311667 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 611670 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 210-4 chr1 79585436 79585602 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -578789 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 414-11 chr4 129366617 129367357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 270835 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 188.666-29 chr4 41957697 41957857 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018126, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_018126, exon 7 of 7) 22348 NM_018126 55161 Hs.31082 NM_018126 ENSG00000109133 TMEM33 1600019D15Rik|Pom33|SHINC-3|SHINC3 transmembrane protein 33 protein-coding 137.333-26 chr11 63709814 63710016 + 1.33333 NA intron (NM_201429, intron 2 of 7) intron (NM_201429, intron 2 of 7) 28415 NM_001265591 10313 Hs.743229 NM_006054 ENSG00000133318 RTN3 ASYIP|HAP|NSPL2|NSPLII|RTN3-A1 reticulon 3 protein-coding 220.333-67 chr2 168417563 168417751 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -38615 NM_001256126 253782 Hs.506829 NM_203463 ENSG00000172292 CERS6 CERS5|LASS6 ceramide synthase 6 protein-coding 302.999-10 chr4 76865558 76865862 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32434 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 366-11 chr2 48115301 48115705 + 1.33333 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy -199179 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 418.333-12 chr5 3922794 3923348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 327239 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 205.333-32 chr10 50830314 50830509 + 1.33333 NA intron (NM_001370131, intron 5 of 11) L1M2|LINE|L1 55216 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 339.667-5 chr15 58184514 58184932 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001320636, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001320636, exon 6 of 6) 46342 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 199.666-25 chr2 97814742 97814990 + 1.33333 NA intron (NM_015348, intron 13 of 40) intron (NM_015348, intron 13 of 40) 80460 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 235.666-3 chr12 13760137 13760434 + 1.33333 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 220071 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 337.666 chr1 171591220 171591527 + 1.33333 NA intron (NM_015172, intron 33 of 33) intron (NM_015172, intron 33 of 33) -28390 NM_001368164 110806290 NM_001368164 MYOCOS - myocilin opposite strand protein-coding 214-141 chr8 143388335 143388605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19594 NM_052924 114822 Hs.521912 NM_052924 ENSG00000158106 RHPN1 ODF5|RHOPHILIN|RHPN rhophilin Rho GTPase binding protein 1 protein-coding 196.667-85 chr20 11842761 11843028 + 1.33333 NA intron (NR_110635, intron 1 of 1) intron (NR_110635, intron 1 of 1) 27821 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 196-87 chr2 65004691 65004863 + 1.33333 NA intron (NM_003038, intron 3 of 7) MER20B|DNA|hAT-Charlie 15378 NM_003038 6509 Hs.654352 NM_003038 ENSG00000115902 SLC1A4 ASCT1|SATT|SPATCCM solute carrier family 1 member 4 protein-coding 230-3 chr1 74727226 74727446 + 1.33333 NA intron (NM_001889, intron 1 of 8) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 5714 NM_001889 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 201-107 chr8 58795971 58796244 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -136254 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 121.333-25 chr10 72314998 72315164 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39838 NM_017626 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 206.333-168 chr8 137255567 137255768 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 157921 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 358-13 chr3 66364576 66365172 + 1.33333 NA intron (NM_001350992, intron 6 of 8) intron (NM_001350992, intron 6 of 8) 135547 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 201-37 chr14 65519918 65520128 + 1.33333 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) AluJo|SINE|Alu 48921 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 331.333-41 chr5 143863133 143863457 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 51134 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 218.666-43 chr2 101249779 101250010 + 1.33333 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 -2992 NM_017546 55571 Hs.744080 NM_017546 ENSG00000158435 CNOT11 C2orf29|C40 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 protein-coding 228.333-56 chr21 31934736 31935076 + 1.33333 NA intron (NM_014586, intron 2 of 10) L1PA16|LINE|L1 61886 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 277.333-48 chr2 176883007 176883269 + 1.33333 NA Intergenic (TACATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 245384 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 204-38 chr11 50384813 50385028 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -24227 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 261-5 chr1 180491257 180491489 + 1.33333 NA intron (NM_032360, intron 3 of 7) intron (NM_032360, intron 3 of 7) 11204 NM_032360 84320 Hs.200051 NM_032360 ENSG00000230124 ACBD6 - acyl-CoA binding domain containing 6 protein-coding 198.667-103 chr2 115611231 115611527 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 267564 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 279-21 chr22 35991909 35992208 + 1.33333 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR -30428 NM_001349994 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 152.666-3 chr11 125399373 125399582 + 1.33333 NA intron (NM_022062, intron 7 of 12) intron (NM_022062, intron 7 of 12) -95737 NM_001301851 403312 Hs.450611 NM_203452 LOC403312 - putative uncharacterized protein MGC39545 protein-coding 387.666 chr17 53094409 53094798 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109098 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 426.999-2 chr5 118180063 118180607 + 1.33333 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -102239 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 225.333-124 chr7 34198105 34198358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 292692 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 391-18 chr8 125916518 125916898 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 34489 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 295.333-7 chr12 57256522 57256801 + 1.33333 NA intron (NM_001351215, intron 20 of 22) intron (NM_001351215, intron 20 of 22) -5474 NR_104422 246329 Hs.417595 NM_145064 ENSG00000185482 STAC3 MYPBB|NAM SH3 and cysteine rich domain 3 protein-coding 212.666-34 chr18 4902704 4902879 + 1.33333 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -178391 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 190.667-143 chr7 151510878 151511109 + 1.33333 NA intron (NM_005614, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 8902 NM_005614 6009 Hs.283521 NM_005614 ENSG00000106615 RHEB RHEB2 Ras homolog, mTORC1 binding protein-coding 264.666-28 chr3 125579776 125580117 + 1.33333 NA exon (NM_022776, exon 3 of 13) exon (NM_022776, exon 3 of 13) 15551 NM_022776 114885 Hs.477440 NM_022776 ENSG00000144909 OSBPL11 ORP-11|ORP11|OSBP12|TCCCIA00292 oxysterol binding protein like 11 protein-coding 178.667-52 chr14 89136581 89136817 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 280534 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 166.666-5 chr12 92367322 92367464 + 1.33333 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -54138 NR_027932 574028 Hs.730377 NM_001025233 ENSG00000257127 CLLU1 - chronic lymphocytic leukemia up-regulated 1 ncRNA 227-48 chr5 139727307 139727561 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 18789 NR_105052 101929696 Hs.147408 NR_105052 ENSG00000249131 PSD2-AS1 - PSD2 antisense RNA 1 ncRNA 201.333-56 chr11 96050576 96050771 + 1.33333 NA intron (NM_032427, intron 2 of 4) LTR87|LTR|ERVL? -126466 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 335.999-4 chr3 81275849 81276122 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 282117 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 353.333-25 chr4 30347749 30348231 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -372379 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 189.666-20 chr2 107776135 107776374 + 1.33333 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) intron (NR_126370, intron 2 of 4) 22142 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 200.667-152 chr8 52719557 52719806 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5215 NM_001083617 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 388-17 chr5 69105173 69105575 + 1.33333 NA TTS (NM_024055) TTS (NM_024055) 11360 NM_022902 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 117.666 chr1 213505867 213506018 + 1.33333 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -418807 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 251.333-8 chr10 12845401 12845698 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -120196 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 242-62 chr6 44799833 44800164 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -248117 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 439.333-6 chr20 9970103 9970590 + 1.33333 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -15987 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 270.666-14 chr2 56128251 56128714 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38100 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 217-85 chr7 52531758 52531948 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -503780 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 208-136 chr5 57035937 57036156 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83916 NM_001297598 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 221-48 chr3 94475855 94476160 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 412946 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 335.333-53 chr7 106683233 106683725 + 1.33333 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -22321 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 117.333-104 chr2 129490671 129490827 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -216858 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 153.333-249 chr21 29884505 29884680 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 55404 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 195.333-226 chr9 37091830 37092080 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12059 NR_036592 100506710 Hs.446271 NR_036592 ENSG00000281649 EBLN3P EBLN3 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 3, pseudogene pseudo 212.333-34 chr12 62059605 62059803 + 1.33333 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) L1MEd|LINE|L1 133135 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 260.666-19 chr2 194665321 194665718 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65076 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 342-35 chr7 3243097 3243666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57871 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 196.666-101 chr7 106110529 106110724 + 1.33333 NA intron (NM_182715, intron 1 of 4) intron (NM_182715, intron 1 of 4) 1686 NM_182715 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 320.333-27 chr7 119557291 119557774 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 349843 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 201.666-8 chr12 38873933 38874157 + 1.33333 NA intron (NM_153634, intron 2 of 19) FLAM_C|SINE|Alu 31546 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 240.333-52 chr2 176011290 176011637 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8643 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 206-180 chr8 102100151 102100333 + 1.33333 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 24092 NM_001040629 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 119-101 chr3 82439212 82439385 + 1.33333 NA intron (NR_147146, intron 4 of 8) L1MC4|LINE|L1 453156 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 272.666-16 chr4 87433153 87433438 + 1.33333 NA intron (NM_024047, intron 1 of 7) L1MC4|LINE|L1 10698 NM_198038 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 251.333-121 chrX 17330966 17331294 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -44070 NM_198270 4810 Hs.201623 NM_198270 ENSG00000188158 NHS CTRCT40|CXN|SCML1 NHS actin remodeling regulator protein-coding 246.333-3 chr1 83930354 83930606 + 1.33333 NA intron (NM_001350215, intron 8 of 19) intron (NM_001350215, intron 8 of 19) 68652 NM_001350215 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 344-53 chr9 82646086 82646469 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 416865 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 178-81 chr3 126142696 126142901 + 1.33333 NA intron (NR_072979, intron 9 of 20) L1MB1|LINE|L1 -37267 NR_046383 100862662 Hs.633362 NR_046383 ENSG00000246022 ALDH1L1-AS2 - ALDH1L1 antisense RNA 2 ncRNA 288.666-33 chr5 147238067 147238491 + 1.33333 NA intron (NM_001112724, intron 1 of 12) MER102c|DNA|hAT-Charlie 3253 NM_001112724 202374 Hs.585069 NM_145001 ENSG00000169302 STK32A YANK1 serine/threonine kinase 32A protein-coding 259.333-51 chr2 144492448 144492822 + 1.33333 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -26979 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 240-88 chr8 81864893 81865163 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -22742 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 420.333 chr1 36747797 36748282 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -264725 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 266.666-22 chr4 184262168 184262491 + 1.33333 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -44456 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 200-130 chr5 91790605 91790881 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -407426 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 208.333-29 chr12 59997092 59997358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 307855 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 308.333-38 chrX 134984472 134984943 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6284 NM_001163438 644538 Hs.42239 NM_001163438 ENSG00000184785 SMIM10 CXorf69 small integral membrane protein 10 protein-coding 215.333-208 chr9 69211851 69212071 + 1.33333 NA intron (NM_001170416, intron 1 of 22) intron (NM_001170416, intron 1 of 22) 6806 NM_001369875 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 203-26 chr12 58590598 58590777 + 1.33333 NA intron (NR_120452, intron 3 of 7) intron (NR_120452, intron 3 of 7) -1015 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 313.666-7 chr2 86417366 86417647 + 1.33333 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack -23865 NM_018433 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 210-103 chr4 54311705 54311958 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21061 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 198-183 chr8 98773465 98773643 + 1.33333 NA intron (NM_006281, intron 2 of 10) AluJr|SINE|Alu 52117 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 153.333-289 chr4 31529031 31529343 + 1.33333 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) L1PA15|LINE|L1 22643 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 199.666-14 chr13 85805675 85805835 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6336 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 182.667-116 chr4 38586723 38586941 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 22829 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 209.333-139 chr21 27727128 27727382 + 1.33333 NA intron (NR_024357, intron 1 of 3) MER50|LTR|ERV1 4876 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 148.666-2 chr16 26928400 26928552 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -138451 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 334.666 chr1 183308377 183308738 + 1.33333 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) L1ME3G|LINE|L1 -3683 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 222.667-66 chr4 72282984 72283336 + 1.33333 NA exon (NM_014243, exon 22 of 22) exon (NM_014243, exon 22 of 22) 244028 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 576.666 chr1 226091853 226092339 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 8521 NR_146920 105373113 Hs.149726 NR_146920 LINC01703 lncPARP1 long intergenic non-protein coding RNA 1703 ncRNA 494.999-2 chr8 131733827 131734455 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -169952 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 353.333-34 chr7 16624959 16625394 + 1.33333 NA intron (NM_020319, intron 3 of 9) intron (NM_020319, intron 3 of 9) 20578 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 241-17 chr12 78776237 78776538 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -87595 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 363.332 chr8 100250187 100250460 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 51870 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 318.999-4 chr4 72307956 72308334 + 1.33333 NA intron (NM_014243, intron 15 of 21) intron (NM_014243, intron 15 of 21) 261076 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 201.333-211 chr4 66970986 66971279 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 450868 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 200-40 chr12 10652017 10652198 + 1.33333 NA intron (NM_018423, intron 1 of 10) MER5B|DNA|hAT-Charlie 21945 NM_018423 55359 Hs.24979 NM_018423 ENSG00000060140 STYK1 NOK|SuRTK106 serine/threonine/tyrosine kinase 1 protein-coding 180-96 chr7 14584075 14584283 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 16 of 24) intron (NM_001350717, intron 16 of 24) 257271 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 140-8 chr1 116279791 116279946 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -93376 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 210.666-89 chr6 14565037 14565280 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -279704 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 203.333-71 chr14 35125286 35125451 + 1.33333 NA intron (NM_001256678, intron 2 of 6) intron (NM_001256678, intron 2 of 6) 2816 NM_001256681 9692 Hs.458487 NM_014672 ENSG00000100890 PRORP KIAA0391|MRPP3 protein only RNase P catalytic subunit protein-coding 178.333-93 chr20 42715255 42715403 + 1.33333 NA intron (NM_133170, intron 6 of 31) L1ME3|LINE|L1 29846 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 206.667-108 chr5 15659097 15659396 + 1.33333 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -44244 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 239.999-5 chr2 85271524 85271763 + 1.33333 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) intron (NM_031283, intron 3 of 11) 56346 NM_001368096 10618 Hs.593382 NM_006464 ENSG00000152291 TGOLN2 TGN38|TGN46|TGN48|TGN51|TTGN2 trans-golgi network protein 2 protein-coding 264-26 chr17 47146168 47146472 + 1.33333 NA intron (NM_001256, intron 9 of 18) MER21C|LTR|ERVL 42975 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 216.333-41 chr12 119867036 119867232 + 1.33333 NA intron (NM_007174, intron 3 of 46) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 10186 NM_007174 11113 Hs.119594 NM_007174 ENSG00000122966 CIT CITK|CRIK|MCPH17|STK21 citron rho-interacting serine/threonine kinase protein-coding 201.333-145 chr2 39080947 39081209 + 1.33333 NA intron (NM_005633, intron 1 of 22) AluJo|SINE|Alu 39385 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 229.333-79 chr3 94889846 94890042 + 1.33333 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 -48319 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 239-8 chr1 245137201 245137537 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -17616 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 191.333-194 chr7 108433559 108433814 + 1.33333 NA intron (NM_001371132, intron 1 of 30) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 22711 NM_001193584 4897 Hs.21422 NM_005010 ENSG00000091129 NRCAM - neuronal cell adhesion molecule protein-coding 432.333-5 chr12 13355698 13356281 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20756 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 258.666-18 chr2 21963444 21963805 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -252972 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 214-147 chr9 96856874 96857079 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2462 NM_001346993 158431 Hs.30567 NM_001001662 ENSG00000196597 ZNF782 - zinc finger protein 782 protein-coding 305.999-7 chr7 53093733 53094206 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58336 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 205.333-247 chr8 108977846 108978096 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -108657 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 146.667-218 chr3 107786179 107786383 + 1.33333 NA intron (NM_020235, intron 13 of 16) L1MB8|LINE|L1 91787 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 380.333-13 chr8 131012488 131012890 + 1.33333 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) LTR16A|LTR|ERVL 28220 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 206-8 chr1 81672532 81672712 + 1.33333 NA intron (NM_001366008, intron 3 of 26) intron (NM_001366008, intron 3 of 26) -27148 NM_001297704 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 199.333-242 chr6 61788510 61788789 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 6 of 13) intron (NR_146874, intron 6 of 13) 214519 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 155.333-311 chr5 154876669 154876895 + 1.33333 NA TTS (NM_001301073) TTS (NM_001301073) 18155 NM_001301077 9337 Hs.26703 NM_004779 ENSG00000155508 CNOT8 CAF1|CALIF|Caf1b|POP2|hCAF1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 protein-coding 146.667-162 chr2 58559299 58559515 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) intron (NR_033873, intron 1 of 13) 38654 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 210.333-48 chr15 58373951 58374205 + 1.33333 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 -57913 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 289-17 chr22 41115350 41115777 + 1.33333 NA intron (NM_001429, intron 1 of 30) AluJo|SINE|Alu 22971 NM_001429 2033 Hs.517517 NM_001429 ENSG00000100393 EP300 KAT3B|MKHK2|RSTS2|p300 E1A binding protein p300 protein-coding 196.666-92 chr6 116028321 116028527 + 1.33333 NA intron (NM_002031, intron 1 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -10307 NR_027338 728402 Hs.729953 NR_027338 TPI1P3 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 3 pseudo 180-95 chr7 8799456 8799640 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 365939 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 196-60 chr16 3798635 3798859 + 1.33333 NA intron (NM_004380, intron 3 of 30) L1MB7|LINE|L1 -81223 NM_016292 10131 Hs.30345 NM_016292 ENSG00000126602 TRAP1 HSP 75|HSP75|HSP90L|TRAP-1 TNF receptor associated protein 1 protein-coding 258.666-34 chr5 61573141 61573464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64458 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 145.333-257 chr6 54826738 54826870 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -19967 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 198-156 chr5 87570133 87570388 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -91782 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 409.333-14 chr7 105211407 105212026 + 1.33333 NA intron (NM_182692, intron 2 of 15) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 57361 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 213-42 chr2 159940354 159940637 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001195641, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_001195641, exon 30 of 30) -35739 NM_002349 4065 Hs.153563 NM_002349 ENSG00000054219 LY75 CD205|CLEC13B|DEC-205|GP200-MR6|LY-75 lymphocyte antigen 75 protein-coding 417-11 chr7 38181506 38182143 + 1.33333 NA intron (NM_001363344, intron 2 of 8) intron (NM_001363344, intron 2 of 8) 3579 NM_001363346 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 197.666-63 chr8 78070612 78070788 + 1.33333 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -445640 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 226.333-58 chr2 43321673 43321932 + 1.33333 NA intron (NR_144316, intron 29 of 36) intron (NR_144316, intron 29 of 36) 94591 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 203.333-218 chr5 115917915 115918100 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -38564 NR_157226 107986443 NR_157226 LINCADL LINC-ADAL lincRNA adipogenesis and lipogenesis associated ncRNA 425.667-6 chr3 94813285 94813784 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -124729 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 256-13 chr10 101920128 101920354 + 1.33333 NA intron (NM_024541, intron 23 of 25) intron (NM_024541, intron 23 of 25) -76321 NM_173197 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 442.999-2 chr19 5330267 5330856 + 1.33333 NA intron (NM_002850, intron 1 of 37) intron (NM_002850, intron 1 of 37) 10251 NM_002850 5802 Hs.744928 NM_002850 ENSG00000105426 PTPRS PTPSIGMA|R-PTP-S|R-PTP-sigma protein tyrosine phosphatase receptor type S protein-coding 175.333-178 chr7 121459240 121459422 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62963 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 229.333-80 chr3 112208070 112208279 + 1.33333 NA intron (NM_001320531, intron 15 of 27).2 intron (NM_001320531, intron 15 of 27).2 74751 NR_157393 112806053 NR_157393 TBILA - TGF-beta induced lncRNA ncRNA 206.666-24 chr12 10328377 10328572 + 1.33333 NA non-coding (NR_147040, exon 5 of 5) non-coding (NR_147040, exon 5 of 5) 9818 NR_159946 113523642 Hs.539490 NR_159946 LINC02617 - long intergenic non-protein coding RNA 2617 ncRNA 266.666-13 chr14 61736923 61737211 + 1.33333 NA exon (NM_001243084, exon 9 of 15) exon (NM_001243084, exon 9 of 15) 12022 NR_045406 100750247 Hs.597216 NR_045406 HIF1A-AS2 3'aHIF-1A|aHIF HIF1A antisense RNA 2 ncRNA 206.666-125 chr9 68493361 68493533 + 1.33333 NA intron (NM_021965, intron 9 of 10) intron (NM_021965, intron 9 of 10) 47420 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 214.666-43 chr3 4717140 4717322 + 1.33333 NA intron (NM_001099952, intron 39 of 58) intron (NM_001099952, intron 39 of 58) 34359 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 232.333-12 chr10 123191485 123191917 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 37299 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 169.333-173 chr4 32973830 32974030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 622892 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 130.667-40 chr10 110802998 110803170 + 1.33333 NA intron (NM_001134363, intron 7 of 13) MIRb|SINE|MIR 67820 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 387.333 chr11 58338280 58338624 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 20617 NM_001005489 219965 NM_001005489 ENSG00000197786 OR5B17 OR11-237|OR5B20P olfactory receptor family 5 subfamily B member 17 protein-coding 211.666-34 chr3 96033850 96034075 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -326002 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 229.333-123 chr9 22260730 22260954 + 1.33333 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -185982 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 246-70 chr3 142125520 142125846 + 1.33333 NA intron (NM_001178139, intron 1 of 12) L1ME4b|LINE|L1 23861 NM_001178138 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 249.666 chr1 43052335 43052710 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 93473 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 173-94 chr8 82672176 82672382 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -239825 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 206.666-102 chr5 156333132 156333305 + 1.33333 NA intron (NM_172244, intron 2 of 7) intron (NM_172244, intron 2 of 7) 6054 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 261.333-73 chr4 32774468 32774825 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 423608 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 231.333-64 chr20 33609847 33610080 + 1.33333 NA intron (NM_001039709, intron 2 of 10) intron (NM_001039709, intron 2 of 10) 47598 NM_005093 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 248.333-100 chr8 83662954 83663257 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 259347 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 173.333-170 chr6 48881491 48881654 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 581681 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 285.666-5 chr3 42785654 42785916 + 1.33333 NA intron (NM_014056, intron 3 of 3) intron (NM_014056, intron 3 of 3) -12532 NM_144719 152206 Hs.604182 NM_144719 ENSG00000244607 CCDC13 - coiled-coil domain containing 13 protein-coding 203.666-15 chr10 122414449 122414620 + 1.33333 NA intron (NM_001330178, intron 7 of 13) L1MD2|LINE|L1 -2431 NR_037506 100500866 NR_037506 ENSG00000265442 MIR3941 - microRNA 3941 ncRNA 293.667-32 chr2 221183894 221184306 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 388204 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 190-100 chr5 96965018 96965268 + 1.33333 NA intron (NM_175920, intron 1 of 17) L1MA4|LINE|L1 6710 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 248.999-3 chr2 27533581 27533862 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 36882 NM_001486 2646 Hs.89771 NM_001486 ENSG00000084734 GCKR FGQTL5|GKRP glucokinase regulator protein-coding 212-60 chr15 60048005 60048183 + 1.33333 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie 43783 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 180-15 chr10 91969193 91969454 + 1.33333 NA intron (NM_003972, intron 14 of 37) intron (NM_003972, intron 14 of 37) 45553 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 251.333-81 chr3 123378323 123378732 + 1.33333 NA intron (NM_183357, intron 1 of 20) intron (NM_183357, intron 1 of 20) 37815 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 209-82 chr4 64199290 64199562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 210024 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 147-43 chr14 59792471 59792715 + 1.33333 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 78183 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 284.667-24 chr2 9882677 9883195 + 1.33333 NA intron (NM_001318977, intron 7 of 13) intron (NM_001318977, intron 7 of 13) 39462 NM_005680 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 175.333-126 chr3 142671963 142672129 + 1.33333 NA intron (NM_001145319, intron 4 of 15) intron (NM_001145319, intron 4 of 15) 15149 NM_001172312 5357 Hs.203637 NM_002670 ENSG00000120756 PLS1 - plastin 1 protein-coding 195.333-205 chr7 52386322 52386605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -649170 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 264.666-17 chr2 56241234 56241514 + 1.33333 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) L1MA3|LINE|L1 -55604 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 341.666-5 chr18 7062943 7063264 + 1.33333 NA intron (NM_005559, intron 3 of 62) intron (NM_005559, intron 3 of 62) 54694 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 165.333-104 chr17 59084462 59084613 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 4 of 23) intron (NR_148346, intron 4 of 23) 22343 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 132.333-34 chr11 82474602 82474778 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -70777 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 236.666-27 chr2 25659574 25659802 + 1.33333 NA intron (NM_033147, intron 1 of 19) L1MB7|LINE|L1 -9466 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 257-27 chr2 59346595 59347029 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 129104 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 181-71 chr7 70254254 70254540 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 655922 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 173.667-156 chr6 129044377 129044550 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 161322 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 224-71 chr5 30725457 30725758 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -468079 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 199.333-71 chr14 45649635 45649922 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 65824 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 211-11 chr10 100115861 100116121 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -34122 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 258-37 chr2 141994072 141994315 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 137508 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 361.333-14 chr20 40618525 40618966 + 1.33333 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 70491 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 336.666-10 chr14 60188589 60189109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18985 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 242.333-41 chr2 29642092 29642341 + 1.33333 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -166839 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 170.667-93 chr2 226079370 226079581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63319 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 204-135 chr3 152408776 152408973 + 1.33333 NA intron (NM_001314057, intron 3 of 11) MER20|DNA|hAT-Charlie -67884 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 180-79 chr5 24043139 24043301 + 1.33333 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) intron (NR_131245, intron 4 of 4) 91872 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 213.333-217 chr8 131221968 131222182 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -181166 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 245.999-7 chr5 4508425 4508700 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -264919 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 304.333 chr1 24370888 24371461 + 1.33333 NA intron (NM_001199013, intron 6 of 8) L1ME4a|LINE|L1 -42313 NM_001322854 57185 Hs.523442 NM_020448 ENSG00000001461 NIPAL3 DJ462O23.2|NPAL3 NIPA like domain containing 3 protein-coding 176-108 chr9 28891304 28891448 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -2421 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 188-113 chr8 96931785 96932008 + 1.33333 NA intron (NM_016134, intron 4 of 7) intron (NM_016134, intron 4 of 7) 286654 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 250-12 chr10 31740725 31741008 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 168060 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 199.333-115 chr2 11602111 11602262 + 1.33333 NA intron (NM_014668, intron 16 of 32) intron (NM_014668, intron 16 of 32) 59500 NM_033090 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 254.666-3 chr1 121508672 121509032 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -10260 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 206.666-64 chr2 222010430 222010619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -287623 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 242.999 chr1 169339160 169339492 + 1.33333 NA intron (NR_104229, intron 1 of 12) intron (NR_104229, intron 1 of 12) 28471 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 198-187 chr8 124878004 124878289 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56088 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 204-94 chr2 38607119 38607408 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -4227 NM_001142650 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 216.333-137 chr8 84581062 84581369 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -124712 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 192.666-31 chr2 53492167 53492385 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -275507 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 185.333-53 chr15 59956630 59956796 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47598 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 226-41 chr2 63404045 63404304 + 1.33333 NA exon (NM_015910, exon 10 of 18) exon (NM_015910, exon 10 of 18) 33833 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 177.666-29 chr7 53211570 53211709 + 1.33333 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 176006 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 209.333-130 chr20 829515 829716 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4100 NM_001289145 83541 Hs.574822 NM_031424 ENSG00000125898 FAM110A C20orf55|F10|bA371L19.3 family with sequence similarity 110 member A protein-coding 284-61 chr7 123461424 123461821 + 1.33333 NA intron (NR_104244, intron 11 of 13) intron (NR_104244, intron 11 of 13) 71326 NR_104244 154865 Hs.159650 NM_178827 ENSG00000164675 IQUB - IQ motif and ubiquitin domain containing protein-coding 279.666-7 chr18 40790339 40790827 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 724297 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 149.333-297 chr5 3530542 3530740 + 1.33333 NA intron (NR_033898, intron 2 of 4) intron (NR_033898, intron 2 of 4) 5453 NR_033898 285577 Hs.582442 NR_033898 ENSG00000248118 LINC01019 - long intergenic non-protein coding RNA 1019 ncRNA 194-143 chr8 89435019 89435286 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 322559 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 205.333-124 chr2 69683096 69683251 + 1.33333 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) intron (NM_001320698, intron 2 of 14) 39365 NM_001320698 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 172-78 chr4 39209954 39210104 + 1.33333 NA intron (NM_025132, intron 9 of 36) L1MEf|LINE|L1 27500 NM_025132 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 279.333-33 chr15 24882260 24882653 + 1.33333 NA intron (NM_001349461, intron 1 of 12) intron (NM_001349461, intron 1 of 12) 25944 NM_001349461 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 199.333-283 chr8 126712984 126713264 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -154646 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 202.666-54 chr18 6519779 6519994 + 1.33333 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 8470 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 219.666-49 chr9 30397923 30398174 + 1.33333 NA intron (NR_046204, intron 1 of 2) L1MA7|LINE|L1 10406 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 293-35 chr6 11829008 11829368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50141 NM_032744 84830 Hs.126409 NM_032744 ENSG00000111863 ADTRP AIG1L|C6orf105|dJ413H6.1 androgen dependent TFPI regulating protein protein-coding 208.333-154 chr8 128947398 128947710 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 18447 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 364.999-2 chr3 120356835 120357431 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7779 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 216.666-25 chr14 24305394 24305619 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001286367, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001286367, exon 10 of 10) -4634 NM_019839 56413 Hs.642693 NM_019839 ENSG00000213906 LTB4R2 BLT2|BLTR2|JULF2|KPG_004|LTB4-R 2|LTB4-R2|NOP9 leukotriene B4 receptor 2 protein-coding 162-85 chr3 133187048 133187211 + 1.33333 NA intron (NM_001282865, intron 1 of 3) intron (NM_001282865, intron 1 of 3) 62308 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 198.333-196 chr8 110690002 110690185 + 1.33333 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 337340 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 151-35 chr14 30789937 30790140 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -84497 NM_001135058 1690 Hs.21016 NM_004086 ENSG00000100473 COCH COCH-5B2|COCH5B2|DFNA9|DFNB110 cochlin protein-coding 200-23 chr10 77439959 77440238 + 1.33333 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) MIR3|SINE|MIR 89226 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 241-44 chr5 87739241 87739512 + 1.33333 NA Intergenic X7A_LINE|LINE|CR1 77334 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 220.666-47 chr3 60159749 60159994 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -78962 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 194.333-95 chr4 43629536 43629724 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137087 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 199.333-69 chr14 44660534 44660692 + 1.33333 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 138513 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 324.333-5 chr10 107277160 107277431 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -112589 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 412.666-3 chr17 14869289 14869688 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -145317 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 155.333-42 chr10 103357701 103357860 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6640 NM_001011663 84108 Hs.335808 NM_032154 ENSG00000156374 PCGF6 MBLR|RNF134 polycomb group ring finger 6 protein-coding 175.333-31 chr12 77056621 77056876 + 1.33333 NA intron (NM_203394, intron 2 of 12) Charlie10|DNA|hAT-Charlie 8821 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 357.333-25 chr8 126578947 126579256 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20623 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 182.667-151 chr7 17938183 17938405 + 1.33333 NA intron (NM_001350862, intron 1 of 25) intron (NM_001350862, intron 1 of 25) 2200 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 153-68 chr18 53056238 53056508 + 1.33333 NA intron (NM_005215, intron 5 of 28) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -180728 NR_130465 100616232 NR_130465 ENSG00000263872 MIR4528 - microRNA 4528 ncRNA 254.666-13 chr13 82542473 82542704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1315605 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 198.666-79 chr5 101874830 101875062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 421338 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 143.333-214 chr4 172026266 172026433 + 1.33333 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) intron (NM_001034845, intron 2 of 12) -212742 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 200.666-46 chr15 97550224 97550436 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 10368 NR_110756 101927310 Hs.560324 NR_110756 ENSG00000259582 LOC101927310 - uncharacterized LOC101927310 ncRNA 196.666-64 chr3 26808480 26808668 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 114017 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 153.666-5 chr6 123822117 123822280 + 1.33333 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) 18333 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 245.999 chr1 119478684 119478888 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28417 NM_001328615 3283 Hs.364941 NM_000862 ENSG00000203857 HSD3B1 3BETAHSD|HSD3B|HSDB3|HSDB3A|SDR11E1 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 protein-coding 349 chr1 58527537 58527967 + 1.33333 NA intron (NM_145243, intron 6 of 8) intron (NM_145243, intron 6 of 8) 18974 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 266-65 chr4 92681751 92682071 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 377512 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 134.333-100 chr20 4767148 4767248 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -26530 NR_024268 149830 Hs.126516 NM_177549 ENSG00000180259 PRNT M8 prion locus lncRNA, testis expressed ncRNA 233.666-31 chr8 73117544 73117840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24520 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 354-19 chr4 41621644 41622022 + 1.33333 NA intron (NM_001330672, intron 7 of 31) intron (NM_001330672, intron 7 of 31) 8931 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 568.999 chr8 81743647 81744259 + 1.33333 NA intron (NM_152284, intron 1 of 4) intron (NM_152284, intron 1 of 4) 11505 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 321.333-4 chr1 81092319 81092670 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -213698 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 265.999-9 chr9 13701930 13702265 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -225874 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 185-41 chr22 25019715 25019962 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8136 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 260-30 chr17 67786144 67786546 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -39158 NM_182641 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 287.333-69 chr9 27257743 27258020 + 1.33333 NA intron (NR_026679, intron 15 of 16) MIRc|SINE|MIR 24912 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 185.333-29 chr11 63120818 63121090 + 1.33333 NA intron (NM_173586, intron 2 of 3) intron (NM_173586, intron 2 of 3) 23267 NM_173586 283238 Hs.375139 NM_173586 ENSG00000197658 SLC22A24 NET46 solute carrier family 22 member 24 protein-coding 159.333-30 chr1 235021727 235021910 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48000 NR_027454 731656 Hs.702477 NR_027454 LINC01348 - long intergenic non-protein coding RNA 1348 ncRNA 227-40 chr4 62880045 62880354 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -718434 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 484.666 chr18 1266472 1266993 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 92897 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 173-48 chr2 47884656 47884820 + 1.33333 NA intron (NM_001190274, intron 1 of 22) intron (NM_001190274, intron 1 of 22) 3981 NM_025133 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 294.333-36 chr6 45332006 45332407 + 1.33333 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) intron (NM_001015051, intron 2 of 7) 3876 NR_103533 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 287-16 chr2 165817407 165817751 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -23332 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 427.333-4 chr2 44911909 44912386 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 26741 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 294.666-17 chr2 119335839 119336228 + 1.33333 NA intron (NM_001322330, intron 2 of 5) intron (NM_001322330, intron 2 of 5) 30709 NM_001322329 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 146-59 chr2 82342613 82342819 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -514087 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 142-38 chr13 66494311 66494470 + 1.33333 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) intron (NM_001318373, intron 3 of 3) 276140 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 210.333-5 chr1 90589582 90589754 + 1.33333 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -68082 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 200.667-23 chr10 76547134 76547416 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -340769 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 180.333-112 chr6 165844613 165844820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -142835 NR_027284 441177 Hs.708964 NM_001013720 ENSG00000281832 LINC00602 - long intergenic non-protein coding RNA 602 ncRNA 204.333-55 chr14 64162771 64162984 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 88 of 114) intron (NM_015180, intron 88 of 114) -51267 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 236-48 chr2 201573631 201573983 + 1.33333 NA intron (NM_001168221, intron 7 of 15) AluSx1|SINE|Alu 45371 NM_001168216 151254 Hs.335788 NM_152525 ENSG00000155754 C2CD6 ALS2CR11 C2 calcium dependent domain containing 6 protein-coding 193-63 chr3 190447715 190447928 + 1.33333 NA exon (NM_207316, exon 2 of 5) exon (NM_207316, exon 2 of 5) 2055 NM_207316 131920 Hs.335321 NM_207316 ENSG00000198398 TMEM207 UNQ846 transmembrane protein 207 protein-coding 212-84 chr2 42059033 42059240 + 1.33333 NA TTS (NM_138370) TTS (NM_138370) 11115 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 231.333-89 chr5 88548216 88548493 + 1.33333 NA intron (NR_152235, intron 2 of 3) intron (NR_152235, intron 2 of 3) -109264 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 169-91 chr6 119956111 119956299 + 1.33333 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -58974 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 216.666-61 chr6 72413416 72413639 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46781 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 212.666-14 chr10 118224745 118225012 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 117446 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 303.333-39 chr2 105092923 105093344 + 1.33333 NA intron (NM_182640, intron 8 of 10) intron (NM_182640, intron 8 of 10) 9811 NR_110227 101927492 Hs.469537 NR_110227 ENSG00000231851 UTAT33 - uncharacterized LOC101927492 ncRNA 271.333-17 chr16 76594237 76594598 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40581 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 138-96 chr5 152733573 152733761 + 1.33333 NA intron (NR_109877, intron 3 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 238682 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 209.333-174 chr4 93780832 93781004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47835 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 198-41 chr13 39586582 39586798 + 1.33333 NA intron (NM_005780, intron 2 of 3) intron (NM_005780, intron 2 of 3) 16503 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 259.666-15 chr16 51691405 51691730 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -70952 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 297-13 chr11 47004951 47005249 + 1.33333 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) intron (NR_103472, intron 2 of 7) 68339 NM_024113 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 189-15 chr11 34314072 34314341 + 1.33333 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) intron (NM_145804, intron 1 of 16) 43804 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 193.333-176 chr7 104753214 104753439 + 1.33333 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 50766 NR_034142 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 196-144 chr5 51186425 51186604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 196818 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 186.666-12 chr10 111903782 111903949 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 279900 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 119.333-211 chr8 75322624 75322739 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -43792 NR_103849 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 197.333-17 chr10 18809905 18810118 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 150580 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 271.333-11 chr12 29752902 29753264 + 1.33333 NA intron (NM_001367875, intron 4 of 19) intron (NM_001367875, intron 4 of 19) 30859 NM_001367875 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 202-141 chr5 10827565 10827801 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66449 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 316.666-12 chr2 101881287 101881686 + 1.33333 NA intron (NM_145686, intron 25 of 30) L1MC|LINE|L1 -101979 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 209.667-9 chr1 112229640 112229943 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -166423 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 323.333-3 chr10 116062039 116062333 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001348099, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001348099, exon 7 of 7) 132603 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 205-83 chr7 22851891 22852223 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2183 NR_146320 109729180 Hs.553139 NR_146320 SNHG26 - small nucleolar RNA host gene 26 ncRNA 232.666-40 chr4 76809553 76809793 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 88471 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 244.667-101 chrX 50945220 50945582 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 34666 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 329.333-30 chr21 27083857 27084266 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116973 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 215.333-152 chr5 30000669 30000949 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 120249 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 148.667-229 chr20 63117446 63117628 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15218 NR_003245 768097 Hs.635159 NR_003245 ENSG00000231133 HAR1B HAR1R|LINC00065|NCRNA00065 highly accelerated region 1B ncRNA 289.333-38 chr3 149182090 149182457 + 1.33333 NA intron (NM_000096, intron 13 of 18) intron (NM_000096, intron 13 of 18) 39556 NR_046371 1356 Hs.558314 NM_000096 ENSG00000047457 CP CP-2 ceruloplasmin protein-coding 199.333-72 chr14 49464003 49464192 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 122283 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 203.333-276 chr9 27868287 27868446 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -294500 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 365.333-13 chr2 37373344 37373869 + 1.33333 NA TTS (NM_012413) TTS (NM_012413) 28976 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 205.333-44 chr11 29500010 29500297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94260 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 204.333-17 chr1 200302976 200303193 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70708 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 201.333-115 chr15 71507974 71508169 + 1.33333 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -39165 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 224-69 chr4 106668426 106668652 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 234915 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 197.333-24 chr10 97715774 97715987 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_031484, exon 1 of 2) 3' UTR (NM_031484, exon 1 of 2) 2150 NM_031484 83742 Hs.744073 NM_031484 ENSG00000155254 MARVELD1 GB14|MARVD1|MRVLDC1|bA548K23.8 MARVEL domain containing 1 protein-coding 264.333-35 chr2 10022805 10023192 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20403 NR_135558 101929882 Hs.405158 NR_135558 LOC101929882 - uncharacterized LOC101929882 ncRNA 198.666-92 chr8 86073370 86073558 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3796 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 214.666-26 chr16 83337717 83337965 + 1.33333 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) MER113B|DNA|hAT-Charlie -170505 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 198-143 chr4 132327358 132327652 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -263584 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 205-22 chr12 32254426 32254723 + 1.33333 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) intron (NR_148725, intron 2 of 9) -144984 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 282.666-17 chr4 95999919 96000258 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 159995 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 431.999 chr10 66246864 66247337 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L1MA2|LINE|L1 675675 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 196.667-116 chr5 6038935 6039185 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 298232 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 190-80 chr3 102649211 102649548 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 214364 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 203.999-3 chr3 121911794 121911947 + 1.33333 NA intron (NM_021082, intron 4 of 21) intron (NM_021082, intron 4 of 21) 17469 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 206.666-21 chr11 85834314 85834510 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -20689 NM_001286159 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 184-22 chr14 23928896 23929116 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24764 NM_001282991 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 192.666-27 chr15 87483577 87483857 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -93212 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 239.666-28 chr8 25816173 25816486 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 229084 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 200.667-25 chr10 110602150 110602402 + 1.33333 NA intron (NM_005445, intron 25 of 28) intron (NM_005445, intron 25 of 28) 34585 NM_005445 9126 Hs.24485 NM_005445 ENSG00000108055 SMC3 BAM|BMH|CDLS3|CSPG6|HCAP|SMC3L1 structural maintenance of chromosomes 3 protein-coding 256-22 chr12 59147812 59148228 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -227482 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 217-6 chr1 155680750 155681033 + 1.33333 NA intron (NM_001198901, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 -1062 NM_001198899 55249 Hs.584927 NM_018253 ENSG00000163374 YY1AP1 GRNG|HCCA1|HCCA2|YY1AP YY1 associated protein 1 protein-coding 172-61 chr2 179926313 179926486 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -64787 NM_152520 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 198-38 chr12 106829461 106829609 + 1.33333 NA intron (NR_147137, intron 4 of 10) intron (NR_147137, intron 4 of 10) -54704 NR_040246 100287944 Hs.742087 NR_040246 ENSG00000257545 LOC100287944 - uncharacterized LOC100287944 ncRNA 346-38 chr7 47718163 47718603 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -43093 NR_038407 84847 Hs.488236 NR_038407 ENSG00000146666 LINC00525 - long intergenic non-protein coding RNA 525 ncRNA 296-67 chr9 95331054 95331457 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -13546 NM_000136 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 226.666-17 chr16 46695752 46695934 + 1.33333 NA intron (NR_037620, intron 5 of 6) intron (NR_037620, intron 5 of 6) 6184 NR_037620 23594 Hs.49760 NM_014321 ENSG00000091651 ORC6 ORC6L origin recognition complex subunit 6 protein-coding 302.667-9 chr14 55048754 55049163 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_080867, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_080867, exon 2 of 2) -2689 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 208.666-10 chr1 118793442 118793680 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 194782 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 238.666-13 chr12 21382860 21383081 + 1.33333 NA intron (NM_134431, intron 1 of 15) intron (NM_134431, intron 1 of 15) 10068 NM_000415 3375 Hs.46835 NM_000415 ENSG00000121351 IAPP DAP|IAP islet amyloid polypeptide protein-coding 153.333-24 chr1 159089091 159089287 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12288 NM_001348247 9447 Hs.733411 NM_004833 ENSG00000163568 AIM2 PYHIN4 absent in melanoma 2 protein-coding 301.333-21 chr16 70430373 70430832 + 1.33333 NA intron (NM_006927, intron 1 of 6) intron (NM_006927, intron 1 of 6) 8498 NM_006927 6483 Hs.368611 NM_006927 ENSG00000157350 ST3GAL2 Gal-NAc6S|SIAT4B|ST3GALII|ST3GalA.2 ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 protein-coding 232.333-33 chr16 83804951 83805195 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1097 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 281.333-45 chr4 147625002 147625413 + 1.33333 NA intron (NM_018241, intron 4 of 9) intron (NM_018241, intron 4 of 9) 7810 NM_018241 55751 Hs.203896 NM_018241 ENSG00000164168 TMEM184C TMEM34 transmembrane protein 184C protein-coding 181.333-158 chr7 11851912 11852277 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -19896 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 227.333-105 chr5 120531591 120531932 + 1.33333 NA intron (NM_001308088, intron 1 of 3) intron (NM_001308088, intron 1 of 3) 297 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 320.666-14 chr6 41386782 41387062 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 51314 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 388.999-2 chr17 79771832 79772163 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -6151 NM_005189 84733 Hs.368410 NM_005189 ENSG00000173894 CBX2 CDCA6|M33|SRXY5 chromobox 2 protein-coding 178-19 chr10 70031731 70031914 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -21024 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 255-19 chr11 33436860 33437187 + 1.33333 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) intron (NM_012194, intron 1 of 20) 60915 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 194-140 chr8 53975102 53975320 + 1.33333 NA intron (NM_201437, intron 7 of 8) L1ME4a|LINE|L1 47237 NR_109902 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 375.333-28 chr6 53493803 53494234 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 51083 NM_001498 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 202-42 chr14 35772857 35773072 + 1.33333 NA intron (NM_014990, intron 3 of 40) intron (NM_014990, intron 3 of 40) -10033 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 204.666-5 chr1 190040774 190040938 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 435154 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 265.999 chr1 97508968 97509299 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 13 of 22) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -287788 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 166.667-242 chr9 2797210 2797412 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46784 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 203.666-43 chr4 88514988 88515160 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 8702 NM_032906 100996939 Hs.26136 NM_032906 ENSG00000145337 PYURF PREY PIGY upstream reading frame protein-coding 222-72 chr5 43565738 43566021 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -8460 NM_183323 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 315.333-23 chr2 182844000 182844491 + 1.33333 NA intron (NM_001463, intron 2 of 5) intron (NM_001463, intron 2 of 5) 22392 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 175.667-145 chr8 83186012 83186233 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -217636 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 260.667-95 chr8 131331669 131331943 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -290897 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 208.666-103 chr7 111483321 111483527 + 1.33333 NA intron (NM_001350964, intron 4 of 4) intron (NM_001350964, intron 4 of 4) 78867 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 385.333-2 chr1 176103230 176103636 + 1.33333 NA intron (NM_022457, intron 9 of 19) MER21C|LTR|ERVL 103811 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 164.667-122 chr2 240048785 240049030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2835 NM_173351 150681 Hs.626616 NM_173351 ENSG00000178586 OR6B3 OR6B3P|OR6B3Q olfactory receptor family 6 subfamily B member 3 protein-coding 146.667-147 chr18 76067380 76067563 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -55527 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 217.333-153 chr8 105717402 105717593 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 343006 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 240.333-53 chr2 181034796 181035149 + 1.33333 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) intron (NM_001278555, intron 3 of 5) 53848 NM_001278554 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 185.666-8 chr12 45233289 45233491 + 1.33333 NA intron (NM_001025356, intron 1 of 19) intron (NM_001025356, intron 1 of 19) 17295 NM_001142679 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 152-94 chr20 17270820 17270980 + 1.33333 NA intron (NM_002594, intron 2 of 11) MIR3|SINE|MIR 43860 NM_001201529 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 202.667-24 chr11 17886696 17886948 + 1.33333 NA intron (NR_104041, intron 8 of 9) intron (NR_104041, intron 8 of 9) 126225 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 195.666-22 chr2 156358059 156358296 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16057 NR_147695 440918 Hs.641142 NR_147695 FLJ46875 - uncharacterized LOC440918 ncRNA 261.333-14 chr10 49316623 49316914 + 1.33333 NA intron (NM_001135196, intron 2 of 2) intron (NM_001135196, intron 2 of 2) 17598 NM_001135196 118461 Hs.585480 NM_199459 ENSG00000177354 C10orf71 CEFIP chromosome 10 open reading frame 71 protein-coding 199.333-178 chr3 29941609 29941885 + 1.33333 NA intron (NM_001177711, intron 11 of 13) L1MC|LINE|L1 -7591 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 302.666-12 chr2 192678361 192678761 + 1.33333 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -71284 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 206.666-20 chr11 56434196 56434356 + 1.33333 NA Intergenic (ATACAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -16044 NM_001004744 219479 Hs.553630 NM_001004744 ENSG00000279961 OR5R1 OR11-185|OR5R1P olfactory receptor family 5 subfamily R member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 286.666-7 chr2 52891630 52891912 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -189156 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 387.333-8 chr4 14702009 14702446 + 1.33333 NA intron (NR_126435, intron 2 of 6) intron (NR_126435, intron 2 of 6) 185942 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 291.333-75 chrX 70689722 70690038 + 1.33333 NA intron (NM_001003811, intron 14 of 30) L1MC3|LINE|L1 156415 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 178.667-136 chr5 132932528 132932736 + 1.33333 NA intron (NM_014423, intron 3 of 20) MER85|DNA|PiggyBac 31002 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 182.333-98 chr20 54752423 54752639 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 276938 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 412-4 chr16 22689031 22689480 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -124907 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 453-9 chr22 19910103 19910746 + 1.33333 NA intron (NR_147957, intron 7 of 16) intron (NR_147957, intron 7 of 16) 22129 NM_001352301 10587 Hs.443430 NM_006440 ENSG00000184470 TXNRD2 GCCD5|SELZ|TR|TR-BETA|TR3|TRXR2 thioredoxin reductase 2 protein-coding 276.666-24 chr4 36004900 36005151 + 1.33333 NA TTS (NR_146893) TTS (NR_146893) 238914 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 212.667-9 chr1 182332389 182332666 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -18466 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 194-42 chr15 56622669 56622863 + 1.33333 NA Intergenic MER99|DNA|hAT? 111320 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 175.667-124 chr6 284195 284357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7781 NR_104474 56940 Hs.29106 NM_020185 ENSG00000112679 DUSP22 JKAP|JSP-1|JSP1|LMW-DSP2|LMWDSP2|MKP-x|MKPX|VHX dual specificity phosphatase 22 protein-coding 254.666 chr1 15109186 15109588 + 1.33333 NA intron (NM_201628, intron 13 of 14) intron (NM_201628, intron 13 of 14) 43077 NR_027136 200197 Hs.531424 NM_182534 ENSG00000175147 TMEM51-AS1 C1orf126 TMEM51 antisense RNA 1 ncRNA 195.666-19 chr16 64699712 64699872 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 422271 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 141.333-203 chr6 17058909 17059033 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -43287 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 194.666-6 chr10 96086654 96086893 + 1.33333 NA intron (NR_134322, intron 2 of 3) intron (NR_134322, intron 2 of 3) 3462 NR_134321 728558 Hs.538374 NR_038444 ENSG00000226688 ENTPD1-AS1 - ENTPD1 antisense RNA 1 ncRNA 214-10 chr1 232650144 232650449 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -67775 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 288-40 chr5 33784251 33784673 + 1.33333 NA intron (NM_001324511, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 107528 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 164-90 chr5 19664533 19664745 + 1.33333 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) L3|LINE|CR1 221633 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 230.333-31 chr12 99786456 99786785 + 1.33333 NA intron (NM_152788, intron 4 of 25) L1MEd|LINE|L1 138867 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 226.666-35 chr5 127645155 127645419 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3734 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 203.666-21 chr14 51698428 51698643 + 1.33333 NA intron (NM_001042481, intron 4 of 14) intron (NM_001042481, intron 4 of 14) -18748 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 209.333-213 chr7 2614973 2615240 + 1.33333 NA TTS (NM_152558) TTS (NM_152558) -16880 NM_025250 80727 Hs.440899 NM_025250 ENSG00000136295 TTYH3 - tweety family member 3 protein-coding 219-32 chr16 82503025 82503246 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -123834 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 201.333-269 chr7 94437860 94438155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43446 NM_000089 1278 Hs.489142 NM_000089 ENSG00000164692 COL1A2 EDSARTH2|EDSCV|OI4 collagen type I alpha 2 chain protein-coding 166.666-12 chr5 65456960 65457127 + 1.33333 NA intron (NR_135689, intron 4 of 25) intron (NR_135689, intron 4 of 25) 24877 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 202-190 chr8 137079267 137079452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 334229 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 203.999-6 chr9 97301293 97301447 + 1.33333 NA intron (NR_036528, intron 14 of 50) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -5967 NM_001348010 100499483 Hs.435629 NM_020893 ENSG00000197816 CCDC180 C9orf174 coiled-coil domain containing 180 protein-coding 164-116 chr8 77191197 77191383 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -190246 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 218-94 chr5 166725259 166725523 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 200979 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 440.999-2 chr4 76101209 76101905 + 1.33333 NA intron (NM_001130017, intron 8 of 9) AluSg|SINE|Alu 26862 NM_001179 419 Hs.24976 NM_001179 ENSG00000156219 ART3 ARTC3 ADP-ribosyltransferase 3 protein-coding 296-46 chr4 35956646 35956944 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 287144 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 180.666-31 chr6 152066232 152066435 + 1.33333 NA intron (NM_001328100, intron 6 of 6) intron (NM_001328100, intron 6 of 6) 101954 NM_001347702 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 256.667-62 chr3 128143898 128144330 + 1.33333 NA intron (NM_001319086, intron 1 of 9) intron (NM_001319086, intron 1 of 9) -9367 NM_021937 60678 Hs.477498 NM_021937 ENSG00000132394 EEFSEC EFSEC|SELB eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA specific protein-coding 302.999-5 chr14 48505354 48505675 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -710500 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 174.333-91 chr3 110555841 110555987 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 514045 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 252.666-48 chr8 131506129 131506396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -397831 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 186.333-47 chr13 92369554 92369750 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -17445 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 209.333-63 chr14 73230672 73230936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6702 NR_158677 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 209.666-38 chr3 166692484 166692674 + 1.33333 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -206104 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 283.333-72 chr7 111218037 111218358 + 1.33333 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 127070 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 198-82 chr2 24261247 24261529 + 1.33333 NA intron (NM_001348182, intron 20 of 38) intron (NM_001348182, intron 20 of 38) 86335 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 354.333-3 chr11 33952537 33953126 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -60755 NM_005574 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 215-14 chr12 123258520 123258756 + 1.33333 NA TTS (NM_001194995) TTS (NM_001194995) 9616 NM_001270434 8099 Hs.433201 NM_004642 ENSG00000111328 CDK2AP1 DOC1|DORC1|ST19|doc-1|p12DOC-1 cyclin dependent kinase 2 associated protein 1 protein-coding 216-71 chr21 44787360 44787594 + 1.33333 NA intron (NM_001202489, intron 1 of 3) intron (NM_001202489, intron 1 of 3) 14343 NM_001202489 7327 Hs.529420 NM_003343 ENSG00000184787 UBE2G2 UBC7 ubiquitin conjugating enzyme E2 G2 protein-coding 225.666-15 chr2 231296068 231296389 + 1.33333 NA exon (NM_001352756, exon 19 of 21) exon (NM_001352756, exon 19 of 21) -66480 NR_039937 100616317 NR_039937 ENSG00000263641 MIR4777 - microRNA 4777 ncRNA 302-72 chr9 76892936 76893305 + 1.33333 NA intron (NM_001308048, intron 1 of 17) AluJo|SINE|Alu 12967 NM_001308047 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 191.666-4 chr13 39824269 39824521 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -160260 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 377.333-8 chr2 25609123 25609509 + 1.33333 NA intron (NM_033147, intron 4 of 19) intron (NM_033147, intron 4 of 19) 40906 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 265.666-7 chr14 43183477 43183693 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 1323698 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 173.667-17 chr10 57557245 57557435 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -252781 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 164.667-128 chr20 53661253 53661505 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53025 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 256.666-37 chr5 66746377 66746604 + 1.33333 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR -82283 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 220-8 chr1 220462238 220462464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65785 NM_001286128 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 171.333-136 chr4 70752596 70752749 + 1.33333 NA intron (NM_001291994, intron 2 of 13) L1MB7|LINE|L1 18262 NM_001345840 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 175-56 chr3 149724656 149724901 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001348362) promoter-TSS (NM_001348362) 10 NM_001348362 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 197.333-185 chr5 94647691 94647928 + 1.33333 NA intron (NM_032290, intron 5 of 20) intron (NM_032290, intron 5 of 20) 29140 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 150-8 chr1 202348355 202348502 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001167857) promoter-TSS (NM_001167857) -271 NM_001331029 4660 Hs.444403 NM_002481 ENSG00000077157 PPP1R12B MYPT2|PP1bp55 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B protein-coding 211-94 chr8 107860219 107860522 + 1.33333 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 221569 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 304.667-28 chr4 87445179 87445627 + 1.33333 NA intron (NM_024047, intron 4 of 7) intron (NM_024047, intron 4 of 7) 22806 NM_198038 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 357.333-2 chr1 199657409 199657914 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -370049 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 226.333-34 chr15 35987645 35987889 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60911 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 276.667-49 chr3 121332734 121333078 + 1.33333 NA intron (NM_001348343, intron 21 of 27) L1PREC2|LINE|L1 213082 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 232-71 chr5 62468216 62468464 + 1.33333 NA intron (NM_016338, intron 6 of 29) intron (NM_016338, intron 6 of 29) 49456 NM_001134779 51194 Hs.482269 NM_016338 ENSG00000086200 IPO11 RanBP11 importin 11 protein-coding 279-37 chr8 83034479 83034855 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 122563 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 134.333-92 chr2 166778155 166778304 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -110258 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 364.666-9 chr4 114912120 114912514 + 1.33333 NA intron (NM_022569, intron 6 of 13) intron (NM_022569, intron 6 of 13) 201303 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 182.666-37 chr7 41420510 41420677 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -273326 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 225.999-11 chr7 68495300 68495524 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 475159 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 199.333-93 chr16 76149174 76149432 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -128098 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 221-38 chr2 196736226 196736486 + 1.33333 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 22818 NM_001353340 284992 Hs.132519 NM_173466 ENSG00000144395 CCDC150 - coiled-coil domain containing 150 protein-coding 190-4 chr1 105458084 105458278 + 1.33333 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 160754 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 425.667-2 chr10 124725548 124726017 + 1.33333 NA intron (NM_014661, intron 1 of 4) intron (NM_014661, intron 1 of 4) 18596 NM_014661 9679 Hs.129195 NM_014661 ENSG00000189319 FAM53B KIAA0140|bA12J10.2|smp family with sequence similarity 53 member B protein-coding 187.333-46 chr12 58787046 58787320 + 1.33333 NA intron (NR_126341, intron 1 of 1) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -5467 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 197.333-160 chr3 189817913 189818075 + 1.33333 NA intron (NM_003722, intron 4 of 13) intron (NM_003722, intron 4 of 13) -11928 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 251.666-14 chr19 10880601 10880975 + 1.33333 NA intron (NM_001370089, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 8359 NM_001370089 10498 Hs.323213 NM_199141 ENSG00000142453 CARM1 PRMT4 coactivator associated arginine methyltransferase 1 protein-coding 202-11 chr1 190242988 190243172 + 1.33333 NA intron (NM_199051, intron 4 of 7) intron (NM_199051, intron 4 of 7) 232930 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 328.333-34 chr6 68826210 68826663 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) L2a|LINE|L2 191154 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 246-43 chr17 78732682 78732880 + 1.33333 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) intron (NM_004762, intron 1 of 12) 4121 NM_001365040 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 205.333-260 chr9 37180545 37180788 + 1.33333 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 60068 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 281.666-16 chr7 107585267 107585676 + 1.33333 NA intron (NR_163927, intron 3 of 6) MIR3|SINE|MIR 5225 NR_163938 260-69 chr6 48594492 48594781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -525947 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 198-42 chr13 67569304 67569489 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 197009 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 219.333-103 chr2 217200362 217200692 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -82206 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 374-8 chr15 57132453 57133034 + 1.33333 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -86687 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 207.333-235 chr6 17661169 17661345 + 1.33333 NA intron (NM_001278209, intron 11 of 22) AluSz|SINE|Alu -44873 NR_134616 105374952 Hs.718703 NR_134616 ENSG00000272269 LOC105374952 - uncharacterized LOC105374952 ncRNA 157.333-277 chr5 31510123 31510302 + 1.33333 NA intron (NM_013235, intron 8 of 34) intron (NM_013235, intron 8 of 34) 21881 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 225.333-70 chr18 8436079 8436293 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69152 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 193-95 chr9 35441813 35442008 + 1.33333 NA intron (NR_003581, intron 6 of 17) intron (NR_003581, intron 6 of 17) 35155 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 231.999-2 chr15 67518727 67518995 + 1.33333 NA intron (NR_040054, intron 2 of 2) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 2112 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 184-54 chr2 144308806 144309062 + 1.33333 NA intron (NM_001354354, intron 1 of 12) L1ME1|LINE|L1 -13621 NM_001354361 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 197-103 chr6 130804540 130804812 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -22729 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 210.666-101 chr8 82319791 82319960 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -477589 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 233.667-37 chr2 35122674 35123046 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -348545 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 266.333-16 chr14 79281187 79281622 + 1.33333 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 2024 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 123.333-183 chr6 28406310 28406472 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -6644 NR_136511 9753 Hs.134816 NM_014724 ENSG00000158691 ZSCAN12 ZFP96|ZNF29K1|ZNF305|ZNF96|dJ29K1.2 zinc finger and SCAN domain containing 12 protein-coding 273.666-19 chr4 27409728 27410158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 192464 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 263.333-80 chr7 113511752 113512178 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -393383 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 184.333-77 chr2 121783593 121783825 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 28058 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 189.333-144 chr4 59289062 59289258 + 1.33333 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 275587 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 214-98 chr4 75185166 75185335 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -100542 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 227.333-89 chr4 74009159 74009342 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10573 NM_002994 6374 Hs.89714 NM_002994 ENSG00000163735 CXCL5 ENA-78|SCYB5 C-X-C motif chemokine ligand 5 protein-coding 400.333-16 chr5 76147484 76148193 + 1.33333 NA intron (NM_014979, intron 2 of 12) intron (NM_014979, intron 2 of 12) 64455 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 127.333-183 chr8 32838949 32839102 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 117190 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 197.333-58 chr13 62078525 62078763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49096 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 295.999 chr1 97406802 97407081 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 14 of 22) intron (NM_000110, intron 14 of 22) 311018 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 196.666-99 chr7 83984716 83984889 + 1.33333 NA intron (NM_006080, intron 13 of 16) intron (NM_006080, intron 13 of 16) 209987 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 531-2 chr21 17388661 17389180 + 1.33333 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie -49970 NR_037585 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 191.333-13 chr1 172582308 172582466 + 1.33333 NA intron (NM_001282751, intron 15 of 21) intron (NM_001282751, intron 15 of 21) 49237 NM_014283 51430 Hs.204559 NM_014283 ENSG00000094975 SUCO C1orf9|CH1|OPT|SLP1 SUN domain containing ossification factor protein-coding 264.999-8 chr5 90453858 90454190 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -19905 NM_001370354 10622 Hs.282387 NM_006467 ENSG00000113356 POLR3G RPC32|RPC7 RNA polymerase III subunit G protein-coding 203.666-6 chr1 231358251 231358443 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20054 NM_032018 83932 Hs.554892 NM_032018 ENSG00000010072 SPRTN C1orf124|DVC1|PRO4323|spartan SprT-like N-terminal domain protein-coding 202-143 chr5 23415455 23415878 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -91943 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 116.333-27 chr10 30450737 30450895 + 1.33333 NA intron (NM_001244134, intron 4 of 7) AluSq2|SINE|Alu 16170 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 195.333-18 chr1 203911799 203912060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50082 NM_001328637 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 175.333-136 chr4 105768849 105769066 + 1.33333 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) intron (NM_001370181, intron 5 of 11) 58144 NM_001031720 79807 Hs.161429 NM_024751 ENSG00000138780 GSTCD - glutathione S-transferase C-terminal domain containing protein-coding 261.333-78 chr4 105639516 105639894 + 1.33333 NA intron (NM_001242729, intron 5 of 13) L1ME4a|LINE|L1 68984 NM_020395 57117 Hs.480454 NM_020395 ENSG00000138785 INTS12 INT12|PHF22|SBBI22 integrator complex subunit 12 protein-coding 172-24 chr11 36617278 36617427 + 1.33333 NA intron (NM_001276725, intron 2 of 3) MER5B|DNA|hAT-Charlie -19073 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 213.666-40 chr6 2118097 2118332 + 1.33333 NA intron (NM_001253846, intron 2 of 10) intron (NM_001253846, intron 2 of 10) 57777 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 222.333-4 chr1 75879282 75879503 + 1.33333 NA intron (NM_002440, intron 12 of 19) intron (NM_002440, intron 12 of 19) 53012 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 363.666-8 chr5 124349504 124349820 + 1.33333 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L1MB7|LINE|L1 88858 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 206.333-97 chr2 240324799 240324964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -110782 NM_002081 2817 Hs.328232 NM_002081 ENSG00000063660 GPC1 glypican glypican 1 protein-coding 184.666-45 chrX 39428452 39428654 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36779 NR_110385 101927449 Hs.553988 NR_110385 ENSG00000236747 LINC01282 - long intergenic non-protein coding RNA 1282 ncRNA 179.333-166 chr6 137375763 137375998 + 1.33333 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 118514 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 217.333-130 chr6 94890856 94891046 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 686500 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 200.666-51 chr18 67333911 67334106 + 1.33333 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 -182538 NR_033921 643542 Hs.652901 NR_033921 ENSG00000265533 LOC643542 - uncharacterized LOC643542 ncRNA 329.999-7 chr2 163115175 163115485 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -276563 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 198-96 chr2 115565975 115566249 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) L1MC4|LINE|L1 222297 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 248.666-13 chr13 105575833 105576200 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -70335 NR_040247 282706 Hs.558713 NR_040247 ENSG00000232307 DAOA-AS1 DAOA-AS|DAOAAS|G30 DAOA antisense RNA 1 ncRNA 221.666-6 chr10 14969874 14970094 + 1.33333 NA intron (NM_001080836, intron 2 of 2) intron (NM_001080836, intron 2 of 2) 10596 NR_147060 644890 Hs.257249 NM_001080836 ENSG00000197889 MEIG1 SPATA39|bA2K17.3 meiosis/spermiogenesis associated 1 protein-coding 249.667-107 chr9 77107330 77107675 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69943 NM_015186 23230 Hs.459790 NM_015186 ENSG00000197969 VPS13A CHAC|CHOREIN vacuolar protein sorting 13 homolog A protein-coding 213.333-169 chr5 135171836 135172003 + 1.33333 NA intron (NR_161235, intron 2 of 5) L1MA6|LINE|L1 76258 NR_037895 340073 Hs.434422 NR_037895 ENSG00000249647 C5orf66-AS2 - C5orf66 antisense RNA 2 ncRNA 176-93 chr8 31520335 31520497 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119336 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 289-6 chr13 51163501 51163976 + 1.33333 NA intron (NR_102431, intron 1 of 4) LTR32|LTR|ERVL 8484 NR_102432 647166 Hs.195052 NM_001351589 ENSG00000226792 C13orf42 LINC00371|LINC00372 chromosome 13 open reading frame 42 protein-coding 217.333-12 chr1 154085688 154086015 + 1.33333 NA intron (NM_001159484, intron 16 of 37) L1MB7|LINE|L1 18741 NR_049883 100847024 NR_049883 ENSG00000263987 MIR5698 - microRNA 5698 ncRNA 183.667-86 chr20 47709402 47709640 + 1.33333 NA intron (NM_198596, intron 3 of 20) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 76543 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 253.666-6 chr16 5423485 5423743 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 192636 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 196.666-84 chr5 68471037 68471204 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 178543 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 212.667-14 chr10 60191906 60192192 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 17 of 43) AluSg|SINE|Alu -51033 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 297.667-7 chr11 10208856 10209266 + 1.33333 NA intron (NM_030962, intron 1 of 39) intron (NM_030962, intron 1 of 39) 85146 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 252-30 chr14 68330669 68331138 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 297884 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 208.666-46 chr16 56719933 56720184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10071 NM_014669 9688 Hs.276878 NM_014669 ENSG00000102900 NUP93 NIC96 nucleoporin 93 protein-coding 164.333-118 chr2 75902752 75903012 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -191967 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 364.333-15 chr2 74011288 74011719 + 1.33333 NA intron (NM_001287491, intron 3 of 11) intron (NM_001287491, intron 3 of 11) 8811 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 276.666-8 chr12 22801058 22801324 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 176020 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 211.667-5 chr1 67339706 67340004 + 1.33333 NA intron (NM_001319233, intron 9 of 15) intron (NM_001319233, intron 9 of 15) 32491 NM_001559 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 328-5 chr10 115063688 115064155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29444 NM_001276282 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 196.666-42 chr19 52018969 52019141 + 1.33333 NA intron (NM_025040, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 9324 NM_025040 80110 Hs.292336 NM_025040 ENSG00000142556 ZNF614 - zinc finger protein 614 protein-coding 200.666-26 chr12 21938224 21938375 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1605 NM_020297 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 298-2 chr1 46053689 46054096 + 1.33333 NA intron (NM_001303429, intron 6 of 8) X6A_LINE|LINE|CR1 76781 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 192.666-4 chr1 178618185 178618404 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59455 NR_039622 100616328 NR_039622 ENSG00000266417 MIR4424 - microRNA 4424 ncRNA 179.333-5 chr1 51343381 51343566 + 1.33333 NA intron (NM_001144832, intron 1 of 17) intron (NM_001144832, intron 1 of 17) 1643 NM_001144832 22996 Hs.112949 NM_001080494 ENSG00000085831 TTC39A C1orf34|DEME-6 tetratricopeptide repeat domain 39A protein-coding 327.666-8 chr5 28382801 28383093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -95282 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 297.667-11 chr14 88769832 88770240 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 1 of 42) L1MC4a|LINE|L1 22917 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 298.666-13 chr4 68277615 68277962 + 1.33333 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -32094 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 201-9 chr1 112649686 112649838 + 1.33333 NA intron (NM_006135, intron 3 of 9) intron (NM_006135, intron 3 of 9) -24550 NM_001286072 4343 Hs.514941 NM_020963 ENSG00000155363 MOV10 fSAP113|gb110 Mov10 RISC complex RNA helicase protein-coding 150-47 chr14 66656485 66656703 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 149187 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 291.333-51 chr5 29818873 29819335 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -61456 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 206-170 chr7 43753148 43753420 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -5389 NM_001253823 644 Hs.488143 NM_000712 ENSG00000106605 BLVRA BLVR|BVR|BVRA biliverdin reductase A protein-coding 264.666-7 chr10 90820030 90820336 + 1.33333 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) LTR85c|LTR|Gypsy? 37856 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 222.666-12 chr12 24245902 24246175 + 1.33333 NA intron (NM_001261414, intron 4 of 16) intron (NM_001261414, intron 4 of 16) 22767 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-150 chr2 181824075 181824282 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -67552 NM_001287503 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 135-28 chr13 85044808 85045004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 103151 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 215-67 chr5 126941217 126941445 + 1.33333 NA intron (NM_178450, intron 1 of 4) intron (NM_178450, intron 1 of 4) 89227 NM_178450 115123 Hs.132441 NM_178450 ENSG00000173926 MARCH3 MARCH-III|RNF173 membrane associated ring-CH-type finger 3 protein-coding 186-42 chr18 7601372 7601600 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 34170 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 219.333-42 chr12 86171580 86171826 + 1.33333 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) intron (NM_001351286, intron 4 of 7) 84688 NM_001351289 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 214.333-77 chr2 76815363 76815582 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -170493 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 205.333-57 chr12 33871586 33871763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150822 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 423.333-5 chr13 59175673 59176394 + 1.33333 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -836685 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 202.667-90 chr21 27515301 27515570 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -206944 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 201.333-51 chr11 42028793 42029082 + 1.33333 NA intron (NR_135065, intron 7 of 9) L1MC1|LINE|L1 56521 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 234.667-23 chr12 22709427 22709764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84424 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 178.667-29 chr11 80945464 80945674 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -182766 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 208-47 chr14 47451833 47452004 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -108672 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 193.333-109 chr20 10735884 10736031 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17133 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 197.333-133 chr20 49924383 49924595 + 1.33333 NA intron (NR_134564, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 8667 NR_134564 105372653 Hs.589895 NR_134564 LOC105372653 - uncharacterized LOC105372653 ncRNA 173.667-37 chr12 54068011 54068253 + 1.33333 NA intron (NR_026655, intron 1 of 1) intron (NR_026655, intron 1 of 1) 9878 NR_026655 440101 Hs.350378 NR_026655 ENSG00000248265 FLJ12825 - uncharacterized LOC440101 ncRNA 324.333-29 chr3 196172369 196172932 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 30014 NR_034088 401109 Hs.280133 NM_001001699 ENSG00000224652 LINC00885 - long intergenic non-protein coding RNA 885 ncRNA 371.333-22 chr8 41508315 41508731 + 1.33333 NA intron (NM_001002296, intron 4 of 4) intron (NM_001002296, intron 4 of 4) 17911 NM_001362980 51125 Hs.654773 NM_016099 ENSG00000147533 GOLGA7 GCP16|GOLGA3AP1|GOLGA7A|HSPC041 golgin A7 protein-coding 229-45 chr4 41207274 41207621 + 1.33333 NA intron (NM_173075, intron 1 of 16) intron (NM_173075, intron 1 of 16) 7095 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 268.333-41 chr3 171310497 171310761 + 1.33333 NA intron (NM_001161563, intron 2 of 31) intron (NM_001161563, intron 2 of 31) 149776 NM_001161566 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 246.999-8 chr8 22186647 22186946 + 1.33333 NA intron (NR_033404, intron 8 of 15) MIR|SINE|MIR 21424 NR_033404 649 Hs.1274 NM_001199 ENSG00000168487 BMP1 OI13|PCOLC|PCP|PCP2|TLD bone morphogenetic protein 1 protein-coding 152.666-5 chr2 46122458 46122616 + 1.33333 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) intron (NM_005400, intron 11 of 14) -174870 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 132.667-167 chr7 84361500 84361690 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -166806 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 236.666-38 chr5 108887653 108887846 + 1.33333 NA intron (NR_146155, intron 8 of 19) intron (NR_146155, intron 8 of 19) -36857 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 202.333-155 chr6 90961251 90961453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -374280 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 210-104 chr4 61394073 61394310 + 1.33333 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) intron (NM_001371343, intron 2 of 23) 192019 NM_001371342 219-5 chr1 111695853 111696149 + 1.33333 NA intron (NM_001370216, intron 3 of 7) L1MC1|LINE|L1 31207 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 236.666-22 chr18 5274641 5274976 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 20918 NM_001243702 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 189.333-175 chr6 123438810 123439054 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_110844) promoter-TSS (NR_110844) -672 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 247-12 chr11 41116591 41116965 + 1.33333 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 342858 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 211-93 chr8 10064401 10064647 + 1.33333 NA intron (NM_001135670, intron 1 of 4) intron (NM_001135670, intron 1 of 4) 10232 NM_012331 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 190-93 chr4 91870101 91870247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 407128 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 420.666-7 chr6 66765346 66765710 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 977649 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 202-191 chr8 138511213 138511370 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -13561 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 188.666-41 chr9 32284437 32284621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -100074 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 298.666-5 chr14 71340213 71340454 + 1.33333 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) 19857 NM_001354289 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 321.666-15 chr8 61445900 61446435 + 1.33333 NA intron (NM_173519, intron 3 of 5) L1MD1|LINE|L1 158197 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 247-9 chr10 59432805 59433150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69796 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 116.333-189 chr6 71775911 71776049 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -110723 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 144.666-10 chr3 8131172 8131306 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -114932 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 199.333-296 chr9 36443193 36443365 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42081 NM_194330 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 184.333-72 chr2 38435173 38435443 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 4014 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 227.666-13 chr18 6527080 6527254 + 1.33333 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) intron (NR_120518, intron 2 of 5) 15751 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 408.333-12 chr8 81291646 81292235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11404 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 259.666-31 chr6 161488767 161489154 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 9 of 11) intron (NM_004562, intron 9 of 11) 17983 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 216.333-114 chr5 56022165 56022517 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 27174 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 208.666-35 chr13 79315879 79316063 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90250 NM_001286632 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 176.666-22 chr5 13167002 13167217 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -134223 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 288.667 chr1 24170343 24170739 + 1.33333 NA intron (NM_173065, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu 16748 NM_173065 163702 Hs.221375 NM_170743 ENSG00000185436 IFNLR1 CRF2/12|IFNLR|IL-28R1|IL28RA|LICR2 interferon lambda receptor 1 protein-coding 290.666-15 chr2 212746658 212746955 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48525 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 327.333-26 chr3 73068585 73069103 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_174907, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_174907, exon 9 of 9) 7185 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 256-32 chr17 57811855 57812195 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 38019 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 190.667-27 chr12 2740064 2740295 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -49022 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 281.333-44 chr4 36162700 36163020 + 1.33333 NA intron (NR_146894, intron 11 of 32) L2|LINE|L2 81079 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 208-153 chr6 144839668 144839839 + 1.33333 NA intron (NM_007124, intron 71 of 73) intron (NM_007124, intron 71 of 73) 434098 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 161.333-30 chr10 56332401 56332626 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 28746 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 202.333-48 chr12 63294346 63294546 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -141636 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 215.333-103 chr2 189248517 189248681 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68838 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 186.667-97 chr4 18864380 18864630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -842630 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 238-68 chr4 72118426 72118811 + 1.33333 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) intron (NM_001144756, intron 2 of 4) 79486 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 181-74 chr8 33494939 33495151 + 1.33333 NA intron (NM_032509, intron 6 of 9) intron (NM_032509, intron 6 of 9) 9863 NM_032509 84549 Hs.583805 NM_032509 ENSG00000198042 MAK16 MAK16L|RBM13 MAK16 homolog protein-coding 189.333-119 chr22 26729647 26729830 + 1.33333 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 56895 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 205.667-116 chr5 157717538 157717846 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -13728 NM_017872 54974 Hs.353090 NM_017872 ENSG00000113272 THG1L ICF45|IHG-1|hTHG1 tRNA-histidine guanylyltransferase 1 like protein-coding 238.333-77 chr6 50807731 50807932 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -11040 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 185.333-11 chr1 166184465 166184615 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -17785 NR_135199 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 240-29 chr15 79793266 79793722 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 103503 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 274.666-33 chr9 13244162 13244427 + 1.33333 NA intron (NM_003829, intron 3 of 45) intron (NM_003829, intron 3 of 45) 35270 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 287.999-10 chr8 119437624 119437908 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21320 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 304-28 chr2 39896280 39896794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21097 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 364.666-2 chr12 12519778 12520077 + 1.33333 NA exon (NM_030640, exon 3 of 7).2 exon (NM_030640, exon 3 of 7).2 42936 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 271.333-21 chr18 8107931 8108200 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 11 of 30) intron (NM_002845, intron 11 of 30) 258969 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 198-190 chr9 2739938 2740162 + 1.33333 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 22540 NM_133497 169522 Hs.622675 NM_133497 ENSG00000168263 KCNV2 KV11.1|Kv8.2|RCD3B potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 2 protein-coding 143.333-180 chr3 63720145 63720261 + 1.33333 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 67528 NM_001348756 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 430-7 chr8 86621538 86622122 + 1.33333 NA intron (NM_019098, intron 13 of 17) AluSc|SINE|Alu 107395 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 231-4 chr1 226344028 226344248 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -34371 NM_001270410 286826 Hs.120817 NM_173083 ENSG00000183814 LIN9 BARA|BARPsv|Lin-9|TGS|TGS1|TGS2 lin-9 DREAM MuvB core complex component protein-coding 226.333-5 chr1 195266983 195267252 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 821598 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 166.667-77 chr15 87611483 87611673 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34649 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 268.333-3 chr1 93449602 93449920 + 1.33333 NA intron (NM_001024948, intron 1 of 13) intron (NM_001024948, intron 1 of 13) 1630 NM_001024948 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 324.666-17 chr7 90222113 90222473 + 1.33333 NA intron (NM_001244944, intron 2 of 5) intron (NM_001244944, intron 2 of 5) 8473 NM_001040666 261729 Hs.489051 NM_152999 ENSG00000157214 STEAP2 IPCA1|PCANAP1|PUMPCn|STAMP1|STMP STEAP2 metalloreductase protein-coding 210.667-119 chr7 28074767 28075063 + 1.33333 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -105542 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 331.333-19 chr15 69665595 69666071 + 1.33333 NA intron (NR_126437, intron 3 of 5) LTR33|LTR|ERVL 73633 NR_126437 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 236.666-47 chr8 86037759 86038003 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31787 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 288.666 chr1 23283265 23283505 + 1.33333 NA non-coding (NR_110616, exon 2 of 2) non-coding (NR_110616, exon 2 of 2) 2133 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 240-71 chr4 178113874 178114180 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -206091 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 189.333-201 chr8 14371052 14371315 + 1.33333 NA intron (NM_001322881, intron 2 of 6) intron (NM_001322881, intron 2 of 6) 482327 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 182-9 chr1 119640015 119640189 + 1.33333 NA intron (NM_001080470, intron 1 of 2) intron (NM_001080470, intron 1 of 2) 8164 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 260.666-4 chr10 31958255 31958570 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -29536 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 253-73 chr8 103863380 103863677 + 1.33333 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) L1PB4|LINE|L1 44308 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 183.666-16 chr3 142365968 142366122 + 1.33333 NA intron (NM_019001, intron 27 of 41) MIRc|SINE|MIR 81992 NM_019001 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 197.666-33 chr2 107363877 107364089 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14458 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 262.666-25 chr7 119341843 119342155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 565376 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 346.333-27 chr5 104654624 104654917 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -444704 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 282.999-4 chr12 70227232 70227504 + 1.33333 NA intron (NR_120461, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -15662 NM_001199302 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 163.666-4 chr13 53294361 53294505 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -142533 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 315.666-14 chr5 96890703 96891024 + 1.33333 NA intron (NM_001329229, intron 4 of 17) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 14924 NM_001130140 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 220-31 chr12 86340733 86341015 + 1.33333 NA intron (NM_001351286, intron 3 of 7) intron (NM_001351286, intron 3 of 7) -83575 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 218-75 chr3 72314012 72314228 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 132503 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 205-108 chr9 35348664 35348948 + 1.33333 NA intron (NM_001371188, intron 1 of 29) MIRc|SINE|MIR 6910 NM_001371187 128.667-172 chr7 133566259 133566398 + 1.33333 NA intron (NM_021807, intron 9 of 17) intron (NM_021807, intron 9 of 17) 258560 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 395-14 chr20 43830759 43831143 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -63767 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 305.333-72 chr8 107947149 107947448 + 1.33333 NA intron (NM_001282863, intron 4 of 4) intron (NM_001282863, intron 4 of 4) 134641 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 231.999-3 chr18 6721400 6721600 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8216 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 197-78 chr4 13579073 13579309 + 1.33333 NA intron (NM_148894, intron 22 of 25) intron (NM_148894, intron 22 of 25) -31367 NR_015450 285548 Hs.529284 NR_015450 LINC01096 - long intergenic non-protein coding RNA 1096 ncRNA 320.999 chr10 20815426 20815829 + 1.33333 NA exon (NM_006393, exon 22 of 28) exon (NM_006393, exon 22 of 28) 81975 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 472.333-3 chr5 16318472 16318954 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 122389 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 224.333-8 chr1 166623684 166623944 + 1.33333 NA intron (NR_002925, intron 6 of 6) intron (NR_002925, intron 6 of 6) 19898 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 268.333-57 chr8 140070055 140070474 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L1ME4c|LINE|L1 30271 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 203.333-203 chr5 14985534 14985825 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -113901 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 441.333-10 chr8 128988005 128988483 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22243 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 201.667-44 chr16 65352105 65352406 + 1.33333 NA intron (NR_027755, intron 7 of 8) intron (NR_027755, intron 7 of 8) -175682 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 287.666-2 chr1 56981299 56981714 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15366 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 206-119 chr3 194742576 194742745 + 1.33333 NA intron (NR_037891, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 26049 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 176.333-156 chr7 48320307 48320535 + 1.33333 NA intron (NM_152701, intron 27 of 61) MER57E1|LTR|ERV1 148963 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 217.333-159 chr8 143197625 143197793 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -15509 NM_001301772 338328 Hs.426410 NM_178172 ENSG00000277494 GPIHBP1 GPI-HBP1|HYPL1D glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1 protein-coding 241.333-66 chr3 25015831 25016048 + 1.33333 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) intron (NM_001290216, intron 2 of 10) 186616 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 249.333-45 chr18 12861594 12862003 + 1.33333 NA intron (NM_080423, intron 1 of 8) intron (NM_080423, intron 1 of 8) -20836 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 272.333-38 chr20 55445870 55446206 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18841 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 247.666-3 chr10 23727345 23727587 + 1.33333 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) AluSx|SINE|Alu 32739 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 212-37 chr12 45660027 45660269 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 67773 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 204.666-78 chr6 24795905 24796168 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2881 NM_001282492 101928603 Hs.635133 NM_001282492 ENSG00000260286 ARMH2 C6orf229 armadillo like helical domain containing 2 protein-coding 204.666-28 chr13 52851160 52851628 + 1.33333 NA Intergenic CpG -2754 NM_032949 5100 Hs.19492 NM_002590 ENSG00000136099 PCDH8 ARCADLIN|PAPC protocadherin 8 protein-coding 206.667-41 chr14 92594711 92594991 + 1.33333 NA intron (NM_024832, intron 3 of 9) intron (NM_024832, intron 3 of 9) 18617 NM_001319987 79890 Hs.326822 NM_024832 ENSG00000100599 RIN3 - Ras and Rab interactor 3 protein-coding 198.667-131 chr3 175213468 175213719 + 1.33333 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) 57503 NR_046713 100874244 Hs.581176 NR_046713 NAALADL2-AS2 - NAALADL2 antisense RNA 2 ncRNA 204.333-98 chr2 77942502 77942671 + 1.33333 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 12440 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 187.666-21 chr3 191563847 191564016 + 1.33333 NA intron (NR_120606, intron 4 of 6) intron (NR_120606, intron 4 of 6) 102768 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 220.999 chr1 40493873 40494074 + 1.33333 NA intron (NM_001320178, intron 5 of 5) intron (NM_001320178, intron 5 of 5) -14746 NM_001346949 64789 Hs.59584 NM_022774 ENSG00000164002 EXO5 C1orf176|DEM1|Exo V|hExo5 exonuclease 5 protein-coding 231.666-7 chr13 47530591 47530903 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 401875 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 227-4 chr1 199452249 199452621 + 1.33333 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 303837 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 195.333-208 chr7 92396728 92397011 + 1.33333 NA intron (NM_019004, intron 18 of 19) intron (NM_019004, intron 18 of 19) 40445 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 189.666-24 chr2 240542654 240542883 + 1.33333 NA intron (NR_148698, intron 3 of 5) LOR1-int|LTR|ERV1 15220 NM_001282781 51281 Hs.656615 NM_016552 ENSG00000144504 ANKMY1 ZMYND13 ankyrin repeat and MYND domain containing 1 protein-coding 205.333-253 chr8 130203441 130203627 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) intron (NM_001362925, intron 5 of 29) 92999 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 217.333 chr1 41814668 41814879 + 1.33333 NA intron (NM_024503, intron 1 of 8) intron (NM_024503, intron 1 of 8) 104149 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 237.667-70 chr6 51982910 51983405 + 1.33333 NA intron (NM_138694, intron 35 of 66) intron (NM_138694, intron 35 of 66) 104456 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 307.333-7 chr1 204216251 204216695 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2485 NM_198447 127845 Hs.532401 NM_198447 ENSG00000174567 GOLT1A CGI-141|GOT1|HMFN1187|YMR292W|hGOT1b golgi transport 1A protein-coding 354.666-13 chr3 197910671 197910984 + 1.33333 NA intron (NM_001323029, intron 9 of 11) AluSx|SINE|Alu 39098 NM_001323027 84223 Hs.591675 NM_032263 ENSG00000114473 IQCG CFAP122|DRC9 IQ motif containing G protein-coding 196-190 chr8 137173775 137174014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 239694 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 198-173 chr7 77325196 77325478 + 1.33333 NA intron (NR_146937, intron 23 of 31) intron (NR_146937, intron 23 of 31) -89861 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 200.666-92 chr4 134534675 134534843 + 1.33333 NA intron (NR_147155, intron 3 of 3) intron (NR_147155, intron 3 of 3) 110891 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 203.333-238 chr7 649282 649547 + 1.33333 NA intron (NM_001164760, intron 4 of 10) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 46016 NR_110055 101926963 Hs.521338 NR_110054 LOC101926963 - uncharacterized LOC101926963 ncRNA 183-13 chr10 60186036 60186220 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 18 of 43) intron (NM_001204403, intron 18 of 43) -45112 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 267.666-8 chr2 13174432 13174707 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -167556 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 205.333-110 chr19 28682606 28682878 + 1.33333 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 44952 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 168-110 chr8 9584668 9584869 + 1.33333 NA intron (NM_003747, intron 2 of 26) intron (NM_003747, intron 2 of 26) 28856 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 190-2 chr1 72074365 72074543 + 1.33333 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) 208085 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 186.333-105 chr3 118248086 118248328 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -393561 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 218.667-107 chr8 89290982 89291296 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 466572 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 376-8 chr17 35165093 35165581 + 1.33333 NA intron (NM_001033576, intron 9 of 19) intron (NM_001033576, intron 9 of 19) 17073 NM_001308281 146862 Hs.379636 NM_173167 ENSG00000141161 UNC45B CMYA4|CTRCT43|SMUNC45|UNC-45B|UNC45 unc-45 myosin chaperone B protein-coding 277-45 chr5 16046034 16046266 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 110968 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 161.333-248 chr6 121124882 121125168 + 1.33333 NA intron (NR_104452, intron 30 of 35) L1M1|LINE|L1 209455 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 244.667-73 chr4 103507527 103507864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 82653 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 186.666-31 chr21 17922561 17922706 + 1.33333 NA intron (NM_001204177, intron 1 of 4) intron (NM_001204177, intron 1 of 4) 5293 NM_001204175 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 256.333-41 chr2 44557683 44558019 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 195904 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 275.333-15 chr12 69125915 69126461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -113381 NM_001300947 11052 Hs.369606 NM_007007 ENSG00000111605 CPSF6 CFIM|CFIM68|CFIM72|HPBRII-4|HPBRII-7 cleavage and polyadenylation specific factor 6 protein-coding 213.333-216 chr8 130571185 130571484 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -127660 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 183-95 chr7 14323942 14324131 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) intron (NM_001350717, intron 22 of 24) -332611 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 184-103 chr7 38838577 38838772 + 1.33333 NA intron (NM_014396, intron 4 of 28) intron (NM_014396, intron 4 of 28) 70517 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 226.333-24 chr12 30614052 30614338 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63049 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 398.667-7 chr3 84733200 84733669 + 1.33333 NA intron (NR_033860, intron 11 of 20) intron (NR_033860, intron 11 of 20) 136141 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 198-55 chr15 38654962 38655197 + 1.33333 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -41519 NR_160786 293.333-6 chr12 14199966 14200237 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -165531 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 281.333-34 chr2 167767266 167767591 + 1.33333 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -51244 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 409.333-7 chr2 43900925 43901557 + 1.33333 NA intron (NM_133259, intron 32 of 37) intron (NM_133259, intron 32 of 37) 62270 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 314-20 chr2 80905695 80906059 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 561069 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 455.332 chr4 30500769 30501117 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -219426 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 215.666-42 chr8 57522269 57522440 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 178567 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 208.666-84 chr4 186743998 186744237 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20261 NM_005245 2195 Hs.481371 NM_005245 ENSG00000083857 FAT1 CDHF7|CDHR8|FAT|ME5|hFat1 FAT atypical cadherin 1 protein-coding 186-7 chr1 207975869 207976089 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -64854 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 215.333-20 chr10 20981857 20982173 + 1.33333 NA intron (NM_001173484, intron 3 of 6) intron (NM_001173484, intron 3 of 6) -84413 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 200.667-145 chr7 49839352 49839608 + 1.33333 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) intron (NR_136188, intron 2 of 3) 64147 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 361.666-7 chr21 29036226 29036684 + 1.33333 NA intron (NM_001001992, intron 5 of 17) intron (NM_001001992, intron 5 of 17) 11787 NM_006447 10600 Hs.99819 NM_006447 ENSG00000156256 USP16 UBP-M|UBPM ubiquitin specific peptidase 16 protein-coding 172-22 chr11 20779244 20779474 + 1.33333 NA intron (NM_201551, intron 2 of 18) LTR102_Mam|LTR|ERVL 109773 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 199.333-162 chr20 11486723 11486952 + 1.33333 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -213454 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 285.333-44 chr3 122188258 122188614 + 1.33333 NA intron (NM_001178065, intron 1 of 6) intron (NM_001178065, intron 1 of 6) 4109 NM_001178065 846 Hs.435615 NM_000388 ENSG00000036828 CASR CAR|EIG8|FHH|FIH|GPRC2A|HHC|HHC1|HYPOC1|NSHPT|PCAR1|hCasR calcium sensing receptor protein-coding 200-173 chr8 136784814 136785054 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1MA5A|LINE|L1 254136 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 212-11 chr1 78779485 78779653 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 129738 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 268-40 chr4 12021918 12022282 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -201351 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 165-87 chr6 67390039 67390206 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -665229 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 170-99 chr5 131694319 131694470 + 1.33333 NA intron (NM_133372, intron 11 of 17) L1MC2|LINE|L1 -59165 NM_001164390 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 150-29 chr12 24827923 24828124 + 1.33333 NA intron (NM_001178091, intron 9 of 9) AluJr|SINE|Alu 74199 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 145.333-280 chr7 83420282 83420453 + 1.33333 NA intron (NM_001178129, intron 4 of 16) L1PREC2|LINE|L1 221064 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 230.666-51 chr9 28325745 28325924 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) MER67D|LTR|ERV1 393471 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 242-12 chr10 23391751 23392088 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -47122 NM_001365862 256815 Hs.132442 NM_153714 ENSG00000179133 C10orf67 C10orf115|LINC01552 chromosome 10 open reading frame 67 protein-coding 128.667-182 chr8 79612359 79612504 + 1.33333 NA intron (NM_007029, intron 1 of 4) intron (NM_007029, intron 1 of 4) 1314 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 171.333-207 chrX 125903068 125903240 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -206608 NR_110409 101928495 Hs.545998 NR_110409 ENSG00000237208 LOC101928495 - uncharacterized LOC101928495 ncRNA 118.667-105 chr2 135524686 135524852 + 1.33333 NA intron (NM_032143, intron 1 of 20) L1M5|LINE|L1 5816 NM_001286568 84083 Hs.658422 NM_032143 ENSG00000121988 ZRANB3 4933425L19Rik|AH2 zinc finger RANBP2-type containing 3 protein-coding 578.666 chr14 71160838 71161653 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -159231 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 280.333-9 chr12 126883145 126883442 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8603 NR_033970 440117 Hs.127100 NR_033970 ENSG00000249873 LINC02372 - long intergenic non-protein coding RNA 2372 ncRNA 204.667-75 chr2 148571726 148571973 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -72902 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 170.666-8 chr14 45673858 45674026 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 41660 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 201.667-104 chr6 54946154 54946401 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 99506 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 206-149 chr5 150058445 150058742 + 1.33333 NA intron (NR_109969, intron 13 of 19) intron (NR_109969, intron 13 of 19) 28047 NR_109969 1436 Hs.586219 NM_005211 ENSG00000182578 CSF1R C-FMS|CD115|CSF-1R|CSFR|FIM2|FMS|HDLS|M-CSF-R colony stimulating factor 1 receptor protein-coding 146-114 chr5 163589662 163589871 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84147 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 217.333-25 chr10 76453286 76453588 + 1.33333 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -434607 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 260.666-28 chr4 60922107 60922419 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_039652) promoter-TSS (NR_039652) -356 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 202.666-30 chr14 32896042 32896197 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -42760 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 197.667-34 chr13 33100988 33101327 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 84734 NM_004795 9365 Hs.524953 NM_004795 ENSG00000133116 KL HFTC3 klotho protein-coding 208-19 chr10 25214501 25214702 + 1.33333 NA intron (NM_020752, intron 1 of 10) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -38325 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 208-125 chr4 94687997 94688166 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 69452 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 276.666-27 chr4 182497491 182497750 + 1.33333 NA intron (NM_001080477, intron 3 of 27) intron (NM_001080477, intron 3 of 27) 254218 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 251-48 chr3 179210728 179210966 + 1.33333 NA intron (NM_006218, intron 9 of 20) L2a|LINE|L2 40768 NM_014407 27094 Hs.591285 NM_014407 ENSG00000171121 KCNMB3 BKBETA3|HBETA3|K(VCA)BETA-3|KCNMB2|KCNMBL|SLO-BETA-3|SLOBETA3 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 3 protein-coding 365.333-24 chr9 26392262 26392629 + 1.33333 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 325770 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 336.666-9 chr14 58078140 58078526 + 1.33333 NA intron (NM_001001872, intron 5 of 7) L3|LINE|CR1 73880 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 259.333-9 chr1 213844321 213844681 + 1.33333 NA intron (NR_037850, intron 4 of 5) intron (NR_037850, intron 4 of 5) -80248 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 146.666-9 chr4 36966470 36966633 + 1.33333 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -35228 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 276.666-30 chr6 34775710 34776035 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -16211 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 280.333-38 chr6 136600703 136601063 + 1.33333 NA intron (NM_005923, intron 21 of 29) intron (NM_005923, intron 21 of 29) -28231 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 210-21 chr10 101477453 101477640 + 1.33333 NA intron (NM_003939, intron 2 of 13) FLAM_C|SINE|Alu 110711 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 387.332 chr5 56748836 56749139 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23884 NM_001365184 105378979 NM_001365184 LOC105378979 - growth/differentiation factor 3 protein-coding 672 chr7 70826145 70826956 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -305594 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 214.999-12 chr8 111529219 111529380 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 152660 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 330.666-19 chr5 26044423 26044755 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 853636 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 256-63 chr4 15006478 15006790 + 1.33333 NA intron (NR_125911, intron 4 of 5) intron (NR_125911, intron 4 of 5) 4153 NM_182646 132864 Hs.656937 NM_182485 ENSG00000137449 CPEB2 CPE-BP2|CPEB-2|hCPEB-2 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2 protein-coding 219-37 chr17 63717000 63717245 + 1.33333 NA intron (NM_153335, intron 2 of 8) intron (NM_153335, intron 2 of 8) 16784 NR_046273 729683 Hs.534931 NR_046273 LOC729683 - uncharacterized LOC729683 ncRNA 247.333-81 chr8 33120068 33120406 + 1.33333 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 352909 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 213.333-9 chr1 110163586 110163783 + 1.33333 NA intron (NM_001010898, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 13190 NM_001010898 388662 Hs.128382 NM_001010898 ENSG00000197106 SLC6A17 MRT48|NTT4 solute carrier family 6 member 17 protein-coding 443.333-9 chr8 119375020 119375436 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -41218 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 112.333-162 chr3 77171991 77172118 + 1.33333 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 74042 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 195.333-130 chr20 14102561 14102765 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 107147 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 184.666-37 chr7 29426354 29426542 + 1.33333 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) intron (NM_001293072, intron 6 of 12) -53264 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 250-26 chr14 46267516 46267875 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) 203536 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 205-82 chr6 140524764 140524934 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -158965 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 355.666-10 chr5 39112659 39113174 + 1.33333 NA intron (NM_001243093, intron 16 of 18) intron (NM_001243093, intron 16 of 18) -38517 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 212.667-104 chr5 57699102 57699405 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48593 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 198-197 chr9 123207783 123208060 + 1.33333 NA intron (NR_033234, intron 1 of 18) L1ME3Cz|LINE|L1 60665 NR_033234 55342 Hs.287659 NM_018387 ENSG00000165209 STRBP HEL162|ILF3L|SPNR|p74 spermatid perinuclear RNA binding protein protein-coding 316-43 chr6 39680255 39680664 + 1.33333 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) intron (NM_001289020, intron 3 of 21) 44949 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 215.666-46 chr9 37871782 37872015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32229 NM_033412 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 143.333-161 chr21 18626165 18626333 + 1.33333 NA intron (NR_109925, intron 2 of 3) intron (NR_109925, intron 2 of 3) 59915 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 279.666-10 chr4 172723836 172724106 + 1.33333 NA intron (NR_125894, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 2907 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 200.333-77 chr2 146873037 146873309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 286116 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 278-24 chr20 23681284 23681639 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 7564 NM_001899 1472 Hs.654549 NM_001899 ENSG00000101441 CST4 - cystatin S protein-coding 283-36 chr8 75440700 75441111 + 1.33333 NA intron (NM_001330561, intron 1 of 11) AluJr|SINE|Alu 33256 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 212.333-56 chr18 32473200 32473361 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2398 NM_001242409 64762 Hs.444314 NM_022751 ENSG00000141441 GAREM1 C18orf11|FAM59A|GAREM|Gm944 GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 1 protein-coding 273.999-5 chr9 26141413 26141755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 74909 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 174.667-58 chr15 35458597 35458797 + 1.33333 NA intron (NM_080650, intron 3 of 8) intron (NM_080650, intron 3 of 8) -86333 NR_037507 100500904 NR_037507 ENSG00000265102 MIR3942 - microRNA 3942 ncRNA 259-16 chr15 94112665 94112902 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -4845 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 256.666-50 chr9 3117162 3117452 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -64282 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 306-27 chr2 217327266 217327604 + 1.33333 NA intron (NR_026597, intron 9 of 12) L2c|LINE|L2 44702 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 282.666-29 chr9 81727223 81727507 + 1.33333 NA intron (NR_109772, intron 1 of 3) L1ME4a|LINE|L1 37652 NR_109772 101927502 Hs.528628 NR_109772 ENSG00000233926 LOC101927502 - uncharacterized LOC101927502 ncRNA 216.666-58 chr5 172208178 172208383 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 14108 NM_001171183 285588 Hs.716824 NM_001171183 ENSG00000214360 EFCAB9 - EF-hand calcium binding domain 9 protein-coding 202-65 chr17 63613388 63613601 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -8923 NM_203351 4215 Hs.29282 NM_002401 ENSG00000198909 MAP3K3 MAPKKK3|MEKK3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 protein-coding 206-56 chr15 61335897 61336146 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -106719 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 261-9 chr10 23662954 23663275 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -31613 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 165.333-12 chr1 114690089 114690309 + 1.33333 NA intron (NM_001172626, intron 1 of 14) MIRc|SINE|MIR 5419 NM_000036 270 Hs.89570 NM_000036 ENSG00000116748 AMPD1 MAD|MADA|MMDD adenosine monophosphate deaminase 1 protein-coding 163.333-150 chr2 114978015 114978169 + 1.33333 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -86481 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 208.333-21 chr11 133096470 133096695 + 1.33333 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) L1MC1|LINE|L1 -152814 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 176.666-30 chr6 142236520 142236683 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65318 NM_001032394 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 336-14 chr2 171549021 171549356 + 1.33333 NA intron (NM_001256909, intron 2 of 3) AluSz6|SINE|Alu 26714 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 201.333-116 chr15 75546777 75546938 + 1.33333 NA intron (NM_002833, intron 1 of 12) L3|LINE|CR1 32458 NM_002833 5780 Hs.445775 NM_002833 ENSG00000169410 PTPN9 MEG2|PTPMEG2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 9 protein-coding 169.333-74 chr14 45714692 45714876 + 1.33333 NA intron (NR_146546, intron 1 of 2) HERVK14-int|LTR|ERVK 818 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 372.332 chr9 19710424 19710704 + 1.33333 NA intron (NM_020344, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 76455 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 399.333-3 chr10 34172994 34173511 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -400572 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 114.333-151 chr3 140849709 140849871 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92046 NM_018155 55186 Hs.144130 NM_018155 ENSG00000114120 SLC25A36 PNC2 solute carrier family 25 member 36 protein-coding 231.333-17 chr10 60384458 60384666 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) MIR|SINE|MIR 5313 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 202-75 chr2 21704857 21705022 + 1.33333 NA intron (NR_038837, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 5713 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 317.333-30 chr5 45292621 45292955 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 6 of 7) intron (NM_021072, intron 6 of 7) 403592 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 272.333-19 chr15 77727070 77727409 + 1.33333 NA intron (NM_001301192, intron 2 of 4) L1MB2|LINE|L1 -6488 NM_001301197 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 206-199 chrX 143409484 143409642 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 107912 NM_001009609 139067 Hs.447320 NM_001009609 ENSG00000189252 SPANXN3 CT11.8|SPANX-N3 SPANX family member N3 protein-coding 211.333-189 chr5 112582279 112582443 + 1.33333 NA Intergenic HERVL32-int|LTR|ERVL -46075 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 187.333-197 chr8 71751981 71752205 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -91030 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 184-36 chr16 25621274 25621475 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70585 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 204-63 chr15 52648640 52648796 + 1.33333 NA intron (NM_019600, intron 2 of 12) intron (NM_019600, intron 2 of 12) 3322 NM_001286495 56204 Hs.152385 NM_019600 ENSG00000047346 FAM214A KIAA1370 family with sequence similarity 214 member A protein-coding 230.333-109 chr7 73730346 73730601 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -4596 NR_026690 171022 Hs.650513 NR_026690 ABHD11-AS1 LINC00035|NCRNA00035|WBSCR26 ABHD11 antisense RNA 1 (tail to tail) ncRNA 374.666 chr1 18929706 18930101 + 1.33333 NA intron (NM_001136265, intron 1 of 8) intron (NM_001136265, intron 1 of 8) 26773 NM_001136265 126917 Hs.466625 NM_001136265 ENSG00000169991 IFFO2 - intermediate filament family orphan 2 protein-coding 219.333-30 chr11 4932782 4933011 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8557 NM_001005237 79324 Hs.554541 NM_001005237 ENSG00000278870 OR51G1 OR11-29|OR51G3P olfactory receptor family 51 subfamily G member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 213-65 chr4 96987317 96987519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -379508 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 299.999-2 chr15 78019261 78019722 + 1.33333 NA intron (NM_144572, intron 6 of 12) intron (NM_144572, intron 6 of 12) -25266 NR_026998 91450 Hs.406766 NR_026998 LOC91450 - uncharacterized LOC91450 ncRNA 272.333-63 chr7 83782591 83782816 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133564 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 230-21 chr13 114105553 114105823 + 1.33333 NA intron (NM_001320821, intron 1 of 25).2 intron (NM_001320821, intron 1 of 25).2 26935 NM_007368 22821 Hs.593075 NM_007368 ENSG00000185989 RASA3 GAP1IP4BP|GAPIII RAS p21 protein activator 3 protein-coding 192.667 chr1 28999828 29000059 + 1.33333 NA intron (NM_001166007, intron 4 of 17) AluJb|SINE|Alu 85367 NM_001166006 2035 Hs.175437 NM_004437 ENSG00000159023 EPB41 4.1R|EL1|HE erythrocyte membrane protein band 4.1 protein-coding 200-4 chr1 55017519 55017704 + 1.33333 NA TTS (NM_057176) TTS (NM_057176) 18678 NM_057176 7809 Hs.151291 NM_057176 ENSG00000162399 BSND BART|DFNB73 barttin CLCNK type accessory beta subunit protein-coding 316-17 chr15 86102615 86103057 + 1.33333 NA intron (NR_120368, intron 3 of 5) L1MA4A|LINE|L1 13881 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 134.333-106 chr22 10778067 10778238 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 183377 NR_132320 102723780 NR_132320 FRG1FP - FSHD region gene 1 family member F, pseudogene pseudo 265-30 chr2 52355370 52355794 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 10 of 10) intron (NR_135237, intron 10 of 10) -15066 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 231-37 chr20 4429348 4429680 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -180227 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 169.333-262 chr8 48503108 48503351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48338 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 154-150 chr9 27138796 27138954 + 1.33333 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) MER8|DNA|TcMar-Tigger 29734 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 243-37 chr2 231769540 231769738 + 1.33333 NA intron (NM_002601, intron 1 of 4) FRAM|SINE|Alu 11643 NR_110994 5147 Hs.516808 NM_002601 ENSG00000156973 PDE6D JBTS22|PDED phosphodiesterase 6D protein-coding 204-157 chr5 14789286 14789615 + 1.33333 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) 36562 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 183.333-166 chr8 123446624 123446835 + 1.33333 NA intron (NR_133926, intron 6 of 6) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 29955 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 177.333-104 chr3 15339240 15339416 + 1.33333 NA intron (NM_001018009, intron 1 of 8) L3|LINE|CR1 2052 NM_001018009 9467 Hs.257761 NM_004844 ENSG00000131370 SH3BP5 SAB|SH3BP-5 SH3 domain binding protein 5 protein-coding 291.999-8 chr7 36370021 36370286 + 1.33333 NA intron (NM_001100425, intron 2 of 6) intron (NM_001100425, intron 2 of 6) -2913 NM_001199706 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 130-27 chr12 105714497 105714652 + 1.33333 NA intron (NR_110111, intron 1 of 1) MIR3|SINE|MIR 7800 NR_110110 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 226.333-88 chr4 36958019 36958280 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43630 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 341.666-2 chr10 59975925 59976210 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -15154 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 349.999-5 chr4 173033269 173033764 + 1.33333 NA intron (NM_001034845, intron 12 of 12) intron (NM_001034845, intron 12 of 12) -135295 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 212.333-147 chr8 84459328 84459566 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 43963 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 201.666-13 chr13 112830012 112830197 + 1.33333 NA intron (NM_032189, intron 12 of 28) MIRb|SINE|MIR -75373 NR_046661 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 223.333-74 chr2 97883389 97883709 + 1.33333 NA intron (NM_015348, intron 4 of 40) intron (NM_015348, intron 4 of 40) 112399 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 204.333-134 chr3 190651146 190651300 + 1.33333 NA non-coding (NR_157353, exon 10 of 10) non-coding (NR_157353, exon 10 of 10) 137138 NM_001364879 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 214.666-59 chr6 27376690 27376903 + 1.33333 NA intron (NM_001322288, intron 1 of 3) AluSx3|SINE|Alu -1422 NR_024553 7754 Hs.8198 NR_002722 ZNF204P ZNF184-Lp|ZNF204|ZNF315P|b24o18.1 zinc finger protein 204, pseudogene pseudo 191.333-97 chr18 60294681 60294857 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 78006 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 322.333-27 chr7 46236704 46237089 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -315624 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 206-7 chr1 75762988 75763317 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001127328, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001127328, exon 12 of 12) -18139 NR_130749 1744 Hs.525459 NR_130749 DLSTP1 DLSTP dihydrolipoamide S-succinyltransferase pseudogene 1 pseudo 356.666-13 chr3 117037269 117037664 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 116035 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 188.333-84 chr2 235298381 235298533 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -195586 NM_014914 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 250-87 chr8 81178344 81178690 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -66449 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 410-4 chr1 229043389 229043838 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 131188 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 206-161 chr6 143857235 143857473 + 1.33333 NA exon (NM_032860, exon 5 of 11) exon (NM_032860, exon 5 of 11) -7120 NM_001013623 153918 Hs.121188 NM_001013623 ENSG00000118491 ZC2HC1B C6orf94|FAM164B|dJ468K18.5 zinc finger C2HC-type containing 1B protein-coding 355.333-12 chr18 29506396 29506818 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -792303 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 211.333-83 chr17 27138436 27138627 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -49290 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 407.333-10 chr14 52860137 52860599 + 1.33333 NA exon (NM_001135000, exon 14 of 15) exon (NM_001135000, exon 14 of 15) -68761 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 215.333-7 chr1 90444037 90444220 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -213622 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 176.666 chr1 85168566 85168722 + 1.33333 NA intron (NM_032184, intron 5 of 6) L1ME4a|LINE|L1 32372 NM_032184 84144 Hs.533853 NM_032184 ENSG00000097096 SYDE2 - synapse defective Rho GTPase homolog 2 protein-coding 239.666-27 chr8 15056958 15057339 + 1.33333 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 181283 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 206.666-41 chr14 73457597 73457873 + 1.33333 NA intron (NM_001320114, intron 1 of 11) intron (NM_001320114, intron 1 of 11) 845 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 271-33 chr4 30320253 30320516 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -399985 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 346-33 chr6 165472463 165472826 + 1.33333 NA intron (NM_006661, intron 4 of 22) intron (NM_006661, intron 4 of 22) -163039 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 133.333-47 chr13 83796965 83797114 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 85354 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 330-5 chr1 162902428 162902926 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -33862 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 190.667-15 chr10 49631398 49631656 + 1.33333 NA intron (NM_001142929, intron 7 of 14) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 17490 NM_001142934 1103 Hs.302002 NM_020549 ENSG00000070748 CHAT CHOACTASE|CMS1A|CMS1A2|CMS6 choline O-acetyltransferase protein-coding 340.999-4 chr14 46278130 46278474 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -193057 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 206.333-14 chr10 61911476 61911661 + 1.33333 NA intron (NM_032199, intron 2 of 9) intron (NM_032199, intron 2 of 9) 9869 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 179.667-123 chr6 153724168 153724401 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -286212 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 127.333-197 chr9 20273099 20273253 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 138062 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 193-92 chr8 120108458 120108657 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16545 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 234.666-54 chr9 30068670 30068925 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 339657 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 279.667-33 chr4 55866722 55867100 + 1.33333 NA intron (NM_001024924, intron 4 of 18) intron (NM_001024924, intron 4 of 18) 13261 NM_178237 55763 Hs.269665 NM_018261 ENSG00000090989 EXOC1 BM-102|SEC3|SEC3L1|SEC3P exocyst complex component 1 protein-coding 199.333-19 chr1 190431561 190431857 + 1.33333 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 44301 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 297.333-19 chr13 93833355 93833746 + 1.33333 NA intron (NR_046536, intron 4 of 6) intron (NR_046536, intron 4 of 6) 24923 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 212.667-29 chr12 54469758 54470051 + 1.33333 NA intron (NM_144594, intron 2 of 8) AluSg|SINE|Alu 3698 NM_144594 121355 Hs.524476 NM_144594 ENSG00000170627 GTSF1 Cue110|FAM112B gametocyte specific factor 1 protein-coding 180-120 chr9 77855959 77856127 + 1.33333 NA intron (NM_002072, intron 2 of 6) intron (NM_002072, intron 2 of 6) 175768 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 367.333-2 chr1 191133859 191134159 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 94489 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 200-30 chr11 15398436 15398623 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -245356 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 224-102 chr8 4234972 4235177 + 1.33333 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 759840 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 212.666-47 chr2 129370780 129370975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -96986 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 294-57 chr7 3819493 3819795 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -310041 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 230-11 chr10 125831094 125831417 + 1.33333 NA intron (NM_078468, intron 4 of 6) intron (NM_078468, intron 4 of 6) 7709 NM_078469 56647 Hs.370292 NM_016567 ENSG00000107949 BCCIP TOK-1|TOK1 BRCA2 and CDKN1A interacting protein protein-coding 214.666-68 chr7 112108043 112108212 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 98272 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 183.333-151 chr7 93742445 93742634 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 25611 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 164.666-16 chr7 103835485 103835686 + 1.33333 NA intron (NM_005045, intron 2 of 64) L1MC1|LINE|L1 153931 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 203.333-208 chr5 64261508 64261685 + 1.33333 NA intron (NM_001113561, intron 5 of 7) intron (NM_001113561, intron 5 of 7) 95753 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 279.333-13 chr10 71714077 71714321 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001168390, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001168390, exon 2 of 2) 5579 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 203.333-187 chr3 187617273 187617513 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 53001 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 167.333-247 chr7 86469621 86469837 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -174180 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 479.666 chr12 12293152 12293681 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26372 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 512.334 chr10 58629158 58629892 + 1.33333 NA intron (NM_001080512, intron 2 of 20) intron (NM_001080512, intron 2 of 20) -85490 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 154-46 chr13 73192178 73192395 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 133281 NM_001730 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 440-7 chr3 80831026 80831615 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 60616 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 198-94 chr2 88891520 88891681 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 79230 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 198.333-27 chr10 92918884 92919157 + 1.33333 NA intron (NM_001319200, intron 7 of 17) intron (NM_001319200, intron 7 of 17) 70500 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 168.666-7 chr15 72038666 72038829 + 1.33333 NA intron (NM_006901, intron 2 of 41) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -75511 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 429.333-7 chr7 87385577 87386109 + 1.33333 NA intron (NM_021151, intron 13 of 17) L1MA4|LINE|L1 40179 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 390.333-9 chr7 109497985 109498389 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 462026 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 184-28 chr14 66774718 66774874 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 267389 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 244.667 chr1 35033086 35033439 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -1317 NM_007167 9204 Hs.533986 NM_007167 ENSG00000163867 ZMYM6 Buster2|MYM|ZBED7|ZNF198L4|ZNF258 zinc finger MYM-type containing 6 protein-coding 192.666-13 chr11 102476652 102476830 + 1.33333 NA intron (NR_135076, intron 1 of 2) MER34-int|LTR|ERV1 9486 NR_135076 102723838 Hs.738066 NR_135076 ENSG00000255482 LOC102723838 - uncharacterized LOC102723838 ncRNA 210-14 chr1 214042927 214043142 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54501 NM_002763 5629 Hs.741808 NM_002763 ENSG00000117707 PROX1 - prospero homeobox 1 protein-coding 212.667-133 chr8 70377751 70378066 + 1.33333 NA intron (NM_001321703, intron 1 of 22) intron (NM_001321703, intron 1 of 22) 25482 NM_001321713 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 192.666-45 chr3 152160352 152160516 + 1.33333 NA intron (NR_136178, intron 2 of 2) intron (NR_136178, intron 2 of 2) 44995 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 250.666-43 chr8 132087728 132087953 + 1.33333 NA intron (NM_001145095, intron 8 of 15) intron (NM_001145095, intron 8 of 15) 17425 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 208-121 chr4 48826495 48826731 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -4430 NM_001079841 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 359-20 chr8 84615183 84615535 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) -90568 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 380.667-11 chr22 38076691 38077167 + 1.33333 NA Intergenic AluYj4|SINE|Alu 6234 NM_013356 23539 Hs.745256 NM_013356 ENSG00000100156 SLC16A8 MCT3|REMP solute carrier family 16 member 8 protein-coding 249.333-57 chr2 130804653 130804878 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -32149 NM_001367493 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 226-85 chr7 14243100 14243303 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) intron (NM_001350717, intron 22 of 24) -251776 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 308.333-23 chr20 56334350 56334767 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24416 NM_080821 116151 Hs.143736 NM_080821 ENSG00000124098 FAM210B 5A3|C20orf108|dJ1167H4.1 family with sequence similarity 210 member B protein-coding 344.666-16 chr2 84143993 84144297 + 1.33333 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -146537 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 202-148 chr5 101885546 101885726 + 1.33333 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger 410648 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 248.666-19 chr17 58889662 58890105 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 134014 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 195.333-198 chr7 11502678 11502832 + 1.33333 NA intron (NM_015204, intron 6 of 26) L1PA14|LINE|L1 329443 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 182-24 chr13 57960431 57960586 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -205319 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 236-18 chr13 67306776 67307100 + 1.33333 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -65449 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 350.667 chr1 74886674 74887141 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -153499 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 196.333-112 chr3 107300185 107300444 + 1.33333 NA intron (NR_028302, intron 2 of 3) MER110-int|LTR|ERV1 59622 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 194.333-53 chr17 40141767 40142029 + 1.33333 NA intron (NM_007359, intron 3 of 13) intron (NM_007359, intron 3 of 13) 1361 NM_007359 22794 Hs.743287 NM_007359 ENSG00000108349 CASC3 BTZ|MLN51 CASC3 exon junction complex subunit protein-coding 189.333-107 chr2 184978003 184978163 + 1.33333 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 188989 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 210.666-36 chr14 71958656 71958913 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 25257 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 259.333-72 chr4 65794003 65794213 + 1.33333 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -123613 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 199-39 chr19 29993544 29993740 + 1.33333 NA intron (NM_001252641, intron 4 of 10) intron (NM_001252641, intron 4 of 10) 51403 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 228.333-105 chr9 9973602 9973780 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 4 of 45) intron (NM_002839, intron 4 of 45) 174299 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 219.333-170 chr7 57162347 57162563 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 17701 NR_030766 642006 Hs.562648 NR_030766 GUSBP10 - GUSB pseudogene 10 pseudo 203.333-256 chr8 56826784 56827070 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 166940 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 351-17 chr5 179935764 179936064 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -28017 NM_198868 23061 Hs.155829 NM_015043 ENSG00000197226 TBC1D9B GRAMD9B TBC1 domain family member 9B protein-coding 191.666-22 chr7 7980747 7980908 + 1.33333 NA intron (NM_138426, intron 1 of 7) intron (NM_138426, intron 1 of 7) 12031 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 351.333-24 chr4 134255967 134256275 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -54332 NM_001363585 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 324.333-31 chr4 127323043 127323308 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -309782 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 210-101 chr4 31635501 31635716 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 129064 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 298-70 chr6 46152887 46153168 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 17953 NM_001290072 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 314.999-3 chr3 101327126 101327389 + 1.33333 NA intron (NM_020654, intron 23 of 23) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -6682 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 205.333-76 chr14 72291492 72291674 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L2b|LINE|L2 -225237 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 216-107 chr6 51987261 51987546 + 1.33333 NA intron (NM_138694, intron 35 of 66) MIR|SINE|MIR 100210 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 195-81 chr4 118763496 118763793 + 1.33333 NA intron (NM_014822, intron 10 of 22) intron (NM_014822, intron 10 of 22) 72482 NM_001318066 9871 Hs.189641 NM_014822 ENSG00000150961 SEC24D CLCRP2 SEC24 homolog D, COPII coat complex component protein-coding 184-57 chr2 240928015 240928162 + 1.33333 NA intron (NM_001351305, intron 5 of 31) L1MEd|LINE|L1 21752 NM_001351305 728763 Hs.647892 NM_001351305 ENSG00000226321 CROCC2 - ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2 protein-coding 305-30 chr7 84017509 84017934 + 1.33333 NA intron (NM_006080, intron 6 of 16) intron (NM_006080, intron 6 of 16) 177068 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 259.666-23 chr20 14586912 14587255 + 1.33333 NA intron (NR_104193, intron 1 of 4) L1MEh|LINE|L1 32699 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 233.333-53 chr18 67731886 67732083 + 1.33333 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) 82838 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 268-54 chr7 11405845 11406224 + 1.33333 NA intron (NM_015204, intron 21 of 26) intron (NM_015204, intron 21 of 26) 426164 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 233.333-83 chr3 58737764 58738089 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -71152 NM_138805 131177 Hs.61265 NM_138805 ENSG00000198643 FAM3D EF7|OIT1 family with sequence similarity 3 member D protein-coding 199.333-188 chr3 145287901 145288056 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 781207 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 210-160 chrX 123351517 123351703 + 1.33333 NA intron (NM_007325, intron 4 of 15) intron (NM_007325, intron 4 of 15) 167332 NM_007325 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 208.666-62 chr2 188615970 188616188 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 174044 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 197.666-29 chr19 3039772 3039927 + 1.33333 NA intron (NM_001144761, intron 2 of 19) intron (NM_001144761, intron 2 of 19) 7786 NM_001144761 7089 Hs.332173 NM_003260 ENSG00000065717 TLE2 ESG|ESG2|GRG2 TLE family member 2, transcriptional corepressor protein-coding 208.667-134 chr8 8794769 8795059 + 1.33333 NA intron (NM_004225, intron 2 of 2) intron (NM_004225, intron 2 of 2) 92977 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 203.666-19 chr12 68044693 68044850 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55326 NR_104125 100885789 Hs.439832 NR_104124 ENSG00000255733 IFNG-AS1 GS1-410F4.2|NEST|Tmevpg1 IFNG antisense RNA 1 ncRNA 202-72 chr18 76301771 76302025 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 92388 NR_146507 105372207 Hs.303880 NR_146507 LINC01893 - long intergenic non-protein coding RNA 1893 ncRNA 372-23 chr8 125257662 125258131 + 1.33333 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) L2c|LINE|L2 166036 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 137.333-86 chr2 13076201 13076371 + 1.33333 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -69273 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 207.333-111 chr16 72032984 72033157 + 1.33333 NA Intergenic tRNA-Glu-GAG_|tRNA|tRNA -21435 NM_005143 3240 Hs.513711 NM_005143 ENSG00000257017 HP BP|HP2ALPHA2|HPA1S haptoglobin protein-coding 227-58 chr8 88752072 88752376 + 1.33333 NA Intergenic LTR2752|LTR|ERV1 -424741 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 213.666-16 chr15 69454016 69454208 + 1.33333 NA intron (NM_001003, intron 2 of 3) AluYm1|SINE|Alu 1294 NM_213725 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 201-31 chr12 120036325 120036513 + 1.33333 NA intron (NR_147894, intron 3 of 8) intron (NR_147894, intron 3 of 8) 46575 NR_147892 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 114.667-12 chr1 179044805 179045010 + 1.33333 NA intron (NM_001324310, intron 2 of 7) L1MC1|LINE|L1 18783 NM_001324311 9917 Hs.5737 NM_014864 ENSG00000116199 FAM20B gxk1 FAM20B glycosaminoglycan xylosylkinase protein-coding 229.666 chr1 57046180 57046359 + 1.33333 NA intron (NM_001353986, intron 9 of 14) MIRb|SINE|MIR -80129 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 207 chr1 12592054 12592309 + 1.33333 NA intron (NM_004753, intron 1 of 5) intron (NM_004753, intron 1 of 5) 4432 NM_001324370 9249 Hs.289347 NM_004753 ENSG00000162496 DHRS3 DD83.1|RDH17|Rsdr1|SDR1|SDR16C1|retSDR1 dehydrogenase/reductase 3 protein-coding 209-110 chr7 38681845 38682061 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5136 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 206.666-85 chr4 54686260 54686455 + 1.33333 NA intron (NM_000222, intron 1 of 20) intron (NM_000222, intron 1 of 20) 28429 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 214.666-41 chr20 52369360 52369566 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -177478 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 304-26 chr2 14990851 14991150 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 358283 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 271-39 chr6 117732337 117732751 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 57075 NM_138459 116150 Hs.289008 NM_138459 ENSG00000153989 NUS1 C6orf68|CDG1AA|MGC:7199|MRD55|NgBR|TANGO14 NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit protein-coding 216.667-86 chr5 115011488 115011804 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 158262 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 253.333-110 chr8 87640735 87641137 + 1.33333 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 233079 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 253.333-49 chr19 28243210 28243537 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -363315 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 186-78 chr5 4566484 4566742 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -206868 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 172-103 chr7 36384302 36384554 + 1.33333 NA intron (NM_001100425, intron 1 of 6) MIR1_Amn|SINE|MIR -5434 NM_018685 54443 Hs.62180 NM_018685 ENSG00000011426 ANLN FSGS8|Scraps|scra anillin actin binding protein protein-coding 331.333-13 chr12 3066125 3066632 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10977 NM_001168320 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 219.666-22 chr17 72282837 72283236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59775 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 433.667 chr10 24151537 24152158 + 1.33333 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) MIR3|SINE|MIR -56944 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 161.333-250 chr6 126866963 126867169 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -251605 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 203.333-111 chr18 5794956 5795161 + 1.33333 NA non-coding (NR_038839, exon 5 of 5) non-coding (NR_038839, exon 5 of 5) -45637 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 281.333-55 chr6 45405313 45405623 + 1.33333 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) MER63A|DNA|hAT-Blackjack -16807 NM_001369405 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 206.666-100 chr5 107531699 107531876 + 1.33333 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 139150 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 222-43 chr2 55857064 55857293 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 66604 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 244.333-7 chr1 177963764 177963978 + 1.33333 NA intron (NR_151492, intron 14 of 22) intron (NR_151492, intron 14 of 22) 6051 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 181.667-64 chr2 38504522 38504816 + 1.33333 NA intron (NR_110259, intron 1 of 4) intron (NR_110259, intron 1 of 4) 11071 NR_110259 101929596 Hs.537341 NR_110259 LINC02613 - long intergenic non-protein coding RNA 2613 ncRNA 198.333-35 chr11 98306218 98306450 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -714615 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 298-7 chr1 106741975 106742474 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -76015 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 252-95 chr6 139672961 139673356 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -97915 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 150.667-360 chr8 16726667 16726844 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 275590 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 211.667-65 chr2 157996092 157996352 + 1.33333 NA intron (NM_001135098, intron 1 of 8) intron (NM_001135098, intron 1 of 8) 1043 NM_001135098 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 140-7 chr1 105172667 105172815 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 446194 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 196.333-20 chr11 84150357 84150585 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 9 of 27) L1PA16|LINE|L1 122809 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 312-2 chr1 109599119 109599397 + 1.33333 NA TTS (NR_029583) TTS (NR_029583) 365 NR_029583 406974 NR_029583 ENSG00000284443 MIR197 MIRN197|miR-197|miRNA197 microRNA 197 ncRNA 138.667-3 chr1 80448377 80448530 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -87302 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 277.333-51 chr20 16443379 16443813 + 1.33333 NA intron (NM_001199866, intron 12 of 22) intron (NM_001199866, intron 12 of 22) 129852 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 232.333-25 chr14 56908878 56909111 + 1.33333 NA intron (NR_029385, intron 3 of 3) intron (NR_029385, intron 3 of 3) 95836 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 208.666-110 chr8 92111873 92112072 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -8587 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 158.666-25 chr6 121879173 121879330 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 443605 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 298-62 chr4 73576494 73576782 + 1.33333 NA exon (NM_001270392, exon 8 of 10) exon (NM_001270392, exon 8 of 10) 43798 NM_001270391 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 201.333-34 chr10 72940890 72941051 + 1.33333 NA intron (NM_001318125, intron 2 of 2) intron (NM_001318125, intron 2 of 2) 13836 NM_032562 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 198.333-187 chr7 157375546 157375833 + 1.33333 NA intron (NM_001363676, intron 5 of 6) intron (NM_001363676, intron 5 of 6) 38685 NM_005494 10049 Hs.490745 NM_005494 ENSG00000105993 DNAJB6 DJ4|DnaJ|HHDJ1|HSJ-2|HSJ2|LGMD1D|LGMD1E|LGMDD1|MRJ|MSJ-1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 protein-coding 182.667-107 chr3 168724127 168724333 + 1.33333 NA intron (NR_021485, intron 6 of 15) intron (NR_021485, intron 6 of 15) 172376 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 204.666-66 chr5 21204618 21204786 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -254778 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 255.666-15 chr18 60429142 60429333 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -56462 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 315.666-2 chr1 151269985 151270580 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -11240 NM_001304764 57592 Hs.186756 NM_020832 ENSG00000143373 ZNF687 PDB6 zinc finger protein 687 protein-coding 250.333-59 chr5 113356647 113356942 + 1.33333 NA intron (NM_001085377, intron 2 of 18) intron (NM_001085377, intron 2 of 18) -61856 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 269.999-10 chr7 137568920 137569137 + 1.33333 NA intron (NM_001321710, intron 19 of 32) intron (NM_001321710, intron 19 of 32) -225295 NM_001321387 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 322-46 chr8 54232693 54233249 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -97715 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 158-38 chr13 35794810 35795023 + 1.33333 NA intron (NM_001195415, intron 11 of 13) intron (NM_001195415, intron 11 of 13) 60751 NM_001195416 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 261.333-25 chr14 42692572 42692832 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 1085846 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 164-9 chr1 164164178 164164374 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -395084 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 282.666-25 chr7 46184742 46184992 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -263595 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 220.667-14 chr10 86950228 86950538 + 1.33333 NA intron (NM_024756, intron 1 of 6) intron (NM_024756, intron 1 of 6) -5376 NM_001330120 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 192.667-57 chr14 30081510 30081818 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -153817 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 212.666-40 chr2 48651413 48651639 + 1.33333 NA intron (NM_172311, intron 8 of 10) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 33670 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 202-85 chr2 102041264 102041527 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28995 NM_001320978 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 236-74 chr5 154549165 154549424 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 46778 NR_036094 100422950 NR_036094 ENSG00000264760 MIR3141 mir-3141 microRNA 3141 ncRNA 367.333-12 chr21 25744146 25744540 + 1.33333 NA intron (NM_001197297, intron 2 of 9) intron (NM_001197297, intron 2 of 9) -8689 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 125.333-104 chr20 51234492 51234694 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -211486 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 238-80 chr5 115522362 115522649 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_020177, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_020177, exon 3 of 3) 22270 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 180-32 chr14 28710997 28711202 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 54220 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 155.666 chr1 189341866 189342062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1134046 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 244.999 chr14 89939033 89939332 + 1.33333 NA intron (NM_001284269, intron 3 of 5) intron (NM_001284269, intron 3 of 5) 15354 NM_001284269 90141 Hs.123232 NM_145231 ENSG00000140025 EFCAB11 C14orf143 EF-hand calcium binding domain 11 protein-coding 195.666-26 chr2 215083665 215083866 + 1.33333 NA intron (NR_103740, intron 2 of 54) intron (NR_103740, intron 2 of 54) -51679 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 193.333-169 chr7 51812130 51812292 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -418955 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 123.333-29 chr10 28584126 28584308 + 1.33333 NA intron (NM_100486, intron 4 of 12) intron (NM_100486, intron 4 of 12) 51099 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 189-44 chr2 149989184 149989378 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -130090 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 227.666-19 chr20 15796138 15796457 + 1.33333 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 127017 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 217.333-101 chr3 171557054 171557220 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -96729 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 227.333-96 chr5 12201573 12201868 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -297274 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 262.667-35 chr19 48038720 48039065 + 1.33333 NA intron (NM_019855, intron 4 of 5) MIRc|SINE|MIR 5187 NM_019855 56344 Hs.117694 NM_016367 ENSG00000105507 CABP5 CABP3 calcium binding protein 5 protein-coding 202.333-18 chr1 227137414 227137652 + 1.33333 NA intron (NM_001366019, intron 10 of 36) L1ME3|LINE|L1 180959 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 361-17 chr8 121569218 121569679 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69898 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 213.333-43 chr12 55652467 55652741 + 1.33333 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 15712 NM_206899 121130 Hs.554551 NM_206899 ENSG00000175398 OR10P1 OR10P1P|OR10P2P|OR10P3P|OR12-7|OST701 olfactory receptor family 10 subfamily P member 1 protein-coding 222.666-61 chrX 30497967 30498157 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 79704 NM_025159 80231 Hs.665009 NM_025159 ENSG00000120280 CXorf21 - chromosome X open reading frame 21 protein-coding 164.667-116 chr2 119819477 119819627 + 1.33333 NA intron (NM_002830, intron 2 of 26) intron (NM_002830, intron 2 of 26) 59630 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 260.333-51 chr5 67967411 67967727 + 1.33333 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 174356 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 205.333-188 chr5 88182253 88182525 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 86456 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 306-18 chr15 67413106 67413577 + 1.33333 NA intron (NR_040052, intron 5 of 5) intron (NR_040052, intron 5 of 5) 107632 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 297.333-24 chr15 64484964 64485396 + 1.33333 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -14240 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 176.667-97 chr3 15701154 15701387 + 1.33333 NA intron (NM_001349280, intron 13 of 26) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -3899 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 257.333-2 chr1 36658123 36658493 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -174994 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 329.333-54 chr7 30515791 30516169 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11139 NM_001199816 79017 Hs.530024 NM_024051 ENSG00000006625 GGCT C7orf24|CRF21|GCTG|GGC gamma-glutamylcyclotransferase protein-coding 264.666-9 chr10 109167099 109167362 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 756016 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 328-31 chr5 25703029 25703371 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 512247 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 211.333-7 chr1 90890730 90891009 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39110 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 213-51 chr3 57297272 57297493 + 1.33333 NA intron (NM_001366028, intron 70 of 73) AluSz|SINE|Alu -4697 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 181.666-24 chr9 29130137 29130347 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) HERV4_I-int|LTR|ERV1 82057 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 483.333-3 chr5 147583810 147584403 + 1.33333 NA intron (NR_038902, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 24112 NR_038902 153469 Hs.184323 NR_038902 ENSG00000280780 JAKMIP2-AS1 - JAKMIP2 antisense RNA 1 ncRNA 172-74 chr3 141144166 141144346 + 1.33333 NA intron (NM_080862, intron 2 of 2) L1ME3|LINE|L1 -87569 NM_001037172 92370 Hs.657887 NM_152282 ENSG00000155893 PXYLP1 ACPL2|HEL124|XYLP 2-phosphoxylose phosphatase 1 protein-coding 157.333-143 chr17 27509180 27509334 + 1.33333 NA intron (NM_014238, intron 2 of 20) AluJo|SINE|Alu 37293 NM_014238 8844 Hs.133534 NM_014238 ENSG00000141068 KSR1 KSR|RSU2 kinase suppressor of ras 1 protein-coding 288-42 chr5 66674218 66674539 + 1.33333 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) intron (NM_001290228, intron 1 of 4) 77985 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 337.667-3 chr11 5002250 5002616 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 3450 NM_001004755 119682 Hs.553559 NM_001004755 ENSG00000176798 OR51L1 OR11-31 olfactory receptor family 51 subfamily L member 1 protein-coding 211.333-102 chr2 223086 223376 + 1.33333 NA intron (NM_001282682, intron 10 of 10) MIRb|SINE|MIR 33109 NM_001282687 26751 Hs.515951 NM_015677 ENSG00000035115 SH3YL1 RAY SH3 and SYLF domain containing 1 protein-coding 329.333-4 chr1 231472946 231473302 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 3401 NR_033826 645339 Hs.382049 NR_033826 SNRPD2P2 - small nuclear ribonucleoprotein D2 pseudogene 2 pseudo 239.666-25 chr6 124471638 124471935 + 1.33333 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 188781 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 206.333-44 chr13 58837405 58837610 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -604390 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 210.333-173 chr8 121567549 121567732 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71706 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 224.333-116 chr7 19585045 19585218 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120305 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 191.333-53 chr13 63905725 63905961 + 1.33333 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -61718 NR_130763 102723968 Hs.551671 NR_130763 ENSG00000219926 LOC102723968 - uncharacterized LOC102723968 ncRNA 308.667-7 chr10 57021012 57021529 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 283289 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 335-10 chr16 56666794 56667133 + 1.33333 NA exon (NM_001301267, exon 3 of 3) exon (NM_001301267, exon 3 of 3) 1102 NM_001301267 4495 Hs.433391 NM_005950 ENSG00000125144 MT1G MT1|MT1K metallothionein 1G protein-coding 217.333-49 chr16 13540104 13540304 + 1.33333 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -379953 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 202.666-68 chr20 43900034 43900288 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5443 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 216.333-127 chr6 117400605 117400776 + 1.33333 NA intron (NM_002944, intron 6 of 42) L2a|LINE|L2 25165 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 322.667-38 chr9 35879701 35880135 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -9517 NM_001004487 392309 Hs.527480 NM_001004487 ENSG00000168828 OR13J1 OR9-2 olfactory receptor family 13 subfamily J member 1 protein-coding 221.333-128 chr6 135693738 135693924 + 1.33333 NA intron (NR_152842, intron 5 of 5) intron (NR_152842, intron 5 of 5) -157870 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 228.666-40 chr5 117453524 117453724 + 1.33333 NA intron (NR_046089, intron 2 of 5) L1PB4|LINE|L1 38112 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 332.333-12 chr15 39160373 39160799 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -90083 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 337-27 chr8 110338040 110338577 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -362537 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 188.667-18 chr10 15470399 15470650 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99235 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 283.333-7 chr1 221695414 221695814 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 41286 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 184.666-18 chr2 63974451 63974622 + 1.33333 NA intron (NM_001005739, intron 3 of 22) L1MCb|LINE|L1 44892 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 196.333-92 chr2 176284095 176284314 + 1.33333 NA intron (NM_001006635, intron 2 of 10) FLAM_A|SINE|Alu 14762 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 226.666-47 chrX 46281402 46281580 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 46183 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 196-38 chr12 59831300 59831578 + 1.33333 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 142069 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 195.666-43 chr7 134970393 134970668 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_004342, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_004342, exon 14 of 14) -15978 NM_001367817 340351 Hs.648616 NM_178563 ENSG00000146856 AGBL3 CCP3 ATP/GTP binding protein like 3 protein-coding 211.666-40 chr5 73016718 73016933 + 1.33333 NA intron (NM_138782, intron 7 of 25) AluJb|SINE|Alu 60784 NM_001146032 115548 Hs.165762 NM_138782 ENSG00000157107 FCHO2 - FCH domain only 2 protein-coding 141.333-179 chr4 91561628 91561844 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 715566 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 211-63 chr3 43726360 43726593 + 1.33333 NA intron (NM_001355186, intron 7 of 7) intron (NM_001355186, intron 7 of 7) -34882 NM_001346468 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 187.333-61 chr14 49184021 49184289 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 402225 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 240.666-20 chr2 77019811 77020043 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR 33962 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 232.333-52 chr20 46512861 46513130 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001353824, exon 1 of 5) 5' UTR (NM_001353824, exon 1 of 5) 577 NM_001353823 55713 Hs.147041 NM_018102 ENSG00000198185 ZNF334 - zinc finger protein 334 protein-coding 200.666-15 chr10 27270388 27270538 + 1.33333 NA intron (NR_138082, intron 2 of 4) L1MB4|LINE|L1 11701 NR_138082 101060171 Hs.568842 NR_138082 ARMC4P1 - armadillo repeat containing 4 pseudogene 1 pseudo 219.333-85 chr19 14948078 14948278 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 6689 NM_012377 26658 Hs.589620 NM_012377 ENSG00000127529 OR7C2 CIT-HSP-87M17|OR19-18|OR7C3 olfactory receptor family 7 subfamily C member 2 protein-coding 189.333-101 chr2 158513091 158513252 + 1.33333 NA intron (NM_001005476, intron 1 of 20) intron (NM_001005476, intron 1 of 20) 56219 NM_001304969 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 242.666-20 chr18 58977667 58977858 + 1.33333 NA intron (NR_148459, intron 9 of 11) AluSx1|SINE|Alu -57917 NR_024021 390858 Hs.716280 NR_024021 OACYLP ACYL3P O-acyltransferase like, pseudogene pseudo 132.666-6 chr4 88536781 88536906 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13033 NR_134663 101929134 Hs.734064 NR_134662 ENSG00000285122 PIGY-DT - PIGY divergent transcript ncRNA 236-93 chrX 87405378 87405590 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -112318 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 117.333-135 chr3 98587107 98587254 + 1.33333 NA intron (NM_000097, intron 4 of 6) intron (NM_000097, intron 4 of 6) 6431 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 229.667-48 chr2 221240716 221241057 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 331418 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 198.666-21 chr13 58966209 58966369 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -733172 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 279.333-17 chr11 72733472 72733727 + 1.33333 NA intron (NM_001040118, intron 1 of 34) intron (NM_001040118, intron 1 of 34) -11241 NM_001135190 116985 Hs.503165 NM_015242 ENSG00000186635 ARAP1 CENTD2 ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 390.667-6 chr3 160195932 160196449 + 1.33333 NA intron (NR_108088, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 10902 NR_108088 101928376 Hs.565865 NR_108088 ENSG00000244040 IL12A-AS1 ILAS1-AS1 IL12A antisense RNA 1 ncRNA 212.667-101 chr5 27623297 27623562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 151137 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 306-40 chr4 94276907 94277225 + 1.33333 NA exon (NM_020159, exon 16 of 24) exon (NM_020159, exon 16 of 24) 23757 NM_001254949 56916 Hs.410406 NM_020159 ENSG00000163104 SMARCAD1 ADERM|BASNS|ETL1|HEL1|HRZ SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 protein-coding 130-39 chr15 37576859 37576968 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -357694 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 222-100 chr8 127211438 127211740 + 1.33333 NA intron (NR_108049, intron 1 of 1) L1ME4a|LINE|L1 7679 NR_108049 100507056 Hs.343864 NR_108049 CCAT1 CARLO5|CARLo-5|onco-lncRNA-40 colon cancer associated transcript 1 ncRNA 204.667-91 chr22 28217401 28217701 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -242318 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 121.333-191 chr9 79081892 79081991 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 63725 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 190.666-58 chr9 3698308 3698504 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30320 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 122.333-213 chr8 132642019 132642132 + 1.33333 NA intron (NR_135908, intron 1 of 7) intron (NR_135908, intron 1 of 7) 33470 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 209-11 chr10 68793525 68793755 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -33891 NM_152709 219736 Hs.37636 NM_152709 ENSG00000165730 STOX1 C10orf24 storkhead box 1 protein-coding 326.666-5 chr17 62829579 62830018 + 1.33333 NA intron (NR_135634, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 21296 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 208.667-63 chr19 39021872 39022142 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 10542 NM_178820 126433 Hs.187461 NM_178820 ENSG00000161243 FBXO27 FBG5|Fbx27 F-box protein 27 protein-coding 226.333-57 chr2 39668809 39669128 + 1.33333 NA intron (NM_152390, intron 1 of 3) intron (NM_152390, intron 1 of 3) 3051 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 222-105 chr9 108440263 108440482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 415614 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 571 chr22 40853369 40854297 + 1.33333 NA intron (NM_003932, intron 1 of 11) intron (NM_003932, intron 1 of 11) 2806 NM_003932 6767 Hs.712713 NM_003932 ENSG00000100380 ST13 AAG2|FAM10A1|FAM10A4|HIP|HOP|HSPABP|HSPABP1|P48|PRO0786|SNC6 ST13 Hsp70 interacting protein protein-coding 204.666-53 chr22 41451938 41452238 + 1.33333 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -5287 NM_016272 10766 Hs.474978 NM_016272 ENSG00000183864 TOB2 APRO5|TOB4|TOBL|TROB2 transducer of ERBB2, 2 protein-coding 248.999-4 chr4 98775328 98775600 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 116562 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 238.333-50 chr2 209392646 209393112 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31168 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 241.333-32 chr12 50274726 50275016 + 1.33333 NA intron (NM_016357, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 8649 NM_016357 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 219.333-177 chr7 112127884 112128050 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) AluSg|SINE|Alu 78432 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 242.333-57 chr20 48344059 48344269 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15747 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 180-112 chr8 89945530 89945727 + 1.33333 NA intron (NM_001024688, intron 14 of 16) intron (NM_001024688, intron 14 of 16) 39043 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 191.333-62 chr14 62611421 62611624 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 433936 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 300.333-41 chr7 25095182 25095670 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 29935 NM_018947 54205 Hs.437060 NM_018947 ENSG00000172115 CYCS CYC|HCS|THC4 cytochrome c, somatic protein-coding 195.333-163 chr4 155791945 155792214 + 1.33333 NA intron (NM_001291951, intron 6 of 14) intron (NM_001291951, intron 6 of 14) 33058 NM_001291952 2983 Hs.77890 NM_000857 ENSG00000061918 GUCY1B1 GC-S-beta-1|GC-SB3|GUC1B3|GUCB3|GUCSB3|GUCY1B3 guanylate cyclase 1 soluble subunit beta 1 protein-coding 411.333-3 chr10 98812589 98813166 + 1.33333 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) MER5A|DNA|hAT-Charlie 111691 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 230.667-29 chr18 3107650 3107987 + 1.33333 NA intron (NM_019856, intron 21 of 36) LTR8B|LTR|ERV1 -95871 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 331.666-2 chr10 65652125 65652751 + 1.33333 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) MER72|LTR|ERV1 81013 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 202.666-81 chr3 154443141 154443349 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13055 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 217-48 chr2 168502665 168502913 + 1.33333 NA intron (NM_001256126, intron 1 of 10) PRIMA4-int|LTR|ERV1 46517 NM_203463 253782 Hs.506829 NM_203463 ENSG00000172292 CERS6 CERS5|LASS6 ceramide synthase 6 protein-coding 211.333-99 chr19 28906232 28906412 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58809 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 185.333-52 chr15 56248925 56249106 + 1.33333 NA Intergenic AmnSINE2|SINE|tRNA-Deu -3933 NM_001370561 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 162-108 chr7 4889732 4889915 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6107 NM_018059 55698 Hs.667336 NM_018059 ENSG00000157927 RADIL RASIP2 Rap associating with DIL domain protein-coding 214-31 chr12 60380274 60380616 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 691075 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 206-68 chr2 13349568 13349819 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -342680 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 427-8 chr8 81447685 81448324 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001348381) promoter-TSS (NM_001348381) -565 NM_001348381 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 333.999-3 chr5 65117170 65117462 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 348386 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 255.666-11 chr15 89079677 89079874 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -8681 NM_152924 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 191.333-105 chr2 46255544 46255763 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -41754 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 293.333-52 chr5 150559979 150560357 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -40908 NM_001166208 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 142.666 chr1 200415577 200415728 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5616 NM_001281294 23528 Hs.59757 NM_012482 ENSG00000162702 ZNF281 ZBP-99|ZNP-99 zinc finger protein 281 protein-coding 169.333-213 chr5 144902198 144902399 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 696907 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 354-16 chr3 44328106 44328793 + 1.33333 NA intron (NM_001145030, intron 19 of 19) intron (NM_001145030, intron 19 of 19) -9670 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 154.667-138 chr17 39533103 39533313 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_016507, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_016507, exon 14 of 14) 71722 NM_016507 51755 Hs.345028 NM_015083 ENSG00000167258 CDK12 CRK7|CRKR|CRKRS cyclin dependent kinase 12 protein-coding 261.333-93 chr5 167579417 167579722 + 1.33333 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) 5910 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 301-37 chr4 79419410 79419981 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11467 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 155.667-376 chr8 142845526 142845762 + 1.33333 NA intron (NM_002066, intron 3 of 3) intron (NM_002066, intron 3 of 3) 10843 NM_002066 2765 Hs.661218 NM_002066 ENSG00000104499 GML LY6DL glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like protein-coding 227-49 chr6 72440910 72441161 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 74289 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 212.333-123 chr5 158678948 158679170 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -269286 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 212-144 chr7 21669779 21670024 + 1.33333 NA intron (NM_001277115, intron 30 of 81) L1ME2|LINE|L1 126862 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 296-26 chr2 9968215 9968604 + 1.33333 NA intron (NM_198182, intron 8 of 15) intron (NM_198182, intron 8 of 15) 16716 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 226.666-7 chr12 2587443 2587650 + 1.33333 NA intron (NM_199460, intron 18 of 49).2 intron (NM_199460, intron 18 of 49).2 84674 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 249.999-4 chr2 50682042 50682320 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 14081 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 208.333-6 chr1 103493931 103494138 + 1.33333 NA intron (NM_001347929, intron 1 of 5) intron (NM_001347929, intron 1 of 5) 31477 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 252-83 chr5 121692155 121692399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -159605 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 215.666-18 chr15 99248088 99248255 + 1.33333 NA intron (NM_001353869, intron 2 of 12) intron (NM_001353869, intron 2 of 12) 1410 NM_001288615 64927 Hs.513195 NM_022905 ENSG00000103852 TTC23 HCC-8 tetratricopeptide repeat domain 23 protein-coding 185.667-52 chr18 3971618 3971835 + 1.33333 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) intron (NR_102696, intron 1 of 4) 9373 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 343.333-23 chr5 16606760 16607115 + 1.33333 NA intron (NM_001034850, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 -8989 NR_109946 101929524 Hs.734029 NR_109946 ENSG00000246214 LOC101929524 - uncharacterized LOC101929524 ncRNA 158.666-12 chr12 48951413 48951621 + 1.33333 NA intron (NM_001659, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu 5970 NM_001659 377 Hs.119177 NM_001659 ENSG00000134287 ARF3 - ADP ribosylation factor 3 protein-coding 306.666 chr1 225664888 225665233 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -11937 NM_001008493 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 185-62 chr6 145341184 145341322 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 345624 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 212.666-4 chr1 181141675 181141901 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32696 NR_125966 101928973 Hs.637822 NR_125966 ENSG00000237292 LINC01732 - long intergenic non-protein coding RNA 1732 ncRNA 178.333-177 chr9 31445066 31445221 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -63653 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 302.666-13 chr21 28717054 28717397 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 168142 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 267.667-15 chr14 86087214 86087663 + 1.33333 NA intron (NR_110155, intron 2 of 3) intron (NR_110155, intron 2 of 3) 152760 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 309-14 chr12 46902684 46903161 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -76925 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 233.333-68 chr2 157171297 157171514 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -86300 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 436-5 chr13 38888536 38889069 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61211 NR_146963 100874073 Hs.253994 NR_146963 FREM2-AS1 - FREM2 antisense RNA 1 ncRNA 200.666-70 chr20 8012341 8012508 + 1.33333 NA intron (NM_021156, intron 1 of 7) MIRc|SINE|MIR 7337 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 369-11 chr4 67573702 67574042 + 1.33333 NA intron (NM_012108, intron 2 of 8) intron (NM_012108, intron 2 of 8) 15145 NM_001317769 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 205.999-6 chr4 58194479 58194634 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 341772 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 269-40 chr4 113017710 113018066 + 1.33333 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) -31526 NM_001354265 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 198-4 chr1 46741839 46742053 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -22832 NM_014774 9813 Hs.707688 NM_014774 ENSG00000159658 EFCAB14 KIAA0494 EF-hand calcium binding domain 14 protein-coding 214-52 chr17 79088405 79088606 + 1.33333 NA TTS (NM_001350453) TTS (NM_001350453) 13568 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 200-105 chr3 73124764 73124936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63191 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 198.666-34 chr18 6934407 6934598 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -4633 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 175.333-142 chr5 64860942 64861110 + 1.33333 NA intron (NM_005869, intron 10 of 13) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 92096 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 189-72 chr5 26251450 26251683 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR 787020 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 309.666-8 chr2 38362314 38362772 + 1.33333 NA intron (NM_001330462, intron 1 of 13) MER5A|DNA|hAT-Charlie 13987 NM_001330459 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 203-45 chr17 58314408 58314617 + 1.33333 NA intron (NM_024418, intron 15 of 30) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -10938 NR_038410 100506779 Hs.718477 NR_038410 ENSG00000265148 TSPOAP1-AS1 BZRAP1-AS1 TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1 ncRNA 313.333-23 chr3 4972726 4973125 + 1.33333 NA intron (NR_125915, intron 1 of 3) L1ME2|LINE|L1 -6512 NM_003670 8553 Hs.744856 NM_003670 ENSG00000134107 BHLHE40 BHLHB2|Clast5|DEC1|HLHB2|SHARP-2|SHARP2|STRA13|Stra14 basic helix-loop-helix family member e40 protein-coding 198.667-132 chr3 190089404 190089687 + 1.33333 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 31352 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 261.333-56 chr2 233591384 233591741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24780 NM_001365479 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 167.666-4 chr18 9826740 9826888 + 1.33333 NA intron (NM_006868, intron 5 of 6) intron (NM_006868, intron 5 of 6) -59159 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 251.666-12 chr17 60901031 60901392 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 10 of 25) AluSz|SINE|Alu 223360 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 205-53 chr20 32771967 32772244 + 1.33333 NA intron (NM_175848, intron 1 of 21) L1MC5a|LINE|L1 -7747 NM_175850 1789 Hs.643024 NM_006892 ENSG00000088305 DNMT3B ICF|ICF1|M.HsaIIIB DNA methyltransferase 3 beta protein-coding 206-22 chr10 104605961 104606218 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35201 NM_014978 22986 Hs.671950 NM_014978 ENSG00000156395 SORCS3 SORCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 3 protein-coding 125.333-27 chr10 84322502 84322658 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6009 NM_018999 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 202-181 chr8 49543658 49543981 + 1.33333 NA Intergenic MER21A|LTR|ERVL -31639 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 201.333-153 chr2 114983388 114983646 + 1.33333 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -81056 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 120.333-189 chr8 87867983 87868142 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5953 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 250.666-16 chr17 63334141 63334428 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 10 of 25) L1MC4a|LINE|L1 105983 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 208-123 chr4 67458008 67458199 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -36103 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 249.666-42 chr8 98720815 98721038 + 1.33333 NA intron (NM_006281, intron 4 of 10) intron (NM_006281, intron 4 of 10) 104745 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 240-90 chr8 91815023 91815311 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 202513 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 343.333-3 chr1 70151703 70152147 + 1.33333 NA intron (NM_017768, intron 12 of 14) intron (NM_017768, intron 12 of 14) 53654 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 184.666-46 chrX 86513940 86514152 + 1.33333 NA intron (NM_001139515, intron 2 of 11) intron (NM_001139515, intron 2 of 11) 251078 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 352.333-22 chr6 67727172 67727677 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -327927 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 202-138 chr4 156253424 156253646 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -299669 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 202.667-40 chr12 62666097 62666387 + 1.33333 NA intron (NM_020700, intron 9 of 9) AluSx3|SINE|Alu 62556 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 199-3 chr1 115317649 115317948 + 1.33333 NA intron (NM_002506, intron 1 of 2) intron (NM_002506, intron 1 of 2) 20438 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 179.333-141 chr4 83628340 83628590 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 92357 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 169.333-84 chr14 71012977 71013168 + 1.33333 NA exon (NM_001308160, exon 9 of 34) exon (NM_001308160, exon 9 of 34) 105613 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 127-84 chr6 69973412 69973589 + 1.33333 NA intron (NM_001858, intron 11 of 50) intron (NM_001858, intron 11 of 50) 106944 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 208.666-22 chr11 31979209 31979387 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 62020 NR_120526 100506675 Hs.446169 NR_120526 ENSG00000254584 LOC100506675 - uncharacterized LOC100506675 ncRNA 355-22 chr4 59564421 59564781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 551028 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 213.333-55 chr14 59307927 59308145 + 1.33333 NA intron (NM_001270520, intron 3 of 24) intron (NM_001270520, intron 3 of 24) 44595 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 298.333-23 chr2 226611485 226611938 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47082 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 473.333-6 chr5 53940871 53941572 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) 10378 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 473.666 chr10 49341529 49342006 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 42597 NM_001135196 118461 Hs.585480 NM_199459 ENSG00000177354 C10orf71 CEFIP chromosome 10 open reading frame 71 protein-coding 160.666-4 chr14 62111069 62111211 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001367650, exon 7 of 7) -6217 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 222.666-50 chr7 22872504 22872707 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15992 NR_003075 692210 NR_003075 ENSG00000221740 SNORD93 HBII-336 small nucleolar RNA, C/D box 93 snoRNA 200.667-114 chr3 154379743 154380024 + 1.33333 NA intron (NM_001038705, intron 3 of 3) L1ME1|LINE|L1 50307 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 274.333-12 chr12 5982060 5982408 + 1.33333 NA intron (NM_000552, intron 41 of 51) intron (NM_000552, intron 41 of 51) -36002 NM_001278597 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 197.667-32 chr12 10705912 10706126 + 1.33333 NA intron (NM_001145426, intron 5 of 8) L1MC4|LINE|L1 17304 NM_003651 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 197.333-136 chr21 27196493 27196760 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -229538 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 199.666-39 chr3 151820178 151820345 + 1.33333 NA intron (NM_001086, intron 2 of 4) intron (NM_001086, intron 2 of 4) 6145 NM_001086 13 Hs.506908 NM_001086 ENSG00000114771 AADAC CES5A1|DAC arylacetamide deacetylase protein-coding 239.333-99 chr7 25197565 25197945 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17401 NM_001371352 195-109 chr8 107192952 107193201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 143439 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 254.667-72 chr6 37259735 37260115 + 1.33333 NA intron (NR_130108, intron 1 of 12) intron (NR_130108, intron 1 of 12) -1770 NR_104442 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 200-182 chrX 87527831 87528046 + 1.33333 NA intron (NM_057162, intron 1 of 10) L1M2|LINE|L1 10136 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 318.666-9 chr15 94093231 94093500 + 1.33333 NA intron (NR_120320, intron 1 of 8) L1MA9|LINE|L1 14573 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 265.666-6 chr13 50951940 50952234 + 1.33333 NA intron (NM_001142279, intron 9 of 9) FAM|SINE|Alu -41375 NR_046552 100874255 Hs.741501 NR_046552 RNASEH2B-AS1 - RNASEH2B antisense RNA 1 ncRNA 231-20 chr17 68784396 68784734 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 156411 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 283.333-67 chr6 100637558 100637911 + 1.33333 NA intron (NM_006828, intron 25 of 41) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -174059 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 170-59 chr2 68069791 68069961 + 1.33333 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -6872 NM_173177 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 186-22 chr12 51486480 51486732 + 1.33333 NA intron (NM_001039960, intron 17 of 24) intron (NM_001039960, intron 17 of 24) 61489 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 211.667-43 chr16 9815772 9816055 + 1.33333 NA intron (NM_001134408, intron 10 of 13) L1MB3|LINE|L1 -360408 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 238-81 chr5 131494485 131494829 + 1.33333 NA intron (NM_016340, intron 13 of 27) intron (NM_016340, intron 13 of 27) 140572 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 139.333-209 chr8 19528356 19528519 + 1.33333 NA intron (NM_001354497, intron 1 of 7) MER90|LTR|ERV1 74108 NM_001354499 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 211-40 chr16 9302431 9302612 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -53067 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 262.333-56 chr3 29456194 29456633 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 2 of 13) intron (NM_001003792, intron 2 of 13) 175101 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 196.666-110 chr8 132301724 132301890 + 1.33333 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 145455 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 320.666-15 chr6 60648990 60649350 + 1.33333 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -924960 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 205.333-165 chr4 31065526 31065801 + 1.33333 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -105481 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 213.333-125 chr3 44249733 44249975 + 1.33333 NA intron (NM_001145030, intron 2 of 19) intron (NM_001145030, intron 2 of 19) 7968 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 183-70 chr20 36991293 36991439 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39523 NM_015474 25939 Hs.580681 NM_015474 ENSG00000101347 SAMHD1 CHBL2|DCIP|HDDC1|MOP-5|SBBI88|hSAMHD1 SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 protein-coding 271.333-70 chr8 129530329 129530588 + 1.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 44560 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 288-30 chr2 143310772 143311066 + 1.33333 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 181500 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 209-85 chr4 171442235 171442524 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 196384 NR_147157 105377536 Hs.550719 NR_147157 ENSG00000249297 LINC02174 - long intergenic non-protein coding RNA 2174 ncRNA 151.667-9 chr1 74227335 74227584 + 1.33333 NA intron (NM_001112808, intron 3 of 26) L1MA2|LINE|L1 -7928 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 257.666-4 chr11 69542463 69542676 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57008 NR_120544 101928292 Hs.736219 NR_120542 LINC01488 BRCAT8 long intergenic non-protein coding RNA 1488 ncRNA 183.333-170 chr9 32948015 32948167 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 53485 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 490.999 chr9 108403282 108403823 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 452434 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 178-52 chr17 28640644 28640868 + 1.33333 NA intron (NM_001321561, intron 7 of 10) intron (NM_001321561, intron 7 of 10) 4402 NM_001321560 9703 Hs.151761 NM_014680 ENSG00000007202 KIAA0100 BCOX|BCOX1|CT101|FMP27 KIAA0100 protein-coding 214.667-9 chr1 233112034 233112346 + 1.33333 NA intron (NM_014801, intron 21 of 33) intron (NM_014801, intron 21 of 33) 161348 NR_138027 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 257.333-82 chr5 96077028 96077469 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) -1890 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 425.333-13 chr8 65492345 65492721 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70133 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 230.667-65 chr5 50573947 50574396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -91760 NM_001178055 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 238-83 chr6 28302078 28302381 + 1.33333 NA exon (NM_001184743, exon 7 of 7) exon (NM_001184743, exon 7 of 7) 20692 NM_001184743 84547 Hs.144527 NM_032507 ENSG00000137338 PGBD1 HUCEP-4|SCAND4|dJ874C20.4 piggyBac transposable element derived 1 protein-coding 226-27 chr16 74213700 74213886 + 1.33333 NA intron (NR_104657, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 1728 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 309.666-11 chr21 32221393 32221745 + 1.33333 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 57480 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 197-30 chr12 121360991 121361184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6878 NM_001137559 51433 Hs.7101 NM_016237 ENSG00000089053 ANAPC5 APC5 anaphase promoting complex subunit 5 protein-coding 175.666-5 chr11 110019441 110019588 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -73878 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 207.666-4 chr1 235286588 235286755 + 1.33333 NA intron (NR_135074, intron 2 of 24) intron (NR_135074, intron 2 of 24) 40816 NM_001206794 51742 Hs.575782 NM_016374 ENSG00000054267 ARID4B BCAA|BRCAA1|RBBP1L1|RBP1L1|SAP180 AT-rich interaction domain 4B protein-coding 216-35 chr14 80256835 80257123 + 1.33333 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) L1ME3Cz|LINE|L1 -25922 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 281.667-2 chr1 21323304 21323725 + 1.33333 NA intron (NM_001113348, intron 1 of 18) FRAM|SINE|Alu 21990 NM_001113348 1889 Hs.195080 NM_001397 ENSG00000117298 ECE1 ECE endothelin converting enzyme 1 protein-coding 199.666-45 chr5 55178193 55178412 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5125 NM_001145734 166979 Hs.669184 NM_152623 ENSG00000164287 CDC20B G6VTS76519 cell division cycle 20B protein-coding 210.333-167 chr8 81866990 81867233 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -24825 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 208.666-107 chr8 78036420 78036595 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -479833 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 210.333-175 chr8 133424887 133425149 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -127714 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 225.333-107 chr5 28313989 28314204 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26431 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 280.333-13 chr14 80155107 80155503 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56114 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 212-137 chr6 47216459 47216716 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 93318 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 243.999 chr1 93292214 93292423 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 53493 NR_034089 100131564 Hs.732666 NR_034089 CCDC18-AS1 - CCDC18 antisense RNA 1 ncRNA 284.666-2 chr1 115382799 115383288 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -44807 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 282.333-34 chr3 64678306 64678629 + 1.33333 NA intron (NM_001318781, intron 3 of 38) MER5B|DNA|hAT-Charlie -6403 NR_038264 100507098 Hs.660881 NR_038264 ENSG00000241684 ADAMTS9-AS2 - ADAMTS9 antisense RNA 2 ncRNA 214.666-2 chr1 58525674 58525901 + 1.33333 NA intron (NM_145243, intron 7 of 8) L1MEg|LINE|L1 20939 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 184.667-46 chr18 21614380 21614596 + 1.33333 NA intron (NM_001291916, intron 1 of 3) intron (NM_001291916, intron 1 of 3) 2174 NM_006938 6632 Hs.464734 NM_006938 ENSG00000167088 SNRPD1 HsT2456|SMD1|SNRPD|Sm-D1 small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide protein-coding 211.333-12 chr1 112982729 112982909 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 26404 NR_103744 100506392 Hs.418285 NR_103743 ENSG00000226419 SLC16A1-AS1 - SLC16A1 antisense RNA 1 ncRNA 258.666-19 chr2 39232127 39232427 + 1.33333 NA intron (NR_144521, intron 1 of 10) intron (NR_144521, intron 1 of 10) -2689 NR_144520 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 171.333-29 chr11 91056574 91056713 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -187441 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 138.667-193 chr7 92210214 92210378 + 1.33333 NA intron (NM_001013406, intron 15 of 16) L1MA4|LINE|L1 -6198 NR_031616 100302218 NR_031616 ENSG00000221520 MIR1285-1 MIRN1285-1|hsa-mir-1285-1 microRNA 1285-1 ncRNA 258.666-7 chr10 130720236 130720567 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 242267 NR_036180 100422867 NR_036180 ENSG00000264803 MIR378C mir-378c microRNA 378c ncRNA 271-28 chr2 168682447 168682878 + 1.33333 NA intron (NM_001256126, intron 4 of 10) LTR16E1|LTR|ERVL 99719 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 331-16 chr18 12848488 12849050 + 1.33333 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -7807 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 195.333-179 chr5 83848628 83848913 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -127915 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 121-104 chr4 38795558 38795758 + 1.33333 NA TTS (NM_003263) TTS (NM_003263) 9133 NM_003263 7096 Hs.621817 NM_003263 ENSG00000174125 TLR1 CD281|TIL|TIL. LPRS5|rsc786 toll like receptor 1 protein-coding 267.667-29 chr2 76001589 76002011 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -290885 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 320.666-7 chr2 50264606 50264944 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 82979 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 197.333-191 chr5 147689624 147689807 + 1.33333 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) L2a|LINE|L2 93013 NM_001282282 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 212.666-37 chr2 14531391 14531567 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101238 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 147.333-113 chr14 75834635 75834821 + 1.33333 NA intron (NM_015072, intron 28 of 31) intron (NM_015072, intron 28 of 31) 147267 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 334-25 chr20 50974721 50975119 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 16102 NM_014484 27304 Hs.159410 NM_014484 ENSG00000124217 MOCS3 UBA4 molybdenum cofactor synthesis 3 protein-coding 224.666-3 chr10 28765846 28766069 + 1.33333 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) intron (NR_120652, intron 2 of 3) 22307 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 480-8 chr6 158089613 158090308 + 1.33333 NA intron (NM_003898, intron 25 of 26) intron (NM_003898, intron 25 of 26) 72867 NM_001178088 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 400.333-17 chr6 45217593 45218360 + 1.33333 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1MD2|LINE|L1 -20206 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 184-39 chr16 57856593 57856773 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 46046 NM_001278081 388282 Hs.434720 NM_001278081 LOC388282 - uncharacterized LOC388282 protein-coding 197.333-83 chr17 53959545 53959818 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 136754 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 208.667-129 chr7 76411474 76411806 + 1.33333 NA intron (NM_007155, intron 1 of 8) L1MD1|LINE|L1 -1943 NM_080744 136853 Hs.567684 NM_080744 ENSG00000146700 SSC4D S4D-SRCRB|SRCRB-S4D|SRCRB4D scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains protein-coding 218.666-45 chr2 139319788 139319993 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 422566 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 151-100 chr5 15681758 15681919 + 1.33333 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -66836 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 322.666-25 chr8 117091004 117091409 + 1.33333 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -43789 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 188.666-40 chr9 16383521 16383818 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -107356 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 247.333-9 chr10 73808745 73809031 + 1.33333 NA intron (NR_160744, intron 2 of 14) intron (NR_160744, intron 2 of 14) 2710 NM_001330107 8509 Hs.654758 NM_003635 ENSG00000166507 NDST2 HSST2|N-HSST 2|NST2 N-deacetylase and N-sulfotransferase 2 protein-coding 267.667-37 chr21 32988190 32988469 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 29441 NR_135522 102724502 Hs.130572 NR_135522 ENSG00000228961 LINC01690 - long intergenic non-protein coding RNA 1690 ncRNA 206.333-83 chr2 80192215 80192434 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 112428 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 250-31 chr17 33323772 33324087 + 1.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L1ME3A|LINE|L1 -30941 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 311.333-61 chr9 89866879 89867150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102402 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 157.333-43 chr10 29533884 29534114 + 1.33333 NA intron (NM_021738, intron 7 of 37) intron (NM_021738, intron 7 of 37) 11098 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 235.333-76 chr3 123316445 123316826 + 1.33333 NA intron (NM_183357, intron 11 of 20) L1MC5a|LINE|L1 99707 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 216.999-7 chr6 122799300 122799474 + 1.33333 NA intron (NM_001286138, intron 2 of 6) MIR3|SINE|MIR 10129 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 171.667-165 chr8 107563805 107564028 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65998 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 243.666-43 chr9 81585241 81585432 + 1.33333 NA intron (NM_005077, intron 18 of 19) intron (NM_005077, intron 18 of 19) 104199 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 201.667-54 chr2 48660824 48661095 + 1.33333 NA intron (NM_172311, intron 8 of 10) L1MB3|LINE|L1 43103 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 206.333-142 chr6 96564652 96564834 + 1.33333 NA intron (NM_020482, intron 2 of 6) intron (NM_020482, intron 2 of 6) 1618 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 237.667-57 chr3 140040127 140040592 + 1.33333 NA intron (NM_022131, intron 1 of 16) intron (NM_022131, intron 1 of 16) 105174 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 190-8 chr1 179608349 179608610 + 1.33333 NA intron (NM_001199092, intron 1 of 13) L1PB1|LINE|L1 2252 NM_001199092 163589 Hs.197354 NM_173533 ENSG00000162782 TDRD5 TUDOR3 tudor domain containing 5 protein-coding 383.666-8 chr8 139949730 139950388 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) intron (NM_001160372, intron 19 of 22) 150476 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 386.999-2 chr14 43272824 43273302 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1234220 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 209-76 chr3 25121390 25121687 + 1.33333 NA intron (NM_001290216, intron 3 of 10) intron (NM_001290216, intron 3 of 10) -219264 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 187.666-8 chr13 23240369 23240608 + 1.33333 NA intron (NM_000231, intron 3 of 7) L1MEc|LINE|L1 59567 NM_000231 6445 Hs.37167 NM_000231 ENSG00000102683 SGCG 35DAG|A4|DAGA4|DMDA|DMDA1|LGMD2C|LGMDR5|MAM|SCARMD2|SCG3|gamma-SG sarcoglycan gamma protein-coding 384-24 chr8 126023291 126023759 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -72328 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 220-56 chr2 23958303 23958538 + 1.33333 NA intron (NM_181713, intron 2 of 6) intron (NM_181713, intron 2 of 6) 17957 NM_181713 165324 Hs.591576 NM_181713 ENSG00000173960 UBXN2A UBXD4 UBX domain protein 2A protein-coding 321-6 chr14 49816798 49817177 + 1.33333 NA intron (NM_001301732, intron 16 of 31) L1MEc|LINE|L1 35801 NM_004713 9147 Hs.655964 NM_004713 ENSG00000165525 NEMF NY-CO-1|SDCCAG1 nuclear export mediator factor protein-coding 149-137 chr7 113570636 113570872 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 348255 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 307-3 chr11 11857140 11857596 + 1.33333 NA intron (NM_017944, intron 1 of 26) intron (NM_017944, intron 1 of 26) 15945 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 208.333-141 chr7 44338184 44338366 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -12644 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 294.333-37 chr6 62409196 62409652 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -123197 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 402.333-8 chr22 28610141 28610621 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1PA6|LINE|L1 69484 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 178.333-57 chr15 79139270 79139433 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -48571 NM_001145648 5923 Hs.459035 NM_002891 ENSG00000058335 RASGRF1 CDC25|CDC25L|GNRP|GRF1|GRF55|H-GRF55|PP13187|ras-GRF1 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1 protein-coding 194.666-32 chr19 52156023 52156179 + 1.33333 NA exon (NM_001102657, exon 5 of 5) exon (NM_001102657, exon 5 of 5) 15520 NM_001102657 162962 Hs.631584 NM_001102657 ENSG00000196267 ZNF836 - zinc finger protein 836 protein-coding 273.666-21 chr4 149459376 149459722 + 1.33333 NA intron (NM_001363507, intron 12 of 13) L1MB3|LINE|L1 305254 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 223.333-155 chr7 68544531 68544822 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 524423 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 172.333-21 chr10 82975376 82975573 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 9 of 10) intron (NR_163253, intron 9 of 10) 701615 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 265-20 chr14 80910645 80911033 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 4 of 24) L1MC5|LINE|L1 30899 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 278-28 chr22 33758231 33758538 + 1.33333 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) L3|LINE|CR1 33398 NR_038950 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 257.333-49 chr2 14886914 14887227 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 254353 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 256.667-84 chr8 89835892 89836198 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65823 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 247.333-39 chr2 16842679 16843022 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -177016 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 214-13 chr10 17521807 17522105 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -67361 NR_144322 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 380.666-15 chr8 49326631 49327070 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 185330 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 171.666 chr1 190831290 190831606 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 206558 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 288.666-37 chr7 112172251 112172574 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 33987 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 168.666-4 chr12 46147930 46148102 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118500 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 209.333-72 chr15 56488566 56488829 + 1.33333 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -23560 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 243.333-40 chr17 5978968 5979297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -91482 NM_015253 23302 Hs.370166 NM_015253 ENSG00000179314 WSCD1 - WSC domain containing 1 protein-coding 207.666-56 chr6 98283961 98284170 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 259534 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 192.333-30 chr11 34397987 34398223 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40095 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 202.666-83 chr4 13234942 13235145 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 249297 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 224.667-27 chr15 81963145 81963433 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 82729 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 348.333-20 chr3 72131289 72131654 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -19786 NR_038221 201617 Hs.382623 NR_038221 ENSG00000243083 LINC00870 - long intergenic non-protein coding RNA 870 ncRNA 262.333-27 chr15 57242164 57242425 + 1.33333 NA intron (NM_207038, intron 12 of 19) intron (NM_207038, intron 12 of 19) 22864 NM_001306219 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 261.666-12 chr20 45755220 45755599 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 33062 NM_178455 391253 Hs.677891 NM_178455 ENSG00000149651 SPINT4 C20orf137|SPINT3|dJ601O1.1 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 protein-coding 291.333-52 chr5 38980110 38980428 + 1.33333 NA intron (NM_001285439, intron 8 of 38) L1MEg|LINE|L1 94130 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 184.667-12 chr1 222974400 222974615 + 1.33333 NA intron (NM_001369594, intron 2 of 7) intron (NM_001369594, intron 2 of 7) 46083 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 152.666-2 chr11 115280012 115280152 + 1.33333 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -53495 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 221.333-61 chr2 51353796 51354123 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) intron (NR_135237, intron 3 of 10) 321358 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 287.333-32 chr2 151490258 151490681 + 1.33333 NA exon (NM_004543, exon 147 of 149) exon (NM_004543, exon 147 of 149) 80567 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 346.666-8 chr18 73676225 73676671 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 351507 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 188.333-82 chr2 189807089 189807256 + 1.33333 NA TTS (NM_001321049) TTS (NM_001321049) 22722 NM_001321048 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 215.666-35 chr7 22120279 22120505 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001367600, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001367600, exon 16 of 16) 73353 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 271.333-18 chr17 61297028 61297373 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L2c|LINE|L2 70504 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 229-9 chr10 71530084 71530341 + 1.33333 NA intron (NM_052836, intron 6 of 12) intron (NM_052836, intron 6 of 12) -18292 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 338.666-5 chr16 7575928 7576287 + 1.33333 NA intron (NM_145893, intron 2 of 13) AluJr|SINE|Alu 243262 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 207.666-38 chr3 122627248 122627498 + 1.33333 NA intron (NM_152615, intron 5 of 7) intron (NM_152615, intron 5 of 7) 11758 NM_152615 165631 Hs.120250 NM_152615 ENSG00000173200 PARP15 ARTD7|BAL3|pART7 poly(ADP-ribose) polymerase family member 15 protein-coding 350-33 chr6 61928159 61928551 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) intron (NR_146874, intron 4 of 13) 354225 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 302.666-2 chr1 33357092 33357388 + 1.33333 NA intron (NM_198040, intron 6 of 13) intron (NM_198040, intron 6 of 13) 6888 NR_125978 101929464 Hs.568627 NR_125978 ENSG00000233246 LOC101929464 - uncharacterized LOC101929464 ncRNA 229.999-8 chr4 38982624 38982809 + 1.33333 NA intron (NM_024943, intron 5 of 6) MLT2A2|LTR|ERVL 49693 NM_024943 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 205.666-17 chr14 73114907 73115165 + 1.33333 NA intron (NM_021239, intron 18 of 18) intron (NM_021239, intron 18 of 18) -21471 NM_000021 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 156-55 chr15 96825171 96825335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 41818 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 271-26 chr2 146823757 146824191 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 236917 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 654 chr12 10300283 10301263 + 1.33333 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -3673 NM_001114396 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 314.333-11 chr17 28768320 28768774 + 1.33333 NA intron (NM_001288631, intron 1 of 3) intron (NM_001288631, intron 1 of 3) 24536 NM_004295 9618 Hs.8375 NM_004295 ENSG00000076604 TRAF4 CART1|MLN62|RNF83 TNF receptor associated factor 4 protein-coding 226-52 chr20 53614778 53615050 + 1.33333 NA intron (NR_134576, intron 1 of 2) intron (NR_134576, intron 1 of 2) 6560 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 220-111 chr7 42207467 42207684 + 1.33333 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) L1ME4a|LINE|L1 29634 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 142-97 chr3 194970306 194970514 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -124178 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 325.333-13 chr14 61998433 61998986 + 1.33333 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) L1ME1|LINE|L1 71014 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 181.333-3 chr1 73480690 73480863 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 174606 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 327.333-27 chr3 95234087 95234414 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 295987 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 202.666-22 chr11 82745342 82745500 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -11557 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 269.667-17 chr12 39545765 39546273 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 73784 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 200.666-110 chr7 11784366 11784569 + 1.33333 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L1MEd|LINE|L1 47731 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 156-148 chr9 125723026 125723365 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15961 NM_024117 79109 Hs.495138 NM_024117 ENSG00000119487 MAPKAP1 JC310|MIP1|SIN1|SIN1b|SIN1g MAPK associated protein 1 protein-coding 371.333-18 chr4 47885660 47885989 + 1.33333 NA intron (NR_103795, intron 13 of 23) intron (NR_103795, intron 13 of 23) -28403 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 185-43 chr3 15653458 15653726 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001281724, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001281724, exon 6 of 6) 43779 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 204.666-92 chr7 120406688 120406908 + 1.33333 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 133623 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 273.333-70 chr7 89226475 89226769 + 1.33333 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) intron (NM_181646, intron 2 of 3) -430885 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 336.666-24 chr8 130820053 130820369 + 1.33333 NA intron (NM_001115, intron 13 of 17) intron (NM_001115, intron 13 of 17) 220698 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 262.666-21 chr6 41095666 41095980 + 1.33333 NA intron (NM_021705, intron 8 of 8) L2b|LINE|L2 1964 NM_001329684 221443 Hs.227457 NM_145063 ENSG00000124596 OARD1 C6orf130|TARG1|dJ34B21.3 O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 protein-coding 293.333-10 chr13 67215370 67215748 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001318374, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001318374, exon 2 of 2) 14777 NM_001318372 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 168.667-109 chr2 144885693 144885895 + 1.33333 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) L1ME4b|LINE|L1 217827 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 214-49 chr17 62196194 62196484 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 79316 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 197-18 chr10 57173612 57173909 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 130799 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 264.666-2 chr1 70555418 70555744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 144313 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 267.333-45 chr19 49375428 49375868 + 1.33333 NA TTS (NM_001197302) TTS (NM_001197302) 11771 NM_001197301 27120 Hs.515855 NM_014419 ENSG00000104901 DKKL1 CT34|SGY|SGY-1|SGY1 dickkopf like acrosomal protein 1 protein-coding 531-3 chr4 49154399 49154988 + 1.33333 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 168051 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 250.667-57 chr4 56581344 56581706 + 1.33333 NA intron (NM_001256475, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu 50919 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 176-37 chr15 98723639 98723844 + 1.33333 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) -60685 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 220-103 chr6 84643879 84644074 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45482 NR_125875 102724201 Hs.667523 NR_125875 ENSG00000228290 TBX18-AS1 - TBX18 antisense RNA 1 ncRNA 193.666-25 chr2 140298516 140298686 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 83 of 90) intron (NM_018557, intron 83 of 90) 288084 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 169.667-207 chr8 83122433 83122679 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 210452 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 164.666-12 chr3 103804128 103804450 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -280173 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 160-108 chr7 36978645 36978814 + 1.33333 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) intron (NM_001206480, intron 16 of 21) 6383 NM_001039459 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 228.333-89 chr7 45313484 45313724 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 155813 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 400.666-2 chr13 60571284 60571635 + 1.33333 NA intron (NM_030794, intron 13 of 13) intron (NM_030794, intron 13 of 13) -101496 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 414.667-10 chr2 188983329 188983919 + 1.33333 NA intron (NM_000090, intron 1 of 50) intron (NM_000090, intron 1 of 50) -5463 NR_039947 100616324 NR_039947 ENSG00000283238 MIR1245B - microRNA 1245b ncRNA 164-78 chr3 193366022 193366259 + 1.33333 NA intron (NM_198505, intron 1 of 29) intron (NM_198505, intron 1 of 29) 12613 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 202.666-126 chr8 126096758 126096988 + 1.33333 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL -145676 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 288.666-40 chrX 24686541 24686945 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7175 NM_001330360 5422 Hs.567319 NM_016937 ENSG00000101868 POLA1 NSX|POLA|p180 DNA polymerase alpha 1, catalytic subunit protein-coding 280.333-3 chr10 52968107 52968418 + 1.33333 NA Intergenic LTR24C|LTR|ERV1 -196562 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 121.333-160 chr6 71644088 71644241 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 223137 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 227.999-5 chr5 128291098 128291334 + 1.33333 NA intron (NM_001999, intron 49 of 64) intron (NM_001999, intron 49 of 64) 207450 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 225.666-23 chr5 14009749 14010050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65419 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 227.333-38 chr15 34037938 34038288 + 1.33333 NA intron (NM_020371, intron 1 of 5) intron (NM_020371, intron 1 of 5) 1091 NM_020371 57099 Hs.555966 NM_020371 ENSG00000169857 AVEN PDCD12 apoptosis and caspase activation inhibitor protein-coding 212.666-102 chrX 126192128 126192299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25924 NM_001013628 340578 Hs.181867 NM_001013628 ENSG00000198354 DCAF12L2 WDR40C DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 2 protein-coding 208.333-146 chr8 100823615 100823934 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101686 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 212-136 chr6 38781388 38781618 + 1.33333 NA intron (NM_001371, intron 15 of 91) intron (NM_001371, intron 15 of 91) 66192 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 292.333-44 chr8 94344323 94344591 + 1.33333 NA Intergenic Alu|SINE|Alu -82138 NM_181702 2669 Hs.654463 NM_005261 ENSG00000164949 GEM KIR GTP binding protein overexpressed in skeletal muscle protein-coding 207.666-10 chr11 4904017 4904253 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3235 NM_001004749 119687 Hs.553560 NM_001004749 ENSG00000176895 OR51A7 OR11-27 olfactory receptor family 51 subfamily A member 7 protein-coding 275.667-63 chr8 73580776 73581232 + 1.33333 NA intron (NM_001164384, intron 10 of 10) intron (NM_001164384, intron 10 of 10) 160930 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 352.667-2 chr1 159986496 159986981 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25514 NR_038849 100505633 Hs.445045 NR_038849 ENSG00000224259 LINC01133 - long intergenic non-protein coding RNA 1133 ncRNA 278-65 chr8 88667116 88667364 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -339757 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 144.667-75 chr13 101789049 101789217 + 1.33333 NA intron (NM_175929, intron 3 of 4) intron (NM_175929, intron 3 of 4) 127512 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 227-20 chr14 76959458 76959736 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_133913) promoter-TSS (NR_133913) -41 NR_133913 105370578 Hs.574184 NR_133913 ENSG00000258602 LINC01629 linc-KIAA1737-2 long intergenic non-protein coding RNA 1629 ncRNA 180.333-139 chr8 117763837 117763984 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 157003 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 260.666-8 chr11 125662941 125663370 + 1.33333 NA intron (NM_001330427, intron 12 of 12) L1MD1|LINE|L1 17692 NM_001612 56 Hs.169222 NM_001612 ENSG00000134940 ACRV1 D11S4365|SP-10|SPACA2 acrosomal vesicle protein 1 protein-coding 199.666-5 chr10 52613892 52614069 + 1.33333 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 141424 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 236.666-50 chr9 4644929 4645109 + 1.33333 NA intron (NR_148446, intron 2 of 8) MER58B|DNA|hAT-Charlie 17204 NR_148448 55064 Hs.179615 NM_017985 ENSG00000106686 SPATA6L C9orf68|bA6J24.2 spermatogenesis associated 6 like protein-coding 172-55 chr2 61482229 61482413 + 1.33333 NA intron (NM_003400, intron 23 of 24) AluJo|SINE|Alu -11234 NM_014709 9736 Hs.644708 NM_014709 ENSG00000115464 USP34 - ubiquitin specific peptidase 34 protein-coding 189.333-88 chr2 13162407 13162573 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -155477 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 179-25 chr13 84531552 84531793 + 1.33333 NA intron (NR_046871, intron 3 of 6) intron (NR_046871, intron 3 of 6) -251982 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 202.666-16 chr10 74300568 74300738 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) AluSz|SINE|Alu 123890 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 156.666-12 chr4 88031031 88031167 + 1.33333 NA intron (NR_156488, intron 2 of 13) MER47B|DNA|TcMar-Tigger 23464 NR_156488 5311 Hs.181272 NM_000297 ENSG00000118762 PKD2 APKD2|PC2|PKD4|Pc-2|TRPP2 polycystin 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 136-19 chr12 42368525 42368735 + 1.33333 NA intron (NM_001364830, intron 3 of 6) MER103C|DNA|hAT-Charlie 36832 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 336.999-4 chr8 82707790 82708144 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -204137 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 221.333-17 chr10 80182299 80182484 + 1.33333 NA intron (NM_001278408, intron 1 of 16) HAL1ME|LINE|L1 22100 NM_001278408 311 Hs.530291 NM_001157 ENSG00000122359 ANXA11 ALS23|ANX11|CAP-50|CAP50 annexin A11 protein-coding 224.333-20 chr10 105812477 105812666 + 1.33333 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) intron (NR_120625, intron 3 of 3) 7762 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 211.333-113 chr2 67389870 67390098 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7349 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 212-21 chr10 21982102 21982328 + 1.33333 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) MER31B|LTR|ERV1 21515 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 455.333-2 chr11 100682658 100683172 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4373 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 376-5 chr12 90186492 90186955 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -106595 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 301.333-34 chr3 83191784 83192209 + 1.33333 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 1205854 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 202.333-28 chr10 77383469 77383620 + 1.33333 NA intron (NM_001271518, intron 1 of 27) L1MB3|LINE|L1 32672 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 248.333-97 chr7 135906834 135907134 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 70375 NM_001128619 767558 Hs.602015 NM_001128619 ENSG00000267697 LUZP6 MPD6|MTPNUT leucine zipper protein 6 protein-coding 196-184 chr8 105249381 105249637 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -68929 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 438.666-6 chr2 18329663 18330302 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 230671 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 179.333-57 chr13 61572960 61573184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -145126 NR_134946 101926951 Hs.732367 NR_134946 ENSG00000279797 LINC02339 - long intergenic non-protein coding RNA 2339 ncRNA 194.666-29 chr18 3487266 3487426 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21096 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 340.666-6 chr12 12507245 12507562 + 1.33333 NA intron (NM_030640, intron 3 of 6).2 intron (NM_030640, intron 3 of 6).2 55460 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 234.666-41 chr6 48769079 48769284 + 1.33333 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 694072 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 204.333-60 chr14 102478466 102478643 + 1.33333 NA intron (NM_014844, intron 17 of 19) AluJb|SINE|Alu 31222 NM_001348651 122416 Hs.432945 NM_152326 ENSG00000156381 ANKRD9 - ankyrin repeat domain 9 protein-coding 217.666-25 chr3 33503418 33503700 + 1.33333 NA intron (NM_001365634, intron 34 of 35) AluSx1|SINE|Alu -63154 NM_001128161 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 219.333-73 chr17 53699180 53699466 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -123604 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 383.332 chr18 6927327 6927644 + 1.33333 NA non-coding (NR_034100, exon 4 of 7) non-coding (NR_034100, exon 4 of 7) 2384 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 288.667-21 chr4 60911791 60912150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10649 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 300-60 chr7 3324304 3324636 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 23218 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 200-124 chr5 22469412 22469689 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -255700 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 174.667-75 chr19 39538491 39538738 + 1.33333 NA TTS (NM_153232) TTS (NM_153232) 1547 NM_153232 163126 Hs.18949 NM_153232 ENSG00000176396 EID2 CRI2|EID-2 EP300 interacting inhibitor of differentiation 2 protein-coding 200-95 chr20 60634754 60635014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70322 NR_039653 100616440 NR_039653 ENSG00000265617 MIR548AG2 - microRNA 548ag-2 ncRNA 411.333-10 chr2 62884364 62884973 + 1.33333 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) intron (NM_001142615, intron 10 of 22) 163043 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 268.333-31 chr2 50084960 50085285 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 19 of 22) intron (NM_001330093, intron 19 of 22) -110919 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 158.666-17 chr3 193252251 193252454 + 1.33333 NA intron (NM_001366112, intron 2 of 4) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 10573 NR_026877 84789 Hs.676481 NM_032703 MGC2889 - uncharacterized protein MGC2889 ncRNA 220-125 chr8 139899200 139899404 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 20 of 22) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -196179 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 182-54 chr2 182388856 182388999 + 1.33333 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) L1M1|LINE|L1 38121 NM_001258313 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 334.666-19 chr8 120921823 120922294 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -110012 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 583.333 chr12 86624913 86625699 + 1.33333 NA intron (NM_001351285, intron 2 of 8) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 119843 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 168.666-12 chr3 30406236 30406408 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -112546 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 326.333-39 chr9 25616753 25617034 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 61965 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 282.333-5 chr10 73138249 73138707 + 1.33333 NA intron (NM_007265, intron 11 of 13) intron (NM_007265, intron 11 of 13) -12271 NR_145776 109617000 NR_145776 ENSG00000221164 SNORA11F - small nucleolar RNA, H/ACA box 11F snoRNA 209.333-246 chr8 129266326 129266490 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25168 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 215.666-16 chr15 27625512 27625706 + 1.33333 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -464290 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 203.666-20 chr12 124067163 124067332 + 1.33333 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) MamRep605|LTR?|LTR? 94032 NM_001204298 144348 Hs.524828 NM_152437 ENSG00000179195 ZNF664 ZFOC1|ZNF176 zinc finger protein 664 protein-coding 160-124 chr8 122886361 122886599 + 1.33333 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) L1MC2|LINE|L1 104825 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 165.666-6 chr8 97866365 97866513 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2625 NM_001317748 4147 Hs.189445 NM_002380 ENSG00000132561 MATN2 - matrilin 2 protein-coding 206.666-83 chr4 44066547 44066706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49564 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 212.666-57 chr4 15577447 15577662 + 1.33333 NA intron (NM_001080522, intron 30 of 37) intron (NM_001080522, intron 30 of 37) 77803 NM_012161 26234 Hs.643433 NM_012161 ENSG00000118564 FBXL5 FBL4|FBL5|FLR1 F-box and leucine rich repeat protein 5 protein-coding 271.999-6 chr8 114276130 114276439 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -839345 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 237-40 chr2 52031854 52032223 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -338610 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 177.333-166 chr8 75245179 75245332 + 1.33333 NA intron (NR_103849, intron 1 of 1) L1MEc|LINE|L1 33226 NR_103850 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 209.333-133 chr21 18399037 18399293 + 1.33333 NA intron (NM_002772, intron 1 of 24) MIRb|SINE|MIR 4620 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 190.333-42 chr13 36566305 36566495 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -107620 NM_203451 400120 Hs.422375 NM_203451 ENSG00000180440 SERTM1 C13orf36 serine rich and transmembrane domain containing 1 protein-coding 253.666-7 chr18 23746184 23746476 + 1.33333 NA intron (NM_001127717, intron 2 of 73) intron (NM_001127717, intron 2 of 73) 56877 NM_198129 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 193-89 chr7 111746454 111746600 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 43 of 52) intron (NM_001363540, intron 43 of 52) -61978 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 334.333-15 chr15 95982350 95982635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 145349 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 233-66 chr8 130442096 130442480 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) MIR3|SINE|MIR 1372 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 185-9 chr11 75109743 75109991 + 1.33333 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -12977 NM_001005285 341152 Hs.554515 NM_001005285 ENSG00000171561 OR2AT4 OR11-265 olfactory receptor family 2 subfamily AT member 4 protein-coding 192.666-38 chr20 12874554 12874744 + 1.33333 NA intron (NR_109868, intron 10 of 11) (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 62314 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 200-179 chr9 98450224 98450458 + 1.33333 NA intron (NM_005458, intron 7 of 18) intron (NM_005458, intron 7 of 18) -194692 NR_051978 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 211.666-37 chr4 104536170 104536393 + 1.33333 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) L1MA6|LINE|L1 -41387 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 236.666-35 chr3 96678096 96678300 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -136396 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 198.667-176 chr7 91962168 91962454 + 1.33333 NA intron (NM_147185, intron 1 of 49) intron (NM_147185, intron 1 of 49) 21436 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 256-23 chr12 109977215 109977485 + 1.33333 NA intron (NM_001330153, intron 7 of 18) AluJb|SINE|Alu 19018 NM_014776 9815 Hs.434996 NM_014776 ENSG00000139436 GIT2 CAT-2|CAT2|PKL GIT ArfGAP 2 protein-coding 154.667-207 chr2 215833928 215834150 + 1.33333 NA intron (NR_037195, intron 1 of 9) intron (NR_037195, intron 1 of 9) 9497 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 257.333-112 chr9 85993128 85993501 + 1.33333 NA intron (NM_024635, intron 11 of 22) AluSz|SINE|Alu 51785 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 196-83 chr2 32427691 32427891 + 1.33333 NA intron (NM_016252, intron 10 of 73) L1M4a1|LINE|L1 70763 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 311.667-24 chr7 30037059 30037631 + 1.33333 NA intron (NM_001363473, intron 1 of 12) intron (NM_001363473, intron 1 of 12) -7740 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 137.333-9 chr1 116512967 116513088 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -34201 NR_125972 101929023 Hs.668091 NR_125972 ENSG00000233154 LINC01762 - long intergenic non-protein coding RNA 1762 ncRNA 347-21 chr4 165699862 165700159 + 1.33333 NA intron (NR_121676, intron 3 of 5) intron (NR_121676, intron 3 of 5) 15371 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 270-61 chrX 77150151 77150370 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -135728 NR_110406 101928469 Hs.640805 NR_110400 ENSG00000280870 MIR325HG MIR384HG MIR325 host gene ncRNA 163.667-256 chr8 121449804 121450010 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -189439 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 432.333-7 chr22 28248526 28249028 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -211092 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 159.333-100 chr14 86723786 86723964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -181903 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 263.333-61 chr3 172459802 172460087 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11488 NM_198407 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 289.999 chr13 67988189 67988640 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 616027 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 196.666-29 chr15 60074319 60074519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70108 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 385-5 chr17 69313654 69314232 + 1.33333 NA intron (NM_018672, intron 1 of 37) intron (NM_018672, intron 1 of 37) 1690 NM_018672 23461 Hs.731824 NM_018672 ENSG00000154265 ABCA5 ABC13|EST90625|HTC3 ATP binding cassette subfamily A member 5 protein-coding 188-71 chr3 76741255 76741461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -298741 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 235-11 chr12 32537249 32537476 + 1.33333 NA intron (NM_001304480, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 3069 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 184.666-20 chr2 203199347 203199493 + 1.33333 NA exon (NM_001114132, exon 48 of 55) exon (NM_001114132, exon 48 of 55) -39021 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 139.666 chr8 86705952 86706118 + 1.33333 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) intron (NM_019098, intron 3 of 17) 37640 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 299.666-17 chr5 85490094 85490418 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -792188 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 160.667-192 chr3 38146393 38146619 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 7845 NM_001172568 4615 Hs.82116 NM_002468 ENSG00000172936 MYD88 MYD88D MYD88 innate immune signal transduction adaptor protein-coding 362.333-9 chr3 197306893 197307346 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7798 NM_001366203 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 212.666-3 chr1 106272631 106272871 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -244498 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 350-6 chr11 116126281 116126665 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -366273 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 148.333-155 chr16 71735755 71735965 + 1.33333 NA intron (NM_001128, intron 21 of 22) intron (NM_001128, intron 21 of 22) -11159 NM_015020 23035 Hs.709458 NM_015020 ENSG00000040199 PHLPP2 PHLPPL|PPM3B PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 protein-coding 264-38 chr4 44813654 44814144 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -87265 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 412.666-4 chr18 12718699 12719110 + 1.33333 NA intron (NM_147163, intron 4 of 6) intron (NM_147163, intron 4 of 6) 15862 NM_020232 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 239.999-8 chr4 108549369 108549614 + 1.33333 NA intron (NR_026968, intron 2 of 3) L1MA4A|LINE|L1 -7742 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 549 chr14 61650900 61651678 + 1.33333 NA intron (NR_039985, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR -44224 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 306.333-12 chr11 99978021 99978420 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 7 of 23) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 422075 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 225-51 chr5 7089293 7089546 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 179935 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 278.333-17 chr13 102990292 102990684 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 75929 NM_000452 6555 Hs.194783 NM_000452 ENSG00000125255 SLC10A2 ASBT|IBAT|ISBT|NTCP2|PBAM solute carrier family 10 member 2 protein-coding 272-43 chr5 134358645 134358968 + 1.33333 NA intron (NM_001113575, intron 3 of 12) AluJo|SINE|Alu 8268 NM_016508 51265 Hs.719926 NM_016508 ENSG00000006837 CDKL3 NKIAMRE cyclin dependent kinase like 3 protein-coding 122-4 chr1 45122063 45122167 + 1.33333 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) intron (NM_020883, intron 1 of 13) 84490 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 273.333-55 chr4 178135737 178135998 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -227931 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 417.333 chr10 104276648 104277232 + 1.33333 NA intron (NM_001191013, intron 3 of 5) intron (NM_001191013, intron 3 of 5) 1774 NM_001191015 119391 Hs.107384 NM_183239 ENSG00000065621 GSTO2 GSTO 2-2|bA127L20.1 glutathione S-transferase omega 2 protein-coding 204.667-114 chr4 182146716 182146984 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2335 NR_027107 90768 Hs.175465 NR_027107 TENM3-AS1 - TENM3 antisense RNA 1 ncRNA 370.667-13 chr2 45424511 45425034 + 1.33333 NA intron (NM_018079, intron 16 of 20) intron (NM_018079, intron 16 of 20) -169831 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 274.667-34 chr22 46808251 46808573 + 1.33333 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) intron (NM_001284305, intron 4 of 12) 34485 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 299-20 chr18 5480141 5480537 + 1.33333 NA intron (NM_001281535, intron 4 of 21) intron (NM_001281535, intron 4 of 21) 60217 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 351.333-29 chr6 161910761 161911253 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 440030 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 192.666-5 chr1 206644953 206645113 + 1.33333 NA intron (NM_001004023, intron 3 of 3) intron (NM_001004023, intron 3 of 3) 9497 NM_003582 8444 Hs.164267 NM_003582 ENSG00000143479 DYRK3 DYRK5|RED|REDK|hYAK3-2 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 3 protein-coding 208-126 chr4 102875214 102875408 + 1.33333 NA intron (NM_001008388, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 6319 NM_001008388 493856 Hs.444955 NM_001008388 ENSG00000145354 CISD2 ERIS|Miner1|NAF-1|WFS2|ZCD2 CDGSH iron sulfur domain 2 protein-coding 268-57 chr8 25334250 25334589 + 1.33333 NA intron (NM_024940, intron 21 of 51) intron (NM_024940, intron 21 of 51) -10983 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 284-34 chr3 100680466 100680896 + 1.33333 NA intron (NM_001308362, intron 9 of 9) L1MEf|LINE|L1 -28609 NM_001007565 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 164.666-8 chr15 60949634 60949808 + 1.33333 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 268152 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 282.666-22 chr6 88929188 88929507 + 1.33333 NA intron (NM_001286428, intron 1 of 13) intron (NM_001286428, intron 1 of 13) 34271 NM_001286428 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 302.333-4 chr1 190735351 190735926 + 1.33333 NA intron (NR_033922, intron 1 of 4) intron (NR_033922, intron 1 of 4) 110748 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 259.333-84 chr6 54209178 54209544 + 1.33333 NA intron (NM_138569, intron 10 of 12) intron (NM_138569, intron 10 of 12) 97918 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 217.333-157 chr8 120579661 120579924 + 1.33333 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) 134373 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 295.333-23 chr2 49697116 49697581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 276855 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 236.999-4 chr2 232140660 232140878 + 1.33333 NA intron (NR_046476, intron 8 of 20) intron (NR_046476, intron 8 of 20) -31884 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 169-50 chr2 197944290 197944649 + 1.33333 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) HAL1|LINE|L1 139876 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 306-33 chr3 19775156 19775524 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 158877 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 216.666-41 chr2 79683101 79683294 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 2 of 17) intron (NM_001282598, intron 2 of 17) -33838 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 163-68 chr5 115094404 115094654 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 75379 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 254.333-40 chr2 68169700 68169998 + 1.33333 NA intron (NM_001329916, intron 5 of 5) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 11961 NM_001329917 56902 Hs.262858 NM_020143 ENSG00000115946 PNO1 KHRBP1|RRP20 partner of NOB1 homolog protein-coding 220.666-44 chr22 31531138 31531313 + 1.33333 NA intron (NM_001007467, intron 4 of 32) intron (NM_001007467, intron 4 of 32) 34689 NM_014775 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 246.333-79 chr5 109940107 109940306 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 57024 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 181-21 chr14 51729635 51729800 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_152330, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_152330, exon 14 of 14) 12434 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 246-83 chr5 25939472 25939787 + 1.33333 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 748676 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 186.333-46 chr13 61151866 61152030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47932 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 240-85 chr8 38589753 38590192 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 11285 NR_003129 286140 Hs.512071 NR_003129 RNF5P1 - ring finger protein 5 pseudogene 1 pseudo 202.666-90 chr5 20283497 20283702 + 1.33333 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) L1MA3|LINE|L1 -21952 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-195 chr5 133938752 133938964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25181 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 360.999-2 chr3 63046316 63046964 + 1.33333 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL -56048 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 232.333-72 chr6 38544079 38544324 + 1.33333 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger 51866 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 229.999-5 chr16 89204085 89204331 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -3671 NM_001366322 146429 Hs.447544 NM_001242757 ENSG00000259803 SLC22A31 - solute carrier family 22 member 31 protein-coding 245.333-40 chr14 46476332 46476557 + 1.33333 NA intron (NR_102700, intron 1 of 1) L1M5|LINE|L1 5085 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 202.667-123 chr5 124954679 124954932 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -82026 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 194-2 chr1 180727137 180727337 + 1.33333 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) intron (NR_137330, intron 2 of 12) 95215 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 305-35 chr8 138448939 138449423 + 1.33333 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 48080 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 348.333-13 chr15 77222808 77223204 + 1.33333 NA TTS (NR_026813) TTS (NR_026813) 2398 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 218.666-44 chr2 124005588 124005852 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 19454 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 284-32 chr3 64338194 64338608 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -70228 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 139.333-231 chr9 102881944 102882085 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -113319 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 204.666-94 chr8 4966698 4966945 + 1.33333 NA intron (NM_033225, intron 1 of 69) intron (NM_033225, intron 1 of 69) 28093 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 255.333-62 chr20 21752609 21752936 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47108 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 200.667-3 chr1 38357951 38358187 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -117127 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 412.999 chr17 61709528 61710132 + 1.33333 NA intron (NM_032043, intron 17 of 19) intron (NM_032043, intron 17 of 19) -118611 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 201.333-291 chr8 123966307 123966522 + 1.33333 NA intron (NM_001039112, intron 5 of 40) intron (NM_001039112, intron 5 of 40) 74368 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 219.666-37 chr5 161864861 161865086 + 1.33333 NA intron (NM_000806, intron 4 of 10) intron (NM_000806, intron 4 of 10) 14248 NM_001127648 2554 Hs.175934 NM_000806 ENSG00000022355 GABRA1 ECA4|EIEE19|EJM|EJM5 gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit protein-coding 226.667-91 chr7 112820090 112820367 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_152556, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_152556, exon 5 of 5) -29805 NR_109840 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 209.333-125 chr2 190815014 190815194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65717 NM_001256310 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 429.333-3 chr12 57273622 57274155 + 1.33333 NA intron (NM_001351215, intron 12 of 22) intron (NM_001351215, intron 12 of 22) -22701 NR_104422 246329 Hs.417595 NM_145064 ENSG00000185482 STAC3 MYPBB|NAM SH3 and cysteine rich domain 3 protein-coding 164.666-11 chr3 68103440 68103584 + 1.33333 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 99265 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 262-76 chr8 80317353 80317701 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 76138 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 230.333-116 chr8 11988635 11988994 + 1.33333 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 6493 NM_001033017 613209 Hs.558284 NM_001033017 ENSG00000205883 DEFB135 DEFB136 defensin beta 135 protein-coding 222.666-29 chr3 21746014 21746208 + 1.33333 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) intron (NM_024697, intron 1 of 7) 5099 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 244.666-14 chr13 38056543 38056959 + 1.33333 NA intron (NR_047500, intron 5 of 5) intron (NR_047500, intron 5 of 5) 86481 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 311-31 chr6 34399184 34399533 + 1.33333 NA intron (NM_001202470, intron 5 of 8) AluSx|SINE|Alu -6689 NM_006703 11165 Hs.188882 NM_006703 ENSG00000272325 NUDT3 DIPP|DIPP-1|DIPP1 nudix hydrolase 3 protein-coding 232.667-71 chr7 27998536 27998918 + 1.33333 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -181730 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 221-10 chr1 237148640 237148885 + 1.33333 NA intron (NM_001035, intron 1 of 104) MIRb|SINE|MIR 106578 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 180.666-14 chr2 36404095 36404259 + 1.33333 NA intron (NM_016441, intron 2 of 16) intron (NM_016441, intron 2 of 16) 48399 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 192-97 chr3 166651336 166651580 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -247225 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 224.666-32 chr5 142704358 142704564 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -6391 NM_001257205 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 319.333-16 chr2 101767215 101767567 + 1.33333 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 69684 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 278-9 chr11 112192370 112192651 + 1.33333 NA intron (NM_031938, intron 2 of 11) intron (NM_031938, intron 2 of 11) 16144 NM_001256397 83875 Hs.728325 NM_031938 ENSG00000197580 BCO2 B-DIOX-II|BCDO2 beta-carotene oxygenase 2 protein-coding 328.333-3 chr1 91322531 91322814 + 1.33333 NA intron (NM_001017975, intron 23 of 38) intron (NM_001017975, intron 23 of 38) 82165 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 196.666-50 chr2 113045935 113046146 + 1.33333 NA intron (NM_173178, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 6827 NM_014438 27177 Hs.278909 NM_014438 ENSG00000136696 IL36B FIL1|FIL1-(ETA)|FIL1H|FILI-(ETA)|IL-1F8|IL-1H2|IL1-ETA|IL1F8|IL1H2 interleukin 36 beta protein-coding 215.666-17 chr15 87785285 87785485 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 160883 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 182.666-19 chr18 4140247 4140407 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) L1MA1|LINE|L1 -124275 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 193.333-7 chr1 107891043 107891208 + 1.33333 NA intron (NM_006113, intron 1 of 26) intron (NM_006113, intron 1 of 26) -6098 NR_107006 102465839 NR_107006 ENSG00000275455 MIR7852 hsa-mir-7852 microRNA 7852 ncRNA 222-64 chr3 132927479 132927737 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -110680 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 216.666-63 chr7 8955339 8955546 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 521833 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 195-13 chr10 12445768 12445919 + 1.33333 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) intron (NM_001351032, intron 3 of 11) 56861 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 250.667-88 chr9 29253151 29253489 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -39719 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 242.333-23 chr12 113034453 113034772 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -23245 NM_004416 1840 Hs.372152 NM_004416 ENSG00000135144 DTX1 RNF140|hDx-1 deltex E3 ubiquitin ligase 1 protein-coding 210.666-41 chr15 63314527 63314719 + 1.33333 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 37018 NM_031301 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 368.666-19 chr8 131790833 131791258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -113048 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 117.333-187 chr7 18709616 18709762 + 1.33333 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) L2b|LINE|L2 200419 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 403.333-5 chr2 172149794 172150161 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46971 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 161-86 chr6 64628822 64629008 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) L1MC3|LINE|L1 -672503 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 210.666-70 chr3 143975713 143975965 + 1.33333 NA intron (NM_001134470, intron 1 of 2) intron (NM_001134470, intron 1 of 2) 2758 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 295.666-2 chr10 17708141 17708508 + 1.33333 NA intron (NM_001324284, intron 13 of 14) MER58B|DNA|hAT-Charlie -43877 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 180.666-16 chr2 85082352 85082524 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15091 NR_146453 100996478 Hs.434398 NR_146453 ENSG00000260840 LINC01964 - long intergenic non-protein coding RNA 1964 ncRNA 256-78 chr5 94072326 94072633 + 1.33333 NA intron (NM_001163418, intron 1 of 8) L1MD2|LINE|L1 39184 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 198-3 chr1 45596260 45596420 + 1.33333 NA intron (NM_001195193, intron 2 of 12) L1MB2|LINE|L1 12299 NM_002482 4678 Hs.319334 NM_002482 ENSG00000132780 NASP FLB7527|HMDRA1|PRO1999 nuclear autoantigenic sperm protein protein-coding 244.666-12 chr11 83207694 83207882 + 1.33333 NA intron (NM_001300975, intron 3 of 10) intron (NM_001300975, intron 3 of 10) 14076 NR_125355 338699 Hs.503438 NM_182603 ENSG00000137494 ANKRD42 PPP1R79|SARP ankyrin repeat domain 42 protein-coding 217.666-29 chr3 105339753 105339990 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26842 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 298-13 chr10 81413299 81413597 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -461746 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 112-174 chr5 91581073 91581241 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -197840 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 203-92 chr6 20055950 20056222 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 156383 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 203-76 chr5 19535757 19536033 + 1.33333 NA intron (NM_001349559, intron 9 of 12) intron (NM_001349559, intron 9 of 12) 350377 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 219.666-33 chr4 169647704 169647958 + 1.33333 NA intron (NM_173872, intron 2 of 13) L1MD3|LINE|L1 -12231 NM_001243374 1182 Hs.481186 NM_001829 ENSG00000109572 CLCN3 CLC3|ClC-3 chloride voltage-gated channel 3 protein-coding 231-59 chr7 75689645 75689961 + 1.33333 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) intron (NM_005338, intron 1 of 30) 49138 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 135.666-8 chr8 86683185 86683437 + 1.33333 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) intron (NM_019098, intron 3 of 17) 60364 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 229.666-10 chr13 89283352 89283564 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -46568 NR_131229 105616982 Hs.564527 NR_131229 ENSG00000232225 LINC01047 - long intergenic non-protein coding RNA 1047 ncRNA 286.666-15 chr3 191389280 191389595 + 1.33333 NA intron (NM_178335, intron 10 of 11) intron (NM_178335, intron 10 of 11) -36087 NR_120606 103344926 NR_120606 LINCR-0002 - uncharacterized LincR-0002 ncRNA 203.333-25 chr10 20267257 20267463 + 1.33333 NA intron (NM_032812, intron 13 of 13) MIR1_Amn|SINE|MIR -284610 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 221.666-29 chr2 105634035 105634318 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23617 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 149.333-160 chr18 71021767 71021901 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -370880 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 290.667-19 chr17 62311908 62312396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36497 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 226.666-26 chr3 192793584 192793778 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66140 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 229.333-13 chr10 107321696 107321947 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157115 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 142.666-4 chr12 24753207 24753354 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 148942 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 236-60 chr4 13545705 13545915 + 1.33333 NA TTS (NR_015450) TTS (NR_015450) -1302 NM_001189 579 Hs.590927 NM_001189 ENSG00000109705 NKX3-2 BAPX1|NKX3.2|NKX3B|SMMD NK3 homeobox 2 protein-coding 353-7 chr15 57144052 57144356 + 1.33333 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) intron (NM_207038, intron 5 of 19) -75226 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 237-5 chr1 165003589 165003865 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -229086 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 260.666-29 chr5 155520101 155520372 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 506481 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 318.667-9 chr12 121274928 121275331 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001270486) promoter-TSS (NM_001270486) -544 NM_001270486 10645 Hs.297343 NM_006549 ENSG00000110931 CAMKK2 CAMKK|CAMKKB calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 protein-coding 180.666-29 chr6 61594868 61595032 + 1.33333 NA intron (NR_146870, intron 14 of 15) LTR49-int|LTR|ERV1 20820 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 220.666-9 chr10 32145704 32145969 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89411 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 201.333-201 chr3 172367510 172367712 + 1.33333 NA intron (NM_001135095, intron 23 of 25) intron (NM_001135095, intron 23 of 25) 80845 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 504.667 chr1 191893059 191893796 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -265035 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 255.333-36 chr15 57076179 57076414 + 1.33333 NA intron (NM_001322158, intron 5 of 20) intron (NM_001322158, intron 5 of 20) -143134 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 321.333-48 chr5 75235460 75235734 + 1.33333 NA intron (NM_001164443, intron 1 of 24) intron (NM_001164443, intron 1 of 24) 1281 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 148-97 chr3 23793374 23793577 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12480 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 194-63 chr19 56050990 56051197 + 1.33333 NA intron (NM_153447, intron 12 of 14) intron (NM_153447, intron 12 of 14) -15591 NR_110741 101928886 Hs.434652 NR_110741 ENSG00000267522 LINC01864 - long intergenic non-protein coding RNA 1864 ncRNA 286 chr1 46120818 46121088 + 1.33333 NA intron (NM_001303427, intron 1 of 9) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 9720 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 222.667-68 chr4 136496694 136497030 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -583182 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 178.667-141 chr6 56837418 56837635 + 1.33333 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 6139 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 404-4 chr12 46557496 46558091 + 1.33333 NA intron (NR_125380, intron 3 of 3) intron (NR_125380, intron 3 of 3) 173686 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 233-39 chr2 52614361 52614790 + 1.33333 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR 88040 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 190-18 chr11 87276306 87276503 + 1.33333 NA intron (NR_033149, intron 5 of 13) L3|LINE|CR1 238470 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 188.666-16 chr15 42135547 42135716 + 1.33333 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 21005 NR_033151 255189 Hs.231873 NM_213600 ENSG00000168907 PLA2G4F PLA2G4FZ phospholipase A2 group IVF protein-coding 148.666-3 chr16 69900041 69900163 + 1.33333 NA intron (NM_001270453, intron 5 of 20) L1ME4a|LINE|L1 -24937 NM_199424 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 265.333-15 chr11 43250071 43250527 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 19070 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 270-54 chr5 127518125 127518377 + 1.33333 NA intron (NM_130809, intron 1 of 8) intron (NM_130809, intron 1 of 8) 611 NM_001286808 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 246.333-36 chr16 48418597 48418899 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -33335 NM_003031 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 189.333-215 chr9 28386851 28387011 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 332374 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 296.333-14 chr15 77297015 77297333 + 1.33333 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) -71770 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 205.333-17 chr1 115683314 115683485 + 1.33333 NA intron (NM_001172411, intron 5 of 7) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 40770 NM_001172412 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 201-33 chr13 90593325 90593505 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100127 NR_120414 101927224 Hs.385801 NR_120414 LINC01049 - long intergenic non-protein coding RNA 1049 ncRNA 188.333-123 chr5 132603302 132603488 + 1.33333 NA exon (NM_005732, exon 14 of 25) exon (NM_005732, exon 14 of 25) 38395 NR_132124 101927761 Hs.598812 NR_132124 ENSG00000223442 TH2LCRR TH2-LCR T helper type 2 locus control region associated RNA ncRNA 372.333-6 chr12 45663064 45663548 + 1.33333 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 64615 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 196.333-136 chr4 168321235 168321460 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2595 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 201.666-2 chr1 173401216 173401449 + 1.33333 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 60030 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 285.667-14 chr14 65465941 65466501 + 1.33333 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) L1MCa|LINE|L1 -4881 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 206.667-73 chr2 241730975 241731267 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -3509 NM_001352824 728294 Hs.516813 NM_152783 ENSG00000180902 D2HGDH D2HGD D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase protein-coding 214-113 chr6 36521936 36522225 + 1.33333 NA intron (NM_007271, intron 4 of 13) intron (NM_007271, intron 4 of 13) 25399 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 474.333-4 chr7 6610621 6611086 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4757 NM_017560 54753 Hs.592170 NM_017560 ENSG00000236609 ZNF853 - zinc finger protein 853 protein-coding 202-23 chr10 99681748 99681907 + 1.33333 NA intron (NM_001349962, intron 6 of 13) L1MB1|LINE|L1 22198 NM_001349963 57089 Hs.28326 NM_020354 ENSG00000198018 ENTPD7 LALP1 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 protein-coding 218-55 chr2 142623685 142623898 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -253873 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 211.333-251 chr9 2837339 2837608 + 1.33333 NA intron (NM_014878, intron 2 of 17) intron (NM_014878, intron 2 of 17) 6622 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 226-94 chr8 126414919 126415219 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 89574 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 172.333-102 chr22 34703549 34703765 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 294259 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 209.333-201 chr6 54377575 54377840 + 1.33333 NA intron (NM_014464, intron 9 of 10) intron (NM_014464, intron 9 of 10) 69266 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 366-9 chr18 37982675 37982990 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 325697 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 235-16 chr13 62589196 62589399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 207395 NR_120404 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 206.666-81 chr3 182049643 182049834 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97374 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 203-117 chr9 90357311 90357580 + 1.33333 NA intron (NR_109795, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 76044 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 270-43 chr4 98271968 98272262 + 1.33333 NA intron (NM_001100427, intron 1 of 14) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 10731 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 141.333-53 chr13 29184285 29184489 + 1.33333 NA intron (NM_001033602, intron 3 of 13) intron (NM_001033602, intron 3 of 13) 159930 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 192.666-40 chr3 8245650 8245814 + 1.33333 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) intron (NR_033378, intron 3 of 3) -229425 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 197.333-73 chr14 85100177 85100372 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -171658 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 226.333-69 chr20 36244762 36245068 + 1.33333 NA exon (NM_001271874, exon 3 of 4) exon (NM_001271874, exon 3 of 4) 8437 NM_001271874 25980 Hs.11314 NM_015511 ENSG00000131043 AAR2 C20orf4|CGI-23 AAR2 splicing factor protein-coding 203-5 chr1 109183124 109183465 + 1.33333 NA intron (NM_001284352, intron 6 of 20) FLAM_C|SINE|Alu -3255 NM_001284353 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 275.333-24 chr15 85022967 85023330 + 1.33333 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) L2|LINE|L2 41174 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 219.333-45 chr13 32653970 32654226 + 1.33333 NA intron (NM_015032, intron 3 of 34) intron (NM_015032, intron 3 of 34) 67646 NM_015032 23047 Hs.744901 NM_015032 ENSG00000083642 PDS5B APRIN|AS3|CG008 PDS5 cohesin associated factor B protein-coding 185.666-19 chr5 102101067 102101273 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 195114 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 235-28 chr18 10877301 10877510 + 1.33333 NA intron (NM_022068, intron 4 of 51) L2|LINE|L2 -117756 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 307.666-8 chr18 7912963 7913336 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 4 of 30) L1MB8|LINE|L1 345833 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 287.999-11 chr8 126556216 126556554 + 1.33333 NA non-coding (NR_156466, exon 2 of 3) non-coding (NR_156466, exon 2 of 3) 2093 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 355.333-11 chr15 87978405 87978707 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001320134, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001320134, exon 13 of 13) -32288 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 325.333-3 chr1 117750819 117751352 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 145037 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 208-28 chr11 58460224 58460506 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -20192 NM_001004733 390191 Hs.553754 NM_001004733 ENSG00000172362 OR5B12 OR11-241|OR5B12P|OR5B16|OST743 olfactory receptor family 5 subfamily B member 12 protein-coding 209.333-175 chr4 99084696 99084984 + 1.33333 NA intron (NM_000671, intron 2 of 8) intron (NM_000671, intron 2 of 8) 3948 NM_000671 128 Hs.78989 NM_000671 ENSG00000197894 ADH5 ADH-3|ADHX|FALDH|FDH|GSH-FDH|GSNOR|HEL-S-60p alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide protein-coding 217.333-37 chr12 28653396 28653594 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -462757 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 204.333-177 chr6 75628419 75628599 + 1.33333 NA intron (NM_001100409, intron 3 of 22) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 26629 NM_015571 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 307-22 chr3 24998751 24999140 + 1.33333 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) intron (NM_001290216, intron 2 of 10) 169622 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 263.999-4 chr22 39316960 39317271 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_000026) promoter-TSS (NR_000026) -219 NR_000026 116936 NR_000026 SNORD139 RNU86|U82|U86 small nucleolar RNA, C/D box 139 snoRNA 392-8 chr2 40775725 40776157 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -263506 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 215-13 chr12 62604057 62604349 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_121682) promoter-TSS (NR_121682) 517 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 155.333-409 chr9 27971964 27972169 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) intron (NM_001354574, intron 5 of 5) -398200 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 616.999 chr5 33037544 33038281 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90469 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 234.667-98 chr6 90710466 90710777 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -123549 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 149.333-120 chr15 49955281 49955408 + 1.33333 NA intron (NR_073597, intron 14 of 26) intron (NR_073597, intron 14 of 26) 158035 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 196.666-14 chr12 34095273 34095424 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 72852 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 218.333-67 chr2 54943097 54943365 + 1.33333 NA intron (NM_001039753, intron 27 of 40) intron (NM_001039753, intron 27 of 40) 67041 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 215.333-17 chr1 246738536 246738731 + 1.33333 NA intron (NM_016002, intron 3 of 11) AluSx1|SINE|Alu 14224 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 312-20 chr16 78579243 78579633 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) L2b|LINE|L2 479784 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 218.667-38 chr15 100079303 100079615 + 1.33333 NA intron (NM_139057, intron 15 of 21) L1MB8|LINE|L1 262516 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 195.666-46 chr8 140594393 140594545 + 1.33333 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 41164 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 134.667-78 chr16 62138729 62138880 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -102366 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 319.333-34 chr8 98431969 98432334 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_020697, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_020697, exon 2 of 2) 5193 NM_020697 3788 Hs.388045 NM_020697 ENSG00000156486 KCNS2 KV9.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 2 protein-coding 146.333-196 chr3 29663926 29664174 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 270106 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 239.333-113 chr9 102586296 102586625 + 1.33333 NA intron (NR_103830, intron 3 of 4) intron (NR_103830, intron 3 of 4) 66823 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 184-18 chr12 32633331 32633591 + 1.33333 NA intron (NM_001370297, intron 12 of 14) intron (NM_001370297, intron 12 of 14) -45739 NM_012063 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 215.666-38 chr7 52690066 52690354 + 1.33333 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -345423 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 154-26 chr11 42739957 42740121 + 1.33333 NA Intergenic LTR16B|LTR|ERVL -486349 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 144.667-27 chr10 54475350 54475549 + 1.33333 NA intron (NM_001142773, intron 2 of 31) MIRb|SINE|MIR -10781 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 319.666-3 chr10 111064964 111065228 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -11933 NM_000681 150 Hs.249159 NM_000681 ENSG00000150594 ADRA2A ADRA2|ADRA2R|ADRAR|ALPHA2AAR|ZNF32 adrenoceptor alpha 2A protein-coding 190.666-42 chr4 138344379 138344530 + 1.33333 NA intron (NR_051987, intron 1 of 2) intron (NR_051987, intron 1 of 2) 34743 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 283.666-10 chr7 49213523 49213935 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 289182 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 205.333-3 chr1 28051576 28051852 + 1.33333 NA intron (NM_001282562, intron 2 of 16) L1M4|LINE|L1 36896 NM_001990 2140 Hs.185774 NM_001990 ENSG00000158161 EYA3 - EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 protein-coding 299.333-40 chr2 69864098 69864462 + 1.33333 NA intron (NM_178439, intron 10 of 13) (TGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29676 NM_006857 11017 Hs.54649 NM_006857 ENSG00000124380 SNRNP27 27K|RY1 small nuclear ribonucleoprotein U4/U6.U5 subunit 27 protein-coding 499.999-2 chr3 100267018 100267696 + 1.33333 NA intron (NM_001199198, intron 1 of 18) intron (NM_001199198, intron 1 of 18) 6365 NM_001199198 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 246.999-7 chr7 79997498 79997782 + 1.33333 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -137191 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 165.333-233 chr6 141226681 141226885 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 542969 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 198.333-38 chr12 7310746 7310998 + 1.33333 NA intron (NM_001080454, intron 3 of 12) intron (NM_001080454, intron 3 of 12) 6540 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 202.666-82 chr3 176569968 176570158 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 54960 NR_107017 102465858 NR_107017 ENSG00000283333 MIR7977 hsa-mir-7977 microRNA 7977 ncRNA 358-23 chr6 18276144 18276528 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11806 NM_001134709 7913 Hs.484813 NM_003472 ENSG00000124795 DEK D6S231E DEK proto-oncogene protein-coding 192.333-60 chr15 85947863 85948070 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 122331 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 206.333-133 chr5 89730498 89730669 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 286137 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 213-78 chr6 165519941 165520301 + 1.33333 NA intron (NM_006661, intron 3 of 22) intron (NM_006661, intron 3 of 22) 141979 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 221.333-60 chr2 49156696 49156889 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -2265 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 199.667-69 chr2 36463109 36463378 + 1.33333 NA intron (NM_016441, intron 4 of 16) intron (NM_016441, intron 4 of 16) 107465 NM_016441 51232 Hs.699247 NM_016441 ENSG00000150938 CRIM1 CRIM-1|S52 cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 protein-coding 198-166 chr6 148751374 148751571 + 1.33333 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) intron (NM_005715, intron 1 of 7) 4442 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 204.666-60 chr4 30135646 30135808 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -584642 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 202.333-151 chr5 174117055 174117298 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 71470 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 349.999-6 chr5 52233167 52233691 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 225398 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 333.333-32 chr2 189595485 189595941 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14902 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 235-13 chr12 66417079 66417471 + 1.33333 NA intron (NM_001366722, intron 15 of 24) L1MA2|LINE|L1 114730 NR_135081 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 302-59 chr6 72215682 72215950 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001350462) promoter-TSS (NM_001350462) -705 NM_001350463 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 384.667-3 chr12 129396171 129396725 + 1.33333 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 187847 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 191.333-86 chr17 21098752 21099013 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 23326 NR_110896 101060544 Hs.585812 NR_110895 ENSG00000236819 LINC01563 HP08942 long intergenic non-protein coding RNA 1563 ncRNA 252.666-39 chr6 71299066 71299361 + 1.33333 NA intron (NM_001324266, intron 6 of 6) intron (NM_001324266, intron 6 of 6) 10402 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 205-42 chr17 59000241 59000404 + 1.33333 NA intron (NM_001320990, intron 23 of 23) intron (NM_001320990, intron 23 of 23) 106558 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 259.666-17 chr17 27799445 27799746 + 1.33333 NA intron (NM_000625, intron 1 of 26) AluJo|SINE|Alu 934 NM_000625 4843 Hs.709191 NM_000625 ENSG00000007171 NOS2 HEP-NOS|INOS|NOS|NOS2A nitric oxide synthase 2 protein-coding 199.333-290 chr8 135294808 135295013 + 1.33333 NA intron (NR_120396, intron 3 of 4) intron (NR_120396, intron 3 of 4) 60779 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 277.999-8 chr3 119610101 119610327 + 1.33333 NA intron (NM_015900, intron 4 of 10) L1PA17|LINE|L1 9943 NM_001293225 51365 Hs.437451 NM_015900 ENSG00000144837 PLA1A PS-PLA1|PSPLA1 phospholipase A1 member A protein-coding 209-99 chr6 55885360 55885639 + 1.33333 NA Intergenic MER131|DNA?|DNA? -9909 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 223-65 chr8 103239489 103239810 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58845 NM_001164615 8323 Hs.591863 NM_003506 ENSG00000164930 FZD6 FZ-6|FZ6|HFZ6|NDNC10 frizzled class receptor 6 protein-coding 193.667-112 chr6 63486161 63486462 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -85701 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 346.333-21 chr3 73324895 73325402 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 108847 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 235.333-56 chr2 39332977 39333211 + 1.33333 NA intron (NM_003618, intron 7 of 33) intron (NM_003618, intron 7 of 33) -89111 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 177.333-179 chr9 72033628 72033936 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 26823 NM_001128618 138240 Hs.371235 NM_001128618 ENSG00000204669 C9orf57 - chromosome 9 open reading frame 57 protein-coding 218-10 chr10 67483973 67484210 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) L1PA16|LINE|L1 -80681 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 298.666-4 chr14 32837634 32837933 + 1.33333 NA TTS (NM_004274) TTS (NM_004274) -101096 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 207.666-51 chr5 77487419 77487680 + 1.33333 NA intron (NM_018268, intron 2 of 12) intron (NM_018268, intron 2 of 12) 4767 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 256.333-75 chr7 90956221 90956498 + 1.33333 NA intron (NM_012395, intron 8 of 13) intron (NM_012395, intron 8 of 13) 246543 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 197.666-13 chr12 9769367 9769603 + 1.33333 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -8584 NM_001781 969 Hs.208854 NM_001781 ENSG00000110848 CD69 AIM|BL-AC/P26|CLEC2C|EA1|GP32/28|MLR-3 CD69 molecule protein-coding 202-192 chr9 2104542 2104697 + 1.33333 NA intron (NM_001289397, intron 23 of 32) intron (NM_001289397, intron 23 of 32) -53043 NM_001289398 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 224.333-126 chr8 110849746 110849933 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 177594 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 205.333-38 chr10 84134419 84134710 + 1.33333 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -4945 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 196-159 chr6 62113636 62113927 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) intron (NR_146874, intron 2 of 13) 172444 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 200.333-123 chr5 99556492 99556682 + 1.33333 NA intron (NR_110562, intron 3 of 3) intron (NR_110562, intron 3 of 3) 22597 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 114.666-3 chr15 40731478 40731653 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_002875, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_002875, exon 10 of 10) 23689 NM_018145 55177 Hs.511067 NM_018145 ENSG00000137824 RMDN3 FAM82A2|FAM82C|RMD-3|RMD3|ptpip51 regulator of microtubule dynamics 3 protein-coding 172.666-27 chr9 75471976 75472138 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 383543 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 203.333-73 chr14 44753014 44753270 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45984 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 301.333-48 chr6 144574883 144575181 + 1.33333 NA intron (NM_007124, intron 49 of 73) L1ME1|LINE|L1 169377 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 202.666-37 chr14 58863583 58863757 + 1.33333 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) intron (NR_110547, intron 1 of 5) 35382 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 177.333-15 chr10 18081221 18081482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59073 NM_001167945 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 331.333-44 chr7 16769516 16769866 + 1.33333 NA intron (NM_014399, intron 1 of 5) L1MEd|LINE|L1 15936 NM_014399 27075 Hs.364544 NM_014399 ENSG00000106537 TSPAN13 NET-6|NET6|TM4SF13 tetraspanin 13 protein-coding 304-16 chr11 27693462 27693835 + 1.33333 NA intron (NR_033312, intron 8 of 8) intron (NR_033312, intron 8 of 8) 6019 NM_170734 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 203.333-104 chr17 19937634 19937923 + 1.33333 NA intron (NM_007202, intron 8 of 14) MIR3|SINE|MIR 40050 NM_007202 11216 Hs.642676 NM_007202 ENSG00000108599 AKAP10 AKAP-10|D-AKAP-2|D-AKAP2|PRKA10 A-kinase anchoring protein 10 protein-coding 165-77 chr5 45530225 45530417 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 166059 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 195.333-99 chr18 34843425 34843573 + 1.33333 NA intron (NM_032978, intron 12 of 16) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 25118 NM_032981 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 184.333-145 chr7 124841222 124841415 + 1.33333 NA intron (NM_001042594, intron 12 of 17) intron (NM_001042594, intron 12 of 17) -50508 NM_001024603 154872 Hs.444163 NM_001024603 ENSG00000275356 C7orf77 - chromosome 7 open reading frame 77 protein-coding 532.665 chr8 130692385 130692860 + 1.33333 NA Intergenic L1P4d|LINE|L1 -248948 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 209.667-28 chr11 94115622 94115919 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13071 NM_015368 24145 Hs.591976 NM_015368 ENSG00000110218 PANX1 MRS1|PX1|UNQ2529 pannexin 1 protein-coding 223.333-32 chr12 20593909 20594173 + 1.33333 NA intron (NM_001244683, intron 1 of 14) intron (NM_001244683, intron 1 of 14) 22177 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 350-27 chr5 96883980 96884389 + 1.33333 NA intron (NM_001329229, intron 3 of 17) intron (NM_001329229, intron 3 of 17) 8245 NM_001130140 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 148.333-172 chr18 13825281 13825511 + 1.33333 NA intron (NM_005913, intron 1 of 1) intron (NM_005913, intron 1 of 1) 1247 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 202.666-72 chr3 1876682 1876941 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -221992 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 245-11 chr11 105962031 105962383 + 1.33333 NA intron (NR_046356, intron 14 of 16) intron (NR_046356, intron 14 of 16) 60033 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 201-36 chr14 48261280 48261552 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -466402 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 225.666-21 chr4 45111585 45111767 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -385042 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 392.333-12 chrX 33662689 33663063 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -323488 NM_000109 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 260.333-67 chr7 104724422 104724646 + 1.33333 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1PA13|LINE|L1 79558 NR_034142 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 244-9 chr1 111355289 111355510 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 8777 NM_181643 128344 Hs.172510 NM_181643 ENSG00000173947 PIFO C1orf88|pitchfork primary cilia formation protein-coding 351-3 chr10 60730433 60730853 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) 2885 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 294.667-24 chr2 159418334 159418711 + 1.33333 NA intron (NM_001329858, intron 12 of 36) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -131819 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 248.333-56 chr21 15541061 15541389 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -188709 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 325.666 chr1 110370229 110370757 + 1.33333 NA intron (NM_001201548, intron 6 of 6) intron (NM_001201548, intron 6 of 6) 20533 NM_001319220 9122 Hs.351306 NM_004696 ENSG00000168679 SLC16A4 MCT4|MCT5 solute carrier family 16 member 4 protein-coding 203.667-119 chr8 78791614 78791910 + 1.33333 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) intron (NM_001199886, intron 2 of 4) 13701 NM_000880 3574 Hs.591873 NM_000880 ENSG00000104432 IL7 IL-7 interleukin 7 protein-coding 316-54 chr9 16179860 16180309 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 73023 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 298-46 chr2 117886937 117887272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53373 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 248-51 chr3 24214058 24214315 + 1.33333 NA intron (NM_001354714, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR 62862 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 211.333-244 chr8 109022243 109022541 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64236 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 207.333-6 chr1 57972256 57972442 + 1.33333 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 111768 NR_104363 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 180.666-2 chr10 52819266 52819421 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47643 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 147.333-38 chr10 36884969 36885089 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -240828 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 191.333-126 chr22 25193216 25193455 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001145206, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001145206, exon 11 of 11) -6523 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 128-102 chr7 10792862 10792986 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12980 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 198-79 chr18 21000930 21001184 + 1.33333 NA intron (NM_005406, intron 16 of 32) L1MB5|LINE|L1 110756 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 218.666-63 chr6 149410169 149410348 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_015093, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_015093, exon 9 of 9) 9996 NM_001002255 387082 Hs.657168 NM_001002255 ENSG00000177688 SUMO4 IDDM5|SMT3H4|SUMO-4|dJ281H8.4 small ubiquitin like modifier 4 protein-coding 291.333-16 chr12 54711253 54711539 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -63031 NM_001300854 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 237-54 chr4 91125676 91126015 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 890814 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 172-88 chr5 30019207 30019365 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 138726 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 188-81 chr4 59523000 59523226 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 509540 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 253.333-7 chr10 28623045 28623412 + 1.33333 NA TTS (NM_016628) TTS (NM_016628) -54293 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 241.666-12 chr3 30236318 30236609 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -282405 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 244.666-18 chr15 71949022 71949232 + 1.33333 NA intron (NM_006901, intron 15 of 41) L1M4a1|LINE|L1 138573 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 132.333-128 chr5 6630110 6630341 + 1.33333 NA intron (NM_001193455, intron 2 of 17) intron (NM_001193455, intron 2 of 17) 2819 NM_017755 54888 Hs.481526 NM_017755 ENSG00000037474 NSUN2 MISU|MRT5|SAKI|TRM4 NOP2/Sun RNA methyltransferase 2 protein-coding 308.333-32 chr5 144802649 144803260 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 597563 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 376.666-11 chr8 106760587 106761284 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_139166, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_139166, exon 2 of 2) 9309 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 395.333-9 chr14 58906307 58906925 + 1.33333 NA intron (NR_110547, intron 2 of 5) L1PB4|LINE|L1 78328 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 191.666-23 chr8 13575432 13575610 + 1.33333 NA intron (NM_001348082, intron 1 of 16) MER21C|LTR|ERVL 8652 NM_001007090 157773 Hs.104941 NM_001007090 ENSG00000164743 C8orf48 - chromosome 8 open reading frame 48 protein-coding 213.333-131 chr3 89095313 89095482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12224 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 265.333-94 chrX 46308408 46308745 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 19098 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 298.333-6 chr11 90163884 90164256 + 1.33333 NA intron (NM_001300930, intron 10 of 17) intron (NM_001300930, intron 10 of 17) 29407 NM_001300930 10003 Hs.112482 NM_005467 ENSG00000077616 NAALAD2 GCPIII|GPCIII|NAADALASE2|NAALADASE2 N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2 protein-coding 171-77 chr8 128007573 128007716 + 1.33333 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) L1ME3G|LINE|L1 -1254 NR_031611 100302170 NR_031611 ENSG00000283200 MIR1206 MIRN1206|hsa-mir-1206 microRNA 1206 ncRNA 204-110 chr2 199848135 199848303 + 1.33333 NA intron (NM_001363886, intron 2 of 4) intron (NM_001363886, intron 2 of 4) 2954 NM_001350853 348751 Hs.734578 NM_001350853 ENSG00000226124 FTCDNL1 FONG formiminotransferase cyclodeaminase N-terminal like protein-coding 237.333-87 chr5 20452544 20452853 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) L1PREC2|LINE|L1 123015 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 450.333-2 chr11 108756014 108756726 + 1.33333 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) intron (NM_004398, intron 13 of 17) 91301 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 218.333-13 chr10 33944911 33945221 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -172386 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 198.667-197 chr9 80598131 80598418 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 623251 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 242-69 chr7 82409996 82410287 + 1.33333 NA intron (NM_000722, intron 1 of 38) intron (NM_000722, intron 1 of 38) 33636 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 147.333-212 chr3 57191455 57191647 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 8427 NM_003865 8820 Hs.171980 NM_003865 ENSG00000163666 HESX1 ANF|CPHD5|RPX HESX homeobox 1 protein-coding 285.667-12 chr14 60416245 60416559 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69661 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 416-9 chr3 150976755 150977246 + 1.33333 NA intron (NR_024066, intron 1 of 5) intron (NR_024066, intron 1 of 5) -4001 NM_001195794 7401 Hs.745448 NM_052995 ENSG00000163646 CLRN1 RP61|USH3|USH3A clarin 1 protein-coding 208-135 chr5 46431666 46431927 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -735416 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 201-103 chr7 66261881 66262092 + 1.33333 NA intron (NM_003596, intron 2 of 5) intron (NM_003596, intron 2 of 5) 56652 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 194-151 chr9 80112120 80112268 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 137171 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 214-149 chrX 70162816 70163033 + 1.33333 NA intron (NM_001370194, intron 3 of 3) AluSz|SINE|Alu -14559 NM_198512 347516 Hs.454355 NM_198512 ENSG00000184210 DGAT2L6 DC3 diacylglycerol O-acyltransferase 2 like 6 protein-coding 191.333-173 chr6 44397802 44398057 + 1.33333 NA intron (NM_001253, intron 5 of 15) intron (NM_001253, intron 5 of 15) 10223 NM_001253 988 Hs.485471 NM_001253 ENSG00000096401 CDC5L CDC5|CDC5-LIKE|CEF1|PCDC5RP|dJ319D22.1 cell division cycle 5 like protein-coding 134-110 chr8 103364940 103365121 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6508 NM_138455 115908 Hs.405614 NM_138455 ENSG00000164932 CTHRC1 - collagen triple helix repeat containing 1 protein-coding 197.666-32 chr2 41944063 41944222 + 1.33333 NA intron (NR_161189, intron 3 of 3) intron (NR_161189, intron 3 of 3) 9664 NR_161189 400950 Hs.738713 NM_001242815 ENSG00000205086 C2orf91 - chromosome 2 open reading frame 91 ncRNA 252.666-12 chr14 63200114 63200406 + 1.33333 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -4183 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 243.333-65 chr22 19649244 19649453 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -65155 NM_002688 5413 Hs.728762 NM_002688 ENSG00000184702 SEPTIN5 CDCREL|CDCREL-1|CDCREL1|H5|HCDCREL-1|PNUTL1|SEPT5 septin 5 protein-coding 196.667-170 chr9 12566481 12566797 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -126746 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 199-63 chr21 29808998 29809250 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 60949 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 229.333-103 chr5 120471068 120471398 + 1.33333 NA intron (NM_001308087, intron 1 of 1) intron (NM_001308087, intron 1 of 1) 5602 NM_001308087 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 254.333-57 chr4 32466628 32466957 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 115754 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 168.667-104 chr2 78693313 78693482 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 147866 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 223-66 chr8 105427787 105428034 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 2 of 7) intron (NM_001362837, intron 2 of 7) 108367 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 204.333-46 chr12 42255987 42256240 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -17745 NM_001190979 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 234-36 chr2 68834107 68834347 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37170 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 562.666 chr3 78962614 78963215 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) 56545 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 376.666-5 chr2 45127400 45127839 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -118167 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 260-42 chr2 197547878 197548249 + 1.33333 NA intron (NM_199482, intron 5 of 7) intron (NM_199482, intron 5 of 7) 31765 NM_001204094 25843 Hs.633165 NM_015387 ENSG00000115540 MOB4 2C4D|CGI-95|MOB1|MOB3|MOBKL3|PHOCN|PREI3 MOB family member 4, phocein protein-coding 207.333-7 chr1 76178242 76178514 + 1.33333 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 103632 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 436.332 chr13 101771703 101772195 + 1.33333 NA intron (NM_175929, intron 3 of 4) intron (NM_175929, intron 3 of 4) 144696 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 275-23 chr2 31870064 31870533 + 1.33333 NA intron (NR_126032, intron 5 of 6) intron (NR_126032, intron 5 of 6) -66318 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 223.666-5 chr10 58884430 58884650 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -114978 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 209-127 chrX 46518048 46518208 + 1.33333 NA intron (NM_001190417, intron 5 of 5) L1MEf|LINE|L1 27293 NM_001039891 641339 Hs.636105 NM_001039891 ENSG00000251192 ZNF674 MRX92|ZNF673B zinc finger protein 674 protein-coding 303.333-15 chr11 45134988 45135378 + 1.33333 NA intron (NM_001359633, intron 2 of 7) L1M5|LINE|L1 -12160 NM_001256695 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 258.333-21 chr15 34307671 34307896 + 1.33333 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) intron (NM_001042496, intron 2 of 25) 11037 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 186.666-39 chr4 95621013 95621166 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -72116 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 250.666-37 chr7 74720130 74720401 + 1.33333 NA intron (NM_033000, intron 11 of 33) intron (NM_033000, intron 11 of 33) 8653 NR_110044 101926943 Hs.654772 NR_110044 ENSG00000232729 LOC101926943 - uncharacterized LOC101926943 ncRNA 151.333-223 chr2 165598197 165598367 + 1.33333 NA intron (NM_024969, intron 2 of 4) L1ME4c|LINE|L1 25946 NM_024969 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 249.333-63 chr2 226578543 226578906 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 80069 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 218-99 chr6 133702302 133702512 + 1.33333 NA intron (NR_109982, intron 4 of 8) L1ME3F|LINE|L1 -118740 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 315.999-5 chr9 37182761 37183065 + 1.33333 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) FAM|SINE|Alu 62315 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 209.333-51 chr12 116736494 116736718 + 1.33333 NA intron (NM_024738, intron 1 of 4) MER94|DNA|hAT-Blackjack 1463 NM_024738 79794 Hs.120170 NM_024738 ENSG00000111412 C12orf49 - chromosome 12 open reading frame 49 protein-coding 194.333-42 chr14 68750846 68751108 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 42937 NM_001244698 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 218.333-120 chr8 89759995 89760361 + 1.33333 NA intron (NM_003821, intron 1 of 10) intron (NM_003821, intron 1 of 10) 2362 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 241.666-11 chr22 34841345 34841786 + 1.33333 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 156351 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 386.666-3 chr16 35136468 35136918 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33698 NR_002837 606551 Hs.646441 NR_002837 UBE2MP1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 M pseudogene 1 pseudo 211.333-222 chr7 48349062 48349376 + 1.33333 NA intron (NM_152701, intron 29 of 61) intron (NM_152701, intron 29 of 61) 177761 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 391.333-21 chr8 102048173 102048635 + 1.33333 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 63972 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 262-68 chr6 52518849 52519086 + 1.33333 NA intron (NM_012288, intron 2 of 10) intron (NM_012288, intron 2 of 10) 58093 NM_012288 9697 Hs.520182 NM_012288 ENSG00000065308 TRAM2 - translocation associated membrane protein 2 protein-coding 188.667-15 chr1 179753045 179753303 + 1.33333 NA intron (NM_001329719, intron 1 of 4) L1MB1|LINE|L1 9883 NM_001329717 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 210-8 chr1 150375113 150375280 + 1.33333 NA intron (NM_015203, intron 1 of 10) intron (NM_015203, intron 1 of 10) 11085 NM_001297674 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 215.333-35 chr11 78369239 78369486 + 1.33333 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) intron (NM_080491, intron 1 of 9) -27482 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 270.333-22 chr15 56157534 56158053 + 1.33333 NA intron (NM_001368073, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu 32139 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 257.666-16 chr4 81838812 81839136 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -367067 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 204-89 chr19 30249619 30249817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -122666 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 259.333-42 chr2 40971778 40972091 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -459499 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 397.999 chr11 98487304 98487668 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -533463 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 386.666 chr10 84465701 84466222 + 1.33333 NA intron (NM_018999, intron 7 of 10) AluYc|SINE|Alu 40792 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 402.333-7 chr20 49001821 49002315 + 1.33333 NA intron (NM_006420, intron 25 of 38) AluSq2|SINE|Alu 43988 NR_110625 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 249.333-99 chr8 83517023 83517408 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113457 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 227.333-56 chr2 14872723 14873033 + 1.33333 NA Intergenic LTR12D|LTR|ERV1 240161 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 213.666-31 chr3 188301690 188301895 + 1.33333 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) AluJo|SINE|Alu 76387 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 343.666 chr1 187085311 187085635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7369 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 270.666-16 chr2 122118154 122118415 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 362633 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 299.333-43 chr2 183820440 183820909 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -558301 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 381 chr10 72685018 72685581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6832 NM_138357 90550 Hs.591366 NM_138357 ENSG00000156026 MCU C10orf42|CCDC109A|HsMCU mitochondrial calcium uniporter protein-coding 216.666-55 chr5 7335373 7335603 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 12489 NR_134277 101929261 Hs.308202 NR_134277 ENSG00000250668 LINC02123 - long intergenic non-protein coding RNA 2123 ncRNA 158-51 chr15 70388285 70388464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 117554 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 199-66 chr3 69062992 69063238 + 1.33333 NA exon (NM_003968, exon 9 of 18) exon (NM_003968, exon 9 of 18) -10782 NM_007114 7110 Hs.267632 NM_007114 ENSG00000144747 TMF1 ARA160|TMF TATA element modulatory factor 1 protein-coding 180.333-117 chr7 29824735 29824915 + 1.33333 NA intron (NM_001080529, intron 1 of 8) intron (NM_001080529, intron 1 of 8) 18271 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 156-29 chr11 90242199 90242361 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -8952 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 167.667-87 chr17 61964965 61965160 + 1.33333 NA exon (NM_005121, exon 20 of 30) exon (NM_005121, exon 20 of 30) -37080 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 150-124 chr6 65962737 65962887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 174933 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 273.333-30 chr2 14542917 14543190 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -89664 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 206-113 chr3 97384305 97384501 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) MIR|SINE|MIR -55204 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 208.333-58 chr17 80851557 80851743 + 1.33333 NA intron (NM_020761, intron 11 of 33) intron (NM_020761, intron 11 of 33) -46018 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 188.666-34 chr7 8712930 8713104 + 1.33333 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) L1M1|LINE|L1 279408 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 218.333-42 chr15 65840098 65840342 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -29271 NM_001206836 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 227.666-12 chr17 80787949 80788166 + 1.33333 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) L1MEh|LINE|L1 17575 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 158-120 chr6 94786663 94786807 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 790716 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 169-88 chr6 40540176 40540329 + 1.33333 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 47112 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 342.666-8 chr13 113794930 113795235 + 1.33333 NA intron (NM_182614, intron 3 of 8) CpG -20528 NR_044995 650669 Hs.369201 NM_001039799 GAS6-AS1 - GAS6 antisense RNA 1 ncRNA 213.333-32 chr11 76020703 76020921 + 1.33333 NA intron (NM_003369, intron 12 of 14) L1M1|LINE|L1 185690 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 281.666-15 chr7 53938651 53939092 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -126940 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 209.333-85 chr16 73909802 73910114 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 305563 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 194.666-5 chr10 77013978 77014170 + 1.33333 NA intron (NM_001271519, intron 17 of 28) L1MA8|LINE|L1 126030 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 274-5 chr11 55065181 55065518 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -196806 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 324.333-17 chr16 56834890 56835213 + 1.33333 NA intron (NM_014669, intron 16 of 21) intron (NM_014669, intron 16 of 21) -23467 NR_029680 406930 NR_029680 ENSG00000207649 MIR138-2 MIRN138-2|mir-138-2 microRNA 138-2 ncRNA 188-98 chr7 33412342 33412521 + 1.33333 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 282867 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 207.666-36 chr3 102516115 102516292 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 81188 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 198.333-19 chr1 224461510 224461800 + 1.33333 NA intron (NM_001322302, intron 2 of 6) L1MB8|LINE|L1 26806 NR_136297 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 237-31 chr15 86074289 86074600 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -5176 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 230-10 chr10 76985750 76986000 + 1.33333 NA intron (NM_001322838, intron 19 of 29) intron (NM_001322838, intron 19 of 29) 97831 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 221.333-120 chr5 144756260 144756539 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 551008 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 250.333-40 chr22 49189949 49190270 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 323339 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 151.333-224 chr2 168685465 168685700 + 1.33333 NA intron (NM_001256126, intron 4 of 10) intron (NM_001256126, intron 4 of 10) 100847 NR_045786 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 203.333-75 chr14 47958219 47958405 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -163298 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 250.333-48 chr4 46961794 46962088 + 1.33333 NA intron (NM_001204267, intron 7 of 7) intron (NM_001204267, intron 7 of 7) 31640 NM_001204267 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 207.333-266 chr8 64419308 64419472 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40241 NR_029669 406908 NR_029669 ENSG00000207816 MIR124-2 MIRN124-2|MIRN124A2|mir-124-2 microRNA 124-2 ncRNA 336.667-3 chr1 54285361 54285848 + 1.33333 NA intron (NM_001009955, intron 4 of 16) intron (NM_001009955, intron 4 of 16) 49161 NR_103541 619518 Hs.591438 NM_001034847 ENSG00000198711 SSBP3-AS1 C1orf191|MST128|MSTP128 SSBP3 antisense RNA 1 ncRNA 194.666-35 chr2 57585727 57585902 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -321837 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 217.333-94 chr3 62799500 62799694 + 1.33333 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) MIRb|SINE|MIR 75819 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 236-36 chr2 61223166 61223390 + 1.33333 NA exon (NM_014709, exon 63 of 80) exon (NM_014709, exon 63 of 80) 45860 NR_152216 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 221.333-118 chr5 131372006 131372261 + 1.33333 NA intron (NM_001038702, intron 2 of 4) intron (NM_001038702, intron 2 of 4) 108124 NM_001038702 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 166-116 chr8 88916373 88916539 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -588973 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 444.333 chr1 105709382 105709949 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -90730 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 234.333-34 chr17 29225448 29225686 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -21290 NM_005208 1411 Hs.46275 NM_005208 ENSG00000108255 CRYBA1 CRYB1|CTRCT10 crystallin beta A1 protein-coding 418 chr12 6575090 6575575 + 1.33333 NA intron (NM_001273, intron 37 of 39) AluSx|SINE|Alu 6277 NR_003012 677780 Hs.689692 NR_003012 ENSG00000251898 SCARNA11 ACA57 small Cajal body-specific RNA 11 ncRNA 214.999-8 chr3 56750485 56750700 + 1.33333 NA intron (NM_001128615, intron 9 of 12) intron (NM_001128615, intron 9 of 12) 25125 NM_001128616 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 213 chr1 32979700 32979942 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -15012 NM_001300826 127544 Hs.591504 NM_153341 ENSG00000116514 RNF19B IBRDC3|NKLAM ring finger protein 19B protein-coding 185.333-128 chr3 197289686 197289854 + 1.33333 NA intron (NM_001366216, intron 3 of 23) intron (NM_001366216, intron 3 of 23) 4178 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 183.333-142 chr6 47774447 47774645 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7493 NM_181744 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 283-31 chr5 121948559 121948929 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13231 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 140-19 chr10 51286438 51286605 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -13052 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 307.333-14 chr10 100394117 100394516 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 20740 NR_026762 90271 Hs.628088 NR_026762 ENSG00000235823 OLMALINC C10orf75|HI-LNC80|LINC00263|NCRNA00263|OLMALINCAS oligodendrocyte maturation-associated long intergenic non-coding RNA ncRNA 253.333-107 chr8 69791026 69791243 + 1.33333 NA intron (NM_001146009, intron 1 of 7) intron (NM_001146009, intron 1 of 7) 42035 NM_001146009 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 199.333-153 chr2 202771967 202772188 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57157 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 212.666-83 chr7 47489514 47489770 + 1.33333 NA intron (NM_022748, intron 3 of 30) intron (NM_022748, intron 3 of 30) -24839 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 324.999-4 chr10 116531869 116532142 + 1.33333 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -13926 NM_000936 5406 Hs.501135 NM_000936 ENSG00000175535 PNLIP PL|PNLIPD|PTL pancreatic lipase protein-coding 228.666-6 chr1 236803305 236803602 + 1.33333 NA exon (NM_001291939, exon 2 of 32) exon (NM_001291939, exon 2 of 32) 8161 NM_001291940 4548 Hs.498187 NM_000254 ENSG00000116984 MTR HMAG|MS|cblG 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase protein-coding 364-26 chr7 31437594 31438194 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -76177 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 255.667-4 chr1 179582487 179582906 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6744 NM_014625 7827 Hs.412710 NM_014625 ENSG00000116218 NPHS2 PDCN|SRN1 NPHS2 stomatin family member, podocin protein-coding 174.667-145 chr5 119324475 119324719 + 1.33333 NA intron (NM_001286815, intron 2 of 2) intron (NM_001286815, intron 2 of 2) -8578 NM_001286814 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 214-60 chr2 21798891 21799062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -88324 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 314.666-13 chr10 25763824 25764093 + 1.33333 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 112246 NR_108069 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 246.666-42 chrX 74362136 74362332 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 58054 NM_203303 389874 Hs.157231 NM_203303 ENSG00000187969 ZCCHC13 CNBP2|ZNF9L zinc finger CCHC-type containing 13 protein-coding 242.666-41 chr8 105549766 105550056 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) AluJo|SINE|Alu 230368 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 290.666-24 chr4 80529993 80530289 + 1.33333 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) intron (NM_152770, intron 2 of 5) 194421 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 177-51 chr3 57879998 57880158 + 1.33333 NA intron (NM_001304420, intron 12 of 21) L1ME3B|LINE|L1 -9836 NM_001311178 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 223.666-22 chr3 76341987 76342226 + 1.33333 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -556557 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 142.333-164 chr3 114553578 114553728 + 1.33333 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 70553 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 213.333-185 chr6 147338140 147338448 + 1.33333 NA intron (NM_139244, intron 19 of 25) L2c|LINE|L2 -133680 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 391.333-19 chr7 64254380 64254748 + 1.33333 NA intron (NM_153363, intron 2 of 4) MER21C|LTR|ERVL 26090 NM_153363 168417 Hs.520884 NM_153363 ENSG00000197123 ZNF679 - zinc finger protein 679 protein-coding 343.666-4 chr16 62019089 62019430 + 1.33333 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 17179 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 378.333-14 chr8 111244890 111245310 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -8897 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 185-60 chr6 114934116 114934278 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 709638 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 192-108 chr5 18155836 18156084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 348686 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 501.999 chr12 17180149 17180618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 191636 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 341.333 chr1 37580846 37581134 + 1.33333 NA intron (NM_013285, intron 8 of 15) MER72|LTR|ERV1 14947 NM_013285 29889 Hs.75528 NM_013285 ENSG00000134697 GNL2 HUMAUANTIG|NGP1|Ngp-1|Nog2|Nug2 G protein nucleolar 2 protein-coding 314.666-8 chr1 190445344 190445831 + 1.33333 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 30423 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 201.333-129 chr18 8349017 8349266 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 21 of 30) intron (NM_002845, intron 21 of 30) 17893 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 210-16 chr10 32748210 32748514 + 1.33333 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) L1PA15|LINE|L1 153110 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 480.666-3 chr3 131477193 131477749 + 1.33333 NA intron (NM_007208, intron 6 of 9) intron (NM_007208, intron 6 of 9) 1762 NR_002985 677836 Hs.735762 NR_002985 SNORA58 ACA58|SNORA58B small nucleolar RNA, H/ACA box 58 snoRNA 336-13 chr2 137672527 137672812 + 1.33333 NA intron (NM_001316349, intron 27 of 27) intron (NM_001316349, intron 27 of 27) 255263 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 281-9 chr14 67957136 67957505 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L2c|LINE|L2 133728 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 204.666-116 chr9 95964809 95965051 + 1.33333 NA intron (NM_020207, intron 13 of 18) intron (NM_020207, intron 13 of 18) 56881 NR_024129 100188953 Hs.434310 NR_024129 ENSG00000225194 LINC00092 NCRNA00092 long intergenic non-protein coding RNA 92 ncRNA 199.666-21 chr2 24447553 24447807 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -43574 NM_003743 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 257.999-4 chr2 115204428 115204642 + 1.33333 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) MIRb|SINE|MIR 42380 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 134-101 chr7 116022465 116022590 + 1.33333 NA intron (NM_012252, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 8236 NM_001018058 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 219.333-113 chr22 33543052 33543330 + 1.33333 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) -106522 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 211-81 chr5 37309176 37309576 + 1.33333 NA intron (NM_001278312, intron 22 of 33) intron (NM_001278312, intron 22 of 33) -59948 NM_023073 65250 Hs.586199 NM_023073 ENSG00000197603 CPLANE1 C5orf42|Hug|JBTS17|OFD6 ciliogenesis and planar polarity effector 1 protein-coding 347.333-5 chr13 102578057 102578512 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -18702 NM_003291 7174 Hs.432424 NM_003291 ENSG00000134900 TPP2 TPP-2|TPP-II|TPPII tripeptidyl peptidase 2 protein-coding 326.666-7 chr2 125738115 125738455 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 379700 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 412 chr1 211103538 211104092 + 1.33333 NA intron (NM_002238, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 29559 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 267-46 chr22 28756089 28756468 + 1.33333 NA intron (NR_134560, intron 5 of 5) intron (NR_134560, intron 5 of 5) 13597 NM_001318316 150274 Hs.632780 NM_172002 ENSG00000100209 HSCB DNAJC20|HSC20|JAC1 HscB mitochondrial iron-sulfur cluster cochaperone protein-coding 186.666-17 chr12 43607266 43607469 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -55164 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 225-34 chr2 50068391 50068712 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 19 of 22) MIRb|SINE|MIR -94348 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 207.333-139 chr2 156903473 156903679 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -354129 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 220.666-59 chr5 62090596 62090806 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -215461 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 244.666-3 chr1 180146407 180146755 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -8252 NM_001004128 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 181.333-118 chr4 54488892 54489090 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118140 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 192.666-7 chr10 18311482 18311720 + 1.33333 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -29108 NM_201590 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 214-73 chr2 188608357 188608561 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 181664 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 202.333-37 chr11 78873664 78873905 + 1.33333 NA intron (NM_001098816, intron 9 of 33) intron (NM_001098816, intron 9 of 33) -298920 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 194-155 chr9 131002150 131002320 + 1.33333 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -6939 NM_006059 10319 Hs.201805 NM_006059 ENSG00000050555 LAMC3 OCCM laminin subunit gamma 3 protein-coding 179.333-55 chr13 20591396 20591609 + 1.33333 NA intron (NR_148465, intron 4 of 20) intron (NR_148465, intron 4 of 20) 24345 NM_001353575 8100 Hs.187376 NM_006531 ENSG00000032742 IFT88 D13S1056E|DAF19|TG737|TTC10|hTg737 intraflagellar transport 88 protein-coding 258-78 chr7 30193235 30193589 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 58426 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 155.333-102 chr14 46071251 46071395 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 7164 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 362.667-28 chr8 122503379 122503803 + 1.33333 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 65053 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 214-82 chr21 21051267 21051451 + 1.33333 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) LTR16A|LTR|ERVL 52950 NM_001352595 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 214.666-29 chr18 7975200 7975465 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) L1MC1|LINE|L1 391702 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 175.333-6 chr1 150331743 150331923 + 1.33333 NA intron (NM_004698, intron 4 of 15) intron (NM_004698, intron 4 of 15) 10300 NM_004698 9129 Hs.11776 NM_004698 ENSG00000117360 PRPF3 HPRP3|HPRP3P|PRP3|Prp3p|RP18|SNRNP90 pre-mRNA processing factor 3 protein-coding 201-7 chr1 104766783 104767083 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 693910 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 160.666-15 chr5 104540397 104540555 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -558998 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 289.666-15 chr5 64720531 64720764 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_173829, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_173829, exon 5 of 5) 30144 NM_001164442 100132916 Hs.591776 NM_001164442 ENSG00000145642 SHISAL2B FAM159B shisa like 2B protein-coding 250.666-28 chr4 139460079 139460275 + 1.33333 NA intron (NM_031296, intron 1 of 1) intron (NM_031296, intron 1 of 1) 6056 NM_031296 83452 Hs.591679 NM_031296 ENSG00000172007 RAB33B SMC2 RAB33B, member RAS oncogene family protein-coding 217-68 chr4 57217930 57218253 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107706 NM_001253835 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 167.667-101 chr2 52373722 52373940 + 1.33333 NA intron (NR_135239, intron 2 of 2) intron (NR_135239, intron 2 of 2) 3183 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 215.333-139 chr3 190702545 190702788 + 1.33333 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 160028 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 192-150 chr8 129044754 129044999 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -78875 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 227.333-127 chr8 117559087 117559308 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 38484 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 226.333-108 chr8 77884569 77884804 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 433989 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 206.666-121 chr9 12610931 12611188 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -82326 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 248-96 chrX 47279248 47279572 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 46401 NM_001371072 209.666-54 chr8 131180240 131180518 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -139470 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 272.666-4 chr11 92511219 92511466 + 1.33333 NA intron (NM_001008781, intron 1 of 24) intron (NM_001008781, intron 1 of 24) 159246 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 192.666-67 chr9 37005641 37005827 + 1.33333 NA intron (NM_001280548, intron 4 of 8) intron (NM_001280548, intron 4 of 8) 28534 NM_001280548 5079 Hs.654464 NM_016734 ENSG00000196092 PAX5 ALL3|BSAP paired box 5 protein-coding 230.333-70 chr21 18306074 18306330 + 1.33333 NA intron (NM_002772, intron 18 of 24) intron (NM_002772, intron 18 of 24) 60327 NM_001204174 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 203-87 chr5 122977664 122977857 + 1.33333 NA intron (NM_014035, intron 3 of 6) intron (NM_014035, intron 3 of 6) 58965 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 267.667-52 chr5 79403371 79403721 + 1.33333 NA intron (NM_004272, intron 5 of 8) L1MC4a|LINE|L1 110290 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 244-64 chr21 23877422 23877638 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 443847 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 200-110 chr3 191320163 191320454 + 1.33333 NA intron (NM_198152, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 -9086 NM_174908 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 327.333-10 chr12 39385566 39385839 + 1.33333 NA intron (NM_001173464, intron 1 of 37) intron (NM_001173464, intron 1 of 37) 57418 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 223.333-167 chr8 106283315 106283570 + 1.33333 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 13264 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 399.333-4 chr10 70491771 70492358 + 1.33333 NA intron (NM_014431, intron 1 of 19) L1MB5|LINE|L1 13297 NM_014431 27143 Hs.202351 NM_014431 ENSG00000107719 PALD1 KIAA1274|PALD phosphatase domain containing paladin 1 protein-coding 206-117 chr3 146273144 146273416 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22101 NM_001128306 57088 Hs.477869 NM_020353 ENSG00000114698 PLSCR4 TRA1 phospholipid scramblase 4 protein-coding 433.666-6 chrX 155412028 155412659 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -29145 NR_036259 100422985 NR_036259 ENSG00000221190 MIR1184-2 - microRNA 1184-2 ncRNA 321.666-2 chr10 57888259 57888567 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 379481 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 447.999-3 chr4 163404354 163404776 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60463 NM_001317091 4889 Hs.519058 NM_006174 ENSG00000164129 NPY5R NPY5-R|NPYR5|NPYY5-R neuropeptide Y receptor Y5 protein-coding 387.666-5 chr8 40440970 40441305 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -97774 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 189.333-164 chr5 148854148 148854410 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27686 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 260.667-59 chr3 131820246 131820582 + 1.33333 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) LTR16A|LTR|ERVL 165517 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 197.333-5 chr1 103347076 103347368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 178289 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 378.333-7 chr2 189750731 189751216 + 1.33333 NA intron (NR_148883, intron 7 of 8) intron (NR_148883, intron 7 of 8) -11807 NR_102429 101409258 Hs.738558 NR_102429 OSGEPL1-AS1 - OSGEPL1 antisense RNA 1 ncRNA 177.666-20 chr4 156991579 156991874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19927 NR_036641 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 404.333-5 chr16 69371861 69372285 + 1.33333 NA intron (NM_005652, intron 4 of 9) intron (NM_005652, intron 4 of 9) 13934 NM_005652 7014 Hs.63335 NM_005652 ENSG00000132604 TERF2 TRBF2|TRF2 telomeric repeat binding factor 2 protein-coding 350.333-10 chr18 5719305 5719728 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29303 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 318-11 chr11 82148519 82148881 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) 255213 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 350.999 chr1 43807269 43807679 + 1.33333 NA intron (NM_001270459, intron 3 of 11) L2b|LINE|L2 -31148 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 116.333-185 chr6 47398141 47398352 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -79543 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 228.666-7 chr10 66654427 66654736 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) L1MA8|LINE|L1 -271455 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 220.666-57 chr5 27947466 27947672 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 340096 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 205.667-18 chr10 97542419 97542704 + 1.33333 NA intron (NM_024954, intron 1 of 2) intron (NM_024954, intron 1 of 2) -29880 NM_001291218 26287 Hs.73708 NM_020349 ENSG00000165887 ANKRD2 ARPP ankyrin repeat domain 2 protein-coding 203.667-140 chrX 101483664 101483904 + 1.33333 NA intron (NR_028407, intron 4 of 15) intron (NR_028407, intron 4 of 15) -1672 NR_045864 100131755 Hs.729062 NM_152583 ENSG00000196440 ARMCX4 CXorf35|GASP4 armadillo repeat containing X-linked 4 protein-coding 178.333-114 chr3 174332029 174332162 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -411299 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-189 chr5 65360463 65360630 + 1.33333 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) intron (NR_135689, intron 7 of 25) 121374 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 268.333-49 chr6 27282447 27282801 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29608 NM_033482 94026 Hs.729955 NM_033482 ENSG00000158553 POM121L2 POM121-L|POM121L POM121 transmembrane nucleoporin like 2 protein-coding 190-75 chr21 27251859 27252015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -284849 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 201.333-266 chr7 78187367 78187593 + 1.33333 NA intron (NM_012301, intron 12 of 21) intron (NM_012301, intron 12 of 21) -159762 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 180 chr1 26250526 26250683 + 1.33333 NA intron (NM_022778, intron 3 of 13) intron (NM_022778, intron 3 of 13) 16404 NM_001281517 64793 Hs.63795 NM_022778 ENSG00000130695 CEP85 CCDC21 centrosomal protein 85 protein-coding 194.333-125 chr5 130395655 130395934 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 491329 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 230.667-2 chr1 38433209 38433544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41820 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 121.666-2 chr1 87998247 87998452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -626694 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 285.333-51 chr4 67051775 67052112 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 370057 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 234.666-33 chr4 31101699 31101949 + 1.33333 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -69320 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 216-22 chr12 112847743 112847995 + 1.33333 NA intron (NR_145127, intron 5 of 22) intron (NR_145127, intron 5 of 22) 56121 NM_014954 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 231-66 chr8 132515923 132516241 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34987 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 288.333-25 chr3 22299168 22299444 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 342167 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 135.333-143 chr5 59229288 59229471 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 46736 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 252.667-46 chr2 52112692 52113014 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -257795 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 198-34 chr12 32603887 32604070 + 1.33333 NA intron (NM_001370297, intron 5 of 14) AluJr|SINE|Alu 69685 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 401.666-6 chr6 156187274 156187637 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -191295 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 199-21 chr12 102036628 102036904 + 1.33333 NA intron (NM_016053, intron 5 of 6) HAL1|LINE|L1 25225 NM_016053 51019 Hs.405692 NM_016053 ENSG00000120860 WASHC3 CCDC53|CGI-116 WASH complex subunit 3 protein-coding 162-97 chr4 139382733 139382926 + 1.33333 NA intron (NM_057175, intron 17 of 19) intron (NM_057175, intron 17 of 19) 71212 NR_159964 107984036 Hs.605782 NR_159963 LOC107984036 - uncharacterized LOC107984036 ncRNA 206-90 chr2 158586212 158586376 + 1.33333 NA intron (NM_001005476, intron 3 of 20) intron (NM_001005476, intron 3 of 20) 129342 NM_001304969 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 176-101 chr8 78962575 78962794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 125155 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 274.333-24 chr16 9826770 9827120 + 1.33333 NA intron (NM_001134408, intron 9 of 13) intron (NM_001134408, intron 9 of 13) 355122 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 198.666-48 chr2 198827965 198828154 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -452962 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 254.333 chr1 90818746 90819103 + 1.33333 NA intron (NR_135038, intron 1 of 2) intron (NR_135038, intron 1 of 2) 17237 NR_147932 105378853 Hs.546492 NR_135038 ENSG00000233593 LINC02609 - long intergenic non-protein coding RNA 2609 ncRNA 315.333-18 chr2 38572589 38573093 + 1.33333 NA intron (NM_138394, intron 8 of 12) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 30087 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 354.666-3 chr11 87072410 87072716 + 1.33333 NA intron (NR_033149, intron 3 of 13) AluSg|SINE|Alu 34629 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 312.667-38 chr8 135278782 135279160 + 1.33333 NA intron (NR_120396, intron 1 of 4) intron (NR_120396, intron 1 of 4) 44840 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 190.666-9 chr1 231793463 231793646 + 1.33333 NA intron (NM_001164547, intron 6 of 7) intron (NM_001164547, intron 6 of 7) 24963 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 196.666-65 chr3 45677248 45677398 + 1.33333 NA TTS (NR_033947) TTS (NR_033947) 11559 NR_033947 644714 Hs.712889 NR_033947 LIMD1-AS1 - LIMD1 antisense RNA 1 ncRNA 213.666-30 chr3 115910933 115911123 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) L1MA4A|LINE|L1 -5902 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 213.333-69 chr16 10693464 10693630 + 1.33333 NA intron (NM_144674, intron 1 of 6) intron (NM_144674, intron 1 of 6) 1383 NM_144674 146279 Hs.143519 NM_144674 ENSG00000153060 TEKT5 CT149 tektin 5 protein-coding 520.332 chr11 72892431 72892996 + 1.33333 NA intron (NM_014824, intron 10 of 19) AluSc8|SINE|Alu 78302 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 266-49 chr20 54037059 54037501 + 1.33333 NA intron (NM_001366297, intron 3 of 8) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 21740 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 180.667-80 chr20 17212974 17213251 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12995 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 328-15 chr15 71085667 71086054 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55589 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 197.333-205 chr6 143556787 143556998 + 1.33333 NA intron (NR_027113, intron 2 of 2) intron (NR_027113, intron 2 of 2) 5159 NR_110149 285740 Hs.432656 NR_027113 ENSG00000235740 PHACTR2-AS1 - PHACTR2 antisense RNA 1 ncRNA 348.333-37 chr9 34875047 34875399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20541 NM_001309426 100129969 Hs.571602 NM_001309426 ENSG00000187791 FAM205C FAM205CP family with sequence similarity 205 member C protein-coding 326-35 chr4 108761045 108761378 + 1.33333 NA intron (NM_031279, intron 1 of 12) intron (NM_031279, intron 1 of 12) 1842 NM_001331033 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 213-32 chr17 59449130 59449428 + 1.33333 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) L1MB7|LINE|L1 77578 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 186.333-80 chr2 119977267 119977465 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_002830, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_002830, exon 27 of 27) -35711 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 314.666-29 chr6 46140372 46140688 + 1.33333 NA intron (NM_014936, intron 2 of 3) intron (NM_014936, intron 2 of 3) 10541 NM_014936 22875 Hs.643497 NM_014936 ENSG00000001561 ENPP4 NPP4 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 protein-coding 151.666-6 chr5 153111347 153111597 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -139123 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 479-2 chr2 54787864 54788602 + 1.33333 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) MER73|LTR|ERVL 63221 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 210.666-110 chr9 11494422 11494618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 881314 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 208.333-123 chr5 173419258 173419461 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 71904 NR_107023 102465862 NR_107023 ENSG00000274994 MIR8056 hsa-mir-8056 microRNA 8056 ncRNA 204-185 chr7 92367209 92367381 + 1.33333 NA intron (NM_019004, intron 10 of 19) intron (NM_019004, intron 10 of 19) 70019 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 200.333-43 chr15 57150361 57150616 + 1.33333 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) L1MEc|LINE|L1 -68942 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 153.666-6 chr7 90265403 90265626 + 1.33333 NA intron (NM_001039706, intron 5 of 22) intron (NM_001039706, intron 5 of 22) 20340 NM_001039706 79846 Hs.521014 NM_024788 ENSG00000105792 CFAP69 C7orf63|FAP69|SPGF24 cilia and flagella associated protein 69 protein-coding 201.333-101 chr14 62466146 62466411 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -326305 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 243.666-38 chr7 133600004 133600305 + 1.33333 NA intron (NM_021807, intron 9 of 17) AluJb|SINE|Alu 224734 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 193.666-11 chr12 26808656 26808818 + 1.33333 NA intron (NM_002223, intron 1 of 56) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 24457 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 224.666-9 chr11 97938177 97938374 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -1082674 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 220.666-49 chr3 66417867 66418049 + 1.33333 NA intron (NM_015541, intron 3 of 18) intron (NM_015541, intron 3 of 18) 82463 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 211-22 chr11 98818223 98818391 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -202642 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 205-38 chr15 98639718 98640003 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -8679 NM_000875 3480 Hs.643120 NM_000875 ENSG00000140443 IGF1R CD221|IGFIR|IGFR|JTK13 insulin like growth factor 1 receptor protein-coding 174.666-21 chr6 142461214 142461391 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 159295 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 210-26 chr11 87399498 87399747 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 319789 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 353.333-13 chr12 85975742 85976328 + 1.33333 NA non-coding (NR_147093, exon 5 of 5) non-coding (NR_147093, exon 5 of 5) 101740 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 210.666-17 chr11 58830078 58830319 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 14506 NM_145016 219970 Hs.254271 NM_145016 ENSG00000156689 GLYATL2 BXMAS2-10|GATF-B glycine-N-acyltransferase like 2 protein-coding 169-10 chr10 71548236 71548467 + 1.33333 NA intron (NM_052836, intron 6 of 12) intron (NM_052836, intron 6 of 12) -36431 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 133.666-2 chr3 58880491 58880622 + 1.33333 NA intron (NM_001351530, intron 6 of 15) intron (NM_001351530, intron 6 of 15) 56085 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 226-12 chr11 41814549 41814771 + 1.33333 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) MER101-int|LTR|ERV1 100092 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 220.999-9 chrX 97259145 97259319 + 1.33333 NA intron (NM_007309, intron 23 of 26) AluSx|SINE|Alu 305303 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 340-14 chr17 61668578 61668939 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -77539 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 255-14 chr10 89810106 89810500 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19190 NR_038382 643529 Hs.618956 NR_038382 ENSG00000232229 LINC00865 - long intergenic non-protein coding RNA 865 ncRNA 212-12 chr1 87256733 87256973 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44184 NM_001290053 101927844 Hs.694591 NM_001290053 LINC02801 - long intergenic non-protein coding RNA 2801 protein-coding 192-54 chr14 71099551 71099818 + 1.33333 NA intron (NM_014982, intron 30 of 35) L1PA16|LINE|L1 192225 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 334.333-14 chr14 81912593 81913062 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -169689 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 356-18 chr16 77332068 77332512 + 1.33333 NA intron (NM_199355, intron 12 of 22) intron (NM_199355, intron 12 of 22) 102744 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 344.333-12 chr2 229797062 229797368 + 1.33333 NA intron (NM_001348330, intron 24 of 41) intron (NM_001348330, intron 24 of 41) -82660 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 243-69 chr8 54112313 54112733 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10506 NM_001279356 10434 Hs.744046 NM_006330 ENSG00000120992 LYPLA1 APT-1|APT1|LPL-I|LPL1|hAPT1 lysophospholipase 1 protein-coding 204.666-84 chr6 152185335 152185568 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001347701) promoter-TSS (NM_001347701) -73 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 284.666-25 chr9 33195351 33195703 + 1.33333 NA Intergenic MER34B|LTR|ERV1 27668 NR_108108 101929639 Hs.545818 NR_108108 ENSG00000233554 B4GALT1-AS1 - B4GALT1 antisense RNA 1 ncRNA 269.666-16 chr7 101893972 101894201 + 1.33333 NA intron (NM_181552, intron 1 of 23) intron (NM_181552, intron 1 of 23) 76460 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 198-81 chr2 22142818 22143068 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -393536 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 222-45 chr2 56213927 56214249 + 1.33333 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -28318 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 287.666-13 chr8 50784854 50785341 + 1.33333 NA intron (NR_135797, intron 20 of 20) L1MB7|LINE|L1 620966 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 196-130 chr3 197224398 197224553 + 1.33333 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) intron (NM_001366216, intron 4 of 23) -40344 NM_001204388 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 154.667-178 chr2 81851144 81851365 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -384308 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 148.333-326 chr5 121584313 121584517 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 261865 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 252-71 chr4 81919685 81920067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -447969 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 445.999 chr6 118643017 118643398 + 1.33333 NA intron (NM_001178035, intron 2 of 13) intron (NM_001178035, intron 2 of 13) 8384 NM_001042475 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 152-125 chr5 35704881 35705048 + 1.33333 NA intron (NM_024867, intron 17 of 36) intron (NM_024867, intron 17 of 36) 87101 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 228.666-45 chr7 113709356 113709697 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 209483 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 237.667-7 chr10 20326052 20326324 + 1.33333 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -225782 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 172-79 chr4 48058564 48058788 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 41904 NM_207330 152519 Hs.134190 NM_207330 ENSG00000163293 NIPAL1 NPAL1 NIPA like domain containing 1 protein-coding 204-159 chr5 28714898 28715089 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -211877 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 224.666-6 chr10 93628846 93629107 + 1.33333 NA intron (NM_006204, intron 7 of 21) intron (NM_006204, intron 7 of 21) 16439 NM_006204 5146 Hs.658121 NM_006204 ENSG00000095464 PDE6C ACHM5|COD4|PDEA2 phosphodiesterase 6C protein-coding 192-137 chr7 45945421 45945614 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24245 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 228-96 chr8 143444678 143445006 + 1.33333 NA intron (NM_015117, intron 9 of 11) L1M5|LINE|L1 -14110 NM_201589 389692 NM_201589 ENSG00000182759 MAFA INSDM|RIPE3b1|hMafA MAF bZIP transcription factor A protein-coding 284-56 chr7 3052314 3052776 + 1.33333 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -8678 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 451.333-2 chr10 70163775 70164294 + 1.33333 NA intron (NM_001142648, intron 1 of 7) intron (NM_001142648, intron 1 of 7) 6480 NM_020150 56681 Hs.499960 NM_020150 ENSG00000079332 SAR1A SAR1|SARA1|Sara|masra2 secretion associated Ras related GTPase 1A protein-coding 277.999-9 chr5 72150899 72151270 + 1.33333 NA intron (NM_005909, intron 2 of 6) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -18383 NR_039967 100616377 NR_039967 ENSG00000264099 MIR4803 - microRNA 4803 ncRNA 201.666-3 chr10 73239827 73240040 + 1.33333 NA intron (NM_173348, intron 13 of 13) intron (NM_173348, intron 13 of 13) 7322 NM_015190 23234 Hs.408577 NM_015190 ENSG00000213551 DNAJC9 HDJC9|JDD1|SB73 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C9 protein-coding 199.333-277 chr8 98926408 98926607 + 1.33333 NA intron (NM_001256312, intron 1 of 12) intron (NM_001256312, intron 1 of 12) 16103 NM_001256312 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 112.667-264 chr8 76968481 76968597 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1689 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 320.333-10 chr19 8974595 8975026 + 1.33333 NA exon (NM_024690, exon 1 of 84) exon (NM_024690, exon 1 of 84) 6532 NM_024690 94025 Hs.432676 NM_024690 ENSG00000181143 MUC16 CA125 mucin 16, cell surface associated protein-coding 208-186 chrX 110260470 110260754 + 1.33333 NA intron (NM_001025580, intron 1 of 4) intron (NM_001025580, intron 1 of 4) -35552 NR_004379 692226 NR_004379 ENSG00000208883 SNORD96B U96b small nucleolar RNA, C/D box 96B snoRNA 230-61 chr6 78241336 78241604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 297839 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 193.333-50 chr13 108040711 108040967 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -173343 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 245.666 chr1 45462231 45462605 + 1.33333 NA intron (NM_007170, intron 1 of 10) AluY|SINE|Alu 28745 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 204.667-40 chr14 54938597 54938836 + 1.33333 NA TTS (NM_001008396) TTS (NM_001008396) -35890 NM_000161 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 361.333-25 chr5 112289619 112289927 + 1.33333 NA intron (NM_001347887, intron 2 of 23) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 61490 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 203.333-199 chr4 142480496 142480662 + 1.33333 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) intron (NM_003866, intron 2 of 26) 365956 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 203.333-41 chr11 7396756 7396953 + 1.33333 NA intron (NM_175733, intron 3 of 6) L1MEc|LINE|L1 68981 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 250.333-69 chr7 4977046 4977418 + 1.33333 NA intron (NR_023385, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 3247 NR_023385 441191 Hs.520636 NR_015449 ENSG00000196204 RNF216P1 RNF216L|hCG2040556 ring finger protein 216 pseudogene 1 pseudo 197-125 chr9 75573908 75574079 + 1.33333 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -316651 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 229.333-107 chr6 69653314 69653645 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 142987 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 200-116 chr4 76651660 76651845 + 1.33333 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) intron (NM_020859, intron 2 of 10) 76201 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 323-13 chr17 61997557 61997931 + 1.33333 NA intron (NM_005121, intron 9 of 29) intron (NM_005121, intron 9 of 29) 67534 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 366.333-16 chr4 46720234 46720545 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 188856 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 181-60 chr5 113486901 113487085 + 1.33333 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) intron (NM_001085377, intron 1 of 18) 1460 NM_001085377 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 225.999-9 chr5 62996229 62996480 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 417535 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 222.667-56 chr3 82813356 82813673 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 827372 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 218-52 chr2 115319689 115319889 + 1.33333 NA intron (NM_001321909, intron 2 of 24) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 10552 NM_001321907 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 191.333-177 chr6 75223670 75223848 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17706 NM_080645 1303 Hs.101302 NM_004370 ENSG00000111799 COL12A1 BA209D8.1|BTHLM2|COL12A1L|DJ234P15.1|EDSMYP|UCMD2 collagen type XII alpha 1 chain protein-coding 517.999 chr12 17881945 17882360 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 208041 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 361.999 chr1 188312935 188313342 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 869510 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 180.666-6 chr10 125195113 125195360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34206 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 307.999-3 chr5 50858199 50858666 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 111755 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 219.333-102 chr2 205324706 205324957 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) intron (NM_205863, intron 18 of 21) -357669 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 224.333-28 chr12 8812718 8813064 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -9730 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 155-44 chr16 11733620 11733760 + 1.33333 NA intron (NR_136672, intron 3 of 9) intron (NR_136672, intron 3 of 9) 9167 NM_001324025 51061 Hs.313847 NM_015914 ENSG00000153066 TXNDC11 EFP1 thioredoxin domain containing 11 protein-coding 238.667-98 chr9 68765012 68765344 + 1.33333 NA intron (NM_003558, intron 2 of 15) intron (NM_003558, intron 2 of 15) -14887 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 375.333-11 chr2 50861042 50861453 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) AluJr|SINE|Alu -164985 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 155-104 chr4 100911180 100911417 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -236185 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 202.666-38 chr14 65532058 65532291 + 1.33333 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) L1PREC2|LINE|L1 61072 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 205.333-232 chr8 24230374 24230576 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -63565 NM_021777 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 219.333-166 chr7 32394276 32394499 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 33837 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 211.666-49 chr8 19472931 19473147 + 1.33333 NA intron (NM_001130518, intron 4 of 9) intron (NM_001130518, intron 4 of 9) 129506 NM_001354499 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 213.333-44 chr12 64209467 64209627 + 1.33333 NA intron (NM_152440, intron 2 of 2) AluSq|SINE|Alu 12749 NM_001300940 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 181.333-191 chr9 73729215 73729500 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 577492 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 169-78 chr4 121978697 121978842 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26709 NM_001130698 7222 Hs.150981 NM_003305 ENSG00000138741 TRPC3 SCA41|TRP3 transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 protein-coding 200.666-32 chr14 37128038 37128260 + 1.33333 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -43877 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 249-39 chr2 102503402 102503736 + 1.33333 NA exon (NM_001011552, exon 3 of 12) exon (NM_001011552, exon 3 of 12) 30343 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 192-9 chr1 113814116 113814351 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001193431, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001193431, exon 21 of 21) 1621 NR_125965 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 351.666-10 chr3 12112934 12113241 + 1.33333 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) intron (NM_133625, intron 1 of 12) 45825 NM_003256 7079 Hs.591665 NM_003256 ENSG00000157150 TIMP4 TIMP-4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 protein-coding 278-11 chr14 56963452 56963841 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 150488 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 351-5 chr11 7680888 7681402 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6878 NM_001302826 51700 Hs.414362 NM_016229 ENSG00000166394 CYB5R2 B5R.2 cytochrome b5 reductase 2 protein-coding 349.333-12 chr14 41600099 41600612 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6501 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 191.333-129 chr3 10773456 10773656 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9347 NR_027102 285370 Hs.157613 NR_027102 ENSG00000226567 LINC00606 - long intergenic non-protein coding RNA 606 ncRNA 435.333-10 chr9 106248425 106249003 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -352214 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 314.666-27 chr4 23811157 23811488 + 1.33333 NA intron (NM_001330752, intron 11 of 13) intron (NM_001330752, intron 11 of 13) 69970 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 203-48 chr19 13358058 13358344 + 1.33333 NA intron (NM_023035, intron 6 of 46) L1MC5a|LINE|L1 148259 NM_001127221 773 Hs.501632 NM_000068 ENSG00000141837 CACNA1A APCA|BI|CACNL1A4|CAV2.1|EA2|EIEE42|FHM|HPCA|MHP|MHP1|SCA6 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A protein-coding 174.666-10 chr15 78987769 78988022 + 1.33333 NA intron (NM_001145648, intron 22 of 26) intron (NM_001145648, intron 22 of 26) 9006 NR_148998 100129540 Hs.459035 NR_148998 ENSG00000177699 LOC100129540 - uncharacterized LOC100129540 ncRNA 225.333-13 chr10 31122182 31122370 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65607 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 144-101 chr3 32082088 32082305 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24315 NM_015141 23171 Hs.82432 NM_015141 ENSG00000152642 GPD1L GPD1-L glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like protein-coding 482.666-3 chr4 16140167 16140888 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56504 NM_001145848 8842 Hs.614734 NM_006017 ENSG00000007062 PROM1 AC133|CD133|CORD12|MCDR2|MSTP061|PROML1|RP41|STGD4 prominin 1 protein-coding 244.333-24 chr11 67070719 67071015 + 1.33333 NA intron (NM_001300886, intron 2 of 2) intron (NM_001300886, intron 2 of 2) 14020 NM_014578 29984 Hs.15114 NM_014578 ENSG00000173156 RHOD ARHD|RHOHP1|RHOM|Rho ras homolog family member D protein-coding 410.666-8 chr6 41317247 41317839 + 1.33333 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -18065 NM_004828 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 206.666-116 chr8 87016649 87016875 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) MER4B-int|LTR|ERV1 150347 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 346.333-30 chr8 109756662 109757087 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65083 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 201.333-308 chrX 118076116 118076267 + 1.33333 NA intron (NM_001168301, intron 1 of 7) intron (NM_001168301, intron 1 of 7) 40674 NM_001168302 90293 Hs.348262 NM_033495 ENSG00000003096 KLHL13 BKLHD2 kelch like family member 13 protein-coding 199.333-147 chr2 174762568 174762842 + 1.33333 NA intron (NM_001039523, intron 1 of 9) intron (NM_001039523, intron 1 of 9) 1767 NM_000079 1134 Hs.434479 NM_000079 ENSG00000138435 CHRNA1 ACHRA|ACHRD|CHRNA|CMS1A|CMS1B|CMS2A|FCCMS|SCCMS cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunit protein-coding 216.333-152 chr9 132912464 132912668 + 1.33333 NA intron (NM_000368, intron 8 of 22) intron (NM_000368, intron 8 of 22) 32050 NM_001162427 7248 Hs.370854 NM_000368 ENSG00000165699 TSC1 LAM|TSC TSC complex subunit 1 protein-coding 410.999-3 chr2 202716647 202717283 + 1.33333 NA intron (NM_173511, intron 2 of 7) L1MA3|LINE|L1 81996 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 469.333-6 chr8 113414083 113414527 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 22634 NM_052900 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 222-77 chr5 114129299 114129496 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -232673 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 269.999-4 chr17 20777124 20777432 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 64832 NR_073509 100287072 Hs.676308 NR_073509 LOC100287072 - ribosomal protein S6 kinase B1 pseudogene pseudo 216-125 chr9 84387940 84388139 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -19312 NM_022127 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 132.333-109 chr3 31543547 31543840 + 1.33333 NA intron (NM_178862, intron 1 of 15) intron (NM_178862, intron 1 of 15) 10768 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 167.333-174 chr3 81806308 81806484 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44751 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 195-93 chr6 83527861 83528092 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 15442 NM_001170423 167681 Hs.98381 NM_153362 ENSG00000146250 PRSS35 C6orf158|dJ223E3.1 serine protease 35 protein-coding 210.666-39 chr15 52339000 52339167 + 1.33333 NA intron (NM_001142495, intron 31 of 39) intron (NM_001142495, intron 31 of 39) -43279 NM_018728 55930 Hs.487036 NM_018728 ENSG00000128833 MYO5C - myosin VC protein-coding 202.666-71 chr22 48104946 48105147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -169318 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 253-14 chr12 15611787 15612102 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 65333 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 235.333-125 chr8 124919279 124919559 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -22589 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 115.333-43 chr12 12660430 12660595 + 1.33333 NA TTS (NM_006143) TTS (NM_006143) 35671 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 236.667-44 chr2 220315948 220316347 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -409582 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 221.333-56 chr2 8271798 8272039 + 1.33333 NA intron (NR_152741, intron 8 of 9) intron (NR_152741, intron 8 of 9) 56501 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 195-82 chr5 29652720 29652928 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -227736 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 334-23 chr2 218906765 218907110 + 1.33333 NA non-coding (NR_110238, exon 4 of 5) non-coding (NR_110238, exon 4 of 5) 23700 NR_110238 101928537 Hs.611129 NR_110238 ENSG00000228135 LINC01494 - long intergenic non-protein coding RNA 1494 ncRNA 219.666-43 chr7 143896659 143896921 + 1.33333 NA intron (NM_001206938, intron 1 of 8) L1ME3D|LINE|L1 5386 NM_014719 9747 Hs.735149 NM_014719 ENSG00000198420 TCAF1 FAM115A TRPM8 channel associated factor 1 protein-coding 178-56 chr18 11183546 11183712 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34867 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 267-2 chr1 110968334 110968608 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -4527 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 161.667-20 chr1 212853934 212854159 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 4092 NR_027285 642946 Hs.552649 NR_027285 ENSG00000198468 FLVCR1-DT FLVCR1-AS1|LQK1|NCRNA00292 FLVCR1 divergent transcript ncRNA 190.333-30 chr11 37269779 37269929 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -668747 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 258.666-25 chr3 20573004 20573271 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 230669 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 187.333-184 chr7 2844438 2844605 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_007353) promoter-TSS (NM_007353) -213 NM_007353 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 272-36 chr4 62218043 62218325 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -56419 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 252.999-6 chr7 105624898 105625197 + 1.33333 NA intron (NM_138495, intron 5 of 9) intron (NM_138495, intron 5 of 9) -43505 NM_001355527 100130771 Hs.719432 NM_001355526 ENSG00000185055 EFCAB10 - EF-hand calcium binding domain 10 protein-coding 251.999-3 chr12 103513695 103513988 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 17801 NR_135004 105369945 Hs.742785 NR_135004 LOC105369945 - uncharacterized LOC105369945 ncRNA 195.666-24 chr2 186293400 186293720 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -192700 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 200-131 chr5 99092336 99092498 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -162703 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 164.667-49 chr12 25747771 25748012 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -99313 NM_001352234 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 172-69 chr21 42470704 42470913 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 25416 NM_001286506 89765 Hs.661069 NM_080860 ENSG00000160188 RSPH1 CT79|RSP44|RSPH10A|TSA2|TSGA2 radial spoke head component 1 protein-coding 216.667-59 chr2 162236069 162236377 + 1.33333 NA intron (NM_004460, intron 2 of 25) L1M4|LINE|L1 7222 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 270.666-5 chr12 74756328 74756564 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 218611 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 250-72 chr6 98107803 98108033 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 83387 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 233.333-26 chr11 9994754 9995080 + 1.33333 NA intron (NM_030962, intron 9 of 39) AluSz|SINE|Alu 155775 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 270.333-10 chr10 73181145 73181529 + 1.33333 NA intron (NM_173348, intron 3 of 13) L1M1|LINE|L1 13218 NM_173348 317662 Hs.408577 NM_173348 ENSG00000138286 FAM149B1 KIAA0974 family with sequence similarity 149 member B1 protein-coding 182.666-39 chr8 62769692 62769857 + 1.33333 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) intron (NM_001304533, intron 4 of 6) -208087 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 221-15 chr11 103058768 103059082 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_032299, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_032299, exon 8 of 8) 33235 NM_032299 84259 Hs.503716 NM_032299 ENSG00000137692 DCUN1D5 SCCRO5 defective in cullin neddylation 1 domain containing 5 protein-coding 206.666-74 chr3 82218558 82218899 + 1.33333 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 232586 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 199-15 chr10 116922552 116922781 + 1.33333 NA intron (NM_001127211, intron 11 of 16) L1ME3B|LINE|L1 -72944 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 198.667-105 chr2 142416415 142416650 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -284831 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 200.666-95 chr5 25711041 25711271 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 520203 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 273.667-24 chr15 62036857 62037227 + 1.33333 NA intron (NM_001018088, intron 3 of 81) intron (NM_001018088, intron 3 of 81) 23405 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 216-44 chr17 57911825 57912096 + 1.33333 NA intron (NM_001271875, intron 1 of 10) intron (NM_001271875, intron 1 of 10) -8571 NM_001292025 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 180-17 chr11 78566582 78566735 + 1.33333 NA intron (NM_024678, intron 3 of 13) intron (NM_024678, intron 3 of 13) 8206 NM_024678 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 272.666-26 chr8 11333606 11333935 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 2784 NM_054028 83650 Hs.458397 NM_054028 ENSG00000177710 SLC35G5 AMAC|AMAC1L2 solute carrier family 35 member G5 protein-coding 288.333-26 chr3 114929801 114930205 + 1.33333 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) intron (NM_001348805, intron 3 of 10) -29378 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 322-44 chr7 112627498 112627828 + 1.33333 NA intron (NR_110158, intron 1 of 7) L1PREC2|LINE|L1 5282 NR_110158 101928012 Hs.521131 NR_110158 ENSG00000223646 LOC101928012 - uncharacterized LOC101928012 ncRNA 367.667-14 chr4 34158568 34159039 + 1.33333 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) L1MA2|LINE|L1 110944 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 310-38 chr3 163541630 163542078 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -238553 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 189.333-100 chr2 152406678 152406834 + 1.33333 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 71582 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 214.333-75 chr2 54082995 54083279 + 1.33333 NA intron (NM_001320587, intron 3 of 5) intron (NM_001320587, intron 3 of 5) -32478 NM_138448 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 195.667-119 chr6 65227706 65227980 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) L1MB4|LINE|L1 -73575 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 221.666-44 chr5 33786923 33787098 + 1.33333 NA intron (NM_001324511, intron 2 of 2) intron (NM_001324511, intron 2 of 2) 104980 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 130.333-60 chr13 75917565 75917696 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17502 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 117.333-6 chr1 72195693 72195867 + 1.33333 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) 86759 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 214.666-16 chr11 116249022 116249243 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -390290 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 192.666-14 chr11 122787785 122787940 + 1.33333 NA intron (NM_001363365, intron 5 of 13) intron (NM_001363365, intron 5 of 13) -50638 NM_019604 56253 Hs.159523 NM_019604 ENSG00000109943 CRTAM CD355 cytotoxic and regulatory T cell molecule protein-coding 157-138 chr9 82282828 82283044 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 294164 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 209.333-106 chr2 38114145 38114330 + 1.33333 NA Intergenic LTR87|LTR|ERVL? -16868 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-19 chr1 244390941 244391140 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL 38405 NM_001276348 200159 Hs.442703 NM_001012970 ENSG00000173728 C1orf100 - chromosome 1 open reading frame 100 protein-coding 196-105 chr21 35703229 35703470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17366 NR_030414 768219 NR_030414 ENSG00000211590 MIR802 MIRN802|hsa-mir-802 microRNA 802 ncRNA 207.666-46 chr4 113081334 113081534 + 1.33333 NA intron (NM_001354232, intron 1 of 46) intron (NM_001354232, intron 1 of 46) -25429 NR_031641 100302188 NR_031641 ENSG00000283193 MIR1243 MIRN1243|hsa-mir-1243 microRNA 1243 ncRNA 270-60 chr9 102373448 102373744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -146041 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 303-11 chr12 3849309 3849626 + 1.33333 NA intron (NM_020367, intron 1 of 7) L1MA4|LINE|L1 23932 NR_104461 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 209-7 chr1 197397540 197397739 + 1.33333 NA intron (NM_001193640, intron 3 of 9) L1ME1|LINE|L1 129387 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 170.667-32 chr12 103128060 103128235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23695 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 189-26 chr14 53265646 53265803 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 112370 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 336-3 chr1 227267912 227268577 + 1.33333 NA intron (NM_001366019, intron 1 of 36) MER58A|DNA|hAT-Charlie 50248 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 220-78 chr3 163261753 163261938 + 1.33333 NA intron (NR_033945, intron 2 of 6) L1MC3|LINE|L1 41456 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 213.666-21 chr2 37796081 37796281 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33530 NR_110011 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 210.333-110 chr3 197909297 197909560 + 1.33333 NA intron (NM_001323029, intron 9 of 11) L1MD|LINE|L1 40497 NM_001323027 84223 Hs.591675 NM_032263 ENSG00000114473 IQCG CFAP122|DRC9 IQ motif containing G protein-coding 225.666-11 chr2 55275344 55275610 + 1.33333 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6229 NM_001321003 4528 Hs.149894 NM_002453 ENSG00000085760 MTIF2 - mitochondrial translational initiation factor 2 protein-coding 221.666-2 chr1 44508490 44508677 + 1.33333 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) -36910 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 162-122 chr8 114524683 114524889 + 1.33333 NA Intergenic (ATATACT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1087847 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 152.667-115 chr14 69722751 69722920 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -44307 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 285.333-35 chr2 155148912 155149185 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 450353 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 183.333-74 chr18 5654421 5654578 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25508 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 204-149 chr4 43697256 43697431 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -204800 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 259.666-2 chr1 50537627 50537890 + 1.33333 NA intron (NM_007051, intron 14 of 18) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -114315 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 304.333-15 chr17 71841997 71842502 + 1.33333 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 183730 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 222.333-26 chr13 84981522 84981829 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 166382 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 369.999-2 chr7 2145622 2146123 + 1.33333 NA intron (NM_001013837, intron 11 of 18) intron (NM_001013837, intron 11 of 18) -56820 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 126.667-62 chr16 19384711 19384869 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25749 NM_001308161 79838 Hs.115838 NM_024780 ENSG00000103534 TMC5 - transmembrane channel like 5 protein-coding 381.666-5 chr2 76897668 76897954 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -88154 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 356.666-8 chr17 57635357 57635708 + 1.33333 NA intron (NM_001322250, intron 10 of 13) intron (NM_001322250, intron 10 of 13) -27120 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 173-60 chr3 150359074 150359234 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35407 NR_110186 101928022 Hs.555199 NR_110186 LINC01214 - long intergenic non-protein coding RNA 1214 ncRNA 365.333-17 chr3 162534617 162535112 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 768437 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 198-107 chr20 58740042 58740223 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -33293 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 298.666-11 chr22 45734794 45735035 + 1.33333 NA intron (NM_013236, intron 7 of 11) AluSx1|SINE|Alu -25610 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 212.333-19 chr10 77614231 77614489 + 1.33333 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) L2b|LINE|L2 23448 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 265-44 chr20 55318292 55318592 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -104601 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 335.666-8 chr2 96478782 96479261 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 26336 NM_001285486 93082 Hs.149219 NM_001080535 ENSG00000163121 NEURL3 LINCR|RNF132 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 242-42 chr2 114758437 114758686 + 1.33333 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) 74987 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 353.333-6 chr11 93813672 93814308 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_004268, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_004268, exon 12 of 12) 29708 NM_004268 9440 Hs.444931 NM_004268 ENSG00000042429 MED17 CRSP6|CRSP77|DRIP80|SRB4|TRAP80 mediator complex subunit 17 protein-coding 248-4 chr1 109887405 109887668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23313 NM_172210 1435 Hs.173894 NM_000757 ENSG00000184371 CSF1 CSF-1|MCSF colony stimulating factor 1 protein-coding 229.667-5 chr1 200110518 200110891 + 1.33333 NA intron (NM_205860, intron 5 of 7) intron (NM_205860, intron 5 of 7) 67879 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 336.666-16 chr20 58173445 58173802 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 22721 NM_178456 128602 Hs.43977 NM_178456 ENSG00000124237 C20orf85 LLC1|bA196N14.1 chromosome 20 open reading frame 85 protein-coding 207.666-32 chr20 51653974 51654167 + 1.33333 NA intron (NM_006045, intron 14 of 27) intron (NM_006045, intron 14 of 27) -91231 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 249.667-64 chr3 147840048 147840392 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -237939 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 216.333-14 chr1 211998242 211998434 + 1.33333 NA intron (NM_015434, intron 7 of 19) L1ME1|LINE|L1 -37215 NM_001286230 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 188-5 chr1 54215440 54215698 + 1.33333 NA intron (NM_001330602, intron 5 of 6) intron (NM_001330602, intron 5 of 6) 15402 NM_016491 51253 Hs.584908 NM_016491 ENSG00000116221 MRPL37 L2mt|L37mt|MRP-L2|MRP-L37|MRPL2|RPML2 mitochondrial ribosomal protein L37 protein-coding 269.333-71 chr5 89097817 89098082 + 1.33333 NA intron (NR_136221, intron 4 of 6) intron (NR_136221, intron 4 of 6) -193844 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 316.333-13 chr18 4461353 4461679 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6209 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 136.667-66 chr15 34327086 34327266 + 1.33333 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) intron (NM_001042496, intron 2 of 25) -8356 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 222.667-69 chr4 155218893 155219208 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 10414 NM_000910 4887 Hs.37125 NM_000910 ENSG00000185149 NPY2R NPY2-R neuropeptide Y receptor Y2 protein-coding 217.667-93 chr9 25774524 25774799 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5395 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 235.999-3 chr8 43195087 43195281 + 1.33333 NA intron (NM_152419, intron 14 of 17) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 54720 NM_152419 138050 Hs.600384 NM_152419 ENSG00000165102 HGSNAT HGNAT|MPS3C|RP73|TMEM76 heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase protein-coding 207-57 chr18 5820987 5821283 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -19560 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 184.333-105 chr3 87213797 87214029 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12364 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 184.333-30 chr13 91774711 91774883 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 5 of 7) LTR16A1|LTR|ERVL 376176 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 200.333-143 chr7 93213125 93213357 + 1.33333 NA intron (NM_001346642, intron 3 of 9) intron (NM_001346642, intron 3 of 9) 6330 NM_001288810 253012 Hs.443169 NM_198151 ENSG00000188175 HEPACAM2 MIKI HEPACAM family member 2 protein-coding 384.666-11 chr6 76498617 76498966 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 94832 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 211.333-234 chr8 73800621 73800909 + 1.33333 NA intron (NR_073120, intron 4 of 5) intron (NR_073120, intron 4 of 5) -53057 NM_001164384 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 408.333-10 chr5 99065992 99066368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -136466 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 251.333-88 chr5 74209102 74209360 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 99094 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 150.667-338 chr6 103269833 103270046 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1589607 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 208-111 chr3 154350507 154350673 + 1.33333 NA intron (NM_001038705, intron 3 of 3) L1MD|LINE|L1 -26093 NM_001114397 170506 Hs.446270 NM_020865 ENSG00000174953 DHX36 DDX36|G4R1|MLEL1|RHAU DEAH-box helicase 36 protein-coding 298.333-24 chr22 30743237 30743548 + 1.33333 NA intron (NM_030758, intron 2 of 13) intron (NM_030758, intron 2 of 13) 11835 NR_036171 100422912 NR_036171 ENSG00000264661 MIR3200 mir-3200 microRNA 3200 ncRNA 201.333-135 chr19 16386787 16387060 + 1.33333 NA intron (NM_021235, intron 19 of 22) L1MEf|LINE|L1 62097 NM_016270 10365 Hs.685136 NM_016270 ENSG00000127528 KLF2 LKLF Kruppel like factor 2 protein-coding 312.666-4 chr12 16564780 16565157 + 1.33333 NA intron (NR_045014, intron 2 of 3) AluJo|SINE|Alu 40411 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 314.666-3 chr1 89935634 89936001 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018103, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_018103, exon 3 of 3) 59149 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 197.333-94 chr18 24741506 24741728 + 1.33333 NA intron (NR_134604, intron 2 of 2) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 15836 NR_134604 105372028 Hs.569901 NR_134604 ENSG00000266573 LOC105372028 - uncharacterized LOC105372028 ncRNA 336.333-2 chr1 76248366 76248810 + 1.33333 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 173842 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 197.666-67 chr8 130761957 130762105 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 278878 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 177.666-14 chr21 14737091 14737395 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94136 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 200-161 chr7 101416050 101416239 + 1.33333 NA intron (NM_133457, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu 53269 NM_001278563 136227 Hs.654854 NM_133457 ENSG00000160963 COL26A1 EMI6|EMID2|EMU2|SH2B collagen type XXVI alpha 1 chain protein-coding 235-50 chr7 121412169 121412506 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15969 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 168.667-81 chr17 70524422 70524663 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 355007 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 255.666-7 chr13 23913745 23913952 + 1.33333 NA intron (NR_073430, intron 3 of 4) MER47A|DNA|TcMar-Tigger -16346 NR_104426 387911 Hs.740810 NM_001007537 ENSG00000205863 C1QTNF9B CTRP9B C1q and TNF related 9B protein-coding 221.333-115 chr5 104353486 104353767 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -745848 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 185.333-46 chr14 56921756 56921942 + 1.33333 NA intron (NR_029385, intron 3 of 3) MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR 108691 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 190.666-61 chr9 70288320 70288473 + 1.33333 NA intron (NM_015110, intron 8 of 24) L1MC|LINE|L1 29418 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 149.666-2 chr11 26611015 26611214 + 1.33333 NA intron (NM_031418, intron 17 of 26) L1MA6|LINE|L1 -38851 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 165.667-171 chr6 3323434 3323628 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001286456, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001286456, exon 4 of 4) 64584 NM_001128591 389362 Hs.207069 NM_001128591 ENSG00000180822 PSMG4 C6orf86|PAC4|bA506K6.2 proteasome assembly chaperone 4 protein-coding 230.667-68 chr6 1585710 1586058 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19647 NR_125804 101927703 Hs.607964 NR_125804 FOXCUT LINC01379|TCONS_00011636 FOXC1 upstream transcript ncRNA 128.666-3 chr15 61496255 61496430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -233576 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 230.666-37 chr3 63838340 63838560 + 1.33333 NA exon (NM_001285404, exon 3 of 8) exon (NM_001285404, exon 3 of 8) 19151 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 251.666-23 chr4 89876889 89877204 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -2465 NM_001371403 253.333-13 chr11 33784207 33784456 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 9632 NR_120550 101928440 Hs.202343 NR_120550 ENSG00000254508 FBXO3-DT FBXO3-AS1 FBXO3 divergent transcript ncRNA 203.333-123 chr2 15681578 15681767 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9110 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 214-41 chr15 75447331 75447574 + 1.33333 NA intron (NM_001145357, intron 1 of 20) L2a|LINE|L2 4238 NM_015477 25942 Hs.513039 NM_015477 ENSG00000169375 SIN3A WITKOS SIN3 transcription regulator family member A protein-coding 233-51 chr4 72096475 72096760 + 1.33333 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) intron (NM_001144756, intron 2 of 4) 57485 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 197.333-79 chr17 3314720 3314884 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 4557 NR_024128 390756 Hs.632245 NM_001005334 ENSG00000180068 OR3A4P OLFRA05|OLFRA06|OR17-13|OR17-16|OR17-24|OR17-25|OR24|OR25|OR3A4|OR3A5P olfactory receptor family 3 subfamily A member 4 pseudogene pseudo 163.667-24 chr10 57037942 57038091 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 266543 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 130.333-3 chr1 30923778 30923926 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 11924 NR_004054 692234 NR_004054 SNORD103A U103 small nucleolar RNA, C/D box 103A snoRNA 205.333-30 chr10 32540713 32540868 + 1.33333 NA intron (NR_109826, intron 11 of 16) L1PA15|LINE|L1 94650 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 403-3 chr17 47332827 47333313 + 1.33333 NA intron (NM_001195192, intron 4 of 21) L1MA7|LINE|L1 9115 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 265.333-82 chr8 49107631 49107996 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35469 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 207.333-212 chr5 15671582 15671816 + 1.33333 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -56697 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 462.666-5 chr5 122666301 122666846 + 1.33333 NA intron (NR_109881, intron 8 of 11) intron (NR_109881, intron 8 of 11) 63987 NR_109881 101927379 Hs.536399 NR_109881 ENSG00000251538 LINC02201 - long intergenic non-protein coding RNA 2201 ncRNA 283.333-28 chr2 24993778 24994217 + 1.33333 NA intron (NR_034113, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 21885 NR_034113 729723 Hs.436366 NR_034113 ENSG00000224165 DNAJC27-AS1 - DNAJC27 antisense RNA 1 ncRNA 369.666-2 chr11 78815029 78815335 + 1.33333 NA intron (NM_001098816, intron 12 of 33) AluSz|SINE|Alu -240318 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 198.333-145 chr4 91086691 91086864 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 851746 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 218-40 chr18 10777068 10777367 + 1.33333 NA intron (NM_022068, intron 17 of 51) intron (NM_022068, intron 17 of 51) -17568 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 215.333-28 chr10 106253191 106253361 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 113111 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 262.333-28 chr15 62401533 62401826 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 58650 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 223.333-97 chr22 27364293 27364595 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 53793 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 211-70 chr3 178082731 178083033 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 266017 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 315 chr1 198774953 198775453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83779 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 385.333-21 chr4 56869844 56870300 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -37828 NM_005612 5978 Hs.307836 NM_005612 ENSG00000084093 REST DFNA27|GINGF5|HGF5|NRSF|WT6|XBR RE1 silencing transcription factor protein-coding 262.999-4 chr2 35596107 35596387 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 124842 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 300.667-31 chr4 98977900 98978315 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17614 NM_015143 23173 Hs.480364 NM_015143 ENSG00000164024 METAP1 MAP1A|MetAP1A methionyl aminopeptidase 1 protein-coding 187-39 chr2 220057906 220058077 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -151426 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 263.333-7 chr10 90706728 90707057 + 1.33333 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 151147 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 201-85 chr4 111739369 111739624 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -405958 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 190-133 chrX 45408611 45408828 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -96669 NR_104645 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 228.666-13 chr12 41460889 41461106 + 1.33333 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) intron (NM_013377, intron 1 of 7) 23258 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 298.333-14 chr15 65795094 65795454 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2981 NM_005848 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 214.666-73 chr8 125069669 125069857 + 1.33333 NA intron (NM_014846, intron 9 of 28) intron (NM_014846, intron 9 of 28) 22029 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 128.333-68 chr15 90672593 90672711 + 1.33333 NA intron (NR_120372, intron 2 of 3) intron (NR_120372, intron 2 of 3) 12418 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 409.667-3 chr18 13585088 13585621 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -25760 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 180.333-97 chr5 105486028 105486334 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 386707 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 206.333-23 chr11 32613773 32613979 + 1.33333 NA exon (NM_001008391, exon 16 of 18) exon (NM_001008391, exon 16 of 18) 30045 NM_006360 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 212.667-93 chr3 179576729 179577034 + 1.33333 NA exon (NM_178042, exon 8 of 14) exon (NM_178042, exon 8 of 14) 13955 NM_004301 86 Hs.435326 NM_004301 ENSG00000136518 ACTL6A ACTL6|ARPN-BETA|Arp4|BAF53A|INO80K actin like 6A protein-coding 230.666-40 chr4 52984375 52984564 + 1.33333 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 122152 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 184-56 chr2 194857996 194858186 + 1.33333 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 127496 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 184.333-70 chr2 15392494 15392762 + 1.33333 NA intron (NR_052013, intron 28 of 50) L1ME1|LINE|L1 168706 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 212-30 chr11 101507704 101507941 + 1.33333 NA intron (NM_004621, intron 1 of 12) HAL1|LINE|L1 12083 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 217.333-6 chr1 85969955 85970264 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 22 of 59) intron (NM_152890, intron 22 of 59) 186362 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 369.333-15 chr2 202720644 202721191 + 1.33333 NA intron (NM_173511, intron 2 of 7) L1MC4|LINE|L1 85948 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 279.333-6 chr1 178288821 178289093 + 1.33333 NA intron (NM_170692, intron 2 of 17) L2-3_Crp|LINE|L2 -52494 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 262.333-29 chr15 65735402 65735758 + 1.33333 NA intron (NM_005848, intron 7 of 31) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -16248 NR_039736 100616379 NR_039736 ENSG00000264737 MIR4511 mir-4511 microRNA 4511 ncRNA 174-56 chr2 177239525 177239719 + 1.33333 NA intron (NM_001313903, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 16388 NR_036075 100422824 NR_036075 ENSG00000265396 MIR3128 mir-3128 microRNA 3128 ncRNA 205.999-5 chr3 84466929 84467083 + 1.33333 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 402569 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 162-107 chr6 149781540 149781671 + 1.33333 NA intron (NM_001252050, intron 3 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 31864 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 212.333-33 chr12 51488352 51488548 + 1.33333 NA intron (NM_001039960, intron 17 of 24) LTR45C|LTR|ERV1 63333 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 202-137 chr4 153119106 153119373 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -33095 NM_001351056 23321 Hs.435711 NM_015271 ENSG00000109654 TRIM2 CMT2R|RNF86 tripartite motif containing 2 protein-coding 274.666-8 chr12 104033473 104033756 + 1.33333 NA intron (NM_031302, intron 2 of 11) L1MA9|LINE|L1 30563 NM_001316967 83468 Hs.631650 NM_031302 ENSG00000120820 GLT8D2 - glycosyltransferase 8 domain containing 2 protein-coding 310-43 chr5 57854035 57854612 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44839 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 126-43 chr17 62728230 62728399 + 1.33333 NA intron (NM_001288780, intron 7 of 10) AluJr|SINE|Alu 22108 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 218-41 chr18 69405564 69405823 + 1.33333 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) intron (NM_152721, intron 1 of 7) 4805 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 412.666 chr1 85433671 85434298 + 1.33333 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) -29478 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 310-6 chr1 197396929 197397340 + 1.33333 NA intron (NM_001193640, intron 3 of 9) L1ME1|LINE|L1 128882 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 180.333-80 chr3 94422191 94422406 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 359237 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 225.333-115 chr6 22581233 22581544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11822 NM_138574 154150 Hs.629246 NM_138574 ENSG00000112273 HDGFL1 HRP-1|Hdgfrp1|PWWP1|dJ309H15.1 HDGF like 1 protein-coding 199.333-227 chr5 78846112 78846359 + 1.33333 NA intron (NM_198709, intron 6 of 7) L1MA5|LINE|L1 139075 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 220-41 chr15 80752013 80752196 + 1.33333 NA intron (NM_021214, intron 2 of 2) intron (NM_021214, intron 2 of 2) -27266 NM_001293304 57214 Hs.459088 NM_018689 ENSG00000103888 CEMIP CCSP1|HYBID|KIAA1199|TMEM2L cell migration inducing hyaluronidase 1 protein-coding 356.666-15 chr5 52806029 52806343 + 1.33333 NA intron (NM_181501, intron 1 of 28) intron (NM_181501, intron 1 of 28) 18270 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 176.666-2 chr1 216436340 216436533 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -12988 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 164.667-34 chr11 31450308 31450459 + 1.33333 NA intron (NM_001304274, intron 4 of 5) intron (NM_001304274, intron 4 of 5) 59239 NM_001304274 196294 Hs.502223 NM_144981 ENSG00000148950 IMMP1L IMMP1|IMP1|IMP1-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 1 protein-coding 220-45 chr16 78999995 79000257 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 600611 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 174.666-24 chr8 122251572 122251717 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 317000 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 220.333-91 chr3 97065205 97065520 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) 250768 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 234.666-7 chr1 176059200 176059582 + 1.33333 NA intron (NM_022457, intron 11 of 19) intron (NM_022457, intron 11 of 19) -90851 NR_002998 677679 NR_002998 ENSG00000252906 SCARNA3 HBI-100 small Cajal body-specific RNA 3 ncRNA 240-65 chr3 192430930 192431288 + 1.33333 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) -22060 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 204-97 chr2 97868727 97869016 + 1.33333 NA intron (NM_015348, intron 4 of 40) intron (NM_015348, intron 4 of 40) 127077 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 171.333-77 chr2 51637245 51637388 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) (AAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 604715 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 268.666-16 chr18 2986851 2987104 + 1.33333 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) 24970 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 138-63 chr2 220325805 220326014 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -419344 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 280-16 chr17 56137289 56137767 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15947 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 251.333-70 chr20 35035819 35036037 + 1.33333 NA intron (NM_199368, intron 7 of 18) intron (NM_199368, intron 7 of 18) -45456 NR_039912 100616134 NR_039912 ENSG00000283441 MIR499B MIR499A|hsa-mir-499b microRNA 499b ncRNA 277.667-19 chr17 59037901 59038275 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 17 of 23) L1MC3|LINE|L1 68792 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 216.333-64 chr18 63060707 63061003 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 258525 NM_000657 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 217.667-39 chr2 23801566 23801856 + 1.33333 NA intron (NR_125717, intron 19 of 28) intron (NR_125717, intron 19 of 28) 125412 NM_017552 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 246.333-85 chr6 13070449 13070659 + 1.33333 NA intron (NM_001322308, intron 4 of 13) MIRb|SINE|MIR 57000 NM_001322314 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 318.333-12 chr14 51492383 51492726 + 1.33333 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) intron (NM_001042481, intron 1 of 14) 3426 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 148-112 chr4 55074652 55074866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50836 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 192-79 chr2 188339042 188339188 + 1.33333 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 41623 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 323.333-6 chr12 20986330 20986737 + 1.33333 NA intron (NM_001371097, intron 13 of 15) AluYk3|SINE|Alu -29163 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 325-25 chr5 31841103 31841485 + 1.33333 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) MIRb|SINE|MIR 94865 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 218.666-79 chrX 135077444 135077669 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 21156 NM_001348255 644596 Hs.656427 NM_001348255 ENSG00000196972 SMIM10L2B LINC00086|LINC00087|NCRNA00086|NCRNA00087|SMIM10L2A small integral membrane protein 10 like 2B protein-coding 208-64 chr18 12960734 12960918 + 1.33333 NA intron (NM_031216, intron 3 of 8) MER50|LTR|ERV1 12815 NM_001013437 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 194.667-75 chr2 152506235 152506517 + 1.33333 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) MER2|DNA|TcMar-Tigger 171202 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 275.333-41 chr20 52531584 52531842 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -89125 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 456.666-4 chr8 129000718 129001249 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34982 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 219.333-66 chr16 26443927 26444198 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 418825 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 505.999-2 chr2 150040486 150040938 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -181521 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 383.666-7 chr8 127180509 127181127 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 16809 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 208.333-92 chr22 29386838 29387132 + 1.33333 NA intron (NM_001166019, intron 1 of 20) intron (NM_001166019, intron 1 of 20) 1585 NM_001166019 162 Hs.368794 NM_001127 ENSG00000100280 AP1B1 ADTB1|AP105A|BAM22|CLAPB2 adaptor related protein complex 1 subunit beta 1 protein-coding 252-55 chr2 232700878 232701253 + 1.33333 NA intron (NM_015575, intron 2 of 30) intron (NM_015575, intron 2 of 30) 3734 NM_001103148 26058 Hs.565319 NM_015575 ENSG00000204120 GIGYF2 GYF2|PARK11|PERQ2|PERQ3|TNRC15 GRB10 interacting GYF protein 2 protein-coding 156-111 chr5 33644095 33644245 + 1.33333 NA intron (NM_001324512, intron 9 of 21) intron (NM_001324512, intron 9 of 21) 203394 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 202-87 chr2 114590434 114590722 + 1.33333 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 129001 NM_001321912 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 233.333-113 chr5 149102526 149102815 + 1.33333 NA intron (NR_122044, intron 2 of 2) L1M2|LINE|L1 -38777 NM_014945 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 180-55 chr2 144668813 144669076 + 1.33333 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) intron (NR_033870, intron 1 of 4) 977 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 257.666-17 chr5 30586744 30587072 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -606778 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 440.666-5 chr18 67292217 67292668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 210858 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 380.999-3 chr6 76309611 76310027 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -237141 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 189.333-37 chr11 81681967 81682129 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 208788 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 164-72 chr21 17431985 17432179 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6808 NR_037585 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 363.333-8 chr14 59275019 59275333 + 1.33333 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) intron (NM_001270520, intron 2 of 24) 11735 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 303.333-50 chr3 28602146 28602593 + 1.33333 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 27091 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 274.666-26 chr5 165537130 165537482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1067027 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 128.333-191 chr8 80659879 80660043 + 1.33333 NA intron (NM_001033723, intron 6 of 8) intron (NM_001033723, intron 6 of 8) 173735 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 187-33 chr2 103919142 103919365 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 489079 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 207.999-4 chr2 197866433 197866593 + 1.33333 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) LTR16C|LTR|ERVL 61920 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 364.666-12 chr5 116291221 116291665 + 1.33333 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) intron (NM_001308080, intron 5 of 6) 35700 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 205.666-41 chr5 61978588 61978749 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -242970 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 209-21 chr11 78247426 78247669 + 1.33333 NA intron (NM_012296, intron 3 of 9) L1M4a1|LINE|L1 58628 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 210.333-100 chr3 40426863 40427094 + 1.33333 NA intron (NM_001248, intron 10 of 10) intron (NM_001248, intron 10 of 10) 26330 NR_040100 285266 Hs.619663 NR_040100 ENSG00000223797 ENTPD3-AS1 - ENTPD3 antisense RNA 1 ncRNA 266-26 chr16 18932593 18932898 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6341 NM_015092 23049 Hs.460179 NM_015092 ENSG00000157106 SMG1 61E3.4|ATX|LIP SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase protein-coding 191-50 chr5 79655935 79656125 + 1.33333 NA intron (NM_001349553, intron 12 of 16) intron (NM_001349553, intron 12 of 16) -33806 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 187.333-81 chr17 52874720 52874987 + 1.33333 NA intron (NR_146899, intron 1 of 2) intron (NR_146899, intron 1 of 2) 12732 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 446-11 chr6 146565461 146565980 + 1.33333 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 21887 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 329.999-4 chr15 88370147 88370473 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 97078 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 185-38 chr2 151857259 151857444 + 1.33333 NA intron (NM_001330116, intron 7 of 10) intron (NM_001330116, intron 7 of 10) -28930 NM_001037174 26225 Hs.470233 NM_012097 ENSG00000162980 ARL5A ARFLP5|ARL5 ADP ribosylation factor like GTPase 5A protein-coding 126.666-3 chr4 142772564 142772709 + 1.33333 NA intron (NM_001331040, intron 1 of 25) intron (NM_001331040, intron 1 of 25) 73899 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 183.333-108 chr3 191177267 191177432 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21892 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 201.333-128 chr18 6363434 6363614 + 1.33333 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 4159 NM_001365770 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 171.333-7 chr1 107282502 107282670 + 1.33333 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 134517 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 205.999-2 chr2 5376254 5376409 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 314787 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 217.333-126 chr6 36892694 36893027 + 1.33333 NA intron (NM_152734, intron 1 of 7) intron (NM_152734, intron 1 of 7) 6908 NM_001286637 221477 Hs.433381 NM_152734 ENSG00000198663 C6orf89 BRAP|PS1TP5TP1 chromosome 6 open reading frame 89 protein-coding 224-72 chr5 31137770 31137967 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55818 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 485.333 chr1 99236889 99237473 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -27111 NM_001166252 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 204.666-95 chr8 16252427 16252664 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59754 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 194-117 chr6 35628174 35628428 + 1.33333 NA intron (NM_001145775, intron 4 of 11) intron (NM_001145775, intron 4 of 11) 36488 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 225.333-85 chr2 198379299 198379564 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4334 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 200-167 chr8 68204998 68205253 + 1.33333 NA intron (NM_024870, intron 37 of 39) intron (NM_024870, intron 37 of 39) -125248 NM_001349479 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 148.666 chr1 196499558 196499716 + 1.33333 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) L1M6|LINE|L1 82844 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 220-114 chr7 138589865 138590072 + 1.33333 NA TTS (NM_015905) TTS (NM_015905) 74256 NM_174959 136306 Hs.99414 NM_174959 ENSG00000157703 SVOPL - SVOP like protein-coding 346-21 chr22 28575296 28575719 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MA3|LINE|L1 104358 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 198.333-95 chr2 64328823 64329006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11845 NR_039632 100616265 NR_039632 ENSG00000283222 MIR4433A MIR4433|hsa-mir-4433a microRNA 4433a ncRNA 245.666-14 chr2 76783320 76783695 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1MB3|LINE|L1 -202458 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 187-66 chr5 113358502 113358763 + 1.33333 NA intron (NM_001085377, intron 2 of 18) intron (NM_001085377, intron 2 of 18) -63694 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 199.333-237 chr6 4031152 4031452 + 1.33333 NA intron (NR_146785, intron 1 of 20) intron (NR_146785, intron 1 of 20) 10002 NR_146784 8899 Hs.159014 NM_003913 ENSG00000112739 PRPF4B PR4H|PRP4|PRP4H|PRP4K|dJ1013A10.1 pre-mRNA processing factor 4B protein-coding 133.666-4 chr7 33362439 33362593 + 1.33333 NA intron (NM_198428, intron 16 of 22) L1M2a|LINE|L1 232952 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 152-74 chr17 69159674 69159850 + 1.33333 NA intron (NM_080282, intron 28 of 39) intron (NM_080282, intron 28 of 39) -17867 NM_080284 23460 Hs.709514 NM_080284 ENSG00000154262 ABCA6 EST155051 ATP binding cassette subfamily A member 6 protein-coding 308-53 chr7 40636027 40636447 + 1.33333 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 343702 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 258.333-25 chr18 4014354 4014687 + 1.33333 NA TTS (NR_102696) TTS (NR_102696) 52167 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 139-25 chr12 21651642 21651879 + 1.33333 NA intron (NM_001174097, intron 2 of 7) intron (NM_001174097, intron 2 of 7) 6034 NM_001174097 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 243.333-11 chr10 116347763 116347975 + 1.33333 NA intron (NM_198515, intron 5 of 8) intron (NM_198515, intron 5 of 8) 23421 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 207-112 chr7 107013331 107013616 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -31232 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 222.333-82 chr6 72307904 72308194 + 1.33333 NA intron (NM_001350433, intron 19 of 25) intron (NM_001350433, intron 19 of 25) -58697 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 146.667-158 chr2 44462904 44463086 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) L1MC5|LINE|L1 101048 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 194.666-62 chr6 96365244 96365408 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -156480 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 164.667-69 chr14 26766532 26766762 + 1.33333 NA intron (NR_147061, intron 3 of 6) intron (NR_147061, intron 3 of 6) -42701 NR_110557 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 351-14 chr5 36200414 36200857 + 1.33333 NA intron (NM_001085411, intron 9 of 11) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 40756 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 405-8 chr2 188280847 188281261 + 1.33333 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) intron (NR_126396, intron 1 of 2) 6637 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 285.999-7 chr6 162907971 162908215 + 1.33333 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) intron (NM_001080379, intron 2 of 4) 146068 NR_110872 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 196.666-34 chr17 31240410 31240651 + 1.33333 NA intron (NM_001042492, intron 29 of 57) L1MA3|LINE|L1 56709 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 157-55 chr18 48810090 48810239 + 1.33333 NA intron (NM_014772, intron 9 of 11) MER33|DNA|hAT-Charlie 132643 NM_001190823 4092 Hs.465087 NM_005904 ENSG00000101665 SMAD7 CRCS3|MADH7|MADH8 SMAD family member 7 protein-coding 196-167 chr7 17822307 17822485 + 1.33333 NA intron (NM_001350862, intron 17 of 25) L1MEd|LINE|L1 118098 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 242.333-39 chr2 17971782 17972158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 93303 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 264-46 chr6 72251124 72251376 + 1.33333 NA exon (NM_001168407, exon 10 of 25) exon (NM_001168407, exon 10 of 25) 34309 NM_001350471 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 348.666-11 chr21 30854755 30855121 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25179 NM_181606 337878 Hs.407656 NM_181606 ENSG00000274749 KRTAP7-1 KAP7.1 keratin associated protein 7-1 (gene/pseudogene) protein-coding 211.333-154 chr3 155796490 155796713 + 1.33333 NA intron (NM_173657, intron 3 of 5) L1MA3|LINE|L1 9677 NM_001308229 285315 Hs.350846 NM_173657 ENSG00000174928 C3orf33 AC3-33 chromosome 3 open reading frame 33 protein-coding 276.333-66 chrX 53405154 53405381 + 1.33333 NA TTS (NR_106916) TTS (NR_106916) 498 NR_106916 102465516 NR_106916 ENSG00000278204 MIR6857 hsa-mir-6857 microRNA 6857 ncRNA 274-56 chr7 10933396 10933761 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_002489, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_002489, exon 4 of 4) 6575 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 200-103 chr3 56537289 56537510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19757 NR_024460 285331 Hs.476399 NM_001012506 ENSG00000180376 CCDC66 - coiled-coil domain containing 66 protein-coding 199.666-44 chr5 15712374 15712563 + 1.33333 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) Ricksha_a|DNA|MULE-MuDR -97466 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 265.333-64 chr5 18358989 18359417 + 1.33333 NA Intergenic (TATAATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 551929 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 206.666-45 chr15 72275104 72275320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2658 NM_001323516 56965 Hs.270244 NM_020213 ENSG00000137817 PARP6 ARTD17|PARP-6-B1|PARP-6-C|pART17 poly(ADP-ribose) polymerase family member 6 protein-coding 205.666-14 chr13 114244700 114244884 + 1.33333 NA TTS (NR_049839) TTS (NR_049839) 287 NR_049839 100847035 NR_049839 ENSG00000264539 MIR548AR - microRNA 548ar ncRNA 240.666-2 chr1 164009278 164009563 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -549940 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 282.666-21 chr6 85158457 85158866 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 231525 NR_134634 101928820 Hs.587370 NR_134633 ENSG00000234155 LINC02535 - long intergenic non-protein coding RNA 2535 ncRNA 306.333-19 chr16 46684223 46684608 + 1.33333 NA intron (NM_018206, intron 1 of 16) intron (NM_018206, intron 1 of 16) 4763 NM_018206 55737 Hs.454528 NM_018206 ENSG00000069329 VPS35 MEM3|PARK17 VPS35 retromer complex component protein-coding 222.333-46 chr2 107119246 107119448 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 230178 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 206.666 chr1 40212930 40213161 + 1.33333 NA intron (NM_012421, intron 5 of 7) intron (NM_012421, intron 5 of 7) -34892 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 326.333-34 chr8 85061637 85062114 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -45363 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 237.666-15 chr7 16846447 16846840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35340 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 284.666-13 chr18 31966262 31966511 + 1.33333 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -23258 NM_014939 22878 Hs.202001 NM_014939 ENSG00000153339 TRAPPC8 GSG1|HsT2706|KIAA1012|TRS85 trafficking protein particle complex 8 protein-coding 407.333-7 chr12 9760647 9761184 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001781) promoter-TSS (NM_001781) -14 NM_001781 969 Hs.208854 NM_001781 ENSG00000110848 CD69 AIM|BL-AC/P26|CLEC2C|EA1|GP32/28|MLR-3 CD69 molecule protein-coding 219.666-14 chr14 69039756 69040018 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60205 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 298-30 chr15 71038331 71038695 + 1.33333 NA intron (NM_017691, intron 15 of 15) intron (NM_017691, intron 15 of 15) -102936 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 237.667-13 chr11 27004732 27005121 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 10814 NM_203371 387758 Hs.712718 NM_203371 ENSG00000176971 FIBIN - fin bud initiation factor homolog protein-coding 137-11 chr10 76665091 76665299 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -222849 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 217-66 chr4 46227578 46227746 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -103608 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 206-159 chr6 124668177 124668378 + 1.33333 NA intron (NM_001040214, intron 4 of 6) intron (NM_001040214, intron 4 of 6) -294268 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 224-44 chr2 73535008 73535231 + 1.33333 NA intron (NM_015120, intron 12 of 22) intron (NM_015120, intron 12 of 22) 78016 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 239.666-23 chr4 88595249 88595505 + 1.33333 NA intron (NM_001271602, intron 1 of 24) intron (NM_001271602, intron 1 of 24) 2897 NM_014606 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 194.666-72 chr8 119780065 119780303 + 1.33333 NA intron (NM_003184, intron 17 of 25) intron (NM_003184, intron 17 of 25) 52657 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 288-28 chr2 99971926 99972353 + 1.33333 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 133444 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 131.666-4 chr9 109075265 109075453 + 1.33333 NA intron (NM_032012, intron 8 of 17) L1M4a1|LINE|L1 -29061 NR_029506 407036 NR_029506 ENSG00000207698 MIR32 MIRN32|hsa-mir-32|miR-32|miRNA32 microRNA 32 ncRNA 168.667-82 chr17 74880120 74880280 + 1.33333 NA intron (NM_178128, intron 4 of 5) intron (NM_178128, intron 4 of 5) -7206 NM_004110 2232 Hs.69745 NM_004110 ENSG00000161513 FDXR ADR|ADXR|ANOA ferredoxin reductase protein-coding 218-103 chr7 79666048 79666281 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 212204 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 186-102 chr8 132843235 132843454 + 1.33333 NA intron (NM_001277196, intron 18 of 19) intron (NM_001277196, intron 18 of 19) -23614 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 206.667-133 chr7 80039224 80039534 + 1.33333 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -95452 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 186.666-5 chr1 119046103 119046262 + 1.33333 NA intron (NM_015836, intron 2 of 5) intron (NM_015836, intron 2 of 5) -1223 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 230-13 chr11 76556105 76556359 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 111207 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 194.667-142 chr7 24976562 24976805 + 1.33333 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) 3495 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 190.333-10 chr1 181810471 181810621 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 251166 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 196.333-17 chr11 25977522 25977686 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -211519 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 148.667-140 chr15 75629160 75629330 + 1.33333 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -2867 NM_001042588 10073 Hs.21577 NM_005701 ENSG00000169371 SNUPN KPNBL|RNUT1|Snurportin1 snurportin 1 protein-coding 264-40 chr4 106928303 106928592 + 1.33333 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) X7B_LINE|LINE|CR1 107866 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 184.333-35 chr14 47856155 47856358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -61242 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 223-2 chr1 95445946 95446270 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28629 NR_033966 440594 Hs.514123 NR_033966 ENSG00000233907 LINC01761 - long intergenic non-protein coding RNA 1761 ncRNA 252.666-34 chr5 44138799 44139073 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -249796 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 412.666-5 chr3 124716597 124717082 + 1.33333 NA intron (NM_007064, intron 25 of 26) intron (NM_007064, intron 25 of 26) -13527 NR_033437 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 184.333-114 chr4 96325345 96325583 + 1.33333 NA intron (NR_147149, intron 1 of 3) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 14761 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 148.666-9 chr6 47952258 47952460 + 1.33333 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 116330 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 193.666-20 chr17 71140041 71140243 + 1.33333 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) L1MC4a|LINE|L1 62037 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 191.333-77 chr15 68857851 68857999 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -37030 NM_006305 8125 Hs.458747 NM_006305 ENSG00000140350 ANP32A C15orf1|HPPCn|I1PP2A|LANP|MAPM|PHAP1|PHAPI|PP32 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A protein-coding 221-6 chr1 169209283 169209575 + 1.33333 NA intron (NR_104229, intron 10 of 12) intron (NR_104229, intron 10 of 12) 102739 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 210.666-80 chr4 136495125 136495317 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -581541 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 198.667-143 chr4 144675522 144675759 + 1.33333 NA intron (NM_022475, intron 4 of 12) intron (NM_022475, intron 4 of 12) 29484 NM_022475 64399 Hs.507991 NM_022475 ENSG00000164161 HHIP HIP hedgehog interacting protein protein-coding 191-71 chr8 13291073 13291233 + 1.33333 NA intron (NM_001348082, intron 5 of 16) AluSq2|SINE|Alu -14369 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 203.666-37 chr21 23246830 23246991 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 137925 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 241.333-100 chr8 29758026 29758362 + 1.33333 NA intron (NR_125815, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 9885 NR_125815 101929450 Hs.512440 NR_125814 ENSG00000253490 LINC02099 - long intergenic non-protein coding RNA 2099 ncRNA 455-5 chr4 66452994 66453597 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176471 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 197.333-212 chr7 49366735 49366949 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -406796 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 202.666-120 chr7 103479850 103480048 + 1.33333 NA intron (NM_005045, intron 63 of 64) intron (NM_005045, intron 63 of 64) -33742 NM_206885 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 238.666-6 chr10 29822091 29822272 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -85245 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 156.666-15 chr6 152718677 152718827 + 1.33333 NA intron (NM_025107, intron 1 of 1) intron (NM_025107, intron 1 of 1) 20857 NM_025107 80177 Hs.18160 NM_025107 ENSG00000120279 MYCT1 MTLC MYC target 1 protein-coding 276-59 chr6 133174791 133175164 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -66380 NM_004100 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 121.333-93 chr2 156654037 156654187 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 217733 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 180-99 chr7 50997624 50997963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -204340 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 185.333 chr1 11509067 11509274 + 1.33333 NA intron (NM_020780, intron 3 of 20) L1MEc|LINE|L1 30015 NM_020780 57540 Hs.202355 NM_020780 ENSG00000204624 DISP3 PTCHD2 dispatched RND transporter family member 3 protein-coding 338-21 chr3 43188286 43188891 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -82509 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 265.333-56 chr3 116098652 116098908 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -193654 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 225.333-78 chr2 43808492 43808669 + 1.33333 NA intron (NM_001348913, intron 12 of 13) intron (NM_001348913, intron 12 of 13) 30259 NM_022436 64240 Hs.132992 NM_022436 ENSG00000138075 ABCG5 STSL ATP binding cassette subfamily G member 5 protein-coding 199.333-98 chr17 50441860 50442142 + 1.33333 NA intron (NM_001288968, intron 2 of 16) AluJr|SINE|Alu 15843 NM_025149 80221 Hs.288959 NM_025149 ENSG00000167107 ACSF2 ACSMW|AVYV493 acyl-CoA synthetase family member 2 protein-coding 197.333-96 chr18 67056027 67056194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25474 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 141.667-203 chr7 11277175 11277394 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 303412 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 401.333-7 chr14 29695328 29695766 + 1.33333 NA intron (NM_001330069, intron 2 of 18) L2a|LINE|L2 231549 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 156.666-14 chr5 22665348 22665487 + 1.33333 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 187927 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 169.333-210 chr5 101297032 101297205 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -393836 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 187.333-126 chr3 46535828 46536105 + 1.33333 NA intron (NM_024512, intron 4 of 8) MIR|SINE|MIR -21432 NR_073385 83598 Hs.570630 NR_073385 ENSG00000268324 LRRC2-AS1 LUZP3|LUZP3P|LUZPP1 LRRC2 antisense RNA 1 ncRNA 334-37 chr8 134888156 134888601 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 38443 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 137.333-70 chr17 65474641 65474795 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 17177 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 211.333-45 chr12 112313283 112313454 + 1.33333 NA intron (NM_001109662, intron 3 of 75) AluSc8|SINE|Alu 69063 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 255.999-4 chr16 48702862 48703161 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -92831 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 208.333-36 chr14 46261149 46261409 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) 197120 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 187-62 chr4 148511221 148511498 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66661 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 192.666-12 chr11 42090613 42090766 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5231 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 183-62 chr2 142253169 142253343 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -121555 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 211.999-10 chr5 33719288 33719476 + 1.33333 NA intron (NM_001324512, intron 3 of 21) L1ME4b|LINE|L1 172608 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 269.333-4 chr10 52217483 52217870 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) intron (NM_001098512, intron 9 of 17) 96452 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 192.333-158 chr7 39534860 39535109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31420 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 218.666-72 chr8 36604977 36605200 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -179286 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 320.333-18 chr2 222349910 222350378 + 1.33333 NA intron (NR_136642, intron 2 of 3) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 29483 NR_136640 440934 Hs.732732 NR_136638 ENSG00000237732 CT75 - cancer/testis associated transcript 75 ncRNA 392-21 chr8 88841438 88842069 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -514270 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 231-12 chr13 79519338 79519604 + 1.33333 NA intron (NM_019080, intron 1 of 7) intron (NM_019080, intron 1 of 7) -38240 NR_046685 100874208 Hs.602801 NR_046685 ENSG00000232132 NDFIP2-AS1 - NDFIP2 antisense RNA 1 ncRNA 329-12 chr2 54775880 54776365 + 1.33333 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) MER107|DNA|hAT-Charlie 51110 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 251.333-67 chr2 220622869 220623200 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -716469 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 250.666-35 chr6 93518591 93518814 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -99120 NM_001288630 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 181.333-18 chr11 6997633 6997819 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001354831, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001354831, exon 4 of 4) 22620 NM_001354832 7761 Hs.445849 NM_013249 ENSG00000149050 ZNF214 BAZ-1|BAZ1 zinc finger protein 214 protein-coding 460.333-5 chr5 13819586 13820029 + 1.33333 NA intron (NM_001369, intron 41 of 78) intron (NM_001369, intron 41 of 78) 124673 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 203.333-116 chr18 67716655 67716850 + 1.33333 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) 98070 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 340.666-2 chr1 93000787 93001420 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39581 NM_001252270 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 231-41 chr3 79680574 79680834 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) L2|LINE|L2 87294 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 220-51 chr18 11221388 11221603 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -72733 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 133-89 chr7 130187470 130187712 + 1.33333 NA intron (NR_156699, intron 6 of 14) L1MEd|LINE|L1 17815 NM_001301163 84928 Hs.267245 NM_032842 ENSG00000146842 TMEM209 NET31 transmembrane protein 209 protein-coding 194.667-98 chr3 106919136 106919391 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 321375 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 305.333-24 chr14 69288134 69288472 + 1.33333 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) MIRc|SINE|MIR 28145 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 334-22 chr2 37438620 37438992 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 94176 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 176.333-49 chr14 54531023 54531238 + 1.33333 NA intron (NM_006568, intron 4 of 5) intron (NM_006568, intron 4 of 5) 21224 NM_006568 10668 Hs.59106 NM_006568 ENSG00000100532 CGRRF1 CGR19|RNF197 cell growth regulator with ring finger domain 1 protein-coding 180.667-32 chr12 84792379 84792646 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 120287 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 263-26 chr17 20027403 20027832 + 1.33333 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) L1MA5|LINE|L1 18258 NM_001243439 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 213.333-47 chr12 75436929 75437153 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -43714 NM_006851 11010 Hs.205558 NM_006851 ENSG00000139278 GLIPR1 CRISP7|GLIPR|RTVP1 GLI pathogenesis related 1 protein-coding 215.333-34 chr11 57758506 57758709 + 1.33333 NA intron (NR_037646, intron 2 of 20) intron (NR_037646, intron 2 of 20) -3195 NM_001085462 1500 Hs.166011 NM_001331 ENSG00000198561 CTNND1 BCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN) catenin delta 1 protein-coding 331.666-17 chr3 185815323 185815776 + 1.33333 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) 5582 NM_001291873 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 208.333-106 chr4 58508900 58509082 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 27337 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 225.333-127 chr7 95411370 95411621 + 1.33333 NA intron (NM_000305, intron 5 of 8) intron (NM_000305, intron 5 of 8) -15120 NM_000940 5446 Hs.440967 NM_000940 ENSG00000105852 PON3 - paraoxonase 3 protein-coding 282.333-7 chr10 133218324 133218535 + 1.33333 NA intron (NM_152643, intron 26 of 29) intron (NM_152643, intron 26 of 29) -11788 NM_003577 8433 Hs.458406 NM_003577 ENSG00000171794 UTF1 - undifferentiated embryonic cell transcription factor 1 protein-coding 293.666 chr1 73894567 73895148 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 220178 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 244.333-65 chr20 54640800 54641132 + 1.33333 NA intron (NM_018431, intron 6 of 7) intron (NM_018431, intron 6 of 7) 165373 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 408.333-11 chr6 82395188 82395669 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31184 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 200.333-155 chr8 84862058 84862218 + 1.33333 NA intron (NM_001287244, intron 4 of 7) intron (NM_001287244, intron 4 of 7) 156211 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 252.666-32 chr5 20370930 20371303 + 1.33333 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) L2|LINE|L2 65565 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 195.333-13 chr1 90360619 90360834 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -297024 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 252-22 chr12 55404682 55405095 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 4359 NM_001005518 403282 Hs.554553 NM_001005518 ENSG00000205328 OR6C65 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 65 protein-coding 154.667-6 chr1 58641278 58641507 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 58670 NM_001085487 114803 Hs.744921 NM_001085487 ENSG00000162601 MYSM1 2A-DUB|2ADUB|BMFS4 Myb like, SWIRM and MPN domains 1 protein-coding 216-89 chr4 62459590 62459888 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -297974 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 261-42 chr3 95847346 95847744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -164352 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 205.666-19 chr15 68130217 68130401 + 1.33333 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) intron (NM_016166, intron 2 of 13) 75733 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 340.333-15 chr5 11264611 11264967 + 1.33333 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) AluSx3|SINE|Alu 324128 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 250.666-5 chr10 121238813 121239037 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 292389 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 550.333 chr1 95166754 95167568 + 1.33333 NA intron (NR_125949, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 49238 NM_001199691 100527978 Hs.483512 NM_001199691 ENSG00000271092 TLCD4-RWDD3 TMEM56-RWDD3 TLCD4-RWDD3 readthrough protein-coding 196.666-43 chr2 14854380 14854632 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 221789 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 288.666-20 chr2 227392637 227392901 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13463 NM_024795 79853 Hs.156652 NM_024795 ENSG00000168955 TM4SF20 PRO994|SLI5|TCCE518 transmembrane 4 L six family member 20 protein-coding 227.333-41 chr15 87303781 87304088 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -272995 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 206-157 chr6 89771663 89771845 + 1.33333 NA intron (NM_014611, intron 14 of 101) AluJo|SINE|Alu 48040 NM_014611 23195 Hs.529948 NM_014611 ENSG00000112159 MDN1 Rea1 midasin AAA ATPase 1 protein-coding 224-48 chr2 126530759 126531037 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -125037 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 287.333-50 chr5 32480106 32480607 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35616 NM_016107 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 216-75 chr22 33177365 33177664 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 68985 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 242-49 chr3 168703158 168703482 + 1.33333 NA intron (NR_021485, intron 5 of 15) intron (NR_021485, intron 5 of 15) 151466 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 219.666-48 chr9 16519823 16520007 + 1.33333 NA intron (NM_001317939, intron 4 of 6) intron (NM_001317939, intron 4 of 6) -206899 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 310-65 chr9 37499127 37499555 + 1.33333 NA intron (NM_001282766, intron 10 of 12) AluJr4|SINE|Alu 13393 NM_022490 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 399-2 chr1 117984395 117984951 + 1.33333 NA intron (NM_206996, intron 41 of 48) intron (NM_206996, intron 41 of 48) 54934 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 201.333-61 chr11 112089725 112089881 + 1.33333 NA intron (NM_003002, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 2930 NM_001276504 6392 Hs.356270 NM_003002 ENSG00000204370 SDHD CBT1|CII-4|CWS3|PGL|PGL1|QPs3|SDH4|cybS succinate dehydrogenase complex subunit D protein-coding 184.667-63 chr2 123160385 123160663 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87043 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 165-18 chr12 59782834 59783015 + 1.33333 NA non-coding (NR_073056, exon 7 of 7) non-coding (NR_073056, exon 7 of 7) 93554 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 230.666-34 chr22 25635402 25635765 + 1.33333 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) L1MC4|LINE|L1 70908 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 233.666-32 chr8 128308526 128308786 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 158540 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 170.666-2 chr10 22448827 22449059 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11014 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 203.333-191 chr4 32408739 32408938 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 57800 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 266-63 chr4 58071812 58072060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 464392 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 370.667-25 chr7 79397357 79397827 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L1ME4a|LINE|L1 -55365 NR_038346 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 219.333-7 chr1 107688201 107688402 + 1.33333 NA intron (NM_006113, intron 18 of 26) intron (NM_006113, intron 18 of 26) 198 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 240-68 chr4 100078792 100079006 + 1.33333 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -111134 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 200.667-77 chr2 98891767 98892043 + 1.33333 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) L1ME3G|LINE|L1 44320 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 237.333-102 chr6 106397536 106397819 + 1.33333 NA intron (NM_001371242, intron 1 of 21) intron (NM_001371242, intron 1 of 21) 36960 NM_001371242 254.666-9 chr11 88754827 88755119 + 1.33333 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) MIRc|SINE|MIR 250397 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 202.667-74 chr18 13064004 13064243 + 1.33333 NA intron (NM_032142, intron 21 of 44) L1MA1|LINE|L1 72761 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 169.333-71 chr14 28388870 28389099 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 376335 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 278.333-43 chr8 65954396 65954789 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -60386 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 181.333-181 chr8 118088826 118089044 + 1.33333 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 22884 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 271.333-50 chr4 24048910 24049206 + 1.33333 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) intron (NM_001330752, intron 2 of 13) -159011 NM_013261 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 182.333-51 chr15 39604348 39604541 + 1.33333 NA intron (NM_152597, intron 11 of 11) intron (NM_152597, intron 11 of 11) 23365 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 274.333-57 chr6 125968139 125968508 + 1.33333 NA intron (NM_138571, intron 2 of 4) L1PA16|LINE|L1 11553 NM_138571 135114 Hs.72325 NM_138571 ENSG00000111911 HINT3 HINT4 histidine triad nucleotide binding protein 3 protein-coding 123.667-94 chr2 102748882 102749068 + 1.33333 NA intron (NM_001321346, intron 1 of 3) intron (NM_001321346, intron 1 of 3) 12040 NM_001321346 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 218-83 chr4 98856112 98856443 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 72856 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 179.666-12 chr8 28438562 28438716 + 1.33333 NA intron (NM_001258211, intron 6 of 7) MIRb|SINE|MIR 51590 NM_172366 157574 Hs.741522 NM_172366 ENSG00000214050 FBXO16 FBX16 F-box protein 16 protein-coding 157.333-153 chr17 58437900 58438066 + 1.33333 NA intron (NM_001080439, intron 5 of 5) L1ME3G|LINE|L1 -20401 NM_017763 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 249.333-27 chr12 98646294 98646570 + 1.33333 NA intron (NM_001160, intron 1 of 25) intron (NM_001160, intron 1 of 25) 1132 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 204.667-16 chr10 52385787 52386082 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 69338 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 358-11 chr18 13043391 13043849 + 1.33333 NA intron (NM_032142, intron 15 of 44) L1ME3D|LINE|L1 52258 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 194.333-93 chr4 38742670 38742829 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 40241 NM_030956 81793 Hs.120551 NM_030956 ENSG00000174123 TLR10 CD290 toll like receptor 10 protein-coding 158.667-332 chr8 127022363 127022549 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 9302 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 291.333-34 chr2 3685588 3685932 + 1.33333 NA intron (NM_018436, intron 7 of 11) L1M1|LINE|L1 -17815 NM_001287444 728597 Hs.304233 NM_001287444 ENSG00000214866 DCDC2C - doublecortin domain containing 2C protein-coding 188.666-26 chr3 182580383 182580584 + 1.33333 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -73359 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 180.666-17 chr2 102263776 102263933 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47648 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 204-82 chr17 76215764 76215985 + 1.33333 NA intron (NM_052916, intron 1 of 18) intron (NM_052916, intron 1 of 18) 24619 NM_052916 114804 Hs.500643 NM_052916 ENSG00000141576 RNF157 - ring finger protein 157 protein-coding 407.333-9 chr12 121206605 121207064 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3295 NM_001261398 5025 Hs.321709 NM_002560 ENSG00000135124 P2RX4 P2X4|P2X4R purinergic receptor P2X 4 protein-coding 351.667-10 chr21 32330798 32331253 + 1.33333 NA intron (NM_014825, intron 30 of 38) intron (NM_014825, intron 30 of 38) 39212 NM_178817 56246 Hs.584940 NM_178817 ENSG00000170262 MRAP B27|C21orf61|FALP|FGD2|GCCD2 melanocortin 2 receptor accessory protein protein-coding 213.999-5 chr6 64140516 64140679 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) LTR33|LTR|ERVL 333761 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 229-52 chr5 35977396 35977678 + 1.33333 NA intron (NM_001171873, intron 3 of 5) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 13853 NM_152404 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 352.333-34 chrX 78188193 78188495 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -48694 NM_015975 51616 Hs.592248 NM_015975 ENSG00000187325 TAF9B DN-7|DN7|TAF9L|TAFII31L|TFIID-31 TATA-box binding protein associated factor 9b protein-coding 417.333-11 chr5 114306982 114307402 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -54878 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 201.333-161 chr2 220332242 220332472 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -425792 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 241-53 chr7 52706922 52707289 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -328528 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 268.666-23 chr4 77787676 77787972 + 1.33333 NA intron (NM_001365006, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 31240 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 206-84 chr2 104153766 104153930 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 254484 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 269.333-84 chr8 17414075 17414563 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_004686) promoter-TSS (NM_004686) -968 NM_004686 9108 Hs.625674 NM_004686 ENSG00000003987 MTMR7 - myotubularin related protein 7 protein-coding 229.333-31 chr12 131846401 131846679 + 1.33333 NA intron (NM_016155, intron 8 of 9) AluSx1|SINE|Alu 18147 NM_016155 4326 Hs.709245 NM_016155 ENSG00000198598 MMP17 MMP-17|MT4-MMP|MT4MMP|MTMMP4 matrix metallopeptidase 17 protein-coding 223-56 chr6 69246197 69246406 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 20 of 31) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 550165 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 355.333-34 chr6 165125235 165125785 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184095 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 174.333-155 chr8 140552314 140552505 + 1.33333 NA intron (NM_001164623, intron 10 of 17) intron (NM_001164623, intron 10 of 17) 40413 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 224.667-7 chr10 105625838 105626111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 194359 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 237.666 chr1 34248377 34248576 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 71569 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 207.333-233 chr6 5270949 5271115 + 1.33333 NA intron (NM_006567, intron 1 of 6) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 9519 NM_006567 10667 Hs.484547 NM_006567 ENSG00000145982 FARS2 COXPD14|FARS1|HSPC320|PheRS|SPG77|mtPheRS phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 355.333-41 chr9 128482321 128482702 + 1.33333 NA intron (NM_153433, intron 9 of 20) intron (NM_153433, intron 9 of 20) -22181 NM_001499 2733 Hs.522418 NM_001499 ENSG00000119392 GLE1 CAAHC|CAAHD|GLE1L|LCCS|LCCS1|hGLE1 GLE1 RNA export mediator protein-coding 357.333-14 chr3 187310069 187310670 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -18347 NM_139125 5648 Hs.89983 NM_001879 ENSG00000127241 MASP1 3MC1|CRARF|CRARF1|MAP1|MASP|MASP3|MAp44|PRSS5|RaRF mannan binding lectin serine peptidase 1 protein-coding 200.666-16 chr10 61164456 61164618 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 148262 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 194-64 chr2 8977561 8977709 + 1.33333 NA intron (NR_135603, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 26049 NM_001321265 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 146-143 chr8 122947413 122947585 + 1.33333 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) MER3|DNA|hAT-Charlie 78273 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 203.333-2 chr1 19865964 19866200 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16313 NM_015207 23252 Hs.374987 NM_015207 ENSG00000169914 OTUD3 DUBA4 OTU deubiquitinase 3 protein-coding 198-71 chr17 53093248 53093471 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 107854 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 247.333-28 chr14 68971407 68971703 + 1.33333 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) MIRb|SINE|MIR 7747 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 183.333-39 chr14 29158689 29158843 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -372979 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 210.333-137 chr5 87810057 87810238 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 148105 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 156-41 chr13 67163469 67163607 + 1.33333 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) intron (NM_001318372, intron 2 of 4) 66798 NM_001318372 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 202.666-64 chr2 111907511 111907666 + 1.33333 NA intron (NM_006343, intron 1 of 18) intron (NM_006343, intron 1 of 18) 8981 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 205.333-25 chr1 231463946 231464240 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 12432 NR_033826 645339 Hs.382049 NR_033826 SNRPD2P2 - small nuclear ribonucleoprotein D2 pseudogene 2 pseudo 204.666-43 chr2 233942870 233943035 + 1.33333 NA intron (NM_024080, intron 6 of 25) intron (NM_024080, intron 6 of 25) 25579 NM_024080 79054 Hs.366053 NM_024080 ENSG00000144481 TRPM8 LTRPC6|LTrpC-6|TRPP8|trp-p8 transient receptor potential cation channel subfamily M member 8 protein-coding 159-52 chr2 24955158 24955309 + 1.33333 NA intron (NM_016544, intron 5 of 6) L1M4a1|LINE|L1 16722 NM_016544 51277 Hs.434993 NM_016544 ENSG00000115137 DNAJC27 RBJ|RabJS DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C27 protein-coding 307.999-6 chr7 10065546 10065946 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 431476 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 469-8 chr5 9841568 9842110 + 1.33333 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) LTR40c|LTR|ERVL -12538 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 205-30 chr14 49133049 49133299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 453206 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 182.666-30 chr3 124960309 124960452 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25629 NM_033049 56667 Hs.5940 NM_033049 ENSG00000173702 MUC13 DRCC1|MUC-13 mucin 13, cell surface associated protein-coding 189.666-9 chr14 42749655 42749910 + 1.33333 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 1142926 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 256-50 chr2 169339140 169339412 + 1.33333 NA intron (NM_004525, intron 1 of 78) (TATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 23258 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 234.667-91 chr5 58520914 58521209 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 9048 NR_039639 100616339 NR_039639 ENSG00000265699 MIR548AE2 - microRNA 548ae-2 ncRNA 176-98 chr8 75644988 75645150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 105101 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 184.333-36 chr14 55758872 55759146 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7236 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 332.666-4 chr11 29837032 29837446 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 145154 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 363.333-26 chr8 111833645 111834044 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 457205 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 278-41 chr4 67930250 67930609 + 1.33333 NA intron (NM_001114387, intron 4 of 9) L3|LINE|CR1 33064 NM_001114387 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 232.666-6 chr10 5281083 5281346 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9978 NR_149060 110806285 NR_149060 ENSG00000224034 LINC02561 - long intergenic non-protein coding RNA 2561 ncRNA 210.666-108 chr8 121538426 121538591 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -100838 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 291-41 chr7 53800775 53801092 + 1.33333 NA intron (NR_038371, intron 1 of 5) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 10998 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 192.666-32 chr2 76035342 76035504 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -324508 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 268.333-36 chr22 28565354 28565877 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 105746 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 356-7 chr10 116378466 116378893 + 1.33333 NA intron (NM_198515, intron 8 of 8) intron (NM_198515, intron 8 of 8) -49168 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 210.333-172 chr8 119575839 119576023 + 1.33333 NA intron (NM_001330600, intron 19 of 25) intron (NM_001330600, intron 19 of 25) 17077 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 184.667-82 chr3 94257432 94257726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 194518 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 488-3 chr22 36390723 36391192 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2890 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 208-24 chr11 7684547 7684783 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10398 NM_001302826 51700 Hs.414362 NM_016229 ENSG00000166394 CYB5R2 B5R.2 cytochrome b5 reductase 2 protein-coding 213.333-110 chr20 19043296 19043543 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1d|LTR|Gypsy -169223 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 178.666-6 chr15 75883845 75884039 + 1.33333 NA intron (NM_001284382, intron 8 of 11) intron (NM_001284382, intron 8 of 11) -19917 NM_012170 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 283.333-26 chr19 8326690 8326971 + 1.33333 NA intron (NM_198471, intron 7 of 10) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 5334 NM_001031 6234 Hs.153177 NM_001031 ENSG00000233927 RPS28 DBA15|S28|eS28 ribosomal protein S28 protein-coding 159.333-218 chr3 131439899 131440081 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39243 NR_002985 677836 Hs.735762 NR_002985 SNORA58 ACA58|SNORA58B small nucleolar RNA, H/ACA box 58 snoRNA 215-73 chr6 62820914 62821148 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 498946 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 305.999-3 chr20 21088748 21089176 + 1.33333 NA intron (NR_147212, intron 2 of 2) intron (NR_147212, intron 2 of 2) 17396 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 206-102 chr22 33721582 33721840 + 1.33333 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) intron (NM_133642, intron 2 of 14) -3275 NR_038949 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 264.667-30 chr14 63438939 63439264 + 1.33333 NA intron (NR_104104, intron 2 of 12) MamRep605|LTR?|LTR? 69137 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 202.667-7 chr1 103416170 103416419 + 1.33333 NA TTS (NM_001286997) TTS (NM_001286997) 109217 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 331.333-4 chr1 96677354 96677765 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -44046 NM_001300988 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 262-52 chr21 35032802 35033098 + 1.33333 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) (TCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 6476 NR_026812 80215 Hs.672131 NM_025143 RUNX1-IT1 C21orf96 RUNX1 intronic transcript 1 ncRNA 392.333-6 chr20 10312239 10312580 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92903 NR_040710 100131208 Hs.658178 NR_040710 ENSG00000227906 SNAP25-AS1 - SNAP25 antisense RNA 1 ncRNA 202.333-119 chr4 26290660 26290937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28912 NM_005349 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 325.666-3 chr11 16307020 16307499 + 1.33333 NA intron (NM_033326, intron 3 of 15) intron (NM_033326, intron 3 of 15) 49287 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 197.333-184 chr5 84484029 84484318 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99293 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 208-122 chr4 57698561 57698794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 272805 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 210.666-85 chr5 61720202 61720382 + 1.33333 NA intron (NR_126524, intron 3 of 3) intron (NR_126524, intron 3 of 3) 15406 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 197.333-54 chr12 92913296 92913498 + 1.33333 NA intron (NM_003566, intron 1 of 28) L1PB4|LINE|L1 15898 NM_003566 8411 Hs.567367 NM_003566 ENSG00000102189 EEA1 MST105|MSTP105|ZFYVE2 early endosome antigen 1 protein-coding 206.667-138 chr8 120800936 120801226 + 1.33333 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) 10965 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 286.333-5 chr12 4381186 4381534 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1648 NM_020638 8074 Hs.287370 NM_020638 ENSG00000118972 FGF23 ADHR|FGFN|HFTC2|HPDR2|HYPF|PHPTC fibroblast growth factor 23 protein-coding 191.333-118 chr2 201407342 201407629 + 1.33333 NA exon (NM_015049, exon 3 of 16) exon (NM_015049, exon 3 of 16) 43973 NM_015049 66008 Hs.152774 NM_015049 ENSG00000115993 TRAK2 ALS2CR3|CALS-C|GRIF-1|GRIF1|MILT2|OIP98 trafficking kinesin protein 2 protein-coding 250.666-8 chr12 20648558 20648778 + 1.33333 NA intron (NM_000921, intron 12 of 15) intron (NM_000921, intron 12 of 15) -46687 NM_001145946 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 213-83 chr8 82187662 82187876 + 1.33333 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? -345483 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 244.667-45 chr16 63758094 63758389 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 1363822 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 208.666-34 chr13 65258929 65259140 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -607013 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 181-18 chr13 34331875 34332120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16046 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 340-9 chr13 31542647 31543067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -196669 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 236.333-33 chr17 25920089 25920313 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1169040 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 255.999-3 chr11 108655144 108655437 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9779 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 188-43 chr17 70725459 70725619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 476640 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 208.333-125 chr6 37143987 37144182 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -26068 NM_002648 5292 Hs.81170 NM_002648 ENSG00000137193 PIM1 PIM Pim-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 225.333-98 chr4 47350131 47350395 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 113439 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 232.333-63 chr4 91567765 91568151 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1PA14|LINE|L1 709344 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 343-5 chr10 82733245 82733549 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) MIR|SINE|MIR -500477 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 290-6 chr1 206832665 206832991 + 1.33333 NA intron (NM_013371, intron 1 of 6) intron (NM_013371, intron 1 of 6) -1521 NM_001369605 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 214.666-30 chr18 9875419 9875615 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -10456 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 211.333-223 chr7 49298429 49298608 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 373971 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 224-80 chr5 79443263 79443519 + 1.33333 NA intron (NM_001277078, intron 4 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 70445 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 212.333-136 chr7 27748637 27748866 + 1.33333 NA intron (NM_001362794, intron 2 of 16) intron (NM_001362794, intron 2 of 16) 8656 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 255.333-104 chr8 43754857 43755058 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 462515 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 299.333-41 chr2 150410976 150411350 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 76532 NM_001254738 390 Hs.6838 NM_005168 ENSG00000115963 RND3 ARHE|Rho8|RhoE|memB Rho family GTPase 3 protein-coding 330.333-21 chr7 84908960 84909258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 212822 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 202.333-122 chr4 38902117 38902380 + 1.33333 NA intron (NM_001330764, intron 3 of 13) MIR|SINE|MIR 34216 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 165.667-3 chr1 70919460 70919632 + 1.33333 NA intron (NR_028293, intron 2 of 4) intron (NR_028293, intron 2 of 4) -126960 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 339.333-36 chr5 66507910 66508460 + 1.33333 NA intron (NR_105001, intron 2 of 2) intron (NR_105001, intron 2 of 2) 3419 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 226-66 chr4 54275556 54275817 + 1.33333 NA intron (NM_001347829, intron 12 of 22) intron (NM_001347829, intron 12 of 22) 41726 NM_001347830 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 191-2 chr1 30725128 30725394 + 1.33333 NA intron (NR_034182, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR -1676 NM_002379 4146 Hs.150366 NM_002379 ENSG00000162510 MATN1 CMP|CRTM matrilin 1 protein-coding 380.666-4 chr12 41324068 41324493 + 1.33333 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -113459 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 296.666-9 chr14 69142806 69143198 + 1.33333 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) intron (NM_003861, intron 1 of 8) 9597 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 191.666-21 chr6 152452145 152452357 + 1.33333 NA intron (NM_182961, intron 25 of 145) intron (NM_182961, intron 25 of 145) 71721 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 310.999-2 chr2 95168818 95169273 + 1.33333 NA intron (NM_001291604, intron 1 of 2) intron (NM_001291604, intron 1 of 2) 3236 NM_001291604 7549 Hs.590916 NM_021088 ENSG00000275111 ZNF2 A1-5|ZNF661|Zfp661 zinc finger protein 2 protein-coding 150.667-182 chr2 100555366 100555589 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -7516 NM_024065 79031 Hs.469459 NM_024065 ENSG00000115539 PDCL3 HTPHLP|PHLP2A|PHLP3|VIAF|VIAF1 phosducin like 3 protein-coding 207.666-72 chrX 68850646 68850821 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 21736 NM_004429 1947 Hs.144700 NM_004429 ENSG00000090776 EFNB1 CFND|CFNS|EFB1|EFL3|EPLG2|Elk-L|LERK2 ephrin B1 protein-coding 132.667-90 chr2 114599721 114599885 + 1.33333 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) L1MEf|LINE|L1 138226 NM_001321912 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 301.333-41 chr5 16210812 16211261 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30795 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 202.667-48 chr14 51089676 51089949 + 1.33333 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 5892 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 236.667-46 chr20 4508969 4509265 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -177339 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 206.666-61 chr2 195496635 195496870 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -160206 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 295-15 chr15 65767358 65767768 + 1.33333 NA intron (NM_005848, intron 1 of 31) AluJo|SINE|Alu 24730 NM_001144823 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 332.667-24 chr8 113815829 113816263 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -379107 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 224.667-6 chr10 61264995 61265284 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -187500 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 220-120 chr8 85948018 85948284 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -120209 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 219.333-5 chr1 92082632 92082879 + 1.33333 NA intron (NM_183242, intron 1 of 8) intron (NM_183242, intron 1 of 8) 2410 NM_183242 284697 Hs.676102 NM_183242 ENSG00000189195 BTBD8 - BTB domain containing 8 protein-coding 207.666-57 chr6 127066537 127066764 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -52021 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 272-48 chr7 105123055 105123379 + 1.33333 NA intron (NM_001350746, intron 14 of 14) intron (NM_001350746, intron 14 of 14) 109012 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 193.333-158 chr6 46645560 46645767 + 1.33333 NA intron (NM_016593, intron 1 of 11) L1MD1|LINE|L1 7155 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 234.333-41 chr2 168306130 168306400 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -58670 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 305.999-5 chr21 32101647 32102030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15543 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 229.333-84 chr4 17675228 17675511 + 1.33333 NA intron (NM_015688, intron 7 of 17) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 60728 NM_025205 80306 Hs.731966 NM_025205 ENSG00000118579 MED28 1500003D12Rik|EG1|magicin mediator complex subunit 28 protein-coding 202-113 chr3 68233842 68234048 + 1.33333 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) intron (NM_001252216, intron 2 of 4) 229698 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 262.666-7 chr16 7500055 7500588 + 1.33333 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) intron (NM_145893, intron 1 of 13) 167476 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 162.333-242 chr7 108527989 108528148 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001256011, exon 1 of 11) 5' UTR (NM_001256011, exon 1 of 11) 110 NM_001256011 50640 Hs.617340 NM_015723 ENSG00000135241 PNPLA8 IPLA2-2|IPLA2G|MMLA|PNPLA-gamma|iPLA2gamma patatin like phospholipase domain containing 8 protein-coding 206.666-54 chr2 17754460 17754746 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001142286) promoter-TSS (NM_001142286) 465 NM_001130009 348654 Hs.467793 NM_182625 ENSG00000178295 GEN1 Gen GEN1 Holliday junction 5' flap endonuclease protein-coding 193-90 chr8 15203795 15203972 + 1.33333 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 34548 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 344.666-19 chr21 23403640 23404061 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -19015 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 225-17 chr12 121099266 121099536 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -33475 NM_002562 5027 Hs.439682 NM_002562 ENSG00000089041 P2RX7 P2X7 purinergic receptor P2X 7 protein-coding 233.666-25 chr6 161908650 161908916 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 437806 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 146.333-82 chr14 28493231 28493466 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 271971 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 209.666-13 chr11 27387127 27387293 + 1.33333 NA intron (NM_018490, intron 4 of 17) L2a|LINE|L2 -23962 NM_080654 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 288.667-31 chr6 145969112 145969481 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4938 NM_001370328 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 210.666-6 chr1 173632115 173632371 + 1.33333 NA intron (NM_198493, intron 3 of 5) L1M1|LINE|L1 -3095 NM_001195190 730159 Hs.647757 NM_001195190 ENSG00000232113 TEX50 - testis expressed 50 protein-coding 207.333-71 chr12 124076337 124076565 + 1.33333 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 103236 NM_001204298 144348 Hs.524828 NM_152437 ENSG00000179195 ZNF664 ZFOC1|ZNF176 zinc finger protein 664 protein-coding 455.666 chr10 122406152 122406666 + 1.33333 NA intron (NM_001330178, intron 5 of 13) intron (NM_001330178, intron 5 of 13) -10556 NR_037506 100500866 NR_037506 ENSG00000265442 MIR3941 - microRNA 3941 ncRNA 335.333-24 chr2 95178626 95179137 + 1.33333 NA intron (NM_001291604, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 13072 NM_001291604 7549 Hs.590916 NM_021088 ENSG00000275111 ZNF2 A1-5|ZNF661|Zfp661 zinc finger protein 2 protein-coding 185-11 chr11 94814612 94814853 + 1.33333 NA intron (NM_130847, intron 3 of 12) L2b|LINE|L2 46376 NM_001301007 154810 Hs.503594 NM_130847 ENSG00000166025 AMOTL1 JEAP angiomotin like 1 protein-coding 200.667-87 chr2 193499098 193499390 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 749399 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 222.666-4 chr1 108594280 108594511 + 1.33333 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) L2|LINE|L2 34295 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 196-192 chr9 9602440 9602676 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 7 of 45) MIR|SINE|MIR -196834 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 192.667-67 chr16 52463140 52463378 + 1.33333 NA intron (NM_001146188, intron 4 of 7) intron (NM_001146188, intron 4 of 7) 83884 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 318.666-6 chr12 77692319 77692737 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -138366 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 207.333-108 chr16 11013399 11013665 + 1.33333 NA intron (NM_015226, intron 10 of 22) AluSz|SINE|Alu 68968 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 336.666-19 chr5 89041371 89041760 + 1.33333 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) UCON4|Unknown|Unknown -137460 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 218.666-36 chr17 75049932 75050161 + 1.33333 NA intron (NM_015353, intron 2 of 5) intron (NM_015353, intron 2 of 5) 2821 NM_015353 23510 Hs.514468 NM_015353 ENSG00000180901 KCTD2 - potassium channel tetramerization domain containing 2 protein-coding 238-107 chr9 15474841 15475171 + 1.33333 NA intron (NM_001317900, intron 8 of 10) MIR3|SINE|MIR 35283 NM_021144 11168 Hs.658434 NM_021144 ENSG00000164985 PSIP1 DFS70|LEDGF|PAIP|PSIP2|p52|p75 PC4 and SFRS1 interacting protein 1 protein-coding 212.667-114 chr5 156295662 156295975 + 1.33333 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL -30939 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 185-48 chr4 45904858 45905076 + 1.33333 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 219087 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 238.667-50 chr2 210632597 210632925 + 1.33333 NA intron (NR_163592, intron 11 of 27) intron (NR_163592, intron 11 of 27) 15190 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 205.333-74 chr14 64497709 64497893 + 1.33333 NA intron (NM_001354685, intron 2 of 4) intron (NM_001354685, intron 2 of 4) 191 NM_001354687 7597 Hs.654571 NM_006977 ENSG00000089775 ZBTB25 C14orf51|KUP|ZNF46 zinc finger and BTB domain containing 25 protein-coding 185.333-13 chr1 191429493 191429733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -201115 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 251.333-77 chr3 64142719 64143040 + 1.33333 NA intron (NM_001370528, intron 7 of 7) MIR|SINE|MIR 39409 NR_046701 100874242 Hs.668874 NR_046701 PRICKLE2-AS2 - PRICKLE2 antisense RNA 2 ncRNA 225.999-2 chr12 78061568 78061743 + 1.33333 NA intron (NM_001024383, intron 12 of 39) intron (NM_001024383, intron 12 of 39) 230761 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 244-86 chr5 99260897 99261129 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -272977 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 210.333-89 chr20 9302619 9302893 + 1.33333 NA intron (NM_182797, intron 1 of 35) intron (NM_182797, intron 1 of 35) -5044 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 215.333-13 chr1 192043384 192043555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -114993 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 255.666-22 chr6 70237819 70238090 + 1.33333 NA intron (NM_001851, intron 33 of 37) intron (NM_001851, intron 33 of 37) 45243 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 166-95 chr5 31546113 31546297 + 1.33333 NA intron (NR_134298, intron 7 of 8) intron (NR_134298, intron 7 of 8) 13904 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 216-111 chr6 163946167 163946366 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -274782 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 120.667-8 chr1 152809071 152809225 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2497 NM_001276331 353133 NM_178351 ENSG00000197084 LCE1C LEP3 late cornified envelope 1C protein-coding 187.333-190 chr7 81332866 81333133 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 228820 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 243-59 chr6 122289674 122289976 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -109726 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 170-101 chr5 162373412 162373648 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 305888 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 209.333-193 chr5 100304360 100304595 + 1.33333 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 83777 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 262.666 chr1 80258144 80258378 + 1.33333 NA Intergenic (TATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -277494 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 189.333-89 chr2 34844269 34844447 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 166801 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 214.333-98 chr3 106544909 106545202 + 1.33333 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -675654 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 223-12 chr11 81762650 81762835 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 128094 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 209.333-66 chr14 78351845 78352084 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 4 of 20) AluSx1|SINE|Alu -51755 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 197-128 chrX 129765075 129765227 + 1.33333 NA intron (NM_003399, intron 19 of 20) L1ME4b|LINE|L1 -14798 NM_018990 54440 Hs.61469 NM_018990 ENSG00000122122 SASH3 753P9|CXorf9|HACS2|SH3D6C|SLY SAM and SH3 domain containing 3 protein-coding 166.333-185 chr5 60633083 60633260 + 1.33333 NA intron (NM_001145208, intron 7 of 9) MIRb|SINE|MIR 66995 NM_018369 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 288-59 chr8 107397887 107398265 + 1.33333 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) -61561 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 217.333-125 chr5 170250656 170250903 + 1.33333 NA exon (NM_005565, exon 20 of 21) exon (NM_005565, exon 20 of 21) 17773 NM_001305393 133874 Hs.519749 NM_001102609 ENSG00000234511 C5orf58 - chromosome 5 open reading frame 58 protein-coding 328.666-17 chr5 52173836 52174214 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 165994 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 179.333-22 chr10 43849958 43850194 + 1.33333 NA non-coding (NR_033923, exon 3 of 3) non-coding (NR_033923, exon 3 of 3) 4770 NR_033923 414260 Hs.351856 NR_033923 ENSG00000226808 LINC00619 C10orf136|bA168P8.1 long intergenic non-protein coding RNA 619 ncRNA 275.333-5 chr1 232501289 232501686 + 1.33333 NA intron (NM_020808, intron 1 of 20) HAL1|LINE|L1 14121 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 400.333-9 chr2 181421389 181421754 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35321 NM_001316312 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 204-67 chr15 66570784 66571156 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4972 NR_103739 197021 Hs.680983 NM_207338 ENSG00000188501 LCTL KLG|KLPH lactase like protein-coding 229-3 chr1 195845475 195845683 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 243136 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 278.666-10 chr14 84201811 84202157 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1069948 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 234.666-26 chr22 25627790 25628121 + 1.33333 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) intron (NM_001362778, intron 2 of 19) 63280 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 186.666 chr1 32032122 32032276 + 1.33333 NA intron (NR_073498, intron 3 of 8) intron (NR_073498, intron 3 of 8) 18331 NR_073498 10657 Hs.445893 NM_006559 ENSG00000121774 KHDRBS1 Sam68|p62|p68 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 1 protein-coding 195.666-42 chr7 46788222 46788419 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -91198 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 197.667-37 chr14 41824065 41824392 + 1.33333 NA intron (NM_001330106, intron 2 of 4) L1PB4|LINE|L1 217372 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 271.666-20 chrX 112481485 112481858 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 198267 NM_178175 340596 Hs.297420 NM_178175 ENSG00000182508 LHFPL1 - LHFPL tetraspan subfamily member 1 protein-coding 360.333-18 chr8 129291996 129292366 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50941 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 173.333-53 chr13 86797682 86797841 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -114159 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 313-37 chr6 7488831 7489280 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -52616 NM_001008844 1832 Hs.519873 NM_004415 ENSG00000096696 DSP DCWHKTA|DP desmoplakin protein-coding 209.333-225 chr7 92994581 92994878 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 123250 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 305.333-29 chr18 7891829 7892121 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 3 of 30) intron (NM_002845, intron 3 of 30) 324659 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 335-24 chr5 39294144 39294606 + 1.33333 NA intron (NM_001737, intron 9 of 10) L1MA5A|LINE|L1 -23726 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 508.333-2 chr21 29647504 29648280 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 6 of 16) intron (NM_000830, intron 6 of 16) 51852 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 153.667-177 chr2 42159809 42160054 + 1.33333 NA intron (NR_110584, intron 1 of 3) L1MC1|LINE|L1 -9422 NM_001145076 27436 Hs.713173 NM_019063 ENSG00000143924 EML4 C2orf2|ELP120|EMAP-4|EMAPL4|ROPP120 EMAP like 4 protein-coding 392.666-5 chr2 20860604 20861045 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37694 NM_001282719 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 181.333-68 chr19 28687601 28687821 + 1.33333 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 39983 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 216.333-49 chr15 65659419 65659698 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001144823, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_001144823, exon 33 of 33) 16679 NM_001254740 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 324-6 chr12 22637457 22637896 + 1.33333 NA intron (NM_001039481, intron 1 of 2) HAL1|LINE|L1 12505 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 218-71 chr21 42572419 42572602 + 1.33333 NA intron (NM_001320537, intron 17 of 19) HAL1|LINE|L1 42585 NR_131192 101928233 Hs.534827 NR_131192 ENSG00000225431 LINC01671 - long intergenic non-protein coding RNA 1671 ncRNA 187-38 chr2 171327745 171327896 + 1.33333 NA intron (NM_001321158, intron 6 of 8) intron (NM_001321158, intron 6 of 8) -96527 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 222.667-21 chr13 48842265 48842538 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133511 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 202.333-146 chr5 85394453 85394672 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -887882 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 348-4 chr10 89956494 89956903 + 1.33333 NA intron (NR_110655, intron 1 of 3) intron (NR_110655, intron 1 of 3) 675 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 284.667-6 chr10 69109585 69109982 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -14370 NM_001035260 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 335.333-54 chr8 121010290 121010727 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -198462 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 231 chr1 11992504 11992809 + 1.33333 NA exon (NM_014874, exon 4 of 19) exon (NM_014874, exon 4 of 19) 12475 NM_001127660 9927 Hs.376681 NM_014874 ENSG00000116688 MFN2 CMT2A|CMT2A2|CMT2A2A|CMT2A2B|CPRP1|HMSN6A|HSG|MARF mitofusin 2 protein-coding 210-114 chr5 7906137 7906298 + 1.33333 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 37069 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 221.666-42 chr5 17129707 17129968 + 1.33333 NA TTS (NR_027253) TTS (NR_027253) 26155 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 222-91 chr7 118108367 118108599 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -75681 NM_016200 51691 Hs.655046 NM_016200 ENSG00000128534 LSM8 NAA38 LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated protein-coding 210.666-19 chr11 67500345 67500515 + 1.33333 NA intron (NM_004910, intron 5 of 23) intron (NM_004910, intron 5 of 23) 4933 NM_004910 9600 Hs.372295 NM_004910 ENSG00000110697 PITPNM1 DRES9|NIR2|PITPNM|RDGB|RDGB1|RDGBA|RDGBA1|Rd9 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1 protein-coding 228.333-96 chr8 42931092 42931428 + 1.33333 NA intron (NM_032410, intron 4 of 21) intron (NM_032410, intron 4 of 21) 34282 NM_032410 84376 Hs.162852 NM_032410 ENSG00000168172 HOOK3 HK3 hook microtubule tethering protein 3 protein-coding 126-123 chr9 81103441 81103581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 586024 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 199-130 chrX 155020496 155020674 + 1.33333 NA intron (NM_000132, intron 1 of 25) L1ME3Cz|LINE|L1 2138 NM_000132 2157 Hs.632836 NM_000132 ENSG00000185010 F8 AHF|DXS1253E|F8B|F8C|FVIII|HEMA coagulation factor VIII protein-coding 239-28 chr2 24554442 24554816 + 1.33333 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -29848 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 187.666-24 chr6 33922840 33923004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23787 NR_106982 102466816 NR_106982 ENSG00000276824 MIR7159 hsa-mir-7159 microRNA 7159 ncRNA 208.333-78 chr2 149685295 149685554 + 1.33333 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) L1MA2|LINE|L1 -97649 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 169.333-47 chr12 25516342 25516488 + 1.33333 NA intron (NM_152590, intron 7 of 8) intron (NM_152590, intron 7 of 8) 36868 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 231-30 chr2 61308811 61309166 + 1.33333 NA intron (NM_014709, intron 27 of 79) AluSx3|SINE|Alu 108389 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 228-32 chr17 29478857 29479382 + 1.33333 NA intron (NM_025142, intron 6 of 17) AluSx1|SINE|Alu 87918 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 485-4 chr4 34407328 34408111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137972 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 172-82 chr4 68214922 68215081 + 1.33333 NA intron (NR_104048, intron 1 of 9) intron (NR_104048, intron 1 of 9) 3079 NR_104048 401136 Hs.652046 NM_001129907 ENSG00000250026 TMPRSS11BNL - TMPRSS11B N-terminal like, pseudogene pseudo 243-62 chr6 156303310 156303699 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -75246 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 301-8 chr11 91575068 91575366 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -649817 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 158.666-31 chr8 60650647 60650810 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28012 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 122-63 chr20 37750607 37750766 + 1.33333 NA intron (NM_001281495, intron 5 of 16) intron (NM_001281495, intron 5 of 16) 56656 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 317.667-27 chr20 45574071 45574440 + 1.33333 NA intron (NM_130896, intron 1 of 5) L1M3|LINE|L1 5029 NM_181510 90199 Hs.116128 NM_130896 ENSG00000158901 WFDC8 C20orf170|HEL-S-292|WAP8|dJ461P17.1 WAP four-disulfide core domain 8 protein-coding 180.333-146 chr8 130660185 130660341 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -216589 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 295.666-5 chr14 55137435 55137827 + 1.33333 NA non-coding (NR_003225, exon 1 of 4) non-coding (NR_003225, exon 1 of 4) 648 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 124-79 chr3 129800166 129800333 + 1.33333 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) L1ME3|LINE|L1 -5637 NM_001349273 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 199.333-59 chr12 118238369 118238611 + 1.33333 NA intron (NM_001346490, intron 6 of 21) intron (NM_001346490, intron 6 of 21) -47955 NM_001346497 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 512.333-3 chr7 129598697 129599205 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -12769 NM_001293164 4899 Hs.654363 NM_005011 ENSG00000106459 NRF1 ALPHA-PAL nuclear respiratory factor 1 protein-coding 214-27 chr11 125258951 125259190 + 1.33333 NA intron (NM_022062, intron 2 of 12) intron (NM_022062, intron 2 of 12) 94319 NM_022062 63876 Hs.278564 NM_022062 ENSG00000165495 PKNOX2 PREP2 PBX/knotted 1 homeobox 2 protein-coding 281.333-61 chr7 32331731 32332083 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) -32579 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 182.333-143 chr7 48362212 48362352 + 1.33333 NA intron (NM_152701, intron 31 of 61) L1M7|LINE|L1 190824 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 222.666-49 chr6 75505385 75505578 + 1.33333 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 -11681 NM_001289987 27145 Hs.201488 NM_015687 ENSG00000118407 FILIP1 FILIP filamin A interacting protein 1 protein-coding 220.666-67 chr7 146714739 146714926 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59439 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 281.666-12 chr4 166644626 166644942 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 589642 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 222.667-18 chr12 54998638 54998990 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14052 NR_147063 9840 Hs.33187 NM_014796 ENSG00000135426 TESPA1 HSPC257|ITPRID3|KIAA0748 thymocyte expressed, positive selection associated 1 protein-coding 148-81 chr2 81238042 81238194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 228828 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 188.333-43 chr13 99212796 99213015 + 1.33333 NA intron (NR_026644, intron 1 of 8) intron (NR_026644, intron 1 of 8) 12051 NM_001144072 337867 Hs.508545 NM_177967 ENSG00000134882 UBAC2 PHGDHL1 UBA domain containing 2 protein-coding 199.333-279 chr8 112492430 112492606 + 1.33333 NA exon (NM_198124, exon 32 of 72) exon (NM_198124, exon 32 of 72) -150975 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 223.333-35 chr12 72868508 72868746 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -290563 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 350.666-20 chr7 120415916 120416454 + 1.33333 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 143010 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 226.333-95 chr4 159655979 159656204 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121693 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 250.666-15 chr17 7769848 7770165 + 1.33333 NA intron (NM_020877, intron 24 of 85) intron (NM_020877, intron 24 of 85) 15686 NR_002778 118432 Hs.658086 NR_002778 ENSG00000240480 RPL29P2 RPL29_10_1510 ribosomal protein L29 pseudogene 2 pseudo 225.666-19 chr3 85657785 85658018 + 1.33333 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -68581 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 174.333-163 chrX 80849234 80849391 + 1.33333 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -39435 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 336.666 chr1 88173107 88173446 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -510868 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 208-99 chr22 26833645 26833869 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -26454 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 209.333-109 chr2 44604681 44604902 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 242844 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 167.667-82 chr17 29295613 29295846 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1581 NM_020772 57532 Hs.462598 NM_020772 ENSG00000108256 NUFIP2 182-FIP|82-FIP|FIP-82|PIG1 nuclear FMR1 interacting protein 2 protein-coding 118-77 chr20 33853813 33853906 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_176812, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_176812, exon 5 of 5) 42511 NM_176812 128866 Hs.472471 NM_176812 ENSG00000101421 CHMP4B C20orf178|CHMP4A|CTPP3|CTRCT31|SNF7|SNF7-2|Shax1|VPS32B|Vps32-2|dJ553F4.4 charged multivesicular body protein 4B protein-coding 329-23 chr7 31515762 31516051 + 1.33333 NA intron (NM_001257967, intron 1 of 14) intron (NM_001257967, intron 1 of 14) -1458 NR_047565 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 300-7 chr10 50615486 50615768 + 1.33333 NA intron (NM_147156, intron 1 of 10) intron (NM_147156, intron 1 of 10) 8329 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 188-60 chr2 190825732 190825954 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -54978 NM_001256310 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 294.666-21 chr3 79341955 79342292 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) L2|LINE|L2 -69604 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 190.666-16 chr14 38562155 38562324 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -306146 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 207.333-10 chr1 97959599 97959879 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -17999 NR_146275 109729128 NR_146275 LINC01930 - long intergenic non-protein coding RNA 1930 ncRNA 314-5 chr11 83786196 83786506 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) intron (NM_001142699, intron 18 of 27) -103926 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 209.333-93 chr18 7763518 7763820 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 196353 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 477.666-3 chr4 140369698 140370298 + 1.33333 NA intron (NR_033939, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu 3394 NR_033939 100129858 Hs.660477 NR_033939 ENSG00000196951 SCOC-AS1 - SCOC antisense RNA 1 ncRNA 278.666-13 chr2 14167743 14168050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 233062 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 166-48 chr16 50825615 50825753 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 19012 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 302.666-3 chr1 86637972 86638320 + 1.33333 NA intron (NR_024604, intron 4 of 14) intron (NR_024604, intron 4 of 14) 3870 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 217.333-112 chr4 140489614 140489807 + 1.33333 NA intron (NM_001277353, intron 1 of 10) L1ME3D|LINE|L1 8583 NM_001277353 152586 Hs.189067 NM_001034840 ENSG00000205301 MGAT4D GnT1IP MGAT4 family member D protein-coding 200.667-163 chr9 28058627 28058906 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -484900 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 340.666-5 chr10 109165544 109165988 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 757480 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 206-140 chr5 65573984 65574173 + 1.33333 NA intron (NM_001278929, intron 4 of 9) intron (NM_001278929, intron 4 of 9) 10782 NM_015342 23398 Hs.121432 NM_015342 ENSG00000113593 PPWD1 - peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1 protein-coding 163.333-222 chr5 62446140 62446318 + 1.33333 NA intron (NM_016338, intron 3 of 29) L1ME3B|LINE|L1 27345 NM_001134779 51194 Hs.482269 NM_016338 ENSG00000086200 IPO11 RanBP11 importin 11 protein-coding 439.333 chr1 33739241 33739736 + 1.33333 NA intron (NM_052896, intron 14 of 69) intron (NM_052896, intron 14 of 69) -120987 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 257.666-18 chr6 18587055 18587497 + 1.33333 NA intron (NR_149116, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 15492 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 212-102 chr3 13468557 13468780 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 11385 NR_046690 100874101 Hs.535701 NR_046690 ENSG00000244502 HDAC11-AS1 - HDAC11 antisense RNA 1 ncRNA 141.666-2 chr14 68906144 68906322 + 1.33333 NA intron (NM_001102, intron 6 of 20) L1MB3|LINE|L1 73069 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 215.333-136 chr3 141596147 141596427 + 1.33333 NA intron (NM_001303246, intron 20 of 24) L1MB8|LINE|L1 -66912 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 192-12 chr1 190636743 190636929 + 1.33333 NA intron (NR_033922, intron 1 of 4) intron (NR_033922, intron 1 of 4) 11946 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 167.666-3 chr14 74336836 74337056 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11525 NM_018228 55237 Hs.578167 NM_018228 ENSG00000133980 VRTN C14orf115|vertnin vertebrae development associated protein-coding 181.333-175 chr8 106120499 106120651 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -60072 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 226.666-20 chr2 23375388 23375623 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -9674 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 305.333-67 chr7 43700037 43700386 + 1.33333 NA intron (NR_163914, intron 1 of 8) intron (NR_163914, intron 1 of 8) 29312 NM_001371317 142-159 chr8 129775655 129775911 + 1.33333 NA intron (NM_031415, intron 3 of 13) L2a|LINE|L2 10841 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 271.333-19 chr17 61748322 61748651 + 1.33333 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) L1M4c|LINE|L1 115073 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 171.333-122 chr3 109751340 109751522 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 148603 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 226.667-90 chr7 110919218 110919576 + 1.33333 NA intron (NM_032549, intron 4 of 5) intron (NM_032549, intron 4 of 5) -171609 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 243-12 chr10 70129308 70129728 + 1.33333 NA intron (NM_001198696, intron 1 of 8) intron (NM_001198696, intron 1 of 8) 3307 NM_032797 84883 Hs.650680 NM_032797 ENSG00000042286 AIFM2 AMID|PRG3 apoptosis inducing factor mitochondria associated 2 protein-coding 207.666-53 chr5 126749289 126749537 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 27073 NR_134485 102723557 Hs.582207 NR_134485 ENSG00000251072 LMNB1-DT - LMNB1 divergent transcript ncRNA 315.333-44 chr6 100776336 100776647 + 1.33333 NA intron (NM_006828, intron 8 of 41) intron (NM_006828, intron 8 of 41) 104838 NM_006828 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 324.999-7 chr7 36687607 36687877 + 1.33333 NA intron (NM_001637, intron 1 of 20) intron (NM_001637, intron 1 of 20) 36752 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 200-22 chr10 70225836 70226020 + 1.33333 NA intron (NM_021129, intron 2 of 10) intron (NM_021129, intron 2 of 10) 7501 NM_021129 5464 Hs.437403 NM_021129 ENSG00000180817 PPA1 HEL-S-66p|IOPPP|PP|PP1|SID6-8061 pyrophosphatase (inorganic) 1 protein-coding 352-8 chr14 61632747 61633125 + 1.33333 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -62283 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 149.333-313 chr5 101596383 101596538 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -693178 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 238-11 chr11 31355752 31356197 + 1.33333 NA intron (NM_181807, intron 1 of 8) intron (NM_181807, intron 1 of 8) 13765 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 156.666-2 chr10 80069784 80069941 + 1.33333 NA intron (NR_027432, intron 1 of 3) LTR1C|LTR|ERV1 -8784 NM_001270373 80195 Hs.169982 NM_025125 ENSG00000133678 TMEM254 C10orf57|bA369J21.6 transmembrane protein 254 protein-coding 301.333-26 chr2 66871277 66871715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32940 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 205.667-117 chr5 178944549 178944845 + 1.33333 NA intron (NM_001323307, intron 2 of 4) intron (NM_001323307, intron 2 of 4) 3499 NM_001323310 285676 Hs.259441 NM_182594 ENSG00000178187 ZNF454 - zinc finger protein 454 protein-coding 201.333-233 chr5 173906827 173907011 + 1.33333 NA intron (NM_001308192, intron 1 of 8) intron (NM_001308192, intron 1 of 8) 13868 NM_001308192 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 219.333-187 chr8 135031517 135031704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 181675 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 204.666-33 chr15 99202592 99202790 + 1.33333 NA intron (NR_109947, intron 7 of 12) intron (NR_109947, intron 7 of 12) 46890 NM_001288615 64927 Hs.513195 NM_022905 ENSG00000103852 TTC23 HCC-8 tetratricopeptide repeat domain 23 protein-coding 174-36 chr14 103765596 103765795 + 1.33333 NA intron (NM_015316, intron 4 of 16) L2c|LINE|L2 49951 NM_001198953 79038 Hs.592322 NM_024071 ENSG00000100711 ZFYVE21 HCVP7TP1|ZF21 zinc finger FYVE-type containing 21 protein-coding 210.666-8 chr1 218874466 218874647 + 1.33333 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) 43955 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 200-57 chr14 65388655 65388812 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -21859 NR_038167 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 325.333-32 chr4 103897900 103898367 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -178148 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 214.333-37 chr13 65736547 65736754 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -129397 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 283.999-8 chr5 58408244 58408533 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 51698 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 196-37 chr12 42328348 42328549 + 1.33333 NA intron (NM_001364830, intron 1 of 6) intron (NM_001364830, intron 1 of 6) 2281 NM_001364827 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 213-84 chr8 90146856 90147096 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64097 NM_004929 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 240-8 chr1 182627713 182628007 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12720 NR_036490 284648 Hs.253475 NR_036490 ENSG00000261504 LINC01686 - long intergenic non-protein coding RNA 1686 ncRNA 279.333-46 chr2 115416790 115417155 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) intron (NM_001321912, intron 4 of 25) 73157 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 192-39 chr11 117034566 117034852 + 1.33333 NA intron (NM_001366687, intron 1 of 4) intron (NM_001366687, intron 1 of 4) 63719 NM_001281748 23387 Hs.167451 NM_025164 ENSG00000160584 SIK3 L19|QSK|SEMDK|SIK-3 SIK family kinase 3 protein-coding 170.667-153 chr7 21316104 21316327 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111868 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 369.333-17 chr3 94150465 94151073 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 87708 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 197.666-28 chr18 5176809 5176975 + 1.33333 NA intron (NM_001330553, intron 1 of 1) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 20365 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 324.666-12 chr3 112204039 112204401 + 1.33333 NA exon (NM_183061, exon 17 of 29) exon (NM_183061, exon 17 of 29) 70797 NR_157393 112806053 NR_157393 TBILA - TGF-beta induced lncRNA ncRNA 389.999-4 chr8 76859383 76859711 + 1.33333 NA intron (NM_024721, intron 10 of 10) intron (NM_024721, intron 10 of 10) 107303 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 209.333-189 chr5 59086569 59086864 + 1.33333 NA intron (NM_006203, intron 5 of 14) L2c|LINE|L2 -47240 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 235.333-32 chr14 58698803 58699024 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60076 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 179.666-16 chr9 34822163 34822322 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 16344 NR_024481 389715 Hs.713965 NM_001126494 FAM205BP C9orf144|C9orf144A|FAM205B transmembrane protein C9orf144B pseudogene pseudo 123-89 chr4 139925199 139925345 + 1.33333 NA intron (NM_018717, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu -202743 NR_147610 101927516 Hs.662570 NR_147610 LOC101927516 - uncharacterized LOC101927516 ncRNA 347.333-3 chr10 75054109 75054483 + 1.33333 NA intron (NM_001003892, intron 1 of 2) L1ME4c|LINE|L1 4287 NM_001003892 338599 Hs.535090 NM_001003892 ENSG00000188716 DUPD1 DUSP27|FMDSP dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 protein-coding 191.333-40 chr11 115009390 115009580 + 1.33333 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -324092 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 378-3 chr1 231836581 231836998 + 1.33333 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) intron (NM_001164541, intron 9 of 9) -18272 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 208.999-3 chr19 45019013 45019201 + 1.33333 NA intron (NM_006509, intron 3 of 10) AluJo|SINE|Alu 17643 NM_006509 5971 Hs.654402 NM_006509 ENSG00000104856 RELB I-REL|IMD53|IREL|REL-B RELB proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 186.333-87 chr2 223705679 223705931 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -103444 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 122-120 chr8 96067153 96067326 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 93567 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 303.333-51 chr3 98740332 98740635 + 1.33333 NA intron (NM_001323366, intron 1 of 11) intron (NM_001323366, intron 1 of 11) 7027 NM_001323365 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 257.333-81 chr5 84773079 84773507 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -388413 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 234.666-9 chr10 13135115 13135314 + 1.33333 NA intron (NM_001008213, intron 15 of 15) intron (NM_001008213, intron 15 of 15) -26344 NM_182751 55388 Hs.198363 NM_018518 ENSG00000065328 MCM10 CNA43|DNA43|PRO2249 minichromosome maintenance 10 replication initiation factor protein-coding 208.666-21 chr10 83693447 83693614 + 1.33333 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -16441 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 137-31 chr15 52412216 52412436 + 1.33333 NA intron (NM_001142495, intron 5 of 39) intron (NM_001142495, intron 5 of 39) -116522 NM_018728 55930 Hs.487036 NM_018728 ENSG00000128833 MYO5C - myosin VC protein-coding 199.333-62 chr12 130889553 130889833 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 17627 NM_006325 5901 Hs.10842 NM_006325 ENSG00000132341 RAN ARA24|Gsp1|TC4 RAN, member RAS oncogene family protein-coding 234-50 chr3 188272639 188272968 + 1.33333 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) intron (NM_005578, intron 2 of 10) 47398 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 209.667-59 chr18 62314693 62314997 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -10442 NM_001270949 8792 Hs.204044 NM_003839 ENSG00000141655 TNFRSF11A CD265|FEO|LOH18CR1|ODFR|OFE|OPTB7|OSTS|PDB2|RANK|TRANCER TNF receptor superfamily member 11a protein-coding 290-8 chr1 223815164 223815472 + 1.33333 NA intron (NM_001031685, intron 2 of 17) intron (NM_001031685, intron 2 of 17) 30629 NM_001031685 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 214.333-94 chr3 59194853 59195021 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -144905 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 154.667-415 chr9 107042642 107042832 + 1.33333 NA intron (NR_126029, intron 4 of 4) MER58B|DNA|hAT-Charlie 60251 NR_126029 340512 Hs.432529 NR_126029 ENSG00000230782 LOC340512 - uncharacterized LOC340512 ncRNA 293.333-24 chr19 27787197 27787525 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -6070 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 171-11 chr12 1071436 1071628 + 1.33333 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) L1ME2|LINE|L1 43784 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 263.333-17 chr12 34280039 34280333 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 257690 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 225.666-32 chr8 108806085 108806277 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18587 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 180-45 chr18 40298023 40298291 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 231871 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 211.333-15 chr1 168065041 168065343 + 1.33333 NA intron (NM_001017977, intron 15 of 18) L2a|LINE|L2 66532 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 327.333-33 chr4 158001668 158002099 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -168869 NR_147408 285505 NR_147407 ENSG00000248429 FAM198B-AS1 - FAM198B antisense RNA 1 ncRNA 210.666-111 chr9 19993136 19993325 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -206211 NM_001193288 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 213.333-224 chr9 33436049 33436215 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 11461 NM_004925 360 Hs.234642 NM_004925 ENSG00000165272 AQP3 AQP-3|GIL aquaporin 3 (Gill blood group) protein-coding 237.666-3 chr10 72524684 72525153 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001195519) promoter-TSS (NM_001195519) -932 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 207.333-65 chr12 92054254 92054439 + 1.33333 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) intron (NR_132341, intron 1 of 4) 87367 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 258.666-35 chr5 72280466 72280773 + 1.33333 NA intron (NM_001286748, intron 4 of 11) intron (NM_001286748, intron 4 of 11) 39621 NM_001286751 23107 Hs.482491 NM_015084 ENSG00000113048 MRPS27 MRP-S27|S27mt mitochondrial ribosomal protein S27 protein-coding 177.666-23 chr5 133983580 133983810 + 1.33333 NA intron (NM_003374, intron 5 of 8) LTR47A2|LTR|ERVL 15006 NR_134247 105379183 Hs.543907 NR_134247 LOC105379183 - uncharacterized LOC105379183 ncRNA 169.333-29 chr10 91596477 91596623 + 1.33333 NA intron (NR_024467, intron 1 of 4) X7A_LINE|LINE|CR1 14910 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 223.666-23 chr3 131589229 131589530 + 1.33333 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) MLT2B3|LTR|ERVL -86408 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 284-41 chr4 44473012 44473372 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -24383 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 190.667-86 chr3 142777919 142778182 + 1.33333 NA intron (NM_001251845, intron 5 of 12) intron (NM_001251845, intron 5 of 12) 53626 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 270.666-12 chr17 56674320 56674654 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 80788 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 326.666-16 chr9 24787352 24787748 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -241653 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 251.666 chr1 61905584 61906039 + 1.33333 NA intron (NM_001350145, intron 24 of 43) MER21C|LTR|ERVL 59736 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 345-6 chr2 169566565 169566928 + 1.33333 NA intron (NM_001322049, intron 2 of 12) intron (NM_001322049, intron 2 of 12) 7119 NM_024622 79675 Hs.529276 NM_024622 ENSG00000138399 FASTKD1 - FAST kinase domains 1 protein-coding 242.999-2 chr11 68110608 68110874 + 1.33333 NA intron (NM_001277, intron 1 of 11) AluSz|SINE|Alu 10647 NM_001277 1119 Hs.77221 NM_001277 ENSG00000110721 CHKA CHK|CK|CKI|EK choline kinase alpha protein-coding 352.667-9 chr14 21667708 21668320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2931 NM_001001912 26686 Hs.547982 NM_001001912 ENSG00000221977 OR4E2 OR14-42 olfactory receptor family 4 subfamily E member 2 protein-coding 306.333-17 chr14 29993279 29993717 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -65651 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 204-30 chr10 81583943 81584174 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -291136 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 222.666-46 chr5 34818914 34819086 + 1.33333 NA intron (NM_015577, intron 13 of 17) intron (NM_015577, intron 13 of 17) -20164 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 222.333-90 chr7 54975253 54975442 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -43670 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 277.333-29 chr14 57358520 57358876 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31888 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 202-126 chr4 31809093 31809268 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -188199 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 212-79 chr2 14355738 14355966 + 1.33333 NA intron (NR_103814, intron 1 of 3) LTR48B|LTR|ERV1 45106 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 244.333-15 chr10 91992117 91992387 + 1.33333 NA exon (NM_003972, exon 21 of 38) exon (NM_003972, exon 21 of 38) 68482 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 135.333-96 chr2 188850697 188850838 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -60644 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 205.667-143 chrX 146318776 146319052 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -291042 NR_030581 100126341 NR_030581 ENSG00000216056 MIR891A MIRN891A microRNA 891a ncRNA 333-10 chr14 57378950 57379258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11482 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 300.666-21 chr7 112839340 112839655 + 1.33333 NA intron (NM_152556, intron 3 of 4) L1MC4a|LINE|L1 -49074 NR_109840 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 168.666-15 chr3 181743048 181743268 + 1.33333 NA TTS (NR_004053) TTS (NR_004053) 31233 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 287.333 chr1 81849632 81849901 + 1.33333 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 47313 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 342-12 chr14 69144053 69144405 + 1.33333 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) intron (NM_003861, intron 1 of 8) 8370 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 236.667-90 chr8 105104372 105104704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -213900 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 362.666-13 chr6 106557172 106557548 + 1.33333 NA intron (NM_001371242, intron 17 of 21) intron (NM_001371242, intron 17 of 21) 45505 NM_001624 202 Hs.724262 NM_001624 ENSG00000112297 CRYBG1 AIM1|ST4 crystallin beta-gamma domain containing 1 protein-coding 171.666-8 chr7 108489110 108489347 + 1.33333 NA intron (NM_001256010, intron 7 of 9) intron (NM_001256010, intron 7 of 9) -32508 NM_001371119 212.333-37 chr13 38467102 38467322 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -100512 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 212.333-114 chr5 49601067 49601319 + 1.33333 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 840095 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 294-22 chr14 35503256 35503545 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30764 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 223-67 chr8 107932312 107932627 + 1.33333 NA intron (NM_001282863, intron 4 of 4) L2|LINE|L2 149470 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 230-65 chr7 7209163 7209545 + 1.33333 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 26739 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 242-13 chr10 33552894 33553184 + 1.33333 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 -218134 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 228.333-76 chr5 37756081 37756358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 78603 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 203-10 chr1 187650587 187650787 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 207059 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 273-9 chr11 12030397 12030826 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_135109) promoter-TSS (NR_135109) -264 NR_135109 105376554 Hs.523483 NR_135109 ENSG00000254486 LINC02547 - long intergenic non-protein coding RNA 2547 ncRNA 228-42 chr2 66399649 66399913 + 1.33333 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL 16475 NR_130931 729348 Hs.723595 NR_130931 ENSG00000232164 LINC01873 - long intergenic non-protein coding RNA 1873 ncRNA 258.333-40 chr22 31831811 31832117 + 1.33333 NA intron (NR_146296, intron 24 of 42) L1ME1|LINE|L1 77941 NM_001369901 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 228-36 chr17 68589952 68590247 + 1.33333 NA intron (NM_017565, intron 1 of 10) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 11268 NM_001243746 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 115-157 chr8 129421991 129422155 + 1.33333 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 62069 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 191.666-3 chr11 114832782 114832952 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 154340 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 215.666-47 chr9 81981721 81981912 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -6956 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 288-12 chr10 48356158 48356441 + 1.33333 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) intron (NM_001323302, intron 3 of 13) -45313 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 268.666-11 chr14 21728365 21728706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57518 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 164-100 chr6 87563503 87563700 + 1.33333 NA intron (NR_146759, intron 3 of 16) intron (NR_146759, intron 3 of 16) 26386 NM_020320 57038 Hs.485910 NM_020320 ENSG00000146282 RARS2 ArgRS|DALRD2|PCH6|PRO1992|RARSL arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 181.333-4 chr1 95980510 95980683 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -11472 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 297.999-8 chr7 3326805 3327215 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 25758 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 303.667-29 chr9 8511747 8512102 + 1.33333 NA intron (NM_130392, intron 10 of 30) intron (NM_130392, intron 10 of 30) 222022 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 221.666-47 chr5 101805760 101806048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 490380 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 182-85 chr4 187439140 187439342 + 1.33333 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) intron (NR_038931, intron 1 of 4) 66372 NR_038931 339975 Hs.639361 NR_038931 LOC339975 - uncharacterized LOC339975 ncRNA 200-45 chr12 72500210 72500367 + 1.33333 NA intron (NM_013381, intron 6 of 18) intron (NM_013381, intron 6 of 18) -226779 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 180-40 chr15 50933878 50934102 + 1.33333 NA intron (NM_001252127, intron 7 of 20) intron (NM_001252127, intron 7 of 20) -10139 NR_027642 100132724 Hs.730493 NR_027642 DCAF13P3 - DDB1 and CUL4 associated factor 13 pseudogene 3 pseudo 324.333-7 chr11 8999829 9000201 + 1.33333 NA intron (NM_020645, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 3986 NM_020645 56675 Hs.523467 NM_020645 ENSG00000175352 NRIP3 C11orf14|NY-SAR-105 nuclear receptor interacting protein 3 protein-coding 252-86 chr5 139334991 139335221 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6726 NR_109830 51247 Hs.396644 NM_016480 ENSG00000120727 PAIP2 PAIP-2|PAIP2A poly(A) binding protein interacting protein 2 protein-coding 297.666-3 chr11 101500929 101501345 + 1.33333 NA intron (NM_004621, intron 2 of 12) intron (NM_004621, intron 2 of 12) 18768 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 232.666-29 chr20 16058333 16058665 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -72617 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 241-9 chr11 71400627 71400823 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 22629 NR_038862 399923 Hs.128191 NM_001001680 ENSG00000172900 FLJ42102 - uncharacterized LOC399923 ncRNA 241.333-95 chr7 38480984 38481317 + 1.33333 NA intron (NM_001635, intron 5 of 20) intron (NM_001635, intron 5 of 20) 139573 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 258-88 chr8 126325752 126326070 + 1.33333 NA intron (NR_125421, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 416 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 421.667 chr1 62867427 62867919 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83541 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 242.333-85 chr5 54262834 54263138 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 1 of 4) intron (NM_019087, intron 1 of 4) 47587 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 498.999-3 chr3 179223467 179224039 + 1.33333 NA intron (NM_006218, intron 14 of 20) MER58A|DNA|hAT-Charlie 27862 NM_014407 27094 Hs.591285 NM_014407 ENSG00000171121 KCNMB3 BKBETA3|HBETA3|K(VCA)BETA-3|KCNMB2|KCNMBL|SLO-BETA-3|SLOBETA3 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 3 protein-coding 241-62 chr9 32081006 32081297 + 1.33333 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -303452 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 267.666-2 chr10 72951013 72951286 + 1.33333 NA intron (NM_001318124, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 3657 NM_032562 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 207.667-111 chr7 19430608 19430898 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 274683 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 203-56 chr2 176667668 176667890 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30025 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 241-10 chr11 79635184 79635555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -194339 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 337.333-29 chr3 72432233 72432603 + 1.33333 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) intron (NM_012234, intron 1 of 3) 14205 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 217.666-13 chr15 50131410 50131628 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12286 NR_073597 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 286.666-18 chr5 180166531 180166833 + 1.33333 NA intron (NM_175062, intron 1 of 13) AluSq2|SINE|Alu 42529 NM_175062 255426 Hs.190559 NM_175062 ENSG00000146090 RASGEF1C - RasGEF domain family member 1C protein-coding 194.333-63 chr2 47730292 47730533 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -52670 NM_000179 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 259-26 chr2 98066611 98066839 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20442 NR_144298 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 269-33 chr3 94744866 94745215 + 1.33333 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -193223 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 191.667-81 chr22 28151316 28151573 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -230832 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 248-62 chr4 65907801 65908224 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -237517 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 205.333-56 chr12 29697116 29697284 + 1.33333 NA intron (NM_001367875, intron 5 of 19) intron (NM_001367875, intron 5 of 19) 86742 NM_001367875 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 397.999-4 chr8 89882114 89882450 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19586 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 352-9 chr15 65032346 65032810 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2939 NM_139242 123263 Hs.531615 NM_139242 ENSG00000103707 MTFMT COXPD15|FMT1|MC1DN27 mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase protein-coding 277.999-11 chr7 24128686 24129030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -155332 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 218.666-59 chr5 68473114 68473428 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 180694 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 214.667-101 chr5 120161759 120162087 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -302355 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 313-8 chr11 113330066 113330391 + 1.33333 NA intron (NM_001352038, intron 9 of 23) intron (NM_001352038, intron 9 of 23) 15645 NM_001352038 54970 Hs.288772 NM_017868 ENSG00000149292 TTC12 TPARM tetratricopeptide repeat domain 12 protein-coding 367.333-16 chr3 89472056 89472442 + 1.33333 NA intron (NM_005233, intron 15 of 16) intron (NM_005233, intron 15 of 16) 364628 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 208-101 chr3 10084482 10084694 + 1.33333 NA intron (NM_173472, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 23667 NM_173472 115795 Hs.190413 NM_173472 ENSG00000163705 FANCD2OS C3orf24 FANCD2 opposite strand protein-coding 249.333-26 chr12 46658654 46658878 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 167231 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 381-2 chr12 79885422 79885758 + 1.33333 NA intron (NM_001244990, intron 2 of 24) intron (NM_001244990, intron 2 of 24) 28321 NM_001143886 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 206.333-30 chr12 15762827 15763129 + 1.33333 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) L1MA2|LINE|L1 26410 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 218.666-47 chr20 13350386 13350603 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -110807 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-28 chr1 181534682 181534870 + 1.33333 NA intron (NM_001205293, intron 3 of 47) L1MEd|LINE|L1 51259 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 246-51 chr2 119561182 119561445 + 1.33333 NA intron (NR_073132, intron 5 of 24) AluSx3|SINE|Alu 16864 NR_073132 200373 Hs.496753 NM_001029996 ENSG00000163075 CFAP221 FAP221|PCDP1 cilia and flagella associated protein 221 protein-coding 200.666-82 chr3 157316631 157316840 + 1.33333 NA intron (NM_024621, intron 10 of 13) intron (NM_024621, intron 10 of 13) -120115 NM_002852 5806 Hs.591286 NM_002852 ENSG00000163661 PTX3 TNFAIP5|TSG-14 pentraxin 3 protein-coding 141.333-184 chr5 12784955 12785136 + 1.33333 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) intron (NR_033383, intron 3 of 3) 117186 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 311-8 chr12 15240689 15241015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19435 NM_032918 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 310-60 chr8 110424164 110424540 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -448581 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 197.333-198 chr6 48016257 48016509 + 1.33333 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 52306 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 286.333-13 chr14 61003365 61003901 + 1.33333 NA intron (NR_033344, intron 3 of 16) intron (NR_033344, intron 3 of 16) -21943 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 319.333-28 chr6 84452643 84453171 + 1.33333 NA intron (NR_132100, intron 3 of 4) intron (NR_132100, intron 3 of 4) 22022 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 209.333-39 chr11 91555642 91555881 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -669273 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 380.667-14 chr7 42703677 42704212 + 1.33333 NA intron (NR_110833, intron 1 of 2) intron (NR_110833, intron 1 of 2) 2503 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 199.666-3 chr1 103003639 103003888 + 1.33333 NA intron (NM_001854, intron 20 of 66) intron (NM_001854, intron 20 of 66) 104733 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 198.666-93 chr8 96728786 96728979 + 1.33333 NA intron (NM_016134, intron 1 of 7) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 83640 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 210-76 chr2 174339195 174339411 + 1.33333 NA TTS (NM_001145250) TTS (NM_001145250) 4349 NM_001145250 100131390 NM_001145250 ENSG00000217236 SP9 ZNF990 Sp9 transcription factor protein-coding 252.666-26 chr22 41723028 41723337 + 1.33333 NA intron (NM_152513, intron 6 of 30) L2b|LINE|L2 23679 NM_152513 150365 Hs.116419 NM_152513 ENSG00000167077 MEI1 HYDM3|SPATA38 meiotic double-stranded break formation protein 1 protein-coding 286.999-3 chr12 43482020 43482373 + 1.33333 NA intron (NM_025003, intron 7 of 38) L1PB3|LINE|L1 70007 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 214-135 chr8 104217374 104217608 + 1.33333 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) AluJb|SINE|Alu -5844 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 207.333-247 chr6 131279708 131279877 + 1.33333 NA intron (NM_138633, intron 2 of 2) intron (NM_138633, intron 2 of 2) 29388 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 211.333-5 chr1 44384387 44384551 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -20691 NM_001319956 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 238.667-57 chr3 128976262 128976662 + 1.33333 NA intron (NM_001348522, intron 7 of 8) intron (NM_001348522, intron 7 of 8) 15435 NM_001348523 57501 Hs.518247 NM_020741 ENSG00000114656 KIAA1257 - KIAA1257 protein-coding 324.999-3 chr10 49294409 49294730 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 4324 NR_108038 100506769 Hs.562293 NR_108038 C10orf71-AS1 - C10orf71 antisense RNA 1 ncRNA 187.333-146 chr4 103648063 103648308 + 1.33333 NA intron (NM_001059, intron 3 of 4) L1MA3|LINE|L1 71800 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 255-2 chr1 46124160 46124480 + 1.33333 NA intron (NM_001303427, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 6353 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 218-38 chr17 63293805 63294031 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 8 of 25) AluJb|SINE|Alu 146349 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 314.667-15 chr13 98221792 98222229 + 1.33333 NA intron (NM_005766, intron 2 of 26) intron (NM_005766, intron 2 of 26) 13486 NR_036129 100422881 NR_036129 ENSG00000263399 MIR3170 mir-3170 microRNA 3170 ncRNA 235.666-14 chr5 83136170 83136542 + 1.33333 NA intron (NM_001318012, intron 3 of 7) Charlie17|DNA|hAT-Charlie 58809 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 326-48 chr8 111597301 111597861 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 220942 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 197-53 chr2 20056600 20056872 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -5108 NM_014713 9741 Hs.467807 NM_014713 ENSG00000068697 LAPTM4A HUMORF13|LAPTM4|MBNT|Mtrp lysosomal protein transmembrane 4 alpha protein-coding 181.666-13 chr20 32998233 32998498 + 1.33333 NA intron (NM_080675, intron 5 of 12) intron (NM_080675, intron 5 of 12) 6068 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 267-20 chr14 35575257 35575732 + 1.33333 NA intron (NM_014990, intron 36 of 40) L3|LINE|CR1 41330 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 231-36 chr2 194307153 194307359 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37013 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 489.999 chr3 47963331 47963791 + 1.33333 NA intron (NM_002375, intron 3 of 18) intron (NM_002375, intron 3 of 18) 114006 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 487.333-5 chr3 173362565 173363174 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33083 NM_001365930 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 347.333-10 chr2 41182055 41182472 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -669828 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 304.333-24 chr3 79759128 79759745 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 8562 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 218.666-58 chr4 122235075 122235330 + 1.33333 NA intron (NM_015312, intron 25 of 83) intron (NM_015312, intron 25 of 83) 64599 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 244-67 chr3 3326572 3326952 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -147045 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 246.999-2 chr19 30020337 30020558 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 78208 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 280.333-6 chr11 84439822 84440191 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -122667 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 192.666-29 chr18 6160785 6160962 + 1.33333 NA intron (NM_001365769, intron 13 of 16) intron (NM_001365769, intron 13 of 16) -95871 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 307.667-40 chr8 72703787 72704169 + 1.33333 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) -28067 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 155.333-270 chr4 94902418 94902647 + 1.33333 NA intron (NM_001203, intron 2 of 12) L1ME3Cz|LINE|L1 -93700 NM_001256792 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 240.333-31 chr13 27743486 27743733 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -48874 NM_145657 219409 Hs.351785 NM_145657 ENSG00000169840 GSX1 GSH1|Gsh-1 GS homeobox 1 protein-coding 229-10 chr10 73442154 73442358 + 1.33333 NA intron (NM_001142353, intron 12 of 13) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -8695 NM_001024593 118490 Hs.631823 NM_001024593 ENSG00000166343 MSS51 ZMYND17 MSS51 mitochondrial translational activator protein-coding 194-88 chr21 29179403 29179561 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -14012 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 199.667-149 chr8 143831794 143832059 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -2611 NM_078480 22827 Hs.521924 NM_014281 ENSG00000179950 PUF60 FIR|RoBPI|SIAHBP1|VRJS poly(U) binding splicing factor 60 protein-coding 190-17 chr11 11875661 11875821 + 1.33333 NA intron (NM_001330208, intron 2 of 28) AluSz6|SINE|Alu 34318 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 221.666-35 chr21 20963768 20964067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34492 NM_001352592 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 186-104 chr9 90603658 90603820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20993 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 219.333-25 chr10 54535075 54535353 + 1.33333 NA intron (NM_001142771, intron 2 of 34) intron (NM_001142771, intron 2 of 34) 48984 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 193.333-76 chr17 69309874 69310045 + 1.33333 NA intron (NM_018672, intron 2 of 37) intron (NM_018672, intron 2 of 37) 5674 NM_018672 23461 Hs.731824 NM_018672 ENSG00000154265 ABCA5 ABC13|EST90625|HTC3 ATP binding cassette subfamily A member 5 protein-coding 213.333-135 chr3 125073680 125073876 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17781 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 416-6 chr2 79762581 79763110 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) intron (NM_001282598, intron 3 of 17) 103738 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 196-55 chr15 69180104 69180319 + 1.33333 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) intron (NM_001324093, intron 2 of 5) 19576 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 171.333-129 chr4 31364150 31364297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -142321 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 200.666-71 chr21 20299953 20300159 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41371 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 257.667-32 chr17 70893629 70893940 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 308395 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 266.333-36 chr22 20616630 20616840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -72820 NR_024592 266697 Hs.558711 NR_024592 POM121L4P - POM121 transmembrane nucleoporin like 4, pseudogene pseudo 200-21 chr10 64481829 64481986 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -343621 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 298.333-42 chr8 117156872 117157257 + 1.33333 NA intron (NM_173851, intron 3 of 7) intron (NM_173851, intron 3 of 7) 22069 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 222-97 chr8 91673115 91673335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 344455 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 240-25 chr14 63721510 63721790 + 1.33333 NA intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 6415 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 197.666-50 chr4 129282350 129282536 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 186291 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 167.666 chr1 190456837 190456985 + 1.33333 NA intron (NM_199051, intron 1 of 7) intron (NM_199051, intron 1 of 7) 19099 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 204-53 chr13 41489519 41489803 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 32111 NM_014059 28984 Hs.507866 NM_014059 ENSG00000102760 RGCC C13orf15|RGC-32|RGC32|bA157L14.2 regulator of cell cycle protein-coding 392-15 chr4 188060114 188060737 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45162 NM_001303419 205860 Hs.276429 NM_173553 ENSG00000179046 TRIML2 SPRYD6 tripartite motif family like 2 protein-coding 167.333-278 chrX 40596931 40597176 + 1.33333 NA intron (NM_005765, intron 3 of 8) intron (NM_005765, intron 3 of 8) 16083 NM_005765 10159 Hs.495960 NM_005765 ENSG00000182220 ATP6AP2 APT6M8-9|ATP6IP2|ATP6M8-9|ELDF10|HT028|M8-9|MRXE|MRXSH|MSTP009|PRR|RENR|XMRE|XPDS ATPase H+ transporting accessory protein 2 protein-coding 283-13 chr16 86835597 86836063 + 1.33333 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 113739 NR_135183 102724344 Hs.585769 NR_135182 ENSG00000261175 LINC02188 - long intergenic non-protein coding RNA 2188 ncRNA 328-43 chr9 9101268 9101610 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 10 of 45) intron (NM_002839, intron 10 of 45) 243421 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 200-92 chr20 32587311 32587506 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_034152) promoter-TSS (NR_034152) -71 NR_034152 149950 Hs.516980 NM_001010976 ENSG00000204393 NOL4L-DT - NOL4L divergent transcript ncRNA 202-157 chr6 24742990 24743247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23964 NM_030939 81688 Hs.744857 NM_030939 ENSG00000112308 C6orf62 Nbla00237|XTP12|dJ30M3.2 chromosome 6 open reading frame 62 protein-coding 316-51 chr7 141970422 141970720 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3202 NM_176817 5726 Hs.647085 NM_176817 ENSG00000257138 TAS2R38 PTC|T2R38|T2R61|THIOT taste 2 receptor member 38 protein-coding 286-49 chr5 56618261 56618548 + 1.33333 NA Intergenic MER51E|LTR|ERV1 -12148 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 240.666-4 chr1 247381646 247381836 + 1.33333 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -34415 NM_001079821 114548 Hs.159483 NM_004895 ENSG00000162711 NLRP3 AGTAVPRL|AII|AVP|C1orf7|CIAS1|CLR1.1|DFNA34|FCAS|FCAS1|FCU|KEFH|MWS|NALP3|PYPAF1 NLR family pyrin domain containing 3 protein-coding 346.333-7 chr11 21137214 21137769 + 1.33333 NA intron (NM_201551, intron 13 of 18) intron (NM_201551, intron 13 of 18) 467905 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 202-123 chr4 14547315 14547524 + 1.33333 NA intron (NR_126435, intron 5 of 6) intron (NR_126435, intron 5 of 6) 340750 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 219-17 chr11 96311011 96311326 + 1.33333 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR -30270 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 196-118 chr3 97607208 97607402 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 12 of 17) intron (NM_001080448, intron 12 of 17) -157216 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 189.333-86 chr2 8916151 8916315 + 1.33333 NA intron (NR_135605, intron 1 of 11) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -78620 NM_001348741 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 178-54 chr17 42921822 42922018 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21121 NM_001270397 2538 Hs.212293 NM_000151 ENSG00000131482 G6PC G6PC1|G6PT|G6Pase|GSD1|GSD1a glucose-6-phosphatase catalytic subunit protein-coding 179.333-118 chr22 36036628 36036825 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7902 NM_001082578 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 464.667-4 chr8 10241071 10241637 + 1.33333 NA intron (NM_001135670, intron 2 of 4) L1MC5|LINE|L1 145703 NM_001135671 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 203-2 chr1 45096986 45097177 + 1.33333 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) intron (NM_020883, intron 1 of 13) 84827 NR_158185 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 269.333-89 chr8 115424889 115425238 + 1.33333 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 242950 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 238-109 chrX 47873452 47873696 + 1.33333 NA intron (NM_007137, intron 2 of 4) intron (NM_007137, intron 2 of 4) 36672 NM_007137 347344 Hs.114246 NM_007137 ENSG00000197779 ZNF81 HFZ20|MRX45|dJ54B20.6 zinc finger protein 81 protein-coding 215.333-184 chr7 75887003 75887276 + 1.33333 NA intron (NM_001040456, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu 8105 NM_001040456 57414 Hs.488827 NM_020684 ENSG00000005486 RHBDD2 NPD007|RHBDL7 rhomboid domain containing 2 protein-coding 444.333-5 chr3 73610589 73611294 + 1.33333 NA intron (NM_015009, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR -12627 NR_046681 101927249 Hs.733334 NR_046681 PDZRN3-AS1 - PDZRN3 antisense RNA 1 ncRNA 259.666-21 chr2 83607496 83607890 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 84879 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 193.666-54 chrX 69614673 69614818 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1368 NM_001005609 1896 Hs.105407 NM_001399 ENSG00000158813 EDA ECTD1|ED1|ED1-A1|ED1-A2|EDA-A1|EDA-A2|EDA1|EDA2|HED|HED1|ODT1|STHAGX1|TNLG7C|XHED|XLHED ectodysplasin A protein-coding 231.333-126 chr9 99658975 99659301 + 1.33333 NA intron (NR_109802, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 160751 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 253-72 chr8 99874517 99874804 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 61 of 61) intron (NM_017890, intron 61 of 61) 19047 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 199.667-50 chr15 50330832 50331103 + 1.33333 NA intron (NM_016654, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 -23207 NR_024490 100129387 Hs.659360 NR_024490 GABPB1-AS1 - GABPB1 antisense RNA 1 ncRNA 199.667-48 chr14 68308335 68308621 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 320309 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 168-50 chr2 57203774 57203913 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -703808 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 312.333-9 chr2 33362611 33363064 + 1.33333 NA intron (NM_206943, intron 28 of 33) MIR|SINE|MIR -55679 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 233.333-102 chr5 18915512 18915781 + 1.33333 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 970626 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 231.333-45 chr16 6474825 6475029 + 1.33333 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) L1ME4a|LINE|L1 -298882 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 202-7 chr1 151926194 151926504 + 1.33333 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -16838 NM_053055 117145 Hs.164070 NM_053055 ENSG00000159445 THEM4 CTMP thioesterase superfamily member 4 protein-coding 178-104 chr6 143123340 143123529 + 1.33333 NA intron (NM_001366344, intron 2 of 6) intron (NM_001366344, intron 2 of 6) -2705 NM_001366358 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 212-118 chr4 71474637 71474806 + 1.33333 NA intron (NM_003759, intron 11 of 22) intron (NM_003759, intron 11 of 22) 135668 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 260.333-28 chr19 32222049 32222389 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116303 NR_110694 101927411 Hs.515337 NR_110694 ENSG00000267204 LINC01782 - long intergenic non-protein coding RNA 1782 ncRNA 190.666-44 chr5 97789430 97789657 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51215 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 183.333-177 chrX 126301185 126301384 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -134995 NM_001013628 340578 Hs.181867 NM_001013628 ENSG00000198354 DCAF12L2 WDR40C DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 2 protein-coding 284.666-27 chrX 155605918 155606154 + 1.33333 NA intron (NM_018196, intron 1 of 7) L1PA15|LINE|L1 -6529 NM_001304990 10251 Hs.381912 NM_005840 ENSG00000168939 SPRY3 spry-3 sprouty RTK signaling antagonist 3 protein-coding 220.333-121 chr7 40106430 40106614 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 28100 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 190.333-99 chr3 183399020 183399186 + 1.33333 NA intron (NM_015078, intron 1 of 29) intron (NM_015078, intron 1 of 29) 29166 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 184.666-7 chr11 82137068 82137228 + 1.33333 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1MCa|LINE|L1 -246312 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 171-24 chr16 9118323 9118538 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_014117, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_014117, exon 4 of 4) 26786 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 207-17 chr10 116446875 116447155 + 1.33333 NA intron (NM_001011709, intron 4 of 11) L1M3d|LINE|L1 19168 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 384.999-2 chr3 44362457 44362933 + 1.33333 NA intron (NM_001282915, intron 4 of 10) intron (NM_001282915, intron 4 of 10) 23929 NM_001282914 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 236-32 chr19 29591045 29591376 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -15073 NM_006627 10775 Hs.412870 NM_006627 ENSG00000105171 POP4 RPP29 POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 223.333-88 chr2 228316247 228316574 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -134723 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 220-77 chr3 121321852 121322131 + 1.33333 NA intron (NM_001348343, intron 21 of 27) L1PA16|LINE|L1 223997 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 197.667-36 chr14 41532275 41532533 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -74452 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 158-88 chr3 84916116 84916310 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 34123 NR_147147 105377192 NR_147147 ENSG00000242339 LINC02025 - long intergenic non-protein coding RNA 2025 ncRNA 214.666-72 chr8 118528576 118528763 + 1.33333 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -92332 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-119 chr2 24203100 24203366 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_019595, exon 39 of 39) 3' UTR (NM_019595, exon 39 of 39) 28180 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 252-102 chr8 25867048 25867388 + 1.33333 NA intron (NM_022659, intron 10 of 15) intron (NM_022659, intron 10 of 15) 178195 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 267.667-43 chr3 158122325 158122711 + 1.33333 NA intron (NM_001271838, intron 2 of 9) intron (NM_001271838, intron 2 of 9) 12429 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 228-69 chr5 128773322 128773622 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -191655 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 416.666-2 chr11 10437985 10438334 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -12162 NM_001172431 272 Hs.501890 NM_000480 ENSG00000133805 AMPD3 - adenosine monophosphate deaminase 3 protein-coding 178-18 chr10 57130747 57131001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 173685 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 113.666-3 chr5 40689548 40689683 + 1.33333 NA intron (NM_000958, intron 2 of 2) intron (NM_000958, intron 2 of 2) 9700 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 264.999 chr10 81938023 81938319 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) L1MB1|LINE|L1 60484 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 179.333-169 chr6 162307590 162307989 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) intron (NM_004562, intron 2 of 11) -419343 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 215.666-19 chr17 47931956 47932185 + 1.33333 NA intron (NR_103857, intron 1 of 2) MER102c|DNA|hAT-Charlie 9334 NR_103857 100506325 Hs.656008 NR_103856 ENSG00000234494 SP2-AS1 - SP2 antisense RNA 1 ncRNA 210.667-127 chr8 83896917 83897177 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -285740 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 544.333 chr4 174536300 174536841 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13672 NM_001145816 3248 Hs.596913 NM_000860 ENSG00000164120 HPGD 15-PGDH|PGDH|PGDH1|PHOAR1|SDR36C1 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase protein-coding 235.333-106 chr6 76221922 76222127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -149346 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 195.333-41 chr10 119162968 119163155 + 1.33333 NA intron (NM_213649, intron 2 of 13) AluJr|SINE|Alu 2631 NR_110305 119559 Hs.655168 NM_178867 ENSG00000183605 SFXN4 BCRM1|COXPD18|SLC56A4 sideroflexin 4 protein-coding 176-18 chr11 24090462 24090609 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -406518 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 177-30 chr16 21649709 21649877 + 1.33333 NA intron (NM_005849, intron 1 of 5).2 AluJo|SINE|Alu 2815 NM_005849 10261 Hs.530902 NM_005849 ENSG00000140749 IGSF6 DORA immunoglobulin superfamily member 6 protein-coding 259.333-76 chr5 5705644 5706030 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 283160 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 301-42 chr5 52584456 52584937 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -203220 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 337.666-12 chr7 96809361 96809716 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99647 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 372.667-13 chr3 48203372 48203867 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 7055 NR_039645 100616407 NR_039645 ENSG00000265483 MIR4443 mir-4443 microRNA 4443 ncRNA 336-26 chr4 121144841 121145248 + 1.33333 NA intron (NM_001128843, intron 10 of 12) intron (NM_001128843, intron 10 of 12) 19277 NM_024873 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 297.666-9 chr21 28880110 28880454 + 1.33333 NA intron (NM_013240, intron 3 of 5) intron (NM_013240, intron 3 of 5) 5085 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 326-13 chr14 29984803 29985108 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57108 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 210.667-39 chr14 51383094 51383352 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 13912 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 117.333-134 chr3 90046497 90046629 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 938942 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 203.333-190 chr4 32263345 32263499 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87616 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 258.666-22 chr2 184742567 184742943 + 1.33333 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 144226 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 196-120 chr3 98242549 98242767 + 1.33333 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 -21586 NM_001005479 79295 Hs.554712 NM_001005479 ENSG00000230301 OR5H6 OR3-11 olfactory receptor family 5 subfamily H member 6 (gene/pseudogene) protein-coding 281-34 chr5 11769503 11769908 + 1.33333 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 134741 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 169-107 chr9 29872962 29873137 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 535405 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 277.333-5 chr1 173430768 173431091 + 1.33333 NA intron (NR_125960, intron 1 of 1) intron (NR_125960, intron 1 of 1) 30433 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 306.999-2 chr6 62446149 62446604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -160149 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 210-37 chr14 53190414 53190628 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 37167 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 344.666-22 chr5 38577877 38578188 + 1.33333 NA intron (NR_103554, intron 1 of 8) intron (NR_103554, intron 1 of 8) 17373 NM_002310 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 206.333-93 chr2 165266360 165266620 + 1.33333 NA intron (NM_001040143, intron 2 of 27) intron (NM_001040143, intron 2 of 27) 25430 NM_001371247 219.333-95 chr2 81942071 81942425 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -475302 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 185-66 chr7 45963667 45963903 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42513 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 239-13 chr11 103026393 103026710 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 65609 NM_032299 84259 Hs.503716 NM_032299 ENSG00000137692 DCUN1D5 SCCRO5 defective in cullin neddylation 1 domain containing 5 protein-coding 363.667-4 chr17 59044545 59045083 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 16 of 23) MER2|DNA|TcMar-Tigger 62066 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 288-3 chr1 42560249 42560553 + 1.33333 NA intron (NM_001355224, intron 12 of 22) AluSx3|SINE|Alu 27381 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 158-138 chr8 95399066 95399243 + 1.33333 NA intron (NR_038209, intron 2 of 3) intron (NR_038209, intron 2 of 3) -129953 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 168-31 chr14 73449329 73449554 + 1.33333 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) MER2|DNA|TcMar-Tigger 9139 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 208-139 chr5 107355087 107355332 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 315728 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 357.999 chr10 65847899 65848203 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 276626 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 202.333-73 chr16 83835338 83835635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27508 NM_001537 3281 Hs.250899 NM_001537 ENSG00000230989 HSBP1 NPC-A-13 heat shock factor binding protein 1 protein-coding 131.333-3 chr1 41839966 41840116 + 1.33333 NA intron (NM_024503, intron 1 of 8) intron (NM_024503, intron 1 of 8) 78881 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 186.666-27 chr2 75486345 75486545 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37623 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 219.333-67 chr16 57796660 57796846 + 1.33333 NA intron (NM_005550, intron 2 of 18) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1264 NM_001130099 3801 Hs.23131 NM_005550 ENSG00000140859 KIFC3 - kinesin family member C3 protein-coding 210-49 chr17 56504947 56505169 + 1.33333 NA intron (NM_001370326, intron 20 of 20) MIRc|SINE|MIR -88641 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 179-38 chr16 75764344 75764600 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37982 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 202.666-97 chr5 93882315 93882473 + 1.33333 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) intron (NR_028080, intron 4 of 8) -140794 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 188.666-28 chr4 16841207 16841350 + 1.33333 NA intron (NM_001304435, intron 1 of 7) intron (NM_001304435, intron 1 of 7) 57367 NM_001130834 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 201-71 chr22 38170591 38170769 + 1.33333 NA intron (NM_001199562, intron 1 of 15) intron (NM_001199562, intron 1 of 15) 11150 NM_001004426 8398 Hs.170479 NM_003560 ENSG00000184381 PLA2G6 CaI-PLA2|GVI|INAD1|IPLA2-VIA|NBIA2|NBIA2A|NBIA2B|PARK14|PLA2|PNPLA9|iPLA2|iPLA2beta phospholipase A2 group VI protein-coding 146.666-10 chr4 180337118 180337257 + 1.33333 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 821962 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 354-7 chr11 125794439 125794997 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 6591 NM_001129883 100169851 Hs.131278 NM_001129883 ENSG00000236027 PATE3 HEL-127|PATE-DJ prostate and testis expressed 3 protein-coding 272-9 chr12 47042387 47042836 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -36992 NM_001281429 91523 Hs.560100 NM_138371 ENSG00000179715 PCED1B FAM113B PC-esterase domain containing 1B protein-coding 182-25 chr13 62269597 62269796 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51609 NR_149075 106144607 Hs.562580 NR_149075 ENSG00000227611 LINC01074 - long intergenic non-protein coding RNA 1074 ncRNA 125-88 chr5 59546349 59546523 + 1.33333 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 40062 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 242.333-99 chr8 85317694 85318015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23860 NM_001164830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 192.333-117 chr3 164630585 164630732 + 1.33333 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 200822 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 374.666-10 chr8 129853546 129853888 + 1.33333 NA intron (NM_001353307, intron 9 of 13) intron (NM_001353307, intron 9 of 13) -67093 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 201.333-84 chr13 57068930 57069114 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71896 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 226-93 chr8 118895276 118895539 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 56478 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 196-115 chr3 55207705 55207983 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 29672 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 214-62 chr2 32427112 32427407 + 1.33333 NA intron (NM_016252, intron 10 of 73) L1M4a2|LINE|L1 70231 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 226.666-2 chr1 216202210 216202397 + 1.33333 NA intron (NM_206933, intron 16 of 71) intron (NM_206933, intron 16 of 71) 129838 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 202.333-4 chr1 37709509 37709753 + 1.33333 NA TTS (NM_018101) TTS (NM_018101) 17115 NM_018101 55143 Hs.524571 NM_018101 ENSG00000134690 CDCA8 BOR|BOREALIN|DasraB|MESRGP cell division cycle associated 8 protein-coding 213.333-11 chr1 151767923 151768191 + 1.33333 NA intron (NM_016178, intron 2 of 4) intron (NM_016178, intron 2 of 4) 1402 NM_016178 51686 Hs.713789 NM_016178 ENSG00000143450 OAZ3 AZ3|OAZ-t|TISP15 ornithine decarboxylase antizyme 3 protein-coding 385.333-4 chr10 29971611 29971977 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 87792 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 214.333-109 chr4 156801664 156801954 + 1.33333 NA intron (NM_016205, intron 3 of 5) MER4C|LTR|ERV1 169990 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 230-33 chr2 13262039 13262272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -255142 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 325.999-2 chr17 77834379 77834686 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49555 NR_028337 400624 Hs.514521 NM_001001685 ENSG00000204283 LINC01973 - long intergenic non-protein coding RNA 1973 ncRNA 193.333-189 chr8 83399067 83399455 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4497 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 365.333-16 chr2 184071378 184071689 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR2b|LTR|Gypsy -307442 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 158.667-131 chr18 5658570 5658773 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29680 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 284.333-26 chr2 150324465 150324864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -67657 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 200.666-58 chr2 97931775 97931933 + 1.33333 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) intron (NM_015348, intron 1 of 40) 64094 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 158-96 chr4 88794373 88794605 + 1.33333 NA intron (NM_001265578, intron 1 of 16) intron (NM_001265578, intron 1 of 16) 28872 NM_001265580 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 247.333-20 chr12 19759258 19759600 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -255256 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 228-57 chr3 98561578 98561900 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29761 NM_005290 2838 Hs.162987 NM_005290 ENSG00000154165 GPR15 BOB G protein-coupled receptor 15 protein-coding 209.333-81 chr16 1050142 1050340 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -22515 NM_001172560 6755 Hs.449840 NM_001053 ENSG00000162009 SSTR5 SS-5-R somatostatin receptor 5 protein-coding 173.666-3 chr10 121951660 121951904 + 1.33333 NA non-coding (NR_120495, exon 2 of 2) non-coding (NR_120495, exon 2 of 2) -22981 NM_001288736 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 324-2 chr10 77337249 77337670 + 1.33333 NA intron (NM_001322838, intron 1 of 29) AluSz|SINE|Alu 13302 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 224-96 chr7 12965783 12966020 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 278268 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 232.999 chr10 50243192 50243488 + 1.33333 NA exon (NM_019893, exon 3 of 20) exon (NM_019893, exon 3 of 20) 5270 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 211.333-137 chr21 31844885 31845085 + 1.33333 NA Intergenic Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger -28035 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 302.666-8 chr17 29497348 29497648 + 1.33333 NA intron (NM_025142, intron 11 of 17) intron (NM_025142, intron 11 of 17) 69539 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 349-20 chr6 132743485 132743942 + 1.33333 NA TTS (NM_001242350) TTS (NM_001242350) -8948 NM_001368155 55350 Hs.183656 NM_018399 VNN3 HSA238982 vanin 3 protein-coding 154-9 chr1 221250542 221250755 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 85648 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 215.333-108 chr2 213238818 213239001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45300 NR_161186 100130451 Hs.608433 NR_144752 SPAG16-DT - SPAG16 divergent transcript ncRNA 157.333-99 chr13 112537166 112537361 + 1.33333 NA intron (NM_006322, intron 11 of 21) L1MB7|LINE|L1 50890 NM_001286278 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 244.333-20 chr11 30647556 30648078 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -61464 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 204.333-174 chr6 55998056 55998337 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 93466 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 292.666-5 chr10 11956189 11956583 + 1.33333 NA exon (NM_015542, exon 13 of 22) exon (NM_015542, exon 13 of 22) -61676 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 242.666-40 chr8 51810016 51810279 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_144651) promoter-TSS (NM_144651) -702 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 365.333-9 chr15 27841752 27842190 + 1.33333 NA intron (NM_001300984, intron 22 of 22) L1ME4a|LINE|L1 257344 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 277.333-19 chr11 111652488 111652842 + 1.33333 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) intron (NM_015191, intron 3 of 14) 50216 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 229.333-25 chr12 32381589 32381768 + 1.33333 NA non-coding (NR_148725, exon 10 of 10) non-coding (NR_148725, exon 10 of 10) -17880 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 317.666-6 chr19 51744703 51745043 + 1.33333 NA TTS (NM_001193306) TTS (NM_001193306) 7005 NM_001193306 2357 Hs.753 NM_002029 ENSG00000171051 FPR1 FMLP|FPR formyl peptide receptor 1 protein-coding 225.333-142 chrX 15381869 15382038 + 1.33333 NA intron (NR_037859, intron 9 of 14) intron (NR_037859, intron 9 of 14) 2460 NM_004469 2277 Hs.11392 NM_004469 ENSG00000165197 VEGFD FIGF|VEGF-D vascular endothelial growth factor D protein-coding 226.666-10 chr13 35455339 35455535 + 1.33333 NA intron (NM_015678, intron 40 of 57) intron (NM_015678, intron 40 of 57) 21252 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 191-33 chr2 178393222 178393386 + 1.33333 NA intron (NM_001201480, intron 24 of 25) intron (NM_001201480, intron 24 of 25) -20355 NR_110204 101927027 Hs.715694 NR_110204 ENSG00000223960 CHROMR CHROME|PRKRA-AS1 cholesterol induced regulator of metabolism RNA ncRNA 205.333-244 chr8 87312151 87312380 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) intron (NM_173538, intron 8 of 10) 445850 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 334.333-12 chr14 45658580 45658996 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 56814 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 208.667-102 chr4 95085376 95085662 + 1.33333 NA intron (NM_001256793, intron 1 of 10) intron (NM_001256793, intron 1 of 10) -5972 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 200.666-115 chr7 86335002 86335159 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -308829 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 196.666-22 chr14 60453782 60453935 + 1.33333 NA intron (NM_174978, intron 16 of 17) L1M5|LINE|L1 32205 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 260-58 chr5 5924766 5925057 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 412381 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 213.333-80 chr18 12159905 12160202 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40726 NR_049896 497259 Hs.451609 NR_049896 C18orf61 - uncharacterized LOC497259 ncRNA 207.333-208 chr4 125234577 125234747 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -81750 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 178.667-156 chr7 124268352 124268609 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 83616 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 198.666-56 chr3 902436 902585 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -190514 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 393.999-2 chr5 120375759 120376084 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -88357 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 292.666-16 chr18 10458156 10458423 + 1.33333 NA intron (NM_153000, intron 1 of 4) intron (NM_153000, intron 1 of 4) 3654 NM_153000 147495 Hs.293274 NM_153000 ENSG00000154856 APCDD1 B7323|DRAPC1|FP7019|HHS|HTS|HYPT1 APC down-regulated 1 protein-coding 168-11 chr10 81675094 81675241 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -200027 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 372-12 chr2 192961001 192961493 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 211402 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 228.666-29 chr3 71702522 71702718 + 1.33333 NA intron (NM_173359, intron 3 of 7) intron (NM_173359, intron 3 of 7) 22782 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 291.666-12 chr6 54753144 54753545 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93427 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 216.666-22 chr12 65299100 65299314 + 1.33333 NA intron (NM_001193461, intron 1 of 6) HAL1|LINE|L1 20220 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 449.333-7 chr5 80906654 80907252 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -53410 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 164.667-81 chr15 62510958 62511184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 134110 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 232.667-74 chr8 49490022 49490417 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 21961 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 227.333-95 chr4 133958151 133958424 + 1.33333 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 243502 NM_001114734 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 226-77 chr5 121727429 121727632 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -124352 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 208-57 chr15 87482013 87482219 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -94813 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 200-154 chr7 52676824 52677091 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -358676 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 208.333-142 chr8 18310436 18310706 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -80711 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 202-149 chr5 105140813 105140996 + 1.33333 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 41430 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 199.333-55 chr12 55311447 55311678 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9038 NM_001005182 390321 Hs.553763 NM_001005182 ENSG00000205330 OR6C1 OST267 olfactory receptor family 6 subfamily C member 1 protein-coding 252-88 chr6 42192469 42192878 + 1.33333 NA intron (NM_002098, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu 2283 NM_002098 2979 Hs.446529 NM_002098 ENSG00000112599 GUCA1B GCAP 2|GCAP2|GUCA2|RP48 guanylate cyclase activator 1B protein-coding 217-14 chr12 42401815 42402059 + 1.33333 NA intron (NM_016488, intron 9 of 12) AluJb|SINE|Alu 70139 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 201.333-50 chr11 33810688 33810948 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 36119 NR_120550 101928440 Hs.202343 NR_120550 ENSG00000254508 FBXO3-DT FBXO3-AS1 FBXO3 divergent transcript ncRNA 247.666-13 chr2 56763328 56763550 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -577669 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 316.333-15 chr2 56638525 56638840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -452912 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 379-7 chr22 30183159 30183601 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -55814 NR_149070 110806283 NR_149070 ENSG00000232530 LIF-AS1 Lnc-LIF-AS LIF antisense RNA 1 ncRNA 158-86 chr3 44259317 44259473 + 1.33333 NA intron (NM_001145030, intron 4 of 19) intron (NM_001145030, intron 4 of 19) 17509 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 155.333-323 chr6 27220333 27220489 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -27290 NM_005865 10279 Hs.274407 NM_005865 ENSG00000112812 PRSS16 TSSP serine protease 16 protein-coding 251 chr1 70789998 70790209 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 83650 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 185-74 chr8 13611858 13612009 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7313 NM_001348081 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 186-55 chr20 57195637 57195879 + 1.33333 NA intron (NM_001719, intron 3 of 6) intron (NM_001719, intron 3 of 6) -17938 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 166.667-15 chr1 119033608 119033816 + 1.33333 NA intron (NM_201263, intron 5 of 5) MER47A|DNA|TcMar-Tigger -13693 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 187-2 chr1 95544881 95545107 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 34878 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 187.667-41 chr14 53959670 53959962 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2925 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 250.333-2 chr1 54388254 54388684 + 1.33333 NA intron (NM_001009955, intron 4 of 16) MIR|SINE|MIR 17925 NM_018070 23648 Hs.476706 NM_018070 ENSG00000157216 SSBP3 CSDP|SSDP|SSDP1 single stranded DNA binding protein 3 protein-coding 256.667-81 chr7 18931189 18931619 + 1.33333 NA intron (NM_058176, intron 21 of 22) intron (NM_058176, intron 21 of 22) 186232 NR_149001 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 358.666-21 chrX 155263462 155263769 + 1.33333 NA intron (NM_171998, intron 1 of 1) intron (NM_171998, intron 1 of 1) 876 NM_171998 116442 Hs.632832 NM_171998 ENSG00000155961 RAB39B BGMR|MRX72|WSMN|WSN RAB39B, member RAS oncogene family protein-coding 312.999-2 chr3 88858087 88858457 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -249349 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 212-87 chr2 67438593 67438882 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 41404 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 291.999 chr1 102508111 102508377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -511010 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 168.667-86 chr19 10927278 10927502 + 1.33333 NA intron (NM_001321440, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 1249 NM_001321439 78992 Hs.164026 NM_024029 ENSG00000130733 YIPF2 FinGER2 Yip1 domain family member 2 protein-coding 226.333-61 chr2 102247826 102248152 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 60675 NM_001351446 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 206.667-93 chr3 178410872 178411133 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -8199 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 209-10 chr10 54866293 54866514 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) -65112 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 185-25 chr16 65260663 65260975 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -84246 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 297.999-7 chr5 168050391 168050654 + 1.33333 NA intron (NM_001368145, intron 5 of 26) intron (NM_001368145, intron 5 of 26) -115323 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 236-81 chr6 155684113 155684390 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 169407 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 141.667-165 chr4 87258110 87258315 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37594 NM_001292006 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 317.666-3 chr14 52341146 52341702 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27112 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 337.667-2 chr10 94573433 94573955 + 1.33333 NA intron (NM_001289075, intron 7 of 20) AluJb|SINE|Alu 27906 NM_018063 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 352.666-6 chr5 87262187 87262651 + 1.33333 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -5464 NM_002890 5921 Hs.664080 NM_002890 ENSG00000145715 RASA1 CM-AVM|CMAVM|CMAVM1|GAP|PKWS|RASA|RASGAP|p120|p120GAP|p120RASGAP RAS p21 protein activator 1 protein-coding 243-17 chr14 40757662 40758024 + 1.33333 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -196868 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 473.332 chr8 99792248 99792729 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 43 of 61) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 101219 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 194-17 chr11 46957876 46958025 + 1.33333 NA intron (NM_001278222, intron 1 of 7) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 21189 NM_024113 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 218-26 chr14 50633918 50634226 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_021818, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_021818, exon 5 of 5) 34234 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 211.333-216 chr7 3902653 3902881 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) L1MC4|LINE|L1 -226918 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 208-144 chr6 53796809 53797048 + 1.33333 NA intron (NM_018214, intron 1 of 13) intron (NM_018214, intron 1 of 13) 1923 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 348.333-19 chr3 39317775 39318236 + 1.33333 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -11704 NM_005201 1237 Hs.113222 NM_005201 ENSG00000179934 CCR8 CC-CKR-8|CCR-8|CDw198|CKRL1|CMKBR8|CMKBRL2|CY6|GPRCY6|TER1 C-C motif chemokine receptor 8 protein-coding 356.333 chr1 44962889 44963199 + 1.33333 NA intron (NM_001166588, intron 3 of 9) AluJb|SINE|Alu 23551 NM_020365 8891 Hs.533549 NM_020365 ENSG00000070785 EIF2B3 EIF-2B|EIF2Bgamma eukaryotic translation initiation factor 2B subunit gamma protein-coding 268.333-46 chr5 647039 647327 + 1.33333 NA intron (NM_018140, intron 10 of 11) intron (NM_018140, intron 10 of 11) 34843 NM_018140 55722 Hs.591741 NM_018140 ENSG00000112877 CEP72 - centrosomal protein 72 protein-coding 340.333-18 chr6 148700462 148700918 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46340 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 208-13 chr1 187099906 187100110 + 1.33333 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 7166 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 181.667-155 chrX 82147429 82147731 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 945478 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 266.333-8 chr10 76979396 76979877 + 1.33333 NA intron (NM_001322838, intron 19 of 29) MIRc|SINE|MIR 91592 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 248-3 chr1 105894260 105894576 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 133835 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 274-35 chr3 192430564 192430865 + 1.33333 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) -21665 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 234.666-55 chr9 84184772 84184967 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121426 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 237.667-61 chr4 93186472 93186849 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 3 of 14) HAL1|LINE|L1 -642093 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 197.333-165 chr4 60165947 60166124 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -756584 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 152.666-7 chr2 141020724 141020855 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 11 of 90) intron (NM_018557, intron 11 of 90) -434104 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 302.999-3 chr12 81527072 81527330 + 1.33333 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) intron (NM_001220474, intron 2 of 30) -14810 NM_001282536 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 137.666-6 chr7 32010983 32011168 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) L1ME1|LINE|L1 59332 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 201.333-59 chr11 108417994 108418269 + 1.33333 NA intron (NM_001351110, intron 2 of 8) L1M4a2|LINE|L1 49398 NM_152587 160140 Hs.653180 NM_152587 ENSG00000166323 C11orf65 - chromosome 11 open reading frame 65 protein-coding 514-3 chr14 32765561 32766131 + 1.33333 NA intron (NM_004274, intron 11 of 13) intron (NM_004274, intron 11 of 13) -173033 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 180.333-143 chr8 126227801 126228042 + 1.33333 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL -97574 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 325-2 chr1 39985386 39985773 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 30434 NR_109896 84879 Hs.655177 NM_032793 ENSG00000168389 MFSD2A MCPH15|MFSD2|NLS1 major facilitator superfamily domain containing 2A protein-coding 325.333-20 chr2 135537835 135538420 + 1.33333 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 6643 NM_001282799 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 272-47 chr7 39182717 39182976 + 1.33333 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 146288 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 164.667-215 chr7 6350344 6350532 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1471 NM_001037163 84792 Hs.696146 NM_001037163 ENSG00000286075 FAM220A ACPIN1|C7orf70|SIPAR family with sequence similarity 220 member A protein-coding 264.999-5 chr20 52034695 52035036 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 70619 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 396-16 chr6 164873878 164874452 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -52102 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 254.999-6 chr7 112200952 112201273 + 1.33333 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 5287 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 283.666-15 chr9 96772048 96772278 + 1.33333 NA intron (NM_001314060, intron 2 of 4) L1ME3|LINE|L1 5924 NM_001314059 22869 Hs.75264 NM_014930 ENSG00000081386 ZNF510 - zinc finger protein 510 protein-coding 300-17 chr13 24707859 24708167 + 1.33333 NA intron (NM_001676, intron 17 of 22) intron (NM_001676, intron 17 of 22) 27602 NM_001185085 479 Hs.147111 NM_001676 ENSG00000075673 ATP12A ATP1AL1|HK ATPase H+/K+ transporting non-gastric alpha2 subunit protein-coding 192-25 chr10 92992471 92992619 + 1.33333 NA intron (NM_001319195, intron 18 of 21) intron (NM_001319195, intron 18 of 21) -68253 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 203.333-159 chr22 26249017 26249225 + 1.33333 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) L1MA5|LINE|L1 79647 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 198.666-43 chr2 112021528 112021738 + 1.33333 NA intron (NM_006343, intron 17 of 18) intron (NM_006343, intron 17 of 18) -33636 NM_032824 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 127.333-120 chr3 136599530 136599657 + 1.33333 NA intron (NM_005862, intron 4 of 33) L1MEi|LINE|L1 152785 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 269.333-33 chr18 6654373 6654705 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -75177 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 290.666-12 chr18 2926921 2927229 + 1.33333 NA intron (NM_014646, intron 12 of 19) intron (NM_014646, intron 12 of 19) 19548 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 258-73 chr6 127238682 127239089 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -27797 NM_001242851 81847 Hs.267120 NM_030963 ENSG00000118518 RNF146 - ring finger protein 146 protein-coding 261.333-62 chr3 8919622 8919972 + 1.33333 NA intron (NM_020165, intron 7 of 12) L1MC4|LINE|L1 43675 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 415.999-3 chr2 38022226 38022589 + 1.33333 NA intron (NM_144713, intron 10 of 10) intron (NM_144713, intron 10 of 10) 13934 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 294-40 chr22 47640935 47641286 + 1.33333 NA intron (NR_122046, intron 2 of 8) L1MC4|LINE|L1 9436 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 339.666-15 chr8 118661837 118662299 + 1.33333 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 -40105 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 204.333-180 chr6 157414941 157415102 + 1.33333 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) intron (NM_024630, intron 1 of 8) 33831 NM_153746 79683 Hs.596214 NM_024630 ENSG00000175048 ZDHHC14 NEW1CP zinc finger DHHC-type containing 14 protein-coding 185-5 chr10 82526383 82526565 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L1ME3B|LINE|L1 -293554 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 203.333-119 chr19 36926082 36926301 + 1.33333 NA intron (NM_001204835, intron 4 of 6) intron (NM_001204835, intron 4 of 6) 9859 NM_001204835 374900 Hs.404220 NM_198539 ENSG00000198453 ZNF568 ZFP568 zinc finger protein 568 protein-coding 185.333-56 chr15 85492661 85492857 + 1.33333 NA intron (NM_007200, intron 2 of 36) L1MC4|LINE|L1 112156 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 246.666-21 chr2 51039759 51039980 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 1 of 10) MER70A|LTR|ERVL 7268 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 346.667-14 chr6 90000068 90000582 + 1.33333 NA intron (NM_021813, intron 6 of 8) intron (NM_021813, intron 6 of 8) 105856 NM_032602 84694 Hs.334499 NM_032602 ENSG00000135355 GJA10 CX62 gap junction protein alpha 10 protein-coding 197.333-225 chr8 23460693 23460862 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -3046 NM_001128930 9583 Hs.444389 NM_004901 ENSG00000197217 ENTPD4 LALP70|LAP70|LYSAL1|NTPDase-4|UDPase ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 protein-coding 259.333-8 chr1 201581356 201581707 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 61627 NR_026667 376693 Hs.605989 NR_026667 RPS10P7 RPS10_2_147 ribosomal protein S10 pseudogene 7 pseudo 285.333-54 chr4 84708012 84708332 + 1.33333 NA intron (NM_014991, intron 53 of 67) intron (NM_014991, intron 53 of 67) 125045 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 180-35 chr14 46050371 46050599 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -13674 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 173.333-14 chr1 147825896 147826114 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52643 NM_005266 2702 Hs.447968 NM_005266 ENSG00000265107 GJA5 ATFB11|CX40 gap junction protein alpha 5 protein-coding 377.999-2 chr18 4722395 4722771 + 1.33333 NA Intergenic LTR86A2|LTR|ERVL -267276 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 257.333-7 chr10 19646623 19646972 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 36 of 39) intron (NM_001142308, intron 36 of 39) 81753 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 244.333-34 chr13 108324681 108325087 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 55255 NM_006573 10673 Hs.525157 NM_006573 ENSG00000102524 TNFSF13B BAFF|BLYS|CD257|DTL|TALL-1|TALL1|THANK|TNFSF20|TNLG7A|ZTNF4 TNF superfamily member 13b protein-coding 175.666-17 chr5 8963828 8963973 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 89995 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 208.333-37 chr14 52788098 52788334 + 1.33333 NA intron (NM_198066, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 3391 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 267.666-12 chr22 19540028 19540308 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -14831 NM_001363067 7122 Hs.505337 NM_003277 ENSG00000184113 CLDN5 AWAL|BEC1|CPETRL1|TMDVCF|TMVCF claudin 5 protein-coding 550.666 chr4 69030995 69031614 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10908 NM_001144767 7365 Hs.201634 NM_001075 ENSG00000109181 UGT2B10 UDPGT2B10 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B10 protein-coding 212.666-38 chr2 23980367 23980608 + 1.33333 NA intron (NM_181713, intron 4 of 6) L1MB7|LINE|L1 -29598 NM_001346880 388931 Hs.407482 NM_001080473 ENSG00000205639 MFSD2B - major facilitator superfamily domain containing 2B protein-coding 340-24 chr5 127286679 127287208 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -3821 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 217.333-90 chr3 35691316 35691589 + 1.33333 NA intron (NM_016300, intron 9 of 19) MIR3|SINE|MIR 10512 NM_198399 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 141-98 chr9 30310050 30310196 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 98331 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 208.333-148 chr8 117184792 117184997 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49899 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 186.667-120 chr5 127973980 127974224 + 1.33333 NA intron (NR_152803, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 109073 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 188.333-77 chr2 134296487 134296711 + 1.33333 NA intron (NM_001371457, intron 3 of 16) intron (NM_001371457, intron 3 of 16) 42527 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 197.666-65 chr8 89016679 89016834 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -689273 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 265.333-10 chr10 82428576 82428936 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L1M4|LINE|L1 -195836 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 214.333-118 chr5 119836449 119836620 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 206975 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 193.666-53 chr9 127836431 127836591 + 1.33333 NA intron (NM_001114753, intron 2 of 14) intron (NM_001114753, intron 2 of 14) 10656 NM_001278138 2022 Hs.76753 NM_000118 ENSG00000106991 ENG END|HHT1|ORW1 endoglin protein-coding 247.333-22 chr12 119750920 119751269 + 1.33333 NA intron (NM_007174, intron 22 of 46) intron (NM_007174, intron 22 of 46) -37370 NR_031589 100302274 NR_031589 ENSG00000283768 MIR1178 MIRN1178|hsa-mir-1178 microRNA 1178 ncRNA 236.666-43 chr7 43002495 43002727 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 70235 NR_156497 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 235.333-71 chr3 27392504 27392810 + 1.33333 NA intron (NM_001258380, intron 19 of 23) AluSz6|SINE|Alu -23197 NM_152534 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 207.333-148 chr2 211945853 211946044 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) intron (NM_001042599, intron 3 of 26) 480412 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 277.667-39 chr5 5637358 5637761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 214882 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 198.666-84 chr6 98194651 98194853 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 170221 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 294.333-50 chr9 98088689 98089104 + 1.33333 NA intron (NM_033219, intron 5 of 6) intron (NM_033219, intron 5 of 6) 30326 NM_014788 9830 Hs.575631 NM_014788 ENSG00000106785 TRIM14 - tripartite motif containing 14 protein-coding 203-75 chr4 162045993 162046257 + 1.33333 NA intron (NR_125888, intron 5 of 5) intron (NR_125888, intron 5 of 5) 23392 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 290.333-25 chr22 20436142 20436463 + 1.33333 NA intron (NM_182895, intron 1 of 10) intron (NM_182895, intron 1 of 10) 1523 NM_153334 91179 Hs.474251 NM_153334 ENSG00000244486 SCARF2 NSR1|SREC-II|SREC2|SRECRP-1|VDEGS scavenger receptor class F member 2 protein-coding 166-32 chr12 31517545 31517703 + 1.33333 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) intron (NM_001308339, intron 1 of 22) -72299 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 416-5 chr2 45380470 45381011 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125799 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 341.333-26 chr6 125847450 125847807 + 1.33333 NA intron (NM_001199621, intron 2 of 14) L1PA6|LINE|L1 -28770 NR_126386 104355145 Hs.590370 NR_126386 ENSG00000232131 NCOA7-AS1 - NCOA7 antisense RNA 1 ncRNA 190-16 chr10 100223709 100223978 + 1.33333 NA intron (NM_001278, intron 2 of 20) MIRb|SINE|MIR 5753 NM_001278 1147 Hs.198998 NM_001278 ENSG00000213341 CHUK IKBKA|IKK-alpha|IKK1|IKKA|NFKBIKA|TCF16 component of inhibitor of nuclear factor kappa B kinase complex protein-coding 342.666-21 chr7 78134980 78135367 + 1.33333 NA exon (NM_012301, exon 17 of 22) exon (NM_012301, exon 17 of 22) -212069 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 308-39 chr4 93365087 93365579 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) L1M6|LINE|L1 -463420 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 119.333-225 chr8 135189296 135189433 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -44767 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 194 chr1 23246621 23246873 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 38771 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 248.333-16 chr11 61597825 61598176 + 1.33333 NA intron (NR_110189, intron 2 of 3) intron (NR_110189, intron 2 of 3) 9506 NR_110189 101927495 Hs.553866 NR_110189 ENSG00000250230 LOC101927495 - uncharacterized LOC101927495 ncRNA 148.667-192 chr2 81117627 81117816 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 349225 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 321.333-59 chr8 82379649 82380051 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -532254 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 150.667-193 chr2 173185427 173185713 + 1.33333 NA intron (NM_133646, intron 4 of 11) intron (NM_133646, intron 4 of 11) 96466 NR_033882 339751 Hs.570083 NR_033882 ENSG00000238133 MAP3K20-AS1 MLK7-AS1 MAP3K20 antisense RNA 1 ncRNA 216.667-49 chr18 6913064 6913331 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001366230, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001366230, exon 18 of 18) 16672 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 342.666-7 chr11 112687018 112687366 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -131390 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 160-43 chr14 60586408 60586647 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -52689 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 138.333-84 chr2 20579323 20579493 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13140 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 288.667-29 chr6 35626544 35626987 + 1.33333 NA intron (NM_001145775, intron 4 of 11) L1MB2|LINE|L1 38024 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 178-16 chr10 17901193 17901360 + 1.33333 NA intron (NM_002438, intron 25 of 29) intron (NM_002438, intron 25 of 29) -50563 NM_001282733 221074 Hs.350895 NM_152725 ENSG00000148482 SLC39A12 LZT-Hs8|ZIP-12|bA570F3.1 solute carrier family 39 member 12 protein-coding 203.666-26 chr15 72184703 72184856 + 1.33333 NA intron (NM_001012642, intron 1 of 11) L1ME4b|LINE|L1 13008 NM_001012642 196996 Hs.596332 NM_001012642 ENSG00000175318 GRAMD2A GRAMD2 GRAM domain containing 2A protein-coding 186-96 chr7 33852485 33852726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52310 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 249.666-2 chr1 65458427 65458681 + 1.33333 NA intron (NM_001003679, intron 2 of 19) L1MCa|LINE|L1 37838 NM_001198681 54741 Hs.23581 NM_017526 ENSG00000213625 LEPROT LEPR|OB-RGRP|OBRGRP|VPS55 leptin receptor overlapping transcript protein-coding 198.666-80 chr5 121911833 121912058 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -50030 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 212-128 chr5 44666125 44666432 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 142515 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 261.999-10 chr8 143894220 143894452 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15872 NM_031308 83481 Hs.200412 NM_031308 ENSG00000261150 EPPK1 EPIPL|EPIPL1 epiplakin 1 protein-coding 219.333-122 chr4 27085242 27085532 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -132092 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 161.667-237 chr7 26206463 26206660 + 1.33333 NA intron (NM_016587, intron 3 of 5) intron (NM_016587, intron 3 of 5) 4816 NM_016587 11335 Hs.381189 NM_007276 ENSG00000122565 CBX3 HECH|HP1-GAMMA|HP1Hs-gamma chromobox 3 protein-coding 225.333-130 chr8 103581225 103581518 + 1.33333 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1M3f|LINE|L1 -79461 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 193.666-33 chr3 145081518 145081681 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 987586 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 183-99 chr8 125302918 125303083 + 1.33333 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -127358 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 253.333-66 chr20 41431579 41431818 + 1.33333 NA intron (NM_032221, intron 27 of 36) L1MD1|LINE|L1 -64880 NM_052846 90187 Hs.726525 NM_052846 ENSG00000183798 EMILIN3 C20orf130|EMILIN5|dJ620E11.4 elastin microfibril interfacer 3 protein-coding 305.333-44 chr3 73054867 73055250 + 1.33333 NA intron (NM_001318026, intron 3 of 8) intron (NM_001318026, intron 3 of 8) -6601 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 424.999 chr13 37551544 37551938 + 1.33333 NA TTS (NR_040244) TTS (NR_040244) 16801 NR_040244 400121 Hs.558894 NR_040244 ENSG00000275226 LINC00547 - long intergenic non-protein coding RNA 547 ncRNA 284.333-39 chr6 134911174 134911569 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 38730 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 204.666-97 chr8 21892983 21893183 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20607 NM_001317800 9046 Hs.71215 NM_003974 ENSG00000147443 DOK2 p56DOK|p56dok-2 docking protein 2 protein-coding 186.666-38 chr3 190043329 190043500 + 1.33333 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 77483 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 235.333-10 chr10 25800482 25800779 + 1.33333 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 133080 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 271.333-52 chr4 46208156 46208412 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -84230 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 229.333-48 chr16 72516317 72516543 + 1.33333 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) MERX|DNA|TcMar-Tigger 148540 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 253-51 chr5 36751443 36751839 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 125053 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 183.333-135 chr5 128634359 128634530 + 1.33333 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -96199 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 216.666-66 chr8 57953868 57954040 + 1.33333 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie -24404 NR_130934 100505477 Hs.434693 NR_130934 ENSG00000205293 LINC01602 T1560 long intergenic non-protein coding RNA 1602 ncRNA 208-32 chr11 107630495 107630773 + 1.33333 NA intron (NM_001308018, intron 4 of 12) intron (NM_001308018, intron 4 of 12) 39487 NM_018712 55531 Hs.495779 NM_018712 ENSG00000110675 ELMOD1 - ELMO domain containing 1 protein-coding 188-55 chr2 52312406 52312595 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -58148 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 605.333 chr2 41068642 41069336 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -556554 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 195.333-115 chr2 103305481 103305689 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -321156 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 202-196 chr9 69934835 69935073 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -108627 NR_125850 256691 Hs.547172 NM_153267 ENSG00000165072 MAMDC2 - MAM domain containing 2 protein-coding 252.333-22 chr14 102272305 102272590 + 1.33333 NA intron (NM_001330234, intron 2 of 11) AluSx|SINE|Alu -31832 NR_073541 5891 Hs.36859 NM_014226 ENSG00000080823 MOK RAGE|RAGE-1|RAGE1|STK30 MOK protein kinase protein-coding 210.667-80 chr22 26174956 26175256 + 1.33333 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 5632 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 158-116 chr6 40107830 40108044 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -173475 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 229.666-2 chr10 12061071 12061270 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7784 NM_018706 55526 Hs.104980 NM_018706 ENSG00000181192 DHTKD1 AMOXAD|CMT2Q dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1 protein-coding 204.667-23 chr11 31313471 31313739 + 1.33333 NA intron (NM_181807, intron 3 of 8) intron (NM_181807, intron 3 of 8) 56134 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 238.333-56 chr22 32441290 32441673 + 1.33333 NA intron (NM_174932, intron 6 of 14) L2a|LINE|L2 15905 NM_174932 254240 Hs.372939 NM_174932 ENSG00000184459 BPIFC BPIL2 BPI fold containing family C protein-coding 226.333-19 chr11 95785252 95785496 + 1.33333 NA intron (NM_001330357, intron 4 of 9) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 4408 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 220.999-6 chr6 36117682 36117897 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -12724 NR_072996 5603 Hs.178695 NM_002754 ENSG00000156711 MAPK13 MAPK 13|MAPK-13|PRKM13|SAPK4|p38delta mitogen-activated protein kinase 13 protein-coding 207.333-278 chr9 29661138 29661341 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -447638 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 219-55 chr3 2019583 2019878 + 1.33333 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -79073 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 166.333-135 chr20 56905855 56906072 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 276657 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 190.667-38 chr14 33818051 33818326 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109251 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 188-2 chr1 39857606 39857805 + 1.33333 NA intron (NM_017646, intron 1 of 10) intron (NM_017646, intron 1 of 10) 25799 NM_017646 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 162-89 chr4 23509349 23509588 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 371824 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 212.666-81 chr6 168722345 168722542 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 241939 NR_136248 105378146 Hs.343631 NR_136248 LOC105378146 - uncharacterized LOC105378146 ncRNA 193.666-32 chr3 139173200 139173361 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 60242 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 234.666-22 chr2 138250137 138250441 + 1.33333 NA Intergenic LTR72|LTR|ERV1 148405 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 144.667-246 chr5 120735485 120735688 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 204122 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 243.666-8 chr12 53509005 53509294 + 1.33333 NA intron (NR_073163, intron 12 of 12) MIR|SINE|MIR -1665 NM_003717 8620 Hs.733076 NM_003717 ENSG00000139574 NPFF FMRFAL neuropeptide FF-amide peptide precursor protein-coding 186-72 chr4 54120542 54120706 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 20461 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 331.666-20 chr6 112331239 112331600 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15911 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 254.666-32 chr8 132919608 132919995 + 1.33333 NA intron (NM_003235, intron 21 of 47) MER20|DNA|hAT-Charlie 52843 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 196.667-46 chr14 71490567 71490823 + 1.33333 NA TTS (NR_027046) TTS (NR_027046) 2834 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 213.999-2 chr12 69827791 69827982 + 1.33333 NA intron (NM_182530, intron 1 of 24) L1ME4a|LINE|L1 2659 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 188.333-126 chr5 180536433 180536644 + 1.33333 NA intron (NR_163438, intron 2 of 10) AluJo|SINE|Alu -5116 NM_001370474 57472 Hs.608380 NM_015455 ENSG00000113300 CNOT6 CCR4|Ccr4a CCR4-NOT transcription complex subunit 6 protein-coding 198-45 chr14 32471265 32471444 + 1.33333 NA intron (NM_004274, intron 2 of 13) intron (NM_004274, intron 2 of 13) 142056 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 197.667-67 chr2 80259999 80260281 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) MIR|SINE|MIR 44612 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 218-115 chr8 122935220 122935540 + 1.33333 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) intron (NM_001362797, intron 3 of 4) 90392 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 208.666-6 chr1 83490094 83490292 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 44139 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 277.666-3 chr1 226629673 226629963 + 1.33333 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL 45250 NR_103784 100506443 Hs.664293 NR_103784 ITPKB-IT1 - ITPKB intronic transcript 1 ncRNA 168.667-130 chr21 36698659 36698876 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_005069) promoter-TSS (NM_005069) -348 NM_009586 6493 Hs.146186 NM_005069 ENSG00000159263 SIM2 HMC13F06|HMC29C01|SIM|bHLHe15 SIM bHLH transcription factor 2 protein-coding 197.667-28 chr11 94342253 94342527 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 36753 NM_001199206 390243 Hs.553758 NM_001080486 ENSG00000183560 IZUMO1R FOLR4|Folbp3|JUNO IZUMO1 receptor, JUNO protein-coding 367.333-21 chr9 26673830 26674234 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 218770 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 336-24 chr4 44666012 44666368 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -12205 NM_001345868 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 209.333-141 chr22 26496287 26496565 + 1.33333 NA intron (NM_001346861, intron 11 of 14) intron (NM_001346861, intron 11 of 14) 12549 NM_001013694 402055 Hs.709914 NM_001013694 ENSG00000100104 SRRD HC/HCC|SRR1L SRR1 domain containing protein-coding 372 chr1 18887646 18888124 + 1.33333 NA intron (NM_001161504, intron 3 of 14) LTR46|LTR|ERV1 3006 NM_001161504 8659 Hs.77448 NM_003748 ENSG00000159423 ALDH4A1 ALDH4|P5CD|P5CDh aldehyde dehydrogenase 4 family member A1 protein-coding 244-100 chr9 123854242 123854656 + 1.33333 NA intron (NM_001352968, intron 2 of 18) AluSx|SINE|Alu 75677 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 227.333-91 chr4 78316877 78317167 + 1.33333 NA intron (NM_001166133, intron 16 of 41) MIRb|SINE|MIR 28037 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 199-112 chr8 54012740 54012902 + 1.33333 NA intron (NM_006756, intron 1 of 9) AluJr4|SINE|Alu 9627 NR_109902 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 181-27 chr15 26766645 26766905 + 1.33333 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) intron (NM_001278631, intron 3 of 9) 6291 NM_000814 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 329.999 chr1 44496674 44496986 + 1.33333 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) -48663 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 257.666-15 chr4 30872123 30872451 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) MER58B|DNA|hAT-Charlie 151918 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 252.333-48 chr4 33163461 33163858 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 812621 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 142.667-10 chr1 209336372 209336551 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 11005 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 215.333 chr1 8757450 8757619 + 1.33333 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) intron (NM_001042681, intron 1 of 22) 60106 NM_012102 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 230.999-5 chr8 81610788 81611030 + 1.33333 NA intron (NR_146081, intron 7 of 7) intron (NR_146081, intron 7 of 7) 20368 NR_146081 650747 NR_146081 IMPA1P1 IMPA1P inositol monophosphatase 1 pseudogene 1 pseudo 314.999 chr1 68515880 68516254 + 1.33333 NA intron (NR_110671, intron 1 of 2) intron (NR_110671, intron 1 of 2) -18985 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 202.667-61 chr16 56455915 56456206 + 1.33333 NA intron (NM_001324363, intron 2 of 11) L2-3_Crp|LINE|L2 3976 NM_001324358 55239 Hs.231883 NM_018233 ENSG00000087263 OGFOD1 TPA1 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 1 protein-coding 234.666-34 chr4 48951900 48952101 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -34275 NM_025087 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 189.333-135 chr3 139523380 139523549 + 1.33333 NA TTS (NM_001130993) TTS (NM_001130993) 16172 NM_001365940 5947 Hs.529571 NM_002899 ENSG00000114115 RBP1 CRABP-I|CRBP|CRBP1|CRBPI|RBPC retinol binding protein 1 protein-coding 222.333-91 chr8 53976185 53976447 + 1.33333 NA intron (NM_201437, intron 7 of 8) intron (NM_201437, intron 7 of 8) 46132 NR_109902 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 217.333-142 chr7 123233838 123234014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33955 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 285.333-74 chr8 138628431 138628705 + 1.33333 NA intron (NM_152888, intron 50 of 64) intron (NM_152888, intron 50 of 64) -130838 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 265.666-23 chr6 157787153 157787492 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -35924 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 222.667-50 chr22 19253664 19253939 + 1.33333 NA intron (NM_007098, intron 3 of 32) FRAM|SINE|Alu 37918 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 237.667-10 chr10 86381391 86381752 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -14776 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 144-71 chr2 26117230 26117385 + 1.33333 NA intron (NM_016131, intron 3 of 5) intron (NM_016131, intron 3 of 5) -55781 NM_001168241 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 277.666-4 chr10 106090827 106091270 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49117 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 194.667-173 chrX 147069035 147069277 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 120631 NR_031709 100302114 NR_031709 ENSG00000216171 MIR513C MIRN513C|hsa-mir-513c microRNA 513c ncRNA 313.333-45 chr8 89070559 89070920 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 686972 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 200.667-172 chrX 19988153 19988417 + 1.33333 NA intron (NR_024440, intron 1 of 1) intron (NR_024440, intron 1 of 1) 1494 NR_024440 729609 Hs.554726 NR_024440 LOC729609 - uncharacterized LOC729609 ncRNA 216-17 chr11 79004025 79004293 + 1.33333 NA intron (NM_001098816, intron 6 of 33) L1PA13|LINE|L1 397950 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 214-86 chr3 78719766 78720067 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 5 of 30) L1ME4a|LINE|L1 299543 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 204.667-24 chr11 91661601 91661901 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -563283 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 224.666-10 chr14 68178516 68178736 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 355034 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 209.666-14 chr11 34668403 34668569 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35920 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 219.666-44 chr8 120960306 120960519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -148366 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 206-67 chr2 11256122 11256358 + 1.33333 NA intron (NM_001321643, intron 3 of 32) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 88396 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 400.333-11 chr21 31238687 31239153 + 1.33333 NA intron (NM_001353686, intron 6 of 27) intron (NM_001353686, intron 6 of 27) -77980 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 197.333-202 chr6 132136142 132136413 + 1.33333 NA intron (NR_038981, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 2299 NR_038981 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 222-17 chr11 77665846 77666051 + 1.33333 NA TTS (NM_016578) TTS (NM_016578) -28142 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 292.667-18 chr2 79395130 79395541 + 1.33333 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 105509 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 205-43 chr18 3904807 3905018 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 19559 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 228.666-27 chr22 44787829 44788099 + 1.33333 NA intron (NM_181335, intron 2 of 11) intron (NM_181335, intron 2 of 11) 35406 NM_001198726 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 204.333-40 chr11 115224101 115224381 + 1.33333 NA intron (NM_001098517, intron 5 of 8) intron (NM_001098517, intron 5 of 8) -109336 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 371-8 chr17 49800152 49800613 + 1.33333 NA intron (NM_007067, intron 4 of 14) intron (NM_007067, intron 4 of 14) 11701 NM_001199157 11143 Hs.21907 NM_007067 ENSG00000136504 KAT7 HBO1|HBOA|MYST2|ZC2HC7 lysine acetyltransferase 7 protein-coding 233.333-22 chr10 90778577 90778844 + 1.33333 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) intron (NM_019860, intron 1 of 2) 79329 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 195-14 chr10 20205658 20205892 + 1.33333 NA intron (NM_032812, intron 9 of 13) intron (NM_032812, intron 9 of 13) -346195 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 315.999-2 chr20 38877289 38877597 + 1.33333 NA intron (NM_015568, intron 2 of 10) AluSq2|SINE|Alu -48974 NM_030919 81610 Hs.726442 NM_030919 ENSG00000101447 FAM83D C20orf129|CHICA|dJ616B8.3 family with sequence similarity 83 member D protein-coding 248-11 chr11 12092135 12092400 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18309 NM_001282668 9645 Hs.501928 NM_014632 ENSG00000133816 MICAL2 MICAL-2|MICAL2PV1|MICAL2PV2 microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2 protein-coding 222.333-23 chr12 12101252 12101424 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -10614 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 238.666 chr1 52282574 52282769 + 1.33333 NA intron (NM_007324, intron 9 of 17) intron (NM_007324, intron 9 of 17) 83534 NM_032449 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 261.333-80 chr4 116004932 116005298 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -294610 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 194-115 chr5 147079235 147079516 + 1.33333 NA intron (NM_181677, intron 2 of 10) L1MA6|LINE|L1 2095 NM_181678 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 171-55 chr3 173331682 173331863 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -64180 NM_001365930 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 199.666-51 chr6 73603577 73603795 + 1.33333 NA intron (NM_012434, intron 9 of 10) AluSq2|SINE|Alu 50306 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 288.667-4 chr10 116844049 116844428 + 1.33333 NA intron (NM_001330164, intron 1 of 12) intron (NM_001330164, intron 1 of 12) -5261 NM_001242699 387712 Hs.693248 NM_001242699 ENSG00000188316 ENO4 C10orf134 enolase 4 protein-coding 179-50 chr19 28778567 28778751 + 1.33333 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -50965 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 196.333-145 chr5 120578019 120578194 + 1.33333 NA intron (NM_001308088, intron 1 of 3) intron (NM_001308088, intron 1 of 3) 46642 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 209-46 chr15 37560115 37560358 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -374371 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 208.333-2 chr1 26789608 26789822 + 1.33333 NA intron (NM_001202554, intron 1 of 3) intron (NM_001202554, intron 1 of 3) 1527 NM_001202554 55650 Hs.259605 NM_017837 ENSG00000060642 PIGV GPI-MT-II|HPMRS1|PIG-V phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class V protein-coding 134.666 chr10 29741084 29741277 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4244 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 246.666-41 chr9 108245866 108246126 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 609990 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 346-16 chr2 148781660 148782084 + 1.33333 NA intron (NM_015630, intron 11 of 13) intron (NM_015630, intron 11 of 13) -93355 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 203.333-141 chr2 114978462 114978765 + 1.33333 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -85960 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 415.333-12 chr7 2325417 2325891 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -11213 NM_013321 29886 Hs.584900 NM_013321 ENSG00000106266 SNX8 Mvp1 sorting nexin 8 protein-coding 190.666-17 chr14 57572546 57572705 + 1.33333 NA intron (NM_001306087, intron 4 of 7) intron (NM_001306087, intron 4 of 7) -78768 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 168-6 chr1 167691548 167691807 + 1.33333 NA intron (NM_001322923, intron 3 of 5) intron (NM_001322923, intron 3 of 5) -30305 NM_003953 9019 Hs.493919 NM_003953 ENSG00000197965 MPZL1 MPZL1b|PZR|PZR1b|PZRa|PZRb myelin protein zero like 1 protein-coding 231.333-99 chr6 5407307 5407529 + 1.33333 NA intron (NM_006567, intron 3 of 6) L1ME1|LINE|L1 50657 NR_125847 101927972 Hs.668417 NR_125846 ENSG00000269985 LOC101927972 - uncharacterized LOC101927972 ncRNA 193.333-104 chr2 182816649 182816837 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49894 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 178.333-109 chr3 116130005 116130380 + 1.33333 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -225066 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 342.333-24 chr4 114735131 114735407 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 78510 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 230.666-42 chr5 19072309 19072544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 813846 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 373.333-9 chr14 72570438 72570896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53847 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 294.333-10 chr12 62734596 62734880 + 1.33333 NA intron (NM_020700, intron 5 of 9) intron (NM_020700, intron 5 of 9) 131052 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 348.666-13 chr3 163118333 163118938 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184666 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 199.667-4 chr1 68121021 68121362 + 1.33333 NA non-coding (NR_040077, exon 8 of 10) non-coding (NR_040077, exon 8 of 10) 62419 NR_031664 100302279 NR_031664 ENSG00000221203 MIR1262 MIRN1262|hsa-mir-1262|mir-1262 microRNA 1262 ncRNA 234-30 chr18 27475223 27475545 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -132728 NR_134589 105372038 Hs.722107 NR_134589 ENSG00000264151 LOC105372038 - uncharacterized LOC105372038 ncRNA 189.667-50 chr15 69206281 69206533 + 1.33333 NA intron (NM_001324094, intron 2 of 5) L1MD3|LINE|L1 45772 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 360.666-16 chr8 88567153 88567674 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -239930 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 275.666-5 chr17 55912418 55912851 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 161529 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 199.667-146 chr8 136791181 136791476 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 3 of 5) intron (NR_147196, intron 3 of 5) 260530 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 189-66 chr3 176132341 176132531 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -112115 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 196.333-78 chr2 14963865 14964111 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 331271 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 114.333-83 chr16 80766267 80766358 + 1.33333 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 38286 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 331-15 chr14 72611757 72612137 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 95127 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 207-8 chr1 214271020 214271184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10057 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 261.333-43 chr2 19946099 19946359 + 1.33333 NA intron (NM_001006657, intron 16 of 27) intron (NM_001006657, intron 16 of 27) 43876 NM_001006657 57539 Hs.205427 NM_020779 ENSG00000118965 WDR35 CED2|IFT121|IFTA1|SRTD7 WD repeat domain 35 protein-coding 309.667-12 chr2 237044855 237045250 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11115 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 531.333 chr2 222834849 222835629 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25797 NM_004457 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 153.333-403 chr8 59601945 59602146 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 482835 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 265.333-25 chr14 76176843 76177210 + 1.33333 NA intron (NM_001322028, intron 6 of 9) intron (NM_001322028, intron 6 of 9) 22672 NM_017972 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 170.666-6 chr10 125612308 125612473 + 1.33333 NA intron (NM_001318133, intron 3 of 3) intron (NM_001318133, intron 3 of 3) 38019 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 196.333-7 chr1 163183087 163183264 + 1.33333 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) intron (NM_001254748, intron 2 of 5) 19741 NM_001254749 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 212-156 chr8 137255091 137255360 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 158363 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 436.666-2 chr1 161870944 161871396 + 1.33333 NA intron (NM_007348, intron 14 of 15) intron (NM_007348, intron 14 of 15) 104850 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 220.333-134 chr8 121896971 121897232 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -255661 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 292-50 chr7 83281651 83282023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -118953 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 211.333-17 chr1 198287586 198287745 + 1.33333 NA intron (NM_133494, intron 7 of 9) intron (NM_133494, intron 7 of 9) 130667 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 313.333-50 chr8 142441949 142442289 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7530 NM_001702 575 Hs.194654 NM_001702 ENSG00000181790 ADGRB1 BAI1|GDAIF adhesion G protein-coupled receptor B1 protein-coding 204.666-68 chr5 54187445 54187636 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 1 of 4) intron (NM_019087, intron 1 of 4) 123033 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 189.333-187 chr7 28579257 28579489 + 1.33333 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -106760 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 237.333-55 chr2 73048713 73049055 + 1.33333 NA intron (NM_001330406, intron 2 of 14) L1MC4|LINE|L1 10288 NM_001330407 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 263.333-74 chr6 74516673 74517002 + 1.33333 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 447386 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 294.666-10 chr14 63792003 63792391 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -60768 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 178.667-85 chr2 170751483 170751714 + 1.33333 NA intron (NR_110185, intron 1 of 5) L1MEc|LINE|L1 -19084 NM_001290031 285141 Hs.443729 NM_001289947 ENSG00000204334 ERICH2 - glutamate rich 2 protein-coding 244-97 chr8 29212757 29213110 + 1.33333 NA intron (NM_015254, intron 2 of 39) intron (NM_015254, intron 2 of 39) 50137 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 153.333-21 chr1 147096108 147096323 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -11459 NR_121645 101447996 NR_121645 ENSG00000286172 RNVU1-8 RNU1-145|vU1.8 RNA, variant U1 small nuclear 8 snRNA 348.333-5 chr1 238930451 238930800 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -444608 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 189.333-180 chr6 141605034 141605244 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 483660 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 202.666-119 chr7 77841714 77841894 + 1.33333 NA intron (NM_001366085, intron 2 of 10) intron (NM_001366085, intron 2 of 10) 1674 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 200.667-86 chr2 181024742 181024981 + 1.33333 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) intron (NM_001278555, intron 3 of 5) 43737 NM_001278554 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 179.333-30 chr10 104153094 104153275 + 1.33333 NA intron (NM_025145, intron 27 of 37) intron (NM_025145, intron 27 of 37) 31013 NM_001002759 119392 Hs.93667 NM_145247 ENSG00000156384 SFR1 C10orf78|MEI5|MEIR5|bA373N18.1 SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 protein-coding 214-47 chr17 48502011 48502192 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 28910 NM_002144 3211 Hs.99992 NM_002144 ENSG00000120094 HOXB1 HCFP3|HOX2|HOX2I|Hox-2.9 homeobox B1 protein-coding 206.666-50 chr18 2472840 2473003 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 98584 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 154.666-8 chr4 103112203 103112326 + 1.33333 NA intron (NM_001813, intron 46 of 48) intron (NM_001813, intron 46 of 48) -12430 NM_020139 56898 Hs.124696 NM_020139 ENSG00000164039 BDH2 DHRS6|EFA6R|PRO20933|SDR15C1|UCPA-OR|UNQ6308 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 2 protein-coding 178.666-18 chr5 174823039 174823208 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 71389 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 203-102 chr7 89774452 89774735 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -344807 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 215.666-2 chr1 200450067 200450332 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40163 NM_001281294 23528 Hs.59757 NM_012482 ENSG00000162702 ZNF281 ZBP-99|ZNP-99 zinc finger protein 281 protein-coding 194-55 chr17 20049563 20049717 + 1.33333 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) intron (NM_001243439, intron 1 of 14) -37382 NM_152904 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 200-155 chr7 64498272 64498494 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 64688 NM_178558 340252 Hs.520886 NM_178558 ENSG00000173041 ZNF680 - zinc finger protein 680 protein-coding 262-13 chr12 28604808 28605061 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -414196 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 143.333-28 chr10 27238180 27238323 + 1.33333 NA intron (NM_001271512, intron 1 of 11) AluY|SINE|Alu 2235 NM_001301252 91452 Hs.530597 NM_145698 ENSG00000107897 ACBD5 - acyl-CoA binding domain containing 5 protein-coding 116.666-4 chr8 136704410 136704524 + 1.33333 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 173669 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 162.333-252 chr8 79293561 79293784 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38516 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 214.333-105 chr4 63651584 63651872 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 757722 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 234.666-46 chr7 77648104 77648341 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 48043 NR_134253 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 247.666-25 chr4 79615799 79616007 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 123310 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 241.333-65 chr3 13738649 13738864 + 1.33333 NA intron (NR_027103, intron 5 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 88035 NR_027103 285375 Hs.319969 NR_027103 ENSG00000224514 LINC00620 - long intergenic non-protein coding RNA 620 ncRNA 201-54 chr2 78543653 78543888 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -1761 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 226.667-73 chr5 41156459 41156744 + 1.33333 NA intron (NM_000065, intron 13 of 17) intron (NM_000065, intron 13 of 17) 56931 NM_000065 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 290.999 chr1 218296186 218296626 + 1.33333 NA intron (NM_016052, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 11113 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 212.333-160 chrX 138435463 138435639 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 232242 NR_030229 574507 NR_030229 ENSG00000207800 MIR504 MIRN504|hsa-mir-504|mir-504 microRNA 504 ncRNA 220-40 chr15 77728569 77728949 + 1.33333 NA intron (NM_001301192, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR -8008 NM_001301197 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 219.333-142 chr5 41304517 41304744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43161 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 249.999-8 chr5 32105307 32105518 + 1.33333 NA intron (NM_178140, intron 24 of 24) L1ME3Cz|LINE|L1 68907 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 204-33 chr10 118811894 118812149 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -57051 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 241.333-90 chr6 155325070 155325325 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -10713 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 142-63 chr2 76545178 76545395 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -440679 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 210.666-45 chr16 79902690 79902915 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 107553 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 223.999-6 chr15 59716611 59716789 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27380 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 184-2 chr1 45857055 45857310 + 1.33333 NA intron (NM_001324320, intron 3 of 29) L2a|LINE|L2 -7166 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 123.333-178 chr5 157366288 157366433 + 1.33333 NA intron (NR_136205, intron 1 of 2) L1ME2z|LINE|L1 -20683 NM_001001343 408263 Hs.437066 NM_001001343 ENSG00000172568 FNDC9 C5orf40 fibronectin type III domain containing 9 protein-coding 229.333-93 chr5 5799871 5800094 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 377305 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 264.333-24 chr15 58644981 58645300 + 1.33333 NA intron (NM_001110, intron 6 of 15) intron (NM_001110, intron 6 of 15) 48467 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 167.333-216 chr5 125791080 125791258 + 1.33333 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 297908 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 161.333-154 chr2 123875292 123875492 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 149782 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 206-37 chr11 106255053 106255312 + 1.33333 NA intron (NR_120551, intron 3 of 4) intron (NR_120551, intron 3 of 4) 3775 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 313.666 chr1 114713077 114713558 + 1.33333 NA intron (NM_002524, intron 3 of 6) AluJo|SINE|Alu 3454 NM_002524 4893 Hs.486502 NM_002524 ENSG00000213281 NRAS ALPS4|CMNS|N-ras|NCMS|NRAS1|NS6 NRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 243-30 chr2 80051832 80052249 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -185457 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 273.333-64 chr5 139900134 139900388 + 1.33333 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 104453 NM_032289 84249 Hs.21963 NM_032289 ENSG00000146005 PSD2 EFA6C pleckstrin and Sec7 domain containing 2 protein-coding 218.666-15 chr11 47483804 47484062 + 1.33333 NA intron (NM_198700, intron 5 of 13) intron (NM_198700, intron 5 of 13) 5091 NM_001172640 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 233-36 chr2 26414926 26415260 + 1.33333 NA intron (NM_145038, intron 2 of 16) intron (NM_145038, intron 2 of 16) 13173 NM_145038 92749 Hs.393714 NM_145038 ENSG00000157856 DRC1 C2orf39|CCDC164|CILD21 dynein regulatory complex subunit 1 protein-coding 181.667-38 chr14 63174334 63174594 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29979 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 290.333-18 chr18 2180588 2181103 + 1.33333 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 390660 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 219.333-107 chr20 63501330 63501514 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -2339 NM_001958 1917 Hs.433839 NM_001958 ENSG00000101210 EEF1A2 EEF1AL|EF-1-alpha-2|EF1A|EIEE33|HS1|MRD38|STN|STNL eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2 protein-coding 187.667-26 chr12 33015668 33016014 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -118995 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 172.666 chr1 174468738 174468926 + 1.33333 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) L2b|LINE|L2 20868 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 220.666-20 chr14 51488213 51488412 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001042481) promoter-TSS (NM_001042481) -816 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 237.333-18 chr11 9838874 9839160 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_120539) promoter-TSS (NR_120539) -125 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 218-78 chr4 39874107 39874407 + 1.33333 NA intron (NM_001100399, intron 20 of 32) intron (NM_001100399, intron 20 of 32) 103654 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 294.667-55 chr8 117947273 117947651 + 1.33333 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -26549 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 386.333-3 chr15 71128724 71129178 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12498 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 255-6 chr1 111152345 111152812 + 1.33333 NA intron (NM_001007794, intron 2 of 8) L1ME3C|LINE|L1 12355 NR_138483 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 244.667-31 chr12 43593159 43593453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41103 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 310.666-3 chr1 241495449 241495798 + 1.33333 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 24162 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 295.333-53 chr7 17827865 17828296 + 1.33333 NA intron (NR_146932, intron 15 of 24) intron (NR_146932, intron 15 of 24) 112414 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 350.666-18 chr5 155137824 155138233 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 124273 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 227.666-4 chr10 36477421 36477671 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -648311 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 207.333-114 chr17 14441637 14441902 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 138029 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 428.667-6 chr15 76386690 76387295 + 1.33333 NA intron (NR_148227, intron 28 of 32) L2a|LINE|L2 50219 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 143-16 chr10 56897293 56897430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 407198 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 220.667-52 chr2 178315991 178316294 + 1.33333 NA intron (NM_001201480, intron 3 of 25) intron (NM_001201480, intron 3 of 25) -4100 NM_145739 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 272.666-15 chr4 70923191 70923473 + 1.33333 NA intron (NM_173468, intron 1 of 5) MER51-int|LTR|ERV1 20963 NM_173468 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 235.333-103 chr5 159221873 159222049 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5754 NR_134261 105377682 NR_134261 ENSG00000253315 LINC01932 - long intergenic non-protein coding RNA 1932 ncRNA 211-20 chr11 73634192 73634416 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12277 NM_021200 58473 Hs.445489 NM_021200 ENSG00000021300 PLEKHB1 KPL1|PHR1|PHRET1 pleckstrin homology domain containing B1 protein-coding 244.667-62 chr20 19446041 19446382 + 1.33333 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) intron (NM_020689, intron 2 of 16) -161615 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 176-54 chr20 38794860 38795082 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -10726 NM_015568 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 202.666-84 chr4 28448701 28448867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -370798 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 250-86 chr8 69973780 69974114 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97305 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 212.666-92 chr8 83244276 83244440 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -159400 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 221.333-33 chr13 55218191 55218469 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 43876 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 205.333-48 chr11 107111802 107112057 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -93453 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 190.333-22 chr10 94260738 94260985 + 1.33333 NA intron (NM_001165979, intron 12 of 31) L1MC2|LINE|L1 26209 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 312.666-19 chr3 190784226 190784565 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 78299 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 191.667-20 chr10 116447916 116448170 + 1.33333 NA intron (NM_001011709, intron 4 of 11) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 20196 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 194.667-38 chr14 31560781 31561057 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_025152) promoter-TSS (NM_025152) -485 NM_025152 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 334.666-12 chr5 167769459 167769772 + 1.33333 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) intron (NM_001080428, intron 1 of 24) 14686 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 151.333-169 chr17 29646191 29646412 + 1.33333 NA intron (NM_033389, intron 13 of 14) intron (NM_033389, intron 13 of 14) -24878 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 194-153 chr9 112626346 112626607 + 1.33333 NA intron (NM_001287036, intron 3 of 4) intron (NM_001287036, intron 3 of 4) 91641 NM_021218 58493 Hs.658575 NM_021218 ENSG00000148153 INIP C9orf80|HSPC043|MISE|SOSSC|SSBIP1|hSSBIP1 INTS3 and NABP interacting protein protein-coding 161.667-65 chr13 104078046 104078194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 652920 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 182.666-38 chr7 70519949 70520124 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) L1M4|LINE|L1 -612108 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 252.667-48 chr2 61040874 61041235 + 1.33333 NA intron (NM_002618, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu -22795 NM_001322127 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 174-65 chr3 98896179 98896424 + 1.33333 NA intron (NM_080927, intron 1 of 15) intron (NM_080927, intron 1 of 15) 5394 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 195.667-45 chr14 67810046 67810276 + 1.33333 NA intron (NM_015346, intron 3 of 41) intron (NM_015346, intron 3 of 41) 6429 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 220.333-132 chr8 112638778 112639105 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 18 of 66) intron (NM_001363185, intron 18 of 66) -4552 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 138-117 chr8 100030152 100030281 + 1.33333 NA intron (NM_015668, intron 14 of 27) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 25634 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 203.333-34 chr10 82383385 82383591 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -150568 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 305.666-12 chr18 7670358 7670802 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 103264 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 244.666-2 chr1 92163565 92163836 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5224 NM_015237 23285 Hs.21554 NM_015237 ENSG00000189195 KIAA1107 - KIAA1107 protein-coding 255.666-25 chr7 39131313 39131748 + 1.33333 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -117963 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 193-61 chr3 165375645 165375978 + 1.33333 NA intron (NR_125764, intron 2 of 5) intron (NR_125764, intron 2 of 5) 168851 NR_125764 103695433 Hs.570689 NR_125764 LINC01322 - long intergenic non-protein coding RNA 1322 ncRNA 211.999-2 chr10 17031042 17031227 + 1.33333 NA intron (NM_001081, intron 27 of 66) intron (NM_001081, intron 27 of 66) 98683 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 188-109 chr8 18295464 18295642 + 1.33333 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 73885 NM_001160174 9 Hs.591847 NM_000662 ENSG00000171428 NAT1 AAC1|MNAT|NAT-1|NATI N-acetyltransferase 1 protein-coding 425.333-4 chr13 37420649 37421187 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63866 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 469 chr12 17074338 17074931 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 85887 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 139-31 chr13 111043112 111043267 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -52649 NR_120415 101927802 Hs.559193 NR_120415 LINC00368 - long intergenic non-protein coding RNA 368 ncRNA 247.666-19 chr22 26228260 26228543 + 1.33333 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 58927 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 314.666-26 chr3 186575256 186575604 + 1.33333 NA intron (NM_016306, intron 2 of 9) intron (NM_016306, intron 2 of 9) 4754 NM_016306 51726 Hs.317192 NM_016306 ENSG00000090520 DNAJB11 ABBP-2|ABBP2|DJ9|Dj-9|EDJ|ERdj3|ERj3|ERj3p|PKD6|PRO1080|UNQ537 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B11 protein-coding 209.333-7 chr1 104551721 104551927 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 478801 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 202.666-59 chr2 12839366 12839562 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 102097 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 294.333-21 chr2 40665759 40666200 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -153544 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 141-61 chr4 94420908 94421050 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30878 NM_001256426 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 192-133 chr7 33770282 33770471 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -134539 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 208.666-77 chr4 33772246 33772433 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 267554 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 214-103 chr5 11441719 11441973 + 1.33333 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 147071 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 338.666-3 chr12 19284215 19284500 + 1.33333 NA intron (NM_001256787, intron 9 of 25) AluSz|SINE|Alu 79032 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 369.333-22 chr5 152384277 152384598 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20842 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 140.333-72 chr15 68536920 68537118 + 1.33333 NA intron (NM_001324014, intron 2 of 12) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 18646 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 240.666-34 chr5 130488562 130488771 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 584201 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 214.667-41 chr14 72001066 72001352 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 67682 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 256.333-4 chr1 71752029 71752359 + 1.33333 NA intron (NM_173808, intron 3 of 6) intron (NM_173808, intron 3 of 6) 84818 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 191.666-16 chr4 139600752 139601030 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -44122 NM_030648 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 195-16 chr10 55448102 55448368 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -150807 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 210.333-35 chr12 128259755 128259950 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7551 NM_001136103 92293 Hs.49599 NM_001136103 ENSG00000181234 TMEM132C PPP1R152 transmembrane protein 132C protein-coding 328.333-14 chr15 55692349 55692709 + 1.33333 NA intron (NM_173814, intron 2 of 19) intron (NM_173814, intron 2 of 19) 50623 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 237.999-2 chr14 52936845 52937041 + 1.33333 NA intron (NM_006832, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu 14107 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 225.999-7 chr2 156862807 156862993 + 1.33333 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -394805 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 252.667-100 chr8 71895073 71895481 + 1.33333 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) L1MD3|LINE|L1 -50781 NM_005098 9242 Hs.442619 NM_005098 ENSG00000178860 MSC ABF-1|ABF1|MYOR|bHLHa22 musculin protein-coding 185.667-100 chr5 42291859 42292080 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -116624 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 178.666-13 chr21 25426355 25426547 + 1.33333 NA intron (NR_024027, intron 2 of 4) intron (NR_024027, intron 2 of 4) 5250 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 225-33 chr2 42677959 42678261 + 1.33333 NA intron (NM_001330444, intron 8 of 15) intron (NM_001330444, intron 8 of 15) 86151 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 223.667-74 chr6 157456319 157456611 + 1.33333 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) intron (NM_024630, intron 1 of 8) -72667 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 210-83 chr20 56899716 56899971 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 270537 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 230.333-5 chr1 109271632 109271870 + 1.33333 NA intron (NM_001408, intron 28 of 33) intron (NM_001408, intron 28 of 33) 11393 NM_001350237 84722 Hs.405925 NM_032636 ENSG00000134222 PSRC1 DDA3|FP3214 proline and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 192.666-66 chr9 31400871 31401186 + 1.33333 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -19538 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 136-49 chr2 69623802 69623998 + 1.33333 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) L1ME4b|LINE|L1 19839 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 139.333-211 chr8 41786779 41786972 + 1.33333 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) intron (NM_001142446, intron 1 of 42) 10747 NM_020476 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 227.333-30 chr12 55498854 55499080 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 6589 NM_001005519 403284 Hs.626886 NM_001005519 ENSG00000205327 OR6C68 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 68 protein-coding 201.666-36 chr6 35324932 35325150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17517 NM_001171818 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 268-21 chr15 98784222 98784479 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_039864) promoter-TSS (NR_039864) -76 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 270-27 chr2 25561208 25561529 + 1.33333 NA intron (NM_001320937, intron 8 of 8) L2|LINE|L2 88854 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 210.666-21 chr11 95503216 95503428 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -270847 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 268-7 chr10 55244359 55244750 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -354488 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 181.666-23 chr9 26940280 26940447 + 1.33333 NA intron (NM_001321546, intron 1 of 12) L1MB3|LINE|L1 -6627 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 157-36 chr12 123474069 123474296 + 1.33333 NA intron (NM_178314, intron 6 of 6) AluSq2|SINE|Alu 14478 NM_180699 11066 Hs.632738 NM_007020 ENSG00000184209 SNRNP35 HM-1|U1SNRNPBP small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 35 protein-coding 194-54 chr16 78853113 78853268 + 1.33333 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 747547 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 266-11 chr10 63741979 63742339 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -220269 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 209-23 chr11 94811214 94811483 + 1.33333 NA intron (NM_130847, intron 3 of 12) AluSx|SINE|Alu 42992 NM_001301007 154810 Hs.503594 NM_130847 ENSG00000166025 AMOTL1 JEAP angiomotin like 1 protein-coding 387.333-3 chr14 58417789 58418195 + 1.33333 NA intron (NM_001304487, intron 1 of 3) L1MD1|LINE|L1 9250 NM_001304486 26520 Hs.440525 NM_012460 ENSG00000100575 TIMM9 TIM9|TIM9A translocase of inner mitochondrial membrane 9 protein-coding 242-16 chr10 66683050 66683359 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -242832 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 270.666-29 chr9 90529912 90530226 + 1.33333 NA intron (NR_034157, intron 1 of 5) intron (NR_034157, intron 1 of 5) 52677 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 188.666-32 chr5 110806276 110806652 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67457 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 147.666-6 chr4 92895949 92896059 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 591605 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 209.666-10 chr10 19121479 19121837 + 1.33333 NA intron (NM_001142308, intron 5 of 39) L2a|LINE|L2 72857 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 194.333-65 chr2 63221343 63221577 + 1.33333 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) intron (NR_148705, intron 13 of 16) -101918 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 288.666-15 chr2 79225344 79225670 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -65754 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 215.333-180 chr7 3447892 3448075 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) AluSp|SINE|Alu 146731 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 147.333-28 chr1 224392678 224392839 + 1.33333 NA intron (NM_025160, intron 13 of 13) intron (NM_025160, intron 13 of 13) 5553 NR_039896 100616468 NR_039896 ENSG00000266618 MIR4742 mir-4742 microRNA 4742 ncRNA 294.333-40 chr6 124265685 124266228 + 1.33333 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -17049 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 198.666-11 chr11 100497722 100497872 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -189491 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 179.666-3 chr13 49632779 49632924 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_138450, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_138450, exon 2 of 2) 4344 NM_138450 115761 Hs.558599 NM_138450 ENSG00000152213 ARL11 ARLTS1 ADP ribosylation factor like GTPase 11 protein-coding 210-29 chr12 14347332 14347494 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -18219 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 162.667-11 chr1 181589688 181589884 + 1.33333 NA intron (NM_001205293, intron 6 of 47) intron (NM_001205293, intron 6 of 47) 106269 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 260.333-54 chr6 61991386 61991596 + 1.33333 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) intron (NR_146874, intron 3 of 13) 294734 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 268.666-25 chr4 144254861 144255108 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -114266 NM_001308190 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 176-105 chr8 129660299 129660564 + 1.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 19808 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 211.333-104 chr2 32024518 32024687 + 1.33333 NA intron (NR_135587, intron 3 of 3) L1ME3A|LINE|L1 -13594 NR_126034 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 377.333-7 chr18 61996354 61996724 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -103532 NM_173557 220441 Hs.165062 NM_173557 ENSG00000176641 RNF152 - ring finger protein 152 protein-coding 307.666-7 chr17 68933410 68933854 + 1.33333 NA intron (NM_001288985, intron 5 of 39) intron (NM_001288985, intron 5 of 39) 21760 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 190-35 chr14 69102578 69102787 + 1.33333 NA intron (NM_003861, intron 5 of 8) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 49917 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 128.333-58 chr14 59803345 59803527 + 1.33333 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 67340 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 228.666-36 chr4 139375913 139376130 + 1.33333 NA intron (NM_057175, intron 15 of 19) intron (NM_057175, intron 15 of 19) -73470 NM_001184987 4717 Hs.84549 NM_002494 ENSG00000109390 NDUFC1 KFYI NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C1 protein-coding 190.666-45 chr5 103584674 103584981 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22038 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 222-79 chr6 35550529 35550818 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -37777 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 172.666-28 chr9 116032570 116032733 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107444 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 560-2 chr8 132254153 132254921 + 1.33333 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 -149272 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 201.666-27 chr20 20483856 20484022 + 1.33333 NA intron (NM_020343, intron 36 of 39) intron (NM_020343, intron 36 of 39) 115835 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 213.667-32 chr14 66512007 66512302 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 4747 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 211.333-81 chr16 89165091 89165373 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1151 NR_046200 400558 Hs.513818 NR_046200 ENSG00000205015 LINC02138 - long intergenic non-protein coding RNA 2138 ncRNA 342.666-18 chr4 52110723 52111160 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 59637 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 146.333-313 chr7 93075206 93075417 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 42668 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 276.333-63 chr8 120211937 120212260 + 1.33333 NA intron (NM_021110, intron 12 of 47) intron (NM_021110, intron 12 of 47) 86996 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 215.333-141 chr4 30434178 30434438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -286061 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 323-7 chr1 218933468 218933842 + 1.33333 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) L1PBa|LINE|L1 -15144 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 207-54 chr17 78464053 78464293 + 1.33333 NA intron (NM_173628, intron 56 of 80) intron (NM_173628, intron 56 of 80) -20737 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-67 chr17 56560146 56560506 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -33373 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 520.666-5 chr4 36148156 36148792 + 1.33333 NA exon (NM_015230, exon 17 of 33) exon (NM_015230, exon 17 of 33) 95465 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 192.667-145 chr6 20813728 20813991 + 1.33333 NA intron (NM_017774, intron 8 of 15) L1ME1|LINE|L1 279402 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 242.333-56 chr20 23358287 23358488 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_109884) promoter-TSS (NR_109884) -260 NR_109884 100505683 Hs.140295 NR_109884 ENSG00000232645 LINC01431 - long intergenic non-protein coding RNA 1431 ncRNA 349.333-3 chr1 96733641 96734116 + 1.33333 NA intron (NM_001300990, intron 2 of 12) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 11240 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 266.333-23 chr15 89604396 89604767 + 1.33333 NA intron (NM_001308025, intron 13 of 21) AluJo|SINE|Alu 28994 NM_001308025 90381 Hs.441708 NM_152259 ENSG00000140534 TICRR C15orf42|SLD3|Treslin TOPBP1 interacting checkpoint and replication regulator protein-coding 236.666-32 chr20 13582084 13582294 + 1.33333 NA intron (NM_017714, intron 5 of 13) L1M4|LINE|L1 56743 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 221.666-30 chr2 118465466 118465882 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 137292 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 177.666-13 chr2 225730070 225730226 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 329262 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 181.333-145 chr5 124699505 124699657 + 1.33333 NA intron (NM_020747, intron 2 of 8) intron (NM_020747, intron 2 of 8) 45531 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 208-124 chr4 71401921 71402118 + 1.33333 NA intron (NM_003759, intron 4 of 22) intron (NM_003759, intron 4 of 22) 62966 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 199.333-43 chr11 107347220 107347378 + 1.33333 NA intron (NM_152434, intron 14 of 17) intron (NM_152434, intron 14 of 17) 110547 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 216.667-111 chr9 31589943 31590243 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -208603 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 160.333-38 chr10 31392566 31392712 + 1.33333 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) 7116 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 194-98 chr4 20566075 20566279 + 1.33333 NA intron (NM_001289135, intron 25 of 35) intron (NM_001289135, intron 25 of 35) 37902 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 191-4 chr1 100857153 100857378 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 37577 NM_001033025 2135 Hs.357637 NM_001439 ENSG00000162694 EXTL2 EXTR2 exostosin like glycosyltransferase 2 protein-coding 156-66 chr2 22530676 22530807 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5738 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 249.666-22 chr2 113692061 113692414 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 29131 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 195.666-6 chr10 56310283 56310481 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 50877 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 189.333-128 chr3 44597681 44597858 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_173658, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_173658, exon 3 of 3) 12805 NM_173658 285349 Hs.733134 NM_173658 ENSG00000144792 ZNF660 - zinc finger protein 660 protein-coding 203.333-126 chr2 37683050 37683410 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10695 NM_001270436 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 444-9 chr8 89951331 89951916 + 1.33333 NA intron (NM_001024688, intron 12 of 16) intron (NM_001024688, intron 12 of 16) 33048 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 416.999-2 chr16 76388781 76389615 + 1.33333 NA intron (NR_136213, intron 3 of 23) intron (NR_136213, intron 3 of 23) 79346 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 243.666-22 chr21 25688752 25689012 + 1.33333 NA intron (NM_001270407, intron 2 of 8) intron (NM_001270407, intron 2 of 8) -46090 NM_001197297 2551 Hs.473470 NM_002040 ENSG00000154727 GABPA E4TF1-60|E4TF1A|NFT2|NRF2|NRF2A|RCH04A07 GA binding protein transcription factor subunit alpha protein-coding 325.333-5 chr10 41739686 41740027 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 628189 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 258.666-32 chr5 18957299 18957564 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 928841 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 196.667-13 chr10 43683912 43684160 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35155 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 212.333-77 chr2 182129707 182129983 + 1.33333 NA non-coding (NR_048566, exon 6 of 6) non-coding (NR_048566, exon 6 of 6) 112218 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 201.333-120 chr16 68784838 68785002 + 1.33333 NA intron (NM_001317185, intron 2 of 15) intron (NM_001317185, intron 2 of 15) 47628 NM_001317185 999 Hs.461086 NM_004360 ENSG00000039068 CDH1 Arc-1|BCDS1|CD324|CDHE|ECAD|LCAM|UVO cadherin 1 protein-coding 315.333-29 chr20 59876934 59877372 + 1.33333 NA intron (NM_014258, intron 33 of 44) intron (NM_014258, intron 33 of 44) 56484 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 152.666-10 chr8 75004313 75004514 + 1.33333 NA intron (NM_001286778, intron 1 of 13) (ATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 4258 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 264-20 chr14 63326911 63327172 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8106 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 207-58 chr18 12469139 12469309 + 1.33333 NA intron (NM_020148, intron 9 of 15) AluSz|SINE|Alu 36450 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 293.666-9 chr2 237907040 237907487 + 1.33333 NA intron (NM_001308353, intron 3 of 3) L1MCc|LINE|L1 47640 NM_005855 10267 Hs.471783 NM_005855 ENSG00000132329 RAMP1 - receptor activity modifying protein 1 protein-coding 171.333-6 chr1 97543714 97543899 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 12 of 22) intron (NM_000110, intron 12 of 22) -253115 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 264.333-33 chr18 2703970 2704347 + 1.33333 NA intron (NM_015295, intron 13 of 47) intron (NM_015295, intron 13 of 47) 48271 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 177-19 chr13 83348214 83348384 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 534094 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 219.333-182 chr8 77809965 77810285 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 359428 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 208.333-127 chr6 71552057 71552302 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 131152 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 157.333-120 chr15 61757906 61758064 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 28067 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 239-15 chr12 39719299 39719795 + 1.33333 NA intron (NR_135051, intron 12 of 18) AluJb|SINE|Alu 93364 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 195.333-107 chr2 40397603 40397806 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 32600 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 234.999 chr1 18262599 18262798 + 1.33333 NA intron (NM_032880, intron 2 of 9) intron (NM_032880, intron 2 of 9) 154900 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 228-45 chr2 129544505 129544814 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -270768 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 216.333-148 chr9 38321052 38321323 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -71515 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 209-35 chr13 35580103 35580375 + 1.33333 NA intron (NM_001204197, intron 5 of 17) intron (NM_001204197, intron 5 of 17) 103490 NM_001204197 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 192.333-169 chr8 81565785 81566019 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -34512 NM_001105281 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 128.666-5 chrX 69047183 69047357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118183 NM_001032396 64219 Hs.522679 NM_022368 ENSG00000181191 PJA1 PRAJA1|RNF70 praja ring finger ubiquitin ligase 1 protein-coding 202.667-131 chr6 165084457 165084721 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 225016 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 220.666-71 chr8 98892886 98893129 + 1.33333 NA intron (NM_001256312, intron 1 of 12) intron (NM_001256312, intron 1 of 12) 49603 NM_001256312 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 202.333-110 chr3 99857617 99857793 + 1.33333 NA intron (NM_001042459, intron 4 of 4) intron (NM_001042459, intron 4 of 4) 18468 NM_001370247 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 237.333-15 chr10 75938441 75938647 + 1.33333 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 155783 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 226.666-44 chr7 133269317 133269535 + 1.33333 NA intron (NM_021807, intron 1 of 17) MIRb|SINE|MIR 16348 NM_021807 60412 Hs.321273 NM_021807 ENSG00000131558 EXOC4 SEC8|SEC8L1|Sec8p exocyst complex component 4 protein-coding 218.333-111 chr6 161887445 161887655 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 416573 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 225.333-99 chr4 56605997 56606280 + 1.33333 NA Intergenic LTR6A|LTR|ERV1 50384 NM_139211 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 307.333-4 chr1 99990714 99991064 + 1.33333 NA intron (NM_001271685, intron 1 of 7) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 20372 NM_001271685 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 231.999-7 chr2 216143366 216143554 + 1.33333 NA intron (NM_021141, intron 13 of 20) intron (NM_021141, intron 13 of 20) 34112 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 340-2 chr1 75880663 75880953 + 1.33333 NA intron (NM_002440, intron 13 of 19) intron (NM_002440, intron 13 of 19) 51596 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 162-2 chr1 52144768 52145003 + 1.33333 NA intron (NM_007324, intron 1 of 17) intron (NM_007324, intron 1 of 17) 2791 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 198.666-44 chr2 119774334 119774505 + 1.33333 NA intron (NM_002830, intron 1 of 26) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 14497 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 188.666-4 chr10 94441569 94441714 + 1.33333 NA intron (NM_015188, intron 1 of 12) L1PA8|LINE|L1 39100 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 208-61 chr16 58710162 58710404 + 1.33333 NA intron (NM_001286220, intron 7 of 8) AluJb|SINE|Alu 24033 NM_002080 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 227.333-22 chr10 106236055 106236236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 95980 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 182-74 chr4 16423233 16423385 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 196646 NR_027697 202020 Hs.445315 NM_152684 ENSG00000263327 TAPT1-AS1 - TAPT1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 202.666-104 chr6 66241355 66241538 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 453567 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 120.333-114 chr2 208821057 208821228 + 1.33333 NA intron (NR_136588, intron 4 of 5) intron (NR_136588, intron 4 of 5) 278500 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 195.333-17 chr1 198969549 198969835 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -32263 NR_040073 100131234 Hs.711077 NR_040073 MIR181A1HG - MIR181A1 host gene ncRNA 142.667-154 chr4 46170816 46170980 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46844 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 316.333-5 chr12 18491088 18491410 + 1.33333 NA intron (NM_001288774, intron 19 of 32) MER102c|DNA|hAT-Charlie 229709 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 306-51 chr7 67534946 67535305 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 199149 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 351.333-14 chr19 38811511 38811891 + 1.33333 NA intron (NM_006149, intron 2 of 9) intron (NM_006149, intron 2 of 9) 1244 NM_006149 3960 Hs.5302 NM_006149 ENSG00000171747 LGALS4 GAL4|L36LBP galectin 4 protein-coding 213-64 chr4 93276472 93276885 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) L1MB7|LINE|L1 -552075 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 213.333-199 chr7 110137795 110138124 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -177746 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 221-53 chr4 125118572 125118823 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -197715 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 115.666-2 chr8 111484514 111484662 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 107949 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 326-21 chr2 60900772 60901122 + 1.33333 NA intron (NM_002908, intron 3 of 10) intron (NM_002908, intron 3 of 10) 19373 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 354.666-8 chr17 70882396 70882947 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 319508 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 204-95 chr2 70025106 70025393 + 1.33333 NA intron (NR_033872, intron 7 of 10) intron (NR_033872, intron 7 of 10) 61766 NR_033872 400960 Hs.683864 NR_033872 ENSG00000179818 PCBP1-AS1 - PCBP1 antisense RNA 1 ncRNA 274.666-7 chr11 114544713 114545202 + 1.33333 NA intron (NM_152315, intron 2 of 5) L1MC3|LINE|L1 14924 NM_001367953 120400 Hs.550126 NM_152315 ENSG00000095110 NXPE1 FAM55A neurexophilin and PC-esterase domain family member 1 protein-coding 207.999-5 chr5 82580401 82580558 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -259676 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 202-193 chr9 22065213 22065370 + 1.33333 NA intron (NR_047541, intron 5 of 5) intron (NR_047541, intron 5 of 5) -55978 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 160-94 chr5 27401148 27401290 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71073 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 423.332-2 chr6 61307841 61308190 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -266115 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 192.667-128 chr4 106485909 106486133 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 52397 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 197-127 chrX 85199405 85199612 + 1.33333 NA intron (NM_001367858, intron 2 of 11) L1MA3|LINE|L1 -11198 NR_110651 101928128 Hs.636014 NR_110651 LOC101928128 - uncharacterized LOC101928128 ncRNA 310-18 chr12 95265366 95265690 + 1.33333 NA intron (NR_147922, intron 5 of 12) intron (NR_147922, intron 5 of 12) -42892 NR_029895 442903 NR_029895 ENSG00000199172 MIR331 MIRN331|hsa-mir-331|mir-331 microRNA 331 ncRNA 165.333-34 chr10 112531583 112531828 + 1.33333 NA intron (NM_001365710, intron 4 of 7) intron (NM_001365710, intron 4 of 7) -84102 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 249.666-16 chr18 8086252 8086547 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 10 of 30) intron (NM_002845, intron 10 of 30) 280635 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 201.666-39 chr7 34585170 34585383 + 1.33333 NA intron (NR_033664, intron 2 of 4) intron (NR_033664, intron 2 of 4) -72942 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 291.333-43 chr3 45383067 45383447 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -5319 NM_015340 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 348.333-3 chr1 165885236 165885914 + 1.33333 NA intron (NM_001363568, intron 2 of 7) intron (NM_001363568, intron 2 of 7) -22346 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 436-6 chr2 32609546 32610125 + 1.33333 NA intron (NM_016252, intron 72 of 73) intron (NM_016252, intron 72 of 73) -18215 NM_001193509 55622 Hs.468125 NM_017735 ENSG00000018699 TTC27 - tetratricopeptide repeat domain 27 protein-coding 246.666-26 chr20 39455094 39455430 + 1.33333 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -230514 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 261.666-22 chrX 77503277 77503704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 56101 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 140.333-77 chr16 54011130 54011350 + 1.33333 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) intron (NM_001363988, intron 9 of 9) -28153 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 207.333-230 chr5 140948250 140948555 + 1.33333 NA intron (NM_018898, intron 1 of 3) L1MEf|LINE|L1 -18074 NM_018899 56134 Hs.199343 NM_018899 ENSG00000243232 PCDHAC2 PCDH-ALPHA-C2 protocadherin alpha subfamily C, 2 protein-coding 183.333-8 chr1 111589189 111589414 + 1.33333 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) FLAM_A|SINE|Alu 19017 NR_034126 100129269 Hs.689728 NR_034126 LINC01160 - long intergenic non-protein coding RNA 1160 ncRNA 250.666-38 chr7 82072091 82072318 + 1.33333 NA intron (NM_000722, intron 7 of 38) intron (NM_000722, intron 7 of 38) 63027 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 192-110 chr5 38407237 38407441 + 1.33333 NA intron (NM_182798, intron 3 of 16) intron (NM_182798, intron 3 of 16) 3798 NM_182798 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 375.333-15 chr22 28827787 28828230 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27436 NM_001079539 7494 Hs.437638 NM_005080 ENSG00000100219 XBP1 TREB-5|TREB5|XBP-1|XBP2 X-box binding protein 1 protein-coding 211-49 chr2 20961498 20961769 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 82440 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 133.333-133 chr4 87917197 87917383 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58360 NM_001251830 6696 Hs.313 NM_000582 ENSG00000118785 SPP1 BNSP|BSPI|ETA-1|OPN secreted phosphoprotein 1 protein-coding 251-19 chr12 94315755 94316184 + 1.33333 NA intron (NM_001042399, intron 13 of 15) L1ME3|LINE|L1 53448 NR_037687 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 208-140 chr5 107544544 107544780 + 1.33333 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 126275 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 270-6 chr10 129751674 129752115 + 1.33333 NA intron (NM_002412, intron 3 of 4) L1MEf|LINE|L1 91480 NR_036179 100422873 NR_036179 ENSG00000266676 MIR4297 - microRNA 4297 ncRNA 248.666-11 chr12 13612929 13613289 + 1.33333 NA intron (NM_000834, intron 7 of 12) intron (NM_000834, intron 7 of 12) -236364 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 299.333-23 chr14 20936681 20937048 + 1.33333 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 17523 NR_033909 643332 Hs.730362 NR_033909 ECRP - ribonuclease A family member 2 pseudogene pseudo 319.666-4 chr12 473313 473821 + 1.33333 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) intron (NM_173593, intron 1 of 19) 13628 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 256.666-8 chr11 30623121 30623358 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -36886 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 287.999-6 chr3 81045362 81045597 + 1.33333 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) intron (NR_132411, intron 1 of 1) 51611 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 258.667-31 chr15 36146591 36147033 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 219956 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 204-60 chr14 62241392 62241561 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -101503 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 211-74 chr4 97987651 97988010 + 1.33333 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) L2a|LINE|L2 155646 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 329.333-11 chr14 43084530 43085058 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 1422489 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 201.666-38 chr7 7845446 7845704 + 1.33333 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) 123177 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 247.666 chr1 30211733 30212068 + 1.33333 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -174288 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 215.333-154 chr5 42120856 42121240 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54297 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 297.333-28 chr18 78184379 78184647 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -190786 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 189.666-17 chr2 67829109 67829486 + 1.33333 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 -3735 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 234.333-8 chr10 12512475 12512762 + 1.33333 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) intron (NM_001351032, intron 3 of 11) -66135 NR_039700 100616151 NR_039700 ENSG00000263584 MIR4480 - microRNA 4480 ncRNA 180-52 chr2 112756675 112756875 + 1.33333 NA exon (NM_152515, exon 4 of 9) exon (NM_152515, exon 4 of 9) 7834 NR_130712 150468 Hs.434250 NM_152515 ENSG00000169607 CKAP2L - cytoskeleton associated protein 2 like protein-coding 205-84 chr7 25031206 25031462 + 1.33333 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -51156 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 189.666-31 chr4 32121534 32121717 + 1.33333 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) LTR16E2|LTR|ERVL -99203 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 195-95 chr6 152306330 152306652 + 1.33333 NA intron (NM_182961, intron 91 of 145) AluSz|SINE|Alu -74039 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 254.999-3 chr20 9510467 9510769 + 1.33333 NA intron (NR_109957, intron 1 of 4) intron (NR_109957, intron 1 of 4) -3740 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 202-10 chr1 186119204 186119412 + 1.33333 NA intron (NM_031935, intron 78 of 106) intron (NM_031935, intron 78 of 106) -176965 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 485.999 chr8 122794959 122795483 + 1.33333 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 13566 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 250-14 chr10 69129086 69129387 + 1.33333 NA intron (NM_001035260, intron 1 of 7) intron (NM_001035260, intron 1 of 7) 5058 NM_001318945 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 129.667-112 chr22 27584656 27584814 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 217021 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 322-38 chr6 161484151 161484457 + 1.33333 NA TTS (NR_134593) TTS (NR_134593) 13327 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 210-2 chr1 40245173 40245343 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2679 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 198.667-121 chr20 54838611 54838881 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 363153 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 212.666-42 chr2 64474490 64474764 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11726 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 223.666-15 chr15 58817347 58817523 + 1.33333 NA intron (NM_001040450, intron 4 of 8) L1ME3B|LINE|L1 46133 NM_001040453 54629 Hs.591122 NM_019092 ENSG00000128923 MINDY2 FAM63B MINDY lysine 48 deubiquitinase 2 protein-coding 196-33 chr12 24945715 24945891 + 1.33333 NA intron (NM_001178091, intron 1 of 9) AluSz6|SINE|Alu 3298 NM_005504 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 225.666-5 chr13 32040722 32040922 + 1.33333 NA intron (NM_023037, intron 1 of 60) intron (NM_023037, intron 1 of 60) 9048 NM_023037 10129 Hs.507669 NM_023037 ENSG00000073910 FRY 13CDNA73|214K23.2|C13orf14|CG003|bA207N4.2|bA37E23.1 FRY microtubule binding protein protein-coding 210-149 chr8 118108524 118108744 + 1.33333 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 3185 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 203.333 chr1 12033375 12033587 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 4323 NR_106787 102466982 NR_106787 ENSG00000276869 MIR6729 hsa-mir-6729 microRNA 6729 ncRNA 200.666-103 chr5 114774386 114774583 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1071 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 233.333-90 chr4 42890037 42890274 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3111 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 206-196 chrX 77593933 77594212 + 1.33333 NA intron (NM_000489, intron 25 of 34) intron (NM_000489, intron 25 of 34) 146683 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 203.666-53 chr8 120513353 120513609 + 1.33333 NA intron (NM_022045, intron 17 of 21) Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 68062 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 257.666-3 chr10 59291819 59292254 + 1.33333 NA intron (NM_001347852, intron 5 of 12) AluY|SINE|Alu 70513 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 305.666-19 chr6 15379534 15380000 + 1.33333 NA intron (NM_004973, intron 2 of 17) MIR|SINE|MIR 130912 NM_001267040 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 233.333-96 chr4 102477274 102477485 + 1.33333 NA intron (NR_136202, intron 1 of 4) L1PBa|LINE|L1 -23980 NM_001165412 4790 Hs.618430 NM_003998 ENSG00000109320 NFKB1 CVID12|EBP-1|KBF1|NF-kB1|NF-kappa-B1|NF-kappaB|NFKB-p105|NFKB-p50|NFkappaB|p105|p50 nuclear factor kappa B subunit 1 protein-coding 142-103 chr4 55531278 55531471 + 1.33333 NA intron (NM_004898, intron 1 of 22) L1M3|LINE|L1 14558 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 236.666-20 chr15 85445515 85445817 + 1.33333 NA intron (NM_007200, intron 1 of 36) intron (NM_007200, intron 1 of 36) 65063 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 335-27 chr7 16193413 16193763 + 1.33333 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) intron (NM_001101426, intron 9 of 9) -16898 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 234.333-10 chr10 32865287 32865572 + 1.33333 NA intron (NM_001321115, intron 42 of 43) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 36043 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 385.333-3 chr1 232253545 232253877 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 261897 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 182-14 chr10 24685065 24685277 + 1.33333 NA intron (NM_001367447, intron 2 of 24) intron (NM_001367447, intron 2 of 24) 37577 NM_001367454 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 187.333-36 chr11 123065774 123065988 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3745 NM_153201 3312 Hs.180414 NM_006597 ENSG00000109971 HSPA8 HEL-33|HEL-S-72p|HSC54|HSC70|HSC71|HSP71|HSP73|HSPA10|LAP-1|LAP1|NIP71 heat shock protein family A (Hsp70) member 8 protein-coding 199.333-16 chr1 109135790 109135991 + 1.33333 NA intron (NM_001284352, intron 1 of 20) intron (NM_001284352, intron 1 of 20) 21775 NM_001267048 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 193-78 chr5 164941735 164942011 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 471594 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 340.999-5 chr7 20987621 20988077 + 1.33333 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 152418 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 242-29 chr15 58982688 58983045 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4797 NM_001270528 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 139.333-137 chr21 28213403 28213570 + 1.33333 NA intron (NR_126012, intron 2 of 5) intron (NR_126012, intron 2 of 5) 15181 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 194.333-140 chr7 40047490 40047728 + 1.33333 NA intron (NM_003718, intron 6 of 13) intron (NM_003718, intron 6 of 13) 87013 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 265.999-5 chr5 39135134 39135350 + 1.33333 NA intron (NM_001243093, intron 7 of 18) intron (NM_001243093, intron 7 of 18) -60843 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 358.333-11 chr12 32382443 32382750 + 1.33333 NA non-coding (NR_148725, exon 10 of 10) non-coding (NR_148725, exon 10 of 10) -16962 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 253.333-21 chr13 110460696 110460920 + 1.33333 NA intron (NM_001846, intron 22 of 47) intron (NM_001846, intron 22 of 47) 2479 NM_001267044 100129836 Hs.640035 NM_001267044 COL4A2-AS2 - COL4A2 antisense 2 protein-coding 331-6 chr11 16562609 16563008 + 1.33333 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) L1MDa|LINE|L1 -86420 NM_033326 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 211.333-224 chr7 51662604 51662862 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -269477 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 203.333-171 chr3 50199279 50199554 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -5855 NM_006841 10991 Hs.76460 NM_006841 ENSG00000188338 SLC38A3 G17|NAT1|SN1|SNAT3 solute carrier family 38 member 3 protein-coding 163.333-143 chr2 57472080 57472226 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -435498 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 389.333-7 chr17 67959941 67960408 + 1.33333 NA intron (NM_182641, intron 24 of 27) intron (NM_182641, intron 24 of 27) 33432 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 244.333-19 chr11 26703785 26704128 + 1.33333 NA intron (NM_178498, intron 4 of 14) intron (NM_178498, intron 4 of 14) 18104 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 211.333-71 chr15 64656416 64656587 + 1.33333 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) intron (NM_015042, intron 2 of 8) 46780 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 216.666-21 chr12 12631475 12631672 + 1.33333 NA intron (NM_001310, intron 1 of 3) intron (NM_001310, intron 1 of 3) 19697 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 193.333-70 chr16 58922407 58922584 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -188179 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 178.667-119 chr4 73209596 73209801 + 1.33333 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) L1MEc|LINE|L1 13359 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 232-55 chr20 540790 541196 + 1.33333 NA intron (NM_001362770, intron 1 of 14) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 2797 NM_001362770 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 209.333-187 chr5 35793924 35794101 + 1.33333 NA intron (NM_024867, intron 32 of 36) L2|LINE|L2 -62879 NR_120485 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 227-30 chr20 24568772 24569048 + 1.33333 NA intron (NM_024893, intron 2 of 3) intron (NM_024893, intron 2 of 3) 98949 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 209.333-30 chr11 18156424 18156652 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16299 NM_054032 117196 Hs.632138 NM_054032 ENSG00000179817 MRGPRX4 GPCR|MRGX4|SNSR6 MAS related GPR family member X4 protein-coding 228-58 chr3 127570974 127571155 + 1.33333 NA TTS (NM_001353002) TTS (NM_001353002) 4267 NR_106883 102466199 NR_106883 ENSG00000275067 MIR6825 hsa-mir-6825 microRNA 6825 ncRNA 218.666-3 chr1 95865296 95865513 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -126664 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 134-87 chr5 123135127 123135307 + 1.33333 NA intron (NM_001136239, intron 3 of 7) MIRc|SINE|MIR -44901 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 218.667-25 chr12 25939384 25939668 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18059 NR_038227 100506451 Hs.560092 NR_038227 RASSF8-AS1 - RASSF8 antisense RNA 1 ncRNA 185-68 chr7 86258339 86258563 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -385458 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 259.666-10 chr11 102089876 102090132 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -20443 NM_001195044 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 335.666 chr1 72520216 72520584 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -237861 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 299.666-4 chr12 22856454 22856906 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 231509 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 253.666-26 chr6 101658131 101658333 + 1.33333 NA intron (NM_001166247, intron 3 of 16) L1PA7|LINE|L1 259247 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 215.667-57 chr2 50693978 50694241 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 2153 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 186.666-19 chr14 46090985 46091191 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 26929 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 223.666-8 chr12 18830029 18830235 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 92013 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 317.333-25 chr2 194550335 194550756 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -180050 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 164-85 chr4 43050233 43050441 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 157071 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 374-19 chr6 84261346 84261889 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33974 NM_001286206 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 202-24 chr11 10616864 10617031 + 1.33333 NA intron (NM_001100163, intron 10 of 20) intron (NM_001100163, intron 10 of 20) 35354 NM_001098579 10335 Hs.501898 NM_130385 ENSG00000072952 MRVI1 IRAG|JAW1L murine retrovirus integration site 1 homolog protein-coding 231-28 chr2 50012216 50012518 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) -38164 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 281-13 chr16 87548628 87548902 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -53070 NR_073379 57338 Hs.592068 NM_020655 ENSG00000154118 JPH3 CAGL237|HDL2|JP-3|JP3|TNRC22 junctophilin 3 protein-coding 199.333-49 chr12 3028261 3028512 + 1.33333 NA intron (NM_201443, intron 8 of 10) L1MB8|LINE|L1 -48969 NM_001168320 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 233.999-2 chr14 69540629 69540900 + 1.33333 NA Intergenic Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 34107 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 206.333-157 chr8 37207470 37207741 + 1.33333 NA Intergenic (ATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 286308 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 339.999-9 chr6 150465583 150465852 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 96705 NR_134655 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 216.667-32 chr12 115986315 115986595 + 1.33333 NA exon (NM_015335, exon 19 of 31) exon (NM_015335, exon 19 of 31) 162199 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 211.333-250 chr8 139262927 139263245 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -349045 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 141-33 chr16 53526830 53526982 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -23602 NM_001012398 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 230.333-58 chr2 42237120 42237306 + 1.33333 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) AluJb|SINE|Alu -66982 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 288.999-2 chr10 27118211 27118612 + 1.33333 NA intron (NM_139312, intron 15 of 19) AluJr|SINE|Alu -17913 NM_014915 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 349.666-9 chr5 40788015 40788477 + 1.33333 NA intron (NM_001355028, intron 1 of 9) L1MA6|LINE|L1 9931 NM_001355028 5562 Hs.43322 NM_006251 ENSG00000132356 PRKAA1 AMPK|AMPKa1 protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1 protein-coding 162-110 chr7 32355542 32355729 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L2c|LINE|L2 -56307 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 227.666-36 chr9 933996 934240 + 1.33333 NA intron (NM_001363767, intron 4 of 4) intron (NM_001363767, intron 4 of 4) -42537 NM_021240 58524 Hs.189174 NM_021240 ENSG00000064218 DMRT3 DMRTA3 doublesex and mab-3 related transcription factor 3 protein-coding 150.666 chr1 7699738 7699934 + 1.33333 NA intron (NM_001349613, intron 1 of 11) L1MB8|LINE|L1 -4900 NM_001349619 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 172-41 chr13 113511396 113511649 + 1.33333 NA intron (NR_146222, intron 7 of 11) intron (NR_146222, intron 7 of 11) 20501 NM_017905 55002 Hs.317593 NM_017905 ENSG00000150403 TMCO3 C13orf11 transmembrane and coiled-coil domains 3 protein-coding 298.667-27 chr7 96499164 96499509 + 1.33333 NA intron (NR_163953, intron 3 of 5) intron (NR_163953, intron 3 of 5) 4187 NR_163949 200.666-120 chr8 121153252 121153413 + 1.33333 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL -341286 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 188-40 chr17 51505775 51506032 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70476 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 326.667-28 chr5 10236540 10236981 + 1.33333 NA intron (NM_199133, intron 2 of 4) intron (NM_199133, intron 2 of 4) 13128 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 264.333-80 chrX 85303339 85303723 + 1.33333 NA intron (NM_001307940, intron 14 of 15) intron (NM_001307940, intron 14 of 15) 59540 NM_001330574 7552 Hs.326801 NM_021998 ENSG00000147180 ZNF711 CMPX1|MRX97|ZNF4|ZNF5|ZNF6|Zfp711|dJ75N13.1 zinc finger protein 711 protein-coding 245.333-111 chr7 47168130 47168412 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 296532 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 192-23 chr10 80729306 80729456 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 79584 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 111.667-264 chr8 141826264 141826465 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -40051 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 199.667-8 chr1 210604925 210605187 + 1.33333 NA intron (NM_001122834, intron 10 of 11) intron (NM_001122834, intron 10 of 11) 275690 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 203.333-245 chr7 48794437 48794707 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -129975 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 215-4 chr1 176572262 176572455 + 1.33333 NA intron (NM_021936, intron 2 of 4) intron (NM_021936, intron 2 of 4) 109183 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 177.333-150 chr7 32883760 32883946 + 1.33333 NA intron (NM_015483, intron 1 of 3) intron (NM_015483, intron 1 of 3) 7907 NM_015483 25948 Hs.372541 NM_015483 ENSG00000170852 KBTBD2 BKLHD1 kelch repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 332.666-21 chr3 20035482 20035886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4762 NM_003884 8850 Hs.533055 NM_003884 ENSG00000114166 KAT2B CAF|P/CAF|PCAF lysine acetyltransferase 2B protein-coding 197-73 chr3 64425194 64425347 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -136076 NR_110150 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 301.666-6 chr2 101612266 101612633 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -85254 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 138.667-131 chr3 81124928 81125115 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 131153 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 201.333-47 chr11 6677618 6677881 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5591 NM_022061 63875 Hs.523456 NM_022061 ENSG00000158042 MRPL17 L17mt|LIP2|MRP-L17|MRP-L26|RPL17L|RPML26 mitochondrial ribosomal protein L17 protein-coding 163.333-140 chr2 51726613 51726844 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1ME3A|LINE|L1 -643920 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 212-129 chr5 64004625 64004934 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42487 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 154.667-26 chr1 200715853 200716064 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23614 NM_001297707 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 299.333-67 chr7 2224945 2225285 + 1.33333 NA intron (NM_001304524, intron 1 of 16) intron (NM_001304524, intron 1 of 16) 7830 NM_001013837 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 202.666-99 chr5 95040885 95041076 + 1.33333 NA intron (NM_024717, intron 1 of 22) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 40886 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 211.666-5 chr10 106146731 106146990 + 1.33333 NA intron (NR_134330, intron 1 of 4) intron (NR_134330, intron 1 of 4) 6695 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 163.666-6 chr18 65901863 65902026 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 150932 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 185-64 chr7 30459253 30459599 + 1.33333 NA intron (NM_006092, intron 2 of 13) MER113|DNA|hAT-Charlie 19358 NM_006092 10392 Hs.405153 NM_006092 ENSG00000106100 NOD1 CARD4|CLR7.1|NLRC1 nucleotide binding oligomerization domain containing 1 protein-coding 148-27 chr11 103164407 103164585 + 1.33333 NA intron (NM_001377, intron 30 of 88) intron (NM_001377, intron 30 of 88) 55070 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 338.333-18 chr8 89916337 89916901 + 1.33333 NA intron (NM_001126111, intron 4 of 5) L2|LINE|L2 14049 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 211.333-161 chr4 36460799 36460987 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34465 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 201.333-296 chr9 3928259 3928438 + 1.33333 NA intron (NM_001042413, intron 6 of 10) intron (NM_001042413, intron 6 of 10) 29702 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 135.667-185 chr8 99193930 99194132 + 1.33333 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 180765 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 204.666-46 chr20 35869726 35869992 + 1.33333 NA intron (NM_016436, intron 7 of 17) intron (NM_016436, intron 7 of 17) 84767 NM_033630 51282 Hs.584909 NM_016558 ENSG00000171222 SCAND1 RAZ1|SDP1 SCAN domain containing 1 protein-coding 180.666-8 chr12 42886035 42886230 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 193916 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 194.666-73 chr8 123828496 123828706 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -23386 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 159.333-46 chr10 74646708 74647085 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) intron (NM_001369124, intron 8 of 9) -117572 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 210-66 chr2 111978479 111978708 + 1.33333 NA intron (NM_006343, intron 7 of 18) AluJr|SINE|Alu -76676 NM_032824 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 336.999 chr2 55344697 55345278 + 1.33333 NA intron (NM_001254943, intron 10 of 33) intron (NM_001254943, intron 10 of 33) 62668 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 411.333-9 chr19 27394882 27395396 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -398292 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 214.333-29 chr11 113296586 113296857 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -17862 NM_017868 54970 Hs.288772 NM_017868 ENSG00000149292 TTC12 TPARM tetratricopeptide repeat domain 12 protein-coding 210.666-34 chr14 66817012 66817185 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) intron (NM_001024218, intron 3 of 21) 309691 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 262.999-6 chr3 73744983 73745276 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -64115 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 210-110 chr4 161508269 161508522 + 1.33333 NA intron (NM_001128428, intron 10 of 14) intron (NM_001128428, intron 10 of 14) -514338 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 186.333-147 chr7 24939896 24940134 + 1.33333 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) (ATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 40163 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 166-57 chr19 36931740 36931892 + 1.33333 NA intron (NM_001204835, intron 4 of 6) L1MB8|LINE|L1 15484 NM_001204835 374900 Hs.404220 NM_198539 ENSG00000198453 ZNF568 ZFP568 zinc finger protein 568 protein-coding 175.666-3 chr10 121770432 121770599 + 1.33333 NA intron (NM_001001976, intron 11 of 11) intron (NM_001001976, intron 11 of 11) 157516 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 179.666-9 chr5 93081570 93081847 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 489635 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 186.666-43 chr6 49702808 49702959 + 1.33333 NA intron (NM_001261822, intron 3 of 8) L1PB1|LINE|L1 10660 NM_001142408 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 183.333-30 chr12 56168183 56168344 + 1.33333 NA intron (NM_001330288, intron 25 of 28) intron (NM_001330288, intron 25 of 28) 9904 NM_079423 4637 Hs.632717 NM_021019 ENSG00000092841 MYL6 ESMLC|LC17|LC17-GI|LC17-NM|LC17A|LC17B|MLC-3|MLC1SM|MLC3NM|MLC3SM myosin light chain 6 protein-coding 233-63 chr8 117040545 117040834 + 1.33333 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) 89714 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 171.333-118 chr3 43164814 43164961 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -58808 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 223.333-136 chr5 148391226 148391527 + 1.33333 NA intron (NM_001271723, intron 1 of 20) intron (NM_001271723, intron 1 of 20) 7418 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 204.333-206 chr8 144939948 144940211 + 1.33333 NA intron (NM_006958, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 10801 NM_006958 7564 Hs.493225 NM_006958 ENSG00000170631 ZNF16 HZF1|KOX9 zinc finger protein 16 protein-coding 219.333-117 chr3 73734228 73734655 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74803 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 206.333-156 chr8 25157910 25158220 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -26624 NM_001322810 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 206-43 chr12 41608213 41608473 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -155846 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 258.666-36 chr5 80328241 80328511 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 8374 NM_032567 84654 Hs.519403 NM_032567 ENSG00000164299 SPZ1 CILD38|NYD-TSP1|PPP1R148 spermatogenic leucine zipper 1 protein-coding 331.999 chr11 22332788 22333111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5432 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 210-156 chr9 103391306 103391530 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -66385 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 205.999-7 chr6 63644384 63644560 + 1.33333 NA intron (NM_001290260, intron 1 of 3) intron (NM_001290260, intron 1 of 3) -2054 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 279-38 chr8 88761220 88761487 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -433870 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 265.666 chr1 67682318 67682562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2761 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 202.999-3 chr3 63346088 63346240 + 1.33333 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 67856 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 214.333-25 chr11 39325134 39325437 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 676427 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 244.333-21 chr11 34456018 34456212 + 1.33333 NA exon (NM_001752, exon 7 of 13) exon (NM_001752, exon 7 of 13) 17181 NM_001752 847 Hs.502302 NM_001752 ENSG00000121691 CAT - catalase protein-coding 181.333-99 chr3 78006278 78006540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42554 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 212-23 chr10 62620650 62620871 + 1.33333 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) intron (NM_199452, intron 1 of 6) 100312 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 252.666-20 chr2 77146618 77146822 + 1.33333 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 160755 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 208.666-55 chr2 9606052 9606209 + 1.33333 NA intron (NM_006826, intron 2 of 5) L1ME4b|LINE|L1 24867 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 184.666-42 chr9 31285488 31285711 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 95891 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 159.333-52 chr10 90976273 90976465 + 1.33333 NA intron (NR_131214, intron 3 of 5) intron (NR_131214, intron 3 of 5) 29069 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 329.333-5 chr1 236652898 236653389 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -33311 NM_001103 88 Hs.498178 NM_001103 ENSG00000077522 ACTN2 CMD1AA|CMH23 actinin alpha 2 protein-coding 258-79 chr7 47167436 47167856 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 297157 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 248-61 chr4 60485775 60486219 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -436622 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 261.667-50 chr3 117995260 117995635 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -304522 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 418.333-11 chr4 160915806 160916179 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -1106741 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 190-29 chr14 31465484 31465703 + 1.33333 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -8087 NM_080664 112487 Hs.116014 NM_080664 ENSG00000129480 DTD2 ATD|C14orf126 D-aminoacyl-tRNA deacylase 2 protein-coding 246.667-81 chr6 88389398 88389703 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 149819 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 211.999-8 chr20 32725386 32725550 + 1.33333 NA intron (NM_001099339, intron 3 of 8) AluY|SINE|Alu 18540 NM_053041 149951 Hs.408427 NM_053041 ENSG00000149600 COMMD7 C20orf92|dJ1085F17.3 COMM domain containing 7 protein-coding 199.666-43 chr4 178844338 178844603 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -936534 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 209-89 chr5 34739113 34739406 + 1.33333 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) MIR|SINE|MIR 51700 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 202.666-75 chr3 95303101 95303301 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 364938 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 189.666-36 chr7 45385189 45385351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -188870 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 202.666-44 chr15 73078965 73079161 + 1.33333 NA intron (NM_002499, intron 1 of 28) intron (NM_002499, intron 1 of 28) 26579 NM_001172623 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 148.667-322 chr5 137717581 137717768 + 1.33333 NA intron (NM_017415, intron 2 of 14) intron (NM_017415, intron 2 of 14) 3636 NM_001257194 26249 Hs.655084 NM_017415 ENSG00000146021 KLHL3 PHA2D kelch like family member 3 protein-coding 261-52 chr7 42437666 42438160 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -200704 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 212-123 chr5 11476973 11477173 + 1.33333 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 111844 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 191.333-158 chr5 65452690 65452861 + 1.33333 NA exon (NM_197941, exon 5 of 25) exon (NM_197941, exon 5 of 25) 29145 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 239.333-5 chr1 81869775 81870013 + 1.33333 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 67441 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 208-73 chr2 16488349 16488631 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 177344 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 227.666 chr1 44892009 44892216 + 1.33333 NA intron (NM_001166588, intron 6 of 9) MIRb|SINE|MIR -48859 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 368.666-11 chr19 43718885 43719236 + 1.33333 NA exon (NM_019612, exon 2 of 2) exon (NM_019612, exon 2 of 2) 2984 NM_019612 56269 Hs.515444 NM_019612 ENSG00000124449 IRGC CINEMA|IFGGE|IRGC1|Iigp5|R30953_1 immunity related GTPase cinema protein-coding 218-28 chr15 57483814 57484084 + 1.33333 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) L1MD1|LINE|L1 107444 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 235.333-66 chr22 50539122 50539416 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6630 NM_138433 113730 Hs.137007 NM_138433 ENSG00000130487 KLHDC7B - kelch domain containing 7B protein-coding 234.333-82 chr7 136384341 136384593 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -407108 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 221.666-53 chr8 21329314 21329581 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 31208 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 228.999-2 chr14 52457118 52457306 + 1.33333 NA intron (NM_001160047, intron 16 of 20) intron (NM_001160047, intron 16 of 20) 95293 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 282.666-15 chr2 185487323 185487715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 251200 NR_110216 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 282.333-3 chr1 215041523 215041874 + 1.33333 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) intron (NM_001017424, intron 1 of 6) 36156 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 320-51 chr9 105362553 105362987 + 1.33333 NA intron (NM_001330731, intron 8 of 15) intron (NM_001330731, intron 8 of 15) -85264 NM_001287191 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 256.333-29 chr14 81086869 81087312 + 1.33333 NA intron (NM_001142626, intron 3 of 8) L1MB8|LINE|L1 115744 NR_003021 677845 Hs.693251 NR_003021 ENSG00000221303 SNORA79 ACA65|SNORA79A small nucleolar RNA, H/ACA box 79 snoRNA 181.666-12 chr16 54749058 54749224 + 1.33333 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 99092 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 186.333-40 chr12 80283222 80283410 + 1.33333 NA intron (NM_001368062, intron 31 of 62) intron (NM_001368062, intron 31 of 62) 73863 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 175.666-19 chr6 24143545 24143767 + 1.33333 NA intron (NM_080723, intron 3 of 3) intron (NM_080723, intron 3 of 3) 17441 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 213-38 chr2 39834405 39834673 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -55263 NM_001321468 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 235.333-19 chr11 13613263 13613713 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -55180 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 145-118 chr8 79662909 79663122 + 1.33333 NA intron (NM_007029, intron 4 of 4) intron (NM_007029, intron 4 of 4) 51898 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 198.333-202 chr9 26591400 26591593 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 301306 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 284.333-44 chr9 69864800 69865269 + 1.33333 NA intron (NM_001308084, intron 4 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 44217 NM_001308084 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 219.333-145 chr5 145974670 145974862 + 1.33333 NA intron (NM_152550, intron 2 of 9) intron (NM_152550, intron 2 of 9) 38188 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 282.999-2 chr1 97382084 97382403 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 15 of 22) intron (NM_000110, intron 15 of 22) 286320 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 237.333-108 chr6 165375512 165375800 + 1.33333 NA intron (NM_006661, intron 19 of 22) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -66051 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 306-39 chr4 63874105 63874578 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 535109 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 205.333-140 chr20 41481556 41481774 + 1.33333 NA intron (NM_032221, intron 16 of 36) L1ME4c|LINE|L1 -114847 NM_052846 90187 Hs.726525 NM_052846 ENSG00000183798 EMILIN3 C20orf130|EMILIN5|dJ620E11.4 elastin microfibril interfacer 3 protein-coding 280.666-6 chr14 65294457 65294730 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 40590 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 403.333-7 chr20 11330952 11331307 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57746 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 210-38 chr14 54712896 54713090 + 1.33333 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) L3b|LINE|CR1 -41840 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 337.333-28 chr22 28556710 28557020 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 96996 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 203-28 chr13 100301150 100301454 + 1.33333 NA intron (NM_001352608, intron 11 of 21) intron (NM_001352608, intron 11 of 21) 179713 NR_047686 100885777 Hs.662554 NR_047686 PCCA-AS1 - PCCA antisense RNA 1 ncRNA 204.666-81 chr6 51006728 51006950 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 187968 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 343.666-2 chr10 25556345 25556759 + 1.33333 NA intron (NM_020752, intron 6 of 10) intron (NM_020752, intron 6 of 10) -95160 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 280.333-31 chr5 42475025 42475347 + 1.33333 NA intron (NM_001242401, intron 1 of 10) intron (NM_001242401, intron 1 of 10) 50205 NM_001242401 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 266.667-55 chr4 136006528 136006881 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -93024 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 211.333-101 chr19 49949325 49949515 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001135163, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001135163, exon 10 of 10) 11752 NM_001135163 114132 Hs.661852 NM_052884 ENSG00000161640 SIGLEC11 - sialic acid binding Ig like lectin 11 protein-coding 415.333-6 chr3 136598252 136598766 + 1.33333 NA intron (NM_005862, intron 4 of 33) AluY|SINE|Alu 153869 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 173.666-6 chr18 56017730 56017875 + 1.33333 NA intron (NR_148972, intron 8 of 8) intron (NR_148972, intron 8 of 8) -24476 NR_146510 102724698 NR_146510 ENSG00000267057 LINC01905 - long intergenic non-protein coding RNA 1905 ncRNA 204-184 chr7 68460180 68460394 + 1.33333 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 440034 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 130.333-108 chr2 130362479 130362626 + 1.33333 NA intron (NM_014369, intron 5 of 14) L1MEc|LINE|L1 6496 NM_014369 26469 Hs.516390 NM_014369 ENSG00000072135 PTPN18 BDP1|PTP-HSCF protein tyrosine phosphatase non-receptor type 18 protein-coding 241.999-3 chr13 20176052 20176336 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15142 NM_021954 2700 Hs.130313 NM_021954 ENSG00000121743 GJA3 CTRCT14|CX46|CZP3 gap junction protein alpha 3 protein-coding 194.666-36 chr2 76536315 76536481 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -449567 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 203.667-118 chr8 42390796 42391093 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_005662) promoter-TSS (NM_005662) -817 NM_001135694 7419 Hs.699301 NM_005662 ENSG00000078668 VDAC3 HD-VDAC3|VDAC-3 voltage dependent anion channel 3 protein-coding 339.333-6 chr10 30943958 30944369 + 1.33333 NA intron (NR_026560, intron 1 of 6) intron (NR_026560, intron 1 of 6) 55354 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 210-41 chr14 72953509 72953697 + 1.33333 NA intron (NM_001352448, intron 9 of 13) AluJo|SINE|Alu 27139 NM_181341 26094 Hs.331491 NM_015604 ENSG00000119599 DCAF4 WDR21|WDR21A DDB1 and CUL4 associated factor 4 protein-coding 207.666-14 chr12 96705492 96705649 + 1.33333 NA intron (NM_001306084, intron 47 of 67) intron (NM_001306084, intron 47 of 67) -201687 NM_001135177 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 261.666-9 chr2 53658227 53658592 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -109374 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 197.333-201 chr6 122017857 122018046 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -381600 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 212-153 chr8 109794512 109794782 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -102856 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 156-43 chr14 53667435 53667690 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 280922 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 195.333-126 chr2 199405571 199405855 + 1.33333 NA intron (NR_134967, intron 3 of 4) intron (NR_134967, intron 3 of 4) 52226 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 281.333-53 chr5 150007106 150007546 + 1.33333 NA intron (NM_001366501, intron 3 of 18) intron (NM_001366501, intron 3 of 18) 6587 NM_014983 22993 Hs.719189 NM_014983 ENSG00000113716 HMGXB3 HMGX3|SMF HMG-box containing 3 protein-coding 163-54 chr3 36559700 36559855 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 179290 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 188-58 chr2 105736744 105736969 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8056 NM_003581 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 246.666-17 chr17 68121224 68121465 + 1.33333 NA intron (NR_027418, intron 4 of 5) AluSg|SINE|Alu 19789 NR_027418 100499466 Hs.591212 NR_027418 LINC00674 - long intergenic non-protein coding RNA 674 ncRNA 348.333-7 chr10 64260778 64261290 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -564494 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 178-116 chr9 4982356 4982582 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2617 NM_001322194 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 462-5 chr11 111939930 111940547 + 1.33333 NA intron (NM_001037954, intron 1 of 19) intron (NM_001037954, intron 1 of 19) 2895 NM_001037954 85458 Hs.655626 NM_033425 ENSG00000150764 DIXDC1 CCD1 DIX domain containing 1 protein-coding 213.333-229 chrX 97612362 97612644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47968 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 231-32 chr2 98596208 98596525 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 12146 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 209.666-25 chr18 68210437 68210706 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -395749 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 271.667-47 chr3 113946677 113947030 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_017577, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_017577, exon 18 of 18) -1048 NM_001363952 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 195-9 chr1 217902162 217902349 + 1.33333 NA intron (NR_048550, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 9355 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 339.333-32 chr3 163465463 163465774 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -162317 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 357.667-16 chr8 121230927 121231390 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -408188 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 211.666-32 chr3 9392418 9392665 + 1.33333 NA intron (NR_027007, intron 1 of 2) intron (NR_027007, intron 1 of 2) 4082 NR_132781 440944 Hs.598958 NM_001013713 ENSG00000206573 THUMPD3-AS1 SETD5-AS1 THUMPD3 antisense RNA 1 ncRNA 181.667-120 chr5 66836056 66836303 + 1.33333 NA intron (NM_015183, intron 1 of 27) AluJb|SINE|Alu 7406 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 168-106 chr7 92262299 92262447 + 1.33333 NA intron (NM_019004, intron 1 of 19) intron (NM_019004, intron 1 of 19) -16273 NM_001350677 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 350.666-12 chr18 8951852 8952221 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -150663 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 224.333-16 chr10 53804584 53804900 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001354420, exon 34 of 34) 3' UTR (NM_001354420, exon 34 of 34) -681488 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 362.666-12 chr4 137601215 137601592 + 1.33333 NA non-coding (NR_146553, exon 2 of 2) non-coding (NR_146553, exon 2 of 2) 55672 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 142.666-16 chr8 102281857 102282003 + 1.33333 NA intron (NM_001282873, intron 40 of 58) intron (NM_001282873, intron 40 of 58) 42479 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 322.667-25 chr5 144789936 144790371 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 584762 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 325.333 chr1 41152593 41153131 + 1.33333 NA intron (NM_001031694, intron 3 of 15) intron (NM_001031694, intron 3 of 15) 8570 NM_001031694 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 198.666-96 chr8 123510832 123511027 + 1.33333 NA intron (NM_001242463, intron 4 of 6) intron (NM_001242463, intron 4 of 6) 21214 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 243.666-20 chr2 44677104 44677384 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 261644 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 297-48 chr9 37320492 37320932 + 1.33333 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) intron (NR_110317, intron 4 of 7) -101984 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 185-50 chr4 93085949 93086154 + 1.33333 NA intron (NM_001510, intron 3 of 15) intron (NM_001510, intron 3 of 15) -742702 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 201.666-35 chr5 147861886 147862099 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16719 NM_054023 117156 Hs.483765 NM_054023 ENSG00000164265 SCGB3A2 LU103|PNSP1|UGRP1|pnSP-1 secretoglobin family 3A member 2 protein-coding 252.666-9 chr14 34362913 34363226 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 99171 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 220.666-60 chr5 64959617 64959840 + 1.33333 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) intron (NM_005869, intron 11 of 13) 190798 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 209-62 chr2 167298139 167298388 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 110891 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 236-86 chr7 112853229 112853631 + 1.33333 NA intron (NM_152556, intron 3 of 4) intron (NM_152556, intron 3 of 4) -63007 NR_109840 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 195-68 chr20 12507392 12507549 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 429493 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 192-71 chr2 57733592 57733761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -173975 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 202.333-141 chr5 51764859 51765019 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -243092 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 158.667-127 chr17 68914274 68914506 + 1.33333 NA intron (NM_001288985, intron 17 of 39) L1MA3|LINE|L1 41002 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 348.333-24 chr5 5063013 5063427 + 1.33333 NA intron (NR_026994, intron 4 of 6) intron (NR_026994, intron 4 of 6) 15091 NR_134266 105374631 Hs.570964 NR_134266 ENSG00000250529 LINC02121 - long intergenic non-protein coding RNA 2121 ncRNA 288.333-16 chr17 28449210 28449433 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -24323 NM_001145975 9058 Hs.102307 NM_003984 ENSG00000007216 SLC13A2 NADC1|NaCT|NaDC-1|SDCT1 solute carrier family 13 member 2 protein-coding 352-19 chr5 4184420 4184871 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 588813 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 192.333-165 chr8 70029990 70030176 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 41169 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 181.333-32 chr12 15646229 15646403 + 1.33333 NA intron (NM_004447, intron 15 of 20) intron (NM_004447, intron 15 of 20) 99705 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 205-37 chr15 96575219 96575529 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 206280 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 413.333-11 chr5 30773969 30774490 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -419457 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 239-62 chr7 87646405 87646744 + 1.33333 NA intron (NM_138290, intron 1 of 11) intron (NM_138290, intron 1 of 11) 18176 NM_138290 154661 Hs.411488 NM_138290 ENSG00000105784 RUNDC3B RPIB9|RPIP9 RUN domain containing 3B protein-coding 228.333-81 chr6 8417394 8417740 + 1.33333 NA intron (NR_163442, intron 6 of 9) intron (NR_163442, intron 6 of 9) 17978 NM_001370478 51000 Hs.285847 NM_015948 ENSG00000124786 SLC35B3 C6orf196|CGI-19|PAPST2 solute carrier family 35 member B3 protein-coding 148-103 chr3 79755410 79755593 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 12497 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 193.666-16 chr14 49705874 49706050 + 1.33333 NA intron (NM_172193, intron 1 of 12) L1MA2|LINE|L1 12842 NM_172193 122773 Hs.509258 NM_172193 ENSG00000197776 KLHDC1 MST025 kelch domain containing 1 protein-coding 169-104 chr8 127724364 127724570 + 1.33333 NA intron (NR_117102, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 9500 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 211.333-140 chr22 27631191 27631470 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 170426 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 210.666-112 chr9 86020253 86020437 + 1.33333 NA intron (NM_024635, intron 21 of 22) intron (NM_024635, intron 21 of 22) 78816 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 184.667-83 chr3 186793068 186793318 + 1.33333 NA intron (NM_181573, intron 5 of 10) L1MB8|LINE|L1 5580 NR_002588 619568 Hs.743897 NR_002588 ENSG00000263776 SNORA4 ACA4 small nucleolar RNA, H/ACA box 4 snoRNA 152-93 chr20 260730 260934 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_207469, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_207469, exon 2 of 2) 3108 NM_207469 400830 Hs.516819 NM_207469 ENSG00000186458 DEFB132 BD-32|DEFB-32|DEFB32|HEL-75|KFLL827|UNQ827 defensin beta 132 protein-coding 371.999-3 chr20 31303575 31303939 + 1.33333 NA intron (NM_001037731, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 4828 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 230.333-23 chr11 76742843 76743140 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21202 NR_024042 390226 Hs.440026 NR_024042 GUCY2EP GC-E|GCD|GUCY2E guanylate cyclase 2E, pseudogene pseudo 195.666-7 chr10 56892649 56892874 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 411798 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 222.999-4 chr5 39897521 39897763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154649 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 185.333-127 chr3 177098025 177098194 + 1.33333 NA intron (NM_001321194, intron 2 of 16) AluSq2|SINE|Alu 98369 NM_001321193 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 287.333-10 chr11 13910567 13910941 + 1.33333 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 14109 NR_135052 101928132 Hs.568970 NR_135052 ENSG00000254438 LINC02683 - long intergenic non-protein coding RNA 2683 ncRNA 216-79 chr3 80398217 80398397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -366590 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 206-162 chr6 145012917 145013124 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 607365 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 200.666-31 chr14 28308938 28309133 + 1.33333 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 456284 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 301.666-4 chr12 33427678 33428087 + 1.33333 NA intron (NM_198992, intron 1 of 6) intron (NM_198992, intron 1 of 6) 11937 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 198.667-43 chr12 6154848 6155135 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30316 NM_000552 7450 Hs.440848 NM_000552 ENSG00000110799 VWF F8VWF|VWD von Willebrand factor protein-coding 206.667-2 chr1 61803930 61804217 + 1.33333 NA intron (NM_001350145, intron 12 of 43) intron (NM_001350145, intron 12 of 43) -42002 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 231.666-22 chr3 194519045 194519329 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 32047 NR_033929 401106 Hs.407087 NR_033929 LINC00884 - long intergenic non-protein coding RNA 884 ncRNA 259.999-9 chr4 92605046 92605333 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 300790 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 201.333-310 chrX 142082614 142082860 + 1.33333 NA Intergenic THE1-int|LTR|ERVL-MaLR 122553 NM_016249 51438 Hs.123536 NM_016249 ENSG00000046774 MAGEC2 CT10|HCA587|MAGEE1 MAGE family member C2 protein-coding 249.666-38 chr7 110822507 110822817 + 1.33333 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -268344 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 207-89 chr4 87607249 87607519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1145 NM_014208 1834 Hs.678914 NM_014208 ENSG00000152591 DSPP DFNA39|DGI1|DMP3|DPP|DSP dentin sialophosphoprotein protein-coding 210.333-94 chr22 24966274 24966436 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19660 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 174-53 chr2 68460617 68460872 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001024680, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001024680, exon 4 of 4) 6550 NR_133923 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 150.666-10 chr2 10685051 10685185 + 1.33333 NA intron (NM_024894, intron 1 of 20) intron (NM_024894, intron 1 of 20) 4857 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 207-30 chr14 37113125 37113351 + 1.33333 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -58788 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 258-22 chr18 4381992 4382309 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 73116 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 203-22 chr11 108117763 108117961 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3705 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 165.666-4 chr6 35558477 35558767 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45726 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 206-122 chr4 30631390 30631663 + 1.33333 NA Intergenic LTR28B|LTR|ERV1 -88843 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 185.667-32 chr14 50615853 50616105 + 1.33333 NA intron (NM_015915, intron 8 of 13) intron (NM_015915, intron 8 of 13) 52327 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 204.666-63 chr4 95837736 95837918 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2266 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 187.333-72 chr15 60996471 60996666 + 1.33333 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 232734 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 243.666-4 chr10 73030160 73030353 + 1.33333 NA intron (NM_001017962, intron 10 of 14) intron (NM_001017962, intron 10 of 14) 66718 NM_001142595 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 229.333-90 chr4 157042229 157042460 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33781 NM_001166061 2743 Hs.32973 NM_000824 ENSG00000109738 GLRB HKPX2 glycine receptor beta protein-coding 199.666-56 chr8 111485660 111485830 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109106 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 196.333-29 chr12 71294660 71294843 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -136752 NM_004616 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 163-8 chr10 55666504 55666667 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38643 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 129.333-127 chr3 99668584 99668728 + 1.33333 NA intron (NM_020351, intron 1 of 3) intron (NM_020351, intron 1 of 3) 30062 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 216.666-40 chr2 75338088 75338264 + 1.33333 NA Intergenic Helitron1Na_Mam|RC|Helitron -138656 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 149.333-416 chr9 9478962 9479196 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) intron (NM_002839, intron 8 of 45) -320313 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 137-65 chr3 126618956 126619065 + 1.33333 NA intron (NM_052883, intron 12 of 15) L1MA5|LINE|L1 36114 NM_001173513 114112 Hs.477475 NM_052883 ENSG00000197763 TXNRD3 TGR|TR2|TR2IT1|TRXR3|TXNRD3IT1|TXNRD3NB|TXNRD3NT1 thioredoxin reductase 3 protein-coding 318.333-35 chr9 1259067 1259385 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 207739 NM_001370532 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 351.333-21 chr3 35929187 35929619 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184927 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 209-68 chr20 31626119 31626288 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11709 NM_032609 84701 Hs.277101 NM_032609 ENSG00000131055 COX4I2 COX4|COX4-2|COX4B|COX4L2|COXIV-2|dJ857M17.2 cytochrome c oxidase subunit 4I2 protein-coding 371.333-20 chr6 69709319 69709849 + 1.33333 NA intron (NM_001367272, intron 9 of 15) L1ME1|LINE|L1 86882 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 150.333-120 chr14 73685184 73685319 + 1.33333 NA intron (NM_001201366, intron 6 of 8) L1MB3|LINE|L1 29133 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 127.333-110 chr3 89292221 89292384 + 1.33333 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) MER2|DNA|TcMar-Tigger 184681 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 142.667-93 chr2 48273908 48274116 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40670 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 243.666-9 chr12 128716669 128716955 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 107146 NM_145648 121260 Hs.507260 NM_145648 ENSG00000139370 SLC15A4 FP12591|PHT1|PTR4 solute carrier family 15 member 4 protein-coding 309.999-2 chr2 4904467 4904761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -248392 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 210-134 chr6 89770657 89770862 + 1.33333 NA intron (NM_014611, intron 15 of 101) AluSz|SINE|Alu 49035 NM_014611 23195 Hs.529948 NM_014611 ENSG00000112159 MDN1 Rea1 midasin AAA ATPase 1 protein-coding 188-26 chr11 28283409 28283594 + 1.33333 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) intron (NM_001113528, intron 4 of 6) 175113 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 222.999 chr10 87941981 87942149 + 1.33333 NA intron (NM_001304717, intron 6 of 9) L1M5|LINE|L1 78440 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 251.667-14 chr11 83131062 83131493 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -25854 NM_015885 51585 Hs.128959 NM_015885 ENSG00000165494 PCF11 - PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit protein-coding 211.667-19 chr10 61626624 61626892 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -36171 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 232.666-12 chr14 45007124 45007307 + 1.33333 NA intron (NR_131765, intron 5 of 19) intron (NR_131765, intron 5 of 19) 45025 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 175.333-91 chr2 108379163 108379402 + 1.33333 NA intron (NR_135779, intron 1 of 2) intron (NR_135779, intron 1 of 2) 1328 NM_006588 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 211.333-208 chr6 72766100 72766295 + 1.33333 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 135702 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 230.667-92 chr8 125443128 125443411 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 11060 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 202.667-60 chr15 77489018 77489290 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -36441 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 200-34 chr11 85276267 85276507 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) intron (NM_001142699, intron 4 of 27) 350883 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 251.666-5 chr11 17120039 17120322 + 1.33333 NA intron (NM_001321380, intron 14 of 31) intron (NM_001321380, intron 14 of 31) -42513 NM_001017 6207 Hs.446588 NM_001017 ENSG00000110700 RPS13 S13 ribosomal protein S13 protein-coding 309.333-20 chr14 82666505 82666814 + 1.33333 NA intron (NR_146650, intron 2 of 5) intron (NR_146650, intron 2 of 5) 24027 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 199.333-201 chr4 70099321 70099583 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32066 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 200.666-11 chr1 217949994 217950167 + 1.33333 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 57180 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 166-98 chr5 165142801 165143035 + 1.33333 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 672639 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 194.333-75 chr2 152773019 152773228 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54486 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 193-86 chr7 18673807 18674078 + 1.33333 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) intron (NM_058176, intron 11 of 22) 164672 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 202.666-125 chr8 110444773 110444963 + 1.33333 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -469097 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 207.333-177 chr3 24412974 24413226 + 1.33333 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) L1ME4a|LINE|L1 -80987 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 306-36 chr4 328404 328765 + 1.33333 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -9230 NM_003441 7700 Hs.654355 NM_003441 ENSG00000131127 ZNF141 D4S90|pHZ-44 zinc finger protein 141 protein-coding 281.333-73 chr9 117435995 117436406 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21143 NM_014010 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 243.333-27 chr13 94592592 94592810 + 1.33333 NA intron (NM_001304430, intron 2 of 11) AluY|SINE|Alu 3451 NM_001304430 23483 Hs.12393 NM_014305 ENSG00000088451 TGDS CATMANS|SDR2E1|TDPGD TDP-glucose 4,6-dehydratase protein-coding 286.667-4 chr1 105249892 105250292 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 368843 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 367.333-6 chr17 44883647 44884146 + 1.33333 NA intron (NM_001142605, intron 3 of 26) intron (NM_001142605, intron 3 of 26) 15472 NM_001258353 9343 Hs.151787 NM_004247 ENSG00000108883 EFTUD2 MFDGA|MFDM|SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 protein-coding 206.666-105 chr6 164866122 164866285 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -44140 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 210-17 chr10 42102944 42103168 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 264989 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 197.667-127 chr5 123120644 123120941 + 1.33333 NA intron (NM_001136239, intron 3 of 7) intron (NM_001136239, intron 3 of 7) -30476 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 141.333-255 chr9 31314914 31315149 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 66459 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 289.333-56 chr6 61419948 61420229 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -154042 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 232-60 chr3 46188630 46188839 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19579 NM_001295 1230 Hs.301921 NM_001295 ENSG00000163823 CCR1 CD191|CKR-1|CKR1|CMKBR1|HM145|MIP1aR|SCYAR1 C-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 233.666-5 chr10 113962301 113962482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -81475 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 203.666-4 chr1 77571988 77572168 + 1.33333 NA intron (NM_015534, intron 12 of 14) intron (NM_015534, intron 12 of 14) 110580 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 237-25 chr13 35648074 35648393 + 1.33333 NA intron (NM_001204197, intron 10 of 17) intron (NM_001204197, intron 10 of 17) -49291 NR_132116 100507114 Hs.236298 NR_132115 ENSG00000236036 LINC00445 - long intergenic non-protein coding RNA 445 ncRNA 233.666-27 chr7 29350116 29350360 + 1.33333 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) MIR3|SINE|MIR -129474 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 183.333-154 chr8 51259235 51259459 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 550098 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 211.333-168 chr4 67845805 67846054 + 1.33333 NA intron (NM_004262, intron 3 of 9) intron (NM_004262, intron 3 of 9) 38073 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 410.666-4 chr15 52895582 52896015 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -105462 NM_004498 3175 Hs.555318 NM_004498 ENSG00000169856 ONECUT1 HNF-6|HNF6|HNF6A one cut homeobox 1 protein-coding 202.666-60 chr2 21000315 21000574 + 1.33333 NA TTS (NM_000384) TTS (NM_000384) 43629 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 245.666-24 chr7 85668912 85669107 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 247887 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 219.333-17 chr1 222972193 222972430 + 1.33333 NA intron (NM_001369594, intron 2 of 7) intron (NM_001369594, intron 2 of 7) 43887 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 196.666-108 chr8 124429243 124429482 + 1.33333 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -21458 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 395-15 chr3 17628685 17629276 + 1.33333 NA intron (NM_001349090, intron 1 of 21) intron (NM_001349090, intron 1 of 21) 71040 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 156.667-350 chr9 249385 249604 + 1.33333 NA intron (NM_203447, intron 1 of 47) intron (NM_203447, intron 1 of 47) -23552 NM_001190458 81704 Hs.132599 NM_203447 ENSG00000107099 DOCK8 HEL-205|MRD2|ZIR8 dedicator of cytokinesis 8 protein-coding 206.666-90 chr4 95959644 95959856 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 119657 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 260.667-90 chr8 91992899 91993327 + 1.33333 NA intron (NM_004349, intron 5 of 10) intron (NM_004349, intron 5 of 10) 24567 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 199-45 chr2 50520730 50520898 + 1.33333 NA intron (NM_001330096, intron 7 of 16) intron (NM_001330096, intron 7 of 16) -173058 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 349-17 chr4 115919203 115919582 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -380333 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 199-10 chr10 57221476 57221743 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 82950 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 224-53 chr2 226571551 226571824 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87106 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 258-68 chr5 123770587 123770982 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 225367 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 240.333-80 chr6 79516114 79516400 + 1.33333 NA intron (NM_001122769, intron 2 of 7) intron (NM_001122769, intron 2 of 7) 21173 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 192-139 chr7 90947712 90947989 + 1.33333 NA intron (NM_012395, intron 7 of 13) intron (NM_012395, intron 7 of 13) 238034 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 366.666-16 chr8 134683651 134684043 + 1.33333 NA intron (NM_001289394, intron 1 of 16) intron (NM_001289394, intron 1 of 16) 12708 NM_001174158 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 188-3 chr1 52857613 52857785 + 1.33333 NA exon (NM_001004339, exon 3 of 14) exon (NM_001004339, exon 3 of 14) 14939 NM_001307931 440590 Hs.658458 NM_001004339 ENSG00000203995 ZYG11A ZYG11 zyg-11 family member A, cell cycle regulator protein-coding 239.333-16 chr10 69078140 69078428 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9319 NM_001321053 5552 Hs.1908 NM_002727 ENSG00000122862 SRGN PPG|PRG|PRG1 serglycin protein-coding 203-27 chr13 40262807 40263101 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42452 NR_033877 400123 Hs.577960 NR_033877 ENSG00000215483 LINC00548 - long intergenic non-protein coding RNA 548 ncRNA 277.333-8 chr10 23319709 23320033 + 1.33333 NA intron (NM_153714, intron 4 of 4) intron (NM_153714, intron 4 of 4) -24086 NR_155752 105376453 NR_155752 LOC105376453 - uncharacterized LOC105376453 ncRNA 203-116 chr9 84132187 84132472 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 68886 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 166.666-4 chr12 74990490 74990668 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 219169 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 124.667-209 chr8 131696556 131696740 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -207445 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 325.333-29 chr4 43348524 43348944 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 143809 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 225.666-27 chr6 161300027 161300264 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -26084 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 173.333-5 chr1 42701589 42701769 + 1.33333 NA intron (NR_132737, intron 6 of 6) intron (NR_132737, intron 6 of 6) 18543 NR_132737 4904 Hs.473583 NM_004559 ENSG00000065978 YBX1 BP-8|CBF-A|CSDA2|CSDB|DBPB|EFI-A|MDR-NF1|NSEP-1|NSEP1|YB-1|YB1 Y-box binding protein 1 protein-coding 346.333-16 chr2 15184388 15184925 + 1.33333 NA intron (NR_052013, intron 49 of 50) MER1A|DNA|hAT-Charlie 376678 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 628.666 chr14 52342706 52343604 + 1.33333 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 28843 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 197.333-243 chr8 133927999 133928199 + 1.33333 NA Intergenic Tigger5|DNA|TcMar-Tigger 41603 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 192.666-48 chr4 111242338 111242518 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -381781 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 187.666-11 chr17 48029977 48030117 + 1.33333 NA intron (NM_016429, intron 6 of 8) AluSx3|SINE|Alu -2835 NR_162100 113218499 NR_162100 MIR10226 - microRNA 10226 ncRNA 160-118 chr8 74608596 74608836 + 1.33333 NA intron (NR_033830, intron 1 of 5) L1MEc|LINE|L1 8850 NR_033830 441355 Hs.647162 NR_033830 ENSG00000254349 MIR2052HG - MIR2052 host gene ncRNA 170.333-106 chr2 27694014 27694161 + 1.33333 NA intron (NM_018158, intron 13 of 13) L1MC5|LINE|L1 21645 NR_135200 100129995 Hs.515878 NR_135200 ENSG00000205334 LINC01460 - long intergenic non-protein coding RNA 1460 ncRNA 168.666-14 chr3 35440674 35440816 + 1.33333 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -46722 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 182.666-2 chr1 214851992 214852148 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -153472 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 241.999-2 chr1 223466486 223466673 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 73164 NM_152610 164127 Hs.192090 NM_152610 ENSG00000178395 CCDC185 C1orf65 coiled-coil domain containing 185 protein-coding 263.333-52 chr21 24472955 24473323 + 1.33333 NA intron (NR_135520, intron 4 of 5) intron (NR_135520, intron 4 of 5) 44399 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 172.666-17 chr3 106495230 106495378 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -625903 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 310.666-11 chr2 75416364 75416680 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107546 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 320-37 chr5 98455387 98455714 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -294311 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 278.667-9 chr11 108094828 108095338 + 1.33333 NA intron (NM_003478, intron 15 of 18) intron (NM_003478, intron 15 of 18) -26484 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 216.999 chr10 122562653 122562843 + 1.33333 NA intron (NM_004406, intron 1 of 39) intron (NM_004406, intron 1 of 39) 1994 NM_001320644 1755 Hs.279611 NM_004406 ENSG00000187908 DMBT1 GP340|SAG|SALSA|muclin deleted in malignant brain tumors 1 protein-coding 178-55 chr17 70746554 70746710 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 455547 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 395.333-18 chr8 91678282 91678761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 339159 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 258-83 chr8 25811831 25812167 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 233414 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 238.666-44 chr9 11333441 11333729 + 1.33333 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 720379 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 200-101 chr3 30937513 30937665 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -42928 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 183.333-159 chr8 98735980 98736222 + 1.33333 NA intron (NM_006281, intron 4 of 10) L1M5|LINE|L1 89570 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 203.333-183 chr3 154626457 154626662 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -196369 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 254.333-13 chr12 52948208 52948613 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_199187) promoter-TSS (NM_199187) -461 NM_199187 3875 Hs.406013 NM_000224 ENSG00000111057 KRT18 CK-18|CYK18|K18 keratin 18 protein-coding 266.667-33 chr19 7567114 7567489 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -28562 NM_020902 57662 Hs.17686 NM_020902 ENSG00000076826 CAMSAP3 KIAA1543|NEZHA|PPP1R80 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 3 protein-coding 276.667-23 chr14 21108874 21109229 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -4347 NM_001102454 51222 Hs.250493 NM_016423 ENSG00000165804 ZNF219 ZFP219 zinc finger protein 219 protein-coding 222.666-5 chr1 182526774 182526953 + 1.33333 NA intron (NM_001366934, intron 11 of 22) L1M4a2|LINE|L1 62393 NM_021133 6041 Hs.518545 NM_021133 ENSG00000135828 RNASEL PRCA1|RNS4 ribonuclease L protein-coding 235.333-113 chr7 41913111 41913389 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -210160 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 201.666-49 chr9 87732532 87732708 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 6501 NM_001257972 1514 Hs.731507 NM_001912 ENSG00000135047 CTSL CATL|CTSL1|MEP cathepsin L protein-coding 160-75 chr3 37934626 37934784 + 1.33333 NA intron (NM_001008392, intron 1 of 7) intron (NM_001008392, intron 1 of 7) -34699 NR_029499 407015 NR_029499 ENSG00000199075 MIR26A1 MIR26A|MIRN26A1|mir-26a-1 microRNA 26a-1 ncRNA 179.333-66 chr14 59501888 59502061 + 1.33333 NA intron (NM_016475, intron 6 of 6) intron (NM_016475, intron 6 of 6) 17457 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 140-70 chr22 32996617 32996811 + 1.33333 NA intron (NM_003490, intron 2 of 13) intron (NM_003490, intron 2 of 13) 10107 NM_133633 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 158.666-5 chr10 62224215 62224390 + 1.33333 NA intron (NM_145307, intron 6 of 11) L1MB3|LINE|L1 44542 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 226.667-74 chr5 95974791 95975069 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 12929 NR_130776 101929710 NR_130776 ENSG00000251314 LOC101929710 - uncharacterized LOC101929710 ncRNA 206-44 chr12 114036530 114036754 + 1.33333 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -70317 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 162.666 chr1 235495577 235495771 + 1.33333 NA intron (NM_152490, intron 1 of 11) intron (NM_152490, intron 1 of 11) 8778 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 339.333-39 chr6 51178303 51178639 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 359600 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 286.667-42 chr8 32310208 32310600 + 1.33333 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -130342 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 213.333-164 chr5 120906618 120906951 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 375320 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 144-85 chr20 16839023 16839169 + 1.33333 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 90743 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 151.333-96 chr12 21867833 21867976 + 1.33333 NA intron (NM_005691, intron 16 of 37) intron (NM_005691, intron 16 of 37) 68790 NM_005691 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 236-25 chr14 70902521 70902940 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4729 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 207.333-274 chr8 131492468 131492645 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -411537 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 192.667-75 chr17 58979513 58979792 + 1.33333 NA intron (NM_014906, intron 6 of 6) intron (NM_014906, intron 6 of 6) 127228 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 346-22 chr3 22258730 22259125 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 301788 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 238-104 chr8 84517452 84517805 + 1.33333 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 102144 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 196.666-67 chr3 149543633 149543804 + 1.33333 NA intron (NM_001348362, intron 6 of 9) intron (NM_001348362, intron 6 of 9) 69021 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 197.666-26 chr17 55353166 55353327 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 68589 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 436.333-4 chr5 80604034 80604673 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 18171 NR_125754 103689917 Hs.740035 NR_125754 ENSG00000251221 LINC01337 TCONS_00009713 long intergenic non-protein coding RNA 1337 ncRNA 212.667-87 chr3 9639160 9639422 + 1.33333 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -10214 NM_001077525 64419 Hs.475382 NM_022485 ENSG00000163719 MTMR14 C3orf29 myotubularin related protein 14 protein-coding 232.333-66 chr5 29354563 29354883 + 1.33333 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 41253 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 204.667-124 chr5 95585467 95585725 + 1.33333 NA intron (NM_198150, intron 4 of 7) L1PB1|LINE|L1 30495 NM_198150 153642 Hs.585051 NM_198150 ENSG00000164291 ARSK TSULF arylsulfatase family member K protein-coding 261.333-33 chr15 86718883 86719400 + 1.33333 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -213739 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 265-5 chr1 111551651 111551982 + 1.33333 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) L1MB7|LINE|L1 9807 NM_001370216 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 328.666-21 chr8 71291548 71291825 + 1.33333 NA intron (NM_001370336, intron 10 of 17) intron (NM_001370336, intron 10 of 17) 65020 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 210-153 chr9 8350442 8350681 + 1.33333 NA intron (NM_130392, intron 24 of 30) intron (NM_130392, intron 24 of 30) 383385 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 212.666-96 chr9 28085261 28085476 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -511502 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 292-2 chr10 34662429 34662868 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) AluSx1|SINE|Alu 152648 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 376.333-2 chr12 28393501 28394005 + 1.33333 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) intron (NM_001352082, intron 9 of 13) -203015 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 233.333-49 chr18 9286677 9287020 + 1.33333 NA TTS (NM_015208) TTS (NM_015208) -47925 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 302.666-9 chr19 42699515 42699997 + 1.33333 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 40725 NM_021016 5671 Hs.654413 NM_021016 ENSG00000221826 PSG3 - pregnancy specific beta-1-glycoprotein 3 protein-coding 364.333-19 chr21 30733865 30734262 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13196 NM_181617 337978 Hs.553699 NM_181617 ENSG00000187026 KRTAP21-2 KAP21.2 keratin associated protein 21-2 protein-coding 272.666-30 chr9 84155698 84156017 + 1.33333 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 92414 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 303.333-31 chr16 76535024 76535508 + 1.33333 NA intron (NM_001322179, intron 17 of 22) intron (NM_001322179, intron 17 of 22) -99732 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 148.666-7 chr3 27179456 27179580 + 1.33333 NA intron (NM_001304384, intron 5 of 16) intron (NM_001304384, intron 5 of 16) 37005 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 285.666 chr10 34475403 34475637 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 3 of 22) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 339776 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 277.333-32 chr15 56255322 56255697 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10427 NM_001370561 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 161-23 chr14 64754301 64754447 + 1.33333 NA intron (NM_001024858, intron 31 of 34) LTR78B|LTR|ERV1 31312 NR_107009 102465841 NR_107009 ENSG00000284269 MIR7855 hsa-mir-7855 microRNA 7855 ncRNA 228.666-32 chr3 138130201 138130452 + 1.33333 NA intron (NM_016161, intron 2 of 2) intron (NM_016161, intron 2 of 2) 2064 NM_016161 51146 Hs.278960 NM_016161 ENSG00000118017 A4GNT alpha4GnT alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 203.333-58 chr12 114363541 114363703 + 1.33333 NA intron (NM_000192, intron 8 of 8) intron (NM_000192, intron 8 of 8) 42522 NM_181486 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 394.333-13 chr3 2596461 2596936 + 1.33333 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) MIR|SINE|MIR -295517 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 201.666-30 chr3 32634661 32634910 + 1.33333 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 -50403 NR_046352 25904 Hs.444851 NM_015442 ENSG00000182973 CNOT10 - CCR4-NOT transcription complex subunit 10 protein-coding 175.333-135 chr4 70517756 70517934 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001286731) promoter-TSS (NM_001286731) -724 NM_001286731 401138 Hs.453069 NM_212557 ENSG00000187689 AMTN AI3B|UNQ689 amelotin protein-coding 238.333-81 chr6 150521135 150521422 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -78607 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 280.666-32 chrX 62694644 62694904 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 656558 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 206-9 chr1 108754148 108754402 + 1.33333 NA intron (NM_007269, intron 3 of 18) AluJb|SINE|Alu 7601 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 180.667-129 chr6 145102063 145102292 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 584700 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 361.666 chr10 76970740 76971126 + 1.33333 NA intron (NM_001161353, intron 18 of 27) intron (NM_001161353, intron 18 of 27) 82889 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 404.666-10 chr3 118082210 118082724 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -391542 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 186-45 chr2 26090254 26090494 + 1.33333 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) HAL1|LINE|L1 56290 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 189.333-161 chr5 102594650 102594854 + 1.33333 NA intron (NR_047462, intron 1 of 1) intron (NR_047462, intron 1 of 1) 13384 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 351.333-20 chr21 29188441 29188959 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4794 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 209.667-66 chr2 107765017 107765324 + 1.33333 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) L1MB4|LINE|L1 11058 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 211.333-158 chr4 25475358 25475563 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 93886 NR_134641 101929161 Hs.125638 NR_134641 LOC101929161 - uncharacterized LOC101929161 ncRNA 221.666-40 chr4 168954341 168954552 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 55809 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 216-73 chr22 27719834 27720109 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 81785 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 274.333-8 chr10 110701320 110701710 + 1.33333 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 57179 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 221.666-56 chr8 139386972 139387196 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 316039 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 408.666-6 chr9 96036247 96036716 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -14670 NR_024129 100188953 Hs.434310 NR_024129 ENSG00000225194 LINC00092 NCRNA00092 long intergenic non-protein coding RNA 92 ncRNA 193.333-132 chr3 195276983 195277236 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_012287, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_012287, exon 23 of 23) -5950 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 193.333-86 chr2 40390119 40390284 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 40103 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 255-70 chr5 169216015 169216359 + 1.33333 NA intron (NM_003062, intron 3 of 35) intron (NM_003062, intron 3 of 35) 47507 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 223-60 chr7 8392384 8392666 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -41084 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 241-37 chr3 112482785 112483122 + 1.33333 NA intron (NM_001085357, intron 1 of 3) intron (NM_001085357, intron 1 of 3) 16519 NM_001085357 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 198-164 chr6 140393457 140393638 + 1.33333 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL 188295 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 258.333-19 chr13 57412377 57412577 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -219267 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 189.666-23 chr2 198773171 198773325 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -398151 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 196-40 chr12 71455861 71456010 + 1.33333 NA intron (NR_110596, intron 1 of 19) intron (NR_110596, intron 1 of 19) 16137 NM_001277226 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 208.666-65 chr21 27677752 27678028 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44489 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 242.667-85 chr5 91963669 91964019 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -580527 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 277.999 chr1 109595869 109596189 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_006496, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_006496, exon 9 of 9) -2864 NR_029583 406974 NR_029583 ENSG00000284443 MIR197 MIRN197|miR-197|miRNA197 microRNA 197 ncRNA 177-72 chr6 144341694 144341866 + 1.33333 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) intron (NM_007124, intron 1 of 73) 50043 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 135.333-141 chr5 54342771 54342915 + 1.33333 NA intron (NR_126379, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 21899 NR_126379 104355136 Hs.559024 NR_126379 ENSG00000249069 LINC01033 - long intergenic non-protein coding RNA 1033 ncRNA 308-27 chr2 137177994 137178349 + 1.33333 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 412626 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 272.333-53 chr4 189044178 189044678 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 267771 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 205-27 chr13 110476984 110477212 + 1.33333 NA intron (NM_001846, intron 29 of 47) FLAM_C|SINE|Alu -13811 NM_001267044 100129836 Hs.640035 NM_001267044 COL4A2-AS2 - COL4A2 antisense 2 protein-coding 343.666-6 chr3 52762064 52762348 + 1.33333 NA intron (NM_003157, intron 5 of 15) intron (NM_003157, intron 5 of 15) 8734 NM_001348414 6787 Hs.631921 NM_003157 ENSG00000114904 NEK4 NRK2|STK2|pp12301 NIMA related kinase 4 protein-coding 134.333-58 chr15 64116486 64116645 + 1.33333 NA intron (NM_148955, intron 2 of 12) intron (NM_148955, intron 2 of 12) 20583 NM_001242933 6642 Hs.188634 NM_003099 ENSG00000028528 SNX1 HsT17379|VPS5 sorting nexin 1 protein-coding 173.333-71 chr16 84964315 84964453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47151 NM_001145548 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 189.666-39 chr8 132654041 132654242 + 1.33333 NA intron (NR_135912, intron 3 of 11) L1M4|LINE|L1 21404 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 196.333-41 chr14 66351896 66352186 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -134330 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 211.333-64 chr14 73280367 73280648 + 1.33333 NA intron (NM_001005743, intron 11 of 12) intron (NM_001005743, intron 11 of 12) -34506 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 219.333-88 chr2 11287962 11288166 + 1.33333 NA intron (NM_001321643, intron 1 of 32) intron (NM_001321643, intron 1 of 32) 56572 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 216.333-115 chr5 60954126 60954393 + 1.33333 NA intron (NM_174889, intron 1 of 3) intron (NM_174889, intron 1 of 3) 9054 NM_174889 91942 Hs.591757 NM_174889 ENSG00000164182 NDUFAF2 B17.2L|MC1DN10|MMTN|NDUFA12L|mimitin NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 protein-coding 232-5 chr1 71069800 71070147 + 1.33333 NA intron (NM_203350, intron 7 of 9) intron (NM_203350, intron 7 of 9) -2257 NR_029707 406962 NR_029707 ENSG00000207721 MIR186 MIRN186|miR-186 microRNA 186 ncRNA 172-75 chr3 178993732 178993945 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 77971 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 161.666-10 chr6 133999179 133999328 + 1.33333 NA intron (NM_145176, intron 4 of 4) intron (NM_145176, intron 4 of 4) 46029 NM_004865 9519 Hs.486507 NM_004865 ENSG00000028839 TBPL1 MGC:8389|MGC:9620|STUD|TLF|TLP|TRF2 TATA-box binding protein like 1 protein-coding 395.333-19 chr8 133151802 133152160 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -39058 NM_080838 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 184.666-4 chr1 218512384 218512579 + 1.33333 NA intron (NR_146760, intron 1 of 2) intron (NR_146760, intron 1 of 2) 2386 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 256-75 chr5 44813893 44814211 + 1.33333 NA intron (NM_016640, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 5105 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 262-80 chr8 120205919 120206236 + 1.33333 NA intron (NM_021110, intron 9 of 47) intron (NM_021110, intron 9 of 47) 80975 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 481.333 chr17 60868965 60869565 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 8 of 25) MIR3|SINE|MIR 191414 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 178.666-9 chr19 36647606 36647797 + 1.33333 NA intron (NM_001322821, intron 4 of 5) L1M3|LINE|L1 19136 NM_001322827 92283 Hs.590972 NM_153257 ENSG00000197808 ZNF461 GIOT-1|GIOT1|HZF28 zinc finger protein 461 protein-coding 223.333-111 chr4 65530613 65530848 + 1.33333 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 138758 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 171.333-183 chr7 69951166 69951350 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 352783 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 235.333-36 chr15 86859201 86859396 + 1.33333 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -73582 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 303.333-4 chr1 103200480 103200750 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92093 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 202-71 chr18 64320708 64321003 + 1.33333 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) L1MC1|LINE|L1 -60800 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 182.333-123 chr5 39400862 39401123 + 1.33333 NA intron (NM_001343, intron 1 of 14) intron (NM_001343, intron 1 of 14) 23988 NM_001343 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 187.333-38 chr11 130966007 130966290 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -49661 NM_001347926 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 295.333-19 chr16 11786445 11786869 + 1.33333 NA intron (NM_014153, intron 1 of 22) intron (NM_014153, intron 1 of 22) 10601 NM_014153 29066 Hs.371856 NM_014153 ENSG00000122299 ZC3H7A HSPC055|ZC3H7|ZC3HDC7 zinc finger CCCH-type containing 7A protein-coding 360.999-3 chr5 51519610 51519970 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 136342 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 323.333-33 chr8 91020010 91020434 + 1.33333 NA exon (NM_018710, exon 3 of 7) exon (NM_018710, exon 3 of 7) 20637 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 182-96 chr6 142126466 142126698 + 1.33333 NA intron (NM_001324308, intron 1 of 2) L1MA9|LINE|L1 -6577 NM_001358410 100126572 NM_001358410 ENSG00000203733 GJE1 CX23 gap junction protein epsilon 1 protein-coding 333.666-6 chr2 52908921 52909238 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -206464 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 212.333-35 chr12 82308243 82308455 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 50038 NM_014167 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 184.666-6 chr10 87662133 87662338 + 1.33333 NA intron (NM_001015880, intron 1 of 12) L2b|LINE|L2 2357 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 255.333-18 chr11 84678968 84679184 + 1.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 41866 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 155.666-4 chr3 36398101 36398336 + 1.33333 NA intron (NM_001292049, intron 1 of 8) intron (NM_001292049, intron 1 of 8) 17731 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 201-78 chr3 139615076 139615272 + 1.33333 NA intron (NM_001320510, intron 3 of 6) L1MC4|LINE|L1 62798 NM_001320510 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 189-24 chr14 35936308 35936486 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 110059 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 328.666-8 chr2 44498879 44499337 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 137161 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 188-70 chr3 45522554 45522714 + 1.33333 NA intron (NM_001368263, intron 18 of 20) AluSz|SINE|Alu -13089 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 124-87 chr4 47383509 47383728 + 1.33333 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 80084 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 181.333-166 chr7 128183984 128184152 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -23804 NR_029596 406917 NR_029596 ENSG00000207705 MIR129-1 MIR-129b|MIRN129-1|mir-129-1 microRNA 129-1 ncRNA 220-69 chr20 46603838 46604076 + 1.33333 NA intron (NM_001193340, intron 4 of 12) AluJb|SINE|Alu 47502 NM_022829 64849 Hs.655498 NM_022829 ENSG00000158296 SLC13A3 ARLIAK|NADC3|SDCT2 solute carrier family 13 member 3 protein-coding 262.333-32 chr16 13333874 13334158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 432418 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 198-119 chr3 42068694 42068843 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -18432 NR_146089 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 258-56 chr5 9362188 9362547 + 1.33333 NA intron (NM_003966, intron 3 of 22) intron (NM_003966, intron 3 of 22) -148966 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 188-27 chr11 89505295 89505569 + 1.33333 NA intron (NM_001143837, intron 2 of 20) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -13213 NM_001300995 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 216-9 chr1 229748228 229748410 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 122072 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 175.333-145 chr5 100685709 100685935 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 130743 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 221.333-59 chr2 43965816 43966074 + 1.33333 NA intron (NM_133259, intron 11 of 37) L1MA9|LINE|L1 30044 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 232.999-2 chr10 74908787 74908969 + 1.33333 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) intron (NM_001370144, intron 3 of 15) -3908 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 186-70 chr4 37181532 37181784 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 60333 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 174-29 chr13 110862409 110862664 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7772 NR_027701 283487 Hs.245390 NM_178514 ENSG00000255874 LINC00346 C13orf29|NCRNA00346 long intergenic non-protein coding RNA 346 ncRNA 206.666-131 chrX 73557466 73557627 + 1.33333 NA intron (NR_029423, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 5539 NR_029423 139201 Hs.586477 NR_029423 ENSG00000269904 MAP2K4P1 - mitogen-activated protein kinase kinase 4 pseudogene 1 pseudo 286.333-30 chr3 128017437 128017745 + 1.33333 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -34846 NM_013336 29927 Hs.518236 NM_013336 ENSG00000058262 SEC61A1 HNFJ4|HSEC61|SEC61|SEC61A SEC61 translocon alpha 1 subunit protein-coding 290.666-5 chr1 246765607 246765877 + 1.33333 NA intron (NM_016002, intron 10 of 11) MIR|SINE|MIR -23875 NR_015422 149134 Hs.720494 NM_207326 LINC01341 - long intergenic non-protein coding RNA 1341 ncRNA 122-31 chr14 31426800 31427007 + 1.33333 NA intron (NR_110045, intron 2 of 3) intron (NR_110045, intron 2 of 3) 6145 NR_110045 101927124 Hs.647561 NR_110045 ENSG00000250365 LOC101927124 - uncharacterized LOC101927124 ncRNA 178-28 chr11 84274398 84274582 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -1210 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 231.666-19 chr3 70384063 70384236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -71511 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 219-77 chr7 89081016 89081198 + 1.33333 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -285370 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 294.667-11 chr14 26359594 26359995 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 193636 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 195.333-69 chr13 46027861 46028018 + 1.33333 NA intron (NM_001330566, intron 5 of 19) L1MCa|LINE|L1 24807 NM_001076788 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 202.333-124 chr4 58260005 58260289 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 276181 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 246-82 chr4 150650372 150650698 + 1.33333 NA intron (NM_001367550, intron 37 of 56) intron (NM_001367550, intron 37 of 56) 68384 NM_006439 10586 Hs.584852 NM_006439 ENSG00000181541 MAB21L2 MCOPS14|MCSKS14 mab-21 like 2 protein-coding 244.666-44 chr6 47577353 47577565 + 1.33333 NA intron (NM_012120, intron 8 of 17) L1ME3G|LINE|L1 -79013 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 197.333-162 chr4 33654590 33654786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 385205 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 287.333-53 chr5 56926829 56927135 + 1.33333 NA non-coding (NR_136555, exon 5 of 5) non-coding (NR_136555, exon 5 of 5) 16920 NR_136557 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 214-34 chr14 47757200 47757474 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 3767 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 198.666-27 chr15 73203943 73204109 + 1.33333 NA intron (NM_002499, intron 7 of 28) L1MCa|LINE|L1 -95884 NR_162148 113219462 NR_162148 MIR12135 - microRNA 12135 ncRNA 225.333-58 chr15 60080193 60080484 + 1.33333 NA Intergenic Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 76027 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 273.666-3 chr1 233277124 233277348 + 1.33333 NA intron (NM_014801, intron 1 of 33) intron (NM_014801, intron 1 of 33) 18489 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 285.333-48 chr4 30773477 30773779 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 53259 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 249.666-33 chr5 34919727 34920117 + 1.33333 NA intron (NM_018321, intron 3 of 9) intron (NM_018321, intron 3 of 9) 4211 NM_018321 55299 Hs.718510 NM_018321 ENSG00000113460 BRIX1 BRIX|BXDC2 biogenesis of ribosomes BRX1 protein-coding 165.333-80 chr14 71708752 71708969 + 1.33333 NA intron (NM_001354286, intron 17 of 24) intron (NM_001354286, intron 17 of 24) 122562 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 204.666-74 chr5 110832482 110832657 + 1.33333 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 93562 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 251.333-56 chr2 66890701 66891052 + 1.33333 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -13560 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 221.667-67 chr5 80744419 80744701 + 1.33333 NA exon (NM_002439, exon 12 of 24) exon (NM_002439, exon 12 of 24) -89577 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 183.333-5 chr1 82900567 82900727 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -2536 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 209.333-196 chr5 144832634 144832811 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 627331 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 205.666-31 chr20 57078459 57078629 + 1.33333 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -135152 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 243-40 chr3 79027317 79027594 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) -7996 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 278-53 chr6 142080888 142081273 + 1.33333 NA intron (NM_001324308, intron 1 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 7719 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 194.667-70 chr2 123634989 123635227 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 390066 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 204-72 chr16 29704348 29704601 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25294 NR_134536 23475 Hs.513484 NM_014298 ENSG00000103485 QPRT HEL-S-90n|QPRTase quinolinate phosphoribosyltransferase protein-coding 358-12 chr2 74690113 74690612 + 1.33333 NA Intergenic (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 36115 NR_073399 10505 Hs.25887 NM_004263 ENSG00000135622 SEMA4F M-SEMA|PRO2353|S4F|SEMAM|SEMAW|m-Sema-M ssemaphorin 4F protein-coding 285.333-73 chr8 120298950 120299329 + 1.33333 NA intron (NM_021110, intron 35 of 47) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 146011 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 176-29 chr14 51613850 51614013 + 1.33333 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) MER33|DNA|hAT-Charlie -13979 NR_047477 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 212.667-125 chr7 16315430 16315700 + 1.33333 NA intron (NM_001101417, intron 2 of 8) L1MC1|LINE|L1 105079 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 198.667-163 chr6 96224888 96225149 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 209044 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 196-67 chr17 43076724 43076919 + 1.33333 NA intron (NR_027676, intron 12 of 22) intron (NR_027676, intron 12 of 22) 47294 NM_007298 672 Hs.194143 NM_007294 ENSG00000012048 BRCA1 BRCAI|BRCC1|BROVCA1|FANCS|IRIS|PNCA4|PPP1R53|PSCP|RNF53 BRCA1 DNA repair associated protein-coding 302.666-7 chr15 57723395 57723691 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 16829 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 186.333-23 chr11 5907310 5907462 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 6621 NM_001005166 390082 NM_001005166 ENSG00000277932 OR52E5 OR11-56 olfactory receptor family 52 subfamily E member 5 protein-coding 341.333-20 chr4 171294994 171295395 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 109010 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 262.333-82 chr8 144133155 144133484 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4455 NM_016458 51236 Hs.300224 NM_016458 ENSG00000235173 HGH1 BRP16|BRP16L|C8orf30A|C8orf30B|FAM203A|FAM203B HGH1 homolog protein-coding 219.333-147 chr5 154010978 154011175 + 1.33333 NA intron (NM_001317993, intron 10 of 14) intron (NM_001317993, intron 10 of 14) 27834 NM_018691 10827 Hs.166551 NM_018691 ENSG00000055147 FAM114A2 133K02|C5orf3 family with sequence similarity 114 member A2 protein-coding 210.333-99 chr3 39221317 39221532 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -28829 NM_001198621 165904 Hs.447868 NM_194293 ENSG00000168334 XIRP1 CMYA1|Xin xin actin binding repeat containing 1 protein-coding 163-7 chr10 35768043 35768382 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10090 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 217-15 chr12 97657083 97657319 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 93389 NR_029678 406926 NR_029678 ENSG00000207586 MIR135A2 MIRN135-2|MIRN135A2|mir-135a-2 microRNA 135a-2 ncRNA 276.333-12 chr13 45661302 45661596 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39735 NR_125786 103752581 NR_125786 LINC01055 - long intergenic non-protein coding RNA 1055 ncRNA 230-67 chr7 90446984 90447238 + 1.33333 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 -22528 NM_001365443 102723899 Hs.731917 NM_001365443 LOC102723899 - uncharacterized LOC102723899 protein-coding 234 chr1 43475357 43475615 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -21497 NM_001190880 81888 Hs.709864 NM_031207 ENSG00000178922 HYI HT036 hydroxypyruvate isomerase (putative) protein-coding 270.667-58 chr8 130572066 130572474 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -128596 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 187.666-22 chr4 19188922 19189079 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -1062905 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 272.667-12 chr11 101103325 101103721 + 1.33333 NA intron (NM_000926, intron 2 of 7) intron (NM_000926, intron 2 of 7) 25540 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 194.666-22 chr14 71062626 71062774 + 1.33333 NA intron (NM_014982, intron 26 of 35) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 155241 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 263.333-31 chr16 17748689 17749029 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -277899 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 235.333-123 chr8 100348005 100348201 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11899 NM_001280539 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 221-40 chr20 41036230 41036480 + 1.33333 NA intron (NM_003286, intron 2 of 20) intron (NM_003286, intron 2 of 20) 7533 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 375.333-12 chr2 182711874 182712373 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -4134 NR_073365 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 192.666-44 chr3 142272740 142272908 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -47239 NR_033289 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 212.666-7 chr1 197115325 197115487 + 1.33333 NA intron (NM_018136, intron 17 of 27) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 31263 NM_018136 259266 Hs.121028 NM_018136 ENSG00000066279 ASPM ASP|Calmbp1|MCPH5 abnormal spindle microtubule assembly protein-coding 355.666-9 chr3 132322031 132322423 + 1.33333 NA intron (NM_001292037, intron 1 of 8) intron (NM_001292037, intron 1 of 8) 4820 NM_001134194 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 152-38 chr12 7631327 7631520 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 34485 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 370.667-6 chr10 118507289 118507811 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 88098 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 203.999-5 chr6 137504643 137504797 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10326 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 238-75 chr5 62358063 62358254 + 1.33333 NA exon (NM_004520, exon 9 of 20) exon (NM_004520, exon 9 of 20) 45747 NM_014473 27292 Hs.731665 NM_014473 ENSG00000086189 DIMT1 DIM1|DIMT1L|HSA9761|HUSSY5 DIMT1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor protein-coding 213-55 chr3 177327849 177328026 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 33495 NR_047465 100820709 Hs.518409 NR_047465 ENSG00000203645 LINC00501 - long intergenic non-protein coding RNA 501 ncRNA 200.667-161 chr8 130819018 130819316 + 1.33333 NA intron (NM_001115, intron 13 of 17) MIRb|SINE|MIR 221742 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 160.333-88 chr13 77612187 77612389 + 1.33333 NA intron (NM_003843, intron 21 of 31) intron (NM_003843, intron 21 of 31) -5737 NR_126412 104355296 Hs.667682 NR_126412 ENSG00000224347 SCEL-AS1 - SCEL antisense RNA 1 ncRNA 201.333-257 chr7 17818937 17819139 + 1.33333 NA intron (NM_001350862, intron 18 of 25) L2a|LINE|L2 121456 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 301.333-5 chr1 100786928 100787350 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67397 NM_001078 7412 Hs.109225 NM_001078 ENSG00000162692 VCAM1 CD106|INCAM-100 vascular cell adhesion molecule 1 protein-coding 305.333-59 chr5 161013322 161013718 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74894 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 272.666-2 chr10 114017971 114018332 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25715 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 178.333-146 chr5 157609671 157609926 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -34023 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 448.332 chr2 39162001 39162489 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41782 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 204.667-135 chr6 132497374 132497666 + 1.33333 NA intron (NM_001326579, intron 2 of 9) L1ME3A|LINE|L1 15263 NM_001326578 8417 Hs.593148 NM_003569 ENSG00000079950 STX7 - syntaxin 7 protein-coding 412-2 chr14 30031087 30031813 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -103603 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 215.333-216 chrX 46496294 46496507 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49021 NM_001039891 641339 Hs.636105 NM_001039891 ENSG00000251192 ZNF674 MRX92|ZNF673B zinc finger protein 674 protein-coding 366-12 chr2 117793959 117794471 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20476 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 214.333-67 chr18 41063808 41064108 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 456719 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 317.999-4 chr14 68163537 68163844 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 340098 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 201.333-164 chr2 224605284 224605510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20000 NM_001257197 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 202.333-135 chr5 7868248 7868517 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001364442) promoter-TSS (NM_001364442) 649 NM_024091 79072 Hs.653162 NM_024091 ENSG00000124279 FASTKD3 - FAST kinase domains 3 protein-coding 192-63 chr17 65518730 65518967 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 42800 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 217-13 chr11 113264071 113264327 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001076682, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001076682, exon 19 of 19) 9702 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 242-53 chr4 89268338 89268596 + 1.33333 NA intron (NM_198281, intron 1 of 1) intron (NM_198281, intron 1 of 1) 39333 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 224.333-65 chr2 152415772 152415982 + 1.33333 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) intron (NM_052905, intron 1 of 25) 80703 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 212-66 chr16 23903475 23903784 + 1.33333 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) intron (NM_002738, intron 2 of 16) 67646 NM_212535 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 278.333-29 chr20 5963652 5964019 + 1.33333 NA intron (NM_182802, intron 8 of 18) AluY|SINE|Alu 13183 NM_032485 84515 Hs.597484 NM_032485 ENSG00000125885 MCM8 C20orf154|POF10|dJ967N21.5 minichromosome maintenance 8 homologous recombination repair factor protein-coding 158.666-3 chr1 66736311 66736446 + 1.33333 NA intron (NM_001350218, intron 19 of 22) (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -16081 NM_152665 200132 Hs.479226 NM_152665 ENSG00000152760 TCTEX1D1 - Tctex1 domain containing 1 protein-coding 183.333-88 chr2 180844013 180844298 + 1.33333 NA intron (NR_104324, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR -136230 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 351.333-30 chr7 26435295 26435646 + 1.33333 NA intron (NR_148500, intron 2 of 5) intron (NR_148500, intron 2 of 5) -36052 NR_136272 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 156.666-10 chr3 64520713 64520884 + 1.33333 NA intron (NM_001318781, intron 38 of 38) L1PA17|LINE|L1 -40548 NR_110150 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 197.666-34 chr2 223521788 223521979 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 80478 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 215-22 chr15 22901375 22901687 + 1.33333 NA intron (NM_001033028, intron 7 of 15) L1MC4|LINE|L1 15782 NM_001033028 23191 Hs.26704 NM_014608 ENSG00000273749 CYFIP1 P140SRA-1|SHYC|SRA-1|SRA1 cytoplasmic FMR1 interacting protein 1 protein-coding 217.333-80 chr20 6561086 6561391 + 1.33333 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 134506 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 258.333-74 chr9 25856791 25857029 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 76854 NR_121604 101929582 Hs.140547 NR_121604 ENSG00000236306 LINC01241 - long intergenic non-protein coding RNA 1241 ncRNA 302.333-16 chr17 31816304 31816677 + 1.33333 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 42472 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 172-66 chr20 47574737 47574925 + 1.33333 NA intron (NM_181659, intron 1 of 22) intron (NM_181659, intron 1 of 22) 72944 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 454.333-6 chrX 74677094 74677702 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -62774 NM_016120 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 159.333-308 chr7 44322382 44322575 + 1.33333 NA intron (NM_172081, intron 1 of 18) intron (NM_172081, intron 1 of 18) 3116 NM_172078 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 176.667-50 chr13 50891939 50892194 + 1.33333 NA intron (NR_046552, intron 1 of 2) intron (NR_046552, intron 1 of 2) -17612 NM_001142279 79621 Hs.306291 NM_024570 ENSG00000136104 RNASEH2B AGS2|DLEU8 ribonuclease H2 subunit B protein-coding 158.666-30 chr7 50511063 50511270 + 1.33333 NA intron (NM_001242889, intron 4 of 12) (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -20593 NR_033845 100129427 Hs.680434 NR_033845 ENSG00000226122 DDC-AS1 - DDC antisense RNA 1 ncRNA 318.333 chr1 55205918 55206332 + 1.33333 NA intron (NM_015306, intron 1 of 67) intron (NM_015306, intron 1 of 67) 9239 NM_015306 23358 Hs.477009 NM_015306 ENSG00000162402 USP24 - ubiquitin specific peptidase 24 protein-coding 219.333-9 chr1 118065980 118066162 + 1.33333 NA intron (NM_206996, intron 18 of 48) intron (NM_206996, intron 18 of 48) 119157 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 284-17 chr14 73804851 73805120 + 1.33333 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 17625 NR_109995 100506476 Hs.287299 NR_109995 LOC100506476 - uncharacterized LOC100506476 ncRNA 188-99 chr7 44850084 44850356 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2094 NM_012412 94239 Hs.488189 NM_012412 ENSG00000105968 H2AFV H2A.Z-2|H2AV H2A histone family member V protein-coding 226.666-6 chr11 129021476 129021822 + 1.33333 NA intron (NM_001142685, intron 10 of 21) intron (NM_001142685, intron 10 of 21) 2539 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 329.333-10 chr13 48295444 48295801 + 1.33333 NA TTS (NR_046414) TTS (NR_046414) 8080 NR_046414 100862704 Hs.374221 NR_046414 ENSG00000231473 RB1-DT LINC00441|ncRNA-RB1 RB1 divergent transcript ncRNA 215.333-133 chr3 86259008 86259253 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -222813 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 247.666-5 chr11 16324797 16324993 + 1.33333 NA intron (NM_033326, intron 2 of 15) L1MA5|LINE|L1 31651 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 233-24 chr14 44903914 44904227 + 1.33333 NA intron (NM_001017923, intron 3 of 4) intron (NM_001017923, intron 3 of 4) 6795 NM_001017923 122525 Hs.82098 NM_001017923 ENSG00000179476 C14orf28 DRIP-1|DRIP1|c14_5270 chromosome 14 open reading frame 28 protein-coding 235.333-121 chr8 69240152 69240387 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -136079 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 232.333-65 chr4 112827678 112827918 + 1.33333 NA intron (NM_001354275, intron 1 of 43) L1PREC2|LINE|L1 9801 NM_001354253 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 351.666-6 chr2 79939650 79940094 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) AluSp|SINE|Alu -73289 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 200.667-98 chr21 21769971 21770260 + 1.33333 NA intron (NR_109958, intron 2 of 4) (TAATTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 23130 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 413-10 chr3 121717646 121718089 + 1.33333 NA intron (NM_001256486, intron 8 of 21) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 31874 NM_004487 2804 Hs.213389 NM_004487 ENSG00000173230 GOLGB1 GCP|GCP372|GOLIM1 golgin B1 protein-coding 391.333-15 chr4 30766982 30767448 + 1.33333 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 46846 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 299.667-37 chr8 60341503 60341991 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -60347 NM_001321837 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 394.666-3 chr16 73489060 73489518 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 102484 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 287.333-51 chr5 42359916 42360212 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63375 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 304.333-13 chr15 93224854 93225226 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 18974 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 191-17 chr13 86873928 86874178 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37867 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 279.666-8 chr3 99959204 99959463 + 1.33333 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu 5065 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 192-140 chr7 92043232 92043424 + 1.33333 NA intron (NM_147185, intron 20 of 49) intron (NM_147185, intron 20 of 49) 91149 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 203.666-25 chr15 58876187 58876379 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 57396 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 146.667-208 chr22 28307083 28307269 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -152693 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 212.666-41 chr2 63489376 63489552 + 1.33333 NA intron (NR_148704, intron 3 of 18) L1MC4|LINE|L1 -51457 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 356-8 chr11 30792561 30793031 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 199890 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 219.666-27 chr20 10580825 10581063 + 1.33333 NA intron (NM_001009608, intron 4 of 7) intron (NM_001009608, intron 4 of 7) 68751 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 245.666-9 chr14 63053118 63053441 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -7821 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 256.333-55 chr3 142483025 142483383 + 1.33333 NA intron (NM_001354579, intron 35 of 45) intron (NM_001354579, intron 35 of 45) -35142 NM_001282859 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 196.333-12 chr10 88999999 89000191 + 1.33333 NA intron (NR_135314, intron 1 of 8) intron (NR_135314, intron 1 of 8) -7120 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 295-50 chr9 37818997 37819491 + 1.33333 NA intron (NM_024345, intron 1 of 6) intron (NM_024345, intron 1 of 6) 18447 NM_024345 79269 Hs.118394 NM_024345 ENSG00000122741 DCAF10 WDR32 DDB1 and CUL4 associated factor 10 protein-coding 163.333-226 chr5 98614256 98614471 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -154269 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 199.333-149 chr2 179346663 179346884 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -81941 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 237.333-130 chr9 33458002 33458186 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 9841 NR_106910 102465512 NR_106910 ENSG00000275651 MIR6851 hsa-mir-6851 microRNA 6851 ncRNA 240.333-69 chr4 83152313 83152647 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -37751 NM_001130715 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 203-78 chr5 35173361 35173549 + 1.33333 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) -55333 NM_001204316 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 213-89 chr9 69534237 69534543 + 1.33333 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) intron (NM_001163, intron 1 of 12) 137981 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 317-16 chr2 63472546 63473001 + 1.33333 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) AluSx|SINE|Alu -34766 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 196.666-89 chr6 61714792 61714976 + 1.33333 NA intron (NR_146872, intron 7 of 9) L1PB4|LINE|L1 140754 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 144-99 chr3 22570244 22570382 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 613174 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 191.333-17 chr1 246658522 246658713 + 1.33333 NA intron (NM_152609, intron 9 of 10) intron (NM_152609, intron 9 of 10) -65792 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 211.333-42 chr12 30042785 30043043 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -258155 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 197.333-80 chr17 43916301 43916497 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_026770) promoter-TSS (NR_026770) -809 NR_026770 23591 Hs.721804 NR_026770 ENSG00000267496 FAM215A APR-2|C17orf88|LINC00530 family with sequence similarity 215 member A ncRNA 172.667-12 chr1 162849525 162849757 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19174 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 165.667-27 chr11 37617496 37617681 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -321013 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 274.666-15 chr17 67096755 67097153 + 1.33333 NA intron (NM_001330447, intron 31 of 32) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 52400 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 154.667-106 chr14 46488331 46488553 + 1.33333 NA intron (NR_102700, intron 1 of 1) intron (NR_102700, intron 1 of 1) 17083 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 154.333-292 chr6 49682288 49682435 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 31182 NM_001142408 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 202.666-89 chr4 108259977 108260210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87973 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 218.667-76 chr4 59238374 59238637 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 224932 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 232.333-48 chr2 202190076 202190361 + 1.33333 NA exon (NM_001367720, exon 19 of 24) exon (NM_001367720, exon 19 of 24) 48379 NM_001005781 7341 Hs.81424 NM_003352 ENSG00000116030 SUMO1 DAP1|GMP1|OFC10|PIC1|SENP2|SMT3|SMT3C|SMT3H3|UBL1 small ubiquitin like modifier 1 protein-coding 165.333-137 chr2 228863153 228863440 + 1.33333 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy -251901 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 198-137 chr4 71251305 71251484 + 1.33333 NA intron (NM_001098484, intron 2 of 25) intron (NM_001098484, intron 2 of 25) 64108 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 207.333-240 chr6 67132665 67132835 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -922601 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 186.666-15 chr11 105972041 105972255 + 1.33333 NA intron (NR_046356, intron 15 of 16) intron (NR_046356, intron 15 of 16) 50092 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 209-25 chr11 109176794 109177038 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -245274 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 245.333-123 chr8 124325948 124326258 + 1.33333 NA intron (NM_194291, intron 3 of 6) intron (NM_194291, intron 3 of 6) 46596 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 217.333-111 chr4 140430457 140430756 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2945 NM_001130675 1047 Hs.86368 NM_004362 ENSG00000153132 CLGN - calmegin protein-coding 167.333-214 chr5 114715116 114715365 + 1.33333 NA intron (NR_130785, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 58173 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 288.333-7 chr11 69258300 69258737 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35637 NM_138768 26579 Hs.523848 NM_138768 ENSG00000172927 MYEOV OCIM myeloma overexpressed protein-coding 286-47 chr5 36339679 36339945 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -37910 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 174-16 chr11 74301274 74301484 + 1.33333 NA intron (NR_110031, intron 3 of 11) intron (NR_110031, intron 3 of 11) -9983 NR_120556 101928580 Hs.569025 NR_120556 ENSG00000246211 P4HA3-AS1 - P4HA3 antisense RNA 1 ncRNA 330.666 chr1 4807909 4808274 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 153482 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 209-56 chr2 46676887 46677072 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -21981 NM_014011 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 255.666-31 chr9 35210068 35210282 + 1.33333 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) intron (NM_006377, intron 1 of 38) 48166 NM_001330653 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 233.333-87 chr4 33407461 33407743 + 1.33333 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 632291 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 173.666-13 chr3 183065614 183065789 + 1.33333 NA intron (NR_120639, intron 5 of 15) MER41-int|LTR|ERV1 33542 NR_120640 56922 Hs.47649 NM_020166 ENSG00000078070 MCCC1 MCC-B|MCCA methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1 protein-coding 171.333-137 chr4 139476663 139476981 + 1.33333 NA TTS (NM_031296) TTS (NM_031296) 22701 NM_031296 83452 Hs.591679 NM_031296 ENSG00000172007 RAB33B SMC2 RAB33B, member RAS oncogene family protein-coding 210.333-57 chr17 69019906 69020095 + 1.33333 NA intron (NM_080283, intron 19 of 38) MLT2C2|LTR|ERVL 15286 NR_126414 104355297 Hs.569827 NR_126414 ENSG00000231749 ABCA9-AS1 - ABCA9 antisense RNA 1 ncRNA 161.333-220 chr4 106102845 106103077 + 1.33333 NA intron (NM_001290768, intron 25 of 26) intron (NM_001290768, intron 25 of 26) -80483 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 197.333-59 chr13 93202513 93202675 + 1.33333 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -24213 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 195.333-22 chr1 218545712 218545974 + 1.33333 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) intron (NR_031644, intron 2 of 6) 35748 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 142.333-224 chr7 9517308 9517481 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -116876 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 181.666-15 chr4 45253923 45254090 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -527372 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 272.667-67 chr9 24514107 24514426 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31410 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 177.333-3 chr1 24102375 24102575 + 1.33333 NA intron (NM_152372, intron 5 of 36) intron (NM_152372, intron 5 of 36) 9660 NM_152372 127294 Hs.523413 NM_152372 ENSG00000142661 MYOM3 - myomesin 3 protein-coding 201.333-24 chr1 217490086 217490281 + 1.33333 NA intron (NM_018040, intron 8 of 9) L1ME1|LINE|L1 140907 NM_001297754 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 179.333-86 chr18 38469530 38469690 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 812475 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 206.333-3 chr1 55981967 55982260 + 1.33333 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 37026 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 202-99 chr20 13896631 13896863 + 1.33333 NA intron (NR_073206, intron 6 of 20) L1M4c|LINE|L1 93867 NR_073206 80343 Hs.590879 NM_025229 ENSG00000101251 SEL1L2 C20orf50|sel-1L2 SEL1L2 adaptor subunit of ERAD E3 ligase protein-coding 234-63 chr6 160383566 160383856 + 1.33333 NA intron (NM_021977, intron 1 of 10) intron (NM_021977, intron 1 of 10) 35333 NM_021977 6581 Hs.567337 NM_021977 ENSG00000146477 SLC22A3 EMT|EMTH|OCT3 solute carrier family 22 member 3 protein-coding 213.333-58 chr14 63970187 63970367 + 1.33333 NA intron (NM_015180, intron 11 of 114) AluJr|SINE|Alu 117273 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 155.333-21 chr10 12692627 12692746 + 1.33333 NA intron (NM_001351032, intron 5 of 11) intron (NM_001351032, intron 5 of 11) 32667 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 220.333-37 chr13 94248188 94248453 + 1.33333 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) intron (NM_005708, intron 4 of 8) -60329 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 181.667-55 chr18 48234497 48234723 + 1.33333 NA intron (NM_001371285, intron 1 of 5) L1MEd|LINE|L1 -17691 NM_001350280 84322 Hs.334493 NM_032362 C18orf12 HEIL1|HsT2508 chromosome 18 open reading frame 12 protein-coding 192.667-107 chr3 95506501 95506741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176572 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 375.333-4 chr10 5114450 5114886 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger 20254 NM_003739 8644 Hs.78183 NM_003739 ENSG00000196139 AKR1C3 DD3|DDX|HA1753|HAKRB|HAKRe|HSD17B5|PGFS|hluPGFS aldo-keto reductase family 1 member C3 protein-coding 202-13 chr1 221699754 221699922 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37062 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 228.333-98 chr8 76496256 76496542 + 1.33333 NA intron (NR_105006, intron 3 of 5) L1MA3|LINE|L1 89745 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 219.333-14 chr1 199055079 199055317 + 1.33333 NA intron (NR_126351, intron 2 of 2) intron (NR_126351, intron 2 of 2) -36234 NR_110525 102800316 Hs.568480 NR_110525 LINC01222 TCONS_00000112 long intergenic non-protein coding RNA 1222 ncRNA 202.333-84 chr2 27408453 27408606 + 1.33333 NA intron (NM_177983, intron 1 of 9) intron (NM_177983, intron 1 of 9) 1062 NM_177983 5496 Hs.643951 NM_177983 ENSG00000115241 PPM1G PP2CG|PP2CGAMMA|PPP2CG protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1G protein-coding 216-36 chr14 80927460 80927689 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 2 of 24) L1PB3|LINE|L1 14164 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 207.333-16 chr1 156101239 156101440 + 1.33333 NA intron (NM_001282625, intron 3 of 12) AluJo|SINE|Alu -13331 NM_170708 4000 Hs.594444 NM_005572 ENSG00000160789 LMNA CDCD1|CDDC|CMD1A|CMT2B1|EMD2|FPL|FPLD|FPLD2|HGPS|IDC|LDP1|LFP|LGMD1B|LMN1|LMNC|LMNL1|MADA|PRO1 lamin A/C protein-coding 270-2 chr1 94157664 94157931 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -36649 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 387.666-4 chr6 130442861 130443280 + 1.33333 NA TTS (NM_001258277) TTS (NM_001258277) 5953 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 287.333-6 chr10 72419279 72419561 + 1.33333 NA intron (NM_001195519, intron 4 of 6) intron (NM_001195519, intron 4 of 6) -64501 NM_001002762 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 205.666-20 chr15 78808056 78808210 + 1.33333 NA intron (NM_014272, intron 1 of 23) AluJr|SINE|Alu 3331 NM_014272 11173 Hs.16441 NM_014272 ENSG00000136378 ADAMTS7 ADAM-TS 7|ADAM-TS7|ADAMTS-7 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 7 protein-coding 167-39 chr14 51065258 51065520 + 1.33333 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 30315 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 187.666-2 chr1 225552632 225552831 + 1.33333 NA intron (NM_001008493, intron 3 of 14) intron (NM_001008493, intron 3 of 14) 100392 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 185.333-62 chr17 14993245 14993412 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -21477 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 339.666-5 chr16 59202463 59202808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -468319 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 312-37 chr4 76553987 76554368 + 1.33333 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) L1MC1|LINE|L1 -19391 NR_039654 100616299 NR_039654 ENSG00000263445 MIR4450 mir-4450 microRNA 4450 ncRNA 180.333-10 chr1 210810176 210810390 + 1.33333 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) HAL1|LINE|L1 323091 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 160.333 chr1 15667481 15667643 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_032341, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_032341, exon 10 of 10) 7849 NM_006511 6248 Hs.239459 NM_006511 ENSG00000215695 RSC1A1 RS1 regulator of solute carriers 1 protein-coding 208-114 chr4 13687869 13688051 + 1.33333 NA intron (NR_121681, intron 2 of 3) intron (NR_121681, intron 2 of 3) 32781 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 220.666-11 chr10 66695425 66695606 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) MIRb|SINE|MIR -230521 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 199.333-165 chr20 31928278 31928492 + 1.33333 NA intron (NR_148013, intron 10 of 16) L1ME3Cz|LINE|L1 23661 NM_030815 81572 Hs.435755 NM_030815 ENSG00000088356 PDRG1 C20orf126|PDRG p53 and DNA damage regulated 1 protein-coding 309.333-16 chr14 33288821 33289211 + 1.33333 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) 350137 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 308.666-24 chr9 3500600 3500875 + 1.33333 NA intron (NM_134428, intron 1 of 17) intron (NM_134428, intron 1 of 17) -11250 NM_001282117 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 240.667-42 chr2 21457793 21458094 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 252709 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 248-39 chr2 150602142 150602468 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -26592 NR_110245 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 115.333-94 chr17 40663733 40663869 + 1.33333 NA intron (NM_152349, intron 1 of 5) intron (NM_152349, intron 1 of 5) 1376 NM_152349 125113 Hs.6920 NM_152349 ENSG00000213424 KRT222 KA21|KRT222P keratin 222 protein-coding 302.999-8 chr2 181106226 181106687 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17381 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 173-76 chr5 79759811 79759989 + 1.33333 NA intron (NM_153610, intron 7 of 12) intron (NM_153610, intron 7 of 12) 70064 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 416.999 chr12 43251370 43251859 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 96299 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 176-52 chr2 224939126 224939375 + 1.33333 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) intron (NM_014689, intron 1 of 55) 7799 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 160.666-8 chr20 41571175 41571322 + 1.33333 NA intron (NM_032221, intron 1 of 36) intron (NM_032221, intron 1 of 36) 47129 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 216.333-138 chr8 89065129 89065383 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 692455 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 301.666-9 chr6 114453480 114454019 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -390872 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 235.333-8 chr10 17663101 17663398 + 1.33333 NA intron (NM_001324287, intron 2 of 11) intron (NM_001324287, intron 2 of 11) 19098 NM_001324287 8027 Hs.335391 NM_003473 ENSG00000136738 STAM STAM-1|STAM1 signal transducing adaptor molecule protein-coding 148-62 chr18 11955310 11955519 + 1.33333 NA Intergenic MER51B|LTR|ERV1 -26093 NM_014214 3613 Hs.743311 NM_014214 ENSG00000141401 IMPA2 - inositol monophosphatase 2 protein-coding 196.666-109 chr8 125090271 125090469 + 1.33333 NA intron (NM_014846, intron 1 of 28) intron (NM_014846, intron 1 of 28) 1422 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 127.667-166 chr7 87805762 87805971 + 1.33333 NA intron (NM_001134406, intron 8 of 9) intron (NM_001134406, intron 8 of 9) 70494 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 288.667-23 chr4 166802238 166802668 + 1.33333 NA intron (NM_001040159, intron 6 of 10) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 431973 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 234.666-4 chr1 109013030 109013280 + 1.33333 NA intron (NM_014969, intron 4 of 14) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 29073 NM_014969 22911 Hs.570055 NM_014969 ENSG00000085433 WDR47 - WD repeat domain 47 protein-coding 274.667-3 chr1 44526339 44526854 + 1.33333 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 -18897 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 208.666-30 chr12 75645707 75645896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -134192 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 344.333 chr1 17740828 17741333 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14253 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 227-3 chr1 172924946 172925144 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 125918 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 178.666-14 chr3 132092284 132092451 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52761 NM_153429 131034 Hs.199877 NM_130808 ENSG00000196353 CPNE4 COPN4|CPN4 copine 4 protein-coding 177-52 chr3 104676404 104676667 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -690178 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 230.333-16 chr10 72494902 72495286 + 1.33333 NA intron (NM_001195519, intron 1 of 6) intron (NM_001195519, intron 1 of 6) 28892 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 181-50 chr3 65851781 65851999 + 1.33333 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -41926 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-37 chr12 123210786 123211113 + 1.33333 NA intron (NR_103517, intron 8 of 23) AluSz|SINE|Alu 22192 NM_022782 10198 Hs.577404 NM_022782 ENSG00000051825 MPHOSPH9 MPP-9|MPP9 M-phase phosphoprotein 9 protein-coding 197.333-19 chr10 21051248 21051542 + 1.33333 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) L1M4c|LINE|L1 -122595 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 370.333-4 chr10 66012255 66012611 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) intron (NM_001127384, intron 15 of 17) 441008 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 284.333-25 chr2 118661181 118661463 + 1.33333 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -58356 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 260.666-31 chr6 158468313 158468554 + 1.33333 NA intron (NM_020245, intron 6 of 13) LTR22B|LTR|ERVK -68003 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 198.667-11 chr1 190602770 190603040 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21985 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 328.666-14 chr3 147504897 147505296 + 1.33333 NA intron (NR_121655, intron 1 of 2) intron (NR_121655, intron 1 of 2) 83769 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 125.333-186 chr9 35016137 35016299 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -24877 NM_001040412 138724 Hs.148250 NM_203299 ENSG00000174038 C9orf131 - chromosome 9 open reading frame 131 protein-coding 214-111 chr5 139427532 139427800 + 1.33333 NA intron (NM_152686, intron 3 of 7) L1MC4|LINE|L1 11859 NM_152686 202052 Hs.483537 NM_152686 ENSG00000170464 DNAJC18 - DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C18 protein-coding 210-69 chr2 124941689 124941933 + 1.33333 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 916524 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 253.999-2 chr15 80889238 80889549 + 1.33333 NA intron (NM_001293304, intron 9 of 29) intron (NM_001293304, intron 9 of 29) -47320 NR_030393 693132 NR_030393 ENSG00000208003 MIR549A MIR549|MIRN549|hsa-mir-549|hsa-mir-549a|mir-549a microRNA 549a ncRNA 206.666-43 chr15 57258426 57258663 + 1.33333 NA intron (NM_207038, intron 15 of 19) intron (NM_207038, intron 15 of 19) 20113 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 223.666-11 chr14 27223643 27223849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 315104 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 348.999-3 chr5 66670963 66671351 + 1.33333 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) intron (NM_001290228, intron 1 of 4) 74764 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 206.666-38 chr14 25941144 25941374 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 612171 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 234-53 chr4 97518191 97518415 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 151377 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 345.333 chr1 59895877 59896329 + 1.33333 NA intron (NM_000775, intron 8 of 8) L1MC4|LINE|L1 30670 NM_000775 1573 Hs.152096 NM_000775 ENSG00000134716 CYP2J2 CPJ2|CYPIIJ2 cytochrome P450 family 2 subfamily J member 2 protein-coding 216.666 chr1 40327176 40327445 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -10024 NM_001852 1298 Hs.418012 NM_001852 ENSG00000049089 COL9A2 DJ39G22.4|EDM2|MED|STL5 collagen type IX alpha 2 chain protein-coding 253-68 chr8 40309464 40309755 + 1.33333 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 33754 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 244.666-41 chr5 99332757 99332987 + 1.33333 NA Intergenic Penelope1_Vert|LINE|Penelope -201118 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 356.667-13 chr4 134636624 134637111 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 212999 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 281-14 chr17 58731924 58732360 + 1.33333 NA intron (NM_058216, intron 7 of 8) intron (NM_058216, intron 7 of 8) -23712 NM_014906 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 174.667-115 chr3 71681151 71681383 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001134649, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001134649, exon 8 of 8) 44135 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 258-77 chr7 6121123 6121446 + 1.33333 NA intron (NM_032172, intron 3 of 17) L1ME1|LINE|L1 16335 NM_032172 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 300 chr1 52152956 52153300 + 1.33333 NA intron (NM_007324, intron 1 of 17) ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 11034 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 138-132 chrX 89149209 89149381 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 402070 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 203.333-12 chr1 157671787 157672065 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 28843 NM_001320333 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 194.666-47 chr3 188861998 188862196 + 1.33333 NA intron (NM_001167672, intron 7 of 9) intron (NM_001167672, intron 7 of 9) 85542 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 140-16 chr10 15587757 15587913 + 1.33333 NA intron (NM_001291494, intron 21 of 28) intron (NM_001291494, intron 21 of 28) 132087 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 210.999-3 chr14 72386580 72386765 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -130148 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 126.333-124 chr3 193240310 193240441 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001366112) promoter-TSS (NM_001366112) -847 NM_001366112 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 159.333-256 chr5 14997613 14997846 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125951 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 206.666-103 chr6 57125327 57125518 + 1.33333 NA intron (NM_015555, intron 4 of 13) intron (NM_015555, intron 4 of 13) 35234 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 183.333-3 chr1 76365788 76365991 + 1.33333 NA intron (NM_001349111, intron 3 of 5) intron (NM_001349111, intron 3 of 5) 291143 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 361.666-10 chr9 95207582 95207998 + 1.33333 NA intron (NM_001243744, intron 4 of 13) intron (NM_001243744, intron 4 of 13) 109464 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 269-12 chr11 35159747 35160155 + 1.33333 NA intron (NM_001001389, intron 1 of 16) intron (NM_001001389, intron 1 of 16) -2999 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 411.333-12 chr3 37205299 37205822 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -29200 NM_001348299 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 225-49 chr4 157911749 157911941 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -258907 NR_147408 285505 NR_147407 ENSG00000248429 FAM198B-AS1 - FAM198B antisense RNA 1 ncRNA 189.333-219 chrX 82564084 82564291 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -944103 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 250-90 chr8 89854380 89854651 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -47353 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 327.333-16 chr16 71711364 71711669 + 1.33333 NA intron (NM_015020, intron 2 of 18) MIR|SINE|MIR 4324 NM_001289003 23035 Hs.709458 NM_015020 ENSG00000040199 PHLPP2 PHLPPL|PPM3B PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 protein-coding 202.666-9 chr10 29031072 29031246 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184751 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 137.666 chr1 238940984 238941098 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -445527 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 410-9 chr15 66536167 66536700 + 1.33333 NA intron (NM_001287823, intron 14 of 17) intron (NM_001287823, intron 14 of 17) 29064 NM_207338 197021 Hs.680983 NM_207338 ENSG00000188501 LCTL KLG|KLPH lactase like protein-coding 307.333-61 chr3 197079283 197079579 + 1.33333 NA intron (NM_001366207, intron 17 of 24) intron (NM_001366207, intron 17 of 24) -49614 NM_033316 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 214-94 chr4 32221357 32221647 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -129536 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 343 chr1 70681305 70681881 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -24860 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 217.667-26 chr12 39583631 39584003 + 1.33333 NA intron (NM_005164, intron 7 of 9) L1PA14|LINE|L1 35986 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 302-52 chr5 36065295 36065621 + 1.33333 NA intron (NR_031764, intron 1 of 5) intron (NR_031764, intron 1 of 5) 1424 NM_001168316 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 202.333-75 chr17 61187178 61187484 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 180373 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 337.333-13 chr14 59558184 59558541 + 1.33333 NA intron (NM_001164399, intron 7 of 19) L2a|LINE|L2 18450 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 205.666-47 chr6 12256496 12256739 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33744 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 231.333-105 chr6 132555287 132555485 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 2702 NM_053278 83551 Hs.350571 NM_053278 ENSG00000146385 TAAR8 GPR102|TA5|TAR5|TRAR5|TaR-5|TaR-8 trace amine associated receptor 8 protein-coding 192-99 chr4 36225108 36225333 + 1.33333 NA intron (NR_146894, intron 2 of 32) intron (NR_146894, intron 2 of 32) 18719 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 279.999-8 chr6 20136834 20137088 + 1.33333 NA intron (NM_001080480, intron 4 of 12) L1ME4c|LINE|L1 75508 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 248.666-7 chr10 121815541 121815832 + 1.33333 NA intron (NM_001001976, intron 10 of 11) intron (NM_001001976, intron 10 of 11) 112345 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 250.666-42 chr8 128317032 128317255 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 167027 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 375.333 chr1 87215202 87215541 + 1.33333 NA intron (NM_001290053, intron 1 of 3) intron (NM_001290053, intron 1 of 3) 2702 NM_001290053 101927844 Hs.694591 NM_001290053 LINC02801 - long intergenic non-protein coding RNA 2801 protein-coding 212.333-126 chr6 90091802 90092049 + 1.33333 NA intron (NM_021813, intron 4 of 8) intron (NM_021813, intron 4 of 8) 197456 NM_032602 84694 Hs.334499 NM_032602 ENSG00000135355 GJA10 CX62 gap junction protein alpha 10 protein-coding 206-167 chr7 14933691 14933941 + 1.33333 NA intron (NM_001350717, intron 1 of 24) intron (NM_001350717, intron 1 of 24) -30160 NM_001350705 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 390.666-6 chrX 149851815 149852238 + 1.33333 NA intron (NR_109813, intron 1 of 2) L1PA13|LINE|L1 26318 NR_109813 101241891 Hs.744829 NR_109813 ENSG00000280752 LINC00850 KUCG1 long intergenic non-protein coding RNA 850 ncRNA 207.666-27 chr2 133580958 133581215 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12623 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 242.666-10 chr11 56110551 56110790 + 1.33333 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 5627 NM_001005200 390151 Hs.553744 NM_001005200 ENSG00000181767 OR8H2 OR11-171 olfactory receptor family 8 subfamily H member 2 protein-coding 182.667-160 chr8 77176747 77177001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -175830 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 200-88 chr2 161612038 161612242 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12195 NM_001354450 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 158-11 chr10 63861467 63861605 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -339646 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 306.667-9 chr14 40656380 40656913 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -298065 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 221.666-36 chr3 55120485 55120682 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57589 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 306.333-38 chr7 54598030 54598284 + 1.33333 NA Intergenic MER107|DNA|hAT-Charlie 41187 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 240-74 chr5 37432938 37433226 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 5 of 17) AluSz6|SINE|Alu 53764 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 212-70 chr17 55666530 55666773 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 56213 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 177-48 chr3 26034198 26034350 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -160579 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 229.333-97 chr5 33697262 33697437 + 1.33333 NA intron (NM_001324512, intron 3 of 21) intron (NM_001324512, intron 3 of 21) 194641 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 229.666-26 chr4 45808996 45809274 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 314919 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 198.333-158 chr5 39678877 39679101 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 158558 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 227.666-11 chr14 69367301 69367471 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 30913 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 602.333 chr8 50786605 50787279 + 1.33333 NA intron (NR_135797, intron 20 of 20) L1MB7|LINE|L1 622811 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 158.333-232 chr4 84937568 84937732 + 1.33333 NA intron (NM_014991, intron 1 of 67) L2a|LINE|L2 -27966 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 184-14 chr11 99516967 99517161 + 1.33333 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) MIR|SINE|MIR -39081 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 170-57 chr2 20857985 20858175 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34950 NM_001282719 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 243.666-13 chr15 61560430 61560736 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -169335 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 257.333-102 chr8 116830642 116830848 + 1.33333 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -43679 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 201.666 chr1 173318281 173318484 + 1.33333 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) intron (NR_037845, intron 2 of 2) -111051 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 440.333-8 chr5 25466196 25466681 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 275485 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 324.333-2 chr1 98299104 98299378 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 88530 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 166.666-9 chr22 26284093 26284243 + 1.33333 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 114694 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 178-27 chr11 82802189 82802371 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -68416 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 198.667-170 chr7 11102314 11102548 + 1.33333 NA intron (NR_033436, intron 15 of 16) intron (NR_033436, intron 15 of 16) 128559 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 200-74 chr18 2461254 2461406 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 110175 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 202.666-108 chr6 149401269 149401470 + 1.33333 NA TTS (NM_001002255) TTS (NM_001002255) 1107 NM_001002255 387082 Hs.657168 NM_001002255 ENSG00000177688 SUMO4 IDDM5|SMT3H4|SUMO-4|dJ281H8.4 small ubiquitin like modifier 4 protein-coding 243.333-108 chr7 83009619 83009895 + 1.33333 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 153127 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 255-58 chr4 83361180 83361434 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -26154 NM_001166498 10855 Hs.44227 NM_006665 ENSG00000173083 HPSE HPA|HPA1|HPR1|HPSE1|HSE1 heparanase protein-coding 189.666-14 chr15 68942657 68942825 + 1.33333 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) MIRc|SINE|MIR 12216 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 308.333-12 chr12 15456195 15456537 + 1.33333 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) L1MB1|LINE|L1 -90245 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 333.999-5 chr7 52848307 52848637 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -187161 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 252.666-43 chr6 149301170 149301572 + 1.33333 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) intron (NM_001292035, intron 2 of 6) -16341 NM_001369506 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 355.666-8 chr3 29356217 29356649 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 75121 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 202.666-69 chr20 44827159 44827386 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -16726 NM_001205317 140730 Hs.517065 NM_182970 ENSG00000101098 RIMS4 C20orf190|RIM 4|RIM-4|RIM4|RIM4-gamma|RIM4gamma regulating synaptic membrane exocytosis 4 protein-coding 288.666-8 chr14 88710833 88711166 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 10 of 42) intron (NM_183387, intron 10 of 42) 81954 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 239.333-53 chr2 57239334 57239673 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -668148 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 268-61 chr8 97995553 97995891 + 1.33333 NA intron (NM_002380, intron 7 of 18) intron (NM_002380, intron 7 of 18) 46495 NR_002581 26775 Hs.684855 NR_002581 ENSG00000207067 SNORA72 RNU72|U72 small nucleolar RNA, H/ACA box 72 snoRNA 166.666-8 chr18 5329165 5329331 + 1.33333 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -32195 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 167.333-37 chr10 31324692 31324909 + 1.33333 NA intron (NM_001323675, intron 1 of 6) intron (NM_001323675, intron 1 of 6) 3140 NM_001323673 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 159.666-2 chr13 106651692 106651890 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2089 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 202-4 chr1 85934477 85934651 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 24 of 59) intron (NM_152890, intron 24 of 59) 221907 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 278.667-3 chr1 235563721 235564085 + 1.33333 NA intron (NM_004485, intron 2 of 2) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -59451 NM_152490 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 210-84 chr20 63214482 63214698 + 1.33333 NA intron (NM_017798, intron 2 of 4) MER4A1_|LTR|ERV1 1541 NM_017798 54915 Hs.744852 NM_017798 ENSG00000149658 YTHDF1 C20orf21 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 1 protein-coding 178.333-106 chr3 104815922 104816122 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -550691 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 344-22 chr2 118020818 118021290 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6984 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 129.666 chr14 73993355 73993506 + 1.33333 NA intron (NM_001249, intron 3 of 15) intron (NM_001249, intron 3 of 15) 25858 NM_001321988 957 Hs.655070 NM_001249 ENSG00000187097 ENTPD5 CD39L4|NTPDase-5|PCPH ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (inactive) protein-coding 243.333-2 chr1 58848571 58848977 + 1.33333 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) intron (NR_108106, intron 1 of 1) 63623 NR_108106 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 251.333-82 chr3 154920304 154920591 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -103677 NM_001354642 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 210.999-2 chr14 30121851 30122042 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -194099 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 250.666-24 chr3 153416141 153416611 + 1.33333 NA intron (NR_146713, intron 5 of 6) L1PA14|LINE|L1 -68119 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 177.333-146 chr6 145004927 145005118 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 599367 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 217-21 chr14 52189069 52189453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -78437 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 293.333-3 chr11 24103133 24103488 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -393743 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 249-44 chr21 18639891 18640198 + 1.33333 NA intron (NR_109925, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 46120 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 183.667-15 chr1 192274284 192274567 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42567 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 165.333-135 chr2 214362185 214362357 + 1.33333 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -48783 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 166.667-45 chr11 104940710 104940865 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22612 NR_034079 643733 Hs.713751 NR_034078 ENSG00000235505 CASP17P - caspase 17, pseudogene pseudo 247.333-93 chr8 140455131 140455373 + 1.33333 NA intron (NM_031466, intron 1 of 22) AluSx|SINE|Alu 2492 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 366.666-9 chr3 80731744 80732171 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32940 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 258.666-42 chr6 68516605 68516962 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 117541 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 162-100 chr5 55809724 55809911 + 1.33333 NA intron (NM_024415, intron 18 of 21) LTR37-int|LTR|ERV1 -41540 NM_001297572 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 246-81 chr4 103199852 103200122 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1644 NM_001286734 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 240.666-39 chrX 93666957 93667226 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 6487 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 226-44 chr2 127733127 127733359 + 1.33333 NA intron (NM_018383, intron 7 of 21) intron (NM_018383, intron 7 of 21) 31746 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 220.667-4 chr1 35381557 35381886 + 1.33333 NA exon (NM_001350138, exon 10 of 31) exon (NM_001350138, exon 10 of 31) -15644 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 175-40 chr2 17052407 17052581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -386660 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 196.333-168 chr8 134611078 134611356 + 1.33333 NA intron (NM_020863, intron 3 of 15) intron (NM_020863, intron 3 of 15) 13146 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 214.333-132 chr6 164833025 164833274 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -11086 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 162-66 chr2 112548013 112548180 + 1.33333 NA intron (NM_019014, intron 3 of 14) intron (NM_019014, intron 3 of 14) -5884 NR_136321 105373562 Hs.599548 NR_136321 LOC105373562 - uncharacterized LOC105373562 ncRNA 169.333-287 chr9 89863807 89863992 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -105517 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 189-17 chr11 42677955 42678192 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -424383 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 205.667-40 chr13 41906739 41907004 + 1.33333 NA intron (NM_001009814, intron 4 of 25) L1ME4b|LINE|L1 54214 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 199.666-11 chr12 22722573 22722802 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97516 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 194-134 chr7 114092615 114092900 + 1.33333 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) 6430 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 226.333-21 chr12 5577330 5577612 + 1.33333 NA intron (NM_001278596, intron 23 of 25) intron (NM_001278596, intron 23 of 25) 83339 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 158.666-8 chr11 64528871 64529058 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26977 NM_001307985 55867 Hs.220844 NM_018484 ENSG00000168065 SLC22A11 OAT4|hOAT4 solute carrier family 22 member 11 protein-coding 229.333-27 chr12 66632183 66632426 + 1.33333 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) MamRep605|LTR?|LTR? 46772 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 166-37 chr12 79279486 79279729 + 1.33333 NA intron (NM_001291901, intron 3 of 9) L1PB3|LINE|L1 -139650 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 179.333-180 chr7 111144037 111144287 + 1.33333 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 53035 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 193-83 chr6 72334704 72334877 + 1.33333 NA intron (NM_001350433, intron 21 of 25) intron (NM_001350433, intron 21 of 25) -31956 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 200-100 chr3 14105723 14105907 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 19055 NM_001098502 131474 Hs.517815 NM_144636 ENSG00000163528 CHCHD4 MIA40|TIMM40 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4 protein-coding 218.666-76 chr8 133623850 133624031 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -52053 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 169.333-223 chr6 38509517 38509769 + 1.33333 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) 28047 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 206-130 chr4 94629271 94629450 + 1.33333 NA intron (NM_006457, intron 8 of 12) AluSc|SINE|Alu 128173 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 258.666-33 chr5 58779416 58779690 + 1.33333 NA intron (NM_138453, intron 3 of 4) AluJr4|SINE|Alu 196478 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 264.333-52 chr4 73698071 73698443 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42312 NM_000584 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 306.666-30 chr5 106961190 106961489 + 1.33333 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) intron (NR_104671, intron 2 of 3) 49675 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 268-35 chr3 30634112 30634484 + 1.33333 NA intron (NM_001024847, intron 2 of 7) intron (NM_001024847, intron 2 of 7) 27697 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 212.667-111 chr5 131416929 131417216 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 153063 NM_001038702 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 270.333-64 chr8 119361711 119362068 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 36718 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 235-22 chr15 27310670 27310871 + 1.33333 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 -149451 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 212.999-4 chr4 96657408 96657570 + 1.33333 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) L1MA5A|LINE|L1 346786 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 270.333-25 chr16 9410514 9410832 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34312 NR_126397 104355218 Hs.564967 NR_126397 ENSG00000261397 LINC01177 - long intergenic non-protein coding RNA 1177 ncRNA 211.333-150 chr3 58229660 58229867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7739 NM_020676 57406 Hs.476454 NM_020676 ENSG00000163686 ABHD6 - abhydrolase domain containing 6 protein-coding 160.333-63 chr11 84717204 84717348 + 1.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 3666 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 213.333-101 chr2 124955487 124955743 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 930328 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 219.666-40 chr6 131109382 131109600 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -25976 NM_016377 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 206.333-25 chr11 43606443 43606655 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 25155 NR_029697 406918 NR_029697 ENSG00000199077 MIR129-2 MIR-129b|MIRN129-2|mir-129-2 microRNA 129-2 ncRNA 158-95 chr4 69779033 69779256 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -18524 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 142.666-6 chr12 125476482 125476613 + 1.33333 NA intron (NM_052907, intron 3 of 8) L1MB5|LINE|L1 -145905 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 159-72 chr21 22051007 22051259 + 1.33333 NA intron (NR_109959, intron 2 of 5) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 47326 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 242-31 chr17 64017015 64017399 + 1.33333 NA intron (NM_001099788, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 3426 NM_001099789 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 288.666-41 chrX 93846362 93846628 + 1.33333 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 172289 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 225.333-29 chr11 85035695 85035919 + 1.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -112386 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 205.667-83 chr20 23996727 23996994 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8081 NM_178311 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 227.667-77 chr8 109925269 109925543 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 50365 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 228.333-73 chr5 11288375 11288639 + 1.33333 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) intron (NM_001288715, intron 8 of 20) 300410 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 243-16 chr13 92427480 92427892 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -62477 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 298-33 chr17 33250233 33250509 + 1.33333 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 42617 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 212-133 chr5 121781804 121782073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69944 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 206.333-57 chr14 70213077 70213430 + 1.33333 NA intron (NR_135825, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 -24183 NM_033262 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 236.999 chr1 174192743 174193003 + 1.33333 NA intron (NM_001366445, intron 1 of 13) intron (NM_001366445, intron 1 of 13) 33353 NR_158981 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 199.333-180 chr3 55299194 55299423 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 121136 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 257-22 chr18 3831885 3832141 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) intron (NM_001242761, intron 4 of 11) 13345 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 187.333-32 chr11 60631875 60632116 + 1.33333 NA intron (NR_026946, intron 3 of 6) L1PBa|LINE|L1 16244 NR_026946 283197 Hs.372650 NM_174939 ENSG00000181995 LINC00301 C11orf64|NCRNA00301 long intergenic non-protein coding RNA 301 ncRNA 201.333-158 chr2 200106716 200106947 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -151340 NR_109905 129450 Hs.204619 NM_152382 ENSG00000162971 TYW5 C2orf60|hTYW5 tRNA-yW synthesizing protein 5 protein-coding 301.333-30 chr20 2490891 2491334 + 1.33333 NA TTS (NM_001282499) TTS (NM_001282499) 17803 NM_001282499 79175 Hs.516846 NM_024325 ENSG00000088876 ZNF343 dJ734P14.5 zinc finger protein 343 protein-coding 217.666-33 chr5 11966608 11966815 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62265 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 303.666-10 chr2 109477792 109478270 + 1.33333 NA intron (NM_001099289, intron 8 of 9) intron (NM_001099289, intron 8 of 9) 135636 NM_001321513 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 204.666-16 chr10 101866968 101867175 + 1.33333 NA intron (NM_024541, intron 24 of 25) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -23151 NM_173197 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 392.666-11 chr8 129531963 129532326 + 1.33333 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 42874 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 245.333-46 chr15 59252366 59252645 + 1.33333 NA intron (NM_004998, intron 4 of 27) AluSx|SINE|Alu 45662 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 296.333-6 chr1 181371272 181371516 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -112123 NM_001205293 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 318.666-21 chr8 67914539 67915053 + 1.33333 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -37250 NM_024870 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 214.333-83 chr2 222543295 222543604 + 1.33333 NA intron (NM_152386, intron 4 of 4) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 112643 NR_130154 10056 Hs.471452 NM_005687 ENSG00000116120 FARSB FARSLB|FRSB|HSPC173|NEDBLLA|PheHB|PheRS|RILDBC phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta protein-coding 225-11 chr11 19019257 19019517 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 40630 NM_001303615 117194 Hs.350566 NM_054030 ENSG00000183695 MRGPRX2 MGRG3|MRGX2 MAS related GPR family member X2 protein-coding 223-7 chr10 51761224 51761430 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -61732 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 227.333-24 chr11 74388180 74388466 + 1.33333 NA intron (NM_173582, intron 1 of 13) L1MB1|LINE|L1 10110 NM_173582 283209 Hs.26612 NM_173582 ENSG00000165434 PGM2L1 BM32A|PMMLP phosphoglucomutase 2 like 1 protein-coding 327-24 chr5 90826404 90826725 + 1.33333 NA intron (NR_003149, intron 76 of 89) MIRb|SINE|MIR 267767 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 286.667-41 chr7 50606977 50607330 + 1.33333 NA intron (NM_001350816, intron 12 of 17) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -41748 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 249-56 chr4 176375558 176375891 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 55758 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 203.333-221 chr5 146568011 146568307 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -52046 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 188-107 chr7 130192490 130192690 + 1.33333 NA intron (NR_156699, intron 6 of 14) intron (NR_156699, intron 6 of 14) 12816 NM_001301163 84928 Hs.267245 NM_032842 ENSG00000146842 TMEM209 NET31 transmembrane protein 209 protein-coding 135.333-205 chr9 84146875 84147015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 83502 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 476.999-2 chr2 176921637 176922140 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 284134 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 181-31 chr17 61768589 61768747 + 1.33333 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 94891 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 258.999-6 chr22 47674302 47674519 + 1.33333 NA intron (NR_122046, intron 2 of 8) intron (NR_122046, intron 2 of 8) 42736 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 206.666-34 chr12 125801852 125802033 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 179490 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 216.666-42 chr2 110166179 110166544 + 1.33333 NA intron (NM_207181, intron 6 of 19) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 38652 NM_000272 4867 Hs.280388 NM_000272 ENSG00000144061 NPHP1 JBTS4|NPH1|SLSN1 nephrocystin 1 protein-coding 196-4 chr1 31349014 31349204 + 1.33333 NA intron (NM_001282571, intron 6 of 6) FAM|SINE|Alu 23967 NM_004102 2170 Hs.576372 NM_004102 ENSG00000121769 FABP3 FABP11|H-FABP|M-FABP|MDGI|O-FABP fatty acid binding protein 3 protein-coding 146.666-5 chr2 118051262 118051419 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37078 NM_001321333 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 191-7 chr10 24496924 24497082 + 1.33333 NA intron (NM_001321681, intron 4 of 13) intron (NM_001321681, intron 4 of 13) 30472 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 211-71 chr4 37079151 37079434 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 77513 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 278.666-6 chr11 121970346 121970696 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 129323 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 240.667-20 chr12 50003830 50004251 + 1.33333 NA intron (NM_001320006, intron 6 of 17) intron (NM_001320006, intron 6 of 17) 21454 NM_001319999 29127 Hs.505469 NM_013277 ENSG00000161800 RACGAP1 CYK4|HsCYK-4|ID-GAP|MgcRacGAP Rac GTPase activating protein 1 protein-coding 314-43 chr7 3675764 3676250 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1P4|LINE|L1 374755 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 248-8 chr10 52480651 52481042 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -10313 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 251.333-52 chr19 37586154 37586432 + 1.33333 NA non-coding (NR_038247, exon 5 of 5) non-coding (NR_038247, exon 5 of 5) 8453 NM_001321272 51276 Hs.590944 NM_016536 ENSG00000180479 ZNF571 HSPC059 zinc finger protein 571 protein-coding 440.333-6 chr3 29287208 29287838 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 6211 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 238.999-4 chr3 90131869 90132099 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1024363 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 260-53 chr4 47006186 47006401 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12712 NM_001204266 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 214.333-50 chr14 83683488 83683721 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 1040972 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 326-7 chr10 55055470 55055830 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) AluJb|SINE|Alu -254359 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 200-111 chr3 194809887 194810073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41271 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 150-71 chr2 61090476 61090681 + 1.33333 NA intron (NM_001129993, intron 10 of 21) AluJr|SINE|Alu 24369 NM_032506 84542 Hs.468653 NM_032506 ENSG00000162929 KIAA1841 - KIAA1841 protein-coding 220-60 chr2 68983858 68984234 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 9473 NM_019617 56287 Hs.69319 NM_019617 ENSG00000169605 GKN1 AMP18|BRICD1|CA11|FOV|foveolin gastrokine 1 protein-coding 279.666-17 chr8 117655138 117655499 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 134605 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 206.666-46 chr16 11516793 11517067 + 1.33333 NA intron (NM_001370704, intron 4 of 66) AluJo|SINE|Alu 10317 NM_001370704 400499 Hs.459937 NM_001370704 ENSG00000188897 LOC400499 - putative uncharacterized protein LOC400499 protein-coding 128-128 chr9 86057970 86058116 + 1.33333 NA intron (NM_016548, intron 3 of 9) intron (NM_016548, intron 3 of 9) 41515 NM_016548 51280 Hs.494337 NM_016548 ENSG00000135052 GOLM1 C9orf155|GOLPH2|GP73|HEL46|PSEC0257|bA379P1.3 golgi membrane protein 1 protein-coding 239-11 chr10 62229633 62230028 + 1.33333 NA intron (NM_145307, intron 6 of 11) intron (NM_145307, intron 6 of 11) 39014 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 170.666-16 chr3 78160219 78160383 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111338 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 163.333-217 chr5 45342750 45342961 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 5 of 7) intron (NM_021072, intron 5 of 7) 353525 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 217.666-23 chr22 31025471 31025745 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55710 NM_006932 6525 Hs.149098 NM_006932 ENSG00000183963 SMTN - smoothelin protein-coding 196.667-31 chr11 99317804 99318063 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) -238212 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 188.666-21 chr2 223733338 223733494 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 104166 NR_110906 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 252-108 chr8 114877032 114877359 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 790818 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 219.333-101 chr2 198042065 198042284 + 1.33333 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 237581 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 297-41 chr5 121901022 121901299 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49278 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 184.667-67 chr2 231150882 231151094 + 1.33333 NA intron (NM_001191037, intron 18 of 23) intron (NM_001191037, intron 18 of 23) -25946 NM_001320758 3357 Hs.421649 NM_000867 ENSG00000135914 HTR2B 5-HT(2B)|5-HT-2B|5-HT2B 5-hydroxytryptamine receptor 2B protein-coding 233.333-16 chr10 46019841 46020061 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001145262) promoter-TSS (NM_001145262) -414 NM_001145262 8031 Hs.643658 NM_005437 ENSG00000266412 NCOA4 ARA70|ELE1|PTC3|RFG nuclear receptor coactivator 4 protein-coding 271.667-7 chr1 244041467 244041888 + 1.33333 NA intron (NR_033883, intron 9 of 11) intron (NR_033883, intron 9 of 11) -7262 NM_001278196 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 211.666-2 chr1 110944442 110944754 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 19324 NM_018372 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 465.333 chr1 177717919 177718520 + 1.33333 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 17695 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 292.666-9 chr13 39903601 39903901 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -239616 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 202.667-3 chr1 61928494 61928793 + 1.33333 NA intron (NM_001350145, intron 27 of 43) MIR|SINE|MIR 82568 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 208.666-95 chr6 69882407 69882564 + 1.33333 NA intron (NM_001858, intron 2 of 50) intron (NM_001858, intron 2 of 50) 15929 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 264.333-2 chr1 53153850 53154346 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11460 NM_006671 6512 Hs.104637 NM_006671 ENSG00000162383 SLC1A7 AAAT|EAAT5 solute carrier family 1 member 7 protein-coding 341.666-3 chr12 54715587 54715962 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -67409 NM_001300854 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 258.666-43 chr6 117570720 117571111 + 1.33333 NA exon (NM_020399, exon 6 of 9) exon (NM_020399, exon 6 of 9) 31596 NM_001017408 57120 Hs.191539 NM_020399 ENSG00000047932 GOPC CAL|FIG|GOPC1|PIST|dJ94G16.2 golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing protein-coding 259.333-27 chr13 27695164 27695402 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 73391 NM_015972 51082 Hs.507584 NM_015972 ENSG00000186184 POLR1D AC19|POLR1C|RPA16|RPA9|RPAC2|RPC16|RPO1-3|TCS2 RNA polymerase I and III subunit D protein-coding 209.333-38 chr11 81346379 81346577 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 544358 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 115.333-18 chr1 217270849 217271023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133234 NM_001243510 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 201.667-65 chr20 40037288 40037554 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 32960 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 223.333-134 chr5 141541744 141541924 + 1.33333 NA intron (NM_005219, intron 17 of 27) L1MB5|LINE|L1 -16477 NR_038333 100505658 Hs.655458 NR_038333 ENSG00000246422 LOC100505658 - uncharacterized LOC100505658 ncRNA 220.333-35 chr12 82018881 82019184 + 1.33333 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 65313 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 172.666-10 chr18 4409186 4409400 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 45973 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 223-22 chr15 26179012 26179210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63298 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 267.333-31 chr14 62453575 62454032 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -313830 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 184.333-115 chr4 123677851 123678060 + 1.33333 NA intron (NR_027105, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 27964 NR_027105 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 196-106 chr22 22196992 22197241 + 1.33333 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -47670 NM_007128 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 159.667-146 chr18 7593306 7593495 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 26084 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 392.666-4 chr15 88860433 88860824 + 1.33333 NA intron (NM_013227, intron 13 of 17) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 34916 NM_178232 145864 Hs.447530 NM_178232 ENSG00000140511 HAPLN3 EXLD1|HsT19883 hyaluronan and proteoglycan link protein 3 protein-coding 205.333-120 chr2 43899409 43899641 + 1.33333 NA exon (NM_133259, exon 33 of 38) exon (NM_133259, exon 33 of 38) 60554 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 229-65 chr7 86436889 86437209 + 1.33333 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -206860 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 253.666-25 chr6 51633554 51633904 + 1.33333 NA intron (NM_138694, intron 64 of 66) L1ME1|LINE|L1 11859 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 207.333-223 chr5 104877095 104877282 + 1.33333 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -222286 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 142.666-5 chr12 31402757 31402905 + 1.33333 NA intron (NM_144973, intron 14 of 20) intron (NM_144973, intron 14 of 20) -33530 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 163.333-120 chr17 13146211 13146420 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -128251 NM_173717 60528 Hs.434232 NM_018127 ENSG00000006744 ELAC2 COXPD17|ELC2|HPC2 elaC ribonuclease Z 2 protein-coding 204-10 chr1 97861586 97861877 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 2 of 22) L1M5|LINE|L1 59328 NM_000110 1806 Hs.335034 NM_000110 ENSG00000188641 DPYD DHP|DHPDHASE|DPD dihydropyrimidine dehydrogenase protein-coding 181-64 chr6 45532369 45532514 + 1.33333 NA intron (NM_001015051, intron 7 of 7) MIR3|SINE|MIR 110166 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 379.333-5 chr2 216114239 216114729 + 1.33333 NA intron (NM_021141, intron 2 of 20) MER50C|LTR|ERV1 5136 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 250.333-55 chr4 167207508 167207854 + 1.33333 NA intron (NM_001204352, intron 2 of 11) intron (NM_001204352, intron 2 of 11) 26745 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 238.666-21 chr17 81224764 81225003 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -1918 NM_001009811 22994 Hs.514578 NM_014984 ENSG00000141577 CEP131 AZ1|AZI1|ZA1 centrosomal protein 131 protein-coding 258.333-2 chr1 62878852 62879234 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 94911 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 185.666-14 chr4 90429438 90429673 + 1.33333 NA intron (NM_207491, intron 4 of 7) intron (NM_207491, intron 4 of 7) 194524 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 190.667-2 chr1 20912265 20912523 + 1.33333 NA intron (NM_003760, intron 9 of 31) intron (NM_003760, intron 9 of 31) 76038 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 159.333-358 chrX 4793096 4793288 + 1.33333 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 -159620 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 292.666-10 chr13 91479839 91480132 + 1.33333 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) intron (NM_004466, intron 2 of 7) 81364 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 264.666-16 chr2 45204750 45204971 + 1.33333 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) L1M2|LINE|L1 50081 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 184-78 chr4 161156334 161156536 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -866298 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 272.667-62 chr7 77231312 77231730 + 1.33333 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) intron (NM_020879, intron 2 of 18) -31702 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 252.666-31 chr5 13118645 13118916 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -85894 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 235-10 chr12 16577566 16577764 + 1.33333 NA intron (NR_045014, intron 2 of 3) intron (NR_045014, intron 2 of 3) 27714 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 201.333-21 chr1 200405351 200405551 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001281294, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001281294, exon 3 of 3) 4585 NM_012482 23528 Hs.59757 NM_012482 ENSG00000162702 ZNF281 ZBP-99|ZNP-99 zinc finger protein 281 protein-coding 277-48 chr7 48989278 48989639 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 64911 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 299.333-56 chr3 87770593 87770916 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -21952 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 199-108 chr7 131311157 131311407 + 1.33333 NA intron (NR_125364, intron 4 of 5) LTR49-int|LTR|ERV1 16497 NR_125364 100506881 Hs.660830 NR_125364 ENSG00000236753 MKLN1-AS MKLN1-AS2 MKLN1 antisense RNA ncRNA 252.666-27 chr3 47979671 47979964 + 1.33333 NA intron (NM_002375, intron 2 of 18) AluJr|SINE|Alu 109031 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 158-5 chr1 171105132 171105316 + 1.33333 NA intron (NM_001002294, intron 3 of 8) L1M5|LINE|L1 -3418 NR_031627 100302178 NR_031627 ENSG00000221390 MIR1295A MIR1295|MIRN1295|hsa-mir-1295|hsa-mir-1295a|mir-1295a microRNA 1295a ncRNA 219.666-51 chrX 50621637 50621860 + 1.33333 NA intron (NR_027121, intron 5 of 9) intron (NR_027121, intron 5 of 9) -150923 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 198.666-99 chr9 123146841 123147015 + 1.33333 NA exon (NM_018387, exon 13 of 19) exon (NM_018387, exon 13 of 19) -31451 NR_026677 81571 Hs.708072 NM_030814 ENSG00000236901 MIR600HG C9orf45|GL012|NCRNA00287 MIR600 host gene ncRNA 318-9 chr11 41519938 41520303 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -60468 NM_001258419 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 441.333 chr1 165176570 165177130 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 179391 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 243.666-14 chr15 83239132 83239348 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -31417 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 279.333-66 chr5 94438715 94439032 + 1.33333 NA intron (NM_001145678, intron 14 of 20) intron (NM_001145678, intron 14 of 20) 179731 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 191.333-213 chr8 140821933 140822098 + 1.33333 NA intron (NR_148037, intron 9 of 34) intron (NR_148037, intron 9 of 34) -89362 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 174.333-2 chr1 112576428 112576686 + 1.33333 NA intron (NM_017744, intron 11 of 14) intron (NM_017744, intron 11 of 14) 42584 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 294.666-16 chr2 79364249 79364572 + 1.33333 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 136434 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 238-6 chr10 58797440 58797734 + 1.33333 NA intron (NM_001080512, intron 10 of 20) intron (NM_001080512, intron 10 of 20) 82572 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 454.333-2 chr12 117076180 117076677 + 1.33333 NA intron (NR_031766, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 22988 NM_017899 54997 Hs.525709 NM_017899 ENSG00000088992 TESC CHP3|TSC tescalcin protein-coding 297-38 chr4 163819038 163819460 + 1.33333 NA intron (NM_001166373, intron 3 of 7) L2b|LINE|L2 -205715 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 112.667-262 chr8 41796092 41796209 + 1.33333 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) intron (NM_001142446, intron 1 of 42) 1472 NM_020476 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 309.333-25 chr15 97190995 97191276 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 330676 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 268.666 chr1 38735768 38736048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 123864 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 209.333-74 chr15 65522279 65522580 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -4740 NM_197961 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 208-30 chr11 93003210 93003519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33741 NM_005959 4544 Hs.569039 NM_005959 ENSG00000134640 MTNR1B FGQTL2|MEL-1B-R|MT2 melatonin receptor 1B protein-coding 289.666-12 chr3 61161538 61161871 + 1.33333 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 89748 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 202-16 chr10 35025311 35025514 + 1.33333 NA intron (NM_003591, intron 16 of 20) intron (NM_003591, intron 16 of 20) 48871 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 327.333-5 chr10 72003594 72004128 + 1.33333 NA intron (NM_004273, intron 1 of 2) FLAM_A|SINE|Alu 39466 NM_004273 9469 Hs.158304 NM_004273 ENSG00000122863 CHST3 C6ST|C6ST1|HSD carbohydrate sulfotransferase 3 protein-coding 277.333-7 chr10 11486196 11486477 + 1.33333 NA intron (NM_014688, intron 10 of 14) intron (NM_014688, intron 10 of 14) 45944 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 130.333-208 chr8 85081024 85081258 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -26097 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 149-29 chr12 39215637 39215824 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 227390 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 232.666-44 chr6 62765371 62765632 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -479274 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 268-32 chr20 48901296 48901576 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -20275 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 184-27 chr14 59528465 59528656 + 1.33333 NA intron (NM_001164399, intron 14 of 19) HAL1|LINE|L1 44043 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 179-9 chr1 236841021 236841170 + 1.33333 NA intron (NM_000254, intron 15 of 32) HAL1|LINE|L1 45803 NM_001291940 4548 Hs.498187 NM_000254 ENSG00000116984 MTR HMAG|MS|cblG 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase protein-coding 211.333-95 chr18 52282345 52282589 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -57730 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 198-130 chr3 181619185 181619362 + 1.33333 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) MER5B|DNA|hAT-Charlie 8939 NR_075089 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 332.666-3 chr11 24525272 24525623 + 1.33333 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 28394 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 264.333-20 chr14 71685799 71686136 + 1.33333 NA intron (NM_001354286, intron 14 of 24) intron (NM_001354286, intron 14 of 24) 99669 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 254.333-79 chr7 49641544 49641826 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -131953 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 247.333-96 chr9 70269214 70269416 + 1.33333 NA intron (NM_015110, intron 3 of 24) AluJb|SINE|Alu 10337 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 202.666-49 chr17 3397189 3397438 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003553, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_003553, exon 1 of 1) 1097 NM_003553 8387 NM_003553 ENSG00000180016 OR1E1 HGM071|OR13-66|OR17-2|OR17-32|OR1E5|OR1E6|OR1E8P|OR1E9P|OST547 olfactory receptor family 1 subfamily E member 1 protein-coding 290-54 chr8 118437945 118438318 + 1.33333 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) intron (NM_001349811, intron 3 of 4) -182870 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 268-16 chr13 20579974 20580355 + 1.33333 NA intron (NR_148465, intron 2 of 20) L1ME4a|LINE|L1 13007 NM_001353575 8100 Hs.187376 NM_006531 ENSG00000032742 IFT88 D13S1056E|DAF19|TG737|TTC10|hTg737 intraflagellar transport 88 protein-coding 389.333-18 chr7 117130609 117131172 + 1.33333 NA intron (NR_002331, intron 2 of 5) intron (NR_002331, intron 2 of 5) 14702 NR_002331 93654 Hs.628891 NR_002331 ENSG00000226367 ST7-AS2 ST7AS2|ST7OT2 ST7 antisense RNA 2 ncRNA 307.666-2 chr10 35054695 35055188 + 1.33333 NA intron (NM_001324376, intron 4 of 21) intron (NM_001324376, intron 4 of 21) 19342 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 251.333-54 chr2 50537387 50537719 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 10 of 22) intron (NM_001330093, intron 10 of 22) 158709 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 219-44 chr2 7413625 7413906 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -7496 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 118.333-40 chr11 39952145 39952262 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 340927 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 187-53 chr3 119514303 119514451 + 1.33333 NA intron (NM_016589, intron 5 of 6) L1MC4|LINE|L1 15830 NM_016589 51300 Hs.477287 NM_016589 ENSG00000113845 TIMMDC1 C3orf1|MC1DN31 translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 protein-coding 254-61 chr4 180455752 180455994 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 703276 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 206.333-45 chr13 60001870 60002030 + 1.33333 NA intron (NM_001258369, intron 9 of 26) MER89-int|LTR|ERV1 -10768 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 230.666-27 chr2 65209670 65210000 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -17860 NM_001005386 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 148-124 chr5 2718952 2719120 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 6445 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 192.333-162 chr8 26264123 26264361 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -27266 NM_002717 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 313.333-53 chr9 104287353 104287741 + 1.33333 NA TTS (NR_135141) TTS (NR_135141) 17318 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 211.999 chr1 231812185 231812352 + 1.33333 NA intron (NM_001164544, intron 8 of 8) AluJr4|SINE|Alu 6249 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 184.666-12 chr15 61998273 61998466 + 1.33333 NA intron (NM_001018088, intron 16 of 81) L2a|LINE|L2 62078 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 230-62 chr6 132188590 132188834 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 54734 NR_038981 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 200.333-97 chr3 118641635 118641883 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_135573) promoter-TSS (NR_135573) -9 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 189.333-20 chr1 174857688 174857917 + 1.33333 NA intron (NM_001366446, intron 19 of 25) intron (NM_001366446, intron 19 of 25) -16584 NM_001243763 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 239.333-81 chr5 19777434 19777668 + 1.33333 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) intron (NM_001349559, intron 3 of 12) 108721 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 182-45 chr2 53882201 53882378 + 1.33333 NA intron (NM_014614, intron 41 of 46) MIR|SINE|MIR -22256 NM_001164165 100302652 Hs.40763 NM_001164165 ENSG00000270898 GPR75-ASB3 ASB-3|ASB3 GPR75-ASB3 readthrough protein-coding 160.333-27 chr1 200102749 200103028 + 1.33333 NA intron (NM_205860, intron 5 of 7) intron (NM_205860, intron 5 of 7) 60063 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 205.333-45 chr11 39153593 39153899 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 504888 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 307-20 chr21 27200020 27200479 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -233161 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 262-90 chrX 54227498 54227831 + 1.33333 NA intron (NM_001002838, intron 21 of 22) L1MB8|LINE|L1 -44410 NM_001300788 54954 Hs.86045 NM_017848 ENSG00000184083 FAM120C CXorf17|ORF34 family with sequence similarity 120C protein-coding 209.333-251 chr9 88696768 88696964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 49039 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 208.333-53 chr17 27171621 27171913 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -82526 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 207.333-37 chr10 98160085 98160378 + 1.33333 NA intron (NM_001351010, intron 4 of 11) L1MC4a|LINE|L1 25574 NM_014472 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 334.666-14 chr6 139148335 139148904 + 1.33333 NA intron (NM_016217, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu 13539 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 229.999-2 chr10 108407284 108407472 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -338085 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 246.333-35 chr15 100998902 100999212 + 1.33333 NA intron (NM_024652, intron 6 of 33) MIRc|SINE|MIR 79700 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 218.666-73 chr8 53022002 53022276 + 1.33333 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 82231 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 301.333-23 chr18 21293155 21293628 + 1.33333 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) intron (NM_001142966, intron 1 of 32) 51149 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 197.333-218 chr7 103910356 103910513 + 1.33333 NA intron (NM_005045, intron 2 of 64) L1PA2|LINE|L1 79082 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 157.666-5 chr7 24069266 24069393 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -214861 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 226.333-44 chr17 59059428 59059626 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 12 of 23) AluJb|SINE|Alu 47353 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 379.999-3 chr14 43381033 43381388 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1126073 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 407.333-18 chr6 133331796 133332394 + 1.33333 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 90596 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 167.333-64 chr12 29434456 29434704 + 1.33333 NA intron (NR_073172, intron 1 of 1) intron (NR_073172, intron 1 of 1) 45286 NR_073170 101055625 Hs.569158 NR_073170 ENSG00000257599 OVCH1-AS1 - OVCH1 antisense RNA 1 ncRNA 276.666-4 chr10 23776037 23776323 + 1.33333 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 81453 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 199.333-157 chr2 236358175 236358395 + 1.33333 NA intron (NR_073043, intron 15 of 19) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -93940 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 196-124 chr3 109724072 109724256 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121336 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 232.666-24 chr2 125971629 125971886 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 146228 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 195.333-156 chr4 52689121 52689298 + 1.33333 NA Intergenic LTR23-int|LTR|ERV1 -23185 NR_145130 57291 Hs.744077 NR_024031 ENSG00000226950 DANCR AGU2|ANCR|KIAA0114|SNHG13|lncRNA-ANCR differentiation antagonizing non-protein coding RNA ncRNA 399.666 chr10 43441227 43441857 + 1.33333 NA intron (NM_001355444, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 4431 NM_001355450 642819 Hs.719657 NM_001355444 ENSG00000243660 ZNF487 KRBO1|ZNF487P zinc finger protein 487 protein-coding 286-2 chr1 69554981 69555329 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12179 NM_001330635 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 278.666-4 chr10 17565025 17565310 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 52207 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 207-12 chr10 53213119 53213379 + 1.33333 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -441549 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 208.666-90 chr5 132734171 132734428 + 1.33333 NA exon (NM_001300791, exon 2 of 19) exon (NM_001300791, exon 2 of 19) 3247 NM_001300791 11127 Hs.43670 NM_007054 ENSG00000131437 KIF3A FLA10|KLP-20 kinesin family member 3A protein-coding 342-10 chr14 61983402 61983835 + 1.33333 NA intron (NM_001367657, intron 3 of 6) AluJr4|SINE|Alu 55923 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 211.666-35 chr3 98959357 98959575 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57771 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 205.666-22 chr2 75938496 75938683 + 1.33333 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -227674 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 184.333-46 chr15 40012463 40012683 + 1.33333 NA intron (NM_001013703, intron 27 of 38) intron (NM_001013703, intron 27 of 38) 26608 NM_003134 6727 Hs.533732 NM_003134 ENSG00000140319 SRP14 ALURBP signal recognition particle 14 protein-coding 225.667-75 chr8 65285822 65286136 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -105639 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 245.333-88 chr4 102385989 102386206 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40615 NM_001135146 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 192-149 chr8 127052515 127052781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27226 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 192-145 chr8 109751103 109751326 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59423 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 247-73 chr8 72110073 72110448 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -34676 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 236.666-41 chr7 19115262 19115471 + 1.33333 NA TTS (NM_000474) TTS (NM_000474) 2270 NR_149001 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 240.333-24 chr11 76360857 76361136 + 1.33333 NA non-coding (NR_130898, exon 4 of 6) non-coding (NR_130898, exon 4 of 6) 19969 NR_130898 5612 Hs.503315 NM_004705 ENSG00000137492 THAP12 DAP4|P52rIPK|PRKRIR|THAP0 THAP domain containing 12 protein-coding 215.666-48 chr9 87008147 87008364 + 1.33333 NA TTS (NR_027471) TTS (NR_027471) 33871 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 196.666-107 chr8 120062080 120062297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62914 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 207-13 chr10 77017001 77017161 + 1.33333 NA intron (NM_001271519, intron 17 of 28) intron (NM_001271519, intron 17 of 28) -123750 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 327.333-45 chr8 92673400 92673763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18087 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 208.666-60 chr2 120974063 120974277 + 1.33333 NA intron (NM_005270, intron 8 of 13) intron (NM_005270, intron 8 of 13) 181889 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 335.333-43 chr5 146377914 146378377 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 39306 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 409-4 chr14 36209963 36210494 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -33577 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 163-52 chr22 28055654 28055891 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -135160 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 303.666-12 chr4 100354433 100354830 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 40616 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 202-3 chr1 52002827 52003018 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12222 NM_002867 5865 Hs.123072 NM_002867 ENSG00000169213 RAB3B - RAB3B, member RAS oncogene family protein-coding 186.333-69 chr2 21481558 21481774 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 228986 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 215-66 chr5 96172514 96172751 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 93494 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 310.666-4 chr10 70616254 70616709 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -13693 NM_005041 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 250-49 chr22 30607654 30607992 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001282328) promoter-TSS (NM_001282328) 649 NM_000355 6948 Hs.417948 NM_000355 ENSG00000185339 TCN2 D22S676|D22S750|II|TC|TC II|TC-2|TC2|TCII transcobalamin 2 protein-coding 214.666-52 chr4 149360202 149360414 + 1.33333 NA intron (NM_001363507, intron 13 of 13) MER2|DNA|TcMar-Tigger 206013 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 245.667-12 chr12 122617607 122617905 + 1.33333 NA intron (NM_014708, intron 57 of 63) intron (NM_014708, intron 57 of 63) 78243 NR_162150 113218511 NR_162150 MIR9902-2 - microRNA 9902-2 ncRNA 413.667-8 chr8 69193781 69194270 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -89835 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 348-9 chr14 47454105 47454500 + 1.33333 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -111056 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 128.667-120 chr3 96689981 96690198 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -124505 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 243.333-88 chr5 44514506 44514825 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4383 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 248.666-30 chr4 92058104 92058407 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 219047 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 327.999-8 chr4 42012457 42012914 + 1.33333 NA intron (NM_006345, intron 2 of 17) L1MA1|LINE|L1 22155 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 290.667-2 chr1 61310015 61310393 + 1.33333 NA intron (NM_001134673, intron 3 of 10) intron (NM_001134673, intron 3 of 10) -56686 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 211.666-20 chr18 69147937 69148208 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -252816 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 165-7 chr1 223335394 223335563 + 1.33333 NA intron (NM_017982, intron 2 of 8) intron (NM_017982, intron 2 of 8) 28698 NM_001037175 55061 Hs.497841 NM_017982 ENSG00000143502 SUSD4 PRO222 sushi domain containing 4 protein-coding 192.667-182 chr8 142386628 142386912 + 1.33333 NA intron (NM_001366903, intron 1 of 9) L1M7|LINE|L1 16412 NM_001366902 203062 Hs.370931 NM_145003 ENSG00000171045 TSNARE1 - t-SNARE domain containing 1 protein-coding 456.333-7 chr2 182846935 182847652 + 1.33333 NA intron (NM_001463, intron 2 of 5) L2b|LINE|L2 19344 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 488.333-4 chr5 40570681 40571169 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -108990 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 241.999-5 chr3 72435601 72435782 + 1.33333 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 10932 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 196-77 chr18 8992461 8992626 + 1.33333 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -110156 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 234.333-37 chr2 10765114 10765368 + 1.33333 NA intron (NM_001039362, intron 5 of 13) intron (NM_001039362, intron 5 of 13) 43611 NM_144583 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 276.333-24 chr2 103670569 103670971 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -686341 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 202.333-187 chr9 92062248 92062472 + 1.33333 NA intron (NM_001368273, intron 7 of 15) L1MD1|LINE|L1 53053 NM_001281303 10558 Hs.90458 NM_006415 ENSG00000090054 SPTLC1 HSAN1|HSN1|LBC1|LCB1|SPT1|SPTI serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1 protein-coding 358.666-18 chr7 46461047 46461439 + 1.33333 NA Intergenic MER61E|LTR|ERV1 235879 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 338-12 chr15 79361329 79361685 + 1.33333 NA intron (NM_001330376, intron 2 of 2) L1PB1|LINE|L1 50395 NM_001301203 23423 Hs.71608 NM_007364 ENSG00000166557 TMED3 C15orf22|P24B|p24g4|p24gamma4|p26 transmembrane p24 trafficking protein 3 protein-coding 314-57 chrX 145809905 145810392 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7681 NM_032539 84631 Hs.106688 NM_032539 ENSG00000185985 SLITRK2 CXorf1|CXorf2|SLITL1|TMEM257 SLIT and NTRK like family member 2 protein-coding 161.666-6 chr20 54122285 54122459 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -51607 NM_001316361 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 175-50 chr3 23551637 23551792 + 1.33333 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) intron (NM_001370225, intron 5 of 5) -254241 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 208-128 chr4 146431113 146431397 + 1.33333 NA intron (NM_001317816, intron 4 of 10) intron (NM_001317816, intron 4 of 10) 22672 NR_107003 102465837 NR_107003 ENSG00000278438 MIR7849 hsa-mir-7849 microRNA 7849 ncRNA 285-10 chr17 48920758 48921150 + 1.33333 NA intron (NM_023079, intron 4 of 6) intron (NM_023079, intron 4 of 6) -11971 NR_135674 105371814 Hs.655254 NR_135674 ENSG00000248278 LOC105371814 - uncharacterized LOC105371814 ncRNA 215.333-15 chr1 222590431 222590658 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_005681) promoter-TSS (NM_005681) 585 NR_110614 100506161 Hs.553851 NR_110613 ENSG00000225265 TAF1A-AS1 - TAF1A antisense RNA 1 ncRNA 184.667-120 chr7 10235330 10235606 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -467208 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 147-48 chr15 78888620 78888735 + 1.33333 NA intron (NM_006791, intron 5 of 11) FRAM|SINE|Alu 15688 NM_001265605 10933 Hs.374503 NM_006791 ENSG00000185787 MORF4L1 Eaf3|FWP006|HsT17725|MEAF3|MORFRG15|MRG15|S863-6 mortality factor 4 like 1 protein-coding 252.666-14 chr14 94614292 94614575 + 1.33333 NA intron (NM_001085, intron 1 of 4) intron (NM_001085, intron 1 of 4) 2042 NM_001085 12 Hs.534293 NM_001085 ENSG00000196136 SERPINA3 AACT|ACT|GIG24|GIG25 serpin family A member 3 protein-coding 283.333 chr1 32660808 32661089 + 1.33333 NA intron (NM_005610, intron 3 of 11) AluJb|SINE|Alu 9590 NM_001135256 5928 Hs.16003 NM_005610 ENSG00000162521 RBBP4 NURF55|RBAP48|lin-53 RB binding protein 4, chromatin remodeling factor protein-coding 215-26 chr16 80633128 80633433 + 1.33333 NA intron (NM_152342, intron 2 of 6) intron (NM_152342, intron 2 of 6) -60472 NR_104666 101928276 Hs.149769 NR_104665 ENSG00000260737 LINC01227 - long intergenic non-protein coding RNA 1227 ncRNA 183.666-11 chr2 184567958 184568238 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -30431 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 196-113 chr3 1596752 1597012 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -501921 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 368.666-12 chr2 81659606 81660011 + 1.33333 NA Intergenic LTR60B|LTR|ERV1 -192862 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 291.667-23 chr3 29500500 29500924 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 219400 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 239.333-9 chr1 244929053 244929371 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -40657 NM_032328 84288 Hs.134857 NM_032328 ENSG00000203666 EFCAB2 CFAP200|DRC8 EF-hand calcium binding domain 2 protein-coding 202-82 chr2 69656715 69656885 + 1.33333 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu 12992 NM_001320698 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 366.666-10 chr4 52032475 52032804 + 1.33333 NA intron (NM_000232, intron 2 of 5) intron (NM_000232, intron 2 of 5) 5680 NM_000232 6443 Hs.438953 NM_000232 ENSG00000163069 SGCB A3b|LGMD2E|LGMDR4|SGC sarcoglycan beta protein-coding 201.666-23 chr2 117406166 117406361 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -408428 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 269-31 chr22 27663645 27663987 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 137940 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 170-87 chr4 41376828 41377055 + 1.33333 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) L1MB7|LINE|L1 16134 NM_001330787 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 242-64 chr7 30304590 30304949 + 1.33333 NA intron (NM_147128, intron 1 of 4) intron (NM_147128, intron 1 of 4) -14879 NR_037513 100500883 NR_037513 ENSG00000283237 MIR550B1 - microRNA 550b-1 ncRNA 237 chr1 11264126 11264435 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -1729 NM_004958 2475 Hs.338207 NM_004958 ENSG00000198793 MTOR FRAP|FRAP1|FRAP2|RAFT1|RAPT1|SKS mechanistic target of rapamycin kinase protein-coding 315.333-31 chr3 36641835 36642210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97839 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 249.333-32 chr14 80693212 80693514 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) intron (NM_152446, intron 19 of 24) 248375 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 228-83 chr7 92988940 92989262 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 128878 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 278-38 chr4 33368801 33369080 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 670953 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 252.667-56 chr21 33572576 33572938 + 1.33333 NA intron (NR_103797, intron 9 of 12) intron (NR_103797, intron 9 of 12) 15927 NM_017613 29980 Hs.436341 NM_017613 ENSG00000159147 DONSON B17|C21orf60|MIMIS|MISSLA downstream neighbor of SON protein-coding 189.333-212 chr8 135562048 135562205 + 1.33333 NA intron (NM_006558, intron 5 of 8) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 104670 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 213.333-157 chr5 36228875 36229118 + 1.33333 NA intron (NM_001287341, intron 1 of 12) intron (NM_001287341, intron 1 of 12) 12395 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 157.667-254 chr5 84258007 84258201 + 1.33333 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 126763 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 268.667-61 chr8 87998836 87999184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -124995 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 263-54 chr5 66785638 66786026 + 1.33333 NA intron (NM_001290228, intron 2 of 4) intron (NM_001290228, intron 2 of 4) -42941 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 294.666-22 chr3 84416567 84416860 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 452862 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 349.999-4 chr2 139031782 139032087 + 1.33333 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 134610 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 220.666-25 chr16 11919825 11920061 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3289 NM_001130007 2935 Hs.528780 NM_002094 ENSG00000103342 GSPT1 551G9.2|ETF3A|GST1|eRF3a G1 to S phase transition 1 protein-coding 190.666-7 chr1 194700209 194700385 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1388418 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 196.667-108 chr4 88423688 88423972 + 1.33333 NA intron (NM_001165136, intron 13 of 21) intron (NM_001165136, intron 13 of 21) -33289 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 265.667-61 chr5 155154824 155155171 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 141242 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 214.666-25 chr15 68927369 68927592 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -3020 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 207.666-7 chr10 58768224 58768458 + 1.33333 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) L1M3c|LINE|L1 53326 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 183-94 chr6 81411261 81411416 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 341343 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 151.333-222 chr2 128847773 128847935 + 1.33333 NA Intergenic LTR35B|LTR|ERV1 -16746 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 356-3 chr1 210625449 210625966 + 1.33333 NA intron (NM_001122834, intron 11 of 11) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 296341 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 231-49 chr4 59645595 59645835 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 632142 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 212.667-56 chr17 55884336 55884645 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 133385 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 242.333-5 chr1 112095346 112095616 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 104945 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 272.999-4 chr4 75581228 75581555 + 1.33333 NA intron (NM_003948, intron 11 of 11) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 25325 NR_046429 152816 Hs.24510 NM_178497 ENSG00000174792 ODAPH AI2A4|C4orf26 odontogenesis associated phosphoprotein protein-coding 204-151 chr4 71443620 71443881 + 1.33333 NA intron (NM_003759, intron 5 of 22) intron (NM_003759, intron 5 of 22) 104697 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 215-51 chr22 28940544 28940768 + 1.33333 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) intron (NM_032173, intron 1 of 8) 23267 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 202-195 chr9 36692109 36692375 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 119347 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 227.333-132 chr9 76496793 76496980 + 1.33333 NA intron (NM_001097635, intron 1 of 2) intron (NM_001097635, intron 1 of 2) -3747 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 206-154 chr6 63240975 63241139 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 78920 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 170-27 chr12 32175654 32175894 + 1.33333 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 68927 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 178.333-142 chr5 88833766 88833919 + 1.33333 NA intron (NM_001131005, intron 2 of 10) intron (NM_001131005, intron 2 of 10) -6654 NM_001364341 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 385.333-12 chr14 61404040 61404434 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 2 of 13) intron (NM_006255, intron 2 of 13) 82794 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 339.333-15 chr16 47576801 47577215 + 1.33333 NA intron (NM_001031835, intron 8 of 31) L1MDa|LINE|L1 115677 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 191-73 chr8 56704343 56704601 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -144649 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 194.666-20 chr14 60798096 60798268 + 1.33333 NA intron (NM_001177963, intron 3 of 6) intron (NM_001177963, intron 3 of 6) 63421 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 190-131 chr9 87698856 87699121 + 1.33333 NA intron (NM_004938, intron 23 of 25) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -27131 NM_001912 1514 Hs.731507 NM_001912 ENSG00000135047 CTSL CATL|CTSL1|MEP cathepsin L protein-coding 424.333-10 chr7 31222064 31222687 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 118351 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 142-91 chr3 95178149 95178309 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 239966 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 292.333-36 chr5 132899696 132900191 + 1.33333 NA intron (NM_014423, intron 7 of 20) intron (NM_014423, intron 7 of 20) 26275 NM_052971 116842 Hs.337588 NM_052971 ENSG00000164406 LEAP2 LEAP-2 liver enriched antimicrobial peptide 2 protein-coding 261.667-48 chr3 60554500 60554860 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 5 of 9) MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 63190 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 192.333-118 chr3 185131730 185132013 + 1.33333 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) L1MEd|LINE|L1 21189 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 205-67 chr4 123869262 123869513 + 1.33333 NA intron (NR_027105, intron 4 of 5) intron (NR_027105, intron 4 of 5) 95123 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 403.999 chr20 29304212 29304537 + 1.33333 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 112587 NR_037925 647476 Hs.274541 NR_037925 FRG2EP - FSHD region gene 2 family member E, pseudogene pseudo 288.666-35 chr6 122520055 122520515 + 1.33333 NA intron (NM_001270393, intron 3 of 7) L2c|LINE|L2 48368 NM_001270394 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 251.333-24 chr12 56275712 56275935 + 1.33333 NA intron (NM_004077, intron 7 of 10) intron (NM_004077, intron 7 of 10) 8497 NM_001099337 93058 Hs.4096 NM_144576 ENSG00000135469 COQ10A - coenzyme Q10A protein-coding 196.666-5 chr1 170853992 170854168 + 1.33333 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -81391 NM_001163629 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 205-111 chrX 40354605 40354800 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 91785 NR_110386 101927476 Hs.522607 NR_110386 ENSG00000236393 LOC101927476 - uncharacterized LOC101927476 ncRNA 238.333-76 chr5 154133368 154133583 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -57258 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 223.333-158 chr7 113924209 113924436 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5313 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 241.333-38 chr14 49855882 49856138 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -2096 NR_145670 378707 NR_145670 ENSG00000278771 RN7SL3 7L30.2|RN7SL631P|RNSRP3 RNA component of signal recognition particle 7SL3 scRNA 149.667-173 chr18 55274065 55274283 + 1.33333 NA intron (NM_001348216, intron 3 of 12) intron (NM_001348216, intron 3 of 12) 28486 NM_001243236 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 192.333-77 chr18 67107225 67107444 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25750 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 333.999-6 chr7 74433999 74434493 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19660 NM_005685 9569 Hs.647056 NM_005685 ENSG00000006704 GTF2IRD1 BEN|CREAM1|GTF3|MUSTRD1|RBAP2|WBS|WBSCR11|WBSCR12|hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1 protein-coding 204.333-185 chr7 11821477 11821701 + 1.33333 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 10609 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 202.667-125 chr5 145093413 145093695 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 741788 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 186.666-8 chr10 48386435 48386632 + 1.33333 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) intron (NM_001323302, intron 3 of 13) -15079 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 206.333-50 chr14 24758077 24758310 + 1.33333 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -124003 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 239.666-24 chr6 39008043 39008334 + 1.33333 NA intron (NM_001371, intron 87 of 91) L2b|LINE|L2 -40593 NM_002062 2740 Hs.351883 NM_002062 ENSG00000112164 GLP1R GLP-1|GLP-1-R|GLP-1R glucagon like peptide 1 receptor protein-coding 209-50 chr17 27324521 27324850 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 30571 NR_145520 26118 Hs.446017 NM_015626 ENSG00000109046 WSB1 SWIP1|WSB-1 WD repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 279.666-16 chr7 154330195 154330440 + 1.33333 NA intron (NR_157196, intron 1 of 25) intron (NR_157196, intron 1 of 25) 25158 NM_001290252 1804 Hs.490684 NM_001936 ENSG00000130226 DPP6 DPL1|DPPX|MRD33|VF2 dipeptidyl peptidase like 6 protein-coding 453.666-4 chr3 80655370 80655893 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -109266 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 212-35 chr12 28595428 28595723 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -404837 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 337.333-22 chr2 44230361 44230948 + 1.33333 NA exon (NM_002706, exon 6 of 6) exon (NM_002706, exon 6 of 6) -44826 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 254.666-23 chr3 117674177 117674512 + 1.33333 NA Intergenic (TTTTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16581 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 314.333-17 chr4 6652257 6652783 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 12429 NM_001272054 93621 Hs.406590 NM_033296 ENSG00000179010 MRFAP1 PAM14|PGR1 Morf4 family associated protein 1 protein-coding 341.999-4 chr13 113116879 113117385 + 1.33333 NA intron (NR_051961, intron 5 of 6) intron (NR_051961, intron 5 of 6) -5667 NM_001312675 2159 Hs.361463 NM_000504 ENSG00000126218 F10 FX|FXA coagulation factor X protein-coding 230-35 chr2 67964139 67964352 + 1.33333 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 98759 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 220.333-54 chr18 7146011 7146378 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28397 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 223.667-18 chr14 41149664 41149972 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 195107 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 216.666-6 chr1 158383664 158383854 + 1.33333 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL 15707 NM_001004475 128360 Hs.553588 NM_001004475 ENSG00000186306 OR10T2 OR1-3 olfactory receptor family 10 subfamily T member 2 protein-coding 214-145 chr9 93489088 93489321 + 1.33333 NA intron (NM_001286723, intron 3 of 9) intron (NM_001286723, intron 3 of 9) -35603 NR_136229 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 390.666-4 chr2 69075970 69076312 + 1.33333 NA intron (NM_032208, intron 7 of 17) AluJb|SINE|Alu -27541 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 222.666-25 chr2 131410744 131410911 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 7926 NR_036499 389043 Hs.586791 NR_036499 LINC01120 - long intergenic non-protein coding RNA 1120 ncRNA 357.333-3 chr11 88292184 88292490 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 45399 NM_001114173 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 225.333-75 chr18 79762748 79763013 + 1.33333 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 81450 NM_001202504 9150 Hs.465490 NM_004715 ENSG00000060069 CTDP1 CCFDN|FCP1 CTD phosphatase subunit 1 protein-coding 212.667-51 chr16 80447249 80447521 + 1.33333 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -93349 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 236.999-2 chr12 79988115 79988302 + 1.33333 NA Intergenic (TTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -52753 NM_001143885 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 282.666-9 chr17 77164308 77164697 + 1.33333 NA intron (NM_001143999, intron 3 of 16) intron (NM_001143999, intron 3 of 16) -20711 NM_001144001 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 229.333-46 chr16 13300550 13300754 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 399054 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 282.333-62 chr9 88281090 88281430 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107184 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 264-32 chr2 214399771 214400004 + 1.33333 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -11167 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 303.333-21 chr14 53237485 53237775 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 84276 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 335.333-44 chr6 36317700 36318009 + 1.33333 NA intron (NM_001010903, intron 11 of 11) intron (NM_001010903, intron 11 of 11) 19034 NM_001010903 389384 Hs.162104 NM_001010903 ENSG00000189325 BNIP5 C6orf222 BCL2 interacting protein 5 protein-coding 228.666-46 chr8 125793737 125793946 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 157356 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 178.333-54 chr14_GL000225v1_random 61441 61625 + 1.33333 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 292.666-6 chr10 49723197 49723481 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 38660 NM_001347819 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 451.332 chr10 65008509 65008873 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -84173 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 331.333-30 chr3 16259004 16259453 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001047434, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001047434, exon 2 of 2) 5715 NM_001047434 285381 Hs.388087 NM_206831 ENSG00000154813 DPH3 DELGIP|DELGIP1|DESR1|DPH3A|KTI11|ZCSL2 diphthamide biosynthesis 3 protein-coding 150.666-6 chr12 119430009 119430184 + 1.33333 NA intron (NM_178499, intron 2 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie 95367 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 251-26 chr15 70715577 70715812 + 1.33333 NA intron (NM_018003, intron 1 of 18) intron (NM_018003, intron 1 of 18) -13412 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 308.333-21 chr2 128652937 128653234 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -211515 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 209.333-118 chr2 114113313 114113511 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -133428 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 200-121 chr4 176241156 176241423 + 1.33333 NA intron (NM_080874, intron 1 of 6) intron (NM_080874, intron 1 of 6) 27933 NM_080874 140458 Hs.591712 NM_080874 ENSG00000164122 ASB5 ASB-5 ankyrin repeat and SOCS box containing 5 protein-coding 207.666-66 chr8 134869999 134870245 + 1.33333 NA intron (NR_125427, intron 1 of 2) intron (NR_125427, intron 1 of 2) 20187 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 200-106 chr3 130579058 130579341 + 1.33333 NA intron (NM_001102608, intron 7 of 35) intron (NM_001102608, intron 7 of 35) 18865 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 215-47 chr20 31846003 31846348 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_004118) promoter-TSS (NM_004118) -571 NM_004118 2307 Hs.516971 NM_004118 ENSG00000179772 FOXS1 FKHL18|FREAC10 forkhead box S1 protein-coding 306.666-19 chr2 178141519 178141760 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29202 NM_152945 129831 Hs.377257 NM_152945 ENSG00000155636 RBM45 DRB1|RB-1 RNA binding motif protein 45 protein-coding 195.667-28 chr12 21558859 21559116 + 1.33333 NA intron (NM_021957, intron 10 of 15) intron (NM_021957, intron 10 of 15) 31062 NR_135188 80763 Hs.130692 NM_030572 ENSG00000134548 SPX C12orf39 spexin hormone protein-coding 189.333-194 chr7 102862440 102862607 + 1.33333 NA intron (NR_105043, intron 17 of 20) intron (NR_105043, intron 17 of 20) -50477 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 199.333-150 chr2 179813096 179813353 + 1.33333 NA intron (NR_148056, intron 1 of 9) L1M2|LINE|L1 47684 NR_031659 100302172 NR_031659 ENSG00000221240 MIR1258 MIRN1258|hsa-mir-1258|mir-1258 microRNA 1258 ncRNA 186.333-16 chr10 55168362 55168628 + 1.33333 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -367204 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 316-15 chr15 35558842 35559321 + 1.33333 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) intron (NR_038251, intron 1 of 2) 12886 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 214.333-113 chr5 39332160 39332411 + 1.33333 NA intron (NM_001737, intron 4 of 10) intron (NM_001737, intron 4 of 10) 32210 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 190.667-85 chr3 116514534 116514758 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37827 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 228.666 chr1 39379134 39379412 + 1.33333 NA exon (NM_012090, exon 48 of 93) exon (NM_012090, exon 48 of 93) -29800 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 208.666-40 chr14 88359608 88359802 + 1.33333 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -25939 NM_001040428 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 209.333-83 chr16 47715877 47716093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -142596 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 215.333-95 chr2 128013424 128013684 + 1.33333 NA intron (NM_001330303, intron 5 of 19) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 13741 NM_001145928 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 206-197 chrX 94640807 94641095 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 422275 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 183.333-57 chr16 7634704 7634873 + 1.33333 NA intron (NM_145893, intron 8 of 13) intron (NM_145893, intron 8 of 13) 301943 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 116.666-2 chr1 66639808 66639959 + 1.33333 NA intron (NM_001350218, intron 4 of 22) intron (NM_001350218, intron 4 of 22) 11443 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 373.333-12 chr18 12815435 12815822 + 1.33333 NA intron (NM_080423, intron 6 of 8) intron (NM_080423, intron 6 of 8) 25334 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 183.666-12 chr2 207887446 207887639 + 1.33333 NA intron (NM_001080475, intron 6 of 7) intron (NM_001080475, intron 6 of 7) -117636 NM_003468 7855 Hs.17631 NM_003468 ENSG00000163251 FZD5 C2orf31|HFZ5 frizzled class receptor 5 protein-coding 235.666-4 chr12 112593550 112593830 + 1.33333 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) intron (NM_001347952, intron 1 of 21) 18454 NM_001347952 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 188.666-39 chr8 134842180 134842343 + 1.33333 NA non-coding (NR_126028, exon 2 of 3) non-coding (NR_126028, exon 2 of 3) 4192 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 243.666-2 chr1 108886004 108886335 + 1.33333 NA intron (NM_013296, intron 2 of 14) FLAM_A|SINE|Alu 9184 NM_001321038 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 176.667-133 chr7 42683556 42683757 + 1.33333 NA intron (NR_110833, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 22791 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 198-110 chr22 24286020 24286281 + 1.33333 NA intron (NM_015330, intron 2 of 16) intron (NM_015330, intron 2 of 16) 15319 NM_015330 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 148-53 chr16 56264839 56265002 + 1.33333 NA intron (NM_138736, intron 2 of 7) intron (NM_138736, intron 2 of 7) 19400 NR_037499 100500891 NR_037499 ENSG00000265281 MIR3935 - microRNA 3935 ncRNA 298-24 chr13 110085568 110085862 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 32430 NR_126387 104355146 Hs.508690 NR_126387 ENSG00000231428 LINC00396 - long intergenic non-protein coding RNA 396 ncRNA 296.666-10 chr17 64771566 64771874 + 1.33333 NA intron (NR_026899, intron 3 of 12) AluSz|SINE|Alu -9039 NR_106728 102464831 NR_106728 ENSG00000278581 MIR6080 hsa-mir-6080 microRNA 6080 ncRNA 226-33 chr17 65206642 65206990 + 1.33333 NA intron (NM_003835, intron 15 of 18) intron (NM_003835, intron 15 of 18) 69446 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 343.333-10 chr15 26653306 26653596 + 1.33333 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) LTR8|LTR|ERV1 -24361 NR_103801 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 170-61 chr2 103951579 103951763 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 456661 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 234.666-45 chr7 70690714 70690959 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) AluJr|SINE|Alu -441308 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 373-14 chr4 79781040 79781396 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -46253 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 343.333-25 chr5 27704146 27704645 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 232103 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 312.666-8 chr16 80760124 80760589 + 1.33333 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) L1MA1|LINE|L1 44242 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 377.333 chr11 93180017 93180376 + 1.33333 NA intron (NM_152313, intron 6 of 10) intron (NM_152313, intron 6 of 10) 17230 NM_001286139 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 257.666-14 chr3 176387832 176388194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -127090 NR_107017 102465858 NR_107017 ENSG00000283333 MIR7977 hsa-mir-7977 microRNA 7977 ncRNA 159.667-317 chr8 81142663 81142915 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -30721 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 238 chr1 39745847 39746079 + 1.33333 NA intron (NM_006112, intron 7 of 9) intron (NM_006112, intron 7 of 9) 7118 NM_001195007 10450 Hs.524690 NM_006112 ENSG00000084072 PPIE CYP-33|CYP33 peptidylprolyl isomerase E protein-coding 353.666-8 chr5 75213246 75213616 + 1.33333 NA intron (NM_001164443, intron 3 of 24) intron (NM_001164443, intron 3 of 24) 23447 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 191.333-74 chr15 60180745 60180969 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176546 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 188.333-92 chr22 24727079 24727254 + 1.33333 NA intron (NM_001008496, intron 16 of 20) intron (NM_001008496, intron 16 of 20) -37335 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 164-4 chr1 59620345 59620551 + 1.33333 NA intron (NM_001350794, intron 9 of 14) L1MEf|LINE|L1 104818 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 302.999-9 chr21 14656353 14656687 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13413 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 219-10 chr10 53668960 53669158 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -817171 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 218.333-64 chr2 41921554 41921728 + 1.33333 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 12082 NR_110263 101929723 Hs.369330 NR_110262 ENSG00000234362 LINC01914 - long intergenic non-protein coding RNA 1914 ncRNA 276.666-18 chr2 57240473 57240948 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -666941 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 214.999-5 chr18 12838656 12838847 + 1.33333 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) intron (NM_080423, intron 2 of 8) 2211 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 238.666-2 chr1 94232578 94232894 + 1.33333 NA intron (NM_001328664, intron 1 of 22) intron (NM_001328664, intron 1 of 22) 4848 NM_001328666 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 277.333-75 chr5 99037542 99037903 + 1.33333 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -108008 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 212.666-63 chr4 72973115 72973288 + 1.33333 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie 96515 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 301.333-24 chr2 4437163 4437458 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 218912 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 204-113 chr20 10405451 10405690 + 1.33333 NA exon (NM_170784, exon 6 of 6) exon (NM_170784, exon 6 of 6) 26355 NM_018848 8195 Hs.472119 NM_018848 ENSG00000125863 MKKS BBS6|HMCS|KMS|MKS McKusick-Kaufman syndrome protein-coding 178-79 chr3 97014347 97014682 + 1.33333 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) 199920 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 121.333-181 chr8 115949775 115949928 + 1.33333 NA TTS (NR_046215) TTS (NR_046215) -280876 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 199.333-95 chr17 12808550 12808848 + 1.33333 NA intron (NM_001321164, intron 1 of 20) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -18415 NR_104607 100128006 Hs.567641 NR_104607 ENSG00000265489 LOC100128006 - uncharacterized LOC100128006 ncRNA 254.667-56 chr3 167063962 167064329 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165462 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 262.333-9 chr10 15244207 15244647 + 1.33333 NA intron (NM_001010924, intron 5 of 7) AluJr|SINE|Alu -75734 NM_004808 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 199.333-146 chr2 174009159 174009330 + 1.33333 NA Intergenic Charlie9|DNA|hAT-Charlie -16036 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 213.666-38 chr5 68355766 68355977 + 1.33333 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger 63294 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 166.333-12 chr1 157875013 157875194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33295 NM_001347698 922 Hs.134035 NM_005894 ENSG00000073754 CD5L AIM|API6|CT-2|PRO229|SP-ALPHA|Spalpha|hAIM CD5 molecule like protein-coding 240-16 chr11 124538697 124538944 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 4834 NM_001005195 219858 Hs.553634 NM_001005195 ENSG00000170953 OR8B12 OR11-317 olfactory receptor family 8 subfamily B member 12 protein-coding 207.333-17 chr1 177327697 177327875 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23800 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 396-2 chr10 75201410 75201967 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8466 NM_001184823 7417 Hs.355927 NM_003375 ENSG00000165637 VDAC2 POR voltage dependent anion channel 2 protein-coding 232-92 chr8 127522004 127522323 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -40024 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 316.667-33 chr8 124375267 124375675 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -2772 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 200.666-60 chr2 113711430 113711664 + 1.33333 NA non-coding (NR_104470, exon 17 of 17) non-coding (NR_104470, exon 17 of 17) 9821 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 132-46 chr15 99143467 99143692 + 1.33333 NA intron (NR_109947, intron 11 of 12) intron (NR_109947, intron 11 of 12) 38499 NM_015286 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 175.666-23 chr7 31247213 31247356 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 93442 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 309.667-25 chr6 64265856 64266247 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) intron (NM_001292009, intron 30 of 43) 459215 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 204.666-42 chr2 152151764 152151922 + 1.33333 NA intron (NM_005843, intron 1 of 13) L1MB8|LINE|L1 23920 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 194-154 chr9 121001905 121002126 + 1.33333 NA intron (NM_001317164, intron 20 of 20) L1ME3G|LINE|L1 48260 NM_001317164 727 Hs.494997 NM_001735 ENSG00000106804 C5 C5D|C5a|C5b|CPAMD4|ECLZB complement C5 protein-coding 283-39 chr9 101972876 101973348 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -234532 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 252-92 chr6 50461756 50462186 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -251573 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 152.333-352 chr7 40100922 40101073 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33625 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 171-27 chr17 40821372 40821551 + 1.33333 NA intron (NM_000421, intron 1 of 7) intron (NM_000421, intron 1 of 7) 1153 NM_000421 3858 Hs.99936 NM_000421 ENSG00000186395 KRT10 BCIE|BIE|CK10|EHK|K10|KPP keratin 10 protein-coding 229-35 chr20 6017717 6018007 + 1.33333 NA intron (NR_136617, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 10613 NM_001323561 54675 Hs.743956 NM_019095 ENSG00000088766 CRLS1 C20orf155|CLS|CLS1|GCD10|dJ967N21.6 cardiolipin synthase 1 protein-coding 254.333-84 chr8 61221791 61222082 + 1.33333 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -66034 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 209.333-49 chr12 87655532 87655841 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -113126 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 306.333-4 chr1 162909095 162909507 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -40486 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 332.666-2 chr1 184717442 184717846 + 1.33333 NA intron (NM_025191, intron 11 of 19) intron (NM_025191, intron 11 of 19) 37214 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 266.999-5 chrX 76680586 76680897 + 1.33333 NA intron (NR_110404, intron 1 of 2) L1PA15|LINE|L1 238619 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 195.333-207 chr7 91379788 91380030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 115476 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 205-44 chr18 7222259 7222488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8731 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 231.333-10 chr1 200876807 200877012 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 3928 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 205.333-138 chr20 13005546 13005781 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3309 NM_018327 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 210.667-21 chr10 68117798 68118103 + 1.33333 NA intron (NM_001256268, intron 2 of 23) MIR|SINE|MIR 8462 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 217.666-39 chr8 121360561 121360820 + 1.33333 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -278656 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 243.666-32 chr7 12683652 12683859 + 1.33333 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie -3072 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 135.333-51 chr14 53165970 53166133 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12697 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 406-6 chr2 168769517 168769962 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_203463, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_203463, exon 10 of 10) 16690 NR_045786 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 248-41 chr2 161447961 161448286 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31826 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 199.666-40 chr4 37019598 37019770 + 1.33333 NA non-coding (NR_134669, exon 2 of 2) non-coding (NR_134669, exon 2 of 2) 17905 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 221.666-54 chr8 29276151 29276350 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13180 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 234.666-35 chr4 54159885 54160170 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 59864 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 217.666-38 chr8 102076258 102076557 + 1.33333 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) intron (NM_001040624, intron 1 of 7) 47927 NM_001040629 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 168-60 chr20 48015315 48015490 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25285 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 191.333-4 chr1 61827532 61827681 + 1.33333 NA intron (NM_001350145, intron 16 of 43) intron (NM_001350145, intron 16 of 43) -18469 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 381.333-10 chr2 115572372 115572771 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 228756 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 189.333-152 chr5 30278094 30278317 + 1.33333 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 397645 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 334.667-10 chr17 60579215 60579598 + 1.33333 NA intron (NR_126009, intron 3 of 3) intron (NR_126009, intron 3 of 3) 14860 NR_126009 388406 Hs.368309 NR_126009 ENSG00000267772 LINC01999 - long intergenic non-protein coding RNA 1999 ncRNA 368.666-14 chr2 212630264 212630672 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -91666 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 154-16 chr10 63404752 63404937 + 1.33333 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) L3|LINE|CR1 -25731 NR_134312 105378330 Hs.602852 NR_134312 LOC105378330 - uncharacterized LOC105378330 ncRNA 418-13 chr7 43577757 43578250 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -5105 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 217.666-40 chr8 122173689 122173925 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 394837 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 309.333-5 chr10 20573140 20573524 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 21362 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 253.999-4 chr2 39737300 39737569 + 1.33333 NA intron (NR_135664, intron 11 of 11) intron (NR_135664, intron 11 of 11) 41824 NM_025264 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 206.333-130 chr5 80571473 80571660 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1286 NM_001004441 340120 Hs.519404 NM_001004441 ENSG00000189127 ANKRD34B DP58 ankyrin repeat domain 34B protein-coding 180-23 chr12 802372 802563 + 1.33333 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) intron (NM_001184985, intron 1 of 27) 49544 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 396-3 chr11 95422017 95422493 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -189780 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 204-86 chr18 34166033 34166241 + 1.33333 NA intron (NM_001353232, intron 1 of 9) intron (NM_001353232, intron 1 of 9) 56333 NM_001353235 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 354-17 chr3 55539448 55539817 + 1.33333 NA intron (NM_015576, intron 16 of 16) AluY|SINE|Alu -51990 NM_003392 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 152.667-45 chr10 61936996 61937220 + 1.33333 NA intron (NM_032199, intron 2 of 9) MER102c|DNA|hAT-Charlie 35409 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 168.667-196 chr7 16375404 16375648 + 1.33333 NA intron (NM_001101417, intron 2 of 8) intron (NM_001101417, intron 2 of 8) 46012 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 209.333-145 chr3 4726727 4727028 + 1.33333 NA intron (NM_001168272, intron 40 of 60) intron (NM_001168272, intron 40 of 60) 24713 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 238-59 chr22 47849407 47849676 + 1.33333 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) intron (NR_122046, intron 8 of 8) 217867 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 324-30 chr8 89072917 89073304 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 684601 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 179.333-43 chr11 104937587 104937759 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -19498 NR_034079 643733 Hs.713751 NR_034078 ENSG00000235505 CASP17P - caspase 17, pseudogene pseudo 217.666-41 chr9 84175988 84176182 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 112642 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 258.333-51 chr5 129734396 129734825 + 1.33333 NA intron (NM_133638, intron 21 of 22) intron (NM_133638, intron 21 of 22) -13484 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 207.333-243 chr6 88701000 88701266 + 1.33333 NA intron (NM_001286428, intron 11 of 13) (GAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -161764 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 318.333-25 chr3 197107361 197107687 + 1.33333 NA intron (NM_001366216, intron 12 of 23) AluY|SINE|Alu 76348 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 178.333-136 chr5 42882156 42882377 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -70190 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 188-64 chr20 33874040 33874285 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 62814 NM_176812 128866 Hs.472471 NM_176812 ENSG00000101421 CHMP4B C20orf178|CHMP4A|CTPP3|CTRCT31|SNF7|SNF7-2|Shax1|VPS32B|Vps32-2|dJ553F4.4 charged multivesicular body protein 4B protein-coding 220.666-2 chr1 66992496 66992691 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61555 NM_015139 23169 Hs.213642 NM_015139 ENSG00000116704 SLC35D1 SHNKND|UGTREL7 solute carrier family 35 member D1 protein-coding 217.333-147 chr8 70417494 70417700 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -13380 NM_001321703 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 187.333-101 chr2 81936108 81936325 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -469270 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 172.667-89 chr2 153177520 153177726 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 301139 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 204.666-15 chr10 98442174 98442394 + 1.33333 NA intron (NM_001322476, intron 3 of 19) L1ME1|LINE|L1 -4037 NR_134451 101927278 Hs.434883 NR_134451 LOC101927278 - uncharacterized LOC101927278 ncRNA 202-186 chr8 120167940 120168147 + 1.33333 NA intron (NM_021110, intron 4 of 47) intron (NM_021110, intron 4 of 47) 42941 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 399.332 chr7 40806116 40806480 + 1.33333 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) Plat_L3|LINE|CR1 173641 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 222-48 chr2 154852428 154852697 + 1.33333 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) intron (NM_002239, intron 2 of 2) 153867 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 124.333-70 chr18 11583740 11583956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25710 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 191.333-31 chr11 43260292 43260493 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 8977 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 200.333-104 chr4 62756052 62756266 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -594394 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 262.666-9 chr17 17175438 17175784 + 1.33333 NA intron (NM_201274, intron 19 of 23) intron (NM_201274, intron 19 of 23) 30722 NM_178836 201164 Hs.729079 NM_178836 ENSG00000179598 PLD6 ZUC phospholipase D family member 6 protein-coding 192-92 chr3 31385349 31385696 + 1.33333 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -147403 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 206.666-78 chr3 128754844 128755018 + 1.33333 NA intron (NM_004637, intron 1 of 5) L1M4c|LINE|L1 28795 NM_004637 7879 Hs.684374 NM_004637 ENSG00000075785 RAB7A PRO2706|RAB7 RAB7A, member RAS oncogene family protein-coding 195-98 chr7 94646548 94646768 + 1.33333 NA intron (NM_001346719, intron 1 of 12) intron (NM_001346719, intron 1 of 12) 9475 NM_001362808 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 172.333-71 chr18 13170114 13170287 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -48560 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 227.666-34 chr8 121017778 121018051 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205868 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 221.333-5 chr1 63182785 63183022 + 1.33333 NA intron (NR_038252, intron 6 of 11) L1MA8|LINE|L1 134354 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 245.333-11 chr1 226088723 226088920 + 1.33333 NA intron (NR_146920, intron 2 of 3) intron (NR_146920, intron 2 of 3) 5246 NR_146920 105373113 Hs.149726 NR_146920 LINC01703 lncPARP1 long intergenic non-protein coding RNA 1703 ncRNA 198.666-57 chr3 7186818 7187089 + 1.33333 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) FAM|SINE|Alu -292936 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 173-64 chr4 43843544 43843701 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -173239 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 193.333-10 chr1 179260500 179260715 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30923 NM_001136001 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 326.666-17 chr9 28934181 28934456 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -45363 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 235.666-2 chr11 31871706 31872037 + 1.33333 NA intron (NR_033971, intron 1 of 2) intron (NR_033971, intron 1 of 2) 45304 NR_117094 103157000 NR_117094 ENSG00000281880 PAUPAR - PAX6 upstream antisense RNA ncRNA 200.333-54 chr17 51092767 51092985 + 1.33333 NA intron (NM_001130527, intron 1 of 29) AluJr|SINE|Alu 27992 NM_001130528 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 416.667-17 chr8 73202122 73202682 + 1.33333 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 57100 NM_001243237 100130301 Hs.202296 NM_001243237 ENSG00000274443 C8orf89 - chromosome 8 open reading frame 89 protein-coding 261.333-104 chr8 112214175 112214549 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -429131 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 225.333-145 chrX 105268935 105269189 + 1.33333 NA intron (NM_017416, intron 5 of 10) intron (NM_017416, intron 5 of 10) -48369 NM_031274 56157 Hs.567543 NM_031274 ENSG00000268629 TEX13A - testis expressed 13A protein-coding 161.333-155 chr2 130994414 130994647 + 1.33333 NA intron (NM_001367493, intron 4 of 13) L1MEg|LINE|L1 98632 NM_001321747 130074 Hs.534679 NM_001009993 ENSG00000152102 FAM168B MANI family with sequence similarity 168 member B protein-coding 196-35 chr12 33187224 33187438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 252488 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 247.333-78 chr7 105544043 105544343 + 1.33333 NA intron (NM_001346603, intron 4 of 11) intron (NM_001346603, intron 4 of 11) 11992 NM_021930 60561 Hs.531388 NM_021930 ENSG00000135249 RINT1 RINT-1 RAD50 interactor 1 protein-coding 221.666-28 chr2 66012137 66012396 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 346062 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 228.667-30 chr17 59285232 59285554 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -46262 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 287.333-70 chr9 98116404 98116826 + 1.33333 NA intron (NM_033219, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 2607 NM_014788 9830 Hs.575631 NM_014788 ENSG00000106785 TRIM14 - tripartite motif containing 14 protein-coding 435.666-3 chr4 60126783 60127342 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -795557 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 202.333-9 chr1 63302257 63302483 + 1.33333 NA intron (NR_038252, intron 3 of 11) AluJo|SINE|Alu 14887 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 339.333-25 chr2 147740449 147740757 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -103914 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 234-66 chr7 55205975 55206177 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001346900, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_001346900, exon 28 of 28) -17127 NR_047551 100507500 Hs.720489 NR_047551 ENSG00000224057 EGFR-AS1 - EGFR antisense RNA 1 ncRNA 227.666-29 chr5 144398053 144398341 + 1.33333 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 192806 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 214.999-3 chr15 58139953 58140153 + 1.33333 NA intron (NM_020980, intron 1 of 5) intron (NM_020980, intron 1 of 5) 1672 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 163.667-233 chr7 41131231 41131379 + 1.33333 NA intron (NR_110832, intron 5 of 5) intron (NR_110832, intron 5 of 5) 29701 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 188.666-5 chr10 99737999 99738348 + 1.33333 NA intron (NM_015960, intron 2 of 8) intron (NM_015960, intron 2 of 8) -5507 NM_004376 1355 Hs.28326 NM_004376 ENSG00000014919 COX15 CEMCOX2 cytochrome c oxidase assembly homolog COX15 protein-coding 204-44 chr11 94530179 94530457 + 1.33333 NA intron (NM_001190462, intron 3 of 3) intron (NM_001190462, intron 3 of 3) -13533 NM_002033 2526 Hs.390420 NM_002033 ENSG00000196371 FUT4 CD15|ELFT|FCT3A|FUC-TIV|FUTIV|LeX|SSEA-1 fucosyltransferase 4 protein-coding 256.333-77 chr8 73827877 73828293 + 1.33333 NA intron (NM_018299, intron 2 of 5) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 50777 NM_001271015 55284 Hs.128841 NM_018299 ENSG00000104343 UBE2W UBC-16|UBC16 ubiquitin conjugating enzyme E2 W protein-coding 210-50 chr17 59032597 59032775 + 1.33333 NA intron (NR_148346, intron 17 of 23) intron (NR_148346, intron 17 of 23) 74194 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 200.333-126 chr5 121932026 121932275 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -29825 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 249.999-10 chr9 91392268 91392549 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30439 NM_001351432 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 200.667-105 chr3 7639816 7640109 + 1.33333 NA intron (NM_000844, intron 8 of 9) L1ME2|LINE|L1 -104678 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 196-169 chr7 52418473 52418758 + 1.33333 NA Intergenic (ATTTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -617018 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 198.333-59 chr14 58444946 58445237 + 1.33333 NA intron (NM_001329944, intron 6 of 31) AluJr|SINE|Alu 5410 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 254.333-18 chr13 77641456 77641830 + 1.33333 NA intron (NM_003843, intron 30 of 31) MER5B|DNA|hAT-Charlie 21160 NM_001310140 100129307 NM_001310140 LOC100129307 - putative UPF0607 protein ENSP00000383144 protein-coding 198.333-112 chr20 46930695 46930853 + 1.33333 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) intron (NM_172110, intron 1 of 13) 35931 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 206-173 chr7 113882852 113883016 + 1.33333 NA intron (NM_002711, intron 1 of 3) intron (NM_002711, intron 1 of 3) 36075 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 222-22 chr12 120858743 120858970 + 1.33333 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) intron (NM_139015, intron 1 of 10) 45502 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 213.333-138 chr3 152191806 152192080 + 1.33333 NA intron (NR_136178, intron 1 of 2) intron (NR_136178, intron 1 of 2) 13486 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 322-37 chr6 69834824 69835405 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31442 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 170.666-23 chrX 40781369 40781553 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45919 NM_004229 9282 Hs.407604 NM_004229 ENSG00000180182 MED14 CRSP150|CRSP2|CSRP|CXorf4|DRIP150|EXLM1|RGR1|TRAP170 mediator complex subunit 14 protein-coding 467.333-5 chr15 63915250 63915861 + 1.33333 NA TTS (NM_001363730) TTS (NM_001363730) -12719 NR_120344 101928988 Hs.673214 NR_120344 ENSG00000259351 LOC101928988 - uncharacterized LOC101928988 ncRNA 252.666-2 chr1 89922669 89922895 + 1.33333 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 72184 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 227.333-62 chr2 60645413 60645594 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -91849 NM_018014 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 208-170 chr8 122716179 122716445 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -22206 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 158.666-26 chr7 17613560 17613726 + 1.33333 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -54734 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 387-4 chr12 40835108 40835662 + 1.33333 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) 7447 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 306.667-7 chr12 12177775 12178207 + 1.33333 NA intron (NM_002336, intron 7 of 22).2 intron (NM_002336, intron 7 of 22).2 66039 NR_128710 103504734 NR_128710 ENSG00000283475 MIR1244-4 hsa-mir-1244-4 microRNA 1244-4 ncRNA 214.333-65 chr18 13178485 13178775 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40130 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 120-17 chr10 115263957 115264139 + 1.33333 NA intron (NM_207303, intron 10 of 28) intron (NM_207303, intron 10 of 28) 170683 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 115.666 chr21 18610181 18610335 + 1.33333 NA intron (NR_109925, intron 2 of 3) intron (NR_109925, intron 2 of 3) 75906 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 215-49 chr21 28457390 28457577 + 1.33333 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -81835 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 151.333-308 chr4 75658043 75658191 + 1.33333 NA intron (NM_203504, intron 3 of 10) intron (NM_203504, intron 3 of 10) 15042 NM_012297 9908 Hs.303676 NM_012297 ENSG00000138757 G3BP2 - G3BP stress granule assembly factor 2 protein-coding 199.333-17 chr1 166527929 166528216 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -38033 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 285.333-53 chr4 72359059 72359550 + 1.33333 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) MIRc|SINE|MIR 209917 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 134.667-148 chr4 120798010 120798164 + 1.33333 NA intron (NM_001300824, intron 9 of 13) intron (NM_001300824, intron 9 of 13) 124779 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 179.333-133 chr4 41871258 41871517 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11224 NR_104143 101927074 Hs.611425 NR_104143 ENSG00000245870 LINC00682 - long intergenic non-protein coding RNA 682 ncRNA 271-15 chr14 22369396 22369804 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63153 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 386-4 chr16 71721482 71722018 + 1.33333 NA intron (NM_015020, intron 1 of 18) intron (NM_015020, intron 1 of 18) 2951 NM_015020 23035 Hs.709458 NM_015020 ENSG00000040199 PHLPP2 PHLPPL|PPM3B PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 protein-coding 215.333-217 chrX 153190490 153190741 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 11331 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 213.666-11 chr13 100601723 100602169 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -13154 NM_001195087 87769 Hs.350868 NM_033110 ENSG00000134864 GGACT A2LD1 gamma-glutamylamine cyclotransferase protein-coding 376.666-9 chr4 184154977 184155289 + 1.33333 NA intron (NM_153343, intron 1 of 7) intron (NM_153343, intron 1 of 7) 62740 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 208.666-7 chr1 97133024 97133188 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 20 of 22) intron (NM_000110, intron 20 of 22) 37183 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 189.333-52 chr14 43036983 43037158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1430214 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 171.333-119 chr3 59469312 59469560 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 189061 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 294.333-35 chr5 115071837 115072375 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 97802 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 296.333-9 chr12 116019089 116019349 + 1.33333 NA intron (NM_015335, intron 7 of 30) intron (NM_015335, intron 7 of 30) 129435 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 214-124 chr7 32388827 32389093 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L1MEd|LINE|L1 39264 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 288.333-21 chr2 69307161 69307555 + 1.33333 NA Intergenic CpG 79869 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 206.666-29 chr12 66295395 66295595 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -6998 NM_001370285 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 194-74 chr2 58738181 58738356 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 217515 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 401-12 chr3 132541570 132541986 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -55492 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 279.333-19 chr11 90160745 90161168 + 1.33333 NA intron (NM_005467, intron 8 of 18).2 LTR37-int|LTR|ERV1 26293 NM_001300930 10003 Hs.112482 NM_005467 ENSG00000077616 NAALAD2 GCPIII|GPCIII|NAADALASE2|NAALADASE2 N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2 protein-coding 157.667-225 chr4 168450410 168450617 + 1.33333 NA intron (NM_001345927, intron 8 of 37) intron (NM_001345927, intron 8 of 37) 29979 NM_001345927 91351 Hs.535011 NM_001012967 ENSG00000181381 DDX60L - DExD/H-box 60 like protein-coding 186-46 chr2 40965797 40966015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -453471 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 172.333-133 chr5 28671654 28671896 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -255095 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 238.333-85 chr7 78362391 78362679 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 7 of 20) intron (NM_001301128, intron 7 of 20) 15293 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 223.333-157 chr7 102997875 102998086 + 1.33333 NA intron (NR_105043, intron 7 of 20) L1MA4|LINE|L1 24550 NM_001085386 58160 Hs.621233 NM_001085386 ENSG00000230257 NFE4 NF-E4 nuclear factor, erythroid 4 protein-coding 165.666 chr11 11281402 11281610 + 1.33333 NA intron (NM_001363464, intron 9 of 9) intron (NM_001363464, intron 9 of 9) 71744 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 238.333-96 chr9 107673717 107674093 + 1.33333 NA Intergenic MER5C|DNA|hAT-Charlie -184136 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 209.333-13 chr10 4355100 4355334 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -29029 NR_108055 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 158.666-4 chr10 12928455 12928612 + 1.33333 NA intron (NM_001282658, intron 6 of 6) intron (NM_001282658, intron 6 of 6) 73180 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 344.999-3 chr5 44739122 44739460 + 1.33333 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 69502 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 222-69 chr4 108855992 108856249 + 1.33333 NA intron (NM_198721, intron 23 of 36) intron (NM_198721, intron 23 of 36) -93067 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 239.666-15 chr2 35101541 35101812 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -369729 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 338.999-3 chr14 79182877 79183393 + 1.33333 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -16847 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 280.666 chr1 82041154 82041470 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 238859 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 208.666-87 chr5 86997863 86998053 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 116996 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 209-67 chr20 21367750 21368022 + 1.33333 NA intron (NM_001317960, intron 26 of 29) L1ME4a|LINE|L1 29640 NM_033176 644524 NM_033176 ENSG00000125816 NKX2-4 NKX2.4|NKX2D NK2 homeobox 4 protein-coding 369.333-23 chr7 6676447 6676964 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 30242 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 247.333-18 chr11 108790091 108790408 + 1.33333 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) intron (NM_004398, intron 13 of 17) 125180 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 216-112 chr6 169508409 169508773 + 1.33333 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 193438 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 162.666-8 chr2 169620170 169620320 + 1.33333 NA intron (NM_004792, intron 9 of 13) L1M2|LINE|L1 35894 NM_004792 9360 Hs.470544 NM_004792 ENSG00000138398 PPIG CARS-Cyp|CYP|SCAF10|SRCyp peptidylprolyl isomerase G protein-coding 196-28 chr11 27570045 27570223 + 1.33333 NA intron (NR_033315, intron 2 of 6) L1ME1|LINE|L1 -55087 NR_107054 102465881 NR_107054 ENSG00000278483 MIR8087 hsa-mir-8087 microRNA 8087 ncRNA 199.333-174 chr22 34351451 34351694 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -428684 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 182.333-60 chr15 101634018 101634171 + 1.33333 NA intron (NM_001307960, intron 4 of 4) L1MDb|LINE|L1 18287 NM_078474 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 288.666-23 chr21 30563525 30563814 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2356 NM_181614 337974 Hs.553696 NM_181614 ENSG00000244362 KRTAP19-7 KAP19.7 keratin associated protein 19-7 protein-coding 236.666 chr1 94335248 94335440 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83033 NM_001122674 5825 Hs.700576 NM_002858 ENSG00000117528 ABCD3 ABC43|CBAS5|PMP70|PXMP1|ZWS2 ATP binding cassette subfamily D member 3 protein-coding 180.666-27 chr5 117229498 117229697 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -185915 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 201.666-29 chr22 30150857 30151012 + 1.33333 NA intron (NM_001329457, intron 11 of 11) HAL1|LINE|L1 70470 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 202.333-180 chr8 126525342 126525530 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 33042 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 187-37 chr2 154752301 154752494 + 1.33333 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 53702 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 234-43 chr2 179143840 179144094 + 1.33333 NA intron (NM_178123, intron 8 of 17) intron (NM_178123, intron 8 of 17) -93830 NM_173648 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 189.333-15 chr1 99368004 99368229 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 103824 NM_014839 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 361.666-4 chr11 120501711 120502023 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9879 NM_014619 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 241.666-4 chr15 88818110 88818381 + 1.33333 NA intron (NM_001369268, intron 1 of 18) intron (NM_001369268, intron 1 of 18) 14802 NM_013227 176 Hs.2159 NM_001135 ENSG00000157766 ACAN AGC1|AGCAN|CSPG1|CSPGCP|MSK16|SEDK|SSOAOD aggrecan protein-coding 288.666-28 chr4 48981391 48981628 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -4766 NM_025087 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 370-4 chr13 93470657 93471206 + 1.33333 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) L1MD2|LINE|L1 244124 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 171.333-93 chr2 166221947 166222157 + 1.33333 NA intron (NM_001365536, intron 24 of 26) L1MB1|LINE|L1 -72891 NM_001353949 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 217.333-20 chr10 15553667 15553895 + 1.33333 NA intron (NM_001291494, intron 25 of 28) AluSq2|SINE|Alu 166141 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 174.666-13 chr2 96723367 96723520 + 1.33333 NA intron (NM_001322354, intron 3 of 7) L1MB8|LINE|L1 16633 NM_001142292 81562 Hs.655743 NM_030805 ENSG00000114988 LMAN2L MRT52|VIPL lectin, mannose binding 2 like protein-coding 226.666-15 chr15 99609976 99610340 + 1.33333 NA intron (NM_001352615, intron 3 of 12) L1MB7|LINE|L1 -22820 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 199.666-18 chr16 56147582 56147786 + 1.33333 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) L1MEd|LINE|L1 43410 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 308-59 chr9 126144794 126145099 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 130969 NR_121584 101929116 Hs.382124 NR_121584 ENSG00000228392 LOC101929116 - uncharacterized LOC101929116 ncRNA 252.667-61 chr3 8602927 8603333 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31348 NR_024065 29931 Hs.433151 NM_013343 LINC00312 ERR-10|ERR10|LMCD1DN|LOH3CR2A|NAG-7|NAG7|NCRNA00312 long intergenic non-protein coding RNA 312 ncRNA 358-3 chr11 23602187 23602596 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183201 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 289.333-22 chr18 1809142 1809360 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -449622 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 222-90 chr7 82294292 82294511 + 1.33333 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 149376 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 221.333-91 chr3 49505181 49505390 + 1.33333 NA intron (NM_001177641, intron 2 of 3) FLAM_A|SINE|Alu 35153 NM_001177644 1605 Hs.76111 NM_004393 ENSG00000173402 DAG1 156DAG|A3a|AGRNR|DAG|LGMDR16|MDDGA9|MDDGC7|MDDGC9 dystroglycan 1 protein-coding 201.333-280 chr8 84748741 84748989 + 1.33333 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 42938 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 293.333-32 chr2 131405399 131405640 + 1.33333 NA non-coding (NR_036499, exon 2 of 3) non-coding (NR_036499, exon 2 of 3) 2618 NR_036499 389043 Hs.586791 NR_036499 LINC01120 - long intergenic non-protein coding RNA 1120 ncRNA 234-47 chr22 45288665 45289055 + 1.33333 NA intron (NM_006953, intron 3 of 5) intron (NM_006953, intron 3 of 5) 3911 NM_006953 7380 Hs.632787 NM_006953 ENSG00000100373 UPK3A UP3A|UPIII|UPIIIA|UPK3 uroplakin 3A protein-coding 159.333-37 chr10 25009773 25009967 + 1.33333 NA intron (NM_145010, intron 1 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 6288 NM_145010 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 217.333-65 chr2 130929141 130929380 + 1.33333 NA intron (NM_001367493, intron 2 of 13) MER5B|DNA|hAT-Charlie 92346 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 418.666-3 chr5 139920551 139920989 + 1.33333 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) (ACAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 122529 NM_013982 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 123.333-180 chr6 1570385 1570526 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -35076 NR_125804 101927703 Hs.607964 NR_125804 FOXCUT LINC01379|TCONS_00011636 FOXC1 upstream transcript ncRNA 183-52 chr19 36718956 36719113 + 1.33333 NA exon (NM_001300979, exon 6 of 6) exon (NM_001300979, exon 6 of 6) 15353 NM_001363651 163081 Hs.412517 NM_152603 ENSG00000189042 ZNF567 - zinc finger protein 567 protein-coding 215-86 chr9 129517081 129517399 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 28580 NR_038955 100506190 Hs.529860 NR_038955 LINC00963 MetaLnc9 long intergenic non-protein coding RNA 963 ncRNA 216.333-35 chr12 10600798 10601000 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1064 NR_028045 10748 Hs.159297 NM_006611 KLRA1P KLRA1|KLRAP1|LY49L|Ly-49L|Ly49 killer cell lectin like receptor A1, pseudogene pseudo 205.666-3 chr1 78115516 78115757 + 1.33333 NA intron (NM_001304725, intron 3 of 5) intron (NM_001304725, intron 3 of 5) 69670 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 200.666-44 chr15 68826929 68827090 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6114 NM_006305 8125 Hs.458747 NM_006305 ENSG00000140350 ANP32A C15orf1|HPPCn|I1PP2A|LANP|MAPM|PHAP1|PHAPI|PP32 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A protein-coding 206-183 chr8 113208790 113208946 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 168284 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 395.333-4 chr10 35612404 35612946 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7334 NM_153368 219770 Hs.638922 NM_153368 ENSG00000177291 GJD4 CX40.1 gap junction protein delta 4 protein-coding 223.333-161 chr8 40890148 40890347 + 1.33333 NA intron (NM_024645, intron 1 of 6) L3b|LINE|CR1 7579 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 258-14 chr14 48717803 48718126 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 868416 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 182-89 chr5 137706660 137706930 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001257195) promoter-TSS (NM_001257195) -368 NM_001257195 26249 Hs.655084 NM_017415 ENSG00000146021 KLHL3 PHA2D kelch like family member 3 protein-coding 238.667-88 chr8 95900333 95900622 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 47871 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 263.333-67 chr4 122230541 122230775 + 1.33333 NA intron (NM_015312, intron 24 of 83) intron (NM_015312, intron 24 of 83) 60055 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 159.333-323 chr8 82804149 82804345 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107857 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 257.666-10 chr19 34794747 34794973 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21645 NM_001007248 148103 Hs.590961 NM_001007247 ENSG00000153896 ZNF599 - zinc finger protein 599 protein-coding 222.666-42 chr4 189157562 189157779 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 381013 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 141.333-89 chr18 8132213 8132445 + 1.33333 NA intron (NM_002845, intron 13 of 30) intron (NM_002845, intron 13 of 30) 234705 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 206-164 chr6 157139130 157139326 + 1.33333 NA intron (NM_020732, intron 8 of 19) intron (NM_020732, intron 8 of 19) 102801 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 201.666-48 chr9 83056036 83056272 + 1.33333 NA intron (NM_152573, intron 1 of 16) intron (NM_152573, intron 1 of 16) 6988 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 231-3 chr1 185107336 185107585 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 49493 NM_030934 81627 Hs.107149 NM_030934 ENSG00000121486 TRMT1L C1orf25|MST070|MSTP070|TRM1L|bG120K12.3 tRNA methyltransferase 1 like protein-coding 114.666-2 chr13 70092435 70092539 + 1.33333 NA intron (NM_020866, intron 1 of 10) intron (NM_020866, intron 1 of 10) -14726 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 228-13 chr10 77046343 77046583 + 1.33333 NA intron (NM_001271519, intron 14 of 28) intron (NM_001271519, intron 14 of 28) -94368 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 290.333-29 chr3 135015913 135016312 + 1.33333 NA intron (NM_004441, intron 3 of 15) intron (NM_004441, intron 3 of 15) 220852 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 221.666-18 chr15 39012387 39012577 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -238187 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 499.333-2 chr18 59537946 59538494 + 1.33333 NA intron (NM_133459, intron 2 of 10) intron (NM_133459, intron 2 of 10) 159203 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 203.999 chr1 55068197 55068351 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_015306, exon 68 of 68) 3' UTR (NM_015306, exon 68 of 68) 28052 NR_110451 255738 Hs.18844 NM_174936 ENSG00000169174 PCSK9 FH3|HCHOLA3|LDLCQ1|NARC-1|NARC1|PC9 proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 protein-coding 173.667-84 chr2 117221339 117221531 + 1.33333 NA Intergenic (GATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -593256 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 304-27 chr2 37355789 37356087 + 1.33333 NA intron (NM_012413, intron 2 of 6) intron (NM_012413, intron 2 of 6) 11308 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 227.333-98 chr5 19258985 19259182 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 627189 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 187-58 chr4 62628140 62628297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -466453 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 286-36 chr22 28915706 28915977 + 1.33333 NA intron (NM_001206998, intron 1 of 8) intron (NM_001206998, intron 1 of 8) -1548 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 325.333-37 chr5 52103082 52103521 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 95270 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 267.333-64 chr3 195335401 195335767 + 1.33333 NA intron (NM_012287, intron 7 of 22) L1ME4a|LINE|L1 -64425 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 178.666-20 chr6 113758678 113758851 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -98581 NM_002356 4082 Hs.519909 NM_002356 ENSG00000277443 MARCKS 80K-L|MACS|PKCSL|PRKCSL myristoylated alanine rich protein kinase C substrate protein-coding 213.333-73 chr16 60140448 60140698 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 219220 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 260.666-2 chr1 92476287 92476633 + 1.33333 NA intron (NM_001127215, intron 6 of 6) intron (NM_001127215, intron 6 of 6) 7494 NM_001127215 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 158-118 chr6 68011073 68011304 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44163 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 237.666-12 chr3 6477054 6477380 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 328232 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 212.667-38 chr14 53049834 53050119 + 1.33333 NA intron (NM_030637, intron 11 of 11) intron (NM_030637, intron 11 of 11) -98879 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 170.333-7 chr1 100487815 100488111 + 1.33333 NA intron (NM_001319212, intron 10 of 13) L2a|LINE|L2 -50176 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 228.333-72 chr5 4984811 4984997 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49455 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 210-73 chr2 145748707 145749011 + 1.33333 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -838198 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 150-144 chr8 94408573 94408742 + 1.33333 NA intron (NM_012415, intron 4 of 14) intron (NM_012415, intron 4 of 14) 28287 NM_001256141 100861412 Hs.30561 NM_001256141 ENSG00000265817 FSBP - fibrinogen silencer binding protein protein-coding 342.666 chr1 69605924 69606293 + 1.33333 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) intron (NM_001366842, intron 1 of 7) 36767 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 220-43 chr16 59353003 59353180 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 402100 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 200.666-84 chr4 67718275 67718515 + 1.33333 NA intron (NR_015439, intron 1 of 1) intron (NR_015439, intron 1 of 1) 17117 NR_015439 550112 Hs.479879 NR_015439 ENSG00000248049 UBA6-AS1 - UBA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 233.333-21 chr10 82191256 82191593 + 1.33333 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 41496 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 232.666-32 chr3 1649651 1649857 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -449049 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 202.666-91 chr5 27940510 27940673 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 347074 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 169-32 chr14 86560940 86561181 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -344718 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 386.667-2 chr1 208949499 208949956 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -22727 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 266.333-27 chr17 47950238 47950485 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 7522 NM_024320 79170 Hs.368260 NM_024320 ENSG00000167183 PRR15L ATAD4 proline rich 15 like protein-coding 211.333-142 chr22 30098506 30098776 + 1.33333 NA intron (NM_001329457, intron 3 of 11) intron (NM_001329457, intron 3 of 11) 18177 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 254-57 chr4 73478511 73478876 + 1.33333 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -3052 NM_001133 173 Hs.168718 NM_001133 ENSG00000079557 AFM ALB2|ALBA|ALF afamin protein-coding 258.666-38 chr5 112261057 112261362 + 1.33333 NA intron (NM_001347887, intron 7 of 23) intron (NM_001347887, intron 7 of 23) 32926 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 152-90 chr2 177486102 177486256 + 1.33333 NA intron (NM_003659, intron 11 of 19) intron (NM_003659, intron 11 of 19) 66617 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 178.666-23 chr7 80649856 80650118 + 1.33333 NA intron (NM_001371079, intron 3 of 13) intron (NM_001371079, intron 3 of 13) 3334 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 290.333-14 chr16 24491780 24492015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47669 NM_006910 5930 Hs.188553 NM_006910 ENSG00000122257 RBBP6 MY038|P2P-R|PACT|RBQ-1|SNAMA RB binding protein 6, ubiquitin ligase protein-coding 152.333-304 chr5 79851525 79851675 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -84979 NR_131226 105616916 Hs.590325 NR_131226 ENSG00000250888 LINC01455 MDONA|TCONS_00009433 long intergenic non-protein coding RNA 1455 ncRNA 305-3 chr11 39700663 39701184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 592207 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 257-63 chr6 117506576 117506932 + 1.33333 NA intron (NM_173674, intron 2 of 14) intron (NM_173674, intron 2 of 14) 24080 NM_001366460 285761 Hs.658304 NM_173674 ENSG00000164465 DCBLD1 dJ94G16.1 discoidin, CUB and LCCL domain containing 1 protein-coding 197-87 chr5 9238744 9238893 + 1.33333 NA intron (NM_003966, intron 5 of 22) intron (NM_003966, intron 5 of 22) -184923 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 228.667-48 chr2 234151481 234151780 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100928 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 225.333-87 chr2 212164582 212164882 + 1.33333 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 261628 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 239.999 chr11 100087573 100087759 + 1.33333 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) L1P4|LINE|L1 531521 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 202.333-49 chr12 79325674 79326017 + 1.33333 NA intron (NM_001291901, intron 7 of 9) MIRb|SINE|MIR -93412 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 295.999-4 chr7 71670028 71670278 + 1.33333 NA intron (NM_022479, intron 8 of 10) intron (NM_022479, intron 8 of 10) -362383 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 358-9 chr15 94115372 94115734 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -7615 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 123-97 chr5 30329390 30329566 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 448918 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 154-28 chr11 78510450 78510659 + 1.33333 NA intron (NM_024678, intron 6 of 13) L1M4c|LINE|L1 -22622 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 162.666-2 chr11 83878728 83878896 + 1.33333 NA intron (NM_001142700, intron 7 of 19) intron (NM_001142700, intron 7 of 19) -196387 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 228.666-41 chr5 123526453 123526666 + 1.33333 NA intron (NM_001364148, intron 1 of 8) L1ME1|LINE|L1 14382 NM_001270573 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 216.667-10 chr1 152987640 152987908 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 3693 NM_005987 6698 Hs.46320 NM_005987 ENSG00000169474 SPRR1A SPRK small proline rich protein 1A protein-coding 253-43 chr2 232792528 232792896 + 1.33333 NA intron (NM_015575, intron 14 of 30) intron (NM_015575, intron 14 of 30) -16147 NM_001172416 3769 Hs.467338 NM_002242 ENSG00000115474 KCNJ13 KIR1.4|KIR7.1|LCA16|SVD potassium voltage-gated channel subfamily J member 13 protein-coding 224-106 chr8 104940633 104940949 + 1.33333 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -351767 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 234-3 chr1 64301220 64301499 + 1.33333 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 97736 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 187.333-54 chr13 76910426 76910644 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17916 NR_026983 690 Hs.567241 NR_026983 BTF3P11 BTF3L1|HUMBTFB|OCIF|OPG|TNFRSF11B basic transcription factor 3 pseudogene 11 pseudo 194.667-119 chr5 38842598 38842856 + 1.33333 NA intron (NR_109951, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 3102 NR_109951 101929768 Hs.546623 NR_109951 OSMR-AS1 CTD-2127H9.1 OSMR antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 159.333-347 chr9 23019254 23019433 + 1.33333 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 373143 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 205-19 chr11 35076090 35076351 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 61812 NR_120528 100507144 Hs.673491 NR_120528 ENSG00000255521 LOC100507144 - uncharacterized LOC100507144 ncRNA 371-24 chrX 74274805 74275302 + 1.33333 NA intron (NR_028379, intron 4 of 6) MER58A|DNA|hAT-Charlie 12156 NR_030258 664614 NR_030258 ENSG00000207820 MIR545 MIRN545|hsa-mir-545|mir-545 microRNA 545 ncRNA 190.333-151 chr9 35474429 35474589 + 1.33333 NA intron (NR_003581, intron 14 of 17) L1ME4a|LINE|L1 -15602 NM_014806 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 190-70 chr2 222414916 222415082 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -8989 NM_001320834 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 291.333-26 chr15 65806465 65806743 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14311 NM_005848 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 186.333-34 chr11 111745965 111746173 + 1.33333 NA intron (NM_181699, intron 11 of 15) intron (NM_181699, intron 11 of 15) 20320 NM_181699 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 297.333-37 chr20 45621339 45621631 + 1.33333 NA intron (NM_147198, intron 1 of 4) MER68|LTR|ERVL -8254 NM_080753 140832 Hs.199380 NM_080753 ENSG00000180305 WFDC10A C20orf146|WAP10|dJ688G8.3 WAP four-disulfide core domain 10A protein-coding 199-16 chr11 29825987 29826289 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 156255 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 217.666-14 chr15 82121033 82121311 + 1.33333 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 32578 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 351.333-4 chr10 54024249 54024630 + 1.33333 NA intron (NM_001354411, intron 19 of 34) intron (NM_001354411, intron 19 of 34) -461791 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 360.666-14 chr6 138713394 138713835 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21946 NR_033896 441172 Hs.92290 NR_033896 FLJ46906 - uncharacterized LOC441172 ncRNA 348.999-2 chr3 82777230 82777523 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 791234 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 198.333-156 chr5 26956781 26957051 + 1.33333 NA intron (NM_016279, intron 2 of 11) intron (NM_016279, intron 2 of 11) 81670 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 230.333-113 chr7 129668177 129668442 + 1.33333 NA intron (NM_001293164, intron 2 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 38231 NM_001040110 4899 Hs.654363 NM_005011 ENSG00000106459 NRF1 ALPHA-PAL nuclear respiratory factor 1 protein-coding 215.666-39 chr7 128802257 128802512 + 1.33333 NA intron (NM_001367764, intron 5 of 17) intron (NM_001367764, intron 5 of 17) 10416 NM_001367765 64753 Hs.521178 NM_022742 ENSG00000128596 CCDC136 NAG6 coiled-coil domain containing 136 protein-coding 183-103 chr9 125889141 125889409 + 1.33333 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) intron (NR_024122, intron 2 of 7) 141092 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 229.333-83 chr3 191352173 191352358 + 1.33333 NA intron (NM_178335, intron 1 of 11) intron (NM_178335, intron 1 of 11) -21729 NM_198152 257313 Hs.518492 NM_198152 ENSG00000188958 UTS2B U2B|URP|UTS2D urotensin 2B protein-coding 447-5 chr12 9100635 9101203 + 1.33333 NA intron (NM_000014, intron 13 of 35) L1PB1|LINE|L1 15310 NM_001347425 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 193.666-23 chr18 45417565 45417760 + 1.33333 NA intron (NM_001371319, intron 4 of 23) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 89374 NR_110899 101927980 Hs.591058 NR_110899 SLC14A2-AS1 - SLC14A2 antisense RNA 1 ncRNA 260.666-17 chr2 109586862 109587139 + 1.33333 NA intron (NM_001321500, intron 1 of 8) L1MEc|LINE|L1 26667 NM_001321513 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 217.333-89 chr3 10137544 10137818 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -3954 NM_000551 7428 Hs.517792 NM_000551 ENSG00000134086 VHL HRCA1|RCA1|VHL1|pVHL von Hippel-Lindau tumor suppressor protein-coding 244.666-31 chr3 54708690 54708982 + 1.33333 NA intron (NM_018398, intron 11 of 37) intron (NM_018398, intron 11 of 37) -68979 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 300.666-14 chr5 42754434 42754937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2133 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 196.667-127 chr5 160756736 160756991 + 1.33333 NA intron (NM_001366652, intron 2 of 24) L1ME1|LINE|L1 -71472 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 361.333-4 chr11 40476818 40477126 + 1.33333 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -183842 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 161.333-232 chr5 78022824 78023011 + 1.33333 NA intron (NM_003664, intron 24 of 26) MIRb|SINE|MIR 64670 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 207.333-72 chr12 125704992 125705197 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 82642 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 208-45 chr14 27931955 27932121 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -258817 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 220.333-95 chr3 159774748 159774915 + 1.33333 NA intron (NM_001197113, intron 5 of 10) intron (NM_001197113, intron 5 of 10) -6219 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 189.333-150 chr4 141158824 141159077 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25481 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 283.333-39 chr20 2849178 2849533 + 1.33333 NA intron (NM_022575, intron 1 of 23) AluSp|SINE|Alu -8204 NM_001271168 64773 Hs.29341 NM_022760 ENSG00000132635 PCED1A C20orf81|FAM113A|bA12M19.1 PC-esterase domain containing 1A protein-coding 291.333-42 chr20 22569841 22570199 + 1.33333 NA intron (NR_001558, intron 1 of 3) intron (NR_001558, intron 1 of 3) 8622 NR_001558 140828 Hs.9842 NR_001558 ENSG00000259974 LINC00261 ALIEN|C20orf56|DEANR1|FALCOR|HCCDR1|NCRNA00261|TCONS_00027846|onco-lncRNA-17 long intergenic non-protein coding RNA 261 ncRNA 200.666-112 chr7 46711480 46711640 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14438 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 215-68 chr5 178752351 178752519 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -21776 NM_001324339 6940 Hs.484324 NM_005649 ENSG00000169131 ZNF354A EZNF|HEL104|HKL1|KID-1|KID1|TCF17 zinc finger protein 354A protein-coding 222-94 chr8 29936808 29936988 + 1.33333 NA intron (NR_024473, intron 2 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 15385 NR_024473 286135 Hs.376840 NR_024473 ENSG00000253279 LINC02209 FAM183CP long intergenic non-protein coding RNA 2209 ncRNA 206-152 chr6 40179296 40179589 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 176564 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 228-84 chr7 101498059 101498255 + 1.33333 NA intron (NM_133457, intron 3 of 12) LTR54|LTR|ERV1 70849 NR_103748 100506527 Hs.535863 NR_103747 ENSG00000233123 LINC01007 - long intergenic non-protein coding RNA 1007 ncRNA 270.666-10 chr17 30790056 30790351 + 1.33333 NA intron (NR_144394, intron 8 of 8) intron (NR_144394, intron 8 of 8) 34489 NM_015986 51379 Hs.649372 NM_015986 ENSG00000176390 CRLF3 CREME-9|CREME9|CRLM9|CYTOR4|FRWS|p48.2 cytokine receptor like factor 3 protein-coding 140.666-14 chr9 38450921 38451070 + 1.33333 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -26541 NM_001007563 347252 Hs.349705 NM_001007563 ENSG00000137142 IGFBPL1 IGFBP-RP4|IGFBPRP4|bA113O24.1 insulin like growth factor binding protein like 1 protein-coding 270-44 chr4 105712615 105712952 + 1.33333 NA intron (NM_001031720, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 1970 NM_001031720 79807 Hs.161429 NM_024751 ENSG00000138780 GSTCD - glutathione S-transferase C-terminal domain containing protein-coding 206.666-106 chr6 166875714 166875877 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13270 NM_001318937 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 429.333-5 chr22 43995502 43996066 + 1.33333 NA intron (NM_015380, intron 14 of 14) intron (NM_015380, intron 14 of 14) -3427 NM_001003828 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 255.666-3 chr1 153875011 153875237 + 1.33333 NA intron (NM_020699, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu 47848 NM_020699 57459 Hs.4779 NM_020699 ENSG00000143614 GATAD2B MRD18|P66beta|p68 GATA zinc finger domain containing 2B protein-coding 193.667-52 chr17 8505273 8505493 + 1.33333 NA intron (NM_001256012, intron 27 of 42) intron (NM_001256012, intron 27 of 42) 69499 NM_001330129 81565 Hs.372123 NM_030808 ENSG00000166579 NDEL1 EOPA|MITAP1|NDE1L1|NDE2|NUDEL nudE neurodevelopment protein 1 like 1 protein-coding 203.667-52 chr2 72753593 72753865 + 1.33333 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) L2b|LINE|L2 72304 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 412.666-6 chr5 72900987 72901515 + 1.33333 NA intron (NM_001364293, intron 22 of 24) intron (NM_001364293, intron 22 of 24) 22660 NR_039968 100616152 NR_039968 ENSG00000263593 MIR4804 - microRNA 4804 ncRNA 204.666-24 chr12 63882466 63882636 + 1.33333 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) AluSq|SINE|Alu 37851 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 263.999-3 chr2 70952306 70952538 + 1.33333 NA intron (NM_001692, intron 2 of 13) AluSx|SINE|Alu -3811 NR_110273 101927750 Hs.676120 NR_110273 ENSG00000239322 ATP6V1B1-AS1 - ATP6V1B1 antisense RNA 1 ncRNA 208.333-124 chr6 9904933 9905215 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -499428 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 277-52 chr8 105502426 105502721 + 1.33333 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) Plat_L3|LINE|CR1 183030 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 381.999-2 chr15 89144093 89144445 + 1.33333 NA intron (NM_007011, intron 7 of 14) AluSz|SINE|Alu 55813 NM_007011 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 348.333-36 chr9 4688440 4688926 + 1.33333 NA intron (NM_017913, intron 3 of 6) intron (NM_017913, intron 3 of 6) 9114 NM_017913 55664 Hs.666439 NM_017913 ENSG00000106993 CDC37L1 CDC37B|HARC cell division cycle 37 like 1 protein-coding 192-20 chr10 53414726 53414874 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -643100 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 241.333-45 chr16 72552805 72553102 + 1.33333 NA intron (NR_159371, intron 1 of 5) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 112017 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 256.666-13 chr14 71577045 71577320 + 1.33333 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -9116 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 150.666-12 chr2 142068410 142068568 + 1.33333 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 63212 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 296.667-24 chr18 58079284 58079700 + 1.33333 NA intron (NM_001144964, intron 1 of 30) MIR|SINE|MIR 32266 NM_001144964 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 388.666 chr12 102375437 102375867 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 102898 NM_001111284 3479 Hs.160562 NM_000618 ENSG00000017427 IGF1 IGF|IGF-I|IGFI|MGF insulin like growth factor 1 protein-coding 283.999-5 chr20 4238354 4238715 + 1.33333 NA intron (NM_000678, intron 1 of 1) intron (NM_000678, intron 1 of 1) 10753 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 200.666-86 chr4 70363126 70363527 + 1.33333 NA intron (NM_012390, intron 2 of 2) intron (NM_012390, intron 2 of 2) 2566 NM_012390 26952 Hs.701334 NM_012390 ENSG00000109208 SMR3A P-B1|PBI|PRL5|PROL5 submaxillary gland androgen regulated protein 3A protein-coding 204-165 chr5 114204631 114204840 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -157335 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 142.666-11 chr2 181692342 181692540 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11776 NM_002500 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 202.666-7 chr1 200116776 200116973 + 1.33333 NA intron (NM_205860, intron 6 of 7) intron (NM_205860, intron 6 of 7) 74049 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 180.333-149 chr9 22400980 22401209 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45730 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 273.333-72 chr8 134833730 134834056 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4176 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 406.666-4 chr3 58164338 58164909 + 1.33333 NA non-coding (NR_135534, exon 2 of 2) non-coding (NR_135534, exon 2 of 2) 6012 NR_135534 105377105 Hs.613914 NR_135534 ENSG00000244161 FLNB-AS1 - FLNB antisense RNA 1 ncRNA 205.333-227 chr7 109146634 109146815 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -262137 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 324.333-32 chr5 30436059 30436654 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 555796 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 225-6 chr1 149905250 149905483 + 1.33333 NA intron (NM_001328675, intron 12 of 12) intron (NM_001328675, intron 12 of 12) 1625 NM_001278719 9900 Hs.516153 NM_014849 ENSG00000159164 SV2A SV2 synaptic vesicle glycoprotein 2A protein-coding 145.666-7 chr8 123926602 123926753 + 1.33333 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 74690 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 225.333-117 chr6 69489849 69490176 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 306454 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 436.666-6 chr4 101360271 101360714 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 12715 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 182-33 chr15 83053560 83053790 + 1.33333 NA intron (NM_001011885, intron 2 of 6) intron (NM_001011885, intron 2 of 6) 13577 NM_001011885 53339 Hs.459149 NM_025238 ENSG00000064726 BTBD1 C15orf1|NS5ATP8 BTB domain containing 1 protein-coding 243.666-35 chr7 31858967 31859192 + 1.33333 NA intron (NM_001191059, intron 8 of 18) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 171864 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 251.333-20 chr11 129141833 129142076 + 1.33333 NA intron (NM_001142685, intron 2 of 21) intron (NM_001142685, intron 2 of 21) 50244 NM_001142685 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 476.667-10 chr9 28520418 28521133 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 198530 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 132-122 chr9 16366395 16366542 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -90155 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 204.667-39 chr14 48139463 48139753 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -344594 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 221.333-26 chr11 72123158 72123376 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10491 NM_001278488 25906 Hs.38044 NM_014042 ENSG00000110200 ANAPC15 APC15|C11orf51|HSPC020 anaphase promoting complex subunit 15 protein-coding 260.333-40 chr3 129167123 129167540 + 1.33333 NA TTS (NM_001127194) TTS (NM_001127194) -6101 NM_001204890 100534599 Hs.512661 NM_001204890 ENSG00000261796 ISY1-RAB43 ISY1 ISY1-RAB43 readthrough protein-coding 197.667-125 chr5 112783149 112783424 + 1.33333 NA intron (NM_001354899, intron 6 of 14) intron (NM_001354899, intron 6 of 14) 45401 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 196-173 chr7 105086897 105087127 + 1.33333 NA intron (NM_182931, intron 13 of 26) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 72807 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 271.333-47 chr3 101647687 101647908 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -28633 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 237.999-4 chr3 153021742 153021939 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -140386 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 182.667-71 chr2 10472413 10472638 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 22797 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 189.333-80 chr18 13563715 13563877 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -47318 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 387.333-17 chrX 73619038 73619556 + 1.33333 NA intron (NM_001300884, intron 3 of 4) L1PBa1|LINE|L1 56149 NM_001039840 53344 Hs.496323 NM_001039840 ENSG00000204116 CHIC1 BRX cysteine rich hydrophobic domain 1 protein-coding 221.333-8 chr1 99693976 99694184 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_017734, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_017734, exon 8 of 8) 18873 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 222.666-31 chr3 78843864 78844096 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 175479 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 146.666-11 chr5 95995314 95995496 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 33404 NR_130776 101929710 NR_130776 ENSG00000251314 LOC101929710 - uncharacterized LOC101929710 ncRNA 182.333-37 chr13 62804145 62804325 + 1.33333 NA intron (NR_120403, intron 1 of 2) intron (NR_120403, intron 1 of 2) 3124 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 318.333-28 chr6 123834726 123834997 + 1.33333 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) L1MC1|LINE|L1 30996 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 228.666-4 chr1 119056874 119057322 + 1.33333 NA intron (NR_126447, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 9693 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 157.667-340 chr8 129782585 129782804 + 1.33333 NA intron (NM_031415, intron 1 of 13) L1MA2|LINE|L1 3930 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 252.999-4 chr19 50748742 50749032 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -21577 NM_001506 2854 Hs.515555 NM_001506 ENSG00000142511 GPR32 RVDR1 G protein-coupled receptor 32 protein-coding 202.666-123 chr8 27483718 27483872 + 1.33333 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -4534 NM_001282455 1135 Hs.57718 NM_000742 ENSG00000120903 CHRNA2 - cholinergic receptor nicotinic alpha 2 subunit protein-coding 205.667-62 chr19 30057674 30057904 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 115550 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 300-56 chr6 55827197 55827548 + 1.33333 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) intron (NM_001329754, intron 1 of 5) 48218 NM_001329754 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 240.333-86 chr7 79050739 79050957 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) MER90|LTR|ERV1 41860 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 251.999-2 chr12 81000662 81000862 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62847 NM_004664 8825 Hs.144333 NM_004664 ENSG00000111052 LIN7A LIN-7A|LIN7|MALS-1|MALS1|TIP-33|VELI1 lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component protein-coding 200.333-138 chr7 24988494 24988732 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8435 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 212.666-21 chr12 71457400 71457592 + 1.33333 NA intron (NR_110596, intron 1 of 19) intron (NR_110596, intron 1 of 19) 17698 NM_001277226 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 202.333-94 chr2 138432897 138433100 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68772 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 316.333 chr1 59383476 59383999 + 1.33333 NA intron (NM_001350794, intron 5 of 14) MER4B|LTR|ERV1 73705 NM_001350794 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 303.333-9 chr1 238585811 238586105 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -99941 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 228.333-78 chr5 50769692 50769873 + 1.33333 NA intron (NM_024615, intron 7 of 25) intron (NM_024615, intron 7 of 25) 102368 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 209.667-3 chr1 37825180 37825480 + 1.33333 NA intron (NM_005955, intron 7 of 10) AluJo|SINE|Alu -17122 NM_024640 79693 Hs.301564 NM_024640 ENSG00000196449 YRDC DRIP3|IRIP|SUA5 yrdC N6-threonylcarbamoyltransferase domain containing protein-coding 199-8 chr10 27044150 27044476 + 1.33333 NA intron (NM_014915, intron 18 of 33) intron (NM_014915, intron 18 of 33) 56185 NM_001256053 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 200-33 chr11 77317757 77318017 + 1.33333 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -16221 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 195-113 chr8 125074026 125074192 + 1.33333 NA intron (NM_014846, intron 8 of 28) intron (NM_014846, intron 8 of 28) 17683 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 213.666-26 chr20 12121797 12121963 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 203987 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 262.333-74 chr7 116091275 116091504 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -60626 NM_012252 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 170.666-18 chr5 32200088 32200246 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25848 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 224.666-23 chr3 41470906 41471082 + 1.33333 NA intron (NR_136342, intron 30 of 34) L1MA7|LINE|L1 271489 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 207.333-27 chr10 50239102 50239402 + 1.33333 NA intron (NM_001143974, intron 3 of 18) intron (NM_001143974, intron 3 of 18) 9358 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 222-3 chr1 61299472 61299714 + 1.33333 NA intron (NM_001134673, intron 3 of 10) intron (NM_001134673, intron 3 of 10) -46075 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 337.333-8 chr11 95219603 95220034 + 1.33333 NA intron (NM_001271594, intron 1 of 8) intron (NM_001271594, intron 1 of 8) -10368 NR_110295 100129203 Hs.191599 NR_110295 LOC100129203 - uncharacterized LOC100129203 ncRNA 297.333-51 chr7 55072605 55073109 + 1.33333 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) -36982 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 200.666-45 chr15 97148702 97148867 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 365349 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 280-21 chr2 48786628 48786911 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31045 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 195.666-11 chr11 128975585 128975862 + 1.33333 NA intron (NM_001142685, intron 19 of 21) intron (NM_001142685, intron 19 of 21) -32324 NM_022112 63970 Hs.160953 NM_022112 ENSG00000120471 TP53AIP1 P53AIP1 tumor protein p53 regulated apoptosis inducing protein 1 protein-coding 185.333-177 chr7 83978209 83978476 + 1.33333 NA intron (NM_006080, intron 14 of 16) intron (NM_006080, intron 14 of 16) 216447 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 213.333-161 chr5 96230585 96230805 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 151557 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 214-84 chr22 34909345 34909619 + 1.33333 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 88434 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 185.667-61 chr2 9934882 9935144 + 1.33333 NA TTS (NM_005680) TTS (NM_005680) -16680 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 208-105 chr3 74641651 74641836 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -120603 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 252-90 chr6 44921620 44921993 + 1.33333 NA intron (NM_001350324, intron 10 of 11) intron (NM_001350324, intron 10 of 11) 275964 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 272.333 chr1 157179518 157179788 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41062 NM_005240 2117 Hs.105636 NM_005240 ENSG00000117036 ETV3 METS|PE-1|PE1 ETS variant 3 protein-coding 274-9 chr12 114407578 114407923 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_038440) promoter-TSS (NR_038440) 262 NM_080717 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 230-60 chr6 74279292 74279612 + 1.33333 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 210001 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 190-28 chr13 42287070 42287283 + 1.33333 NA intron (NM_016248, intron 3 of 12) intron (NM_016248, intron 3 of 12) 15024 NM_016248 11215 Hs.105105 NM_016248 ENSG00000023516 AKAP11 AKAP-11|AKAP220|PPP1R44|PRKA11 A-kinase anchoring protein 11 protein-coding 193.333-164 chr7 7275416 7275573 + 1.33333 NA intron (NR_108073, intron 3 of 3) intron (NR_108073, intron 3 of 3) 20340 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 349-18 chr5 45143062 45143414 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 334291 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 319.333-11 chr16 60089085 60089447 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 233913 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 213.333-202 chr7 115841903 115842141 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 126291 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 206-6 chr1 56905737 56905928 + 1.33333 NA intron (NM_000562, intron 7 of 10) intron (NM_000562, intron 7 of 10) 51062 NM_000562 731 Hs.93210 NM_000562 ENSG00000157131 C8A - complement C8 alpha chain protein-coding 195.333-186 chr5 175641666 175641820 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16328 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 215.333-192 chr8 55800129 55800415 + 1.33333 NA intron (NM_001317902, intron 7 of 10) MIRc|SINE|MIR 26826 NM_001363184 96764 Hs.335068 NM_024831 ENSG00000137574 TGS1 NCOA6IP|PIMT|PIPMT trimethylguanosine synthase 1 protein-coding 205.333-215 chr7 15097632 15097820 + 1.33333 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -122868 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 177.666-19 chr4 46154961 46155152 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31002 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 235.333-4 chr1 173665906 173666171 + 1.33333 NA intron (NM_198493, intron 1 of 5) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 3813 NM_198493 339416 Hs.130054 NM_198493 ENSG00000183831 ANKRD45 CT117 ankyrin repeat domain 45 protein-coding 230-56 chr5 83883661 83883938 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -162944 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 221.666-3 chr1 60424992 60425205 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 197587 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 270.666-26 chr6 34919594 34920042 + 1.33333 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) MIR|SINE|MIR 30563 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 298.333 chr1 17908986 17909269 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 153794 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 292.666-35 chr9 70324110 70324518 + 1.33333 NA intron (NM_015110, intron 17 of 24) intron (NM_015110, intron 17 of 24) 65336 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 334.333-37 chrX 97395438 97395780 + 1.33333 NA intron (NM_007309, intron 25 of 26) intron (NM_007309, intron 25 of 26) 168926 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 220.333-84 chr22 40841553 40841839 + 1.33333 NA intron (NM_003932, intron 4 of 11) AluJb|SINE|Alu 14943 NM_003932 6767 Hs.712713 NM_003932 ENSG00000100380 ST13 AAG2|FAM10A1|FAM10A4|HIP|HOP|HSPABP|HSPABP1|P48|PRO0786|SNC6 ST13 Hsp70 interacting protein protein-coding 369-2 chr10 128507110 128507630 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 221420 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 196-148 chr5 73787688 73787884 + 1.33333 NA intron (NM_001177693, intron 7 of 35) intron (NM_001177693, intron 7 of 35) -25760 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 178.333-132 chr4 184149374 184149637 + 1.33333 NA intron (NM_153343, intron 2 of 7) intron (NM_153343, intron 2 of 7) 68368 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 207-41 chr14 83783590 83783810 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1141068 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 202-28 chr11 32041184 32041397 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_120526) promoter-TSS (NR_120526) 28 NR_120526 100506675 Hs.446169 NR_120526 ENSG00000254584 LOC100506675 - uncharacterized LOC100506675 ncRNA 176.333-174 chr8 137565670 137565888 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -152191 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 199.333-31 chr10 101397725 101397881 + 1.33333 NA intron (NM_003939, intron 1 of 13) intron (NM_003939, intron 1 of 13) 43638 NM_033637 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 306.333-6 chr10 76984992 76985410 + 1.33333 NA intron (NM_001322838, intron 19 of 29) intron (NM_001322838, intron 19 of 29) 97157 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 258-31 chr2 39633325 39633694 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31989 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 330.999-2 chr2 215444162 215444704 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8363 NM_001306129 2335 Hs.203717 NM_002026 ENSG00000115414 FN1 CIG|ED-B|FINC|FN|FNZ|GFND|GFND2|LETS|MSF|SMDCF fibronectin 1 protein-coding 350.666-21 chr8 66100608 66101020 + 1.33333 NA non-coding (NR_146171, exon 7 of 7) non-coding (NR_146171, exon 7 of 7) -26315 NM_184085 84675 Hs.85524 NM_033058 ENSG00000147573 TRIM55 MURF-2|RNF29|muRF2 tripartite motif containing 55 protein-coding 190.666-40 chr4 90979452 90979666 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) intron (NM_001145065, intron 9 of 10) 744528 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 316-28 chr2 190682350 190682672 + 1.33333 NA intron (NM_001321315, intron 3 of 5) intron (NM_001321315, intron 3 of 5) 23353 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 265.333-76 chr7 46639689 46639934 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57311 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 128-60 chr20 40567741 40567950 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 121391 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 158.667-26 chr1 190729848 190730026 + 1.33333 NA intron (NR_033922, intron 1 of 4) L1MA5|LINE|L1 105047 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 215.333-18 chr10 16413777 16413993 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -23058 NM_001001484 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 277.333-79 chr7 10546940 10547161 + 1.33333 NA intron (NR_147499, intron 2 of 2) intron (NR_147499, intron 2 of 2) -155626 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 248.333-99 chr8 42569863 42570341 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -28148 NM_006749 6575 Hs.653173 NM_006749 ENSG00000168575 SLC20A2 GLVR-2|GLVR2|IBGC1|IBGC3|MLVAR|PIT-2|PIT2|RAM1|Ram-1 solute carrier family 20 member 2 protein-coding 162.666-7 chr15 88597583 88597713 + 1.33333 NA intron (NR_120370, intron 2 of 2) L1ME3Cz|LINE|L1 6955 NR_120369 101929743 Hs.558810 NR_120369 ENSG00000249487 LINC01586 - long intergenic non-protein coding RNA 1586 ncRNA 307.333-56 chr3 87176717 87177011 + 1.33333 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL 49413 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 236.666-6 chr11 4917141 4917354 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1584 NM_001005238 81282 Hs.542302 NM_001005238 ENSG00000176893 OR51G2 OR11-28 olfactory receptor family 51 subfamily G member 2 protein-coding 212.333-7 chr1 88629332 88629491 + 1.33333 NA intron (NR_110682, intron 1 of 3) intron (NR_110682, intron 1 of 3) -54733 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 197.333-37 chr11 80779393 80779603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16695 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 206-62 chr18 726854 727032 + 1.33333 NA intron (NM_005433, intron 11 of 11) intron (NM_005433, intron 11 of 11) -14279 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 246.999-6 chr6 147451752 147452042 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -56793 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 259.333-94 chr7 119074030 119074312 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 833204 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 343.333-31 chr6 142000900 142001410 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 87644 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 166.667-230 chr8 65229691 65229949 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49480 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 265.333-90 chr8 139151201 139151624 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -237371 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 137.333-31 chr11 114326364 114326517 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 30627 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 294-7 chr1 179245603 179245954 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16094 NM_001136001 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 203.667-32 chr15 64274638 64274928 + 1.33333 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) intron (NM_001329607, intron 2 of 11) 81390 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 209.333-203 chr6 72117739 72118014 + 1.33333 NA intron (NM_014989, intron 4 of 33) L1PB|LINE|L1 -95017 NM_001350442 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 216.333-78 chr2 73190924 73191184 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11520 NM_001134462 344022 Hs.694384 NM_001134462 ENSG00000214513 NOTO - notochord homeobox protein-coding 208-79 chr2 65341686 65341911 + 1.33333 NA intron (NM_001128210, intron 2 of 5) intron (NM_001128210, intron 2 of 5) 24980 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 206.666-107 chr7 7711004 7711250 + 1.33333 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) L1MD1|LINE|L1 7480 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 190.666-52 chr8 15328529 15328739 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -90203 NM_001322879 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 214.333 chr1 20708678 20708990 + 1.33333 NA intron (NM_001122819, intron 4 of 14) intron (NM_001122819, intron 4 of 14) 9173 NM_001122819 57576 Hs.130411 NM_020816 ENSG00000117245 KIF17 KIF17B|KIF3X|KLP-2|OSM-3 kinesin family member 17 protein-coding 209.666-7 chr1 212019666 212019948 + 1.33333 NA intron (NM_001199809, intron 2 of 18) L3|LINE|CR1 -15746 NM_001286230 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 206.666-87 chr4 60929619 60929815 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 7098 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 195.667-121 chr6 91564981 91565247 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 43454 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 156.667-328 chr8 9071990 9072216 + 1.33333 NA intron (NM_001354638, intron 6 of 7) intron (NM_001354638, intron 6 of 7) -13473 NR_145772 109616996 NR_145772 SNORD3I - small nucleolar RNA, C/D box 3I snoRNA 221.333-145 chr8 122154029 122154221 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 414519 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 214-93 chr4 5549356 5549552 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 24298 NR_126518 10141 Hs.177972 NM_005750 ENSG00000082929 LINC01587 C4orf6|aC1 long intergenic non-protein coding RNA 1587 ncRNA 174-102 chr8 132932293 132932439 + 1.33333 NA intron (NM_003235, intron 23 of 47) intron (NM_003235, intron 23 of 47) 65408 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 220.667-103 chr8 86209246 86209543 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20987 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 204-141 chr3 196588600 196588796 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001105573, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001105573, exon 3 of 3) -20024 NM_001345911 348793 Hs.385865 NM_182627 ENSG00000185798 WDR53 - WD repeat domain 53 protein-coding 216.999-6 chr4 140169889 140170078 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15799 NM_018717 55534 Hs.586165 NM_018717 ENSG00000196782 MAML3 CAGH3|ERDA3|GDN|MAM-2|MAM2|TNRC3|mam-3 mastermind like transcriptional coactivator 3 protein-coding 296.333-15 chr16 76760489 76760836 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -108274 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 251.666-7 chr11 66795758 66796080 + 1.33333 NA intron (NM_024650, intron 5 of 16) intron (NM_024650, intron 5 of 16) -47522 NM_005133 9986 Hs.654972 NM_005133 ENSG00000173653 RCE1 FACE2|RCE1A|RCE1B Ras converting CAAX endopeptidase 1 protein-coding 204-122 chr21 29737123 29737348 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -10940 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 180-87 chr6 64075942 64076197 + 1.33333 NA intron (NM_001292009, intron 32 of 43) MER58A|DNA|hAT-Charlie 269233 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 129.333-86 chr2 9022908 9023060 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -19300 NM_001321267 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 255.666-10 chr15 73409674 73410019 + 1.33333 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -33318 NM_001348772 283677 Hs.743574 NM_001042367 ENSG00000183324 REC114 C15orf60|CT147 REC114 meiotic recombination protein protein-coding 178.333-49 chr14 39067373 39067577 + 1.33333 NA intron (NM_006364, intron 9 of 19) intron (NM_006364, intron 9 of 19) -35665 NR_146545 105370458 NR_146545 ENSG00000258651 SEC23A-AS1 - SEC23A antisense RNA 1 ncRNA 230.333-108 chr7 37188738 37189066 + 1.33333 NA intron (NM_001206480, intron 13 of 21) intron (NM_001206480, intron 13 of 21) 164766 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 204.666-10 chr10 16544819 16545056 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23058 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 325-29 chr8 88633726 88634221 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -306490 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 198.667-7 chr1 119949005 119949246 + 1.33333 NA exon (NM_024408, exon 16 of 34) exon (NM_024408, exon 16 of 34) -52610 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 285.667-35 chr3 108683768 108684147 + 1.33333 NA intron (NM_014648, intron 26 of 32) MIR3|SINE|MIR 73326 NM_032579 84666 Hs.307047 NM_032579 ENSG00000163515 RETNLB FIZZ1|FIZZ2|HXCP2|RELM-beta|RELMb|RELMbeta|XCP2 resistin like beta protein-coding 328.666-3 chr11 102075171 102075481 + 1.33333 NA intron (NM_032930, intron 4 of 6) intron (NM_032930, intron 4 of 6) 27888 NM_001363505 85016 Hs.98328 NM_032930 ENSG00000137691 CFAP300 C11orf70|CILD38 cilia and flagella associated protein 300 protein-coding 265.333-73 chr6 128802027 128802413 + 1.33333 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -80918 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 183-31 chr13 76548784 76549001 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 337513 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 205.333-66 chr13 93085656 93085923 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 40448 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 208.666-96 chr6 140165952 140166170 + 1.33333 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -39191 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 238-32 chr17 35462800 35463089 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -14178 NM_144682 146857 Hs.462833 NM_144682 ENSG00000154760 SLFN13 SLFN10|hSLFN13 schlafen family member 13 protein-coding 277-28 chr2 73014843 73015236 + 1.33333 NA intron (NR_138476, intron 6 of 14) L1M5|LINE|L1 44133 NM_001330407 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 317.999-6 chr3 135924925 135925243 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40644 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 228-49 chr2 179507547 179507745 + 1.33333 NA intron (NR_148056, intron 5 of 9) intron (NR_148056, intron 5 of 9) 54942 NM_001113398 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 243.333-91 chr5 107055901 107056159 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45016 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 226-29 chr17 22631301 22631501 + 1.33333 NA Intergenic (CT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 108290 NM_001190452 100462977 Hs.740185 NM_001190452 ENSG00000256618 MTRNR2L1 HN1 MT-RNR2 like 1 protein-coding 196.666-41 chr19 44022344 44022567 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -2887 NM_013360 7673 Hs.279840 NM_013360 ENSG00000159885 ZNF222 - zinc finger protein 222 protein-coding 263.666-16 chr9 81075128 81075357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 614293 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 196-103 chr21 22899496 22899763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -179655 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 192-60 chr16 88719244 88719426 + 1.33333 NA intron (NM_001142864, intron 44 of 50) intron (NM_001142864, intron 44 of 50) -2998 NR_039873 100616167 NR_039873 ENSG00000284585 MIR4722 - microRNA 4722 ncRNA 136.667-101 chr2 183228361 183228528 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 104001 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 228.666-24 chr20 36011634 36011913 + 1.33333 NA intron (NR_130714, intron 8 of 8) L1MC3|LINE|L1 39187 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 305.999-2 chr2 192277845 192278258 + 1.33333 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -83118 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 189.333 chr1 28415319 28415571 + 1.33333 NA intron (NM_001350160, intron 3 of 14) intron (NM_001350160, intron 3 of 14) -22705 NM_023923 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 171.333-170 chr6 75164737 75164990 + 1.33333 NA intron (NM_004370, intron 14 of 65) intron (NM_004370, intron 14 of 65) -36081 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 192.333-145 chr6 13204767 13204929 + 1.33333 NA intron (NM_001322314, intron 5 of 12) intron (NM_001322314, intron 5 of 12) 78594 NR_134859 100130357 Hs.484678 NM_001242698 LOC100130357 - uncharacterized LOC100130357 ncRNA 179.666-11 chr7 1791048 1791244 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -48836 NR_120509 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 186.333-61 chr17 60265737 60265957 + 1.33333 NA intron (NM_032582, intron 8 of 33) intron (NM_032582, intron 8 of 33) -34202 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 235.333-105 chr6 37836063 37836327 + 1.33333 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 16468 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 187.666-7 chr12 126111466 126111655 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15568 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 370.666 chr10 48655317 48655743 + 1.33333 NA non-coding (NR_045675, exon 1 of 11) non-coding (NR_045675, exon 1 of 11) 735 NM_001347736 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 318.666-11 chr2 14000910 14001267 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 399870 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 195-62 chr2 154292813 154293088 + 1.33333 NA intron (NM_052917, intron 8 of 12) intron (NM_052917, intron 8 of 12) 164488 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 198-92 chr2 78437562 78437762 + 1.33333 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -107869 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 322-18 chr15 87528039 87528389 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -48715 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 155.333-264 chr4 71844388 71844552 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -38950 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 212-42 chr12 95294275 95294547 + 1.33333 NA intron (NR_147922, intron 11 of 12) intron (NR_147922, intron 11 of 12) -14009 NR_029895 442903 NR_029895 ENSG00000199172 MIR331 MIRN331|hsa-mir-331|mir-331 microRNA 331 ncRNA 198.666-29 chr16 74780282 74780433 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -5537 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 244.666-13 chr12 116052899 116053107 + 1.33333 NA intron (NM_015335, intron 4 of 30) intron (NM_015335, intron 4 of 30) 95651 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 508.999-3 chr5 45358498 45358949 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) LTR49|LTR|ERV1 337657 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 208.666-8 chr1 103515684 103515988 + 1.33333 NA intron (NM_001347929, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 9675 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 210.667-4 chr1 79180314 79180597 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -173725 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 383.999-4 chr4 63866903 63867320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 542339 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 295.666-14 chr3 180375920 180376277 + 1.33333 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -38075 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 211.333-22 chr10 8679695 8679925 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -85419 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 225-68 chr9 33056184 33056452 + 1.33333 NA intron (NM_018225, intron 8 of 11) intron (NM_018225, intron 8 of 11) 20356 NM_018225 55234 Hs.655351 NM_018225 ENSG00000122692 SMU1 BWD|SMU-1|fSAP57 SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor protein-coding 193.333-42 chr11 120488596 120488787 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001301084, exon 41 of 41) 3' UTR (NM_001301084, exon 41 of 41) -23055 NM_014619 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 156-138 chr8 51186064 51186267 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 623280 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 282.999-5 chr17 42995630 42996007 + 1.33333 NA TTS (NM_001321381) TTS (NM_001321381) -2455 NM_001349921 6155 Hs.514196 NM_000988 ENSG00000131469 RPL27 DBA16|L27 ribosomal protein L27 protein-coding 199.333-45 chr11 114901901 114902102 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 223474 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 154-103 chr4 60319124 60319351 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -603382 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 289.333-6 chr10 31403578 31403859 + 1.33333 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) -3963 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 170-116 chr8 66360833 66361022 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 68050 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 165.667-64 chr15 86088674 86088922 + 1.33333 NA intron (NR_120368, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 9178 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 167-15 chr10 95274030 95274184 + 1.33333 NA intron (NM_020992, intron 1 of 6) intron (NM_020992, intron 1 of 6) 16896 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 129.666-3 chr5 110346374 110346517 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 167470 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 298.666-14 chr5 2087006 2087319 + 1.33333 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 199831 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 194-124 chr6 115472798 115473071 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 170901 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 416.667-6 chr2 179035794 179036434 + 1.33333 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) intron (NM_001316745, intron 2 of 11) 14023 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 264.667-78 chr7 38196799 38197189 + 1.33333 NA intron (NM_001363344, intron 2 of 8) intron (NM_001363344, intron 2 of 8) 18749 NM_001363346 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 168-117 chr8 127058256 127058453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21520 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 227.666-22 chr3 93985152 93985345 + 1.33333 NA intron (NM_144996, intron 1 of 7) intron (NM_144996, intron 1 of 7) 5093 NM_001321328 200894 Hs.533086 NM_144996 ENSG00000169379 ARL13B ARL2L1|JBTS8 ADP ribosylation factor like GTPase 13B protein-coding 206.667-23 chr11 74514053 74514350 + 1.33333 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -20477 NM_001144869 387787 Hs.591971 NM_001144869 ENSG00000175536 LIPT2 - lipoyl(octanoyl) transferase 2 protein-coding 186.666-35 chr3 120120782 120120956 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26422 NM_001146156 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 277.333-34 chr15 71003302 71003566 + 1.33333 NA intron (NM_017691, intron 11 of 15) intron (NM_017691, intron 11 of 15) 110991 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 191.333-38 chr11 94936886 94937096 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 36565 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 224.666-11 chr15 62063511 62063689 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 3097 NR_135690 101928907 Hs.552949 NR_135690 LOC101928907 - uncharacterized LOC101928907 ncRNA 354.667-2 chr1 209941217 209941691 + 1.33333 NA intron (NM_153262, intron 1 of 7) intron (NM_153262, intron 1 of 7) 3237 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 190-50 chr17 42678473 42678725 + 1.33333 NA TTS (NM_016602) TTS (NM_016602) -1605 NM_024927 79990 Hs.632251 NM_024927 ENSG00000068137 PLEKHH3 - pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H3 protein-coding 181.333-101 chr3 89687428 89687575 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 579880 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 244.666-20 chr18 6854029 6854273 + 1.33333 NA intron (NM_001010000, intron 3 of 16) intron (NM_001010000, intron 3 of 16) 19666 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 151.333-274 chr3 33616369 33616510 + 1.33333 NA intron (NM_001365634, intron 12 of 35) L1M5|LINE|L1 43240 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 225.333-44 chr14 46206339 46206533 + 1.33333 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1P1|LINE|L1 142277 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 213.333-191 chr7 38635891 38636160 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4458 NM_139316 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 124-20 chr10 74226680 74226821 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) L1ME2z|LINE|L1 49987 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 212.666-60 chr4 60810918 60811216 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -111552 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 203.333-237 chr6 144580278 144580433 + 1.33333 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) intron (NM_007124, intron 50 of 73) 174700 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 242 chr1 27249460 27249797 + 1.33333 NA intron (NM_001276252, intron 1 of 15) AluJr4|SINE|Alu 14996 NM_015023 23038 Hs.469154 NM_015023 ENSG00000142784 WDTC1 ADP|DCAF9 WD and tetratricopeptide repeats 1 protein-coding 196.666 chr1 47269150 47269305 + 1.33333 NA intron (NM_001282938, intron 16 of 18) intron (NM_001282938, intron 16 of 18) -36892 NM_001290403 6886 Hs.705618 NM_003189 ENSG00000162367 TAL1 SCL|TCL5|bHLHa17|tal-1 TAL bHLH transcription factor 1, erythroid differentiation factor protein-coding 273.667-5 chr1 152510776 152511131 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_178438, exon 1 of 2) 5' UTR (NM_178438, exon 1 of 2) 150 NM_178438 254910 Hs.516410 NM_178438 ENSG00000186207 LCE5A LEP18|SPRL5A late cornified envelope 5A protein-coding 204.667-116 chr5 25765126 25765384 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 574302 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 176.333-57 chr15 33737356 33737522 + 1.33333 NA intron (NM_001243996, intron 49 of 102) intron (NM_001243996, intron 49 of 102) -231058 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 303.666-7 chr19 30259068 30259529 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -113086 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 112.666 chr5 104462911 104463056 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -636491 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 142.666-12 chr20 4326640 4326778 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -77422 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 384.666-4 chr16 85820320 85820726 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20828 NM_001318794 1327 Hs.433419 NM_001861 ENSG00000131143 COX4I1 COX IV-1|COX4|COX4-1|COXIV|COXIV-1 cytochrome c oxidase subunit 4I1 protein-coding 212.333-61 chr2 14428987 14429155 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -28113 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 254-28 chr18 52590952 52591257 + 1.33333 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 250907 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 242.333-54 chr2 159863214 159863510 + 1.33333 NA intron (NM_002349, intron 14 of 34) L1MA8|LINE|L1 41394 NM_001198760 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 259-57 chrX 29858534 29858929 + 1.33333 NA intron (NM_014271, intron 6 of 10) intron (NM_014271, intron 6 of 10) 284453 NR_049877 100847047 NR_049877 ENSG00000264090 MIR4666B - microRNA 4666b ncRNA 156.666 chr1 183669373 183669571 + 1.33333 NA intron (NM_001297670, intron 1 of 17) L1MCa|LINE|L1 -16156 NM_203454 403314 Hs.97335 NM_203454 ENSG00000173627 APOBEC4 C1orf169 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4 protein-coding 210.666-56 chr2 117085620 117085838 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -728962 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 188.667-23 chr10 126475458 126475733 + 1.33333 NA intron (NR_146939, intron 5 of 11) Tigger8|DNA|TcMar-Tigger 45898 NM_001004298 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 216-31 chr14 69222373 69222618 + 1.33333 NA intron (NR_034165, intron 4 of 10) L2|LINE|L2 30729 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 209-112 chr7 45308318 45308525 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 150630 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 270-38 chr3 87645697 87646145 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -146785 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 236.666-30 chr2 172961525 172961804 + 1.33333 NA intron (NM_001282901, intron 2 of 24) MIRb|SINE|MIR 33459 NM_001282901 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 272.999 chr16 60301836 60302210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57770 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 166-6 chr1 85758056 85758268 + 1.33333 NA intron (NR_146345, intron 55 of 59) intron (NR_146345, intron 55 of 59) -49729 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 216.666-36 chr18 13209596 13209795 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9065 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 194.667-78 chr2 198531594 198531825 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -156612 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 472.666-2 chr20 32829030 32829583 + 1.33333 NA intron (NM_012325, intron 2 of 6) intron (NM_012325, intron 2 of 6) 9352 NM_012325 22919 Hs.472437 NM_012325 ENSG00000101367 MAPRE1 EB1 microtubule associated protein RP/EB family member 1 protein-coding 205.333-177 chr4 170889130 170889312 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -145486 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 296.333-35 chr6 19722935 19723375 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 81604 NR_134649 100506885 Hs.346489 NR_134649 ENSG00000228412 LOC100506885 - uncharacterized LOC100506885 ncRNA 247.999 chr1 89498817 89499029 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25906 NM_001134476 23507 Hs.482017 NM_015350 ENSG00000197147 LRRC8B TA-LRRP|TALRRP leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B protein-coding 313-29 chr5 8212146 8212504 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 245239 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 208-127 chr4 106412325 106412504 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -21210 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 173.333-93 chr2 60771017 60771241 + 1.33333 NA intron (NM_022894, intron 6 of 21) HAL1|LINE|L1 14861 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 254.333-43 chr2 161831769 161832047 + 1.33333 NA intron (NM_001354443, intron 4 of 25) LTR40a|LTR|ERVL 207492 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 255.667-35 chr17 40671790 40672153 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy -6794 NM_152349 125113 Hs.6920 NM_152349 ENSG00000213424 KRT222 KA21|KRT222P keratin 222 protein-coding 280.666-16 chr2 205245776 205246137 + 1.33333 NA intron (NM_057177, intron 16 of 21) intron (NM_057177, intron 16 of 21) -436544 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 247.666-10 chr14 55115977 55116317 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13105 NM_001357678 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 326.333-32 chr7 44350613 44350933 + 1.33333 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -25142 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 320-24 chr2 75294274 75294594 + 1.33333 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -94914 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 306.666-6 chr14 65310414 65310788 + 1.33333 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 24582 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 203.666-18 chr12 64100023 64100225 + 1.33333 NA intron (NM_001346201, intron 15 of 21) MIRb|SINE|MIR 122172 NM_001300940 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 198.666-52 chr21 27514543 27514765 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -207725 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 176-9 chr1 150043204 150043425 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -24068 NM_001279353 11311 Hs.443750 NM_007259 ENSG00000136631 VPS45 H1|H1VPS45|SCN5|VPS45A|VPS45B|VPS54A|VSP45|VSP45A vacuolar protein sorting 45 homolog protein-coding 220.333-93 chr3 133163766 133163962 + 1.33333 NA intron (NM_001282865, intron 1 of 3) intron (NM_001282865, intron 1 of 3) 39043 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 199.666-60 chr8 131847462 131847728 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56498 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 326.999 chr12 23604756 23605204 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 11 of 17) intron (NM_152989, intron 11 of 17) -20394 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 246-31 chr15 37010905 37011167 + 1.33333 NA intron (NM_172316, intron 8 of 12) intron (NM_172316, intron 8 of 12) -38135 NR_107030 102466875 NR_107030 ENSG00000277202 MIR8063 hsa-mir-8063 microRNA 8063 ncRNA 123.333-136 chr21 30498653 30498752 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1537 NM_181610 337971 Hs.553693 NM_181610 ENSG00000186967 KRTAP19-4 KAP19.4 keratin associated protein 19-4 protein-coding 350.333-8 chr16 74611576 74611976 + 1.33333 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -4662 NM_001145666 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 199.333-87 chr15 61920831 61921039 + 1.33333 NA intron (NM_001018088, intron 55 of 81) intron (NM_001018088, intron 55 of 81) 139512 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 164.667-234 chr8 43877920 43878145 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 585590 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 218.333-118 chr7 126592235 126592502 + 1.33333 NA intron (NM_001371085, intron 8 of 10) L1MA8|LINE|L1 465816 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 199.333-247 chr6 127461499 127461776 + 1.33333 NA intron (NM_001012279, intron 7 of 11) intron (NM_001012279, intron 7 of 11) -2248 NM_014702 9729 Hs.319247 NM_014702 ENSG00000189367 KIAA0408 - KIAA0408 protein-coding 245.333-54 chr17 64376261 64376557 + 1.33333 NA intron (NM_000442, intron 3 of 15) intron (NM_000442, intron 3 of 15) 14451 NM_000442 5175 Hs.376675 NM_000442 ENSG00000261371 PECAM1 CD31|CD31/EndoCAM|GPIIA'|PECA1|PECAM-1|endoCAM platelet and endothelial cell adhesion molecule 1 protein-coding 358.333 chr1 60691006 60691316 + 1.33333 NA intron (NR_110628, intron 4 of 5) MER5B|DNA|hAT-Charlie -68476 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 162-45 chr14 86628925 86629064 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -276784 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 313.333-21 chr2 212995717 212996029 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -69537 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 331.666-14 chr22 32772583 32772933 + 1.33333 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -28058 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 308.333-11 chr11 47559879 47560332 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5325 NM_001143984 114971 Hs.656205 NM_175732 ENSG00000110536 PTPMT1 DUSP23|MOSP|PLIP|PNAS-129 protein tyrosine phosphatase mitochondrial 1 protein-coding 236-66 chr4 119511472 119511675 + 1.33333 NA intron (NM_033437, intron 14 of 20) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 56790 NR_037630 645513 Hs.677546 NR_037630 ENSG00000245958 LOC645513 - septin 7 pseudogene pseudo 320-19 chr15 99530314 99530633 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -34944 NM_001352617 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 208-59 chr16 3615873 3616067 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4364 NM_032444 84464 Hs.143681 NM_032444 ENSG00000188827 SLX4 BTBD12|FANCP|MUS312 SLX4 structure-specific endonuclease subunit protein-coding 257.667-34 chr18 64840018 64840456 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -580182 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 323.333-20 chr21 28804776 28805234 + 1.33333 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 80362 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 414.666-15 chr8 55882438 55882891 + 1.33333 NA intron (NM_002350, intron 1 of 12) intron (NM_002350, intron 1 of 12) 2829 NM_002350 4067 Hs.491767 NM_002350 ENSG00000254087 LYN JTK8|p53Lyn|p56Lyn LYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 237.666-4 chr11 32861950 32862184 + 1.33333 NA Intergenic MER87B|LTR|ERV1 -30744 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 180-67 chr3 99384452 99384594 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -254071 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 205.667-26 chr11 73443973 73444264 + 1.33333 NA intron (NM_001286051, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 67450 NM_032871 84957 Hs.533720 NM_032871 ENSG00000054967 RELT AI3C|TNFRSF19L|TRLT RELT TNF receptor protein-coding 370.333-25 chr7 4007923 4008237 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 14 of 44) L1MB3|LINE|L1 -121605 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 182.667-92 chr3 47118777 47118989 + 1.33333 NA intron (NR_146158, intron 3 of 21) intron (NR_146158, intron 3 of 21) 45094 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 207.333-182 chr3 64189300 64189592 + 1.33333 NA intron (NR_046702, intron 1 of 3) intron (NR_046702, intron 1 of 3) 1902 NR_046702 100874243 Hs.670840 NR_046702 ENSG00000226017 PRICKLE2-AS3 - PRICKLE2 antisense RNA 3 ncRNA 248-94 chr9 17090554 17090829 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44349 NM_001286984 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 187.333-157 chr5 65689283 65689548 + 1.33333 NA intron (NM_019072, intron 5 of 10) intron (NM_019072, intron 5 of 10) 32694 NM_019072 54557 Hs.482301 NM_019072 ENSG00000197860 SGTB SGT2 small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing beta protein-coding 217.666-36 chr7 26683822 26683998 + 1.33333 NA intron (NM_003930, intron 11 of 12) MIRc|SINE|MIR 46039 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 169.333-180 chr4 66583539 66583776 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 306833 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 206.333-84 chr2 80689556 80689783 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 376290 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 199.333-248 chr6 133955239 133955485 + 1.33333 NA intron (NM_004865, intron 1 of 6) intron (NM_004865, intron 1 of 6) 2138 NM_004865 9519 Hs.486507 NM_004865 ENSG00000028839 TBPL1 MGC:8389|MGC:9620|STUD|TLF|TLP|TRF2 TATA-box binding protein like 1 protein-coding 217.333-113 chr5 153655 153851 + 1.33333 NA intron (NM_052909, intron 7 of 19) AluJb|SINE|Alu -37742 NM_001080478 389257 Hs.103142 NM_001080478 ENSG00000185028 LRRC14B - leucine rich repeat containing 14B protein-coding 347.666-11 chr4 20504494 20504867 + 1.33333 NA intron (NM_001289135, intron 9 of 35) intron (NM_001289135, intron 9 of 35) -23595 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 276.333-64 chr8 121824283 121824790 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -183096 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 200.333-56 chr17 61067836 61068126 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 20 of 25) intron (NM_001330413, intron 20 of 25) 299723 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 377.666-2 chr1 41134551 41134969 + 1.33333 NA intron (NM_001172218, intron 7 of 15) intron (NM_001172218, intron 7 of 15) 26672 NM_001031694 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 284.666-4 chr10 91048832 91049121 + 1.33333 NA intron (NR_047467, intron 3 of 3) AluSx1|SINE|Alu 3168 NR_047467 100874184 Hs.512240 NR_047467 LINC00502 - long intergenic non-protein coding RNA 502 ncRNA 216-23 chr13 50531451 50531675 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -4114 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 120.667-173 chr8 111309939 111310090 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -66625 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 336.666-15 chr2 204590487 204590853 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 1 of 21) intron (NM_205863, intron 1 of 21) 45195 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 227.666-33 chr7 41634769 41634976 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -59047 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 292-20 chr17 7282935 7283357 + 1.33333 NA intron (NM_001042, intron 1 of 10) intron (NM_001042, intron 1 of 10) 1428 NM_001042 6517 Hs.380691 NM_001042 ENSG00000181856 SLC2A4 GLUT4 solute carrier family 2 member 4 protein-coding 240.666-32 chr5 30583926 30584209 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -609619 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 258.667-7 chr1 160925634 160925969 + 1.33333 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -6664 NR_110695 101928372 NR_110695 ENSG00000198358 LOC101928372 - uncharacterized LOC101928372 ncRNA 257.999-2 chr1 205492482 205492709 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12074 NM_212502 5129 Hs.445402 NM_002596 ENSG00000117266 CDK18 PCTAIRE|PCTAIRE3|PCTK3 cyclin dependent kinase 18 protein-coding 204.666-8 chr1 215754210 215754370 + 1.33333 NA intron (NM_206933, intron 58 of 71) intron (NM_206933, intron 58 of 71) 186986 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 343-4 chr10 82197322 82197742 + 1.33333 NA intron (NM_001165973, intron 2 of 10) intron (NM_001165973, intron 2 of 10) 35388 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 586-2 chr3 128116327 128117147 + 1.33333 NA intron (NM_003707, intron 2 of 10) intron (NM_003707, intron 2 of 10) 7075 NM_003707 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 295-30 chr3 50290864 50291145 + 1.33333 NA intron (NM_006764, intron 1 of 11) intron (NM_006764, intron 1 of 11) 1591 NM_006764 7866 Hs.315177 NM_006764 ENSG00000214706 IFRD2 IFNRP|SKMc15|SM15 interferon related developmental regulator 2 protein-coding 212.666-86 chr8 8991753 8992030 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11006 NM_001354636 90459 Hs.20000 NM_153332 ENSG00000104626 ERI1 3'HEXO|HEXO|THEX1 exoribonuclease 1 protein-coding 198.333-127 chr3 87487060 87487291 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -210591 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 250-34 chr18 44080888 44081202 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 450652 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 196-147 chr5 67277248 67277429 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -80539 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 357.999-2 chr14 54769942 54770410 + 1.33333 NA exon (NM_001161577, exon 4 of 9) exon (NM_001161577, exon 4 of 9) 15343 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 193-76 chr5 113253642 113253838 + 1.33333 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) HAL1ME|LINE|L1 41198 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 265.333-42 chr2 129566925 129567364 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -293253 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 295.333-14 chr14 65588623 65588954 + 1.33333 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 117686 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 205.333-211 chr6 170124151 170124349 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -36392 NR_125878 102724511 Hs.550045 NR_125878 LOC102724511 - uncharacterized LOC102724511 ncRNA 400-10 chr4 33128825 33129340 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 778044 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 233.333-134 chr8 123710879 123711206 + 1.33333 NA intron (NM_001003954, intron 3 of 11) L2|LINE|L2 26351 NM_004306 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 305.999-4 chr20 31246476 31246765 + 1.33333 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -11044 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 192-58 chr15 40729493 40729736 + 1.33333 NA exon (NM_002875, exon 8 of 10) exon (NM_002875, exon 8 of 10) 25640 NM_018145 55177 Hs.511067 NM_018145 ENSG00000137824 RMDN3 FAM82A2|FAM82C|RMD-3|RMD3|ptpip51 regulator of microtubule dynamics 3 protein-coding 208-100 chr22 27685193 27685444 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 116438 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 245.333-110 chr7 43725931 43726309 + 1.33333 NA intron (NM_001371314, intron 1 of 7) intron (NM_001371314, intron 1 of 7) 3403 NM_001371317 209.333-116 chr2 95563497 95563747 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28379 NM_138800 129868 Hs.232026 NM_138800 ENSG00000144015 TRIM43 TRIM43A tripartite motif containing 43 protein-coding 249.333-30 chr14 60483047 60483316 + 1.33333 NA intron (NM_174978, intron 4 of 17) intron (NM_174978, intron 4 of 17) 2882 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 190-27 chr12 106409043 106409213 + 1.33333 NA intron (NM_001160708, intron 11 of 27) intron (NM_001160708, intron 11 of 27) 51046 NM_001160708 55703 Hs.62696 NM_018082 ENSG00000013503 POLR3B C128|HLD8|INMAP|RPC2 RNA polymerase III subunit B protein-coding 178.333-164 chr7 84534855 84535132 + 1.33333 NA intron (NR_110079, intron 1 of 2) intron (NR_110079, intron 1 of 2) 2517 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 143.667-50 chr12 10035756 10036004 + 1.33333 NA intron (NM_207345, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 5198 NM_207345 283420 Hs.531189 NM_207345 ENSG00000197992 CLEC9A CD370|DNGR-1|DNGR1|UNQ9341 C-type lectin domain containing 9A protein-coding 206-156 chr6 84973556 84973817 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -209088 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 277.333-40 chr18 31906723 31907056 + 1.33333 NA intron (NM_014939, intron 9 of 28) MIRb|SINE|MIR 36239 NM_014939 22878 Hs.202001 NM_014939 ENSG00000153339 TRAPPC8 GSG1|HsT2706|KIAA1012|TRS85 trafficking protein particle complex 8 protein-coding 262-35 chr18 38801086 38801387 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 820939 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 252.333-56 chr5 66231844 66232150 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22551 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 184.666-17 chr2 63925741 63925921 + 1.33333 NA intron (NM_001005739, intron 12 of 22) L1ME3D|LINE|L1 83951 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 286.667-5 chr1 172168007 172168377 + 1.33333 NA intron (NR_146559, intron 15 of 20) intron (NR_146559, intron 15 of 20) -23357 NR_038397 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 148.667-204 chr2 157750586 157750756 + 1.33333 NA intron (NM_001111067, intron 9 of 10) L1M2|LINE|L1 87959 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 204.333-22 chr10 19710809 19710962 + 1.33333 NA non-coding (NR_120646, exon 5 of 5) non-coding (NR_120646, exon 5 of 5) 17665 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 155.333-315 chr5 174435266 174435451 + 1.33333 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) intron (NR_125806, intron 2 of 5) 99004 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 175.666-24 chr7 41649167 41649320 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44676 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 253.333-38 chr16 63939914 63940241 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 1181986 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 247.333-38 chr2 10833551 10833882 + 1.33333 NA intron (NM_001282705, intron 1 of 13) intron (NM_001282705, intron 1 of 13) -1231 NM_001282706 10130 Hs.212102 NM_005742 ENSG00000143870 PDIA6 ERP5|P5|TXNDC7 protein disulfide isomerase family A member 6 protein-coding 252.666-24 chr2 166102703 166103035 + 1.33333 NA intron (NR_110260, intron 2 of 11) L1PA15|LINE|L1 21338 NR_110260 101929680 Hs.662210 NR_110260 ENSG00000236107 SCN1A-AS1 - SCN1A and SCN9A antisense RNA 1 ncRNA 214-123 chr7 32090037 32090249 + 1.33333 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -18707 NM_001322057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 204.666-37 chr18 2325141 2325304 + 1.33333 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 246283 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 140.666-4 chr2 112008721 112008869 + 1.33333 NA intron (NM_006343, intron 14 of 18) intron (NM_006343, intron 14 of 18) -46474 NM_032824 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 234.666-50 chr8 50816512 50816697 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 652473 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 165-27 chr15 70475683 70475831 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 30171 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 204-103 chr2 165055627 165055923 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -100250 NM_001351540 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 243.666-15 chr16 74128025 74128427 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87295 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 350.333-19 chr4 70545171 70545650 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 26841 NM_212557 401138 Hs.453069 NM_212557 ENSG00000187689 AMTN AI3B|UNQ689 amelotin protein-coding 221.999-9 chr4 121170167 121170346 + 1.33333 NA intron (NM_001128843, intron 3 of 12) L2c|LINE|L2 -5935 NM_024873 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 228.666-21 chr2 16244171 16244410 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193863 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 202.667-127 chr6 66026107 66026373 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 238361 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 245.333-89 chr4 102716622 102717015 + 1.33333 NA intron (NM_005908, intron 4 of 16) intron (NM_005908, intron 4 of 16) 44150 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 207.333-282 chr9 118909739 118909964 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 230180 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 447.666-3 chr3 53579209 53579600 + 1.33333 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) intron (NM_001128840, intron 3 of 47) 84793 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 206-178 chr8 79900638 79900808 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28986 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 204-210 chrX 70983197 70983428 + 1.33333 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -52216 NM_032803 84889 Hs.175220 NM_032803 ENSG00000165349 SLC7A3 ATRC3|CAT-3|CAT3 solute carrier family 7 member 3 protein-coding 398.333-8 chr9 25550855 25551235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 127813 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 236.666-51 chrX 100725257 100725445 + 1.33333 NA intron (NM_001370167, intron 2 of 19) L1M|LINE|L1 6183 NM_001370169 94121 Hs.592224 NM_080737 ENSG00000102362 SYTL4 SLP4 synaptotagmin like 4 protein-coding 200.666-7 chr1 108939996 108940146 + 1.33333 NA exon (NM_001278202, exon 5 of 9) exon (NM_001278202, exon 5 of 9) 10377 NM_001278202 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 297.333-27 chr16 85324359 85324728 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -18218 NR_049816 100847022 NR_049816 ENSG00000266307 MIR5093 - microRNA 5093 ncRNA 295.666-16 chr5 107713906 107714475 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -43253 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 190-3 chr1 85793157 85793480 + 1.33333 NA intron (NM_152890, intron 47 of 59) intron (NM_152890, intron 47 of 59) -84885 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 291.666-4 chr12 16731620 16732014 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -123603 NM_001243609 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 195.333-188 chr6 23848239 23848385 + 1.33333 NA Intergenic (TATAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -277903 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 351-4 chr10 72775400 72775821 + 1.33333 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) L1MA4|LINE|L1 54581 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 194.666-41 chr3 45342980 45343150 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -45511 NM_015340 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 349.333-24 chr4 116683581 116683884 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 384007 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 176-38 chr16 2846387 2846583 + 1.33333 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -3734 NR_026864 124221 Hs.434388 NM_178453 ENSG00000172460 PRSS30P Disp|TMPRSS8|TMPRSS8P serine protease 30, pseudogene pseudo 203.333-107 chr17 79283463 79283683 + 1.33333 NA intron (NM_001082575, intron 3 of 14) intron (NM_001082575, intron 3 of 14) 208636 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 188-77 chr4 32535155 32535302 + 1.33333 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 184190 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 317.333-15 chr17 21537664 21538018 + 1.33333 NA intron (NR_160801, intron 1 of 1) L1MD3|LINE|L1 13837 NR_160801 339263 Hs.514016 NM_001113434 ENSG00000212719 LINC02693 C17orf51 long intergenic non-protein coding RNA 2693 ncRNA 180.667-130 chr6 147804909 147805158 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 296343 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 222.666-6 chr1 186270731 186270927 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -25444 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 284.667-50 chr7 69962016 69962397 + 1.33333 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 363731 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 217.333-75 chr2 195020484 195020763 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 290028 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 142.666-15 chr5 37213378 37213531 + 1.33333 NA intron (NM_023073, intron 16 of 51) intron (NM_023073, intron 16 of 51) -35592 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 181.666-6 chr12 62681871 62682030 + 1.33333 NA intron (NM_020700, intron 8 of 9) MIRc|SINE|MIR 78264 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 226-64 chr3 195854602 195854896 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_134940) promoter-TSS (NR_134940) -521 NR_134940 101929697 Hs.551750 NR_134939 LINC01983 - long intergenic non-protein coding RNA 1983 ncRNA 206.333-74 chr18 27912333 27912551 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 124199 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 204-186 chr7 111563991 111564253 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1605 NM_001350959 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 262.999-9 chr9 127358245 127358568 + 1.33333 NA intron (NR_104591, intron 21 of 26) intron (NR_104591, intron 21 of 26) -38732 NM_001271711 29988 Hs.179522 NM_014580 ENSG00000136856 SLC2A8 GLUT8|GLUTX1 solute carrier family 2 member 8 protein-coding 228.666-23 chr2 209728741 209729081 + 1.33333 NA intron (NM_001039538, intron 13 of 14) intron (NM_001039538, intron 13 of 14) -42921 NM_182587 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 197.667-88 chr3 124733816 124734114 + 1.33333 NA intron (NR_033437, intron 2 of 6) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 1526 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 366.333-7 chr13 76433468 76433919 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 452712 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 203.333-28 chr10 41883138 41883292 + 1.33333 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 484830 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 218.667-40 chr17 43883997 43884263 + 1.33333 NA exon (NM_001278372, exon 4 of 14) exon (NM_001278372, exon 4 of 14) 16494 NM_001278376 4355 Hs.514208 NM_005374 ENSG00000108852 MPP2 DLG2 membrane palmitoylated protein 2 protein-coding 202-49 chr14 88652686 88652860 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 27 of 42) intron (NM_183387, intron 27 of 42) 58353 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 176.667 chr1 22209852 22210061 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -56283 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 174-74 chr5 3943552 3943717 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 347802 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 184.333-80 chr2 145864702 145864887 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -722263 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 220-30 chr12 37951784 37951976 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -364894 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 209.333-73 chr15 61728825 61729070 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_146448) promoter-TSS (NR_146448) -971 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 309.999-10 chr9 127737982 127738277 + 1.33333 NA TTS (NM_170600) TTS (NM_170600) -2835 NM_001252021 27433 Hs.444106 NM_130459 ENSG00000160404 TOR2A TORP1 torsin family 2 member A protein-coding 243.333-60 chr20 32192314 32192503 + 1.33333 NA TTS (NM_002657) TTS (NM_002657) -2048 NR_002781 128854 Hs.647447 NR_002781 ENSG00000235217 TSPY26P TSPYL3|bA392M18.1 testis specific protein Y-linked 26, pseudogene pseudo 347.999-2 chr8 130398399 130398733 + 1.33333 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) (TAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 45094 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 350.333-15 chr20 12458775 12459231 + 1.33333 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 477960 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 260.333-56 chr6 100301752 100302101 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 161749 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 200-134 chr5 106777787 106777988 + 1.33333 NA Intergenic AluYk4|SINE|Alu 233127 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 302-45 chr4 80305337 80305776 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30164 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 224.666 chr1 100625259 100625506 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21622 NR_038914 100128787 Hs.536050 NR_038914 LINC01349 - long intergenic non-protein coding RNA 1349 ncRNA 200.667-2 chr1 21088074 21088368 + 1.33333 NA intron (NM_003760, intron 1 of 31) AluSq2|SINE|Alu 23162 NM_003760 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 237.333-105 chr6 137116239 137116512 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 57269 NM_181310 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 219.667-82 chr6 46710797 46711099 + 1.33333 NA intron (NM_005084, intron 7 of 11) MIRb|SINE|MIR -22783 NR_134643 101926934 Hs.664979 NR_134642 ENSG00000242973 LOC101926934 - uncharacterized LOC101926934 ncRNA 270.333-27 chr17 70852685 70853034 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 349320 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 223.666-6 chr11 18516195 18516444 + 1.33333 NA intron (NM_006292, intron 2 of 9) intron (NM_006292, intron 2 of 9) 10623 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 209.666-51 chr7 80359788 80359947 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 14572 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 427.332 chr6 149754676 149755001 + 1.33333 NA intron (NM_001252051, intron 1 of 6) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 5097 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 291.333-69 chr8 134240735 134241031 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 354387 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 211.667-87 chr4 29464156 29464451 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 250011 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 210.666-62 chr20 25466959 25467225 + 1.33333 NA intron (NM_025176, intron 19 of 23) intron (NM_025176, intron 19 of 23) 59409 NR_134574 9837 Hs.658464 NM_021067 ENSG00000101003 GINS1 IMD55|PSF1 GINS complex subunit 1 protein-coding 255-87 chr9 26898791 26899106 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6120 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 143-125 chr8 77866017 77866173 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 415398 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 222.666-23 chr2 34778008 34778237 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100565 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 224.333-24 chr11 23234839 23235106 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 184218 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 466.333 chr2 236870801 236871239 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 185147 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 287-17 chr20 54097158 54097486 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -26557 NM_001316361 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 214-72 chr2 155398535 155398822 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 699983 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 283.333-5 chr1 179651486 179651935 + 1.33333 NA intron (NM_001199091, intron 12 of 16) AluSc8|SINE|Alu 45483 NM_001199092 163589 Hs.197354 NM_173533 ENSG00000162782 TDRD5 TUDOR3 tudor domain containing 5 protein-coding 352-28 chr7 39093076 39093718 + 1.33333 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -79830 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 142.333-86 chr14 70184286 70184459 + 1.33333 NA intron (NM_033262, intron 1 of 7) intron (NM_033262, intron 1 of 7) -2736 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 379.999-9 chr5 80649528 80649838 + 1.33333 NA TTS (NM_001190470) TTS (NM_001190470) 1325 NM_001190470 100462981 NM_001190470 MTRNR2L2 HN2 MT-RNR2 like 2 protein-coding 310-15 chr12 3938146 3938644 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -64947 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 196-94 chr2 206824654 206824918 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -41478 NR_036077 100422993 NR_036077 ENSG00000283469 MIR3130-1 MIR3130-3|mir-3130-1 microRNA 3130-1 ncRNA 251.667-41 chr2 68464102 68464472 + 1.33333 NA exon (NM_001024680, exon 4 of 4) exon (NM_001024680, exon 4 of 4) 3007 NR_133923 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 235-41 chr4 26393369 26393696 + 1.33333 NA intron (NM_203284, intron 3 of 11) AluSz|SINE|Alu 72304 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 381.999-4 chr17 51782164 51782728 + 1.33333 NA intron (NM_001082533, intron 4 of 9) intron (NM_001082533, intron 4 of 9) 347019 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 242.666-12 chr11 107883482 107883752 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -24830 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 218.666-35 chr17 27326713 27326954 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 32719 NR_145520 26118 Hs.446017 NM_015626 ENSG00000109046 WSB1 SWIP1|WSB-1 WD repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 129.333-41 chr12 7964982 7965173 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28890 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 256.333-3 chr1 30341574 30341780 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -304065 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 217-11 chr10 81660251 81660430 + 1.33333 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -214854 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 239.333-101 chr7 95582429 95582650 + 1.33333 NA TTS (NM_002612) TTS (NM_002612) 13977 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 236.666-44 chr7 51249080 51249336 + 1.33333 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) intron (NM_015198, intron 1 of 12) 67601 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 242.667-73 chr4 56120883 56121222 + 1.33333 NA Intergenic MER97a|DNA|hAT-Tip100 -49143 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 207.333-91 chr14 67237978 67238169 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -3362 NM_022474 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 417.666-3 chr5 119166493 119166867 + 1.33333 NA exon (NM_001290322, exon 22 of 43) exon (NM_001290322, exon 22 of 43) 12043 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 231.333-4 chr1 107644991 107645253 + 1.33333 NA intron (NM_006113, intron 19 of 26) intron (NM_006113, intron 19 of 26) 43377 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 220.666-64 chr6 122868250 122868431 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 79082 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 222.666-57 chr8 144486714 144486997 + 1.33333 NA intron (NM_032902, intron 2 of 12) L1MD2|LINE|L1 8504 NM_001329445 84988 Hs.521937 NM_032902 ENSG00000160972 PPP1R16A MYPT3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 16A protein-coding 314.333-31 chr8 114249820 114250206 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -813074 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 185.333-4 chr1 71744938 71745100 + 1.33333 NA intron (NM_173808, intron 3 of 6) LTR49-int|LTR|ERV1 91993 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 200-42 chr12 38881747 38881933 + 1.33333 NA intron (NM_153634, intron 1 of 19) intron (NM_153634, intron 1 of 19) 23751 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 235.333-99 chr5 112808057 112808385 + 1.33333 NA intron (NM_001354895, intron 8 of 15) L1MC5|LINE|L1 -52967 NM_001204196 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 220.666-18 chr13 39672798 39673016 + 1.33333 NA intron (NM_001145079, intron 4 of 18) L1MB7|LINE|L1 -8772 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 277.999-10 chr6 116151725 116152149 + 1.33333 NA intron (NM_152729, intron 6 of 11) intron (NM_152729, intron 6 of 11) -25805 NM_000493 1300 Hs.520339 NM_000493 ENSG00000123500 COL10A1 - collagen type X alpha 1 chain protein-coding 188.666-14 chr14 65787659 65787810 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 316632 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 193.333-54 chr14 50629056 50629261 + 1.33333 NA intron (NM_015915, intron 13 of 13) intron (NM_015915, intron 13 of 13) 39148 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 185.666-6 chr11 46158294 46158510 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13553 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 220.666-24 chr15 58315247 58315437 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -116649 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 217.667-69 chr4 93690823 93691132 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -137776 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 308.666-16 chr7 11017368 11017900 + 1.33333 NA intron (NR_033436, intron 4 of 16) L1MA1|LINE|L1 43762 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 179.333-16 chr1 219921161 219921334 + 1.33333 NA intron (NM_018713, intron 2 of 3) LTR24C|LTR|ERV1 7404 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 198.333-198 chr8 113462200 113462454 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -25388 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 242-28 chr15 49977870 49978066 + 1.33333 NA intron (NR_073597, intron 12 of 26) MIRb|SINE|MIR 135411 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 299.333-73 chr8 104446371 104446900 + 1.33333 NA intron (NM_001385, intron 3 of 9) intron (NM_001385, intron 3 of 9) 20420 NM_001385 1807 Hs.443161 NM_001385 ENSG00000147647 DPYS DHP|DHPase dihydropyrimidinase protein-coding 175-77 chr7 69033977 69034236 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 563518 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 219-27 chr15 59724434 59724624 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -35209 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 221.666-48 chr5 105286275 105286599 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 186963 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 242.333-84 chr5 32422085 32422321 + 1.33333 NA intron (NM_016107, intron 2 of 19) intron (NM_016107, intron 2 of 19) 22537 NR_144318 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 309.333-31 chr2 26216488 26216868 + 1.33333 NA intron (NM_000182, intron 7 of 19) L1ME1|LINE|L1 27954 NM_000182 3030 Hs.516032 NM_000182 ENSG00000084754 HADHA ECHA|GBP|HADH|LCEH|LCHAD|MTPA|TP-ALPHA hydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alpha protein-coding 245.999-9 chr5 154898649 154898933 + 1.33333 NA intron (NM_015465, intron 22 of 27) intron (NM_015465, intron 22 of 27) 39420 NM_015465 25929 Hs.483921 NM_015465 ENSG00000082516 GEMIN5 GEMIN-5 gem nuclear organelle associated protein 5 protein-coding 206.333-153 chr7 137642538 137642819 + 1.33333 NA intron (NM_001321710, intron 6 of 32) Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 203654 NM_001321709 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 222.667-29 chr14 67068882 67069157 + 1.33333 NA intron (NM_001024218, intron 10 of 21) intron (NM_001024218, intron 10 of 21) -120421 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 298.333-12 chr14 73623253 73623721 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 6643 NM_001037162 641372 Hs.122038 NM_001037162 ENSG00000205669 ACOT6 C14orf42|c14_5530 acyl-CoA thioesterase 6 protein-coding 264.333-75 chr7 125290677 125290913 + 1.33333 NA intron (NR_110188, intron 3 of 8) MER58A|DNA|hAT-Charlie -26504 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 203.333-205 chr5 27718263 27718441 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 246060 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 192.333-167 chr8 76879750 76879992 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 86979 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 162-69 chr2 157739504 157739697 + 1.33333 NA intron (NM_001111067, intron 9 of 10) intron (NM_001111067, intron 9 of 10) 99030 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 307.667-20 chr2 30011668 30012141 + 1.33333 NA Intergenic MSTA1|LTR|ERVL-MaLR -90318 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 218.666-69 chr7 115462792 115462983 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 118554 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 176.666-4 chr10 60997170 60997361 + 1.33333 NA intron (NM_001350902, intron 1 of 11) intron (NM_001350902, intron 1 of 11) 3732 NM_001350908 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 180.666-19 chr2 155130143 155130350 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 431551 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 311.667-27 chr8 141277695 141278056 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -23246 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 254.333-59 chr4 44370260 44370699 + 1.33333 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 78330 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 342.666-17 chr3 52989526 52990110 + 1.33333 NA intron (NM_016329, intron 1 of 20) intron (NM_016329, intron 1 of 20) 56255 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 149.333-73 chr11 38764253 38764448 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 115492 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 213.333-40 chr12 23698350 23698575 + 1.33333 NA intron (NM_152989, intron 9 of 17) L1ME1|LINE|L1 -113876 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 215.333-196 chr8 86645951 86646117 + 1.33333 NA intron (NM_019098, intron 8 of 17) intron (NM_019098, intron 8 of 17) 97641 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 194.666-33 chr2 28763211 28763435 + 1.33333 NA intron (NM_206876, intron 2 of 8) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 11493 NM_002709 5500 Hs.702907 NM_002709 ENSG00000213639 PPP1CB HEL-S-80p|NSLH2|PP-1B|PP1B|PP1beta|PPP1CD protein phosphatase 1 catalytic subunit beta protein-coding 230.666 chr1 61769612 61769796 + 1.33333 NA intron (NM_001350145, intron 5 of 43) MIRb|SINE|MIR 27224 NM_176877 10207 Hs.478125 NM_005799 ENSG00000132849 PATJ Cipp|INADL|InaD-like|hINADL PATJ crumbs cell polarity complex component protein-coding 207.333-131 chr2 22441765 22441954 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94620 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 259.666-35 chr9 105391089 105391396 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001286730, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001286730, exon 16 of 16) -56792 NM_001287191 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 218.666-32 chr15 45316540 45316984 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -37540 NR_120335 101928414 NR_120335 ENSG00000259520 LOC101928414 - uncharacterized LOC101928414 ncRNA 155.666-2 chr2 78257102 78257388 + 1.33333 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 33486 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 228-29 chr14 58579746 58580101 + 1.33333 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -54145 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 219.333-132 chr4 170234892 170235217 + 1.33333 NA intron (NR_125889, intron 1 of 2) intron (NR_125889, intron 1 of 2) 8463 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 149.666-3 chr12 53793426 53793603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36480 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 270-29 chr2 146562348 146562602 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24582 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 212.666-33 chr17 64221701 64221860 + 1.33333 NA intron (NM_018469, intron 1 of 11) L1MB2|LINE|L1 8954 NM_001288733 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 234.667-52 chr2 80753512 80753843 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 440298 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 231.333-16 chr10 55818174 55818488 + 1.33333 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -190389 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 209-18 chr11 9401354 9401544 + 1.33333 NA intron (NM_006391, intron 1 of 24) FLAM_C|SINE|Alu 16797 NM_006391 10527 Hs.744911 NM_006391 ENSG00000205339 IPO7 Imp7|RANBP7 importin 7 protein-coding 385.333-19 chr3 80544918 80545334 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -219771 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 195.333-42 chr11 13908825 13909022 + 1.33333 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 15940 NR_135052 101928132 Hs.568970 NR_135052 ENSG00000254438 LINC02683 - long intergenic non-protein coding RNA 2683 ncRNA 335.666-3 chr10 103146949 103147289 + 1.33333 NA intron (NM_001351187, intron 3 of 21) MER5C|DNA|hAT-Charlie 6702 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 156-27 chr11 36018284 36018527 + 1.33333 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 8307 NR_039769 100616311 NR_039769 ENSG00000263389 MIR3973 - microRNA 3973 ncRNA 222.333-53 chr2 218625288 218625561 + 1.33333 NA intron (NM_032726, intron 6 of 15) intron (NM_032726, intron 6 of 15) 17525 NM_032726 84812 Hs.632528 NM_032726 ENSG00000115556 PLCD4 - phospholipase C delta 4 protein-coding 152-61 chr15 59906365 59906507 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -97875 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 278.333-19 chr14 84045890 84046138 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1225918 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 174.666-6 chr12 90868105 90868283 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49829 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 341.999-5 chr17 75941518 75941824 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_007292, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_007292, exon 14 of 14) -3439 NM_001319193 85302 Hs.720068 NM_001080542 ENSG00000188878 FBF1 Alb|FBF-1 Fas binding factor 1 protein-coding 314.666-12 chr10 24401170 24401618 + 1.33333 NA intron (NM_019590, intron 3 of 20) L1MD2|LINE|L1 -48020 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 244-13 chr1 205473558 205473926 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -17656 NR_103783 101669762 Hs.666219 NR_103783 BLACAT1 LINC00912|linc-UBC1|onco-lncRNA-30 bladder cancer associated transcript 1 ncRNA 372.666-7 chr2 138319563 138319941 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -182018 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 216-21 chr12 65703635 65703865 + 1.33333 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -61378 NR_120432 100507065 Hs.591038 NR_120431 LOC100507065 - uncharacterized LOC100507065 ncRNA 208.333-4 chr1 75552128 75552374 + 1.33333 NA intron (NM_152697, intron 1 of 23) intron (NM_152697, intron 1 of 23) 58863 NM_001320287 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 206-53 chr14 62314406 62314643 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -174551 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 196-71 chr17 70652145 70652381 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 482728 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 246.333-61 chr3 98749023 98749340 + 1.33333 NA intron (NM_001323366, intron 1 of 11) intron (NM_001323366, intron 1 of 11) -14126 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 237-51 chr3 194659488 194659702 + 1.33333 NA intron (NM_018385, intron 6 of 13) intron (NM_018385, intron 6 of 13) 12596 NM_018385 55341 Hs.744061 NM_018385 ENSG00000041802 LSG1 - large 60S subunit nuclear export GTPase 1 protein-coding 317.666-12 chr7 52821766 52822246 + 1.33333 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -213627 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 239-49 chr4 86469317 86469527 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -16227 NM_002753 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 222-103 chr9 72764110 72764319 + 1.33333 NA intron (NM_138691, intron 12 of 23) intron (NM_138691, intron 12 of 23) 109895 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 253.333-69 chr3 27194339 27194622 + 1.33333 NA intron (NM_001304384, intron 4 of 16) intron (NM_001304384, intron 4 of 16) 22043 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 198-83 chr2 29584873 29585049 + 1.33333 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -109584 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 172-106 chr7 74629136 74629344 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -28425 NM_001280800 2969 Hs.647041 NM_001518 ENSG00000263001 GTF2I BAP135|BTKAP1|DIWS|GTFII-I|IB291|SPIN|TFII-I|WBS|WBSCR6 general transcription factor IIi protein-coding 355.333-15 chr2 179492722 179493081 + 1.33333 NA intron (NR_148056, intron 5 of 9) intron (NR_148056, intron 5 of 9) 69687 NM_001113398 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 155.666-5 chr4 160792238 160792444 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -1014557 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 197.333-141 chr21 41988255 41988445 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001320729, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001320729, exon 3 of 3) -20844 NR_119384 150142 Hs.143833 NM_198078 ENSG00000237232 ZNF295-AS1 C21orf121|NCRNA00318|PRED87 ZNF295 antisense RNA 1 ncRNA 277 chr1 44492428 44492747 + 1.33333 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) L1MB8|LINE|L1 -52906 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 285.333-45 chr3 165737139 165737518 + 1.33333 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 100095 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 174.333-44 chr17 7357204 7357400 + 1.33333 NA TTS (NM_198154) TTS (NM_198154) 2146 NM_198154 339168 Hs.259432 NM_198154 ENSG00000182896 TMEM95 UNQ9390 transmembrane protein 95 protein-coding 203.666-22 chr14 61290429 61290684 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9218 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 202.667-147 chr8 123346532 123346789 + 1.33333 NA exon (NM_014109, exon 17 of 28) exon (NM_014109, exon 17 of 28) -1374 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 218.666-42 chr2 69889785 69889974 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4077 NM_006857 11017 Hs.54649 NM_006857 ENSG00000124380 SNRNP27 27K|RY1 small nuclear ribonucleoprotein U4/U6.U5 subunit 27 protein-coding 198.666-47 chr2 194450668 194451062 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 106596 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 206.666-59 chr2 113148595 113148755 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 21077 NM_173842 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 252.667-109 chrX 134273889 134274154 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 36808 NM_001353453 347475 Hs.679431 NM_001101357 ENSG00000203952 CCDC160 - coiled-coil domain containing 160 protein-coding 201.333-256 chr7 17363679 17363939 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11108 NR_110015 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 181.333-184 chr8 120505546 120505701 + 1.33333 NA intron (NM_022045, intron 15 of 21) intron (NM_022045, intron 15 of 21) 60204 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 222.999-3 chr4 73649232 73649441 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28705 NM_201431 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 221-67 chr8 28303975 28304398 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13082 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 193-21 chr14 59986235 59986426 + 1.33333 NA intron (NR_075071, intron 17 of 32) intron (NR_075071, intron 17 of 32) 66617 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 315.333 chr1 27310200 27310513 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11789 NM_032125 84065 Hs.469171 NM_032125 ENSG00000186501 TMEM222 C1orf160 transmembrane protein 222 protein-coding 435.333-3 chr4 71123996 71124702 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -62910 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 299.333-15 chr12 64838899 64839198 + 1.33333 NA intron (NM_001364838, intron 7 of 11) intron (NM_001364838, intron 7 of 11) 14401 NM_015279 23329 Hs.192492 NM_015279 ENSG00000111490 TBC1D30 - TBC1 domain family member 30 protein-coding 156.667-100 chr14 45372897 45373106 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -119799 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 224.333-62 chr2 76553622 76553922 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -432193 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 183.333-121 chr4 187654494 187654654 + 1.33333 NA intron (NR_110436, intron 2 of 2) intron (NR_110436, intron 2 of 2) 18067 NR_110436 100506272 Hs.508163 NR_110436 ENSG00000250590 LINC02492 - long intergenic non-protein coding RNA 2492 ncRNA 210-34 chr14 30523300 30523536 + 1.33333 NA intron (NR_151720, intron 3 of 3) intron (NR_151720, intron 3 of 3) -35705 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 225.333-136 chr8 144773156 144773414 + 1.33333 NA exon (NM_001286770, exon 5 of 5) exon (NM_001286770, exon 5 of 5) 14060 NM_001286769 80778 Hs.631854 NM_030580 ENSG00000196378 ZNF34 KOX32 zinc finger protein 34 protein-coding 124-91 chr5 36646884 36646990 + 1.33333 NA intron (NM_004172, intron 3 of 9) intron (NM_004172, intron 3 of 9) 40331 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 121-4 chr1 99731300 99731403 + 1.33333 NA intron (NM_001013660, intron 7 of 16) intron (NM_001013660, intron 7 of 16) -18398 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 212.333-72 chr2 134625180 134625486 + 1.33333 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 93667 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 268-24 chr16 86318111 86318486 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27381 NR_024406 732275 Hs.558087 NR_024406 ENSG00000168367 LINC00917 - long intergenic non-protein coding RNA 917 ncRNA 270.667-60 chr9 30859317 30859794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -451101 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 291.333-60 chr6 137910583 137910920 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35049 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 276.333-22 chr2 21322752 21323127 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 198953 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 250.999-4 chr12 126667580 126667897 + 1.33333 NA intron (NR_110034, intron 1 of 2) intron (NR_110034, intron 1 of 2) 22580 NR_110036 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 273.333-27 chr17 77819778 77820258 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 64069 NR_028337 400624 Hs.514521 NM_001001685 ENSG00000204283 LINC01973 - long intergenic non-protein coding RNA 1973 ncRNA 223.666-2 chr1 44197870 44198066 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15503 NM_019100 55929 Hs.8008 NM_019100 ENSG00000178028 DMAP1 DNMAP1|DNMTAP1|EAF2|MEAF2|SWC4 DNA methyltransferase 1 associated protein 1 protein-coding 525-2 chr4 30596809 30597607 + 1.33333 NA Intergenic Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger -123161 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 234.667-87 chr4 157941379 157941786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -229170 NR_147408 285505 NR_147407 ENSG00000248429 FAM198B-AS1 - FAM198B antisense RNA 1 ncRNA 186.667-113 chr5 1820043 1820217 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 18723 NM_004553 4726 Hs.408257 NM_004553 ENSG00000145494 NDUFS6 CI-13kA|CI-13kD-A|CI13KDA|MC1DN9 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S6 protein-coding 391.333-7 chr12 126166606 126166999 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70810 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 194.333-12 chr1 159757266 159757519 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -23570 NM_001319659 54935 Hs.425801 NM_017823 ENSG00000158716 DUSP23 DUSP25|LDP-3|LDP3|MOSP|VHZ dual specificity phosphatase 23 protein-coding 202.666-19 chr11 23768196 23768365 + 1.33333 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 -349090 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 228.333-110 chr9 124145439 124145795 + 1.33333 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -111989 NM_001166167 10783 Hs.197071 NM_014397 ENSG00000119408 NEK6 SID6-1512 NIMA related kinase 6 protein-coding 203.333-271 chr8 118834470 118834702 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 117299 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 267-64 chr7 84801087 84801464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 268799 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 363.666 chr10 58798265 58798577 + 1.33333 NA exon (NM_001080512, exon 11 of 21) exon (NM_001080512, exon 11 of 21) 83406 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 344-27 chr22 34328262 34328715 + 1.33333 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -405600 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 306.666-31 chr5 124778936 124779314 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -34013 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 250-57 chr4 103999935 104000219 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -280092 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 291-31 chr4 72039266 72039509 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001144756, exon 1 of 5) 5' UTR (NM_001144756, exon 1 of 5) 255 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 451.333-3 chr12 90839866 90840341 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -77920 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 277.333-77 chr5 158471977 158472283 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -62357 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 148-70 chr2 19107664 19107887 + 1.33333 NA Intergenic (ACATGC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -80804 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 145.333-172 chr22 40463643 40463849 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001282660) promoter-TSS (NM_001282660) -306 NM_001282660 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 222.667-4 chr1 167200180 167200491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4530 NR_110811 101928484 Hs.568496 NR_110811 LINC01363 RBSG4 long intergenic non-protein coding RNA 1363 ncRNA 348.667-6 chr10 82273410 82273921 + 1.33333 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -40745 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 212.666-72 chr6 34540154 34540439 + 1.33333 NA intron (NM_012391, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu 16033 NM_012391 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 170-85 chr3 192731215 192731369 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3751 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 272.999-5 chr4 154906870 154907193 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 125526 NM_001277173 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 331.333-46 chr8 76926696 76927080 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 39962 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 213.333-95 chr2 66231731 66231929 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 126498 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 271.333-4 chr1 183834092 183834335 + 1.33333 NA intron (NM_001297671, intron 2 of 17) L2c|LINE|L2 29093 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 212-122 chr4 157369154 157369426 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 148562 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 201.333-243 chr6 88313056 88313290 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -145824 NM_001370547 1268 Hs.75110 NM_016083 ENSG00000118432 CNR1 CANN6|CB-R|CB1|CB1A|CB1K5|CB1R|CNR cannabinoid receptor 1 protein-coding 175.667-17 chr10 26042356 26042608 + 1.33333 NA intron (NM_017433, intron 10 of 34) L1M1|LINE|L1 108253 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 187.333-45 chr12 31393048 31393305 + 1.33333 NA intron (NM_144973, intron 17 of 20) intron (NM_144973, intron 17 of 20) -23875 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 279.999-7 chr5 18452566 18452791 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 645404 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 255.333-35 chr15 26769956 26770337 + 1.33333 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) intron (NM_001278631, intron 3 of 9) 2920 NM_000814 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 264.333-81 chrX 110950824 110951183 + 1.33333 NA intron (NM_001128167, intron 1 of 14) L1ME3G|LINE|L1 6606 NM_001324330 5063 Hs.593599 NM_002578 ENSG00000077264 PAK3 ARA|MRX30|MRX47|OPHN3|PAK-3|PAK3beta|bPAK|beta-PAK p21 (RAC1) activated kinase 3 protein-coding 245.333-23 chr11 81797594 81797813 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 93133 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 212.666-29 chr14 88163620 88163818 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 107192 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 228-95 chr8 130293477 130293696 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 2947 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 220-57 chr2 30826163 30826494 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -18882 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 239.666-8 chr13 113577604 113578018 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -6877 NR_026580 7027 Hs.79353 NM_007111 ENSG00000198176 TFDP1 DILC|DP1|DRTF1|Dp-1 transcription factor Dp-1 protein-coding 380.666-11 chr5 63589655 63590152 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 372389 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 164.667-15 chr1 208518930 208519136 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -209655 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 209.333-250 chr9 82699828 82699996 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 363230 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 164.333-7 chr1 189672065 189672227 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 803864 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 197-50 chr19 15823936 15824165 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4897 NR_015379 652995 Hs.644234 NR_015379 ENSG00000214049 UCA1 CUDR|LINC00178|NCRNA00178|UCAT1|onco-lncRNA-36 urothelial cancer associated 1 ncRNA 205.333-192 chr5 135992081 135992353 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36771 NM_000358 7045 Hs.369397 NM_000358 ENSG00000120708 TGFBI BIGH3|CDB1|CDG2|CDGG1|CSD|CSD1|CSD2|CSD3|EBMD|LCD1 transforming growth factor beta induced protein-coding 245.666-13 chr18 33771027 33771268 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 192928 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 220-63 chr2 85956303 85956621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 67182 NR_110569 101928113 Hs.625888 NR_110569 ST3GAL5-AS1 - ST3GAL5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 284-46 chr5 45282365 45282785 + 1.33333 NA intron (NM_021072, intron 6 of 7) L2|LINE|L2 413805 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 332.666-18 chr21 17883074 17883353 + 1.33333 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 2395 NR_024354 54075 Hs.404306 NR_024354 CHODL-AS1 C21orf39|NCRNA00157 CHODL antisense RNA 1 ncRNA 259.333-92 chr7 30597942 30598338 + 1.33333 NA intron (NM_002047, intron 1 of 16) L2|LINE|L2 3262 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 231.667-23 chr16 89742391 89742760 + 1.33333 NA intron (NM_000135, intron 37 of 42) AluY|SINE|Alu 21038 NM_001113525 92822 Hs.290154 NM_152287 ENSG00000158805 ZNF276 CENP-Z|CENPZ|ZADT|ZFP276|ZNF477 zinc finger protein 276 protein-coding 194.666-43 chr3 84213956 84214330 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 655432 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 248.999 chr1 78736916 78737221 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 87237 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 226-72 chr5 74826238 74826543 + 1.33333 NA intron (NR_046462, intron 4 of 11) HAL1|LINE|L1 -39503 NR_134288 441086 Hs.653007 NR_134288 LOC441086 - uncharacterized LOC441086 ncRNA 209-20 chr11 76357735 76357938 + 1.33333 NA intron (NM_004705, intron 3 of 4) L1MEh|LINE|L1 23129 NR_130898 5612 Hs.503315 NM_004705 ENSG00000137492 THAP12 DAP4|P52rIPK|PRKRIR|THAP0 THAP domain containing 12 protein-coding 239.333-89 chr5 136739565 136739907 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -374260 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 197.333-149 chr3 88848501 88848676 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -259033 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 320.333-3 chr1 177738096 177738386 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37717 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 246.333-76 chr5 91360412 91360707 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19538 NM_001329670 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 205.666-44 chr5 109504744 109504953 + 1.33333 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -94874 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 274-60 chr8 140791680 140792010 + 1.33333 NA intron (NR_148037, intron 14 of 34) L2b|LINE|L2 -59192 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 216.667-77 chr4 46362528 46362813 + 1.33333 NA intron (NM_001114175, intron 2 of 8) intron (NM_001114175, intron 2 of 8) 26709 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 127.666 chr3 100975148 100975299 + 1.33333 NA intron (NM_001349332, intron 1 of 35) intron (NM_001349332, intron 1 of 35) 18267 NM_001349330 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 364.999 chr16 8373751 8374055 + 1.33333 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 215935 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 140.333-147 chr3 124607752 124607964 + 1.33333 NA intron (NM_007064, intron 1 of 26) AluSz|SINE|Alu 23199 NM_001322997 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 347.666-19 chr9 8776107 8776478 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 11 of 45) intron (NM_002839, intron 11 of 45) -42346 NM_001171025 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 313.333-25 chr3 75205831 75206274 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -8424 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 200-47 chr12 116403814 116404060 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 24381 NR_039683 100616309 NR_039683 ENSG00000264037 MIR4472-2 - microRNA 4472-2 ncRNA 149.666-5 chr18 3847949 3848126 + 1.33333 NA intron (NM_001242761, intron 4 of 11) AluJr|SINE|Alu -2679 NM_001003809 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 202.666-39 chr14 67812160 67812314 + 1.33333 NA intron (NM_015346, intron 3 of 41) L1ME4a|LINE|L1 4353 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 193.666-42 chr7 11737866 11738075 + 1.33333 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 94228 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 243.999-7 chr5 180778654 180778847 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 24056 NM_001364393 4245 Hs.519818 NM_002406 ENSG00000131446 MGAT1 GLCNAC-TI|GLCT1|GLYT1|GNT-1|GNT-I|GnTI|MGAT mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 204.333-78 chr18 2966100 2966381 + 1.33333 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) -19617 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 173.333-129 chr3 105618011 105618176 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 249498 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 189.333-25 chr10 9548384 9548603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -252900 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 209.333-15 chr10 10742961 10743154 + 1.33333 NA intron (NM_001326317, intron 2 of 14) L2b|LINE|L2 51857 NR_027082 207107 Hs.31562 NR_027082 ENSG00000225383 SFTA1P SFTPF surfactant associated 1, pseudogene pseudo 236.333-25 chr13 43626712 43626928 + 1.33333 NA intron (NM_001127615, intron 1 of 16) L1MDa|LINE|L1 2657 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 180.333-79 chr3 94416315 94416464 + 1.33333 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 353328 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 356-26 chr4 76575726 76576073 + 1.33333 NA TTS (NR_039655) TTS (NR_039655) 348 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 361.667-16 chr6 53828638 53829116 + 1.33333 NA intron (NM_018214, intron 1 of 13) intron (NM_018214, intron 1 of 13) 33872 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 256.666-9 chr11 37246985 37247211 + 1.33333 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -648819 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 300-54 chr5 115918908 115919309 + 1.33333 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -37463 NR_157226 107986443 NR_157226 LINCADL LINC-ADAL lincRNA adipogenesis and lipogenesis associated ncRNA 199-77 chr5 13289802 13289954 + 1.33333 NA Intergenic (GATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -256992 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 167.333-45 chr10 70877580 70877770 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003901, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_003901, exon 15 of 15) 10206 NM_001289797 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 224.333-81 chr3 102520456 102520773 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 85599 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 251.666-32 chrX 146741271 146741557 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68357 NM_001244892 100133053 NM_001244892 ENSG00000235699 CXorf51B CXorf51A chromosome X open reading frame 51B protein-coding 206.666-42 chr15 26851011 26851247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15933 NM_000810 2558 Hs.24969 NM_000810 ENSG00000186297 GABRA5 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit protein-coding 177.333-65 chr16 14305089 14305227 + 1.33333 NA intron (NR_132983, intron 1 of 1) intron (NR_132983, intron 1 of 1) 1191 NR_030177 574455 NR_030177 ENSG00000207639 MIR193B MIRN193B|mir-193b microRNA 193b ncRNA 187.333-99 chr2 69918544 69918724 + 1.33333 NA intron (NM_001202514, intron 2 of 4) intron (NM_001202514, intron 2 of 4) 3525 NM_001202513 4084 Hs.468908 NM_002357 ENSG00000059728 MXD1 BHLHC58|MAD|MAD1 MAX dimerization protein 1 protein-coding 226.333-43 chr17 57967320 57967496 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11996 NM_001271875 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 177.333-68 chr16 62231004 62231267 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -194697 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 245.666-12 chr15 78248280 78248464 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13807 NM_001199377 23205 Hs.655760 NM_015162 ENSG00000103740 ACSBG1 BG|BG1|BGM|GR-LACS|LPD acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 protein-coding 375.333-21 chr4 93744307 93744772 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -84214 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 206.666-9 chr1 179353522 179353735 + 1.33333 NA non-coding (NR_045530, exon 14 of 14) non-coding (NR_045530, exon 14 of 14) -12343 NM_144696 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 294.666-5 chr14 35499314 35499675 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -34670 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 225.333-134 chr8 125007322 125007568 + 1.33333 NA exon (NM_003129, exon 4 of 11) exon (NM_003129, exon 4 of 11) 8940 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 306-20 chr16 77812347 77812687 + 1.33333 NA intron (NM_020927, intron 1 of 8) MIRc|SINE|MIR 23953 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 182.666-18 chr16 63628122 63628312 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1493846 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 196.666-70 chr3 181254009 181254170 + 1.33333 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 22352 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 229.666-24 chr4 19756087 19756357 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -495683 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 313.666-3 chr10 75704921 75705376 + 1.33333 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) -7307 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 152-68 chr16 76543131 76543311 + 1.33333 NA intron (NR_136213, intron 21 of 23) intron (NR_136213, intron 21 of 23) -91777 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 213.333-127 chr3 60697626 60697821 + 1.33333 NA intron (NM_001320900, intron 5 of 9) intron (NM_001320900, intron 5 of 9) -79853 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 219.666-11 chr13 33633458 33633674 + 1.33333 NA intron (NM_001243476, intron 3 of 17) intron (NM_001243476, intron 3 of 17) 43228 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 384.333-5 chr14 66927718 66928264 + 1.33333 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) L1MA3|LINE|L1 -261449 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 185.667-127 chr8 79588199 79588447 + 1.33333 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -22794 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 146-144 chr8 139527930 139528093 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 175112 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 232.333-81 chr7 39216878 39217244 + 1.33333 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) intron (NM_001370959, intron 4 of 9) 112073 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 154-78 chr2 75832263 75832449 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -121441 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 147-52 chr16 85306242 85306466 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_049816) promoter-TSS (NR_049816) -29 NR_049816 100847022 NR_049816 ENSG00000266307 MIR5093 - microRNA 5093 ncRNA 194.666-56 chr5 100738016 100738223 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 78446 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 192.667-102 chr3 5914747 5914996 + 1.33333 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -664616 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 146-82 chr3 52962350 52962501 + 1.33333 NA intron (NM_016329, intron 2 of 20) L1MC5a|LINE|L1 -64877 NM_001198974 100526772 NM_001198974 ENSG00000248592 STIMATE-MUSTN1 TMEM110-MUSTN1 STIMATE-MUSTN1 readthrough protein-coding 172.666-20 chr4 73155983 73156158 + 1.33333 NA exon (NM_015574, exon 4 of 34) exon (NM_015574, exon 4 of 34) 66987 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 272.666-29 chr9 76818877 76819253 + 1.33333 NA intron (NM_001308048, intron 6 of 17) AluJb|SINE|Alu 54629 NR_132313 50652 Hs.663766 NR_015342 ENSG00000225937 PCA3 DD3|NCRNA00019|PCAT3|PRUNE2-AS1 prostate cancer associated 3 ncRNA 308-22 chr18 1851679 1852121 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -492271 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 205.333-144 chr21 17005229 17005461 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 415108 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 293.333-69 chr9 73385717 73385984 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 233985 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 294.333-33 chr5 23906811 23907087 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44399 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 367.333-5 chr15 23495068 23495377 + 1.33333 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -47979 NM_001304388 283685 NM_182561 ENSG00000174450 GOLGA6L2 CT105 golgin A6 family like 2 protein-coding 171.333-50 chr14 62562202 62562346 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -422301 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 324.667-33 chr7 11761410 11761865 + 1.33333 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 70561 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 216.666-20 chr12 5583088 5583330 + 1.33333 NA intron (NM_001278596, intron 21 of 25) intron (NM_001278596, intron 21 of 25) 89077 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 301.333-42 chr5 64895787 64896141 + 1.33333 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) L1MEd|LINE|L1 127034 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 181.666-10 chr15 71014666 71014834 + 1.33333 NA intron (NM_017691, intron 14 of 15) L1M5|LINE|L1 122307 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 234.666-43 chr7 21377698 21377940 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -50264 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 209.333-43 chr12 25118099 25118381 + 1.33333 NA intron (NM_001352063, intron 10 of 13) intron (NM_001352063, intron 10 of 13) 65534 NM_001204127 4033 Hs.124922 NM_006152 ENSG00000118308 LRMP JAW1 lymphoid restricted membrane protein protein-coding 178.667 chr1 32571159 32571419 + 1.33333 NA intron (NR_111980, intron 2 of 3) L1ME2|LINE|L1 31862 NR_111980 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 196.333-175 chr9 103137861 103138025 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 142610 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 198.666-90 chr8 56685821 56686018 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -126096 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 379.333-7 chr22 46707028 46707577 + 1.33333 NA intron (NM_022766, intron 6 of 12) intron (NM_022766, intron 6 of 12) 30950 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 235.666-5 chr14 62612132 62612514 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 433135 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 249.333-43 chr17 15072939 15073286 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 33075 NR_103559 94151 Hs.98684 NR_103559 CDRT8 - CMT1A duplicated region transcript 8 ncRNA 524.333-2 chr17 63083588 63084246 + 1.33333 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) L1MCa|LINE|L1 117682 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 205.333-255 chr8 135530972 135531216 + 1.33333 NA intron (NM_006558, intron 2 of 8) intron (NM_006558, intron 2 of 8) 73638 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 205.667-31 chr11 111779642 111779928 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13396 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 215.667-123 chr8 123332275 123332595 + 1.33333 NA intron (NM_014109, intron 24 of 27) L1ME3A|LINE|L1 -15599 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 193.666-38 chr5 53275720 53275885 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165960 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 261.333-64 chr3 29044915 29045162 + 1.33333 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 235901 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 233.333-39 chr14 60679942 60680261 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -30624 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 208-35 chr12 4454793 4454974 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9269 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 195-119 chrX 129380198 129380396 + 1.33333 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 143193 NM_001282874 6594 Hs.152292 NM_003069 ENSG00000102038 SMARCA1 ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SNF2LT|SWI|SWI2|hSNF2L SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1 protein-coding 323-23 chr5 171165370 171165771 + 1.33333 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) MIRc|SINE|MIR -143678 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 165.333-93 chr16 64110319 64110480 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 1011664 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 256.666-28 chr3 58324408 58324712 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_007042, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_007042, exon 6 of 6) -8330 NM_001349494 54899 Hs.190544 NM_017771 ENSG00000168297 PXK MONAKA|SLOB PX domain containing serine/threonine kinase like protein-coding 226-61 chr3 133815981 133816259 + 1.33333 NA intron (NR_163491, intron 5 of 7) intron (NR_163491, intron 5 of 7) 10305 NR_163491 58477 Hs.12152 NM_021203 ENSG00000144867 SRPRB APMCF1|SR-beta SRP receptor subunit beta protein-coding 200.333-114 chr5 35866315 35866610 + 1.33333 NA intron (NR_120485, intron 2 of 5) L1ME2|LINE|L1 9571 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 201.333-184 chr3 65888278 65888512 + 1.33333 NA intron (NR_145422, intron 2 of 2) intron (NR_145422, intron 2 of 2) -5421 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 255-42 chr2 44214107 44214329 + 1.33333 NA intron (NM_177969, intron 2 of 4) AluY|SINE|Alu 45343 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 230-36 chr2 115105921 115106317 + 1.33333 NA intron (NM_001178037, intron 1 of 25) intron (NM_001178037, intron 1 of 25) 41546 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 271.333-36 chr2 232668868 232669182 + 1.33333 NA intron (NM_025202, intron 2 of 3) intron (NM_025202, intron 2 of 3) -28306 NM_001103147 26058 Hs.565319 NM_015575 ENSG00000204120 GIGYF2 GYF2|PARK11|PERQ2|PERQ3|TNRC15 GRB10 interacting GYF protein 2 protein-coding 232-17 chr11 14837324 14837639 + 1.33333 NA intron (NM_000922, intron 11 of 15) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 54724 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 201-10 chr1 157672682 157672955 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 27951 NM_001320333 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 246-101 chr7 80629774 80630034 + 1.33333 NA intron (NM_001371077, intron 1 of 14) intron (NM_001371077, intron 1 of 14) 5812 NM_001371077 180-84 chr6 44208822 44208965 + 1.33333 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 -8033 NM_001315494 101929726 Hs.438979 NM_001315494 ENSG00000262179 MYMX MINION|hMINION myomixer, myoblast fusion factor protein-coding 198-90 chr2 57244469 57244725 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -663054 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 282-53 chrX 101397877 101398262 + 1.33333 NA exon (NM_000169, exon 7 of 7) exon (NM_000169, exon 7 of 7) 7058 NM_021029 6173 Hs.432485 NM_021029 ENSG00000241343 RPL36A L36A|L44L|MIG6|RPL44 ribosomal protein L36a protein-coding 222-12 chr10 69683467 69683686 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 53329 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 344.333-15 chr22 45477092 45477408 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -25633 NM_006485 2192 Hs.24601 NM_001996 ENSG00000077942 FBLN1 FBLN|FIBL1 fibulin 1 protein-coding 362.333-12 chr5 155421416 155421827 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 407866 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 198-13 chr10 10504073 10504230 + 1.33333 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) L1MD1|LINE|L1 41601 NM_001326320 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 195.667-122 chr6 113904415 113904663 + 1.33333 NA non-coding (NR_027060, exon 1 of 4) non-coding (NR_027060, exon 1 of 4) 152 NR_027060 285759 Hs.376634 NM_173673 ENSG00000175967 FLJ34503 - uncharacterized FLJ34503 ncRNA 217-45 chr2 84410559 84410738 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 48632 NM_003849 8802 Hs.270428 NM_003849 ENSG00000163541 SUCLG1 GALPHA|MTDPS9|SUCLA1 succinate-CoA ligase alpha subunit protein-coding 183.333-152 chr7 104171285 104171488 + 1.33333 NA intron (NM_181747, intron 8 of 8) intron (NM_181747, intron 8 of 8) 36627 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 207.333-222 chr5 102257674 102257836 + 1.33333 NA intron (NM_180991, intron 7 of 12) AluSx3|SINE|Alu 38529 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 216.667-43 chr17 49914991 49915314 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -54038 NM_138281 1748 Hs.591167 NM_001934 ENSG00000108813 DLX4 BP1|DLX7|DLX8|DLX9|OFC15 distal-less homeobox 4 protein-coding 334.333-9 chr12 37886703 37887224 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -429811 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 200-78 chr19 58437537 58437699 + 1.33333 NA intron (NM_003433, intron 1 of 2) intron (NM_003433, intron 1 of 2) 2535 NM_003433 7691 Hs.156169 NM_003433 ENSG00000131849 ZNF132 pHZ-12 zinc finger protein 132 protein-coding 242.333-22 chr12 78644088 78644414 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -219731 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 181.666-18 chr5 143207465 143207613 + 1.33333 NA intron (NR_146198, intron 21 of 22) intron (NR_146198, intron 21 of 22) 15039 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 222-30 chr14 86999544 86999739 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 93863 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 194.667-74 chr2 144764218 144764456 + 1.33333 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) intron (NR_033870, intron 1 of 4) 96370 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 194.666-70 chr8 80890982 80891223 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16321 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 261-28 chr17 55238997 55239457 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -25733 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 214-21 chr10 119761315 119761489 + 1.33333 NA intron (NM_014937, intron 2 of 19) intron (NM_014937, intron 2 of 19) 35352 NM_014937 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 127.333-85 chr2 145284421 145284641 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 616564 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 203.666-40 chr3 81093188 81093451 + 1.33333 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 99451 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 198-65 chr16 46561184 46561425 + 1.33333 NA intron (NR_026556, intron 3 of 16) intron (NR_026556, intron 3 of 16) 7793 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 271.999 chr11 94209915 94210253 + 1.33333 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 81243 NM_015368 24145 Hs.591976 NM_015368 ENSG00000110218 PANX1 MRS1|PX1|UNQ2529 pannexin 1 protein-coding 208-11 chr1 177340289 177340479 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11202 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 220.667-107 chr8 120388329 120388629 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 56671 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 320-7 chr12 10666045 10666535 + 1.33333 NA intron (NM_018423, intron 1 of 10) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 7762 NM_018423 55359 Hs.24979 NM_018423 ENSG00000060140 STYK1 NOK|SuRTK106 serine/threonine/tyrosine kinase 1 protein-coding 289.333-27 chr2 67431359 67431800 + 1.33333 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 34246 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 174.667-50 chr14 57257556 57257742 + 1.33333 NA intron (NM_006544, intron 1 of 17) intron (NM_006544, intron 1 of 17) 11256 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 238.333-83 chr7 31423915 31424149 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -83306 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 276-57 chr6 56670194 56670499 + 1.33333 NA intron (NM_001144770, intron 7 of 94) AluJb|SINE|Alu -27457 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 168-94 chr6 53119066 53119247 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 29685 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 228.666-28 chr3 1611700 1611898 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -487004 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 326.333-25 chr6 45475009 45475543 + 1.33333 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 53001 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 235.333-16 chr10 122931642 122931930 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_024942, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_024942, exon 6 of 6) 21176 NM_001029888 118670 Hs.369829 NM_001029888 ENSG00000203795 FAM24A - family with sequence similarity 24 member A protein-coding 204-168 chr5 124899498 124899716 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -137224 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 274-10 chr12 115252223 115252600 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -568236 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 311.333-3 chr1 155640055 155640457 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 30068 NR_024117 100129405 Hs.656361 NR_024117 MSTO2P MSTO2 misato family member 2, pseudogene pseudo 399.333-10 chr17 38897492 38897960 + 1.33333 NA intron (NR_073384, intron 4 of 7) intron (NR_073384, intron 4 of 7) -17253 NR_106837 102465467 NR_106837 ENSG00000277057 MIR6779 hsa-mir-6779 microRNA 6779 ncRNA 157.666-4 chr4 148727346 148727497 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 214957 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 533 chr14 70290120 70290975 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -42746 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 184.667 chr1 25608976 25609223 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8369 NM_020379 57134 Hs.197043 NM_020379 ENSG00000117643 MAN1C1 HMIC|MAN1A3|MAN1C|pp6318 mannosidase alpha class 1C member 1 protein-coding 264.666-8 chr10 94269646 94269956 + 1.33333 NA intron (NM_001165979, intron 16 of 31) intron (NM_001165979, intron 16 of 31) 17269 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 264.666-21 chr20 16954763 16955011 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 206534 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 289.333-2 chr1 119838133 119838593 + 1.33333 NA intron (NM_001047980, intron 5 of 7) intron (NM_001047980, intron 5 of 7) 6517 NM_001047980 343505 NM_001047980 NBPF7 - NBPF member 7 protein-coding 330.666-8 chr13 32403578 32403918 + 1.33333 NA non-coding (NR_148479, exon 4 of 5) non-coding (NR_148479, exon 4 of 5) 24382 NR_148476 90634 Hs.732118 NM_052818 ENSG00000139597 N4BP2L1 CG018 NEDD4 binding protein 2 like 1 protein-coding 227.999-6 chr6 56534634 56534813 + 1.33333 NA intron (NM_001144770, intron 55 of 94) L2a|LINE|L2 108166 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 269.666-5 chr12 11616098 11616408 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33601 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 211.333-75 chr16 17847536 17847759 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -376687 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 373.667-2 chr12 59212229 59212720 + 1.33333 NA Intergenic LTR103_Mam|LTR|ERV1? -291936 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 310.333-5 chr1 114284588 114284905 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -130877 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 203.333-259 chr8 72029430 72029678 + 1.33333 NA intron (NM_007332, intron 24 of 26) Tigger5|DNA|TcMar-Tigger 46030 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 279.333-43 chr2 74396287 74396545 + 1.33333 NA non-coding (NR_158174, exon 3 of 3) non-coding (NR_158174, exon 3 of 3) -4329 NR_033935 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 209.333-108 chr2 43709955 43710241 + 1.33333 NA exon (NM_172069, exon 12 of 30) exon (NM_172069, exon 12 of 30) -33669 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 192-86 chr21 25340628 25340852 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 90961 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 260.667-70 chr5 36955336 36955685 + 1.33333 NA exon (NM_133433, exon 3 of 47) exon (NM_133433, exon 3 of 47) 78741 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 218.666-61 chr5 161486818 161486992 + 1.33333 NA intron (NM_000813, intron 4 of 9) intron (NM_000813, intron 4 of 9) 61219 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 163.333-58 chr11 103705120 103705276 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -144708 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 210-42 chr14 74109225 74109440 + 1.33333 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu 24379 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 156.333-210 chr20 46516111 46516269 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -2618 NM_001353815 55713 Hs.147041 NM_018102 ENSG00000198185 ZNF334 - zinc finger protein 334 protein-coding 335.333 chr1 88744214 88744586 + 1.33333 NA intron (NM_006256, intron 2 of 21) intron (NM_006256, intron 2 of 21) -59196 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 258.333-45 chr3 172291072 172291460 + 1.33333 NA intron (NM_001135095, intron 7 of 25) intron (NM_001135095, intron 7 of 25) 157190 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 356.999-6 chr3 16119496 16119867 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -54999 NM_001319051 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 314.666-15 chr11 84713169 84713550 + 1.33333 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) MIR|SINE|MIR 7583 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 194.333-85 chr3 23009418 23009699 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 193020 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 214.667-107 chr7 85276507 85276766 + 1.33333 NA Intergenic LTR51|LTR|ERV1 -144486 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 129.667-119 chr3 78770240 78770465 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) L1P4|LINE|L1 249107 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 193.333-32 chr11 9733904 9734152 + 1.33333 NA intron (NM_015055, intron 7 of 11) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -24265 NR_036485 283104 Hs.632156 NR_036485 ENSG00000246273 SBF2-AS1 - SBF2 antisense RNA 1 ncRNA 125.666-3 chr8 92916669 92916823 + 1.33333 NA intron (NM_001171797, intron 3 of 4) intron (NM_001171797, intron 3 of 4) 48843 NM_001191036 286144 Hs.440643 NM_001171795 ENSG00000205133 TRIQK C8orf83|PRO0845|UPF0599 triple QxxK/R motif containing protein-coding 165-22 chr14 27179933 27180127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 271388 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 268.666-20 chr3 37358381 37358830 + 1.33333 NA intron (NM_001172713, intron 22 of 22) intron (NM_001172713, intron 22 of 22) -27664 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 296.666-5 chr11 102380015 102380294 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 32780 NM_001256163 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 198.666-77 chr5 82472134 82472322 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 192766 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 223-31 chr2 31525774 31526084 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_000348, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_000348, exon 5 of 5) 55009 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 244-47 chr18 1600067 1600488 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -240648 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 287.333-55 chr5 78760462 78760859 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -111888 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 313.999-3 chr8 117621042 117621337 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100476 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 238.666-9 chr11 85563754 85564149 + 1.33333 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) L1ME1|LINE|L1 63319 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 217.999-5 chr5 19147788 19147959 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 738399 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 175.666-16 chr4 68218535 68218680 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_104048) promoter-TSS (NR_104048) -527 NR_104048 401136 Hs.652046 NM_001129907 ENSG00000250026 TMPRSS11BNL - TMPRSS11B N-terminal like, pseudogene pseudo 216.666-10 chr10 30493709 30493963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 59190 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 201.666-5 chr10 74869495 74869681 + 1.33333 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) L1ME4c|LINE|L1 42988 NM_001370142 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 205-18 chr11 10125156 10125433 + 1.33333 NA intron (NM_030962, intron 2 of 39) L1M2|LINE|L1 168913 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 340.666-13 chr22 26908003 26908509 + 1.33333 NA intron (NR_110540, intron 2 of 2) intron (NR_110540, intron 2 of 2) 4964 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 161.666-3 chr12 103550758 103550901 + 1.33333 NA intron (NR_110103, intron 4 of 4) L1ME4a|LINE|L1 3035 NR_110103 101929084 Hs.440981 NR_110103 ENSG00000257762 LINC02401 - long intergenic non-protein coding RNA 2401 ncRNA 263.666-6 chr2 159540864 159541261 + 1.33333 NA intron (NM_001329858, intron 2 of 36) intron (NM_001329858, intron 2 of 36) -74232 NR_110587 643072 Hs.632541 NR_110587 LOC643072 - uncharacterized LOC643072 ncRNA 135-86 chr5 64120362 64120529 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -45398 NM_001113561 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 290.667-30 chr3 112518642 112519020 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -19359 NM_181780 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 312.666-14 chr2 133287709 133288125 + 1.33333 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) 21722 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 322.333-18 chr22 48106405 48106996 + 1.33333 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -167664 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 338.666-9 chr4 32780935 32781241 + 1.33333 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 430050 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 209-72 chr22 27587205 27587455 + 1.33333 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 214426 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 190.666-55 chr8 125002819 125002981 + 1.33333 NA intron (NM_003129, intron 1 of 10) intron (NM_003129, intron 1 of 10) 4395 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 330-6 chr1 211626774 211627053 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12895 NR_131925 105748977 Hs.553186 NR_131925 LINC01693 - long intergenic non-protein coding RNA 1693 ncRNA 317.333-12 chr14 83885795 83886162 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 1243346 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 188.666-37 chr8 82907520 82907670 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4509 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 445.667-3 chr17 79357596 79358145 + 1.33333 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 158278 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 293-28 chr21 27514855 27515210 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -207347 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 186-39 chr15 71801666 71801864 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8789 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 177.333-108 chr3 102761798 102762048 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 326908 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 194.666-8 chr11 77980373 77980544 + 1.33333 NA intron (NM_033547, intron 3 of 22) AluJo|SINE|Alu 14210 NM_033547 92105 Hs.533723 NM_033547 ENSG00000149262 INTS4 INT4|MST093 integrator complex subunit 4 protein-coding 178.333-23 chr10 95924125 95924360 + 1.33333 NA intron (NM_001349008, intron 3 of 34) intron (NM_001349008, intron 3 of 34) 16277 NM_001130446 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 330.999 chr17 15182378 15182869 + 1.33333 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 69073 NR_039884 100616125 NR_039884 ENSG00000265110 MIR4731 - microRNA 4731 ncRNA 208-95 chr21 29786533 29786813 + 1.33333 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 38498 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 275.333-29 chr18 43214819 43215334 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 62414 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 204-19 chr1 210779767 210780042 + 1.33333 NA intron (NM_002238, intron 9 of 10) intron (NM_002238, intron 9 of 10) 353470 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 154.333-187 chr20 50110194 50110383 + 1.33333 NA intron (NM_001257398, intron 1 of 4) intron (NM_001257398, intron 1 of 4) 2862 NM_001282577 7335 Hs.420529 NM_021988 ENSG00000244687 UBE2V1 CIR1|CROC-1|CROC1|UBE2V|UEV-1|UEV1|UEV1A ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 protein-coding 214.667-74 chr2 184563576 184563889 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -34797 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 173.333-185 chr7 48152430 48152579 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -18954 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 195-46 chr16 80503246 80503474 + 1.33333 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -37374 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 204-64 chr15 54329125 54329369 + 1.33333 NA intron (NM_001329919, intron 13 of 31) L1MA4|LINE|L1 316599 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 273.333-69 chr7 48017057 48017405 + 1.33333 NA intron (NM_001030019, intron 3 of 9) intron (NM_001030019, intron 3 of 9) 11876 NM_001284350 256979 Hs.406741 NM_152782 ENSG00000164744 SUN3 SUNC1 Sad1 and UNC84 domain containing 3 protein-coding 205-12 chr10 34545213 34545467 + 1.33333 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 269956 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 216.666-33 chr16 81522792 81522962 + 1.33333 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) L1ME3Cz|LINE|L1 -11025 NR_107008 102465840 NR_107008 ENSG00000277255 MIR7854 hsa-mir-7854 microRNA 7854 ncRNA 315.666-9 chr22 41493602 41493939 + 1.33333 NA intron (NM_001098, intron 1 of 17) intron (NM_001098, intron 1 of 17) 24653 NM_001098 50 Hs.643610 NM_001098 ENSG00000100412 ACO2 ACONM|HEL-S-284|ICRD|OCA8|OPA9 aconitase 2 protein-coding 237.667-22 chr14 68680258 68680766 + 1.33333 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) MER63C|DNA|hAT-Blackjack -51725 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 188-21 chr10 72239464 72239632 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -22414 NM_001369086 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 196.666-19 chr13 27124131 27124358 + 1.33333 NA intron (NM_182488, intron 1 of 8) intron (NM_182488, intron 1 of 8) -1289 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 264-3 chr1 81305097 81305483 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001366004) promoter-TSS (NM_001366004) -902 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 201.666-28 chr21 30453323 30453536 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 13150 NM_181623 254950 Hs.553654 NM_181623 ENSG00000186970 KRTAP15-1 KAP15.1 keratin associated protein 15-1 protein-coding 250.666 chr1 178898717 178899069 + 1.33333 NA intron (NM_152663, intron 17 of 19) intron (NM_152663, intron 17 of 19) -27816 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 125.666-4 chr8 107033884 107034107 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -263751 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 406.666-5 chr3 181255759 181256146 + 1.33333 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 24215 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 531.667-3 chr8 87078331 87078956 + 1.33333 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 212228 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 275.333-44 chr22 28462753 28463152 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 3083 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 285.333-71 chr8 90104923 90105197 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -22181 NM_004929 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 428.667-10 chr7 44844257 44844902 + 1.33333 NA intron (NM_012412, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 3547 NM_201436 94239 Hs.488189 NM_012412 ENSG00000105968 H2AFV H2A.Z-2|H2AV H2A histone family member V protein-coding 224.333-7 chr1 161328501 161328798 + 1.33333 NA intron (NM_003001, intron 3 of 5) intron (NM_003001, intron 3 of 5) 14268 NR_103459 6391 Hs.444472 NM_003001 ENSG00000143252 SDHC CYB560|CYBL|PGL3|QPS1|SDH3 succinate dehydrogenase complex subunit C protein-coding 195.333-196 chr6 161352121 161352304 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 11 of 11) intron (NM_004562, intron 11 of 11) -78151 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 240-76 chr5 133272164 133272437 + 1.33333 NA intron (NM_015082, intron 6 of 15) intron (NM_015082, intron 6 of 15) 155406 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 216.666-2 chr1 74115771 74115986 + 1.33333 NA intron (NM_001105659, intron 4 of 7) intron (NM_001105659, intron 4 of 7) 82298 NM_001105659 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 201.333-94 chr14 35967907 35968099 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -102424 NR_073454 101101773 Hs.640678 NR_073454 ENSG00000257585 LINC00609 - long intergenic non-protein coding RNA 609 ncRNA 198.333-176 chr6 72501460 72501729 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -120249 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 199.333-299 chr9 81506641 81506794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 182818 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 236.666-18 chr14 103496052 103496246 + 1.33333 NA intron (NM_001128920, intron 15 of 15) intron (NM_001128920, intron 15 of 15) 26681 NM_001823 1152 Hs.173724 NM_001823 ENSG00000166165 CKB B-CK|BCK|CKBB|CPK-B|HEL-211|HEL-S-29 creatine kinase B protein-coding 198-16 chr10 52578569 52578748 + 1.33333 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) -108125 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 270.667-7 chr10 49590398 49590824 + 1.33333 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -18484 NM_020984 1103 Hs.302002 NM_020549 ENSG00000070748 CHAT CHOACTASE|CMS1A|CMS1A2|CMS6 choline O-acetyltransferase protein-coding 292.666-24 chr3 3204630 3205218 + 1.33333 NA Intergenic (ATTGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -25207 NM_001173482 51185 Hs.18925 NM_016302 ENSG00000113851 CRBN MRT2|MRT2A cereblon protein-coding 186.666-25 chr19 56501382 56501525 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6402 NM_001321768 57573 Hs.230188 NM_020813 ENSG00000196263 ZNF471 ERP1|Z1971 zinc finger protein 471 protein-coding 236-37 chr2 70030961 70031246 + 1.33333 NA intron (NR_033872, intron 7 of 10) intron (NR_033872, intron 7 of 10) 55912 NR_033872 400960 Hs.683864 NR_033872 ENSG00000179818 PCBP1-AS1 - PCBP1 antisense RNA 1 ncRNA 324.333-24 chr2 88900578 88901058 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 88448 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 178.666-16 chr5 132938463 132938633 + 1.33333 NA intron (NM_014423, intron 1 of 20) AluSz|SINE|Alu 25086 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 136-89 chr5 178925170 178925328 + 1.33333 NA intron (NM_030613, intron 4 of 4) L1ME3D|LINE|L1 -15949 NM_001323306 285676 Hs.259441 NM_182594 ENSG00000178187 ZNF454 - zinc finger protein 454 protein-coding 230.666-50 chr8 125490383 125490608 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58286 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 214.667-20 chr10 121948415 121948698 + 1.33333 NA intron (NR_120495, intron 1 of 1) intron (NR_120495, intron 1 of 1) -19755 NM_001288736 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 198.333-80 chr17 54835726 54835907 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -64875 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 246.667-26 chr13 111962980 111963282 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9179 NR_120392 100505996 Hs.654853 NR_120392 ENSG00000224243 SOX1-OT LINC00403 SOX1 overlapping transcript ncRNA 276.666-5 chr10 87522800 87523173 + 1.33333 NA intron (NM_001178118, intron 4 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 15153 NM_001178118 9562 Hs.121260 NM_004897 ENSG00000107789 MINPP1 HIPER1|MINPP2|MIPP multiple inositol-polyphosphate phosphatase 1 protein-coding 301.333-51 chr7 42673048 42673325 + 1.33333 NA intron (NR_110833, intron 1 of 2) intron (NR_110833, intron 1 of 2) 33261 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 198-19 chr10 71833256 71833432 + 1.33333 NA intron (NM_001042465, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu 17907 NM_001042466 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 210.333-161 chr7 92598383 92598580 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8091 NR_109929 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 271.666-2 chr12 52178190 52178431 + 1.33333 NA intron (NM_182507, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 13704 NM_001081492 144501 Hs.140978 NM_182507 ENSG00000167767 KRT80 KB20 keratin 80 protein-coding 213.333-48 chr12 87834188 87834400 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -49583 NR_033410 400058 Hs.572212 NR_033410 MKRN9P MKRN5|MKRN9|MKRNP6|RNF65|ZNF127L3 makorin ring finger protein 9, pseudogene pseudo 246-68 chr3 85795511 85795878 + 1.33333 NA intron (NM_001256504, intron 3 of 10) (TAAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 32356 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 308-4 chr10 17002301 17002752 + 1.33333 NA intron (NM_001081, intron 28 of 66) intron (NM_001081, intron 28 of 66) 127291 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 197.333-69 chr14 66492069 66492312 + 1.33333 NA non-coding (NR_024338, exon 7 of 11) non-coding (NR_024338, exon 7 of 11) 5819 NR_110308 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 205-28 chr14 20001119 20001336 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001348271) promoter-TSS (NM_001348271) -835 NM_001348271 390432 NM_001348271 ENSG00000196383 OR4Q2 OR4Q2P olfactory receptor family 4 subfamily Q member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 212.667-126 chr7 39814307 39814604 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 80887 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 294-14 chr11 78217037 78217527 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_080491, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_080491, exon 10 of 10) 28363 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 196-107 chr22 28181224 28181468 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L2c|LINE|L2 -260734 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 217.333-139 chr7 44743720 44743966 + 1.33333 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -4723 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 286.999-6 chr2 10280022 10280399 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22694 NM_002149 3241 Hs.580427 NM_002149 ENSG00000115756 HPCAL1 BDR1|HLP2|VILIP-3 hippocalcin like 1 protein-coding 301.333-47 chr6 102132911 102133340 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 734140 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 366.666-15 chr7 52197097 52197525 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -804055 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 185.333-114 chr21 42553478 42553683 + 1.33333 NA intron (NM_001320537, intron 9 of 19) intron (NM_001320537, intron 9 of 19) 39728 NM_001320537 54020 Hs.547009 NM_018964 ENSG00000160190 SLC37A1 G3PP solute carrier family 37 member 1 protein-coding 227.333-50 chr17 69508990 69509290 + 1.33333 NA intron (NM_001330450, intron 2 of 11) L1MD2|LINE|L1 6878 NM_001330450 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 120.333-67 chr15 93446134 93446284 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 240143 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 349.666-6 chr20 32554467 32554870 + 1.33333 NA intron (NM_001256798, intron 1 of 10) intron (NM_001256798, intron 1 of 10) 30665 NM_001256798 140688 Hs.516978 NM_080616 ENSG00000197183 NOL4L C20orf112|C20orf113 nucleolar protein 4 like protein-coding 196.666-113 chrX 96371762 96371950 + 1.33333 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -33954 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 220.333-105 chr4 90065510 90065794 + 1.33333 NA Intergenic (GTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -61881 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 189.667-103 chr3 190615930 190616229 + 1.33333 NA intron (NR_157352, intron 5 of 10) intron (NR_157352, intron 5 of 10) 101994 NM_001364879 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 231.666-26 chr5 102719362 102719742 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35231 NM_001319943 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 182.666-13 chr14 82617464 82617762 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -25019 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 352.666-3 chr10 73582837 73583450 + 1.33333 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) L1MC4a|LINE|L1 -7468 NM_152586 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 234-62 chr6 1178695 1178942 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -77486 NR_027115 285768 Hs.209463 NR_027115 LINC01622 - long intergenic non-protein coding RNA 1622 ncRNA 313.333-16 chr18 1166859 1167335 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 192532 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 206.666-73 chr3 259510 259678 + 1.33333 NA intron (NM_001253387, intron 2 of 26) L2a|LINE|L2 -60089 NM_001253388 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 376-23 chr8 137288940 137289350 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 124443 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 183.666-9 chr2 53171327 53171490 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -468793 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 239-55 chr5 167942999 167943313 + 1.33333 NA intron (NM_001368145, intron 2 of 26) intron (NM_001368145, intron 2 of 26) 188227 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 228-21 chr12 59491665 59491910 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -104242 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 249.999-7 chr4 39081809 39082020 + 1.33333 NA intron (NM_199039, intron 2 of 9) intron (NM_199039, intron 2 of 9) 19682 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 350-8 chr14 59286961 59287297 + 1.33333 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) L1PA16|LINE|L1 23688 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 288.999-9 chr5 157841203 157841438 + 1.33333 NA intron (NM_001195556, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 17825 NM_014666 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 535-4 chr7 1658108 1658964 + 1.33333 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -29583 NM_001128636 392617 Hs.42896 NM_001128636 ENSG00000225968 ELFN1 PPP1R28 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 290.666-28 chr8 119680254 119680612 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -7043 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 199.333-258 chr7 34341882 34342057 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -316249 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 196.666-3 chr1 97539103 97539253 + 1.33333 NA intron (NM_000110, intron 12 of 22) intron (NM_000110, intron 12 of 22) -257743 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 156.667-334 chr8 81216777 81216955 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63670 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 206.333-58 chr14 70771278 70771586 + 1.33333 NA intron (NM_001284231, intron 1 of 11) intron (NM_001284231, intron 1 of 11) 12020 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 281.666-18 chr8 125654053 125654300 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 221967 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 209-114 chr7 68655331 68655610 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 635217 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 354-5 chr10 66148778 66149169 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) 577548 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 263-21 chr14 57349898 57350200 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -40537 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 451-6 chr5 119570569 119570969 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58789 NM_001367956 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 267.999 chr1 50930293 50930592 + 1.33333 NA intron (NM_007051, intron 1 of 18) MIRb|SINE|MIR 29825 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 307-38 chr8 113122031 113122471 + 1.33333 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) intron (NM_001363185, intron 4 of 66) 254901 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 156.666-8 chr20 52391144 52391304 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -199239 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 235.666 chr1 225558152 225558570 + 1.33333 NA intron (NM_001008493, intron 2 of 14) L1ME3A|LINE|L1 94762 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 225.333-103 chr4 89598087 89598369 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -238173 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 266.667-22 chr14 61492514 61492848 + 1.33333 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) L2c|LINE|L2 77513 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 199-4 chr1 184048062 184048348 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -3525 NM_001300766 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 196-150 chr5 84859901 84860168 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -475154 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 226-19 chr12 115856840 115857126 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 291671 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 354.667-24 chr8 133341988 133342435 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -44907 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 186.666-44 chr6 51156584 51156731 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 337786 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 203.333-74 chr14 46799683 46799842 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -147981 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 335.333-45 chr6 52423186 52423569 + 1.33333 NA intron (NM_001172420, intron 1 of 11) intron (NM_001172420, intron 1 of 11) 2369 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 194.666-7 chr11 10756682 10756839 + 1.33333 NA exon (NM_001346279, exon 5 of 24) exon (NM_001346279, exon 5 of 24) 5514 NM_001346279 9646 Hs.725151 NM_014633 ENSG00000198730 CTR9 SH2BP1|TSBP|p150|p150TSP CTR9 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 233-38 chr2 47189348 47189646 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12561 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 223.333-103 chr3 28658504 28658773 + 1.33333 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 83360 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 275.333-53 chr4 62084591 62085009 + 1.33333 NA intron (NR_110595, intron 6 of 7) intron (NR_110595, intron 6 of 7) 76965 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 366.667-5 chr15 101668967 101669643 + 1.33333 NA intron (NM_152334, intron 15 of 18) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -16914 NM_025141 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 198.333-144 chr4 73712118 73712325 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -28348 NM_000584 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 289.333-37 chr3 98338869 98339156 + 1.33333 NA Intergenic LTR41C|LTR|ERVL -14842 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 122.667-150 chr5 24551737 24551889 + 1.33333 NA intron (NM_001362460, intron 2 of 9) L1M5|LINE|L1 93165 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 164-58 chr2 95499657 95499836 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15015 NM_001164464 653192 Hs.723811 NM_001164464 ENSG00000144010 TRIM43B - tripartite motif containing 43B protein-coding 200.666-76 chr3 17894171 17894379 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -68277 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 195.333-56 chr12 15370111 15370273 + 1.33333 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) 47684 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 185.333-184 chr8 74512796 74512981 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -35655 NR_049860 100847058 NR_049860 ENSG00000266502 MIR5681A - microRNA 5681a ncRNA 467.666-2 chr7 72119148 72119909 + 1.33333 NA intron (NM_001363460, intron 2 of 5) intron (NM_001363460, intron 2 of 5) 217863 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 212-24 chr10 98226506 98226780 + 1.33333 NA intron (NM_001256619, intron 6 of 10) L1M4|LINE|L1 41551 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 349.333-6 chr10 112222315 112222689 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38737 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 182 chr1 20874260 20874604 + 1.33333 NA intron (NM_003760, intron 15 of 31) L1PA8A|LINE|L1 -87744 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 183.666-19 chr5 18731089 18731285 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 923913 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 223.666-17 chr17 48284626 48284819 + 1.33333 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -9625 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 206.666-84 chr4 54202683 54202852 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -26526 NM_006206 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 238-101 chr7 122140858 122141168 + 1.33333 NA intron (NM_005763, intron 1 of 23) intron (NM_005763, intron 1 of 23) 3236 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 205-110 chr9 84815019 84815280 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001369552, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001369552, exon 10 of 10) 109248 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 535-2 chr17 72722383 72722940 + 1.33333 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) AluSx1|SINE|Alu -82189 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 181.333-112 chr4 37862276 37862515 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_018290, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_018290, exon 14 of 14) -28689 NM_015173 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 164-2 chr1 32826856 32827075 + 1.33333 NA intron (NR_135106, intron 2 of 7) intron (NR_135106, intron 2 of 7) 1652 NR_135107 64766 Hs.440880 NM_022753 ENSG00000116497 S100PBP S100PBPR S100P binding protein protein-coding 242.333-78 chr4 100024733 100025044 + 1.33333 NA intron (NR_125923, intron 1 of 3) intron (NR_125923, intron 1 of 3) 74394 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 336.333-23 chr3 98839769 98840059 + 1.33333 NA intron (NM_080927, intron 3 of 15) L2a|LINE|L2 61781 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 150.666-13 chr2 241728042 241728199 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_032329, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_032329, exon 8 of 8) -6510 NM_001352824 728294 Hs.516813 NM_152783 ENSG00000180902 D2HGDH D2HGD D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase protein-coding 217.666-7 chr11 72283594 72283882 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -39562 NM_005169 401 Hs.731115 NM_005169 ENSG00000165462 PHOX2A ARIX|CFEOM2|FEOM2|NCAM2|PMX2A paired like homeobox 2A protein-coding 204-200 chr8 118989688 118989959 + 1.33333 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 37560 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 268.999-3 chr12 8786284 8786577 + 1.33333 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -36191 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 234.666-11 chr11 93450726 93450921 + 1.33333 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 92568 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 164-20 chr10 113088183 113088347 + 1.33333 NA intron (NM_001198528, intron 4 of 14) intron (NM_001198528, intron 4 of 14) -38368 NM_001349871 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 258.666-5 chr10 82698656 82698888 + 1.33333 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) MIRb|SINE|MIR -465852 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 227.667-5 chr10 15378089 15378415 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6963 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 268.333-44 chr4 85209363 85209717 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 242056 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 330.666-18 chr5 20658818 20659166 + 1.33333 NA intron (NR_149120, intron 1 of 11) Tigger5|DNA|TcMar-Tigger -43457 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 215.333-170 chr6 11984601 11984867 + 1.33333 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 16510 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 331.333-49 chr8 140334865 140335263 + 1.33333 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) intron (NM_001160372, intron 9 of 22) 122680 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 181.666-25 chrX 65312248 65312464 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -176379 NM_001010888 340554 Hs.21249 NM_001010888 ENSG00000102053 ZC3H12B CXorf32|MCPIP2 zinc finger CCCH-type containing 12B protein-coding 220.666-46 chr3 57730081 57730315 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -27058 NM_001304420 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 201-111 chr8 120520955 120521212 + 1.33333 NA intron (NM_022045, intron 20 of 21) HAL1|LINE|L1 75664 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 198.333-120 chr3 17878772 17878986 + 1.33333 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -83673 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 270.666 chr10 30886345 30886736 + 1.33333 NA intron (NM_001143766, intron 5 of 7) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 112977 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 388.333-3 chr1 101667623 101668155 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 179191 NM_001288821 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 189.666-35 chr6 1801929 1802123 + 1.33333 NA intron (NM_001253846, intron 7 of 10) intron (NM_001253846, intron 7 of 10) 192111 NM_001453 2296 Hs.348883 NM_001453 ENSG00000054598 FOXC1 ARA|ASGD3|FKHL7|FREAC-3|FREAC3|IGDA|IHG1|IRID1|RIEG3 forkhead box C1 protein-coding 208.666-74 chr3 137782992 137783235 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 11202 NR_109987 100507274 Hs.360349 NR_109987 ENSG00000239513 LINC01210 - long intergenic non-protein coding RNA 1210 ncRNA 263.333-72 chr5 69026650 69026947 + 1.33333 NA intron (NR_130778, intron 1 of 3) LTR103b_Mam|LTR|ERV1? 3129 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 223.333-25 chr11 74166717 74166899 + 1.33333 NA intron (NM_001286577, intron 2 of 32) MIRb|SINE|MIR 4194 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 259.666-30 chr5 71867336 71867673 + 1.33333 NA Intergenic (AATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 148229 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 162.333-60 chr13 43533632 43533870 + 1.33333 NA intron (NM_001347965, intron 1 of 15) intron (NM_001347965, intron 1 of 15) 84899 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 251-4 chr1 192814811 192815169 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 5951 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 267.667-68 chr8 56651959 56652263 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -92288 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 196-69 chr17 54273460 54273677 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 450641 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 245.333-63 chr2 33523731 33523992 + 1.33333 NA intron (NM_015376, intron 6 of 16) intron (NM_015376, intron 6 of 16) 9986 NM_015376 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 244.666-37 chr5 29561188 29561399 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -165317 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 231.999-8 chr2 232983809 232983999 + 1.33333 NA intron (NM_019850, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR -28710 NR_136325 101928881 Hs.570311 NR_136325 ENSG00000222001 LOC101928881 - uncharacterized LOC101928881 ncRNA 237.333-7 chr1 156611575 156611944 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7656 NM_021817 60484 Hs.410719 NM_021817 ENSG00000132702 HAPLN2 BRAL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 2 protein-coding 242-79 chr9 26740431 26740709 + 1.33333 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 152232 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 216.333-153 chrX 81801001 81801287 + 1.33333 NA Intergenic Charlie10b|DNA|hAT-Charlie 599042 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 192-96 chr3 125658527 125658694 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -63113 NM_022776 114885 Hs.477440 NM_022776 ENSG00000144909 OSBPL11 ORP-11|ORP11|OSBP12|TCCCIA00292 oxysterol binding protein like 11 protein-coding 287.333-12 chr11 88383238 88383562 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45664 NM_001814 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 170.333-202 chr7 46771908 46772082 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -74873 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 180.667-117 chr5 155754439 155754702 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -572187 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 172.667-72 chr19 46483869 46484106 + 1.33333 NA intron (NM_001205281, intron 3 of 3) L1ME4b|LINE|L1 11880 NM_020709 57469 Hs.7193 NM_020709 ENSG00000204851 PNMA8B PNMAL2 PNMA family member 8B protein-coding 316.666-6 chr15 25522938 25523463 + 1.33333 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -84144 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 187-21 chr14 67903433 67903611 + 1.33333 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 79930 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 206-72 chr2 42649293 42649475 + 1.33333 NA intron (NM_001330443, intron 6 of 16) AluSx1|SINE|Alu 80752 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 207.333-82 chr14 36495257 36495470 + 1.33333 NA intron (NR_161365, intron 1 of 4) intron (NR_161365, intron 1 of 4) 18172 NR_161363 253970 Hs.509165 NM_001101341 ENSG00000229415 SFTA3 NANCI|SFTPH|SP-H|SPH surfactant associated 3 ncRNA 173.333-168 chr5 170547693 170547871 + 1.33333 NA intron (NM_001278339, intron 1 of 7) L1PA12|LINE|L1 43762 NM_001278339 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 301.666-7 chr3 50851602 50851887 + 1.33333 NA intron (NM_004947, intron 3 of 52) L1PA15-16|LINE|L1 176664 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 160-6 chr1 102202701 102202935 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205584 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 175.333-111 chr22 36306264 36306437 + 1.33333 NA intron (NM_002473, intron 16 of 40) intron (NM_002473, intron 16 of 40) -19443 NR_106877 102465491 NR_106877 ENSG00000278420 MIR6819 hsa-mir-6819 microRNA 6819 ncRNA 169-39 chr18 5491726 5491884 + 1.33333 NA intron (NM_001330557, intron 1 of 21) intron (NM_001330557, intron 1 of 21) 48751 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 253.333-72 chr3 114549021 114549386 + 1.33333 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 75003 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 198.333-61 chr14 67597548 67597774 + 1.33333 NA intron (NM_004569, intron 1 of 3) intron (NM_004569, intron 1 of 3) 2607 NM_004569 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 198-192 chr9 9637210 9637415 + 1.33333 NA intron (NM_002839, intron 7 of 45) MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -162080 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 219-4 chr1 96326118 96326383 + 1.33333 NA intron (NR_110693, intron 3 of 5) intron (NR_110693, intron 3 of 5) 47875 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 156.667-89 chr13 36602099 36602303 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -71819 NM_203451 400120 Hs.422375 NM_203451 ENSG00000180440 SERTM1 C13orf36 serine rich and transmembrane domain containing 1 protein-coding 174-15 chr11 18027959 18028137 + 1.33333 NA intron (NM_004179, intron 5 of 9) intron (NM_004179, intron 5 of 9) 12740 NM_004179 7166 Hs.591999 NM_004179 ENSG00000129167 TPH1 TPRH|TRPH tryptophan hydroxylase 1 protein-coding 315.333-9 chr12 114606661 114607019 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 77335 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 201.333-216 chr4 185944513 185944787 + 1.33333 NA intron (NM_001270771, intron 1 of 23) intron (NM_001270771, intron 1 of 23) 11722 NM_001270771 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 371-14 chr5 17056043 17056427 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 99757 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 212-2 chr1 27828349 27828672 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2272 NM_138558 5511 Hs.533474 NM_002713 ENSG00000117751 PPP1R8 ARD-1|ARD1|NIPP-1|NIPP1|PRO2047 protein phosphatase 1 regulatory subunit 8 protein-coding 302-18 chr14 50472505 50472837 + 1.33333 NA intron (NM_198794, intron 9 of 31) intron (NM_198794, intron 9 of 31) 59898 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 170-42 chr16 24796979 24797151 + 1.33333 NA intron (NM_014494, intron 9 of 24) Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger -48798 NM_001258412 115584 Hs.164118 NM_052944 ENSG00000158865 SLC5A11 KST1|RKST1|SGLT6|SMIT2 solute carrier family 5 member 11 protein-coding 387.999-4 chr5 10395183 10395585 + 1.33333 NA intron (NM_001270660, intron 8 of 24) intron (NM_001270660, intron 8 of 24) -6980 NR_162106 113218502 NR_162106 MIR10397 - microRNA 10397 ncRNA 399.999 chr5 26390806 26391169 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 647599 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 205.333-234 chr8 49555492 49555721 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -43426 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 231-53 chr5 145032065 145032353 + 1.33333 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 803133 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 207.333-123 chr18 10519306 10519690 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6529 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 374.333-15 chr6 139715513 139715904 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -55365 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 326.666-6 chr18 896132 896786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8412 NM_001099733 116 Hs.531719 NM_001117 ENSG00000141433 ADCYAP1 PACAP adenylate cyclase activating polypeptide 1 protein-coding 198.333-166 chr5 85323444 85323700 + 1.33333 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -938692 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 206.666-23 chr11 114662235 114662462 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -16179 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 494-7 chr6 164971201 164971999 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -149537 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 270-42 chr4 18647571 18647886 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -625853 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 207.333-198 chr4 60817970 60818143 + 1.33333 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -104563 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 193.333-100 chr2 134056266 134056482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -63561 NM_001371457 329.333-46 chr5 93305186 93305637 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 265932 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 220-82 chr4 113319431 113319625 + 1.33333 NA intron (NM_001354275, intron 27 of 43) intron (NM_001354275, intron 27 of 43) 26689 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 270.333-58 chr7 86034465 86034825 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -609264 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 327.666-6 chr3 43729581 43730036 + 1.33333 NA intron (NM_001355186, intron 7 of 7) intron (NM_001355186, intron 7 of 7) -38214 NM_001346468 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 184-90 chr5 145114035 145114222 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 721214 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 189.333-68 chr17 1951289 1951460 + 1.33333 NA intron (NM_178568, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 -66342 NR_135642 105371485 Hs.655867 NR_135642 ENSG00000228133 LOC105371485 - uncharacterized LOC105371485 ncRNA 220.666-31 chr2 15572305 15572501 + 1.33333 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 -11069 NM_015909 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 247.999-9 chr4 122426755 122427054 + 1.33333 NA intron (NM_001159285, intron 11 of 11) L1ME1|LINE|L1 29591 NM_000586 3558 Hs.89679 NM_000586 ENSG00000109471 IL2 IL-2|TCGF|lymphokine interleukin 2 protein-coding 213-7 chr10 42364182 42364486 + 1.33333 NA intron (NR_024380, intron 1 of 2) intron (NR_024380, intron 1 of 2) 3711 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 113.333-224 chr6 40405826 40405953 + 1.33333 NA intron (NM_020737, intron 2 of 2) intron (NM_020737, intron 2 of 2) 27552 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 175.333-169 chr7 33264430 33264645 + 1.33333 NA intron (NM_198428, intron 7 of 22) intron (NM_198428, intron 7 of 22) 134973 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 153.666-2 chr2 197500191 197500404 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001202485) promoter-TSS (NM_001202485) -23 NM_199440 3329 Hs.595053 NM_002156 ENSG00000144381 HSPD1 CPN60|GROEL|HLD4|HSP-60|HSP60|HSP65|HuCHA60|SPG13 heat shock protein family D (Hsp60) member 1 protein-coding 216.666-29 chr14 73119230 73119431 + 1.33333 NA intron (NM_021239, intron 18 of 18) AluY|SINE|Alu -17177 NM_000021 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 243-31 chr2 81457166 81457510 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 9608 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 215-24 chr16 47520744 47521015 + 1.33333 NA intron (NM_001031835, intron 7 of 31) L1M4|LINE|L1 59548 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 437.999 chr10 83573653 83574080 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 103223 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 196.333-171 chr9 88373017 88373265 + 1.33333 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -15303 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 255.333-76 chr4 53571528 53571856 + 1.33333 NA intron (NM_001126328, intron 2 of 10) AluJr|SINE|Alu -13423 NM_032622 84708 Hs.518760 NM_032622 ENSG00000072201 LNX1 LNX|MPDZ|PDZRN2 ligand of numb-protein X 1 protein-coding 227.333-108 chr6 62323513 62323707 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -37383 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 359.333-22 chr5 111325556 111325912 + 1.33333 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) L1PA8|LINE|L1 101350 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 220-3 chr1 82735538 82735845 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -167492 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 278.666-8 chr13 86133097 86133431 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -333845 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 207.666-59 chr7 88619085 88619318 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -140499 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 424-8 chr2 155497962 155498537 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 756682 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 207-9 chr1 233195362 233195614 + 1.33333 NA intron (NM_014801, intron 15 of 33) L1ME1|LINE|L1 100237 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 199.333-241 chr6 52880585 52880846 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 28983 NM_000847 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 162.333-196 chr5 35688871 35689071 + 1.33333 NA intron (NM_024867, intron 10 of 36) L1M5|LINE|L1 71108 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 197.333-155 chr3 101494346 101494543 + 1.33333 NA intron (NM_001282804, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 18768 NM_020654 57337 Hs.529551 NM_020654 ENSG00000138468 SENP7 - SUMO specific peptidase 7 protein-coding 203.666-41 chr3 135798131 135798327 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -167499 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 359.333-7 chr14 86336093 86336438 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 401587 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 177.667-129 chr7 106408726 106408900 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -123830 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 200-141 chr6 52648878 52649036 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -15444 NR_024405 730101 Hs.7921 NR_024403 ENSG00000216775 LOC730101 - uncharacterized LOC730101 ncRNA 236.999-7 chr5 151568224 151568454 + 1.33333 NA exon (NM_001447, exon 1 of 23) exon (NM_001447, exon 1 of 23) 605 NM_001447 2196 Hs.591255 NM_001447 ENSG00000086570 FAT2 CDHF8|CDHR9|HFAT2|MEGF1|SCA45 FAT atypical cadherin 2 protein-coding 186.666-34 chr3 94866279 94866446 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -71901 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 199.333-288 chr8 134409834 134410028 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -188140 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 205.333-130 chr2 143652582 143652769 + 1.33333 NA intron (NM_018460, intron 12 of 13) L1ME1|LINE|L1 -284392 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 217.666-15 chr16 73692991 73693227 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 306304 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 232.666-2 chr1 149990838 149991207 + 1.33333 NA intron (NM_020205, intron 1 of 11) intron (NM_020205, intron 1 of 11) 19704 NM_020205 56957 Hs.98322 NM_020205 ENSG00000264522 OTUD7B CEZANNE|ZA20D1 OTU deubiquitinase 7B protein-coding 190.666-12 chr11 17368621 17368815 + 1.33333 NA intron (NM_001202439, intron 3 of 4) intron (NM_001202439, intron 3 of 4) 16918 NM_001202439 374383 Hs.146274 NM_001009913 ENSG00000188211 NCR3LG1 B7-H6|B7H6|DKFZp686O24166 natural killer cell cytotoxicity receptor 3 ligand 1 protein-coding 200.333-142 chr7 50815761 50815911 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -22383 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 248.333-18 chr12 12491144 12491435 + 1.33333 NA intron (NM_030640, intron 4 of 6).2 FLAM_A|SINE|Alu 71574 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 273.333-11 chr11 61782625 61782943 + 1.33333 NA intron (NM_013279, intron 21 of 25) intron (NM_013279, intron 21 of 25) 9777 NR_030342 693196 NR_030342 ENSG00000284108 MIR611 MIRN611|hsa-mir-611 microRNA 611 ncRNA 259.333-5 chr1 110150236 110150435 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001010898) promoter-TSS (NM_001010898) -159 NM_001010898 388662 Hs.128382 NM_001010898 ENSG00000197106 SLC6A17 MRT48|NTT4 solute carrier family 6 member 17 protein-coding 214.666-50 chr4 122678135 122678328 + 1.33333 NA intron (NR_104126, intron 10 of 10) intron (NR_104126, intron 10 of 10) 54227 NR_024041 729338 Hs.647968 NR_024041 CETN4P - centrin 4, pseudogene pseudo 272.667-6 chr1 218294161 218294541 + 1.33333 NA intron (NM_016052, intron 1 of 4) MER21B|LTR|ERVL 9058 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 294.999 chr10 123348832 123349236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 194632 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 296-3 chr1 65989392 65989913 + 1.33333 NA intron (NM_002600, intron 3 of 16) intron (NM_002600, intron 3 of 16) -2964 NM_001037340 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 142-157 chr8 127635052 127635213 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 98835 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 245.333-121 chr8 119655365 119655639 + 1.33333 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) MIR|SINE|MIR -16663 NM_001040092 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 202.666-74 chr3 70396540 70396722 + 1.33333 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -83993 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 290.333-6 chr11 109338397 109338834 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83575 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 270-22 chr18 71972671 71973046 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -190632 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 256.666-27 chr3 49254001 49254243 + 1.33333 NA intron (NM_001135197, intron 6 of 7) AluSx1|SINE|Alu -19998 NR_036233 100422952 NR_036233 ENSG00000264633 MIR4271 - microRNA 4271 ncRNA 230-20 chr13 55552006 55552294 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 377696 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 294.666-8 chr14 52270648 52270963 + 1.33333 NA intron (NM_001281469, intron 2 of 2) intron (NM_001281469, intron 2 of 2) 3107 NM_000953 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 186-19 chr10 87866650 87866910 + 1.33333 NA intron (NM_001304717, intron 2 of 9) intron (NM_001304717, intron 2 of 9) 3155 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 181-20 chr13 113467511 113467664 + 1.33333 NA intron (NM_001014283, intron 4 of 6) L1MB3|LINE|L1 -14099 NM_138430 113622 Hs.98669 NM_138430 ENSG00000153531 ADPRHL1 ARH2 ADP-ribosylhydrolase like 1 protein-coding 225.333-6 chr1 185859933 185860124 + 1.33333 NA intron (NM_031935, intron 2 of 106) intron (NM_031935, intron 2 of 106) 125637 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 206-195 chr9 100106752 100106991 + 1.33333 NA intron (NR_134606, intron 2 of 16) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 7628 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 359-3 chr13 54682508 54682858 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -370635 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 187.333-87 chr2 9881578 9881809 + 1.33333 NA intron (NM_005680, intron 7 of 14) L2a|LINE|L2 38219 NM_005680 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 382.666-5 chr14 72497580 72498148 + 1.33333 NA intron (NM_001370280, intron 13 of 17) L1MEj|LINE|L1 -18956 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 287.999-7 chr4 32025428 32025841 + 1.33333 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -3212 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 241.666-20 chr7 6161621 6161898 + 1.33333 NA TTS (NM_004227) TTS (NM_004227) 10378 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 259.667-42 chr3 33070703 33071095 + 1.33333 NA intron (NM_001079811, intron 2 of 15) intron (NM_001079811, intron 2 of 15) 25933 NM_001079811 2720 Hs.443031 NM_000404 ENSG00000170266 GLB1 EBP|ELNR1|MPS4B galactosidase beta 1 protein-coding 209.333-27 chr11 7596062 7596270 + 1.33333 NA intron (NM_001351860, intron 2 of 21) intron (NM_001351860, intron 2 of 21) -1020 NM_001256568 8495 Hs.655714 NM_003621 ENSG00000166387 PPFIBP2 Cclp1 PPFIA binding protein 2 protein-coding 212-77 chr2 10851750 10852017 + 1.33333 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -14171 NM_001282705 10130 Hs.212102 NM_005742 ENSG00000143870 PDIA6 ERP5|P5|TXNDC7 protein disulfide isomerase family A member 6 protein-coding 208-77 chr2 40886059 40886272 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -373730 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 162.667-33 chr10 91195709 91195941 + 1.33333 NA intron (NM_001257101, intron 1 of 9) LTR16E2|LTR|ERVL -24326 NM_001256549 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 263.666-14 chr6 92065163 92065477 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -374892 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 203.333-178 chr3 120071104 120071259 + 1.33333 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 13467 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 166.666-11 chr4 90181541 90181724 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) intron (NM_001145065, intron 1 of 10) -53399 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 425.332-3 chr6 74595211 74595545 + 1.33333 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 525927 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 288.666-5 chr12 69018712 69019130 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -55681 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 196.667-8 chr1 228801105 228801386 + 1.33333 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 65766 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 172.667-127 chr5 161476912 161477146 + 1.33333 NA intron (NM_000813, intron 4 of 9) L1MB2|LINE|L1 71095 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 210-82 chr20 35081507 35081691 + 1.33333 NA intron (NM_199368, intron 1 of 18) L1MEg|LINE|L1 11208 NM_015638 26133 Hs.168073 NM_015638 ENSG00000100991 TRPC4AP C20orf188|PPP1R158|TRRP4AP|TRUSS transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein protein-coding 277-25 chr19 42298213 42298562 + 1.33333 NA intron (NM_001145940, intron 5 of 5) AluSz|SINE|Alu -3745 NM_199285 284338 Hs.585901 NM_199285 ENSG00000188368 PRR19 - proline rich 19 protein-coding 141.666-6 chr8 86861941 86862143 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4373 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 466-4 chr14 70472003 70472536 + 1.33333 NA intron (NR_037933, intron 1 of 1) L1ME2|LINE|L1 11487 NR_037933 317760 Hs.188369 NR_037933 ENSG00000259158 ADAM20P1 C14orf55 ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene 1 pseudo 428.666-5 chr2 229424444 229425042 + 1.33333 NA intron (NM_139072, intron 8 of 12) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -153456 NM_017933 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 206.666-132 chrX 86714049 86714276 + 1.33333 NA intron (NM_001139515, intron 5 of 11) intron (NM_001139515, intron 5 of 11) 451194 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 195.333-62 chr12 72025557 72025718 + 1.33333 NA intron (NM_173353, intron 9 of 10) intron (NM_173353, intron 9 of 10) 86792 NM_173353 121278 Hs.736576 NM_173353 ENSG00000139287 TPH2 ADHD7|NTPH tryptophan hydroxylase 2 protein-coding 190.666-56 chr8 125018257 125018460 + 1.33333 NA intron (NM_003129, intron 8 of 10) intron (NM_003129, intron 8 of 10) 19853 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 148.667-367 chr8 36554154 36554337 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -230129 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 216.666-53 chr4 71498702 71498888 + 1.33333 NA intron (NM_003759, intron 13 of 22) MER102b|DNA|hAT-Charlie 159742 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 288.999-11 chr9 123760937 123761338 + 1.33333 NA intron (NM_001352968, intron 3 of 18) intron (NM_001352968, intron 3 of 18) 168989 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 209.333-176 chr4 102715310 102715479 + 1.33333 NA intron (NM_005908, intron 4 of 16) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 45574 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 310.666-8 chr17 16189630 16190107 + 1.33333 NA intron (NM_001190440, intron 1 of 44) HAL1ME|LINE|L1 4771 NM_001190438 9611 Hs.462323 NM_006311 ENSG00000141027 NCOR1 N-CoR|N-CoR1|PPP1R109|TRAC1|hN-CoR nuclear receptor corepressor 1 protein-coding 123.666-2 chr14 37860212 37860318 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 41859 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 148-169 chr9 86708068 86708197 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 239374 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 271.333-54 chr4 57503091 57503402 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 77374 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 253.666 chr1 150782663 150783049 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -17078 NM_001199739 1520 Hs.181301 NM_004079 ENSG00000163131 CTSS - cathepsin S protein-coding 175.333-183 chr8 48852117 48852253 + 1.33333 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 69244 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 358.999-3 chr8 117494036 117494361 + 1.33333 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -26515 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 310-64 chr9 28962450 28962752 + 1.33333 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -73646 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 322.333-24 chr5 34908903 34909242 + 1.33333 NA intron (NR_026591, intron 4 of 4) intron (NR_026591, intron 4 of 4) 6432 NM_002853 5810 Hs.38114 NM_002853 ENSG00000113456 RAD1 HRAD1|REC1 RAD1 checkpoint DNA exonuclease protein-coding 361.666-2 chr11 73425370 73425705 + 1.33333 NA intron (NM_001286050, intron 3 of 8) MIRb|SINE|MIR 48869 NM_032871 84957 Hs.533720 NM_032871 ENSG00000054967 RELT AI3C|TNFRSF19L|TRLT RELT TNF receptor protein-coding 164.667-254 chr9 30949847 30950060 + 1.33333 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 431537 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 264-18 chr14 53489373 53489627 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 336146 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 202-188 chr8 130497159 130497453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53632 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 273-12 chr12 64736093 64736337 + 1.33333 NA intron (NM_002076, intron 9 of 13) intron (NM_002076, intron 9 of 13) 23191 NM_002076 2799 Hs.334534 NM_002076 ENSG00000135677 GNS G6S glucosamine (N-acetyl)-6-sulfatase protein-coding 266-25 chr15 94823094 94823378 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32127 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 162.333-217 chr6 69694088 69694231 + 1.33333 NA intron (NM_001367272, intron 14 of 15) intron (NM_001367272, intron 14 of 15) 102307 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 183-17 chr11 13736359 13736590 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -47912 NR_149108 105376562 Hs.577257 NR_149108 ENSG00000255411 LINC02548 - long intergenic non-protein coding RNA 2548 ncRNA 317-26 chr8 134431936 134432412 + 1.33333 NA Intergenic MamGypLTR2c|LTR|Gypsy -165897 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 365.666-5 chr20 49661062 49661428 + 1.33333 NA intron (NM_004776, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 52633 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 207.666-48 chr4 122194757 122194943 + 1.33333 NA intron (NM_015312, intron 9 of 83) intron (NM_015312, intron 9 of 83) 24247 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 373.333 chr10 119003201 119003599 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -26314 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 190.333-34 chr11 112281825 112282003 + 1.33333 NA intron (NR_126004, intron 1 of 3) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 11165 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 245-69 chr7 62835484 62835695 + 1.33333 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 468467 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 186.667-2 chr1 62842554 62842796 + 1.33333 NA intron (NM_178221, intron 10 of 10) intron (NM_178221, intron 10 of 10) 58543 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 214.666-12 chr10 92686128 92686344 + 1.33333 NA Intergenic BC200|scRNA|scRNA -3719 NM_002729 3087 Hs.118651 NM_002729 ENSG00000152804 HHEX HEX|HMPH|HOX11L-PEN|PRH|PRHX hematopoietically expressed homeobox protein-coding 193.666-8 chr10 114553763 114553994 + 1.33333 NA intron (NM_001352440, intron 4 of 20) LTR78B|LTR|ERV1 -26965 NM_001322890 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 248.667-103 chr8 66617858 66618211 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4816 NM_001080416 4603 Hs.445898 NM_001080416 ENSG00000185697 MYBL1 A-MYB|AMYB MYB proto-oncogene like 1 protein-coding 369.333-16 chr3 82864979 82865278 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 878986 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 279.333-67 chr6 20177846 20178226 + 1.33333 NA intron (NM_001080480, intron 1 of 12) intron (NM_001080480, intron 1 of 12) 34433 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 197.333-189 chr5 141073985 141074273 + 1.33333 NA intron (NR_105056, intron 1 of 3) intron (NR_105056, intron 1 of 3) 3902 NR_105056 101926905 Hs.570900 NR_105056 LOC101926905 - uncharacterized LOC101926905 ncRNA 336.666-13 chr17 43716898 43717459 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 41613 NM_025237 50964 Hs.349204 NM_025237 ENSG00000167941 SOST CDD|DAND6|SOST1|VBCH sclerostin protein-coding 203-103 chr7 92374782 92375043 + 1.33333 NA intron (NM_019004, intron 11 of 19) L1M5|LINE|L1 62402 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 247.666-11 chr15 43968543 43968843 + 1.33333 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) -90522 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 221-4 chr1 87761488 87761744 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -389961 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 238.667-68 chr5 65554019 65554329 + 1.33333 NA intron (NM_001349369, intron 3 of 10) AluSc|SINE|Alu 8994 NM_001267038 64105 Hs.529778 NM_022145 ENSG00000123219 CENPK AF5alpha|CENP-K|FKSG14|P33|Solt centromere protein K protein-coding 140.667-95 chr17 62806750 62806959 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001100875) promoter-TSS (NM_001100875) -214 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 136-93 chr6 139173580 139173692 + 1.33333 NA intron (NM_016217, intron 2 of 3) intron (NM_016217, intron 2 of 3) 38556 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 234-26 chr16 31849457 31849743 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -24158 NR_049749 10308 Hs.460645 NM_003414 ENSG00000185947 ZNF267 HZF2 zinc finger protein 267 protein-coding 229-8 chr10 52943709 52944017 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -172163 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 257.667-56 chr3 61977920 61978250 + 1.33333 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) AluSx1|SINE|Alu 340862 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 299.333-79 chr9 12382328 12382579 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -310932 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 358.333-20 chr3 85640182 85640580 + 1.33333 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) -86101 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 366-15 chr3 51427867 51428222 + 1.33333 NA intron (NR_146065, intron 11 of 25) intron (NR_146065, intron 11 of 25) 36759 NM_013286 29890 Hs.118738 NM_013286 ENSG00000259956 RBM15B HUMAGCGB|HsOTT3|OTT3 RNA binding motif protein 15B protein-coding 339.666 chr1 77343897 77344429 + 1.33333 NA intron (NM_012093, intron 6 of 13) intron (NM_012093, intron 6 of 13) 61076 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 192.667-41 chr11 110853522 110853777 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -140460 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 205.999-8 chr8 126860538 126860693 + 1.33333 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -152539 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 192-31 chr11 26631337 26631536 + 1.33333 NA intron (NM_031418, intron 18 of 26) intron (NM_031418, intron 18 of 26) -59173 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 304.666-27 chr8 16861596 16861900 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 140597 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 252-80 chr5 87136068 87136427 + 1.33333 NA intron (NR_105018, intron 1 of 3) AluJr4|SINE|Alu 16099 NR_105018 101929380 NR_105018 LOC101929380 - uncharacterized LOC101929380 ncRNA 180.666 chr1 75644325 75644495 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28247 NM_001320283 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 209.333-220 chr7 64581930 64582154 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_033245) promoter-TSS (NR_033245) -568 NR_033245 641746 Hs.488363 NR_033245 LOC641746 - glycine cleavage system protein H (aminomethyl carrier) pseudogene pseudo 245-20 chr14 51837471 51837744 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -23005 NM_001243773 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 422.666-6 chr7 2620823 2621332 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10909 NM_025250 80727 Hs.440899 NM_025250 ENSG00000136295 TTYH3 - tweety family member 3 protein-coding 286.999-5 chr19 33756162 33756557 + 1.33333 NA intron (NM_001127895, intron 3 of 4) intron (NM_001127895, intron 3 of 4) -40511 NM_001129995 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 197.333-128 chr20 13006388 13006569 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2494 NM_018327 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 207.333-76 chr13 68298731 68298980 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 586470 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 217.666-28 chr3 97828045 97828309 + 1.33333 NA intron (NM_153605, intron 1 of 21) L1ME4b|LINE|L1 6166 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 187-82 chr7 107936257 107936420 + 1.33333 NA intron (NM_002291, intron 26 of 33) FLAM_A|SINE|Alu 45155 NM_000108 1738 Hs.131711 NM_000108 ENSG00000091140 DLD DLDD|DLDH|E3|GCSL|LAD|PHE3 dihydrolipoamide dehydrogenase protein-coding 239.666-7 chr12 93555554 93555872 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -14256 NM_003877 8835 Hs.485572 NM_003877 ENSG00000120833 SOCS2 CIS2|Cish2|SOCS-2|SSI-2|SSI2|STATI2 suppressor of cytokine signaling 2 protein-coding 237.333-48 chr18 6822097 6822314 + 1.33333 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -12280 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 250.333-27 chr18 1429774 1430140 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70328 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 297.333-45 chr5 16470847 16471286 + 1.33333 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -5266 NM_033414 90441 Hs.60300 NM_033414 ENSG00000173545 ZNF622 ZPR9 zinc finger protein 622 protein-coding 259.667-38 chr2 170057935 170058321 + 1.33333 NA intron (NM_172070, intron 33 of 38) intron (NM_172070, intron 33 of 38) -120019 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 224-67 chr4 62534077 62534328 + 1.33333 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -372437 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 142.667-227 chr8 120057374 120057538 + 1.33333 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -67646 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 160.667-98 chr14 99173127 99173311 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_138576, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_138576, exon 4 of 4) 98978 NM_022898 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 245.333-81 chr3 161415740 161415973 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10571 NR_102265 101243545 Hs.737526 NR_102265 ENSG00000240567 LINC02067 - long intergenic non-protein coding RNA 2067 ncRNA 365.667 chr1 44740118 44740604 + 1.33333 NA intron (NM_006845, intron 1 of 20) intron (NM_006845, intron 1 of 20) 524 NM_006845 11004 Hs.720061 NM_006845 ENSG00000142945 KIF2C CT139|KNSL6|MCAK kinesin family member 2C protein-coding 206.666-22 chr11 101958112 101958311 + 1.33333 NA exon (NM_020802, exon 5 of 11) exon (NM_020802, exon 5 of 11) -41689 NM_178127 253935 Hs.318370 NM_178127 ENSG00000187151 ANGPTL5 - angiopoietin like 5 protein-coding 215.666-27 chr3 19065346 19065552 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -83061 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 228.666-35 chr4 92817417 92817621 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 513120 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 206-123 chr4 32561833 32562114 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 210935 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 226.666-27 chr4 27000218 27000459 + 1.33333 NA intron (NM_001169118, intron 5 of 12) intron (NM_001169118, intron 5 of 12) 139497 NM_001169118 57620 Hs.744950 NM_020860 ENSG00000109689 STIM2 - stromal interaction molecule 2 protein-coding 198-69 chr17 11133707 11133900 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -107410 NM_001173462 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 281.666-14 chr5 64984250 64984575 + 1.33333 NA intron (NM_005869, intron 13 of 13) intron (NM_005869, intron 13 of 13) 215482 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 145.333-185 chr3 52575937 52576096 + 1.33333 NA intron (NM_001366074, intron 25 of 30) L1M4|LINE|L1 39411 NM_001124767 440957 Hs.660577 NM_001124767 ENSG00000168273 SMIM4 C3orf78 small integral membrane protein 4 protein-coding 224-108 chr8 125772370 125772576 + 1.33333 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 178724 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 208.667 chr1 39499979 39500244 + 1.33333 NA intron (NM_181809, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 8475 NM_181809 353500 Hs.472497 NM_181809 ENSG00000183682 BMP8A - bone morphogenetic protein 8a protein-coding 200.333-55 chr17 59214172 59214335 + 1.33333 NA intron (NM_018149, intron 3 of 3) AluSx1|SINE|Alu 4243 NM_018149 55181 Hs.7296 NM_018149 ENSG00000167447 SMG8 C17orf71 SMG8 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 243.333-43 chr18 13413297 13413654 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 3 of 5) intron (NM_181482, intron 3 of 5) 14059 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 126.333-87 chr2 54840381 54840525 + 1.33333 NA intron (NM_001039753, intron 6 of 40) intron (NM_001039753, intron 6 of 40) 115441 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 227-33 chr22 45674418 45674788 + 1.33333 NA intron (NM_001167621, intron 1 of 10) intron (NM_001167621, intron 1 of 10) 2769 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 208.666-89 chr5 101152997 101153244 + 1.33333 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -249838 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 177.333-107 chr3 89240292 89240541 + 1.33333 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 132795 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 342-29 chr5 52409185 52409487 + 1.33333 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -378580 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 176.333-41 chr12 131955007 131955248 + 1.33333 NA intron (NM_015409, intron 1 of 52) intron (NM_015409, intron 1 of 52) 5185 NM_015409 57634 Hs.723478 NM_015409 ENSG00000183495 EP400 CAGH32|P400|TNRC12 E1A binding protein p400 protein-coding 225.333-97 chr4 43967185 43967404 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -49567 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 189.666-7 chr12 52397706 52397863 + 1.33333 NA intron (NM_033033, intron 5 of 8) AluSz|SINE|Alu 8608 NM_033033 3888 Hs.134640 NM_033033 ENSG00000161850 KRT82 HB2|Hb-2|KRTHB2 keratin 82 protein-coding 159.333-84 chr14 34586333 34586538 + 1.33333 NA intron (NM_001366519, intron 7 of 12) AluSx|SINE|Alu -30046 NR_004400 26863 NR_004400 ENSG00000206737 RNVU1-18 RNU1-25|RNU1-25P|RNU1-5|RNU1P1|RNU1P9|U1.15|U1P101|U1P15|vU1.18 RNA, variant U1 small nuclear 18 snRNA 220.667-96 chr7 26096116 26096391 + 1.33333 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -55945 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 276.333-8 chr10 129054123 129054394 + 1.33333 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 141425 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 304.666-4 chr10 31301988 31302565 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -16141 NM_001323638 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 195.666-35 chr4 106361960 106362146 + 1.33333 NA intron (NM_001195138, intron 1 of 1) intron (NM_001195138, intron 1 of 1) 5382 NM_001195138 100507096 Hs.722750 NM_001195138 ENSG00000250298 GIMD1 - GIMAP family P-loop NTPase domain containing 1 protein-coding 216.999-3 chr12 78651511 78651726 + 1.33333 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -212364 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 196.667-71 chr2 45349384 45349634 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -94568 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 182-68 chr3 105809157 105809453 + 1.33333 NA intron (NR_135809, intron 3 of 18) intron (NR_135809, intron 3 of 18) 58286 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 309.333-44 chr3 10322038 10322400 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1031 NM_001278946 6396 Hs.166924 NM_030673 ENSG00000157020 SEC13 D3S1231E|SEC13L1|SEC13R|npp-20 SEC13 homolog, nuclear pore and COPII coat complex component protein-coding 238-33 chr17 55341674 55341893 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 75561 NM_001330375 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 145.333-303 chr8 102615736 102615894 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 38149 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 162.667-247 chr6 125162525 125162763 + 1.33333 NA intron (NM_001292026, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 8398 NM_001003395 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 337.333-15 chr14 73072539 73072899 + 1.33333 NA intron (NM_021239, intron 2 of 18) FLAM_A|SINE|Alu 14185 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 214.667-76 chr20 55608497 55608787 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -181445 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 146-58 chr2 67028091 67028249 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -58276 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 204.666-36 chr17 61370353 61370513 + 1.33333 NA intron (NM_001099432, intron 24 of 24) AluSg|SINE|Alu -2729 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 186-80 chr5 61293793 61293957 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28946 NR_146624 105378992 Hs.621682 NR_146624 ENSG00000249279 LINC02057 - long intergenic non-protein coding RNA 2057 ncRNA 142.333-115 chr2 25581399 25581554 + 1.33333 NA intron (NM_001320935, intron 4 of 17) MIRc|SINE|MIR 68746 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 133-30 chr15 67236512 67236681 + 1.33333 NA intron (NM_001271885, intron 2 of 9) intron (NM_001271885, intron 2 of 9) 18065 NM_024666 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 462-10 chr17 44907846 44908368 + 1.33333 NA TTS (NM_001242376) TTS (NM_001242376) 4277 NM_001258400 100528020 NM_001258400 ENSG00000214447 FAM187A - family with sequence similarity 187 member A protein-coding 233-33 chr18 70030321 70030631 + 1.33333 NA intron (NM_001318520, intron 40 of 47) intron (NM_001318520, intron 40 of 47) -73677 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 120.333-188 chr8 86560172 86560320 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003909, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_003909, exon 17 of 17) 45811 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 144-54 chr14 70325952 70326162 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001202547, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001202547, exon 6 of 6) 33626 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 196.666-46 chr2 47183830 47184128 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7043 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 158-76 chr2 170887455 170887684 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -40908 NM_001201428 26003 Hs.431317 NM_015530 ENSG00000115806 GORASP2 GOLPH6|GRASP55|GRS2|p59 golgi reassembly stacking protein 2 protein-coding 287.667-42 chr9 28382848 28383261 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 336251 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 228-22 chr12 99040752 99041039 + 1.33333 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) MIR|SINE|MIR -52464 NR_110095 101928937 Hs.555499 NR_110095 ENSG00000258039 LOC101928937 - uncharacterized LOC101928937 ncRNA 193.333-112 chr20 41495517 41495665 + 1.33333 NA intron (NM_032221, intron 8 of 36) L1MA9|LINE|L1 122786 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 195-27 chr11 98211267 98211441 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -809595 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 199.333-226 chr5 77617811 77618013 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 20785 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 188.667-148 chr8 78360015 78360232 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -156217 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 294-46 chr3 123607956 123608313 + 1.33333 NA intron (NR_121654, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 12414 NM_053032 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 253.666-2 chr10 120583852 120584200 + 1.33333 NA intron (NR_134516, intron 4 of 4) intron (NR_134516, intron 4 of 4) -13923 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 321-2 chr1 197694076 197694355 + 1.33333 NA intron (NR_125340, intron 3 of 19) intron (NR_125340, intron 3 of 19) 81265 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 426.333-3 chr10 66585955 66586562 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) L1PB3|LINE|L1 -339778 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 218-22 chr13 23813090 23813412 + 1.33333 NA intron (NM_005932, intron 14 of 18) intron (NM_005932, intron 14 of 18) -75617 NM_001014442 542767 Hs.642624 NM_001014442 PCOTH C1QTNF9B-AS1 Pro-X-Gly collagen triple helix like repeat containing protein-coding 251.999-6 chr18 1319453 1319739 + 1.33333 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) L1M1|LINE|L1 40033 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 201-83 chr4 90595908 90596120 + 1.33333 NA intron (NM_207491, intron 5 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie 360983 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 411.333-4 chr11 7578055 7578498 + 1.33333 NA 5' UTR (NM_001351860, exon 1 of 22) 5' UTR (NM_001351860, exon 1 of 22) 385 NM_001351860 8495 Hs.655714 NM_003621 ENSG00000166387 PPFIBP2 Cclp1 PPFIA binding protein 2 protein-coding 219.666-16 chr15 47247516 47247797 + 1.33333 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) intron (NM_001198999, intron 1 of 19) 63567 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 161-46 chr2 163168806 163169047 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -330159 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 140-23 chr10 96052539 96052715 + 1.33333 NA intron (NM_019084, intron 3 of 5) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie 9044 NM_001134375 54619 Hs.596479 NM_019084 ENSG00000107443 CCNJ bA690P14.1 cyclin J protein-coding 342.666-11 chr17 67894674 67894964 + 1.33333 NA intron (NM_182641, intron 7 of 27) intron (NM_182641, intron 7 of 27) 69316 NM_004459 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 273.333-38 chr21 35428341 35428773 + 1.33333 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 152207 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 277-40 chr4 55997362 55997805 + 1.33333 NA intron (NM_025009, intron 15 of 25) intron (NM_025009, intron 15 of 25) 48638 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 148.333-107 chr13 35955858 35955979 + 1.33333 NA intron (NM_001330071, intron 3 of 16) intron (NM_001330071, intron 3 of 16) -100057 NM_001195415 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 268.666-10 chr12 74550925 74551230 + 1.33333 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 13242 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 189-40 chr2 51355233 51355503 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) intron (NR_135237, intron 3 of 10) 322767 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 236 chr1 46758716 46759101 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -39794 NM_014774 9813 Hs.707688 NM_014774 ENSG00000159658 EFCAB14 KIAA0494 EF-hand calcium binding domain 14 protein-coding 214-9 chr1 168798571 168798867 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 11778 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 335.333-8 chr11 8819112 8819462 + 1.33333 NA intron (NM_005418, intron 3 of 22) AluJb|SINE|Alu -7952 NM_139157 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 271-55 chr9 96266594 96266973 + 1.33333 NA intron (NM_000197, intron 2 of 10) HAL1|LINE|L1 20320 NR_146524 105376162 Hs.662614 NR_146524 ENSG00000232283 HSD17B3-AS1 - HSD17B3 antisense RNA 1 ncRNA 178-5 chr1 72196917 72197067 + 1.33333 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) 85547 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 251.333-98 chr6 125508396 125508767 + 1.33333 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -165772 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 146.667-32 chr10 44338913 44339112 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46085 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 207.333-158 chr2 241347650 241347843 + 1.33333 NA intron (NM_001349311, intron 11 of 13) AluSz|SINE|Alu -8539 NM_001282984 9855 Hs.726316 NM_014808 ENSG00000006607 FARP2 FIR|FRG|PLEKHC3 FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 protein-coding 138-16 chr10 53782590 53782738 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -703566 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 230.666-3 chr1 114673367 114673602 + 1.33333 NA intron (NM_001172626, intron 14 of 14) intron (NM_001172626, intron 14 of 14) -3435 NM_198459 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 314.667-32 chr5 29735782 29736160 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -144589 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 247-10 chr10 108265600 108265899 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -196456 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 188.666-36 chr7 78760546 78760735 + 1.33333 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -248348 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 168.667-165 chr4 116496597 116496843 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 196995 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 199.333-20 chr1 219427807 219428089 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 129376 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 293.666-5 chr12 119297407 119297921 + 1.33333 NA intron (NR_024246, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 5716 NR_024246 144742 Hs.524782 NR_024246 ENSG00000281196 LINC00934 - long intergenic non-protein coding RNA 934 ncRNA 195.333-123 chr2 178314301 178314454 + 1.33333 NA intron (NM_001201480, intron 3 of 25) intron (NM_001201480, intron 3 of 25) -5865 NM_145739 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 206.667-43 chr15 57740736 57741015 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 34161 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 390-22 chr7 113542049 113542777 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 376596 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 205.333-184 chr5 57638789 57638961 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -11785 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 313.333-19 chr2 40993167 40993534 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -480915 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 432.333-8 chr3 166237556 166238157 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -400433 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 151.333-112 chr13 55478533 55478721 + 1.33333 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 304173 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 335.333-38 chr5 59765147 59765566 + 1.33333 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) L3|LINE|CR1 3492 NM_001364601 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 206.666-70 chr21 31704335 31704669 + 1.33333 NA intron (NM_001145444, intron 2 of 18) L1ME4b|LINE|L1 27616 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 310-50 chr6 68941595 68941947 + 1.33333 NA intron (NM_001704, intron 5 of 31) intron (NM_001704, intron 5 of 31) 306489 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 170.333-214 chr8 33088434 33088611 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 366687 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 390.333-5 chr17 29487293 29487846 + 1.33333 NA intron (NM_025142, intron 8 of 17) L1MC4|LINE|L1 79468 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 200.666-25 chr12 13966589 13966756 + 1.33333 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 13684 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 337.333-14 chr14 61878218 61878527 + 1.33333 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) intron (NM_001367656, intron 1 of 7) -49323 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 259.666-12 chr12 29683008 29683410 + 1.33333 NA intron (NM_001367875, intron 5 of 19) intron (NM_001367875, intron 5 of 19) 100733 NM_001367875 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 233.666-7 chr12 41812863 41813169 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 48827 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 316-20 chr17 59668812 59669195 + 1.33333 NA intron (NM_001288653, intron 14 of 31) intron (NM_001288653, intron 14 of 31) 38595 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 195-31 chr12 51081656 51081878 + 1.33333 NA intron (NM_030809, intron 1 of 4) intron (NM_030809, intron 1 of 4) 1829 NM_030809 81566 Hs.524425 NM_030809 ENSG00000110925 CSRNP2 C12orf2|C12orf22|FAM130A1|PPP1R72|TAIP-12 cysteine and serine rich nuclear protein 2 protein-coding 340-20 chr3 79565629 79565974 + 1.33333 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie 57914 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 440.333 chr10 114528987 114529587 + 1.33333 NA intron (NM_001352440, intron 6 of 20) AluSc|SINE|Alu -2374 NM_001322890 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 159.333-71 chr12 76569442 76569646 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9773 NM_020841 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 203-73 chr4 101316692 101316943 + 1.33333 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) 13597 NR_031656 100302193 NR_031656 ENSG00000221265 MIR1255A MIRN1255A|hsa-mir-1255a microRNA 1255a ncRNA 148.666-8 chr3 96397736 96397986 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 37897 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 255.666-24 chr7 28659280 28659567 + 1.33333 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -26710 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 347.333-30 chr8 122725350 122725693 + 1.33333 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -31415 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 234.333-59 chr5 74190573 74190791 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 117643 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 247.667-4 chr1 174660527 174660816 + 1.33333 NA intron (NM_001366446, intron 14 of 25) L2a|LINE|L2 -39868 NM_001366450 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 202.666-79 chr3 123366161 123366403 + 1.33333 NA intron (NM_183357, intron 1 of 20) intron (NM_183357, intron 1 of 20) 50060 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 240.333-101 chr9 80989538 80989767 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 699883 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 258-65 chr5 83184206 83184517 + 1.33333 NA intron (NM_001318012, intron 3 of 7) intron (NM_001318012, intron 3 of 7) 106814 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 254.333-9 chr11 71231220 71231494 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -6561 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 183.333-150 chr7 32580772 32580996 + 1.33333 NA TTS (NR_036680) TTS (NR_036680) 85395 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 176.666-33 chr9 35822125 35822282 + 1.33333 NA intron (NR_052026, intron 3 of 7) L2c|LINE|L2 6529 NM_001012446 392307 Hs.128075 NM_001012446 ENSG00000204930 FAM221B C9orf128 family with sequence similarity 221 member B protein-coding 145.667-37 chr10 74125300 74125431 + 1.33333 NA intron (NM_207012, intron 8 of 9) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 25463 NR_135191 26985 Hs.500104 NM_012095 ENSG00000185009 AP3M1 - adaptor related protein complex 3 subunit mu 1 protein-coding 509-3 chr3 17312231 17313059 + 1.33333 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) intron (NM_014744, intron 13 of 21) 379449 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 264.666-39 chrX 76694853 76695087 + 1.33333 NA intron (NR_110400, intron 1 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 224390 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 200.666-80 chr3 133423770 133424003 + 1.33333 NA intron (NM_003571, intron 1 of 6) intron (NM_003571, intron 1 of 6) 23830 NM_003571 8419 Hs.659862 NM_003571 ENSG00000170819 BFSP2 CP47|CP49|CTRCT12|LIFL-L|PHAKOSIN beaded filament structural protein 2 protein-coding 269.333-7 chr10 106087000 106087294 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -53018 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 220-23 chr11 76148056 76148358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 58295 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 297.333-9 chr11 8536409 8536699 + 1.33333 NA intron (NM_030906, intron 1 of 13) L1MC5a|LINE|L1 57422 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 259.333-15 chr10 66495882 66496197 + 1.33333 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) intron (NM_001127384, intron 11 of 17) -429997 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 219.999-4 chr18 10963890 10964055 + 1.33333 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) intron (NM_022068, intron 3 of 51) 184790 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 329.666-2 chr10 116995841 116996127 + 1.33333 NA intron (NM_001258300, intron 2 of 17) MER34B-int|LTR|ERV1 9203 NM_018330 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 176.667-92 chr21 41427416 41427673 + 1.33333 NA intron (NM_001144925, intron 4 of 18) intron (NM_001144925, intron 4 of 18) 1305 NM_002462 4599 Hs.517307 NM_002462 ENSG00000157601 MX1 IFI-78K|IFI78|MX|MxA MX dynamin like GTPase 1 protein-coding 333.333-6 chr10 24240743 24241231 + 1.33333 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) AluJb|SINE|Alu 31849 NM_019590 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 158.333-52 chr11 24323160 24323298 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -173824 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 175.333-82 chr2 43509958 43510091 + 1.33333 NA intron (NM_001083953, intron 22 of 37) L1MC5a|LINE|L1 85950 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 321.666-7 chr22 27340199 27340474 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 29685 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 408.333-3 chr12 47244642 47245008 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28382 NR_026544 100233209 Hs.657722 NR_026544 ENSG00000247774 PCED1B-AS1 - PCED1B antisense RNA 1 ncRNA 210-106 chr4 90150980 90151270 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) intron (NM_001145065, intron 1 of 10) 23592 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 132-81 chr3 84220341 84220525 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 649142 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 253.999-6 chr2 124781895 124782116 + 1.33333 NA intron (NM_130773, intron 17 of 23) intron (NM_130773, intron 17 of 23) 756718 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 216-33 chr14 71943733 71944003 + 1.33333 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) intron (NM_001370288, intron 1 of 16) 10341 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 297.999-6 chr4 78056473 78056749 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_025074) promoter-TSS (NM_025074) -712 NM_025074 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 321.333-36 chr2 66906774 66907099 + 1.33333 NA intron (NR_110169, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 2500 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 187.666-26 chr8 127556756 127556916 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -74697 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 319.666-15 chr6 122705695 122706058 + 1.33333 NA intron (NM_001270394, intron 6 of 7) intron (NM_001270394, intron 6 of 7) -43325 NM_001319042 2173 Hs.26770 NM_001446 ENSG00000164434 FABP7 B-FABP|BLBP|FABPB|MRG fatty acid binding protein 7 protein-coding 174-40 chr15 91927511 91927705 + 1.33333 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) intron (NR_135775, intron 2 of 10) 73304 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 120.667-140 chr5 85618644 85618786 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -663729 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 235.333-34 chr14 71581150 71581375 + 1.33333 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) FLAM_C|SINE|Alu -5036 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 114.667-172 chr3 77794335 77794453 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 254569 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 188.666-33 chr5 148507773 148507989 + 1.33333 NA intron (NR_104445, intron 6 of 7) intron (NR_104445, intron 6 of 7) 123923 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 279-26 chr5 30430414 30430785 + 1.33333 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 550039 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 316-13 chr14 60032006 60032389 + 1.33333 NA intron (NR_075071, intron 29 of 32) L1M5|LINE|L1 -59714 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 198-17 chr10 61503303 61503577 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23399 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 352.667-7 chr12 50389402 50389900 + 1.33333 NA intron (NM_001145475, intron 1 of 7) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 6958 NM_001145475 121006 Hs.133187 NM_001145475 ENSG00000185958 FAM186A - family with sequence similarity 186 member A protein-coding 136-11 chr11 19346872 19347115 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3731 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 330.666-15 chr3 82508501 82508998 + 1.33333 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 522607 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 202-60 chr16 81745503 81745718 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -33681 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 185.333-93 chr2 105831920 105832083 + 1.33333 NA intron (NM_003581, intron 2 of 4) L1MA5|LINE|L1 -19846 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 241.666-6 chr18 63715683 63715906 + 1.33333 NA intron (NM_001291278, intron 4 of 5) intron (NM_001291278, intron 4 of 5) 12834 NM_001291279 89778 Hs.350958 NM_080475 ENSG00000206072 SERPINB11 EPIPIN|SERPIN11 serpin family B member 11 (gene/pseudogene) protein-coding 204-137 chr3 175231618 175231784 + 1.33333 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) 39395 NR_046713 100874244 Hs.581176 NR_046713 NAALADL2-AS2 - NAALADL2 antisense RNA 2 ncRNA 210.333-120 chr4 91076648 91076849 + 1.33333 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) L1MEc|LINE|L1 841717 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 331.333-8 chr1 190927166 190927482 + 1.33333 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 301174 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 159-53 chr2 37813677 37813891 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 15927 NR_110011 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 317.999-7 chr8 109688953 109689278 + 1.33333 NA intron (NM_001099743, intron 1 of 7) intron (NM_001099743, intron 1 of 7) 2485 NM_001099743 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 205.333-262 chr9 91251798 91252000 + 1.33333 NA intron (NM_001698, intron 6 of 9) intron (NM_001698, intron 6 of 9) 110025 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 199.333-8 chr1 66822280 66822430 + 1.33333 NA intron (NM_024763, intron 16 of 16) intron (NM_024763, intron 16 of 16) -21096 NM_005478 10022 Hs.251380 NM_005478 ENSG00000172410 INSL5 PRO182|UNQ156 insulin like 5 protein-coding 212.666-22 chr12 116027938 116028134 + 1.33333 NA intron (NM_015335, intron 4 of 30) MIRc|SINE|MIR 120618 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 245.333-17 chr11 3942155 3942382 + 1.33333 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) intron (NM_001277962, intron 1 of 12) 86206 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 433.999 chr14 80696964 80697469 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) intron (NM_152446, intron 19 of 24) 244522 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 259.333-46 chr2 71924452 71924758 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 223257 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 225.333-19 chr10 74504980 74505201 + 1.33333 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 24234 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 196.666-95 chr7 26667348 26667573 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001303468, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001303468, exon 13 of 13) 29589 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 156-145 chr8 137188470 137188630 + 1.33333 NA Intergenic L2c|LINE|L2 225038 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 384-4 chr12 8654506 8654935 + 1.33333 NA intron (NR_123734, intron 5 of 9) AluSx1|SINE|Alu 8106 NM_003480 8076 Hs.512842 NM_003480 ENSG00000197614 MFAP5 AAT9|MAGP-2|MAGP2|MFAP-5|MP25 microfibril associated protein 5 protein-coding 232-49 chr2 79778398 79778690 + 1.33333 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) (CATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 88039 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 192-98 chr3 168977433 168977608 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 75575 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 359.333 chr1 94379716 94380100 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -38469 NM_001122674 5825 Hs.700576 NM_002858 ENSG00000117528 ABCD3 ABC43|CBAS5|PMP70|PXMP1|ZWS2 ATP binding cassette subfamily D member 3 protein-coding 335.333-6 chr10 64104747 64105096 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -583031 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 330-7 chr10 26952473 26952803 + 1.33333 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -10637 NR_026795 387644 Hs.529965 NR_026795 ENSG00000283709 FAM238C C10orf51|LINC00202|LINC00202-1|NCRNA00202|bB27G4.1 family with sequence similarity 238 member C ncRNA 353.333-21 chr2 115769923 115770273 + 1.33333 NA intron (NM_001321912, intron 14 of 25) L1MA3|LINE|L1 426283 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 147-117 chr6 12437530 12437762 + 1.33333 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 147285 NM_001955 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 211.666-42 chr5 149984082 149984329 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_000112, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_000112, exon 3 of 3) 16449 NM_001243253 81789 Hs.169333 NM_030953 ENSG00000164296 TIGD6 - tigger transposable element derived 6 protein-coding 310-9 chr10 44888683 44889121 + 1.33333 NA intron (NR_033842, intron 2 of 7) intron (NR_033842, intron 2 of 7) -22414 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 196.666-7 chr1 197475865 197476075 + 1.33333 NA intron (NR_047564, intron 11 of 11) AluSx1|SINE|Alu 207718 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 237.333-73 chr3 8209728 8209976 + 1.33333 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -193545 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 118.666 chr14 52332391 52332524 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 18145 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 479.333-7 chr21 30768326 30768818 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13144 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 299.333-47 chr20 32833994 32834387 + 1.33333 NA intron (NM_012325, intron 3 of 6) intron (NM_012325, intron 3 of 6) 14236 NM_012325 22919 Hs.472437 NM_012325 ENSG00000101367 MAPRE1 EB1 microtubule associated protein RP/EB family member 1 protein-coding 152.666-4 chr12 88001199 88001350 + 1.33333 NA intron (NM_001363616, intron 3 of 11) L1M4b|LINE|L1 28127 NM_001363616 160419 Hs.112930 NM_152589 ENSG00000165805 C12orf50 - chromosome 12 open reading frame 50 protein-coding 186-18 chr10 86776750 86776899 + 1.33333 NA intron (NM_004329, intron 1 of 12) L2|LINE|L2 20185 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 216-122 chr8 101423049 101423308 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 54285 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 206-38 chr11 113613395 113613693 + 1.33333 NA Intergenic MER95|LTR|ERV1 92764 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 215-23 chr15 46274536 46274843 + 1.33333 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 569494 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 206.666-75 chr3 88366203 88366409 + 1.33333 NA intron (NM_001368167, intron 2 of 2) intron (NM_001368167, intron 2 of 2) 27850 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 207.666-11 chr11 28604254 28604412 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -126785 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 180.333-132 chr8 61762815 61763024 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 48131 NR_039680 100616484 NR_039680 ENSG00000264408 MIR4470 mir-4470 microRNA 4470 ncRNA 226.666-34 chr5 96207145 96207368 + 1.33333 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L1PA15|LINE|L1 128118 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 221.667-69 chr5 153268912 153269219 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -221459 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 323.333-29 chr6 146763929 146764265 + 1.33333 NA exon (NM_024694, exon 28 of 36) exon (NM_024694, exon 28 of 36) 39727 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 317.666-4 chr16 7277662 7278146 + 1.33333 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -54941 NM_145892 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 329.666-13 chr8 50056550 50056921 + 1.33333 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) MIR|SINE|MIR -107396 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 210.333-164 chr8 28258763 28259003 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58385 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 192-70 chr2 52268439 52268589 + 1.33333 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) ERVL-E-int|LTR|ERVL -102134 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 394.333-16 chr5 3085198 3085853 + 1.33333 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -92310 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 276.333-16 chr14 69846602 69846916 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -32657 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 329.333-37 chr3 164770860 164771161 + 1.33333 NA intron (NR_126405, intron 1 of 3) L1MA6|LINE|L1 60470 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 238-26 chr15 57231637 57231841 + 1.33333 NA intron (NM_001306220, intron 2 of 11) intron (NM_001306220, intron 2 of 11) 12309 NM_001306219 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 307.666-12 chr5 45709941 45710212 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13696 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 163.333-67 chr12 62963210 62963402 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28156 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 332.666-16 chr2 154122970 154123353 + 1.33333 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) L1MCa|LINE|L1 178767 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 271.333-6 chr10 65901176 65901490 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 329908 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 219.666-53 chrX 70050963 70051206 + 1.33333 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -1146 NM_001002254 158835 Hs.661507 NM_001002254 ENSG00000147160 AWAT2 ARAT|DC4|DGAT2L4|MFAT|WS acyl-CoA wax alcohol acyltransferase 2 protein-coding 198-31 chr11 105662743 105663003 + 1.33333 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 52167 NR_046356 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 326-50 chr8 137185768 137186285 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 227562 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 229.333-50 chr17 49273070 49273262 + 1.33333 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 15288 NR_106745 102465137 NR_106745 ENSG00000273500 MIR6129 hsa-mir-6129 microRNA 6129 ncRNA 174-69 chr4 18674715 18674858 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -652911 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 199.333-123 chr2 53036220 53036496 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -333743 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 257.333-92 chr7 43095436 43095650 + 1.33333 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -17104 NM_015052 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 240.666-30 chr4 72225881 72226194 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 186905 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 262-11 chr11 128398628 128398921 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 123536 NM_005238 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 259.333-58 chr2 204976672 204977005 + 1.33333 NA intron (NM_205863, intron 3 of 21) AluSz|SINE|Alu 431363 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 389.666-8 chr8 139518127 139518593 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 184763 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 269.666-13 chr4 167497066 167497429 + 1.33333 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -262657 NM_001204352 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 248.666-41 chr9 112271463 112271676 + 1.33333 NA intron (NM_001244896, intron 2 of 12) AluSx1|SINE|Alu 61457 NM_001244898 9991 Hs.269988 NM_005156 ENSG00000119314 PTBP3 ROD1 polypyrimidine tract binding protein 3 protein-coding 127.333-93 chr20 48274790 48274939 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -85047 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 335-34 chr9 27086555 27086890 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -22419 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 239.667-19 chr14 58193015 58193381 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -6951 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 206.666-36 chr13 109657650 109657871 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -70514 NR_103846 101409253 Hs.578072 NR_103846 ENSG00000234854 LINC00676 - long intergenic non-protein coding RNA 676 ncRNA 208.667-36 chr12 46103295 46103603 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -112875 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 202.666-36 chr14 52440621 52440849 + 1.33333 NA intron (NM_001160047, intron 18 of 20) intron (NM_001160047, intron 18 of 20) 111770 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 250-44 chr2 195481340 195481719 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -175429 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 255.333-2 chr1 163268566 163268910 + 1.33333 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) MER74B|LTR|ERVL 53053 NR_045630 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 266.333-30 chr2 138438699 138439035 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -62903 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 253.333-104 chr8 13308004 13308208 + 1.33333 NA intron (NM_024767, intron 4 of 4) intron (NM_024767, intron 4 of 4) -31322 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 194.666-67 chr7 117964804 117965043 + 1.33333 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -91482 NM_033427 83992 Hs.592285 NM_033427 ENSG00000077063 CTTNBP2 C7orf8|CORTBP2|Orf4 cortactin binding protein 2 protein-coding 169.333-228 chr6 74379884 74380124 + 1.33333 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 310553 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 204.666-61 chr4 36902321 36902582 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -99328 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 196.333-48 chr15 48054438 48054627 + 1.33333 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -66458 NM_205850 283652 Hs.710240 NM_205850 ENSG00000188467 SLC24A5 JSX|NCKX5|OCA6|SHEP4 solute carrier family 24 member 5 protein-coding 205.667-7 chr1 92681289 92681575 + 1.33333 NA intron (NM_001350198, intron 9 of 19) intron (NM_001350198, intron 9 of 19) 103676 NM_001350197 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 180.666-13 chr17 82041877 82042016 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 4028 NR_159948 113523640 Hs.562696 NR_159947 DCXR-DT - DCXR divergent transcript ncRNA 214.333-153 chr8 78591127 78591309 + 1.33333 NA intron (NM_006823, intron 2 of 3) intron (NM_006823, intron 2 of 3) -32715 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 204-51 chr12 60164345 60164596 + 1.33333 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 475100 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 330.333-9 chr17 83165782 83166174 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -60919 NR_029406 388574 Hs.546918 NR_029406 ENSG00000232938 RPL23AP87 - ribosomal protein L23a pseudogene 87 pseudo 346.333-23 chr3 179827024 179827455 + 1.33333 NA intron (NM_001349408, intron 8 of 14) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -70955 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 197.666-25 chr17 28922598 28922893 + 1.33333 NA intron (NM_001033561, intron 4 of 14) L1ME4b|LINE|L1 -3530 NR_110803 101927018 Hs.665702 NR_110803 ENSG00000265845 LOC101927018 - uncharacterized LOC101927018 ncRNA 192.333-2 chr1 35067691 35067857 + 1.33333 NA intron (NM_001289088, intron 1 of 10) AluSq2|SINE|Alu 7988 NM_001289088 79830 Hs.471243 NM_024772 ENSG00000197056 ZMYM1 MYM zinc finger MYM-type containing 1 protein-coding 215.999-10 chr9 72698119 72698283 + 1.33333 NA intron (NM_138691, intron 7 of 23) intron (NM_138691, intron 7 of 23) 175908 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 149.666-4 chr13 90974586 90974739 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -48065 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 201.333-254 chr7 8266188 8266393 + 1.33333 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) intron (NR_125740, intron 3 of 5) -3678 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 231.666-21 chr3 161468814 161469166 + 1.33333 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -27818 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 234-45 chr2 218021270 218021455 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13572 NR_034176 285180 Hs.570069 NM_198483 ENSG00000188282 RUFY4 ZFYVE31 RUN and FYVE domain containing 4 protein-coding 191-11 chr11 83093437 83093805 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 21555 NR_038903 100506233 Hs.503429 NR_038903 ENSG00000246067 RAB30-DT RAB30-AS1 RAB30 divergent transcript ncRNA 197.333-123 chr2 161062212 161062424 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -74637 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 212-107 chr3 106254898 106255122 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -385609 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 386.333-7 chr21 34907093 34907541 + 1.33333 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) MER112|DNA|hAT-Charlie -18618 NM_001001890 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 206.666-80 chr3 180137308 180137478 + 1.33333 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 -100456 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 210.666-104 chr8 101714635 101714830 + 1.33333 NA intron (NM_001040624, intron 6 of 7) AluYb8|SINE|Alu 76237 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 306-44 chr5 173321944 173322366 + 1.33333 NA intron (NM_003714, intron 3 of 3) intron (NM_003714, intron 3 of 3) 7348 NM_003714 8614 Hs.233160 NM_003714 ENSG00000113739 STC2 STC-2|STCRP stanniocalcin 2 protein-coding 322.666-20 chr5 32394738 32395008 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_030305) promoter-TSS (NR_030305) -398 NR_030305 693164 NR_030305 ENSG00000207956 MIR579 MIRN579|hsa-mir-579 microRNA 579 ncRNA 189.333-179 chr6 135416825 135417031 + 1.33333 NA intron (NM_017651, intron 19 of 27) intron (NM_017651, intron 19 of 27) 80812 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 156-63 chr19 33575043 33575298 + 1.33333 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -46783 NM_001127895 64377 Hs.165724 NM_022467 ENSG00000124302 CHST8 GALNAC4ST1|GalNAc4ST|PSS3 carbohydrate sulfotransferase 8 protein-coding 209.666-16 chr12 50254617 50254874 + 1.33333 NA intron (NM_016357, intron 1 of 10) intron (NM_016357, intron 1 of 10) -20533 NR_031625 100302220 NR_031625 ENSG00000221604 MIR1293 MIRN1293|hsa-mir-1293|mir-1293 microRNA 1293 ncRNA 143.333-32 chr10 49151677 49151919 + 1.33333 NA TTS (NR_038973) TTS (NR_038973) -17778 NM_001164484 170370 Hs.646291 NM_001164484 ENSG00000172538 FAM170B C10orf73 family with sequence similarity 170 member B protein-coding 241.999-8 chr7 99550943 99551130 + 1.33333 NA intron (NM_145111, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 1078 NM_145111 221786 Hs.596587 NM_145111 ENSG00000221909 FAM200A C7orf38 family with sequence similarity 200 member A protein-coding 200-165 chr8 27056497 27056665 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -7618 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 268.999 chr10 124219083 124219451 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -125669 NM_001270764 51363 Hs.287537 NM_014863 ENSG00000182022 CHST15 BRAG|GALNAC4S-6ST carbohydrate sulfotransferase 15 protein-coding 195.666-47 chr9 27932018 27932182 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -358234 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 240-15 chr11 111860479 111860835 + 1.33333 NA intron (NR_147984, intron 4 of 15) intron (NR_147984, intron 4 of 15) 10624 NM_001352415 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 236-84 chr7 82002212 82002477 + 1.33333 NA intron (NM_001366867, intron 18 of 38) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -6833 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 216.999-4 chr17 78357681 78357865 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_003955, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_003955, exon 2 of 2) 2306 NM_003955 9021 Hs.527973 NM_003955 ENSG00000184557 SOCS3 ATOD4|CIS3|Cish3|SOCS-3|SSI-3|SSI3 suppressor of cytokine signaling 3 protein-coding 254-21 chr14 69066627 69066846 + 1.33333 NA intron (NM_003861, intron 7 of 8) intron (NM_003861, intron 7 of 8) 85863 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 220.666-8 chr10 12443579 12443803 + 1.33333 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) AluSx1|SINE|Alu 54709 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 250-61 chr5 53682550 53682831 + 1.33333 NA intron (NR_134474, intron 5 of 5) intron (NR_134474, intron 5 of 5) 122051 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 259-25 chr2 48046185 48046511 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -140555 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 191-6 chr1 246121710 246121951 + 1.33333 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 295582 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 218.666-46 chr2 191778366 191778533 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14391 NR_157850 729254 NR_157850 LOC729254 - hCG2045843 ncRNA 402.666-6 chr16 55371775 55372188 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 47422 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 192-85 chr21 20172303 20172549 + 1.33333 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 86259 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 210.666-32 chr14 62691236 62691395 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 354143 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 245.333-65 chr2 58568209 58568487 + 1.33333 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) intron (NR_033873, intron 1 of 13) 47595 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 201.333-181 chr3 43083162 43083358 + 1.33333 NA intron (NM_032806, intron 1 of 1) intron (NM_032806, intron 1 of 1) 22819 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 231.999-5 chr2 42379043 42379225 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -10177 NM_001319036 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 224-82 chr5 120389792 120390044 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -74360 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 287.666-12 chr8 18051390 18051859 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 31572 NM_001363743 427 Hs.527412 NM_004315 ENSG00000104763 ASAH1 AC|ACDase|ASAH|PHP|PHP32|SMAPME N-acylsphingosine amidohydrolase 1 protein-coding 164-24 chr11 111630345 111630488 + 1.33333 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) L1ME2|LINE|L1 27967 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 172-35 chr12 117186614 117186770 + 1.33333 NA intron (NM_015002, intron 2 of 11) intron (NM_015002, intron 2 of 11) 3778 NM_015002 23014 Hs.740376 NM_015002 ENSG00000135108 FBXO21 FBX21 F-box protein 21 protein-coding 484.333-4 chr8 83784907 83785532 + 1.33333 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 381461 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 216.667-31 chr12 98683566 98683888 + 1.33333 NA intron (NM_001160, intron 15 of 25) intron (NM_001160, intron 15 of 25) 38427 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 274.666-13 chr14 69548358 69548731 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 26327 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 192-125 chr6 100668726 100668978 + 1.33333 NA intron (NM_006828, intron 14 of 41) L1M1|LINE|L1 -205177 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 261.999-9 chr5 53945159 53945503 + 1.33333 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) 6268 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 248.667-64 chr2 182992254 182992594 + 1.33333 NA intron (NM_013436, intron 8 of 30) HAL1ME|LINE|L1 46033 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 297-50 chrX 50976732 50976981 + 1.33333 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 66121 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 233-50 chr4 53781132 53781469 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 85399 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 205-71 chr5 58294270 58294507 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 165698 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 345.999-4 chr3 13106142 13106439 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -32861 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 256.666-7 chr1 244430225 244430474 + 1.33333 NA intron (NM_001365073, intron 4 of 12) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 21560 NM_001126 159 Hs.498313 NM_001126 ENSG00000035687 ADSS ADEH|ADSS 2|ADSS2 adenylosuccinate synthase protein-coding 210-32 chr14 22426212 22426381 + 1.33333 NA intron (NR_148364, intron 1 of 1) intron (NR_148364, intron 1 of 1) 6457 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 186-36 chr14 63694096 63694417 + 1.33333 NA intron (NM_030791, intron 2 of 2).2 AluJb|SINE|Alu 33809 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 151.667-3 chr1 44865757 44865985 + 1.33333 NA intron (NM_020365, intron 10 of 11) intron (NM_020365, intron 10 of 11) -22618 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 222.667-91 chr7 65276071 65276368 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -97580 NM_001287532 168374 Hs.9521 NM_007139 ENSG00000146757 ZNF92 HEL-203|HPF12|HTF12|TF12 zinc finger protein 92 protein-coding 204.666-7 chr1 196011824 196011997 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 76805 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 212.333-103 chr4 41887478 41887717 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4986 NR_104143 101927074 Hs.611425 NR_104143 ENSG00000245870 LINC00682 - long intergenic non-protein coding RNA 682 ncRNA 198.333-133 chr3 169407503 169407874 + 1.33333 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) intron (NM_001366473, intron 1 of 15) -40179 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 246.333-80 chr5 114042666 114042914 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -319280 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 235.333-86 chr4 94382263 94382472 + 1.33333 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -39531 NM_014485 27306 Hs.128433 NM_014485 ENSG00000163106 HPGDS GSTS|GSTS1|GSTS1-1|PGD2|PGDS hematopoietic prostaglandin D synthase protein-coding 152.333-395 chr8 144292475 144292694 + 1.33333 NA intron (NM_005526, intron 1 of 12) intron (NM_005526, intron 1 of 12) 980 NM_005526 3297 Hs.530227 NM_005526 ENSG00000185122 HSF1 HSTF1 heat shock transcription factor 1 protein-coding 412-10 chr5 162833668 162834127 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -603674 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 169.333-243 chr7 44407766 44407915 + 1.33333 NA intron (NM_015332, intron 3 of 5) HAL1|LINE|L1 -82209 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 442.666-2 chr4 14404178 14404577 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 292409 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 232.666-8 chr12 4200603 4200797 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -73062 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 441-7 chr8 40578002 40578609 + 1.33333 NA intron (NM_024645, intron 6 of 6) L1M5|LINE|L1 -234942 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 229.666-21 chr3 108045329 108045514 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001777, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001777, exon 11 of 11) 45667 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 245-15 chr13 90481852 90482161 + 1.33333 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -11282 NR_120414 101927224 Hs.385801 NR_120414 LINC01049 - long intergenic non-protein coding RNA 1049 ncRNA 210-62 chr2 55159895 55160194 + 1.33333 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -22213 NM_001321904 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 326-43 chr7 39659018 39659389 + 1.33333 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 35631 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 214.333-139 chr7 17391038 17391216 + 1.33333 NA intron (NR_110015, intron 1 of 2) intron (NR_110015, intron 1 of 2) 16210 NR_110014 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 370.333-24 chr6 70900095 70900698 + 1.33333 NA intron (NM_080742, intron 1 of 3) intron (NM_080742, intron 1 of 3) 56664 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 276.333-17 chr14 71927400 71927623 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -4660 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 202.333-140 chr5 29702621 29702849 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -177825 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 238.666-19 chr14 50154240 50154523 + 1.33333 NA intron (NM_006939, intron 12 of 22) L1ME2z|LINE|L1 -37809 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 200-36 chr11 113335317 113335482 + 1.33333 NA intron (NM_001318533, intron 8 of 21) intron (NM_001318533, intron 8 of 21) 20816 NM_001352038 54970 Hs.288772 NM_017868 ENSG00000149292 TTC12 TPARM tetratricopeptide repeat domain 12 protein-coding 287.999-9 chr7 7881505 7881888 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 87056 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 249.666-36 chr6 122852909 122853203 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 63798 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 216.666-28 chr14 67641410 67641654 + 1.33333 NA intron (NM_001172, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 21612 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 199.667-67 chr2 3025174 3025479 + 1.33333 NA intron (NR_110228, intron 3 of 6) intron (NR_110228, intron 3 of 6) 100700 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 245.333-75 chr3 41449911 41450260 + 1.33333 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) intron (NR_136342, intron 32 of 34) 250580 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 196-85 chr2 40132660 40132945 + 1.33333 NA intron (NM_001351483, intron 8 of 8) intron (NM_001351483, intron 8 of 8) 215168 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 281.333-65 chr7 153676800 153677233 + 1.33333 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -71117 NM_001364499 1804 Hs.490684 NM_001936 ENSG00000130226 DPP6 DPL1|DPPX|MRD33|VF2 dipeptidyl peptidase like 6 protein-coding 245.999-3 chr11 94131880 94132134 + 1.33333 NA intron (NM_015368, intron 1 of 4) intron (NM_015368, intron 1 of 4) 3166 NM_015368 24145 Hs.591976 NM_015368 ENSG00000110218 PANX1 MRS1|PX1|UNQ2529 pannexin 1 protein-coding 184.667-117 chr6 122219274 122219520 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -180154 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 206.667-46 chr16 19574569 19574847 + 1.33333 NA intron (NM_001300743, intron 4 of 27) MER20|DNA|hAT-Charlie 19005 NR_158161 57020 Hs.654964 NM_020314 ENSG00000103544 VPS35L C16orf62 VPS35 endosomal protein sorting factor like protein-coding 241.666-13 chr3 42425162 42425512 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14727 NM_001304386 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 206.333-26 chr11 63149553 63149730 + 1.33333 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -5420 NM_001136506 283238 Hs.375139 NM_173586 ENSG00000197658 SLC22A24 NET46 solute carrier family 22 member 24 protein-coding 189.333-143 chr4 53195361 53195538 + 1.33333 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) intron (NM_152540, intron 4 of 8) 170612 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 222-10 chr10 29201554 29201741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -87423 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 297-44 chr8 131845468 131845873 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -58423 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 158-117 chr6 41147571 41147740 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 6694 NM_001271808 340205 Hs.117331 NM_178174 ENSG00000161911 TREML1 GLTL1825|PRO3438|TLT-1|TLT1|dJ238O23.3 triggering receptor expressed on myeloid cells like 1 protein-coding 262.667-7 chr1 206893887 206894231 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -3384 NM_006850 11009 Hs.58831 NM_006850 ENSG00000162892 IL24 C49A|FISP|IL10B|MDA7|MOB5|ST16 interleukin 24 protein-coding 216.667-70 chr3 69206529 69206846 + 1.33333 NA intron (NM_015123, intron 11 of 22) intron (NM_015123, intron 11 of 22) -84092 NM_198271 56203 Hs.350621 NM_198271 ENSG00000163380 LMOD3 NEM10 leiomodin 3 protein-coding 204-171 chr5 163400131 163400302 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37355 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 168.333-202 chr7 119674675 119674906 + 1.33333 NA intron (NR_131960, intron 4 of 4) intron (NR_131960, intron 4 of 4) 232585 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 189-85 chr7 82268875 82269092 + 1.33333 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 174794 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 178.333-178 chr9 68934652 68934826 + 1.33333 NA intron (NM_003558, intron 12 of 15) intron (NM_003558, intron 12 of 15) 41102 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 332-34 chr8 120957893 120958451 + 1.33333 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -146126 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 194-126 chr6 162219069 162219244 + 1.33333 NA intron (NM_004562, intron 3 of 11) AluJb|SINE|Alu -507976 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 239.999-6 chr3 79840524 79840721 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -72624 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 264.333-32 chr18 1054392 1054599 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -126502 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 327.333-42 chr7 1785553 1785906 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -43419 NR_120509 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 196-146 chr5 62602148 62602384 + 1.33333 NA intron (NM_016338, intron 29 of 29) intron (NM_016338, intron 29 of 29) 23447 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 226.666-25 chr3 29760764 29760972 + 1.33333 NA intron (NM_001003792, intron 5 of 13) intron (NM_001003792, intron 5 of 13) 173288 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 167-13 chr10 61717350 61717587 + 1.33333 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) intron (NM_173554, intron 4 of 6) 54507 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 185.333-117 chr3 17235656 17235838 + 1.33333 NA intron (NM_001349086, intron 15 of 20) intron (NM_001349086, intron 15 of 20) 302551 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 213.333-35 chr11 103524908 103525184 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -324860 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 227.999-2 chr12 15439105 15439323 + 1.33333 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) L1PA16|LINE|L1 -107397 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 154.333-366 chr9 19391479 19391636 + 1.33333 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -11321 NM_001010 6194 Hs.408073 NM_001010 ENSG00000137154 RPS6 S6 ribosomal protein S6 protein-coding 172.666-11 chr18 7298284 7298470 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 67273 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 214-118 chr6 135082894 135083187 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -28218 NM_006620 10767 Hs.378532 NM_006620 ENSG00000112339 HBS1L EF-1a|ERFS|HBS1|HSPC276|eRF3c HBS1 like translational GTPase protein-coding 213.333-33 chr11 88160621 88160866 + 1.33333 NA intron (NM_022337, intron 1 of 2) L1PA16|LINE|L1 14700 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 208.333-112 chr4 164629172 164629380 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -124855 NM_001352885 100505989 Hs.328236 NM_001352885 ENSG00000248771 SMIM31 LINC01207 small integral membrane protein 31 protein-coding 211.666-33 chr3 56968362 56968723 + 1.33333 NA intron (NM_001128615, intron 2 of 12) AluJo|SINE|Alu 28502 NR_046572 100874200 Hs.549631 NR_046572 ENSG00000240198 ARHGEF3-AS1 - ARHGEF3 antisense RNA 1 ncRNA 212.666-87 chr8 22708233 22708491 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -14882 NM_004430 1960 Hs.534313 NM_004430 ENSG00000179388 EGR3 EGR-3|PILOT early growth response 3 protein-coding 180-34 chr14 45091417 45091584 + 1.33333 NA intron (NM_017922, intron 1 of 13) intron (NM_017922, intron 1 of 13) 7384 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 296.666-18 chr21 26901441 26901911 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -52285 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 199.333-103 chr17 71954930 71955142 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 70943 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 275.666-18 chr8 124283314 124283640 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36079 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 270.667-39 chr5 55403974 55404423 + 1.33333 NA intron (NM_015360, intron 21 of 26) intron (NM_015360, intron 21 of 26) 96209 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 247.333-87 chr8 107053068 107053288 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -282934 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 229.333-69 chr2 200075982 200076265 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -120632 NR_109905 129450 Hs.204619 NM_152382 ENSG00000162971 TYW5 C2orf60|hTYW5 tRNA-yW synthesizing protein 5 protein-coding 330.333-19 chr7 25412503 25412892 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -184211 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 407.666-6 chr17 72177264 72177658 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 56441 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 262.333-43 chr2 50668247 50668478 + 1.33333 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 27900 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 207.333-119 chr17 69901480 69901724 + 1.33333 NA intron (NR_109971, intron 5 of 5) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -60105 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 173.333-54 chr14 32102423 32102567 + 1.33333 NA intron (NM_001173, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu 25191 NM_001030055 394 Hs.592313 NM_001173 ENSG00000100852 ARHGAP5 GFI2|RhoGAP5|p190-B|p190BRhoGAP Rho GTPase activating protein 5 protein-coding 287-2 chr1 168157830 168158383 + 1.33333 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -20439 NM_001267609 23432 Hs.271809 NM_007369 ENSG00000143147 GPR161 RE2 G protein-coupled receptor 161 protein-coding 440-3 chr12 65383654 65384254 + 1.33333 NA intron (NM_001031679, intron 5 of 6) AluSx|SINE|Alu 104967 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 211.333-124 chr2 144808210 144808452 + 1.33333 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) L1MC5a|LINE|L1 140364 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 144.666 chr1 5037031 5037168 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 382490 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 204.666-49 chr21 33919780 33919983 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4077 NM_001697 539 Hs.409140 NM_001697 ENSG00000241837 ATP5PO ATP5O|ATPO|HMC08D05|OSCP ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP protein-coding 347.333-16 chr21 46655558 46655923 + 1.33333 NA TTS (NM_001242865) TTS (NM_001242865) 20066 NM_206962 3275 Hs.154163 NM_001535 ENSG00000160310 PRMT2 HRMT1L1 protein arginine methyltransferase 2 protein-coding 347.333-12 chr2 83994813 83995147 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -295702 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 289.333-58 chr6 134847358 134847794 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 102525 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 180.667-15 chr10 63688679 63688879 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -166889 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 326.333-2 chr1 168048135 168048484 + 1.33333 NA intron (NM_001017977, intron 14 of 18) intron (NM_001017977, intron 14 of 18) 49649 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 197.666-66 chr8 116640979 116641189 + 1.33333 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -11016 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 387-2 chr10 93942228 93942636 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 19483 NR_002319 266971 Hs.149255 NR_002319 ENSG00000180764 PIPSL PIP5K1L1|PIP5K1P3|PSMD4P2|bA429H9.1 PIP5K1A and PSMD4 like (pseudogene) pseudo 191.333-5 chr1 73680877 73681095 + 1.33333 NA intron (NR_146300, intron 1 of 3) intron (NR_146300, intron 1 of 3) 6307 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 190.333-96 chr3 151437747 151438011 + 1.33333 NA exon (NM_001178145, exon 2 of 2) exon (NM_001178145, exon 2 of 2) 2901 NM_001178146 285313 Hs.58561 NM_178822 ENSG00000152580 IGSF10 CMF608 immunoglobulin superfamily member 10 protein-coding 219.333-140 chr5 23353731 23354006 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -153741 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 210.666-42 chr16 9171515 9171693 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 79960 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 367.333-11 chr20 37977883 37978271 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 55379 NM_014657 9675 Hs.655481 NM_014657 ENSG00000101407 TTI1 KIAA0406|smg-10 TELO2 interacting protein 1 protein-coding 267.666-3 chr11 59581707 59582130 + 1.33333 NA intron (NM_002556, intron 9 of 13) MIRc|SINE|MIR 13240 NR_036120 100422880 NR_036120 ENSG00000264559 MIR3162 mir-3162 microRNA 3162 ncRNA 226.333-113 chr8 129374997 129375255 + 1.33333 NA intron (NR_130918, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 109016 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 181-30 chr16 57320441 57320713 + 1.33333 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -35905 NM_015993 51090 Hs.632215 NM_015993 ENSG00000102934 PLLP PMLP|TM4SF11 plasmolipin protein-coding 204-172 chr5 177139709 177139918 + 1.33333 NA intron (NM_172349, intron 3 of 23) AluJr|SINE|Alu 5584 NM_001365684 64324 Hs.106861 NM_022455 ENSG00000165671 NSD1 ARA267|KMT3B|SOTOS|SOTOS1|STO nuclear receptor binding SET domain protein 1 protein-coding 198.667-4 chr1 100989383 100989616 + 1.33333 NA TTS (NM_001077395) TTS (NM_001077395) 36285 NM_001077395 51611 Hs.440776 NM_015958 ENSG00000117543 DPH5 AD-018|CGI-30|HSPC143|NPD015 diphthamide biosynthesis 5 protein-coding 274.333-27 chr16 59390391 59390821 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 364585 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 221.333-148 chr8 132729258 132729473 + 1.33333 NA intron (NM_144649, intron 5 of 9) UCON51|LTR?|LTR? 31217 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 257.666-20 chr6 62927594 62927905 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 392228 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 179.333-82 chr18 4486147 4486358 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30945 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 329.333-58 chr7 141333028 141333431 + 1.33333 NA intron (NM_001195278, intron 2 of 3) intron (NM_001195278, intron 2 of 3) -218181 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 269.666-8 chr15 41949160 41949416 + 1.33333 NA intron (NM_139265, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 23269 NM_139265 30844 Hs.143703 NM_139265 ENSG00000103966 EHD4 PAST4 EH domain containing 4 protein-coding 232-2 chr1 47601192 47601530 + 1.33333 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -164044 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 288.333-20 chr2 68560624 68561026 + 1.33333 NA intron (NM_173545, intron 8 of 9) intron (NM_173545, intron 8 of 9) -82763 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 177.666-31 chr7 81228311 81228477 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -306005 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 338.667-24 chr4 98075476 98075893 + 1.33333 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) L1MEg|LINE|L1 67792 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 298-28 chr14 96506762 96507239 + 1.33333 NA intron (NM_001293628, intron 1 of 21) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 4135 NM_001293628 10914 Hs.253726 NM_032632 ENSG00000090060 PAPOLA PAP|PAP-alpha poly(A) polymerase alpha protein-coding 235.333-45 chr17 70083538 70083864 + 1.33333 NA intron (NM_001270422, intron 1 of 5) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 8476 NM_001270422 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 199.333-88 chr15 75390363 75390572 + 1.33333 NA intron (NM_015477, intron 15 of 20) intron (NM_015477, intron 15 of 20) -21840 NM_001256494 4123 Hs.26232 NM_006715 ENSG00000140400 MAN2C1 MAN6A8|MANA|MANA1 mannosidase alpha class 2C member 1 protein-coding 239.666-5 chr12 50506524 50506777 + 1.33333 NA intron (NM_173602, intron 1 of 37) intron (NM_173602, intron 1 of 37) 1665 NM_173602 57609 Hs.505516 NM_020849 ENSG00000066084 DIP2B - disco interacting protein 2 homolog B protein-coding 225.666-17 chr22 46932277 46932515 + 1.33333 NA intron (NR_104292, intron 10 of 13) intron (NR_104292, intron 10 of 13) -16354 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 261.333-55 chr2 225547978 225548293 + 1.33333 NA intron (NM_001371273, intron 4 of 7) intron (NM_001371273, intron 4 of 7) 147249 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 270.667-38 chr5 21114012 21114372 + 1.33333 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -345288 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 374.333-6 chr17 61413011 61413404 + 1.33333 NA TTS (NR_160788) TTS (NR_160788) 1456 NR_160788 388407 Hs.434459 NM_203425 C17orf82 - chromosome 17 open reading frame 82 ncRNA 237-63 chr6 22500548 22500937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -68824 NM_138574 154150 Hs.629246 NM_138574 ENSG00000112273 HDGFL1 HRP-1|Hdgfrp1|PWWP1|dJ309H15.1 HDGF like 1 protein-coding 299.999-7 chr4 122976051 122976326 + 1.33333 NA intron (NM_001317799, intron 9 of 10) intron (NM_001317799, intron 9 of 10) 53110 NM_145207 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 163.333-216 chr5 23745595 23745782 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -205660 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 257-75 chr8 118919611 118919841 + 1.33333 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 32159 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 136-2 chr1 99938170 99938316 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -31753 NM_001271684 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 198-162 chr6 120334624 120334803 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 319534 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 184.666-39 chr8 76963437 76963659 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 3302 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 236.333-58 chr3 56354185 56354436 + 1.33333 NA intron (NR_132749, intron 2 of 17) intron (NR_132749, intron 2 of 17) 114157 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 228.666-2 chr1 40892014 40892273 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -29780 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 318.666-18 chr5 98976563 98976955 + 1.33333 NA intron (NR_151718, intron 1 of 3) intron (NR_151718, intron 1 of 3) -47045 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 192.333-49 chr14 50134510 50134682 + 1.33333 NA intron (NM_006939, intron 18 of 22) intron (NM_006939, intron 18 of 22) -18024 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 172-116 chrX 152222134 152222366 + 1.33333 NA intron (NM_000808, intron 6 of 9) L1ME3A|LINE|L1 -83672 NM_001011543 4109 Hs.18048 NM_021048 ENSG00000124260 MAGEA10 CT1.10|MAGE10 MAGE family member A10 protein-coding 326-19 chr18 41420171 41420499 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 100342 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 374.666-3 chr12 107410077 107410468 + 1.33333 NA intron (NM_001347944, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 89684 NM_001347944 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 267-52 chr5 55352833 55353272 + 1.33333 NA intron (NM_015360, intron 13 of 26) intron (NM_015360, intron 13 of 26) 45063 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 269.333-38 chr19 5574138 5574633 + 1.33333 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu -6351 NR_027064 257000 Hs.515575 NM_153375 ENSG00000223573 TINCR LINC00036|NCRNA00036|PLAC2|onco-lncRNA-16 TINCR ubiquitin domain containing ncRNA 216-84 chr3 118530961 118531279 + 1.33333 NA intron (NR_135547, intron 3 of 3) MER41B|LTR|ERV1 -110648 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 185-55 chr5 34898326 34898584 + 1.33333 NA intron (NM_001317949, intron 10 of 10) intron (NM_001317949, intron 10 of 10) 17049 NM_002853 5810 Hs.38114 NM_002853 ENSG00000113456 RAD1 HRAD1|REC1 RAD1 checkpoint DNA exonuclease protein-coding 327-14 chr2 159967337 159967631 + 1.33333 NA intron (NM_001007267, intron 20 of 26) intron (NM_001007267, intron 20 of 26) -62728 NM_002349 4065 Hs.153563 NM_002349 ENSG00000054219 LY75 CD205|CLEC13B|DEC-205|GP200-MR6|LY-75 lymphocyte antigen 75 protein-coding 216.666-48 chr3 75196925 75197130 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -17449 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 320-27 chr2 193883421 193883856 + 1.33333 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -460631 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 375.333-9 chr18 9032875 9033235 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -69644 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 410.666-5 chr16 10134646 10135124 + 1.33333 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 47182 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 259.333-13 chr10 35279601 35279858 + 1.33333 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) MER76|LTR|ERVL 32704 NM_181698 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 483-5 chr6 48825949 48826681 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 636938 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 206.333-48 chr14 20226909 20227141 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -1956 NM_001348273 390441 NM_001348273 ENSG00000258806 OR11H7 OR11H7P olfactory receptor family 11 subfamily H member 7 (gene/pseudogene) protein-coding 203-15 chr10 121342798 121342954 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 188438 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 206.666-92 chr4 173349746 173349951 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -15490 NM_002129 3148 Hs.434953 NM_002129 ENSG00000164104 HMGB2 HMG2 high mobility group box 2 protein-coding 287.999-8 chr5 81700499 81700762 + 1.33333 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 50623 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 174-76 chr5 21102773 21102952 + 1.33333 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -356618 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 162.333-169 chr3 134687383 134687555 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -36447 NM_001366277 339855 Hs.146730 NM_178554 ENSG00000174611 KY MFM7 kyphoscoliosis peptidase protein-coding 205-55 chr21 31549479 31549700 + 1.33333 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) L1MB7|LINE|L1 9498 NM_003253 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 142-90 chr3 71575167 71575332 + 1.33333 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) intron (NR_146142, intron 2 of 19) 8479 NR_146143 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 334-35 chr7 3449774 3450155 + 1.33333 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L2c|LINE|L2 148712 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 180-116 chr8 140857454 140857702 + 1.33333 NA intron (NR_148037, intron 6 of 34) intron (NR_148037, intron 6 of 34) -124925 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 383.666 chr1 81793572 81793978 + 1.33333 NA intron (NM_001366008, intron 4 of 26) intron (NM_001366008, intron 4 of 26) -6601 NM_001366005 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 207-16 chr10 100257850 100258100 + 1.33333 NA intron (NM_001303406, intron 1 of 10) AluSq2|SINE|Alu 9663 NM_001303407 55280 Hs.215502 NM_018294 ENSG00000095485 CWF19L1 C19L1|SCAR17|hDrn1 CWF19 like cell cycle control factor 1 protein-coding 380.666-16 chr9 94805284 94805824 + 1.33333 NA intron (NM_032823, intron 5 of 14) intron (NM_032823, intron 5 of 14) -4408 NR_031755 100313780 NR_031755 ENSG00000252153 MIR2278 mir-2278 microRNA 2278 ncRNA 333.333-17 chr12 3403456 3403882 + 1.33333 NA intron (NM_001256536, intron 1 of 9) AluSz|SINE|Alu 22320 NM_001256536 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 345.333-41 chrX 9629875 9630201 + 1.33333 NA intron (NM_001139468, intron 3 of 17) intron (NM_001139468, intron 3 of 17) 135809 NM_000273 4935 Hs.74124 NM_000273 ENSG00000101850 GPR143 NYS6|OA1 G protein-coupled receptor 143 protein-coding 198.333-107 chr2 231224194 231224435 + 1.33333 NA intron (NM_001352757, intron 6 of 19) AluJb|SINE|Alu 25683 NM_001352759 80210 Hs.162411 NM_025139 ENSG00000135931 ARMC9 ARM|JBTS30|KU-MEL-1|NS21 armadillo repeat containing 9 protein-coding 269-45 chr6 67663513 67664022 + 1.33333 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -391584 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 358.333-8 chr11 40769536 40769847 + 1.33333 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) L1MA3|LINE|L1 -476561 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 250.333-25 chr16 22913813 22914086 + 1.33333 NA intron (NM_006043, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 99787 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 202.333-179 chr8 115808277 115808495 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -139411 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 207.333-285 chrX 51965682 51965989 + 1.33333 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 72212 NM_006986 9500 Hs.5258 NM_006986 ENSG00000179222 MAGED1 DLXIN-1|NRAGE MAGE family member D1 protein-coding 206.333-148 chr7 42357080 42357319 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -119990 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 326.333-28 chr6 129280796 129281112 + 1.33333 NA intron (NM_000426, intron 18 of 64) intron (NM_000426, intron 18 of 64) 397813 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 401-13 chr5 37610865 37611607 + 1.33333 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 223586 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 396.999-3 chr2 41935670 41936017 + 1.33333 NA non-coding (NR_161189, exon 4 of 4) non-coding (NR_161189, exon 4 of 4) -2120 NR_110262 101929723 Hs.369330 NR_110262 ENSG00000234362 LINC01914 - long intergenic non-protein coding RNA 1914 ncRNA 188.667-131 chr6 128576570 128576797 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -56084 NM_002844 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 298.667-21 chr5 97761599 97761998 + 1.33333 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -78960 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 184.333-20 chr11 90721017 90721229 + 1.33333 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) L1MC1|LINE|L1 148079 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 240.667-63 chr5 12366126 12366465 + 1.33333 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -208562 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 217.333-52 chr16 61280281 61280454 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -224601 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 214-30 chr12 53671967 53672265 + 1.33333 NA intron (NR_163135, intron 2 of 4) intron (NR_163135, intron 2 of 4) 3303 NM_001330269 517 Hs.524464 NM_005176 ENSG00000135390 ATP5MC2 ATP5A|ATP5G2 ATP synthase membrane subunit c locus 2 protein-coding 128-29 chr16 80110595 80110761 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 315429 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 140.667-98 chr17 69570100 69570253 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -23811 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 273.333-46 chr3 101404033 101404261 + 1.33333 NA intron (NM_001282801, intron 4 of 22) L1PREC2|LINE|L1 -83572 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 190-20 chr11 97027873 97028060 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 519541 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 195.666-38 chr5 172131930 172132087 + 1.33333 NA intron (NM_005990, intron 2 of 18) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 56216 NM_005990 6793 Hs.744005 NM_005990 ENSG00000072786 STK10 LOK|PRO2729 serine/threonine kinase 10 protein-coding 181.333-55 chr16 76636462 76636787 + 1.33333 NA intron (NR_110934, intron 2 of 3) intron (NR_110934, intron 2 of 3) 1626 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 325.999-3 chr2 103798832 103799236 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 609298 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 371.666-6 chr2 55246029 55246674 + 1.33333 NA exon (NM_001321002, exon 10 of 16) exon (NM_001321002, exon 10 of 16) 12187 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 138-105 chr7 16228065 16228219 + 1.33333 NA intron (NM_001101426, intron 8 of 9) L1MA8|LINE|L1 17656 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 156.667-193 chr2 171041737 171041957 + 1.33333 NA intron (NM_001136555, intron 9 of 18) intron (NM_001136555, intron 9 of 18) 25126 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 211.333-240 chr8 89792903 89793161 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 35216 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 214-2 chr1 43161327 43161597 + 1.33333 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 10250 NR_106791 102465439 NR_106791 ENSG00000284410 MIR6733 hsa-mir-6733 microRNA 6733 ncRNA 191.333-39 chr11 107661102 107661384 + 1.33333 NA intron (NM_001308018, intron 12 of 12) intron (NM_001308018, intron 12 of 12) 50813 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 166.333-53 chr12 17827394 17827649 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 154222 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 184.666-10 chr13 46488481 46488651 + 1.33333 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -21790 NR_120426 101929344 Hs.491939 NR_120426 LINC01198 - long intergenic non-protein coding RNA 1198 ncRNA 160.666-18 chr7 22323309 22323480 + 1.33333 NA intron (NM_012294, intron 1 of 25) intron (NM_012294, intron 1 of 25) 33760 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 208.666-88 chr5 99066782 99066950 + 1.33333 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -137152 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 259.333-12 chr10 14609632 14609971 + 1.33333 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) intron (NM_001282695, intron 2 of 5) -5400 NM_001282697 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 172.333-31 chr11 60082561 60082721 + 1.33333 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -6023 NM_001256916 2206 Hs.386748 NM_000139 ENSG00000149534 MS4A2 APY|ATOPY|FCER1B|FCERI|IGEL|IGER|IGHER|MS4A1 membrane spanning 4-domains A2 protein-coding 417.999-2 chr10 71380008 71380400 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -16716 NM_001171931 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 205-68 chr5 7213446 7213633 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 55815 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 212-46 chr13 21099572 21099743 + 1.33333 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -38071 NM_014572 26524 Hs.78960 NM_014572 ENSG00000150457 LATS2 KPM large tumor suppressor kinase 2 protein-coding 192.333-124 chr4 62601982 62602236 + 1.33333 NA Intergenic (CTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -440344 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 207.333-145 chr2 194976803 194976986 + 1.33333 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 246299 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 218.667-86 chr6 13902988 13903297 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21304 NM_001165034 221687 Hs.111164 NM_152737 ENSG00000180537 RNF182 - ring finger protein 182 protein-coding 252.333-10 chr10 93175170 93175534 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 101459 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 231.333-15 chr10 44740224 44740419 + 1.33333 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -170995 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 318-6 chr10 30081907 30082335 + 1.33333 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) intron (NM_001350022, intron 1 of 4) -22535 NM_001350001 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 218-106 chr7 126348534 126348789 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 709523 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 202.666-47 chr16 53922533 53922719 + 1.33333 NA intron (NM_001363894, intron 8 of 9) intron (NM_001363894, intron 8 of 9) -116767 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 337.333-25 chr2 219290551 219291103 + 1.33333 NA exon (NM_002846, exon 21 of 23) exon (NM_002846, exon 21 of 23) 3373 NR_029688 406944 NR_029688 ENSG00000207647 MIR153-1 MIRN153-1|mir-153-1 microRNA 153-1 ncRNA 182-20 chr12 3023287 3023551 + 1.33333 NA intron (NM_201443, intron 8 of 10) intron (NM_201443, intron 8 of 10) -53936 NM_001168320 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 272.666-21 chr5 67525473 67525807 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 121149 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 199.333-228 chr5 81579611 81579849 + 1.33333 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) intron (NM_012446, intron 4 of 16) 171523 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 316.667-23 chr4 11601291 11601717 + 1.33333 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 167964 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 242.666-42 chr9 28534928 28535252 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) L1ME4a|LINE|L1 184215 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 218-32 chr16 10349429 10349614 + 1.33333 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -36540 NR_045815 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 200.333-65 chr2 44394189 44394565 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 32430 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 146-135 chr8 68534992 68535191 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001195639, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001195639, exon 7 of 7) -203600 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 353.999 chr2 185170452 185170796 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -3552 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 219.666-15 chr15 33534730 33534970 + 1.33333 NA intron (NM_001243996, intron 5 of 102) L3|LINE|CR1 223883 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 198.333-143 chr4 70753647 70753801 + 1.33333 NA intron (NM_001291994, intron 2 of 13) intron (NM_001291994, intron 2 of 13) 19314 NM_001345840 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 207.333-205 chr4 110973702 110973937 + 1.33333 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -113172 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 192.667-55 chr13 67951020 67951256 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 578751 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 214-80 chr20 48382917 48383144 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 23119 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 245-2 chr1 40346058 40346334 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -27531 NM_022733 64744 Hs.15200 NM_022733 ENSG00000084070 SMAP2 SMAP1L small ArfGAP2 protein-coding 236.666-11 chr13 89387199 89387397 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 113211 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 186.333-136 chr6 38239829 38239994 + 1.33333 NA intron (NM_052893, intron 10 of 11) intron (NM_052893, intron 10 of 11) -241685 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 311.333-32 chr21 28658928 28659208 + 1.33333 NA Intergenic L3|LINE|CR1 119750 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 271.333-69 chr8 104657730 104658089 + 1.33333 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -68885 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 226-80 chr6 73923601 73923855 + 1.33333 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -145723 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 226.333-68 chr2 232267665 232267967 + 1.33333 NA intron (NR_046477, intron 12 of 18) intron (NR_046477, intron 12 of 18) 95163 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 323-19 chr22 28095702 28096290 + 1.33333 NA intron (NM_001145418, intron 11 of 22) intron (NM_001145418, intron 11 of 22) -175384 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 182-36 chr16 9614563 9614774 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -159163 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 200.333-147 chr8 34627244 34627403 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -156598 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 223.333-59 chr18 64497294 64497642 + 1.33333 NA Intergenic L2|LINE|L2 -237413 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 141.333-226 chr7 90436081 90436279 + 1.33333 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 32719 NM_001185073 9069 Hs.731917 NM_012129 ENSG00000157224 CLDN12 - claudin 12 protein-coding 206.666-91 chr4 106412001 106412256 + 1.33333 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -21496 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 327.333-15 chr15 81086002 81086339 + 1.33333 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -48100 NM_001353365 161502 Hs.130979 NM_173528 ENSG00000156206 CFAP161 C15orf26 cilia and flagella associated protein 161 protein-coding 204-147 chr4 41282026 41282324 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 25247 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 271.333-8 chr10 100072148 100072564 + 1.33333 NA intron (NM_001308, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 9513 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 257.333-34 chr14 59383492 59383817 + 1.33333 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 81726 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 113.667-59 chr14 48923283 48923482 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 662998 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 165.333-186 chr4 66061262 66061484 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -215451 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 307.333-70 chr6 166156929 166157241 + 1.33333 NA TTS (NM_003181) TTS (NM_003181) 10766 NM_001366285 6862 Hs.389457 NM_003181 ENSG00000164458 TBXT SAVA|T|TFT T-box transcription factor T protein-coding 376-11 chr3 27052225 27052705 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 164058 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 285.333-9 chr10 7803610 7804031 + 1.33333 NA intron (NM_005174, intron 8 of 8) intron (NM_005174, intron 8 of 8) -14685 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 143.333-95 chr14 83510221 83510372 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 867664 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 232.666-22 chr2 37338108 37338397 + 1.33333 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 -6378 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 203.333-33 chr10 75974909 75975117 + 1.33333 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 192252 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 357.666-3 chr12 129511400 129511793 + 1.33333 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) L1ME1|LINE|L1 302995 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 138.666-3 chr12 70951169 70951324 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -30508 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 196-68 chr17 49815050 49815335 + 1.33333 NA intron (NM_007067, intron 7 of 14) intron (NM_007067, intron 7 of 14) 26511 NM_001199157 11143 Hs.21907 NM_007067 ENSG00000136504 KAT7 HBO1|HBOA|MYST2|ZC2HC7 lysine acetyltransferase 7 protein-coding 224.666-37 chr8 123648223 123648514 + 1.33333 NA intron (NM_001081675, intron 2 of 3) intron (NM_001081675, intron 2 of 3) 5433 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 183-81 chr4 92314995 92315252 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 10724 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 201.333-205 chr4 37018358 37018529 + 1.33333 NA non-coding (NR_134669, exon 2 of 2) non-coding (NR_134669, exon 2 of 2) 16664 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 309.666-6 chr17 59758030 59758274 + 1.33333 NA intron (NM_001329401, intron 4 of 9) intron (NM_001329401, intron 4 of 9) 50498 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 181.333-26 chr11 74107497 74107661 + 1.33333 NA intron (NM_001286577, intron 12 of 32) intron (NM_001286577, intron 12 of 32) 63423 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 228.333-19 chr12 32666036 32666212 + 1.33333 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 -13076 NM_012063 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 143-92 chr5 28236462 28236625 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 51122 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 251.666-22 chr4 53694840 53695162 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_125918) promoter-TSS (NR_125918) -900 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 297.999-5 chr2 16444661 16444942 + 1.33333 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 221033 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 131.333-17 chr1 209963523 209963637 + 1.33333 NA intron (NM_001256006, intron 3 of 8) intron (NM_001256006, intron 3 of 8) 25363 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 344-6 chr11 6774061 6774402 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -5274 NM_001004490 338755 Hs.534614 NM_001004490 ENSG00000188124 OR2AG2 OR11-76|OR2AG2P olfactory receptor family 2 subfamily AG member 2 protein-coding 143.333-218 chr5 23409895 23410075 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -97624 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 234.666-32 chr3 182449315 182449555 + 1.33333 NA intron (NR_040105, intron 2 of 3) intron (NR_040105, intron 2 of 3) 36927 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 421.667-6 chr5 21085427 21086018 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -373758 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 192.666-46 chr4 45577710 45577862 + 1.33333 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 546268 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 227.666-18 chr2 237842091 237842408 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_001080504, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001080504, exon 16 of 16) -17374 NM_001308353 10267 Hs.471783 NM_005855 ENSG00000132329 RAMP1 - receptor activity modifying protein 1 protein-coding 259.667-50 chr4 31991062 31991526 + 1.33333 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -6085 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 208-25 chr11 13958207 13958491 + 1.33333 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -4374 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 167.333-137 chr2 119658375 119658540 + 1.33333 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -20710 NM_001105198 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 311.666-10 chr4 19278151 19278600 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -973530 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 150-121 chr6 37568388 37568544 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -13044 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 196.667-59 chr17 59270723 59270977 + 1.33333 NA intron (NM_182569, intron 7 of 9) intron (NM_182569, intron 7 of 9) 50339 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 203.333-220 chr5 131277143 131277356 + 1.33333 NA intron (NM_001038702, intron 1 of 4) intron (NM_001038702, intron 1 of 4) 13240 NM_001038702 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 242.666-3 chr1 92143068 92143301 + 1.33333 NA intron (NM_183242, intron 7 of 8) LTR78B|LTR|ERV1 -25740 NM_015237 23285 Hs.21554 NM_015237 ENSG00000189195 KIAA1107 - KIAA1107 protein-coding 241.333-92 chr7 614310 614574 + 1.33333 NA intron (NM_001164760, intron 4 of 10) MIRc|SINE|MIR 11044 NR_110055 101926963 Hs.521338 NR_110054 LOC101926963 - uncharacterized LOC101926963 ncRNA 197.333-232 chr8 87806079 87806327 + 1.33333 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 67812 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 292-39 chr5 12659592 12660013 + 1.33333 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) intron (NR_033383, intron 2 of 3) -8057 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 200-153 chr7 51442710 51442891 + 1.33333 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 -49544 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 203-104 chr7 105567091 105567338 + 1.33333 NA exon (NM_021930, exon 15 of 15) exon (NM_021930, exon 15 of 15) 14279 NM_001355526 100130771 Hs.719432 NM_001355526 ENSG00000185055 EFCAB10 - EF-hand calcium binding domain 10 protein-coding 261.666-7 chr18 60692245 60692585 + 1.33333 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -319640 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 258-17 chr14 88635173 88635498 + 1.33333 NA intron (NM_183387, intron 31 of 42) intron (NM_183387, intron 31 of 42) 40915 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 238.666-37 chr7 80704390 80704678 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 57881 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 261.333-21 chr11 114359875 114360186 + 1.33333 NA TTS (NR_120567) TTS (NR_120567) 20009 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 197.667-111 chr4 77502748 77503005 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -8877 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 243-72 chr8 121300515 121300848 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -338665 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 310.666-16 chr4 61144903 61145221 + 1.33333 NA intron (NR_147148, intron 2 of 3) intron (NR_147148, intron 2 of 3) 1406 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 267-29 chr15 99405397 99405741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 148044 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 296.666-8 chr12 30099214 30099739 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -314717 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 196.667-29 chr11 81569103 81569362 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 321604 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 224.333-6 chr1 115763839 115764083 + 1.33333 NA intron (NM_001232, intron 1 of 10) intron (NM_001232, intron 1 of 10) 4844 NM_001232 845 Hs.57975 NM_001232 ENSG00000118729 CASQ2 PDIB2 calsequestrin 2 protein-coding 262.999-2 chr10 131981097 131981378 + 1.33333 NA intron (NM_004052, intron 1 of 5) intron (NM_004052, intron 1 of 5) 776 NM_004052 664 Hs.144873 NM_004052 ENSG00000176171 BNIP3 NIP3 BCL2 interacting protein 3 protein-coding 194.666-27 chr17 61104149 61104347 + 1.33333 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 263456 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 198.667-101 chr2 62717449 62717740 + 1.33333 NA intron (NM_001142615, intron 2 of 22) intron (NM_001142615, intron 2 of 22) 10697 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 208-65 chr18 60370357 60370590 + 1.33333 NA TTS (NM_005912) TTS (NM_005912) 2302 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 291.333-48 chr4 82394063 82394548 + 1.33333 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -20309 NM_001003810 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 247.666-24 chr4 39913268 39913457 + 1.33333 NA intron (NM_001100399, intron 9 of 32) AluSx1|SINE|Alu 64549 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 210-27 chr11 101818312 101818546 + 1.33333 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -96581 NM_001363543 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 365.666-7 chr3 141042043 141042720 + 1.33333 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -8966 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 214.333-99 chr3 117975328 117975534 + 1.33333 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -284506 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 225.999-3 chr13 35976879 35977127 + 1.33333 NA intron (NM_001330071, intron 3 of 16) intron (NM_001330071, intron 3 of 16) -121142 NM_001195415 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 185.666-18 chr5 94747329 94747534 + 1.33333 NA intron (NM_001297777, intron 16 of 19) intron (NM_001297777, intron 16 of 19) 128762 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 216-58 chr2 67841688 67841976 + 1.33333 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -16270 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 201.666-41 chr8 12803608 12803777 + 1.33333 NA intron (NR_102423, intron 1 of 1) MER3|DNA|hAT-Charlie 7786 NR_015383 340357 Hs.434302 NR_015383 ENSG00000254813 LOC340357 - uncharacterized LOC340357 ncRNA 206-143 chr5 93735683 93735881 + 1.33333 NA 3' UTR (NM_153216, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_153216, exon 1 of 1) 5818 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 256-93 chr9 91906727 91907074 + 1.33333 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 43328 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 206-82 chr2 85179563 85179845 + 1.33333 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) intron (NM_031283, intron 3 of 11) -6705 NR_046797 100874334 Hs.693125 NR_046797 ENSG00000231134 TCF7L1-IT1 - TCF7L1 intronic transcript 1 ncRNA 164-33 chr14 36681379 36681708 + 1.33333 NA intron (NM_001171170, intron 9 of 10) intron (NM_001171170, intron 9 of 10) 23975 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 140.667-26 chr10 23808495 23808682 + 1.33333 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) L1MEd|LINE|L1 113861 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 206-16 chr10 17365453 17365617 + 1.33333 NA intron (NM_001004470, intron 3 of 7) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -21401 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 329.333 chr1 64302417 64302719 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 98945 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 318.333-20 chr20 39487775 39488213 + 1.33333 NA Intergenic LTR19-int|LTR|ERV1 -263246 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 328-12 chr14 52856644 52856956 + 1.33333 NA TTS (NM_001134999) TTS (NM_001134999) -65193 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 253.333-12 chr11 25632363 25632609 + 1.33333 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -556637 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 256.666-16 chr16 83016824 83017225 + 1.33333 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) intron (NM_001220490, intron 2 of 12) -26726 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 192-68 chr19 45451330 45451563 + 1.33333 NA promoter-TSS (NM_001369417) promoter-TSS (NM_001369417) 101 NM_001369412 2067 Hs.435981 NM_001983 ENSG00000012061 ERCC1 COFS4|RAD10|UV20 ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit protein-coding 470-3 chr5 144800691 144801302 + 1.33333 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 595605 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 322.666-2 chr1 180733575 180733890 + 1.33333 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) L2c|LINE|L2 101710 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 198-66 chr16 52304727 52304937 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 46268 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 211-33 chr14 51943789 51944093 + 1.33333 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) L1MB3|LINE|L1 -25370 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 293.666-7 chr18 29203030 29203467 + 1.33333 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 -1026118 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 244-101 chrX 18599484 18599790 + 1.33333 NA intron (NM_001037343, intron 12 of 21) AluJr|SINE|Alu 72466 NM_000330 6247 Hs.715725 NM_000330 ENSG00000102104 RS1 RS|XLRS1 retinoschisin 1 protein-coding 160-7 chr1 163338881 163339039 + 1.33333 NA intron (NM_145697, intron 7 of 13) intron (NM_145697, intron 7 of 13) 17006 NM_031423 83540 Hs.651950 NM_031423 ENSG00000143228 NUF2 CDCA1|CT106|NUF2R NUF2 component of NDC80 kinetochore complex protein-coding 201.333-80 chr12 111636808 111636998 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -37227 NR_132311 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 147.666 chr1 174308115 174308374 + 1.33333 NA intron (NM_001366445, intron 11 of 13) L1MB5|LINE|L1 33144 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 200-62 chr15 41706757 41706912 + 1.33333 NA intron (NM_001164273, intron 5 of 23) AluSz|SINE|Alu 15249 NR_030356 693211 NR_030356 ENSG00000207766 MIR626 MIRN626|hsa-mir-626 microRNA 626 ncRNA 314-47 chr7 105756213 105756542 + 1.33333 NA intron (NM_020725, intron 3 of 11) intron (NM_020725, intron 3 of 11) -77215 NM_138495 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 198-36 chr12 54515397 54515660 + 1.33333 NA intron (NM_001184976, intron 9 of 30) intron (NM_001184976, intron 9 of 30) 16750 NM_001184976 3071 Hs.182014 NM_005337 ENSG00000123338 NCKAP1L HEM1 NCK associated protein 1 like protein-coding 249.666-40 chr8 72454431 72454817 + 1.33333 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -82601 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 268.666-33 chrX 133679415 133679639 + 1.33333 NA intron (NM_001164619, intron 4 of 6) intron (NM_001164619, intron 4 of 6) -217916 NR_148713 110806308 Hs.658628 NR_148713 ENSG00000286096 GPC3-AS1 - GPC3 antisense RNA 1 ncRNA 308-57 chr8 94308056 94308389 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -45903 NM_181702 2669 Hs.654463 NM_005261 ENSG00000164949 GEM KIR GTP binding protein overexpressed in skeletal muscle protein-coding 230.667-46 chr2 195904024 195904340 + 1.33333 NA intron (NM_018897, intron 27 of 64) intron (NM_018897, intron 27 of 64) 164655 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 421.666-6 chr5 44002154 44002478 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -386416 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 131.333-55 chr14 80626769 80627009 + 1.33333 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) AluSg4|SINE|Alu 314849 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 207-11 chr10 36181782 36181981 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 403579 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 241.666-14 chr3 88625638 88625923 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 287324 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 196.666-59 chr20 16327825 16327987 + 1.33333 NA intron (NM_024704, intron 24 of 25) intron (NM_024704, intron 24 of 25) 245542 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 160-83 chr4 46075105 46075321 + 1.33333 NA intron (NM_173536, intron 3 of 8) intron (NM_173536, intron 3 of 8) 48841 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 271.333-15 chr15 70596043 70596313 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -9572 NR_135691 101929151 Hs.434703 NR_135691 ENSG00000280639 LINC02204 - long intergenic non-protein coding RNA 2204 ncRNA 196-45 chr14 40390560 40390753 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -564055 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 214.666-34 chr2 128120219 128120497 + 1.33333 NA exon (NM_020120, exon 9 of 41) exon (NM_020120, exon 9 of 41) 29158 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 213.666-45 chr8 91249739 91249908 + 1.33333 NA exon (NM_001282356, exon 3 of 20) exon (NM_001282356, exon 3 of 20) 504 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 216.667-114 chr9 99202079 99202390 + 1.33333 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 19708 NM_033087 85365 Hs.40919 NM_033087 ENSG00000119523 ALG2 CDG1I|CDGIi|CMS14|CMSTA3|NET38|hALPG2 ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferase protein-coding 292.333-28 chr22 33698616 33699169 + 1.33333 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) intron (NM_133642, intron 2 of 14) 6028 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 161.333-15 chr1 206449112 206449274 + 1.33333 NA intron (NM_015326, intron 17 of 21) intron (NM_015326, intron 17 of 21) -21283 NM_001193321 9641 Hs.321045 NM_014002 ENSG00000263528 IKBKE IKK-E|IKK-i|IKKE|IKKI inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit epsilon protein-coding 201.667-24 chr12 38927106 38927368 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -21646 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 168-95 chr6 100659453 100659606 + 1.33333 NA intron (NM_006828, intron 16 of 41) intron (NM_006828, intron 16 of 41) -195854 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 281.333-67 chr8 64482757 64483106 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 94332 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 385.666-7 chr5 94154543 94154941 + 1.33333 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -43043 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 262-17 chr14 49751040 49751423 + 1.33333 NA intron (NM_172193, intron 12 of 12) intron (NM_172193, intron 12 of 12) -16922 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 214.333-90 chr22 30702815 30702995 + 1.33333 NA intron (NM_030758, intron 1 of 13) intron (NM_030758, intron 1 of 13) 8031 NM_030758 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 249.999-2 chr15 80125474 80125755 + 1.33333 NA intron (NM_001242918, intron 4 of 4) intron (NM_001242918, intron 4 of 4) 27198 NM_001242919 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 203.666-2 chr1 54681785 54682000 + 1.33333 NA intron (NM_001039464, intron 13 of 23) MIRb|SINE|MIR -33930 NM_001291333 7268 Hs.412482 NM_004623 ENSG00000243725 TTC4 CNS1 tetratricopeptide repeat domain 4 protein-coding 226.333-59 chr2 45417569 45417836 + 1.33333 NA intron (NM_018079, intron 18 of 20) intron (NM_018079, intron 18 of 20) -162761 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 266.333-42 chr4 29549254 29549714 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 335192 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 198-122 chr3 69321922 69322078 + 1.33333 NA intron (NM_015123, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 64088 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 218-95 chr6 54463321 54463518 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 154978 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 174.667-80 chr2 48727806 48728060 + 1.33333 NA intron (NM_000233, intron 3 of 10) MIRb|SINE|MIR 27791 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 238-64 chr3 167716963 167717265 + 1.33333 NA intron (NM_145859, intron 3 of 8) intron (NM_145859, intron 3 of 8) 17728 NM_145860 11235 Hs.478150 NM_007217 ENSG00000114209 PDCD10 CCM3|TFAR15 programmed cell death 10 protein-coding 184-47 chr2 12383947 12384120 + 1.33333 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 184903 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 228-73 chr6 63559826 63560077 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12061 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 331.333-21 chr17 31253049 31253494 + 1.33333 NA intron (NM_001042492, intron 31 of 57) intron (NM_001042492, intron 31 of 57) 43968 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 220-14 chr10 81159460 81159656 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 509761 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 247-64 chr5 106721235 106721645 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 289574 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 192 chr1 40677847 40678004 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -12243 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 253.667-82 chr9 28577836 28578141 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) L2b|LINE|L2 141317 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 184-98 chr6 154023694 154023952 + 1.33333 NA intron (NM_001145280, intron 1 of 3) L1M1|LINE|L1 13327 NM_001145281 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 203.333-224 chr5 157798689 157798969 + 1.33333 NA intron (NM_014666, intron 8 of 11) L1ME4a|LINE|L1 55117 NM_173491 134353 Hs.23648 NM_173491 ENSG00000155858 LSM11 - LSM11, U7 small nuclear RNA associated protein-coding 200.333-117 chr5 42821307 42821559 + 1.33333 NA Intergenic MER30B|DNA|hAT-Charlie -9357 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 168.667-148 chr3 144485111 144485267 + 1.33333 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 512108 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 200.333-102 chr4 39034702 39034963 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -2423 NM_001303228 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 232.667-59 chr4 80424848 80425174 + 1.33333 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) intron (NM_152770, intron 2 of 5) 89291 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 187.666-14 chr2 11785168 11785308 + 1.33333 NA intron (NM_001349203, intron 10 of 20) intron (NM_001349203, intron 10 of 20) 17794 NR_036071 100422862 NR_036071 ENSG00000265056 MIR548S - microRNA 548s ncRNA 178-43 chr14 53418784 53418951 + 1.33333 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 265513 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 220.333-61 chr2 44631421 44631614 + 1.33333 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) AluJr|SINE|Alu 269570 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 221.333-78 chr20 10151095 10151261 + 1.33333 NA intron (NR_040710, intron 2 of 4) intron (NR_040710, intron 2 of 4) -67620 NM_003081 6616 Hs.167317 NM_003081 ENSG00000132639 SNAP25 CMS18|RIC-4|RIC4|SEC9|SNAP|SNAP-25|SUP|bA416N4.2|dJ1068F16.2 synaptosome associated protein 25 protein-coding 205.333-185 chr5 73161709 73162019 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -11272 NR_134252 105379030 NR_134252 ENSG00000251599 LOC105379030 - uncharacterized LOC105379030 ncRNA 214-85 chr3 69926898 69927081 + 1.33333 NA intron (NM_198159, intron 2 of 9) intron (NM_198159, intron 2 of 9) -9603 NM_001184968 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 361.333-7 chr14 76042746 76043352 + 1.33333 NA intron (NR_045664, intron 3 of 7) intron (NR_045664, intron 3 of 7) 57286 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 284.333-33 chr3 196939391 196939775 + 1.33333 NA promoter-TSS (NR_046630) promoter-TSS (NR_046630) -294 NR_046630 100874001 Hs.591671 NR_046630 NCBP2-AS1 - NCBP2 antisense RNA 1 ncRNA 266.666-14 chr15 38462372 38462658 + 1.33333 NA intron (NM_173611, intron 1 of 7) L1MC5a|LINE|L1 8388 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 211.666-16 chr16 8034621 8034809 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 555123 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 320.333-28 chr8 78980921 78981367 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 143615 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 232.667-27 chr17 72144027 72144341 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 23164 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 220-104 chr6 135372974 135373146 + 1.33333 NA intron (NM_017651, intron 22 of 27) intron (NM_017651, intron 22 of 27) 124680 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 214.333-69 chr19 28244331 28244621 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -362212 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 303.666-2 chr10 60580047 60580474 + 1.33333 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -7304 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 214.999 chr10 51284476 51284643 + 1.33333 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -15014 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 228-85 chr7 104368830 104369037 + 1.33333 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 40277 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 303.333-82 chr8 134258589 134259018 + 1.33333 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -339268 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 221.333-108 chr5 8989755 8989953 + 1.33333 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 64041 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 367.999-2 chr18 7491075 7491404 + 1.33333 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -30233 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 202.666-11 chr10 48923596 48923767 + 1.33333 NA intron (NM_020945, intron 47 of 61) L2c|LINE|L2 -9446 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 214.666-71 chr8 9732207 9732378 + 1.33333 NA intron (NM_003747, intron 14 of 26) intron (NM_003747, intron 14 of 26) -9380 NR_030327 693182 NR_030327 ENSG00000207701 MIR597 MIRN597|hsa-mir-597|mir-597 microRNA 597 ncRNA 204.666-17 chr11 31025801 31025980 + 1.33333 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) MIR3|SINE|MIR -33204 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 221.333-23 chr11 31424649 31424989 + 1.33333 NA intron (NM_181706, intron 3 of 4) intron (NM_181706, intron 3 of 4) 54959 NM_181706 120526 Hs.187269 NM_181706 ENSG00000170946 DNAJC24 DPH4|JJJ3|ZCSL3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C24 protein-coding 216.666-50 chr4 38430508 38430742 + 1.33333 NA intron (NR_110951, intron 7 of 7) intron (NR_110951, intron 7 of 7) 63711 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 182.333-36 chr13 60773798 60773986 + 1.33333 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 100937 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 304.667-2 chr1 164058143 164058581 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -500998 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 216-29 chr14 56287850 56288060 + 1.33333 NA intron (NM_021255, intron 3 of 5) intron (NM_021255, intron 3 of 5) 169544 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 218.666-5 chr1 173439336 173439566 + 1.33333 NA intron (NR_125960, intron 1 of 1) intron (NR_125960, intron 1 of 1) 21911 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 162.666-4 chr12 109083135 109083343 + 1.33333 NA intron (NM_001301175, intron 14 of 15) intron (NM_001301175, intron 14 of 15) 10233 NM_001145374 121642 Hs.374458 NM_001001655 ENSG00000189046 ALKBH2 ABH2 alkB homolog 2, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 150.666-7 chr13 35258473 35258699 + 1.33333 NA intron (NM_015678, intron 34 of 57) MER58C|DNA|hAT-Charlie 218103 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 154.667-41 chr10 53823878 53824115 + 1.33333 NA intron (NM_001142773, intron 30 of 31) intron (NM_001142773, intron 30 of 31) -662234 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 269.333-50 chr2 169204177 169204625 + 1.33333 NA intron (NM_004525, intron 41 of 78) intron (NM_004525, intron 41 of 78) 123294 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 225.333-140 chr9 77113625 77113912 + 1.33333 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -63677 NM_015186 23230 Hs.459790 NM_015186 ENSG00000197969 VPS13A CHAC|CHOREIN vacuolar protein sorting 13 homolog A protein-coding 162.667-199 chr4 92926333 92926481 + 1.33333 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 622008 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 366-25 chr7 52410919 52411443 + 1.33333 NA Intergenic MER61F|LTR|ERV1 -624452 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 209.666-26 chr19 31796607 31796783 + 1.33333 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 204414 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 198-108 chr21 19977493 19977741 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -77862 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 202.667-124 chr5 131918913 131919154 + 1.33333 NA intron (NM_001303622, intron 6 of 12) L1MC4a|LINE|L1 26630 NM_001303622 728637 Hs.631802 NM_001278059 ENSG00000239642 MEIKIN - meiotic kinetochore factor protein-coding 166.667-156 chr3 188167828 188168057 + 1.33333 NA intron (NM_001167672, intron 1 of 9) L1ME4c|LINE|L1 -10601 NR_024413 401105 Hs.679026 NM_207488 ENSG00000279891 FLJ42393 AVPC1948 uncharacterized LOC401105 ncRNA 163.333-256 chr7 33569835 33570068 + 1.33333 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) L1MC4a|LINE|L1 -334964 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 190.333-36 chr12 9621562 9621769 + 1.33333 NA intron (NR_046450, intron 1 of 4) L1MB2|LINE|L1 4381 NR_046450 374443 Hs.569124 NR_002814 ENSG00000256594 LOC374443 - C-type lectin domain family 2 member D pseudogene pseudo 138.666-2 chr12 28804720 28804835 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -344501 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 212.667-61 chr18 9208335 9208604 + 1.33333 NA intron (NM_015208, intron 4 of 12) intron (NM_015208, intron 4 of 12) 70906 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 136-95 chr7 50759209 50759404 + 1.33333 NA intron (NM_001001555, intron 1 of 16) intron (NM_001001555, intron 1 of 16) 23590 NM_001371009 327.999-3 chr18 13249988 13250263 + 1.33333 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) L1MA5A|LINE|L1 10582 NR_146617 147276 Hs.675872 NR_146617 ENSG00000279020 C18orf15 HsT3231 chromosome 18 open reading frame 15 (putative) ncRNA 532.667-3 chr8 130252114 130253025 + 1.33333 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 43964 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 132.666-3 chr12 10323246 10323424 + 1.33333 NA non-coding (NR_147040, exon 5 of 5) non-coding (NR_147040, exon 5 of 5) 14957 NR_159946 113523642 Hs.539490 NR_159946 LINC02617 - long intergenic non-protein coding RNA 2617 ncRNA 322.666-26 chr9 28431396 28431736 + 1.33333 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 287739 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 135.333-60 chr16 5228163 5228303 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -130413 NM_001289029 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 171.333-4 chr1 72372902 72373152 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -90488 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 215.667-74 chr21 15789421 15789723 + 1.33333 NA intron (NM_001283042, intron 4 of 24) intron (NM_001283042, intron 4 of 24) 59590 NM_013396 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 253.999 chr12 63129983 63130198 + 1.33333 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 22720 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 207.333-239 chr6 62563058 62563220 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -276912 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 181.666-21 chr8 89625806 89626051 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic 131783 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 309.333-59 chr8 19433553 19434008 + 1.33333 NA intron (NM_001130518, intron 6 of 9) MER30|DNA|hAT-Charlie 119804 NM_001174159 63898 Hs.303208 NM_022071 ENSG00000104611 SH2D4A PPP1R38|SH2A SH2 domain containing 4A protein-coding 243.333-102 chr7 6557825 6558028 + 1.33333 NA Intergenic Intergenic -6490 NM_001145118 392862 Hs.512174 NM_001145118 ENSG00000215045 GRID2IP DELPHILIN Grid2 interacting protein protein-coding 266.666-6 chr10 78495907 78496198 + 1.33333 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 228710 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 198.667-126 chr3 38092300 38092541 + 1.33333 NA intron (NM_007335, intron 10 of 36) intron (NM_007335, intron 10 of 36) 44707 NM_001607 30 Hs.643487 NM_001607 ENSG00000060971 ACAA1 ACAA|PTHIO|THIO acetyl-CoA acyltransferase 1 protein-coding 148.333-279 chr4 48101556 48101785 + 1 NA intron (NM_003328, intron 6 of 14) intron (NM_003328, intron 6 of 14) 32580 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 215.667-18 chr11 43468984 43469320 + 1 NA intron (NM_018259, intron 21 of 23) L1ME2|LINE|L1 -90504 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 155.667-166 chr2 65668176 65668495 + 1 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -235736 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 148.333-338 chr6 53577012 53577160 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -3811 NR_110840 101927136 Hs.509788 NR_110840 ENSG00000231683 LOC101927136 - uncharacterized LOC101927136 ncRNA 146.333-40 chr10 121779087 121779306 + 1 NA intron (NM_001001976, intron 11 of 11) L2c|LINE|L2 148835 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 166.667-222 chr7 100175531 100175800 + 1 NA exon (NM_152742, exon 3 of 10) exon (NM_152742, exon 3 of 10) 1716 NM_152742 221914 Hs.211701 NM_152742 ENSG00000213420 GPC2 - glypican 2 protein-coding 219.333-146 chr5 147411871 147412216 + 1 NA intron (NM_001197294, intron 6 of 13) intron (NM_001197294, intron 6 of 13) 41649 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 143.333-177 chr3 36950386 36950685 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -5481 NM_001329998 9881 Hs.170999 NM_014831 ENSG00000168016 TRANK1 LBA1 tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 protein-coding 148.333-285 chr4 63174868 63175134 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -1013236 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 188.667-49 chr15 56712149 56712568 + 1 NA intron (NM_001002843, intron 1 of 20) intron (NM_001002843, intron 1 of 20) 21728 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 202.333-139 chr5 28023442 28023835 + 1 NA Intergenic Intergenic 264027 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 263.333-86 chr9 128298266 128298578 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 22276 NM_001318089 375757 Hs.259594 NM_001040011 ENSG00000175854 SWI5 C9orf119|SAE3 SWI5 homologous recombination repair protein protein-coding 161.333-123 chr18 1222830 1223155 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 136637 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 212.667-74 chr2 80261522 80261896 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 43043 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 147.667-174 chr2 66800647 66800912 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -97552 NR_110265 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 182.667-35 chr12 121890685 121890961 + 1 NA intron (NM_001261400, intron 1 of 3) MER113|DNA|hAT-Charlie 2033 NR_048555 5715 Hs.131151 NM_002813 ENSG00000110801 PSMD9 Rpn4|p27 proteasome 26S subunit, non-ATPase 9 protein-coding 641.666-2 chr5 165921429 165922528 + 1 NA Intergenic Intergenic 1004392 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 151.667-195 chr21 27362673 27362931 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -359577 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 255.667-18 chr12 22748032 22748360 + 1 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 123025 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 134.333-87 chr2 121988265 121988417 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 232690 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 235.333-62 chr2 202532511 202532936 + 1 NA exon (NM_001204, exon 9 of 13) exon (NM_001204, exon 9 of 13) -102246 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 239.667-37 chr2 88376424 88376817 + 1 NA Intergenic Intergenic 76073 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 122.667-197 chr8 106641432 106641676 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -16254 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 155.667-108 chr15 27399545 27399711 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) intron (NM_001270873, intron 5 of 5) -238309 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 147.333-107 chr14 61792284 61792523 + 1 NA intron (NM_003082, intron 8 of 9) intron (NM_003082, intron 8 of 9) -19759 NM_001367650 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 197.333-97 chr18 70003062 70003326 + 1 NA 3' UTR (NM_173630, exon 49 of 49) 3' UTR (NM_173630, exon 49 of 49) -46395 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 144.667-154 chr2 157747867 157748048 + 1 NA intron (NM_001111067, intron 9 of 10) intron (NM_001111067, intron 9 of 10) 90673 NM_001347667 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 170.333-153 chr4 30691437 30691718 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -28792 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 190.333-44 chr13 77298791 77299087 + 1 NA intron (NM_015057, intron 1 of 82) L2a|LINE|L2 28155 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 156.333-340 chr7 69309892 69310092 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 287632 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 156.333-115 chr14 82516189 82516441 + 1 NA Intergenic Intergenic -126317 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 225.667-61 chr5 62422847 62423332 + 1 NA intron (NM_001134779, intron 1 of 29) intron (NM_001134779, intron 1 of 29) 4205 NM_001134779 51194 Hs.482269 NM_016338 ENSG00000086200 IPO11 RanBP11 importin 11 protein-coding 152.333-343 chr6 155277618 155277892 + 1 NA intron (NM_016020, intron 5 of 6) intron (NM_016020, intron 5 of 6) 13742 NM_001001346 49861 Hs.567491 NM_001001346 ENSG00000171217 CLDN20 - claudin 20 protein-coding 197.333-170 chr4 77155703 77156019 + 1 NA Intergenic Intergenic -1346 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 294.333-9 chr12 5624992 5625551 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 17 of 25) L2a|LINE|L2 131139 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 135.333-113 chr3 26819831 26820072 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 125394 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 201.333-5 chr1 42527303 42527604 + 1 NA intron (NM_001355227, intron 6 of 18) MIR|SINE|MIR -5567 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 162.667-9 chr1 164526419 164526711 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -32795 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 167.333-24 chr1 172724469 172724676 + 1 NA Intergenic Intergenic 65469 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 132.333-89 chr2 144335053 144335260 + 1 NA Intergenic Intergenic -2087 NM_001354360 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 230.667-74 chr6 153701361 153701758 + 1 NA Intergenic Intergenic -308937 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 240.667-64 chr5 35929146 35929520 + 1 NA intron (NM_144647, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 9289 NM_001042625 133690 Hs.55150 NM_144647 ENSG00000152611 CAPSL - calcyphosine like protein-coding 122.333-223 chrX 67642083 67642263 + 1 NA intron (NM_001011645, intron 2 of 8) intron (NM_001011645, intron 2 of 8) 97550 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 156.667-236 chr4 3855530 3855695 + 1 NA Intergenic Intergenic 89227 NM_000683 152 Hs.123022 NM_000683 ENSG00000184160 ADRA2C ADRA2L2|ADRA2RL2|ADRARL2|ALPHA2CAR adrenoceptor alpha 2C protein-coding 217.333-61 chr2 25511263 25511654 + 1 NA intron (NM_033147, intron 9 of 19) AluSq2|SINE|Alu 138764 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 169.667-33 chr11 63739007 63739215 + 1 NA intron (NM_001265589, intron 3 of 8) intron (NM_001265589, intron 3 of 8) 29664 NM_001144936 65998 Hs.191073 NM_001144936 ENSG00000188070 C11orf95 - chromosome 11 open reading frame 95 protein-coding 153.667-347 chr6 143484513 143484768 + 1 NA intron (NM_003630, intron 10 of 11) L1ME4a|LINE|L1 27080 NM_032020 2519 Hs.17680 NM_032020 ENSG00000001036 FUCA2 dJ20N2.5 alpha-L-fucosidase 2 protein-coding 186.333-101 chr3 82886960 82887159 + 1 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR 900917 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 210.667-88 chr3 83229108 83229484 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 1243154 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 181.333-39 chr13 35766321 35766588 + 1 NA Intergenic Intergenic 68727 NR_132115 100507114 Hs.236298 NR_132115 ENSG00000236036 LINC00445 - long intergenic non-protein coding RNA 445 ncRNA 151.333-375 chr6 158510296 158510467 + 1 NA 3' UTR (NM_001007466, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001007466, exon 13 of 13) -26055 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 173.667-39 chr12 76329765 76329947 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 18559 NM_024685 79738 Hs.96322 NM_024685 ENSG00000179941 BBS10 C12orf58 Bardet-Biedl syndrome 10 protein-coding 158.667 chr1 3040330 3040515 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 18955 NM_080431 140625 Hs.236635 NM_080431 ENSG00000169717 ACTRT2 ARPM2|ARPT2|Arp-T2|HARPM2 actin related protein T2 protein-coding 119.667-88 chr2 170732088 170732239 + 1 NA intron (NR_110185, intron 1 of 5) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 16826 NM_001003845 389058 Hs.368802 NM_001003845 ENSG00000204335 SP5 - Sp5 transcription factor protein-coding 232.667-58 chr4 75976992 75977316 + 1 NA intron (NM_001288983, intron 3 of 20) intron (NM_001288983, intron 3 of 20) -3636 NR_125906 101928809 Hs.637575 NR_125906 ENSG00000245928 LOC101928809 - uncharacterized LOC101928809 ncRNA 138.667-120 chr20 50061631 50061820 + 1 NA Intergenic Intergenic -20096 NR_051976 100887755 Hs.195705 NR_051976 TRERNA1 LINC00651|treRNA translation regulatory long non-coding RNA 1 ncRNA 149.667-246 chr22 26710459 26710670 + 1 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 37721 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 168.667-173 chr5 67695947 67696126 + 1 NA Intergenic Intergenic -49247 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 149.333-148 chr17 66380963 66381146 + 1 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) AluJr|SINE|Alu 35800 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 292.333-13 chr13 91279489 91279919 + 1 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -68006 NR_047004 100874150 Hs.711947 NR_047004 LINC00379 - long intergenic non-protein coding RNA 379 ncRNA 185.667-88 chr3 63163426 63163753 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 60901 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 227.667-64 chr5 154163687 154163974 + 1 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -26903 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 165.667-118 chr3 29127800 29127986 + 1 NA Intergenic Intergenic 153046 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 157.667-265 chr5 151583462 151583622 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -14598 NM_001447 2196 Hs.591255 NM_001447 ENSG00000086570 FAT2 CDHF8|CDHR9|HFAT2|MEGF1|SCA45 FAT atypical cadherin 2 protein-coding 159.667-148 chr18 13631571 13631750 + 1 NA intron (NM_001003675, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu -10098 NM_001276251 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 125.667-176 chr7 33850969 33851190 + 1 NA Intergenic Intergenic -53836 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 151.333-126 chr14 57125388 57125596 + 1 NA Intergenic Intergenic 143413 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 178.667-55 chr15 59529820 59530083 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -81832 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 333.333-14 chr11 36681329 36681685 + 1 NA Intergenic Intergenic -83228 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 149.667-402 chr8 98929872 98930026 + 1 NA intron (NM_001256312, intron 1 of 12) MER103C|DNA|hAT-Charlie 12661 NM_001256312 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 127.667-175 chr8 78755420 78755643 + 1 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L1M2|LINE|L1 -31157 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 161.333-45 chr10 120616505 120616805 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 18706 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 118.333-190 chr7 26372979 26373113 + 1 NA 3' UTR (NM_001318198, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001318198, exon 8 of 8) 3223 NR_136271 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 292.333-7 chr10 54490494 54490882 + 1 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 4458 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 171.667-127 chr4 164040221 164040510 + 1 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 157346 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 148.333-272 chr4 30518970 30519122 + 1 NA Intergenic Intergenic -201323 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 287.667-20 chr2 72392848 72393384 + 1 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) AluSx4|SINE|Alu -245254 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 157.333-66 chr11 58765464 58765729 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -33622 NM_005838 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 171.667-33 chr11 81543511 81543725 + 1 NA Intergenic Intergenic 347218 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 151.667-233 chr3 138934201 138934361 + 1 NA TTS (NR_121649) TTS (NR_121649) 9739 NR_121649 103344930 Hs.195033 NR_121649 ENSG00000244578 LINC01391 - long intergenic non-protein coding RNA 1391 ncRNA 227.333-67 chr2 181463624 181463928 + 1 NA intron (NM_000885, intron 2 of 27) L2b|LINE|L2 6390 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 171.333-148 chr5 44875776 44876046 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 66964 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 149.333-107 chr14 29128426 29128666 + 1 NA Intergenic Intergenic -342759 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 160.333-154 chr2 181758025 181758234 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -77464 NM_002500 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 274.333-51 chr4 41220003 41220526 + 1 NA non-coding (NR_102709, exon 3 of 3) non-coding (NR_102709, exon 3 of 3) -5722 NM_173075 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 289.333-42 chr4 87689025 87689411 + 1 NA Intergenic Intergenic 38938 NM_001079911 1758 Hs.652366 NM_004407 ENSG00000152592 DMP1 ARHP|ARHR|DMP-1 dentin matrix acidic phosphoprotein 1 protein-coding 271.333-71 chr8 136683914 136684233 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 153275 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 194.667-94 chr3 95372703 95372980 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 310352 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 174.667-98 chr2 219093779 219093982 + 1 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) intron (NM_024782, intron 5 of 7) -32959 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 126.333-172 chr8 10803296 10803465 + 1 NA intron (NM_001284356, intron 5 of 5) L1MC5a|LINE|L1 22063 NR_031711 100302166 NR_031711 ENSG00000283210 MIR1322 MIRN1322|hsa-mir-1322 microRNA 1322 ncRNA 128.667-128 chr4 54848908 54849075 + 1 NA Intergenic Intergenic 191063 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 178.333-171 chr8 104919239 104919651 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -330421 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 113.667-58 chr14 46079836 46080034 + 1 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) (AGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 15776 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 144.333-83 chr15 56443315 56443501 + 1 NA intron (NM_018365, intron 7 of 9) L1MEf|LINE|L1 21729 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 124.667-128 chr21 27505251 27505407 + 1 NA Intergenic Intergenic -217050 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 281.667-42 chr6 49466332 49466801 + 1 NA intron (NM_018132, intron 1 of 8) intron (NM_018132, intron 1 of 8) 3196 NM_018132 55166 Hs.88663 NM_018132 ENSG00000031691 CENPQ C6orf139|CENP-Q centromere protein Q protein-coding 160.333-202 chr4 21514285 21514563 + 1 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 30232 NM_001035004 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 150.667-8 chr1 72887655 72887852 + 1 NA Intergenic Intergenic -418417 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 144.333-189 chr4 61339729 61339873 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 137629 NM_001371342 162.667-175 chr3 68292487 68292714 + 1 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu -208037 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 228.333-18 chr12 20804133 20804510 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6384 NM_019844 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 141.333-92 chr18 35952943 35953141 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -18900 NR_037497 100500864 NR_037497 ENSG00000265641 MIR3929 - microRNA 3929 ncRNA 268.667-39 chr22 26598737 26599173 + 1 NA TTS (NM_001887) TTS (NM_001887) -8823 NM_001362923 8459 Hs.632768 NM_003595 ENSG00000128294 TPST2 TANGO13B|TPST-2 tyrosylprotein sulfotransferase 2 protein-coding 211.667-30 chr12 11861367 11861749 + 1 NA intron (NM_001987, intron 4 of 7) intron (NM_001987, intron 4 of 7) -188303 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 180.667-37 chr13 74371804 74372015 + 1 NA Intergenic Intergenic 47206 NR_144452 100288208 Hs.532467 NM_001013669 ENSG00000177596 LOC100288208 - uncharacterized LOC100288208 ncRNA 142.667-107 chr2 156705639 156705871 + 1 NA Intergenic Intergenic 269376 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 161.333-139 chr2 15287021 15287304 + 1 NA exon (NM_015909, exon 42 of 52) exon (NM_015909, exon 42 of 52) 274172 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 282.667-24 chr21 21775628 21776088 + 1 NA intron (NR_109958, intron 2 of 4) intron (NR_109958, intron 2 of 4) 28873 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 209.333-6 chr1 84394322 84394539 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -4102 NM_021233 58511 Hs.129142 NM_021233 ENSG00000137976 DNASE2B DLAD deoxyribonuclease 2 beta protein-coding 128.333-181 chr7 79673913 79674086 + 1 NA Intergenic Intergenic 220039 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 156.667-56 chr11 25717688 25717869 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -471345 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 159.333-144 chr2 31503660 31503954 + 1 NA Intergenic Intergenic 77131 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 153.667-155 chr17 65236238 65236463 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 98980 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 155.333-410 chr9 28256482 28256773 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 462678 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 234.333-12 chr11 27237807 27238108 + 1 NA Intergenic Intergenic -17844 NR_125767 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 299.667-6 chr12 107344645 107344999 + 1 NA intron (NM_001347944, intron 1 of 14) intron (NM_001347944, intron 1 of 14) 24234 NM_001347944 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 150.667-172 chr2 45654914 45655087 + 1 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 3325 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 167.667-169 chr5 64188930 64189145 + 1 NA intron (NM_001113561, intron 1 of 7) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 23194 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 143.333-260 chr7 27561628 27561869 + 1 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) L1MEd|LINE|L1 -54226 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 143.667-247 chr8 60826088 60826254 + 1 NA intron (NM_017780, intron 13 of 37) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 84912 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 152.333-104 chr14 46896548 46896720 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) intron (NM_001113498, intron 10 of 16) -244853 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 315.333-30 chr3 15701526 15702114 + 1 NA intron (NM_001349280, intron 13 of 26) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -4449 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 200.667-57 chr17 27495515 27495769 + 1 NA intron (NM_014238, intron 2 of 20) intron (NM_014238, intron 2 of 20) 23678 NM_014238 8844 Hs.133534 NM_014238 ENSG00000141068 KSR1 KSR|RSU2 kinase suppressor of ras 1 protein-coding 591.333-2 chr9 74776671 74777594 + 1 NA intron (NM_017662, intron 23 of 38) MER5A|DNA|hAT-Charlie 110215 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 182.667-77 chr2 64738031 64738320 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -84262 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 112.667-161 chr21 39225020 39225250 + 1 NA exon (NM_033656, exon 28 of 41) exon (NM_033656, exon 28 of 41) -41621 NR_049728 8624 Hs.473838 NM_003720 ENSG00000183527 PSMG1 C21LRP|DSCR2|LRPC21|PAC-1|PAC1 proteasome assembly chaperone 1 protein-coding 147.333-320 chr8 120007961 120008112 + 1 NA intron (NM_022783, intron 7 of 8) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger -117066 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 267.333-67 chr4 47317659 47317987 + 1 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 145879 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 237.667-67 chr5 111857799 111858250 + 1 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -54484 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 167.667-122 chr20 52560612 52560860 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -60102 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 179.667-23 chr10 99885899 99886180 + 1 NA intron (NM_015221, intron 13 of 16) intron (NM_015221, intron 13 of 16) 28053 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 170.667-111 chr3 74858483 74858702 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -337452 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 212.333-104 chr4 74080040 74080345 + 1 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR 19003 NM_002089 2920 Hs.75765 NM_002089 ENSG00000081041 CXCL2 CINC-2a|GRO2|GROb|MGSA-b|MIP-2a|MIP2|MIP2A|SCYB2 C-X-C motif chemokine ligand 2 protein-coding 203.667-97 chr5 78082138 78082462 + 1 NA intron (NM_003664, intron 22 of 26) intron (NM_003664, intron 22 of 26) 124053 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 287.667-25 chr3 1985781 1986169 + 1 NA Intergenic Intergenic -112828 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 163.333-176 chr22 30339851 30340150 + 1 NA intron (NM_005877, intron 9 of 15) intron (NM_005877, intron 9 of 15) -13059 NM_001204240 83874 Hs.655273 NM_031937 ENSG00000099992 TBC1D10A EPI64|TBC1D10|dJ130H16.1|dJ130H16.2 TBC1 domain family member 10A protein-coding 155.667-196 chr20 40838362 40838558 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -123837 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 159.333-60 chr11 47543122 47543384 + 1 NA intron (NM_006560, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 9879 NM_006560 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 139.333-32 chr11 16953150 16953406 + 1 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) intron (NM_001329630, intron 3 of 26) -27256 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 131.667-42 chr12 43968017 43968287 + 1 NA intron (NM_001286212, intron 3 of 6) intron (NM_001286212, intron 3 of 6) 132071 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 142.333-64 chr12 118224098 118224356 + 1 NA intron (NM_001346490, intron 10 of 21) MIRb|SINE|MIR -33692 NM_001346497 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 130.333-42 chr10 119767173 119767325 + 1 NA intron (NM_014937, intron 2 of 19) L1MEg|LINE|L1 41199 NM_014937 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 212.667-115 chr5 166915246 166915632 + 1 NA intron (NR_108020, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 10931 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 158.667-197 chr22 34887000 34887207 + 1 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 110813 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 335.667-21 chr5 10528860 10529221 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -6956 NR_134289 389273 Hs.519206 NR_134289 ENSG00000249160 LINC02213 - long intergenic non-protein coding RNA 2213 ncRNA 153.667-101 chr12 116928908 116929142 + 1 NA intron (NM_153348, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu 18069 NM_012174 26259 Hs.624537 NM_012174 ENSG00000174989 FBXW8 FBW6|FBW8|FBX29|FBXO29|FBXW6 F-box and WD repeat domain containing 8 protein-coding 130.333-19 chr1 199232766 199233006 + 1 NA intron (NR_147896, intron 3 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 84288 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 241.667-68 chr5 10808106 10808534 + 1 NA Intergenic Intergenic -47086 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 154.667-193 chr2 173066381 173066663 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -9324 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 147.333-202 chr22 25477748 25478026 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 22241 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 132.667-5 chr1 86200570 86200817 + 1 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -43709 NR_146340 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 203.333-98 chr16 46638453 46638779 + 1 NA Intergenic Intergenic -17237 NM_001324318 79801 Hs.123253 NM_024745 ENSG00000171241 SHCBP1 PAL SHC binding and spindle associated 1 protein-coding 145.333-242 chr5 111153333 111153502 + 1 NA Intergenic Intergenic 61245 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 145.333-126 chr19 21430194 21430355 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 33141 NM_001076678 284443 Hs.656558 NM_145326 ENSG00000196268 ZNF493 - zinc finger protein 493 protein-coding 268.667-36 chr2 207934531 207934983 + 1 NA intron (NM_001080475, intron 4 of 7) intron (NM_001080475, intron 4 of 7) 90770 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 147.333-241 chr4 79500440 79500679 + 1 NA intron (NR_038826, intron 2 of 3) L1MD1|LINE|L1 7966 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 120.667-167 chr7 104819852 104819995 + 1 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) intron (NM_199000, intron 2 of 2) -15831 NR_034141 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 191.333-10 chr1 111788187 111788460 + 1 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 32422 NM_007204 11218 Hs.591405 NM_007204 ENSG00000064703 DDX20 DP103|GEMIN3 DEAD-box helicase 20 protein-coding 169.333-207 chr5 60562031 60562234 + 1 NA Intergenic Intergenic -65846 NM_001364599 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 135.333-68 chr17 62129435 62129657 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -64268 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 262.667-72 chr6 113371405 113371833 + 1 NA Intergenic Intergenic 61828 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 275.667-9 chr10 65213528 65214016 + 1 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 -289254 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 259.333-22 chr12 26290068 26290408 + 1 NA Intergenic Intergenic 94665 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 252.667-92 chr6 140127357 140127657 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -77745 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 170.333-89 chr17 20025878 20026207 + 1 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) L1MB7|LINE|L1 16683 NM_001243439 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 192.333-72 chr18 3058237 3058587 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -46465 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 188.333-127 chr6 36599293 36599623 + 1 NA intron (NM_003017, intron 3 of 5) intron (NM_003017, intron 3 of 5) 5096 NM_003017 6428 Hs.405144 NM_003017 ENSG00000112081 SRSF3 SFRS3|SRp20 serine and arginine rich splicing factor 3 protein-coding 154.667-324 chr5 148132758 148132920 + 1 NA intron (NM_006846, intron 31 of 32) intron (NM_006846, intron 31 of 32) -35707 NM_001001325 408187 Hs.553815 NM_001001325 ENSG00000196800 SPINK14 SPINK5L2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (putative) protein-coding 220.667-24 chr12 88452154 88452509 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 128140 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 211.667-77 chr3 50000706 50001107 + 1 NA intron (NM_001349194, intron 3 of 17) intron (NM_001349194, intron 3 of 17) 60756 NM_001349193 10180 Hs.696735 NM_005777 ENSG00000004534 RBM6 3G2|DEF-3|DEF3|HLC-11|NY-LU-12|g16 RNA binding motif protein 6 protein-coding 166.333-54 chr12 25451461 25451634 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 101736 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 267.333-35 chr15 90423416 90423839 + 1 NA intron (NM_003870, intron 2 of 37) intron (NM_003870, intron 2 of 37) 35385 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 160.333-2 chr1 17936502 17936714 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -129049 NR_125946 101927876 Hs.522954 NR_125946 ENSG00000261781 LINC01654 - long intergenic non-protein coding RNA 1654 ncRNA 187.333-213 chr9 76565980 76566290 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 65502 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 126.333-58 chr15 63756086 63756247 + 1 NA intron (NM_003922, intron 5 of 77) L2a|LINE|L2 77782 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 235.667-52 chr6 27744717 27745173 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -16799 NR_038929 100131289 Hs.200573 NR_038929 LOC100131289 - uncharacterized LOC100131289 ncRNA 155.333-283 chr5 22447283 22447523 + 1 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) intron (NM_004061, intron 2 of 14) -233553 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 160.667-32 chr10 34645665 34645871 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 169528 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 199.667-115 chr5 66499129 66499600 + 1 NA Intergenic Intergenic 12240 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 215.667-87 chr3 130270240 130270686 + 1 NA non-coding (NR_027898, exon 23 of 23) non-coding (NR_027898, exon 23 of 23) 57643 NR_027898 646300 Hs.170475 NR_027898 COL6A4P2 COL6A4 collagen type VI alpha 4 pseudogene 2 pseudo 323.667-15 chr2 212130460 212130937 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 295662 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 306.667-17 chr18 77921059 77921785 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 72305 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 210.667-51 chr16 10612504 10612973 + 1 NA Intergenic Intergenic -32140 NM_001424 2013 Hs.531561 NM_001424 ENSG00000213853 EMP2 XMP epithelial membrane protein 2 protein-coding 149.667-20 chr1 96298444 96298701 + 1 NA intron (NR_110693, intron 5 of 5) L1MC4|LINE|L1 75553 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 290.333-8 chr12 114858522 114858833 + 1 NA Intergenic Intergenic -174502 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 134.667-36 chr11 84609691 84609842 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 111176 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 187.333-205 chr8 131445663 131446016 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -404930 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 134.333-112 chr3 25966802 25966971 + 1 NA Intergenic Intergenic -93191 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 153.333-188 chr2 23073846 23074075 + 1 NA Intergenic Intergenic -311219 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 173.333-224 chrX 126578388 126578649 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -25704 NM_178470 139170 Hs.120403 NM_178470 ENSG00000198889 DCAF12L1 KIAA1892L|WDR40B DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 1 protein-coding 199.667-101 chr4 33675967 33676191 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 363814 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 117.667-158 chr5 148238186 148238341 + 1 NA promoter-TSS (NM_001363511) promoter-TSS (NM_001363511) -262 NM_001363511 105378220 Hs.534838 NM_001363511 ENSG00000248109 MARCOL - MARCO like protein-coding 287.333-30 chr2 59836885 59837483 + 1 NA Intergenic Intergenic 545852 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 215.333-76 chr18 13193393 13193726 + 1 NA Intergenic Intergenic -25201 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 144.667-238 chr5 66957656 66957807 + 1 NA intron (NM_015183, intron 3 of 27) MER91A|DNA|hAT-Tip100 -1342 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 145.333-116 chr18 2387477 2387691 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 183921 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 159.667-88 chr12 104123141 104123403 + 1 NA exon (NM_006166, exon 5 of 8) exon (NM_006166, exon 5 of 8) 14938 NM_006166 4801 Hs.84928 NM_006166 ENSG00000120837 NFYB CBF-A|CBF-B|HAP3|NF-YB nuclear transcription factor Y subunit beta protein-coding 178.333-66 chr18 11924141 11924385 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -15946 NR_040242 65258 Hs.712666 NM_023075 ENSG00000154889 MPPE1 PGAP5 metallophosphoesterase 1 protein-coding 143.333-240 chr6 56543256 56543507 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 53 of 94) intron (NM_001144770, intron 53 of 94) 99508 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 174.667-181 chrX 25283847 25284139 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -268028 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 180.667-36 chr13 49194043 49194314 + 1 NA intron (NM_001079673, intron 19 of 25) AluSz6|SINE|Alu -26160 NM_001507 2862 Hs.248126 NM_001507 ENSG00000102539 MLNR GPR38|MTLR1 motilin receptor protein-coding 148.667-286 chr4 86026196 86026456 + 1 NA intron (NM_001363657, intron 13 of 13) intron (NM_001363657, intron 13 of 13) -93480 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 158.333-66 chr12 55614829 55615092 + 1 NA Intergenic MLT1F2-int|LTR|ERVL-MaLR -21932 NM_206899 121130 Hs.554551 NM_206899 ENSG00000175398 OR10P1 OR10P1P|OR10P2P|OR10P3P|OR12-7|OST701 olfactory receptor family 10 subfamily P member 1 protein-coding 210.333-182 chr9 130956009 130956289 + 1 NA Intergenic Intergenic -16902 NM_032843 84929 Hs.133205 NM_032843 ENSG00000130720 FIBCD1 - fibrinogen C domain containing 1 protein-coding 132.667-173 chr8 38890163 38890391 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -11069 NM_021623 59339 Hs.369123 NM_021623 ENSG00000169499 PLEKHA2 TAPP2 pleckstrin homology domain containing A2 protein-coding 255.667-69 chr5 40967899 40968321 + 1 NA intron (NM_000587, intron 14 of 17) L1MEg|LINE|L1 58613 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 223.333-18 chr10 57215445 57215903 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 88885 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 124.333-169 chr7 49414117 49414288 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -359436 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 146.667-243 chr4 153455486 153455707 + 1 NA Intergenic Intergenic -10750 NM_015196 23240 Hs.732450 NM_015196 ENSG00000121210 TMEM131L KIAA0922 transmembrane 131 like protein-coding 154.667-283 chr4 115576745 115577012 + 1 NA Intergenic Intergenic -463258 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 182.667-29 chr12 5189371 5189707 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 53612 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 244.667-39 chr13 95326139 95326593 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -24915 NM_001105515 10257 Hs.508423 NM_005845 ENSG00000125257 ABCC4 MOAT-B|MOATB|MRP4 ATP binding cassette subfamily C member 4 protein-coding 157.333-349 chr8 124718319 124718491 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 1 of 14) intron (NM_001282971, intron 1 of 14) 10068 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 220.333-46 chr16 56247759 56248112 + 1 NA intron (NM_138736, intron 2 of 7) intron (NM_138736, intron 2 of 7) 2415 NR_037499 100500891 NR_037499 ENSG00000265281 MIR3935 - microRNA 3935 ncRNA 159.333-363 chrX 70348119 70348351 + 1 NA intron (NM_012310, intron 13 of 30) AluJo|SINE|Alu 58131 NM_012310 24137 Hs.648326 NM_012310 ENSG00000090889 KIF4A KIF4|KIF4G1|MRX100 kinesin family member 4A protein-coding 144.333-120 chr2 30658420 30658610 + 1 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL 148931 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 271.667-33 chr17 58727145 58727583 + 1 NA intron (NM_058216, intron 7 of 8) AluSq2|SINE|Alu -28490 NM_014906 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 123.333-65 chr13 45181522 45181698 + 1 NA intron (NM_004128, intron 4 of 7) intron (NM_004128, intron 4 of 7) 19435 NM_198404 386618 Hs.23406 NM_198404 ENSG00000180332 KCTD4 bA321C24.3 potassium channel tetramerization domain containing 4 protein-coding 149.333-331 chr6 22821074 22821247 + 1 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -103236 NR_134614 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 157.333-69 chr11 95724886 95725168 + 1 NA Intergenic Intergenic 64755 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 150.333-250 chr22 28155740 28155971 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -235243 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 136.667-118 chr3 96231561 96231864 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -128252 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 142.333-134 chr2 206044903 206045089 + 1 NA intron (NM_017759, intron 5 of 10) intron (NM_017759, intron 5 of 10) 41178 NM_017759 54891 Hs.445036 NM_017759 ENSG00000114933 INO80D - INO80 complex subunit D protein-coding 152.667-341 chr7 53006668 53006941 + 1 NA Intergenic Intergenic -28829 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 171.333-39 chr13 36616812 36617108 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -57060 NM_203451 400120 Hs.422375 NM_203451 ENSG00000180440 SERTM1 C13orf36 serine rich and transmembrane domain containing 1 protein-coding 153.333-252 chr22 25602774 25603042 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) L1ME2|LINE|L1 38233 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 247.667-78 chr5 76134772 76135114 + 1 NA intron (NM_014979, intron 2 of 12) L2b|LINE|L2 51560 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 144.333-20 chr10 15489569 15489823 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -118407 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 240.333-33 chr13 94653785 94654182 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 52126 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 216.333-37 chr12 17086624 17086964 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 98047 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 172.333-98 chr21 28799580 28799875 + 1 NA Intergenic Intergenic 85640 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 207.333-252 chr7 55430914 55431241 + 1 NA intron (NM_018697, intron 8 of 8) intron (NM_018697, intron 8 of 8) 65629 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 153.333-369 chr6 123465136 123465323 + 1 NA intron (NM_001256020, intron 8 of 8) intron (NM_001256020, intron 8 of 8) 25625 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 192.333-8 chr1 111214134 111214364 + 1 NA Intergenic Intergenic -9711 NM_001271833 79961 Hs.557850 NM_024901 ENSG00000162777 DENND2D - DENN domain containing 2D protein-coding 194.333-160 chr9 26603893 26604263 + 1 NA Intergenic Intergenic 288724 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 206.667-125 chr7 14449439 14449799 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) 391831 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 224.333-102 chr5 117522437 117522871 + 1 NA intron (NR_046089, intron 3 of 5) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 107142 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 271.667-30 chr16 13505030 13505551 + 1 NA Intergenic Intergenic -414867 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 251.333-116 chr9 71190803 71191229 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) MIRb|SINE|MIR -69395 NM_001366148 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 143.333-30 chr10 34464556 34464777 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 4 of 22) intron (NM_001184789, intron 4 of 22) 350630 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 264.667-31 chr15 34197215 34197692 + 1 NA intron (NM_024713, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 12643 NM_024713 79768 Hs.633566 NM_024713 ENSG00000134152 KATNBL1 C15orf29 katanin regulatory subunit B1 like 1 protein-coding 125.667-139 chr4 124881142 124881353 + 1 NA Intergenic Intergenic -168515 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 143.333-273 chr7 95680897 95681074 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -84469 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 268.333-58 chr8 141029231 141029641 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -27357 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 305.667-13 chr17 60984527 60984916 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) L1MA1|LINE|L1 306870 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 165.333-184 chr4 46468213 46468425 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -78191 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 231.667-52 chr6 125553440 125553850 + 1 NA Intergenic Intergenic -120708 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 155.333-285 chr5 32047851 32048137 + 1 NA intron (NM_178140, intron 7 of 24) L1ME3A|LINE|L1 -111835 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 126.667-84 chr2 135650856 135651014 + 1 NA intron (NM_001354199, intron 16 of 25) intron (NM_001354199, intron 16 of 25) -14462 NR_029672 406915 NR_029672 ENSG00000207654 MIR128-1 MIR128A|MIRN128-1|MIRN128A|mir-128-1 microRNA 128-1 ncRNA 140.333-164 chr4 83087126 83087340 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 22656 NM_001130716 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 196.667-26 chr11 23968626 23968846 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -528317 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 179.667-60 chr16 75252208 75252575 + 1 NA promoter-TSS (NM_001170717) promoter-TSS (NM_001170717) -767 NM_014567 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 128.333-55 chr14 41162874 41163110 + 1 NA Intergenic Intergenic 208281 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 176.333-138 chr5 87525388 87525607 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -112464 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 219.333-92 chr2 61314367 61314726 + 1 NA intron (NM_014709, intron 25 of 79) intron (NM_014709, intron 25 of 79) 102831 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 153.333-221 chr2 171572994 171573280 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 50663 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 181.333-53 chr15 81654581 81654847 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -280501 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 149.333-201 chr2 169783867 169784071 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -14902 NM_003142 6741 Hs.632535 NM_003142 ENSG00000138385 SSB LARP3|La|La/SSB small RNA binding exonuclease protection factor La protein-coding 150.667-361 chr8 24320467 24320729 + 1 NA intron (NR_130710, intron 7 of 22) intron (NR_130710, intron 7 of 22) 26529 NR_130710 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 222.333-94 chr8 107426697 107426966 + 1 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 71087 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 239.333-28 chr13 32159409 32159701 + 1 NA intron (NM_023037, intron 16 of 60) intron (NM_023037, intron 16 of 60) 127781 NM_023037 10129 Hs.507669 NM_023037 ENSG00000073910 FRY 13CDNA73|214K23.2|C13orf14|CG003|bA207N4.2|bA37E23.1 FRY microtubule binding protein protein-coding 122.333-169 chr5 17724500 17724650 + 1 NA Intergenic Intergenic -68937 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 159.667-197 chr21 18161035 18161241 + 1 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) L1PA13|LINE|L1 -83695 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 154.667-264 chr3 189159005 189159172 + 1 NA Intergenic Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 -12883 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 172.667-43 chr12 69892430 69892711 + 1 NA intron (NM_182530, intron 7 of 24) AluJb|SINE|Alu 67343 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 171.667-181 chr9 71919989 71920198 + 1 NA intron (NM_001365055, intron 2 of 4) AluSc|SINE|Alu 8454 NM_182505 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 300.333-48 chr8 15200827 15201294 + 1 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu 37371 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 139.333-238 chrX 154866706 154866894 + 1 NA intron (NM_000132, intron 22 of 25) L1MA9|LINE|L1 -18169 NM_001017991 474381 Hs.534498 NM_001017991 ENSG00000277858 H2AFB2 H2A.Bbd H2A histone family member B2 protein-coding 218.667-90 chr6 49233535 49233976 + 1 NA Intergenic Intergenic 229498 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 266.667-41 chr2 144259988 144260441 + 1 NA intron (NM_001354354, intron 1 of 12) HAL1b|LINE|L1 -11515 NR_148872 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 280.667-34 chr4 142265881 142266285 + 1 NA intron (NM_001331040, intron 10 of 25) intron (NM_001331040, intron 10 of 25) 580452 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 237.333-120 chr8 114936606 114936974 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 731223 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 157.333-199 chr2 150149978 150150135 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 106951 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 223.333-16 chr1 248771088 248771511 + 1 NA Intergenic Intergenic -15512 NM_001291283 646627 Hs.146268 NM_001085474 ENSG00000259823 LYPD8 - LY6/PLAUR domain containing 8 protein-coding 309.333-4 chr10 16402028 16402406 + 1 NA Intergenic Intergenic -34726 NM_001001484 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 212.333-134 chr7 4517338 4517715 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -164769 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 148.667-27 chr1 218227660 218227818 + 1 NA Intergenic Intergenic -57554 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 161.667-148 chr2 218212921 218213143 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4157 NM_152862 10109 Hs.529303 NM_005731 ENSG00000163466 ARPC2 ARC34|PNAS-139|PRO2446|p34-Arc actin related protein 2/3 complex subunit 2 protein-coding 145.667-299 chr8 130013863 130014038 + 1 NA intron (NM_001353245, intron 1 of 13) intron (NM_001353245, intron 1 of 13) 2610 NM_001353310 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 149.667-85 chr12 7194353 7194623 + 1 NA intron (NM_001351131, intron 5 of 15) L1MD2|LINE|L1 4126 NM_000319 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 292.667-33 chr5 73111548 73111862 + 1 NA Intergenic Intergenic -8870 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 118.333-83 chr17 39320229 39320489 + 1 NA intron (NM_001370209, intron 2 of 13) intron (NM_001370209, intron 2 of 13) 22959 NR_162098 113839521 NR_162098 MIR548BC - microRNA 548BC ncRNA 263.333-63 chr4 72713862 72714183 + 1 NA Intergenic (TGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -144801 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 218.333-11 chr10 14546191 14546446 + 1 NA intron (NM_031453, intron 2 of 4) intron (NM_031453, intron 2 of 4) 2319 NM_001320739 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 142.667-51 chr14 39152320 39152492 + 1 NA intron (NM_177452, intron 3 of 4) intron (NM_177452, intron 3 of 4) 17927 NM_177452 122553 Hs.13303 NM_177452 ENSG00000182400 TRAPPC6B NEDMEBA|TPC6 trafficking protein particle complex 6B protein-coding 153.333-390 chr7 111088482 111088696 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) -2417 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 265.667-77 chr9 122431786 122432107 + 1 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 45980 NM_001004451 347168 Hs.632692 NM_001004451 ENSG00000136834 OR1J1 OR9-18|hg32 olfactory receptor family 1 subfamily J member 1 protein-coding 137.333-144 chr5 4962075 4962236 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -72204 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 125.667 chr1 5906938 5907112 + 1 NA intron (NM_001291594, intron 9 of 25) intron (NM_001291594, intron 9 of 25) -44284 NR_039838 100616421 NR_039838 ENSG00000264101 MIR4689 mir-4689 microRNA 4689 ncRNA 163.333-223 chr5 67145725 67145900 + 1 NA intron (NM_001290227, intron 21 of 25) intron (NM_001290227, intron 21 of 25) 50987 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 191.333-175 chr6 65717778 65717986 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -10656 NM_001142800 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 182.667-34 chr12 98023137 98023406 + 1 NA Intergenic Intergenic -27823 NR_036189 100422924 NR_036189 ENSG00000263890 MIR4303 - microRNA 4303 ncRNA 202.333-168 chr8 38330448 38330739 + 1 NA intron (NM_023034, intron 5 of 23) intron (NM_023034, intron 5 of 23) 51678 NM_023034 54904 Hs.434966 NM_017778 ENSG00000147548 NSD3 KMT3F|KMT3G|WHISTLE|WHSC1L1|pp14328 nuclear receptor binding SET domain protein 3 protein-coding 204.667-63 chr19 39002008 39002344 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -26434 NM_024907 115290 Hs.531770 NM_024907 ENSG00000269190 FBXO17 FBG4|FBX26|FBXO26|Fbx17 F-box protein 17 protein-coding 293.333-44 chr3 194460557 194460909 + 1 NA exon (NM_024524, exon 3 of 32) exon (NM_024524, exon 3 of 32) 7506 NM_024524 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 152.667-335 chr7 14241267 14241525 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) intron (NM_001350717, intron 22 of 24) -249971 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 194.333-147 chr7 141885571 141885982 + 1 NA Intergenic Intergenic -33100 NM_001001656 130075 Hs.690171 NM_001001656 ENSG00000258083 OR9A4 - olfactory receptor family 9 subfamily A member 4 protein-coding 180.333-67 chr21 35060492 35060750 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -11323 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 124.667-149 chr4 47286648 47286829 + 1 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) LTR102_Mam|LTR|ERVL 176964 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 144.333-152 chr21 15995455 15995726 + 1 NA Intergenic Intergenic -74898 NR_136541 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 197.333-42 chr11 127178775 127179204 + 1 NA Intergenic Intergenic -92081 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 247.333-21 chr12 43904276 43904719 + 1 NA intron (NM_001286213, intron 2 of 6) intron (NM_001286213, intron 2 of 6) 68416 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 255.333-110 chr8 108671244 108671539 + 1 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) intron (NR_136411, intron 1 of 3) 116203 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 202.667-151 chr8 134821148 134821603 + 1 NA Intergenic CR1-3_Croc|LINE|CR1 -16430 NR_029599 407033 NR_029599 ENSG00000199153 MIR30D MIRN30D|mir-30d microRNA 30d ncRNA 178.667-2 chr1 48205744 48205988 + 1 NA Intergenic Intergenic -16850 NM_001135181 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 141.333-85 chr17 77014342 77014533 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -45238 NR_136417 105371899 Hs.634683 NR_136416 ENSG00000267568 LOC105371899 - uncharacterized LOC105371899 ncRNA 152.667-314 chr5 177169392 177169680 + 1 NA intron (NM_172349, intron 3 of 23) HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner 35307 NM_001365684 64324 Hs.106861 NM_022455 ENSG00000165671 NSD1 ARA267|KMT3B|SOTOS|SOTOS1|STO nuclear receptor binding SET domain protein 1 protein-coding 154.333-63 chr11 68538650 68538820 + 1 NA intron (NR_147971, intron 4 of 24) intron (NR_147971, intron 4 of 24) 77983 NM_001164164 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 161.333-70 chr12 76334418 76334616 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 13898 NM_024685 79738 Hs.96322 NM_024685 ENSG00000179941 BBS10 C12orf58 Bardet-Biedl syndrome 10 protein-coding 148.667-276 chr4 46659600 46659783 + 1 NA Intergenic Intergenic 249554 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 184.333-164 chr9 84782821 84783117 + 1 NA intron (NM_001369547, intron 13 of 13) intron (NM_001369547, intron 13 of 13) 77068 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 174.333-138 chr7 31651023 31651241 + 1 NA intron (NM_194300, intron 10 of 12) intron (NM_194300, intron 10 of 12) -35885 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 156.667-362 chr9 122983685 122983895 + 1 NA intron (NM_012197, intron 2 of 25) intron (NM_012197, intron 2 of 25) 42770 NM_012197 23637 Hs.271341 NM_012197 ENSG00000011454 RABGAP1 GAPCENA|TBC1D11 RAB GTPase activating protein 1 protein-coding 174.667-51 chr14 60895602 60895959 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) (AACAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 85299 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 220.333-36 chr13 55760947 55761315 + 1 NA Intergenic Intergenic 586677 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 148.667-406 chrX 47495236 47495429 + 1 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -12063 NM_001324148 7592 Hs.496074 NM_007130 ENSG00000147124 ZNF41 MRX89 zinc finger protein 41 protein-coding 164.667-167 chr4 92488974 92489147 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 184661 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 141.333-188 chr5 53358428 53358701 + 1 NA Intergenic Intergenic -122065 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 184.333-25 chr12 49512871 49513073 + 1 NA intron (NR_120663, intron 10 of 14) intron (NR_120663, intron 10 of 14) -26058 NM_001314030 23416 Hs.64064 NM_012284 ENSG00000135519 KCNH3 BEC1|ELK2|Kv12.2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 3 protein-coding 217.667-31 chr15 79824430 79824786 + 1 NA Intergenic Intergenic 72389 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 158.667-198 chr22 39395433 39395697 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4215 NM_006116 10454 Hs.507681 NM_006116 ENSG00000100324 TAB1 3'-Tab1|MAP3K7IP1 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 1 protein-coding 172.667-107 chr4 57999535 57999804 + 1 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL 536659 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 190.667-21 chr11 30746482 30746793 + 1 NA Intergenic Intergenic -160284 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 350.333 chr1 35925266 35925705 + 1 NA 3' UTR (NM_012199, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_012199, exon 19 of 19) -5620 NM_024852 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 158.333-14 chr1 154854478 154854802 + 1 NA intron (NM_001204087, intron 1 of 8) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 5236 NM_170782 3782 Hs.490765 NM_002249 ENSG00000143603 KCNN3 KCa2.3|SK3|SKCA3|hSK3 potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 protein-coding 222.667-27 chr14 58428544 58429004 + 1 NA intron (NM_001329944, intron 1 of 31) intron (NM_001329944, intron 1 of 31) 1055 NM_001329945 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 244.667-53 chr19 36995967 36996246 + 1 NA intron (NM_001204839, intron 8 of 8) AluJo|SINE|Alu 79774 NM_001204835 374900 Hs.404220 NM_198539 ENSG00000198453 ZNF568 ZFP568 zinc finger protein 568 protein-coding 205.333-182 chr5 41103715 41104035 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -32533 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 154.667-221 chr21 17464681 17464938 + 1 NA Intergenic Intergenic 25919 NR_037586 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 193.667-125 chr7 28638949 28639244 + 1 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -47037 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 389.667 chr1 8934898 8935409 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -10715 NM_001270500 765 Hs.100322 NM_001215 ENSG00000131686 CA6 CA-VI|GUSTIN carbonic anhydrase 6 protein-coding 121.333-168 chr7 50022162 50022352 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 5 of 7) L1M4|LINE|L1 70989 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 239.667-22 chr14 85045150 85045578 + 1 NA Intergenic Intergenic -226568 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 163.333-212 chr5 12282302 12282569 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -292422 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 120.667-57 chr15 39282867 39283004 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 32266 NR_144507 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 206.333-120 chr4 46970602 46971012 + 1 NA intron (NM_001204267, intron 6 of 7) intron (NM_001204267, intron 6 of 7) 22774 NM_001204267 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 155.333-92 chr13 48830474 48830719 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -145316 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 166.333-115 chr2 69072044 69072252 + 1 NA intron (NM_032208, intron 5 of 17) intron (NM_032208, intron 5 of 17) -31534 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 143.333-169 chr22 47726073 47726312 + 1 NA intron (NR_122046, intron 7 of 8) L1ME2|LINE|L1 94518 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 172.667-21 chr10 33874977 33875290 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -102453 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 145.333-130 chr2 51066258 51066434 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 33745 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 201.333-186 chr3 71200594 71200900 + 1 NA intron (NR_146142, intron 5 of 19) intron (NR_146142, intron 5 of 19) 44330 NM_001244814 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 211.667-110 chr8 99475867 99476101 + 1 NA intron (NM_017890, intron 24 of 61) intron (NM_017890, intron 24 of 61) 60746 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 150.667-42 chr10 68158223 68158407 + 1 NA intron (NR_045663, intron 6 of 17) 7SK|RNA|RNA 48827 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 187.333-85 chr18 72598892 72599299 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -54753 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 277.333-56 chr20 59415705 59416092 + 1 NA Intergenic Intergenic 115287 NM_207033 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 182.333-100 chr22 24730610 24730862 + 1 NA intron (NM_001008496, intron 14 of 20) intron (NM_001008496, intron 14 of 20) -33765 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 112.667-12 chr1 158512353 158512558 + 1 NA Intergenic Intergenic 32577 NM_001004472 343406 Hs.451913 NM_001004472 ENSG00000198965 OR10R2 OR1-8|OR10R2Q olfactory receptor family 10 subfamily R member 2 protein-coding 196.333-13 chr10 89748224 89748638 + 1 NA intron (NM_016195, intron 23 of 32) MIRb|SINE|MIR 46841 NM_001284259 9585 Hs.240 NM_016195 ENSG00000138182 KIF20B CT90|KRMP1|MPHOSPH1|MPP-1|MPP1 kinesin family member 20B protein-coding 170.333-201 chr7 44883194 44883525 + 1 NA 3' UTR (NM_033224, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_033224, exon 1 of 1) -1559 NR_039801 100616393 NR_039801 ENSG00000284261 MIR4657 mir-4657 microRNA 4657 ncRNA 177.333-74 chr17 78013833 78014028 + 1 NA intron (NM_018996, intron 2 of 20) intron (NM_018996, intron 2 of 20) 9693 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 322.667-36 chr9 27910756 27911188 + 1 NA Intergenic Intergenic -337106 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 156.667-257 chr5 8146363 8146634 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 277350 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 244.667-102 chrX 67773031 67773434 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 228609 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 234.667-9 chr10 28033864 28034390 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -35048 NM_018076 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 200.333-11 chr10 56545900 56546252 + 1 NA Intergenic Intergenic -184803 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 121.667-62 chr15 34061363 34061492 + 1 NA intron (NM_012125, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 -22223 NM_020371 57099 Hs.555966 NM_020371 ENSG00000169857 AVEN PDCD12 apoptosis and caspase activation inhibitor protein-coding 300.333-29 chr22 37273318 37273896 + 1 NA Intergenic Intergenic -8901 NM_013385 27128 Hs.170944 NM_013385 ENSG00000100055 CYTH4 CYT4|DJ63G5.1|PSCD4|cytohesin-4 cytohesin 4 protein-coding 176.667-30 chr10 65474302 65474559 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -96995 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 115.333-192 chr6 119838492 119838629 + 1 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) -176619 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 169.667-82 chr15 97289538 97289761 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 232162 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 137.667-18 chr1 227273574 227273746 + 1 NA intron (NM_001366019, intron 1 of 36) intron (NM_001366019, intron 1 of 36) 44832 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 132.667-157 chr7 7514176 7514435 + 1 NA intron (NM_001037763, intron 8 of 34) MIRc|SINE|MIR 21568 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 149.333-362 chr7 16002952 16003185 + 1 NA Intergenic Intergenic -207418 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 183.333-51 chr14 96676627 96676946 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -64405 NR_146552 105370646 NR_146552 ENSG00000258979 LINC02299 - long intergenic non-protein coding RNA 2299 ncRNA 160.667-304 chr8 87124344 87124551 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1M3|LINE|L1 258032 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 129.333-125 chr3 87205707 87205881 + 1 NA Intergenic Intergenic 20483 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 136.667 chr1 29119045 29119250 + 1 NA TTS (NM_001171868) TTS (NM_001171868) 3354 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 148.667-148 chr16 61789941 61790132 + 1 NA intron (NM_001796, intron 7 of 11) intron (NM_001796, intron 7 of 11) 246402 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 148.333-168 chr18 8995917 8996121 + 1 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -106680 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 151.667-201 chr22 27568800 27568979 + 1 NA Intergenic Intergenic 232867 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 175.667-148 chr9 18834528 18834783 + 1 NA intron (NM_001040272, intron 23 of 28) L1ME1|LINE|L1 198554 NM_153707 158297 Hs.731593 NM_153707 ENSG00000155875 SAXO1 C9orf138|FAM154A stabilizer of axonemal microtubules 1 protein-coding 233.667-24 chr15 69209466 69209858 + 1 NA intron (NM_001324094, intron 2 of 5) L1MD3|LINE|L1 49027 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 351.333-19 chr21 28770473 28770927 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 114667 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 124.667-195 chr7 118384833 118385062 + 1 NA Intergenic Intergenic 160243 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 169.667-11 chr1 182369407 182369764 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 21819 NM_001033056 2752 Hs.132016 NM_002065 ENSG00000135821 GLUL GLNS|GS|PIG43|PIG59 glutamate-ammonia ligase protein-coding 148.333-294 chr4 163075016 163075250 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 18495 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 157.667-157 chr2 195422075 195422373 + 1 NA Intergenic Intergenic -234734 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 198.667-193 chr9 27316671 27317077 + 1 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -19724 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 144.333-130 chr2 112303745 112303910 + 1 NA intron (NM_198581, intron 3 of 11) L1MB4|LINE|L1 28230 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 197.667-4 chr1 90898568 90898836 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 46943 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 281.667-21 chr16 25200850 25201189 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -15928 NM_001169 343 Hs.176658 NM_001169 ENSG00000103375 AQP8 AQP-8 aquaporin 8 protein-coding 183.333-34 chr12 124764929 124765215 + 1 NA Intergenic Intergenic 74599 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 198.333-130 chr3 103979051 103979260 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -455039 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 162.667-161 chr21 23757127 23757343 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -372400 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 144.333-168 chr3 64915914 64916090 + 1 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 -228002 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 152.667-308 chr5 152582864 152583121 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -177713 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 171.667-147 chr6 146525786 146525988 + 1 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 -17946 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 243.333-18 chr12 40466575 40466855 + 1 NA intron (NM_173600, intron 51 of 173) MER67C|LTR|ERV1 73321 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 224.333-80 chr3 99751936 99752329 + 1 NA intron (NM_001850, intron 3 of 4) intron (NM_001850, intron 3 of 4) -65730 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 126.667-37 chr12 60156884 60157076 + 1 NA Intergenic Intergenic 467610 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 236.667-70 chr6 16393995 16394308 + 1 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) intron (NM_000332, intron 7 of 8) 155564 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 213.333-152 chr4 169158527 169158810 + 1 NA intron (NM_020870, intron 2 of 11) intron (NM_020870, intron 2 of 11) 112288 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 176.333-133 chr5 40934818 40935052 + 1 NA intron (NM_000587, intron 4 of 17) intron (NM_000587, intron 4 of 17) 25438 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 150.667-251 chr3 189435812 189436037 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -160822 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 137.667-124 chr3 74512766 74513002 + 1 NA intron (NM_020872, intron 1 of 21) intron (NM_020872, intron 1 of 21) 8256 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 189.333-98 chr2 123354026 123354335 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -280699 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 198.333-194 chr8 97473418 97473633 + 1 NA Intergenic Intergenic -27028 NR_125390 101927066 Hs.732112 NR_125390 LOC101927066 - uncharacterized LOC101927066 ncRNA 194.667-107 chr4 57089455 57089795 + 1 NA intron (NM_001553, intron 1 of 4) intron (NM_001553, intron 1 of 4) -20137 NR_034081 255130 Hs.691061 NR_034081 ENSG00000245067 IGFBP7-AS1 - IGFBP7 antisense RNA 1 ncRNA 156.333 chr1 14264971 14265142 + 1 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 154917 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 168.667-49 chr13 32677250 32677486 + 1 NA intron (NM_015032, intron 9 of 34) intron (NM_015032, intron 9 of 34) 90916 NM_015032 23047 Hs.744901 NM_015032 ENSG00000083642 PDS5B APRIN|AS3|CG008 PDS5 cohesin associated factor B protein-coding 463.333 chr11 3704294 3705062 + 1 NA intron (NR_157590, intron 22 of 31) intron (NR_157590, intron 22 of 31) -33294 NM_001303034 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 133.333-70 chr19 39972950 39973107 + 1 NA intron (NM_153001, intron 3 of 10) AluSq2|SINE|Alu 1863 NM_006503 5704 Hs.211594 NM_006503 ENSG00000013275 PSMC4 MIP224|RPT3|S6|TBP-7|TBP7 proteasome 26S subunit, ATPase 4 protein-coding 156.333-3 chr1 36872912 36873194 + 1 NA intron (NM_000831, intron 3 of 15) L2b|LINE|L2 161462 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 248.667-50 chr18 29843229 29843523 + 1 NA Intergenic Intergenic -455534 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 209.333-48 chr12 58842860 58843187 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -61307 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 191.667-58 chr17 54357007 54357376 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 534264 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 163.667-162 chr3 175207862 175208173 + 1 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) 63079 NR_046713 100874244 Hs.581176 NR_046713 NAALADL2-AS2 - NAALADL2 antisense RNA 2 ncRNA 131.333-113 chr3 18465046 18465218 + 1 NA intron (NR_125803, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR -19540 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 378.667-16 chr3 122272848 122273347 + 1 NA intron (NM_001178065, intron 4 of 6) intron (NM_001178065, intron 4 of 6) -52151 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 225.667-39 chr2 118420143 118420476 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 182657 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 244.333-73 chr3 112588851 112589408 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 12840 NR_109779 100506621 Hs.86538 NR_109779 LINC01279 - long intergenic non-protein coding RNA 1279 ncRNA 155.333-24 chr10 53782861 53783051 + 1 NA Intergenic Intergenic -703274 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 173.667-52 chr15 58683507 58683722 + 1 NA intron (NM_001320570, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu 9993 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 257.667-88 chr9 105539205 105539513 + 1 NA intron (NM_001287191, intron 13 of 13) intron (NM_001287191, intron 13 of 13) -18771 NM_006731 2218 Hs.55777 NM_006731 ENSG00000106692 FKTN CMD1X|FCMD|LGMD2M|LGMDR13|MDDGA4|MDDGB4|MDDGC4 fukutin protein-coding 151.667-85 chr12 50047389 50047675 + 1 NA Intergenic Intergenic -10064 NR_046389 41 Hs.274361 NM_001095 ENSG00000110881 ASIC1 ACCN2|ASIC|BNaC2 acid sensing ion channel subunit 1 protein-coding 236.667-10 chr10 16226938 16227217 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -209866 NM_001001484 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 178.667-149 chr7 5358432 5358622 + 1 NA intron (NM_001080495, intron 15 of 29) intron (NM_001080495, intron 15 of 29) 65019 NM_001080495 84629 Hs.520638 NM_001013722 ENSG00000182095 TNRC18 CAGL79|TNRC18A trinucleotide repeat containing 18 protein-coding 216.667-93 chr6 37227975 37228283 + 1 NA intron (NM_145316, intron 1 of 3) FLAM_A|SINE|Alu 29470 NM_145316 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 168.333-119 chr20 54117040 54117264 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -46387 NM_001316361 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 201.333-226 chr5 35612021 35612342 + 1 NA Intergenic Intergenic -5682 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 153.333-282 chr3 176857456 176857764 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -40609 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 151.333-378 chr7 3430383 3430586 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 129232 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 171.667-105 chr22 35283290 35283478 + 1 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -15891 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 148.667-261 chr3 146694805 146695052 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -88712 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 139.667-146 chr5 13885062 13885249 + 1 NA exon (NM_001369, exon 19 of 79) exon (NM_001369, exon 19 of 79) 59325 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 150.333-262 chr3 57635706 57635891 + 1 NA intron (NM_152678, intron 12 of 19) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 38009 NR_132370 106144532 Hs.667207 NR_132369 ENSG00000272146 ARF4-AS1 - ARF4 antisense RNA 1 ncRNA 348.667-8 chr12 106029142 106029776 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 110574 NM_014840 9891 Hs.524692 NM_014840 ENSG00000074590 NUAK1 ARK5 NUAK family kinase 1 protein-coding 178.333-37 chr12 63137315 63137610 + 1 NA Intergenic Intergenic 15348 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 195.667-57 chr17 45160137 45160483 + 1 NA 5' UTR (NM_144608, exon 1 of 4) 5' UTR (NM_144608, exon 1 of 4) 136 NM_001303438 124790 Hs.56382 NM_144608 ENSG00000168517 HEXIM2 L3 HEXIM P-TEFb complex subunit 2 protein-coding 146.333-344 chr8 139385082 139385286 + 1 NA Intergenic Intergenic 317939 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 151.667-294 chr5 145129672 145129836 + 1 NA Intergenic Intergenic 705588 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 159.333-157 chr2 69476509 69476793 + 1 NA intron (NM_014911, intron 21 of 21) intron (NM_014911, intron 21 of 21) -39023 NM_001002756 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 158.667-152 chr2 39562585 39562847 + 1 NA intron (NR_037875, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu -102782 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 245.333-91 chr4 106225899 106226213 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 20 of 26) AluJb|SINE|Alu -89554 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 246.667-74 chr5 119735103 119735543 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 105764 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 159.667-289 chr7 3701699 3701901 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1MD2|LINE|L1 400548 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 315.667-18 chr5 2546741 2547278 + 1 NA Intergenic Intergenic -165582 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 246.333-24 chr12 70036526 70036890 + 1 NA Intergenic Intergenic -206322 NM_001199302 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 129.333-3 chr1 69644288 69644458 + 1 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) L1M5|LINE|L1 75032 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 157.333-284 chr5 77890573 77890781 + 1 NA intron (NR_105012, intron 1 of 1) intron (NR_105012, intron 1 of 1) 6021 NR_105012 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 157.333-132 chr16 13936585 13936819 + 1 NA intron (NM_005236, intron 8 of 10) MIR3|SINE|MIR 16545 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 161.333-165 chr2 233539621 233539820 + 1 NA intron (NM_001365479, intron 10 of 31) L1MEf|LINE|L1 25853 NM_018218 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 204.333-110 chr2 203491135 203491362 + 1 NA exon (NM_213589, exon 3 of 14) exon (NM_213589, exon 3 of 14) 44053 NM_203365 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 304.667-30 chr5 81442123 81442518 + 1 NA intron (NM_012446, intron 13 of 16) intron (NM_012446, intron 13 of 16) -48186 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 161.667-88 chr15 54270401 54270623 + 1 NA intron (NM_001329919, intron 9 of 31) MIRb|SINE|MIR 257864 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 294.333-11 chr12 65908913 65909280 + 1 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -26771 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 268.333-60 chr9 91390135 91390518 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -28357 NM_001351432 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 132.667-192 chr9 107936769 107936930 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -447080 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 182.667-45 chr14 64306790 64307031 + 1 NA intron (NM_001291712, intron 2 of 13) L1M5|LINE|L1 -12500 NM_001437 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 143.333-2 chr1 22701350 22701618 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9354 NM_017449 2048 Hs.380705 NM_004442 ENSG00000133216 EPHB2 CAPB|DRT|EK5|EPHT3|ERK|Hek5|PCBC|Tyro5 EPH receptor B2 protein-coding 202.667-101 chr3 111068237 111068649 + 1 NA intron (NR_045114, intron 2 of 3) intron (NR_045114, intron 2 of 3) 1516 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 154.667-83 chr12 85436830 85437075 + 1 NA Intergenic Intergenic 156732 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 150.667-208 chr2 229890221 229890410 + 1 NA intron (NM_001348335, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 31364 NM_001348334 9320 Hs.572642 NM_004238 ENSG00000153827 TRIP12 MRD49|TRIP-12|ULF thyroid hormone receptor interactor 12 protein-coding 155.667-130 chr17 62330374 62330569 + 1 NA Intergenic Intergenic -39747 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 135.667-178 chr8 29533434 29533676 + 1 NA Intergenic Intergenic -182871 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 151.333-395 chr7 82345159 82345384 + 1 NA intron (NM_000722, intron 2 of 38) intron (NM_000722, intron 2 of 38) 98506 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 270.667-44 chr6 1861330 1861763 + 1 NA intron (NM_001253846, intron 7 of 10) intron (NM_001253846, intron 7 of 10) 251631 NM_001453 2296 Hs.348883 NM_001453 ENSG00000054598 FOXC1 ARA|ASGD3|FKHL7|FREAC-3|FREAC3|IGDA|IHG1|IRID1|RIEG3 forkhead box C1 protein-coding 242.667-54 chr2 134832343 134832726 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -6082 NM_001307983 130013 Hs.655728 NM_138326 ENSG00000153086 ACMSD - aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase protein-coding 111.667-169 chr3 98563438 98563586 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 30099 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 306.333-30 chr22 19365061 19365407 + 1 NA intron (NM_003325, intron 15 of 24) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 66499 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 262.667-24 chr14 61031124 61031435 + 1 NA intron (NR_033344, intron 6 of 16) intron (NR_033344, intron 6 of 16) -49589 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 165.667-91 chr2 84622693 84622890 + 1 NA intron (NM_001370, intron 26 of 76) L1M2|LINE|L1 106336 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 159.333-290 chr6 107220158 107220349 + 1 NA intron (NM_020381, intron 4 of 7) L1MB7|LINE|L1 -104738 NM_001367314 57673 Hs.418045 NM_001080450 ENSG00000178409 BEND3 KIAA1553 BEN domain containing 3 protein-coding 170.333-93 chr17 61738777 61738998 + 1 NA intron (NM_032043, intron 16 of 19) L1ME3G|LINE|L1 124672 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 169.667-120 chr20 38068735 38068995 + 1 NA intron (NM_021215, intron 6 of 6) intron (NM_021215, intron 6 of 6) 35119 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 229.333-12 chr10 76615093 76615476 + 1 NA Intergenic Intergenic -272760 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-351 chr7 8008793 8008971 + 1 NA intron (NM_138426, intron 2 of 7) L1ME2z|LINE|L1 40086 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 135.667-139 chr5 23282228 23282491 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -225250 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 326.333-8 chr14 48387610 48388332 + 1 NA Intergenic Intergenic -592957 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 162.667-180 chr3 143415796 143415984 + 1 NA intron (NM_173653, intron 12 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 73644 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-132 chr22 22988738 22989029 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -81636 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 153.333-451 chrX 57216535 57216694 + 1 NA Intergenic (TATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -70063 NM_001353840 158584 Hs.496205 NM_174912 ENSG00000165591 FAAH2 AMDD fatty acid amide hydrolase 2 protein-coding 184.333-148 chr8 51553824 51554025 + 1 NA intron (NM_144651, intron 4 of 22) intron (NM_144651, intron 4 of 22) 255521 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 227.333-33 chr13 36960142 36960478 + 1 NA intron (NM_013338, intron 8 of 9) HAL1|LINE|L1 39030 NM_013338 29880 Hs.507769 NM_013338 ENSG00000120697 ALG5 bA421P11.2 ALG5 dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase protein-coding 191.333-135 chr3 98352152 98352570 + 1 NA Intergenic Intergenic -1493 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 161.667-143 chr2 174432524 174432713 + 1 NA 3' UTR (NM_152529, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_152529, exon 16 of 16) 36888 NM_024583 79634 Hs.470679 NM_024583 ENSG00000144306 SCRN3 SES3 secernin 3 protein-coding 172.667-106 chr4 57238961 57239201 + 1 NA Intergenic Intergenic -128696 NM_001253835 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 215.333-38 chr12 3850549 3850922 + 1 NA intron (NM_020367, intron 1 of 7) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 22664 NR_104461 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 158.333-160 chr2 138055333 138055563 + 1 NA Intergenic LTR83|LTR|ERVL -46436 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 267.333-85 chr7 39816886 39817480 + 1 NA Intergenic Intergenic 83615 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 149.667-160 chr17 61129523 61129700 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 238093 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 117.667-154 chr5 84049051 84049215 + 1 NA intron (NM_001278642, intron 8 of 9) intron (NM_001278642, intron 8 of 9) -328278 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 139.667-4 chr1 96663220 96663411 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -58290 NM_001300988 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 145.667-131 chr2 59921823 59922016 + 1 NA Intergenic Intergenic 461117 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 157.333-87 chr12 56251784 56252042 + 1 NA intron (NM_173595, intron 15 of 27) intron (NM_173595, intron 15 of 27) 6471 NM_173595 283373 Hs.524506 NM_173595 ENSG00000139645 ANKRD52 ANKRD33 ankyrin repeat domain 52 protein-coding 205.333-72 chr14 61166285 61166604 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 114894 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 165.333-109 chr17 78976832 78977159 + 1 NA intron (NM_005567, intron 2 of 5) intron (NM_005567, intron 2 of 5) 2928 NM_005567 3959 Hs.514535 NM_005567 ENSG00000108679 LGALS3BP 90K|BTBD17B|CyCAP|M2BP|MAC-2-BP|TANGO10B|gp90 galectin 3 binding protein protein-coding 152.667-236 chr3 11169489 11169762 + 1 NA intron (NM_001098212, intron 1 of 1) intron (NM_001098212, intron 1 of 1) 15132 NM_001098212 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 122.333-131 chr22 38646049 38646199 + 1 NA intron (NM_001013647, intron 2 of 16) intron (NM_001013647, intron 2 of 16) 10268 NM_001013647 646851 Hs.542707 NM_001013647 ENSG00000184949 FAM227A - family with sequence similarity 227 member A protein-coding 130.667-81 chr16 70134674 70134853 + 1 NA intron (NM_001322119, intron 6 of 16) AluSx|SINE|Alu 21137 NM_017990 55066 Hs.744043 NM_017990 ENSG00000090857 PDPR PDP3 pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit protein-coding 144.667-299 chr8 96289095 96289355 + 1 NA intron (NM_014754, intron 4 of 12) MER21C|LTR|ERVL 27323 NM_001290225 9791 Hs.292579 NM_014754 ENSG00000156471 PTDSS1 LMHD|PSS1|PSSA phosphatidylserine synthase 1 protein-coding 256.667-20 chr12 60010548 60010959 + 1 NA Intergenic Intergenic 321383 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 169.667-41 chr12 34678565 34678881 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 656227 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 144.333-108 chr18 62090369 62090629 + 1 NA exon (NM_012327, exon 23 of 30) exon (NM_012327, exon 23 of 30) 96557 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 160.667-198 chr3 78618414 78618658 + 1 NA intron (NM_002941, intron 26 of 30) intron (NM_002941, intron 26 of 30) 400923 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 219.667-87 chr7 18046291 18046573 + 1 NA Intergenic MER5C|DNA|hAT-Charlie -18586 NM_175886 221823 Hs.169284 NM_175886 ENSG00000229937 PRPS1L1 PRPS1|PRPS3|PRPSL|PRS-III phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1 like 1 protein-coding 211.333-152 chr3 74268931 74269310 + 1 NA intron (NM_020872, intron 19 of 21) intron (NM_020872, intron 19 of 21) 252020 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 134.667-98 chr2 62883674 62883849 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) AluJb|SINE|Alu 163950 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 309.333-12 chr11 108975154 108975530 + 1 NA Intergenic Intergenic 310273 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 349.333-11 chr14 38344072 38344566 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -88226 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 157.667-298 chr7 34838806 34839086 + 1 NA intron (NM_207172, intron 6 of 8) intron (NM_207172, intron 6 of 8) -4615 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 158.333-25 chr1 231855145 231855409 + 1 NA 3' UTR (NM_001164539, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001164539, exon 10 of 10) -36760 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 147.667-193 chr2 194705995 194706194 + 1 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -24501 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 140.667-20 chr1 185814345 185814531 + 1 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) intron (NM_031935, intron 1 of 106) 80047 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 246.333-41 chr17 57466927 57467274 + 1 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 56497 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 142.667-167 chr4 135014349 135014512 + 1 NA Intergenic Intergenic 109129 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 175.333-195 chr8 133487388 133487710 + 1 NA intron (NM_003033, intron 3 of 8) intron (NM_003033, intron 3 of 8) 84338 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 140.333-248 chr9 103906629 103906791 + 1 NA Intergenic Intergenic -92999 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 250.333-34 chr20 15009008 15009394 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -79683 NR_072988 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 129.667-93 chr2 72755028 72755261 + 1 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 70889 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 134.333-76 chr18 50606998 50607230 + 1 NA intron (NM_001292039, intron 1 of 4) intron (NM_001292039, intron 1 of 4) 47027 NM_002747 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 164.667-210 chr6 140425583 140425768 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 220423 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 187.667-8 chr1 191510016 191510326 + 1 NA Intergenic MER41D|LTR|ERV1 -281673 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 170.333-192 chr7 514999 515248 + 1 NA intron (NM_002607, intron 2 of 6) intron (NM_002607, intron 2 of 6) 4721 NM_002607 5154 Hs.535898 NM_002607 ENSG00000197461 PDGFA PDGF-A|PDGF1 platelet derived growth factor subunit A protein-coding 168.333-192 chr7 43605717 43605994 + 1 NA intron (NM_004760, intron 2 of 6) intron (NM_004760, intron 2 of 6) 22747 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 165.667-12 chr1 223083835 223084047 + 1 NA Intergenic Intergenic 59307 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 144.667-212 chr4 30819531 30819679 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 99236 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 196.333-46 chr14 102040848 102041151 + 1 NA intron (NM_001376, intron 64 of 77) intron (NM_001376, intron 64 of 77) 46045 NM_005348 3320 Hs.525600 NM_005348 ENSG00000080824 HSP90AA1 EL52|HEL-S-65p|HSP86|HSP89A|HSP90A|HSP90N|HSPC1|HSPCA|HSPCAL1|HSPCAL4|HSPN|Hsp103|Hsp89|Hsp90|LAP-2|LAP2 heat shock protein 90 alpha family class A member 1 protein-coding 231.333-33 chr12 37387631 37387934 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -928992 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 173.667-103 chr21 21000716 21000929 + 1 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) 2413 NM_001352595 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 205.333-186 chr5 73354586 73354911 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 16842 NR_146627 105379033 Hs.145178 NR_146627 LINC02230 - long intergenic non-protein coding RNA 2230 ncRNA 177.333-153 chr7 50658094 50658390 + 1 NA intron (NM_001350816, intron 6 of 17) intron (NM_001350816, intron 6 of 17) 47059 NM_001001550 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 135.667-150 chr5 160164926 160165136 + 1 NA Intergenic Intergenic -22350 NM_001130958 2172 Hs.519719 NM_001445 ENSG00000170231 FABP6 I-15P|I-BABP|I-BALB|I-BAP|ILBP|ILBP3|ILLBP fatty acid binding protein 6 protein-coding 138.333-14 chr1 220951686 220951908 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -71657 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 243.667-14 chr11 110009141 110009430 + 1 NA Intergenic Intergenic -84107 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 166.667-232 chr8 96201007 96201217 + 1 NA Intergenic Intergenic 34522 NM_001254752 7381 Hs.131255 NM_006294 ENSG00000156467 UQCRB MC3DN3|QCR7|QP-C|QPC|UQBC|UQBP|UQCR6|UQPC ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein protein-coding 125.667-7 chr1 82463092 82463251 + 1 NA Intergenic Intergenic -440012 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 155.667-354 chr8 84713945 84714247 + 1 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) L1MA8|LINE|L1 8169 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 306.667-20 chr2 56202597 56202973 + 1 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -17015 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 261.333-9 chr1 227250665 227251029 + 1 NA intron (NM_001366019, intron 2 of 36) AluJo|SINE|Alu 67645 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 161.333-208 chr4 39906414 39906730 + 1 NA intron (NM_001100399, intron 11 of 32) intron (NM_001100399, intron 11 of 32) 71339 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 203.333-39 chr10 112091025 112091477 + 1 NA Intergenic Intergenic 92514 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 195.667-40 chr14 31911405 31911610 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -33346 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 226.333-18 chr11 89545809 89546167 + 1 NA intron (NM_001143837, intron 2 of 20) intron (NM_001143837, intron 2 of 20) 43569 NM_001143837 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 149.333-372 chr7 83136937 83137164 + 1 NA intron (NM_033026, intron 2 of 24) intron (NM_033026, intron 2 of 24) 25834 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 152.333-324 chr6 28341149 28341388 + 1 NA intron (NM_145909, intron 3 of 7) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -4893 NM_001243244 64288 Hs.656413 NM_030899 ENSG00000235109 ZSCAN31 ZNF20-Lp|ZNF310P|ZNF323 zinc finger and SCAN domain containing 31 protein-coding 162.667-204 chr4 138340294 138340592 + 1 NA intron (NR_051987, intron 1 of 2) intron (NR_051987, intron 1 of 2) 30732 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 332.333-20 chr4 101918242 101918696 + 1 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) intron (NM_017935, intron 7 of 16) 104627 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 170.333-102 chr19 15102995 15103252 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -4278 NM_033025 85360 Hs.528701 NM_033025 ENSG00000105137 SYDE1 7h3|SYD1 synapse defective Rho GTPase homolog 1 protein-coding 224.667-72 chr7 53331667 53332022 + 1 NA Intergenic Intergenic 296211 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 122.667-207 chr9 32872500 32872704 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 89062 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 158.333-277 chr6 99139215 99139494 + 1 NA Intergenic Intergenic 14745 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 164.333-253 chrUn_KI270538v1 2113 2352 + 1 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 297.333-16 chr12 38590915 38591292 + 1 NA Intergenic Intergenic 274329 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 207.333-46 chr11 37299858 37300280 + 1 NA Intergenic Intergenic -638532 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 145.667-40 chr10 110384646 110384922 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -79864 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 158.667-101 chr14 73078731 73079005 + 1 NA intron (NM_021239, intron 4 of 18) AluSz6|SINE|Alu 20334 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 207.333-245 chr6 128769894 128770239 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -113072 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 146.667-103 chr14 59313874 59314126 + 1 NA intron (NM_001270520, intron 3 of 24) intron (NM_001270520, intron 3 of 24) 50559 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 153.333-388 chr7 104930793 104931001 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -4252 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 141.667-28 chr10 59478902 59479152 + 1 NA Intergenic Intergenic -115846 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 262.333-81 chr8 138756493 138756923 + 1 NA intron (NM_152888, intron 18 of 64) intron (NM_152888, intron 18 of 64) 157333 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 163.667-159 chr3 119881023 119881192 + 1 NA intron (NM_002093, intron 7 of 11) L1ME3D|LINE|L1 98397 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 162.333-135 chr20 31380842 31381129 + 1 NA intron (NR_073153, intron 1 of 2) L1MD2|LINE|L1 9605 NM_153323 245932 Hs.516998 NM_153289 ENSG00000180483 DEFB119 DEFB-19|DEFB-20|DEFB120|DEFB20|ESC42-RELA|ESC42-RELB defensin beta 119 protein-coding 143.333-82 chr14 50261211 50261438 + 1 NA intron (NM_024884, intron 9 of 9) intron (NM_024884, intron 9 of 9) -29746 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 134.333-131 chr4 107921546 107921696 + 1 NA intron (NR_125929, intron 1 of 6) L1MB4|LINE|L1 -9928 NM_183075 113612 Hs.109087 NM_183075 ENSG00000155016 CYP2U1 P450TEC|SPG49|SPG56 cytochrome P450 family 2 subfamily U member 1 protein-coding 337.333-33 chr4 146411488 146411903 + 1 NA intron (NM_001317816, intron 4 of 10) intron (NM_001317816, intron 4 of 10) 3112 NR_107003 102465837 NR_107003 ENSG00000278438 MIR7849 hsa-mir-7849 microRNA 7849 ncRNA 129.667-144 chr5 180678315 180678466 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -5706 NR_146728 105377765 Hs.131536 NR_146728 LINC02222 - long intergenic non-protein coding RNA 2222 ncRNA 151.333-214 chr2 85039002 85039239 + 1 NA intron (NM_020122, intron 3 of 6) intron (NM_020122, intron 3 of 6) 28227 NR_146453 100996478 Hs.434398 NR_146453 ENSG00000260840 LINC01964 - long intergenic non-protein coding RNA 1964 ncRNA 127.333-193 chr8 117370603 117370845 + 1 NA Intergenic Intergenic -149989 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 176.333-14 chr1 206867698 206868004 + 1 NA intron (NM_018724, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 2042 NM_018724 50604 Hs.272373 NM_018724 ENSG00000162891 IL20 IL-20|IL10D|ZCYTO10 interleukin 20 protein-coding 229.333-126 chr9 81102886 81103264 + 1 NA Intergenic Intergenic 586460 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 112.333-31 chr10 120008287 120008449 + 1 NA Intergenic Intergenic 49855 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 159.667-227 chr4 35071286 35071481 + 1 NA Intergenic Intergenic -801636 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 151.667-198 chr21 37984121 37984272 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -67739 NM_002240 3763 Hs.626242 NM_002240 ENSG00000157542 KCNJ6 BIR1|GIRK-2|GIRK2|KATP-2|KATP2|KCNJ7|KIR3.2|KPLBS|hiGIRK2 potassium voltage-gated channel subfamily J member 6 protein-coding 151.333-452 chrX 97646670 97646824 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -82212 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 234.333-73 chr7 25267195 25267483 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -38853 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 193.667-14 chr1 168842785 168843054 + 1 NA Intergenic Intergenic 55978 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 189.333-204 chr8 62347857 62348161 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 99155 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 225.333-2 chr1 41143234 41143613 + 1 NA intron (NM_001172220, intron 4 of 13) intron (NM_001172220, intron 4 of 13) 18009 NM_001031694 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 159.667-345 chrX 65729228 65729436 + 1 NA intron (NM_002444, intron 3 of 12) intron (NM_002444, intron 3 of 12) 61678 NM_002444 4478 Hs.87752 NM_002444 ENSG00000147065 MSN HEL70|IMD50 moesin protein-coding 156.333-64 chr11 110922255 110922451 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 174965 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 118.667-5 chr1 72110503 72110686 + 1 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) 171945 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 178.667-135 chr5 124912415 124912648 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -124300 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 143.667-160 chr3 62107275 62107540 + 1 NA intron (NM_002841, intron 5 of 29) intron (NM_002841, intron 5 of 29) 211540 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 144.333-12 chr1 116354871 116355108 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -18255 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 149.667-230 chr20 10026436 10026673 + 1 NA non-coding (NR_040710, exon 4 of 5) non-coding (NR_040710, exon 4 of 5) -8433 NM_198798 63926 Hs.70903 NM_022096 ENSG00000132623 ANKEF1 ANKRD5 ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 protein-coding 238.667-40 chr2 66516494 66516987 + 1 NA intron (NM_002398, intron 8 of 12) intron (NM_002398, intron 8 of 12) -57290 NR_110156 100507073 Hs.667940 NR_110156 ENSG00000232046 LINC01798 - long intergenic non-protein coding RNA 1798 ncRNA 117.667-43 chr12 103108357 103108518 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -43405 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 245.667-70 chr8 35074269 35074618 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -161032 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 153.333-64 chr11 32712943 32713146 + 1 NA intron (NM_001008391, intron 3 of 17) intron (NM_001008391, intron 3 of 17) 81614 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 264.667-46 chr20 18729276 18729596 + 1 NA intron (NM_080820, intron 4 of 5) intron (NM_080820, intron 4 of 5) -30728 NR_109955 101929526 Hs.639402 NR_109955 ENSG00000233993 LOC101929526 - uncharacterized LOC101929526 ncRNA 164.667-43 chr11 112219553 112219850 + 1 NA TTS (NM_001256400) TTS (NM_001256400) -6727 NM_000317 5805 Hs.503860 NM_000317 ENSG00000150787 PTS PTPS 6-pyruvoyltetrahydropterin synthase protein-coding 193.667-28 chr11 124290635 124291061 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 19918 NM_001002917 283159 Hs.504211 NM_001002917 ENSG00000196341 OR8D1 JCG9|OR8D3|OST004|PDJ9J14 olfactory receptor family 8 subfamily D member 1 protein-coding 288.667-37 chr9 72060277 72060826 + 1 NA promoter-TSS (NM_001128618) promoter-TSS (NM_001128618) 54 NM_001128618 138240 Hs.371235 NM_001128618 ENSG00000204669 C9orf57 - chromosome 9 open reading frame 57 protein-coding 190.333-98 chr3 161563950 161564378 + 1 NA Intergenic Intergenic 67356 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 266.667-7 chr1 107268418 107268903 + 1 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 120591 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 138.333-113 chr21 26133082 26133242 + 1 NA intron (NM_001136131, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu 7228 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 288.667-39 chr9 115316336 115316942 + 1 NA intron (NR_163556, intron 4 of 7) intron (NR_163556, intron 4 of 7) 174821 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 200.333-106 chr4 94060085 94060462 + 1 NA Intergenic Intergenic 147283 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 138.333-30 chr10 83151343 83151583 + 1 NA Intergenic Intergenic 525626 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 126.333-19 chr10 43949468 43949670 + 1 NA intron (NR_033846, intron 5 of 7) L1MB8|LINE|L1 37167 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 206.333-36 chr12 51878354 51878715 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -9569 NM_182608 341405 Hs.433492 NM_182608 ENSG00000167612 ANKRD33 C12orf7|PANKY ankyrin repeat domain 33 protein-coding 155.667 chr1 9967311 9967482 + 1 NA promoter-TSS (NR_049882) promoter-TSS (NR_049882) 15 NR_049882 100847055 NR_049882 ENSG00000265521 MIR5697 - microRNA 5697 ncRNA 165.333-261 chr9 25391853 25392080 + 1 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 286892 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 192.667-123 chr4 61698354 61698641 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 4 of 20) intron (NM_001371342, intron 4 of 20) 463268 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 125.667-67 chr15 27227668 27227821 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) intron (NM_001270873, intron 3 of 5) -66425 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-379 chr8 100749463 100749667 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -27477 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 156.667-241 chr4 42074279 42074535 + 1 NA intron (NM_006345, intron 15 of 17) intron (NM_006345, intron 15 of 17) 78248 NM_001159547 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 122.667-49 chr14 65444220 65444405 + 1 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) L1ME1|LINE|L1 -26790 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 166.333-192 chr5 134908622 134908816 + 1 NA intron (NM_032151, intron 1 of 3) intron (NM_032151, intron 1 of 3) 3599 NM_032151 84105 Hs.710014 NM_032151 ENSG00000132570 PCBD2 DCOH2|DCOHM|PHS2 pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 2 protein-coding 160.667-17 chr1 117517926 117518095 + 1 NA intron (NM_006699, intron 12 of 12) intron (NM_006699, intron 12 of 12) 87760 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 160.333-158 chr2 212257278 212257542 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 168950 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 205.667-38 chr12 129819439 129819775 + 1 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 84418 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 283.333-31 chr2 50556604 50556953 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) intron (NM_001330093, intron 8 of 22) 139484 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 274.333-11 chr11 100188944 100189286 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) L1PA16|LINE|L1 -498173 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 249.667-16 chr11 6609769 6610256 + 1 NA exon (NM_001278442, exon 10 of 12) exon (NM_001278442, exon 10 of 12) 2204 NM_006284 6881 Hs.5158 NM_006284 ENSG00000166337 TAF10 TAF2A|TAF2H|TAFII30 TATA-box binding protein associated factor 10 protein-coding 166.333-164 chr4 33120201 33120435 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 769280 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 244.667-69 chr3 197232245 197232528 + 1 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) intron (NM_001366216, intron 4 of 23) -48255 NM_001204388 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 152.667-20 chr1 182903296 182903534 + 1 NA intron (NM_030933, intron 8 of 9) intron (NM_030933, intron 8 of 9) 49751 NM_030933 81626 Hs.497034 NM_030933 ENSG00000157060 SHCBP1L C1orf14|GE36 SHC binding and spindle associated 1 like protein-coding 117.333-13 chr1 155847024 155847212 + 1 NA intron (NM_032292, intron 2 of 20) intron (NM_032292, intron 2 of 20) 10096 NM_001282858 54856 Hs.656361 NM_032292 ENSG00000116580 GON4L GON-4|GON4|YARP gon-4 like protein-coding 159.667-49 chr10 70891147 70891415 + 1 NA Intergenic LTR28|LTR|ERV1 -2716 NM_000281 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 178.333-62 chr17 56962416 56962791 + 1 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -1553 NM_004645 8161 Hs.532795 NM_004645 ENSG00000121058 COIL CLN80|p80-coilin coilin protein-coding 336.667-2 chr1 51111397 51112136 + 1 NA intron (NM_001136508, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 9538 NM_001136508 284546 Hs.176177 NM_001136508 ENSG00000204006 C1orf185 - chromosome 1 open reading frame 185 protein-coding 164.333-193 chr5 46055745 46055909 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -359447 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 142.667-38 chr12 60860454 60860725 + 1 NA Intergenic Intergenic 1171219 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 186.333-3 chr1 65598874 65599152 + 1 NA intron (NM_001003679, intron 8 of 19) intron (NM_001003679, intron 8 of 19) 73324 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 155.667-268 chr5 25514427 25514665 + 1 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 323593 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 163.333-291 chr8 131083932 131084137 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -43125 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 144.333-162 chr3 23264042 23264267 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 60827 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 160.667-164 chr2 165643854 165644155 + 1 NA intron (NM_024969, intron 2 of 4) intron (NM_024969, intron 2 of 4) 71668 NM_024969 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 137.667-132 chr3 189038074 189038296 + 1 NA Intergenic Intergenic -90546 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 242.333-16 chr10 126991201 126991555 + 1 NA intron (NM_001290223, intron 6 of 51) MIR3|SINE|MIR 85969 NM_001290223 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 320.333-9 chr17 72519244 72519826 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 73269 NR_152515 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 149.333-98 chr12 132835440 132835680 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -6691 NM_001172557 2802 Hs.507333 NM_005895 ENSG00000090615 GOLGA3 GCP170|MEA-2 golgin A3 protein-coding 122.667-190 chr8 51347682 51347860 + 1 NA intron (NM_144651, intron 19 of 22) intron (NM_144651, intron 19 of 22) 461674 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 147.333-83 chr12 55909333 55909527 + 1 NA intron (NM_032345, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 17695 NM_001143853 84305 Hs.505687 NM_032345 ENSG00000170473 PYM1 PYM|WIBG PYM homolog 1, exon junction complex associated factor protein-coding 165.333-257 chr9 15235297 15235602 + 1 NA intron (NM_001168340, intron 2 of 18) L1PB4|LINE|L1 14769 NM_001168342 158219 Hs.563630 NM_152574 ENSG00000155158 TTC39B C9orf52 tetratricopeptide repeat domain 39B protein-coding 165.667-126 chr3 104919757 104920046 + 1 NA Intergenic Intergenic -446812 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 140.333-68 chr14 78746667 78746847 + 1 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) intron (NR_073547, intron 8 of 20) 343038 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 154.333-333 chr8 48666769 48667044 + 1 NA intron (NR_105002, intron 2 of 3) L1MC5|LINE|L1 46503 NR_105004 101929217 Hs.547790 NR_105004 ENSG00000253455 LOC101929217 - uncharacterized LOC101929217 ncRNA 147.667-379 chr8 136348758 136348979 + 1 NA Intergenic Intergenic -181930 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 216.333-6 chr1 80807992 80808491 + 1 NA Intergenic Intergenic 166954 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 193.667-88 chr3 112097784 112098178 + 1 NA intron (NM_024616, intron 2 of 5) MER85|DNA|PiggyBac 11646 NM_001171747 79669 Hs.434247 NM_024616 ENSG00000114529 C3orf52 TTMP chromosome 3 open reading frame 52 protein-coding 156.667-293 chr6 24993108 24993299 + 1 NA intron (NM_001286446, intron 1 of 13) L1PA10|LINE|L1 49085 NM_001286446 9750 Hs.559459 NM_014722 ENSG00000111913 RIPOR2 C6orf32|DFNB104|DIFF40|DIFF48|FAM65B|MYONAP|PL48 RHO family interacting cell polarization regulator 2 protein-coding 136.333-159 chr5 3359134 3359392 + 1 NA Intergenic Intergenic -93553 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 159.333-151 chr2 50443957 50444181 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -96313 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 162.667-2 chr1 49093455 49093644 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) L2c|LINE|L2 -163862 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 154.333-119 chr17 52673779 52674050 + 1 NA Intergenic Intergenic -188207 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 255.667-5 chr1 202992644 202993053 + 1 NA intron (NR_036557, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 14417 NR_036557 100506747 Hs.642024 NR_036557 LOC100506747 - alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog pseudo 146.333-340 chr8 126285419 126285659 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -39956 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 168.667-48 chr12 129773164 129773467 + 1 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 130710 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 202.333-6 chr1 48353483 48353892 + 1 NA intron (NM_001286238, intron 11 of 12) L1ME3A|LINE|L1 118517 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 287.333-38 chr3 103097583 103098094 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 426278 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 111.667-116 chr18 22489285 22489472 + 1 NA Intergenic Intergenic -71463 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 118.333-173 chr5 153606778 153606945 + 1 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) L1ME3|LINE|L1 114689 NM_001258021 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 161.667-197 chr5 25970246 25970448 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 779394 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 180.667-22 chr11 27541624 27541845 + 1 NA intron (NR_033315, intron 2 of 6) L1ME1|LINE|L1 -26687 NR_107054 102465881 NR_107054 ENSG00000278483 MIR8087 hsa-mir-8087 microRNA 8087 ncRNA 182.667-127 chr5 5642278 5642582 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 219753 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 202.667-33 chr11 104223084 104223395 + 1 NA Intergenic Intergenic -59092 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 213.667-70 chr4 114715996 114716316 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 59397 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 137.333-50 chr14 79258030 79258198 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -21266 NM_001272020 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 157.667-201 chr3 156611214 156611397 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -56105 NM_001308197 6747 Hs.518346 NM_007107 ENSG00000114850 SSR3 TRAPG signal sequence receptor subunit 3 protein-coding 153.667-201 chr2 149106834 149107011 + 1 NA intron (NM_001317004, intron 1 of 6) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -11252 NM_001317002 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 212.333-20 chr10 97806083 97806352 + 1 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -34218 NM_003015 6425 Hs.279565 NM_003015 ENSG00000120057 SFRP5 SARP3 secreted frizzled related protein 5 protein-coding 179.333-40 chr11 82787546 82787755 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -53786 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 256.667-82 chr7 69338568 69339004 + 1 NA Intergenic Intergenic 258838 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 156.667-344 chr8 125348467 125348633 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -81808 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 175.333-45 chr14 60555904 60556195 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 46903 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 214.667-123 chr8 129888396 129888707 + 1 NA intron (NM_001353307, intron 4 of 13) L2a|LINE|L2 51260 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 191.333-191 chr7 81913915 81914196 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -95122 NR_110077 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 158.667-75 chr12 51282543 51282777 + 1 NA intron (NM_001364779, intron 12 of 12) AluSz6|SINE|Alu -12245 NM_001031628 57228 Hs.652389 NM_001031628 ENSG00000170545 SMAGP hSMAGP small cell adhesion glycoprotein protein-coding 250.333-49 chr4 62634140 62634564 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -472587 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 190.333-46 chr14 61039220 61039496 + 1 NA intron (NR_033344, intron 8 of 16) intron (NR_033344, intron 8 of 16) -57668 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 173.667-171 chr7 137581775 137582136 + 1 NA intron (NM_001321710, intron 14 of 32) intron (NM_001321710, intron 14 of 32) -238222 NM_001321387 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 190.333-142 chr8 63732650 63732981 + 1 NA Intergenic Intergenic -36615 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 158.667-126 chr17 67475493 67475744 + 1 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) intron (NM_181671, intron 1 of 9) -4033 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 144.667-172 chr20 55486849 55487089 + 1 NA Intergenic Intergenic -59772 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 166.667-37 chr11 33756236 33756535 + 1 NA intron (NM_012175, intron 4 of 10) intron (NM_012175, intron 4 of 10) 18135 NM_033406 26273 Hs.406787 NM_012175 ENSG00000110429 FBXO3 FBA|FBX3 F-box protein 3 protein-coding 171.667-57 chr15 78681100 78681317 + 1 NA Intergenic Intergenic -39998 NM_000750 1143 Hs.624178 NM_000750 ENSG00000117971 CHRNB4 - cholinergic receptor nicotinic beta 4 subunit protein-coding 261.667-38 chr2 109171439 109171862 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -30062 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 183.333-56 chr15 77208652 77208931 + 1 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) intron (NM_024776, intron 4 of 7) 16613 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 116.667-204 chr8 112422874 112423052 + 1 NA intron (NM_052900, intron 31 of 68) intron (NM_052900, intron 31 of 68) -220530 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 143.667-36 chr11 14464654 14464807 + 1 NA intron (NM_016451, intron 18 of 21) L2b|LINE|L2 35128 NM_016451 1315 Hs.339278 NM_016451 ENSG00000129083 COPB1 COPB coatomer protein complex subunit beta 1 protein-coding 212.333-105 chr4 79735805 79736179 + 1 NA Intergenic Intergenic -91479 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 148.333-413 chr9 87357861 87358101 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -139247 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 142.333-122 chr2 112466938 112467186 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15094 NM_153712 150465 Hs.358997 NM_153712 ENSG00000114999 TTL - tubulin tyrosine ligase protein-coding 177.333-109 chr3 125564334 125564583 + 1 NA intron (NM_022776, intron 6 of 12) intron (NM_022776, intron 6 of 12) 31039 NM_022776 114885 Hs.477440 NM_022776 ENSG00000144909 OSBPL11 ORP-11|ORP11|OSBP12|TCCCIA00292 oxysterol binding protein like 11 protein-coding 150.667-84 chr12 23593905 23594067 + 1 NA intron (NM_152989, intron 12 of 17) intron (NM_152989, intron 12 of 17) -9400 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 126.667-27 chr11 115416689 115416922 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) 20049 NR_135103 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 160.667-185 chr22 27211740 27211972 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 12823 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 166.667-88 chr17 54246922 54247163 + 1 NA Intergenic Intergenic 424115 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 144.333-6 chr1 44214072 44214304 + 1 NA intron (NM_019100, intron 1 of 9) intron (NM_019100, intron 1 of 9) 717 NM_001034024 55929 Hs.8008 NM_019100 ENSG00000178028 DMAP1 DNMAP1|DNMTAP1|EAF2|MEAF2|SWC4 DNA methyltransferase 1 associated protein 1 protein-coding 179.667-127 chr7 77211564 77211795 + 1 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) AluSz|SINE|Alu -11860 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 139.667-120 chr3 94483466 94483663 + 1 NA Intergenic Intergenic 420503 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 234.333 chr1 27466651 27467049 + 1 NA intron (NM_006990, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu 23317 NM_006990 10163 Hs.469244 NM_006990 ENSG00000158195 WASF2 IMD2|SCAR2|WASF4|WAVE2|dJ393P12.2 WASP family member 2 protein-coding 253.667-21 chr14 68218666 68219185 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 395333 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 306.667-18 chr2 20569000 20569513 + 1 NA Intergenic Intergenic 23292 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 163.667-87 chr17 68242437 68242713 + 1 NA intron (NM_001346472, intron 2 of 7) AluSx|SINE|Alu -4999 NM_001346485 51321 Hs.293560 NM_016627 ENSG00000196704 AMZ2 - archaelysin family metallopeptidase 2 protein-coding 116.667-76 chr17 21063678 21063885 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -11775 NR_110895 101060544 Hs.585812 NR_110895 ENSG00000236819 LINC01563 HP08942 long intergenic non-protein coding RNA 1563 ncRNA 165.667-167 chr5 167614945 167615160 + 1 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) Eulor6B|DNA?|DNA? 41393 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 208.667-92 chr3 181572685 181572908 + 1 NA intron (NR_075091, intron 4 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -37538 NR_004053 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 220.667-40 chr2 16445912 16446244 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 219756 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 163.333-281 chr8 80646875 80647113 + 1 NA intron (NM_001033723, intron 7 of 8) intron (NM_001033723, intron 7 of 8) 160768 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 155.333-299 chr5 83205329 83205543 + 1 NA intron (NM_001318012, intron 6 of 7) intron (NM_001318012, intron 6 of 7) 127889 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 145.333-110 chr17 14392697 14392945 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 89081 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 201.667-32 chr14 21731897 21732269 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -61066 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 167.667-199 chr7 100045925 100046233 + 1 NA TTS (NM_001346579) TTS (NM_001346579) -3695 NM_001362781 7589 Hs.632294 NM_145914 ENSG00000166529 ZSCAN21 NY-REN-21|ZNF38|Zipro1 zinc finger and SCAN domain containing 21 protein-coding 140.333-81 chr17 39114324 39114628 + 1 NA intron (NM_020405, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 37161 NM_020405 57125 Hs.125036 NM_020405 ENSG00000161381 PLXDC1 TEM3|TEM7 plexin domain containing 1 protein-coding 206.667-21 chr11 34362027 34362423 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -4215 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 252.667-95 chr7 17508166 17508543 + 1 NA intron (NR_110013, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 50555 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 189.667-131 chr7 11493906 11494201 + 1 NA intron (NM_015204, intron 6 of 26) intron (NM_015204, intron 6 of 26) 338145 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 200.667-110 chr3 72431752 72432023 + 1 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 14736 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 281.333-6 chr10 90258114 90258628 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 282434 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 149.333-310 chr5 89786406 89786678 + 1 NA Intergenic Intergenic 230178 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 165.333-149 chr21 28211669 28211874 + 1 NA intron (NR_126012, intron 3 of 5) intron (NR_126012, intron 3 of 5) 16896 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 313.333-42 chr8 59402640 59403163 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 283691 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 148.333-195 chr2 119959307 119959571 + 1 NA intron (NM_002830, intron 22 of 26) intron (NM_002830, intron 22 of 26) -53638 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 149.333-382 chr7 146285281 146285461 + 1 NA Intergenic Intergenic -488900 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 319.667-3 chr10 115893434 115893950 + 1 NA intron (NM_207303, intron 28 of 28) intron (NM_207303, intron 28 of 28) 301097 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 336.333-34 chr7 41219474 41219904 + 1 NA Intergenic Intergenic 118085 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 247.667-86 chr6 134867190 134867497 + 1 NA Intergenic MER97c|DNA|hAT-Tip100 82758 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 112.667-9 chr1 113131481 113131680 + 1 NA 3' UTR (NM_001312686, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001312686, exon 19 of 19) 58382 NM_001312686 9860 Hs.448972 NM_014813 ENSG00000198799 LRIG2 LIG-2|LIG2|UFS2 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 protein-coding 166.333-129 chr2 195956847 195957119 + 1 NA intron (NM_018897, intron 19 of 64) intron (NM_018897, intron 19 of 64) 111854 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 119.333-8 chr1 72268992 72269161 + 1 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) 13463 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 217.333-10 chr1 109941407 109941774 + 1 NA Intergenic Intergenic 30741 NM_000757 1435 Hs.173894 NM_000757 ENSG00000184371 CSF1 CSF-1|MCSF colony stimulating factor 1 protein-coding 186.667-16 chr10 89401078 89401393 + 1 NA intron (NM_001270929, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 8612 NM_001270929 3434 Hs.20315 NM_001548 ENSG00000185745 IFIT1 C56|G10P1|IFI-56|IFI-56K|IFI56|IFIT-1|IFNAI1|ISG56|P56|RNM561 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1 protein-coding 312.667-24 chr3 41526910 41527350 + 1 NA intron (NR_136342, intron 30 of 34) intron (NR_136342, intron 30 of 34) 327625 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 142.333-241 chr8 112971441 112971684 + 1 NA intron (NM_052900, intron 6 of 68) MIRb|SINE|MIR 328069 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 155.333-55 chr11 93807614 93807908 + 1 NA intron (NM_004268, intron 10 of 11) intron (NM_004268, intron 10 of 11) 23479 NM_004268 9440 Hs.444931 NM_004268 ENSG00000042429 MED17 CRSP6|CRSP77|DRIP80|SRB4|TRAP80 mediator complex subunit 17 protein-coding 225.333-131 chr8 105220851 105221303 + 1 NA Intergenic Intergenic -97361 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 171.333-26 chr10 117621912 117622134 + 1 NA Intergenic Intergenic -76955 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 133.333-81 chr2 105404025 105404171 + 1 NA intron (NM_201557, intron 1 of 5) intron (NM_201557, intron 1 of 5) -4431 NM_001318894 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 154.667-168 chr2 46091280 46091632 + 1 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) intron (NM_005400, intron 11 of 14) -205951 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 150.333-254 chr22 34188884 34189082 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -266095 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 127.667-150 chr6 47852933 47853135 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 65966 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 310.333-35 chr7 94922241 94922587 + 1 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 12516 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 170.333-130 chr21 31546879 31547083 + 1 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) intron (NM_003253, intron 1 of 28) 12106 NM_003253 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 156.333-5 chr1 42553870 42554102 + 1 NA intron (NM_001355227, intron 9 of 18) intron (NM_001355227, intron 9 of 18) 20966 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 206.667-130 chr7 40237502 40237791 + 1 NA exon (NM_001193313, exon 7 of 14) exon (NM_001193313, exon 7 of 14) 102670 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 152.333-183 chr2 77939711 77939978 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 15182 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 158.333-165 chr2 168804984 168805164 + 1 NA intron (NM_052946, intron 1 of 14) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 2477 NM_052946 115677 Hs.189780 NM_052946 ENSG00000163072 NOSTRIN DaIP2 nitric oxide synthase trafficking protein-coding 293.667-50 chr5 105989642 105990006 + 1 NA Intergenic Intergenic 890350 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 168.667-84 chr18 13297217 13297385 + 1 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 19196 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 178.667-117 chr4 58143352 58143678 + 1 NA Intergenic Intergenic 392813 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 268.333-7 chr10 55285639 55286065 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -313190 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 139.333-235 chrX 22183077 22183250 + 1 NA intron (NM_001282754, intron 14 of 20) intron (NM_001282754, intron 14 of 20) -10180 NR_046639 100873942 Hs.633194 NR_046639 ENSG00000224204 PHEX-AS1 - PHEX antisense RNA 1 ncRNA 143.667-148 chr22 19557778 19557948 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 8976 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 218.667-5 chr1 152187537 152187856 + 1 NA Intergenic Intergenic -28468 NM_001122965 126638 Hs.376144 NM_152364 ENSG00000215853 RPTN - repetin protein-coding 383.333-8 chr2 184041645 184042204 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -337051 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 129.333-158 chr5 112659279 112659420 + 1 NA intron (NR_104673, intron 1 of 2) L1PA15|LINE|L1 23539 NR_104673 102467216 Hs.174158 NR_104673 LOC102467216 - uncharacterized LOC102467216 ncRNA 147.333-101 chr14 52679398 52679574 + 1 NA intron (NM_014584, intron 3 of 15) AluSx1|SINE|Alu 16072 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 186.667-32 chr12 123024728 123024921 + 1 NA intron (NM_020845, intron 2 of 24) L1MB7|LINE|L1 -14096 NR_036187 100422931 NR_036187 ENSG00000265526 MIR4304 - microRNA 4304 ncRNA 196.333-61 chr17 2799737 2800019 + 1 NA intron (NM_001100398, intron 1 of 23) intron (NM_001100398, intron 1 of 23) 3440 NM_015085 23108 Hs.499659 NM_015085 ENSG00000132359 RAP1GAP2 GARNL4|RAP1GA3 RAP1 GTPase activating protein 2 protein-coding 175.333-176 chr7 100169395 100169653 + 1 NA promoter-TSS (NM_024637) promoter-TSS (NM_024637) -907 NM_024637 79690 Hs.44856 NM_024637 ENSG00000197093 GAL3ST4 GAL3ST-4 galactose-3-O-sulfotransferase 4 protein-coding 381.333-19 chr5 114167492 114168116 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -194266 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 147.667-67 chr12 18192790 18193005 + 1 NA Intergenic Intergenic -68643 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 262.667-61 chr5 55499316 55499772 + 1 NA intron (NR_103485, intron 1 of 6) intron (NR_103485, intron 1 of 6) 9382 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 121.333-12 chr1 197099910 197100174 + 1 NA intron (NM_001206846, intron 17 of 26) intron (NM_001206846, intron 17 of 26) -32775 NM_001994 2165 Hs.435782 NM_001994 ENSG00000143278 F13B FXIIIB coagulation factor XIII B chain protein-coding 293.333-5 chr11 115352100 115352777 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) 18861 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 140.333-207 chr6 121248528 121248770 + 1 NA intron (NR_104452, intron 17 of 35) L1PB2|LINE|L1 85831 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 137.333-161 chr5 111705830 111706101 + 1 NA intron (NR_040093, intron 2 of 6) MamRep1151|LTR?|LTR? 50286 NM_001142483 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 144.667-57 chr12 42456485 42456699 + 1 NA TTS (NM_153026) TTS (NM_153026) 27023 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 307.333-34 chr17 59527499 59527924 + 1 NA promoter-TSS (NR_110813) promoter-TSS (NR_110813) -854 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 361.667-10 chr2 81722981 81723609 + 1 NA Intergenic Intergenic -256349 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 157.667-321 chr8 62741976 62742256 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) MER34A1|LTR|ERV1 -235745 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 152.667-62 chr11 78488359 78488565 + 1 NA intron (NM_024678, intron 7 of 13) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -44714 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 174.667-60 chr15 69006250 69006539 + 1 NA intron (NR_033672, intron 2 of 16) MER57A-int|LTR|ERV1 -8301 NM_001184779 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 182.667-61 chr17 59115900 59116167 + 1 NA intron (NM_001100595, intron 2 of 2) intron (NM_001100595, intron 2 of 2) -9153 NM_001353082 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 151.667-244 chr4 30414200 30414377 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -306081 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 141.333-193 chr5 83660911 83661092 + 1 NA intron (NM_001884, intron 2 of 4) intron (NM_001884, intron 2 of 4) 59854 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 141.667-77 chr14 69213591 69213869 + 1 NA intron (NR_034165, intron 4 of 10) AluSc8|SINE|Alu 21964 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 161.333-195 chr3 117731501 117731705 + 1 NA Intergenic Intergenic -40678 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 134.667-51 chr13 57940428 57940683 + 1 NA Intergenic Intergenic -225272 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 152.333-179 chr2 58662626 58662779 + 1 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu 141949 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 183.333-116 chr4 78132475 78132695 + 1 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) intron (NM_001166133, intron 2 of 41) 75015 NM_001166133 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 154.333-55 chr11 34459826 34460055 + 1 NA intron (NM_001752, intron 8 of 12) intron (NM_001752, intron 8 of 12) 21006 NM_001752 847 Hs.502302 NM_001752 ENSG00000121691 CAT - catalase protein-coding 153.333-450 chrX 42575889 42576063 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 202187 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 196.333-73 chr18 5946895 5947252 + 1 NA Intergenic Intergenic -51119 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 142.667-144 chr3 154715389 154715571 + 1 NA Intergenic Intergenic -285290 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 191.667-7 chr1 153618482 153618681 + 1 NA TTS (NM_005979) TTS (NM_005979) -2256 NM_020672 57402 Hs.288998 NM_020672 ENSG00000189334 S100A14 BCMP84|S100A15 S100 calcium binding protein A14 protein-coding 349.667-12 chr2 145231597 145232045 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 563854 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 247.667-66 chr3 149737870 149738209 + 1 NA TTS (NM_016094) TTS (NM_016094) -13251 NM_001348362 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 157.333-25 chr1 165570468 165570660 + 1 NA intron (NR_026744, intron 3 of 6) MIRc|SINE|MIR 11591 NR_026744 400794 Hs.374847 NR_026744 ENSG00000237463 LRRC52-AS1 - LRRC52 antisense RNA 1 ncRNA 234.667-90 chr5 22849250 22849613 + 1 NA intron (NM_001364105, intron 1 of 15) intron (NM_001364105, intron 1 of 15) 3913 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 145.667-307 chr9 35631888 35632058 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -13560 NM_001782 971 Hs.116481 NM_001782 ENSG00000137101 CD72 CD72b|LYB2 CD72 molecule protein-coding 288.667-7 chr12 37402694 37403166 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -913844 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 153.333-378 chr7 18320075 18320236 + 1 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) 30063 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 171.333-66 chr17 63365298 63365526 + 1 NA intron (NM_025185, intron 13 of 25) L2a|LINE|L2 74855 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 152.667-165 chr2 18424548 18424720 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 136019 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 151.667-174 chr2 158643333 158643546 + 1 NA intron (NM_001005476, intron 11 of 20) AluJr|SINE|Alu 91563 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-169 chr21 28585597 28585791 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 46376 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 217.333-108 chr4 95077439 95077764 + 1 NA intron (NM_001256793, intron 1 of 10) intron (NM_001256793, intron 1 of 10) -13890 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 350.667-7 chr19 49264251 49264761 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 44362 NR_036209 100422979 NR_036209 ENSG00000265407 MIR4324 mir-4324 microRNA 4324 ncRNA 189.667-47 chr14 81726436 81726704 + 1 NA Intergenic Intergenic 16568 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 180.333-18 chr11 72867806 72868062 + 1 NA exon (NM_014824, exon 13 of 20) exon (NM_014824, exon 13 of 20) 53523 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 156.333-30 chr10 9489189 9489428 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -193715 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 117.333-145 chr4 42285078 42285245 + 1 NA Intergenic Intergenic 106107 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 178.667-61 chr16 83405527 83405734 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -102716 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 158.333-201 chr3 50335958 50336136 + 1 NA intron (NM_001206957, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 1403 NM_170713 11186 Hs.476270 NM_007182 ENSG00000068028 RASSF1 123F2|NORE2A|RASSF1A|RDA32|REH3P21 Ras association domain family member 1 protein-coding 193.667-130 chr7 137915067 137915361 + 1 NA intron (NM_001318246, intron 3 of 11) intron (NM_001318246, intron 3 of 11) 17774 NM_001318246 64764 Hs.490273 NM_194071 ENSG00000182158 CREB3L2 BBF2H7 cAMP responsive element binding protein 3 like 2 protein-coding 225.333-109 chr5 50800157 50800650 + 1 NA intron (NM_024615, intron 14 of 25) L1MB5|LINE|L1 132989 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 161.333-85 chr14 27062877 27063101 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 154347 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 454.333-3 chr14 20488350 20489020 + 1 NA Intergenic Intergenic 19306 NM_000270 4860 Hs.75514 NM_000270 ENSG00000198805 PNP NP|PRO1837|PUNP purine nucleoside phosphorylase protein-coding 194.667-52 chr17 62176906 62177170 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 98617 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 366.333-4 chr10 43143846 43144579 + 1 NA intron (NM_018590, intron 1 of 7) intron (NM_018590, intron 1 of 7) 5767 NM_018590 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 163.333-91 chr14 73701212 73701426 + 1 NA 3' UTR (NM_031427, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_031427, exon 8 of 8) 13065 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 129.667-55 chr14 57967990 57968223 + 1 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR -102014 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 133.667-150 chr8 89120226 89120405 + 1 NA Intergenic Intergenic 637396 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 150.333-176 chr18 27864867 27865085 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 171665 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 143.667-266 chr9 94617313 94617519 + 1 NA intron (NM_000507, intron 3 of 6) intron (NM_000507, intron 3 of 6) 22102 NM_000507 2203 Hs.494496 NM_000507 ENSG00000165140 FBP1 FBP fructose-bisphosphatase 1 protein-coding 149.667-78 chr11 84200084 84200364 + 1 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) L1ME2|LINE|L1 73056 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 176.667-149 chr8 125318806 125319111 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) L1ME1|LINE|L1 -111400 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 308.667-37 chr7 27882028 27882442 + 1 NA intron (NM_175061, intron 3 of 4) intron (NM_175061, intron 3 of 4) 142140 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 120.333-186 chr8 84216248 84216442 + 1 NA intron (NM_001354323, intron 1 of 7) intron (NM_001354323, intron 1 of 7) 31679 NM_001100391 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 148.333-222 chr20 19048594 19048748 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -163971 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 151.333-241 chr20 11062760 11062970 + 1 NA Intergenic Intergenic 36321 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 169.667-14 chr10 9665192 9665363 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -369684 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 150.667-340 chr6 134727505 134727720 + 1 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -187607 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 187.667-68 chr2 63032099 63032402 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) intron (NM_001142615, intron 19 of 22) 15461 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 170.667-138 chr5 100233966 100234298 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 154122 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 141.667-90 chr16 73202359 73202555 + 1 NA Intergenic Intergenic -58010 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 171.333-97 chr2 178343503 178343744 + 1 NA intron (NM_001201482, intron 11 of 23) intron (NM_001201482, intron 11 of 23) 23381 NM_145739 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 263.667-31 chr15 94672101 94672456 + 1 NA Intergenic Intergenic -183085 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 358.667-9 chr14 36064627 36065036 + 1 NA Intergenic Intergenic -5596 NR_073454 101101773 Hs.640678 NR_073454 ENSG00000257585 LINC00609 - long intergenic non-protein coding RNA 609 ncRNA 143.667-229 chr7 25894191 25894372 + 1 NA Intergenic Intergenic 55705 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 148.333-163 chr17 72431324 72431506 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 88604 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 224.667-75 chr7 98373640 98374090 + 1 NA intron (NM_018842, intron 1 of 13) intron (NM_018842, intron 1 of 13) 27225 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 153.667-362 chr7 80785288 80785573 + 1 NA intron (NM_006379, intron 12 of 17) intron (NM_006379, intron 12 of 17) 133621 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 168.333-111 chr2 234670917 234671114 + 1 NA Intergenic Intergenic -11653 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 164.667-180 chr5 11643914 11644079 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) MER97c|DNA|hAT-Tip100 -54930 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 239.333-76 chr4 57493809 57494144 + 1 NA Intergenic Intergenic 68104 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 134.333-36 chr12 30615402 30615553 + 1 NA Intergenic Intergenic 61767 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 119.667-183 chr8 88663452 88663617 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -336051 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 210.333-67 chr2 30792933 30793229 + 1 NA intron (NM_144575, intron 1 of 22) L1ME1|LINE|L1 14365 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 169.667-80 chr15 78457182 78457428 + 1 NA intron (NM_001354994, intron 2 of 21) HAL1|LINE|L1 18884 NM_001320942 3658 Hs.436031 NM_004136 ENSG00000136381 IREB2 ACO3|IRE-BP 2|IRE-BP2|IRP2|IRP2AD|NDCAMA iron responsive element binding protein 2 protein-coding 248.333-21 chr12 41169217 41169524 + 1 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack -18950 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 142.333-243 chr8 116555658 116555857 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -96343 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 192.333-50 chr14 52978446 52978758 + 1 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 -27505 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 218.667-54 chr2 99576571 99576819 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 17 of 23) intron (NM_001025108, intron 17 of 23) -86678 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 211.333-116 chr2 94984139 94984514 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -36984 NR_037597 442028 Hs.611545 NR_037597 ENSG00000259848 LOC442028 - uncharacterized LOC442028 ncRNA 162.667-95 chr16 50234284 50234489 + 1 NA 3' UTR (NM_001040284, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001040284, exon 13 of 13) -32165 NM_001114 113 Hs.513578 NM_001114 ENSG00000121281 ADCY7 AC7 adenylate cyclase 7 protein-coding 327.667-23 chr5 12100651 12101138 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -196448 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 156.333-11 chr1 61282713 61283008 + 1 NA intron (NM_001134673, intron 3 of 10) intron (NM_001134673, intron 3 of 10) -29342 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 228.667-35 chr19 30299612 30300049 + 1 NA Intergenic Intergenic -72554 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 130.333-194 chr7 49646836 49647036 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -126702 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 162.667-116 chr19 32862050 32862312 + 1 NA exon (NM_001243036, exon 6 of 13) exon (NM_001243036, exon 6 of 13) 7586 NM_001243036 11136 Hs.743345 NM_014270 ENSG00000021488 SLC7A9 BAT1|CSNU3 solute carrier family 7 member 9 protein-coding 161.333-224 chr4 182115389 182115630 + 1 NA Intergenic Intergenic 29006 NR_125905 90768 Hs.175465 NR_027107 TENM3-AS1 - TENM3 antisense RNA 1 ncRNA 190.667-157 chr9 22657558 22657853 + 1 NA intron (NR_038977, intron 1 of 5) intron (NR_038977, intron 1 of 5) 11505 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 145.333-239 chr5 97400889 97401067 + 1 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -103718 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 175.333-16 chr10 49268370 49268635 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 30391 NR_108038 100506769 Hs.562293 NR_108038 C10orf71-AS1 - C10orf71 antisense RNA 1 ncRNA 216.333-69 chr2 6863094 6863424 + 1 NA intron (NR_046236, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 2560 NM_001256478 129607 Hs.7155 NM_207315 ENSG00000134326 CMPK2 NDK|TMPK2|TYKi|UMP-CMPK2 cytidine/uridine monophosphate kinase 2 protein-coding 186.667-108 chr4 95898809 95899078 + 1 NA Intergenic Intergenic 58850 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 190.667-3 chr1 23883154 23883375 + 1 NA intron (NM_001841, intron 1 of 1) L1ME3A|LINE|L1 -14895 NM_000147 2517 Hs.370858 NM_000147 ENSG00000179163 FUCA1 FUCA alpha-L-fucosidase 1 protein-coding 148.667-215 chr2 212089340 212089700 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 2 of 26) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 336840 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 114.667-36 chr10 74936621 74936769 + 1 NA TTS (NR_134476) TTS (NR_134476) 23909 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 155.333-411 chr9 37225166 37225347 + 1 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) L1ME1|LINE|L1 104658 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 128.333-79 chr17 63080606 63080782 + 1 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) intron (NM_025185, intron 3 of 25) 114459 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 176.333-3 chr1 29616434 29616817 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -266511 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 152.333-280 chr4 99526417 99526715 + 1 NA intron (NM_032149, intron 4 of 8) L1ME1|LINE|L1 15545 NM_032149 84103 Hs.97501 NM_032149 ENSG00000138813 C4orf17 - chromosome 4 open reading frame 17 protein-coding 137.667-168 chr6 135299721 135299958 + 1 NA intron (NM_017651, intron 26 of 27) intron (NM_017651, intron 26 of 27) 60679 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 188.333-124 chr5 163983147 163983430 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 477669 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 152.667-312 chr5 167413778 167413978 + 1 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -159781 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 284.333-32 chr3 178986623 178987024 + 1 NA Intergenic MER65D|LTR|ERV1 84986 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 228.333-7 chr10 55510452 55510773 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -88430 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 226.667-48 chr2 31989903 31990368 + 1 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 20529 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 162.667-211 chr5 31471670 31471841 + 1 NA intron (NM_013235, intron 16 of 34) L1M5|LINE|L1 60338 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 163.667-23 chr10 56900497 56900679 + 1 NA Intergenic Intergenic 403971 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 206.333-172 chr9 78094735 78095011 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -63062 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 172.333-100 chr22 28262690 28262976 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -197036 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 171.667-119 chr4 33567865 33568036 + 1 NA Intergenic Intergenic 471943 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 174.667-139 chr5 26757492 26757752 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 280964 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 152.333-214 chr21 26923492 26923787 + 1 NA 3' UTR (NM_007038, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_007038, exon 8 of 8) -30322 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 145.333-202 chr3 170808633 170808797 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 61480 NM_001320451 200916 Hs.380933 NM_001099645 ENSG00000163584 RPL22L1 - ribosomal protein L22 like 1 protein-coding 158.333-89 chr14 67545006 67545216 + 1 NA intron (NM_020715, intron 2 of 28) intron (NM_020715, intron 2 of 28) -11261 NM_001348546 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 144.667-28 chr10 62887674 62887874 + 1 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -68607 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 132.333-146 chr6 8882019 8882167 + 1 NA Intergenic Intergenic 229884 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 307.667-25 chr3 4444472 4445110 + 1 NA intron (NM_001164674, intron 2 of 7) HAL1M8|LINE|L1 22478 NM_182760 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 198.333-115 chr21 21055291 21055650 + 1 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) 57061 NM_001352595 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 149.333-39 chr10 8902492 8902737 + 1 NA intron (NR_131944, intron 1 of 3) intron (NR_131944, intron 1 of 3) 4625 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 150.667-24 chr1 245090850 245091030 + 1 NA intron (NM_001143943, intron 6 of 6) intron (NM_001143943, intron 6 of 6) -64045 NM_018012 55083 Hs.143134 NM_018012 ENSG00000162849 KIF26B - kinesin family member 26B protein-coding 268.667-46 chr3 182879754 182880228 + 1 NA intron (NM_014616, intron 20 of 29) Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger 86487 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 124.333-60 chr16 72966095 72966257 + 1 NA intron (NM_006885, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 81952 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 199.333-244 chr6 83044389 83044702 + 1 NA exon (NM_198920, exon 4 of 10) exon (NM_198920, exon 4 of 10) 21296 NR_146807 90025 Hs.148609 NM_198920 ENSG00000118420 UBE3D C6orf157|H10BH|UBE2CBP|YJR141W ubiquitin protein ligase E3D protein-coding 273.333-5 chr1 114689261 114689645 + 1 NA intron (NM_001172626, intron 1 of 14) MIR1_Amn|SINE|MIR 6165 NM_000036 270 Hs.89570 NM_000036 ENSG00000116748 AMPD1 MAD|MADA|MMDD adenosine monophosphate deaminase 1 protein-coding 188.333-152 chr8 49801324 49801564 + 1 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 -108352 NM_001321775 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 170.333-158 chr4 85699104 85699337 + 1 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) intron (NM_001025616, intron 2 of 9) -23248 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 158.333-297 chr7 42353975 42354198 + 1 NA Intergenic Intergenic -116877 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 198.667-141 chr4 125046887 125047188 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -269375 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 149.667-406 chr8 110123203 110123377 + 1 NA Intergenic Intergenic -147519 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 205.667-56 chr16 88047479 88047790 + 1 NA intron (NM_001173539, intron 11 of 12) intron (NM_001173539, intron 11 of 12) 53351 NR_120310 400553 Hs.592071 NR_120310 ENSG00000205037 LOC400553 - uncharacterized LOC400553 ncRNA 260.667-51 chr2 168532789 168533366 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 1 of 10) intron (NM_001256126, intron 1 of 10) -49866 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 123.333-154 chr4 6608789 6609056 + 1 NA intron (NM_001292038, intron 11 of 18) intron (NM_001292038, intron 11 of 18) -31169 NM_033296 93621 Hs.406590 NM_033296 ENSG00000179010 MRFAP1 PAM14|PGR1 Morf4 family associated protein 1 protein-coding 267.667-35 chr2 188356983 188357581 + 1 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) L1MA5|LINE|L1 59790 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 117.333-23 chr10 36340484 36340630 + 1 NA Intergenic Intergenic 562255 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 125.667-8 chr1 97533251 97533401 + 1 NA intron (NM_000110, intron 12 of 22) intron (NM_000110, intron 12 of 22) -263595 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 270.333-13 chr10 128947525 128947952 + 1 NA Intergenic Intergenic 34905 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 233.667-71 chr7 143311347 143311685 + 1 NA intron (NM_001130026, intron 8 of 10) intron (NM_001130026, intron 8 of 10) -4595 NR_046453 1180 Hs.121483 NM_000083 ENSG00000188037 CLCN1 CLC1 chloride voltage-gated channel 1 protein-coding 141.667-65 chr13 54209910 54210089 + 1 NA Intergenic Intergenic -77128 NR_108062 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 224.333 chr1 52535289 52535585 + 1 NA intron (NM_001009881, intron 1 of 29) HAL1|LINE|L1 17653 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 124.333-157 chr6 43311181 43311382 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -2455 NM_001366068 401262 Hs.653165 NM_206922 ENSG00000146215 CRIP3 CRP-3|TLP|TLP-A|h6LIMo cysteine rich protein 3 protein-coding 159.667-65 chr11 81273835 81274053 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -511141 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 147.667-396 chrX 22777817 22778030 + 1 NA intron (NR_073010, intron 3 of 11) L1MB2|LINE|L1 -222037 NM_182699 168400 Hs.434416 NM_182699 ENSG00000184735 DDX53 CAGE|CT26 DEAD-box helicase 53 protein-coding 120.333-81 chr17 64450979 64451130 + 1 NA intron (NM_001291317, intron 2 of 8) L1ME3G|LINE|L1 1939 NM_001369493 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 294.667-58 chr9 25210886 25211394 + 1 NA Intergenic Intergenic 467718 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 138.333-77 chr17 51719434 51719715 + 1 NA intron (NM_001082533, intron 5 of 9) intron (NM_001082533, intron 5 of 9) 284147 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 249.667-90 chr7 77954058 77954514 + 1 NA intron (NM_020432, intron 16 of 16) AluSz|SINE|Alu 114156 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 202.667-4 chr1 67126197 67126452 + 1 NA intron (NM_001276352, intron 3 of 8) intron (NM_001276352, intron 3 of 8) 8646 NM_001276352 400757 Hs.666621 NM_001013674 ENSG00000203963 C1orf141 - chromosome 1 open reading frame 141 protein-coding 154.333-95 chr14 67237770 67237934 + 1 NA Intergenic Intergenic -3583 NM_022474 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 152.667-269 chr4 40013151 40013456 + 1 NA Intergenic (TTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -35347 NM_001100400 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 217.333-128 chr6 43108720 43109031 + 1 NA intron (NM_001270398, intron 1 of 19) L1MC5|LINE|L1 32061 NM_001270398 5754 Hs.90572 NM_002821 ENSG00000112655 PTK7 CCK-4|CCK4 protein tyrosine kinase 7 (inactive) protein-coding 169.333-132 chr2 186926340 186926551 + 1 NA Intergenic Intergenic -77275 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 232.667-2 chr1 237396925 237397427 + 1 NA intron (NM_001035, intron 10 of 104) AluSz|SINE|Alu -73943 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 164.333-93 chr17 62408278 62408448 + 1 NA intron (NM_001144933, intron 10 of 11) L2a|LINE|L2 -15522 NM_181725 339175 Hs.381204 NM_181725 ENSG00000087995 METTL2A METTL2 methyltransferase like 2A protein-coding 139.333-31 chr11 14027750 14027981 + 1 NA intron (NM_006108, intron 2 of 15) intron (NM_006108, intron 2 of 15) 65142 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 221.333-105 chr4 146815521 146815907 + 1 NA intron (NR_133922, intron 11 of 13) L2|LINE|L2 130150 NR_133922 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 149.667-417 chr8 139333711 139333984 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 369276 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 141.333-218 chr6 163847149 163847328 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -175754 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 157.333-234 chr3 89394799 89394975 + 1 NA intron (NM_182644, intron 5 of 6) intron (NM_182644, intron 5 of 6) 287266 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 140.333-141 chr3 103072344 103072525 + 1 NA Intergenic Intergenic 451682 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 246.667-12 chr10 23760020 23760463 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 65514 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 209.667-13 chr1 213519977 213520336 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -404593 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 173.333-64 chr15 100327115 100327404 + 1 NA intron (NM_139057, intron 3 of 21) intron (NM_139057, intron 3 of 21) 14716 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 153.333-279 chr3 129970313 129970577 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4275 NM_007117 7200 Hs.182231 NM_007117 ENSG00000170893 TRH Pro-TRH|TRF thyrotropin releasing hormone protein-coding 140.333-134 chr22 45616219 45616400 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -10662 NR_131244 100506737 Hs.517692 NR_131244 ENSG00000238120 LINC01589 TCONS_00029353 long intergenic non-protein coding RNA 1589 ncRNA 163.667-90 chr17 78853488 78853709 + 1 NA 3' UTR (NM_003255, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_003255, exon 5 of 5) -13071 NM_001321291 57602 Hs.464243 NM_025090 ENSG00000055483 USP36 DUB1 ubiquitin specific peptidase 36 protein-coding 208.667-61 chr19 14400590 14400919 + 1 NA intron (NM_001784, intron 7 of 17) AluSx1|SINE|Alu 18587 NM_005804 10212 Hs.311609 NM_005804 ENSG00000123136 DDX39A BAT1|BAT1L|DDX39|DDXL|URH49 DExD-box helicase 39A protein-coding 278.333-33 chr3 132690666 132691009 + 1 NA intron (NR_037804, intron 17 of 44) intron (NR_037804, intron 17 of 44) 30140 NM_001321238 79876 Hs.170737 NM_024818 ENSG00000081307 UBA5 EIEE44|SCAR24|THIFP1|UBE1DC1 ubiquitin like modifier activating enzyme 5 protein-coding 271.333-31 chr2 123420359 123420698 + 1 NA Intergenic Intergenic -347047 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 177.667-67 chr19 45969016 45969222 + 1 NA intron (NM_002516, intron 1 of 3) AluSx|SINE|Alu 4746 NM_002516 4858 Hs.375439 NM_002516 ENSG00000104967 NOVA2 ANOVA|NOVA3 NOVA alternative splicing regulator 2 protein-coding 170.333-173 chr5 53694823 53695013 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 124764 NR_147168 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 259.333-98 chr8 62574871 62575185 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) L1MA3|LINE|L1 326174 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 168.667-183 chr6 34459560 34459745 + 1 NA Intergenic Intergenic -6424 NM_020804 29993 Hs.520087 NM_020804 ENSG00000124507 PACSIN1 SDPI protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 protein-coding 272.333-26 chr18 73091609 73092053 + 1 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 172667 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 275.667-26 chr17 78808138 78808617 + 1 NA intron (NM_001321291, intron 13 of 20) AluJr|SINE|Alu -26035 NM_004762 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 137.333-56 chr16 6927627 6927872 + 1 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 153940 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 167.667-121 chr20 52043429 52043745 + 1 NA Intergenic Intergenic 61897 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 131.667-219 chrX 94433036 94433216 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 630100 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 123.333-186 chr6 109557875 109558027 + 1 NA intron (NM_001145128, intron 24 of 40) L1MEc|LINE|L1 -74714 NM_014797 9841 Hs.409876 NM_014797 ENSG00000112365 ZBTB24 BIF1|ICF2|PATZ2|ZNF450 zinc finger and BTB domain containing 24 protein-coding 222.333-81 chr6 62786424 62786850 + 1 NA Intergenic Intergenic -500410 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 152.667-288 chr5 15298624 15298786 + 1 NA Intergenic Intergenic -32145 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 178.667-118 chr4 59638682 59638909 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 625222 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 136.667-83 chr18 5257604 5257816 + 1 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 19610 NR_015389 339290 Hs.643553 NR_015389 ENSG00000263753 LINC00667 - long intergenic non-protein coding RNA 667 ncRNA 312.667-15 chr14 49456586 49457217 + 1 NA Intergenic Intergenic 129479 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 186.667-31 chr12 62570423 62570670 + 1 NA intron (NM_001278469, intron 29 of 35) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 32888 NR_121682 283416 Hs.375881 NM_175895 ENSG00000221949 LINC01465 C12orf61 long intergenic non-protein coding RNA 1465 ncRNA 230.667-63 chr5 33156949 33157358 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -72582 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 157.333-345 chr8 119683357 119683554 + 1 NA Intergenic Intergenic -10065 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 130.333-37 chr10 96265110 96265346 + 1 NA intron (NM_013314, intron 1 of 16) AluJr|SINE|Alu 6288 NM_001258442 29760 Hs.665244 NM_013314 ENSG00000095585 BLNK AGM4|BASH|BLNK-S|LY57|SLP-65|SLP65|bca B cell linker protein-coding 129.333-82 chr18 11753418 11753664 + 1 NA intron (NM_001369387, intron 2 of 11) intron (NM_001369387, intron 2 of 11) 1456 NM_001369387 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 152.333-191 chr2 145584603 145584836 + 1 NA Intergenic Intergenic 916752 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 145.667-169 chr22 25191764 25191978 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 10 of 10) MER46C|DNA|TcMar-Tigger -7987 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 257.667-7 chr10 44187911 44188497 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -104546 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 158.333-331 chr8 128984090 128984277 + 1 NA Intergenic Intergenic -18182 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 153.333-374 chr7 1943456 1943638 + 1 NA intron (NM_001013837, intron 16 of 18) L1M4|LINE|L1 -2976 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 220.333-52 chr18 1312487 1312857 + 1 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) intron (NR_023926, intron 2 of 5) 46957 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 158.667-268 chr5 61146071 61146335 + 1 NA intron (NM_174889, intron 3 of 3) intron (NM_174889, intron 3 of 3) -16113 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 209.333-151 chr3 99126891 99127142 + 1 NA Intergenic Intergenic -225321 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 203.667-132 chr8 139926559 139926980 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) L1MEf|LINE|L1 173766 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 160.333-176 chr22 37650557 37650861 + 1 NA exon (NM_001350055, exon 16 of 18) exon (NM_001350055, exon 16 of 18) 7668 NR_109952 101927051 NR_109952 ENSG00000233360 LOC101927051 - uncharacterized LOC101927051 ncRNA 180.667-111 chr5 30050570 30050755 + 1 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 170102 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 169.667-184 chr6 85726323 85726556 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -47706 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 228.333-91 chr7 85789695 85790100 + 1 NA Intergenic Intergenic 368775 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 116.667-126 chr3 8773107 8773231 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3555 NM_001354653 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 187.333-52 chr13 57912777 57912991 + 1 NA Intergenic Intergenic -252943 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 139.667-116 chr3 70237501 70237662 + 1 NA intron (NM_001364677, intron 2 of 3) intron (NM_001364677, intron 2 of 3) 75057 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 151.333-129 chr14 63860845 63861027 + 1 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) MER5A|DNA|hAT-Charlie 7932 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 171.667-61 chr16 13783939 13784243 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -136066 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 163.333-64 chr12 23771757 23772049 + 1 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) 177767 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 268.667-58 chr6 133158136 133158666 + 1 NA Intergenic Intergenic 70321 NR_026969 285735 Hs.407549 NM_001037231 LINC00326 NCRNA00326 long intergenic non-protein coding RNA 326 ncRNA 255.667-84 chr8 135919021 135919387 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 461748 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 284.333-19 chr18 5411305 5411652 + 1 NA intron (NM_001281535, intron 14 of 21) intron (NM_001281535, intron 14 of 21) -114425 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 161.333-35 chr10 71914845 71915044 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -49451 NM_004273 9469 Hs.158304 NM_004273 ENSG00000122863 CHST3 C6ST|C6ST1|HSD carbohydrate sulfotransferase 3 protein-coding 334.667-30 chr8 128247367 128247796 + 1 NA Intergenic Intergenic 97465 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 216.667-83 chr5 40687187 40687610 + 1 NA intron (NM_000958, intron 2 of 2) intron (NM_000958, intron 2 of 2) 7483 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 150.667-91 chr12 75184325 75184562 + 1 NA intron (NM_001260499, intron 2 of 3) intron (NM_001260499, intron 2 of 3) 25305 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 122.333-72 chr17 52168673 52168820 + 1 NA Intergenic Intergenic -8729 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 151.667-92 chr12 105894462 105894689 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 187801 NR_110110 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 139.333-78 chr15 27845347 27845508 + 1 NA intron (NM_001300984, intron 21 of 22) intron (NM_001300984, intron 21 of 22) 253888 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 120.667-33 chr11 128600431 128600599 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12957 NM_001143820 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 176.333-99 chr21 22891365 22891690 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -187757 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 207.333-130 chr2 11038126 11038373 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 93927 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 182.333-30 chr12 12113132 12113482 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 1355 NR_128710 103504734 NR_128710 ENSG00000283475 MIR1244-4 hsa-mir-1244-4 microRNA 1244-4 ncRNA 255.333-115 chr8 120365504 120366052 + 1 NA intron (NM_021110, intron 45 of 47) intron (NM_021110, intron 45 of 47) 79372 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 120.333-10 chr1 118794729 118794882 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 193538 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 119.333-91 chr14 87333528 87333687 + 1 NA Intergenic Intergenic 321687 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 156.667-233 chr3 161427019 161427228 + 1 NA non-coding (NR_102265, exon 1 of 4) non-coding (NR_102265, exon 1 of 4) 696 NR_102265 101243545 Hs.737526 NR_102265 ENSG00000240567 LINC02067 - long intergenic non-protein coding RNA 2067 ncRNA 149.667-96 chr12 80232794 80233087 + 1 NA exon (NM_173591, exon 8 of 58) exon (NM_173591, exon 8 of 58) 23487 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 158.667-239 chr4 55072944 55073158 + 1 NA Intergenic Intergenic 52544 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 147.667-129 chr16 79454503 79454799 + 1 NA Intergenic Intergenic 146086 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 184.333-101 chr3 30759130 30759460 + 1 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) intron (NM_207359, intron 14 of 14) 135366 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 159.667-179 chr2 152231497 152231765 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -55868 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 316.667-22 chr3 167028783 167029402 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 130409 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 207.667-86 chr4 58162644 58162992 + 1 NA Intergenic Intergenic 373510 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 160.667-327 chr9 104662970 104663137 + 1 NA Intergenic Intergenic -31369 NM_001004484 286365 Hs.553683 NM_001004484 ENSG00000179055 OR13D1 OR9-15 olfactory receptor family 13 subfamily D member 1 protein-coding 237.667-83 chr9 76537907 76538330 + 1 NA Intergenic Intergenic 37485 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 112.333-243 chr7 33069013 33069242 + 1 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -6330 NM_001002009 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 153.333-315 chr4 159161795 159162030 + 1 NA intron (NM_001351724, intron 1 of 30) intron (NM_001351724, intron 1 of 30) -33018 NR_037459 100500881 NR_037459 ENSG00000264105 MIR3688-1 MIR3688|mir-3688-1 microRNA 3688-1 ncRNA 245.667-62 chr6 110131402 110132002 + 1 NA intron (NM_001024936, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 47968 NM_003931 8936 Hs.75850 NM_003931 ENSG00000112290 WASF1 SCAR1|WAVE|WAVE1 WASP family member 1 protein-coding 201.333 chr1 11141854 11142093 + 1 NA intron (NM_004958, intron 34 of 57) AluY|SINE|Alu -1925 NR_046600 100873935 Hs.679133 NR_046600 ENSG00000225602 MTOR-AS1 - MTOR antisense RNA 1 ncRNA 175.333-93 chr2 152115125 152115328 + 1 NA Intergenic Intergenic -16059 NM_000726 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 230.333-117 chr8 21208534 21208987 + 1 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -89479 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 197.667-119 chr5 29496419 29496757 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -100612 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 233.667-32 chr18 4240768 4241047 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -23695 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 208.667-109 chr5 68634449 68634770 + 1 NA Intergenic Intergenic 342032 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 248.667-16 chr10 100025085 100025565 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15378 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 207.667-120 chr8 119019502 119019850 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 -47571 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 241.333-34 chr12 110333454 110333740 + 1 NA intron (NM_170665, intron 10 of 19) intron (NM_170665, intron 10 of 19) 52350 NM_170665 488 Hs.506759 NM_001681 ENSG00000174437 ATP2A2 ATP2B|DAR|DD|SERCA2 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 2 protein-coding 185.667-6 chr1 202117340 202117653 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -5421 NM_004767 9283 Hs.132049 NM_004767 ENSG00000170075 GPR37L1 ET(B)R-LP-2|ETBR-LP-2|ETBRLP2 G protein-coupled receptor 37 like 1 protein-coding 226.667-26 chr11 77484464 77484791 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -10564 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 166.667-70 chr14 68058282 68058577 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MC4a|LINE|L1 234837 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 246.667-45 chr2 190011745 190012250 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 50732 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 151.333-171 chr17 32611548 32611704 + 1 NA intron (NM_015194, intron 20 of 21) AluSx1|SINE|Alu 124633 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 243.667-35 chr2 43944696 43945088 + 1 NA intron (NM_133259, intron 22 of 37) intron (NM_133259, intron 22 of 37) 51097 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 186.667-10 chr10 12009645 12009861 + 1 NA intron (NM_080599, intron 4 of 21) L1MEc|LINE|L1 33056 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 159.333-123 chr17 52293162 52293452 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -97215 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 130.667-37 chr10 101502093 101502375 + 1 NA intron (NM_001256856, intron 3 of 13) intron (NM_001256856, intron 3 of 13) 86023 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 262.667-74 chr7 36882456 36882890 + 1 NA intron (NR_038120, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 36759 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 221.333-10 chr10 9297147 9297480 + 1 NA Intergenic Intergenic -1720 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 134.667-45 chr12 40336714 40336871 + 1 NA intron (NM_198578, intron 40 of 50) intron (NM_198578, intron 40 of 50) -56602 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 170.667-179 chrX 8958255 8958496 + 1 NA Intergenic Intergenic 75752 NM_205849 171483 Hs.733351 NM_173696 ENSG00000177138 FAM9B TEX39B family with sequence similarity 9 member B protein-coding 157.333-265 chr4 79069774 79070003 + 1 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) L1MA4|LINE|L1 98140 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 163.333-289 chr8 122258875 122259071 + 1 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 309671 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 209.333-61 chr14 58373356 58373593 + 1 NA 3' UTR (NM_023000, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_023000, exon 24 of 24) -22456 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 166.333-105 chr2 27075927 27076171 + 1 NA Intergenic Intergenic -2566 NM_007046 11117 Hs.63348 NM_007046 ENSG00000138080 EMILIN1 EMI|EMILIN|gp115 elastin microfibril interfacer 1 protein-coding 187.667-7 chr1 189450549 189450865 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 1025303 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 142.333-226 chr7 27262409 27262649 + 1 NA Intergenic Intergenic -15300 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 159.333-26 chr1 197946995 197947164 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 29707 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 146.333-200 chr3 30539181 30539369 + 1 NA Intergenic Intergenic 20407 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 216.667-62 chr2 203446929 203447164 + 1 NA 3' UTR (NM_001282925, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001282925, exon 11 of 11) 80162 NM_001282927 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 195.667-143 chr8 87455247 87455490 + 1 NA Intergenic Intergenic 418647 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 153.667-188 chr2 82482188 82482347 + 1 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -374536 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 163.667-198 chr5 37099516 37099808 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -149384 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 146.667-183 chr2 191600217 191600412 + 1 NA Intergenic Intergenic -77758 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 148.667-336 chr6 85570075 85570307 + 1 NA intron (NM_001350538, intron 4 of 28) L2c|LINE|L2 23667 NM_153816 57231 Hs.485871 NM_020468 ENSG00000135317 SNX14 RGS-PX2|SCAR20 sorting nexin 14 protein-coding 215.667-62 chr2 120074850 120075208 + 1 NA intron (NM_001330307, intron 5 of 16) AluSz6|SINE|Alu 61952 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 136.333-191 chr7 49345385 49345578 + 1 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 420934 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 179.667-130 chr8 18718898 18719096 + 1 NA intron (NM_015310, intron 9 of 15) intron (NM_015310, intron 9 of 15) 89870 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 149.333-355 chr6 153573138 153573373 + 1 NA Intergenic Intergenic -437241 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 176.333-19 chr10 63273788 63273988 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) intron (NM_001322258, intron 2 of 24) -4645 NM_001318153 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 114.333-52 chr12 26749665 26749853 + 1 NA intron (NM_002223, intron 2 of 56) intron (NM_002223, intron 2 of 56) 83435 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 164.667-164 chr4 83763812 83763999 + 1 NA Intergenic Intergenic 227797 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 265.333-87 chr8 116286820 116287204 + 1 NA intron (NR_046215, intron 1 of 13) L1PA15|LINE|L1 38047 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 149.333-282 chr4 74424588 74424741 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -20472 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 116.333-222 chrX 5269586 5269755 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -636098 NR_110390 101928201 Hs.586488 NR_110390 ENSG00000236513 LOC101928201 - uncharacterized LOC101928201 ncRNA 218.667-100 chr7 47932524 47933010 + 1 NA intron (NM_138295, intron 4 of 56) intron (NM_138295, intron 4 of 56) 15724 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 144.667-258 chr6 40427098 40427368 + 1 NA intron (NM_020737, intron 2 of 2) L3|LINE|CR1 48896 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 160.667-325 chr9 32293995 32294180 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -90516 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 144.667-139 chr2 76610229 76610448 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -375627 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 288.333-24 chr22 40597604 40598207 + 1 NA intron (NM_020831, intron 1 of 14) intron (NM_020831, intron 1 of 14) 38814 NM_020831 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 131.667-9 chr1 90395783 90396022 + 1 NA Intergenic Intergenic -261848 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 123.333-64 chr13 31672923 31673127 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -66501 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 210.667-32 chr12 46787569 46787900 + 1 NA intron (NM_018018, intron 5 of 16) intron (NM_018018, intron 5 of 16) 38263 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 213.333-87 chr2 25622922 25623249 + 1 NA intron (NM_033147, intron 4 of 19) L1MEh|LINE|L1 27137 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 190.667-112 chr6 56742285 56742580 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) -99543 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 215.333-98 chr2 163363112 163363489 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 372708 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 154.667-174 chr2 71426438 71426670 + 1 NA exon (NM_014497, exon 24 of 28) exon (NM_014497, exon 24 of 28) -27007 NM_001130978 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 148.667-34 chr1 247822711 247822910 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -7081 NM_001001966 284532 Hs.626620 NM_001001966 ENSG00000196772 OR14A16 OR5AT1 olfactory receptor family 14 subfamily A member 16 protein-coding 149.333-16 chr1 101782312 101782492 + 1 NA Intergenic Intergenic 64678 NM_001288821 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 232.333-26 chr15 60125699 60126130 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 121603 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 142.333-92 chr15 95682948 95683171 + 1 NA Intergenic Intergenic 249966 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 127.333-25 chr10 60416671 60416858 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) MER3|DNA|hAT-Charlie -26889 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 260.333-10 chr12 33857333 33857725 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -164967 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 173.333-157 chr5 58096418 58096768 + 1 NA Intergenic Intergenic 25748 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 115.333-36 chr11 101512429 101512649 + 1 NA intron (NM_004621, intron 1 of 12) intron (NM_004621, intron 1 of 12) 7366 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 158.667-99 chr14 60414369 60414615 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 71571 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 178.667-167 chr8 130664824 130665149 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -221312 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 249.667-47 chr2 160858729 160859045 + 1 NA Intergenic Intergenic -278068 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 217.333-55 chr17 48418707 48419028 + 1 NA intron (NM_001075099, intron 1 of 12) L1ME2|LINE|L1 11347 NM_003726 8631 Hs.316931 NM_003726 ENSG00000141293 SKAP1 HEL-S-81p|SCAP1|SKAP55 src kinase associated phosphoprotein 1 protein-coding 154.333-369 chr9 80812060 80812221 + 1 NA Intergenic Intergenic 837117 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 228.667-55 chr3 36718973 36719266 + 1 NA intron (NM_033403, intron 3 of 4) L1ME4a|LINE|L1 20742 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 165.667-185 chr7 31531839 31532165 + 1 NA intron (NM_001257968, intron 1 of 14) MER73|LTR|ERVL 2540 NM_001257968 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 141.333-21 chr10 43274113 43274321 + 1 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -7152 NM_145313 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 174.667-151 chr6 54583404 54583670 + 1 NA Intergenic Intergenic -263234 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 234.333-81 chr7 116502879 116503156 + 1 NA intron (NM_001233, intron 2 of 2) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 2971 NM_001206748 858 Hs.212332 NM_001233 ENSG00000105971 CAV2 CAV caveolin 2 protein-coding 162.333-138 chr20 51268262 51268557 + 1 NA Intergenic Intergenic 184568 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 133.333-4 chr1 73990110 73990307 + 1 NA Intergenic Intergenic 207968 NM_001105659 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 128.333-195 chr8 101283198 101283326 + 1 NA Intergenic Intergenic -77198 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 203.667-66 chr20 48107274 48107508 + 1 NA Intergenic MamRep488|DNA|hAT-Tip100 -117274 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 152.667-75 chr12 22282765 22283062 + 1 NA intron (NM_003034, intron 2 of 4) intron (NM_003034, intron 2 of 4) 51801 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 134.667-193 chr8 66559623 66559853 + 1 NA Intergenic Intergenic 53480 NM_001294282 4603 Hs.445898 NM_001080416 ENSG00000185697 MYBL1 A-MYB|AMYB MYB proto-oncogene like 1 protein-coding 199.667-104 chr4 130028742 130029058 + 1 NA Intergenic MER57C2|LTR|ERV1 257281 NR_151713 107986313 Hs.112740 NR_151713 ENSG00000249618 LINC02465 - long intergenic non-protein coding RNA 2465 ncRNA 241.333-67 chr3 44084644 44085053 + 1 NA Intergenic Intergenic -29364 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 117.667-100 chr2 149198756 149198902 + 1 NA intron (NM_001317002, intron 4 of 7) intron (NM_001317002, intron 4 of 7) 80655 NM_001317002 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 176.667-153 chr8 140911112 140911406 + 1 NA intron (NM_001352700, intron 1 of 34) intron (NM_001352700, intron 1 of 34) 89745 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 144.333-23 chr10 56004823 56004970 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 356363 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 247.333-45 chr2 199552041 199552431 + 1 NA Intergenic Intergenic -55832 NR_110270 101927641 Hs.549598 NR_110270 ENSG00000238217 LINC01877 - long intergenic non-protein coding RNA 1877 ncRNA 156.667-105 chr14 54408888 54409070 + 1 NA intron (NM_001330173, intron 4 of 8) intron (NM_001330173, intron 4 of 8) 11972 NM_005192 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 147.333-124 chr15 76359712 76359974 + 1 NA intron (NR_148227, intron 30 of 32) intron (NR_148227, intron 30 of 32) 23070 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 192.333-175 chr9 33130310 33130510 + 1 NA intron (NM_001497, intron 2 of 5) intron (NM_001497, intron 2 of 5) 21718 NR_162131 113219452 NR_162131 MIR12117 - microRNA 12117 ncRNA 157.667-12 chr1 116203072 116203375 + 1 NA Intergenic Intergenic 91468 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 153.667-22 chr1 181952580 181952814 + 1 NA Intergenic Intergenic 109015 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 159.333-280 chr6 51845465 51845779 + 1 NA intron (NM_138694, intron 50 of 66) intron (NM_138694, intron 50 of 66) 223752 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 228.667-6 chr1 86517172 86517591 + 1 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -29697 NR_024602 22802 Hs.567422 NM_012128 ENSG00000016602 CLCA4 CaCC|CaCC2 chloride channel accessory 4 protein-coding 266.667-15 chr11 5661089 5661542 + 1 NA Intergenic Intergenic 23759 NM_033092 85363 Hs.125300 NM_033034 ENSG00000132256 TRIM5 RNF88|TRIM5alpha tripartite motif containing 5 protein-coding 171.333-111 chr3 17201742 17202102 + 1 NA intron (NM_014744, intron 18 of 21) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 268726 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 304.333-19 chr2 140872886 140873269 + 1 NA intron (NM_018557, intron 25 of 90) MER4-int|LTR|ERV1 -286392 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 233.333-14 chr10 26754424 26754803 + 1 NA intron (NM_001178125, intron 5 of 6) intron (NM_001178125, intron 5 of 6) 56912 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 321.667-7 chr15 52361975 52362537 + 1 NA intron (NM_001142495, intron 24 of 39) intron (NM_001142495, intron 24 of 39) -66452 NM_018728 55930 Hs.487036 NM_018728 ENSG00000128833 MYO5C - myosin VC protein-coding 182.667-24 chr11 30933637 30933831 + 1 NA intron (NM_001367979, intron 21 of 38) LTR71A|LTR|ERV1 58952 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 136.333-41 chr12 23298981 23299168 + 1 NA Intergenic Intergenic 123438 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 130.667-204 chr9 20694981 20695179 + 1 NA intron (NM_017794, intron 3 of 45) L1MC5a|LINE|L1 -10330 NR_121601 101929548 Hs.668302 NR_121601 ENSG00000227071 FOCAD-AS1 - FOCAD antisense RNA 1 ncRNA 152.333-143 chr17 30271813 30271998 + 1 NA intron (NM_000386, intron 9 of 11) intron (NM_000386, intron 9 of 11) 20039 NM_000386 642 Hs.371914 NM_000386 ENSG00000108578 BLMH BH|BMH bleomycin hydrolase protein-coding 211.667-2 chr1 12373538 12373860 + 1 NA intron (NM_015378, intron 54 of 69) intron (NM_015378, intron 54 of 69) -133547 NR_003022 677882 Hs.658450 NR_003022 ENSG00000266079 SNORA59B ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59B snoRNA 192.333-170 chr8 86150149 86150441 + 1 NA intron (NM_152565, intron 6 of 7) intron (NM_152565, intron 6 of 7) 51385 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 156.667-59 chr11 35954543 35954766 + 1 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) intron (NM_001304264, intron 1 of 5) 10592 NM_174902 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 137.333-85 chr19 50302956 50303175 + 1 NA intron (NM_024729, intron 38 of 40) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 26312 NM_004977 3748 Hs.467146 NM_004977 ENSG00000131398 KCNC3 KSHIIID|KV3.3|SCA13 potassium voltage-gated channel subfamily C member 3 protein-coding 219.667-74 chr5 83175486 83175836 + 1 NA intron (NM_001318012, intron 3 of 7) AluSx|SINE|Alu 98114 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 178.333-7 chr1 164378134 164378360 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -181113 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 159.667-34 chr1 218024709 218025039 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18631 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 337.333-16 chr15 59903262 59903930 + 1 NA Intergenic Intergenic -100715 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 235.667-11 chr11 88276278 88276637 + 1 NA Intergenic Intergenic 61279 NM_001114173 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 188.667-52 chr16 12970943 12971260 + 1 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 69503 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 362.667-7 chr13 92374984 92375543 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) MER89-int|LTR|ERV1 -23056 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 151.667-320 chr6 124623288 124623457 + 1 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) -339173 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 206.667-11 chr1 228527093 228527428 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -14972 NM_001287262 100129094 Hs.730208 NM_001287262 BTNL10 BTN4|BUTR1 butyrophilin like 10 protein-coding 199.333-243 chr6 67312224 67312671 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -742904 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 160.667-251 chr5 116180308 116180488 + 1 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) intron (NM_001308080, intron 5 of 6) -75345 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 164.333-149 chr3 15358122 15358308 + 1 NA Intergenic Intergenic -16835 NM_001018009 9467 Hs.257761 NM_004844 ENSG00000131370 SH3BP5 SAB|SH3BP-5 SH3 domain binding protein 5 protein-coding 155.333-291 chr5 54730912 54731178 + 1 NA intron (NR_104658, intron 1 of 2) intron (NR_104658, intron 1 of 2) 13213 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 199.333-207 chr4 100237040 100237347 + 1 NA Intergenic Intergenic -46725 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 251.667-12 chr11 19242640 19243032 + 1 NA Intergenic CpG -1181 NM_001256372 79733 Hs.523526 NM_024680 ENSG00000129173 E2F8 E2F-8 E2F transcription factor 8 protein-coding 193.333-193 chr8 121824863 121825150 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -183566 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 223.333-55 chr17 69691289 69691673 + 1 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) intron (NR_109972, intron 3 of 4) 97494 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 224.333-47 chr15 69139420 69139802 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -20986 NM_001324091 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 188.333-80 chr2 145985494 145985856 + 1 NA Intergenic Intergenic -601382 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 234.667-76 chr3 186942457 186942766 + 1 NA intron (NM_173216, intron 1 of 7) intron (NM_173216, intron 1 of 7) 12085 NM_173217 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 236.333-24 chr12 82476078 82476498 + 1 NA intron (NR_144943, intron 10 of 12) intron (NR_144943, intron 10 of 12) -117483 NR_033192 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 152.333-289 chr5 14241381 14241551 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 98124 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 165.333-107 chr17 69412978 69413146 + 1 NA Intergenic Intergenic -1635 NM_002758 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 161.667-250 chr8 83721590 83721924 + 1 NA Intergenic Intergenic 317999 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 189.333-70 chr17 39406656 39406989 + 1 NA 3' UTR (NM_004774, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_004774, exon 17 of 17) -4266 NM_001370208 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 145.333-30 chr10 35038917 35039062 + 1 NA exon (NM_001198777, exon 9 of 21) exon (NM_001198777, exon 9 of 21) 35294 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 160.333-221 chr4 106552977 106553241 + 1 NA Intergenic LTR83|LTR|ERVL 119485 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 279.667 chr1 59158336 59158677 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -11699 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 165.333-13 chr1 114931052 114931226 + 1 NA intron (NM_001282542, intron 23 of 30) L1M4a2|LINE|L1 76276 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 145.333-87 chr14 66692070 66692216 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) intron (NM_001024218, intron 2 of 21) 184736 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 158.333-35 chr10 53091042 53091287 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -319464 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 153.333-200 chr2 73576185 73576437 + 1 NA intron (NM_015120, intron 16 of 22) L1MB8|LINE|L1 66111 NM_003960 9027 Hs.14637 NM_003960 ENSG00000144035 NAT8 ATase2|CCNAT|CML1|GLA|Hcml1|TSC501|TSC510 N-acetyltransferase 8 (putative) protein-coding 278.333-20 chr15 84670893 84671234 + 1 NA intron (NM_001271919, intron 3 of 4) MIRc|SINE|MIR -12864 NM_021077 4828 Hs.386470 NM_021077 ENSG00000197696 NMB - neuromedin B protein-coding 181.667-116 chr5 18659050 18659284 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 851893 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 160.667-134 chr18 57516658 57516840 + 1 NA Intergenic Intergenic 69953 NM_001012515 2235 Hs.365365 NM_000140 ENSG00000066926 FECH EPP|EPP1|FCE ferrochelatase protein-coding 162.333-114 chr2 62982961 62983243 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 15 of 22) intron (NM_001142615, intron 15 of 22) 64609 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 139.667-200 chr9 13231231 13231401 + 1 NA intron (NM_003829, intron 3 of 45) AluSz6|SINE|Alu 48248 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 276.667-46 chr3 55983292 55983627 + 1 NA intron (NR_132749, intron 11 of 17) intron (NR_132749, intron 11 of 17) -130865 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 153.667-276 chr4 16921790 16922028 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -23100 NM_001304435 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 140.667-13 chr1 115233419 115233658 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -49496 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 284.667-7 chr11 99576074 99576463 + 1 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 20123 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 154.333-227 chr3 141647188 141647475 + 1 NA Intergenic Intergenic -15868 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 221.333-82 chr20 61365842 61366323 + 1 NA intron (NM_001794, intron 2 of 15) intron (NM_001794, intron 2 of 15) 113821 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 151.333-413 chr8 74822704 74822857 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -1754 NM_015886 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 134.333-110 chr22 29322364 29322617 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -6793 NM_006477 10633 Hs.73088 NM_006477 ENSG00000100276 RASL10A RRP22 RAS like family 10 member A protein-coding 120.333-150 chr5 36464202 36464404 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -142052 NM_001166696 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 283.333-54 chr3 179442162 179442532 + 1 NA intron (NM_021629, intron 1 of 9) X7A_LINE|LINE|CR1 9123 NM_021629 59345 Hs.173030 NM_021629 ENSG00000114450 GNB4 CMTD1F G protein subunit beta 4 protein-coding 188.667-78 chr2 117305328 117305571 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -509242 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 252.333-12 chr11 24569662 24570063 + 1 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 72809 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 157.333-352 chr8 133597605 133597770 + 1 NA Intergenic Intergenic -25800 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 159.667-177 chr2 129575442 129575680 + 1 NA Intergenic Intergenic -301670 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 214.667-29 chr12 17606227 17606536 + 1 NA Intergenic Intergenic -17303 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 125.667-29 chr10 126845985 126846124 + 1 NA Intergenic Intergenic -59355 NM_001380 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 175.333-63 chr16 79410728 79410949 + 1 NA Intergenic Intergenic 189899 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 186.333-24 chr11 8783488 8783847 + 1 NA intron (NR_120590, intron 1 of 4) L1ME4a|LINE|L1 14889 NR_120590 102724784 Hs.613276 NR_120590 LOC102724784 - uncharacterized LOC102724784 ncRNA 219.333-34 chr11 58508077 58508323 + 1 NA promoter-TSS (NM_001005218) promoter-TSS (NM_001005218) -95 NM_001005218 219968 Hs.553647 NM_001005218 ENSG00000198283 OR5B21 - olfactory receptor family 5 subfamily B member 21 protein-coding 153.667-374 chr8 53875792 53875990 + 1 NA intron (NM_001286674, intron 1 of 2) intron (NM_001286674, intron 1 of 2) -4981 NM_003702 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 179.667-71 chr19 18978236 18978528 + 1 NA Intergenic Intergenic -37165 NM_004838 9454 Hs.720208 NM_004838 ENSG00000051128 HOMER3 HOMER-3|VESL3 homer scaffold protein 3 protein-coding 149.333-174 chr2 43407665 43407917 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 28 of 37) MIR|SINE|MIR 180580 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 236.333-42 chr2 44922806 44923188 + 1 NA non-coding (NR_147195, exon 2 of 2) non-coding (NR_147195, exon 2 of 2) 15891 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 154.333-135 chr18 71687018 71687295 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 95070 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 168.333-170 chr5 164909101 164909269 + 1 NA Intergenic Intergenic 438906 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 160.333-6 chr1 42121757 42121954 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -31555 NM_007102 2981 Hs.32966 NM_007102 ENSG00000044012 GUCA2B GCAP-II|UGN guanylate cyclase activator 2B protein-coding 148.333-93 chr12 41103109 41103282 + 1 NA Intergenic Intergenic -85125 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 155.667-329 chr7 43418651 43418924 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 7 of 27) L1MEf|LINE|L1 103755 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 203.667-64 chr20 35982704 35983033 + 1 NA intron (NR_130714, intron 4 of 8) AluJb|SINE|Alu 14278 NM_001304367 140894 Hs.732697 NM_080834 ENSG00000149646 CNBD2 C20orf152|CNMPD1 cyclic nucleotide binding domain containing 2 protein-coding 155.667-17 chr1 105353169 105353328 + 1 NA Intergenic Intergenic 265687 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 323.333-9 chr15 22789308 22789775 + 1 NA intron (NM_144599, intron 1 of 4) MER50-int|LTR|ERV1 2897 NM_144599 123606 Hs.511797 NM_144599 ENSG00000170113 NIPA1 FSP3|SLC57A1|SPG6 NIPA magnesium transporter 1 protein-coding 146.333-336 chr8 120957089 120957344 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -145170 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 160.667-69 chr12 32610233 32610503 + 1 NA intron (NM_001370297, intron 6 of 14) intron (NM_001370297, intron 6 of 14) -68832 NM_012063 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 232.333-50 chr2 232223973 232224274 + 1 NA intron (NR_046477, intron 9 of 18) intron (NR_046477, intron 9 of 18) 51470 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 282.667-6 chr11 78625054 78625445 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -50385 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 307.667 chr1 52444975 52445369 + 1 NA intron (NM_001009881, intron 24 of 29) intron (NM_001009881, intron 24 of 29) 40570 NM_032864 84950 Hs.5301 NM_032284 ENSG00000134748 PRPF38A PRP38A|Prp38 pre-mRNA processing factor 38A protein-coding 191.667-50 chr14 75139343 75139585 + 1 NA intron (NM_006827, intron 3 of 4) intron (NM_006827, intron 3 of 4) -12416 NM_001329237 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 112.333-171 chr3 156191511 156191664 + 1 NA intron (NM_003471, intron 1 of 13) intron (NM_003471, intron 1 of 13) 36296 NR_046617 100874083 Hs.603823 NR_046617 ENSG00000240596 KCNAB1-AS2 - KCNAB1 antisense RNA 2 ncRNA 120.667-119 chr3 170101337 170101505 + 1 NA intron (NM_024947, intron 14 of 14) intron (NM_024947, intron 14 of 14) 63426 NM_014373 26996 Hs.231320 NM_014373 ENSG00000173890 GPR160 GPCR1|GPCR150 G protein-coupled receptor 160 protein-coding 214.333-125 chr6 44939819 44940161 + 1 NA intron (NM_181356, intron 11 of 12) L1PB4|LINE|L1 257780 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 167.667-71 chr16 47730287 47730624 + 1 NA Intergenic Intergenic -128126 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 410.333-10 chr7 10844161 10844691 + 1 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -64482 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 216.667-58 chr2 139467015 139467345 + 1 NA Intergenic Intergenic 569856 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 220.667-18 chr11 4939852 4940110 + 1 NA Intergenic Intergenic 7119 NM_001005329 401666 Hs.555481 NM_001005329 ENSG00000205497 OR51A4 - olfactory receptor family 51 subfamily A member 4 protein-coding 154.667-171 chr2 53120402 53120686 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -417929 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 206.667-22 chr11 47102548 47102851 + 1 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) intron (NM_001003677, intron 3 of 8) 74180 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 245.333-109 chr7 40124841 40125130 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 9637 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 164.667-240 chr8 113720159 113720338 + 1 NA Intergenic Intergenic -283309 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 118.667-45 chr11 81780145 81780330 + 1 NA Intergenic Intergenic 110599 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 146.333-143 chr2 39423531 39423722 + 1 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) L1MC2|LINE|L1 13659 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 169.333-69 chr13 113358685 113358983 + 1 NA intron (NR_046541, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 5296 NM_024719 79774 Hs.745043 NM_024719 ENSG00000139835 GRTP1 TBC1D6 growth hormone regulated TBC protein 1 protein-coding 268.667-12 chr13 94523932 94524400 + 1 NA intron (NM_001322186, intron 1 of 9) intron (NM_001322186, intron 1 of 9) 25240 NM_001322185 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 117.333-148 chr4 44436550 44436693 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) L1MC5a|LINE|L1 12188 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 224.667-59 chr3 172143178 172143469 + 1 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 102792 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 161.667-12 chr1 101682735 101683042 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 164192 NM_001288821 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 145.667-216 chr5 77496932 77497140 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -4720 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 130.333-115 chr20 31537427 31537641 + 1 NA intron (NM_178580, intron 2 of 12) intron (NM_178580, intron 2 of 12) 23092 NM_178582 81502 Hs.373741 NM_030789 ENSG00000101294 HM13 H13|IMP1|IMPAS|IMPAS-1|MSTP086|PSENL3|PSL3|SPP|SPPL1 histocompatibility minor 13 protein-coding 158.667-21 chr1 178535866 178536026 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -6850 NR_033186 400798 Hs.668085 NM_207467 ENSG00000213057 C1orf220 - chromosome 1 open reading frame 220 (putative) ncRNA 160.667-125 chr17 71908432 71908686 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 117420 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 144.667-23 chr1 227216990 227217264 + 1 NA intron (NM_001366019, intron 2 of 36) L2a|LINE|L2 101365 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 176.667-86 chr2 212663365 212663584 + 1 NA Intergenic Intergenic -124672 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 121.333-66 chr16 77896121 77896288 + 1 NA intron (NM_020927, intron 7 of 8) L2c|LINE|L2 107640 NM_020927 57687 Hs.461405 NM_020927 ENSG00000171724 VAT1L - vesicle amine transport 1 like protein-coding 151.667-103 chr14 20250932 20251134 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 8241 NM_001004479 390442 Hs.553767 NM_001004479 ENSG00000176198 OR11H4 OR14-36 olfactory receptor family 11 subfamily H member 4 protein-coding 112.333-78 chr14 88716909 88717147 + 1 NA intron (NM_183387, intron 8 of 42) intron (NM_183387, intron 8 of 42) 75925 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 189.333-147 chr4 78262455 78262706 + 1 NA intron (NM_001166133, intron 6 of 41) intron (NM_001166133, intron 6 of 41) -26405 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 175.667-84 chr2 236765645 236765844 + 1 NA Intergenic Intergenic 195919 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 151.667-314 chr6 75228052 75228280 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 15635 NM_001366293 1347 Hs.70312 NM_001865 ENSG00000112695 COX7A2 COX7AL|COX7AL1|COXVIIAL|COXVIIa-L|VIIAL cytochrome c oxidase subunit 7A2 protein-coding 263.333-58 chr3 80376719 80377264 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -387906 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 194.333-159 chr8 140353378 140353750 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) intron (NM_001160372, intron 9 of 22) 104180 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 180.667-12 chr10 34379104 34379496 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 9 of 22) intron (NM_001184789, intron 9 of 22) 435996 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 185.667-150 chrX 68844286 68844530 + 1 NA Intergenic Intergenic 15411 NM_004429 1947 Hs.144700 NM_004429 ENSG00000090776 EFNB1 CFND|CFNS|EFB1|EFL3|EPLG2|Elk-L|LERK2 ephrin B1 protein-coding 233.333-76 chr21 19444548 19445073 + 1 NA Intergenic Intergenic 454945 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 149.333-283 chr4 76180878 76181087 + 1 NA exon (NM_005506, exon 3 of 12) exon (NM_005506, exon 3 of 12) -32467 NR_103781 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 158.667-266 chr5 43646314 43646545 + 1 NA intron (NM_012343, intron 10 of 21) AluJb|SINE|Alu -43199 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 229.667-44 chr2 146800376 146800645 + 1 NA Intergenic Intergenic 213453 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 211.667-62 chr2 115651295 115651637 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 307651 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 321.333-22 chr14 53265882 53266238 + 1 NA Intergenic Intergenic 112706 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 296.667-62 chr9 95448993 95449450 + 1 NA exon (NM_001083606, exon 22 of 24) exon (NM_001083606, exon 22 of 24) -14388 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 152.667-398 chr9 124737019 124737204 + 1 NA intron (NM_001278546, intron 1 of 9) intron (NM_001278546, intron 1 of 9) 34200 NM_001489 2649 Hs.20131 NM_001489 ENSG00000148200 NR6A1 CT150|GCNF|GCNF1|NR61|RTR|hGCNF|hRTR nuclear receptor subfamily 6 group A member 1 protein-coding 221.667-87 chrX 23305464 23305705 + 1 NA Intergenic Intergenic -12438 NR_073010 100873065 Hs.628459 NR_046436 PTCHD1-AS DDX53-AS1|PTCHD1AS1|PTCHD1AS2 PTCHD1 antisense RNA (head to head) ncRNA 123.333-102 chr2 19147323 19147553 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -120467 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 171.333-194 chr8 79411894 79412075 + 1 NA Intergenic Intergenic 79796 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 149.333-407 chr8 121897557 121897804 + 1 NA Intergenic Intergenic -256240 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 146.333-264 chr5 101102415 101102694 + 1 NA Intergenic Intergenic -199272 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 209.667-112 chr8 89758522 89758840 + 1 NA promoter-TSS (NR_125822) promoter-TSS (NR_125822) 865 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 318.333-22 chr3 102439009 102439578 + 1 NA intron (NM_175056, intron 2 of 10) intron (NM_175056, intron 2 of 10) 4278 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 168.667-198 chr7 29552838 29553091 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -10871 NM_001329996 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 181.333-102 chr3 95452520 95452740 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 230563 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 139.333-101 chr18 45077735 45077987 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -90102 NM_001371319 195.333-217 chr8 116906148 116906486 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -31451 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 258.333-69 chr8 127277591 127277901 + 1 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 33109 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 192.667-44 chr12 12244142 12244496 + 1 NA exon (NM_002336, exon 2 of 23).2 exon (NM_002336, exon 2 of 23).2 22725 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 277.333-26 chr14 20837479 20837830 + 1 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -34810 NM_198234 6035 Hs.78224 NM_002933 ENSG00000129538 RNASE1 RAC1|RIB1|RNS1 ribonuclease A family member 1, pancreatic protein-coding 136.333-16 chr10 13965910 13966131 + 1 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) AluSq|SINE|Alu 5876 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 384.333-14 chr6 152972182 152972790 + 1 NA intron (NM_012177, intron 3 of 4) intron (NM_012177, intron 3 of 4) 10555 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 206.333-134 chr5 107019374 107019694 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -8520 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 158.667-62 chr11 70013364 70013596 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 50444 NR_120530 101928443 Hs.313468 NR_120529 ENSG00000248844 LINC02753 - long intergenic non-protein coding RNA 2753 ncRNA 186.333-129 chr5 108069837 108070044 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 312158 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 152.667-80 chr12 38693955 38694226 + 1 NA intron (NM_153634, intron 14 of 19) intron (NM_153634, intron 14 of 19) 211501 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 249.667-79 chr5 142979939 142980261 + 1 NA intron (NR_146198, intron 11 of 22) L1ME3|LINE|L1 -111190 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-205 chr2 194301148 194301424 + 1 NA Intergenic Intergenic -42983 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 223.667-78 chr7 83355389 83355826 + 1 NA Intergenic Intergenic -192723 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 234.333-17 chr12 15483782 15484130 + 1 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) intron (NM_030667, intron 1 of 26) -62655 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 244.667-29 chr12 3612151 3612667 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -119590 NR_126055 100129223 Hs.586788 NR_126055 THCAT155 - thyroid cancer-associated transcript 155 ncRNA 153.667-367 chr7 149889262 149889524 + 1 NA intron (NR_147012, intron 10 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 15424 NM_001367794 155066 Hs.556998 NM_145230 ENSG00000171130 ATP6V0E2 ATP6V0E2L|C7orf32 ATPase H+ transporting V0 subunit e2 protein-coding 207.333-224 chr5 107751006 107751317 + 1 NA Intergenic Intergenic -80224 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 159.667-284 chr6 73949261 73949528 + 1 NA Intergenic Intergenic -120057 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 181.667-142 chr8 40765213 40765462 + 1 NA intron (NM_024645, intron 3 of 6) intron (NM_024645, intron 3 of 6) 132489 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 152.333-408 chr9 124362609 124362847 + 1 NA intron (NM_002799, intron 6 of 7) L1MA8|LINE|L1 9255 NR_027406 100129034 Hs.654980 NR_027406 LOC100129034 - uncharacterized LOC100129034 ncRNA 244.333-63 chr2 233230656 233231122 + 1 NA Intergenic Intergenic -20682 NM_198890 55054 Hs.529322 NM_017974 ENSG00000085978 ATG16L1 APG16L|ATG16A|ATG16L|IBD10|WDR30 autophagy related 16 like 1 protein-coding 224.667-57 chr3 123073645 123074037 + 1 NA intron (NM_006810, intron 1 of 16) intron (NM_006810, intron 1 of 16) 6816 NR_028444 10954 Hs.477352 NM_006810 ENSG00000065485 PDIA5 PDIR protein disulfide isomerase family A member 5 protein-coding 179.333-112 chr20 10915627 10915858 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -6470 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 320.667-18 chr18 21099306 21099960 + 1 NA intron (NM_005406, intron 1 of 32) AluJr|SINE|Alu 12180 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 218.333-47 chr16 54467782 54468193 + 1 NA Intergenic Intergenic -97288 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 190.667-23 chr11 61918308 61918546 + 1 NA promoter-TSS (NM_013401) promoter-TSS (NM_013401) -861 NM_013401 5866 Hs.13759 NM_013401 ENSG00000167994 RAB3IL1 GRAB RAB3A interacting protein like 1 protein-coding 257.333-9 chr10 48253688 48254016 + 1 NA intron (NM_001018071, intron 1 of 28) L1M4|LINE|L1 -2095 NM_001318191 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 154.333-167 chr2 134005000 134005302 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -114784 NM_001371457 205.667-25 chr11 40959330 40959682 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 500130 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 227.333-83 chr3 139758773 139759109 + 1 NA Intergenic Intergenic -80891 NM_001320511 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 161.667-80 chr14 66379116 66379390 + 1 NA Intergenic Intergenic -107118 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 162.667-226 chr5 106081087 106081319 + 1 NA Intergenic Intergenic 929811 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 163.333-52 chr11 40940810 40940979 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 518742 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 142.333-114 chr2 15122879 15123171 + 1 NA Intergenic Intergenic 438309 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 306.333-14 chr12 34580195 34580769 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 557986 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 148.333-220 chr20 5809232 5809503 + 1 NA intron (NM_001303478, intron 3 of 3) intron (NM_001303478, intron 3 of 3) 58966 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 159.667-343 chrX 43029828 43030003 + 1 NA Intergenic Intergenic -147079 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 245.667-84 chrX 34361735 34362028 + 1 NA Intergenic Intergenic -229551 NM_203408 158724 Hs.143268 NM_203408 ENSG00000185448 FAM47A - family with sequence similarity 47 member A protein-coding 208.333-102 chr4 34163203 34163660 + 1 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) L1MA2|LINE|L1 106316 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 167.333-7 chr1 58808956 58809142 + 1 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) intron (NR_108106, intron 1 of 1) 23898 NR_108106 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 282.333-24 chr18 5756277 5756779 + 1 NA intron (NR_038839, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 7709 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 165.333-72 chr14 45234700 45234973 + 1 NA intron (NM_018353, intron 6 of 16) L2a|LINE|L2 18366 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 149.333-422 chr9 28247499 28247673 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1PA10|LINE|L1 471719 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 123.333-62 chr12 118502383 118502548 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 125910 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 176.667-138 chr7 66024852 66025143 + 1 NA Intergenic Intergenic -42784 NM_001293105 2990 Hs.255230 NM_000181 ENSG00000169919 GUSB BG|MPS7 glucuronidase beta protein-coding 212.667-129 chr7 72150150 72150531 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 187051 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 169.667-176 chr6 12516156 12516399 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 69127 NR_149140 101928309 Hs.639414 NR_149140 ENSG00000234015 LINC02530 - long intergenic non-protein coding RNA 2530 ncRNA 158.333-33 chr10 44001171 44001367 + 1 NA Intergenic Intergenic 88867 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 203.333-65 chr13 101562664 101562882 + 1 NA intron (NM_001271756, intron 1 of 9) L1MEf|LINE|L1 72821 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 216.667-102 chr8 33954730 33955085 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -354801 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 229.667-15 chr11 76512910 76513194 + 1 NA intron (NM_001300942, intron 10 of 21) intron (NM_001300942, intron 10 of 21) 68027 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 143.667-231 chr7 41147965 41148139 + 1 NA Intergenic Intergenic 46448 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 164.667-98 chr18 58898073 58898287 + 1 NA intron (NM_001353535, intron 2 of 6) HAL1|LINE|L1 33303 NM_001353534 55205 Hs.529023 NM_018181 ENSG00000074657 ZNF532 - zinc finger protein 532 protein-coding 155.667-60 chr11 112042346 112042601 + 1 NA intron (NM_001931, intron 7 of 13) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 17659 NM_001931 1737 Hs.335551 NM_001931 ENSG00000150768 DLAT DLTA|E2|PDC-E2|PDCE2 dihydrolipoamide S-acetyltransferase protein-coding 240.333-54 chr2 184659412 184659833 + 1 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 61093 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 198.667-37 chr11 85343092 85343359 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) L1MC5a|LINE|L1 284045 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 111.667-70 chr12 117176938 117177088 + 1 NA intron (NM_015002, intron 4 of 11) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 13457 NM_015002 23014 Hs.740376 NM_015002 ENSG00000135108 FBXO21 FBX21 F-box protein 21 protein-coding 205.333-128 chr2 109442598 109442959 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 7 of 9) L1MEc|LINE|L1 -129153 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 169.667-60 chr14 56349474 56349779 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -164705 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 127.667-160 chr7 27549269 27549483 + 1 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) L1MA8|LINE|L1 -66598 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 255.333-99 chr7 106764057 106764442 + 1 NA Intergenic Intergenic -101033 NM_001282426 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 232.667-31 chr18 71420440 71420707 + 1 NA Intergenic Intergenic 158383 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 246.667-9 chr1 218253033 218253348 + 1 NA Intergenic Intergenic -32103 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 251.333-109 chr8 129081807 129082223 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -116014 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 144.667-68 chr13 35811281 35811467 + 1 NA intron (NM_001195415, intron 7 of 13) intron (NM_001195415, intron 7 of 13) 44293 NM_001195416 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 190.667-127 chr7 2240135 2240516 + 1 NA intron (NM_013393, intron 1 of 2) intron (NM_013393, intron 1 of 2) 1880 NM_013393 29960 Hs.279877 NM_013393 ENSG00000122687 MRM2 FJH1|FTSJ2|HEL97|RRMJ2 mitochondrial rRNA methyltransferase 2 protein-coding 195.333-3 chr1 38638812 38639107 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 163763 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 146.333-228 chr4 32921061 32921233 + 1 NA Intergenic Intergenic 570109 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 220.333-53 chr18 2927446 2927806 + 1 NA intron (NM_014646, intron 12 of 19) intron (NM_014646, intron 12 of 19) 18997 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 151.333-31 chr1 200867886 200868100 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4988 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 159.333-355 chr9 93490451 93490707 + 1 NA intron (NM_001286723, intron 3 of 9) intron (NM_001286723, intron 3 of 9) -36978 NR_136229 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 224.333-33 chr12 121402291 121402584 + 1 NA intron (NM_001256858, intron 1 of 4) intron (NM_001256858, intron 1 of 4) 2319 NM_194271 80196 Hs.292804 NM_025126 ENSG00000170633 RNF34 CARP-1|CARP1|RFI|RIF|RIFF|hRFI ring finger protein 34 protein-coding 143.667-64 chr13 25319471 25319750 + 1 NA intron (NM_014089, intron 7 of 15) intron (NM_014089, intron 7 of 15) 17985 NM_001008564 9818 Hs.507537 NM_014089 ENSG00000139496 NUP58 NUP45|NUPL1|PRO2463 nucleoporin 58 protein-coding 147.333-313 chr8 34987002 34987163 + 1 NA Intergenic Intergenic 203161 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 232.333-42 chr2 59319597 59320052 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 102116 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 214.667-55 chr18 12408725 12409036 + 1 NA intron (NM_001142405, intron 1 of 6) L1PB4|LINE|L1 951 NM_006553 10650 Hs.514718 NM_006553 ENSG00000141391 PRELID3A C18orf43|HFL-EDDG1|SLMO1 PRELI domain containing 3A protein-coding 162.333-9 chr1 95923204 95923438 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -68747 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 231.667-5 chr11 83529777 83530140 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 21 of 27) L2c|LINE|L2 152467 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 160.667-235 chr5 5127318 5127572 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 12609 NR_109915 101929176 Hs.208717 NR_109915 CTD-2297D10.2 - uncharacterized LOC101929176 ncRNA 182.667-48 chr14 69119108 69119410 + 1 NA intron (NM_003861, intron 2 of 8) intron (NM_003861, intron 2 of 8) 33340 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 367.667-10 chr2 73037669 73038251 + 1 NA intron (NR_138476, intron 3 of 14) intron (NR_138476, intron 3 of 14) 21212 NM_001330407 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 129.667-19 chr10 24402036 24402194 + 1 NA intron (NM_019590, intron 3 of 20) L1MD2|LINE|L1 -47299 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 120.333-128 chr3 66176599 66176793 + 1 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) intron (NM_173471, intron 1 of 10) 43086 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 122.333-206 chr8 106517071 106517239 + 1 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) L1ME3A|LINE|L1 69231 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 153.667-49 chr10 78184061 78184251 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -64469 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 245.667-20 chr14 56317213 56317529 + 1 NA Intergenic Intergenic -196960 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 130.667-159 chr4 174876439 174876606 + 1 NA TTS (NR_125900) TTS (NR_125900) -41836 NM_001130705 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 150.333-431 chr9 29339488 29339675 + 1 NA Intergenic Intergenic -125980 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 168.333-30 chr10 119079668 119079954 + 1 NA intron (NM_003750, intron 1 of 21) MIR3|SINE|MIR 1006 NM_003750 8661 Hs.523299 NM_003750 ENSG00000107581 EIF3A EIF3|EIF3S10|P167|TIF32|eIF3-p170|eIF3-theta|p180|p185 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A protein-coding 158.667-103 chr14 84404748 84405000 + 1 NA Intergenic Intergenic -867058 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 214.667-126 chr9 35132504 35132810 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -16795 NM_025182 80256 Hs.301696 NM_025182 ENSG00000005238 FAM214B KIAA1539 family with sequence similarity 214 member B protein-coding 151.667-89 chr12 83820058 83820222 + 1 NA Intergenic Intergenic 1092659 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 223.667-29 chr17 47676962 47677389 + 1 NA intron (NM_002265, intron 17 of 21) intron (NM_002265, intron 17 of 21) -18089 NM_014726 9755 Hs.94790 NM_014726 ENSG00000198933 TBKBP1 ProSAPiP2|SINTBAD TBK1 binding protein 1 protein-coding 377.333-15 chr4 117050582 117051132 + 1 NA Intergenic Intergenic 34719 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 194.667-112 chr4 79695985 79696218 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -131370 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 156.333-134 chr16 71945495 71945673 + 1 NA intron (NM_181536, intron 22 of 29) AluSx|SINE|Alu 50053 NM_014761 9798 Hs.232194 NM_014761 ENSG00000182149 IST1 CHMP8|OLC1 IST1 factor associated with ESCRT-III protein-coding 275.667-57 chr7 75858111 75858443 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -20715 NR_144391 57414 Hs.488827 NM_020684 ENSG00000005486 RHBDD2 NPD007|RHBDL7 rhomboid domain containing 2 protein-coding 148.667-297 chr4 186376792 186376951 + 1 NA intron (NR_033900, intron 1 of 3) L1ME3F|LINE|L1 110682 NM_001354804 2160 Hs.1430 NM_000128 ENSG00000088926 F11 FXI|PTA coagulation factor XI protein-coding 168.333-76 chr18 1624278 1624553 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -264786 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 149.333-109 chr14 46777754 46777990 + 1 NA Intergenic Intergenic -126091 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 201.667-105 chr6 56168654 56168986 + 1 NA intron (NM_030820, intron 5 of 29) L2c|LINE|L2 -77158 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 154.667-136 chr17 4220322 4220583 + 1 NA intron (NR_047571, intron 2 of 23) intron (NR_047571, intron 2 of 23) 43395 NM_001257999 51479 Hs.696087 NM_016376 ENSG00000185722 ANKFY1 ANKHZN|BTBD23|ZFYVE14 ankyrin repeat and FYVE domain containing 1 protein-coding 201.333-143 chr2 26092600 26092905 + 1 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) intron (NM_016131, intron 1 of 5) 58668 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 155.667-78 chr12 126141674 126141956 + 1 NA Intergenic Intergenic 45823 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 134.667-6 chr1 76437005 76437174 + 1 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) intron (NM_001349109, intron 3 of 3) 342178 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 184.667-138 chr8 128942854 128943072 + 1 NA Intergenic Intergenic 23038 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 235.333-23 chr11 77660888 77661258 + 1 NA Intergenic Intergenic -23267 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 173.667-51 chr15 37488997 37489314 + 1 NA Intergenic Intergenic -387844 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 213.333-79 chr17 68627739 68628026 + 1 NA promoter-TSS (NR_110825) promoter-TSS (NR_110825) -272 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 201.667-67 chr21 19300601 19300931 + 1 NA Intergenic Intergenic -540954 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 280.667-39 chr5 36072232 36072672 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -5570 NM_174914 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 205.333-24 chr1 222122013 222122319 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -143646 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 147.333-111 chr14 70452079 70452261 + 1 NA promoter-TSS (NM_003813) promoter-TSS (NM_003813) -4 NM_003813 8747 Hs.178748 NM_003813 ENSG00000139985 ADAM21 ADAM 21|ADAM31 ADAM metallopeptidase domain 21 protein-coding 132.667-79 chr2 28156336 28156585 + 1 NA intron (NR_120504, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 50501 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 158.333-254 chr5 39702875 39703121 + 1 NA Intergenic Intergenic 182567 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 138.333-181 chr7 40137406 40137662 + 1 NA intron (NM_024728, intron 1 of 14) intron (NM_024728, intron 1 of 14) 2558 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 182.667-117 chr4 47483421 47483638 + 1 NA Intergenic Intergenic -1746 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 175.333-165 chr6 155481653 155481875 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -25925 NM_015718 50508 Hs.247776 NM_015718 ENSG00000074771 NOX3 GP91-3|MOX-2 NADPH oxidase 3 protein-coding 215.667-3 chr1 116983549 116983898 + 1 NA intron (NM_020440, intron 7 of 8) intron (NM_020440, intron 7 of 8) -18027 NM_004258 9398 Hs.654598 NM_004258 ENSG00000134256 CD101 EWI-101|IGSF2|V7 CD101 molecule protein-coding 148.333-138 chr15 59131622 59131877 + 1 NA TTS (NM_004998) TTS (NM_004998) 26603 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 161.667-253 chr8 92006727 92006986 + 1 NA intron (NM_004349, intron 4 of 10) intron (NM_004349, intron 4 of 10) 10824 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 154.333 chr1 22426949 22427170 + 1 NA Intergenic Intergenic -24792 NM_001083621 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 187.667-63 chr19 48820001 48820341 + 1 NA intron (NM_016246, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu -9142 NM_001190 587 Hs.512670 NM_001190 ENSG00000105552 BCAT2 BCAM|BCATM|BCT2|PP18 branched chain amino acid transaminase 2 protein-coding 128.667-133 chr4 99662853 99663045 + 1 NA Intergenic Intergenic -8270 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 187.333-152 chr5 33742986 33743366 + 1 NA intron (NM_001324512, intron 3 of 21) L2a|LINE|L2 148814 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 163.667-236 chr7 66516396 66516581 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 22797 NR_134572 100289098 Hs.662276 NR_134570 ENSG00000237310 GS1-124K5.4 - uncharacterized LOC100289098 ncRNA 189.667-3 chr1 51327882 51328204 + 1 NA intron (NM_001144832, intron 1 of 17) intron (NM_001144832, intron 1 of 17) -1611 NR_123731 102724097 Hs.568648 NR_123731 ENSG00000261664 TTC39A-AS1 - TTC39A antisense RNA 1 ncRNA 197.333-244 chr9 27100380 27100665 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -8619 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 154.667-395 chr8 111662171 111662479 + 1 NA Intergenic Intergenic 285686 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 374.333-7 chr18 34018609 34019248 + 1 NA intron (NM_001353232, intron 6 of 9) intron (NM_001353232, intron 6 of 9) 29684 NM_001198549 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 237.333-128 chr8 136961346 136961691 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 430720 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 147.667-158 chr19 28525064 28525219 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) AluSg4|SINE|Alu -81547 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 122.333-38 chr11 111793407 111793589 + 1 NA intron (NM_001352420, intron 14 of 15) AluY|SINE|Alu -27109 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 161.667-201 chr5 56115220 56115457 + 1 NA intron (NM_024669, intron 9 of 11) AluSx|SINE|Alu 117992 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 205.667-125 chr7 95637392 95637814 + 1 NA Intergenic Intergenic -41087 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 127.333-94 chr20 56349869 56350004 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9038 NM_080821 116151 Hs.143736 NM_080821 ENSG00000124098 FAM210B 5A3|C20orf108|dJ1167H4.1 family with sequence similarity 210 member B protein-coding 158.667-44 chr10 80559085 80559343 + 1 NA intron (NM_001145719, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 18395 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 203.333-136 chr2 79192711 79193039 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -33122 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 205.667-101 chr3 160506829 160507202 + 1 NA intron (NM_002268, intron 15 of 16) HAL1ME|LINE|L1 8221 NR_003001 677767 Hs.675953 NR_003001 ENSG00000238741 SCARNA7 U90 small Cajal body-specific RNA 7 ncRNA 182.667-100 chr3 106353860 106354169 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -484613 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 161.667-150 chr2 222994894 222995064 + 1 NA Intergenic Intergenic -56951 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 112.333-198 chr5 5898178 5898351 + 1 NA Intergenic Intergenic 439028 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 160.333-215 chr4 67497650 67497842 + 1 NA intron (NR_155754, intron 12 of 18) AluJb|SINE|Alu 47757 NR_155754 1060 Hs.479867 NM_001812 ENSG00000145241 CENPC CENP-C|CENPC1|MIF2|hcp-4 centromere protein C protein-coding 124.667-137 chr3 110931075 110931281 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 138781 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 111.667-267 chr9 9586615 9586765 + 1 NA intron (NM_002839, intron 7 of 45) intron (NM_002839, intron 7 of 45) -212702 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 137.333-60 chr16 55229781 55229973 + 1 NA Intergenic Intergenic -94682 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 199.333-61 chr12 123103643 123103940 + 1 NA intron (NM_020845, intron 1 of 24) MIR3|SINE|MIR 6637 NM_020845 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 231.667-21 chr16 78907424 78907690 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) LTR8A|LTR|ERV1 693180 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 164.333-101 chr18 36756827 36757103 + 1 NA intron (NM_001281739, intron 21 of 23) intron (NM_001281739, intron 21 of 23) 72037 NM_015476 25941 Hs.436636 NM_015476 ENSG00000134779 TPGS2 C18orf10|HMFN0601|L17|PGs2 tubulin polyglutamylase complex subunit 2 protein-coding 190.333-143 chr8 66656218 66656488 + 1 NA intron (NM_025054, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 10878 NM_025054 80124 Hs.632066 NM_025054 ENSG00000175073 VCPIP1 DUBA3|VCIP135 valosin containing protein interacting protein 1 protein-coding 412.333-8 chr7 82749851 82750554 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -306246 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 214.333-92 chr3 9322843 9323189 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -40038 NM_001114092 25917 Hs.443081 NM_015453 ENSG00000134077 THUMPD3 - THUMP domain containing 3 protein-coding 250.667-68 chr5 160036290 160036590 + 1 NA intron (NM_003314, intron 3 of 7) intron (NM_003314, intron 3 of 7) 27301 NM_003314 7265 Hs.519718 NM_003314 ENSG00000113312 TTC1 TPR1 tetratricopeptide repeat domain 1 protein-coding 230.333-100 chr5 169357215 169357695 + 1 NA Intergenic Intergenic -56316 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 170.667-155 chr7 46758337 46758658 + 1 NA Intergenic Intergenic -61375 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 259.667-37 chr2 139777711 139778161 + 1 NA Intergenic Intergenic 808749 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 248.333-88 chr5 168519775 168520239 + 1 NA TTS (NM_002887) TTS (NM_002887) -9298 NM_001355274 345630 Hs.166262 NM_001355274 ENSG00000188573 FBLL1 - fibrillarin like 1 protein-coding 281.333-68 chr8 81085741 81086210 + 1 NA intron (NM_018440, intron 1 of 8) AluY|SINE|Alu 26093 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 133.333-88 chr2 164873428 164873615 + 1 NA Intergenic Intergenic -31445 NM_001365670 22837 Hs.470457 NM_014900 ENSG00000082438 COBLL1 COBLR1 cordon-bleu WH2 repeat protein like 1 protein-coding 224.667-51 chr20 47476608 47476918 + 1 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -25124 NM_001174088 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 144.333-87 chr15 81513000 81513200 + 1 NA Intergenic Intergenic -138887 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 181.667-74 chr2 149080129 149080330 + 1 NA intron (NM_001317004, intron 1 of 6) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 2707 NM_001317004 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 254.333-54 chr3 51566624 51567168 + 1 NA intron (NM_001322253, intron 3 of 23) L1MEd|LINE|L1 25307 NM_001322257 23132 Hs.105399 NM_015106 ENSG00000164080 RAD54L2 ARIP4|HSPC325|SRISNF2L RAD54 like 2 protein-coding 159.667-84 chr12 71024420 71024636 + 1 NA Intergenic Intergenic -103790 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 128.333-176 chr6 121514507 121514729 + 1 NA Intergenic Intergenic 78972 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 144.667-34 chr10 120698138 120698318 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 100279 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 142.333-199 chr5 69093630 69093814 + 1 NA promoter-TSS (NM_024055) promoter-TSS (NM_024055) -292 NM_024055 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 147.333-219 chr3 104058892 104059097 + 1 NA Intergenic Intergenic -534878 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 210.667-79 chr21 31847340 31847810 + 1 NA Intergenic Intergenic -25445 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 152.667-132 chr16 50086059 50086304 + 1 NA intron (NR_138092, intron 11 of 15) intron (NR_138092, intron 11 of 15) 20211 NR_138093 55027 Hs.733027 NM_017939 ENSG00000155393 HEATR3 SYO1 HEAT repeat containing 3 protein-coding 154.667-336 chr6 51165481 51165690 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 346714 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 360.333-16 chr6 44933433 44934225 + 1 NA intron (NM_181356, intron 11 of 12) AluJo|SINE|Alu 263941 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 247.667-42 chr18 60394479 60394917 + 1 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -21923 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 150.333-30 chr10 13949060 13949216 + 1 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) intron (NM_018027, intron 2 of 24) 22758 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 149.667-279 chr4 42463742 42464029 + 1 NA intron (NM_001105529, intron 26 of 35) intron (NM_001105529, intron 26 of 35) 66397 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 188.667-10 chr1 94588201 94588482 + 1 NA Intergenic Intergenic 44639 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 168.333-122 chr21 42730695 42730949 + 1 NA intron (NM_001001584, intron 3 of 17) intron (NM_001001584, intron 3 of 17) 49172 NR_135517 101928311 Hs.570404 NR_135517 ENSG00000283051 LINC01668 - long intergenic non-protein coding RNA 1668 ncRNA 229.333-105 chr6 45781174 45781599 + 1 NA Intergenic Intergenic 156211 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 163.333-240 chr6 39646406 39646686 + 1 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) (AGTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 78862 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 282.333-23 chr18 822016 822487 + 1 NA Intergenic Intergenic -10009 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 160.667-252 chr5 129834788 129834957 + 1 NA Intergenic Intergenic -69593 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 151.667-131 chr15 95861669 95861929 + 1 NA Intergenic Intergenic 266042 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 156.333-19 chr1 155682193 155682369 + 1 NA intron (NM_001198901, intron 1 of 9) intron (NM_001198901, intron 1 of 9) -2452 NM_001198899 55249 Hs.584927 NM_018253 ENSG00000163374 YY1AP1 GRNG|HCCA1|HCCA2|YY1AP YY1 associated protein 1 protein-coding 152.333-290 chr5 18339237 18339444 + 1 NA Intergenic Intergenic 532066 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 272.333-35 chr2 176521370 176521839 + 1 NA Intergenic Intergenic 79448 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 137.667-148 chr4 168741793 168741983 + 1 NA intron (NM_001166108, intron 10 of 21) intron (NM_001166108, intron 10 of 21) -90207 NM_001166110 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 168.667-47 chr12 117574020 117574263 + 1 NA intron (NM_173598, intron 7 of 19) MER5A|DNA|hAT-Charlie -212339 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 168.333-212 chr8 119024815 119025017 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) -42331 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 129.333-114 chr3 4457860 4458004 + 1 NA intron (NM_001164674, intron 1 of 7) L1MA7|LINE|L1 9337 NM_182760 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 132.333-72 chr18 65988989 65989158 + 1 NA Intergenic Intergenic 238061 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 167.667-69 chr16 9954632 9954930 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 227286 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 191.667-39 chr12 43531256 43531487 + 1 NA intron (NM_025003, intron 3 of 38) intron (NM_025003, intron 3 of 38) 20832 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 169.333-245 chr7 54495025 54495267 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -47179 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 140.333-153 chr3 187188110 187188318 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -9272 NM_153708 132112 Hs.518480 NM_153708 ENSG00000175077 RTP1 Z3CXXC1 receptor transporter protein 1 protein-coding 157.667-98 chr14 47686590 47686870 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -11776 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 216.333-126 chr6 95606173 95606486 + 1 NA exon (NM_024641, exon 5 of 5) exon (NM_024641, exon 5 of 5) 28794 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 130.333-23 chr1 237602110 237602277 + 1 NA intron (NM_001035, intron 35 of 104) intron (NM_001035, intron 35 of 104) 131074 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 145.333-119 chr18 38479015 38479193 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 821969 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 165.667-80 chr18 8824497 8824737 + 1 NA intron (NM_015210, intron 14 of 16) intron (NM_015210, intron 14 of 16) 107236 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 182.333-126 chr5 63351316 63351570 + 1 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 610849 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 155.333-213 chr22 25887919 25888138 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 25 of 43) intron (NM_001318245, intron 25 of 43) 145840 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 256.667-55 chr3 15612193 15612618 + 1 NA intron (NM_001281725, intron 1 of 3) L1M7|LINE|L1 10436 NM_001281725 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 195.667-88 chr3 59603772 59604068 + 1 NA Intergenic Intergenic 54577 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 249.667-80 chr6 14125473 14125771 + 1 NA intron (NM_001040280, intron 2 of 4) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 7850 NM_004233 9308 Hs.595133 NM_004233 ENSG00000112149 CD83 BL11|HB15 CD83 molecule protein-coding 184.667-90 chr4 53065362 53065561 + 1 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 203144 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 295.333-31 chr2 188207421 188208026 + 1 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) MER91C|DNA|hAT-Tip100 79968 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 247.333-32 chr16 78351877 78352210 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 252389 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 144.333-51 chr12 49427079 49427270 + 1 NA intron (NM_001293285, intron 3 of 14) AluJo|SINE|Alu 38000 NR_033267 100335030 Hs.687044 NR_033267 LOC100335030 - FGFR1 oncogene partner 2 pseudogene pseudo 150.667-20 chr1 224106505 224106677 + 1 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -7520 NM_001136115 23219 Hs.64691 NM_015176 ENSG00000143756 FBXO28 CENP-30|Fbx28 F-box protein 28 protein-coding 212.333-25 chr11 92249816 92250064 + 1 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) intron (NM_001367949, intron 1 of 27) 24906 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 149.667-338 chr5 176697983 176698225 + 1 NA Intergenic Intergenic -45101 NR_108030 102577424 Hs.349025 NR_108030 ENSG00000248859 LINC01574 HI-LNC12 long intergenic non-protein coding RNA 1574 ncRNA 244.667-61 chr20 507454 507712 + 1 NA intron (NM_177560, intron 1 of 11) intron (NM_177560, intron 1 of 11) 36207 NM_001362770 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 162.667-229 chr5 120449361 120449528 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -14834 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 169.667-39 chr11 128668850 128669168 + 1 NA Intergenic Intergenic -17526 NM_001271012 2313 Hs.504281 NM_002017 ENSG00000151702 FLI1 BDPLT21|EWSR2|SIC-1 Fli-1 proto-oncogene, ETS transcription factor protein-coding 276.667-24 chr14 33530991 33531542 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) L1ME1|LINE|L1 -177671 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 267.667-22 chr18 47508553 47509080 + 1 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) (CAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 128320 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 151.667-375 chr8 117351998 117352223 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -168603 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 158.667-157 chr2 71905509 71905679 + 1 NA Intergenic Intergenic 242268 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 154.667-302 chr5 21820792 21820953 + 1 NA intron (NM_004061, intron 8 of 14) intron (NM_004061, intron 8 of 14) -63582 NR_132787 106635539 NR_132787 SNORA105A - small nucleolar RNA, H/ACA box 105A snoRNA 260.333-13 chr12 88194647 88195087 + 1 NA exon (NM_001366580, exon 13 of 13) exon (NM_001366580, exon 13 of 13) 52560 NM_001366579 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 272.667-55 chr5 109133579 109134024 + 1 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) intron (NR_146155, intron 17 of 19) 192568 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 206.667-99 chr4 31270068 31270500 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 99140 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 221.667-55 chr3 194948191 194948491 + 1 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR -146247 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 168.333-218 chr8 136761381 136761668 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 230726 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 140.333-127 chr21 16435833 16436017 + 1 NA intron (NR_136550, intron 1 of 3) intron (NR_136550, intron 1 of 3) 15630 NR_136550 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 170.667-127 chr4 103877496 103877899 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -157712 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 120.333-21 chr10 63459277 63459433 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) intron (NM_001322258, intron 1 of 24) -5874 NR_027182 84989 Hs.659950 NM_032903 ENSG00000272767 JMJD1C-AS1 - JMJD1C antisense RNA 1 ncRNA 157.667-120 chr17 6437004 6437293 + 1 NA Intergenic Intergenic -2027 NM_001285399 23746 Hs.279887 NM_014336 ENSG00000129221 AIPL1 AIPL2|LCA4 aryl hydrocarbon receptor interacting protein like 1 protein-coding 181.667-122 chr5 91159118 91159441 + 1 NA intron (NR_003149, intron 89 of 89) intron (NR_003149, intron 89 of 89) 155123 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 146.667-136 chr17 48483177 48483424 + 1 NA Intergenic Intergenic 38467 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 192.333-6 chr1 104320380 104320666 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 247500 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 137.667-38 chr11 87896684 87896941 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -177401 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 150.333-165 chr17 80130160 80130422 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 16837 NM_014740 9775 Hs.389649 NM_014740 ENSG00000141543 EIF4A3 DDX48|Fal1|MUK34|NMP265|NUK34|RCPS|eIF-4A-III|eIF4A-III|eIF4AIII eukaryotic translation initiation factor 4A3 protein-coding 297.667-39 chr8 111919023 111919724 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 542734 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 212.333-101 chr3 153484432 153484764 + 1 NA non-coding (NR_160966, exon 1 of 3) non-coding (NR_160966, exon 1 of 3) 103 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 157.667-335 chr8 106845461 106845634 + 1 NA Intergenic Intergenic -75303 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 240.333-44 chr17 58186353 58186640 + 1 NA Intergenic Intergenic -6230 NM_000502 8288 Hs.279259 NM_000502 ENSG00000121053 EPX EPO|EPP|EPX-PEN|EPXD eosinophil peroxidase protein-coding 151.333-140 chr15 20380150 20380302 + 1 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 60261 NR_036443 440248 Hs.531509 NM_199045 ENSG00000206149 HERC2P9 - hect domain and RLD 2 pseudogene 9 pseudo 128.333-26 chr10 33783897 33784053 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -11295 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 181.333-5 chr1 115696837 115697152 + 1 NA 3' UTR (NM_138959, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_138959, exon 8 of 8) 54365 NM_001172412 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 156.333-380 chr9 109614718 109614931 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -25964 NM_001037293 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 220.333-43 chr16 23888678 23889071 + 1 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) intron (NM_002738, intron 2 of 16) 52891 NM_212535 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 129.667-77 chr17 58812986 58813175 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 57211 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 118.333-164 chr5 46398731 46398891 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -702431 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 263.667-69 chr6 48376442 48376756 + 1 NA Intergenic Intergenic -307910 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 156.333-56 chr11 38498390 38498625 + 1 NA Intergenic Intergenic 147849 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 152.333-76 chr12 17053133 17053313 + 1 NA Intergenic Intergenic 64476 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 241.667-71 chr5 39119835 39120357 + 1 NA intron (NM_001243093, intron 14 of 18) intron (NM_001243093, intron 14 of 18) -45697 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 134.333-39 chr12 79836205 79836381 + 1 NA intron (NM_001244990, intron 4 of 24) intron (NM_001244990, intron 4 of 24) 77618 NM_001143886 4659 Hs.49582 NM_002480 ENSG00000058272 PPP1R12A M130|MBS|MYPT1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A protein-coding 186.667-102 chr4 48805908 48806143 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -25018 NM_001079841 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 126.333-157 chr6 146085644 146085825 + 1 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) intron (NM_001278065, intron 2 of 9) 56536 NM_001278067 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 123.667-37 chr11 7387443 7387631 + 1 NA intron (NM_175733, intron 3 of 6) L1M5|LINE|L1 78298 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 209.333-163 chr4 21432037 21432360 + 1 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 32560 NR_107018 102465859 NR_107018 ENSG00000283281 MIR7978 hsa-mir-7978 microRNA 7978 ncRNA 238.667-9 chr1 239237261 239237614 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -149131 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 154.333-212 chr3 46318271 46318504 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -35357 NM_001123041 729230 Hs.511794 NM_001123041 ENSG00000121807 CCR2 CC-CKR-2|CCR-2|CCR2A|CCR2B|CD192|CKR2|CKR2A|CKR2B|CMKBR2|MCP-1-R C-C motif chemokine receptor 2 protein-coding 201.667-53 chr2 41576136 41576506 + 1 NA Intergenic Intergenic -301234 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 276.333-19 chr16 78900109 78900440 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 700463 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 183.333-19 chr11 35723975 35724372 + 1 NA intron (NM_017583, intron 2 of 4) intron (NM_017583, intron 2 of 4) 61398 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 164.667-17 chr10 11837773 11838008 + 1 NA intron (NM_153256, intron 1 of 3) intron (NM_153256, intron 1 of 3) 14534 NM_153256 254427 Hs.435775 NM_153256 ENSG00000148426 PROSER2 C10orf47 proline and serine rich 2 protein-coding 147.333-43 chr10 55320807 55320974 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1PA15|LINE|L1 -278152 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 284.333 chr1 55331181 55331653 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 105776 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 148.667-303 chr5 30105831 30106014 + 1 NA Intergenic Intergenic 225362 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 207.333-283 chrX 9616499 9616945 + 1 NA intron (NM_001139468, intron 3 of 17) intron (NM_001139468, intron 3 of 17) 149125 NM_000273 4935 Hs.74124 NM_000273 ENSG00000101850 GPR143 NYS6|OA1 G protein-coupled receptor 143 protein-coding 161.667-217 chr5 176737756 176737940 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -5357 NR_108030 102577424 Hs.349025 NR_108030 ENSG00000248859 LINC01574 HI-LNC12 long intergenic non-protein coding RNA 1574 ncRNA 155.667-139 chr18 12929140 12929370 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -18729 NM_031216 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 194.667-32 chr12 40852234 40852460 + 1 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) MIRc|SINE|MIR 24409 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 168.333-106 chr2 191026486 191026672 + 1 NA intron (NR_136318, intron 1 of 2) MSTB1-int|LTR|ERVL-MaLR 5053 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 195.667-81 chr21 43596096 43596424 + 1 NA intron (NM_007031, intron 7 of 8) intron (NM_007031, intron 7 of 8) 13729 NR_106718 102464825 NR_106718 ENSG00000278433 MIR6070 hsa-mir-6070 microRNA 6070 ncRNA 366.667-4 chr15 67612620 67613059 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 8 of 21) intron (NM_001206804, intron 8 of 21) 63745 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 169.333-143 chr20 56037788 56038087 + 1 NA Intergenic Intergenic -32418 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 183.667-48 chr15 56633671 56633901 + 1 NA intron (NM_001002843, intron 20 of 20) AluSg|SINE|Alu 100300 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 181.333-97 chr3 4219339 4219636 + 1 NA Intergenic Intergenic -83817 NM_001320677 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 173.667-122 chr3 172567832 172568014 + 1 NA intron (NR_146714, intron 3 of 3) L1PA12|LINE|L1 27684 NR_146714 105374219 Hs.186269 NR_146714 ENSG00000223387 LINC02068 - long intergenic non-protein coding RNA 2068 ncRNA 173.667-49 chr14 75186528 75186775 + 1 NA Intergenic Intergenic -10039 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 186.667-65 chr2 64911271 64911567 + 1 NA intron (NR_036586, intron 1 of 2) intron (NR_036586, intron 1 of 2) 21028 NR_036586 400958 Hs.591565 NR_036586 LINC02245 - long intergenic non-protein coding RNA 2245 ncRNA 149.667-17 chr1 91450838 91451042 + 1 NA Intergenic Intergenic -46103 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 150.333-156 chr17 50976668 50976915 + 1 NA intron (NM_001251971, intron 23 of 26) intron (NM_001251971, intron 23 of 26) 70087 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 230.333-65 chr2 144084230 144084607 + 1 NA intron (NM_001354355, intron 7 of 13) intron (NM_001354355, intron 7 of 13) 127161 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 163.667-47 chr12 84857243 84857463 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 55446 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 138.667-130 chr3 77814837 77815053 + 1 NA Intergenic Intergenic 234018 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 154.667-277 chr4 90346589 90346746 + 1 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) intron (NM_207491, intron 3 of 7) 111636 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 127.667-58 chr17 32479762 32479905 + 1 NA intron (NM_002815, intron 10 of 13) X6B_LINE|LINE|CR1 -7160 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 150.667-400 chr9 102825841 102826068 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -169379 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 113.333-245 chr7 82983767 82983913 + 1 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 179044 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 264.667-65 chr5 52141740 52142089 + 1 NA Intergenic Intergenic 133883 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 154.667-223 chr21 32513395 32513549 + 1 NA intron (NR_104472, intron 6 of 6) AluY|SINE|Alu 72051 NM_144659 140290 Hs.728804 NM_018277 ENSG00000242220 TCP10L C21orf77|PRED77|TCP10A-1|TCP10A-2 t-complex 10 like protein-coding 202.667-22 chr10 98344410 98344705 + 1 NA Intergenic Intergenic 50750 NR_031619 100302133 NR_031619 ENSG00000284415 MIR1287 MIRN1287|hsa-mir-1287|mir-1287 microRNA 1287 ncRNA 308.667-19 chr2 67330030 67330397 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -67120 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 161.333-245 chr6 84443818 84443983 + 1 NA intron (NR_132100, intron 4 of 4) intron (NR_132100, intron 4 of 4) 31029 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 168.667-30 chr11 22233484 22233778 + 1 NA intron (NM_001142649, intron 7 of 21) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 40455 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 147.333-253 chr5 22535870 22536065 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) MER2|DNA|TcMar-Tigger 317377 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 157.667-21 chr1 235213834 235214028 + 1 NA exon (NM_016374, exon 17 of 24) exon (NM_016374, exon 17 of 24) -23815 NR_039908 100616224 NR_039908 ENSG00000263439 MIR4753 mir-4753 microRNA 4753 ncRNA 225.333-100 chr4 77554546 77554952 + 1 NA intron (NM_006419, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 42996 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 127.667-132 chr4 168053013 168053191 + 1 NA Intergenic Intergenic -39435 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 162.333-55 chr12 65050605 65050813 + 1 NA TTS (NM_007191) TTS (NM_007191) -58418 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 383.333-11 chr4 64647634 64648147 + 1 NA Intergenic Intergenic -238430 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 218.667-101 chr7 49538251 49538591 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -235217 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 173.333-8 chr1 75073195 75073539 + 1 NA Intergenic Intergenic -55067 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 189.667-153 chrX 66385190 66385510 + 1 NA Intergenic Intergenic 217600 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 181.667-146 chr8 76747801 76748011 + 1 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) AluSx1|SINE|Alu -64631 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-342 chr6 100698659 100698916 + 1 NA intron (NM_006828, intron 13 of 41) intron (NM_006828, intron 13 of 41) 182542 NM_006828 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 125.667-149 chr5 45538356 45538524 + 1 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 157940 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 165.667-177 chr6 56552744 56552989 + 1 NA exon (NM_015548, exon 42 of 84) exon (NM_015548, exon 42 of 84) 90023 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 222.333-57 chr22 27133411 27133845 + 1 NA Intergenic Intergenic -53888 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 192.333-105 chr21 7258756 7259127 + 1 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -171696 NM_001322044 102724219 Hs.743984 NM_001322044 LOC102724219 - uncharacterized LOC102724219 protein-coding 226.667-20 chr10 70412699 70413078 + 1 NA intron (NM_004096, intron 1 of 2) intron (NM_004096, intron 1 of 2) 8743 NM_004096 1979 Hs.621200 NM_004096 ENSG00000148730 EIF4EBP2 4EBP2|PHASII eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 protein-coding 142.333-38 chr11 25615441 25615665 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -573570 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 175.333-211 chrX 99671562 99671843 + 1 NA Intergenic Intergenic 738571 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 166.667-125 chr2 199650687 199650937 + 1 NA intron (NR_110270, intron 6 of 6) L1MA9|LINE|L1 42744 NR_110270 101927641 Hs.549598 NR_110270 ENSG00000238217 LINC01877 - long intergenic non-protein coding RNA 1877 ncRNA 133.333-196 chr9 38093266 38093419 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -24115 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 156.333-256 chr3 191714095 191714351 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 253060 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 151.667-207 chr3 21122026 21122178 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -283624 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 150.667-99 chr13 47659336 47659545 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 273182 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 131.667-131 chr3 97123465 97123646 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) 308961 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 183.667-61 chr17 31357906 31358197 + 1 NA intron (NM_001042492, intron 54 of 57) intron (NM_001042492, intron 54 of 57) -33624 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 329.333-36 chr3 149573299 149573717 + 1 NA intron (NM_001348362, intron 5 of 9) intron (NM_001348362, intron 5 of 9) 84517 NM_015472 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 144.333-281 chr9 19644289 19644496 + 1 NA intron (NM_020344, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR 142627 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 174.333-55 chr2 13569392 13569738 + 1 NA Intergenic Intergenic -562552 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 140.667-103 chr18 48099138 48099308 + 1 NA intron (NM_001371291, intron 4 of 6) intron (NM_001371291, intron 4 of 6) 37925 NM_001039360 201501 Hs.515388 NM_001039360 ENSG00000184828 ZBTB7C APM-1|APM1|ZBTB36|ZNF857C zinc finger and BTB domain containing 7C protein-coding 161.333-276 chr8 25994402 25994717 + 1 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) L1PA15|LINE|L1 50854 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 132.667-189 chr9 12206422 12206567 + 1 NA Intergenic Intergenic -486891 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 284.667-39 chr4 116200267 116200734 + 1 NA Intergenic Intergenic -99225 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 145.667-12 chr1 79475230 79475441 + 1 NA Intergenic Intergenic -468605 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 316.333-7 chr12 120841809 120842443 + 1 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) intron (NM_139015, intron 1 of 10) 62232 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 163.667-220 chr6 142598564 142598819 + 1 NA intron (NR_027311, intron 1 of 2) intron (NR_027311, intron 1 of 2) 39145 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 205.333-87 chr15 90763053 90763345 + 1 NA intron (NM_001287246, intron 9 of 22) intron (NM_001287246, intron 9 of 22) 45853 NM_001287246 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 144.667-307 chr8 127401156 127401312 + 1 NA non-coding (NR_109834, exon 1 of 1) non-coding (NR_109834, exon 1 of 1) 835 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 192.667-176 chr8 123133631 123133961 + 1 NA intron (NM_001363154, intron 15 of 18) intron (NM_001363154, intron 15 of 18) -45251 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 168.333-114 chr20 4474636 4474809 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -211734 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 189.667-132 chr7 21247799 21248174 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -180097 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 212.667-46 chr15 67926784 67927185 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -86939 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 152.333-170 chr2 34597498 34597697 + 1 NA Intergenic Intergenic -79960 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 148.667-277 chr4 54603626 54603903 + 1 NA non-coding (NR_134657, exon 2 of 2) non-coding (NR_134657, exon 2 of 2) 3367 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 214.333-87 chr20 47182480 47182919 + 1 NA intron (NM_005244, intron 14 of 15) AluSz|SINE|Alu 15732 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 155.333-85 chr12 117893159 117893342 + 1 NA intron (NM_173598, intron 1 of 19) AluJb|SINE|Alu 75740 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 187.333-91 chr2 42115972 42116231 + 1 NA Intergenic Intergenic -53252 NM_001145076 27436 Hs.713173 NM_019063 ENSG00000143924 EML4 C2orf2|ELP120|EMAP-4|EMAPL4|ROPP120 EMAP like 4 protein-coding 156.667-128 chr16 72414075 72414318 + 1 NA intron (NR_126330, intron 7 of 13) intron (NR_126330, intron 7 of 13) -241746 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 267.333-14 chr10 70848951 70849390 + 1 NA intron (NM_003901, intron 3 of 14) intron (NM_003901, intron 3 of 14) 33222 NM_003901 8879 Hs.499984 NM_003901 ENSG00000166224 SGPL1 NPHS14|S1PL|SPL sphingosine-1-phosphate lyase 1 protein-coding 138.333-164 chr6 48773753 48773931 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 689411 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 189.333-190 chr7 41953088 41953309 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -250108 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 264.667-28 chr14 61250659 61251057 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 30480 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 157.333-137 chr16 67692096 67692367 + 1 NA intron (NM_001243650, intron 1 of 1) L1ME5|LINE|L1 25417 NM_001012984 388284 Hs.632208 NM_001012984 ENSG00000159761 C16orf86 - chromosome 16 open reading frame 86 protein-coding 143.667-41 chr11 76554818 76555048 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 109908 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 269.667-48 chr7 35771852 35772165 + 1 NA intron (NR_120511, intron 3 of 5) MER113|DNA|hAT-Charlie 28617 NR_120512 101928545 Hs.648103 NR_120511 SEPTIN7-AS1 SEPT7-AS1 SEPT7 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 420.667-4 chr15 60185483 60186040 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 181450 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 127.333-134 chr4 168417005 168417198 + 1 NA intron (NM_001345927, intron 19 of 37) L2a|LINE|L2 63391 NM_001345927 91351 Hs.535011 NM_001012967 ENSG00000181381 DDX60L - DExD/H-box 60 like protein-coding 162.333-38 chr11 21652969 21653175 + 1 NA Intergenic Intergenic -540013 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 171.667-6 chr1 72494758 72494964 + 1 NA Intergenic Intergenic -212322 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 159.333-17 chr1 159007934 159008177 + 1 NA intron (NM_001364867, intron 1 of 12) intron (NM_001364867, intron 1 of 12) -1852 NM_001206567 3428 Hs.380250 NM_005531 ENSG00000163565 IFI16 IFNGIP1|PYHIN2 interferon gamma inducible protein 16 protein-coding 135.667-173 chr7 77674782 77674963 + 1 NA intron (NR_134251, intron 2 of 3) AluYe5|SINE|Alu 21393 NR_134253 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 154.667-328 chr5 154159117 154159290 + 1 NA Intergenic Intergenic -31530 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 221.667-36 chr16 59289324 59289716 + 1 NA Intergenic Intergenic 465671 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 203.333-120 chr19 50148004 50148315 + 1 NA Intergenic CpG -7839 NR_024243 100170227 Hs.717309 NR_024243 SNAR-D - small NF90 (ILF3) associated RNA D snRNA 240.667-25 chr14 54596211 54596610 + 1 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu 28798 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 157.667-363 chrX 81116562 81116846 + 1 NA intron (NM_030763, intron 5 of 6) intron (NM_030763, intron 5 of 6) 85209 NM_030763 79366 Hs.282204 NM_030763 ENSG00000198157 HMGN5 NBP-45|NSBP1 high mobility group nucleosome binding domain 5 protein-coding 285.667-44 chr5 21597518 21598027 + 1 NA Intergenic MER101|LTR|ERV1 138292 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 228.667-43 chr2 116089090 116089478 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 745469 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 234.667-104 chr7 29475756 29476179 + 1 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) L1MB5|LINE|L1 -3745 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 127.333-158 chr6 87225967 87226118 + 1 NA intron (NM_015021, intron 4 of 7) L3|LINE|CR1 70477 NM_015021 23036 Hs.444800 NM_015021 ENSG00000188994 ZNF292 Nbla00365|ZFP292|ZN-16|Zn-15|bA393I2.3 zinc finger protein 292 protein-coding 322.333-21 chr4 70345998 70346626 + 1 NA Intergenic Intergenic 11331 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 195.333-117 chr2 116582216 116582431 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -1232368 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 144.667-107 chr16 51000783 51000974 + 1 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) MIRc|SINE|MIR -16880 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 180.667-30 chr12 69954131 69954470 + 1 NA intron (NM_182530, intron 21 of 24) MIRb|SINE|MIR 129073 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 150.667-194 chr2 175244816 175245085 + 1 NA Intergenic Intergenic -63240 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 148.333-176 chr19 36705884 36706068 + 1 NA intron (NM_001363651, intron 1 of 4) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 2295 NM_001363651 163081 Hs.412517 NM_152603 ENSG00000189042 ZNF567 - zinc finger protein 567 protein-coding 210.333-36 chr13 21087294 21087639 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -25880 NM_014572 26524 Hs.78960 NM_014572 ENSG00000150457 LATS2 KPM large tumor suppressor kinase 2 protein-coding 155.333-27 chr10 62912472 62912713 + 1 NA Intergenic Intergenic -93425 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 172.333-89 chr2 170882022 170882263 + 1 NA Intergenic Intergenic -46335 NM_001201428 26003 Hs.431317 NM_015530 ENSG00000115806 GORASP2 GOLPH6|GRASP55|GRS2|p59 golgi reassembly stacking protein 2 protein-coding 193.333-67 chr15 100922309 100922705 + 1 NA intron (NM_024652, intron 1 of 33) intron (NM_024652, intron 1 of 33) 3150 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 167.667-203 chr8 67263151 67263472 + 1 NA intron (NM_006421, intron 14 of 38) L2a|LINE|L2 80470 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 205.667-27 chr11 75934145 75934556 + 1 NA intron (NM_003369, intron 6 of 14) L1MA3|LINE|L1 119140 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 145.333-218 chr4 83511625 83511905 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24149 NM_001256422 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 208.333-41 chr15 34181113 34181468 + 1 NA intron (NM_024713, intron 1 of 9) intron (NM_024713, intron 1 of 9) 28806 NM_024713 79768 Hs.633566 NM_024713 ENSG00000134152 KATNBL1 C15orf29 katanin regulatory subunit B1 like 1 protein-coding 142.333-212 chr6 37754218 37754485 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -56468 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 151.667-129 chr15 95387559 95387753 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -45437 NR_027133 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 171.667-175 chr8 132061514 132061745 + 1 NA 3' UTR (NM_001145095, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001145095, exon 16 of 16) -2247 NM_001080399 729330 Hs.653174 NM_001080399 ENSG00000253117 OC90 PLA2L otoconin 90 protein-coding 192.333-18 chr10 76051574 76051884 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 4 of 6) MIR3|SINE|MIR 268968 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 179.667-85 chr20 23642045 23642233 + 1 NA Intergenic Intergenic -4184 NM_001288614 1471 Hs.304682 NM_000099 ENSG00000101439 CST3 ARMD11|HEL-S-2 cystatin C protein-coding 146.333-80 chr13 63692091 63692336 + 1 NA intron (NR_047011, intron 3 of 3) intron (NR_047011, intron 3 of 3) -45222 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 248.333-31 chr14 87042280 87042734 + 1 NA Intergenic Intergenic 136729 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 164.667-185 chr5 38069296 38069529 + 1 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) 43715 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 195.333-159 chr4 89910590 89910877 + 1 NA intron (NM_001371403, intron 3 of 8) intron (NM_001371403, intron 3 of 8) 15879 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 312.333-29 chr8 67422517 67423060 + 1 NA intron (NM_020361, intron 10 of 10) intron (NM_020361, intron 10 of 10) 78954 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 131.667-108 chr20 40792020 40792152 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -77463 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 203.667-90 chr4 117166521 117166871 + 1 NA Intergenic Intergenic -81120 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 213.667-12 chr10 31183243 31183519 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -4502 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 157.667-55 chr11 60156279 60156519 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 26932 NM_152851 64231 Hs.523702 NM_022349 ENSG00000110077 MS4A6A 4SPAN3|4SPAN3.2|CD20L3|CDA01|MS4A6|MST090|MSTP090 membrane spanning 4-domains A6A protein-coding 146.667-299 chr7 16051033 16051200 + 1 NA Intergenic Intergenic -159370 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 162.667-203 chr4 108882681 108882864 + 1 NA intron (NM_198721, intron 18 of 36) intron (NM_198721, intron 18 of 36) -119719 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 162.333-56 chr12 75714799 75715000 + 1 NA Intergenic Intergenic -203290 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 183.667-101 chr4 47564479 47564715 + 1 NA intron (NM_020453, intron 15 of 22) intron (NM_020453, intron 15 of 22) 79322 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 141.333-162 chr3 150914957 150915128 + 1 NA Intergenic Intergenic -9603 NM_001351281 646951 Hs.380222 NM_001351281 MINDY4B C3orf76|FAM188B2 MINDY family member 4B protein-coding 146.333-96 chr14 68207006 68207215 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MC4|LINE|L1 383518 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 203.333-246 chr7 80599686 80599995 + 1 NA Intergenic Intergenic -2367 NM_001371080 249.333-13 chr10 19100999 19101279 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 4 of 39) MIR|SINE|MIR 52338 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 167.333-99 chr16 48921189 48921506 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -311167 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 172.333-38 chr12 28585106 28585425 + 1 NA Intergenic Intergenic -394527 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 195.333-37 chr10 99485544 99485772 + 1 NA Intergenic Intergenic 45519 NR_120618 101927324 Hs.642588 NR_120618 ENSG00000257582 LINC01475 - long intergenic non-protein coding RNA 1475 ncRNA 154.333-327 chr7 77358358 77358516 + 1 NA intron (NR_146937, intron 14 of 31) intron (NR_146937, intron 14 of 31) -56761 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 138.667-196 chr7 130432997 130433257 + 1 NA intron (NR_046443, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 7889 NM_001257158 95681 Hs.368315 NM_018718 ENSG00000106477 CEP41 JBTS15|TSGA14 centrosomal protein 41 protein-coding 144.333-119 chr2 22411342 22411521 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -125048 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 170.333-31 chr10 39351180 39351396 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 654692 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 149.333-198 chr2 149829168 149829393 + 1 NA intron (NR_145421, intron 2 of 4) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 29911 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 217.333-167 chr9 122896002 122896421 + 1 NA intron (NM_001100588, intron 2 of 20) MER30|DNA|hAT-Charlie 9148 NM_001100588 54542 Hs.533499 NM_018835 ENSG00000056586 RC3H2 MNAB|RNF164 ring finger and CCCH-type domains 2 protein-coding 131.333-42 chr12 15602325 15602519 + 1 NA Intergenic Intergenic 55811 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 181.667-78 chr2 205364445 205364661 + 1 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) intron (NM_205863, intron 18 of 21) -317947 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 166.667-191 chr5 145943823 145944096 + 1 NA intron (NM_152550, intron 2 of 9) intron (NM_152550, intron 2 of 9) 7381 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 225.667-35 chr2 13814821 13815263 + 1 NA Intergenic Intergenic 585916 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 154.667-20 chr1 145628250 145628464 + 1 NA intron (NM_001097612, intron 5 of 13) L2a|LINE|L2 20369 NM_001097612 653519 Hs.504320 NM_001097612 ENSG00000117262 GPR89A GPHR|GPR89|GPR89B|SH120|UNQ192 G protein-coupled receptor 89A protein-coding 201.333-90 chr14 29490831 29491112 + 1 NA Intergenic Intergenic 436125 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 146.667-321 chr7 117196676 117196827 + 1 NA intron (NR_002332, intron 6 of 8) L1MB1|LINE|L1 14070 NR_002332 93655 Hs.368131 NR_002332 ENSG00000004866 ST7-OT3 NCRNA00026|ST7|ST7OT3 ST7 overlapping transcript 3 ncRNA 150.333-180 chr19 31100446 31100603 + 1 NA Intergenic Intergenic -66986 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 127.333-44 chr13 106265118 106265373 + 1 NA Intergenic Intergenic -111319 NR_034119 728192 Hs.559194 NR_034119 LINC00460 - long intergenic non-protein coding RNA 460 ncRNA 276.667-54 chr4 158604122 158604636 + 1 NA intron (NR_045581, intron 4 of 17) MIR3|SINE|MIR 67508 NM_001008393 201725 Hs.380920 NM_001008393 ENSG00000205208 C4orf46 RCDG1 chromosome 4 open reading frame 46 protein-coding 235.667-39 chr21 32372854 32373128 + 1 NA intron (NM_014825, intron 7 of 38) intron (NM_014825, intron 7 of 38) 4331 NR_002996 677846 Hs.712293 NR_002996 ENSG00000200792 SNORA80A ACA67|SNORA80 small nucleolar RNA, H/ACA box 80A snoRNA 159.333-98 chr14 78901603 78901784 + 1 NA intron (NM_004796, intron 7 of 16) intron (NM_004796, intron 7 of 16) -298289 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 309.333-29 chr2 2774207 2774734 + 1 NA Intergenic Intergenic 351556 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 293.333-51 chr5 131862945 131863434 + 1 NA intron (NM_001303622, intron 9 of 12) L1M2|LINE|L1 -66172 NM_001346114 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 230.667-49 chr22 18128040 18128445 + 1 NA intron (NM_001193414, intron 4 of 4) intron (NM_001193414, intron 4 of 4) 17433 NM_018943 51807 Hs.137400 NM_018943 ENSG00000183785 TUBA8 CDCBM8|TUBAL2 tubulin alpha 8 protein-coding 193.667-53 chr17 59570367 59570682 + 1 NA exon (NM_024612, exon 3 of 18) exon (NM_024612, exon 3 of 18) 4914 NM_001166301 79665 Hs.29403 NM_024612 ENSG00000108406 DHX40 ARG147|DDX40|PAD DEAH-box helicase 40 protein-coding 366.333-13 chr20 37051903 37052542 + 1 NA intron (NM_002895, intron 11 of 21) AluSg|SINE|Alu 43775 NM_001323282 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 148.667-200 chr2 142440254 142440408 + 1 NA Intergenic Intergenic -308630 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 146.667-94 chr14 30623450 30623699 + 1 NA intron (NM_001257376, intron 1 of 22) intron (NM_001257376, intron 1 of 22) 1255 NM_001257376 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 332.667-18 chr3 43170006 43170459 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -64153 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 155.333-108 chr14 62171502 62171778 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -31667 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 134.667-58 chr14 56263471 56263686 + 1 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) L1M7|LINE|L1 145167 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 244.333-9 chr10 49088612 49088986 + 1 NA intron (NM_001031746, intron 2 of 7) intron (NM_001031746, intron 2 of 7) 26723 NM_001031746 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 294.667-45 chr6 39068007 39068512 + 1 NA intron (NR_136563, intron 5 of 13) MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR -6055 NR_162114 113218508 NR_162114 MIR9983 - microRNA 9983 ncRNA 139.333-7 chr1 77584382 77584625 + 1 NA intron (NM_015534, intron 6 of 14) intron (NM_015534, intron 6 of 14) 98155 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 146.667-41 chr10 82664875 82665072 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -432053 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 207.667-89 chr4 93732289 93732696 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -96261 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 151.667-30 chr1 202435243 202435507 + 1 NA intron (NM_002481, intron 9 of 23) intron (NM_002481, intron 9 of 23) -27339 NM_032103 4660 Hs.444403 NM_002481 ENSG00000077157 PPP1R12B MYPT2|PP1bp55 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B protein-coding 286.333-32 chr4 61849908 61850398 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) MIRb|SINE|MIR 311612 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 182.667-59 chr16 85559681 85559957 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -51590 NM_001134473 23199 Hs.461647 NM_014615 ENSG00000131149 GSE1 CRHSP24|KIAA0182 Gse1 coiled-coil protein protein-coding 271.333-34 chr2 164236139 164236515 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 332168 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 303.667-23 chr8 60236098 60236536 + 1 NA intron (NR_135821, intron 3 of 9) MLT2C2|LTR|ERVL 45083 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 122.667-94 chr2 125938299 125938543 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 179564 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 162.667-142 chr2 147680257 147680504 + 1 NA Intergenic Intergenic -164137 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 165.667-206 chr9 20458001 20458183 + 1 NA intron (NM_001286691, intron 2 of 10) intron (NM_001286691, intron 2 of 10) 44250 NR_039685 100616441 NR_039685 ENSG00000264941 MIR4474 - microRNA 4474 ncRNA 147.667-207 chr20 53767712 53767908 + 1 NA Intergenic Intergenic 107899 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 161.667-205 chr5 92371960 92372181 + 1 NA Intergenic Intergenic -988753 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 391.333 chr1 35405999 35406662 + 1 NA intron (NM_005095, intron 25 of 29) intron (NM_005095, intron 25 of 29) -40253 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 192.667-131 chr4 115798697 115799037 + 1 NA Intergenic Intergenic -500858 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 157.333-203 chr2 177679861 177680057 + 1 NA intron (NM_001077197, intron 17 of 20) intron (NM_001077197, intron 17 of 20) 6637 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 184.667-24 chr12 72529567 72529935 + 1 NA intron (NM_013381, intron 6 of 18) L2a|LINE|L2 -256242 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 135.667-39 chr12 61830558 61830769 + 1 NA intron (NM_178539, intron 2 of 4) L1PB4|LINE|L1 362176 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 214.333-39 chr14 29162825 29163216 + 1 NA Intergenic Intergenic -377233 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 172.667-134 chr6 48481443 48481676 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -412870 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 268.333-28 chr18 33439263 33439611 + 1 NA intron (NM_001308126, intron 2 of 23) intron (NM_001308126, intron 2 of 23) 1134 NM_001371121 152.667-34 chr10 34840067 34840366 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 24448 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 182.333 chr1 23159323 23159665 + 1 NA intron (NM_033631, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 9362 NM_033631 7798 Hs.257900 NM_033631 ENSG00000169641 LUZP1 LUZP leucine zipper protein 1 protein-coding 148.333-317 chr5 73492088 73492294 + 1 NA Intergenic Intergenic -6234 NM_001037637 689 Hs.591768 NM_001207 ENSG00000145741 BTF3 BETA-NAC|BTF3a|BTF3b|NACB basic transcription factor 3 protein-coding 165.333-11 chr1 113945277 113945562 + 1 NA intron (NM_198268, intron 2 of 15) L1MB4|LINE|L1 -5726 NM_198269 204851 Hs.532363 NM_152696 ENSG00000163349 HIPK1 Myak|Nbak2 homeodomain interacting protein kinase 1 protein-coding 127.333-126 chr4 13441364 13441529 + 1 NA intron (NM_001017979, intron 4 of 6) intron (NM_001017979, intron 4 of 6) 42894 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 194.333-77 chr2 184280118 184280483 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -98675 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 185.333-24 chr10 114804047 114804243 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -17635 NM_020940 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 138.333-36 chr11 4126553 4126725 + 1 NA intron (NM_001318064, intron 11 of 17) intron (NM_001318064, intron 11 of 17) 10561 NM_001318065 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 238.333-86 chr8 17816672 17817144 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -15329 NM_001363061 57509 Hs.7946 NM_020749 ENSG00000129422 MTUS1 ATBP|ATIP|ATIP3|ICIS|MP44|MTSG1 microtubule associated scaffold protein 1 protein-coding 215.667-93 chr4 95585779 95586204 + 1 NA Intergenic Intergenic -37018 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 156.667-200 chr2 223424502 223424798 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 177711 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 168.667 chr1 6048306 6048498 + 1 NA intron (NM_001199863, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 2514 NM_001199863 8514 Hs.440497 NM_003636 ENSG00000069424 KCNAB2 AKR6A5|HKvbeta2|HKvbeta2.1|HKvbeta2.2|KCNA2B|KV-BETA-2 potassium voltage-gated channel subfamily A regulatory beta subunit 2 protein-coding 159.333-67 chr12 33506226 33506422 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -66505 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 131.333-124 chr4 39379263 39379416 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -12977 NM_001363496 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 218.333-95 chr4 92814997 92815321 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 510760 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 163.667-96 chr18 68895657 68895969 + 1 NA intron (NM_001093729, intron 7 of 9) MIRb|SINE|MIR 97733 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 150.333-441 chr9 128631795 128631945 + 1 NA intron (NM_003127, intron 51 of 55) intron (NM_003127, intron 51 of 55) 24980 NM_052844 89891 Hs.495240 NM_052844 ENSG00000119333 WDR34 DIC5|FAP133|SRTD11|bA216B9.3 WD repeat domain 34 protein-coding 113.667-8 chr1 67701643 67701798 + 1 NA 3' UTR (NM_018841, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_018841, exon 4 of 4) 16519 NM_001199741 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 142.667-194 chr6 126302836 126303041 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -36851 NM_001286525 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 177.333-71 chr17 27223394 27223707 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 70446 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 151.333-23 chr1 151430360 151430519 + 1 NA intron (NM_001194938, intron 3 of 17) intron (NM_001194938, intron 3 of 17) 11766 NM_207171 23126 Hs.489873 NM_015100 ENSG00000143442 POGZ MRD37|WHSUS|ZNF280E|ZNF635|ZNF635m pogo transposable element derived with ZNF domain protein-coding 166.667-103 chr2 13787009 13787241 + 1 NA Intergenic Intergenic 613833 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 242.667-109 chr8 120194838 120195208 + 1 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 69921 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 157.333-301 chr6 36530877 36531158 + 1 NA intron (NM_007271, intron 2 of 13) intron (NM_007271, intron 2 of 13) 16462 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 129.667-187 chr9 102554080 102554248 + 1 NA intron (NR_103830, intron 1 of 4) L1P4|LINE|L1 34527 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 276.667-13 chr11 32646433 32646902 + 1 NA intron (NM_001008391, intron 12 of 17) HAL1|LINE|L1 62836 NM_006360 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 141.667-215 chr7 113813136 113813398 + 1 NA Intergenic Intergenic 105742 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 190.667-78 chr22 24935970 24936311 + 1 NA intron (NM_001001663, intron 3 of 3) intron (NM_001001663, intron 3 of 3) 10555 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 150.667-12 chr1 119913903 119914120 + 1 NA 3' UTR (NM_024408, exon 34 of 34) 3' UTR (NM_024408, exon 34 of 34) -17496 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 222.667-96 chr8 111568231 111568634 + 1 NA Intergenic Intergenic 191793 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 167.333-176 chr3 102769616 102769910 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 334748 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 205.667-94 chr3 58357693 58358191 + 1 NA intron (NM_001349498, intron 1 of 17) AluSx1|SINE|Alu 24636 NM_001349498 54899 Hs.190544 NM_017771 ENSG00000168297 PXK MONAKA|SLOB PX domain containing serine/threonine kinase like protein-coding 191.667-46 chr14 29211079 29211388 + 1 NA Intergenic Intergenic -425446 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 160.333-136 chr18 77042540 77042723 + 1 NA intron (NM_001025100, intron 3 of 3) intron (NM_001025100, intron 3 of 3) -25576 NM_001025081 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 148.667-234 chr22 30593994 30594159 + 1 NA intron (NM_001282327, intron 2 of 16) intron (NM_001282327, intron 2 of 16) -2166 NM_001243225 23481 Hs.517543 NM_014303 ENSG00000100029 PES1 NOP7|PES pescadillo ribosomal biogenesis factor 1 protein-coding 283.667-31 chr6 35863743 35864089 + 1 NA intron (NM_003137, intron 12 of 15) L1MA2|LINE|L1 57182 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 160.667-115 chr16 73358794 73358967 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27925 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 162.667-159 chr20 47547636 47547911 + 1 NA intron (NM_181659, intron 1 of 22) AluSx1|SINE|Alu 45886 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 149.667-114 chr14 45872694 45872922 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -157206 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 183.667-78 chr2 115548066 115548276 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 204356 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 148.667-18 chr1 175002359 175002518 + 1 NA intron (NM_014412, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 2491 NM_014412 27101 Hs.508524 NM_014412 ENSG00000116161 CACYBP GIG5|PNAS-107|S100A6BP|SIP calcyclin binding protein protein-coding 164.333-41 chr11 78461832 78462108 + 1 NA intron (NM_024678, intron 11 of 13) AluSx|SINE|Alu -32134 NR_120564 101928865 Hs.407574 NR_120564 ENSG00000251323 LINC02728 - long intergenic non-protein coding RNA 2728 ncRNA 173.333-16 chr1 169807957 169808238 + 1 NA intron (NM_001320047, intron 9 of 24) intron (NM_001320047, intron 9 of 24) 13057 NR_159440 55732 Hs.443551 NM_018186 ENSG00000000460 C1orf112 - chromosome 1 open reading frame 112 protein-coding 156.333-116 chr14 85637303 85637559 + 1 NA 3' UTR (NM_013231, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_013231, exon 2 of 2) 104082 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 150.667-380 chr8 114924991 114925151 + 1 NA Intergenic Intergenic 742942 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 155.667-176 chr2 138213412 138213574 + 1 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 111609 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 140.333-20 chr1 195181594 195181830 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 907003 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 228.333-84 chr6 101698941 101699228 + 1 NA intron (NM_001166247, intron 6 of 16) intron (NM_001166247, intron 6 of 16) 300099 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 157.667-267 chr5 162996044 162996322 + 1 NA Intergenic Intergenic -441388 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 141.333-16 chr10 10473296 10473478 + 1 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 10837 NM_001326320 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 189.667-95 chr3 89168971 89169272 + 1 NA intron (NM_182644, intron 2 of 6) intron (NM_182644, intron 2 of 6) 61500 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 112.667-238 chr6 144001907 144002052 + 1 NA intron (NM_001289040, intron 1 of 5) L1MC4a|LINE|L1 6280 NM_001080954 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 214.333-127 chr6 90616356 90616660 + 1 NA Intergenic Intergenic -29436 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 161.333-48 chr11 14040241 14040485 + 1 NA intron (NM_006108, intron 2 of 15) L1ME5|LINE|L1 77640 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 308.667-24 chr21 29862619 29863207 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 77083 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 140.667-190 chr5 120448959 120449270 + 1 NA Intergenic Intergenic -15164 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 129.333-132 chr3 116234617 116234768 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -125332 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 151.667-293 chr5 131530804 131531098 + 1 NA intron (NM_016340, intron 6 of 27) intron (NM_016340, intron 6 of 27) 104278 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 160.333-117 chr15 89586720 89586969 + 1 NA intron (NM_001308025, intron 4 of 21) L2a|LINE|L2 11257 NM_001308025 90381 Hs.441708 NM_152259 ENSG00000140534 TICRR C15orf42|SLD3|Treslin TOPBP1 interacting checkpoint and replication regulator protein-coding 205.333-170 chr4 58311834 58312104 + 1 NA Intergenic Intergenic 224359 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 123.667-157 chr5 59105097 59105296 + 1 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) intron (NM_001364603, intron 5 of 15) -65720 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 151.667-136 chr16 48961445 48961662 + 1 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 320285 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 133.333-149 chr5 92613087 92613367 + 1 NA Intergenic Intergenic 958116 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 160.667-146 chr2 81440282 81440560 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 26525 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 141.667-252 chr9 110183171 110183333 + 1 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 24881 NM_001012993 401546 Hs.125608 NM_001012993 ENSG00000188959 C9orf152 bA470J20.2 chromosome 9 open reading frame 152 protein-coding 166.667-16 chr1 153884666 153884932 + 1 NA intron (NM_020699, intron 1 of 10) AluSx1|SINE|Alu 38173 NM_020699 57459 Hs.4779 NM_020699 ENSG00000143614 GATAD2B MRD18|P66beta|p68 GATA zinc finger domain containing 2B protein-coding 152.667-282 chr4 122807883 122808087 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -18723 NM_002006 2247 Hs.284244 NM_002006 ENSG00000138685 FGF2 BFGF|FGF-2|FGFB|HBGF-2 fibroblast growth factor 2 protein-coding 123.333-67 chr13 63611041 63611196 + 1 NA Intergenic Intergenic -126317 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 157.333-140 chr16 75844002 75844238 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -117630 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 260.333-66 chr7 93158382 93158669 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -10140 NM_001303497 219285 Hs.489118 NM_152703 ENSG00000177409 SAMD9L ATXPC|C7orf6|DRIF2|UEF1 sterile alpha motif domain containing 9 like protein-coding 162.333-47 chr12 10508977 10509194 + 1 NA intron (NM_001357731, intron 1 of 1) intron (NM_001357731, intron 1 of 1) 3192 NM_001357734 255308 Hs.547382 NM_001357731 ENSG00000180574 EIF2S3B EIF2S3L|eIF-2gA|eIF2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma B protein-coding 230.333-35 chr14 40481941 40482451 + 1 NA Intergenic Intergenic -472515 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 145.333-169 chr22 26725119 26725386 + 1 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 52409 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 152.667-19 chr1 167999632 167999826 + 1 NA intron (NM_001017977, intron 7 of 18) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 1069 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 141.333-137 chr21 30302190 30302486 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -12824 NM_001128598 100131902 Hs.580882 NM_001128598 ENSG00000232263 KRTAP25-1 KAP25.1 keratin associated protein 25-1 protein-coding 255.333-106 chr8 78249901 78250417 + 1 NA Intergenic Intergenic -266181 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 198.667-53 chr12 117260733 117261100 + 1 NA intron (NM_001204213, intron 12 of 27) AluSx|SINE|Alu 44136 NM_001204213 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 265.333-27 chr15 93687384 93687698 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -169019 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 161.667-60 chr12 123544886 123545064 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 8566 NR_037470 100500909 NR_037470 ENSG00000266655 MIR3908 - microRNA 3908 ncRNA 116.667-222 chrX 114159863 114160035 + 1 NA Intergenic Intergenic -221731 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 142.333-29 chr10 95076717 95076908 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -7315 NM_001198853 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 143.667-55 chr12 18601467 18601654 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 30 of 32) L1MA5A|LINE|L1 135949 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 175.333-44 chr14 55561453 55561750 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 18491 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 245.333-113 chr7 118379030 118379314 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 154468 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 147.667-169 chr2 57901923 57902074 + 1 NA Intergenic Intergenic -5653 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 223.333-171 chr8 137783894 137784278 + 1 NA Intergenic Intergenic 299459 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 142.667-119 chr2 234234679 234234917 + 1 NA Intergenic Intergenic 184096 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 298.333-30 chr4 44178531 44179048 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 161727 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 290.667-3 chr1 69186865 69187213 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 131141 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 329.333-23 chr2 107785471 107785992 + 1 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) intron (NR_126370, intron 2 of 4) 31619 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 159.667-73 chr12 32094608 32094846 + 1 NA Intergenic AluYe5|SINE|Alu -12080 NM_001363603 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 146.667-11 chr1 76022923 76023115 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 11695 NR_125939 101927342 Hs.216363 NR_125939 LOC101927342 - uncharacterized LOC101927342 ncRNA 171.333-62 chr16 12114430 12114684 + 1 NA intron (NM_032167, intron 11 of 20) intron (NM_032167, intron 11 of 20) 137823 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 141.333-80 chr17 65036534 65036698 + 1 NA intron (NM_006572, intron 2 of 3) AluSz6|SINE|Alu 19158 NM_001282425 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 147.667-210 chr21 31571415 31571593 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 12271 NM_001321023 150051 Hs.708976 NM_001321023 LOC150051 - uncharacterized LOC150051 protein-coding 252.667-37 chr16 46478470 46478903 + 1 NA intron (NR_026556, intron 13 of 16) intron (NR_026556, intron 13 of 16) 90411 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 138.333-195 chr8 84456539 84456742 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) L2c|LINE|L2 41156 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 205.333-14 chr1 89667004 89667340 + 1 NA intron (NM_032270, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 34052 NM_032270 84230 Hs.412836 NM_032270 ENSG00000171488 LRRC8C AD158|FAD158 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit C protein-coding 157.333-327 chr7 121027479 121027740 + 1 NA intron (NM_001105533, intron 2 of 17) intron (NM_001105533, intron 2 of 17) 38218 NM_001105533 79974 Hs.189652 NM_024913 ENSG00000106034 CPED1 C7orf58 cadherin like and PC-esterase domain containing 1 protein-coding 152.667-85 chr12 77773727 77773984 + 1 NA Intergenic Intergenic -57039 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 269.667-32 chr2 197056752 197057078 + 1 NA intron (NM_001367496, intron 16 of 27) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -130208 NM_001321099 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 133.667-157 chr8 129873241 129873461 + 1 NA intron (NM_001353287, intron 6 of 14) intron (NM_001353287, intron 6 of 14) 66460 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 323.667-23 chr7 4137867 4138363 + 1 NA intron (NM_001079653, intron 2 of 19) intron (NM_001079653, intron 2 of 19) -3278 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 147.333-118 chr15 42611199 42611485 + 1 NA intron (NM_020759, intron 3 of 32) intron (NM_020759, intron 3 of 32) 35736 NM_020759 57519 Hs.122061 NM_020759 ENSG00000159433 STARD9 KIF16A StAR related lipid transfer domain containing 9 protein-coding 243.333-87 chr5 34639420 34639778 + 1 NA Intergenic Intergenic -16729 NM_015577 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 162.333-51 chr12 37772347 37772563 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -544319 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 126.333-150 chr6 47914980 47915197 + 1 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) intron (NM_207499, intron 2 of 2) 128020 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 165.333-231 chr6 104707149 104707367 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 152288 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 166.333-198 chr6 42943593 42943898 + 1 NA intron (NR_134890, intron 2 of 4) intron (NR_134890, intron 2 of 4) 14265 NM_006586 10695 Hs.414099 NM_006586 ENSG00000137161 CNPY3 CAG4A|EIEE60|ERDA5|PRAT4A|TNRC5 canopy FGF signaling regulator 3 protein-coding 184.333-158 chr8 130610594 130610877 + 1 NA Intergenic Intergenic -167061 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 149.333-118 chr14 83480830 83481016 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 838291 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 165.333-219 chr6 37304127 37304324 + 1 NA intron (NR_130108, intron 8 of 12) L2a|LINE|L2 -46070 NR_104442 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 169.667-122 chr21 23157790 23158011 + 1 NA Intergenic Intergenic 78616 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 136.333-83 chr18 33392357 33392580 + 1 NA intron (NM_001308126, intron 4 of 23) intron (NM_001308126, intron 4 of 23) 48103 NM_001371121 165.333-209 chr5 76778987 76779206 + 1 NA Intergenic Intergenic -39934 NM_005242 2150 Hs.744181 NM_005242 ENSG00000164251 F2RL1 GPR11|PAR2 F2R like trypsin receptor 1 protein-coding 151.667-13 chr1 95600692 95600883 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 90671 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 220.333-112 chr5 59674716 59675027 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 28832 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 182.667-90 chr3 38851673 38851969 + 1 NA intron (NM_014139, intron 24 of 25) intron (NM_014139, intron 24 of 25) -57811 NM_001293306 6336 Hs.250443 NM_006514 ENSG00000185313 SCN10A FEPS2|Nav1.8|PN3|SNS|hPN3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 protein-coding 196.333-62 chr17 30312906 30313338 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie 20935 NM_001319942 388364 Hs.371005 NM_206832 ENSG00000182271 TMIGD1 TMIGD|UNQ9372 transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 protein-coding 155.333-337 chr6 122450036 122450342 + 1 NA intron (NM_020755, intron 7 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 21618 NM_020755 57515 Hs.146668 NM_020755 ENSG00000111897 SERINC1 TDE1L|TDE2|TMS-2|TMS2 serine incorporator 1 protein-coding 144.333-118 chr2 22276387 22276585 + 1 NA Intergenic Intergenic -259993 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 131.333-68 chr18 2004476 2004659 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 566938 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 253.667-68 chr7 12805216 12805710 + 1 NA Intergenic Intergenic 117830 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 232.667-76 chr8 113106472 113106984 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) intron (NM_001363185, intron 4 of 66) 270424 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 216.333-141 chr8 127731666 127732026 + 1 NA intron (NR_117101, intron 1 of 1) FLAM_A|SINE|Alu 2121 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 130.333-10 chr1 91486204 91486374 + 1 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -14558 NM_001134419 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 146.333-343 chr8 137100994 137101146 + 1 NA Intergenic Intergenic 312518 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 112.667 chr1 39998796 39998944 + 1 NA Intergenic Intergenic -41195 NM_001350480 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 112.333-37 chr11 77580443 77580667 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9080 NM_001363477 282679 Hs.503345 NM_173039 ENSG00000178301 AQP11 AQPX1 aquaporin 11 protein-coding 262.333-70 chr6 45123742 45124225 + 1 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) MER58B|DNA|hAT-Charlie 73787 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 173.333-82 chr19 37516318 37516538 + 1 NA intron (NM_001013659, intron 2 of 7) AluSq|SINE|Alu -9341 NR_110723 101927720 Hs.18070 NR_110723 ENSG00000266916 ZNF793-AS1 - ZNF793 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 196.333-74 chr18 5969247 5969566 + 1 NA non-coding (NR_158610, exon 15 of 17) non-coding (NR_158610, exon 15 of 17) -73452 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 193.333-161 chr6 112760646 112760912 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 413449 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 158.333-91 chr14 76214666 76214916 + 1 NA TTS (NM_017926) TTS (NM_017926) 60437 NM_017972 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 166.667-75 chr15 62716261 62716429 + 1 NA exon (NM_015059, exon 20 of 56) exon (NM_015059, exon 20 of 56) 69034 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 138.667-103 chr2 52908333 52908562 + 1 NA Intergenic Intergenic -205832 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 147.667-123 chr16 22648644 22648821 + 1 NA Intergenic Intergenic 103034 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 160.667-143 chr2 64513457 64513687 + 1 NA Intergenic Intergenic 10583 NR_136167 101927402 Hs.187018 NR_136167 ENSG00000260101 LOC101927402 - uncharacterized LOC101927402 ncRNA 295.667-35 chr9 100604736 100605235 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 26906 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 186.667-95 chr3 114497427 114497747 + 1 NA intron (NR_121661, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 43994 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 160.333-76 chr12 56145370 56145547 + 1 NA TTS (NM_015292) TTS (NM_015292) -7129 NM_002475 140465 Hs.632731 NM_002475 ENSG00000196465 MYL6B MLC1SA myosin light chain 6B protein-coding 121.333-92 chr2 150339456 150339694 + 1 NA Intergenic Intergenic -82568 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 117.333-159 chr4 107342739 107342880 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -306496 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 232.667-4 chr1 244173370 244173751 + 1 NA Intergenic Intergenic 120355 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 193.333-192 chr8 121416696 121417000 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -222498 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 319.667-28 chr6 39691296 39691924 + 1 NA 3' UTR (NM_001351503, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001351503, exon 4 of 4) 33798 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 142.667-116 chr2 216595234 216595407 + 1 NA intron (NR_110392, intron 2 of 3) intron (NR_110392, intron 2 of 3) 11618 NR_110392 101928232 Hs.694592 NR_110392 LINC01280 - long intergenic non-protein coding RNA 1280 ncRNA 179.333-147 chr4 176716842 176717096 + 1 NA intron (NM_005429, intron 3 of 6) intron (NM_005429, intron 3 of 6) 75953 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 149.667-415 chr8 130488348 130488579 + 1 NA Intergenic Intergenic -44789 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 159.667-186 chr2 230217400 230217600 + 1 NA intron (NM_001185015, intron 2 of 15) MIR|SINE|MIR 2484 NM_004510 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 169.667-101 chr2 21635899 21636175 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 74615 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 154.667-120 chr15 25763221 25763481 + 1 NA intron (NM_024490, intron 2 of 20) intron (NM_024490, intron 2 of 20) 85474 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 173.333-61 chr15 33514179 33514441 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 3 of 102) intron (NM_001243996, intron 3 of 102) 203343 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 140.333-182 chr5 62361389 62361619 + 1 NA exon (NM_004520, exon 11 of 20) exon (NM_004520, exon 11 of 20) 42401 NM_014473 27292 Hs.731665 NM_014473 ENSG00000086189 DIMT1 DIM1|DIMT1L|HSA9761|HUSSY5 DIMT1 rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor protein-coding 283.667-23 chr22 32465077 32465435 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -7870 NM_174932 254240 Hs.372939 NM_174932 ENSG00000184459 BPIFC BPIL2 BPI fold containing family C protein-coding 154.667-108 chr14 52196109 52196286 + 1 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -71501 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 161.333-293 chr8 131875485 131875723 + 1 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -28489 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 161.333-22 chr1 239741431 239741619 + 1 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) MER39|LTR|ERV1 -22406 NR_103776 100506915 Hs.667175 NR_103776 ENSG00000233355 CHRM3-AS2 - CHRM3 antisense RNA 2 ncRNA 150.667-179 chr2 76522921 76523129 + 1 NA Intergenic Intergenic -462940 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 203.667-41 chr17 74324180 74324440 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1916 NM_153209 124602 Hs.372773 NM_153209 ENSG00000196169 KIF19 KIF19A kinesin family member 19 protein-coding 157.667-238 chr5 38550672 38550933 + 1 NA intron (NM_002310, intron 1 of 19) MIR3|SINE|MIR 5844 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 159.667-325 chr8 109112547 109112804 + 1 NA intron (NM_003301, intron 2 of 2) intron (NM_003301, intron 2 of 2) 26047 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 116.333-161 chr4 115342874 115343050 + 1 NA Intergenic Intergenic -229342 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 161.667-229 chr6 152488960 152489170 + 1 NA intron (NM_182961, intron 11 of 145) L2b|LINE|L2 108535 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 157.667-33 chr10 61259469 61259706 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -193052 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 148.333-386 chr8 91064806 91064967 + 1 NA intron (NR_110438, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 5303 NR_110438 100506365 Hs.153412 NR_110438 ENSG00000253738 OTUD6B-AS1 GS1-251I9.4 OTUD6B antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 165.667-104 chr20 19800881 19801065 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -85548 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 179.667-17 chr10 33358175 33358499 + 1 NA Intergenic Intergenic -23432 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 171.667-120 chr4 39661653 39661864 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -22893 NM_174921 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 149.667-72 chr11 39239912 39240117 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 591156 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 409.333-9 chr22 29178414 29179306 + 1 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -27036 NM_001267895 129080 Hs.289106 NM_133455 ENSG00000186998 EMID1 EMI5|EMU1 EMI domain containing 1 protein-coding 204.667-80 chr2 228179486 228179777 + 1 NA intron (NM_030623, intron 1 of 10) intron (NM_030623, intron 1 of 10) 2014 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 174.333-111 chr5 11449669 11450005 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) L2a|LINE|L2 139080 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 174.667-70 chr17 73027737 73028076 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 4 of 9) intron (NM_001352692, intron 4 of 9) 64782 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 196.667-123 chr5 117056007 117056318 + 1 NA Intergenic Intergenic -293953 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 115.667-74 chr14 55542238 55542451 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 37748 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 173.667-24 chr10 98125965 98126265 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -8509 NM_001256620 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 257.333-66 chr3 124535418 124535903 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 33 of 59) intron (NM_001024660, intron 33 of 59) -48998 NM_007064 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 157.667-334 chr8 104579186 104579380 + 1 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) L1PA13|LINE|L1 9741 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 232.667-57 chr4 53873851 53874117 + 1 NA Intergenic Intergenic 113298 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 169.333-264 chr8 61267450 61267845 + 1 NA Intergenic Intergenic -20323 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 140.333-222 chr7 110080699 110080901 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -120587 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 148.667-182 chr2 56935283 56935543 + 1 NA Intergenic Intergenic -749643 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 153.333-12 chr1 83953086 83953290 + 1 NA intron (NM_024686, intron 1 of 20) intron (NM_024686, intron 1 of 20) 45944 NM_001350215 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 130.667-110 chr2 102933858 102934063 + 1 NA Intergenic Intergenic -38238 NR_135562 105373518 Hs.738351 NR_135562 ENSG00000277527 LINC01796 - long intergenic non-protein coding RNA 1796 ncRNA 161.667-158 chr21 34784144 34784357 + 1 NA non-coding (NR_038885, exon 3 of 3) non-coding (NR_038885, exon 3 of 3) 38425 NR_038886 100506385 Hs.120179 NR_038885 ENSG00000234380 LINC01426 lincRNA-uc002yug.2 long intergenic non-protein coding RNA 1426 ncRNA 166.667-2 chr1 29469191 29469398 + 1 NA Intergenic Intergenic -119180 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 164.333-121 chr2 124608381 124608573 + 1 NA intron (NM_130773, intron 11 of 23) L2b|LINE|L2 583190 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 169.333-65 chr13 46834427 46834738 + 1 NA 3' UTR (NM_000621, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_000621, exon 4 of 4) -17558 NR_046612 100874082 Hs.569281 NR_046612 ENSG00000224517 HTR2A-AS1 - HTR2A antisense RNA 1 ncRNA 156.667-22 chr1 114899749 114899928 + 1 NA intron (NM_001282542, intron 16 of 30) MER61-int|LTR|ERV1 44975 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 162.333-152 chr22 43981431 43981751 + 1 NA intron (NM_015380, intron 11 of 14) intron (NM_015380, intron 11 of 14) -17620 NM_001003828 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 179.667-134 chr8 72799307 72799618 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 67417 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 165.667-127 chr3 122760540 122760784 + 1 NA intron (NM_001320728, intron 3 of 6) intron (NM_001320728, intron 3 of 6) 33169 NM_024610 79663 Hs.29169 NM_024610 ENSG00000169087 HSPBAP1 PASS1 HSPB1 associated protein 1 protein-coding 165.667-24 chr11 6955194 6955481 + 1 NA intron (NM_013250, intron 6 of 6) intron (NM_013250, intron 6 of 6) 27675 NM_001354854 7762 Hs.523457 NM_013250 ENSG00000149054 ZNF215 BAZ-2|BAZ2|ZKSCAN11|ZSCAN43 zinc finger protein 215 protein-coding 191.667-105 chr6 34945352 34945658 + 1 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) L1MC2|LINE|L1 56250 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 175.333-151 chr5 173035037 173035407 + 1 NA 3' UTR (NM_003945, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_003945, exon 4 of 4) 14496 NR_002988 677841 Hs.692720 NR_002988 ENSG00000212402 SNORA74B U19-2 small nucleolar RNA, H/ACA box 74B snoRNA 171.333-32 chr11 115107270 115107524 + 1 NA Intergenic Intergenic -226180 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 151.667-187 chr20 9117241 9117480 + 1 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) L1ME4c|LINE|L1 48306 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 191.667-45 chr13 101320964 101321360 + 1 NA intron (NM_001350749, intron 7 of 43) intron (NM_001350749, intron 7 of 43) 95346 NM_001350748 259232 Hs.525146 NM_052867 ENSG00000102452 NALCN CLIFAHDD|CanIon|IHPRF|IHPRF1|INNFD|VGCNL1|bA430M15.1 sodium leak channel, non-selective protein-coding 126.667-130 chr4 157797097 157797316 + 1 NA Intergenic Intergenic 224716 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 138.333-153 chr5 98884679 98884841 + 1 NA intron (NM_001364113, intron 18 of 36) AluJr|SINE|Alu 41774 NM_001270 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 181.667-75 chr2 155272380 155272644 + 1 NA Intergenic Intergenic 573817 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 261.333-79 chr4 106820846 106821144 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 215318 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 202.333-144 chr5 80893099 80893524 + 1 NA Intergenic Intergenic -67052 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 155.333-57 chr11 97372244 97372475 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 863934 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 197.667-79 chr21 28077472 28077719 + 1 NA intron (NR_126010, intron 1 of 4) intron (NR_126010, intron 1 of 4) -12808 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 139.667-53 chr14 56910358 56910516 + 1 NA intron (NR_029385, intron 3 of 3) intron (NR_029385, intron 3 of 3) 97279 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 192.333-128 chr4 80613299 80613695 + 1 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) 277777 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 140.333-251 chr9 118457937 118458139 + 1 NA Intergenic Intergenic -221633 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 288.333-42 chr9 86348808 86349274 + 1 NA intron (NM_001185059, intron 2 of 26) AluSq2|SINE|Alu 5369 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 126.333-41 chr13 49797365 49797588 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -4794 NM_002267 3839 Hs.527919 NM_002267 ENSG00000102753 KPNA3 IPOA4|SRP1|SRP1gamma|SRP4|hSRP1 karyopherin subunit alpha 3 protein-coding 145.333-230 chr5 13413155 13413438 + 1 NA Intergenic Intergenic -380410 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 260.667-25 chr15 70717073 70717405 + 1 NA intron (NM_018003, intron 1 of 18) intron (NM_018003, intron 1 of 18) -14957 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 143.667-200 chr5 37912718 37912870 + 1 NA Intergenic Intergenic -35697 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 149.333-183 chr2 76655478 76655660 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -330396 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 153.333-84 chr12 12921452 12921673 + 1 NA Intergenic Intergenic 5733 NR_030345 693199 NR_030345 ENSG00000283759 MIR614 MIRN614|hsa-mir-614 microRNA 614 ncRNA 161.333-99 chr15 61807657 61807873 + 1 NA Intergenic Intergenic 77847 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 208.667-135 chr8 13380285 13380582 + 1 NA intron (NM_024767, intron 4 of 4) intron (NM_024767, intron 4 of 4) -103649 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 229.667-68 chr5 61839641 61839950 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -104097 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 124.333-97 chr2 171444025 171444197 + 1 NA intron (NM_001164821, intron 3 of 11) MER103C|DNA|hAT-Charlie -9308 NM_024770 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 163.333-183 chr3 105341586 105341906 + 1 NA Intergenic Intergenic -24967 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 162.667-187 chr3 196852994 196853323 + 1 NA Intergenic AluYe5|SINE|Alu -14698 NM_001308045 205564 Hs.240770 NM_152699 ENSG00000119231 SENP5 - SUMO specific peptidase 5 protein-coding 321.333-23 chr14 65947387 65947946 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 476564 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 118.333-27 chr10 21334070 21334269 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 38781 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 251.667-95 chr8 84216719 84217180 + 1 NA intron (NM_001354323, intron 1 of 7) intron (NM_001354323, intron 1 of 7) 32283 NM_001100391 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 350.667-2 chr1 83098709 83099225 + 1 NA intron (NR_147074, intron 9 of 10) intron (NR_147074, intron 9 of 10) -112759 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 154.667-291 chr4 180189860 180190043 + 1 NA Intergenic Intergenic 969198 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 194.667-44 chr16 46857499 46857843 + 1 NA Intergenic Intergenic -26491 NM_001348660 388272 Hs.406551 NM_001001436 ENSG00000155330 C16orf87 - chromosome 16 open reading frame 87 protein-coding 198.333-167 chr5 92176230 92176596 + 1 NA Intergenic Intergenic -793096 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 189.333-104 chr2 181575413 181575853 + 1 NA intron (NR_027690, intron 2 of 11) intron (NR_027690, intron 2 of 11) 81472 NM_201548 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 135.667-196 chr9 28094866 28095040 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -521087 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 239.667-67 chr7 45946433 45946937 + 1 NA Intergenic Intergenic -25413 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 254.333-11 chr12 39643777 39644280 + 1 NA intron (NM_001031748, intron 3 of 12) intron (NM_001031748, intron 3 of 12) 17845 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 172.333-164 chr7 77576710 77577043 + 1 NA intron (NM_001131009, intron 2 of 16) intron (NM_001131009, intron 2 of 16) 38833 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 150.667-382 chr8 117784214 117784459 + 1 NA Intergenic Intergenic 136577 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 112.667-237 chr6 143708627 143708781 + 1 NA intron (NM_001100165, intron 1 of 11) intron (NM_001100165, intron 1 of 11) 30739 NM_001100164 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 170.333-151 chr3 191751108 191751327 + 1 NA Intergenic Intergenic 290054 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 366.333-23 chr7 116308350 116309021 + 1 NA Intergenic Intergenic -21958 NR_130922 102724434 Hs.667624 NR_130921 ENSG00000237870 LOC102724434 - uncharacterized LOC102724434 ncRNA 193.667-86 chr3 89920659 89920932 + 1 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 813174 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 221.333-30 chr12 39142947 39143306 + 1 NA Intergenic Intergenic -237535 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 261.333-29 chr14 82402785 82403244 + 1 NA Intergenic Intergenic -239618 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 257.667-30 chr16 59651326 59651777 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 103640 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 265.667-42 chr20 54695047 54695464 + 1 NA Intergenic Intergenic 219662 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 182.333-46 chr14 69847664 69847972 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -31598 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 205.333-92 chr16 71718396 71718833 + 1 NA intron (NM_015020, intron 1 of 18) AluJr|SINE|Alu -2774 NM_001289003 23035 Hs.709458 NM_015020 ENSG00000040199 PHLPP2 PHLPPL|PPM3B PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 protein-coding 151.667-123 chr15 48391366 48391661 + 1 NA Intergenic Intergenic 59316 NM_001948 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 171.667-11 chr1 164604915 164605237 + 1 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 45354 NM_001353130 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 153.333-83 chr12 11457475 11457697 + 1 NA intron (NR_148969, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 29092 NR_148969 440084 Hs.121321 NR_148969 LOC440084 - uncharacterized LOC440084 ncRNA 121.667-145 chr4 97269820 97269972 + 1 NA Intergenic Intergenic -97030 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 255.333-22 chr12 2097518 2097933 + 1 NA intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 44440 NM_199460 775 Hs.118262 NM_000719 ENSG00000151067 CACNA1C CACH2|CACN2|CACNL1A1|CCHL1A1|CaV1.2|LQT8|TS|TS. LQT8 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C protein-coding 158.333-337 chr9 11563764 11563946 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 950649 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 160.667-89 chr14 63831297 63831478 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -21578 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 168.333-121 chr21 30024628 30024919 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -84721 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 308.333-26 chr3 97284839 97285207 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -154584 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 149.667-294 chr4 80873814 80874083 + 1 NA intron (NM_152770, intron 4 of 5) intron (NM_152770, intron 4 of 5) -156760 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 174.333-45 chr17 49243507 49243823 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -4578 NR_034161 124871 Hs.446890 NM_001007529 ENSG00000177369 FLJ40194 - uncharacterized FLJ40194 ncRNA 192.333-12 chr1 232245386 232245609 + 1 NA Intergenic Intergenic 270111 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 173.667-14 chr10 9604466 9604772 + 1 NA Intergenic Intergenic -309026 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 151.333-400 chr7 107188162 107188328 + 1 NA intron (NM_001244262, intron 6 of 10) L2c|LINE|L2 19242 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 145.667-94 chr14 97635790 97635996 + 1 NA intron (NR_033943, intron 3 of 3) intron (NR_033943, intron 3 of 3) 50765 NR_033943 100129345 Hs.23632 NR_033943 ENSG00000197176 LINC02291 - long intergenic non-protein coding RNA 2291 ncRNA 229.333-98 chr5 40789064 40789500 + 1 NA intron (NM_001355028, intron 1 of 9) L1MA6|LINE|L1 8895 NM_001355028 5562 Hs.43322 NM_006251 ENSG00000132356 PRKAA1 AMPK|AMPKa1 protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1 protein-coding 148.667-134 chr15 60813771 60814053 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 132343 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 153.333-395 chr8 15759224 15759383 + 1 NA 3' UTR (NM_001356429, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001356429, exon 11 of 11) 219040 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 276.667-16 chr12 88908163 88908604 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 111309 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 330.667-28 chr7 109541694 109542115 + 1 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 418309 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 191.333-81 chr16 47964688 47965004 + 1 NA promoter-TSS (NR_146502) promoter-TSS (NR_146502) -843 NR_146502 105371238 Hs.743032 NR_146502 LINC02134 - long intergenic non-protein coding RNA 2134 ncRNA 146.333-73 chr13 39731270 39731518 + 1 NA intron (NM_001145079, intron 18 of 18) intron (NM_001145079, intron 18 of 18) -67259 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 113.667-96 chr2 25395813 25395968 + 1 NA intron (NM_001351385, intron 14 of 17) intron (NM_001351385, intron 14 of 17) -53300 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 207.333-125 chr18 68506584 68506880 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 208376 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 122.333-61 chr14 96800333 96800469 + 1 NA intron (NM_003384, intron 1 of 12) intron (NM_003384, intron 1 of 12) 3019 NM_003384 7443 Hs.422662 NM_003384 ENSG00000100749 VRK1 PCH1|PCH1A VRK serine/threonine kinase 1 protein-coding 136.667-16 chr10 46242407 46242575 + 1 NA intron (NR_103828, intron 2 of 2) L1M2|LINE|L1 27117 NR_103828 100996567 Hs.546758 NR_103827 ANTXRLP1 - ANTXR like pseudogene 1 pseudo 148.333-208 chr2 191067149 191067381 + 1 NA intron (NM_003151, intron 6 of 23) LTR48B|LTR|ERV1 45739 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 202.667-110 chr4 85866798 85867186 + 1 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) intron (NM_001287805, intron 1 of 7) 39055 NM_001287805 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 191.667-73 chr2 190380891 190381222 + 1 NA Intergenic MER45R|DNA|hAT-Tip100 -27299 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 168.667-137 chr3 17663379 17663576 + 1 NA intron (NM_001134381, intron 1 of 23) intron (NM_001134381, intron 1 of 23) 36543 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 136.667-49 chr13 87996742 87996905 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -146044 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 138.333-203 chr9 3999710 3999867 + 1 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) L1MEd|LINE|L1 101142 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 129.667-143 chr5 154732289 154732501 + 1 NA intron (NM_001367717, intron 1 of 18) intron (NM_001367717, intron 1 of 18) 19552 NM_015315 23367 Hs.292078 NM_015315 ENSG00000155506 LARP1 LARP La ribonucleoprotein domain family member 1 protein-coding 266.333-56 chr6 61599622 61599968 + 1 NA intron (NR_146870, intron 14 of 15) LTR49-int|LTR|ERV1 25665 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 162.667-69 chr13 41876458 41876702 + 1 NA intron (NM_001009814, intron 9 of 25) L2a|LINE|L2 84505 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 205.667-50 chr15 49648005 49648430 + 1 NA 3' UTR (NM_001144955, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001144955, exon 5 of 5) 27169 NM_020234 56986 Hs.127432 NM_020234 ENSG00000104047 DTWD1 MDS009 DTW domain containing 1 protein-coding 169.333-94 chr16 86688370 86688651 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 33449 NR_135181 101928614 Hs.399823 NR_135181 ENSG00000260026 LINC02189 - long intergenic non-protein coding RNA 2189 ncRNA 171.333-116 chr3 36867526 36867823 + 1 NA intron (NM_001329998, intron 9 of 23) intron (NM_001329998, intron 9 of 23) -45174 NR_147141 105377031 Hs.333862 NR_147141 ENSG00000279727 LINC02033 - long intergenic non-protein coding RNA 2033 ncRNA 306.333-18 chr14 42225493 42225969 + 1 NA Intergenic Intergenic 618875 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 253.667-16 chr12 17102968 17103426 + 1 NA Intergenic Intergenic 114450 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 268.667-42 chr3 49559288 49559656 + 1 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) L1MC5|LINE|L1 4995 NM_003458 8927 Hs.194684 NM_003458 ENSG00000164061 BSN ZNF231 bassoon presynaptic cytomatrix protein protein-coding 255.333-38 chr15 81127156 81127473 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -6956 NM_001353365 161502 Hs.130979 NM_173528 ENSG00000156206 CFAP161 C15orf26 cilia and flagella associated protein 161 protein-coding 275.333-20 chr12 117692713 117693162 + 1 NA intron (NM_173598, intron 4 of 19) L1MB5|LINE|L1 276053 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 356.667-6 chr11 100658214 100658927 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -28718 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 168.333-42 chr12 981602 981947 + 1 NA intron (NM_001297419, intron 1 of 11) (AAATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8267 NM_001297419 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 188.667-38 chr12 114680401 114680690 + 1 NA intron (NM_016569, intron 2 of 7) intron (NM_016569, intron 2 of 7) 3630 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 158.667-352 chr9 82362146 82362334 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 373468 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 167.667-170 chr5 66312768 66312969 + 1 NA Intergenic Intergenic -103422 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 112.667-102 chr18 72141289 72141475 + 1 NA Intergenic Intergenic -359156 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 122.667-26 chr11 66064019 66064152 + 1 NA intron (NM_006842, intron 19 of 21) L2a|LINE|L2 -6187 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 153.333-253 chr22 28008259 28008549 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 14 of 22) intron (NM_001145418, intron 14 of 22) -87792 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 139.333-192 chr6 72535729 72535929 + 1 NA Intergenic Intergenic -86014 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 303.333-85 chrX 69952793 69953272 + 1 NA intron (NM_001005609, intron 1 of 7) intron (NM_001005609, intron 1 of 7) -69825 NR_037494 100500887 NR_037494 ENSG00000211991 MIR676 hsa-mir-676|mir-676 microRNA 676 ncRNA 132.667-194 chrX 8313799 8314028 + 1 NA Intergenic Intergenic -142646 NM_016378 51480 Hs.279737 NM_016378 ENSG00000177504 VCX2 VCX-2r|VCX2R|VCXB variable charge X-linked 2 protein-coding 141.333-30 chr11 5671436 5671652 + 1 NA intron (NM_033034, intron 4 of 7) L1M4a2|LINE|L1 13530 NM_033092 85363 Hs.125300 NM_033034 ENSG00000132256 TRIM5 RNF88|TRIM5alpha tripartite motif containing 5 protein-coding 161.333-113 chr17 43490004 43490171 + 1 NA intron (NR_136228, intron 2 of 23) intron (NR_136228, intron 2 of 23) 6112 NM_001322219 1659 Hs.463105 NM_004941 ENSG00000067596 DHX8 DDX8|Dhr2|HRH1|PRP22|PRPF22 DEAH-box helicase 8 protein-coding 163.333-99 chr15 63808661 63808867 + 1 NA intron (NM_003922, intron 1 of 77) intron (NM_003922, intron 1 of 77) 25184 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 146.667-67 chr12 4799870 4800065 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9209 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 133.667-32 chr12 6508312 6508529 + 1 NA intron (NM_014865, intron 2 of 31) L1MC4a|LINE|L1 -1802 NR_004387 692148 NR_004387 ENSG00000239002 SCARNA10 U85 small Cajal body-specific RNA 10 ncRNA 164.333-66 chr14 43280443 43280655 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 1226734 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 144.333-274 chr8 120188615 120188770 + 1 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 63590 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 154.667-73 chr12 21506176 21506387 + 1 NA intron (NM_016072, intron 1 of 4) X7B_LINE|LINE|CR1 4492 NM_016072 51026 Hs.62275 NM_016072 ENSG00000111711 GOLT1B CGI-141|GCT2|GOT1|GOT1B|YMR292W golgi transport 1B protein-coding 295.333-46 chr4 83644691 83645146 + 1 NA Intergenic Intergenic 108810 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 234.667-66 chr3 64285570 64285866 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -17545 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 207.667-82 chr4 26401094 26401392 + 1 NA intron (NM_203284, intron 3 of 11) intron (NM_203284, intron 3 of 11) 80015 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 156.667-249 chr4 94689978 94690224 + 1 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 67432 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 157.667-28 chr10 43880721 43880905 + 1 NA intron (NR_038268, intron 4 of 4) L1MC|LINE|L1 21402 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 146.333-269 chr5 121076189 121076430 + 1 NA Intergenic Intergenic -246241 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 282.333-61 chr8 108182776 108183459 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 65600 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 171.333-150 chr5 73286843 73287166 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -50902 NR_146627 105379033 Hs.145178 NR_146627 LINC02230 - long intergenic non-protein coding RNA 2230 ncRNA 155.333-414 chr9 109179411 109179584 + 1 NA intron (NM_019114, intron 24 of 25) L2b|LINE|L2 -12206 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 202.333-158 chr6 139951732 139952139 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -24384 NR_121622 100507477 Hs.179213 NR_121622 ENSG00000236013 LOC100507477 - uncharacterized LOC100507477 ncRNA 205.667-53 chr15 75052031 75052421 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 8940 NM_001301104 60490 Hs.458922 NM_021823 ENSG00000138621 PPCDC MDS018|PPC-DC|coaC phosphopantothenoylcysteine decarboxylase protein-coding 148.667-36 chr10 16659916 16660117 + 1 NA intron (NM_152724, intron 7 of 7) LTR40a|LTR|ERVL -138137 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 128.667-56 chr14 59886975 59887141 + 1 NA Intergenic Intergenic -16282 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 180.667-73 chr2 190375228 190375474 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 31762 NM_002194 3628 Hs.32309 NM_002194 ENSG00000151689 INPP1 - inositol polyphosphate-1-phosphatase protein-coding 161.333-241 chr6 7184891 7185067 + 1 NA intron (NM_001003699, intron 4 of 12) intron (NM_001003699, intron 4 of 12) 77018 NM_001003698 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 147.667-351 chr8 16862500 16862688 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 139751 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 169.333-282 chr9 14841627 14841834 + 1 NA intron (NR_163238, intron 10 of 30) intron (NR_163238, intron 10 of 30) -61299 NR_163242 158326 Hs.50850 NM_144966 ENSG00000164946 FREM1 BNAR|C9orf143|C9orf145|C9orf154|MOTA|TILRR|TRIGNO2 FRAS1 related extracellular matrix 1 protein-coding 205.333-266 chrX 93622594 93622990 + 1 NA Intergenic Intergenic 50786 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 180.333-138 chr8 116892361 116892551 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17590 NM_006265 5885 Hs.81848 NM_006265 ENSG00000164754 RAD21 CDLS4|HR21|HRAD21|MCD1|MGS|NXP1|SCC1|hHR21 RAD21 cohesin complex component protein-coding 151.333-357 chr6 20108698 20108850 + 1 NA intron (NR_073465, intron 9 of 9) MIR|SINE|MIR 103695 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 150.333-284 chr3 190157397 190157556 + 1 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -35039 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 126.333-131 chr4 59198655 59198939 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 185224 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 264.667-25 chr14 52220377 52220832 + 1 NA Intergenic Intergenic -47094 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 174.333-79 chr21 24467092 24467304 + 1 NA intron (NR_135520, intron 4 of 5) intron (NR_135520, intron 4 of 5) 38458 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 166.667-99 chr18 38617373 38617560 + 1 NA Intergenic Intergenic 960331 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 180.333-36 chr14 76805517 76805874 + 1 NA intron (NM_001370747, intron 5 of 11) intron (NM_001370747, intron 5 of 11) 7187 NM_001370747 23357 Hs.497448 NM_015305 ENSG00000013523 ANGEL1 Ccr4e|KIAA0759 angel homolog 1 protein-coding 149.667-244 chr21 43348163 43348399 + 1 NA Intergenic Intergenic 14068 NR_131902 101928399 Hs.517319 NR_131902 ENSG00000237989 LINC01679 TCONS_00029157 long intergenic non-protein coding RNA 1679 ncRNA 232.667-25 chr15 58262268 58262541 + 1 NA Intergenic Intergenic 124023 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 136.667-146 chr5 91068583 91068751 + 1 NA intron (NR_003149, intron 85 of 89) L1PA16|LINE|L1 245735 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 199.667-47 chr14 67776342 67776583 + 1 NA intron (NM_015346, intron 25 of 41) MER58A|DNA|hAT-Charlie 40128 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 245.667-21 chr14 69969856 69970226 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 3 of 11) intron (NM_001034852, intron 3 of 11) -8092 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 194.667-159 chr8 135870061 135870480 + 1 NA Intergenic Intergenic 412814 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 185.333-159 chr5 166298994 166299261 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 627243 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 120.333-139 chr4 47804756 47804966 + 1 NA intron (NM_006587, intron 2 of 21) L1MA2|LINE|L1 -26484 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 235.333-75 chr3 109175114 109175444 + 1 NA Intergenic Intergenic -2886 NR_026767 677779 Hs.618669 NM_001040054 ENSG00000214381 LINC00488 C3orf66 long intergenic non-protein coding RNA 488 ncRNA 231.333-97 chr5 149720537 149720926 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -9579 NM_133263 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 172.333-23 chr10 92493052 92493235 + 1 NA intron (NR_136399, intron 11 of 25) L3|LINE|CR1 4618 NM_001322797 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 156.333-154 chr18 26528714 26528914 + 1 NA intron (NM_001258222, intron 1 of 4) intron (NM_001258222, intron 1 of 4) 19739 NM_001142730 284252 Hs.526630 NM_198991 ENSG00000134504 KCTD1 C18orf5 potassium channel tetramerization domain containing 1 protein-coding 146.667-166 chr2 73989485 73989723 + 1 NA intron (NM_001287491, intron 2 of 11) intron (NM_001287491, intron 2 of 11) 4694 NM_001287491 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 141.667-72 chr14 50418559 50418721 + 1 NA 3' UTR (NM_006575, exon 32 of 32) 3' UTR (NM_006575, exon 32 of 32) -21342 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 220.667-79 chr5 28781043 28781440 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -145629 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 149.333-231 chr3 17944192 17944363 + 1 NA Intergenic Intergenic -18275 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 162.333-27 chr10 51203493 51203691 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -95981 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 149.333-135 chr17 9382289 9382440 + 1 NA intron (NM_004853, intron 6 of 7) L1ME2|LINE|L1 193456 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 264.333-4 chr1 96100104 96100661 + 1 NA Intergenic Intergenic 108314 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 235.333-55 chr2 35181158 35181540 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -290056 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 189.333-83 chr18 73801951 73802155 + 1 NA Intergenic Intergenic 345781 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 146.667-148 chr18 77974408 77974664 + 1 NA intron (NR_104127, intron 1 of 1) (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19191 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 170.333-187 chr6 72533936 72534144 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -87803 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 203.333-52 chr12 34592982 34593422 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 570706 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 144.333-131 chr2 114085402 114085566 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -105500 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 162.333-277 chr9 107966855 107967092 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -477204 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 123.667-96 chr2 132476152 132476332 + 1 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) 42531 NR_162099 113218485 NR_162099 MIR9986 - microRNA 9986 ncRNA 329.667-18 chr7 35444750 35445206 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 131123 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 130.333-73 chr15 58273970 58274180 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 135694 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 335.333-29 chr21 16618886 16619360 + 1 NA intron (NR_136541, intron 7 of 9) (ATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 28886 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 155.667-177 chr2 142740528 142740831 + 1 NA Intergenic (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat -136985 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 264.667-2 chr1 96959437 96959755 + 1 NA Intergenic Intergenic -136327 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 292.667 chr1 89539599 89539962 + 1 NA intron (NM_001369819, intron 2 of 6) intron (NM_001369819, intron 2 of 6) 14942 NM_015350 23507 Hs.482017 NM_015350 ENSG00000197147 LRRC8B TA-LRRP|TALRRP leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B protein-coding 302.667-36 chr8 87141040 87141448 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 274829 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 192.333-99 chr2 214212336 214212705 + 1 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) L2a|LINE|L2 -198534 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 184.667-19 chr10 97602927 97603127 + 1 NA intron (NM_138413, intron 6 of 6) AluSz|SINE|Alu 13306 NM_001009997 414157 Hs.662302 NM_001009997 ENSG00000203942 C10orf62 bA548K23.1 chromosome 10 open reading frame 62 protein-coding 264.667-8 chr1 173897388 173897705 + 1 NA 3' UTR (NM_001346115, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001346115, exon 4 of 4) 19781 NM_001365052 462 Hs.75599 NM_000488 ENSG00000117601 SERPINC1 AT3|AT3D|ATIII|ATIII-R2|ATIII-T1|ATIII-T2|THPH7 serpin family C member 1 protein-coding 127.333-173 chr7 55957116 55957276 + 1 NA TTS (NM_015969) TTS (NM_015969) 5319 NM_015969 51373 Hs.44298 NM_015969 ENSG00000239789 MRPS17 HSPC011|MRP-S17|RPMS17|S17mt mitochondrial ribosomal protein S17 protein-coding 194.333-154 chr8 113949889 113950180 + 1 NA Intergenic Intergenic -513095 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 151.333-258 chr22 24376438 24376623 + 1 NA intron (NM_001254732, intron 13 of 14) L1MB5|LINE|L1 34422 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 128.667-126 chr4 53777264 53777432 + 1 NA Intergenic Intergenic 81447 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 151.333-337 chr5 59270120 59270405 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 5853 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 141.333-201 chr5 179301238 179301454 + 1 NA intron (NM_014244, intron 2 of 21) MIRb|SINE|MIR 44115 NM_021599 9509 Hs.23871 NM_014244 ENSG00000087116 ADAMTS2 ADAM-TS2|ADAMTS-2|ADAMTS-3|EDSDERMS|NPI|PC I-NP|PCI-NP|PCINP|PCPNI|PNPI ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2 protein-coding 154.667-252 chr3 124455808 124455993 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 22 of 59) intron (NM_001024660, intron 22 of 59) 81568 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 159.333-310 chr7 71014409 71014574 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -117653 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 125.667-155 chr5 98187341 98187528 + 1 NA Intergenic Intergenic -26195 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 186.667-142 chr7 88291855 88292179 + 1 NA intron (NM_001205315, intron 1 of 5) intron (NM_001205315, intron 1 of 5) 14877 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 144.333-273 chr8 120032611 120032827 + 1 NA intron (NM_022783, intron 8 of 8) LTR33C|LTR|ERVL -92383 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 160.667-132 chr18 43203724 43204019 + 1 NA Intergenic Intergenic 73619 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 243.667-47 chr20 3003410 3003881 + 1 NA intron (NM_080841, intron 8 of 22) AluJr|SINE|Alu -39977 NM_178332 2797 Hs.129715 NM_001501 ENSG00000125787 GNRH2 GnRH-II|LH-RHII gonadotropin releasing hormone 2 protein-coding 143.333-4 chr1 42197391 42197686 + 1 NA intron (NM_001198850, intron 7 of 12) MER2|DNA|TcMar-Tigger -32793 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 238.333-88 chr8 81815745 81816079 + 1 NA intron (NM_001348189, intron 6 of 9) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 26273 NR_145472 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 168.667-189 chr6 115901162 115901418 + 1 NA Intergenic Intergenic -137441 NR_027338 728402 Hs.729953 NR_027338 TPI1P3 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 3 pseudo 237.333-12 chr1 238158216 238158538 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -267455 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 241.333-15 chr10 67715240 67715543 + 1 NA Intergenic Intergenic -19196 NM_013266 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 155.333-390 chr8 87752418 87752688 + 1 NA Intergenic Intergenic 121462 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 181.333-37 chr12 61450052 61450338 + 1 NA Intergenic Intergenic 742644 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 145.667-310 chr9 85385538 85385705 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 356408 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 163.333-249 chr6 144798432 144798670 + 1 NA intron (NM_007124, intron 63 of 73) intron (NM_007124, intron 63 of 73) 392896 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 252.667-14 chr11 8990103 8990631 + 1 NA intron (NM_020645, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 13634 NM_020645 56675 Hs.523467 NM_020645 ENSG00000175352 NRIP3 C11orf14|NY-SAR-105 nuclear receptor interacting protein 3 protein-coding 153.667-336 chr6 57328016 57328290 + 1 NA intron (NM_000947, intron 5 of 13) intron (NM_000947, intron 5 of 13) 10523 NM_000947 5558 Hs.654580 NM_000947 ENSG00000146143 PRIM2 PRIM2A|p58 DNA primase subunit 2 protein-coding 121.667-132 chr3 177648885 177649093 + 1 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) intron (NR_047568, intron 3 of 3) -167876 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 227.333-7 chr1 117971166 117971489 + 1 NA intron (NM_206996, intron 45 of 48) intron (NM_206996, intron 45 of 48) 41588 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 156.667-268 chr5 41379714 41379992 + 1 NA intron (NM_001005473, intron 2 of 2) intron (NM_001005473, intron 2 of 2) -118384 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 176.667-143 chr8 54502725 54503037 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 44946 NM_022454 64321 Hs.98367 NM_022454 ENSG00000164736 SOX17 VUR3 SRY-box transcription factor 17 protein-coding 330.333-16 chr6 38680149 38680569 + 1 NA intron (NM_006708, intron 5 of 5) AluSp|SINE|Alu 22786 NM_006708 2739 Hs.268849 NM_006708 ENSG00000124767 GLO1 GLOD1|GLYI|HEL-S-74 glyoxalase I protein-coding 176.333-26 chr11 13417564 13417893 + 1 NA intron (NM_032320, intron 4 of 8) intron (NM_032320, intron 4 of 8) 22551 NM_001297742 84280 Hs.332382 NM_032320 ENSG00000148925 BTBD10 GMRP-1|GMRP1 BTB domain containing 10 protein-coding 191.667-51 chr15 60268480 60268742 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 129375 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 158.667-253 chr4 140587984 140588151 + 1 NA Intergenic Intergenic -19106 NM_021833 7350 Hs.249211 NM_021833 ENSG00000109424 UCP1 SLC25A7|UCP uncoupling protein 1 protein-coding 152.667-374 chr8 83535204 83535424 + 1 NA Intergenic Intergenic 131556 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 263.333-43 chr2 102366114 102366585 + 1 NA intron (NM_001371424, intron 2 of 8) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 10066 NM_003855 8809 Hs.469521 NM_003855 ENSG00000115604 IL18R1 CD218a|CDw218a|IL-1Rrp|IL18RA|IL1RRP interleukin 18 receptor 1 protein-coding 125.667-39 chr11 109428856 109429017 + 1 NA 3' UTR (NM_207645, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_207645, exon 2 of 2) 6746 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 159.333-239 chr4 67518527 67518697 + 1 NA intron (NR_155754, intron 6 of 18) intron (NR_155754, intron 6 of 18) 26891 NR_155754 1060 Hs.479867 NM_001812 ENSG00000145241 CENPC CENP-C|CENPC1|MIF2|hcp-4 centromere protein C protein-coding 354.333-14 chr3 95656495 95656940 + 1 NA intron (NR_077228, intron 4 of 4) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 26476 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 195.333-83 chr14 87794066 87794463 + 1 NA Intergenic Intergenic -138970 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 130.333-168 chr5 75311005 75311246 + 1 NA Intergenic Charlie13b|DNA|hAT-Charlie -26043 NM_001130996 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 153.333-3 chr1 39723832 39724054 + 1 NA Intergenic Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 -14902 NM_006112 10450 Hs.524690 NM_006112 ENSG00000084072 PPIE CYP-33|CYP33 peptidylprolyl isomerase E protein-coding 160.667-194 chr3 48494058 48494259 + 1 NA intron (NM_001272065, intron 2 of 5) L1MA8|LINE|L1 9892 NM_001272068 51246 Hs.414579 NM_016479 ENSG00000164054 SHISA5 SCOTIN shisa family member 5 protein-coding 310.333 chr1 54091872 54092317 + 1 NA intron (NR_130900, intron 3 of 4) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 38015 NR_039942 100616315 NR_039942 ENSG00000283749 MIR4781 mir-4781 microRNA 4781 ncRNA 128.333-89 chr19 50866207 50866442 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -7109 NM_001256080 3817 Hs.515560 NM_005551 ENSG00000167751 KLK2 KLK2A2|hGK-1|hK2 kallikrein related peptidase 2 protein-coding 230.667-12 chr11 90493593 90493900 + 1 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 62111 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 233.333-111 chr5 129236465 129236839 + 1 NA Intergenic Intergenic 138964 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 279.333-27 chr14 29791224 29791693 + 1 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) L1ME1|LINE|L1 135638 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 166.333-120 chr2 103389805 103389990 + 1 NA Intergenic Intergenic -405468 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 156.667-33 chr1 208653326 208653543 + 1 NA Intergenic Intergenic -75254 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 142.667-15 chr1 225189569 225189774 + 1 NA intron (NM_001367479, intron 37 of 85) L1MB5|LINE|L1 238367 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 117.333-111 chr2 201547539 201547674 + 1 NA exon (NM_152525, exon 10 of 15) exon (NM_152525, exon 10 of 15) 71572 NM_001168216 151254 Hs.335788 NM_152525 ENSG00000155754 C2CD6 ALS2CR11 C2 calcium dependent domain containing 6 protein-coding 257.333-99 chr8 83654261 83654719 + 1 NA Intergenic Intergenic 250732 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 154.667-383 chr8 80434559 80434827 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -50900 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 373.667-16 chr8 78561603 78562089 + 1 NA intron (NM_181839, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR -3343 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 141.333-5 chr1 68575379 68575578 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -78396 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 233.667-40 chr2 105614898 105615220 + 1 NA Intergenic Intergenic -4500 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 132.333-123 chr4 101710114 101710339 + 1 NA Intergenic Intergenic -80381 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 206.333-113 chr3 109116019 109116386 + 1 NA intron (NM_014429, intron 1 of 27) L2c|LINE|L2 1932 NM_014429 27136 Hs.591296 NM_014429 ENSG00000114487 MORC1 CT33|MORC|ZCW6 MORC family CW-type zinc finger 1 protein-coding 156.333-379 chr9 102427509 102427734 + 1 NA Intergenic Intergenic -92016 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 157.333-322 chr7 55021039 55021299 + 1 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) 2137 NM_201283 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 156.333-195 chr2 148502684 148502877 + 1 NA intron (NM_018328, intron 13 of 14) intron (NM_018328, intron 13 of 14) -141971 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 180.333-89 chr4 37951101 37951363 + 1 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) L1MC5|LINE|L1 -9166 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 150.667-119 chr14 56700512 56700785 + 1 NA Intergenic Intergenic 105019 NM_172337 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 178.667-114 chr4 38813207 38813456 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -8540 NM_003263 7096 Hs.621817 NM_003263 ENSG00000174125 TLR1 CD281|TIL|TIL. LPRS5|rsc786 toll like receptor 1 protein-coding 268.667-13 chr13 95605703 95606265 + 1 NA intron (NM_014934, intron 13 of 21) intron (NM_014934, intron 13 of 21) 38722 NM_198968 22873 Hs.656580 NM_014934 ENSG00000134874 DZIP1 DZIP|DZIPt1 DAZ interacting zinc finger protein 1 protein-coding 144.667-218 chr4 66913037 66913231 + 1 NA Intergenic Intergenic 508866 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 126.333-153 chr6 74351883 74352080 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 282530 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 146.333-250 chr5 28570558 28570754 + 1 NA Intergenic Intergenic -282991 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 165.333-238 chr7 22648386 22648581 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 17050 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 166.333-232 chr8 104149680 104149867 + 1 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) intron (NM_001348498, intron 20 of 24) -73562 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 154.333-78 chr13 112973373 112973620 + 1 NA intron (NM_001366644, intron 1 of 29) intron (NM_001366644, intron 1 of 29) 3936 NM_001366644 23263 Hs.170422 NM_024979 ENSG00000126217 MCF2L ARHGEF14|DBS|OST MCF.2 cell line derived transforming sequence like protein-coding 271.667-84 chrX 98555410 98555839 + 1 NA Intergenic Intergenic -991089 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 156.333-215 chr20 61309660 61309852 + 1 NA intron (NM_001794, intron 2 of 15) intron (NM_001794, intron 2 of 15) 57495 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 157.333-52 chr10 95549682 95549896 + 1 NA intron (NM_001290295, intron 1 of 24) intron (NM_001290295, intron 1 of 24) 11582 NM_001290294 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 333.333-49 chr7 33286884 33287602 + 1 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) intron (NM_198428, intron 9 of 22) 157679 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 167.333-229 chr6 63681265 63681501 + 1 NA intron (NM_001370350, intron 3 of 14) HAL1|LINE|L1 34857 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 216.333-48 chr15 62029248 62029569 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 5 of 81) intron (NM_001018088, intron 5 of 81) 31039 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 131.667-182 chr7 48269577 48269786 + 1 NA intron (NM_152701, intron 16 of 61) intron (NM_152701, intron 16 of 61) 98223 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 236.333-49 chr2 143240399 143240803 + 1 NA intron (NM_018460, intron 5 of 13) intron (NM_018460, intron 5 of 13) 111182 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 123.333-51 chr11 100023828 100023981 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 8 of 23) L1MC1|LINE|L1 467759 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 329.333-57 chr7 124489498 124489907 + 1 NA Intergenic Intergenic -137606 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 146.333-360 chrX 48906021 48906176 + 1 NA intron (NM_005660, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 5548 NM_001282647 7355 Hs.21899 NM_005660 ENSG00000102100 SLC35A2 CDG2M|CDGX|UDP-Gal-Tr|UGALT|UGAT|UGT|UGT1|UGT2|UGTL solute carrier family 35 member A2 protein-coding 201.333-31 chr10 69363195 69363500 + 1 NA intron (NM_033496, intron 3 of 17) L3b|LINE|CR1 44500 NM_000188 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 146.333-100 chr15 33781344 33781586 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 65 of 102) intron (NM_001243996, intron 65 of 102) -187032 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 239.667-57 chr5 3370625 3370999 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -82004 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 181.333-111 chr4 31728796 31728999 + 1 NA Intergenic Intergenic 222353 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 274.333-35 chr18 12807610 12808041 + 1 NA intron (NM_080423, intron 7 of 8) L1MA6|LINE|L1 33137 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 153.667-130 chr14 100971335 100971600 + 1 NA promoter-TSS (NR_003207) promoter-TSS (NR_003207) -636 NR_003207 767592 NR_003207 ENSG00000199593 SNORD114-14 14q(II-14) small nucleolar RNA, C/D box 114-14 snoRNA 142.333-87 chr14 72345964 72346123 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -170777 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 183.333-125 chr5 28573235 28573489 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -285697 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 203.667-133 chr9 28480022 28480318 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 239135 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 122.667-13 chr10 21909193 21909411 + 1 NA intron (NM_022365, intron 6 of 11) intron (NM_022365, intron 6 of 11) 94428 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 148.333-18 chr1 101709493 101709699 + 1 NA Intergenic Intergenic 137484 NM_001288821 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 147.667-358 chr8 82480229 82480498 + 1 NA Intergenic Intergenic -431741 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 124.667-192 chr7 92069487 92069635 + 1 NA intron (NM_147185, intron 26 of 49) intron (NM_147185, intron 26 of 49) 64916 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 169.667-96 chr18 40493815 40494064 + 1 NA Intergenic Intergenic 427653 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 139.333-85 chr16 86041244 86041393 + 1 NA Intergenic Intergenic 122971 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 171.333-200 chr8 125891907 125892086 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 59201 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 169.667-97 chr18 57032882 57033074 + 1 NA Intergenic Intergenic 39141 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 244.333-57 chr2 47833290 47833634 + 1 NA intron (NM_025133, intron 7 of 22) intron (NM_025133, intron 7 of 22) 49507 NM_001281494 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 130.667-84 chr17 2718193 2718407 + 1 NA Intergenic Intergenic 5991 NR_136412 105371592 Hs.731739 NR_136412 ENSG00000262050 LOC105371592 - uncharacterized LOC105371592 ncRNA 220.667-54 chr2 180028745 180028984 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -21567 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 154.333-237 chr4 34914255 34914436 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -644598 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 262.667-33 chr18 71323919 71324376 + 1 NA Intergenic Intergenic 254809 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 179.667-156 chrX 44867937 44868127 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5143 NM_001291415 7403 Hs.522616 NM_021140 ENSG00000147050 KDM6A KABUK2|UTX|bA386N14.2 lysine demethylase 6A protein-coding 164.667-251 chr8 140474732 140474996 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -16285 NM_031466 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 121.667-16 chr1 191174937 191175132 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 53464 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 222.333-68 chr4 175098647 175099062 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 180496 NM_001278127 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 294.333-44 chr7 158213917 158214284 + 1 NA intron (NM_001308267, intron 2 of 21) intron (NM_001308267, intron 2 of 21) 318713 NR_030325 693180 NR_030325 ENSG00000207637 MIR595 MIRN595|hsa-mir-595 microRNA 595 ncRNA 154.667-101 chr14 26093160 26093387 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 460157 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 169.667-183 chr6 81183965 81184285 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 568556 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 171.667-90 chr2 206762422 206762741 + 1 NA intron (NR_104261, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 2747 NM_001039845 130752 Hs.147816 NM_206892 ENSG00000138400 MDH1B RP11-95H11 malate dehydrogenase 1B protein-coding 163.333-102 chr15 83802630 83802849 + 1 NA intron (NM_207517, intron 4 of 29) L1ME1|LINE|L1 148616 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 231.667-7 chr11 116735251 116735511 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 37606 NM_032725 84811 Hs.437341 NM_032725 ENSG00000137656 BUD13 Cwc26|fSAP71 BUD13 homolog protein-coding 161.333-283 chr8 78097758 78098045 + 1 NA Intergenic Intergenic -418439 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 163.667-170 chr4 20486201 20486430 + 1 NA intron (NM_001289135, intron 7 of 35) intron (NM_001289135, intron 7 of 35) -41960 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 146.667-55 chr11 47678586 47678866 + 1 NA intron (NM_024783, intron 13 of 18).2 intron (NM_024783, intron 13 of 18).2 -36072 NM_001317232 23788 Hs.269944 NM_014342 ENSG00000109919 MTCH2 HSPC032|MIMP|SLC25A50 mitochondrial carrier 2 protein-coding 148.333-198 chr2 129096789 129097005 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 176994 NR_122042 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 144.333-96 chr17 61006488 61006670 + 1 NA intron (NM_001353144, intron 16 of 25) intron (NM_001353144, intron 16 of 25) 328728 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 240.667-15 chr11 18556177 18556510 + 1 NA intron (NM_001040697, intron 7 of 11) intron (NM_001040697, intron 7 of 11) 23175 NM_001261385 55293 Hs.407991 NM_018314 ENSG00000151116 UEVLD ATTP|UEV3 UEV and lactate/malate dehyrogenase domains protein-coding 210.667-134 chr9 77788129 77788384 + 1 NA intron (NM_002072, intron 5 of 6) L1ME3C|LINE|L1 -139934 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 189.667-32 chr12 14971680 14972012 + 1 NA Intergenic Intergenic -1196 NM_006205 5149 Hs.54471 NM_006205 ENSG00000139053 PDE6H ACHM6|RCD3 phosphodiesterase 6H protein-coding 185.333-44 chr14 34965910 34966230 + 1 NA intron (NR_151701, intron 2 of 4) intron (NR_151701, intron 2 of 4) 16496 NR_151701 100506157 NR_151701 SRP54-AS1 - SRP54 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 240.333-84 chr7 52786406 52786780 + 1 NA Intergenic Intergenic -249040 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 147.667-154 chr18 64224401 64224574 + 1 NA intron (NR_033983, intron 2 of 2) L1MEc|LINE|L1 35568 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 161.667-170 chr3 95490995 95491248 + 1 NA Intergenic Intergenic 192072 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 216.667-107 chr8 121403776 121404111 + 1 NA Intergenic Intergenic -235403 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 140.667-204 chr6 159996395 159996655 + 1 NA intron (NM_000876, intron 2 of 47) L1PA17|LINE|L1 11139 NR_047511 100271873 Hs.742166 NR_047511 ENSG00000268257 AIRN AIR|IGF2R-AS|IGF2R-AS1|IGF2RAS|NCRNA00088 antisense of IGF2R non-protein coding RNA ncRNA 157.333-319 chr7 41651916 41652148 + 1 NA Intergenic Intergenic -41887 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 150.333-4 chr1 55388921 55389092 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 163365 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 158.667-137 chr18 52129221 52129419 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -210877 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 158.667-311 chr7 112199430 112199589 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 6890 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 151.333-77 chr11 45245323 45245563 + 1 NA intron (NM_020826, intron 5 of 5) intron (NM_020826, intron 5 of 5) 40898 NM_020826 57586 Hs.436643 NM_020826 ENSG00000019505 SYT13 - synaptotagmin 13 protein-coding 176.333-115 chr3 188653890 188654232 + 1 NA intron (NM_005578, intron 6 of 10) intron (NM_005578, intron 6 of 10) -34720 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 192.333-10 chr1 158344191 158344440 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -9381 NM_001185114 913 Hs.249217 NM_030893 ENSG00000158488 CD1E CD1A|R2 CD1e molecule protein-coding 121.667-126 chr3 71057465 71057643 + 1 NA intron (NR_146142, intron 7 of 19) intron (NR_146142, intron 7 of 19) 7370 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 147.333-54 chr10 122468141 122468421 + 1 NA intron (NM_002775, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 6728 NM_002775 5654 Hs.501280 NM_002775 ENSG00000166033 HTRA1 ARMD7|CADASIL2|CARASIL|HtrA|L56|ORF480|PRSS11 HtrA serine peptidase 1 protein-coding 180.667-137 chr7 81605234 81605514 + 1 NA intron (NR_126025, intron 4 of 10) intron (NR_126025, intron 4 of 10) 20842 NR_126026 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 158.333-61 chr12 14515266 14515452 + 1 NA intron (NM_024829, intron 6 of 10) intron (NM_024829, intron 6 of 10) -52373 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 243.333-35 chr15 63235528 63235790 + 1 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) L1ME3C|LINE|L1 -41891 NM_001145646 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 178.667-48 chr14 39493305 39493578 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -60941 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 150.667-386 chr8 125206071 125206289 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 114320 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 222.667-6 chr1 200466555 200466938 + 1 NA Intergenic Intergenic -56710 NM_001281294 23528 Hs.59757 NM_012482 ENSG00000162702 ZNF281 ZBP-99|ZNP-99 zinc finger protein 281 protein-coding 263.333-36 chr18 12843488 12843891 + 1 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) intron (NM_080423, intron 2 of 8) -2727 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 143.667-68 chr14 25243932 25244090 + 1 NA Intergenic Intergenic -193714 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 233.667-27 chr17 35056955 35057336 + 1 NA intron (NR_037713, intron 1 of 6) AluSq|SINE|Alu 6562 NM_001017368 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 133.333-31 chr11 35922720 35922911 + 1 NA Intergenic Intergenic -21166 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 148.333-385 chr8 89171678 89171895 + 1 NA Intergenic Intergenic 585925 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 212.333-131 chr6 156183440 156183863 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -195099 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 160.333-134 chr18 63718824 63718989 + 1 NA intron (NM_001370475, intron 5 of 7) MER117|DNA|hAT-Charlie 15946 NM_001291279 89778 Hs.350958 NM_080475 ENSG00000206072 SERPINB11 EPIPIN|SERPIN11 serpin family B member 11 (gene/pseudogene) protein-coding 138.667-127 chr3 27012962 27013122 + 1 NA Intergenic Intergenic 203481 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 196.333-174 chr9 100114425 100114797 + 1 NA intron (NR_134606, intron 2 of 16) AluJb|SINE|Alu 15368 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 272.667-43 chr3 161721076 161721413 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 224436 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 256.333-14 chr10 64275126 64275472 + 1 NA Intergenic Intergenic -550229 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 190.333-156 chrX 70241574 70241780 + 1 NA Intergenic Intergenic 7022 NM_001013579 158833 Hs.407641 NM_001013579 ENSG00000204195 AWAT1 DGA2|DGAT2L3 acyl-CoA wax alcohol acyltransferase 1 protein-coding 152.333-384 chr8 110553657 110553932 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 473639 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 227.333-120 chr7 117160341 117160644 + 1 NA intron (NR_161419, intron 8 of 15) MIRb|SINE|MIR -14900 NR_109981 93654 Hs.628891 NR_002331 ENSG00000226367 ST7-AS2 ST7AS2|ST7OT2 ST7 antisense RNA 2 ncRNA 129.333-25 chr10 91982279 91982490 + 1 NA intron (NM_003972, intron 17 of 37) intron (NM_003972, intron 17 of 37) 58614 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 139.667-27 chr11 59243425 59243577 + 1 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -30574 NM_001039396 219972 Hs.744920 NM_001039396 ENSG00000197629 MPEG1 MPG1|MPS1|Mpg-1|P-2 macrophage expressed 1 protein-coding 178.667-75 chr2 42188788 42189115 + 1 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) intron (NM_001145076, intron 1 of 21) -18720 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 143.333-246 chr6 90379841 90380080 + 1 NA Intergenic Intergenic 67218 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 152.333-148 chr17 60496444 60496598 + 1 NA intron (NM_001282476, intron 1 of 11) intron (NM_001282476, intron 1 of 11) 29719 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 149.333-114 chr14 63021625 63021807 + 1 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 23742 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 148.667-292 chr4 109867001 109867211 + 1 NA intron (NM_198506, intron 2 of 3) intron (NM_198506, intron 2 of 3) 18999 NM_198506 345193 Hs.308127 NM_198506 ENSG00000183423 LRIT3 CSNB1F|FIGLER4 leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 3 protein-coding 178.333-84 chr2 150965574 150965976 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 296088 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 196.667-14 chr10 57961585 57961850 + 1 NA Intergenic Intergenic 306177 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 188.667-71 chr2 57115936 57116206 + 1 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -791580 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 148.333-162 chr17 59617178 59617367 + 1 NA Intergenic Intergenic -2417 NM_001288653 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 162.333-239 chr7 96177119 96177391 + 1 NA intron (NM_001160210, intron 11 of 17) intron (NM_001160210, intron 11 of 17) 42501 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 135.667-44 chr13 33041068 33041288 + 1 NA intron (NM_004795, intron 1 of 4) L1ME2|LINE|L1 24755 NM_004795 9365 Hs.524953 NM_004795 ENSG00000133116 KL HFTC3 klotho protein-coding 276.667-15 chr12 30955818 30956353 + 1 NA intron (NM_001370302, intron 2 of 7) intron (NM_001370302, intron 2 of 7) 29181 NM_001080509 441631 Hs.505141 NM_001080509 ENSG00000110900 TSPAN11 VSSW1971 tetraspanin 11 protein-coding 148.333-36 chr10 9143522 9143691 + 1 NA Intergenic Intergenic -132007 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 153.667-13 chr1 71825978 71826191 + 1 NA intron (NR_046218, intron 1 of 2) intron (NR_046218, intron 1 of 2) 10928 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 216.333-4 chr1 54126557 54126910 + 1 NA Intergenic Intergenic 26448 NM_001353655 200008 NM_201546 ENSG00000157211 CDCP2 - CUB domain containing protein 2 protein-coding 145.333-164 chr21 15660323 15660507 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -69519 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 151.333-304 chr4 52586058 52586238 + 1 NA Intergenic Intergenic 70391 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 144.667-237 chr5 56576569 56576830 + 1 NA intron (NR_161255, intron 1 of 5) L1ME3|LINE|L1 29557 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 137.333-183 chr7 79701254 79701478 + 1 NA Intergenic Intergenic 247406 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 142.667-19 chr10 49834266 49834466 + 1 NA intron (NM_001303486, intron 15 of 17) intron (NM_001303486, intron 15 of 17) -71987 NM_001347826 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 147.667-267 chr4 171410544 171410793 + 1 NA Intergenic Intergenic 224484 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 194.333-141 chr7 40447317 40447560 + 1 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) intron (NM_024728, intron 9 of 14) 312462 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 159.667-210 chr3 26777028 26777206 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 82560 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 266.333-49 chr5 123380101 123380516 + 1 NA intron (NM_153223, intron 15 of 20) intron (NM_153223, intron 15 of 20) 43284 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 179.333-158 chr5 112702811 112703105 + 1 NA Intergenic (TTTTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4540 NM_001354895 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 164.333-124 chr2 147257122 147257316 + 1 NA Intergenic Intergenic -587298 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 188.333-96 chr3 84326448 84326772 + 1 NA Intergenic Intergenic 542965 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 199.667-85 chr20 49289166 49289368 + 1 NA TTS (NR_036659) TTS (NR_036659) 8584 NR_003030 692057 NR_003030 ENSG00000212304 SNORD12 HBII-99|MIR1259|MIRN1259 small nucleolar RNA, C/D box 12 snoRNA 152.667-238 chr3 19405674 19405865 + 1 NA intron (NM_144633, intron 7 of 15) MIR3|SINE|MIR -90838 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 191.333-133 chr3 64711229 64711492 + 1 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) FLAM_A|SINE|Alu -23360 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 160.333-237 chr5 139441032 139441205 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -1593 NM_152686 202052 Hs.483537 NM_152686 ENSG00000170464 DNAJC18 - DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C18 protein-coding 143.667-73 chr14 50848084 50848352 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -17097 NM_020921 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 188.667-73 chr2 65625395 65625666 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -192931 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 311.333-20 chr15 58144952 58145513 + 1 NA intron (NM_020980, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 6851 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 246.667-89 chr7 146076683 146077102 + 1 NA Intergenic Intergenic -697379 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 210.667-72 chr2 160901092 160901431 + 1 NA Intergenic LTR40A1|LTR|ERVL -235694 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 150.333-282 chr3 174451366 174451694 + 1 NA Intergenic Intergenic -407804 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 224.333-15 chr10 45584538 45584904 + 1 NA intron (NM_145021, intron 1 of 6) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 10185 NM_145021 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 154.333-207 chr3 28154320 28154564 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -87177 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 158.667-65 chr11 87092382 87092673 + 1 NA intron (NM_001168724, intron 4 of 13) intron (NM_001168724, intron 4 of 13) 54593 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 168.333-171 chr5 180559192 180559390 + 1 NA intron (NM_001370474, intron 3 of 10) L1MDa|LINE|L1 17637 NM_001370474 57472 Hs.608380 NM_015455 ENSG00000113300 CNOT6 CCR4|Ccr4a CCR4-NOT transcription complex subunit 6 protein-coding 167.333-30 chr1 204396733 204397022 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 14940 NM_032833 84919 Hs.304376 NM_032833 ENSG00000158615 PPP1R15B CREP|MSSGM2 protein phosphatase 1 regulatory subunit 15B protein-coding 153.667-331 chr5 167047954 167048133 + 1 NA Intergenic Intergenic -25199 NM_001122679 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 151.667-309 chr6 53120927 53121213 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 27771 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 145.667-251 chr6 72846820 72847050 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 120818 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 209.333-135 chr21 20975602 20975959 + 1 NA Intergenic Intergenic -22629 NM_001352592 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 259.667-94 chrX 155111246 155111556 + 1 NA intron (NM_024332, intron 8 of 11) L1MDb|LINE|L1 39981 NM_024332 79184 Hs.558537 NM_024332 ENSG00000185515 BRCC3 BRCC36|C6.1A|CXorf53 BRCA1/BRCA2-containing complex subunit 3 protein-coding 141.667-178 chr5 51612610 51612791 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 229252 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 174.333-17 chr10 116504339 116504707 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -41408 NM_000936 5406 Hs.501135 NM_000936 ENSG00000175535 PNLIP PL|PNLIPD|PTL pancreatic lipase protein-coding 204.667-143 chr7 104155689 104155922 + 1 NA intron (NM_002553, intron 12 of 13) intron (NM_002553, intron 12 of 13) 52208 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 234.333-53 chr4 42020392 42020856 + 1 NA intron (NM_006345, intron 4 of 17) intron (NM_006345, intron 4 of 17) 30094 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 151.667-143 chr17 51301255 51301452 + 1 NA Intergenic Intergenic 33809 NR_110751 101927274 Hs.591168 NR_110751 ENSG00000249383 LINC02071 - long intergenic non-protein coding RNA 2071 ncRNA 129.333-69 chr15 60281688 60281882 + 1 NA Intergenic Intergenic 116201 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 135.333-77 chr2 8810190 8810352 + 1 NA intron (NM_001348732, intron 6 of 28) intron (NM_001348732, intron 6 of 28) 27342 NM_001348742 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 127.667-17 chr10 69193756 69193969 + 1 NA intron (NM_001323588, intron 6 of 13) intron (NM_001323588, intron 6 of 13) 13628 NM_003171 6832 Hs.106469 NM_003171 ENSG00000156502 SUPV3L1 SUV3 Suv3 like RNA helicase protein-coding 210.333-136 chr5 68857414 68857840 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 172300 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 149.667-416 chr8 135747087 135747377 + 1 NA Intergenic Intergenic 289776 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 129.667-140 chr5 86830881 86831043 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 84144 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 287.333-63 chr7 111307636 111308226 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 216804 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 161.667-124 chr2 48903912 48904073 + 1 NA Intergenic Intergenic -148268 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 149.333-345 chr6 117189219 117189415 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -76241 NM_182645 245806 Hs.99324 NM_153453 ENSG00000170162 VGLL2 VGL2|VITO1 vestigial like family member 2 protein-coding 358.667-11 chr14 63789311 63789769 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -61475 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 255.667-30 chr16 28963404 28963898 + 1 NA intron (NM_032815, intron 7 of 7) intron (NM_032815, intron 7 of 7) 5068 NR_039742 100616487 NR_039742 ENSG00000284541 MIR4517 mir-4517 microRNA 4517 ncRNA 153.667-262 chr3 114733091 114733303 + 1 NA intron (NM_001348801, intron 4 of 11) intron (NM_001348801, intron 4 of 11) 10328 NR_039959 100616166 NR_039959 ENSG00000264623 MIR4796 mir-4796 microRNA 4796 ncRNA 148.667-116 chr14 55267874 55268130 + 1 NA Intergenic Intergenic -3419 NM_017943 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 147.333-79 chr12 26633607 26633783 + 1 NA intron (NM_002223, intron 21 of 56) intron (NM_002223, intron 21 of 56) 199499 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 152.333-226 chr3 18263616 18263801 + 1 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) L1MC5|LINE|L1 161631 NM_002971 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 161.667-249 chr8 82861594 82861791 + 1 NA Intergenic Intergenic -50412 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 174.667-44 chr14 21488812 21489091 + 1 NA intron (NM_001303523, intron 3 of 7) intron (NM_001303523, intron 3 of 7) 11756 NM_014828 9878 Hs.555910 NM_014828 ENSG00000092203 TOX4 C14orf92|KIAA0737|LCP1|MIG7 TOX high mobility group box family member 4 protein-coding 148.333-325 chr5 111982768 111983011 + 1 NA intron (NR_046678, intron 3 of 3) intron (NR_046678, intron 3 of 3) -5957 NM_001142474 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 282.667-35 chr5 4504996 4505332 + 1 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -268317 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 158.667-269 chr5 66734576 66734802 + 1 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) MER3|DNA|hAT-Charlie -94084 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 160.667-221 chr4 40666022 40666274 + 1 NA Intergenic Intergenic -35554 NM_001371114 154.333-222 chr3 107871984 107872262 + 1 NA intron (NR_024276, intron 3 of 7) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 5945 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 261.667-76 chr9 32308608 32309011 + 1 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -75794 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 151.333-449 chr9 108898557 108898821 + 1 NA exon (NM_003640, exon 21 of 37) exon (NM_003640, exon 21 of 37) 35435 NM_003640 8518 Hs.494738 NM_003640 ENSG00000070061 ELP1 DYS|FD|IKAP|IKBKAP|IKI3|TOT1 elongator complex protein 1 protein-coding 157.333-237 chr3 100005314 100005531 + 1 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -41024 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 190.667-103 chr5 92469596 92469917 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -1086439 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 169.333-149 chr21 33705574 33705780 + 1 NA intron (NM_001001132, intron 1 of 29) AluY|SINE|Alu 63176 NM_001331011 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 153.667-94 chr12 78222373 78222626 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 137247 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 211.333-112 chr2 61985551 61985884 + 1 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) L1MA2|LINE|L1 80075 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 146.333-57 chr11 123880087 123880242 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 5506 NM_001363605 338661 Hs.98377 NM_001013743 ENSG00000204300 TMEM225 PMP22CD|PPP1R154|SPATA47 transmembrane protein 225 protein-coding 126.667-89 chr2 190939663 190939868 + 1 NA intron (NM_014905, intron 14 of 17) intron (NM_014905, intron 14 of 17) 58944 NM_014905 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 155.667-334 chr7 82727960 82728207 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -284127 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 155.333-125 chr16 21977601 21977825 + 1 NA intron (NM_003366, intron 12 of 13) intron (NM_003366, intron 12 of 13) 23403 NM_001363519 255762 Hs.98244 NM_173806 ENSG00000155714 PDZD9 C16orf65 PDZ domain containing 9 protein-coding 240.333-29 chr12 77453849 77454350 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -376795 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 157.667-68 chr12 9001337 9001519 + 1 NA intron (NM_005810, intron 3 of 4) LTR42|LTR|ERVL 11803 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 112.333-75 chr14 54145130 54145350 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -188349 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 158.667-281 chr6 34033789 34033963 + 1 NA intron (NM_000841, intron 9 of 10) AluSz|SINE|Alu -33825 NR_031681 100302123 NR_031681 ENSG00000221697 MIR1275 MIRN1275|hsa-mir-1275|mir-1275 microRNA 1275 ncRNA 154.667-89 chr12 122091682 122091864 + 1 NA intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 MER102c|DNA|hAT-Charlie 13017 NM_014938 22877 Hs.437153 NM_014938 ENSG00000175727 MLXIP MIR|MONDOA|bHLHe36 MLX interacting protein protein-coding 190.333-65 chr2 5417960 5418185 + 1 NA Intergenic MLT-int|LTR|ERVL-MaLR 273046 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 156.333-258 chr4 8390238 8390470 + 1 NA intron (NM_003501, intron 11 of 17) AluJr|SINE|Alu 50369 NM_003501 8310 Hs.479122 NM_003501 ENSG00000087008 ACOX3 - acyl-CoA oxidase 3, pristanoyl protein-coding 210.667-10 chr1 205274415 205274763 + 1 NA Intergenic Intergenic 17392 NM_001331034 9911 Hs.6360 NM_014858 ENSG00000133069 TMCC2 HUCEP11 transmembrane and coiled-coil domain family 2 protein-coding 142.667-42 chr13 27962996 27963219 + 1 NA 3' UTR (NM_001354700, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001354700, exon 3 of 3) 6208 NM_001265 1045 Hs.127383 NM_001265 ENSG00000165556 CDX2 CDX-3|CDX2/AS|CDX3 caudal type homeobox 2 protein-coding 273.333-15 chr12 44191800 44192139 + 1 NA intron (NM_001286213, intron 3 of 6) intron (NM_001286213, intron 3 of 6) 355888 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 319.667 chr10 14661290 14661631 + 1 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) MLT2B1|LTR|ERVL -57059 NM_001282697 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 153.333-237 chr20 14959723 14960033 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -30360 NR_072988 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-134 chr15 73406993 73407289 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -36023 NM_001348772 283677 Hs.743574 NM_001042367 ENSG00000183324 REC114 C15orf60|CT147 REC114 meiotic recombination protein protein-coding 182.667-33 chr12 95397171 95397413 + 1 NA Intergenic Intergenic -76860 NM_001317183 10988 Hs.444986 NM_006838 ENSG00000111142 METAP2 MAP2|MNPEP|p67eIF2 methionyl aminopeptidase 2 protein-coding 148.667-252 chr3 65624609 65624774 + 1 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -269125 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 176.333-137 chr5 87061479 87061808 + 1 NA Intergenic Intergenic 53311 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 325.667-18 chr3 56243132 56243725 + 1 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) intron (NR_132749, intron 3 of 17) 225039 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 191.667-77 chr20 44964616 44964885 + 1 NA non-coding (NR_038341, exon 3 of 3) non-coding (NR_038341, exon 3 of 3) 1708 NR_038341 100505826 Hs.196065 NR_038341 ENSG00000227477 STK4-AS1 - STK4 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 297.667-34 chr7 32262567 32263129 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 36480 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 149.333-206 chr2 187445052 187445318 + 1 NA intron (NM_001369435, intron 1 of 15) intron (NM_001369435, intron 1 of 15) 3067 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 155.333-202 chr20 51879026 51879184 + 1 NA Intergenic Intergenic -16192 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 138.667-36 chr11 94726157 94726365 + 1 NA intron (NR_135096, intron 1 of 6) intron (NR_135096, intron 1 of 6) 14094 NR_135094 105369438 Hs.568921 NR_135093 ENSG00000255929 LOC105369438 - uncharacterized LOC105369438 ncRNA 271.333-56 chr5 3540705 3541295 + 1 NA Intergenic Intergenic -4906 NR_033898 285577 Hs.582442 NR_033898 ENSG00000248118 LINC01019 - long intergenic non-protein coding RNA 1019 ncRNA 278.667-53 chr9 22143445 22143815 + 1 NA Intergenic Intergenic -134317 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 165.667-39 chr12 49380265 49380519 + 1 NA intron (NM_023071, intron 2 of 13) L1MD3|LINE|L1 -8782 NR_033267 100335030 Hs.687044 NR_033267 LOC100335030 - FGFR1 oncogene partner 2 pseudogene pseudo 138.667-138 chr3 136318872 136319104 + 1 NA intron (NM_000532, intron 10 of 14) L1MB4|LINE|L1 68648 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 255.333-117 chr8 126715048 126715395 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -156743 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 168.333-100 chr2 161563953 161564146 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -56147 NR_077058 285116 Hs.470435 NR_077058 AHCTF1P1 AHCTF1P|ELYS-like AT-hook containing transcription factor 1 pseudogene 1 pseudo 196.667-143 chr7 75023748 75023984 + 1 NA intron (NM_001145064, intron 7 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 49936 NM_030798 81554 Hs.529623 NM_030798 ENSG00000274523 RCC1L WBSCR16 RCC1 like protein-coding 147.333-257 chr5 27407008 27407291 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -65143 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 127.667-202 chrX 42689630 42689762 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 88467 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 134.667-15 chr10 22797198 22797463 + 1 NA Intergenic Intergenic -82752 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 137.333-209 chrX 101960297 101960490 + 1 NA Intergenic Intergenic -28366 NM_001282400 84460 Hs.496512 NM_001011657 ENSG00000166432 ZMAT1 - zinc finger matrin-type 1 protein-coding 127.667-56 chr16 80402553 80402766 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) L1MC5|LINE|L1 -138075 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 136.333-99 chr2 135570781 135571006 + 1 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) intron (NM_001282799, intron 1 of 22) -15459 NM_001354199 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 162.333-137 chr20 38581142 38581350 + 1 NA promoter-TSS (NM_001018082) promoter-TSS (NM_001018082) 49 NR_130907 149685 Hs.368028 NM_174906 ENSG00000182035 ADIG SMAF1 adipogenin protein-coding 133.333-151 chr5 129023317 129023501 + 1 NA intron (NM_001017372, intron 5 of 9) intron (NM_001017372, intron 5 of 9) 57921 NM_001017372 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 151.667-376 chr8 121203973 121204226 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -392053 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 133.333-14 chr1 183070255 183070449 + 1 NA intron (NM_002293, intron 1 of 27) intron (NM_002293, intron 1 of 27) 46932 NM_002293 3915 Hs.609663 NM_002293 ENSG00000135862 LAMC1 LAMB2 laminin subunit gamma 1 protein-coding 187.333-94 chr2 58917628 58917888 + 1 NA intron (NR_033873, intron 4 of 13) intron (NR_033873, intron 4 of 13) -299950 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 158.333-69 chr12 76516772 76516978 + 1 NA intron (NM_001003712, intron 1 of 22) AluSz|SINE|Alu 42896 NM_001319652 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 230.667-15 chr13 74410703 74411218 + 1 NA Intergenic Intergenic 8155 NR_144452 100288208 Hs.532467 NM_001013669 ENSG00000177596 LOC100288208 - uncharacterized LOC100288208 ncRNA 202.333-177 chr8 90015080 90015390 + 1 NA intron (NM_001330575, intron 3 of 11) MIR|SINE|MIR 13758 NM_001359 1666 Hs.492212 NM_001359 ENSG00000104325 DECR1 DECR|NADPH|SDR18C1 2,4-dienoyl-CoA reductase 1 protein-coding 158.667-115 chr16 70523697 70523859 + 1 NA promoter-TSS (NM_001195139) promoter-TSS (NM_001195139) -38 NM_012426 23450 Hs.514435 NM_012426 ENSG00000189091 SF3B3 RSE1|SAP130|SF3b130|STAF130 splicing factor 3b subunit 3 protein-coding 239.667-64 chr6 43592048 43592351 + 1 NA intron (NM_006502, intron 4 of 10) intron (NM_006502, intron 4 of 10) 16014 NM_001291970 5429 Hs.655467 NM_006502 ENSG00000170734 POLH RAD30|RAD30A|XP-V|XPV DNA polymerase eta protein-coding 155.667-76 chr12 80514679 80514912 + 1 NA intron (NM_001145026, intron 17 of 44) intron (NM_001145026, intron 17 of 44) 70560 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 297.667-35 chr8 59213253 59213615 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 94224 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 344.333-24 chr7 101907311 101907707 + 1 NA intron (NM_181552, intron 1 of 23) AluSx|SINE|Alu 89883 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 162.667-94 chr16 24178973 24179169 + 1 NA intron (NM_002738, intron 12 of 16) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -24045 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 136.667-140 chr5 22941433 22941604 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -88174 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 263.667-41 chr18 3220798 3221415 + 1 NA promoter-TSS (NM_003803) promoter-TSS (NM_003803) -998 NM_003803 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 144.667-102 chr15 96003026 96003176 + 1 NA Intergenic Intergenic 124740 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 123.667-34 chr10 86526476 86526700 + 1 NA Intergenic Intergenic -4796 NM_015045 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 370.667-7 chr11 5047197 5047839 + 1 NA TTS (NM_001001916) TTS (NM_001001916) 992 NM_001001916 119679 Hs.553558 NM_001001916 ENSG00000205495 OR52J3 OR11-32 olfactory receptor family 52 subfamily J member 3 protein-coding 164.667-23 chr10 43772367 43772628 + 1 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 6328 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 200.333-28 chr12 28402067 28402507 + 1 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) L1MCa|LINE|L1 -211549 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 128.333-152 chr5 45162281 45162537 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 353462 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 172.333-6 chr1 182206495 182206766 + 1 NA intron (NR_104175, intron 2 of 2) intron (NR_104175, intron 2 of 2) 107431 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 184.667-94 chr5 7426079 7426429 + 1 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) intron (NM_020546, intron 2 of 24) 30116 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 247.667-53 chr2 139262063 139262443 + 1 NA Intergenic Intergenic 364929 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 207.333-234 chr6 12172184 12172645 + 1 NA Intergenic Intergenic -117947 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 149.667-123 chr14 72056765 72056938 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 123324 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 246.667-14 chr10 122857699 122858088 + 1 NA intron (NM_152644, intron 1 of 3) intron (NM_152644, intron 1 of 3) -12036 NR_037912 50624 Hs.647182 NM_022034 ENSG00000138161 CUZD1 ERG-1|ERG1|ITMAP1|UO-44 CUB and zona pellucida like domains 1 protein-coding 163.667-117 chr2 157312292 157312464 + 1 NA 3' UTR (NM_014568, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_014568, exon 10 of 10) 13446 NM_020711 57471 Hs.443894 NM_020711 ENSG00000136541 ERMN JN|KIAA1189 ermin protein-coding 219.667-37 chr18 70476072 70476382 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -91636 NR_110764 101060542 Hs.586967 NR_110764 ENSG00000266278 LINC01910 - long intergenic non-protein coding RNA 1910 ncRNA 203.333-114 chr18 12115067 12115448 + 1 NA intron (NM_001277333, intron 9 of 13) intron (NM_001277333, intron 9 of 13) 21414 NM_001277333 342850 Hs.448906 NM_001277333 ENSG00000181626 ANKRD62 DKFZp779B1634 ankyrin repeat domain 62 protein-coding 158.667-313 chr7 131995111 131995288 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 84979 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 405.333-12 chr8 120605733 120606226 + 1 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) MER91A|DNA|hAT-Tip100 -155274 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 292.333-20 chr19 30166425 30166945 + 1 NA Intergenic Intergenic -205699 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 178.333-27 chr11 95612741 95613009 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 176907 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 302.333-20 chr20 15487439 15487862 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 7 of 17) intron (NM_001351663, intron 7 of 17) 290810 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 231.667-22 chr16 86514413 86514858 + 1 NA 3' UTR (NM_001451, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001451, exon 2 of 2) 4108 NM_001451 2294 Hs.155591 NM_001451 ENSG00000103241 FOXF1 ACDMPV|FKHL5|FREAC1 forkhead box F1 protein-coding 153.333-125 chr14 67636569 67636725 + 1 NA intron (NM_001172, intron 2 of 7) intron (NM_001172, intron 2 of 7) 16727 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 173.333-106 chr21 10753284 10753601 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 231928 NM_199260 7179 Hs.122986 NM_199259 ENSG00000274391 TPTE CT44|PTEN2 transmembrane phosphatase with tensin homology protein-coding 166.667-52 chr12 123605736 123606015 + 1 NA intron (NR_135104, intron 1 of 13) intron (NR_135104, intron 1 of 13) 3776 NM_020936 57696 Hs.286173 NM_020936 ENSG00000111364 DDX55 - DEAD-box helicase 55 protein-coding 151.333-48 chr10 36216868 36217050 + 1 NA Intergenic Intergenic 438657 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 177.667-32 chr12 7452734 7453061 + 1 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -8712 NM_001297650 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 217.667-81 chr7 89739266 89739765 + 1 NA Intergenic Intergenic -379885 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 199.333-51 chr12 23764263 23764577 + 1 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) -179834 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 156.667-366 chrX 136831105 136831315 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 48061 NR_002735 26787 NR_002735 ENSG00000206979 SNORD61 HBII-342|RNU61|U61 small nucleolar RNA, C/D box 61 snoRNA 134.333-170 chr8 59198237 59198480 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 79148 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 114.667-63 chr12 59737952 59738096 + 1 NA intron (NR_073056, intron 3 of 6) intron (NR_073056, intron 3 of 6) 48654 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 227.667-74 chr7 94168355 94168641 + 1 NA Intergenic Intergenic -164143 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 269.667-27 chr18 3205703 3206282 + 1 NA intron (NM_019856, intron 2 of 36) L2b|LINE|L2 13976 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 135.667-86 chr2 36856015 36856221 + 1 NA intron (NM_003162, intron 14 of 17) L1ME2|LINE|L1 110418 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 309.667-6 chr12 14100344 14100963 + 1 NA Intergenic Intergenic -120297 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 148.333-355 chr7 9247223 9247382 + 1 NA Intergenic Intergenic -386968 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 167.333-112 chr17 64324843 64325015 + 1 NA intron (NM_000442, intron 15 of 15) MER41B|LTR|ERV1 -61669 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 269.667-4 chr10 43876426 43876799 + 1 NA intron (NR_038268, intron 4 of 4) intron (NR_038268, intron 4 of 4) 17201 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 160.667-183 chr22 25668162 25668383 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 5 of 19) intron (NM_001362778, intron 5 of 19) -73916 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 200.333-131 chr6 25302173 25302517 + 1 NA intron (NM_001173977, intron 2 of 36) UCON105|Unknown|Unknown 22971 NM_001173977 55604 Hs.649550 NM_017640 ENSG00000079691 CARMIL1 CARMIL|CARMIL1a|LRRC16|LRRC16A|dJ501N12.1|dJ501N12.5 capping protein regulator and myosin 1 linker 1 protein-coding 154.333-16 chr1 108803156 108803378 + 1 NA intron (NM_007269, intron 17 of 18) L1MEd|LINE|L1 53827 NM_152763 254268 Hs.729441 NM_152763 ENSG00000162641 AKNAD1 C1orf62 AKNA domain containing 1 protein-coding 234.667-11 chr10 66298412 66298770 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -627445 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 129.667-122 chr3 99400084 99400339 + 1 NA Intergenic Intergenic -238383 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 164.667-89 chr17 56333910 56334123 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 4 of 20) intron (NM_001370326, intron 4 of 20) 180541 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 166.333-179 chr5 20265897 20266075 + 1 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) MLT2B1|LTR|ERVL -39565 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 116.667-145 chr4 60651162 60651297 + 1 NA Intergenic Intergenic -271390 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 112.333-92 chr17 51513057 51513287 + 1 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 77745 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 240.667-17 chr11 42303283 42303840 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -49871 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 129.667-153 chr6 104039907 104040071 + 1 NA Intergenic Intergenic 819557 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 207.333-124 chr18 38318036 38318347 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 661056 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 158.667-349 chr9 38267969 38268247 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -124594 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 159.333-349 chr9 28628438 28628730 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 90721 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 130.667-67 chr14 56918359 56918540 + 1 NA intron (NR_029385, intron 3 of 3) intron (NR_029385, intron 3 of 3) 105291 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 126.667-96 chr21 16615941 16616133 + 1 NA intron (NR_136541, intron 7 of 9) intron (NR_136541, intron 7 of 9) 25800 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 265.667-19 chr14 46083885 46084386 + 1 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1ME2|LINE|L1 19976 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 152.333-308 chr5 105981248 105981431 + 1 NA Intergenic Intergenic 881865 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 131.667-33 chr11 63722196 63722435 + 1 NA intron (NM_001265589, intron 3 of 8) intron (NM_001265589, intron 3 of 8) 40815 NM_001265591 10313 Hs.743229 NM_006054 ENSG00000133318 RTN3 ASYIP|HAP|NSPL2|NSPLII|RTN3-A1 reticulon 3 protein-coding 157.333-272 chr4 178981396 178981653 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1073588 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 144.667-21 chr1 189857222 189857466 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 618666 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 304.333-29 chr6 69155047 69155573 + 1 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) intron (NM_001704, intron 17 of 31) 520028 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 151.667-51 chr10 69126126 69126420 + 1 NA intron (NM_001035260, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu 2095 NM_001318945 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 201.667-78 chr3 107423816 107424116 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -6964 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 206.667-66 chr2 153108591 153108860 + 1 NA Intergenic Intergenic 370037 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 202.333-147 chr5 101456459 101456957 + 1 NA Intergenic Intergenic -553426 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 239.333-17 chr10 90430823 90431218 + 1 NA intron (NR_110657, intron 3 of 6) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 109785 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 272.667-31 chr2 78582189 78582539 + 1 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie 36833 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 137.333-44 chr14 65437935 65438131 + 1 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) intron (NR_038170, intron 1 of 10) 25303 NR_038170 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 173.333-88 chr2 17129596 17129772 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 388756 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 193.667-2 chr1 27742769 27743112 + 1 NA intron (NM_001143914, intron 4 of 7) AluSx3|SINE|Alu 16979 NM_001143914 199870 Hs.469359 NM_152660 ENSG00000009780 FAM76A - family with sequence similarity 76 member A protein-coding 140.333-242 chr8 133753439 133753660 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 23803 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 206.333-100 chr20 54252457 54252688 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 44485 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 208.667-101 chr4 72487927 72488357 + 1 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 81079 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 235.333-98 chr5 87927579 87927885 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 265690 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 135.667-101 chr2 145246030 145246224 + 1 NA Intergenic Intergenic 578160 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 213.333-205 chr8 42249402 42249753 + 1 NA Intergenic Intergenic 21384 NR_125823 101929897 Hs.60288 NR_125823 ENSG00000253408 LOC101929897 - uncharacterized LOC101929897 ncRNA 241.667-70 chr5 23156474 23156902 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -303344 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 248.667-78 chr3 141125198 141125497 + 1 NA intron (NM_080862, intron 2 of 2) intron (NM_080862, intron 2 of 2) 74000 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 222.667-8 chr1 229813675 229814003 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 71979 NR_146476 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 167.333-160 chr21 29121188 29121465 + 1 NA promoter-TSS (NM_001371370) promoter-TSS (NM_001371370) -664 NM_001371376 158.333-153 chr2 112122096 112122409 + 1 NA Intergenic Intergenic -16133 NM_153214 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 196.333-156 chr6 122728636 122728930 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -20418 NM_001319042 2173 Hs.26770 NM_001446 ENSG00000164434 FABP7 B-FABP|BLBP|FABPB|MRG fatty acid binding protein 7 protein-coding 160.667-268 chr6 120702429 120702676 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 631928 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 127.333-111 chr3 96922325 96922580 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) L1MC5|LINE|L1 107858 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 165.667-151 chr5 2119322 2119510 + 1 NA Intergenic Intergenic 192785 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 193.333-25 chr10 94201883 94202259 + 1 NA intron (NM_001165979, intron 3 of 31) intron (NM_001165979, intron 3 of 31) 84999 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 234.667-118 chr9 97717266 97717545 + 1 NA intron (NR_147055, intron 8 of 10) intron (NR_147055, intron 8 of 10) -19996 NR_149091 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 154.667-387 chr8 89529171 89529371 + 1 NA Intergenic Intergenic 228440 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 159.667-333 chr8 132157249 132157579 + 1 NA intron (NM_001204824, intron 9 of 14) intron (NM_001204824, intron 9 of 14) -52149 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 154.333-8 chr1 86033779 86033977 + 1 NA non-coding (NR_146343, exon 13 of 60) non-coding (NR_146343, exon 13 of 60) 122593 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 156.333-106 chr14 46038450 46038654 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -25607 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 157.333-339 chr8 97498976 97499170 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -52576 NR_125390 101927066 Hs.732112 NR_125390 LOC101927066 - uncharacterized LOC101927066 ncRNA 175.333-123 chr3 111763180 111763504 + 1 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR 30846 NM_001134437 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 116.333-49 chr12 11840717 11840892 + 1 NA intron (NM_001987, intron 3 of 7) intron (NM_001987, intron 3 of 7) 190950 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 170.667-113 chr3 106179474 106179692 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -310182 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 141.667-144 chr3 69551067 69551287 + 1 NA Intergenic Intergenic -165089 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 185.667-39 chr16 5500684 5500894 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 115461 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 225.333-112 chr5 107915962 107916321 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) intron (NM_001163315, intron 7 of 8) -245204 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 186.667-61 chr2 18335132 18335481 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 225347 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 148.333-262 chr3 154366054 154366248 + 1 NA intron (NM_001038705, intron 3 of 3) MER4D|LTR|ERV1 -41654 NM_001114397 170506 Hs.446270 NM_020865 ENSG00000174953 DHX36 DDX36|G4R1|MLEL1|RHAU DEAH-box helicase 36 protein-coding 226.333-60 chr2 100683761 100684099 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 80191 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 217.667-51 chr20 48441840 48442155 + 1 NA Intergenic Intergenic 82086 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 151.333-72 chr11 14991736 14991992 + 1 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -19513 NR_125898 796 Hs.37058 NM_001741 ENSG00000110680 CALCA CALC1|CGRP|CGRP-I|CGRP1|CT|KC|PCT calcitonin related polypeptide alpha protein-coding 158.667-334 chr8 130202017 130202175 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) intron (NM_001362925, intron 5 of 29) 94437 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 193.333-103 chr2 168337482 168337905 + 1 NA Intergenic Intergenic -90098 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 121.667-97 chr2 160490789 160491033 + 1 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 2896 NM_016836 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 138.667-57 chr14 43319943 43320081 + 1 NA Intergenic Intergenic 1187271 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 165.667-144 chr4 79467994 79468166 + 1 NA Intergenic (CTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -24513 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 145.333-59 chr11 112061290 112061533 + 1 NA intron (NM_001931, intron 13 of 13) MER2B|DNA|TcMar-Tigger 12760 NM_138789 120379 Hs.420662 NM_138789 ENSG00000150773 PIH1D2 - PIH1 domain containing 2 protein-coding 209.667-111 chr8 82307441 82307682 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -465275 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 134.333-89 chr2 135133910 135134080 + 1 NA exon (NM_012233, exon 15 of 24) exon (NM_012233, exon 15 of 24) -2633 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 218.333-56 chr18 56734901 56735148 + 1 NA intron (NM_015285, intron 14 of 27) intron (NM_015285, intron 14 of 27) 83639 NM_015285 23335 Hs.465213 NM_015285 ENSG00000091157 WDR7 TRAG WD repeat domain 7 protein-coding 166.667-81 chr16 83610358 83610545 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 7 of 12) L1ME3A|LINE|L1 102105 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 217.333-115 chr5 22025305 22025742 + 1 NA intron (NM_004061, intron 5 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -116829 NR_003921 5369 Hs.247975 NM_031887 ENSG00000168967 PMCHL1 - pro-melanin concentrating hormone like 1 (pseudogene) pseudo 169.333-21 chr10 35082087 35082368 + 1 NA intron (NM_001198777, intron 1 of 20) AluJb|SINE|Alu -2547 NR_037405 100500890 NR_037405 ENSG00000266228 MIR3611 - microRNA 3611 ncRNA 167.333-195 chr4 105357521 105357821 + 1 NA Intergenic Intergenic -4790 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 195.333-189 chr6 35374791 35375091 + 1 NA intron (NM_001171819, intron 2 of 6) L2c|LINE|L2 32383 NM_006238 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 131.333-23 chr10 19962161 19962304 + 1 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) Charlie11|DNA|hAT-Charlie 145800 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 202.667-57 chr15 54411420 54411711 + 1 NA intron (NM_001329919, intron 17 of 31) L1MD|LINE|L1 398917 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 168.667-194 chr7 11203724 11203956 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 229968 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 240.667-13 chr10 111303385 111303758 + 1 NA Intergenic Intergenic 189280 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 186.667-157 chrX 80106493 80106782 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 83577 NM_001303475 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 257.667-19 chr14 57632132 57632548 + 1 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) intron (NM_001352014, intron 1 of 9) -138483 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 144.333-237 chr6 127218350 127218638 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -48188 NM_001242851 81847 Hs.267120 NM_030963 ENSG00000118518 RNF146 - ring finger protein 146 protein-coding 144.333-228 chr6 25336938 25337181 + 1 NA intron (NM_001173977, intron 2 of 36) intron (NM_001173977, intron 2 of 36) 57685 NM_001173977 55604 Hs.649550 NM_017640 ENSG00000079691 CARMIL1 CARMIL|CARMIL1a|LRRC16|LRRC16A|dJ501N12.1|dJ501N12.5 capping protein regulator and myosin 1 linker 1 protein-coding 219.667-7 chr10 37556336 37556745 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 46391 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 271.333-43 chr22 44515433 44515953 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -17460 NM_032287 84247 Hs.744991 NM_032287 ENSG00000188636 RTL6 LDOC1L|Mar6|Mart6|SIRH3|dJ1033E15.2 retrotransposon Gag like 6 protein-coding 168.333-27 chr10 85484178 85484413 + 1 NA intron (NR_120671, intron 5 of 5) L1P1|LINE|L1 34703 NR_120671 101929684 Hs.554059 NR_120671 ENSG00000230962 LINC01520 - long intergenic non-protein coding RNA 1520 ncRNA 145.667-211 chr5 57203304 57203523 + 1 NA intron (NM_001331037, intron 2 of 12) AluSz6|SINE|Alu -10661 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 226.667-68 chr4 118293789 118294152 + 1 NA intron (NM_003619, intron 11 of 12) L1ME3Cz|LINE|L1 14780 NR_002963 677809 Hs.744742 NR_002963 ENSG00000275994 SNORA24 ACA24|SNORA24A small nucleolar RNA, H/ACA box 24 snoRNA 178.667-152 chr7 44749778 44750080 + 1 NA intron (NM_031449, intron 1 of 18) CR1_Mam|LINE|CR1 1082 NM_031449 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 153.333-274 chr3 114109240 114109507 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 52636 NM_001256836 79691 Hs.477162 NM_024638 ENSG00000151576 QTRT2 QTRTD1 queuine tRNA-ribosyltransferase accessory subunit 2 protein-coding 313.333-2 chr1 188988680 188989096 + 1 NA Intergenic Intergenic 1487122 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 154.667-325 chr5 148404316 148404577 + 1 NA intron (NM_001271723, intron 5 of 20) intron (NM_001271723, intron 5 of 20) 20488 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 160.333-172 chr21 23399407 23399598 + 1 NA Intergenic Intergenic -14667 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 179.667-22 chr10 89197612 89197924 + 1 NA Intergenic Intergenic 9549 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 253.333-103 chr7 138435787 138436127 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -24302 NM_003852 8805 Hs.490287 NM_003852 ENSG00000122779 TRIM24 PTC6|RNF82|TF1A|TIF1|TIF1A|TIF1ALPHA|hTIF1 tripartite motif containing 24 protein-coding 300.333-50 chr8 75969366 75969737 + 1 NA Intergenic Intergenic 429583 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 257.667-33 chr18 22291635 22291993 + 1 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie 122377 NM_005257 2627 Hs.514746 NM_005257 ENSG00000141448 GATA6 - GATA binding protein 6 protein-coding 185.667-26 chr12 124769763 124770089 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 69745 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 145.667-91 chr14 84190775 84190985 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -1081052 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 161.333-184 chr3 67850847 67851030 + 1 NA intron (NR_109992, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR -140654 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 117.333-52 chr14 49767152 49767379 + 1 NA promoter-TSS (NM_014315) promoter-TSS (NM_014315) -888 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 158.333-215 chr3 173109472 173109737 + 1 NA intron (NM_031955, intron 2 of 10) intron (NM_031955, intron 2 of 10) 31631 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 211.333-119 chr2 116271905 116272222 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 928248 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 236.333-74 chr4 159228985 159229373 + 1 NA 5' UTR (NM_001351725, exon 1 of 27) 5' UTR (NM_001351725, exon 1 of 27) 696 NM_001351725 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 181.333-66 chr19 6508050 6508231 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -5292 NM_001289129 10382 Hs.110837 NM_006087 ENSG00000104833 TUBB4A DYT4|TUBB4|beta-5 tubulin beta 4A class IVa protein-coding 249.333-72 chr3 154940425 154940764 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -83530 NM_001354642 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 153.333-44 chr10 33706616 33706887 + 1 NA Intergenic Intergenic 65929 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 284.667-16 chr14 54811628 54812107 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 57034 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 256.667-89 chr9 16816623 16816931 + 1 NA intron (NM_017637, intron 1 of 6) intron (NM_017637, intron 1 of 6) 53893 NM_017637 54796 Hs.656581 NM_017637 ENSG00000173068 BNC2 BSN2 basonuclin 2 protein-coding 193.667-47 chr16 1686983 1687331 + 1 NA intron (NM_144570, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 8878 NM_144570 90861 Hs.513261 NM_144570 ENSG00000206053 JPT2 C16orf34|HN1L|L11 Jupiter microtubule associated homolog 2 protein-coding 154.333-14 chr1 106091650 106091871 + 1 NA Intergenic Intergenic -63507 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 168.667-207 chr7 88131236 88131429 + 1 NA exon (NM_021722, exon 11 of 31) exon (NM_021722, exon 11 of 31) -85328 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 274.333-68 chr8 105605391 105605816 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 286060 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 233.333-37 chr14 47909923 47910248 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -115071 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 220.333-22 chr11 5208501 5208898 + 1 NA Intergenic Intergenic -7999 NM_001004760 283111 Hs.553670 NM_001004760 ENSG00000176742 OR51V1 OR11-36|OR51A12 olfactory receptor family 51 subfamily V member 1 protein-coding 144.667-74 chr13 94414317 94414500 + 1 NA Intergenic Intergenic 65274 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 206.333-150 chr7 89073931 89074289 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -278373 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 152.333-405 chr9 100577276 100577447 + 1 NA promoter-TSS (NM_001018116) promoter-TSS (NM_001018116) -718 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 157.333-197 chr2 140200878 140201187 + 1 NA Intergenic Intergenic 385653 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 136.667-78 chr17 40790259 40790435 + 1 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -7797 NM_181537 342574 Hs.59363 NM_181537 ENSG00000171446 KRT27 K25IRS3|KRT25C keratin 27 protein-coding 131.667-10 chr1 98648929 98649184 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -12665 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 241.333-68 chr3 57627015 57627308 + 1 NA 3' UTR (NM_152678, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_152678, exon 20 of 20) 29372 NR_132370 106144532 Hs.667207 NR_132369 ENSG00000272146 ARF4-AS1 - ARF4 antisense RNA 1 ncRNA 165.333-68 chr13 81910483 81910690 + 1 NA Intergenic (TATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -683603 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 147.333-296 chr7 42820905 42821068 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 90857 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 193.333-160 chr6 86440954 86441222 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -496440 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 285.667-53 chr9 13070520 13070869 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -98061 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 310.333-25 chr20 13744047 13744553 + 1 NA intron (NM_001276380, intron 9 of 13) L1M5|LINE|L1 40586 NM_016649 51575 Hs.369284 NM_016649 ENSG00000089048 ESF1 ABTAP|C20orf6|HDCMC28P|bA526K24.1 ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog protein-coding 146.333-361 chrX 58392580 58392859 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -482086 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 123.667-8 chr1 73808709 73808921 + 1 NA Intergenic Intergenic 134136 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 172.667-67 chr17 68556653 68556832 + 1 NA intron (NM_017565, intron 1 of 10) intron (NM_017565, intron 1 of 10) 1685 NR_027751 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 144.333-109 chr18 78280883 78281138 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -287283 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 191.333-186 chr7 13319653 13319854 + 1 NA Intergenic Intergenic 632120 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 144.667-294 chr8 76559199 76559366 + 1 NA Intergenic Intergenic -121965 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 133.667-117 chr5 39843270 39843475 + 1 NA Intergenic Intergenic -208919 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 132.667-28 chr10 114182394 114182539 + 1 NA intron (NM_198795, intron 1 of 25) intron (NM_198795, intron 1 of 25) 3113 NM_001365891 56165 Hs.333132 NM_198795 ENSG00000095627 TDRD1 CT41.1 tudor domain containing 1 protein-coding 166.667-69 chr14 67424830 67425021 + 1 NA Intergenic Intergenic -12760 NM_016445 26499 Hs.170473 NM_016445 ENSG00000100558 PLEK2 - pleckstrin 2 protein-coding 343.333-6 chr11 58782866 58783345 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -51131 NM_005838 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 153.667-334 chr6 46194029 46194213 + 1 NA Intergenic Intergenic -23111 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 174.667-56 chr14 74842881 74843139 + 1 NA Intergenic Intergenic 20824 NM_001243007 283571 Hs.675293 NM_001080408 ENSG00000119608 PROX2 PROX-2 prospero homeobox 2 protein-coding 152.333-16 chr1 95824871 95825058 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -167104 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 329.333-40 chr4 65662397 65662947 + 1 NA intron (NM_001281767, intron 1 of 16) intron (NM_001281767, intron 1 of 16) 6816 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 161.333-101 chr15 78548599 78548796 + 1 NA intron (NM_001330676, intron 8 of 8) intron (NM_001330676, intron 8 of 8) 8011 NM_001330676 5685 Hs.251531 NM_002789 ENSG00000041357 PSMA4 HC9|HsT17706|PSC9 proteasome subunit alpha 4 protein-coding 164.333-219 chr6 159154736 159154942 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -14561 NM_032532 84624 Hs.520525 NM_032532 ENSG00000164694 FNDC1 AGS8|FNDC2|MEL4B3|bA243O10.1|dJ322A24.1 fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 157.667-170 chr20 43009554 43009740 + 1 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) intron (NM_133170, intron 1 of 31) 40904 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 112.333-21 chr10 23832010 23832265 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) MER21B|LTR|ERVL 137410 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 130.333-127 chr3 26272616 26272825 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -350086 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 324.667-38 chr8 25788885 25789472 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 256235 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 192.667-58 chr14 63704292 63704504 + 1 NA intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 L1MB5|LINE|L1 23667 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 150.333-246 chr21 32229206 32229379 + 1 NA Intergenic Intergenic 49757 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 198.333-113 chr20 47998637 47998918 + 1 NA Intergenic Intergenic -8660 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 319.333-37 chr9 78997078 78997494 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 148380 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 161.667-126 chr2 62576051 62576354 + 1 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -70007 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 160.667-186 chr22 34035384 34035577 + 1 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -112592 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 279.333-71 chr8 130195069 130195560 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) AluJo|SINE|Alu 101219 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 144.333-80 chr14 70962803 70963032 + 1 NA intron (NM_014982, intron 3 of 35) intron (NM_014982, intron 3 of 35) 55458 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 180.667-39 chr14 26771899 26772233 + 1 NA intron (NR_147061, intron 3 of 6) intron (NR_147061, intron 3 of 6) -37282 NR_110557 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 119.667-124 chr3 152379635 152379782 + 1 NA intron (NM_001314057, intron 2 of 11) intron (NM_001314057, intron 2 of 11) -38718 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 201.333-118 chr15 96968675 96969013 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 185409 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 304.667-22 chr20 62884527 62885082 + 1 NA intron (NM_033081, intron 15 of 15) intron (NM_033081, intron 15 of 15) -1901 NR_145839 109623463 NR_145839 SNORA117 - small nucleolar RNA, H/ACA box 117 snoRNA 129.333-83 chr18 31792658 31792852 + 1 NA Intergenic Intergenic -31875 NM_001034172 147407 Hs.567708 NM_001034172 ENSG00000141437 SLC25A52 MCART2 solute carrier family 25 member 52 protein-coding 143.333-61 chr12 17640159 17640376 + 1 NA Intergenic Intergenic -33032 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 112.667-30 chr10 67260432 67260625 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 142882 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 152.667-255 chr3 146694436 146694719 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -88361 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 142.333-117 chr2 50401251 50401533 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -53636 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 142.667-157 chr4 76510140 76510324 + 1 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) L1ME4a|LINE|L1 -63336 NR_039654 100616299 NR_039654 ENSG00000263445 MIR4450 mir-4450 microRNA 4450 ncRNA 157.333-76 chr12 5426175 5426458 + 1 NA Intergenic Intergenic -5792 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 142.667-175 chr5 12833048 12833240 + 1 NA Intergenic Intergenic 165285 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 160.333-242 chr6 37540806 37541080 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 14479 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 147.333-92 chr13 60995140 60995336 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 204642 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 346.333-26 chr5 55277094 55277734 + 1 NA intron (NR_144323, intron 12 of 26) intron (NR_144323, intron 12 of 26) 30280 NM_001345965 54505 Hs.593268 NM_019030 ENSG00000067248 DHX29 DDX29 DExH-box helicase 29 protein-coding 170.333-197 chr7 24148550 24148826 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -135502 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 154.667-297 chr5 15694858 15695064 + 1 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -79959 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 158.667-16 chr1 113314023 113314202 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -76403 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 151.667-31 chr1 207945590 207945806 + 1 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -34573 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 113.333-137 chr2 186362700 186362883 + 1 NA Intergenic Intergenic -123469 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 373.667-10 chr4 11208334 11208820 + 1 NA Intergenic Intergenic -160250 NR_030298 693157 NR_030298 ENSG00000207716 MIR572 MIRN572|hsa-mir-572 microRNA 572 ncRNA 162.667-218 chr5 75066131 75066430 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -13722 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 233.333-9 chr1 187655131 187655530 + 1 NA Intergenic Intergenic 211702 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 156.667-203 chr20 7407284 7407445 + 1 NA Intergenic Intergenic 35756 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 241.667-86 chr7 114769270 114769639 + 1 NA Intergenic Intergenic 116109 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 259.667-32 chr2 42243099 42243408 + 1 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) intron (NM_001145076, intron 1 of 21) -73022 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 146.667-306 chr7 46784630 46784906 + 1 NA Intergenic Intergenic -87646 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 126.667-56 chr15 61499869 61500095 + 1 NA Intergenic Intergenic -229936 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 138.667-25 chr10 105801718 105801926 + 1 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) intron (NR_120625, intron 3 of 3) 18511 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 303.334-2 chr12 40154894 40155457 + 1 NA Intergenic Intergenic -1064 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 160.333-109 chr15 45553467 45553765 + 1 NA intron (NR_022014, intron 5 of 5) intron (NR_022014, intron 5 of 5) 16365 NR_145777 109617005 NR_145777 ENSG00000207516 SNORA41B - small nucleolar RNA, H/ACA box 41B snoRNA 154.333-300 chr6 106742859 106743031 + 1 NA intron (NR_033557, intron 1 of 6) intron (NR_033557, intron 1 of 6) -41180 NR_030314 693172 NR_030314 ENSG00000207577 MIR587 MIRN587|hsa-mir-587 microRNA 587 ncRNA 133.333-173 chr7 52289359 52289518 + 1 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -746195 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 213.667-79 chr5 92476412 92476658 + 1 NA Intergenic Intergenic -1093218 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 162.333-245 chr8 50313175 50313384 + 1 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) L1M3|LINE|L1 149148 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 226.333-26 chr13 63513860 63514242 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -185957 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 138.333-71 chr15 66446122 66446403 + 1 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) AluY|SINE|Alu 50772 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 138.333-184 chr7 53625484 53625738 + 1 NA Intergenic Intergenic 186320 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 213.667-18 chr10 117249021 117249426 + 1 NA intron (NM_003054, intron 3 of 15) intron (NM_003054, intron 3 of 15) 8109 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 166.333-110 chr2 54849669 54849947 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 8 of 40) intron (NM_001039753, intron 8 of 40) 124796 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 266.333-48 chr5 104832682 104833171 + 1 NA Intergenic Intergenic -266548 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 240.333-65 chr3 47007822 47008142 + 1 NA intron (NM_001365116, intron 48 of 52) intron (NM_001365116, intron 48 of 52) -3560 NR_024046 100129354 Hs.201522 NR_024046 NRADDP - neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene pseudo 230.333-102 chr6 37739604 37739879 + 1 NA Intergenic Intergenic -41858 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 149.667-274 chr4 24595801 24596023 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -11358 NM_001358 1665 Hs.696074 NM_001358 ENSG00000109606 DHX15 DBP1|DDX15|HRH2|PRP43|PRPF43|PrPp43p DEAH-box helicase 15 protein-coding 226.667-34 chr14 44622704 44623093 + 1 NA Intergenic Intergenic 115489 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 163.667-156 chr3 97421482 97421814 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 6 of 17) L1ME3F|LINE|L1 -17959 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 157.667-53 chr11 36446795 36447116 + 1 NA intron (NM_001160169, intron 6 of 6) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 45958 NM_001160169 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 149.333-298 chr5 5873661 5873880 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 451093 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 177.333-67 chr16 60125014 60125293 + 1 NA Intergenic Intergenic 234640 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 176.333-148 chr6 114209426 114209645 + 1 NA intron (NR_125845, intron 8 of 9) intron (NR_125845, intron 8 of 9) -146658 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 148.667-351 chr7 43433732 43433881 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 7 of 27) MamRep1527|LTR|LTR 88736 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 150.333-244 chr21 28375778 28375962 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -147203 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 139.333-45 chr12 1140665 1140804 + 1 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) MER33|DNA|hAT-Charlie 112986 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 312.667-14 chr12 96418163 96418491 + 1 NA Intergenic Intergenic -17888 NM_002595 5128 Hs.506415 NM_002595 ENSG00000059758 CDK17 PCTAIRE2|PCTK2 cyclin dependent kinase 17 protein-coding 162.667-10 chr1 167406615 167406782 + 1 NA intron (NM_001198783, intron 13 of 15) L1MB7|LINE|L1 77628 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 253.667-46 chr4 36647715 36648007 + 1 NA Intergenic Intergenic -5961 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 159.667-108 chr15 51965598 51965771 + 1 NA intron (NM_001323904, intron 2 of 11) intron (NM_001323904, intron 2 of 11) 6094 NM_001323904 123169 Hs.567662 NM_138792 ENSG00000166477 LEO1 RDL LEO1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 164.667-255 chr9 71103072 71103243 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 18464 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 245.333-4 chr1 88976341 88976707 + 1 NA intron (NM_001349447, intron 2 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 16105 NM_001008661 56267 Hs.481898 NM_001008661 ENSG00000137944 KYAT3 CCBL2|KAT3|KATIII kynurenine aminotransferase 3 protein-coding 138.333-101 chr2 183859442 183859655 + 1 NA Intergenic Intergenic -519427 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 142.333-163 chr3 99897058 99897235 + 1 NA intron (NM_001042459, intron 4 of 4) AluSz|SINE|Alu -20943 NM_001282794 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 147.667-359 chr8 82838301 82838461 + 1 NA Intergenic Intergenic -73723 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 146.667-126 chr17 2588375 2588537 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -5198 NM_000430 5048 Hs.77318 NM_000430 ENSG00000007168 PAFAH1B1 LIS1|LIS2|MDCR|MDS|NudF|PAFAH platelet activating factor acetylhydrolase 1b regulatory subunit 1 protein-coding 173.333-124 chr3 84476503 84476862 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 392893 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 212.667-110 chr5 110941405 110941720 + 1 NA Intergenic Intergenic -128518 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 177.667-79 chr2 205434330 205434523 + 1 NA intron (NM_205863, intron 19 of 21) intron (NM_205863, intron 19 of 21) -248074 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 173.333-190 chr7 88059594 88059915 + 1 NA intron (NM_001324421, intron 3 of 28) L1PA17|LINE|L1 125503 NM_001324417 53616 Hs.256398 NM_004194 ENSG00000008277 ADAM22 ADAM 22|EIEE61|MDC2 ADAM metallopeptidase domain 22 protein-coding 328.333-24 chr2 162346313 162346977 + 1 NA intron (NM_001330270, intron 1 of 7) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 2277 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 212.667-30 chr12 81266836 81267200 + 1 NA intron (NM_001282536, intron 26 of 29) intron (NM_001282536, intron 26 of 29) -12171 NR_120491 102724663 Hs.667264 NR_120491 ENSG00000257467 PPFIA2-AS1 - PPFIA2 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-309 chr7 53656233 53656426 + 1 NA non-coding (NR_038371, exon 6 of 6) non-coding (NR_038371, exon 6 of 6) 155602 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 145.667-96 chr15 59957639 59957892 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -46546 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 115.333-140 chr3 79728797 79728967 + 1 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 39116 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 256.667-94 chr9 102677079 102677484 + 1 NA Intergenic Intergenic 157644 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 127.333-124 chr3 180985720 180985904 + 1 NA intron (NR_046073, intron 2 of 2) intron (NR_046073, intron 2 of 2) 3706 NM_001190233 131118 Hs.230601 NM_145261 ENSG00000205981 DNAJC19 PAM18|TIM14|TIMM14 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C19 protein-coding 175.333-94 chr2 156010963 156011176 + 1 NA Intergenic Intergenic 243862 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 149.333-204 chr2 182050780 182051011 + 1 NA intron (NM_001261425, intron 2 of 5) intron (NM_001261425, intron 2 of 5) 65042 NM_001261425 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 228.333-102 chr8 127695863 127696321 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 37875 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 215.667-46 chr17 68833947 68834342 + 1 NA Intergenic Intergenic 121248 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 149.667-136 chr15 39643239 39643449 + 1 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) intron (NM_152597, intron 10 of 11) 62265 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 154.333-15 chr1 108342215 108342442 + 1 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu -98247 NM_001143989 148545 Hs.511849 NM_152488 ENSG00000196427 NBPF4 - NBPF member 4 protein-coding 226.333-13 chr10 126684476 126684807 + 1 NA Intergenic Intergenic -14131 NM_001350923 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 129.667-4 chr1 72108331 72108479 + 1 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) 174134 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 190.667-150 chr8 91158482 91158811 + 1 NA intron (NR_148895, intron 7 of 10) intron (NR_148895, intron 7 of 10) -46839 NR_039805 100616245 NR_039805 ENSG00000266194 MIR4661 - microRNA 4661 ncRNA 153.667-364 chr7 107436741 107437009 + 1 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) intron (NM_181733, intron 6 of 20) -33182 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 144.333-170 chr3 87901682 87901942 + 1 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) intron (NM_001322210, intron 2 of 2) -80764 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 175.333-62 chr16 77372676 77372910 + 1 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) intron (NM_199355, intron 3 of 22) 62241 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 312.333-27 chr8 46952075 46952485 + 1 NA Intergenic (TCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 111394 NR_027012 497634 Hs.406982 NR_027012 LINC00293 BEYLA|NCRNA00293 long intergenic non-protein coding RNA 293 ncRNA 173.667-194 chr9 124190321 124190500 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -67196 NM_001166167 10783 Hs.197071 NM_014397 ENSG00000119408 NEK6 SID6-1512 NIMA related kinase 6 protein-coding 146.667-71 chr12 44978606 44978824 + 1 NA Intergenic Intergenic -64787 NM_001145110 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 268.667-25 chr2 12424488 12424809 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 225518 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 128.333-42 chr11 114341446 114341746 + 1 NA Intergenic Intergenic 38443 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 143.667-225 chr7 3569339 3569531 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 268183 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 156.333-361 chr8 113301711 113301871 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) intron (NM_001363185, intron 2 of 66) 75361 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 242.667-112 chr9 95688090 95688487 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -171231 NM_001354919 5727 Hs.494538 NM_000264 ENSG00000185920 PTCH1 BCNS|NBCCS|PTC|PTC1|PTCH patched 1 protein-coding 352.333-26 chr7 56253963 56254350 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -137739 NM_001145712 389493 Hs.177948 NM_001145712 ENSG00000185290 NUPR2 NUPR1L nuclear protein 2, transcriptional regulator protein-coding 175.333-167 chr7 10471923 10472267 + 1 NA intron (NR_147499, intron 2 of 2) intron (NR_147499, intron 2 of 2) -230581 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 156.667-137 chr17 60958928 60959183 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) AluJo|SINE|Alu 281204 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 152.333-269 chr4 43542572 43542869 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -50177 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 145.333-109 chr17 6499554 6499823 + 1 NA intron (NM_031220, intron 4 of 19) intron (NM_031220, intron 4 of 19) 55233 NM_019013 54478 Hs.592116 NM_019013 ENSG00000129195 PIMREG CATS|FAM64A|RCS1 PICALM interacting mitotic regulator protein-coding 174.333-109 chr4 161636148 161636395 + 1 NA intron (NM_001128428, intron 7 of 14) intron (NM_001128428, intron 7 of 14) -386462 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 173.333-35 chr11 77760207 77760474 + 1 NA intron (NM_016578, intron 2 of 15) L1MB7|LINE|L1 60494 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 155.333-91 chr13 42340899 42341170 + 1 NA Intergenic Intergenic 68882 NM_016248 11215 Hs.105105 NM_016248 ENSG00000023516 AKAP11 AKAP-11|AKAP220|PPP1R44|PRKA11 A-kinase anchoring protein 11 protein-coding 173.333-142 chr4 44843143 44843386 + 1 NA Intergenic Intergenic -116630 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 158.667-271 chr5 74731373 74731590 + 1 NA intron (NM_032380, intron 16 of 20) MER77|LTR|ERVL 35636 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 183.333-110 chr3 196632038 196632381 + 1 NA intron (NR_132101, intron 1 of 1) intron (NR_132101, intron 1 of 1) 378 NR_132101 101929769 Hs.518527 NR_132101 ENSG00000232065 LINC01063 - long intergenic non-protein coding RNA 1063 ncRNA 153.667-127 chr14 80684187 80684478 + 1 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) L1PA15-16|LINE|L1 257406 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 187.333-41 chr12 10582953 10583340 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 16689 NR_028045 10748 Hs.159297 NM_006611 KLRA1P KLRA1|KLRAP1|LY49L|Ly-49L|Ly49 killer cell lectin like receptor A1, pseudogene pseudo 165.333-100 chr17 20014681 20014870 + 1 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) AluSx|SINE|Alu 5416 NM_001243439 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 155.333-304 chr5 115894212 115894438 + 1 NA intron (NM_001364122, intron 3 of 3) MER77|LTR|ERVL 51838 NR_157087 1176 Hs.406191 NM_001284 ENSG00000177879 AP3S1 CLAPS3|Sigma3A adaptor related protein complex 3 subunit sigma 1 protein-coding 176.667-148 chr8 122731792 122732107 + 1 NA Intergenic Intergenic -37843 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 159.333-240 chr4 72601659 72601841 + 1 NA Intergenic Intergenic -32529 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 285.333-52 chr4 71411834 71412321 + 1 NA intron (NM_003759, intron 4 of 22) L3b|LINE|CR1 73024 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 216.667-71 chr3 94374334 94374683 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 311447 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 208.667-81 chr21 19851120 19851445 + 1 NA Intergenic Intergenic 48473 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 153.333-251 chr22 20075130 20075425 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -4955 NM_001190326 54487 Hs.643452 NM_022720 ENSG00000128191 DGCR8 C22orf12|DGCRK6|Gy1|pasha DGCR8 microprocessor complex subunit protein-coding 137.667-154 chr5 118699971 118700127 + 1 NA Intergenic Intergenic 103861 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 236.667-41 chr2 78889635 78890163 + 1 NA Intergenic Intergenic -135803 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 292.667-17 chr2 54187565 54187868 + 1 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 64433 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 150.667-35 chr10 32793215 32793424 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 30 of 43) ERVL-E-int|LTR|ERVL 108153 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 140.333-219 chr7 93829984 93830146 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 60688 NM_001271004 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 168.333-208 chr8 75331477 75331695 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -52697 NR_103849 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 137.333-43 chr14 41364477 41364709 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -242263 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 170.333-59 chr12 116805657 116805829 + 1 NA intron (NM_001109903, intron 7 of 11) AluSz6|SINE|Alu 67428 NM_032814 84900 Hs.437195 NM_032814 ENSG00000135119 RNFT2 TMEM118 ring finger protein, transmembrane 2 protein-coding 166.667-147 chr3 23559030 23559340 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) intron (NM_001370225, intron 5 of 5) -246770 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 206.333-8 chr1 182505545 182505885 + 1 NA intron (NM_001366934, intron 10 of 22) L1MEc|LINE|L1 55569 NM_001137669 353299 Hs.121200 NM_032267 ENSG00000121446 RGSL1 RGSL|RGSL2 regulator of G protein signaling like 1 protein-coding 223.333-19 chr10 71643855 71644416 + 1 NA intron (NM_052836, intron 11 of 12) intron (NM_052836, intron 11 of 12) 75643 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 131.333-170 chr7 103693544 103693731 + 1 NA intron (NM_005045, intron 10 of 64) L2b|LINE|L2 -247430 NM_206885 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 224.333-17 chr10 74692077 74692461 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) AluSq2|SINE|Alu -132986 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 181.333-48 chr15 34311996 34312315 + 1 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) MIRb|SINE|MIR 6665 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 259.333-10 chr1 234953191 234953531 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 10638 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 178.333-19 chr10 61274176 61274491 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -178306 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 171.667-158 chr8 52393950 52394207 + 1 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) intron (NR_148195, intron 2 of 3) 15678 NM_001352884 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 157.333-77 chr12 10294882 10295094 + 1 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) L1ME3A|LINE|L1 -9458 NM_001114396 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 201.333-110 chr14 95257218 95257516 + 1 NA intron (NM_024734, intron 1 of 12) intron (NM_024734, intron 1 of 12) 62541 NM_024734 79789 Hs.301478 NM_024734 ENSG00000165959 CLMN - calmin protein-coding 226.333-117 chr9 117392895 117393231 + 1 NA intron (NM_014010, intron 1 of 21) intron (NM_014010, intron 1 of 21) 21994 NM_001365069 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 211.667-55 chr2 29682224 29682536 + 1 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -207003 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 183.667-119 chr5 83341395 83341763 + 1 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) intron (NM_022550, intron 7 of 7) -130095 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 152.333-303 chr5 79071558 79071724 + 1 NA intron (NM_001178005, intron 1 of 6) L1PA12|LINE|L1 1874 NM_017614 23743 Hs.114172 NM_017614 ENSG00000132840 BHMT2 - betaine--homocysteine S-methyltransferase 2 protein-coding 141.333-133 chr20 46980992 46981210 + 1 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) intron (NM_172110, intron 1 of 13) 86258 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 160.333-113 chr15 61893592 61893851 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 66 of 81) L1MA4|LINE|L1 163803 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 323.333-13 chr18 74094153 74094489 + 1 NA intron (NM_001142958, intron 8 of 9) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 53513 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 214.333-142 chr7 36201631 36202067 + 1 NA intron (NM_030636, intron 2 of 7) intron (NM_030636, intron 2 of 7) 48595 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 131.667-6 chr1 58520341 58520500 + 1 NA intron (NM_145243, intron 7 of 8) L1M4|LINE|L1 26306 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 140.667-70 chr14 21803996 21804178 + 1 NA Intergenic Intergenic -133070 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 139.667-203 chr9 30423438 30423583 + 1 NA Intergenic AluYk4|SINE|Alu -15056 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 122.333-137 chr3 107705793 107705938 + 1 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) MIRb|SINE|MIR 172203 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 140.333-90 chr19 41156367 41156524 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -36774 NM_030622 29785 Hs.98370 NM_030622 ENSG00000167600 CYP2S1 CYPIIS1 cytochrome P450 family 2 subfamily S member 1 protein-coding 277.333-78 chr6 136823566 136824091 + 1 NA intron (NM_000288, intron 1 of 9) AluSp|SINE|Alu 1236 NM_000288 5191 Hs.280932 NM_000288 ENSG00000112357 PEX7 PBD9B|PTS2R|RCDP1|RD peroxisomal biogenesis factor 7 protein-coding 124.333-13 chr1 195291731 195291895 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 796902 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 148.333-391 chr8 114546716 114547014 + 1 NA Intergenic Intergenic -1109926 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 209.333-256 chrX 110180589 110181023 + 1 NA intron (NM_001353850, intron 7 of 7) intron (NM_001353850, intron 7 of 7) 44254 NR_004379 692226 NR_004379 ENSG00000208883 SNORD96B U96b small nucleolar RNA, C/D box 96B snoRNA 142.667-252 chrY 11305282 11305453 + 1 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite 1116223 NR_033667 352887 Hs.546221 NR_033667 ENSG00000206159 GYG2P1 GYG2P glycogenin 2 pseudogene 1 pseudo 160.667-250 chr5 113122708 113122904 + 1 NA exon (NM_002387, exon 4 of 17) exon (NM_002387, exon 4 of 17) 146008 NR_038352 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 180.667-20 chr11 21513885 21514176 + 1 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) -679055 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 156.333-259 chr4 13513340 13513513 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 17991 NR_034054 285547 Hs.381892 NR_034054 ENSG00000281202 LINC01097 - long intergenic non-protein coding RNA 1097 ncRNA 147.667-63 chr11 116238640 116239020 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -400592 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 224.333-48 chr15 80363605 80363979 + 1 NA Intergenic Intergenic -21987 NR_033833 283688 Hs.525933 NR_033833 ENSG00000259361 LINC00927 - long intergenic non-protein coding RNA 927 ncRNA 226.667-39 chr16 49077458 49077787 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 204216 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 229.667-13 chr10 122004752 122005210 + 1 NA intron (NM_206862, intron 1 of 22) L1MC4|LINE|L1 15818 NM_206862 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 123.667-154 chr5 41892759 41892910 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -11510 NM_175921 285636 Hs.29899 NM_175921 ENSG00000205765 C5orf51 - chromosome 5 open reading frame 51 protein-coding 234.333-76 chr7 52665363 52665638 + 1 NA Intergenic Intergenic -370133 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 149.667-335 chr5 158388278 158388435 + 1 NA intron (NR_109888, intron 1 of 6) UCON29|DNA|PiggyBac? 21417 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 217.667-24 chr12 14604474 14604962 + 1 NA intron (NR_120465, intron 2 of 5) L1ME1|LINE|L1 -36835 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 147.667-221 chr3 19925844 19926073 + 1 NA intron (NM_001330688, intron 3 of 14) intron (NM_001330688, intron 3 of 14) 8259 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 122.333-84 chr19 28260501 28260686 + 1 NA Intergenic Intergenic -346095 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 264.333-68 chr6 84423926 84424238 + 1 NA intron (NR_132100, intron 4 of 4) L1MA5|LINE|L1 50847 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 123.667-99 chr2 212598024 212598175 + 1 NA Intergenic Intergenic -59297 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 184.333-7 chr1 191163287 191163621 + 1 NA Intergenic Intergenic 65044 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 126.333-3 chr1 74730999 74731181 + 1 NA intron (NM_001130042, intron 1 of 9) intron (NM_001130042, intron 1 of 9) 1960 NM_001889 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 267.333-46 chr2 15364225 15364691 + 1 NA intron (NR_052013, intron 32 of 50) AluSp|SINE|Alu 196876 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 122.667-61 chr15 94094481 94094660 + 1 NA intron (NR_120320, intron 1 of 8) intron (NR_120320, intron 1 of 8) 13368 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 252.333-64 chr6 36005113 36005539 + 1 NA intron (NM_001193476, intron 3 of 19) L1MC4a|LINE|L1 19174 NM_138718 116369 Hs.435836 NM_052961 ENSG00000112053 SLC26A8 SPGF3|TAT1 solute carrier family 26 member 8 protein-coding 123.333-71 chr13 107498206 107498459 + 1 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 32916 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 194.667-81 chr20 53553033 53553338 + 1 NA intron (NR_110051, intron 1 of 5) L1MD3|LINE|L1 415 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 267.333-48 chr2 123090650 123091127 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -17407 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 163.667-185 chr4 111776625 111776826 + 1 NA Intergenic Intergenic -368729 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 155.667-373 chr8 131080393 131080595 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -39585 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 134.333-42 chr13 28847894 28848109 + 1 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) intron (NM_001366651, intron 2 of 14) 27662 NM_001366651 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 150.333-202 chr2 109708659 109708810 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -84024 NM_032260 84220 Hs.469630 NM_005054 ENSG00000015568 RGPD5 BS-63|BS63|HEL161|RGP5 RANBP2 like and GRIP domain containing 5 protein-coding 156.667-224 chr3 72733928 72734130 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -69780 NR_135531 105377162 Hs.123457 NR_135531 LOC105377162 - uncharacterized LOC105377162 ncRNA 156.667-31 chr1 201847228 201847401 + 1 NA exon (NM_018085, exon 2 of 24) exon (NM_018085, exon 2 of 24) -16059 NR_106797 102466724 NR_106797 ENSG00000277681 MIR6739 hsa-mir-6739 microRNA 6739 ncRNA 210.333-154 chr7 12048359 12048802 + 1 NA Intergenic Intergenic -162714 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 248.667-29 chr12 122861089 122861693 + 1 NA exon (NM_003959, exon 31 of 32) exon (NM_003959, exon 31 of 32) 25934 NM_001303097 9026 Hs.524815 NM_003959 ENSG00000130787 HIP1R HIP12|HIP3|ILWEQ huntingtin interacting protein 1 related protein-coding 167.333-23 chr1 172402812 172403118 + 1 NA intron (NM_001350206, intron 20 of 20) MER5A|DNA|hAT-Charlie -17720 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 206.333-34 chr12 46886744 46887006 + 1 NA Intergenic (TTTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -60878 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 159.667-9 chr1 53253796 53253973 + 1 NA intron (NM_004631, intron 16 of 18) intron (NM_004631, intron 16 of 18) 15274 NR_038953 100507564 Hs.592502 NR_038953 ENSG00000226754 LOC100507564 - uncharacterized LOC100507564 ncRNA 281.667-36 chr4 36996976 36997361 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -4611 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 155.333-32 chr10 68314422 68314736 + 1 NA intron (NM_001033083, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 -17114 NM_001322445 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 201.333-67 chr12 5230910 5231217 + 1 NA Intergenic Intergenic 12088 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 120.333-24 chr10 99424730 99424901 + 1 NA intron (NM_002079, intron 1 of 8) intron (NM_002079, intron 1 of 8) 5809 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 140.667-54 chr11 96464577 96464825 + 1 NA intron (NR_047481, intron 1 of 4) intron (NR_047481, intron 1 of 4) 42176 NR_047481 100874053 Hs.742044 NR_047481 JRKL-AS1 - JRKL antisense RNA 1 ncRNA 206.667-4 chr1 113931898 113932325 + 1 NA intron (NM_001369807, intron 1 of 15) intron (NM_001369807, intron 1 of 15) 2267 NM_001369806 204851 Hs.532363 NM_152696 ENSG00000163349 HIPK1 Myak|Nbak2 homeodomain interacting protein kinase 1 protein-coding 328.333-10 chr11 125482607 125483195 + 1 NA intron (NM_005103, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu -12313 NM_001301851 403312 Hs.450611 NM_203452 LOC403312 - putative uncharacterized protein MGC39545 protein-coding 193.333-71 chr16 73951153 73951440 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 264225 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 133.333-44 chr12 103414826 103415064 + 1 NA intron (NR_103526, intron 2 of 10) L1P4|LINE|L1 81023 NM_198521 374470 Hs.534649 NM_198521 ENSG00000179088 C12orf42 - chromosome 12 open reading frame 42 protein-coding 121.333-164 chr6 141790611 141790838 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 298075 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 205.667-24 chr11 36024421 36024751 + 1 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) intron (NM_001304264, intron 1 of 5) 14488 NR_039769 100616311 NR_039769 ENSG00000263389 MIR3973 - microRNA 3973 ncRNA 146.333-140 chr2 14618124 14618324 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -14493 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 188.333-166 chr9 37573616 37573962 + 1 NA intron (NM_012166, intron 1 of 10) intron (NM_012166, intron 1 of 10) 2591 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 214.333-11 chr1 189890622 189891007 + 1 NA Intergenic Intergenic 585196 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 162.333-175 chr3 191430114 191430315 + 1 NA intron (NR_120606, intron 1 of 6) MER31B|LTR|ERV1 4690 NR_120606 103344926 NR_120606 LINCR-0002 - uncharacterized LincR-0002 ncRNA 150.333-306 chr4 83543415 83543586 + 1 NA intron (NM_001256421, intron 2 of 12) intron (NM_001256421, intron 2 of 12) 7392 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 230.667-71 chr6 134057982 134058480 + 1 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -5607 NM_145176 154091 Hs.486508 NM_145176 ENSG00000146411 SLC2A12 GLUT12|GLUT8 solute carrier family 2 member 12 protein-coding 135.333-67 chr17 61616163 61616369 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -25047 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 170.333-107 chr2 38017184 38017444 + 1 NA 3' UTR (NM_001170791, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001170791, exon 11 of 11) 19027 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 200.333-84 chr21 20519382 20519720 + 1 NA Intergenic Intergenic -260866 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 151.333-157 chr16 1722312 1722586 + 1 NA intron (NM_001040439, intron 1 of 30) intron (NM_001040439, intron 1 of 30) -12536 NR_036138 100423012 NR_036138 ENSG00000265820 MIR3177 mir-3177 microRNA 3177 ncRNA 175.667-76 chr2 134790378 134790599 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -48128 NM_001307983 130013 Hs.655728 NM_138326 ENSG00000153086 ACMSD - aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase protein-coding 160.667-105 chr15 62702956 62703231 + 1 NA intron (NM_015059, intron 16 of 55) intron (NM_015059, intron 16 of 55) 55782 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 127.667-161 chr7 30018936 30019116 + 1 NA exon (NM_017946, exon 3 of 4) exon (NM_017946, exon 3 of 4) 7676 NR_046478 55033 Hs.390838 NM_017946 ENSG00000106080 FKBP14 EDSKMH|EDSKSCL2|FKBP22|IPBP12 FKBP prolyl isomerase 14 protein-coding 141.667-156 chr4 30188727 30188965 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -531523 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 123.333-179 chr5 167315026 167315237 + 1 NA intron (NM_001122679, intron 2 of 29) L1ME4c|LINE|L1 -146730 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 215.333-168 chr5 111710262 111710506 + 1 NA intron (NR_040093, intron 2 of 6) L1MD1|LINE|L1 45867 NM_001142483 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 134.333-55 chr15 48170566 48170729 + 1 NA intron (NR_125408, intron 1 of 8) intron (NR_125408, intron 1 of 8) 7648 NM_016132 50804 Hs.6638 NM_016132 ENSG00000104177 MYEF2 HsT18564|MEF-2|MST156|MSTP156|myEF-2 myelin expression factor 2 protein-coding 154.333-34 chr10 63017871 63018151 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -115236 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 207.667-41 chr16 90033002 90033378 + 1 NA intron (NM_001286208, intron 4 of 9) intron (NM_001286208, intron 4 of 9) -3289 NR_122031 750 Hs.633032 NM_001214 ENSG00000221819 GAS8-AS1 C16orf3 GAS8 antisense RNA 1 ncRNA 142.667-193 chr6 125858955 125859218 + 1 NA intron (NM_181782, intron 3 of 15) intron (NM_181782, intron 3 of 15) -40228 NR_126386 104355145 Hs.590370 NR_126386 ENSG00000232131 NCOA7-AS1 - NCOA7 antisense RNA 1 ncRNA 182.333-80 chr2 53205283 53205545 + 1 NA Intergenic Intergenic -502799 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 195.333-185 chr5 159025525 159025850 + 1 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 72269 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 208.333-86 chr20 8225803 8226085 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) -22760 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 128.667-2 chr1 41450140 41450319 + 1 NA Intergenic Intergenic 34454 NM_001302269 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 152.667-322 chr6 49329708 49329896 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 133451 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 160.333-301 chr9 76075673 76075898 + 1 NA intron (NR_120409, intron 7 of 19) intron (NR_120409, intron 7 of 19) 185112 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 229.333-85 chr4 30738702 30739033 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 18498 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 151.667-75 chr12 1150271 1150558 + 1 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) intron (NR_027948, intron 7 of 19) 122666 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 216.667-57 chr2 104022023 104022330 + 1 NA Intergenic Intergenic 386156 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 262.667-85 chr9 111688100 111688619 + 1 NA intron (NM_173521, intron 25 of 25) intron (NM_173521, intron 25 of 25) 26754 NM_001017998 2790 Hs.534196 NM_001017998 ENSG00000242616 GNG10 - G protein subunit gamma 10 protein-coding 217.333-11 chr1 110920423 110920811 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 43305 NM_018372 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 240.333-55 chr20 43795377 43795768 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -68570 NM_176791 149699 Hs.447626 NM_176791 ENSG00000124196 GTSF1L C20orf65|FAM112A|dJ1028D15.4 gametocyte specific factor 1 like protein-coding 151.667-306 chr6 28198439 28198629 + 1 NA Intergenic Intergenic 20395 NR_002936 222699 Hs.161441 NR_002936 TOB2P1 TOB2P|TOB4p|p373c6.3 transducer of ERBB2, 2 pseudogene 1 pseudo 327.667-17 chr2 45482063 45482431 + 1 NA intron (NM_018079, intron 15 of 20) L1MD|LINE|L1 129020 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 155.667-302 chr6 41080854 41081057 + 1 NA intron (NM_002505, intron 3 of 9) intron (NM_002505, intron 3 of 9) 7981 NM_021705 4800 Hs.10441 NM_002505 ENSG00000001167 NFYA CBF-A|CBF-B|HAP2|NF-YA nuclear transcription factor Y subunit alpha protein-coding 228.667-38 chr2 12318499 12318770 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 119504 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 170.667-178 chr9 120660000 120660197 + 1 NA intron (NM_001080497, intron 1 of 5) intron (NM_001080497, intron 1 of 5) 54372 NM_001080497 1955 Hs.744903 NM_001080497 ENSG00000106780 MEGF9 EGFL5 multiple EGF like domains 9 protein-coding 128.667-61 chr15 46257714 46257928 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 552626 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 174.667-107 chr21 30622910 30623099 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 2377 NM_001350977 100151643 Hs.580879 NM_001350977 ENSG00000206105 KRTAP20-4 KAP20.4 keratin associated protein 20-4 protein-coding 155.667-202 chr21 29260342 29260643 + 1 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 -38430 NM_001186 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 130.667-97 chr18 50945327 50945511 + 1 NA intron (NM_002396, intron 15 of 15) AluSx1|SINE|Alu -22621 NM_018696 55520 Hs.657360 NM_018696 ENSG00000141642 ELAC1 D29 elaC ribonuclease Z 1 protein-coding 170.333-129 chr20 59106080 59106397 + 1 NA Intergenic Intergenic -63392 NR_037930 100533975 Hs.656865 NR_037929 SLMO2-ATP5E - SLMO2-ATP5E readthrough ncRNA 211.667-74 chr21 42101706 42102158 + 1 NA TTS (NR_027243) TTS (NR_027243) 6602 NR_027243 150147 Hs.558646 NM_152507 ENSG00000184385 UMODL1-AS1 C21orf128 UMODL1 antisense RNA 1 ncRNA 175.333-28 chr12 34278595 34278841 + 1 NA Intergenic L1P2|LINE|L1 256222 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 305.333-74 chr9 94739767 94740171 + 1 NA intron (NM_001193331, intron 1 of 7) MER74B|LTR|ERVL 13270 NM_001193331 84909 Hs.434253 NM_032823 ENSG00000148120 AOPEP AP-O|APO|C90RF3|C9orf3|ONPEP aminopeptidase O (putative) protein-coding 253.333-20 chr13 33895358 33895808 + 1 NA intron (NM_181558, intron 8 of 8) L1PB3|LINE|L1 77434 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 361.667-7 chr19 28630014 28630581 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MA5A|LINE|L1 23609 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 141.333-239 chr8 89488805 89489000 + 1 NA Intergenic MLT1F2-int|LTR|ERVL-MaLR 268809 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 141.333-165 chr3 187928185 187928347 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 48141 NR_135537 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 205.667-130 chr8 101062753 101063220 + 1 NA intron (NR_033962, intron 2 of 2) intron (NR_033962, intron 2 of 2) 10932 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 155.667-161 chr2 46592753 46593045 + 1 NA intron (NM_173074, intron 4 of 6) L1ME4b|LINE|L1 -12661 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 134.667-117 chr20 40263963 40264126 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 259583 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 183.667-26 chr10 73015370 73015628 + 1 NA intron (NM_001142596, intron 10 of 13) intron (NM_001142596, intron 10 of 13) -60693 NM_001318124 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 220.667-43 chr2 38093616 38093875 + 1 NA Intergenic Intergenic -17564 NM_000104 1545 Hs.154654 NM_000104 ENSG00000138061 CYP1B1 ASGD6|CP1B|CYPIB1|GLC3A|P4501B1 cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 protein-coding 174.667-113 chr3 45668254 45668428 + 1 NA exon (NM_014240, exon 4 of 8) exon (NM_014240, exon 4 of 8) 20541 NR_033947 644714 Hs.712889 NR_033947 LIMD1-AS1 - LIMD1 antisense RNA 1 ncRNA 158.667-322 chr8 92644251 92644565 + 1 NA intron (NR_125827, intron 2 of 4) intron (NR_125827, intron 2 of 4) 11086 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 166.333-159 chr3 152647287 152647545 + 1 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 -187715 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 237.333-56 chr2 101853499 101853934 + 1 NA intron (NM_145686, intron 12 of 30) HAL1|LINE|L1 -129749 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 163.333-61 chr12 6713239 6713531 + 1 NA Intergenic Intergenic -10661 NM_001164095 50813 Hs.530823 NM_016319 ENSG00000111652 COPS7A CSN7|CSN7A|SGN7a COP9 signalosome subunit 7A protein-coding 223.333-142 chr6 51272509 51272880 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -349176 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 242.333-67 chr3 43296507 43296951 + 1 NA intron (NM_001330750, intron 1 of 4) intron (NM_001330750, intron 1 of 4) 10189 NM_017719 54861 Hs.476052 NM_017719 ENSG00000163788 SNRK HSNFRK SNF related kinase protein-coding 194.333-24 chr10 78353427 78353717 + 1 NA Intergenic Intergenic 86230 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 144.667-226 chr4 146613245 146613403 + 1 NA Intergenic Intergenic -25569 NM_004575 5458 Hs.266 NM_004575 ENSG00000151615 POU4F2 BRN3.2|BRN3B|Brn-3b POU class 4 homeobox 2 protein-coding 154.667-24 chr1 189733949 189734242 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 741915 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 155.333-175 chr2 129653776 129653986 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 223610 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 165.667-31 chr11 112110150 112110554 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 23479 NM_001276504 6392 Hs.356270 NM_003002 ENSG00000204370 SDHD CBT1|CII-4|CWS3|PGL|PGL1|QPs3|SDH4|cybS succinate dehydrogenase complex subunit D protein-coding 160.333-115 chr15 68450303 68450533 + 1 NA Intergenic Intergenic -18255 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 119.333-227 chr8 137606834 137607008 + 1 NA Intergenic Intergenic -193333 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 146.667-177 chr2 143911195 143911357 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -25791 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 146.667-221 chr3 112266622 112266771 + 1 NA intron (NR_135297, intron 6 of 22) intron (NR_135297, intron 6 of 22) 27520 NM_001320531 285335 Hs.680112 NM_183061 ENSG00000172139 SLC9C1 NHE|NHE-10|SLC9A10|sperm-NHE solute carrier family 9 member C1 protein-coding 152.333-320 chr5 153440428 153440605 + 1 NA Intergenic Intergenic -50008 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 247.333-2 chr1 109447539 109447981 + 1 NA Intergenic Intergenic -18786 NM_001040709 284612 Hs.528366 NM_001006603 ENSG00000143028 SYPL2 MG29 synaptophysin like 2 protein-coding 279.667-26 chr2 190537132 190537468 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -2578 NR_136298 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 151.333-25 chr1 155397712 155397890 + 1 NA intron (NM_018489, intron 6 of 27) AluSx1|SINE|Alu -35379 NR_034180 645682 Hs.632482 NR_034180 ENSG00000237872 POU5F1P4 OCT3|OCT4|OTF-3|OTF3|Oct-3|Oct-4|Oct4-pg4|POU5F1|POU5FLC1 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 pseudo 168.333-87 chr19 46401395 46401655 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 12039 NM_032040 83987 Hs.97876 NM_032040 ENSG00000169515 CCDC8 3M3|PPP1R20|p90 coiled-coil domain containing 8 protein-coding 153.333-354 chr6 40476834 40476989 + 1 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 98574 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 150.333-220 chr2 170635676 170635878 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 31 of 33) intron (NM_001083615, intron 31 of 33) 78790 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 148.333-273 chr4 30521673 30521846 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -198610 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 187.333-62 chr14 69199264 69199457 + 1 NA intron (NM_001193363, intron 1 of 8) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 7594 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 255.333-59 chr2 187428171 187428602 + 1 NA intron (NM_005795, intron 1 of 14) intron (NM_005795, intron 1 of 14) 19866 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 204.667-89 chr21 29243932 29244372 + 1 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) intron (NR_027072, intron 1 of 1) 50658 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 121.667-67 chr15 79442216 79442374 + 1 NA intron (NM_015206, intron 1 of 3) intron (NM_015206, intron 1 of 3) 9779 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 159.667-117 chr15 94726338 94726589 + 1 NA Intergenic Intergenic -128900 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 157.333 chr1 8586267 8586528 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 4 of 22) L1ME3B|LINE|L1 -91484 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 159.333-344 chr8 139811228 139811433 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) HAL1|LINE|L1 -108207 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 158.333-330 chr8 126116666 126116842 + 1 NA Intergenic Intergenic -165557 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 154.667-190 chr2 153051021 153051181 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 332464 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 148.667-187 chr2 63963663 63963918 + 1 NA intron (NM_001005739, intron 6 of 22) intron (NM_001005739, intron 6 of 22) 55638 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 174.667-125 chr4 71745004 71745333 + 1 NA intron (NM_000583, intron 12 of 12) MIRb|SINE|MIR 38911 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 121.333-108 chr3 15753930 15754103 + 1 NA intron (NM_001349279, intron 4 of 28) intron (NM_001349279, intron 4 of 28) 2531 NM_001195099 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 200.667-151 chr8 27790718 27791015 + 1 NA intron (NM_001017420, intron 7 of 10) L1M5|LINE|L1 16312 NM_001017420 157570 Hs.99480 NM_001017420 ENSG00000171320 ESCO2 2410004I17Rik|EFO2|EFO2p|RBS|hEFO2 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 protein-coding 272.667-18 chr14 51130635 51131212 + 1 NA Intergenic Intergenic -35219 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 155.667-226 chr3 119364972 119365144 + 1 NA intron (NM_020754, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu -42298 NR_046748 100874246 Hs.607097 NR_046748 ENSG00000241155 ARHGAP31-AS1 - ARHGAP31 antisense RNA 1 ncRNA 178.333-73 chr2 47140296 47140604 + 1 NA intron (NM_001163561, intron 3 of 6) L1MC1|LINE|L1 14858 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 148.333-64 chr11 24094737 24094905 + 1 NA Intergenic Intergenic -402232 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 167.667-8 chr1 92310654 92310981 + 1 NA intron (NM_024813, intron 6 of 12) AluSx|SINE|Alu 11758 NM_024813 79871 Hs.444421 NM_024813 ENSG00000122484 RPAP2 C1orf82|Rtr1 RNA polymerase II associated protein 2 protein-coding 222.667-49 chr21 37301513 37301887 + 1 NA Intergenic Intergenic -33592 NM_001331018 10311 Hs.369488 NM_006052 ENSG00000157538 VPS26C DCRA|DSCR3|DSCRA VPS26 endosomal protein sorting factor C protein-coding 238.333-62 chr3 186861241 186861518 + 1 NA promoter-TSS (NR_046662) promoter-TSS (NR_046662) -11 NR_046662 100874095 Hs.638968 NR_046662 ENSG00000226482 ADIPOQ-AS1 - ADIPOQ antisense RNA 1 ncRNA 278.667-43 chr5 152403157 152403447 + 1 NA intron (NM_020167, intron 1 of 3) MIR3|SINE|MIR 1977 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 261.667-19 chr14 74656525 74656875 + 1 NA Intergenic Intergenic -44463 NM_000428 4053 Hs.512776 NM_000428 ENSG00000119681 LTBP2 C14orf141|GLC3D|LTBP3|MSPKA|MSTP031|WMS3 latent transforming growth factor beta binding protein 2 protein-coding 193.667-101 chr5 39144480 39144804 + 1 NA intron (NM_001243093, intron 3 of 18) AluSx1|SINE|Alu -70243 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 178.333-34 chr12 27739884 27740262 + 1 NA intron (NM_021821, intron 7 of 7) intron (NM_021821, intron 7 of 7) 29241 NM_021821 60488 Hs.714076 NM_021821 ENSG00000061794 MRPS35 HDCMD11P|MDS023|MRP-S28|MRPS28 mitochondrial ribosomal protein S35 protein-coding 207.667-106 chr6 64059399 64059658 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 33 of 43) intron (NM_001292009, intron 33 of 43) 252692 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 260.667-67 chr4 114528388 114528789 + 1 NA Intergenic Intergenic -69814 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 169.667-19 chr10 50402495 50402683 + 1 NA intron (NM_147156, intron 6 of 10) intron (NM_147156, intron 6 of 10) -153979 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 209.333-227 chr8 59570295 59570540 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 451207 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 272.333-6 chr10 114701042 114701524 + 1 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) L1ME2|LINE|L1 -16280 NM_001322882 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 171.333-73 chr2 26045886 26046158 + 1 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) intron (NM_016131, intron 1 of 5) 11938 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 143.667-136 chr2 177415692 177415947 + 1 NA intron (NM_003659, intron 1 of 19) intron (NM_003659, intron 1 of 19) 23046 NM_003659 8540 Hs.516543 NM_003659 ENSG00000018510 AGPS ADAP-S|ADAS|ADHAPS|ADPS|ALDHPSY|RCDP3 alkylglycerone phosphate synthase protein-coding 197.667-121 chr5 57085351 57085581 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -88482 NM_001331037 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 158.667-102 chr14 83447165 83447386 + 1 NA Intergenic Intergenic 804643 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 289.333-41 chr4 34478153 34478502 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -208580 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 200.667-119 chr4 52285863 52286132 + 1 NA Intergenic Intergenic 234693 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 238.667-96 chr9 26443561 26443982 + 1 NA Intergenic Intergenic 377096 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 217.667-71 chr5 6194348 6194650 + 1 NA Intergenic Intergenic 142793 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 165.667-79 chr18 6286942 6287121 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) intron (NM_001365769, intron 4 of 16) 30287 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 134.333-2 chr1 59180580 59180791 + 1 NA Intergenic Intergenic -33878 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 157.333-188 chr2 80885195 80885430 + 1 NA Intergenic Intergenic 571933 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 134.667-134 chr3 65336377 65336632 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -557312 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 158.667-94 chr14 43510560 43510754 + 1 NA Intergenic Intergenic 996626 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 251.667-100 chr8 127640386 127640733 + 1 NA Intergenic Intergenic 93408 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 140.333-155 chr3 192220814 192221079 + 1 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) intron (NM_004113, intron 4 of 5) -17684 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-24 chr1 195964330 195964611 + 1 NA Intergenic Intergenic 124245 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 131.667-166 chr5 121957119 121957341 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -4745 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 345.333-21 chr21 24762035 24762621 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -78222 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 124.667-178 chr6 89700304 89700540 + 1 NA intron (NM_014611, intron 56 of 101) MIR|SINE|MIR -61675 NM_020466 57226 Hs.177275 NM_020466 ENSG00000083099 LYRM2 DJ122O8.2 LYR motif containing 2 protein-coding 160.333-249 chr6 83375891 83376196 + 1 NA intron (NM_002395, intron 3 of 13) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 55008 NM_002395 4199 Hs.21160 NM_002395 ENSG00000065833 ME1 HUMNDME|MES malic enzyme 1 protein-coding 207.333-238 chr6 55568699 55568998 + 1 NA intron (NM_001287746, intron 1 of 9) intron (NM_001287746, intron 1 of 9) 10366 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 191.333-188 chr7 46965853 46966136 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -268872 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 126.667-41 chr12 128972580 128972770 + 1 NA intron (NM_144669, intron 7 of 7) MIR|SINE|MIR 119197 NM_001366886 144423 Hs.655668 NM_144669 ENSG00000151948 GLT1D1 - glycosyltransferase 1 domain containing 1 protein-coding 139.333-60 chr13 36688400 36688545 + 1 NA intron (NM_203451, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 14452 NM_203451 400120 Hs.422375 NM_203451 ENSG00000180440 SERTM1 C13orf36 serine rich and transmembrane domain containing 1 protein-coding 337.667-18 chr3 115518785 115519324 + 1 NA Intergenic Intergenic -104456 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 188.667-65 chr18 62819102 62819388 + 1 NA intron (NM_194449, intron 1 of 16) intron (NM_194449, intron 1 of 16) 103704 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 147.333-23 chr1 176728513 176728769 + 1 NA intron (NM_020318, intron 12 of 22) L1MEc|LINE|L1 265466 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 144.667-200 chr3 117799875 117800112 + 1 NA Intergenic Intergenic -109068 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 159.333-39 chr10 31761827 31762095 + 1 NA Intergenic Intergenic 146965 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 157.333-24 chr1 156300437 156300621 + 1 NA promoter-TSS (NM_001004319) promoter-TSS (NM_001004319) -892 NM_001004319 391104 Hs.532378 NM_001004319 ENSG00000189030 VHLL VHLP|VLP VHL like protein-coding 277.667-8 chr11 86921783 86922278 + 1 NA intron (NR_120592, intron 2 of 2) intron (NR_120592, intron 2 of 2) 33365 NM_012193 8322 Hs.591968 NM_012193 ENSG00000174804 FZD4 CD344|EVR1|FEVR|FZD4S|Fz-4|Fz4|FzE4|GPCR|hFz4 frizzled class receptor 4 protein-coding 205.667-14 chr1 222230392 222230744 + 1 NA Intergenic Intergenic -252048 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 302.667-37 chr9 24128385 24128765 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -277974 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 155.333-14 chr1 187593021 187593192 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 149478 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 192.333-88 chr2 55822358 55822575 + 1 NA Intergenic Intergenic 101316 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 132.667-4 chr1 68044699 68044842 + 1 NA intron (NR_040077, intron 2 of 9) intron (NR_040077, intron 2 of 9) 6861 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 142.667-218 chr8 69222978 69223142 + 1 NA Intergenic Intergenic -118870 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 165.667-128 chr3 124184751 124184986 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) intron (NM_001024660, intron 1 of 59) 51939 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 240.333-42 chr16 3107193 3107613 + 1 NA Intergenic Intergenic -5176 NM_001278158 7755 Hs.592088 NM_003456 ENSG00000122386 ZNF205 RhitH|ZNF210|Zfp13 zinc finger protein 205 protein-coding 144.333-59 chr13 63021342 63021528 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -214076 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 198.333-96 chr2 72811319 72811623 + 1 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) L1MC4a|LINE|L1 14562 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 175.667-32 chr13 50195472 50195803 + 1 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) intron (NR_109974, intron 2 of 6) 23619 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 170.333-35 chr10 82009229 82009509 + 1 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 131682 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 208.667-90 chr3 136345681 136345966 + 1 NA intron (NM_005862, intron 29 of 33) intron (NM_005862, intron 29 of 33) 95483 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 120.667-169 chr7 121510406 121510634 + 1 NA Intergenic HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 -114152 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 142.333-33 chr11 4192034 4192213 + 1 NA intron (NR_047550, intron 1 of 1) intron (NR_047550, intron 1 of 1) 4971 NR_047550 100506082 Hs.445705 NR_047550 ENSG00000254480 LINC02749 - long intergenic non-protein coding RNA 2749 ncRNA 220.333-83 chr22 27248894 27249236 + 1 NA Intergenic Intergenic -24386 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 143.333-110 chr16 65533417 65533620 + 1 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 42782 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 226.333-93 chr4 105405150 105405539 + 1 NA intron (NM_176867, intron 1 of 5) intron (NM_176867, intron 1 of 5) -52463 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 228.333-20 chr12 54566362 54566834 + 1 NA intron (NM_001165975, intron 1 of 14) intron (NM_001165975, intron 1 of 14) 5133 NM_001165975 5153 Hs.530871 NM_000924 ENSG00000123360 PDE1B HEL-S-79p|PDE1B1|PDES1B phosphodiesterase 1B protein-coding 151.333-79 chr11 60502961 60503137 + 1 NA intron (NM_017716, intron 4 of 6) intron (NM_017716, intron 4 of 6) 10271 NM_017716 54860 Hs.272789 NM_017716 ENSG00000071203 MS4A12 Ms4a10 membrane spanning 4-domains A12 protein-coding 204.333-129 chr3 112905868 112906136 + 1 NA Intergenic Intergenic -60052 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 240.667-66 chr5 45454339 45454882 + 1 NA intron (NM_021072, intron 3 of 7) intron (NM_021072, intron 3 of 7) 241770 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 128.333-180 chr7 31667886 31668123 + 1 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 -19013 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 184.333-146 chr8 5477475 5477805 + 1 NA Intergenic Intergenic -482726 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 149.333-300 chr5 13189013 13189243 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -156242 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 252.333-45 chr22 32416978 32417340 + 1 NA intron (NM_174932, intron 12 of 14) intron (NM_174932, intron 12 of 14) -4912 NM_014306 51493 Hs.474643 NM_014306 ENSG00000100220 RTCB C22orf28|DJ149A16.6|FAAP|HSPC117 RNA 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH ligase protein-coding 184.667-33 chr14 67556497 67556712 + 1 NA intron (NM_020715, intron 3 of 28) intron (NM_020715, intron 3 of 28) -22754 NM_001348546 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 162.667-213 chr5 51559398 51559684 + 1 NA Intergenic Intergenic 176093 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 369.333-9 chr18 9814203 9814775 + 1 NA intron (NM_006868, intron 4 of 6) intron (NM_006868, intron 4 of 6) -71484 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 157.333-225 chr3 39814147 39814351 + 1 NA intron (NM_001284424, intron 1 of 15) L1ME3Cz|LINE|L1 4589 NM_001284425 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 158.667-222 chr3 158998943 158999145 + 1 NA Intergenic Intergenic -70208 NM_001197114 100505385 Hs.134665 NM_001197113 ENSG00000283154 IQCJ-SCHIP1 - IQCJ-SCHIP1 readthrough protein-coding 164.667-25 chr10 53742366 53742683 + 1 NA Intergenic Intergenic -743706 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 140.333-50 chr12 41242800 41242964 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 54562 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 153.333-327 chr5 36728509 36728800 + 1 NA Intergenic Intergenic 122048 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 136.333-184 chr6 119227266 119227439 + 1 NA intron (NM_005907, intron 6 of 12) L1ME1|LINE|L1 -78159 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 213.333-100 chr2 121426133 121426520 + 1 NA intron (NM_001207051, intron 21 of 37) L1M4|LINE|L1 -104554 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 156.333-204 chr20 34627963 34628265 + 1 NA intron (NM_080476, intron 6 of 11) intron (NM_080476, intron 6 of 11) 49171 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 239.667-81 chrX 102526484 102526890 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -9948 NM_021992 11013 Hs.56145 NM_021992 ENSG00000158164 TMSB15A TMSB15|TMSB15B|TMSL8|TMSNB|Tb15|TbNB thymosin beta 15a protein-coding 120.333-148 chr5 15244381 15244526 + 1 NA intron (NR_109944, intron 1 of 2) intron (NR_109944, intron 1 of 2) 22107 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 163.333-171 chr21 31758768 31758961 + 1 NA Intergenic Intergenic -26746 NM_001145445 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 158.667-200 chr3 7247644 7247811 + 1 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) L1ME2|LINE|L1 287557 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 172.667-118 chr4 135583502 135583727 + 1 NA Intergenic Intergenic 304479 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 134.667-108 chr2 190357642 190357897 + 1 NA intron (NM_001128928, intron 2 of 6) L1ME4a|LINE|L1 14180 NM_002194 3628 Hs.32309 NM_002194 ENSG00000151689 INPP1 - inositol polyphosphate-1-phosphatase protein-coding 147.667-223 chr3 49659219 49659403 + 1 NA intron (NM_003458, intron 5 of 11) intron (NM_003458, intron 5 of 11) -15040 NM_001640 327 Hs.517969 NM_001640 ENSG00000164062 APEH AARE|ACPH|APH|D3F15S2|D3S48E|DNF15S2|OPH acylaminoacyl-peptide hydrolase protein-coding 168.667-123 chr20 55769412 55769614 + 1 NA Intergenic Intergenic 236006 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 221.333-113 chr5 68137429 68137767 + 1 NA Intergenic Intergenic -52278 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 141.333-9 chr1 109552916 109553198 + 1 NA intron (NM_006496, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 4442 NM_006496 2773 Hs.73799 NM_006496 ENSG00000065135 GNAI3 87U6|ARCND1 G protein subunit alpha i3 protein-coding 111.667-160 chr21 20484630 20484803 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -226031 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 166.667-7 chr1 74912024 74912246 + 1 NA Intergenic Intergenic -178727 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 157.333-29 chr1 178467865 178468033 + 1 NA intron (NM_004841, intron 15 of 15) intron (NM_004841, intron 15 of 15) -45160 NM_032126 84066 Hs.534501 NM_032126 ENSG00000240021 TEX35 C1orf49|TSC24 testis expressed 35 protein-coding 195.667-150 chr8 140193074 140193498 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -92751 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 190.667-91 chr4 93561792 93562020 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 12 of 14) L1MC1|LINE|L1 -266847 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 145.333-265 chr6 141489592 141489796 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 599105 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 150.667-305 chr5 67260342 67260506 + 1 NA Intergenic Intergenic -63625 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 148.333-210 chr2 202107312 202107466 + 1 NA intron (NM_001277372, intron 9 of 23) intron (NM_001277372, intron 9 of 23) 9669 NR_135243 729224 Hs.623895 NR_135243 KIAA2012-AS1 - KIAA2012 antisense RNA 1 ncRNA 179.667-154 chr9 124239330 124239747 + 1 NA Intergenic Intergenic -18068 NM_001166167 10783 Hs.197071 NM_014397 ENSG00000119408 NEK6 SID6-1512 NIMA related kinase 6 protein-coding 247.333-49 chr3 10797733 10798310 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -18207 NM_001317406 6538 Hs.655078 NM_014229 ENSG00000132164 SLC6A11 GAT-3|GAT3|GAT4 solute carrier family 6 member 11 protein-coding 147.667-117 chr15 89920818 89921005 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7959 NM_182616 348110 Hs.6734 NM_182616 ENSG00000242498 ARPIN C15orf38 actin related protein 2/3 complex inhibitor protein-coding 124.667-7 chr1 91824228 91824372 + 1 NA intron (NR_036634, intron 2 of 17) intron (NR_036634, intron 2 of 17) 61851 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 251.667-75 chr5 11151980 11152551 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 11 of 20) intron (NM_001288715, intron 11 of 20) -391031 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 143.333-187 chr3 104332735 104332919 + 1 NA Intergenic Intergenic -808711 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 315.333-34 chr4 171999829 172000449 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) intron (NM_001034845, intron 2 of 12) -186532 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 265.667-13 chr10 101293859 101294226 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -30492 NR_120621 101927419 Hs.638503 NR_120621 ENSG00000229649 LINC02681 - long intergenic non-protein coding RNA 2681 ncRNA 151.667-313 chr6 68108086 68108254 + 1 NA Intergenic Intergenic 52819 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 132.333-195 chr9 120946468 120946613 + 1 NA intron (NR_148450, intron 1 of 1) MER90a|LTR|ERV1 6291 NR_148450 110599590 NR_148450 C5-OT1 C5T1LNCRNA C5 3' UTR overlapping transcript 1 ncRNA 256.333-53 chr3 88642342 88642651 + 1 NA Intergenic Intergenic 304040 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 318.667-25 chr5 45847089 45847412 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -150870 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 260.333-19 chr14 58448688 58449004 + 1 NA intron (NM_001329944, intron 7 of 31) intron (NM_001329944, intron 7 of 31) 9165 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 146.667-73 chr12 46726105 46726290 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 99800 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 173.667-189 chr9 31703164 31703412 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -321798 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 121.667-58 chr14 61645786 61645968 + 1 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -49636 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 127.333-163 chr6 142607387 142607535 + 1 NA intron (NR_027311, intron 1 of 2) intron (NR_027311, intron 1 of 2) 30375 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 194.667-163 chr9 37768662 37768995 + 1 NA intron (NR_104612, intron 5 of 8) intron (NR_104612, intron 5 of 8) 15023 NM_144964 158234 Hs.655614 NM_144964 ENSG00000165275 TRMT10B RG9MTD3|bA3J10.9 tRNA methyltransferase 10B protein-coding 191.333-216 chr9 75009170 75009445 + 1 NA intron (NM_001320497, intron 3 of 7) AluJo|SINE|Alu 17844 NM_001320497 138199 Hs.567688 NM_152420 ENSG00000156017 CARNMT1 C9orf41|UPF0586 carnosine N-methyltransferase 1 protein-coding 137.667-119 chr3 36331640 36331788 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -48773 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 155.667-250 chr4 75060278 75060438 + 1 NA Intergenic Intergenic 24350 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 169.667-219 chr9 90715298 90715614 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -72632 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 191.667-23 chr11 25551812 25552064 + 1 NA Intergenic Intergenic -637185 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 203.333-139 chr2 105366560 105366818 + 1 NA intron (NM_001450, intron 4 of 5) intron (NM_001450, intron 4 of 5) 29149 NM_024093 79074 Hs.549577 NM_024093 ENSG00000135974 C2orf49 asw chromosome 2 open reading frame 49 protein-coding 141.667-241 chr9 23587464 23587621 + 1 NA intron (NR_121602, intron 11 of 27) intron (NR_121602, intron 11 of 27) 84857 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 160.333-276 chr8 71131946 71132108 + 1 NA Intergenic Intergenic 224679 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 158.333-193 chr3 9719203 9719429 + 1 NA intron (NM_001308388, intron 16 of 19) intron (NM_001308388, intron 16 of 19) -12413 NM_001319050 7862 Hs.1004 NM_004634 ENSG00000156983 BRPF1 BR140|IDDDFP bromodomain and PHD finger containing 1 protein-coding 148.667-263 chr3 177843494 177843687 + 1 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) intron (NR_110826, intron 1 of 2) 26725 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 188.667-62 chr18 37606242 37606479 + 1 NA Intergenic Intergenic -40562 NM_001353734 56853 Hs.435976 NM_020180 ENSG00000101489 CELF4 BRUNOL4|CELF-4 CUGBP Elav-like family member 4 protein-coding 239.667-70 chr7 94112159 94112535 + 1 NA Intergenic Intergenic -107992 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 166.333-226 chr8 80563559 80563780 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 77443 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 394.333-10 chr20 45438885 45439344 + 1 NA intron (NR_159957, intron 2 of 3) MER4B-int|LTR|ERV1 11692 NR_159957 105372631 Hs.729907 NR_159957 LOC105372631 - uncharacterized LOC105372631 ncRNA 155.333-234 chr3 102335588 102335801 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -99321 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 297.667-16 chr16 73276656 73277020 + 1 NA Intergenic Intergenic -109967 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 277.333-57 chr20 60460641 60461120 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 12096 NR_109903 101928048 Hs.572803 NR_109903 LOC101928048 - uncharacterized LOC101928048 ncRNA 213.667-57 chr3 148356038 148356460 + 1 NA intron (NR_146712, intron 3 of 4) AluJr|SINE|Alu 75358 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 135.333-74 chr18 59063768 59063950 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 28180 NR_024021 390858 Hs.716280 NR_024021 OACYLP ACYL3P O-acyltransferase like, pseudogene pseudo 160.333-4 chr1 32140325 32140581 + 1 NA intron (NM_012316, intron 1 of 13) L1MC5a|LINE|L1 32397 NM_012316 23633 Hs.470588 NM_012316 ENSG00000025800 KPNA6 IPOA7|KPNA7 karyopherin subunit alpha 6 protein-coding 166.667-121 chr2 162187599 162187814 + 1 NA intron (NM_004460, intron 20 of 25) intron (NM_004460, intron 20 of 25) -35459 NM_002054 2641 Hs.516494 NM_002054 ENSG00000115263 GCG GLP-1|GLP1|GLP2|GRPP glucagon protein-coding 114.667-135 chr2 116307708 116307825 + 1 NA Intergenic Intergenic 963951 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 153.333-306 chr4 87647945 87648169 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -2223 NM_004407 1758 Hs.652366 NM_004407 ENSG00000152592 DMP1 ARHP|ARHR|DMP-1 dentin matrix acidic phosphoprotein 1 protein-coding 164.667-84 chr15 74405411 74405618 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 5918 NR_106941 102465530 NR_106941 ENSG00000277391 MIR6881 hsa-mir-6881 microRNA 6881 ncRNA 139.333-176 chr4 187760263 187760482 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -87731 NR_110436 100506272 Hs.508163 NR_110436 ENSG00000250590 LINC02492 - long intergenic non-protein coding RNA 2492 ncRNA 133.667-42 chr12 66165843 66166020 + 1 NA intron (NM_001282606, intron 1 of 7) L1M3|LINE|L1 4141 NM_001282610 51643 Hs.505934 NM_016056 ENSG00000155957 TMBIM4 CGI-119|GAAP|LFG4|S1R|ZPRO transmembrane BAX inhibitor motif containing 4 protein-coding 147.667-21 chr1 180806051 180806258 + 1 NA exon (NM_001328662, exon 5 of 11) exon (NM_001328662, exon 5 of 11) -106743 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 213.667-7 chr1 195068140 195068453 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 1020419 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 144.667-193 chr3 76439096 76439292 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -600905 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 167.667-3 chr1 45095257 45095550 + 1 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 83149 NR_158185 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 136.333-33 chr11 96443813 96444021 + 1 NA intron (NR_047481, intron 4 of 4) intron (NR_047481, intron 4 of 4) 53904 NM_003772 8690 Hs.105940 NM_003772 ENSG00000183340 JRKL HHMJG JRK like protein-coding 176.667-123 chr5 116186744 116186969 + 1 NA non-coding (NR_146218, exon 7 of 7) non-coding (NR_146218, exon 7 of 7) -68887 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 166.667-62 chr14 50215035 50215234 + 1 NA intron (NM_006939, intron 1 of 22) AluY|SINE|Alu 16444 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 235.333-130 chr9 27349948 27350267 + 1 NA intron (NM_024761, intron 3 of 3) MER3|DNA|hAT-Charlie -52957 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 149.667-242 chr21 27372537 27372788 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -349717 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 151.333-121 chr14 31160372 31160658 + 1 NA intron (NM_015382, intron 10 of 42) intron (NM_015382, intron 10 of 42) 47278 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 183.667-146 chr8 140723830 140724206 + 1 NA intron (NM_001352718, intron 22 of 32) intron (NM_001352718, intron 22 of 32) -5449 NM_001352750 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 191.667-134 chr9 94293976 94294272 + 1 NA intron (NM_194320, intron 4 of 4) L1M5|LINE|L1 34520 NM_017561 54754 Hs.648183 NM_017561 ENSG00000130950 NUTM2F FAM22F|NUTMF NUT family member 2F protein-coding 144.667-97 chr15 61957986 61958247 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 37 of 81) intron (NM_001018088, intron 37 of 81) 102331 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 164.667-27 chr10 83946111 83946317 + 1 NA Intergenic Intergenic -193295 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 181.333-8 chr1 208282160 208282499 + 1 NA Intergenic (TCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -37945 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 170.333-80 chr14 86677403 86677662 + 1 NA Intergenic Intergenic -228246 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 162.333-273 chr9 70852829 70853101 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 3 of 25) intron (NM_001366143, intron 3 of 25) 16087 NM_001366154 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 154.333-83 chr14 43022706 43023040 + 1 NA Intergenic Intergenic 1416017 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 230.333-53 chr19 43922842 43923136 + 1 NA intron (NM_003425, intron 6 of 9) AluJo|SINE|Alu 12293 NM_003425 7596 Hs.381285 NM_003425 ENSG00000124459 ZNF45 KOX5|ZNF13 zinc finger protein 45 protein-coding 145.667-38 chr10 83301115 83301389 + 1 NA Intergenic Intergenic 375837 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 292.667-25 chr3 195408147 195408511 + 1 NA intron (NM_012287, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 34691 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 156.667-230 chr3 128120508 128120715 + 1 NA intron (NM_001319086, intron 1 of 9) intron (NM_001319086, intron 1 of 9) 3201 NM_003707 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 190.667-139 chr7 75604747 75605018 + 1 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) intron (NM_005338, intron 1 of 30) -76759 NR_028059 5387 Hs.659871 NM_005395 ENSG00000127957 PMS2P3 PMS2L3|PMS2L9|PMS5|PMSR3 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 3 pseudo 264.667-51 chr3 22255160 22255604 + 1 NA Intergenic Intergenic 298243 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 150.333-2 chr1 17234682 17234845 + 1 NA intron (NM_013358, intron 11 of 15).2 L2a|LINE|L2 -14335 NM_016233 51702 Hs.149195 NM_016233 ENSG00000142619 PADI3 PAD3|PDI3|UHS1 peptidyl arginine deiminase 3 protein-coding 239.333-107 chr8 100441859 100442234 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 59283 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 219.333-27 chr10 89547504 89547866 + 1 NA Intergenic Intergenic -12091 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 157.667-42 chr10 112884584 112884829 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 61210 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 192.667-59 chr14 77079645 77079955 + 1 NA Intergenic Intergenic -3609 NR_110553 102724190 Hs.562528 NR_110553 ENSG00000258819 LINC02289 - long intergenic non-protein coding RNA 2289 ncRNA 219.333-125 chr4 47776477 47776844 + 1 NA intron (NM_001278585, intron 2 of 19) intron (NM_001278585, intron 2 of 19) -54685 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 122.667-173 chr7 29587708 29587878 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 22260 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 151.333-142 chr15 33611131 33611363 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 18 of 102) intron (NM_001243996, intron 18 of 102) 300280 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 228.667-83 chr8 124022716 124023056 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 17 of 40) intron (NM_001039112, intron 17 of 40) 17896 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-50 chr10 82109173 82109335 + 1 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 123666 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 345.333-11 chr14 61438580 61439176 + 1 NA intron (NM_006255, intron 2 of 13) intron (NM_006255, intron 2 of 13) 117435 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 147.333-242 chr4 84283650 84283885 + 1 NA intron (NR_125909, intron 4 of 8) Eulor6A|DNA?|DNA? 15402 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 296.667-41 chr4 47713710 47714254 + 1 NA intron (NM_006587, intron 5 of 21) intron (NM_006587, intron 5 of 21) 61313 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 146.333-90 chr14 58206543 58206765 + 1 NA intron (NM_018477, intron 2 of 12) intron (NM_018477, intron 2 of 12) 6505 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 320.333-2 chr1 104443645 104444052 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 370825 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 295.333-38 chr3 114040476 114041001 + 1 NA intron (NR_148531, intron 2 of 14) L1M4|LINE|L1 15788 NM_001353766 57577 Hs.477159 NM_020817 ENSG00000163617 CCDC191 KIAA1407 coiled-coil domain containing 191 protein-coding 393.667-11 chr6 72577611 72578212 + 1 NA Intergenic Intergenic -43932 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 157.333-321 chr7 53869432 53869616 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -57593 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 186.333-150 chr7 80406259 80406656 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -32018 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 171.333-113 chr3 29345343 29345535 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 64127 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 148.667-401 chr9 130004314 130004475 + 1 NA intron (NM_001363755, intron 1 of 15) intron (NM_001363755, intron 1 of 15) 38795 NM_001363755 23048 Hs.189409 NM_015033 ENSG00000187239 FNBP1 FBP17 formin binding protein 1 protein-coding 196.333-67 chr17 70884202 70884448 + 1 NA Intergenic Intergenic 317854 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 139.667-38 chr12 55523126 55523361 + 1 NA Intergenic Intergenic -27984 NM_001005494 341418 Hs.495021 NM_001005494 ENSG00000179626 OR6C4 OR12-10 olfactory receptor family 6 subfamily C member 4 protein-coding 195.333-174 chr5 38135573 38135957 + 1 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) -12715 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 152.333-33 chr10 8042652 8042899 + 1 NA Intergenic Intergenic 9716 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 144.333-220 chr5 151173210 151173407 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -15529 NM_001363114 309 Hs.412117 NM_001155 ENSG00000197043 ANXA6 ANX6|CBP68|CPB-II|p68|p70 annexin A6 protein-coding 159.333-55 chr10 110724922 110725160 + 1 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 80705 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 152.667-206 chr2 187038904 187039127 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -189845 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 153.333-57 chr10 110340749 110340945 + 1 NA Intergenic Intergenic -35927 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 123.333-52 chr11 102402727 102402948 + 1 NA intron (NM_052932, intron 2 of 4) intron (NM_052932, intron 2 of 4) 49928 NM_052932 114908 Hs.503709 NM_052932 ENSG00000152558 TMEM123 KCT3|PORIMIN|PORMIN transmembrane protein 123 protein-coding 171.333-11 chr1 187341057 187341360 + 1 NA intron (NR_126347, intron 3 of 3) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -102420 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 142.333-205 chr5 133418197 133418375 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) L1ME2|LINE|L1 9420 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 292.667-2 chr10 55947994 55948359 + 1 NA Intergenic Intergenic -320234 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 191.333-44 chr12 33576283 33576649 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -136647 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 240.667-71 chr6 155649996 155650466 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 135387 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 269.333-57 chr3 13115753 13116078 + 1 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -42486 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 157.667-189 chr3 43563488 43563693 + 1 NA intron (NM_001346463, intron 8 of 12) L1MA4A|LINE|L1 58336 NM_001346466 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 176.333-15 chr1 219118893 219119121 + 1 NA intron (NR_038845, intron 3 of 4) intron (NR_038845, intron 3 of 4) 54781 NR_038845 643723 Hs.519774 NR_038845 LYPLAL1-DT LYPLAL1-AS1 LYPLAL1 divergent transcript ncRNA 270.667-35 chr4 2262649 2263100 + 1 NA promoter-TSS (NM_006454) promoter-TSS (NM_006454) -765 NM_006454 10608 Hs.655020 NM_006454 ENSG00000123933 MXD4 MAD4|MST149|MSTP149|bHLHc12 MAX dimerization protein 4 protein-coding 300.333-20 chr2 28843392 28843773 + 1 NA intron (NM_182756, intron 7 of 7) intron (NM_182756, intron 7 of 7) 26727 NM_017910 55006 Hs.468026 NM_017910 ENSG00000171103 TRMT61B - tRNA methyltransferase 61B protein-coding 126.333-114 chr22 46809005 46809190 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 35170 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 244.333-31 chr12 64406817 64407144 + 1 NA intron (NM_007235, intron 1 of 24) MIRb|SINE|MIR 2588 NM_007235 11260 Hs.85951 NM_007235 ENSG00000184575 XPOT XPO3 exportin for tRNA protein-coding 182.333-35 chr13 26617925 26618227 + 1 NA intron (NM_006646, intron 2 of 9) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 60373 NM_001291965 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 158.667-318 chr8 58550314 58550582 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2476 NM_001348341 6386 Hs.200804 NM_005625 ENSG00000137575 SDCBP MDA-9|MDA9|ST1|SYCL|TACIP18 syndecan binding protein protein-coding 340.667-14 chr3 178603139 178603778 + 1 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 44608 NM_005832 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 133.333-7 chr1 113707533 113707688 + 1 NA intron (NM_001323043, intron 11 of 18) intron (NM_001323043, intron 11 of 18) 51545 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 262.667-38 chr2 112998362 112998679 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -6939 NM_014440 27179 Hs.278910 NM_014440 ENSG00000136694 IL36A FIL1|FIL1(EPSILON)|FIL1E|IL-1F6|IL1(EPSILON)|IL1F6 interleukin 36 alpha protein-coding 158.333-105 chr16 65564504 65564726 + 1 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 11685 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 126.333-95 chr2 149583906 149584216 + 1 NA intron (NM_015702, intron 2 of 7) intron (NM_015702, intron 2 of 7) -3297 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 117.667-59 chr16 12863261 12863430 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -38253 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 163.333-155 chr2 161030013 161030259 + 1 NA Intergenic Intergenic -106819 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 249.667-51 chr20 39042852 39043319 + 1 NA Intergenic Intergenic 80741 NM_021931 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 154.333-372 chr9 87261800 87261962 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 113237 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 228.667-7 chr1 191702319 191702700 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -455953 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 137.667-110 chr20 39583292 39583462 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -358629 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 148.333-406 chr9 12115689 12115925 + 1 NA Intergenic Intergenic -577578 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 261.667-64 chr6 48402895 48403491 + 1 NA Intergenic Intergenic -334504 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 163.667-101 chr2 28907469 28907680 + 1 NA intron (NM_015131, intron 3 of 17) AluJb|SINE|Alu -6088 NR_003074 692209 NR_003074 ENSG00000264994 SNORD92 HBII-316 small nucleolar RNA, C/D box 92 snoRNA 153.667-253 chr3 78958317 78958635 + 1 NA intron (NM_002941, intron 3 of 30) intron (NM_002941, intron 3 of 30) 60983 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 120.333-38 chr11 109126362 109126537 + 1 NA Intergenic Intergenic -295741 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 159.333-51 chr10 90521672 90521927 + 1 NA intron (NR_110657, intron 2 of 6) AluJo|SINE|Alu 19006 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 236.333-89 chr8 31398570 31398919 + 1 NA Intergenic Intergenic -241008 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 128.667-144 chr5 73065693 73065886 + 1 NA intron (NM_001146032, intron 17 of 24) L1PB4|LINE|L1 -54786 NM_001161342 134285 Hs.162246 NM_173490 ENSG00000157111 TMEM171 PRP2 transmembrane protein 171 protein-coding 206.333-80 chr2 53186435 53186736 + 1 NA Intergenic Intergenic -483970 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 205.333-52 chr12 21042059 21042417 + 1 NA intron (NM_001009562, intron 5 of 12) L1MA1|LINE|L1 26542 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 135.333-79 chr2 15036779 15037006 + 1 NA Intergenic Intergenic 404175 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 286.333-23 chr2 150185911 150186269 + 1 NA Intergenic Intergenic 70917 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 156.333-274 chr4 177572014 177572250 + 1 NA Intergenic Intergenic -129629 NM_001171988 175 Hs.207776 NM_000027 ENSG00000038002 AGA AGU|ASRG|GA aspartylglucosaminidase protein-coding 124.667-18 chr1 179522252 179522513 + 1 NA intron (NR_073544, intron 21 of 25) L1MEd|LINE|L1 53566 NM_001297575 7827 Hs.412710 NM_014625 ENSG00000116218 NPHS2 PDCN|SRN1 NPHS2 stomatin family member, podocin protein-coding 237.333-42 chr17 54190170 54190530 + 1 NA Intergenic Intergenic 367423 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 145.333-330 chrX 81185606 81185854 + 1 NA intron (NM_030763, intron 1 of 6) L1MA3|LINE|L1 16183 NM_030763 79366 Hs.282204 NM_030763 ENSG00000198157 HMGN5 NBP-45|NSBP1 high mobility group nucleosome binding domain 5 protein-coding 126.667-60 chr16 10768079 10768273 + 1 NA 3' UTR (NM_001318873, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001318873, exon 8 of 8) 24307 NM_001323597 4682 Hs.81469 NM_002484 ENSG00000103274 NUBP1 CIAO5|NBP|NBP1|NBP35 nucleotide binding protein 1 protein-coding 207.667-22 chr12 41429460 41429689 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -8165 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 166.333-140 chr22 27190664 27190832 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 3232 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 140.667-35 chr10 59494838 59494997 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -131736 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 153.667-379 chr8 86134509 86134784 + 1 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) L1MD2|LINE|L1 35736 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 150.333-41 chr10 77277982 77278151 + 1 NA intron (NM_001271518, intron 1 of 27) intron (NM_001271518, intron 1 of 27) 72695 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 183.667-3 chr1 39840542 39840879 + 1 NA TTS (NM_001312691) TTS (NM_001312691) 42794 NM_017646 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 267.667-50 chr5 25581427 25581926 + 1 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 390723 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 254.667-7 chr10 36154884 36155264 + 1 NA Intergenic Intergenic 376772 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 150.667-6 chr1 38842445 38842670 + 1 NA intron (NM_022157, intron 6 of 6) L1ME3C|LINE|L1 17215 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 213.667-60 chr3 168906181 168906571 + 1 NA intron (NR_109989, intron 2 of 4) intron (NR_109989, intron 2 of 4) 4431 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 249.333-69 chr3 99509980 99510401 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -128404 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 131.667-107 chr20 2736771 2737005 + 1 NA intron (NM_001110514, intron 7 of 17) intron (NM_001110514, intron 7 of 17) 44010 NM_001110514 57593 Hs.471955 NM_020833 ENSG00000088881 EBF4 COE4|O/E-4 EBF family member 4 protein-coding 175.333-153 chr6 42236541 42236850 + 1 NA intron (NM_001297573, intron 15 of 17) intron (NM_001297573, intron 15 of 17) -18834 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 204.333-75 chr17 63396378 63396626 + 1 NA intron (NM_025185, intron 17 of 25) intron (NM_025185, intron 17 of 25) 43765 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 161.667-238 chr7 43571210 43571399 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -11804 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 166.333-126 chr2 180565724 180565903 + 1 NA Intergenic Intergenic -126291 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 182.333-58 chr15 84932154 84932487 + 1 NA intron (NM_001287761, intron 11 of 14) intron (NM_001287761, intron 11 of 14) 47658 NM_001287762 9154 Hs.459187 NM_004213 ENSG00000156222 SLC28A1 CNT1|HCNT1 solute carrier family 28 member 1 protein-coding 177.667-125 chr7 19122510 19122784 + 1 NA Intergenic Intergenic -5011 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 113.333-268 chr9 24766756 24766899 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -220930 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 144.333-257 chr8 19823937 19824149 + 1 NA exon (NM_018142, exon 7 of 17) exon (NM_018142, exon 7 of 17) 6627 NM_018142 55174 Hs.512627 NM_018142 ENSG00000104613 INTS10 C8orf35|INT10 integrator complex subunit 10 protein-coding 138.333-125 chr3 137341837 137342010 + 1 NA Intergenic Intergenic 383940 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 170.667-117 chr3 188064471 188064670 + 1 NA Intergenic Intergenic -88163 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 191.667-124 chr8 82424839 82425231 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -487069 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 220.333-133 chr8 117077027 117077361 + 1 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -57801 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 191.333-219 chr9 124192957 124193272 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -64492 NM_001166167 10783 Hs.197071 NM_014397 ENSG00000119408 NEK6 SID6-1512 NIMA related kinase 6 protein-coding 128.333-62 chr14 75448189 75448496 + 1 NA intron (NM_130469, intron 2 of 3) MER5A|DNA|hAT-Charlie 16208 NM_001135049 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 319.667-19 chr22 28460448 28460848 + 1 NA TTS (NR_106713) TTS (NR_106713) 779 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 315.333-40 chr5 135804658 135805299 + 1 NA intron (NM_001349335, intron 3 of 10) SATR2|Satellite|Satellite -1903 NR_049867 100847082 NR_049867 ENSG00000265924 MIR5692C1 - microRNA 5692c-1 ncRNA 171.333-189 chr8 26008625 26008799 + 1 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) intron (NM_022659, intron 6 of 15) 36701 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 252.333-38 chr2 190356355 190356937 + 1 NA intron (NM_001128928, intron 2 of 6) intron (NM_001128928, intron 2 of 6) 13057 NM_002194 3628 Hs.32309 NM_002194 ENSG00000151689 INPP1 - inositol polyphosphate-1-phosphatase protein-coding 240.667-80 chr8 78918701 78919076 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 81359 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 130.333-162 chr5 31863503 31863677 + 1 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) intron (NM_178140, intron 2 of 24) 72569 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 139.667-98 chr2 187317684 187317906 + 1 NA Intergenic Intergenic 130457 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 224.333-44 chr14 75781037 75781402 + 1 NA intron (NM_015072, intron 24 of 31) intron (NM_015072, intron 24 of 31) 119973 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 142.333-222 chr6 145928997 145929193 + 1 NA intron (NM_001370328, intron 16 of 31) intron (NM_001370328, intron 16 of 31) 35002 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 147.667-231 chr3 94216473 94216661 + 1 NA Intergenic Intergenic 153506 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 148.667-372 chr8 67153912 67154125 + 1 NA intron (NM_024790, intron 16 of 28) intron (NM_024790, intron 16 of 28) 70170 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 224.333-91 chr5 2381186 2381566 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -69175 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 134.667-178 chr7 2279776 2280005 + 1 NA intron (NM_013321, intron 1 of 10) intron (NM_013321, intron 1 of 10) -22313 NR_106895 102465503 NR_106895 ENSG00000284047 MIR6836 hsa-mir-6836 microRNA 6836 ncRNA 236.333-11 chr1 176481686 176482082 + 1 NA intron (NM_021936, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 18709 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 143.333-15 chr1 163290683 163290830 + 1 NA intron (NM_001254748, intron 2 of 5) intron (NM_001254748, intron 2 of 5) 31035 NR_045630 8490 Hs.24950 NM_003617 ENSG00000143248 RGS5 MST092|MST106|MST129|MSTP032|MSTP092|MSTP106|MSTP129 regulator of G protein signaling 5 protein-coding 139.667-132 chr4 32533975 32534149 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 183024 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 152.333-169 chr2 32506604 32506879 + 1 NA intron (NM_016252, intron 50 of 73) intron (NM_016252, intron 50 of 73) -25412 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 258.667-9 chr1 179988138 179988552 + 1 NA intron (NM_014810, intron 3 of 37) intron (NM_014810, intron 3 of 37) 33535 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 261.667-30 chr18 64058205 64058575 + 1 NA Intergenic Intergenic -45701 NR_033881 284294 Hs.385642 NR_033881 ENSG00000267134 LINC01924 - long intergenic non-protein coding RNA 1924 ncRNA 271.333-28 chr2 63023818 63024181 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) intron (NM_001142615, intron 19 of 22) 23712 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 159.667-323 chr8 100271446 100271662 + 1 NA intron (NM_001353837, intron 3 of 9) intron (NM_001353837, intron 3 of 9) 30639 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 237.667-80 chr8 127013238 127013640 + 1 NA non-coding (NR_045262, exon 1 of 2) non-coding (NR_045262, exon 1 of 2) 285 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 256.667-65 chr4 32817160 32817633 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 466358 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 132.667-132 chr4 124934851 124935056 + 1 NA Intergenic Intergenic -222221 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 169.333-56 chr12 77828958 77829155 + 1 NA Intergenic Intergenic -1838 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 214.667-27 chr11 92284112 92284433 + 1 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) L2c|LINE|L2 59238 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 119.667-166 chr6 55216484 55216629 + 1 NA intron (NM_001526, intron 2 of 7) MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR 110096 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 145.333-328 chrX 77158329 77158566 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -143915 NR_110406 101928469 Hs.640805 NR_110400 ENSG00000280870 MIR325HG MIR384HG MIR325 host gene ncRNA 175.333-210 chrX 83513631 83513957 + 1 NA Intergenic Intergenic 5504 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 237.333-10 chr1 220745012 220745397 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -3118 NM_001317338 54996 Hs.369042 NM_017898 ENSG00000117791 MARC2 MOSC2 mitochondrial amidoxime reducing component 2 protein-coding 154.333-89 chr14 56650578 56650844 + 1 NA Intergenic Intergenic 70913 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 118.333-189 chr7 18150325 18150570 + 1 NA intron (NM_001204144, intron 1 of 12) intron (NM_001204144, intron 1 of 12) -23138 NR_031635 100302140 NR_031635 ENSG00000221393 MIR1302-6 MIRN1302-6|hsa-mir-1302-6 microRNA 1302-6 ncRNA 158.667-219 chr3 127315600 127315890 + 1 NA Intergenic Intergenic -27699 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 260.333-42 chr4 101687975 101688264 + 1 NA Intergenic Intergenic -102488 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 146.333-79 chr13 56582296 56582494 + 1 NA Intergenic Intergenic -558523 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 167.667-186 chr6 102435058 102435384 + 1 NA Intergenic Intergenic 1036236 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 291.333-45 chr4 40864156 40864532 + 1 NA intron (NM_173075, intron 11 of 16) intron (NM_173075, intron 11 of 16) -7152 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 149.667-250 chr22 40865766 40865980 + 1 NA intron (NM_022098, intron 1 of 9) intron (NM_022098, intron 1 of 9) -3760 NM_145174 150353 Hs.585042 NM_145174 ENSG00000172404 DNAJB7 DJ5|HSC3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B7 protein-coding 186.667-18 chr10 97211138 97211551 + 1 NA intron (NR_037909, intron 11 of 14) intron (NR_037909, intron 11 of 14) -25385 NM_003061 6585 Hs.632082 NM_003061 ENSG00000187122 SLIT1 MEGF4|SLIL1|SLIT-1|SLIT3 slit guidance ligand 1 protein-coding 177.667-10 chr1 165830280 165830624 + 1 NA intron (NM_012474, intron 1 of 6) AluY|SINE|Alu 2838 NM_012474 7371 Hs.458360 NM_012474 ENSG00000143179 UCK2 TSA903|UK|UMPK uridine-cytidine kinase 2 protein-coding 223.333-17 chr10 53935151 53935512 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 26 of 34) L1M8|LINE|L1 -550899 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 157.333-6 chr1 45652354 45652526 + 1 NA intron (NM_021639, intron 6 of 12) intron (NM_021639, intron 6 of 12) -5755 NR_026768 728963 Hs.675157 NR_026768 RPS15AP10 RPS15A_4_42 ribosomal protein S15a pseudogene 10 pseudo 158.333-266 chr5 153013805 153014021 + 1 NA Intergenic L1M3d|LINE|L1 -41564 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 160.667-182 chr21 26902643 26902946 + 1 NA Intergenic Intergenic -51167 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 161.333-174 chr21 21060030 21060203 + 1 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) 61707 NM_001352595 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 198.667-136 chr4 65757407 65757745 + 1 NA Intergenic Intergenic -87081 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 119.667-61 chr16 3296629 3296863 + 1 NA Intergenic Intergenic -8660 NM_153028 7627 Hs.513292 NM_153028 ENSG00000162086 ZNF75A - zinc finger protein 75a protein-coding 282.333-59 chr8 89092614 89093117 + 1 NA Intergenic Intergenic 664846 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 150.333-26 chr1 191506741 191506921 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -278333 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 144.667-195 chr3 88044650 88044893 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 14225 NM_003663 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 155.667-241 chr4 39008748 39008979 + 1 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) L1PA17|LINE|L1 23546 NM_024943 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 249.667-49 chr2 222108317 222108656 + 1 NA Intergenic Intergenic -189661 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 112.667-73 chr15 38545295 38545533 + 1 NA intron (NM_001306086, intron 2 of 14) intron (NM_001306086, intron 2 of 14) 19400 NM_005739 10125 Hs.591127 NM_005739 ENSG00000172575 RASGRP1 CALDAG-GEFI|CALDAG-GEFII|RASGRP RAS guanyl releasing protein 1 protein-coding 167.333-273 chr9 36284314 36284566 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -7384 NM_001190388 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 216.333-142 chr8 135451962 135452279 + 1 NA Intergenic Intergenic -5336 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 116.667-100 chr2 103523858 103524079 + 1 NA Intergenic Intergenic -539539 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 177.667-2 chr1 38933932 38934281 + 1 NA intron (NM_017821, intron 1 of 7) AluSz6|SINE|Alu -4587 NM_001304746 54933 Hs.524626 NM_017821 ENSG00000158315 RHBDL2 RRP2 rhomboid like 2 protein-coding 257.667-4 chr1 228386893 228387354 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 9986 NR_106800 102465444 NR_106800 ENSG00000284311 MIR6742 hsa-mir-6742 microRNA 6742 ncRNA 165.333-159 chr3 24619013 24619183 + 1 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 -123390 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 153.667-322 chr5 105476671 105476933 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 377328 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 158.667-243 chr4 77395971 77396139 + 1 NA Intergenic HERVK3-int|LTR|ERVK -115698 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 156.333-250 chr3 141530501 141530770 + 1 NA intron (NM_006506, intron 4 of 23) intron (NM_006506, intron 4 of 23) 43608 NM_001303245 5922 Hs.98445 NM_006506 ENSG00000155903 RASA2 GAP1M RAS p21 protein activator 2 protein-coding 140.667-110 chr2 32033561 32033813 + 1 NA intron (NM_001321210, intron 3 of 5) AluSp|SINE|Alu 6118 NM_001321209 84661 Hs.531788 NM_032574 ENSG00000162961 DPY30 Cps25|HDPY-30|Saf19 dpy-30 histone methyltransferase complex regulatory subunit protein-coding 200.667-55 chr16 83806794 83807027 + 1 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -1068 NM_001537 3281 Hs.250899 NM_001537 ENSG00000230989 HSBP1 NPC-A-13 heat shock factor binding protein 1 protein-coding 145.667-220 chr5 87478893 87479102 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -65964 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 173.667-167 chr7 54982388 54982723 + 1 NA Intergenic Intergenic -36462 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 126.667-138 chr5 43542833 43543033 + 1 NA intron (NM_006451, intron 4 of 10) intron (NM_006451, intron 4 of 10) 14144 NM_006451 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 216.667-27 chr12 4079055 4079479 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -194495 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 255.333-29 chr14 38522173 38522523 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -266255 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 117.333-136 chr3 103095915 103096066 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 428126 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 157.333-112 chr14 85508092 85508304 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21827 NR_144387 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 242.667-66 chr3 8927766 8928151 + 1 NA intron (NM_020165, intron 7 of 12) L1PA4|LINE|L1 35514 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 215.667-129 chrX 100626035 100626394 + 1 NA TTS (NM_003270) TTS (NM_003270) 10592 NM_001278740 7105 Hs.43233 NM_003270 ENSG00000000003 TSPAN6 T245|TM4SF6|TSPAN-6 tetraspanin 6 protein-coding 139.333-62 chr13 63150957 63151166 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 177033 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 180.333-16 chr11 22949539 22949846 + 1 NA Intergenic Intergenic -89218 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 181.667-149 chr8 110853691 110854025 + 1 NA Intergenic Intergenic 173575 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 150.333-166 chr17 80377029 80377296 + 1 NA intron (NM_001256071, intron 53 of 67) intron (NM_001256071, intron 53 of 67) -38005 NR_148043 284131 Hs.389678 NM_173627 ENSG00000173818 ENDOV - endonuclease V protein-coding 141.667-163 chr4 62982603 62982821 + 1 NA Intergenic Intergenic -820947 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-110 chr5 52846286 52846579 + 1 NA intron (NM_181501, intron 1 of 28) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 58516 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 144.667-104 chr16 13980158 13980312 + 1 NA Intergenic Intergenic 35783 NR_110909 101927311 NR_110909 ENSG00000262097 LINC02185 - long intergenic non-protein coding RNA 2185 ncRNA 149.667-297 chr4 187370121 187370287 + 1 NA promoter-TSS (NR_149103) promoter-TSS (NR_149103) -444 NR_149103 105377602 Hs.582096 NR_149103 ENSG00000250042 LINC02514 - long intergenic non-protein coding RNA 2514 ncRNA 164.333-208 chr5 172241854 172242041 + 1 NA intron (NM_152277, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 41817 NM_152277 92181 Hs.131570 NM_152277 ENSG00000168246 UBTD2 DCUBP ubiquitin domain containing 2 protein-coding 159.333-181 chr2 230697145 230697320 + 1 NA intron (NR_040038, intron 1 of 3) MER92-int|LTR|ERV1 3297 NR_040038 151475 Hs.528154 NR_040038 ENSG00000226125 LINC01907 - long intergenic non-protein coding RNA 1907 ncRNA 197.667-97 chr3 175222277 175222693 + 1 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) 48611 NR_046713 100874244 Hs.581176 NR_046713 NAALADL2-AS2 - NAALADL2 antisense RNA 2 ncRNA 256.667-43 chr2 103187339 103187634 + 1 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -203057 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 149.667-192 chr2 37028272 37028527 + 1 NA intron (NM_019024, intron 23 of 35) intron (NM_019024, intron 23 of 35) 55973 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 140.333-40 chr11 82744611 82744896 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -10889 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 143.667-218 chr6 101855126 101855295 + 1 NA intron (NM_001166247, intron 9 of 16) L2a|LINE|L2 456225 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 115.333-76 chr14 77763136 77763363 + 1 NA intron (NR_161324, intron 1 of 1) intron (NR_161324, intron 1 of 1) -2093 NM_001318844 22938 Hs.445498 NM_012245 ENSG00000100603 SNW1 Bx42|FUN20|NCOA-62|PRPF45|Prp45|SKIIP|SKIP|SKIP1 SNW domain containing 1 protein-coding 162.333-53 chr12 40570349 40570660 + 1 NA exon (NM_173600, exon 174 of 174) exon (NM_173600, exon 174 of 174) -121935 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 271.333-46 chr3 68002670 68003087 + 1 NA intron (NM_001252216, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR -1369 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 164.667-256 chr9 86327075 86327279 + 1 NA intron (NM_001185059, intron 11 of 26) intron (NM_001185059, intron 11 of 26) 27233 NM_001185074 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 148.333-420 chrX 51394292 51394471 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12567 NM_203407 340602 Hs.97053 NM_203407 ENSG00000187690 EZHIP CXorf67 EZH inhibitory protein protein-coding 294.667-57 chr8 122311776 122312217 + 1 NA Intergenic Intergenic 256648 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 237.333-32 chr14 81755903 81756253 + 1 NA Intergenic LTR66|LTR|ERVL -12940 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 250.333-32 chr2 222812685 222812985 + 1 NA Intergenic Intergenic -48201 NM_004457 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 235.667-63 chr8 111915423 111915778 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 538961 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 231.667-39 chr20 42949167 42949606 + 1 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -19357 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 183.667-2 chr1 26682982 26683332 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 10974 NR_135804 101928728 Hs.128770 NR_135804 ENSG00000260063 LOC101928728 - uncharacterized LOC101928728 ncRNA 188.333-170 chr9 104886415 104886748 + 1 NA intron (NM_005502, intron 3 of 49) intron (NM_005502, intron 3 of 49) 41574 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 154.667-135 chr16 79911080 79911234 + 1 NA Intergenic Intergenic 115908 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 144.667-128 chr19 56865376 56865566 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 24569 NR_024059 100073347 Hs.467337 NR_024059 ENSG00000268654 MIMT1 LINC00067|MIM1|NCRNA00067 MER1 repeat containing imprinted transcript 1 ncRNA 143.333-306 chrX 142278132 142278392 + 1 NA Intergenic Intergenic -72972 NM_016249 51438 Hs.123536 NM_016249 ENSG00000046774 MAGEC2 CT10|HCA587|MAGEE1 MAGE family member C2 protein-coding 156.333-299 chr5 151494708 151494961 + 1 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 27314 NR_106752 102465246 NR_106752 ENSG00000276622 MIR6499 hsa-mir-6499|mir-6499 microRNA 6499 ncRNA 159.667-161 chr2 23150082 23150300 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -234988 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 163.667-131 chr20 8128624 8128862 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3523 NM_015192 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 303.667-24 chr8 85586287 85586903 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 69081 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 166.667-38 chr11 35475395 35475627 + 1 NA intron (NM_015430, intron 3 of 11) intron (NM_015430, intron 3 of 11) 50105 NM_015430 25891 Hs.55044 NM_015430 ENSG00000149090 PAMR1 DKFZP586H2123|FP938|RAMP peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1 protein-coding 113.333-53 chr11 98610871 98611006 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -410011 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 222.667-90 chr7 52401925 52402221 + 1 NA Intergenic Intergenic -633560 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 253.667-48 chr4 46926379 46926796 + 1 NA 3' UTR (NM_001204266, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001204266, exon 9 of 9) -17342 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 112.667-47 chr12 26947930 26948104 + 1 NA intron (NM_015633, intron 1 of 6) L1MB8|LINE|L1 9547 NM_015633 26127 Hs.591162 NM_015633 ENSG00000111790 FGFR1OP2 HSPC123-like|WIT3.0 FGFR1 oncogene partner 2 protein-coding 176.667-81 chr2 168779529 168779902 + 1 NA intron (NR_045787, intron 1 of 2) LTR1C1|LTR|ERV1 6714 NR_045786 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 231.333-49 chr17 47096386 47096677 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 92764 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 161.333-200 chr3 157598611 157598786 + 1 NA intron (NM_001130002, intron 4 of 4) intron (NM_001130002, intron 4 of 4) 55354 NM_001099777 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 253.667-53 chr4 141587907 141588234 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -48513 NM_000585 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 246.667-100 chr8 113849605 113850054 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -412890 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 138.667-150 chr4 58322698 58322876 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 213541 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 290.667-10 chr12 42515533 42515989 + 1 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) HAL1|LINE|L1 -31751 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 181.667-106 chr4 58606690 58606909 + 1 NA Intergenic Intergenic -70471 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 164.667-73 chr14 55692748 55693072 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -73335 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 210.333-130 chr5 33988458 33988742 + 1 NA non-coding (NR_037951, exon 9 of 9) non-coding (NR_037951, exon 9 of 9) -3907 NM_001012509 51151 Hs.278962 NM_016180 ENSG00000164175 SLC45A2 1A1|AIM1|MATP|OCA4|SHEP5 solute carrier family 45 member 2 protein-coding 158.667-2 chr1 28676037 28676201 + 1 NA intron (NM_024482, intron 1 of 9) intron (NM_024482, intron 1 of 9) 7335 NM_006582 10691 Hs.632373 NM_006582 ENSG00000162419 GMEB1 P96PIF|PIF96 glucocorticoid modulatory element binding protein 1 protein-coding 158.333-312 chr8 52053412 52053674 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -140819 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 239.333-15 chr10 65799366 65799693 + 1 NA Intergenic Intergenic 228104 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 124.667-201 chr8 16342161 16342396 + 1 NA Intergenic Intergenic -149487 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 392.667-3 chr15 62991575 62992347 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -50786 NM_001018004 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 212.667-35 chr14 41747917 41748232 + 1 NA intron (NM_001346173, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 141218 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 180.667-155 chr9 18353841 18354046 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -120210 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 179.667-42 chr13 93881196 93881485 + 1 NA intron (NM_005708, intron 3 of 8) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -22867 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 173.333-155 chr5 37595579 37595782 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) intron (NM_001345998, intron 9 of 17) 216362 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 282.667-52 chrX 17468738 17469083 + 1 NA intron (NM_198270, intron 1 of 7) L1ME3A|LINE|L1 43029 NR_039925 100616249 NR_039925 ENSG00000265465 MIR4768 - microRNA 4768 ncRNA 135.333-125 chr4 65227433 65227579 + 1 NA Intergenic Intergenic -223006 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 153.333-148 chr15 76527863 76528048 + 1 NA intron (NR_148227, intron 23 of 32) L2b|LINE|L2 -58692 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 127.333-83 chr2 117686830 117686983 + 1 NA Intergenic Intergenic -127785 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 172.667-172 chr9 123460542 123460786 + 1 NA intron (NM_001352968, intron 12 of 18) intron (NM_001352968, intron 12 of 18) 24958 NR_106972 102465688 NR_106972 ENSG00000274932 MIR7150 hsa-mir-7150 microRNA 7150 ncRNA 146.333-323 chr8 82867025 82867282 + 1 NA Intergenic Intergenic -44951 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 148.333-384 chr8 88994105 88994320 + 1 NA Intergenic Intergenic -666729 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 178.667-100 chr3 56136399 56136679 + 1 NA intron (NR_132749, intron 6 of 17) intron (NR_132749, intron 6 of 17) -283945 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 222.333-62 chr3 81248597 81249057 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 254959 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 120.667-157 chr7 24531084 24531262 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -42279 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 125.667-68 chr15 27295287 27295469 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) intron (NM_001270873, intron 3 of 5) -134059 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-166 chr2 22749891 22750183 + 1 NA Intergenic Intergenic 213558 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 188.667-116 chr4 77025727 77026118 + 1 NA intron (NM_001306147, intron 9 of 11) intron (NM_001306147, intron 9 of 11) 48988 NM_001348133 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 162.333-79 chr14 76875918 76876124 + 1 NA Intergenic Intergenic 49613 NM_194287 145497 Hs.147276 NM_194287 ENSG00000100565 LRRC74A C14orf166B|LRRC74 leucine rich repeat containing 74A protein-coding 162.667-92 chr15 100983161 100983458 + 1 NA intron (NM_024652, intron 3 of 33) MER33|DNA|hAT-Charlie 63952 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 182.667-43 chr14 54025872 54026116 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -69103 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 175.333-85 chr2 51105405 51105734 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 72968 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 193.333-128 chr3 147987506 147987828 + 1 NA Intergenic Intergenic -90492 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 147.333-204 chr22 27332003 27332161 + 1 NA Intergenic Intergenic 21431 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 165.333-196 chr4 142497153 142497329 + 1 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) intron (NM_003866, intron 2 of 26) 349294 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 179.667-66 chr17 78756217 78756560 + 1 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) L1ME1|LINE|L1 -19486 NM_001365040 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 250.333-15 chr12 40338614 40339050 + 1 NA intron (NM_198578, intron 40 of 50) intron (NM_198578, intron 40 of 50) -54562 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 221.667-12 chr11 20276335 20276825 + 1 NA Intergenic Intergenic -87105 NM_006410 10553 Hs.90753 NM_006410 ENSG00000109854 HTATIP2 CC3|SDR44U1|TIP30 HIV-1 Tat interactive protein 2 protein-coding 239.667-3 chr1 67023189 67023486 + 1 NA intron (NM_015139, intron 8 of 11) L1ME1|LINE|L1 30811 NM_015139 23169 Hs.213642 NM_015139 ENSG00000116704 SLC35D1 SHNKND|UGTREL7 solute carrier family 35 member D1 protein-coding 155.667-8 chr1 50657970 50658216 + 1 NA intron (NM_007051, intron 7 of 18) intron (NM_007051, intron 7 of 18) -234650 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 170.667-72 chr2 10509065 10509256 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 59432 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 153.667-3 chr1 42729557 42729790 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 10563 NM_001123395 149461 Hs.496270 NM_148960 ENSG00000164007 CLDN19 HOMG5 claudin 19 protein-coding 150.667-72 chr11 82797064 82797280 + 1 NA Intergenic Intergenic -63308 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 157.333-279 chr5 42509013 42509270 + 1 NA intron (NM_001242401, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 -38902 NM_001242402 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 170.333-22 chr1 239917412 239917716 + 1 NA Intergenic Intergenic -17692 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 238.667-23 chr14 31539549 31539831 + 1 NA Intergenic Intergenic -21714 NM_025152 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 136.667-112 chr22 36733019 36733163 + 1 NA intron (NR_134623, intron 2 of 3) intron (NR_134623, intron 2 of 3) 29215 NR_134623 105373021 Hs.401697 NR_134623 LOC105373021 - uncharacterized LOC105373021 ncRNA 191.333-49 chr12 121433897 121434239 + 1 NA intron (NM_001005366, intron 21 of 22) AluJb|SINE|Alu 10284 NR_106957 102465665 NR_106957 ENSG00000284402 MIR7107 hsa-mir-7107 microRNA 7107 ncRNA 176.667-113 chr4 111933188 111933398 + 1 NA Intergenic Intergenic -212161 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 164.667-212 chr6 145342673 145342860 + 1 NA Intergenic Intergenic 344111 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 217.333-24 chr10 76138888 76139213 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 356289 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 280.667-29 chr2 142832267 142832883 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -45089 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 360.667-5 chr14 61366472 61367013 + 1 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 45299 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 144.667-265 chr6 74072319 74072486 + 1 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 2951 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 211.333-247 chr8 121998228 121998573 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -356960 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 198.333-33 chr11 73093044 73093328 + 1 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) MER77B|LTR|ERVL 49132 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 156.333-196 chr2 152673774 152674076 + 1 NA intron (NM_001365601, intron 9 of 24) intron (NM_001365601, intron 9 of 24) 43536 NM_001365604 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 222.667-33 chr16 64387141 64387495 + 1 NA Intergenic Intergenic 734745 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 148.667-298 chr4 186702352 186702555 + 1 NA intron (NM_005245, intron 2 of 26) intron (NM_005245, intron 2 of 26) 21403 NM_005245 2195 Hs.481371 NM_005245 ENSG00000083857 FAT1 CDHF7|CDHR8|FAT|ME5|hFat1 FAT atypical cadherin 1 protein-coding 173.667-57 chr17 80950077 80950291 + 1 NA intron (NM_020761, intron 28 of 33) intron (NM_020761, intron 28 of 33) 21029 NR_148968 400627 Hs.591201 NR_148968 ENSG00000261924 LOC400627 - uncharacterized LOC400627 ncRNA 135.667-64 chr15 86489799 86489965 + 1 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) intron (NM_152336, intron 18 of 24) -172914 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 168.667-212 chr7 141954207 141954507 + 1 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -7383 NM_001301167 23601 Hs.446235 NM_013252 ENSG00000258227 CLEC5A CLECSF5|MDL-1|MDL1 C-type lectin domain containing 5A protein-coding 247.667-88 chr7 26415476 26415898 + 1 NA intron (NR_148500, intron 2 of 5) intron (NR_148500, intron 2 of 5) -16269 NR_136272 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 158.667-238 chr4 54795684 54795966 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 137897 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 152.667-176 chr2 54598606 54598787 + 1 NA intron (NM_178313, intron 1 of 30) intron (NM_178313, intron 1 of 30) 40302 NM_178313 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 290.333-44 chr7 22223633 22224191 + 1 NA intron (NM_012294, intron 8 of 25) MER58B|DNA|hAT-Charlie -29102 NM_001367602 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 155.667-323 chr7 24969155 24969375 + 1 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) L1ME4b|LINE|L1 10913 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 219.333 chr1 22995703 22996166 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 19918 NM_001242521 729059 Hs.236896 NM_001242521 ENSG00000227868 TEX46 C1orf234|TEX# testis expressed 46 protein-coding 222.333-11 chr10 68339511 68339866 + 1 NA intron (NM_001322437, intron 6 of 9) AluYh3|SINE|Alu -6760 NM_022129 64081 Hs.198158 NM_022129 ENSG00000108187 PBLD HEL-S-306|MAWBP|MAWDBP phenazine biosynthesis like protein domain containing protein-coding 166.667-34 chr11 19351225 19351509 + 1 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) intron (NM_001111018, intron 1 of 37) 643 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 274.333-63 chr7 105939610 105940130 + 1 NA Intergenic Intergenic -23394 NM_001301161 222256 Hs.150120 NM_152750 ENSG00000128536 CDHR3 CDH28 cadherin related family member 3 protein-coding 325.667-23 chr6 70417503 70417991 + 1 NA intron (NM_001331005, intron 2 of 19) intron (NM_001331005, intron 2 of 19) -3789 NR_147708 105377849 Hs.669000 NR_147708 ENSG00000224349 LOC105377849 - uncharacterized LOC105377849 ncRNA 144.667-250 chr5 170195021 170195386 + 1 NA intron (NR_108022, intron 3 of 4) intron (NR_108022, intron 3 of 4) 3938 NR_108022 100507267 Hs.634846 NR_108022 LINC01187 CTB-27N1.1|KIDR long intergenic non-protein coding RNA 1187 ncRNA 168.667-14 chr1 232458982 232459298 + 1 NA intron (NM_020808, intron 8 of 20) intron (NM_020808, intron 8 of 20) 56468 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 212.667-140 chr8 132473151 132473558 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 7741 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 156.333-378 chr9 77378613 77378802 + 1 NA intron (NM_001018038, intron 67 of 68) L1M4|LINE|L1 -68942 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-346 chr7 85803105 85803371 + 1 NA Intergenic Intergenic 382116 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 169.667-196 chr7 94358437 94358711 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 33618 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 300.333-6 chr10 63119416 63119900 + 1 NA Intergenic Intergenic -13589 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 168.667-176 chr5 81368188 81368435 + 1 NA intron (NM_130767, intron 3 of 14) L1MEc|LINE|L1 25823 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 272.667-50 chr5 12849094 12849438 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 181407 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 275.333-28 chr17 69549098 69549611 + 1 NA 3' UTR (NM_002758, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_002758, exon 12 of 12) -44633 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 216.667-97 chr7 35438861 35439124 + 1 NA Intergenic Intergenic 125137 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 212.667-121 chr6 43167043 43167332 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4082 NM_003131 6722 Hs.520140 NM_003131 ENSG00000112658 SRF MCM1 serum response factor protein-coding 131.667-81 chr18 67966891 67967047 + 1 NA Intergenic Intergenic -152147 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 143.333-195 chr3 189508321 189508554 + 1 NA Intergenic Intergenic -88309 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 137.333-16 chr10 31689033 31689259 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 219780 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 155.333-197 chr20 32833396 32833627 + 1 NA intron (NM_012325, intron 2 of 6) intron (NM_012325, intron 2 of 6) 13557 NM_012325 22919 Hs.472437 NM_012325 ENSG00000101367 MAPRE1 EB1 microtubule associated protein RP/EB family member 1 protein-coding 191.667-17 chr10 57358246 57358541 + 1 NA Intergenic Intergenic -53834 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 143.333-199 chr4 43532534 43532717 + 1 NA Intergenic Intergenic -40082 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 228.333-94 chr7 122651914 122652295 + 1 NA intron (NM_001167940, intron 3 of 29) intron (NM_001167940, intron 3 of 29) 47013 NM_139175 168433 Hs.126730 NM_139175 ENSG00000188050 RNF133 - ring finger protein 133 protein-coding 121.333-180 chr8 109292190 109292445 + 1 NA intron (NM_032869, intron 4 of 9) intron (NM_032869, intron 4 of 9) 37616 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 312.667-22 chr20 25352791 25353240 + 1 NA intron (NM_001042472, intron 1 of 12) intron (NM_001042472, intron 1 of 12) 37820 NM_001042472 26090 Hs.441550 NM_015600 ENSG00000100997 ABHD12 ABHD12A|BEM46L2|C20orf22|PHARC|dJ965G21.2|hABHD12 abhydrolase domain containing 12 protein-coding 147.667-54 chr11 48126471 48126723 + 1 NA intron (NM_001098503, intron 6 of 8) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 29815 NR_036119 100423000 NR_036119 ENSG00000263693 MIR3161 - microRNA 3161 ncRNA 180.667-96 chr3 83727272 83727475 + 1 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 1142202 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 209.333-240 chr8 100880568 100880799 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 69888 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 185.333-78 chr19 31522708 31522961 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -65355 NM_001278578 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 158.333-351 chrX 72505340 72505500 + 1 NA intron (NM_001166448, intron 2 of 4) LTR37A|LTR|ERV1 67423 NR_051952 55869 Hs.310536 NM_018486 ENSG00000147099 HDAC8 CDA07|CDLS5|HD8|HDACL1|KDAC8|MRXS6|RPD3|WTS histone deacetylase 8 protein-coding 183.667-108 chr4 78754324 78754560 + 1 NA Intergenic Intergenic -21908 NM_017593 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 264.667-74 chr6 155504751 155505263 + 1 NA Intergenic Intergenic -9837 NR_134596 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 200.333-94 chr3 94778252 94778618 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -159828 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 235.667-40 chr22 21700679 21701061 + 1 NA TTS (NM_148175) TTS (NM_148175) 34858 NM_148175 23759 Hs.438587 NM_014337 ENSG00000100023 PPIL2 CYC4|CYP60|Cyp-60|UBOX7|hCyP-60 peptidylprolyl isomerase like 2 protein-coding 147.333-140 chr17 60707830 60707982 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 4 of 25) L1M4|LINE|L1 30055 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 159.667-59 chr11 31790307 31790557 + 1 NA TTS (NM_019040) TTS (NM_019040) 10229 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 150.667-336 chr6 99381358 99381563 + 1 NA intron (NM_017421, intron 2 of 6) L2b|LINE|L2 12735 NM_017421 51805 Hs.713623 NM_017421 ENSG00000132423 COQ3 DHHBMT|DHHBMTASE|UG0215E05|bA9819.1 coenzyme Q3, methyltransferase protein-coding 310.333-21 chr2 34271365 34271993 + 1 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) L1MCb|LINE|L1 204453 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 171.333-117 chr3 40149488 40149715 + 1 NA intron (NM_001284426, intron 1 of 14) intron (NM_001284426, intron 1 of 14) 49590 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 199.667-75 chr2 75910623 75910988 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -199890 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 153.333-219 chr2 164369685 164369891 + 1 NA Intergenic Intergenic 198707 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 137.333-20 chr10 82770435 82770597 + 1 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -537596 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-279 chr8 71170083 71170295 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 186517 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 324.667-34 chr7 51862522 51862960 + 1 NA Intergenic Intergenic -469485 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 180.333-9 chr1 200383572 200383896 + 1 NA Intergenic Intergenic -9942 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 125.333-29 chr10 99899900 99900117 + 1 NA exon (NM_001318326, exon 4 of 14) exon (NM_001318326, exon 4 of 14) 14084 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 121.333-154 chr6 5927087 5927271 + 1 NA Intergenic Intergenic 76865 NM_001278711 51299 Hs.103291 NM_016588 ENSG00000124785 NRN1 NRN|dJ380B8.2 neuritin 1 protein-coding 200.667-160 chr8 121344744 121345098 + 1 NA Intergenic Intergenic -294425 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-23 chr1 223381406 223381674 + 1 NA Intergenic Intergenic -11875 NM_152610 164127 Hs.192090 NM_152610 ENSG00000178395 CCDC185 C1orf65 coiled-coil domain containing 185 protein-coding 151.333-318 chr4 112269975 112270150 + 1 NA non-coding (NR_136622, exon 10 of 10) non-coding (NR_136622, exon 10 of 10) 15842 NM_052864 92610 Hs.310640 NM_052864 ENSG00000145365 TIFA T2BP|T6BP|TIFAA TRAF interacting protein with forkhead associated domain protein-coding 144.333-175 chr3 125535019 125535220 + 1 NA intron (NM_022776, intron 11 of 12) L1MEc|LINE|L1 -14917 NR_073435 8723 Hs.507243 NM_003794 ENSG00000114520 SNX4 ATG24B sorting nexin 4 protein-coding 168.667-147 chr3 120126591 120126816 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -32256 NM_001146156 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 170.333-42 chr10 123162020 123162199 + 1 NA intron (NM_004725, intron 5 of 7) intron (NM_004725, intron 5 of 7) 7707 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 153.333-372 chr6 169551778 169552076 + 1 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) MER58A|DNA|hAT-Charlie 150102 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 158.667-136 chr18 45000024 45000232 + 1 NA intron (NM_015559, intron 4 of 5) intron (NM_015559, intron 4 of 5) -29962 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 150.667-116 chr14 54357408 54357596 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -39366 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 161.333-51 chr11 35251835 35252089 + 1 NA 3' UTR (NM_004171, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_004171, exon 11 of 11) 89012 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 123.333-133 chr21 16518027 16518153 + 1 NA intron (NR_136546, intron 2 of 2) intron (NR_136546, intron 2 of 2) -17482 NR_136547 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 143.667-59 chr12 108314778 108314937 + 1 NA intron (NM_001142344, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 5805 NM_001142345 1240 Hs.197143 NM_004072 ENSG00000174600 CMKLR1 CHEMERINR|ChemR23|DEZ|RVER1 chemerin chemokine-like receptor 1 protein-coding 214.667-60 chr2 33627804 33628107 + 1 NA Intergenic Intergenic -28593 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 182.333-43 chr14 59676890 59677206 + 1 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) intron (NM_021136, intron 3 of 8) -30028 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 149.667-351 chr6 75086430 75086645 + 1 NA 3' UTR (NM_004370, exon 66 of 66) 3' UTR (NM_004370, exon 66 of 66) 42245 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 175.667-25 chr11 33830347 33830704 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 39353 NM_001142316 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 157.333-209 chr2 228646569 228646734 + 1 NA Intergenic Intergenic -35256 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 172.667-111 chr4 87238348 87238598 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -17855 NM_001292006 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 212.667-48 chr16 68445391 68445750 + 1 NA intron (NM_018667, intron 1 of 8) intron (NM_018667, intron 1 of 8) 2938 NM_018667 55512 Hs.368421 NM_018667 ENSG00000103056 SMPD3 NSMASE2 sphingomyelin phosphodiesterase 3 protein-coding 151.333-34 chr1 223284778 223284931 + 1 NA intron (NM_017982, intron 3 of 8) L1MA5A|LINE|L1 79322 NM_001037175 55061 Hs.497841 NM_017982 ENSG00000143502 SUSD4 PRO222 sushi domain containing 4 protein-coding 153.667-275 chr4 10745252 10745418 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -60567 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 120.333-20 chr10 49493926 49494161 + 1 NA intron (NM_001346440, intron 7 of 20) intron (NM_001346440, intron 7 of 20) 30238 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 195.667-52 chr15 87603938 87604333 + 1 NA Intergenic Intergenic 27206 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 166.333-151 chr3 42222314 42222509 + 1 NA intron (NM_001349247, intron 16 of 16) intron (NM_001349247, intron 16 of 16) 41536 NM_001174138 885 Hs.458426 NM_000729 ENSG00000187094 CCK - cholecystokinin protein-coding 152.667-222 chr20 32954613 32954782 + 1 NA intron (NM_001143967, intron 23 of 26) L1ME1|LINE|L1 49736 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 155.667-116 chr15 65696687 65696898 + 1 NA TTS (NR_145750) TTS (NR_145750) 144 NR_145750 109617020 NR_145750 ENSG00000238311 SNORD13E - small nucleolar RNA, C/D box 13E snoRNA 199.333-128 chr2 78011491 78011825 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR -56632 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 160.333-269 chr7 139047553 139047785 + 1 NA exon (NM_001363491, exon 13 of 13) exon (NM_001363491, exon 13 of 13) -3512 NR_162108 113218503 NR_162108 MIR10399 - microRNA 10399 ncRNA 193.333-122 chr3 79227435 79227823 + 1 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) L2|LINE|L2 -184098 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 136.667-39 chr12 79403407 79403570 + 1 NA intron (NM_001291901, intron 8 of 9) MLT2D|LTR|ERVL -15769 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 163.333-259 chr7 48411867 48412180 + 1 NA intron (NM_152701, intron 40 of 61) intron (NM_152701, intron 40 of 61) 240565 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 151.333-370 chr6 137510419 137510680 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -16155 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 300.667-14 chr18 13028947 13029493 + 1 NA intron (NM_032142, intron 9 of 44) intron (NM_032142, intron 9 of 44) 37858 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 216.333-132 chr7 104200530 104200924 + 1 NA intron (NM_181747, intron 3 of 8) intron (NM_181747, intron 3 of 8) 7286 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 156.333-98 chr14 20363373 20363545 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 19845 NM_005484 10038 Hs.409412 NM_005484 ENSG00000129484 PARP2 ADPRT2|ADPRTL2|ADPRTL3|ARTD2|PARP-2|pADPRT-2 poly(ADP-ribose) polymerase 2 protein-coding 151.667-192 chr20 33795771 33795952 + 1 NA intron (NR_110623, intron 2 of 3) intron (NR_110623, intron 2 of 3) 15238 NR_110623 101929746 Hs.504633 NR_110623 ENSG00000230753 ZNF341-AS1 - ZNF341 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-213 chr2 219718862 219719156 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 91379 NM_005070 6508 Hs.1176 NM_005070 ENSG00000114923 SLC4A3 AE3|CAE3/BAE3|SLC2C solute carrier family 4 member 3 protein-coding 250.333-13 chr11 110607168 110607565 + 1 NA intron (NM_020809, intron 9 of 15) intron (NM_020809, intron 9 of 15) 104459 NM_001258415 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 165.667-135 chr3 196673556 196673756 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 33962 NM_198565 375387 Hs.702186 NM_198565 ENSG00000174004 NRROS ELLP3030|GARPL1|LRRC33|UNQ3030 negative regulator of reactive oxygen species protein-coding 123.667-185 chr8 119091131 119091293 + 1 NA exon (NM_006438, exon 3 of 6) exon (NM_006438, exon 3 of 6) -22430 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 184.667-140 chr9 25191179 25191439 + 1 NA Intergenic Intergenic 487549 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 149.667-346 chr6 53683449 53683712 + 1 NA Intergenic Intergenic -17824 NM_001003760 401265 Hs.131064 NM_001003760 ENSG00000124743 KLHL31 BKLHD6|KBTBD1|KLHL|bA345L23.2 kelch like family member 31 protein-coding 147.667-205 chr20 49011547 49011795 + 1 NA intron (NM_006420, intron 27 of 38) intron (NM_006420, intron 27 of 38) 34385 NR_110625 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 198.667-150 chr5 53037722 53038023 + 1 NA intron (NR_073106, intron 2 of 29) intron (NR_073106, intron 2 of 29) 48520 NR_073107 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 131.667-37 chr11 111860960 111861118 + 1 NA intron (NR_147984, intron 4 of 15) MIRb|SINE|MIR 10242 NM_001352415 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 153.667-88 chr12 29578276 29578459 + 1 NA intron (NM_001367875, intron 10 of 19) intron (NM_001367875, intron 10 of 19) -78674 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 160.333-87 chr13 56761600 56761776 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -379230 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 153.667-54 chr10 116305633 116305939 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -18662 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 111.667-259 chr8 100665384 100665535 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -15794 NM_152628 169166 Hs.567758 NM_152628 ENSG00000174226 SNX31 - sorting nexin 31 protein-coding 285.667-47 chr7 29978265 29978671 + 1 NA intron (NM_001145514, intron 1 of 7) intron (NM_001145514, intron 1 of 7) 11333 NM_001145515 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 194.667-103 chr3 194227173 194227456 + 1 NA intron (NR_125403, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 -20334 NR_125402 101929337 Hs.548086 NR_125402 ENSG00000238097 LINC02037 - long intergenic non-protein coding RNA 2037 ncRNA 275.333-23 chr14 69021871 69022474 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 42490 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 197.667-149 chr8 107900601 107900897 + 1 NA 3' UTR (NM_001317942, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001317942, exon 5 of 5) 181190 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 143.667-97 chr17 28123108 28123280 + 1 NA intron (NM_016231, intron 2 of 10) intron (NM_016231, intron 2 of 10) 80517 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 301.667-5 chr10 32184821 32185356 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -128663 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 164.333-186 chr5 6474030 6474214 + 1 NA intron (NM_001145161, intron 1 of 1) intron (NM_001145161, intron 1 of 1) 25263 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 257.333-110 chr9 2741278 2741577 + 1 NA Intergenic Intergenic 23917 NM_133497 169522 Hs.622675 NM_133497 ENSG00000168263 KCNV2 KV11.1|Kv8.2|RCD3B potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 2 protein-coding 157.667-210 chr4 51910852 51911153 + 1 NA intron (NM_015115, intron 8 of 9) intron (NM_015115, intron 8 of 9) 67423 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 194.333-163 chrX 95527578 95527894 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -464510 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 171.333-107 chr22 27135596 27135821 + 1 NA Intergenic Intergenic -51808 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 165.667-107 chr20 36423778 36423994 + 1 NA intron (NM_001365621, intron 2 of 12) AluSx|SINE|Alu -37582 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 331.667-16 chr4 71385223 71385706 + 1 NA intron (NM_003759, intron 3 of 22) AluSp|SINE|Alu 46411 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 191.333-95 chr18 7905362 7905599 + 1 NA intron (NM_002845, intron 3 of 30) intron (NM_002845, intron 3 of 30) 338164 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 160.667-227 chr4 83298699 83298974 + 1 NA intron (NM_001098540, intron 11 of 11) intron (NM_001098540, intron 11 of 11) -13702 NM_015697 27235 Hs.144304 NM_015697 ENSG00000173085 COQ2 CL640|COQ10D1|MSA1|PHB:PPT coenzyme Q2, polyprenyltransferase protein-coding 286.667-21 chr22 28397993 28398394 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -61676 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 141.667-202 chr7 9761770 9761996 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 127613 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 215.667-94 chr4 97849072 97849490 + 1 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) L1PA2|LINE|L1 294195 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 248.333-64 chr3 154077612 154078038 + 1 NA intron (NR_037901, intron 2 of 3) intron (NR_037901, intron 2 of 3) -43178 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 181.333-45 chr14 70493401 70493595 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -9742 NR_037933 317760 Hs.188369 NR_037933 ENSG00000259158 ADAM20P1 C14orf55 ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene 1 pseudo 136.667-164 chr7 11036224 11036380 + 1 NA intron (NR_033436, intron 7 of 16) intron (NR_033436, intron 7 of 16) 62430 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 130.667-177 chr6 10276614 10276859 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -127766 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 149.667-52 chr10 54563952 54564121 + 1 NA intron (NM_001142771, intron 2 of 34) intron (NM_001142771, intron 2 of 34) 43921 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 181.333-180 chr8 113853179 113853443 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -416372 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 197.667-8 chr1 157434242 157434567 + 1 NA Intergenic LTR19-int|LTR|ERV1 118111 NM_031281 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 165.667-192 chr8 9630195 9630432 + 1 NA intron (NM_003747, intron 3 of 26) intron (NM_003747, intron 3 of 26) 74401 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 131.333-69 chr18 4869902 4870110 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -211176 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 164.333-160 chr3 104888944 104889120 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -477681 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 212.333-16 chr10 44164681 44164945 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -127937 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 121.333-136 chr4 107459252 107459417 + 1 NA Intergenic Intergenic 260900 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 208.333 chr1 17086977 17087363 + 1 NA intron (NM_007365, intron 6 of 15) intron (NM_007365, intron 6 of 15) 32281 NM_007365 11240 Hs.33455 NM_007365 ENSG00000117115 PADI2 PAD-H19|PAD2|PDI2 peptidyl arginine deiminase 2 protein-coding 138.333-168 chr6 67811922 67812183 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -243299 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 168.667-73 chr16 6104852 6105122 + 1 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) intron (NM_018723, intron 1 of 15) 85284 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 219.333-138 chr5 16143177 16143513 + 1 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 36446 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 147.333-213 chr3 69358168 69358359 + 1 NA intron (NM_015123, intron 1 of 22) MER45A|DNA|hAT-Tip100 27825 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 234.333-43 chr2 186621485 186621789 + 1 NA intron (NM_001145000, intron 2 of 27) L1MC4|LINE|L1 21432 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 191.333-3 chr1 51395416 51395627 + 1 NA intron (NM_001159969, intron 8 of 12) (ACACACAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26574 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 146.667-171 chr2 107664725 107665008 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -89246 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 163.333-295 chr9 37324658 37324921 + 1 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) intron (NR_110317, intron 4 of 7) -97907 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 153.667-234 chr22 27313479 27313770 + 1 NA non-coding (NR_134581, exon 1 of 2) non-coding (NR_134581, exon 1 of 2) 2973 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 154.667-14 chr1 97918232 97918513 + 1 NA intron (NM_000110, intron 1 of 22) MIR|SINE|MIR 2687 NM_000110 1806 Hs.335034 NM_000110 ENSG00000188641 DPYD DHP|DHPDHASE|DPD dihydropyrimidine dehydrogenase protein-coding 166.667-63 chr14 52234478 52234681 + 1 NA Intergenic Intergenic -33119 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 255.667-73 chr6 4259479 4259781 + 1 NA Intergenic Intergenic -69601 NR_125874 102724096 Hs.571140 NR_125874 LOC102724096 - uncharacterized LOC102724096 ncRNA 142.333-100 chr17 31221344 31221590 + 1 NA intron (NM_001042492, intron 14 of 57) intron (NM_001042492, intron 14 of 57) 75772 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 201.667-45 chr16 77503130 77503502 + 1 NA Intergenic Intergenic -68282 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 249.333-37 chr15 79869694 79869997 + 1 NA intron (NR_037654, intron 2 of 2) intron (NR_037654, intron 2 of 2) 27152 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 261.333-52 chr2 192370686 192371058 + 1 NA Intergenic Intergenic -175939 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 113.667-177 chr5 133702058 133702237 + 1 NA Intergenic Intergenic -89606 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 114.667-62 chr12 41557877 41558024 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 7 of 9) intron (NM_001164595, intron 7 of 9) 120211 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 160.333-103 chr14 66821476 66821703 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) L2c|LINE|L2 314182 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 146.333-160 chr2 156245272 156245552 + 1 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) intron (NR_110250, intron 1 of 3) 9519 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 154.667-173 chr2 62881678 62881931 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) intron (NM_001142615, intron 10 of 22) 165907 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 167.333-82 chr14 63981624 63981845 + 1 NA intron (NM_015180, intron 16 of 114) intron (NM_015180, intron 16 of 114) 113391 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 170.333-72 chr14 50363355 50363542 + 1 NA intron (NM_001282236, intron 2 of 8) intron (NM_001282236, intron 2 of 8) 33433 NM_001367065 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 140.333-253 chrX 58225957 58226212 + 1 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -315451 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 320.667-19 chr18 35029165 35029567 + 1 NA intron (NM_001143827, intron 2 of 7) intron (NM_001143827, intron 2 of 7) -12047 NM_001256420 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 157.333-74 chr11 119761793 119762058 + 1 NA Intergenic Intergenic 32342 NR_120587 102724301 Hs.637640 NR_120587 ENSG00000254854 LOC102724301 - uncharacterized LOC102724301 ncRNA 226.333-51 chr18 12532586 12532982 + 1 NA intron (NM_020148, intron 4 of 15) intron (NM_020148, intron 4 of 15) 100010 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 125.667-134 chr4 80100502 80100656 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -27107 NM_001286780 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 165.667-109 chr20 51015544 51015746 + 1 NA intron (NM_002237, intron 1 of 2) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 7462 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 153.333-449 chrX 42525369 42525628 + 1 NA Intergenic Intergenic 252665 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 120.667-24 chr10 121346130 121346367 + 1 NA Intergenic Intergenic 185066 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 122.667-41 chr13 44610187 44610309 + 1 NA Intergenic Intergenic -30121 NR_149082 106144541 Hs.578031 NR_149082 LINC00407 - long intergenic non-protein coding RNA 407 ncRNA 219.667-21 chr14 64888790 64889122 + 1 NA Intergenic Intergenic -9049 NM_001355437 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 144.333-48 chr12 22856027 22856269 + 1 NA Intergenic Intergenic 230977 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 149.333-252 chr3 98938753 98938913 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -37138 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 203.333-265 chr8 85592657 85593061 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 62817 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 142.667-8 chr1 112568697 112568854 + 1 NA intron (NM_017744, intron 11 of 14) FLAM_C|SINE|Alu 50366 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 187.667-102 chr4 27092928 27093204 + 1 NA Intergenic Intergenic -124413 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 148.667-251 chr3 59382197 59382356 + 1 NA Intergenic Intergenic 276221 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 154.667-60 chr11 12973504 12973725 + 1 NA Intergenic Intergenic 15934 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 186.333-165 chr8 99711640 99711983 + 1 NA intron (NM_017890, intron 36 of 61) intron (NM_017890, intron 36 of 61) -174950 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 263.333-11 chr11 20265528 20265845 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -97999 NM_006410 10553 Hs.90753 NM_006410 ENSG00000109854 HTATIP2 CC3|SDR44U1|TIP30 HIV-1 Tat interactive protein 2 protein-coding 159.333-262 chr5 33301697 33301939 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 72083 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 116.667-80 chr17 57889479 57889674 + 1 NA intron (NM_001271875, intron 1 of 10) MIRc|SINE|MIR 13813 NM_001292025 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 153.333-392 chr7 132977119 132977320 + 1 NA intron (NM_001317177, intron 3 of 8) MER5A|DNA|hAT-Charlie 57696 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 203.333-161 chr22 28322015 28322261 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -137731 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 113.333-203 chr5 16098869 16099093 + 1 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 80810 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 189.667-116 chr5 111017874 111018084 + 1 NA Intergenic Intergenic -52101 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 175.333-68 chr17 80114513 80114715 + 1 NA intron (NM_001079804, intron 15 of 19) L1M4|LINE|L1 13033 NM_000152 2548 Hs.1437 NM_000152 ENSG00000171298 GAA LYAG glucosidase alpha, acid protein-coding 150.667-355 chr7 89296693 89296921 + 1 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -501070 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 150.333-312 chr4 118834218 118834416 + 1 NA intron (NM_014822, intron 1 of 22) intron (NM_014822, intron 1 of 22) 1809 NM_001318066 9871 Hs.189641 NM_014822 ENSG00000150961 SEC24D CLCRP2 SEC24 homolog D, COPII coat complex component protein-coding 145.333-24 chr1 229537024 229537194 + 1 NA intron (NM_012089, intron 6 of 12) L1MB5|LINE|L1 21598 NM_012089 23456 Hs.17614 NM_012089 ENSG00000135776 ABCB10 EST20237|M-ABC2|MTABC2 ATP binding cassette subfamily B member 10 protein-coding 132.667-127 chr4 58422121 58422288 + 1 NA Intergenic Intergenic 114124 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 247.333-14 chr11 77106550 77106910 + 1 NA intron (NM_004055, intron 3 of 12) intron (NM_004055, intron 3 of 12) 3890 NM_006189 4975 Hs.673853 NM_006189 ENSG00000254550 OMP - olfactory marker protein protein-coding 204.667-155 chr9 28547355 28547666 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 171795 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 218.333-37 chr14 41103168 41103543 + 1 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) L1PA15|LINE|L1 148644 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 316.333-19 chr22 43083047 43083563 + 1 NA intron (NR_027779, intron 1 of 11) AluY|SINE|Alu 6086 NM_012263 25809 Hs.660298 NM_012263 ENSG00000100271 TTLL1 C22orf7|HS323M22B tubulin tyrosine ligase like 1 protein-coding 153.333-387 chr7 96855614 96855801 + 1 NA Intergenic Intergenic -145816 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 154.333-289 chr6 38462957 38463162 + 1 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) AluJb|SINE|Alu -18537 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-57 chr11 94465084 94465293 + 1 NA intron (NM_001330347, intron 10 of 19) intron (NM_001330347, intron 10 of 19) 1392 NR_031630 100302275 NR_031630 ENSG00000221230 MIR548L MIRN548L|hsa-mir-548l microRNA 548l ncRNA 147.333-63 chr11 30960455 30960688 + 1 NA intron (NM_001367979, intron 20 of 38) intron (NM_001367979, intron 20 of 38) 32115 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 143.333-99 chr15 52519188 52519354 + 1 NA intron (NM_001142495, intron 1 of 39) intron (NM_001142495, intron 1 of 39) 9609 NM_001142495 4644 Hs.21213 NM_000259 ENSG00000197535 MYO5A GS1|MYH12|MYO5|MYR12 myosin VA protein-coding 213.667-95 chr9 19619206 19619542 + 1 NA intron (NM_020344, intron 3 of 9) intron (NM_020344, intron 3 of 9) 167645 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 172.667-10 chr1 150999452 150999723 + 1 NA intron (NM_001163258, intron 7 of 10) intron (NM_001163258, intron 7 of 10) 7210 NM_001163259 55793 Hs.743952 NM_018379 ENSG00000143409 MINDY1 FAM63A|MINDY-1 MINDY lysine 48 deubiquitinase 1 protein-coding 160.333-188 chr3 87946674 87946968 + 1 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) AluSc8|SINE|Alu -35755 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 270.333-28 chr18 3532933 3533271 + 1 NA intron (NM_001242762, intron 7 of 9) AluJo|SINE|Alu -61012 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 173.333-21 chr1 247094283 247094562 + 1 NA Intergenic HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner 9950 NM_001142572 79862 Hs.163754 NM_024804 ENSG00000188295 ZNF669 - zinc finger protein 669 protein-coding 147.667-208 chr21 19988315 19988476 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -88640 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 337.667-12 chr2 58768890 58769456 + 1 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 248420 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 136.667-187 chr9 95002553 95002728 + 1 NA intron (NM_032823, intron 9 of 14) L2a|LINE|L2 -57086 NR_147614 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 244.667-2 chr1 54020127 54020482 + 1 NA Intergenic LTR7|LTR|ERV1 -2118 NM_001276392 388633 Hs.439583 NM_001010978 ENSG00000203985 LDLRAD1 - low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 protein-coding 149.333-394 chr8 81283959 81284189 + 1 NA intron (NM_001444, intron 3 of 3) intron (NM_001444, intron 3 of 3) 3538 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 210.667-35 chr13 36866363 36866732 + 1 NA intron (NM_005905, intron 3 of 5) intron (NM_005905, intron 3 of 5) 47345 NM_000538 5994 Hs.24422 NM_000538 ENSG00000133111 RFXAP - regulatory factor X associated protein protein-coding 151.333-334 chr5 53774859 53775020 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 44743 NR_147168 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 194.667-90 chr3 26028728 26029056 + 1 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -155197 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 358.667-24 chr6 51097771 51098346 + 1 NA Intergenic Intergenic 279187 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 183.667-8 chr1 94857994 94858217 + 1 NA intron (NM_001258340, intron 10 of 14) AluSc|SINE|Alu 33612 NM_001350223 126969 Hs.483423 NM_152369 ENSG00000143036 SLC44A3 CTL3 solute carrier family 44 member 3 protein-coding 125.667-4 chr1 41037028 41037262 + 1 NA intron (NR_135092, intron 13 of 15) intron (NR_135092, intron 13 of 15) -15390 NM_001168247 200172 Hs.194609 NM_144990 ENSG00000171790 SLFNL1 - schlafen like 1 protein-coding 159.667-154 chr18 78019958 78020204 + 1 NA Intergenic Intergenic -26354 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 306.667-28 chr20 2190486 2190893 + 1 NA Intergenic Intergenic -16239 NR_161305 388780 Hs.132163 NR_161305 LOC388780 - uncharacterized LOC388780 ncRNA 157.333-363 chr9 94196274 94196464 + 1 NA intron (NR_160773, intron 2 of 2) L1PB3|LINE|L1 8197 NR_046165 158257 Hs.652626 NR_046163 ENSG00000230262 LINC02603 MIRLET7DHG long intergenic non-protein coding RNA 2603 ncRNA 147.333-308 chr8 19043877 19044143 + 1 NA Intergenic Intergenic -30307 NM_015310 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 143.667-49 chr12 9583738 9583907 + 1 NA Intergenic Intergenic 24094 NM_002258 3820 Hs.169824 NM_002258 ENSG00000111796 KLRB1 CD161|CLEC5B|NKR|NKR-P1|NKR-P1A|NKRP1A|hNKR-P1A killer cell lectin like receptor B1 protein-coding 352.333-13 chr20 808625 809146 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -24830 NM_001289145 83541 Hs.574822 NM_031424 ENSG00000125898 FAM110A C20orf55|F10|bA371L19.3 family with sequence similarity 110 member A protein-coding 149.333-270 chr3 184720877 184721138 + 1 NA intron (NR_160768, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 8764 NR_160768 107986163 NR_160768 LOC107986163 - uncharacterized LOC107986163 ncRNA 123.667-182 chr8 83859409 83859659 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -323253 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 193.667-97 chr4 170831719 170832036 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -88142 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 149.667-197 chr2 65707183 65707374 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -274679 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 168.667-168 chr4 173729628 173729950 + 1 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -167484 NR_146487 101928478 NR_146487 ENSG00000250708 LINC02269 - long intergenic non-protein coding RNA 2269 ncRNA 157.667-31 chr10 60908046 60908273 + 1 NA intron (NM_001350906, intron 5 of 12) intron (NM_001350906, intron 5 of 12) 36026 NM_001350910 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 210.333-126 chr5 26594232 26594621 + 1 NA Intergenic Intergenic 444160 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 191.333-91 chr17 72826156 72826577 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -185894 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 216.667-89 chr5 148731190 148731511 + 1 NA Intergenic Intergenic -76823 NR_104445 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 153.333-89 chr12 33805003 33805217 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -217386 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 176.667-63 chr17 2495185 2495378 + 1 NA intron (NM_024086, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu 16607 NM_024086 79066 Hs.632237 NM_024086 ENSG00000127804 METTL16 METT10D methyltransferase like 16 protein-coding 135.333-26 chr10 84580566 84580743 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 155485 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 149.333-377 chr7 107372555 107372759 + 1 NA exon (NM_006348, exon 8 of 22) exon (NM_006348, exon 8 of 22) -97400 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 159.667-96 chr14 51872521 51872724 + 1 NA intron (NM_001243774, intron 1 of 2) intron (NM_001243774, intron 1 of 2) 12010 NM_053064 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 151.667-357 chr8 42692989 42693273 + 1 NA Intergenic Intergenic -4235 NM_000749 1142 Hs.654576 NM_000749 ENSG00000147432 CHRNB3 - cholinergic receptor nicotinic beta 3 subunit protein-coding 215.667-84 chr3 72182636 72182964 + 1 NA Intergenic Intergenic 31543 NR_038221 201617 Hs.382623 NR_038221 ENSG00000243083 LINC00870 - long intergenic non-protein coding RNA 870 ncRNA 151.333-40 chr10 16501989 16502193 + 1 NA intron (NM_001261837, intron 4 of 4) intron (NM_001261837, intron 4 of 4) 19788 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 127.333-181 chr7 139186191 139186426 + 1 NA intron (NM_001144920, intron 16 of 16) AluJr4|SINE|Alu -44929 NM_173569 254048 Hs.153458 NM_173569 ENSG00000157741 UBN2 - ubinuclein 2 protein-coding 193.667-140 chr9 11761632 11761879 + 1 NA Intergenic Intergenic -931630 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 146.667-149 chr2 12027454 12027652 + 1 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) intron (NR_110196, intron 2 of 5) 20437 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 119.333-100 chr15 97406130 97406356 + 1 NA intron (NR_120324, intron 3 of 4) intron (NR_120324, intron 3 of 4) 115568 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 217.667-40 chr2 37572339 37572651 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 99704 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 243.667-16 chr12 70877139 70877680 + 1 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) intron (NM_002849, intron 2 of 13) 43329 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 155.333-184 chr2 171960682 171960844 + 1 NA intron (NR_027862, intron 3 of 9) AluJr|SINE|Alu 38302 NM_003642 8520 Hs.632532 NM_003642 ENSG00000128708 HAT1 KAT1 histone acetyltransferase 1 protein-coding 136.667-96 chr2 148639751 148639969 + 1 NA Intergenic Intergenic -4891 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 149.667-8 chr1 42321799 42322010 + 1 NA intron (NM_001198851, intron 2 of 14) intron (NM_001198851, intron 2 of 14) 13051 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 220.667-56 chr2 230384616 230384977 + 1 NA intron (NM_001352892, intron 8 of 18) AluSx1|SINE|Alu -31360 NM_001206703 6672 Hs.369056 NM_003113 ENSG00000067066 SP100 lysp100b SP100 nuclear antigen protein-coding 136.667-167 chr7 50857497 50857675 + 1 NA Intergenic Intergenic -64133 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 182.333-145 chr7 56613899 56614098 + 1 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite -75868 NR_108099 101928401 Hs.385614 NR_108099 ENSG00000233288 LOC101928401 - uncharacterized LOC101928401 ncRNA 258.667-30 chr14 85558586 85558894 + 1 NA intron (NR_144387, intron 3 of 4) intron (NR_144387, intron 3 of 4) 25391 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 281.667-46 chr6 156865156 156865609 + 1 NA intron (NM_017519, intron 2 of 18) HAL1|LINE|L1 -85651 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 282.333-9 chr12 64025757 64026076 + 1 NA intron (NM_001346201, intron 4 of 21) MIR|SINE|MIR 181216 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 141.333-129 chr2 234412895 234413153 + 1 NA Intergenic Intergenic 41571 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 272.667-57 chr5 145041587 145042011 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 793543 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 247.667-79 chr5 86042823 86043213 + 1 NA Intergenic Intergenic -239426 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 154.333-367 chr9 35780183 35780345 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -12145 NM_003995 4882 Hs.78518 NM_000907 ENSG00000159899 NPR2 AMDM|ANPRB|ANPb|ECDM|GUC2B|GUCY2B|NPRB|NPRBi|SNSK natriuretic peptide receptor 2 protein-coding 229.667-66 chr5 14168766 14169150 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 25616 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 130.333-202 chr8 18657840 18658013 + 1 NA intron (NM_015310, intron 9 of 15) intron (NM_015310, intron 9 of 15) 150941 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 147.667-125 chr16 55438822 55439022 + 1 NA intron (NR_147198, intron 4 of 6) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 23375 NR_147198 107984884 Hs.666473 NR_147198 MMP2-AS1 - MMP2 antisense RNA 1 ncRNA 146.667-134 chr17 40643903 40644155 + 1 NA intron (NM_003079, intron 3 of 10) intron (NM_003079, intron 3 of 10) 3789 NM_003079 6605 Hs.743978 NM_003079 ENSG00000073584 SMARCE1 BAF57|CSS5 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 protein-coding 213.667-40 chr17 75021087 75021438 + 1 NA TTS (NM_001303265) TTS (NM_001303265) 8592 NM_001303265 3396 Hs.407955 NM_001545 ENSG00000167862 MRPL58 DS-1|DS1|ICT1|MRP-L58 mitochondrial ribosomal protein L58 protein-coding 174.333-46 chr17 56081151 56081370 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -72215 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 240.667-16 chr11 39019849 39020173 + 1 NA Intergenic Intergenic 371153 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 141.667-3 chr1 53761643 53761895 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22605 NM_001367484 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 151.333-285 chr3 89312563 89312802 + 1 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) L1PA13|LINE|L1 205061 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 230.333-39 chr14 72522387 72522625 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 15 of 16) MER58B|DNA|hAT-Charlie 5686 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 231.333-119 chr8 110400674 110401122 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -425127 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 142.667-138 chr3 98905145 98905352 + 1 NA Intergenic Intergenic -3553 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 153.667-389 chr8 117524601 117524819 + 1 NA intron (NM_001282986, intron 1 of 2) L1ME4b|LINE|L1 3997 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 355.333-19 chr21 30025580 30026296 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -85886 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 220.333-117 chr6 129710186 129710573 + 1 NA promoter-TSS (NM_033515) promoter-TSS (NM_033515) -202 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 183.667-110 chr4 144522987 144523234 + 1 NA Intergenic Intergenic 122909 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 177.667-84 chr21 15943769 15944048 + 1 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -126580 NR_136541 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 158.333-318 chr8 72979869 72980112 + 1 NA Intergenic Intergenic -28874 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 149.333-395 chr8 83812341 83812610 + 1 NA Intergenic Intergenic -370312 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 199.667-65 chr18 68228694 68229017 + 1 NA Intergenic Intergenic -414033 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 150.333-214 chr2 148069086 148069281 + 1 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -47579 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 283.667-25 chr3 186784748 186785227 + 1 NA TTS (NR_002587) TTS (NR_002587) 191 NR_002587 619567 NR_002587 ENSG00000238942 SNORD2 R39B|SNR39B small nucleolar RNA, C/D box 2 snoRNA 226.333-112 chr8 128385226 128385681 + 1 NA Intergenic Intergenic 179226 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 224.333-13 chr10 21143117 21143444 + 1 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) AluSq2|SINE|Alu -30710 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 148.333-139 chr15 59662284 59662508 + 1 NA 3' UTR (NM_001368061, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001368061, exon 8 of 8) -4881 NM_004492 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 264.667-89 chr8 136925211 136925583 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 394599 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 162.333-178 chr4 3170349 3170561 + 1 NA intron (NM_002111, intron 29 of 66) L1MEc|LINE|L1 -73914 NM_001330620 345222 Hs.442291 NM_001012982 ENSG00000188981 MSANTD1 C4orf44 Myb/SANT DNA binding domain containing 1 protein-coding 245.667-35 chr2 132566205 132566756 + 1 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) intron (NM_001508, intron 1 of 1) 103725 NM_001321234 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 251.667-39 chr2 64507833 64508127 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 16175 NR_136167 101927402 Hs.187018 NR_136167 ENSG00000260101 LOC101927402 - uncharacterized LOC101927402 ncRNA 353.333-17 chr18 4517525 4518164 + 1 NA Intergenic Intergenic -62537 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 127.667-70 chr18 70150060 70150228 + 1 NA intron (NM_001318520, intron 15 of 47) intron (NM_001318520, intron 15 of 47) 55543 NM_173630 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 158.333-222 chr3 191401224 191401412 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -24206 NR_120606 103344926 NR_120606 LINCR-0002 - uncharacterized LincR-0002 ncRNA 147.667-341 chr7 81093099 81093273 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -170797 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 202.667-116 chr5 58255261 58255565 + 1 NA Intergenic Intergenic -133072 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 222.667-87 chr7 23331873 23332163 + 1 NA intron (NM_006547, intron 10 of 14) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 32679 NM_138446 115416 Hs.87385 NM_138446 ENSG00000156928 MALSU1 C7orf30|mtRsfA mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1 protein-coding 187.667-97 chr3 128793885 128794257 + 1 NA intron (NM_004637, intron 1 of 5) intron (NM_004637, intron 1 of 5) -52737 NR_162138 113219457 NR_162138 MIR12124 - microRNA 12124 ncRNA 183.667-24 chr10 39235151 39235471 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 538715 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 166.333-91 chr17 57272190 57272431 + 1 NA intron (NM_001322250, intron 5 of 13) intron (NM_001322250, intron 5 of 13) 15291 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 187.333-191 chr7 85189119 85189426 + 1 NA Intergenic Intergenic -67341 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 123.333-194 chr7 41563619 41563822 + 1 NA Intergenic Intergenic -130199 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 169.667-100 chr2 8180149 8180361 + 1 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) L1MEc|LINE|L1 148164 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 172.667-57 chr14 68376453 68376719 + 1 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 252201 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 161.333-60 chr12 30261975 30262280 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 415117 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 252.667-13 chr10 36888058 36888626 + 1 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -237515 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 194.333-134 chr6 141435292 141435528 + 1 NA Intergenic Intergenic 653389 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 183.667-79 chr2 121620350 121620716 + 1 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) AluSc|SINE|Alu 28929 NM_015282 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 243.667-62 chr5 141042800 141043112 + 1 NA Intergenic Intergenic -8420 NM_013340 29930 Hs.278950 NM_013340 ENSG00000171815 PCDHB1 PCDH-BETA1 protocadherin beta 1 protein-coding 150.333-230 chr2 232578161 232578346 + 1 NA intron (NM_001330203, intron 6 of 6) intron (NM_001330203, intron 6 of 6) 27447 NM_001330202 9470 Hs.292026 NM_004846 ENSG00000135930 EIF4E2 4E-LP|4EHP|EIF4EL3|IF4e|h4EHP eukaryotic translation initiation factor 4E family member 2 protein-coding 163.667-210 chr6 55054052 55054307 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -52281 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 258.667-26 chr14 45505349 45505727 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 210064 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 148.667-11 chr1 100207416 100207639 + 1 NA intron (NM_001918, intron 8 of 10) intron (NM_001918, intron 8 of 10) -29254 NM_001256387 127495 Hs.44277 NM_144620 ENSG00000122477 LRRC39 - leucine rich repeat containing 39 protein-coding 150.333-34 chr10 33862805 33862956 + 1 NA Intergenic Intergenic -90200 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 241.667-12 chr10 59508891 59509289 + 1 NA Intergenic Intergenic -145909 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 186.333-65 chr19 34815853 34816127 + 1 NA TTS (NR_033982) TTS (NR_033982) 16879 NR_033982 400685 Hs.730118 NR_033982 ENSG00000267767 LINC01801 - long intergenic non-protein coding RNA 1801 ncRNA 175.333-14 chr10 30080921 30081111 + 1 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) intron (NM_001350022, intron 1 of 4) -21430 NM_001350001 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 164.333-189 chr5 22610833 22611046 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 242405 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 208.667-115 chr5 146493289 146493640 + 1 NA intron (NM_006706, intron 15 of 21) intron (NM_006706, intron 15 of 21) 22649 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 160.333-245 chr6 51567683 51568001 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -54028 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 156.667-345 chr8 125860642 125860935 + 1 NA Intergenic Intergenic 90409 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 147.667-204 chr20 48235990 48236274 + 1 NA Intergenic Intergenic -123779 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 149.333-402 chr8 111170222 111170435 + 1 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) 65875 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 156.333-293 chr5 131452677 131452965 + 1 NA intron (NM_001164388, intron 21 of 27) MIRb|SINE|MIR 182408 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 263.667-3 chr1 59822411 59822714 + 1 NA intron (NM_015888, intron 2 of 21) intron (NM_015888, intron 2 of 21) 7613 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 222.667-63 chr4 39022286 39022678 + 1 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) L1MEd|LINE|L1 9927 NM_024943 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 240.333-77 chr5 91281906 91282233 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 32333 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 159.333-47 chr10 76640486 76640753 + 1 NA Intergenic Intergenic -247425 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 184.333-93 chr21 34293894 34294293 + 1 NA Intergenic Intergenic -69931 NM_172201 9992 Hs.551521 NM_172201 ENSG00000159197 KCNE2 ATFB4|LQT5|LQT6|MIRP1 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 2 protein-coding 149.667-94 chr12 62400476 62400646 + 1 NA intron (NR_147080, intron 18 of 19) MER2B|DNA|TcMar-Tigger -66265 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 236.667-30 chr15 63212671 63212976 + 1 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) intron (NM_016530, intron 1 of 7) 23217 NM_016530 51762 Hs.389733 NM_016530 ENSG00000166128 RAB8B - RAB8B, member RAS oncogene family protein-coding 179.333-198 chr9 78979559 78979743 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 166015 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 141.667-150 chr3 146725716 146725941 + 1 NA Intergenic Intergenic -119612 NM_001085420 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 282.333-16 chr14 69087408 69087987 + 1 NA intron (NM_003861, intron 6 of 8) MIRb|SINE|MIR 64902 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 248.667-27 chr12 42442342 42442799 + 1 NA TTS (NM_001364824) TTS (NM_001364824) 41045 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 193.333-139 chr4 87959183 87959532 + 1 NA Intergenic Intergenic -16293 NM_001251830 6696 Hs.313 NM_000582 ENSG00000118785 SPP1 BNSP|BSPI|ETA-1|OPN secreted phosphoprotein 1 protein-coding 111.667-233 chr7 11135578 11135714 + 1 NA intron (NR_033436, intron 16 of 16) intron (NR_033436, intron 16 of 16) 161774 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 219.667-59 chr4 32888897 32889313 + 1 NA Intergenic Intergenic 538067 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 305.333-22 chr14 59025694 59026221 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -162710 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 226.667-56 chr21 15787514 15787826 + 1 NA intron (NM_001283042, intron 4 of 24) L1M5|LINE|L1 57688 NM_013396 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 265.333-84 chr8 80446543 80447112 + 1 NA Intergenic Intergenic -38766 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 140.333-45 chr12 22625440 22625614 + 1 NA promoter-TSS (NR_135030) promoter-TSS (NR_135030) 356 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 125.333-97 chr2 177121798 177122016 + 1 NA Intergenic Intergenic 90504 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 186.333-100 chr3 62944091 62944403 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -68831 NM_183394 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 198.333-24 chr10 35123607 35123835 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -3120 NM_001881 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 207.667-6 chr1 165072588 165072820 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 283537 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 136.667-68 chr15 48309310 48309547 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -21667 NM_001330286 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 370.667-3 chr1 177538423 177539052 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -161787 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 266.333-18 chr15 69918110 69918408 + 1 NA Intergenic Intergenic 83025 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 179.667-14 chr1 244318182 244318417 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -34336 NM_001012970 200159 Hs.442703 NM_001012970 ENSG00000173728 C1orf100 - chromosome 1 open reading frame 100 protein-coding 171.667-24 chr11 9785607 9785826 + 1 NA intron (NM_030962, intron 36 of 39) AluJb|SINE|Alu -26183 NR_033972 440028 Hs.677541 NR_033972 ENSG00000245522 LINC02709 - long intergenic non-protein coding RNA 2709 ncRNA 161.333-76 chr13 46044929 46045122 + 1 NA exon (NM_015070, exon 3 of 17) exon (NM_015070, exon 3 of 17) 7721 NM_001076788 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 140.667-250 chr9 89886520 89886717 + 1 NA Intergenic Intergenic -82798 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 223.333-77 chr2 105321598 105321932 + 1 NA intron (NR_137328, intron 1 of 12) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 7891 NR_137328 9392 Hs.446350 NM_004257 ENSG00000135966 TGFBRAP1 TRAP-1|TRAP1|VPS3 transforming growth factor beta receptor associated protein 1 protein-coding 160.667-39 chr10 67139865 67140092 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) 127712 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 179.667-79 chr2 169647415 169647720 + 1 NA intron (NM_001085447, intron 8 of 8) L1MC5a|LINE|L1 46838 NM_001085447 129881 Hs.370111 NM_001085447 ENSG00000154479 CCDC173 C2orf77 coiled-coil domain containing 173 protein-coding 149.333-130 chr16 22895472 22895763 + 1 NA intron (NM_006043, intron 1 of 1) intron (NM_006043, intron 1 of 1) 81455 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 194.667-101 chr3 142505362 142505671 + 1 NA intron (NM_001354579, intron 27 of 45) intron (NM_001354579, intron 27 of 45) -57454 NM_001282859 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 158.667-161 chr2 96937554 96937801 + 1 NA intron (NM_001122646, intron 8 of 16) intron (NM_001122646, intron 8 of 16) 18571 NR_110209 101927053 Hs.677537 NR_110209 LOC101927053 - uncharacterized LOC101927053 ncRNA 327.333-12 chr13 113426633 113427128 + 1 NA intron (NM_199162, intron 4 of 6) intron (NM_199162, intron 4 of 6) -12487 NM_001304433 101928841 Hs.646609 NM_001003399 LOC101928841 - collagen alpha-1(II) chain-like protein-coding 158.667-48 chr10 97892479 97892794 + 1 NA intron (NM_001206528, intron 11 of 14) MIRb|SINE|MIR -16739 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 130.333-197 chr7 81630662 81630848 + 1 NA intron (NR_126025, intron 1 of 10) MLT1G-int|LTR|ERVL-MaLR -4539 NR_126026 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 153.667-291 chr4 59623502 59623763 + 1 NA Intergenic Intergenic 610059 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 331.667-20 chr8 78206560 78206991 + 1 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -309565 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 209.333-149 chr3 52974080 52974446 + 1 NA intron (NM_016329, intron 1 of 20) intron (NM_016329, intron 1 of 20) 71810 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 151.333-254 chr20 58600096 58600366 + 1 NA intron (NR_034147, intron 6 of 6) intron (NR_034147, intron 6 of 6) -34541 NR_125359 79160 Hs.280135 NR_125359 ENSG00000268941 LINC01711 - long intergenic non-protein coding RNA 1711 ncRNA 116.333-53 chr12 39320278 39320453 + 1 NA intron (NM_001173464, intron 27 of 37) intron (NM_001173464, intron 27 of 37) 122755 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 150.667-398 chr9 73962125 73962397 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -409270 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 145.333-148 chr2 171823357 171823563 + 1 NA intron (NR_047549, intron 8 of 16) intron (NR_047549, intron 8 of 16) 70784 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 121.667-190 chr7 35034775 35034925 + 1 NA intron (NM_015283, intron 1 of 21) intron (NM_015283, intron 1 of 21) 2635 NM_001366673 23333 Hs.408623 NM_015283 ENSG00000173852 DPY19L1 - dpy-19 like C-mannosyltransferase 1 protein-coding 205.667-64 chr2 24957119 24957464 + 1 NA intron (NM_016544, intron 4 of 6) intron (NM_016544, intron 4 of 6) 14664 NM_016544 51277 Hs.434993 NM_016544 ENSG00000115137 DNAJC27 RBJ|RabJS DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C27 protein-coding 123.333-63 chr13 27481044 27481242 + 1 NA Intergenic Intergenic -30541 NM_152912 219402 Hs.534582 NM_152912 ENSG00000122033 MTIF3 IF3mt mitochondrial translational initiation factor 3 protein-coding 177.333-63 chr15 96623071 96623381 + 1 NA Intergenic Intergenic 158428 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 134.667-182 chr7 40648908 40649091 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 330940 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 146.333-177 chr20 23162821 23163008 + 1 NA Intergenic Intergenic -30278 NR_034149 200261 Hs.352228 NM_182535 ENSG00000233746 LINC00656 - long intergenic non-protein coding RNA 656 ncRNA 117.333-9 chr1 94686157 94686397 + 1 NA intron (NR_160779, intron 2 of 5) intron (NR_160779, intron 2 of 5) 59623 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 195.667-30 chr12 46830594 46830809 + 1 NA Intergenic Intergenic -4704 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 203.333-166 chr3 15186182 15186471 + 1 NA intron (NR_027927, intron 1 of 4) intron (NR_027927, intron 1 of 4) 19633 NR_027927 344875 Hs.722756 NR_027927 ENSG00000230524 COL6A4P1 COL6A4|COL6A4P|DIVA|DVWA|VWA6 collagen type VI alpha 4 pseudogene 1 pseudo 141.667-14 chr1 186296731 186296972 + 1 NA 5' UTR (NM_001127709, exon 2 of 11) 5' UTR (NM_001127709, exon 2 of 11) 578 NM_001127710 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 161.667-83 chr14 75637284 75637538 + 1 NA intron (NM_017791, intron 5 of 9) intron (NM_017791, intron 5 of 9) 23465 NM_007176 11161 Hs.15106 NM_007176 ENSG00000133935 ERG28 C14orf1|NET51 ergosterol biosynthesis 28 homolog protein-coding 151.667-218 chr3 61899742 61899990 + 1 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) MIRc|SINE|MIR 338295 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 165.667-164 chr5 137931662 137931827 + 1 NA intron (NM_001300921, intron 12 of 14) intron (NM_001300921, intron 12 of 14) 42287 NM_014386 27039 Hs.716884 NM_014386 ENSG00000078795 PKD2L2 TRPP5 polycystin 2 like 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 145.667-173 chr3 23883442 23883724 + 1 NA intron (NM_003341, intron 3 of 5) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -32962 NM_001253379 6138 Hs.381219 NM_002948 ENSG00000174748 RPL15 DBA12|EC45|L15|RPL10|RPLY10|RPYL10 ribosomal protein L15 protein-coding 132.667-78 chr2 24283078 24283245 + 1 NA intron (NM_001348182, intron 16 of 38) L2|LINE|L2 77375 NM_019595 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 132.333-187 chr9 33219241 33219418 + 1 NA Intergenic Intergenic -20838 NM_014471 27290 Hs.555934 NM_014471 ENSG00000122711 SPINK4 HEL136|PEC-60|PEC60 serine peptidase inhibitor, Kazal type 4 protein-coding 275.333-31 chr19 48382171 48382701 + 1 NA TTS (NM_006801) TTS (NM_006801) 9115 NM_006801 10945 Hs.515515 NM_006801 ENSG00000105438 KDELR1 ERD2|ERD2.1|HDEL|PM23 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 1 protein-coding 143.667-183 chr4 73144357 73144627 + 1 NA intron (NM_032217, intron 11 of 33) intron (NM_032217, intron 11 of 33) -74733 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 152.333-284 chr4 127908168 127908326 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 27003 NM_001190801 10733 Hs.172052 NM_014264 ENSG00000142731 PLK4 MCCRP2|SAK|STK18 polo like kinase 4 protein-coding 153.333-135 chr15 45554270 45554495 + 1 NA intron (NR_022014, intron 5 of 5) L1M4|LINE|L1 17131 NR_145777 109617005 NR_145777 ENSG00000207516 SNORA41B - small nucleolar RNA, H/ACA box 41B snoRNA 158.667-150 chr2 27894487 27894738 + 1 NA exon (NM_001329113, exon 3 of 14) exon (NM_001329113, exon 3 of 14) -3498 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-136 chr6 140043272 140043561 + 1 NA intron (NR_121623, intron 1 of 1) intron (NR_121623, intron 1 of 1) -52155 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 179.333-76 chr16 86268505 86268879 + 1 NA intron (NR_104139, intron 3 of 5) intron (NR_104139, intron 3 of 5) 17555 NR_104139 101154687 Hs.640512 NR_104139 LINC01081 TCONS00024764|TCONS_00024764 long intergenic non-protein coding RNA 1081 ncRNA 145.667-144 chr2 124099615 124099789 + 1 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 74415 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 190.333-40 chr12 127227219 127227576 + 1 NA Intergenic Intergenic 56886 NR_146537 105370065 NR_146537 LINC02376 - long intergenic non-protein coding RNA 2376 ncRNA 161.667-74 chr14 53421144 53421338 + 1 NA Intergenic Intergenic 267887 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 162.333-189 chr4 174679426 174679666 + 1 NA intron (NM_006529, intron 6 of 9) L1MA4|LINE|L1 149701 NM_001042543 8001 Hs.413099 NM_006529 ENSG00000145451 GLRA3 - glycine receptor alpha 3 protein-coding 140.333-24 chr10 18851402 18851649 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 192094 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 147.667-49 chr10 119791411 119791671 + 1 NA exon (NM_001243195, exon 4 of 5) exon (NM_001243195, exon 4 of 5) -27716 NM_001243194 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 155.667-285 chr5 94644089 94644410 + 1 NA intron (NM_032290, intron 5 of 20) L2b|LINE|L2 25580 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 233.333-5 chr1 111287583 111287995 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -3062 NM_001258004 27159 Hs.128814 NM_021797 ENSG00000134216 CHIA AMCASE|CHIT2|TSA1902 chitinase acidic protein-coding 188.667-88 chr20 8124714 8124915 + 1 NA Intergenic Intergenic -7452 NM_015192 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 137.667-50 chr13 69084822 69084970 + 1 NA Intergenic Intergenic -137450 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 154.667-369 chr7 65375594 65375894 + 1 NA intron (NM_001287534, intron 1 of 1) AluSc|SINE|Alu 1889 NM_001287534 168374 Hs.9521 NM_007139 ENSG00000146757 ZNF92 HEL-203|HPF12|HTF12|TF12 zinc finger protein 92 protein-coding 152.667-189 chr2 104564262 104564555 + 1 NA Intergenic Tigger1a_Art|DNA|TcMar-Tigger -53899 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 137.667-191 chr8 143325041 143325280 + 1 NA intron (NM_052963, intron 5 of 13) intron (NM_052963, intron 5 of 13) 9720 NM_052963 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 156.333-95 chr13 99292920 99293146 + 1 NA intron (NR_026644, intron 4 of 8) intron (NR_026644, intron 4 of 8) 14366 NM_004951 1880 Hs.784 NM_004951 ENSG00000169508 GPR183 EBI2|hEBI2 G protein-coupled receptor 183 protein-coding 145.333-270 chr7 33670113 33670322 + 1 NA Intergenic Intergenic -234698 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 134.667-83 chr17 71192183 71192333 + 1 NA intron (NR_104152, intron 1 of 3) intron (NR_104152, intron 1 of 3) 9921 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 155.333-136 chr17 50779087 50779333 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 10560 NR_107026 102466918 NR_107026 ENSG00000278672 MIR8059 hsa-mir-8059 microRNA 8059 ncRNA 240.667-19 chr12 29432251 29432635 + 1 NA intron (NR_073172, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 43149 NR_073170 101055625 Hs.569158 NR_073170 ENSG00000257599 OVCH1-AS1 - OVCH1 antisense RNA 1 ncRNA 212.667-28 chr12 47915349 47915592 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -10439 NM_001017535 7421 Hs.524368 NM_000376 ENSG00000111424 VDR NR1I1|PPP1R163 vitamin D receptor protein-coding 145.333-204 chr3 182920856 182921135 + 1 NA 3' UTR (NM_014616, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_014616, exon 30 of 30) 59543 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 140.333-189 chr5 125869951 125870258 + 1 NA Intergenic Intergenic -309473 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 280.667-60 chr8 136968037 136968459 + 1 NA Intergenic Intergenic 437450 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 151.667-156 chr18 58073968 58074126 + 1 NA intron (NM_001144964, intron 1 of 30) intron (NM_001144964, intron 1 of 30) 26821 NM_001144964 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 177.333-51 chr14 50511362 50511654 + 1 NA intron (NM_198794, intron 2 of 31) L1MA5A|LINE|L1 21061 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 236.667-82 chr7 36589228 36589662 + 1 NA intron (NM_001177507, intron 11 of 19) intron (NM_001177507, intron 11 of 19) 10675 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 139.667 chr1 52465156 52465302 + 1 NA intron (NM_001009881, intron 15 of 29) intron (NM_001009881, intron 15 of 29) 60627 NM_032864 84950 Hs.5301 NM_032284 ENSG00000134748 PRPF38A PRP38A|Prp38 pre-mRNA processing factor 38A protein-coding 155.333-360 chr7 33314910 33315084 + 1 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 185433 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 160.667-246 chr5 59493177 59493442 + 1 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) intron (NM_001349242, intron 1 of 16) 93189 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 267.333-4 chr1 59963164 59963557 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -36562 NR_134981 1573 Hs.152096 NM_000775 ENSG00000134716 CYP2J2 CPJ2|CYPIIJ2 cytochrome P450 family 2 subfamily J member 2 protein-coding 148.667-331 chr6 49646689 49646884 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9912 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 303.333-23 chr14 59428494 59429023 + 1 NA Intergenic Intergenic 36622 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 164.667-157 chr4 34942500 34942761 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -672883 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 324.667-24 chr3 112719024 112719472 + 1 NA Intergenic Intergenic -17841 NR_162092 113218483 NR_162092 MIR9900 - microRNA 9900 ncRNA 135.333-163 chr6 119634936 119635187 + 1 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) L1ME2|LINE|L1 85253 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 132.333-86 chr2 101207759 101207958 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -45028 NM_017546 55571 Hs.744080 NM_017546 ENSG00000158435 CNOT11 C2orf29|C40 CCR4-NOT transcription complex subunit 11 protein-coding 119.333-143 chr21 30657678 30657910 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 14930 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 200.667-168 chr9 92665971 92666276 + 1 NA intron (NM_022755, intron 1 of 12) intron (NM_022755, intron 1 of 12) 4008 NM_022755 64768 Hs.459896 NM_022755 ENSG00000127080 IPPK C9orf12|INSP5K2|IP5K|IPK1|bA476B13.1 inositol-pentakisphosphate 2-kinase protein-coding 175.667-73 chr2 119745381 119745564 + 1 NA Intergenic Intergenic -14450 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 147.333-59 chr11 7976346 7976568 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -10880 NM_003754 8665 Hs.516023 NM_003754 ENSG00000175390 EIF3F EIF3S5|MRT67|eIF3-p47 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F protein-coding 199.333-125 chr2 55764935 55765237 + 1 NA Intergenic Intergenic -71242 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 115.333-197 chr7 3951849 3952087 + 1 NA intron (NM_152744, intron 7 of 44) intron (NM_152744, intron 7 of 44) -177717 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 263.667-6 chr1 183571175 183571648 + 1 NA intron (NM_001190789, intron 3 of 12) AluSx1|SINE|Alu 19193 NM_000433 4688 Hs.587558 NM_000433 ENSG00000116701 NCF2 NCF-2|NOXA2|P67-PHOX|P67PHOX neutrophil cytosolic factor 2 protein-coding 155.667-73 chr12 44316427 44316657 + 1 NA intron (NM_001286211, intron 6 of 6) L1PA16|LINE|L1 480461 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 159.667-41 chr10 26027977 26028155 + 1 NA intron (NM_017433, intron 10 of 34) intron (NM_017433, intron 10 of 34) 93837 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 150.667-144 chr17 35074600 35074816 + 1 NA intron (NR_037713, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR -11001 NM_001017368 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 236.667-64 chr5 44808476 44808803 + 1 NA promoter-TSS (NM_016640) promoter-TSS (NM_016640) 154 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 257.333-43 chr17 33576401 33576994 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -42937 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 144.333-10 chr1 95226697 95226853 + 1 NA intron (NR_125949, intron 1 of 3) intron (NR_125949, intron 1 of 3) 7207 NR_125949 101928118 Hs.656443 NR_125948 ENSG00000226026 LOC101928118 - uncharacterized LOC101928118 ncRNA 184.667-9 chr1 182001751 182002192 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 59741 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 133.333-161 chr6 50059809 50059960 + 1 NA Intergenic Intergenic -9955 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 192.667-106 chr3 71740566 71740794 + 1 NA intron (NM_173359, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -11562 NM_001134650 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 259.333-102 chr8 123741833 123742193 + 1 NA Intergenic Intergenic -4620 NM_001003954 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 187.333-177 chr6 72391076 72391337 + 1 NA intron (NM_001350433, intron 22 of 25) intron (NM_001350433, intron 22 of 25) 24460 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 170.667-67 chr17 81196711 81196893 + 1 NA exon (NM_014984, exon 15 of 26) exon (NM_014984, exon 15 of 26) 26163 NM_001319229 22994 Hs.514578 NM_014984 ENSG00000141577 CEP131 AZ1|AZI1|ZA1 centrosomal protein 131 protein-coding 176.667-159 chr9 93685255 93685558 + 1 NA Intergenic Intergenic 90565 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 242.333-14 chr10 83842810 83843122 + 1 NA Intergenic Intergenic -165877 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 174.667-171 chr8 87683571 87683881 + 1 NA Intergenic Intergenic 190289 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 165.333-36 chr10 116587198 116587401 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -3660 NM_006229 5407 Hs.73923 NM_006229 ENSG00000187021 PNLIPRP1 PLRP1 pancreatic lipase related protein 1 protein-coding 156.333-105 chr14 44084776 44085013 + 1 NA Intergenic Intergenic 422389 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 117.333-54 chr14 53095647 53095813 + 1 NA intron (NM_030637, intron 2 of 11) intron (NM_030637, intron 2 of 11) 57593 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 124.333-24 chr11 36498074 36498292 + 1 NA intron (NM_145803, intron 4 of 7) AluSg|SINE|Alu 12089 NM_004620 7189 Hs.444172 NM_004620 ENSG00000175104 TRAF6 MGC:3310|RNF85 TNF receptor associated factor 6 protein-coding 173.667-147 chr5 142566599 142566933 + 1 NA Intergenic Intergenic 54568 NM_001144892 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 238.667-95 chr9 16082669 16083088 + 1 NA Intergenic Intergenic 170229 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 253.667-39 chr3 5460932 5461231 + 1 NA Intergenic Intergenic -210826 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 235.667-26 chr15 88051497 88051771 + 1 NA intron (NM_001007156, intron 13 of 15) MIR|SINE|MIR -105366 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 152.333-25 chr1 180750489 180750714 + 1 NA intron (NR_137330, intron 2 of 12) L1M5|LINE|L1 118579 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 216.667-98 chr7 81409127 81409467 + 1 NA Intergenic Intergenic 152522 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 223.667-91 chr9 9453523 9453910 + 1 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) intron (NM_002839, intron 8 of 45) -345676 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 136.333-17 chr10 16948958 16949108 + 1 NA intron (NM_001081, intron 34 of 66) MIR|SINE|MIR -131579 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 221.667-62 chr5 3539465 3539887 + 1 NA Intergenic Intergenic -3582 NR_033898 285577 Hs.582442 NR_033898 ENSG00000248118 LINC01019 - long intergenic non-protein coding RNA 1019 ncRNA 129.333-142 chr4 98913331 98913482 + 1 NA intron (NM_001331017, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 15727 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 145.333-195 chr3 108063812 108064081 + 1 NA intron (NM_198793, intron 3 of 8) intron (NM_198793, intron 3 of 8) 27142 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 137.667-149 chr5 8253405 8253606 + 1 NA Intergenic Intergenic 204059 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 201.667-69 chr22 39930759 39931013 + 1 NA intron (NM_001291828, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 4282 NM_001291824 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 182.667-14 chr1 217009075 217009272 + 1 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) 67819 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 211.333-246 chr8 115267238 115267471 + 1 NA Intergenic Intergenic 400659 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 143.667-263 chr8 140681192 140681376 + 1 NA intron (NM_001352743, intron 27 of 32) AluSx1|SINE|Alu 37285 NM_001352749 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 259.667-51 chr4 41281056 41281587 + 1 NA Intergenic Intergenic 24393 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 157.333-347 chr8 122010944 122011163 + 1 NA Intergenic Intergenic -369613 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 222.333-50 chr2 197509051 197509375 + 1 NA intron (NM_001202485, intron 2 of 8) intron (NM_001202485, intron 2 of 8) -6341 NM_199482 25843 Hs.633165 NM_015387 ENSG00000115540 MOB4 2C4D|CGI-95|MOB1|MOB3|MOBKL3|PHOCN|PREI3 MOB family member 4, phocein protein-coding 145.667-269 chr7 55412641 55412911 + 1 NA intron (NM_018697, intron 6 of 8) intron (NM_018697, intron 6 of 8) 47328 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 242.667-55 chr2 154387937 154388415 + 1 NA intron (NM_052917, intron 9 of 12) L1MA7|LINE|L1 69262 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 154.333-262 chr5 41780318 41780520 + 1 NA intron (NR_157114, intron 12 of 15) L1M5|LINE|L1 63238 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 132.333-101 chr20 15393890 15394064 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 6 of 17) intron (NM_001351663, intron 6 of 17) 197137 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 215.667-58 chr2 62712001 62712429 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 2 of 22) L2|LINE|L2 5318 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 253.333-60 chr2 191139062 191139350 + 1 NA intron (NM_003151, intron 3 of 23) L1PB2|LINE|L1 11788 NM_003151 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 210.667-26 chr11 69723874 69724208 + 1 NA Intergenic Intergenic -20019 NM_005117 9965 Hs.249200 NM_005117 ENSG00000162344 FGF19 - fibroblast growth factor 19 protein-coding 187.667-22 chr11 67657408 67657620 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -6784 NM_080658 91703 Hs.126265 NM_080658 ENSG00000132744 ACY3 ACY-3|HCBP1 aminoacylase 3 protein-coding 165.333-250 chr8 103277605 103277861 + 1 NA intron (NR_148215, intron 2 of 3) MER3|DNA|hAT-Charlie -20761 NM_001164615 8323 Hs.591863 NM_003506 ENSG00000164930 FZD6 FZ-6|FZ6|HFZ6|NDNC10 frizzled class receptor 6 protein-coding 152.667-384 chr8 119094828 119095078 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 5 of 7) L1ME3A|LINE|L1 -26171 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 152.667-266 chr4 33370590 33370870 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 669163 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 271.667-59 chr7 12550327 12550645 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -20234 NR_156701 85477 Hs.633359 NM_033128 ENSG00000006747 SCIN - scinderin protein-coding 237.333-72 chr22 47513087 47513379 + 1 NA Intergenic Intergenic -26122 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 157.667-205 chr3 179647989 179648172 + 1 NA Intergenic Charlie17a|DNA|hAT-Charlie -4960 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 139.333-163 chr4 43957671 43957865 + 1 NA Intergenic Intergenic -59093 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 163.667-255 chr8 119059776 119060107 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) L1M4a1|LINE|L1 -7306 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 180.333-125 chr8 22939919 22940254 + 1 NA intron (NM_001363233, intron 1 of 6) intron (NM_001363233, intron 1 of 6) 991 NM_001363233 157310 Hs.491242 NM_144962 ENSG00000134020 PEBP4 CORK-1|CORK1|GWTM1933|HEL-S-300|PEBP-4|PRO4408|hPEBP4 phosphatidylethanolamine binding protein 4 protein-coding 149.333-333 chr6 45106723 45106935 + 1 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu 90941 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 205.667-78 chr2 188625675 188626081 + 1 NA Intergenic Intergenic 164245 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 178.667-67 chr18 30275618 30275932 + 1 NA Intergenic Intergenic -23135 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 196.667-124 chr5 121486668 121487085 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 164326 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 290.333-38 chr6 27109293 27109885 + 1 NA Intergenic Intergenic 23207 NM_021058 8970 Hs.591807 NM_021058 ENSG00000124635 HIST1H2BJ H2B/r|H2BFR|H2BJ histone cluster 1 H2B family member j protein-coding 145.667-97 chr15 63563206 63563400 + 1 NA intron (NM_001256702, intron 7 of 13) intron (NM_001256702, intron 7 of 13) -34084 NM_203373 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 289.667-21 chr2 125180819 125181383 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 936884 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 145.333-3 chr1 80479157 80479367 + 1 NA Intergenic Intergenic -56493 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 162.667-274 chr8 101919081 101919316 + 1 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) L1PA16|LINE|L1 -65234 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 213.333-155 chr5 7475565 7475903 + 1 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) L2|LINE|L2 79596 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 234.333-90 chr9 28462522 28462902 + 1 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) MIR3|SINE|MIR 256593 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 364.667-11 chr4 70597939 70598449 + 1 NA intron (NM_016519, intron 3 of 12) intron (NM_016519, intron 3 of 12) 5938 NM_016519 258 Hs.272396 NM_016519 ENSG00000178522 AMBN AI1F ameloblastin protein-coding 262.667-17 chr11 106087724 106088249 + 1 NA intron (NM_015423, intron 2 of 5) intron (NM_015423, intron 2 of 5) -10248 NM_152433 143879 Hs.101949 NM_152433 ENSG00000182359 KBTBD3 BKLHD3 kelch repeat and BTB domain containing 3 protein-coding 243.667-15 chr12 11667416 11667929 + 1 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 17818 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 116.667-56 chr14 63282328 63282485 + 1 NA intron (NM_020663, intron 3 of 4) intron (NM_020663, intron 3 of 4) 36529 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 169.333-258 chr7 113892953 113893215 + 1 NA intron (NM_002711, intron 1 of 3) MER117|DNA|hAT-Charlie 25925 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 151.667-36 chr10 10106443 10106705 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 47852 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 150.333-6 chr1 73351864 73352074 + 1 NA Intergenic Intergenic 45799 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 148.333-45 chr10 55570633 55570874 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -28289 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 139.333-121 chr2 186600617 186600828 + 1 NA intron (NM_001144999, intron 1 of 29) AluSq2|SINE|Alu 517 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 280.667-2 chr1 42909055 42909500 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 49591 NM_006516 6513 Hs.473721 NM_006516 ENSG00000117394 SLC2A1 CSE|DYT17|DYT18|DYT9|EIG12|GLUT|GLUT-1|GLUT1|GLUT1DS|HTLVR|PED|SDCHCN solute carrier family 2 member 1 protein-coding 207.667-97 chr5 26963059 26963371 + 1 NA intron (NM_016279, intron 2 of 11) intron (NM_016279, intron 2 of 11) 75371 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 149.333-165 chr2 13926008 13926251 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 474829 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 141.667-50 chr11 78636200 78636400 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -61436 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 155.333-254 chr4 30760914 30761099 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 40637 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 243.667-22 chr14 66629830 66630157 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 122586 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 138.667-194 chr7 115547071 115547233 + 1 NA Intergenic Intergenic 34289 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 183.667-19 chr10 13789444 13789670 + 1 NA intron (NM_001318336, intron 4 of 23) intron (NM_001318336, intron 4 of 23) -81990 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 161.333-61 chr12 32302303 32302472 + 1 NA intron (NR_148725, intron 3 of 9) intron (NR_148725, intron 3 of 9) -97171 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 131.333-186 chr8 138284859 138285109 + 1 NA intron (NM_015912, intron 3 of 19) intron (NM_015912, intron 3 of 19) -201439 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 330.667-9 chr15 59889945 59890461 + 1 NA Intergenic Intergenic -114108 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 141.333-135 chr20 57108553 57108746 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -105047 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 275.333-35 chr2 135724831 135725235 + 1 NA 3' UTR (NM_015361, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_015361, exon 26 of 26) -16822 NM_014607 23190 Hs.591242 NM_014607 ENSG00000144224 UBXN4 UBXD2|UBXDC1|erasin UBX domain protein 4 protein-coding 158.333-264 chr5 131518954 131519124 + 1 NA intron (NM_016340, intron 7 of 27) L1ME1|LINE|L1 116190 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 158.333-155 chr2 118329208 118329441 + 1 NA Intergenic Intergenic -142938 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 211.667-10 chr1 147654074 147654422 + 1 NA non-coding (NR_136636, exon 6 of 9) non-coding (NR_136636, exon 6 of 9) 16276 NR_136635 51205 Hs.562154 NM_016361 ENSG00000162836 ACP6 ACPL1|LPAP|PACPL1 acid phosphatase 6, lysophosphatidic protein-coding 198.667-62 chr14 73295479 73295747 + 1 NA intron (NM_001005743, intron 7 of 12) intron (NM_001005743, intron 7 of 12) -49612 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 174.333-108 chr4 122137671 122138065 + 1 NA Intergenic Intergenic -32735 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 285.333-16 chr12 20892086 20892443 + 1 NA intron (NM_019844, intron 13 of 15) L2a|LINE|L2 69716 NM_001349920 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 171.333-192 chr8 65723441 65723644 + 1 NA exon (NM_002603, exon 12 of 13) exon (NM_002603, exon 12 of 13) 53669 NM_001145838 9650 Hs.584788 NM_014637 ENSG00000066855 MTFR1 CHPPR|FAM54A2 mitochondrial fission regulator 1 protein-coding 113.667-206 chr8 19821949 19822185 + 1 NA intron (NR_148458, intron 4 of 18) intron (NR_148458, intron 4 of 18) 4651 NM_018142 55174 Hs.512627 NM_018142 ENSG00000104613 INTS10 C8orf35|INT10 integrator complex subunit 10 protein-coding 160.667-233 chr4 148096366 148096571 + 1 NA intron (NM_000901, intron 8 of 8) intron (NM_000901, intron 8 of 8) 313873 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 270.667-41 chr5 90395033 90395437 + 1 NA intron (NM_004365, intron 4 of 4) intron (NM_004365, intron 4 of 4) 14551 NM_001297765 1070 Hs.591767 NM_004365 ENSG00000153140 CETN3 CDC31|CEN3 centrin 3 protein-coding 130.333-146 chr4 52287077 52287309 + 1 NA Intergenic Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 235889 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 154.333-193 chr21 29043504 29043794 + 1 NA intron (NM_001032410, intron 14 of 18) intron (NM_001032410, intron 14 of 18) 18981 NM_006447 10600 Hs.99819 NM_006447 ENSG00000156256 USP16 UBP-M|UBPM ubiquitin specific peptidase 16 protein-coding 169.333-290 chr9 95930348 95930644 + 1 NA intron (NM_020207, intron 11 of 18) intron (NM_020207, intron 11 of 18) 54488 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 154.667-405 chr8 142713566 142713841 + 1 NA intron (NR_038925, intron 1 of 2) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 13270 NR_038925 100288181 Hs.716823 NR_038925 ENSG00000253741 LNCOC1 Lnc-OC1 lncRNA associated with ovarian cancer 1 ncRNA 285.666-6 chr3 95160214 95160738 + 1 NA Intergenic Intergenic 222213 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 195.667-111 chr5 156254241 156254457 + 1 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -72408 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 190.667-73 chr20 34179362 34179692 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -67284 NM_003908 8894 Hs.429180 NM_003908 ENSG00000125977 EIF2S2 EIF2|EIF2B|EIF2beta|PPP1R67|eIF-2-beta eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta protein-coding 232.333-46 chr2 171845414 171845847 + 1 NA intron (NR_047549, intron 3 of 16) intron (NR_047549, intron 3 of 16) 48614 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 251.333-37 chr14 68716581 68717145 + 1 NA Intergenic Intergenic 77051 NM_001244698 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 146.333-169 chr2 208955059 208955211 + 1 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 412493 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 292.667-16 chr19 15328532 15328911 + 1 NA intron (NM_001330384, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 3818 NM_001330384 23476 Hs.187763 NM_014299 ENSG00000141867 BRD4 CAP|HUNK1|HUNKI|MCAP bromodomain containing 4 protein-coding 242.667-51 chr2 58021107 58021498 + 1 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -25340 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 153.333-414 chr8 94138566 94138728 + 1 NA intron (NM_001144663, intron 15 of 17) L1ME1|LINE|L1 69908 NM_004063 1015 Hs.591853 NM_004063 ENSG00000079112 CDH17 CDH16|HPT-1|HPT1 cadherin 17 protein-coding 229.667-56 chr3 22765422 22765755 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 436990 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 155.333-177 chr2 136462820 136463068 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -302601 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 155.667-123 chr16 5310916 5311084 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -213180 NM_001289029 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 112.667-275 chr8 136365520 136365757 + 1 NA Intergenic Intergenic -165160 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 307.333-2 chr1 59773821 59774202 + 1 NA intron (NR_110627, intron 1 of 2) LTR78B|LTR|ERV1 1216 NR_110627 101926944 Hs.720353 NR_110627 LOC101926944 - uncharacterized LOC101926944 ncRNA 223.333-66 chr2 40409733 40409997 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 20439 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 225.667-72 chr7 56105552 56105806 + 1 NA intron (NM_001320327, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 797 NM_016139 51142 Hs.389996 NM_016139 ENSG00000106153 CHCHD2 C7orf17|MIX17B|MNRR1|NS2TP|PARK22 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2 protein-coding 181.667-56 chr18 50681782 50681983 + 1 NA intron (NM_002747, intron 2 of 5) L1MB7|LINE|L1 121795 NM_002747 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 161.667-228 chr6 152379007 152379305 + 1 NA intron (NM_182961, intron 56 of 145) intron (NM_182961, intron 56 of 145) -1374 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 189.667-64 chr18 38448559 38448769 + 1 NA Intergenic MamGypLTR1d|LTR|Gypsy 791529 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 250.333-6 chr1 206548280 206548686 + 1 NA intron (NM_182664, intron 2 of 4) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -8681 NM_182665 83593 Hs.497579 NM_031437 ENSG00000266094 RASSF5 Maxp1|NORE1|NORE1A|NORE1B|RAPL|RASSF3 Ras association domain family member 5 protein-coding 172.333-163 chr7 52876656 52876959 + 1 NA Intergenic Intergenic -158826 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 162.333-149 chr22 33206510 33206768 + 1 NA Intergenic Intergenic 98110 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 194.333-156 chr8 123407778 123408103 + 1 NA Intergenic Intergenic -8785 NR_133926 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 159.667-85 chr12 78409656 78409885 + 1 NA Intergenic Intergenic -50024 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 160.333-132 chr18 25912728 25912908 + 1 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 177795 NM_001007559 6760 Hs.129261 NM_005637 ENSG00000141380 SS18 SSXT|SYT SS18 subunit of BAF chromatin remodeling complex protein-coding 201.333-240 chr6 52745577 52745876 + 1 NA promoter-TSS (NR_033760) promoter-TSS (NR_033760) -567 NR_033760 730152 Hs.739662 NR_033760 GSTA7P GSTAP2|GSTAP6 glutathione S-transferase alpha 7, pseudogene pseudo 125.667-110 chr20 54510562 54510790 + 1 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) intron (NM_018431, intron 1 of 7) 35083 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 164.333-117 chr2 69324771 69324974 + 1 NA 3' UTR (NM_001244710, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001244710, exon 20 of 20) 62355 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 113.667-41 chr12 45018475 45018640 + 1 NA intron (NM_001004329, intron 3 of 3) L1ME3A|LINE|L1 32542 NM_001004329 440097 Hs.302764 NM_001004329 ENSG00000185610 DBX2 - developing brain homeobox 2 protein-coding 201.333-306 chrX 47851670 47852109 + 1 NA intron (NM_007137, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 14987 NM_007137 347344 Hs.114246 NM_007137 ENSG00000197779 ZNF81 HFZ20|MRX45|dJ54B20.6 zinc finger protein 81 protein-coding 147.667-105 chr14 64569316 64569568 + 1 NA intron (NM_172365, intron 7 of 11) intron (NM_172365, intron 7 of 11) 19481 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 141.667-193 chr6 37119688 37119886 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -50365 NM_002648 5292 Hs.81170 NM_002648 ENSG00000137193 PIM1 PIM Pim-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 143.333-13 chr1 158136726 158136940 + 1 NA intron (NR_033946, intron 1 of 2) L1PA4|LINE|L1 3807 NR_033946 646268 Hs.506902 NR_033946 ENSG00000231666 LINC01704 - long intergenic non-protein coding RNA 1704 ncRNA 161.333-213 chr4 65732409 65732673 + 1 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? -62046 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 138.333-49 chr12 69847769 69847975 + 1 NA intron (NM_182530, intron 1 of 24) intron (NM_182530, intron 1 of 24) 22645 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 263.333-54 chr22 31557847 31558130 + 1 NA intron (NM_001007467, intron 7 of 32) intron (NM_001007467, intron 7 of 32) 61452 NM_014775 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 181.667-65 chr2 38880927 38881302 + 1 NA intron (NM_001145450, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 5152 NM_001145450 729967 Hs.729207 NM_194270 ENSG00000188010 MORN2 BLOCK27|MOPT MORN repeat containing 2 protein-coding 162.333-124 chr2 155185690 155185876 + 1 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 487088 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 138.333-171 chr6 110152866 110153092 + 1 NA intron (NM_001024936, intron 1 of 8) L1ME2|LINE|L1 26691 NM_003931 8936 Hs.75850 NM_003931 ENSG00000112290 WASF1 SCAR1|WAVE|WAVE1 WASP family member 1 protein-coding 153.667-32 chr1 238225357 238225559 + 1 NA Intergenic Intergenic 260559 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 131.667-45 chr12 62225361 62225607 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -32645 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 196.333-159 chr7 35795143 35795503 + 1 NA intron (NR_120512, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 5302 NR_120512 101928545 Hs.648103 NR_120511 SEPTIN7-AS1 SEPT7-AS1 SEPT7 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 147.667-149 chr18 2301607 2301768 + 1 NA Intergenic Intergenic 269818 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 241.333-24 chr10 102123319 102123668 + 1 NA Intergenic Intergenic -3020 NM_001113407 8861 Hs.454418 NM_003893 ENSG00000198728 LDB1 CLIM-2|CLIM2|LDB-1|NLI LIM domain binding 1 protein-coding 154.667-355 chr7 7161936 7162105 + 1 NA Intergenic Intergenic -20595 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 154.667-317 chr5 108838271 108838457 + 1 NA intron (NR_146155, intron 4 of 19) intron (NR_146155, intron 4 of 19) -86242 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 183.333-111 chr4 17461857 17462068 + 1 NA Intergenic Intergenic 50128 NM_000320 5860 Hs.75438 NM_000320 ENSG00000151552 QDPR DHPR|HDHPR|PKU2|SDR33C1 quinoid dihydropteridine reductase protein-coding 153.667-329 chr5 145527607 145527761 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 307658 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 121.333-76 chr2 5479727 5479981 + 1 NA Intergenic MER130|DNA|DNA 211264 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 261.333-117 chr9 109043392 109043705 + 1 NA intron (NM_032012, intron 14 of 17) L3|LINE|CR1 2750 NR_029506 407036 NR_029506 ENSG00000207698 MIR32 MIRN32|hsa-mir-32|miR-32|miRNA32 microRNA 32 ncRNA 241.333-14 chr10 58008275 58008558 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 259478 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 116.333-192 chr6 155901803 155902029 + 1 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -44881 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 198.333-105 chr2 207171420 207171653 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -4290 NM_001270943 8609 Hs.59908 NM_003709 ENSG00000118263 KLF7 UKLF Kruppel like factor 7 protein-coding 132.333-196 chrX 77001970 77002179 + 1 NA intron (NR_110403, intron 1 of 3) intron (NR_110403, intron 1 of 3) 3427 NR_029905 442899 NR_029905 ENSG00000207995 MIR325 MIRN325|hsa-mir-325 microRNA 325 ncRNA 135.667-181 chr8 67777615 67777794 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -31344 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 148.667-363 chr7 112268933 112269094 + 1 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 62318 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 112.667-124 chr2 69314071 69314230 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 73077 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 186.333-102 chr3 103012447 103012727 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 511529 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 143.667-224 chr7 3470816 3471001 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 169656 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 236.333-87 chr7 41251761 41252179 + 1 NA Intergenic Intergenic 150366 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 120.667-60 chr15 59222114 59222266 + 1 NA intron (NM_004998, intron 9 of 27) intron (NM_004998, intron 9 of 27) 15347 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 221.333-53 chr19 29011483 29011738 + 1 NA intron (NR_040036, intron 4 of 4) L1MB2|LINE|L1 9055 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 195.667-83 chr22 27823319 27823761 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -21784 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 175.333-52 chr14 91024871 91025156 + 1 NA intron (NM_182398, intron 1 of 12) AluSx3|SINE|Alu 35111 NM_001322237 9252 Hs.510225 NM_004755 ENSG00000100784 RPS6KA5 MSK1|MSPK1|RLPK ribosomal protein S6 kinase A5 protein-coding 151.333-98 chr12 22596728 22597003 + 1 NA intron (NR_135030, intron 2 of 3) intron (NR_135030, intron 2 of 3) 28181 NR_135031 105369691 Hs.556287 NR_135030 LOC105369691 - uncharacterized LOC105369691 ncRNA 163.333-38 chr10 74684634 74684820 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) AluJb|SINE|Alu -140528 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 153.333-96 chr12 55279824 55280025 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 15308 NM_001005493 283365 Hs.554555 NM_001005493 ENSG00000188324 OR6C6 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 6 protein-coding 280.333-27 chr4 33560995 33561620 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 478586 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 171.333-45 chr14 49028329 49028592 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 557920 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 152.667-81 chr12 45035184 45035339 + 1 NA intron (NM_001004329, intron 2 of 3) intron (NM_001004329, intron 2 of 3) 15838 NM_001004329 440097 Hs.302764 NM_001004329 ENSG00000185610 DBX2 - developing brain homeobox 2 protein-coding 207.667-61 chr2 226936236 226936530 + 1 NA intron (NM_001349069, intron 8 of 8) intron (NM_001349069, intron 8 of 8) 100329 NM_032276 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 159.667-28 chr1 181923865 181924071 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 137744 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 214.667-85 chr3 188823270 188823666 + 1 NA intron (NM_001167672, intron 7 of 9) intron (NM_001167672, intron 7 of 9) 124171 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 126.667-31 chr12 19196582 19196777 + 1 NA intron (NM_019012, intron 3 of 25) intron (NM_019012, intron 3 of 25) -8646 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 250.333-79 chr8 128224168 128224614 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 74275 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 121.667-214 chr8 140801606 140801869 + 1 NA intron (NM_001352716, intron 10 of 34) intron (NM_001352716, intron 10 of 34) -69084 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 166.667-217 chr7 43138095 43138374 + 1 NA intron (NR_135295, intron 3 of 6) intron (NR_135295, intron 3 of 6) -12661 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 157.667-277 chr6 47564436 47564703 + 1 NA intron (NM_012120, intron 5 of 17) intron (NM_012120, intron 5 of 17) 86780 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 179.333-116 chr22 20902870 20903164 + 1 NA Intergenic Intergenic -14390 NM_005207 1399 Hs.5613 NM_005207 ENSG00000099942 CRKL - CRK like proto-oncogene, adaptor protein protein-coding 167.667-24 chr10 51247253 51247482 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -52206 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 156.333-164 chr19 48220424 48220595 + 1 NA intron (NM_014959, intron 10 of 12) intron (NM_014959, intron 10 of 12) 20554 NR_033679 22900 Hs.68846 NM_014959 ENSG00000105483 CARD8 CARDINAL|DACAR|DAKAR|NDPP|NDPP1|TUCAN caspase recruitment domain family member 8 protein-coding 204.333-155 chr5 42312022 42312286 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -111285 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 171.667-59 chr15 87803413 87803766 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 142679 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 245.667-51 chr4 104080936 104081225 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -361095 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 148.667-39 chr10 33995811 33995973 + 1 NA Intergenic Intergenic -223212 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 128.333-74 chr16 79234667 79234817 + 1 NA Intergenic Intergenic 365995 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 210.667-131 chr8 116705808 116706269 + 1 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 49785 NM_003756 8667 Hs.492599 NM_003756 ENSG00000147677 EIF3H EIF3S3|eIF3-gamma|eIF3-p40 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H protein-coding 270.667-16 chr14 67335802 67336277 + 1 NA TTS (NM_022474) TTS (NM_022474) 23765 NM_015994 51382 Hs.272630 NM_015994 ENSG00000100554 ATP6V1D ATP6M|VATD|VMA8 ATPase H+ transporting V1 subunit D protein-coding 135.333-2 chr1 33463720 33463867 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -8852 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 179.333-32 chr10 119812799 119813085 + 1 NA intron (NM_014937, intron 15 of 19) intron (NM_014937, intron 15 of 19) -6315 NM_001243194 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 287.333-18 chr14 44804278 44804634 + 1 NA Intergenic Intergenic -5330 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 155.667-191 chr2 234343012 234343198 + 1 NA Intergenic Intergenic 111490 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 121.667-166 chr5 94952918 94953182 + 1 NA intron (NM_001297777, intron 3 of 19) intron (NM_001297777, intron 3 of 19) 128816 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 268.667-19 chr16 54750768 54751085 + 1 NA Intergenic Intergenic 97307 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 173.667-34 chr12 16959710 16959899 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -28943 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 183.333-18 chr11 31312017 31312354 + 1 NA intron (NM_181807, intron 3 of 8) intron (NM_181807, intron 3 of 8) 57554 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 138.667-15 chr10 49548973 49549175 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -9536 NM_001277059 2074 Hs.49063 NM_000124 ENSG00000225830 ERCC6 ARMD5|CKN2|COFS|COFS1|CSB|CSB-PGBD3|POF11|RAD26|UVSS1 ERCC excision repair 6, chromatin remodeling factor protein-coding 219.667-66 chr4 72187288 72187639 + 1 NA Intergenic Intergenic 148331 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 220.667-34 chr16 57882898 57883221 + 1 NA 3' UTR (NM_001286130, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_001286130, exon 33 of 33) 72422 NM_001278081 388282 Hs.434720 NM_001278081 LOC388282 - uncharacterized LOC388282 protein-coding 208.667-113 chr5 98487080 98487347 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -281419 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 225.333-144 chrX 80821718 80822058 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -12011 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 150.333-345 chr5 134907240 134907426 + 1 NA intron (NM_032151, intron 1 of 3) AluSg|SINE|Alu 2213 NM_032151 84105 Hs.710014 NM_032151 ENSG00000132570 PCBD2 DCOH2|DCOHM|PHS2 pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 2 protein-coding 303.333-68 chr6 110174335 110174652 + 1 NA intron (NM_001024935, intron 1 of 9) intron (NM_001024935, intron 1 of 9) 5177 NM_003931 8936 Hs.75850 NM_003931 ENSG00000112290 WASF1 SCAR1|WAVE|WAVE1 WASP family member 1 protein-coding 157.667-7 chr1 89697379 89697687 + 1 NA intron (NM_032270, intron 2 of 2) intron (NM_032270, intron 2 of 2) 64413 NM_032270 84230 Hs.412836 NM_032270 ENSG00000171488 LRRC8C AD158|FAD158 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit C protein-coding 152.333-254 chr3 158310237 158310482 + 1 NA intron (NM_001271838, intron 5 of 9) intron (NM_001271838, intron 5 of 9) 200270 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 304.667-36 chr8 105021916 105022470 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -296245 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 162.333-195 chr5 33775269 33775521 + 1 NA intron (NM_001324511, intron 2 of 2) intron (NM_001324511, intron 2 of 2) 116595 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 154.667-208 chr2 219078976 219079158 + 1 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) intron (NM_024782, intron 5 of 7) -18146 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 209.333-165 chr4 31380809 31381176 + 1 NA Intergenic Intergenic -125552 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 217.667-2 chr1 61965591 61965808 + 1 NA intron (NM_001350145, intron 27 of 43) MIR|SINE|MIR -113087 NR_036058 100422902 NR_036058 ENSG00000263908 MIR3116-1 - microRNA 3116-1 ncRNA 113.667-197 chr7 72035398 72035537 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) L1M4c|LINE|L1 301924 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 224.667-12 chr11 58415990 58416410 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 7113 NM_001005566 390190 Hs.553753 NM_001005566 ENSG00000172365 OR5B2 OR11-240|OST073 olfactory receptor family 5 subfamily B member 2 protein-coding 234.333-93 chr9 92414018 92414399 + 1 NA TTS (NM_005014) TTS (NM_005014) -9509 NM_024416 4969 Hs.109439 NM_014057 ENSG00000106809 OGN OG|OIF|SLRR3A osteoglycin protein-coding 144.333-33 chr10 115193429 115193632 + 1 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) L1MA3|LINE|L1 100165 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 116.667-3 chr1 42865720 42865872 + 1 NA intron (NR_104171, intron 1 of 3) L1M2|LINE|L1 8174 NR_104171 339539 Hs.434301 NR_104171 LOC339539 - uncharacterized LOC339539 ncRNA 153.667-44 chr10 53907644 53907929 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 26 of 34) intron (NM_001354411, intron 26 of 34) -578444 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 339.333-3 chr1 169554120 169554701 + 1 NA intron (NM_000130, intron 7 of 24) L1ME4b|LINE|L1 32121 NM_000130 2153 Hs.30054 NM_000130 ENSG00000198734 F5 FVL|PCCF|RPRGL1|THPH2 coagulation factor V protein-coding 157.333-245 chr3 153103288 153103497 + 1 NA Intergenic Intergenic -58834 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 218.333-23 chr11 76058740 76059069 + 1 NA intron (NM_003369, intron 12 of 14) intron (NM_003369, intron 12 of 14) 147598 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 300.333-47 chr7 104872047 104872627 + 1 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) AluSx4|SINE|Alu 54308 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 154.667-230 chr22 46926457 46926761 + 1 NA intron (NR_104292, intron 10 of 13) MLT2C1|LTR|ERVL -10567 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 159.667-201 chr22 26474472 26474650 + 1 NA intron (NR_146315, intron 4 of 14) L1ME2z|LINE|L1 4927 NR_073136 89781 Hs.474436 NM_022081 ENSG00000100099 HPS4 BLOC3S2|LE HPS4 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2 protein-coding 204.667-139 chr7 24916541 24916880 + 1 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) -24089 NM_145322 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 214.333-121 chr5 146651305 146651778 + 1 NA intron (NM_181678, intron 6 of 10) intron (NM_181678, intron 6 of 10) -135428 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 343.333-2 chr1 55932367 55932947 + 1 NA intron (NR_147162, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 12306 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 161.333-16 chr1 220902184 220902426 + 1 NA Intergenic Intergenic -22165 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 155.667-52 chr11 68281168 68281405 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -9313 NM_001300913 53838 Hs.303025 NM_022338 ENSG00000171067 C11orf24 DM4E3 chromosome 11 open reading frame 24 protein-coding 253.667-51 chr4 74606538 74606822 + 1 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL 161544 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 138.667-8 chr1 171875188 171875421 + 1 NA intron (NM_001278252, intron 1 of 14) L1PA16|LINE|L1 11112 NR_046845 100874284 NR_046845 ENSG00000233540 DNM3-IT1 - DNM3 intronic transcript 1 ncRNA 154.333-379 chrX 132994761 132994984 + 1 NA Intergenic Intergenic 33400 NM_031907 83844 Hs.333137 NM_031907 ENSG00000134588 USP26 - ubiquitin specific peptidase 26 protein-coding 129.667-116 chr3 23259149 23259325 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 55910 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 213.333-173 chr5 171507436 171507805 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 87973 NM_003862 8817 Hs.87191 NM_003862 ENSG00000156427 FGF18 FGF-18|ZFGF5 fibroblast growth factor 18 protein-coding 126.667-64 chr17 18915530 18915734 + 1 NA intron (NM_001353099, intron 9 of 11) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -35044 NM_001282417 125206 Hs.462418 NM_152351 ENSG00000154025 SLC5A10 SGLT-5|SGLT5 solute carrier family 5 member 10 protein-coding 227.333-59 chr2 29487488 29487878 + 1 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) MIRc|SINE|MIR -12306 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 187.667-149 chr9 19812095 19812441 + 1 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -25249 NM_001193288 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 273.667-21 chr13 112810348 112810658 + 1 NA intron (NM_032189, intron 4 of 28) intron (NM_032189, intron 4 of 28) -55772 NR_046661 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 272.667-52 chr5 63448875 63449272 + 1 NA Intergenic Intergenic 513219 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 148.667-19 chr1 176662946 176663128 + 1 NA intron (NM_021936, intron 3 of 4) L3|LINE|CR1 199862 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 142.333-141 chr20 39374285 39374437 + 1 NA Intergenic Intergenic -149613 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 252.334-8 chr18 14102556 14103061 + 1 NA 3' UTR (NM_145287, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_145287, exon 3 of 3) 29627 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 166.333-38 chr10 105572039 105572250 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 248189 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 228.333-77 chr5 43469016 43469394 + 1 NA intron (NM_022483, intron 1 of 2) L1MA1|LINE|L1 14660 NM_022483 64417 Hs.732093 NM_022483 ENSG00000151881 TMEM267 C5orf28 transmembrane protein 267 protein-coding 131.333-190 chr9 28035245 28035417 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -461465 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 373.667-9 chr3 68100885 68101455 + 1 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) L1PA13|LINE|L1 96923 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 128.333-163 chr5 146084810 146085015 + 1 NA intron (NM_001029869, intron 3 of 3) L1ME4b|LINE|L1 20665 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 188.667-59 chr17 61725639 61725927 + 1 NA intron (NM_032043, intron 16 of 19) AluJr4|SINE|Alu -134564 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 261.333-99 chr7 87877549 87877872 + 1 NA intron (NM_001318061, intron 1 of 11) intron (NM_001318061, intron 1 of 11) 1217 NM_001318060 10926 Hs.485380 NM_006716 ENSG00000006634 DBF4 ASK|CHIF|DBF4A|ZDBF1 DBF4 zinc finger protein-coding 230.333-93 chr5 61180577 61180879 + 1 NA intron (NR_109908, intron 3 of 3) intron (NR_109908, intron 3 of 3) -18260 NM_001048249 643155 Hs.508479 NM_001048249 ENSG00000188725 SMIM15 C5orf43 small integral membrane protein 15 protein-coding 217.667-61 chr3 169888780 169889187 + 1 NA Intergenic Intergenic -19048 NM_001277128 79782 Hs.411295 NM_024727 ENSG00000114248 LRRC31 HEL-S-293 leucine rich repeat containing 31 protein-coding 173.333-114 chr3 4604641 4604869 + 1 NA intron (NM_001168272, intron 4 of 60) intron (NM_001168272, intron 4 of 60) 111407 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 128.333-57 chr14 50492259 50492405 + 1 NA intron (NM_198794, intron 3 of 31) AluJo|SINE|Alu 40237 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 231.333-20 chr10 99314807 99315143 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -14124 NR_144311 26507 Hs.274579 NM_020348 ENSG00000119946 CNNM1 ACDP1|CLP-1 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1 protein-coding 328.333-30 chr4 58115607 58116162 + 1 NA Intergenic Intergenic 420444 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 191.333-145 chr4 54695452 54695852 + 1 NA exon (NM_001093772, exon 2 of 21) exon (NM_001093772, exon 2 of 21) 37724 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 169.333-24 chr10 46322854 46323132 + 1 NA intron (NM_001278688, intron 16 of 16) MER57A-int|LTR|ERV1 35996 NM_001354208 195977 Hs.538515 NM_001278688 ENSG00000274209 ANTXRL - ANTXR like protein-coding 170.667-82 chr2 96213859 96214088 + 1 NA promoter-TSS (NR_145789) promoter-TSS (NR_145789) -666 NR_145789 109623481 NR_145789 SNORA112 - small nucleolar RNA, H/ACA box 112 snoRNA 214.667-23 chr11 46394153 46394433 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2625 NM_001366692 1132 Hs.248100 NM_000741 ENSG00000180720 CHRM4 HM4|M4R cholinergic receptor muscarinic 4 protein-coding 132.667-101 chr22 24783213 24783431 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -8602 NM_001008496 440822 Hs.448343 NM_001008496 ENSG00000184571 PIWIL3 HIWI3 piwi like RNA-mediated gene silencing 3 protein-coding 133.333-65 chr17 68896024 68896186 + 1 NA intron (NM_001288985, intron 21 of 39) L1MB8|LINE|L1 59287 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 159.333-101 chr14 88008889 88009064 + 1 NA intron (NM_003608, intron 1 of 1) L1MEd|LINE|L1 3841 NM_003608 8477 Hs.443243 NM_003608 ENSG00000140030 GPR65 TDAG8|hTDAG8 G protein-coupled receptor 65 protein-coding 148.333-32 chr1 214105403 214105594 + 1 NA Intergenic Intergenic 116965 NM_002763 5629 Hs.741808 NM_002763 ENSG00000117707 PROX1 - prospero homeobox 1 protein-coding 160.667-53 chr11 34724382 34724589 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 91919 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 149.333-363 chr7 17424142 17424395 + 1 NA intron (NR_110015, intron 1 of 2) intron (NR_110015, intron 1 of 2) 49351 NR_110014 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 148.667-2 chr1 25571945 25572143 + 1 NA Intergenic Intergenic 28459 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 121.667-77 chr17 79483039 79483189 + 1 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 33034 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 139.667-33 chr12 5724354 5724632 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 15 of 25) intron (NM_001278596, intron 15 of 25) 220766 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 184.333-22 chr11 109454768 109454993 + 1 NA Intergenic Intergenic 32690 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 153.333-146 chr15 69571605 69571890 + 1 NA TTS (NR_026979) TTS (NR_026979) 10027 NR_026979 145837 Hs.410126 NR_026979 DRAIC - downregulated RNA in cancer, inhibitor of cell invasion and migration ncRNA 233.667-20 chr14 64296115 64296420 + 1 NA intron (NR_073496, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR -1857 NM_001437 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 142.667-205 chr7 42186039 42186289 + 1 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) intron (NM_000168, intron 2 of 14) 51045 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 180.667-125 chr6 107897126 107897397 + 1 NA intron (NM_007214, intron 14 of 20) intron (NM_007214, intron 14 of 20) 60947 NM_007214 11231 Hs.26904 NM_007214 ENSG00000025796 SEC63 DNAJC23|ERdj2|PCLD2|PRO2507|SEC63L SEC63 homolog, protein translocation regulator protein-coding 261.333-116 chr9 91826727 91827210 + 1 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) L1ME4a|LINE|L1 123260 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 152.333-153 chr17 69092126 69092402 + 1 NA intron (NM_080284, intron 25 of 38) MIR|SINE|MIR -7278 NR_049834 100847008 NR_049834 ENSG00000265331 MIR4524B - microRNA 4524b ncRNA 187.333-217 chrX 49868801 49869062 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 10425 NR_026742 158572 Hs.408191 NM_001025449 ENSG00000234390 USP27X-AS1 - USP27X antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 280.667-20 chr13 62590835 62591354 + 1 NA Intergenic Intergenic 205598 NR_120404 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 189.667-67 chr2 29003084 29003300 + 1 NA intron (NM_001321538, intron 5 of 18) MIR3|SINE|MIR 21894 NM_001321539 165186 Hs.525977 NM_199280 ENSG00000189350 TOGARAM2 FAM179A TOG array regulator of axonemal microtubules 2 protein-coding 111.667-156 chr20 38206514 38206684 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -40091 NM_001323316 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 151.667-221 chr3 70492732 70492957 + 1 NA Intergenic Intergenic -180206 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 246.667-93 chr8 54864096 54864367 + 1 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -237797 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 114.667-48 chr11 42498149 42498322 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -244545 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 177.667-86 chr22 26181982 26182396 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 12715 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 145.667-294 chr8 119320495 119320754 + 1 NA Intergenic Intergenic -4547 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 144.667-179 chr22 20103215 20103468 + 1 NA intron (NM_022720, intron 9 of 13) L1ME1|LINE|L1 11410 NR_106874 102465490 NR_106874 ENSG00000278278 MIR6816 hsa-mir-6816 microRNA 6816 ncRNA 267.333-68 chr4 71713362 71713775 + 1 NA Intergenic Intergenic 70511 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 231.667-36 chr2 235363735 235364139 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -130106 NM_014914 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 159.333-233 chr4 35129340 35129640 + 1 NA Intergenic Intergenic -859743 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 157.333-371 chrX 51976532 51976834 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 83060 NM_006986 9500 Hs.5258 NM_006986 ENSG00000179222 MAGED1 DLXIN-1|NRAGE MAGE family member D1 protein-coding 163.333-9 chr1 69949681 69949929 + 1 NA intron (NM_001370785, intron 8 of 26) L1ME4b|LINE|L1 30483 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 190.333-59 chr18 2208678 2209000 + 1 NA Intergenic Intergenic 362666 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 199.667-56 chr16 49086552 49086996 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 195064 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 187.667-43 chr14 63350955 63351239 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -32162 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 310.333-15 chr14 49274591 49275049 + 1 NA Intergenic Intergenic 311560 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 213.667-5 chr1 191089133 191089499 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 139182 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 148.333-199 chr2 141528352 141528606 + 1 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 603222 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 152.667-355 chr8 13573629 13573927 + 1 NA intron (NM_001348082, intron 1 of 16) intron (NM_001348082, intron 1 of 16) 6909 NM_001007090 157773 Hs.104941 NM_001007090 ENSG00000164743 C8orf48 - chromosome 8 open reading frame 48 protein-coding 133.667-9 chr1 165670569 165670734 + 1 NA intron (NM_001365774, intron 6 of 10) L1MC4|LINE|L1 27911 NM_001365774 223 Hs.2533 NM_000696 ENSG00000143149 ALDH9A1 ALDH4|ALDH7|ALDH9|E3|TMABADH aldehyde dehydrogenase 9 family member A1 protein-coding 123.333-156 chr4 31908100 31908256 + 1 NA Intergenic Intergenic -89201 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 153.667-278 chr4 30888830 30889032 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 168562 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 274.333-15 chr14 65001834 65002306 + 1 NA intron (NM_002028, intron 1 of 11) intron (NM_002028, intron 1 of 11) 15175 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 286.667-12 chr13 78987268 78987694 + 1 NA Intergenic Intergenic -147431 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 152.667-166 chr2 25571218 25571501 + 1 NA intron (NM_001320937, intron 8 of 8) L2a|LINE|L2 78863 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 292.333-43 chr8 37424897 37425499 + 1 NA intron (NR_121620, intron 5 of 6) intron (NR_121620, intron 5 of 6) 68715 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 280.333-29 chr4 70673972 70674558 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -7757 NM_144646 3512 Hs.643431 NM_144646 ENSG00000132465 JCHAIN IGCJ|IGJ|JCH joining chain of multimeric IgA and IgM protein-coding 290.667-34 chr5 31356454 31356773 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 162927 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 202.667-11 chr1 197597896 197598171 + 1 NA intron (NR_125340, intron 12 of 19) MER33|DNA|hAT-Charlie 177447 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 148.667-355 chr7 71698291 71698516 + 1 NA intron (NM_022479, intron 9 of 10) L1MEd|LINE|L1 -390633 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 152.667-358 chr8 22960742 22960931 + 1 NA Intergenic LTR44|LTR|ERV1 -19759 NM_001363233 157310 Hs.491242 NM_144962 ENSG00000134020 PEBP4 CORK-1|CORK1|GWTM1933|HEL-S-300|PEBP-4|PRO4408|hPEBP4 phosphatidylethanolamine binding protein 4 protein-coding 162.333-106 chr2 17480917 17481132 + 1 NA Intergenic Intergenic 37416 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 151.333-178 chr18 4345284 4345512 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 80796 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 144.667-329 chrX 75118128 75118277 + 1 NA intron (NM_001271699, intron 1 of 14) MER41-int|LTR|ERV1 38081 NM_001271698 22 Hs.370480 NM_004299 ENSG00000131269 ABCB7 ABC7|ASAT|Atm1p|EST140535 ATP binding cassette subfamily B member 7 protein-coding 136.667-157 chr6 71821686 71821845 + 1 NA Intergenic Intergenic -64938 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 174.667-152 chr6 66429892 66430176 + 1 NA Intergenic Intergenic 642155 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 145.333-106 chr16 80818003 80818217 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -13512 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 253.333-6 chr10 7844852 7845434 + 1 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) intron (NM_031923, intron 2 of 6) 26638 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 117.667-83 chr2 73456652 73456856 + 1 NA promoter-TSS (NR_046762) promoter-TSS (NR_046762) -349 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 218.333-7 chr1 157010342 157010804 + 1 NA intron (NM_014784, intron 1 of 39) AluJr|SINE|Alu 35169 NM_198236 9826 Hs.516954 NM_014784 ENSG00000132694 ARHGEF11 GTRAP48|PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 11 protein-coding 128.667-72 chr17 9690902 9691057 + 1 NA intron (NM_001267576, intron 8 of 14) L1MB4|LINE|L1 45442 NM_001267576 124739 Hs.709621 NM_153210 ENSG00000154914 USP43 - ubiquitin specific peptidase 43 protein-coding 163.333-153 chr2 144357761 144358010 + 1 NA Intergenic Intergenic -24816 NM_001354360 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 197.333-216 chr7 77993781 77994003 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 153762 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 173.333-52 chr13 85305213 85305414 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -58290 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 149.667-24 chr1 106833503 106833785 + 1 NA intron (NR_147165, intron 2 of 2) L2|LINE|L2 15405 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 367.667-11 chr2 152937282 152937801 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 218904 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 148.667-8 chr1 74907381 74907659 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -174112 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 130.667-195 chr8 86539345 86539607 + 1 NA intron (NM_003909, intron 7 of 16) intron (NM_003909, intron 7 of 16) 25041 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 207.667-31 chr14 73027375 73027753 + 1 NA promoter-TSS (NM_001281734) promoter-TSS (NM_001281734) -458 NM_001281734 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 223.333-41 chr15 51647164 51647647 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -24634 NM_001174116 23312 Hs.511386 NM_015263 ENSG00000104093 DMXL2 DFNA71|PEPNS|RC3 Dmx like 2 protein-coding 149.333-311 chr5 92024557 92024851 + 1 NA Intergenic Intergenic -641387 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 184.667-2 chr1 32783459 32783725 + 1 NA intron (NM_003680, intron 8 of 12) AluSx3|SINE|Alu 17965 NM_001198972 57648 Hs.591502 NM_020888 ENSG00000162522 KIAA1522 - KIAA1522 protein-coding 205.667-118 chr6 8478600 8478910 + 1 NA intron (NR_038980, intron 2 of 4) L1ME3D|LINE|L1 43132 NR_038980 100506207 Hs.311049 NR_038979 ENSG00000285219 LOC100506207 - uncharacterized LOC100506207 ncRNA 229.667-3 chr1 110800534 110800836 + 1 NA Intergenic Intergenic -70514 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 157.333-251 chr4 19509332 19509627 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -742426 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 152.333-361 chr7 123229113 123229268 + 1 NA Intergenic Intergenic -29219 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 140.333-170 chr4 113597612 113597872 + 1 NA intron (NM_001221, intron 4 of 18) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 163996 NM_001321592 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 274.333-43 chr2 225368042 225368411 + 1 NA Intergenic Intergenic -31484 NM_001371273 164.667-146 chr3 77954931 77955226 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 93885 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 215.667-75 chr22 25892520 25892852 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 27 of 43) intron (NM_001318245, intron 27 of 43) 150498 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 245.333-41 chr14 53609445 53609880 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 338822 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 139.333-52 chr12 40071038 40071220 + 1 NA intron (NM_052885, intron 1 of 9) MER20|DNA|hAT-Charlie 34952 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 241.667-30 chr17 60151476 60151957 + 1 NA intron (NR_137422, intron 1 of 11) intron (NR_137422, intron 1 of 11) 1743 NM_000717 762 Hs.89485 NM_000717 ENSG00000167434 CA4 CAIV|Car4|RP17 carbonic anhydrase 4 protein-coding 297.667-24 chr22 29183960 29184530 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21651 NM_001267895 129080 Hs.289106 NM_133455 ENSG00000186998 EMID1 EMI5|EMU1 EMI domain containing 1 protein-coding 186.333-35 chr11 119227226 119227543 + 1 NA intron (NM_005188, intron 1 of 15) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 21108 NM_005188 867 Hs.504096 NM_005188 ENSG00000110395 CBL C-CBL|CBL2|FRA11B|NSLL|RNF55 Cbl proto-oncogene protein-coding 162.667-164 chr22 26366520 26366783 + 1 NA intron (NM_001184775, intron 13 of 15) AluJo|SINE|Alu -62609 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 145.667-194 chr4 72938153 72938327 + 1 NA Intergenic Intergenic 131476 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 314.667-26 chr20 56443290 56443926 + 1 NA intron (NM_001164116, intron 3 of 6) LTR65|LTR|ERV1 -24977 NM_001283035 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 198.667-76 chr16 75061641 75061842 + 1 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) intron (NM_032268, intron 1 of 4) 55031 NM_153486 197257 Hs.380929 NM_153486 ENSG00000166816 LDHD DLACD|DLD lactate dehydrogenase D protein-coding 116.333-220 chr9 114251147 114251303 + 1 NA intron (NM_032888, intron 25 of 60) MIR|SINE|MIR 41791 NR_030255 619556 NR_030255 ENSG00000207726 MIR455 MIRN455|hsa-mir-455|mir-455 microRNA 455 ncRNA 153.667-166 chr18 61835658 61835859 + 1 NA intron (NM_173557, intron 1 of 1) L1MC5a|LINE|L1 57249 NM_173557 220441 Hs.165062 NM_173557 ENSG00000176641 RNF152 - ring finger protein 152 protein-coding 154.333-11 chr1 99920972 99921250 + 1 NA intron (NM_000028, intron 33 of 33) intron (NM_000028, intron 33 of 33) -48885 NM_001271684 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 231.667-64 chr8 130720197 130720537 + 1 NA Intergenic Intergenic -276693 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 160.333-31 chr1 220460624 220460845 + 1 NA Intergenic Intergenic -67402 NM_001286128 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 315.333-21 chr2 119007396 119007789 + 1 NA Intergenic Intergenic 65423 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 313.667-21 chr18 66512141 66512561 + 1 NA intron (NR_073130, intron 9 of 11) intron (NR_073130, intron 9 of 11) 91739 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 224.333-41 chr14 67049612 67049984 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 9 of 21) AluSc|SINE|Alu -139642 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 159.333-155 chr2 63824677 63824953 + 1 NA Intergenic Intergenic -16149 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 159.667-272 chr5 130174463 130174658 + 1 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 270095 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 139.667-90 chr2 116057032 116057228 + 1 NA Intergenic Intergenic 713315 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 180.333-102 chr5 176385608 176385907 + 1 NA intron (NM_001291308, intron 2 of 3) intron (NM_001291308, intron 2 of 3) 2841 NM_001291308 51491 Hs.696283 NM_016391 ENSG00000048162 NOP16 HSPC111|HSPC185 NOP16 nucleolar protein protein-coding 209.667-78 chr22 26874488 26874810 + 1 NA intron (NR_146604, intron 3 of 5) intron (NR_146604, intron 3 of 5) 14438 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 169.667-35 chr11 80611783 80611974 + 1 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 150925 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 153.667-311 chr5 37016445 37016651 + 1 NA intron (NM_015384, intron 23 of 45) intron (NM_015384, intron 23 of 45) 139779 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 246.667-77 chr6 38295070 38295596 + 1 NA intron (NM_052893, intron 8 of 11) AluJo|SINE|Alu -186263 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-189 chr2 103442970 103443157 + 1 NA Intergenic Intergenic -458634 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 137.333-133 chr4 47886035 47886243 + 1 NA intron (NR_103795, intron 12 of 23) L1ME3|LINE|L1 -28088 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 148.333-349 chr6 165407497 165407792 + 1 NA intron (NM_006661, intron 14 of 22) intron (NM_006661, intron 14 of 22) -98039 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 339.333-2 chr1 109526936 109527368 + 1 NA Intergenic Intergenic -12720 NM_031936 83873 Hs.709782 NM_031936 ENSG00000156097 GPR61 BALGR|GPCR3 G protein-coupled receptor 61 protein-coding 257.667-22 chr14 70877640 70877971 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -29654 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 193.333-44 chr12 111936871 111937279 + 1 NA intron (NM_001193453, intron 6 of 9) intron (NM_001193453, intron 6 of 9) 38012 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 222.667-30 chr14 70014771 70015098 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 10 of 11) intron (NM_001034852, intron 10 of 11) 36801 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 155.333-97 chr13 92300738 92301014 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 51331 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 295.333-21 chr18 38274784 38275151 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 617832 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 165.333-115 chr18 75841945 75842111 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -129625 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 150.667-218 chr21 23058759 23058933 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -20438 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 134.667-203 chr8 132332758 132332917 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 114425 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 266.333-55 chr6 55042301 55042875 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -63872 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 154.667-210 chr2 221049311 221049609 + 1 NA Intergenic Intergenic 522844 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 275.667-66 chr8 110034877 110035316 + 1 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -59325 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 237.333 chr1 45074780 45075206 + 1 NA intron (NM_020883, intron 2 of 13) L1MA2|LINE|L1 62739 NR_158185 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 149.667-438 chrX 109996861 109997032 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5689 NM_001353851 84187 Hs.496572 NM_017698 ENSG00000157600 TMEM164 bB360B22.3 transmembrane protein 164 protein-coding 188.333-106 chr4 46268521 46268923 + 1 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) L1MA7|LINE|L1 120657 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 299.333-10 chr11 62506625 62507100 + 1 NA intron (NM_024060, intron 4 of 5) intron (NM_024060, intron 4 of 5) 38802 NM_001346446 79026 Hs.502756 NM_001620 ENSG00000124942 AHNAK AHNAKRS|PM227 AHNAK nucleoprotein protein-coding 150.333-249 chr22 28007013 28007249 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 14 of 22) intron (NM_001145418, intron 14 of 22) -86519 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 156.333-192 chr2 138999842 139000068 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 102631 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 174.667-135 chr4 173268966 173269221 + 1 NA TTS (NR_036093) TTS (NR_036093) 933 NR_036093 100422849 NR_036093 ENSG00000221296 MIR548T - microRNA 548t ncRNA 185.667-113 chr7 6260019 6260217 + 1 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) AluSp|SINE|Alu 12506 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 204.667-32 chr12 14730149 14730425 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -33688 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 147.333-72 chr11 107002043 107002194 + 1 NA intron (NM_001256424, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 16358 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 177.667-116 chr6 41355994 41356199 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 20488 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 176.333-131 chr5 28346703 28347048 + 1 NA Intergenic (TTTTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -59210 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 199.667-136 chr8 38780690 38780994 + 1 NA intron (NM_001352804, intron 1 of 10) intron (NM_001352804, intron 1 of 10) -6394 NM_001352779 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 348.667 chr1 184139279 184139984 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 87901 NR_125335 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 283.667-14 chr2 25507316 25507761 + 1 NA intron (NM_033147, intron 9 of 19) L2a|LINE|L2 142684 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 138.333-63 chr14 60865747 60865900 + 1 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) L2|LINE|L2 115256 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 162.667-17 chr1 227377706 227377987 + 1 NA Intergenic Intergenic -59354 NM_001366019 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 153.667-386 chr8 101845805 101846046 + 1 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) L1MA4|LINE|L1 -54956 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 230.333-36 chr14 46011973 46012259 + 1 NA Intergenic Intergenic -52043 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 185.333-134 chr4 53620982 53621192 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 28131 NR_046827 100873955 Hs.351074 NR_046827 LNX1-AS2 - LNX1 antisense RNA 2 ncRNA 193.333-149 chr5 74190839 74191084 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 117364 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 198.333-20 chr1 234235736 234236156 + 1 NA intron (NM_173508, intron 3 of 7) intron (NM_173508, intron 3 of 7) 21735 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 283.333-58 chr5 45902486 45902930 + 1 NA Intergenic Intergenic -206328 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 156.667-182 chr2 72672753 72673010 + 1 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L1MA4|LINE|L1 153152 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 148.667-269 chr4 36072902 36073078 + 1 NA intron (NR_146894, intron 32 of 32) intron (NR_146894, intron 32 of 32) 170949 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 151.333-383 chr7 24902087 24902272 + 1 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) -9558 NM_145322 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 156.667-160 chr18 52522765 52523007 + 1 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 182689 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 236.667-56 chr3 189601708 189602128 + 1 NA intron (NM_001329964, intron 1 of 13) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 5172 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 157.333-162 chr18 3577588 3577761 + 1 NA intron (NM_001242762, intron 5 of 9) intron (NM_001242762, intron 5 of 9) -16440 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 404.333 chr1 49428723 49429556 + 1 NA intron (NR_046839, intron 2 of 3) intron (NR_046839, intron 2 of 3) 42946 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 230.333-126 chr9 36521345 36521848 + 1 NA Intergenic Intergenic -51266 NR_046337 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 116.667-32 chr12 31676036 31676227 + 1 NA intron (NR_103522, intron 7 of 8) L1M4|LINE|L1 16443 NM_001135863 254013 Hs.740628 NM_173802 ENSG00000139160 ETFBKMT C12orf72|ETFB-KMT|METTL20 electron transfer flavoprotein subunit beta lysine methyltransferase protein-coding 155.333-290 chr5 43230276 43230504 + 1 NA intron (NR_072980, intron 1 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 37538 NR_072980 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 184.333-161 chr8 141315738 141315941 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -24710 NR_024441 731779 Hs.586414 NR_024441 ENSG00000253595 LINC01300 - long intergenic non-protein coding RNA 1300 ncRNA 147.333-42 chr10 52298935 52299203 + 1 NA TTS (NM_006258) TTS (NM_006258) 15059 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 163.667-251 chr8 112489981 112490151 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 29 of 66) intron (NM_001363185, intron 29 of 66) -153427 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 182.667-10 chr1 189400371 189400759 + 1 NA Intergenic Intergenic 1075445 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 155.667-239 chr4 14414420 14414627 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 302555 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 155.333-10 chr1 117526592 117526772 + 1 NA 3' UTR (NM_006699, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_006699, exon 13 of 13) 79088 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 267.333-84 chr7 29320509 29320992 + 1 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) intron (NM_001293070, intron 2 of 13) -111780 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 152.333-249 chr3 133903934 133904173 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8171 NM_016577 51560 Hs.715344 NM_016577 ENSG00000154917 RAB6B - RAB6B, member RAS oncogene family protein-coding 175.667-92 chr3 8142853 8143195 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -126717 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 239.667-54 chr4 112917885 112918242 + 1 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) MamRep605|LTR?|LTR? 57076 NM_001354267 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 200.667-112 chr3 127303081 127303374 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -15181 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 211.333-108 chr2 51324247 51324577 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 291811 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 151.667-230 chr3 127876775 127877053 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -38318 NM_207335 166348 Hs.132087 NM_207335 ENSG00000187715 KBTBD12 KLHDC6 kelch repeat and BTB domain containing 12 protein-coding 239.333-54 chr2 60793768 60794205 + 1 NA exon (NM_022894, exon 19 of 22) exon (NM_022894, exon 19 of 22) 37718 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 230.333-40 chr14 103807249 103807703 + 1 NA intron (NM_015316, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 40099 NM_015316 23368 Hs.709297 NM_015316 ENSG00000088808 PPP1R13B ASPP1|p53BP2-like|p85 protein phosphatase 1 regulatory subunit 13B protein-coding 140.667-116 chr2 50964951 50965196 + 1 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 67059 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 403.333-12 chr4 169355636 169356334 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -85029 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 148.333-70 chr11 58259203 58259474 + 1 NA Intergenic Intergenic 8922 NM_207374 81341 Hs.531507 NM_207374 ENSG00000172772 OR10W1 OR10W1P|OR10W1Q|OR11-236|UNQ6469 olfactory receptor family 10 subfamily W member 1 protein-coding 297.667-37 chr8 88598207 88598782 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -271011 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 165.667-150 chr4 152260673 152260945 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -76846 NR_104273 102191832 Hs.712524 NR_104273 ENSG00000270751 FBXW7-AS1 DEAR|DEspR FBXW7 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-66 chr10 108434155 108434430 + 1 NA Intergenic Intergenic -364999 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 301.333-56 chrX 17074508 17074993 + 1 NA intron (NM_001080975, intron 12 of 17) intron (NM_001080975, intron 12 of 17) 128092 NM_001080975 9185 Hs.186810 NM_004726 ENSG00000169891 REPS2 POB1 RALBP1 associated Eps domain containing 2 protein-coding 155.333-195 chr20 5642666 5642917 + 1 NA Intergenic Intergenic -31785 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 237.333-136 chrX 20957569 20957992 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -416638 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 211.333-79 chr16 71470106 71470432 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8022 NM_145911 7571 Hs.656643 NM_145911 ENSG00000167377 ZNF23 KOX16|ZNF359|ZNF612|Zfp612 zinc finger protein 23 protein-coding 161.667-112 chr18 22714788 22714949 + 1 NA Intergenic Intergenic 71969 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 172.333-10 chr10 15138584 15138815 + 1 NA intron (NM_004808, intron 2 of 11) intron (NM_004808, intron 2 of 11) 16648 NR_036506 100192204 Hs.714691 NR_036506 ENSG00000206448 PPIAP30 - peptidylprolyl isomerase A pseudogene 30 pseudo 168.333-61 chr14 80001711 80001936 + 1 NA Intergenic Intergenic -209596 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-257 chr6 159678887 159679071 + 1 NA TTS (NM_001024466) TTS (NM_001024466) 14262 NM_000636 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 117.667-29 chr11 77463028 77463216 + 1 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) intron (NM_001128620, intron 1 of 15) 10941 NM_001128620 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 145.667-92 chr14 90746991 90747168 + 1 NA intron (NM_001320421, intron 3 of 20) MER77|LTR|ERVL 49746 NR_135190 105370622 Hs.662373 NR_135190 ENSG00000258716 LOC105370622 - uncharacterized LOC105370622 ncRNA 150.333-280 chr3 169468688 169468868 + 1 NA intron (NR_134932, intron 3 of 4) intron (NR_134932, intron 3 of 4) 20911 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 202.667-114 chr5 22533921 22534193 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 319287 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 157.667-66 chr11 133985512 133985706 + 1 NA Intergenic Intergenic -28813 NM_001277285 22997 Hs.204121 NM_014987 ENSG00000080854 IGSF9B - immunoglobulin superfamily member 9B protein-coding 155.667-224 chr3 87921034 87921281 + 1 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) intron (NM_001322210, intron 2 of 2) -61419 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 148.667-308 chr5 54800403 54800683 + 1 NA Intergenic Intergenic -56285 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 230.333-83 chr4 14508818 14509178 + 1 NA intron (NR_126435, intron 5 of 6) intron (NR_126435, intron 5 of 6) 379171 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 144.333-43 chr11 124571440 124571586 + 1 NA TTS (NM_001005194) TTS (NM_001005194) 1516 NM_001005194 390275 Hs.632104 NM_001005194 ENSG00000196119 OR8A1 OR11-318|OST025 olfactory receptor family 8 subfamily A member 1 protein-coding 237.667-50 chr21 30020730 30021296 + 1 NA Intergenic (TGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -80961 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 143.333-239 chr6 28465485 28465631 + 1 NA Intergenic Intergenic -22067 NM_001012455 222696 Hs.721841 NM_001012455 ENSG00000187987 ZSCAN23 ZNF390|ZNF453|dJ29K1.3|dJ29K1.3.1 zinc finger and SCAN domain containing 23 protein-coding 150.667-286 chr5 9929650 9929934 + 1 NA Intergenic Intergenic -25968 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 293.667-23 chr2 36211174 36211549 + 1 NA Intergenic Intergenic 144209 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 124.667-200 chr8 14408849 14409048 + 1 NA intron (NM_001322881, intron 2 of 6) intron (NM_001322881, intron 2 of 6) 444562 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 163.667-157 chr3 98914709 98914989 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -13154 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 128.333-205 chr9 82450306 82450480 + 1 NA Intergenic Intergenic 461621 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 209.333-197 chr5 161940980 161941349 + 1 NA intron (NR_126372, intron 1 of 2) L1PA15|LINE|L1 60032 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 181.667-99 chr3 145446142 145446508 + 1 NA Intergenic Intergenic 622860 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 203.333-147 chr2 170286149 170286527 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) intron (NM_001083615, intron 7 of 33) 64605 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 154.333-134 chr18 64542367 64542549 + 1 NA Intergenic CR1-16_AMi|LINE|CR1 -282403 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 129.667-91 chr2 54821937 54822111 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 4 of 40) L1ME4a|LINE|L1 97012 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 225.333-23 chr11 25651962 25652436 + 1 NA Intergenic Intergenic -536924 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 154.667-80 chr12 72394300 72394485 + 1 NA intron (NM_013381, intron 3 of 18) L2a|LINE|L2 -120883 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 227.333-4 chr1 84194579 84194930 + 1 NA intron (NM_001300915, intron 8 of 11) AluJo|SINE|Alu 13122 NM_001242862 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 131.333-79 chr2 32593165 32593392 + 1 NA intron (NM_016252, intron 66 of 73) intron (NM_016252, intron 66 of 73) -18460 NR_125793 103752586 Hs.666092 NR_125793 ENSG00000279897 BIRC6-AS2 linc-birc6|megamind BIRC6 antisense RNA 2 ncRNA 177.333-69 chr16 73607477 73607852 + 1 NA Intergenic Intergenic 220859 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 262.333-42 chr2 30791954 30792342 + 1 NA intron (NM_144575, intron 1 of 22) intron (NM_144575, intron 1 of 22) 15298 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 135.667-129 chr4 47332246 47332385 + 1 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 131387 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 160.667-272 chr7 24350390 24350565 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 66287 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 257.667-28 chr15 93651682 93652022 + 1 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -204708 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 155.333-28 chr10 65553829 65554002 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -17510 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 171.333-131 chr4 35179371 35179697 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -909787 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 166.667-111 chr2 59070262 59070610 + 1 NA Intergenic Intergenic -147272 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 124.333-148 chr5 122484575 122484788 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -5594 NR_051996 153163 Hs.679757 NR_051996 ENSG00000250328 MGC32805 - uncharacterized LOC153163 ncRNA 151.333-165 chr16 74317852 74318024 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 21124 NM_002811 5713 Hs.440604 NM_002811 ENSG00000103035 PSMD7 MOV34|P40|Rpn8|S12 proteasome 26S subunit, non-ATPase 7 protein-coding 124.667-142 chr3 152318231 152318415 + 1 NA intron (NM_207296, intron 1 of 7) intron (NM_207296, intron 1 of 7) 18918 NM_207295 4154 Hs.201858 NM_021038 ENSG00000152601 MBNL1 EXP|MBNL muscleblind like splicing regulator 1 protein-coding 146.333-120 chr16 73987415 73987627 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 228000 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 167.333-251 chr8 33231811 33232012 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 241235 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 142.333-88 chr14 74674441 74674632 + 1 NA intron (NM_001039479, intron 8 of 19) AluSz6|SINE|Alu 38544 NM_001039479 9870 Hs.497417 NM_014821 ENSG00000119682 AREL1 FIEL1|KIAA0317 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 149.333-102 chr13 68565352 68565653 + 1 NA Intergenic Intergenic 319823 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 157.333-193 chr2 115476962 115477211 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) L1MB3|LINE|L1 133271 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 394.333-3 chr12 41953596 41954347 + 1 NA Intergenic Intergenic 189782 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 124.667-46 chr12 48138111 48138330 + 1 NA intron (NR_148956, intron 9 of 20) intron (NR_148956, intron 9 of 20) 5423 NR_106760 102466657 NR_106760 ENSG00000275770 MIR6505 hsa-mir-6505|mir-6505 microRNA 6505 ncRNA 149.333-334 chr6 46016826 46016983 + 1 NA intron (NM_001370649, intron 1 of 5) L1ME3|LINE|L1 -1015 NM_001256023 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 134.667-195 chr8 82594461 82594652 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -317548 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 121.667-197 chr8 15241694 15241843 + 1 NA Intergenic Intergenic -3337 NM_001322879 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 240.333-88 chr7 116245270 116245590 + 1 NA intron (NM_015641, intron 2 of 6) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 22477 NM_152829 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 196.667-90 chr22 20575616 20575879 + 1 NA intron (NM_001003891, intron 9 of 17) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 67700 NM_001293237 51586 Hs.517421 NM_015889 ENSG00000099917 MED15 ARC105|CAG7A|CTG7A|PCQAP|TIG-1|TIG1|TNRC7 mediator complex subunit 15 protein-coding 175.333-199 chr9 13047020 13047234 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -74494 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 238.333-30 chr16 76945002 76945313 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 76221 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 162.667-108 chr18 6127595 6127949 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) intron (NM_001365769, intron 14 of 16) -128972 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 156.333-306 chr6 42139467 42139712 + 1 NA intron (NM_001164446, intron 1 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie 3031 NM_001164446 647024 Hs.444277 NM_001164446 ENSG00000188112 C6orf132 bA7K24.2 chromosome 6 open reading frame 132 protein-coding 126.667-34 chr12 33517259 33517485 + 1 NA Intergenic Intergenic -77553 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 238.667-66 chr5 44027330 44027708 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -361213 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 221.667-83 chr8 101446049 101446409 + 1 NA Intergenic Intergenic -46210 NM_024915 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 137.333-174 chr6 137402659 137402848 + 1 NA Intergenic Intergenic 91641 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 178.333-155 chr6 137584403 137584636 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -81127 NR_125867 102723649 Hs.129235 NR_125867 LOC102723649 - uncharacterized LOC102723649 ncRNA 157.667-326 chr8 78504875 78505125 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -11340 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 148.333-268 chr3 196518550 196518698 + 1 NA Intergenic LTR9|LTR|ERV1 -3278 NM_001320473 255798 Hs.631933 NM_001077657 ENSG00000214097 SMCO1 C3orf43 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 1 protein-coding 150.667-37 chr10 41793054 41793259 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 574889 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 178.333-43 chr12 115171776 115172021 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -487723 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 318.667-29 chr6 120911005 120911518 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 423219 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 151.333-94 chr12 8937239 8937495 + 1 NA intron (NM_004426, intron 13 of 14) intron (NM_004426, intron 13 of 14) 12278 NM_002355 4074 Hs.134084 NM_002355 ENSG00000003056 M6PR CD-M6PR|CD-MPR|MPR 46|MPR-46|MPR46|SMPR mannose-6-phosphate receptor, cation dependent protein-coding 242.667-50 chr2 53518026 53518493 + 1 NA Intergenic Intergenic -249524 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 138.333-160 chr6 10542605 10542765 + 1 NA intron (NM_145649, intron 3 of 4) L1MB7|LINE|L1 -13031 NM_001491 2651 Hs.519884 NM_001491 ENSG00000111846 GCNT2 CCAT|CTRCT13|GCNT2C|GCNT5|IGNT|II|NACGT1|NAGCT1|ULG3|bA360O19.2|bA421M1.1 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2 (I blood group) protein-coding 156.333-73 chr12 25238971 25239141 + 1 NA intron (NM_001369786, intron 2 of 5) L1ME4b|LINE|L1 11873 NM_004985 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 160.333-128 chr17 65703063 65703301 + 1 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 123269 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 155.667-350 chr8 76878186 76878398 + 1 NA Intergenic Intergenic 88558 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 154.333-45 chr10 107672323 107672523 + 1 NA Intergenic Intergenic 396870 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 150.667-186 chr2 109423089 109423239 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 5 of 9) intron (NM_001099289, intron 5 of 9) -109539 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 287.667-16 chr16 74690995 74691329 + 1 NA intron (NM_152649, intron 4 of 10) MIRc|SINE|MIR 9700 NM_152649 197259 Hs.119878 NM_152649 ENSG00000168404 MLKL hMLKL mixed lineage kinase domain like pseudokinase protein-coding 295.667-26 chr5 112837888 112838415 + 1 NA exon (NM_001354898, exon 16 of 16) exon (NM_001354898, exon 16 of 16) -23037 NM_001204196 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 193.667-10 chr1 113837768 113837977 + 1 NA exon (NM_001193431, exon 13 of 21) exon (NM_001193431, exon 13 of 21) -18763 NR_037864 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-369 chr8 14879811 14880055 + 1 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) AluSx|SINE|Alu -26423 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 338.667-6 chr11 39837035 39837553 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 455836 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 160.667-218 chr4 31104287 31104513 + 1 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -66744 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 219.333-141 chr5 33963932 33964403 + 1 NA intron (NM_001012509, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 20526 NM_016180 51151 Hs.278962 NM_016180 ENSG00000164175 SLC45A2 1A1|AIM1|MATP|OCA4|SHEP5 solute carrier family 45 member 2 protein-coding 293.667-51 chr5 115713991 115714321 + 1 NA Intergenic Intergenic -41504 NR_104674 102467217 Hs.147738 NR_104674 LOC102467217 - uncharacterized LOC102467217 ncRNA 208.667-16 chr10 17253853 17254173 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -24028 NR_108061 100507347 Hs.740502 NR_108060 ENSG00000229124 VIM-AS1 - VIM antisense RNA 1 ncRNA 140.667-3 chr1 45665253 45665418 + 1 NA intron (NM_021639, intron 2 of 12) intron (NM_021639, intron 2 of 12) -18650 NR_026768 728963 Hs.675157 NR_026768 RPS15AP10 RPS15A_4_42 ribosomal protein S15a pseudogene 10 pseudo 184.667-88 chr4 30778946 30779285 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 58746 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 230.667-84 chr8 31418133 31418509 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -221431 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 141.667-79 chr15 26692150 26692402 + 1 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) intron (NM_001278631, intron 3 of 9) 24489 NM_001191320 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 158.333-135 chr2 15257821 15258007 + 1 NA intron (NR_052013, intron 44 of 50) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 303420 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 280.667-47 chr6 127305117 127305652 + 1 NA intron (NM_001002030, intron 5 of 5) L1MA2|LINE|L1 37023 NM_001139510 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 148.667-63 chr11 14943743 14943986 + 1 NA Intergenic Intergenic 28422 NM_001033952 796 Hs.37058 NM_001741 ENSG00000110680 CALCA CALC1|CGRP|CGRP-I|CGRP1|CT|KC|PCT calcitonin related polypeptide alpha protein-coding 156.667-347 chr8 135828564 135828838 + 1 NA Intergenic Intergenic 371245 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 312.333-18 chr3 130906951 130907436 + 1 NA intron (NM_001001485, intron 2 of 27) intron (NM_001001485, intron 2 of 27) 12603 NM_001001486 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 128.667-118 chr3 80794797 80794969 + 1 NA Intergenic Intergenic 24179 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 115.667-58 chr12 60651342 60651490 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 962046 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 153.667-81 chr12 10055018 10055239 + 1 NA intron (NM_207345, intron 5 of 8) intron (NM_207345, intron 5 of 8) 24446 NM_207345 283420 Hs.531189 NM_207345 ENSG00000197992 CLEC9A CD370|DNGR-1|DNGR1|UNQ9341 C-type lectin domain containing 9A protein-coding 199.333-75 chr14 52913446 52913850 + 1 NA intron (NM_006832, intron 3 of 14) intron (NM_006832, intron 3 of 14) 37402 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 129.667-85 chr19 45561440 45561696 + 1 NA intron (NM_025136, intron 1 of 1) intron (NM_025136, intron 1 of 1) 23234 NM_025136 80207 Hs.466945 NM_025136 ENSG00000125741 OPA3 MGA3 outer mitochondrial membrane lipid metabolism regulator OPA3 protein-coding 168.667-58 chr14 42488967 42489232 + 1 NA Intergenic Intergenic 882243 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 170.667-38 chr13 29310889 29311100 + 1 NA intron (NM_001033602, intron 4 of 13) L1ME3B|LINE|L1 -117666 NM_015233 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 135.333-118 chr3 108054937 108055202 + 1 NA intron (NM_198793, intron 7 of 8) intron (NM_198793, intron 7 of 8) 36019 NM_001777 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 210.333-140 chr5 168698853 168699084 + 1 NA intron (NM_003062, intron 27 of 35) intron (NM_003062, intron 27 of 35) -7959 NR_130737 101927969 Hs.661903 NR_130737 LOC101927969 - uncharacterized LOC101927969 ncRNA 186.333-143 chr6 130689714 130689982 + 1 NA Intergenic Intergenic -137557 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 154.333-141 chr19 56324343 56324633 + 1 NA intron (NM_001322072, intron 2 of 6) L1MA4|LINE|L1 -9649 NM_001322074 79149 Hs.177688 NM_024303 ENSG00000131848 ZSCAN5A ZNF495|ZSCAN5 zinc finger and SCAN domain containing 5A protein-coding 151.333-434 chr8 133875375 133875664 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -10977 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 232.333-20 chr13 76232256 76232624 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -297308 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 143.667-112 chr18 10509151 10509366 + 1 NA Intergenic Intergenic -16769 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 151.333-423 chr8 90416900 90417187 + 1 NA Intergenic LTR86B1|LTR|ERVL 189020 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 147.333-315 chr8 51246489 51246686 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 562858 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 150.667-183 chr2 103220320 103220536 + 1 NA Intergenic Intergenic -235999 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 277.667-48 chr8 106211609 106212064 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -58342 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 253.333-101 chr7 119514616 119515130 + 1 NA Intergenic Intergenic 392502 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 220.333-96 chr4 24000482 24000814 + 1 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) intron (NM_001330752, intron 2 of 13) -110601 NM_013261 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 198.667-9 chr1 168442931 168443278 + 1 NA Intergenic Intergenic -20448 NR_037851 100505918 Hs.568494 NR_037851 LOC100505918 - uncharacterized LOC100505918 ncRNA 269.333-70 chr5 61097723 61098048 + 1 NA intron (NM_174889, intron 2 of 3) intron (NM_174889, intron 2 of 3) -64431 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 196.667-158 chr8 87844268 87844541 + 1 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 29611 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 261.333-83 chr5 43564327 43564691 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -7090 NM_183323 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 152.333-176 chr2 51862067 51862296 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1ME3|LINE|L1 -508467 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 148.333-78 chr11 126203965 126204174 + 1 NA intron (NM_032795, intron 6 of 6) intron (NM_032795, intron 6 of 6) 7581 NM_032795 84881 Hs.150458 NM_032795 ENSG00000165526 RPUSD4 - RNA pseudouridine synthase D4 protein-coding 147.667-319 chr6 113089795 113090064 + 1 NA Intergenic Intergenic 343518 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 168.333-120 chr20 63635403 63635722 + 1 NA Intergenic Intergenic 8327 NR_132417 100505771 Hs.448392 NR_132417 ENSG00000232442 MHENCR - melanoma highly expressed competing endogenous lncRNA for miR-425 and miR-489 ncRNA 154.333-104 chr15 68343113 68343342 + 1 NA intron (NM_001004439, intron 10 of 29) intron (NM_001004439, intron 10 of 29) 65482 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 160.333-195 chr3 124978911 124979105 + 1 NA intron (NM_020733, intron 14 of 16) AluSq2|SINE|Alu -44257 NM_033049 56667 Hs.5940 NM_033049 ENSG00000173702 MUC13 DRCC1|MUC-13 mucin 13, cell surface associated protein-coding 139.667-59 chr15 60880626 60880831 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 199159 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 204.333-32 chr11 21103484 21103800 + 1 NA intron (NM_201551, intron 12 of 18) intron (NM_201551, intron 12 of 18) 434056 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 281.333-10 chr11 130127049 130127617 + 1 NA intron (NR_024515, intron 5 of 13) MER113|DNA|hAT-Charlie -32449 NM_021978 6768 Hs.504315 NM_021978 ENSG00000149418 ST14 ARCI11|HAI|MT-SP1|MTSP1|PRSS14|SNC19|TADG15|TMPRSS14 suppression of tumorigenicity 14 protein-coding 148.667-407 chrX 57491832 57492053 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -99894 NM_007157 158586 Hs.156257 NM_007157 ENSG00000198455 ZXDB ZNF905|dJ83L6.1 zinc finger X-linked duplicated B protein-coding 148.333-158 chr16 80003283 80003433 + 1 NA Intergenic Intergenic 208109 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 180.667-104 chr4 35768249 35768521 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 475554 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 201.667-30 chr13 49358886 49359236 + 1 NA intron (NM_001079670, intron 6 of 10) intron (NM_001079670, intron 6 of 10) 42481 NM_030925 81617 Hs.87159 NM_030925 ENSG00000102547 CAB39L MO25-BETA|MO2L|bA103J18.3 calcium binding protein 39 like protein-coding 282.667-40 chr6 38541553 38541901 + 1 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) AluSc8|SINE|Alu 54340 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 256.667-41 chr2 47441758 47442264 + 1 NA intron (NM_000251, intron 7 of 15) L1PA17|LINE|L1 38944 NM_001258281 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 256.333-58 chr4 14043955 14044500 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -67741 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 163.667-89 chr17 74266252 74266471 + 1 NA Intergenic Intergenic -7873 NR_148379 64446 Hs.147472 NM_023036 ENSG00000171595 DNAI2 CILD9|DIC2 dynein axonemal intermediate chain 2 protein-coding 206.333-175 chr9 118648382 118648739 + 1 NA Intergenic Intergenic -31111 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 183.333-143 chr6 70304768 70305068 + 1 NA Intergenic Intergenic -1834 NM_001851 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 160.333-89 chr13 87112294 87112589 + 1 NA Intergenic Intergenic 200521 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 229.667-43 chr2 138853037 138853422 + 1 NA Intergenic Intergenic -44095 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 163.667-38 chr11 83085943 83086244 + 1 NA Intergenic Intergenic 14027 NR_038903 100506233 Hs.503429 NR_038903 ENSG00000246067 RAB30-DT RAB30-AS1 RAB30 divergent transcript ncRNA 127.667-171 chr7 139944568 139944749 + 1 NA intron (NM_001366537, intron 4 of 11) intron (NM_001366537, intron 4 of 11) 115394 NM_001061 6916 Hs.520757 NM_001061 ENSG00000059377 TBXAS1 BDPLT14|CYP5|CYP5A1|GHOSAL|THAS|TS|TXAS|TXS thromboxane A synthase 1 protein-coding 220.333-71 chr20 8215287 8215696 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) -33213 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 151.333-280 chr3 72309413 72309661 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 137086 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 122.333-19 chr10 31381170 31381317 + 1 NA intron (NM_001323638, intron 4 of 12) L1M5|LINE|L1 18512 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 137.667-169 chr6 152877239 152877432 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 105706 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 154.333-380 chrX 142654290 142654555 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -371506 NM_001009613 441525 Hs.535082 NM_001009613 ENSG00000189326 SPANXN4 CT11.9 SPANX family member N4 protein-coding 207.667-12 chr10 77268727 77269183 + 1 NA intron (NM_001271518, intron 1 of 27) intron (NM_001271518, intron 1 of 27) 81806 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 292.333-14 chr14 46981982 46982336 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) intron (NM_001113498, intron 8 of 16) -330378 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 273.333-28 chr18 13799829 13800159 + 1 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -24155 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 180.667-49 chr16 74842252 74842495 + 1 NA Intergenic Intergenic -67553 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 366.333-12 chr20 31053547 31054030 + 1 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -203876 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 158.333-164 chr2 163265290 163265560 + 1 NA Intergenic Intergenic -426658 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 198.667-116 chr20 2073630 2073895 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -28065 NM_080836 140901 Hs.100057 NM_080836 ENSG00000125834 STK35 CLIK1|STK35L1 serine/threonine kinase 35 protein-coding 132.333-77 chr2 28032040 28032203 + 1 NA intron (NM_199193, intron 6 of 13) intron (NM_199193, intron 6 of 13) 35754 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 132.333-182 chr8 121907242 121907442 + 1 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -265902 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 173.333-38 chr12 1889448 1889628 + 1 NA intron (NM_172364, intron 6 of 37).2 FLAM_C|SINE|Alu 29114 NM_172364 93589 Hs.13768 NM_172364 ENSG00000151062 CACNA2D4 RCD4 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 4 protein-coding 285.333-5 chr1 185946856 185947210 + 1 NA intron (NM_031935, intron 11 of 106) intron (NM_031935, intron 11 of 106) 212642 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 247.667-9 chr10 10038345 10038802 + 1 NA Intergenic Intergenic -20149 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 173.333-198 chr8 67152404 67152768 + 1 NA intron (NM_024790, intron 16 of 28) intron (NM_024790, intron 16 of 28) 68738 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 178.333-157 chr6 140181935 140182174 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -23198 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 139.667-114 chr3 28076807 28077049 + 1 NA Intergenic Intergenic -164691 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 152.333-234 chr3 61024877 61025069 + 1 NA intron (NR_148922, intron 3 of 3) intron (NR_148922, intron 3 of 3) 226479 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 176.333-27 chr11 36100081 36100384 + 1 NA intron (NM_001304263, intron 3 of 4) intron (NM_001304263, intron 3 of 4) -22331 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 260.333-18 chr14 49058486 49058952 + 1 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac 527661 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 149.667-18 chr1 93237494 93237704 + 1 NA intron (NM_001306076, intron 19 of 28) L2a|LINE|L2 56883 NM_001306076 343099 Hs.482873 NM_206886 ENSG00000122483 CCDC18 NY-SAR-41 coiled-coil domain containing 18 protein-coding 242.333-4 chr1 101024263 101024670 + 1 NA intron (NM_001077394, intron 2 of 7) intron (NM_001077394, intron 2 of 7) 1318 NM_001077395 51611 Hs.440776 NM_015958 ENSG00000117543 DPH5 AD-018|CGI-30|HSPC143|NPD015 diphthamide biosynthesis 5 protein-coding 336.333-19 chr2 77537602 77538198 + 1 NA Intergenic Intergenic -15467 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 164.667-24 chr10 44072838 44073007 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 160520 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 149.333-390 chr8 77632378 77632658 + 1 NA Intergenic Intergenic 181821 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 232.333-75 chr6 46311944 46312265 + 1 NA intron (NR_125838, intron 2 of 3) intron (NR_125838, intron 2 of 3) 13788 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 147.667-230 chr3 86434737 86434949 + 1 NA Intergenic Intergenic -47100 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 149.667-203 chr2 75582061 75582251 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -12437 NM_032181 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 146.333-351 chr9 69648264 69648435 + 1 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) intron (NM_001163, intron 1 of 12) 24022 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 168.333-213 chr8 121746460 121746718 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -105149 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 160.667-170 chr2 229264265 229264573 + 1 NA intron (NM_017933, intron 1 of 3) intron (NM_017933, intron 1 of 3) 6868 NM_001330158 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 192.667-33 chr10 103149448 103149656 + 1 NA intron (NM_001351187, intron 3 of 21) intron (NM_001351187, intron 3 of 21) 4269 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 129.333-65 chr14 67211878 67212076 + 1 NA intron (NM_173526, intron 6 of 8) Plat_L3|LINE|CR1 22537 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 169.333-7 chr1 113259591 113259824 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -53454 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 232.333-83 chr7 113774146 113774511 + 1 NA Intergenic Intergenic 144681 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 210.333-82 chr2 108171920 108172232 + 1 NA intron (NR_131251, intron 3 of 4) intron (NR_131251, intron 3 of 4) 45765 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 158.667-128 chr17 78345160 78345470 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 14764 NM_003955 9021 Hs.527973 NM_003955 ENSG00000184557 SOCS3 ATOD4|CIS3|Cish3|SOCS-3|SSI-3|SSI3 suppressor of cytokine signaling 3 protein-coding 196.667-164 chr8 123551851 123552144 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -10791 NM_001242463 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 169.667-199 chr7 107808324 107808621 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -5239 NM_000111 1811 Hs.1650 NM_000111 ENSG00000091138 SLC26A3 CLD|DRA solute carrier family 26 member 3 protein-coding 143.333-124 chr19 15809438 15809601 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1393 NM_013940 26539 Hs.533925 NM_013940 ENSG00000186723 OR10H1 - olfactory receptor family 10 subfamily H member 1 protein-coding 183.667-10 chr1 115049133 115049405 + 1 NA 3' UTR (NM_001308315, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001308315, exon 7 of 7) 15323 NM_001277991 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 175.333-37 chr14 22648968 22649194 + 1 NA Intergenic Intergenic -14237 NM_001348233 79549 NM_001348233 ENSG00000255804 OR6J1 OR6J1P|OR6J2 olfactory receptor family 6 subfamily J member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 199.333-215 chr4 152317667 152318030 + 1 NA Intergenic Intergenic -19807 NR_104273 102191832 Hs.712524 NR_104273 ENSG00000270751 FBXW7-AS1 DEAR|DEspR FBXW7 antisense RNA 1 ncRNA 218.667-30 chr14 56339643 56340016 + 1 NA Intergenic Intergenic -174502 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 158.667-307 chr7 80662582 80662854 + 1 NA intron (NM_001289909, intron 4 of 11) L1PA8|LINE|L1 16065 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 156.333-7 chr1 45237259 45237435 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -30742 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 147.667-284 chr5 63453329 63453490 + 1 NA Intergenic LTR86C|LTR|ERVL 508883 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 387.667-7 chr17 63112848 63113248 + 1 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 146813 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 194.667-85 chr22 34812891 34813175 + 1 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 184883 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 234.667-41 chr16 30701151 30701522 + 1 NA intron (NM_006662, intron 3 of 33) intron (NM_006662, intron 3 of 33) 2165 NM_006662 10847 Hs.620916 NM_006662 ENSG00000080603 SRCAP DOMO1|EAF1|FLHS|SWR1 Snf2 related CREBBP activator protein protein-coding 349.333-7 chr10 117551201 117551658 + 1 NA Intergenic Intergenic -6361 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 204.333-211 chrX 33911288 33911709 + 1 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 220832 NM_203408 158724 Hs.143268 NM_203408 ENSG00000185448 FAM47A - family with sequence similarity 47 member A protein-coding 154.333-209 chr3 39500027 39500301 + 1 NA intron (NR_103506, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 -1902 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 190.667-37 chr14 26079795 26080074 + 1 NA Intergenic Intergenic 473496 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 131.333-62 chr16 81508322 81508600 + 1 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) L1MC4a|LINE|L1 13107 NM_030629 80790 Hs.594095 NM_030629 ENSG00000153815 CMIP TCMIP c-Maf inducing protein protein-coding 184.667-77 chr3 18623225 18623486 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -177763 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 166.333-98 chr18 73914217 73914383 + 1 NA Intergenic Intergenic 233534 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 131.667-7 chr1 70975992 70976123 + 1 NA intron (NM_198719, intron 2 of 3) intron (NM_198719, intron 2 of 3) -70449 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-292 chr8 118707477 118707648 + 1 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) intron (NR_038210, intron 3 of 4) -85599 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 132.333-54 chr14 79563972 79564191 + 1 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 284701 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 192.667-76 chr17 63586165 63586500 + 1 NA intron (NR_073585, intron 6 of 7) AluJr4|SINE|Alu -14563 NM_016360 51204 Hs.174134 NM_016360 ENSG00000136463 TACO1 CCDC44 translational activator of cytochrome c oxidase I protein-coding 199.667-143 chr8 124773434 124773678 + 1 NA Intergenic Intergenic -45049 NM_001282974 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 137.333-57 chr16 8812680 8812895 + 1 NA intron (NM_000303, intron 6 of 7) intron (NM_000303, intron 6 of 7) 14948 NM_000303 5373 Hs.625732 NM_000303 ENSG00000140650 PMM2 CDG1|CDG1a|CDGS|PMI|PMI1|PMM 2 phosphomannomutase 2 protein-coding 163.333-124 chr17 72069951 72070121 + 1 NA Intergenic Intergenic -2297 NR_110827 101928205 Hs.620808 NR_110827 ENSG00000226101 LINC02097 - long intergenic non-protein coding RNA 2097 ncRNA 158.333-307 chr7 108802952 108803191 + 1 NA Intergenic Intergenic 81516 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 248.333-52 chr20 8408548 8408946 + 1 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) MIR3|SINE|MIR 160043 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 172.667-171 chr9 96455021 96455264 + 1 NA intron (NM_014282, intron 1 of 7) intron (NM_014282, intron 1 of 7) 4973 NM_014282 22927 Hs.494567 NM_014282 ENSG00000130956 HABP4 IHABP-4|IHABP4|Ki-1/57|SERBP1L hyaluronan binding protein 4 protein-coding 230.667-3 chr1 50670636 50671006 + 1 NA intron (NM_007051, intron 7 of 18) AluSz|SINE|Alu -247378 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 153.333-181 chr19 54012651 54012945 + 1 NA TTS (NM_145814) TTS (NM_145814) 20510 NM_145814 59285 Hs.631560 NM_031897 ENSG00000130433 CACNG6 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 6 protein-coding 206.667-42 chr15 53226339 53226721 + 1 NA Intergenic Intergenic 110165 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 159.667-58 chr11 31465182 31465443 + 1 NA intron (NM_001304274, intron 1 of 5) L1MA5|LINE|L1 44310 NM_001304274 196294 Hs.502223 NM_144981 ENSG00000148950 IMMP1L IMMP1|IMP1|IMP1-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 1 protein-coding 177.667-99 chr4 66723069 66723416 + 1 NA Intergenic Intergenic 446418 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 162.333-102 chr19 15689858 15690088 + 1 NA intron (NR_117085, intron 8 of 10) L1PB2|LINE|L1 16886 NR_117085 66002 Hs.131459 NM_023944 ENSG00000186204 CYP4F12 CYPIVF12|F22329_1 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 12 protein-coding 150.333-382 chr7 47845861 47846011 + 1 NA intron (NM_138295, intron 32 of 56) L2a|LINE|L2 50645 NR_161269 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 176.333-32 chr11 111223834 111224193 + 1 NA Intergenic (TAATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -21712 NM_198498 341032 Hs.298685 NM_198498 ENSG00000150750 C11orf53 - chromosome 11 open reading frame 53 protein-coding 160.333-252 chr6 105131047 105131209 + 1 NA intron (NM_147147, intron 2 of 7) intron (NM_147147, intron 2 of 7) 5218 NM_147147 11149 Hs.221660 NM_007073 ENSG00000112276 BVES CARICK|HBVES|LGMD2X|LGMDR25|POP1|POPDC1 blood vessel epicardial substance protein-coding 111.667-43 chr10 128128727 128128875 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -2378 NM_001145966 4288 Hs.80976 NM_002417 ENSG00000148773 MKI67 KIA|MIB-|MIB-1|PPP1R105 marker of proliferation Ki-67 protein-coding 154.667-294 chr5 7456230 7456488 + 1 NA intron (NM_020546, intron 2 of 24) intron (NM_020546, intron 2 of 24) 60221 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 155.667-263 chr5 4105700 4105881 + 1 NA Intergenic Intergenic 509958 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 153.333-367 chr6 81077402 81077619 + 1 NA Intergenic Intergenic 675171 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 323.333-35 chr9 7211049 7211433 + 1 NA Intergenic Intergenic 453891 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 148.333-328 chr5 122086601 122086825 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -8454 NM_002317 4015 Hs.102267 NM_002317 ENSG00000113083 LOX AAT10 lysyl oxidase protein-coding 157.333-117 chr15 45276707 45277010 + 1 NA 3' UTR (NM_004212, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_004212, exon 18 of 18) 2364 NR_120335 101928414 NR_120335 ENSG00000259520 LOC101928414 - uncharacterized LOC101928414 ncRNA 285.667-42 chr4 175887333 175887882 + 1 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) L1MEd|LINE|L1 -74493 NM_201591 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 169.333-272 chr8 123528968 123529272 + 1 NA intron (NM_148177, intron 1 of 5) intron (NM_148177, intron 1 of 5) 3023 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 156.333-54 chr11 36138455 36138625 + 1 NA intron (NM_001304263, intron 3 of 4) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -60639 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 234.333-35 chr18 14007685 14008061 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -92166 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 150.667-303 chr5 63322646 63322924 + 1 NA Intergenic Intergenic 639507 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 238.333-80 chr6 141739295 141739563 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 349370 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 154.333-253 chr4 168510468 168510684 + 1 NA intron (NM_001166108, intron 1 of 21) MER58B|DNA|hAT-Charlie 13524 NM_001166108 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 261.333-39 chr17 75822356 75822805 + 1 NA exon (NM_001080419, exon 14 of 16) exon (NM_001080419, exon 14 of 16) 22137 NM_199242 201294 Hs.41045 NM_199242 ENSG00000092929 UNC13D FHL3|HLH3|HPLH3|Munc13-4 unc-13 homolog D protein-coding 292.333-47 chr9 29748442 29749004 + 1 NA Intergenic Intergenic -535122 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 183.333-65 chr17 59072385 59072686 + 1 NA intron (NR_148346, intron 8 of 23) AluSz|SINE|Alu 34345 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 156.667-294 chr6 26503676 26503841 + 1 NA intron (NM_001732, intron 3 of 7) intron (NM_001732, intron 3 of 7) 3455 NM_001732 696 Hs.153058 NM_001732 ENSG00000124557 BTN1A1 BT|BTN|BTN1 butyrophilin subfamily 1 member A1 protein-coding 251.333-69 chr20 10464533 10464996 + 1 NA intron (NM_001009608, intron 2 of 7) intron (NM_001009608, intron 2 of 7) 29459 NM_001009608 128710 Hs.668782 NM_001009608 ENSG00000149346 SLX4IP C20orf94|bA204H22.1|bA254M13.1|dJ1099D15.3 SLX4 interacting protein protein-coding 145.667-67 chr12 90191707 90191933 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -101498 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 203.667-138 chr9 135618086 135618336 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 21329 NM_182974 360203 Hs.522491 NM_182974 ENSG00000204007 GLT6D1 GLTDC1|GT6M7 glycosyltransferase 6 domain containing 1 protein-coding 227.333-104 chr5 117074375 117074752 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -312354 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 314.333-6 chr11 10853396 10853919 + 1 NA exon (NM_021211, exon 3 of 3) exon (NM_021211, exon 3 of 3) 4396 NM_021211 58486 Hs.655066 NM_021211 ENSG00000236287 ZBED5 Buster1 zinc finger BED-type containing 5 protein-coding 237.333-134 chr9 105660799 105661275 + 1 NA Intergenic Intergenic -1420 NM_005421 6887 Hs.247978 NM_005421 ENSG00000186051 TAL2 - TAL bHLH transcription factor 2 protein-coding 164.667-12 chr1 116061418 116061597 + 1 NA intron (NM_018420, intron 8 of 11) intron (NM_018420, intron 8 of 11) -50248 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 129.333-160 chr5 123246655 123246836 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -156429 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 171.333-127 chr3 191297245 191297441 + 1 NA intron (NM_198152, intron 4 of 8) intron (NM_198152, intron 4 of 8) -32051 NM_174908 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 163.667-40 chr11 103873550 103873749 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 23743 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 144.333-70 chr14 47170989 47171164 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 172170 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 160.667-211 chr3 180139014 180139196 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -102168 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 200.667-46 chr14 72848837 72849108 + 1 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 43677 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 154.333-202 chr22 47874729 47874963 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 243172 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 157.667-127 chr18 13409218 13409511 + 1 NA intron (NM_181482, intron 3 of 5) intron (NM_181482, intron 3 of 5) 18170 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 258.667-102 chr9 88717679 88718060 + 1 NA Intergenic Intergenic 28036 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 187.667-121 chr5 119483656 119483942 + 1 NA intron (NM_001199291, intron 9 of 24) L1MC5a|LINE|L1 31302 NM_001292028 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 249.333-79 chr4 158281586 158281877 + 1 NA Intergenic Intergenic 71245 NM_018342 55314 Hs.176227 NM_018342 ENSG00000164124 TMEM144 - transmembrane protein 144 protein-coding 147.667-201 chr20 19208837 19209186 + 1 NA Intergenic Intergenic -3631 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 278.333-22 chr16 76298851 76299289 + 1 NA intron (NM_001322189, intron 2 of 24) L1PA4|LINE|L1 -10782 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 134.333-108 chr22 26145396 26145647 + 1 NA Intergenic Intergenic -23941 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 206.667-77 chr21 28313353 28313775 + 1 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL -84897 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 195.667-107 chr5 28055935 28056213 + 1 NA Intergenic MER92A|LTR|ERV1 231591 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 168.667-29 chr11 22031540 22031722 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -161454 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 166.333-29 chr10 62946339 62946546 + 1 NA Intergenic Intergenic -127275 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 209.667-49 chr15 72112220 72112531 + 1 NA intron (NM_006901, intron 1 of 41) intron (NM_006901, intron 1 of 41) -1883 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 193.333-198 chr9 98603729 98604072 + 1 NA intron (NM_005458, intron 1 of 18) intron (NM_005458, intron 1 of 18) 105035 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 205.667-3 chr1 53987525 53987863 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 30492 NM_001010978 388633 Hs.439583 NM_001010978 ENSG00000203985 LDLRAD1 - low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 protein-coding 165.333-24 chr10 20810629 20810850 + 1 NA intron (NM_006393, intron 24 of 27) intron (NM_006393, intron 24 of 27) 86863 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 159.333-28 chr1 220012596 220012776 + 1 NA intron (NM_004446, intron 12 of 31) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 33819 NM_004446 2058 Hs.497788 NM_004446 ENSG00000136628 EPRS EARS|GLUPRORS|HLD15|PARS|PIG32|QARS|QPRS glutamyl-prolyl-tRNA synthetase protein-coding 264.333-70 chr6 141434317 141434795 + 1 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 654243 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 166.333-231 chr8 101413441 101413678 + 1 NA Intergenic Intergenic 44666 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 146.333-6 chr1 70504659 70504917 + 1 NA Intergenic Intergenic 93520 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 285.667-23 chr2 154238124 154238489 + 1 NA intron (NM_052917, intron 4 of 12) Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 219132 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 145.333-83 chr14 52842239 52842496 + 1 NA Intergenic Intergenic -50760 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 152.333 chr1 9697924 9698090 + 1 NA intron (NM_005026, intron 2 of 23) AluSz6|SINE|Alu 6540 NM_001350235 5293 Hs.518451 NM_005026 ENSG00000171608 PIK3CD APDS|IMD14|P110DELTA|PI3K|p110D phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta protein-coding 124.667-150 chr4 66493977 66494114 + 1 NA Intergenic Intergenic 217221 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 146.667-211 chr3 29525304 29525471 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) intron (NM_001003792, intron 3 of 13) 244075 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 174.333-64 chr2 98518699 98518935 + 1 NA intron (NM_001351428, intron 1 of 24) intron (NM_001351428, intron 1 of 24) 72807 NM_001351427 3631 Hs.469386 NM_001566 ENSG00000040933 INPP4A INPP4|TVAS1 inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A protein-coding 144.667-164 chr2 234956254 234956484 + 1 NA intron (NM_014521, intron 1 of 5) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 4352 NM_014521 23677 Hs.516777 NM_014521 ENSG00000130147 SH3BP4 BOG25|TTP SH3 domain binding protein 4 protein-coding 172.333-151 chr6 25350044 25350312 + 1 NA intron (NM_001173977, intron 2 of 36) intron (NM_001173977, intron 2 of 36) 70804 NM_001173977 55604 Hs.649550 NM_017640 ENSG00000079691 CARMIL1 CARMIL|CARMIL1a|LRRC16|LRRC16A|dJ501N12.1|dJ501N12.5 capping protein regulator and myosin 1 linker 1 protein-coding 159.667-258 chr5 61536932 61537228 + 1 NA intron (NM_020928, intron 10 of 13) intron (NM_020928, intron 10 of 13) -100680 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 209.667-16 chr10 16556690 16557091 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -35011 NM_001010908 389941 Hs.676792 NM_001010908 ENSG00000165985 C1QL3 C1QTNF13|C1ql|CTRP13|K100 complement C1q like 3 protein-coding 146.333-201 chr3 35517566 35517821 + 1 NA Intergenic Intergenic -121832 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 153.333-402 chr8 59585999 59586291 + 1 NA Intergenic Intergenic 466935 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 135.333-16 chr1 207184487 207184751 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 80386 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 180.333-39 chr15 69044780 69045022 + 1 NA intron (NM_024505, intron 10 of 15) intron (NM_024505, intron 10 of 15) 30206 NM_024505 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 184.667-52 chr2 39331605 39331964 + 1 NA intron (NM_003618, intron 8 of 33) intron (NM_003618, intron 8 of 33) -87801 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 126.333-97 chr2 182475724 182475940 + 1 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 46694 NM_005019 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 150.333-357 chr6 46417577 46417759 + 1 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) intron (NM_001251973, intron 2 of 4) 73655 NM_001251974 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 162.667-57 chr12 52876350 52876671 + 1 NA Intergenic Intergenic 22474 NR_162090 113218482 NR_162090 MIR9898 - microRNA 9898 ncRNA 169.667-214 chr8 135982528 135982749 + 1 NA Intergenic Intergenic 525182 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 161.667-210 chr5 129338828 129339042 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 58212 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 141.667-81 chr15 56159457 56159617 + 1 NA intron (NM_001368073, intron 2 of 8) intron (NM_001368073, intron 2 of 8) 30395 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 180.667-118 chr5 157404780 157404983 + 1 NA intron (NR_136204, intron 1 of 3) L1MA4A|LINE|L1 -55138 NM_001099287 348938 Hs.4285 NM_001099287 ENSG00000172548 NIPAL4 ARCI6|ICHTHYIN|ICHYN NIPA like domain containing 4 protein-coding 145.667-84 chr14 71639784 71640068 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 8 of 24) AluSz|SINE|Alu 53628 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 155.667-367 chr8 113623667 113623878 + 1 NA Intergenic Intergenic -186833 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 166.667-161 chr4 37117599 37117872 + 1 NA Intergenic Intergenic 115956 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 166.333-19 chr1 246737541 246737730 + 1 NA intron (NM_016002, intron 3 of 11) AluSz|SINE|Alu 13226 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 169.667-216 chr8 142856549 142856874 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 21910 NM_002066 2765 Hs.661218 NM_002066 ENSG00000104499 GML LY6DL glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like protein-coding 243.333-39 chr16 75461748 75462140 + 1 NA intron (NM_001304998, intron 1 of 2) intron (NM_001304998, intron 1 of 2) 2499 NM_001304997 124491 Hs.487510 NM_145254 ENSG00000166822 TMEM170A TMEM170 transmembrane protein 170A protein-coding 143.333-193 chr3 142217411 142217603 + 1 NA intron (NM_001039547, intron 1 of 15) L1ME1|LINE|L1 8078 NM_001039547 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 146.333-89 chr14 56926009 56926238 + 1 NA intron (NR_029385, intron 3 of 3) intron (NR_029385, intron 3 of 3) 112965 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 258.333-3 chr1 113275190 113275659 + 1 NA Intergenic Intergenic -69171 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 128.333-119 chr20 21021560 21021782 + 1 NA Intergenic Intergenic 84687 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 230.333-48 chr17 72256765 72257260 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -85799 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 190.667-71 chr2 195654828 195655079 + 1 NA Intergenic Intergenic -2005 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 269.333-44 chr2 102411721 102412172 + 1 NA Intergenic Intergenic -6844 NM_003853 8807 Hs.158315 NM_003853 ENSG00000115607 IL18RAP ACPL|CD218b|CDw218b|IL-18R-beta|IL-18RAcP|IL-18Rbeta|IL-1R-7|IL-1R7|IL-1RAcPL|IL18RB interleukin 18 receptor accessory protein protein-coding 172.667-146 chr7 31103025 31103242 + 1 NA intron (NM_001199636, intron 14 of 16) intron (NM_001199636, intron 14 of 16) 50672 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 243.667-77 chr8 132598186 132598594 + 1 NA intron (NR_135913, intron 9 of 10) MIR|SINE|MIR -36911 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 158.667-110 chr15 85352641 85352807 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -27872 NR_106993 102465803 NR_106993 ENSG00000284160 MIR7706 hsa-mir-7706 microRNA 7706 ncRNA 306.333-36 chr5 102273465 102273958 + 1 NA intron (NM_180991, intron 2 of 12) L1M7|LINE|L1 22573 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 158.333-185 chr22 25924423 25924587 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 34 of 43) L2a|LINE|L2 182317 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 119.333-115 chr18 13820987 13821144 + 1 NA Intergenic Intergenic -3084 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 152.333-340 chr6 145587031 145587260 + 1 NA Intergenic Intergenic 99732 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 183.667-35 chr12 24656309 24656567 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -72270 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 141.333-262 chrX 65038952 65039215 + 1 NA Intergenic Intergenic -4342 NM_001178032 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 216.333-12 chr1 186314934 186315268 + 1 NA TTS (NM_001127709) TTS (NM_001127709) 18828 NM_001127710 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 124.333-93 chr2 162339101 162339327 + 1 NA intron (NM_001330265, intron 2 of 8) intron (NM_001330265, intron 2 of 8) -4918 NM_012198 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 143.667-101 chr17 70569334 70569585 + 1 NA Intergenic Intergenic 399924 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 161.667-35 chr11 13387293 13387503 + 1 NA TTS (NM_001297742) TTS (NM_001297742) 52881 NM_001297742 84280 Hs.332382 NM_032320 ENSG00000148925 BTBD10 GMRP-1|GMRP1 BTB domain containing 10 protein-coding 139.333-114 chr2 124138932 124139164 + 1 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 113761 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 149.667-331 chr5 134625202 134625419 + 1 NA intron (NM_016103, intron 1 of 6) intron (NM_016103, intron 1 of 6) 7518 NM_001033503 51128 Hs.432984 NM_016103 ENSG00000152700 SAR1B ANDD|CMRD|GTBPB|SARA2 secretion associated Ras related GTPase 1B protein-coding 168.333-55 chr14 28308411 28308595 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 456816 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 273.667-45 chr5 149934332 149934915 + 1 NA exon (NM_000440, exon 2 of 22) exon (NM_000440, exon 2 of 22) -1646 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 157.667-337 chr8 120512185 120512348 + 1 NA intron (NM_022045, intron 17 of 21) intron (NM_022045, intron 17 of 21) 66847 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 149.333-131 chr16 23873667 23873852 + 1 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) intron (NM_002738, intron 2 of 16) 37776 NM_212535 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 134.667-76 chr16 31369375 31369558 + 1 NA intron (NM_000887, intron 14 of 29) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 14290 NM_000887 3687 Hs.248472 NM_000887 ENSG00000140678 ITGAX CD11C|SLEB6 integrin subunit alpha X protein-coding 169.667-164 chr5 25835301 25835525 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 644460 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 144.333-244 chr7 18383791 18384065 + 1 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) 93836 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 172.333-125 chr4 87432499 87432812 + 1 NA intron (NM_024047, intron 1 of 7) L1M3|LINE|L1 10058 NM_198038 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 206.333-176 chrX 20800727 20801017 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -533963 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 195.667-33 chr12 93205908 93206202 + 1 NA intron (NR_040096, intron 3 of 4) AluJr|SINE|Alu 31689 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 274.333-29 chr17 11772272 11772598 + 1 NA intron (NM_001372, intron 38 of 68) intron (NM_001372, intron 38 of 68) -110467 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 171.333-81 chr2 71256421 71256600 + 1 NA Intergenic Intergenic -29407 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 218.333-66 chr2 42691221 42691667 + 1 NA intron (NM_001330443, intron 9 of 16) L1M1|LINE|L1 72817 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 122.667-168 chr6 148723201 148723402 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -23729 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 172.333-106 chr3 10668426 10668661 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -41736 NR_046766 100874325 Hs.143004 NR_046766 ENSG00000224771 ATP2B2-IT2 - ATP2B2 intronic transcript 2 ncRNA 209.333-242 chr8 113811192 113811513 + 1 NA Intergenic Intergenic -374413 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 122.667-76 chr18 4129019 4129265 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) -135460 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 152.667-350 chr7 114179796 114180070 + 1 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) 93606 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 135.667-14 chr10 29837591 29837762 + 1 NA Intergenic Intergenic -100740 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 167.333-270 chr9 26175948 26176229 + 1 NA Intergenic Intergenic 109413 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 158.667-146 chr19 44440498 44440776 + 1 NA intron (NM_001278510, intron 4 of 5) L1M7|LINE|L1 7835 NM_014518 7772 Hs.709348 NM_014518 ENSG00000278318 ZNF229 - zinc finger protein 229 protein-coding 194.333-155 chr8 122894098 122894428 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) AmnSINE2|SINE|tRNA-Deu 112608 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 258.333-12 chr11 40508930 40509299 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L1ME4c|LINE|L1 -215984 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 169.333-138 chr2 220363122 220363385 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -456688 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 319.667-17 chr21 30518897 30519438 + 1 NA Intergenic Intergenic -17026 NM_181611 337972 Hs.553694 NM_181611 ENSG00000186977 KRTAP19-5 KAP19.5 keratin associated protein 19-5 protein-coding 142.667-103 chr2 133398372 133398595 + 1 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 132288 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 128.333-19 chr10 9358749 9358896 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -63229 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 164.667-53 chr12 47845705 47845929 + 1 NA intron (NM_001017535, intron 10 of 10) intron (NM_001017535, intron 10 of 10) -25914 NM_001368046 51564 Hs.200063 NM_015401 ENSG00000061273 HDAC7 HD7|HD7A|HDAC7A histone deacetylase 7 protein-coding 257.667-90 chrX 66144961 66145278 + 1 NA Intergenic Intergenic -17552 NM_138737 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 182.333-22 chr10 101429877 101430147 + 1 NA intron (NM_003939, intron 1 of 13) intron (NM_003939, intron 1 of 13) 75847 NM_033637 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 138.333-123 chr3 107391777 107391970 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -9714 NR_126332 101929579 Hs.552750 NR_126332 LOC101929579 - uncharacterized LOC101929579 ncRNA 196.667-57 chr17 28630528 28630799 + 1 NA intron (NM_001363826, intron 22 of 37) AluSz|SINE|Alu 14495 NM_001321560 9703 Hs.151761 NM_014680 ENSG00000007202 KIAA0100 BCOX|BCOX1|CT101|FMP27 KIAA0100 protein-coding 139.333-24 chr10 95267858 95268134 + 1 NA intron (NM_020992, intron 3 of 6) intron (NM_020992, intron 3 of 6) 23007 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 148.667-402 chr9 130913384 130913593 + 1 NA intron (NM_001145106, intron 5 of 7) CpG -16676 NM_198180 347148 Hs.660704 NM_198180 ENSG00000188710 QRFP 26RFa|P518 pyroglutamylated RFamide peptide protein-coding 202.667-87 chr2 220395070 220395344 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -488642 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 143.333-256 chr7 22037677 22037960 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -91919 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 146.333-288 chr6 74409661 74409849 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 340304 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 244.667-92 chr8 31424549 31424841 + 1 NA Intergenic Intergenic -215057 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 296.667-4 chr10 33388950 33389363 + 1 NA Intergenic Intergenic -54251 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 287.333-58 chr6 74771525 74772108 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 356966 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 162.667-296 chr9 103904442 103904704 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -95136 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 281.667-48 chr7 46054279 46054793 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -133264 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 324.333-11 chr12 58358639 58359359 + 1 NA Intergenic Intergenic -232703 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 165.667-124 chr3 96457700 96458002 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 97887 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 149.333-378 chr7 108171660 108171847 + 1 NA intron (NM_001371136, intron 25 of 28) L2c|LINE|L2 -41392 NM_007356 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 256.667-22 chr13 26127014 26127369 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -67669 NR_146971 107984009 NR_146971 LINC00415 - long intergenic non-protein coding RNA 415 ncRNA 116.667-38 chr12 96854192 96854404 + 1 NA intron (NM_001306084, intron 66 of 67) intron (NM_001306084, intron 66 of 67) -52959 NM_001135177 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 377.667-3 chr12 74233704 74234193 + 1 NA intron (NR_038300, intron 3 of 6) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 58683 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 148.333-161 chr17 11773724 11773886 + 1 NA intron (NM_001372, intron 38 of 68) L1ME3Cz|LINE|L1 -109097 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 203.667-114 chr7 106824056 106824285 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -41112 NM_001282426 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 179.667-49 chr14 75009821 75010073 + 1 NA 3' UTR (NM_014239, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_014239, exon 8 of 8) 7026 NM_014239 8892 Hs.409137 NM_014239 ENSG00000119718 EIF2B2 EIF-2Bbeta|EIF2B eukaryotic translation initiation factor 2B subunit beta protein-coding 133.333-104 chr3 30544451 30544629 + 1 NA Intergenic Intergenic 25672 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 189.333-146 chr4 75284625 75284894 + 1 NA Intergenic Intergenic -69317 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 153.333-120 chr14 59640962 59641172 + 1 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) AluJb|SINE|Alu 5953 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 161.667-221 chr6 22666086 22666402 + 1 NA intron (NR_134613, intron 1 of 1) intron (NR_134613, intron 1 of 1) 51680 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 252.333-35 chr2 142659871 142660206 + 1 NA Intergenic Intergenic -217626 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 199.667-58 chr17 27045422 27045643 + 1 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 43709 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 166.333-65 chr14 32620963 32621175 + 1 NA intron (NM_004274, intron 7 of 13) L1PB3|LINE|L1 291771 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 172.667-142 chr7 3860571 3860801 + 1 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) LTR56|LTR|ERV1 -268999 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 146.333-268 chr5 120388667 120388820 + 1 NA Intergenic Intergenic -75535 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 122.667-195 chr8 104109757 104109939 + 1 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) intron (NM_001348498, intron 19 of 24) -113487 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 154.667-266 chr4 2232918 2233119 + 1 NA intron (NM_001303143, intron 5 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 9103 NM_024511 79441 Hs.665869 NM_024511 ENSG00000214367 HAUS3 C4orf15|IT1|dgt3 HAUS augmin like complex subunit 3 protein-coding 134.667-22 chr10 68037305 68037553 + 1 NA intron (NM_001278185, intron 5 of 23) intron (NM_001278185, intron 5 of 23) -26546 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 203.333-150 chr2 209567921 209568240 + 1 NA intron (NM_001039538, intron 2 of 14) intron (NM_001039538, intron 2 of 14) -11256 NM_001363913 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 117.667-193 chr8 105414300 105414481 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 94847 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 210.667-77 chr20 57354367 57354615 + 1 NA intron (NM_003610, intron 2 of 11) intron (NM_003610, intron 2 of 11) 2929 NM_001015885 8480 Hs.371698 NM_003610 ENSG00000101146 RAE1 Gle2|MIG14|MRNP41|Mnrp41|dJ481F12.3|dJ800J21.1 ribonucleic acid export 1 protein-coding 191.667-42 chr12 124237089 124237381 + 1 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) MER33|DNA|hAT-Charlie -51929 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 215.333-55 chr14 42510253 42510576 + 1 NA Intergenic Intergenic 903558 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 159.333-152 chr2 50688462 50688777 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 7643 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 167.333-138 chr2 119973743 119973957 + 1 NA intron (NM_002830, intron 26 of 26) L1MC5|LINE|L1 -39227 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 192.333-177 chr9 78521912 78522188 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 224925 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 175.667-117 chr5 105182251 105182493 + 1 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 82898 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 157.333-262 chr4 76065343 76065554 + 1 NA intron (NM_001130017, intron 1 of 9) MER6|DNA|TcMar-Tigger -9247 NM_001130016 419 Hs.24976 NM_001179 ENSG00000156219 ART3 ARTC3 ADP-ribosyltransferase 3 protein-coding 140.333-204 chr6 112086104 112086414 + 1 NA intron (NM_016262, intron 3 of 11) intron (NM_016262, intron 3 of 11) 1223 NM_016262 51175 Hs.34851 NM_016262 ENSG00000074935 TUBE1 TUBE|dJ142L7.2 tubulin epsilon 1 protein-coding 164.667-86 chr15 80550456 80550635 + 1 NA intron (NM_014862, intron 8 of 18) intron (NM_014862, intron 8 of 18) 12399 NR_120363 101929586 Hs.569426 NR_120363 ENSG00000259175 LOC101929586 - uncharacterized LOC101929586 ncRNA 188.333-27 chr11 40617751 40618096 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) LTR52|LTR|ERVL -324793 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 208.667-8 chr1 114179333 114179773 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -25684 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 162.667-36 chr10 108551361 108551637 + 1 NA Intergenic Intergenic -482206 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 158.333-322 chr8 101357769 101358092 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -10963 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 260.667-35 chr17 59727883 59728323 + 1 NA intron (NM_001329394, intron 1 of 11) intron (NM_001329394, intron 1 of 11) 20449 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 114.333-64 chr13 89390695 89390843 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 109740 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 179.333-25 chr10 59373703 59374058 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -10699 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 175.667-80 chr2 162778634 162778878 + 1 NA intron (NR_110258, intron 2 of 4) intron (NR_110258, intron 2 of 4) 9820 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 169.667-168 chr5 84693590 84693914 + 1 NA Intergenic Intergenic -308872 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 164.333-39 chr11 47985365 47985544 + 1 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 4895 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 237.667-14 chr11 78236578 78236872 + 1 NA intron (NM_012296, intron 3 of 9) L1M5|LINE|L1 47806 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 271.667-36 chr19 27722773 27723225 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -70432 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 276.667-8 chr10 22786324 22786883 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -72025 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 197.667-120 chr5 56132469 56132796 + 1 NA intron (NM_024669, intron 7 of 11) L1MC1|LINE|L1 100698 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 242.667-60 chr20 11599080 11599337 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 271507 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 178.333-20 chr10 70834821 70835115 + 1 NA intron (NM_003901, intron 2 of 14) intron (NM_003901, intron 2 of 14) 19020 NM_003901 8879 Hs.499984 NM_003901 ENSG00000166224 SGPL1 NPHS14|S1PL|SPL sphingosine-1-phosphate lyase 1 protein-coding 216.333-108 chr4 79902449 79902696 + 1 NA 3' UTR (NM_001286780, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001286780, exon 17 of 17) 75101 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 153.667-25 chr1 199566196 199566427 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 417713 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 156.333-74 chr12 27246369 27246535 + 1 NA intron (NM_015000, intron 1 of 13) intron (NM_015000, intron 1 of 13) 2166 NM_015000 23012 Hs.184523 NM_015000 ENSG00000211455 STK38L NDR2 serine/threonine kinase 38 like protein-coding 226.333-4 chr1 195102380 195102730 + 1 NA Intergenic Intergenic 986160 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 227.667-69 chr6 157700234 157700540 + 1 NA Intergenic Intergenic -122859 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 235.333-52 chr2 31394949 31395226 + 1 NA intron (NM_000379, intron 6 of 35) L1MC1|LINE|L1 19655 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 246.333-11 chr1 229809433 229809790 + 1 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 76207 NR_146476 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 302.667-40 chr9 81599570 81600010 + 1 NA intron (NM_005077, intron 14 of 19) intron (NM_005077, intron 14 of 19) 89745 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 251.667-43 chr2 85996705 85997187 + 1 NA Intergenic Intergenic 107666 NR_110569 101928113 Hs.625888 NR_110569 ST3GAL5-AS1 - ST3GAL5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 158.333-54 chr11 39978050 39978226 + 1 NA Intergenic Intergenic 314992 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 134.667-63 chr14 67727239 67727452 + 1 NA intron (NM_152443, intron 7 of 8) intron (NM_152443, intron 7 of 8) 25459 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 179.333-160 chr5 144105459 144105690 + 1 NA Intergenic Intergenic 65085 NM_001271732 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 152.333-154 chr17 71166418 71166635 + 1 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) intron (NR_104152, intron 2 of 3) 35653 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 155.333-221 chr3 7776393 7776582 + 1 NA Intergenic Intergenic 239820 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 133.667-164 chr9 92208690 92208849 + 1 NA Intergenic Intergenic -17613 NM_001350291 138652 Hs.742918 NM_001350291 PRSS47 - serine protease 47 protein-coding 135.333-136 chr5 24768671 24768842 + 1 NA Intergenic Intergenic 71827 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 153.667-391 chr8 120529550 120529805 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 84258 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 161.333-291 chr8 126117958 126118189 + 1 NA Intergenic Intergenic -166876 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 155.333-126 chr16 30467804 30468005 + 1 NA Intergenic Intergenic -4838 NM_001114380 3683 Hs.174103 NM_002209 ENSG00000005844 ITGAL CD11A|LFA-1|LFA1A integrin subunit alpha L protein-coding 133.333-191 chr8 129984980 129985149 + 1 NA intron (NM_001353245, intron 1 of 13) AluSp|SINE|Alu 23389 NR_049826 100847051 NR_049826 ENSG00000264653 MIR5194 mir-5194 microRNA 5194 ncRNA 149.333-239 chr3 43318235 43318403 + 1 NA intron (NM_001100594, intron 2 of 5) intron (NM_001100594, intron 2 of 5) 31779 NM_017719 54861 Hs.476052 NM_017719 ENSG00000163788 SNRK HSNFRK SNF related kinase protein-coding 123.333-213 chr8 101820368 101820585 + 1 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) -29507 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 277.333-53 chr20 34650736 34651047 + 1 NA intron (NM_080476, intron 2 of 11) AluSx|SINE|Alu 26394 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 176.667-131 chr7 3164046 3164242 + 1 NA Intergenic Intergenic -5571 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 224.333-134 chrX 96094221 96094615 + 1 NA Intergenic Intergenic 243484 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 283.333-37 chr2 223366440 223366924 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 235679 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 167.667-139 chr3 103155747 103156043 + 1 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 368221 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 218.333-125 chr9 36014515 36014857 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -22227 NM_001316348 8434 Hs.388918 NM_021111 ENSG00000122707 RECK ST15 reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs protein-coding 183.333-130 chr5 89350701 89350914 + 1 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) intron (NR_136219, intron 7 of 9) -446702 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 152.333-399 chr9 29679162 29679347 + 1 NA Intergenic Intergenic -465653 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 181.333 chr1 18796765 18797070 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 62744 NM_152232 80834 Hs.553548 NM_152232 ENSG00000179002 TAS1R2 GPR71|T1R2|TR2 taste 1 receptor member 2 protein-coding 172.667-87 chr2 144889031 144889255 + 1 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) intron (NR_033870, intron 2 of 4) 221176 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 122.667-130 chr3 187809717 187809865 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -64323 NM_001706 604 Hs.478588 NM_001706 ENSG00000113916 BCL6 BCL5|BCL6A|LAZ3|ZBTB27|ZNF51 BCL6 transcription repressor protein-coding 406.667-2 chr14 52658059 52658843 + 1 NA intron (NM_014584, intron 9 of 15) intron (NM_014584, intron 9 of 15) 37107 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 123.333-134 chr21 18379237 18379385 + 1 NA exon (NM_002772, exon 5 of 25) exon (NM_002772, exon 5 of 25) 24474 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 157.667-356 chr9 100382626 100382837 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29789 NM_017746 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 248.667-84 chr5 16472109 16472403 + 1 NA TTS (NM_001034850) TTS (NM_001034850) -6456 NM_033414 90441 Hs.60300 NM_033414 ENSG00000173545 ZNF622 ZPR9 zinc finger protein 622 protein-coding 204.333-102 chr2 143860311 143860695 + 1 NA Intergenic Intergenic -76564 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 140.667-127 chr2 152137834 152138034 + 1 NA intron (NM_005843, intron 7 of 13) L1ME3Cz|LINE|L1 37829 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 135.333-89 chr2 132247334 132247623 + 1 NA intron (NR_152415, intron 1 of 5) ALR/Alpha|Satellite|centr 9602 NR_031608 100313824 NR_031608 ENSG00000221288 MIR663B MIRN663B|mir-663b microRNA 663b ncRNA 237.333-66 chr20 51147400 51147683 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -124434 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 171.667-143 chr6 67164430 67164733 + 1 NA Intergenic Intergenic -890770 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 184.333-16 chr10 84734601 84734945 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 309604 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 121.667-28 chr10 70981991 70982123 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 43004 NR_134313 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 266.667-2 chr1 24659675 24660046 + 1 NA intron (NR_159388, intron 10 of 18) intron (NR_159388, intron 10 of 18) 16281 NM_001366596 10250 Hs.18192 NM_005839 ENSG00000133226 SRRM1 160-KD|POP101|SRM160 serine and arginine repetitive matrix 1 protein-coding 158.333-154 chr2 117246085 117246303 + 1 NA Intergenic Intergenic -568497 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 300.333-45 chr7 90978489 90978870 + 1 NA intron (NM_012395, intron 8 of 13) intron (NM_012395, intron 8 of 13) 268863 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 158.667-180 chr2 222850764 222850946 + 1 NA Intergenic Intergenic -10181 NM_004457 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 147.667-238 chr3 111723410 111723704 + 1 NA intron (NM_153268, intron 3 of 3) intron (NM_153268, intron 3 of 3) -8939 NM_001134437 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 129.667-146 chr6 33934240 33934388 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 35179 NR_106982 102466816 NR_106982 ENSG00000276824 MIR7159 hsa-mir-7159 microRNA 7159 ncRNA 140.333-254 chrX 73281019 73281226 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -66271 NM_021963 4674 Hs.66180 NM_021963 ENSG00000186462 NAP1L2 BPX nucleosome assembly protein 1 like 2 protein-coding 157.333-276 chr5 29949320 29949555 + 1 NA Intergenic MER70B|LTR|ERVL 68877 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 148.667-207 chr2 173497348 173497632 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 142618 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 223.333-50 chr17 32591020 32591328 + 1 NA intron (NM_015194, intron 21 of 21) intron (NM_015194, intron 21 of 21) 104181 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 294.667-15 chr14 84029068 84029561 + 1 NA Intergenic Intergenic -1242618 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 178.667-68 chr18 69115395 69115592 + 1 NA Intergenic Intergenic -285395 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 175.333-80 chr2 41038242 41038556 + 1 NA Intergenic Intergenic -525964 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 140.667-135 chr21 23962797 23963042 + 1 NA Intergenic Intergenic 358458 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 240.667-38 chr17 80619104 80619616 + 1 NA intron (NM_020761, intron 1 of 33) intron (NM_020761, intron 1 of 33) 74522 NM_020761 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 175.667-45 chr15 47805745 47805980 + 1 NA intron (NR_120336, intron 3 of 4) intron (NR_120336, intron 3 of 4) 40374 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 207.667 chr1 21410491 21410862 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -29461 NM_001330381 84224 Hs.325422 NM_032264 ENSG00000142794 NBPF3 AE2 NBPF member 3 protein-coding 190.667-123 chr6 131384027 131384306 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 133762 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 197.667-112 chr4 90275098 90275350 + 1 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) intron (NM_207491, intron 1 of 7) 40193 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 172.667-7 chr1 67282708 67282995 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -24513 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 166.667-123 chr2 173968472 173968770 + 1 NA Intergenic Intergenic -2919 NM_001172712 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 246.333-7 chr1 174294085 174294381 + 1 NA intron (NM_001366445, intron 10 of 13) intron (NM_001366445, intron 10 of 13) 19133 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 163.667-171 chr4 30899449 30899683 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 179197 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 151.667-191 chr20 33264122 33264414 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -18946 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 156.667-286 chr5 137630474 137630741 + 1 NA intron (NM_017415, intron 12 of 14) intron (NM_017415, intron 12 of 14) 17042 NR_030588 100126343 NR_030588 ENSG00000216009 MIR874 MIRN874|hsa-mir-874|mir-874 microRNA 874 ncRNA 151.667-96 chr13 89513300 89513532 + 1 NA Intergenic Intergenic -12907 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 160.667-19 chr1 163997617 163997804 + 1 NA Intergenic Intergenic -561650 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 187.667-106 chr4 58439668 58439930 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 96529 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 207.667-79 chr3 139683033 139683289 + 1 NA Intergenic Intergenic -5111 NM_001320511 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 260.333-44 chr4 115551704 115552086 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -438275 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 163.333-148 chr2 107771722 107771894 + 1 NA intron (NR_126370, intron 2 of 4) intron (NR_126370, intron 2 of 4) 17696 NR_126370 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 145.333-314 chr9 17069792 17069968 + 1 NA Intergenic Intergenic -65160 NM_001286984 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 159.333-254 chr5 12863491 12863741 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 169270 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 149.667-159 chr17 60994361 60994530 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 15 of 25) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 316594 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 352.667-11 chr14 82935309 82935841 + 1 NA Intergenic Intergenic 292943 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 202.333-136 chr5 14685255 14685579 + 1 NA intron (NM_138348, intron 4 of 6) intron (NM_138348, intron 4 of 6) 20699 NM_138348 90268 Hs.406335 NM_138348 ENSG00000154124 OTULIN AIPDS|FAM105B|GUM OTU deubiquitinase with linear linkage specificity protein-coding 350.667-14 chr8 131668209 131668658 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -235660 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 124.667-5 chr1 60944575 60944731 + 1 NA intron (NR_110617, intron 5 of 6) intron (NR_110617, intron 5 of 6) 26123 NR_110618 100996570 Hs.46616 NR_110617 ENSG00000237928 NFIA-AS2 - NFIA antisense RNA 2 ncRNA 234.333-95 chrX 74741766 74742062 + 1 NA exon (NM_001008537, exon 3 of 4) exon (NM_001008537, exon 3 of 4) -127290 NM_016120 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 118.667-173 chr6 138515436 138515598 + 1 NA intron (NM_020464, intron 1 of 6) intron (NM_020464, intron 1 of 6) -16023 NM_001144060 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 164.333-13 chr1 226173835 226174031 + 1 NA intron (NM_022735, intron 1 of 7) AluSx|SINE|Alu 12808 NM_022735 64746 Hs.520207 NM_022735 ENSG00000182827 ACBD3 GCP60|GOCAP1|GOLPH1|PAP7 acyl-CoA binding domain containing 3 protein-coding 371.667-6 chr21 27691999 27692656 + 1 NA Intergenic Intergenic -30052 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 208.667-30 chr11 94274328 94274718 + 1 NA Intergenic Intergenic -31114 NM_001199206 390243 Hs.553758 NM_001080486 ENSG00000183560 IZUMO1R FOLR4|Folbp3|JUNO IZUMO1 receptor, JUNO protein-coding 168.667-175 chr5 74440683 74440954 + 1 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 96158 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 118.667-134 chr3 66092572 66092867 + 1 NA Intergenic Intergenic -40891 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 163.667-54 chr13 106754407 106754707 + 1 NA Intergenic Intergenic 100677 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 193.333-13 chr1 206802493 206802842 + 1 NA intron (NM_153758, intron 2 of 6) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -26210 NM_013371 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 319.333-6 chr11 40283545 40284069 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 4 of 6) AluSp|SINE|Alu 9323 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 128.667-87 chr2 44155677 44155854 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -13038 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 315.667-14 chr22 24974711 24975224 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -28272 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 211.667-63 chr2 123973222 123973506 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 51810 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 150.333-147 chr16 70251868 70252059 + 1 NA promoter-TSS (NM_058219) promoter-TSS (NM_058219) -23 NM_058219 118460 Hs.660633 NM_058219 ENSG00000223496 EXOSC6 EAP4|MTR3|Mtr3p|hMtr3p|p11 exosome component 6 protein-coding 202.333-85 chr2 36886240 36886498 + 1 NA intron (NM_003162, intron 8 of 17) intron (NM_003162, intron 8 of 17) 80167 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 213.333-94 chr2 60962453 60962892 + 1 NA intron (NM_144709, intron 9 of 17) L2b|LINE|L2 54540 NM_001322124 150962 Hs.368348 NM_144709 ENSG00000162927 PUS10 CCDC139|DOBI pseudouridine synthase 10 protein-coding 141.667-183 chr5 88977885 88978048 + 1 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 -73861 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 197.333-132 chr20 42039308 42039661 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -421107 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 184.333-19 chr11 81011598 81011915 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -248953 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 253.667-17 chr12 39906560 39906926 + 1 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) intron (NM_052885, intron 4 of 9) 199338 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 163.333-62 chr12 13010810 13011134 + 1 NA intron (NR_149067, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 10530 NR_002774 93164 Hs.593282 NR_002774 ENSG00000183935 HTR7P1 HTR7P 5-hydroxytryptamine receptor 7 pseudogene 1 pseudo 173.667-148 chr6 38149892 38150103 + 1 NA intron (NM_021943, intron 5 of 5) intron (NM_021943, intron 5 of 5) 330270 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 134.667-140 chr3 120903609 120903763 + 1 NA Intergenic Intergenic -4519 NM_014980 9515 Hs.477315 NM_014980 ENSG00000145087 STXBP5L LLGL4 syntaxin binding protein 5 like protein-coding 267.333-55 chr2 213518613 213519079 + 1 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) L1PA16|LINE|L1 234382 NR_047660 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 168.333-9 chr1 184357016 184357347 + 1 NA Intergenic Intergenic -29848 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 254.667-11 chr11 13149158 13149463 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -127342 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 119.333-145 chr21 31940901 31941148 + 1 NA intron (NM_014586, intron 3 of 10) intron (NM_014586, intron 3 of 10) 68004 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 146.667-198 chr20 48080957 48081104 + 1 NA Intergenic Intergenic -90913 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 115.667-25 chr10 43941486 43941688 + 1 NA intron (NR_033846, intron 2 of 7) intron (NR_033846, intron 2 of 7) 29185 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 153.333-302 chr4 78790299 78790461 + 1 NA intron (NM_017593, intron 1 of 13) L1M5|LINE|L1 14002 NM_198892 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 158.667-167 chr2 148199855 148200173 + 1 NA intron (NM_018328, intron 3 of 14) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -178410 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 373.333-4 chr12 4132271 4132665 + 1 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -141294 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 195.333-49 chr11 62024316 62024654 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -56851 NM_002032 2495 Hs.524910 NM_002032 ENSG00000167996 FTH1 FHC|FTH|FTHL6|HFE5|PIG15|PLIF ferritin heavy chain 1 protein-coding 223.667-71 chr5 86540034 86540292 + 1 NA Intergenic Intergenic -77778 NM_001867 1350 Hs.430075 NM_001867 ENSG00000127184 COX7C - cytochrome c oxidase subunit 7C protein-coding 139.667-157 chr5 152071566 152071715 + 1 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) MIRc|SINE|MIR 112742 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 155.333-210 chr22 16993443 16993719 + 1 NA intron (NM_001037814, intron 1 of 9) L2|LINE|L2 14641 NR_159481 128954 Hs.434113 NM_001037814 ENSG00000215568 GAB4 - GRB2 associated binding protein family member 4 protein-coding 188.333-145 chr7 78311327 78311682 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 9 of 20) L2|LINE|L2 -35738 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 183.333-96 chr20 57920366 57920708 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -83367 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 159.333-91 chr14 64376812 64377011 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11442 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 150.333-398 chr8 67530495 67530772 + 1 NA intron (NM_020361, intron 2 of 10) L1MEd|LINE|L1 186799 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 156.667-2 chr1 21159646 21159842 + 1 NA intron (NM_001198803, intron 1 of 12) AluJr4|SINE|Alu 8295 NM_001198803 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 149.333-52 chr10 68468426 68468625 + 1 NA intron (NM_001080449, intron 2 of 20) intron (NM_001080449, intron 2 of 20) 3448 NM_001080449 1763 Hs.532446 NM_001080449 ENSG00000138346 DNA2 DNA2L|hDNA2 DNA replication helicase/nuclease 2 protein-coding 187.667-77 chr2 166112067 166112408 + 1 NA intron (NR_110260, intron 2 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 15783 NM_006920 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 187.333-122 chr3 6213931 6214170 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 591399 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 244.667-34 chr12 80088394 80088731 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10975 NM_001368062 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 187.333-71 chr15 60943009 60943372 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 261621 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 144.333-125 chr2 72529970 72530217 + 1 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) L1MD1|LINE|L1 295940 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 234.667-58 chr2 171884628 171885018 + 1 NA intron (NR_047549, intron 2 of 16) intron (NR_047549, intron 2 of 16) 9421 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 209.667-120 chr9 85226520 85226940 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 515299 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 113.667-93 chr2 18189546 18189816 + 1 NA Intergenic Intergenic 311014 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 159.667-53 chr10 89332317 89332625 + 1 NA promoter-TSS (NM_001031683) promoter-TSS (NM_001031683) -58 NM_001031683 3437 Hs.47338 NM_001549 ENSG00000119917 IFIT3 CIG-49|GARG-49|IFI60|IFIT4|IRG2|ISG60|P60|RIG-G|cig41 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3 protein-coding 230.667-26 chr17 67037404 67037846 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -6929 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 119.333-26 chr10 19485055 19485214 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 29 of 39) L1PB3|LINE|L1 243416 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 185.333-168 chr6 90827386 90827709 + 1 NA Intergenic Intergenic -240475 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 147.667-24 chr1 195908041 195908282 + 1 NA Intergenic Intergenic 180554 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 337.667-10 chr16 72757732 72758154 + 1 NA Intergenic BC200|scRNA|scRNA -92973 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 132.667-92 chr2 138710166 138710389 + 1 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) L1MB4|LINE|L1 70113 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 124.333-96 chr2 164079309 164079461 + 1 NA Intergenic Intergenic -343377 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 143.333-247 chr6 96536513 96536749 + 1 NA intron (NM_015323, intron 8 of 18) intron (NM_015323, intron 8 of 18) 14825 NM_015323 23376 Hs.149367 NM_015323 ENSG00000014123 UFL1 KIAA0776|Maxer|NLBP|RCAD UFM1 specific ligase 1 protein-coding 232.667-66 chr6 71086617 71086902 + 1 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 -129699 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 132.333-171 chr7 113749777 113749931 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 169155 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 235.667-34 chr2 185104395 185104802 + 1 NA Intergenic Intergenic 62474 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 155.333-251 chr4 15208532 15208718 + 1 NA intron (NR_125911, intron 2 of 5) LTR79|LTR|ERVL -131363 NM_001135170 114905 Hs.153714 NM_031911 ENSG00000163145 C1QTNF7 CTRP7|ZACRP7 C1q and TNF related 7 protein-coding 201.333-147 chr2 58408252 58408622 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -112316 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 247.333-24 chr14 29513415 29513757 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 413510 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 150.333-381 chr7 43448792 43448949 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 10 of 27) intron (NM_001287059, intron 10 of 27) 73672 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 185.333-108 chr20 16861891 16862176 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 113680 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 196.667-141 chr7 44331816 44332289 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -6421 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 132.667-9 chr1 161814227 161814379 + 1 NA intron (NM_007348, intron 7 of 15) intron (NM_007348, intron 7 of 15) 47983 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 196.667-53 chr15 88466438 88466710 + 1 NA intron (NM_022163, intron 1 of 3) intron (NM_022163, intron 1 of 3) 814 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 185.667-98 chr5 4398148 4398454 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -375180 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 146.333-324 chr8 88094161 88094340 + 1 NA intron (NM_005941, intron 6 of 9) intron (NM_005941, intron 6 of 9) -220235 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 259.333-50 chr2 142238253 142238830 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -106840 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 203.333-248 chr7 89120905 89121169 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR -325300 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 151.667-116 chr14 76451626 76451877 + 1 NA intron (NM_004452, intron 4 of 10) AluSx3|SINE|Alu 80404 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 211.333-114 chr2 67501326 67501627 + 1 NA Intergenic Intergenic 104143 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 254.333-2 chr1 197515429 197515952 + 1 NA intron (NR_125340, intron 17 of 19) intron (NR_125340, intron 17 of 19) 247438 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 128.333-8 chr1 116097699 116097891 + 1 NA Intergenic Intergenic -13960 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 187.333-178 chr6 142506482 142506692 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 131249 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 155.667-228 chr3 125566853 125567016 + 1 NA intron (NM_022776, intron 6 of 12) FRAM|SINE|Alu 28563 NM_022776 114885 Hs.477440 NM_022776 ENSG00000144909 OSBPL11 ORP-11|ORP11|OSBP12|TCCCIA00292 oxysterol binding protein like 11 protein-coding 144.667-251 chr6 4753264 4753470 + 1 NA intron (NM_001368125, intron 3 of 8) intron (NM_001368125, intron 3 of 8) -23037 NM_001368126 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 198.667-100 chr2 48648905 48649130 + 1 NA intron (NM_172311, intron 8 of 10) intron (NM_172311, intron 8 of 10) 31161 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 164.667-36 chr11 43850967 43851168 + 1 NA intron (NM_016142, intron 9 of 10) intron (NM_016142, intron 9 of 10) -29764 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 152.667-39 chr10 47054820 47055024 + 1 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 143200 NM_001352524 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 207.667-34 chr14 96824053 96824543 + 1 NA intron (NM_003384, intron 1 of 12) intron (NM_003384, intron 1 of 12) 26916 NM_003384 7443 Hs.422662 NM_003384 ENSG00000100749 VRK1 PCH1|PCH1A VRK serine/threonine kinase 1 protein-coding 154.333-341 chr8 100787359 100787552 + 1 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -65367 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 149.333-141 chr17 53795420 53795633 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -27401 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 182.333-83 chr2 78186550 78186816 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 97953 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 150.333-48 chr10 121220324 121220548 + 1 NA Intergenic Intergenic 310878 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 214.667-67 chr2 113732172 113732517 + 1 NA intron (NM_001330316, intron 9 of 14) L2b|LINE|L2 -10976 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 263.667-62 chr4 47737485 47737939 + 1 NA intron (NM_006587, intron 5 of 21) LTR16A|LTR|ERVL 85043 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 242.667-48 chr2 20017544 20017996 + 1 NA Intergenic Intergenic -5102 NM_002381 4148 Hs.656199 NM_002381 ENSG00000132031 MATN3 DIPOA|EDM5|HOA|OADIP|OS2 matrilin 3 protein-coding 262.667-60 chr5 22839673 22839975 + 1 NA intron (NM_001364105, intron 1 of 15) intron (NM_001364105, intron 1 of 15) 13520 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 239.333-98 chr7 10727037 10727559 + 1 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) 24622 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 136.667-106 chr20 52449027 52449269 + 1 NA Intergenic Intergenic -171690 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 198.667-173 chr7 77942612 77943019 + 1 NA intron (NM_001366081, intron 14 of 16) intron (NM_001366081, intron 14 of 16) 102685 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 205.667-55 chr16 58561609 58561916 + 1 NA intron (NM_206999, intron 16 of 30) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -1831 NR_002980 677830 Hs.677515 NR_002980 ENSG00000281910 SNORA50A ACA50|SNORA50|SNORA76A small nucleolar RNA, H/ACA box 50A snoRNA 152.667-389 chr8 130476374 130476534 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32780 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 143.667-27 chr10 72696616 72696784 + 1 NA intron (NM_001270680, intron 1 of 7) intron (NM_001270680, intron 1 of 7) 4081 NM_001270680 90550 Hs.591366 NM_138357 ENSG00000156026 MCU C10orf42|CCDC109A|HsMCU mitochondrial calcium uniporter protein-coding 162.667-302 chrX 99375452 99375637 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 1034729 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 258.667-15 chr10 95398329 95398815 + 1 NA intron (NM_001034955, intron 10 of 30) intron (NM_001034955, intron 10 of 30) 42608 NM_001034956 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 157.667-352 chr9 35517168 35517381 + 1 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) intron (NM_001330740, intron 1 of 10) -21358 NM_001135999 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 161.667-224 chr6 68792717 68793018 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 157585 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 123.667-77 chr18 68293235 68293465 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 421758 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 222.333-101 chrX 42446262 42446530 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 331767 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 379.667-5 chr2 8255666 8256198 + 1 NA intron (NR_152741, intron 8 of 9) AluSx1|SINE|Alu 72487 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 146.333-145 chr2 46037647 46037916 + 1 NA intron (NM_005400, intron 10 of 14) intron (NM_005400, intron 10 of 14) -259626 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 230.667-95 chrX 51374081 51374503 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -32656 NM_203407 340602 Hs.97053 NM_203407 ENSG00000187690 EZHIP CXorf67 EZH inhibitory protein protein-coding 264.667-76 chr7 4067168 4067588 + 1 NA intron (NM_152744, intron 19 of 44) intron (NM_152744, intron 19 of 44) -62307 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 248.333-47 chr2 172869342 172869704 + 1 NA intron (NM_001282899, intron 1 of 27) intron (NM_001282899, intron 1 of 27) 9485 NM_001282900 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 136.667-40 chr12 97070599 97070791 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 163229 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 258.667-66 chr3 185001255 185001612 + 1 NA intron (NM_001009921, intron 44 of 46) MER21B|LTR|ERVL 151627 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 246.333-103 chr9 18232845 18233257 + 1 NA Intergenic Intergenic -241102 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 250.667-58 chr4 70500460 70500749 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -17965 NM_001286731 401138 Hs.453069 NM_212557 ENSG00000187689 AMTN AI3B|UNQ689 amelotin protein-coding 159.667-328 chr8 119663612 119663812 + 1 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) intron (NM_001330600, intron 1 of 25) 9678 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 178.667-25 chr10 92400522 92400719 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -18041 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 156.667-308 chr6 154425991 154426241 + 1 NA intron (NM_001368116, intron 7 of 12) intron (NM_001368116, intron 7 of 12) 7957 NM_001368119 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 162.667-99 chr17 14010672 14010964 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -13680 NR_003261 94158 Hs.633073 NR_003261 CDRT15P1 CDRT15P CMT1A duplicated region transcript 15 pseudogene 1 pseudo 154.333-357 chr8 129624981 129625268 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 -50106 NR_130920 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 145.667-52 chr11 107196650 107196848 + 1 NA Intergenic Intergenic -178273 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 236.667-55 chr3 153702586 153702857 + 1 NA intron (NR_146713, intron 2 of 6) L1ME3A|LINE|L1 59805 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 118.333-157 chr4 159129144 159129310 + 1 NA promoter-TSS (NR_037459) promoter-TSS (NR_037459) -333 NR_037459 100500881 NR_037459 ENSG00000264105 MIR3688-1 MIR3688|mir-3688-1 microRNA 3688-1 ncRNA 226.333-3 chr1 62659265 62659602 + 1 NA intron (NM_001367561, intron 2 of 49) L1MDa|LINE|L1 28935 NM_033407 85440 Hs.744927 NM_033407 ENSG00000116641 DOCK7 EIEE23|ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 protein-coding 161.333-126 chr18 6851092 6851398 + 1 NA intron (NM_001010000, intron 3 of 16) intron (NM_001010000, intron 3 of 16) 16760 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 178.333-183 chrX 100688285 100688519 + 1 NA exon (NM_001129896, exon 11 of 18) exon (NM_001129896, exon 11 of 18) 43132 NM_001370169 94121 Hs.592224 NM_080737 ENSG00000102362 SYTL4 SLP4 synaptotagmin like 4 protein-coding 132.333-43 chr12 56623564 56623790 + 1 NA intron (NM_013449, intron 1 of 28) MER20|DNA|hAT-Charlie 6649 NM_001300905 11176 Hs.314263 NM_013449 ENSG00000076108 BAZ2A TIP5|WALp3 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A protein-coding 159.333-325 chr8 87277588 87277802 + 1 NA intron (NM_173538, intron 6 of 10) L1MEg|LINE|L1 411280 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 156.667-335 chr8 84429095 84429291 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 13709 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 146.667-59 chr11 82044925 82045084 + 1 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -154168 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 180.333-62 chr2 232753534 232753838 + 1 NA intron (NM_015575, intron 7 of 30) MIR|SINE|MIR 19269 NR_103492 26058 Hs.565319 NM_015575 ENSG00000204120 GIGYF2 GYF2|PARK11|PERQ2|PERQ3|TNRC15 GRB10 interacting GYF protein 2 protein-coding 262.667-26 chr14 98871202 98871563 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 159769 NR_161367 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 145.667-27 chr10 20154047 20154195 + 1 NA intron (NM_032812, intron 6 of 13) intron (NM_032812, intron 6 of 13) 337689 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 238.667-4 chr1 196360846 196361278 + 1 NA intron (NR_146057, intron 13 of 26) intron (NR_146057, intron 13 of 26) 221419 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 272.667-14 chr12 45578534 45579124 + 1 NA Intergenic Intergenic 149092 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 173.333-56 chr14 47915552 47915879 + 1 NA Intergenic Intergenic -120701 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 164.667-121 chr2 235205858 235206085 + 1 NA Intergenic Intergenic 178236 NM_001371306 142.667-96 chr2 64481121 64481265 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5160 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 248.667-4 chr1 159895044 159895545 + 1 NA intron (NM_012337, intron 1 of 11) intron (NM_012337, intron 1 of 11) 4785 NR_130464 100422852 NR_130464 ENSG00000266458 MIR4259 - microRNA 4259 ncRNA 251.333-62 chr2 186155140 186155601 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -69053 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 204.333-13 chr1 155925444 155925836 + 1 NA TTS (NR_003005) TTS (NR_003005) 446 NR_003005 677771 Hs.678903 NR_003005 ENSG00000281394 SCARNA4 ACA26 small Cajal body-specific RNA 4 ncRNA 251.333-49 chr18 41197334 41197655 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 323183 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 150.333-290 chr4 21089054 21089235 + 1 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -105135 NM_001363504 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 151.333-416 chr8 81487302 81487510 + 1 NA Intergenic Intergenic -4173 NM_001442 2167 Hs.391561 NM_001442 ENSG00000170323 FABP4 A-FABP|AFABP|ALBP|HEL-S-104|aP2 fatty acid binding protein 4 protein-coding 160.667-59 chr11 86982013 86982174 + 1 NA intron (NR_038905, intron 2 of 2) MER58B|DNA|hAT-Charlie 26472 NR_038905 100506368 Hs.559920 NR_038905 ENSG00000246523 FZD4-DT - FZD4 divergent transcript ncRNA 234.333-84 chr8 48916883 48917215 + 1 NA TTS (NM_003068) TTS (NM_003068) 4380 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 141.667-147 chr3 110541349 110541612 + 1 NA Intergenic Intergenic 528479 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 156.667-256 chr4 174420578 174420854 + 1 NA Intergenic Intergenic -3079 NR_036236 100423042 NR_036236 ENSG00000265846 MIR4276 - microRNA 4276 ncRNA 195.333-63 chr12 72736285 72736622 + 1 NA Intergenic Intergenic -422737 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 164.333-217 chr6 150226390 150226597 + 1 NA intron (NM_030949, intron 3 of 3) intron (NM_030949, intron 3 of 3) 83449 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 254.667-63 chr5 10519442 10519947 + 1 NA intron (NR_134289, intron 1 of 2) intron (NR_134289, intron 1 of 2) 2390 NR_134289 389273 Hs.519206 NR_134289 ENSG00000249160 LINC02213 - long intergenic non-protein coding RNA 2213 ncRNA 291.333-32 chr18 2076194 2076587 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 495115 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 147.667-292 chr5 115536297 115536471 + 1 NA intron (NM_020177, intron 2 of 2) intron (NM_020177, intron 2 of 2) 8391 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 164.667-140 chr3 10187101 10187370 + 1 NA intron (NM_001570, intron 2 of 12) HAL1ME|LINE|L1 22316 NM_001570 3656 Hs.449207 NM_001570 ENSG00000134070 IRAK2 IRAK-2 interleukin 1 receptor associated kinase 2 protein-coding 278.333-5 chr1 72396799 72397238 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -114479 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 157.333-152 chr17 53597480 53597767 + 1 NA Intergenic Intergenic -225304 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 145.333-212 chr4 38123764 38124034 + 1 NA intron (NM_001253915, intron 1 of 3) intron (NM_001253915, intron 1 of 3) 3945 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 151.333-339 chr5 60262010 60262188 + 1 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) 110564 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 195.333-209 chr7 111026299 111026648 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) -64533 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 195.667-138 chr8 31945590 31945918 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) CR1-16_AMi|LINE|CR1 -79982 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 222.333-78 chr5 150413024 150413308 + 1 NA promoter-TSS (NM_001364084) promoter-TSS (NM_001364084) -230 NM_001025159 972 Hs.436568 NM_004355 ENSG00000019582 CD74 DHLAG|HLADG|II|Ia-GAMMA|p33 CD74 molecule protein-coding 145.667-105 chr16 13503126 13503399 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -416895 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 180.667-134 chr7 16784124 16784355 + 1 NA 3' UTR (NM_014399, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_014399, exon 6 of 6) 20760 NM_006408 10551 Hs.530009 NM_006408 ENSG00000106541 AGR2 AG-2|AG2|GOB-4|HAG-2|HEL-S-116|HPC8|PDIA17|XAG-2 anterior gradient 2, protein disulphide isomerase family member protein-coding 214.667-131 chrX 80684536 80684967 + 1 NA intron (NM_153252, intron 36 of 40) intron (NM_153252, intron 36 of 40) 125126 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 164.333-54 chr12 28865315 28865561 + 1 NA Intergenic Intergenic -283840 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 219.333-68 chr16 63859569 63859879 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 1262339 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 129.667-41 chr12 75828443 75828655 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 203227 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 172.333-20 chr10 81269081 81269368 + 1 NA Intergenic LTR12F|LTR|ERV1 -605970 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 173.333-86 chr2 12003226 12003471 + 1 NA Intergenic Intergenic -3768 NR_110196 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 133.333-142 chr5 25739965 25740166 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 549112 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 207.333-25 chr10 13200716 13201120 + 1 NA intron (NM_018518, intron 16 of 19) AluSx1|SINE|Alu -16351 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 149.667-286 chr4 62669517 62669690 + 1 NA Intergenic Intergenic -507838 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 133.667-56 chr16 7941107 7941258 + 1 NA Intergenic Intergenic 608337 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 185.667-108 chr6 72043278 72043533 + 1 NA intron (NM_001350411, intron 2 of 3) intron (NM_001350411, intron 2 of 3) 156702 NM_001350411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 265.667-58 chr5 64976154 64976632 + 1 NA intron (NM_001297644, intron 12 of 12) L1ME4c|LINE|L1 207463 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 149.667-144 chr15 76904068 76904272 + 1 NA intron (NR_148227, intron 1 of 32) MIRc|SINE|MIR 1170 NM_001353011 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 115.333-65 chr14 52683262 52683418 + 1 NA intron (NM_014584, intron 2 of 15) intron (NM_014584, intron 2 of 15) 12218 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 136.333-87 chr2 45514314 45514576 + 1 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) intron (NM_018079, intron 14 of 20) 96822 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 159.333-7 chr1 52048686 52048853 + 1 NA intron (NM_015913, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -2149 NR_126385 104355143 Hs.603708 NR_126385 ENSG00000228369 TXNDC12-AS1 - TXNDC12 antisense RNA 1 ncRNA 197.667-82 chr3 45353765 45354098 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -34645 NM_015340 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 121.333-84 chr2 58159524 58159679 + 1 NA exon (NM_001288839, exon 12 of 12) exon (NM_001288839, exon 12 of 12) 81779 NM_018062 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 254.333-90 chr8 125114992 125115559 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 23415 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 152.667-338 chr7 28925119 28925312 + 1 NA Intergenic Intergenic 33115 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 310.333-36 chr8 35375303 35375694 + 1 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) 140023 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 251.333-64 chr2 191852296 191852594 + 1 NA Intergenic Intergenic -5357 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 190.333-7 chr1 166834833 166835232 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -4443 NM_001314014 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 132.667-24 chr10 84372640 84372934 + 1 NA intron (NM_018999, intron 2 of 10) intron (NM_018999, intron 2 of 10) 44198 NM_001284241 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 258.667-87 chr6 112002735 112003188 + 1 NA Intergenic Intergenic -51114 NM_003880 8838 Hs.558428 NM_003880 ENSG00000112761 CCN6 LIBC|PPAC|PPD|WISP-3|WISP3 cellular communication network factor 6 protein-coding 275.333-3 chr1 100545089 100545434 + 1 NA Intergenic Intergenic 7122 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 147.667-145 chr17 68977004 68977156 + 1 NA intron (NM_080283, intron 37 of 38) intron (NM_080283, intron 37 of 38) -21688 NM_001288986 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 113.333-162 chr22 32863545 32863717 + 1 NA TTS (NM_000362) TTS (NM_000362) 62815 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 142.667-90 chr2 11499769 11499939 + 1 NA Intergenic Intergenic -33677 NM_001278277 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 196.667-98 chr3 89953880 89954191 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 846414 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 267.333-47 chr2 102183219 102183537 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -3595 NM_001351448 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 123.333-77 chr14 48642822 48642990 + 1 NA Intergenic Intergenic -847892 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 142.667-106 chr2 141103836 141104053 + 1 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -517259 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 138.333-151 chr5 86519984 86520219 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -97840 NM_001867 1350 Hs.430075 NM_001867 ENSG00000127184 COX7C - cytochrome c oxidase subunit 7C protein-coding 348.667-13 chr20 44978102 44978644 + 1 NA intron (NM_001352385, intron 2 of 11) intron (NM_001352385, intron 2 of 11) 11861 NM_006282 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 277.333-20 chr12 9006501 9006905 + 1 NA intron (NM_005810, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 17078 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 159.333-207 chr3 52679972 52680151 + 1 NA intron (NM_001350075, intron 1 of 29) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 5538 NM_001350077 55193 Hs.189920 NM_018165 ENSG00000163939 PBRM1 BAF180|PB1 polybromo 1 protein-coding 157.667-151 chr2 142506399 142506616 + 1 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -371157 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 167.667-28 chr10 70994681 70994883 + 1 NA Intergenic Intergenic 55729 NR_134313 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 124.667-27 chr10 48501227 48501464 + 1 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) intron (NR_144642, intron 3 of 9) -7695 NM_001256026 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 160.333-12 chr1 60155931 60156162 + 1 NA Intergenic Intergenic -82276 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 175.667-122 chr5 174821179 174821385 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 69548 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 124.667-177 chr6 56495217 56495410 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 74 of 94) intron (NM_001144770, intron 74 of 94) -101185 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 139.667-7 chr1 114657345 114657535 + 1 NA intron (NM_001256404, intron 1 of 20) intron (NM_001256404, intron 1 of 20) 12609 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 155.667-59 chr11 110121117 110121386 + 1 NA intron (NM_033390, intron 1 of 5) intron (NM_033390, intron 1 of 5) 27859 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 122.333-14 chr1 191922219 191922405 + 1 NA Intergenic Intergenic -236150 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 147.667-272 chr5 8255454 8255699 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 201988 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 170.333-211 chr8 14183917 14184121 + 1 NA intron (NM_139167, intron 4 of 7) L1MEd|LINE|L1 554329 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 270.667-13 chr12 112480549 112480916 + 1 NA intron (NM_001330437, intron 9 of 15) intron (NM_001330437, intron 9 of 15) 61785 NM_080601 5781 Hs.506852 NM_002834 ENSG00000179295 PTPN11 BPTP3|CFC|JMML|METCDS|NS1|PTP-1D|PTP2C|SH-PTP2|SH-PTP3|SHP2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11 protein-coding 121.667-114 chr20 49064003 49064184 + 1 NA intron (NM_001362762, intron 3 of 24) MER20|DNA|hAT-Charlie 17781 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 156.333-89 chr12 118494172 118494399 + 1 NA Intergenic Intergenic 117730 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 292.333-4 chr1 174811659 174812018 + 1 NA non-coding (NR_158982, exon 19 of 27) non-coding (NR_158982, exon 19 of 27) 12100 NM_001366454 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 179.667-58 chr16 23361741 23361947 + 1 NA intron (NM_000336, intron 4 of 12) FRAM|SINE|Alu 59542 NM_000336 6338 Hs.414614 NM_000336 ENSG00000168447 SCNN1B BESC1|ENaCb|ENaCbeta|LIDLS1|SCNEB sodium channel epithelial 1 beta subunit protein-coding 194.667-116 chr5 2056637 2056854 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 169414 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 293.667-49 chr5 59721080 59721542 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -17608 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 136.333-57 chr14 81951690 81951859 + 1 NA Intergenic Intergenic -208636 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 141.667-5 chr1 81045647 81045832 + 1 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -260453 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 193.333-177 chr7 106909850 106910157 + 1 NA Intergenic Intergenic 44524 NM_002649 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 208.667-155 chrX 150943989 150944293 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -36366 NM_001301231 3149 Hs.19114 NM_005342 ENSG00000029993 HMGB3 HMG-2a|HMG-4|HMG2A|HMG4 high mobility group box 3 protein-coding 270.667-15 chr14 54255159 54255481 + 1 NA Intergenic Intergenic -141548 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 223.667-66 chr5 29699850 29700127 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -180572 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 151.333-207 chr2 57689079 57689245 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -218489 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 157.667-156 chr2 187575329 187575530 + 1 NA Intergenic Intergenic -20924 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 153.667-296 chr4 84254701 84254896 + 1 NA intron (NR_125909, intron 4 of 8) L1MC4|LINE|L1 44371 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 229.333-66 chr2 99145923 99146288 + 1 NA intron (NM_144706, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu -4402 NM_182911 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 134.333 chr1 27686927 27687109 + 1 NA Intergenic Intergenic -14826 NM_022873 2537 Hs.523847 NM_002038 ENSG00000126709 IFI6 6-16|FAM14C|G1P3|IFI-6-16|IFI616 interferon alpha inducible protein 6 protein-coding 186.667-89 chr3 54455889 54456151 + 1 NA intron (NM_018398, intron 4 of 37) L1MA5|LINE|L1 183837 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 147.667-38 chr10 57144856 57145034 + 1 NA Intergenic Intergenic 159614 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 233.333-91 chr4 47642948 47643224 + 1 NA exon (NM_001278586, exon 14 of 14) exon (NM_001278586, exon 14 of 14) -9583 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 169.667-38 chr11 123820562 123820819 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -14341 NM_001005325 390261 Hs.557924 NM_001005325 ENSG00000196099 OR6M1 OR11-271 olfactory receptor family 6 subfamily M member 1 protein-coding 141.333-6 chr1 69681019 69681163 + 1 NA intron (NM_001370785, intron 2 of 26) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 111750 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 146.667-340 chr8 127811581 127811832 + 1 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 15744 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 152.667-251 chr3 121238784 121238947 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 12 of 27) intron (NM_001348343, intron 12 of 27) 189225 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 346.333-2 chr1 67535144 67535635 + 1 NA Intergenic Intergenic -104987 NM_015640 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 148.333-227 chr20 48445617 48445800 + 1 NA Intergenic LTR45C|LTR|ERV1 85797 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 136.333-173 chr5 111799446 111799599 + 1 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -41304 NM_001142476 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 175.333-205 chr9 73494451 73494724 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 342722 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 143.333-181 chr3 66332838 66333099 + 1 NA intron (NR_028475, intron 5 of 9) L1MEj|LINE|L1 111965 NM_001350992 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 181.333-80 chr2 146515365 146515644 + 1 NA Intergenic Intergenic -71553 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 237.333-70 chr22 22659932 22660301 + 1 NA Intergenic Intergenic 13804 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 259.333-100 chr8 114596195 114596515 + 1 NA Intergenic Intergenic 1071658 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 180.333-22 chr12 17439186 17439368 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 149801 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 165.667-56 chr14 70980712 70981034 + 1 NA intron (NM_001308160, intron 6 of 33) intron (NM_001308160, intron 6 of 33) 73414 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 159.667-71 chr12 22570519 22570702 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26064 NM_001286177 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 166.667-18 chr1 171644346 171644682 + 1 NA intron (NM_000261, intron 1 of 2) intron (NM_000261, intron 1 of 2) 8174 NM_000261 4653 Hs.436037 NM_000261 ENSG00000034971 MYOC GLC1A|GPOA|JOAG|JOAG1|TIGR myocilin protein-coding 162.333-104 chr2 13496516 13496790 + 1 NA Intergenic Intergenic -489640 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 141.333-86 chr17 82379482 82379658 + 1 NA Intergenic Intergenic 5293 NM_018949 2837 Hs.192720 NM_018949 ENSG00000181408 UTS2R GPR14|UR-2-R|UTR|UTR2 urotensin 2 receptor protein-coding 266.667-65 chr6 49145727 49146048 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 317366 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 165.333-74 chr14 55981574 55981878 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -136685 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 202.333-33 chr11 40609037 40609406 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L1MB1|LINE|L1 -316091 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 199.667-128 chr7 38286353 38286668 + 1 NA Intergenic Intergenic -12863 NM_001003806 445347 Hs.534032 NM_001003799 TARP CD3G|TCRG|TCRGC1|TCRGC2|TCRGV TCR gamma alternate reading frame protein protein-coding 148.667-284 chr4 78752042 78752192 + 1 NA Intergenic Intergenic -24233 NM_017593 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 130.667-209 chr9 123789394 123789550 + 1 NA intron (NM_001352965, intron 1 of 20) intron (NM_001352965, intron 1 of 20) 140654 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 211.333-212 chr6 144599129 144599480 + 1 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) intron (NM_007124, intron 50 of 73) 193649 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 204.333-126 chr3 99699229 99699517 + 1 NA intron (NM_001850, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 60779 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 157.667-94 chr13 103453586 103453791 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 28488 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 244.667-41 chr14 33919433 33919723 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 31496 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 247.667-68 chr3 181334590 181334922 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 103019 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 424.333-7 chr5 133054783 133055607 + 1 NA intron (NM_002154, intron 1 of 18) intron (NM_002154, intron 1 of 18) 3182 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 158.667-58 chr11 44150954 44151267 + 1 NA intron (NM_001178083, intron 8 of 14) L1MC1|LINE|L1 54913 NM_000401 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 243.667-19 chr14 20380698 20381110 + 1 NA intron (NM_001319035, intron 31 of 52) intron (NM_001319035, intron 31 of 52) 32597 NM_001319035 7011 Hs.508835 NM_007110 ENSG00000129566 TEP1 TLP1|TP1|TROVE1|VAULT2|p240 telomerase associated protein 1 protein-coding 245.667-77 chr8 132630496 132630790 + 1 NA intron (NR_135913, intron 4 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 44902 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 144.333-166 chr3 35083824 35083998 + 1 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) ERVL-int|LTR|ERVL 310112 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 146.333-321 chr8 72225754 72225982 + 1 NA intron (NR_033867, intron 11 of 19) intron (NR_033867, intron 11 of 19) 25766 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 115.667-96 chr17 18000491 18000686 + 1 NA intron (NM_031294, intron 9 of 13) L1ME4b|LINE|L1 27726 NM_001130091 83450 Hs.579264 NM_031294 ENSG00000171962 DRC3 CFAP134|LRRC48 dynein regulatory complex subunit 3 protein-coding 184.333-122 chr5 53283195 53283394 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 173452 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 197.667-50 chr17 59252027 59252363 + 1 NA intron (NM_182569, intron 4 of 9) AluSz|SINE|Alu 31684 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 140.333-158 chr4 57786122 57786337 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 360357 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 212.333-153 chr9 81202687 81203104 + 1 NA Intergenic Intergenic 486640 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 164.333-231 chr7 145996300 145996556 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -777843 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 157.667-168 chr20 24595511 24595824 + 1 NA intron (NM_024893, intron 3 of 3) L1PA15|LINE|L1 125706 NR_147606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 291.667-34 chr7 94111256 94111696 + 1 NA Intergenic Intergenic -107121 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 422.333-8 chr6 41803101 41803615 + 1 NA intron (NM_001286554, intron 3 of 5) AluSx1|SINE|Alu 15915 NM_001134493 100188893 Hs.731633 NM_001134493 ENSG00000214736 TOMM6 OBTP|TOM6 translocase of outer mitochondrial membrane 6 protein-coding 246.333-30 chr14 63217830 63218289 + 1 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 13616 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 127.333-137 chr5 37058655 37058819 + 1 NA intron (NM_015384, intron 43 of 45) intron (NM_015384, intron 43 of 45) 181968 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 123.333-215 chr8 110527383 110527581 + 1 NA Intergenic Intergenic 499951 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 309.667-13 chr20 10839669 10840057 + 1 NA Intergenic Intergenic 69409 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 266.666-32 chr8 126831007 126831608 + 1 NA Intergenic Intergenic -181847 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 138.667-171 chr5 124922254 124922420 + 1 NA Intergenic Intergenic -114494 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 147.667-311 chr6 50457098 50457258 + 1 NA Intergenic Intergenic -256366 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 185.333-111 chr20 35389340 35389712 + 1 NA intron (NM_018244, intron 2 of 9) AluSc8|SINE|Alu 22447 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 178.333-55 chr15 68004309 68004542 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -49754 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 193.667-81 chr22 29859882 29860308 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -21821 NM_001369927 84164 Hs.731754 NM_032204 ENSG00000100325 ASCC2 ASC1p100|p100 activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 protein-coding 154.667-380 chr8 69074941 69075159 + 1 NA intron (NR_039986, intron 1 of 4) intron (NR_039986, intron 1 of 4) 29140 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 188.667-90 chr20 51227924 51228213 + 1 NA Intergenic Intergenic -204961 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 183.333-33 chr12 80233899 80234118 + 1 NA intron (NM_001368062, intron 14 of 62) MIRc|SINE|MIR 24555 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 147.667-268 chr4 177508654 177508846 + 1 NA Intergenic Intergenic -66247 NM_001171988 175 Hs.207776 NM_000027 ENSG00000038002 AGA AGU|ASRG|GA aspartylglucosaminidase protein-coding 206.667-147 chr9 17489243 17489667 + 1 NA intron (NM_001365029, intron 25 of 25) intron (NM_001365029, intron 25 of 25) -89611 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 210.333-83 chr2 122813696 122814115 + 1 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 259576 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 341.333-2 chr1 170648996 170649433 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -14917 NM_006902 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 236.333-64 chr3 178120302 178120738 + 1 NA Intergenic Intergenic -298681 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 209.667-65 chr2 105914464 105914691 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 62730 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 192.667-186 chr9 118574750 118575131 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -104731 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 159.667-94 chr14 45068070 45068315 + 1 NA intron (NR_131765, intron 17 of 19) intron (NR_131765, intron 17 of 19) -15924 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 134.333-12 chr1 216930119 216930329 + 1 NA intron (NM_001350123, intron 2 of 8) intron (NM_001350123, intron 2 of 8) 9449 NM_001243513 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 288.333-41 chr9 85455939 85456436 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 285842 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 118.333-47 chr11 111592679 111592846 + 1 NA Intergenic MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? -9687 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 153.333-35 chr1 229154214 229154459 + 1 NA Intergenic Intergenic 20465 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 211.667-102 chr6 126964975 126965274 + 1 NA Intergenic Intergenic -153547 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 150.667-381 chr8 117271276 117271551 + 1 NA Intergenic Intergenic 136418 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 141.333-176 chr4 85347522 85347714 + 1 NA Intergenic Intergenic -127532 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 245.333-116 chr8 34186263 34186624 + 1 NA Intergenic Intergenic -586337 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 251.667-49 chr20 38216047 38216566 + 1 NA intron (NM_001029864, intron 13 of 13) intron (NM_001029864, intron 13 of 13) -43869 NR_104170 149684 Hs.628250 NR_104170 ENSG00000285347 LOC149684 - uncharacterized LOC149684 ncRNA 274.333-50 chr3 151508853 151509412 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -50423 NM_178822 285313 Hs.58561 NM_178822 ENSG00000152580 IGSF10 CMF608 immunoglobulin superfamily member 10 protein-coding 149.333-76 chr11 83603683 83603843 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) L1ME3E|LINE|L1 78662 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 247.333-19 chr12 12134222 12134543 + 1 NA intron (NM_002336, intron 17 of 22).2 L1ME4c|LINE|L1 22430 NR_128710 103504734 NR_128710 ENSG00000283475 MIR1244-4 hsa-mir-1244-4 microRNA 1244-4 ncRNA 140.333-241 chr8 123717373 123717581 + 1 NA intron (NM_004306, intron 1 of 10) intron (NM_004306, intron 1 of 10) 19916 NM_004306 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 172.333-43 chr12 122246802 122247126 + 1 NA intron (NM_001351018, intron 6 of 12) L1ME4a|LINE|L1 -19508 NM_019887 56616 Hs.169611 NM_019887 ENSG00000184047 DIABLO DFNA64|SMAC diablo IAP-binding mitochondrial protein protein-coding 155.333-103 chr14 52001445 52001633 + 1 NA intron (NM_016039, intron 5 of 7) intron (NM_016039, intron 5 of 7) 11993 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 169.667-53 chr14 25249384 25249564 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -199177 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 273.333-36 chr2 164391130 164391701 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 177080 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 191.333-6 chr1 77137129 77137506 + 1 NA intron (NM_005482, intron 9 of 10) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 77174 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 197.333-89 chr17 80901036 80901432 + 1 NA intron (NM_020761, intron 20 of 33) intron (NM_020761, intron 20 of 33) 69979 NR_148968 400627 Hs.591201 NR_148968 ENSG00000261924 LOC400627 - uncharacterized LOC400627 ncRNA 151.333-358 chr6 62249547 62249760 + 1 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 36572 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 157.333-362 chr9 91387271 91387438 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -25385 NM_001351432 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 247.667-56 chr2 226962000 226962322 + 1 NA intron (NM_001349069, intron 8 of 8) intron (NM_001349069, intron 8 of 8) 126107 NM_032276 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 163.333-191 chr3 188004785 188005070 + 1 NA Intergenic Intergenic -28520 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 130.333-223 chr9 126760840 126761076 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -44048 NM_001135776 23099 Hs.355581 NM_014007 ENSG00000169155 ZBTB43 ZBTB22B|ZNF-X|ZNF297B zinc finger and BTB domain containing 43 protein-coding 327.667-19 chr2 206834057 206834569 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -51005 NR_036077 100422993 NR_036077 ENSG00000283469 MIR3130-1 MIR3130-3|mir-3130-1 microRNA 3130-1 ncRNA 120.333-101 chr2 142517459 142517642 + 1 NA Intergenic Intergenic -360114 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 124.333-37 chr12 33701003 33701216 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -261290 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 200.667-29 chr11 17500128 17500450 + 1 NA intron (NR_123738, intron 17 of 19) intron (NR_123738, intron 17 of 19) -23444 NM_001351295 6833 Hs.54470 NM_000352 ENSG00000006071 ABCC8 ABC36|HHF1|HI|HRINS|MRP8|PHHI|SUR|SUR1|SUR1delta2|TNDM2 ATP binding cassette subfamily C member 8 protein-coding 271.333-24 chr2 10832044 10832392 + 1 NA 5' UTR (NM_001282706, exon 1 of 14) 5' UTR (NM_001282706, exon 1 of 14) 267 NM_001282704 10130 Hs.212102 NM_005742 ENSG00000143870 PDIA6 ERP5|P5|TXNDC7 protein disulfide isomerase family A member 6 protein-coding 149.667-165 chr18 1450518 1450773 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -91016 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 167.333-41 chr10 51607330 51607547 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 92157 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 295.667-16 chr21 26129587 26129893 + 1 NA intron (NM_001136131, intron 1 of 15) intron (NM_001136131, intron 1 of 15) 10650 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 147.667-184 chr2 117692102 117692306 + 1 NA Intergenic Intergenic -122487 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 230.667-4 chr1 102463609 102464081 + 1 NA Intergenic Intergenic -466611 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 243.667-80 chr9 24818264 24818682 + 1 NA Intergenic Intergenic -272576 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 211.333-202 chr6 41238826 41239112 + 1 NA TTS (NM_198153) TTS (NM_198153) -10408 NR_002794 221438 Hs.639392 NR_002794 TREML5P TLT5|TREML2P|TREML2P1 triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene pseudo 210.333-25 chr11 73515816 73516263 + 1 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) AluSc5|SINE|Alu 82073 NM_015159 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 342.333-19 chr3 39354456 39355124 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 25081 NM_005201 1237 Hs.113222 NM_005201 ENSG00000179934 CCR8 CC-CKR-8|CCR-8|CDw198|CKRL1|CMKBR8|CMKBRL2|CY6|GPRCY6|TER1 C-C motif chemokine receptor 8 protein-coding 335.333-13 chr14 85894340 85894799 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -40109 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 224.667-80 chr8 84986478 84986775 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -120612 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 146.333-23 chr10 43472250 43472415 + 1 NA intron (NM_001355446, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 35221 NM_001355450 642819 Hs.719657 NM_001355444 ENSG00000243660 ZNF487 KRBO1|ZNF487P zinc finger protein 487 protein-coding 151.667-240 chr3 184628496 184628774 + 1 NA Intergenic Intergenic 66850 NM_004443 2049 Hs.2913 NM_004443 ENSG00000182580 EPHB3 EK2|ETK2|HEK2|TYRO6 EPH receptor B3 protein-coding 252.333-58 chr5 96868974 96869364 + 1 NA Intergenic Intergenic -6770 NR_137637 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 237.333-45 chr17 60873493 60873787 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 8 of 25) intron (NM_001330413, intron 8 of 25) 195789 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 151.333-284 chr3 84237503 84237658 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 631995 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 306.667-41 chr7 125792126 125792441 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -527992 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 218.667-43 chr19 29751057 29751468 + 1 NA Intergenic Intergenic -35473 NM_001256047 83636 Hs.529094 NM_031448 ENSG00000131943 C19orf12 MPAN|NBIA3|NBIA4|SPG43 chromosome 19 open reading frame 12 protein-coding 175.333-182 chr8 41462338 41462602 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -27926 NM_001362979 51125 Hs.654773 NM_016099 ENSG00000147533 GOLGA7 GCP16|GOLGA3AP1|GOLGA7A|HSPC041 golgin A7 protein-coding 159.333-319 chr8 26303987 26304196 + 1 NA intron (NM_001177591, intron 2 of 9) intron (NM_001177591, intron 2 of 9) 10875 NM_001177591 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 190.667-115 chr6 75429268 75429608 + 1 NA TTS (NR_039670) TTS (NR_039670) 1031 NR_039670 100616389 NR_039670 ENSG00000263533 MIR4463 - microRNA 4463 ncRNA 154.333-38 chr10 78751414 78751620 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 315931 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 260.667-52 chr2 174041826 174042224 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 16745 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 296.667-11 chr12 19778200 19778577 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -236297 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 149.333-262 chr3 137088133 137088325 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 130246 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 138.667-123 chr21 42521835 42522007 + 1 NA intron (NM_001320537, intron 2 of 19) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 8069 NM_001320537 54020 Hs.547009 NM_018964 ENSG00000160190 SLC37A1 G3PP solute carrier family 37 member 1 protein-coding 160.333-62 chr11 81972543 81972708 + 1 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) L1MC|LINE|L1 -81789 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 332.667-14 chr2 43273501 43273898 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 36 of 37) intron (NM_001083953, intron 36 of 37) 46488 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 226.667-93 chr9 9235971 9236307 + 1 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) AluSq2|SINE|Alu 378121 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 156.333-174 chr2 45537155 45537391 + 1 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) intron (NM_018079, intron 14 of 20) 73994 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 205.333-209 chr6 161494492 161494835 + 1 NA intron (NM_004562, intron 9 of 11) MIRb|SINE|MIR 23686 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 198.333-26 chr10 62144220 62144508 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 95007 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 176.667-90 chr21 15441608 15441827 + 1 NA Intergenic Intergenic -288217 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 222.667-75 chr5 168366408 168366736 + 1 NA intron (NM_001161661, intron 1 of 22) intron (NM_001161661, intron 1 of 22) 74927 NM_001161661 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 171.667-144 chr6 77787368 77787566 + 1 NA intron (NM_001282136, intron 3 of 4) L1M3a|LINE|L1 134428 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 147.667-276 chr5 14271820 14272096 + 1 NA intron (NM_007118, intron 2 of 56) intron (NM_007118, intron 2 of 56) 128616 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 307.667-29 chr4 144983664 144984118 + 1 NA Intergenic Intergenic 113491 NM_001318367 10393 Hs.480876 NM_014885 ENSG00000164162 ANAPC10 APC10|DOC1 anaphase promoting complex subunit 10 protein-coding 219.333-129 chr4 111276553 111277044 + 1 NA Intergenic Intergenic -416151 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 115.667-171 chr5 11209126 11209277 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 9 of 20) L1MD|LINE|L1 379716 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 289.333-23 chr18 45690943 45691414 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -33003 NM_015865 6563 Hs.101307 NM_015865 ENSG00000141469 SLC14A1 HUT11|HsT1341|JK|RACH1|RACH2|UT-B1|UT1|UTE solute carrier family 14 member 1 (Kidd blood group) protein-coding 205.667-129 chr8 12741782 12742181 + 1 NA intron (NR_138256, intron 2 of 10).2 intron (NR_138256, intron 2 of 10).2 13545 NR_138255 91694 Hs.180178 NM_152271 ENSG00000154359 LONRF1 RNF191 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 1 protein-coding 312.667-16 chr14 81532193 81532758 + 1 NA intron (NM_005065, intron 1 of 20) intron (NM_005065, intron 1 of 20) 1378 NM_005065 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 133.667-130 chr6 87424681 87424982 + 1 NA intron (NM_001031743, intron 7 of 12) intron (NM_001031743, intron 7 of 12) 16859 NM_001031743 154313 Hs.82921 NM_178823 ENSG00000272514 CFAP206 C6orf165|dJ382I10.1 cilia and flagella associated protein 206 protein-coding 195.667-56 chr17 32758920 32759252 + 1 NA TTS (NM_001303280) TTS (NM_001303280) 118038 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 152.333-93 chr13 48597616 48597825 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -16819 NR_051983 100129597 Hs.175225 NR_051983 ENSG00000233610 LINC00462 - long intergenic non-protein coding RNA 462 ncRNA 127.667-15 chr10 50561206 50561352 + 1 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) MIR|SINE|MIR 62677 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 209.667-52 chr15 87720268 87720680 + 1 NA Intergenic Intergenic 143545 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 121.667-130 chr3 152484980 152485127 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -144063 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 116.667-33 chr12 32089015 32089188 + 1 NA Intergenic Intergenic -17706 NM_001363603 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 330.333-18 chr6 84183817 84184239 + 1 NA intron (NM_001286206, intron 13 of 26) L2|LINE|L2 43615 NM_014895 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 154.333-68 chr12 32275164 32275328 + 1 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) intron (NR_148725, intron 2 of 9) -124312 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 145.333-188 chr3 80637196 80637408 + 1 NA Intergenic Intergenic -127595 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 161.667-215 chr5 163059036 163059313 + 1 NA Intergenic Intergenic -378397 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 141.333-143 chr22 37230380 37230543 + 1 NA intron (NM_002872, intron 5 of 6) intron (NM_002872, intron 5 of 6) 13808 NM_002872 5880 Hs.517601 NM_002872 ENSG00000128340 RAC2 EN-7|Gx|HSPC022|p21-Rac2 Rac family small GTPase 2 protein-coding 140.667-144 chr3 32295994 32296224 + 1 NA intron (NM_001320308, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 57429 NM_178868 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 166.667-96 chr18 3909609 3909861 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 24382 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 211.333-6 chr1 53745015 53745393 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -6040 NM_001367484 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 307.667-30 chr4 149115926 149116404 + 1 NA Intergenic Intergenic -38130 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 147.333-240 chr4 76656489 76656642 + 1 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) intron (NM_020859, intron 2 of 10) 81014 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 221.667-53 chr3 121325114 121325480 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 21 of 27) intron (NM_001348343, intron 21 of 27) 220691 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 177.333-26 chr11 50517263 50517464 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 108216 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 146.333-25 chr10 44328594 44328762 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 35928 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 247.667-18 chr11 105120568 105120864 + 1 NA Intergenic Intergenic 19053 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 269.333-22 chr14 69771167 69771474 + 1 NA exon (NM_006925, exon 8 of 8) exon (NM_006925, exon 8 of 8) -3607 NR_029378 100289511 Hs.729250 NR_029378 LOC100289511 - uncharacterized LOC100289511 ncRNA 141.667-164 chr4 65111886 65112078 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -107482 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 168.667-182 chr5 173488577 173488849 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -90921 NR_027108 285593 Hs.409730 NR_027108 ENSG00000253955 LOC285593 - uncharacterized LOC285593 ncRNA 160.667-124 chr17 62161770 62161969 + 1 NA Intergenic Intergenic -96591 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 234.333-39 chr2 79228927 79229197 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -69309 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 119.667-129 chr4 30547371 30547556 + 1 NA Intergenic Intergenic -172906 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 228.667-72 chr7 42866962 42867385 + 1 NA Intergenic Intergenic 44670 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 212.667-141 chr8 136953579 136954034 + 1 NA Intergenic Intergenic 423008 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 154.667-198 chr2 185890398 185890556 + 1 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -90326 NR_144454 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 179.667-135 chr8 73266944 73267197 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -7568 NM_001243237 100130301 Hs.202296 NM_001243237 ENSG00000274443 C8orf89 - chromosome 8 open reading frame 89 protein-coding 159.333-241 chr4 78147274 78147525 + 1 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) MIRb|SINE|MIR 89829 NM_001166133 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 153.333-232 chr2 238640337 238640582 + 1 NA Intergenic Intergenic -84960 NR_037809 151171 Hs.652076 NR_037809 ENSG00000225493 LINC01107 - long intergenic non-protein coding RNA 1107 ncRNA 155.667-95 chr14 60110852 60111050 + 1 NA intron (NM_001330177, intron 2 of 10) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 19028 NM_001330177 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 159.333-66 chr12 22556601 22556824 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -12166 NM_001286177 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 145.333-80 chr14 48844923 48845183 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 741327 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 224.333-94 chr5 35885191 35885462 + 1 NA Intergenic Intergenic 28435 NM_002185 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 161.333-277 chr8 32431538 32431734 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -9110 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 149.667-196 chr2 58401149 58401313 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -119522 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 202.333-14 chr1 114359744 114360043 + 1 NA Intergenic MER83B-int|LTR|ERV1 151310 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 252.333-44 chr22 25658670 25658981 + 1 NA intron (NM_005160, intron 3 of 20) L2a|LINE|L2 -83363 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 139.667-73 chr18 20999241 20999499 + 1 NA intron (NM_005406, intron 16 of 32) intron (NM_005406, intron 16 of 32) 112443 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 134.333-116 chr3 56924308 56924515 + 1 NA intron (NM_001128615, intron 3 of 12) MER41A|LTR|ERV1 -7975 NM_001289698 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 150.333-337 chr5 102392343 102392558 + 1 NA intron (NM_173488, intron 10 of 13) intron (NM_173488, intron 10 of 13) -96166 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 139.667-22 chr10 104010143 104010299 + 1 NA intron (NM_001304743, intron 12 of 17) intron (NM_001304743, intron 12 of 17) 37965 NR_030760 100126326 NR_030760 ENSG00000283788 MIR936 MIRN936|hsa-mir-936 microRNA 936 ncRNA 238.667-7 chr1 214267647 214267936 + 1 NA Intergenic Intergenic -13368 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 161.333-14 chr1 199874479 199874781 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -153080 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 242.667-95 chr7 102442677 102443020 + 1 NA intron (NM_032831, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 9273 NM_001126340 80228 Hs.363308 NM_032831 ENSG00000160991 ORAI2 C7orf19|CBCIP2|MEM142B|TMEM142B ORAI calcium release-activated calcium modulator 2 protein-coding 154.333-183 chr20 35231051 35231251 + 1 NA intron (NM_006690, intron 1 of 8) CR1_Mam|LINE|CR1 4461 NM_006690 10893 Hs.715494 NM_006690 ENSG00000125966 MMP24 MMP-24|MMP25|MT-MMP 5|MT-MMP5|MT5-MMP|MT5MMP|MTMMP5 matrix metallopeptidase 24 protein-coding 164.667-67 chr13 105817606 105817873 + 1 NA Intergenic Intergenic 110909 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 198.667-46 chr12 24553796 24554173 + 1 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 8507 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 349.667-7 chr14 61949088 61949578 + 1 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) intron (NM_001367663, intron 1 of 7) 21638 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 265.667-49 chr3 78370874 78371203 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -322075 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 156.667-78 chr12 32521718 32522002 + 1 NA intron (NM_001370297, intron 1 of 14) intron (NM_001370297, intron 1 of 14) -12433 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 195.333-193 chr6 63565521 63565797 + 1 NA Intergenic Intergenic -6353 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 231.667-13 chr13 90790942 90791238 + 1 NA Intergenic Intergenic 135507 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 150.333-275 chr3 125473933 125474216 + 1 NA intron (NM_003794, intron 8 of 13) intron (NM_003794, intron 8 of 13) 46128 NM_003794 8723 Hs.507243 NM_003794 ENSG00000114520 SNX4 ATG24B sorting nexin 4 protein-coding 269.667-12 chr11 35885763 35886259 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -57970 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 145.667-184 chr3 172795333 172795503 + 1 NA intron (NM_001349095, intron 18 of 25) MER101-int|LTR|ERV1 44416 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 135.333-164 chr6 133457844 133458066 + 1 NA intron (NM_172103, intron 5 of 18) MIR3|SINE|MIR 216456 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 147.667-280 chr5 30525012 30525215 + 1 NA Intergenic Intergenic 644553 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 249.333-14 chr10 31554015 31554315 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -154410 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 318.333-3 chr1 101493627 101494269 + 1 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 170111 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 223.333-172 chr9 71064758 71065053 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 56716 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 299.667-4 chr12 42314696 42315165 + 1 NA intron (NM_033114, intron 5 of 7) AluSz6|SINE|Alu 8929 NR_107005 102467003 NR_107005 ENSG00000278520 MIR7851 hsa-mir-7851 microRNA 7851 ncRNA 178.333-6 chr1 155969755 155969955 + 1 NA intron (NM_001350112, intron 1 of 21) intron (NM_001350112, intron 1 of 21) 8320 NM_001350111 9181 Hs.743352 NM_004723 ENSG00000116584 ARHGEF2 GEF|GEF-H1|GEFH1|LFP40|NEDMHM|P40 Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 159.667-50 chr10 73351828 73352094 + 1 NA intron (NM_001367801, intron 3 of 27) L1MDa|LINE|L1 6793 NM_001350934 118491 Hs.591367 NM_145170 ENSG00000156042 CFAP70 TTC18 cilia and flagella associated protein 70 protein-coding 133.333-128 chr4 62350948 62351134 + 1 NA Intergenic Intergenic -189276 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 141.667-167 chr4 109096860 109097150 + 1 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) LTR54B|LTR|ERV1 205653 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 150.333-267 chr3 94012131 94012374 + 1 NA intron (NM_001174151, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 16345 NM_001001850 415117 Hs.679768 NM_001001850 ENSG00000178750 STX19 - syntaxin 19 protein-coding 147.333-30 chr1 231558502 231558737 + 1 NA intron (NR_028393, intron 4 of 15) intron (NR_028393, intron 4 of 15) 29950 NM_005999 7257 Hs.13318 NM_005999 ENSG00000116918 TSNAX C3PO|TRAX translin associated factor X protein-coding 120.333-205 chr9 128163863 128164056 + 1 NA TTS (NM_024112) TTS (NM_024112) 3694 NM_024112 79095 Hs.522412 NM_024112 ENSG00000171159 C9orf16 EST00098 chromosome 9 open reading frame 16 protein-coding 150.333-407 chr8 86135789 86135994 + 1 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) intron (NM_152565, intron 2 of 7) 36981 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 162.333-142 chr21 27345437 27345683 + 1 NA Intergenic Intergenic -376819 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 126.667-97 chr21 30194689 30194889 + 1 NA Intergenic Intergenic 16994 NR_038855 266919 Hs.561028 NR_038855 ENSG00000227342 LINC00307 D21S2091E|NCRNA00307 long intergenic non-protein coding RNA 307 ncRNA 168.333-206 chr8 38721628 38721799 + 1 NA Intergenic Intergenic -6473 NR_148053 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 186.333-118 chr5 7179910 7180237 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 89281 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 149.667-266 chr3 131613845 131614056 + 1 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) intron (NM_130808, intron 7 of 15) -110979 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 164.333-144 chr21 20074117 20074367 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -174487 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 228.667-22 chr14 36880721 36881066 + 1 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) 71498 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 258.667-35 chr15 90604084 90604535 + 1 NA intron (NM_001042574, intron 4 of 14) intron (NM_001042574, intron 4 of 14) -55925 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 152.667-233 chr22 35035245 35035483 + 1 NA Intergenic Intergenic -30794 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 142.333-268 chrX 94204320 94204530 + 1 NA Intergenic LTR60B|LTR|ERV1 530219 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 449.667 chr11 111735130 111735803 + 1 NA intron (NM_181699, intron 15 of 15) intron (NM_181699, intron 15 of 15) 30923 NM_181699 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 152.667-230 chr22 28012239 28012518 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 14 of 22) intron (NM_001145418, intron 14 of 22) -91766 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 149.667-157 chr17 47634019 47634283 + 1 NA Intergenic Intergenic -15768 NM_002265 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 198.667-65 chr14 83316555 83316875 + 1 NA Intergenic Intergenic 674083 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 153.667-145 chr16 13065987 13066183 + 1 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 164487 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 245.667-25 chr18 32062614 32063057 + 1 NA intron (NM_017831, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR -29039 NM_016271 51444 Hs.302408 NM_016271 ENSG00000134758 RNF138 HSD-4|NARF|STRIN|hNARF ring finger protein 138 protein-coding 154.667-267 chr4 24024294 24024456 + 1 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) MIRb|SINE|MIR -134328 NM_013261 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 194.667-143 chr7 29590885 29591191 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 25505 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 158.667-121 chr17 27169632 27169935 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -80542 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 223.333-104 chr3 55092681 55093031 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -85316 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 237.667-24 chr15 65652023 65652550 + 1 NA intron (NM_001254740, intron 5 of 6) intron (NM_001254740, intron 5 of 6) 9407 NM_001254740 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 152.667-250 chr3 106771922 106772120 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 468617 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 159.667-26 chr1 177307487 177307652 + 1 NA Intergenic Intergenic -44017 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 193.333-55 chr14 51682796 51683204 + 1 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) intron (NM_001267046, intron 1 of 13) 31090 NM_152330 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 150.333-84 chr12 70610740 70610962 + 1 NA promoter-TSS (NM_001206971) promoter-TSS (NM_001206971) -827 NM_001206971 5787 Hs.201030 NM_002837 ENSG00000127329 PTPRB HPTP-BETA|HPTPB|PTPB|R-PTP-BETA|VEPTP protein tyrosine phosphatase receptor type B protein-coding 190.667-83 chr3 35051473 35051849 + 1 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 342362 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 150.667-388 chr8 129660605 129660790 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 19542 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 170.667-136 chr5 86254712 86255023 + 1 NA Intergenic Intergenic -27577 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 226.667-94 chr9 38298234 38298611 + 1 NA Intergenic Intergenic -94280 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 124.667-163 chr5 31276849 31277041 + 1 NA intron (NM_001362435, intron 2 of 10) intron (NM_001362435, intron 2 of 10) 83259 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 204.667-18 chr10 109804572 109805028 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 118446 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 147.667-20 chr1 178231429 178231648 + 1 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) L1ME2z|LINE|L1 -109913 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 148.667-317 chr5 100296507 100296742 + 1 NA Intergenic Intergenic 91630 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 277.667 chr1 115032247 115032613 + 1 NA intron (NM_000549, intron 1 of 2) intron (NM_000549, intron 1 of 2) -1516 NM_001277991 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 118.333-73 chr15 65614519 65614756 + 1 NA intron (NM_001301033, intron 2 of 11) intron (NM_001301033, intron 2 of 11) 3287 NM_001301033 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 118.667-28 chr10 73037902 73038088 + 1 NA intron (NM_001017962, intron 9 of 14) AluJb|SINE|Alu 58979 NM_001142595 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 142.667-76 chr16 74518778 74518993 + 1 NA intron (NM_001145666, intron 1 of 25) L1PA7|LINE|L1 88229 NM_001145667 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 131.667-171 chr6 49206396 49206633 + 1 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy 256739 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 163.333-130 chr18 11721106 11721357 + 1 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) Cheshire|DNA|hAT-Charlie -30241 NM_001261443 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 182.667-136 chr5 122506854 122507054 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -27867 NR_051996 153163 Hs.679757 NR_051996 ENSG00000250328 MGC32805 - uncharacterized LOC153163 ncRNA 253.667-3 chr1 80494793 80495230 + 1 NA Intergenic Intergenic -40744 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 152.333-271 chr4 65270827 65271039 + 1 NA Intergenic Intergenic -266433 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 158.333-241 chr4 112154451 112154660 + 1 NA intron (NM_152400, intron 1 of 1) AluSz6|SINE|Alu 9101 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 151.333-279 chr3 71694112 71694380 + 1 NA intron (NM_173359, intron 5 of 7) intron (NM_173359, intron 5 of 7) 31156 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 153.333-404 chr8 65419532 65419741 + 1 NA Intergenic Intergenic 143030 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 155.667-33 chr10 23959339 23959572 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) AluJr4|SINE|Alu -249336 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 218.667-92 chr6 55508699 55509057 + 1 NA intron (NM_001287741, intron 4 of 7) intron (NM_001287741, intron 4 of 7) 70336 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 225.667-10 chr10 81314978 81315342 + 1 NA Intergenic Intergenic -560034 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 247.667-32 chr14 80906435 80906883 + 1 NA intron (NM_152446, intron 4 of 24) L1M6|LINE|L1 35079 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 142.333-255 chr9 31196393 31196656 + 1 NA Intergenic Intergenic 184966 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 141.667-237 chr8 142920710 142920937 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -2980 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 202.667-80 chr2 70093396 70093806 + 1 NA Intergenic AluYk4|SINE|Alu 6124 NM_006196 5093 Hs.2853 NM_006196 ENSG00000169564 PCBP1 HEL-S-85|HNRPE1|HNRPX|hnRNP-E1|hnRNP-X poly(rC) binding protein 1 protein-coding 200.333-171 chr9 102564530 102564874 + 1 NA intron (NR_103830, intron 1 of 4) intron (NR_103830, intron 1 of 4) 45065 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 272.667-48 chr4 91201881 91202221 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 967020 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 308.667-16 chr16 56708704 56709059 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -21248 NM_014669 9688 Hs.276878 NM_014669 ENSG00000102900 NUP93 NIC96 nucleoporin 93 protein-coding 130.333-66 chr14 60957060 60957210 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) L1M1|LINE|L1 23944 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 164.667-39 chr11 79114937 79115214 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 4 of 33) L2a|LINE|L2 287034 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 138.333-147 chr5 64572436 64572643 + 1 NA intron (NM_001029875, intron 2 of 5) intron (NM_001029875, intron 2 of 5) -3111 NR_073511 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 242.667-38 chr16 21167254 21167672 + 1 NA intron (NR_125971, intron 3 of 6) intron (NR_125971, intron 3 of 6) -8022 NM_017539 55567 Hs.526500 NM_017539 ENSG00000158486 DNAH3 DNAHC3-B|DNAHC3B|HDHC8|HEL-36|HSADHC3 dynein axonemal heavy chain 3 protein-coding 151.333-382 chr7 18284464 18284765 + 1 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) MIRb|SINE|MIR -5478 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 164.667-32 chr11 4712040 4712216 + 1 NA Intergenic Intergenic -14275 NM_030774 81285 Hs.501758 NM_030774 ENSG00000167332 OR51E2 HPRAJ|OR51E3P|OR52A2|PSGR olfactory receptor family 51 subfamily E member 2 protein-coding 149.333-180 chr2 66191831 66192015 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 166405 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 243.667-54 chr4 47859895 47860324 + 1 NA intron (NR_103795, intron 20 of 23) L1MA8|LINE|L1 -22003 NM_001278585 10699 Hs.518618 NM_006587 ENSG00000145244 CORIN ATC2|CRN|Lrp4|PEE5|TMPRSS10 corin, serine peptidase protein-coding 188.333-23 chr11 11919441 11919683 + 1 NA intron (NM_001282659, intron 8 of 27) intron (NM_001282659, intron 8 of 27) 78139 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 114.667-215 chr5 112088071 112088293 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -72344 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 133.333-105 chr3 49260395 49260662 + 1 NA Intergenic Intergenic -13592 NR_036233 100422952 NR_036233 ENSG00000264633 MIR4271 - microRNA 4271 ncRNA 145.667-158 chr20 25698620 25698864 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -1889 NM_015655 26152 Hs.61881 NM_015655 ENSG00000130684 ZNF337 - zinc finger protein 337 protein-coding 281.667-50 chr7 115782845 115783317 + 1 NA Intergenic Intergenic 185232 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 217.667-38 chr18 29265519 29265873 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -1033214 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 200.333-42 chr15 38467093 38467455 + 1 NA intron (NM_173611, intron 3 of 7) L1ME4b|LINE|L1 13147 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 169.667-36 chr11 96508928 96509182 + 1 NA intron (NR_135097, intron 1 of 3) intron (NR_135097, intron 1 of 3) 630 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 164.667-30 chr10 116338550 116338744 + 1 NA intron (NM_198515, intron 3 of 8) intron (NM_198515, intron 3 of 8) 14199 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 172.667-45 chr12 104907627 104907872 + 1 NA intron (NM_032148, intron 4 of 11) MIRb|SINE|MIR 50541 NM_001352171 84102 Hs.577463 NM_032148 ENSG00000136052 SLC41A2 SLC41A1-L1 solute carrier family 41 member 2 protein-coding 141.667-153 chr3 187629121 187629278 + 1 NA Intergenic Intergenic 41195 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 204.333-99 chr2 79175961 79176325 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -16390 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 160.667-184 chr22 26954576 26954825 + 1 NA Intergenic Intergenic 51408 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 189.333-99 chr2 139369444 139369652 + 1 NA Intergenic Intergenic 472224 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 174.667-73 chr18 21323887 21324071 + 1 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) L1PB3|LINE|L1 81737 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 127.667-95 chr2 166562324 166562542 + 1 NA Intergenic Intergenic -75462 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 163.333-42 chr10 82232259 82232543 + 1 NA intron (NR_120666, intron 2 of 3) intron (NR_120666, intron 2 of 3) 519 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 285.667-26 chr2 168966421 168966768 + 1 NA intron (NM_003742, intron 17 of 27) intron (NM_003742, intron 17 of 27) 64730 NM_003742 8647 Hs.158316 NM_003742 ENSG00000073734 ABCB11 ABC16|BRIC2|BSEP|PFIC-2|PFIC2|PGY4|SPGP ATP binding cassette subfamily B member 11 protein-coding 151.667-132 chr16 3995453 3995659 + 1 NA intron (NM_001116, intron 3 of 10) intron (NM_001116, intron 3 of 10) -45112 NR_120311 102724927 Hs.364739 NR_120311 ENSG00000262185 LOC102724927 - uncharacterized LOC102724927 ncRNA 173.667-77 chr2 69287192 69287374 + 1 NA Intergenic Intergenic 99944 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 119.667-42 chr13 28893404 28893556 + 1 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) intron (NM_001366651, intron 2 of 14) 73141 NM_001366651 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 215.667-10 chr1 233657142 233657390 + 1 NA intron (NM_002245, intron 1 of 2) intron (NM_002245, intron 1 of 2) 33114 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 132.667-74 chr18 80193685 80193925 + 1 NA intron (NM_032510, intron 2 of 2) intron (NM_032510, intron 2 of 2) 45881 NR_028339 100130522 Hs.352602 NM_001145731 ENSG00000267270 PARD6G-AS1 - PARD6G antisense RNA 1 ncRNA 160.667-70 chr12 33150825 33151020 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -254076 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 172.333-176 chr8 71336189 71336512 + 1 NA intron (NM_001370336, intron 4 of 17) L3|LINE|CR1 20356 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 154.667-72 chr12 20572887 20573049 + 1 NA intron (NM_001244683, intron 1 of 14) intron (NM_001244683, intron 1 of 14) 1104 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 168.667-37 chr11 111595869 111596123 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -6453 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 188.333-172 chrX 53041574 53041778 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -7648 NM_018969 54328 Hs.193011 NM_018969 ENSG00000184194 GPR173 SREB3 G protein-coupled receptor 173 protein-coding 186.333-14 chr10 34109515 34109811 + 1 NA 3' UTR (NM_001184785, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001184785, exon 25 of 25) -336983 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 313.667-8 chr10 64495516 64496099 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -329721 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 182.333-106 chr3 65562444 65562656 + 1 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) AluJr|SINE|Alu -331266 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-239 chr3 183198018 183198221 + 1 NA intron (NM_015078, intron 25 of 29) L1ME1|LINE|L1 -35385 NM_014398 27074 Hs.518448 NM_014398 ENSG00000078081 LAMP3 CD208|DC LAMP|DC-LAMP|DCLAMP|LAMP|LAMP-3|TSC403 lysosomal associated membrane protein 3 protein-coding 127.667-167 chr7 88605490 88605711 + 1 NA Intergenic Intergenic -154100 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 155.667-368 chr8 118815570 118815860 + 1 NA Intergenic Intergenic 136170 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 157.667-20 chr1 227137777 227138042 + 1 NA intron (NM_001366019, intron 10 of 36) L1ME3|LINE|L1 180583 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 171.667-124 chr4 101054908 101055259 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 10 of 12) intron (NM_001130691, intron 10 of 12) 185789 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 161.667-97 chr16 80842980 80843211 + 1 NA intron (NR_131948, intron 1 of 2) L1M3c|LINE|L1 -38497 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 170.333-43 chr11 12360060 12360305 + 1 NA 3' UTR (NM_032867, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_032867, exon 9 of 9) -17389 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 173.667-69 chr2 33316945 33317257 + 1 NA intron (NM_001166264, intron 20 of 28) intron (NM_001166264, intron 20 of 28) -101415 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 146.333-236 chr4 86159818 86160088 + 1 NA intron (NM_001318069, intron 3 of 13) intron (NM_001318069, intron 3 of 13) 40147 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 245.333-95 chr5 19982669 19983028 + 1 NA intron (NM_001291956, intron 3 of 14) AluSc8|SINE|Alu 5352 NM_001349560 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 216.667-7 chr1 76944147 76944502 + 1 NA intron (NM_001320274, intron 2 of 2) intron (NM_001320274, intron 2 of 2) 76844 NM_001320273 81849 Hs.149201 NM_030965 ENSG00000117069 ST6GALNAC5 SIAT7-E|SIAT7E|ST6GalNAcV ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5 protein-coding 149.333-235 chr3 32094093 32094388 + 1 NA Intergenic Intergenic -12271 NM_015141 23171 Hs.82432 NM_015141 ENSG00000152642 GPD1L GPD1-L glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like protein-coding 165.667-36 chr12 17310844 17311127 + 1 NA Intergenic Intergenic 278093 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 142.667-46 chr13 56938630 56938806 + 1 NA Intergenic Intergenic -202200 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 236.667-58 chr4 59212934 59213341 + 1 NA Intergenic Intergenic 199564 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 140.667-257 chrX 65084527 65084682 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -49863 NM_001178032 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 149.333-203 chr2 177801200 177801465 + 1 NA intron (NM_001077197, intron 10 of 20) L2a|LINE|L2 87424 NM_001077196 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 141.333-199 chr5 162255443 162255614 + 1 NA Intergenic Intergenic 187886 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 153.667-321 chr5 99096379 99096592 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -166771 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 153.333-58 chr10 113726028 113726325 + 1 NA intron (NM_033340, intron 6 of 7) L2a|LINE|L2 16831 NM_001267058 840 Hs.9216 NM_001227 ENSG00000165806 CASP7 CASP-7|CMH-1|ICE-LAP3|LICE2|MCH3 caspase 7 protein-coding 221.667-58 chr4 64310823 64311202 + 1 NA intron (NM_001363796, intron 5 of 11) AluJb|SINE|Alu 98438 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 134.333-171 chr8 65017694 65017894 + 1 NA Intergenic Intergenic 162546 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 141.333-219 chr7 8910134 8910360 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 476638 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 307.333-79 chr8 86557175 86557611 + 1 NA intron (NM_003909, intron 16 of 16) AluSz6|SINE|Alu 42958 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 145.667-81 chr14 62488358 62488576 + 1 NA Intergenic Intergenic -348494 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 191.667-122 chr8 59324310 59324635 + 1 NA Intergenic Intergenic 205262 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 156.667-248 chr4 92355865 92356124 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 51595 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 150.333-99 chr14 26543788 26544076 + 1 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) intron (NM_001366393, intron 2 of 4) 9498 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 248.667-53 chr2 13833183 13833483 + 1 NA Intergenic Intergenic 567625 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 170.667-47 chr14 75055516 75055794 + 1 NA intron (NR_126394, intron 1 of 1) intron (NR_126394, intron 1 of 1) -4123 NM_001040108 27030 Hs.436650 NM_014381 ENSG00000119684 MLH3 HNPCC7 mutL homolog 3 protein-coding 149.333-276 chr4 46862966 46863117 + 1 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) LOR1-int|LTR|ERV1 46204 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 267.667-8 chr10 116309560 116309982 + 1 NA Intergenic Intergenic -14677 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 226.667-52 chr2 139327920 139328237 + 1 NA Intergenic Intergenic 430754 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 173.333-46 chr12 66685533 66685769 + 1 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) intron (NM_001366724, intron 1 of 23) -6575 NM_021150 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 242.667-29 chr13 52908574 52908909 + 1 NA Intergenic Intergenic -60101 NM_032949 5100 Hs.19492 NM_002590 ENSG00000136099 PCDH8 ARCADLIN|PAPC protocadherin 8 protein-coding 116.667-167 chr5 139704363 139704544 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 29010 NM_001317211 51523 Hs.189119 NM_016463 ENSG00000171604 CXXC5 CF5|HSPC195|RINF|WID CXXC finger protein 5 protein-coding 162.333-134 chr20 23956726 23956912 + 1 NA Intergenic Intergenic 30056 NM_178312 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 228.333-21 chr12 93952203 93952494 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -8742 NR_135017 105369911 Hs.577495 NR_135017 ENSG00000257283 LOC105369911 - uncharacterized LOC105369911 ncRNA 164.667-200 chr6 51881680 51881920 + 1 NA intron (NM_138694, intron 46 of 66) intron (NM_138694, intron 46 of 66) 205813 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 299.667-10 chr15 79484940 79485523 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 52715 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 197.667-131 chr6 47141689 47141982 + 1 NA Intergenic Intergenic -99503 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 213.333-119 chr22 26775059 26775418 + 1 NA intron (NR_110543, intron 3 of 5) intron (NR_110543, intron 3 of 5) -84973 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 469.333-4 chr18 3917122 3917722 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 32069 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 233.333 chr1 31203040 31203453 + 1 NA intron (NM_024522, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 36641 NM_024522 79570 Hs.470259 NM_024522 ENSG00000084628 NKAIN1 FAM77C sodium/potassium transporting ATPase interacting 1 protein-coding 199.333-10 chr1 71858891 71859184 + 1 NA intron (NM_173808, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 -22025 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 217.333-135 chr6 166506886 166507275 + 1 NA intron (NM_001006932, intron 6 of 21) intron (NM_001006932, intron 6 of 21) 2353 NR_031734 100302141 NR_031734 ENSG00000222958 MIR1913 MIRN1913|hsa-mir-1913 microRNA 1913 ncRNA 202.667-5 chr1 75370142 75370379 + 1 NA intron (NM_001320283, intron 1 of 21) intron (NM_001320283, intron 1 of 21) 235872 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 269.333-6 chr10 92079524 92080011 + 1 NA intron (NM_001178137, intron 9 of 9) intron (NM_001178137, intron 9 of 9) 155997 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 165.333-181 chr3 194660315 194660534 + 1 NA intron (NM_018385, intron 5 of 13) intron (NM_018385, intron 5 of 13) 11767 NM_018385 55341 Hs.744061 NM_018385 ENSG00000041802 LSG1 - large 60S subunit nuclear export GTPase 1 protein-coding 229.333-8 chr1 182763943 182764212 + 1 NA Intergenic Intergenic -25372 NM_001200050 80896 Hs.496969 NM_030769 ENSG00000135838 NPL C112|C1orf13|NAL|NPL1 N-acetylneuraminate pyruvate lyase protein-coding 239.333-73 chr3 193954248 193954615 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 39807 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 113.333-229 chr6 119229186 119229428 + 1 NA intron (NM_005907, intron 6 of 12) MER103C|DNA|hAT-Charlie -80114 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 152.333-267 chr4 34403512 34403813 + 1 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -133915 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 216.333-32 chr11 90243537 90243941 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -7493 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 151.667-238 chr3 182461826 182462027 + 1 NA intron (NR_040105, intron 2 of 3) L1MA5|LINE|L1 24436 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 147.333-161 chr2 12252162 12252412 + 1 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 53157 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 339.667 chr1 119685372 119685832 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -26332 NM_006623 26227 Hs.487296 NM_006623 ENSG00000092621 PHGDH 3-PGDH|3PGDH|HEL-S-113|NLS|NLS1|PDG|PGAD|PGD|PGDH|PHGDHD|SERA phosphoglycerate dehydrogenase protein-coding 175.333-115 chr3 22985022 22985273 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 217431 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 201.333-252 chr6 162069633 162069873 + 1 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) intron (NM_004562, intron 4 of 11) 598776 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 174.667-14 chr1 186579607 186579830 + 1 NA Intergenic Intergenic 100705 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 120.667-139 chr5 55127027 55127182 + 1 NA intron (NM_001145734, intron 8 of 10) intron (NM_001145734, intron 8 of 10) 24458 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 237.333-69 chr22 19478814 19479123 + 1 NA promoter-TSS (NM_001178011) promoter-TSS (NM_001178011) 225 NM_001362910 7353 Hs.474213 NM_005659 ENSG00000070010 UFD1 UFD1L ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1 protein-coding 171.667-159 chr8 66334524 66334713 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 94359 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 158.667-362 chrX 126397877 126398140 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 154806 NM_178470 139170 Hs.120403 NM_178470 ENSG00000198889 DCAF12L1 KIAA1892L|WDR40B DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 1 protein-coding 209.667-4 chr1 41509215 41509509 + 1 NA 3' UTR (NM_001127714, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001127714, exon 8 of 8) -24679 NR_126098 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 272.667-56 chr5 122079167 122079563 + 1 NA Intergenic Intergenic -1106 NM_002317 4015 Hs.102267 NM_002317 ENSG00000113083 LOX AAT10 lysyl oxidase protein-coding 178.667-72 chr19 58178801 58178995 + 1 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -4091 NM_001278734 10782 Hs.83761 NM_016324 ENSG00000171606 ZNF274 HFB101|ZF2|ZKSCAN19|ZSCAN51 zinc finger protein 274 protein-coding 271.333-20 chr18 7878894 7879295 + 1 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 311778 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 199.333-79 chr14 70894605 70894890 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12712 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 206.333-66 chr16 88972094 88972411 + 1 NA intron (NM_005187, intron 1 of 11) intron (NM_005187, intron 1 of 11) 4955 NM_005187 863 Hs.513811 NM_005187 ENSG00000129993 CBFA2T3 ETO2|MTG16|MTGR2|RUNX1T3|ZMYND4 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 3 protein-coding 323.667-21 chr5 63516817 63517383 + 1 NA Intergenic Intergenic 445192 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 233.667-54 chr4 30581944 30582211 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -138292 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 116.333-46 chr11 100322047 100322252 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 20 of 23) L1ME3A|LINE|L1 -365139 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 182.333-77 chr2 22428300 22428657 + 1 NA Intergenic Intergenic -108001 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 189.333-133 chr3 127609095 127609410 + 1 NA intron (NR_073375, intron 8 of 15) MIR1_Amn|SINE|MIR 10841 NM_004526 4171 Hs.477481 NM_004526 ENSG00000073111 MCM2 BM28|CCNL1|CDCL1|D3S3194|DFNA70|MITOTIN|cdc19 minichromosome maintenance complex component 2 protein-coding 153.667-111 chr13 80936832 80937018 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -81466 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 194.667-92 chr3 34304418 34304631 + 1 NA Intergenic Intergenic 505894 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 150.667-328 chr6 37692953 37693211 + 1 NA intron (NM_153487, intron 1 of 16) intron (NM_153487, intron 1 of 16) 4801 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 158.667-3 chr1 38781823 38782095 + 1 NA Intergenic Intergenic 77813 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 167.333-234 chr6 124454571 124454822 + 1 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 171691 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 150.667-64 chr11 38357791 38358038 + 1 NA Intergenic Intergenic 288442 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 191.333-43 chr12 21201292 21201704 + 1 NA intron (NM_006446, intron 9 of 14) intron (NM_006446, intron 9 of 14) 70304 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 281.333-74 chrX 56113003 56113358 + 1 NA intron (NM_001324104, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu -119176 NM_007250 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 266.333-29 chr2 72619070 72619387 + 1 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 206805 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 132.667-183 chr8 121699530 121699701 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -58175 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 159.667-200 chr21 30107751 30107928 + 1 NA Intergenic Intergenic 58966 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 152.333-109 chr14 65569678 65569875 + 1 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 98674 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 216.333-29 chr11 76618312 76618636 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 51464 NM_001370188 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 158.333-138 chr2 33674948 33675221 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -31802 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 173.667-63 chr18 63470978 63471206 + 1 NA Intergenic Intergenic -5866 NM_002639 5268 Hs.55279 NM_002639 ENSG00000206075 SERPINB5 PI5|maspin serpin family B member 5 protein-coding 153.333-191 chr2 40161883 40162105 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 6 of 8) intron (NM_001351483, intron 6 of 8) 244360 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-393 chr7 133167501 133167708 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -59093 NR_133931 105375512 Hs.521205 NR_133931 LOC105375512 - uncharacterized LOC105375512 ncRNA 144.667-146 chr2 106651964 106652230 + 1 NA Intergenic Intergenic 164733 NM_001349727 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 150.667-175 chr2 59918796 59919075 + 1 NA Intergenic Intergenic 464101 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 216.667-17 chr11 8131533 8131820 + 1 NA intron (NM_001346690, intron 4 of 6) AluSx|SINE|Alu 37349 NM_001206672 79608 Hs.231850 NM_024557 ENSG00000166405 RIC3 AYST720|PRO1385 RIC3 acetylcholine receptor chaperone protein-coding 149.667-328 chr5 111792503 111792691 + 1 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -34379 NM_001142476 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 118.333-89 chr18 43118143 43118313 + 1 NA Intergenic Intergenic -2536 NM_001272077 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 153.667-152 chr17 48756078 48756314 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -27447 NM_006361 10481 Hs.66731 NM_006361 ENSG00000159184 HOXB13 HPC9|PSGD homeobox B13 protein-coding 166.333-81 chr15 78048336 78048621 + 1 NA intron (NM_144572, intron 2 of 12) intron (NM_144572, intron 2 of 12) 29174 NM_144572 23102 Hs.567426 NM_015079 ENSG00000167202 TBC1D2B - TBC1 domain family member 2B protein-coding 158.333-161 chr2 148207891 148208085 + 1 NA intron (NM_018328, intron 3 of 14) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -186384 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 208.667-96 chr4 10981915 10982272 + 1 NA Intergenic Intergenic -297325 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 180.333-144 chr8 127133092 127133445 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -51047 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 203.667-92 chr5 31857359 31857647 + 1 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) HAL1|LINE|L1 78656 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 139.667-40 chr12 58440761 58440933 + 1 NA Intergenic Intergenic -150855 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 159.333-166 chr2 133199092 133199337 + 1 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) L1ME2|LINE|L1 -66981 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 191.333-69 chr14 87051121 87051386 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 145475 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 153.333-45 chr10 45049607 45049792 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 48776 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 178.667-120 chr4 95179975 95180228 + 1 NA intron (NM_003728, intron 14 of 15) MIR|SINE|MIR 88610 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 196.333-15 chr10 111689626 111689926 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 493989 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 200.667-103 chr22 50615213 50615626 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 12733 NM_000487 410 Hs.88251 NM_000487 ENSG00000100299 ARSA ASA|MLD arylsulfatase A protein-coding 191.667-112 chr6 140514477 140514685 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -169233 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 196.333-151 chr6 2024597 2024873 + 1 NA intron (NM_001253846, intron 4 of 10) L1MEd|LINE|L1 151256 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 141.333-206 chr6 37211968 37212291 + 1 NA TTS (NM_001286401) TTS (NM_001286401) 41977 NM_001243186 5292 Hs.81170 NM_002648 ENSG00000137193 PIM1 PIM Pim-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 157.667-108 chr15 46969220 46969402 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -214778 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 186.667-83 chr20 51469382 51469633 + 1 NA intron (NM_012340, intron 5 of 10) intron (NM_012340, intron 5 of 10) -16530 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 170.333-78 chr14 82415828 82416115 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -226661 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 140.667-14 chr1 115806703 115806902 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 33901 NM_001111061 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 168.333-58 chr14 54721738 54721985 + 1 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) intron (NM_001161576, intron 2 of 10) -32972 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 188.333-50 chr15 42309649 42309943 + 1 NA intron (NM_001301409, intron 9 of 11) AluSz|SINE|Alu 35628 NM_001301410 2595 Hs.730806 NM_198141 ENSG00000214013 GANC - glucosidase alpha, neutral C protein-coding 161.333-74 chr12 126812672 126812925 + 1 NA Intergenic Intergenic -40536 NR_033878 387895 Hs.534660 NR_033878 LINC00944 - long intergenic non-protein coding RNA 944 ncRNA 168.333-199 chr7 83932944 83933167 + 1 NA Intergenic Intergenic 261734 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 298.333-28 chr3 159864931 159865286 + 1 NA intron (NM_001197109, intron 1 of 6) intron (NM_001197109, intron 1 of 6) 25247 NM_001197109 29970 Hs.134665 NM_014575 ENSG00000151967 SCHIP1 SCHIP-1 schwannomin interacting protein 1 protein-coding 116.333-42 chr11 59921927 59922087 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -20872 NR_130719 255649 Hs.722773 NR_130719 OOSP1 - oocyte secreted protein 1 pseudo 199.667-6 chr1 113169204 113169498 + 1 NA Intergenic Intergenic 36902 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 151.333-428 chr8 121958899 121959067 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -317543 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 154.667-253 chr3 126046064 126046310 + 1 NA intron (NM_001008486, intron 2 of 10) L1M4c|LINE|L1 10588 NM_001008487 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 164.333-230 chr7 138081561 138081755 + 1 NA intron (NM_001190907, intron 1 of 7) AluSp|SINE|Alu 5199 NM_001190907 6718 Hs.201667 NM_005989 ENSG00000122787 AKR1D1 3o5bred|CBAS2|SRD5B1 aldo-keto reductase family 1 member D1 protein-coding 144.333-132 chr2 117919003 117919252 + 1 NA 3' UTR (NM_019044, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_019044, exon 24 of 24) 85396 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 198.333-153 chr5 11151469 11151818 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 11 of 20) intron (NM_001288715, intron 11 of 20) -390409 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 134.667-210 chrX 97976335 97976510 + 1 NA Intergenic Intergenic -411887 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 355.667-15 chr8 130213192 130213714 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) intron (NM_001362925, intron 5 of 29) 83080 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 113.333-111 chr18 75613157 75613319 + 1 NA Intergenic Intergenic 99165 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 181.667-29 chr12 110251361 110251635 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -29749 NM_001681 488 Hs.506759 NM_001681 ENSG00000174437 ATP2A2 ATP2B|DAR|DD|SERCA2 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 2 protein-coding 363.333-3 chr10 72789259 72789725 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 68463 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 134.333-9 chr1 209942899 209943047 + 1 NA intron (NM_153262, intron 1 of 7) intron (NM_153262, intron 1 of 7) 4756 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 203.667-131 chr8 137591886 137592225 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -178467 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 236.333-26 chr14 55559461 55559813 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 20455 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 134.333-167 chr8 49667487 49667680 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -155403 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 154.667-176 chr2 72527875 72528101 + 1 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) L1MD1|LINE|L1 298045 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 196.333-119 chr3 161823036 161823316 + 1 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie 326368 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 161.667-178 chr3 136761156 136761477 + 1 NA Intergenic Intergenic -8938 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 126.667-26 chr11 115379916 115380064 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -16766 NR_135102 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 165.667-209 chr9 29167611 29167874 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 44557 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 177.333-165 chr8 73462419 73462644 + 1 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) AluJo|SINE|Alu 42457 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 128.667-127 chr4 54392671 54392808 + 1 NA Intergenic Intergenic 59847 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 159.667-147 chr18 9202088 9202267 + 1 NA intron (NM_001204056, intron 3 of 11) intron (NM_001204056, intron 3 of 11) 64614 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 129.667-61 chr14 71545019 71545171 + 1 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) AluJo|SINE|Alu -41203 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 275.333-30 chr18 73913731 73914067 + 1 NA Intergenic Intergenic 233935 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 213.333-172 chr5 160416601 160416959 + 1 NA intron (NM_006425, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 2301 NM_001364520 10569 Hs.435342 NM_006425 ENSG00000164609 SLU7 9G8|hSlu7 SLU7 homolog, splicing factor protein-coding 211.333-46 chr12 114576724 114576984 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 107321 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 169.333-127 chr2 155788190 155788375 + 1 NA Intergenic Intergenic 466649 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 166.333-26 chr10 48366943 48367147 + 1 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) intron (NM_001323302, intron 3 of 13) -34567 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 147.333-53 chr10 116837809 116838039 + 1 NA intron (NM_001330164, intron 1 of 12) intron (NM_001330164, intron 1 of 12) -10356 NR_162126 113218494 NR_162126 MIR9851 - microRNA 9851 ncRNA 278.667-21 chr18 31795502 31795812 + 1 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 -34777 NM_001034172 147407 Hs.567708 NM_001034172 ENSG00000141437 SLC25A52 MCART2 solute carrier family 25 member 52 protein-coding 136.667-62 chr14 86724928 86725105 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -180762 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 204.667-77 chr2 166762502 166762811 + 1 NA Intergenic Intergenic -125831 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 264.667-84 chr8 67790080 67790633 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -43996 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 193.333-190 chr8 88961111 88961402 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -633773 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 135.333-52 chr14 56826899 56827043 + 1 NA intron (NR_146411, intron 2 of 2) intron (NR_146411, intron 2 of 2) 13813 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 163.333-282 chr8 82408647 82408821 + 1 NA Intergenic Intergenic -503370 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 155.667-47 chr10 119525473 119525663 + 1 NA intron (NM_001005339, intron 3 of 4) intron (NM_001005339, intron 3 of 4) 10965 NM_002925 6001 Hs.501200 NM_002925 ENSG00000148908 RGS10 - regulator of G protein signaling 10 protein-coding 250.667-54 chr4 39618769 39619146 + 1 NA intron (NM_001317896, intron 1 of 5) intron (NM_001317896, intron 1 of 5) 8164 NM_001317897 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 218.333-100 chr5 122813936 122814386 + 1 NA intron (NM_003100, intron 7 of 14) L2c|LINE|L2 -31288 NR_146145 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 370.667-8 chr11 81234222 81234839 + 1 NA Intergenic Intergenic -471727 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 186.333-139 chr6 63469271 63469479 + 1 NA Intergenic Intergenic -102637 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 152.667-18 chr1 162993758 162993993 + 1 NA Intergenic Intergenic -74731 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 132.333-26 chr10 119355137 119355388 + 1 NA intron (NM_005308, intron 2 of 15) L1M2|LINE|L1 -22710 NR_039829 100616398 NR_039829 ENSG00000265719 MIR4681 - microRNA 4681 ncRNA 155.667-32 chr10 23562080 23562392 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 122967 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 168.667-166 chr4 139510618 139510900 + 1 NA 3' UTR (NM_030648, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_030648, exon 8 of 8) 46010 NR_131339 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 160.667-229 chr4 93630920 93631113 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) MIR|SINE|MIR -197737 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 121.333-71 chr17 58804868 58805050 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1MA4A|LINE|L1 49090 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 169.333-289 chr9 92023313 92023610 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -73233 NM_001318204 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 207.333-116 chr17 62386865 62387162 + 1 NA intron (NM_001144933, intron 4 of 11) AluJo|SINE|Alu 6460 NM_173503 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 158.667-343 chr9 31505607 31505862 + 1 NA Intergenic Intergenic -124244 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 248.333-58 chr22 35962574 35962877 + 1 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) -1095 NM_001349994 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 192.333-113 chr3 42618407 42618661 + 1 NA intron (NM_001349126, intron 3 of 18) AluSz|SINE|Alu -17456 NM_001201572 9117 Hs.445892 NM_004206 ENSG00000093183 SEC22C SEC22L3 SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein protein-coding 166.667-223 chr7 111365128 111365447 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 197004 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 381.667-5 chr20 8069092 8069623 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -49596 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 255.333-102 chr7 145533416 145533885 + 1 NA Intergenic LTR52-int|LTR|ERVL -697597 NM_001350887 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 214.667-130 chrX 79328227 79328554 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 38944 NM_004867 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 150.333-439 chr9 113921884 113922094 + 1 NA intron (NM_001318042, intron 1 of 14) L1ME4a|LINE|L1 45680 NM_001318042 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 186.667-93 chr3 104679830 104680117 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -686740 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 256.333-49 chr20 34108211 34108511 + 1 NA intron (NM_003908, intron 1 of 8) intron (NM_003908, intron 1 of 8) 3882 NM_001316363 8894 Hs.429180 NM_003908 ENSG00000125977 EIF2S2 EIF2|EIF2B|EIF2beta|PPP1R67|eIF-2-beta eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta protein-coding 156.667-63 chr11 74620992 74621230 + 1 NA intron (NM_001363597, intron 7 of 11) intron (NM_001363597, intron 7 of 11) 28529 NR_046410 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 221.667-49 chr3 18699754 18700180 + 1 NA Intergenic Intergenic -254375 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 204.333-43 chr12 9804522 9804788 + 1 NA intron (NR_159359, intron 1 of 5) L1M4b|LINE|L1 4603 NR_159359 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 248.333-106 chrX 113888664 113889080 + 1 NA intron (NR_131204, intron 1 of 2) L1M3c|LINE|L1 49346 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 183.333-91 chr20 155981 156372 + 1 NA Intergenic Intergenic -1278 NM_139074 140850 Hs.99362 NM_139074 ENSG00000088782 DEFB127 C20orf73|DEF-27|DEFB-27|DEFB27|bA530N10.2|hBD-27 defensin beta 127 protein-coding 246.667-36 chr17 29887049 29887385 + 1 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) intron (NM_001282129, intron 1 of 15) -42686 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 204.333-190 chr7 103329134 103329421 + 1 NA intron (NM_001362668, intron 3 of 17) MIR|SINE|MIR 15490 NM_014377 27000 Hs.558476 NM_014377 ENSG00000105821 DNAJC2 MPHOSPH11|MPP11|ZRF1|ZUO1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2 protein-coding 205.333-254 chr8 134789959 134790396 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 10430 NR_029666 407030 NR_029666 ENSG00000207582 MIR30B MIRN30B|mir-30b microRNA 30b ncRNA 182.667-167 chr9 69660766 69661021 + 1 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) intron (NM_001163, intron 1 of 12) 11478 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 201.667-108 chr6 141109762 141110068 + 1 NA Intergenic Intergenic 426101 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 213.333-53 chr14 21980695 21980996 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -309828 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 220.333-11 chr10 18250469 18250771 + 1 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) -10102 NM_001330060 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 204.333-162 chr5 75051762 75051993 + 1 NA intron (NM_001366737, intron 2 of 3) intron (NM_001366737, intron 2 of 3) 681 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 163.333-290 chr8 124717841 124718093 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 1 of 14) intron (NM_001282971, intron 1 of 14) 10506 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 161.333-69 chr12 71107146 71107327 + 1 NA Intergenic Intergenic 50573 NM_001369760 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 309.667-23 chr5 175501713 175502190 + 1 NA intron (NM_001322982, intron 2 of 10) LTR8|LTR|ERV1 23391 NM_001322977 94081 Hs.369440 NM_022754 ENSG00000164466 SFXN1 SLC56A1|TCC sideroflexin 1 protein-coding 226.333-118 chrX 77440991 77441304 + 1 NA Intergenic Intergenic -6242 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 161.667-23 chr1 219031931 219032113 + 1 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -113511 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 152.333-369 chr8 52496959 52497168 + 1 NA Intergenic Intergenic 68367 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 165.667-78 chr18 3494298 3494577 + 1 NA Intergenic Intergenic 28187 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 216.667-47 chr18 1189093 1189482 + 1 NA Intergenic Intergenic 170342 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 238.667-77 chr6 28014649 28014933 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 57550 NM_012367 26212 Hs.532145 NM_012367 ENSG00000124657 OR2B6 OR2B1|OR2B1P|OR2B5|OR2B6P|OR5-40|OR5-41|OR6-31|dJ408B20.2 olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 protein-coding 152.333-99 chr14 22299088 22299300 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 133559 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 174.667-101 chr20 33721840 33722032 + 1 NA Intergenic Intergenic -1626 NM_007238 11264 Hs.654857 NM_007238 ENSG00000101417 PXMP4 PMP24 peroxisomal membrane protein 4 protein-coding 243.667-57 chr4 103270911 103271228 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -72726 NM_001286734 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 164.333-171 chr4 33595946 33596264 + 1 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 443788 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 280.667-6 chr1 103896961 103897396 + 1 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? 147337 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 153.667-274 chr3 189097970 189098154 + 1 NA Intergenic Intergenic -73909 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 154.667-29 chr1 214655594 214655804 + 1 NA intron (NM_016343, intron 17 of 19) AluJb|SINE|Alu 52504 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 118.333-67 chr14 78308779 78308934 + 1 NA intron (NR_073547, intron 4 of 20) intron (NR_073547, intron 4 of 20) -94863 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 151.667-389 chr9 37324343 37324594 + 1 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) intron (NR_110317, intron 4 of 7) -98228 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 333.667-17 chr6 52717500 52717921 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 27449 NR_033760 730152 Hs.739662 NR_033760 GSTA7P GSTAP2|GSTAP6 glutathione S-transferase alpha 7, pseudogene pseudo 185.667-111 chr6 144420591 144420938 + 1 NA intron (NM_007124, intron 2 of 73) intron (NM_007124, intron 2 of 73) 15109 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 278.333-52 chrX 50937445 50937994 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 26984 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 204.667-19 chr10 110721761 110722072 + 1 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 77580 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 201.667-21 chr12 7442749 7442972 + 1 NA intron (NM_001297650, intron 1 of 19) intron (NM_001297650, intron 1 of 19) 1325 NM_174941 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 164.667-93 chr18 3156348 3156611 + 1 NA intron (NM_019856, intron 10 of 36) intron (NM_019856, intron 10 of 36) 63489 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 164.333-37 chr10 124839136 124839363 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 37430 NM_032182 23172 Hs.280695 NM_032182 ENSG00000165660 ABRAXAS2 ABRO1|FAM175B|KIAA0157 abraxas 2, BRISC complex subunit protein-coding 112.333-174 chr4 27024468 27024612 + 1 NA 3' UTR (NM_020860, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_020860, exon 12 of 12) 163699 NM_001169118 57620 Hs.744950 NM_020860 ENSG00000109689 STIM2 - stromal interaction molecule 2 protein-coding 215.333-100 chr2 178219541 178219794 + 1 NA intron (NM_001201480, intron 1 of 25) intron (NM_001201480, intron 1 of 25) 25155 NM_001201480 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 167.333-155 chr20 51427946 51428121 + 1 NA intron (NM_012340, intron 9 of 10) L2a|LINE|L2 24944 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 143.333-208 chr4 88831423 88831591 + 1 NA intron (NM_014883, intron 7 of 23) intron (NM_014883, intron 7 of 23) -8146 NM_001265579 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 205.667-4 chr1 54795182 54795563 + 1 NA intron (NM_001114108, intron 1 of 6) intron (NM_001114108, intron 1 of 6) 5951 NM_017904 55001 Hs.16230 NM_017904 ENSG00000006555 TTC22 - tetratricopeptide repeat domain 22 protein-coding 190.667-118 chr6 105162177 105162475 + 1 NA intron (NM_022361, intron 1 of 3) intron (NM_022361, intron 1 of 3) 13929 NR_024539 64208 Hs.458336 NM_022361 ENSG00000132429 POPDC3 POP3|bA355M14.1 popeye domain containing 3 protein-coding 415.333-11 chr6 74855091 74855697 + 1 NA Intergenic Intergenic 273388 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 150.333-149 chr16 72998833 72999109 + 1 NA intron (NM_006885, intron 1 of 9) intron (NM_006885, intron 1 of 9) 49157 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 152.333-257 chr3 196595860 196596116 + 1 NA Intergenic Intergenic -27314 NM_001345911 348793 Hs.385865 NM_182627 ENSG00000185798 WDR53 - WD repeat domain 53 protein-coding 173.667-106 chr3 35259225 35259479 + 1 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L1MDa|LINE|L1 134671 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 148.333-276 chr4 37851126 37851415 + 1 NA intron (NM_018290, intron 12 of 13) MER5A|DNA|hAT-Charlie 24584 NM_018290 55276 Hs.23363 NM_018290 ENSG00000169299 PGM2 MSTP006 phosphoglucomutase 2 protein-coding 198.333-21 chr10 18179799 18180089 + 1 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) 39520 NM_201572 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 356.333-17 chr2 34344617 34345452 + 1 NA Intergenic Intergenic 277808 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 164.333-224 chr7 39582622 39582841 + 1 NA intron (NM_001282446, intron 2 of 2) intron (NM_001282446, intron 2 of 2) 16327 NM_001282446 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 201.667-63 chr20 14118186 14118394 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 122774 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 156.667-323 chr7 90301395 90301594 + 1 NA intron (NM_001039706, intron 17 of 22) L1PREC2|LINE|L1 -33729 NR_110085 101927446 Hs.734999 NR_110085 ENSG00000105793 LOC101927446 - uncharacterized LOC101927446 ncRNA 185.667-4 chr1 190596341 190596701 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -28369 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 148.667-94 chr12 42620035 42620305 + 1 NA intron (NR_110042, intron 5 of 5) LTR49-int|LTR|ERV1 26328 NR_110042 101927058 Hs.434238 NR_110042 ENSG00000257510 LINC02402 - long intergenic non-protein coding RNA 2402 ncRNA 159.667-238 chr4 105803666 105803886 + 1 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) L1ME3E|LINE|L1 23396 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 146.333-345 chr9 683257 683539 + 1 NA intron (NM_001354333, intron 2 of 11) intron (NM_001354333, intron 2 of 11) -3369 NM_001354336 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 120.333-122 chr22 28397559 28397692 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -62244 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 172.333-179 chr8 79691554 79691826 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 74785 NM_001282851 23462 Hs.234434 NM_012258 ENSG00000164683 HEY1 BHLHb31|CHF2|HERP2|HESR1|HRT-1|NERP2|OAF1|hHRT1 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1 protein-coding 303.667-14 chr3 45667671 45668078 + 1 NA intron (NM_014240, intron 3 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie 21008 NR_033947 644714 Hs.712889 NR_033947 LIMD1-AS1 - LIMD1 antisense RNA 1 ncRNA 143.667-87 chr15 88965892 88966077 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -52605 NM_005928 4240 Hs.3745 NM_005928 ENSG00000140545 MFGE8 BA46|EDIL1|HMFG|HsT19888|MFG-E8|MFGM|OAcGD3S|SED1|SPAG10|hP47 milk fat globule-EGF factor 8 protein protein-coding 240.667-83 chr8 118241885 118242196 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu -130221 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 127.667-25 chr11 9144665 9144919 + 1 NA intron (NR_145966, intron 18 of 21) AluSx|SINE|Alu 50429 NR_027713 283102 Hs.689472 NR_027713 ENSG00000213538 KRT8P41 - keratin 8 pseudogene 41 pseudo 240.333-15 chr10 74991794 74992080 + 1 NA intron (NM_001370144, intron 11 of 15) L3b|LINE|CR1 -29796 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 206.333-164 chr8 99080458 99080687 + 1 NA intron (NR_047582, intron 4 of 8) L1M5|LINE|L1 67306 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 112.667-70 chr14 74314261 74314393 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -11393 NM_001353601 5826 Hs.94395 NM_005050 ENSG00000119688 ABCD4 ABC41|EST352188|MAHCJ|P70R|P79R|PMP69|PXMP1L ATP binding cassette subfamily D member 4 protein-coding 159.333-359 chrX 10096902 10097169 + 1 NA intron (NM_015691, intron 7 of 22) AluJo|SINE|Alu -59910 NM_001256944 1183 Hs.495674 NM_001830 ENSG00000073464 CLCN4 CLC4|ClC-4|ClC-4A|MRX15|MRX49|MRXSRC chloride voltage-gated channel 4 protein-coding 150.333-435 chr9 36957254 36957480 + 1 NA intron (NR_104000, intron 6 of 9) intron (NR_104000, intron 6 of 9) -63836 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 204.667-110 chr4 94007595 94007988 + 1 NA Intergenic Intergenic 179038 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 118.333-106 chr2 72318925 72319085 + 1 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) L1ME4c|LINE|L1 -171143 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 258.333-75 chr9 28121016 28121472 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -547378 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 150.667-311 chr5 100039099 100039380 + 1 NA Intergenic Intergenic 349015 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 148.333-146 chr15 89214516 89214746 + 1 NA intron (NM_000326, intron 6 of 8) intron (NM_000326, intron 6 of 8) 6948 NM_000326 6017 Hs.1933 NM_000326 ENSG00000140522 RLBP1 CRALBP retinaldehyde binding protein 1 protein-coding 115.333-58 chr13 45960763 45960955 + 1 NA intron (NM_001330566, intron 18 of 19) intron (NM_001330566, intron 18 of 19) 91887 NM_001076788 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 139.333-123 chr2 195219962 195220171 + 1 NA Intergenic Intergenic -436892 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 245.333-127 chr9 27568832 27569149 + 1 NA intron (NM_145005, intron 1 of 4) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 4491 NM_018325 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 131.333-150 chr5 167247207 167247442 + 1 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) intron (NM_001122679, intron 1 of 29) -78923 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 159.667-298 chr7 41520261 41520456 + 1 NA Intergenic Intergenic -173561 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 123.667-44 chr12 18505676 18505915 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 24 of 32) intron (NM_001288774, intron 24 of 32) 231714 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 152.667-290 chr5 23899882 23900040 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -51387 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 199.333-27 chr10 72407810 72408128 + 1 NA exon (NM_001363513, exon 11 of 13) exon (NM_001363513, exon 11 of 13) -53050 NM_001002762 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 156.333-352 chr8 25310078 25310339 + 1 NA intron (NM_024940, intron 12 of 51) intron (NM_024940, intron 12 of 51) -35194 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 193.333-142 chr4 114396916 114397124 + 1 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -201382 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 140.667-159 chr4 36863235 36863465 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -138429 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 146.333-355 chr9 109241037 109241244 + 1 NA 3' UTR (NM_018424, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_018424, exon 16 of 16) -73849 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 151.667-317 chr6 100168431 100168727 + 1 NA Intergenic Intergenic -174341 NM_032503 84539 Hs.591342 NM_032503 ENSG00000152034 MCHR2 GPR145|GPRv17|MCH-2R|MCH-R2|MCH2|MCH2R|MCHR-2|SLT melanin concentrating hormone receptor 2 protein-coding 263.667-72 chr6 71505750 71506176 + 1 NA Intergenic Intergenic 84936 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 209.667-121 chr9 88584459 88584789 + 1 NA Intergenic Intergenic 49446 NM_145283 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 157.333-98 chr13 59777400 59777657 + 1 NA intron (NM_001258369, intron 25 of 26) L1MC4|LINE|L1 -235190 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 210.333-134 chr5 58881203 58881519 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 118537 NM_001197223 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 133.333-200 chr9 105335035 105335276 + 1 NA intron (NM_001330731, intron 3 of 15) intron (NM_001330731, intron 3 of 15) 90504 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 210.333-131 chr5 37827008 37827402 + 1 NA intron (NM_001278098, intron 1 of 2) L1MC4|LINE|L1 7617 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 407.667-8 chr2 125965508 125966269 + 1 NA Intergenic Intergenic 152097 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 152.667-162 chr19 49620074 49620240 + 1 NA intron (NM_020719, intron 9 of 13) L2b|LINE|L2 19986 NM_006270 6237 Hs.515536 NM_006270 ENSG00000126458 RRAS R-Ras RAS related protein-coding 179.667-76 chr2 38461337 38461636 + 1 NA intron (NR_110259, intron 4 of 4) L1ME4a|LINE|L1 30192 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 144.333-149 chr20 54712772 54712947 + 1 NA Intergenic Intergenic 237266 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 246.333-73 chr5 39184737 39185041 + 1 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) (AATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 34674 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 171.333-153 chr5 94858355 94858643 + 1 NA intron (NM_001002796, intron 17 of 22) intron (NM_001002796, intron 17 of 22) 223367 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 286.667-10 chr12 130940370 130940883 + 1 NA Intergenic Intergenic -13281 NM_001330497 283383 Hs.719239 NM_198827 ENSG00000111452 ADGRD1 GPR133|PGR25 adhesion G protein-coupled receptor D1 protein-coding 175.333-206 chr9 97376074 97376295 + 1 NA intron (NM_020893, intron 36 of 36) intron (NM_020893, intron 36 of 36) -12503 NR_031637 100302223 NR_031637 ENSG00000221269 MIR1302-8 MIRN1302-8|hsa-mir-1302-8 microRNA 1302-8 ncRNA 149.333-25 chr1 161340189 161340359 + 1 NA intron (NR_103459, intron 4 of 6) AluSg4|SINE|Alu 25893 NR_103459 6391 Hs.444472 NM_003001 ENSG00000143252 SDHC CYB560|CYBL|PGL3|QPS1|SDH3 succinate dehydrogenase complex subunit C protein-coding 147.667-202 chr20 20447831 20447983 + 1 NA intron (NM_020343, intron 37 of 39) intron (NM_020343, intron 37 of 39) 79803 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 184.333-154 chr8 117875761 117876097 + 1 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 44984 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 115.667-101 chr17 80759421 80759599 + 1 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) intron (NM_020761, intron 6 of 33) 46122 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 147.667-177 chr2 88462880 88463040 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -10267 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 114.333-132 chr20 35652188 35652381 + 1 NA 3' UTR (NM_001198840, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001198840, exon 2 of 2) 1625 NM_003915 8904 Hs.246413 NM_003915 ENSG00000214078 CPNE1 COPN1|CPN1 copine 1 protein-coding 187.667-46 chr14 68302024 68302316 + 1 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) L2b|LINE|L2 326617 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 181.333-49 chr15 43018136 43018363 + 1 NA intron (NM_174916, intron 27 of 46) AluY|SINE|Alu 87789 NM_174916 197131 Hs.591121 NM_174916 ENSG00000159459 UBR1 JBS ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 protein-coding 170.333-217 chr8 53892560 53892751 + 1 NA intron (NR_104579, intron 1 of 3) intron (NR_104579, intron 1 of 3) 11783 NR_104578 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 142.667-34 chr11 92420642 92420822 + 1 NA intron (NM_001008781, intron 1 of 24) intron (NM_001008781, intron 1 of 24) 68636 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 162.333-259 chr8 110463120 110463343 + 1 NA Intergenic Intergenic -487460 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 163.667-65 chr14 89350393 89350662 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 3 of 6) intron (NM_001085471, intron 3 of 6) 66706 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 265.667-67 chr7 53587770 53588093 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 224000 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 225.667-82 chr9 1451473 1451881 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 400190 NM_001370532 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 146.333-240 chr4 117422804 117422954 + 1 NA Intergenic Intergenic -5519 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 155.333-300 chr5 83859363 83859604 + 1 NA Intergenic Intergenic -138628 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 156.333-29 chr10 7958091 7958331 + 1 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) intron (NM_031923, intron 2 of 6) 94280 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 140.667-193 chr6 12506977 12507180 + 1 NA Intergenic Intergenic 78326 NR_149140 101928309 Hs.639414 NR_149140 ENSG00000234015 LINC02530 - long intergenic non-protein coding RNA 2530 ncRNA 127.667-115 chr3 65284358 65284528 + 1 NA Intergenic Intergenic -596443 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 172.333-87 chr2 150672052 150672341 + 1 NA Intergenic Intergenic 43299 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 187.667-45 chr14 66938079 66938405 + 1 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) LTR37-int|LTR|ERV1 -251198 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 258.667-51 chr2 200802727 200803053 + 1 NA intron (NR_110275, intron 1 of 3) L1MB3|LINE|L1 -8656 NM_014670 9689 Hs.355983 NM_014670 ENSG00000082153 BZW1 BZAP45|Nbla10236 basic leucine zipper and W2 domains 1 protein-coding 157.667-290 chr7 14351016 14351227 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -359696 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 113.667-131 chr3 1312011 1312169 + 1 NA intron (NM_001349359, intron 6 of 20) L1ME4a|LINE|L1 219066 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 153.667-103 chr12 121345091 121345277 + 1 NA intron (NM_001137559, intron 4 of 16) L2a|LINE|L2 7227 NM_016237 51433 Hs.7101 NM_016237 ENSG00000089053 ANAPC5 APC5 anaphase promoting complex subunit 5 protein-coding 246.667-21 chr12 38491441 38491729 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 174811 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 281.333-56 chr6 61784025 61784392 + 1 NA intron (NR_146874, intron 6 of 13) intron (NR_146874, intron 6 of 13) 210078 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 122.667-43 chr14 45938540 45938810 + 1 NA Intergenic Intergenic -125484 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 140.667-163 chr4 63869083 63869360 + 1 NA Intergenic Intergenic 540229 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 134.667-65 chr14 75449636 75449784 + 1 NA intron (NM_130469, intron 2 of 3) intron (NM_130469, intron 2 of 3) 17576 NM_001135049 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 117.667-57 chr15 80539397 80539589 + 1 NA intron (NM_014862, intron 8 of 18) L1M5|LINE|L1 23451 NR_120363 101929586 Hs.569426 NR_120363 ENSG00000259175 LOC101929586 - uncharacterized LOC101929586 ncRNA 261.667-62 chr5 94188939 94189436 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) L1ME1|LINE|L1 -77488 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 153.667-37 chr10 24691031 24691229 + 1 NA intron (NM_001367447, intron 2 of 24) intron (NM_001367447, intron 2 of 24) 31618 NM_001367454 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 151.333-246 chr20 35891003 35891173 + 1 NA intron (NM_016436, intron 9 of 17) intron (NM_016436, intron 9 of 17) 63538 NM_033630 51282 Hs.584909 NM_016558 ENSG00000171222 SCAND1 RAZ1|SDP1 SCAN domain containing 1 protein-coding 162.667-151 chr2 233052035 233052248 + 1 NA Intergenic Intergenic -8201 NM_005541 3635 Hs.262886 NM_005541 ENSG00000168918 INPP5D SHIP|SHIP-1|SHIP1|SIP-145|hp51CN|p150Ship inositol polyphosphate-5-phosphatase D protein-coding 159.333-25 chr1 197776705 197776995 + 1 NA Intergenic Intergenic -1370 NM_001195215 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 138.333-67 chr14 83755348 83755608 + 1 NA Intergenic Intergenic 1112846 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 203.333-253 chr8 13596266 13596640 + 1 NA intron (NM_001348082, intron 1 of 16) intron (NM_001348082, intron 1 of 16) 8167 NM_001348082 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 156.667-175 chr2 42018144 42018328 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -29785 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 126.333-75 chr18 56948270 56948480 + 1 NA intron (NM_015285, intron 25 of 27) intron (NM_015285, intron 25 of 27) 123744 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 150.333-239 chr20 58274989 58275163 + 1 NA intron (NR_003505, intron 3 of 16) L1MB8|LINE|L1 34363 NR_003505 55370 Hs.473179 NM_018498 PPP4R1L C20orf192|PPP4R1P1|PRO1085 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 like (pseudogene) pseudo 158.333-50 chr11 20409716 20409946 + 1 NA intron (NM_005788, intron 9 of 15) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 22115 NM_005788 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 196.333-82 chr2 40072152 40072436 + 1 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) L1PA13|LINE|L1 154660 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-284 chr8 99672728 99672903 + 1 NA intron (NM_017890, intron 35 of 61) L1MA9|LINE|L1 -135954 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 125.667-58 chr14 50685879 50686007 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -17637 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 156.333-203 chr20 19898529 19898723 + 1 NA intron (NM_001242581, intron 2 of 11) LTR37B|LTR|ERV1 9060 NM_018993 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 150.333-237 chr20 57565782 57565952 + 1 NA 3' UTR (NM_002591, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_002591, exon 10 of 10) 4757 NM_002591 5105 Hs.1872 NM_002591 ENSG00000124253 PCK1 PCKDC|PEPCK-C|PEPCK1|PEPCKC phosphoenolpyruvate carboxykinase 1 protein-coding 308.333-34 chr7 21450304 21450783 + 1 NA intron (NM_003112, intron 3 of 5) intron (NM_003112, intron 3 of 5) -20515 NR_031594 100302122 NR_031594 ENSG00000221783 MIR1183 MIRN1183|hsa-mir-1183 microRNA 1183 ncRNA 195.667-154 chr9 69207890 69208206 + 1 NA intron (NM_001170416, intron 1 of 22) L2a|LINE|L2 2893 NM_001369875 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 133.333-189 chr8 126190649 126190835 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -134753 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 167.333-96 chr15 91433646 91433906 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -29563 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 175.667-100 chr3 117071472 117071704 + 1 NA Intergenic Intergenic 150157 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 337.667-17 chr3 55177229 55177652 + 1 NA promoter-TSS (NR_147142) promoter-TSS (NR_147142) -732 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 361.333-16 chr3 96041313 96041781 + 1 NA Intergenic Intergenic -318417 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 141.667-8 chr1 99587344 99587547 + 1 NA intron (NR_031666, intron 1 of 4) MER41-int|LTR|ERV1 -58668 NM_017734 54873 Hs.483993 NM_017734 ENSG00000099260 PALMD C1orf11|PALML palmdelphin protein-coding 210.667-122 chr7 133924098 133924594 + 1 NA intron (NM_021807, intron 13 of 17) intron (NM_021807, intron 13 of 17) -99458 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 248.333-5 chr1 105421541 105421933 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 197198 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 253.667-2 chr1 43711457 43711828 + 1 NA intron (NR_125986, intron 3 of 3) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 4106 NM_174971 6487 Hs.597915 NM_006279 ENSG00000126091 ST3GAL3 EIEE15|MRT12|SIAT6|ST3GALII|ST3Gal III|ST3GalIII|ST3N ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 3 protein-coding 226.667-82 chr7 6657878 6658183 + 1 NA 3' UTR (NM_001278559, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001278559, exon 9 of 9) 20712 NM_001278559 100131017 Hs.112668 NM_001278559 ENSG00000205903 ZNF316 MZF-3 zinc finger protein 316 protein-coding 418.667-2 chr12 15007681 15008111 + 1 NA Intergenic Intergenic 6063 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 387.667-12 chr5 133145145 133145773 + 1 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger 93446 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 161.667-268 chr9 8921857 8922090 + 1 NA intron (NM_002839, intron 11 of 45) intron (NM_002839, intron 11 of 45) 63955 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 179.667-117 chr6 43135676 43135930 + 1 NA intron (NM_152881, intron 7 of 16) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -35466 NM_003131 6722 Hs.520140 NM_003131 ENSG00000112658 SRF MCM1 serum response factor protein-coding 152.667-61 chr11 75233914 75234108 + 1 NA Intergenic Intergenic -6763 NM_001195528 100507050 Hs.577323 NM_001195528 ENSG00000261594 TPBGL - trophoblast glycoprotein like protein-coding 125.667-114 chr22 30145954 30146103 + 1 NA intron (NM_001329457, intron 11 of 11) L1ME2|LINE|L1 65564 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 127.333-143 chr5 123623873 123624150 + 1 NA Intergenic Intergenic 78594 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 172.333-40 chr12 52913098 52913445 + 1 NA intron (NM_001256293, intron 1 of 8) intron (NM_001256293, intron 1 of 8) -8195 NM_002273 3856 Hs.533782 NM_002273 ENSG00000170421 KRT8 CARD2|CK-8|CK8|CYK8|K2C8|K8|KO keratin 8 protein-coding 228.333-66 chr4 27774480 27774795 + 1 NA Intergenic Intergenic 557158 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 173.333-212 chr9 35928293 35928638 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 18975 NM_001348107 158376 Hs.302677 NM_001348107 ENSG00000235387 SPAAR LINC00961|SPAR small regulatory polypeptide of amino acid response protein-coding 222.333-98 chr9 29269033 29269504 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -55667 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 188.667-155 chr8 138584042 138584331 + 1 NA Intergenic Intergenic -86456 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 178.333-92 chr20 20788589 20788807 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -76054 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 140.333-95 chr19 56364623 56364889 + 1 NA intron (NM_001322072, intron 1 of 6) L1ME2|LINE|L1 -3343 NR_003127 147947 Hs.467326 NM_194319 ENSG00000240225 ZNF542P ZNF542 zinc finger protein 542, pseudogene pseudo 200.667-134 chr6 38807449 38807854 + 1 NA exon (NM_001206927, exon 24 of 93) exon (NM_001206927, exon 24 of 93) 92340 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 133.667-8 chr1 152626538 152626771 + 1 NA Intergenic Intergenic -3551 NM_178431 353142 Hs.553714 NM_178431 ENSG00000185962 LCE3A LEP13 late cornified envelope 3A protein-coding 142.333-229 chr7 112246832 112247050 + 1 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) LTR56|LTR|ERV1 40246 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 211.667-4 chr1 50653703 50654163 + 1 NA intron (NM_007051, intron 8 of 18) AluSq10|SINE|Alu -230490 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 155.667-394 chr9 137951687 137951922 + 1 NA intron (NM_001243812, intron 6 of 45) intron (NM_001243812, intron 6 of 45) -4744 NR_132977 105376331 NR_132977 LOC105376331 - uncharacterized LOC105376331 ncRNA 217.667-73 chr5 52786243 52786502 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1544 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 144.667-71 chr13 67044056 67044231 + 1 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) intron (NM_001318372, intron 2 of 4) 53257 NR_046637 100874087 Hs.606903 NR_046637 ENSG00000233840 PCDH9-AS4 - PCDH9 antisense RNA 4 ncRNA 197.333-44 chr12 3933229 3933498 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -59915 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 161.667-276 chr9 112234169 112234468 + 1 NA intron (NM_001244896, intron 7 of 12) intron (NM_001244896, intron 7 of 12) -59021 NM_001282640 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 158.333-354 chrX 101885001 101885181 + 1 NA intron (NM_001282401, intron 8 of 8) intron (NM_001282401, intron 8 of 8) -27514 NR_159739 55998 Hs.307077 NM_032946 ENSG00000126952 NXF5 - nuclear RNA export factor 5 protein-coding 134.667-70 chr15 56753903 56754118 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -19924 NM_001002843 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 158.333-62 chr12 15621765 15621995 + 1 NA intron (NM_004447, intron 20 of 20) intron (NM_004447, intron 20 of 20) 75269 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 137.667-175 chr7 37791836 37792107 + 1 NA Intergenic SATR2|Satellite|Satellite -56626 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 267.333-26 chr12 100655787 100656103 + 1 NA Intergenic Intergenic 62327 NM_001303131 283431 Hs.20575 NM_174942 ENSG00000139354 GAS2L3 G2L3 growth arrest specific 2 like 3 protein-coding 219.333-83 chr18 75583589 75583849 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 128684 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 207.667-35 chr14 101857482 101857860 + 1 NA intron (NM_001161725, intron 4 of 15) intron (NM_001161725, intron 4 of 15) 47808 NM_001352912 5527 Hs.368264 NM_002719 ENSG00000078304 PPP2R5C B56G|B56gamma|PR61G protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma protein-coding 210.667-34 chr12 77124480 77124816 + 1 NA Intergenic Intergenic -59079 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 160.333-100 chr14 55189623 55189837 + 1 NA intron (NM_001146015, intron 1 of 19) MER21B|LTR|ERVL 1855 NM_014750 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 153.333-203 chr2 82513348 82513585 + 1 NA Intergenic Intergenic -343337 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 194.333-157 chr8 135016996 135017332 + 1 NA Intergenic Intergenic 167229 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 316.333-26 chr7 35571593 35572094 + 1 NA Intergenic Intergenic 123292 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 215.333-214 chr9 96721751 96722057 + 1 NA Intergenic Intergenic -3917 NR_026792 441455 Hs.229613 NR_026792 LOC441455 - makorin ring finger protein 1 pseudogene pseudo 130.667-205 chr9 31669775 31670019 + 1 NA Intergenic Intergenic -288407 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 150.333-236 chr20 53979850 53980068 + 1 NA intron (NM_003657, intron 7 of 11) intron (NM_003657, intron 7 of 11) 79061 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 148.667-114 chr14 49515853 49516071 + 1 NA Intergenic Intergenic 70418 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 175.333 chr1 23114025 23114237 + 1 NA intron (NM_033631, intron 1 of 4) intron (NM_033631, intron 1 of 4) 54725 NM_033631 7798 Hs.257900 NM_033631 ENSG00000169641 LUZP1 LUZP leucine zipper protein 1 protein-coding 158.667-29 chr1 218044558 218044849 + 1 NA intron (NR_110794, intron 1 of 3) intron (NR_110794, intron 1 of 3) 1198 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 351.667 chr10 69999072 69999519 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -53551 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 121.333-20 chr10 58613242 58613460 + 1 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) 100479 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 157.333-94 chr12 116007899 116008124 + 1 NA intron (NM_015335, intron 10 of 30) MIR|SINE|MIR 140643 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 151.333-122 chr14 33277135 33277380 + 1 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) MIR3|SINE|MIR 338378 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 116.333-23 chr1 220257433 220257651 + 1 NA intron (NM_012414, intron 1 of 34) L1PA11|LINE|L1 10173 NR_001587 6791 Hs.654849 NR_001587 AURKAP1 AURKAPS1|AurAps1|STK6P aurora kinase A pseudogene 1 pseudo 298.333-35 chr5 16863150 16863615 + 1 NA intron (NM_012334, intron 2 of 40) intron (NM_012334, intron 2 of 40) 72906 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 190.667-162 chrX 69337794 69338050 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 158365 NR_103715 100996279 NR_103715 ENSG00000215162 LINC00269 CXorf62|NCRNA00269 long intergenic non-protein coding RNA 269 ncRNA 350.333-7 chr16 68718278 68718724 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -18791 NM_004360 999 Hs.461086 NM_004360 ENSG00000039068 CDH1 Arc-1|BCDS1|CD324|CDHE|ECAD|LCAM|UVO cadherin 1 protein-coding 146.667-130 chr17 28383379 28383570 + 1 NA intron (NM_015077, intron 2 of 8) intron (NM_015077, intron 2 of 8) 11780 NM_015077 23098 Hs.743510 NM_015077 ENSG00000004139 SARM1 MyD88-5|SAMD2|SARM sterile alpha and TIR motif containing 1 protein-coding 160.667-75 chr12 56001606 56001861 + 1 NA intron (NM_000456, intron 3 of 5) MIRb|SINE|MIR 4457 NM_000456 6821 Hs.558403 NM_000456 ENSG00000139531 SUOX - sulfite oxidase protein-coding 292.333-24 chr2 138284646 138285009 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 182943 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 146.667-36 chr10 53619069 53619361 + 1 NA Intergenic Intergenic -847515 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 230.667-91 chr8 119216009 119216355 + 1 NA intron (NR_149111, intron 1 of 1) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 7819 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 154.333-184 chr20 44226167 44226461 + 1 NA TTS (NR_038339) TTS (NR_038339) 15228 NR_038337 100505783 Hs.159049 NR_038337 ENSG00000223891 OSER1-DT OSER1-AS1 OSER1 divergent transcript ncRNA 260.333-14 chr13 55003132 55003519 + 1 NA Intergenic Intergenic -171129 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 201.667-17 chr11 81392011 81392239 + 1 NA Intergenic Intergenic 498711 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 162.667-198 chr4 92782039 92782282 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 477761 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 163.333-117 chr16 83562550 83562752 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) intron (NM_001220489, intron 6 of 12) 54305 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 157.667 chr1 23326665 23326936 + 1 NA intron (NM_001297622, intron 3 of 8).2 intron (NM_001297622, intron 3 of 8).2 17484 NM_001102398 10236 Hs.373763 NM_005826 ENSG00000125944 HNRNPR HNRPR|hnRNP-R heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R protein-coding 176.667-137 chr7 56525409 56525666 + 1 NA Intergenic Intergenic 12593 NR_108099 101928401 Hs.385614 NR_108099 ENSG00000233288 LOC101928401 - uncharacterized LOC101928401 ncRNA 371.667-2 chr13 40080270 40080759 + 1 NA Intergenic Intergenic -101295 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 258.667-20 chr11 55057783 55058093 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -204217 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 147.333-221 chr3 120773781 120773981 + 1 NA intron (NM_005513, intron 3 of 4) intron (NM_005513, intron 3 of 4) 31137 NM_005513 2960 Hs.445272 NM_005513 ENSG00000153767 GTF2E1 FE|TF2E1|TFIIE-A general transcription factor IIE subunit 1 protein-coding 158.333-60 chr12 12828351 12828591 + 1 NA intron (NM_201224, intron 10 of 10) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 15125 NM_201224 51202 Hs.719938 NM_016355 ENSG00000213782 DDX47 E4-DBP|HQ0256|MSTP162|RRP3 DEAD-box helicase 47 protein-coding 205.667-12 chr1 199120473 199120815 + 1 NA Intergenic Intergenic -27954 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 138.333-208 chr9 74554388 74554622 + 1 NA intron (NM_006914, intron 1 of 9) intron (NM_006914, intron 1 of 9) -55952 NR_125791 103752585 Hs.635501 NR_125791 RORB-AS1 - RORB antisense RNA 1 ncRNA 220.333-42 chr15 100815489 100815780 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -34118 NR_160703 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 144.667-287 chr7 106751837 106752113 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -90817 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 138.333-185 chr7 92511092 92511298 + 1 NA intron (NM_001282677, intron 7 of 22) AluJb|SINE|Alu 17325 NM_001282678 5189 Hs.164682 NM_000466 ENSG00000127980 PEX1 HMLR1|PBD1A|PBD1B|ZWS|ZWS1 peroxisomal biogenesis factor 1 protein-coding 313.667-28 chr20 38037894 38038413 + 1 NA intron (NM_021215, intron 1 of 6) intron (NM_021215, intron 1 of 6) 4407 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 152.333-283 chr4 126107505 126107792 + 1 NA Intergenic Intergenic 600389 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 246.333-8 chr1 184313792 184314356 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -72955 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 115.333-102 chr18 43253267 43253450 + 1 NA Intergenic Intergenic 24132 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 152.667-121 chr15 42219661 42219890 + 1 NA intron (NM_015497, intron 16 of 19) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -11471 NM_015289 23339 Hs.88025 NM_015289 ENSG00000166887 VPS39 TLP|VAM6|hVam6p VPS39 subunit of HOPS complex protein-coding 156.667-66 chr11 84215135 84215420 + 1 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) intron (NM_001142700, intron 1 of 19) 58003 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 115.667-144 chr3 22687292 22687439 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 515213 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 156.667-109 chr14 67949772 67949949 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 126268 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 156.333-243 chr3 110931820 110932132 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 137983 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 209.667-41 chr14 20095069 20095411 + 1 NA Intergenic Intergenic -22228 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 116.667-54 chr14 54102754 54102906 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -145939 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 178.667-129 chr5 53490590 53490898 + 1 NA Intergenic Intergenic 10115 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 134.667-114 chr20 13517529 13517746 + 1 NA intron (NR_136631, intron 10 of 13) intron (NR_136631, intron 10 of 13) 121295 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 184.333-147 chr8 10783380 10783566 + 1 NA intron (NM_001284356, intron 5 of 5) intron (NM_001284356, intron 5 of 5) 41970 NR_031711 100302166 NR_031711 ENSG00000283210 MIR1322 MIRN1322|hsa-mir-1322 microRNA 1322 ncRNA 173.333-44 chr12 56459079 56459310 + 1 NA Intergenic Intergenic -4537 NM_012064 4284 Hs.574026 NM_012064 ENSG00000135517 MIP AQP0|CTRCT15|LIM1|MIP26|MP26 major intrinsic protein of lens fiber protein-coding 139.333-48 chr12 8991956 8992197 + 1 NA intron (NM_001329102, intron 2 of 5) intron (NM_001329102, intron 2 of 5) 2451 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 153.667-189 chr2 82518714 82518935 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -337979 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 130.667-101 chr19 36448316 36448573 + 1 NA 3' UTR (NM_001145343, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001145343, exon 5 of 5) 27270 NR_033748 644189 Hs.608412 NR_033748 LOC644189 - acyl-CoA thioesterase 4 pseudogene pseudo 153.333-198 chr2 64371923 64372127 + 1 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -31177 NR_106995 102465833 NR_106995 ENSG00000264297 MIR4433B hsa-mir-4433b microRNA 4433b ncRNA 188.667-50 chr15 82879286 82879492 + 1 NA intron (NM_004839, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 69761 NM_001080435 123720 Hs.377360 NM_001080435 ENSG00000156232 WHAMM WHAMM1|WHDC1 WASP homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules protein-coding 133.667-166 chrX 85073958 85074163 + 1 NA exon (NM_198450, exon 7 of 9) exon (NM_198450, exon 7 of 9) 34908 NM_001012980 340562 Hs.640783 NM_001012980 ENSG00000184788 SATL1 - spermidine/spermine N1-acetyl transferase like 1 protein-coding 213.667-8 chr1 215190133 215190361 + 1 NA intron (NM_001017424, intron 5 of 6) intron (NM_001017424, intron 5 of 6) 107510 NM_001017425 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 150.333-14 chr1 113705945 113706246 + 1 NA exon (NM_001323041, exon 13 of 19) exon (NM_001323041, exon 13 of 19) 53060 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 135.667-158 chr6 89751682 89751864 + 1 NA intron (NM_014611, intron 22 of 101) intron (NM_014611, intron 22 of 101) 68021 NM_014611 23195 Hs.529948 NM_014611 ENSG00000112159 MDN1 Rea1 midasin AAA ATPase 1 protein-coding 156.333-103 chr14 38172824 38173105 + 1 NA Intergenic Intergenic -34940 NM_001049 6751 Hs.248160 NM_001049 ENSG00000139874 SSTR1 SRIF-2|SS-1-R|SS1-R|SS1R somatostatin receptor 1 protein-coding 125.333-92 chr2 72235291 72235481 + 1 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) L1PA15|LINE|L1 -87524 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 300.667-19 chr2 82728471 82729051 + 1 NA Intergenic Intergenic -128042 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 150.667-159 chr18 40399313 40399578 + 1 NA Intergenic Intergenic 333159 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 275.333-59 chr5 173974626 173975091 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -14312 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 274.333-32 chr17 78286323 78286908 + 1 NA Intergenic Intergenic -8123 NR_073178 100996291 Hs.744493 NR_073178 ENSG00000204277 LINC01993 - long intergenic non-protein coding RNA 1993 ncRNA 281.667-44 chr6 55845228 55845795 + 1 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) intron (NM_001329754, intron 1 of 5) 30079 NM_001329754 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 244.333-54 chr19 49813358 49813886 + 1 NA promoter-TSS (NM_001352262) promoter-TSS (NM_001352262) -330 NM_001171937 80199 Hs.288800 NM_025129 ENSG00000010361 FUZ CPLANE3|FY|NTD fuzzy planar cell polarity protein protein-coding 157.333-204 chr2 191208905 191209091 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -36406 NM_001330238 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 169.333-277 chr8 127663020 127663253 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 70831 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 153.333-164 chr17 63196873 63197030 + 1 NA intron (NM_025185, intron 5 of 25) MIR|SINE|MIR 230716 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 153.333-290 chr4 31773434 31773710 + 1 NA Intergenic Intergenic -223807 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 159.667-256 chr5 50782011 50782264 + 1 NA intron (NM_024615, intron 9 of 25) intron (NM_024615, intron 9 of 25) 114723 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 328.667-18 chr8 24539755 24540251 + 1 NA intron (NR_125808, intron 1 of 5) intron (NR_125808, intron 1 of 5) 8615 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 251.333-87 chr5 57291877 57292274 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 78001 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 175.667-42 chr14 83845804 83846054 + 1 NA Intergenic Intergenic 1203297 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 126.667-70 chr18 65549636 65549865 + 1 NA Intergenic Intergenic -200502 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 165.667-149 chr4 125673093 125673301 + 1 NA Intergenic Intergenic 165938 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 146.333-32 chr10 76561899 76562130 + 1 NA Intergenic Intergenic -326030 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 140.333-58 chr14 29495307 29495572 + 1 NA Intergenic Intergenic 431657 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 172.667-80 chr2 62423347 62423658 + 1 NA Intergenic Intergenic 82693 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 214.333-133 chr6 167843036 167843367 + 1 NA intron (NM_001291964, intron 1 of 32) intron (NM_001291964, intron 1 of 32) 15566 NM_001291964 4301 Hs.614974 NM_005936 ENSG00000130396 AFDN AF6|MLL-AF6|MLLT4|l-afadin afadin, adherens junction formation factor protein-coding 112.667-100 chr18 5527079 5527344 + 1 NA intron (NM_001330557, intron 1 of 21) intron (NM_001330557, intron 1 of 21) 13345 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 165.333-86 chr15 84948703 84949011 + 1 NA intron (NM_001321722, intron 18 of 18) L3|LINE|CR1 -31610 NM_001243137 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 234.667-63 chr20 4751594 4751960 + 1 NA Intergenic Intergenic -11109 NR_024268 149830 Hs.126516 NM_177549 ENSG00000180259 PRNT M8 prion locus lncRNA, testis expressed ncRNA 179.667-108 chr4 133870304 133870548 + 1 NA Intergenic Intergenic 331363 NM_001114734 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 145.333-211 chr4 37160560 37160707 + 1 NA Intergenic Intergenic 81358 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 157.667-195 chr3 105468121 105468318 + 1 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 101310 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 121.667-207 chr8 109357299 109357560 + 1 NA Intergenic Intergenic -5032 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 124.667-36 chr11 114038947 114039138 + 1 NA Intergenic Intergenic -20669 NM_001354750 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 168.333-207 chr8 47863354 47863612 + 1 NA exon (NM_006904, exon 42 of 86) exon (NM_006904, exon 42 of 86) 96653 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 128.333-29 chr10 112831934 112832109 + 1 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) 8525 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 180.333-28 chr12 114963751 114964074 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -279737 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 153.333-193 chr2 51484376 51484547 + 1 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) intron (NR_135237, intron 4 of 10) 451860 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 115.667-16 chr10 16698073 16698292 + 1 NA intron (NM_152724, intron 6 of 7) intron (NM_152724, intron 6 of 7) 119242 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 165.667-40 chr12 118235726 118236011 + 1 NA 5' UTR (NM_001346493, exon 8 of 23) 5' UTR (NM_001346493, exon 8 of 23) -45333 NM_001346497 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 141.667-161 chr4 61093963 61094231 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -49559 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 157.667-178 chr22 17134639 17135008 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 13228 NR_103793 100996342 Hs.714550 NR_103793 ENSG00000235478 LINC01664 - long intergenic non-protein coding RNA 1664 ncRNA 134.667-119 chr20 43930200 43930387 + 1 NA intron (NM_001098796, intron 1 of 8) intron (NM_001098796, intron 1 of 8) 14163 NM_032883 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 230.333-118 chr8 58185773 58186125 + 1 NA Intergenic Intergenic 86152 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 213.333-54 chr14 40714221 40714454 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -240374 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 124.667-44 chr12 42969651 42969803 + 1 NA Intergenic Intergenic -185588 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 231.667-44 chr3 82276665 82277057 + 1 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 290719 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 153.333-351 chr6 34305670 34305838 + 1 NA intron (NM_001202470, intron 6 of 8) L1M5|LINE|L1 -56646 NR_155741 221491 Hs.381300 NM_178508 ENSG00000186577 SMIM29 C6orf1|LBH small integral membrane protein 29 protein-coding 151.333-208 chr2 63267613 63267799 + 1 NA intron (NR_148704, intron 14 of 18) L1MA7|LINE|L1 -148164 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 187.333-202 chr8 117130764 117131059 + 1 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -4084 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 208.667-143 chr8 79884855 79885195 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13288 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 163.667-204 chr5 125044216 125044433 + 1 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) intron (NR_109882, intron 2 of 5) 7493 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 247.667-28 chr13 40018739 40019034 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -162923 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 192.667-109 chr3 110599803 110600072 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 470022 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 211.333-176 chr5 11189604 11189959 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 10 of 20) L2a|LINE|L2 399136 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 193.667-111 chr6 56297103 56297535 + 1 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) intron (NM_001318752, intron 1 of 28) -49739 NM_030820 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 247.333-95 chr9 38762158 38762525 + 1 NA Intergenic Intergenic 141253 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 340.667 chr1 73006263 73006786 + 1 NA Intergenic Intergenic -299646 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 188.333-56 chr16 76263752 76264061 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13495 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 165.333-90 chr15 101423082 101423320 + 1 NA intron (NM_138325, intron 6 of 13) L1MEf|LINE|L1 66506 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 154.667-337 chr6 55437489 55437773 + 1 NA intron (NR_109869, intron 4 of 4) L2|LINE|L2 110162 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 225.667-7 chr10 16886995 16887307 + 1 NA intron (NM_001081, intron 56 of 66) intron (NM_001081, intron 56 of 66) -69697 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 149.667-212 chr2 124228289 124228468 + 1 NA intron (NM_130773, intron 2 of 23) MLT2B3|LTR|ERVL 203091 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 166.333-31 chr10 72734562 72734775 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) AluJr|SINE|Alu 13639 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 235.667-29 chr18 1395018 1395304 + 1 NA Intergenic Intergenic -35532 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 241.333-98 chr8 23731411 23731958 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -25086 NM_001136271 137814 Hs.532654 NM_001136271 ENSG00000180053 NKX2-6 CSX2|CTHM|NKX2F|NKX4-2 NK2 homeobox 6 protein-coding 206.333-112 chr3 89803716 89804141 + 1 NA Intergenic Intergenic 696307 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 139.667-24 chr11 7208255 7208411 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26433 NR_031683 100313774 NR_031683 ENSG00000221703 MIR302E MIRN302E microRNA 302e ncRNA 247.333-4 chr1 223241050 223241527 + 1 NA intron (NM_001037175, intron 5 of 5) L1MC1|LINE|L1 -98040 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 147.333-310 chr8 26990171 26990371 + 1 NA Intergenic Intergenic 58692 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 246.667-32 chr15 90074776 90075072 + 1 NA intron (NR_146321, intron 1 of 1) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 7283 NR_146321 109729181 Hs.655249 NR_146321 ENSG00000259291 ZNF710-AS1 - ZNF710 antisense RNA 1 ncRNA 124.333-147 chr5 80974494 80974649 + 1 NA intron (NM_006909, intron 1 of 26) HERVL40-int|LTR|ERVL -13664 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 136.667-97 chr2 155359745 155359921 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 661138 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 147.667-86 chr13 43574881 43575155 + 1 NA intron (NM_001347965, intron 1 of 15) intron (NM_001347965, intron 1 of 15) 54459 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 149.333-152 chr18 2828808 2828958 + 1 NA Intergenic Intergenic -18123 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 210.667-71 chr2 141976031 141976335 + 1 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 155518 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 134.667-200 chr8 125283050 125283269 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) MIR|SINE|MIR -147199 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 166.333-245 chrX 48578696 48578972 + 1 NA 3' UTR (NM_006743, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_006743, exon 7 of 7) 4350 NM_006743 5935 Hs.301404 NM_006743 ENSG00000102317 RBM3 IS1-RNPL|RNPL RNA binding motif protein 3 protein-coding 148.667-198 chr2 122841674 122841823 + 1 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 231733 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 286.333-17 chr17 78144646 78145327 + 1 NA Intergenic Intergenic -1399 NM_001163075 100141515 Hs.633034 NM_001163075 ENSG00000187997 C17orf99 IL-40|UNQ464 chromosome 17 open reading frame 99 protein-coding 216.667-8 chr1 115577872 115578239 + 1 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -63915 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 176.333-89 chr2 107120318 107120676 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 229028 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 172.667-122 chr5 44770458 44770755 + 1 NA intron (NR_109865, intron 1 of 2) intron (NR_109865, intron 1 of 2) 38187 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 149.667-58 chr10 68060958 68061117 + 1 NA intron (NM_001278185, intron 3 of 23) intron (NM_001278185, intron 3 of 23) 14246 NM_001278187 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 284.333-31 chr3 165927201 165927646 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -90000 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 175.333-138 chr5 25792371 25792629 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 601547 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 142.333-121 chr2 107306956 107307252 + 1 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 42421 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 136.667-137 chr5 5141447 5141604 + 1 NA intron (NM_139056, intron 2 of 22) intron (NM_139056, intron 2 of 22) 1195 NR_136935 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 211.667-40 chr14 52560237 52560560 + 1 NA intron (NM_001353361, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 7562 NR_148417 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 143.333-132 chr2 32601748 32601909 + 1 NA intron (NM_016252, intron 70 of 73) intron (NM_016252, intron 70 of 73) -26222 NM_001193509 55622 Hs.468125 NM_017735 ENSG00000018699 TTC27 - tetratricopeptide repeat domain 27 protein-coding 316.667-20 chr22 27881487 27881862 + 1 NA intron (NM_001284278, intron 7 of 11) intron (NM_001284278, intron 7 of 11) 37540 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 215.667-89 chr3 180054341 180054710 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -17588 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 141.667-139 chr3 12385350 12385612 + 1 NA intron (NM_001330615, intron 3 of 5) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 33979 NM_015869 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 146.333-146 chr2 47416758 47416944 + 1 NA intron (NM_000251, intron 6 of 15) intron (NM_000251, intron 6 of 15) 13784 NM_001258281 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 148.333-374 chr7 135853085 135853331 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -104395 NM_205855 389558 Hs.55200 NM_205855 ENSG00000189320 FAM180A UNQ1940 family with sequence similarity 180 member A protein-coding 146.667-175 chr2 134948022 134948377 + 1 NA intron (NR_135468, intron 8 of 9) AluJb|SINE|Alu 29377 NR_135468 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 200.333-145 chr7 114756678 114757153 + 1 NA Intergenic Intergenic 103570 NR_037439 100500896 NR_037439 ENSG00000272230 MIR3666 - microRNA 3666 ncRNA 147.667-182 chr2 112812946 112813168 + 1 NA Intergenic Intergenic 23722 NM_000576 3553 Hs.126256 NM_000576 ENSG00000125538 IL1B IL-1|IL1-BETA|IL1F2 interleukin 1 beta protein-coding 165.333-117 chr19 56654110 56654321 + 1 NA intron (NR_163263, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 11056 NM_001193628 147670 Hs.336588 NM_001193628 ENSG00000268182 SMIM17 - small integral membrane protein 17 protein-coding 215.333-190 chr7 107466022 107466359 + 1 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) intron (NM_181733, intron 6 of 20) -3867 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 169.667-71 chr15 38227793 38227992 + 1 NA Intergenic Intergenic -24944 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 197.333-18 chr10 20858845 20859186 + 1 NA intron (NM_006393, intron 8 of 27) intron (NM_006393, intron 8 of 27) 38587 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 154.333-60 chr11 46845513 46845822 + 1 NA promoter-TSS (NR_038909) promoter-TSS (NR_038909) 613 NM_001008938 9793 Hs.201253 NM_014756 ENSG00000175216 CKAP5 CHTOG|MSPS|TOG|TOGp|ch-TOG cytoskeleton associated protein 5 protein-coding 129.667-135 chr5 3689807 3690057 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 94100 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 258.667-57 chr22 16994613 16995016 + 1 NA intron (NM_001037814, intron 1 of 9) L1M5|LINE|L1 13408 NR_159481 128954 Hs.434113 NM_001037814 ENSG00000215568 GAB4 - GRB2 associated binding protein family member 4 protein-coding 184.667-10 chr1 189852255 189852533 + 1 NA Intergenic Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 623616 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 205.667-75 chr2 118709817 118710194 + 1 NA Intergenic Intergenic -107039 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 251.667-51 chr20 44288557 44288970 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 22439 NM_001080472 128486 Hs.632269 NM_001080472 ENSG00000197296 FITM2 C20orf142|Fit2|dJ881L22.2 fat storage inducing transmembrane protein 2 protein-coding 256.667-29 chr14 87107650 87108006 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 202050 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 138.667-217 chr9 87165722 87165986 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 17210 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 142.333-44 chr11 97049502 97049673 + 1 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 541162 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 184.667-11 chr1 200167073 200167368 + 1 NA intron (NM_205860, intron 7 of 7) L2c|LINE|L2 124395 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 135.333-10 chr1 105752024 105752199 + 1 NA Intergenic Intergenic -133176 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 172.667-44 chr12 74663110 74663337 + 1 NA Intergenic Intergenic 125388 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 375.333-3 chr10 4574349 4574884 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -81540 NR_015425 338588 Hs.121365 NR_015425 LINC00705 - long intergenic non-protein coding RNA 705 ncRNA 149.667-77 chr11 70480366 70480562 + 1 NA intron (NR_110766, intron 8 of 8) intron (NR_110766, intron 8 of 8) 81935 NM_005231 2017 Hs.596164 NM_005231 ENSG00000085733 CTTN EMS1 cortactin protein-coding 165.333-265 chr9 37971489 37971759 + 1 NA intron (NM_003028, intron 3 of 5) intron (NM_003028, intron 3 of 5) -67271 NR_024873 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 151.333-156 chr15 96071525 96071676 + 1 NA Intergenic Intergenic 56241 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 130.667-190 chr8 5805035 5805258 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 601402 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 140.333-215 chr7 43402782 43403023 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 6 of 27) intron (NM_001287059, intron 6 of 27) 119640 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 133.333-102 chr3 10839335 10839536 + 1 NA intron (NM_014229, intron 4 of 13) intron (NM_014229, intron 4 of 13) 23207 NM_014229 6538 Hs.655078 NM_014229 ENSG00000132164 SLC6A11 GAT-3|GAT3|GAT4 solute carrier family 6 member 11 protein-coding 239.667-18 chr14 45654521 45654911 + 1 NA Intergenic Intergenic 60886 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 220.667-35 chr16 63640594 63640949 + 1 NA Intergenic Intergenic 1481292 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 150.333-25 chr1 182122098 182122329 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -60501 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 185.667-36 chr15 63527810 63528135 + 1 NA intron (NM_001256702, intron 1 of 13) intron (NM_001256702, intron 1 of 13) 23379 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 195.333-10 chr1 78527982 78528235 + 1 NA intron (NM_001039585, intron 3 of 3) intron (NM_001039585, intron 3 of 3) 37134 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 166.667-171 chr4 117260390 117260627 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 100131 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 284.667-38 chr4 112650317 112650705 + 1 NA promoter-TSS (NR_146092) promoter-TSS (NR_146092) -460 NR_146092 109864269 Hs.642978 NR_146092 ENSG00000249532 MIR302CHG - miR-302/367 cluster host gene ncRNA 168.333-154 chr4 115624616 115624787 + 1 NA Intergenic MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR -511081 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 165.333-59 chr12 87165058 87165270 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -165575 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 265.667-66 chr7 24614257 24614722 + 1 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) L1MA5A|LINE|L1 41037 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 151.333-220 chr2 125486218 125486532 + 1 NA Intergenic Intergenic 631610 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 264.333-65 chr6 44266047 44266352 + 1 NA promoter-TSS (NM_004556) promoter-TSS (NM_004556) -411 NM_004556 4794 Hs.458276 NM_004556 ENSG00000146232 NFKBIE IKBE NFKB inhibitor epsilon protein-coding 162.333-246 chr8 58296593 58296938 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -24664 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 151.667-95 chr13 38007124 38007276 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 136032 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 164.333-19 chr10 4383609 4383820 + 1 NA promoter-TSS (NR_108054) promoter-TSS (NR_108054) -532 NR_108055 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 130.333-193 chr7 43323683 43323835 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 4 of 27) AluSq2|SINE|Alu 172864 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 153.333-56 chr10 107787793 107788079 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 281357 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 258.667-12 chr10 51914277 51914750 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) intron (NM_001098512, intron 5 of 17) -214918 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 159.333-229 chr4 27450452 27450757 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 233125 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 148.333-59 chr11 11689110 11689258 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -32462 NR_036184 100423026 NR_036184 ENSG00000266645 MIR4299 - microRNA 4299 ncRNA 332.333-6 chr10 60453070 60453608 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) L3b|LINE|CR1 -63464 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 157.333-242 chr3 101847478 101847755 + 1 NA intron (NM_001005474, intron 2 of 12) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -1898 NM_031419 64332 Hs.319171 NM_031419 ENSG00000144802 NFKBIZ IKBZ|INAP|MAIL NFKB inhibitor zeta protein-coding 199.667-10 chr1 234498230 234498492 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -19182 NM_005646 6894 Hs.498115 NM_005646 ENSG00000059588 TARBP1 TRM3|TRMT3|TRP-185|TRP185 TAR (HIV-1) RNA binding protein 1 protein-coding 152.333-274 chr4 74257825 74258089 + 1 NA intron (NM_001144978, intron 6 of 7) L1M3e|LINE|L1 -50513 NM_001270993 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 165.667-123 chr3 96138436 96138614 + 1 NA Intergenic Intergenic -221439 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 154.667-107 chr14 51948349 51948557 + 1 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) -29882 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 153.667-251 chr3 66958858 66959131 + 1 NA Intergenic Intergenic -39313 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 186.333-66 chr2 3550701 3551010 + 1 NA intron (NR_148533, intron 3 of 7) intron (NR_148533, intron 3 of 7) 7478 NR_148533 246243 Hs.568006 NM_002936 ENSG00000171865 RNASEH1 H1RNA|PEOB2|RNH1 ribonuclease H1 protein-coding 200.667-11 chr1 178787183 178787480 + 1 NA intron (NM_152663, intron 4 of 19) MER33|DNA|hAT-Charlie 62087 NM_152663 55103 Hs.632485 NM_018037 ENSG00000116191 RALGPS2 dJ595C2.1 Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2 protein-coding 126.333-148 chr6 35772104 35772278 + 1 NA Intergenic Intergenic -4403 NR_104469 389383 Hs.259563 NM_207409 ENSG00000196748 CLPSL2 AAAL3045|C6orf126|UNQ3045|dJ510O8.5 colipase like 2 protein-coding 140.667-73 chr14 41323811 41324063 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -282919 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 202.333-123 chr4 55937299 55937604 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11494 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 243.333-58 chr2 217224104 217224543 + 1 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -58410 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-238 chr4 66140963 66141266 + 1 NA Intergenic Intergenic -135710 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 232.667-61 chr4 110009206 110009611 + 1 NA intron (NM_001178131, intron 22 of 22) intron (NM_001178131, intron 22 of 22) 96525 NM_001178131 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 222.667-94 chr8 59697941 59698406 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 578963 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 155.667-117 chr15 68776198 68776484 + 1 NA Intergenic Intergenic 25584 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 171.667-77 chr2 35260881 35261204 + 1 NA Intergenic Intergenic -210363 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 160.333-40 chr10 34835522 34835787 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 19886 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 177.667-128 chr7 104897531 104897904 + 1 NA intron (NR_027374, intron 3 of 3) intron (NR_027374, intron 3 of 3) 28928 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 151.333-53 chr10 50877179 50877438 + 1 NA intron (NM_001198818, intron 1 of 13) intron (NM_001198818, intron 1 of 13) 8319 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 123.333-197 chr7 48735412 48735592 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -189045 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 116.667-84 chr18 4723999 4724152 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -268768 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 152.333-238 chr3 83173308 83173460 + 1 NA Intergenic Intergenic 1187242 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 391.667-3 chr12 14661104 14661532 + 1 NA intron (NM_004963, intron 10 of 26) intron (NM_004963, intron 10 of 26) 35281 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 198.333-73 chr16 26413045 26413445 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 388008 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 239.333-86 chr5 81604100 81604527 + 1 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) intron (NM_012446, intron 4 of 16) 146940 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 183.667-42 chr14 30250071 30250349 + 1 NA Intergenic MER104|DNA|TcMar-Tc2 -308913 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 143.333-279 chr7 148927477 148927677 + 1 NA Intergenic Intergenic -13911 NR_001571 6090 NR_001571 RNY5 Y5|hY5 RNA, Ro60-associated Y5 ncRNA 247.667-43 chr18 64310905 64311202 + 1 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) intron (NR_033881, intron 5 of 9) -50998 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 121.667-2 chr1 30971823 30971977 + 1 NA intron (NM_001020658, intron 10 of 21) intron (NM_001020658, intron 10 of 21) -3663 NR_003066 692200 NR_003066 SNORD103C HBII-251|SNORD85 small nucleolar RNA, C/D box 103C snoRNA 142.667-54 chr14 49558283 49558492 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 27993 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 159.667-112 chr15 72075579 72075772 + 1 NA intron (NM_006901, intron 1 of 41) AluJo|SINE|Alu -38583 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 201.333-162 chr2 220398449 220398773 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -492046 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 151.333-442 chr9 91462268 91462482 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -37749 NM_001290000 4783 Hs.79334 NM_005384 ENSG00000165030 NFIL3 E4BP4|IL3BP1|NF-IL3A|NFIL3A nuclear factor, interleukin 3 regulated protein-coding 193.333-179 chr7 114799574 114799776 + 1 NA Intergenic Intergenic -122479 NM_199072 29969 Hs.741413 NM_199072 ENSG00000135272 MDFIC HIC|MDFIC1 MyoD family inhibitor domain containing protein-coding 171.333-83 chr2 75481290 75481509 + 1 NA Intergenic Intergenic -42669 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 116.667-206 chr8 121350187 121350395 + 1 NA Intergenic Intergenic -289055 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 212.333-117 chr5 80012822 80013096 + 1 NA intron (NM_001306213, intron 2 of 22) intron (NM_001306213, intron 2 of 22) 21663 NM_001306213 7060 Hs.211426 NM_003248 ENSG00000113296 THBS4 TSP-4|TSP4 thrombospondin 4 protein-coding 145.667-280 chr8 66609573 66609763 + 1 NA intron (NM_001294282, intron 1 of 14) intron (NM_001294282, intron 1 of 14) 3550 NM_001294282 4603 Hs.445898 NM_001080416 ENSG00000185697 MYBL1 A-MYB|AMYB MYB proto-oncogene like 1 protein-coding 170.667-76 chr2 30128578 30128918 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -18259 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 237.333-123 chr8 120103354 120103731 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -21560 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 285.333-57 chr5 41045134 41045614 + 1 NA intron (NM_173489, intron 18 of 41) intron (NM_173489, intron 18 of 41) 25968 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 230.333-69 chr2 238802701 238803112 + 1 NA Intergenic U4|snRNA|snRNA 45001 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 147.667-14 chr1 152848534 152848841 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 5831 NM_001128600 448835 Hs.62927 NM_001128600 ENSG00000235942 LCE6A C1orf44 late cornified envelope 6A protein-coding 178.667-42 chr13 58735167 58735494 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -502213 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 236.667-79 chr7 11158158 11158522 + 1 NA intron (NR_033436, intron 16 of 16) L1MC4a|LINE|L1 184468 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 207.667-93 chr4 141083531 141083993 + 1 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) intron (NM_020724, intron 1 of 6) 49707 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 201.333-248 chr6 137614901 137615115 + 1 NA Intergenic Intergenic -50638 NR_125867 102723649 Hs.129235 NR_125867 LOC102723649 - uncharacterized LOC102723649 ncRNA 147.667-398 chrX 56515421 56515635 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -48065 NM_013444 29978 Hs.179309 NM_013444 ENSG00000188021 UBQLN2 ALS15|CHAP1|DSK2|HRIHFB2157|N4BP4|PLIC2 ubiquilin 2 protein-coding 144.333-69 chr14 45599674 45599954 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 115788 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 131.333-119 chr3 192478761 192478993 + 1 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) -36145 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 134.667-180 chr7 20447116 20447261 + 1 NA Intergenic Intergenic -115426 NR_110120 101927811 Hs.285724 NR_110119 ENSG00000271133 LOC101927811 - uncharacterized LOC101927811 ncRNA 156.667-7 chr1 52257281 52257583 + 1 NA intron (NM_007324, intron 4 of 17) intron (NM_007324, intron 4 of 17) 108773 NM_032449 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 197.667-26 chr11 83970253 83970622 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 12 of 27) intron (NM_001142699, intron 12 of 27) -288012 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 229.333-53 chr18 13341661 13342065 + 1 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 63758 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 216.333-83 chr2 130855402 130855766 + 1 NA intron (NM_001367493, intron 1 of 13) MER77|LTR|ERVL 18670 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 132.333-192 chr9 105724945 105725191 + 1 NA intron (NM_018112, intron 4 of 5) L2a|LINE|L2 30527 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 146.333-293 chr6 136899656 136899810 + 1 NA intron (NM_000288, intron 9 of 9) intron (NM_000288, intron 9 of 9) -22568 NM_001008783 340146 Hs.369703 NM_001008783 ENSG00000182747 SLC35D3 FRCL1 solute carrier family 35 member D3 protein-coding 168.667-219 chr8 80173895 80174125 + 1 NA Intergenic Intergenic -2446 NM_001025253 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 145.333-45 chr10 102724139 102724317 + 1 NA intron (NM_001350989, intron 2 of 12) L1PREC2|LINE|L1 9592 NM_178858 118980 Hs.44070 NM_178858 ENSG00000156398 SFXN2 SLC56A2 sideroflexin 2 protein-coding 160.333-32 chr1 241336119 241336301 + 1 NA intron (NM_001350116, intron 1 of 16) intron (NM_001350116, intron 1 of 16) 19616 NM_001350116 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 244.667-78 chr5 23662266 23662683 + 1 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 154819 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 133.333-169 chr7 22288121 22288280 + 1 NA intron (NM_012294, intron 6 of 25) intron (NM_012294, intron 6 of 25) 68954 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 163.667-260 chr8 139187267 139187431 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -273308 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 211.333-49 chr13 40504853 40505231 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -24036 NR_024506 646982 Hs.287664 NR_024505 ENSG00000215483 LINC00598 lncFOXO1 long intergenic non-protein coding RNA 598 ncRNA 149.667-224 chr2 204255318 204255502 + 1 NA Intergenic Intergenic -290065 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 162.333-281 chrX 90058744 90059003 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 136965 NM_138960 90316 Hs.592220 NM_138960 ENSG00000153779 TGIF2LX TGIFLX TGFB induced factor homeobox 2 like X-linked protein-coding 145.333-17 chr1 189650983 189651246 + 1 NA Intergenic Intergenic 824896 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 151.667-223 chr3 77901038 77901245 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 147822 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 172.333-170 chr7 106887617 106887934 + 1 NA intron (NM_001282426, intron 10 of 10) intron (NM_001282426, intron 10 of 10) 22296 NM_002649 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 157.667-70 chr12 15540521 15540770 + 1 NA intron (NM_030667, intron 12 of 26) intron (NM_030667, intron 12 of 26) -5966 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 236.333-22 chr12 9957905 9958180 + 1 NA intron (NM_001207010, intron 1 of 6) LOR1-int|LTR|ERV1 -4705 NR_135047 400002 NR_135047 ENSG00000231560 CLEC12A-AS1 - CLEC12A antisense RNA 1 ncRNA 150.333-229 chr2 221434686 221434851 + 1 NA intron (NM_001363748, intron 13 of 17) intron (NM_001363748, intron 13 of 17) 137536 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 180.333-30 chr13 28363992 28364385 + 1 NA intron (NM_002019, intron 14 of 29) L1ME3Cz|LINE|L1 130940 NM_001159920 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 173.667-110 chr3 73001946 73002185 + 1 NA intron (NM_001318025, intron 2 of 7) L1MA4|LINE|L1 5254 NM_001318027 151987 Hs.431092 NM_174907 ENSG00000163605 PPP4R2 PP4R2 protein phosphatase 4 regulatory subunit 2 protein-coding 138.333-12 chr1 216499385 216499549 + 1 NA Intergenic Intergenic -76019 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 175.333-75 chr2 12483321 12483506 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -233459 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 137.333-55 chr15 96669144 96669377 + 1 NA Intergenic Intergenic 112394 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 143.667-190 chr4 156901386 156901586 + 1 NA intron (NR_036641, intron 1 of 6) intron (NR_036641, intron 1 of 6) 70313 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 150.667-227 chr22 30064444 30064601 + 1 NA intron (NR_110541, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 15735 NR_110541 101929664 Hs.592197 NR_110541 HORMAD2-AS1 MTMR3-AS1 HORMAD2 and MTMR3 antisense RNA 1 ncRNA 165.667-178 chr6 121108770 121108972 + 1 NA intron (NR_104452, intron 33 of 35) intron (NR_104452, intron 33 of 35) 225609 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 145.667-14 chr1 99712974 99713173 + 1 NA promoter-TSS (NR_031666) promoter-TSS (NR_031666) -120 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 250.667-36 chr2 51767457 51768001 + 1 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) intron (NR_135237, intron 6 of 10) -602919 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 141.667-21 chr1 235523912 235524184 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -19596 NM_152490 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 148.667-339 chr6 138619341 138619506 + 1 NA Intergenic Intergenic -46854 NM_020464 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 223.667-42 chr20 53093709 53093977 + 1 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) -91440 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 238.667-83 chr7 25507231 25507711 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 155669 NR_157826 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 258.333-49 chr4 79868842 79869186 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 41543 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 264.333-26 chr16 9547279 9547709 + 1 NA Intergenic Intergenic -91989 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 167.333-111 chr17 61845077 61845332 + 1 NA intron (NM_032043, intron 6 of 19) intron (NM_032043, intron 6 of 19) 18355 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 162.333-192 chr5 14878289 14878549 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -6641 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 115.333-87 chr16 65514788 65515023 + 1 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 61395 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 180.333-25 chr12 41967224 41967482 + 1 NA Intergenic Intergenic 177521 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 166.333-41 chr11 11207395 11207773 + 1 NA Intergenic Intergenic 145666 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 169.667-150 chr4 55082143 55082366 + 1 NA intron (NM_002253, intron 28 of 29) intron (NM_002253, intron 28 of 29) 43341 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 161.667-89 chr15 56472012 56472202 + 1 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -6970 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 118.667-69 chr14 79174015 79174234 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -25858 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 186.667-3 chr1 85240794 85241022 + 1 NA Intergenic Intergenic 18754 NR_024113 148423 Hs.26226 NM_198077 ENSG00000162642 C1orf52 gm117 chromosome 1 open reading frame 52 protein-coding 274.667-8 chr10 76685113 76685488 + 1 NA Intergenic Intergenic -202744 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 250.667-53 chr3 187068695 187069041 + 1 NA intron (NM_173216, intron 5 of 7) intron (NM_173216, intron 5 of 7) 30150 NM_001353916 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 191.667-67 chr2 105578813 105579090 + 1 NA Intergenic Intergenic 31608 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 130.333-183 chr6 94715119 94715302 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 862241 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 136.333-133 chr3 122334444 122334632 + 1 NA intron (NM_005213, intron 1 of 2) intron (NM_005213, intron 1 of 2) 9290 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 220.667-83 chr5 50867916 50868244 + 1 NA Intergenic Intergenic 102107 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 494.333-2 chr19 35127130 35128254 + 1 NA intron (NM_139284, intron 6 of 8) intron (NM_139284, intron 6 of 8) 4992 NR_106947 102466205 NR_106947 ENSG00000284065 MIR6887 hsa-mir-6887 microRNA 6887 ncRNA 158.333-46 chr10 131602271 131602522 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 187803 NR_038365 399827 Hs.523353 NM_001001677 ENSG00000189275 LINC01164 - long intergenic non-protein coding RNA 1164 ncRNA 227.667-72 chr7 62663008 62663364 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 640870 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 178.667-39 chr12 125633198 125633531 + 1 NA intron (NM_001286219, intron 1 of 4) L1MA2|LINE|L1 10912 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 160.667-155 chr2 135273342 135273532 + 1 NA intron (NM_001286569, intron 9 of 21) intron (NM_001286569, intron 9 of 21) 136809 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 251.667-21 chr13 44270970 44271317 + 1 NA Intergenic Intergenic -74943 NR_107046 102465876 NR_107046 ENSG00000276319 MIR8079 hsa-mir-8079 microRNA 8079 ncRNA 240.333-63 chr3 32587711 32588049 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16956 NM_001329135 51143 Hs.529495 NM_016141 ENSG00000144635 DYNC1LI1 DLC-A|DNCLI1|LIC1 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 protein-coding 154.333-206 chr3 27083994 27084268 + 1 NA Intergenic Intergenic 132392 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 318.333-6 chr10 88292904 88293417 + 1 NA intron (NM_001031709, intron 6 of 6) intron (NM_001031709, intron 6 of 6) 290158 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 183.333-162 chr8 112469379 112469730 + 1 NA intron (NM_052900, intron 31 of 68) MER1B|DNA|hAT-Charlie -173939 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 264.333-39 chr2 109598973 109599295 + 1 NA intron (NM_001321509, intron 1 of 10) intron (NM_001321509, intron 1 of 10) 14533 NM_001321513 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 150.667-102 chr13 67191561 67191802 + 1 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) intron (NM_001318372, intron 2 of 4) 38655 NM_001318372 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 151.333-272 chr3 28745403 28745612 + 1 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 170229 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 153.333-297 chr4 60977097 60977256 + 1 NA Intergenic Intergenic 54557 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 141.333-246 chr8 124338804 124339002 + 1 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) MER57C1|LTR|ERV1 33796 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 163.667-199 chr5 76588293 76588486 + 1 NA intron (NM_006633, intron 5 of 35) intron (NM_006633, intron 5 of 35) 20580 NR_134278 101929109 Hs.665172 NR_134278 ENSG00000249713 LOC101929109 - uncharacterized LOC101929109 ncRNA 180.333-107 chr6 119860610 119860876 + 1 NA Intergenic Intergenic -154436 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 222.333-19 chr11 40647595 40647883 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -354609 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 116.667-178 chr6 81394902 81395069 + 1 NA Intergenic Intergenic 357696 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 143.667-216 chr6 63034067 63034287 + 1 NA Intergenic Intergenic 285800 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 198.333-83 chr17 67347468 67347966 + 1 NA intron (NM_174871, intron 4 of 9) L1ME1|LINE|L1 18860 NM_174871 5718 Hs.4295 NM_002816 ENSG00000197170 PSMD12 Rpn5|STISS|p55 proteasome 26S subunit, non-ATPase 12 protein-coding 111.667-62 chr12 38654700 38654880 + 1 NA intron (NM_153634, intron 19 of 19) intron (NM_153634, intron 19 of 19) 250801 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 113.667-230 chr9 119345174 119345396 + 1 NA intron (NM_014618, intron 1 of 7) intron (NM_014618, intron 1 of 7) 24150 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 160.667-275 chr7 34495562 34495730 + 1 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) intron (NR_033665, intron 2 of 3) -162572 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 334.667-6 chr10 51003761 51004108 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) L1MC4a|LINE|L1 13046 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 172.667-159 chr8 75704564 75704784 + 1 NA Intergenic Intergenic 164706 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 160.333-266 chr7 84789392 84789564 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 257002 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 233.333-122 chr7 50996178 50996457 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -202864 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 153.333-250 chr21 32907010 32907198 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -51784 NR_135522 102724502 Hs.130572 NR_135522 ENSG00000228961 LINC01690 - long intergenic non-protein coding RNA 1690 ncRNA 252.333-18 chr14 24709339 24709796 + 1 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -75377 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 175.333-96 chr2 186667627 186667837 + 1 NA exon (NM_001144999, exon 24 of 30) exon (NM_001144999, exon 24 of 30) -26328 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 224.667-56 chr3 98755501 98755862 + 1 NA intron (NM_001323366, intron 1 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -7626 NM_001323368 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 145.667-145 chr2 127314861 127315129 + 1 NA intron (NM_006609, intron 13 of 15) intron (NM_006609, intron 13 of 15) -20819 NM_000122 2071 Hs.469872 NM_000122 ENSG00000163161 ERCC3 BTF2|GTF2H|RAD25|TFIIH|TTD2|XPB ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit protein-coding 170.333-139 chr3 93786882 93787244 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 187018 NM_001314077 5627 Hs.64016 NM_000313 ENSG00000184500 PROS1 PROS|PS21|PS22|PS23|PS24|PS25|PSA|THPH5|THPH6 protein S protein-coding 125.333-85 chr2 27615840 27616065 + 1 NA intron (NM_001271289, intron 10 of 12) intron (NM_001271289, intron 10 of 12) -12696 NM_001145048 11321 Hs.18259 NM_007266 ENSG00000198522 GPN1 ATPBD1A|MBDIN|NTPBP|RPAP4|XAB1 GPN-loop GTPase 1 protein-coding 118.333 chr1 13787344 13787486 + 1 NA 3' UTR (NM_015866, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_015866, exon 9 of 9) 38000 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 158.667-108 chr15 66382649 66382929 + 1 NA Intergenic MADE2|DNA|TcMar-Mariner -4084 NM_002755 5604 Hs.145442 NM_002755 ENSG00000169032 MAP2K1 CFC3|MAPKK1|MEK1|MKK1|PRKMK1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 protein-coding 168.333-126 chr3 2773925 2774174 + 1 NA intron (NM_175607, intron 6 of 24) AluSx1|SINE|Alu -118166 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 244.333-87 chr6 4443810 4444434 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -44676 NR_149117 105374895 Hs.436882 NR_149117 LINC02533 - long intergenic non-protein coding RNA 2533 ncRNA 155.667-283 chr5 89522698 89522914 + 1 NA Intergenic Intergenic 493914 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 179.667-142 chr8 89953171 89953391 + 1 NA exon (NM_002485, exon 11 of 16) exon (NM_002485, exon 11 of 16) 31390 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 202.667-104 chr3 163477353 163477790 + 1 NA Intergenic Intergenic -174270 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 356.333-24 chr5 36867363 36867785 + 1 NA Intergenic Intergenic 9120 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 160.333-219 chr4 96709816 96710007 + 1 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) L1ME2|LINE|L1 399208 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 289.333-7 chr10 32580822 32581329 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 17 of 43) intron (NM_001321115, intron 17 of 43) 134935 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 123.667-150 chr5 4719765 4719895 + 1 NA Intergenic Intergenic -53651 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 146.667-104 chr14 62587708 62587863 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -447812 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 152.333-380 chr8 89419318 89419610 + 1 NA Intergenic Intergenic 338247 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 152.333-377 chr8 82661490 82661678 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -250520 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 173.333-111 chr21 35425300 35425574 + 1 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 155327 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 202.667-133 chr7 29243478 29243784 + 1 NA intron (NM_001293072, intron 1 of 12) intron (NM_001293072, intron 1 of 12) -34661 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 157.333-127 chr15 91537860 91538060 + 1 NA Intergenic Intergenic 74621 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 141.667-131 chr20 43030908 43031104 + 1 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) LTR16|LTR|ERVL 62263 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 277.667-27 chr3 7739119 7739719 + 1 NA intron (NM_181874, intron 10 of 10) intron (NM_181874, intron 10 of 10) -204135 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 164.333-25 chr10 36032455 36032760 + 1 NA Intergenic Intergenic 254305 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 163.333-277 chr8 27832996 27833323 + 1 NA intron (NM_001278945, intron 1 of 7) intron (NM_001278945, intron 1 of 7) 4658 NM_001278945 55872 Hs.104741 NM_018492 ENSG00000168078 PBK CT84|HEL164|Nori-3|SPK|TOPK PDZ binding kinase protein-coding 214.333-17 chr10 29594578 29594950 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 3 of 38) AluJb|SINE|Alu 7582 NR_030634 100126327 NR_030634 ENSG00000216035 MIR938 MIRN938|hsa-mir-938 microRNA 938 ncRNA 123.667-142 chr4 62837580 62837864 + 1 NA Intergenic Intergenic -675957 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 142.333-240 chr8 110022134 110022460 + 1 NA Intergenic Intergenic -46526 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 205.667-86 chr21 26275310 26275618 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -104336 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 139.667-175 chr7 107135707 107135892 + 1 NA intron (NM_002736, intron 4 of 10) L1MC1|LINE|L1 -33162 NM_001244262 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 213.667-64 chr4 61789860 61790215 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 8 of 23) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 371728 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 123.333-164 chr4 92927995 92928160 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) LTR40a|LTR|ERVL 623678 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 146.333-76 chr13 47953247 47953417 + 1 NA intron (NM_003850, intron 8 of 10) intron (NM_003850, intron 8 of 10) -20710 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 138.333-47 chr12 38761029 38761293 + 1 NA intron (NM_153634, intron 9 of 19) intron (NM_153634, intron 9 of 19) 144430 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 151.333-317 chr4 112262193 112262352 + 1 NA intron (NM_001128426, intron 5 of 8) AluJo|SINE|Alu 23632 NM_052864 92610 Hs.310640 NM_052864 ENSG00000145365 TIFA T2BP|T6BP|TIFAA TRAF interacting protein with forkhead associated domain protein-coding 148.667-400 chr9 125776017 125776221 + 1 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) L1M4|LINE|L1 27936 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 281.667-13 chr11 131296991 131297339 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -73450 NM_001352003 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 281.333-31 chr2 108195149 108195438 + 1 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) MER58C|DNA|hAT-Charlie 22548 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 154.333-9 chr1 90903488 90903788 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 51879 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 148.333-241 chr22 31486634 31486908 + 1 NA intron (NM_001164502, intron 2 of 16) AluSz|SINE|Alu 2785 NM_001164501 56478 Hs.517559 NM_019843 ENSG00000184708 EIF4ENIF1 4E-T|Clast4 eukaryotic translation initiation factor 4E nuclear import factor 1 protein-coding 211.333-143 chr22 32867083 32867509 + 1 NA intron (NM_003490, intron 5 of 13) L2a|LINE|L2 66480 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 226.667-81 chr6_GL383533v1_alt 92809 93192 + 1 NA NA Intergenic NA NA 154.333-205 chr3 21680229 21680397 + 1 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) intron (NM_024697, intron 1 of 7) 70897 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 205.667-134 chr8 125160879 125161219 + 1 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) intron (NR_146191, intron 5 of 8) 69189 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 134.333-8 chr1 200851933 200852159 + 1 NA intron (NM_001297707, intron 12 of 17) intron (NM_001297707, intron 12 of 17) -20935 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 130.667-183 chr7 28723335 28723500 + 1 NA intron (NM_001011666, intron 2 of 6) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 37284 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 278.667-42 chr5 56071574 56072101 + 1 NA Intergenic Intergenic 76670 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 167.333-94 chr15 72505315 72505529 + 1 NA intron (NM_005744, intron 1 of 13) L1ME3G|LINE|L1 31092 NM_005744 25820 Hs.268787 NM_005744 ENSG00000166233 ARIH1 ARI|HARI|HHARI|UBCH7BP ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 149.333-47 chr10 55386821 55386970 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -212147 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 200.333-44 chr15 65813943 65814266 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -21811 NM_005848 10260 Hs.654567 NM_005848 ENSG00000174485 DENND4A IRLB|MYCPBP DENN domain containing 4A protein-coding 153.333-151 chr16 12152579 12152762 + 1 NA intron (NM_032167, intron 13 of 20) L3|LINE|CR1 175936 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 124.667-114 chr2 174484803 174484940 + 1 NA intron (NM_001033045, intron 1 of 16) AluJb|SINE|Alu 2158 NM_152529 151556 Hs.516604 NM_152529 ENSG00000163328 GPR155 DEP.7|DEPDC3|PGR22 G protein-coupled receptor 155 protein-coding 152.667-199 chr2 144329303 144329515 + 1 NA intron (NM_001354353, intron 1 of 9) intron (NM_001354353, intron 1 of 9) 2862 NM_001354362 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 237.667-38 chr2 83574795 83575097 + 1 NA Intergenic Intergenic 52132 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 225.667-11 chr10 91060254 91060580 + 1 NA intron (NR_047467, intron 3 of 3) intron (NR_047467, intron 3 of 3) 14609 NR_047467 100874184 Hs.512240 NR_047467 LINC00502 - long intergenic non-protein coding RNA 502 ncRNA 115.667-141 chr22 30873126 30873317 + 1 NA intron (NM_001282741, intron 2 of 12) intron (NM_001282741, intron 2 of 12) -8460 NM_001282742 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 155.333-80 chr12 85636921 85637140 + 1 NA Intergenic Intergenic 199379 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 166.667-87 chr17 51221985 51222300 + 1 NA intron (NM_017643, intron 3 of 16) L2a|LINE|L2 37907 NM_017643 54799 Hs.656803 NM_017643 ENSG00000011258 MBTD1 SA49P01 mbt domain containing 1 protein-coding 234.333-29 chr15 62801489 62801840 + 1 NA intron (NM_015059, intron 47 of 55) intron (NM_015059, intron 47 of 55) -22293 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 160.333-93 chr14 19925446 19925686 + 1 NA Intergenic Intergenic 4959 NM_001005483 79317 Hs.554585 NM_001005483 ENSG00000176281 OR4K5 OR14-16 olfactory receptor family 4 subfamily K member 5 protein-coding 192.333-76 chr18 45157016 45157305 + 1 NA Intergenic Intergenic -10803 NM_001371319 145.333-296 chr8 64211759 64211957 + 1 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) L1MEd|LINE|L1 156700 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 139.667-112 chr3 4709433 4709633 + 1 NA intron (NM_001168272, intron 36 of 60) intron (NM_001168272, intron 36 of 60) 42057 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 192.667-72 chr17 50136172 50136574 + 1 NA intron (NM_032595, intron 7 of 9) intron (NM_032595, intron 7 of 9) -6213 NM_001257359 201191 Hs.567769 NM_174920 ENSG00000167100 SAMD14 - sterile alpha motif domain containing 14 protein-coding 280.667-14 chr10 132693614 132694016 + 1 NA intron (NM_005539, intron 5 of 15) L1MC2|LINE|L1 12540 NM_001321042 3632 Hs.523360 NM_005539 ENSG00000068383 INPP5A 5PTASE inositol polyphosphate-5-phosphatase A protein-coding 250.667-20 chr14 70622946 70623255 + 1 NA intron (NR_110071, intron 2 of 2) L1M4|LINE|L1 18198 NR_110071 101928075 Hs.737532 NR_110071 ENSG00000245466 LOC101928075 - uncharacterized LOC101928075 ncRNA 174.667-86 chr2 77553004 77553182 + 1 NA Intergenic Intergenic -30660 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 374.667 chr1 169935955 169936789 + 1 NA intron (NM_014970, intron 19 of 19) intron (NM_014970, intron 19 of 19) -42413 NM_181093 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 249.333-77 chr4 106253607 106254052 + 1 NA intron (NM_033115, intron 3 of 23) MER68B|LTR|ERVL -61781 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 148.667-83 chr11 120216825 120217036 + 1 NA intron (NM_178507, intron 1 of 3) intron (NM_178507, intron 1 of 3) 5898 NM_178507 220323 Hs.445081 NM_178507 ENSG00000184232 OAF NS5ATP13TP2 out at first homolog protein-coding 362.667 chr1 22332272 22332796 + 1 NA Intergenic Intergenic 66295 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 161.667-190 chr4 76203979 76204168 + 1 NA intron (NM_001204255, intron 1 of 8) intron (NM_001204255, intron 1 of 8) 9751 NM_005506 950 Hs.349656 NM_005506 ENSG00000138760 SCARB2 AMRF|CD36L2|EPM4|HLGP85|LGP85|LIMP-2|LIMPII|SR-BII scavenger receptor class B member 2 protein-coding 209.667-107 chr7 122532897 122533227 + 1 NA intron (NM_001167940, intron 8 of 29) intron (NM_001167940, intron 8 of 29) 166055 NM_139175 168433 Hs.126730 NM_139175 ENSG00000188050 RNF133 - ring finger protein 133 protein-coding 162.333-44 chr11 93362365 93362656 + 1 NA intron (NM_181645, intron 4 of 13) L1M4|LINE|L1 31793 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 162.667-168 chr22 35548738 35548914 + 1 NA intron (NM_014310, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 7995 NM_014310 23551 Hs.474711 NM_014310 ENSG00000100302 RASD2 Rhes|TEM2 RASD family member 2 protein-coding 146.667-89 chr13 73949985 73950233 + 1 NA intron (NM_007249, intron 2 of 7) intron (NM_007249, intron 2 of 7) 183820 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 243.667-46 chr2 189214628 189215092 + 1 NA Intergenic Intergenic -35099 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 165.333-132 chr2 133084690 133084884 + 1 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 169230 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 132.667-60 chr15 85582510 85582685 + 1 NA intron (NM_007200, intron 7 of 36) intron (NM_007200, intron 7 of 36) -37353 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 290.333-9 chr13 94383929 94384481 + 1 NA intron (NM_005708, intron 7 of 8) intron (NM_005708, intron 7 of 8) 95477 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 170.667-171 chr9 28210869 28211044 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 508349 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 158.333-258 chr5 68967695 68967961 + 1 NA TTS (NR_130778) TTS (NR_130778) 62099 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 152.333-86 chr12 53134342 53134535 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 30055 NM_001244706 51380 Hs.279815 NM_015989 ENSG00000139631 CSAD CSD|PCAP cysteine sulfinic acid decarboxylase protein-coding 145.667-15 chr1 101064869 101065173 + 1 NA intron (NR_109849, intron 1 of 4) intron (NR_109849, intron 1 of 4) 39175 NR_109849 102606465 Hs.593669 NR_109849 LOC102606465 - uncharacterized LOC102606465 ncRNA 189.667-27 chr11 78524352 78524612 + 1 NA intron (NM_024678, intron 6 of 13) intron (NM_024678, intron 6 of 13) -8694 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 281.333-50 chr5 103423091 103423439 + 1 NA Intergenic Intergenic 118720 NR_104670 102467212 Hs.641885 NR_104670 ENSG00000248757 LINC02115 - long intergenic non-protein coding RNA 2115 ncRNA 159.333-329 chr8 96402001 96402239 + 1 NA Intergenic Intergenic -14682 NR_125828 102724804 Hs.571415 NR_125828 ENSG00000253105 LOC102724804 - uncharacterized LOC102724804 ncRNA 135.667-58 chr15 56185294 56185579 + 1 NA intron (NM_001370561, intron 4 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 4496 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 153.333-431 chr8 120260115 120260313 + 1 NA intron (NM_021110, intron 23 of 47) Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 135112 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 154.667-23 chr1 187290821 187290997 + 1 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) -152719 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 143.667-223 chr6 158529857 158530010 + 1 NA Intergenic Intergenic -6503 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 201.333-4 chr1 27401627 27401873 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 9128 NM_005281 2827 Hs.66542 NM_005281 ENSG00000181773 GPR3 ACCA G protein-coupled receptor 3 protein-coding 219.667-20 chr14 52795280 52795564 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -3815 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 131.333-82 chr2 47919063 47919253 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -13365 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 168.667-54 chr13 90159070 90159365 + 1 NA Intergenic Intergenic -39500 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 187.667-78 chr2 183501532 183501740 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 377193 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 142.333-170 chr4 33571788 33572057 + 1 NA Intergenic Intergenic 467971 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 155.333-29 chr10 66136811 66137030 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) AluSz|SINE|Alu 565495 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 231.333-100 chr6 51063433 51063799 + 1 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 244745 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 150.667-341 chr6 140940066 140940351 + 1 NA Intergenic Intergenic 256394 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 165.667-211 chr9 70992538 70992846 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) MER3|DNA|hAT-Charlie -123640 NM_206948 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 146.667-7 chr1 50679422 50679664 + 1 NA intron (NM_007051, intron 7 of 18) L2|LINE|L2 -256100 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 153.667-259 chr3 105244581 105244741 + 1 NA Intergenic Intergenic -122052 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 205.333-160 chr3 153942471 153942818 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -178359 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 150.667-271 chr4 80165450 80165701 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -19695 NM_020226 56978 Hs.373642 NM_020226 ENSG00000152784 PRDM8 EPM10|KMT8D|PFM5 PR/SET domain 8 protein-coding 143.333-164 chr21 29154018 29154227 + 1 NA intron (NM_001286620, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 8545 NM_001286624 56911 Hs.222802 NM_020152 ENSG00000156265 MAP3K7CL C21orf7|HC21ORF7|TAK1L|TAKL|TAKL-1|TAKL-2|TAKL-4 MAP3K7 C-terminal like protein-coding 131.667-30 chr10 131971224 131971399 + 1 NA intron (NM_004052, intron 3 of 5) intron (NM_004052, intron 3 of 5) 10702 NM_004052 664 Hs.144873 NM_004052 ENSG00000176171 BNIP3 NIP3 BCL2 interacting protein 3 protein-coding 138.667-18 chr10 68048380 68048647 + 1 NA intron (NM_001278185, intron 3 of 23) L1MC1|LINE|L1 26770 NM_001278187 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 142.333-46 chr11 104666892 104667067 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -57677 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 132.333-194 chr9 111849010 111849272 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -47673 NM_003358 7357 Hs.304249 NM_003358 ENSG00000148154 UGCG GCS|GLCT1 UDP-glucose ceramide glucosyltransferase protein-coding 140.333-177 chr5 37418872 37419024 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 5 of 17) AluSx1|SINE|Alu 39630 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 159.667-171 chr2 77842194 77842396 + 1 NA intron (NR_110288, intron 2 of 3) MER5A|DNA|hAT-Charlie -73639 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 232.333-38 chr2 438250 438547 + 1 NA Intergenic Intergenic 54257 NR_146437 727944 NR_146436 ENSG00000223985 LINC01874 - long intergenic non-protein coding RNA 1874 ncRNA 382.333-2 chr12 127926407 127926894 + 1 NA intron (NR_046392, intron 1 of 4) L1PB2|LINE|L1 11240 NR_046392 100862680 Hs.385496 NR_046392 ENSG00000256193 LINC00507 - long intergenic non-protein coding RNA 507 ncRNA 168.333-161 chr5 63921172 63921422 + 1 NA Intergenic Intergenic 40995 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 161.667-122 chr2 23425616 23425782 + 1 NA intron (NM_052920, intron 1 of 13) intron (NM_052920, intron 1 of 13) 40520 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 157.333-287 chr5 105702077 105702311 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 602720 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 290.667-20 chr18 72834939 72835382 + 1 NA 3' UTR (NM_001354022, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001354022, exon 5 of 5) 18222 NR_049858 100847083 NR_049858 ENSG00000263750 MIR548AV - microRNA 548av ncRNA 147.667-99 chr14 44956143 44956333 + 1 NA intron (NM_017658, intron 1 of 4) FLAM_C|SINE|Alu 5247 NM_001308112 54813 Hs.550906 NM_017658 ENSG00000179454 KLHL28 BTBD5 kelch like family member 28 protein-coding 277.333-11 chr10 114487923 114488478 + 1 NA intron (NM_001352440, intron 7 of 20) intron (NM_001352440, intron 7 of 20) 38713 NM_001322898 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 144.667-199 chr3 111748950 111749218 + 1 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) 16588 NM_001134437 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 224.667-20 chr13 88687622 88687973 + 1 NA Intergenic Intergenic 60944 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 126.333-91 chr2 83761051 83761258 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 238340 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 146.667-76 chr12 62244411 62244800 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -15735 NM_001252079 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 263.667-81 chr8 136582310 136582783 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 51748 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 162.333-241 chr7 99912324 99912579 + 1 NA intron (NM_033091, intron 1 of 5) AluSz6|SINE|Alu 7079 NM_033091 89122 Hs.50749 NM_033017 ENSG00000146833 TRIM4 RNF87 tripartite motif containing 4 protein-coding 166.667-98 chr18 13248896 13249162 + 1 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) L1MA5A|LINE|L1 9486 NR_146617 147276 Hs.675872 NR_146617 ENSG00000279020 C18orf15 HsT3231 chromosome 18 open reading frame 15 (putative) ncRNA 209.667-106 chr7 103821516 103821962 + 1 NA intron (NM_005045, intron 3 of 64) intron (NM_005045, intron 3 of 64) 167777 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 146.667-180 chr2 177028476 177028654 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 183846 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 147.333-192 chr20 48335389 48335632 + 1 NA Intergenic Intergenic -24401 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 183.667-128 chr6 121631790 121632045 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 196271 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 186.667 chr1 14109777 14110168 + 1 NA Intergenic Intergenic 310001 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 162.333-110 chr2 46383407 46383688 + 1 NA intron (NM_001430, intron 15 of 15) MIR|SINE|MIR 10620 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 141.333-230 chr7 136133867 136134122 + 1 NA Intergenic Intergenic -156635 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 139.333-112 chr2 116405436 116405759 + 1 NA Intergenic Intergenic 1061782 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 159.333-126 chr17 74376793 74377073 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 9427 NM_181790 350383 Hs.574368 NM_181790 ENSG00000257008 GPR142 GPRg1b|PGR2 G protein-coupled receptor 142 protein-coding 161.667-191 chr4 76487768 76487967 + 1 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) intron (NM_020859, intron 1 of 10) 52638 NM_020859 57619 Hs.683808 NM_020859 ENSG00000138771 SHROOM3 APXL3|MSTP013|SHRM|ShrmL shroom family member 3 protein-coding 170.333-191 chr6 145906105 145906423 + 1 NA intron (NM_001370328, intron 27 of 31) L2a|LINE|L2 57833 NM_173082 257218 Hs.723297 NM_173082 ENSG00000146414 SHPRH bA545I5.2 SNF2 histone linker PHD RING helicase protein-coding 121.667-122 chr3 16915049 16915277 + 1 NA intron (NM_001144382, intron 1 of 5).2 intron (NM_001144382, intron 1 of 5).2 -17927 NM_015184 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 169.333-240 chr7 31244688 31245019 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 95873 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 121.667-101 chr2 188188854 188189048 + 1 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) intron (NR_126396, intron 1 of 2) 98740 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 278.667-26 chr2 108190305 108190718 + 1 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) L1PA16|LINE|L1 27330 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 228.667-74 chr7 55128513 55128866 + 1 NA intron (NM_001346900, intron 1 of 27) intron (NM_001346900, intron 1 of 27) 18850 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 159.333-230 chr4 30530261 30530460 + 1 NA Intergenic Intergenic -190009 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 132.667-119 chr4 30620346 30620576 + 1 NA Intergenic Intergenic -99908 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 113.667-62 chr14 63386147 63386361 + 1 NA intron (NR_104104, intron 10 of 12) MIRb|SINE|MIR -67319 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 165.333-163 chr3 32804888 32805079 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -13014 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 180.667-157 chrX 45808523 45808781 + 1 NA Intergenic Intergenic 42838 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 184.667-128 chr8 24208642 24208935 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -85252 NM_021777 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 172.667-98 chr3 86720765 86721078 + 1 NA Intergenic Intergenic 238978 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 272.667-9 chr10 92537380 92537776 + 1 NA intron (NR_136399, intron 1 of 25) intron (NR_136399, intron 1 of 25) 35928 NM_001322796 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 159.667-82 chr12 61517584 61517786 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 675154 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 186.333-89 chr20 34614150 34614362 + 1 NA intron (NM_080476, intron 7 of 11) AluJb|SINE|Alu 55538 NM_032514 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 230.333-112 chr7 106645575 106645852 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 15445 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 147.667-237 chr3 109572621 109572842 + 1 NA Intergenic Intergenic -30097 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 157.667-188 chr3 33225677 33225860 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -6958 NM_015551 26032 Hs.196647 NM_015551 ENSG00000173705 SUSD5 - sushi domain containing 5 protein-coding 156.667-23 chr1 154253578 154253740 + 1 NA intron (NM_001127320, intron 14 of 24) AluY|SINE|Alu -6068 NR_145714 109617023 NR_145714 ENSG00000201129 SNORA58B - small nucleolar RNA, H/ACA box 58B snoRNA 143.667-265 chr9 30725366 30725669 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -317063 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 152.333-345 chr6 156728762 156729047 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -48951 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 116.333-107 chr2 14228517 14228667 + 1 NA TTS (NR_103814) TTS (NR_103814) 172366 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 125.333-80 chr18 64534723 64534932 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -274772 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 167.333-135 chr2 112954674 112954875 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -23232 NM_019618 56300 Hs.211238 NM_019618 ENSG00000136688 IL36G IL-1F9|IL-1H1|IL-1RP2|IL1E|IL1F9|IL1H1|IL1RP2 interleukin 36 gamma protein-coding 166.333-112 chr2 58985192 58985457 + 1 NA intron (NR_033873, intron 6 of 13) L1MEd|LINE|L1 -232384 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 178.667-87 chr2 205536794 205536993 + 1 NA intron (NM_205863, intron 20 of 21) intron (NM_205863, intron 20 of 21) -145607 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 138.333-82 chr18 72067966 72068138 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -285826 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 159.333-201 chr22 30217298 30217498 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21796 NR_149070 110806283 NR_149070 ENSG00000232530 LIF-AS1 Lnc-LIF-AS LIF antisense RNA 1 ncRNA 150.333-127 chr15 58332019 58332225 + 1 NA Intergenic Intergenic -99869 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 183.333-14 chr10 11616372 11616697 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -4745 NR_125732 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 134.333-10 chr1 211587086 211587332 + 1 NA Intergenic Intergenic -8048 NM_021194 7779 Hs.519469 NM_021194 ENSG00000170385 SLC30A1 ZNT1|ZRC1 solute carrier family 30 member 1 protein-coding 253.667-43 chr3 130332891 130333272 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -12435 NR_022012 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 365.667-2 chr1 201624775 201625212 + 1 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -23329 NM_020443 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 156.333-10 chr1 56427420 56427657 + 1 NA Intergenic Intergenic 12575 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 158.667-350 chr9 38406342 38406610 + 1 NA TTS (NM_001007563) TTS (NM_001007563) 13774 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 220.667-113 chr9 79173185 79173433 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -27643 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 149.333-285 chr4 87606078 87606247 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -2367 NM_014208 1834 Hs.678914 NM_014208 ENSG00000152591 DSPP DFNA39|DGI1|DMP3|DPP|DSP dentin sialophosphoprotein protein-coding 148.333-143 chr15 75583060 75583233 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3831 NM_002833 5780 Hs.445775 NM_002833 ENSG00000169410 PTPN9 MEG2|PTPMEG2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 9 protein-coding 164.667-22 chr10 32320588 32320896 + 1 NA intron (NM_001282391, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu 26416 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 158.667-270 chr5 68782561 68782747 + 1 NA Intergenic Intergenic 247273 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 159.667-66 chr11 86157875 86158119 + 1 NA Intergenic Intergenic -86387 NM_001330334 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 225.667-40 chr2 121277632 121277949 + 1 NA intron (NM_014553, intron 2 of 14) L1ME4a|LINE|L1 7412 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 175.333-146 chr5 104013987 104014259 + 1 NA Intergenic Intergenic -451334 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 197.667-85 chr3 89830730 89831014 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 723251 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 214.667-115 chr8 79385252 79385694 + 1 NA Intergenic Intergenic 53285 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 179.667-57 chr16 14261298 14261568 + 1 NA exon (NM_001365414, exon 15 of 15) exon (NM_001365414, exon 15 of 15) -40855 NR_132983 100129781 Hs.190748 NR_132983 MIR193BHG - MIR193B host gene ncRNA 150.333-392 chr7 132855429 132855626 + 1 NA intron (NR_133671, intron 6 of 10) intron (NR_133671, intron 6 of 10) 96557 NR_134332 100506937 Hs.98247 NR_134332 ENSG00000225881 LOC100506937 - uncharacterized LOC100506937 ncRNA 278.333-44 chr8 77755958 77756356 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 305460 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 158.667-240 chr4 58362584 58362803 + 1 NA Intergenic LTR06|LTR|ERV1 173635 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 169.667-125 chr22 23156042 23156233 + 1 NA intron (NM_001349878, intron 6 of 10) intron (NM_001349878, intron 6 of 10) 10660 NR_146295 9609 Hs.353024 NM_004914 ENSG00000100228 RAB36 - RAB36, member RAS oncogene family protein-coding 241.333-18 chr10 80560425 80560909 + 1 NA intron (NM_001145719, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 19848 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 166.667-14 chr1 114662030 114662307 + 1 NA intron (NM_001256404, intron 1 of 20) intron (NM_001256404, intron 1 of 20) 7881 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 146.667-46 chr10 107559011 107559174 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -394386 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 146.667-13 chr1 89667783 89667933 + 1 NA intron (NM_032270, intron 1 of 2) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 34738 NM_032270 84230 Hs.412836 NM_032270 ENSG00000171488 LRRC8C AD158|FAD158 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit C protein-coding 202.333-53 chr13 79055254 79055553 + 1 NA Intergenic Intergenic -215353 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 145.667-62 chr12 50196662 50196813 + 1 NA intron (NM_001243775, intron 1 of 4) intron (NM_001243775, intron 1 of 4) 4796 NM_001243775 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 159.333-350 chr9 33454661 33454968 + 1 NA Intergenic Intergenic -7221 NM_001318144 360 Hs.234642 NM_004925 ENSG00000165272 AQP3 AQP-3|GIL aquaporin 3 (Gill blood group) protein-coding 247.333-55 chr4 49103483 49103972 + 1 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 117085 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 183.333-148 chr7 26196540 26196891 + 1 NA intron (NM_002137, intron 4 of 10) intron (NM_002137, intron 4 of 10) 4031 NM_031243 3181 Hs.487774 NM_002137 ENSG00000122566 HNRNPA2B1 HNRNPA2|HNRNPB1|HNRPA2|HNRPA2B1|HNRPB1|IBMPFD2|RNPA2|SNRPB1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 protein-coding 137.667-195 chr9 114817222 114817480 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -11312 NM_005118 9966 Hs.23349 NM_005118 ENSG00000181634 TNFSF15 TL1|TL1A|TNLG1B|VEGI|VEGI192A TNF superfamily member 15 protein-coding 133.667-97 chr3 76895012 76895230 + 1 NA Intergenic Intergenic -144978 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 133.667-116 chr4 172283143 172283304 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 3 of 12) intron (NM_001034845, intron 3 of 12) 405694 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 162.667-282 chr8 122800132 122800315 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 18568 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 229.333-121 chr8 123482216 123482516 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 49777 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 224.333-14 chr10 29563482 29563792 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 4 of 38) MIR|SINE|MIR -18540 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 127.333-77 chr2 59489954 59490137 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 272337 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 173.333-22 chr10 15651526 15651859 + 1 NA intron (NM_001291494, intron 10 of 28) intron (NM_001291494, intron 10 of 28) 68230 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 166.667-128 chr2 229104062 229104265 + 1 NA intron (NM_001330157, intron 1 of 1) intron (NM_001330157, intron 1 of 1) 127929 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 266.333-38 chr3 133655873 133656194 + 1 NA intron (NM_001363889, intron 5 of 27) intron (NM_001363889, intron 5 of 27) 5908 NM_001363889 11073 Hs.593379 NM_007027 ENSG00000163781 TOPBP1 Dpb11|TOP2BP1 DNA topoisomerase II binding protein 1 protein-coding 179.667-40 chr13 76156832 76157108 + 1 NA Intergenic Intergenic -221838 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 162.667-266 chr8 74442216 74442384 + 1 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) 91897 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 165.667-69 chr16 90017566 90017877 + 1 NA intron (NM_001288708, intron 1 of 4) intron (NM_001288708, intron 1 of 4) 1735 NM_001042610 79007 Hs.301394 NM_024043 ENSG00000003249 DBNDD1 - dysbindin domain containing 1 protein-coding 249.333-2 chr1 48875394 48875692 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) intron (NM_001323575, intron 5 of 12) -98574 NM_001302082 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 148.667-78 chr11 83137021 83137315 + 1 NA Intergenic Intergenic -19963 NM_015885 51585 Hs.128959 NM_015885 ENSG00000165494 PCF11 - PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit protein-coding 148.667-203 chr2 152629673 152629874 + 1 NA intron (NM_052905, intron 19 of 25) intron (NM_052905, intron 19 of 25) 87688 NM_001365604 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 252.333-66 chr6 62920833 62921158 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 398982 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 183.333-79 chr2 10085076 10085462 + 1 NA Intergenic Intergenic -4858 NM_001037160 192668 Hs.27092 NM_001037160 ENSG00000205795 CYS1 - cystin 1 protein-coding 136.333-225 chrX 80668497 80668705 + 1 NA TTS (NM_153252) TTS (NM_153252) 141276 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 132.667-142 chr5 112596342 112596556 + 1 NA Intergenic LTR102_Mam|LTR|ERVL -31987 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 156.667-76 chr12 26411657 26411839 + 1 NA intron (NM_002223, intron 51 of 56) Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger 216175 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 150.333-35 chr10 54475058 54475296 + 1 NA intron (NM_001142773, intron 2 of 31) intron (NM_001142773, intron 2 of 31) -11053 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 162.667-149 chr2 212047142 212047312 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 2 of 26) intron (NM_001042599, intron 2 of 26) 379133 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 146.667-361 chrX 41232026 41232239 + 1 NA intron (NM_001039591, intron 44 of 44) intron (NM_001039591, intron 44 of 44) -43607 NR_135616 105373185 Hs.546119 NR_135616 ENSG00000223714 LINC02601 - long intergenic non-protein coding RNA 2601 ncRNA 214.333-60 chr17 33559563 33559917 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -25980 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 145.667-23 chr1 214842187 214842390 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -163254 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 314.667-41 chr9 121817924 121818238 + 1 NA Intergenic Intergenic 75296 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 161.667-69 chr14 22813560 22813761 + 1 NA intron (NM_001126105, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu 1775 NR_040448 9056 Hs.513147 NM_003982 ENSG00000155465 SLC7A7 LAT3|LPI|MOP-2|Y+LAT1|y+LAT-1 solute carrier family 7 member 7 protein-coding 282.333-63 chr9 109898651 109899088 + 1 NA intron (NM_053016, intron 3 of 6) L2b|LINE|L2 118671 NM_053016 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 161.333-296 chr9 2266073 2266338 + 1 NA Intergenic Intergenic 107749 NM_001289400 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 142.333-234 chr8 55524165 55524335 + 1 NA 3' UTR (NM_052898, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_052898, exon 3 of 3) -3272 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 211.667-22 chr10 84239772 84240147 + 1 NA intron (NM_015613, intron 1 of 3) intron (NM_015613, intron 1 of 3) 1587 NM_015613 26103 Hs.226000 NM_015613 ENSG00000148602 LRIT1 FIGLER9|LRRC21|PAL leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 1 protein-coding 165.333-96 chr16 75692503 75692782 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 8819 NM_001351307 100033411 NM_001351307 ENSG00000282757 DUXB - double homeobox B protein-coding 145.667-51 chr11 93490084 93490238 + 1 NA intron (NM_020179, intron 2 of 2) intron (NM_020179, intron 2 of 2) 53230 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 223.333-102 chr3 17829374 17829629 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 86557 NR_135536 105376975 Hs.543238 NR_135536 LOC105376975 - uncharacterized LOC105376975 ncRNA 189.667-51 chr15 69693905 69694215 + 1 NA intron (NR_126437, intron 5 of 5) LTR50|LTR|ERVL 101860 NR_126437 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 143.667-86 chr15 78296269 78296509 + 1 NA intron (NM_001303248, intron 1 of 8) AluSc|SINE|Alu 3220 NM_001303248 80349 Hs.513055 NM_025234 ENSG00000140395 WDR61 REC14|SKI8 WD repeat domain 61 protein-coding 159.333-221 chr3 145024916 145025075 + 1 NA Intergenic Intergenic 1044190 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 281.667-49 chr7 50023271 50023615 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 5 of 7) L1MCb|LINE|L1 69803 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 118.333-48 chr11 131078955 131079106 + 1 NA Intergenic Intergenic -162543 NM_001347926 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 179.333-165 chr6 93798319 93798648 + 1 NA Intergenic Intergenic 80180 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 167.667-214 chr8 141263883 141264143 + 1 NA Intergenic Intergenic -9384 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 149.333-191 chr2 117775417 117775574 + 1 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -39196 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 165.667-216 chr9 90867139 90867402 + 1 NA intron (NM_001174167, intron 7 of 13) intron (NM_001174167, intron 7 of 13) 39850 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 236.667-28 chr14 99081739 99082153 + 1 NA Intergenic Intergenic 190251 NM_022898 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 172.333-104 chr22 41526308 41526661 + 1 NA 3' UTR (NM_001018052, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001018052, exon 5 of 5) 17986 NM_001018050 171568 Hs.712617 NM_138338 ENSG00000100413 POLR3H RPC22.9|RPC8 RNA polymerase III subunit H protein-coding 165.333-226 chr6 67694820 67695009 + 1 NA Intergenic Intergenic -360437 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 148.667-246 chr3 41911435 41911645 + 1 NA intron (NM_017886, intron 10 of 36) intron (NM_017886, intron 10 of 36) 50563 NM_001322501 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 217.333-9 chr1 108685528 108685779 + 1 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -6657 NM_001349766 55119 Hs.342307 NM_018061 ENSG00000134186 PRPF38B NET1 pre-mRNA processing factor 38B protein-coding 152.667-158 chr19 28895207 28895450 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -69803 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 263.667-52 chr20 11450726 11451040 + 1 NA Intergenic Intergenic -177500 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 375.333-18 chr4 29320857 29321508 + 1 NA Intergenic Intergenic 106890 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 336.333-26 chr4 91133726 91134273 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) AluSg|SINE|Alu 898968 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 122.333-139 chr3 118229482 118229725 + 1 NA Intergenic Intergenic -412165 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 192.333-44 chr13 49739301 49739664 + 1 NA intron (NM_002267, intron 2 of 16) intron (NM_002267, intron 2 of 16) -47995 NR_103802 84650 Hs.433278 NM_032565 ENSG00000123179 EBPL EBRP EBP like protein-coding 127.333-114 chr3 106503133 106503384 + 1 NA Intergenic Intergenic -633857 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 152.667-48 chr10 87925942 87926107 + 1 NA intron (NM_001304717, intron 4 of 9) intron (NM_001304717, intron 4 of 9) 62399 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 153.333-433 chr8 133935648 133935838 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 49247 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 211.333-57 chr14 20988510 20988855 + 1 NA Intergenic Intergenic -1298 NM_022734 64745 Hs.512693 NM_022734 ENSG00000165792 METTL17 METT11D1 methyltransferase like 17 protein-coding 190.667-108 chr5 176957032 176957407 + 1 NA intron (NM_016290, intron 7 of 14) intron (NM_016290, intron 7 of 14) 49223 NM_016290 51720 Hs.232721 NM_016290 ENSG00000087206 UIMC1 RAP80|X2HRIP110 ubiquitin interaction motif containing 1 protein-coding 148.333-310 chr5 42319193 42319347 + 1 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL -104169 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 172.667-79 chr2 32160236 32160470 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5488 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 153.333-199 chr2 69420383 69420570 + 1 NA intron (NR_045632, intron 2 of 5) intron (NR_045632, intron 2 of 5) 16959 NR_045631 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 192.333-135 chr5 15001200 15001494 + 1 NA Intergenic Intergenic -129569 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 232.333-53 chr22 26532290 26532649 + 1 NA intron (NM_003595, intron 5 of 6) AluSg|SINE|Alu 19937 NR_144529 100507599 Hs.405877 NR_144529 LOC100507599 - uncharacterized LOC100507599 ncRNA 346.667-8 chr20 50963714 50964298 + 1 NA TTS (NM_014484) TTS (NM_014484) 5188 NM_014484 27304 Hs.159410 NM_014484 ENSG00000124217 MOCS3 UBA4 molybdenum cofactor synthesis 3 protein-coding 160.667-296 chr8 24136948 24137119 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -157007 NM_021777 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 168.667-12 chr1 202805351 202805559 + 1 NA intron (NM_001314042, intron 1 of 27) intron (NM_001314042, intron 1 of 27) 4015 NM_001347591 10765 Hs.18891 NM_006618 ENSG00000117139 KDM5B CT31|JARID1B|MRT65|PLU-1|PLU1|PPP1R98|PUT1|RBBP2H1A|RBP2-H1 lysine demethylase 5B protein-coding 285.333-69 chr8 77051002 77051494 + 1 NA Intergenic Intergenic -50204 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 149.667-342 chr6 34887761 34887919 + 1 NA exon (NM_005643, exon 1 of 5) exon (NM_005643, exon 1 of 5) 202 NM_005643 6882 Hs.112444 NM_005643 ENSG00000064995 TAF11 MGC:15243|PRO2134|TAF2I|TAFII28 TATA-box binding protein associated factor 11 protein-coding 248.333-44 chr2 80046966 80047369 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -180584 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 237.333-85 chr4 143621427 143621813 + 1 NA intron (NM_001168235, intron 4 of 7) L2b|LINE|L2 62148 NR_003675 441046 Hs.135705 NM_001011539 ENSG00000236296 GUSBP5 GYPELOC441046 GUSB pseudogene 5 pseudo 111.667-232 chr7 8335119 8335287 + 1 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) intron (NR_125740, intron 3 of 5) -72591 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 129.667-56 chr14 58193739 58194016 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -6272 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 157.333-330 chr8 38257682 38257840 + 1 NA intron (NR_156417, intron 15 of 16) AluSz|SINE|Alu 11459 NM_032483 84513 Hs.567619 NM_032483 ENSG00000147535 PLPP5 DPPL1|HTPAP|PPAPDC1B phospholipid phosphatase 5 protein-coding 142.333-145 chr20 57905247 57905492 + 1 NA Intergenic Intergenic -98535 NR_147083 105376992 Hs.736662 NR_147083 ENSG00000275852 LINC01742 - long intergenic non-protein coding RNA 1742 ncRNA 176.333-44 chr14 19870195 19870397 + 1 NA Intergenic Intergenic -1123 NR_145507 283617 NM_001348266 ENSG00000176290 OR4K3 OR14-10|OR4K3P olfactory receptor family 4 subfamily K member 3 (gene/pseudogene) protein-coding 159.667-124 chr16 58763365 58763563 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -29148 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 172.333-173 chr7 141889109 141889289 + 1 NA Intergenic Intergenic -29677 NM_001001656 130075 Hs.690171 NM_001001656 ENSG00000258083 OR9A4 - olfactory receptor family 9 subfamily A member 4 protein-coding 215.333-142 chr4 42108473 42108774 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 44032 NM_001159547 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 165.667-157 chr5 42904692 42904911 + 1 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 88532 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 115.667-77 chr14 68946269 68946416 + 1 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) intron (NM_001102, intron 1 of 20) 32960 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 242.333-24 chr12 130007761 130008164 + 1 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL 34380 NR_024457 100190940 Hs.625993 NR_024457 ENSG00000214039 LINC02418 - long intergenic non-protein coding RNA 2418 ncRNA 184.667-42 chr17 35205232 35205562 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -11004 NM_152462 146861 Hs.514814 NM_152462 ENSG00000164729 SLC35G3 AMAC1|TMEM21A solute carrier family 35 member G3 protein-coding 192.333-153 chr6 140567833 140568131 + 1 NA Intergenic Intergenic -115832 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 209.333-218 chr7 50402382 50402832 + 1 NA 3' UTR (NM_001291842, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001291842, exon 5 of 5) 47743 NM_001042762 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 158.667-279 chr5 172829385 172829583 + 1 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -4767 NM_001031711 57222 Hs.509163 NM_020462 ENSG00000113719 ERGIC1 AMCN|ERGIC-32|ERGIC32|NET24 endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment 1 protein-coding 157.333-28 chr1 172291610 172291858 + 1 NA intron (NR_146559, intron 16 of 20) L2b|LINE|L2 -128951 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 202.667-120 chr5 111136549 111136832 + 1 NA Intergenic Intergenic 44518 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 231.667-60 chr8 102312340 102312766 + 1 NA intron (NM_001282873, intron 16 of 58) intron (NM_001282873, intron 16 of 58) 73102 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 157.667-143 chr2 71477514 71477833 + 1 NA intron (NM_001130985, intron 1 of 54) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 10974 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 160.667-36 chr10 65047871 65048052 + 1 NA Intergenic Intergenic -123443 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 161.333-234 chr5 101379989 101380203 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -476814 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 187.667-101 chr4 19051159 19051484 + 1 NA Intergenic Intergenic -1029446 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 156.333-75 chr12 29769490 29769670 + 1 NA intron (NM_175861, intron 1 of 17) intron (NM_175861, intron 1 of 17) 14362 NM_001367875 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 132.333-81 chr2 47754642 47754805 + 1 NA Intergenic Intergenic -28359 NM_000179 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 145.333-51 chr11 30721722 30722030 + 1 NA Intergenic Intergenic -135523 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 249.667-17 chr11 37210360 37210826 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -612314 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 148.333-229 chr20 50239800 50239999 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27587 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 185.333-10 chr1 105531015 105531302 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 87777 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 152.333-385 chr8 117451770 117451938 + 1 NA Intergenic Intergenic -68859 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 145.667-147 chr2 138166253 138166488 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 64486 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 212.667 chr1 28479664 28480047 + 1 NA intron (NM_023923, intron 7 of 12) AluSq|SINE|Alu -26088 NR_002909 8420 Hs.469723 NR_002909 ENSG00000242125 SNHG3 NCRNA00014|RNU17C|RNU17D|U17HG|U17HG-A|U17HG-AB small nucleolar RNA host gene 3 ncRNA 149.333-244 chr3 69378487 69378688 + 1 NA intron (NM_015123, intron 1 of 22) intron (NM_015123, intron 1 of 22) 7501 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 133.333-32 chr11 39070061 39070230 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 421287 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 246.667-8 chr1 177252659 177253222 + 1 NA intron (NM_021165, intron 2 of 7) L1MA6|LINE|L1 81982 NM_021165 57795 Hs.495918 NM_021165 ENSG00000198797 BRINP2 DBCCR1L2|FAM5B BMP/retinoic acid inducible neural specific 2 protein-coding 207.667-99 chr5 43380339 43380672 + 1 NA 3' UTR (NM_001301875, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001301875, exon 3 of 3) 16632 NM_001301875 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 351.667-9 chr2 63814008 63814591 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -26665 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 165.333-130 chr2 102885115 102885297 + 1 NA intron (NR_135562, intron 3 of 3) intron (NR_135562, intron 3 of 3) 10516 NR_135562 105373518 Hs.738351 NR_135562 ENSG00000277527 LINC01796 - long intergenic non-protein coding RNA 1796 ncRNA 148.333-186 chr2 59651578 59651738 + 1 NA Intergenic Intergenic 433950 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 211.667-15 chr10 20255163 20255487 + 1 NA intron (NM_032812, intron 13 of 13) intron (NM_032812, intron 13 of 13) -296645 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 163.667-174 chr4 35077308 35077640 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -807727 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 133.667-82 chr2 209951795 209951956 + 1 NA intron (NM_032504, intron 46 of 63) L1ME3|LINE|L1 -50690 NM_001318927 6120 Hs.282260 NM_006916 ENSG00000197713 RPE RPE2-1 ribulose-5-phosphate-3-epimerase protein-coding 210.667-62 chr2 13855361 13855783 + 1 NA Intergenic Intergenic 545386 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 195.333-230 chr9 135752129 135752527 + 1 NA intron (NM_001272003, intron 3 of 30) HAL1|LINE|L1 50143 NM_001272003 57582 Hs.104950 NM_020822 ENSG00000107147 KCNT1 EIEE14|ENFL5|KCa4.1|SLACK|Slo2.2|bA100C15.2 potassium sodium-activated channel subfamily T member 1 protein-coding 183.667-62 chr17 51699385 51699618 + 1 NA intron (NM_001082533, intron 5 of 9) intron (NM_001082533, intron 5 of 9) 264074 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 187.333-40 chr12 9668553 9668896 + 1 NA promoter-TSS (NR_036693) promoter-TSS (NR_036693) -989 NM_001197317 29121 Hs.268326 NM_013269 ENSG00000069493 CLEC2D CLAX|LLT1|OCIL C-type lectin domain family 2 member D protein-coding 114.333-211 chr7 115003653 115003805 + 1 NA intron (NM_001166345, intron 4 of 4) L2b|LINE|L2 -75229 NR_120521 102724386 Hs.352357 NR_120521 ENSG00000225535 LINC01393 - long intergenic non-protein coding RNA 1393 ncRNA 127.667-38 chr12 73222267 73222429 + 1 NA Intergenic Intergenic 63158 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 466.667-3 chr2 51531920 51532473 + 1 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) L1ME1|LINE|L1 499595 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 364.333-29 chr9 37796306 37796794 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -4004 NM_001286810 79269 Hs.118394 NM_024345 ENSG00000122741 DCAF10 WDR32 DDB1 and CUL4 associated factor 10 protein-coding 117.667-189 chr8 74906694 74906898 + 1 NA Intergenic Intergenic -77709 NM_031461 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 136.667-32 chr11 83105758 83106029 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 33827 NR_038903 100506233 Hs.503429 NR_038903 ENSG00000246067 RAB30-DT RAB30-AS1 RAB30 divergent transcript ncRNA 276.667-28 chr14 83633861 83634397 + 1 NA Intergenic Intergenic 991497 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 167.667-200 chr7 110145030 110145341 + 1 NA Intergenic Intergenic -184972 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 196.333-150 chr5 169226514 169226825 + 1 NA intron (NM_003062, intron 3 of 35) MIRb|SINE|MIR 37025 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 198.667-59 chr14 56454078 56454392 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -60096 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 159.667-164 chr2 42019843 42020068 + 1 NA Intergenic Intergenic -28066 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 134.667-110 chr2 207421238 207421447 + 1 NA Intergenic Intergenic -108620 NR_135473 1385 Hs.516646 NM_004379 ENSG00000118260 CREB1 CREB|CREB-1 cAMP responsive element binding protein 1 protein-coding 147.667-75 chr12 72731037 72731286 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -428029 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 149.667-61 chr10 72796929 72797225 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 76048 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 185.333-169 chr6 123620526 123620726 + 1 NA intron (NM_001256020, intron 1 of 8) intron (NM_001256020, intron 1 of 8) 16324 NM_001251987 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 114.667-79 chr14 50477339 50477519 + 1 NA intron (NM_198794, intron 6 of 31) L1ME4a|LINE|L1 55140 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 237.667-32 chr18 34944863 34945237 + 1 NA Intergenic Intergenic -31878 NM_001143826 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 127.667-21 chr10 101738523 101738716 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 37495 NM_006119 2253 Hs.57710 NM_006119 ENSG00000107831 FGF8 AIGF|FGF-8|HBGF-8|HH6|KAL6 fibroblast growth factor 8 protein-coding 220.333-127 chr8 27338592 27339018 + 1 NA intron (NM_173175, intron 1 of 29) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 13241 NM_173175 2185 Hs.491322 NM_004103 ENSG00000120899 PTK2B CADTK|CAKB|FADK2|FAK2|PKB|PTK|PYK2|RAFTK protein tyrosine kinase 2 beta protein-coding 147.667-240 chr3 116030640 116030919 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 2 of 8) intron (NM_001318915, intron 2 of 8) -125653 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 171.667-173 chr8 127847238 127847459 + 1 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) L1MC4a|LINE|L1 51386 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 188.667-96 chr22 33101981 33102199 + 1 NA Intergenic Intergenic -6439 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 240.667-34 chr17 31515787 31516065 + 1 NA intron (NM_001346748, intron 1 of 12) intron (NM_001346748, intron 1 of 12) -18957 NR_039877 100616248 NR_039877 ENSG00000284424 MIR4724 mir-4724 microRNA 4724 ncRNA 299.333-37 chr2 21243421 21243953 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 119701 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 193.667-21 chr10 88297207 88297481 + 1 NA intron (NM_001031709, intron 6 of 6) L1ME1|LINE|L1 285974 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 154.667-284 chr4 122128978 122129179 + 1 NA Intergenic Intergenic -41525 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 253.667-47 chr4 41078021 41078515 + 1 NA intron (NM_173075, intron 3 of 16) HAL1|LINE|L1 136274 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 136.333-106 chr2 189112596 189112835 + 1 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) 20396 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 342.333-7 chr15 40622262 40622733 + 1 NA exon (NM_170589, exon 11 of 27) exon (NM_170589, exon 11 of 27) 28248 NM_170589 57082 Hs.181855 NM_144508 ENSG00000137812 KNL1 AF15Q14|CASC5|CT29|D40|MCPH4|PPP1R55|Spc7|hKNL-1|hSpc105 kinetochore scaffold 1 protein-coding 282.333-15 chr14 65342160 65342475 + 1 NA Intergenic Intergenic -7134 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 213.333-141 chr3 189783535 189783907 + 1 NA intron (NM_003722, intron 3 of 13) L1M5|LINE|L1 -5938 NM_001329146 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 253.333-34 chr16 9240472 9240957 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -114874 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 260.667-8 chr1 181076750 181077223 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -11714 NM_016545 51278 Hs.15725 NM_016545 ENSG00000162783 IER5 SBBI48 immediate early response 5 protein-coding 143.667-271 chr9 125952228 125952493 + 1 NA intron (NR_024122, intron 4 of 7) intron (NR_024122, intron 4 of 7) 204177 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 246.333-94 chr7 134923359 134923787 + 1 NA intron (NM_033139, intron 1 of 12) intron (NM_033139, intron 1 of 12) 32115 NM_033140 800 Hs.490203 NM_004342 ENSG00000122786 CALD1 CDM|H-CAD|HCAD|L-CAD|LCAD|NAG22 caldesmon 1 protein-coding 149.667-168 chr18 12689599 12689763 + 1 NA intron (NM_001271989, intron 6 of 10) intron (NM_001271989, intron 6 of 10) 13042 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 140.667-153 chr3 138257205 138257480 + 1 NA intron (NM_001282342, intron 10 of 19) intron (NM_001282342, intron 10 of 19) 69811 NM_001267042 25852 Hs.744868 NM_014154 ENSG00000114098 ARMC8 GID5|HSPC056|S863-2|VID28 armadillo repeat containing 8 protein-coding 198.667-113 chr2 214959546 214959910 + 1 NA intron (NR_103740, intron 41 of 54) intron (NR_103740, intron 41 of 54) 72358 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 164.667-10 chr1 97219116 97219288 + 1 NA intron (NM_000110, intron 19 of 22) intron (NM_000110, intron 19 of 22) 123279 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 205.667-136 chr9 72334983 72335215 + 1 NA intron (NR_110952, intron 3 of 4) MIR3|SINE|MIR 29457 NM_001278243 7763 Hs.406096 NM_006007 ENSG00000107372 ZFAND5 ZA20D2|ZFAND5A|ZNF216 zinc finger AN1-type containing 5 protein-coding 300.667-15 chr18 41277597 41278133 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 242812 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 227.333-13 chr1 206640065 206640554 + 1 NA intron (NM_001004023, intron 3 of 3) intron (NM_001004023, intron 3 of 3) 4773 NM_003582 8444 Hs.164267 NM_003582 ENSG00000143479 DYRK3 DYRK5|RED|REDK|hYAK3-2 dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 3 protein-coding 171.333-42 chr14 28096348 28096715 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -423310 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 231.333-112 chr7 112286914 112287483 + 1 NA intron (NM_021994, intron 2 of 11) AluJr|SINE|Alu 80503 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 235.667-48 chr4 122631154 122631516 + 1 NA intron (NR_104126, intron 7 of 10) intron (NR_104126, intron 7 of 10) -10269 NM_021803 59067 Hs.567559 NM_021803 ENSG00000138684 IL21 CVID11|IL-21|Za11 interleukin 21 protein-coding 326.333-30 chr7 26575340 26575806 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -36748 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 206.667-100 chr4 67035970 67036202 + 1 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL 385914 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 149.333-177 chr2 62703859 62704087 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 1 of 22) intron (NM_001142615, intron 1 of 22) -1651 NM_001354212 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 251.667-90 chr7 108380408 108380970 + 1 NA intron (NR_163871, intron 2 of 29) AluJb|SINE|Alu -52163 NM_001371177 242.333-91 chr7 87109979 87110298 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 42179 NR_136252 101927420 Hs.633960 NR_136252 ENSG00000224046 LOC101927420 - uncharacterized LOC101927420 ncRNA 307.333-46 chr2 176657900 176658267 + 1 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 20329 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 164.333-97 chr17 75987431 75987713 + 1 NA intron (NM_001113324, intron 2 of 3) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 8332 NM_001113324 100134934 Hs.593566 NM_001113324 ENSG00000257949 TEN1 C17orf106 TEN1 subunit of CST complex protein-coding 158.667-274 chr5 97014812 97015110 + 1 NA exon (NM_175920, exon 13 of 18) exon (NM_175920, exon 13 of 18) 56528 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 147.667-213 chr22 22170468 22170710 + 1 NA Intergenic Intergenic -74197 NM_007128 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 180.667-23 chr11 125897093 125897288 + 1 NA intron (NM_031307, intron 1 of 3) intron (NM_031307, intron 1 of 3) 6016 NM_031307 83480 Hs.660922 NM_031307 ENSG00000110060 PUS3 2610020J05Rik|FKSG32|MRT55 pseudouridine synthase 3 protein-coding 167.333-65 chr12 42529161 42529443 + 1 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) -45292 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 134.667-89 chr18 60716890 60717089 + 1 NA Intergenic Intergenic -344214 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 169.333-114 chr2 29324854 29325065 + 1 NA intron (NM_004304, intron 6 of 28) intron (NM_004304, intron 6 of 28) -101059 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 128.667-121 chr3 111154678 111154924 + 1 NA intron (NM_001243288, intron 7 of 8) L1ME1|LINE|L1 82985 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 224.667-73 chr7 77600700 77601056 + 1 NA intron (NM_001131009, intron 7 of 16) intron (NM_001131009, intron 7 of 16) 62835 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 152.667-207 chr2 192342987 192343229 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -148175 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 287.667-23 chr2 112660735 112661333 + 1 NA intron (NM_005415, intron 9 of 10) intron (NM_005415, intron 9 of 10) 15095 NM_005415 6574 Hs.187946 NM_005415 ENSG00000144136 SLC20A1 GLVR1|Glvr-1|PIT1|PiT-1 solute carrier family 20 member 1 protein-coding 337.333 chr1 33061335 33061787 + 1 NA Intergenic Intergenic -19592 NM_001350401 113451 Hs.101807 NM_052998 ENSG00000142920 AZIN2 ADC|AZI2|AZIB1|ODC-p|ODC1L|ODCp antizyme inhibitor 2 protein-coding 162.667-290 chr9 27115685 27115905 + 1 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) L2a|LINE|L2 6654 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 204.333-160 chr5 63153697 63154066 + 1 NA Intergenic Intergenic 575062 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 180.333-90 chr4 57446063 57446250 + 1 NA intron (NR_125907, intron 4 of 5) intron (NR_125907, intron 4 of 5) 20284 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 279.667-24 chr2 33115593 33116044 + 1 NA intron (NM_206943, intron 4 of 33) intron (NM_206943, intron 4 of 33) -18779 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 154.667-79 chr12 71598488 71598695 + 1 NA Intergenic Intergenic 65257 NM_144982 196441 Hs.245798 NM_144982 ENSG00000133858 ZFC3H1 CCDC131|CSRC2|PSRC2 zinc finger C3H1-type containing protein-coding 182.333-142 chr7 33321737 33322123 + 1 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) L1MA3|LINE|L1 192366 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 194.667-60 chr2 13818515 13818788 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 582307 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 172.333-118 chr3 181375221 181375487 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 67132 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 180.333-148 chr8 144194501 144194747 + 1 NA intron (NM_001099281, intron 9 of 11) L1MC|LINE|L1 45979 NM_001288814 727957 Hs.443139 NM_032450 ENSG00000179832 MROH1 HEATR7A maestro heat like repeat family member 1 protein-coding 287.333-41 chr4 68128656 68129009 + 1 NA intron (NM_207407, intron 1 of 9) intron (NM_207407, intron 1 of 9) 1037 NM_207407 389208 Hs.677557 NM_207407 ENSG00000198092 TMPRSS11F - transmembrane serine protease 11F protein-coding 193.333-2 chr1 40840474 40840709 + 1 NA TTS (NM_172163) TTS (NM_172163) 21772 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 352.333-30 chr8 112760288 112760872 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 117087 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 124.333-153 chr5 152562978 152563226 + 1 NA Intergenic Intergenic -157823 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 145.667-107 chr16 81995952 81996250 + 1 NA 3' UTR (NM_145168, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_145168, exon 3 of 3) 15369 NM_145168 93517 Hs.87779 NM_145168 ENSG00000184860 SDR42E1 HSPC105 short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 protein-coding 284.667-55 chr8 87200740 87201208 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1M4|LINE|L1 334559 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 227.333-39 chr15 51854693 51854972 + 1 NA intron (NM_014547, intron 1 of 9) intron (NM_014547, intron 1 of 9) 25179 NM_014547 29766 Hs.4998 NM_014547 ENSG00000138594 TMOD3 UTMOD tropomodulin 3 protein-coding 150.667-22 chr1 238629337 238629520 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -143411 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 163.333-170 chr21 28892337 28892653 + 1 NA Intergenic Intergenic -7122 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 201.333-185 chr3 70784916 70785351 + 1 NA Intergenic Intergenic 279791 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 310.333-29 chr4 32663841 32664356 + 1 NA Intergenic Intergenic 313060 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 171.667-125 chr4 111704626 111704887 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -440698 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 137.333-175 chr6 145053623 145053823 + 1 NA Intergenic Intergenic 633154 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 261.667-56 chr4 104299203 104299655 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -191536 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-178 chr3 1229190 1229469 + 1 NA intron (NM_001289080, intron 4 of 22) intron (NM_001289080, intron 4 of 22) 136305 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 183.667-43 chr14 49095140 49095372 + 1 NA Intergenic Intergenic 491124 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 152.333-292 chr5 27498837 27499042 + 1 NA Intergenic Intergenic 26647 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 194.667-86 chr22 45872909 45873265 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 104075 NM_058238 7477 Hs.512714 NM_058238 ENSG00000188064 WNT7B - Wnt family member 7B protein-coding 156.333-23 chr1 187388561 187388721 + 1 NA Intergenic Intergenic -54987 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 202.667-78 chr2 33817363 33817739 + 1 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -89334 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 189.333-40 chr12 29993757 29994122 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -209180 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 216.333-40 chr12 86111510 86111832 + 1 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) intron (NM_001351286, intron 4 of 7) 144720 NM_001351289 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 113.333-264 chr8 136085462 136085623 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -445256 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 419.333-17 chr8 125079887 125080753 + 1 NA intron (NM_014846, intron 5 of 28) intron (NM_014846, intron 5 of 28) 11472 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 282.667-28 chr3 55435181 55435530 + 1 NA Intergenic Intergenic 46043 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 124.667-96 chr2 20073257 20073407 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -21704 NM_014713 9741 Hs.467807 NM_014713 ENSG00000068697 LAPTM4A HUMORF13|LAPTM4|MBNT|Mtrp lysosomal protein transmembrane 4 alpha protein-coding 154.667-74 chr12 23380597 23380814 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 203881 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 131.333-148 chr5 148718327 148718557 + 1 NA Intergenic Intergenic -63915 NR_104445 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 148.333-101 chr12 79242595 79242779 + 1 NA intron (NM_001291901, intron 3 of 9) MIRc|SINE|MIR -176570 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 242.667-22 chr11 95849868 95850268 + 1 NA intron (NM_001243571, intron 11 of 17) intron (NM_001243571, intron 11 of 17) 59570 NM_014679 9702 Hs.101014 NM_014679 ENSG00000166037 CEP57 MVA2|PIG8|TSP57 centrosomal protein 57 protein-coding 207.667-114 chr7 77252026 77252350 + 1 NA intron (NM_020879, intron 4 of 18) L1MEf|LINE|L1 -52369 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 206.667-32 chr12 123242724 123243216 + 1 NA intron (NM_001194995, intron 1 of 2) intron (NM_001194995, intron 1 of 2) 9226 NM_001143905 91574 Hs.319128 NM_152269 ENSG00000130921 C12orf65 COXPD7|SPG55 chromosome 12 open reading frame 65 protein-coding 155.333-284 chr5 26606166 26606338 + 1 NA Intergenic Intergenic 432334 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 245.667-22 chr16 10585667 10586034 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5252 NM_001424 2013 Hs.531561 NM_001424 ENSG00000213853 EMP2 XMP epithelial membrane protein 2 protein-coding 125.333-173 chr7 143209076 143209267 + 1 NA intron (NM_001130026, intron 8 of 10) LTR78B|LTR|ERV1 -12866 NM_176882 259286 Hs.352241 NM_176882 ENSG00000221937 TAS2R40 GPR60|T2R40|T2R58 taste 2 receptor member 40 protein-coding 112.333-222 chr5 164826683 164826848 + 1 NA Intergenic Intergenic 356486 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 154.667-78 chr12 53182657 53182859 + 1 NA intron (NM_001004304, intron 2 of 6) intron (NM_001004304, intron 2 of 6) -1833 NM_001244705 51380 Hs.279815 NM_015989 ENSG00000139631 CSAD CSD|PCAP cysteine sulfinic acid decarboxylase protein-coding 132.333-20 chr10 56669363 56669582 + 1 NA Intergenic Intergenic -308199 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 267.333-13 chr10 60988481 60988798 + 1 NA intron (NM_001350902, intron 1 of 11) L1PA16|LINE|L1 12358 NM_001350908 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 151.333-68 chr10 111564056 111564284 + 1 NA Intergenic Intergenic 449879 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 138.333-157 chr5 125823656 125823928 + 1 NA Intergenic Intergenic 330531 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 195.667-139 chr8 46085896 46086231 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 531580 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 168.333-191 chr7 26705313 26705641 + 1 NA intron (NM_003930, intron 9 of 12) intron (NM_003930, intron 9 of 12) 67606 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 166.333-95 chr18 21255651 21255885 + 1 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) intron (NM_001142966, intron 1 of 32) 13526 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 281.333-18 chr14 89213577 89213920 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 203485 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 247.667-7 chr1 211288885 211289174 + 1 NA intron (NM_018254, intron 6 of 10) intron (NM_018254, intron 6 of 10) 29082 NM_018254 55758 Hs.356399 NM_018254 ENSG00000117625 RCOR3 - REST corepressor 3 protein-coding 164.333-79 chr15 78891064 78891280 + 1 NA intron (NM_006791, intron 6 of 11) intron (NM_006791, intron 6 of 11) 18183 NM_001265605 10933 Hs.374503 NM_006791 ENSG00000185787 MORF4L1 Eaf3|FWP006|HsT17725|MEAF3|MORFRG15|MRG15|S863-6 mortality factor 4 like 1 protein-coding 223.667-4 chr1 83788085 83788525 + 1 NA intron (NR_119375, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 72241 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 147.667-131 chr16 85297251 85297488 + 1 NA Intergenic Intergenic 8956 NR_049816 100847022 NR_049816 ENSG00000266307 MIR5093 - microRNA 5093 ncRNA 139.667-70 chr17 78987585 78987877 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7808 NM_005567 3959 Hs.514535 NM_005567 ENSG00000108679 LGALS3BP 90K|BTBD17B|CyCAP|M2BP|MAC-2-BP|TANGO10B|gp90 galectin 3 binding protein protein-coding 149.667-200 chr2 72649569 72649777 + 1 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L1MD|LINE|L1 176360 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 325.667-7 chr15 100992944 100993442 + 1 NA intron (NM_024652, intron 6 of 33) MIR|SINE|MIR 73836 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 243.667-56 chr4 99118000 99118438 + 1 NA intron (NR_037884, intron 1 of 9) intron (NR_037884, intron 1 of 9) 26079 NM_000670 127 Hs.1219 NM_000670 ENSG00000198099 ADH4 ADH-2|HEL-S-4 alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide protein-coding 154.667-69 chr11 112341828 112342113 + 1 NA intron (NR_126004, intron 2 of 3) intron (NR_126004, intron 2 of 3) 71221 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 177.333-135 chr5 162845190 162845511 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -592221 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 116.333-147 chr3 123356255 123356480 + 1 NA intron (NM_183357, intron 1 of 20) L1M4|LINE|L1 59975 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 118.667-152 chr4 146441815 146442005 + 1 NA 3' UTR (NM_001317817, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001317817, exon 4 of 4) 33327 NR_107003 102465837 NR_107003 ENSG00000278438 MIR7849 hsa-mir-7849 microRNA 7849 ncRNA 156.333-230 chr3 39407221 39407513 + 1 NA intron (NM_002295, intron 1 of 6) intron (NM_002295, intron 1 of 6) 647 NM_002295 3921 Hs.449909 NM_002295 ENSG00000168028 RPSA 37LRP|67LR|ICAS|LAMBR|LAMR1|LBP|LBP/p40|LRP|LRP/LR|NEM/1CHD4|SA|lamR|p40 ribosomal protein SA protein-coding 217.667-32 chr16 13052438 13052915 + 1 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 151078 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 152.333-48 chr10 73564577 73564782 + 1 NA intron (NR_146997, intron 4 of 21) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 10996 NM_152586 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 172.667-130 chr6 9383993 9384350 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 731962 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 175.667-2 chr1 35896338 35896538 + 1 NA intron (NM_001317122, intron 8 of 18) AluSz6|SINE|Alu 13229 NM_012199 26523 Hs.22867 NM_012199 ENSG00000092847 AGO1 EIF2C|EIF2C1|GERP95|Q99|hAgo1 argonaute RISC component 1 protein-coding 228.333-32 chr17 17730988 17731398 + 1 NA intron (NM_030665, intron 2 of 5) intron (NM_030665, intron 2 of 5) 35109 NR_130894 100861516 Hs.624874 NR_130894 ENSG00000237328 RAI1-AS1 - RAI1 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-51 chr11 33400401 33400584 + 1 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) intron (NM_012194, intron 1 of 20) 24384 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 181.333-52 chr15 80288096 80288404 + 1 NA intron (NR_033833, intron 1 of 2) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -36037 NM_001352888 100996492 Hs.20034 NM_001352888 ENSG00000259417 CTXND1 LINC01314 cortexin domain containing 1 protein-coding 297.667-38 chr8 101021340 101021808 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -30480 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 132.333-120 chr4 61455981 61456223 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) AluSx1|SINE|Alu 253930 NM_001371342 153.333-67 chr11 43642466 43642764 + 1 NA Intergenic Intergenic -38123 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 167.333-173 chr3 79812972 79813146 + 1 NA Intergenic Intergenic -45061 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 163.667-11 chr1 225641664 225641883 + 1 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) AluSx|SINE|Alu 11350 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 118.333-206 chr8 105837609 105837760 + 1 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) intron (NR_125796, intron 2 of 7) 222819 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 242.333-63 chr22 45833536 45833944 + 1 NA intron (NM_013236, intron 10 of 11) intron (NM_013236, intron 10 of 11) 73216 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 287.667-43 chr9 33415728 33416288 + 1 NA Intergenic Intergenic -13326 NR_134514 364 Hs.455323 NM_001170 ENSG00000165269 AQP7 AQP7L|AQPap|GLYCQTL aquaporin 7 protein-coding 152.667-253 chr3 139161466 139161651 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 57373 NR_026783 60467 Hs.512673 NM_021812 ENSG00000232416 BPESC1 NCRNA00187 blepharophimosis, epicanthus inversus and ptosis candidate 1 ncRNA 139.667-94 chr2 165756592 165756780 + 1 NA intron (NM_004482, intron 7 of 10) intron (NM_004482, intron 7 of 10) 37561 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 160.667-236 chr5 5472941 5473255 + 1 NA intron (NM_015325, intron 15 of 18) L1MD3|LINE|L1 50421 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 165.333-147 chr21 14218022 14218233 + 1 NA intron (NR_135309, intron 1 of 3) intron (NR_135309, intron 1 of 3) 1970 NR_135308 54033 Hs.283828 NM_144770 ENSG00000185272 RBM11 - RNA binding motif protein 11 protein-coding 160.667-101 chr15 45747163 45747440 + 1 NA intron (NR_135680, intron 1 of 4) intron (NR_135680, intron 1 of 4) 42106 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 183.667-148 chr9 21595392 21595662 + 1 NA Intergenic Intergenic -35729 NR_027054 554202 Hs.458096 NR_027054 MIR31HG LncHIFCAR|hsa-lnc-31 MIR31 host gene ncRNA 119.333-209 chr8 64648629 64648783 + 1 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) intron (NM_004820, intron 1 of 5) -66814 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 195.667-16 chr11 4463669 4463953 + 1 NA Intergenic HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 14516 NM_001005172 119774 Hs.553568 NM_001005172 ENSG00000181963 OR52K2 OR11-7 olfactory receptor family 52 subfamily K member 2 protein-coding 160.333-80 chr12 120865665 120865884 + 1 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) MER1A|DNA|hAT-Charlie 38584 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 194.667-134 chr6 46450453 46450697 + 1 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) L1MA8|LINE|L1 40748 NM_001251974 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 202.333-71 chr16 69551609 69552018 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 14055 NR_031719 100302119 NR_031719 ENSG00000223109 MIR1538 MIRN1538|hsa-mir-1538 microRNA 1538 ncRNA 171.667-122 chr4 62795902 62796178 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -634275 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-92 chr12 55353132 55353322 + 1 NA Intergenic Intergenic -11884 NM_001005497 390323 Hs.554554 NM_001005497 ENSG00000187857 OR6C75 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 75 protein-coding 160.333-199 chr3 172085580 172085884 + 1 NA intron (NM_001135095, intron 1 of 25) intron (NM_001135095, intron 1 of 25) 45201 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 262.333-71 chr6 55329308 55329780 + 1 NA intron (NM_207410, intron 1 of 8) intron (NM_207410, intron 1 of 8) 2075 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 205.667-69 chr2 68665691 68666149 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 22332 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 161.333-202 chr3 159577655 159577821 + 1 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 190874 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 249.667-56 chr22 23068794 23069301 + 1 NA intron (NM_014433, intron 4 of 6) intron (NM_014433, intron 4 of 6) -1472 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 205.333-50 chr12 15045334 15045653 + 1 NA Intergenic Intergenic 43660 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 167.667-127 chr21 27527489 27527811 + 1 NA Intergenic Intergenic -194729 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 234.667-116 chr9 69545245 69545592 + 1 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 126953 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 203.333-252 chr7 130118427 130118869 + 1 NA intron (NM_014997, intron 3 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -23083 NR_149034 100128325 Hs.105944 NR_149033 ENSG00000229196 LOC100128325 - uncharacterized LOC100128325 ncRNA 248.667-30 chr12 128227825 128228196 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -39393 NM_001136103 92293 Hs.49599 NM_001136103 ENSG00000181234 TMEM132C PPP1R152 transmembrane protein 132C protein-coding 155.667-150 chr2 22042422 22042596 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -331857 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 153.667-406 chr9 83153089 83153374 + 1 NA Intergenic Intergenic -90089 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 236.667-78 chr7 4553348 4553772 + 1 NA Intergenic Intergenic -128735 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 143.333-65 chr12 52635468 52635723 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 16616 NM_000423 3849 Hs.707 NM_000423 ENSG00000172867 KRT2 CK-2e|K2e|KRT2A|KRT2E|KRTE keratin 2 protein-coding 230.667-19 chr15 80997104 80997531 + 1 NA TTS (NR_039739) TTS (NR_039739) 156 NR_039739 100616181 NR_039739 ENSG00000265855 MIR4514 - microRNA 4514 ncRNA 250.333-29 chr18 69999776 70000212 + 1 NA Intergenic Intergenic -43195 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 139.333-108 chr2 34216219 34216379 + 1 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) LTR16E2|LTR|ERVL 149073 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 146.667-140 chr18 2300158 2300317 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 271268 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 168.333-85 chr19 28686786 28687064 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 40769 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 204.333-143 chr4 121343821 121344113 + 1 NA intron (NM_198179, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 37051 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 149.667-407 chr8 117288347 117288503 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 153430 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 215.333-128 chr3 51919699 51920051 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -16522 NM_152397 132141 Hs.671210 NM_152397 ENSG00000173389 IQCF1 - IQ motif containing F1 protein-coding 124.667-97 chr2 29924578 29924772 + 1 NA Intergenic Intergenic -3089 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 155.667-37 chr10 68716081 68716261 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -5068 NM_018237 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 173.667-20 chr10 72491311 72491604 + 1 NA intron (NM_001195519, intron 1 of 6) intron (NM_001195519, intron 1 of 6) 32529 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 143.667-132 chr2 122573551 122573782 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 499815 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 120.333-57 chr14 79364728 79364897 + 1 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 85432 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 132.333-85 chr2 66971200 66971457 + 1 NA non-coding (NR_110169, exon 5 of 5) non-coding (NR_110169, exon 5 of 5) -48838 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 199.667-147 chr8 138601674 138601946 + 1 NA intron (NM_152888, intron 60 of 64) intron (NM_152888, intron 60 of 64) -104080 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 125.333-18 chr10 23293557 23293734 + 1 NA intron (NM_001365862, intron 5 of 15) intron (NM_001365862, intron 5 of 15) -50312 NR_155752 105376453 NR_155752 LOC105376453 - uncharacterized LOC105376453 ncRNA 184.333-60 chr17 71519763 71520052 + 1 NA Intergenic Intergenic -317728 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 154.667-301 chr5 18860659 18860838 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 1025524 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 259.333-103 chr8 125727794 125728335 + 1 NA Intergenic Intergenic 223133 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 193.333-78 chr17 78074216 78074490 + 1 NA intron (NM_018996, intron 8 of 20) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 37446 NR_040071 100131096 Hs.635442 NR_040071 ENSG00000204282 TNRC6C-AS1 TMC6|lnc TNRC6C antisense RNA 1 ncRNA 127.667-137 chr5 22869549 22869759 + 1 NA Intergenic Intergenic -16310 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 141.333-151 chr3 83129661 83129823 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 1143600 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 147.333-206 chr22 41884840 41885071 + 1 NA exon (NM_004599, exon 11 of 19) exon (NM_004599, exon 11 of 19) -15989 NR_029507 407039 NR_029507 ENSG00000207932 MIR33A MIR33|MIRN33|MIRN33A|hsa-mir-33|hsa-mir-33a|miR-33|miRNA33A|mir-33a microRNA 33a ncRNA 275.333-79 chr8 117750884 117751285 + 1 NA Intergenic Intergenic 169829 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 176.667-28 chr10 57323818 57324157 + 1 NA Intergenic Intergenic -19428 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 278.667-30 chr20 51848052 51848573 + 1 NA intron (NR_110016, intron 1 of 2) intron (NR_110016, intron 1 of 2) 14601 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 189.333-22 chr1 216990326 216990654 + 1 NA intron (NM_001134285, intron 1 of 8) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -50817 NM_001243512 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 268.333-53 chr8 34636024 34636343 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -147738 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 148.333-221 chr20 16091029 16091265 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -105265 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 111.667-117 chr18 58345506 58345635 + 1 NA intron (NM_001144965, intron 16 of 30) intron (NM_001144965, intron 16 of 30) -105504 NR_029667 406906 NR_029667 ENSG00000284440 MIR122 MIR122A|MIRN122|MIRN122A|hsa-mir-122|miRNA122|miRNA122A|mir-122 microRNA 122 ncRNA 118.333-108 chr2 88360480 88360666 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 92120 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 163.667-237 chr7 68038708 68038964 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 18583 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 162.667-182 chr3 154034235 154034420 + 1 NA intron (NR_037901, intron 2 of 3) intron (NR_037901, intron 2 of 3) -86676 NM_001251962 26084 Hs.240845 NM_015595 ENSG00000114790 ARHGEF26 CSGEF|HMFN1864|SGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 26 protein-coding 159.333-231 chr4 31790185 31790468 + 1 NA Intergenic Intergenic -207053 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 148.667-304 chr5 36415572 36415769 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -113768 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 129.667-73 chr16 64419432 64419644 + 1 NA Intergenic Intergenic 702525 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 144.333-71 chr14 50591491 50591698 + 1 NA exon (NM_001127713, exon 5 of 14) exon (NM_001127713, exon 5 of 14) 31569 NM_181598 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 328.333-28 chr3 28113272 28113691 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -128138 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 429.667-6 chr8 124392655 124393309 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -20283 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 305.333-68 chr7 68850872 68851469 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 746454 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 241.333-89 chr6 153257989 153258458 + 1 NA Intergenic Intergenic -126941 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 157.333-239 chr3 100613086 100613263 + 1 NA intron (NM_032787, intron 1 of 15) AluSz|SINE|Alu 3573 NM_032787 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 528.667 chr1 175494487 175495596 + 1 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) 248554 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 313.667-40 chr9 13876548 13877094 + 1 NA Intergenic Intergenic -51150 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 132.667-147 chr5 145044465 145044621 + 1 NA Intergenic Intergenic 790799 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 170.667-74 chr2 25684585 25684881 + 1 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -11059 NM_001256304 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 160.667-207 chr3 159249243 159249497 + 1 NA intron (NM_001197114, intron 2 of 9) intron (NM_001197114, intron 2 of 9) -23877 NM_001197108 29970 Hs.134665 NM_014575 ENSG00000151967 SCHIP1 SCHIP-1 schwannomin interacting protein 1 protein-coding 123.333-227 chr9 15261755 15262020 + 1 NA intron (NM_001168340, intron 2 of 18) intron (NM_001168340, intron 2 of 18) -11669 NM_001168342 158219 Hs.563630 NM_152574 ENSG00000155158 TTC39B C9orf52 tetratricopeptide repeat domain 39B protein-coding 200.333-81 chr20 35478868 35479108 + 1 NA intron (NM_007186, intron 17 of 34) intron (NM_007186, intron 17 of 34) 19005 NM_001318219 11190 Hs.443976 NM_007186 ENSG00000126001 CEP250 C-NAP1|CEP2|CNAP1|CRDHL2 centrosomal protein 250 protein-coding 257.667-11 chr10 89955669 89956145 + 1 NA non-coding (NR_110655, exon 3 of 4) non-coding (NR_110655, exon 3 of 4) 1466 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 118.333-62 chr14 30288996 30289195 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -270028 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 117.333-143 chr4 21819725 21819905 + 1 NA intron (NM_147182, intron 1 of 8) intron (NM_147182, intron 1 of 8) 33373 NR_002813 359822 Hs.354058 NR_002813 ENSG00000280650 KCNIP4-IT1 NCRNA00099|UM9(5)|UM9-5 KCNIP4 intronic transcript 1 ncRNA 235.333-63 chr2 235045108 235045504 + 1 NA intron (NM_001371302, intron 4 of 5) intron (NM_001371302, intron 4 of 5) 17571 NM_001371306 147.667-25 chr1 197993831 197994081 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 76584 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 129.333-186 chr8 64453600 64453822 + 1 NA Intergenic Intergenic 74562 NR_029669 406908 NR_029669 ENSG00000207816 MIR124-2 MIRN124-2|MIRN124A2|mir-124-2 microRNA 124-2 ncRNA 135.333-126 chr4 71891687 71891877 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -86262 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 218.333-21 chr11 18009440 18009752 + 1 NA intron (NR_104040, intron 1 of 11) MIR3|SINE|MIR 3451 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 339.667-11 chr2 78265456 78265901 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1PA15|LINE|L1 25053 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 277.333-4 chr1 156607438 156607824 + 1 NA Intergenic Intergenic -6144 NM_182679 54865 Hs.193832 NM_015590 ENSG00000160818 GPATCH4 GPATC4 G-patch domain containing 4 protein-coding 138.667-43 chr12 24385253 24385461 + 1 NA intron (NM_152989, intron 2 of 17) Tigger5|DNA|TcMar-Tigger 162086 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 169.333-10 chr1 180485241 180485490 + 1 NA intron (NM_032360, intron 3 of 7) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 17212 NM_032360 84320 Hs.200051 NM_032360 ENSG00000230124 ACBD6 - acyl-CoA binding domain containing 6 protein-coding 249.667-8 chr10 21630417 21630868 + 1 NA intron (NM_001195626, intron 8 of 22) LTR40b|LTR|ERVL 96470 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 132.667-153 chr6 69357327 69357483 + 1 NA intron (NM_001704, intron 28 of 31) L3|LINE|CR1 439061 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 151.667-257 chr4 124019108 124019384 + 1 NA Intergenic Intergenic 244982 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 203.667-129 chr8 123077816 123078079 + 1 NA intron (NM_001363156, intron 2 of 19) AluSz|SINE|Alu 4698 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 291.667-21 chr21 30377615 30378049 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -2454 NR_036221 100422891 NR_036221 ENSG00000265007 MIR4327 - microRNA 4327 ncRNA 168.667-228 chr8 126494149 126494380 + 1 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 64214 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 194.667-170 chrX 109358071 109358415 + 1 NA Intergenic LTR1E|LTR|ERV1 123843 NM_001522 2986 Hs.123074 NM_001522 ENSG00000101890 GUCY2F CYGF|GC-F|GUC2DL|GUC2F|RETGC-2|ROS-GC2 guanylate cyclase 2F, retinal protein-coding 282.333-21 chr17 28847983 28848380 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -5391 NM_001288639 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 186.333-68 chr2 14542468 14542762 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -90102 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 155.333-193 chr2 236796693 236796866 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 226954 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 279.667-37 chr5 132755543 132755935 + 1 NA TTS (NM_015146) TTS (NM_015146) 8294 NM_001287252 645121 Hs.522057 NM_001039780 ENSG00000205089 CCNI2 - cyclin I family member 2 protein-coding 215.333-157 chr5 53009174 53009569 + 1 NA intron (NR_073107, intron 1 of 28) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 20019 NR_073107 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 156.333-163 chr19 44433111 44433284 + 1 NA intron (NM_001278510, intron 4 of 5) AluJr|SINE|Alu 15275 NM_014518 7772 Hs.709348 NM_014518 ENSG00000278318 ZNF229 - zinc finger protein 229 protein-coding 153.333-52 chr10 77313183 77313444 + 1 NA intron (NM_001322838, intron 1 of 29) intron (NM_001322838, intron 1 of 29) 37448 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 187.667-146 chr8 129308324 129308623 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -67233 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 136.333-209 chr8 100067211 100067364 + 1 NA intron (NM_001286693, intron 4 of 25) intron (NM_001286693, intron 4 of 25) 38339 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 149.667-257 chr3 82499894 82500156 + 1 NA Intergenic Intergenic 513883 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 327.333-20 chr2 103088725 103089254 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -104560 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 144.333-84 chr15 69320903 69321170 + 1 NA intron (NM_001104554, intron 1 of 8) intron (NM_001104554, intron 1 of 8) 6633 NM_001104554 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 140.333-130 chr21 33683829 33684128 + 1 NA intron (NM_001001132, intron 1 of 29) intron (NM_001001132, intron 1 of 29) 41477 NM_001331011 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 177.333-155 chr7 89305199 89305498 + 1 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) intron (NM_181646, intron 2 of 3) -509611 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 253.333-62 chr20 4099066 4099399 + 1 NA Intergenic AluSq10|SINE|Alu -49547 NM_001270691 54498 Hs.433337 NM_175839 ENSG00000088826 SMOX C20orf16|PAO|PAO-1|PAO1|PAOH|PAOH1|SMO spermine oxidase protein-coding 161.333-13 chr1 195244928 195245290 + 1 NA Intergenic Intergenic 843606 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 137.667-51 chr13 74198713 74198936 + 1 NA Intergenic Intergenic -32620 NR_144451 100507612 Hs.447508 NR_144451 ENSG00000235532 LINC00402 - long intergenic non-protein coding RNA 402 ncRNA 239.667-47 chr4 11874537 11874959 + 1 NA Intergenic Intergenic 91570 NR_162127 113218507 NR_162127 MIR12113 - microRNA 12113 ncRNA 147.333-325 chr8 130567011 130567204 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -123433 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 179.667-13 chr1 228744305 228744652 + 1 NA non-coding (NR_037962, exon 3 of 3) non-coding (NR_037962, exon 3 of 3) 8999 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 154.667-196 chr2 184115119 184115308 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -263762 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 171.667-154 chr7 45297634 45297824 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 139938 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 135.333-7 chr1 73019267 73019454 + 1 NA Intergenic Intergenic -286810 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 154.667-181 chr2 103977845 103978057 + 1 NA Intergenic Intergenic 430381 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 156.667-223 chr3 40707900 40708179 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 183079 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 157.667-72 chr12 31858323 31858566 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 28759 NR_135029 105369723 Hs.736954 NR_135029 ENSG00000255760 LINC02422 - long intergenic non-protein coding RNA 2422 ncRNA 123.667-71 chr17 56869304 56869463 + 1 NA 3' UTR (NM_003647, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_003647, exon 12 of 12) 15530 NR_027025 246754 Hs.720736 NR_027025 MTVR2 - mouse mammary tumor virus receptor homolog 2 pseudo 352.333-19 chr4 58263729 58264183 + 1 NA Intergenic Intergenic 272372 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 146.333-341 chr8 126725512 126725739 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -167147 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 247.333-35 chr18 65657837 65658268 + 1 NA Intergenic Intergenic -92200 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 148.333-136 chr15 25033132 25033335 + 1 NA non-coding (NR_146168, exon 1 of 1) non-coding (NR_146168, exon 1 of 1) 1360 NR_146168 100506965 Hs.592473 NR_146168 PWAR6 HBT8|PAR-6 Prader Willi/Angelman region RNA 6 ncRNA 163.667-14 chr1 230003179 230003510 + 1 NA intron (NR_135116, intron 1 of 1) intron (NR_135116, intron 1 of 1) 627 NR_135116 101927532 Hs.40183 NR_135116 ENSG00000228058 LINC01736 - long intergenic non-protein coding RNA 1736 ncRNA 197.333-28 chr10 123322623 123322844 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 168331 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 144.667-203 chr3 145447598 145447858 + 1 NA Intergenic Intergenic 621457 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 210.667-125 chr8 79811339 79811722 + 1 NA intron (NR_110954, intron 3 of 5) AluSz6|SINE|Alu 43388 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 386.333-12 chr4 60406888 60407490 + 1 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -515430 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 139.333-203 chr7 106028507 106028741 + 1 NA intron (NM_152750, intron 17 of 18) intron (NM_152750, intron 17 of 18) 65360 NM_152750 222256 Hs.150120 NM_152750 ENSG00000128536 CDHR3 CDH28 cadherin related family member 3 protein-coding 122.667-22 chr10 118736799 118736960 + 1 NA intron (NM_153810, intron 1 of 8) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 18091 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 138.667-142 chr3 186721710 186721857 + 1 NA intron (NM_001102416, intron 2 of 9) intron (NM_001102416, intron 2 of 9) 4424 NM_001102416 3827 Hs.77741 NM_000893 ENSG00000113889 KNG1 BDK|BK|HMWK|KNG kininogen 1 protein-coding 161.667-270 chr9 71141843 71142099 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -20350 NM_001366148 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 303.333-29 chr15 100458956 100459477 + 1 NA intron (NM_001290341, intron 12 of 13) L1ME4b|LINE|L1 85070 NM_001290342 204219 Hs.662371 NM_178842 ENSG00000154227 CERS3 ARCI9|LASS3 ceramide synthase 3 protein-coding 148.333-211 chr2 206379165 206379454 + 1 NA Intergenic Intergenic -64223 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 356.333-8 chr11 74612163 74613058 + 1 NA intron (NM_001363597, intron 4 of 11) intron (NM_001363597, intron 4 of 11) 20028 NR_046410 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 380.667-13 chr6 39818778 39819446 + 1 NA intron (NM_015345, intron 1 of 24) intron (NM_015345, intron 1 of 24) 26115 NM_015345 23500 Hs.357128 NM_015345 ENSG00000146122 DAAM2 dJ90A20A.1 dishevelled associated activator of morphogenesis 2 protein-coding 164.667-203 chr6 87671291 87671506 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 30835 NM_018064 55122 Hs.485915 NM_018064 ENSG00000135334 AKIRIN2 C6orf166|FBI1|dJ486L4.2 akirin 2 protein-coding 151.667-367 chr8 88036680 88036956 + 1 NA 3' UTR (NM_005941, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_005941, exon 10 of 10) -162803 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 304.667-12 chr14 69141831 69142318 + 1 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 10525 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 152.667-360 chr8 42432959 42433216 + 1 NA intron (NM_006749, intron 8 of 10) L1MB2|LINE|L1 41207 NM_005662 7419 Hs.699301 NM_005662 ENSG00000078668 VDAC3 HD-VDAC3|VDAC-3 voltage dependent anion channel 3 protein-coding 160.333-20 chr1 116901748 116902026 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8029 NM_020440 5738 Hs.418093 NM_020440 ENSG00000134247 PTGFRN CD315|CD9P-1|EWI-F|FPRP|SMAP-6 prostaglandin F2 receptor inhibitor protein-coding 183.667-31 chr11 84815483 84815727 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -94663 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 148.667-319 chr5 106340582 106340834 + 1 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 670306 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 159.667-301 chr7 49978348 49978525 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) intron (NM_001159878, intron 7 of 7) 114810 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 165.333-54 chr12 14614545 14614792 + 1 NA intron (NR_120465, intron 4 of 5) intron (NR_120465, intron 4 of 5) -46785 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 217.333-63 chr2 43691869 43692331 + 1 NA intron (NM_172069, intron 3 of 29) intron (NM_172069, intron 3 of 29) -15671 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 130.667-86 chr17 45306954 45307095 + 1 NA intron (NM_003954, intron 1 of 15) AluSz6|SINE|Alu 9996 NM_003954 9020 Hs.404183 NM_003954 ENSG00000006062 MAP3K14 FTDCR1B|HS|HSNIK|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 protein-coding 197.333-86 chr17 60702024 60702469 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 4 of 25) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 24395 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 114.667-163 chr22 22183546 22183686 + 1 NA Intergenic Intergenic -61170 NM_007128 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 155.333-106 chr14 61801414 61801658 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -10626 NM_001367650 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 258.333-14 chr11 83325571 83326193 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -39475 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 146.667-319 chr7 111012205 111012448 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) -78680 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 153.333-417 chr8 101020331 101020505 + 1 NA Intergenic Intergenic -31636 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 122.333-22 chr10 82102700 82102905 + 1 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) L1MEf|LINE|L1 130118 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 157.667-196 chr3 124717572 124717731 + 1 NA intron (NM_007064, intron 26 of 26) AluY|SINE|Alu -12715 NR_033437 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 192.667-5 chr1 97650142 97650505 + 1 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) intron (NM_000110, intron 8 of 22) -146598 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 151.333-234 chr2 202233985 202234170 + 1 NA intron (NR_163943, intron 1 of 5) intron (NR_163943, intron 1 of 5) 4520 NM_001005781 7341 Hs.81424 NM_003352 ENSG00000116030 SUMO1 DAP1|GMP1|OFC10|PIC1|SENP2|SMT3|SMT3C|SMT3H3|UBL1 small ubiquitin like modifier 1 protein-coding 176.667-62 chr15 89161635 89161948 + 1 NA intron (NM_007011, intron 9 of 14) L1MC5|LINE|L1 59788 NM_000326 6017 Hs.1933 NM_000326 ENSG00000140522 RLBP1 CRALBP retinaldehyde binding protein 1 protein-coding 245.333-48 chr15 66422138 66422493 + 1 NA intron (NM_002755, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 35442 NM_002755 5604 Hs.145442 NM_002755 ENSG00000169032 MAP2K1 CFC3|MAPKK1|MEK1|MKK1|PRKMK1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 protein-coding 185.667-137 chr8 135721187 135721394 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 263834 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 146.333-125 chr17 67689786 67689982 + 1 NA intron (NM_181671, intron 9 of 9) intron (NM_181671, intron 9 of 9) -27949 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 238.667-10 chr10 44264145 44264434 + 1 NA Intergenic Intergenic -28461 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 277.333-44 chr2 41455436 41455899 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -421888 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 147.667-336 chr7 54562506 54562728 + 1 NA intron (NR_038994, intron 2 of 3) intron (NR_038994, intron 2 of 3) 5647 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 163.667-242 chr7 136358923 136359133 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -381669 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 152.333-78 chr12 20457584 20457816 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 88455 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 157.667-185 chr22 44772470 44772748 + 1 NA intron (NM_181335, intron 1 of 11) L1M5|LINE|L1 20051 NM_001198726 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 144.333-176 chr3 145856662 145856876 + 1 NA Intergenic Intergenic 212416 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 171.333-21 chr10 69217087 69217341 + 1 NA intron (NR_120648, intron 4 of 4) intron (NR_120648, intron 4 of 4) -3118 NM_025130 80201 Hs.522988 NM_025130 ENSG00000156510 HKDC1 - hexokinase domain containing 1 protein-coding 122.333-45 chr12 70133648 70133797 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -109308 NM_001199302 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 257.333-101 chr8 89749019 89749415 + 1 NA intron (NR_125822, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 8494 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 146.333-335 chr8 119568582 119568739 + 1 NA intron (NM_001330600, intron 22 of 25) AluJr|SINE|Alu 24348 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 231.667-43 chr22 35384560 35384900 + 1 NA intron (NM_002133, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 3634 NM_002133 3162 Hs.517581 NM_002133 ENSG00000100292 HMOX1 HMOX1D|HO-1|HSP32|bK286B10 heme oxygenase 1 protein-coding 183.333-169 chr9 31669148 31669575 + 1 NA Intergenic Intergenic -287871 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 161.333-160 chr2 155125943 155126232 + 1 NA Intergenic Intergenic 427392 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 161.333-104 chr16 10062070 10062260 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 119902 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 153.333-167 chr18 1124784 1124940 + 1 NA Intergenic Intergenic -196869 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 220.667-62 chr3 61062459 61062730 + 1 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 188858 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 176.333-103 chr22 25481423 25481741 + 1 NA Intergenic Intergenic 25936 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 158.333-70 chr12 95296609 95296774 + 1 NA intron (NM_001352104, intron 12 of 12) AluSz|SINE|Alu -11729 NR_029895 442903 NR_029895 ENSG00000199172 MIR331 MIRN331|hsa-mir-331|mir-331 microRNA 331 ncRNA 156.333-150 chr18 3491841 3492147 + 1 NA Intergenic Intergenic 25744 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 179.667-56 chr15 95525971 95526167 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 92976 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 161.333-134 chr19 30035240 30035418 + 1 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 93090 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 135.333-158 chr6 52177532 52177713 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -8753 NM_002190 3605 Hs.41724 NM_002190 ENSG00000112115 IL17A CTLA-8|CTLA8|IL-17|IL-17A|IL17 interleukin 17A protein-coding 160.333-146 chr2 100078749 100078936 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) MER2|DNA|TcMar-Tigger 26741 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 244.667-17 chr10 93376824 93377179 + 1 NA intron (NM_013451, intron 22 of 53) intron (NM_013451, intron 22 of 53) 105333 NM_133337 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 152.667-242 chr3 40020299 40020464 + 1 NA intron (NM_001284424, intron 2 of 15) intron (NM_001284424, intron 2 of 15) -79630 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 166.667-248 chrX 35394024 35394326 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -404167 NM_001099921 139604 NM_001099921 ENSG00000189023 MAGEB16 - MAGE family member B16 protein-coding 156.333-281 chr5 39162821 39162998 + 1 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) intron (NM_001243093, intron 2 of 18) 56654 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 187.333-3 chr1 46968794 46969094 + 1 NA intron (NM_001320289, intron 1 of 11) intron (NM_001320289, intron 1 of 11) 7580 NM_001320289 260293 Hs.439760 NM_178033 ENSG00000186377 CYP4X1 CYPIVX1 cytochrome P450 family 4 subfamily X member 1 protein-coding 160.333-260 chr7 9188856 9189023 + 1 NA Intergenic Intergenic -445331 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 152.667-301 chr5 111443373 111443597 + 1 NA intron (NM_001744, intron 5 of 10) intron (NM_001744, intron 5 of 10) -68741 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 212.333-90 chr21 20115844 20116084 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 142721 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 210.667-29 chr12 2697498 2697873 + 1 NA 3' UTR (NM_001129827, exon 49 of 49) 3' UTR (NM_001129827, exon 49 of 49) -6528 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 305.667-24 chr3 112576111 112576724 + 1 NA intron (NM_001348908, intron 3 of 4) AluSc8|SINE|Alu 14372 NM_017945 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 172.333-143 chr5 119238260 119238514 + 1 NA intron (NM_001290321, intron 40 of 43) intron (NM_001290321, intron 40 of 43) -30372 NM_001286815 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 202.667-6 chr1 77597807 77598234 + 1 NA intron (NM_001308237, intron 4 of 13) L1MC3|LINE|L1 84638 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 127.333-198 chr9 80100807 80101013 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 125887 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 168.333-196 chr7 72483998 72484242 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -36977 NM_001363460 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 153.667-69 chr11 58111255 58111409 + 1 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) intron (NM_001005212, intron 2 of 2) 8112 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 148.333-7 chr1 58480454 58480692 + 1 NA TTS (NM_145243) TTS (NM_145243) 66153 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 131.333-11 chr1 156166494 156166742 + 1 NA intron (NM_001370567, intron 9 of 13) intron (NM_001370567, intron 9 of 13) 12070 NM_001370567 64218 Hs.408846 NM_022367 ENSG00000196189 SEMA4A CORD10|RP35|SEMAB|SEMB semaphorin 4A protein-coding 193.667-30 chr12 5624546 5624937 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 17 of 25) L2a|LINE|L2 130609 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 173.667-144 chr5 93018654 93018883 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 552575 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 180.333-116 chr7 25114198 25114475 + 1 NA Intergenic Intergenic 11025 NM_018947 54205 Hs.437060 NM_018947 ENSG00000172115 CYCS CYC|HCS|THC4 cytochrome c, somatic protein-coding 200.667-26 chr10 113249397 113249724 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 120289 NM_001349870 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 115.333-19 chr1 221012281 221012453 + 1 NA Intergenic Intergenic -132227 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 138.333-114 chr21 44451023 44451211 + 1 NA non-coding (NR_047476, exon 4 of 4) non-coding (NR_047476, exon 4 of 4) 4167 NR_047476 100861510 Hs.505254 NR_047476 ENSG00000229356 LRRC3-DT LRRC3-AS1 LRRC3 divergent transcript ncRNA 159.333-242 chr4 92324216 92324443 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 19930 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 162.333-235 chr7 48564954 48565218 + 1 NA intron (NM_152701, intron 55 of 61) L3|LINE|CR1 -359461 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 154.667-91 chr12 123718948 123719109 + 1 NA intron (NM_012463, intron 2 of 19) L1ME3G|LINE|L1 6675 NM_012463 23545 Hs.25786 NM_012463 ENSG00000185344 ATP6V0A2 A2|ARCL|ARCL2A|ATP6A2|ATP6N1D|J6B7|RTF|STV1|TJ6|TJ6M|TJ6S|VPH1|WSS ATPase H+ transporting V0 subunit a2 protein-coding 118.667-59 chr12 125659038 125659210 + 1 NA 3' UTR (NM_001286219, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001286219, exon 5 of 5) 36672 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 160.667-298 chr8 35521860 35522055 + 1 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) -22435 NM_001322818 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 149.667-143 chr15 73237305 73237525 + 1 NA intron (NM_002499, intron 8 of 28) intron (NM_002499, intron 8 of 28) -62495 NR_162148 113219462 NR_162148 MIR12135 - microRNA 12135 ncRNA 119.333-219 chr8 111304262 111304412 + 1 NA Intergenic Intergenic -68134 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 155.667-91 chr14 51494615 51494800 + 1 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) intron (NM_001042481, intron 1 of 14) 5579 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 123.333-223 chr8 133676998 133677158 + 1 NA intron (NR_134462, intron 1 of 2) L1MEc|LINE|L1 6988 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 146.333-144 chr2 41894009 41894213 + 1 NA TTS (NR_033996) TTS (NR_033996) 16556 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 394.667-5 chr3 34062461 34063078 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 264139 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 173.333-68 chr16 64051794 64052124 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 1070104 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 154.667-231 chr3 4305092 4305263 + 1 NA intron (NM_001320678, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 1873 NM_001320676 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 155.667-377 chr9 1998434 1998598 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -16831 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 206.667-124 chr7 12763056 12763577 + 1 NA Intergenic Intergenic 75683 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 307.333-73 chr7 48346147 48346533 + 1 NA intron (NM_152701, intron 29 of 61) intron (NM_152701, intron 29 of 61) 174882 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 161.667-147 chr2 211500572 211500786 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 20 of 26) intron (NM_001042599, intron 20 of 26) 883108 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 191.667-107 chr6 48721593 48721965 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -653090 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 211.667-82 chr3 101355427 101355671 + 1 NA intron (NM_020654, intron 11 of 23) L1PREC2|LINE|L1 -34974 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 192.333-23 chr10 94467634 94467908 + 1 NA intron (NM_015188, intron 2 of 12) AluJo|SINE|Alu 65230 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 160.333-238 chr5 142591183 142591362 + 1 NA TTS (NM_001354962) TTS (NM_001354962) 30062 NM_001144892 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 368.667-2 chr15 70599843 70600247 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -13439 NR_135691 101929151 Hs.434703 NR_135691 ENSG00000280639 LINC02204 - long intergenic non-protein coding RNA 2204 ncRNA 183.667-115 chr5 25269712 25269944 + 1 NA intron (NR_136209, intron 1 of 3) L1PA13|LINE|L1 78875 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 164.333-60 chr12 122183645 122183827 + 1 NA intron (NM_001098519, intron 1 of 11) intron (NM_001098519, intron 1 of 11) 613 NM_001098519 254050 Hs.374856 NM_152759 ENSG00000158113 LRRC43 - leucine rich repeat containing 43 protein-coding 201.333-23 chr1 214729332 214729643 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 126292 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 144.667-127 chr19 55895289 55895516 + 1 NA TTS (NM_176810) TTS (NM_176810) 36934 NM_176810 126204 Hs.446924 NM_176810 ENSG00000173572 NLRP13 CLR19.7|NALP13|NOD14|PAN13 NLR family pyrin domain containing 13 protein-coding 133.333-95 chr21 35379872 35380057 + 1 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 200800 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 175.667-54 chr17 35700668 35700855 + 1 NA intron (NM_001030006, intron 18 of 21) intron (NM_001030006, intron 18 of 21) -30878 NM_033315 91608 Hs.744994 NM_033315 ENSG00000270885 RASL10B RRP17|VTS58635 RAS like family 10 member B protein-coding 247.333-97 chr9 102627394 102627688 + 1 NA intron (NR_103830, intron 3 of 4) L1PA16|LINE|L1 107904 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 307.333-31 chr15 85154228 85154647 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 80344 NR_158179 101929479 Hs.681665 NR_158179 LOC101929479 - golgin A2 pseudogene pseudo 151.333-46 chr10 33542069 33542359 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -207309 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 322.667-19 chr4 41255895 41256567 + 1 NA promoter-TSS (NM_004181) promoter-TSS (NM_004181) 496 NR_102709 101410542 Hs.518731 NR_102709 ENSG00000251173 UCHL1-AS1 - UCHL1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 156.333-9 chr1 54023624 54023792 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5522 NM_001276392 388633 Hs.439583 NM_001010978 ENSG00000203985 LDLRAD1 - low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 protein-coding 119.667-125 chr3 159325401 159325554 + 1 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 42831 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 175.667-106 chr4 42320811 42321130 + 1 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) L1MD|LINE|L1 70298 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 149.667-147 chr16 22081645 22081838 + 1 NA 3' UTR (NM_001164579, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001164579, exon 3 of 3) -10800 NM_173615 146177 Hs.10697 NM_173615 ENSG00000175267 VWA3A - von Willebrand factor A domain containing 3A protein-coding 187.333-169 chr5 167732222 167732497 + 1 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -22570 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 155.667-296 chr5 171890061 171890360 + 1 NA intron (NM_012300, intron 6 of 12) L1MEf|LINE|L1 104338 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 279.667-16 chr15 38908266 38908729 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 211899 NR_160786 169.333-283 chr9 28647511 28647745 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 71677 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 162.333-107 chr2 19830756 19830987 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -37983 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 150.667-223 chr21 40516970 40517252 + 1 NA intron (NR_073202, intron 3 of 32) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 113656 NR_046774 100874326 Hs.679746 NR_046774 ENSG00000233756 DSCAM-IT1 zag4 DSCAM intronic transcript 1 ncRNA 164.333-164 chr3 162400638 162400909 + 1 NA Intergenic Intergenic 902528 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 195.333-20 chr1 205387907 205388176 + 1 NA TTS (NR_038425) TTS (NR_038425) 14789 NR_038425 284576 Hs.585440 NR_038425 ENSG00000226235 LEMD1-AS1 - LEMD1 antisense RNA 1 ncRNA 410.667-6 chr15 90563925 90564424 + 1 NA intron (NM_001042574, intron 2 of 14) MIR|SINE|MIR 34251 NM_022769 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 229.667-24 chr14 31849459 31849736 + 1 NA intron (NM_001201573, intron 7 of 8) intron (NM_001201573, intron 7 of 8) -95256 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 313.333-31 chr4 166326972 166327483 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 453990 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 213.667 chr1 43215419 43215756 + 1 NA intron (NM_001195831, intron 12 of 23) intron (NM_001195831, intron 12 of 23) -43017 NM_001159936 10969 Hs.346868 NM_006824 ENSG00000117395 EBNA1BP2 EBP2|NOBP|P40 EBNA1 binding protein 2 protein-coding 161.333-29 chr10 53760522 53760760 + 1 NA Intergenic Intergenic -725589 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 218.333-106 chr6 56416376 56416719 + 1 NA Intergenic Intergenic -22419 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 200.667-107 chr3 55427419 55427671 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 53853 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 227.667-18 chr13 69496150 69496661 + 1 NA Intergenic Intergenic 274059 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 155.667-12 chr1 88156073 88156415 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -527900 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 305.667-22 chr22 23708258 23708781 + 1 NA intron (NR_024448, intron 5 of 11) L1MA6|LINE|L1 8904 NR_024448 91316 Hs.148656 NR_024448 ENSG00000228315 GUSBP11 - GUSB pseudogene 11 pseudo 166.333-97 chr18 52350081 52350291 + 1 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) L2b|LINE|L2 9989 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 174.667-7 chr1 102754641 102754952 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 353700 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 240.333-19 chr11 16149934 16150199 + 1 NA intron (NM_033326, intron 6 of 15) intron (NM_033326, intron 6 of 15) -180445 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 243.667-37 chr2 66837886 66838298 + 1 NA Intergenic Intergenic -66344 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 172.667-36 chr11 132691252 132691459 + 1 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) intron (NM_001319104, intron 1 of 6) 252282 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 151.333-263 chr22 39740068 39740260 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 153596 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 194.667-25 chr11 37408806 37409018 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -529689 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 284.667-36 chr4 41942938 41943291 + 1 NA intron (NM_018126, intron 3 of 6) intron (NM_018126, intron 3 of 6) 7685 NM_018126 55161 Hs.31082 NM_018126 ENSG00000109133 TMEM33 1600019D15Rik|Pom33|SHINC-3|SHINC3 transmembrane protein 33 protein-coding 146.667-331 chr8 81051125 81051306 + 1 NA intron (NM_018440, intron 2 of 8) intron (NM_018440, intron 2 of 8) 60853 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 246.667-54 chr3 12610451 12610736 + 1 NA intron (NM_001354695, intron 2 of 14) intron (NM_001354695, intron 2 of 14) 52915 NM_001354690 5894 Hs.159130 NM_002880 ENSG00000132155 RAF1 CMD1NN|CRAF|NS5|Raf-1|c-Raf Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 173.667-7 chr1 150704698 150704921 + 1 NA intron (NM_032132, intron 10 of 14) AluSz|SINE|Alu -7655 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 223.333-30 chr11 125147268 125147616 + 1 NA Intergenic Intergenic 17167 NR_125759 103695364 Hs.576940 NR_125759 ENSG00000254880 PKNOX2-AS1 - PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 148.333-183 chr2 55999822 55999999 + 1 NA TTS (NR_030623) TTS (NR_030623) 885 NR_030623 100126319 NR_030623 ENSG00000211520 MIR216B MIRN216B|mir-216b microRNA 216b ncRNA 150.333-333 chr5 84523805 84524062 + 1 NA Intergenic Intergenic -139053 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 242.667 chr1 51902499 51902892 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -23758 NM_002525 4898 Hs.584782 NM_002525 ENSG00000078618 NRDC NRD1|hNRD1|hNRD2 nardilysin convertase protein-coding 142.333-111 chr2 10313614 10313829 + 1 NA intron (NM_134421, intron 1 of 5) MIR3|SINE|MIR 10021 NM_134421 3241 Hs.580427 NM_002149 ENSG00000115756 HPCAL1 BDR1|HLP2|VILIP-3 hippocalcin like 1 protein-coding 148.667-392 chr8 130465221 130465391 + 1 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -21632 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 166.667-224 chr7 112265220 112265501 + 1 NA intron (NM_021994, intron 1 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 58665 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 147.333-270 chr5 167857676 167857944 + 1 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) intron (NM_001080428, intron 1 of 24) 102881 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 199.667-121 chr6 56813795 56814143 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 29696 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 292.667-8 chr12 85014660 85015020 + 1 NA intron (NM_001100917, intron 8 of 8) intron (NM_001100917, intron 8 of 8) 21437 NM_001100917 144448 Hs.156962 NM_001100917 ENSG00000231738 TSPAN19 - tetraspanin 19 protein-coding 165.667-87 chr2 36839038 36839252 + 1 NA 3' UTR (NM_003162, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_003162, exon 18 of 18) 127391 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 205.667-98 chr3 110311134 110311407 + 1 NA Intergenic Intergenic 708442 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 159.333-133 chr18 77729490 77729706 + 1 NA Intergenic Intergenic 264129 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 136.333-180 chr6 76075985 76076247 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3438 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 171.333-174 chr6 150977085 150977330 + 1 NA intron (NM_001350486, intron 20 of 27) intron (NM_001350486, intron 20 of 27) -29801 NM_001350490 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 251.333-53 chr2 44346568 44346892 + 1 NA intron (NM_001171617, intron 1 of 13) intron (NM_001171617, intron 1 of 13) 13019 NM_001042386 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 149.333-393 chr8 80832909 80833105 + 1 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) intron (NM_001033723, intron 1 of 8) 41461 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 182.667-89 chr3 38253130 38253453 + 1 NA 3' UTR (NM_005109, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_005109, exon 18 of 18) -12521 NM_004256 9390 Hs.225941 NM_004256 ENSG00000172940 SLC22A13 OAT10|OCTL1|OCTL3|ORCTL-3|ORCTL3 solute carrier family 22 member 13 protein-coding 270.333-9 chr10 65835611 65835953 + 1 NA Intergenic Intergenic 264357 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 218.333-35 chr14 24659178 24659646 + 1 NA Intergenic Intergenic -25222 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 198.333-40 chr12 8037247 8037476 + 1 NA intron (NM_018416, intron 1 of 10) intron (NM_018416, intron 1 of 10) 4645 NM_018416 55810 Hs.120844 NM_018416 ENSG00000065970 FOXJ2 FHX forkhead box J2 protein-coding 299.667-3 chr1 113535173 113535594 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 144868 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 157.667-229 chr5 11690908 11691178 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -101977 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 310.333-16 chr15 41482974 41483391 + 1 NA 3' UTR (NM_015138, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_015138, exon 18 of 18) -10692 NM_002220 3706 Hs.2722 NM_002220 ENSG00000137825 ITPKA IP3-3KA|IP3KA inositol-trisphosphate 3-kinase A protein-coding 274.333-23 chr15 96191764 96192297 + 1 NA intron (NR_125738, intron 2 of 4) L1MB7|LINE|L1 -64189 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 329.333-45 chr5 53165561 53165941 + 1 NA Intergenic Intergenic 55909 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 137.333-182 chr7 69763947 69764149 + 1 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) intron (NM_015570, intron 1 of 18) 165573 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 140.667-171 chr4 173489599 173489764 + 1 NA intron (NM_001329597, intron 1 of 3) intron (NM_001329597, intron 1 of 3) 29557 NM_001329597 11341 Hs.7122 NM_007281 ENSG00000164106 SCRG1 SCRG-1 stimulator of chondrogenesis 1 protein-coding 157.333-110 chr14 73304354 73304597 + 1 NA intron (NM_001005745, intron 5 of 10) AluJr|SINE|Alu -58474 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 176.667-5 chr1 45070351 45070641 + 1 NA intron (NM_020883, intron 2 of 13) HAL1|LINE|L1 58242 NR_158185 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 153.667-235 chr22 27870874 27871074 + 1 NA intron (NM_001284278, intron 8 of 11) intron (NM_001284278, intron 8 of 11) 48240 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 167.333-223 chr6 37505490 37505803 + 1 NA Intergenic Intergenic -1702 NR_126057 100505530 Hs.582978 NM_001039791 LINC02520 - long intergenic non-protein coding RNA 2520 ncRNA 175.333-77 chr2 20850854 20851077 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -27835 NM_001282719 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 175.333-191 chr8 122741216 122741504 + 1 NA Intergenic Intergenic -40295 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 204.667-66 chr2 16830081 16830400 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -164406 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 113.333-110 chr18 73313944 73314094 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -10922 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 117.667-79 chr2 41375232 41375382 + 1 NA Intergenic Intergenic -502248 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 135.667-151 chr5 161148943 161149089 + 1 NA Intergenic Intergenic -210390 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 132.333-106 chr21 20317952 20318099 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -59340 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 217.667 chr1 40944843 40945166 + 1 NA Intergenic Intergenic -34692 NM_001905 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 154.667-87 chr12 110936827 110937103 + 1 NA intron (NR_036513, intron 1 of 1) intron (NR_036513, intron 1 of 1) 363 NR_036513 100131138 Hs.152129 NR_036513 ENSG00000185847 LINC01405 - long intergenic non-protein coding RNA 1405 ncRNA 164.333-65 chr14 39106212 39106507 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3124 NM_006364 10484 Hs.272927 NM_006364 ENSG00000100934 SEC23A CLSD|hSec23A Sec23 homolog A, coat complex II component protein-coding 155.333-354 chr7 18572077 18572296 + 1 NA intron (NM_001204147, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 62916 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 155.667-113 chr15 62734540 62734743 + 1 NA intron (NM_015059, intron 25 of 55) intron (NM_015059, intron 25 of 55) 87330 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 161.333-305 chrX 62673723 62673891 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 677525 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 122.667-30 chr11 94780196 94780351 + 1 NA intron (NM_001301007, intron 1 of 11) intron (NM_001301007, intron 1 of 11) 11917 NM_001301007 154810 Hs.503594 NM_130847 ENSG00000166025 AMOTL1 JEAP angiomotin like 1 protein-coding 157.333-44 chr10 31653656 31653931 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -254038 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 171.333-157 chr5 117364137 117364354 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -51267 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 153.333-209 chr2 121924959 121925276 + 1 NA Intergenic Intergenic 169466 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 198.333-140 chr4 44916841 44917246 + 1 NA Intergenic Intergenic -190409 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 155.333-216 chr22 27946599 27946789 + 1 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) AluSc|SINE|Alu -26082 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 116.667-179 chr6 111206554 111206761 + 1 NA exon (NM_018593, exon 4 of 6) exon (NM_018593, exon 4 of 6) -52682 NM_153369 91749 Hs.400572 NM_153369 ENSG00000173214 MFSD4B KIAA1919|NaGLT1 major facilitator superfamily domain containing 4B protein-coding 229.333-101 chr5 95484423 95484862 + 1 NA intron (NM_014639, intron 38 of 42) AluJr4|SINE|Alu 70363 NM_014639 9652 Hs.482868 NM_014639 ENSG00000198677 TTC37 KIAA0372|Ski3|THES tetratricopeptide repeat domain 37 protein-coding 252.667 chr1 14118754 14119217 + 1 NA Intergenic Intergenic 300988 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 283.667-17 chr2 137524513 137524857 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 15 of 27) intron (NM_001316349, intron 15 of 27) 403247 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 260.333-12 chr12 42984931 42985385 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -170157 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 117.333-26 chr10 100822831 100822989 + 1 NA intron (NM_003988, intron 7 of 10) L2c|LINE|L2 77199 NM_003987 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 159.667-219 chr3 133094807 133095065 + 1 NA intron (NM_001136469, intron 2 of 5) intron (NM_001136469, intron 2 of 5) -29885 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 216.667-81 chr4 168783734 168784023 + 1 NA intron (NM_001166108, intron 10 of 21) intron (NM_001166108, intron 10 of 21) -48217 NM_001166110 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 238.667-22 chr13 96304754 96305025 + 1 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) AluSg4|SINE|Alu -122340 NR_039723 100616137 NR_039723 ENSG00000283487 MIR4501 - microRNA 4501 ncRNA 256.333-18 chr11 10803896 10804257 + 1 NA intron (NM_001172705, intron 7 of 21) intron (NM_001172705, intron 7 of 21) -2468 NR_004403 692223 Hs.723086 NR_004403 ENSG00000238622 SNORD97 U97 small nucleolar RNA, C/D box 97 snoRNA 207.667-124 chr8 129933870 129934198 + 1 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) HERVL40-int|LTR|ERVL 5777 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 148.333-85 chr12 21238743 21238968 + 1 NA intron (NM_006446, intron 14 of 14) intron (NM_006446, intron 14 of 14) 96062 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 142.667-2 chr1 62080124 62080301 + 1 NA intron (NM_001350145, intron 32 of 43) intron (NM_001350145, intron 32 of 43) -1356 NR_036059 100422946 NR_036059 ENSG00000283690 MIR3116-2 - microRNA 3116-2 ncRNA 128.667-110 chr3 9617468 9617638 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -31952 NM_001077525 64419 Hs.475382 NM_022485 ENSG00000163719 MTMR14 C3orf29 myotubularin related protein 14 protein-coding 174.333-43 chr15 68575690 68576045 + 1 NA intron (NM_001324014, intron 2 of 12) intron (NM_001324014, intron 2 of 12) -3126 NM_006091 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 206.333-107 chr22 42993356 42993617 + 1 NA intron (NM_001184970, intron 1 of 10) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 21663 NM_001184970 11252 Hs.162877 NM_007229 ENSG00000100266 PACSIN2 SDPII protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2 protein-coding 237.333-35 chr15 67343204 67343489 + 1 NA intron (NM_001031715, intron 5 of 20) intron (NM_001031715, intron 5 of 20) -88148 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 154.333-27 chr1 229101242 229101520 + 1 NA Intergenic Intergenic 73420 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 143.333-143 chr2 138947719 138947915 + 1 NA Intergenic Intergenic 50493 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 186.333-79 chr2 108328732 108328987 + 1 NA intron (NR_037191, intron 2 of 3) intron (NR_037191, intron 2 of 3) 6621 NR_037191 151234 Hs.447681 NR_037191 ENSG00000237223 SULT1C2P1 SULT1C1P sulfotransferase family 1C member 2 pseudogene 1 pseudo 260.667-10 chr10 13735683 13735988 + 1 NA intron (NM_001318336, intron 11 of 23) intron (NM_001318336, intron 11 of 23) -28268 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 119.333-29 chr10 35301124 35301278 + 1 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) MIR|SINE|MIR -35308 NM_001282854 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 218.667-4 chr1 110404455 110404729 + 1 NA intron (NM_006402, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR -3217 NR_102697 101410535 Hs.559121 NR_102697 LAMTOR5-AS1 - LAMTOR5 antisense RNA 1 ncRNA 242.333-20 chr12 7444524 7444863 + 1 NA promoter-TSS (NM_174941) promoter-TSS (NM_174941) -508 NM_001297650 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 155.667-229 chr3 131613149 131613433 + 1 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) intron (NM_130808, intron 7 of 15) -110320 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 189.333-106 chr2 184493974 184494212 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -104436 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 135.333-35 chr11 80458826 80459016 + 1 NA Intergenic Intergenic 303882 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 125.667-100 chr2 107822513 107822705 + 1 NA TTS (NR_126370) TTS (NR_126370) 4160 NR_024439 729121 Hs.386155 NR_024439 ENSG00000230651 RGPD4-AS1 - RGPD4 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 205.667-8 chr1 102321479 102321847 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -324429 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 146.333-99 chr14 92127433 92127621 + 1 NA intron (NM_001322272, intron 2 of 15) L2a|LINE|L2 5558 NM_001322270 53981 Hs.657632 NM_017437 ENSG00000165934 CPSF2 CPSF100 cleavage and polyadenylation specific factor 2 protein-coding 296.667-53 chr7 3967033 3967584 + 1 NA intron (NM_152744, intron 9 of 44) intron (NM_152744, intron 9 of 44) -162377 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 145.667-217 chr5 82882826 82883108 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -23131 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 228.667-20 chr13 93386178 93386705 + 1 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) intron (NM_005708, intron 1 of 8) 159634 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 155.667-19 chr1 150874045 150874203 + 1 NA intron (NM_001350224, intron 1 of 22) intron (NM_001350224, intron 1 of 22) 2475 NM_001350224 405 Hs.632446 NM_001668 ENSG00000143437 ARNT HIF-1-beta|HIF-1beta|HIF1-beta|HIF1B|HIF1BETA|TANGO|bHLHe2 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein-coding 296.667-19 chr16 28210295 28210731 + 1 NA intron (NM_001270940, intron 1 of 24) L2c|LINE|L2 1452 NM_015171 23214 Hs.460468 NM_015171 ENSG00000169180 XPO6 EXP6|RANBP20 exportin 6 protein-coding 187.333-6 chr1 82283920 82284197 + 1 NA Intergenic Intergenic 481605 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 150.333-37 chr10 59805655 59805815 + 1 NA intron (NM_005436, intron 6 of 8) intron (NM_005436, intron 6 of 8) -52280 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 258.667-76 chr5 78321879 78322400 + 1 NA Intergenic Intergenic -27384 NM_003664 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 300.333-49 chr8 57468626 57469216 + 1 NA Intergenic Intergenic 125134 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 181.333-20 chr11 12700844 12701183 + 1 NA intron (NM_021961, intron 2 of 12) intron (NM_021961, intron 2 of 12) 26592 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 163.667-78 chr16 66795783 66795947 + 1 NA intron (NM_001136505, intron 3 of 18) AluJb|SINE|Alu 5755 NM_001136505 283847 Hs.376505 NM_173616 ENSG00000249961 TERB1 CCDC79 telomere repeat binding bouquet formation protein 1 protein-coding 256.667-16 chr11 120641752 120642055 + 1 NA intron (NM_001282470, intron 1 of 19) MER41B|LTR|ERV1 77467 NM_001282470 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 158.667-74 chr12 41029621 41029930 + 1 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) intron (NM_001843, intron 23 of 23) 121418 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 173.333-72 chr17 42008723 42008956 + 1 NA intron (NM_003315, intron 1 of 13) AluSq|SINE|Alu 8326 NM_001144766 7266 Hs.500156 NM_003315 ENSG00000168259 DNAJC7 DJ11|DJC7|TPR2|TTC2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C7 protein-coding 147.667-80 chr12 107963063 107963245 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -59383 NR_037629 728739 Hs.741995 NR_037629 LOC728739 - programmed cell death 2 pseudogene pseudo 195.667-47 chr14 75998397 75998776 + 1 NA intron (NM_001102564, intron 2 of 8) L2b|LINE|L2 12823 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 260.667-40 chr19 43804862 43805224 + 1 NA intron (NM_182573, intron 1 of 4) intron (NM_182573, intron 1 of 4) -2596 NM_001031749 284348 Hs.44289 NM_182573 ENSG00000159871 LYPD5 PRO4356 LY6/PLAUR domain containing 5 protein-coding 182.333-118 chr4 175354540 175354855 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 432979 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 151.333-373 chr6 152230221 152230374 + 1 NA intron (NM_182961, intron 115 of 145) L1MC5a|LINE|L1 -44919 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 210.333-33 chr12 116243942 116244282 + 1 NA intron (NM_015335, intron 1 of 30) L3|LINE|CR1 33074 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 196.667-177 chrX 97756317 97756666 + 1 NA Intergenic Intergenic -191956 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 268.333-50 chr6 37244484 37244802 + 1 NA intron (NM_145316, intron 1 of 3) intron (NM_145316, intron 1 of 3) 12956 NM_145316 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 198.667-80 chr17 56506336 56506668 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 20 of 20) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -87197 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 190.667-29 chr12 29266361 29266632 + 1 NA intron (NM_001271784, intron 1 of 10) L1MA3|LINE|L1 42830 NM_018099 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 154.667-247 chr3 111781652 111781951 + 1 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) 49305 NM_001134437 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 254.333-63 chr5 6779812 6780204 + 1 NA Intergenic Intergenic -15872 NR_146281 109729133 Hs.582455 NR_146281 ENSG00000251365 LINC02236 - long intergenic non-protein coding RNA 2236 ncRNA 351.667-4 chr12 48600918 48601312 + 1 NA Intergenic HERVIP10F-int|LTR|ERV1 -31069 NM_002289 3906 Hs.72938 NM_002289 ENSG00000167531 LALBA LYZG lactalbumin alpha protein-coding 123.333-43 chr11 12845847 12846122 + 1 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 143564 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 259.333-21 chr12 22234352 22234857 + 1 NA intron (NM_003034, intron 4 of 4) Kanga1c|DNA|TcMar-Tc2 100110 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 220.333-13 chr10 26249162 26249515 + 1 NA intron (NM_000818, intron 8 of 16) intron (NM_000818, intron 8 of 16) 32564 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 202.667-47 chr14 46309354 46309789 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -161788 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 261.667-22 chr16 17784794 17785361 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -314117 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 252.667-87 chr5 169877996 169878302 + 1 NA intron (NM_001129891, intron 3 of 3) intron (NM_001129891, intron 3 of 3) 102346 NM_001129891 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 201.667-85 chr4 56741083 56741396 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -59533 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 193.667-5 chr1 52698703 52698916 + 1 NA promoter-TSS (NM_023077) promoter-TSS (NM_023077) -462 NM_023077 65260 Hs.349905 NM_023077 ENSG00000162377 COA7 C1orf163|RESA1|SCAN3|SELRC1 cytochrome c oxidase assembly factor 7 (putative) protein-coding 282.667-22 chr2 203096562 203096895 + 1 NA intron (NM_001114132, intron 10 of 54) MER103C|DNA|hAT-Charlie 81849 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 195.333-192 chr6 56546569 56546925 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 53 of 94) intron (NM_001144770, intron 53 of 94) 96142 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 150.333-231 chr20 11375132 11375369 + 1 NA Intergenic Intergenic -101867 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 172.333-3 chr1 32828255 32828476 + 1 NA intron (NM_022753, intron 4 of 6) intron (NM_022753, intron 4 of 6) 3052 NR_135107 64766 Hs.440880 NM_022753 ENSG00000116497 S100PBP S100PBPR S100P binding protein protein-coding 171.667-40 chr12 28443926 28444144 + 1 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) intron (NM_001352082, intron 9 of 13) -253297 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 145.333-117 chr18 4142318 4142470 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) -122208 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 230.667-13 chr12 67509898 67510227 + 1 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL -10020 NR_103861 100507175 Hs.505986 NR_103861 ENSG00000203585 LINC02408 - long intergenic non-protein coding RNA 2408 ncRNA 300.333-17 chr17 39737968 39738542 + 1 NA promoter-TSS (NM_001030002) promoter-TSS (NM_001030002) -68 NM_001030002 2886 Hs.86859 NM_005310 ENSG00000141738 GRB7 - growth factor receptor bound protein 7 protein-coding 170.333-131 chr21 33826398 33826660 + 1 NA intron (NM_001001132, intron 25 of 29) intron (NM_001001132, intron 25 of 29) 89275 NM_001697 539 Hs.409140 NM_001697 ENSG00000241837 ATP5PO ATP5O|ATPO|HMC08D05|OSCP ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP protein-coding 182.333-153 chr8 69016224 69016464 + 1 NA intron (NR_039986, intron 2 of 4) intron (NR_039986, intron 2 of 4) 87846 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 147.667-58 chr11 85642403 85642551 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5442 NM_001244735 84233 Hs.533725 NM_032273 ENSG00000171202 TMEM126A OPA7 transmembrane protein 126A protein-coding 165.667-174 chr6 40434102 40434345 + 1 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 55886 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 126.667-104 chr3 38943045 38943247 + 1 NA intron (NM_014139, intron 3 of 25) L1ME1|LINE|L1 7415 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 191.667-56 chr16 81104775 81105031 + 1 NA intron (NM_052892, intron 43 of 43) intron (NM_052892, intron 43 of 43) -8508 NR_033249 2653 Hs.546256 NM_004483 ENSG00000140905 GCSH GCE|NKH glycine cleavage system protein H protein-coding 269.333-5 chr10 85028234 85028709 + 1 NA Intergenic Intergenic 170434 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 160.333-223 chr4 118305260 118305444 + 1 NA intron (NM_003619, intron 8 of 12) intron (NM_003619, intron 8 of 12) 26162 NR_002963 677809 Hs.744742 NR_002963 ENSG00000275994 SNORA24 ACA24|SNORA24A small nucleolar RNA, H/ACA box 24 snoRNA 157.667-235 chr5 23893410 23893603 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -57842 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 139.667-15 chr1 180848633 180848818 + 1 NA intron (NM_004736, intron 11 of 14) L1MA5A|LINE|L1 -64172 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 247.667-80 chr5 105717374 105717665 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 618045 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 248.667-21 chr11 75732501 75732948 + 1 NA 3' UTR (NM_025098, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_025098, exon 6 of 6) 14886 NM_025098 80168 Hs.288568 NM_025098 ENSG00000166391 MOGAT2 DGAT2L5|DGAT2L5.|MGAT2|hDC5 monoacylglycerol O-acyltransferase 2 protein-coding 155.333-38 chr10 96888989 96889233 + 1 NA intron (NM_001170766, intron 2 of 8) L1MB7|LINE|L1 56166 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 199.667-155 chr9 122575805 122576075 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -7463 NM_001004454 138881 Hs.632695 NM_001004454 ENSG00000171496 OR1L8 OR9-24 olfactory receptor family 1 subfamily L member 8 protein-coding 309.667-5 chr11 77460648 77460990 + 1 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 13244 NM_001128620 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 205.333-202 chr6 53076309 53076633 + 1 NA intron (NM_033481, intron 3 of 12) intron (NM_033481, intron 3 of 12) 5498 NM_012347 26268 Hs.216653 NM_012347 ENSG00000112146 FBXO9 FBX9|NY-REN-57|VCIA1|dJ341E18.2 F-box protein 9 protein-coding 197.333-223 chr8 6286557 6286859 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 119840 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 135.667-187 chr8 110617006 110617259 + 1 NA Intergenic Intergenic 410301 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 423.667-6 chr15 46375470 46376074 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 670577 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 208.667-124 chr7 23292094 23292514 + 1 NA Intergenic Intergenic -7035 NM_138446 115416 Hs.87385 NM_138446 ENSG00000156928 MALSU1 C7orf30|mtRsfA mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1 protein-coding 152.333-102 chr14 39153330 39153522 + 1 NA intron (NM_177452, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 16907 NM_177452 122553 Hs.13303 NM_177452 ENSG00000182400 TRAPPC6B NEDMEBA|TPC6 trafficking protein particle complex 6B protein-coding 161.667-13 chr1 113983811 113984035 + 1 NA Intergenic Intergenic 4449 NM_001286352 56944 Hs.9315 NM_020190 ENSG00000116774 OLFML3 HNOEL-iso|OLF44 olfactomedin like 3 protein-coding 161.667-36 chr11 24445531 24445733 + 1 NA Intergenic Intergenic -51421 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 293.333-37 chr2 227928301 227928711 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 56875 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 117.667-152 chr5 37492458 37492634 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 8 of 17) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 113228 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 178.667-30 chr11 91083055 91083300 + 1 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -213975 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 214.333-44 chr14 52445087 52445401 + 1 NA intron (NM_001160047, intron 18 of 20) intron (NM_001160047, intron 18 of 20) 107261 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 152.333-215 chr21 27463188 27463439 + 1 NA Intergenic Intergenic -259066 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 171.333-130 chr4 33281750 33282067 + 1 NA Intergenic Intergenic 757985 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 131.667-50 chr12 128568901 128569119 + 1 NA intron (NM_001136103, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 254948 NM_145648 121260 Hs.507260 NM_145648 ENSG00000139370 SLC15A4 FP12591|PHT1|PTR4 solute carrier family 15 member 4 protein-coding 168.333-95 chr2 70467250 70467540 + 1 NA TTS (NR_046798) TTS (NR_046798) 14245 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 133.667-125 chr5 133515883 133516146 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -88308 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 187.333-15 chr1 235468491 235468912 + 1 NA intron (NM_152490, intron 6 of 11) AluSc|SINE|Alu 35751 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 166.333-156 chr3 96514247 96514468 + 1 NA Intergenic (GTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 154393 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 188.667-156 chr8 143489688 143489899 + 1 NA intron (NM_015117, intron 4 of 11) intron (NM_015117, intron 4 of 11) 16455 NR_145785 109623485 NR_145785 SNORD149 - small nucleolar RNA, C/D box 149 snoRNA 242.333-74 chr3 195384003 195384305 + 1 NA intron (NM_012287, intron 2 of 22) L1ME4b|LINE|L1 58866 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 171.667-78 chr2 36769810 36770049 + 1 NA intron (NM_001177969, intron 7 of 14) intron (NM_001177969, intron 7 of 14) 73222 NM_053276 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 153.667-159 chr17 78055711 78056001 + 1 NA intron (NM_018996, intron 4 of 20) MIRb|SINE|MIR 51619 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 119.333-17 chr1 212784002 212784177 + 1 NA intron (NM_015471, intron 3 of 5) intron (NM_015471, intron 3 of 5) 7688 NM_001297736 25936 Hs.497692 NM_015471 ENSG00000117697 NSL1 C1orf48|DC8|MIS14 NSL1 component of MIS12 kinetochore complex protein-coding 130.667-193 chr8 76926465 76926632 + 1 NA Intergenic Intergenic 40302 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 257.333-95 chr8 21922129 21922505 + 1 NA intron (NM_015024, intron 1 of 27) intron (NM_015024, intron 1 of 27) 2655 NR_156173 23039 Hs.172685 NM_015024 ENSG00000130227 XPO7 EXP7|RANBP16 exportin 7 protein-coding 141.333-103 chr2 50585262 50585459 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) L1MB2|LINE|L1 110902 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 412.333-7 chr5 24467252 24467717 + 1 NA Intergenic Intergenic 177494 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 153.333-2 chr1 22445321 22445489 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -6446 NM_001083621 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 196.333-124 chr3 183463373 183463630 + 1 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu 9687 NR_145763 109617007 NR_145763 ENSG00000199363 SNORA63E - small nucleolar RNA, H/ACA box 63E snoRNA 207.333-47 chr11 40212243 40212614 + 1 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) intron (NM_020929, intron 3 of 4) 80702 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 271.667-74 chr8 111945022 111945484 + 1 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 568614 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 163.333-186 chr3 138132347 138132591 + 1 NA promoter-TSS (NM_016161) promoter-TSS (NM_016161) -79 NM_016161 51146 Hs.278960 NM_016161 ENSG00000118017 A4GNT alpha4GnT alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 157.333-223 chr22 39901493 39901738 + 1 NA intron (NM_004810, intron 1 of 7) intron (NM_004810, intron 1 of 7) 531 NM_004810 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 183.667-38 chr12 91093478 91093752 + 1 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 17879 NM_002345 4060 Hs.406475 NM_002345 ENSG00000139329 LUM LDC|SLRR2D lumican protein-coding 241.667-31 chr17 67547097 67547392 + 1 NA intron (NM_181671, intron 2 of 9) AluJo|SINE|Alu -75659 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 167.667-183 chr6 72838198 72838517 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 129396 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 333.333-39 chr4 31682817 31683338 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 176533 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 159.667-245 chr5 821767 821994 + 1 NA exon (NM_024786, exon 9 of 13) exon (NM_024786, exon 9 of 13) 29106 NM_024786 79844 Hs.654874 NM_024786 ENSG00000188818 ZDHHC11 ZNF399 zinc finger DHHC-type containing 11 protein-coding 130.333-77 chr15 82010967 82011225 + 1 NA Intergenic Intergenic 34922 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 150.333-300 chr4 64394042 64394282 + 1 NA intron (NM_001363796, intron 1 of 11) intron (NM_001363796, intron 1 of 11) 15288 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 280.333-17 chr2 34583109 34583511 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -94247 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 158.667-251 chr4 114395820 114395986 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -202499 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 159.333-285 chr6 64708206 64708430 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -593100 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 146.333-155 chr2 112274280 112274499 + 1 NA Intergenic Intergenic -1208 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 141.333-49 chr12 61506346 61506532 + 1 NA Intergenic Intergenic 686400 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 197.333-156 chr3 105650346 105650699 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 217069 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 127.333-112 chr3 97410495 97410735 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 6 of 17) intron (NM_001080448, intron 6 of 17) -28992 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 152.333-87 chr12 112718159 112718342 + 1 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) intron (NM_001347952, intron 1 of 21) -23074 NR_031631 100302227 NR_031631 ENSG00000283507 MIR1302-1 MIRN1302-1|hsa-mir-1302-1 microRNA 1302-1 ncRNA 118.333-84 chr17 57775720 57775873 + 1 NA Intergenic Intergenic -30497 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 262.667-80 chr8 88178246 88178561 + 1 NA intron (NM_005941, intron 3 of 9) L1MC2|LINE|L1 149080 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 177.333-44 chr13 25349677 25349979 + 1 NA Intergenic Intergenic -22146 NM_016529 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 135.667-33 chr12 14226784 14227049 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -138716 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 144.333-292 chrX 75293283 75293459 + 1 NA intron (NR_030774, intron 1 of 7) intron (NR_030774, intron 1 of 7) 19286 NM_145052 139596 Hs.91612 NM_145052 ENSG00000094841 UPRT FUR1|UPP uracil phosphoribosyltransferase homolog protein-coding 252.333-70 chr7 39612729 39613058 + 1 NA TTS (NM_001282446) TTS (NM_001282446) -10679 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 248.667-46 chr16 75770849 75771290 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -44579 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 169.667-155 chr4 107064605 107064887 + 1 NA Intergenic Intergenic -28433 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 452.333-3 chr16 6632140 6632976 + 1 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) -141251 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 147.333-93 chr13 107251873 107252064 + 1 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 68995 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 123.333-75 chr14 39324829 39324978 + 1 NA intron (NM_001354150, intron 19 of 23) AluSx|SINE|Alu 57518 NM_203355 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 191.333-9 chr1 109739171 109739414 + 1 NA intron (NM_000849, intron 4 of 8) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 1746 NR_024537 2947 Hs.2006 NM_000849 ENSG00000134202 GSTM3 GST5|GSTB|GSTM3-3|GTM3 glutathione S-transferase mu 3 protein-coding 111.667-38 chr10 84521941 84522157 + 1 NA Intergenic Intergenic 96880 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 114.333-103 chr2 69661278 69661526 + 1 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) FLAM_C|SINE|Alu 17594 NM_001320698 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 146.333-179 chr20 61578208 61578395 + 1 NA intron (NM_001252338, intron 1 of 14) intron (NM_001252338, intron 1 of 14) -21460 NM_001252339 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 175.333-29 chr12 39841792 39842031 + 1 NA intron (NM_052885, intron 6 of 9) intron (NM_052885, intron 6 of 9) 215728 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 158.667-258 chr5 13138653 13138908 + 1 NA Intergenic Intergenic -105894 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 158.333-342 chr9 93088554 93088724 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -7578 NR_134468 84270 Hs.434213 NM_032310 ENSG00000165233 CARD19 BinCARD|C9orf89 caspase recruitment domain family member 19 protein-coding 204.667-20 chr10 114377457 114377718 + 1 NA intron (NM_001351073, intron 1 of 19) intron (NM_001351073, intron 1 of 19) 26915 NM_001001936 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 178.667-20 chr10 49356879 49357222 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 39039 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 145.333-2 chr1 42635894 42636155 + 1 NA intron (NM_001080850, intron 11 of 16) L1MB8|LINE|L1 -22399 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 192.333-62 chr16 47784588 47784898 + 1 NA Intergenic Intergenic -73838 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 151.667-213 chr3 45739012 45739282 + 1 NA intron (NM_001319071, intron 18 of 19) intron (NM_001319071, intron 18 of 19) 49751 NM_001319073 22908 Hs.156509 NM_014016 ENSG00000211456 SACM1L SAC1 SAC1 like phosphatidylinositide phosphatase protein-coding 167.667-124 chr20 54150090 54150377 + 1 NA Intergenic MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 23753 NM_000782 1591 Hs.89663 NM_000782 ENSG00000019186 CYP24A1 CP24|CYP24|HCAI|HCINF1|P450-CC24 cytochrome P450 family 24 subfamily A member 1 protein-coding 135.333-203 chr9 78113791 78114004 + 1 NA Intergenic Intergenic -82086 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 113.667-201 chr7 93724140 93724356 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 7320 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 165.333-180 chr3 183058844 183059049 + 1 NA intron (NR_120639, intron 5 of 15) intron (NR_120639, intron 5 of 15) 40297 NR_120640 56922 Hs.47649 NM_020166 ENSG00000078070 MCCC1 MCC-B|MCCA methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1 protein-coding 200.333-129 chr5 147385088 147385537 + 1 NA 3' UTR (NM_001287740, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001287740, exon 14 of 14) 68380 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 222.333-29 chr14 45206195 45206452 + 1 NA intron (NM_018353, intron 14 of 16) AluJb|SINE|Alu 46879 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 212.667-50 chr16 79527773 79528136 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 72783 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 130.667-92 chr18 1901627 1901820 + 1 NA Intergenic Intergenic -542094 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 127.667-138 chr5 30556120 30556264 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -637494 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 150.667-289 chr5 19936081 19936314 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) -49925 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 211.333-31 chr10 115032379 115032741 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 37903 NR_120677 102724589 NR_120677 ENSG00000236799 LINC02626 - long intergenic non-protein coding RNA 2626 ncRNA 125.333-103 chr20 38693569 38693793 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -30805 NM_080552 140679 Hs.179080 NM_080552 ENSG00000101438 SLC32A1 VGAT|VIAAT solute carrier family 32 member 1 protein-coding 158.667-315 chr7 137423577 137423829 + 1 NA intron (NM_001321710, intron 28 of 32) intron (NM_001321710, intron 28 of 32) -79970 NM_001321387 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 148.333-337 chr6 52460767 52460931 + 1 NA intron (NR_033327, intron 4 of 9) L1MEd|LINE|L1 39841 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 159.333-163 chr2 109643343 109643589 + 1 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 29102 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 241.667-96 chr9 31211659 31211955 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 169683 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 192.667-73 chr17 52587228 52587526 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 196855 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 126.667-115 chr3 155040572 155040712 + 1 NA intron (NM_001354642, intron 1 of 22) L1MC4|LINE|L1 16518 NM_001354642 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 117.333-7 chr1 86572291 86572436 + 1 NA intron (NR_135837, intron 4 of 4) intron (NR_135837, intron 4 of 4) 25285 NM_012128 22802 Hs.567422 NM_012128 ENSG00000016602 CLCA4 CaCC|CaCC2 chloride channel accessory 4 protein-coding 157.333-41 chr10 8792886 8793085 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -105004 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 230.333-73 chr22 29789998 29790402 + 1 NA intron (NM_001369943, intron 17 of 17) MIR|SINE|MIR 22831 NM_013387 29796 Hs.284292 NM_013387 ENSG00000184076 UQCR10 HSPC051|HSPC119|HSPC151|QCR9|UCCR7.2|UCRC ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit X protein-coding 160.667-295 chr8 8617573 8617766 + 1 NA Intergenic Intergenic -84268 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 149.667-412 chr8 126276116 126276371 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -49252 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 195.333-73 chr14 19958268 19958701 + 1 NA Intergenic Intergenic -17035 NM_001005486 81127 Hs.554583 NM_001005486 ENSG00000169488 OR4K15 OR14-20|OR4K15Q olfactory receptor family 4 subfamily K member 15 protein-coding 128.333-7 chr1 112280522 112280710 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -115598 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 213.667-67 chr4 66772328 66772648 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 495664 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 197.667-146 chr8 50701230 50701472 + 1 NA intron (NR_135797, intron 17 of 20) intron (NR_135797, intron 17 of 20) 537220 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 134.333-101 chr20 5594798 5594948 + 1 NA intron (NM_019593, intron 3 of 19) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 16133 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 118.667-157 chr5 44514892 44515034 + 1 NA Intergenic Intergenic -4681 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 185.333-106 chr2 221360002 221360313 + 1 NA Intergenic Intergenic 212147 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 148.667-253 chr3 80082916 80083136 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -315028 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 194.333-51 chr16 87001473 87001896 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -56100 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 135.333-131 chr4 118585825 118585979 + 1 NA Intergenic Intergenic -5842 NR_109983 729218 Hs.448518 NR_103825 LOC729218 - uncharacterized LOC729218 pseudo 149.667-46 chr10 28989532 28989691 + 1 NA Intergenic Intergenic 143203 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 354.333-23 chr9 70015940 70016474 + 1 NA Intergenic Intergenic -27374 NR_125850 256691 Hs.547172 NM_153267 ENSG00000165072 MAMDC2 - MAM domain containing 2 protein-coding 169.333-104 chr18 3219976 3220193 + 1 NA promoter-TSS (NM_003803) promoter-TSS (NM_003803) 24 NM_003803 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 153.667-375 chr8 63601457 63601634 + 1 NA Intergenic Intergenic 135696 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 252.667-82 chr5 68684568 68685000 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 345143 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 162.667-97 chr16 79063727 79064025 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 536861 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 342.333-26 chr6 140492803 140493308 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -190759 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 162.667-64 chr12 112868419 112868631 + 1 NA exon (NM_001347954, exon 8 of 22) exon (NM_001347954, exon 8 of 22) -38252 NM_002534 4938 Hs.524760 NM_002534 ENSG00000089127 OAS1 E18/E16|IFI-4|OIAS|OIASI 2'-5'-oligoadenylate synthetase 1 protein-coding 340.333 chr1 48611869 48612476 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 9 of 12) intron (NM_001323575, intron 9 of 12) -139964 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 136.333-78 chr17 47086897 47087050 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 102322 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 144.667-247 chr5 120948272 120948535 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -374147 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 286.333-11 chr14 36685337 36685860 + 1 NA intron (NM_001171170, intron 7 of 10) intron (NM_001171170, intron 7 of 10) 28030 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 142.667-75 chr16 72609315 72609569 + 1 NA intron (NR_159372, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 55528 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 163.333-36 chr10 67831541 67831717 + 1 NA intron (NM_021800, intron 1 of 4) intron (NM_021800, intron 1 of 4) 6550 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 171.333-185 chr7 89042244 89042547 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -246658 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 261.667-10 chr12 18379804 18380324 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 13 of 32) intron (NM_001288774, intron 13 of 32) 118524 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 171.667-81 chr2 45086273 45086618 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -76993 NM_016932 10736 Hs.101937 NM_016932 ENSG00000170577 SIX2 - SIX homeobox 2 protein-coding 151.333-250 chr20 52137717 52138008 + 1 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) intron (NM_199427, intron 5 of 8) -32378 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 154.667-285 chr4 122159624 122159824 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -10879 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 161.667-176 chr3 123692818 123693052 + 1 NA TTS (NR_046629) TTS (NR_046629) 3291 NR_046629 100873940 Hs.667316 NR_046629 ENSG00000250174 MYLK-AS2 - MYLK antisense RNA 2 ncRNA 353.667 chr10 68191905 68192497 + 1 NA intron (NR_045663, intron 11 of 17) L1MA4|LINE|L1 39912 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 409.333-11 chr3 184061276 184061803 + 1 NA TTS (NM_130770) TTS (NM_130770) 8492 NM_130770 170572 Hs.632579 NM_130770 ENSG00000178084 HTR3C - 5-hydroxytryptamine receptor 3C protein-coding 141.667-194 chr6 37471207 37471367 + 1 NA intron (NM_015050, intron 14 of 23) L2a|LINE|L2 28606 NM_138493 154467 Hs.284207 NM_138493 ENSG00000198937 CCDC167 C6orf129|HSPC265 coiled-coil domain containing 167 protein-coding 156.667-331 chr8 71014738 71015008 + 1 NA Intergenic Intergenic 341833 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 147.667-92 chr13 91121411 91121660 + 1 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 -31918 NR_104057 101930747 Hs.112745 NR_104057 LINC00380 - long intergenic non-protein coding RNA 380 ncRNA 215.667-100 chr5 106701416 106701709 + 1 NA Intergenic Intergenic 309452 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 155.667-15 chr1 98852135 98852483 + 1 NA Intergenic Intergenic -151967 NR_033940 100129620 Hs.588631 NR_033940 ENSG00000232825 LOC100129620 - uncharacterized LOC100129620 ncRNA 165.333-259 chr9 23274472 23274742 + 1 NA Intergenic Intergenic 397792 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 124.667-64 chr15 25667903 25668107 + 1 NA Intergenic Intergenic 180820 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 149.667-312 chr5 52502514 52502720 + 1 NA Intergenic Intergenic -285299 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 139.333-8 chr1 83073449 83073712 + 1 NA intron (NR_147074, intron 5 of 10) (TTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -87372 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 284.333-11 chr12 22663413 22663870 + 1 NA intron (NM_018638, intron 4 of 7) intron (NM_018638, intron 4 of 7) 38470 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 142.333-112 chr2 11287064 11287334 + 1 NA intron (NM_001321643, intron 2 of 32) intron (NM_001321643, intron 2 of 32) 57437 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 177.333-111 chr3 142736989 142737204 + 1 NA intron (NM_003304, intron 2 of 11) intron (NM_003304, intron 2 of 11) 12672 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 155.333-276 chr4 136540854 136541116 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -627305 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 142.333-195 chr5 61144803 61145072 + 1 NA intron (NM_174889, intron 3 of 3) intron (NM_174889, intron 3 of 3) -17379 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 156.667-156 chr18 12842146 12842385 + 1 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) intron (NM_080423, intron 2 of 8) -1303 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 153.667-64 chr11 33747889 33748061 + 1 NA intron (NM_012175, intron 9 of 10) intron (NM_012175, intron 9 of 10) -11496 NM_203331 966 Hs.278573 NM_000611 ENSG00000085063 CD59 16.3A5|1F5|EJ16|EJ30|EL32|G344|HRF-20|HRF20|MAC-IP|MACIF|MEM43|MIC11|MIN1|MIN2|MIN3|MIRL|MSK21|p18-20 CD59 molecule (CD59 blood group) protein-coding 266.667-62 chr5 92570538 92571042 + 1 NA Intergenic Intergenic 1000553 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 161.667-198 chr5 31951288 31951453 + 1 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -15211 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 250.667-51 chr3 130470122 130470410 + 1 NA intron (NM_001278298, intron 38 of 40) intron (NM_001278298, intron 38 of 40) -90068 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 198.333-138 chr4 32636923 32637215 + 1 NA Intergenic Intergenic 286031 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 280.667-4 chr1 77479685 77480145 + 1 NA intron (NM_012093, intron 8 of 13) intron (NM_012093, intron 8 of 13) 196828 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 138.667-202 chr8 68709769 68709955 + 1 NA intron (NR_146187, intron 9 of 13) intron (NR_146187, intron 9 of 13) -378371 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-121 chr18 58835376 58835532 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 21574 NR_146904 105372147 Hs.210837 NR_146904 ENSG00000267593 LINC01926 - long intergenic non-protein coding RNA 1926 ncRNA 149.667-129 chr14 81684753 81684964 + 1 NA Intergenic Intergenic 58280 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 126.333-22 chr10 71804144 71804288 + 1 NA intron (NM_001171934, intron 8 of 21) intron (NM_001171934, intron 8 of 21) -7667 NM_001171935 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 140.333-31 chr10 74984096 74984324 + 1 NA intron (NM_001370132, intron 11 of 16) intron (NM_001370132, intron 11 of 16) -37523 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 200.667-53 chr15 99152097 99152402 + 1 NA intron (NR_109947, intron 11 of 12) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 47169 NM_015286 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 184.333-3 chr1 108903379 108903580 + 1 NA intron (NM_013296, intron 9 of 14) intron (NM_013296, intron 9 of 14) 26494 NM_001321038 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 164.333-111 chr2 34416831 34417024 + 1 NA Intergenic Intergenic -260630 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 156.667-263 chr5 32408888 32409100 + 1 NA intron (NM_016107, intron 5 of 19) intron (NM_016107, intron 5 of 19) -14519 NR_030305 693164 NR_030305 ENSG00000207956 MIR579 MIRN579|hsa-mir-579 microRNA 579 ncRNA 264.667-22 chr12 97461061 97461383 + 1 NA Intergenic Intergenic -1554 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 151.333-327 chr5 14921498 14921744 + 1 NA Intergenic Intergenic -49843 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 176.667-105 chr3 167299336 167299616 + 1 NA intron (NM_001199202, intron 17 of 20) intron (NM_001199202, intron 17 of 20) 80807 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 169.333-232 chr6 103960427 103960723 + 1 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 898971 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 263.333 chr1 180382613 180383026 + 1 NA intron (NM_032360, intron 6 of 7) L1MA4A|LINE|L1 55571 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 339.333-37 chr5 107214303 107214810 + 1 NA Intergenic Intergenic -203542 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 168.333-133 chr3 150044674 150045068 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -51572 NR_136187 105374313 Hs.151216 NR_136187 LOC105374313 - uncharacterized LOC105374313 ncRNA 152.667-197 chr2 139839238 139839468 + 1 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie 747332 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 146.333-71 chr13 27398367 27398551 + 1 NA Intergenic Intergenic -26160 NM_002097 2971 Hs.445977 NM_002097 ENSG00000122034 GTF3A AP2|TFIIIA general transcription factor IIIA protein-coding 225.333-64 chr16 24318506 24318780 + 1 NA intron (NM_006539, intron 1 of 3) intron (NM_006539, intron 1 of 3) 63090 NM_006539 10368 Hs.7235 NM_006539 ENSG00000006116 CACNG3 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 3 protein-coding 176.333-23 chr10 81262429 81262667 + 1 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 -612646 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 166.667-26 chr10 65363546 65363796 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -207754 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 164.333-212 chr6 40423319 40423485 + 1 NA intron (NM_020737, intron 2 of 2) intron (NM_020737, intron 2 of 2) 45065 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 243.333-71 chr3 62366831 62367211 + 1 NA Intergenic Intergenic 6529 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 212.667-76 chr2 109143452 109143750 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) AluJo|SINE|Alu -2013 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 303.667-13 chr3 45208954 45209558 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 17031 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 149.333-265 chr3 150377612 150377874 + 1 NA Intergenic Intergenic -30555 NM_001303264 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 125.667-122 chr3 107409611 107409805 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -21222 NR_110039 101929607 Hs.252565 NR_110039 ENSG00000273125 LINC01990 - long intergenic non-protein coding RNA 1990 ncRNA 265.667-12 chr10 92894627 92894948 + 1 NA intron (NM_001319195, intron 2 of 21) intron (NM_001319195, intron 2 of 21) 46267 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 165.333-17 chr1 185520540 185520806 + 1 NA Intergenic LTR44|LTR|ERV1 107815 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 289.667-15 chr17 59606559 59606863 + 1 NA intron (NM_024612, intron 17 of 17) AluY|SINE|Alu -12978 NM_001288653 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 137.333-99 chr2 96787386 96787676 + 1 NA intron (NM_020184, intron 1 of 6) intron (NM_020184, intron 1 of 6) -10747 NR_036074 100422928 NR_036074 ENSG00000264157 MIR3127 mir-3127 microRNA 3127 ncRNA 169.667-147 chr4 41429795 41430011 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 69096 NM_001330787 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 189.667-4 chr1 80154885 80155093 + 1 NA Intergenic Intergenic -380766 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 144.333-44 chr11 126853778 126853946 + 1 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) -86884 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 193.333-191 chr8 113590865 113591272 + 1 NA Intergenic Intergenic -154129 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 185.333-150 chr5 16133975 16134270 + 1 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 45669 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 221.333-7 chr1 92949845 92950096 + 1 NA intron (NM_001006605, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 11492 NM_001006605 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 164.333-35 chr10 120222059 120222229 + 1 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL 133079 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 156.667-234 chr3 184368609 184368838 + 1 NA TTS (NM_001278699) TTS (NM_001278699) 5362 NM_001278698 5437 Hs.432574 NM_006232 ENSG00000163882 POLR2H RPABC3|RPB17|RPB8 RNA polymerase II subunit H protein-coding 112.333-135 chr2 141890383 141890550 + 1 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 241235 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 202.667-94 chr22 31299135 31299443 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -6755 NM_001135911 113791 Hs.26670 NM_052880 ENSG00000100100 PIK3IP1 HGFL|TrIP|hHGFL(S) phosphoinositide-3-kinase interacting protein 1 protein-coding 185.667-12 chr10 65510014 65510296 + 1 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -61270 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 134.333-130 chr4 94115056 94115312 + 1 NA Intergenic Intergenic 92372 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 289.333-15 chr14 50814064 50814494 + 1 NA intron (NM_016350, intron 3 of 28) intron (NM_016350, intron 3 of 28) -7518 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 161.667-200 chr5 45279821 45280030 + 1 NA intron (NM_021072, intron 6 of 7) intron (NM_021072, intron 6 of 7) 416455 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 148.667-340 chr6 153981637 153981814 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -28771 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 150.667-335 chr6 93809149 93809300 + 1 NA Intergenic (ACATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 90921 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 113.667-163 chr4 102814819 102815010 + 1 NA intron (NM_181893, intron 1 of 6) intron (NM_181893, intron 1 of 6) 10946 NM_001300795 7323 Hs.518773 NM_003340 ENSG00000109332 UBE2D3 E2(17)KB3|UBC4/5|UBCH5C ubiquitin conjugating enzyme E2 D3 protein-coding 163.333-231 chr5 149849402 149849578 + 1 NA 3' UTR (NM_133263, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_133263, exon 12 of 12) 77550 NM_001172699 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 162.667-47 chr11 40130091 40130349 + 1 NA intron (NR_047674, intron 1 of 1) intron (NR_047674, intron 1 of 1) 162910 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 200.333-167 chr9 28564517 28564960 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) MER3|DNA|hAT-Charlie 154567 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 146.333-299 chr6 165562268 165562430 + 1 NA intron (NM_001130690, intron 1 of 21) intron (NM_001130690, intron 1 of 21) 99751 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 240.667-39 chr18 2728988 2729411 + 1 NA intron (NM_015295, intron 23 of 47) intron (NM_015295, intron 23 of 47) 73312 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 153.333-94 chr12 50875561 50875763 + 1 NA intron (NM_182559, intron 3 of 4) L1PA16|LINE|L1 32736 NM_182559 283471 Hs.125571 NM_182559 ENSG00000186452 TMPRSS12 CT151 transmembrane serine protease 12 protein-coding 162.667-101 chr17 59701635 59701831 + 1 NA intron (NM_001015509, intron 1 of 2) AluY|SINE|Alu 5865 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 150.667-5 chr1 31148654 31148806 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -83013 NM_001020658 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 185.667-17 chr10 121900989 121901241 + 1 NA intron (NR_110006, intron 4 of 9) AluSq2|SINE|Alu 26916 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 189.667-149 chr9 39588554 39588840 + 1 NA Intergenic Intergenic -124171 NR_003528 401509 Hs.449445 NM_001032297 ZNF658B - zinc finger protein 658B (pseudogene) pseudo 248.333-55 chr20 62835407 62835704 + 1 NA intron (NM_001853, intron 26 of 31) intron (NM_001853, intron 26 of 31) -9011 NM_080750 100132911 NM_080750 DPH3P1 C20orf143|DPH3B|ZCSL1 diphthamide biosynthesis 3 pseudogene 1 protein-coding 130.333-104 chr2 73128467 73128698 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -15634 NM_015470 26056 Hs.24557 NM_015470 ENSG00000135631 RAB11FIP5 GAF1|RIP11|pp75 RAB11 family interacting protein 5 protein-coding 187.667-53 chr15 64047719 64048040 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -1394 NM_014326 23604 Hs.237886 NM_014326 ENSG00000035664 DAPK2 DRP-1|DRP1 death associated protein kinase 2 protein-coding 155.667-274 chr5 46014227 46014527 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -317997 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 163.667-116 chr2 156023515 156023759 + 1 NA intron (NR_110249, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 231294 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 195.333-104 chr2 10437098 10437425 + 1 NA Intergenic Intergenic 9588 NR_028374 100302743 Hs.730525 NR_028374 ENSG00000206633 SNORA80B ACA67B small nucleolar RNA, H/ACA box 80B snoRNA 162.667-53 chr12 13238943 13239114 + 1 NA Intergenic Intergenic 42302 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 151.667-360 chr8 63918118 63918346 + 1 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 148802 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 173.667-98 chr20 51094348 51094581 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -71357 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 148.667-37 chr10 18178514 18178710 + 1 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) 38188 NM_201572 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 175.333-125 chr3 130297917 130298199 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -47458 NR_022012 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 149.667-288 chr4 65277529 65277762 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -273145 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 146.333-276 chr5 161378120 161378277 + 1 NA intron (NM_000813, intron 6 of 9) MIR|SINE|MIR 169926 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 178.667-97 chr22 35418023 35418281 + 1 NA intron (NM_006739, intron 13 of 16) MIRb|SINE|MIR 18012 NM_006739 4174 Hs.517582 NM_006739 ENSG00000100297 MCM5 CDC46|MGORS8|P1-CDC46 minichromosome maintenance complex component 5 protein-coding 156.667 chr1 1463837 1464085 + 1 NA intron (NM_001039211, intron 11 of 11) AluSz|SINE|Alu -7804 NM_031921 83858 Hs.729021 NM_031921 ENSG00000160072 ATAD3B AAA-TOB3|TOB3 ATPase family AAA domain containing 3B protein-coding 187.667-60 chr18 3808048 3808372 + 1 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) intron (NM_001242762, intron 2 of 9) 37148 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 156.333-152 chr18 10308392 10308688 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 105830 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 148.667-97 chr12 122633708 122633940 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 62175 NR_162150 113218511 NR_162150 MIR9902-2 - microRNA 9902-2 ncRNA 189.667-14 chr1 246528251 246528534 + 1 NA Intergenic Intergenic -4105 NR_040002 255654 Hs.407570 NR_040002 ENSG00000242042 LINC01743 - long intergenic non-protein coding RNA 1743 ncRNA 270.333-34 chr22 27065567 27066110 + 1 NA Intergenic Intergenic -5320 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 118.333-163 chr5 41264797 41264967 + 1 NA Intergenic Intergenic -3413 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 266.333-14 chr13 53494283 53494687 + 1 NA Intergenic Intergenic -320934 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 172.667-73 chr19 52127569 52127770 + 1 NA intron (NM_178523, intron 2 of 3) intron (NM_178523, intron 2 of 3) 12269 NM_178523 90317 Hs.645225 NM_178523 ENSG00000204611 ZNF616 - zinc finger protein 616 protein-coding 290.333-22 chr2 158650292 158650587 + 1 NA intron (NM_001005476, intron 11 of 20) intron (NM_001005476, intron 11 of 20) 84563 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 227.667-31 chr18 10996382 10996674 + 1 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) L1MB5|LINE|L1 152234 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 148.667-382 chr8 114066317 114066518 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -629478 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 168.333-57 chr14 49569120 49569380 + 1 NA Intergenic Intergenic 17130 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 132.333-64 chr16 51981800 51981983 + 1 NA Intergenic Intergenic 92044 NM_001242473 388276 Hs.534669 NM_001242473 C16orf97 - chromosome 16 open reading frame 97 protein-coding 197.667-30 chr11 126674069 126674334 + 1 NA intron (NR_120533, intron 1 of 1) intron (NR_120533, intron 1 of 1) 18115 NR_120533 101929427 Hs.600341 NR_120532 ENSG00000254607 LOC101929427 - uncharacterized LOC101929427 ncRNA 118.667-127 chr22 30609317 30609472 + 1 NA intron (NM_000355, intron 1 of 8) intron (NM_000355, intron 1 of 8) 2220 NM_000355 6948 Hs.417948 NM_000355 ENSG00000185339 TCN2 D22S676|D22S750|II|TC|TC II|TC-2|TC2|TCII transcobalamin 2 protein-coding 165.667-148 chr4 120874023 120874266 + 1 NA intron (NM_001300824, intron 2 of 13) L1MA5|LINE|L1 48722 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 149.333-222 chr22 17069281 17069479 + 1 NA Intergenic Intergenic -15579 NM_014339 23765 Hs.48353 NM_014339 ENSG00000177663 IL17RA CANDF5|CD217|CDw217|IL-17RA|IL17R|IMD51|hIL-17R interleukin 17 receptor A protein-coding 197.667-133 chr6 64939351 64939746 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 15 of 43) intron (NM_001292009, intron 15 of 43) -361870 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 178.667-95 chr22 26225674 26225906 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 56316 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 156.333-278 chr5 18994067 18994340 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 892069 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 169.333-8 chr1 166280721 166280918 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -114064 NR_135199 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 144.667-83 chr14 54101848 54102041 + 1 NA Intergenic Intergenic -145053 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 248.667-39 chr14 68933008 68933319 + 1 NA intron (NM_001102, intron 1 of 20) AluSz|SINE|Alu 46139 NM_001102 87 Hs.235750 NM_001102 ENSG00000072110 ACTN1 BDPLT15 actinin alpha 1 protein-coding 228.667-21 chr14 33025542 33025903 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 86843 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 178.667-77 chr2 58320997 58321212 + 1 NA Intergenic Intergenic 45227 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 162.667-143 chr2 164433503 164433668 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 134910 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 221.333-110 chr5 14807684 14807942 + 1 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) L5|LINE|RTE-X 18199 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 212.333-38 chr13 62016333 62016675 + 1 NA intron (NR_046995, intron 1 of 1) MER33|DNA|hAT-Charlie 13044 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 120.667-134 chr4 169278535 169278714 + 1 NA Intergenic Intergenic -7668 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 233.333-23 chr10 95790630 95790991 + 1 NA intron (NR_038444, intron 4 of 5) L3|LINE|CR1 34647 NM_001776 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 167.667-52 chr13 67272780 67272981 + 1 NA Intergenic Intergenic -42544 NM_020403 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 222.667-52 chr22 39737224 39737628 + 1 NA Intergenic Intergenic 156334 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 156.667-116 chr15 38859931 38860123 + 1 NA Intergenic Intergenic 163429 NR_160786 207.667-63 chr2 235571521 235571945 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 1 of 17) intron (NM_001037131, intron 1 of 17) -53812 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 299.333-39 chr2 56359119 56359459 + 1 NA intron (NM_001348515, intron 3 of 3) intron (NM_001348515, intron 3 of 3) -173519 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 150.333-224 chr2 201781246 201781478 + 1 NA promoter-TSS (NM_001135745) promoter-TSS (NM_001135745) -429 NM_020919 57679 Hs.471096 NM_020919 ENSG00000003393 ALS2 ALS2CR6|ALSJ|IAHSP|PLSJ alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2 protein-coding 171.667-65 chr17 31932126 31932336 + 1 NA Intergenic Intergenic -4776 NM_001321207 23512 Hs.462732 NM_015355 ENSG00000178691 SUZ12 CHET9|JJAZ1 SUZ12 polycomb repressive complex 2 subunit protein-coding 152.667-193 chr2 119370523 119370714 + 1 NA intron (NM_001079862, intron 2 of 3) intron (NM_001079862, intron 2 of 3) 2943 NM_001079863 1622 Hs.78888 NM_020548 ENSG00000155368 DBI ACBD1|ACBP|CCK-RP|EP diazepam binding inhibitor, acyl-CoA binding protein protein-coding 172.667-62 chr15 87417699 87417965 + 1 NA Intergenic Intergenic -159097 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 133.333-126 chr4 54341218 54341379 + 1 NA intron (NR_147160, intron 1 of 1) intron (NR_147160, intron 1 of 1) 8406 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 181.667-141 chr8 26155829 26156204 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -110603 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 267.667-11 chr12 117516696 117517244 + 1 NA intron (NM_173598, intron 14 of 19) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -155168 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 214.333-145 chr7 43698543 43698851 + 1 NA intron (NR_163914, intron 1 of 8) intron (NR_163914, intron 1 of 8) 30826 NM_001371317 149.333-302 chr5 21221299 21221455 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -238103 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 118.333-9 chr1 94169579 94169745 + 1 NA 3' UTR (NM_001328667, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_001328667, exon 22 of 22) -48514 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 175.333-186 chr8 85058374 85058579 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -48762 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 129.333-171 chr6 124196300 124196530 + 1 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR -86590 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 241.333-13 chr10 29754689 29755116 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -17966 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 155.667-325 chr7 27535513 27535727 + 1 NA intron (NM_152740, intron 6 of 7) intron (NM_152740, intron 6 of 7) -80354 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 258.667-70 chr4 47241469 47241924 + 1 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) LTR86A1|LTR|ERVL 210129 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 154.667-68 chr11 111003208 111003468 + 1 NA Intergenic Intergenic 93980 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 129.667-70 chr16 31320858 31321092 + 1 NA intron (NM_001145808, intron 14 of 29) AluJo|SINE|Alu -34201 NM_001286375 3687 Hs.248472 NM_000887 ENSG00000140678 ITGAX CD11C|SLEB6 integrin subunit alpha X protein-coding 151.333-70 chr11 11897048 11897321 + 1 NA intron (NM_001282659, intron 4 of 27) intron (NM_001282659, intron 4 of 27) 55761 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 150.667-222 chr21 34253564 34253790 + 1 NA Intergenic Intergenic 73000 NR_027266 114036 Hs.720230 NM_153751 ENSG00000227456 LINC00310 C21orf82|NCRNA00310 long intergenic non-protein coding RNA 310 ncRNA 143.333-210 chr4 101794504 101794655 + 1 NA intron (NM_001127507, intron 1 of 15) intron (NM_001127507, intron 1 of 15) 3849 NM_017935 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 164.667-83 chr15 73495521 73495707 + 1 NA intron (NM_001348772, intron 2 of 4) intron (NM_001348772, intron 2 of 4) 52450 NM_001042367 283677 Hs.743574 NM_001042367 ENSG00000183324 REC114 C15orf60|CT147 REC114 meiotic recombination protein protein-coding 158.667-54 chr10 133035768 133036001 + 1 NA Intergenic Intergenic 50813 NR_111905 100128127 Hs.694139 NR_111905 ADGRA1-AS1 GPR123-AS1 adhesion G protein-coupled receptor A1 antisense RNA 1 ncRNA 209.667-6 chr1 67602592 67602876 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -82467 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 144.667-285 chr7 95076680 95076875 + 1 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 166879 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 150.333-318 chr5 13642678 13642964 + 1 NA Intergenic Intergenic 301659 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 378.333-11 chr4 74905919 74906541 + 1 NA Intergenic Intergenic -26886 NM_015393 25849 Hs.105460 NM_015393 ENSG00000169116 PARM1 Cipar1|DKFZP564O0823|PARM-1|WSC4 prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 protein-coding 223.333-21 chr10 129248190 129248448 + 1 NA Intergenic Intergenic -218922 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 172.667-161 chr8 81198650 81198931 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -81746 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 119.667-92 chr2 185757146 185757294 + 1 NA intron (NM_173651, intron 9 of 22) intron (NM_173651, intron 9 of 22) -16743 NR_110217 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 130.667-43 chr11 25734146 25734385 + 1 NA Intergenic Intergenic -454858 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 198.667-146 chr5 36572544 36572847 + 1 NA Intergenic Intergenic -33660 NM_001166696 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 170.667-70 chr19 8571934 8572218 + 1 NA intron (NM_012335, intron 1 of 27) intron (NM_012335, intron 1 of 27) 5366 NM_001348355 4542 Hs.465818 NM_012335 ENSG00000142347 MYO1F - myosin IF protein-coding 148.667-409 chrX 82127689 82127875 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 925680 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 154.333-288 chr6 37289738 37290004 + 1 NA intron (NR_130108, intron 7 of 12) intron (NR_130108, intron 7 of 12) -31716 NR_104442 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 154.667-180 chr2 100167952 100168145 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -25458 NM_002285 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 386.667-12 chr8 100394317 100394723 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 11757 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 150.333-274 chr3 123255483 123255656 + 1 NA intron (NM_012430, intron 5 of 6) intron (NM_012430, intron 5 of 6) 53626 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 242.333-48 chr2 105372431 105372859 + 1 NA intron (NM_001318898, intron 3 of 5) AluSc|SINE|Alu 26406 NM_001318899 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 161.333-143 chr2 42881926 42882102 + 1 NA Intergenic Intergenic -89431 NM_012205 23498 Hs.368805 NM_012205 ENSG00000162882 HAAO 3-HAO|HAO|VCRL1|h3HAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase protein-coding 117.333-64 chr15 40792484 40792695 + 1 NA intron (NM_018163, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu -14500 NM_001077268 84936 Hs.121676 NM_032850 ENSG00000166140 ZFYVE19 ANCHR|MPFYVE zinc finger FYVE-type containing 19 protein-coding 302.667-5 chr11 81698819 81699247 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 191803 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 163.667-110 chr2 65084908 65085138 + 1 NA non-coding (NR_134966, exon 6 of 6) non-coding (NR_134966, exon 6 of 6) 28607 NM_001319100 23177 Hs.709257 NM_015147 ENSG00000011523 CEP68 KIAA0582 centrosomal protein 68 protein-coding 153.333-280 chr3 170101624 170101815 + 1 NA intron (NM_024947, intron 14 of 14) intron (NM_024947, intron 14 of 14) 63724 NM_014373 26996 Hs.231320 NM_014373 ENSG00000173890 GPR160 GPCR1|GPCR150 G protein-coupled receptor 160 protein-coding 127.333-42 chr13 44185468 44185603 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 10665 NR_107046 102465876 NR_107046 ENSG00000276319 MIR8079 hsa-mir-8079 microRNA 8079 ncRNA 159.333-134 chr19 27570737 27570908 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -222609 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 138.667-154 chr4 100938977 100939151 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -263951 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 256.667-25 chr14 32110277 32110630 + 1 NA intron (NM_001173, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 33149 NM_001030055 394 Hs.592313 NM_001173 ENSG00000100852 ARHGAP5 GFI2|RhoGAP5|p190-B|p190BRhoGAP Rho GTPase activating protein 5 protein-coding 144.333-161 chr3 2795693 2795890 + 1 NA intron (NM_175607, intron 6 of 24) AluY|SINE|Alu -96424 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 188.333-24 chr11 24777591 24777924 + 1 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) intron (NM_001252010, intron 5 of 9) 280704 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 283.333-6 chr1 182895563 182895978 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -56179 NR_148933 647070 Hs.191518 NR_148933 LOC647070 - uncharacterized LOC647070 ncRNA 256.667-30 chr15 26075889 26076318 + 1 NA Intergenic Intergenic -39710 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 151.667-161 chr2 38270253 38270521 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 106143 NM_001330459 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 166.333-42 chr11 32420377 32420676 + 1 NA intron (NR_160306, intron 3 of 9) MIR|SINE|MIR 10287 NM_001198552 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 183.667-51 chr15 67532164 67532501 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -10371 NM_145160 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 155.333-156 chr2 24034942 24035304 + 1 NA intron (NM_025203, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 12268 NM_025203 80304 Hs.24624 NM_025203 ENSG00000163026 WDCP C2orf44|MMAP|PP384 WD repeat and coiled coil containing protein-coding 516.333-2 chr11 21858872 21859717 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -333791 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 223.667-12 chr10 62234933 62235286 + 1 NA intron (NM_145307, intron 6 of 11) L1MC5a|LINE|L1 33735 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 150.333-358 chr6 53710215 53710464 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -44583 NM_001003760 401265 Hs.131064 NM_001003760 ENSG00000124743 KLHL31 BKLHD6|KBTBD1|KLHL|bA345L23.2 kelch like family member 31 protein-coding 215.667-71 chr2 233683127 233683461 + 1 NA intron (NM_019077, intron 1 of 4) L1MC|LINE|L1 1356 NM_019077 54577 Hs.554822 NM_019077 ENSG00000244122 UGT1A7 GNT1|UDPGT|UDPGT 1-7|UGT-1A|UGT-1G|UGT1|UGT1-01|UGT1-07|UGT1.1|UGT1.7|UGT1A|UGT1A1|UGT1G|hUG-BR1 UDP glucuronosyltransferase family 1 member A7 protein-coding 131.667-82 chr18 74925483 74925635 + 1 NA intron (NM_017757, intron 7 of 7) intron (NM_017757, intron 7 of 7) 279954 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 220.667-22 chr12 8613567 8614046 + 1 NA promoter-TSS (NM_020661) promoter-TSS (NM_020661) -947 NM_020661 57379 Hs.149342 NM_020661 ENSG00000111732 AICDA AID|ARP2|CDA2|HEL-S-284|HIGM2 activation induced cytidine deaminase protein-coding 151.667-188 chr20 14205733 14205945 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L3|LINE|CR1 131773 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 184.333-125 chr5 152057835 152058067 + 1 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) intron (NR_109876, intron 1 of 2) 99053 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 236.333-32 chr16 6997018 6997420 + 1 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 223410 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 129.667-121 chr3 98735122 98735327 + 1 NA intron (NM_001323366, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 1768 NM_001323365 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 140.333-148 chr3 124948687 124948913 + 1 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -14049 NM_033049 56667 Hs.5940 NM_033049 ENSG00000173702 MUC13 DRCC1|MUC-13 mucin 13, cell surface associated protein-coding 207.333-262 chr8 24052455 24052782 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -197812 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 153.667-153 chr17 49194980 49195250 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 14266 NM_031498 2793 Hs.181781 NM_031498 ENSG00000167083 GNGT2 G-GAMMA-8|G-GAMMA-C|GNG8|GNG9|GNGT8 G protein subunit gamma transducin 2 protein-coding 167.667-47 chr12 68702607 68702839 + 1 NA intron (NM_020401, intron 7 of 27) intron (NM_020401, intron 7 of 27) 15745 NM_001330192 57122 Hs.524574 NM_020401 ENSG00000111581 NUP107 NPHS11|NUP84|ODG6|ODG6; GAMOS7 nucleoporin 107 protein-coding 251.667-15 chr11 90608438 90608890 + 1 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) intron (NR_104190, intron 3 of 6) -52807 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 205.667-91 chr22 40709753 40710069 + 1 NA Intergenic Intergenic 30733 NM_005297 2847 Hs.248122 NM_005297 ENSG00000128285 MCHR1 GPR24|MCH-1R|MCH1R|SLC-1|SLC1 melanin concentrating hormone receptor 1 protein-coding 146.333-133 chr18 69064990 69065208 + 1 NA Intergenic Intergenic 267019 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 244.333-47 chr16 59270711 59271058 + 1 NA Intergenic Intergenic 484307 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 157.333-96 chr12 125172756 125172985 + 1 NA Intergenic Intergenic -13516 NM_001366854 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 139.667-210 chr9 84651238 84651430 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -17124 NM_006180 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 152.333-23 chr1 175669586 175669774 + 1 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 73915 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 255.667-42 chr2 52496201 52496563 + 1 NA Intergenic Intergenic 125734 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 145.667-212 chr5 59274463 59274715 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 1526 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 145.667-225 chr5 96755456 96755709 + 1 NA intron (NM_001042446, intron 17 of 26) intron (NM_001042446, intron 17 of 26) 11980 NR_104285 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 188.667-117 chr4 78796524 78796817 + 1 NA intron (NM_017593, intron 1 of 13) intron (NM_017593, intron 1 of 13) 20292 NM_198892 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 113.333-216 chr5 132328261 132328400 + 1 NA intron (NM_003059, intron 5 of 9) intron (NM_003059, intron 5 of 9) 33936 NM_003059 6583 Hs.310591 NM_003059 ENSG00000197208 SLC22A4 DFNB60|OCTN1 solute carrier family 22 member 4 protein-coding 142.333-148 chr21 32860868 32861034 + 1 NA Intergenic Intergenic -47248 NM_001162496 56245 Hs.517235 NM_019596 ENSG00000205929 C21orf62 B37|C21orf120|PRED81 chromosome 21 open reading frame 62 protein-coding 153.667-24 chr1 189054379 189054605 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 1421518 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 158.333-76 chr13 57990579 57990743 + 1 NA Intergenic Intergenic -175166 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 151.333-80 chr11 63730804 63731003 + 1 NA intron (NM_001265589, intron 3 of 8) L1MEf|LINE|L1 37872 NM_001144936 65998 Hs.191073 NM_001144936 ENSG00000188070 C11orf95 - chromosome 11 open reading frame 95 protein-coding 125.667-154 chr5 96989801 96989949 + 1 NA intron (NM_005575, intron 4 of 17) intron (NM_005575, intron 4 of 17) 31442 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 158.333-305 chr7 101890570 101890734 + 1 NA intron (NM_181552, intron 1 of 23) intron (NM_181552, intron 1 of 23) 73026 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 155.667-307 chr6 71394812 71395094 + 1 NA Intergenic Intergenic 8668 NR_029504 407029 NR_029504 ENSG00000207827 MIR30A MIRN30A|mir-30a microRNA 30a ncRNA 230.333-101 chr6 27571405 27571694 + 1 NA Intergenic MER58D|DNA|hAT-Charlie -98431 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 166.333-172 chr5 9970238 9970412 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -66501 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 150.667-344 chr6 149757204 149757426 + 1 NA intron (NM_001252051, intron 1 of 6) intron (NM_001252051, intron 1 of 6) 7574 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 192.333-147 chr6 61583502 61583821 + 1 NA intron (NR_146870, intron 14 of 15) L1ME2|LINE|L1 9531 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 167.667-113 chr2 212698119 212698302 + 1 NA Intergenic Intergenic -97121 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 162.667-157 chr20 41540427 41540728 + 1 NA intron (NM_032221, intron 2 of 36) intron (NM_032221, intron 2 of 36) 77800 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 149.667-91 chr12 38617601 38617750 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 287916 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 156.333-226 chr3 23802154 23802363 + 1 NA Intergenic Intergenic -3697 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 221.333-64 chr2 72343140 72343546 + 1 NA intron (NR_135774, intron 17 of 19) AluSz6|SINE|Alu -195481 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 446.667-7 chr3 102148951 102149919 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -14270 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 184.667-104 chr5 115573068 115573425 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -28471 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 207.667-39 chr15 69614032 69614326 + 1 NA intron (NR_126437, intron 2 of 5) intron (NR_126437, intron 2 of 5) 21979 NR_126437 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 179.667-139 chr8 86085129 86085454 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -13619 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 191.667-109 chr6 64364163 64364417 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) MIR3|SINE|MIR 557454 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 134.333-27 chr11 34098150 34098298 + 1 NA 3' UTR (NM_203364, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_203364, exon 18 of 18) -7405 NM_024662 55226 Hs.577281 NM_024662 ENSG00000135372 NAT10 ALP|Kre33|NET43 N-acetyltransferase 10 protein-coding 134.667-28 chr10 93675020 93675250 + 1 NA intron (NM_145246, intron 12 of 13) intron (NM_145246, intron 12 of 13) 27437 NM_001347713 118924 Hs.586650 NM_145246 ENSG00000148690 FRA10AC1 C10orf4|F26C11.1-like|FRA10A FRA10A associated CGG repeat 1 protein-coding 147.667-133 chr17 15208929 15209169 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 42647 NR_039884 100616125 NR_039884 ENSG00000265110 MIR4731 - microRNA 4731 ncRNA 115.667-140 chr22 23726672 23726841 + 1 NA Intergenic Intergenic -9333 NR_024448 91316 Hs.148656 NR_024448 ENSG00000228315 GUSBP11 - GUSB pseudogene 11 pseudo 148.667-366 chr8 29618880 29619065 + 1 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 129137 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 168.667-145 chr3 106263077 106263370 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -393822 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 150.333-46 chr10 95698254 95698452 + 1 NA Intergenic MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR -4210 NM_001143973 26123 Hs.438991 NM_015631 ENSG00000119977 TCTN3 C10orf61|JBTS18|OFD4|TECT3 tectonic family member 3 protein-coding 147.333-267 chr5 128221516 128221672 + 1 NA Intergenic LTR3B_|LTR|ERVK 137828 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 202.333-102 chr20 1135462 1135833 + 1 NA intron (NM_006814, intron 4 of 6) intron (NM_006814, intron 4 of 6) 17045 NM_001323409 9491 Hs.471917 NM_006814 ENSG00000125818 PSMF1 PI31 proteasome inhibitor subunit 1 protein-coding 151.333-350 chr5 132513648 132513816 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -22959 NM_001354924 3659 Hs.436061 NM_002198 ENSG00000125347 IRF1 IRF-1|MAR interferon regulatory factor 1 protein-coding 182.667-49 chr14 82711029 82711244 + 1 NA Intergenic Intergenic 68504 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 242.333-53 chr2 159676875 159677334 + 1 NA Intergenic Intergenic 35338 NR_110586 29994 Hs.470369 NM_013450 ENSG00000123636 BAZ2B WALp4 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B protein-coding 154.667-204 chr2 207993304 207993484 + 1 NA intron (NM_001080475, intron 2 of 7) intron (NM_001080475, intron 2 of 7) 32133 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 246.667-16 chr11 31605852 31606151 + 1 NA intron (NM_001288725, intron 5 of 10) intron (NM_001288725, intron 5 of 10) 96234 NM_001288725 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 252.667-80 chr5 41835106 41835606 + 1 NA intron (NM_001364301, intron 7 of 16) intron (NM_001364301, intron 7 of 16) 8301 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 147.333-278 chr6 115876425 115876576 + 1 NA Intergenic Intergenic -162231 NR_027338 728402 Hs.729953 NR_027338 TPI1P3 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 3 pseudo 215.667-41 chr15 58185238 58185567 + 1 NA 3' UTR (NM_001320636, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001320636, exon 6 of 6) 47021 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 162.333-77 chr14 74015791 74016029 + 1 NA 5' UTR (NM_001321985, exon 2 of 17) 5' UTR (NM_001321985, exon 2 of 17) 3378 NM_001321988 957 Hs.655070 NM_001249 ENSG00000187097 ENTPD5 CD39L4|NTPDase-5|PCPH ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (inactive) protein-coding 260.667-3 chr1 103853766 103854179 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 104131 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 156.667-231 chr3 145049058 145049343 + 1 NA Intergenic Intergenic 1019985 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 148.333-223 chr20 25000331 25000597 + 1 NA Intergenic Intergenic -7713 NM_020531 57136 Hs.472330 NM_020531 ENSG00000101474 APMAP BSCv|C20orf3 adipocyte plasma membrane associated protein protein-coding 187.333-188 chr7 39748786 39749067 + 1 NA intron (NR_026999, intron 1 of 11) AluJo|SINE|Alu 15358 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 161.667-28 chr10 80460699 80460950 + 1 NA intron (NM_001351270, intron 1 of 9) intron (NM_001351270, intron 1 of 9) 1350 NM_001351270 81619 Hs.308615 NM_030927 ENSG00000108219 TSPAN14 DC-TM4F2|TM4SF14|tspan-14 tetraspanin 14 protein-coding 391.333-9 chr17 66806772 66807461 + 1 NA 3' UTR (NM_002737, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_002737, exon 17 of 17) 20044 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 210.333-14 chr10 44315119 44315481 + 1 NA Intergenic Intergenic 22550 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 181.667-130 chr6 53584012 53584297 + 1 NA Intergenic Intergenic -10879 NR_110840 101927136 Hs.509788 NR_110840 ENSG00000231683 LOC101927136 - uncharacterized LOC101927136 ncRNA 155.667-314 chr6 139387116 139387393 + 1 NA Intergenic Intergenic -12606 NM_006079 10370 Hs.82071 NM_006079 ENSG00000164442 CITED2 ASD8|MRG-1|MRG1|P35SRJ|VSD2 Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2 protein-coding 162.333-14 chr1 150345517 150345834 + 1 NA intron (NM_004698, intron 12 of 15) intron (NM_004698, intron 12 of 15) -18436 NM_001297673 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 148.667-51 chr10 75607252 75607516 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) -40125 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 128.667-81 chr18 13103036 13103243 + 1 NA intron (NM_032142, intron 38 of 44) intron (NM_032142, intron 38 of 44) 111777 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 152.333-32 chr1 246997551 246997703 + 1 NA intron (NR_037892, intron 3 of 5) L1MA9|LINE|L1 10430 NR_037892 57116 Hs.669893 NM_020394 ENSG00000197472 ZNF695 SBZF3 zinc finger protein 695 protein-coding 168.667-146 chr3 111122340 111122527 + 1 NA intron (NM_001243288, intron 4 of 8) HAL1|LINE|L1 50617 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 186.667-106 chr4 73237005 73237254 + 1 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) -14072 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 122.333-113 chr2 200633190 200633344 + 1 NA intron (NM_001159, intron 20 of 34) L1MDa|LINE|L1 47253 NM_001159 316 Hs.406238 NM_001159 ENSG00000138356 AOX1 AO|AOH1 aldehyde oxidase 1 protein-coding 175.333-124 chr3 117319698 117319949 + 1 NA Intergenic L1M3d|LINE|L1 371102 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 238.667-25 chr14 51960912 51961295 + 1 NA intron (NM_001243773, intron 3 of 3) L1MEc|LINE|L1 -28443 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 188.667-89 chr20 14284037 14284246 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) 53471 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 186.333-176 chr9 115434364 115434619 + 1 NA Intergenic Intergenic 292673 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 239.333-106 chr8 99144599 99145145 + 1 NA intron (NM_017890, intron 13 of 61) L2a|LINE|L2 131606 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 191.333-196 chr8 22964958 22965232 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -22156 NM_001160036 23221 Hs.372688 NM_015178 ENSG00000008853 RHOBTB2 DBC2|EIEE64 Rho related BTB domain containing 2 protein-coding 163.667-35 chr11 34275116 34275316 + 1 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) intron (NM_145804, intron 1 of 16) 82794 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 182.667-130 chr5 40945601 40945878 + 1 NA intron (NM_000587, intron 7 of 17) AluJo|SINE|Alu 36242 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 174.667-153 chr6 97263400 97263661 + 1 NA intron (NM_001350600, intron 7 of 23) intron (NM_001350600, intron 7 of 23) 19686 NM_001350600 253714 Hs.444292 NM_198468 ENSG00000146263 MMS22L C6orf167|dJ39B17.2 MMS22 like, DNA repair protein protein-coding 169.667-208 chr8 100370884 100371116 + 1 NA Intergenic Intergenic -11763 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 120.667-46 chr13 65121045 65121194 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -744928 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 162.333-6 chr1 48568079 48568271 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 11 of 12) intron (NM_001323575, intron 11 of 12) -95967 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 207.333-194 chr4 32128386 32128749 + 1 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) LTR40a|LTR|ERVL -106145 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 157.333-62 chr11 24146277 24146504 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -350663 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 154.667-290 chr4 158607760 158607972 + 1 NA intron (NM_001253733, intron 6 of 17) L1MB3|LINE|L1 64021 NM_001008393 201725 Hs.380920 NM_001008393 ENSG00000205208 C4orf46 RCDG1 chromosome 4 open reading frame 46 protein-coding 161.333-272 chr7 130832304 130832651 + 1 NA Intergenic Intergenic 44333 NR_029503 407021 NR_029503 ENSG00000284032 MIR29A MIRN29|MIRN29A|hsa-mir-29|hsa-mir-29a|miRNA29A|mir-29a microRNA 29a ncRNA 151.333-197 chr2 27942995 27943154 + 1 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) AluJb|SINE|Alu -51960 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-213 chr6 152222855 152223096 + 1 NA intron (NM_182961, intron 117 of 145) intron (NM_182961, intron 117 of 145) -37597 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 264.333-71 chr7 33497617 33498022 + 1 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 368255 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 232.333-76 chr6 50611157 50611543 + 1 NA Intergenic Intergenic -102194 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 213.333-99 chr2 114183212 114183504 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -203374 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 118.667-99 chr2 81619646 81619819 + 1 NA Intergenic Intergenic -152786 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 150.333-56 chr11 25731604 25731764 + 1 NA Intergenic Intergenic -457439 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 172.333-140 chr5 73856170 73856406 + 1 NA intron (NM_001177693, intron 14 of 35) intron (NM_001177693, intron 14 of 35) 42742 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 187.333-155 chr5 60307377 60307608 + 1 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) 65171 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 206.667-6 chr1 147411689 147412034 + 1 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) L1M4a2|LINE|L1 106014 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 158.667-321 chr8 89750628 89750800 + 1 NA intron (NR_125822, intron 1 of 4) L1MD2|LINE|L1 6997 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 217.667-4 chr1 156419724 156420099 + 1 NA TTS (NR_029691) TTS (NR_029691) 518 NR_029691 407046 NR_029691 ENSG00000207933 MIR9-1 MIRN9-1|hsa-mir-9-1|miRNA9-1|mir-9-1 microRNA 9-1 ncRNA 186.333-153 chr7 98185565 98185943 + 1 NA intron (NM_014916, intron 8 of 13) FLAM_C|SINE|Alu -26500 NM_177455 168620 Hs.511979 NM_177455 ENSG00000180535 BHLHA15 BHLHB8|MIST1 basic helix-loop-helix family member a15 protein-coding 151.667-300 chr5 159817824 159817999 + 1 NA intron (NR_109891, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 53473 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 195.333-204 chr7 50108468 50108780 + 1 NA intron (NM_001161834, intron 2 of 8) intron (NM_001161834, intron 2 of 8) 12538 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 113.333-28 chr10 63264904 63265065 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) intron (NM_001322258, intron 2 of 24) 4239 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 248.667-24 chr11 117577870 117578195 + 1 NA intron (NM_020693, intron 3 of 32) AluSq2|SINE|Alu 219184 NM_001367904 57453 Hs.659513 NM_020693 ENSG00000177103 DSCAML1 DSCAM2 DS cell adhesion molecule like 1 protein-coding 202.667-17 chr10 28450986 28451265 + 1 NA intron (NR_134496, intron 1 of 2) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 44688 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 239.333-59 chr2 184907865 184908286 + 1 NA intron (NM_194250, intron 2 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 258997 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 300.667 chr1 29083267 29083676 + 1 NA intron (NM_001166007, intron 13 of 17) intron (NM_001166007, intron 13 of 17) 39030 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 282.333-18 chr14 101432957 101433388 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -8904 NR_135240 100507277 Hs.123543 NR_135240 ENSG00000259082 LINC02314 - long intergenic non-protein coding RNA 2314 ncRNA 261.333-102 chr8 81131019 81131594 + 1 NA Intergenic Intergenic -19238 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 175.333-10 chr10 4469977 4470290 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 63664 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 145.667-265 chr7 20010958 20011238 + 1 NA intron (NR_110114, intron 3 of 5) intron (NR_110114, intron 3 of 5) 129328 NR_110114 101927668 Hs.715900 NR_110114 LOC101927668 - uncharacterized LOC101927668 ncRNA 148.667-165 chr18 21442607 21442775 + 1 NA intron (NM_001142966, intron 10 of 32) intron (NM_001142966, intron 10 of 32) 158013 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 175.667-68 chr2 33162230 33162576 + 1 NA intron (NM_206943, intron 5 of 33) intron (NM_206943, intron 5 of 33) 27806 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 350.333-12 chr2 45759792 45760319 + 1 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 108380 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 225.333-56 chr15 27394468 27394737 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) L1M4|LINE|L1 -233283 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-278 chr8 81735033 81735387 + 1 NA intron (NM_152284, intron 1 of 4) intron (NM_152284, intron 1 of 4) 2762 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 155.667-172 chr2 122976488 122976645 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 96915 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 166.667-32 chr11 1442660 1442952 + 1 NA intron (NM_003957, intron 5 of 19) intron (NM_003957, intron 5 of 19) 31654 NM_001256630 9024 Hs.170819 NM_003957 ENSG00000174672 BRSK2 C11orf7|PEN11B|SAD1|SADA|STK29 BR serine/threonine kinase 2 protein-coding 131.333-20 chr10 15909482 15909639 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -49027 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 199.667-132 chr7 129690813 129691161 + 1 NA intron (NM_005011, intron 5 of 10) intron (NM_005011, intron 5 of 10) 60909 NM_001040110 4899 Hs.654363 NM_005011 ENSG00000106459 NRF1 ALPHA-PAL nuclear respiratory factor 1 protein-coding 119.333-21 chr1 230413047 230413192 + 1 NA intron (NM_001258311, intron 1 of 6) MER6B|DNA|TcMar-Tigger 13213 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 171.667-186 chrX 42261010 42261267 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -337584 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 305.667-30 chr5 100691587 100692123 + 1 NA Intergenic Intergenic 124710 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 122.667-198 chr8 112841220 112841436 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 9 of 66) L2c|LINE|L2 197835 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 156.667-111 chr14 75609478 75609677 + 1 NA intron (NM_001195283, intron 1 of 9) intron (NM_001195283, intron 1 of 9) 4037 NM_001195283 55640 Hs.509966 NM_017791 ENSG00000119686 FLVCR2 C14orf58|CCT|EPV|FLVCRL14q|MFSD7C|PVHH|SLC49A2 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor family member 2 protein-coding 263.333-64 chr4 75473555 75474074 + 1 NA Intergenic Intergenic 35482 NR_103725 25898 Hs.48297 NM_015436 ENSG00000163743 RCHY1 ARNIP|CHIMP|PIRH2|PRO1996|RNF199|ZCHY|ZNF363 ring finger and CHY zinc finger domain containing 1 protein-coding 145.333-316 chr9 31191570 31191787 + 1 NA Intergenic Intergenic 189812 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 146.333-282 chr6 47512672 47512881 + 1 NA intron (NM_012120, intron 2 of 17) L1ME3G|LINE|L1 34987 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 162.333-199 chr5 67968228 67968448 + 1 NA Intergenic Intergenic 175125 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 166.333-143 chr3 3000367 3000559 + 1 NA intron (NM_175607, intron 14 of 24) L3|LINE|CR1 60682 NR_046554 100873975 Hs.581502 NR_046554 CNTN4-AS1 - CNTN4 antisense RNA 1 ncRNA 246.333-25 chr12 77858431 77858749 + 1 NA intron (NM_001024383, intron 1 of 39) intron (NM_001024383, intron 1 of 39) 27696 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 134.667 chr1 28278645 28278887 + 1 NA intron (NM_031459, intron 8 of 9) MIRc|SINE|MIR 19248 NM_031459 83667 Hs.469543 NM_031459 ENSG00000130766 SESN2 HI95|SES2|SEST2 sestrin 2 protein-coding 197.333-48 chr12 21112110 21112495 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -18892 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 152.333-295 chr5 38090309 38090570 + 1 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) L1ME2|LINE|L1 -58041 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 117.333-170 chr5 89936336 89936491 + 1 NA Intergenic Intergenic 80307 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 156.667-166 chr2 18569085 18569288 + 1 NA intron (NM_001199104, intron 9 of 10) L1ME1|LINE|L1 -8533 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 145.667-59 chr12 45232079 45232356 + 1 NA intron (NM_001025356, intron 1 of 19) intron (NM_001025356, intron 1 of 19) 16122 NM_001142679 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 209.333-60 chr14 58266194 58266538 + 1 NA non-coding (NR_029434, exon 5 of 5) non-coding (NR_029434, exon 5 of 5) 21523 NM_002788 5684 Hs.558799 NM_002788 ENSG00000100567 PSMA3 HC8|PSC3 proteasome subunit alpha 3 protein-coding 152.333-84 chr12 39533077 39533398 + 1 NA Intergenic Intergenic 86566 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 232.667-29 chr18 42540417 42540847 + 1 NA intron (NR_046174, intron 6 of 9) AluSc8|SINE|Alu 353964 NR_046174 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 183.667-153 chr9 81274537 81274826 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 414854 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 159.333-322 chr8 82134400 82134596 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -292212 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 149.333-128 chr16 7083416 7083577 + 1 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -249349 NM_145892 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 149.667-247 chr22 30090945 30091159 + 1 NA intron (NM_001329457, intron 2 of 11) L1MA5|LINE|L1 10588 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 182.667-78 chr2 71203388 71203632 + 1 NA intron (NM_020459, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 23593 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 303.667-20 chr5 134964418 134964933 + 1 NA Intergenic Intergenic -3232 NM_178019 347732 Hs.631804 NM_178019 ENSG00000152705 CATSPER3 CACRC cation channel sperm associated 3 protein-coding 142.333-146 chr21 24355074 24355225 + 1 NA Intergenic Intergenic -33772 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 155.333-185 chr2 176411818 176412174 + 1 NA Intergenic Intergenic 142554 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 161.667-85 chr14 92057515 92057819 + 1 NA TTS (NM_030660) TTS (NM_030660) -17608 NM_001321851 9321 Hs.632339 NM_004239 ENSG00000100815 TRIP11 ACG1A|CEV14|GMAP-210|GMAP210|ODCD|TRIP-11|TRIP230 thyroid hormone receptor interactor 11 protein-coding 154.667-288 chr4 150897257 150897471 + 1 NA intron (NM_001367550, intron 15 of 56) intron (NM_001367550, intron 15 of 56) 117903 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 154.333-158 chr2 98292407 98292569 + 1 NA intron (NM_001345864, intron 17 of 21) intron (NM_001345864, intron 17 of 21) -53667 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 132.333-42 chr12 50026367 50026567 + 1 NA promoter-TSS (NM_013277) promoter-TSS (NM_013277) -910 NM_001320007 29127 Hs.505469 NM_013277 ENSG00000161800 RACGAP1 CYK4|HsCYK-4|ID-GAP|MgcRacGAP Rac GTPase activating protein 1 protein-coding 156.667-93 chr13 64320726 64320895 + 1 NA Intergenic Intergenic -244799 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 223.333-9 chr1 115416028 115416363 + 1 NA Intergenic Intergenic -77959 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 121.667-18 chr10 10364950 10365177 + 1 NA Intergenic Intergenic 97286 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 134.333-7 chr1 192315409 192315609 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -1483 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 220.333-137 chr9 35040394 35040760 + 1 NA promoter-TSS (NM_001040411) promoter-TSS (NM_001040411) -518 NM_001040412 138724 Hs.148250 NM_203299 ENSG00000174038 C9orf131 - chromosome 9 open reading frame 131 protein-coding 127.333-109 chr3 81227645 81227811 + 1 NA Intergenic Intergenic 233860 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 164.667-221 chr7 44621950 44622226 + 1 NA intron (NM_002541, intron 1 of 22) intron (NM_002541, intron 1 of 22) 15461 NM_002541 4967 Hs.488181 NM_002541 ENSG00000105953 OGDH AKGDH|E1k|OGDC oxoglutarate dehydrogenase protein-coding 215.333-89 chr2 61405112 61405443 + 1 NA intron (NM_014709, intron 3 of 79) intron (NM_014709, intron 3 of 79) 12100 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 149.667-341 chr6 19843159 19843349 + 1 NA Intergenic Intergenic 5884 NM_001546 3400 Hs.519601 NM_001546 ENSG00000172201 ID4 IDB4|bHLHb27 inhibitor of DNA binding 4, HLH protein protein-coding 140.667-27 chr10 24045401 24045615 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) HAL1ME|LINE|L1 -163283 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 329.667-10 chr17 78531407 78531832 + 1 NA intron (NM_173628, intron 20 of 80) AluY|SINE|Alu 45775 NM_173628 8632 Hs.375975 NM_003727 ENSG00000187775 DNAH17 DNAHL1|DNEL2 dynein axonemal heavy chain 17 protein-coding 151.667-285 chr5 104572793 104572980 + 1 NA Intergenic Intergenic -526588 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 255.333-80 chr4 147946413 147946808 + 1 NA intron (NM_024605, intron 14 of 22) intron (NM_024605, intron 14 of 22) 164015 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 177.333-47 chr14 41866223 41866626 + 1 NA intron (NM_001330106, intron 2 of 4) intron (NM_001330106, intron 2 of 4) 259568 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 163.667-51 chr13 39106179 39106477 + 1 NA Intergenic LTR18B|LTR|ERVL 67872 NM_001012754 387921 Hs.507783 NM_001012754 ENSG00000188811 NHLRC3 - NHL repeat containing 3 protein-coding 326.333-3 chr1 178544104 178544554 + 1 NA intron (NR_033186, intron 1 of 2) intron (NR_033186, intron 1 of 2) 1533 NR_033186 400798 Hs.668085 NM_207467 ENSG00000213057 C1orf220 - chromosome 1 open reading frame 220 (putative) ncRNA 195.333-82 chr14 77781836 77782084 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -18149 NM_001142545 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 136.333-212 chr8 129870038 129870276 + 1 NA intron (NM_001353307, intron 6 of 13) AluJb|SINE|Alu 69654 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 174.333-56 chr2 25802800 25803114 + 1 NA intron (NM_001369346, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu -8266 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 125.333-95 chr2 104558486 104558751 + 1 NA Intergenic Intergenic -48109 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 127.333-10 chr1 163008474 163008705 + 1 NA Intergenic LTR85a|LTR|Gypsy? -60017 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 165.333-154 chr22 19325031 19325219 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -33406 NM_007098 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 171.667-121 chr4 42633876 42634104 + 1 NA intron (NM_001105529, intron 1 of 35) intron (NM_001105529, intron 1 of 35) 23115 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 129.667-113 chr22 29245008 29245270 + 1 NA intron (NM_001267895, intron 13 of 14) intron (NM_001267895, intron 13 of 14) 22842 NM_012265 25807 Hs.106730 NM_012265 ENSG00000100263 RHBDD3 C22orf3|HS984G1A|PTAG rhomboid domain containing 3 protein-coding 207.333-88 chr14 53575750 53576067 + 1 NA Intergenic Intergenic 372576 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 201.333-12 chr1 118287186 118287545 + 1 NA Intergenic Intergenic -102137 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 158.333-92 chr14 76570221 76570484 + 1 NA Intergenic Intergenic -191116 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 146.667-165 chr2 65844473 65844623 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -411949 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 145.667-3 chr1 45878432 45878607 + 1 NA intron (NM_001324321, intron 1 of 28) L1ME2z|LINE|L1 14171 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 154.667-102 chr14 40988660 40988816 + 1 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) L1MA2|LINE|L1 34027 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 167.333-70 chr12 107753418 107753618 + 1 NA intron (NM_012406, intron 4 of 11) intron (NM_012406, intron 4 of 11) 7619 NM_012406 11108 Hs.506655 NM_012406 ENSG00000110851 PRDM4 PFM1 PR/SET domain 4 protein-coding 124.667-183 chr7 9983251 9983395 + 1 NA Intergenic Intergenic 349053 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 192.667-69 chr16 68992827 68993148 + 1 NA intron (NM_024562, intron 15 of 17) AluSx|SINE|Alu -112666 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 143.333-119 chr18 12837624 12837820 + 1 NA intron (NM_080423, intron 2 of 8) intron (NM_080423, intron 2 of 8) 3240 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 160.667-54 chr11 36131633 36131809 + 1 NA intron (NM_001304263, intron 3 of 4) intron (NM_001304263, intron 3 of 4) -53820 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 223.667-77 chr7 66299790 66300216 + 1 NA intron (NM_003596, intron 3 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 94669 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 202.667-141 chr7 138232213 138232541 + 1 NA Intergenic Intergenic 108619 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 149.667-12 chr1 69326058 69326257 + 1 NA Intergenic Intergenic -107098 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 191.667-44 chr13 101127324 101127552 + 1 NA intron (NM_001350749, intron 17 of 43) AluSz|SINE|Alu -183074 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 119.667-127 chr3 176056280 176056537 + 1 NA Intergenic Intergenic -188143 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 138.333-75 chr16 74463713 74463927 + 1 NA intron (NR_027264, intron 20 of 26) AluSx|SINE|Alu -42350 NM_001011880 497190 Hs.454670 NM_001011880 ENSG00000140839 CLEC18B MRCL2 C-type lectin domain family 18 member B protein-coding 157.667-39 chr10 100789625 100789915 + 1 NA intron (NM_003990, intron 6 of 10) intron (NM_003990, intron 6 of 10) 44059 NM_003987 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 154.667-392 chr8 105982670 105982831 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L1MA8|LINE|L1 77753 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-163 chr20 22675073 22675383 + 1 NA intron (NR_146527, intron 2 of 2) L1MC5|LINE|L1 10116 NR_146527 105372566 Hs.555065 NR_146527 LINC01747 - long intergenic non-protein coding RNA 1747 ncRNA 122.333-43 chr12 43615751 43615948 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -63646 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 175.333-53 chr14 99057104 99057362 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 214964 NM_022898 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 200.333-170 chr9 86071083 86071513 + 1 NA intron (NM_016548, intron 3 of 9) AluJr4|SINE|Alu 28260 NM_016548 51280 Hs.494337 NM_016548 ENSG00000135052 GOLM1 C9orf155|GOLPH2|GP73|HEL46|PSEC0257|bA379P1.3 golgi membrane protein 1 protein-coding 191.333-112 chr2 77945426 77945671 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) 9478 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 151.333-118 chr13 97838725 97838918 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -114854 NM_002271 3843 Hs.712598 NM_002271 ENSG00000065150 IPO5 IMB3|KPNB3|Pse1|RANBP5|imp5 importin 5 protein-coding 236.333-29 chr14 71430311 71430674 + 1 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) MIRb|SINE|MIR -8447 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 156.333-193 chr2 139653512 139653778 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 756321 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 186.667-63 chr2 54404673 54404959 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -51511 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 222.667-99 chr9 14938407 14938744 + 1 NA Intergenic Intergenic -27580 NR_163238 158326 Hs.50850 NM_144966 ENSG00000164946 FREM1 BNAR|C9orf143|C9orf145|C9orf154|MOTA|TILRR|TRIGNO2 FRAS1 related extracellular matrix 1 protein-coding 303.667-3 chr12 26879155 26879609 + 1 NA Intergenic Intergenic -46188 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 119.333-194 chr6 139353423 139353591 + 1 NA Intergenic Intergenic 20706 NM_001168389 10370 Hs.82071 NM_006079 ENSG00000164442 CITED2 ASD8|MRG-1|MRG1|P35SRJ|VSD2 Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2 protein-coding 212.333-15 chr10 43404505 43404857 + 1 NA intron (NM_001098204, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu 3170 NM_001098206 3185 Hs.808 NM_004966 ENSG00000169813 HNRNPF HNRPF|OK/SW-cl.23|mcs94-1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F protein-coding 366.667-14 chr5 109019981 109020456 + 1 NA intron (NR_146155, intron 13 of 19) intron (NR_146155, intron 13 of 19) 95612 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 300.333-34 chr3 111951767 111952240 + 1 NA intron (NM_001134437, intron 10 of 17) intron (NM_001134437, intron 10 of 17) -27023 NR_073571 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 183.667-23 chr10 32777878 32778225 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) L1PA16|LINE|L1 123421 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 120.667-181 chrX 132899819 132899972 + 1 NA intron (NM_001077188, intron 3 of 5) L1MB8|LINE|L1 61475 NM_147175 90161 Hs.385956 NM_147175 ENSG00000171004 HS6ST2 MRXSPM heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 protein-coding 237.333-80 chr3 103655824 103656271 + 1 NA Intergenic Intergenic -131931 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 174.667-102 chr20 48245938 48246126 + 1 NA Intergenic Intergenic -113879 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 255.333-41 chr16 83588384 83588909 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) intron (NM_001220489, intron 6 of 12) 80300 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 204.333-140 chr4 69481401 69481739 + 1 NA intron (NM_001297615, intron 4 of 4) L1MA2|LINE|L1 14335 NM_001297615 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 145.667-20 chr1 199465641 199465912 + 1 NA Intergenic Intergenic 317178 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 160.667-292 chr7 110211791 110211958 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -251661 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 156.333-267 chr4 66320472 66320630 + 1 NA Intergenic MER135|DNA|DNA 43727 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 175.667-51 chr16 48349859 48350050 + 1 NA intron (NM_031490, intron 14 of 14) intron (NM_031490, intron 14 of 14) 15933 NM_001006610 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 312.667-8 chr10 59602489 59603064 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 107115 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 147.667-375 chr8 131326581 131326853 + 1 NA Intergenic Intergenic -285808 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 248.333-59 chr22 43948712 43949009 + 1 NA Intergenic Intergenic -6582 NM_015380 25813 Hs.505824 NM_015380 ENSG00000100347 SAMM50 CGI-51|OMP85|SAM50|TOB55|TRG-3|YNL026W SAMM50 sorting and assembly machinery component protein-coding 176.667-46 chr12 89077428 89077643 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -57843 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 150.333-256 chr3 10327130 10327370 + 1 NA 3' UTR (NM_001353564, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001353564, exon 21 of 21) -2979 NR_036084 100422933 NR_036084 ENSG00000264534 MIR378B - microRNA 378b ncRNA 357.667-17 chr8 125901670 125902284 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 49220 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 156.333-300 chr5 161785769 161785935 + 1 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -61339 NM_000806 2554 Hs.175934 NM_000806 ENSG00000022355 GABRA1 ECA4|EIEE19|EJM|EJM5 gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit protein-coding 129.667-47 chr13 46008826 46009038 + 1 NA intron (NM_001330566, intron 8 of 19) L2a|LINE|L2 43814 NM_001076788 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 172.667-141 chr6 156404480 156404689 + 1 NA Intergenic Intergenic 25834 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 162.667-3 chr1 65888975 65889155 + 1 NA intron (NM_002600, intron 1 of 16) L1MA4A|LINE|L1 -24180 NM_001297441 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 136.333-123 chr3 30592890 30593134 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -13490 NM_001024847 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 121.333-38 chr12 17672551 17672735 + 1 NA promoter-TSS (NR_039770) promoter-TSS (NR_039770) -656 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 216.667-113 chr9 77065960 77066324 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 46487 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 129.333-51 chr12 44985756 44985925 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 65259 NM_001004329 440097 Hs.302764 NM_001004329 ENSG00000185610 DBX2 - developing brain homeobox 2 protein-coding 135.667-195 chr9 5055261 5055492 + 1 NA intron (NM_004972, intron 7 of 24) intron (NM_004972, intron 7 of 24) 13683 NM_001322204 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 145.333-144 chr2 137430668 137430873 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 14 of 27) intron (NM_001316349, intron 14 of 27) 497162 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 174.667-126 chr4 73208242 73208521 + 1 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) L1MEc|LINE|L1 14676 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 213.333-76 chr17 51608759 51609124 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 173514 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 151.333-183 chr18 63080226 63080388 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 239073 NM_000657 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 255.667-63 chr4 67438365 67438791 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -16578 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 152.667-178 chr2 61495359 61495539 + 1 NA intron (NM_003400, intron 11 of 24) intron (NM_003400, intron 11 of 24) -24362 NM_014709 9736 Hs.644708 NM_014709 ENSG00000115464 USP34 - ubiquitin specific peptidase 34 protein-coding 254.667-51 chr3 42404264 42404560 + 1 NA intron (NM_001304386, intron 3 of 4) intron (NM_001304386, intron 3 of 4) 6198 NM_144634 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 212.333-45 chr14 60943229 60943607 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) MIRc|SINE|MIR 37661 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 137.667-173 chr7 27827428 27827642 + 1 NA intron (NM_001362794, intron 15 of 16) intron (NM_001362794, intron 15 of 16) 87440 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 153.333-248 chr21 29731078 29731349 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -16962 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 181.333-133 chr5 24374253 24374494 + 1 NA Intergenic LTR27D|LTR|ERV1 270605 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 210.333-108 chr3 151438365 151438666 + 1 NA exon (NM_001178145, exon 2 of 2) exon (NM_001178145, exon 2 of 2) 2265 NM_001178146 285313 Hs.58561 NM_178822 ENSG00000152580 IGSF10 CMF608 immunoglobulin superfamily member 10 protein-coding 224.667-38 chr2 33245738 33246222 + 1 NA intron (NM_206943, intron 10 of 33) intron (NM_206943, intron 10 of 33) 111383 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 153.333-266 chr3 27984414 27984639 + 1 NA Intergenic Intergenic -150390 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 225.667-44 chr2 229236655 229236916 + 1 NA intron (NM_001330158, intron 1 of 3) intron (NM_001330158, intron 1 of 3) -4693 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 286.333-43 chr8 18160678 18161019 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -9619 NM_001160179 9 Hs.591847 NM_000662 ENSG00000171428 NAT1 AAC1|MNAT|NAT-1|NATI N-acetyltransferase 1 protein-coding 215.667-125 chr9 29126392 29126754 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 85726 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 201.333-239 chr6 43819269 43819494 + 1 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL 32952 NR_149142 285857 Hs.582798 NR_149142 ENSG00000283215 LINC02537 - long intergenic non-protein coding RNA 2537 ncRNA 207.667-87 chr4 66892901 66893325 + 1 NA Intergenic Intergenic 528887 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 201.667-11 chr10 86670886 86671214 + 1 NA intron (NM_001368066, intron 2 of 14) intron (NM_001368066, intron 2 of 14) 2486 NM_001080116 11155 Hs.657271 NM_007078 ENSG00000122367 LDB3 CMD1C|CMH24|CMPD3|CYPHER|LDB3Z1|LDB3Z4|LVNC3|MFM4|ORACLE|PDLIM6|ZASP LIM domain binding 3 protein-coding 162.333-155 chr3 3065562 3065818 + 1 NA TTS (NM_000564) TTS (NM_000564) -4545 NR_046554 100873975 Hs.581502 NR_046554 CNTN4-AS1 - CNTN4 antisense RNA 1 ncRNA 341.667-3 chr11 94864630 94865389 + 1 NA intron (NM_130847, intron 10 of 12) intron (NM_130847, intron 10 of 12) 96653 NM_001301007 154810 Hs.503594 NM_130847 ENSG00000166025 AMOTL1 JEAP angiomotin like 1 protein-coding 134.333-191 chr9 125966027 125966194 + 1 NA non-coding (NR_024123, exon 7 of 7) non-coding (NR_024123, exon 7 of 7) 217927 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 238.667-80 chr6 91454093 91454629 + 1 NA Intergenic Intergenic -67299 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 165.667-161 chr5 117249442 117249705 + 1 NA Intergenic Intergenic -165939 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 198.667-165 chr6 106331956 106332313 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -6314 NM_001286111 9474 Hs.486063 NM_004849 ENSG00000057663 ATG5 APG5|APG5-LIKE|APG5L|ASP|SCAR25|hAPG5 autophagy related 5 protein-coding 152.667-205 chr2 179486230 179486506 + 1 NA intron (NR_148056, intron 5 of 9) intron (NR_148056, intron 5 of 9) 76220 NM_001113398 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 232.667-45 chr21 15139506 15139870 + 1 NA Intergenic Intergenic -74688 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 149.333-325 chr5 169253061 169253245 + 1 NA intron (NM_003062, intron 1 of 35) intron (NM_003062, intron 1 of 35) 10541 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 225.667-62 chr5 99060863 99061289 + 1 NA Intergenic Intergenic -131362 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 176.333-188 chrX 49937192 49937565 + 1 NA intron (NM_001127899, intron 3 of 14) intron (NM_001127899, intron 3 of 14) 14782 NM_001127898 1184 Hs.166486 NM_000084 ENSG00000171365 CLCN5 CLC5|CLCK2|ClC-5|DENTS|NPHL1|NPHL2|XLRH|XRN|hCIC-K2 chloride voltage-gated channel 5 protein-coding 225.333-5 chr1 103096549 103096889 + 1 NA intron (NM_001854, intron 1 of 66) intron (NM_001854, intron 1 of 66) 11777 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 149.333-305 chr5 59693557 59693839 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 10005 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 156.333-99 chr14 27016420 27016586 + 1 NA Intergenic Intergenic 107861 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 217.333-54 chr17 29683340 29683707 + 1 NA intron (NM_033389, intron 5 of 14) intron (NM_033389, intron 5 of 14) -62100 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 168.333-198 chr7 77857857 77858073 + 1 NA intron (NM_001366089, intron 2 of 18) intron (NM_001366089, intron 2 of 18) 17835 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 135.333-31 chr10 122753968 122754176 + 1 NA Intergenic Intergenic -2622 NR_003570 375940 Hs.650695 NM_198577 ENSG00000176584 DMBT1P1 - deleted in malignant brain tumors 1 pseudogene 1 pseudo 163.667-15 chr1 231350703 231350925 + 1 NA intron (NM_001010984, intron 3 of 3) intron (NM_001010984, intron 3 of 3) 12521 NM_032018 83932 Hs.554892 NM_032018 ENSG00000010072 SPRTN C1orf124|DVC1|PRO4323|spartan SprT-like N-terminal domain protein-coding 150.333-136 chr15 83176604 83176815 + 1 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) intron (NM_016073, intron 1 of 5) 31114 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 299.667-34 chr7 25835263 25835884 + 1 NA Intergenic Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger -45454 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 156.333-309 chr6 56422933 56423122 + 1 NA Intergenic Intergenic -28899 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 153.667-325 chr5 133574600 133574766 + 1 NA intron (NM_015082, intron 2 of 15) L1ME3A|LINE|L1 37858 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 325.333-10 chr11 129017643 129018030 + 1 NA intron (NM_001142685, intron 10 of 21) L1MD|LINE|L1 6352 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 178.333-107 chr3 106729539 106729875 + 1 NA Intergenic Intergenic 510931 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 222.333-21 chr11 101011820 101012167 + 1 NA Intergenic Intergenic 77719 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 182.333-150 chr8 31601393 31601782 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -38165 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 240.667-79 chr8 78282400 78282933 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -233674 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 186.333-114 chr4 67188183 67188493 + 1 NA Intergenic Intergenic 233662 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 149.333-202 chr2 172778566 172778843 + 1 NA intron (NM_007023, intron 1 of 30) intron (NM_007023, intron 1 of 30) -42498 NR_026995 91149 Hs.711021 NR_026995 ENSG00000228016 RAPGEF4-AS1 - RAPGEF4 antisense RNA 1 ncRNA 132.667-171 chr7 135678080 135678280 + 1 NA Intergenic Intergenic 15666 NM_001130929 647087 Hs.200022 NM_001130929 ENSG00000243317 STMP1 C7orf73|PL-5283 short transmembrane mitochondrial protein 1 protein-coding 219.333-104 chr2 239499389 239499705 + 1 NA Intergenic Intergenic 97799 NR_135577 101928111 Hs.534680 NR_135575 ENSG00000222020 HDAC4-AS1 - HDAC4 antisense RNA 1 ncRNA 132.333-60 chr15 51460668 51460882 + 1 NA intron (NM_001174116, intron 33 of 42) intron (NM_001174116, intron 33 of 42) 83529 NM_001330297 342035 Hs.526441 NM_181789 ENSG00000186417 GLDN CLOM|COLM|CRG-L2|CRGL2|LCCS11|UNC-112 gliomedin protein-coding 140.333-114 chr2 196258956 196259185 + 1 NA promoter-TSS (NR_110225) promoter-TSS (NR_110225) -954 NR_110225 101927482 Hs.191841 NR_110225 HECW2-AS1 - HECW2 antisense RNA 1 ncRNA 178.333-14 chr10 6585911 6586328 + 1 NA TTS (NR_036502) TTS (NR_036502) -5473 NM_001323265 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 162.333-238 chr7 88419223 88419437 + 1 NA Intergenic Intergenic -112436 NM_001205316 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 236.667-54 chr3 124895989 124896260 + 1 NA intron (NM_001354766, intron 1 of 13) intron (NM_001354766, intron 1 of 13) 5287 NM_001354764 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 224.333-76 chr22 27366416 27366768 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 55941 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 145.333-311 chr8 139172493 139172756 + 1 NA Intergenic (TAGTAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -258583 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 135.333-71 chr18 2949694 2949881 + 1 NA intron (NM_014646, intron 4 of 19) (ATTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3164 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 242.667-61 chr20 11907709 11908021 + 1 NA intron (NM_001282550, intron 1 of 4) intron (NM_001282550, intron 1 of 4) -10000 NM_001282551 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 145.667-164 chr21 17070437 17070614 + 1 NA Intergenic Intergenic -368365 NR_037585 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 153.333-408 chr8 81673054 81673276 + 1 NA intron (NM_005536, intron 6 of 8) MER4A|LTR|ERV1 13160 NM_005536 3612 Hs.656694 NM_005536 ENSG00000133731 IMPA1 IMP|IMPA|MRT59 inositol monophosphatase 1 protein-coding 327.667-4 chr11 15774449 15775067 + 1 NA Intergenic Intergenic 130873 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 191.333-107 chr2 61461803 61462115 + 1 NA intron (NM_014709, intron 1 of 79) AluSx1|SINE|Alu 9128 NM_014709 9736 Hs.644708 NM_014709 ENSG00000115464 USP34 - ubiquitin specific peptidase 34 protein-coding 115.333-93 chr17 39822078 39822312 + 1 NA intron (NM_001257409, intron 2 of 5) MER21-int|LTR|ERVL 41993 NM_001284514 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 190.667-42 chr14 70312236 70312455 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 47338 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 181.667-62 chr2 10828688 10828987 + 1 NA intron (NM_001282704, intron 1 of 14) intron (NM_001282704, intron 1 of 14) 3648 NM_001282704 10130 Hs.212102 NM_005742 ENSG00000143870 PDIA6 ERP5|P5|TXNDC7 protein disulfide isomerase family A member 6 protein-coding 218.667-37 chr15 79674027 79674452 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 222758 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 240.667-31 chr16 80015692 80016093 + 1 NA Intergenic Intergenic 220643 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 372.333-26 chrX 150466197 150466704 + 1 NA intron (NM_005491, intron 2 of 6) intron (NM_005491, intron 2 of 6) 20996 NM_001177466 10046 Hs.20136 NM_005491 ENSG00000013619 MAMLD1 CG1|CXorf6|F18|HYSP2 mastermind like domain containing 1 protein-coding 150.333-11 chr1 104674634 104674794 + 1 NA Intergenic Intergenic 601691 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 157.667-109 chr15 50572826 50573052 + 1 NA intron (NR_149154, intron 35 of 37) intron (NR_149154, intron 35 of 37) -26273 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 131.333-199 chrX 79175509 79175725 + 1 NA TTS (NM_032553) TTS (NM_032553) 4645 NM_032553 84636 Hs.326713 NM_032553 ENSG00000147138 GPR174 FKSG79|GPCR17|LYPSR3 G protein-coupled receptor 174 protein-coding 168.667-70 chr15 76710148 76710347 + 1 NA intron (NR_148227, intron 17 of 32) L1ME2|LINE|L1 123600 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 259.333-96 chr8 36446822 36447155 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -337386 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 121.333-144 chr5 68899573 68899734 + 1 NA Intergenic Intergenic 130274 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 168.667-44 chr12 64428276 64428581 + 1 NA intron (NM_007235, intron 16 of 24) intron (NM_007235, intron 16 of 24) -23692 NM_013254 29110 Hs.505874 NM_013254 ENSG00000183735 TBK1 FTDALS4|IIAE8|NAK|T2K TANK binding kinase 1 protein-coding 127.667-3 chr1 69057913 69058158 + 1 NA intron (NR_146608, intron 1 of 4) MER39|LTR|ERV1 2137 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 166.667-13 chr1 111405050 111405310 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -15329 NR_029429 441897 Hs.568387 NR_029429 ENSG00000227179 PGCP1 - progastricsin pseudogene 1 pseudo 114.333-194 chr6 54865929 54866173 + 1 NA intron (NM_001010872, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 19280 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 114.667-99 chr16 58235839 58236009 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -14012 NM_001142302 29070 Hs.11614 NM_014157 ENSG00000103021 CCDC113 HSPC065 coiled-coil domain containing 113 protein-coding 160.333-126 chr17 60891590 60891795 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 10 of 25) L1PB4|LINE|L1 213841 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 157.667-48 chr11 20508654 20508964 + 1 NA 3' UTR (NM_001145166, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001145166, exon 14 of 14) -90591 NM_004211 9152 Hs.136557 NM_004211 ENSG00000165970 SLC6A5 GLYT-2|GLYT2|HKPX3|NET1 solute carrier family 6 member 5 protein-coding 130.333-221 chr9 106841879 106842030 + 1 NA Intergenic Intergenic -21212 NM_021224 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 305.333-35 chr2 100228103 100228678 + 1 NA intron (NR_103730, intron 1 of 2) L1MDa|LINE|L1 20136 NR_103730 150577 Hs.434127 NM_001102655 ENSG00000232084 LINC01104 - long intergenic non-protein coding RNA 1104 ncRNA 159.667-76 chr12 42537851 42538131 + 1 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) MIR1_Amn|SINE|MIR 51755 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 293.667-36 chr21 29210004 29210390 + 1 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) intron (NR_027072, intron 1 of 1) 16703 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 352.333-33 chrX 38403047 38403509 + 1 NA intron (NM_000531, intron 5 of 9) L2a|LINE|L2 50674 NM_000531 5009 Hs.117050 NM_000531 ENSG00000036473 OTC OCTD ornithine carbamoyltransferase protein-coding 147.333-197 chr21 32475860 32476144 + 1 NA intron (NR_104472, intron 3 of 6) L1MC|LINE|L1 63296 NM_001286556 59271 Hs.208358 NM_058187 ENSG00000166979 EVA1C B18|B19|C21orf63|C21orf64|FAM176C|PRED34|SUE21 eva-1 homolog C protein-coding 265.333-70 chr6 66576767 66577239 + 1 NA Intergenic Intergenic 789124 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 218.333-96 chr4 94332747 94333206 + 1 NA intron (NM_014485, intron 2 of 5) HAL1|LINE|L1 9860 NM_014485 27306 Hs.128433 NM_014485 ENSG00000163106 HPGDS GSTS|GSTS1|GSTS1-1|PGD2|PGDS hematopoietic prostaglandin D synthase protein-coding 171.667-184 chr9 109041684 109041959 + 1 NA intron (NM_032012, intron 14 of 17) L1MA8|LINE|L1 4477 NR_029506 407036 NR_029506 ENSG00000207698 MIR32 MIRN32|hsa-mir-32|miR-32|miRNA32 microRNA 32 ncRNA 168.667-71 chr15 89454963 89455268 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 41468 NR_110261 51458 Hs.459284 NM_016321 ENSG00000140519 RHCG C15orf6|PDRC2|RHGK|SLC42A3 Rh family C glycoprotein protein-coding 185.667-47 chr17 59239111 59239440 + 1 NA intron (NM_182569, intron 2 of 9) MIRb|SINE|MIR 18764 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 228.667-45 chr2 181576475 181576816 + 1 NA intron (NR_027690, intron 2 of 11) L2c|LINE|L2 80460 NM_201548 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 198.667-95 chr19 56639896 56640164 + 1 NA intron (NR_163262, intron 3 of 5) MER68|LTR|ERVL -3129 NM_001193628 147670 Hs.336588 NM_001193628 ENSG00000268182 SMIM17 - small integral membrane protein 17 protein-coding 231.667-53 chr6 128565164 128565482 + 1 NA Intergenic Intergenic -44724 NM_002844 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 160.333-102 chr14 63344306 63344490 + 1 NA Intergenic Intergenic -25463 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 149.333-243 chr3 59778090 59778344 + 1 NA intron (NM_001354590, intron 7 of 8) intron (NM_001354590, intron 7 of 8) -119720 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 153.333-438 chr8 140732004 140732217 + 1 NA TTS (NR_029892) TTS (NR_029892) 543 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 120.667-64 chr15 80406167 80406406 + 1 NA intron (NM_014862, intron 1 of 18) intron (NM_014862, intron 1 of 18) 1904 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 150.667-196 chr2 190162634 190162814 + 1 NA intron (NM_001042520, intron 1 of 1) intron (NM_001042520, intron 1 of 1) 12478 NM_001042520 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 198.667-26 chr10 74165266 74165507 + 1 NA intron (NM_001369123, intron 1 of 9) MIR3|SINE|MIR -11103 NM_001202449 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 235.667-35 chr2 225916888 225917315 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -225693 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 196.333-131 chr4 91372820 91373099 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 904343 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 257.333-96 chr8 47186576 47187157 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -2441 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 165.333-216 chr5 163586179 163586348 + 1 NA Intergenic Intergenic 80644 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 153.333-87 chr12 23181397 23181594 + 1 NA intron (NR_120471, intron 1 of 4) intron (NR_120471, intron 1 of 4) 5859 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 162.667-7 chr1 100056143 100056388 + 1 NA intron (NM_033055, intron 2 of 11) L1MA3|LINE|L1 18170 NM_033055 64645 Hs.124156 NM_033055 ENSG00000156875 MFSD14A HIAT1 major facilitator superfamily domain containing 14A protein-coding 189.333-193 chr7 101848531 101848842 + 1 NA intron (NM_181552, intron 1 of 23) intron (NM_181552, intron 1 of 23) 31060 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 318.667-11 chr14 54173753 54174086 + 1 NA Intergenic Intergenic -217028 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 173.667-42 chr13 86826520 86826793 + 1 NA Intergenic Intergenic -85264 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 214.333-128 chr6 134438356 134438666 + 1 NA non-coding (NR_038218, exon 1 of 3) non-coding (NR_038218, exon 1 of 3) 121 NR_038219 154092 Hs.223718 NR_038216 LINC01010 - long intergenic non-protein coding RNA 1010 ncRNA 167.333-98 chr16 19772254 19772540 + 1 NA intron (NM_001305122, intron 7 of 8) L1MC5a|LINE|L1 -54170 NM_001348528 400506 Hs.585209 NM_001012991 ENSG00000103550 KNOP1 101F10.1|C16orf88|FAM191A|TSG118 lysine rich nucleolar protein 1 protein-coding 155.333-117 chr15 47703100 47703316 + 1 NA intron (NM_001198999, intron 4 of 19) intron (NM_001198999, intron 4 of 19) -14297 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 151.333-267 chr3 1559805 1560054 + 1 NA Intergenic Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 466905 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 137.333-155 chr5 64500955 64501147 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -4964 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 256.333-23 chr12 68234915 68235439 + 1 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL -9367 NM_018402 55801 Hs.272350 NM_018402 ENSG00000111536 IL26 AK155|IL-26 interleukin 26 protein-coding 166.667-152 chr3 84902309 84902560 + 1 NA Intergenic Intergenic 20344 NR_147147 105377192 NR_147147 ENSG00000242339 LINC02025 - long intergenic non-protein coding RNA 2025 ncRNA 159.333-110 chr15 101095534 101095789 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 156387 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 203.667-134 chr9 31678806 31679301 + 1 NA Intergenic Intergenic -297563 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 188.333-107 chr4 56822872 56823072 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1103 NM_021114 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 158.667-235 chr4 45234157 45234439 + 1 NA Intergenic Intergenic -507664 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 232.667-9 chr11 108097220 108097583 + 1 NA intron (NM_003478, intron 16 of 18) intron (NM_003478, intron 16 of 18) -24166 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 199.333-114 chr18 71802147 71802445 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -20070 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 234.667-117 chr9 76567474 76567804 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 67006 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 314.667-28 chr3 61717493 61717996 + 1 NA intron (NM_002841, intron 1 of 29) AluSc5|SINE|Alu 156173 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 157.333-90 chr12 78401136 78401380 + 1 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -41512 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 263.667-18 chr12 124870157 124870475 + 1 NA Intergenic Intergenic -6452 NR_160416 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 296.333-33 chr5 74739893 74740268 + 1 NA exon (NM_170691, exon 12 of 20) exon (NM_170691, exon 12 of 20) 27037 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 161.667-2 chr1 42853447 42853733 + 1 NA Intergenic Intergenic -4032 NR_104171 339539 Hs.434301 NR_104171 LOC339539 - uncharacterized LOC339539 ncRNA 226.333-10 chr10 68686403 68686811 + 1 NA exon (NM_030625, exon 11 of 12) exon (NM_030625, exon 11 of 12) -34632 NM_018237 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 151.333-451 chrX 12668942 12669123 + 1 NA intron (NM_001368400, intron 3 of 15) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -122323 NM_002765 5634 Hs.654581 NM_002765 ENSG00000101911 PRPS2 PRSII phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 2 protein-coding 173.333-178 chr7 5098682 5099036 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 26799 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 210.667-19 chr10 59556944 59557381 + 1 NA Intergenic Intergenic 152729 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 257.333-25 chr11 113199314 113199772 + 1 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) 74358 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 172.333-58 chr15 79855570 79855798 + 1 NA intron (NR_037654, intron 2 of 2) L1PREC2|LINE|L1 41313 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 156.333-181 chr2 72046316 72046588 + 1 NA Intergenic Intergenic 101410 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 153.333-376 chr7 13380812 13380979 + 1 NA Intergenic Intergenic 605619 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 116.333-117 chr2 45443848 45444068 + 1 NA intron (NM_018079, intron 16 of 20) intron (NM_018079, intron 16 of 20) 167309 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 147.333-230 chr4 12624430 12624629 + 1 NA Intergenic Intergenic 401078 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 118.333-38 chr11 13709612 13709800 + 1 NA intron (NM_032228, intron 4 of 11) intron (NM_032228, intron 4 of 11) 41038 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 345.333-3 chr10 75813701 75814416 + 1 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 31297 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 129.667-127 chr4 73307029 73307277 + 1 NA Intergenic Intergenic -48355 NM_198889 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 130.333-220 chr9 77928480 77928668 + 1 NA intron (NM_002072, intron 1 of 6) intron (NM_002072, intron 1 of 6) 103237 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 192.333-16 chr10 64656000 64656350 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -169353 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 314.667-19 chr15 78216248 78216641 + 1 NA intron (NM_015162, intron 1 of 13) intron (NM_015162, intron 1 of 13) 18121 NM_015162 23205 Hs.655760 NM_015162 ENSG00000103740 ACSBG1 BG|BG1|BGM|GR-LACS|LPD acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 protein-coding 196.333-5 chr1 93710497 93710794 + 1 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) L2b|LINE|L2 -28808 NM_003567 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 174.667-42 chr13 77255202 77255450 + 1 NA intron (NM_015057, intron 14 of 82) intron (NM_015057, intron 14 of 82) 71768 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 200.333-80 chr2 240122085 240122412 + 1 NA Intergenic Intergenic 14057 NM_001163424 150678 Hs.293884 NM_138336 ENSG00000172428 COPS9 CSNAP|MYEOV2 COP9 signalosome subunit 9 protein-coding 112.667-66 chr14 53351354 53351503 + 1 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 198074 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 157.667-10 chr1 95700271 95700476 + 1 NA Intergenic Intergenic 190257 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 112.667-138 chr2 193175576 193175714 + 1 NA Intergenic Intergenic 425800 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 159.667-324 chr8 102129853 102130149 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 4569 NR_049859 100847001 NR_049859 ENSG00000266756 MIR5680 - microRNA 5680 ncRNA 159.667-275 chr5 147021027 147021281 + 1 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) L1ME1|LINE|L1 34983 NM_181674 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 182.333-55 chr15 62156765 62156965 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 8420 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 250.667-33 chr17 70005938 70006223 + 1 NA Intergenic Intergenic 44373 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 169.333-112 chr2 27412049 27412288 + 1 NA Intergenic Intergenic -2577 NM_177983 5496 Hs.643951 NM_177983 ENSG00000115241 PPM1G PP2CG|PP2CGAMMA|PPP2CG protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1G protein-coding 149.333-57 chr10 75443407 75443699 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) L1M3|LINE|L1 11929 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 152.667-367 chr8 70453553 70453745 + 1 NA Intergenic Intergenic -17485 NR_110653 101926892 Hs.367827 NR_110653 ENSG00000253967 LOC101926892 - uncharacterized LOC101926892 ncRNA 152.333-163 chr19 8616311 8616512 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -5696 NM_030957 81794 Hs.657508 NM_030957 ENSG00000142303 ADAMTS10 ADAM-TS10|ADAMTS-10|WMS|WMS1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 10 protein-coding 260.667-92 chr8 122754609 122754948 + 1 NA Intergenic Intergenic -26877 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 145.667-317 chrX 155171802 155171997 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -25108 NM_001303544 7411 Hs.436803 NM_003372 ENSG00000155959 VBP1 HIBBJ46|PFD3|PFDN3|VBP-1 VHL binding protein 1 protein-coding 140.333-181 chr5 61401653 61401815 + 1 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 69476 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 159.333-334 chr8 119038752 119038933 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) intron (NM_001324095, intron 3 of 7) -28405 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 164.333-59 chr12 119448373 119448538 + 1 NA intron (NM_178499, intron 2 of 13) MIRb|SINE|MIR 113726 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 264.667-27 chr14 56609667 56610084 + 1 NA intron (NM_017799, intron 6 of 15) intron (NM_017799, intron 6 of 15) 30077 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 324.667-17 chr2 119984412 119984932 + 1 NA 3' UTR (NM_002830, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_002830, exon 27 of 27) -28405 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 313.333-10 chr13 69568850 69569422 + 1 NA Intergenic Intergenic 346790 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 213.333-142 chr3 190523163 190523473 + 1 NA intron (NM_001364879, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 9233 NM_001364879 3556 Hs.478673 NM_002182 ENSG00000196083 IL1RAP C3orf13|IL-1RAcP|IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein protein-coding 174.333-38 chr14 45473861 45474160 + 1 NA Intergenic Intergenic -220808 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 190.333-90 chr3 71047424 71047695 + 1 NA intron (NM_001244812, intron 4 of 15) intron (NM_001244812, intron 4 of 15) 17365 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 163.667-138 chr20 56138060 56138248 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -110578 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 153.333-62 chr11 18206557 18206715 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -2502 NR_026564 494141 Hs.446327 NR_026541 ENSG00000189332 SLC25A51P4 - SLC25A51 pseudogene 4 pseudo 166.667-104 chr2 20302889 20303123 + 1 NA intron (NM_001282790, intron 6 of 18) LTR45C|LTR|ERV1 24380 NM_001282791 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 150.667-47 chr10 87538522 87538791 + 1 NA intron (NM_001178118, intron 4 of 4) intron (NM_001178118, intron 4 of 4) 30823 NM_001178118 9562 Hs.121260 NM_004897 ENSG00000107789 MINPP1 HIPER1|MINPP2|MIPP multiple inositol-polyphosphate phosphatase 1 protein-coding 277.667-40 chr5 43648075 43648499 + 1 NA intron (NM_012343, intron 10 of 21) intron (NM_012343, intron 10 of 21) -45057 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 223.667-36 chr2 32827545 32827945 + 1 NA intron (NR_027098, intron 1 of 5) intron (NR_027098, intron 1 of 5) 2312 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 175.333-154 chr6 44878050 44878466 + 1 NA intron (NM_181356, intron 12 of 12) intron (NM_181356, intron 12 of 12) 319512 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 202.667-111 chr4 105707327 105707529 + 1 NA intron (NM_020395, intron 1 of 7) intron (NM_020395, intron 1 of 7) 1261 NM_020395 57117 Hs.480454 NM_020395 ENSG00000138785 INTS12 INT12|PHF22|SBBI22 integrator complex subunit 12 protein-coding 277.667-43 chr6 102322193 102322492 + 1 NA Intergenic Intergenic 923357 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 218.333-3 chr1 63768212 63768520 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -5651 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 186.333-36 chr11 121606111 121606393 + 1 NA intron (NM_003105, intron 35 of 47) intron (NM_003105, intron 35 of 47) 153938 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 199.667-91 chr3 55631407 55631695 + 1 NA intron (NR_132749, intron 16 of 17) intron (NR_132749, intron 16 of 17) 27918 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 167.333-92 chr15 64359666 64359900 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3610 NM_001329606 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 153.333-325 chr5 33000912 33001154 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 53590 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 184.333-69 chr2 12256658 12256944 + 1 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 57671 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 155.333-280 chr5 9127713 9127883 + 1 NA intron (NM_003966, intron 13 of 22) MIR3|SINE|MIR -73903 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 275.333-63 chr6 48921489 48921969 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 541524 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 151.333-360 chr6 63713842 63714012 + 1 NA 3' UTR (NM_015153, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_015153, exon 15 of 15) 67401 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 194.333-37 chr13 80934909 80935131 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -83371 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 148.667-25 chr1 211071466 211071724 + 1 NA intron (NM_002238, intron 5 of 10) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 61779 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 192.667-86 chr2 60874125 60874530 + 1 NA intron (NR_033980, intron 1 of 2) intron (NR_033980, intron 1 of 2) 6987 NR_033980 400957 Hs.170358 NR_033980 ENSG00000228414 LINC01185 - long intergenic non-protein coding RNA 1185 ncRNA 239.333-63 chr20 46662496 46662808 + 1 NA intron (NM_001193340, intron 2 of 12) intron (NM_001193340, intron 2 of 12) -11193 NM_001193339 64849 Hs.655498 NM_022829 ENSG00000158296 SLC13A3 ARLIAK|NADC3|SDCT2 solute carrier family 13 member 3 protein-coding 293.667-10 chr11 116096601 116097007 + 1 NA Intergenic Intergenic -336604 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 166.333-239 chr9 30255549 30255846 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 152757 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 131.333-160 chr6 141524034 141524199 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 564683 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 152.667-263 chr4 29972463 29972676 + 1 NA Intergenic Intergenic -747800 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 264.333-22 chr14 76770528 76770892 + 1 NA intron (NM_014909, intron 2 of 6) intron (NM_014909, intron 2 of 6) 9242 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 156.333-316 chr6 127247286 127247447 + 1 NA Intergenic Intergenic -19316 NM_001242851 81847 Hs.267120 NM_030963 ENSG00000118518 RNF146 - ring finger protein 146 protein-coding 181.333-172 chr8 89126086 89126453 + 1 NA Intergenic Intergenic 631442 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 139.667-151 chr5 51851111 51851357 + 1 NA Intergenic Intergenic -156797 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 219.333-69 chr16 71542268 71542617 + 1 NA Intergenic Intergenic 16016 NM_001166395 10164 Hs.251383 NM_005769 ENSG00000140835 CHST4 GST3|GlcNAc6ST2|HECGLCNAC6ST|LSST carbohydrate sulfotransferase 4 protein-coding 164.333-198 chr5 101128228 101128558 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -225111 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 171.667-58 chr15 87451305 87451544 + 1 NA Intergenic Intergenic -125505 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 243.667-13 chr11 106832619 106833004 + 1 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) intron (NM_001256424, intron 4 of 8) 185665 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 221.333-4 chr1 57446064 57446456 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) -21339 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 136.667-168 chr7 75071891 75072107 + 1 NA intron (NM_001281441, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 1803 NM_030798 81554 Hs.529623 NM_030798 ENSG00000274523 RCC1L WBSCR16 RCC1 like protein-coding 205.667-63 chr2 8465601 8465929 + 1 NA Intergenic Intergenic 118027 NR_110257 101929567 Hs.634706 NR_110257 ENSG00000236008 LINC01814 - long intergenic non-protein coding RNA 1814 ncRNA 171.667-112 chr3 94139867 94140097 + 1 NA Intergenic Intergenic 76921 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 148.333-49 chr10 63171729 63171908 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 23 of 24) intron (NM_001322258, intron 23 of 24) 38490 NM_030759 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 212.333-83 chr20 38857546 38857873 + 1 NA intron (NM_015568, intron 2 of 10) intron (NM_015568, intron 2 of 10) 52012 NM_001172735 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 201.333-303 chr9 111014466 111015000 + 1 NA intron (NM_001351399, intron 1 of 5) intron (NM_001351399, intron 1 of 5) 22047 NM_001351420 1902 Hs.126667 NM_001401 ENSG00000198121 LPAR1 EDG2|GPR26|Gpcr26|LPA1|Mrec1.3|VZG1|edg-2|rec.1.3|vzg-1 lysophosphatidic acid receptor 1 protein-coding 141.667-121 chr2 95496970 95497111 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12309 NM_001164464 653192 Hs.723811 NM_001164464 ENSG00000144010 TRIM43B - tripartite motif containing 43B protein-coding 256.333-46 chr2 169377664 169378018 + 1 NA Intergenic Intergenic -15307 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 136.667-149 chr5 126962876 126963027 + 1 NA intron (NM_178450, intron 1 of 4) intron (NM_178450, intron 1 of 4) 67607 NM_178450 115123 Hs.132441 NM_178450 ENSG00000173926 MARCH3 MARCH-III|RNF173 membrane associated ring-CH-type finger 3 protein-coding 154.333-236 chr4 25516317 25516496 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 52940 NR_134641 101929161 Hs.125638 NR_134641 LOC101929161 - uncharacterized LOC101929161 ncRNA 151.333-435 chr8 138675164 138675413 + 1 NA intron (NM_152888, intron 41 of 64) intron (NM_152888, intron 41 of 64) -177558 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 186.667-57 chr18 59390759 59391038 + 1 NA Intergenic Intergenic -31633 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 243.667-44 chr2 132868094 132868383 + 1 NA intron (NM_207481, intron 10 of 17) intron (NM_207481, intron 10 of 17) -47319 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 148.333-370 chr7 94356436 94356623 + 1 NA Intergenic Intergenic 35663 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 319.667-15 chr2 100372908 100373393 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 44518 NM_004854 9486 Hs.516370 NM_004854 ENSG00000115526 CHST10 HNK-1ST|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 10 protein-coding 289.667-17 chr2 14526984 14527306 + 1 NA Intergenic Intergenic -105572 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 169.667-204 chr8 63676486 63676719 + 1 NA Intergenic Intergenic -92828 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 154.333-274 chr5 120641084 120641350 + 1 NA intron (NM_001308088, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 109753 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 168.667-230 chr8 130606863 130607041 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -163278 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 295.333-56 chr8 28244669 28245161 + 1 NA Intergenic Intergenic -72353 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 228.333-101 chr8 122070308 122070570 + 1 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -428999 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 208.667-40 chr12 80442263 80442598 + 1 NA Intergenic Intergenic -1805 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 169.333-58 chr12 100308518 100308742 + 1 NA intron (NM_017988, intron 4 of 17) L1PA7|LINE|L1 41246 NM_001330253 55681 Hs.506481 NM_017988 ENSG00000136021 SCYL2 CVAK104 SCY1 like pseudokinase 2 protein-coding 169.667-22 chr10 78120936 78121242 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 87226 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 152.667-191 chr2 115554599 115554863 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 210916 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 228.667-58 chr3 87706065 87706334 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -86507 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 164.333-154 chr3 39980817 39981071 + 1 NA intron (NM_001284424, intron 2 of 15) L1MB3|LINE|L1 -119067 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 227.333-131 chr9 74353545 74353928 + 1 NA Intergenic Intergenic -17795 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 138.667-45 chr12 39711583 39711761 + 1 NA intron (NM_001031748, intron 11 of 12) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 85489 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 263.667-74 chr7 41124572 41125101 + 1 NA intron (NR_110832, intron 4 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 23232 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 246.667-71 chr5 90503821 90504123 + 1 NA intron (NM_001370351, intron 6 of 7) intron (NM_001370351, intron 6 of 7) 25612 NM_001286812 116068 Hs.136235 NM_198273 ENSG00000176018 LYSMD3 - LysM domain containing 3 protein-coding 166.667-54 chr13 26605923 26606098 + 1 NA intron (NM_006646, intron 1 of 9) intron (NM_006646, intron 1 of 9) 48307 NM_001291965 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 179.333-39 chr11 62280492 62280693 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 10434 NM_002411 4250 Hs.46452 NM_002411 ENSG00000110484 SCGB2A2 MGB1|UGB2 secretoglobin family 2A member 2 protein-coding 113.333-210 chr5 85977121 85977267 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -305250 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 127.667-194 chr9 27670353 27670589 + 1 NA Intergenic Intergenic -96605 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 298.667-8 chr12 80905183 80905608 + 1 NA intron (NM_004664, intron 1 of 5) intron (NM_004664, intron 1 of 5) 30438 NR_030349 693203 NR_030349 ENSG00000208022 MIR618 MIRN618|hsa-mir-618|mir-618 microRNA 618 ncRNA 168.333-99 chr2 152985497 152985682 + 1 NA Intergenic Intergenic 266952 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 154.333-311 chr7 8654445 8654653 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 220940 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 266.333-50 chr5 127705108 127705497 + 1 NA intron (NM_001317938, intron 1 of 6) intron (NM_001317938, intron 1 of 6) 1913 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 225.667-29 chr15 75934908 75935288 + 1 NA non-coding (NR_037623, exon 6 of 6) non-coding (NR_037623, exon 6 of 6) 31220 NM_147188 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 133.333-19 chr1 229495501 229495688 + 1 NA intron (NM_018230, intron 7 of 25) L2a|LINE|L2 12747 NM_018230 55746 Hs.12457 NM_018230 ENSG00000069248 NUP133 GAMOS8|NPHS18|hNUP133 nucleoporin 133 protein-coding 201.333-36 chr10 82011615 82011906 + 1 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 134073 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 199.667-111 chr5 40250789 40251093 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 198650 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 223.333-27 chr11 85884522 85884896 + 1 NA intron (NM_001286159, intron 4 of 10) intron (NM_001286159, intron 4 of 10) 29608 NM_173556 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 164.667-79 chr15 57248171 57248386 + 1 NA intron (NM_207038, intron 13 of 19) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 28848 NM_001306219 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 172.333-191 chr9 12404416 12404691 + 1 NA Intergenic Intergenic -288832 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 144.667-64 chr12 90290171 90290413 + 1 NA Intergenic Intergenic -3026 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 157.667-278 chr6 53936531 53936887 + 1 NA intron (NR_125842, intron 1 of 3) intron (NR_125842, intron 1 of 3) 6727 NR_125842 101927189 Hs.453592 NR_125842 ENSG00000236740 LOC101927189 - uncharacterized LOC101927189 ncRNA 149.667-296 chr4 164098787 164098960 + 1 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) 98838 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 186.667-7 chr1 200813105 200813310 + 1 NA intron (NM_001297707, intron 3 of 17) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -59774 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 253.333-111 chr8 99736052 99736354 + 1 NA intron (NM_017890, intron 39 of 61) intron (NM_017890, intron 39 of 61) 157504 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 161.333-24 chr10 10002866 10003192 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -55693 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 161.333-266 chr7 80580396 80580591 + 1 NA Intergenic MamGypLTR1a|LTR|Gypsy -21714 NM_001371080 171.667-101 chr21 30163384 30163630 + 1 NA Intergenic Intergenic 3298 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 246.333-47 chr2 12286839 12287263 + 1 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 87921 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 183.667-107 chr4 73884799 73885093 + 1 NA Intergenic Intergenic 15553 NR_046035 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 128.333-127 chr3 49978539 49978753 + 1 NA intron (NM_001349190, intron 4 of 18) intron (NM_001349190, intron 4 of 18) 38496 NM_001349193 10180 Hs.696735 NM_005777 ENSG00000004534 RBM6 3G2|DEF-3|DEF3|HLC-11|NY-LU-12|g16 RNA binding motif protein 6 protein-coding 213.333-93 chr2 55567407 55567649 + 1 NA intron (NM_020463, intron 11 of 14) AluSz|SINE|Alu 47933 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 158.333-314 chr8 54950634 54950811 + 1 NA Intergenic Intergenic -151306 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 146.667-51 chr10 128690541 128690728 + 1 NA Intergenic Intergenic -222199 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 213.333-176 chr6 20601850 20602201 + 1 NA intron (NM_017774, intron 4 of 15) MIRb|SINE|MIR 67568 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 313.333-39 chr6 98058899 98059307 + 1 NA Intergenic Intergenic 34572 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 271.667-24 chr14 49445282 49445771 + 1 NA Intergenic Intergenic 140854 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 155.667-240 chr4 37775507 37775696 + 1 NA Intergenic Intergenic -51085 NM_018290 55276 Hs.23363 NM_018290 ENSG00000169299 PGM2 MSTP006 phosphoglucomutase 2 protein-coding 205.333-125 chr2 70571237 70571528 + 1 NA Intergenic Intergenic -17556 NM_001099691 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 190.667-84 chr3 60509916 60510337 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) 107744 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 210.667-95 chr3 166556291 166556636 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -342220 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 289.333-64 chr8 105891834 105892136 + 1 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) L1MA6|LINE|L1 168518 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 292.667-24 chr3 79672099 79672454 + 1 NA intron (NM_002941, intron 1 of 30) intron (NM_002941, intron 1 of 30) 95722 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 160.667-127 chr18 4449255 4449489 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 5894 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 243.333-53 chr2 102577400 102577786 + 1 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -41960 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 191.667-132 chr9 28492618 28492900 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 226546 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 150.333-198 chr2 86480664 86480906 + 1 NA intron (NM_018433, intron 16 of 25) intron (NM_018433, intron 16 of 25) 39324 NM_001146688 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 207.667-43 chr17 43734117 43734502 + 1 NA Intergenic Intergenic 24482 NM_025237 50964 Hs.349204 NM_025237 ENSG00000167941 SOST CDD|DAND6|SOST1|VBCH sclerostin protein-coding 218.667-7 chr1 161785221 161785534 + 1 NA intron (NM_007348, intron 4 of 15) intron (NM_007348, intron 4 of 15) 19057 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 315.667-13 chr20 21215024 21215370 + 1 NA intron (NM_018474, intron 8 of 12) intron (NM_018474, intron 8 of 12) 3092 NR_109956 101929591 Hs.656066 NR_109956 ENSG00000232712 KIZ-AS1 - KIZ antisense RNA 1 ncRNA 175.333-71 chr18 40000557 40000925 + 1 NA Intergenic Intergenic -65545 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 298.333-10 chr14 59418101 59418529 + 1 NA Intergenic Intergenic 47065 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 199.333-280 chr8 115624526 115625013 + 1 NA intron (NM_014112, intron 1 of 6) intron (NM_014112, intron 1 of 6) 43244 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 150.667-70 chr11 73361347 73361618 + 1 NA intron (NM_014786, intron 12 of 20) intron (NM_014786, intron 12 of 20) -14917 NM_152222 84957 Hs.533720 NM_032871 ENSG00000054967 RELT AI3C|TNFRSF19L|TRLT RELT TNF receptor protein-coding 124.333-50 chr14 58008116 58008362 + 1 NA intron (NM_001001872, intron 6 of 7) L1MC4|LINE|L1 -142147 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 128.333-15 chr1 208926530 208926748 + 1 NA Intergenic Intergenic -45815 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 167.333-101 chr16 64963313 64963504 + 1 NA intron (NM_001330576, intron 10 of 11) L1MCa|LINE|L1 158655 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 307.667-15 chr15 45503996 45504525 + 1 NA intron (NM_001321036, intron 3 of 3) intron (NM_001321036, intron 3 of 3) -6876 NR_022014 283651 Hs.574240 NM_173609 HMGN2P46 C15orf21|D-PCa-2 high mobility group nucleosomal binding domain 2 pseudogene 46 pseudo 159.667-296 chr7 33171372 33171611 + 1 NA intron (NM_198428, intron 4 of 22) MER57A-int|LTR|ERV1 41927 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 148.667-330 chr6 36842950 36843175 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -3618 NM_020939 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 131.333-130 chr4 73000583 73000769 + 1 NA Intergenic Intergenic 69040 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 121.333-69 chr17 52508804 52509027 + 1 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 118393 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 185.333-145 chr4 166271562 166271819 + 1 NA Intergenic Intergenic 398453 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 210.667-68 chr2 63077393 63077844 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 26788 NR_130153 5013 Hs.734360 NM_014562 ENSG00000115507 OTX1 - orthodenticle homeobox 1 protein-coding 125.667-184 chr8 35303040 35303244 + 1 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 67667 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 202.333-16 chr1 191898590 191898959 + 1 NA Intergenic Intergenic -259688 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 131.667-215 chr9 74857204 74857431 + 1 NA intron (NM_017662, intron 2 of 38) intron (NM_017662, intron 2 of 38) 30030 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 167.667-118 chr20 47583503 47583840 + 1 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 81784 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 154.667-194 chr2 174605971 174606138 + 1 NA intron (NM_001077269, intron 1 of 7) intron (NM_001077269, intron 1 of 7) 28551 NM_003387 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 150.667-125 chr14 71683054 71683254 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 13 of 24) AluJb|SINE|Alu 96856 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 222.667-71 chr5 9775014 9775266 + 1 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) L1MA3|LINE|L1 -79237 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 376.333-7 chr18 69269085 69269722 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -131485 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 239.333-8 chr1 173494005 173494290 + 1 NA Intergenic Intergenic 16812 NM_004905 9588 Hs.120 NM_004905 ENSG00000117592 PRDX6 1-Cys|AOP2|HEL-S-128m|NSGPx|PRX|aiPLA2|p29 peroxiredoxin 6 protein-coding 253.667-66 chr6 123689962 123690290 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -53033 NM_001256022 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 217.667-21 chr11 103243145 103243599 + 1 NA intron (NM_001080463, intron 64 of 89) intron (NM_001080463, intron 64 of 89) 133946 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 123.667-114 chr22 35973582 35973724 + 1 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) -12023 NM_001349994 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 205.667-132 chr8 122142240 122142510 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 426269 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 160.667-284 chr7 74503262 74503492 + 1 NA intron (NM_016328, intron 1 of 26) intron (NM_016328, intron 1 of 26) 49471 NM_001199207 9569 Hs.647056 NM_005685 ENSG00000006704 GTF2IRD1 BEN|CREAM1|GTF3|MUSTRD1|RBAP2|WBS|WBSCR11|WBSCR12|hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1 protein-coding 141.667-206 chr7 23974176 23974460 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 264099 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 310.333-28 chr21 27264161 27264547 + 1 NA Intergenic Intergenic -297266 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 167.333-69 chr12 59183714 59184003 + 1 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -263320 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 196.667-131 chr6 56920953 56921260 + 1 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 33724 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 270.667-32 chr22 21585074 21585407 + 1 NA intron (NR_046082, intron 1 of 3) intron (NR_046082, intron 1 of 3) 17526 NR_046082 7332 Hs.108104 NM_003347 ENSG00000185651 UBE2L3 E2-F1|L-UBC|UBCH7|UbcM4 ubiquitin conjugating enzyme E2 L3 protein-coding 170.333-215 chr8 34638054 34638329 + 1 NA Intergenic Intergenic -145730 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 181.667-117 chr5 44160445 44160675 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -228172 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 189.333-207 chr8 108360742 108361002 + 1 NA Intergenic Intergenic -82711 NM_001329495 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 185.333-70 chr17 77155532 77155783 + 1 NA intron (NM_001143999, intron 3 of 16) intron (NM_001143999, intron 3 of 16) 14688 NM_001143998 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 126.667-71 chr19 12315235 12315368 + 1 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 18332 NM_145276 147837 Hs.663510 NM_145276 ENSG00000188868 ZNF563 - zinc finger protein 563 protein-coding 185.333-155 chr5 55195434 55195711 + 1 NA Intergenic Intergenic -22395 NM_001145734 166979 Hs.669184 NM_152623 ENSG00000164287 CDC20B G6VTS76519 cell division cycle 20B protein-coding 298.667-30 chr8 137350593 137351093 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 62745 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 173.333-62 chr15 86254298 86254593 + 1 NA intron (NM_152336, intron 7 of 24) MIR|SINE|MIR 62523 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 119.667-18 chr10 6666221 6666418 + 1 NA Intergenic Intergenic 31249 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 195.333-65 chr12 100020662 100020912 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -36133 NM_001352185 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 144.333-95 chr17 44661312 44661590 + 1 NA intron (NM_001145080, intron 2 of 7) MIRc|SINE|MIR 4983 NM_001145080 284071 Hs.349758 NM_001033659 ENSG00000180336 MEIOC C17orf104 meiosis specific with coiled-coil domain protein-coding 254.333-94 chr9 135704530 135704844 + 1 NA intron (NM_001272003, intron 1 of 30) intron (NM_001272003, intron 1 of 30) 2502 NM_001272003 57582 Hs.104950 NM_020822 ENSG00000107147 KCNT1 EIEE14|ENFL5|KCa4.1|SLACK|Slo2.2|bA100C15.2 potassium sodium-activated channel subfamily T member 1 protein-coding 171.667-39 chr11 120496302 120496558 + 1 NA Intergenic Intergenic -15316 NM_014619 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 157.333-320 chr7 52545625 52545786 + 1 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -489928 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 294.667-20 chr18 37970953 37971439 + 1 NA Intergenic Intergenic 314061 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 161.667-165 chr3 33910629 33910851 + 1 NA Intergenic Intergenic 112110 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 211.333-215 chr7 1354277 1354746 + 1 NA Intergenic Intergenic 104959 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 146.667-167 chr2 75453113 75453324 + 1 NA Intergenic Intergenic -70850 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 285.667-13 chr14 60632121 60632727 + 1 NA Intergenic Intergenic -6792 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 120.667-175 chr8 135051001 135051180 + 1 NA Intergenic Intergenic -183041 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 165.333-160 chr3 25801615 25801983 + 1 NA Intergenic Intergenic 11709 NM_017897 54995 Hs.55781 NM_017897 ENSG00000151093 OXSM CEM1|FASN2D|KASI|KS 3-oxoacyl-ACP synthase, mitochondrial protein-coding 286.667-40 chr7 49182026 49182391 + 1 NA Intergenic Intergenic 257661 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 221.667-82 chr8 95887836 95888188 + 1 NA Intergenic Intergenic 60336 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 115.667-146 chr3 36602042 36602197 + 1 NA Intergenic Intergenic 137742 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 260.667-54 chr20 1414197 1414512 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -21182 NM_054014 2280 Hs.471933 NM_000801 ENSG00000088832 FKBP1A FKBP-12|FKBP-1A|FKBP1|FKBP12|PKC12|PKCI2|PPIASE FKBP prolyl isomerase 1A protein-coding 147.667-301 chr6 10321348 10321565 + 1 NA Intergenic Intergenic -83046 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 113.333-185 chr3 180792925 180793076 + 1 NA intron (NR_109986, intron 3 of 13) intron (NR_109986, intron 3 of 13) 77178 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 235.333-80 chr3 190209843 190210255 + 1 NA Intergenic Intergenic -87612 NM_001134418 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 162.667-132 chr2 81792127 81792397 + 1 NA Intergenic Intergenic -325316 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 235.667-15 chr12 104298026 104298482 + 1 NA intron (NM_001261446, intron 2 of 13) intron (NM_001261446, intron 2 of 13) -5485 NM_001008394 493861 Hs.659857 NM_001008394 ENSG00000255150 EID3 NS4EB|NSE4B|NSMCE4B EP300 interacting inhibitor of differentiation 3 protein-coding 204.667-142 chr7 88300675 88301098 + 1 NA intron (NM_001205315, intron 1 of 5) intron (NM_001205315, intron 1 of 5) 6008 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 223.333-44 chr15 72738018 72738387 + 1 NA non-coding (NR_045565, exon 17 of 17) non-coding (NR_045565, exon 17 of 17) -44633 NR_040107 100287559 Hs.562587 NR_040107 ENSG00000260898 ADPGK-AS1 - ADPGK antisense RNA 1 ncRNA 152.333-305 chr5 83236857 83237096 + 1 NA intron (NM_001318012, intron 6 of 7) L1MA4|LINE|L1 159429 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 163.333-301 chrX 56468736 56468905 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -94773 NM_013444 29978 Hs.179309 NM_013444 ENSG00000188021 UBQLN2 ALS15|CHAP1|DSK2|HRIHFB2157|N4BP4|PLIC2 ubiquilin 2 protein-coding 146.667-49 chr10 121376057 121376312 + 1 NA Intergenic Intergenic 155130 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 149.333-200 chr2 163457845 163458002 + 1 NA Intergenic Intergenic 278085 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 147.667-386 chr9 6036372 6036519 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -20821 NM_001243202 26953 Hs.167496 NM_012416 ENSG00000137040 RANBP6 - RAN binding protein 6 protein-coding 128.333-24 chr10 29569671 29569833 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 3 of 38) intron (NM_001323599, intron 3 of 38) -24655 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 260.667-66 chr4 94663123 94663678 + 1 NA intron (NM_006457, intron 12 of 12) intron (NM_006457, intron 12 of 12) 94133 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 188.667-135 chr7 20803662 20803931 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -16910 NM_198956 221833 Hs.195922 NM_182700 ENSG00000164651 SP8 BTD Sp8 transcription factor protein-coding 158.667-284 chr6 39257043 39257292 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -27692 NM_003740 8645 Hs.444448 NM_003740 ENSG00000164626 KCNK5 K2p5.1|KCNK5b|TASK-2|TASK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 5 protein-coding 203.333-83 chr14 76846848 76847161 + 1 NA intron (NM_194287, intron 7 of 13) L2a|LINE|L2 20596 NM_194287 145497 Hs.147276 NM_194287 ENSG00000100565 LRRC74A C14orf166B|LRRC74 leucine rich repeat containing 74A protein-coding 186.667-74 chr2 135925575 135925862 + 1 NA intron (NM_001293312, intron 6 of 14) intron (NM_001293312, intron 6 of 14) -49275 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 157.333-113 chr14 97928583 97928796 + 1 NA intron (NR_015430, intron 2 of 2) intron (NR_015430, intron 2 of 2) 49435 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 151.667-322 chr6 130093158 130093365 + 1 NA intron (NM_001007102, intron 16 of 21) L1MD1|LINE|L1 73617 NM_001346550 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 312.333-11 chr2 143410579 143411280 + 1 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) AluSx1|SINE|Alu 281510 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 233.667-21 chr14 69929120 69929490 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR -48828 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 150.333-174 chr18 22564350 22564500 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -146510 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 120.333-93 chr2 49001001 49001240 + 1 NA intron (NM_000145, intron 4 of 9) MIRc|SINE|MIR -58483 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 155.333-391 chr8 99667686 99667877 + 1 NA intron (NM_017890, intron 35 of 61) intron (NM_017890, intron 35 of 61) -130920 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 243.667-23 chr14 68188789 68189109 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 365357 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 149.333-339 chr6 88987178 88987365 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -23653 NM_001286426 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 353.667-14 chr7 68166257 68166860 + 1 NA Intergenic Intergenic 146305 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 175.667-85 chr20 16114669 16114859 + 1 NA Intergenic Intergenic -128882 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 149.667-29 chr1 154140017 154140181 + 1 NA intron (NM_001159484, intron 4 of 37) AluSz|SINE|Alu 15017 NM_001159484 91181 Hs.67639 NM_207308 ENSG00000143552 NUP210L - nucleoporin 210 like protein-coding 213.667-96 chr9 27078957 27079307 + 1 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -30009 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 223.667-41 chr20 36290094 36290486 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -16049 NM_001365621 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 121.333-190 chr9 26927678 26927921 + 1 NA intron (NM_001321546, intron 4 of 12) intron (NM_001321546, intron 4 of 12) -19191 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 123.667-48 chr13 101670437 101670679 + 1 NA intron (NM_001271754, intron 6 of 10) MER65-int|LTR|ERV1 180606 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 159.333-193 chr21 16350966 16351153 + 1 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -66291 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 159.333-97 chr14 72205636 72205903 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 272242 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 217.333-45 chr15 46282934 46283285 + 1 NA Intergenic Intergenic 577914 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 221.333-20 chr10 109005026 109005503 + 1 NA Intergenic Intergenic 917982 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 156.333-368 chr8 124918126 124918309 + 1 NA Intergenic Intergenic -23791 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 176.667-161 chrX 46094043 46094266 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 233520 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 146.333-63 chr12 41056487 41056719 + 1 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) intron (NM_001843, intron 23 of 23) -131717 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 161.667-39 chr11 34077874 34078163 + 1 NA intron (NM_005898, intron 6 of 18) intron (NM_005898, intron 6 of 18) 26287 NM_203364 4076 Hs.471818 NM_005898 ENSG00000135387 CAPRIN1 GPIAP1|GPIP137|GRIP137|M11S1|RNG105|p137GPI cell cycle associated protein 1 protein-coding 153.667-51 chr10 86259086 86259310 + 1 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) intron (NM_017551, intron 2 of 15) 5590 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 172.333-158 chr6 107522850 107523104 + 1 NA intron (NM_018013, intron 3 of 6) intron (NM_018013, intron 3 of 6) 32860 NM_018013 55084 Hs.445244 NM_018013 ENSG00000112320 SOBP JXC1|MRAMS sine oculis binding protein homolog protein-coding 161.667-54 chr12 42159321 42159689 + 1 NA non-coding (NR_135139, exon 7 of 7) non-coding (NR_135139, exon 7 of 7) -14631 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 181.333-25 chr11 66629261 66629541 + 1 NA 3' UTR (NM_001198837, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001198837, exon 2 of 2) -9216 NM_001198843 5936 Hs.523822 NM_002896 ENSG00000173933 RBM4 LARK|RBM4A|ZCCHC21|ZCRB3A RNA binding motif protein 4 protein-coding 162.333-179 chr4 30487452 30487614 + 1 NA Intergenic Intergenic -232836 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 140.667-218 chr7 88662033 88662282 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -97543 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 151.667-353 chr8 32475960 32476176 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 35322 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 159.333-70 chr12 75857160 75857375 + 1 NA Intergenic Intergenic 174509 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 214.667-118 chr8 89083470 89083783 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 674085 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 356.667-22 chr9 132100888 132101467 + 1 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -21310 NM_001253881 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 251.667-66 chr3 193443604 193443963 + 1 NA intron (NM_032279, intron 18 of 29) L1MEf|LINE|L1 -65030 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 143.667-167 chr3 125021513 125021685 + 1 NA intron (NM_020733, intron 3 of 16) intron (NM_020733, intron 3 of 16) 34398 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 251.333-6 chr1 244771812 244772304 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -63248 NM_001312871 116228 Hs.411490 NM_198076 ENSG00000203667 COX20 FAM36A cytochrome c oxidase assembly factor COX20 protein-coding 278.333-24 chr18 3787548 3788006 + 1 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) LTR48B|LTR|ERV1 57581 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 157.667-115 chr15 100746151 100746390 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -103482 NR_160703 105369201 Hs.612155 NR_160702 ENSG00000272808 LOC105369201 - uncharacterized LOC105369201 ncRNA 161.333-210 chr4 45759371 45759654 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 364542 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 172.667-14 chr1 214320951 214321242 + 1 NA intron (NM_020197, intron 5 of 11) intron (NM_020197, intron 5 of 11) 39937 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 221.333-25 chr11 45335396 45335769 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -19789 NR_120557 101928812 Hs.444059 NR_120557 ENSG00000254427 LINC02696 - long intergenic non-protein coding RNA 2696 ncRNA 259.667-63 chr5 107416302 107416774 + 1 NA intron (NM_001962, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 254399 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 174.667-67 chr17 3880995 3881285 + 1 NA intron (NM_172206, intron 8 of 15) MIRb|SINE|MIR 9603 NM_172206 84254 Hs.8417 NM_032294 ENSG00000004660 CAMKK1 CAMKKA calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 1 protein-coding 160.667-21 chr1 201679323 201679598 + 1 NA intron (NM_020443, intron 1 of 29) intron (NM_020443, intron 1 of 29) 31138 NM_020443 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 194.333-25 chr10 119820827 119821173 + 1 NA intron (NM_014937, intron 16 of 19) intron (NM_014937, intron 16 of 19) 1743 NM_001243194 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 143.333-303 chr9 33317503 33317759 + 1 NA intron (NM_002504, intron 7 of 23) AluJb|SINE|Alu 27115 NM_002504 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 276.333-30 chr20 63237290 63237735 + 1 NA intron (NM_022161, intron 1 of 6) intron (NM_022161, intron 1 of 6) -1267 NR_036163 100423014 NR_036163 ENSG00000266463 MIR3196 mir-3196 microRNA 3196 ncRNA 151.333-74 chr11 23364438 23364719 + 1 NA Intergenic Intergenic 54612 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 206.667-82 chr22 39201644 39201929 + 1 NA Intergenic Intergenic 39123 NM_033016 5155 Hs.1976 NM_002608 ENSG00000100311 PDGFB IBGC5|PDGF-2|PDGF2|SIS|SSV|c-sis platelet derived growth factor subunit B protein-coding 192.333-114 chr3 82675455 82675661 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 689416 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 259.333-7 chr1 173339830 173340220 + 1 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) MLT2B4|LTR|ERVL 121337 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 228.667-4 chr1 70838080 70838455 + 1 NA Intergenic Intergenic 131814 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 192.667-91 chr2 133325981 133326190 + 1 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) intron (NM_207481, intron 3 of 17) 59890 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 201.667-46 chr17 18000939 18001213 + 1 NA intron (NM_031294, intron 9 of 13) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 28214 NM_001130091 83450 Hs.579264 NM_031294 ENSG00000171962 DRC3 CFAP134|LRRC48 dynein regulatory complex subunit 3 protein-coding 147.667-354 chr8 69761975 69762225 + 1 NA intron (NM_001146009, intron 1 of 7) intron (NM_001146009, intron 1 of 7) 71069 NM_001146009 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 207.333-189 chr3 166892816 166893056 + 1 NA Intergenic Intergenic -5747 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 221.667-11 chr11 19023444 19023790 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 36400 NM_001303615 117194 Hs.350566 NM_054030 ENSG00000183695 MRGPRX2 MGRG3|MRGX2 MAS related GPR family member X2 protein-coding 162.333-197 chr5 37187148 37187438 + 1 NA intron (NM_023073, intron 23 of 51) intron (NM_023073, intron 23 of 51) -61753 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 128.667-99 chr2 214677959 214678124 + 1 NA Intergenic Intergenic 131642 NM_001282545 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 333.333-54 chr9 112121543 112121970 + 1 NA intron (NM_022486, intron 6 of 16) intron (NM_022486, intron 6 of 16) 53541 NM_001282643 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 166.333-169 chr4 159802506 159802815 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -24876 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 163.667-137 chr20 53426231 53426531 + 1 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -126389 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 314.333-22 chr5 35140050 35140640 + 1 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) -22223 NM_001204316 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 165.333-215 chr5 156864760 156865110 + 1 NA Intergenic Intergenic 14640 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 169.333-170 chr3 124708905 124709112 + 1 NA intron (NM_007064, intron 24 of 26) L1MEf|LINE|L1 -21358 NR_033437 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 154.667-4 chr1 53872273 53872570 + 1 NA intron (NR_036639, intron 6 of 11) L1ME4b|LINE|L1 17376 NR_036640 54432 Hs.11923 NM_018982 ENSG00000058799 YIPF1 DJ167A19.1|FinGER1 Yip1 domain family member 1 protein-coding 136.333-217 chr9 28585763 28586019 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 133414 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 214.333-144 chr7 42471893 42472223 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 234389 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 179.667-84 chr20 13330881 13331097 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -91302 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-289 chr8 126680856 126681070 + 1 NA Intergenic Intergenic -122485 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 224.333-54 chr17 48989768 48990121 + 1 NA Intergenic Intergenic -7441 NM_006546 10642 Hs.144936 NM_006546 ENSG00000159217 IGF2BP1 CRD-BP|CRDBP|IMP-1|IMP1|VICKZ1|ZBP1 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 protein-coding 151.333-164 chr16 73449699 73449873 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 62981 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 190.667-59 chr2 14601439 14601687 + 1 NA Intergenic Intergenic -31154 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 190.667 chr1 9453320 9453615 + 1 NA Intergenic Intergenic -24471 NR_104622 100506022 Hs.131775 NR_104622 ENSG00000284693 LINC02606 - long intergenic non-protein coding RNA 2606 ncRNA 174.333-114 chr5 38435209 38435515 + 1 NA intron (NM_182798, intron 11 of 16) intron (NM_182798, intron 11 of 16) -10184 NM_182801 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 118.333-184 chr6 159121105 159121257 + 1 NA Intergenic Intergenic -48219 NM_032532 84624 Hs.520525 NM_032532 ENSG00000164694 FNDC1 AGS8|FNDC2|MEL4B3|bA243O10.1|dJ322A24.1 fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 193.667-146 chrX 23939787 23940251 + 1 NA TTS (NM_152761) TTS (NM_152761) 32013 NM_001169574 254158 Hs.351265 NM_152761 ENSG00000165182 CXorf58 - chromosome X open reading frame 58 protein-coding 145.333-193 chr3 100053257 100053490 + 1 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 61140 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 156.667-295 chr6 37192638 37192798 + 1 NA Intergenic Intergenic 22566 NM_001243186 5292 Hs.81170 NM_002648 ENSG00000137193 PIM1 PIM Pim-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 170.667-129 chr5 12850516 12850851 + 1 NA Intergenic MER91B|DNA|hAT-Tip100 182203 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 166.333-205 chr6 149295730 149295911 + 1 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) AluSg|SINE|Alu -21892 NM_001369506 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 167.333-185 chr4 30783408 30783577 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 63123 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 190.667-144 chr8 49813560 49813917 + 1 NA Intergenic Intergenic -96058 NM_001321775 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 191.667-100 chr5 32885162 32885408 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -62158 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 160.667-13 chr1 89969332 89969577 + 1 NA Intergenic Intergenic 25512 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 129.333-134 chr3 133917554 133917711 + 1 NA Intergenic Intergenic 12180 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 145.333-283 chr7 96668519 96668762 + 1 NA intron (NR_163952, intron 2 of 6) MIR3|SINE|MIR -4302 NR_038948 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 173.333-132 chr3 124139100 124139313 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) intron (NM_001024660, intron 1 of 59) 6277 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 260.333-35 chr22 39772930 39773310 + 1 NA intron (NM_152512, intron 5 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 120640 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 202.333-129 chr4 91510342 91510735 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1PA16|LINE|L1 766764 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 163.667-57 chr14 38445354 38445603 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -189385 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 141.667-174 chr5 30046652 30046835 + 1 NA Intergenic Intergenic 166183 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 152.333-140 chr16 82580095 82580265 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -46789 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 209.667-118 chr8 141162921 141163321 + 1 NA intron (NM_001362798, intron 9 of 21) intron (NM_001362798, intron 9 of 21) 34532 NR_148197 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 147.667-52 chr11 47382153 47382301 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3680 NM_001080547 6688 Hs.502511 NM_003120 ENSG00000066336 SPI1 OF|PU.1|SFPI1|SPI-1|SPI-A Spi-1 proto-oncogene protein-coding 202.333-160 chr7 13559155 13559573 + 1 NA Intergenic Intergenic 427150 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 159.667-274 chr5 138287476 138287698 + 1 NA intron (NM_001364026, intron 9 of 12) intron (NM_001364026, intron 9 of 12) -12966 NM_001496 2676 Hs.58042 NM_001496 ENSG00000146013 GFRA3 GDNFR3 GDNF family receptor alpha 3 protein-coding 232.667-20 chr13 80447305 80447696 + 1 NA Intergenic Intergenic -106374 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 154.333-264 chr5 45795343 45795551 + 1 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 -99067 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 236.333-72 chr4 79649386 79649712 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 156956 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 140.667-83 chr15 26683272 26683478 + 1 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) intron (NM_001278631, intron 3 of 9) 33390 NM_001191320 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 156.667-11 chr1 65094822 65095121 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -27225 NM_001321853 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 243.333-62 chr21 21792709 21793116 + 1 NA intron (NR_109958, intron 4 of 4) intron (NR_109958, intron 4 of 4) 45927 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 210.667-106 chr5 62519293 62519632 + 1 NA intron (NM_016338, intron 20 of 29) HAL1|LINE|L1 -59273 NR_073584 101180901 Hs.482269 NR_073584 ENSG00000086200 IPO11-LRRC70 - IPO11-LRRC70 readthrough ncRNA 198.333-50 chr12 120650677 120650890 + 1 NA intron (NM_004276, intron 1 of 5) intron (NM_004276, intron 1 of 5) 506 NM_031205 9478 Hs.458482 NM_004276 ENSG00000157782 CABP1 CALBRAIN|HCALB_BR calcium binding protein 1 protein-coding 146.667-365 chrX 110998023 110998274 + 1 NA intron (NM_001128167, intron 1 of 14) L2a|LINE|L2 53751 NM_001324330 5063 Hs.593599 NM_002578 ENSG00000077264 PAK3 ARA|MRX30|MRX47|OPHN3|PAK-3|PAK3beta|bPAK|beta-PAK p21 (RAC1) activated kinase 3 protein-coding 190.333-26 chr10 128779466 128779736 + 1 NA Intergenic Intergenic -133232 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 146.333-205 chr3 68016393 68016632 + 1 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 12265 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 123.333-196 chr7 48117147 48117298 + 1 NA Intergenic Intergenic 27957 NM_001287429 7378 Hs.488240 NM_003364 ENSG00000183696 UPP1 UDRPASE|UP|UPASE|UPP uridine phosphorylase 1 protein-coding 195.333-40 chr10 118821871 118822308 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -67119 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 253.333-2 chr1 145900704 145900992 + 1 NA exon (NM_001303041, exon 10 of 26) exon (NM_001303041, exon 10 of 26) 9202 NM_001303040 8515 Hs.158237 NM_003637 ENSG00000143127 ITGA10 PRO827 integrin subunit alpha 10 protein-coding 161.667-225 chr6 71718557 71718823 + 1 NA Intergenic Intergenic -168013 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 242.667-47 chr19 38146357 38146885 + 1 NA intron (NM_015073, intron 12 of 21) L1MD2|LINE|L1 -16475 NR_145800 109623473 NR_145800 SNORD152 - small nucleolar RNA, C/D box 152 snoRNA 169.667-197 chr7 99386452 99386688 + 1 NA intron (NM_005720, intron 2 of 9) intron (NM_005720, intron 2 of 9) 11840 NM_005720 10095 Hs.489284 NM_005720 ENSG00000130429 ARPC1B ARC41|PLTEID|p40-ARC|p41-ARC actin related protein 2/3 complex subunit 1B protein-coding 147.667-60 chr11 96885391 96885545 + 1 NA Intergenic Intergenic 377043 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 308.667-8 chr10 59054943 59055462 + 1 NA Intergenic Intergenic 55684 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 162.667-181 chr3 146152630 146152904 + 1 NA intron (NM_182943, intron 1 of 19) intron (NM_182943, intron 1 of 19) 8417 NM_182943 5352 Hs.477866 NM_000935 ENSG00000152952 PLOD2 BRKS2|LH2|TLH procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 protein-coding 237.333-113 chr7 96077833 96078103 + 1 NA intron (NM_004411, intron 15 of 16) intron (NM_004411, intron 15 of 16) 141788 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 173.667-102 chr21 19728099 19728435 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 171488 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 171.667-128 chr5 22909789 22909983 + 1 NA Intergenic Intergenic -56542 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 268.333-56 chr8 125010453 125010779 + 1 NA intron (NM_003129, intron 6 of 10) intron (NM_003129, intron 6 of 10) 12111 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 164.333-33 chr10 110039081 110039363 + 1 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) intron (NM_001121, intron 1 of 13) -30841 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 165.333-193 chr4 115240782 115240957 + 1 NA Intergenic Intergenic -127249 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 214.333-63 chr17 61422195 61422473 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 10583 NR_160788 388407 Hs.434459 NM_203425 C17orf82 - chromosome 17 open reading frame 82 ncRNA 313.333-14 chr15 64696895 64697380 + 1 NA intron (NM_002537, intron 1 of 4) AluSc|SINE|Alu 6144 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 118.667-48 chr11 122282895 122283050 + 1 NA intron (NR_137180, intron 2 of 4) intron (NR_137180, intron 2 of 4) 26515 NR_137193 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 167.333-73 chr13 93133699 93133892 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 88454 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 285.667-22 chr2 139423466 139423854 + 1 NA Intergenic Intergenic 526336 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 254.333-22 chr14 81654529 81654924 + 1 NA Intergenic Intergenic -31665 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 167.667-7 chr1 90590705 90590933 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -66931 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 119.667-13 chr1 174152960 174153160 + 1 NA intron (NR_121197, intron 3 of 3) intron (NR_121197, intron 3 of 3) 6227 NR_121197 102724601 Hs.563791 NR_121197 ENSG00000227373 RABGAP1L-DT - RABGAP1L divergent transcript ncRNA 152.333-83 chr12 33385077 33385318 + 1 NA exon (NM_198992, exon 4 of 7) exon (NM_198992, exon 4 of 7) 54622 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 167.333-153 chr20 32640703 32640871 + 1 NA intron (NM_182584, intron 4 of 5) L1MB8|LINE|L1 33154 NM_182584 284805 Hs.353262 NM_182584 ENSG00000198547 C20orf203 - chromosome 20 open reading frame 203 protein-coding 152.667-280 chr4 96218429 96218614 + 1 NA Intergenic Intergenic -92182 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 149.333-246 chr3 83435218 83435441 + 1 NA Intergenic Intergenic 1434246 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 283.333-46 chr3 30195941 30196333 + 1 NA Intergenic Intergenic -261981 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 185.667-73 chr2 141086434 141086637 + 1 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -499850 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 240.667-26 chr15 47186113 47186395 + 1 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) intron (NM_001198999, intron 1 of 19) 2165 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 146.667-278 chr6 56883529 56883757 + 1 NA intron (NM_001144769, intron 3 of 96) L1MC5|LINE|L1 -31727 NM_001144770 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 115.667-127 chr2 203311211 203311431 + 1 NA Intergenic Intergenic -16918 NM_001282932 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 195.667-137 chr8 3633680 3633978 + 1 NA intron (NM_033225, intron 7 of 69) intron (NM_033225, intron 7 of 69) -905378 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 167.667-145 chr3 193568367 193568603 + 1 NA Intergenic Intergenic -13590 NM_032279 84239 Hs.674423 NM_032279 ENSG00000127249 ATP13A4 - ATPase 13A4 protein-coding 170.667-159 chr7 77750031 77750248 + 1 NA intron (NM_198467, intron 3 of 7) intron (NM_198467, intron 3 of 7) 48295 NM_032936 85025 Hs.19025 NM_032936 ENSG00000135211 TMEM60 C7orf35|DC32 transmembrane protein 60 protein-coding 268.667-51 chr5 19900145 19900768 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) L1MA6|LINE|L1 -14184 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 267.667-73 chr9 100384906 100385340 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32181 NM_017746 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 165.333-128 chr2 85742309 85742526 + 1 NA Intergenic Intergenic -11574 NM_032827 84913 Hs.135569 NM_032827 ENSG00000168874 ATOH8 HATH6|bHLHa21 atonal bHLH transcription factor 8 protein-coding 172.333-145 chr5 134265785 134266011 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -39825 NM_002715 5515 Hs.105818 NM_002715 ENSG00000113575 PPP2CA NEDLBA|PP2Ac|PP2CA|PP2Calpha|RP-C protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha protein-coding 165.333-251 chr8 120836164 120836333 + 1 NA Intergenic Intergenic -24202 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 348.333-2 chr1 65769778 65770292 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -22475 NM_001037341 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 255.333-50 chr19 28674432 28674737 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) MER58C|DNA|hAT-Charlie 53110 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 275.333-77 chr8 82000510 82000845 + 1 NA Intergenic Intergenic -158391 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 250.667-55 chr4 41154796 41155082 + 1 NA intron (NM_173075, intron 1 of 16) intron (NM_173075, intron 1 of 16) 59603 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 144.333-268 chr8 99389607 99389858 + 1 NA intron (NM_017890, intron 20 of 61) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 146998 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 214.333-110 chr4 161582030 161582326 + 1 NA intron (NM_001128428, intron 8 of 14) intron (NM_001128428, intron 8 of 14) -440555 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 147.667-366 chr8 106314789 106315021 + 1 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) intron (NM_018002, intron 1 of 15) 44727 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 171.333-186 chr7 101813249 101813454 + 1 NA Intergenic Intergenic -2656 NM_181500 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 261.333-84 chr5 54107333 54107649 + 1 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -155892 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 235.667-22 chr14 81444690 81445081 + 1 NA intron (NR_109999, intron 1 of 2) intron (NR_109999, intron 1 of 2) 5272 NR_109999 100506700 Hs.116304 NR_109999 ENSG00000258675 LINC02308 - long intergenic non-protein coding RNA 2308 ncRNA 146.667-157 chr2 41823226 41823405 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -54240 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 157.667-190 chr3 63299443 63299733 + 1 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) intron (NM_001130003, intron 2 of 5) 21280 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 260.333-49 chr5 42375167 42375468 + 1 NA Intergenic Intergenic -48122 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 163.333-137 chr2 11300006 11300249 + 1 NA intron (NM_001321643, intron 1 of 32) intron (NM_001321643, intron 1 of 32) 44509 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 231.667-8 chr12 13723450 13723758 + 1 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 256752 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 208.333-131 chr6 128761184 128761518 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -121787 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 260.667-42 chr2 21064317 21064813 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -20492 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 161.333-302 chr9 132890828 132891084 + 1 NA TTS (NM_001162426) TTS (NM_001162426) 12058 NM_001316900 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 244.667-68 chr3 156550163 156550446 + 1 NA intron (NM_007107, intron 2 of 4) intron (NM_007107, intron 2 of 4) 3821 NM_001308205 6747 Hs.518346 NM_007107 ENSG00000114850 SSR3 TRAPG signal sequence receptor subunit 3 protein-coding 148.667-143 chr15 92847820 92847976 + 1 NA Intergenic Intergenic -34945 NR_037600 100507217 Hs.622504 NR_037600 LINC01578 - long intergenic non-protein coding RNA 1578 ncRNA 190.667-125 chr6 157745192 157745549 + 1 NA Intergenic Intergenic -77876 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 274.667-4 chr1 99393340 99393676 + 1 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 94296 NR_125951 101928270 Hs.576048 NR_125951 ENSG00000224445 LINC01708 - long intergenic non-protein coding RNA 1708 ncRNA 137.333-103 chr2 149443250 149443489 + 1 NA intron (NM_194317, intron 2 of 4) intron (NM_194317, intron 2 of 4) 112782 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 139.333-234 chrUn_KI270337v1 747 901 + 1 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 173.667-74 chr2 60724971 60725268 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -31149 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 119.333-49 chr11 43684304 43684561 + 1 NA intron (NM_016142, intron 1 of 10) intron (NM_016142, intron 1 of 10) 3694 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 161.667-93 chr16 10237758 10238006 + 1 NA Intergenic Intergenic -54974 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 154.333-66 chr12 2706035 2706286 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -15003 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 145.667-279 chr8 65345093 65345238 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -164825 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 154.667-360 chr7 28941711 28941905 + 1 NA Intergenic Intergenic 16522 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 199.667-77 chr2 136923107 136923470 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) L1MB2|LINE|L1 157743 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 219.333-82 chr18 38209837 38210246 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 552906 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 153.333-385 chr7 55163187 55163394 + 1 NA intron (NM_201284, intron 13 of 15) intron (NM_201284, intron 13 of 15) 25659 NR_047551 100507500 Hs.720489 NR_047551 ENSG00000224057 EGFR-AS1 - EGFR antisense RNA 1 ncRNA 144.667-198 chr3 111105464 111105751 + 1 NA intron (NM_001243288, intron 1 of 8) L1M5|LINE|L1 33791 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 232.333-32 chr16 78220729 78221272 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 121346 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 147.667-298 chr5 159932816 159933066 + 1 NA intron (NM_000679, intron 1 of 1) L1ME4b|LINE|L1 16459 NM_000679 147 Hs.368632 NM_000679 ENSG00000170214 ADRA1B ADRA1|ALPHA1BAR adrenoceptor alpha 1B protein-coding 196.333-133 chr4 102559977 102560271 + 1 NA intron (NM_003998, intron 5 of 23) intron (NM_003998, intron 5 of 23) -57638 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 136.333-222 chr9 118803521 118803679 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 123929 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 255.333-14 chr11 9220338 9220634 + 1 NA intron (NR_145966, intron 1 of 21) AluSp|SINE|Alu 44840 NR_145966 23258 Hs.501857 NM_015213 ENSG00000184014 DENND5A EIEE49|RAB6IP1 DENN domain containing 5A protein-coding 151.333-398 chr7 87175424 87175623 + 1 NA intron (NR_024550, intron 7 of 17) intron (NR_024550, intron 7 of 17) 22969 NM_021145 9988 Hs.196129 NM_021145 ENSG00000135164 DMTF1 DMP1|DMTF|MRUL|hDMP1 cyclin D binding myb like transcription factor 1 protein-coding 292.333-15 chr14 47052446 47053017 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 7 of 16) intron (NM_001113498, intron 7 of 16) 290515 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 339.667-23 chr7 40610279 40610953 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 369323 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 187.667-65 chr2 19934678 19935052 + 1 NA intron (NM_001006657, intron 22 of 27) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie -32882 NM_001008237 130502 Hs.591547 NM_001008237 ENSG00000183891 TTC32 - tetratricopeptide repeat domain 32 protein-coding 162.333-70 chr14 53254537 53254863 + 1 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 101346 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 157.333-231 chr3 84350061 84350288 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 519401 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 258.333-8 chr10 77135103 77135448 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 5 of 28) L1MA8|LINE|L1 -5556 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 154.667-265 chr3 193422784 193422975 + 1 NA intron (NM_032279, intron 25 of 29) L1MA6|LINE|L1 -44126 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 167.333 chr1 8370909 8371116 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 12 of 22) intron (NM_001042681, intron 12 of 22) 52820 NM_001042682 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 159.667-280 chr6 53110860 53111166 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 37828 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 189.333-160 chr5 88959038 88959307 + 1 NA intron (NR_136220, intron 3 of 7) intron (NR_136220, intron 3 of 7) -55067 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 151.333-401 chr7 120042878 120043036 + 1 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -135582 NR_131960 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 111.667-143 chr2 194395545 194395709 + 1 NA intron (NR_110222, intron 4 of 5) MLT2B1|LTR|ERVL 51358 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 134.333-79 chr19 7717730 7717942 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 14335 NM_001244856 339390 Hs.220649 NM_198492 ENSG00000182566 CLEC4G DTTR431|LP2698|LSECtin|UNQ431 C-type lectin domain family 4 member G protein-coding 170.667-51 chr14 89241663 89241895 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 175454 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 118.333-205 chr8 103064535 103064788 + 1 NA intron (NM_001695, intron 10 of 12) intron (NM_001695, intron 10 of 12) 43578 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 150.667-351 chr7 37326664 37326886 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 2 of 21) intron (NM_001206480, intron 2 of 21) 26893 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 444.667-4 chr21 29732427 29733084 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) -15420 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 155.667-281 chr5 79085340 79085497 + 1 NA intron (NM_001178005, intron 6 of 6) AluSx1|SINE|Alu 15651 NM_017614 23743 Hs.114172 NM_017614 ENSG00000132840 BHMT2 - betaine--homocysteine S-methyltransferase 2 protein-coding 274.667-16 chr13 38139612 38140188 + 1 NA intron (NR_047500, intron 1 of 5) L1PA16|LINE|L1 3332 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 214.333-82 chr2 181958866 181959341 + 1 NA intron (NR_048567, intron 1 of 4) L1ME3A|LINE|L1 4862 NR_048567 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 175.667-98 chr3 98533718 98534069 + 1 NA 3' UTR (NM_005290, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_005290, exon 1 of 1) 1915 NM_005290 2838 Hs.162987 NM_005290 ENSG00000154165 GPR15 BOB G protein-coupled receptor 15 protein-coding 268.667-62 chr8 119166635 119167040 + 1 NA Intergenic Intergenic -41526 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 147.667-151 chr18 6772198 6772431 + 1 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -42452 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 157.667-310 chr7 92692870 92693071 + 1 NA intron (NM_001259, intron 4 of 7) intron (NM_001259, intron 4 of 7) -102580 NR_109929 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 230.333-29 chr12 63404478 63404865 + 1 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 -251861 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 213.667-62 chr4 18803710 18804046 + 1 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -782003 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 250.333-44 chr3 114327045 114327344 + 1 NA non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) -10625 NR_030293 693153 NR_030293 ENSG00000284134 MIR568 MIRN568|hsa-mir-568 microRNA 568 ncRNA 160.667-314 chr8 123983093 123983370 + 1 NA TTS (NR_040044) TTS (NR_040044) 57551 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 292.667-35 chr5 123754305 123754632 + 1 NA Intergenic Intergenic 209051 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 160.333-184 chr3 50779824 50780102 + 1 NA intron (NM_004947, intron 2 of 52) intron (NM_004947, intron 2 of 52) 104883 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 152.333-264 chr4 30495801 30496069 + 1 NA Intergenic Intergenic -224434 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 120.667-97 chr2 100485675 100485828 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 15269 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 156.333-297 chr5 150607159 150607394 + 1 NA intron (NM_001166208, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 6200 NM_001166208 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 156.333-237 chr3 87211500 87211751 + 1 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 14652 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 161.333-303 chrX 46621660 46621895 + 1 NA intron (NM_001257291, intron 14 of 16) intron (NM_001257291, intron 14 of 16) 48012 NM_019886 56548 Hs.129955 NM_019886 ENSG00000147119 CHST7 C6ST-2|GST-5 carbohydrate sulfotransferase 7 protein-coding 122.667-8 chr1 166850339 166850501 + 1 NA 3' UTR (NM_001314014, exon 3 of 4) 3' UTR (NM_001314014, exon 3 of 4) 10945 NM_017542 57645 Hs.432752 NM_017542 ENSG00000143157 POGK BASS2|KRBOX2|LST003 pogo transposable element derived with KRAB domain protein-coding 139.667-172 chr7 40848847 40849009 + 1 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 131011 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 241.333-104 chr9 37510654 37510936 + 1 NA TTS (NM_012166) TTS (NM_012166) 24847 NM_022490 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 153.333-15 chr1 113309056 113309352 + 1 NA Intergenic Intergenic -81311 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 130.667-57 chr12 54918241 54918402 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 55411 NM_001351155 9840 Hs.33187 NM_014796 ENSG00000135426 TESPA1 HSPC257|ITPRID3|KIAA0748 thymocyte expressed, positive selection associated 1 protein-coding 154.667-184 chr2 114320371 114320534 + 1 NA Intergenic Intergenic -122189 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 340.333-23 chr8 139348018 139348480 + 1 NA Intergenic Intergenic 354874 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 305.667-17 chr2 69973207 69973586 + 1 NA intron (NR_033872, intron 9 of 10) MER63C|DNA|hAT-Blackjack -11131 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 213.667-80 chr6 40388968 40389313 + 1 NA Intergenic Intergenic 10803 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 188.333-5 chr1 86009947 86010302 + 1 NA intron (NR_146340, intron 20 of 60) L1MC4a|LINE|L1 146347 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 142.667-156 chr4 67744092 67744313 + 1 NA intron (NM_001012763, intron 2 of 2) intron (NM_001012763, intron 2 of 2) 11884 NM_001012763 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 176.333-90 chr2 129639906 129640233 + 1 NA Intergenic Intergenic 237422 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 147.333-250 chr5 8140757 8141046 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 271753 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 129.333-38 chr11 110232285 110232435 + 1 NA intron (NM_001260493, intron 13 of 15) intron (NM_001260493, intron 13 of 15) 64352 NM_001260494 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 162.333-181 chr4 39424094 39424321 + 1 NA intron (NM_175737, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 12297 NR_049857 100847065 NR_049857 ENSG00000264621 MIR5591 - microRNA 5591 ncRNA 129.333-62 chr14 52908216 52908420 + 1 NA intron (NM_006832, intron 3 of 14) L1ME1|LINE|L1 42732 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 185.667-46 chr17 22240114 22240476 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 37300 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 168.333-172 chr6 27867994 27868227 + 1 NA promoter-TSS (NM_005322) promoter-TSS (NM_005322) -529 NM_005322 3009 Hs.131956 NM_005322 ENSG00000184357 HIST1H1B H1|H1.5|H1B|H1F5|H1s-3 histone cluster 1 H1 family member b protein-coding 165.667-81 chr19 49798159 49798424 + 1 NA intron (NM_130787, intron 7 of 22) intron (NM_130787, intron 7 of 22) 6425 NR_106857 102465479 NR_106857 ENSG00000276270 MIR6799 hsa-mir-6799 microRNA 6799 ncRNA 238.333-15 chr11 60202494 60202812 + 1 NA intron (NM_001351235, intron 5 of 5) intron (NM_001351235, intron 5 of 5) 6503 NR_106758 102465250 NR_106758 ENSG00000275344 MIR6503 hsa-mir-6503 microRNA 6503 ncRNA 218.333-29 chr12 24286320 24286692 + 1 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) L3|LINE|CR1 63235 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 140.667-4 chr1 61558686 61558859 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -95470 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 251.667-82 chr6 53048246 53048542 + 1 NA intron (NM_014920, intron 1 of 13) intron (NM_014920, intron 1 of 13) 13408 NM_016513 22858 Hs.417022 NM_014920 ENSG00000112144 ICK ECO|EJM10|LCK2|MRK intestinal cell kinase protein-coding 209.667-14 chr10 5757144 5757431 + 1 NA intron (NM_017782, intron 16 of 20) intron (NM_017782, intron 16 of 20) 56147 NM_001494 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 159.333-54 chr10 96971005 96971271 + 1 NA intron (NM_001346516, intron 7 of 7) intron (NM_001346516, intron 7 of 7) -131618 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-60 chr11 29511818 29512119 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -82445 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 308.667-14 chr14 73618877 73619428 + 1 NA intron (NM_001037162, intron 1 of 1) intron (NM_001037162, intron 1 of 1) 2308 NM_001037162 641372 Hs.122038 NM_001037162 ENSG00000205669 ACOT6 C14orf42|c14_5530 acyl-CoA thioesterase 6 protein-coding 205.667-138 chr9 90641893 90642131 + 1 NA intron (NM_017594, intron 1 of 1) intron (NM_017594, intron 1 of 1) 812 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 171.333-149 chr5 53176445 53176703 + 1 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 66732 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 202.333-173 chr8 80503657 80503940 + 1 NA intron (NM_001105539, intron 2 of 5) AluSz|SINE|Alu 17572 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 169.333-142 chr20 42453899 42454271 + 1 NA intron (NM_133170, intron 8 of 31) L1ME3D|LINE|L1 -231398 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 166.667-205 chr6 121481706 121481923 + 1 NA Intergenic Intergenic 46168 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 150.333-242 chr21 21406925 21407095 + 1 NA intron (NM_001352592, intron 10 of 18) intron (NM_001352592, intron 10 of 18) 259848 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 151.667-356 chr8 40709607 40709865 + 1 NA intron (NM_024645, intron 3 of 6) HAL1M8|LINE|L1 188090 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 158.333-3 chr1 29661006 29661272 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -311025 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 157.333-168 chr2 4931192 4931393 + 1 NA Intergenic Intergenic -275070 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 158.333-77 chr13 91088876 91089047 + 1 NA intron (NR_104057, intron 1 of 1) intron (NR_104057, intron 1 of 1) 656 NR_104057 101930747 Hs.112745 NR_104057 LINC00380 - long intergenic non-protein coding RNA 380 ncRNA 121.667-187 chr7 11715383 11715641 + 1 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 116686 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 255.667-21 chr12 125472203 125472621 + 1 NA intron (NM_052907, intron 3 of 8) intron (NM_052907, intron 3 of 8) 145796 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 263.667-43 chr18 10065017 10065455 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 151220 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 447.333-4 chr14 53378648 53379465 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 225702 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 242.333-6 chr1 172674617 172674940 + 1 NA Intergenic Intergenic 15675 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 123.333-167 chr4 176271024 176271223 + 1 NA Intergenic Intergenic -1901 NM_080874 140458 Hs.591712 NM_080874 ENSG00000164122 ASB5 ASB-5 ankyrin repeat and SOCS box containing 5 protein-coding 235.333-77 chr3 160745150 160745440 + 1 NA Intergenic Intergenic -10936 NM_139245 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 131.667-210 chr9 5386912 5387128 + 1 NA intron (NM_018465, intron 3 of 5) intron (NM_018465, intron 3 of 5) -47144 NM_006911 6013 Hs.368996 NM_006911 ENSG00000107018 RLN1 H1|H1RLX|RLXH1|bA12D24.3.1|bA12D24.3.2 relaxin 1 protein-coding 195.667-10 chr10 73350251 73350612 + 1 NA intron (NM_001367801, intron 3 of 27) L1ME4b|LINE|L1 8323 NM_001350934 118491 Hs.591367 NM_145170 ENSG00000156042 CFAP70 TTC18 cilia and flagella associated protein 70 protein-coding 228.667-2 chr1 28616837 28617189 + 1 NA intron (NM_005644, intron 3 of 5) AluSp|SINE|Alu 24518 NM_001193532 115273 Hs.652321 NM_152304 ENSG00000188060 RAB42 - RAB42, member RAS oncogene family protein-coding 131.667-201 chr8 116603842 116604065 + 1 NA Intergenic Intergenic -48147 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 188.333-69 chr2 35574471 35574778 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 103219 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 124.667-213 chr9 12632509 12632706 + 1 NA Intergenic Intergenic -60778 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 196.667-55 chr16 59661697 59662001 + 1 NA Intergenic Intergenic 93342 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 133.667-11 chr1 183147325 183147521 + 1 NA Intergenic Intergenic -6153 NR_149048 110841583 Hs.604063 NR_149048 ENSG00000224468 LAMC1-AS1 lnc-LAMC2-1:1 LAMC1 antisense RNA 1 ncRNA 162.667-238 chr6 49731749 49731931 + 1 NA intron (NM_001368123, intron 6 of 7) intron (NM_001368123, intron 6 of 7) 12548 NM_001368123 10321 Hs.404466 NM_006061 ENSG00000096006 CRISP3 Aeg2|CRISP-3|CRS3|SGP28|dJ442L6.3 cysteine rich secretory protein 3 protein-coding 144.667-189 chr3 41325546 41325711 + 1 NA intron (NR_136342, intron 33 of 34) (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 126123 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 147.667-270 chr5 6046915 6047095 + 1 NA Intergenic Intergenic 290287 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 171.333 chr1 11475392 11475634 + 1 NA Intergenic Intergenic -3642 NM_020780 57540 Hs.202355 NM_020780 ENSG00000204624 DISP3 PTCHD2 dispatched RND transporter family member 3 protein-coding 142.333-11 chr1 171385034 171385191 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 46216 NR_002719 7151 Hs.661092 NR_002719 TOP1P1 - DNA topoisomerase I pseudogene 1 pseudo 234.667-86 chr4 129043839 129044182 + 1 NA exon (NM_144643, exon 3 of 21) exon (NM_144643, exon 3 of 21) 49529 NM_001300897 132320 Hs.654690 NM_144643 ENSG00000151466 SCLT1 CAP-1A|CAP1A sodium channel and clathrin linker 1 protein-coding 209.667-42 chr14 35692763 35693065 + 1 NA intron (NM_014990, intron 16 of 40) MIR|SINE|MIR 70017 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 263.333-38 chr18 65846739 65847174 + 1 NA intron (NM_001362438, intron 7 of 11) intron (NM_001362438, intron 7 of 11) 95944 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 155.333-400 chr8 122627761 122628028 + 1 NA Intergenic Intergenic -59250 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 327.667-7 chr12 54914430 54915011 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 59012 NM_001351155 9840 Hs.33187 NM_014796 ENSG00000135426 TESPA1 HSPC257|ITPRID3|KIAA0748 thymocyte expressed, positive selection associated 1 protein-coding 153.667-254 chr3 88423804 88424058 + 1 NA intron (NM_001368168, intron 2 of 2) intron (NM_001368168, intron 2 of 2) 85475 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 120.333-58 chr15 59682369 59682516 + 1 NA exon (NM_001368061, exon 2 of 8) exon (NM_001368061, exon 2 of 8) 6484 NM_001320675 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 161.667-173 chr3 112192614 112192849 + 1 NA intron (NM_001320531, intron 19 of 27).2 L1M2c|LINE|L1 59308 NR_157393 112806053 NR_157393 TBILA - TGF-beta induced lncRNA ncRNA 123.667-194 chr9 27196328 27196579 + 1 NA intron (NM_001290077, intron 10 of 21) intron (NM_001290077, intron 10 of 21) 86340 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 160.667-44 chr10 89345659 89345855 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 13228 NM_001289759 3437 Hs.47338 NM_001549 ENSG00000119917 IFIT3 CIG-49|GARG-49|IFI60|IFIT4|IRG2|ISG60|P60|RIG-G|cig41 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3 protein-coding 147.333-176 chr2 164562993 164563180 + 1 NA intron (NM_004490, intron 2 of 13) intron (NM_004490, intron 2 of 13) 5409 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 139.667-173 chr7 92367620 92367803 + 1 NA intron (NM_019004, intron 10 of 19) intron (NM_019004, intron 10 of 19) 69603 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 156.333-235 chr3 63598168 63598490 + 1 NA intron (NM_001130003, intron 4 of 5) intron (NM_001130003, intron 4 of 5) -48278 NR_046677 100874016 Hs.441275 NR_046677 ENSG00000241359 SYNPR-AS1 - SYNPR antisense RNA 1 ncRNA 136.667-154 chr6 45855631 45855798 + 1 NA Intergenic Intergenic 81883 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 158.667-319 chr8 73078520 73078759 + 1 NA intron (NM_153225, intron 2 of 4) intron (NM_153225, intron 2 of 4) 14533 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 147.333-237 chr4 62695208 62695431 + 1 NA Intergenic Intergenic -533554 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 230.667-48 chr20 12847317 12847626 + 1 NA Intergenic Intergenic 89492 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 133.333-30 chr11 32540489 32540685 + 1 NA Intergenic Intergenic -43244 NM_001307929 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 311.667-7 chr15 87168331 87168706 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -180092 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 157.333-50 chr10 75146767 75146997 + 1 NA intron (NM_144660, intron 1 of 4) intron (NM_144660, intron 1 of 4) 35226 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 181.333-138 chr5 64568912 64569191 + 1 NA intron (NM_001029875, intron 2 of 5) intron (NM_001029875, intron 2 of 5) -6599 NR_073511 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 144.333-103 chr18 39579107 39579322 + 1 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) intron (NR_024391, intron 2 of 3) 42961 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 155.333-5 chr1 61321927 61322086 + 1 NA intron (NM_001134673, intron 3 of 10) intron (NM_001134673, intron 3 of 10) -68488 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 144.667-308 chr8 129614203 129614413 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -39290 NR_130920 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 178.333-150 chr6 48180770 48180982 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -112187 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 197.667-77 chr20 58118669 58118935 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -32100 NM_178456 128602 Hs.43977 NM_178456 ENSG00000124237 C20orf85 LLC1|bA196N14.1 chromosome 20 open reading frame 85 protein-coding 160.333-302 chr9 78510038 78510311 + 1 NA Intergenic Intergenic 213049 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 209.667-50 chr15 75953761 75954021 + 1 NA intron (NM_138573, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu 50013 NM_147188 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 156.667-280 chr5 120514923 120515229 + 1 NA intron (NM_016644, intron 2 of 2) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -16388 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 144.333-135 chr2 138418462 138418747 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -83166 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 171.667-135 chr5 109790434 109790612 + 1 NA intron (NM_002372, intron 12 of 21) intron (NM_002372, intron 12 of 21) -92659 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 274.333-47 chr3 34891009 34891457 + 1 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 502790 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 182.333-168 chr9 79233701 79233905 + 1 NA Intergenic Intergenic -88137 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 152.333-400 chr9 29877855 29878096 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 530479 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 242.333-40 chr2 20275596 20276033 + 1 NA intron (NM_001282790, intron 11 of 18) L1MC5a|LINE|L1 -50381 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 146.333-31 chr10 64231832 64232102 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -593561 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 333.667-14 chr4 60629543 60629949 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -292873 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 196.333-178 chrX 55884848 55885264 + 1 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -23067 NM_001324105 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 271.667-85 chrX 109251139 109251629 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 230702 NM_001522 2986 Hs.123074 NM_001522 ENSG00000101890 GUCY2F CYGF|GC-F|GUC2DL|GUC2F|RETGC-2|ROS-GC2 guanylate cyclase 2F, retinal protein-coding 186.333-29 chr11 65876477 65876861 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3168 NM_001335 1521 Hs.416848 NM_001335 ENSG00000172543 CTSW LYPN cathepsin W protein-coding 159.333-141 chr2 10102185 10102391 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -20280 NM_001165931 6241 Hs.226390 NM_001034 ENSG00000171848 RRM2 R2|RR2|RR2M ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 protein-coding 153.333-159 chr17 32181338 32181515 + 1 NA intron (NM_001033566, intron 6 of 19) L2a|LINE|L2 -29855 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 179.333-60 chr14 44996714 44996953 + 1 NA intron (NR_131765, intron 2 of 19) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 34643 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 154.667-349 chr6 151353960 151354117 + 1 NA intron (NM_001370346, intron 2 of 2) intron (NM_001370346, intron 2 of 2) 12332 NM_001370346 9590 Hs.371240 NM_005100 ENSG00000131016 AKAP12 AKAP250|SSeCKS A-kinase anchoring protein 12 protein-coding 122.333-33 chr11 48013408 48013564 + 1 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) L2b|LINE|L2 32927 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 160.667-140 chr2 48501572 48501824 + 1 NA intron (NM_001193475, intron 16 of 19) AluJo|SINE|Alu -28227 NM_001198593 286749 Hs.732016 NM_172311 ENSG00000068781 STON1-GTF2A1L ALF|GTF2A1L|GTF2A1LF|SALF STON1-GTF2A1L readthrough protein-coding 146.333-59 chr12 15077091 15077321 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -74717 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 175.667-142 chr8 64512216 64512448 + 1 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 64931 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 199.333-41 chr11 73730077 73730457 + 1 NA intron (NM_198896, intron 2 of 7) L1M4|LINE|L1 29826 NM_001243719 5870 Hs.503222 NM_002869 ENSG00000175582 RAB6A RAB6 RAB6A, member RAS oncogene family protein-coding 122.333-15 chr1 203647237 203647439 + 1 NA intron (NM_001365784, intron 1 of 20) AluJr|SINE|Alu 19401 NM_001365784 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 193.667-4 chr1 51044263 51044672 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -15370 NR_039617 100616189 NR_039617 ENSG00000265538 MIR4421 - microRNA 4421 ncRNA 182.333-119 chr5 13968094 13968300 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -23717 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 129.667-141 chr5 106238647 106238815 + 1 NA Intergenic Intergenic 772283 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 145.333-65 chr12 30724569 30724748 + 1 NA intron (NM_001002259, intron 9 of 17) intron (NM_001002259, intron 9 of 17) -28789 NM_006390 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 140.333-125 chr20 59375754 59376010 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 75271 NM_207033 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 142.333-75 chr13 97243105 97243345 + 1 NA intron (NM_144778, intron 1 of 8) intron (NM_144778, intron 1 of 8) 20892 NM_144778 10150 Hs.657347 NM_144778 ENSG00000139793 MBNL2 MBLL|MBLL39|PRO2032 muscleblind like splicing regulator 2 protein-coding 238.667-27 chr14 60257066 60257369 + 1 NA intron (NM_177951, intron 2 of 3) intron (NM_177951, intron 2 of 3) 7996 NM_177951 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 138.333-37 chr11 40614162 40614328 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -321115 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 150.333-32 chr10 21141900 21142062 + 1 NA intron (NM_001173484, intron 2 of 6) intron (NM_001173484, intron 2 of 6) -32009 NR_046283 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 194.333-55 chr18 3275086 3275406 + 1 NA intron (NM_001144944, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 12527 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 160.667-276 chr7 36295151 36295357 + 1 NA intron (NM_030636, intron 6 of 7) L1MC3|LINE|L1 71986 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 154.333-144 chr2 19991375 19991574 + 1 NA TTS (NM_002381) TTS (NM_002381) 1270 NR_110235 101928222 Hs.6985 NR_110235 LOC101928222 - uncharacterized LOC101928222 ncRNA 214.333-114 chr5 40498428 40498872 + 1 NA Intergenic Intergenic -181265 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 190.333-29 chr11 36534108 36534366 + 1 NA Intergenic Intergenic -23965 NM_145803 7189 Hs.444172 NM_004620 ENSG00000175104 TRAF6 MGC:3310|RNF85 TNF receptor associated factor 6 protein-coding 161.667-180 chr3 157350246 157350480 + 1 NA intron (NM_024621, intron 9 of 13) L1M2c|LINE|L1 -86487 NM_002852 5806 Hs.591286 NM_002852 ENSG00000163661 PTX3 TNFAIP5|TSG-14 pentraxin 3 protein-coding 115.667-42 chr11 45581006 45581186 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 84526 NM_003654 8534 Hs.104576 NM_003654 ENSG00000175264 CHST1 C6ST|GST-1|KS6ST|KSGal6ST|KSST carbohydrate sulfotransferase 1 protein-coding 128.667-8 chr1 152105462 152105633 + 1 NA TTS (NM_007113) TTS (NM_007113) 9907 NM_007113 7062 Hs.432416 NM_007113 ENSG00000159450 TCHH THH|THL|TRHY|UHS3 trichohyalin protein-coding 165.333-175 chr3 106130444 106130749 + 1 NA Intergenic Intergenic -261195 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 370.667-24 chr6 51573435 51574092 + 1 NA Intergenic Intergenic -48107 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 139.333-96 chr17 81316847 81317008 + 1 NA Intergenic Intergenic -7679 NR_038080 284185 Hs.631762 NM_178519 LINC00482 C17orf55 long intergenic non-protein coding RNA 482 ncRNA 200.333-99 chr3 144116322 144116633 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 143396 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 173.667-66 chr19 41870505 41870695 + 1 NA TTS (NR_106855) TTS (NR_106855) 973 NR_106855 102465478 NR_106855 ENSG00000276926 MIR6797 hsa-mir-6797 microRNA 6797 ncRNA 150.333-211 chr2 137179693 137179900 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 414251 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 235.667-5 chr10 68082999 68083408 + 1 NA Intergenic Intergenic -7920 NM_001278185 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 358.667-14 chr18 2364759 2365261 + 1 NA Intergenic Intergenic 206495 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 269.667-19 chr13 89067120 89067556 + 1 NA Intergenic Intergenic -167953 NR_047025 100874172 Hs.569291 NR_047025 LINC00440 - long intergenic non-protein coding RNA 440 ncRNA 222.333-12 chr10 68481504 68481860 + 1 NA TTS (NM_001324312) TTS (NM_001324312) -9561 NR_102264 1763 Hs.532446 NM_001080449 ENSG00000138346 DNA2 DNA2L|hDNA2 DNA replication helicase/nuclease 2 protein-coding 155.333-240 chr3 157847017 157847175 + 1 NA Intergenic Intergenic 259067 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 155.667-322 chr7 18447892 18448124 + 1 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu -47702 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 134.333-30 chr11 83016525 83016743 + 1 NA intron (NM_001286060, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR 17640 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 257.667-18 chr14 50101600 50102146 + 1 NA intron (NR_131171, intron 1 of 8) AluSp|SINE|Alu 3170 NR_131171 196913 Hs.406934 NM_001014830 LINC01599 C14orf183 long intergenic non-protein coding RNA 1599 ncRNA 151.667-340 chr7 86845500 86845760 + 1 NA intron (NM_000840, intron 4 of 5) HERVL40-int|LTR|ERVL 120269 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 119.333-241 chrX 47466234 47466497 + 1 NA intron (NM_001324149, intron 1 of 3) intron (NM_001324149, intron 1 of 3) 1304 NM_001324156 7592 Hs.496074 NM_007130 ENSG00000147124 ZNF41 MRX89 zinc finger protein 41 protein-coding 394.333-7 chr2 34293181 34293691 + 1 NA intron (NR_126403, intron 5 of 5) intron (NR_126403, intron 5 of 5) 226210 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 232.667-37 chr2 88590736 88591110 + 1 NA exon (NM_001313915, exon 5 of 17) exon (NM_001313915, exon 5 of 17) 34006 NM_001313915 9451 Hs.591589 NM_004836 ENSG00000172071 EIF2AK3 PEK|PERK|WRS eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 protein-coding 219.667-75 chr5 86961190 86961538 + 1 NA Intergenic Intergenic 153590 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 164.333-234 chr8 69903114 69903331 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -68244 NM_030958 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 414.333-2 chr10 115280896 115281516 + 1 NA intron (NM_207303, intron 13 of 28) intron (NM_207303, intron 13 of 28) 187841 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 177.667-35 chr12 28188546 28188785 + 1 NA non-coding (NR_148936, exon 1 of 1) non-coding (NR_148936, exon 1 of 1) -1791 NM_001352084 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 136.333-223 chr9 118927601 118927815 + 1 NA Intergenic Intergenic 248037 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 214.333-117 chr5 94224802 94225105 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -113254 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 266.667-70 chr8 82125533 82125892 + 1 NA Intergenic Intergenic -283426 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 177.333-110 chr3 135962301 135962514 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -3321 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 278.667-34 chr3 119520671 119521214 + 1 NA intron (NM_016589, intron 6 of 6) L1MA5|LINE|L1 22395 NM_016589 51300 Hs.477287 NM_016589 ENSG00000113845 TIMMDC1 C3orf1|MC1DN31 translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 protein-coding 158.333-102 chr15 77368161 77368361 + 1 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 51843 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 113.667-137 chr3 66576133 66576309 + 1 NA Intergenic Intergenic -75800 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 293.333-34 chr2 163582240 163582680 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 153548 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 143.667-226 chr7 4671878 4672075 + 1 NA Intergenic Intergenic -10319 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 239.667-79 chr8 142121817 142122137 + 1 NA Intergenic Intergenic -54362 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 173.667-101 chr21 17946607 17946811 + 1 NA intron (NM_001204177, intron 1 of 4) L1M1|LINE|L1 29369 NM_001204175 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 144.333-172 chr3 105195462 105195726 + 1 NA Intergenic Intergenic -171119 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 172.333-85 chr2 139233989 139234236 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 336788 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 161.667-99 chr16 85862095 85862365 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -36932 NM_002163 3394 Hs.137427 NM_002163 ENSG00000140968 IRF8 H-ICSBP|ICSBP|ICSBP1|IMD32A|IMD32B|IRF-8 interferon regulatory factor 8 protein-coding 200.667-40 chr14 34451815 34452238 + 1 NA intron (NM_138288, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 10214 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 294.333-38 chr6 63609843 63610187 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -25787 NM_001370350 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 237.667-51 chr22 31177265 31177622 + 1 NA intron (NR_024212, intron 1 of 5) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 17261 NM_152267 91445 Hs.517553 NM_152267 ENSG00000138942 RNF185 - ring finger protein 185 protein-coding 146.333-266 chr5 104952638 104952791 + 1 NA Intergenic Intergenic -146760 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 225.667-65 chr5 164552763 164553162 + 1 NA Intergenic Intergenic 82683 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 141.333-17 chr10 11452556 11452743 + 1 NA Intergenic Intergenic 79631 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 131.333-52 chr14 53025845 53026108 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -74879 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 249.333-48 chr2 351500 351991 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 35461 NR_146953 105373350 NR_146953 LINC01865 - long intergenic non-protein coding RNA 1865 ncRNA 161.333-77 chr13 56668295 56668466 + 1 NA Intergenic Intergenic -472538 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 234.667-61 chr2 231087971 231088368 + 1 NA intron (NM_001191037, intron 16 of 23) MIR|SINE|MIR 31302 NM_002807 5707 Hs.3887 NM_002807 ENSG00000173692 PSMD1 P112|Rpn2|S1 proteasome 26S subunit, non-ATPase 1 protein-coding 251.667-48 chr2 237696615 237697018 + 1 NA intron (NM_001137551, intron 1 of 11) (GCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 4611 NM_001137552 9208 Hs.471779 NM_004735 ENSG00000124831 LRRFIP1 FLAP-1|FLAP1|FLIIAP1|GCF-2|GCF2|HUFI-1|TRIP LRR binding FLII interacting protein 1 protein-coding 249.667-66 chr4 31848328 31848843 + 1 NA Intergenic Intergenic -148794 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 205.333-90 chr16 59697897 59698274 + 1 NA Intergenic Intergenic 57106 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 279.333-21 chr11 104546161 104546506 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 62969 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 202.333-174 chr8 82040121 82040506 + 1 NA Intergenic Intergenic -198027 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 161.333-88 chr14 50353634 50353930 + 1 NA intron (NM_001282236, intron 3 of 8) FLAM_A|SINE|Alu 41458 NM_001003803 27109 Hs.438489 NM_015684 ENSG00000125375 DMAC2L ATP5S|ATPW|FB|HSU79253 distal membrane arm assembly complex 2 like protein-coding 234.667-19 chr11 108718352 108718641 + 1 NA intron (NM_004398, intron 11 of 17) intron (NM_004398, intron 11 of 17) 53427 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 212.333-17 chr10 62077636 62077996 + 1 NA intron (NM_001244638, intron 5 of 6) intron (NM_001244638, intron 5 of 6) 28459 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 164.333-233 chr8 67016301 67016499 + 1 NA intron (NM_001364910, intron 2 of 7) intron (NM_001364910, intron 2 of 7) 12151 NM_001348563 286187 Hs.583933 NM_001013626 ENSG00000178125 PPP1R42 LRRC67|TLLR|TLRR|dtr protein phosphatase 1 regulatory subunit 42 protein-coding 152.667-299 chr5 95019337 95019508 + 1 NA intron (NM_024717, intron 1 of 22) L1MA9|LINE|L1 62444 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 112.667-31 chr10 81676889 81677078 + 1 NA Intergenic Intergenic -198211 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 132.667-33 chr11 103937215 103937399 + 1 NA intron (NM_025208, intron 5 of 6) intron (NM_025208, intron 5 of 6) 87401 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 152.333-357 chr7 72071795 72071949 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) L1M4c|LINE|L1 265519 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 192.333-104 chr20 39593839 39594056 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -369199 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 259.333-101 chr8 122776219 122776820 + 1 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -5136 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 185.667-145 chr9 34520665 34520897 + 1 NA TTS (NM_198573) TTS (NM_198573) 2209 NM_198573 375704 Hs.522085 NM_198573 ENSG00000168913 ENHO C9orf165|UNQ470 energy homeostasis associated protein-coding 298.333-13 chr14 100932165 100932487 + 1 NA intron (NR_146000, intron 9 of 50) AluSx|SINE|Alu 2407 NR_003231 767563 NR_003231 ENSG00000201700 SNORD113-3 14q(I-3) small nucleolar RNA, C/D box 113-3 snoRNA 152.667-51 chr10 110316140 110316341 + 1 NA Intergenic Intergenic -11320 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 244.333-71 chr3 90638060 90638616 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1530717 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 255.333-9 chr10 74407362 74407763 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) L1MEc|LINE|L1 121762 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 311.667-2 chr1 240838802 240839191 + 1 NA intron (NM_001350116, intron 9 of 16) AluY|SINE|Alu -226841 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 147.667-152 chr18 54273994 54274288 + 1 NA intron (NM_001351620, intron 3 of 8) intron (NM_001351620, intron 3 of 8) 4567 NM_001351618 11201 Hs.438533 NM_007195 ENSG00000101751 POLI RAD30B|RAD3OB|eta2 DNA polymerase iota protein-coding 197.333-56 chr13 21418204 21418509 + 1 NA intron (NR_104486, intron 3 of 14) intron (NR_104486, intron 3 of 14) 40947 NR_104486 253832 Hs.564611 NM_153251 ENSG00000180776 ZDHHC20 4933421L13Rik|DHHC-20|DHHC20 zinc finger DHHC-type containing 20 protein-coding 181.667-156 chrX 95575193 95575482 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -512111 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 158.333-206 chr3 103361617 103361890 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 162363 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 289.333-66 chr8 132676970 132677548 + 1 NA Intergenic Intergenic -1714 NR_135910 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 188.333-22 chr11 5004380 5004705 + 1 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL 5559 NM_001004755 119682 Hs.553559 NM_001004755 ENSG00000176798 OR51L1 OR11-31 olfactory receptor family 51 subfamily L member 1 protein-coding 128.667-50 chr13 76695971 76696122 + 1 NA Intergenic Intergenic 190359 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 157.333-176 chr2 47089244 47089484 + 1 NA intron (NM_001163561, intron 6 of 6) intron (NM_001163561, intron 6 of 6) 65944 NM_173649 285051 Hs.531575 NM_173649 ENSG00000239605 STPG4 C2orf61|GSE sperm-tail PG-rich repeat containing 4 protein-coding 121.667-103 chr2 211943098 211943336 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) intron (NM_001042599, intron 3 of 26) 483143 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 155.667-106 chr14 85746192 85746380 + 1 NA Intergenic Intergenic -188392 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 270.333-39 chr3 103380183 103380642 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 143704 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 144.667-36 chr11 8887346 8887521 + 1 NA intron (NM_005418, intron 1 of 22) intron (NM_005418, intron 1 of 22) 23518 NM_005418 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 196.667-36 chr12 23645313 23645644 + 1 NA intron (NM_152989, intron 10 of 17) intron (NM_152989, intron 10 of 17) -60892 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 167.333-71 chr13 38022543 38022848 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 120537 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 238.667-13 chr10 89277147 89277498 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -24724 NM_001547 3433 Hs.437609 NM_001547 ENSG00000119922 IFIT2 G10P2|GARG-39|IFI-54|IFI-54K|IFI54|IFIT-2|ISG-54 K|ISG-54K|ISG54|P54|cig42 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 2 protein-coding 168.333-73 chr17 67912316 67912528 + 1 NA exon (NM_004459, exon 13 of 30) exon (NM_004459, exon 13 of 30) 81184 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 156.667-177 chr2 47303140 47303391 + 1 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) MER34A|LTR|ERV1 -32050 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 286.667-37 chr6 134647363 134648039 + 1 NA Intergenic Intergenic -107696 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 153.667-109 chr13 75087616 75087785 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 152681 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 156.667-103 chr14 51411097 51411364 + 1 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -14095 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 152.667-33 chr10 31249712 31250063 + 1 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) L1MB3|LINE|L1 62004 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 262.333-39 chr19 27969163 27969725 + 1 NA intron (NR_146734, intron 5 of 7) intron (NR_146734, intron 5 of 7) -175504 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 151.667-286 chr5 108882681 108882841 + 1 NA intron (NR_146155, intron 7 of 19) intron (NR_146155, intron 7 of 19) -41845 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 182.333-132 chr5 104412454 104412763 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -686866 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 147.333-335 chr9 128193049 128193222 + 1 NA intron (NM_012127, intron 1 of 16) CpG -1031 NM_001257975 25792 Hs.212395 NM_012127 ENSG00000148337 CIZ1 LSFR1|NP94|ZNF356 CDKN1A interacting zinc finger protein 1 protein-coding 167.333-131 chr2 106923290 106923520 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -36296 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 124.667-57 chr14 52649679 52649868 + 1 NA intron (NM_014584, intron 13 of 15) intron (NM_014584, intron 13 of 15) 45785 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 166.667-190 chr5 145842247 145842430 + 1 NA Intergenic Intergenic -6996 NM_205846 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 183.667-67 chr19 39740478 39740684 + 1 NA Intergenic Intergenic -2552 NM_001828 1178 Hs.889 NM_001828 ENSG00000105205 CLC GAL10|Gal-10|LGALS10|LGALS10A|LPPL_HUMAN Charcot-Leyden crystal galectin protein-coding 195.667-108 chr5 44937307 44937675 + 1 NA Intergenic Intergenic 128544 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 167.333-140 chr2 124164103 124164393 + 1 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) L2a|LINE|L2 138961 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 148.333-327 chr5 121968337 121968559 + 1 NA intron (NM_152546, intron 1 of 7) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 6473 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 204.333-135 chr3 193623515 193623825 + 1 NA intron (NR_046634, intron 1 of 2) intron (NR_046634, intron 1 of 2) 3662 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 118.667-114 chr2 208988341 208988585 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -435584 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 145.667-16 chr1 151092829 151093060 + 1 NA intron (NM_001323906, intron 3 of 9) intron (NM_001323906, intron 3 of 9) 22183 NM_001323911 126626 Hs.15671 NM_144618 ENSG00000143458 GABPB2 GABPB-2 GA binding protein transcription factor subunit beta 2 protein-coding 197.667-3 chr1 88754253 88754547 + 1 NA intron (NM_006256, intron 2 of 21) L2c|LINE|L2 -69196 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 275.667-50 chr6 74571530 74571950 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) L1MD|LINE|L1 502289 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 151.667-247 chr4 40538115 40538275 + 1 NA intron (NM_001098634, intron 2 of 6) intron (NM_001098634, intron 2 of 6) -22210 NM_019027 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 285.333-56 chr5 14461454 14461856 + 1 NA intron (NM_007118, intron 35 of 56) intron (NM_007118, intron 35 of 56) -2328 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 154.667-75 chr12 41099656 41099856 + 1 NA Intergenic Intergenic -88564 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 117.667-26 chr11 45057668 45057900 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -36229 NM_001359633 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 146.333-267 chr5 109699079 109699231 + 1 NA intron (NM_002372, intron 1 of 21) HAL1ME|LINE|L1 9789 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 158.333-205 chr3 96727144 96727368 + 1 NA Intergenic Intergenic -87338 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 173.667-181 chr8 120524228 120524456 + 1 NA TTS (NM_022045) TTS (NM_022045) 78923 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 172.333-117 chr3 158220726 158220980 + 1 NA intron (NM_001271838, intron 4 of 9) intron (NM_001271838, intron 4 of 9) 110764 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 151.333-100 chr12 24608879 24609171 + 1 NA Intergenic Intergenic -24857 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 209.667-18 chr10 28383638 28384076 + 1 NA Intergenic Intergenic -80793 NR_134518 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 162.667-23 chr10 26302486 26302770 + 1 NA 3' UTR (NM_001134366, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001134366, exon 16 of 16) 85854 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 160.667-330 chrX 65260461 65260746 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -225862 NM_001178032 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 130.667 chr1 17206264 17206537 + 1 NA intron (NM_013358, intron 1 of 15).2 intron (NM_013358, intron 1 of 15).2 1272 NM_013358 29943 Hs.412941 NM_013358 ENSG00000142623 PADI1 HPAD10|PAD1|PDI|PDI1 peptidyl arginine deiminase 1 protein-coding 148.667-136 chr15 66591015 66591177 + 1 NA intron (NR_110372, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 8906 NR_110372 102723165 Hs.636703 NR_110372 ENSG00000259471 LINC01169 - long intergenic non-protein coding RNA 1169 ncRNA 126.667-164 chr7 18463280 18463449 + 1 NA intron (NM_001204144, intron 3 of 12) L1ME3A|LINE|L1 -32346 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 276.333-57 chr6 88605615 88605961 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -66419 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 203.667-112 chr7 28041150 28041493 + 1 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -139136 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 157.667-288 chr7 3493483 3493773 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 192376 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 157.333-329 chr8 20900447 20900738 + 1 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -53041 NR_130773 102467222 Hs.444226 NR_130773 ENSG00000253147 LOC102467222 - uncharacterized LOC102467222 ncRNA 216.333-92 chr21 30778275 30778627 + 1 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -23023 NM_181619 337977 Hs.567837 NM_181619 ENSG00000187005 KRTAP21-1 KAP21.1 keratin associated protein 21-1 protein-coding 252.333-50 chr4 72203981 72204362 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 165039 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 128.333-71 chr16 47217495 47217777 + 1 NA intron (NM_030790, intron 14 of 17) intron (NM_030790, intron 14 of 17) 73568 NR_110903 101927102 Hs.634652 NR_110903 ITFG1-AS1 - ITFG1 antisense RNA 1 ncRNA 154.667-409 chr9 38636952 38637199 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 15987 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 162.333-18 chr1 230675337 230675593 + 1 NA intron (NM_007357, intron 9 of 17) intron (NM_007357, intron 9 of 17) 32984 NM_007357 22796 Hs.211800 NM_007357 ENSG00000135775 COG2 CDG2Q|LDLC component of oligomeric golgi complex 2 protein-coding 290.333-17 chr17 58072474 58072845 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 10545 NR_110809 101927666 Hs.552237 NR_110809 ENSG00000266290 LOC101927666 - uncharacterized LOC101927666 ncRNA 213.333-78 chr17 60982312 60982591 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) AluJo|SINE|Alu 304600 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 123.333-162 chr4 80227724 80227928 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 30323 NM_001099403 56978 Hs.373642 NM_020226 ENSG00000152784 PRDM8 EPM10|KMT8D|PFM5 PR/SET domain 8 protein-coding 232.667-73 chr8 28698203 28698516 + 1 NA TTS (NR_126027) TTS (NR_126027) 3105 NR_126027 101929402 Hs.667366 NR_126027 ENSG00000246339 EXTL3-AS1 C8orf50 EXTL3 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-295 chr9 30017031 30017251 + 1 NA Intergenic Intergenic 391313 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 226.333-42 chr17 32729645 32730007 + 1 NA intron (NM_015194, intron 14 of 21) intron (NM_015194, intron 14 of 21) 147298 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 281.667-16 chr12 116162792 116163311 + 1 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) intron (NM_015335, intron 2 of 30) -14397 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 249.333-10 chr1 177331772 177332077 + 1 NA Intergenic Intergenic -19662 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 131.667-4 chr1 43181240 43181394 + 1 NA intron (NM_001195831, intron 2 of 23) AluSx1|SINE|Alu -8747 NM_001159936 10969 Hs.346868 NM_006824 ENSG00000117395 EBNA1BP2 EBP2|NOBP|P40 EBNA1 binding protein 2 protein-coding 232.333-70 chr5 95596757 95597180 + 1 NA intron (NM_198150, intron 6 of 7) intron (NM_198150, intron 6 of 7) -23119 NM_199243 285601 Hs.143315 NM_199243 ENSG00000178015 GPR150 PGR11 G protein-coupled receptor 150 protein-coding 166.667-155 chr3 183888541 183888844 + 1 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL 1892 NR_039650 100616127 NR_039650 ENSG00000263932 MIR4448 - microRNA 4448 ncRNA 244.667-60 chr2 227381586 227381927 + 1 NA Intergenic Intergenic -2450 NM_024795 79853 Hs.156652 NM_024795 ENSG00000168955 TM4SF20 PRO994|SLI5|TCCE518 transmembrane 4 L six family member 20 protein-coding 196.667-129 chr6 12133089 12133505 + 1 NA intron (NM_002114, intron 6 of 8) intron (NM_002114, intron 6 of 8) 120985 NM_002114 3096 Hs.567284 NM_002114 ENSG00000095951 HIVEP1 CIRIP|CRYBP1|GAAP|MBP-1|PRDII-BF1|Schnurri-1|ZAS1|ZNF40|ZNF40A human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 protein-coding 361.333-5 chr12 27941972 27942628 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 27676 NM_198964 5744 Hs.591159 NM_002820 ENSG00000087494 PTHLH BDE2|HHM|PLP|PTHR|PTHRP parathyroid hormone like hormone protein-coding 138.667-118 chr20 35054850 35054988 + 1 NA intron (NM_199368, intron 5 of 18) L3|LINE|CR1 37888 NM_015638 26133 Hs.168073 NM_015638 ENSG00000100991 TRPC4AP C20orf188|PPP1R158|TRRP4AP|TRUSS transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein protein-coding 327.667-6 chr11 116042850 116043239 + 1 NA Intergenic Intergenic -282844 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 142.667-216 chr8 28455557 28455705 + 1 NA intron (NM_001258211, intron 4 of 7) intron (NM_001258211, intron 4 of 7) 34598 NM_172366 157574 Hs.741522 NM_172366 ENSG00000214050 FBXO16 FBX16 F-box protein 16 protein-coding 160.667-213 chr3 185114557 185114772 + 1 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) intron (NM_001025266, intron 1 of 1) 38396 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 128.667-13 chr1 191057999 191058224 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 170387 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 128.333-17 chr1 228326504 228326661 + 1 NA intron (NM_052843, intron 56 of 80) L1MD2|LINE|L1 70527 NR_106800 102465444 NR_106800 ENSG00000284311 MIR6742 hsa-mir-6742 microRNA 6742 ncRNA 169.333-152 chr22 45146337 45146533 + 1 NA intron (NR_038956, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 6149 NR_038957 100506714 Hs.189902 NR_038956 NUP50-DT NUP50-AS1 NUP50 divergent transcript ncRNA 255.667-33 chr17 12628090 12628464 + 1 NA intron (NR_034145, intron 3 of 3) intron (NR_034145, intron 3 of 3) -37613 NM_001146312 93649 Hs.462257 NM_153604 ENSG00000141052 MYOCD MYCD myocardin protein-coding 162.667-163 chr22 24149609 24149780 + 1 NA intron (NM_012295, intron 29 of 36) intron (NM_012295, intron 29 of 36) -31793 NM_019601 56241 Hs.131819 NM_019601 ENSG00000099994 SUSD2 BK65A6.2|W5C5 sushi domain containing 2 protein-coding 151.667-180 chr2 195333542 195333744 + 1 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -323315 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 153.667-74 chr11 82013612 82013909 + 1 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -122924 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 149.333-367 chr7 40219815 40219980 + 1 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) LTR83|LTR|ERVL 84921 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 234.333-4 chr1 112629855 112630270 + 1 NA intron (NM_006135, intron 1 of 9) AluSx3|SINE|Alu 10230 NM_006135 829 Hs.744974 NM_006135 ENSG00000116489 CAPZA1 CAPPA1|CAPZ|CAZ1 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 1 protein-coding 287.667-7 chr10 75149258 75149724 + 1 NA intron (NM_144660, intron 1 of 4) intron (NM_144660, intron 1 of 4) 37835 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 187.333-176 chr6 72357302 72357733 + 1 NA intron (NM_001350433, intron 21 of 25) MIR3|SINE|MIR -9229 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 151.667-176 chr2 175002289 175002484 + 1 NA intron (NR_038133, intron 1 of 11) intron (NR_038133, intron 1 of 11) 2867 NM_001822 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 457.667-3 chr4 40645535 40646188 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -15267 NM_001371114 161.667-103 chr17 60547460 60547650 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -16991 NR_126009 388406 Hs.368309 NR_126009 ENSG00000267772 LINC01999 - long intergenic non-protein coding RNA 1999 ncRNA 291.333-4 chr1 180864060 180864678 + 1 NA intron (NR_137330, intron 10 of 12) L2c|LINE|L2 -48528 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 116.333-196 chr7 39501601 39501763 + 1 NA Intergenic Intergenic -64722 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 190.667-96 chr5 12770161 12770376 + 1 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) intron (NR_033383, intron 3 of 3) 102409 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 133.333-118 chr3 179343815 179343964 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3820 NM_033540 55669 Hs.478383 NM_017927 ENSG00000171109 MFN1 hfzo1|hfzo2 mitofusin 1 protein-coding 129.667-54 chr14 50927005 50927168 + 1 NA intron (NM_002863, intron 4 of 19) intron (NM_002863, intron 4 of 19) 17397 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 159.333-331 chr8 107675319 107675562 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -177522 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 131.667-213 chr9 69891164 69891437 + 1 NA intron (NM_001010940, intron 5 of 5) MamRep38|DNA|hAT 70483 NM_001308084 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 143.667-146 chr21 26128179 26128448 + 1 NA intron (NM_001136131, intron 1 of 15) intron (NM_001136131, intron 1 of 15) 12077 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 208.333-98 chr3 114949198 114949562 + 1 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) L1ME3A|LINE|L1 -48755 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 113.333-2 chr1 49057343 49057572 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) intron (NM_001323575, intron 4 of 12) -199954 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 122.333-161 chr4 111700124 111700268 + 1 NA Intergenic Intergenic -445258 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 236.667-5 chr1 112739362 112739598 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 18913 NM_001004440 284467 Hs.439116 NM_182759 ENSG00000184599 TAFA3 FAM19A3|TAFA-3 TAFA chemokine like family member 3 protein-coding 136.333-55 chr14 65332524 65332769 + 1 NA Intergenic LTR26D|LTR|ERV1 2537 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 214.667-11 chr10 18139457 18139872 + 1 NA promoter-TSS (NM_201572) promoter-TSS (NM_201572) -760 NM_001167945 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 147.333-170 chr2 72994420 72994617 + 1 NA intron (NR_138476, intron 9 of 14) ERVL-E-int|LTR|ERVL 64654 NM_001330407 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 147.333-129 chr16 14350768 14350916 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 19424 NR_131191 105447648 Hs.554151 NR_131191 ENSG00000260009 LINC02130 - long intergenic non-protein coding RNA 2130 ncRNA 112.333-40 chr11 88544991 88545134 + 1 NA intron (NM_001143831, intron 7 of 8) L2|LINE|L2 40486 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 173.333-162 chr5 96344882 96345106 + 1 NA intron (NR_130776, intron 3 of 4) intron (NR_130776, intron 3 of 4) 87165 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 147.667-372 chr8 127730112 127730342 + 1 NA TTS (NR_117101) TTS (NR_117101) 3740 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 276.333-34 chr22 41610762 41611315 + 1 NA intron (NM_015704, intron 1 of 5) intron (NM_015704, intron 1 of 5) 10005 NM_015704 27351 Hs.570455 NM_015704 ENSG00000100418 DESI1 D15Wsu75e|DESI2|DJ347H13.4|DeSI-1|FAM152B|POST|PPPDE2 desumoylating isopeptidase 1 protein-coding 151.333-314 chr4 97662167 97662411 + 1 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) L1PA13|LINE|L1 295363 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 185.333-153 chr5 35281012 35281349 + 1 NA Intergenic Intergenic -50693 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 155.667-193 chr20 6791384 6791578 + 1 NA Intergenic Intergenic 23795 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 216.333-99 chr3 105594850 105595186 + 1 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 228109 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 159.667-276 chr5 172614819 172615035 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -26336 NM_001142651 54492 Hs.91521 NM_001142651 ENSG00000214357 NEURL1B NEURL3|RNF67B|hNeur2|neur2 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B protein-coding 219.667-55 chr3 66720072 66720335 + 1 NA Intergenic Intergenic 18133 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 150.667-228 chr22 31546882 31547041 + 1 NA exon (NM_001258327, exon 3 of 31) exon (NM_001258327, exon 3 of 31) 50425 NM_014775 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 290.333-31 chr3 182457785 182458265 + 1 NA intron (NR_040105, intron 2 of 3) L1MA5|LINE|L1 28337 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 232.333-10 chr10 103354112 103354578 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -3205 NM_001011663 84108 Hs.335808 NM_032154 ENSG00000156374 PCGF6 MBLR|RNF134 polycomb group ring finger 6 protein-coding 161.333-32 chr10 61662289 61662524 + 1 NA promoter-TSS (NM_001366909) promoter-TSS (NM_001366909) -523 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 243.333-96 chr6 64104162 64104467 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 297478 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 193.333-26 chr10 98249608 98249877 + 1 NA intron (NM_032211, intron 14 of 14) intron (NM_032211, intron 14 of 14) 18452 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 147.667-376 chr8 131456498 131456678 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -415679 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 152.333-301 chr5 59312208 59312445 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MER50-int|LTR|ERV1 -36211 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 238.667-67 chr5 51886864 51887209 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -120995 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 206.667-83 chr22 44654592 44654898 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13802 NM_001017528 55615 Hs.102336 NM_015366 ENSG00000186654 PRR5 FLJ20185k|PP610|PROTOR-1|PROTOR1 proline rich 5 protein-coding 207.667-8 chr1 225230477 225230752 + 1 NA intron (NM_001367479, intron 41 of 85) intron (NM_001367479, intron 41 of 85) 197424 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 274.333-19 chr14 80551802 80552200 + 1 NA intron (NM_152446, intron 21 of 24) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -320944 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 126.333-88 chr2 64612704 64612940 + 1 NA non-coding (NR_034023, exon 2 of 4) non-coding (NR_034023, exon 2 of 4) 5510 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 262.667-64 chr5 169239164 169239599 + 1 NA intron (NM_003062, intron 3 of 35) L1MC3|LINE|L1 24313 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 143.667-255 chr8 122764387 122764577 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -17173 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 118.333-45 chr11 102580478 102580610 + 1 NA intron (NM_004771, intron 8 of 9) intron (NM_004771, intron 8 of 9) 44788 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 249.333-83 chr5 57317495 57317802 + 1 NA Intergenic Intergenic 103574 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 228.333-24 chr13 48831940 48832355 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -143765 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 134.667-92 chr19 43891623 43891768 + 1 NA TTS (NR_038334) TTS (NR_038334) 10108 NR_038334 100505715 Hs.76561 NR_038334 ENSG00000267058 LOC100505715 - uncharacterized LOC100505715 ncRNA 259.667-10 chr10 94808995 94809527 + 1 NA intron (NM_000769, intron 5 of 8) L1MA2|LINE|L1 46580 NM_000769 1557 Hs.282409 NM_000769 ENSG00000165841 CYP2C19 CPCJ|CYP2C|CYPIIC17|CYPIIC19|P450C2C|P450IIC19 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19 protein-coding 222.333-47 chr2 114812164 114812420 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) 21256 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 263.667-65 chr5 45481684 45482177 + 1 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 214450 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 148.333-20 chr1 113458462 113458647 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) AluJo|SINE|Alu 68039 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 187.667-21 chr11 62458266 62458512 + 1 NA intron (NM_024060, intron 5 of 5) intron (NM_024060, intron 5 of 5) 39356 NM_003357 7356 Hs.523732 NM_003357 ENSG00000149021 SCGB1A1 CC10|CC16|CCPBP|CCSP|UGB|UP-1|UP1 secretoglobin family 1A member 1 protein-coding 281.667-39 chr5 55873922 55874355 + 1 NA intron (NM_001297572, intron 4 of 10) L1MB7|LINE|L1 20816 NM_001242639 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 177.667 chr1 32601766 32602031 + 1 NA non-coding (NR_111980, exon 4 of 4) non-coding (NR_111980, exon 4 of 4) 48652 NM_001366278 339487 Hs.655921 NM_178547 ENSG00000176261 ZBTB8OS ARCH|ARCH2 zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand protein-coding 111.667-128 chr2 40324108 40324317 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 106092 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 249.667-82 chr6 51059366 51059770 + 1 NA Intergenic Intergenic 240697 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 134.667-118 chr20 40293113 40293287 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 288739 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 129.667-49 chr13 86692960 86693089 + 1 NA Intergenic Intergenic -218896 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 148.667-107 chr13 112536207 112536484 + 1 NA intron (NM_006322, intron 11 of 21) L1MB7|LINE|L1 51808 NM_001286278 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 158.667-178 chr2 214937715 214937890 + 1 NA intron (NR_103740, intron 52 of 54) intron (NR_103740, intron 52 of 54) 90855 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 171.333-24 chr10 100275703 100275903 + 1 NA intron (NM_173809, intron 4 of 4) intron (NM_173809, intron 4 of 4) -8165 NM_001303406 55280 Hs.215502 NM_018294 ENSG00000095485 CWF19L1 C19L1|SCAR17|hDrn1 CWF19 like cell cycle control factor 1 protein-coding 404.333-9 chr5 98211119 98211619 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -50130 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 212.333-92 chr22 45697157 45697610 + 1 NA intron (NM_013236, intron 3 of 11) AluSq|SINE|Alu 25549 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 326.333-37 chr8 129788261 129788677 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -1845 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 146.667-90 chr13 75564599 75564832 + 1 NA intron (NM_006002, intron 3 of 8) AluSx|SINE|Alu 14965 NM_006002 7347 Hs.162241 NM_006002 ENSG00000118939 UCHL3 UCH-L3 ubiquitin C-terminal hydrolase L3 protein-coding 145.667-170 chr22 28279072 28279253 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L1ME2z|LINE|L1 -180707 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 143.333-179 chr3 63376554 63376773 + 1 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 -66649 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 145.667-36 chr10 72442484 72442693 + 1 NA intron (NM_001195519, intron 3 of 6) intron (NM_001195519, intron 3 of 6) 81398 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 116.333-35 chr10 72984193 72984345 + 1 NA Intergenic Intergenic -29463 NM_001318124 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 192.667-45 chr12 12935242 12935569 + 1 NA intron (NR_149067, intron 1 of 2) intron (NR_149067, intron 1 of 2) 7679 NR_149064 100506314 Hs.127718 NR_038920 ENSG00000247498 GPRC5D-AS1 - GPRC5D and HEBP1 antisense RNA 1 ncRNA 296.667-61 chr9 31502464 31503063 + 1 NA Intergenic Intergenic -121273 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 215.667-128 chr9 75915132 75915465 + 1 NA intron (NR_120409, intron 1 of 19) intron (NR_120409, intron 1 of 19) 24625 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 119.667-104 chr22 26398405 26398561 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -30777 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 113.667-99 chr2 46226654 46226857 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -70652 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 202.667-132 chr7 26609238 26609525 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -28490 NR_161202 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 149.333-278 chr4 56471167 56471330 + 1 NA intron (NR_151856, intron 2 of 19) intron (NR_151856, intron 2 of 19) 3631 NM_001267722 6731 Hs.237825 NM_006947 ENSG00000174780 SRP72 BMFF|BMFS1|HEL103 signal recognition particle 72 protein-coding 143.667-147 chr21 29176421 29176621 + 1 NA TTS (NM_001286624) TTS (NM_001286624) -16973 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 203.667-53 chr2 73139083 73139486 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -26336 NM_015470 26056 Hs.24557 NM_015470 ENSG00000135631 RAB11FIP5 GAF1|RIP11|pp75 RAB11 family interacting protein 5 protein-coding 278.333-23 chr17 59404817 59405431 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 39041 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 188.333-114 chr4 142614495 142614874 + 1 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) L1P4|LINE|L1 231851 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 265.667-69 chr7 112511438 112511812 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 30634 NM_182597 286006 Hs.396189 NM_182597 ENSG00000181016 LSMEM1 C7orf53 leucine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 191.333-202 chr8 90006556 90007013 + 1 NA intron (NM_001330575, intron 3 of 11) intron (NM_001330575, intron 3 of 11) 5307 NM_001359 1666 Hs.492212 NM_001359 ENSG00000104325 DECR1 DECR|NADPH|SDR18C1 2,4-dienoyl-CoA reductase 1 protein-coding 185.667-15 chr10 107664315 107664577 + 1 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 404847 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 227.667-20 chr14 54708527 54708960 + 1 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 -46090 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 186.667-14 chr10 65969777 65970117 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 16 of 17) L1PA16|LINE|L1 398522 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 137.667-181 chr7 101048872 101049035 + 1 NA non-coding (NR_133665, exon 5 of 12) non-coding (NR_133665, exon 5 of 12) 28872 NR_133665 140453 Hs.271819 NM_001004430 ENSG00000169876 MUC17 MUC-17|MUC-3|MUC3 mucin 17, cell surface associated protein-coding 335.333-33 chr3 36721461 36722070 + 1 NA intron (NM_033403, intron 2 of 4) intron (NM_033403, intron 2 of 4) 18096 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 143.333-103 chr15 78471391 78471582 + 1 NA intron (NM_001354994, intron 6 of 21) intron (NM_001354994, intron 6 of 21) 33065 NM_001320942 3658 Hs.436031 NM_004136 ENSG00000136381 IREB2 ACO3|IRE-BP 2|IRE-BP2|IRP2|IRP2AD|NDCAMA iron responsive element binding protein 2 protein-coding 242.333-30 chr14 47369020 47369369 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) L1ME4a|LINE|L1 -25948 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 167.667-135 chr3 60702661 60702911 + 1 NA intron (NR_148921, intron 4 of 4) L1M5|LINE|L1 -84916 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 151.333-399 chr7 103842057 103842400 + 1 NA intron (NM_005045, intron 2 of 64) intron (NM_005045, intron 2 of 64) 147288 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 255.333-27 chr12 120784001 120784436 + 1 NA intron (NM_139015, intron 4 of 10) intron (NM_139015, intron 4 of 10) 58392 NM_000017 35 Hs.507076 NM_000017 ENSG00000122971 ACADS ACAD3|SCAD acyl-CoA dehydrogenase short chain protein-coding 214.333-74 chr2 52496715 52497073 + 1 NA Intergenic Intergenic 126246 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 269.667-54 chr8 46048032 46048422 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 569416 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 137.333-158 chr5 104605615 104605769 + 1 NA Intergenic Intergenic -493782 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 125.333-20 chr10 27784329 27784560 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -38625 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 146.667-181 chr2 180550659 180550899 + 1 NA Intergenic Intergenic -141325 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 217.333-166 chr9 99600401 99600748 + 1 NA intron (NR_109802, intron 3 of 6) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 219315 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 233.667-79 chr9 75446744 75447213 + 1 NA Intergenic Intergenic 358464 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 144.667-196 chr3 95197558 95197841 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 259436 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 124.667-205 chr8 87321330 87321559 + 1 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) L1MB1|LINE|L1 455029 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 169.667-85 chr16 60603777 60604033 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -244112 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 246.333-55 chr20 51738461 51738873 + 1 NA intron (NM_006045, intron 1 of 27) AluSx|SINE|Alu 29723 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 189.667-146 chr8 138146384 138146804 + 1 NA intron (NM_015912, intron 14 of 19) intron (NM_015912, intron 14 of 19) -63049 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 160.667-150 chr2 98675202 98675498 + 1 NA intron (NM_012214, intron 3 of 15) intron (NM_012214, intron 3 of 15) -11877 NM_001160154 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 131.333-77 chr2 17953454 17953665 + 1 NA Intergenic Intergenic 74892 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 238.667-89 chr8 102355731 102356146 + 1 NA intron (NM_001282873, intron 5 of 58) intron (NM_001282873, intron 5 of 58) 56751 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 148.667-395 chr9 29122729 29123000 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 89435 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 129.667-38 chr12 40092304 40092467 + 1 NA intron (NM_052885, intron 1 of 9) intron (NM_052885, intron 1 of 9) 13696 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 218.667-64 chr22 39550279 39550623 + 1 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -17703 NM_194326 91582 Hs.526933 NM_194326 ENSG00000187051 RPS19BP1 AROS|S19BP ribosomal protein S19 binding protein 1 protein-coding 235.333-65 chr22 39289681 39289998 + 1 NA Intergenic Intergenic 24072 NR_000028 116938 NR_000028 ENSG00000209480 SNORD83B RNU83B|U83B small nucleolar RNA, C/D box 83B snoRNA 158.667-23 chr1 183535738 183535905 + 1 NA intron (NM_001331007, intron 11 of 23) intron (NM_001331007, intron 11 of 23) 54783 NM_000433 4688 Hs.587558 NM_000433 ENSG00000116701 NCF2 NCF-2|NOXA2|P67-PHOX|P67PHOX neutrophil cytosolic factor 2 protein-coding 222.667-46 chr20 8218572 8218883 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) MER20B|DNA|hAT-Charlie -29977 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 153.667-15 chr1 82390362 82390660 + 1 NA Intergenic Intergenic -512672 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 214.333-116 chr5 54433183 54433526 + 1 NA Intergenic Intergenic -22345 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 244.333-60 chr2 131137345 131137644 + 1 NA intron (NM_001267064, intron 6 of 7) L1MD2|LINE|L1 32647 NM_001267066 55041 Hs.469944 NM_017958 ENSG00000115762 PLEKHB2 EVT2 pleckstrin homology domain containing B2 protein-coding 203.333-226 chr5 173015910 173016221 + 1 NA intron (NM_003945, intron 2 of 3) MER21B|LTR|ERVL -4661 NR_002988 677841 Hs.692720 NR_002988 ENSG00000212402 SNORA74B U19-2 small nucleolar RNA, H/ACA box 74B snoRNA 134.667-72 chr15 67038682 67038860 + 1 NA intron (NR_135686, intron 2 of 5) intron (NR_135686, intron 2 of 5) 25411 NR_135686 102723493 Hs.419760 NR_135686 LOC102723493 - uncharacterized LOC102723493 ncRNA 247.333-7 chr10 37853222 37853727 + 1 NA 5' UTR (NM_001352488, exon 3 of 6) 5' UTR (NM_001352488, exon 3 of 6) 4136 NR_148003 57209 Hs.528423 NM_021045 ENSG00000198105 ZNF248 bA162G10.3 zinc finger protein 248 protein-coding 188.333-158 chr8 126159188 126159400 + 1 NA Intergenic MLT2E|LTR|ERVL -166201 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 294.333-39 chr6 123613633 123613958 + 1 NA intron (NM_001256020, intron 1 of 8) intron (NM_001256020, intron 1 of 8) 23155 NM_001251987 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 133.667-60 chr17 80955100 80955292 + 1 NA intron (NM_020761, intron 28 of 33) intron (NM_020761, intron 28 of 33) 16017 NR_148968 400627 Hs.591201 NR_148968 ENSG00000261924 LOC400627 - uncharacterized LOC400627 ncRNA 173.667-134 chr4 63389899 63390109 + 1 NA Intergenic Intergenic 1019446 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 270.333-59 chr7 104958612 104959103 + 1 NA Intergenic Intergenic -32212 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 180.333-72 chr3 26223821 26224022 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -350226 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 142.333-142 chr20 44992012 44992251 + 1 NA intron (NM_001352385, intron 5 of 11) intron (NM_001352385, intron 5 of 11) 25619 NM_006282 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 214.667-121 chr8 123685489 123685760 + 1 NA intron (NM_001003954, intron 10 of 11) intron (NM_001003954, intron 10 of 11) -31823 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 212.333-51 chr15 66846086 66846376 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 110284 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 281.333-12 chr12 6636449 6636827 + 1 NA promoter-TSS (NM_020400) promoter-TSS (NM_020400) -679 NM_020400 57121 Hs.155538 NM_020400 ENSG00000184574 LPAR5 GPR92|GPR93|KPG_010|LPA5 lysophosphatidic acid receptor 5 protein-coding 157.667-3 chr1 51638080 51638333 + 1 NA intron (NM_148906, intron 1 of 22) intron (NM_148906, intron 1 of 22) 21114 NR_036662 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 191.333-65 chr14 70373594 70373819 + 1 NA intron (NM_001202547, intron 3 of 5) intron (NM_001202547, intron 3 of 5) -14023 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 162.333-180 chr4 37054386 37054655 + 1 NA Intergenic Intergenic 52741 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 215.667-8 chr1 213858982 213859305 + 1 NA intron (NR_037850, intron 4 of 5) intron (NR_037850, intron 4 of 5) -65606 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 265.333-77 chr7 52727857 52728255 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -307577 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 170.333-222 chr8 117839196 117839390 + 1 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 81620 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 152.667-102 chr14 46664994 46665242 + 1 NA Intergenic Intergenic -13337 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 140.333-116 chr2 218525361 218525614 + 1 NA intron (NM_020935, intron 10 of 25) AluJb|SINE|Alu 42864 NM_020935 57695 Hs.166068 NM_020935 ENSG00000135913 USP37 - ubiquitin specific peptidase 37 protein-coding 152.667-317 chr6 17044718 17044871 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -57464 NM_001190766 401236 Hs.677399 NM_001190766 ENSG00000230873 STMND1 - stathmin domain containing 1 protein-coding 189.667-76 chr2 121520744 121521109 + 1 NA intron (NM_015282, intron 6 of 38) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -9954 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 232.333 chr1 23098446 23098819 + 1 NA intron (NM_001142546, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 54327 NR_036057 100422866 NR_036057 ENSG00000263793 MIR3115 mir-3115 microRNA 3115 ncRNA 206.333-40 chr12 111220874 111221280 + 1 NA intron (NM_015267, intron 3 of 21) intron (NM_015267, intron 3 of 21) -83065 NR_106818 102465455 NR_106818 ENSG00000273700 MIR6760 hsa-mir-6760 microRNA 6760 ncRNA 153.667-218 chr20 10897541 10897820 + 1 NA intron (NR_109866, intron 1 of 6) intron (NR_109866, intron 1 of 6) 11592 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 238.333-2 chr1 91419112 91419536 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -14487 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 159.333-300 chr7 3715368 3715596 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -414203 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 166.667-50 chr12 66318681 66318997 + 1 NA intron (NM_001370285, intron 7 of 12) intron (NM_001370285, intron 7 of 12) 16294 NR_135081 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 142.333-7 chr1 68874323 68874472 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -181501 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 154.667-318 chr5 114448935 114449223 + 1 NA intron (NR_130785, intron 11 of 12) intron (NR_130785, intron 11 of 12) 15568 NR_103458 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 191.333-168 chr5 143966392 143966723 + 1 NA Intergenic Intergenic 154396 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 138.667-80 chr16 56132980 56133252 + 1 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) L1M5|LINE|L1 57978 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 192.333-63 chr16 55536620 55536940 + 1 NA intron (NM_017839, intron 7 of 13) intron (NM_017839, intron 7 of 13) 27708 NM_017839 54947 Hs.460857 NM_017839 ENSG00000087253 LPCAT2 AGPAT11|AYTL1|LysoPAFAT lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 protein-coding 155.333-228 chr3 52163599 52163774 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -9263 NM_015426 25886 Hs.476306 NM_015426 ENSG00000164087 POC1A PIX2|SOFT|WDR51A POC1 centriolar protein A protein-coding 201.667-26 chr12 90501543 90501922 + 1 NA Intergenic Intergenic 208414 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 163.333-252 chr7 5221560 5221735 + 1 NA intron (NM_016003, intron 6 of 11) intron (NM_016003, intron 6 of 11) 7378 NM_001033520 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 159.667-209 chr3 14536733 14536909 + 1 NA intron (NM_001080423, intron 1 of 23) intron (NM_001080423, intron 1 of 23) 3521 NM_001080423 80852 Hs.517819 NM_001080423 ENSG00000144596 GRIP2 - glutamate receptor interacting protein 2 protein-coding 141.333-38 chr11 88538413 88538562 + 1 NA intron (NM_001143831, intron 7 of 8) intron (NM_001143831, intron 7 of 8) 33911 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-348 chr7 7630481 7630765 + 1 NA Intergenic Intergenic -10129 NM_001302349 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 217.333-32 chr11 61446339 61446674 + 1 NA 3' UTR (NM_017841, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_017841, exon 4 of 4) 16381 NM_017841 54949 Hs.313247 NM_017841 ENSG00000167985 SDHAF2 C11orf79|PGL2|SDH5 succinate dehydrogenase complex assembly factor 2 protein-coding 171.667-70 chr18 54583247 54583572 + 1 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -4350 NM_001307955 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 117.333-214 chr8 134712489 134712621 + 1 NA intron (NM_001289394, intron 1 of 16) CpG 476 NR_110323 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 172.667-149 chr7 51282282 51282622 + 1 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) L1PA16|LINE|L1 34357 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 128.667-57 chr14 63025987 63026223 + 1 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) L1MA8|LINE|L1 19353 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 167.333-159 chr21 20211047 20211268 + 1 NA Intergenic Intergenic 47528 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 197.333-33 chr11 45606536 45606898 + 1 NA Intergenic Intergenic 58905 NM_003654 8534 Hs.104576 NM_003654 ENSG00000175264 CHST1 C6ST|GST-1|KS6ST|KSGal6ST|KSST carbohydrate sulfotransferase 1 protein-coding 149.667-362 chr6 158661368 158661664 + 1 NA intron (NM_001242394, intron 3 of 17) intron (NM_001242394, intron 3 of 17) -1887 NM_001318745 94120 Hs.436977 NM_001009991 ENSG00000164674 SYTL3 SLP3 synaptotagmin like 3 protein-coding 240.667-88 chr9 95270783 95271194 + 1 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) intron (NM_001243744, intron 1 of 13) 46266 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 155.333-139 chr17 61960787 61961076 + 1 NA exon (NM_005121, exon 23 of 30) exon (NM_005121, exon 23 of 30) -32949 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 222.667-104 chrX 114272467 114272794 + 1 NA Intergenic Intergenic -311448 NM_001256761 3358 Hs.149037 NM_000868 ENSG00000147246 HTR2C 5-HT1C|5-HT2C|5-HTR2C|5HTR2C|HTR1C 5-hydroxytryptamine receptor 2C protein-coding 183.667-33 chr11 102135431 102135772 + 1 NA intron (NM_001130145, intron 2 of 8) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 23153 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 238.667-39 chr2 25843466 25843815 + 1 NA intron (NM_018263, intron 2 of 11) intron (NM_018263, intron 2 of 11) -12739 NM_001369346 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 173.667-19 chr10 67803327 67803500 + 1 NA intron (NM_021800, intron 4 of 4) L1ME4a|LINE|L1 34766 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 257.333-98 chr8 80419425 80419867 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -65947 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 117.333-106 chr2 162006509 162006695 + 1 NA intron (NM_001935, intron 22 of 25) intron (NM_001935, intron 22 of 25) 67613 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 170.667-102 chr21 24521804 24522011 + 1 NA intron (NR_135519, intron 1 of 2) intron (NR_135519, intron 1 of 2) 93167 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 229.667-58 chr3 54059824 54060166 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -62557 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 141.667-149 chr3 133065480 133065737 + 1 NA intron (NM_001136469, intron 2 of 5) intron (NM_001136469, intron 2 of 5) 27320 NM_023943 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 250.667-85 chr9 5803206 5803762 + 1 NA intron (NM_024896, intron 10 of 14) intron (NM_024896, intron 10 of 14) 29633 NM_024896 79956 Hs.591078 NM_024896 ENSG00000099219 ERMP1 FXNA|KIAA1815|bA207C16.3 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 protein-coding 160.333-246 chr6 56607784 56607997 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 36 of 94) intron (NM_001144770, intron 36 of 94) 34999 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 167.667-154 chr4 64534274 64534548 + 1 NA Intergenic Intergenic -124951 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 166.333-7 chr1 52812826 52813119 + 1 NA intron (NM_024646, intron 10 of 13) L1MEc|LINE|L1 -29788 NM_001004339 440590 Hs.658458 NM_001004339 ENSG00000203995 ZYG11A ZYG11 zyg-11 family member A, cell cycle regulator protein-coding 173.667-130 chr4 36799255 36799567 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -157511 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 157.333-186 chr2 79148372 79148634 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -10076 NR_002714 5969 Hs.584797 NR_002714 REG1CP REG1P|REGL|RS regenerating family member 1 gamma, pseudogene pseudo 146.667-240 chr4 128904433 128904616 + 1 NA intron (NM_144643, intron 18 of 20) intron (NM_144643, intron 18 of 20) 92680 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 151.333-92 chr11 131696695 131696928 + 1 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -33255 NR_126159 101929637 Hs.730330 NM_207432 ENSG00000224795 NTM-AS1 C11orf39 NTM antisense RNA 1 ncRNA 296.667-63 chrX 72594686 72595053 + 1 NA intron (NM_001122670, intron 27 of 30) L1MB8|LINE|L1 -21766 NM_001166420 55869 Hs.310536 NM_018486 ENSG00000147099 HDAC8 CDA07|CDLS5|HD8|HDACL1|KDAC8|MRXS6|RPD3|WTS histone deacetylase 8 protein-coding 150.667-97 chr13 27339121 27339316 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 68041 NM_001331126 387496 Hs.192131 NM_206827 ENSG00000122035 RASL11A - RAS like family 11 member A protein-coding 132.333-155 chr6 122725572 122725789 + 1 NA 3' UTR (NM_001270395, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001270395, exon 5 of 5) -23521 NM_001319042 2173 Hs.26770 NM_001446 ENSG00000164434 FABP7 B-FABP|BLBP|FABPB|MRG fatty acid binding protein 7 protein-coding 134.333-125 chr4 40826990 40827242 + 1 NA intron (NM_001330656, intron 13 of 16) intron (NM_001330656, intron 13 of 16) 30039 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 152.333-10 chr1 65183728 65183907 + 1 NA intron (NM_001330616, intron 1 of 4) intron (NM_001330616, intron 1 of 4) 34823 NM_001330616 205 Hs.10862 NM_013410 ENSG00000162433 AK4 AK 4|AK3|AK3L1|AK3L2 adenylate kinase 4 protein-coding 152.333-390 chr8 129583661 129583870 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -8747 NR_130920 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 212.667-144 chr9 28052107 28052436 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -478405 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 154.667-378 chr8 60788326 60788498 + 1 NA intron (NM_017780, intron 3 of 37) AluJr|SINE|Alu 47153 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 230.667-80 chr7 23720183 23720501 + 1 NA intron (NM_031414, intron 4 of 23) intron (NM_031414, intron 4 of 23) 10123 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 151.667-225 chr3 94823538 94823794 + 1 NA Intergenic Intergenic -114597 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 127.333 chr1 49324797 49324961 + 1 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 67468 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 162.333-231 chr7 23017815 23018129 + 1 NA Intergenic Intergenic -3842 NM_001363467 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 192.667-162 chr7 54194078 54194345 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -136486 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 193.667-79 chr21 31664340 31664654 + 1 NA intron (NM_000454, intron 2 of 4) intron (NM_000454, intron 2 of 4) 4875 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 140.667-244 chr9 19598719 19598942 + 1 NA intron (NM_020344, intron 3 of 9) intron (NM_020344, intron 3 of 9) 188189 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 214.667-93 chr4 113295853 113296202 + 1 NA intron (NM_001354275, intron 23 of 43) intron (NM_001354275, intron 23 of 43) 3188 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 238.333-64 chr3 189827808 189828102 + 1 NA intron (NM_003722, intron 4 of 13) L2c|LINE|L2 -1967 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 145.333-14 chr1 118348566 118348854 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -163482 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 123.667-87 chr2 54600792 54601032 + 1 NA intron (NM_178313, intron 2 of 30) intron (NM_178313, intron 2 of 30) 42518 NM_178313 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 243.333-113 chr8 53054190 53054655 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 114514 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 173.333-203 chr8 107445323 107445586 + 1 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 52464 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 140.333-132 chr22 27656737 27656942 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 144917 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 203.333-128 chr2 47592001 47592405 + 1 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 -21872 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 179.667-44 chr14 35301157 35301359 + 1 NA intron (NM_001282232, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 8876 NM_002791 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 213.667-24 chr11 107895494 107895790 + 1 NA Intergenic Intergenic -32806 NM_017516 54734 Hs.354906 NM_017516 ENSG00000179331 RAB39A RAB39 RAB39A, member RAS oncogene family protein-coding 370.333-3 chr1 246611675 246612311 + 1 NA intron (NM_152609, intron 2 of 10) L1MB4|LINE|L1 45537 NM_152609 163882 Hs.368353 NM_152609 ENSG00000162852 CNST C1orf71|PPP1R64 consortin, connexin sorting protein protein-coding 326.667-17 chr16 64074100 64074602 + 1 NA Intergenic Intergenic 1047712 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 250.333-14 chr12 12577692 12578102 + 1 NA Intergenic Intergenic -15034 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 321.333-39 chr2 146610513 146611037 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 23718 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 209.333-107 chr2 39315232 39315463 + 1 NA exon (NM_001270425, exon 13 of 33) exon (NM_001270425, exon 13 of 33) -71364 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 122.667-151 chr5 33244004 33244199 + 1 NA intron (NR_147008, intron 1 of 3) LTR33A_|LTR|ERVL 14366 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 171.667-131 chr5 45738562 45738795 + 1 NA Intergenic Intergenic -42298 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 326.333-5 chr12 56591680 56592193 + 1 NA 3' UTR (NM_002898, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_002898, exon 14 of 14) 38390 NM_001300905 11176 Hs.314263 NM_013449 ENSG00000076108 BAZ2A TIP5|WALp3 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A protein-coding 119.333-88 chr14 65033243 65033426 + 1 NA intron (NM_002028, intron 7 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 -11354 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 153.333-363 chr6 68431491 68431738 + 1 NA Intergenic Intergenic -101715 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 288.667-22 chr4 79038934 79039269 + 1 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) intron (NR_038342, intron 2 of 5) 67353 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 147.667-165 chr2 36225925 36226072 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 129572 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 157.667-311 chr7 104103270 104103451 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 104653 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 122.333-190 chr7 12304642 12304855 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 93454 NM_001134232 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 184.667-26 chr13 49224018 49224292 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 3817 NM_001507 2862 Hs.248126 NM_001507 ENSG00000102539 MLNR GPR38|MTLR1 motilin receptor protein-coding 135.333-184 chr8 50081006 50081165 + 1 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) L1ME1|LINE|L1 -83046 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 162.333-282 chrX 99212316 99212523 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 1197854 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 151.667-319 chr6 123077721 123077903 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 81577 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 188.667-140 chr7 90257321 90257530 + 1 NA intron (NM_001039706, intron 2 of 22) L1MA4A|LINE|L1 12251 NM_001039706 79846 Hs.521014 NM_024788 ENSG00000105792 CFAP69 C7orf63|FAP69|SPGF24 cilia and flagella associated protein 69 protein-coding 155.667-35 chr10 30492134 30492381 + 1 NA Intergenic Intergenic 57611 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 146.333-314 chr8 14643879 14644045 + 1 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 209548 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 256.333-63 chr5 19827926 19828401 + 1 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) L1PA15|LINE|L1 58109 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 324.667-20 chr2 199283297 199283852 + 1 NA intron (NM_001172509, intron 10 of 10) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 174365 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 261.667-35 chr2 52200989 52201327 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1MA4A|LINE|L1 -169490 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 186.333-163 chr8 86178723 86179037 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 51501 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 137.667-188 chr8 120469225 120469367 + 1 NA intron (NM_022045, intron 10 of 21) AluSx|SINE|Alu 23877 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 163.333-292 chr8 139592308 139592549 + 1 NA Intergenic Intergenic 110695 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 158.333-129 chr18 80251018 80251188 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3589 NM_032510 84552 Hs.654920 NM_032510 ENSG00000178184 PARD6G PAR-6G|PAR6gamma par-6 family cell polarity regulator gamma protein-coding 141.667-141 chr3 21139136 21139366 + 1 NA Intergenic Intergenic -266475 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 165.667-86 chr2 27650584 27650855 + 1 NA TTS (NM_001282729) TTS (NM_001282729) -12752 NM_018158 22950 Hs.306000 NM_018158 ENSG00000163798 SLC4A1AP HLC3 solute carrier family 4 member 1 adaptor protein protein-coding 160.667-307 chr8 101549828 101550105 + 1 NA intron (NM_024915, intron 2 of 15) intron (NM_024915, intron 2 of 15) 57527 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 313.667-29 chr21 16560871 16561585 + 1 NA intron (NR_136547, intron 2 of 2) intron (NR_136547, intron 2 of 2) 21400 NR_029480 406885 NR_029480 ENSG00000199030 MIRLET7C LET7C|MIRNLET7C|hsa-let-7c|let-7c microRNA let-7c ncRNA 164.333-11 chr1 207892247 207892452 + 1 NA intron (NM_001025109, intron 4 of 7) AluSx1|SINE|Alu 18776 NM_001025109 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 314.333-4 chr10 53265147 53265717 + 1 NA Intergenic Intergenic -493732 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 131.333-78 chr2 28778718 28778984 + 1 NA exon (NM_002709, exon 3 of 8) exon (NM_002709, exon 3 of 8) 27021 NM_002709 5500 Hs.702907 NM_002709 ENSG00000213639 PPP1CB HEL-S-80p|NSLH2|PP-1B|PP1B|PP1beta|PPP1CD protein phosphatase 1 catalytic subunit beta protein-coding 135.333-169 chr7 21497387 21497599 + 1 NA intron (NM_003112, intron 5 of 5) L1M4|LINE|L1 26435 NR_031594 100302122 NR_031594 ENSG00000221783 MIR1183 MIRN1183|hsa-mir-1183 microRNA 1183 ncRNA 162.667-265 chr8 62630336 62630510 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 3 of 6) intron (NM_001304533, intron 3 of 6) -347438 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 134.333-111 chr3 15696357 15696513 + 1 NA TTS (NR_036085) TTS (NR_036085) 936 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 233.667-73 chr8 78957453 78957783 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 120089 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 202.667-63 chr16 59011245 59011563 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -277088 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 116.333-7 chr1 45155847 45155986 + 1 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) L1PB1|LINE|L1 50689 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 150.333-109 chr14 51099536 51099702 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -3915 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 125.333-81 chr19 9497185 9497414 + 1 NA intron (NM_152476, intron 2 of 9) intron (NM_152476, intron 2 of 9) 1317 NM_152476 147741 Hs.631613 NM_152476 ENSG00000198028 ZNF560 - zinc finger protein 560 protein-coding 226.667-7 chr1 111224630 111224969 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2860 NM_001025197 1117 Hs.514840 NM_004000 ENSG00000064886 CHI3L2 CHIL2|YKL-39|YKL39 chitinase 3 like 2 protein-coding 130.333-94 chr18 36525955 36526269 + 1 NA intron (NM_001281740, intron 5 of 28) intron (NM_001281740, intron 5 of 28) 137306 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 131.667-85 chr2 15015421 15015659 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 382823 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 156.333-337 chr7 43201328 43201564 + 1 NA intron (NM_015052, intron 2 of 29) intron (NM_015052, intron 2 of 29) 50551 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 153.667-118 chr14 62269842 62270140 + 1 NA Intergenic (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -130018 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 202.667-76 chr19 28752096 28752549 + 1 NA Intergenic Intergenic -24628 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 185.667-132 chr8 121304817 121305197 + 1 NA Intergenic Intergenic -334339 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 140.333-200 chr6 48536095 48536325 + 1 NA Intergenic Intergenic -467521 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 204.667-43 chr14 65518078 65518374 + 1 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 47124 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 159.333-92 chr14 64510191 64510455 + 1 NA intron (NM_001123329, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR -5110 NM_001304507 7597 Hs.654571 NM_006977 ENSG00000089775 ZBTB25 C14orf51|KUP|ZNF46 zinc finger and BTB domain containing 25 protein-coding 156.333-100 chr14 31203246 31203419 + 1 NA intron (NM_015382, intron 2 of 42) intron (NM_015382, intron 2 of 42) 4461 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 158.667-87 chr13 66242133 66242306 + 1 NA Intergenic Intergenic 23969 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 128.333-92 chr2 31162502 31162683 + 1 NA Intergenic Intergenic -24152 NM_024572 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 223.667-53 chr3 156973749 156974115 + 1 NA intron (NM_001004316, intron 6 of 12) L1ME5|LINE|L1 -107909 NR_135546 105374177 Hs.634263 NR_135546 ENSG00000241544 LINC02029 - long intergenic non-protein coding RNA 2029 ncRNA 133.667-143 chr7 91235780 91236011 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -28538 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 149.667-80 chr11 106099134 106099406 + 1 NA TTS (NM_015423) TTS (NM_015423) -21532 NM_152433 143879 Hs.101949 NM_152433 ENSG00000182359 KBTBD3 BKLHD3 kelch repeat and BTB domain containing 3 protein-coding 252.667-79 chr5 36915311 36915654 + 1 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) intron (NM_015384, intron 1 of 45) 38713 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 218.333-12 chr10 32355116 32355424 + 1 NA intron (NR_104163, intron 1 of 1) intron (NR_104163, intron 1 of 1) 7906 NR_104163 102031319 Hs.128132 NR_104163 ENSG00000229327 LOC102031319 - uncharacterized LOC102031319 ncRNA 226.667-42 chr17 82295504 82295799 + 1 NA Intergenic LTR22A|LTR|ERVK -2837 NR_135639 101929511 Hs.147682 NR_135639 ENSG00000265692 LINC01970 - long intergenic non-protein coding RNA 1970 ncRNA 144.667-235 chr5 38143464 38143683 + 1 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) -4907 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 183.333 chr1 2025055 2025249 + 1 NA intron (NM_000815, intron 2 of 8) intron (NM_000815, intron 2 of 8) 5807 NM_000815 2563 Hs.113882 NM_000815 ENSG00000187730 GABRD EIG10|EJM7|GEFSP5 gamma-aminobutyric acid type A receptor delta subunit protein-coding 146.333-60 chr12 15486372 15486597 + 1 NA intron (NM_030667, intron 2 of 26) L1MCc|LINE|L1 -60127 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 131.667-140 chr3 132178571 132178739 + 1 NA Intergenic Intergenic -138752 NM_001099 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 149.667-220 chr2 162930075 162930287 + 1 NA Intergenic Intergenic -91414 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 188.667-95 chr22 25126743 25127064 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) -14211 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 189.333-18 chr1 118091232 118091457 + 1 NA intron (NM_206996, intron 10 of 48) intron (NM_206996, intron 10 of 48) 93884 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 142.667-188 chr6 49837602 49837761 + 1 NA intron (NM_170609, intron 6 of 6) intron (NM_170609, intron 6 of 6) -12915 NR_110843 101927048 Hs.742154 NR_110843 LOC101927048 - uncharacterized LOC101927048 ncRNA 166.333-23 chr10 21670586 21670768 + 1 NA non-coding (NR_136736, exon 11 of 26) non-coding (NR_136736, exon 11 of 26) 136505 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 185.667-56 chr18 53879391 53879627 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -298450 NR_110800 101928167 Hs.382012 NR_110800 ENSG00000260433 LINC01917 - long intergenic non-protein coding RNA 1917 ncRNA 142.333-213 chr6 42518721 42518923 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -45200 NM_015255 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 149.667-408 chr8 117640079 117640345 + 1 NA Intergenic Intergenic 119499 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 246.667-86 chr7 55500758 55501121 + 1 NA intron (NM_001321242, intron 2 of 4) intron (NM_001321242, intron 2 of 4) 25941 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 210.667-66 chr2 56930557 56930833 + 1 NA Intergenic Intergenic -744925 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 145.667-287 chr8 99473284 99473456 + 1 NA intron (NM_017890, intron 24 of 61) L1ME1|LINE|L1 63360 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 138.667-73 chr15 77255787 77256020 + 1 NA intron (NM_024776, intron 3 of 7) intron (NM_024776, intron 3 of 7) -30499 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 143.333-38 chr10 72518883 72519032 + 1 NA intron (NM_006077, intron 5 of 11) AluSz|SINE|Alu 5029 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 206.333-68 chr17 61945508 61945849 + 1 NA 3' UTR (NM_005121, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_005121, exon 30 of 30) -17696 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 184.333-13 chr10 56922299 56922500 + 1 NA Intergenic Intergenic 382160 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 212.667-65 chr2 16271823 16272096 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 221532 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 170.333-163 chr4 153599654 153599866 + 1 NA intron (NM_001131007, intron 21 of 34) MER3|DNA|hAT-Charlie -40408 NR_134873 100419170 Hs.382102 NR_134873 ENSG00000250771 LOC100419170 - toll like receptor 2 pseudogene pseudo 176.667-116 chr5 9422092 9422321 + 1 NA intron (NM_003966, intron 2 of 22) intron (NM_003966, intron 2 of 22) -89127 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 335.333-17 chr16 53240990 53241457 + 1 NA intron (NM_001352157, intron 11 of 37) L2a|LINE|L2 32772 NM_001352158 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 247.667-22 chr12 25143570 25144050 + 1 NA intron (NR_147910, intron 7 of 11) intron (NR_147910, intron 7 of 11) 51350 NM_001204101 55259 Hs.407771 NM_018272 ENSG00000118307 CASC1 LAS1|PPP1R54 cancer susceptibility 1 protein-coding 152.667-252 chr3 124470805 124471046 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 25 of 59) MER103C|DNA|hAT-Charlie 96593 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 150.333-201 chr2 107587705 107588001 + 1 NA Intergenic Intergenic 58434 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 242.667-79 chr4 130225502 130225797 + 1 NA Intergenic Intergenic -150712 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 141.333-257 chr9 71177456 71177623 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -55918 NM_001366148 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 157.667-77 chr12 46456722 46456950 + 1 NA intron (NR_125378, intron 3 of 3) intron (NR_125378, intron 3 of 3) 72729 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 166.667-186 chr5 110334769 110335081 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 178990 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 238.333-89 chr8 83368557 83368910 + 1 NA Intergenic Intergenic -35025 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 133.667-6 chr1 111770988 111771183 + 1 NA Intergenic Intergenic 15184 NM_007204 11218 Hs.591405 NM_007204 ENSG00000064703 DDX20 DP103|GEMIN3 DEAD-box helicase 20 protein-coding 119.667-184 chr8 111135488 111135700 + 1 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 100609 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 232.667-40 chr2 114009664 114010060 + 1 NA intron (NR_148509, intron 1 of 1) intron (NR_148509, intron 1 of 1) -29878 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 124.333-22 chr11 9941471 9941738 + 1 NA intron (NM_030962, intron 16 of 39) L1ME3E|LINE|L1 102462 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 155.667-370 chr8 124350822 124350982 + 1 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) intron (NM_194291, intron 1 of 6) 21797 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 195.667-21 chr11 106241587 106241849 + 1 NA Intergenic Intergenic -8301 NR_120552 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 131.667-103 chr2 176025338 176025557 + 1 NA Intergenic Intergenic -22627 NR_130941 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 253.333-14 chr12 1191935 1192287 + 1 NA intron (NM_001301248, intron 11 of 18) intron (NM_001301248, intron 11 of 18) 164363 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 160.667-58 chr11 77866276 77866437 + 1 NA intron (NM_001316962, intron 3 of 4) intron (NM_001316962, intron 3 of 4) 25218 NM_001363564 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 298.333-38 chr5 156549164 156549607 + 1 NA intron (NM_001128209, intron 3 of 7) intron (NM_001128209, intron 3 of 7) 222221 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 311.333-25 chr18 3190627 3191094 + 1 NA intron (NM_019856, intron 3 of 36) intron (NM_019856, intron 3 of 36) 29108 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 153.333-106 chr13 47477193 47477464 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 455294 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 180.333-133 chr8 63723786 63724028 + 1 NA Intergenic Intergenic -45523 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 158.667-80 chr12 106804860 106805115 + 1 NA intron (NM_001351364, intron 3 of 11) intron (NM_001351364, intron 3 of 11) -30156 NR_040246 100287944 Hs.742087 NR_040246 ENSG00000257545 LOC100287944 - uncharacterized LOC100287944 ncRNA 150.667-291 chr5 26997297 26997498 + 1 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) intron (NM_016279, intron 1 of 11) 41189 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 160.333-147 chr2 108567295 108567475 + 1 NA intron (NM_001193483, intron 1 of 9) MER6|DNA|TcMar-Tigger -20921 NM_004987 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 163.667-80 chr16 74762893 74763203 + 1 NA intron (NM_024306, intron 1 of 6) intron (NM_024306, intron 1 of 6) 11772 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 227.333-52 chr18 8534836 8535203 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -74426 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 201.333-193 chr3 115083535 115083761 + 1 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) -12234 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 138.667-34 chr11 84941738 84941888 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L1MA3|LINE|L1 -18392 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 163.333-285 chr8 100675579 100675825 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -26037 NM_152628 169166 Hs.567758 NM_152628 ENSG00000174226 SNX31 - sorting nexin 31 protein-coding 118.667-185 chr7 140917859 140918007 + 1 NA intron (NR_148928, intron 1 of 17) MER58B|DNA|hAT-Charlie 6996 NM_004333 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 191.667-60 chr17 70136316 70136610 + 1 NA TTS (NM_001291622) TTS (NM_001291622) 31618 NM_001291623 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 129.333-108 chr21 15209125 15209294 + 1 NA Intergenic Intergenic -144209 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 305.333-23 chr14 65546920 65547308 + 1 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) L1MD3|LINE|L1 76012 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 201.333-92 chr14 33204158 33204519 + 1 NA intron (NM_001164749, intron 2 of 11) intron (NM_001164749, intron 2 of 11) 265459 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 194.333-13 chr1 162564482 162564889 + 1 NA intron (NM_001324113, intron 2 of 10) intron (NM_001324113, intron 2 of 10) 2786 NM_001324114 6675 Hs.492859 NM_003115 ENSG00000117143 UAP1 AGX|AGX1|AGX2|SPAG2 UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 protein-coding 140.333-97 chr2 20965915 20966167 + 1 NA Intergenic Intergenic 78032 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 168.667-170 chr5 34034684 34034876 + 1 NA intron (NR_037951, intron 2 of 8) intron (NR_037951, intron 2 of 8) 8433 NM_030945 114899 Hs.171929 NM_030945 ENSG00000082196 C1QTNF3 C1ATNF3|CORCS|CORS|CORS-26|CORS26|CTRP3 C1q and TNF related 3 protein-coding 207.667-103 chr6 42368583 42368913 + 1 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) intron (NM_001297573, intron 2 of 17) 83303 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 276.667-27 chr14 73688225 73688605 + 1 NA intron (NM_001201366, intron 7 of 8) AluSz6|SINE|Alu 25969 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 148.667-360 chr7 99179164 99179365 + 1 NA intron (NM_001145715, intron 8 of 9) intron (NM_001145715, intron 8 of 9) 28225 NM_001145715 402569 Hs.253050 NM_001145715 ENSG00000185467 KPNA7 IPOA8 karyopherin subunit alpha 7 protein-coding 200.667-135 chr6 54262729 54263024 + 1 NA intron (NM_138569, intron 12 of 12) MER67C|LTR|ERV1 -45565 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 136.667-185 chr9 4822608 4822835 + 1 NA intron (NM_001286699, intron 1 of 6) AluJr4|SINE|Alu -17048 NM_001286701 10171 Hs.194121 NM_005772 ENSG00000120158 RCL1 RNAC|RPCL1 RNA terminal phosphate cyclase like 1 protein-coding 179.333-137 chr4 73402531 73402773 + 1 NA Intergenic Intergenic -1635 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 208.333-107 chr4 73790174 73790611 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -46286 NM_002993 6372 Hs.164021 NM_002993 ENSG00000124875 CXCL6 CKA-3|GCP-2|GCP2|SCYB6 C-X-C motif chemokine ligand 6 protein-coding 182.667-142 chr5 177572426 177572756 + 1 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -18028 NM_001190946 54540 Hs.484289 NM_019057 ENSG00000146067 FAM193B IRIZIO family with sequence similarity 193 member B protein-coding 130.667-117 chr2 158595513 158595680 + 1 NA intron (NM_001005476, intron 3 of 20) intron (NM_001005476, intron 3 of 20) 138644 NM_001304969 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 201.667-48 chr18 7614048 7614393 + 1 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 46904 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 117.333-128 chr22 41723635 41723850 + 1 NA intron (NM_152513, intron 6 of 30) L2b|LINE|L2 24239 NM_152513 150365 Hs.116419 NM_152513 ENSG00000167077 MEI1 HYDM3|SPATA38 meiotic double-stranded break formation protein 1 protein-coding 340.333-11 chr2 119918500 119918965 + 1 NA intron (NM_002830, intron 11 of 26) L1ME3|LINE|L1 -94345 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 148.667-368 chr8 50009490 50009684 + 1 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) 98180 NR_135796 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 258.667-16 chr10 97698344 97698787 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11324 NM_021732 60370 Hs.23918 NM_021732 ENSG00000119986 AVPI1 PP5395|VIP32|VIT32 arginine vasopressin induced 1 protein-coding 139.667-138 chr4 76106040 76106288 + 1 NA intron (NM_001130016, intron 10 of 11) intron (NM_001130016, intron 10 of 11) 31469 NM_001179 419 Hs.24976 NM_001179 ENSG00000156219 ART3 ARTC3 ADP-ribosyltransferase 3 protein-coding 148.667-199 chr2 126441558 126441853 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -214230 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 130.333-145 chr4 36497565 36497711 + 1 NA intron (NR_149124, intron 4 of 4) intron (NR_149124, intron 4 of 4) -71210 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 146.333-224 chr3 185789700 185789935 + 1 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) AluSx1|SINE|Alu -21913 NR_049838 100847078 NR_049838 ENSG00000265470 MIR548AQ - microRNA 548aq ncRNA 230.333-26 chr12 21586191 21586680 + 1 NA intron (NM_021957, intron 1 of 15) (TATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18412 NM_021957 2998 Hs.82614 NM_021957 ENSG00000111713 GYS2 - glycogen synthase 2 protein-coding 214.667-120 chr8 107488332 107488782 + 1 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 9361 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 264.333-8 chr10 92971181 92971512 + 1 NA intron (NM_001319195, intron 17 of 21) L1M4|LINE|L1 -89452 NM_183374 340665 Hs.369993 NM_183374 ENSG00000187553 CYP26C1 FFDD4 cytochrome P450 family 26 subfamily C member 1 protein-coding 177.333-142 chr6 80787972 80788213 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 681421 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 247.667-16 chr11 83197890 83198254 + 1 NA intron (NM_001300975, intron 1 of 10) L1MCb|LINE|L1 4360 NR_125355 338699 Hs.503438 NM_182603 ENSG00000137494 ANKRD42 PPP1R79|SARP ankyrin repeat domain 42 protein-coding 144.333-35 chr11 21387461 21387617 + 1 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) MIR|SINE|MIR 717953 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 154.333-64 chr11 83377688 83377900 + 1 NA Intergenic Intergenic -91387 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 354.667-12 chr20 49069713 49070343 + 1 NA intron (NM_001362762, intron 7 of 24) intron (NM_001362762, intron 7 of 24) 23716 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 217.667-30 chr15 69727236 69727558 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -107837 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 112.333-245 chr7 37619549 37619707 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -64138 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 173.667-100 chr21 16366201 16366418 + 1 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -52894 NR_136546 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 272.667-38 chr21 22965443 22965900 + 1 NA Intergenic Intergenic -113613 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 156.333-273 chr4 168658728 168658999 + 1 NA intron (NM_001166109, intron 1 of 18) intron (NM_001166109, intron 1 of 18) 27285 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 281.667-17 chr14 29306873 29307338 + 1 NA Intergenic Intergenic -521318 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 150.333-148 chr16 72620969 72621195 + 1 NA intron (NR_159372, intron 1 of 7) intron (NR_159372, intron 1 of 7) 43888 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 155.667-67 chr12 25081525 25081749 + 1 NA intron (NR_159367, intron 8 of 19) L1ME4b|LINE|L1 28931 NM_001204127 4033 Hs.124922 NM_006152 ENSG00000118308 LRMP JAW1 lymphoid restricted membrane protein protein-coding 140.333-102 chr2 65256252 65256528 + 1 NA intron (NM_001005386, intron 7 of 9) intron (NM_001005386, intron 7 of 9) 28695 NM_005722 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 193.667-98 chr5 2961807 2962127 + 1 NA Intergenic Intergenic 44113 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 126.333-171 chr7 136034021 136034181 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -56742 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 144.667-111 chr17 59627675 59627838 + 1 NA intron (NM_001288653, intron 1 of 31) intron (NM_001288653, intron 1 of 31) 7861 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 284.333-29 chr3 101672272 101672782 + 1 NA intron (NM_014415, intron 1 of 10) MADE2|DNA|TcMar-Mariner -3903 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 337.667-20 chr4 120495471 120496129 + 1 NA Intergenic Intergenic 427066 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 217.667-74 chr5 174491189 174491573 + 1 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) L2b|LINE|L2 155027 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 174.333-37 chr14 45173384 45173686 + 1 NA intron (NM_001308133, intron 12 of 21) intron (NM_001308133, intron 12 of 21) 37596 NM_001308134 57697 Hs.509229 NM_020937 ENSG00000187790 FANCM FAAP250|KIAA1596|POF15|SPGF28 FA complementation group M protein-coding 280.667-13 chr10 46317886 46318235 + 1 NA intron (NM_001278688, intron 16 of 16) intron (NM_001278688, intron 16 of 16) 31063 NM_001354208 195977 Hs.538515 NM_001278688 ENSG00000274209 ANTXRL - ANTXR like protein-coding 151.333-123 chr14 48748445 48748709 + 1 NA Intergenic Intergenic 837803 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 156.333-43 chr10 73888954 73889213 + 1 NA Intergenic Intergenic -14492 NM_172171 818 Hs.523045 NM_001222 ENSG00000148660 CAMK2G CAMK|CAMK-II|CAMKG calcium/calmodulin dependent protein kinase II gamma protein-coding 142.667-31 chr11 73532116 73532327 + 1 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 65891 NM_015159 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 166.667-107 chr2 39910871 39911090 + 1 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -6654 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-261 chr4 60476456 60476623 + 1 NA Intergenic Intergenic -446080 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 151.667-330 chr7 10193802 10193985 + 1 NA Intergenic Intergenic -508783 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 145.667-297 chr8 122992093 122992292 + 1 NA Intergenic (TGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 33580 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 253.667-63 chr6 53759445 53759758 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -35404 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 248.333-22 chr12 51962571 51963001 + 1 NA intron (NM_020327, intron 1 of 8) intron (NM_020327, intron 1 of 8) 9406 NM_020327 91 Hs.438918 NM_004302 ENSG00000135503 ACVR1B ACTRIB|ACVRLK4|ALK4|SKR2 activin A receptor type 1B protein-coding 222.667-101 chr9 77322263 77322562 + 1 NA intron (NM_001018038, intron 44 of 68) intron (NM_001018038, intron 44 of 68) -125237 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 122.333-216 chr9 29174379 29174530 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 37845 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 155.667-381 chr9 28278878 28279068 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 440332 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 149.333-84 chr12 21675845 21676011 + 1 NA Intergenic Intergenic -18073 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 167.333-144 chr2 175342690 175342857 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -161063 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 151.667-385 chr9 16859079 16859339 + 1 NA intron (NM_001317940, intron 1 of 5) L1MB2|LINE|L1 11461 NM_017637 54796 Hs.656581 NM_017637 ENSG00000173068 BNC2 BSN2 basonuclin 2 protein-coding 300.333-42 chr7 38484301 38484674 + 1 NA intron (NM_001635, intron 5 of 20) L1MB1|LINE|L1 142910 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 198.333-101 chr2 146632942 146633244 + 1 NA Intergenic Intergenic 46036 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 148.333-6 chr1 57624408 57624596 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) -199581 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 138.333-207 chr9 35574706 35574882 + 1 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 -10916 NM_001287238 730112 Hs.98959 NM_001099951 ENSG00000215187 FAM166B - family with sequence similarity 166 member B protein-coding 181.667-126 chr5 153122687 153123107 + 1 NA Intergenic Intergenic -150548 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 225.667-73 chr8 11287207 11287595 + 1 NA intron (NM_015458, intron 1 of 9).2 intron (NM_015458, intron 1 of 9).2 2585 NM_015458 66036 Hs.591395 NM_015458 ENSG00000104643 MTMR9 C8orf9|LIP-STYX|MTMR8 myotubularin related protein 9 protein-coding 237.333-122 chr8 118735810 118736306 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -114095 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 151.333-41 chr10 18691391 18691678 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 32103 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 159.333-80 chr13 53565527 53565698 + 1 NA Intergenic Intergenic -249807 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 200.333-156 chr8 111949721 111950056 + 1 NA Intergenic Intergenic 573249 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 156.333-362 chr8 117021443 117021733 + 1 NA intron (NM_001172813, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 70613 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 161.333-37 chr10 75874471 75874673 + 1 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) MIRc|SINE|MIR 91811 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 155.333-192 chr2 224260741 224260906 + 1 NA Intergenic Intergenic 141171 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 148.667-9 chr1 79482508 79482831 + 1 NA Intergenic Intergenic -475939 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 156.667-139 chr17 68776051 68776207 + 1 NA Intergenic Intergenic 147975 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 187.667-127 chr6 53463491 53463689 + 1 NA Intergenic Intergenic 81511 NM_001498 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 166.667-41 chr11 72420494 72420761 + 1 NA intron (NM_001258394, intron 2 of 17) L2c|LINE|L2 13904 NM_001258393 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 168.333-97 chr2 104446007 104446245 + 1 NA intron (NR_015399, intron 1 of 3) intron (NR_015399, intron 1 of 3) 11779 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 148.667-191 chr2 77662556 77662845 + 1 NA Intergenic Intergenic -140267 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 181.333-196 chrX 44884538 44884760 + 1 NA intron (NR_111960, intron 2 of 27) intron (NR_111960, intron 2 of 27) 11474 NM_001291416 7403 Hs.522616 NM_021140 ENSG00000147050 KDM6A KABUK2|UTX|bA386N14.2 lysine demethylase 6A protein-coding 273.333-9 chr10 96105493 96105981 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -15502 NR_134320 728558 Hs.538374 NR_038444 ENSG00000226688 ENTPD1-AS1 - ENTPD1 antisense RNA 1 ncRNA 152.333-130 chr16 5468258 5468422 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 147910 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 152.333-54 chr10 109431343 109431544 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 491803 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 137.333-150 chr5 29714554 29714805 + 1 NA Intergenic Intergenic -165881 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 263.667-23 chr14 53684755 53685072 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 263571 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 149.667-145 chr15 86401746 86401898 + 1 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) L1PB2|LINE|L1 -84854 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 206.333-6 chr1 115870184 115870523 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -29227 NM_005599 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 159.667-61 chr11 62236348 62236608 + 1 NA Intergenic Intergenic -5761 NM_006551 10647 Hs.204096 NM_006551 ENSG00000124935 SCGB1D2 LIPB|LPHB|LPNB secretoglobin family 1D member 2 protein-coding 167.667-103 chr2 63471251 63471470 + 1 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) intron (NR_148704, intron 7 of 18) -33353 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 140.667-173 chr4 189336776 189336955 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -322741 NR_121679 101928971 Hs.519164 NR_121679 ENSG00000250739 LINC01262 TCONS_l2_00021807 long intergenic non-protein coding RNA 1262 ncRNA 181.667-121 chr5 81856052 81856290 + 1 NA Intergenic Intergenic -104918 NM_001256734 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 243.333-9 chr10 48921796 48922224 + 1 NA intron (NM_020945, intron 47 of 61) L1MEf|LINE|L1 -7775 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 156.333-263 chr4 44720167 44720436 + 1 NA intron (NR_073094, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 6255 NM_138335 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 134.667-157 chr5 54828564 54828786 + 1 NA Intergenic Intergenic -84417 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 156.333-275 chr4 184334956 184335144 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 18927 NR_040108 728175 Hs.590107 NR_040108 ENSG00000180712 LINC02363 - long intergenic non-protein coding RNA 2363 ncRNA 206.667-87 chr3 65021795 65022302 + 1 NA Intergenic Intergenic -334048 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 185.333-9 chr1 83769453 83769710 + 1 NA intron (NR_119375, intron 1 of 2) intron (NR_119375, intron 1 of 2) 90965 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 175.667-43 chr14 85676121 85676392 + 1 NA Intergenic Intergenic 142907 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 223.333-58 chr18 48254378 48254784 + 1 NA intron (NM_001371290, intron 5 of 9) LTR9|LTR|ERV1 2280 NM_001350280 84322 Hs.334493 NM_032362 C18orf12 HEIL1|HsT2508 chromosome 18 open reading frame 12 protein-coding 204.667-49 chr15 41892589 41892879 + 1 NA promoter-TSS (NR_135681) promoter-TSS (NR_135681) -43 NR_135681 105370792 Hs.627877 NR_135681 LOC105370792 - uncharacterized LOC105370792 ncRNA 149.667-117 chr14 51681439 51681594 + 1 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 29606 NM_152330 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 153.333-243 chr20 46375422 46375595 + 1 NA intron (NM_133171, intron 12 of 21) intron (NM_133171, intron 12 of 21) -11050 NM_001281458 51006 Hs.593344 NM_015945 ENSG00000080189 SLC35C2 BA394O2.1|C20orf5|CGI-15|OVCOV1 solute carrier family 35 member C2 protein-coding 156.667-322 chr7 54415342 54415543 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 84745 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 162.667-260 chr7 89713329 89713521 + 1 NA Intergenic Intergenic -405975 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 255.667-41 chr2 37218518 37218832 + 1 NA intron (NM_005760, intron 5 of 15) AluSx|SINE|Alu 12921 NM_005760 10153 Hs.135406 NM_005760 ENSG00000115816 CEBPZ CBF|CBF2|HSP-CBF|NOC1 CCAAT enhancer binding protein zeta protein-coding 191.667-16 chr10 51916435 51916838 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) MER41A|LTR|ERV1 -217041 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 154.333-37 chr10 73572915 73573092 + 1 NA intron (NR_146997, intron 3 of 21) AluJo|SINE|Alu 2672 NM_152586 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 257.333-5 chr1 91808540 91809148 + 1 NA intron (NR_036634, intron 2 of 17) intron (NR_036634, intron 2 of 17) 77307 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 181.333-12 chr10 33832372 33832625 + 1 NA Intergenic X2_LINE|LINE|CR1 -59818 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 195.667-134 chr7 103437172 103437484 + 1 NA intron (NR_135802, intron 2 of 17) L1MA7|LINE|L1 5883 NR_120443 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 158.667-199 chr22 48086260 48086475 + 1 NA Intergenic LTR71B|LTR|ERV1 -187997 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 262.667-81 chr8 99243865 99244344 + 1 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) intron (NM_017890, intron 17 of 61) 230838 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 222.667-86 chr7 13057281 13057671 + 1 NA Intergenic Intergenic 369843 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 214.333-27 chr11 77062604 77062941 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -4199 NM_004055 726 Hs.248153 NM_004055 ENSG00000149260 CAPN5 ADNIV|HTRA3|VRNI|nCL-3 calpain 5 protein-coding 192.667-32 chr10 101489701 101490077 + 1 NA intron (NM_001256856, intron 3 of 13) intron (NM_001256856, intron 3 of 13) 98368 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 228.333-35 chr17 60746572 60746839 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) MIRc|SINE|MIR 68854 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 146.333-270 chr5 121915159 121915365 + 1 NA Intergenic Intergenic -46713 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 195.667-125 chr6 148961481 148961750 + 1 NA intron (NR_038408, intron 1 of 2) Plat_L3|LINE|CR1 3069 NR_038408 100128176 Hs.557541 NR_038408 UST-AS1 - UST antisense RNA 1 ncRNA 180.333-95 chr5 29558276 29558536 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -162430 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 341.667-22 chr9 25361201 25361653 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 317431 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 212.333-155 chr9 97029730 97030091 + 1 NA 3' UTR (NM_001333, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001333, exon 8 of 8) 9232 NM_001333 1515 Hs.610096 NM_001333 ENSG00000136943 CTSV CATL2|CTSL2|CTSU cathepsin V protein-coding 267.667-47 chr4 127957404 127957760 + 1 NA exon (NM_001363521, exon 2 of 9) exon (NM_001363521, exon 2 of 9) 7591 NM_001363521 256471 Hs.480701 NM_152778 ENSG00000164073 MFSD8 CCMD|CLN7 major facilitator superfamily domain containing 8 protein-coding 284.667-22 chr18 2665277 2665757 + 1 NA intron (NM_015295, intron 1 of 47) AluSg|SINE|Alu 9630 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 168.667-157 chr4 30955131 30955337 + 1 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) L3|LINE|CR1 -215910 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 163.333-94 chr14 80853794 80854080 + 1 NA intron (NM_152446, intron 9 of 24) L1MEd|LINE|L1 87801 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 122.667-123 chr3 127935202 127935371 + 1 NA intron (NM_001370224, intron 4 of 6) L1M4a1|LINE|L1 20054 NM_001370224 166348 Hs.132087 NM_207335 ENSG00000187715 KBTBD12 KLHDC6 kelch repeat and BTB domain containing 12 protein-coding 175.333-132 chr4 59313240 59313561 + 1 NA Intergenic Intergenic 299827 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 213.333-163 chr5 111975334 111975692 + 1 NA intron (NM_001142475, intron 1 of 3) intron (NM_001142475, intron 1 of 3) 1419 NM_001142475 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 154.333-231 chr3 185130931 185131234 + 1 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 21978 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 201.333-123 chr17 13848446 13848754 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -175898 NR_003261 94158 Hs.633073 NR_003261 CDRT15P1 CDRT15P CMT1A duplicated region transcript 15 pseudogene 1 pseudo 273.333-13 chr11 105993933 105994296 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 28126 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 189.333-199 chr7 133021221 133021564 + 1 NA intron (NM_001317177, intron 3 of 8) intron (NM_001317177, intron 3 of 8) 13523 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 162.333-244 chr8 28148525 28148692 + 1 NA intron (NM_018091, intron 10 of 14) L1MCa|LINE|L1 55469 NM_001284220 55140 Hs.491336 NM_018091 ENSG00000134014 ELP3 KAT9 elongator acetyltransferase complex subunit 3 protein-coding 156.667-106 chr14 64185706 64185919 + 1 NA intron (NM_015180, intron 96 of 114) AluSx|SINE|Alu -28332 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 146.333-147 chr2 52445899 52446176 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 75389 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 201.333-228 chr5 63533559 63533869 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 428578 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 182.333-133 chr5 112731474 112731780 + 1 NA intron (NM_001354902, intron 1 of 14) L1ME4a|LINE|L1 -6258 NM_001354898 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 198.333-186 chr7 129431285 129431677 + 1 NA Intergenic Intergenic -2951 NM_020704 57464 Hs.489988 NM_020704 ENSG00000128578 STRIP2 FAM40B|FAR11B striatin interacting protein 2 protein-coding 173.667-28 chr11 27868267 27868573 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -146390 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 118.667-190 chr8 87391600 87391790 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 482320 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 140.333-173 chr5 6428599 6428780 + 1 NA Intergenic Intergenic -20170 NM_001145161 134111 Hs.126856 NM_001145161 ENSG00000215218 UBE2QL1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q family like 1 protein-coding 259.667-11 chr10 110929226 110929708 + 1 NA intron (NR_136749, intron 1 of 7) intron (NR_136749, intron 1 of 7) 7788 NR_026715 644511 Hs.632083 NR_026715 ENSG00000234118 RPL13AP6 RPL13A_7_1096|bA348N5.5 ribosomal protein L13a pseudogene 6 pseudo 170.333-162 chr4 124693350 124693573 + 1 NA intron (NM_001167882, intron 1 of 3) intron (NM_001167882, intron 1 of 3) 19271 NM_001167882 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 245.333-85 chr4 45902235 45902635 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 221619 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 154.333-278 chr5 138303855 138304062 + 1 NA intron (NM_001790, intron 7 of 13) L2|LINE|L2 27846 NM_001790 995 Hs.656 NM_001790 ENSG00000158402 CDC25C CDC25|PPP1R60 cell division cycle 25C protein-coding 150.333-129 chr15 60588034 60588324 + 1 NA intron (NM_134260, intron 1 of 11) intron (NM_134260, intron 1 of 11) 4347 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 228.333-109 chr9 116377721 116378024 + 1 NA intron (NM_002581, intron 20 of 21) MIR|SINE|MIR 22734 NR_103711 493913 Hs.728832 NR_103711 ENSG00000256040 PAPPA-AS1 DIPAS|NCRNA00156|PAPPA-AS|PAPPAAS|PAPPAS|TAF2C2|TAF4B|TAFII105 PAPPA antisense RNA 1 ncRNA 177.667-25 chr10 104748394 104748666 + 1 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -82314 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 114.333-107 chr2 86584812 86584962 + 1 NA intron (NM_001198954, intron 3 of 7) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -21444 NM_001193517 51652 Hs.591582 NM_016079 ENSG00000115561 CHMP3 CGI-149|NEDF|VPS24 charged multivesicular body protein 3 protein-coding 224.333-114 chr7 10098445 10098953 + 1 NA Intergenic Intergenic 464429 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 165.333-260 chr9 24246947 24247216 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 298595 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 152.333-367 chr8 27590406 27590669 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 20214 NR_106902 102465508 NR_106902 ENSG00000284280 MIR6843 hsa-mir-6843 microRNA 6843 ncRNA 210.667-5 chr1 83576035 83576400 + 1 NA non-coding (NR_119375, exon 3 of 3) non-coding (NR_119375, exon 3 of 3) 130163 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 181.667-60 chr18 78845508 78845827 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -134608 NM_171999 27164 Hs.700557 NM_171999 ENSG00000256463 SALL3 ZNF796 spalt like transcription factor 3 protein-coding 133.667-114 chr4 102057897 102058137 + 1 NA intron (NM_017935, intron 11 of 16) L1ME4c|LINE|L1 244175 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 211.667-86 chr3 192385516 192385864 + 1 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) MER115|DNA|hAT-Tip100 23359 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 119.333-233 chr9 27427437 27427628 + 1 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) intron (NM_024761, intron 2 of 3) -96782 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 159.667-83 chr12 64105067 64105310 + 1 NA intron (NM_001346201, intron 15 of 21) L1MB3|LINE|L1 117108 NM_001300940 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 157.667-184 chr22 38720692 38720976 + 1 NA intron (NM_004286, intron 4 of 11) MIRb|SINE|MIR 14890 NM_004286 9567 Hs.276925 NM_004286 ENSG00000100226 GTPBP1 GP-1|GP1|HSPC018 GTP binding protein 1 protein-coding 168.333-179 chr6 76008816 76008997 + 1 NA intron (NM_001563, intron 8 of 16) L1ME1|LINE|L1 63756 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 207.333-273 chr8 130155630 130155886 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 13 of 29) intron (NM_001362925, intron 13 of 29) -70990 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 170.333-74 chr14 60314445 60314624 + 1 NA Intergenic (ATGGAGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8662 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 524.667-4 chr3 173497038 173497715 + 1 NA intron (NM_014932, intron 2 of 6) AluSq2|SINE|Alu -87058 NM_001365933 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 251.333-89 chr5 98982295 98982737 + 1 NA intron (NR_151718, intron 1 of 3) intron (NR_151718, intron 1 of 3) -52802 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 125.333-131 chr4 159622301 159622557 + 1 NA Intergenic Intergenic 155355 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 147.667-224 chr3 56690838 56691015 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -7661 NM_001365636 23272 Hs.116877 NM_015224 ENSG00000163946 TASOR C3orf63|FAM208A|RAP140|TASOR1|se89-1 transcription activation suppressor protein-coding 254.667-21 chr14 56222374 56222839 + 1 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 104195 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 220.333-77 chr21 27586085 27586512 + 1 NA Intergenic Intergenic -136081 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 149.667-373 chr7 69072403 69072650 + 1 NA Intergenic Intergenic 525098 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 145.333-226 chr4 138287585 138287754 + 1 NA Intergenic Intergenic -22042 NR_051987 100874047 Hs.570848 NR_051987 ENSG00000251372 LINC00499 - long intergenic non-protein coding RNA 499 ncRNA 264.333-41 chr2 192627382 192627823 + 1 NA Intergenic Intergenic -122243 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 135.333-82 chr2 41718486 41718708 + 1 NA Intergenic Intergenic -158958 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 119.667-189 chr9 35838291 35838458 + 1 NA intron (NM_001042589, intron 4 of 13) L2|LINE|L2 9146 NM_001363622 51754 Hs.9187 NM_016446 ENSG00000137103 TMEM8B C9orf127|FP588|LINC00950|NAG-5|NAG5|NGX6 transmembrane protein 8B protein-coding 142.667-178 chr5 53121125 53121361 + 1 NA Intergenic Intergenic 11401 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 184.667-23 chr12 26913537 26913787 + 1 NA exon (NM_018164, exon 14 of 17) exon (NM_018164, exon 14 of 17) 24319 NM_018164 55726 Hs.505077 NM_018164 ENSG00000064102 INTS13 ASUN|C12orf11|GCT1|Mat89Bb|NET48|SPATA30 integrator complex subunit 13 protein-coding 154.667-134 chr16 78420787 78421074 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 5 of 7) intron (NM_001291997, intron 5 of 7) 321276 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 131.667-91 chr2 51819375 51819570 + 1 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) intron (NR_135237, intron 6 of 10) -551176 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 208.667-88 chr3 47014315 47014719 + 1 NA Intergenic Intergenic 2975 NR_024046 100129354 Hs.201522 NR_024046 NRADDP - neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene pseudo 217.333-168 chrX 14342479 14342820 + 1 NA Intergenic Intergenic 98384 NR_110506 286480 Hs.567831 NR_110506 UBE2E4P UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E4 pseudogene pseudo 217.667-55 chr3 51450996 51451461 + 1 NA intron (NR_146065, intron 5 of 25) AluJr4|SINE|Alu 48774 NM_001171904 9730 Hs.716623 NM_014703 ENSG00000145041 DCAF1 RIP|VPRBP DDB1 and CUL4 associated factor 1 protein-coding 134.667-47 chr12 66126413 66126592 + 1 NA intron (NM_032338, intron 2 of 2) intron (NM_032338, intron 2 of 2) 4248 NM_032338 84298 Hs.504820 NM_032338 ENSG00000139233 LLPH C12orf31|hLLP LLP homolog, long-term synaptic facilitation factor protein-coding 172.333-34 chr11 84615993 84616256 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L2b|LINE|L2 104818 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 125.333-149 chr5 172577960 172578177 + 1 NA Intergenic Intergenic -19054 NR_146726 105377728 Hs.131465 NR_146726 LINC01944 CTB-54I1.1 long intergenic non-protein coding RNA 1944 ncRNA 295.667-13 chr18 60197584 60198144 + 1 NA Intergenic Intergenic 174911 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 192.333-146 chr6 53611356 53611710 + 1 NA Intergenic Intergenic -16847 NR_125841 101927171 Hs.334005 NR_125841 ENSG00000235899 LINC01564 TCONS_00011314|XLOC_005327 long intergenic non-protein coding RNA 1564 ncRNA 154.333-164 chr2 119961056 119961365 + 1 NA intron (NM_002830, intron 23 of 26) L1MB8|LINE|L1 -51867 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 145.333-256 chr6 54339604 54339904 + 1 NA intron (NM_014464, intron 4 of 10) intron (NM_014464, intron 4 of 10) 31313 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 205.333-176 chr4 118183237 118183540 + 1 NA intron (NM_004784, intron 6 of 13) intron (NM_004784, intron 6 of 13) -95374 NR_003584 100093630 Hs.535762 NR_003584 ENSG00000269893 SNHG8 LINC00060|NCRNA00060 small nucleolar RNA host gene 8 ncRNA 156.333-202 chr20 16138193 16138563 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -152496 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 262.333-23 chr14 55562054 55562503 + 1 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger 17814 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-272 chr4 83440303 83440529 + 1 NA intron (NM_001297757, intron 6 of 16) intron (NM_001297757, intron 6 of 16) 15407 NM_133636 113510 Hs.480101 NM_133636 ENSG00000163312 HELQ HEL308 helicase, POLQ like protein-coding 130.667-119 chr2 174554840 174554970 + 1 NA Intergenic Intergenic 3167 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 154.667-118 chr14 92136015 92136182 + 1 NA intron (NM_001322272, intron 6 of 15) intron (NM_001322272, intron 6 of 15) 14129 NM_001322270 53981 Hs.657632 NM_017437 ENSG00000165934 CPSF2 CPSF100 cleavage and polyadenylation specific factor 2 protein-coding 298.667-7 chr10 99274501 99275152 + 1 NA Intergenic Intergenic -38951 NM_021828 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 296.667-39 chr3 95354199 95354634 + 1 NA Intergenic Intergenic 328777 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 148.667-168 chr18 33544957 33545209 + 1 NA Intergenic Intergenic -33136 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 207.667-98 chr5 36792238 36792622 + 1 NA Intergenic Intergenic 84264 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 135.667-138 chr5 16945757 16946008 + 1 NA Intergenic Intergenic -9594 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 178.333-90 chr2 231737412 231737700 + 1 NA intron (NM_002601, intron 3 of 4) intron (NM_002601, intron 3 of 4) 24242 NR_036262 100422885 NR_036262 ENSG00000283498 MIR1244-2 - microRNA 1244-2 ncRNA 156.667-90 chr13 54020257 54020454 + 1 NA Intergenic Intergenic 112516 NR_108063 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 196.667-40 chr13 94214126 94214472 + 1 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) intron (NM_005708, intron 4 of 8) -26308 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 177.667-121 chr6 156834238 156834505 + 1 NA intron (NM_017519, intron 2 of 18) intron (NM_017519, intron 2 of 18) -54640 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 190.333-131 chr6 103973819 103974020 + 1 NA Intergenic Intergenic 885627 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 169.333-73 chr14 41557267 41557581 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -49432 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 157.333-100 chr14 20244275 20244436 + 1 NA TTS (NM_001004479) TTS (NM_001004479) 1563 NM_001004479 390442 Hs.553767 NM_001004479 ENSG00000176198 OR11H4 OR14-36 olfactory receptor family 11 subfamily H member 4 protein-coding 210.333-51 chr16 7762732 7763091 + 1 NA Intergenic Intergenic 430066 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 196.667-56 chr16 78209161 78209466 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 109659 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 161.667-4 chr1 55683998 55684226 + 1 NA Intergenic Intergenic 260851 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 183.667-72 chr2 35046790 35047214 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 369445 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 355.333-6 chr11 109757052 109757531 + 1 NA Intergenic Intergenic 335101 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 125.667-62 chr14 64087772 64087949 + 1 NA intron (NM_015180, intron 58 of 114) intron (NM_015180, intron 58 of 114) 7265 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 163.333-10 chr1 70116777 70117032 + 1 NA intron (NM_001370785, intron 26 of 26) intron (NM_001370785, intron 26 of 26) 88675 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 148.667-105 chr13 68925306 68925490 + 1 NA Intergenic Intergenic -40073 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 130.333-217 chr8 142871331 142871484 + 1 NA TTS (NM_000497) TTS (NM_000497) 8413 NM_001026213 1584 Hs.184927 NM_000497 ENSG00000160882 CYP11B1 CPN1|CYP11B|FHI|P450C11 cytochrome P450 family 11 subfamily B member 1 protein-coding 119.667-162 chr6 4729417 4729618 + 1 NA intron (NM_001368125, intron 2 of 8) intron (NM_001368125, intron 2 of 8) 23379 NM_001368125 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 163.333-88 chr14 61683948 61684254 + 1 NA intron (NR_047116, intron 1 of 1) L1ME4b|LINE|L1 -11412 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 220.667-20 chr11 115682214 115682551 + 1 NA Intergenic Intergenic 52380 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 162.667-81 chr14 65667429 65667684 + 1 NA intron (NM_004480, intron 5 of 9) L1PA15|LINE|L1 196454 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 159.667-248 chr5 9694849 9695019 + 1 NA intron (NR_027112, intron 9 of 12) intron (NR_027112, intron 9 of 12) -64583 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 146.667-300 chr7 18215691 18215897 + 1 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) intron (NM_001321872, intron 2 of 11) -74298 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 214.333-47 chr14 64473060 64473473 + 1 NA 3' UTR (NM_004857, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_004857, exon 2 of 2) 7767 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 156.333-138 chr16 74689626 74689830 + 1 NA intron (NM_152649, intron 4 of 10) L1ME5|LINE|L1 11134 NM_152649 197259 Hs.119878 NM_152649 ENSG00000168404 MLKL hMLKL mixed lineage kinase domain like pseudokinase protein-coding 149.667-437 chrX 100418538 100418709 + 1 NA Intergenic Intergenic -8350 NM_001105243 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 153.333-276 chr3 121853514 121853722 + 1 NA intron (NM_001320041, intron 2 of 4) L1MC5a|LINE|L1 18409 NM_018456 55840 Hs.477325 NM_018456 ENSG00000145088 EAF2 BM040|TRAITS|U19 ELL associated factor 2 protein-coding 135.333-53 chr14 59858989 59859236 + 1 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 11664 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 148.333-94 chr12 43507295 43507507 + 1 NA intron (NM_025003, intron 3 of 38) intron (NM_025003, intron 3 of 38) 44802 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 149.333-284 chr4 86202189 86202415 + 1 NA intron (NM_001363657, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 82496 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 294.333-31 chr4 123983261 123983686 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 209209 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 143.667-220 chr6 131883038 131883256 + 1 NA intron (NM_006208, intron 21 of 24) intron (NM_006208, intron 21 of 24) 68225 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 153.667-335 chr6 48620388 48620639 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -551824 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 155.333-132 chr17 5273878 5274115 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8288 NM_004703 9135 Hs.584784 NM_004703 ENSG00000029725 RABEP1 RAB5EP|RABPT5 rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 protein-coding 149.333-5 chr1 40172120 40172310 + 1 NA intron (NM_012421, intron 1 of 7) HAL1ME|LINE|L1 10828 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 137.333-129 chr4 31371168 31371335 + 1 NA Intergenic Intergenic -135293 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 178.333-126 chr4 99548372 99548685 + 1 NA 3' UTR (NM_152292, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_152292, exon 8 of 8) 15195 NM_152292 93587 Hs.380412 NM_152292 ENSG00000145331 TRMT10A HEL-S-88|MSSGM|MSSGM1|RG9MTD2|TRM10 tRNA methyltransferase 10A protein-coding 131.667-64 chr15 89268077 89268233 + 1 NA intron (NM_001113378, intron 9 of 37) AluJb|SINE|Alu 24176 NM_018193 55215 Hs.513126 NM_018193 ENSG00000140525 FANCI KIAA1794 FA complementation group I protein-coding 245.333-126 chr8 134619997 134620289 + 1 NA intron (NM_020863, intron 3 of 15) intron (NM_020863, intron 3 of 15) 22072 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 239.333-10 chr1 246445887 246446194 + 1 NA intron (NM_001167740, intron 1 of 11) intron (NM_001167740, intron 1 of 11) -28628 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 127.667-32 chr11 115029444 115029641 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -304035 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 187.333-31 chr11 34774553 34774885 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -141411 NM_001135024 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 350.667-13 chr7 102058007 102058630 + 1 NA intron (NM_001913, intron 3 of 22) AluSx|SINE|Alu -226823 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 141.333-75 chr16 81297216 81297418 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -17649 NM_022041 8139 Hs.112569 NM_022041 ENSG00000261609 GAN GAN1|KLHL16 gigaxonin protein-coding 179.667-43 chr14 25557269 25557597 + 1 NA Intergenic Intergenic -507136 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 156.333-18 chr1 154602765 154602954 + 1 NA intron (NM_001365045, intron 1 of 14) intron (NM_001365045, intron 1 of 14) 3394 NM_001193495 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 137.667-72 chr17 19499799 19499977 + 1 NA Intergenic Intergenic -33966 NM_018242 55244 Hs.232054 NM_018242 ENSG00000142494 SLC47A1 MATE1 solute carrier family 47 member 1 protein-coding 150.333-57 chr11 29090911 29091080 + 1 NA Intergenic Intergenic -503418 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 267.667-16 chr15 39313927 39314344 + 1 NA Intergenic Intergenic 63466 NR_144507 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 164.667-38 chr11 73612624 73612857 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -14628 NM_001286051 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 150.667-80 chr12 4582990 4583154 + 1 NA intron (NM_001371301, intron 2 of 14) intron (NM_001371301, intron 2 of 14) -7000 NM_003845 8798 Hs.439530 NM_003845 ENSG00000010219 DYRK4 - dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4 protein-coding 227.333-86 chr4 38075104 38075481 + 1 NA intron (NM_001253912, intron 14 of 20) intron (NM_001253912, intron 14 of 20) -34889 NM_001253913 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 263.667-24 chr14 65616421 65616964 + 1 NA intron (NM_004480, intron 4 of 9) intron (NM_004480, intron 4 of 9) 145590 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 189.667-74 chr2 113207847 113208115 + 1 NA 3' UTR (NM_012455, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_012455, exon 17 of 17) -27546 NR_047570 654433 Hs.656660 NR_015377 ENSG00000189223 PAX8-AS1 - PAX8 antisense RNA 1 ncRNA 220.333-124 chr7 93633303 93633659 + 1 NA Intergenic Intergenic -58751 NM_001164737 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 193.333-119 chr3 55939222 55939565 + 1 NA intron (NR_132749, intron 12 of 17) MER103C|DNA|hAT-Charlie -86799 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 229.333-68 chr2 190019046 190019573 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 43420 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 145.333-86 chr14 61186693 61186882 + 1 NA Intergenic Intergenic 94551 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 146.333-105 chr15 56982285 56982536 + 1 NA intron (NM_207038, intron 3 of 19) intron (NM_207038, intron 3 of 19) 62965 NM_001322165 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 208.667-93 chr3 188741653 188741950 + 1 NA intron (NM_001167672, intron 6 of 9) L1ME1|LINE|L1 53020 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 151.333-47 chr10 34667244 34667445 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 147952 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 196.333-135 chr4 150635277 150635649 + 1 NA intron (NM_001367550, intron 37 of 56) intron (NM_001367550, intron 37 of 56) 53312 NM_006439 10586 Hs.584852 NM_006439 ENSG00000181541 MAB21L2 MCOPS14|MCSKS14 mab-21 like 2 protein-coding 191.333-92 chr17 74711013 74711400 + 1 NA intron (NR_110298, intron 1 of 5) intron (NR_110298, intron 1 of 5) 1717 NM_001289084 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 123.333-146 chr3 93885751 93885936 + 1 NA intron (NM_000313, intron 11 of 14) intron (NM_000313, intron 11 of 14) 88238 NM_001314077 5627 Hs.64016 NM_000313 ENSG00000184500 PROS1 PROS|PS21|PS22|PS23|PS24|PS25|PSA|THPH5|THPH6 protein S protein-coding 118.333-178 chr6 73130894 73131052 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 9 of 13) intron (NM_001160132, intron 9 of 13) 12541 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 146.333-106 chr15 57009686 57009970 + 1 NA intron (NM_001322164, intron 3 of 19) intron (NM_001322164, intron 3 of 19) 90383 NM_001322165 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 172.667-93 chr20 52716347 52716541 + 1 NA Intergenic Intergenic 95606 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 160.333-185 chr3 53765476 53765787 + 1 NA intron (NM_001128839, intron 30 of 45) intron (NM_001128839, intron 30 of 45) 80788 NM_018397 55349 Hs.126688 NM_018397 ENSG00000016391 CHDH - choline dehydrogenase protein-coding 152.667-122 chr15 44473480 44473755 + 1 NA intron (NM_016396, intron 2 of 12) L1MB8|LINE|L1 45988 NM_016396 51496 Hs.497967 NM_016396 ENSG00000137770 CTDSPL2 HSPC058|HSPC129 CTD small phosphatase like 2 protein-coding 294.333-8 chr12 1768778 1769435 + 1 NA intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 -51161 NM_001163925 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 216.333-117 chr5 127134433 127134725 + 1 NA Intergenic Intergenic -61087 NM_001164478 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 166.667-93 chr18 2957608 2957934 + 1 NA intron (NM_014646, intron 2 of 19) intron (NM_014646, intron 2 of 19) -11148 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 181.667-89 chr21 46574701 46574963 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 30250 NM_006272 6285 Hs.422181 NM_006272 ENSG00000160307 S100B NEF|S100|S100-B|S100beta S100 calcium binding protein B protein-coding 221.667-30 chr14 52468382 52468791 + 1 NA intron (NM_001160047, intron 16 of 20) L1M2|LINE|L1 83919 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 151.667-220 chr3 63674527 63674724 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 21950 NM_001348756 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 151.667-251 chr4 72548248 72548409 + 1 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 20893 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 280.667-32 chr3 109069642 109070145 + 1 NA intron (NM_014429, intron 8 of 27) intron (NM_014429, intron 8 of 27) -31563 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 181.667-73 chr2 143994152 143994353 + 1 NA intron (NM_001354353, intron 7 of 9) L2a|LINE|L2 57185 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 133.333-172 chr7 38177310 38177547 + 1 NA promoter-TSS (NM_001363345) promoter-TSS (NM_001363345) -817 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 160.667-248 chr5 75493090 75493404 + 1 NA intron (NM_031361, intron 2 of 16) L1MC5|LINE|L1 18382 NM_031361 10087 Hs.270437 NM_005713 ENSG00000113163 CERT1 CERT|CERTL|COL4A3BP|GPBP|MRD34|STARD11 ceramide transporter 1 protein-coding 206.333-125 chr4 115593669 115593990 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -480209 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 148.333-340 chr6 57129920 57130098 + 1 NA intron (NM_015555, intron 5 of 13) L2c|LINE|L2 39821 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 147.667-71 chr12 43049145 43049392 + 1 NA Intergenic AluYk11|SINE|Alu -106047 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 246.667-52 chr22 34600693 34601186 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 396977 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 122.333-120 chr20 3396451 3396619 + 1 NA intron (NM_001009984, intron 1 of 36) L2a|LINE|L2 11127 NM_001009984 25943 Hs.516853 NM_001009984 ENSG00000088854 C20orf194 - chromosome 20 open reading frame 194 protein-coding 261.667-6 chr10 44724258 44724720 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -186827 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 195.667-3 chr1 70017723 70018074 + 1 NA intron (NM_001370785, intron 14 of 26) intron (NM_001370785, intron 14 of 26) 98576 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 154.333-107 chr15 71081627 71081919 + 1 NA Intergenic Intergenic -59676 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 165.333-232 chr6 136900964 136901242 + 1 NA intron (NM_000288, intron 9 of 9) intron (NM_000288, intron 9 of 9) -21198 NM_001008783 340146 Hs.369703 NM_001008783 ENSG00000182747 SLC35D3 FRCL1 solute carrier family 35 member D3 protein-coding 126.333-113 chr22 46799344 46799512 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) L1MC4|LINE|L1 25501 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 121.667-94 chr2 109035506 109035776 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -46421 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 202.333-157 chr6 134295678 134295998 + 1 NA intron (NM_001143676, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 22220 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 161.333-81 chr13 93271961 93272247 + 1 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) intron (NM_005708, intron 1 of 8) 45297 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 258.667-8 chr1 173219059 173219344 + 1 NA Intergenic Intergenic -11870 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 234.333-64 chr6 39675256 39675798 + 1 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) L1MEd|LINE|L1 49881 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 175.333-180 chr8 3873617 3873969 + 1 NA intron (NM_033225, intron 5 of 69) intron (NM_033225, intron 5 of 69) 1121121 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 137.667-184 chr8 61677207 61677373 + 1 NA intron (NM_001164756, intron 4 of 4) intron (NM_001164756, intron 4 of 4) 12521 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 127.667-16 chr10 62926266 62926434 + 1 NA Intergenic Intergenic -107183 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 174.333-143 chr7 120250052 120250227 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -23036 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 379.667-2 chr11 54548441 54549152 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 55202 NM_001004703 119749 Hs.553564 NM_001004703 ENSG00000185926 OR4C46 - olfactory receptor family 4 subfamily C member 46 protein-coding 143.667-215 chr6 56085023 56085245 + 1 NA intron (NM_030820, intron 17 of 29) intron (NM_030820, intron 17 of 29) 6528 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 159.667-193 chr20 47642564 47642901 + 1 NA intron (NM_181659, intron 17 of 22) intron (NM_181659, intron 17 of 22) 140845 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 219.667-96 chr8 144876977 144877228 + 1 NA 3' UTR (NM_001363101, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001363101, exon 6 of 6) 23203 NM_001363103 58500 Hs.532277 NM_021061 ENSG00000196150 ZNF250 ZFP647|ZNF647 zinc finger protein 250 protein-coding 143.333-59 chr12 9692935 9693215 + 1 NA exon (NM_001004419, exon 5 of 6) exon (NM_001004419, exon 5 of 6) 23362 NM_001197319 29121 Hs.268326 NM_013269 ENSG00000069493 CLEC2D CLAX|LLT1|OCIL C-type lectin domain family 2 member D protein-coding 228.333-88 chr7 32332708 32333108 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L1ME3A|LINE|L1 -33580 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 151.333-405 chr8 34082338 34082557 + 1 NA Intergenic Intergenic -482341 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 217.333-170 chrX 78720583 78720924 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -26956 NM_001278000 2846 Hs.522701 NM_005296 ENSG00000147145 LPAR4 GPR23|LPA4|P2RY9|P2Y5-LIKE|P2Y9 lysophosphatidic acid receptor 4 protein-coding 292.667-34 chr5 101983609 101983952 + 1 NA Intergenic Intergenic 312504 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 208.667-25 chr10 111093499 111093935 + 1 NA Intergenic Intergenic 16688 NM_000681 150 Hs.249159 NM_000681 ENSG00000150594 ADRA2A ADRA2|ADRA2R|ADRAR|ALPHA2AAR|ZNF32 adrenoceptor alpha 2A protein-coding 272.333-31 chr2 62993060 62993711 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 16 of 22) intron (NM_001142615, intron 16 of 22) 54326 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 179.667 chr1 20471023 20471215 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 15091 NM_018584 55450 Hs.731383 NM_018584 ENSG00000162545 CAMK2N1 PRO1489 calcium/calmodulin dependent protein kinase II inhibitor 1 protein-coding 321.333-17 chr12 106003202 106003610 + 1 NA Intergenic Intergenic 136627 NM_014840 9891 Hs.524692 NM_014840 ENSG00000074590 NUAK1 ARK5 NUAK family kinase 1 protein-coding 159.333-293 chr6 133720134 133720432 + 1 NA intron (NR_109982, intron 4 of 8) L2a|LINE|L2 -100864 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 145.667-180 chr3 107658391 107658640 + 1 NA intron (NM_001276286, intron 3 of 16) intron (NM_001276286, intron 3 of 16) 135553 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 146.667-314 chr7 86115260 86115465 + 1 NA Intergenic Intergenic -528547 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 145.333-81 chr14 50609776 50610022 + 1 NA intron (NM_015915, intron 6 of 13) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 49874 NM_181598 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 148.667-208 chr2 174943848 174944082 + 1 NA intron (NM_001025201, intron 4 of 12) L1MC4a|LINE|L1 61288 NM_001822 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 203.333-96 chr16 11365435 11365772 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 20144 NM_152308 116028 Hs.347524 NM_152308 ENSG00000175643 RMI2 BLAP18|C16orf75 RecQ mediated genome instability 2 protein-coding 175.333-118 chr3 56801512 56801714 + 1 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 336 NM_019555 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 229.333-128 chrX 96194107 96194500 + 1 NA Intergenic Intergenic 143599 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 172.667-99 chr3 105736665 105736961 + 1 NA intron (NR_135809, intron 8 of 18) intron (NR_135809, intron 8 of 18) 130778 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 145.333-29 chr10 31840241 31840409 + 1 NA intron (NM_001270695, intron 7 of 18) intron (NM_001270695, intron 7 of 18) 68601 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 126.667-77 chr2 70016291 70016454 + 1 NA intron (NR_033872, intron 7 of 10) AluJo|SINE|Alu -54107 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 153.333-423 chr8 112151415 112151600 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -491986 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 128.667-107 chr21 24127396 24127538 + 1 NA Intergenic Intergenic 193910 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 394.333-19 chr7 48973612 48974082 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 49300 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 138.667-155 chr4 127908637 127908888 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 27518 NM_001190801 10733 Hs.172052 NM_014264 ENSG00000142731 PLK4 MCCRP2|SAK|STK18 polo like kinase 4 protein-coding 182.667-153 chr7 31257059 31257318 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 83538 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 123.333-184 chr6 50011607 50011797 + 1 NA intron (NM_001037728, intron 1 of 1) intron (NM_001037728, intron 1 of 1) 10279 NM_001037728 245913 Hs.571093 NM_001037497 ENSG00000203970 DEFB110 DEFB-10|DEFB-11|DEFB111 defensin beta 110 protein-coding 148.667-113 chr14 43790181 43790329 + 1 NA Intergenic Intergenic 717028 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 143.667-168 chr3 139682137 139682372 + 1 NA Intergenic Intergenic -4204 NM_001320511 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 157.333-369 chr9 123807546 123807749 + 1 NA intron (NM_001352968, intron 2 of 18) L2b|LINE|L2 122479 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 147.667-304 chr6 16669214 16669395 + 1 NA intron (NM_000332, intron 3 of 8) intron (NM_000332, intron 3 of 8) 90880 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 152.333-259 chr4 14051304 14051465 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -60584 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 354.667-4 chr10 32668949 32669455 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 22 of 43) L1MA8|LINE|L1 223062 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 201.333-124 chr17 18876657 18876939 + 1 NA intron (NM_001353099, intron 5 of 11) L2a|LINE|L2 11329 NM_001243940 5636 Hs.632236 NM_002767 ENSG00000141127 PRPSAP2 PAP41 phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 2 protein-coding 156.667-260 chr5 14358629 14358791 + 1 NA intron (NM_007118, intron 12 of 56) intron (NM_007118, intron 12 of 56) -105273 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 349.667 chr10 11604329 11604754 + 1 NA intron (NM_014688, intron 1 of 14) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -6760 NR_160647 107984208 Hs.590986 NR_160647 LOC107984208 - uncharacterized LOC107984208 ncRNA 149.667-217 chr2 148439811 148440006 + 1 NA intron (NM_018328, intron 5 of 14) AluJr4|SINE|Alu -204843 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 131.333-158 chr6 115091762 115091916 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 551996 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 236.667-20 chr12 58300659 58300972 + 1 NA Intergenic Intergenic 212923 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 139.667-17 chr1 247556238 247556441 + 1 NA intron (NM_001281835, intron 3 of 5) intron (NM_001281835, intron 3 of 5) 7205 NM_145278 148823 Hs.732113 NM_145278 ENSG00000169224 GCSAML C1orf150 germinal center associated signaling and motility like protein-coding 206.667-119 chr5 180743498 180743885 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -3633 NM_001001657 134083 Hs.554719 NM_001001657 ENSG00000174339 OR2Y1 OR5-2 olfactory receptor family 2 subfamily Y member 1 protein-coding 248.333-98 chr7 140737997 140738490 + 1 NA intron (NR_148928, intron 17 of 17) intron (NR_148928, intron 17 of 17) -41166 NR_024454 100134713 Hs.534141 NR_024454 ENSG00000240889 NDUFB2-AS1 - NDUFB2 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-119 chr14 59022245 59022411 + 1 NA Intergenic Intergenic -166339 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 371.667 chr11 68839525 68840083 + 1 NA intron (NM_001031847, intron 1 of 18) CpG 2112 NM_001876 1374 Hs.503043 NM_001876 ENSG00000110090 CPT1A CPT1|CPT1-L|L-CPT1 carnitine palmitoyltransferase 1A protein-coding 280.333-2 chr1 173281733 173282278 + 1 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) L1MA4|LINE|L1 -74674 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 149.333-4 chr1 33917133 33917400 + 1 NA intron (NM_052896, intron 5 of 69) intron (NM_052896, intron 5 of 69) 48310 NR_038372 402779 Hs.666207 NR_038372 ENSG00000231163 CSMD2-AS1 - CSMD2 antisense RNA 1 ncRNA 190.667-55 chr17 58237377 58237575 + 1 NA promoter-TSS (NM_001160102) promoter-TSS (NM_001160102) -950 NM_001160102 4025 Hs.234742 NM_006151 ENSG00000167419 LPO SPO lactoperoxidase protein-coding 330.333-4 chr10 71726537 71727126 + 1 NA intron (NM_022124, intron 29 of 67) intron (NM_022124, intron 29 of 67) -7053 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 155.667-389 chr9 96768870 96769030 + 1 NA intron (NM_001314060, intron 2 of 4) L1MB7|LINE|L1 9137 NM_001314059 22869 Hs.75264 NM_014930 ENSG00000081386 ZNF510 - zinc finger protein 510 protein-coding 146.333-221 chr3 162029512 162029711 + 1 NA Intergenic Intergenic 532803 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 201.667-117 chr8 52661444 52661754 + 1 NA exon (NM_014781, exon 9 of 24) exon (NM_014781, exon 9 of 24) 52836 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 316.333-22 chr5 39376028 39376468 + 1 NA intron (NM_001343, intron 12 of 14) intron (NM_001343, intron 12 of 14) -11753 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 151.667-182 chr2 216004599 216004750 + 1 NA intron (NM_018000, intron 1 of 4) intron (NM_018000, intron 1 of 4) 8877 NM_018000 55686 Hs.620391 NM_018000 ENSG00000118242 MREG DSU|WDT2 melanoregulin protein-coding 213.667-75 chr5 66970248 66970598 + 1 NA intron (NM_001290226, intron 1 of 26) intron (NM_001290226, intron 1 of 26) 11350 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 259.333-37 chr15 101104669 101105136 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 147146 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 212.667-57 chr17 57918300 57918737 + 1 NA intron (NM_001271875, intron 1 of 10) intron (NM_001271875, intron 1 of 10) -15129 NM_001292025 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 167.667-89 chr17 78338255 78338430 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 21737 NM_003955 9021 Hs.527973 NM_003955 ENSG00000184557 SOCS3 ATOD4|CIS3|Cish3|SOCS-3|SSI-3|SSI3 suppressor of cytokine signaling 3 protein-coding 252.333-28 chr19 51819966 51820428 + 1 NA intron (NR_163433, intron 9 of 11) intron (NR_163433, intron 9 of 11) 25040 NM_002030 2359 Hs.445466 NM_002030 ENSG00000187474 FPR3 FML2_HUMAN|FMLP-R-II|FMLPY|FPRH1|FPRH2|FPRL2|RMLP-R-I formyl peptide receptor 3 protein-coding 169.333-217 chr5 163694882 163695068 + 1 NA Intergenic Intergenic 189356 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 146.667-271 chr5 162860359 162860668 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -577058 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 171.667-111 chr3 50076871 50077151 + 1 NA exon (NM_005777, exon 21 of 21) exon (NM_005777, exon 21 of 21) -11908 NR_036627 10181 Hs.439480 NM_005778 ENSG00000003756 RBM5 G15|H37|LUCA-15|LUCA15|RMB5 RNA binding motif protein 5 protein-coding 130.333-106 chr2 111084654 111084847 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) L1PREC2|LINE|L1 30838 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 154.333-88 chr14 52760383 52760618 + 1 NA intron (NM_001130701, intron 10 of 11) intron (NM_001130701, intron 10 of 11) 30334 NM_145251 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 220.333-82 chr22 25269319 25269668 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -48764 NR_029395 91353 Hs.651077 NM_001013618 IGLL3P 16.1|IGLL3 immunoglobulin lambda like polypeptide 3, pseudogene pseudo 154.333-87 chr14 51382823 51383016 + 1 NA Intergenic Intergenic 14216 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 128.333-98 chr2 52637559 52637721 + 1 NA Intergenic Intergenic 64975 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 190.333-23 chr10 115774149 115774421 + 1 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) AluSx1|SINE|Alu 420504 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 153.667-399 chr8 143193179 143193348 + 1 NA Intergenic Intergenic -19955 NM_001301772 338328 Hs.426410 NM_178172 ENSG00000277494 GPIHBP1 GPI-HBP1|HYPL1D glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1 protein-coding 230.333-2 chr1 72023424 72023729 + 1 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) -186564 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 157.333-40 chr10 116380 116552 + 1 NA Intergenic Intergenic -13622 NM_001370103 10771 Hs.292265 NM_006624 ENSG00000015171 ZMYND11 BRAM1|BS69|MRD30 zinc finger MYND-type containing 11 protein-coding 158.667-312 chr7 113466167 113466444 + 1 NA Intergenic Intergenic -347723 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 210.667-128 chr8 85994096 85994405 + 1 NA Intergenic Intergenic 75418 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 176.333-171 chr8 124897627 124897970 + 1 NA Intergenic Intergenic -44210 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 149.333-27 chr1 181052218 181052368 + 1 NA exon (NM_001194999, exon 5 of 7) exon (NM_001194999, exon 5 of 7) 18868 NM_001310213 3140 Hs.13500 NM_001531 ENSG00000153029 MR1 HLALS major histocompatibility complex, class I-related protein-coding 180.667-87 chr21 31705889 31706184 + 1 NA intron (NM_020706, intron 2 of 19) AluSz6|SINE|Alu 26082 NM_020706 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 179.333-109 chr2 235022799 235023041 + 1 NA intron (NM_001371304, intron 2 of 5) intron (NM_001371304, intron 2 of 5) -4815 NM_001371306 160.333-283 chr8 111797450 111797640 + 1 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL 420906 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 227.667-25 chr16 71679435 71679827 + 1 NA intron (NM_015020, intron 6 of 18) intron (NM_015020, intron 6 of 18) 19070 NR_033337 100379141 Hs.725116 NR_033337 ENSG00000263666 SNORA70D U70D small nucleolar RNA, H/ACA box 70D snoRNA 159.667-165 chr2 42462600 42462795 + 1 NA intron (NM_172344, intron 1 of 1) AluSz6|SINE|Alu 31285 NM_133329 170850 Hs.352633 NM_133329 ENSG00000171126 KCNG3 KV10.1|KV6.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 3 protein-coding 121.667-203 chr8 92568146 92568400 + 1 NA intron (NR_125827, intron 4 of 4) intron (NR_125827, intron 4 of 4) 87221 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 228.333-60 chr3 22264233 22264609 + 1 NA Intergenic Intergenic 307282 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 274.667-32 chr20 50388995 50389305 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -67808 NR_109950 101927586 Hs.637665 NR_109950 ENSG00000233077 LINC01271 - long intergenic non-protein coding RNA 1271 ncRNA 143.667-35 chr11 13440013 13440157 + 1 NA 5' UTR (NM_001297742, exon 1 of 8) 5' UTR (NM_001297742, exon 1 of 8) 194 NM_001297742 84280 Hs.332382 NM_032320 ENSG00000148925 BTBD10 GMRP-1|GMRP1 BTB domain containing 10 protein-coding 161.333-78 chr13 69982482 69982752 + 1 NA intron (NM_020866, intron 1 of 10) L1MA6|LINE|L1 -124596 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 159.333-194 chr21 18234534 18234722 + 1 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -10205 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 177.667-23 chr10 90904952 90905203 + 1 NA intron (NM_001104546, intron 13 of 13) intron (NM_001104546, intron 13 of 13) 16198 NM_014391 27063 Hs.448589 NM_014391 ENSG00000148677 ANKRD1 ALRP|C-193|CARP|CVARP|MCARP|bA320F15.2 ankyrin repeat domain 1 protein-coding 168.333-71 chr17 35288577 35288844 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 45638 NM_001330183 162394 Hs.585792 NM_144975 ENSG00000166750 SLFN5 - schlafen family member 5 protein-coding 203.667-135 chr9 38257281 38257659 + 1 NA Intergenic Intergenic -135232 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 143.333-205 chr4 61309687 61309860 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 107601 NM_001371342 309.333-9 chr10 88472461 88472947 + 1 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) MER5A|DNA|hAT-Charlie 110614 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 209.333-177 chr4 110979512 110979817 + 1 NA Intergenic Intergenic -119017 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 147.333-231 chr4 24956860 24957108 + 1 NA intron (NM_173463, intron 1 of 12) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 23220 NM_173463 91050 Hs.106432 NM_173463 ENSG00000181982 CCDC149 - coiled-coil domain containing 149 protein-coding 152.667-57 chr11 37381115 37381276 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -557406 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 189.667-115 chr5 66726878 66727144 + 1 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 -101762 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 159.667-262 chr5 95663149 95663347 + 1 NA intron (NR_125328, intron 4 of 7) L1ME3A|LINE|L1 16369 NM_001131065 317671 Hs.399758 NM_173362 ENSG00000175449 RFESD - Rieske Fe-S domain containing protein-coding 149.667-267 chr3 132706503 132706676 + 1 NA intron (NR_037804, intron 7 of 44) intron (NR_037804, intron 7 of 44) -15161 NR_152743 348808 Hs.586111 NR_002811 ENSG00000248724 NPHP3-AS1 NCRNA00119 NPHP3 antisense RNA 1 ncRNA 145.667-99 chr15 82900449 82900739 + 1 NA intron (NM_004839, intron 1 of 8) L1M5|LINE|L1 52126 NM_004839 9455 Hs.578443 NM_004839 ENSG00000103942 HOMER2 ACPD|CPD|DFNA68|HOMER-2|VESL-2 homer scaffold protein 2 protein-coding 192.667-48 chr12 30426714 30426967 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 250404 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 214.667-112 chr8 28705845 28706205 + 1 NA intron (NR_073468, intron 1 of 4) L1ME4a|LINE|L1 4524 NR_073469 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 147.333-261 chr5 56355370 56355520 + 1 NA Intergenic Intergenic -122115 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 140.667-151 chr3 130777037 130777225 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -30302 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 151.667-6 chr1 62649040 62649291 + 1 NA intron (NM_001367561, intron 4 of 49) intron (NM_001367561, intron 4 of 49) 39203 NM_033407 85440 Hs.744927 NM_033407 ENSG00000116641 DOCK7 EIEE23|ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 protein-coding 229.667-79 chr8 105498227 105498533 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 178837 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 192.667-137 chr5 94755731 94755970 + 1 NA intron (NM_001297777, intron 16 of 19) L2c|LINE|L2 137181 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 236.333-96 chr9 104474481 104474762 + 1 NA Intergenic Intergenic -29642 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 169.333-77 chr14 55908480 55908713 + 1 NA Intergenic Intergenic -111922 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 300.333-22 chr2 49642391 49642971 + 1 NA Intergenic Intergenic 331522 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 192.667-148 chr6 54136117 54136390 + 1 NA intron (NM_138569, intron 3 of 12) intron (NM_138569, intron 3 of 12) 24810 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 147.333-76 chr12 10388949 10389148 + 1 NA intron (NM_001199805, intron 6 of 12) intron (NM_001199805, intron 6 of 12) 993 NM_007360 22914 Hs.387787 NM_007360 ENSG00000213809 KLRK1 CD314|D12S2489E|KLR|NKG2-D|NKG2D killer cell lectin like receptor K1 protein-coding 150.333-97 chr13 104969234 104969477 + 1 NA Intergenic Intergenic -496512 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 187.333-110 chr2 185886780 185887057 + 1 NA Intergenic Intergenic -86767 NR_144454 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 213.333-197 chr7 101679681 101680120 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -50604 NM_138403 93408 Hs.247831 NM_138403 ENSG00000106436 MYL10 MYLC2PL|PLRLC myosin light chain 10 protein-coding 240.333-46 chr18 38891294 38891580 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 730738 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 198.333-178 chr6 74253516 74253845 + 1 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) intron (NR_110856, intron 1 of 3) 184229 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 479.333-2 chr12 64854668 64855334 + 1 NA intron (NM_001364838, intron 8 of 11) L1M1|LINE|L1 -28773 NR_033988 400046 Hs.591032 NR_033988 ENSG00000255693 LINC02389 - long intergenic non-protein coding RNA 2389 ncRNA 162.333-125 chr2 162970558 162970740 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -131882 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 202.667-91 chr21 29038861 29039162 + 1 NA intron (NM_001032410, intron 8 of 18) intron (NM_001032410, intron 8 of 18) 14343 NM_006447 10600 Hs.99819 NM_006447 ENSG00000156256 USP16 UBP-M|UBPM ubiquitin specific peptidase 16 protein-coding 150.333-311 chr4 112368153 112368374 + 1 NA intron (NM_001102406, intron 2 of 15) (AATTTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 70894 NM_025144 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 161.667-194 chr4 148551053 148551221 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -106439 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 242.667-42 chr16 89808251 89808688 + 1 NA intron (NM_001351830, intron 4 of 9) intron (NM_001351830, intron 4 of 9) 8178 NM_001286167 2175 Hs.744083 NM_000135 ENSG00000187741 FANCA FA|FA-H|FA1|FAA|FACA|FAH|FANCH FA complementation group A protein-coding 161.667-196 chr5 15215705 15215953 + 1 NA intron (NR_109944, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 50731 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 223.333-164 chr8 55831729 55832053 + 1 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -47944 NM_001111097 4067 Hs.491767 NM_002350 ENSG00000254087 LYN JTK8|p53Lyn|p56Lyn LYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 158.667-326 chr8 111946823 111946987 + 1 NA Intergenic Intergenic 570266 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 250.667-22 chr14 78376114 78376596 + 1 NA intron (NR_073547, intron 4 of 20) MER102c|DNA|hAT-Charlie -27364 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 147.667-170 chr2 61331817 61332096 + 1 NA intron (NM_014709, intron 19 of 79) intron (NM_014709, intron 19 of 79) 85421 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 153.667-209 chr2 205475213 205475396 + 1 NA intron (NM_057177, intron 19 of 21) intron (NM_057177, intron 19 of 21) -207196 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 188.667-67 chr2 12789138 12789470 + 1 NA Intergenic Intergenic 51937 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 156.333-160 chr19 28700702 28701042 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 26822 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 163.667-249 chr8 99102141 99102417 + 1 NA intron (NR_047582, intron 5 of 8) (TTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 89013 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 158.333-293 chr7 30255936 30256156 + 1 NA intron (NR_136267, intron 2 of 3) intron (NR_136267, intron 2 of 3) -28551 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 193.667-150 chrX 64177448 64177803 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 28083 NM_152424 139285 Hs.314225 NM_152424 ENSG00000184675 AMER1 FAM123B|OSCS|WTX APC membrane recruitment protein 1 protein-coding 166.667-39 chr11 38153580 38153878 + 1 NA Intergenic Intergenic 215128 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 143.667-236 chr7 68956621 68956904 + 1 NA Intergenic Intergenic 640862 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 217.667-23 chr11 111846702 111847059 + 1 NA intron (NR_147984, intron 8 of 15) intron (NR_147984, intron 8 of 15) 24401 NM_001352415 79796 Hs.745155 NM_024740 ENSG00000086848 ALG9 CDG1L|DIBD1|GIKANIS|LOH11CR1J ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferase protein-coding 149.667-396 chr8 83159055 83159241 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -244610 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 125.333-91 chr2 53817549 53817713 + 1 NA intron (NM_015701, intron 13 of 13) intron (NM_015701, intron 13 of 13) 30587 NM_015701 27248 Hs.438336 NM_015701 ENSG00000068912 ERLEC1 C2orf30|CIM|CL24936|CL25084|HEL117|XTP3-B|XTP3TPB endoplasmic reticulum lectin 1 protein-coding 291.333-30 chr17 62632575 62633026 + 1 NA intron (NM_006039, intron 1 of 29) intron (NM_006039, intron 1 of 29) 5130 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 240.333-94 chr8 83008166 83008463 + 1 NA Intergenic Intergenic 96210 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 163.333-218 chr5 50189773 50189964 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 251420 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 332.333-4 chr1 218302765 218303231 + 1 NA intron (NM_016052, intron 2 of 4) intron (NM_016052, intron 2 of 4) 17705 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 198.667-15 chr1 236913685 236913988 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 90605 NM_001276687 645745 Hs.632513 NM_001039954 ENSG00000244020 MT1HL1 MT1P2 metallothionein 1H like 1 protein-coding 172.333-141 chr5 81939721 81939898 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -32214 NM_031482 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 131.333-156 chr6 65100515 65100742 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) (TTTGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -200790 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 177.333-5 chr1 50748927 50749137 + 1 NA intron (NM_007051, intron 4 of 18) intron (NM_007051, intron 4 of 18) 211235 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 163.333-280 chr8 73326572 73326771 + 1 NA intron (NR_125388, intron 3 of 5) intron (NR_125388, intron 3 of 5) 29790 NR_125388 101926926 Hs.640090 NR_125388 ENSG00000250295 RDH10-AS1 - RDH10 antisense RNA 1 ncRNA 202.333-38 chr11 84096419 84096788 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 10 of 27) intron (NM_001142699, intron 10 of 27) 176677 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 132.667-84 chr2 65464166 65464357 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -31662 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 141.667-210 chr7 64751758 64751899 + 1 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 -42600 NM_001160183 7697 Hs.184080 NM_006524 ENSG00000197008 ZNF138 pHZ-32 zinc finger protein 138 protein-coding 182.667-156 chr8 18401263 18401460 + 1 NA TTS (NM_000015) TTS (NM_000015) 10079 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 130.667-139 chr3 22392157 22392410 + 1 NA Intergenic Intergenic 435144 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 281.667-6 chr10 32339233 32339723 + 1 NA intron (NM_001282391, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu 7680 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 184.667-78 chr3 34605506 34605789 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 788376 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 178.667-86 chr2 182961965 182962282 + 1 NA intron (NM_013436, intron 18 of 30) intron (NM_013436, intron 18 of 30) 76334 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 155.333-22 chr10 28709007 28709276 + 1 NA Intergenic Intergenic 31620 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 139.667-156 chr5 145066466 145066646 + 1 NA Intergenic Intergenic 768786 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 160.667-137 chr2 26746669 26746866 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -17517 NM_017877 54978 Hs.1594 NM_017877 ENSG00000213699 SLC35F6 ANT2BP|C2orf18|TANGO9 solute carrier family 35 member F6 protein-coding 157.333-355 chr9 12704837 12705056 + 1 NA intron (NM_000550, intron 6 of 7) intron (NM_000550, intron 6 of 7) 11561 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 167.667-184 chr6 78574732 78574977 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -35545 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 225.667-37 chr2 46380126 46380563 + 1 NA exon (NM_001430, exon 12 of 16) exon (NM_001430, exon 12 of 16) 13823 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 170.333-141 chr3 99011441 99011693 + 1 NA Intergenic Intergenic -109872 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 200.667-88 chr2 195049504 195049913 + 1 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 319113 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 217.667-44 chr2 64844723 64845081 + 1 NA Intergenic Intergenic 18729 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 157.667-159 chr2 209314411 209314598 + 1 NA Intergenic Intergenic -109543 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 155.667-210 chr22 47769365 47769596 + 1 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) AluY|SINE|Alu 137806 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 122.667-91 chr2 76870217 76870364 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -115675 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 119.667-56 chr15 70783968 70784176 + 1 NA Intergenic Intergenic -20514 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 147.333-295 chr7 38425871 38426160 + 1 NA intron (NM_001635, intron 15 of 20) intron (NM_001635, intron 15 of 20) 84438 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 209.667-45 chr14 64321374 64321761 + 1 NA intron (NM_001291712, intron 2 of 13) L1ME5|LINE|L1 16983 NM_001291723 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 159.667-128 chr17 508786 508960 + 1 NA 3' UTR (NM_001128159, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_001128159, exon 22 of 22) -62933 NM_182705 359845 Hs.345588 NM_182705 ENSG00000183688 RFLNB CFM1|FAM101B refilin B protein-coding 169.333-197 chr5 11105453 11105666 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 13 of 20) intron (NM_001288715, intron 13 of 20) -344325 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 256.333-69 chr6 46333972 46334387 + 1 NA intron (NR_125838, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 -8287 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 124.667-135 chr3 58502928 58503083 + 1 NA TTS (NM_001128214) TTS (NM_001128214) 4640 NM_153331 200845 Hs.13982 NM_153331 ENSG00000168301 KCTD6 KCASH3 potassium channel tetramerization domain containing 6 protein-coding 165.333-111 chr18 3930237 3930621 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -31924 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 153.333-10 chr1 65471109 65471333 + 1 NA intron (NM_001003679, intron 2 of 19) L2b|LINE|L2 50505 NM_001198681 54741 Hs.23581 NM_017526 ENSG00000213625 LEPROT LEPR|OB-RGRP|OBRGRP|VPS55 leptin receptor overlapping transcript protein-coding 286.333-22 chr2 137146030 137146385 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 5 of 27) intron (NM_001316349, intron 5 of 27) 380662 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 203.667-67 chr20 53548624 53548977 + 1 NA Intergenic Intergenic -3970 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 157.333-218 chr21 18790425 18790657 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -30729 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 177.667-34 chr12 24956426 24956772 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7498 NM_001178091 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 161.667-244 chr8 32889319 32889558 + 1 NA Intergenic Intergenic 167603 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 172.667-78 chr2 30221779 30222028 + 1 NA Intergenic Intergenic -9631 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 242.667-36 chr15 69962899 69963301 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 116368 NR_030714 693214 NR_030714 ENSG00000207965 MIR629 MIRN629|hsa-mir-629|mir-629 microRNA 629 ncRNA 148.333-39 chr10 11968224 11968410 + 1 NA intron (NM_080599, intron 9 of 21) intron (NM_080599, intron 9 of 21) -73607 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 192.333-109 chr22 27360515 27360852 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 50032 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 128.333-35 chr11 27817646 27817900 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -95743 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 189.333-11 chr1 91140252 91140549 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -118145 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 127.333-3 chr1 76311100 76311239 + 1 NA intron (NM_001349111, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 236423 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 190.333-82 chr20 33259187 33259394 + 1 NA Intergenic Intergenic 23294 NM_130852 51297 Hs.211092 NM_016583 ENSG00000198183 BPIFA1 LUNX|NASG|PLUNC|SPLUNC1|SPURT|bA49G10.5 BPI fold containing family A member 1 protein-coding 165.333-120 chr2 30528775 30529055 + 1 NA intron (NM_182551, intron 3 of 6) intron (NM_182551, intron 3 of 6) 81669 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 203.667-14 chr10 103963898 103964211 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3086 NM_014720 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 158.333-12 chr1 100447690 100447862 + 1 NA intron (NM_001319212, intron 7 of 13) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -90363 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 255.667-28 chr15 77476942 77477520 + 1 NA intron (NM_001304505, intron 6 of 9) intron (NM_001304505, intron 6 of 9) -48364 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 152.333-165 chr2 21918959 21919139 + 1 NA Intergenic Intergenic -208397 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 171.667-132 chr5 66158881 66159079 + 1 NA intron (NM_139168, intron 3 of 12) intron (NM_139168, intron 3 of 12) 14145 NM_139168 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 128.333-84 chr18 5423920 5424108 + 1 NA intron (NM_001281535, intron 12 of 21) intron (NM_001281535, intron 12 of 21) 116542 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 149.333-365 chr7 23526491 23526739 + 1 NA intron (NM_001282757, intron 1 of 8) intron (NM_001282757, intron 1 of 8) 5366 NM_013293 29896 Hs.445652 NM_013293 ENSG00000164548 TRA2A AWMS1|HSU53209 transformer 2 alpha homolog protein-coding 255.333-100 chr7 111292771 111293125 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 201821 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 273.333-73 chr8 139281421 139281894 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -367616 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 201.333-275 chr8 29001617 29001838 + 1 NA intron (NM_001324384, intron 4 of 10) L1ME2|LINE|L1 110413 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 363.333-2 chr10 62920152 62920707 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -101262 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 156.667-221 chr3 35985283 35985531 + 1 NA Intergenic Intergenic 240931 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 159.667-52 chr10 85051286 85051552 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 147486 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 182.333-32 chr12 59303274 59303512 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -292636 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 192.333-131 chr4 107040870 107041184 + 1 NA Intergenic Intergenic -4714 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 218.333-4 chr1 92198727 92199062 + 1 NA Intergenic Intergenic -19021 NM_001012425 388649 Hs.558823 NM_001012425 ENSG00000203910 C1orf146 - chromosome 1 open reading frame 146 protein-coding 149.667-193 chr2 48613030 48613226 + 1 NA intron (NM_172311, intron 3 of 10) AluJo|SINE|Alu -4652 NM_001193487 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 260.667-23 chr15 63516499 63516903 + 1 NA intron (NM_001256702, intron 1 of 13) HAL1|LINE|L1 12108 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 219.333-149 chr6 9700947 9701390 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -703334 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 265.667-53 chr4 71689267 71689727 + 1 NA Intergenic Intergenic 94582 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 245.333-43 chr14 81946848 81947131 + 1 NA Intergenic Intergenic -203851 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 242.667-56 chr2 195121753 195122074 + 1 NA Intergenic Intergenic 391318 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 223.667-60 chr4 135213427 135213769 + 1 NA Intergenic Intergenic -90039 NR_147187 105377439 Hs.570727 NR_147187 LINC02485 - long intergenic non-protein coding RNA 2485 ncRNA 197.333-178 chr5 28524864 28525137 + 1 NA Intergenic Intergenic -237335 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 192.667-130 chr4 114450617 114450907 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -147640 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 239.667-82 chrX 115261054 115261359 + 1 NA Intergenic LTR1D1|LTR|ERV1 -27110 NM_020871 57631 Hs.65366 NM_020871 ENSG00000130224 LRCH2 dA204F4.4 leucine rich repeats and calponin homology domain containing 2 protein-coding 321.667-17 chr5 105283998 105284364 + 1 NA Intergenic Intergenic 184707 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 207.333-89 chr14 57290531 57290901 + 1 NA non-coding (NR_026895, exon 7 of 7) non-coding (NR_026895, exon 7 of 7) 21745 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 154.667-158 chr19 51956305 51956538 + 1 NA intron (NR_103847, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 7287 NR_103847 101669766 Hs.637744 NR_103847 ENSG00000269235 ZNF350-AS1 HCCAT3|uc002pyc ZNF350 antisense RNA 1 ncRNA 135.667-93 chr2 81705553 81705796 + 1 NA Intergenic Intergenic -238728 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 115.333-88 chr16 70594317 70594532 + 1 NA intron (NM_152456, intron 1 of 6) L1ME4b|LINE|L1 14525 NM_001172771 146433 Hs.461214 NM_152456 ENSG00000157368 IL34 C16orf77|IL-34 interleukin 34 protein-coding 132.667-104 chr3 30987970 30988281 + 1 NA Intergenic Intergenic -93464 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 134.667-14 chr10 15385662 15385808 + 1 NA Intergenic Intergenic -14446 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 138.667-7 chr1 165154149 165154381 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 201976 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 149.667-44 chr1 237687545 237687782 + 1 NA intron (NM_001035, intron 63 of 104) intron (NM_001035, intron 63 of 104) -174512 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 154.667-390 chr8 94908723 94908888 + 1 NA intron (NM_001354534, intron 1 of 8) MIRc|SINE|MIR 13006 NR_148906 137682 Hs.435500 NM_152416 ENSG00000156170 NDUFAF6 C8orf38|MC1DN17 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6 protein-coding 156.333-169 chr2 20828313 20828549 + 1 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -5301 NM_001282719 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 163.333-29 chr10 18822407 18822658 + 1 NA Intergenic Intergenic 163101 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 156.667-255 chr4 148408149 148408391 + 1 NA intron (NM_000901, intron 2 of 8) intron (NM_000901, intron 2 of 8) 34144 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 142.333-59 chr12 46480451 46480599 + 1 NA intron (NR_125380, intron 3 of 3) intron (NR_125380, intron 3 of 3) 96418 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 133.333-202 chrX 11430247 11430439 + 1 NA intron (NR_109776, intron 1 of 14) intron (NR_109776, intron 1 of 14) -2525 NM_001287242 395 Hs.435291 NM_001174 ENSG00000047648 ARHGAP6 RHOGAP6|RHOGAPX-1 Rho GTPase activating protein 6 protein-coding 249.667-50 chr2 228292293 228292851 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -110885 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 148.667-32 chr1 239358977 239359186 + 1 NA Intergenic Intergenic -27487 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 153.333-384 chr7 54718299 54718511 + 1 NA Intergenic Intergenic 40806 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 222.333-64 chr3 103925833 103926163 + 1 NA Intergenic Intergenic -401882 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 121.333-70 chr17 57173503 57173654 + 1 NA Intergenic Intergenic 78089 NM_001370427 8165 Hs.463506 NM_003488 ENSG00000121057 AKAP1 AKAP|AKAP121|AKAP149|AKAP84|D-AKAP1|PPP1R43|PRKA1|SAKAP84|TDRD17 A-kinase anchoring protein 1 protein-coding 231.333-128 chrX 18266566 18266925 + 1 NA intron (NR_033717, intron 7 of 15) intron (NR_033717, intron 7 of 15) -45841 NM_001184767 139105 Hs.403802 NM_153346 ENSG00000177324 BEND2 CXorf20 BEN domain containing 2 protein-coding 160.333-157 chr2 197252844 197253062 + 1 NA intron (NR_046837, intron 5 of 5) intron (NR_046837, intron 5 of 5) 49566 NR_046837 101927547 Hs.687027 NR_046837 ENSG00000236977 ANKRD44-IT1 - ANKRD44 intronic transcript 1 ncRNA 113.333-165 chr3 2494667 2494818 + 1 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) MER4D|LTR|ERV1 255913 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 375.333-20 chr4 45857086 45857564 + 1 NA Intergenic Intergenic 266729 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 211.333-221 chr7 37100664 37100912 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 14 of 21) intron (NM_001206480, intron 14 of 21) 102992 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 228.667-44 chr2 123939833 123940223 + 1 NA Intergenic Intergenic 85146 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 148.333-335 chr6 555638 555815 + 1 NA intron (NM_018303, intron 19 of 27) intron (NM_018303, intron 19 of 27) 101238 NM_148959 135458 Hs.669039 NM_148959 ENSG00000188996 HUS1B - HUS1 checkpoint clamp component B protein-coding 187.667-96 chr3 120012912 120013259 + 1 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 71563 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 148.333-189 chr2 81448132 81448283 + 1 NA Intergenic Intergenic 18739 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 215.667-115 chr7 43420652 43420898 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 7 of 27) L1M5|LINE|L1 101767 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 158.667-20 chr1 168143647 168143836 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -6074 NM_001267609 23432 Hs.271809 NM_007369 ENSG00000143147 GPR161 RE2 G protein-coupled receptor 161 protein-coding 168.333-113 chr2 238789797 238790071 + 1 NA Intergenic Intergenic 57973 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 152.333-336 chr6 74568747 74568899 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 499372 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 228.667-81 chr8 114261520 114261897 + 1 NA Intergenic LTR10F|LTR|ERV1 -824769 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 132.333-91 chr2 155827027 155827203 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 427816 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 141.667-189 chr5 175225408 175225620 + 1 NA Intergenic Intergenic 218668 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 246.667-78 chr6 66402887 66403225 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 615177 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 160.333-21 chr1 118138235 118138417 + 1 NA intron (NM_206996, intron 3 of 48) L2c|LINE|L2 46902 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 379.667 chr10 14890040 14890675 + 1 NA intron (NM_001193427, intron 2 of 5) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 11457 NM_024670 79723 Hs.554883 NM_024670 ENSG00000152455 SUV39H2 KMT1B suppressor of variegation 3-9 homolog 2 protein-coding 284.333-27 chr2 241378243 241378881 + 1 NA intron (NM_014808, intron 2 of 26) AluJb|SINE|Alu 22277 NM_001282983 9855 Hs.726316 NM_014808 ENSG00000006607 FARP2 FIR|FRG|PLEKHC3 FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 protein-coding 220.667-81 chr5 40465223 40465580 + 1 NA Intergenic Intergenic -214514 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 172.333-77 chr19 35193269 35193524 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 35329 NM_152481 148109 Hs.128069 NM_152481 ENSG00000177558 FAM187B TMEM162 family with sequence similarity 187 member B protein-coding 149.333-46 chr10 53753118 53753325 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -733009 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 144.333-42 chr11 103752141 103752373 + 1 NA Intergenic Intergenic -97649 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 208.667-98 chr4 47797294 47797568 + 1 NA intron (NM_006587, intron 2 of 21) intron (NM_006587, intron 2 of 21) -33914 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 122.333-183 chr6 44424322 44424495 + 1 NA intron (NM_001253, intron 10 of 15) intron (NM_001253, intron 10 of 15) -11233 NR_039785 100616352 NR_039785 ENSG00000266619 MIR4642 - microRNA 4642 ncRNA 123.667-168 chr6 95549846 95549977 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 27540 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 153.333-365 chr6 77774447 77774643 + 1 NA intron (NM_001282136, intron 3 of 4) intron (NM_001282136, intron 3 of 4) 121506 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 223.667-47 chr3 95332375 95332764 + 1 NA Intergenic Intergenic 350624 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 173.667-96 chr20 18136779 18136961 + 1 NA promoter-TSS (NM_001164811) promoter-TSS (NM_001164811) -993 NM_001164811 100303755 Hs.488051 NM_001164811 ENSG00000232838 PET117 CSRP2BP PET117 cytochrome c oxidase chaperone protein-coding 180.333-51 chr18 75146816 75147063 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 58574 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 189.333-121 chr22 38853517 38853803 + 1 NA Intergenic Intergenic -9632 NM_014293 23467 Hs.91622 NM_014293 ENSG00000221890 NPTXR NPR neuronal pentraxin receptor protein-coding 184.667-118 chr6 131346433 131346633 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 96129 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 156.667-238 chr4 34244487 34244783 + 1 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 25112 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 147.667-346 chr7 109518549 109518816 + 1 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 441531 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 276.334-6 chr15 68089859 68090455 + 1 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) AluSz|SINE|Alu 35581 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 155.333-115 chr15 33640491 33640716 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 27 of 102) intron (NM_001243996, intron 27 of 102) -327894 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 194.667-11 chr1 174104687 174105018 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 54435 NR_121197 102724601 Hs.563791 NR_121197 ENSG00000227373 RABGAP1L-DT - RABGAP1L divergent transcript ncRNA 159.667-246 chr5 3678167 3678437 + 1 NA Intergenic Intergenic 82470 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 309.333 chr1 78046598 78047012 + 1 NA intron (NM_017655, intron 1 of 5) intron (NM_017655, intron 1 of 5) 839 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 163.333-25 chr1 221313395 221313620 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 22789 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 296.667-32 chr2 190179855 190180445 + 1 NA promoter-TSS (NM_032321) promoter-TSS (NM_032321) -713 NM_001042519 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 156.333-46 chr10 93714983 93715279 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -12172 NM_001347714 118924 Hs.586650 NM_145246 ENSG00000148690 FRA10AC1 C10orf4|F26C11.1-like|FRA10A FRA10A associated CGG repeat 1 protein-coding 171.333-167 chr6 73046963 73047174 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 3 of 13) intron (NM_001160132, intron 3 of 13) -79315 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 334.667-22 chr4 63402216 63402642 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 1007021 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 285.667-37 chr3 156546446 156546871 + 1 NA intron (NM_007107, intron 3 of 4) intron (NM_007107, intron 3 of 4) 7467 NM_001308205 6747 Hs.518346 NM_007107 ENSG00000114850 SSR3 TRAPG signal sequence receptor subunit 3 protein-coding 194.667-47 chr17 28045059 28045307 + 1 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) intron (NM_016231, intron 1 of 10) 2506 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 150.333-43 chr10 85089838 85089990 + 1 NA Intergenic Intergenic 108991 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 276.667-59 chr5 89752557 89752975 + 1 NA Intergenic Intergenic 263954 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 149.667-218 chr2 151366962 151367149 + 1 NA intron (NM_007115, intron 3 of 5) intron (NM_007115, intron 3 of 5) -1279 NR_039931 100616392 NR_039931 ENSG00000264684 MIR4773-1 - microRNA 4773-1 ncRNA 243.667-33 chr2 27803081 27803373 + 1 NA intron (NM_022128, intron 7 of 7) intron (NM_022128, intron 7 of 7) 31508 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 145.667-101 chr15 85707369 85707514 + 1 NA intron (NM_007200, intron 17 of 36) intron (NM_007200, intron 17 of 36) 51284 NR_120366 101929679 Hs.513112 NR_120366 LOC101929679 - uncharacterized LOC101929679 ncRNA 171.667-91 chr2 220062500 220062673 + 1 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -156021 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 209.667-43 chr14 50406054 50406505 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -8981 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 195.333-175 chr5 65787550 65787838 + 1 NA intron (NM_020726, intron 7 of 12) intron (NM_020726, intron 7 of 12) 65489 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 245.333-120 chr8 117251557 117251976 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 116771 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 130.333-195 chr7 70162659 70162850 + 1 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) HAL1b|LINE|L1 564279 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 199.333-53 chr12 31040581 31041022 + 1 NA intron (NR_038927, intron 2 of 2) L1MEf|LINE|L1 33046 NR_038927 100506660 Hs.586774 NR_038927 ENSG00000245614 DDX11-AS1 CONCR|SCAT4 DDX11 antisense RNA 1 ncRNA 136.667-46 chr13 50701637 50701830 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -106122 NR_046551 100874074 Hs.734030 NR_046551 ENSG00000176124 DLEU7-AS1 - DLEU7 antisense RNA 1 ncRNA 165.667-202 chr8 121027912 121028188 + 1 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 -216004 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 162.667-300 chrX 82917976 82918235 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -590185 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 174.667-158 chr7 33692326 33692565 + 1 NA Intergenic Intergenic -212470 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 151.333-125 chr14 56189108 56189406 + 1 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 70846 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 156.333-320 chr6 146630609 146630871 + 1 NA intron (NM_024694, intron 1 of 35) intron (NM_024694, intron 1 of 35) 31768 NM_024694 79747 Hs.720870 NM_024694 ENSG00000118492 ADGB C6orf103|CAPN16 androglobin protein-coding 214.333-137 chr7 10082283 10082677 + 1 NA Intergenic Intergenic 448210 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 152.667-159 chr19 32821494 32821745 + 1 NA intron (NM_001366102, intron 28 of 32) AluJr|SINE|Alu 48148 NM_001243036 11136 Hs.743345 NM_014270 ENSG00000021488 SLC7A9 BAT1|CSNU3 solute carrier family 7 member 9 protein-coding 163.333-76 chr13 55337606 55337812 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 163255 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 161.333-65 chr12 51530112 51530317 + 1 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -61019 NM_014191 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 147.667-322 chr6 140449457 140449707 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -234232 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 117.667-124 chr3 139544046 139544190 + 1 NA intron (NR_121609, intron 3 of 4) intron (NR_121609, intron 3 of 4) -4376 NM_001130993 5947 Hs.529571 NM_002899 ENSG00000114115 RBP1 CRABP-I|CRBP|CRBP1|CRBPI|RBPC retinol binding protein 1 protein-coding 141.667-103 chr18 22318103 22318316 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 99706 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 244.667-42 chr14 60375141 60375517 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 52133 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 142.333-123 chr2 114960730 114960900 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -103758 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 144.667-101 chr15 78333997 78334160 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6275 NM_004378 1381 Hs.346950 NM_004378 ENSG00000166426 CRABP1 CRABP|CRABP-I|CRABPI|RBP5 cellular retinoic acid binding protein 1 protein-coding 136.333-186 chr6 142999531 142999681 + 1 NA intron (NR_038987, intron 2 of 2) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 37976 NR_038987 100507489 Hs.486645 NR_038987 LINC01277 - long intergenic non-protein coding RNA 1277 ncRNA 127.333-9 chr1 115043885 115044085 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 10039 NM_001277991 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 217.333-127 chr6 41109296 41109615 + 1 NA non-coding (NR_026938, exon 5 of 23) non-coding (NR_026938, exon 5 of 23) 8421 NR_026938 221442 Hs.374076 NM_001010871 ENSG00000161912 ADCY10P1 - ADCY10 pseudogene 1 pseudo 132.667-19 chr10 44306232 44306469 + 1 NA Intergenic Intergenic 13600 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 128.333-144 chr4 123391678 123391852 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -5030 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 158.333-51 chr11 23924523 23924763 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -505453 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 189.333-197 chr7 119814547 119814847 + 1 NA intron (NR_131963, intron 1 of 2) MLT2A1|LTR|ERVL 92678 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 146.333-10 chr1 82741782 82741964 + 1 NA Intergenic Intergenic -161310 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 156.333-133 chr16 62503537 62503815 + 1 NA Intergenic Intergenic -467238 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 195.333-146 chr3 66260996 66261234 + 1 NA intron (NM_001350992, intron 2 of 8) FLAM_A|SINE|Alu 40112 NM_001350992 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 191.667-74 chr2 193537114 193537516 + 1 NA Intergenic Intergenic 787470 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 178.667-6 chr1 83118717 83118927 + 1 NA intron (NR_147074, intron 9 of 10) intron (NR_147074, intron 9 of 10) -132614 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 286.667-26 chr4 41428093 41428475 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) MIR|SINE|MIR 67477 NM_001330787 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 216.667-74 chr3 197962800 197963239 + 1 NA intron (NM_033029, intron 1 of 15) L1ME2z|LINE|L1 2802 NR_026787 89782 Hs.518540 NM_033029 ENSG00000185621 LMLN GP63|INV|IX14|LMNL1|MSP leishmanolysin like peptidase protein-coding 121.333-172 chr7 99213969 99214211 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -6601 NM_001145715 402569 Hs.253050 NM_001145715 ENSG00000185467 KPNA7 IPOA8 karyopherin subunit alpha 7 protein-coding 168.667-136 chr22 46427378 46427558 + 1 NA intron (NM_014246, intron 5 of 34) AluSx|SINE|Alu 91754 NM_001282783 55687 Hs.439524 NM_018006 ENSG00000100416 TRMU LCAL3|MTO2|MTU1|TRMT|TRMT1 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase protein-coding 282.333-53 chr6 134583019 134583507 + 1 NA Intergenic Intergenic -43258 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 189.667-56 chr16 14274089 14274427 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -28030 NR_132983 100129781 Hs.190748 NR_132983 MIR193BHG - MIR193B host gene ncRNA 161.667-38 chr11 33586296 33586598 + 1 NA intron (NM_012194, intron 11 of 20) intron (NM_012194, intron 11 of 20) 114293 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 197.667-75 chr20 20779656 20780063 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -67215 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 156.333-209 chr20 46015131 46015429 + 1 NA intron (NR_147699, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 6372 NM_004994 4318 Hs.297413 NM_004994 ENSG00000100985 MMP9 CLG4B|GELB|MANDP2|MMP-9 matrix metallopeptidase 9 protein-coding 350.667-12 chr6 70287347 70287775 + 1 NA intron (NM_001851, intron 5 of 37) L2a|LINE|L2 -4364 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 151.667-43 chr10 29228242 29228519 + 1 NA Intergenic Intergenic -60690 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 299.667-35 chr7 26854374 26854747 + 1 NA intron (NM_003930, intron 2 of 12) intron (NM_003930, intron 2 of 12) 3163 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 323.667-3 chr10 24464669 24464992 + 1 NA intron (NM_001321681, intron 1 of 13) intron (NM_001321681, intron 1 of 13) -1701 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 171.667-170 chr8 124111992 124112204 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 39 of 40) MIR3|SINE|MIR 59424 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 153.667-129 chr14 84391225 84391382 + 1 NA Intergenic LTR81AB|LTR|Gypsy -880629 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 170.333-4 chr1 74228161 74228396 + 1 NA intron (NM_001112808, intron 3 of 26) L1MA2|LINE|L1 -7109 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 258.333-9 chr10 82509436 82509946 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -276771 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 125.333-156 chr6 71875501 71875734 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -11086 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 158.333-245 chr4 130429403 130429649 + 1 NA Intergenic Intergenic 53165 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 241.667-56 chr3 126665738 126666172 + 1 NA intron (NR_034158, intron 2 of 4) intron (NR_034158, intron 2 of 4) 3874 NR_034158 255330 Hs.145435 NM_174935 ENSG00000198284 NUP210P1 C3orf46 nucleoporin 210 pseudogene 1 pseudo 271.667-21 chr13 98581422 98581752 + 1 NA Intergenic Intergenic 4332 NR_046542 100874069 Hs.594160 NR_046542 STK24-AS1 - STK24 antisense RNA 1 ncRNA 244.333-110 chr9 83384505 83384825 + 1 NA intron (NM_001244960, intron 2 of 13) intron (NM_001244960, intron 2 of 13) -52704 NM_001244961 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 258.333-73 chr9 24424421 24424882 + 1 NA Intergenic Intergenic 121025 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 288.333-3 chr1 246186528 246186995 + 1 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 230651 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 272.333-20 chr15 81504903 81505294 + 1 NA Intergenic Intergenic -130885 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 192.667-151 chr6 122081012 122081344 + 1 NA Intergenic Intergenic -318373 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 153.667-349 chr6 164009694 164009882 + 1 NA Intergenic Intergenic -338304 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 239.333-65 chr22 27077770 27078176 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -17455 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 164.667-247 chr8 125357005 125357216 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR -73248 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 130.667-111 chr2 103640468 103640681 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -656145 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 295.667-11 chr17 60808156 60808743 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 130598 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 243.333-19 chr12 68029007 68029303 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 39710 NR_104125 100885789 Hs.439832 NR_104124 ENSG00000255733 IFNG-AS1 GS1-410F4.2|NEST|Tmevpg1 IFNG antisense RNA 1 ncRNA 235.667-54 chr7 8213179 8213589 + 1 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) intron (NM_001350836, intron 7 of 14) 48668 NM_022307 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 237.667-82 chr8 140284647 140284917 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 13 of 22) intron (NM_001160372, intron 13 of 22) 172962 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 166.667-166 chr4 73762555 73762853 + 1 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 22135 NM_001354840 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 159.333-225 chr3 187932884 187933178 + 1 NA Intergenic Intergenic 43376 NR_135537 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 315.333-43 chr6 74936198 74936597 + 1 NA Intergenic Intergenic 192385 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 162.667-298 chr9 134248155 134248423 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 47108 NR_146518 105376310 Hs.573484 NR_146518 ENSG00000223729 LINC02247 - long intergenic non-protein coding RNA 2247 ncRNA 202.333-62 chr14 100564876 100565262 + 1 NA intron (NM_001159531, intron 1 of 5) intron (NM_001159531, intron 1 of 5) 3001 NM_001159531 57596 Hs.211751 NM_020836 ENSG00000183092 BEGAIN - brain enriched guanylate kinase associated protein-coding 134.333-138 chr5 63918783 63918924 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 43439 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 149.333-188 chr2 99938816 99939094 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 166628 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 149.667-53 chr10 57802787 57803003 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 464999 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 213.667-93 chr8 106197341 106197651 + 1 NA Intergenic Intergenic -72682 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 346.333-12 chr15 90789369 90789951 + 1 NA intron (NM_001287246, intron 15 of 22) intron (NM_001287246, intron 15 of 22) 72314 NM_001287246 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 148.667-378 chr8 102941702 102941945 + 1 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 77552 NR_126338 100506753 Hs.602901 NR_126338 AZIN1-AS1 - AZIN1 antisense RNA 1 ncRNA 246.333-54 chr2 214923903 214924194 + 1 NA intron (NR_110292, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 77101 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 319.333-17 chr2 133197189 133197627 + 1 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) L1ME2|LINE|L1 -68787 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 134.333-74 chr17 56162295 56162503 + 1 NA intron (NM_153228, intron 1 of 16) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 8924 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 266.667-50 chr3 186459667 186460169 + 1 NA intron (NR_033844, intron 3 of 7) intron (NR_033844, intron 3 of 7) 19573 NR_151708 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 162.333-225 chr6 123683757 123683965 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -46768 NM_001256022 10345 Hs.144744 NM_006073 ENSG00000186439 TRDN CPVT5|TDN|TRISK triadin protein-coding 196.333-16 chr10 120754682 120754964 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 96356 NR_033850 283089 Hs.568750 NR_033850 ENSG00000227165 WDR11-AS1 - WDR11 antisense RNA 1 ncRNA 115.333-73 chr14 66639908 66640134 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) intron (NM_001024218, intron 1 of 21) 132614 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 254.667-31 chr17 63197567 63197970 + 1 NA intron (NM_025185, intron 5 of 25) intron (NM_025185, intron 5 of 25) 231533 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 125.333-71 chr16 72744044 72744191 + 1 NA Intergenic Intergenic -79147 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 142.333-120 chr2 102168263 102168496 + 1 NA intron (NM_001320978, intron 6 of 11) intron (NM_001320978, intron 6 of 11) 14438 NM_001320984 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 144.667-84 chr14 57806854 57807045 + 1 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) intron (NR_159373, intron 1 of 10) 58050 NM_001352013 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 149.667-378 chr7 104028965 104029151 + 1 NA Intergenic Intergenic -39400 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 146.667-220 chr3 110580239 110580486 + 1 NA Intergenic Intergenic 489597 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 161.667-167 chr3 40504688 40504927 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -1232 NM_175888 253639 Hs.581541 NM_175888 ENSG00000177842 ZNF620 - zinc finger protein 620 protein-coding 236.667-72 chr6 97973489 97973903 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -50835 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 187.333-161 chr5 98458672 98459027 + 1 NA Intergenic Intergenic -297610 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 195.333-139 chr22 25170369 25170777 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) MER81|DNA|hAT-Blackjack -29285 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 167.667-179 chr6 25557221 25557523 + 1 NA intron (NM_001173977, intron 29 of 36) intron (NM_001173977, intron 29 of 36) -94843 NM_006998 10590 Hs.116428 NM_006998 ENSG00000079689 SCGN CALBL|DJ501N12.8|SECRET|SEGN|setagin secretagogin, EF-hand calcium binding protein protein-coding 114.333-163 chr4 130904111 130904345 + 1 NA Intergenic Intergenic 527867 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 156.667-202 chr2 232839579 232839771 + 1 NA intron (NM_015575, intron 24 of 30) intron (NM_015575, intron 24 of 30) -29339 NM_001346122 389084 Hs.657509 NM_206895 ENSG00000182600 SNORC ASCL830|C2orf82|UNQ830 secondary ossification center associated regulator of chondrocyte maturation protein-coding 163.333-98 chr15 62590213 62590394 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 54878 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 148.667-218 chr20 34430201 34430424 + 1 NA intron (NM_001257137, intron 8 of 25) intron (NM_001257137, intron 8 of 25) -36013 NR_030374 693229 NR_030374 ENSG00000207997 MIR644A MIR644|MIRN644|hsa-mir-644|hsa-mir-644a microRNA 644a ncRNA 172.333-36 chr11 104379916 104380175 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -215898 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 308.667-33 chr5 58177457 58177800 + 1 NA Intergenic Intergenic -55287 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 143.667-165 chr3 119295809 119295997 + 1 NA intron (NM_020754, intron 1 of 11) intron (NM_020754, intron 1 of 11) 1520 NM_020754 57514 Hs.668218 NM_020754 ENSG00000031081 ARHGAP31 AOS1|CDGAP Rho GTPase activating protein 31 protein-coding 155.333-233 chr3 83260866 83261068 + 1 NA Intergenic Intergenic 1274825 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 278.333-26 chr2 67409757 67410289 + 1 NA exon (NM_019002, exon 6 of 6) exon (NM_019002, exon 6 of 6) 12690 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 114.333-120 chr2 180645895 180646136 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -46089 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 220.667-6 chr1 62544237 62544536 + 1 NA intron (NM_001272000, intron 22 of 48) intron (NM_001272000, intron 22 of 48) -53134 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 197.667-57 chr18 33637642 33638051 + 1 NA intron (NM_030632, intron 2 of 11) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 59627 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 150.667-376 chr8 109476475 109476725 + 1 NA exon (NM_177531, exon 52 of 78) exon (NM_177531, exon 52 of 78) -63100 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 290.333-28 chr3 121292050 121292611 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 20 of 27) L1PB1|LINE|L1 242690 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 113.667-23 chr10 58947688 58947884 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -51732 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 151.667-326 chr6 157336492 157336712 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -12343 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 164.667-225 chr7 52544131 52544343 + 1 NA Intergenic Intergenic -491396 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 199.667-106 chr5 2630508 2630951 + 1 NA Intergenic Intergenic -81862 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 144.667-50 chr12 26568036 26568221 + 1 NA intron (NM_002223, intron 34 of 56) intron (NM_002223, intron 34 of 56) 265066 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 172.333-39 chr12 45329996 45330287 + 1 NA intron (NM_001025356, intron 2 of 19) intron (NM_001025356, intron 2 of 19) 37451 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 136.333-68 chr15 89270550 89270700 + 1 NA intron (NM_001113378, intron 10 of 37) L1MC4|LINE|L1 26646 NM_018193 55215 Hs.513126 NM_018193 ENSG00000140525 FANCI KIAA1794 FA complementation group I protein-coding 221.333-41 chr15 57071514 57071889 + 1 NA intron (NM_207038, intron 4 of 19) intron (NM_207038, intron 4 of 19) -147729 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 153.667-239 chr22 36249969 36250245 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -2964 NM_145343 8542 Hs.114309 NM_003661 ENSG00000100342 APOL1 APO-L|APOL|APOL-I|FSGS4 apolipoprotein L1 protein-coding 270.333-35 chr22 35124072 35124444 + 1 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) LTR16E2|LTR|ERVL 58100 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 160.333-292 chr8 140868111 140868283 + 1 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) intron (NM_001352737, intron 3 of 32) 132807 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 219.667-52 chr22 43648263 43648607 + 1 NA intron (NM_198856, intron 15 of 29) L1PA16|LINE|L1 132181 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 198.667-48 chr12 60487251 60487546 + 1 NA Intergenic Intergenic 798028 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 164.333-146 chr21 32869363 32869621 + 1 NA Intergenic (TCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -55789 NM_001162496 56245 Hs.517235 NM_019596 ENSG00000205929 C21orf62 B37|C21orf120|PRED81 chromosome 21 open reading frame 62 protein-coding 233.667-68 chr6 151955485 151955753 + 1 NA intron (NM_001122741, intron 5 of 8) intron (NM_001122741, intron 5 of 8) 146512 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 308.667-30 chr4 148405101 148405542 + 1 NA intron (NM_000901, intron 2 of 8) intron (NM_000901, intron 2 of 8) 37093 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 153.667-248 chr3 33049960 33050124 + 1 NA intron (NM_001079811, intron 9 of 15) intron (NM_001079811, intron 9 of 15) 46790 NM_001079811 2720 Hs.443031 NM_000404 ENSG00000170266 GLB1 EBP|ELNR1|MPS4B galactosidase beta 1 protein-coding 150.333-36 chr10 55933473 55933662 + 1 NA Intergenic Intergenic -305625 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 140.333-115 chr2 202971155 202971366 + 1 NA intron (NR_136330, intron 9 of 14) intron (NR_136330, intron 9 of 14) -43619 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 222.333-83 chr6 103622811 103623101 + 1 NA Intergenic Intergenic 1236590 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 113.333-184 chr3 172597481 172597641 + 1 NA Intergenic Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -1954 NR_146714 105374219 Hs.186269 NR_146714 ENSG00000223387 LINC02068 - long intergenic non-protein coding RNA 2068 ncRNA 189.667-54 chr15 89378466 89378669 + 1 NA intron (NR_133002, intron 2 of 5) CpG 525 NR_015411 254559 Hs.136313 NR_015411 ENSG00000255571 MIR9-3HG LINC00925 MIR9-3 host gene ncRNA 257.333-14 chr10 80790271 80790645 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 140661 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 207.333-78 chr13 108639316 108639786 + 1 NA intron (NM_001198950, intron 1 of 34) intron (NM_001198950, intron 1 of 34) 9940 NM_001198950 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 161.333-285 chr8 90424594 90424871 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 181331 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 145.667-264 chr7 7898934 7899126 + 1 NA Intergenic Intergenic 69722 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 144.333-186 chr4 33794496 33794661 + 1 NA Intergenic Intergenic 245315 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 156.333-307 chr6 50943840 50944135 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 125116 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 116.333-145 chr3 106024186 106024371 + 1 NA Intergenic Intergenic -154877 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 377.333-2 chr11 102793151 102793653 + 1 NA intron (NR_038390, intron 2 of 7) AluSz|SINE|Alu 4758 NM_001145938 4312 Hs.83169 NM_002421 ENSG00000196611 MMP1 CLG|CLGN matrix metallopeptidase 1 protein-coding 155.667-278 chr5 73713586 73713844 + 1 NA intron (NM_001177693, intron 2 of 35) intron (NM_001177693, intron 2 of 35) 87557 NM_001080479 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 271.667 chr1 65610839 65611337 + 1 NA intron (NM_001003679, intron 14 of 19) intron (NM_001003679, intron 14 of 19) 85399 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 148.667-131 chr15 40997682 40997962 + 1 NA intron (NM_017553, intron 28 of 35) intron (NM_017553, intron 28 of 35) 44351 NM_024111 79094 Hs.155569 NM_024111 ENSG00000128965 CHAC1 - ChaC glutathione specific gamma-glutamylcyclotransferase 1 protein-coding 156.333-124 chr15 40062917 40063214 + 1 NA intron (NR_040060, intron 2 of 2) intron (NR_040060, intron 2 of 2) 23754 NR_040061 100131089 Hs.386000 NR_040059 ENSG00000248508 SRP14-AS1 - SRP14 antisense RNA1 (head to head) ncRNA 175.333-17 chr10 88144503 88144816 + 1 NA Intergenic Intergenic 281034 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 153.667-6 chr1 52240361 52240567 + 1 NA intron (NM_007324, intron 4 of 17) intron (NM_007324, intron 4 of 17) 98370 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 242.667-10 chr1 175067988 175068297 + 1 NA intron (NM_022093, intron 1 of 18) intron (NM_022093, intron 1 of 18) 309 NM_022093 63923 Hs.156369 NM_022093 ENSG00000120332 TNN TN-W tenascin N protein-coding 144.667-13 chr1 117799150 117799403 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 130345 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 137.333-137 chr4 112028686 112028903 + 1 NA Intergenic Intergenic -116660 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 337.333-45 chr8 99222793 99223228 + 1 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) AluSz|SINE|Alu 209744 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 223.333-54 chr17 63235016 63235470 + 1 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) intron (NM_025185, intron 6 of 25) 205024 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 156.667-198 chr2 215825771 215826051 + 1 NA intron (NR_037195, intron 1 of 9) intron (NR_037195, intron 1 of 9) 17625 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 119.667-21 chr10 37732152 37732312 + 1 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 62943 NR_051997 100419868 Hs.741719 NR_051997 ZNF33BP1 - zinc finger protein 33B pseudogene 1 pseudo 153.667-2 chr1 31862178 31862438 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -46257 NM_001281988 90853 Hs.62604 NM_144569 ENSG00000134668 SPOCD1 PPP1R146 SPOC domain containing 1 protein-coding 122.333-198 chr8 12846268 12846428 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -34870 NR_152742 340357 Hs.434302 NR_015383 ENSG00000254813 LOC340357 - uncharacterized LOC340357 ncRNA 338.667-4 chr1 235114832 235115215 + 1 NA intron (NM_014765, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 12914 NR_002956 677802 Hs.744743 NR_002956 ENSG00000207181 SNORA14B ACA14b small nucleolar RNA, H/ACA box 14B snoRNA 351.333-23 chr4 93269393 93270024 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 7 of 14) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -559045 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 167.667-148 chr4 41303960 41304173 + 1 NA Intergenic Intergenic 47138 NM_004181 7345 Hs.518731 NM_004181 ENSG00000154277 UCHL1 HEL-117|HEL-S-53|NDGOA|PARK5|PGP 9.5|PGP9.5|PGP95|SPG79|Uch-L1 ubiquitin C-terminal hydrolase L1 protein-coding 297.667-21 chr2 104652366 104652903 + 1 NA Intergenic Intergenic 105085 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 164.333-221 chr7 475119 475412 + 1 NA Intergenic Intergenic 44579 NM_002607 5154 Hs.535898 NM_002607 ENSG00000197461 PDGFA PDGF-A|PDGF1 platelet derived growth factor subunit A protein-coding 157.667-88 chr13 59433285 59433481 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -579335 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 232.333-96 chrX 16944368 16944675 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -2137 NM_004726 9185 Hs.186810 NM_004726 ENSG00000169891 REPS2 POB1 RALBP1 associated Eps domain containing 2 protein-coding 152.667-107 chr14 56196338 56196494 + 1 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 78005 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 152.667-14 chr1 117443300 117443536 + 1 NA intron (NM_006699, intron 6 of 12) intron (NM_006699, intron 6 of 12) 75969 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 252.667-67 chr3 143963816 143964216 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -7782 NM_001363944 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 216.667-104 chr8 101487386 101487815 + 1 NA Intergenic Intergenic -4839 NM_024915 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 144.333-191 chr4 88421713 88421884 + 1 NA intron (NM_001165136, intron 13 of 21) L1MB8|LINE|L1 -35321 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 147.333-131 chr16 21285846 21286039 + 1 NA intron (NM_001888, intron 1 of 9).2 LTR49-int|LTR|ERV1 -14907 NR_026675 400508 Hs.578949 NM_001101368 CRYM-AS1 NCRNA00169 CRYM antisense RNA 1 ncRNA 173.667-4 chr1 57650712 57650978 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) L2c|LINE|L2 -209736 NR_104362 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 146.667-292 chr6 149798951 149799231 + 1 NA intron (NM_001360452, intron 6 of 7) AluJr|SINE|Alu 49350 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 153.667-241 chr22 41070208 41070496 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 3369 NR_132979 106635682 NR_132979 SNORD140 - small nucleolar RNA, C/D box 140 snoRNA 172.667-9 chr1 103887647 103887891 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 137928 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 228.667-80 chr8 109947924 109948200 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 27709 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 250.333-41 chr3 424887 425374 + 1 NA Intergenic Intergenic -39335 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 120.333-166 chr7 4797189 4797377 + 1 NA 3' UTR (NM_018059, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_018059, exon 15 of 15) -8644 NR_039800 100616465 NR_039800 ENSG00000264474 MIR4656 - microRNA 4656 ncRNA 242.333-64 chr3 9451655 9451944 + 1 NA intron (NM_001080517, intron 16 of 22) intron (NM_001080517, intron 16 of 22) 54099 NM_001080517 55209 Hs.288164 NM_018187 ENSG00000168137 SETD5 - SET domain containing 5 protein-coding 180.333-142 chr8 124251958 124252155 + 1 NA Intergenic Intergenic -4658 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 181.667-113 chr4 93418594 93419030 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 8 of 14) L1MEd|LINE|L1 -409941 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 168.667-38 chr11 119466707 119466999 + 1 NA intron (NR_034160, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 -41868 NM_001311162 7070 Hs.644697 NM_006288 ENSG00000154096 THY1 CD90|CDw90 Thy-1 cell surface antigen protein-coding 178.333-59 chr16 71963930 71964173 + 1 NA intron (NM_181536, intron 15 of 29) intron (NM_181536, intron 15 of 29) 35927 NM_181536 342372 Hs.675286 NM_181536 ENSG00000277481 PKD1L3 - polycystin 1 like 3, transient receptor potential channel interacting protein-coding 119.667-93 chr2 203471606 203471861 + 1 NA intron (NM_001329728, intron 5 of 15) intron (NM_001329728, intron 5 of 15) 63568 NM_203365 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 131.333-196 chr9 105585318 105585543 + 1 NA intron (NM_001351502, intron 5 of 13) AluJr4|SINE|Alu 27299 NM_001351501 2218 Hs.55777 NM_006731 ENSG00000106692 FKTN CMD1X|FCMD|LGMD2M|LGMDR13|MDDGA4|MDDGB4|MDDGC4 fukutin protein-coding 172.667-147 chr7 36423474 36423735 + 1 NA intron (NM_001284302, intron 13 of 22) intron (NM_001284302, intron 13 of 22) -33247 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 247.667-40 chr16 69668457 69668840 + 1 NA intron (NM_173215, intron 7 of 13) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 40027 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 331.667-5 chr16 22887995 22888525 + 1 NA intron (NM_006043, intron 1 of 1) intron (NM_006043, intron 1 of 1) 74098 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 203.667-68 chr20 54938543 54938828 + 1 NA Intergenic Intergenic 463092 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 178.667-158 chr8 52705645 52705842 + 1 NA intron (NM_001083617, intron 1 of 23) AluJr4|SINE|Alu 8692 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 208.333-132 chr6 143232183 143232527 + 1 NA intron (NM_001366354, intron 3 of 4) intron (NM_001366354, intron 3 of 4) 67573 NM_001366361 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 210.667-30 chr12 22824749 22824999 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 199703 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 144.333-34 chr11 9937398 9937672 + 1 NA intron (NM_030962, intron 16 of 39) L1M5|LINE|L1 98393 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 114.667-117 chr19 44047318 44047539 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -4608 NM_013361 7766 Hs.720813 NM_013361 ENSG00000178386 ZNF223 - zinc finger protein 223 protein-coding 154.333-71 chr12 85066577 85066806 + 1 NA intron (NM_001079910, intron 9 of 26) intron (NM_001079910, intron 9 of 26) 30340 NM_001079910 84125 Hs.402200 NM_032165 ENSG00000133640 LRRIQ1 - leucine rich repeats and IQ motif containing 1 protein-coding 150.667-176 chr2 70452931 70453105 + 1 NA intron (NM_003236, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR 28622 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 177.333-84 chr2 110973384 110973594 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 13 of 18) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 142099 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 214.667-89 chr4 57483527 57483842 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 57812 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 213.333-154 chr5 5379450 5379747 + 1 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 -43079 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 249.333-52 chr2 81504587 81505026 + 1 NA Intergenic Intergenic -37860 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 198.333-98 chr2 121753388 121753646 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -2028 NM_001261401 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 248.333-2 chr1 39885594 39886023 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2297 NR_132403 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 185.333-87 chr2 58065845 58066244 + 1 NA intron (NM_001288836, intron 3 of 13) L1MD2|LINE|L1 19332 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 160.333-299 chr9 38713818 38714038 + 1 NA Intergenic Intergenic 92840 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 134.667-139 chr3 119142938 119143168 + 1 NA intron (NM_152538, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 2967 NM_001353322 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 191.667-11 chr10 7866185 7866540 + 1 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) L2b|LINE|L2 47857 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 168.333-21 chr10 43279406 43279699 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -12487 NM_145313 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 162.667-237 chr6 40725001 40725173 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -137723 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 159.667-304 chr7 61776933 61777221 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1526979 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 215.333-193 chr8 63918715 63918958 + 1 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) L1MEd|LINE|L1 149406 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 151.333-361 chr6 69493821 69494053 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 302529 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 410.333-12 chr8 121765277 121765984 + 1 NA Intergenic Intergenic -124190 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 122.333-42 chr12 13606496 13606666 + 1 NA intron (NM_000834, intron 9 of 12) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -229836 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 205.667-42 chr13 106460335 106460586 + 1 NA Intergenic Intergenic 74580 NM_004093 1948 Hs.149239 NM_004093 ENSG00000125266 EFNB2 EPLG5|HTKL|Htk-L|LERK5 ephrin B2 protein-coding 193.667-7 chr1 84490918 84491170 + 1 NA intron (NM_025065, intron 5 of 8) intron (NM_025065, intron 5 of 8) 11778 NM_025065 80135 Hs.481202 NM_025065 ENSG00000117133 RPF1 BXDC5 ribosome production factor 1 homolog protein-coding 181.667-131 chr6 76032321 76032620 + 1 NA intron (NM_001563, intron 4 of 16) intron (NM_001563, intron 4 of 16) 40192 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 249.667-32 chr15 80163426 80163869 + 1 NA intron (NM_000137, intron 5 of 13) intron (NM_000137, intron 5 of 13) 10648 NM_000137 2184 Hs.73875 NM_000137 ENSG00000103876 FAH - fumarylacetoacetate hydrolase protein-coding 127.667-168 chr7 112001122 112001296 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 2 of 52) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 192704 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-2 chr1 11506852 11507026 + 1 NA intron (NM_020780, intron 3 of 20) AluJr|SINE|Alu 27784 NM_020780 57540 Hs.202355 NM_020780 ENSG00000204624 DISP3 PTCHD2 dispatched RND transporter family member 3 protein-coding 218.333-116 chr7 90969623 90969936 + 1 NA intron (NM_012395, intron 8 of 13) intron (NM_012395, intron 8 of 13) 259963 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 148.667-17 chr1 171062927 171063123 + 1 NA intron (NM_001163629, intron 21 of 21) (ATTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -27880 NM_001319173 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 172.667-95 chr20 56746549 56746913 + 1 NA Intergenic Intergenic 117425 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 149.667-268 chr3 144539821 144540001 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 566830 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 128.667-202 chr9 130337998 130338279 + 1 NA intron (NM_001291815, intron 23 of 97) (CCTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 72378 NM_001291815 256158 Hs.32194 NM_144655 ENSG00000148357 HMCN2 - hemicentin 2 protein-coding 141.667-51 chr11 78803490 78803656 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 15 of 33) intron (NM_001098816, intron 15 of 33) -228709 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 144.667-209 chr4 22499327 22499503 + 1 NA intron (NM_145290, intron 1 of 18) MIR3|SINE|MIR -15897 NR_162129 113219450 NR_162129 MIR12115 - microRNA 12115 ncRNA 252.667-63 chr3 38754067 38754499 + 1 NA intron (NM_006514, intron 10 of 26) L2c|LINE|L2 39727 NM_006514 6336 Hs.250443 NM_006514 ENSG00000185313 SCN10A FEPS2|Nav1.8|PN3|SNS|hPN3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 protein-coding 119.667-99 chr20 32717101 32717355 + 1 NA intron (NM_001099339, intron 3 of 8) AluJr|SINE|Alu 26780 NM_053041 149951 Hs.408427 NM_053041 ENSG00000149600 COMMD7 C20orf92|dJ1085F17.3 COMM domain containing 7 protein-coding 237.667-30 chr17 59536663 59536946 + 1 NA Intergenic Intergenic -9947 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 154.667-112 chr14 66258667 66258832 + 1 NA Intergenic Intergenic -227622 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 187.667-49 chr14 74775409 74775669 + 1 NA intron (NM_019589, intron 1 of 20) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 12223 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 243.667-61 chr5 58269920 58270347 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -147792 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 124.667-86 chr17 57015724 57015933 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29650 NR_002818 376412 Hs.132299 NR_002818 ENSG00000261192 RNF126P1 - ring finger protein 126 pseudogene 1 pseudo 168.333-163 chr5 83004115 83004294 + 1 NA Intergenic Intergenic 60133 NR_003139 677765 Hs.693283 NR_003139 ENSG00000238835 SCARNA18 SCARNA18A|U109 small Cajal body-specific RNA 18 ncRNA 309.667-14 chr22 28370110 28370497 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) LTR33|LTR|ERVL -89566 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 241.667-45 chr20 11106370 11106798 + 1 NA Intergenic Intergenic 80040 NR_146878 728434 Hs.570365 NR_146878 ENSG00000125899 C20orf187 - chromosome 20 open reading frame 187 (putative) ncRNA 125.333-189 chr9 93572251 93572464 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -4227 NM_005392 5253 Hs.211441 NM_005392 ENSG00000197724 PHF2 CENP-35|GRC5|JHDM1E|KDM7C PHD finger protein 2 protein-coding 215.333-8 chr1 166185956 166186399 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -19422 NR_135199 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 211.667-89 chr4 128444539 128444829 + 1 NA intron (NR_125882, intron 1 of 8) L1PA13|LINE|L1 16668 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 381.667-8 chr5 154697359 154698033 + 1 NA intron (NM_001367715, intron 1 of 17) L1MB8|LINE|L1 11920 NR_031638 100302284 NR_031638 ENSG00000221552 MIR1303 MIRN1303|hsa-mir-1303 microRNA 1303 ncRNA 353.333-35 chr7 21784097 21784548 + 1 NA intron (NM_001277115, intron 57 of 81) intron (NM_001277115, intron 57 of 81) 161577 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 117.333-166 chr5 45757915 45758098 + 1 NA Intergenic Intergenic -61626 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 161.667-172 chr3 108854436 108854685 + 1 NA 3' UTR (NM_016388, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_016388, exon 6 of 6) 31774 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 150.667-88 chr12 60990536 60990788 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 1202177 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 205.333-153 chr3 88775127 88775420 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -332348 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 414.333-4 chr18 44961572 44962114 + 1 NA intron (NM_015559, intron 4 of 5) intron (NM_015559, intron 4 of 5) 8323 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 209.667-22 chr10 66357229 66357594 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) L1MB8|LINE|L1 -568625 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 152.667-112 chr14 63725893 63726058 + 1 NA intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 2090 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 166.667-95 chr18 3524734 3524983 + 1 NA intron (NM_001242762, intron 7 of 9) intron (NM_001242762, intron 7 of 9) 58608 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 156.667-183 chr2 80635744 80635951 + 1 NA intron (NM_001320810, intron 12 of 12) MER117|DNA|hAT-Charlie 322468 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 239.667-27 chr16 81423872 81424288 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -21090 NM_198390 80790 Hs.594095 NM_030629 ENSG00000153815 CMIP TCMIP c-Maf inducing protein protein-coding 281.667-7 chr10 104199647 104200128 + 1 NA intron (NM_025145, intron 8 of 37) PABL_B|LTR|ERV1 18996 NR_030340 693194 NR_030340 ENSG00000208033 MIR609 MIRN609|hsa-mir-609 microRNA 609 ncRNA 240.667-14 chr10 122923001 122923286 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 12533 NM_001029888 118670 Hs.369829 NM_001029888 ENSG00000203795 FAM24A - family with sequence similarity 24 member A protein-coding 144.667-268 chr6 115565711 115565937 + 1 NA Intergenic Intergenic 78011 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 183.667-129 chr6 128891222 128891537 + 1 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 8238 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 133.667-141 chr7 84095412 84095582 + 1 NA intron (NM_006080, intron 4 of 16) intron (NM_006080, intron 4 of 16) 99292 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 319.333-3 chr10 75117596 75118057 + 1 NA intron (NM_144660, intron 1 of 4) intron (NM_144660, intron 1 of 4) 6170 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 312.333-7 chr16 2476675 2476995 + 1 NA intron (NM_020705, intron 1 of 6) intron (NM_020705, intron 1 of 6) 1708 NM_020705 57465 Hs.353087 NM_020705 ENSG00000162065 TBC1D24 DFNA65|DFNB86|DOORS|EIEE16|FIME|TLDC6 TBC1 domain family member 24 protein-coding 152.333-61 chr11 29692144 29692447 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 73493 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 262.667-23 chr13 93898899 93899332 + 1 NA intron (NM_005708, intron 3 of 8) intron (NM_005708, intron 3 of 8) -40642 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 130.333-123 chr22 29671425 29671656 + 1 NA intron (NR_156186, intron 11 of 16) AluSg7|SINE|Alu -48463 NM_182527 164633 Hs.643608 NM_182527 ENSG00000100314 CABP7 CALN2 calcium binding protein 7 protein-coding 153.333-422 chr8 111479620 111479921 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 103131 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 137.667-31 chr10 123018123 123018356 + 1 NA intron (NM_001609, intron 1 of 10) intron (NM_001609, intron 1 of 10) 9233 NM_001330174 36 Hs.81934 NM_001609 ENSG00000196177 ACADSB 2-MEBCAD|ACAD7|SBCAD acyl-CoA dehydrogenase short/branched chain protein-coding 220.667-61 chr3 56007313 56007654 + 1 NA intron (NR_132749, intron 9 of 17) intron (NR_132749, intron 9 of 17) -154889 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 113.333-131 chr2 113071329 113071449 + 1 NA promoter-TSS (NM_032556) promoter-TSS (NM_032556) -929 NM_032556 84639 Hs.306974 NM_032556 ENSG00000136697 IL1F10 FIL1-theta|FKSG75|IL-1HY2|IL-38|IL1-theta|IL1HY2 interleukin 1 family member 10 protein-coding 230.667-67 chr5 140445466 140445732 + 1 NA intron (NM_001197030, intron 5 of 9) intron (NM_001197030, intron 5 of 9) 43766 NM_024668 54882 Hs.594084 NM_017747 ENSG00000131503 ANKHD1 MASK|MASK1|PP2500|VBARP ankyrin repeat and KH domain containing 1 protein-coding 151.333-17 chr1 93672440 93672709 + 1 NA intron (NM_001261409, intron 2 of 11) intron (NM_001261409, intron 2 of 11) 8796 NM_001261409 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 221.667-3 chr1 118966866 118967299 + 1 NA intron (NM_152380, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 21261 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 137.667-63 chr14 91207606 91207856 + 1 NA intron (NM_001102368, intron 12 of 13) L1MCa|LINE|L1 36973 NM_001177676 8111 Hs.8882 NM_003485 ENSG00000119714 GPR68 AI2A6|GPR12A|OGR1 G protein-coupled receptor 68 protein-coding 127.667-110 chr22 30131631 30131771 + 1 NA intron (NM_001329457, intron 11 of 11) intron (NM_001329457, intron 11 of 11) 51237 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 158.333-269 chr5 173884092 173884253 + 1 NA Intergenic Intergenic -4177 NM_001308189 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 144.333-240 chr7 1413531 1413744 + 1 NA Intergenic Intergenic 45833 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 259.667-4 chr1 159052294 159052606 + 1 NA intron (NM_001206567, intron 9 of 10) intron (NM_001206567, intron 9 of 10) 24316 NM_004833 9447 Hs.733411 NM_004833 ENSG00000163568 AIM2 PYHIN4 absent in melanoma 2 protein-coding 196.667-72 chr2 53523895 53524224 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -243724 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 141.333-102 chr2 47409829 47409998 + 1 NA intron (NM_000251, intron 2 of 15) AluSg|SINE|Alu 6846 NM_001258281 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 135.667-143 chr5 66938973 66939126 + 1 NA intron (NM_015183, intron 3 of 27) L1MEg|LINE|L1 -20024 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 135.333-90 chr2 142387629 142387777 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -256002 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 354.333-8 chr18 7562796 7563254 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -4291 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 247.667-94 chr8 35754788 35755083 + 1 NA intron (NM_001322818, intron 13 of 16) intron (NM_001322818, intron 13 of 16) -44615 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 267.667-28 chr2 55374237 55374720 + 1 NA intron (NM_001254943, intron 4 of 33) intron (NM_001254943, intron 4 of 33) 45378 NM_001135597 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 317.667-11 chr14 90772014 90772487 + 1 NA intron (NM_001320421, intron 3 of 20) L1ME4a|LINE|L1 44167 NM_001320421 145567 Hs.655697 NM_001010854 ENSG00000165914 TTC7B TTC7L1|c14_5685 tetratricopeptide repeat domain 7B protein-coding 145.333-52 chr11 37867324 37867558 + 1 NA Intergenic Intergenic -71160 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 154.333-22 chr1 190954171 190954335 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 274245 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 146.333-11 chr1 88624712 88624929 + 1 NA intron (NR_110682, intron 1 of 3) L1PREC2|LINE|L1 -59324 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 169.667-157 chr4 132498709 132498969 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -92250 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 284.333-38 chr6 55761367 55761715 + 1 NA intron (NM_001329754, intron 4 of 5) L2a|LINE|L2 114049 NM_001329754 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 155.333-355 chr7 19462735 19462956 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 242591 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 145.667-273 chr7 86749914 86750082 + 1 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 106084 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 154.667-420 chrX 84362248 84362440 + 1 NA intron (NM_001177478, intron 4 of 9) MIRc|SINE|MIR -136516 NR_031690 100302191 NR_031690 ENSG00000221494 MIR548I4 MIR548I-4|MIRN548I4|hsa-mir-548i-4 microRNA 548i-4 ncRNA 160.333-149 chr2 112296684 112296856 + 1 NA intron (NM_198581, intron 1 of 11) L2b|LINE|L2 21173 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 168.333-194 chr7 47840899 47841197 + 1 NA intron (NM_138295, intron 34 of 56) L1M5|LINE|L1 45757 NR_161269 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 281.667-43 chr6 52674389 52674887 + 1 NA intron (NM_014051, intron 1 of 4) intron (NM_014051, intron 1 of 4) 3525 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 187.333-120 chr22 31767962 31768304 + 1 NA intron (NR_146296, intron 6 of 42) L1PB1|LINE|L1 14110 NM_001369901 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 131.333 chr1 20058479 20058634 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -11638 NM_000929 5322 Hs.319438 NM_000929 ENSG00000127472 PLA2G5 FRFB|GV-PLA2|PLA2-10|hVPLA(2) phospholipase A2 group V protein-coding 148.333-356 chr7 24801805 24801980 + 1 NA intron (NR_104111, intron 21 of 21) L1ME4b|LINE|L1 -43953 NM_004403 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 194.667-138 chr6 124268083 124268366 + 1 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -14781 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 136.667-182 chr8 130388854 130388999 + 1 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) MIR|SINE|MIR 54734 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 140.333-66 chr14 72842524 72842764 + 1 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) L1ME3A|LINE|L1 50005 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 249.667-88 chr7 49694250 49694674 + 1 NA Intergenic Intergenic -79176 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 209.333-17 chr10 19033029 19033444 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -15565 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 208.667-33 chr11 117976744 117977057 + 1 NA Intergenic Intergenic -9491 NM_001558 3587 Hs.504035 NM_001558 ENSG00000110324 IL10RA CD210|CD210a|CDW210A|HIL-10R|IL-10R1|IL10R interleukin 10 receptor subunit alpha protein-coding 138.667-75 chr15 94506283 94506500 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 150461 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 204.333 chr1 11243053 11243381 + 1 NA exon (NM_004958, exon 9 of 58) exon (NM_004958, exon 9 of 58) 19334 NM_004958 2475 Hs.338207 NM_004958 ENSG00000198793 MTOR FRAP|FRAP1|FRAP2|RAFT1|RAPT1|SKS mechanistic target of rapamycin kinase protein-coding 154.333-170 chr2 170395370 170395527 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 16 of 33) intron (NM_001083615, intron 16 of 33) -44505 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 133.333-85 chr2 150545663 150545861 + 1 NA Intergenic Intergenic 26459 NR_110241 101929260 Hs.732324 NR_110241 ENSG00000236049 LINC01920 - long intergenic non-protein coding RNA 1920 ncRNA 166.667-249 chrX 52158026 52158238 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -26691 NM_177535 81557 Hs.522650 NM_030801 ENSG00000187243 MAGED4B - MAGE family member D4B protein-coding 241.667-26 chr15 65695223 65695655 + 1 NA intron (NM_005848, intron 21 of 31) MER58B|DNA|hAT-Charlie 1497 NR_145750 109617020 NR_145750 ENSG00000238311 SNORD13E - small nucleolar RNA, C/D box 13E snoRNA 164.333-46 chr11 121231748 121231975 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -60910 NM_006918 6309 Hs.287749 NM_006918 ENSG00000109929 SC5D ERG3|S5DES|SC5DL sterol-C5-desaturase protein-coding 189.667-31 chr12 9607674 9608019 + 1 NA promoter-TSS (NM_002258) promoter-TSS (NM_002258) 70 NM_002258 3820 Hs.169824 NM_002258 ENSG00000111796 KLRB1 CD161|CLEC5B|NKR|NKR-P1|NKR-P1A|NKRP1A|hNKR-P1A killer cell lectin like receptor B1 protein-coding 205.333-237 chr8 71789184 71789628 + 1 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -53717 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 160.667-84 chr14 30869554 30869733 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4892 NM_001135058 1690 Hs.21016 NM_004086 ENSG00000100473 COCH COCH-5B2|COCH5B2|DFNA9|DFNB110 cochlin protein-coding 154.333-20 chr1 175549023 175549223 + 1 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 194472 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 154.333-61 chr11 57275059 57275253 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -37703 NM_005161 187 Hs.438311 NM_005161 ENSG00000134817 APLNR AGTRL1|APJ|APJR|HG11 apelin receptor protein-coding 196.333-126 chr4 34010672 34011054 + 1 NA intron (NR_125902, intron 1 of 4) intron (NR_125902, intron 1 of 4) 29030 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 174.333-71 chr2 220765375 220765621 + 1 NA Intergenic Intergenic 806806 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 120.333-141 chr4 72720289 72720598 + 1 NA Intergenic Intergenic -151222 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 127.667-187 chr8 129037226 129037405 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -71314 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 202.667-145 chr8 90822216 90822432 + 1 NA intron (NM_022351, intron 2 of 12) intron (NM_022351, intron 2 of 12) 30549 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 147.333-186 chr20 11481846 11481994 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -208537 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 129.667-23 chr10 33765026 33765231 + 1 NA intron (NR_038932, intron 2 of 2) intron (NR_038932, intron 2 of 2) 7552 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 196.667-6 chr1 190311671 190311966 + 1 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 164192 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 156.333-328 chr7 7778900 7779120 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR -60403 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 141.333-107 chr2 63198238 63198503 + 1 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) L1M8|LINE|L1 -78828 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 157.333-273 chr5 7620318 7620518 + 1 NA intron (NM_020546, intron 3 of 24) intron (NM_020546, intron 3 of 24) 224280 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 317.333-33 chr5 140408911 140409326 + 1 NA intron (NM_001197030, intron 1 of 9) intron (NM_001197030, intron 1 of 9) 7285 NM_024668 54882 Hs.594084 NM_017747 ENSG00000131503 ANKHD1 MASK|MASK1|PP2500|VBARP ankyrin repeat and KH domain containing 1 protein-coding 122.333-89 chr2 51327380 51327644 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) MER67D|LTR|ERV1 294911 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 181.333-15 chr10 99169560 99169793 + 1 NA intron (NM_021828, intron 2 of 11) MER20B|DNA|hAT-Charlie 66199 NM_001166246 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 136.667-94 chr2 115645519 115645746 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 301817 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 207.333-242 chr6 73680659 73680914 + 1 NA Intergenic Intergenic -15299 NM_001159587 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 166.333-144 chr3 8359018 8359186 + 1 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 142556 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-183 chr5 22724976 22725176 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 128268 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 218.333-26 chr11 105912580 105912849 + 1 NA 3' UTR (NM_001112812, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001112812, exon 10 of 10) 109526 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 146.667-334 chr8 101795095 101795341 + 1 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) L1MEg|LINE|L1 -4249 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 232.333-49 chr2 222521497 222522030 + 1 NA intron (NM_152386, intron 2 of 4) intron (NM_152386, intron 2 of 4) 97220 NM_001320833 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 204.333-27 chr10 89345204 89345577 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 12861 NM_001289759 3437 Hs.47338 NM_001549 ENSG00000119917 IFIT3 CIG-49|GARG-49|IFI60|IFIT4|IRG2|ISG60|P60|RIG-G|cig41 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 3 protein-coding 130.667-128 chr2 240011505 240011793 + 1 NA exon (NM_004544, exon 6 of 10) exon (NM_004544, exon 6 of 10) 13693 NR_136157 4705 Hs.277677 NM_004544 ENSG00000130414 NDUFA10 CI-42KD|CI-42k|MC1DN22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A10 protein-coding 276.333-3 chr1 200726448 200726789 + 1 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -12954 NM_001297707 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 225.667-2 chr1 115077434 115077814 + 1 NA intron (NM_005725, intron 1 of 7) intron (NM_005725, intron 1 of 7) 11876 NM_001308316 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 330.667-4 chr10 73605798 73606154 + 1 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) AluSx|SINE|Alu -14634 NR_135249 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 225.667-28 chr14 86450193 86450539 + 1 NA Intergenic Intergenic -455412 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 117.667-11 chr1 213252734 213252888 + 1 NA intron (NM_001136138, intron 11 of 13) intron (NM_001136138, intron 11 of 13) 201570 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 143.333-221 chr5 32406110 32406290 + 1 NA intron (NM_016107, intron 6 of 19) intron (NM_016107, intron 6 of 19) -11725 NR_030305 693164 NR_030305 ENSG00000207956 MIR579 MIRN579|hsa-mir-579 microRNA 579 ncRNA 204.333-113 chr20 4566793 4567108 + 1 NA Intergenic Intergenic -119506 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 154.333-23 chr1 201534919 201535119 + 1 NA TTS (NR_160747) TTS (NR_160747) 15115 NR_026667 376693 Hs.605989 NR_026667 RPS10P7 RPS10_2_147 ribosomal protein S10 pseudogene 7 pseudo 152.333-24 chr1 177959265 177959437 + 1 NA intron (NM_001356500, intron 7 of 24) MIRb|SINE|MIR 10571 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 170.333-51 chr11 129594015 129594240 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 23142 NR_120582 101929557 Hs.385785 NR_120582 ENSG00000281097 LINC01395 - long intergenic non-protein coding RNA 1395 ncRNA 165.667-105 chr20 33477921 33478316 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11978 NM_001032999 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 177.667-82 chr20 8095464 8095731 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -36669 NM_015192 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 234.667-78 chr4 10839830 10840208 + 1 NA Intergenic Intergenic -155251 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 197.667-89 chr3 139656594 139656927 + 1 NA intron (NM_178177, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 21212 NM_001320510 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 252.333-36 chr2 144688622 144688944 + 1 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) intron (NR_033870, intron 1 of 4) 20816 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 175.667-26 chr11 43460221 43460586 + 1 NA intron (NM_018259, intron 21 of 23) MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -99253 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 184.333-120 chr5 29639019 29639305 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -241398 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 245.667-37 chr2 173353516 173353811 + 1 NA Intergenic Intergenic -1209 NM_145810 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 206.333-63 chr16 49459902 49460288 + 1 NA Intergenic Intergenic 58490 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 383.333-2 chr10 72907902 72908303 + 1 NA intron (NR_130125, intron 4 of 7) AluSx1|SINE|Alu 14363 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 286.667-22 chr3 31335581 31336103 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -174055 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 143.667-17 chr10 28955881 28956115 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 109590 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 152.667-142 chr17 71201714 71201964 + 1 NA intron (NR_104152, intron 1 of 3) intron (NR_104152, intron 1 of 3) 340 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 142.333-176 chr4 56471479 56471657 + 1 NA intron (NR_151856, intron 2 of 19) MIRc|SINE|MIR 3951 NM_001267722 6731 Hs.237825 NM_006947 ENSG00000174780 SRP72 BMFF|BMFS1|HEL103 signal recognition particle 72 protein-coding 249.333-49 chr2 9019089 9019438 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -15579 NM_001321267 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 143.333-283 chr8 53777568 53777824 + 1 NA intron (NM_213620, intron 9 of 13) MER58A|DNA|hAT-Charlie 65346 NM_213620 51606 Hs.491737 NM_015941 ENSG00000047249 ATP6V1H CGI-11|MSTP042|NBP1|SFD|SFDalpha|SFDbeta|VMA13 ATPase H+ transporting V1 subunit H protein-coding 325.333-11 chr12 60600276 60600739 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 911137 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 157.333-351 chr8 133009640 133009947 + 1 NA intron (NM_003235, intron 35 of 47) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 36788 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 249.667-23 chr12 32890813 32891248 + 1 NA intron (NM_001005242, intron 1 of 12) intron (NM_001005242, intron 1 of 12) 5816 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 159.333-311 chr7 77232698 77232913 + 1 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) intron (NM_020879, intron 2 of 18) -32986 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 160.333-217 chr4 83045111 83045281 + 1 NA intron (NM_001258006, intron 1 of 8) intron (NM_001258006, intron 1 of 8) 10013 NM_016129 51138 Hs.190384 NM_016129 ENSG00000138663 COPS4 CSN4|SGN4 COP9 signalosome subunit 4 protein-coding 139.667-216 chr9 124652674 124652826 + 1 NA intron (NM_033334, intron 2 of 9) intron (NM_033334, intron 2 of 9) -5686 NR_038975 100379345 Hs.660412 NR_038975 ENSG00000224020 MIR181A2HG - MIR181A2 host gene ncRNA 184.333-34 chr14 45839032 45839286 + 1 NA Intergenic Intergenic -123557 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 152.667-90 chr12 104626266 104626533 + 1 NA intron (NM_018413, intron 2 of 2) intron (NM_018413, intron 2 of 2) 34766 NR_037487 100500843 NR_037487 ENSG00000264295 MIR3922 - microRNA 3922 ncRNA 210.667-13 chr10 12168017 12168352 + 1 NA intron (NR_024576, intron 12 of 12) AluSc|SINE|Alu 27707 NM_014142 11164 Hs.555956 NM_014142 ENSG00000165609 NUDT5 YSA1|YSA1H|YSAH1|hNUDT5 nudix hydrolase 5 protein-coding 182.333-74 chr2 9135203 9135403 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -71462 NM_001135191 8853 Hs.555902 NM_003887 ENSG00000151693 ASAP2 AMAP2|CENTB3|DDEF2|PAG3|PAP|Pap-alpha|SHAG1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 434.667 chr13 91521600 91522078 + 1 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) MER21B|LTR|ERVL 123218 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 168.333-36 chr11 71415268 71415568 + 1 NA intron (NR_038862, intron 2 of 2) intron (NR_038862, intron 2 of 2) 7936 NR_038862 399923 Hs.128191 NM_001001680 ENSG00000172900 FLJ42102 - uncharacterized LOC399923 ncRNA 118.333-21 chr1 171323826 171323978 + 1 NA intron (NM_002022, intron 4 of 9) intron (NM_002022, intron 4 of 9) 9719 NM_002022 2329 Hs.386502 NM_002022 ENSG00000076258 FMO4 FMO2 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 4 protein-coding 144.333-145 chr2 216479534 216479713 + 1 NA intron (NM_001127207, intron 17 of 17) intron (NM_001127207, intron 17 of 17) -19221 NM_000998 6168 Hs.433701 NM_000998 ENSG00000197756 RPL37A L37A ribosomal protein L37a protein-coding 162.333-185 chr4 72281510 72281751 + 1 NA 3' UTR (NM_014243, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_014243, exon 22 of 22) 242498 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 140.667-219 chr7 111927457 111927693 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 12 of 52) intron (NM_001363540, intron 12 of 52) 119070 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 141.333-130 chr20 4319818 4319979 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -70611 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 170.333-178 chr5 140030638 140030960 + 1 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) intron (NM_013983, intron 1 of 10) 12500 NM_013982 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 191.667-68 chr2 106114642 106114874 + 1 NA intron (NM_025076, intron 9 of 14) intron (NM_025076, intron 9 of 14) 24123 NM_001253876 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 151.667-41 chr10 25213156 25213386 + 1 NA intron (NM_020752, intron 1 of 10) L1M5|LINE|L1 -36995 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 172.667-158 chr8 73645018 73645344 + 1 NA intron (NM_001164383, intron 1 of 9) L1MD2|LINE|L1 101659 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 175.667-58 chr18 13192009 13192272 + 1 NA Intergenic Intergenic -26620 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 322.333-2 chr1 157736653 157736995 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -36055 NR_135215 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 156.333-31 chr10 20207655 20207814 + 1 NA intron (NM_032812, intron 9 of 13) intron (NM_032812, intron 9 of 13) -344236 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 156.667-188 chr2 132733497 132733780 + 1 NA intron (NM_207481, intron 14 of 17) intron (NM_207481, intron 14 of 17) -62112 NM_001077427 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 373.667-6 chr2 45286633 45287225 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -31988 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 168.333-101 chr2 164911234 164911452 + 1 NA intron (NM_001199148, intron 9 of 10) intron (NM_001199148, intron 9 of 10) 44182 NM_001351539 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 171.333-160 chr5 179585930 179586248 + 1 NA intron (NM_001040452, intron 8 of 17) intron (NM_001040452, intron 8 of 17) 17652 NR_110560 101928445 Hs.663255 NR_110560 ENSG00000244945 LOC101928445 - uncharacterized LOC101928445 ncRNA 151.333-232 chr2 192520758 192520960 + 1 NA Intergenic Intergenic -228986 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 146.667-294 chr6 151373633 151373807 + 1 NA intron (NM_020861, intron 1 of 2) intron (NM_020861, intron 1 of 2) 17839 NM_020861 57621 Hs.520073 NM_020861 ENSG00000181472 ZBTB2 ZNF437 zinc finger and BTB domain containing 2 protein-coding 161.333-122 chr17 80852973 80853231 + 1 NA intron (NM_020761, intron 11 of 33) intron (NM_020761, intron 11 of 33) -47470 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 197.333-49 chr12 26362405 26362744 + 1 NA intron (NM_002223, intron 55 of 56) intron (NM_002223, intron 55 of 56) 167001 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 166.667-100 chr18 55105451 55105696 + 1 NA TTS (NR_110743) TTS (NR_110743) 18733 NR_110743 101927229 Hs.638474 NR_110743 ENSG00000267013 LINC01929 - long intergenic non-protein coding RNA 1929 ncRNA 256.667-58 chr3 106299201 106299698 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -430048 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 114.333-21 chr10 29225898 29226098 + 1 NA Intergenic Intergenic -63072 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 241.667-66 chr4 137216099 137216526 + 1 NA Intergenic Intergenic -3513 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 201.333-20 chr1 197383842 197384118 + 1 NA intron (NM_001193640, intron 3 of 9) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 115728 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 150.333-175 chr18 26198578 26198873 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -27720 NR_121653 6875 Hs.369519 NM_005640 ENSG00000141384 TAF4B SPGF13|TAF2C2|TAFII105 TATA-box binding protein associated factor 4b protein-coding 157.333-187 chr2 79300702 79300971 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -141083 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 157.333-161 chr18 2386840 2387049 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 184561 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 136.333-148 chr4 96231170 96231329 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -79454 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 140.667-178 chr5 20978536 20978770 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -363118 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 143.333-102 chr15 68937004 68937149 + 1 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) intron (NM_001184780, intron 1 of 15) 6551 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 253.667-12 chr10 110282157 110282649 + 1 NA intron (NM_001008541, intron 4 of 4) L3|LINE|CR1 22517 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 156.667-254 chr4 106890914 106891120 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 145296 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 199.667-12 chr10 39163554 39163992 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 467177 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 212.667-34 chr14 27708072 27708398 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -35014 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 121.667-137 chr4 32569103 32569300 + 1 NA Intergenic Intergenic 218163 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 267.333-71 chr4 148991123 148991451 + 1 NA Intergenic Intergenic -48909 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 208.667-147 chr8 119049636 119049915 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) intron (NM_001324095, intron 3 of 7) -17472 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 205.667-41 chr13 82534379 82534750 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -1307581 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 143.333-9 chr1 104138841 104139095 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 65945 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 128.333-43 chr11 131006538 131006741 + 1 NA Intergenic Intergenic -90152 NM_001347926 399979 Hs.444024 NM_014758 ENSG00000120451 SNX19 CHET8 sorting nexin 19 protein-coding 152.667-70 chr11 108688285 108688492 + 1 NA intron (NM_004398, intron 6 of 17) L1ME2z|LINE|L1 23319 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 210.333-11 chr10 11510887 11511117 + 1 NA intron (NM_014688, intron 5 of 14) intron (NM_014688, intron 5 of 14) 21278 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 147.667-253 chr4 45380804 45381085 + 1 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger -654310 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 241.667-52 chr3 23043086 23043352 + 1 NA Intergenic Intergenic 159359 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 148.667-152 chr16 87035833 87036034 + 1 NA Intergenic Intergenic -21851 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 221.667-71 chr6 11728406 11728777 + 1 NA intron (NM_032744, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 50456 NM_001143948 84830 Hs.126409 NM_032744 ENSG00000111863 ADTRP AIG1L|C6orf105|dJ413H6.1 androgen dependent TFPI regulating protein protein-coding 147.667-64 chr11 119780377 119780681 + 1 NA Intergenic Intergenic 50946 NR_120587 102724301 Hs.637640 NR_120587 ENSG00000254854 LOC102724301 - uncharacterized LOC102724301 ncRNA 277.333-69 chr4 154180008 154180537 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 311527 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 153.333-322 chr5 27599834 27600031 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 127640 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 119.333-239 chr9 112931399 112931553 + 1 NA Intergenic Intergenic -40600 NM_033051 57864 Hs.512668 NM_033051 ENSG00000119457 SLC46A2 Ly110|TSCOT solute carrier family 46 member 2 protein-coding 157.333-70 chr11 100958659 100958842 + 1 NA intron (NM_001367945, intron 14 of 25) intron (NM_001367945, intron 14 of 25) 24476 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 159.667-243 chr4 144534508 144534675 + 1 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 111428 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 200.667-79 chr2 114524809 114525138 + 1 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) L3|LINE|CR1 63396 NM_001321912 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 200.667-62 chr18 52599500 52599764 + 1 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) AluSq2|SINE|Alu 259435 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 151.333-330 chr5 36427922 36428196 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -126157 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 151.667-97 chr13 93777642 93777857 + 1 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) intron (NM_005708, intron 2 of 8) 80724 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 240.333-40 chr15 65209317 65209858 + 1 NA intron (NM_003613, intron 2 of 8) intron (NM_003613, intron 2 of 8) 1886 NM_003613 8483 Hs.442180 NM_003613 ENSG00000138615 CILP CILP-1|HsT18872 cartilage intermediate layer protein protein-coding 164.333-163 chr3 147334457 147334760 + 1 NA Intergenic Intergenic 57822 NR_040762 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 166.667-149 chr3 42250497 42250721 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 13338 NM_001174138 885 Hs.458426 NM_000729 ENSG00000187094 CCK - cholecystokinin protein-coding 135.667-135 chr4 125474797 125474954 + 1 NA intron (NM_001291303, intron 11 of 16) intron (NM_001291303, intron 11 of 16) -32384 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 277.333-2 chr1 97485663 97486131 + 1 NA intron (NM_000110, intron 13 of 22) HAL1|LINE|L1 -311024 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 197.667-6 chr1 97116191 97116514 + 1 NA intron (NM_000110, intron 20 of 22) intron (NM_000110, intron 20 of 22) 20429 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 234.333-75 chr7 40483710 40484013 + 1 NA intron (NM_024728, intron 11 of 14) L1ME3Cz|LINE|L1 348885 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 138.667-105 chr2 66008154 66008356 + 1 NA Intergenic Intergenic 350073 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 198.667-194 chr9 29093413 29093742 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 118722 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 184.333-40 chr14 60542487 60542800 + 1 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 33497 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 156.333-291 chr5 111488276 111488478 + 1 NA 3' UTR (NM_001323377, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001323377, exon 10 of 10) -23849 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 242.667-72 chr4 30124086 30124375 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -596139 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 151.667-10 chr1 75314836 75314987 + 1 NA intron (NM_001320287, intron 4 of 24) intron (NM_001320287, intron 4 of 24) 180523 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 188.333-55 chr16 52858841 52859153 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 193876 NR_136518 105371267 Hs.147562 NR_136518 ENSG00000277639 LOC105371267 PR-lncRNA-1 p53-regulated lncRNA 1 ncRNA 160.333-82 chr13 22525102 22525325 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 314928 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 220.333-20 chr10 114710562 114710816 + 1 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) AluJb|SINE|Alu -25686 NM_001322882 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 161.333-221 chr4 108287595 108287766 + 1 NA Intergenic Intergenic 115560 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 195.333-25 chr10 4289963 4290418 + 1 NA Intergenic Intergenic -46278 NR_108040 100652988 Hs.433011 NR_108040 LINC00702 - long intergenic non-protein coding RNA 702 ncRNA 190.667-22 chr11 57103664 57104035 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 66315 NR_036445 219525 Hs.554519 NR_036445 ENSG00000283307 OR5AK4P PJCG3 olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene pseudo 148.667-387 chr8 124777581 124777898 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -44246 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 259.667-58 chr4 160903402 160903687 + 1 NA Intergenic (TTTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1119189 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 170.333-73 chr14 54113954 54114131 + 1 NA Intergenic Intergenic -157151 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 233.333-42 chr15 64508728 64509122 + 1 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 9505 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 170.667-163 chr8 72213715 72214027 + 1 NA intron (NR_033867, intron 14 of 19) L1MB5|LINE|L1 37763 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 183.333-145 chr6 150396048 150396295 + 1 NA intron (NR_134655, intron 5 of 5) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 27159 NR_134655 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 131.667-115 chr21 24351902 24352062 + 1 NA Intergenic Intergenic -30605 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 204.667-65 chr2 13198754 13199082 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -191905 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 122.333-130 chr22 24826986 24827147 + 1 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) intron (NM_001098498, intron 2 of 23) 20845 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 194.667-57 chr18 67830452 67830708 + 1 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) -15758 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 147.667-90 chr13 72684700 72684847 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 42856 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 126.333-103 chr2 240990952 240991133 + 1 NA intron (NM_001351305, intron 30 of 31) intron (NM_001351305, intron 30 of 31) -7576 NM_001080437 25992 Hs.471834 NM_001080437 ENSG00000162804 SNED1 IRE-BP1|SST3|Snep sushi, nidogen and EGF like domains 1 protein-coding 179.667-61 chr17 19882474 19882707 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -14654 NM_014683 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 165.333-44 chr11 74911332 74911603 + 1 NA intron (NM_001270380, intron 8 of 14) intron (NM_001270380, intron 8 of 14) 37624 NM_001270380 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 150.667-262 chr4 60869756 60869911 + 1 NA Intergenic Intergenic -52786 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 176.333-40 chr12 119254643 119254847 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 48635 NR_024246 144742 Hs.524782 NR_024246 ENSG00000281196 LINC00934 - long intergenic non-protein coding RNA 934 ncRNA 160.667-85 chr14 36173677 36173887 + 1 NA intron (NR_049735, intron 1 of 3) L1MEf|LINE|L1 2869 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 137.333-142 chr4 130870388 130870551 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 494108 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 169.667-58 chr14 46700986 46701250 + 1 NA Intergenic Intergenic -49337 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 184.333-47 chr15 56646984 56647246 + 1 NA intron (NM_001002843, intron 18 of 20) intron (NM_001002843, intron 18 of 20) 86971 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 173.667-31 chr11 116021839 116022084 + 1 NA Intergenic Intergenic -261761 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 219.667-32 chr17 58104985 58105237 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 21692 NM_080677 140735 Hs.720595 NM_080677 ENSG00000264364 DYNLL2 DNCL1B|Dlc2|RSPH22 dynein light chain LC8-type 2 protein-coding 329.333-3 chr1 176724790 176725479 + 1 NA intron (NM_020318, intron 12 of 22) MER58B|DNA|hAT-Charlie 261959 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 161.333-242 chr6 44453947 44454186 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 18425 NR_039785 100616352 NR_039785 ENSG00000266619 MIR4642 - microRNA 4642 ncRNA 240.333-12 chr10 60169427 60169992 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 22 of 43) L1MC3|LINE|L1 -28693 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 130.333-83 chr16 50897195 50897340 + 1 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) L1MEc|LINE|L1 18494 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 152.333-65 chr11 84668837 84669011 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L2a|LINE|L2 52018 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 156.333-27 chr1 232475191 232475457 + 1 NA intron (NM_020808, intron 5 of 20) L2a|LINE|L2 40284 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 134.667-162 chr5 89563973 89564176 + 1 NA Intergenic Intergenic 452646 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 147.667-364 chr8 101468924 101469184 + 1 NA Intergenic Intergenic -23385 NM_024915 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 162.333-150 chr22 33878489 33878726 + 1 NA intron (NM_001362949, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 41821 NM_133642 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 185.667-43 chr16 77056885 77057092 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -134202 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 509.333-2 chr12 123799838 123800678 + 1 NA exon (NM_207437, exon 14 of 78) exon (NM_207437, exon 14 of 78) 37763 NM_207437 196385 Hs.622654 NM_207437 ENSG00000197653 DNAH10 - dynein axonemal heavy chain 10 protein-coding 153.333-323 chr5 31970256 31970421 + 1 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) L1ME3G|LINE|L1 -34179 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 146.333-215 chr3 106784314 106784497 + 1 NA Intergenic Intergenic 456233 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 161.333-145 chr2 80353778 80353960 + 1 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) MER135|DNA|DNA 40490 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 120.667-104 chr20 22032182 22032335 + 1 NA Intergenic Intergenic -21832 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 154.333-108 chr15 73046796 73047040 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5545 NM_002499 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 157.333-33 chr1 191244386 191244598 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -15994 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 229.667-29 chr14 70224195 70224702 + 1 NA intron (NR_135825, intron 2 of 3) intron (NR_135825, intron 2 of 3) 23353 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 181.333-90 chr20 11557260 11557458 + 1 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL -283976 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 188.333-57 chr17 38942053 38942430 + 1 NA intron (NM_001008777, intron 9 of 10) intron (NM_001008777, intron 9 of 10) 17073 NR_038847 100505576 Hs.634043 NR_038847 ENSG00000263874 LINC00672 - long intergenic non-protein coding RNA 672 ncRNA 180.333-52 chr2 9918795 9919094 + 1 NA intron (NM_001318977, intron 11 of 13) intron (NM_001318977, intron 11 of 13) -32749 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 174.667-53 chr14 62449510 62449743 + 1 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -309653 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 130.333-156 chr4 135946547 135946726 + 1 NA Intergenic Intergenic -32956 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 160.333-216 chr4 74264101 74264388 + 1 NA intron (NR_147097, intron 8 of 9) L1M4|LINE|L1 -44226 NM_001270993 255324 Hs.401237 NM_001013442 ENSG00000182585 EPGN ALGV3072|EPG|PRO9904 epithelial mitogen protein-coding 119.667-155 chr5 100254746 100254891 + 1 NA Intergenic Intergenic 133436 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 236.333 chr1 16102371 16102697 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -28883 NM_182623 348487 Hs.126825 NM_182623 ENSG00000185519 FAM131C C1orf117 family with sequence similarity 131 member C protein-coding 256.667-28 chr14 79921341 79921742 + 1 NA Intergenic Intergenic -289878 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 300.333-44 chr7 61949988 61950430 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1353847 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 166.333-75 chr15 40166962 40167156 + 1 NA intron (NM_001211, intron 2 of 22) LTR56|LTR|ERV1 6050 NM_001211 701 Hs.513645 NM_001211 ENSG00000156970 BUB1B BUB1beta|BUBR1|Bub1A|MAD3L|MVA1|SSK1|hBUBR1 BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase B protein-coding 258.333-4 chr1 234526222 234526652 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 5342 NR_038426 100506795 Hs.448989 NR_038426 ENSG00000231768 LINC01354 - long intergenic non-protein coding RNA 1354 ncRNA 149.333-208 chr2 209976462 209976675 + 1 NA intron (NM_032504, intron 56 of 63) intron (NM_032504, intron 56 of 63) -25997 NM_001318927 6120 Hs.282260 NM_006916 ENSG00000197713 RPE RPE2-1 ribulose-5-phosphate-3-epimerase protein-coding 133.667-75 chr2 100917142 100917334 + 1 NA intron (NM_002518, intron 2 of 20) L1ME1|LINE|L1 59923 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 179.667-98 chr4 63928234 63928512 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 481077 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 194.667-135 chr6 52208262 52208585 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 22048 NM_002190 3605 Hs.41724 NM_002190 ENSG00000112115 IL17A CTLA-8|CTLA8|IL-17|IL-17A|IL17 interleukin 17A protein-coding 153.333-386 chr7 80841305 80841505 + 1 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) intron (NM_006379, intron 2 of 17) 77646 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 171.667-167 chr8 115525747 115526022 + 1 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 142129 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 208.667-132 chr7 87777191 87777474 + 1 NA intron (NM_138290, intron 8 of 11) MIR|SINE|MIR -64009 NM_001348944 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 155.333-361 chr7 33394445 33394740 + 1 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 265028 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 308.667-2 chr1 110026468 110026853 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -4917 NM_001270768 85369 Hs.584996 NM_033088 ENSG00000143093 STRIP1 FAM40A|FAR11A striatin interacting protein 1 protein-coding 157.667-50 chr11 27331762 27331943 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 31363 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 176.333-2 chr1 27259390 27259657 + 1 NA intron (NM_001276252, intron 1 of 15) FLAM_C|SINE|Alu 24891 NM_015023 23038 Hs.469154 NM_015023 ENSG00000142784 WDTC1 ADP|DCAF9 WD and tetratricopeptide repeats 1 protein-coding 167.333-77 chr14 46861714 46862057 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 14 of 16) intron (NM_001113498, intron 14 of 16) -210104 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 198.667-86 chr18 4133277 4133582 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) -131173 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 146.667-151 chr2 22182002 22182352 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -354302 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 195.667-44 chr14 60371610 60371959 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 48588 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 162.333-31 chr10 60268308 60268500 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 6 of 43) L1MC|LINE|L1 121471 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 144.333-150 chr20 55682518 55682784 + 1 NA Intergenic Intergenic -255454 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 200.667-140 chr6 141556358 141556571 + 1 NA Intergenic Intergenic 532335 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 164.333-87 chr16 78784627 78784840 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 685079 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 162.667-106 chr17 73099758 73099999 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -7190 NM_001159770 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 119.333-154 chr3 119999101 119999246 + 1 NA intron (NM_002093, intron 2 of 11) intron (NM_002093, intron 2 of 11) 85475 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 192.333-102 chr20 8663836 8664139 + 1 NA intron (NM_182734, intron 9 of 32) intron (NM_182734, intron 9 of 32) -167198 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 145.667-160 chr20 46248973 46249237 + 1 NA intron (NM_021248, intron 2 of 11) MIRb|SINE|MIR 59393 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 153.667-293 chr4 73725021 73725300 + 1 NA Intergenic Intergenic -15409 NM_000584 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 164.333-49 chr12 18835831 18836058 + 1 NA Intergenic Intergenic 97825 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 143.667-205 chr5 103830250 103830436 + 1 NA Intergenic Intergenic -267554 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 207.333-4 chr1 49872396 49872772 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) MER4-int|LTR|ERV1 151370 NR_136623 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 201.667-107 chr6 93586359 93586733 + 1 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -117471 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 217.667-13 chr10 57733037 57733485 + 1 NA Intergenic Intergenic -428702 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 135.667-170 chr7 37102268 37102418 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 14 of 21) intron (NM_001206480, intron 14 of 21) 104547 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 178.333-8 chr1 168846481 168846766 + 1 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 59682 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 159.333-228 chr4 6982094 6982315 + 1 NA intron (NM_020773, intron 3 of 13) L1ME1|LINE|L1 -5005 NM_001113363 57533 Hs.518611 NM_020773 ENSG00000132405 TBC1D14 - TBC1 domain family member 14 protein-coding 163.333-206 chr4 113690383 113690670 + 1 NA intron (NM_001321585, intron 2 of 19) intron (NM_001321585, intron 2 of 19) 71212 NM_001321592 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 241.333-56 chr2 161343071 161343360 + 1 NA intron (NM_005805, intron 3 of 11) L1MB3|LINE|L1 34790 NM_005805 10213 Hs.740477 NM_005805 ENSG00000115233 PSMD14 PAD1|POH1|RPN11 proteasome 26S subunit, non-ATPase 14 protein-coding 151.667-311 chr6 63630924 63631079 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -4801 NM_001370350 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 323.667-22 chr5 68263494 68264040 + 1 NA intron (NM_181523, intron 2 of 15) intron (NM_181523, intron 2 of 15) -24752 NM_181524 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 294.333-41 chr6 137217554 137217920 + 1 NA intron (NM_001363526, intron 1 of 7) intron (NM_001363526, intron 1 of 7) 1459 NM_001363527 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 189.667-87 chr20 52080992 52081253 + 1 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 24362 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 149.333-294 chr4 151629738 151629926 + 1 NA exon (NM_001348694, exon 7 of 13) exon (NM_001348694, exon 7 of 13) 131175 NM_004564 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 372.667-3 chr10 43170295 43170793 + 1 NA intron (NM_018590, intron 6 of 7) L1MD3|LINE|L1 15647 NM_001319654 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 189.667-141 chr8 79818293 79818631 + 1 NA intron (NR_110954, intron 3 of 5) intron (NR_110954, intron 3 of 5) 50320 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 165.667-218 chr9 104224713 104225014 + 1 NA Intergenic Intergenic -45366 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 151.667-289 chr5 121298640 121298808 + 1 NA Intergenic Intergenic -23826 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 165.333-118 chr2 4438573 4438795 + 1 NA Intergenic Intergenic 217538 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 202.333-172 chr8 80022454 80022857 + 1 NA intron (NM_014018, intron 1 of 2) intron (NM_014018, intron 1 of 2) 7604 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 171.667-97 chr20 32327844 32328165 + 1 NA intron (NM_004798, intron 7 of 8) AluJb|SINE|Alu -30340 NM_001164603 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 157.333-202 chr2 175716974 175717232 + 1 NA Intergenic Intergenic 285164 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 153.333-60 chr11 5761054 5761241 + 1 NA Intergenic Intergenic 6454 NM_001005175 390072 Hs.553735 NM_001005175 ENSG00000181074 OR52N4 OR11-64 olfactory receptor family 52 subfamily N member 4 (gene/pseudogene) protein-coding 170.667-22 chr11 17872043 17872222 + 1 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) L1ME3|LINE|L1 136184 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 131.667-155 chr5 11907271 11907460 + 1 NA Intergenic Intergenic -2919 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 239.667-33 chr18 21709712 21710032 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5098 NM_138340 171586 Hs.397978 NM_138340 ENSG00000158201 ABHD3 LABH3 abhydrolase domain containing 3 protein-coding 288.667-24 chr4 182590874 182591230 + 1 NA intron (NM_001080477, intron 3 of 27) L2a|LINE|L2 326201 NM_001351744 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 228.667-84 chr9 86316119 86316475 + 1 NA intron (NM_001185059, intron 17 of 26) MIR3|SINE|MIR -33759 NM_030940 81689 Hs.449291 NM_030940 ENSG00000135070 ISCA1 HBLD2|ISA1|MMDS5|hIscA iron-sulfur cluster assembly 1 protein-coding 151.333-277 chr3 50331553 50331831 + 1 NA exon (NM_170714, exon 4 of 6) exon (NM_170714, exon 4 of 6) -3454 NM_007275 11334 Hs.517981 NM_007275 ENSG00000114383 TUSC2 C3orf11|FUS1|PAP|PDAP2 tumor suppressor 2, mitochondrial calcium regulator protein-coding 190.333-35 chr11 117904514 117904865 + 1 NA intron (NM_001077263, intron 10 of 12) MER90a|LTR|ERV1 24713 NM_001206789 84000 Hs.266308 NM_032046 ENSG00000137747 TMPRSS13 MSP|MSPL|MSPS|TMPRSS11 transmembrane serine protease 13 protein-coding 122.667-71 chr17 58129414 58129708 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -25593 NM_012374 26689 Hs.531188 NM_012374 ENSG00000141194 OR4D1 OR17-23|OR4D3|OR4D4P|TPCR16 olfactory receptor family 4 subfamily D member 1 protein-coding 186.667-54 chr17 60405429 60405638 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13400 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 301.333-17 chr15 64486592 64486935 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -12657 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 140.667-238 chr8 129910132 129910379 + 1 NA intron (NM_001353246, intron 1 of 12) intron (NM_001353246, intron 1 of 12) 29556 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 143.333-125 chr19 24366927 24367136 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -203584 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 147.333-188 chr20 35048591 35048879 + 1 NA intron (NM_199368, intron 6 of 18) intron (NM_199368, intron 6 of 18) 44072 NM_015638 26133 Hs.168073 NM_015638 ENSG00000100991 TRPC4AP C20orf188|PPP1R158|TRRP4AP|TRUSS transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein protein-coding 159.333-75 chr12 100945629 100945887 + 1 NA intron (NM_001286616, intron 4 of 26) intron (NM_001286616, intron 4 of 26) 44112 NM_001286616 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 168.667-25 chr10 74378552 74378814 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) L2a|LINE|L2 150641 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 163.333-243 chr6 66005871 66006075 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 218094 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 159.667-54 chr10 89869654 89869894 + 1 NA intron (NR_149080, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 15868 NR_149080 105378425 Hs.559891 NR_149079 ENSG00000280560 LINC01374 TCONS_00018278 long intergenic non-protein coding RNA 1374 ncRNA 119.667-159 chr5 166561314 166561492 + 1 NA Intergenic Intergenic 364967 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 148.333-333 chr5 146795035 146795243 + 1 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 83646 NM_001271948 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 151.333-243 chr20 21132485 21132660 + 1 NA intron (NM_001163023, intron 2 of 10) AluSz|SINE|Alu 6490 NM_001352436 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 142.333-103 chr17 67936873 67937146 + 1 NA intron (NM_182641, intron 18 of 27) L2a|LINE|L2 56597 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 137.667-76 chr17 60878254 60878510 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 9 of 25) L1ME3A|LINE|L1 200531 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 187.333-192 chr7 88083954 88084338 + 1 NA intron (NM_001324421, intron 4 of 28) intron (NM_001324421, intron 4 of 28) -132514 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 164.333-28 chr10 78083846 78084108 + 1 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 50114 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 152.333-235 chr3 70563888 70564162 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -251387 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 133.333-75 chr2 35405758 35405966 + 1 NA Intergenic Intergenic -65543 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 152.333-27 chr1 181474275 181474565 + 1 NA Intergenic Intergenic -9097 NM_001205293 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 158.667-179 chr2 220464703 220464981 + 1 NA Intergenic Intergenic -558277 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 194.667-147 chr7 84147483 84147855 + 1 NA intron (NM_006080, intron 1 of 16) L2c|LINE|L2 47120 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 153.667-402 chr9 70297997 70298223 + 1 NA exon (NM_015110, exon 9 of 25) exon (NM_015110, exon 9 of 25) 39132 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 152.667-375 chr8 84333609 84333797 + 1 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -81781 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 179.667-128 chr7 96421458 96421651 + 1 NA Intergenic Intergenic 81969 NR_163949 238.667-61 chr4 70711990 70712335 + 1 NA intron (NM_001130709, intron 1 of 11) intron (NM_001130709, intron 1 of 11) 7225 NM_001130709 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 158.333-309 chr7 145790198 145790480 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -954286 NM_001350887 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 202.667-134 chr7 39645532 39645841 + 1 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 22114 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 121.667-90 chr2 57467657 57467890 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -439878 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 330.667-27 chr7 48368957 48369618 + 1 NA intron (NM_152701, intron 32 of 61) L1PB1|LINE|L1 197829 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 136.333-117 chr22 17443905 17444227 + 1 NA intron (NM_001290047, intron 1 of 18) intron (NM_001290047, intron 1 of 18) 74606 NM_001290047 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 153.667-5 chr1 48299712 48299870 + 1 NA intron (NM_019073, intron 12 of 12) MIRb|SINE|MIR 77075 NM_001011547 200010 Hs.37890 NM_001011547 ENSG00000117834 SLC5A9 SGLT4 solute carrier family 5 member 9 protein-coding 244.667-65 chr22 29321899 29322290 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6397 NM_006477 10633 Hs.73088 NM_006477 ENSG00000100276 RASL10A RRP22 RAS like family 10 member A protein-coding 162.667-83 chr14 81171332 81171633 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 31352 NR_003021 677845 Hs.693251 NR_003021 ENSG00000221303 SNORA79 ACA65|SNORA79A small nucleolar RNA, H/ACA box 79 snoRNA 168.667-169 chr5 5545508 5545680 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 122917 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 156.667-189 chr2 133039619 133039878 + 1 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) MER5A|DNA|hAT-Charlie 124191 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-288 chr5 38623033 38623242 + 1 NA intron (NR_103554, intron 2 of 8) intron (NR_103554, intron 2 of 8) -27732 NM_002310 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 157.667-37 chr10 87741014 87741217 + 1 NA intron (NM_001015880, intron 9 of 12) intron (NM_001015880, intron 9 of 12) 77116 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 147.333-171 chr2 79943745 79944024 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -77301 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 190.667-161 chrX 3165633 3165871 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 98953 NM_004042 416 Hs.101674 NM_004042 ENSG00000062096 ARSF ASF arylsulfatase F protein-coding 150.333-359 chr6 62864497 62864664 + 1 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite 455397 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 250.333-74 chr8 83454095 83454505 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 50542 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 117.667-113 chr3 35800456 35800607 + 1 NA Intergenic Intergenic 56055 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 135.333-162 chr6 105215592 105215751 + 1 NA Intergenic Intergenic -35657 NM_022361 64208 Hs.458336 NM_022361 ENSG00000132429 POPDC3 POP3|bA355M14.1 popeye domain containing 3 protein-coding 151.667-399 chrX 20262898 20263141 + 1 NA intron (NM_004586, intron 1 of 21) intron (NM_004586, intron 1 of 21) 3890 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 111.667-182 chr4 52688325 52688493 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -23985 NR_145130 57291 Hs.744077 NR_024031 ENSG00000226950 DANCR AGU2|ANCR|KIAA0114|SNHG13|lncRNA-ANCR differentiation antagonizing non-protein coding RNA ncRNA 148.667-222 chr20 45938045 45938195 + 1 NA intron (NM_022104, intron 2 of 16) intron (NM_022104, intron 2 of 16) 3437 NM_022104 63935 Hs.472856 NM_022104 ENSG00000100982 PCIF1 C20orf67|CAPAM|PPP1R121|hCAPAM|hPCIF1 PDX1 C-terminal inhibiting factor 1 protein-coding 180.667-43 chr14 56046810 56047188 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -71412 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 214.333-160 chr8 134228233 134228555 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 341898 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 140.333-229 chr8 63359189 63359337 + 1 NA Intergenic Intergenic -106586 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 150.333-18 chr1 164297862 164298020 + 1 NA Intergenic Intergenic -261419 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 147.333-175 chr2 149075255 149075427 + 1 NA intron (NM_001317006, intron 1 of 4) intron (NM_001317006, intron 1 of 4) -2181 NM_001317004 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 163.667-258 chr8 129211907 129212210 + 1 NA Intergenic Intergenic 29182 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 134.333-28 chr11 58165318 58165515 + 1 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) intron (NM_001005212, intron 2 of 2) -25018 NM_001005283 219957 Hs.553643 NM_001005283 ENSG00000186513 OR9Q2 OR9Q2P olfactory receptor family 9 subfamily Q member 2 protein-coding 154.333-149 chr2 47328948 47329206 + 1 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -6238 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 274.667-2 chr1 40603683 40604141 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 61770 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 249.333-35 chr15 68940371 68940746 + 1 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) L1MC5|LINE|L1 10033 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 169.333-230 chr6 90717647 90717860 + 1 NA Intergenic Intergenic -130681 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 149.667-22 chr1 103343525 103343817 + 1 NA Intergenic Intergenic 181840 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 218.667-84 chr5 75659908 75660327 + 1 NA intron (NM_001276713, intron 10 of 13) L1MB2|LINE|L1 48641 NM_001276713 728780 Hs.370455 NM_001271529 ENSG00000189045 ANKDD1B - ankyrin repeat and death domain containing 1B protein-coding 155.667-16 chr1 102991631 102991929 + 1 NA intron (NM_001854, intron 28 of 66) intron (NM_001854, intron 28 of 66) 116716 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 331.333-23 chr17 70969221 70969635 + 1 NA Intergenic Intergenic 232751 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 293.333-20 chr17 66646854 66647389 + 1 NA intron (NM_002737, intron 5 of 16) intron (NM_002737, intron 5 of 16) -139951 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 294.333-5 chr10 32764535 32765211 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 136599 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 130.667-141 chr3 49388748 49388960 + 1 NA intron (NM_001664, intron 1 of 4) L1MB8|LINE|L1 23122 NM_001313947 387 Hs.247077 NM_001664 ENSG00000067560 RHOA ARH12|ARHA|RHO12|RHOH12 ras homolog family member A protein-coding 150.667-384 chr8 120705765 120705983 + 1 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR -55379 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 172.667-109 chr4 71939226 71939407 + 1 NA Intergenic Intergenic -92488 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 144.667-129 chr2 12546577 12546730 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) -170219 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 142.333-41 chr11 37799338 37799497 + 1 NA Intergenic Intergenic -139184 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 148.333-38 chr10 11544629 11544893 + 1 NA intron (NM_014688, intron 2 of 14) AluSq2|SINE|Alu -12481 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 204.333-118 chr21 29309685 29309997 + 1 NA intron (NR_027655, intron 1 of 7) intron (NR_027655, intron 1 of 7) 4637 NR_027655 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 196.667-69 chr2 27929758 27930094 + 1 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) intron (NM_199193, intron 4 of 13) -38812 NR_028308 100302650 Hs.729719 NR_028308 BABAM2-AS1 BRE-AS1 BABAM2 antisense RNA 1 ncRNA 133.667-54 chr15 56238510 56238770 + 1 NA intron (NM_001370561, intron 4 of 11) intron (NM_001370561, intron 4 of 11) 5239 NM_001368073 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 179.333-28 chr10 94934986 94935221 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -3555 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 207.667-100 chr5 50840805 50841059 + 1 NA intron (NM_024615, intron 25 of 25) intron (NM_024615, intron 25 of 25) 129255 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 354.333-17 chr7 620198 620606 + 1 NA intron (NM_001164760, intron 4 of 10) L1M5|LINE|L1 17004 NR_110055 101926963 Hs.521338 NR_110054 LOC101926963 - uncharacterized LOC101926963 ncRNA 310.333-32 chr4 162579437 162579953 + 1 NA Intergenic Intergenic -415661 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 188.667-26 chr11 60763451 60763691 + 1 NA intron (NM_152717, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 6704 NM_001278242 219995 Hs.207465 NM_152717 ENSG00000166961 MS4A15 - membrane spanning 4-domains A15 protein-coding 114.667-91 chr15 57845243 57845488 + 1 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 138651 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 132.667-6 chr1 113711395 113711619 + 1 NA intron (NM_001323043, intron 10 of 18) intron (NM_001323043, intron 10 of 18) 47648 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 188.667-133 chr6 155463183 155463416 + 1 NA Intergenic Intergenic -7460 NM_015718 50508 Hs.247776 NM_015718 ENSG00000074771 NOX3 GP91-3|MOX-2 NADPH oxidase 3 protein-coding 251.333-44 chr17 60474363 60474885 + 1 NA intron (NM_006380, intron 4 of 12) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 51616 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 153.333-425 chr8 115435004 115435203 + 1 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 232910 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 220.333-72 chr20 48162303 48162718 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -172393 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 293.667-52 chr6 45256925 45257431 + 1 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1MB8|LINE|L1 -59408 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 202.667-50 chr14 55265247 55265566 + 1 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -6015 NM_017943 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 181.667-10 chr10 27089266 27089581 + 1 NA intron (NM_014915, intron 4 of 33) intron (NM_014915, intron 4 of 33) 11075 NM_001256053 22852 Hs.361041 NM_014915 ENSG00000107890 ANKRD26 THC2|bA145E8.1 ankyrin repeat domain 26 protein-coding 207.333-288 chrX 139358552 139358921 + 1 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -88083 NR_028597 6719 Hs.730315 NR_028597 SRD5A1P1 SRD5AP1 steroid 5 alpha-reductase 1 pseudogene 1 pseudo 161.667-242 chr7 96186787 96187005 + 1 NA intron (NM_001160210, intron 9 of 17) intron (NM_001160210, intron 9 of 17) 32860 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 157.333-356 chr9 12928734 12928891 + 1 NA Intergenic Intergenic 43821 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 148.333-91 chr12 38594599 38594793 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 277922 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 157.333-84 chr12 46905917 46906126 + 1 NA Intergenic Intergenic -80024 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 201.333-98 chr14 61850610 61850951 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) intron (NM_001367656, intron 1 of 7) 38077 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 216.333-109 chr4 96882314 96882561 + 1 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -484489 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 154.333-146 chr2 41673151 41673315 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -204322 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 213.667-88 chr7 48472272 48472664 + 1 NA intron (NM_152701, intron 45 of 61) intron (NM_152701, intron 45 of 61) 301010 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 206.667-126 chr7 17861817 17862153 + 1 NA intron (NM_001350862, intron 9 of 25) MER50|LTR|ERV1 78509 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 306.667-38 chr6 45918773 45919262 + 1 NA non-coding (NR_045674, exon 3 of 5) non-coding (NR_045674, exon 3 of 5) 18580 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 138.333-141 chr4 182739580 182739731 + 1 NA intron (NM_001080477, intron 18 of 27) intron (NM_001080477, intron 18 of 27) 177598 NM_001351744 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 150.667-277 chr4 105358743 105359027 + 1 NA Intergenic Intergenic -6004 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 152.333-379 chr8 88323425 88323745 + 1 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 3898 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 152.667-167 chr2 28197456 28197746 + 1 NA intron (NR_120504, intron 1 of 2) intron (NR_120504, intron 1 of 2) 9360 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 138.333-106 chr2 221408016 221408176 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 164208 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 153.667-175 chr2 41062374 41062578 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -550041 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 166.667-142 chr22 27456949 27457246 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 146446 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 147.333-98 chr14 50499806 50499983 + 1 NA intron (NM_198794, intron 3 of 31) HAL1b|LINE|L1 32675 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 181.667-100 chr3 153084677 153085052 + 1 NA Intergenic Intergenic -77362 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 160.667-320 chr9 12706963 12707235 + 1 NA intron (NM_000550, intron 6 of 7) intron (NM_000550, intron 6 of 7) 13714 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 157.333-108 chr14 70067769 70068058 + 1 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) 12304 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 181.667-39 chr15 33674050 33674379 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 38 of 102) intron (NM_001243996, intron 38 of 102) -294283 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 141.333-63 chr14 29102504 29102748 + 1 NA Intergenic Intergenic -316839 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 191.333-215 chr9 17232720 17232998 + 1 NA intron (NM_001365029, intron 3 of 25) intron (NM_001365029, intron 3 of 25) 97819 NM_001365029 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 197.667-81 chr22 50024661 50024880 + 1 NA intron (NM_001350317, intron 13 of 13) MER65C|LTR|ERV1 -12005 NM_001371417 162.667-124 chr2 39842257 39842432 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -63068 NM_001321468 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 144.667-309 chr8 129742418 129742571 + 1 NA Intergenic Intergenic 44130 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 151.333-6 chr1 44050160 44050380 + 1 NA Intergenic Intergenic -18808 NM_001024845 6536 Hs.442590 NM_006934 ENSG00000196517 SLC6A9 GCENSG|GLYT1 solute carrier family 6 member 9 protein-coding 146.667-311 chr7 82030457 82030625 + 1 NA TTS (NR_110076) TTS (NR_110076) 21364 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 159.667-224 chr3 188601468 188601644 + 1 NA intron (NM_001167672, intron 4 of 9) intron (NM_001167672, intron 4 of 9) -32890 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 152.667-276 chr4 77454200 77454396 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -57455 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 199.667-103 chr4 77098651 77098949 + 1 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -22811 NM_006835 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 317.333-7 chr12 3638721 3639190 + 1 NA intron (NM_001144958, intron 13 of 19) MIR3|SINE|MIR 114154 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 199.667-36 chr12 115811982 115812408 + 1 NA Intergenic Intergenic 336459 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 219.333-158 chr6 74298594 74299084 + 1 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) L1MA9|LINE|L1 229388 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 259.667-49 chr3 152615162 152615510 + 1 NA Intergenic MER101|LTR|ERV1 -219795 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 151.667-259 chr4 136602365 136602640 + 1 NA Intergenic Intergenic -591254 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 329.333-42 chr4 149274526 149275053 + 1 NA intron (NR_125887, intron 12 of 12) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 120494 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 133.667-112 chr4 83825485 83825682 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 289475 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 272.333-30 chr2 39596176 39596508 + 1 NA intron (NR_037875, intron 5 of 5) intron (NR_037875, intron 5 of 5) -69156 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 146.667-5 chr1 45314027 45314222 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 10214 NR_024270 400752 Hs.334348 NR_024270 ENSG00000281912 LINC01144 - long intergenic non-protein coding RNA 1144 ncRNA 142.667-69 chr15 75914043 75914235 + 1 NA non-coding (NR_037623, exon 3 of 6) non-coding (NR_037623, exon 3 of 6) 10261 NM_147188 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 149.333-108 chr14 35450314 35450481 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -45643 NM_020529 4792 Hs.81328 NM_020529 ENSG00000100906 NFKBIA EDAID2|IKBA|MAD-3|NFKBI NFKB inhibitor alpha protein-coding 203.333-210 chr5 71834039 71834334 + 1 NA Intergenic Intergenic 114911 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 240.333-47 chr19 28237367 28237642 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -369184 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 165.667-147 chr4 101934259 101934558 + 1 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) intron (NM_017935, intron 7 of 16) 120566 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 150.333-273 chr3 115642286 115642528 + 1 NA intron (NM_002045, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 18897 NM_001130064 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 190.333-107 chr4 77406197 77406601 + 1 NA Intergenic Intergenic -105354 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 163.333-11 chr1 77304961 77305213 + 1 NA intron (NM_012093, intron 5 of 13) L1MA1|LINE|L1 22000 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 209.333-206 chr6 101264039 101264328 + 1 NA Intergenic Intergenic -134802 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 118.667-85 chr17 59870487 59870669 + 1 NA intron (NM_001193612, intron 6 of 8) HAL1|LINE|L1 22365 NM_016261 51174 Hs.463638 NM_016261 ENSG00000108423 TUBD1 TUBD tubulin delta 1 protein-coding 197.667-87 chr3 103309644 103310039 + 1 NA Intergenic Intergenic 214275 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 155.333-261 chr4 54843665 54843834 + 1 NA Intergenic Intergenic 185821 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 192.333-154 chr6 167573688 167573900 + 1 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -101004 NR_134591 105378127 Hs.58456 NR_134591 LOC105378127 - uncharacterized LOC105378127 ncRNA 145.333-145 chr2 138844460 138844737 + 1 NA Intergenic Intergenic -52726 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 165.333-71 chr14 44895672 44895978 + 1 NA Intergenic Intergenic -1450 NM_001017923 122525 Hs.82098 NM_001017923 ENSG00000179476 C14orf28 DRIP-1|DRIP1|c14_5270 chromosome 14 open reading frame 28 protein-coding 136.667-160 chr6 142781697 142781910 + 1 NA intron (NM_006734, intron 3 of 9) intron (NM_006734, intron 3 of 9) -143914 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 161.333-163 chr2 213457919 213458195 + 1 NA intron (NR_047660, intron 8 of 14) L1MEg|LINE|L1 173593 NR_047660 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 143.667-115 chr18 12656263 12656439 + 1 NA intron (NM_020148, intron 1 of 15) intron (NM_020148, intron 1 of 15) 381 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 217.333-162 chr9 37390323 37390794 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -32138 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 132.333-116 chr4 16689943 16690239 + 1 NA intron (NM_001304435, intron 2 of 7) intron (NM_001304435, intron 2 of 7) 208554 NM_001130834 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 173.667-175 chr8 73175495 73175767 + 1 NA Intergenic Intergenic -82459 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 191.667-10 chr1 228453484 228453880 + 1 NA Intergenic Intergenic 4177 NM_033445 92815 Hs.26331 NM_033445 ENSG00000181218 HIST3H2A - histone cluster 3 H2A protein-coding 191.667-98 chr4 108794133 108794472 + 1 NA Intergenic Intergenic -31249 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 283.667-6 chr10 99516054 99516430 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 14935 NR_120618 101927324 Hs.642588 NR_120618 ENSG00000257582 LINC01475 - long intergenic non-protein coding RNA 1475 ncRNA 147.333-235 chr4 48410137 48410406 + 1 NA intron (NM_020846, intron 6 of 7) L1MB7|LINE|L1 68742 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 146.333-258 chr5 76717751 76718013 + 1 NA intron (NM_001992, intron 1 of 1) intron (NM_001992, intron 1 of 1) 1756 NM_001311313 2149 Hs.482562 NM_001992 ENSG00000181104 F2R CF2R|HTR|PAR-1|PAR1|TR coagulation factor II thrombin receptor protein-coding 244.333-67 chr22 19395044 19395437 + 1 NA intron (NM_003325, intron 7 of 24) intron (NM_003325, intron 7 of 24) 36493 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 188.667-51 chr16 9916828 9917200 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 3 of 13) intron (NM_001134408, intron 3 of 13) 265053 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 224.667-84 chr8 121319751 121320044 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -319449 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 162.333-190 chr4 187880184 187880449 + 1 NA Intergenic Intergenic -115455 NM_174900 132625 Hs.335787 NM_174900 ENSG00000179059 ZFP42 REX-1|REX1|ZNF754|zfp-42 ZFP42 zinc finger protein protein-coding 149.667-124 chr14 72577856 72578089 + 1 NA Intergenic Intergenic 61152 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 122.333-83 chr18 69868960 69869148 + 1 NA intron (NM_001303618, intron 4 of 5) L1PA12|LINE|L1 78819 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 133.333-68 chr18 37653656 37653882 + 1 NA Intergenic Intergenic -3366 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 148.333-296 chr4 170468663 170468833 + 1 NA Intergenic Intergenic 242157 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 131.667-78 chr18 5585980 5586159 + 1 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) LTR33|LTR|ERVL -41730 NM_001330557 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 192.667-154 chr6 149033189 149033628 + 1 NA promoter-TSS (NR_134599) promoter-TSS (NR_134599) -747 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 111.667-7 chr1 41318389 41318566 + 1 NA Intergenic Intergenic -42957 NM_001291281 100132074 Hs.559677 NM_001291281 FOXO6 - forkhead box O6 protein-coding 115.667-32 chr10 93803203 93803374 + 1 NA Intergenic Intergenic 45352 NM_005097 9211 Hs.533670 NM_005097 ENSG00000108231 LGI1 ADLTE|ADPAEF|ADPEAF|EPITEMPIN|EPT|ETL1|IB1099 leucine rich glioma inactivated 1 protein-coding 166.667-179 chr5 36247870 36248055 + 1 NA 3' UTR (NM_001161429, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001161429, exon 15 of 15) -5683 NM_001287341 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 135.667-113 chr3 6115956 6116100 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 689421 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 293.333-2 chr10 112807744 112808197 + 1 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) AluJr|SINE|Alu -15526 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 168.333-49 chr12 109392994 109393232 + 1 NA intron (NM_001101421, intron 1 of 30) L2b|LINE|L2 4394 NM_001101421 283446 Hs.512008 NM_173597 ENSG00000174527 MYO1H - myosin IH protein-coding 198.667-82 chr17 61965883 61966164 + 1 NA intron (NM_005121, intron 19 of 29) intron (NM_005121, intron 19 of 29) -38041 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 167.333-224 chr6 37795537 37795805 + 1 NA Intergenic Intergenic -24056 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 163.333-17 chr1 172759042 172759262 + 1 NA Intergenic LTR107_Mam|LTR|LTR 100049 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 219.667-65 chr4 69868954 69869230 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -8947 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 230.333-71 chr21 29895824 29896090 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 44039 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 153.333-121 chr14 60810690 60810975 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 4 of 6) L1M3|LINE|L1 76071 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 268.667-29 chr2 33624865 33625323 + 1 NA Intergenic Intergenic -25732 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 148.667-138 chr15 67307129 67307375 + 1 NA TTS (NM_022784) TTS (NM_022784) -52054 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 264.667-80 chr7 54278289 54278655 + 1 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -52225 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 211.667-100 chr6 91192545 91192874 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -328951 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 128.667-134 chr4 101422026 101422212 + 1 NA Intergenic Intergenic 74342 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 330.667-24 chr7 37043245 37043864 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) L1ME1|LINE|L1 45758 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-128 chr4 95072468 95072714 + 1 NA intron (NM_001256793, intron 1 of 10) intron (NM_001256793, intron 1 of 10) -18900 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 162.333-165 chr3 99188410 99188573 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -286796 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 149.667-434 chrX 58198623 58198821 + 1 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -288089 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 123.667-132 chr4 12916145 12916328 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 568104 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 164.333-182 chr4 141917287 141917497 + 1 NA Intergenic Intergenic 280809 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 153.333-317 chr4 162303220 162303477 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -139314 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 164.667-105 chr2 44494127 44494350 + 1 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 132291 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 156.333-189 chr2 125251427 125251640 + 1 NA Intergenic Intergenic 866452 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 246.333-90 chr7 2979556 2980073 + 1 NA intron (NM_032415, intron 1 of 24) intron (NM_032415, intron 1 of 24) 64053 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 134.667-54 chr14 38108489 38108733 + 1 NA Intergenic Intergenic -99293 NM_001049 6751 Hs.248160 NM_001049 ENSG00000139874 SSTR1 SRIF-2|SS-1-R|SS1-R|SS1R somatostatin receptor 1 protein-coding 228.333-47 chr2 71364986 71365333 + 1 NA intron (NM_001252613, intron 5 of 27) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 33377 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 144.333-8 chr1 47546852 47547086 + 1 NA Intergenic Intergenic -109652 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 314.667-4 chr10 8606635 8607209 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -12531 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 161.667-49 chr12 10204145 10204336 + 1 NA Intergenic Intergenic -8637 NM_031412 23710 Hs.524250 NM_031412 ENSG00000139112 GABARAPL1 APG8-LIKE|APG8L|ATG8|ATG8B|ATG8L|GEC1 GABA type A receptor associated protein like 1 protein-coding 229.333-14 chr10 131735614 131736008 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 54388 NR_038365 399827 Hs.523353 NM_001001677 ENSG00000189275 LINC01164 - long intergenic non-protein coding RNA 1164 ncRNA 137.667-125 chr3 80462311 80462529 + 1 NA Intergenic Intergenic -302477 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 188.667-97 chr22 35016163 35016430 + 1 NA Intergenic Intergenic -18380 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 117.667-63 chr16 49694045 49694213 + 1 NA intron (NM_001271620, intron 3 of 7) intron (NM_001271620, intron 3 of 7) -29805 NM_001330533 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 125.333-162 chr6 125108029 125108174 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -45672 NM_003287 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 154.333-19 chr1 174227910 174228143 + 1 NA intron (NM_001366445, intron 3 of 13) L1MEc|LINE|L1 -47074 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 122.333-156 chr4 46595622 46595777 + 1 NA Intergenic Intergenic -205571 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 304.667-32 chr6 48042114 48042656 + 1 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) MIRc|SINE|MIR 26304 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 191.333-182 chr6 145835474 145835686 + 1 NA intron (NR_038246, intron 2 of 2) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 20704 NR_038245 100507557 Hs.124537 NR_038244 ENSG00000235652 LOC100507557 - uncharacterized LOC100507557 ncRNA 161.333-17 chr1 225265237 225265404 + 1 NA exon (NM_001367479, exon 48 of 86) exon (NM_001367479, exon 48 of 86) 162718 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 144.667-66 chr12 126099642 126099914 + 1 NA intron (NR_110053, intron 2 of 4) intron (NR_110053, intron 2 of 4) 3786 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 264.667-3 chr1 103298786 103299249 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -190495 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 142.667-121 chr20 23885308 23885504 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -5658 NM_001900 1473 Hs.121489 NM_001900 ENSG00000170367 CST5 - cystatin D protein-coding 229.667-34 chr15 58834524 58834881 + 1 NA intron (NM_001040450, intron 6 of 8) intron (NM_001040450, intron 6 of 8) 63400 NM_001040453 54629 Hs.591122 NM_019092 ENSG00000128923 MINDY2 FAM63B MINDY lysine 48 deubiquitinase 2 protein-coding 159.333-253 chr5 11653773 11654008 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) L1MA9|LINE|L1 -64824 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 181.333-16 chr10 110896918 110897135 + 1 NA intron (NM_001199492, intron 11 of 11) intron (NM_001199492, intron 11 of 11) -1064 NR_039828 100616113 NR_039828 ENSG00000284482 MIR4680 - microRNA 4680 ncRNA 212.667-73 chr2 65902193 65902487 + 1 NA Intergenic Intergenic 455988 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 157.667-97 chr14 42180744 42180902 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 573967 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 200.667-95 chr20 15371501 15371778 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 6 of 17) intron (NM_001351663, intron 6 of 17) 174799 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 136.333-204 chr8 77404309 77404563 + 1 NA Intergenic Intergenic -46261 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 147.333-226 chr3 182617078 182617294 + 1 NA Intergenic Intergenic -110062 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 247.667-47 chr2 26626552 26626963 + 1 NA intron (NM_001029881, intron 3 of 6) intron (NM_001029881, intron 3 of 6) 14609 NM_001029881 130106 Hs.591579 NM_001029881 ENSG00000157884 CIB4 KIP4 calcium and integrin binding family member 4 protein-coding 223.333-126 chr5 41232022 41232405 + 1 NA intron (NM_001115131, intron 1 of 17) L1MA8|LINE|L1 -18681 NM_000065 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 143.667-195 chr5 5619291 5619463 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 196700 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 263.333-32 chr16 88795213 88795648 + 1 NA Intergenic Intergenic -8359 NM_030928 81620 Hs.122908 NM_030928 ENSG00000167513 CDT1 DUP|RIS2 chromatin licensing and DNA replication factor 1 protein-coding 217.667-48 chr2 101976311 101976679 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -6970 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 148.667-196 chr2 117103173 117103451 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -711379 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 195.333-212 chr8 50857190 50857385 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 693156 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 158.333-157 chr2 127544066 127544307 + 1 NA intron (NM_001080527, intron 1 of 46) FRAM|SINE|Alu 8384 NM_001080527 4648 Hs.154578 NM_183371 ENSG00000169994 MYO7B - myosin VIIB protein-coding 170.333-228 chr9 73240111 73240361 + 1 NA Intergenic Intergenic 88371 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 169.667-172 chr5 112066110 112066484 + 1 NA Intergenic Intergenic -89365 NM_001142474 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 153.667-198 chr2 138300211 138300395 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 198419 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 155.667-262 chr4 154607439 154607609 + 1 NA intron (NM_000509, intron 7 of 9) intron (NM_000509, intron 7 of 9) 5132 NM_021870 2266 Hs.727584 NM_000509 ENSG00000171557 FGG - fibrinogen gamma chain protein-coding 127.333-128 chr4 60142966 60143159 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -779557 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 146.667-236 chr4 78493987 78494216 + 1 NA intron (NM_025074, intron 59 of 73) L1ME5|LINE|L1 -57669 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 146.667-215 chr3 83002174 83002402 + 1 NA Intergenic Intergenic 1016146 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 223.333-5 chr1 71373324 71373818 + 1 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 292247 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 133.333-106 chr3 65870270 65870473 + 1 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -23445 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 154.667-321 chr5 135288149 135288398 + 1 NA intron (NR_161235, intron 3 of 5) L1MA9|LINE|L1 -40096 NR_037895 340073 Hs.434422 NR_037895 ENSG00000249647 C5orf66-AS2 - C5orf66 antisense RNA 2 ncRNA 234.667-26 chr12 121207888 121208325 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2023 NM_001261398 5025 Hs.321709 NM_002560 ENSG00000135124 P2RX4 P2X4|P2X4R purinergic receptor P2X 4 protein-coding 145.333-88 chr14 70804936 70805117 + 1 NA intron (NM_033141, intron 1 of 12) intron (NM_033141, intron 1 of 12) 4145 NM_001284230 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 148.667-70 chr11 43799802 43800030 + 1 NA intron (NM_016142, intron 4 of 10) intron (NM_016142, intron 4 of 10) -80915 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 127.333-100 chr22 29269416 29269590 + 1 NA intron (NM_013986, intron 1 of 17) intron (NM_013986, intron 1 of 17) 1235 NM_005243 2130 Hs.374477 NM_005243 ENSG00000182944 EWSR1 EWS|EWS-FLI1|bK984G1.4 EWS RNA binding protein 1 protein-coding 187.667-38 chr14 34269028 34269349 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 193052 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 314.333-10 chr17 18269710 18270383 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 8936 NM_148886 125170 Hs.655555 NM_139162 ENSG00000177427 MIEF2 MID49|SMCR7 mitochondrial elongation factor 2 protein-coding 199.667-120 chr6 50672765 50673045 + 1 NA Intergenic Intergenic -40639 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 297.333-14 chr12 15140125 15140489 + 1 NA intron (NM_032918, intron 2 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -11616 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 111.667-184 chr4 70898325 70898567 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3923 NM_001244767 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 230.667-22 chr16 73221409 73221756 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -77135 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 128.667-114 chr3 34863399 34863590 + 1 NA Intergenic Intergenic 530529 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 208.333-113 chr5 20264356 20264688 + 1 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) intron (NM_001349556, intron 1 of 13) -41029 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 158.333-108 chr16 89331188 89331466 + 1 NA intron (NR_045839, intron 2 of 9) MER33|DNA|hAT-Charlie 10194 NM_001242885 100287036 Hs.656995 NM_001242885 LOC100287036 - uncharacterized LOC100287036 protein-coding 165.333-262 chr9 27339464 27339643 + 1 NA intron (NM_024761, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR -42403 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 208.667-80 chr21 18211954 18212290 + 1 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -32711 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 168.667-96 chr2 28567221 28567406 + 1 NA intron (NR_138141, intron 1 of 35) intron (NR_138141, intron 1 of 35) 956 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 322.667-16 chr21 25253963 25254450 + 1 NA Intergenic MER106A|DNA|hAT-Charlie 177495 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 208.333-64 chr18 78408999 78409354 + 1 NA Intergenic Intergenic -415449 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 265.333-63 chr4 163237975 163238566 + 1 NA Intergenic Intergenic -71380 NM_138386 92345 Hs.129095 NM_138386 ENSG00000145414 NAF1 - nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein protein-coding 128.333-115 chr2 208545297 208545477 + 1 NA intron (NR_136588, intron 1 of 5) intron (NR_136588, intron 1 of 5) 2745 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 144.333-93 chr17 33749539 33749692 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -215855 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 150.667-4 chr1 24806626 24806810 + 1 NA intron (NM_013943, intron 2 of 5) intron (NM_013943, intron 2 of 5) 61271 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 404.333-6 chr2 12034846 12035417 + 1 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) intron (NR_110196, intron 2 of 5) 28015 NR_110197 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 125.667-66 chr14 89193023 89193279 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 224082 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 149.667-234 chr20 38944125 38944287 + 1 NA intron (NM_030919, intron 2 of 3) intron (NM_030919, intron 2 of 3) 17789 NM_030919 81610 Hs.726442 NM_030919 ENSG00000101447 FAM83D C20orf129|CHICA|dJ616B8.3 family with sequence similarity 83 member D protein-coding 176.333-68 chr17 80229352 80229633 + 1 NA intron (NM_001166348, intron 6 of 16) AluSz|SINE|Alu 9065 NM_001166348 284129 Hs.4866 NM_173626 ENSG00000181045 SLC26A11 - solute carrier family 26 member 11 protein-coding 187.667-35 chr14 28282129 28282363 + 1 NA Intergenic Intergenic 483073 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 167.667-189 chr6 145399273 145399550 + 1 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 287466 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 230.333-60 chr2 56545520 56545877 + 1 NA Intergenic Intergenic -359928 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 191.333-18 chr10 10245829 10246255 + 1 NA Intergenic Intergenic 187320 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 151.333-390 chr7 55129842 55130013 + 1 NA intron (NM_001346900, intron 1 of 27) MER58A|DNA|hAT-Charlie 20088 NM_001346900 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 158.667-91 chr14 22579135 22579309 + 1 NA intron (NM_001344, intron 1 of 2) intron (NM_001344, intron 1 of 2) 10002 NM_001344 1603 Hs.82890 NM_001344 ENSG00000129562 DAD1 OST2 defender against cell death 1 protein-coding 172.667-38 chr12 27715562 27715872 + 1 NA intron (NM_021821, intron 2 of 7) intron (NM_021821, intron 2 of 7) 4885 NM_021821 60488 Hs.714076 NM_021821 ENSG00000061794 MRPS35 HDCMD11P|MDS023|MRP-S28|MRPS28 mitochondrial ribosomal protein S35 protein-coding 272.333-47 chr4 65311593 65311929 + 1 NA Intergenic Intergenic -307261 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 210.333-29 chr11 118530724 118531104 + 1 NA promoter-TSS (NM_032780) promoter-TSS (NM_032780) -139 NR_120572 101929089 Hs.666633 NR_120572 ENSG00000255435 LOC101929089 - uncharacterized LOC101929089 ncRNA 172.667-68 chr17 69094875 69095122 + 1 NA intron (NM_080284, intron 25 of 38) intron (NM_080284, intron 25 of 38) -4544 NR_049834 100847008 NR_049834 ENSG00000265331 MIR4524B - microRNA 4524b ncRNA 157.333-166 chr19 35662633 35662971 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3714 NM_001281443 11045 Hs.159309 NM_007000 ENSG00000105668 UPK1A TSPAN21|UP1A|UPIA|UPKA uroplakin 1A protein-coding 122.333-54 chr14 28805201 28805496 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -19561 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 154.333-204 chr3 6473873 6474121 + 1 NA Intergenic Intergenic 331452 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 170.333-57 chr12 51635189 51635421 + 1 NA intron (NM_001369788, intron 1 of 25) L2b|LINE|L2 44069 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 148.333-293 chr4 129896888 129897044 + 1 NA intron (NR_151713, intron 11 of 16) intron (NR_151713, intron 11 of 16) 125347 NR_151713 107986313 Hs.112740 NR_151713 ENSG00000249618 LINC02465 - long intergenic non-protein coding RNA 2465 ncRNA 115.667-124 chr2 178590465 178590672 + 1 NA exon (NM_133432, exon 133 of 192) exon (NM_133432, exon 133 of 192) 67377 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 198.333-188 chr7 157914641 157915007 + 1 NA intron (NM_130843, intron 10 of 21) L1ME3E|LINE|L1 60239 NR_038966 100506585 Hs.661265 NR_038966 LOC100506585 - uncharacterized LOC100506585 ncRNA 194.333-161 chr9 92477486 92477776 + 1 NA intron (NM_017680, intron 1 of 8) intron (NM_017680, intron 1 of 8) 4875 NM_017680 54829 Hs.435655 NM_017680 ENSG00000106819 ASPN OS3|PLAP-1|PLAP1|SLRR1C asporin protein-coding 142.333-217 chr6 54077161 54077337 + 1 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) MER58A|DNA|hAT-Charlie -29655 NR_046710 100873951 NR_046710 MLIP-AS1 - MLIP antisense RNA 1 ncRNA 216.333-8 chr1 119907872 119908233 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -11537 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 210.333-87 chr2 220774934 220775190 + 1 NA Intergenic Intergenic 797242 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 241.667-60 chr4 26188127 26188557 + 1 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -131368 NM_005349 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 127.667-39 chr12 111949285 111949469 + 1 NA intron (NM_138341, intron 3 of 9) MER101-int|LTR|ERV1 50314 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 228.333-111 chrX 45271503 45271774 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -70762 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 151.667-88 chr12 81526052 81526264 + 1 NA intron (NM_001220474, intron 2 of 30) intron (NM_001220474, intron 2 of 30) -13767 NM_001282536 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 160.333-241 chr5 168212811 168213116 + 1 NA intron (NM_001122679, intron 21 of 29) intron (NM_001122679, intron 21 of 29) 19409 NR_109894 101927862 Hs.659376 NR_109894 ENSG00000253978 CTB-178M22.2 - uncharacterized LOC101927862 ncRNA 225.333-91 chr22 20257043 20257524 + 1 NA intron (NM_023004, intron 1 of 1) intron (NM_023004, intron 1 of 1) -8072 NR_031618 100302118 NR_031618 ENSG00000221039 MIR1286 MIRN1286|hsa-mir-1286|mir-1286 microRNA 1286 ncRNA 246.667-50 chr20 58157480 58157768 + 1 NA intron (NM_178456, intron 3 of 3) L1ME4a|LINE|L1 6722 NM_178456 128602 Hs.43977 NM_178456 ENSG00000124237 C20orf85 LLC1|bA196N14.1 chromosome 20 open reading frame 85 protein-coding 390.667-15 chr8 139491079 139491717 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 211725 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 158.333-217 chr3 175964922 175965082 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -188669 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 170.333-137 chr3 55287522 55287748 + 1 NA Intergenic Intergenic 109463 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 251.667-74 chr4 189004575 189004870 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 228065 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 179.333-88 chr2 6739727 6739954 + 1 NA intron (NR_038369, intron 1 of 5) intron (NR_038369, intron 1 of 5) 30471 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 167.667-96 chr19 51812017 51812211 + 1 NA intron (NR_163433, intron 10 of 11) HERVL74-int|LTR|ERVL 16957 NM_002030 2359 Hs.445466 NM_002030 ENSG00000187474 FPR3 FML2_HUMAN|FMLP-R-II|FMLPY|FPRH1|FPRH2|FPRL2|RMLP-R-I formyl peptide receptor 3 protein-coding 294.333-47 chr8 68612303 68612677 + 1 NA intron (NR_146186, intron 7 of 12) intron (NR_146186, intron 7 of 12) -280999 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 181.333-62 chr18 636315 636565 + 1 NA intron (NM_199167, intron 6 of 8) intron (NM_199167, intron 6 of 8) 19740 NM_199167 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 130.667-154 chr4 57307073 57307233 + 1 NA Intergenic Intergenic -118719 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 244.333-107 chr8 128511829 128512249 + 1 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 52640 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 169.333-117 chr2 59029130 59029334 + 1 NA intron (NR_033873, intron 11 of 13) intron (NR_033873, intron 11 of 13) -188476 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 145.667-83 chr14 67888038 67888264 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 64559 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 254.667-48 chr21 39286671 39286974 + 1 NA intron (NM_018963, intron 8 of 41) intron (NM_018963, intron 8 of 41) 26810 NM_018963 54014 Hs.627139 NM_018963 ENSG00000185658 BRWD1 C21orf107|DCAF19|N143|WDR9|WRD9 bromodomain and WD repeat domain containing 1 protein-coding 163.333-60 chr12 3475164 3475333 + 1 NA intron (NM_001256536, intron 1 of 9) intron (NM_001256536, intron 1 of 9) -15955 NM_019854 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 144.333-293 chrX 77797192 77797412 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -11086 NM_000489 546 Hs.533526 NM_000489 ENSG00000085224 ATRX JMS|MRX52|RAD54|RAD54L|XH2|XNP|ZNF-HX ATRX chromatin remodeler protein-coding 245.667-56 chr5 83924689 83925146 + 1 NA Intergenic Intergenic -204062 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 500.667 chr2 37326750 37327448 + 1 NA Intergenic Intergenic -10015 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 201.333-219 chr5 18661400 18661683 + 1 NA Intergenic Intergenic 854267 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 234.333-66 chr6 41762623 41763092 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15456 NM_001166424 5225 Hs.1867 NM_002630 ENSG00000096088 PGC PEPC|PGII progastricsin protein-coding 208.667-87 chr3 30356422 30356733 + 1 NA Intergenic Intergenic -162291 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 189.667-57 chr16 17577170 17577557 + 1 NA Intergenic Intergenic -106403 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 183.667-105 chr4 72115765 72116127 + 1 NA intron (NM_001144756, intron 2 of 4) intron (NM_001144756, intron 2 of 4) 76814 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 279.667-45 chr8 86573388 86573734 + 1 NA TTS (NM_019098) TTS (NM_019098) 59126 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 150.667-51 chr10 103356296 103356588 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -5302 NM_001011663 84108 Hs.335808 NM_032154 ENSG00000156374 PCGF6 MBLR|RNF134 polycomb group ring finger 6 protein-coding 224.333-75 chr22 26691360 26691756 + 1 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 18715 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 168.333-74 chr17 75922675 75922934 + 1 NA intron (NM_001319193, intron 13 of 28) intron (NM_001319193, intron 13 of 28) 15428 NM_001319193 85302 Hs.720068 NM_001080542 ENSG00000188878 FBF1 Alb|FBF-1 Fas binding factor 1 protein-coding 214.667 chr1 8518430 8518739 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 7 of 22) intron (NM_001042681, intron 7 of 22) -23671 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 275.667-64 chr8 82982383 82982797 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 70486 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 132.333-140 chr5 147145825 147146023 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -64404 NM_001271900 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 139.333-40 chr11 98072454 98072606 + 1 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger -948419 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 262.667-20 chr12 97562690 97563185 + 1 NA promoter-TSS (NR_029678) promoter-TSS (NR_029678) -875 NR_029678 406926 NR_029678 ENSG00000207586 MIR135A2 MIRN135-2|MIRN135A2|mir-135a-2 microRNA 135a-2 ncRNA 113.667-68 chr15 68973688 68973840 + 1 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) L1MD2|LINE|L1 -40931 NM_001184779 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 152.667-385 chr8 120882475 120882697 + 1 NA Intergenic Intergenic -70540 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 153.333-32 chr1 203617632 203617873 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9035 NM_001001396 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 135.333-91 chr2 158511887 158512143 + 1 NA intron (NM_001005476, intron 1 of 20) intron (NM_001005476, intron 1 of 20) 55063 NM_001304969 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 127.667-123 chr4 33749082 33749274 + 1 NA Intergenic Intergenic 290715 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 181.333-33 chr12 27701434 27701669 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 5104 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 374.333-2 chr1 221558916 221559416 + 1 NA Intergenic Intergenic 177734 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 223.333-105 chr3 75045523 75045930 + 1 NA Intergenic Intergenic -168750 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 159.667-278 chr5 178595225 178595409 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -4924 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 117.333-157 chr4 105964780 105964933 + 1 NA intron (NM_001184692, intron 9 of 10) intron (NM_001184692, intron 9 of 10) 57622 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 284.667-52 chr7 108856363 108856733 + 1 NA Intergenic Intergenic 28039 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 146.333-280 chr6 35890691 35890850 + 1 NA intron (NM_003137, intron 3 of 15) intron (NM_003137, intron 3 of 15) 30328 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 195.333-170 chr5 24804866 24805088 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 35606 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 163.667-214 chr6 97095425 97095722 + 1 NA intron (NR_136579, intron 4 of 7) intron (NR_136579, intron 4 of 7) 85497 NM_001323261 114792 Hs.45056 NM_052904 ENSG00000186231 KLHL32 BKLHD5|KIAA1900|UG0030H05|dJ21F7.1 kelch like family member 32 protein-coding 187.333-140 chr4 78185344 78185558 + 1 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) intron (NM_001166133, intron 2 of 41) -103534 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 175.667-154 chrX 11669359 11669632 + 1 NA Intergenic Intergenic -3575 NM_013427 395 Hs.435291 NM_001174 ENSG00000047648 ARHGAP6 RHOGAP6|RHOGAPX-1 Rho GTPase activating protein 6 protein-coding 227.333-27 chr11 111142805 111143255 + 1 NA Intergenic Intergenic -45712 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 267.667 chr1 9551218 9551579 + 1 NA intron (NM_032315, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 11933 NM_032315 84275 Hs.568613 NM_032315 ENSG00000171612 SLC25A33 BMSC-MCP|PNC1 solute carrier family 25 member 33 protein-coding 117.333-116 chr2 223738152 223738313 + 1 NA Intergenic Intergenic 99350 NR_110906 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 131.667-189 chr7 137344553 137344734 + 1 NA promoter-TSS (NM_002825) promoter-TSS (NM_002825) -910 NM_001321387 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 142.667-225 chr8 112286160 112286383 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 54 of 66) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -357222 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 127.667-157 chr7 3826199 3826364 + 1 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -303404 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 167.667-190 chr6 155551663 155551927 + 1 NA Intergenic Intergenic 36951 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 251.333-79 chr3 98087347 98087734 + 1 NA exon (NM_054106, exon 1 of 1) exon (NM_054106, exon 1 of 1) 367 NM_054106 81050 Hs.554715 NM_054106 ENSG00000196578 OR5AC2 HSA1 olfactory receptor family 5 subfamily AC member 2 protein-coding 255.333-20 chr11 103839561 103839920 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -10166 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 160.333-58 chr11 25941889 25942104 + 1 NA Intergenic Intergenic -247127 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 144.333-202 chr4 174437846 174438063 + 1 NA Intergenic Intergenic 14159 NR_036236 100423042 NR_036236 ENSG00000265846 MIR4276 - microRNA 4276 ncRNA 143.667-119 chr19 33159391 33159539 + 1 NA intron (NR_135565, intron 7 of 11) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 27351 NR_135565 126248 Hs.211046 NM_173479 ENSG00000166359 WDR88 PQWD WD repeat domain 88 protein-coding 163.667-201 chr5 89918242 89918503 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 98348 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 188.333-61 chr18 3947569 3947951 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) -14593 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 142.333-107 chr18 42584280 42584531 + 1 NA intron (NR_046174, intron 7 of 9) intron (NR_046174, intron 7 of 9) 397737 NR_046174 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 133.333-158 chr5 180808366 180808570 + 1 NA intron (NR_157150, intron 1 of 1) intron (NR_157150, intron 1 of 1) 1349 NM_001114618 4245 Hs.519818 NM_002406 ENSG00000131446 MGAT1 GLCNAC-TI|GLCT1|GLYT1|GNT-1|GNT-I|GnTI|MGAT mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 226.333-23 chr12 18401531 18401947 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 16 of 32) L1MB8|LINE|L1 140199 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 193.333-64 chr15 83137105 83137390 + 1 NA non-coding (NR_148561, exon 8 of 8) non-coding (NR_148561, exon 8 of 8) 29602 NR_148560 53346 Hs.513094 NM_023003 ENSG00000136404 TM6SF1 - transmembrane 6 superfamily member 1 protein-coding 146.667-16 chr1 115552748 115553039 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -89077 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 146.333-243 chr4 142289066 142289303 + 1 NA intron (NM_001331040, intron 9 of 25) intron (NM_001331040, intron 9 of 25) 557351 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 237.333-67 chr20 63338670 63338949 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -21179 NR_110634 100130587 Hs.640129 NR_110634 ENSG00000203900 LOC100130587 - uncharacterized LOC100130587 ncRNA 132.667-71 chr17 67546322 67546502 + 1 NA intron (NM_181671, intron 2 of 9) intron (NM_181671, intron 2 of 9) -74827 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 153.667-96 chr12 84251008 84251191 + 1 NA Intergenic Intergenic 661700 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 151.667-222 chr3 72795620 72795802 + 1 NA intron (NM_018130, intron 9 of 10) intron (NM_018130, intron 9 of 10) 52734 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 211.333-76 chr16 19925631 19925939 + 1 NA Intergenic Intergenic -40151 NM_001304771 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 180.333-115 chr7 7975372 7975749 + 1 NA intron (NM_138426, intron 1 of 7) intron (NM_138426, intron 1 of 7) 6764 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 303.667-21 chr6 162518799 162519167 + 1 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) Alu|SINE|Alu -208149 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 146.667-14 chr1 105960820 105961007 + 1 NA intron (NR_146609, intron 5 of 5) L1MA6|LINE|L1 67340 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 144.333-165 chr3 34412417 34412738 + 1 NA Intergenic Intergenic 613947 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 152.333-265 chr4 30512229 30512422 + 1 NA Intergenic Intergenic -208044 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 159.333-171 chr2 169171204 169171395 + 1 NA intron (NM_004525, intron 58 of 78) intron (NM_004525, intron 58 of 78) 90192 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 158.333-107 chr16 74303972 74304261 + 1 NA intron (NM_002811, intron 5 of 6) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 7302 NM_002811 5713 Hs.440604 NM_002811 ENSG00000103035 PSMD7 MOV34|P40|Rpn8|S12 proteasome 26S subunit, non-ATPase 7 protein-coding 199.333-131 chr2 88620790 88621157 + 1 NA intron (NM_004836, intron 1 of 16) intron (NM_004836, intron 1 of 16) 3956 NM_001313915 9451 Hs.591589 NM_004836 ENSG00000172071 EIF2AK3 PEK|PERK|WRS eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 protein-coding 169.333-270 chr8 113313069 113313256 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) intron (NM_001363185, intron 2 of 66) 63990 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 119.333-112 chr17 79315142 79315341 + 1 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 200907 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 130.333-22 chr1 236948140 236948389 + 1 NA Intergenic Intergenic 56177 NM_001276687 645745 Hs.632513 NM_001039954 ENSG00000244020 MT1HL1 MT1P2 metallothionein 1H like 1 protein-coding 153.667-82 chr12 11684539 11684799 + 1 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) L1MC5|LINE|L1 34815 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 189.333-151 chr5 9186077 9186386 + 1 NA intron (NM_003966, intron 11 of 22) intron (NM_003966, intron 11 of 22) -132336 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 237.667-9 chr10 81049945 81050253 + 1 NA Intergenic Intergenic 400302 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 184.667-44 chr18 4245479 4245752 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -18987 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 127.333-88 chr2 198212774 198212918 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 162251 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 241.667-21 chr13 42081051 42081430 + 1 NA intron (NM_178009, intron 1 of 29) AluSz|SINE|Alu 32592 NM_178009 160851 Hs.630380 NM_152910 ENSG00000102780 DGKH DGKeta diacylglycerol kinase eta protein-coding 144.667-206 chr3 169976927 169977075 + 1 NA exon (NM_003262, exon 3 of 8) exon (NM_003262, exon 3 of 8) 10194 NM_003262 7095 Hs.744859 NM_003262 ENSG00000008952 SEC62 Dtrp1|HTP1|TLOC1|TP-1 SEC62 homolog, preprotein translocation factor protein-coding 145.667-156 chr20 19831542 19831785 + 1 NA Intergenic Intergenic -54858 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 210.667-2 chr1 71385509 71385830 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 304345 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 208.667-71 chr2 104770604 104770948 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -13057 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 238.333-71 chr5 11753477 11753896 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) L1PA15|LINE|L1 150760 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 401.333-11 chr15 75553710 75554269 + 1 NA intron (NM_002833, intron 1 of 12) intron (NM_002833, intron 1 of 12) 25326 NM_002833 5780 Hs.445775 NM_002833 ENSG00000169410 PTPN9 MEG2|PTPMEG2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 9 protein-coding 198.333-125 chr3 82101505 82101780 + 1 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) L1MC4|LINE|L1 115500 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 261.333-70 chr3 176316448 176317042 + 1 NA Intergenic Intergenic 72194 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 151.667-94 chr13 27837818 27838107 + 1 NA intron (NR_047484, intron 2 of 4) L1MD2|LINE|L1 45479 NM_145657 219409 Hs.351785 NM_145657 ENSG00000169840 GSX1 GSH1|Gsh-1 GS homeobox 1 protein-coding 186.667-66 chr2 66836125 66836435 + 1 NA Intergenic Intergenic -68156 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 147.333-35 chr10 13036936 13037133 + 1 NA intron (NM_001282658, intron 5 of 6) AluJb|SINE|Alu -35321 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 140.667-101 chr18 7426426 7426601 + 1 NA Intergenic Intergenic 34493 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 114.667-205 chr5 53148381 53148586 + 1 NA Intergenic Intergenic 38641 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 131.667-92 chr2 54188328 54188587 + 1 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 65174 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 165.667-88 chr2 37093259 37093567 + 1 NA intron (NM_001322249, intron 5 of 7) intron (NM_001322249, intron 5 of 7) 8962 NM_001278505 253635 Hs.595250 NM_174931 ENSG00000152133 GPATCH11 CCDC75|CENP-Y|CENPY G-patch domain containing 11 protein-coding 306.667-32 chr3 64640353 64640740 + 1 NA intron (NM_001318781, intron 11 of 38) intron (NM_001318781, intron 11 of 38) -44324 NR_038264 100507098 Hs.660881 NR_038264 ENSG00000241684 ADAMTS9-AS2 - ADAMTS9 antisense RNA 2 ncRNA 246.333-34 chr15 80306917 80307382 + 1 NA intron (NR_033833, intron 1 of 2) intron (NR_033833, intron 1 of 2) 34656 NR_033833 283688 Hs.525933 NR_033833 ENSG00000259361 LINC00927 - long intergenic non-protein coding RNA 927 ncRNA 216.333-88 chr2 239422270 239422655 + 1 NA Intergenic Intergenic 20714 NR_135577 101928111 Hs.534680 NR_135575 ENSG00000222020 HDAC4-AS1 - HDAC4 antisense RNA 1 ncRNA 397.667-2 chr12 40983971 40984659 + 1 NA intron (NM_001843, intron 16 of 23) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 75958 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 149.667-135 chr15 38226645 38226910 + 1 NA Intergenic Intergenic -26059 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 266.667-10 chr1 228657390 228657860 + 1 NA intron (NR_037962, intron 1 of 2) L1M4c|LINE|L1 -11467 NR_023368 100169757 NR_023368 ENSG00000200624 RNA5S6 RN5S6 RNA, 5S ribosomal 6 rRNA 148.667-106 chr13 88823561 88823737 + 1 NA Intergenic Intergenic 196796 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 144.667-264 chr6 62597791 62598048 + 1 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -311692 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 156.667-252 chr4 99879507 99879807 + 1 NA non-coding (NR_024170, exon 6 of 6) non-coding (NR_024170, exon 6 of 6) 14770 NM_021970 8649 Hs.433332 NM_021970 ENSG00000109270 LAMTOR3 MAP2K1IP1|MAPBP|MAPKSP1|MP1|PRO0633|Ragulator3 late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 protein-coding 211.333-100 chr19 34451810 34452255 + 1 NA exon (NM_005499, exon 10 of 17) exon (NM_005499, exon 10 of 17) 23651 NM_005499 10054 Hs.631580 NM_005499 ENSG00000126261 UBA2 ARX|HRIHFB2115|SAE2 ubiquitin like modifier activating enzyme 2 protein-coding 301.667-34 chr5 62575214 62575801 + 1 NA intron (NM_016338, intron 27 of 29) L1MC4|LINE|L1 -3228 NR_073584 101180901 Hs.482269 NR_073584 ENSG00000086200 IPO11-LRRC70 - IPO11-LRRC70 readthrough ncRNA 152.333-378 chr8 85928044 85928236 + 1 NA Intergenic LTR12F|LTR|ERV1 -100198 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 281.333-52 chr5 117152803 117153475 + 1 NA Intergenic Intergenic -262373 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 230.333-32 chr13 86321529 86321801 + 1 NA Intergenic Intergenic -522246 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 283.333-15 chr14 41958139 41958638 + 1 NA Intergenic Intergenic 351532 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 169.667-202 chr8 47859908 47860129 + 1 NA intron (NM_001081640, intron 45 of 84) intron (NM_001081640, intron 45 of 84) 100118 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 286.333-33 chr4 71958997 71959397 + 1 NA Intergenic Intergenic -72607 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 135.333-194 chr8 106141956 106142117 + 1 NA Intergenic Intergenic -81533 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 136.333-215 chr8 139389035 139389267 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 313972 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 130.667-18 chr1 234686889 234687054 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -37071 NR_038856 100506810 Hs.586634 NR_038856 ENSG00000227630 LINC01132 - long intergenic non-protein coding RNA 1132 ncRNA 277.333-31 chr14 67929159 67929642 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1M2|LINE|L1 105808 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 145.667-256 chr6 114831358 114831604 + 1 NA Intergenic Intergenic -768604 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 163.667-172 chr4 31353051 31353219 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -153409 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 143.667-154 chr3 17302239 17302499 + 1 NA intron (NM_014744, intron 14 of 21) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 369173 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 159.333-243 chr4 92516968 92517209 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 212689 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 202.667-67 chr17 31161127 31161439 + 1 NA intron (NM_001042492, intron 3 of 57) intron (NM_001042492, intron 3 of 57) 66306 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 149.667-397 chr8 84106382 84106631 + 1 NA Intergenic Intergenic -76281 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 267.667-26 chr2 22577521 22577954 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 41258 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 118.333-171 chr5 130223112 130223352 + 1 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 318767 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 168.667-208 chr7 90414135 90414404 + 1 NA 3' UTR (NM_001185072, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001185072, exon 4 of 4) 10808 NM_001185073 9069 Hs.731917 NM_012129 ENSG00000157224 CLDN12 - claudin 12 protein-coding 152.667-101 chr14 37125557 37125859 + 1 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -46318 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-154 chr5 65672612 65672826 + 1 NA intron (NM_019072, intron 8 of 10) intron (NM_019072, intron 8 of 10) 47692 NM_001365341 112441434 NM_001365341 SHLD3 CTC-534A2.2|RINN1 shieldin complex subunit 3 protein-coding 314.667-23 chr2 99526187 99526520 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -36336 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 154.333-229 chr3 174793979 174794150 + 1 NA Intergenic Intergenic -65270 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 167.667-133 chr3 46760262 46760462 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -3507 NR_160552 100288960 NR_160552 PRSS43P PRSS43|TESSP3 serine protease 43, pseudogene pseudo 136.333-73 chr16 47354783 47355027 + 1 NA intron (NM_030790, intron 8 of 17) L1MA6|LINE|L1 106158 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 217.333-105 chr4 39134774 39135049 + 1 NA Intergenic Intergenic -47618 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 173.667-79 chr2 72769179 72769366 + 1 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) L1MEg|LINE|L1 56761 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 215.667-102 chr5 147801663 147802031 + 1 NA Intergenic Intergenic -19119 NM_001270941 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 117.667-144 chr4 173121350 173121506 + 1 NA Intergenic Intergenic -47383 NM_017423 51809 Hs.548088 NM_017423 ENSG00000109586 GALNT7 GALNAC-T7|GalNAcT7 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 protein-coding 122.667-55 chr14 84573779 84573997 + 1 NA Intergenic Intergenic -698044 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 237.333-121 chr8 115614252 115614690 + 1 NA intron (NM_001282902, intron 2 of 5) intron (NM_001282902, intron 2 of 5) 53542 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 131.333-128 chr4 63978295 63978453 + 1 NA Intergenic Intergenic 431076 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 196.667-22 chr10 110279912 110280193 + 1 NA exon (NM_130439, exon 5 of 6) exon (NM_130439, exon 5 of 6) 24868 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 234.333-20 chr12 40921971 40922246 + 1 NA intron (NM_001256064, intron 4 of 15) intron (NM_001256064, intron 4 of 15) 13751 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 365.667-6 chr12 33273040 33273776 + 1 NA Intergenic Intergenic 166411 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 224.333-51 chr15 96117326 96117696 + 1 NA intron (NR_158193, intron 4 of 7) L1MA9|LINE|L1 10330 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 147.667-138 chr17 59674906 59675054 + 1 NA intron (NM_001288653, intron 16 of 31) intron (NM_001288653, intron 16 of 31) 32618 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 166.333-121 chr2 111714332 111714568 + 1 NA Intergenic Intergenic 56684 NR_039928 100616370 NR_039928 ENSG00000264793 MIR4771-1 - microRNA 4771-1 ncRNA 161.333-203 chr3 188355404 188355609 + 1 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) intron (NM_001167671, intron 2 of 10) 130101 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 132.333-100 chr2 221371950 221372167 + 1 NA Intergenic Intergenic 200246 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 175.333-173 chr7 51483910 51484190 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -90794 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 152.333-402 chr9 72285889 72286122 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -19431 NR_110953 100507540 Hs.54957 NR_110952 ENSG00000225434 LINC01504 - long intergenic non-protein coding RNA 1504 ncRNA 253.333-55 chr2 143697244 143697691 + 1 NA intron (NM_018460, intron 12 of 13) MIR|SINE|MIR -239600 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 166.667-43 chr11 91952814 91953045 + 1 NA Intergenic Intergenic -272105 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 185.667-60 chr19 30365360 30365636 + 1 NA Intergenic Intergenic -6886 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 152.667-5 chr1 70390930 70391161 + 1 NA Intergenic Intergenic -20173 NM_001190463 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 353.667-11 chr22 31921758 31922282 + 1 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16434 NM_001302819 25775 Hs.627602 NM_015372 ENSG00000128254 C22orf24 HSN44A4A chromosome 22 open reading frame 24 protein-coding 237.333-16 chr10 94780695 94781063 + 1 NA intron (NM_000769, intron 4 of 8) intron (NM_000769, intron 4 of 8) 18198 NM_000769 1557 Hs.282409 NM_000769 ENSG00000165841 CYP2C19 CPCJ|CYP2C|CYPIIC17|CYPIIC19|P450C2C|P450IIC19 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19 protein-coding 150.333-442 chrX 45044836 45044992 + 1 NA intron (NR_111960, intron 8 of 27) intron (NR_111960, intron 8 of 27) 155962 NM_024689 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 198.333-31 chr11 38759240 38759491 + 1 NA Intergenic Intergenic 110507 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 176.333-22 chr10 72455685 72456026 + 1 NA intron (NM_001195519, intron 3 of 6) intron (NM_001195519, intron 3 of 6) 68131 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 146.333-5 chr1 64619165 64619408 + 1 NA intron (NM_020925, intron 4 of 26) intron (NM_020925, intron 4 of 26) 39439 NR_039957 100616338 NR_039957 ENSG00000264470 MIR4794 - microRNA 4794 ncRNA 173.333-45 chr12 63248484 63248709 + 1 NA Intergenic Intergenic -95786 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 144.667-283 chr7 85050793 85051020 + 1 NA intron (NM_152754, intron 7 of 16) intron (NM_152754, intron 7 of 16) 71025 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 135.667-26 chr11 44498216 44498413 + 1 NA Intergenic Intergenic -67349 NM_001024844 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 287.333-20 chr14 60174308 60174653 + 1 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -4616 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 190.333-43 chr13 37013918 37014147 + 1 NA intron (NM_001014286, intron 23 of 25) L1MC4|LINE|L1 13246 NM_181503 11340 Hs.294041 NM_181503 ENSG00000120699 EXOSC8 CIP3|EAP2|OIP2|PCH1C|RRP43|Rrp43p|bA421P11.3|p9 exosome component 8 protein-coding 154.667-305 chr5 23936849 23937117 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -14365 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 260.667-46 chr2 77096224 77096710 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1ME3C|LINE|L1 110502 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 154.667-330 chr5 156323324 156323636 + 1 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -3277 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 180.667-127 chr6 124540881 124541164 + 1 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) MIRb|SINE|MIR 258017 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 161.333-177 chr22 30048920 30049085 + 1 NA intron (NR_110541, intron 2 of 4) intron (NR_110541, intron 2 of 4) 31255 NR_110541 101929664 Hs.592197 NR_110541 HORMAD2-AS1 MTMR3-AS1 HORMAD2 and MTMR3 antisense RNA 1 ncRNA 166.667-110 chr2 54413432 54413636 + 1 NA Intergenic Intergenic -42793 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 209.333-99 chr19 57594633 57595081 + 1 NA TTS (NM_001321146) TTS (NM_001321146) -5028 NR_135923 348327 Hs.97111 NM_020880 ENSG00000183647 ZNF530 - zinc finger protein 530 protein-coding 150.667-110 chr13 95794486 95794708 + 1 NA 3' UTR (NM_006260, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_006260, exon 12 of 12) 117458 NM_006260 5611 Hs.59214 NM_006260 ENSG00000102580 DNAJC3 ACPHD|ERdj6|HP58|P58|P58IPK|PRKRI DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C3 protein-coding 153.333-213 chr2 137436943 137437199 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 14 of 27) intron (NM_001316349, intron 14 of 27) 490861 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 117.667-2 chr1 64751914 64752059 + 1 NA intron (NM_001366165, intron 1 of 11) intron (NM_001366165, intron 1 of 11) 6911 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 173.333-65 chr16 10254031 10254286 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -71250 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 204.667-8 chr1 109896758 109897075 + 1 NA Intergenic Intergenic -13933 NM_172210 1435 Hs.173894 NM_000757 ENSG00000184371 CSF1 CSF-1|MCSF colony stimulating factor 1 protein-coding 131.667-143 chr4 46310769 46310905 + 1 NA intron (NM_001114175, intron 4 of 8) intron (NM_001114175, intron 4 of 8) 78542 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 181.667-53 chr18 37945322 37945700 + 1 NA Intergenic Intergenic 288376 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 222.333-32 chr15 61765709 61766144 + 1 NA Intergenic Intergenic 36008 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 200.333-26 chr12 3863900 3864196 + 1 NA intron (NM_001286522, intron 1 of 7) MER77|LTR|ERVL 9351 NR_104461 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 124.333-94 chr2 162489715 162489935 + 1 NA intron (NM_033272, intron 6 of 15) intron (NM_033272, intron 6 of 15) 145457 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 133.667-94 chr3 56145645 56145900 + 1 NA intron (NR_132749, intron 5 of 17) intron (NR_132749, intron 5 of 17) -293178 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 178.667-16 chr10 13100586 13100844 + 1 NA promoter-TSS (NM_001282658) promoter-TSS (NM_001282658) 552 NM_001008212 10133 Hs.332706 NM_021980 ENSG00000123240 OPTN ALS12|FIP2|GLC1E|HIP7|HYPL|NRP|TFIIIA-INTP optineurin protein-coding 314.667-3 chr1 205135782 205136277 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14051 NM_001193272 5929 Hs.519230 NM_005057 ENSG00000117222 RBBP5 RBQ3|SWD1 RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 171.667-106 chr22 42287935 42288148 + 1 NA Intergenic Intergenic -4114 NM_005650 6942 Hs.475018 NM_005650 ENSG00000100207 TCF20 AR1|DDVIBA|SPBP|TCF-20 transcription factor 20 protein-coding 221.667-16 chr11 121951070 121951413 + 1 NA Intergenic Intergenic 148603 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 176.333-140 chr5 117804645 117804962 + 1 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 74442 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 156.667-117 chr15 50328463 50328670 + 1 NA intron (NM_016654, intron 1 of 8) L1MC5a|LINE|L1 -25608 NR_024490 100129387 Hs.659360 NR_024490 GABPB1-AS1 - GABPB1 antisense RNA 1 ncRNA 140.667-31 chr10 35339315 35339556 + 1 NA intron (NM_001282852, intron 1 of 8) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2561 NM_001282852 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 203.667-86 chr4 41651696 41652055 + 1 NA intron (NM_001330786, intron 10 of 22) intron (NM_001330786, intron 10 of 22) 38973 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 216.667-69 chr3 67530846 67531181 + 1 NA intron (NM_001177599, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 123601 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 260.667-30 chr16 60836025 60836531 + 1 NA Intergenic Intergenic 219488 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 120.667-125 chr4 58019817 58019957 + 1 NA Intergenic Intergenic 516441 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 253.333-16 chr12 59576092 59576521 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -19723 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 236.667-45 chr2 223457126 223457551 + 1 NA Intergenic Intergenic 145023 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 279.333-48 chr2 198093520 198093942 + 1 NA intron (NM_006226, intron 3 of 5) intron (NM_006226, intron 3 of 5) 281366 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 161.667-239 chr7 45071310 45071515 + 1 NA intron (NM_001029835, intron 6 of 9) intron (NM_001029835, intron 6 of 9) 17557 NM_001146334 23148 Hs.96633 NM_001146334 ENSG00000136274 NACAD - NAC alpha domain containing protein-coding 294.333-24 chr2 143623996 143624445 + 1 NA exon (NM_018460, exon 12 of 14) exon (NM_018460, exon 12 of 14) -312847 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 146.333-123 chr17 62308051 62308292 + 1 NA Intergenic Intergenic -32516 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 183.667-125 chr6 45822122 45822475 + 1 NA Intergenic Intergenic 115299 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 162.667-277 chr8 111532509 111532759 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 155995 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 191.667-53 chr15 85013763 85014125 + 1 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 31970 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 152.333-126 chr15 71727254 71727504 + 1 NA intron (NM_001286429, intron 2 of 11) intron (NM_001286429, intron 2 of 11) -35840 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 166.333-219 chr8 64544485 64544794 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 32624 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 137.667-161 chr6 51487026 51487200 + 1 NA Intergenic Intergenic -134757 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 182.333-164 chr9 4730494 4730821 + 1 NA intron (NM_001199853, intron 1 of 4) intron (NM_001199853, intron 1 of 4) -4430 NM_001199856 50808 Hs.732022 NM_016282 ENSG00000147853 AK3 AK3L1|AK6|AKL3L|AKL3L1|FIX adenylate kinase 3 protein-coding 157.333-361 chr9 74849824 74850009 + 1 NA intron (NM_017662, intron 3 of 38) intron (NM_017662, intron 3 of 38) 37431 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 279.333-5 chr1 173921999 173922342 + 1 NA Intergenic Intergenic -4792 NM_000488 462 Hs.75599 NM_000488 ENSG00000117601 SERPINC1 AT3|AT3D|ATIII|ATIII-R2|ATIII-T1|ATIII-T2|THPH7 serpin family C member 1 protein-coding 198.333-84 chr18 4088473 4088798 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) L1MCc|LINE|L1 126282 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 200.667-72 chr2 63314877 63315202 + 1 NA intron (NR_148704, intron 13 of 18) intron (NR_148704, intron 13 of 18) 122968 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 148.333-392 chr8 117319551 117319798 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 184679 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 158.333-301 chr7 51191259 51191443 + 1 NA intron (NM_015198, intron 3 of 12) intron (NM_015198, intron 3 of 12) 125458 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 222.667-54 chr3 9941669 9942098 + 1 NA intron (NM_001077415, intron 7 of 10) MIRc|SINE|MIR -5521 NR_046734 100874032 Hs.616388 NR_046734 ENSG00000230082 PRRT3-AS1 - PRRT3 antisense RNA 1 ncRNA 126.333-147 chr6 34993768 34994013 + 1 NA intron (NM_015245, intron 9 of 23) intron (NM_015245, intron 9 of 23) 104635 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 140.333-19 chr1 193973967 193974123 + 1 NA Intergenic Intergenic 669300 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 269.667-22 chr14 74310861 74311207 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8100 NM_001353601 5826 Hs.94395 NM_005050 ENSG00000119688 ABCD4 ABC41|EST352188|MAHCJ|P70R|P79R|PMP69|PXMP1L ATP binding cassette subfamily D member 4 protein-coding 269.667-43 chr6 27740716 27741019 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -20877 NR_038929 100131289 Hs.200573 NR_038929 LOC100131289 - uncharacterized LOC100131289 ncRNA 164.333-162 chr3 123575727 123575938 + 1 NA intron (NM_001329784, intron 2 of 8) intron (NM_001329784, intron 2 of 8) 8785 NM_001329787 201562 Hs.705480 NM_198402 ENSG00000206527 HACD2 PTPLB 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2 protein-coding 153.667-215 chr2 231893492 231893677 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -1286 NR_031717 100302126 NR_031717 ENSG00000222246 MIR1471 MIRN1471|hsa-mir-1471 microRNA 1471 ncRNA 195.667-145 chr8 100550178 100550480 + 1 NA intron (NM_001270377, intron 1 of 4) L1MC1|LINE|L1 9430 NM_198401 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 169.333-51 chr12 42921902 42922177 + 1 NA Intergenic Intergenic 229823 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 149.667-68 chr10 98909866 98910042 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 14614 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 157.667-242 chr5 53132814 53133042 + 1 NA Intergenic Intergenic 23086 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 196.667-52 chr15 75616849 75617235 + 1 NA intron (NM_001042581, intron 3 of 8) intron (NM_001042581, intron 3 of 8) 8683 NM_005701 10073 Hs.21577 NM_005701 ENSG00000169371 SNUPN KPNBL|RNUT1|Snurportin1 snurportin 1 protein-coding 145.667-139 chr2 102947990 102948233 + 1 NA Intergenic Intergenic 36318 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 152.667-316 chr6 10807007 10807295 + 1 NA intron (NR_134935, intron 6 of 14) L2a|LINE|L2 23726 NM_005906 4117 Hs.446125 NM_005906 ENSG00000111837 MAK RP62 male germ cell associated kinase protein-coding 143.667-81 chr15 37562810 37562974 + 1 NA Intergenic Intergenic -371715 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 145.667-29 chr10 21855998 21856280 + 1 NA intron (NM_022365, intron 8 of 11) intron (NM_022365, intron 8 of 11) 147591 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 138.333-122 chr3 98035420 98035585 + 1 NA promoter-TSS (NR_047685) promoter-TSS (NR_047685) -198 NM_001105580 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 362.667-5 chr11 94500582 94501068 + 1 NA Intergenic Intergenic 6841 NM_017704 54851 Hs.29052 NM_017704 ENSG00000168876 ANKRD49 FGIF|GBIF ankyrin repeat domain 49 protein-coding 150.667-118 chr14 55939038 55939253 + 1 NA Intergenic Intergenic -142471 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 260.667-31 chr16 63380388 63380753 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -1344132 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 146.667-85 chr12 123018803 123018950 + 1 NA intron (NM_020845, intron 2 of 24) AluSz6|SINE|Alu -8148 NR_036187 100422931 NR_036187 ENSG00000265526 MIR4304 - microRNA 4304 ncRNA 143.667-58 chr12 92709549 92709784 + 1 NA Intergenic Intergenic 6677 NM_001178097 338809 Hs.326303 NM_001037671 ENSG00000187510 C12orf74 - chromosome 12 open reading frame 74 protein-coding 237.667-74 chr6 126365164 126365444 + 1 NA intron (NR_104462, intron 2 of 3) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 25189 NR_104462 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 166.333-148 chr3 35056731 35057057 + 1 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 337129 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 158.333-127 chr18 41345545 41345778 + 1 NA Intergenic Intergenic 175016 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 164.333-205 chr5 156601636 156601822 + 1 NA intron (NM_001128209, intron 5 of 7) AluY|SINE|Alu -248566 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 160.667-264 chr6 65481777 65481967 + 1 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) intron (NM_198283, intron 4 of 9) 97932 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 231.667-33 chr2 154455095 154455410 + 1 NA intron (NR_161181, intron 2 of 4) intron (NR_161181, intron 2 of 4) 2186 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 197.667-152 chr8 124134084 124134401 + 1 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) L1PA15|LINE|L1 37280 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 202.333-181 chr8 127291214 127291486 + 1 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 46713 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 113.667-37 chr12 5204759 5204987 + 1 NA Intergenic G-rich|Low_complexity|Low_complexity 38278 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 172.333-64 chr17 30204380 30204596 + 1 NA intron (NM_001045, intron 13 of 14) intron (NM_001045, intron 13 of 14) 31209 NM_001045 6532 Hs.29792 NM_001045 ENSG00000108576 SLC6A4 5-HTT|5-HTTLPR|5HTT|HTT|OCD1|SERT|SERT1|hSERT solute carrier family 6 member 4 protein-coding 112.333-125 chr2 53173497 53173718 + 1 NA Intergenic Intergenic -470992 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 209.333-228 chr8 67962117 67962394 + 1 NA intron (NM_024870, intron 1 of 39) intron (NM_024870, intron 1 of 39) 10209 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 263.333-9 chr10 109088052 109088535 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 834953 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 149.333-182 chr2 73827699 73827914 + 1 NA Intergenic Intergenic -1105 NM_001353971 10617 Hs.469018 NM_006463 ENSG00000124356 STAMBP AMSH|MICCAP STAM binding protein protein-coding 230.667-8 chr10 18160296 18160661 + 1 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) 20054 NM_201572 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 186.333-151 chr7 91711713 91711981 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 168855 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 229.667-37 chr18 9590815 9591089 + 1 NA intron (NR_052003, intron 3 of 19) L1M5|LINE|L1 23607 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 164.667-72 chr14 49592801 49593058 + 1 NA intron (NM_001351375, intron 1 of 2) intron (NM_001351375, intron 1 of 2) -5768 NM_203467 122769 Hs.451090 NM_152329 ENSG00000165501 LRR1 4-1BBLRR|LRR-1|PPIL5 leucine rich repeat protein 1 protein-coding 218.333-33 chr13 82191933 82192294 + 1 NA Intergenic Intergenic -965130 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 298.333-39 chr8 4301783 4302242 + 1 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 692902 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 144.667-108 chr16 64429968 64430214 + 1 NA Intergenic Intergenic 691972 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 155.333-128 chr16 68328841 68329054 + 1 NA intron (NR_147058, intron 5 of 18) intron (NR_147058, intron 5 of 18) 17833 NM_001290018 54496 Hs.640229 NM_019023 ENSG00000132600 PRMT7 SBIDDS protein arginine methyltransferase 7 protein-coding 306.667-10 chr14 46604879 46605269 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 46707 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 135.667-147 chr5 126693346 126693544 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 61740 NM_207408 389320 Hs.177983 NM_207408 ENSG00000196900 TEX43 C5orf48|Tseg7 testis expressed 43 protein-coding 141.333-24 chr10 54285921 54286127 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) L1MA6|LINE|L1 -200206 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 123.333-31 chr10 59369230 59369386 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -6127 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 175.667-134 chr7 89084579 89084809 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -288957 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 165.667-169 chr5 174054059 174054288 + 1 NA intron (NM_015980, intron 2 of 4) intron (NM_015980, intron 2 of 4) 8467 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 143.333-137 chr2 83087774 83088079 + 1 NA Intergenic Intergenic 231123 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 153.667-14 chr1 75192276 75192495 + 1 NA Intergenic Intergenic 57997 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 287.667-5 chr10 72957381 72957737 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -2753 NM_001318124 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 307.333-52 chr3 18726216 18726805 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -280918 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 155.667-190 chr2 226490151 226490429 + 1 NA Intergenic Intergenic 168503 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 129.333-156 chr5 105730213 105730427 + 1 NA Intergenic Intergenic 630846 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 141.667-18 chr1 213511247 213511421 + 1 NA Intergenic Intergenic -413415 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 186.333-113 chr4 45557677 45557875 + 1 NA Intergenic Intergenic 566278 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 152.333-310 chr5 109015111 109015282 + 1 NA intron (NR_146155, intron 13 of 19) intron (NR_146155, intron 13 of 19) 90590 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 127.333-190 chr8 84030524 84030692 + 1 NA Intergenic Intergenic -152179 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 179.333-96 chr2 70096415 70096684 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 9072 NM_006196 5093 Hs.2853 NM_006196 ENSG00000169564 PCBP1 HEL-S-85|HNRPE1|HNRPX|hnRNP-E1|hnRNP-X poly(rC) binding protein 1 protein-coding 171.333-121 chr3 105806855 105807232 + 1 NA intron (NR_135809, intron 3 of 18) intron (NR_135809, intron 3 of 18) 60548 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 124.667-208 chr8 127408040 127408167 + 1 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) intron (NR_117100, intron 5 of 5) 7704 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 169.333-39 chr11 72253184 72253353 + 1 NA Intergenic Intergenic -9092 NM_005169 401 Hs.731115 NM_005169 ENSG00000165462 PHOX2A ARIX|CFEOM2|FEOM2|NCAM2|PMX2A paired like homeobox 2A protein-coding 120.333-14 chr1 174690583 174690738 + 1 NA intron (NM_001366446, intron 15 of 25) intron (NM_001366446, intron 15 of 25) -9879 NM_001366450 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 156.333-247 chr3 120042741 120043004 + 1 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 41776 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 223.667-34 chr2 16067015 16067273 + 1 NA intron (NR_126559, intron 1 of 3) intron (NR_126559, intron 1 of 3) 16717 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 146.333-275 chr5 160451298 160451511 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -16847 NR_132748 107075116 Hs.735831 NR_132748 ENSG00000253522 MIR3142HG - MIR3142 host gene ncRNA 153.667-260 chr3 110702326 110702508 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 367542 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 144.333-259 chr8 51000602 51000764 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 808762 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 226.333-49 chr18 3153301 3153769 + 1 NA intron (NM_019856, intron 11 of 36) intron (NM_019856, intron 11 of 36) 66433 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 184.333-167 chrX 71447911 71448113 + 1 NA intron (NR_104394, intron 33 of 39) intron (NR_104394, intron 33 of 39) 44437 NR_002226 27160 Hs.721806 NR_002226 ENSG00000243468 INGX ING1-like|ING2 inhibitor of growth family, X-linked (pseudogene) pseudo 207.667-74 chr3 64135028 64135298 + 1 NA intron (NM_001370528, intron 7 of 7) intron (NM_001370528, intron 7 of 7) 31693 NR_046701 100874242 Hs.668874 NR_046701 PRICKLE2-AS2 - PRICKLE2 antisense RNA 2 ncRNA 339.333-40 chr6 55500184 55500705 + 1 NA intron (NM_001287741, intron 4 of 7) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 78770 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 182.667-65 chr18 10262275 10262474 + 1 NA Intergenic Intergenic 151996 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 153.333-439 chr8 140735197 140735427 + 1 NA exon (NM_001316342, exon 22 of 33) exon (NM_001316342, exon 22 of 33) -2659 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 188.333-35 chr12 58394476 58394845 + 1 NA Intergenic Intergenic -197042 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 250.667-28 chr15 83804265 83804789 + 1 NA intron (NM_207517, intron 4 of 29) intron (NM_207517, intron 4 of 29) 150404 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 119.333-129 chr2 103521223 103521385 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -536875 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 304.667-38 chr9 13544856 13545320 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -113759 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 115.667-46 chr11 111076105 111076341 + 1 NA Intergenic Intergenic 21095 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 132.667-160 chr7 23566501 23566697 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 19928 NR_002711 1197 Hs.632635 NR_002711 CLK2P1 CLK2P CDC like kinase 2, pseudogene 1 pseudo 248.667-70 chr20 9614372 9614896 + 1 NA intron (NM_020341, intron 4 of 10) L1MCa|LINE|L1 -99636 NR_109957 101929329 Hs.589878 NR_109957 ENSG00000225988 LAMP5-AS1 - LAMP5 antisense RNA 1 ncRNA 184.333-130 chr6 66138625 66138884 + 1 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 350875 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 162.667-146 chr2 170493441 170493609 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 25 of 33) intron (NM_001083615, intron 25 of 33) -142582 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 159.333-302 chr7 26779160 26779370 + 1 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 78458 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 173.667-32 chr12 4687401 4687709 + 1 NA 3' UTR (NM_005002, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_005002, exon 11 of 11) 32547 NR_110112 101929549 Hs.663336 NR_110112 ENSG00000255474 GAU1 GALNT8-DT GALNT8 antisense upstream 1 ncRNA 147.667-10 chr1 103494258 103494420 + 1 NA intron (NM_001347929, intron 1 of 5) L1PA15|LINE|L1 31172 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 195.667-148 chr8 115930423 115930660 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -261566 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 162.667-243 chr6 81511378 81511630 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 241177 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 114.667-126 chr2 35846618 35846837 + 1 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 375322 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 141.667-251 chr9 95285921 95286124 + 1 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) L1ME4a|LINE|L1 31232 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 298.333-15 chr15 67661508 67661947 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 12 of 21) intron (NM_001206804, intron 12 of 21) 112633 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 315.667-20 chr5 84873010 84873501 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -488375 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 278.333-49 chr9 74675084 74675618 + 1 NA intron (NM_006914, intron 9 of 9) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 59817 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 213.333-81 chr18 59819100 59819530 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -80681 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 306.333-10 chr11 42494386 42494889 + 1 NA Intergenic Intergenic -240947 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 212.667-13 chr10 53322328 53322601 + 1 NA Intergenic Intergenic -550764 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 228.667-42 chr2 115301991 115302364 + 1 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -7060 NM_020868 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 278.667-54 chr9 22746059 22746481 + 1 NA intron (NR_038977, intron 4 of 5) intron (NR_038977, intron 4 of 5) 100070 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 154.667-215 chr20 37777050 37777208 + 1 NA intron (NM_001281495, intron 8 of 16) intron (NM_001281495, intron 8 of 16) 83099 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 148.333-207 chr2 183017058 183017235 + 1 NA intron (NM_013436, intron 2 of 30) intron (NM_013436, intron 2 of 30) 21311 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 277.667-46 chr8 74126563 74126973 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 135376 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 151.333-172 chr17 33626641 33626847 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 -92984 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 215.333-74 chr17 73058120 73058478 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 3 of 9) intron (NM_001352692, intron 3 of 9) 34389 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 417.333-3 chr16 50526240 50526972 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -21790 NM_033119 85407 Hs.187578 NM_033119 ENSG00000140807 NKD1 Naked1 NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1 protein-coding 147.667-12 chr1 118501611 118501820 + 1 NA Intergenic Intergenic -316487 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 156.667-12 chr1 71163483 71163711 + 1 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) intron (NR_046217, intron 2 of 3) 82273 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 271.667-53 chr5 55020690 55021185 + 1 NA TTS (NR_104662) TTS (NR_104662) 3232 NR_104662 102467081 NR_104662 LOC102467081 - uncharacterized LOC102467081 ncRNA 155.667-395 chrX 13676197 13676473 + 1 NA Intergenic Intergenic -12786 NM_001195328 9367 Hs.495704 NM_004251 ENSG00000123595 RAB9A RAB9 RAB9A, member RAS oncogene family protein-coding 148.333-295 chr4 168267751 168268003 + 1 NA exon (NM_017631, exon 21 of 38) exon (NM_017631, exon 21 of 38) 50875 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 113.667-53 chr13 108106788 108106992 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 107892 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 171.667-162 chr8 87743594 87743930 + 1 NA Intergenic Intergenic 130253 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 208.333-68 chr2 24546819 24547186 + 1 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -37475 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 240.667-37 chr17 65933156 65933443 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 18 of 26) L1MA7|LINE|L1 -106756 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 205.333-84 chr15 83501043 83501354 + 1 NA intron (NM_001324185, intron 2 of 9) intron (NM_001324185, intron 2 of 9) 10584 NM_001324187 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 203.667-61 chr2 171948754 171949109 + 1 NA intron (NM_003642, intron 3 of 10) L1MC4|LINE|L1 26470 NM_003642 8520 Hs.632532 NM_003642 ENSG00000128708 HAT1 KAT1 histone acetyltransferase 1 protein-coding 172.667-145 chr7 26785850 26786155 + 1 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) MER115|DNA|hAT-Tip100 71721 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 266.333-64 chr8 114881375 114881728 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 786462 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 154.667-353 chr7 2188399 2188600 + 1 NA intron (NM_001013837, intron 10 of 18) L1MB3|LINE|L1 44446 NM_001013837 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 167.333-204 chr5 12542725 12543033 + 1 NA Intergenic (ATAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -31978 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 156.667-253 chr4 101028551 101028743 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 12 of 12) intron (NM_001130691, intron 12 of 12) 212225 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 224.333-32 chr12 116923989 116924447 + 1 NA intron (NM_153348, intron 1 of 10) intron (NM_153348, intron 1 of 10) 13262 NM_012174 26259 Hs.624537 NM_012174 ENSG00000174989 FBXW8 FBW6|FBW8|FBX29|FBXO29|FBXW6 F-box and WD repeat domain containing 8 protein-coding 190.667-82 chr3 8642730 8643128 + 1 NA intron (NM_001256749, intron 1 of 11) intron (NM_001256749, intron 1 of 11) 1869 NR_046358 51066 Hs.736935 NM_015931 ENSG00000125046 SSUH2 C3orf32|SSU-2|fls485 ssu-2 homolog protein-coding 140.667-248 chr9 72629663 72629824 + 1 NA intron (NM_138691, intron 4 of 23) L2c|LINE|L2 107942 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 256.333-80 chr8 79438247 79438815 + 1 NA Intergenic Intergenic 106343 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 132.333-173 chr8 17069135 17069293 + 1 NA intron (NR_146233, intron 2 of 15) intron (NR_146233, intron 2 of 15) 41976 NM_001349810 286097 Hs.403594 NM_181723 ENSG00000155970 MICU3 EFHA2 mitochondrial calcium uptake family member 3 protein-coding 197.333-215 chr7 72070105 72070535 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) intron (NM_001363460, intron 3 of 5) 267071 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 169.333-40 chr11 79170248 79170548 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 3 of 33) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 231711 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 215.333-62 chr15 70902803 70903225 + 1 NA intron (NM_017691, intron 4 of 15) intron (NM_017691, intron 4 of 15) 10571 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 151.667-68 chr11 87580758 87581053 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 138506 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 134.667-85 chr17 75358139 75358303 + 1 NA intron (NM_002086, intron 2 of 5) intron (NM_002086, intron 2 of 5) 47457 NM_002086 2885 Hs.444356 NM_002086 ENSG00000177885 GRB2 ASH|EGFRBP-GRB2|Grb3-3|MST084|MSTP084|NCKAP2 growth factor receptor bound protein 2 protein-coding 159.667-74 chr12 42190461 42190715 + 1 NA intron (NR_135139, intron 4 of 6) L1MD|LINE|L1 -45714 NM_001099650 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 172.333-174 chr8 56394003 56394222 + 1 NA Intergenic Intergenic -3402 NR_103832 442388 Hs.632065 NM_001145251 ENSG00000253542 SDR16C6P SDR16C6 short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, pseudogene pseudo 229.667-41 chr2 74368608 74368870 + 1 NA exon (NM_001190836, exon 13 of 28) exon (NM_001190836, exon 13 of 28) 5996 NM_001135041 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 223.333-156 chr7 94368695 94369111 + 1 NA intron (NR_147206, intron 5 of 5) intron (NR_147206, intron 5 of 5) 23289 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 241.667-97 chr9 37976622 37977034 + 1 NA intron (NM_003028, intron 2 of 5) intron (NM_003028, intron 2 of 5) -72475 NR_024873 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 149.333-241 chr3 59287823 59288083 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -237921 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 155.333-230 chr3 63670444 63670757 + 1 NA Intergenic Intergenic 17925 NM_001348756 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 147.667-348 chr7 115113529 115113684 + 1 NA intron (NR_120521, intron 1 of 3) intron (NR_120521, intron 1 of 3) 34648 NR_120521 102724386 Hs.352357 NR_120521 ENSG00000225535 LINC01393 - long intergenic non-protein coding RNA 1393 ncRNA 212.667-12 chr10 33291954 33292379 + 1 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) AluJb|SINE|Alu 42501 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 160.667-131 chr18 13840152 13840346 + 1 NA Intergenic Intergenic 16100 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 327.666-10 chr7 43869898 43870665 + 1 NA promoter-TSS (NM_032014) promoter-TSS (NM_032014) -764 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 204.667-46 chr14 87548632 87548939 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 106509 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 381.667-6 chr3 124786992 124787507 + 1 NA intron (NM_001354766, intron 9 of 13) intron (NM_001354766, intron 9 of 13) 54810 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 170.333-176 chr5 121135181 121135492 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -187214 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 375.333-10 chr2 25243147 25243701 + 1 NA intron (NR_135490, intron 16 of 23) L1ME4a|LINE|L1 8707 NM_001320893 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 266.667-26 chr15 42367859 42368464 + 1 NA intron (NM_000070, intron 1 of 23) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 8660 NM_000070 825 Hs.143261 NM_000070 ENSG00000092529 CAPN3 CANP3|CANPL3|LGMD2|LGMD2A|LGMDD4|LGMDR1|nCL-1|p94 calpain 3 protein-coding 128.667-165 chr7 41321796 41322015 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 220301 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 247.667-90 chr7 92322246 92322690 + 1 NA intron (NM_019004, intron 4 of 19) intron (NM_019004, intron 4 of 19) -76368 NM_001350677 889 Hs.531987 NM_004912 ENSG00000001631 KRIT1 CAM|CCM1 KRIT1 ankyrin repeat containing protein-coding 192.333-168 chr8 81223584 81223910 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -56789 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 258.667-94 chr8 64426592 64427032 + 1 NA Intergenic Intergenic 47663 NR_029669 406908 NR_029669 ENSG00000207816 MIR124-2 MIRN124-2|MIRN124A2|mir-124-2 microRNA 124-2 ncRNA 202.667-160 chr9 131693792 131694156 + 1 NA intron (NM_001304275, intron 1 of 23) intron (NM_001304275, intron 1 of 23) 15868 NM_198679 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 189.667-38 chr13 73921694 73921943 + 1 NA intron (NM_007249, intron 3 of 7) intron (NM_007249, intron 3 of 7) 212111 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 157.667-118 chr16 64760803 64761025 + 1 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 361149 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 302.667-2 chr1 183234461 183234974 + 1 NA intron (NM_005562, intron 15 of 22) intron (NM_005562, intron 15 of 22) 48453 NM_005562 3918 Hs.591484 NM_005562 ENSG00000058085 LAMC2 B2T|BM600|CSF|EBR2|EBR2A|LAMB2T|LAMNB2 laminin subunit gamma 2 protein-coding 205.333-27 chr10 20785494 20785908 + 1 NA 3' UTR (NM_213569, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_213569, exon 7 of 7) 111901 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 275.667-68 chr9 28188216 28188617 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 530889 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 163.333-180 chr3 62115003 62115318 + 1 NA intron (NM_002841, intron 5 of 29) intron (NM_002841, intron 5 of 29) 203787 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 181.333-130 chr4 183075255 183075506 + 1 NA Intergenic Intergenic 23819 NR_024008 152641 Hs.745108 NM_153008 ENSG00000251359 WWC2-AS2 C4orf38 WWC2 antisense RNA 2 ncRNA 190.667-80 chr22 47161223 47161520 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 12 of 12) intron (NM_001284305, intron 12 of 12) -184200 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 205.667-49 chr15 34306209 34306501 + 1 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) L1MEj|LINE|L1 12465 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 223.667-76 chr7 14410140 14410648 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -418969 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 169.333-226 chr6 54154887 54155126 + 1 NA intron (NM_001281746, intron 5 of 11) intron (NM_001281746, intron 5 of 11) 43563 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 162.333-136 chr20 34240252 34240426 + 1 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -20026 NM_001672 434 Hs.659995 NM_001672 ENSG00000101440 ASIP AGSW|AGTI|AGTIL|ASP|SHEP9 agouti signaling protein protein-coding 220.667-10 chr1 219344738 219345030 + 1 NA Intergenic Intergenic 169915 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 176.333-109 chr3 2568849 2569134 + 1 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) intron (NM_175607, intron 3 of 24) -323224 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 172.333-44 chr13 30911371 30911561 + 1 NA intron (NM_032849, intron 1 of 4) intron (NM_032849, intron 1 of 4) 5195 NM_032849 84935 Hs.147880 NM_032849 ENSG00000102802 MEDAG AWMS3|C13orf33|MEDA-4|MEDA4|hAWMS3 mesenteric estrogen dependent adipogenesis protein-coding 140.667-78 chr14 59768986 59769179 + 1 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 101694 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 127.333-165 chr7 1105666 1105880 + 1 NA intron (NM_001134395, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu 17660 NM_001098201 2852 Hs.20961 NM_001505 ENSG00000164850 GPER1 CEPR|CMKRL2|DRY12|FEG-1|GPCR-Br|GPER|GPR30|LERGU|LERGU2|LyGPR|mER G protein-coupled estrogen receptor 1 protein-coding 160.667-319 chr8 143406937 143407237 + 1 NA Intergenic Intergenic -10592 NR_126358 104326051 Hs.202140 NR_126358 ENSG00000254338 MAFA-AS1 TCONS_00014882 MAFA antisense RNA 1 ncRNA 154.667-143 chr17 62937009 62937278 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -7072 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 154.667-300 chr5 18660687 18660861 + 1 NA Intergenic Intergenic 853500 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 241.667-37 chr2 124831127 124831501 + 1 NA intron (NM_130773, intron 19 of 23) MER101-int|LTR|ERV1 806027 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 275.667-56 chr7 67206454 67206960 + 1 NA intron (NR_134540, intron 14 of 14) intron (NR_134540, intron 14 of 14) -92310 NR_039794 100616331 NR_039794 ENSG00000264494 MIR4650-2 - microRNA 4650-2 ncRNA 155.333-68 chr12 1296785 1296965 + 1 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) L1MEf|LINE|L1 -203616 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 190.333-106 chr4 73120771 73121132 + 1 NA exon (NM_015574, exon 20 of 34) exon (NM_015574, exon 20 of 34) -51192 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 231.667-10 chr12 38417254 38417689 + 1 NA Intergenic LTR10A|LTR|ERV1 100697 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 133.333-43 chr12 94670377 94670588 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -19925 NM_020698 57458 Hs.370410 NM_020698 ENSG00000057704 TMCC3 - transmembrane and coiled-coil domain family 3 protein-coding 325.333-41 chr6 43683130 43683832 + 1 NA intron (NM_001193343, intron 1 of 4) intron (NM_001193343, intron 1 of 4) 4331 NM_018135 55168 Hs.520149 NM_018135 ENSG00000096080 MRPS18A HumanS18b|MRP-S18-3|MRP-S18-a|MRPS18-3|S18bmt|S18mt-a mitochondrial ribosomal protein S18A protein-coding 137.667-196 chr9 118339262 118339412 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -340334 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 150.333-293 chr4 33091386 33091548 + 1 NA Intergenic Intergenic 740429 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 156.333-335 chr7 37499038 37499238 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -49812 NM_001206480 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 157.667-52 chr11 33747215 33747470 + 1 NA intron (NM_012175, intron 9 of 10) intron (NM_012175, intron 9 of 10) -10863 NM_203331 966 Hs.278573 NM_000611 ENSG00000085063 CD59 16.3A5|1F5|EJ16|EJ30|EL32|G344|HRF-20|HRF20|MAC-IP|MACIF|MEM43|MIC11|MIN1|MIN2|MIN3|MIRL|MSK21|p18-20 CD59 molecule (CD59 blood group) protein-coding 154.667-213 chr2 222778682 222778877 + 1 NA Intergenic Intergenic -82257 NM_004457 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 144.667-29 chr10 71640350 71640582 + 1 NA intron (NM_052836, intron 11 of 12) MER5A|DNA|hAT-Charlie 79312 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 205.667-20 chr10 115294350 115294709 + 1 NA intron (NM_207303, intron 15 of 28) L1MA5A|LINE|L1 201164 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 139.333-92 chr17 60911991 60912156 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 12 of 25) intron (NM_001330413, intron 12 of 25) 234222 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 335.333-34 chr4 84626725 84627371 + 1 NA intron (NM_001263, intron 5 of 12) intron (NM_001263, intron 5 of 12) 43921 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 175.667-95 chr3 25878852 25879066 + 1 NA Intergenic Intergenic -5264 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 147.667-28 chr1 219077429 219077607 + 1 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) 96270 NR_038845 643723 Hs.519774 NR_038845 LYPLAL1-DT LYPLAL1-AS1 LYPLAL1 divergent transcript ncRNA 215.333-183 chr7 56286766 56287250 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 161367 NR_029420 650226 Hs.448401 NR_029420 LOC650226 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene pseudo 252.333-49 chr4 44059286 44059681 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 42421 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 172.667-54 chr14 50519405 50519646 + 1 NA intron (NM_198794, intron 2 of 31) AluSx|SINE|Alu 13044 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 139.667-136 chr4 64512607 64512857 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -103272 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 164.333-29 chr10 79987801 79988120 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -38855 NM_003019 6441 Hs.253495 NM_003019 ENSG00000133661 SFTPD COLEC7|PSP-D|SFTP4|SP-D surfactant protein D protein-coding 147.333-216 chr3 96022173 96022425 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -337665 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 151.333-191 chr19 51580613 51580844 + 1 NA intron (NM_007147, intron 2 of 4) intron (NM_007147, intron 2 of 4) 9445 NR_136208 7728 Hs.119014 NM_007147 ENSG00000105497 ZNF175 OTK18 zinc finger protein 175 protein-coding 133.667-154 chr8 121831791 121832045 + 1 NA Intergenic Intergenic -190478 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 161.667-153 chr20 5346506 5346708 + 1 NA Intergenic Intergenic -29875 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 367.667-15 chr4 41374034 41374498 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 13459 NM_001330787 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 142.333-109 chr19 41239629 41239905 + 1 NA intron (NM_001278599, intron 7 of 16) intron (NM_001278599, intron 7 of 16) 13012 NM_001278599 558 Hs.590970 NM_001699 ENSG00000167601 AXL ARK|JTK11|Tyro7|UFO AXL receptor tyrosine kinase protein-coding 150.667-245 chr3 118897090 118897329 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -45867 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 227.333-90 chr4 76486469 76486890 + 1 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) MER91C|DNA|hAT-Tip100 51450 NM_020859 57619 Hs.683808 NM_020859 ENSG00000138771 SHROOM3 APXL3|MSTP013|SHRM|ShrmL shroom family member 3 protein-coding 131.333-153 chr6 47133176 47133397 + 1 NA Intergenic Intergenic -90954 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 199.667-107 chr5 3503914 3504207 + 1 NA promoter-TSS (NR_104618) promoter-TSS (NR_104618) -56 NR_104618 102467075 Hs.652949 NR_104618 ENSG00000250716 LINC01017 - long intergenic non-protein coding RNA 1017 ncRNA 225.333-121 chr7 13957474 13957759 + 1 NA intron (NM_001163148, intron 5 of 12) intron (NM_001163148, intron 5 of 12) 28898 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 248.333-76 chr4 182880893 182881221 + 1 NA Intergenic Intergenic 36196 NM_001351744 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 154.333-246 chr4 91868198 91868402 + 1 NA Intergenic Intergenic 409002 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 233.333-79 chr22 19369639 19369991 + 1 NA intron (NM_003325, intron 15 of 24) AluSz|SINE|Alu 61918 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 114.333-192 chr6 47815827 47815960 + 1 NA intron (NR_033806, intron 6 of 6) intron (NR_033806, intron 6 of 6) 28825 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 150.667-92 chr12 85995954 85996216 + 1 NA intron (NM_001351286, intron 5 of 7) L1MEc|LINE|L1 121790 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 111.667-278 chrX 84612629 84612854 + 1 NA Intergenic Intergenic -110288 NM_001177479 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 138.667-147 chr4 44983356 44983604 + 1 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -256846 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 245.667-60 chr6 27985308 27985617 + 1 NA Intergenic Intergenic 28221 NM_012367 26212 Hs.532145 NM_012367 ENSG00000124657 OR2B6 OR2B1|OR2B1P|OR2B5|OR2B6P|OR5-40|OR5-41|OR6-31|dJ408B20.2 olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 protein-coding 122.333-173 chr5 39858465 39858614 + 1 NA Intergenic Intergenic -193752 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 242.667-63 chr21 34861918 34862353 + 1 NA intron (NM_001001890, intron 2 of 5) (GA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26564 NM_001122607 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 164.333-211 chr6 36870213 36870381 + 1 NA intron (NM_016059, intron 2 of 3) intron (NM_016059, intron 2 of 3) -1547 NM_001286636 221477 Hs.433381 NM_152734 ENSG00000198663 C6orf89 BRAP|PS1TP5TP1 chromosome 6 open reading frame 89 protein-coding 184.333-68 chr19 50427771 50427975 + 1 NA intron (NM_001244000, intron 5 of 5) intron (NM_001244000, intron 5 of 5) -5019 NM_004533 4606 Hs.85937 NM_004533 ENSG00000086967 MYBPC2 MYBPC|MYBPCF myosin binding protein C, fast type protein-coding 178.333-127 chr4 112606940 112607239 + 1 NA intron (NM_018392, intron 8 of 27) intron (NM_018392, intron 8 of 27) -29875 NM_001267039 51574 Hs.713663 NM_015454 ENSG00000174720 LARP7 ALAZS|HDCMA18P|PIP7S La ribonucleoprotein domain family member 7 protein-coding 171.333-199 chr8 124330480 124330734 + 1 NA intron (NM_194291, intron 2 of 6) intron (NM_194291, intron 2 of 6) 42092 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 257.333-35 chr14 70580444 70580927 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 20005 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 220.667-49 chr2 137251056 137251394 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 10 of 27) intron (NM_001316349, intron 10 of 27) 485680 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 150.667-370 chr8 77294319 77294481 + 1 NA Intergenic Intergenic -156297 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 165.667-55 chr14 69395041 69395349 + 1 NA intron (NM_004450, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 3104 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 171.333-67 chr17 71461755 71462062 + 1 NA Intergenic Intergenic -259729 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 143.667-211 chr6 42445514 42445776 + 1 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) L2a|LINE|L2 6406 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 150.333-354 chr6 26242729 26242897 + 1 NA Intergenic Intergenic 2387 NM_003540 8361 Hs.247816 NM_003540 ENSG00000274618 HIST1H4F H4|H4/c|H4FC histone cluster 1 H4 family member f protein-coding 176.333-164 chr8 59016448 59016665 + 1 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 102591 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 238.333-24 chr15 49042292 49042813 + 1 NA intron (NM_001193489, intron 1 of 17) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 3894 NM_014701 9728 Hs.9997 NM_014701 ENSG00000138593 SECISBP2L SBP2L|SLAN SECIS binding protein 2 like protein-coding 158.667-287 chr6 75417256 75417458 + 1 NA intron (NR_125859, intron 4 of 8) intron (NR_125859, intron 4 of 8) -11050 NR_039670 100616389 NR_039670 ENSG00000263533 MIR4463 - microRNA 4463 ncRNA 181.667-123 chr5 94446925 94447128 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 13 of 20) L2c|LINE|L2 171578 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 157.333-23 chr1 155857168 155857439 + 1 NA promoter-TSS (NM_001282860) promoter-TSS (NM_001282860) -8 NM_001282860 54856 Hs.656361 NM_032292 ENSG00000116580 GON4L GON-4|GON4|YARP gon-4 like protein-coding 326.667-18 chr17 75742192 75742787 + 1 NA exon (NM_000213, exon 24 of 40) exon (NM_000213, exon 24 of 40) 17793 NM_001005619 3691 Hs.632226 NM_000213 ENSG00000132470 ITGB4 CD104|GP150 integrin subunit beta 4 protein-coding 167.333-102 chr16 74805998 74806318 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -31338 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 268.333-6 chr10 54061992 54062260 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 19 of 34) AluSq2|SINE|Alu -424104 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 235.667-9 chr11 15326877 15327360 + 1 NA Intergenic Intergenic 178016 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 270.333-21 chr14 51307676 51308095 + 1 NA intron (NR_145423, intron 1 of 1) intron (NR_145423, intron 1 of 1) 20500 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 151.667-217 chr3 59415105 59415258 + 1 NA Intergenic Intergenic 243316 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 340.667-10 chr2 23829459 23829935 + 1 NA intron (NR_125717, intron 14 of 28) AluJb|SINE|Alu 97426 NM_017552 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 321.333-52 chr6 133443053 133443503 + 1 NA intron (NM_172103, intron 3 of 18) L1MEf|LINE|L1 201779 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 207.667-84 chr4 32737630 32737934 + 1 NA Intergenic Intergenic 386744 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 154.667-105 chr14 46225507 46225681 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 161435 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 176.667-59 chr15 60864693 60864927 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 183241 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 188.333-25 chr11 37226132 37226450 + 1 NA Intergenic Intergenic -628012 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 143.333-86 chr14 61739198 61739470 + 1 NA intron (NM_181054, intron 10 of 13) intron (NM_181054, intron 10 of 13) 9755 NR_045406 100750247 Hs.597216 NR_045406 HIF1A-AS2 3'aHIF-1A|aHIF HIF1A antisense RNA 2 ncRNA 152.333-105 chr14 47441043 47441338 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -97944 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 163.333-101 chr15 71282063 71282344 + 1 NA intron (NM_024817, intron 5 of 16) intron (NM_024817, intron 5 of 16) -93144 NR_120350 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 272.333-7 chr10 120756551 120757005 + 1 NA Intergenic Intergenic 94401 NR_033850 283089 Hs.568750 NR_033850 ENSG00000227165 WDR11-AS1 - WDR11 antisense RNA 1 ncRNA 237.333-39 chr16 74079949 74080310 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 135392 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 187.333-145 chr4 91850172 91850519 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 426957 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 291.667-17 chr2 172447333 172447888 + 1 NA intron (NM_001365530, intron 1 of 25) intron (NM_001365530, intron 1 of 25) 18412 NR_157573 101929947 Hs.710861 NR_157573 ITGA6-AS1 - ITGA6 antisense RNA 1 ncRNA 204.333-19 chr1 220916760 220917036 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -36758 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 157.667-101 chr14 63734216 63734444 + 1 NA Intergenic Intergenic -6265 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 378.667-23 chr8 120274314 120274808 + 1 NA intron (NM_021110, intron 26 of 47) L1PB3|LINE|L1 149459 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 183.333-55 chr15 76794478 76794762 + 1 NA intron (NM_001145923, intron 7 of 31) intron (NM_001145923, intron 7 of 31) 67324 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 181.333-56 chr16 84740136 84740413 + 1 NA intron (NR_073577, intron 2 of 11) intron (NR_073577, intron 2 of 11) 40274 NM_005153 9100 Hs.136778 NM_005153 ENSG00000103194 USP10 UBPO ubiquitin specific peptidase 10 protein-coding 166.667-92 chr17 79992371 79992663 + 1 NA intron (NM_019020, intron 3 of 11) intron (NM_019020, intron 3 of 11) -41664 NM_001271846 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 207.333-259 chr7 117415206 117415517 + 1 NA intron (NM_001301821, intron 4 of 12) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 12132 NM_001301821 136991 Hs.352412 NM_130768 ENSG00000154438 ASZ1 ALP1|ANKL1|C7orf7|CT1.19|GASZ|Orf3 ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain containing 1 protein-coding 231.333-68 chr22 27842687 27843117 + 1 NA Intergenic Intergenic -41146 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 169.333-229 chr6 87017053 87017304 + 1 NA TTS (NM_000865) TTS (NM_000865) 77928 NM_001252383 1081 Hs.119689 NM_000735 ENSG00000135346 CGA CG-ALPHA|FSHA|GPA1|GPHA1|GPHa|HCG|LHA|TSHA glycoprotein hormones, alpha polypeptide protein-coding 140.667-139 chr21 33995266 33995447 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 18974 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 118.333-74 chr15 72213867 72213990 + 1 NA intron (NM_001206798, intron 3 of 10) L1M5|LINE|L1 15983 NM_001206799 5315 Hs.534770 NM_002654 ENSG00000067225 PKM CTHBP|HEL-S-30|OIP3|PK3|PKM2|TCB|THBP1 pyruvate kinase M1/2 protein-coding 158.333-271 chr6 46678442 46678695 + 1 NA TTS (NM_004277) TTS (NM_004277) -1700 NR_144468 221400 Hs.656983 NM_001010870 ENSG00000180113 TDRD6 CT41.2|NY-CO-45|SPATA36|TDR2|bA446F17.4 tudor domain containing 6 protein-coding 166.333-218 chr8 58219896 58220088 + 1 NA Intergenic Intergenic 52109 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 148.333-267 chr3 186560540 186560769 + 1 NA intron (NM_001286749, intron 1 of 6) intron (NM_001286749, intron 1 of 6) 6685 NM_018138 55171 Hs.518469 NM_018138 ENSG00000113838 TBCCD1 - TBCC domain containing 1 protein-coding 140.667-102 chr18 12636512 12636756 + 1 NA intron (NM_020148, intron 1 of 15) intron (NM_020148, intron 1 of 15) 20098 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 207.333-187 chr3 124860668 124861121 + 1 NA intron (NM_001354766, intron 2 of 13) intron (NM_001354766, intron 2 of 13) 26471 NM_002213 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 207.333-160 chr20 43004865 43005168 + 1 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) intron (NM_133170, intron 1 of 31) 36273 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 211.667-69 chr2 170605275 170605694 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 31 of 33) L2b|LINE|L2 109083 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 138.333-90 chr2 45234041 45234281 + 1 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 20780 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 174.333-94 chr3 173510155 173510505 + 1 NA intron (NM_014932, intron 2 of 6) intron (NM_014932, intron 2 of 6) -74104 NM_001365933 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 362.667-14 chr2 128114973 128115434 + 1 NA exon (NM_020120, exon 7 of 41) exon (NM_020120, exon 7 of 41) 24003 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 193.667-25 chr11 35942338 35942596 + 1 NA Intergenic Intergenic -1514 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 142.333-126 chr2 140462919 140463099 + 1 NA intron (NM_018557, intron 60 of 90) intron (NM_018557, intron 60 of 90) 123676 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 145.333-290 chr8 20436622 20436780 + 1 NA Intergenic Intergenic -132738 NM_021020 11178 Hs.521432 NM_021020 ENSG00000061337 LZTS1 F37|FEZ1 leucine zipper tumor suppressor 1 protein-coding 143.333-228 chr5 100728508 100728677 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 87973 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 136.333-2 chr1 16327549 16327712 + 1 NA intron (NM_018994, intron 1 of 9) intron (NM_018994, intron 1 of 9) 24850 NM_018994 54455 Hs.522384 NM_018994 ENSG00000037637 FBXO42 Fbx42|JFK F-box protein 42 protein-coding 254.667-70 chr5 94683260 94683600 + 1 NA intron (NM_032290, intron 15 of 20) L2a|LINE|L2 64761 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 393.667-9 chr3 124720416 124720890 + 1 NA 3' UTR (NM_001322993, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001322993, exon 27 of 27) -9713 NR_033437 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 214.667-80 chr3 40882409 40882766 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -316918 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 144.333-57 chr13 51440704 51441052 + 1 NA 3' UTR (NM_001039938, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001039938, exon 3 of 3) 12158 NM_001306091 26512 Hs.439440 NM_012141 ENSG00000102786 INTS6 DBI-1|DDX26|DDX26A|DICE1|HDB|INT6|Notchl2 integrator complex subunit 6 protein-coding 249.333-29 chr13 107871339 107871780 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4063 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 150.667-225 chr21 45727520 45727670 + 1 NA intron (NM_001348238, intron 2 of 16) MER74A|LTR|ERVL -20419 NM_001348243 54039 Hs.474049 NM_020528 ENSG00000183570 PCBP3 ALPHA-CP3|PCBP3-OT1|PCBP3OT poly(rC) binding protein 3 protein-coding 148.333-174 chr19 29064172 29064376 + 1 NA Intergenic Intergenic 61719 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 258.667-5 chr1 86060532 86061029 + 1 NA intron (NM_152890, intron 8 of 59) intron (NM_152890, intron 8 of 59) 95691 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 186.333-44 chr13 34868868 34869097 + 1 NA Intergenic Intergenic -73305 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 140.667-56 chr11 104027169 104027370 + 1 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) intron (NM_025208, intron 1 of 6) -9371 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 193.667-91 chr4 39848288 39848646 + 1 NA intron (NM_001100399, intron 28 of 32) MIRb|SINE|MIR 129444 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 249.333-12 chr1 223804113 223804483 + 1 NA exon (NM_001031685, exon 6 of 18) exon (NM_001031685, exon 6 of 18) 41649 NM_001031685 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 144.333-86 chr15 76791058 76791302 + 1 NA intron (NM_001353011, intron 9 of 32) L1M5|LINE|L1 70764 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 151.333-58 chr10 71468237 71468424 + 1 NA intron (NM_052836, intron 3 of 12) intron (NM_052836, intron 3 of 12) 43590 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-14 chr1 229569011 229569216 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10406 NM_012089 23456 Hs.17614 NM_012089 ENSG00000135776 ABCB10 EST20237|M-ABC2|MTABC2 ATP binding cassette subfamily B member 10 protein-coding 173.333-70 chr16 72424086 72424311 + 1 NA TTS (NR_159371) TTS (NR_159371) 240772 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 150.667-111 chr13 106776059 106776266 + 1 NA Intergenic Intergenic 122282 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 224.667-34 chr18 7914800 7915147 + 1 NA intron (NM_002845, intron 4 of 30) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 347657 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 185.333-101 chr2 190484769 190485072 + 1 NA intron (NM_017694, intron 4 of 7) intron (NM_017694, intron 4 of 7) 49802 NM_001142645 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 118.667-29 chr10 73280811 73280958 + 1 NA intron (NM_001367801, intron 20 of 27) L1M5|LINE|L1 28143 NR_134460 414245 Hs.568860 NR_038373 ENSG00000227540 DNAJC9-AS1 C10orf103|bA537A6.3 DNAJC9 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-141 chr16 10921541 10921795 + 1 NA intron (NR_104444, intron 14 of 17) MIR|SINE|MIR 20800 NM_014015 28955 Hs.592051 NM_014015 ENSG00000182108 DEXI MYLE Dexi homolog protein-coding 260.333-58 chr6 163707872 163708329 + 1 NA Intergenic Intergenic -36616 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 143.667-184 chr4 73308909 73309143 + 1 NA Intergenic Intergenic -50228 NM_198889 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 182.667-162 chr8 83689278 83689531 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 285646 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 139.333-113 chr2 123279794 123280023 + 1 NA Intergenic Intergenic -206427 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 124.667-71 chr15 69587573 69587756 + 1 NA Intergenic Intergenic -4536 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 156.667-360 chr9 103108436 103108597 + 1 NA Intergenic Intergenic 113183 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 207.333-207 chr4 114119520 114119839 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -140032 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 117.667-38 chr12 42578471 42578660 + 1 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) 11181 NM_153026 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 209.333-114 chr2 79540206 79540537 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) MIR|SINE|MIR 17188 NM_001282598 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 123.333-119 chr2 195892500 195892672 + 1 NA intron (NM_018897, intron 30 of 64) L1MC2|LINE|L1 176251 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 235.333-104 chr6 9633967 9634336 + 1 NA Intergenic Intergenic -770351 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 156.333-59 chr11 83177515 83177780 + 1 NA intron (NM_001346415, intron 10 of 15) intron (NM_001346415, intron 10 of 15) 9837 NR_133914 106736475 Hs.595343 NR_133914 PCF11-AS1 - PCF11 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-106 chr2 108276518 108276679 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -12297 NM_176825 6819 Hs.436123 NM_001056 ENSG00000198203 SULT1C2 ST1C1|ST1C2|SULT1C1|humSULTC2 sulfotransferase family 1C member 2 protein-coding 137.333-173 chr6 124835052 124835307 + 1 NA Intergenic Intergenic -127366 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 172.333-81 chr2 36918678 36918955 + 1 NA intron (NM_003162, intron 2 of 17) intron (NM_003162, intron 2 of 17) 47720 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 159.667-133 chr17 39559100 39559298 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 48721 NM_006160 4761 Hs.322431 NM_006160 ENSG00000171532 NEUROD2 EIEE72|NDRF|bHLHa1 neuronal differentiation 2 protein-coding 117.333-158 chr4 107064252 107064396 + 1 NA Intergenic Intergenic -28011 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 180.333-76 chr3 47713402 47713631 + 1 NA intron (NM_003074, intron 8 of 27) AluJb|SINE|Alu -51822 NR_145791 109623484 NR_145791 SNORD146 - small nucleolar RNA, C/D box 146 snoRNA 150.667-377 chr8 111187546 111187776 + 1 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) intron (NR_125418, intron 1 of 3) 48542 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 160.667-4 chr1 48682741 48682908 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 6 of 12) MIRc|SINE|MIR 94067 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 388.333-17 chr5 149509518 149510168 + 1 NA intron (NM_001271742, intron 7 of 9) intron (NM_001271742, intron 7 of 9) 40522 NM_001271742 1452 Hs.529862 NM_001892 ENSG00000113712 CSNK1A1 CK1|CK1a|CKIa|HEL-S-77p|HLCDGP1|PRO2975 casein kinase 1 alpha 1 protein-coding 159.667-48 chr10 66751472 66751756 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -174422 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 293.667-7 chr10 60819537 60819854 + 1 NA Intergenic Intergenic 41217 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 170.333-96 chr18 11905178 11905493 + 1 NA intron (NM_001242904, intron 1 of 7) (CAAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2982 NR_040241 65258 Hs.712666 NM_023075 ENSG00000154889 MPPE1 PGAP5 metallophosphoesterase 1 protein-coding 330.667-14 chr20 46047787 46048260 + 1 NA exon (NM_001134771, exon 16 of 26) exon (NM_001134771, exon 16 of 26) 18808 NM_020708 57468 Hs.21413 NM_020708 ENSG00000124140 SLC12A5 EIEE34|EIG14|KCC2|hKCC2 solute carrier family 12 member 5 protein-coding 175.333-56 chr15 72698279 72698489 + 1 NA intron (NM_033028, intron 2 of 15) L1MB4|LINE|L1 12177 NM_033028 585 Hs.208681 NM_033028 ENSG00000140463 BBS4 - Bardet-Biedl syndrome 4 protein-coding 116.667-44 chr12 132789632 132789861 + 1 NA intron (NM_001172557, intron 12 of 15) intron (NM_001172557, intron 12 of 15) -27914 NM_015114 23141 Hs.654628 NM_015114 ENSG00000176915 ANKLE2 KIAA0692|LEMD7|Lem4|MCPH16 ankyrin repeat and LEM domain containing 2 protein-coding 155.333-127 chr16 66050368 66050619 + 1 NA Intergenic Intergenic -316198 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 157.667-347 chr8 137902969 137903212 + 1 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 180455 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 138.333-135 chr4 57421799 57421944 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -4001 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 129.333-21 chr10 83270121 83270337 + 1 NA Intergenic Intergenic 406860 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 143.333-122 chr18 60790835 60791099 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -418192 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 129.667-138 chr5 40480387 40480641 + 1 NA Intergenic Intergenic -199401 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 150.667-257 chr4 40113936 40114094 + 1 NA intron (NM_001318359, intron 8 of 18) intron (NM_001318359, intron 8 of 18) -56816 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 245.667-9 chr11 40907912 40908258 + 1 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) 551551 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 170.333-14 chr1 176085004 176085201 + 1 NA intron (NM_022457, intron 10 of 19) intron (NM_022457, intron 10 of 19) -116562 NR_002998 677679 NR_002998 ENSG00000252906 SCARNA3 HBI-100 small Cajal body-specific RNA 3 ncRNA 185.667-107 chr6 65584644 65584954 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) intron (NM_001292009, intron 2 of 43) -4995 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 238.667-73 chr5 118770374 118770657 + 1 NA Intergenic Intergenic 174327 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 166.333-21 chr10 15048141 15048342 + 1 NA intron (NM_018324, intron 2 of 8) AluSx1|SINE|Alu 4298 NM_018324 55301 Hs.24309 NM_018324 ENSG00000152463 OLAH AURA1|SAST|TE2|THEDC1 oleoyl-ACP hydrolase protein-coding 267.667-64 chr7 73918193 73918610 + 1 NA Intergenic Intergenic 57242 NM_182504 135886 Hs.647026 NM_182504 ENSG00000175877 TMEM270 WBSCR28 transmembrane protein 270 protein-coding 176.667-3 chr1 23980491 23980717 + 1 NA promoter-TSS (NR_034035) promoter-TSS (NR_034035) -141 NR_034035 10772 Hs.3530 NM_006625 ENSG00000188529 SRSF10 FUSIP1|FUSIP2|NSSR|PPP1R149|SFRS13|SFRS13A|SRp38|SRrp40|TASR|TASR1|TASR2 serine and arginine rich splicing factor 10 protein-coding 248.333-83 chr5 94302872 94303165 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -191319 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 116.333-198 chr7 49950496 49950732 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 142632 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 155.667-273 chr5 39393237 39393453 + 1 NA exon (NM_001244871, exon 3 of 14) exon (NM_001244871, exon 3 of 14) -28850 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 160.667-173 chr20 11472756 11472979 + 1 NA Intergenic Intergenic -199484 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 330.667-6 chr11 96644615 96645102 + 1 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy 136433 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 184.667-79 chr3 38321969 38322295 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 16196 NM_004803 9389 Hs.165559 NM_004803 ENSG00000144671 SLC22A14 OCTL2|OCTL4|ORCTL4 solute carrier family 22 member 14 protein-coding 135.667-5 chr1 80427764 80427996 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -107875 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 179.333-176 chr7 88797969 88798226 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) LTR101_Mam|LTR|ERVL -2360 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 154.667-341 chr6 74439770 74439928 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 370398 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 148.333-69 chr11 45356206 45356442 + 1 NA non-coding (NR_120557, exon 2 of 2) non-coding (NR_120557, exon 2 of 2) 953 NR_120558 101928812 Hs.444059 NR_120557 ENSG00000254427 LINC02696 - long intergenic non-protein coding RNA 2696 ncRNA 151.667-44 chr10 34609063 34609223 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 206153 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 188.333-122 chr5 117955860 117956178 + 1 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 225658 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 157.667-18 chr1 199504358 199504580 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 355871 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 191.667-116 chr7 42876411 42876688 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 35294 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 153.667-332 chr6 34434861 34435045 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -8828 NM_001202470 100529239 Hs.188882 NM_001202470 ENSG00000270800 RPS10-NUDT3 - RPS10-NUDT3 readthrough protein-coding 194.667-106 chr4 55310316 55310569 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -35800 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 144.667-8 chr1 86932148 86932377 + 1 NA intron (NM_012262, intron 1 of 6) L1MA4A|LINE|L1 17627 NM_001134492 9653 Hs.743280 NM_012262 ENSG00000153936 HS2ST1 dJ604K5.2 heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 protein-coding 210.667-136 chr9 113834899 113835361 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -41152 NM_001318040 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 128.667-26 chr10 74528449 74528685 + 1 NA intron (NR_120673, intron 1 of 4) L1MB4|LINE|L1 757 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 153.333-130 chr14 79057663 79057882 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) L2|LINE|L2 -142210 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 210.667-65 chr2 52135815 52136292 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -234595 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 213.333-112 chr20 51900762 51901201 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -38068 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 311.333-30 chr2 186745750 186746180 + 1 NA intron (NM_177454, intron 3 of 7) intron (NM_177454, intron 3 of 7) 51905 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 250.667-60 chr4 126995687 126996277 + 1 NA Intergenic Intergenic -636975 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 276.333-5 chr10 32866505 32866955 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 42 of 43) intron (NM_001321115, intron 42 of 43) 34742 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 138.667-9 chr1 179499860 179500058 + 1 NA intron (NM_144696, intron 20 of 25) L1M5|LINE|L1 75989 NM_001297575 7827 Hs.412710 NM_014625 ENSG00000116218 NPHS2 PDCN|SRN1 NPHS2 stomatin family member, podocin protein-coding 147.667-121 chr16 6206091 6206314 + 1 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 186499 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 152.333-142 chr17 30066908 30067095 + 1 NA intron (NM_198529, intron 14 of 22) L1MA5|LINE|L1 -49806 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 241.667-55 chr3 116350505 116350781 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -9381 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 150.333-144 chr16 25604633 25604981 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -87152 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 284.667-27 chr2 135656639 135656928 + 1 NA intron (NM_001282798, intron 17 of 25) L1M4a1|LINE|L1 -8614 NR_029672 406915 NR_029672 ENSG00000207654 MIR128-1 MIR128A|MIRN128-1|MIRN128A|mir-128-1 microRNA 128-1 ncRNA 164.333-246 chr9 24049839 24050185 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -199411 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 202.333-96 chr2 156910666 156911027 + 1 NA Intergenic Intergenic -346859 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 210.333-40 chr13 81722580 81723017 + 1 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -495815 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 155.667-256 chr4 108642450 108642607 + 1 NA Intergenic Intergenic -8057 NM_001267817 58505 Hs.445803 NM_021227 ENSG00000198856 OSTC DC2 oligosaccharyltransferase complex non-catalytic subunit protein-coding 159.667-241 chr4 124683936 124684220 + 1 NA intron (NM_001167882, intron 1 of 3) L1M7|LINE|L1 28654 NM_001167882 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 150.333-52 chr11 10277700 10277908 + 1 NA intron (NM_030962, intron 1 of 39) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 16403 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 170.667-40 chr13 51313207 51313385 + 1 NA Intergenic Intergenic -27736 NM_001101320 647174 Hs.685891 NM_001101320 ENSG00000253309 SERPINE3 - serpin family E member 3 protein-coding 147.333-269 chr5 167354636 167354820 + 1 NA intron (NM_001122679, intron 2 of 29) MIR|SINE|MIR -186327 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 142.667-137 chr3 97672746 97672942 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -91677 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 167.333-44 chr10 62003071 62003350 + 1 NA intron (NM_032199, intron 4 of 9) L2c|LINE|L2 -46147 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 148.667-221 chr20 44183091 44183300 + 1 NA intron (NM_175913, intron 1 of 1) intron (NM_175913, intron 1 of 1) 3993 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 147.333-339 chrX 118489545 118489786 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -6244 NM_144658 139818 Hs.368203 NM_144658 ENSG00000147251 DOCK11 ACG|ZIZ2|bB128O4.1 dedicator of cytokinesis 11 protein-coding 258.667-69 chr4 10012066 10012527 + 1 NA intron (NM_001001290, intron 3 of 12) intron (NM_001001290, intron 3 of 12) 9201 NM_020041 56606 Hs.444612 NM_020041 ENSG00000109667 SLC2A9 GLUT9|GLUTX|UAQTL2|URATv1 solute carrier family 2 member 9 protein-coding 141.667-71 chr14 44580756 44580924 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 73431 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 157.667-217 chr4 65990556 65990773 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -286160 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 152.667-69 chr11 104880394 104880604 + 1 NA Intergenic Intergenic 18171 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 199.333-214 chr4 151329537 151329978 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 52584 NM_001353611 345062 Hs.651266 NM_183375 ENSG00000189099 PRSS48 ESSPL serine protease 48 protein-coding 120.333-121 chr21 35541786 35541986 + 1 NA intron (NR_073512, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 38878 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 243.667-48 chr22 28950256 28950553 + 1 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) intron (NM_032173, intron 1 of 8) 33015 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 266.667-39 chr2 74385297 74385861 + 1 NA promoter-TSS (NR_158172) promoter-TSS (NR_158172) 76 NR_158174 100189589 Hs.585961 NR_024463 ENSG00000237737 DCTN1-AS1 - DCTN1 antisense RNA 1 ncRNA 209.667-2 chr1 28726365 28726639 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10119 NM_001173128 51441 Hs.532286 NM_016258 ENSG00000198492 YTHDF2 CAHL|HGRG8|NY-REN-2 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2 protein-coding 155.333-401 chr8 123547025 123547269 + 1 NA Intergenic Intergenic -5941 NM_001242463 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 151.333-331 chr5 41902106 41902272 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2155 NM_175921 285636 Hs.29899 NM_175921 ENSG00000205765 C5orf51 - chromosome 5 open reading frame 51 protein-coding 204.333-33 chr11 26728592 26728878 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6675 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 185.667-92 chr3 115275741 115276000 + 1 NA Intergenic Intergenic -128582 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 172.667-90 chr20 41111819 41112040 + 1 NA intron (NM_003286, intron 13 of 20) intron (NM_003286, intron 13 of 20) -25614 NM_002660 5335 Hs.268177 NM_002660 ENSG00000124181 PLCG1 NCKAP3|PLC-II|PLC1|PLC148|PLCgamma1 phospholipase C gamma 1 protein-coding 175.333-100 chr2 215769055 215769301 + 1 NA intron (NR_037195, intron 1 of 9) intron (NR_037195, intron 1 of 9) 51135 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 162.333-274 chr9 71800199 71800375 + 1 NA Intergenic Intergenic -31774 NM_001349784 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 211.333-144 chr22 34444472 34444842 + 1 NA Intergenic Intergenic -521769 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 128.667-157 chr6 55477783 55477932 + 1 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) L1M5|LINE|L1 101357 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 147.333-184 chr20 6303165 6303450 + 1 NA Intergenic Intergenic -123425 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 150.333-203 chr2 110990185 110990417 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 14 of 18) L1ME3F|LINE|L1 125287 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 184.333-150 chr8 85132576 85132919 + 1 NA intron (NM_033402, intron 12 of 18) MER58A|DNA|hAT-Charlie 25509 NM_033402 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 169.667-105 chr2 52213229 52213535 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -157266 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 141.667-122 chr2 143087618 143087868 + 1 NA Intergenic Intergenic -41676 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 175.667-60 chr18 44585594 44585999 + 1 NA Intergenic Intergenic 54017 NR_131768 105667213 Hs.135737 NR_131768 LINC01601 - long intergenic non-protein coding RNA 1601 ncRNA 189.667-120 chr5 133433216 133433465 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -5634 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 156.667-300 chr6 86386861 86387135 + 1 NA Intergenic CR1-3_Croc|LINE|CR1 -550530 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 252.333-72 chr7 118219487 118219937 + 1 NA Intergenic Intergenic -4992 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 154.667-259 chr3 165200934 165201154 + 1 NA Intergenic Intergenic -3935 NM_001318811 22865 Hs.101745 NM_014926 ENSG00000121871 SLITRK3 - SLIT and NTRK like family member 3 protein-coding 376.333-3 chr14 35208805 35209511 + 1 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) AluSz|SINE|Alu -69400 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 150.333-27 chr1 197794255 197794437 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -18866 NM_001195215 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 216.333-21 chr10 96224633 96225100 + 1 NA intron (NM_013314, intron 5 of 16) AluSx1|SINE|Alu 46650 NM_001258442 29760 Hs.665244 NM_013314 ENSG00000095585 BLNK AGM4|BASH|BLNK-S|LY57|SLP-65|SLP65|bca B cell linker protein-coding 170.667-161 chr8 56589160 56589494 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -29504 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 140.667-161 chr4 45161927 45162142 + 1 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -435400 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 143.333-156 chr20 47139229 47139437 + 1 NA intron (NM_172110, intron 9 of 13) HAL1|LINE|L1 -27634 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 116.333-72 chr15 59698602 59698783 + 1 NA Intergenic Intergenic -9372 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 148.333-181 chr2 38033437 38033606 + 1 NA intron (NR_102712, intron 1 of 3) intron (NR_102712, intron 1 of 3) 2820 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 147.333-321 chr8 125662517 125662686 + 1 NA Intergenic Intergenic 230392 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 154.333-360 chr8 136580953 136581233 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 50295 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 220.333-100 chr4 32478073 32478503 + 1 NA Intergenic Intergenic 127250 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 213.667-97 chr9 68775550 68775964 + 1 NA intron (NM_003558, intron 2 of 15) L1ME3|LINE|L1 -4308 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 198.667-157 chr5 176482422 176482789 + 1 NA intron (NM_014613, intron 2 of 10) AluJb|SINE|Alu 34220 NM_014613 23197 Hs.484242 NM_014613 ENSG00000113194 FAF2 ETEA|UBXD8|UBXN3B Fas associated factor family member 2 protein-coding 129.333-87 chr2 19252346 19252542 + 1 NA Intergenic Intergenic -95985 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 155.333-19 chr1 232364346 232364617 + 1 NA Intergenic Intergenic 151127 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 147.667-128 chr16 76625609 76625887 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -9250 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 119.333-121 chr2 19960058 19960299 + 1 NA intron (NM_001006657, intron 12 of 27) intron (NM_001006657, intron 12 of 27) 29927 NM_001006657 57539 Hs.205427 NM_020779 ENSG00000118965 WDR35 CED2|IFT121|IFTA1|SRTD7 WD repeat domain 35 protein-coding 184.333-123 chr5 107081128 107081494 + 1 NA Intergenic Intergenic -70297 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 121.333-147 chr5 91727074 91727288 + 1 NA Intergenic Intergenic -343864 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 264.667-47 chr20 47351928 47352261 + 1 NA promoter-TSS (NR_134501) promoter-TSS (NR_134501) -197 NM_001363741 23613 Hs.446240 NM_012408 ENSG00000101040 ZMYND8 PRKCBP1|PRO2893|RACK7 zinc finger MYND-type containing 8 protein-coding 156.333-36 chr10 56027794 56028073 + 1 NA Intergenic Intergenic 333326 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 171.333-53 chr14 69368671 69368993 + 1 NA Intergenic Intergenic 29467 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 177.667-8 chr1 160003731 160004045 + 1 NA Intergenic Intergenic 28102 NM_145167 93183 Hs.552810 NM_145167 ENSG00000143315 PIGM GPI-MT-I phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class M protein-coding 114.667-41 chr10 122738437 122738577 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -18187 NR_003570 375940 Hs.650695 NM_198577 ENSG00000176584 DMBT1P1 - deleted in malignant brain tumors 1 pseudogene 1 pseudo 143.667-124 chr2 27847595 27847850 + 1 NA intron (NM_022128, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR -40987 NM_001329112 9577 Hs.258314 NM_004899 ENSG00000158019 BABAM2 BRCC4|BRCC45|BRE BRISC and BRCA1 A complex member 2 protein-coding 112.333-241 chr7 18222785 18222969 + 1 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) L1ME4a|LINE|L1 -67215 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 184.333-88 chr20 48536650 48536850 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 176839 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 163.667-221 chr6 146538400 146538678 + 1 NA Intergenic Intergenic -5294 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 146.333-358 chrX 28695903 28696096 + 1 NA intron (NM_014271, intron 1 of 10) intron (NM_014271, intron 1 of 10) 108553 NM_014271 11141 Hs.658912 NM_014271 ENSG00000169306 IL1RAPL1 IL-1-RAPL-1|IL-1RAPL-1|IL1R8|IL1RAPL|IL1RAPL-1|MRX10|MRX21|MRX34|OPHN4|TIGIRR-2 interleukin 1 receptor accessory protein like 1 protein-coding 122.667-188 chr8 47621355 47621535 + 1 NA intron (NM_001080394, intron 10 of 19) intron (NM_001080394, intron 10 of 19) -32643 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 149.333-197 chr2 142519010 142519281 + 1 NA Intergenic Intergenic -358519 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 200.667-73 chr2 63485904 63486177 + 1 NA intron (NR_148704, intron 5 of 18) intron (NR_148704, intron 5 of 18) -48033 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 156.333-358 chr8 109499702 109499934 + 1 NA intron (NM_177531, intron 67 of 77) LTR16A1|LTR|ERVL -39882 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 201.667-10 chr10 81958706 81959047 + 1 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu 81189 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 147.333-37 chr10 34794709 34794952 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 20466 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 169.667-169 chr5 87603901 87604159 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -58012 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 204.333-130 chr3 113706996 113707338 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10521 NR_111981 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 196.333-35 chr14 25358982 25359375 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -308881 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 281.667-26 chr2 48244871 48245465 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -69514 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 159.667-216 chr3 102256365 102256585 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 92770 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 158.667-139 chr19 3817880 3818109 + 1 NA intron (NM_015174, intron 12 of 18) L1MB4|LINE|L1 -16195 NM_002378 4145 Hs.631845 NM_002378 ENSG00000007264 MATK CHK|CTK|HHYLTK|HYL|HYLTK|Lsk megakaryocyte-associated tyrosine kinase protein-coding 150.667-95 chr12 112054784 112055043 + 1 NA intron (NM_024953, intron 13 of 23) L3|LINE|CR1 -17198 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 241.667-33 chr2 6292778 6293071 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 82498 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 209.667-30 chr12 13102869 13103265 + 1 NA non-coding (NR_159953, exon 3 of 3) non-coding (NR_159953, exon 3 of 3) 600 NM_001367361 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 245.667-64 chr6 125418925 125419210 + 1 NA Intergenic Intergenic -117100 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 192.667-180 chr8 130857786 130858122 + 1 NA intron (NM_001115, intron 9 of 17) L1MC5|LINE|L1 182955 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 180.667-10 chr10 8344944 8345195 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -76764 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 150.333-186 chr2 18674044 18674322 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -84603 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 136.333-21 chr10 55428191 55428351 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1MEc|LINE|L1 -170771 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 212.667-96 chr3 188097159 188097480 + 1 NA Intergenic Intergenic -56579 NM_001167672 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 191.667 chr1 40850128 40850373 + 1 NA Intergenic Intergenic 12113 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 146.333-4 chr1 51079500 51079681 + 1 NA Intergenic Intergenic 19572 NR_106754 102466656 NR_106754 ENSG00000275816 MIR6500 hsa-mir-6500 microRNA 6500 ncRNA 161.667-159 chr21 36861064 36861424 + 1 NA intron (NM_001352515, intron 6 of 10) intron (NM_001352515, intron 6 of 10) 101114 NM_001352518 3141 Hs.371350 NM_000411 ENSG00000159267 HLCS HCS holocarboxylase synthetase protein-coding 118.667-191 chr8 88978699 88978874 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -651303 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 210.333-65 chr2 20251234 20251496 + 1 NA 3' UTR (NM_001352918, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001352918, exon 21 of 21) -25932 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 149.333-256 chr3 119713671 119713911 + 1 NA intron (NM_033364, intron 5 of 17) L1ME4a|LINE|L1 10769 NM_001320316 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 173.667-58 chr18 4315747 4316003 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 51273 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 167.333-245 chr7 72376872 72377045 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 35380 NM_031468 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 167.667-152 chr4 61525201 61525501 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) L2c|LINE|L2 323179 NM_001371342 169.667-55 chr14 31303286 31303467 + 1 NA intron (NM_015473, intron 32 of 35) AluSx4|SINE|Alu -95583 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 243.667-5 chr1 221211494 221211765 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 124667 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 144.667-30 chr10 72827183 72827461 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) -66417 NM_152635 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 133.667-39 chr12 48638541 48638776 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 15860 NR_002968 677815 Hs.689717 NR_002968 ENSG00000221491 SNORA2C ACA34|MIR1291|SNORA34 small nucleolar RNA, H/ACA box 2C snoRNA 122.333-217 chr9 74971536 74971746 + 1 NA intron (NR_121183, intron 1 of 4) L1MA4A|LINE|L1 18676 NR_121183 101927380 Hs.257556 NR_121183 CARNMT1-AS1 C9orf41-AS1 CARNMT1 antisense RNA 1 ncRNA 130.667-138 chr22 33076708 33076864 + 1 NA Intergenic Intergenic -18405 NM_003490 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 263.333-76 chr7 29319893 29320202 + 1 NA intron (NM_001293070, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR -111077 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 255.333-63 chr20 49035297 49035688 + 1 NA 3' UTR (NM_006420, exon 39 of 39) 3' UTR (NM_006420, exon 39 of 39) 10564 NR_110625 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 158.667-112 chr15 95167525 95167765 + 1 NA Intergenic Intergenic 159455 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 159.333-40 chr10 46531946 46532254 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 23971 NM_014696 9721 Hs.523375 NM_014696 ENSG00000204175 GPRIN2 GRIN2|KIAA0514 G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 protein-coding 140.667-172 chr4 181572594 181572773 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 257290 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 168.667-209 chr7 98112191 98112478 + 1 NA intron (NM_014916, intron 1 of 13) FRAM|SINE|Alu 5472 NM_014916 22853 Hs.444179 NM_014916 ENSG00000164715 LMTK2 AATYK2|BREK|KPI-2|KPI2|LMR2|PPP1R100|cprk|hBREK lemur tyrosine kinase 2 protein-coding 266.667-38 chr2 66071144 66071639 + 1 NA Intergenic Intergenic 286937 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 207.333-87 chr14 50834132 50834424 + 1 NA Intergenic Intergenic -3157 NM_020921 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 237.333-98 chr6 66086290 66086568 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 298550 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 284.667-32 chr3 108878259 108878798 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 55742 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 201.667-132 chr9 99023260 99023668 + 1 NA intron (NM_001855, intron 14 of 41) L1MC5|LINE|L1 79557 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 188.667-53 chr16 82113714 82113912 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 56411 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 267.333-24 chr12 58603882 58604379 + 1 NA intron (NR_126341, intron 1 of 1) intron (NR_126341, intron 1 of 1) 12428 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 170.333-172 chr5 45062154 45062454 + 1 NA Intergenic Intergenic 253357 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 142.667-230 chr8 124503700 124503904 + 1 NA intron (NM_001146160, intron 7 of 9) MIR3|SINE|MIR 4774 NR_106903 102466200 NR_106903 ENSG00000284087 MIR6844 hsa-mir-6844 microRNA 6844 ncRNA 173.333-179 chr7 8987970 8988187 + 1 NA Intergenic Intergenic 554469 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 190.333-83 chr20 38060832 38061143 + 1 NA intron (NM_021215, intron 5 of 6) intron (NM_021215, intron 5 of 6) 27241 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 151.333-346 chr5 96727529 96727690 + 1 NA intron (NM_001042446, intron 3 of 26) intron (NM_001042446, intron 3 of 26) -15993 NR_104285 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 128.667-124 chr4 19375123 19375285 + 1 NA Intergenic Intergenic -876701 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 161.333-237 chr5 136371451 136371661 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -6080 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 156.333-322 chr6 150814908 150815089 + 1 NA intron (NM_001329803, intron 8 of 13) AluSz6|SINE|Alu -50681 NM_015440 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 175.333-196 chr8 138241453 138241730 + 1 NA intron (NM_015912, intron 7 of 19) intron (NM_015912, intron 7 of 19) -158046 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 319.667-20 chr3 16429581 16430084 + 1 NA intron (NM_015150, intron 3 of 9) intron (NM_015150, intron 3 of 9) 83867 NM_015150 23180 Hs.98910 NM_015150 ENSG00000131378 RFTN1 MIG2|PIB10|PIG9|RAFTLIN raftlin, lipid raft linker 1 protein-coding 161.667-53 chr12 38592098 38592311 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 275430 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 157.333-111 chr14 78022040 78022228 + 1 NA Intergenic Intergenic -148239 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 223.333-91 chr20 35390053 35390486 + 1 NA intron (NM_018244, intron 2 of 9) AluSz|SINE|Alu 21704 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 387.333-5 chr15 73180368 73180810 + 1 NA intron (NM_002499, intron 7 of 28) intron (NM_002499, intron 7 of 28) -119321 NR_162148 113219462 NR_162148 MIR12135 - microRNA 12135 ncRNA 149.333-155 chr18 8833582 8833787 + 1 NA TTS (NM_015210) TTS (NM_015210) 116303 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 175.667-31 chr12 128008378 128008553 + 1 NA Intergenic Intergenic 18701 NR_131985 105370070 NR_131985 ENSG00000256643 LINC02441 CRAT8 long intergenic non-protein coding RNA 2441 ncRNA 213.333-158 chr5 36656073 36656440 + 1 NA intron (NM_004172, intron 3 of 9) MIRb|SINE|MIR 49650 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 187.333-133 chr3 115086774 115087217 + 1 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) 13313 NM_001348804 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 129.667-168 chr8 43810808 43810962 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 518443 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 139.667-100 chr2 197200745 197200912 + 1 NA intron (NM_153697, intron 1 of 9) intron (NM_153697, intron 1 of 9) 2837 NR_135584 101927596 NR_135584 ENSG00000231621 LOC101927596 - uncharacterized LOC101927596 ncRNA 170.667-52 chr14 92063303 92063627 + 1 NA non-coding (NR_028464, exon 10 of 10) non-coding (NR_028464, exon 10 of 10) -23406 NM_001321851 9321 Hs.632339 NM_004239 ENSG00000100815 TRIP11 ACG1A|CEV14|GMAP-210|GMAP210|ODCD|TRIP-11|TRIP230 thyroid hormone receptor interactor 11 protein-coding 216.333-22 chr10 107346868 107347115 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -182285 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 182.333-69 chr18 66358301 66358501 + 1 NA Intergenic Intergenic 245689 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 142.333-257 chr9 33962194 33962349 + 1 NA intron (NR_163243, intron 6 of 24) intron (NR_163243, intron 6 of 24) -9417 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 144.333-213 chr5 78956676 78956910 + 1 NA intron (NM_198709, intron 4 of 7) MIRb|SINE|MIR 28517 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 207.667-45 chr18 776625 776911 + 1 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) intron (NM_005433, intron 1 of 11) 35474 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 185.333-107 chr20 16516526 16516870 + 1 NA intron (NM_001199866, intron 3 of 22) intron (NM_001199866, intron 3 of 22) 56750 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 176.667-145 chr8 82587199 82587565 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -324722 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 117.667-199 chr8 120713193 120713412 + 1 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) -47951 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 178.667-172 chr9 127265200 127265414 + 1 NA intron (NR_104591, intron 1 of 26) intron (NR_104591, intron 1 of 26) 533 NM_032293 84253 Hs.29304 NM_032293 ENSG00000136895 GARNL3 bA356B19.1 GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3 protein-coding 150.333-216 chr2 155207674 155207867 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 509075 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 170.333-55 chr12 33461821 33462156 + 1 NA Intergenic Intergenic -22169 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 268.667 chr1 27900135 27900634 + 1 NA intron (NM_002946, intron 4 of 8) AluSz|SINE|Alu 14191 NM_002946 6118 Hs.79411 NM_002946 ENSG00000117748 RPA2 REPA2|RP-A p32|RP-A p34|RPA32 replication protein A2 protein-coding 175.333-92 chr2 117587430 117587668 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -227142 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 174.333-4 chr1 151336290 151336565 + 1 NA Intergenic Intergenic -8712 NM_001369624 5298 Hs.632465 NM_002651 ENSG00000143393 PI4KB NPIK|PI4K-BETA|PI4K92|PI4KBETA|PI4KIIIBETA|PIK4CB phosphatidylinositol 4-kinase beta protein-coding 150.667-15 chr1 181994849 181995021 + 1 NA Intergenic Intergenic 66777 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 151.667-200 chr22 26765426 26765602 + 1 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 92671 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 152.667-72 chr12 6757780 6757966 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4732 NR_026581 8079 Hs.524214 NM_005439 ENSG00000089693 MLF2 NTN4 myeloid leukemia factor 2 protein-coding 200.667-148 chr7 105102631 105102938 + 1 NA intron (NM_182931, intron 17 of 26) intron (NM_182931, intron 17 of 26) 88579 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 179.667-106 chr4 126016950 126017167 + 1 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 509799 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 148.667-293 chr4 127535028 127535244 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -97821 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 162.333-61 chr13 79337089 79337252 + 1 NA exon (NM_001286631, exon 19 of 22) exon (NM_001286631, exon 19 of 22) 69051 NM_001286632 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 193.667-90 chr4 25963305 25963649 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 49285 NM_001145432 389203 Hs.479386 NM_001145432 ENSG00000250317 SMIM20 C4orf52|MITRAC7|PNX small integral membrane protein 20 protein-coding 155.667-69 chr12 34514833 34515013 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 492427 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 158.333-239 chr4 109587971 109588186 + 1 NA intron (NM_017918, intron 1 of 7) intron (NM_017918, intron 1 of 7) 27832 NM_017918 55013 Hs.234149 NM_017918 ENSG00000005059 MCUB CCDC109B mitochondrial calcium uniporter dominant negative beta subunit protein-coding 288.667-34 chr8 54358456 54359025 + 1 NA Intergenic Intergenic 28054 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 161.333-169 chr20 34484432 34484726 + 1 NA intron (NM_001257137, intron 21 of 25) intron (NM_001257137, intron 21 of 25) 18254 NR_030374 693229 NR_030374 ENSG00000207997 MIR644A MIR644|MIRN644|hsa-mir-644|hsa-mir-644a microRNA 644a ncRNA 321.333-33 chr18 54807230 54807645 + 1 NA Intergenic Intergenic -21040 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 212.667-89 chr3 47873565 47873874 + 1 NA intron (NM_002375, intron 10 of 18) MIR3|SINE|MIR 24164 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 153.667-117 chr14 47111412 47111708 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 5 of 16) intron (NM_001113498, intron 5 of 16) 231686 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 143.667-116 chr18 39504203 39504440 + 1 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) intron (NR_024391, intron 3 of 3) 117854 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 144.333-17 chr1 194303353 194303571 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 998717 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 226.333-15 chr11 30352719 30353017 + 1 NA Intergenic Intergenic 29764 NM_152316 120534 Hs.502208 NM_152316 ENSG00000152219 ARL14EP ARF7EP|C11orf46|dJ299F11.1 ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein protein-coding 142.333-6 chr1 66820677 66820846 + 1 NA intron (NM_024763, intron 16 of 16) L2a|LINE|L2 -19502 NM_005478 10022 Hs.251380 NM_005478 ENSG00000172410 INSL5 PRO182|UNQ156 insulin like 5 protein-coding 126.333-15 chr10 1567573 1567738 + 1 NA intron (NM_018702, intron 1 of 9) intron (NM_018702, intron 1 of 9) 20895 NR_152792 642394 Hs.568831 NM_001098830 ENSG00000205696 ADARB2-AS1 C10orf109|NCRNA00168 ADARB2 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-43 chr14 28460157 28460480 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 305001 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 185.667-2 chr1 47020414 47020628 + 1 NA intron (NM_001320290, intron 1 of 11) intron (NM_001320290, intron 1 of 11) -3148 NM_178033 260293 Hs.439760 NM_178033 ENSG00000186377 CYP4X1 CYPIVX1 cytochrome P450 family 4 subfamily X member 1 protein-coding 256.667-80 chr7 7978649 7978924 + 1 NA intron (NM_138426, intron 1 of 7) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 9990 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 213.667-76 chr5 73168072 73168512 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -4901 NM_153217 134288 Hs.508588 NM_153217 ENSG00000164325 TMEM174 - transmembrane protein 174 protein-coding 244.333-22 chr11 43360070 43360456 + 1 NA intron (NM_001307943, intron 1 of 19) intron (NM_001307943, intron 1 of 19) 1343 NM_018259 55761 Hs.191186 NM_018259 ENSG00000052841 TTC17 - tetratricopeptide repeat domain 17 protein-coding 186.667-30 chr12 61948050 61948404 + 1 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 244612 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 159.667-174 chr2 102158162 102158342 + 1 NA intron (NM_001320978, intron 3 of 11) L2a|LINE|L2 4311 NM_001320984 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 257.333-59 chr22 19393541 19394105 + 1 NA intron (NM_003325, intron 8 of 24) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 37910 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 125.667-15 chr1 222958445 222958661 + 1 NA intron (NM_001369594, intron 2 of 7) intron (NM_001369594, intron 2 of 7) 30129 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 192.333-11 chr1 163601351 163601701 + 1 NA Intergenic Intergenic -178335 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 150.333-238 chr20 58108048 58108217 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -42770 NM_178456 128602 Hs.43977 NM_178456 ENSG00000124237 C20orf85 LLC1|bA196N14.1 chromosome 20 open reading frame 85 protein-coding 193.667-64 chr2 166194245 166194500 + 1 NA TTS (NM_002977) TTS (NM_002977) -45211 NM_001353949 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 212.667-77 chr2 126711120 126711362 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 55083 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 143.667-52 chr12 12670863 12671021 + 1 NA intron (NM_006143, intron 3 of 3) intron (NM_006143, intron 3 of 3) 25241 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 210.667-27 chr11 104409127 104409387 + 1 NA Intergenic Intergenic 200045 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 123.333-45 chr11 33553045 33553209 + 1 NA intron (NM_012194, intron 6 of 20) intron (NM_012194, intron 6 of 20) 147613 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 258.667-62 chr3 62542434 62542925 + 1 NA intron (NM_003716, intron 11 of 29) intron (NM_003716, intron 11 of 29) -169129 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 145.667-151 chr2 220101528 220101769 + 1 NA Intergenic Intergenic -195083 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 153.333-441 chr9 34323024 34323190 + 1 NA intron (NM_194313, intron 1 of 12) intron (NM_194313, intron 1 of 12) 6161 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 144.667-3 chr1 52080189 52080343 + 1 NA intron (NM_001243767, intron 3 of 4) intron (NM_001243767, intron 3 of 4) 23971 NM_152265 91408 Hs.429839 NM_152265 ENSG00000134717 BTF3L4 - basic transcription factor 3 like 4 protein-coding 160.333-129 chr17 65711154 65711447 + 1 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 115151 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 118.667-103 chr2 120589821 120590013 + 1 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL -123568 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 236.667-21 chr12 60822308 60822636 + 1 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1133102 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 385.667-7 chr22 19437673 19438269 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 5032 NM_001318152 64976 Hs.431307 NM_003776 ENSG00000185608 MRPL40 L40mt|MRP-L22|MRP-L40|MRPL22|NLVCF|URIM mitochondrial ribosomal protein L40 protein-coding 236.667-63 chr5 43501848 43502279 + 1 NA intron (NM_198566, intron 6 of 12) intron (NM_198566, intron 6 of 12) 13085 NM_198566 375444 Hs.661641 NM_198566 ENSG00000172244 C5orf34 - chromosome 5 open reading frame 34 protein-coding 156.333-110 chr14 62487069 62487352 + 1 NA Intergenic Intergenic -347237 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 218.667-10 chr1 212136818 212137075 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 59333 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 136.333-114 chr21 27730075 27730237 + 1 NA intron (NR_024357, intron 1 of 3) intron (NR_024357, intron 1 of 3) 7777 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 151.667-290 chr5 121347449 121347731 + 1 NA Intergenic Intergenic 25040 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 149.667-369 chr7 40050030 40050308 + 1 NA intron (NM_003718, intron 7 of 13) L1MA8|LINE|L1 84453 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 210.333-92 chr20 48646711 48647064 + 1 NA intron (NM_020820, intron 25 of 39) MIR|SINE|MIR 181112 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 163.333-246 chr6 110638123 110638374 + 1 NA intron (NM_001300963, intron 6 of 13) intron (NM_001300963, intron 6 of 13) -161635 NM_033125 85413 Hs.520319 NM_033125 ENSG00000004809 SLC22A16 CT2|FLIPT2|HEL-S-18|OAT6|OCT6|OKB1|dJ261K5.1 solute carrier family 22 member 16 protein-coding 214.333-119 chr5 124271927 124272251 + 1 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 166431 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 367.333-10 chr2 163176779 163177452 + 1 NA Intergenic Intergenic -338348 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 195.667-2 chr1 63614491 63614806 + 1 NA intron (NM_001172819, intron 1 of 10) intron (NM_001172819, intron 1 of 10) -8568 NM_001172818 5236 Hs.1869 NM_002633 ENSG00000079739 PGM1 CDG1T|GSD14 phosphoglucomutase 1 protein-coding 267.333 chr1 25605575 25606053 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -11654 NM_020379 57134 Hs.197043 NM_020379 ENSG00000117643 MAN1C1 HMIC|MAN1A3|MAN1C|pp6318 mannosidase alpha class 1C member 1 protein-coding 175.333-200 chr9 20696246 20696441 + 1 NA intron (NM_017794, intron 3 of 45) L1MA9|LINE|L1 -11593 NR_121601 101929548 Hs.668302 NR_121601 ENSG00000227071 FOCAD-AS1 - FOCAD antisense RNA 1 ncRNA 151.333-101 chr12 28834523 28834814 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -314610 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 188.333-89 chr21 23848111 23848408 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -463424 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 167.333-57 chr11 83333034 83333290 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -46755 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 150.667-9 chr1 98152189 98152346 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -58444 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 189.333-46 chr12 116670793 116671109 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 67118 NM_024738 79794 Hs.120170 NM_024738 ENSG00000111412 C12orf49 - chromosome 12 open reading frame 49 protein-coding 165.333-202 chr5 23894319 23894594 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -56892 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 154.667-122 chr15 51841491 51841771 + 1 NA intron (NM_014547, intron 1 of 9) intron (NM_014547, intron 1 of 9) 11978 NM_014547 29766 Hs.4998 NM_014547 ENSG00000138594 TMOD3 UTMOD tropomodulin 3 protein-coding 146.667-212 chr3 30520342 30520588 + 1 NA intron (NR_147054, intron 1 of 2) intron (NR_147054, intron 1 of 2) 1597 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 207.333-100 chr15 66301510 66301882 + 1 NA intron (NM_001323948, intron 2 of 15) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 7881 NM_001323945 115752 Hs.446251 NM_133375 ENSG00000166938 DIS3L DIS3L1 DIS3 like exosome 3'-5' exoribonuclease protein-coding 168.333-193 chr7 46202208 46202488 + 1 NA Intergenic Intergenic -281076 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 317.333-43 chr8 120149248 120149688 + 1 NA intron (NM_021110, intron 2 of 47) intron (NM_021110, intron 2 of 47) 24366 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 155.667-57 chr11 95843484 95843772 + 1 NA intron (NM_001243571, intron 14 of 17) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 53130 NM_014679 9702 Hs.101014 NM_014679 ENSG00000166037 CEP57 MVA2|PIG8|TSP57 centrosomal protein 57 protein-coding 160.333-277 chr8 75648652 75648910 + 1 NA Intergenic Intergenic 108813 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 251.667-57 chr22 45485080 45485378 + 1 NA Intergenic MER83B-int|LTR|ERV1 -17654 NM_006485 2192 Hs.24601 NM_001996 ENSG00000077942 FBLN1 FBLN|FIBL1 fibulin 1 protein-coding 253.333-86 chr5 107207272 107207663 + 1 NA Intergenic Intergenic -196453 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 272.333-52 chr4 127977166 127977521 + 1 NA intron (NM_001366044, intron 2 of 11) AluSp|SINE|Alu -11380 NM_152778 256471 Hs.480701 NM_152778 ENSG00000164073 MFSD8 CCMD|CLN7 major facilitator superfamily domain containing 8 protein-coding 157.667-220 chr4 82569513 82569756 + 1 NA Intergenic Intergenic -7381 NM_001353454 441027 Hs.507676 NM_001080506 ENSG00000249242 TMEM150C TTN3 transmembrane protein 150C protein-coding 232.667-11 chr11 119460974 119461481 + 1 NA intron (NR_034160, intron 2 of 3) intron (NR_034160, intron 2 of 3) -36242 NM_001311162 7070 Hs.644697 NM_006288 ENSG00000154096 THY1 CD90|CDw90 Thy-1 cell surface antigen protein-coding 249.667-109 chr9 93605956 93606402 + 1 NA intron (NM_005392, intron 1 of 21) AluJb|SINE|Alu 11338 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 176.667-8 chr1 66987731 66987996 + 1 NA 3' UTR (NM_001146111, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001146111, exon 16 of 16) 57607 NM_001077701 57708 Hs.605432 NM_020948 ENSG00000198160 MIER1 ER1|MI-ER1 MIER1 transcriptional regulator protein-coding 174.333-20 chr11 105863718 105863936 + 1 NA intron (NR_046356, intron 4 of 16) intron (NR_046356, intron 4 of 16) 158413 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 181.667-105 chr4 28241819 28242136 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -577605 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 154.333-165 chr2 122248578 122248835 + 1 NA Intergenic Intergenic 493055 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 148.667-160 chr17 68152986 68153203 + 1 NA Intergenic Intergenic -45566 NR_027283 440461 Hs.661522 NR_027283 ARHGAP27P2 - Rho GTPase activating protein 27 pseudogene 2 pseudo 157.333-17 chr1 108810802 108811082 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 46152 NM_152763 254268 Hs.729441 NM_152763 ENSG00000162641 AKNAD1 C1orf62 AKNA domain containing 1 protein-coding 155.333-295 chr5 71843722 71843883 + 1 NA Intergenic Intergenic 124527 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 148.667-237 chr22 45849801 45850004 + 1 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 89378 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 268.333-33 chr2 220767472 220767905 + 1 NA Intergenic Intergenic 804616 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 141.333-97 chr18 78422156 78422359 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -428530 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 165.667-213 chr9 78404108 78404316 + 1 NA Intergenic Intergenic 107087 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 170.333-94 chr17 64615322 64615649 + 1 NA intron (NM_022739, intron 1 of 18) intron (NM_022739, intron 1 of 18) 46822 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 296.333-26 chr22 27058877 27059241 + 1 NA intron (NM_001318329, intron 1 of 1) intron (NM_001318329, intron 1 of 1) 1459 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 147.333-40 chr10 49809861 49810104 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -47603 NM_001347826 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 124.667-28 chr10 54551554 54551705 + 1 NA intron (NM_001142771, intron 2 of 34) intron (NM_001142771, intron 2 of 34) 56328 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 126.667-5 chr1 66130858 66131065 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) -80243 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 139.333-233 chr9 132634006 132634305 + 1 NA intron (NR_136309, intron 14 of 18) L1ME4a|LINE|L1 29171 NM_001322343 64794 Hs.660767 NM_022779 ENSG00000125485 DDX31 PPP1R25 DEAD-box helicase 31 protein-coding 194.333-76 chr2 179489919 179490170 + 1 NA intron (NR_148056, intron 5 of 9) intron (NR_148056, intron 5 of 9) 72544 NM_001113398 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 138.667-191 chr7 77430418 77430646 + 1 NA Intergenic Intergenic -14183 NR_146937 54103 Hs.186649 NM_017439 ENSG00000186088 GSAP PION gamma-secretase activating protein protein-coding 151.667-347 chr7 114093977 114094224 + 1 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) 7773 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 309.333-60 chr8 111287058 111287369 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -51010 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 189.333-24 chr1 244698307 244698647 + 1 NA intron (NM_016076, intron 4 of 4) MER68-int|LTR|ERVL 45351 NM_016076 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 159.333-33 chr1 244337262 244337558 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -15225 NM_001012970 200159 Hs.442703 NM_001012970 ENSG00000173728 C1orf100 - chromosome 1 open reading frame 100 protein-coding 154.667-347 chr6 114045288 114045515 + 1 NA intron (NR_125845, intron 4 of 9) intron (NR_125845, intron 4 of 9) 17476 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 336.333-25 chr4 29133900 29134423 + 1 NA Intergenic Intergenic -80131 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 160.333-190 chr3 88232132 88232306 + 1 NA Intergenic Intergenic 82260 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 211.667-78 chr3 66321334 66321715 + 1 NA intron (NR_028475, intron 5 of 9) intron (NR_028475, intron 5 of 9) 100521 NM_001350992 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 175.333-81 chr2 42331280 42331469 + 1 NA 3' UTR (NM_019063, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_019063, exon 23 of 23) 28664 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 130.333-219 chr9 75875468 75875622 + 1 NA Intergenic Intergenic -15099 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 273.333 chr1 25598672 25599038 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -18613 NM_020379 57134 Hs.197043 NM_020379 ENSG00000117643 MAN1C1 HMIC|MAN1A3|MAN1C|pp6318 mannosidase alpha class 1C member 1 protein-coding 147.667-392 chr9 108236356 108236581 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 619518 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 164.667-77 chr14 97824361 97824628 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -61663 NR_146447 100132612 Hs.587781 NR_146447 ENSG00000258869 LINC02312 - long intergenic non-protein coding RNA 2312 ncRNA 177.333-151 chr7 33262153 33262454 + 1 NA intron (NM_198428, intron 6 of 22) intron (NM_198428, intron 6 of 22) 132739 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 125.333-64 chr15 39869702 39869912 + 1 NA intron (NM_001271854, intron 1 of 3) intron (NM_001271854, intron 1 of 3) -40531 NM_001271855 11245 Hs.37196 NM_007223 ENSG00000166073 GPR176 HB-954 G protein-coupled receptor 176 protein-coding 199.333-102 chr17 68390264 68390547 + 1 NA intron (NM_001352899, intron 9 of 12) intron (NM_001352899, intron 9 of 12) -23218 NM_001278433 5573 Hs.280342 NM_002734 ENSG00000108946 PRKAR1A ACRDYS1|ADOHR|CAR|CNC|CNC1|PKR1|PPNAD1|PRKAR1|TSE1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha protein-coding 214.667-28 chr11 97095099 97095450 + 1 NA Intergenic Intergenic 586849 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 145.333-159 chr20 45392498 45392643 + 1 NA intron (NR_003189, intron 3 of 5) AluSx3|SINE|Alu -13423 NM_001197139 55861 Hs.730643 NM_018478 ENSG00000244274 DBNDD2 C20orf35|CK1BP|HSMNP1 dysbindin domain containing 2 protein-coding 203.667-100 chr5 129283352 129283566 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 113688 NR_039665 100616325 NR_039665 ENSG00000265691 MIR4460 - microRNA 4460 ncRNA 374.667-6 chr17 72552557 72553151 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 39950 NR_152515 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 139.667-30 chr11 103290376 103290627 + 1 NA intron (NM_001377, intron 75 of 88) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 181075 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 145.333-249 chr5 169448264 169448493 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -135395 NM_017785 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 285.667-50 chr8 68769809 68770165 + 1 NA intron (NM_001349479, intron 9 of 11) L2b|LINE|L2 334203 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 114.667-85 chr14 80525313 80525512 + 1 NA intron (NM_152446, intron 23 of 24) MIRb|SINE|MIR -294355 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 139.333-225 chr8 133125636 133125878 + 1 NA intron (NM_003235, intron 45 of 47) intron (NM_003235, intron 45 of 47) -23155 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 129.667-118 chr3 59244764 59244922 + 1 NA Intergenic Intergenic -194811 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 122.333-201 chr8 81207482 81207674 + 1 NA Intergenic Intergenic -72958 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 167.667-73 chr16 57324898 57325089 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -33790 NM_002990 6367 Hs.534347 NM_002990 ENSG00000102962 CCL22 A-152E5.1|ABCD-1|DC/B-CK|MDC|SCYA22|STCP-1 C-C motif chemokine ligand 22 protein-coding 166.667-170 chr4 103479331 103479547 + 1 NA Intergenic Intergenic 54397 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 144.333-204 chr5 10572585 10572789 + 1 NA intron (NM_001164440, intron 1 of 3) intron (NM_001164440, intron 1 of 3) 8617 NM_001164440 651746 Hs.26039 NM_001164440 ENSG00000164236 ANKRD33B - ankyrin repeat domain 33B protein-coding 155.333-69 chr12 7219860 7220096 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 29616 NM_000319 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 229.333-65 chr2 67638100 67638412 + 1 NA Intergenic Intergenic 187306 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 133.667-22 chr10 81580288 81580477 + 1 NA Intergenic Intergenic -294812 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 201.333-17 chr1 189142473 189142848 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 1333350 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 112.333-22 chr10 43257989 43258196 + 1 NA intron (NM_145313, intron 1 of 12) intron (NM_145313, intron 1 of 12) 8973 NM_145313 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 154.667-148 chr18 3188266 3188425 + 1 NA intron (NM_019856, intron 4 of 36) AluSz|SINE|Alu 31623 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 184.667-101 chr5 100476848 100477125 + 1 NA Intergenic Intergenic -58388 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 215.333-16 chr1 223414484 223414780 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 21217 NM_152610 164127 Hs.192090 NM_152610 ENSG00000178395 CCDC185 C1orf65 coiled-coil domain containing 185 protein-coding 216.333-47 chr15 48509650 48509894 + 1 NA intron (NM_000138, intron 14 of 65) intron (NM_000138, intron 14 of 65) 136016 NM_000138 2200 Hs.591133 NM_000138 ENSG00000166147 FBN1 ACMICD|ECTOL1|FBN|GPHYSD2|MASS|MFLS|MFS1|OCTD|SGS|SSKS|WMS|WMS2 fibrillin 1 protein-coding 209.667-36 chr12 95606301 95606621 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -42794 NR_077225 100132594 Hs.676211 NR_077225 ENSG00000257150 PGAM1P5 - phosphoglycerate mutase 1 pseudogene 5 pseudo 162.333-253 chr8 80029199 80029383 + 1 NA intron (NM_014018, intron 1 of 2) MER5C|DNA|hAT-Charlie 968 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 378.333-9 chr4 54823026 54823516 + 1 NA Intergenic Intergenic 165343 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 270.667-10 chr11 104200585 104201049 + 1 NA Intergenic Intergenic -36670 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 141.333-23 chr10 51229644 51229881 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) AluJb|SINE|Alu -69811 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 170.333-110 chr2 61251492 61251673 + 1 NA intron (NM_014709, intron 48 of 79) intron (NM_014709, intron 48 of 79) 74164 NR_152216 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 209.333-47 chr12 50987017 50987395 + 1 NA non-coding (NR_033421, exon 16 of 16) non-coding (NR_033421, exon 16 of 16) 22009 NM_001174130 4891 Hs.505545 NM_000617 ENSG00000110911 SLC11A2 AHMIO1|DCT1|DMT1|NRAMP2 solute carrier family 11 member 2 protein-coding 256.667-51 chr20 52283950 52284301 + 1 NA Intergenic Intergenic -92140 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 220.333-75 chr20 55079110 55079349 + 1 NA Intergenic Intergenic -343814 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 191.333-76 chr15 66394942 66395299 + 1 NA intron (NM_002755, intron 1 of 10) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 8247 NM_002755 5604 Hs.145442 NM_002755 ENSG00000169032 MAP2K1 CFC3|MAPKK1|MEK1|MKK1|PRKMK1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 protein-coding 208.667-122 chr6 165900619 165900956 + 1 NA Intergenic Intergenic -86764 NR_027284 441177 Hs.708964 NM_001013720 ENSG00000281832 LINC00602 - long intergenic non-protein coding RNA 602 ncRNA 119.333-89 chr14 75126309 75126450 + 1 NA intron (NM_001329238, intron 1 of 21) MIRc|SINE|MIR 669 NM_033116 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 180.667-35 chr13 32488914 32489147 + 1 NA intron (NM_001320836, intron 6 of 9) AluSx|SINE|Alu 9462 NR_051980 100462953 Hs.687692 NR_051980 MICOS10P1 CG012|MINOS1P1|N4BP2L2-IT|N4BP2L2-IT1|N4BP2L2IT1 MICOS10 pseudogene 1 pseudo 209.333-182 chr5 23249002 23249280 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -258468 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 160.667-244 chr5 52602848 52603029 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -184978 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 158.667-211 chr3 69261337 69261519 + 1 NA intron (NM_015123, intron 5 of 22) intron (NM_015123, intron 5 of 22) 124660 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 157.333-370 chr9 132956650 132956892 + 1 NA intron (NM_004188, intron 1 of 10) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 11064 NR_049862 100846992 NR_049862 ENSG00000263816 MIR548AW - microRNA 548aw ncRNA 141.667-177 chr5 45389507 45389681 + 1 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) intron (NM_021072, intron 4 of 7) 306786 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 236.333-15 chr10 75872861 75873312 + 1 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 90325 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 129.667-167 chr8 34651889 34652111 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -131921 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 147.333-272 chr6 27313895 27314074 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -1752 NM_033482 94026 Hs.729955 NM_033482 ENSG00000158553 POM121L2 POM121-L|POM121L POM121 transmembrane nucleoporin like 2 protein-coding 158.333-334 chr8 140438272 140438473 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 3 of 22) L1MB7|LINE|L1 19372 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 268.667-35 chr2 163060090 163060640 + 1 NA Intergenic Intergenic -221598 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 162.667-186 chr3 193411651 193411949 + 1 NA intron (NM_032279, intron 27 of 29) intron (NM_032279, intron 27 of 29) -33047 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 144.667-153 chr2 156553857 156554033 + 1 NA intron (NM_000408, intron 8 of 16) intron (NM_000408, intron 8 of 16) 117566 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 153.333-131 chr15 26956397 26956665 + 1 NA Intergenic Intergenic -14650 NM_001270873 2567 Hs.569475 NM_033223 ENSG00000182256 GABRG3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma3 subunit protein-coding 152.667-145 chr18 3402560 3402853 + 1 NA Intergenic Intergenic -9221 NM_174886 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 146.667-182 chr2 188565477 188565656 + 1 NA intron (NM_016315, intron 7 of 11) L1ME2|LINE|L1 224557 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 266.333-41 chr3 171600519 171600960 + 1 NA 3' UTR (NM_001130081, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001130081, exon 26 of 26) -140331 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 179.667-103 chr4 104170150 104170460 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -320660 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 183.333-161 chr8 105622782 105623057 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 303376 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 157.667-274 chr6 36475324 36475488 + 1 NA intron (NM_173562, intron 3 of 7) AluSx1|SINE|Alu 32406 NM_173562 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 437.333-4 chr11 111144509 111145234 + 1 NA Intergenic Intergenic -47553 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 126.667-69 chr18 26698952 26699119 + 1 NA intron (NR_024259, intron 1 of 1) intron (NR_024259, intron 1 of 1) 4603 NR_024259 728606 Hs.170599 NR_024259 ENSG00000265369 PCAT18 LINC01092 prostate cancer associated transcript 18 ncRNA 239.667-2 chr1 34898210 34898657 + 1 NA intron (NM_001080418, intron 5 of 11) L2a|LINE|L2 31217 NM_001080418 58512 Hs.436393 NM_001080418 ENSG00000116544 DLGAP3 DAP3|SAPAP3 DLG associated protein 3 protein-coding 137.333-130 chr4 36783941 36784102 + 1 NA Intergenic Intergenic -142121 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 170.667-85 chr2 110892757 110893110 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) intron (NM_001371254, intron 10 of 18) 160360 NM_001371254 265.667-29 chr17 67098586 67099047 + 1 NA intron (NM_001330447, intron 31 of 32) intron (NM_001330447, intron 31 of 32) 54262 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 159.667-183 chr2 208584712 208584973 + 1 NA intron (NR_136588, intron 2 of 5) X6B_LINE|LINE|CR1 42200 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 161.667-104 chr17 61726756 61726973 + 1 NA intron (NM_032043, intron 16 of 19) intron (NM_032043, intron 16 of 19) -135645 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 242.667-78 chr4 92229514 92229975 + 1 NA Intergenic Intergenic 47558 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 143.667-142 chr20 46891894 46892070 + 1 NA Intergenic Intergenic -2642 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 155.667-56 chr11 86051112 86051384 + 1 NA intron (NM_001206947, intron 1 of 18) intron (NM_001206947, intron 1 of 18) 17836 NM_001206946 8301 Hs.163893 NM_007166 ENSG00000073921 PICALM CALM|CLTH|LAP phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein protein-coding 146.333-255 chr5 53300175 53300375 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -180354 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 157.667-194 chr3 78077396 78077748 + 1 NA Intergenic Intergenic -28609 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 159.667-232 chr4 59968150 59968433 + 1 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR -954328 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 158.333-329 chr8 125340556 125340848 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -89656 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 243.333-68 chr22 26962632 26963116 + 1 NA Intergenic Intergenic 59582 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 169.667-90 chr17 61921225 61921403 + 1 NA intron (NM_001351695, intron 4 of 24) AluJr|SINE|Alu 6668 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 235.333-90 chr4 123523523 123523800 + 1 NA Intergenic Intergenic 124121 NM_005841 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 162.667-34 chr10 93679867 93680098 + 1 NA intron (NM_145246, intron 11 of 13) L2b|LINE|L2 22590 NM_001347713 118924 Hs.586650 NM_145246 ENSG00000148690 FRA10AC1 C10orf4|F26C11.1-like|FRA10A FRA10A associated CGG repeat 1 protein-coding 225.667-3 chr1 150158409 150158687 + 1 NA intron (NM_016274, intron 5 of 5) AluSz|SINE|Alu -2180 NR_135098 105371433 Hs.599366 NR_135098 LOC105371433 - uncharacterized LOC105371433 ncRNA 154.333-344 chr8 107099131 107099357 + 1 NA Intergenic Intergenic 237271 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 211.333-36 chr11 74807500 74807889 + 1 NA intron (NM_001098638, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 58845 NM_001098638 254225 Hs.370145 NM_001098638 ENSG00000166439 RNF169 - ring finger protein 169 protein-coding 192.667-36 chr10 120987786 120988000 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 136531 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 217.333-91 chr3 43822946 43823326 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -131542 NM_001346468 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 138.333-97 chr2 157036074 157036282 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -221527 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 260.333-48 chr5 28222893 28223305 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 64566 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 176.333-123 chr4 96373666 96373971 + 1 NA intron (NR_147149, intron 1 of 3) intron (NR_147149, intron 1 of 3) 63115 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 160.667-138 chr2 37239478 37239764 + 1 NA intron (NR_146408, intron 4 of 10) L1ME3E|LINE|L1 7963 NM_001350027 55471 Hs.433466 NM_018607 ENSG00000003509 NDUFAF7 C2orf56|MidA|PRO1853 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 7 protein-coding 188.333-90 chr21 31853831 31854099 + 1 NA Intergenic Intergenic -19055 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 205.667-48 chr14 65497587 65497986 + 1 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 26684 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 168.667-88 chr19 28721454 28721713 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) 6111 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 141.667-95 chr17 57029026 57029255 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -16338 NR_002818 376412 Hs.132299 NR_002818 ENSG00000261192 RNF126P1 - ring finger protein 126 pseudogene 1 pseudo 184.333-108 chr3 99890857 99891241 + 1 NA intron (NM_001042459, intron 4 of 4) L1MEd|LINE|L1 -14846 NM_001282794 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 158.333-262 chr5 98216733 98216940 + 1 NA Intergenic Intergenic -55597 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 129.333-26 chr10 94570309 94570522 + 1 NA intron (NM_001289075, intron 6 of 20) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 24627 NM_018063 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 151.667-189 chr20 20136247 20136430 + 1 NA intron (NM_015585, intron 8 of 26) L1M1|LINE|L1 79692 NM_001167816 26074 Hs.729168 NM_015585 ENSG00000089101 CFAP61 C20orf26|CaM-IP3|dJ1002M8.3|dJ1178H5.4 cilia and flagella associated protein 61 protein-coding 154.333-155 chr2 86524132 86524353 + 1 NA intron (NR_036454, intron 1 of 3) HAL1ME|LINE|L1 39201 NR_036454 51652 Hs.591582 NM_016079 ENSG00000115561 CHMP3 CGI-149|NEDF|VPS24 charged multivesicular body protein 3 protein-coding 200.667-12 chr1 183854284 183854534 + 1 NA intron (NM_001297669, intron 4 of 18) intron (NM_001297669, intron 4 of 18) 49289 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 139.667-62 chr15 75376001 75376187 + 1 NA intron (NM_015477, intron 19 of 20) intron (NM_015477, intron 19 of 20) -7467 NM_001256494 4123 Hs.26232 NM_006715 ENSG00000140400 MAN2C1 MAN6A8|MANA|MANA1 mannosidase alpha class 2C member 1 protein-coding 233.667-70 chr7 43337463 43337765 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 4 of 27) intron (NM_001287059, intron 4 of 27) 184928 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 279.667-35 chr4 65369820 65370306 + 1 NA intron (NM_182472, intron 8 of 16) intron (NM_182472, intron 8 of 16) 299425 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 137.667-183 chr8 5296936 5297102 + 1 NA Intergenic Intergenic -302105 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 580.333-2 chr3 184826115 184826859 + 1 NA intron (NM_001009921, intron 3 of 46) MER3|DNA|hAT-Charlie 13980 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 160.333-194 chr3 122703453 122703729 + 1 NA intron (NM_017554, intron 6 of 16) intron (NM_017554, intron 6 of 16) 22752 NM_017554 54625 Hs.518203 NM_017554 ENSG00000173193 PARP14 ARTD8|BAL2|PARP-14|pART8 poly(ADP-ribose) polymerase family member 14 protein-coding 152.667-143 chr17 79969266 79969426 + 1 NA intron (NM_019020, intron 3 of 11) AluSx|SINE|Alu -18493 NM_001271846 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 122.667-80 chr18 71448622 71448833 + 1 NA Intergenic Intergenic 130229 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 188.667 chr1 28469252 28469597 + 1 NA intron (NM_023923, intron 5 of 12) intron (NM_023923, intron 5 of 12) 31274 NM_023923 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 130.667-168 chr5 94528514 94528663 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 3 of 20) intron (NM_001145678, intron 3 of 20) 90016 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 130.333-211 chr8 118305198 118305396 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) L1MB4|LINE|L1 -193478 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 146.333-317 chr8 50609612 50609767 + 1 NA intron (NR_135797, intron 15 of 20) L1ME1|LINE|L1 445558 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 155.667-337 chr7 87379128 87379316 + 1 NA intron (NM_021151, intron 10 of 17) intron (NM_021151, intron 10 of 17) 33558 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 161.667-90 chr15 68062799 68063015 + 1 NA intron (NM_001320687, intron 2 of 14) L1ME3G|LINE|L1 8331 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 338.667-22 chr3 133575768 133576191 + 1 NA intron (NM_001282765, intron 2 of 4) intron (NM_001282765, intron 2 of 4) 1545 NM_001134423 55573 Hs.518265 NM_017548 ENSG00000091527 CDV3 H41 CDV3 homolog protein-coding 197.333-126 chr2 214215959 214216307 + 1 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -194921 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 175.667-119 chr5 127052335 127052671 + 1 NA intron (NM_001164478, intron 4 of 4) intron (NM_001164478, intron 4 of 4) 20989 NM_001164479 401207 Hs.49573 NM_001164478 ENSG00000164241 C5orf63 YDR286C chromosome 5 open reading frame 63 protein-coding 201.333-176 chr22 28488499 28488813 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 28787 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 216.333-31 chr11 88677260 88677686 + 1 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 172897 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 261.333-19 chr11 62438617 62439088 + 1 NA intron (NM_024060, intron 5 of 5) intron (NM_024060, intron 5 of 5) 19819 NM_003357 7356 Hs.523732 NM_003357 ENSG00000149021 SCGB1A1 CC10|CC16|CCPBP|CCSP|UGB|UP-1|UP1 secretoglobin family 1A member 1 protein-coding 231.333-12 chr1 228785135 228785629 + 1 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 49903 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 142.667-146 chr3 159020421 159020651 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -48716 NM_001197114 100505385 Hs.134665 NM_001197113 ENSG00000283154 IQCJ-SCHIP1 - IQCJ-SCHIP1 readthrough protein-coding 208.333-35 chr14 40625956 40626257 + 1 NA Intergenic Intergenic -328605 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 153.667-361 chr7 71167904 71168130 + 1 NA intron (NM_022479, intron 1 of 10) L1ME1|LINE|L1 35873 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 197.667-130 chr5 147152431 147152676 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -71033 NM_001271900 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 118.667-180 chr7 51152533 51152724 + 1 NA intron (NM_015198, intron 5 of 12) intron (NM_015198, intron 5 of 12) 164181 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 217.333-137 chr7 33153499 33153830 + 1 NA intron (NM_001348038, intron 3 of 22) intron (NM_001348038, intron 3 of 22) 24100 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 146.667-350 chr9 30354092 30354333 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 54242 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 134.667-96 chr2 45861683 45861862 + 1 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) L1ME4b|LINE|L1 210097 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 199.667-125 chr7 14465063 14465311 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) 376263 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 117.667-81 chr2 56728130 56728388 + 1 NA Intergenic Intergenic -542489 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 141.333-215 chr6 118884501 118884769 + 1 NA intron (NM_017696, intron 6 of 11) L1MB8|LINE|L1 -9517 NM_014034 25842 Hs.292316 NM_014034 ENSG00000111875 ASF1A CGI-98|CIA|HSPC146 anti-silencing function 1A histone chaperone protein-coding 187.667-30 chr13 59810720 59810984 + 1 NA exon (NM_030932, exon 19 of 21) exon (NM_030932, exon 19 of 21) -201866 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 320.667-10 chr12 41629321 41629801 + 1 NA Intergenic Intergenic -134628 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 349.667-14 chr22 30700794 30701269 + 1 NA intron (NM_030758, intron 1 of 13) AluSq2|SINE|Alu 6157 NM_030758 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 288.333-40 chr8 129131934 129132359 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 109094 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 149.333-30 chr1 198111109 198111315 + 1 NA Intergenic Intergenic -45786 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 128.667-100 chr2 216091169 216091395 + 1 NA intron (NM_001142310, intron 2 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 9363 NM_001142312 92691 Hs.334916 NM_138390 ENSG00000163449 TMEM169 - transmembrane protein 169 protein-coding 151.333-14 chr1 83821760 83821945 + 1 NA intron (NR_119374, intron 2 of 2) L1MC1|LINE|L1 38694 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 117.667-145 chr4 182986709 182986857 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -50882 NR_003612 403315 Hs.652187 NR_003612 ENSG00000230219 FAM92A1P2 FAM92A3 family with sequence similarity 92, member A3 pseudo 203.333-185 chr3 177517186 177517458 + 1 NA intron (NR_047568, intron 1 of 3) intron (NR_047568, intron 1 of 3) 75401 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 161.333-183 chr3 51173938 51174254 + 1 NA intron (NM_004947, intron 12 of 52) L1MA9|LINE|L1 -211195 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 166.667-21 chr10 6416267 6416503 + 1 NA intron (NM_001323267, intron 17 of 17) L1PB2|LINE|L1 66069 NR_148966 399716 Hs.737229 NR_148966 LINC02656 - long intergenic non-protein coding RNA 2656 ncRNA 194.667-31 chr12 9361032 9361251 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -6323 NR_120479 101930452 Hs.734183 NR_120479 ENSG00000260423 LINC02367 - long intergenic non-protein coding RNA 2367 ncRNA 188.333-161 chr8 136097063 136097276 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -433629 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 247.667-30 chr14 46695578 46696002 + 1 NA Intergenic Intergenic -44009 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 193.333-127 chr3 139246262 139246578 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -12898 NR_027070 140464 Hs.721270 NR_027070 PISRT1 NCRNA00195 PISRT1 lncRNA ncRNA 273.667-12 chr10 68435481 68436045 + 1 NA intron (NM_001080449, intron 10 of 20) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28469 NM_001042417 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 208.333-136 chr7 7310654 7310928 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 55637 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 149.667-330 chr5 128724082 128724308 + 1 NA Intergenic Intergenic -185950 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 142.333-206 chr5 148578159 148578428 + 1 NA intron (NM_001040172, intron 1 of 5) intron (NM_001040172, intron 1 of 5) 58768 NM_001286410 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 135.667-31 chr11 121149598 121149766 + 1 NA intron (NM_005422, intron 11 of 22) MIRb|SINE|MIR 47016 NM_005422 7007 Hs.248162 NM_005422 ENSG00000109927 TECTA DFNA12|DFNA8|DFNB21 tectorin alpha protein-coding 162.667-283 chr8 125683198 125683381 + 1 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 251080 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 265.333-88 chr8 126257830 126258241 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -67460 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 214.667-17 chr10 79426481 79426764 + 1 NA intron (NM_153367, intron 2 of 3) L1MB8|LINE|L1 19002 NM_153367 219654 Hs.523080 NM_153367 ENSG00000165424 ZCCHC24 C10orf56|Z3CXXC8 zinc finger CCHC-type containing 24 protein-coding 144.667-184 chr3 1355298 1355570 + 1 NA intron (NM_001289080, intron 12 of 22) intron (NM_001289080, intron 12 of 22) 262410 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 198.667-118 chr20 32441959 32442230 + 1 NA TTS (NM_080616) TTS (NM_080616) 41396 NM_001351680 140688 Hs.516978 NM_080616 ENSG00000197183 NOL4L C20orf112|C20orf113 nucleolar protein 4 like protein-coding 155.333-140 chr17 65878907 65879198 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 20 of 26) intron (NM_001353129, intron 20 of 26) -52509 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 202.667-53 chr14 65290720 65291036 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 44305 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 155.667-352 chr8 82015805 82016098 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -173665 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 137.333-200 chr8 119036428 119036583 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) -30742 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 219.333-136 chr4 188338815 188339232 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -116555 NR_033869 401164 Hs.435756 NR_033869 ENSG00000249378 LINC01060 - long intergenic non-protein coding RNA 1060 ncRNA 300.667-44 chr8 85079762 85080270 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -27222 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 238.667-59 chr4 34410509 34410806 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -140910 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 345.667-3 chr10 31295049 31295606 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -23090 NM_001323638 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 245.333-80 chr3 143156300 143156592 + 1 NA Intergenic Intergenic 36675 NM_004267 9435 Hs.8786 NM_004267 ENSG00000175040 CHST2 C6ST|GST-2|GST2|Gn6ST-1|HEL-S-75|glcNAc6ST-1 carbohydrate sulfotransferase 2 protein-coding 182.667-164 chr8 128393923 128394310 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 170563 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 135.333-76 chr19 41363201 41363390 + 1 NA promoter-TSS (NM_001098825) promoter-TSS (NM_001098825) -652 NM_001369864 641649 Hs.709417 NM_001042595 ENSG00000142046 TMEM91 DSPC3|IFITMD6 transmembrane protein 91 protein-coding 243.667-18 chr13 72457437 72457989 + 1 NA Intergenic Intergenic 269916 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 225.333-49 chr14 62472787 62473076 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -332958 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 172.333-128 chr4 122697089 122697424 + 1 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 35202 NR_024041 729338 Hs.647968 NR_024041 CETN4P - centrin 4, pseudogene pseudo 170.333-100 chr18 38589872 38590042 + 1 NA Intergenic Intergenic 932822 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 115.333-170 chr5 34033040 34033287 + 1 NA intron (NR_037951, intron 3 of 8) intron (NR_037951, intron 3 of 8) 10050 NM_030945 114899 Hs.171929 NM_030945 ENSG00000082196 C1QTNF3 C1ATNF3|CORCS|CORS|CORS-26|CORS26|CTRP3 C1q and TNF related 3 protein-coding 149.333-112 chr14 56235489 56235660 + 1 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 117163 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 242.333-26 chr13 64960615 64960922 + 1 NA Intergenic Intergenic -884757 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 232.333-40 chr2 52199906 52200328 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) L1MA4A|LINE|L1 -170531 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 187.667-33 chr14 21395483 21395835 + 1 NA intron (NM_001170629, intron 28 of 37) intron (NM_001170629, intron 28 of 37) 1742 NR_002916 319103 Hs.680078 NR_002916 ENSG00000200785 SNORD8 RNU6C|mgU6-53 small nucleolar RNA, C/D box 8 snoRNA 224.333-29 chr12 23437527 23437811 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 146917 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 208.333-140 chr7 43913655 43913999 + 1 NA intron (NM_001290076, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -6758 NM_017920 55665 Hs.663312 NM_017920 ENSG00000106608 URGCP URG4 upregulator of cell proliferation protein-coding 117.667-28 chr11 62587497 62587726 + 1 NA intron (NM_022830, intron 2 of 8) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 3912 NM_022830 64852 Hs.728983 NM_022830 ENSG00000149016 TUT1 PAPD2|RBM21|STARPAP|TENT1|TUTase|URLC6 terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific protein-coding 225.667-78 chr8 120217709 120218139 + 1 NA intron (NM_021110, intron 14 of 47) intron (NM_021110, intron 14 of 47) 92822 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 149.667-84 chr12 4529908 4530088 + 1 NA exon (NM_020374, exon 4 of 14) exon (NM_020374, exon 4 of 14) 8471 NM_020374 57102 Hs.302977 NM_020374 ENSG00000047621 C12orf4 - chromosome 12 open reading frame 4 protein-coding 150.333-310 chr4 108211684 108211943 + 1 NA Intergenic Intergenic 39693 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 233.667-7 chr10 35653671 35654134 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -12468 NM_031866 8325 Hs.302634 NM_031866 ENSG00000177283 FZD8 FZ-8|hFZ8 frizzled class receptor 8 protein-coding 147.667-85 chr13 33514524 33514753 + 1 NA intron (NM_001243476, intron 4 of 17) intron (NM_001243476, intron 4 of 17) 162156 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 117.667-61 chr16 26103864 26104002 + 1 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) intron (NM_006040, intron 1 of 1) 78696 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 134.667-10 chr1 216337976 216338139 + 1 NA intron (NM_206933, intron 4 of 71) L1ME3C|LINE|L1 85339 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 118.667-38 chr10 104701220 104701411 + 1 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -35099 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-32 chr11 110889275 110889479 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -176188 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 138.333-94 chr2 119143155 119143343 + 1 NA Intergenic Intergenic 15502 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 212.333-156 chr9 97793636 97793978 + 1 NA intron (NR_147055, intron 5 of 10) L2|LINE|L2 59273 NR_147055 101928337 NR_147055 ENSG00000236130 PTCSC2 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 2 ncRNA 161.333-264 chr7 53520603 53520814 + 1 NA Intergenic Intergenic 291223 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 160.333-137 chr19 47517445 47517625 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2472 NR_038457 8775 Hs.126938 NM_003827 ENSG00000105402 NAPA SNAPA NSF attachment protein alpha protein-coding 296.667-2 chr1 115390668 115391168 + 1 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -52682 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 185.333-72 chr18 11451696 11452023 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -2619 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 177.333-125 chr4 111302348 111302657 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -441855 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 200.333-139 chr7 28814967 28815273 + 1 NA intron (NM_001011666, intron 5 of 6) AluJr|SINE|Alu 128987 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 174.667-32 chr12 20183977 20184226 + 1 NA Intergenic Intergenic -56200 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 158.333-323 chr8 105535898 105536062 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 216437 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 185.667-48 chr17 76765530 76765780 + 1 NA intron (NR_148240, intron 9 of 13) AluJb|SINE|Alu 28154 NR_148234 79157 Hs.73965 NM_024311 ENSG00000092931 MFSD11 ET major facilitator superfamily domain containing 11 protein-coding 438.667-9 chr8 125467159 125468018 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 35379 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 270.667-59 chr9 831043 831391 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -10480 NM_021951 1761 Hs.98586 NM_021951 ENSG00000137090 DMRT1 CT154|DMT1 doublesex and mab-3 related transcription factor 1 protein-coding 172.333-33 chr11 83767009 83767311 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -84735 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 139.667-64 chr16 12471042 12471242 + 1 NA intron (NM_032167, intron 18 of 20) intron (NM_032167, intron 18 of 20) -249179 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 154.667-403 chr8 134823006 134823292 + 1 NA Intergenic Intergenic -14920 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 260.667-19 chr12 93232635 93232970 + 1 NA intron (NR_040096, intron 2 of 4) L3|LINE|CR1 58436 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 140.333-44 chr11 111770437 111770696 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4177 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 244.333-94 chr7 29521208 29521489 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 37532 NM_001293081 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 120.333-146 chr4 165650308 165650456 + 1 NA Intergenic Intergenic -34257 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 124.667-186 chr7 35495583 35495844 + 1 NA Intergenic Intergenic 181858 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 151.333-90 chr11 111790793 111791025 + 1 NA intron (NM_001352420, intron 14 of 15) intron (NM_001352420, intron 14 of 15) -24520 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 189.333-185 chr7 24419946 24420271 + 1 NA Intergenic Intergenic 135918 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 147.333-142 chr17 61996461 61996678 + 1 NA intron (NM_005121, intron 9 of 29) L2a|LINE|L2 -68587 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 217.667-68 chr4 90271437 90271818 + 1 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) L1MA3|LINE|L1 36596 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 290.333-46 chr8 76613089 76613473 + 1 NA intron (NR_024360, intron 3 of 3) intron (NR_024360, intron 3 of 3) -67966 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 221.667-35 chr16 5758212 5758586 + 1 NA Intergenic Intergenic 125932 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 254.667-46 chr21 15135563 15135868 + 1 NA Intergenic Intergenic -70715 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 179.667-96 chr4 38430120 38430358 + 1 NA intron (NR_110951, intron 7 of 7) intron (NR_110951, intron 7 of 7) 63325 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 146.333-77 chr13 53801615 53801882 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -13671 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 159.667-208 chr3 5390379 5390701 + 1 NA Intergenic Intergenic -140285 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 352.667-31 chrUn_KI270438v1 105465 106031 + 1 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 395.667 chr11 79241208 79241795 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 2 of 33) intron (NM_001098816, intron 2 of 33) 160608 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 153.667-83 chr12 14432096 14432276 + 1 NA intron (NM_001286515, intron 2 of 12) intron (NM_001286515, intron 2 of 12) 46905 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 126.667-44 chr13 67673387 67673563 + 1 NA Intergenic LTR40A1|LTR|ERVL 301088 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 177.667-42 chr13 66050748 66051108 + 1 NA Intergenic Intergenic -84499 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 212.333-102 chr3 197164058 197164389 + 1 NA intron (NM_001290983, intron 5 of 25) AluSg|SINE|Alu 19649 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 171.667-149 chr6 167059603 167059946 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -52033 NM_004367 1235 Hs.46468 NM_004367 ENSG00000112486 CCR6 BN-1|C-C CKR-6|CC-CKR-6|CCR-6|CD196|CKR-L3|CKRL3|CMKBR6|DCR2|DRY6|GPR29|GPRCY4|STRL22 C-C motif chemokine receptor 6 protein-coding 144.667-177 chr21 29906405 29906645 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 33471 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 167.667-123 chr20 54067449 54067665 + 1 NA TTS (NR_039913) TTS (NR_039913) 928 NR_039913 100616225 NR_039913 ENSG00000265595 MIR4756 - microRNA 4756 ncRNA 160.667-177 chr20 40989984 40990233 + 1 NA intron (NR_145525, intron 1 of 2) AluSx3|SINE|Alu 9395 NR_145525 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 313.333-24 chr3 67488156 67488621 + 1 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) intron (NM_001177599, intron 9 of 10) 166226 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 148.333-411 chr9 38710281 38710477 + 1 NA Intergenic Intergenic 89291 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 214.667-6 chr1 193797140 193797594 + 1 NA Intergenic Intergenic 492622 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 148.667-41 chr10 49704998 49705147 + 1 NA intron (NM_182554, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 25421 NM_001042427 282966 Hs.131287 NM_182554 ENSG00000178645 C10orf53 - chromosome 10 open reading frame 53 protein-coding 155.667-313 chr6 133231058 133231295 + 1 NA Intergenic Intergenic -10181 NM_004100 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 144.333-49 chr12 29253678 29253954 + 1 NA intron (NM_001271784, intron 1 of 10) MIRc|SINE|MIR 30150 NM_018099 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 154.667-103 chr14 41179074 41179243 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 224447 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 187.333-218 chrX 65633477 65633805 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -34013 NM_002444 4478 Hs.87752 NM_002444 ENSG00000147065 MSN HEL70|IMD50 moesin protein-coding 160.333-5 chr1 41299975 41300202 + 1 NA Intergenic Intergenic -57782 NM_001172218 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 198.667-21 chr10 59237907 59238333 + 1 NA intron (NM_001143774, intron 3 of 4) intron (NM_001143774, intron 3 of 4) 60653 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 181.333-59 chr17 55732745 55733016 + 1 NA promoter-TSS (NM_001099640) promoter-TSS (NM_001099640) -799 NM_001099640 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 200.333-92 chr3 83258550 83258884 + 1 NA Intergenic Intergenic 1272575 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 200.333-68 chr2 64307835 64308151 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -32766 NR_039632 100616265 NR_039632 ENSG00000283222 MIR4433A MIR4433|hsa-mir-4433a microRNA 4433a ncRNA 151.667-2 chr1 26139100 26139263 + 1 NA Intergenic Intergenic -19898 NM_024869 79927 Hs.694119 NM_024869 ENSG00000197245 FAM110D GRRP1 family with sequence similarity 110 member D protein-coding 284.333-13 chr14 49927849 49928525 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 35105 NM_001663 382 Hs.525330 NM_001663 ENSG00000165527 ARF6 - ADP ribosylation factor 6 protein-coding 153.667-162 chr18 13002030 13002237 + 1 NA intron (NM_032142, intron 3 of 44) L1ME4a|LINE|L1 10771 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 196.333-96 chr20 5345948 5346314 + 1 NA Intergenic Intergenic -29399 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 124.333-69 chr18 6086892 6087062 + 1 NA intron (NM_001365766, intron 15 of 16) MIR|SINE|MIR -169767 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 114.667-245 chr8 93228724 93228955 + 1 NA Intergenic Intergenic -61989 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 149.333-291 chr4 125298741 125298961 + 1 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -17561 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 118.333-204 chr8 91475715 91475865 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 226471 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 149.333-137 chr17 26882455 26882610 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 206709 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 135.333-156 chr6 27573458 27573691 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -100456 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 170.333-147 chr3 144369971 144370260 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 397034 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 149.667-395 chr8 82000892 82001246 + 1 NA Intergenic Intergenic -158783 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 335.667-10 chr17 56493037 56493781 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 19 of 20) L2c|LINE|L2 -100290 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 164.333-40 chr11 76035402 76035704 + 1 NA intron (NM_003369, intron 12 of 14) intron (NM_003369, intron 12 of 14) 170949 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 160.333-120 chr16 68169341 68169616 + 1 NA intron (NM_004555, intron 5 of 10) AluJb|SINE|Alu 64021 NR_106831 102466194 NR_106831 ENSG00000284259 MIR6773 hsa-mir-6773 microRNA 6773 ncRNA 191.333-25 chr10 50884405 50884616 + 1 NA intron (NM_001198818, intron 1 of 13) intron (NM_001198818, intron 1 of 13) 1117 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 218.333-16 chr10 111653157 111653554 + 1 NA Intergenic Intergenic 530410 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 130.333-71 chr15 25913248 25913456 + 1 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) L1MA10|LINE|L1 10992 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 275.667-53 chr7 12650968 12651418 + 1 NA intron (NR_156701, intron 13 of 14) LTR49|LTR|ERV1 -35634 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 238.333-55 chr20 59872533 59872911 + 1 NA intron (NM_014258, intron 35 of 44) intron (NM_014258, intron 35 of 44) 60915 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 215.333-102 chr2 187506510 187506899 + 1 NA intron (NM_006287, intron 1 of 7) L1MC3|LINE|L1 47731 NM_001329240 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 136.333-152 chr4 119982460 119982635 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 43007 NR_121639 100996694 Hs.119926 NR_121639 ENSG00000250392 LINC02502 - long intergenic non-protein coding RNA 2502 ncRNA 197.667-150 chr8 115006916 115007246 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 660932 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 119.333-51 chr11 62562775 62562979 + 1 NA intron (NM_001404, intron 7 of 9) intron (NM_001404, intron 7 of 9) -2571 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 126.333-164 chr7 42543887 42544045 + 1 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 162481 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 152.333-166 chr2 24205976 24206142 + 1 NA intron (NM_001348182, intron 36 of 38) intron (NM_001348182, intron 36 of 38) 31006 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 242.667-20 chr11 60088784 60089199 + 1 NA intron (NM_000139, intron 1 of 6) intron (NM_000139, intron 1 of 6) 327 NM_000139 2206 Hs.386748 NM_000139 ENSG00000149534 MS4A2 APY|ATOPY|FCER1B|FCERI|IGEL|IGER|IGHER|MS4A1 membrane spanning 4-domains A2 protein-coding 158.667-123 chr17 43001028 43001246 + 1 NA intron (NM_000988, intron 3 of 4) AluY|SINE|Alu 2718 NM_001349922 6155 Hs.514196 NM_000988 ENSG00000131469 RPL27 DBA16|L27 ribosomal protein L27 protein-coding 164.667-51 chr12 41712359 41712616 + 1 NA Intergenic Intergenic -51702 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 153.333-383 chr7 53479795 53480020 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 332024 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 154.667-385 chr8 84763269 84763431 + 1 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 57423 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 206.667-121 chr6 120964908 120965293 + 1 NA Intergenic Intergenic 369380 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 214.667-88 chr4 43764358 43764697 + 1 NA Intergenic Intergenic -252334 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 167.333-107 chr17 39512765 39513108 + 1 NA intron (NM_015083, intron 8 of 13) L1MC5|LINE|L1 51450 NM_016507 51755 Hs.345028 NM_015083 ENSG00000167258 CDK12 CRK7|CRKR|CRKRS cyclin dependent kinase 12 protein-coding 140.667-123 chr2 114514339 114514546 + 1 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 52865 NM_001321912 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 151.667-214 chr3 49746801 49747032 + 1 NA intron (NM_001006115, intron 1 of 4) L1MB4|LINE|L1 -22942 NM_013334 29925 Hs.567488 NM_013334 ENSG00000173540 GMPPB LGMDR19|MDDGA14|MDDGB14|MDDGC14 GDP-mannose pyrophosphorylase B protein-coding 138.333-107 chr2 221681399 221681651 + 1 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -107323 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 188.333-49 chr14 78447633 78447927 + 1 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) MIR|SINE|MIR 44061 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 217.667-42 chr2 43891051 43891383 + 1 NA intron (NM_133259, intron 36 of 37) intron (NM_133259, intron 36 of 37) 52246 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 171.333-128 chr3 196986132 196986397 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -16642 NR_038285 100507057 Hs.666451 NR_038285 ENSG00000228109 MELTF-AS1 MFI2-AS1 MELTF antisense RNA 1 ncRNA 139.667-145 chr5 1537305 1537475 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -13430 NM_024830 79888 Hs.368853 NM_024830 ENSG00000153395 LPCAT1 AGPAT10|AGPAT9|AYTL2|LPCAT-1|PFAAP3|lpcat|lysoPAFAT lysophosphatidylcholine acyltransferase 1 protein-coding 155.333-392 chr8 99836128 99836328 + 1 NA intron (NM_017890, intron 54 of 61) intron (NM_017890, intron 54 of 61) 57479 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 294.667-4 chr10 78058533 78058970 + 1 NA Intergenic Intergenic 24888 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 303.667-30 chr9 85153647 85154162 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 448003 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 135.333-111 chr3 17277225 17277422 + 1 NA intron (NM_014744, intron 15 of 21) intron (NM_014744, intron 15 of 21) 344127 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 122.667-114 chr22 39861799 39861942 + 1 NA exon (NM_152512, exon 3 of 7) exon (NM_152512, exon 3 of 7) 31890 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 177.667-87 chr3 68361163 68361443 + 1 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) L1MA4A|LINE|L1 -139334 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 159.667-93 chr14 22730099 22730287 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -36495 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 156.667-123 chr15 90924832 90925125 + 1 NA Intergenic Intergenic -5202 NM_001039675 55898 Hs.389461 NM_017979 ENSG00000140553 UNC45A GC-UNC45|GCUNC-45|GCUNC45|IRO039700|SMAP-1|SMAP1|UNC-45A unc-45 myosin chaperone A protein-coding 279.333-7 chr1 190211781 190212114 + 1 NA intron (NM_199051, intron 6 of 7) intron (NM_199051, intron 6 of 7) 264063 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 133.667-122 chr5 111164735 111165035 + 1 NA Intergenic Intergenic -58698 NM_001323375 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 292.333-45 chr8 135492214 135492619 + 1 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) intron (NM_006558, intron 1 of 8) 34960 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 115.667-231 chr9 125341222 125341371 + 1 NA intron (NM_001354298, intron 17 of 25) intron (NM_001354298, intron 17 of 25) 79470 NM_001354293 26130 Hs.42376 NM_015635 ENSG00000165219 GAPVD1 GAPEX5|GAPex-5|RAP6 GTPase activating protein and VPS9 domains 1 protein-coding 213.333-144 chr4 30458011 30458479 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -262124 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 173.333-154 chr5 35683114 35683310 + 1 NA intron (NM_024867, intron 10 of 36) intron (NM_024867, intron 10 of 36) 65349 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 116.667-142 chr4 32041932 32042113 + 1 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) L1MA4A|LINE|L1 -19600 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 162.667-208 chr5 24868794 24869044 + 1 NA Intergenic Intergenic -28336 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 242.667-97 chr7 108366568 108366915 + 1 NA intron (NR_163871, intron 2 of 29) intron (NR_163871, intron 2 of 29) -38215 NM_001371177 147.667-373 chr8 129420417 129420619 + 1 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 63624 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 198.667-188 chr8 129125520 129125856 + 1 NA Intergenic Intergenic 115552 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 180.333-147 chr8 138298545 138298782 + 1 NA intron (NM_015912, intron 3 of 19) intron (NM_015912, intron 3 of 19) 198598 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 127.667-188 chr8 134632140 134632331 + 1 NA intron (NM_020863, intron 3 of 15) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 34164 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 173.333-6 chr1 56946848 56947078 + 1 NA intron (NM_000066, intron 6 of 11) intron (NM_000066, intron 6 of 11) 19052 NM_000066 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 171.667-156 chr7 104164983 104165200 + 1 NA intron (NM_002553, intron 11 of 13) intron (NM_002553, intron 11 of 13) 42922 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 141.667-170 chr5 14806747 14806991 + 1 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) 19143 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 203.333-48 chr12 7205772 7206137 + 1 NA intron (NM_001351136, intron 10 of 15) intron (NM_001351136, intron 10 of 15) 15592 NM_000319 5830 Hs.567327 NM_000319 ENSG00000139197 PEX5 PBD2A|PBD2B|PTS1-BP|PTS1R|PXR1|RCDP5 peroxisomal biogenesis factor 5 protein-coding 148.333-37 chr10 10424032 10424180 + 1 NA intron (NR_120637, intron 2 of 3) intron (NR_120637, intron 2 of 3) 38243 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 117.667-76 chr18 49163982 49164144 + 1 NA intron (NM_001353210, intron 13 of 16) intron (NM_001353210, intron 13 of 16) -114295 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 174.333-103 chr4 81519486 81519747 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -47709 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 200.667-32 chr11 82493076 82493332 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -89291 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 166.333-44 chr11 41735464 41735747 + 1 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) intron (NR_120584, intron 2 of 5) 21037 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 172.667-136 chr6 93594572 93594953 + 1 NA Intergenic MLT1F1-int|LTR|ERVL-MaLR -109255 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 199.333-107 chr18 5888798 5889138 + 1 NA TTS (NM_001080209) TTS (NM_001080209) 6986 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 176.667-60 chr15 69025207 69025532 + 1 NA intron (NM_024505, intron 1 of 15) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 10674 NM_024505 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 176.333-124 chr4 104623737 104624012 + 1 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -128980 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 184.333-104 chr3 62577894 62578139 + 1 NA intron (NM_003716, intron 8 of 29) L1MEc|LINE|L1 -204466 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 188.667-29 chr11 94285324 94285581 + 1 NA Intergenic Intergenic -20185 NM_001199206 390243 Hs.553758 NM_001080486 ENSG00000183560 IZUMO1R FOLR4|Folbp3|JUNO IZUMO1 receptor, JUNO protein-coding 187.333-206 chr8 133389961 133390260 + 1 NA Intergenic Intergenic -92806 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 227.333-42 chr16 8076712 8077103 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 512931 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 148.667-89 chr12 4238768 4239031 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -34863 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 152.667-127 chr15 90558081 90558354 + 1 NA intron (NM_001042574, intron 2 of 14) L2a|LINE|L2 28294 NM_022769 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 183.667-6 chr1 89870814 89871030 + 1 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 48983 NM_018103 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 173.667-187 chr9 13754326 13754589 + 1 NA Intergenic Intergenic -173514 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 156.333-28 chr1 234320441 234320641 + 1 NA intron (NM_173508, intron 7 of 7) intron (NM_173508, intron 7 of 7) 14074 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 284.333-40 chr7 86787791 86788218 + 1 NA intron (NM_001363522, intron 3 of 4) intron (NM_001363522, intron 3 of 4) 144090 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 158.333-11 chr1 89119335 89119630 + 1 NA intron (NM_004120, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 6632 NM_004120 2634 Hs.386567 NM_004120 ENSG00000162645 GBP2 - guanylate binding protein 2 protein-coding 158.333-79 chr14 24170290 24170567 + 1 NA Intergenic Intergenic -1652 NM_005132 9985 Hs.419259 NM_005132 ENSG00000100918 REC8 HR21spB|REC8L1|Rec8p REC8 meiotic recombination protein protein-coding 230.667-56 chr3 119137275 119137671 + 1 NA intron (NM_152538, intron 1 of 8) L1MA3|LINE|L1 8547 NM_001353322 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 174.333-113 chr5 32546791 32547003 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -38660 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 189.333-38 chr11 103811907 103812250 + 1 NA Intergenic Intergenic -37828 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 170.667-89 chr2 192725880 192726130 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -23840 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 217.667-60 chr3 151844799 151845180 + 1 NA intron (NR_110203, intron 1 of 2) intron (NR_110203, intron 1 of 2) -28654 NM_033050 56670 Hs.133181 NM_033050 ENSG00000198829 SUCNR1 GPR91 succinate receptor 1 protein-coding 158.333-19 chr1 186575118 186575426 + 1 NA Intergenic Intergenic 105151 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 150.667-219 chr21 27011957 27012181 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -44981 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 161.667-76 chr14 60154833 60155090 + 1 NA intron (NM_016029, intron 2 of 6) intron (NM_016029, intron 2 of 6) 10437 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 291.333-74 chr9 119348234 119348675 + 1 NA intron (NM_014618, intron 1 of 7) L1MC1|LINE|L1 20981 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 242.667-35 chr15 62813312 62813744 + 1 NA intron (NM_015059, intron 49 of 55) intron (NM_015059, intron 49 of 55) -10429 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 160.333-298 chr9 33306647 33306919 + 1 NA intron (NM_002504, intron 4 of 23) intron (NM_002504, intron 4 of 23) 16267 NM_002504 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 165.333-173 chr3 105445075 105445365 + 1 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) L1MA6|LINE|L1 78311 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 128.667-189 chr8 125880603 125880812 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 70490 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 159.333-198 chr22 23015042 23015252 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -55372 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 127.667-163 chr7 54731001 54731263 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 28079 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 150.333-331 chr5 76177218 76177385 + 1 NA intron (NM_014979, intron 2 of 12) intron (NM_014979, intron 2 of 12) 93918 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 197.667-155 chr9 36669477 36669795 + 1 NA intron (NM_001256691, intron 13 of 15) intron (NM_001256691, intron 13 of 15) 96741 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 145.333-325 chrX 53590070 53590220 + 1 NA intron (NM_031407, intron 35 of 83) intron (NM_031407, intron 35 of 83) -32871 NR_029484 406889 NR_029484 ENSG00000208012 MIRLET7F2 LET7F2|MIRNLET7F2|let-7f-2 microRNA let-7f-2 ncRNA 266.667-63 chr5 97022073 97022598 + 1 NA exon (NM_175920, exon 14 of 18) exon (NM_175920, exon 14 of 18) 63902 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 192.333-4 chr1 94484950 94485224 + 1 NA intron (NM_002858, intron 10 of 22) MER58A|DNA|hAT-Charlie 56672 NM_001993 2152 Hs.62192 NM_001993 ENSG00000117525 F3 CD142|TF|TFA coagulation factor III, tissue factor protein-coding 284.667-14 chr13 102731749 102732294 + 1 NA exon (NM_001146197, exon 4 of 4) exon (NM_001146197, exon 4 of 4) 27051 NM_001146197 643677 Hs.368382 NM_001146197 ENSG00000175820 CCDC168 C13orf40 coiled-coil domain containing 168 protein-coding 123.333-117 chr2 184778291 184778420 + 1 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 179826 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 202.667-108 chr4 53856462 53856815 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 130644 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 141.333-61 chr14 21607799 21607967 + 1 NA Intergenic Intergenic 27057 NM_001005466 26534 Hs.554580 NM_001005466 ENSG00000255582 OR10G2 OR14-41 olfactory receptor family 10 subfamily G member 2 protein-coding 279.667-19 chr17 30541063 30541382 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -35243 NR_015341 107133515 Hs.568209 NR_015341 SMURF2P1-LRRC37BP1 - SMURF2P1-LRRC37BP1 readthrough transcribed pseudogene pseudo 156.667-242 chr4 46968127 46968345 + 1 NA intron (NM_001204267, intron 6 of 7) intron (NM_001204267, intron 6 of 7) 25345 NM_001204267 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 187.667-47 chr14 69434769 69435123 + 1 NA intron (NM_001330185, intron 2 of 5) L1MEf|LINE|L1 36254 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 218.333-63 chr2 40463021 40463454 + 1 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) intron (NM_001112802, intron 1 of 7) -11147 NM_001351491 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 212.667-60 chr18 6215893 6216231 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 10 of 16) MIRb|SINE|MIR -40682 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 114.333-82 chr16 80006835 80006962 + 1 NA Intergenic Intergenic 211649 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 200.667-20 chr10 43999140 43999442 + 1 NA Intergenic Intergenic 86889 NR_136148 283033 Hs.178244 NR_033846 LINC00841 - long intergenic non-protein coding RNA 841 ncRNA 183.333-103 chr3 48492550 48492928 + 1 NA intron (NM_001272065, intron 2 of 5) LTR47A|LTR|ERVL 11311 NM_001272068 51246 Hs.414579 NM_016479 ENSG00000164054 SHISA5 SCOTIN shisa family member 5 protein-coding 155.667-363 chr8 105754711 105754910 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 305693 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-292 chr5 129995738 129996035 + 1 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) (CTCTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 91421 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 322.333-3 chr1 214045157 214045608 + 1 NA Intergenic Intergenic 56849 NM_002763 5629 Hs.741808 NM_002763 ENSG00000117707 PROX1 - prospero homeobox 1 protein-coding 165.333-106 chr17 60068594 60068854 + 1 NA intron (NM_022070, intron 7 of 19) L2c|LINE|L2 10207 NM_022070 63897 Hs.221899 NM_022070 ENSG00000068097 HEATR6 ABC1 HEAT repeat containing 6 protein-coding 149.333-12 chr1 69654680 69654884 + 1 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) intron (NM_001366842, intron 1 of 7) 85441 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 156.333-136 chr16 73258555 73258866 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -114263 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 129.333-157 chr5 106058069 106058277 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 952841 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 136.667-87 chr2 25582849 25583093 + 1 NA intron (NM_001320935, intron 4 of 17) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 67251 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 219.333-49 chr14 49594581 49595003 + 1 NA intron (NM_001351375, intron 1 of 2) MER65D|LTR|ERV1 -3905 NM_203467 122769 Hs.451090 NM_152329 ENSG00000165501 LRR1 4-1BBLRR|LRR-1|PPIL5 leucine rich repeat protein 1 protein-coding 130.667-191 chr8 28030494 28030722 + 1 NA intron (NM_001010906, intron 15 of 18) L2c|LINE|L2 -37935 NM_173833 286133 Hs.591833 NM_173833 ENSG00000168079 SCARA5 NET33|Tesr scavenger receptor class A member 5 protein-coding 180.333-70 chr22 48895731 48896056 + 1 NA non-coding (NR_038944, exon 6 of 7) non-coding (NR_038944, exon 6 of 7) 29123 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 140.333-79 chr16 80292523 80292717 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -248114 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 269.333-29 chr17 63060206 63060609 + 1 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) AluSq2|SINE|Alu 94172 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 143.333-162 chr21 20020634 20020895 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -121009 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 136.667-76 chr17 28098907 28099050 + 1 NA intron (NM_016231, intron 1 of 10) AluSp|SINE|Alu 56301 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 162.333-151 chr22 34953932 34954247 + 1 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 43827 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 234.333-28 chr15 34326036 34326424 + 1 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) intron (NM_001042496, intron 2 of 25) -7410 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 253.667-22 chr14 71305324 71305876 + 1 NA Intergenic Intergenic -14876 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 178.333-141 chr5 83577299 83577629 + 1 NA intron (NM_001164098, intron 12 of 13) LTR44|LTR|ERV1 -15150 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 126.333-104 chr20 5049506 5049713 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -39296 NM_203327 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 313.333-15 chr17 30972828 30973145 + 1 NA intron (NM_197939, intron 1 of 3) AluSc|SINE|Alu 1947 NM_001184992 84282 Hs.29874 NM_032322 ENSG00000181481 RNF135 L13|MMFD|REUL|Riplet ring finger protein 135 protein-coding 211.667-31 chr12 19945866 19946140 + 1 NA Intergenic Intergenic -68682 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 128.333-16 chr1 227164214 227164361 + 1 NA intron (NM_001366019, intron 5 of 36) L1ME3G|LINE|L1 154205 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 214.333-40 chr14 42584380 42584724 + 1 NA Intergenic Intergenic 977696 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 214.667-57 chr18 43415982 43416298 + 1 NA Intergenic Intergenic -138650 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 257.333-50 chr2 19323176 19323518 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -25082 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 219.333-105 chr20 53545831 53546117 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6796 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 283.333-17 chr14 62319518 62319926 + 1 NA Intergenic Intergenic -179749 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 124.333-145 chr5 66545163 66545360 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -33657 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 155.333-138 chr17 61586317 61586592 + 1 NA Intergenic Intergenic 4765 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 206.667-75 chr21 24793999 24794406 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -46348 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 154.667-384 chr8 80843157 80843447 + 1 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) intron (NM_001033723, intron 1 of 8) 31166 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 149.667-86 chr12 15536265 15536551 + 1 NA intron (NM_030667, intron 12 of 26) L2a|LINE|L2 -10203 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 157.333-270 chr4 126966083 126966256 + 1 NA Intergenic Intergenic -666788 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 120.333-36 chr11 64302028 64302252 + 1 NA intron (NM_001039496, intron 2 of 4) intron (NM_001039496, intron 2 of 4) 1782 NM_001039496 25858 Hs.97174 NM_001039496 ENSG00000219435 CATSPERZ C11orf20|TEX40 catsper channel auxiliary subunit zeta protein-coding 199.333-231 chr5 94684577 94684995 + 1 NA intron (NM_032290, intron 15 of 20) intron (NM_032290, intron 15 of 20) 66117 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 165.667-20 chr10 74694263 74694441 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) FLAM_C|SINE|Alu -130903 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 290.667-38 chr7 3726967 3727425 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -402489 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 136.333-72 chr16 23669764 23670002 + 1 NA non-coding (NR_037573, exon 7 of 7) non-coding (NR_037573, exon 7 of 7) -9006 NM_005030 5347 Hs.592049 NM_005030 ENSG00000166851 PLK1 PLK|STPK13 polo like kinase 1 protein-coding 199.667-93 chr3 65625278 65625636 + 1 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) MIR|SINE|MIR -268359 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 205.667-15 chr1 226846997 226847378 + 1 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -23385 NM_012486 5664 Hs.25363 NM_000447 ENSG00000143801 PSEN2 AD3L|AD4|CMD1V|PS2|STM2 presenilin 2 protein-coding 282.667-16 chr2 42779345 42779808 + 1 NA intron (NM_012205, intron 4 of 9) AluSg|SINE|Alu 13007 NM_012205 23498 Hs.368805 NM_012205 ENSG00000162882 HAAO 3-HAO|HAO|VCRL1|h3HAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase protein-coding 156.667-303 chr6 120281790 120281964 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 266698 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 146.667-214 chr3 71238724 71238907 + 1 NA intron (NR_146142, intron 5 of 19) intron (NR_146142, intron 5 of 19) 6262 NM_001244814 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 160.667-336 chrX 151955916 151956139 + 1 NA intron (NM_004961, intron 6 of 8) intron (NM_004961, intron 6 of 8) 2631 NR_029638 407009 NR_029638 ENSG00000284363 MIR224 MIRN224|miRNA224 microRNA 224 ncRNA 251.667-54 chr22 22317489 22317853 + 1 NA intron (NR_027293, intron 8 of 10) MER4A1|LTR|ERV1 19573 NR_027293 96610 Hs.449601 NM_080926 BMS1P20 IGL|IGLV|IGLV1 BMS1 pseudogene 20 pseudo 246.667-60 chr3 178383965 178384449 + 1 NA Intergenic Intergenic -34994 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 165.667-182 chr6 161608347 161608526 + 1 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) HAL1|LINE|L1 137459 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 174.667-116 chr3 95894725 95894985 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -211662 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 168.333-96 chr2 102545638 102545828 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 72507 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 167.333-104 chr17 1959171 1959424 + 1 NA intron (NM_178568, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 -58419 NR_135642 105371485 Hs.655867 NR_135642 ENSG00000228133 LOC105371485 - uncharacterized LOC105371485 ncRNA 207.333-69 chr12 106802171 106802496 + 1 NA intron (NM_001351364, intron 3 of 11) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie -27502 NR_040246 100287944 Hs.742087 NR_040246 ENSG00000257545 LOC100287944 - uncharacterized LOC100287944 ncRNA 146.667-101 chr14 55000402 55000633 + 1 NA exon (NM_001008396, exon 9 of 25) exon (NM_001008396, exon 9 of 25) 26582 NM_007086 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 162.333-187 chr4 94614222 94614432 + 1 NA intron (NM_001256426, intron 11 of 16) AluJo|SINE|Alu 143206 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 187.333-10 chr1 173115322 173115707 + 1 NA Intergenic Intergenic -64551 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 169.667-211 chr8 124811175 124811410 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -10693 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 166.667-184 chr5 92378850 92379041 + 1 NA Intergenic Intergenic -995628 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 153.667-40 chr10 33287013 33287228 + 1 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 47547 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 166.667-202 chr6 83494629 83494928 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -17756 NM_153362 167681 Hs.98381 NM_153362 ENSG00000146250 PRSS35 C6orf158|dJ223E3.1 serine protease 35 protein-coding 154.667-307 chr5 35957779 35958063 + 1 NA intron (NM_152404, intron 4 of 6) L1M4|LINE|L1 19120 NR_104630 100506406 Hs.116864 NR_104630 ENSG00000249748 LOC100506406 - uncharacterized LOC100506406 ncRNA 209.667-29 chr11 107999274 107999686 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -9418 NM_003478 8065 Hs.440320 NM_003478 ENSG00000166266 CUL5 CUL-5|VACM-1|VACM1 cullin 5 protein-coding 145.667-258 chr6 154183486 154183742 + 1 NA intron (NM_015553, intron 10 of 11) intron (NM_015553, intron 10 of 11) 93852 NM_001285528 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 206.667-15 chr10 51483205 51483496 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 183777 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 158.667-291 chr6 96154059 96154289 + 1 NA intron (NM_006581, intron 2 of 2) intron (NM_006581, intron 2 of 2) 138200 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 315.333-35 chr5 36353861 36354283 + 1 NA Intergenic Intergenic -52170 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 288.333-34 chr5 181192291 181192668 + 1 NA promoter-TSS (NR_108031) promoter-TSS (NR_108031) -571 NR_108031 102577426 Hs.277359 NR_108031 ENSG00000248473 LINC01962 - long intergenic non-protein coding RNA 1962 ncRNA 279.333-22 chr11 107210348 107210795 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -192095 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 413.667 chr1 178302641 178303160 + 1 NA intron (NM_170692, intron 3 of 17) AluSx3|SINE|Alu -38551 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 180.667-26 chr12 9602424 9602695 + 1 NA intron (NM_002258, intron 1 of 5) intron (NM_002258, intron 1 of 5) 5357 NM_002258 3820 Hs.169824 NM_002258 ENSG00000111796 KLRB1 CD161|CLEC5B|NKR|NKR-P1|NKR-P1A|NKRP1A|hNKR-P1A killer cell lectin like receptor B1 protein-coding 117.667-156 chr5 121856244 121856408 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 4444 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 294.666-9 chr14 52680455 52681168 + 1 NA intron (NM_014584, intron 3 of 15) intron (NM_014584, intron 3 of 15) 14747 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 124.667-17 chr1 179195376 179195527 + 1 NA intron (NM_007314, intron 1 of 11) L1MB3|LINE|L1 34226 NM_007314 27 Hs.159472 NM_005158 ENSG00000143322 ABL2 ABLL|ARG ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 146.667-247 chr5 9768400 9768579 + 1 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) L2a|LINE|L2 -85888 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 159.667-170 chr2 76279349 76279547 + 1 NA Intergenic Intergenic -568533 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 173.667-99 chr20 54690284 54690491 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 214794 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 150.333-416 chr8 117271866 117272149 + 1 NA Intergenic Intergenic 137012 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 143.333-257 chr7 22168339 22168501 + 1 NA intron (NM_001367603, intron 1 of 5) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 25325 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 152.333-228 chr3 28804356 28804559 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 229179 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 191.333-80 chr15 89500543 89501023 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -4200 NM_001321041 51458 Hs.459284 NM_016321 ENSG00000140519 RHCG C15orf6|PDRC2|RHGK|SLC42A3 Rh family C glycoprotein protein-coding 125.333-61 chr14 88471408 88471565 + 1 NA intron (NM_007039, intron 15 of 18) L1M1|LINE|L1 83521 NM_007039 11099 Hs.437040 NM_007039 ENSG00000070778 PTPN21 PTPD1|PTPRL10 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 21 protein-coding 150.333-58 chr11 32107173 32107358 + 1 NA Intergenic Intergenic 16191 NM_002901 5954 Hs.97887 NM_002901 ENSG00000049449 RCN1 HEL-S-84|PIG20|RCAL|RCN reticulocalbin 1 protein-coding 164.333-137 chr20 6729037 6729344 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 6946 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 234.667-47 chr2 15223319 15223791 + 1 NA intron (NM_015909, intron 47 of 51) intron (NM_015909, intron 47 of 51) 337779 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 424.667 chr1 55979567 55980076 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 34734 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 145.333-235 chr5 56865952 56866170 + 1 NA intron (NM_005921, intron 6 of 19) intron (NM_005921, intron 6 of 19) -43199 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 127.667-129 chr4 81063193 81063413 + 1 NA Intergenic Intergenic 32595 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 239.333-38 chr16 27596274 27596641 + 1 NA intron (NM_015202, intron 2 of 27) intron (NM_015202, intron 2 of 27) 46313 NM_015202 23247 Hs.460459 NM_015202 ENSG00000047578 KIAA0556 JBTS26 KIAA0556 protein-coding 162.333-7 chr1 88134625 88134849 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -549407 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 138.667-177 chr6 11656563 11656760 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 118912 NM_001100829 100113407 Hs.146317 NM_001100829 ENSG00000205269 TMEM170B - transmembrane protein 170B protein-coding 175.667-53 chr17 33704910 33705221 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -171305 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 151.333-328 chr5 31783824 31784090 + 1 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) intron (NM_178140, intron 1 of 24) 144826 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 124.667-98 chr2 40888444 40888658 + 1 NA Intergenic Intergenic -376116 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 163.667-133 chr20 31929076 31929275 + 1 NA intron (NR_148013, intron 10 of 16) AluJo|SINE|Alu 22871 NM_030815 81572 Hs.435755 NM_030815 ENSG00000088356 PDRG1 C20orf126|PDRG p53 and DNA damage regulated 1 protein-coding 143.667-10 chr1 74161512 74161764 + 1 NA intron (NM_001105659, intron 3 of 7) intron (NM_001105659, intron 3 of 7) 36538 NM_001105659 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 118.667-102 chr2 106954279 106954509 + 1 NA Intergenic Intergenic -67285 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 144.333-291 chrX 64681656 64681929 + 1 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -286340 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 205.333-194 chr5 143033298 143033629 + 1 NA intron (NR_146198, intron 12 of 22) intron (NR_146198, intron 12 of 22) -159037 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 151.667-390 chr9 37727282 37727568 + 1 NA intron (NM_001371225, intron 7 of 15) MER58A|DNA|hAT-Charlie -26378 NR_104612 158234 Hs.655614 NM_144964 ENSG00000165275 TRMT10B RG9MTD3|bA3J10.9 tRNA methyltransferase 10B protein-coding 189.667-148 chr9 38662122 38662433 + 1 NA Intergenic Intergenic 41189 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 229.667-39 chr19 29830319 29830683 + 1 NA Intergenic Intergenic 18510 NM_001238 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 258.667-71 chr4 80701363 80701884 + 1 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -329085 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 163.333-37 chr10 69715026 69715354 + 1 NA Intergenic Intergenic 84943 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 240.333-28 chr12 65075844 65076236 + 1 NA intron (NM_007191, intron 3 of 9) AluJo|SINE|Alu 45265 NM_007191 11197 Hs.284122 NM_007191 ENSG00000156076 WIF1 WIF-1 WNT inhibitory factor 1 protein-coding 155.333-250 chr3 196713296 196713525 + 1 NA intron (NM_017861, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 1033 NM_017861 54965 Hs.223296 NM_017861 ENSG00000163964 PIGX PIG-X phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class X protein-coding 177.333-138 chr6 39591481 39591856 + 1 NA intron (NM_001289020, intron 7 of 21) intron (NM_001289020, intron 7 of 21) 133740 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 252.667-70 chr4 61838107 61838432 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 323496 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 233.333-24 chr10 113827660 113827937 + 1 NA Intergenic Intergenic 26284 NM_014881 9937 Hs.1560 NM_014881 ENSG00000198924 DCLRE1A PSO2|SNM1|SNM1A DNA cross-link repair 1A protein-coding 186.333-30 chr11 69936444 69936726 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -117169 NM_005247 2248 Hs.37092 NM_005247 ENSG00000186895 FGF3 HBGF-3|INT2 fibroblast growth factor 3 protein-coding 394.333-5 chr15 62306862 62307459 + 1 NA Intergenic Intergenic -2426 NR_107034 102465869 NR_107034 ENSG00000277919 MIR8067 hsa-mir-8067 microRNA 8067 ncRNA 155.667-246 chr4 58083601 58083772 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 452642 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 166.333-243 chr9 137652551 137652735 + 1 NA intron (NM_001354612, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 33638 NM_001354611 79813 Hs.495511 NM_024757 ENSG00000181090 EHMT1 EHMT1-IT1|EUHMTASE1|Eu-HMTase1|FP13812|GLP|GLP1|KLEFS1|KMT1D euchromatic histone lysine methyltransferase 1 protein-coding 196.667-76 chr2 124809110 124809518 + 1 NA intron (NM_130773, intron 19 of 23) HAL1|LINE|L1 784027 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 145.333-157 chr20 30474171 30474486 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -70866 NR_045115 140678 Hs.653099 NR_045115 MLLT10P1 MLLT10L|bA348I14.3 MLLT10 pseudogene 1 pseudo 269.667-50 chr7 55336958 55337337 + 1 NA Intergenic LTR1F1|LTR|ERV1 -28301 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 146.333-198 chr3 29939992 29940146 + 1 NA intron (NM_001177711, intron 11 of 13) L2|LINE|L2 -5913 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 112.667-75 chr15 58159367 58159540 + 1 NA intron (NM_020980, intron 1 of 5) L1MA4|LINE|L1 21072 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 171.333-144 chr5 22767002 22767267 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 86210 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 246.667-76 chr5 165734953 165735355 + 1 NA Intergenic Intergenic 1191216 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 169.667-173 chr5 140137184 140137398 + 1 NA Intergenic Intergenic 11354 NM_001007189 492311 Hs.696360 NM_001007189 ENSG00000182700 IGIP C5orf53 IgA inducing protein protein-coding 159.333-304 chr7 31678451 31678613 + 1 NA Intergenic Intergenic -8485 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 267.333-82 chr6 138096782 138097265 + 1 NA intron (NM_022121, intron 1 of 2) intron (NM_022121, intron 1 of 2) 10396 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 225.333-90 chr21 25538203 25538586 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -23751 NR_001458 114614 Hs.697120 NR_001458 ENSG00000234883 MIR155HG BIC|MIRHG2|NCRNA00172 MIR155 host gene ncRNA 143.333-53 chr11 83461708 83462003 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 27 of 27) intron (NM_001142699, intron 27 of 27) -175448 NM_001286119 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 164.667-127 chr20 53185946 53186167 + 1 NA intron (NM_001193421, intron 1 of 2) intron (NM_001193421, intron 1 of 2) 773 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 172.333-144 chr5 121977802 121978050 + 1 NA intron (NM_152546, intron 3 of 7) intron (NM_152546, intron 3 of 7) 15951 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 247.333-88 chr8 117501776 117502105 + 1 NA Intergenic Intergenic -18773 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 181.333-89 chr2 226495383 226495666 + 1 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 163269 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 204.667-44 chr14 75852370 75852679 + 1 NA intron (NM_015072, intron 28 of 31) intron (NM_015072, intron 28 of 31) 129471 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 251.667-2 chr1 63043247 63043538 + 1 NA Intergenic Intergenic -30921 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 125.667-194 chr8 132593882 132594086 + 1 NA intron (NR_135913, intron 9 of 10) L1M5|LINE|L1 -32505 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 147.333-167 chr2 48346973 48347169 + 1 NA intron (NM_002158, intron 3 of 6) L1MEg|LINE|L1 32389 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 153.333-399 chr8 40678171 40678358 + 1 NA intron (NM_024645, intron 4 of 6) intron (NM_024645, intron 4 of 6) 219562 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 233.667-38 chr2 40982722 40983064 + 1 NA Intergenic Intergenic -470458 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 285.333-50 chr4 60165472 60165885 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -756941 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 174.667-41 chr13 71242896 71243076 + 1 NA Intergenic Intergenic 227845 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 258.667-36 chr15 100974391 100974912 + 1 NA intron (NM_024652, intron 3 of 33) L1ME4a|LINE|L1 55294 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 149.333-228 chr3 452374 452587 + 1 NA Intergenic Intergenic -66685 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 183.667-123 chr5 164217474 164217791 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 249770 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 300.333-8 chr12 6858512 6859106 + 1 NA intron (NM_001098536, intron 8 of 19) FLAM_C|SINE|Alu 6659 NM_001098536 8078 Hs.631661 NM_003481 ENSG00000111667 USP5 ISOT ubiquitin specific peptidase 5 protein-coding 288.333-37 chr7 110594182 110594511 + 1 NA Intergenic Intergenic -496660 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 152.667-117 chr14 73936926 73937079 + 1 NA intron (NM_152445, intron 7 of 8) intron (NM_152445, intron 7 of 8) -12932 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 156.333-55 chr11 37349766 37349930 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -588753 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 181.667-103 chr3 179659097 179659429 + 1 NA intron (NM_003940, intron 1 of 20) intron (NM_003940, intron 1 of 20) 6223 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 174.667-136 chr4 187130499 187130774 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -71350 NR_147159 105377600 Hs.641158 NR_147159 LINC02374 - long intergenic non-protein coding RNA 2374 ncRNA 158.333-156 chr2 118380262 118380551 + 1 NA Intergenic Intergenic -194020 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 157.667-255 chr5 85835369 85835542 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -446989 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 158.667-169 chr2 163376199 163376518 + 1 NA Intergenic Intergenic 359650 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 269.333-41 chr2 46740464 46740979 + 1 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) intron (NM_144949, intron 1 of 1) 41426 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 188.333-59 chr17 72817269 72817681 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -177003 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 160.667-29 chr10 26768960 26769221 + 1 NA intron (NM_001012752, intron 4 of 9) intron (NM_001012752, intron 4 of 9) 71389 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 165.667-137 chr4 17840544 17840775 + 1 NA TTS (NR_136669) TTS (NR_136669) 29680 NR_073124 64151 Hs.567567 NM_022346 ENSG00000109805 NCAPG CAPG|CHCG|NY-MEL-3|YCG1 non-SMC condensin I complex subunit G protein-coding 265.333-86 chr8 115684784 115685280 + 1 NA Intergenic Intergenic -16057 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 152.333-168 chr2 31932662 31932888 + 1 NA intron (NR_126032, intron 2 of 6) intron (NR_126032, intron 2 of 6) 77889 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 139.333-98 chr18 13071933 13072162 + 1 NA intron (NM_032142, intron 28 of 44) intron (NM_032142, intron 28 of 44) 80685 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 215.333-30 chr11 5139545 5139871 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -7066 NM_001005160 390054 Hs.546593 NM_001005160 ENSG00000171944 OR52A5 OR11-33 olfactory receptor family 52 subfamily A member 5 protein-coding 196.667-178 chrX 132993277 132993701 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -32119 NM_001077188 90161 Hs.385956 NM_147175 ENSG00000171004 HS6ST2 MRXSPM heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 protein-coding 214.333-26 chr11 47785120 47785391 + 1 NA intron (NM_015231, intron 32 of 35) AluJo|SINE|Alu -17914 NM_015308 23360 Hs.6834 NM_015308 ENSG00000109920 FNBP4 FBP30 formin binding protein 4 protein-coding 147.667-76 chr12 73316740 73316946 + 1 NA Intergenic Intergenic 157653 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 206.667-44 chr15 83427406 83427715 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -19668 NR_136711 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 144.667-140 chr2 76988870 76989080 + 1 NA intron (NR_110284, intron 2 of 3) intron (NR_110284, intron 2 of 3) 3010 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 256.667-52 chr21 16903136 16903476 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 313069 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 277.333-49 chr2 238348667 238349012 + 1 NA exon (NM_015650, exon 11 of 17) exon (NM_015650, exon 11 of 17) 28295 NM_001139490 26146 Hs.631898 NM_015650 ENSG00000204104 TRAF3IP1 IFT54|MIP-T3|MIPT3|SLSN9 TRAF3 interacting protein 1 protein-coding 164.667-145 chr3 63679927 63680102 + 1 NA Intergenic Intergenic 27339 NM_001348756 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 212.667-39 chr14 66430203 66430504 + 1 NA Intergenic Intergenic -56018 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 181.667-7 chr1 168252390 168252665 + 1 NA 3' UTR (NM_199344, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_199344, exon 8 of 8) -5097 NR_026844 84832 Hs.537067 NR_026844 ENSG00000214262 ANKRD36BP1 ANKRD26L1|ANKRD36BL1 ankyrin repeat domain 36B pseudogene 1 pseudo 210.333-127 chr5 31657681 31657977 + 1 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) L3|LINE|CR1 18698 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 201.333-40 chr10 109634585 109634866 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 288521 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 142.667-41 chr12 123954266 123954484 + 1 NA intron (NM_001304958, intron 1 of 5) intron (NM_001304958, intron 1 of 5) 17684 NM_001304960 80212 Hs.114111 NM_025140 ENSG00000119242 CCDC92 - coiled-coil domain containing 92 protein-coding 151.667-33 chr1 214319585 214319748 + 1 NA intron (NM_020197, intron 5 of 11) intron (NM_020197, intron 5 of 11) 38507 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 188.333-169 chr9 94945186 94945440 + 1 NA intron (NR_147613, intron 1 of 2) L1MC4a|LINE|L1 241 NR_147613 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 143.333-173 chr3 3943656 3943926 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -142916 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 153.333-19 chr1 118034184 118034396 + 1 NA intron (NM_206996, intron 24 of 48) L2c|LINE|L2 104551 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 251.667-28 chr17 55690108 55690413 + 1 NA Intergenic Intergenic 32604 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 140.667-133 chr20 57779543 57779707 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -68089 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 177.667-16 chr10 21346213 21346480 + 1 NA intron (NR_155751, intron 4 of 4) (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26604 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 285.667-43 chr5 11810620 11811230 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 93521 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 149.333-320 chr5 130828998 130829163 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 336176 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 145.333-35 chr10 60558163 60558341 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 14704 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 346.667-10 chr4 92351129 92351610 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) L1MA5|LINE|L1 46970 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 161.333-259 chr7 47515210 47515387 + 1 NA intron (NM_022748, intron 2 of 30) intron (NM_022748, intron 2 of 30) -50495 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 200.333-83 chr20 62282736 62283126 + 1 NA intron (NM_001363878, intron 10 of 14) intron (NM_001363878, intron 10 of 14) -19965 NM_001281438 11047 Hs.90107 NM_007002 ENSG00000130706 ADRM1 ARM-1|ARM1|GP110 adhesion regulating molecule 1 protein-coding 145.667-77 chr14 58486059 58486279 + 1 NA intron (NM_001329944, intron 21 of 31) L1PA16|LINE|L1 46488 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 161.333-47 chr11 12676718 12677005 + 1 NA intron (NM_021961, intron 2 of 12) intron (NM_021961, intron 2 of 12) 2440 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 161.333-182 chr3 44293002 44293255 + 1 NA intron (NM_001145030, intron 12 of 19) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -44991 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 139.333-157 chr3 180703061 180703287 + 1 NA Intergenic Intergenic -23685 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 158.333-65 chr12 49430848 49431011 + 1 NA intron (NM_001293285, intron 3 of 14) AluSz|SINE|Alu 41755 NR_033267 100335030 Hs.687044 NR_033267 LOC100335030 - FGFR1 oncogene partner 2 pseudogene pseudo 170.667-91 chr2 224375340 224375665 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 26492 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 284.667-40 chr5 11639608 11640120 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -50798 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 134.333-168 chr8 51208309 51208477 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 601052 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 222.667-80 chr6 64072554 64072896 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 32 of 43) intron (NM_001292009, intron 32 of 43) 265889 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 156.333-83 chr12 84897851 84898179 + 1 NA intron (NM_182767, intron 1 of 11) HAL1b|LINE|L1 14784 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 307.333-41 chr2 54749685 54750297 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) intron (NM_001039753, intron 1 of 40) 24979 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 154.667-57 chr11 8000257 8000542 + 1 NA 3' UTR (NM_003754, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_003754, exon 8 of 8) 13062 NM_003754 8665 Hs.516023 NM_003754 ENSG00000175390 EIF3F EIF3S5|MRT67|eIF3-p47 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F protein-coding 112.333-63 chr13 73648373 73648545 + 1 NA Intergenic Intergenic 84215 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 181.667-49 chr17 50633063 50633376 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -1662 NM_003786 8714 Hs.463421 NM_003786 ENSG00000108846 ABCC3 ABC31|EST90757|MLP2|MOAT-D|MRP3|cMOAT2 ATP binding cassette subfamily C member 3 protein-coding 295.667-7 chr12 18338401 18338946 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 9 of 32) (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 77133 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 358.667-19 chr3 8483489 8483921 + 1 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 17953 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 156.667-304 chr6 121988097 121988257 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -411374 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 151.667-226 chr3 97603205 97603397 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 12 of 17) intron (NM_001080448, intron 12 of 17) -161220 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 160.333-152 chr2 176899653 176899819 + 1 NA Intergenic Intergenic 261982 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 348.333-11 chr12 26636914 26637539 + 1 NA intron (NM_002223, intron 21 of 56) intron (NM_002223, intron 21 of 56) 195968 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 276.333-15 chr14 64336478 64336870 + 1 NA 5' UTR (NM_001291712, exon 2 of 14) 5' UTR (NM_001291712, exon 2 of 14) 1876 NM_001291723 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 137.333-184 chr7 90240591 90240855 + 1 NA Intergenic Intergenic -4451 NM_001363438 79846 Hs.521014 NM_024788 ENSG00000105792 CFAP69 C7orf63|FAP69|SPGF24 cilia and flagella associated protein 69 protein-coding 248.667-93 chr6 132882000 132882346 + 1 NA Intergenic Intergenic 64954 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 162.333-97 chr18 8069471 8069637 + 1 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 297480 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 157.667-135 chr2 11429115 11429358 + 1 NA Intergenic Intergenic 35255 NR_047499 100874055 Hs.102428 NR_047499 ENSG00000224177 LINC00570 ncRNA-a5 long intergenic non-protein coding RNA 570 ncRNA 149.333-431 chr9 37481470 37481696 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -4352 NM_001282766 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 150.667-50 chr10 98238110 98238345 + 1 NA intron (NM_001256620, intron 8 of 8) intron (NM_001256620, intron 8 of 8) 29967 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 160.667-117 chr16 77497236 77497520 + 1 NA Intergenic Intergenic -62344 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 113.667-226 chr9 70654003 70654146 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 9 of 25) MER4-int|LTR|ERV1 156010 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 275.333-72 chr7 82018562 82018986 + 1 NA intron (NM_000722, intron 12 of 38) AluSz|SINE|Alu 9597 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 141.333-56 chr13 64585861 64586047 + 1 NA Intergenic Intergenic -509943 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 164.333-2 chr1 28946630 28946799 + 1 NA intron (NM_001166006, intron 1 of 14) intron (NM_001166006, intron 1 of 14) 32138 NM_001166006 2035 Hs.175437 NM_004437 ENSG00000159023 EPB41 4.1R|EL1|HE erythrocyte membrane protein band 4.1 protein-coding 115.333-33 chr11 34787068 34787284 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -128954 NM_001135024 8050 Hs.502315 NM_003477 ENSG00000110435 PDHX DLDBP|E3BP|OPDX|PDHXD|PDX1|proX pyruvate dehydrogenase complex component X protein-coding 135.667-153 chr6 13498514 13498769 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -11004 NM_001242629 54438 Hs.484686 NM_018988 ENSG00000145990 GFOD1 ADG-90|C6orf114 glucose-fructose oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 240.333-49 chr2 97968182 97968597 + 1 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) intron (NM_015348, intron 1 of 40) 27559 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 220.333-110 chr5 23154450 23154812 + 1 NA Intergenic Intergenic -301287 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 159.667-307 chr7 95656743 95656974 + 1 NA Intergenic Intergenic -60342 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 149.667-308 chr5 36372471 36372662 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -70664 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 149.667-347 chr6 66944697 66944931 + 1 NA Intergenic Intergenic -1110537 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 179.667-70 chr18 64853294 64853536 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -593360 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 156.333-69 chr12 6998938 6999145 + 1 NA intron (NM_005768, intron 1 of 12) intron (NM_005768, intron 1 of 12) 19435 NM_005768 10162 Hs.655248 NM_005768 ENSG00000111684 LPCAT3 C3F|LPCAT|LPLAT 5|LPSAT|MBOAT5|OACT5|nessy lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 protein-coding 160.333-95 chr14 46943842 46944117 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 9 of 16) MER58A|DNA|hAT-Charlie -292198 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 147.667-321 chr6 124217619 124217863 + 1 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -65264 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 165.333-236 chr6 166432687 166432871 + 1 NA intron (NM_001006932, intron 15 of 21) AluSz6|SINE|Alu 32604 NR_046793 100874353 Hs.675698 NR_046793 ENSG00000232082 RPS6KA2-IT1 - RPS6KA2 intronic transcript 1 ncRNA 146.333-134 chr18 75895458 75895639 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -183145 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 148.333-289 chr4 101793753 101794003 + 1 NA intron (NM_001127507, intron 1 of 15) intron (NM_001127507, intron 1 of 15) 3148 NM_017935 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 269.333-56 chr21 30598105 30598520 + 1 NA TTS (NM_181604) TTS (NM_181604) 562 NM_181604 337967 Hs.553690 NM_181604 ENSG00000186930 KRTAP6-2 KAP6.2 keratin associated protein 6-2 protein-coding 195.667-53 chr16 70159128 70159459 + 1 NA 3' UTR (NM_017990, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_017990, exon 19 of 19) 14155 NR_126007 400541 Hs.461183 NR_126007 ENSG00000247228 LOC400541 - uncharacterized LOC400541 ncRNA 214.667-15 chr10 71556906 71557155 + 1 NA intron (NM_052836, intron 6 of 12) intron (NM_052836, intron 6 of 12) -45110 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 158.333-236 chr4 98115443 98115607 + 1 NA intron (NM_174952, intron 3 of 10) intron (NM_174952, intron 3 of 10) 27951 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 159.667-240 chr4 111745599 111745777 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -399766 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 201.333-234 chr6 8292859 8293293 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 142469 NM_001370478 51000 Hs.285847 NM_015948 ENSG00000124786 SLC35B3 C6orf196|CGI-19|PAPST2 solute carrier family 35 member B3 protein-coding 209.667-73 chr20 8879280 8879610 + 1 NA intron (NM_182734, intron 32 of 32) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 48260 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 137.333-110 chr20 17503369 17503534 + 1 NA intron (NM_001195, intron 5 of 7) intron (NM_001195, intron 5 of 7) 27928 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 296.333-41 chr8 87100921 87101448 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MEb|LINE|L1 234769 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 271.667-60 chr7 22984708 22985083 + 1 NA intron (NM_032581, intron 2 of 10) intron (NM_032581, intron 2 of 10) 29235 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 198.667-164 chr6 100935928 100936345 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -54764 NM_022091 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 112.667-175 chr3 104628572 104628746 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -738054 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 114.333-93 chr18 70177748 70177932 + 1 NA intron (NM_001318520, intron 10 of 47) L1MB4|LINE|L1 27847 NM_173630 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 240.333-100 chr9 76849925 76850207 + 1 NA intron (NR_131751, intron 2 of 15) AluSz6|SINE|Alu 56021 NM_001308047 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 247.667-37 chr15 91302979 91303245 + 1 NA TTS (NM_001323031) TTS (NM_001323031) -160227 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 164.333-85 chr16 71954716 71954948 + 1 NA intron (NM_181536, intron 16 of 29) L1MEi|LINE|L1 45146 NM_181536 342372 Hs.675286 NM_181536 ENSG00000277481 PKD1L3 - polycystin 1 like 3, transient receptor potential channel interacting protein-coding 153.333-335 chr5 81361668 81361872 + 1 NA intron (NM_130767, intron 4 of 14) LTR108e_Mam|LTR|ERVL 32364 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 141.667-209 chr7 55389982 55390242 + 1 NA intron (NM_018697, intron 1 of 8) intron (NM_018697, intron 1 of 8) 24664 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 213.333-179 chr6 64828827 64829138 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 19 of 43) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -472436 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 208.333-43 chr15 77293438 77293866 + 1 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 -68248 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 159.333-3 chr1 28387915 28388223 + 1 NA intron (NM_001048183, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 18329 NM_001350158 65979 Hs.225641 NM_023923 ENSG00000204138 PHACTR4 PPP1R124 phosphatase and actin regulator 4 protein-coding 134.333-172 chr8 67480081 67480264 + 1 NA intron (NR_136224, intron 4 of 4) intron (NR_136224, intron 4 of 4) 136338 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 148.333-322 chr5 110706277 110706492 + 1 NA intron (NM_001039763, intron 1 of 13) intron (NM_001039763, intron 1 of 13) 20287 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 153.667-183 chr2 70349860 70350033 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -47879 NM_001329755 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 182.667-120 chr4 92279839 92280044 + 1 NA Intergenic Intergenic -2639 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 206.333-62 chr16 19977521 19977754 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -92003 NM_001304771 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 264.667-87 chr8 88882345 88882712 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -555045 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 189.667-147 chr9 33964132 33964357 + 1 NA intron (NR_163243, intron 5 of 24) MamRep605|LTR?|LTR? -11390 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 209.333-96 chr18 76420895 76421191 + 1 NA intron (NM_014643, intron 3 of 6) intron (NM_014643, intron 3 of 6) -70609 NR_136504 101927989 Hs.665186 NR_136504 ENSG00000265778 LOC101927989 - uncharacterized LOC101927989 ncRNA 178.667-105 chr3 95277651 95277851 + 1 NA Intergenic Intergenic 339488 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 145.333-262 chr6 129862523 129862686 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -1289 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 132.667-139 chr5 68308108 68308329 + 1 NA Intergenic Intergenic 15641 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 149.333-105 chr14 20229215 20229427 + 1 NA non-coding (NR_145509, exon 1 of 1) non-coding (NR_145509, exon 1 of 1) 340 NR_145509 390441 NM_001348273 ENSG00000258806 OR11H7 OR11H7P olfactory receptor family 11 subfamily H member 7 (gene/pseudogene) protein-coding 229.333-116 chr7 37713663 37714019 + 1 NA intron (NM_001329994, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 30075 NM_001329993 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 199.333-155 chr2 208922874 208923191 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 380390 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 155.667-88 chr14 21507591 21507873 + 1 NA intron (NM_019852, intron 1 of 10) intron (NM_019852, intron 1 of 10) 3608 NM_019852 56339 Hs.168799 NM_019852 ENSG00000165819 METTL3 IME4|M6A|MT-A70|Spo8|hMETTL3 methyltransferase like 3 protein-coding 261.667-54 chr4 57876990 57877304 + 1 NA Intergenic Intergenic 451275 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 153.667-403 chr9 74741060 74741320 + 1 NA intron (NM_017662, intron 33 of 38) intron (NM_017662, intron 33 of 38) 125656 NM_001365023 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 243.333-69 chr3 31561224 31561672 + 1 NA intron (NM_178862, intron 1 of 15) L1MA1|LINE|L1 28523 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 242.667-103 chr8 33177764 33178122 + 1 NA Intergenic Intergenic 295203 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 273.333-63 chr5 135848242 135848651 + 1 NA intron (NR_146141, intron 2 of 8) intron (NR_146141, intron 2 of 8) 13770 NM_145282 153328 Hs.412418 NM_145282 ENSG00000145832 SLC25A48 - solute carrier family 25 member 48 protein-coding 167.333-35 chr10 16368928 16369257 + 1 NA Intergenic Intergenic -67851 NM_001001484 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 244.333-25 chr11 73359394 73359829 + 1 NA intron (NM_014786, intron 9 of 20) intron (NM_014786, intron 9 of 20) -16788 NM_152222 84957 Hs.533720 NM_032871 ENSG00000054967 RELT AI3C|TNFRSF19L|TRLT RELT TNF receptor protein-coding 152.333-327 chr6 38383449 38383651 + 1 NA intron (NM_052893, intron 7 of 11) L1MEd|LINE|L1 -98046 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 271.333-48 chr3 104856697 104857333 + 1 NA Intergenic Intergenic -509698 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 165.667-119 chr3 34893683 34893856 + 1 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 500254 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 183.333-20 chr11 35987371 35987749 + 1 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) L1PA16|LINE|L1 -22538 NR_039769 100616311 NR_039769 ENSG00000263389 MIR3973 - microRNA 3973 ncRNA 196.667-63 chr18 59283223 59283466 + 1 NA Intergenic Intergenic -9890 NM_013435 30062 Hs.278957 NM_013435 ENSG00000134438 RAX MCOP3|RX retina and anterior neural fold homeobox protein-coding 162.667-259 chr7 89233612 89233911 + 1 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) AluSp|SINE|Alu -438024 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 273.333-44 chr3 45797449 45797923 + 1 NA Intergenic (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1150 NM_022405 54716 Hs.413095 NM_020208 ENSG00000163817 SLC6A20 SIT1|XT3|Xtrp3 solute carrier family 6 member 20 protein-coding 138.667-35 chr11 90467004 90467248 + 1 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 88731 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 221.667-46 chr20 49525560 49525878 + 1 NA intron (NM_000961, intron 5 of 9) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 42418 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 135.667-35 chr12 33003389 33003582 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -106639 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 143.667-240 chr7 140897990 140898235 + 1 NA intron (NR_148928, intron 1 of 17) AluJr|SINE|Alu 26817 NM_004333 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 176.667-41 chr12 6514026 6514245 + 1 NA intron (NM_014865, intron 6 of 31) intron (NM_014865, intron 6 of 31) 3913 NR_004387 692148 NR_004387 ENSG00000239002 SCARNA10 U85 small Cajal body-specific RNA 10 ncRNA 135.667-13 chr1 248082940 248083099 + 1 NA intron (NM_001304535, intron 1 of 1) intron (NM_001304535, intron 1 of 1) 22337 NM_001004687 391192 Hs.690412 NM_001004687 ENSG00000198128 OR2L3 - olfactory receptor family 2 subfamily L member 3 protein-coding 291.667-15 chr16 58301443 58301777 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -6563 NM_001080492 221191 Hs.411239 NM_001080492 ENSG00000103023 PRSS54 CT67|KLKBL4 serine protease 54 protein-coding 153.667-115 chr14 28992518 28992807 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -206875 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 161.333-107 chr16 74604053 74604242 + 1 NA intron (NR_027264, intron 1 of 26) FRAM|SINE|Alu 2967 NM_001145667 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 270.666-21 chr4 76881088 76881716 + 1 NA Intergenic Intergenic 16742 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 189.667-126 chr6 39787681 39787975 + 1 NA Intergenic Intergenic -4548 NM_001201427 23500 Hs.357128 NM_015345 ENSG00000146122 DAAM2 dJ90A20A.1 dishevelled associated activator of morphogenesis 2 protein-coding 254.667-44 chr20 57643655 57644054 + 1 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 -23428 NM_030776 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 116.333-9 chr1 75871552 75871702 + 1 NA intron (NM_002440, intron 9 of 19) intron (NM_002440, intron 9 of 19) 60777 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 329.333-21 chr2 63756700 63757114 + 1 NA Intergenic Intergenic -84057 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 202.667-146 chr8 119062916 119063272 + 1 NA non-coding (NR_134297, exon 2 of 2) non-coding (NR_134297, exon 2 of 2) -4153 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 146.333-204 chr3 64846058 64846273 + 1 NA intron (NR_038264, intron 3 of 5) intron (NR_038264, intron 3 of 5) -158165 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 143.333-234 chr5 135302719 135303048 + 1 NA intron (NR_161235, intron 3 of 5) L1ME1|LINE|L1 -54706 NR_037895 340073 Hs.434422 NR_037895 ENSG00000249647 C5orf66-AS2 - C5orf66 antisense RNA 2 ncRNA 174.667-104 chr20 54854595 54854855 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 379132 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 184.333-10 chr10 12274796 12275066 + 1 NA Intergenic Intergenic -74616 NM_020397 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 114.667-4 chr1 67663937 67664152 + 1 NA Intergenic Intergenic -21157 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 293.667-27 chr2 98037293 98037706 + 1 NA Intergenic Intergenic -41551 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 412.667-5 chr16 21580674 21581160 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -16304 NM_001288660 51108 Hs.279583 NM_016025 ENSG00000197006 METTL9 CGI-81|DREV|DREV1|PAP1 methyltransferase like 9 protein-coding 155.667-366 chr8 112378587 112378840 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 34 of 66) L1MA4|LINE|L1 -264780 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 276.333-35 chr3 23976362 23976649 + 1 NA intron (NM_005126, intron 7 of 7) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 30384 NM_001145425 9975 Hs.37288 NM_005126 ENSG00000174738 NR1D2 BD73|EAR-1R|REVERBB|REVERBbeta|RVR nuclear receptor subfamily 1 group D member 2 protein-coding 175.333-69 chr18 6241136 6241417 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 8 of 16) intron (NM_001365769, intron 8 of 16) -15468 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 165.333-195 chr4 136547912 136548186 + 1 NA Intergenic Intergenic -634369 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 146.667-60 chr11 87608014 87608223 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 111293 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 283.333-78 chr9 27728754 27729179 + 1 NA Intergenic Intergenic -155100 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 140.667-118 chr2 68620899 68621071 + 1 NA Intergenic Intergenic -22603 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 151.333-195 chr2 27326047 27326257 + 1 NA 3' UTR (NM_001521, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001521, exon 20 of 20) -3055 NM_002437 4358 Hs.75659 NM_002437 ENSG00000115204 MPV17 CMT2EE|MTDPS6|SYM1 mitochondrial inner membrane protein MPV17 protein-coding 146.333-165 chr2 189726791 189727005 + 1 NA intron (NM_144708, intron 12 of 22) L1MC4|LINE|L1 -35882 NR_102429 101409258 Hs.738558 NR_102429 OSGEPL1-AS1 - OSGEPL1 antisense RNA 1 ncRNA 161.667-240 chr7 53927558 53927872 + 1 NA Intergenic Intergenic -115784 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 145.667-172 chr3 22432076 22432281 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 475039 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 156.333-257 chr4 2213379 2213639 + 1 NA intron (NM_181808, intron 3 of 25) intron (NM_181808, intron 3 of 25) 28612 NM_024511 79441 Hs.665869 NM_024511 ENSG00000214367 HAUS3 C4orf15|IT1|dgt3 HAUS augmin like complex subunit 3 protein-coding 196.333-88 chr2 141745342 141745683 + 1 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) L1MA3|LINE|L1 386189 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 138.333-7 chr1 160244201 160244415 + 1 NA intron (NR_028104, intron 1 of 12) intron (NR_028104, intron 1 of 12) -17441 NR_147618 100287049 Hs.657648 NR_147618 ENSG00000228606 LOC100287049 - uncharacterized LOC100287049 ncRNA 170.333-124 chr2 238480959 238481233 + 1 NA Intergenic Intergenic 54169 NM_001040445 51665 Hs.516788 NM_016114 ENSG00000065802 ASB1 ASB-1 ankyrin repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 173.333-2 chr1 11734950 11735152 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1034 NM_001040195 57085 Hs.464438 NM_020350 ENSG00000177674 AGTRAP ATRAP angiotensin II receptor associated protein protein-coding 142.333-165 chr3 188353560 188353803 + 1 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) intron (NM_001167671, intron 2 of 10) 128276 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 134.667-44 chr12 24953858 24954023 + 1 NA Intergenic Intergenic -4839 NM_001178091 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 127.667-62 chr17 60295078 60295313 + 1 NA intron (NM_032582, intron 3 of 33) L1ME3Cz|LINE|L1 -63550 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 115.333-38 chr11 109884047 109884219 + 1 NA Intergenic Intergenic -209259 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 251.333-31 chr14 45541231 45541680 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 174147 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 136.667-80 chr17 71445729 71445907 + 1 NA Intergenic Intergenic -243639 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 212.667-5 chr1 95418191 95418639 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -56322 NR_033966 440594 Hs.514123 NR_033966 ENSG00000233907 LINC01761 - long intergenic non-protein coding RNA 1761 ncRNA 153.667-11 chr1 71140925 71141178 + 1 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) L1ME3A|LINE|L1 59727 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 138.667-96 chr2 12532352 12532498 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) -184447 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 194.333-118 chr5 65897090 65897366 + 1 NA Intergenic Intergenic -29326 NM_001006600 55914 Hs.591774 NM_018695 ENSG00000112851 ERBIN ERBB2IP|HEL-S-78|LAP2 erbb2 interacting protein protein-coding 156.333-350 chr8 19143208 19143368 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 102234 NR_038919 100128993 Hs.697742 NR_038919 LOC100128993 - uncharacterized LOC100128993 ncRNA 134.333-133 chr4 122069081 122069316 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -101405 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 129.667-160 chr7 38772319 38772559 + 1 NA intron (NM_014396, intron 13 of 28) intron (NM_014396, intron 13 of 28) -85350 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 150.333-65 chr11 99693974 99694250 + 1 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) L2c|LINE|L2 137967 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 165.667-65 chr15 87725160 87725395 + 1 NA Intergenic Intergenic 148348 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 163.333-84 chr14 56786246 56786459 + 1 NA Intergenic Intergenic 19315 NM_172337 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 255.667-49 chr2 184453728 184454033 + 1 NA Intergenic Intergenic 74905 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 157.667-333 chr8 88079800 88080065 + 1 NA intron (NM_005941, intron 6 of 9) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -205917 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 351.333-27 chr5 100604356 100604891 + 1 NA Intergenic Intergenic 69249 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 161.333-95 chr14 72032233 72032407 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) L1ME4c|LINE|L1 98793 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 115.333-21 chr1 239573441 239573660 + 1 NA intron (NM_001347716, intron 3 of 7) intron (NM_001347716, intron 3 of 7) -55523 NM_000740 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 204.667-10 chr1 172149894 172150277 + 1 NA intron (NR_146559, intron 15 of 20) intron (NR_146559, intron 15 of 20) -5250 NR_038397 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 223.333-117 chr4 102529833 102530204 + 1 NA intron (NM_001165412, intron 3 of 23) intron (NM_001165412, intron 3 of 23) -27532 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 113.333-159 chr22 25939132 25939352 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 34 of 43) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 197054 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 196.333-165 chr8 86320807 86321204 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21542 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 201.667-112 chr6 157216435 157216671 + 1 NA Intergenic Intergenic 107706 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 144.667-98 chr15 73125224 73125413 + 1 NA intron (NM_002499, intron 3 of 28) intron (NM_002499, intron 3 of 28) 72834 NM_001172623 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 147.333-10 chr1 56163072 56163337 + 1 NA Intergenic Intergenic 218117 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 157.667-123 chr17 56479097 56479260 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 16 of 20) intron (NM_001370326, intron 16 of 20) -114521 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 121.667-149 chr4 135611678 135611828 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 276340 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 154.667-275 chr4 73528365 73528617 + 1 NA TTS (NR_046377) TTS (NR_046377) 19688 NR_046377 728040 Hs.640574 NR_046377 ENSG00000250436 LINC02499 - long intergenic non-protein coding RNA 2499 ncRNA 179.667-2 chr1 53786268 53786575 + 1 NA intron (NR_033142, intron 15 of 16) intron (NR_033142, intron 15 of 16) -47257 NM_001367484 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 191.667-27 chr11 76703669 76703998 + 1 NA intron (NR_024042, intron 12 of 20) MIR|SINE|MIR 17956 NR_024042 390226 Hs.440026 NR_024042 GUCY2EP GC-E|GCD|GUCY2E guanylate cyclase 2E, pseudogene pseudo 208.333-100 chr4 13673310 13673684 + 1 NA intron (NR_121681, intron 2 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 18318 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 301.667-28 chr20 9261923 9262480 + 1 NA intron (NM_182797, intron 1 of 35) intron (NM_182797, intron 1 of 35) 44811 NM_182797 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 169.667-107 chr2 70760585 70760785 + 1 NA intron (NM_017482, intron 1 of 12) L1ME3B|LINE|L1 7030 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 152.667-3 chr1 30466640 30466873 + 1 NA Intergenic Intergenic -252016 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-230 chr5 85348607 85348927 + 1 NA Intergenic Intergenic -933677 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 182.667-166 chr9 36261905 36262169 + 1 NA intron (NM_001128227, intron 1 of 11) intron (NM_001128227, intron 1 of 11) -3589 NM_001190384 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 152.667-87 chr12 93227993 93228285 + 1 NA intron (NR_040096, intron 2 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 53773 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 149.667-374 chr7 82059276 82059500 + 1 NA intron (NM_001302890, intron 10 of 10) intron (NM_001302890, intron 10 of 10) 50211 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 206.667-139 chr8 127340356 127340764 + 1 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR -59839 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 150.333-393 chr7 143193214 143193435 + 1 NA intron (NM_001130026, intron 8 of 10) intron (NM_001130026, intron 8 of 10) 9905 NM_176881 259285 Hs.553660 NM_176881 ENSG00000236398 TAS2R39 T2R39|T2R57 taste 2 receptor member 39 protein-coding 159.667-309 chr7 113735692 113735897 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 183215 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 262.667-70 chr6 71693468 71693955 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -192992 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 133.667-102 chr3 143536069 143536243 + 1 NA intron (NM_173653, intron 9 of 15) intron (NM_173653, intron 9 of 15) 193910 NR_048544 100885796 Hs.581618 NR_048544 ENSG00000240012 SLC9A9-AS1 - SLC9A9 antisense RNA 1 ncRNA 213.333-74 chr16 69462028 69462329 + 1 NA intron (NM_030579, intron 4 of 4) intron (NM_030579, intron 4 of 4) 37583 NM_030579 80777 Hs.461131 NM_030579 ENSG00000103018 CYB5B CYB5-M|CYPB5M|OMB5 cytochrome b5 type B protein-coding 329.333-47 chr5 119244785 119245332 + 1 NA intron (NM_001290321, intron 43 of 43) intron (NM_001290321, intron 43 of 43) -23701 NM_001286815 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 151.667-133 chr16 24192597 24192870 + 1 NA intron (NM_212535, intron 16 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie -10383 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 312.333-17 chr20 16127316 16127687 + 1 NA Intergenic Intergenic -141619 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 154.333-79 chr14 33114958 33115282 + 1 NA intron (NM_001164749, intron 2 of 11) MIR|SINE|MIR 176241 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 248.667-67 chr2 220369216 220369640 + 1 NA Intergenic Intergenic -462863 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 223.333-82 chr2 139388900 139389159 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 491705 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 227.667-11 chr11 116493290 116493697 + 1 NA Intergenic Intergenic -145929 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 160.333-159 chr2 215274922 215275135 + 1 NA Intergenic Intergenic -37031 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 159.333-271 chr5 92923588 92923886 + 1 NA Intergenic Intergenic 647606 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 254.667-5 chr1 214518427 214518900 + 1 NA intron (NM_005401, intron 1 of 18) intron (NM_005401, intron 1 of 18) 32939 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 190.333-97 chr3 157892302 157892586 + 1 NA Intergenic Intergenic 213719 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 229.333-74 chr3 886202 886517 + 1 NA Intergenic Intergenic -206665 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 325.333-18 chr2 39043400 39043986 + 1 NA intron (NM_005633, intron 6 of 22) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 76770 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 123.667-147 chr4 110060982 110061216 + 1 NA intron (NM_001130721, intron 3 of 4) intron (NM_001130721, intron 3 of 4) 137516 NM_001130721 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 154.667-295 chr5 11898776 11899065 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 5526 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 126.667-80 chr2 110912828 110912989 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 11 of 18) L1MB7|LINE|L1 180335 NM_001371254 151.667-118 chr14 85444267 85444547 + 1 NA Intergenic Intergenic 50492 NR_102738 100996280 Hs.135735 NR_102737 ENSG00000259107 LINC00911 - long intergenic non-protein coding RNA 911 ncRNA 160.667-57 chr11 77370255 77370518 + 1 NA intron (NM_001128620, intron 5 of 15) L1MEi|LINE|L1 -68720 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 146.667-187 chr2 212663068 212663282 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -124373 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 297.667-5 chr10 90091224 90091593 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -134035 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 158.333-216 chr3 173479229 173479481 + 1 NA intron (NM_014932, intron 2 of 6) intron (NM_014932, intron 2 of 6) 81611 NM_001365926 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 131.667-100 chr2 127308063 127308215 + 1 NA intron (NM_006609, intron 15 of 15) intron (NM_006609, intron 15 of 15) -13963 NM_000122 2071 Hs.469872 NM_000122 ENSG00000163161 ERCC3 BTF2|GTF2H|RAD25|TFIIH|TTD2|XPB ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit protein-coding 258.667-98 chr8 115958767 115959078 + 1 NA intron (NR_046215, intron 11 of 13) intron (NR_046215, intron 11 of 13) -289947 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 194.667-148 chr8 14510442 14510860 + 1 NA intron (NM_001322881, intron 2 of 6) MER67C|LTR|ERV1 342859 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 212.333-59 chr19 41841061 41841488 + 1 NA intron (NM_001291419, intron 1 of 4) AluJr|SINE|Alu 2453 NM_001291419 147719 Hs.98660 NM_173506 ENSG00000273111 LYPD4 SMR LY6/PLAUR domain containing 4 protein-coding 227.667-24 chr16 68129701 68130065 + 1 NA intron (NM_004555, intron 3 of 10) AluJr|SINE|Alu 44513 NM_173163 4775 Hs.436585 NM_004555 ENSG00000072736 NFATC3 NF-AT4c|NFAT4|NFATX nuclear factor of activated T cells 3 protein-coding 165.667-111 chr21 15882315 15882562 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 152456 NM_013396 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 170.333-49 chr11 101791713 101791998 + 1 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -123155 NM_001363543 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 137.333-21 chr10 121048646 121048836 + 1 NA Intergenic Intergenic 197379 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 188.333-104 chr4 34489412 34489661 + 1 NA Intergenic Intergenic -219789 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 147.667-235 chr3 103200227 103200459 + 1 NA Intergenic Intergenic 323773 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 159.333-125 chr17 70936051 70936321 + 1 NA Intergenic Intergenic 265993 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 121.667-79 chr18 2360386 2360596 + 1 NA Intergenic Intergenic 211014 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 163.667-119 chr2 161642661 161642948 + 1 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) intron (NM_001354451, intron 1 of 25) 18388 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 174.333-96 chr3 191081676 191081892 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -117457 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 278.333-27 chr2 96169817 96170303 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -24620 NM_004418 1844 Hs.1183 NM_004418 ENSG00000158050 DUSP2 PAC-1|PAC1 dual specificity phosphatase 2 protein-coding 212.333-121 chr5 133450807 133451178 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -23286 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 153.667-222 chr20 40390978 40391256 + 1 NA Intergenic Intergenic 298119 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 161.667-129 chr2 69912405 69912570 + 1 NA Intergenic Intergenic -2554 NM_001202514 4084 Hs.468908 NM_002357 ENSG00000059728 MXD1 BHLHC58|MAD|MAD1 MAX dimerization protein 1 protein-coding 235.333-60 chr2 149512738 149513100 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -74439 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 176.333-153 chr7 24887457 24887765 + 1 NA intron (NR_104111, intron 1 of 21) intron (NR_104111, intron 1 of 21) 5010 NM_145320 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 263.333-27 chr15 58906847 58907240 + 1 NA intron (NR_135042, intron 4 of 18) MIRc|SINE|MIR 26636 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 160.333-263 chr7 64894918 64895177 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -8195 NM_021148 10793 Hs.520889 NM_021148 ENSG00000198039 ZNF273 HZF9 zinc finger protein 273 protein-coding 129.667-16 chr1 231530671 231530872 + 1 NA intron (NR_028398, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu 2102 NM_005999 7257 Hs.13318 NM_005999 ENSG00000116918 TSNAX C3PO|TRAX translin associated factor X protein-coding 224.333-110 chr6 137908682 137909090 + 1 NA Intergenic Intergenic 36914 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 213.333-66 chr15 52298740 52299031 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -3081 NM_018728 55930 Hs.487036 NM_018728 ENSG00000128833 MYO5C - myosin VC protein-coding 276.667-42 chr2 213227238 213227839 + 1 NA Intergenic Intergenic 56671 NR_161186 100130451 Hs.608433 NR_144752 SPAG16-DT - SPAG16 divergent transcript ncRNA 154.333-128 chr18 7056631 7056907 + 1 NA intron (NM_005559, intron 3 of 62) intron (NM_005559, intron 3 of 62) 61028 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 124.333-175 chr8 86175457 86175611 + 1 NA Intergenic Intergenic 54847 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 145.667-150 chr2 168632707 168633015 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 4 of 10) intron (NM_001256126, intron 4 of 10) 49918 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 150.333-414 chr8 111906422 111906586 + 1 NA Intergenic Intergenic 529865 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 195.333-223 chr8 144617002 144617240 + 1 NA intron (NM_001308208, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu -3618 NM_001308207 80728 Hs.148988 NM_025251 ENSG00000147799 ARHGAP39 CrGAP|Vilse Rho GTPase activating protein 39 protein-coding 113.333-270 chr9 84942044 84942249 + 1 NA intron (NM_001018064, intron 14 of 17) intron (NM_001018064, intron 14 of 17) 236245 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 162.667-294 chr9 73512187 73512394 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 360425 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 163.667-28 chr10 75474145 75474359 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) 42628 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 244.333-111 chr9 117338032 117338421 + 1 NA intron (NM_014010, intron 1 of 21) intron (NM_014010, intron 1 of 21) 76831 NM_001365069 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 154.667-222 chr21 25224630 25224790 + 1 NA Intergenic Intergenic 206991 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 195.333-135 chr20 62917018 62917227 + 1 NA intron (NM_022105, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 9383 NM_001193370 11083 Hs.517172 NM_022105 ENSG00000101191 DIDO1 BYE1|C20orf158|DATF-1|DATF1|DIDO2|DIDO3|DIO-1|DIO1|dJ885L7.8 death inducer-obliterator 1 protein-coding 128.333-63 chr15 52694826 52695089 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -16323 NM_019600 56204 Hs.152385 NM_019600 ENSG00000047346 FAM214A KIAA1370 family with sequence similarity 214 member A protein-coding 132.667-53 chr14 66406774 66406930 + 1 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -79519 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 284.667-29 chr22 24214462 24214987 + 1 NA Intergenic Intergenic 30418 NM_001099781 2687 Hs.437156 NM_004121 ENSG00000099998 GGT5 GGL|GGT 5|GGT-REL|GGTLA1 gamma-glutamyltransferase 5 protein-coding 125.667-90 chr2 28212505 28212728 + 1 NA intron (NM_199193, intron 8 of 13) intron (NM_199193, intron 8 of 13) -5655 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 137.667-112 chr20 41665031 41665221 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -46749 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 255.333-60 chr2 194819378 194819686 + 1 NA Intergenic Intergenic 88937 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 167.667-5 chr1 73050200 73050557 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -255792 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 142.667-102 chr2 123758848 123759048 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 266226 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 305.667-2 chr1 244932078 244932683 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -37489 NM_032328 84288 Hs.134857 NM_032328 ENSG00000203666 EFCAB2 CFAP200|DRC8 EF-hand calcium binding domain 2 protein-coding 219.333-118 chr3 108911161 108911414 + 1 NA intron (NM_005459, intron 3 of 3) intron (NM_005459, intron 3 of 3) 42559 NM_001363884 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 304.333-16 chr18 8367499 8367925 + 1 NA promoter-TSS (NR_024419) promoter-TSS (NR_024419) -678 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 146.667-79 chr12 74442603 74442847 + 1 NA Intergenic Intergenic -95110 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 148.333-312 chr5 45591105 45591365 + 1 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) L1MC1|LINE|L1 105145 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 118.667-97 chr2 70777548 70777703 + 1 NA intron (NM_001004311, intron 4 of 4) L1ME4c|LINE|L1 -9425 NM_017488 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 111.667-250 chr8 35281180 35281386 + 1 NA intron (NM_080872, intron 1 of 16) intron (NM_080872, intron 1 of 16) 45808 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 189.667-114 chr5 52338984 52339314 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 331118 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 262.667-36 chr19 48931943 48932253 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1601 NM_014475 27294 Hs.631555 NM_014475 ENSG00000104808 DHDH 2DD|HUM2DD dihydrodiol dehydrogenase protein-coding 248.333-104 chr9 79484722 79485099 + 1 NA Intergenic Intergenic -86863 NM_001282753 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 277.667-44 chr7 81062646 81063209 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -140538 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 171.333-58 chr15 61369026 61369198 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -139810 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 219.333-189 chr9 10441066 10441433 + 1 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) L2c|LINE|L2 171753 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 168.667-211 chr7 124405197 124405390 + 1 NA Intergenic Intergenic -53197 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 156.667-115 chr15 37436364 37436633 + 1 NA Intergenic Intergenic -335187 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 156.667-259 chr5 13180377 13180602 + 1 NA Intergenic Intergenic -147603 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 190.667-152 chr8 123608176 123608528 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 45449 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 150.667-169 chr2 27947326 27947585 + 1 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) L1ME1|LINE|L1 -48912 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 129.667-8 chr1 108633022 108633229 + 1 NA intron (NM_001010883, intron 10 of 10) MIR|SINE|MIR 27968 NM_001102592 113802 Hs.7962 NM_144584 ENSG00000162639 HENMT1 C1orf59|HEN1 HEN methyltransferase 1 protein-coding 138.667-38 chr11 115217890 115218028 + 1 NA exon (NM_001301043, exon 6 of 12) exon (NM_001301043, exon 6 of 12) -115618 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 134.667-179 chr7 11758256 11758445 + 1 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L1MEd|LINE|L1 73848 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 124.333-140 chr5 27564485 27564672 + 1 NA Intergenic Intergenic 92286 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 196.667-130 chr6 55435896 55436200 + 1 NA intron (NR_109869, intron 4 of 4) intron (NR_109869, intron 4 of 4) 108579 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 160.667-238 chr5 18160008 18160293 + 1 NA Intergenic Intergenic 352876 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 145.667-190 chr4 31951631 31951795 + 1 NA Intergenic Intergenic -45666 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 307.667-22 chr20 58641310 58641676 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 6721 NR_125359 79160 Hs.280135 NR_125359 ENSG00000268941 LINC01711 - long intergenic non-protein coding RNA 1711 ncRNA 171.333-3 chr1 24764900 24765113 + 1 NA intron (NM_013943, intron 1 of 5) intron (NM_013943, intron 1 of 5) 19559 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 163.333-185 chr3 122782526 122782717 + 1 NA intron (NM_001320728, intron 1 of 6) intron (NM_001320728, intron 1 of 6) 11210 NM_024610 79663 Hs.29169 NM_024610 ENSG00000169087 HSPBAP1 PASS1 HSPB1 associated protein 1 protein-coding 270.333-33 chr20 56307129 56307583 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -51618 NM_080821 116151 Hs.143736 NM_080821 ENSG00000124098 FAM210B 5A3|C20orf108|dJ1167H4.1 family with sequence similarity 210 member B protein-coding 182.667-110 chr3 186918054 186918320 + 1 NA Intergenic Intergenic -12339 NM_173216 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 310.667-40 chr7 51701776 51702177 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -308720 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 220.667-106 chr8 116832106 116832349 + 1 NA Intergenic Intergenic -42197 NR_033886 644660 Hs.706174 NR_033886 ENSG00000253327 RAD21-AS1 C8orf81|NCRNA00255 RAD21 antisense RNA 1 ncRNA 119.667-81 chr2 61441861 61442079 + 1 NA intron (NM_014709, intron 1 of 79) L1MA5A|LINE|L1 -24593 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 167.333-52 chr11 27169728 27169950 + 1 NA intron (NR_125767, intron 2 of 4) L1PA16|LINE|L1 48929 NR_125768 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 303.333-26 chr15 64651149 64651572 + 1 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) intron (NM_015042, intron 2 of 8) 51921 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 163.667-69 chr15 66858324 66858666 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 98020 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 146.667-287 chr6 131799037 131799224 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 6958 NR_039610 100616455 NR_039610 ENSG00000266807 MIR548H5 - microRNA 548h-5 ncRNA 171.333-179 chr7 35340718 35341120 + 1 NA intron (NR_038864, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 27064 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 141.333-247 chr8 125771056 125771232 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 180053 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 146.333-181 chr21 22446663 22446857 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 348143 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 123.667-58 chr14 70888912 70889169 + 1 NA Intergenic Intergenic -18419 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 182.667-9 chr1 147662104 147662343 + 1 NA intron (NM_001323625, intron 1 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 8301 NR_136635 51205 Hs.562154 NM_016361 ENSG00000162836 ACP6 ACPL1|LPAP|PACPL1 acid phosphatase 6, lysophosphatidic protein-coding 144.333-247 chr7 53547731 53547908 + 1 NA Intergenic Intergenic 264112 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 201.667-92 chr5 37215374 37215660 + 1 NA intron (NM_023073, intron 15 of 51) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -33529 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 162.667-228 chr5 117161976 117162143 + 1 NA Intergenic Intergenic -253453 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 285.667-24 chr2 156153330 156153814 + 1 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 101359 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 160.667-73 chr12 46076656 46076927 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -86217 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 170.667-41 chr13 62863873 62864150 + 1 NA Intergenic Intergenic -56652 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 132.333-160 chr7 17937066 17937308 + 1 NA intron (NM_001350862, intron 1 of 25) intron (NM_001350862, intron 1 of 25) 3307 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 160.333-17 chr1 78906218 78906533 + 1 NA intron (NM_022159, intron 12 of 14) intron (NM_022159, intron 12 of 14) 100355 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 132.667-29 chr11 12388158 12388387 + 1 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) intron (NM_018222, intron 1 of 12) 10701 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 163.667-36 chr11 38013923 38014149 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 75435 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 166.667-30 chr10 118387375 118387632 + 1 NA Intergenic Intergenic 30395 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 224.333-101 chr5 112209277 112209550 + 1 NA intron (NM_001347887, intron 13 of 23) intron (NM_001347887, intron 13 of 23) -18870 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 170.667-180 chrX 71085791 71086027 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -9942 NM_005938 4303 Hs.584654 NM_005938 ENSG00000184481 FOXO4 AFX|AFX1|MLLT7 forkhead box O4 protein-coding 137.667-192 chr9 79914008 79914244 + 1 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) intron (NR_121213, intron 1 of 2) -60897 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 149.333-194 chr2 132877399 132877551 + 1 NA intron (NM_207481, intron 9 of 17) MER5A|DNA|hAT-Charlie -38082 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 181.667-20 chr11 48016259 48016571 + 1 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) MIR3|SINE|MIR 35856 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 167.333-95 chr15 80941410 80941686 + 1 NA intron (NM_001293304, intron 25 of 29) MIRb|SINE|MIR 48271 NM_015154 23184 Hs.578450 NM_015154 ENSG00000117899 MESD BOCA|MESDC2 mesoderm development LRP chaperone protein-coding 246.667-19 chr12 9138744 9139086 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -22686 NM_001347424 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 280.667-36 chr4 170560099 170560548 + 1 NA Intergenic Intergenic 183412 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 174.667-35 chr12 67350722 67351067 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 81536 NM_001329674 55832 Hs.546407 NM_018448 ENSG00000111530 CAND1 TIP120|TIP120A cullin associated and neddylation dissociated 1 protein-coding 259.667-7 chr10 20612496 20612775 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 60665 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 113.667-218 chr8 134635937 134636095 + 1 NA intron (NM_020863, intron 3 of 15) intron (NM_020863, intron 3 of 15) 37945 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 136.333-170 chr5 85146497 85146756 + 1 NA Intergenic Intergenic -761746 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 189.667-140 chr8 71813985 71814288 + 1 NA Intergenic Intergenic -28987 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 128.667-35 chr11 81109663 81109928 + 1 NA Intergenic Intergenic -346992 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 124.333-52 chr14 63492308 63492481 + 1 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 15844 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 195.667-35 chr12 112477366 112477768 + 1 NA intron (NM_001330437, intron 7 of 15) intron (NM_001330437, intron 7 of 15) 58620 NM_080601 5781 Hs.506852 NM_002834 ENSG00000179295 PTPN11 BPTP3|CFC|JMML|METCDS|NS1|PTP-1D|PTP2C|SH-PTP2|SH-PTP3|SHP2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11 protein-coding 169.333-288 chr9 90656426 90656685 + 1 NA Intergenic Intergenic -13731 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 129.667-31 chr11 55940318 55940464 + 1 NA Intergenic Intergenic -3991 NM_006637 10798 Hs.533706 NM_006637 ENSG00000167825 OR5I1 HSOlf1|OLF1 olfactory receptor family 5 subfamily I member 1 protein-coding 149.667-427 chr9 98029169 98029320 + 1 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -27488 NM_018946 54187 Hs.522310 NM_018946 ENSG00000095380 NANS HEL-S-100|SAS|SEMDCG|SEMDG N-acetylneuraminate synthase protein-coding 142.667-184 chr5 163293819 163294074 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -143625 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 112.667-196 chr4 97773190 97773349 + 1 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) intron (NM_174952, intron 9 of 10) 370207 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 207.333-254 chr7 70767999 70768235 + 1 NA intron (NM_015570, intron 10 of 18) intron (NM_015570, intron 10 of 18) -364027 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 125.667-183 chr8 28506288 28506566 + 1 NA intron (NM_017412, intron 3 of 7) MIRc|SINE|MIR -1245 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 329.333-43 chr5 20221121 20221563 + 1 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L1MA3|LINE|L1 -84209 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-149 chr17 44781096 44781401 + 1 NA 3' UTR (NM_002390, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_002390, exon 27 of 27) 22260 NM_002390 4185 Hs.6088 NM_002390 ENSG00000073670 ADAM11 MDC ADAM metallopeptidase domain 11 protein-coding 165.333-87 chr15 87336953 87337300 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -239803 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 133.667-53 chr14 87967218 87967460 + 1 NA intron (NM_000153, intron 8 of 16) L1ME4a|LINE|L1 25843 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 141.667-245 chr9 73806370 73806621 + 1 NA Intergenic Intergenic -565036 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 221.333-44 chr16 64850991 64851473 + 1 NA Intergenic Intergenic 270831 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 277.333-54 chr20 34733009 34733527 + 1 NA intron (NM_001242539, intron 9 of 11) L2a|LINE|L2 28549 NM_001329431 58476 Hs.516994 NM_021202 ENSG00000078804 TP53INP2 C20orf110|DOR|PIG-U|PIGU|PINH|dJ1181N3.1 tumor protein p53 inducible nuclear protein 2 protein-coding 184.667-123 chr7 85075878 85076164 + 1 NA intron (NM_152754, intron 3 of 16) intron (NM_152754, intron 3 of 16) 45910 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 169.333-166 chr3 98011807 98012122 + 1 NA intron (NM_001105580, intron 5 of 9) intron (NM_001105580, intron 5 of 9) 23340 NR_047685 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 143.333-81 chr14 49506692 49506907 + 1 NA Intergenic Intergenic 79581 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 243.333-24 chr13 27446419 27446694 + 1 NA intron (NM_152912, intron 1 of 4) intron (NM_152912, intron 1 of 4) 3633 NM_001166262 219402 Hs.534582 NM_152912 ENSG00000122033 MTIF3 IF3mt mitochondrial translational initiation factor 3 protein-coding 165.667-99 chr2 193931524 193931770 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -412622 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 166.667-211 chr6 165611906 165612130 + 1 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) intron (NM_006661, intron 1 of 22) 50082 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 166.667-47 chr12 23239114 23239345 + 1 NA Intergenic MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR 63593 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 277.333-38 chr18 1472154 1472709 + 1 NA Intergenic Intergenic -112802 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 144.333-285 chr9 31770378 31770523 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -388960 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 228.667-28 chr16 61747974 61748252 + 1 NA intron (NM_001796, intron 8 of 11) intron (NM_001796, intron 8 of 11) 288325 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 211.667-80 chr3 80102137 80102552 + 1 NA Intergenic Intergenic -334346 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 149.333-87 chr12 29959792 29959997 + 1 NA Intergenic Intergenic -175135 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 187.333-79 chr17 19620260 19620591 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -27725 NM_001369137 224 Hs.499886 NM_000382 ENSG00000072210 ALDH3A2 ALDH10|FALDH|SLS aldehyde dehydrogenase 3 family member A2 protein-coding 152.667-55 chr11 22200844 22201054 + 1 NA intron (NM_001142649, intron 1 of 21) MER2|DNA|TcMar-Tigger 7773 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 155.333-194 chr20 2117697 2117948 + 1 NA intron (NM_080836, intron 3 of 3) intron (NM_080836, intron 3 of 3) 15995 NM_080836 140901 Hs.100057 NM_080836 ENSG00000125834 STK35 CLIK1|STK35L1 serine/threonine kinase 35 protein-coding 227.667-8 chr10 56877424 56877842 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 426926 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 258.333-26 chr18 60426984 60427541 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -54487 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 120.333-109 chr2 184962983 184963269 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 203946 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 215.333-85 chr2 37293074 37293474 + 1 NA intron (NM_005813, intron 1 of 17) intron (NM_005813, intron 1 of 17) 23810 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 174.667-10 chr1 119974265 119974560 + 1 NA intron (NM_001200001, intron 5 of 21) intron (NM_001200001, intron 5 of 21) -77897 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 167.667-30 chr10 83543771 83543957 + 1 NA Intergenic Intergenic 133225 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 171.667-172 chr8 125059541 125059831 + 1 NA intron (NM_014846, intron 12 of 28) intron (NM_014846, intron 12 of 28) 32106 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 163.333-87 chr14 60732380 60732661 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2241 NM_002431 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 183.333-59 chr16 13867909 13868124 + 1 NA Intergenic Intergenic -52141 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 222.333-63 chr3 90146237 90146538 + 1 NA Intergenic Intergenic 1038766 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 148.667-76 chr11 79832949 79833137 + 1 NA Intergenic Intergenic -392013 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 150.667-34 chr10 30909127 30909320 + 1 NA intron (NR_026560, intron 2 of 6) intron (NR_026560, intron 2 of 6) 90294 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 214.333-51 chr15 35713232 35713639 + 1 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 167240 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 149.333-386 chr8 31962386 31962605 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -63241 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 200.333-79 chr2 181825503 181825869 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -66044 NM_001287503 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 437.334-4 chr8 84691923 84692848 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1M5|LINE|L1 -13542 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 116.333-144 chr3 88254476 88254681 + 1 NA Intergenic Intergenic -83878 NM_001368168 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 195.333-24 chr1 229849138 229849390 + 1 NA Intergenic Intergenic 36554 NR_146476 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 153.667-144 chr16 7353594 7353869 + 1 NA intron (NM_145893, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 20886 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 164.333-192 chr5 41675655 41675858 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -165155 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 165.667-18 chr10 61837471 61837657 + 1 NA Intergenic Intergenic -64135 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 218.333-45 chr16 19764010 19764325 + 1 NA intron (NM_001305122, intron 7 of 8) intron (NM_001305122, intron 7 of 8) -45940 NM_001348528 400506 Hs.585209 NM_001012991 ENSG00000103550 KNOP1 101F10.1|C16orf88|FAM191A|TSG118 lysine rich nucleolar protein 1 protein-coding 194.333-47 chr15 37892057 37892377 + 1 NA Intergenic Intergenic -42390 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 225.667-9 chr10 56305398 56305658 + 1 NA Intergenic Intergenic 55731 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 192.333-87 chr2 45578204 45578522 + 1 NA intron (NM_018079, intron 7 of 20) intron (NM_018079, intron 7 of 20) 32904 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 143.333-74 chr13 37764923 37765188 + 1 NA intron (NM_003306, intron 2 of 10) intron (NM_003306, intron 2 of 10) 105370 NM_001354799 7223 Hs.262960 NM_003306 ENSG00000133107 TRPC4 HTRP-4|HTRP4|TRP4 transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 protein-coding 157.667-243 chr5 55235234 55235538 + 1 NA Intergenic Intergenic -1669 NR_125347 10309 Hs.3041 NM_021147 ENSG00000152669 CCNO CCNU|CILD29|UDG2 cyclin O protein-coding 158.333-261 chr5 96998292 96998535 + 1 NA intron (NM_005575, intron 8 of 17) intron (NM_005575, intron 8 of 17) 39980 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 239.333-2 chr1 42211136 42211565 + 1 NA intron (NM_001198850, intron 5 of 12) L1PBb|LINE|L1 -46605 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 158.667-327 chr8 115014025 115014183 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 653909 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 142.333-207 chr5 150750252 150750432 + 1 NA intron (NM_001135643, intron 3 of 13) L1M5|LINE|L1 8178 NM_001135644 51164 Hs.675564 NM_016221 ENSG00000132912 DCTN4 DYN4|P62 dynactin subunit 4 protein-coding 176.667-134 chr7 50029524 50029803 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 5 of 7) L1MCb|LINE|L1 63583 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 147.333-69 chr11 83649942 83650171 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) intron (NM_001142699, intron 18 of 27) 32369 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 178.667-143 chr6 74657664 74657886 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 471007 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 235.667-38 chr21 28883857 28884281 + 1 NA intron (NM_013240, intron 1 of 5) intron (NM_013240, intron 1 of 5) 1298 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 156.667-10 chr1 63353537 63353754 + 1 NA Intergenic Intergenic -13982 NM_013339 29929 Hs.258501 NM_013339 ENSG00000088035 ALG6 CDG1C ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase protein-coding 148.333-122 chr14 58523328 58523527 + 1 NA intron (NM_001329945, intron 29 of 29) intron (NM_001329945, intron 29 of 29) 83746 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 155.333-187 chr2 187065147 187065444 + 1 NA Intergenic Intergenic -216125 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 150.333-385 chr7 82684341 82684618 + 1 NA Intergenic Intergenic -240523 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 193.333-156 chr5 147086628 147086913 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -5250 NM_001271900 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 162.667-78 chr14 41694419 41694681 + 1 NA intron (NM_001346173, intron 1 of 4) L1MA7|LINE|L1 87694 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 162.667-39 chr10 125024902 125025112 + 1 NA intron (NM_001290214, intron 3 of 10) intron (NM_001290214, intron 3 of 10) 3064 NM_022802 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 112.667-286 chrX 98575492 98575657 + 1 NA Intergenic Intergenic -1011039 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 129.333-193 chr8 136581484 136581640 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 50764 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 134.333-80 chr2 5163303 5163538 + 1 NA Intergenic Intergenic -507198 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 144.667-208 chr3 197161609 197161777 + 1 NA exon (NM_001098424, exon 6 of 26) exon (NM_001098424, exon 6 of 26) 22179 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 156.667-315 chr7 28234507 28234712 + 1 NA intron (NR_034097, intron 3 of 3) intron (NR_034097, intron 3 of 3) -53814 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 224.333-68 chr2 189563131 189563531 + 1 NA intron (NM_014585, intron 7 of 7) intron (NM_014585, intron 7 of 7) 17480 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 145.333-182 chr3 44291927 44292181 + 1 NA intron (NM_001145030, intron 12 of 19) intron (NM_001145030, intron 12 of 19) -46065 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 139.333-125 chr2 204098008 204098178 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 161345 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 141.667-250 chr9 95015448 95015703 + 1 NA intron (NM_032823, intron 11 of 14) intron (NM_032823, intron 11 of 14) -49775 NR_106729 102466518 NR_106729 ENSG00000274115 MIR6081 hsa-mir-6081 microRNA 6081 ncRNA 205.667-79 chr2 193128285 193128692 + 1 NA Intergenic Intergenic 378643 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 196.667-23 chr10 118882176 118882480 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -127358 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 242.333-28 chr14 23340874 23341164 + 1 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 11432 NM_020372 51310 Hs.373498 NM_016609 ENSG00000092096 SLC22A17 24p3R|BOCT|BOIT|NGALR|NGALR2|NGALR3|hBOIT solute carrier family 22 member 17 protein-coding 139.667-122 chr3 136598844 136599034 + 1 NA intron (NM_005862, intron 4 of 33) L1MEi|LINE|L1 153439 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 222.333-35 chr16 35131929 35132316 + 1 NA Intergenic Intergenic 38269 NR_002837 606551 Hs.646441 NR_002837 UBE2MP1 - ubiquitin conjugating enzyme E2 M pseudogene 1 pseudo 216.667-109 chr9 28052939 28053186 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L2b|LINE|L2 -479196 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 210.667-86 chr3 71689147 71689698 + 1 NA intron (NM_173359, intron 7 of 7) intron (NM_173359, intron 7 of 7) 35980 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 149.333-326 chr5 169330253 169330463 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -29219 NM_003062 6586 Hs.552087 NM_003062 ENSG00000184347 SLIT3 MEGF5|SLIL2|SLIT1|Slit-3|slit2 slit guidance ligand 3 protein-coding 251.667-86 chr7 55024720 55025181 + 1 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) 5918 NM_201283 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 197.667-153 chr8 140551023 140551266 + 1 NA intron (NM_001164623, intron 11 of 17) intron (NM_001164623, intron 11 of 17) 39148 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 113.333-38 chr10 114945851 114946039 + 1 NA intron (NM_139169, intron 2 of 7) intron (NM_139169, intron 2 of 7) 7750 NM_139169 142940 Hs.21187 NM_139169 ENSG00000165832 TRUB1 PUS4 TruB pseudouridine synthase family member 1 protein-coding 178.333-165 chr7 94397346 94397635 + 1 NA intron (NM_000089, intron 1 of 51) (ATTAATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2929 NM_000089 1278 Hs.489142 NM_000089 ENSG00000164692 COL1A2 EDSARTH2|EDSCV|OI4 collagen type I alpha 2 chain protein-coding 147.667-309 chr6 46938569 46938805 + 1 NA intron (NM_015234, intron 1 of 20) intron (NM_015234, intron 1 of 20) 16252 NM_015234 221395 Hs.362806 NM_015234 ENSG00000069122 ADGRF5 GPR116|KPG_001 adhesion G protein-coupled receptor F5 protein-coding 149.667-47 chr10 32464228 32464466 + 1 NA intron (NR_109827, intron 6 of 8) L2|LINE|L2 18207 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 290.667-46 chrX 147332472 147332780 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -47898 NR_030240 574518 NR_030240 ENSG00000207867 MIR514A3 MIR514-3|MIRN514-3|hsa-mir-514a-3 microRNA 514a-3 ncRNA 250.333-61 chr5 168393966 168394384 + 1 NA intron (NM_001161661, intron 3 of 22) HAL1|LINE|L1 -92296 NM_002887 5917 Hs.654907 NM_002887 ENSG00000113643 RARS ArgRS|DALRD1|HLD9 arginyl-tRNA synthetase protein-coding 132.667-154 chr6 145707315 145707484 + 1 NA intron (NM_001360064, intron 1 of 3) intron (NM_001360064, intron 1 of 3) -20522 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 142.667-215 chr8 15691985 15692137 + 1 NA intron (NM_001356429, intron 6 of 10) AluSz|SINE|Alu 151798 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 201.333-93 chr14 33636154 33636473 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -72624 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 112.333-231 chr6 67571934 67572061 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -483354 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 136.333-71 chr15 101180457 101180644 + 1 NA intron (NM_014918, intron 2 of 2) intron (NM_014918, intron 2 of 2) 71498 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 146.667-88 chr13 58702119 58702268 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -469076 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 242.667-37 chr15 89126713 89127064 + 1 NA intron (NM_007011, intron 7 of 14) intron (NM_007011, intron 7 of 14) 38432 NM_007011 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 244.667-12 chr10 28033267 28033784 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -34446 NM_018076 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 251.667-4 chr1 78307699 78308046 + 1 NA intron (NR_027310, intron 3 of 5) intron (NR_027310, intron 3 of 5) 78273 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 191.667-138 chrX 95781127 95781397 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 556640 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 153.333-288 chr4 31090399 31090681 + 1 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -80604 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 114.667-204 chr5 40527883 40528032 + 1 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -151958 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 169.667-186 chr6 100510092 100510271 + 1 NA intron (NM_006828, intron 40 of 41) intron (NM_006828, intron 40 of 41) -46506 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 166.667-235 chr8 121059008 121059196 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -247056 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 143.667-180 chr4 63151093 63151295 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -989429 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 214.333-76 chr2 71775140 71775471 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 308606 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 167.333-19 chr1 158880095 158880279 + 1 NA Intergenic Intergenic 48836 NM_002432 4332 Hs.153837 NM_002432 ENSG00000163563 MNDA PYHIN3 myeloid cell nuclear differentiation antigen protein-coding 227.333-130 chr8 124148798 124149181 + 1 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) intron (NR_103547, intron 1 of 4) 22533 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 116.667-102 chr2 116354367 116354514 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 1010625 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 164.333-135 chr2 218292604 218292813 + 1 NA promoter-TSS (NM_001321433) promoter-TSS (NM_001321433) -131 NM_001321433 64114 Hs.591605 NM_022152 ENSG00000135926 TMBIM1 LFG3|MST100|MSTP100|PP1201|RECS1 transmembrane BAX inhibitor motif containing 1 protein-coding 255.667-8 chr10 88388877 88389187 + 1 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 194286 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 148.333-341 chr6 63049342 63049542 + 1 NA Intergenic Intergenic 270535 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 262.667-50 chr21 36438885 36439238 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 27406 NM_012130 23562 Hs.660278 NM_012130 ENSG00000159261 CLDN14 DFNB29 claudin 14 protein-coding 353.333-28 chr5 123653861 123654268 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 108647 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 167.667-80 chr17 17392293 17392583 + 1 NA Intergenic LTR12_|LTR|ERV1 -84562 NM_018019 55090 Hs.244595 NM_018019 ENSG00000141026 MED9 MED25 mediator complex subunit 9 protein-coding 133.333-203 chrX 22037264 22037408 + 1 NA intron (NM_001282754, intron 1 of 20) intron (NM_001282754, intron 1 of 20) 5011 NM_001282754 5251 Hs.495834 NM_000444 ENSG00000102174 PHEX HPDR|HPDR1|HYP|HYP1|LXHR|PEX|XLH phosphate regulating endopeptidase homolog X-linked protein-coding 246.333-53 chr2 196890414 196890720 + 1 NA intron (NM_001321099, intron 11 of 27) intron (NM_001321099, intron 11 of 27) 36140 NM_024989 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 157.333-212 chr20 11705552 11705832 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 165023 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 157.667-237 chr5 30277747 30277948 + 1 NA Intergenic Intergenic 397287 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 151.333-134 chr14 81069307 81069552 + 1 NA intron (NM_001142626, intron 3 of 8) L1MEg|LINE|L1 113808 NM_000369 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 145.667-155 chr20 16316347 16316570 + 1 NA intron (NM_024704, intron 24 of 25) intron (NM_024704, intron 24 of 25) 256990 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 215.333-23 chr10 51813961 51814309 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) intron (NM_001098512, intron 4 of 17) -114540 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 151.333-29 chr1 190028318 190028547 + 1 NA Intergenic Intergenic 447578 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 363.333-21 chr3 178416125 178416586 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -2846 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 160.333-57 chr11 22861801 22862008 + 1 NA Intergenic Intergenic -1430 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 132.667-22 chr10 60542579 60542725 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 30304 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 185.667-131 chr8 120583956 120584225 + 1 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) AluSz6|SINE|Alu 138671 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 117.333-30 chr10 116202610 116202767 + 1 NA intron (NM_145793, intron 3 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -7899 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 220.333-12 chr10 25011344 25011601 + 1 NA intron (NM_145010, intron 1 of 5) L1PA3|LINE|L1 4686 NM_145010 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 159.667-42 chr10 50909971 50910332 + 1 NA Intergenic Intergenic -24476 NM_001198819 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 148.667-42 chr10 50905447 50905719 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -19908 NM_001198819 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 249.333-102 chr8 119020854 119021255 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) -46193 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 203.667-10 chr1 220017869 220018177 + 1 NA intron (NM_004446, intron 12 of 31) intron (NM_004446, intron 12 of 31) 28482 NM_004446 2058 Hs.497788 NM_004446 ENSG00000136628 EPRS EARS|GLUPRORS|HLD15|PARS|PIG32|QARS|QPRS glutamyl-prolyl-tRNA synthetase protein-coding 313.667-10 chr10 121311423 121311870 + 1 NA Intergenic Intergenic 219668 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 121.333-56 chr14 80911426 80911620 + 1 NA intron (NM_152446, intron 4 of 24) AluJo|SINE|Alu 30215 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 149.333-430 chr9 35432424 35432625 + 1 NA intron (NR_003582, intron 2 of 10) intron (NR_003582, intron 2 of 10) 25769 NR_003582 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 154.333-293 chr6 51391324 51391603 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -230407 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 131.667-197 chr8 106156518 106156730 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -96121 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 192.667-24 chr10 26992520 26992820 + 1 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 -50669 NR_026795 387644 Hs.529965 NR_026795 ENSG00000283709 FAM238C C10orf51|LINC00202|LINC00202-1|NCRNA00202|bB27G4.1 family with sequence similarity 238 member C ncRNA 216.667-19 chr11 23090490 23090974 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -230258 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 252.333-79 chr9 37607741 37608186 + 1 NA intron (NM_001371225, intron 1 of 15) X6B_LINE|LINE|CR1 4734 NM_001371225 263.667-36 chr17 70967170 70967636 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 234776 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 160.333-177 chr3 1056999 1057230 + 1 NA Intergenic Intergenic -35910 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 146.667-141 chr18 3885029 3885177 + 1 NA promoter-TSS (NR_106776) promoter-TSS (NR_106776) -250 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 160.333-161 chr2 226545709 226545883 + 1 NA Intergenic Intergenic 112997 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 161.333-144 chr2 60329180 60329432 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 53730 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 192.333-42 chr12 26466254 26466591 + 1 NA intron (NM_002223, intron 45 of 56) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 270849 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 147.333-327 chr8 138222414 138222659 + 1 NA intron (NM_015912, intron 7 of 19) MIR|SINE|MIR -138991 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 218.333-122 chr8 112767365 112767751 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) MIR|SINE|MIR 124065 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 151.333-170 chr17 30989835 30990043 + 1 NA intron (NM_032322, intron 3 of 4) AluSq2|SINE|Alu 14604 NR_002221 503645 Hs.683578 NR_002221 ENSG00000264743 DPRXP4 - divergent-paired related homeobox pseudogene 4 pseudo 121.667-82 chr18 33580606 33580821 + 1 NA intron (NM_030632, intron 1 of 11) intron (NM_030632, intron 1 of 11) 2494 NM_030632 80816 Hs.464876 NM_030632 ENSG00000141431 ASXL3 BRPS|KIAA1713 ASXL transcriptional regulator 3 protein-coding 176.667-11 chr1 161111974 161112256 + 1 NA intron (NM_012394, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 5922 NM_012394 5202 Hs.492516 NM_012394 ENSG00000143256 PFDN2 PFD2 prefoldin subunit 2 protein-coding 150.667-90 chr12 65327979 65328161 + 1 NA intron (NM_001031679, intron 3 of 6) intron (NM_001031679, intron 3 of 6) 49083 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 256.333-40 chr2 41506189 41506602 + 1 NA Intergenic Intergenic -371160 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 201.333-231 chr5 147604491 147604804 + 1 NA intron (NM_001282282, intron 19 of 20) intron (NM_001282282, intron 19 of 20) 44653 NR_038902 153469 Hs.184323 NR_038902 ENSG00000280780 JAKMIP2-AS1 - JAKMIP2 antisense RNA 1 ncRNA 161.333-270 chr7 110956533 110956743 + 1 NA intron (NM_032549, intron 4 of 5) MER94|DNA|hAT-Blackjack -134368 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 211.667-9 chr1 118418448 118418890 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -233441 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 163.333-233 chr5 167630188 167630439 + 1 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 56654 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 130.667-96 chr18 12517884 12518121 + 1 NA intron (NM_020148, intron 4 of 15) intron (NM_020148, intron 4 of 15) 85228 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 156.333-20 chr1 163613690 163613942 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -190625 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 221.333-102 chr4 70186967 70187431 + 1 NA Intergenic Intergenic -9328 NM_017855 54959 Hs.143811 NM_017855 ENSG00000109205 ODAM APIN odontogenic, ameloblast associated protein-coding 160.667-149 chr2 88870119 88870388 + 1 NA Intergenic Intergenic 57883 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 127.667-146 chr5 131720158 131720370 + 1 NA intron (NM_001346114, intron 2 of 16) L1MB1|LINE|L1 76753 NM_001008738 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 173.667-48 chr14 72307950 72308197 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -208747 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 167.333-158 chr20 63303264 63303536 + 1 NA intron (NM_020882, intron 3 of 35) intron (NM_020882, intron 3 of 35) 10214 NM_020882 57642 Hs.271285 NM_020882 ENSG00000101203 COL20A1 - collagen type XX alpha 1 chain protein-coding 193.333-180 chr7 138514712 138514997 + 1 NA intron (NM_003852, intron 2 of 18) MIRb|SINE|MIR 54595 NM_015905 8805 Hs.490287 NM_003852 ENSG00000122779 TRIM24 PTC6|RNF82|TF1A|TIF1|TIF1A|TIF1ALPHA|hTIF1 tripartite motif containing 24 protein-coding 115.667-119 chr2 122401081 122401271 + 1 NA Intergenic Intergenic 645525 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 196.667-48 chr14 87384948 87385252 + 1 NA Intergenic Intergenic 270194 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 148.333-330 chr5 136689967 136690247 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -324631 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 198.333-168 chr5 94583057 94583343 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 1 of 20) L1PA6|LINE|L1 35404 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 135.333-150 chr5 132245203 132245360 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -12377 NM_001131027 8572 Hs.424312 NM_003687 ENSG00000131435 PDLIM4 RIL PDZ and LIM domain 4 protein-coding 166.667-27 chr10 79433708 79433964 + 1 NA intron (NM_153367, intron 1 of 3) intron (NM_153367, intron 1 of 3) 11788 NM_153367 219654 Hs.523080 NM_153367 ENSG00000165424 ZCCHC24 C10orf56|Z3CXXC8 zinc finger CCHC-type containing 24 protein-coding 212.333-39 chr13 94412233 94412675 + 1 NA Intergenic Intergenic 67228 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 158.333-47 chr10 132952810 132953033 + 1 NA intron (NR_120627, intron 1 of 1) intron (NR_120627, intron 1 of 1) -5625 NR_120626 101927590 Hs.448598 NR_120626 ENSG00000232903 LINC01166 - long intergenic non-protein coding RNA 1166 ncRNA 145.333-241 chr5 107334423 107334624 + 1 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -323509 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 155.667-249 chr4 74133704 74134032 + 1 NA intron (NM_001351311, intron 2 of 7) L1MA4|LINE|L1 10595 NM_001351311 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 143.333-229 chr5 103838662 103838860 + 1 NA Intergenic Intergenic -275972 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 179.333-153 chr5 87386771 87387015 + 1 NA exon (NM_002890, exon 23 of 25) exon (NM_002890, exon 23 of 25) 26011 NM_001199189 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 144.667-211 chr4 30371407 30371665 + 1 NA Intergenic Intergenic -348833 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 163.667-179 chr4 73823228 73823460 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -13334 NM_002993 6372 Hs.164021 NM_002993 ENSG00000124875 CXCL6 CKA-3|GCP-2|GCP2|SCYB6 C-X-C motif chemokine ligand 6 protein-coding 171.667-68 chr18 13087287 13087541 + 1 NA intron (NM_032142, intron 31 of 44) intron (NM_032142, intron 31 of 44) 96052 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 111.667-249 chr7 124262858 124263074 + 1 NA Intergenic Intergenic 89130 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 184.333-91 chr20 54300130 54300364 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 92160 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 166.333-240 chr9 84494921 84495094 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -126280 NM_022127 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 157.667-244 chr5 58127676 58127968 + 1 NA Intergenic Intergenic -5481 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 160.333-255 chr6 145614124 145614318 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 72656 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 200.333-161 chr8 134533313 134533571 + 1 NA intron (NM_020863, intron 11 of 15) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -64629 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 156.667-37 chr10 18001586 18001875 + 1 NA TTS (NR_038419) TTS (NR_038419) 8832 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 382.667-5 chr10 119677391 119677970 + 1 NA 3' UTR (NM_004281, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_004281, exon 4 of 4) 26310 NM_004281 9531 Hs.523309 NM_004281 ENSG00000151929 BAG3 BAG-3|BIS|CAIR-1|MFM6 BCL2 associated athanogene 3 protein-coding 274.667-29 chr2 124523540 124523897 + 1 NA intron (NM_130773, intron 8 of 23) MIRb|SINE|MIR 498431 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 151.667-56 chr10 126170951 126171113 + 1 NA intron (NM_001288974, intron 3 of 18) intron (NM_001288974, intron 3 of 18) -197759 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-185 chr2 85862150 85862303 + 1 NA intron (NM_001354233, intron 2 of 7) intron (NM_001354233, intron 2 of 7) 5444 NM_001042437 8869 Hs.415117 NM_003896 ENSG00000115525 ST3GAL5 SATI|SIAT9|SIATGM3S|SPDRS|ST3Gal V|ST3GalV ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5 protein-coding 154.333-6 chr1 78834013 78834303 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 172572 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 180.667-48 chr16 8512031 8512389 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 77628 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 165.667-10 chr1 207864704 207864942 + 1 NA Intergenic Intergenic -42120 NR_135298 100128537 Hs.445414 NR_135298 MIR29B2CHG C1orf132 MIR29B2 and MIR29C host gene ncRNA 178.333-3 chr1 49131198 49131428 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) L1ME1|LINE|L1 -126098 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 153.667-208 chr2 201031245 201031440 + 1 NA intron (NM_001321624, intron 1 of 11) intron (NM_001321624, intron 1 of 11) 40329 NM_001321618 285172 Hs.24701 NM_173822 ENSG00000155744 FAM126B HYCC2 family with sequence similarity 126 member B protein-coding 276.667-36 chr2 27491647 27492166 + 1 NA TTS (NM_022823) TTS (NM_022823) -2163 NM_015662 26160 Hs.127401 NM_015662 ENSG00000138002 IFT172 BBS20|NPHP17|RP71|SLB|SRTD10|osm-1|wim intraflagellar transport 172 protein-coding 147.667-342 chr7 94590601 94590751 + 1 NA intron (NM_001346717, intron 8 of 9) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 65457 NM_001362808 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 236.667-32 chr15 86581435 86581843 + 1 NA intron (NM_152336, intron 22 of 24) intron (NM_152336, intron 22 of 24) -264671 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 173.333-36 chr11 106762318 106762491 + 1 NA intron (NM_001256424, intron 6 of 8) intron (NM_001256424, intron 6 of 8) 256072 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 154.333-355 chr8 126290328 126290572 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -35045 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 146.333-227 chr4 20529878 20530060 + 1 NA intron (NM_001289135, intron 15 of 35) L2c|LINE|L2 1694 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 137.667-81 chr18 9348334 9348547 + 1 NA intron (NM_020648, intron 2 of 4) intron (NM_020648, intron 2 of 4) 13667 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 234.333-7 chr1 200808130 200808559 + 1 NA intron (NM_001297707, intron 3 of 17) intron (NM_001297707, intron 3 of 17) -64637 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 149.667-310 chr5 36772303 36772563 + 1 NA Intergenic Intergenic 104261 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 356.333-21 chr20 54196356 54196859 + 1 NA Intergenic Intergenic -11480 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 144.667-103 chr16 2351554 2351793 + 1 NA intron (NR_003574, intron 1 of 16) FLAM_A|SINE|Alu 10751 NR_003574 650655 Hs.376281 NR_003574 ENSG00000238098 ABCA17P ABCA17 ATP binding cassette subfamily A member 17, pseudogene pseudo 167.333-14 chr1 98405104 98405428 + 1 NA Intergenic Intergenic 194555 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 135.667-169 chr7 28079787 28080029 + 1 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -100549 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-133 chr4 142501521 142501757 + 1 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) L1MEj|LINE|L1 344896 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 341.333-7 chr12 87588851 87589314 + 1 NA Intergenic Intergenic -179730 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 204.333-44 chr12 14811181 14811489 + 1 NA intron (NM_001013698, intron 1 of 1) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 2847 NM_001013698 440087 Hs.220931 NM_001013698 ENSG00000179256 SMCO3 C12orf69 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 3 protein-coding 164.667-134 chr22 26434062 26434267 + 1 NA exon (NM_020437, exon 2 of 4) exon (NM_020437, exon 2 of 4) 4904 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 145.333-251 chr6 25532941 25533130 + 1 NA intron (NM_001173977, intron 24 of 36) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -119180 NM_006998 10590 Hs.116428 NM_006998 ENSG00000079689 SCGN CALBL|DJ501N12.8|SECRET|SEGN|setagin secretagogin, EF-hand calcium binding protein protein-coding 310.667-20 chr2 104101953 104102443 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 306134 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 151.667-50 chr10 68500023 68500204 + 1 NA intron (NM_001324314, intron 5 of 9) intron (NM_001324314, intron 5 of 9) 18105 NR_136737 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 148.667-403 chr9 131168393 131168584 + 1 NA intron (NM_001318324, intron 21 of 35) L1ME1|LINE|L1 -21651 NM_001318325 8021 Hs.654530 NM_005085 ENSG00000126883 NUP214 CAIN|CAN nucleoporin 214 protein-coding 183.333-67 chr17 63356572 63356829 + 1 NA intron (NM_025185, intron 13 of 25) MIRb|SINE|MIR 83567 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 141.333-191 chr5 61444975 61445166 + 1 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) LOR1-int|LTR|ERV1 112812 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 157.333-342 chr8 112232871 112233053 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 64 of 66) intron (NM_001363185, intron 64 of 66) -410531 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 191.667-70 chr2 134839243 134839707 + 1 NA intron (NM_138326, intron 1 of 9) intron (NM_138326, intron 1 of 9) 859 NM_138326 130013 Hs.655728 NM_138326 ENSG00000153086 ACMSD - aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase protein-coding 158.333-221 chr3 189505856 189506089 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -90774 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 156.333-21 chr1 180448622 180448881 + 1 NA intron (NM_032360, intron 3 of 7) L1M8|LINE|L1 -10361 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 132.667-155 chr7 3384800 3385025 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 83660 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 228.667-65 chr6 7423334 7423689 + 1 NA Intergenic Intergenic 33682 NM_001348194 83732 Hs.437474 NM_031480 ENSG00000124784 RIOK1 AD034|RIO1|RRP10|bA288G3.1 RIO kinase 1 protein-coding 193.333-49 chr13 100530277 100530606 + 1 NA TTS (NM_001352607) TTS (NM_001352607) 3361 NM_033110 87769 Hs.350868 NM_033110 ENSG00000134864 GGACT A2LD1 gamma-glutamylamine cyclotransferase protein-coding 156.667-120 chr15 69734110 69734392 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -100983 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 236.333-39 chr17 76516705 76517204 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -10632 NR_033357 768206 Hs.634380 NM_001077620 ENSG00000214140 PRCD RP36 photoreceptor disc component protein-coding 237.333-33 chr15 46777836 46778111 + 1 NA Intergenic Intergenic -406116 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 128.667-38 chr11 111788293 111788480 + 1 NA intron (NM_001077690, intron 14 of 14) intron (NM_001077690, intron 14 of 14) -21997 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 301.333-39 chr4 149605122 149605448 + 1 NA intron (NM_001363507, intron 8 of 13) intron (NM_001363507, intron 8 of 13) 210558 NM_001363509 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 336.333-31 chr6 65463740 65464237 + 1 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) intron (NM_198283, intron 4 of 9) 115816 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 211.333-177 chr5 12913999 12914240 + 1 NA non-coding (NR_147005, exon 3 of 5) non-coding (NR_147005, exon 3 of 5) 118767 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 152.333-139 chr16 80151317 80151589 + 1 NA Intergenic Intergenic 356204 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 168.333-3 chr1 44905334 44905557 + 1 NA intron (NM_001166588, intron 5 of 9) MLT2F|LTR|ERVL -62192 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 141.333-83 chr17 70797722 70798016 + 1 NA Intergenic Intergenic 404310 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 156.333-45 chr10 82459443 82459715 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -226659 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 197.667-142 chr7 102385633 102385930 + 1 NA intron (NR_038967, intron 4 of 8) L1MEg|LINE|L1 -10582 NM_024653 79706 Hs.722104 NM_024653 ENSG00000128563 PRKRIP1 C114|KRBOX3 PRKR interacting protein 1 protein-coding 216.333-61 chr17 67720797 67721217 + 1 NA intron (NM_001303272, intron 3 of 16) intron (NM_001303272, intron 3 of 16) 3071 NM_015462 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 187.667-132 chr6 159820644 159820849 + 1 NA TTS (NM_001271862) TTS (NM_001271862) 20470 NM_001271862 154197 Hs.349077 NM_173516 ENSG00000146453 PNLDC1 HsPNLDC1 PARN like, ribonuclease domain containing 1 protein-coding 153.667-84 chr12 16458728 16458992 + 1 NA Intergenic Intergenic 105443 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 140.667-162 chr4 61281797 61282028 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 79740 NM_001371342 181.333-169 chr8 65489134 65489353 + 1 NA Intergenic Intergenic 73423 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 163.333-196 chr4 45926037 45926221 + 1 NA Intergenic Intergenic 197925 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 161.667-278 chrX 99564907 99565163 + 1 NA Intergenic Intergenic 845238 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 160.333-116 chr15 75942766 75942970 + 1 NA TTS (NR_037623) TTS (NR_037623) 38990 NM_147188 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 155.333-66 chr12 1226308 1226495 + 1 NA intron (NR_027948, intron 12 of 19) L1MA9|LINE|L1 198653 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 173.667-25 chr10 101683697 101684007 + 1 NA intron (NM_001323541, intron 1 of 8) intron (NM_001323541, intron 1 of 8) 11318 NM_022039 6468 Hs.500822 NM_022039 ENSG00000107829 FBXW4 DAC|FBW4|FBWD4|SHFM3|SHSF3 F-box and WD repeat domain containing 4 protein-coding 151.333-30 chr1 192640075 192640323 + 1 NA intron (NM_002927, intron 3 of 6) intron (NM_002927, intron 3 of 6) 4052 NM_002927 6003 Hs.497220 NM_002927 ENSG00000127074 RGS13 - regulator of G protein signaling 13 protein-coding 127.333-102 chr22 47833352 47833585 + 1 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) L2a|LINE|L2 201794 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 156.667-169 chr2 24794234 24794396 + 1 NA promoter-TSS (NM_001013663) promoter-TSS (NM_001013663) 890 NR_136183 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 239.333-80 chr4 180182592 180182895 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 976406 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 160.333-187 chr3 81390108 81390386 + 1 NA Intergenic Intergenic 371398 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 147.667-29 chr1 227862094 227862329 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 46494 NM_183062 339501 Hs.97604 NM_183062 ENSG00000185888 PRSS38 MPN2 serine protease 38 protein-coding 126.333-173 chr8 16599140 16599375 + 1 NA Intergenic Intergenic 403088 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 189.333-188 chr7 29399098 29399430 + 1 NA intron (NM_001293072, intron 5 of 12) intron (NM_001293072, intron 5 of 12) -80448 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 126.667-72 chr19 41362556 41362727 + 1 NA intron (NM_030578, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR -1306 NM_001369864 641649 Hs.709417 NM_001042595 ENSG00000142046 TMEM91 DSPC3|IFITMD6 transmembrane protein 91 protein-coding 150.333-268 chr3 100547533 100547683 + 1 NA intron (NM_001363876, intron 2 of 6) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 54989 NM_018004 55076 Hs.658956 NM_018004 ENSG00000181458 TMEM45A DERP7|DNAPTP4 transmembrane protein 45A protein-coding 154.333-306 chr6 131485596 131485784 + 1 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 -87536 NR_160934 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 155.667-46 chr10 115705377 115705559 + 1 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) intron (NM_207303, intron 26 of 28) 489321 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 173.667-83 chr2 112322581 112322804 + 1 NA exon (NM_198581, exon 9 of 12) exon (NM_198581, exon 9 of 12) 47095 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 175.333-87 chr2 59151970 59152246 + 1 NA Intergenic Intergenic -65600 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 244.333-104 chr8 117743646 117744122 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 177029 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 203.333-165 chr22 39188159 39188420 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -35609 NM_175709 23492 Hs.356416 NM_175709 ENSG00000100307 CBX7 - chromobox 7 protein-coding 258.667-40 chr18 53860324 53860631 + 1 NA Intergenic Intergenic -279418 NR_110800 101928167 Hs.382012 NR_110800 ENSG00000260433 LINC01917 - long intergenic non-protein coding RNA 1917 ncRNA 180.333-105 chr6 27729838 27730041 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -31805 NR_038929 100131289 Hs.200573 NR_038929 LOC100131289 - uncharacterized LOC100131289 ncRNA 213.333-62 chr14 84854534 84854925 + 1 NA Intergenic Intergenic -417203 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 275.333-6 chr10 33295499 33296008 + 1 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 38914 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 250.667-9 chr10 83232122 83232463 + 1 NA Intergenic Intergenic 444797 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 163.333-157 chr2 167612691 167612989 + 1 NA Intergenic Intergenic -205832 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 322.667-14 chr2 96475936 96476565 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 29107 NM_001285486 93082 Hs.149219 NM_001080535 ENSG00000163121 NEURL3 LINCR|RNF132 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 177.333-143 chr6 80974381 80974600 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 778191 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 150.667-337 chr6 102744099 102744395 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 1345262 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 155.667-23 chr1 171778786 171778979 + 1 NA Intergenic Intergenic -2778 NM_001007239 51603 Hs.494705 NM_014955 ENSG00000010165 EEF1AKNMT 5630401D24Rik|CGI-01|DFNB26|DFNB26M|KIAA0859|METTL13|feat eEF1A lysine and N-terminal methyltransferase protein-coding 138.667-86 chr18 6690555 6690702 + 1 NA Intergenic Intergenic -39088 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 169.333-26 chr10 57786812 57787058 + 1 NA Intergenic LTR60B|LTR|ERV1 480959 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 151.333-4 chr1 38423591 38423767 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -51517 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 175.333-131 chr4 42824791 42825099 + 1 NA Intergenic Intergenic -68321 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 191.667-129 chr8 131003246 131003589 + 1 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) intron (NM_001115, intron 1 of 17) 37492 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 150.667-25 chr1 246314171 246314425 + 1 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 103114 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 154.667-261 chr3 171124227 171124430 + 1 NA intron (NM_001161563, intron 16 of 31) intron (NM_001161563, intron 16 of 31) -17569 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 294.333-42 chr6 166933212 166933550 + 1 NA intron (NM_003730, intron 7 of 8) AluJr|SINE|Alu 23169 NM_003730 8635 Hs.529989 NM_003730 ENSG00000026297 RNASET2 RNASE6PL|bA514O12.3 ribonuclease T2 protein-coding 154.333-312 chr7 8839509 8839763 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 406027 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 202.333-34 chr11 60968517 60968864 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -2990 NM_001254750 923 Hs.744366 NM_006725 ENSG00000013725 CD6 TP120 CD6 molecule protein-coding 205.333-258 chr8 141124186 141124599 + 1 NA Intergenic Intergenic -4197 NM_001352891 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 169.333-179 chr4 59833053 59833398 + 1 NA Intergenic HY3|scRNA|scRNA 819652 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 164.667-31 chr10 125298327 125298500 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -137383 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 171.667-49 chr14 55369471 55369719 + 1 NA 3' UTR (NM_014924, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_014924, exon 10 of 10) 42263 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 205.333-187 chr5 80780111 80780428 + 1 NA intron (NM_002439, intron 17 of 23) MER63A|DNA|hAT-Blackjack -125286 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 144.333-9 chr1 51850873 51851093 + 1 NA intron (NM_001101662, intron 1 of 30) LTR39-int|LTR|ERV1 -14581 NR_031580 100313892 NR_031580 ENSG00000283899 MIR761 hsa-mir-761 microRNA 761 ncRNA 257.667-9 chr10 73974468 73974780 + 1 NA Intergenic Intergenic -23490 NM_014000 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 219.667-68 chr4 106322517 106322802 + 1 NA intron (NM_001142416, intron 1 of 6) intron (NM_001142416, intron 1 of 6) -5865 NM_001163436 93627 Hs.151498 NM_033115 ENSG00000145348 TBCK HSPC302|IHPRF3|TBCKL TBC1 domain containing kinase protein-coding 132.333-181 chr8 102832036 102832181 + 1 NA intron (NM_015878, intron 10 of 12) L1MC4|LINE|L1 25286 NR_149020 401472 NR_149020 GASAL1 GASL1 growth arrest associated lncRNA 1 ncRNA 156.333-223 chr22 41750746 41750962 + 1 NA intron (NM_152513, intron 15 of 30) intron (NM_152513, intron 15 of 30) -49768 NM_001304797 79879 Hs.474991 NM_024821 ENSG00000100147 CCDC134 - coiled-coil domain containing 134 protein-coding 211.667-29 chr12 1517320 1517642 + 1 NA Intergenic Intergenic 14711 NR_160736 107984507 NR_160736 LOC107984507 - uncharacterized LOC107984507 ncRNA 212.667-118 chr6 5328794 5329121 + 1 NA intron (NM_006567, intron 1 of 6) intron (NM_006567, intron 1 of 6) 67444 NM_006567 10667 Hs.484547 NM_006567 ENSG00000145982 FARS2 COXPD14|FARS1|HSPC320|PheRS|SPG77|mtPheRS phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 161.667-75 chr14 55962086 55962386 + 1 NA Intergenic Intergenic -156175 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 146.667-310 chr7 65912250 65912438 + 1 NA intron (NM_001284342, intron 1 of 1) intron (NM_001284342, intron 1 of 1) 39270 NM_001284342 154807 Hs.427232 NM_173517 ENSG00000196715 VKORC1L1 - vitamin K epoxide reductase complex subunit 1 like 1 protein-coding 169.333-35 chr11 18675226 18675404 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -23464 NM_153347 144110 Hs.502100 NM_153347 ENSG00000151117 TMEM86A - transmembrane protein 86A protein-coding 162.667-8 chr1 107365154 107365448 + 1 NA intron (NM_001113226, intron 2 of 6) intron (NM_001113226, intron 2 of 6) 217232 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 158.667-328 chr8 117949718 117949919 + 1 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR -28905 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 158.667-305 chr7 77596833 77597107 + 1 NA intron (NM_001131009, intron 5 of 16) L1MC1|LINE|L1 58927 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 156.333-312 chr6 68200474 68200637 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 129344 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 148.333-41 chr10 22802909 22803239 + 1 NA Intergenic Intergenic -88496 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 197.333-66 chr14 59567264 59567550 + 1 NA intron (NM_001164399, intron 4 of 19) intron (NM_001164399, intron 4 of 19) 9405 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 141.667-23 chr10 33520370 33520608 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -185584 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 179.667-69 chr18 13440302 13440502 + 1 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -12868 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 184.333-15 chr10 82542458 82542667 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L1MC4|LINE|L1 -309642 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 209.333-111 chr2 64955479 64955780 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -23182 NR_036586 400958 Hs.591565 NR_036586 LINC02245 - long intergenic non-protein coding RNA 2245 ncRNA 155.667-120 chr15 92621079 92621238 + 1 NA intron (NM_207446, intron 2 of 2) L1MC4|LINE|L1 34617 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 177.667-77 chr2 151171181 151171473 + 1 NA Intergenic Intergenic 90536 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 158.333-181 chr22 19295127 19295354 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -3521 NM_007098 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 152.667-274 chr4 60132430 60132688 + 1 NA Intergenic Intergenic -790060 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 308.667-15 chr15 90915124 90915659 + 1 NA intron (NR_135502, intron 19 of 22) intron (NR_135502, intron 19 of 22) 11201 NR_135504 4122 Hs.116459 NM_006122 ENSG00000196547 MAN2A2 MANA2X mannosidase alpha class 2A member 2 protein-coding 238.333-11 chr11 14466029 14466401 + 1 NA intron (NM_016451, intron 17 of 21) intron (NM_016451, intron 17 of 21) 33643 NM_016451 1315 Hs.339278 NM_016451 ENSG00000129083 COPB1 COPB coatomer protein complex subunit beta 1 protein-coding 208.333-88 chr20 59256602 59256964 + 1 NA 3' UTR (NM_178457, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_178457, exon 5 of 5) -43828 NM_001302455 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 148.667-291 chr4 107180860 107181044 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -144639 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 113.667-149 chr3 181828958 181829142 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 117125 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 252.333 chr1 95376450 95376774 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -24505 NR_146486 101928169 NR_146486 LINC01650 - long intergenic non-protein coding RNA 1650 ncRNA 147.667-255 chr4 52914475 52914685 + 1 NA intron (NM_152540, intron 6 of 8) LTR87|LTR|ERVL? 52263 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 151.667-227 chr3 107272306 107272531 + 1 NA intron (NR_028302, intron 1 of 3) intron (NR_028302, intron 1 of 3) 31726 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 160.333-30 chr1 217461217 217461421 + 1 NA intron (NM_018040, intron 8 of 9) L2c|LINE|L2 169771 NM_001297754 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 149.333-7 chr1 45470890 45471048 + 1 NA intron (NM_007170, intron 1 of 10) AluSx4|SINE|Alu 20194 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 146.333-277 chr5 163632982 163633146 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 127445 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 169.333-113 chr2 29313652 29313925 + 1 NA intron (NM_004304, intron 8 of 28) intron (NM_004304, intron 8 of 28) -89888 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 139.667-48 chr13 63065164 63065440 + 1 NA Intergenic Intergenic -257943 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 149.333-307 chr5 68537228 68537463 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 244768 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 150.667-157 chr18 8998959 8999120 + 1 NA Intergenic Intergenic -103660 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 156.333-24 chr1 196534819 196534981 + 1 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) 47581 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 155.333-46 chr10 125118728 125119036 + 1 NA intron (NM_001083914, intron 1 of 10) intron (NM_001083914, intron 1 of 10) 39895 NM_001321013 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 166.667-11 chr1 97873660 97873855 + 1 NA intron (NM_000110, intron 2 of 22) L2a|LINE|L2 47302 NM_000110 1806 Hs.335034 NM_000110 ENSG00000188641 DPYD DHP|DHPDHASE|DPD dihydropyrimidine dehydrogenase protein-coding 201.333-244 chr6 104051286 104051575 + 1 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 808116 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 123.667-9 chr1 74209370 74209493 + 1 NA TTS (NM_001199328) TTS (NM_001199328) 11219 NM_001199328 8790 Hs.480085 NM_003838 ENSG00000254685 FPGT GFPP fucose-1-phosphate guanylyltransferase protein-coding 213.667-17 chr10 115240913 115241316 + 1 NA intron (NM_207303, intron 9 of 28) L1ME3A|LINE|L1 147749 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 154.333-185 chr20 48277640 48277866 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -82158 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 156.333-17 chr1 112205628 112205828 + 1 NA Intergenic AluYk11|SINE|Alu -190486 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 146.333-202 chr3 37267366 37267639 + 1 NA intron (NM_002078, intron 2 of 23) intron (NM_002078, intron 2 of 23) -23307 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 237.667-17 chr13 89218495 89218867 + 1 NA intron (NR_131229, intron 3 of 4) FLAM_A|SINE|Alu -16610 NR_047025 100874172 Hs.569291 NR_047025 LINC00440 - long intergenic non-protein coding RNA 440 ncRNA 119.667-100 chr20 35785021 35785252 + 1 NA intron (NM_016436, intron 1 of 17) MIRb|SINE|MIR 13121 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 128.333-117 chr20 6958444 6958674 + 1 NA Intergenic Intergenic 190873 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 222.667-84 chr6 135664053 135664364 + 1 NA intron (NR_152842, intron 3 of 5) L1MA5A|LINE|L1 166407 NR_026805 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 172.667-18 chr10 8425107 8425297 + 1 NA Intergenic Intergenic -156897 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 158.667-116 chr16 74490277 74490533 + 1 NA intron (NR_027264, intron 8 of 26) L1PA10|LINE|L1 -68935 NM_001011880 497190 Hs.454670 NM_001011880 ENSG00000140839 CLEC18B MRCL2 C-type lectin domain family 18 member B protein-coding 153.667-365 chr7 116979651 116979858 + 1 NA intron (NR_161423, intron 1 of 13) intron (NR_161423, intron 1 of 13) -25420 NR_002330 93653 Hs.597516 NR_002330 ENSG00000227199 ST7-AS1 ST7AS1|ST7OT1 ST7 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-171 chr2 139059119 139059300 + 1 NA Intergenic Intergenic 161885 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 148.667-357 chr7 79005178 79005385 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -3707 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 133.667-37 chr12 30015580 30015774 + 1 NA Intergenic Intergenic -230918 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 166.333-11 chr1 114877913 114878211 + 1 NA intron (NM_001282542, intron 11 of 30) intron (NM_001282542, intron 11 of 30) 23199 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 206.333-116 chr4 30830270 30830659 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 110095 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 141.667-216 chr8 3377989 3378174 + 1 NA intron (NM_033225, intron 18 of 69) intron (NM_033225, intron 18 of 69) -649630 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 199.333-196 chr4 44527943 44528254 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -79289 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 201.667-70 chr22 46315242 46315616 + 1 NA intron (NM_016426, intron 6 of 11) AluJr|SINE|Alu 18559 NM_016426 51512 Hs.386189 NM_016426 ENSG00000075218 GTSE1 B99 G2 and S-phase expressed 1 protein-coding 227.667-66 chr6 93295336 93295714 + 1 NA intron (NM_004440, intron 5 of 16) L1M5|LINE|L1 124034 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 167.667-11 chr1 178406314 178406484 + 1 NA intron (NM_004841, intron 2 of 15) L1ME1|LINE|L1 64948 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 204.667-56 chr17 40406274 40406577 + 1 NA exon (NM_001067, exon 16 of 35) exon (NM_001067, exon 16 of 35) 11471 NM_001067 7153 Hs.156346 NM_001067 ENSG00000131747 TOP2A TOP2|TP2A DNA topoisomerase II alpha protein-coding 153.333-170 chr18 8997876 8998102 + 1 NA Intergenic Intergenic -104710 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 173.333-148 chr4 102034109 102034409 + 1 NA intron (NM_017935, intron 10 of 16) intron (NM_017935, intron 10 of 16) 220417 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 189.333-31 chr10 93312573 93312949 + 1 NA intron (NM_013451, intron 51 of 53) intron (NM_013451, intron 51 of 53) 169573 NM_133337 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 151.667-163 chr2 44835257 44835462 + 1 NA Intergenic Intergenic 103529 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 210.667 chr1 24585167 24585450 + 1 NA intron (NM_001010980, intron 1 of 3) intron (NM_001010980, intron 1 of 3) 29221 NM_001010980 400746 Hs.200253 NM_001010980 ENSG00000184454 NCMAP C1orf130|MP11 non-compact myelin associated protein protein-coding 161.333-62 chr12 32694025 32694224 + 1 NA intron (NM_001330380, intron 1 of 18) AluSg|SINE|Alu 14823 NM_012062 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 235.667-44 chr4 23311152 23311429 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 570002 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 270.667-47 chr6 127206509 127206909 + 1 NA Intergenic Intergenic -59973 NM_001242851 81847 Hs.267120 NM_030963 ENSG00000118518 RNF146 - ring finger protein 146 protein-coding 299.333-13 chr12 18507828 18508249 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 24 of 32) intron (NM_001288774, intron 24 of 32) 229471 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 153.667-120 chr14 66577480 66577655 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) LTR84b|LTR|ERVL 70160 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 197.667-38 chr14 43717715 43718085 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 789383 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 152.667-15 chr1 145892561 145892788 + 1 NA 3' UTR (NM_001303041, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001303041, exon 26 of 26) -6808 NM_001280799 148741 Hs.710624 NM_144698 ENSG00000198483 ANKRD35 - ankyrin repeat domain 35 protein-coding 375.333-30 chr6 77136177 77136652 + 1 NA Intergenic Intergenic 327608 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 171.333-145 chr5 31519954 31520155 + 1 NA intron (NM_013235, intron 5 of 34) L1ME4a|LINE|L1 12039 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 170.333-70 chr14 43302319 43302516 + 1 NA Intergenic Intergenic 1204866 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 149.667-2 chr1 23453770 23453955 + 1 NA intron (NM_001143778, intron 3 of 23).2 L2b|LINE|L2 -29114 NM_003196 6920 Hs.446354 NM_003196 ENSG00000204219 TCEA3 TFIIS|TFIIS.H transcription elongation factor A3 protein-coding 193.667-67 chr2 192395832 192396161 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -201063 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 247.333-47 chr2 220780433 220780868 + 1 NA Intergenic Intergenic 791654 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 129.667-176 chr8 121108904 121109081 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -296946 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 155.333-8 chr1 106451609 106451834 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -366518 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 144.667-185 chr3 5961779 5961999 + 1 NA Intergenic Intergenic -711634 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 139.333-156 chr3 163807391 163807582 + 1 NA Intergenic Intergenic 364070 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 155.333-421 chrX 100579872 100580146 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4927 NM_022144 64102 Hs.132957 NM_022144 ENSG00000000005 TNMD BRICD4|CHM1L|TEM tenomodulin protein-coding 250.667-31 chr16 23012369 23012759 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 136706 NM_020718 57478 Hs.183817 NM_020718 ENSG00000103404 USP31 - ubiquitin specific peptidase 31 protein-coding 131.333-51 chr14 43636554 43636709 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 870652 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 209.333-219 chr7 50482880 50483201 + 1 NA intron (NM_001242888, intron 7 of 12) L1M5|LINE|L1 -32634 NM_001287495 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 274.667-46 chr5 109589951 109590276 + 1 NA Intergenic Intergenic -99253 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 153.333-333 chr5 77485168 77485447 + 1 NA intron (NM_018268, intron 2 of 12) intron (NM_018268, intron 2 of 12) 7009 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 153.333-448 chrX 41622595 41622848 + 1 NA intron (NM_003688, intron 10 of 26) intron (NM_003688, intron 10 of 26) -66252 NM_001097579 2857 Hs.495989 NM_005300 ENSG00000171659 GPR34 LYPSR1 G protein-coupled receptor 34 protein-coding 142.667-192 chr6 116554408 116554601 + 1 NA intron (NM_001366078, intron 1 of 1) intron (NM_001366078, intron 1 of 1) 1373 NM_001366078 221301 Hs.350750 NM_153036 ENSG00000164451 CALHM4 C6orf78|FAM26D calcium homeostasis modulator family member 4 protein-coding 154.333-339 chr8 80835553 80835810 + 1 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) MER4C|LTR|ERV1 38787 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 161.667-16 chr1 182076850 182077044 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -15235 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 154.333-299 chr6 100858895 100859072 + 1 NA 3' UTR (NM_022091, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_022091, exon 4 of 4) 22346 NM_006828 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 142.333-246 chr8 136348481 136348676 + 1 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -182220 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 132.667-136 chr5 28309081 28309261 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -21506 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 192.667-124 chr4 67858961 67859172 + 1 NA intron (NM_004262, intron 2 of 9) intron (NM_004262, intron 2 of 9) 24936 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 182.667-115 chr4 34254464 34254677 + 1 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 15177 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 122.667-58 chr15 49281231 49281389 + 1 NA intron (NM_001289030, intron 6 of 10) intron (NM_001289030, intron 6 of 10) 111063 NM_001289030 2585 Hs.122006 NM_002044 ENSG00000156958 GALK2 GK2 galactokinase 2 protein-coding 154.667-49 chr10 87779190 87779473 + 1 NA intron (NM_001321967, intron 5 of 9) (ATAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 38900 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 229.333-102 chr5 102968658 102968918 + 1 NA intron (NM_001364589, intron 14 of 23) L1PA7|LINE|L1 102965 NM_000919 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 198.667-27 chr10 88272525 88272822 + 1 NA Intergenic Intergenic 310645 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 457.667 chr14 73134952 73135670 + 1 NA Intergenic Intergenic -1196 NM_000021 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 203.333-3 chr1 20806138 20806579 + 1 NA TTS (NM_001198801) TTS (NM_001198801) -19670 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 197.333-251 chrX 64329923 64330161 + 1 NA intron (NM_017677, intron 11 of 13) MIRb|SINE|MIR 65410 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 152.333-80 chr12 25462529 25462708 + 1 NA Intergenic Intergenic 90665 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 215.667-28 chr12 28449400 28449799 + 1 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) intron (NM_001352082, intron 9 of 13) -258861 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 145.667-162 chr20 55761879 55762122 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 243519 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 173.667-92 chr2 169114796 169115018 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 33800 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 226.333-25 chr12 80209038 80209381 + 1 NA promoter-TSS (NM_173591) promoter-TSS (NM_173591) -244 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 192.667-103 chr3 7190186 7190609 + 1 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) -296380 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 116.333-129 chr20 36176365 36176506 + 1 NA intron (NM_177996, intron 3 of 19) intron (NM_177996, intron 3 of 19) -20675 NR_147703 100130373 Hs.570339 NR_147703 LOC100130373 - uncharacterized LOC100130373 ncRNA 119.667-36 chr12 38853657 38853894 + 1 NA intron (NM_153634, intron 3 of 19) intron (NM_153634, intron 3 of 19) 51816 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 177.333-184 chrX 104924791 104925074 + 1 NA intron (NM_017416, intron 2 of 10) L1PA15-16|LINE|L1 295761 NM_001291277 56157 Hs.567543 NM_031274 ENSG00000268629 TEX13A - testis expressed 13A protein-coding 178.333-61 chr17 27353133 27353355 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 59130 NR_145520 26118 Hs.446017 NM_015626 ENSG00000109046 WSB1 SWIP1|WSB-1 WD repeat and SOCS box containing 1 protein-coding 137.333-152 chr5 52372733 52372890 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 364780 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 149.333-346 chr6 121710509 121710759 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 274988 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 162.667-6 chr1 91625457 91625820 + 1 NA Intergenic Intergenic 124530 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 142.667-115 chr2 208823056 208823261 + 1 NA intron (NR_136588, intron 4 of 5) intron (NR_136588, intron 4 of 5) 280516 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 280.333-43 chr8 117440241 117440682 + 1 NA Intergenic Intergenic -80252 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 152.333-299 chr5 54952523 54952676 + 1 NA Intergenic Intergenic 32994 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 201.333-76 chr12 39835354 39835578 + 1 NA intron (NM_052885, intron 6 of 9) intron (NM_052885, intron 6 of 9) 209283 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 160.333-288 chr8 122487837 122488089 + 1 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) L1PA7|LINE|L1 80681 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 143.667-71 chr14 48220751 48220957 + 1 NA Intergenic Intergenic -425840 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 230.667-34 chr19 12381592 12381963 + 1 NA Intergenic Intergenic -16094 NM_001363774 79973 Hs.253193 NM_030824 ENSG00000198342 ZNF442 - zinc finger protein 442 protein-coding 151.667-5 chr1 59091420 59091648 + 1 NA Intergenic Intergenic 55273 NR_027120 729467 Hs.662291 NR_027120 ENSG00000224609 HSD52 - uncharacterized LOC729467 ncRNA 130.333-80 chr15 89696079 89696309 + 1 NA intron (NM_001284395, intron 1 of 16) L1ME1|LINE|L1 5383 NM_001284396 56964 Hs.177557 NM_020212 ENSG00000140527 WDR93 - WD repeat domain 93 protein-coding 303.333-18 chr12 34554612 34555109 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 532364 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 385.333-26 chr8 90185980 90186541 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -35228 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 140.667-220 chr7 121153092 121153256 + 1 NA intron (NM_001105533, intron 15 of 17) intron (NM_001105533, intron 15 of 17) 163783 NM_001105533 79974 Hs.189652 NM_024913 ENSG00000106034 CPED1 C7orf58 cadherin like and PC-esterase domain containing 1 protein-coding 145.333-151 chr2 190361534 190361722 + 1 NA intron (NM_002194, intron 2 of 5) intron (NM_002194, intron 2 of 5) 18039 NM_002194 3628 Hs.32309 NM_002194 ENSG00000151689 INPP1 - inositol polyphosphate-1-phosphatase protein-coding 159.667-306 chr7 95199133 95199404 + 1 NA intron (NM_017650, intron 6 of 15) intron (NM_017650, intron 6 of 15) 125264 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 318.667-4 chr10 90009890 90010440 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -52792 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 174.333-27 chr12 43258886 43259161 + 1 NA Intergenic Intergenic 103708 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 137.667-32 chr10 125756504 125756688 + 1 NA intron (NR_110859, intron 24 of 25) L1MCc|LINE|L1 -4536 NR_120633 101927983 Hs.634269 NR_120633 ENSG00000236991 EDRF1-AS1 - EDRF1 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-66 chr12 51012703 51012901 + 1 NA intron (NM_001174125, intron 1 of 15) intron (NM_001174125, intron 1 of 15) -3587 NM_001174130 4891 Hs.505545 NM_000617 ENSG00000110911 SLC11A2 AHMIO1|DCT1|DMT1|NRAMP2 solute carrier family 11 member 2 protein-coding 167.333-88 chr15 34779258 34779536 + 1 NA intron (NR_120329, intron 2 of 2) intron (NR_120329, intron 2 of 2) 16152 NM_005159 70 Hs.118127 NM_005159 ENSG00000159251 ACTC1 ACTC|ASD5|CMD1R|CMH11|LVNC4 actin alpha cardiac muscle 1 protein-coding 217.333-150 chr8 88528896 88529282 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -201606 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 139.333-81 chr15 87168822 87168981 + 1 NA Intergenic Intergenic -180475 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 226.667-84 chr7 19123162 19123497 + 1 NA Intergenic Intergenic -5693 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 135.333-181 chr7 88792996 88793237 + 1 NA TTS (NM_152706) TTS (NM_152706) 2621 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 160.667-94 chr14 73952547 73952797 + 1 NA intron (NM_182476, intron 1 of 11) intron (NM_182476, intron 1 of 11) 2370 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 236.667-49 chr22 47635105 47635528 + 1 NA non-coding (NR_122046, exon 2 of 9) non-coding (NR_122046, exon 2 of 9) 3642 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 253.667-26 chr17 73203322 73203638 + 1 NA intron (NM_018714, intron 8 of 13) intron (NM_018714, intron 8 of 13) 10425 NM_018714 9382 Hs.103555 NM_018714 ENSG00000166685 COG1 CDG2G|LDLB component of oligomeric golgi complex 1 protein-coding 253.667-25 chr16 59193058 59193566 + 1 NA Intergenic Intergenic -458996 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 252.333-82 chrX 122278848 122279149 + 1 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -905245 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 494.666 chr3 192174394 192175091 + 1 NA intron (NM_004113, intron 4 of 5) MIRc|SINE|MIR -63888 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 240.667-47 chr2 135571133 135571405 + 1 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) L1MB8|LINE|L1 -15083 NM_001354199 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 135.667-27 chr11 47864090 47864281 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15641 NM_015231 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 243.667-4 chr1 205604498 205604916 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 28165 NM_001973 2005 Hs.497520 NM_001973 ENSG00000158711 ELK4 SAP1 ETS transcription factor ELK4 protein-coding 269.333-66 chr4 24633924 24634379 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -49597 NM_001358 1665 Hs.696074 NM_001358 ENSG00000109606 DHX15 DBP1|DDX15|HRH2|PRP43|PRPF43|PrPp43p DEAH-box helicase 15 protein-coding 152.667-130 chr16 1866834 1867042 + 1 NA intron (NM_001163560, intron 2 of 13) intron (NM_001163560, intron 2 of 13) 5226 NM_152764 254528 Hs.729604 NM_152764 ENSG00000162039 MEIOB C16orf73|SPGF22|gs129 meiosis specific with OB-fold protein-coding 185.333-189 chr8 104119887 104120098 + 1 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) intron (NM_001348498, intron 19 of 24) -103343 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 170.667-146 chr6 89626216 89626399 + 1 NA intron (NM_001242809, intron 13 of 15) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 12190 NR_028495 57226 Hs.177275 NM_020466 ENSG00000083099 LYRM2 DJ122O8.2 LYR motif containing 2 protein-coding 149.333-184 chr2 81664394 81664595 + 1 NA Intergenic CR1-3_Croc|LINE|CR1 -197548 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 146.667-322 chr7 123372022 123372195 + 1 NA Intergenic Intergenic 160840 NR_104244 154865 Hs.159650 NM_178827 ENSG00000164675 IQUB - IQ motif and ubiquitin domain containing protein-coding 164.333-175 chr4 66421997 66422343 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 145346 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 155.667-144 chr19 29434177 29434415 + 1 NA intron (NR_040029, intron 1 of 9) intron (NR_040029, intron 1 of 9) 91456 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 165.333-38 chr11 9201542 9201712 + 1 NA intron (NR_145966, intron 4 of 21) AluJb|SINE|Alu 63699 NR_145966 23258 Hs.501857 NM_015213 ENSG00000184014 DENND5A EIEE49|RAB6IP1 DENN domain containing 5A protein-coding 206.333-119 chr4 46349461 46349763 + 1 NA intron (NM_001114175, intron 2 of 8) intron (NM_001114175, intron 2 of 8) 39767 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 150.667-101 chr13 59874788 59875013 + 1 NA intron (NM_001258369, intron 21 of 26) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -137818 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 201.333-167 chr20 2018536 2018857 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -24411 NM_001190899 5173 Hs.22584 NM_024411 ENSG00000101327 PDYN ADCA|PENKB|SCA23 prodynorphin protein-coding 122.667-129 chr3 187545331 187545475 + 1 NA Intergenic Intergenic 98357 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 175.667-93 chr3 17931333 17931683 + 1 NA Intergenic Intergenic -31044 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 149.333-247 chr3 88376616 88376803 + 1 NA intron (NM_001368167, intron 2 of 2) intron (NM_001368167, intron 2 of 2) 38253 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 155.667-147 chr19 39926188 39926360 + 1 NA intron (NM_003890, intron 2 of 28) AluJo|SINE|Alu 8352 NM_003890 8857 Hs.111732 NM_003890 FCGBP FC(GAMMA)BP Fc fragment of IgG binding protein protein-coding 505.333-5 chr15 25390110 25390853 + 1 NA intron (NM_001354546, intron 1 of 9) L1MC1|LINE|L1 47748 NM_001354526 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 118.333-107 chr2 74819485 74819680 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -13073 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 189.333-125 chr3 12415516 12415727 + 1 NA intron (NM_001330615, intron 5 of 5) intron (NM_001330615, intron 5 of 5) 64119 NM_015869 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 205.333-159 chr3 126241804 126242247 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -60839 NM_001270364 10840 Hs.434435 NM_012190 ENSG00000144908 ALDH1L1 10-FTHFDH|10-fTHF|FDH|FTHFD aldehyde dehydrogenase 1 family member L1 protein-coding 154.667-15 chr1 108979479 108979675 + 1 NA intron (NM_014969, intron 13 of 14) HAL1|LINE|L1 -16078 NM_001048210 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 149.667-377 chr7 101464018 101464270 + 1 NA intron (NM_133457, intron 3 of 12) AluJr|SINE|Alu 101269 NM_001278563 136227 Hs.654854 NM_133457 ENSG00000160963 COL26A1 EMI6|EMID2|EMU2|SH2B collagen type XXVI alpha 1 chain protein-coding 158.667-237 chr4 49651361 49651564 + 1 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 664820 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 150.667-98 chr13 37432379 37432618 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 52286 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 142.333-8 chr1 80679644 80679874 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 38472 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 165.333-168 chr3 86225694 86225972 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -256110 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 190.667-147 chr8 76424411 76424672 + 1 NA intron (NR_105006, intron 1 of 5) intron (NR_105006, intron 1 of 5) 17887 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 169.667-195 chr7 39357520 39357739 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 5 of 9) intron (NM_001370959, intron 5 of 9) -28495 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 183.333-60 chr16 68303370 68303688 + 1 NA intron (NM_032178, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 7417 NM_032178 84138 Hs.729520 NM_032178 ENSG00000103061 SLC7A6OS - solute carrier family 7 member 6 opposite strand protein-coding 246.667-17 chr11 40236667 40237068 + 1 NA intron (NM_020929, intron 3 of 4) intron (NM_020929, intron 3 of 4) 56263 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 170.333-16 chr1 214980649 214980898 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -24769 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 156.667-45 chr10 68536870 68537027 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9425 NM_001324312 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 143.333-101 chr15 60818881 60819157 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 137450 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 207.333-263 chr8 37762555 37762799 + 1 NA promoter-TSS (NM_001349346) promoter-TSS (NM_001349346) 32 NM_001349346 11212 Hs.304792 NM_007198 ENSG00000147471 PLPBP EPVB6D|PROSC pyridoxal phosphate binding protein protein-coding 149.333-257 chr3 121625384 121625630 + 1 NA intron (NM_016298, intron 3 of 3) intron (NM_016298, intron 3 of 3) 32128 NM_016298 51725 Hs.272564 NM_016298 ENSG00000163833 FBXO40 FBX40 F-box protein 40 protein-coding 162.667-88 chr15 72392308 72392513 + 1 NA Intergenic Intergenic -5895 NM_001080462 338949 Hs.446069 NM_001080462 ENSG00000187806 TMEM202 - transmembrane protein 202 protein-coding 137.667-80 chr18 8464685 8464830 + 1 NA Intergenic Intergenic -97723 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 166.667-112 chr2 71450778 71451057 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -2644 NM_001130978 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 132.667-34 chr12 4366252 4366419 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 13377 NM_020638 8074 Hs.287370 NM_020638 ENSG00000118972 FGF23 ADHR|FGFN|HFTC2|HPDR2|HYPF|PHPTC fibroblast growth factor 23 protein-coding 163.667-241 chr7 106483536 106483714 + 1 NA Intergenic Intergenic 177533 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 148.667-396 chr9 35379558 35379743 + 1 NA intron (NM_006377, intron 16 of 38) intron (NM_006377, intron 16 of 38) -27105 NR_003581 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 214.333-138 chr7 11117100 11117521 + 1 NA intron (NR_033436, intron 16 of 16) intron (NR_033436, intron 16 of 16) 143438 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 208.667-11 chr1 174096351 174096789 + 1 NA Intergenic Intergenic 62717 NR_121197 102724601 Hs.563791 NR_121197 ENSG00000227373 RABGAP1L-DT - RABGAP1L divergent transcript ncRNA 165.333-254 chr8 141952942 141953249 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -166782 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 237.667-79 chr8 111323654 111324043 + 1 NA Intergenic Intergenic -52791 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 249.333-64 chr20 38860851 38861339 + 1 NA intron (NM_015568, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 55398 NM_001172735 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 157.667-294 chr7 30789728 30789954 + 1 NA intron (NR_037598, intron 6 of 19) intron (NR_037598, intron 6 of 19) 18424 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 179.333-196 chr9 37487119 37487344 + 1 NA intron (NM_001282766, intron 2 of 12) intron (NM_001282766, intron 2 of 12) 1283 NM_022490 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 157.333-309 chr6 127600637 127600799 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 23544 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 335.333-23 chr2 62790717 62791176 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 5 of 22) intron (NM_001142615, intron 5 of 22) 84049 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 394.333-20 chr7 113055913 113056521 + 1 NA Intergenic Intergenic 30121 NM_001146266 54329 Hs.152009 NM_018970 ENSG00000164604 GPR85 SREB|SREB2 G protein-coupled receptor 85 protein-coding 309.667-9 chr15 95215440 95216007 + 1 NA Intergenic Intergenic 111377 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 237.667-78 chr8 17666566 17666977 + 1 NA intron (NR_156437, intron 7 of 13) intron (NR_156437, intron 7 of 13) 9730 NM_001330470 57509 Hs.7946 NM_020749 ENSG00000129422 MTUS1 ATBP|ATIP|ATIP3|ICIS|MP44|MTSG1 microtubule associated scaffold protein 1 protein-coding 323.667-11 chr18 74025678 74026188 + 1 NA Intergenic Intergenic 121901 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 183.667-112 chr5 2656149 2656467 + 1 NA Intergenic Intergenic -56283 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 142.667-58 chr14 72050731 72050908 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MER8|DNA|TcMar-Tigger 117292 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 156.667-134 chr17 49179955 49180209 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 29299 NM_031498 2793 Hs.181781 NM_031498 ENSG00000167083 GNGT2 G-GAMMA-8|G-GAMMA-C|GNG8|GNG9|GNGT8 G protein subunit gamma transducin 2 protein-coding 147.667-296 chr5 146284092 146284250 + 1 NA intron (NM_018989, intron 19 of 20) intron (NM_018989, intron 19 of 20) -54668 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 141.667-200 chr6 141889941 141890098 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 198780 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 126.333-175 chr8 29512025 29512187 + 1 NA Intergenic MER58D|DNA|hAT-Charlie -161422 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 146.333-168 chr2 207568466 207568684 + 1 NA intron (NR_163947, intron 4 of 8) L1M4|LINE|L1 9453 NM_001371428 173.667-85 chr2 118129719 118129984 + 1 NA Intergenic Intergenic 41301 NM_001321332 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 174.333-152 chr8 130850741 130850962 + 1 NA intron (NM_001115, intron 9 of 17) MIRb|SINE|MIR 190058 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 118.333-154 chr4 105626550 105626699 + 1 NA intron (NM_001242729, intron 3 of 13) L2|LINE|L2 65033 NR_046840 100874374 Hs.668908 NR_046840 ENSG00000249885 ARHGEF38-IT1 - ARHGEF38 intronic transcript 1 ncRNA 154.667-52 chr10 99049022 99049204 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1PA16|LINE|L1 -124545 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 156.667-104 chr14 53466062 53466364 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 312859 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 195.667-5 chr1 226509466 226509778 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -39142 NM_001003665 375057 Hs.116827 NM_001003665 ENSG00000203685 STUM C1orf95 stum, mechanosensory transduction mediator homolog protein-coding 157.333-107 chr14 62315401 62315584 + 1 NA Intergenic Intergenic -175519 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 166.333-204 chr6 149031888 149032143 + 1 NA intron (NR_134599, intron 1 of 1) intron (NR_134599, intron 1 of 1) 646 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 141.667-57 chr12 43309647 43309818 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 154417 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 176.333-12 chr1 182689877 182690138 + 1 NA Intergenic Intergenic -17075 NM_001102450 85397 Hs.20982 NM_033345 ENSG00000135824 RGS8 - regulator of G protein signaling 8 protein-coding 149.667-354 chr6 82362225 82362473 + 1 NA promoter-TSS (NM_006670) promoter-TSS (NM_006670) -857 NM_006670 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 142.333-221 chr6 126471827 126472005 + 1 NA intron (NR_104462, intron 3 of 3) intron (NR_104462, intron 3 of 3) -12715 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 157.333-291 chr5 133142149 133142396 + 1 NA Intergenic Intergenic 90259 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 150.333-305 chr4 71458652 71458895 + 1 NA intron (NM_003759, intron 9 of 22) intron (NM_003759, intron 9 of 22) 119720 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 117.333-112 chr2 213005333 213005594 + 1 NA 3' UTR (NM_016260, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_016260, exon 8 of 8) -79127 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 168.667-74 chr16 49060569 49060763 + 1 NA Intergenic Intergenic 221172 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 240.667-73 chr7 27190577 27190960 + 1 NA Intergenic Intergenic 5360 NR_002795 221883 Hs.587427 NR_002795 ENSG00000240990 HOXA11-AS HOXA-AS5|HOXA11-AS1|HOXA11AS|HOXA11S|NCRNA00076 HOXA11 antisense RNA ncRNA 147.333-39 chr10 49507328 49507564 + 1 NA intron (NM_001346440, intron 5 of 20) intron (NM_001346440, intron 5 of 20) 16835 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 129.333-103 chr20 5046193 5046432 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -35999 NM_203327 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 154.667-133 chr16 74160353 74160627 + 1 NA Intergenic Intergenic 55031 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 166.667-25 chr10 55466835 55467084 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -132083 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 369.667-14 chr9 29751813 29752417 + 1 NA Intergenic Intergenic -538514 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 155.333-281 chr5 15319821 15319981 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -53341 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 162.333-153 chr22 46714540 46714804 + 1 NA intron (NM_022766, intron 3 of 12) L1ME3A|LINE|L1 23580 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 165.333-5 chr1 47372385 47372587 + 1 NA intron (NM_016308, intron 2 of 5) intron (NM_016308, intron 2 of 5) 38696 NR_046395 51727 Hs.731647 NM_016308 ENSG00000162368 CMPK1 CK|CMK|CMPK|UMK|UMP-CMPK|UMPK cytidine/uridine monophosphate kinase 1 protein-coding 116.333-37 chr10 80680934 80681094 + 1 NA Intergenic Intergenic 31217 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 144.667-70 chr13 65948027 65948207 + 1 NA Intergenic Intergenic 18312 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 162.667-184 chr3 185027771 185028059 + 1 NA intron (NM_001009921, intron 45 of 46) LTR82A|LTR|ERVL 125145 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 294.667-8 chr11 97010260 97010655 + 1 NA Intergenic Intergenic 502032 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 174.667-183 chrX 94350150 94350359 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 676048 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 135.667-198 chr9 31844692 31844936 + 1 NA Intergenic Intergenic -463324 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 160.333-125 chr17 58806446 58806684 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) LTR103_Mam|LTR|ERV1? 50696 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 235.333-101 chr5 127483507 127483808 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -33983 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 161.667-111 chr18 2693706 2694010 + 1 NA intron (NM_015295, intron 7 of 47) AluSx|SINE|Alu 37971 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 154.667-244 chr3 103700545 103700780 + 1 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -176546 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 160.667-204 chr3 123495100 123495374 + 1 NA intron (NM_001329786, intron 5 of 5) intron (NM_001329786, intron 5 of 5) -46692 NM_183357 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 164.333-174 chr4 55975754 55975944 + 1 NA intron (NM_025009, intron 11 of 25) intron (NM_025009, intron 11 of 25) 26904 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 135.667-142 chr5 44897374 44897566 + 1 NA Intergenic Intergenic 88523 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 121.667-165 chr5 91065771 91065924 + 1 NA intron (NR_003149, intron 85 of 89) intron (NR_003149, intron 85 of 89) 248555 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 171.667-66 chr17 62912713 62913024 + 1 NA Intergenic Intergenic -31347 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 201.333-48 chr11 16065041 16065368 + 1 NA intron (NM_017508, intron 8 of 14) L1MA2|LINE|L1 -95583 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 206.667-111 chr5 54527059 54527332 + 1 NA intron (NM_001145427, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 9436 NM_001102575 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 168.667-39 chr12 2544129 2544334 + 1 NA intron (NM_199460, intron 9 of 49).2 intron (NM_199460, intron 9 of 49).2 127989 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 149.667-436 chrX 84888450 84888660 + 1 NA Intergenic Intergenic -45596 NR_024062 100131816 Hs.460809 NM_178567 ENSG00000229547 UBE2DNL - ubiquitin conjugating enzyme E2 D N-terminal like (pseudogene) pseudo 131.667-83 chr19 51941914 51942139 + 1 NA intron (NM_001031721, intron 5 of 5) intron (NM_001031721, intron 5 of 5) -7108 NR_103847 101669766 Hs.637744 NR_103847 ENSG00000269235 ZNF350-AS1 HCCAT3|uc002pyc ZNF350 antisense RNA 1 ncRNA 271.667-49 chr3 171262657 171263267 + 1 NA intron (NM_001161563, intron 2 of 31) intron (NM_001161563, intron 2 of 31) -156203 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 237.333-109 chr7 17339905 17340195 + 1 NA exon (NM_001621, exon 10 of 11) exon (NM_001621, exon 10 of 11) -34867 NR_110015 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 155.667-288 chr5 97909433 97909598 + 1 NA intron (NR_146299, intron 2 of 2) MER41B|LTR|ERV1 68757 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 246.333-64 chr3 126041226 126041594 + 1 NA intron (NM_001008486, intron 2 of 10) L1MEd|LINE|L1 15365 NM_001008487 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 158.667-107 chr15 63039878 63040088 + 1 NA Intergenic Intergenic -2764 NM_001018004 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 183.333-146 chr6 160948881 160949145 + 1 NA Intergenic Intergenic -42714 NM_001291958 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 156.667-74 chr12 6314811 6315072 + 1 NA intron (NM_001144857, intron 2 of 14) intron (NM_001144857, intron 2 of 14) 2290 NM_001144857 55200 Hs.631660 NM_018173 ENSG00000008323 PLEKHG6 MyoGEF pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G6 protein-coding 115.333-10 chr1 105614677 105614846 + 1 NA intron (NR_125955, intron 1 of 3) intron (NR_125955, intron 1 of 3) 4174 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 199.667-112 chr5 43662919 43663225 + 1 NA intron (NM_012343, intron 17 of 21) intron (NM_012343, intron 17 of 21) -59842 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 120.333-18 chr10 11484601 11484794 + 1 NA intron (NM_014688, intron 13 of 14) intron (NM_014688, intron 13 of 14) 47583 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 240.667-76 chr7 108298699 108298982 + 1 NA intron (NM_001371126, intron 3 of 32) AluSx|SINE|Alu 29686 NM_001371178 175.333-119 chr3 78669718 78669953 + 1 NA intron (NM_002941, intron 11 of 30) intron (NM_002941, intron 11 of 30) 349624 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 191.333-103 chr2 21733143 21733406 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -22622 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 293.667-14 chr12 116471067 116471572 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -43001 NR_039683 100616309 NR_039683 ENSG00000264037 MIR4472-2 - microRNA 4472-2 ncRNA 159.667-45 chr10 62972940 62973118 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -153862 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 208.667-10 chr1 172794559 172794959 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 135656 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 174.667-3 chr1 40627578 40627825 + 1 NA intron (NM_014747, intron 7 of 7) AluJo|SINE|Alu 37981 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 212.333-137 chr7 47431805 47432159 + 1 NA intron (NM_022748, intron 8 of 30) L1M2|LINE|L1 32821 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 292.333-42 chr7 126742334 126742724 + 1 NA intron (NM_001371088, intron 7 of 7) intron (NM_001371088, intron 7 of 7) 315655 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 334.333-29 chr8 3448515 3448907 + 1 NA intron (NM_033225, intron 12 of 69) intron (NM_033225, intron 12 of 69) -720260 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 212.333-91 chr22 24497494 24497794 + 1 NA intron (NM_016327, intron 1 of 9) intron (NM_016327, intron 1 of 9) 2312 NM_016327 51733 Hs.731656 NM_016327 ENSG00000100024 UPB1 BUP1 beta-ureidopropionase 1 protein-coding 147.667-258 chr4 82980338 82980590 + 1 NA intron (NM_001115008, intron 2 of 12) intron (NM_001115008, intron 2 of 12) 30359 NM_194282 132660 Hs.96952 NM_194282 ENSG00000189308 LIN54 CXCDC1|JC8.6|MIP120|TCX1 lin-54 DREAM MuvB core complex component protein-coding 114.667-152 chr20 9436025 9436237 + 1 NA intron (NM_000933, intron 25 of 35) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -78227 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 264.667-35 chr17 61663252 61663648 + 1 NA Intergenic Intergenic -72231 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 159.667-152 chr18 64123148 64123326 + 1 NA intron (NR_033881, intron 1 of 9) L1PB4|LINE|L1 19146 NR_033881 284294 Hs.385642 NR_033881 ENSG00000267134 LINC01924 - long intergenic non-protein coding RNA 1924 ncRNA 177.333-42 chr12 111523978 111524206 + 1 NA intron (NR_132311, intron 6 of 23) L1ME4b|LINE|L1 75223 NM_002973 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 155.667-132 chr17 71456738 71457032 + 1 NA Intergenic Intergenic -254706 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 163.667-91 chr18 11114544 11114723 + 1 NA intron (NM_022068, intron 1 of 51) AluSz6|SINE|Alu 34129 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 150.667-334 chr6 90445876 90446139 + 1 NA Intergenic Intergenic 133265 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 162.333-224 chr6 123171995 123172240 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 175882 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 152.333-106 chr14 50152130 50152404 + 1 NA intron (NM_006939, intron 13 of 22) intron (NM_006939, intron 13 of 22) -35695 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 167.333-166 chr22 45705894 45706143 + 1 NA intron (NM_013236, intron 5 of 11) MER1B|DNA|hAT-Charlie 34184 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 139.667-76 chr18 68084105 68084418 + 1 NA Intergenic LTR80B|LTR|ERVL -269439 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 278.333-46 chr8 89058459 89059013 + 1 NA Intergenic Intergenic 698975 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 145.333-166 chr21 21004628 21004840 + 1 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) 6325 NM_001352595 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 163.667-34 chr11 6799833 6800144 + 1 NA Intergenic Intergenic -4080 NM_003696 8590 Hs.652252 NM_003696 ENSG00000184933 OR6A2 I7|OR11-55|OR6A1|OR6A2P olfactory receptor family 6 subfamily A member 2 protein-coding 197.667-139 chr7 11334859 11335137 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 361126 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 168.667-52 chr13 49671862 49672092 + 1 NA intron (NM_032565, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 19509 NM_032565 84650 Hs.433278 NM_032565 ENSG00000123179 EBPL EBRP EBP like protein-coding 201.667-119 chr8 99641249 99641613 + 1 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) intron (NM_017890, intron 33 of 61) -104570 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 147.333-154 chr18 52075400 52075612 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -264691 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 156.333-51 chr11 12910138 12910402 + 1 NA intron (NM_021961, intron 10 of 12) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 79278 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 163.333-142 chr2 57070270 57070497 + 1 NA Intergenic Intergenic -837268 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 153.667-373 chr8 39048781 39048938 + 1 NA intron (NR_027638, intron 12 of 20) L1MB1|LINE|L1 -30174 NR_145988 109616979 NR_145736 ENSG00000207199 SNORD38D - small nucleolar RNA, C/D box 38D snoRNA 226.667-15 chr10 13151803 13152062 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -9626 NM_182751 55388 Hs.198363 NM_018518 ENSG00000065328 MCM10 CNA43|DNA43|PRO2249 minichromosome maintenance 10 replication initiation factor protein-coding 133.333-76 chr2 39439716 39439928 + 1 NA intron (NR_037875, intron 1 of 5) L3|LINE|CR1 2406 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 125.333-17 chr1 244506529 244506727 + 1 NA intron (NM_001130957, intron 7 of 21) intron (NM_001130957, intron 7 of 21) 45257 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 268.333-4 chr1 192032540 192032886 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -125749 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 550.333-2 chr10 86423940 86424721 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -57535 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 256.667-85 chr8 111639286 111639597 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 262802 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 132.667-198 chrX 83616585 83616791 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 108398 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 199.333-263 chr7 83435753 83436043 + 1 NA intron (NM_001178129, intron 4 of 16) intron (NM_001178129, intron 4 of 16) 205533 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 193.667-82 chr3 31837227 31837529 + 1 NA intron (NM_017784, intron 3 of 11) intron (NM_017784, intron 3 of 11) 133165 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 156.333-172 chr2 37882268 37882502 + 1 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -6522 NR_110012 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 170.333-65 chr13 43645234 43645502 + 1 NA intron (NM_001347964, intron 2 of 17) AluJr|SINE|Alu -15891 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 140.333-122 chr20 31612065 31612210 + 1 NA Intergenic Intergenic 4951 NR_036161 100422904 NR_036161 ENSG00000264395 MIR3193 - microRNA 3193 ncRNA 126.667-114 chr3 149311903 149312133 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 21420 NM_001184723 116441 Hs.22026 NM_138786 ENSG00000163762 TM4SF18 L6D transmembrane 4 L six family member 18 protein-coding 191.333-160 chr5 85349530 85349914 + 1 NA Intergenic Intergenic -932722 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 146.333-309 chr7 69520875 69521117 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 76628 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 302.333-13 chr12 114309202 114309589 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -67625 NR_146536 105369996 Hs.577438 NR_146536 ENSG00000257476 LINC02459 - long intergenic non-protein coding RNA 2459 ncRNA 150.667-307 chr5 92386106 92386379 + 1 NA Intergenic Intergenic -1002925 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 168.333-83 chr18 58911666 58911864 + 1 NA intron (NM_001353535, intron 2 of 6) intron (NM_001353535, intron 2 of 6) 46888 NM_001353534 55205 Hs.529023 NM_018181 ENSG00000074657 ZNF532 - zinc finger protein 532 protein-coding 150.667-132 chr15 68073344 68073610 + 1 NA intron (NM_001320687, intron 2 of 14) L2c|LINE|L2 18901 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 172.667-50 chr13 39949978 39950293 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -231674 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 190.333-24 chr10 117476726 117477012 + 1 NA Intergenic Intergenic -65576 NM_001165924 2018 Hs.202095 NM_004098 ENSG00000170370 EMX2 - empty spiracles homeobox 2 protein-coding 141.667-246 chr9 75736245 75736410 + 1 NA Intergenic Intergenic -154317 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 247.667-61 chr3 72386737 72387069 + 1 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) intron (NM_012234, intron 1 of 3) 59720 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 156.667-67 chr11 98321780 98321936 + 1 NA Intergenic Intergenic -699091 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 186.667-17 chr10 91706683 91706966 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -73753 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 304.333-30 chr6 103683095 103683596 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 1176201 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 179.667-119 chr6 86276952 86277278 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -598382 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 196.333-58 chr16 60955805 60956102 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 99813 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 152.333-97 chr13 91452340 91452622 + 1 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) intron (NM_004466, intron 2 of 7) 53860 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 159.333-74 chr12 100284424 100284666 + 1 NA intron (NM_017988, intron 2 of 17) AluSz|SINE|Alu 17161 NM_001330253 55681 Hs.506481 NM_017988 ENSG00000136021 SCYL2 CVAK104 SCY1 like pseudokinase 2 protein-coding 125.667-170 chr6 131990391 131990624 + 1 NA Intergenic Intergenic -39135 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 159.667-268 chr5 117995983 117996277 + 1 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) 265769 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 175.333-104 chr20 33519083 33519422 + 1 NA intron (NM_001032999, intron 1 of 10) AluSx|SINE|Alu 29156 NM_001032999 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 151.333-404 chr8 27946555 27946743 + 1 NA intron (NM_173833, intron 3 of 8) intron (NM_173833, intron 3 of 8) 46024 NM_173833 286133 Hs.591833 NM_173833 ENSG00000168079 SCARA5 NET33|Tesr scavenger receptor class A member 5 protein-coding 180.333-74 chr3 38782426 38782664 + 1 NA intron (NM_006514, intron 3 of 26) HAL1|LINE|L1 11465 NM_006514 6336 Hs.250443 NM_006514 ENSG00000185313 SCN10A FEPS2|Nav1.8|PN3|SNS|hPN3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 protein-coding 258.333-22 chr15 61288594 61289068 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -59529 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 152.333-133 chr16 54568283 54568526 + 1 NA Intergenic Intergenic -197705 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 158.333-141 chr2 40023904 40024150 + 1 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 106393 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 140.667-36 chr10 71817645 71817800 + 1 NA intron (NM_001042465, intron 14 of 14) intron (NM_001042465, intron 14 of 14) 5839 NM_001171936 64072 Hs.656032 NM_022124 ENSG00000107736 CDH23 CDHR23|PITA5|USH1D cadherin related 23 protein-coding 262.667-46 chr20 13044227 13044654 + 1 NA intron (NM_001349945, intron 2 of 12) intron (NM_001349945, intron 2 of 12) 35468 NM_001349945 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 145.667-218 chr5 84992040 84992214 + 1 NA Intergenic Intergenic -607247 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 168.667-60 chr14 58698044 58698250 + 1 NA Intergenic Intergenic 59310 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 161.667-188 chr4 52944622 52944856 + 1 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 82422 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 122.333-167 chr5 15267445 15267631 + 1 NA promoter-TSS (NR_109944) promoter-TSS (NR_109944) -978 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 141.333-244 chr8 117147556 117147781 + 1 NA intron (NM_173851, intron 2 of 7) L1ME4a|LINE|L1 12673 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 164.667-99 chr18 66056014 66056240 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 305115 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 209.667-46 chr14 67005791 67006102 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -183494 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 150.333-150 chr16 84916383 84916604 + 1 NA Intergenic LTR62|LTR|ERVL 95042 NM_001145548 55625 Hs.461610 NM_017740 ENSG00000153786 ZDHHC7 DHHC7|SERZ-B|SERZ1|ZNF370 zinc finger DHHC-type containing 7 protein-coding 197.333-180 chr5 64946823 64947242 + 1 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) intron (NM_005869, intron 11 of 13) 178102 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 156.333-176 chr2 59426478 59426707 + 1 NA Intergenic Intergenic 208884 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 235.333-100 chr5 119151508 119151816 + 1 NA intron (NM_001290321, intron 18 of 43) intron (NM_001290321, intron 18 of 43) -2975 NR_049892 100847085 NR_049892 ENSG00000264536 MIR5706 - microRNA 5706 ncRNA 235.333-51 chr2 20657162 20657438 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -6202 NM_022460 64342 Hs.531785 NM_022460 ENSG00000118960 HS1BP3 ETM2|HS1-BP3 HCLS1 binding protein 3 protein-coding 152.667-73 chr12 13301805 13302048 + 1 NA Intergenic Intergenic 74819 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 138.667-213 chr9 20419177 20419388 + 1 NA intron (NM_001286691, intron 4 of 10) L1MEj|LINE|L1 -8044 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 277.667-6 chr10 119552463 119552862 + 1 NA Intergenic Intergenic -9943 NM_001005339 6001 Hs.501200 NM_002925 ENSG00000148908 RGS10 - regulator of G protein signaling 10 protein-coding 149.667-64 chr10 89045956 89046254 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -17231 NR_039826 100616128 NR_039826 ENSG00000283664 MIR4679-1 - microRNA 4679-1 ncRNA 140.333-9 chr1 75952482 75952693 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -20183 NR_026546 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 123.333-218 chr8 124545475 124545654 + 1 NA intron (NM_001311168, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 6441 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 236.667-69 chr6 15984445 15984751 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -144488 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 177.667-115 chr6 36690380 36690702 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -7285 NM_001257357 401258 Hs.485258 NM_207498 ENSG00000255587 RAB44 RASD3|RASL13|dJ431A14.3 RAB44, member RAS oncogene family protein-coding 200.333-136 chr7 5665380 5665696 + 1 NA intron (NR_046834, intron 2 of 2) intron (NR_046834, intron 2 of 2) 14923 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 160.667-142 chr2 50259586 50259779 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 88072 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 288.333-4 chr10 24668220 24668695 + 1 NA intron (NM_001367447, intron 3 of 24) MER6A|DNA|TcMar-Tigger -45614 NM_001367455 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 260.667-18 chr12 62022189 62022654 + 1 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 170418 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 226.667-65 chr4 63944272 63944765 + 1 NA Intergenic Intergenic 464932 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 156.667-251 chr4 97498894 97499050 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 132046 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 219.667-83 chr6 47942905 47943172 + 1 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) intron (NM_207499, intron 2 of 2) 125651 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 171.667-177 chr8 134296122 134296397 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -301812 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 149.667-368 chr7 38917191 38917442 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -8116 NM_080631 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 150.667-350 chr7 32247390 32247682 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 51792 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 205.667-61 chr18 1555769 1556078 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -196294 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 302.667-8 chr12 85357898 85358331 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 77894 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 133.333-52 chr14 47398022 47398230 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) MIR|SINE|MIR -54880 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 164.667-228 chr7 100362664 100362883 + 1 NA intron (NR_036570, intron 16 of 16) AluSz|SINE|Alu 4770 NM_178238 29990 Hs.632314 NM_013440 ENSG00000121716 PILRB FDFACT1|FDFACT2 paired immunoglobin like type 2 receptor beta protein-coding 146.333-95 chr14 68038225 68038504 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 214772 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 157.333-353 chr8 134522230 134522486 + 1 NA intron (NM_020863, intron 12 of 15) intron (NM_020863, intron 12 of 15) -75713 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 158.333-73 chr13 35858437 35858664 + 1 NA intron (NM_001330071, intron 5 of 16) intron (NM_001330071, intron 5 of 16) -2689 NM_001195415 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 169.333-184 chr4 81208888 81209138 + 1 NA intron (NM_006259, intron 1 of 18) intron (NM_006259, intron 1 of 18) 6104 NM_006259 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 257.333 chr1 1818630 1819127 + 1 NA intron (NM_001282539, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu -38847 NM_001353641 65220 Hs.654792 NM_023018 ENSG00000008130 NADK dJ283E3.1 NAD kinase protein-coding 162.333-163 chr3 69688204 69688425 + 1 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -51150 NM_001354605 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 161.667-98 chr16 83319012 83319195 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) intron (NM_001220489, intron 4 of 12) -189243 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 139.667-213 chr9 93722459 93722664 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -96796 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 118.667-92 chr19 30180554 30180694 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -191760 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 185.667-62 chr2 18439031 18439360 + 1 NA Intergenic Intergenic 121458 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 212.667-63 chr18 78211463 78211760 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -217884 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 141.667-186 chr5 147292212 147292411 + 1 NA intron (NM_001112724, intron 4 of 12) LTR49-int|LTR|ERV1 57285 NM_001112724 202374 Hs.585069 NM_145001 ENSG00000169302 STK32A YANK1 serine/threonine kinase 32A protein-coding 156.333-61 chr11 103525337 103525588 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -324444 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 144.667-138 chr2 74259159 74259439 + 1 NA intron (NM_133478, intron 12 of 30) intron (NM_133478, intron 12 of 30) 55726 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 336.667-10 chr15 75243431 75243936 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13993 NM_001321990 105376731 NM_001321990 LOC105376731 - taste receptor cell protein 1-like protein-coding 230.667-25 chr17 62377304 62377733 + 1 NA intron (NM_001144933, intron 2 of 11) intron (NM_001144933, intron 2 of 11) -3035 NM_173503 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 180.667 chr1 4524370 4524589 + 1 NA Intergenic Intergenic -47008 NR_147025 105376679 NR_147025 ENSG00000232596 LINC01646 - long intergenic non-protein coding RNA 1646 ncRNA 129.667-20 chr10 25847229 25847381 + 1 NA Intergenic Intergenic 86405 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 149.333-286 chr4 89050295 89050546 + 1 NA intron (NM_014883, intron 1 of 23) AluSz6|SINE|Alu 6765 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 401.667-4 chr13 101123779 101124191 + 1 NA intron (NM_001350748, intron 18 of 44) intron (NM_001350748, intron 18 of 44) -179621 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 340.333-19 chr6 153161312 153161797 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -30272 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 123.667-6 chr1 66033836 66034014 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) 16793 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 206.667-10 chr1 213464054 213464326 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 412949 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 161.667-123 chr2 43562910 43563166 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 15 of 37) L1M4|LINE|L1 32936 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 171.667-36 chr11 99967366 99967612 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 7 of 23) intron (NM_001243270, intron 7 of 23) 411344 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 196.667-20 chr10 95104086 95104379 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -34735 NM_001198853 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 276.333-59 chr7 24068497 24068885 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -215499 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 207.667-71 chr22 25135883 25136293 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) -23396 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 147.333-17 chr1 108816863 108817071 + 1 NA intron (NM_152763, intron 15 of 15) intron (NM_152763, intron 15 of 15) 40127 NM_152763 254268 Hs.729441 NM_152763 ENSG00000162641 AKNAD1 C1orf62 AKNA domain containing 1 protein-coding 137.333-65 chr17 41810919 41811081 + 1 NA exon (NM_006455, exon 3 of 8) exon (NM_006455, exon 3 of 8) 949 NM_006455 10609 Hs.446459 NM_006455 ENSG00000141696 P3H4 LEPREL4|NO55|NOL55|SC65 prolyl 3-hydroxylase family member 4 (non-enzymatic) protein-coding 243.667-11 chr10 131328731 131329142 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -17215 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 139.667-67 chr17 54923125 54923412 + 1 NA intron (NM_001321173, intron 7 of 9) L1MB5|LINE|L1 22416 NM_005486 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 168.333-68 chr16 6914060 6914319 + 1 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 140380 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 233.333-36 chr12 107340295 107340632 + 1 NA intron (NM_001347944, intron 1 of 14) intron (NM_001347944, intron 1 of 14) 19875 NM_001347944 121551 Hs.271272 NM_152322 ENSG00000151136 BTBD11 ABTB2B BTB domain containing 11 protein-coding 238.333-51 chr2 214401898 214402139 + 1 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -9036 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 299.333 chr1 84567336 84567804 + 1 NA intron (NM_004388, intron 3 of 6) MIR3|SINE|MIR 6870 NM_004388 1486 Hs.513557 NM_004388 ENSG00000117151 CTBS CTB chitobiase protein-coding 138.667-23 chr10 99472375 99472576 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -41851 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 170.333-117 chr2 164800358 164800617 + 1 NA intron (NM_001365670, intron 2 of 13) L1ME1|LINE|L1 -40262 NR_110574 101929633 Hs.570267 NR_110574 LOC101929633 - uncharacterized LOC101929633 ncRNA 149.333-134 chr16 77689971 77690121 + 1 NA Intergenic Intergenic -32446 NM_001243657 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 121.667-199 chr8 62405149 62405340 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) L1M1|LINE|L1 156390 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 140.667-202 chr6 119749071 119749347 + 1 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) L1PA17|LINE|L1 199401 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 162.333-162 chr3 67782202 67782404 + 1 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) L3|LINE|CR1 127606 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 304.333-8 chr12 12497700 12498251 + 1 NA intron (NM_030640, intron 4 of 6).2 (AAACA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 64888 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 199.667-5 chr1 108173353 108173645 + 1 NA intron (NM_013386, intron 3 of 9).2 THE1C|LTR|ERVL-MaLR 19336 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 208.667-126 chr7 31854100 31854322 + 1 NA intron (NM_001191059, intron 8 of 18) intron (NM_001191059, intron 8 of 18) 166996 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 238.667-46 chr2 111043587 111043988 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 16 of 18) intron (NM_001371254, intron 16 of 18) 71801 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 129.333-106 chr20 42302885 42303082 + 1 NA intron (NM_133170, intron 12 of 31) intron (NM_133170, intron 12 of 31) -382500 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 154.667-37 chr10 25475449 25475690 + 1 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) intron (NM_020752, intron 5 of 10) -176143 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 266.667-4 chr1 65863983 65864446 + 1 NA intron (NM_002600, intron 1 of 16) L1PA8|LINE|L1 -49031 NM_001297441 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 193.667-74 chr20 43361182 43361394 + 1 NA Intergenic Intergenic -96608 NR_034009 6431 Hs.684950 NM_006275 ENSG00000124193 SRSF6 B52|HEL-S-91|SFRS6|SRP55 serine and arginine rich splicing factor 6 protein-coding 328.333-25 chr2 201650918 201651466 + 1 NA intron (NM_033066, intron 18 of 21) intron (NM_033066, intron 18 of 21) -7689 NM_001044385 65062 Hs.12319 NM_152388 ENSG00000155755 TMEM237 ALS2CR4|JBTS14 transmembrane protein 237 protein-coding 221.667-9 chr11 9800911 9801287 + 1 NA intron (NM_030962, intron 32 of 39) intron (NM_030962, intron 32 of 39) -38043 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 157.667-146 chr2 98288446 98288649 + 1 NA intron (NM_001345864, intron 16 of 21) L1MEf|LINE|L1 -57608 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 182.667 chr1 38716200 38716400 + 1 NA Intergenic Intergenic 143472 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 137.667-87 chr2 13873107 13873267 + 1 NA Intergenic Intergenic 527771 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 168.333-72 chr17 66760314 66760565 + 1 NA intron (NM_002737, intron 13 of 16) L1MCa|LINE|L1 -26633 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 204.667-101 chr3 174422179 174422498 + 1 NA Intergenic Intergenic -436996 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 147.667-299 chr5 164566180 164566332 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 95977 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 200.333-72 chr2 110802019 110802323 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 8 of 18) L1ME4a|LINE|L1 69598 NM_001371254 174.333-70 chr2 167965148 167965492 + 1 NA intron (NM_013233, intron 16 of 17) intron (NM_013233, intron 16 of 17) -24176 NR_131227 105616981 Hs.512811 NR_131227 LOC105616981 - uncharacterized LOC105616981 ncRNA 203.333-278 chr9 31396876 31397214 + 1 NA Intergenic Intergenic -15555 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 184.667-99 chr5 71876629 71876925 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 157502 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 167.333-208 chr5 77534053 77534317 + 1 NA Intergenic Intergenic -41869 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 156.333-13 chr1 62781123 62781309 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -2890 NM_178221 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 162.667-79 chr14 58856127 58856328 + 1 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) L1MA4A|LINE|L1 27939 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 147.667-178 chr2 89850001 89850158 + 1 NA Intergenic Intergenic -212172 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 115.667-179 chr5 76465534 76465782 + 1 NA intron (NM_006633, intron 2 of 35) L1MB7|LINE|L1 62373 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 364.667-9 chr16 3295965 3296474 + 1 NA Intergenic Intergenic -9187 NM_153028 7627 Hs.513292 NM_153028 ENSG00000162086 ZNF75A - zinc finger protein 75a protein-coding 199.667-23 chr10 118138060 118138432 + 1 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) L1ME3F|LINE|L1 -91305 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 243.333-48 chr2 12272180 12272440 + 1 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) L1M4|LINE|L1 73180 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 147.667-115 chr15 87347229 87347377 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -229626 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 263.333-12 chr11 107703562 107703971 + 1 NA Intergenic Intergenic 8290 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 130.667-14 chr1 176761250 176761508 + 1 NA intron (NM_020318, intron 14 of 22) intron (NM_020318, intron 14 of 22) 268066 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 168.333-25 chr10 84369872 84370149 + 1 NA intron (NM_018999, intron 1 of 10) L1PB3|LINE|L1 41421 NM_001284241 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 274.333-48 chr3 35535916 35536394 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -103370 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 264.667-88 chr8 99638111 99638476 + 1 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) MIR|SINE|MIR -101432 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 152.333-374 chr8 68785877 68786047 + 1 NA intron (NR_146187, intron 11 of 13) intron (NR_146187, intron 11 of 13) 318228 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 166.667-212 chr7 3867618 3867941 + 1 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -261906 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 283.333-32 chr2 60382942 60383408 + 1 NA promoter-TSS (NR_132991) promoter-TSS (NR_132991) -139 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 154.333-17 chr1 115035729 115035977 + 1 NA Intergenic Intergenic 1907 NM_001277991 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 199.333-158 chr2 237168953 237169310 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 83242 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 358.333-14 chr17 79618844 79619407 + 1 NA Intergenic Intergenic -8074 NM_001350451 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 164.667-111 chr2 88588556 88588893 + 1 NA intron (NM_004836, intron 7 of 16) intron (NM_004836, intron 7 of 16) 36205 NM_001313915 9451 Hs.591589 NM_004836 ENSG00000172071 EIF2AK3 PEK|PERK|WRS eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 protein-coding 162.333-100 chr18 66676384 66676553 + 1 NA Intergenic Intergenic -72378 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 197.667-109 chr4 56009686 56009956 + 1 NA exon (NM_025009, exon 19 of 26) exon (NM_025009, exon 19 of 26) 60876 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 167.667-27 chr10 70855148 70855467 + 1 NA intron (NM_003901, intron 5 of 14) (ATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 32574 NM_001289797 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 130.667-143 chr3 59667789 59668044 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -9419 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 164.667-148 chr3 103430870 103431159 + 1 NA Intergenic Intergenic 93102 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 236.667-98 chrX 76765752 76766031 + 1 NA intron (NR_110400, intron 1 of 3) L1MA9|LINE|L1 153469 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 170.667-120 chr4 7793156 7793444 + 1 NA intron (NM_198595, intron 11 of 16) MER58A|DNA|hAT-Charlie 39210 NR_026892 84740 Hs.663029 NM_032654 ENSG00000272620 AFAP1-AS1 AFAP1-AS|AFAP1AS AFAP1 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-82 chr11 87904766 87905030 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -185487 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 150.667-170 chr2 35197079 35197260 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -274236 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 142.333-14 chr1 232802217 232802414 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -2577 NM_019090 54627 Hs.160373 NM_019090 ENSG00000212916 MAP10 KIAA1383|MTR120 microtubule associated protein 10 protein-coding 194.333-29 chr11 27124137 27124486 + 1 NA intron (NM_003986, intron 7 of 8) intron (NM_003986, intron 7 of 8) 83496 NM_003986 8424 Hs.591996 NM_003986 ENSG00000129151 BBOX1 BBH|BBOX|G-BBH|gamma-BBH gamma-butyrobetaine hydroxylase 1 protein-coding 219.333-77 chr17 68445430 68445763 + 1 NA intron (NM_001320772, intron 2 of 11) intron (NM_001320772, intron 2 of 11) 11900 NM_017983 55062 Hs.463964 NM_017983 ENSG00000070540 WIPI1 ATG18|ATG18A|WIPI49 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 protein-coding 167.333-215 chr5 121177984 121178192 + 1 NA Intergenic Intergenic -144462 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 147.667-143 chr17 62603634 62603802 + 1 NA intron (NM_001284363, intron 17 of 19) L1MC5|LINE|L1 -23952 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 155.667-310 chr6 116707705 116707942 + 1 NA intron (NM_001366310, intron 7 of 8) L1MB5|LINE|L1 26612 NM_001366308 3841 Hs.182971 NM_002269 ENSG00000196911 KPNA5 IPOA6|SRP6 karyopherin subunit alpha 5 protein-coding 184.333-8 chr1 231963233 231963583 + 1 NA intron (NM_001164538, intron 10 of 10) intron (NM_001164538, intron 10 of 10) 37574 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 231.667-27 chr2 20239329 20239627 + 1 NA Intergenic Intergenic -14045 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 141.667-233 chr8 127054058 127054277 + 1 NA Intergenic Intergenic -25707 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 186.667-43 chr15 69064509 69064704 + 1 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -16244 NR_026949 283673 Hs.177927 NM_173610 ENSG00000212766 EWSAT1 LINC00277|NCRNA00277|TMEM84 Ewing sarcoma associated transcript 1 ncRNA 231.333-6 chr1 116229898 116230253 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 118320 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 214.667-97 chr5 32764133 32764413 + 1 NA intron (NM_001364460, intron 2 of 6) L1MEf|LINE|L1 52952 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 130.667-41 chr10 122421457 122421639 + 1 NA intron (NM_001330178, intron 9 of 13) L1MC4|LINE|L1 4583 NR_037506 100500866 NR_037506 ENSG00000265442 MIR3941 - microRNA 3941 ncRNA 144.667-276 chr6 166854350 166854528 + 1 NA intron (NM_001318936, intron 2 of 22) intron (NM_001318936, intron 2 of 22) 8086 NM_001006932 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 224.333-104 chr5 145191263 145191746 + 1 NA Intergenic Intergenic 643838 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 268.667-37 chr20 31413808 31414220 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -1176 NM_001171832 245934 Hs.272294 NM_001011878 ENSG00000204548 DEFB121 DEFB21|ESC42RELC defensin beta 121 protein-coding 154.333-345 chr8 107626975 107627151 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -129145 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 118.667-154 chr5 9591274 9591424 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 39002 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 123.667-85 chr2 40962519 40962678 + 1 NA Intergenic Intergenic -450163 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 214.667-111 chr8 25335050 25335411 + 1 NA intron (NM_024940, intron 21 of 51) intron (NM_024940, intron 21 of 51) -10172 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 281.333-70 chr8 106567247 106567758 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -90306 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 193.667-43 chr14 71071007 71071327 + 1 NA intron (NM_014982, intron 26 of 35) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 163708 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 156.333-386 chrX 63768595 63768900 + 1 NA intron (NM_001330495, intron 1 of 10) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -13531 NM_001353923 23229 Hs.54697 NM_015185 ENSG00000131089 ARHGEF9 COLLYBISTIN|EIEE8|HPEM-2|PEM-2|PEM2 Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9 protein-coding 149.333-90 chr12 48000613 48000766 + 1 NA intron (NM_001844, intron 1 of 53) intron (NM_001844, intron 1 of 53) 3787 NM_001844 1280 Hs.408182 NM_001844 ENSG00000139219 COL2A1 ANFH|AOM|COL11A3|SEDC|STL1 collagen type II alpha 1 chain protein-coding 214.333-155 chr8 89193965 89194246 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 563606 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 324.333-39 chr8 115192690 115193090 + 1 NA Intergenic Intergenic 475123 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 302.333-32 chr7 96765285 96765770 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -55636 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 148.333-26 chr1 152525378 152525621 + 1 NA Intergenic Intergenic 11017 NM_019060 54544 Hs.110196 NM_019060 ENSG00000169509 CRCT1 C1orf42|NICE-1|NICE1 cysteine rich C-terminal 1 protein-coding 169.667 chr1 16266443 16266659 + 1 NA intron (NM_018994, intron 4 of 9) intron (NM_018994, intron 4 of 9) -29368 NM_030907 79363 Hs.546430 NM_030907 ENSG00000132881 CPLANE2 C1orf89|RSG1 ciliogenesis and planar polarity effector 2 protein-coding 223.667-11 chr10 58602635 58602991 + 1 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) 89941 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 154.333-228 chr3 163187910 163188067 + 1 NA intron (NR_033945, intron 4 of 6) L2|LINE|L2 115313 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 248.667-63 chr2 172479030 172479458 + 1 NA intron (NM_001365530, intron 9 of 25) L1ME4b|LINE|L1 -13222 NR_157573 101929947 Hs.710861 NR_157573 ITGA6-AS1 - ITGA6 antisense RNA 1 ncRNA 143.667-45 chr11 107709134 107709285 + 1 NA intron (NM_003063, intron 1 of 1) intron (NM_003063, intron 1 of 1) 2847 NM_003063 6588 Hs.334629 NM_003063 ENSG00000170290 SLN - sarcolipin protein-coding 206.667-102 chr4 74371292 74371549 + 1 NA intron (NM_001432, intron 1 of 4) intron (NM_001432, intron 1 of 4) 6275 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 129.667-158 chr7 15144442 15144598 + 1 NA Intergenic Intergenic -169662 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 203.333-170 chr3 41597268 41597694 + 1 NA intron (NR_136342, intron 29 of 34) intron (NR_136342, intron 29 of 34) 364622 NM_001322501 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 240.667-32 chr16 88354664 88355187 + 1 NA Intergenic Intergenic -72546 NM_001367624 84627 Hs.54925 NM_001127464 ENSG00000225614 ZNF469 BCS|BCS1 zinc finger protein 469 protein-coding 181.333-29 chr11 121204510 121204713 + 1 NA Intergenic Intergenic -88160 NM_006918 6309 Hs.287749 NM_006918 ENSG00000109929 SC5D ERG3|S5DES|SC5DL sterol-C5-desaturase protein-coding 124.333-158 chr6 49740274 49740451 + 1 NA intron (NM_001368123, intron 1 of 7) intron (NM_001368123, intron 1 of 7) 4026 NM_001368123 10321 Hs.404466 NM_006061 ENSG00000096006 CRISP3 Aeg2|CRISP-3|CRS3|SGP28|dJ442L6.3 cysteine rich secretory protein 3 protein-coding 177.667-105 chr4 168009510 168009729 + 1 NA Intergenic Intergenic -82918 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 138.667-110 chr2 107498689 107498844 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -30653 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 119.333-191 chr6 111201357 111201542 + 1 NA intron (NM_018593, intron 3 of 5) intron (NM_018593, intron 3 of 5) -57890 NM_153369 91749 Hs.400572 NM_153369 ENSG00000173214 MFSD4B KIAA1919|NaGLT1 major facilitator superfamily domain containing 4B protein-coding 152.333-200 chr2 200315442 200315743 + 1 NA intron (NM_001282744, intron 1 of 12) intron (NM_001282744, intron 1 of 12) 6642 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 150.667-294 chr5 32301928 32302129 + 1 NA intron (NM_001294344, intron 1 of 13) intron (NM_001294344, intron 1 of 13) 10911 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 301.667-6 chr11 36024992 36025367 + 1 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) intron (NM_001304264, intron 1 of 5) 15081 NR_039769 100616311 NR_039769 ENSG00000263389 MIR3973 - microRNA 3973 ncRNA 150.667-14 chr1 175517938 175518217 + 1 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) 225518 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 138.667-145 chr4 36259040 36259201 + 1 NA intron (NR_122080, intron 1 of 2) intron (NR_122080, intron 1 of 2) 2602 NR_122080 439933 Hs.591071 NR_122079 ENSG00000247193 LOC439933 - uncharacterized LOC439933 ncRNA 249.667-76 chr5 23958618 23959020 + 1 NA intron (NR_131245, intron 1 of 4) L1PA10|LINE|L1 7471 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 244.667-16 chr10 78339759 78340048 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 72561 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 186.333-10 chr1 226270924 226271188 + 1 NA intron (NM_001366239, intron 7 of 13) intron (NM_001366239, intron 7 of 13) 38108 NM_001366245 286826 Hs.120817 NM_173083 ENSG00000183814 LIN9 BARA|BARPsv|Lin-9|TGS|TGS1|TGS2 lin-9 DREAM MuvB core complex component protein-coding 158.333-218 chr3 177822759 177823033 + 1 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) intron (NR_110826, intron 1 of 2) 6031 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 153.667-306 chr5 23254260 23254547 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -253206 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 198.333-78 chr17 40738702 40739030 + 1 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL 16465 NM_181534 147183 Hs.55412 NM_181534 ENSG00000204897 KRT25 ARWH3|KRT24IRS1|KRT25A keratin 25 protein-coding 122.333-70 chr16 87297927 87298124 + 1 NA Intergenic Intergenic -5573 NR_104667 101928682 Hs.149004 NR_104667 ENSG00000261697 LOC101928682 - uncharacterized LOC101928682 ncRNA 275.667-11 chr11 25482351 25482887 + 1 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -706504 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 342.667-6 chr3 151934935 151935491 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7038 NR_110203 101928142 Hs.680207 NR_110202 AADACL2-AS1 - AADACL2 antisense RNA 1 ncRNA 218.667-24 chr12 1459415 1459665 + 1 NA intron (NR_027948, intron 19 of 19) L1MC4|LINE|L1 -40951 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 151.667-38 chr10 17585872 17586087 + 1 NA Intergenic Intergenic 31395 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 156.333-225 chr3 22351861 22352033 + 1 NA Intergenic Intergenic 394808 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 154.667-270 chr4 47006661 47006937 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -13218 NM_001204266 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 149.667-221 chr2 181998833 181999097 + 1 NA intron (NM_001261425, intron 2 of 5) intron (NM_001261425, intron 2 of 5) 13112 NM_001261425 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 269.333-42 chr2 67919542 67919936 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -94177 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 164.667-174 chr4 149209720 149209916 + 1 NA intron (NR_125887, intron 5 of 12) intron (NR_125887, intron 5 of 12) 55523 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 124.667-180 chr6 134169196 134169346 + 1 NA TTS (NM_001143676) TTS (NM_001143676) 5595 NM_001291995 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 215.333-70 chr16 64096685 64097040 + 1 NA Intergenic Intergenic 1025201 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 173.333-87 chr2 15620517 15620842 + 1 NA intron (NM_004939, intron 17 of 25) intron (NM_004939, intron 17 of 25) 28811 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 163.333-107 chr15 97565942 97566227 + 1 NA Intergenic Intergenic -5386 NR_110756 101927310 Hs.560324 NR_110756 ENSG00000259582 LOC101927310 - uncharacterized LOC101927310 ncRNA 180.333-33 chr14 62330406 62330759 + 1 NA Intergenic Intergenic -190609 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 241.667-74 chr5 72756951 72757282 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -59475 NM_002270 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 115.333-51 chr12 100841572 100841757 + 1 NA intron (NM_001286615, intron 1 of 27) L2a|LINE|L2 46888 NM_001286615 121601 Hs.58785 NM_178826 ENSG00000151572 ANO4 TMEM16D anoctamin 4 protein-coding 173.333-211 chr9 24838184 24838374 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -292382 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 168.667-200 chr7 40306830 40307014 + 1 NA intron (NM_024728, intron 8 of 14) intron (NM_024728, intron 8 of 14) 171946 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 150.333-122 chr15 24822788 24823043 + 1 NA promoter-TSS (NM_022808) promoter-TSS (NM_022808) -693 NM_001349459 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 471.333-7 chr8 128265487 128266249 + 1 NA Intergenic Intergenic 115752 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 146.667-10 chr1 73424097 73424248 + 1 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL 118002 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 157.667-271 chr6 4816674 4816964 + 1 NA intron (NM_001368127, intron 1 of 5) intron (NM_001368127, intron 1 of 5) -19279 NM_001143970 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 158.667-32 chr10 17450656 17450841 + 1 NA intron (NM_001004470, intron 2 of 7) intron (NM_001004470, intron 2 of 7) 3847 NM_001004470 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 219.667-93 chr8 78289561 78289937 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -226591 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 243.333-15 chr11 116553451 116553798 + 1 NA Intergenic Intergenic -85798 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 169.333-17 chr1 232051561 232051746 + 1 NA Intergenic (GGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 125819 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 156.667-276 chr5 106043967 106044150 + 1 NA Intergenic Intergenic 944584 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 185.333-122 chr3 106281613 106281832 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -412321 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 155.333-3 chr1 44177854 44178079 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -35505 NM_019100 55929 Hs.8008 NM_019100 ENSG00000178028 DMAP1 DNMAP1|DNMTAP1|EAF2|MEAF2|SWC4 DNA methyltransferase 1 associated protein 1 protein-coding 155.333-148 chr18 65070865 65071063 + 1 NA Intergenic Intergenic -679288 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 128.667-129 chr4 62033774 62033997 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 21 of 23) intron (NM_001371343, intron 21 of 23) 127880 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 122.333-112 chr2 197039803 197039965 + 1 NA intron (NM_001367496, intron 16 of 27) LTR37B|LTR|ERV1 -113177 NM_001321099 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 133.667-153 chr8 116908598 116908929 + 1 NA Intergenic Intergenic -29444 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 165.667-121 chr3 46481528 46481705 + 1 NA intron (NM_001321122, intron 1 of 19) AluSx1|SINE|Alu 3618 NM_001321122 4057 Hs.529517 NM_002343 ENSG00000012223 LTF GIG12|HEL110|HLF2|LF lactotransferrin protein-coding 258.333-79 chrX 77552779 77553073 + 1 NA intron (NM_000489, intron 30 of 34) intron (NM_000489, intron 30 of 34) 105537 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 218.333-9 chr1 169333469 169333921 + 1 NA intron (NR_104229, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 34102 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 201.667-111 chr6 153950664 153951012 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -59658 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 166.333-80 chr15 66295504 66295815 + 1 NA intron (NM_001323948, intron 2 of 15) intron (NM_001323948, intron 2 of 15) 1844 NM_001323945 115752 Hs.446251 NM_133375 ENSG00000166938 DIS3L DIS3L1 DIS3 like exosome 3'-5' exoribonuclease protein-coding 151.333-356 chr6 7596284 7596495 + 1 NA intron (NM_152551, intron 4 of 8) intron (NM_152551, intron 4 of 8) 6191 NM_152551 154007 Hs.13366 NM_152551 ENSG00000168566 SNRNP48 C6orf151|dJ336K20B.1|dJ512B11.2 small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 48 protein-coding 137.333-81 chr18 66105128 66105354 + 1 NA Intergenic Intergenic 354229 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 189.333-181 chr6 156295314 156295621 + 1 NA Intergenic Charlie14a|DNA|hAT-Charlie -83283 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 141.667-54 chr12 23841659 23841898 + 1 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) L1MC3|LINE|L1 107892 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 172.667 chr1 14370135 14370417 + 1 NA intron (NR_149058, intron 3 of 4) intron (NR_149058, intron 3 of 4) 49697 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 155.333-398 chr8 118878315 118878475 + 1 NA Intergenic Intergenic 73490 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 164.667-141 chr3 12077032 12077238 + 1 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) intron (NM_133625, intron 1 of 12) 72744 NM_133625 6854 Hs.445503 NM_003178 ENSG00000157152 SYN2 SYNII synapsin II protein-coding 161.667-128 chr2 67957368 67957646 + 1 NA Intergenic Intergenic 105497 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 200.333-24 chr11 111596245 111596543 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -6055 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 200.667-142 chr6 165784075 165784413 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -121964 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 171.667-176 chr8 132810557 132810839 + 1 NA intron (NM_198513, intron 7 of 7) intron (NM_198513, intron 7 of 7) 35310 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 145.667-191 chr4 38809222 38809448 + 1 NA Intergenic Intergenic -4544 NM_003263 7096 Hs.621817 NM_003263 ENSG00000174125 TLR1 CD281|TIL|TIL. LPRS5|rsc786 toll like receptor 1 protein-coding 200.667-162 chr8 131686866 131687107 + 1 NA Intergenic Intergenic -217107 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 164.667-42 chr11 107005700 107005966 + 1 NA intron (NM_001256424, intron 1 of 8) intron (NM_001256424, intron 1 of 8) 12643 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 169.333-178 chr4 54522189 54522481 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 84796 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 193.667-116 chr6 143706986 143707319 + 1 NA intron (NM_001100165, intron 1 of 11) intron (NM_001100165, intron 1 of 11) 29187 NM_001100164 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 167.667-112 chr2 192184367 192184630 + 1 NA intron (NM_001305134, intron 2 of 9) intron (NM_001305134, intron 2 of 9) 10435 NM_016192 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 148.667-214 chr2 207585879 207586125 + 1 NA intron (NM_001330133, intron 3 of 3) L1MA5|LINE|L1 26880 NM_001371428 157.667-132 chr19 29364101 29364292 + 1 NA intron (NR_040029, intron 9 of 9) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -151045 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 291.667-16 chr2 58752541 58752906 + 1 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 231970 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 153.667-354 chr7 27566633 27566867 + 1 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) L1ME1|LINE|L1 -49224 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 277.667-18 chr17 53873799 53874133 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 51039 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 214.667-8 chr1 229939603 229940054 + 1 NA Intergenic Intergenic -45920 NR_146475 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 216.667-40 chr15 101418348 101418808 + 1 NA intron (NM_138325, intron 6 of 13) AluSx1|SINE|Alu 71129 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 235.667-16 chr13 87378683 87379009 + 1 NA Intergenic Intergenic 239894 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 147.333-282 chr6 127348035 127348232 + 1 NA Intergenic Intergenic -4524 NM_001002030 55862 Hs.486410 NM_018479 ENSG00000093144 ECHDC1 HEL-S-76|MMCD|dJ351K20.2 ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1 protein-coding 247.667-82 chr5 161404980 161405325 + 1 NA intron (NM_000813, intron 6 of 9) L3|LINE|CR1 142972 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 205.667-28 chr11 91455645 91455927 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -586584 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 238.333-37 chr19 1179573 1179865 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5451 NM_014963 22904 Hs.408708 NM_014963 ENSG00000064932 SBNO2 KIAA0963|SNO|STNO strawberry notch homolog 2 protein-coding 187.333-199 chr8 101303082 101303397 + 1 NA Intergenic Intergenic -65654 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 161.667-231 chr6 161434958 161435226 + 1 NA intron (NM_004562, intron 9 of 11) intron (NM_004562, intron 9 of 11) -35885 NR_134594 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 146.333-12 chr1 89625085 89625321 + 1 NA non-coding (NR_033981, exon 3 of 3) non-coding (NR_033981, exon 3 of 3) 7691 NR_033981 400761 Hs.741594 NR_033981 ENSG00000231999 LRRC8C-DT - LRRC8C divergent transcript ncRNA 158.667-42 chr10 74035699 74035858 + 1 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) MER2|DNA|TcMar-Tigger 37662 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 334.667-28 chr6 151746184 151746602 + 1 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) intron (NM_001122742, intron 2 of 9) 55897 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 175.667-130 chr6 166833028 166833372 + 1 NA intron (NM_001318936, intron 2 of 22) intron (NM_001318936, intron 2 of 22) 29325 NM_001006932 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 152.667-36 chr10 43010419 43010666 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 12979 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 198.667-85 chr18 2685475 2685788 + 1 NA intron (NM_015295, intron 5 of 47) L1MB4|LINE|L1 29744 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 163.333-53 chr11 62759314 62759566 + 1 NA Intergenic LTR24|LTR|ERV1 -2140 NM_002696 5436 Hs.14839 NM_002696 ENSG00000168002 POLR2G RPB19|RPB7|hRPB19|hsRPB7 RNA polymerase II subunit G protein-coding 124.667-187 chr7 35619475 35619720 + 1 NA Intergenic Intergenic 75538 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 259.667-80 chr7 104406937 104407275 + 1 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 78450 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 117.333-162 chr4 168356478 168356716 + 1 NA TTS (NM_001012967) TTS (NM_001012967) -37845 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 144.667-112 chr17 61551122 61551415 + 1 NA Intergenic Intergenic 39951 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 145.667-219 chr5 86819368 86819570 + 1 NA Intergenic Intergenic 72651 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 152.667-241 chr3 37772478 37772632 + 1 NA intron (NR_110531, intron 3 of 3) intron (NR_110531, intron 3 of 3) 89225 NR_110532 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 164.333-148 chr3 6555940 6556222 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 249368 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 148.667-122 chr14 68228120 68228276 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) MIRb|SINE|MIR 400589 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 215.333-115 chr21 28379165 28379466 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -150648 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 307.333-32 chr16 51223848 51224310 + 1 NA intron (NR_039672, intron 5 of 6) L2b|LINE|L2 -72807 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 141.667-9 chr1 116161138 116161304 + 1 NA Intergenic Intergenic 49466 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 160.333-101 chr14 56514725 56514889 + 1 NA intron (NR_135241, intron 1 of 1) L1MB3|LINE|L1 476 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 220.333-99 chr4 32182646 32182988 + 1 NA Intergenic Intergenic -160395 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 193.333-5 chr1 106064376 106064678 + 1 NA Intergenic Intergenic -36274 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 176.333-134 chr5 55764748 55765040 + 1 NA intron (NM_001166533, intron 6 of 20) intron (NM_001166533, intron 6 of 20) -1991 NM_001166534 54514 Hs.223581 NM_019039 ENSG00000152670 DDX4 VASA DEAD-box helicase 4 protein-coding 154.333-142 chr2 285492 285712 + 1 NA intron (NM_001002919, intron 4 of 5) intron (NM_001002919, intron 4 of 5) 2489 NM_001002919 285016 Hs.355207 NM_001002919 ENSG00000189292 ALKAL2 AUGA|FAM150B|PRO1097|RGPG542 ALK and LTK ligand 2 protein-coding 250.667-62 chr5 37999224 37999524 + 1 NA Intergenic Intergenic -26323 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 121.333-39 chr12 26533000 26533178 + 1 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 300105 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 162.667-245 chr6 85128947 85129164 + 1 NA Intergenic Intergenic 261131 NR_134634 101928820 Hs.587370 NR_134633 ENSG00000234155 LINC02535 - long intergenic non-protein coding RNA 2535 ncRNA 269.667-29 chr2 36696704 36697312 + 1 NA intron (NM_001177969, intron 1 of 14) intron (NM_001177969, intron 1 of 14) 301 NM_053276 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 133.667-24 chr10 116281291 116281518 + 1 NA Intergenic Intergenic -7759 NM_001145453 2674 Hs.388347 NM_005264 ENSG00000151892 GFRA1 GDNFR|GDNFRA|GFR-ALPHA-1|RET1L|RETL1|TRNR1 GDNF family receptor alpha 1 protein-coding 196.667-102 chr3 170916971 170917395 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -8546 NM_020390 56648 Hs.164144 NM_020390 ENSG00000163577 EIF5A2 EIF-5A2|eIF5AII eukaryotic translation initiation factor 5A2 protein-coding 164.333-21 chr10 11271622 11272014 + 1 NA intron (NM_001025076, intron 7 of 13) intron (NM_001025076, intron 7 of 13) 72856 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-343 chr8 116662693 116662945 + 1 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 10719 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 222.333-51 chr2 206248069 206248571 + 1 NA intron (NR_104359, intron 2 of 5).2 AluSp|SINE|Alu -26343 NM_020923 57683 Hs.110489 NM_020923 ENSG00000204186 ZDBF2 Slx9 zinc finger DBF-type containing 2 protein-coding 215.333-94 chr2 126273012 126273327 + 1 NA Intergenic Intergenic -155184 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 225.667-25 chr14 61951009 61951441 + 1 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) intron (NM_001367663, intron 1 of 7) 23530 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 173.667-45 chr14 61242028 61242246 + 1 NA Intergenic Intergenic 39201 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 118.333-177 chr6 50493627 50493849 + 1 NA Intergenic Intergenic -219806 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 157.333-274 chr5 15162216 15162430 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 104237 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 147.667-87 chr13 47794570 47794813 + 1 NA Intergenic Intergenic 137931 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 151.667-268 chr5 22505615 22505796 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) L1MC3|LINE|L1 -291855 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 289.667-28 chr4 52392140 52392494 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 264222 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 147.667-164 chr2 36067205 36067407 + 1 NA Intergenic Intergenic 288264 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 177.667-117 chr6 44248295 44248576 + 1 NA intron (NM_001371238, intron 1 of 11) intron (NM_001371238, intron 1 of 11) 492 NM_001371238 267.667-63 chr7 28256568 28256835 + 1 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -42620 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 180.667-131 chr6 152803193 152803496 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 52547 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 172.667-82 chr2 66777503 66777772 + 1 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -74410 NR_110265 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 157.333-160 chr18 1745205 1745452 + 1 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -385699 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 232.333-84 chr8 8489645 8490061 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -103414 NR_163138 157285 Hs.583863 NM_001080826 ENSG00000275342 PRAG1 NACK|PEAK2|PRAGMIN|SGK223 PEAK1 related, kinase-activating pseudokinase 1 protein-coding 121.667-23 chr10 59336595 59336830 + 1 NA intron (NM_001347848, intron 4 of 15) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 25837 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 223.667-28 chr16 81668161 81668625 + 1 NA intron (NM_030629, intron 7 of 20) intron (NM_030629, intron 7 of 20) 3039 NR_045112 100129617 Hs.657151 NR_045112 LOC100129617 - uncharacterized LOC100129617 ncRNA 207.333-74 chr13 42100737 42101138 + 1 NA intron (NM_178009, intron 1 of 29) MIR3|SINE|MIR -37105 NR_123715 160851 Hs.630380 NM_152910 ENSG00000102780 DGKH DGKeta diacylglycerol kinase eta protein-coding 150.333-444 chrX 74838130 74838387 + 1 NA intron (NM_001008537, intron 1 of 3) intron (NM_001008537, intron 1 of 3) 87194 NM_001008537 340533 Hs.124128 NM_001008537 ENSG00000050030 NEXMIF KIAA2022|KIDLIA|MRX98|XPN neurite extension and migration factor protein-coding 196.333-109 chr3 81338042 81338456 + 1 NA Intergenic Intergenic 344381 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 229.667-60 chr3 82811838 82812159 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 825856 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 331.333-3 chr1 65233265 65233680 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -31222 NM_001256865 9829 Hs.647643 NM_014787 ENSG00000116675 DNAJC6 DJC6|PARK19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 protein-coding 180.667-114 chr5 133834449 133834858 + 1 NA Intergenic Intergenic -79024 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 154.667-201 chr2 192853552 192853755 + 1 NA Intergenic Intergenic 103808 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 114.667-202 chr5 33795166 33795323 + 1 NA intron (NM_001324511, intron 2 of 2) intron (NM_001324511, intron 2 of 2) 96746 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 130.333-132 chr3 88509220 88509387 + 1 NA Intergenic Intergenic 170847 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 159.667-288 chr6 170013187 170013392 + 1 NA Intergenic Intergenic 50666 NR_027434 100131532 Hs.703417 NR_027434 LOC100131532 - uncharacterized LOC100131532 ncRNA 176.667-150 chr8 128131008 128131359 + 1 NA Intergenic Intergenic -18933 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 196.667-66 chr19 56583011 56583243 + 1 NA TTS (NM_001001668) TTS (NM_001001668) -12169 NM_021216 58491 Hs.301431 NM_021216 ENSG00000197951 ZNF71 EZFIT zinc finger protein 71 protein-coding 124.667-132 chr3 2627699 2627860 + 1 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) AluY|SINE|Alu -264436 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 158.667-60 chr11 60593641 60593917 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -21972 NR_026946 283197 Hs.372650 NM_174939 ENSG00000181995 LINC00301 C11orf64|NCRNA00301 long intergenic non-protein coding RNA 301 ncRNA 161.333-82 chr13 99022785 99023002 + 1 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) AluJo|SINE|Alu -7108 NM_001366677 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 192.333-79 chr19 10526457 10526774 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -8650 NM_001166215 53637 Hs.501561 NM_030760 ENSG00000180739 S1PR5 EDG8|Edg-8|S1P5|SPPR-1|SPPR-2 sphingosine-1-phosphate receptor 5 protein-coding 216.333-44 chr13 112717091 112717432 + 1 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) intron (NM_032189, intron 1 of 28) 26932 NM_032189 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 126.667-145 chr5 114977625 114977774 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 192209 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 227.667-62 chr5 119386595 119386881 + 1 NA intron (NM_014350, intron 1 of 1) intron (NM_014350, intron 1 of 1) 30719 NM_014350 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 225.333-129 chr7 107967083 107967489 + 1 NA intron (NM_002291, intron 13 of 33) intron (NM_002291, intron 13 of 33) 35875 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 166.333-117 chr2 75187220 75187442 + 1 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) intron (NM_015727, intron 1 of 3) 12189 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 168.667-141 chr3 78809944 78810226 + 1 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 209374 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 150.333-130 chr15 65200309 65200492 + 1 NA intron (NM_003613, intron 8 of 8) intron (NM_003613, intron 8 of 8) 11073 NM_003613 8483 Hs.442180 NM_003613 ENSG00000138615 CILP CILP-1|HsT18872 cartilage intermediate layer protein protein-coding 163.333-168 chr21 24592641 24592832 + 1 NA Intergenic Intergenic 163996 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 364.667-5 chr12 90891140 90891518 + 1 NA Intergenic Intergenic -26694 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 218.667-63 chr22 28050519 28050907 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) intron (NM_001145418, intron 12 of 22) -130101 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 202.333-116 chr3 185701489 185701849 + 1 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) -11583 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 118.333-158 chr4 175566130 175566309 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 221457 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 229.667-55 chr3 4424527 4424833 + 1 NA intron (NM_001164674, intron 2 of 7) intron (NM_001164674, intron 2 of 7) 42589 NM_182760 285362 Hs.350475 NM_182760 ENSG00000144455 SUMF1 AAPA3037|FGE|UNQ3037 sulfatase modifying factor 1 protein-coding 157.667-287 chr6 142544497 142544657 + 1 NA intron (NR_027311, intron 2 of 2) intron (NR_027311, intron 2 of 2) 93259 NR_027311 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 136.667-191 chrX 100142664 100142843 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 267520 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 205.333-233 chr8 49246838 49247163 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 174656 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 137.333-143 chr4 145173429 145173621 + 1 NA intron (NM_017493, intron 2 of 6) intron (NM_017493, intron 2 of 6) 4633 NM_017493 54726 Hs.270851 NM_017493 ENSG00000164164 OTUD4 DUBA6|HIN1|HSHIN1 OTU deubiquitinase 4 protein-coding 132.333-31 chr11 50645252 50645419 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 236188 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 156.333-364 chr8 117198674 117198895 + 1 NA Intergenic Intergenic 63789 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 143.667-191 chr4 157621116 157621360 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 48748 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 219.333-98 chr2 107659477 107659859 + 1 NA Intergenic Intergenic -94444 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 172.667-34 chr11 122410706 122410962 + 1 NA intron (NR_137179, intron 1 of 4) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 12037 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 220.333-136 chr8 142137583 142138013 + 1 NA Intergenic Intergenic -38541 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 131.667-52 chr13 88059395 88059547 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -83396 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 159.333-72 chr12 89596790 89596996 + 1 NA intron (NM_001366521, intron 20 of 20) intron (NM_001366521, intron 20 of 20) -70631 NM_001199782 100528030 Hs.25130 NM_001199781 ENSG00000259075 POC1B-GALNT4 GALNT4|GalNAc-T4 POC1B-GALNT4 readthrough protein-coding 161.667-212 chr5 145475058 145475224 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 360201 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 166.333-74 chr14 70934167 70934421 + 1 NA intron (NM_014982, intron 1 of 35) Charlie25|DNA|hAT-Charlie 26835 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 229.333-119 chr8 88962804 88963179 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -635508 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 197.667-66 chr2 77393372 77393779 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 128801 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 112.333-93 chr17 53448211 53448431 + 1 NA Intergenic Intergenic -374606 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 167.667-129 chr22 21610387 21610621 + 1 NA intron (NM_001256355, intron 2 of 3) L1MC1|LINE|L1 19518 NR_163922 138.333-108 chr20 33505979 33506249 + 1 NA intron (NM_001032999, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu 16018 NM_001032999 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 149.667-154 chr17 35442884 35443044 + 1 NA intron (NM_144682, intron 4 of 5) intron (NM_144682, intron 4 of 5) 5802 NM_144682 146857 Hs.462833 NM_144682 ENSG00000154760 SLFN13 SLFN10|hSLFN13 schlafen family member 13 protein-coding 141.333-35 chr11 47863260 47863541 + 1 NA Intergenic Intergenic -14856 NM_015231 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 225.667-42 chr2 148878601 148878891 + 1 NA intron (NM_004522, intron 1 of 25) intron (NM_004522, intron 1 of 25) 3519 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 241.333-103 chr9 9213661 9214030 + 1 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) intron (NM_002839, intron 9 of 45) 355827 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 214.333-112 chr5 13964893 13965327 + 1 NA Intergenic Intergenic -20630 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 145.333-19 chr1 197868045 197868236 + 1 NA Intergenic Intergenic -34490 NM_001024594 388722 Hs.61329 NM_001024594 ENSG00000203724 C1orf53 - chromosome 1 open reading frame 53 protein-coding 131.667-69 chr16 68281603 68281751 + 1 NA intron (NM_003983, intron 3 of 10) intron (NM_003983, intron 3 of 10) 17151 NM_003983 9057 Hs.679580 NM_003983 ENSG00000103064 SLC7A6 LAT-2|LAT3|y+LAT-2 solute carrier family 7 member 6 protein-coding 118.333-118 chr2 234353381 234353663 + 1 NA Intergenic Intergenic 101073 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 165.667-29 chr11 61086598 61086882 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -7223 NM_001346456 921 Hs.58685 NM_014207 ENSG00000110448 CD5 LEU1|T1 CD5 molecule protein-coding 143.667-143 chr20 47196343 47196583 + 1 NA Intergenic Intergenic 29496 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 162.667-75 chr13 111924194 111924385 + 1 NA Intergenic LTR89|LTR|ERVL? 30793 NR_120401 101928616 Hs.528450 NR_046992 LINC00354 - long intergenic non-protein coding RNA 354 ncRNA 151.333-431 chr8 128056173 128056416 + 1 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) intron (NR_003367, intron 5 of 8) 7142 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 173.667-8 chr1 158842794 158842997 + 1 NA intron (NM_002432, intron 2 of 6) intron (NM_002432, intron 2 of 6) 11544 NM_002432 4332 Hs.153837 NM_002432 ENSG00000163563 MNDA PYHIN3 myeloid cell nuclear differentiation antigen protein-coding 187.333-100 chr2 77560769 77560982 + 1 NA Intergenic Intergenic -38442 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 116.667-176 chr6 48182580 48182772 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -113987 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 153.333-430 chr8 120021744 120021900 + 1 NA intron (NM_022783, intron 8 of 8) intron (NM_022783, intron 8 of 8) -103280 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 275.667-52 chr7 1681547 1682012 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -6340 NM_001128636 392617 Hs.42896 NM_001128636 ENSG00000225968 ELFN1 PPP1R28 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 162.667-50 chr11 94490731 94490967 + 1 NA exon (NM_005590, exon 3 of 19) exon (NM_005590, exon 3 of 19) 2995 NM_005590 4361 Hs.192649 NM_005590 ENSG00000020922 MRE11 ATLD|HNGS1|MRE11A|MRE11B MRE11 homolog, double strand break repair nuclease protein-coding 113.333-209 chr5 65226957 65227071 + 1 NA intron (NR_135689, intron 16 of 25) intron (NR_135689, intron 16 of 25) 254906 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 159.333-287 chr6 72578536 72578742 + 1 NA Intergenic Charlie14a|DNA|hAT-Charlie -43204 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 291.667-11 chr11 29611439 29611920 + 1 NA intron (NR_149107, intron 3 of 3) intron (NR_149107, intron 3 of 3) -7123 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 147.333-58 chr11 7242342 7242533 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 7671 NR_031683 100313774 NR_031683 ENSG00000221703 MIR302E MIRN302E microRNA 302e ncRNA 138.667-85 chr18 1850816 1850987 + 1 NA Intergenic Intergenic -491272 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 249.333-96 chr8 29272862 29273233 + 1 NA Intergenic Intergenic -9977 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 118.333-2 chr1 35276430 35276600 + 1 NA intron (NM_005095, intron 1 of 29) L1MC5a|LINE|L1 7806 NM_001350139 9202 Hs.269211 NM_005095 ENSG00000146463 ZMYM4 CDIR|MYM|ZNF198L3|ZNF262 zinc finger MYM-type containing 4 protein-coding 160.667-30 chr10 31328086 31328309 + 1 NA intron (NM_001323675, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 6537 NM_001323673 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 206.333-149 chr7 53308021 53308532 + 1 NA Intergenic Intergenic 272643 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 119.333-36 chr10 72407193 72407345 + 1 NA intron (NM_001195519, intron 5 of 6) L1ME2z|LINE|L1 -52350 NM_001002762 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 202.667-117 chr5 75836388 75836691 + 1 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -119102 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 154.667-314 chr5 68816570 68816739 + 1 NA Intergenic Intergenic 213273 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 181.333-93 chr20 54681415 54681692 + 1 NA Intergenic Intergenic 205960 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 131.333-151 chr5 180843844 180844049 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -12328 NR_045680 100859930 Hs.655606 NR_045680 ENSG00000278970 HEIH HCCAT2|LINC-HEIH|LINC00848|lncRNA-HEIH hepatocellular carcinoma up-regulated EZH2-associated long non-coding RNA ncRNA 151.333-366 chr6 100663886 100664091 + 1 NA intron (NM_006828, intron 14 of 41) intron (NM_006828, intron 14 of 41) -200313 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 115.667-116 chr2 103666920 103667132 + 1 NA Intergenic Intergenic -682597 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 291.667-6 chr10 10927921 10928594 + 1 NA intron (NM_001326327, intron 2 of 14) L2a|LINE|L2 23906 NR_024411 254312 Hs.498620 NR_015413 ENSG00000229240 LINC00710 - long intergenic non-protein coding RNA 710 ncRNA 139.333-131 chr2 239220882 239221091 + 1 NA intron (NM_006037, intron 3 of 26) intron (NM_006037, intron 3 of 26) -25529 NR_026664 85009 Hs.744565 NM_032923 MGC16025 - uncharacterized LOC85009 ncRNA 153.667-108 chr13 73845651 73845946 + 1 NA intron (NM_007249, intron 4 of 7) intron (NM_007249, intron 4 of 7) 281554 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 146.667-290 chr6 142842649 142842910 + 1 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 102397 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 197.333-106 chr2 52030791 52031073 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -339716 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 308.333-6 chr10 59276128 59276672 + 1 NA intron (NM_001347852, intron 6 of 12) MIR|SINE|MIR 86149 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 173.667-127 chr3 194794397 194794620 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -25799 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 174.667-118 chr3 113401529 113401846 + 1 NA exon (NM_018338, exon 10 of 21) exon (NM_018338, exon 10 of 21) -2311 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 244.333-97 chr7 146556490 146556883 + 1 NA Intergenic Intergenic -217585 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 252.333-27 chr19 32466673 32467112 + 1 NA intron (NM_207325, intron 15 of 18) intron (NM_207325, intron 15 of 18) 60767 NM_207325 147991 Hs.194392 NM_207325 ENSG00000178904 DPY19L3 - dpy-19 like C-mannosyltransferase 3 protein-coding 157.667-71 chr12 24351933 24352098 + 1 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 128744 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 183.667-111 chr4 168927639 168927962 + 1 NA 3' UTR (NM_001367569, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001367569, exon 11 of 11) 82455 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 192.333-73 chr18 4018649 4018988 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 56465 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 146.667-301 chr7 19259677 19259886 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -114360 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 124.333-136 chr4 134540186 134540363 + 1 NA intron (NR_147155, intron 3 of 3) LTR40c|LTR|ERVL 116406 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 258.667-101 chr9 27129920 27130261 + 1 NA intron (NM_001290078, intron 1 of 20) L1MD|LINE|L1 20949 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 132.333-121 chr4 83874028 83874197 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 338004 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 157.667-78 chr12 57025121 57025376 + 1 NA Intergenic Intergenic -8719 NM_013251 6866 Hs.9730 NM_013251 ENSG00000166863 TAC3 HH10|NKB|NKNB|PRO1155|ZNEUROK1 tachykinin 3 protein-coding 149.333-100 chr13 49351928 49352182 + 1 NA intron (NM_001079670, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 49487 NM_030925 81617 Hs.87159 NM_030925 ENSG00000102547 CAB39L MO25-BETA|MO2L|bA103J18.3 calcium binding protein 39 like protein-coding 161.333-102 chr15 90899376 90899601 + 1 NA Intergenic LTR75B|LTR|ERVL -2894 NM_001320977 4122 Hs.116459 NM_006122 ENSG00000196547 MAN2A2 MANA2X mannosidase alpha class 2A member 2 protein-coding 238.667-15 chr12 5103213 5103602 + 1 NA Intergenic Intergenic 59528 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 171.667-103 chr21 35043581 35043789 + 1 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) intron (NM_001754, intron 2 of 8) -4259 NR_026812 80215 Hs.672131 NM_025143 RUNX1-IT1 C21orf96 RUNX1 intronic transcript 1 ncRNA 146.667-170 chr2 89828512 89828722 + 1 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -190710 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 158.333-190 chr22 50482264 50482565 + 1 NA intron (NM_001369882, intron 1 of 1) intron (NM_001369882, intron 1 of 1) 871 NM_001369882 79924 Hs.449099 NM_024866 ENSG00000128165 ADM2 AM2|dJ579N16.4 adrenomedullin 2 protein-coding 191.333-208 chr8 122351876 122352217 + 1 NA Intergenic Intergenic 216598 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 127.667-108 chr21 28314139 28314284 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -85544 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 151.667-333 chr7 33773631 33773810 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -131195 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 190.667-160 chr9 121850583 121850892 + 1 NA intron (NM_001139442, intron 8 of 8) MLT2B3|LTR|ERVL 107952 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 305.333-38 chr20 40099277 40099586 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 94970 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 191.333-109 chr2 66095641 66095860 + 1 NA Intergenic Intergenic 262578 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 131.667-58 chr14 78732807 78732962 + 1 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) intron (NR_073547, intron 8 of 20) 329165 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 196.667-32 chr11 105702794 105703148 + 1 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) AluSz|SINE|Alu 92265 NR_046356 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 166.333-227 chr8 81048720 81048905 + 1 NA intron (NM_018440, intron 2 of 8) intron (NM_018440, intron 2 of 8) 63256 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 179.333-201 chrX 56274822 56275111 + 1 NA intron (NM_001324104, intron 6 of 6) L1MA2|LINE|L1 41808 NR_136704 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 307.667-11 chr13 102747626 102748149 + 1 NA exon (NM_001146197, exon 4 of 4) exon (NM_001146197, exon 4 of 4) 11185 NM_001146197 643677 Hs.368382 NM_001146197 ENSG00000175820 CCDC168 C13orf40 coiled-coil domain containing 168 protein-coding 170.333-171 chr5 16504999 16505183 + 1 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) intron (NM_001034850, intron 3 of 8) 3907 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 181.333-164 chr7 54581015 54581247 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 24161 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 205.667-74 chr2 113097880 113098198 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -19854 NM_173841 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 148.333-188 chr2 73710656 73710929 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -9452 NR_132338 51471 Hs.278983 NM_016347 ENSG00000204872 NAT8B CML2|Hcml2|NAT8BP N-acetyltransferase 8B (putative, gene/pseudogene) protein-coding 140.667-57 chr11 116494129 116494375 + 1 NA Intergenic Intergenic -145170 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 120.667-20 chr10 68543821 68544028 + 1 NA Intergenic Intergenic -16401 NM_001324312 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 159.667-218 chr3 109573959 109574222 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -28738 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 217.667-80 chr7 75567159 75567629 + 1 NA intron (NM_005338, intron 9 of 30) intron (NM_005338, intron 9 of 30) -39271 NR_028059 5387 Hs.659871 NM_005395 ENSG00000127957 PMS2P3 PMS2L3|PMS2L9|PMS5|PMSR3 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 3 pseudo 245.333-86 chr4 62993062 62993422 + 1 NA Intergenic Intergenic -831477 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 266.667-13 chr10 48856058 48856616 + 1 NA intron (NM_020945, intron 39 of 61) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 57898 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 201.333-74 chr12 30803667 30804000 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 8152 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 150.333-232 chr20 17403634 17403824 + 1 NA intron (NM_002594, intron 5 of 11) intron (NM_002594, intron 5 of 11) 127650 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 239.333-43 chr17 66165808 66166171 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 4 of 26) intron (NM_001353129, intron 4 of 26) 25903 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 150.667-21 chr1 230492097 230492256 + 1 NA Intergenic Intergenic -65844 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 137.333-170 chr6 27859040 27859232 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -6193 NM_003511 8332 Hs.233568 NM_003511 ENSG00000276903 HIST1H2AL H2A.i|H2A/i|H2AFI|dJ193B12.9 histone cluster 1 H2A family member l protein-coding 186.333-93 chr22 37884642 37884892 + 1 NA intron (NM_001242923, intron 9 of 10) AluJb|SINE|Alu -21530 NM_033386 85377 Hs.517610 NM_033386 ENSG00000100139 MICALL1 MICAL-L1|MIRAB13 MICAL like 1 protein-coding 171.667-130 chr5 39318829 39319109 + 1 NA intron (NM_001737, intron 5 of 10) intron (NM_001737, intron 5 of 10) 45526 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 252.667-96 chr7 19797422 19797789 + 1 NA Intergenic Intergenic -23988 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 123.667-198 chrX 94538060 94538233 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 525080 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 220.667-51 chr2 174092829 174093112 + 1 NA intron (NM_001011708, intron 6 of 9) intron (NM_001011708, intron 6 of 9) 67690 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 185.667-91 chr3 98232027 98232399 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -32031 NM_001005479 79295 Hs.554712 NM_001005479 ENSG00000230301 OR5H6 OR3-11 olfactory receptor family 5 subfamily H member 6 (gene/pseudogene) protein-coding 152.333-348 chr7 3928376 3928590 + 1 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) intron (NM_152744, intron 5 of 44) -201202 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 250.667-91 chrX 20328625 20328963 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -61885 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 165.667-92 chr2 104199021 104199338 + 1 NA Intergenic Intergenic 209153 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 154.333-247 chr4 94183022 94183310 + 1 NA intron (NR_125922, intron 1 of 8) L1MB7|LINE|L1 24390 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 194.333-105 chr4 111013357 111013644 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -152853 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 126.667-143 chr5 93427024 93427235 + 1 NA intron (NR_109822, intron 2 of 2) intron (NR_109822, intron 2 of 2) 144214 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-37 chr11 85320251 85320465 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) MIR3|SINE|MIR 306912 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 133.667-156 chr8 125548684 125548872 + 1 NA Intergenic Intergenic 116569 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 158.667-177 chr2 208878252 208878447 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 335707 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 148.667-120 chr14 61597786 61598045 + 1 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) L1ME4a|LINE|L1 -27262 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 383.333-12 chr4 178186258 178186898 + 1 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -278642 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 170.333-177 chr5 125687721 125688044 + 1 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger 194621 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 169.333-123 chr2 105651901 105652106 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -41444 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 246.333-81 chr5 114254671 114254948 + 1 NA Intergenic Intergenic -107261 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 164.667-232 chr8 30374411 30374661 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9965 NM_001008712 11030 Hs.334587 NM_006867 ENSG00000157110 RBPMS HERMES RNA binding protein, mRNA processing factor protein-coding 256.667-53 chr21 28973804 28974186 + 1 NA intron (NM_015565, intron 6 of 29) L1MEd|LINE|L1 18882 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 434.333 chr10 56117868 56118432 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 243109 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 151.667-135 chr16 35709512 35709755 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -36919 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 159.667-180 chr2 162731081 162731348 + 1 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) L1ME3Cz|LINE|L1 -37722 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 166.333-132 chr2 230752468 230752794 + 1 NA intron (NM_001130849, intron 1 of 8) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 39083 NM_001130850 51719 Hs.603930 NM_016289 ENSG00000135932 CAB39 CGI-66|MO25 calcium binding protein 39 protein-coding 198.333-183 chr7 36049272 36049484 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -45932 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 177.333-100 chr22 21691127 21691364 + 1 NA intron (NM_148175, intron 15 of 20) intron (NM_148175, intron 15 of 20) 25233 NM_148175 23759 Hs.438587 NM_014337 ENSG00000100023 PPIL2 CYC4|CYP60|Cyp-60|UBOX7|hCyP-60 peptidylprolyl isomerase like 2 protein-coding 151.333-186 chr19 34320470 34320656 + 1 NA intron (NM_014686, intron 3 of 13) intron (NM_014686, intron 3 of 13) -44177 NM_001184722 2821 Hs.466471 NM_000175 ENSG00000105220 GPI AMF|GNPI|NLK|PGI|PHI|SA-36|SA36 glucose-6-phosphate isomerase protein-coding 237.333-59 chr2 144095325 144095602 + 1 NA intron (NM_001354355, intron 7 of 13) MIRb|SINE|MIR 116116 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 176.333-157 chr7 67993496 67993703 + 1 NA Intergenic Intergenic -26654 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 232.667-55 chr4 32322613 32323051 + 1 NA Intergenic MER83C|LTR|ERV1 -28206 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 150.333-55 chr11 24115062 24115277 + 1 NA Intergenic Intergenic -381884 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 154.333-122 chr17 60917564 60917811 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 12 of 25) AluSx1|SINE|Alu 239836 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 183.333-158 chr8 96188935 96189120 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -28221 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 201.333-284 chr8 101812312 101812683 + 1 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) -21528 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 216.667-75 chr4 43636235 43636563 + 1 NA Intergenic Intergenic -143856 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 266.333-66 chrX 70991030 70991466 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -60152 NM_032803 84889 Hs.175220 NM_032803 ENSG00000165349 SLC7A3 ATRC3|CAT-3|CAT3 solute carrier family 7 member 3 protein-coding 148.667-118 chr14 60004617 60004801 + 1 NA intron (NR_075071, intron 21 of 32) intron (NR_075071, intron 21 of 32) 84996 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 170.667-97 chr20 24757271 24757599 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -191834 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 218.667-33 chr15 62778484 62778722 + 1 NA intron (NM_015059, intron 40 of 55) intron (NM_015059, intron 40 of 55) -45354 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 134.333-157 chr7 33225475 33225685 + 1 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) L1MC5|LINE|L1 96016 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 130.667-53 chr12 20098059 20098224 + 1 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) intron (NR_040098, intron 2 of 2) 29760 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 144.667-190 chr3 60172993 60173242 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -92208 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 155.667-327 chr7 30107504 30107810 + 1 NA intron (NM_001350973, intron 13 of 13) L1M5|LINE|L1 -27329 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 165.333-134 chr2 169535513 169535837 + 1 NA intron (NR_104020, intron 11 of 13) intron (NR_104020, intron 11 of 13) 25973 NM_006063 10324 Hs.50550 NM_006063 ENSG00000239474 KLHL41 KBTBD10|Krp1|SARCOSIN kelch like family member 41 protein-coding 216.333-149 chr9 71715664 71716047 + 1 NA intron (NM_013390, intron 14 of 23) AluJr|SINE|Alu 52658 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 151.667-315 chr6 80640252 80640534 + 1 NA Intergenic MamGypsy2-LTR|LTR|Gypsy 533722 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 143.667-12 chr1 170588022 170588265 + 1 NA Intergenic Intergenic -55534 NR_125958 101928650 Hs.676662 NR_125958 GORAB-AS1 - GORAB antisense RNA 1 ncRNA 144.667-274 chr6 147213254 147213431 + 1 NA intron (NM_139244, intron 2 of 25) AluJb|SINE|Alu -8728 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 300.667-6 chr13 22104812 22105182 + 1 NA Intergenic Intergenic -105288 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 191.333-67 chr14 78640546 78640794 + 1 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 236951 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 327.667-3 chr10 10678930 10679560 + 1 NA intron (NM_001326317, intron 1 of 14) intron (NM_001326317, intron 1 of 14) 115669 NR_027082 207107 Hs.31562 NR_027082 ENSG00000225383 SFTA1P SFTPF surfactant associated 1, pseudogene pseudo 191.667-83 chr3 28168464 28168728 + 1 NA Intergenic (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -73023 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 216.333-24 chr10 113909503 113909898 + 1 NA 3' UTR (NM_198514, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_198514, exon 11 of 11) 55039 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 150.333-143 chr16 24775266 24775492 + 1 NA intron (NM_014494, intron 4 of 24) intron (NM_014494, intron 4 of 24) 45728 NM_014494 27327 Hs.655057 NM_014494 ENSG00000090905 TNRC6A CAGH26|FAME6|GW1|GW182|TNRC6 trinucleotide repeat containing adaptor 6A protein-coding 165.333-125 chr2 69171841 69172012 + 1 NA intron (NM_032208, intron 14 of 17) intron (NM_032208, intron 14 of 17) 68244 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 135.667-197 chr9 29039975 29040208 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -151136 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 147.333-65 chr11 37964431 37964587 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 25908 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 293.667-41 chr3 30558925 30559285 + 1 NA Intergenic Intergenic 40237 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 150.667-300 chr5 54977850 54978018 + 1 NA TTS (NM_007036) TTS (NM_007036) 7659 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 175.667-86 chr20 33568851 33569049 + 1 NA intron (NM_001039709, intron 1 of 10) intron (NM_001039709, intron 1 of 10) 6585 NM_005093 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 206.333-55 chr14 55805960 55806228 + 1 NA Intergenic MER4A1_|LTR|ERV1 -9420 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 160.667-87 chr14 38533044 38533306 + 1 NA Intergenic Intergenic -277082 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 221.333-103 chr4 83844042 83844342 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 308084 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 162.667-110 chr18 7546822 7547019 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -20396 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 143.667-202 chr5 66071361 66071540 + 1 NA intron (NM_001253699, intron 22 of 25) intron (NM_001253699, intron 22 of 25) -72850 NM_001323534 140890 Hs.49367 NM_139168 ENSG00000153914 SREK1 SFRS12|SRrp508|SRrp86 splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 protein-coding 244.667-7 chr1 167294976 167295336 + 1 NA intron (NM_001365848, intron 2 of 17) L1PB3|LINE|L1 -33914 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 178.667-146 chr6 150597777 150598047 + 1 NA Intergenic Intergenic -1973 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 212.667-27 chr12 40114531 40114923 + 1 NA Intergenic Intergenic -8646 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 176.667-155 chr9 32627305 32627562 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 8236 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 234.667-34 chr14 50273630 50274037 + 1 NA intron (NM_024884, intron 6 of 9) AluSp|SINE|Alu 26113 NR_039726 100616261 NR_039726 ENSG00000264712 MIR4504 - microRNA 4504 ncRNA 223.333-52 chr17 48703048 48703346 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 19321 NM_032391 84366 Hs.116467 NM_032391 ENSG00000159182 PRAC1 C17orf92|PRAC PRAC1 small nuclear protein protein-coding 140.667-66 chr13 36373557 36373773 + 1 NA Intergenic Intergenic -3485 NM_001142294 23111 Hs.440414 NM_015087 ENSG00000133104 SPART SPG20|TAHCCP1 spartin protein-coding 192.667-153 chr6 138345564 138345956 + 1 NA Intergenic Intergenic -31883 NM_001368163 110806279 NM_001368163 ENSG00000262543 SMIM28 - small integral membrane protein 28 protein-coding 275.333-70 chr7 34560177 34560551 + 1 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) L1ME2|LINE|L1 -97854 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 204.333-196 chr8 78080167 78080515 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -435999 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 155.667-13 chr1 90566408 90566589 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -91252 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 183.333-9 chr1 147025149 147025343 + 1 NA intron (NR_024442, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 17793 NR_024442 728989 Hs.537068 NR_024442 LOC728989 - phosphodiesterase 4D interacting protein pseudogene pseudo 159.333-336 chr8 119716397 119716603 + 1 NA Intergenic Intergenic -43110 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 304.333-2 chr1 33525869 33526247 + 1 NA intron (NM_052896, intron 64 of 69) L1MA7|LINE|L1 53413 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 117.333-149 chr4 44678997 44679174 + 1 NA intron (NM_001345869, intron 1 of 15) intron (NM_001345869, intron 1 of 15) 665 NM_021927 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 150.333-269 chr3 100870280 100870530 + 1 NA intron (NM_001349332, intron 9 of 35) L1MA9|LINE|L1 123085 NM_001349330 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 243.667-82 chrX 147679095 147679513 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 232513 NR_024501 100126270 Hs.561999 NR_024499 ENSG00000268066 FMR1-AS1 ASFMR1|FMR1-AS|FMR1AS|FMR4 FMR1 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-254 chr3 145103111 145103353 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 965953 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 138.333-55 chr13 94416431 94416656 + 1 NA Intergenic Intergenic 63139 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 188.333-46 chr14 68192038 68192367 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 368610 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 224.333-46 chr15 58271100 58271379 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 132858 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 193.667-34 chr12 65459916 65460209 + 1 NA intron (NM_001031679, intron 6 of 6) intron (NM_001031679, intron 6 of 6) 97249 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 153.667-318 chr5 80839260 80839453 + 1 NA intron (NM_002439, intron 20 of 23) AluSz6|SINE|Alu -121007 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 124.333-133 chr4 89777797 89778005 + 1 NA intron (NM_001146054, intron 4 of 5) AluSq2|SINE|Alu -58500 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 152.333-392 chr8 131432909 131433110 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -392100 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 145.667-261 chr7 2971998 2972259 + 1 NA intron (NM_032415, intron 1 of 24) AluJr|SINE|Alu 71739 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 213.667-51 chr21 29872980 29873306 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 66853 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 216.333-76 chr2 50399445 50399751 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -51842 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 173.333-117 chr3 18536741 18536946 + 1 NA Intergenic Intergenic -91251 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 121.667-73 chr17 65800047 65800203 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) L1MB7|LINE|L1 26326 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 165.333-207 chr5 64198212 64198413 + 1 NA intron (NM_001113561, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 32469 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 234.667-111 chr8 101788456 101788881 + 1 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 2301 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 192.667-136 chr5 74923822 74924033 + 1 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -56961 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 166.333-145 chr3 26692950 26693142 + 1 NA intron (NM_001317810, intron 2 of 2) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -1511 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 156.333-317 chr6 139920927 139921112 + 1 NA Intergenic Intergenic -55300 NR_121622 100507477 Hs.179213 NR_121622 ENSG00000236013 LOC100507477 - uncharacterized LOC100507477 ncRNA 126.667-133 chr5 15378796 15378941 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -112308 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 144.667-263 chr6 57168442 57168596 + 1 NA 3' UTR (NM_001031623, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001031623, exon 15 of 15) 3694 NR_110742 101927211 Hs.705718 NR_110742 ZNF451-AS1 - ZNF451 regulatory antisense RNA 1 ncRNA 168.333-181 chr6 112317619 112317825 + 1 NA Intergenic Intergenic -29608 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 155.333-182 chr2 159343086 159343337 + 1 NA intron (NM_001329858, intron 31 of 36) L1MA5A|LINE|L1 -56508 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 143.333-267 chr7 66245127 66245299 + 1 NA intron (NM_003596, intron 2 of 5) MER31A|LTR|ERV1 39879 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 215.333-179 chr6 147160290 147160552 + 1 NA intron (NR_132442, intron 1 of 2) intron (NR_132442, intron 1 of 2) 1496 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 154.333-101 chr15 41655537 41655753 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -4767 NM_001080541 23269 Hs.187569 NM_001080541 ENSG00000174197 MGA MAD5|MXD5 MAX dimerization protein MGA protein-coding 220.667-9 chr1 157873150 157873509 + 1 NA Intergenic Intergenic -31521 NM_001347698 922 Hs.134035 NM_005894 ENSG00000073754 CD5L AIM|API6|CT-2|PRO229|SP-ALPHA|Spalpha|hAIM CD5 molecule like protein-coding 215.667-2 chr1 88710632 88711176 + 1 NA intron (NM_001320708, intron 1 of 20) L1PA13|LINE|L1 -25700 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 253.333-40 chr16 81563807 81564233 + 1 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) intron (NM_030629, intron 1 of 20) 30118 NR_107008 102465840 NR_107008 ENSG00000277255 MIR7854 hsa-mir-7854 microRNA 7854 ncRNA 144.333-249 chr7 85885065 85885306 + 1 NA Intergenic Intergenic 464063 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 183.667-121 chr5 135153052 135153426 + 1 NA intron (NR_161235, intron 2 of 5) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 94938 NR_037895 340073 Hs.434422 NR_037895 ENSG00000249647 C5orf66-AS2 - C5orf66 antisense RNA 2 ncRNA 143.333-276 chr7 106882697 106882885 + 1 NA intron (NM_001282426, intron 7 of 10) intron (NM_001282426, intron 7 of 10) 17312 NM_002649 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 127.667-40 chr13 85362163 85362345 + 1 NA Intergenic Intergenic -1349 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 158.333-78 chr13 98145549 98145785 + 1 NA intron (NM_005766, intron 1 of 26) AluSx1|SINE|Alu 2573 NM_001001715 10160 Hs.403917 NM_005766 ENSG00000152767 FARP1 CDEP|FARP1-IT1|PLEKHC2|PPP1R75 FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1 protein-coding 146.667-204 chr21 28230420 28230646 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -1866 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 171.667-113 chr3 133973797 133974046 + 1 NA intron (NM_005630, intron 2 of 13) intron (NM_005630, intron 2 of 13) -44109 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 183.667-80 chr2 124002574 124002775 + 1 NA Intergenic Intergenic 22500 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 157.667-47 chr11 10571989 10572193 + 1 NA TTS (NM_001206881) TTS (NM_001206881) -3426 NM_006691 10894 Hs.655332 NM_006691 ENSG00000133800 LYVE1 CRSBP-1|HAR|LYVE-1|XLKD1 lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 protein-coding 198.333-123 chr3 37319094 37319403 + 1 NA intron (NM_001172713, intron 13 of 22) intron (NM_001172713, intron 13 of 22) -67021 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 125.667-151 chr5 92665997 92666169 + 1 NA Intergenic Intergenic 905260 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 189.333-209 chr8 119223200 119223408 + 1 NA non-coding (NR_149114, exon 4 of 6) non-coding (NR_149114, exon 4 of 6) 14941 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 142.667-198 chr7 10574801 10574993 + 1 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) -127779 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 156.667-305 chr6 125897321 125897530 + 1 NA intron (NM_001199621, intron 9 of 14) intron (NM_001199621, intron 9 of 14) -21830 NM_001199622 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 223.333-64 chr2 30072778 30073106 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -74065 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 142.667-148 chr3 173077677 173077916 + 1 NA intron (NM_031955, intron 2 of 10) intron (NM_031955, intron 2 of 10) 63439 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 155.333-73 chr12 23495846 23496091 + 1 NA Intergenic Intergenic 88618 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 116.333-213 chr8 131213549 131213715 + 1 NA Intergenic (GATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -172723 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 233.333-11 chr1 224782359 224782722 + 1 NA Intergenic Intergenic -147114 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 229.333-110 chr6 129674926 129675212 + 1 NA intron (NM_033515, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 35108 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 323.667-20 chr5 36612806 36613302 + 1 NA intron (NM_001289939, intron 2 of 8) intron (NM_001289939, intron 2 of 8) 6448 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 236.667-88 chr8 72371620 72371924 + 1 NA Intergenic Intergenic -120138 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 149.667-359 chr6 131751645 131751943 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -40378 NR_039610 100616455 NR_039610 ENSG00000266807 MIR548H5 - microRNA 548h-5 ncRNA 177.333-93 chr2 234675781 234676076 + 1 NA Intergenic Intergenic -6740 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 156.333-268 chr4 88761552 88761742 + 1 NA intron (NM_001015045, intron 7 of 17) L2|LINE|L2 51858 NR_002806 285512 Hs.744957 NR_002806 ENSG00000248019 FAM13A-AS1 FAM13A1OS|FAM13AOS|NCRNA00039 FAM13A antisense RNA 1 ncRNA 162.667-102 chr17 62351913 62352129 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -18197 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 158.667-301 chr7 29498551 29498725 + 1 NA intron (NM_001293078, intron 2 of 4) intron (NM_001293078, intron 2 of 4) 14822 NM_001293081 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 238.333-59 chr3 9467309 9467728 + 1 NA intron (NM_001080517, intron 18 of 22) intron (NM_001080517, intron 18 of 22) 69818 NM_001080517 55209 Hs.288164 NM_018187 ENSG00000168137 SETD5 - SET domain containing 5 protein-coding 257.667-39 chr2 78068170 78068475 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -20408 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 157.667-175 chr21 28707214 28707432 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 168005 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 236.667-39 chr2 46402637 46403084 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -8693 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 279.333-11 chr10 58715197 58715696 + 1 NA non-coding (NR_027508, exon 1 of 1) non-coding (NR_027508, exon 1 of 1) 431 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 277.667-17 chr16 50953022 50953345 + 1 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 -64575 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 119.333-123 chr2 33785541 33785775 + 1 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 -57441 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 216.667-60 chr2 180480809 180481062 + 1 NA Intergenic Intergenic -211169 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 245.667-39 chr20 21208959 21209275 + 1 NA intron (NM_018474, intron 7 of 12) intron (NM_018474, intron 7 of 12) 9172 NR_109956 101929591 Hs.656066 NR_109956 ENSG00000232712 KIZ-AS1 - KIZ antisense RNA 1 ncRNA 221.333-48 chr17 71899396 71899743 + 1 NA Intergenic Intergenic 126410 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 148.333-390 chr8 113179470 113179706 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 197564 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 253.667-76 chr8 96879478 96879896 + 1 NA intron (NM_016134, intron 3 of 7) intron (NM_016134, intron 3 of 7) 234445 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 140.667-122 chr2 111073367 111073514 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) L1MD2|LINE|L1 42148 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 127.667-48 chr14 60502791 60502972 + 1 NA Intergenic MER131|DNA?|DNA? -6265 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 247.667-69 chr3 182977098 182977515 + 1 NA intron (NM_001308101, intron 1 of 6) MIR3|SINE|MIR 3232 NM_020640 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 136.667-173 chr8 27292612 27292828 + 1 NA intron (NM_171982, intron 3 of 5) L1MB7|LINE|L1 18552 NM_171982 23087 Hs.104223 NM_171982 ENSG00000104228 TRIM35 HLS5|MAIR tripartite motif containing 35 protein-coding 164.333-15 chr1 234749001 234749207 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 10952 NR_148962 100130249 Hs.617350 NR_148962 ENSG00000279261 PP2672 - uncharacterized LOC100130249 ncRNA 158.333-300 chr7 49865830 49866054 + 1 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR 90609 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 161.667-25 chr10 43176266 43176550 + 1 NA intron (NM_018590, intron 7 of 7) intron (NM_018590, intron 7 of 7) 21511 NM_001319654 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 308.333-37 chr9 24057367 24057879 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -207022 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 343.333-19 chr4 32955265 32955705 + 1 NA Intergenic LTR73|LTR|ERV1 604447 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 120.333-152 chr5 43235425 43235587 + 1 NA intron (NR_072980, intron 1 of 3) intron (NR_072980, intron 1 of 3) 42654 NR_072980 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 119.333-107 chr17 39526716 39526907 + 1 NA intron (NM_015083, intron 13 of 13) intron (NM_015083, intron 13 of 13) 65325 NM_016507 51755 Hs.345028 NM_015083 ENSG00000167258 CDK12 CRK7|CRKR|CRKRS cyclin dependent kinase 12 protein-coding 265.333-53 chr3 61138628 61139122 + 1 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 112577 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 189.333-3 chr1 52590738 52591008 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -11498 NM_015696 2882 Hs.43728 NM_015696 ENSG00000116157 GPX7 CL683|GPX6|GPx-7|GSHPx-7|NPGPx glutathione peroxidase 7 protein-coding 192.667-39 chr11 46731106 46731408 + 1 NA intron (NM_000506, intron 12 of 13) AluSx1|SINE|Alu 12044 NM_001311257 2147 Hs.655207 NM_000506 ENSG00000180210 F2 PT|RPRGL2|THPH1 coagulation factor II, thrombin protein-coding 146.667-4 chr1 45225164 45225353 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -18653 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 267.333-23 chr12 40304734 40305025 + 1 NA intron (NM_198578, intron 27 of 50) intron (NM_198578, intron 27 of 50) 79882 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 151.667-215 chr3 54881016 54881236 + 1 NA intron (NM_018398, intron 21 of 37) intron (NM_018398, intron 21 of 37) 20129 NR_046666 100874237 Hs.570583 NR_046666 ENSG00000243715 CACNA2D3-AS1 - CACNA2D3 antisense RNA 1 ncRNA 324.667 chr1 61369717 61370151 + 1 NA intron (NM_001134673, intron 6 of 10) intron (NM_001134673, intron 6 of 10) -116416 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 158.333-321 chr8 100869131 100869388 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 81312 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 152.667-170 chr2 35615038 35615220 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 143724 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 164.667-78 chr15 46846598 46846882 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -337349 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 138.667-41 chr12 5133699 5133920 + 1 NA Intergenic Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 89930 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 202.333-23 chr10 55727003 55727362 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -99240 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 157.333-241 chr3 101217645 101217846 + 1 NA Intergenic Intergenic 102830 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 217.333-160 chr8 144815566 144815817 + 1 NA intron (NR_147501, intron 2 of 4) L1MA4|LINE|L1 11349 NR_147501 100130027 Hs.639618 NR_147501 LOC100130027 - uncharacterized LOC100130027 ncRNA 317.667-10 chr14 42069602 42070047 + 1 NA Intergenic Intergenic 462968 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 122.667-187 chr8 25990677 25990825 + 1 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) intron (NM_022659, intron 6 of 15) 54662 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 162.333-16 chr1 164511723 164511922 + 1 NA Intergenic Intergenic -47538 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 121.333-173 chr8 55088494 55088699 + 1 NA Intergenic Intergenic -13432 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 202.667-137 chr7 77745823 77746161 + 1 NA intron (NM_198467, intron 2 of 7) MER1A|DNA|hAT-Charlie -48647 NR_038361 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 151.333-63 chr10 93372658 93372837 + 1 NA intron (NM_013451, intron 24 of 53) intron (NM_013451, intron 24 of 53) 109587 NM_133337 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 155.333-81 chr12 94314269 94314439 + 1 NA intron (NM_001042399, intron 13 of 15) L1ME3A|LINE|L1 51833 NR_037687 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 151.333-144 chr15 45665900 45666112 + 1 NA intron (NM_021199, intron 3 of 9) intron (NM_021199, intron 3 of 9) 30977 NM_021199 58472 Hs.511251 NM_021199 ENSG00000137767 SQOR CGI-44|PRO1975|SQR|SQRDL sulfide quinone oxidoreductase protein-coding 153.333-70 chr11 86695325 86695507 + 1 NA Intergenic Intergenic -22780 NM_001161586 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 155.667-165 chr2 63483511 63483698 + 1 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) intron (NR_148704, intron 7 of 18) -45597 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 357.667-15 chr8 56498904 56499435 + 1 NA intron (NR_125813, intron 2 of 3) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -52528 NM_001135690 5179 Hs.339831 NM_006211 ENSG00000181195 PENK PE|PENK-A proenkephalin protein-coding 192.667-96 chr2 224240664 224241070 + 1 NA Intergenic Intergenic 161127 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 176.667-112 chr4 60883787 60884159 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -38646 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 127.667-68 chr18 24346458 24346699 + 1 NA intron (NM_080597, intron 4 of 27) L1MB7|LINE|L1 24903 NR_031724 100302195 NR_031724 ENSG00000212051 MIR320C2 MIR320C-2|MIRN320C2|hsa-mir-320c-2|mir-320c-2 microRNA 320c-2 ncRNA 257.667-72 chr6 152329072 152329566 + 1 NA intron (NM_182961, intron 78 of 145) AluSx1|SINE|Alu -51211 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 250.667-18 chr14 61538076 61538517 + 1 NA intron (NM_006255, intron 12 of 13) intron (NM_006255, intron 12 of 13) 31898 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 175.667-114 chr5 87081986 87082330 + 1 NA Intergenic Intergenic 32796 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 142.667-105 chr2 138956377 138956658 + 1 NA Intergenic Intergenic 59193 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 134.667-42 chr12 20162765 20162931 + 1 NA Intergenic Intergenic -34947 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 180.667-132 chr6 157941544 157941781 + 1 NA intron (NM_016224, intron 17 of 17) intron (NM_016224, intron 17 of 17) -40201 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 150.667-317 chr5 157543956 157544129 + 1 NA intron (NM_033274, intron 3 of 22) intron (NM_033274, intron 3 of 22) 31733 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 174.333-26 chr12 42198657 42198939 + 1 NA intron (NR_135139, intron 4 of 6) intron (NR_135139, intron 4 of 6) 39570 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 120.333-203 chr9 93375551 93375746 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -29234 NM_001098808 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 276.333-14 chr14 54921298 54921664 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18655 NM_000161 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 174.667-27 chr10 83774878 83775170 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -97935 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 150.667-137 chr16 8298603 8298754 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 291160 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 205.667-36 chr12 85164526 85164836 + 1 NA intron (NM_001079910, intron 24 of 26) MIRb|SINE|MIR -115539 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 200.667-21 chr10 52706632 52706918 + 1 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 48629 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 150.333-81 chr12 54860630 54860831 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 6214 NM_058173 118430 Hs.348419 NM_058173 ENSG00000172551 MUCL1 SBEM mucin like 1 protein-coding 172.667-165 chr9 31173224 31173438 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 208159 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 155.333-368 chr7 68295152 68295333 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 274989 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 166.667-150 chr3 47034542 47034754 + 1 NA intron (NR_146158, intron 19 of 21) AluJr4|SINE|Alu 23106 NR_024046 100129354 Hs.201522 NR_024046 NRADDP - neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene pseudo 123.667-19 chr1 166644118 166644310 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 40298 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 166.667-116 chr2 113229734 113229939 + 1 NA intron (NM_013953, intron 7 of 9) intron (NM_013953, intron 7 of 9) -5691 NR_047570 654433 Hs.656660 NR_015377 ENSG00000189223 PAX8-AS1 - PAX8 antisense RNA 1 ncRNA 121.667-93 chr2 102211315 102211469 + 1 NA intron (NM_001351448, intron 3 of 8) intron (NM_001351448, intron 3 of 8) 24078 NM_001351446 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 126.333-185 chr9 20665057 20665261 + 1 NA intron (NM_017794, intron 2 of 45) intron (NM_017794, intron 2 of 45) 6850 NM_017794 54914 Hs.136247 NM_017794 ENSG00000188352 FOCAD KIAA1797 focadhesin protein-coding 177.333-89 chr2 172645676 172645870 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 89683 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 154.667-100 chr14 21472396 21472692 + 1 NA intron (NM_001163380, intron 2 of 6) intron (NM_001163380, intron 2 of 6) 4130 NM_001163380 84932 Hs.22399 NM_032846 ENSG00000129472 RAB2B - RAB2B, member RAS oncogene family protein-coding 246.333-102 chr8 142779756 142780252 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -2132 NM_023946 111188157 NM_023946 ENSG00000284505 LYNX1-SLURP2 - LYNX1-SLURP2 readthrough protein-coding 166.333-161 chr3 183230614 183230787 + 1 NA intron (NM_015078, intron 16 of 29) L1ME4c|LINE|L1 -22553 NM_032047 84002 Hs.718506 NM_032047 ENSG00000176597 B3GNT5 B3GN-T5|beta3Gn-T5 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 protein-coding 162.333-193 chr5 23536979 23537189 + 1 NA Intergenic Intergenic 29429 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 126.333-81 chr2 25444115 25444366 + 1 NA intron (NM_033147, intron 12 of 19) intron (NM_033147, intron 12 of 19) -101650 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 249.667-99 chr8 99560362 99560849 + 1 NA intron (NM_017890, intron 31 of 61) LTR16|LTR|ERVL -23744 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 296.333-25 chr2 236742948 236743366 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 173332 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 145.333-75 chr13 81811329 81811520 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -584441 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 168.333-17 chr10 6651953 6652291 + 1 NA Intergenic Intergenic 17052 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 213.667-59 chr3 164598945 164599250 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 232383 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 208.333-73 chr2 101201205 101201523 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 49704 NR_135594 100506286 Hs.679790 NR_135594 ENSG00000272902 TBC1D8-AS1 - TBC1 domain family member 8 antisense RNA 1 ncRNA 133.667-106 chr4 8167654 8167823 + 1 NA Intergenic Intergenic -8925 NM_001130085 84448 Hs.233404 NM_032432 ENSG00000163995 ABLIM2 - actin binding LIM protein family member 2 protein-coding 126.333-35 chr12 30102111 30102263 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -317428 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 291.333-19 chr12 116236036 116236559 + 1 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) intron (NM_015335, intron 2 of 30) 40889 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 159.333-142 chr2 13181264 13181567 + 1 NA Intergenic Intergenic -174402 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 219.667-43 chr2 236528075 236528497 + 1 NA Intergenic Intergenic -20751 NM_001270584 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 282.333-44 chr5 40365888 40366170 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 313738 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 161.667-168 chr3 59143036 59143211 + 1 NA Intergenic Intergenic -93091 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 165.333-32 chr10 78615311 78615570 + 1 NA Intergenic Intergenic 348098 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 153.667-378 chr8 76710886 76711159 + 1 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) intron (NM_024721, intron 3 of 10) -27747 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 156.667-150 chr18 6327170 6327374 + 1 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) L1ME3Cz|LINE|L1 31758 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 163.667-202 chr5 96769820 96770068 + 1 NA intron (NM_001042446, intron 24 of 26) L1MA9|LINE|L1 26342 NR_104285 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 186.333-82 chr2 153573254 153573531 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -94630 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 152.333-182 chr2 71921507 71921802 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 226208 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 286.667-9 chr10 91592945 91593317 + 1 NA intron (NR_024467, intron 1 of 4) intron (NR_024467, intron 1 of 4) 18329 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 184.333-135 chr7 13283292 13283544 + 1 NA Intergenic Intergenic 595785 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 184.333-109 chr3 109002759 109003052 + 1 NA intron (NM_014429, intron 20 of 27) L2c|LINE|L2 -49026 NM_005459 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 160.333-10 chr1 57124281 57124453 + 1 NA intron (NM_001365793, intron 4 of 14) intron (NM_001365793, intron 4 of 14) -158227 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 234.333-91 chr9 69783591 69784107 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -23838 NR_159516 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 154.333-225 chr3 109963327 109963553 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 360612 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 132.667-102 chr22 43586127 43586308 + 1 NA intron (NM_198856, intron 22 of 29) L1MCb|LINE|L1 69963 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 125.667-107 chr2 191006375 191006537 + 1 NA intron (NM_007315, intron 5 of 24) intron (NM_007315, intron 5 of 24) 7794 NM_139266 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 156.333-8 chr1 51645282 51645587 + 1 NA intron (NM_148906, intron 1 of 22) L1M4|LINE|L1 28342 NR_036662 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 188.333-110 chr4 66665949 66666187 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 389244 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 250.333-54 chr4 152315969 152316376 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -21483 NR_104273 102191832 Hs.712524 NR_104273 ENSG00000270751 FBXW7-AS1 DEAR|DEspR FBXW7 antisense RNA 1 ncRNA 129.333-169 chr6 40760629 40760800 + 1 NA Intergenic Intergenic -173350 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 166.333-18 chr1 242693287 242693485 + 1 NA Intergenic Intergenic -168689 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 233.667-34 chr18 47188669 47189098 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -12519 NM_016097 51124 Hs.130917 NM_016097 ENSG00000134049 IER3IP1 HSPC039|MEDS|PRO2309 immediate early response 3 interacting protein 1 protein-coding 139.667-77 chr18 68316034 68316226 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 398978 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 158.333-27 chr10 13422005 13422218 + 1 NA Intergenic Intergenic -73813 NM_001195602 22929 Hs.124027 NM_012247 ENSG00000086475 SEPHS1 SELD|SPS|SPS1 selenophosphate synthetase 1 protein-coding 194.333-113 chr5 16469649 16469878 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -3963 NM_033414 90441 Hs.60300 NM_033414 ENSG00000173545 ZNF622 ZPR9 zinc finger protein 622 protein-coding 153.333-116 chr14 50495370 50495533 + 1 NA intron (NM_198794, intron 3 of 31) L1MB2|LINE|L1 37118 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 169.333-220 chr6 28433784 28434059 + 1 NA 3' UTR (NM_001012455, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001012455, exon 4 of 4) 9570 NM_001012455 222696 Hs.721841 NM_001012455 ENSG00000187987 ZSCAN23 ZNF390|ZNF453|dJ29K1.3|dJ29K1.3.1 zinc finger and SCAN domain containing 23 protein-coding 337.667-24 chr8 29324470 29324922 + 1 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite 24109 NM_057158 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 154.333-258 chr5 17219984 17220273 + 1 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 2497 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 157.667-67 chr12 7768494 7768728 + 1 NA intron (NM_001145465, intron 1 of 3) AluY|SINE|Alu 3395 NM_001145465 360030 Hs.558004 NM_001145465 ENSG00000205857 NANOGNB - NANOG neighbor homeobox protein-coding 140.667-184 chr5 62037654 62037824 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -268423 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 124.667-109 chr2 148817534 148817684 + 1 NA Intergenic Intergenic -57618 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 167.333-17 chr1 155119024 155119313 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8708 NM_182685 1942 Hs.516664 NM_004428 ENSG00000169242 EFNA1 B61|ECKLG|EFL1|EPLG1|LERK-1|LERK1|TNFAIP4 ephrin A1 protein-coding 117.333-186 chr7 14756207 14756377 + 1 NA intron (NM_001350722, intron 3 of 25) intron (NM_001350722, intron 3 of 25) 85158 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 302.667-26 chr4 77778890 77779301 + 1 NA intron (NM_001365006, intron 1 of 11) intron (NM_001365006, intron 1 of 11) 39969 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 339.333-4 chr1 220596083 220596510 + 1 NA intron (NM_018650, intron 3 of 17) L2|LINE|L2 68113 NM_001286124 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 149.667-66 chr10 94842429 94842592 + 1 NA intron (NM_000769, intron 6 of 8) L1MA1|LINE|L1 79829 NM_000769 1557 Hs.282409 NM_000769 ENSG00000165841 CYP2C19 CPCJ|CYP2C|CYPIIC17|CYPIIC19|P450C2C|P450IIC19 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19 protein-coding 148.333-255 chr3 100161703 100161965 + 1 NA intron (NM_001167924, intron 3 of 9) intron (NM_001167924, intron 3 of 9) -23990 NR_028357 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 194.333-33 chr12 21401951 21402191 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6634 NM_134431 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 199.667-15 chr10 63032861 63033225 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -100204 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 146.667-128 chr17 10261991 10262152 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -63465 NM_201433 8522 Hs.462214 NM_003644 ENSG00000007237 GAS7 - growth arrest specific 7 protein-coding 133.333-18 chr1 198294822 198294992 + 1 NA intron (NM_133494, intron 8 of 9) intron (NM_133494, intron 8 of 9) 137909 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 229.333-2 chr1 8468112 8468485 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 10 of 22) intron (NM_001042681, intron 10 of 22) 26615 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 247.667-85 chr6 124969889 124970387 + 1 NA intron (NM_001286398, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 -7111 NR_026876 7955 Hs.544438 NR_026876 ENSG00000236548 RNF217-AS1 STL RNF217 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 165.333-136 chr2 225955938 225956139 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -186756 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 140.667-209 chr7 20811024 20811236 + 1 NA Intergenic Intergenic -16168 NR_026673 222901 Hs.722187 NR_026673 ENSG00000219451 RPL23P8 RPL23_4_790 ribosomal protein L23 pseudogene 8 pseudo 146.667-86 chr13 47282371 47282533 + 1 NA Intergenic Intergenic -385376 NM_001165947 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 219.333-124 chr4 47340863 47341171 + 1 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 122685 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 149.667-141 chr15 61084636 61084790 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 144589 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 174.333-53 chr2 9449785 9450090 + 1 NA intron (NM_016207, intron 11 of 17) intron (NM_016207, intron 11 of 17) -24614 NM_001320859 285148 Hs.667226 NM_001039613 ENSG00000134330 IAH1 - isoamyl acetate hydrolyzing esterase 1 (putative) protein-coding 155.667-342 chr7 128288861 128289142 + 1 NA Intergenic Intergenic 47723 NM_000230 3952 Hs.194236 NM_000230 ENSG00000174697 LEP LEPD|OB|OBS leptin protein-coding 359.667-6 chr2 192280678 192281241 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -86026 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 172.333-93 chr2 217683206 217683516 + 1 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 73232 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 147.333-117 chr14 87887756 87887984 + 1 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL 105312 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 161.333-142 chr2 35460076 35460357 + 1 NA Intergenic Intergenic -11189 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 132.333-149 chr6 38071125 38071300 + 1 NA intron (NM_021943, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 251485 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 164.333-177 chr4 81388641 81388899 + 1 NA Intergenic Intergenic 83137 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 159.667-339 chr9 28933472 28933651 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -44606 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 307.667-4 chr1 203446201 203446723 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -29344 NM_201348 5549 Hs.632481 NM_002725 ENSG00000188783 PRELP MST161|MSTP161|SLRR2A proline and arginine rich end leucine rich repeat protein protein-coding 167.667-62 chr14 73853761 73854045 + 1 NA intron (NM_001371328, intron 1 of 8) intron (NM_001371328, intron 1 of 8) 1956 NM_001371328 124.333-130 chr4 64808592 64808750 + 1 NA Intergenic Intergenic 195829 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 158.667-295 chr6 137525342 137525543 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -31048 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 282.667-9 chr14 69383633 69384112 + 1 NA intron (NM_004450, intron 3 of 3) FLAM_C|SINE|Alu 14427 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 175.333-20 chr11 20646957 20647330 + 1 NA intron (NM_004211, intron 14 of 15) MIR3|SINE|MIR -22408 NM_201551 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 156.667-135 chr17 54166948 54167175 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 344134 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 250.667-66 chr5 122127079 122127523 + 1 NA Intergenic Intergenic -2245 NM_207317 133923 Hs.729673 NM_207317 ENSG00000164185 ZNF474 - zinc finger protein 474 protein-coding 172.667-167 chr9 81685894 81686158 + 1 NA intron (NM_005077, intron 2 of 19) intron (NM_005077, intron 2 of 19) 3509 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 121.667-123 chr3 18799144 18799314 + 1 NA Intergenic Intergenic -349281 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 123.667-40 chr11 90225086 90225266 + 1 NA Intergenic Intergenic -1812 NM_001144073 26973 Hs.22857 NM_012124 ENSG00000110172 CHORDC1 CHP1 cysteine and histidine rich domain containing 1 protein-coding 338.667-7 chr12 25872214 25872675 + 1 NA Intergenic Intergenic 1635 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 243.667-43 chr2 120360334 120360621 + 1 NA Intergenic Intergenic 14341 NM_002193 3625 Hs.1735 NM_002193 ENSG00000163083 INHBB - inhibin subunit beta B protein-coding 157.333-91 chr12 98596618 98596858 + 1 NA intron (NM_213611, intron 2 of 6) AluSz|SINE|Alu -2897 NR_003015 677832 Hs.693250 NR_003015 ENSG00000212443 SNORA53 ACA53 small nucleolar RNA, H/ACA box 53 snoRNA 155.333-181 chr2 155566726 155566919 + 1 NA Intergenic Intergenic 688109 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 154.667-220 chr20 55290684 55290920 + 1 NA Intergenic Intergenic -132241 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 198.333-93 chr2 47575849 47576177 + 1 NA Intergenic Intergenic -5682 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 338.667-11 chr14 73957156 73957792 + 1 NA TTS (NM_001330189) TTS (NM_001330189) 7172 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 214.333-164 chr9 136140722 136141156 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -22064 NR_134506 90120 Hs.287411 NM_152833 ENSG00000238227 TMEM250 C9orf69 transmembrane protein 250 protein-coding 121.667-138 chr4 54469941 54470120 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 137101 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 172.333-172 chr7 123226726 123226916 + 1 NA Intergenic Intergenic -26850 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 295.667-2 chr10 61573597 61573944 + 1 NA Intergenic Intergenic -89159 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 176.333-100 chr21 25803428 25803710 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -67915 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 189.333-102 chr2 166834781 166835105 + 1 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger -53544 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 146.667-31 chr10 35323510 35323694 + 1 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) L1ME2|LINE|L1 -12907 NM_001282854 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 192.333-156 chr7 31312470 31312819 + 1 NA Intergenic Intergenic 28082 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 181.667-77 chr2 196777861 196778203 + 1 NA intron (NM_012086, intron 10 of 17) intron (NM_012086, intron 10 of 17) 21651 NM_001206774 9330 Hs.470996 NM_012086 ENSG00000119041 GTF3C3 TFIIIC102|TFIIICgamma|TFiiiC2-102 general transcription factor IIIC subunit 3 protein-coding 137.333-3 chr1 45239671 45239912 + 1 NA Intergenic Intergenic -33186 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 190.333-108 chr4 155780186 155780477 + 1 NA intron (NM_001291952, intron 5 of 14) L2c|LINE|L2 21310 NM_001291952 2983 Hs.77890 NM_000857 ENSG00000061918 GUCY1B1 GC-S-beta-1|GC-SB3|GUC1B3|GUCB3|GUCSB3|GUCY1B3 guanylate cyclase 1 soluble subunit beta 1 protein-coding 175.667-37 chr14 66913098 66913419 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) intron (NM_001024218, intron 5 of 21) -276182 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 121.667-12 chr1 86017559 86017729 + 1 NA intron (NM_152890, intron 18 of 59) intron (NM_152890, intron 18 of 59) 138827 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 207.333-41 chr10 124762939 124763268 + 1 NA intron (NM_001304467, intron 5 of 6) intron (NM_001304467, intron 5 of 6) -18725 NM_014661 9679 Hs.129195 NM_014661 ENSG00000189319 FAM53B KIAA0140|bA12J10.2|smp family with sequence similarity 53 member B protein-coding 143.333-201 chr4 46713780 46713961 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 195375 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 154.667-19 chr1 119953743 119953947 + 1 NA intron (NM_001200001, intron 13 of 21) intron (NM_001200001, intron 13 of 21) -57330 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 152.333-221 chr22 40772657 40772895 + 1 NA intron (NM_006358, intron 8 of 8) AluJr|SINE|Alu 41182 NR_039923 100616283 NR_039923 ENSG00000266594 MIR4766 mir-4766 microRNA 4766 ncRNA 168.333-38 chr11 103961291 103961585 + 1 NA intron (NM_025208, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 -75202 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 135.667-154 chr6 18164302 18164544 + 1 NA intron (NM_001364614, intron 5 of 21) AluSx|SINE|Alu 9001 NM_001364614 221656 Hs.709336 NM_153042 ENSG00000165097 KDM1B AOF1|C6orf193|LSD2 lysine demethylase 1B protein-coding 290.667-7 chr10 74117472 74117837 + 1 NA intron (NM_014000, intron 21 of 21) AluJb|SINE|Alu 33174 NR_135191 26985 Hs.500104 NM_012095 ENSG00000185009 AP3M1 - adaptor related protein complex 3 subunit mu 1 protein-coding 204.667-28 chr11 111627108 111627412 + 1 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) intron (NM_015191, intron 3 of 14) 24811 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 156.333-132 chr16 60331414 60331669 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 28252 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 138.667-204 chr8 80884174 80884325 + 1 NA Intergenic Intergenic -9468 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 242.667-106 chr8 71884140 71884518 + 1 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) L1MA1|LINE|L1 -39833 NM_005098 9242 Hs.442619 NM_005098 ENSG00000178860 MSC ABF-1|ABF1|MYOR|bHLHa22 musculin protein-coding 186.333-107 chr3 163384597 163384893 + 1 NA Intergenic Intergenic -81444 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 196.667-113 chr4 167221227 167221574 + 1 NA intron (NM_001204352, intron 2 of 11) intron (NM_001204352, intron 2 of 11) 13026 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 183.333-64 chr17 58931658 58932006 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1M7|LINE|L1 175048 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 243.667-21 chr14 55221168 55221559 + 1 NA Intergenic Intergenic -29778 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 281.667-25 chr19 24384626 24385012 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -221372 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 139.667-11 chr1 167514704 167514935 + 1 NA intron (NM_000734, intron 1 of 7) intron (NM_000734, intron 1 of 7) 3710 NM_000734 919 Hs.156445 NM_000734 ENSG00000198821 CD247 CD3-ZETA|CD3H|CD3Q|CD3Z|IMD25|T3Z|TCRZ CD247 molecule protein-coding 171.333-71 chr19 42137456 42137643 + 1 NA TTS (NR_038332) TTS (NR_038332) -4036 NR_036208 100422980 NR_036208 ENSG00000266226 MIR4323 - microRNA 4323 ncRNA 325.667-13 chr2 97930729 97931346 + 1 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) MIR|SINE|MIR 64911 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 142.667-155 chr4 48485595 48485764 + 1 NA intron (NM_152679, intron 2 of 2) intron (NM_152679, intron 2 of 2) 2336 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 177.667-69 chr2 21409114 21409420 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 285281 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 119.667-120 chr3 110614929 110615170 + 1 NA Intergenic Intergenic 454910 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 130.333-24 chr10 9391852 9392073 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -96369 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 225.667-87 chrX 63644390 63644728 + 1 NA intron (NM_001369043, intron 8 of 9) L1MEj|LINE|L1 26943 NR_138419 100874355 Hs.671524 NR_138419 ENSG00000231729 ARHGEF9-IT1 - ARHGEF9 intronic transcript 1 ncRNA 182.667-2 chr1 44703123 44703540 + 1 NA intron (NM_001145636, intron 5 of 11) intron (NM_001145636, intron 5 of 11) 18570 NR_002753 26828 NR_002753 ENSG00000199377 RNU5F-1 RNU5F|U5F RNA, U5F small nuclear 1 snRNA 256.667-6 chr10 61528533 61528836 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 48643 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 213.667-20 chr11 24317887 24318129 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -179045 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 210.333-177 chr9 26886764 26887088 + 1 NA intron (NM_001167575, intron 2 of 5) intron (NM_001167575, intron 2 of 5) 5876 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 142.667-235 chr8 131541333 131541498 + 1 NA Intergenic Intergenic -362678 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 158.667-6 chr1 51557155 51557320 + 1 NA Intergenic Intergenic 26494 NR_161259 441884 NR_161259 CALR4P - calreticulin 4, pseudogene pseudo 123.333-165 chr4 110675193 110675343 + 1 NA Intergenic Intergenic -33145 NM_153427 5308 Hs.643588 NM_000325 ENSG00000164093 PITX2 ARP1|ASGD4|Brx1|IDG2|IGDS|IGDS2|IHG2|IRID2|Otlx2|PTX2|RGS|RIEG|RIEG1|RS paired like homeodomain 2 protein-coding 156.667-343 chr8 124266155 124266425 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18892 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 213.667-72 chr5 4627076 4627546 + 1 NA Intergenic Intergenic -146170 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 177.333-14 chr1 233013190 233013448 + 1 NA intron (NM_014801, intron 28 of 33) intron (NM_014801, intron 28 of 33) 62477 NR_138027 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 163.333-274 chr8 11755789 11755952 + 1 NA intron (NM_001308093, intron 4 of 5) AluJo|SINE|Alu -5386 NM_001031839 606553 Hs.545529 NM_001031839 C8orf49 G4DM chromosome 8 open reading frame 49 protein-coding 169.667-128 chr3 45499793 45500098 + 1 NA intron (NM_001368263, intron 13 of 20) intron (NM_001368263, intron 13 of 20) 9600 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 155.667-27 chr1 200102416 200102591 + 1 NA intron (NM_205860, intron 5 of 7) intron (NM_205860, intron 5 of 7) 59678 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 115.333-225 chr8 136208283 136208527 + 1 NA Intergenic Intergenic -322393 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 170.667-2 chr1 8478594 8478813 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 10 of 22) intron (NM_001042681, intron 10 of 22) 16210 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 145.667-312 chr9 95906009 95906289 + 1 NA intron (NM_020207, intron 3 of 18) L2|LINE|L2 30141 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 210.667-18 chr10 34864511 34864814 + 1 NA Intergenic Intergenic 48894 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 382.333-6 chr2 27719539 27720053 + 1 NA intron (NR_160725, intron 2 of 2) intron (NR_160725, intron 2 of 2) 3673 NR_160725 105374378 NR_160725 LOC105374378 - uncharacterized LOC105374378 ncRNA 184.333-168 chrX 93794246 93794458 + 1 NA Intergenic Intergenic 120146 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 329.333-35 chr3 148004449 148005094 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -73388 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 151.333-202 chr2 43387198 43387453 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) intron (NM_001083953, intron 29 of 37) 160114 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 199.667-97 chr3 160597995 160598210 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -32531 NM_002268 3840 Hs.467866 NM_002268 ENSG00000186432 KPNA4 IPOA3|QIP1|SRP3 karyopherin subunit alpha 4 protein-coding 146.667-309 chr7 61909659 61909825 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1394314 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 149.667-148 chr16 51703473 51703717 + 1 NA Intergenic Intergenic -58924 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 127.333-182 chr8 29215577 29215821 + 1 NA intron (NM_015254, intron 2 of 39) intron (NM_015254, intron 2 of 39) 47371 NM_015254 23303 Hs.444767 NM_015254 ENSG00000197892 KIF13B GAKIN kinesin family member 13B protein-coding 145.333-171 chr22 34697170 34697453 + 1 NA Intergenic Intergenic 300605 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 262.667-68 chr6 51252405 51252830 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -369253 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 143.333-105 chr15 91113762 91113973 + 1 NA intron (NM_001323039, intron 1 of 12) MIRb|SINE|MIR 12071 NM_001323040 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 145.333-234 chr5 44863866 44864053 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 55012 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 205.333-75 chr14 67753147 67753392 + 1 NA intron (NM_015346, intron 39 of 41) intron (NM_015346, intron 39 of 41) 51383 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 206.667-79 chr22 25443998 25444409 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -3884 NR_033734 1416 Hs.571835 NR_033733 ENSG00000100058 CRYBB2P1 CRYB2B crystallin beta B2 pseudogene 1 pseudo 167.667-43 chr12 31558424 31558598 + 1 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) intron (NM_001308339, intron 1 of 22) -31412 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 188.667-137 chr7 47979529 47979808 + 1 NA promoter-TSS (NM_001363683) promoter-TSS (NM_001363683) -53 NM_004507 3364 Hs.152983 NM_004507 ENSG00000136273 HUS1 hHUS1 HUS1 checkpoint clamp component protein-coding 307.667-6 chr10 68470362 68470778 + 1 NA intron (NM_001080449, intron 1 of 20) FRAM|SINE|Alu 1403 NM_001080449 1763 Hs.532446 NM_001080449 ENSG00000138346 DNA2 DNA2L|hDNA2 DNA replication helicase/nuclease 2 protein-coding 170.333-206 chr7 82688705 82688930 + 1 NA Intergenic Intergenic -244861 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 149.667-75 chr11 54924667 54924823 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 217913 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 140.333-171 chr4 169136651 169136799 + 1 NA intron (NM_020870, intron 4 of 11) intron (NM_020870, intron 4 of 11) -126470 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 150.333-395 chr8 46978114 46978355 + 1 NA Intergenic Intergenic 137348 NR_027012 497634 Hs.406982 NR_027012 LINC00293 BEYLA|NCRNA00293 long intergenic non-protein coding RNA 293 ncRNA 215.667-50 chr18 13065824 13066316 + 1 NA intron (NM_032142, intron 21 of 44) intron (NM_032142, intron 21 of 44) 74708 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 181.667-139 chr8 3528308 3528571 + 1 NA intron (NM_033225, intron 10 of 69) intron (NM_033225, intron 10 of 69) -799988 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 248.333-54 chr20 46621184 46621582 + 1 NA intron (NM_001193340, intron 2 of 12) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 30076 NM_022829 64849 Hs.655498 NM_022829 ENSG00000158296 SLC13A3 ARLIAK|NADC3|SDCT2 solute carrier family 13 member 3 protein-coding 211.333-211 chr6 141909012 141909399 + 1 NA Intergenic Intergenic 179594 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 176.333-70 chr18 4309318 4309710 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 44912 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 142.333-2 chr1 37679044 37679268 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 11373 NM_017850 54955 Hs.272673 NM_017850 ENSG00000116922 C1orf109 - chromosome 1 open reading frame 109 protein-coding 161.333-226 chr5 11853706 11853873 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) L2a|LINE|L2 50657 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 147.333-89 chr12 121928309 121928525 + 1 NA intron (NM_001178003, intron 3 of 17) intron (NM_001178003, intron 3 of 17) 9825 NM_144668 144406 Hs.709837 NM_144668 ENSG00000158023 WDR66 CFAP251|CaM-IP4|SPGF33 WD repeat domain 66 protein-coding 149.333-81 chr11 122128463 122128733 + 1 NA intron (NR_137184, intron 1 of 1) intron (NR_137184, intron 1 of 1) -12383 NM_001001786 414899 Hs.686109 NM_001001786 ENSG00000259571 BLID BRCC2 BH3-like motif containing, cell death inducer protein-coding 125.667-56 chr14 44971657 44971809 + 1 NA intron (NR_131765, intron 1 of 19) L1MC1|LINE|L1 9543 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 176.333-108 chr3 2204262 2204573 + 1 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) intron (NM_175607, intron 2 of 24) -34412 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 295.333-29 chr2 167237746 167238115 + 1 NA intron (NM_001199144, intron 3 of 8) intron (NM_001199144, intron 3 of 8) 50558 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 192.667-15 chr1 211940000 211940362 + 1 NA TTS (NM_001199809) TTS (NM_001199809) -95372 NM_001286230 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 157.667-110 chr15 62115142 62115339 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 48263 NM_207322 145741 Hs.202656 NM_207322 ENSG00000198535 C2CD4A FAM148A|NLF1 C2 calcium dependent domain containing 4A protein-coding 128.333-174 chr6 116748950 116749125 + 1 NA Intergenic Intergenic 16682 NM_001085480 221303 Hs.126712 NM_001085480 ENSG00000183807 FAM162B C6orf189|bA86F4.2 family with sequence similarity 162 member B protein-coding 179.333-3 chr1 43372999 43373374 + 1 NA Intergenic Intergenic -5112 NM_001256401 64834 Hs.25597 NM_022821 ENSG00000066322 ELOVL1 CGI-88|Ssc1 ELOVL fatty acid elongase 1 protein-coding 175.667-147 chr8 86601536 86601752 + 1 NA intron (NM_019098, intron 15 of 17) intron (NM_019098, intron 15 of 17) 87209 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 190.667-25 chr11 124218932 124219195 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -5576 NM_001291438 26492 Hs.381319 NM_001291438 OR8G2P HSTPCR120|OR8G2|OR8G4|ORL206|ORL486|TPCR120 olfactory receptor family 8 subfamily G member 2 pseudogene protein-coding 200.667-113 chr3 133827447 133827806 + 1 NA non-coding (NR_163491, exon 8 of 8) non-coding (NR_163491, exon 8 of 8) 21811 NR_163491 58477 Hs.12152 NM_021203 ENSG00000144867 SRPRB APMCF1|SR-beta SRP receptor subunit beta protein-coding 205.333-268 chrX 139981445 139981650 + 1 NA Intergenic Intergenic -16026 NM_001013403 347487 Hs.121384 NM_001013403 ENSG00000203933 CXorf66 SGPX chromosome X open reading frame 66 protein-coding 232.333-35 chr17 40769110 40769514 + 1 NA intron (NM_181539, intron 5 of 7) AluSz|SINE|Alu 2847 NM_181539 353288 Hs.592133 NM_181539 ENSG00000186393 KRT26 CK26|K25|K25IRS2|K26|KRT25B keratin 26 protein-coding 160.667-260 chr6 12883052 12883330 + 1 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) intron (NM_001322308, intron 3 of 13) -74165 NM_001322311 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 153.333-156 chr16 88389659 88389841 + 1 NA Intergenic Intergenic -37721 NM_001367624 84627 Hs.54925 NM_001127464 ENSG00000225614 ZNF469 BCS|BCS1 zinc finger protein 469 protein-coding 133.667-120 chr5 76363630 76363787 + 1 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 -39577 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 183.333-94 chr20 42444360 42444710 + 1 NA intron (NM_133170, intron 9 of 31) intron (NM_133170, intron 9 of 31) -240948 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 264.667-44 chr2 182657318 182657654 + 1 NA Intergenic Intergenic -58771 NR_073365 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 134.333-29 chr11 78291651 78291803 + 1 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 50153 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 167.667-53 chr13 67955362 67955607 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 583097 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 258.333-61 chr8 54241724 54242146 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -88751 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 145.333-72 chr12 120711722 120711895 + 1 NA intron (NM_001080533, intron 1 of 4) intron (NM_001080533, intron 1 of 4) 1350 NM_001080533 84747 Hs.127610 NM_032661 ENSG00000175970 UNC119B POC7B unc-119 lipid binding chaperone B protein-coding 186.667-87 chr3 5478784 5479108 + 1 NA Intergenic Intergenic -228691 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 113.333-45 chr11 58441143 58441296 + 1 NA Intergenic Intergenic -1046 NM_001004733 390191 Hs.553754 NM_001004733 ENSG00000172362 OR5B12 OR11-241|OR5B12P|OR5B16|OST743 olfactory receptor family 5 subfamily B member 12 protein-coding 167.667-99 chr2 38653531 38653857 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -12420 NM_138801 130589 Hs.435012 NM_138801 ENSG00000143891 GALM BLOCK25|GLAT|HEL-S-63p|IBD1 galactose mutarotase protein-coding 153.333-109 chr14 35637631 35637806 + 1 NA intron (NM_014990, intron 30 of 40) L1PA5|LINE|L1 103554 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 220.667-3 chr1 17998639 17998894 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -66891 NR_125946 101927876 Hs.522954 NR_125946 ENSG00000261781 LINC01654 - long intergenic non-protein coding RNA 1654 ncRNA 167.333-198 chr4 140572533 140572709 + 1 NA Intergenic Intergenic -3660 NM_021833 7350 Hs.249211 NM_021833 ENSG00000109424 UCP1 SLC25A7|UCP uncoupling protein 1 protein-coding 246.667-94 chr8 61791405 61791729 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 76779 NR_039680 100616484 NR_039680 ENSG00000264408 MIR4470 mir-4470 microRNA 4470 ncRNA 161.333-10 chr1 175429003 175429206 + 1 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) -236117 NM_001162893 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 143.333-248 chr6 118689155 118689395 + 1 NA intron (NM_001178035, intron 1 of 13) intron (NM_001178035, intron 1 of 13) 20800 NM_001178035 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 148.667-373 chr8 71048250 71048409 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 308377 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 156.667-173 chr2 34568885 34569148 + 1 NA Intergenic Intergenic -108541 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 220.333-60 chr2 34044097 34044462 + 1 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) AluY|SINE|Alu -22947 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 151.333-293 chr3 192815687 192815937 + 1 NA intron (NM_178496, intron 1 of 1) intron (NM_178496, intron 1 of 1) -88271 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 227.333-29 chr12 33836644 33836912 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -185718 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 173.333-182 chr7 31270022 31270248 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 70591 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 128.333-175 chr6 118669099 118669300 + 1 NA intron (NM_001178035, intron 1 of 13) intron (NM_001178035, intron 1 of 13) -17608 NM_206921 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 219.667-67 chr4 105383393 105383872 + 1 NA intron (NM_176869, intron 10 of 11) intron (NM_176869, intron 10 of 11) -30751 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 156.333-15 chr1 87998859 87999272 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -627410 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 135.667-57 chr15 39926834 39927075 + 1 NA Intergenic Intergenic -6062 NM_007223 11245 Hs.37196 NM_007223 ENSG00000166073 GPR176 HB-954 G protein-coupled receptor 176 protein-coding 223.333-28 chr11 104432386 104432813 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 176703 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 362.667-16 chr20 33525369 33526068 + 1 NA intron (NM_001032999, intron 1 of 10) AluJr|SINE|Alu 35622 NM_001032999 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 190.667-149 chr8 83048387 83048813 + 1 NA Intergenic Intergenic 136496 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 165.667-94 chr2 147670160 147670478 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -174198 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 153.667-345 chr6 141155475 141155761 + 1 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 471804 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 214.333-73 chr2 35972388 35972631 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 383061 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 193.333-133 chr4 13437973 13438293 + 1 NA intron (NM_001017979, intron 4 of 6) intron (NM_001017979, intron 4 of 6) 46207 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 232.667-48 chr22 44055716 44056124 + 1 NA intron (NM_001243386, intron 1 of 11) MLT2B1|LTR|ERVL -13197 NM_001243385 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 142.667-231 chr8 124994804 124994962 + 1 NA Intergenic MER41D|LTR|ERV1 3315 NR_134457 105375744 Hs.575534 NR_134457 ENSG00000253513 LOC105375744 - uncharacterized LOC105375744 ncRNA 132.667-123 chr4 36808961 36809208 + 1 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -167184 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 180.333-126 chr8 33999291 33999533 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -399306 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 129.333-187 chr8 84506228 84506438 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 90849 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 237.333-54 chr2 72191914 72192341 + 1 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -44265 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 154.333-40 chr10 82881934 82882118 + 1 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) intron (NR_163253, intron 6 of 10) -649106 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 173.667-5 chr1 73236079 73236389 + 1 NA Intergenic Intergenic -69936 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 123.667-56 chr14 57867310 57867462 + 1 NA Intergenic Intergenic -1294 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 280.667-40 chr5 84740003 84740440 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -355341 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 161.667-216 chr5 174046183 174046393 + 1 NA intron (NM_015980, intron 1 of 4) intron (NM_015980, intron 1 of 4) 582 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 164.667-233 chr8 34231698 34231869 + 1 NA Intergenic Intergenic -552138 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 126.667-90 chr2 227887633 227887812 + 1 NA intron (NM_178821, intron 2 of 12) intron (NM_178821, intron 2 of 12) 16091 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 151.333-109 chr12 119318544 119318739 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15261 NR_024246 144742 Hs.524782 NR_024246 ENSG00000281196 LINC00934 - long intergenic non-protein coding RNA 934 ncRNA 153.667-9 chr1 63608962 63609225 + 1 NA intron (NM_001172819, intron 1 of 10) intron (NM_001172819, intron 1 of 10) -14123 NM_001172818 5236 Hs.1869 NM_002633 ENSG00000079739 PGM1 CDG1T|GSD14 phosphoglucomutase 1 protein-coding 142.667-127 chr21 23358762 23359021 + 1 NA Intergenic Intergenic 25944 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 280.667-19 chr12 43541827 43542291 + 1 NA intron (NM_025003, intron 2 of 38) intron (NM_025003, intron 2 of 38) 10144 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 211.667-17 chr10 49482923 49483239 + 1 NA intron (NM_001346440, intron 9 of 20) intron (NM_001346440, intron 9 of 20) 41200 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 171.667-14 chr1 225828579 225828753 + 1 NA intron (NM_000120, intron 1 of 8) intron (NM_000120, intron 1 of 8) 3312 NM_000120 2052 Hs.89649 NM_000120 ENSG00000143819 EPHX1 EPHX|EPOX|HYL1|MEH epoxide hydrolase 1 protein-coding 168.667-224 chr8 102980626 102980885 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -40328 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 236.667-81 chr7 30259076 30259426 + 1 NA intron (NR_136267, intron 2 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -25346 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 179.667-88 chr22 45683565 45683806 + 1 NA intron (NM_001167621, intron 1 of 10) L1M5|LINE|L1 11851 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 150.667-143 chr17 31749295 31749568 + 1 NA Intergenic Intergenic 109531 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 175.667-16 chr10 17199728 17200025 + 1 NA intron (NM_004412, intron 1 of 10) intron (NM_004412, intron 1 of 10) 1796 NM_001321006 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 130.667-30 chr10 68774790 68774933 + 1 NA intron (NR_104262, intron 18 of 23) intron (NR_104262, intron 18 of 23) 19689 NR_003076 692211 NR_003076 ENSG00000283551 SNORD98 HBII-419 small nucleolar RNA, C/D box 98 snoRNA 153.333-412 chr8 88127092 88127253 + 1 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) intron (NM_005941, intron 4 of 9) 200311 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 264.667-6 chr1 113530985 113531420 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 140687 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 148.333-11 chr1 75163437 75163626 + 1 NA Intergenic Intergenic 29143 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 145.333-129 chr2 46921045 46921209 + 1 NA intron (NM_001288953, intron 2 of 20) L1M4|LINE|L1 -5015 NM_001171507 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 146.333-217 chr3 119921250 119921479 + 1 NA intron (NM_002093, intron 4 of 11) L1MC5|LINE|L1 138654 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 175.333-19 chr10 129309887 129310141 + 1 NA Intergenic Intergenic -157227 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 146.667-286 chr6 131242428 131242616 + 1 NA intron (NM_016377, intron 7 of 7) intron (NM_016377, intron 7 of 7) -7882 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 171.667-47 chr14 51591442 51591680 + 1 NA intron (NR_047477, intron 1 of 3) Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger 8391 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 128.667-150 chr5 130695286 130695493 + 1 NA Intergenic Intergenic 469867 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 164.333-191 chr5 35331850 35332042 + 1 NA Intergenic Intergenic -101459 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 163.667-150 chr3 36114965 36115228 + 1 NA Intergenic Intergenic -265391 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 122.667-19 chr10 107520844 107521035 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -356233 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 254.333-71 chr6 38753152 38753439 + 1 NA intron (NM_001371, intron 8 of 91) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 37984 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 167.667-55 chr14 50620275 50620557 + 1 NA intron (NM_015915, intron 8 of 13) intron (NM_015915, intron 8 of 13) 47890 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 210.667-91 chr3 111959712 111960031 + 1 NA intron (NM_001134437, intron 12 of 17) intron (NM_001134437, intron 12 of 17) -19155 NR_073571 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 287.333-66 chr8 99888925 99889378 + 1 NA intron (NM_004374, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 4556 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 167.667-74 chr16 61124906 61125136 + 1 NA Intergenic Intergenic -69255 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 158.667-202 chr3 19772179 19772341 + 1 NA Intergenic Intergenic 161957 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 176.667-53 chr14 45043382 45043580 + 1 NA intron (NR_131765, intron 11 of 19) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -40635 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 188.667-24 chr10 132679657 132679937 + 1 NA intron (NM_005539, intron 4 of 15) L1MB3|LINE|L1 -1478 NM_001321042 3632 Hs.523360 NM_005539 ENSG00000068383 INPP5A 5PTASE inositol polyphosphate-5-phosphatase A protein-coding 167.333-122 chr2 4550997 4551173 + 1 NA Intergenic Intergenic 105137 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 268.667-45 chr3 180861454 180861963 + 1 NA intron (NR_109986, intron 1 of 13) L1PA16|LINE|L1 8470 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 142.333-53 chr12 6444244 6444426 + 1 NA promoter-TSS (NM_001242) promoter-TSS (NM_001242) -550 NM_001242 939 Hs.355307 NM_001242 ENSG00000139193 CD27 S152|S152. LPFS2|T14|TNFRSF7|Tp55 CD27 molecule protein-coding 296.333 chr1 54134634 54135116 + 1 NA intron (NM_001353655, intron 6 of 6) AluSx1|SINE|Alu 18306 NM_001353655 200008 NM_201546 ENSG00000157211 CDCP2 - CUB domain containing protein 2 protein-coding 154.333-261 chr5 40346784 40347079 + 1 NA Intergenic Intergenic 294640 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 193.667-106 chr5 147695758 147696137 + 1 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) intron (NM_001270934, intron 1 of 20) 86781 NM_001282282 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 159.667-319 chr8 84074342 84074534 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -108349 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 178.667-62 chr17 48106137 48106361 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1284 NM_001330320 29916 Hs.15827 NM_013323 ENSG00000002919 SNX11 - sorting nexin 11 protein-coding 149.667-100 chr13 28594306 28594532 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -64711 NM_015932 51371 Hs.268742 NM_015932 ENSG00000132963 POMP C13orf12|HSPC014|PNAS-110|PRAAS2|UMP1 proteasome maturation protein protein-coding 208.667-105 chr4 178290819 178291271 + 1 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -383109 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 176.667-70 chr18 69390239 69390584 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10477 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 216.333-85 chr2 186467564 186468011 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -18473 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 248.333-46 chr2 125968837 125969287 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 148923 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 123.667-33 chr10 71347270 71347484 + 1 NA intron (NM_018344, intron 3 of 5) intron (NM_018344, intron 3 of 5) 28118 NM_018344 55315 Hs.438419 NM_018344 ENSG00000198246 SLC29A3 ENT3|HCLAP|HJCD|PHID solute carrier family 29 member 3 protein-coding 255.667-64 chr4 69959583 69959887 + 1 NA intron (NM_001891, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 1276 NM_001302770 1447 Hs.2242 NM_001891 ENSG00000135222 CSN2 CASB casein beta protein-coding 158.333-150 chr2 96279760 96280045 + 1 NA intron (NM_014014, intron 35 of 44) AluJb|SINE|Alu 13677 NM_004804 9391 Hs.12109 NM_004804 ENSG00000144021 CIAO1 CIA1|WDR39 cytosolic iron-sulfur assembly component 1 protein-coding 296.333-11 chr14 46229456 46229879 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) MER21C|LTR|ERVL 165508 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 155.333-150 chr18 71520812 71521042 + 1 NA non-coding (NR_038325, exon 7 of 7) non-coding (NR_038325, exon 7 of 7) 58029 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 261.667-66 chr7 4126578 4127107 + 1 NA TTS (NR_158215) TTS (NR_158215) -2843 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 127.333-162 chr6 137161676 137161901 + 1 NA 5' UTR (NM_052962, exon 2 of 7) 5' UTR (NM_052962, exon 2 of 7) 11856 NM_181310 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 139.333-177 chr5 13785555 13785740 + 1 NA intron (NM_001369, intron 52 of 78) L1MB3|LINE|L1 158833 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 137.667-144 chr4 94729781 94730003 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 27641 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 135.667-12 chr1 235728169 235728378 + 1 NA intron (NM_000081, intron 37 of 52) intron (NM_000081, intron 37 of 52) -77519 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 142.667-83 chr18 44166804 44167021 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 364785 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 234.333-83 chr8 21890311 21890836 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 23117 NM_001317800 9046 Hs.71215 NM_003974 ENSG00000147443 DOK2 p56DOK|p56dok-2 docking protein 2 protein-coding 261.333-109 chr8 126776887 126777196 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -218563 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 151.667-349 chr7 137791563 137791720 + 1 NA intron (NM_001321708, intron 1 of 32) intron (NM_001321708, intron 1 of 32) 54691 NM_001321709 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 158.667-220 chr3 152500702 152500963 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -159842 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 290.667-25 chr20 46497146 46497651 + 1 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 16174 NM_001353823 55713 Hs.147041 NM_018102 ENSG00000198185 ZNF334 - zinc finger protein 334 protein-coding 207.333-45 chr11 35099456 35099898 + 1 NA Intergenic Intergenic 38355 NR_120528 100507144 Hs.673491 NR_120528 ENSG00000255521 LOC100507144 - uncharacterized LOC100507144 ncRNA 201.333-83 chr13 52415957 52416450 + 1 NA intron (NM_001282168, intron 12 of 13) intron (NM_001282168, intron 12 of 13) -10031 NM_018676 55901 Hs.325667 NM_018676 ENSG00000136114 THSD1 TMTSP|UNQ3010 thrombospondin type 1 domain containing 1 protein-coding 161.333-166 chr2 235360448 235360702 + 1 NA Intergenic Intergenic -133468 NM_014914 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 119.667-181 chr8 79156350 79156510 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -175758 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 194.667-120 chr5 39613928 39614219 + 1 NA Intergenic Intergenic 93642 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 200.667-70 chr2 24160551 24160862 + 1 NA intron (NM_001145710, intron 7 of 10) intron (NM_001145710, intron 7 of 10) -14347 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 158.667-316 chr8 5360400 5360602 + 1 NA Intergenic Intergenic -365587 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 243.667-41 chr2 115052136 115052496 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) L1MB5|LINE|L1 -12257 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 265.667-6 chr10 28036753 28037139 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 36432 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 239.333-6 chr1 152463124 152463450 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -47516 NM_178438 254910 Hs.516410 NM_178438 ENSG00000186207 LCE5A LEP18|SPRL5A late cornified envelope 5A protein-coding 207.667-118 chr8 110027734 110028051 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -52121 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 126.333-31 chr11 130270438 130270600 + 1 NA intron (NR_163265, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 44193 NM_001301099 29068 Hs.721470 NM_014155 ENSG00000196323 ZBTB44 BTBD15|HSPC063|ZNF851 zinc finger and BTB domain containing 44 protein-coding 241.667-40 chr2 136840935 136841339 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) MIRb|SINE|MIR 75592 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 142.667-61 chr15 23927587 23927878 + 1 NA Intergenic Intergenic -47415 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 214.333-48 chr14 65773919 65774174 + 1 NA Intergenic Intergenic 302944 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 267.667-30 chr2 117820370 117820848 + 1 NA intron (NM_006773, intron 3 of 13) intron (NM_006773, intron 3 of 13) 5918 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 231.333-47 chr16 80419396 80419840 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR -121116 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 118.333-210 chr8 131238311 131238460 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -197476 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 191.333-155 chr5 34956133 34956490 + 1 NA 3' UTR (NM_001348420, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001348420, exon 12 of 12) 26718 NM_194283 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 168.667-154 chr3 186389166 186389440 + 1 NA Intergenic Intergenic -27069 NM_001080745 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 231.333-5 chr1 113857120 113857526 + 1 NA intron (NR_037864, intron 1 of 4) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 688 NR_037864 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-119 chr14 96548204 96548446 + 1 NA intron (NM_001363662, intron 16 of 20) intron (NM_001363662, intron 16 of 20) 45460 NM_001293628 10914 Hs.253726 NM_032632 ENSG00000090060 PAPOLA PAP|PAP-alpha poly(A) polymerase alpha protein-coding 153.333-98 chr12 58418028 58418317 + 1 NA Intergenic Intergenic -173530 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 158.667-275 chr5 107644549 107644826 + 1 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 26250 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 172.667-129 chr6 7522645 7522924 + 1 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -18887 NM_001008844 1832 Hs.519873 NM_004415 ENSG00000096696 DSP DCWHKTA|DP desmoplakin protein-coding 156.667-28 chr1 192543978 192544134 + 1 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 -31717 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 222.667-12 chr10 118078276 118078727 + 1 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) intron (NR_026940, intron 3 of 3) -31560 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 159.667-87 chr12 102019215 102019449 + 1 NA intron (NM_016053, intron 6 of 6) intron (NM_016053, intron 6 of 6) 42659 NM_016053 51019 Hs.405692 NM_016053 ENSG00000120860 WASHC3 CCDC53|CGI-116 WASH complex subunit 3 protein-coding 228.667-76 chr7 88348312 88348585 + 1 NA Intergenic Intergenic -41554 NM_001205316 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 265.333-11 chr10 107604077 107604432 + 1 NA Intergenic Intergenic -439548 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 171.667-164 chr8 106136536 106136734 + 1 NA Intergenic Intergenic -76132 NR_125797 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 152.333-57 chr10 120356501 120356656 + 1 NA Intergenic Intergenic -1355 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 144.333-11 chr1 114231943 114232173 + 1 NA Intergenic Intergenic -78189 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 226.333-54 chr19 44328014 44328350 + 1 NA exon (NM_001083335, exon 5 of 5) exon (NM_001083335, exon 5 of 5) -23157 NM_004234 9310 Hs.613424 NM_004234 ENSG00000159917 ZNF235 ANF270|HZF6|ZFP93|ZNF270 zinc finger protein 235 protein-coding 159.667-199 chr21 27556294 27556478 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -165993 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 208.333-51 chr16 76359061 76359522 + 1 NA intron (NR_136213, intron 3 of 23) intron (NR_136213, intron 3 of 23) 49439 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 127.333-64 chr17 53721945 53722156 + 1 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL -100877 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 136.333-98 chr2 132856400 132856630 + 1 NA intron (NM_207481, intron 11 of 17) intron (NM_207481, intron 11 of 17) -59042 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 223.333-14 chr1 199654190 199654535 + 1 NA Intergenic Intergenic -373348 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 188.667-130 chr6 42789750 42789996 + 1 NA intron (NR_134654, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 6377 NR_134654 401261 Hs.656652 NM_001004322 LOC401261 - uncharacterized LOC401261 ncRNA 203.667-103 chr6 8413532 8413810 + 1 NA non-coding (NR_109913, exon 12 of 12) non-coding (NR_109913, exon 12 of 12) 21874 NM_001370478 51000 Hs.285847 NM_015948 ENSG00000124786 SLC35B3 C6orf196|CGI-19|PAPST2 solute carrier family 35 member B3 protein-coding 196.333-154 chr6 48433876 48434207 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -365352 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 131.667-114 chr21 18067658 18067840 + 1 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) 150409 NM_001204175 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 185.667-138 chr8 137072506 137072717 + 1 NA Intergenic Intergenic 340977 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 153.333-173 chr18 73975929 73976231 + 1 NA Intergenic Intergenic 171754 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 179.333-34 chr11 18259166 18259436 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6924 NM_001178006 6288 Hs.632144 NM_000331 ENSG00000173432 SAA1 PIG4|SAA|SAA2|TP53I4 serum amyloid A1 protein-coding 140.667-148 chr3 81146298 81146561 + 1 NA Intergenic Intergenic 152561 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 139.667-9 chr1 145757441 145757658 + 1 NA intron (NM_014455, intron 4 of 8) MLT1F1-int|LTR|ERVL-MaLR 38050 NR_103845 11126 Hs.488237 NM_007053 ENSG00000117281 CD160 BY55|NK1|NK28 CD160 molecule protein-coding 292.333-12 chr12 50051367 50052022 + 1 NA Intergenic Intergenic -5902 NR_046389 41 Hs.274361 NM_001095 ENSG00000110881 ASIC1 ACCN2|ASIC|BNaC2 acid sensing ion channel subunit 1 protein-coding 120.667-89 chr2 35835472 35835658 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 364160 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 279.667-28 chr20 57797205 57797538 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -85835 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 158.333-288 chr7 5543353 5543620 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -12885 NM_001101 60 Hs.520640 NM_001101 ENSG00000075624 ACTB BRWS1|PS1TP5BP1 actin beta protein-coding 259.333-71 chr4 61273065 61273371 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 71046 NM_001371342 154.667-206 chr2 213343121 213343375 + 1 NA intron (NR_047660, intron 5 of 14) L1MEc|LINE|L1 58784 NR_047660 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 432.667-7 chr2 15544566 15545187 + 1 NA intron (NR_052013, intron 6 of 50) AluSg|SINE|Alu 16458 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 251.333-110 chr8 132361883 132362226 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 85208 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 185.333-165 chr6 64133672 64133919 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 326959 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 192.333-69 chr17 59085907 59086128 + 1 NA intron (NR_148346, intron 4 of 23) L1MB2|LINE|L1 20863 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 150.667-210 chr20 20158820 20159081 + 1 NA intron (NM_015585, intron 9 of 26) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 102304 NM_001167816 26074 Hs.729168 NM_015585 ENSG00000089101 CFAP61 C20orf26|CaM-IP3|dJ1002M8.3|dJ1178H5.4 cilia and flagella associated protein 61 protein-coding 149.333-186 chr2 98114070 98114219 + 1 NA intron (NR_144297, intron 2 of 18) L1MEf|LINE|L1 26977 NR_144296 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 114.333-233 chr8 124954461 124954640 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 12542 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 148.667-220 chr20 42509965 42510131 + 1 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) intron (NM_133170, intron 7 of 31) -175435 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 259.667-75 chr7 47561777 47562251 + 1 NA intron (NM_022748, intron 1 of 30) intron (NM_022748, intron 1 of 30) 20097 NM_022748 64759 Hs.520814 NM_022748 ENSG00000136205 TNS3 TEM6|TENS1 tensin 3 protein-coding 154.333-178 chr2 223502354 223502572 + 1 NA Intergenic Intergenic 99898 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 187.333-73 chr15 65375916 65376145 + 1 NA intron (NM_004884, intron 1 of 13) intron (NM_004884, intron 1 of 13) 1972 NM_004884 9543 Hs.128292 NM_004884 ENSG00000174498 IGDCC3 HsT18880|PUNC immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3 protein-coding 149.667-216 chr2 142583784 142583950 + 1 NA Intergenic Intergenic -293797 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 177.667-26 chr10 110060582 110060865 + 1 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) intron (NM_001121, intron 1 of 13) -52342 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 165.667-102 chr20 2687212 2687488 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -5430 NR_138537 57593 Hs.471955 NM_020833 ENSG00000088881 EBF4 COE4|O/E-4 EBF family member 4 protein-coding 170.333-34 chr10 81940704 81941002 + 1 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 63166 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 165.667-63 chr15 85064921 85065178 + 1 NA intron (NM_001243137, intron 2 of 21) L1MC4|LINE|L1 83075 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 197.333-194 chr6 15253927 15254225 + 1 NA intron (NM_001267040, intron 1 of 17) intron (NM_001267040, intron 1 of 17) 5221 NM_001267040 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 229.667-76 chr8 26362156 26362503 + 1 NA intron (NM_001177591, intron 6 of 9) AluSx3|SINE|Alu 20624 NR_144550 157489 Hs.586388 NR_144550 ENSG00000228451 SDAD1P1 - SDA1 domain containing 1 pseudogene 1 pseudo 168.333-162 chr5 80007598 80007819 + 1 NA intron (NM_001306213, intron 2 of 22) intron (NM_001306213, intron 2 of 22) 16412 NM_001306213 7060 Hs.211426 NM_003248 ENSG00000113296 THBS4 TSP-4|TSP4 thrombospondin 4 protein-coding 150.333-228 chr2 219261136 219261387 + 1 NA intron (NM_001355221, intron 1 of 3) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -6653 NM_001278552 7277 Hs.75318 NM_006000 ENSG00000127824 TUBA4A ALS22|H2-ALPHA|TUBA1 tubulin alpha 4a protein-coding 216.667-15 chr10 116455072 116455306 + 1 NA intron (NM_001011709, intron 4 of 11) L1MA7|LINE|L1 27342 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 147.667-23 chr1 191551351 191551515 + 1 NA Intergenic Intergenic -322935 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 224.333-127 chr8 118755553 118756011 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -133819 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 318.333-29 chr7 20975336 20975901 + 1 NA intron (NR_126381, intron 2 of 5) intron (NR_126381, intron 2 of 5) 140187 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 370.333-2 chr1 236345496 236346077 + 1 NA Intergenic Intergenic -48500 NM_145861 128178 Hs.352224 NM_080738 ENSG00000186197 EDARADD ECTD11A|ECTD11B|ED3|EDA3 EDAR associated death domain protein-coding 165.667-179 chr6 132426478 132426708 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -25118 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 178.667-41 chr13 27531691 27531930 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -81208 NM_152912 219402 Hs.534582 NM_152912 ENSG00000122033 MTIF3 IF3mt mitochondrial translational initiation factor 3 protein-coding 174.667-129 chr4 79368848 79369024 + 1 NA Intergenic Intergenic 39292 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 136.667-166 chr7 49659820 49660017 + 1 NA Intergenic (ACCTAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -113720 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 125.333-5 chr1 77586612 77586857 + 1 NA intron (NM_001308237, intron 4 of 13) L3|LINE|CR1 95924 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 144.333-14 chr1 166689019 166689300 + 1 NA Intergenic Intergenic 85243 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 255.667-79 chr7 30362490 30362793 + 1 NA intron (NM_147128, intron 4 of 4) AluSz6|SINE|Alu -7409 NR_002186 222161 Hs.112423 NR_002186 DKFZP586I1420 - uncharacterized protein DKFZp586I1420 pseudo 175.333-170 chr7 37151884 37152180 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 13 of 21) intron (NM_001206480, intron 13 of 21) 154236 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 158.667-162 chr2 101499518 101499724 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -24509 NM_001145664 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 170.333-62 chr13 22862328 22862678 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 35678 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 180.333-57 chr2 137862464 137862694 + 1 NA Intergenic Intergenic 65353 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 125.333-185 chr9 27618536 27618679 + 1 NA Intergenic Intergenic -44741 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 245.333-39 chr14 30147241 30147701 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -219624 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 137.667-5 chr1 73820967 73821129 + 1 NA Intergenic Intergenic 146369 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 156.667-142 chr17 73676511 73676696 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -32158 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 169.667-134 chr3 118047161 118047373 + 1 NA Intergenic AluYj4|SINE|Alu -356342 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 159.667-138 chr17 62738131 62738292 + 1 NA TTS (NR_147886) TTS (NR_147886) 32005 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 158.667-165 chr2 127096289 127096525 + 1 NA intron (NM_001320633, intron 1 of 14) intron (NM_001320633, intron 1 of 14) 10747 NM_139343 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 226.667-92 chr8 80659077 80659516 + 1 NA intron (NM_001033723, intron 7 of 8) intron (NM_001033723, intron 7 of 8) 173070 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 182.333-131 chr5 101833763 101833959 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 462423 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 163.333-173 chr22 26131699 26131897 + 1 NA Intergenic Intergenic -37664 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 171.333-49 chr14 61478624 61478838 + 1 NA intron (NM_006255, intron 9 of 13) AluJo|SINE|Alu 91463 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 197.333-60 chr13 100846831 100847182 + 1 NA intron (NR_047687, intron 2 of 7) L2b|LINE|L2 97358 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 210.333-158 chr7 44345380 44345674 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -19896 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 131.333-80 chr2 39702321 39702524 + 1 NA intron (NM_152390, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 36505 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 142.667-9 chr1 168781275 168781532 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5538 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 156.333-224 chr3 4114304 4114510 + 1 NA Intergenic Intergenic -188897 NM_001320677 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 153.667-282 chr4 36020917 36021181 + 1 NA intron (NR_146893, intron 35 of 36) L2|LINE|L2 222890 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 166.667-101 chr18 61653906 61654230 + 1 NA Intergenic Intergenic -94108 NR_103449 100996669 Hs.586981 NR_103449 LINC01544 - long intergenic non-protein coding RNA 1544 ncRNA 199.667-133 chr7 153032174 153032475 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 272572 NM_020445 57180 Hs.647117 NM_020445 ENSG00000133627 ACTR3B ARP11|ARP3BETA actin related protein 3B protein-coding 147.667-330 chr7 28051745 28051962 + 1 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -128604 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 122.333-147 chr3 173836158 173836302 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) 84566 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 138.333-58 chr14 52581898 52582088 + 1 NA intron (NM_001353361, intron 1 of 7) intron (NM_001353361, intron 1 of 7) 29157 NR_148417 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 149.333-323 chr5 154025918 154026104 + 1 NA intron (NM_001317993, intron 9 of 14) intron (NM_001317993, intron 9 of 14) 12899 NM_018691 10827 Hs.166551 NM_018691 ENSG00000055147 FAM114A2 133K02|C5orf3 family with sequence similarity 114 member A2 protein-coding 132.333-126 chr4 162447855 162448023 + 1 NA Intergenic Intergenic -283905 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 259.333-48 chr2 122984976 122985395 + 1 NA Intergenic LTR102_Mam|LTR|ERVL 88296 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 179.333-127 chr3 86847585 86847826 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 143444 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 158.667-138 chr18 63521701 63521919 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -34350 NM_001307928 89777 Hs.348541 NM_080474 ENSG00000166634 SERPINB12 YUKOPIN serpin family B member 12 protein-coding 164.667-184 chr5 34522774 34523012 + 1 NA Intergenic Intergenic -133435 NM_015577 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 230.667-35 chr2 20677449 20677801 + 1 NA 3' UTR (NM_182828, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_182828, exon 2 of 2) 10481 NM_182828 151449 Hs.447688 NM_182828 ENSG00000143869 GDF7 BMP12 growth differentiation factor 7 protein-coding 150.667-392 chr9 18629525 18629808 + 1 NA intron (NM_052866, intron 5 of 12) L1MEc|LINE|L1 56360 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 152.333-398 chr9 28344831 28345044 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) MER119|DNA|hAT-Charlie 374368 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 149.333-41 chr10 21232003 21232254 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 57826 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 130.333-139 chr3 129278041 129278302 + 1 NA promoter-TSS (NM_001370345) promoter-TSS (NM_001370345) -661 NM_001370345 56941 Hs.458320 NM_020187 ENSG00000183624 HMCES C3orf37|DC12|SRAPD1 5-hydroxymethylcytosine binding, ES cell specific protein-coding 140.333-47 chr12 32704512 32704682 + 1 NA intron (NM_012063, intron 2 of 18) intron (NM_012063, intron 2 of 18) 25296 NM_012062 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 174.667-130 chr4 107657779 107658040 + 1 NA intron (NM_005443, intron 6 of 11) intron (NM_005443, intron 6 of 11) 62325 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 125.667-50 chr12 115852241 115852391 + 1 NA Intergenic Intergenic 296338 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 193.667-40 chr14 40945694 40945924 + 1 NA Intergenic Intergenic -8902 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 258.667-55 chr20 43805138 43805543 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -78338 NM_176791 149699 Hs.447626 NM_176791 ENSG00000124196 GTSF1L C20orf65|FAM112A|dJ1028D15.4 gametocyte specific factor 1 like protein-coding 171.667-50 chr14 60563218 60563484 + 1 NA Intergenic Intergenic 54205 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 148.333-65 chr11 24553179 24553410 + 1 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 56241 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 119.667-40 chr12 79093670 79093892 + 1 NA intron (NM_005639, intron 3 of 10) LTR49-int|LTR|ERV1 48089 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 165.667-155 chr5 36446911 36447172 + 1 NA Intergenic Intergenic -145139 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 161.333-109 chr16 83358600 83358903 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -149595 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 172.333-78 chr19 57788665 57788913 + 1 NA Intergenic Intergenic 19113 NM_017652 54807 Hs.625133 NM_017652 ENSG00000083828 ZNF586 - zinc finger protein 586 protein-coding 152.333-193 chr2 150285843 150286042 + 1 NA Intergenic Intergenic -28935 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 154.333-137 chr19 28202039 28202283 + 1 NA Intergenic Intergenic -404527 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 201.667-73 chr3 31041159 31041463 + 1 NA Intergenic Intergenic 120476 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 163.333-82 chr14 49923448 49923760 + 1 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 30522 NM_001663 382 Hs.525330 NM_001663 ENSG00000165527 ARF6 - ADP ribosylation factor 6 protein-coding 266.667-14 chr10 81336311 81336794 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -538642 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 179.667-20 chr10 70343242 70343466 + 1 NA intron (NR_103468, intron 1 of 2) intron (NR_103468, intron 1 of 2) 33425 NM_001278213 55222 Hs.7778 NM_018205 ENSG00000172731 LRRC20 - leucine rich repeat containing 20 protein-coding 226.333-30 chr14 58270972 58271304 + 1 NA intron (NR_038123, intron 9 of 9) intron (NR_038123, intron 9 of 9) -16895 NR_146595 55451 NR_146595 ENSG00000279636 LINC00216 C14orf107|NCRNA00216|PRO1617 long intergenic non-protein coding RNA 216 ncRNA 150.667-373 chr8 96058325 96058500 + 1 NA Intergenic Intergenic 102394 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 158.333-162 chr2 149077303 149077540 + 1 NA promoter-TSS (NM_001317004) promoter-TSS (NM_001317004) -101 NM_001317004 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 122.333-39 chr11 124868119 124868339 + 1 NA intron (NM_022370, intron 1 of 27) intron (NM_022370, intron 1 of 27) 2797 NM_022370 64221 Hs.435621 NM_022370 ENSG00000154134 ROBO3 HGPPS|HGPPS1|HGPS|RBIG1|RIG1 roundabout guidance receptor 3 protein-coding 156.333-213 chr20 53727692 53727979 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 119481 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 152.667-372 chr8 80527975 80528195 + 1 NA Intergenic Intergenic 41859 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 155.667-194 chr20 17104113 17104361 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -121870 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 256.667-2 chr1 113366794 113367185 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -23526 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 153.333-334 chr5 80861377 80861614 + 1 NA intron (NM_002439, intron 21 of 23) L1MCa|LINE|L1 -98868 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 248.333-75 chr4 182214670 182214939 + 1 NA Intergenic Intergenic -28598 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 264.667-7 chr1 114994094 114994412 + 1 NA intron (NR_104211, intron 31 of 32) L1MB3|LINE|L1 -35571 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 141.667-11 chr1 172532260 172532425 + 1 NA promoter-TSS (NM_016227) promoter-TSS (NM_016227) -7 NM_016227 51430 Hs.204559 NM_014283 ENSG00000094975 SUCO C1orf9|CH1|OPT|SLP1 SUN domain containing ossification factor protein-coding 153.333-300 chr4 64244576 64244738 + 1 NA Intergenic Intergenic 164793 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 213.333-212 chr8 121652245 121652635 + 1 NA Intergenic Intergenic -11000 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 196.333-101 chr21 29639368 29639668 + 1 NA intron (NM_000830, intron 7 of 16) intron (NM_000830, intron 7 of 16) 43478 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 155.667-142 chr18 70155321 70155560 + 1 NA intron (NM_001318520, intron 14 of 47) intron (NM_001318520, intron 14 of 47) 50247 NM_173630 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 214.667-98 chr5 50789353 50789646 + 1 NA intron (NM_024615, intron 10 of 25) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 122085 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 300.333-9 chr12 29321176 29321554 + 1 NA intron (NM_001271783, intron 9 of 11) AluJb|SINE|Alu -3517 NR_103860 100506606 Hs.298851 NR_103860 ENSG00000257176 LOC100506606 - uncharacterized LOC100506606 ncRNA 169.333-212 chr5 128912784 128912957 + 1 NA Intergenic Intergenic -52257 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 144.667-48 chr12 9842211 9842443 + 1 NA exon (NM_016523, exon 5 of 6) exon (NM_016523, exon 5 of 6) 14846 NM_016523 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 169.333-129 chr2 169623213 169623509 + 1 NA intron (NM_004792, intron 9 of 13) MER85|DNA|PiggyBac 39010 NM_004792 9360 Hs.470544 NM_004792 ENSG00000138398 PPIG CARS-Cyp|CYP|SCAF10|SRCyp peptidylprolyl isomerase G protein-coding 223.333-144 chr6 72156546 72156936 + 1 NA intron (NM_014989, intron 4 of 33) L1MA9|LINE|L1 -56152 NM_001350442 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 170.333-227 chr9 71810845 71811049 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -42434 NM_001349784 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 166.333-76 chr15 46199264 46199610 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 494242 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 165.333-99 chr17 17666932 17667150 + 1 NA Intergenic Intergenic 10647 NR_131243 105371564 Hs.369680 NR_131243 ENSG00000223979 SMCR2 TCONS_00025215 Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 2 ncRNA 137.333-195 chr8 85354557 85354779 + 1 NA intron (NM_001738, intron 1 of 8) intron (NM_001738, intron 1 of 8) -12954 NM_001164830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 164.667-33 chr11 17473649 17473821 + 1 NA intron (NR_147094, intron 2 of 37) intron (NR_147094, intron 2 of 37) 3110 NM_001287174 6833 Hs.54470 NM_000352 ENSG00000006071 ABCC8 ABC36|HHF1|HI|HRINS|MRP8|PHHI|SUR|SUR1|SUR1delta2|TNDM2 ATP binding cassette subfamily C member 8 protein-coding 192.667-79 chr18 12592128 12592411 + 1 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 64463 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 219.333-74 chr17 55115004 55115289 + 1 NA intron (NM_178509, intron 16 of 17) intron (NM_178509, intron 16 of 17) -146361 NM_001321518 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 187.333-195 chr8 56982306 56982512 + 1 NA intron (NM_017813, intron 1 of 4) AluSc|SINE|Alu 11458 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 226.667-36 chr14 64456042 64456498 + 1 NA intron (NM_001364837, intron 26 of 26) intron (NM_001364837, intron 26 of 26) -9229 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 173.667-143 chr5 91965747 91965961 + 1 NA Intergenic Intergenic -582537 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 175.667-90 chr21 20260199 20260486 + 1 NA Intergenic Intergenic -1657 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 169.667-161 chr5 1595476 1595714 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1064 NR_003263 728609 Hs.379186 NR_003263 SDHAP3 SDHACL|SDHAL succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A pseudogene 3 pseudo 136.333-110 chr20 3015741 3015911 + 1 NA intron (NM_080841, intron 10 of 22) (TTTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -27796 NM_178332 2797 Hs.129715 NM_001501 ENSG00000125787 GNRH2 GnRH-II|LH-RHII gonadotropin releasing hormone 2 protein-coding 178.333-176 chr8 136877799 136878130 + 1 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 347166 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 256.333-26 chr12 117614433 117614886 + 1 NA intron (NM_173598, intron 5 of 19) intron (NM_173598, intron 5 of 19) -252857 NM_001204218 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 159.333-224 chr3 183723724 183723939 + 1 NA intron (NM_001351371, intron 5 of 21) AluSx1|SINE|Alu 13592 NM_001351369 55689 Hs.632575 NM_018023 ENSG00000163872 YEATS2 - YEATS domain containing 2 protein-coding 206.333-87 chr2 119761428 119761654 + 1 NA intron (NM_002830, intron 1 of 26) intron (NM_002830, intron 1 of 26) 1619 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 172.333-188 chr8 117069632 117069814 + 1 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) MER115|DNA|hAT-Tip100 -65272 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 206.333-85 chr2 100770341 100770586 + 1 NA Intergenic Intergenic -49676 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 149.667-28 chr1 118910835 118911030 + 1 NA intron (NM_152380, intron 6 of 7) intron (NM_152380, intron 6 of 7) 77411 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 158.667-61 chr11 60697841 60698094 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -1645 NM_031457 83661 Hs.150878 NM_031457 ENSG00000166959 MS4A8 4SPAN4|CD20L5|MS4A4|MS4A8B membrane spanning 4-domains A8 protein-coding 356.333-15 chr16 34585794 34586247 + 1 NA Intergenic Intergenic -204540 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 176.333-29 chr11 44593489 44593762 + 1 NA intron (NM_001024844, intron 2 of 8) intron (NM_001024844, intron 2 of 8) 27962 NM_002231 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 536.333-3 chr8 78830612 78831531 + 1 NA Intergenic Intergenic -6458 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 172.333-153 chr6 36161033 36161216 + 1 NA Intergenic Intergenic 30611 NM_002754 5603 Hs.178695 NM_002754 ENSG00000156711 MAPK13 MAPK 13|MAPK-13|PRKM13|SAPK4|p38delta mitogen-activated protein kinase 13 protein-coding 161.667-271 chr9 90056786 90057041 + 1 NA Intergenic Intergenic -15414 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 156.667-4 chr1 40555438 40555621 + 1 NA Intergenic Intergenic 23892 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 150.333-213 chr2 146725160 146725361 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 138203 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 217.333-93 chr3 60240674 60240995 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -159925 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 146.333-281 chr6 42604992 42605208 + 1 NA intron (NM_015255, intron 5 of 46) intron (NM_015255, intron 5 of 46) 41071 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 161.333-244 chr6 68675914 68676195 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 40772 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 146.333-315 chr8 26000278 26000489 + 1 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) L2c|LINE|L2 45030 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 155.333-33 chr10 72691853 72692010 + 1 NA promoter-TSS (NR_073062) promoter-TSS (NR_073062) -200 NM_138357 90550 Hs.591366 NM_138357 ENSG00000156026 MCU C10orf42|CCDC109A|HsMCU mitochondrial calcium uniporter protein-coding 168.667-227 chr8 122538422 122538733 + 1 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) L1PB1|LINE|L1 30067 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 211.333-166 chr4 53529182 53529474 + 1 NA intron (NM_001126328, intron 2 of 10) intron (NM_001126328, intron 2 of 10) 28941 NM_032622 84708 Hs.518760 NM_032622 ENSG00000072201 LNX1 LNX|MPDZ|PDZRN2 ligand of numb-protein X 1 protein-coding 155.667-36 chr10 64636370 64636553 + 1 NA Intergenic Intergenic -189067 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 186.667-55 chr17 60912201 60912435 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 12 of 25) intron (NM_001330413, intron 12 of 25) 234467 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 153.667-390 chr8 120504117 120504366 + 1 NA intron (NM_022045, intron 15 of 21) HAL1ME|LINE|L1 58822 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 139.333-83 chr16 51101618 51101758 + 1 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu 48909 NM_001127892 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 191.333-26 chr10 64025284 64025590 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -503547 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 256.333-6 chr1 85878420 85878749 + 1 NA intron (NM_152890, intron 32 of 59) L1MC2|LINE|L1 -170151 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 302.333-25 chr4 39903989 39904366 + 1 NA exon (NM_001100400, exon 12 of 16) exon (NM_001100400, exon 12 of 16) 73734 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 198.667-106 chr2 144160856 144161141 + 1 NA intron (NM_001284234, intron 2 of 9) intron (NM_001284234, intron 2 of 9) 50581 NM_001284233 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 206.667-37 chr14 69019522 69019796 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 39977 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 157.667-279 chr6 62385197 62385465 + 1 NA Intergenic Intergenic -99104 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 243.667-28 chr16 81022457 81022802 + 1 NA exon (NM_001270473, exon 6 of 10) exon (NM_001270473, exon 6 of 10) -13213 NM_015251 23300 Hs.16349 NM_015251 ENSG00000166454 ATMIN ASCIZ|ZNF822 ATM interactor protein-coding 166.667-4 chr1 40746179 40746435 + 1 NA intron (NM_001142589, intron 2 of 8) intron (NM_001142589, intron 2 of 8) 7471 NM_001308114 4802 Hs.713051 NM_014223 ENSG00000066136 NFYC CBF-C|CBFC|H1TF2A|HAP5|HSM|NF-YC nuclear transcription factor Y subunit gamma protein-coding 122.667-6 chr1 91226937 91227141 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 177798 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 150.333-328 chr5 68486522 68486820 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 194094 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 193.667-122 chr7 11643520 11643860 + 1 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 188508 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 263.667-20 chr13 113895737 113896217 + 1 NA intron (NM_001278674, intron 1 of 7) intron (NM_001278674, intron 1 of 7) 874 NM_001278674 643365 Hs.127655 NM_001039767 LINC00452 LINC00453 long intergenic non-protein coding RNA 452 protein-coding 351.667-16 chr5 86507298 86507730 + 1 NA Intergenic Intergenic -110427 NM_001867 1350 Hs.430075 NM_001867 ENSG00000127184 COX7C - cytochrome c oxidase subunit 7C protein-coding 123.667-88 chr2 55532978 55533138 + 1 NA intron (NM_001282761, intron 5 of 10) L2c|LINE|L2 13463 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 211.667-52 chr19 36891460 36891820 + 1 NA exon (NM_001171979, exon 6 of 6) exon (NM_001171979, exon 6 of 6) 24399 NM_001171979 374899 Hs.720312 NM_001037232 ENSG00000185869 ZNF829 - zinc finger protein 829 protein-coding 238.333-48 chr2 134387620 134387893 + 1 NA intron (NM_001371457, intron 11 of 16) L3|LINE|CR1 133684 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 150.333-253 chr22 30346018 30346229 + 1 NA intron (NM_005877, intron 3 of 15) MIRb|SINE|MIR -10501 NM_001318334 550631 Hs.505597 NM_001017437 ENSG00000187860 CCDC157 - coiled-coil domain containing 157 protein-coding 112.667-27 chr10 36244706 36244846 + 1 NA Intergenic Intergenic 466474 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 119.333-65 chr12 5793364 5793511 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 10 of 25) intron (NM_001278596, intron 10 of 25) 151822 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 145.667-108 chr17 40623088 40623239 + 1 NA Intergenic Intergenic 24655 NM_003079 6605 Hs.743978 NM_003079 ENSG00000073584 SMARCE1 BAF57|CSS5 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 protein-coding 127.333-62 chr17 19652526 19652733 + 1 NA exon (NM_001031806, exon 3 of 11) exon (NM_001031806, exon 3 of 11) 3878 NM_001031806 224 Hs.499886 NM_000382 ENSG00000072210 ALDH3A2 ALDH10|FALDH|SLS aldehyde dehydrogenase 3 family member A2 protein-coding 241.667-81 chr6 108554134 108554400 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5558 NM_201559 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 197.667-122 chr5 61480351 61480619 + 1 NA intron (NM_020928, intron 2 of 13) intron (NM_020928, intron 2 of 13) 148227 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 155.667-53 chr11 74385278 74385566 + 1 NA intron (NM_173582, intron 1 of 13) intron (NM_173582, intron 1 of 13) 13011 NM_173582 283209 Hs.26612 NM_173582 ENSG00000165434 PGM2L1 BM32A|PMMLP phosphoglucomutase 2 like 1 protein-coding 145.333-94 chr14 78273887 78274067 + 1 NA intron (NR_073547, intron 2 of 20) intron (NR_073547, intron 2 of 20) 103604 NR_158975 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 245.333-32 chr12 113881666 113882002 + 1 NA intron (NM_001146698, intron 21 of 24) intron (NM_001146698, intron 21 of 24) 84491 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 124.333-41 chr13 30977206 30977380 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 44637 NM_001353390 122046 Hs.124463 NM_152325 ENSG00000175664 TEX26 C13orf26 testis expressed 26 protein-coding 189.333-29 chr10 75844828 75845154 + 1 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) intron (NM_032024, intron 1 of 5) 62230 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 135.333-191 chr8 86384327 86384576 + 1 NA intron (NM_007013, intron 5 of 24) intron (NM_007013, intron 5 of 24) 41904 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 220.667-110 chr8 135499596 135499976 + 1 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) intron (NM_006558, intron 1 of 8) 42330 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 208.333-30 chr12 61739483 61739876 + 1 NA intron (NM_178539, intron 4 of 4) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 453160 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 161.667-267 chr9 6495263 6495477 + 1 NA intron (NM_152896, intron 10 of 15) intron (NM_152896, intron 10 of 15) 82171 NM_152896 115426 Hs.493401 NM_152896 ENSG00000147854 UHRF2 NIRF|RNF107|TDRD23|URF2 ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 protein-coding 163.333-46 chr11 4477114 4477436 + 1 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR -11604 NM_001005171 390036 Hs.553726 NM_001005171 ENSG00000196778 OR52K1 OR11-8 olfactory receptor family 52 subfamily K member 1 protein-coding 150.333-78 chr12 26914251 26914472 + 1 NA intron (NM_018164, intron 12 of 16) intron (NM_018164, intron 12 of 16) 23620 NM_018164 55726 Hs.505077 NM_018164 ENSG00000064102 INTS13 ASUN|C12orf11|GCT1|Mat89Bb|NET48|SPATA30 integrator complex subunit 13 protein-coding 151.333-240 chr2 241280191 241280419 + 1 NA intron (NM_005336, intron 1 of 27) intron (NM_005336, intron 1 of 27) -7419 NM_001243900 3069 Hs.471851 NM_005336 ENSG00000115677 HDLBP HBP|PRO2900|VGL high density lipoprotein binding protein protein-coding 321.333-5 chr1 118038197 118038697 + 1 NA intron (NM_206996, intron 23 of 48) L1MC1|LINE|L1 108708 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 204.333-18 chr1 217644068 217644471 + 1 NA intron (NM_138796, intron 1 of 10) intron (NM_138796, intron 1 of 10) 12925 NM_138796 128153 Hs.171130 NM_138796 ENSG00000162814 SPATA17 IQCH|MSRG-11|MSRG11 spermatogenesis associated 17 protein-coding 332.333-14 chr2 177290361 177291235 + 1 NA intron (NR_026966, intron 8 of 8) AluSz|SINE|Alu 23084 NR_106767 102465255 NR_106767 ENSG00000278418 MIR6512 hsa-mir-6512|mir-6512 microRNA 6512 ncRNA 310.333-30 chr4 59205794 59206142 + 1 NA Intergenic Intergenic 192395 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 364.333-10 chr12 129270459 129271061 + 1 NA intron (NM_133448, intron 4 of 8) intron (NM_133448, intron 4 of 8) 62159 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 327.333-46 chr8 122906463 122906981 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) AluSz|SINE|Alu 119050 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 153.333-23 chr1 154166073 154166292 + 1 NA 3' UTR (NM_001364683, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001364683, exon 9 of 9) -11066 NM_207308 91181 Hs.67639 NM_207308 ENSG00000143552 NUP210L - nucleoporin 210 like protein-coding 149.333-56 chr10 75270050 75270237 + 1 NA Intergenic Intergenic -26240 NR_038224 253264 Hs.662111 NR_038223 ENSG00000226051 ZNF503-AS1 - ZNF503 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-287 chr5 10432095 10432318 + 1 NA intron (NM_001270660, intron 24 of 24) MIRb|SINE|MIR 9645 NR_102746 100505845 Hs.599395 NR_102746 ROPN1L-AS1 - ROPN1L antisense RNA 1 ncRNA 132.667-80 chr2 54825884 54826158 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 4 of 40) intron (NM_001039753, intron 4 of 40) 101009 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 208.667-138 chr8 58932392 58932660 + 1 NA intron (NM_014729, intron 3 of 8) intron (NM_014729, intron 3 of 8) 186621 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 197.333-68 chr14 61585903 61586202 + 1 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -15399 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 152.333-356 chr7 71402627 71402782 + 1 NA intron (NM_022479, intron 3 of 10) intron (NM_022479, intron 3 of 10) -94934 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 151.333-11 chr1 72872029 72872257 + 1 NA Intergenic Intergenic -434027 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 208.333-122 chr5 173142203 173142529 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2165 NM_013979 662 Hs.145726 NM_001205 ENSG00000113734 BNIP1 NIP1|SEC20|TRG-8 BCL2 interacting protein 1 protein-coding 152.333-60 chr11 18042680 18042884 + 1 NA Intergenic Intergenic -1994 NM_004179 7166 Hs.591999 NM_004179 ENSG00000129167 TPH1 TPRH|TRPH tryptophan hydroxylase 1 protein-coding 153.333-381 chr7 42899650 42899820 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 12108 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 205.333-197 chr6 27057274 27057500 + 1 NA Intergenic Intergenic -37081 NR_026776 100270746 Hs.590428 NR_026776 LOC100270746 - uncharacterized LOC100270746 ncRNA 170.333-229 chr9 77487438 77487716 + 1 NA intron (NR_121184, intron 2 of 4) intron (NR_121184, intron 2 of 4) 39928 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 232.667-24 chr14 52093180 52093551 + 1 NA Intergenic Intergenic -24306 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 263.667-60 chr3 112349830 112350362 + 1 NA TTS (NM_001365851) TTS (NM_001365851) 16940 NR_158642 4345 Hs.79015 NM_005944 ENSG00000091972 CD200 MOX1|MOX2|MRC|OX-2 CD200 molecule protein-coding 149.667-60 chr10 69270904 69271108 + 1 NA intron (NM_001322364, intron 1 of 19) intron (NM_001322364, intron 1 of 19) 1006 NM_033497 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 237.333-29 chr14 47114865 47115150 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 5 of 16) L1PA10|LINE|L1 228239 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 251.667-55 chr22 25671482 25671910 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 5 of 19) MIR|SINE|MIR -70492 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 155.667-134 chr18 1967076 1967291 + 1 NA Intergenic Intergenic 604322 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 162.333-3 chr1 37221441 37221681 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 59998 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 162.333-43 chr11 84680598 84680813 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) MIRb|SINE|MIR 40237 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 177.333-21 chr10 104298698 104298986 + 1 NA intron (NM_001191013, intron 5 of 5) intron (NM_001191013, intron 5 of 5) 23676 NM_001191015 119391 Hs.107384 NM_183239 ENSG00000065621 GSTO2 GSTO 2-2|bA127L20.1 glutathione S-transferase omega 2 protein-coding 147.667-27 chr1 217390138 217390405 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 240819 NM_001297754 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 143.333-10 chr1 104289412 104289594 + 1 NA Intergenic Intergenic 216480 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 146.333-354 chr9 96705607 96705753 + 1 NA Intergenic Intergenic -20141 NR_026792 441455 Hs.229613 NR_026792 LOC441455 - makorin ring finger protein 1 pseudogene pseudo 127.333-101 chr22 31268834 31268979 + 1 NA intron (NM_001031801, intron 10 of 14) intron (NM_001031801, intron 10 of 14) 20522 NM_001031801 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 183.667-37 chr12 43744623 43744966 + 1 NA intron (NM_001098615, intron 4 of 8) MER5B|DNA|hAT-Charlie 13996 NM_001271826 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 159.667-90 chr12 114667238 114667408 + 1 NA Intergenic CpG 16852 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 142.333-77 chr14 40603310 40603505 + 1 NA Intergenic Intergenic -351304 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 154.333-340 chr8 91198285 91198533 + 1 NA intron (NR_148895, intron 8 of 10) MIRb|SINE|MIR -7076 NR_039805 100616245 NR_039805 ENSG00000266194 MIR4661 - microRNA 4661 ncRNA 156.333-347 chr7 123386014 123386182 + 1 NA Intergenic Intergenic 146850 NR_104244 154865 Hs.159650 NM_178827 ENSG00000164675 IQUB - IQ motif and ubiquitin domain containing protein-coding 246.667-6 chr1 114402061 114402400 + 1 NA intron (NM_015906, intron 16 of 19) L2|LINE|L2 108973 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 220.333-86 chr3 863885 864295 + 1 NA Intergenic Intergenic -228934 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 147.333-163 chr2 19435529 19435763 + 1 NA Intergenic Intergenic -77023 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 159.667-95 chr14 50483109 50483403 + 1 NA intron (NM_198794, intron 5 of 31) intron (NM_198794, intron 5 of 31) 49313 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 137.667-122 chr3 61769345 61769491 + 1 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) AluJr|SINE|Alu 207847 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 128.333-56 chr14 41823023 41823184 + 1 NA intron (NM_001330106, intron 2 of 4) L1PB4|LINE|L1 216247 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 233.667-12 chr11 45219257 45219611 + 1 NA intron (NM_001256695, intron 5 of 7) intron (NM_001256695, intron 5 of 7) 66907 NM_020826 57586 Hs.436643 NM_020826 ENSG00000019505 SYT13 - synaptotagmin 13 protein-coding 274.667-41 chr4 85577064 85577523 + 1 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 102143 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 227.667-16 chr12 127088224 127088673 + 1 NA Intergenic Intergenic -28051 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 125.667-192 chr8 118640604 118640772 + 1 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) intron (NR_038210, intron 2 of 4) -18725 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 294.333 chr1 102130639 102131167 + 1 NA Intergenic Intergenic -133669 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 140.333-21 chr1 197652547 197652799 + 1 NA intron (NR_125340, intron 6 of 19) intron (NR_125340, intron 6 of 19) 122807 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 153.667-312 chr5 44248292 44248585 + 1 NA Intergenic Intergenic -140294 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 220.333-78 chr21 28468452 28468828 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -70678 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 221.667-75 chr7 95089364 95089744 + 1 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 179656 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 121.333-192 chr9 107379699 107379857 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 86807 NR_121581 101928720 Hs.125496 NR_121581 LINC01509 PRCAT37 long intergenic non-protein coding RNA 1509 ncRNA 156.333-90 chr12 118965211 118965488 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -16192 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 145.333-21 chr1 216526758 216527025 + 1 NA intron (NM_001243518, intron 6 of 7) MIR3|SINE|MIR -103443 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 136.667-136 chr5 2246593 2246769 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 65520 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 345.667-19 chr5 111694455 111695032 + 1 NA intron (NR_040093, intron 2 of 6) intron (NR_040093, intron 2 of 6) 61508 NM_001142483 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 151.333-212 chr2 78342805 78342986 + 1 NA Intergenic Intergenic -52164 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 148.667-333 chr6 66736760 66736944 + 1 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 948973 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 133.667-34 chr12 18729523 18729674 + 1 NA intron (NM_001330774, intron 3 of 14) intron (NM_001330774, intron 3 of 14) 7911 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 149.667-213 chr2 125610742 125610969 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 507130 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 149.667-150 chr16 61507812 61508096 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -452188 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 153.333-149 chr15 101720430 101720613 + 1 NA intron (NM_152334, intron 3 of 18) intron (NM_152334, intron 3 of 18) 3952 NM_152334 123283 Hs.657163 NM_152334 ENSG00000185418 TARSL2 - threonyl-tRNA synthetase like 2 protein-coding 151.667-8 chr1 69283954 69284136 + 1 NA Intergenic Intergenic -149210 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 153.333-208 chr2 102794981 102795250 + 1 NA intron (NM_001321346, intron 3 of 3) L1MEf|LINE|L1 33084 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 173.333-130 chr3 111851227 111851404 + 1 NA intron (NM_001134437, intron 2 of 17) intron (NM_001134437, intron 2 of 17) -7865 NM_145753 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 197.333-104 chr2 43484343 43484706 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 26 of 37) intron (NM_001083953, intron 26 of 37) 111450 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 162.333-171 chr3 146429113 146429409 + 1 NA Intergenic MST-int|LTR|ERVL-MaLR 40040 NM_001199978 57047 Hs.744414 NM_020359 ENSG00000163746 PLSCR2 - phospholipid scramblase 2 protein-coding 165.667-140 chr4 54413844 54414165 + 1 NA Intergenic Intergenic 81112 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 202.333-29 chr10 79274275 79274713 + 1 NA intron (NM_020338, intron 7 of 24) intron (NM_020338, intron 7 of 24) -72975 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 130.667-64 chr14 49184894 49185189 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 401339 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 159.667-2 chr1 27094604 27094801 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 60423 NM_003047 6548 Hs.469116 NM_003047 ENSG00000090020 SLC9A1 APNH|LIKNS|NHE-1|NHE1|PPP1R143 solute carrier family 9 member A1 protein-coding 150.333-164 chr17 75201789 75201943 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -3570 NM_001330472 79902 Hs.362817 NM_024844 ENSG00000125450 NUP85 FROUNT|NPHS17|Nup75 nucleoporin 85 protein-coding 149.667-344 chr6 48643158 48643311 + 1 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 -574545 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 206.667-26 chr12 4786089 4786330 + 1 NA Intergenic Intergenic -22967 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 145.667-89 chr14 78330658 78330804 + 1 NA intron (NR_073547, intron 4 of 20) intron (NR_073547, intron 4 of 20) -72988 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 342.667 chr1 182950977 182951470 + 1 NA intron (NM_030933, intron 2 of 9) intron (NM_030933, intron 2 of 9) 1943 NM_030933 81626 Hs.497034 NM_030933 ENSG00000157060 SHCBP1L C1orf14|GE36 SHC binding and spindle associated 1 like protein-coding 152.667-337 chr7 28344775 28344932 + 1 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) L1M1|LINE|L1 45532 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 483.667-4 chr7 79903624 79904287 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -230876 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 166.333-113 chr2 63890610 63890788 + 1 NA intron (NM_001001521, intron 9 of 9) intron (NM_001001521, intron 9 of 9) 48819 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 210.333-7 chr1 114237149 114237428 + 1 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -83419 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 153.333-377 chr7 16828403 16828590 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -23497 NM_006408 10551 Hs.530009 NM_006408 ENSG00000106541 AGR2 AG-2|AG2|GOB-4|HAG-2|HEL-S-116|HPC8|PDIA17|XAG-2 anterior gradient 2, protein disulphide isomerase family member protein-coding 148.667-338 chr6 129333022 129333273 + 1 NA intron (NM_000426, intron 29 of 64) AluSx1|SINE|Alu 377030 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 145.333-272 chr7 48385309 48385498 + 1 NA intron (NM_152701, intron 35 of 61) L1PA13|LINE|L1 213945 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 195.667-60 chr17 58053401 58053621 + 1 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 29693 NR_110809 101927666 Hs.552237 NR_110809 ENSG00000266290 LOC101927666 - uncharacterized LOC101927666 ncRNA 158.667-191 chr21 27834995 27835234 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 112735 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 124.333-18 chr10 43792642 43792794 + 1 NA Intergenic Intergenic -2301 NR_002726 10151 Hs.632956 NR_002726 HNRNPA3P1 D10S102|FBRNP|HNRPA3|HNRPA3P1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 1 pseudo 146.333-213 chr3 101399454 101399737 + 1 NA intron (NM_001282801, intron 4 of 22) intron (NM_001282801, intron 4 of 22) -79020 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 287.333-47 chr5 27754895 27755269 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 282790 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 226.333-116 chr9 88719221 88719562 + 1 NA Intergenic Intergenic 26514 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 153.333-154 chr16 53890023 53890360 + 1 NA intron (NM_001363903, intron 7 of 7) intron (NM_001363903, intron 7 of 7) -149202 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 147.667-287 chr5 93850237 93850451 + 1 NA intron (NM_032042, intron 7 of 10) LTR86B2|LTR|ERVL -108744 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 264.667-85 chr8 74992377 74992872 + 1 NA intron (NM_031461, intron 2 of 14) intron (NM_031461, intron 2 of 14) -7531 NM_001286777 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 169.333-2 chr1 42534651 42534951 + 1 NA intron (NM_001080850, intron 1 of 16) intron (NM_001080850, intron 1 of 16) 1781 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 149.667-365 chr7 26740372 26740581 + 1 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 102605 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 157.667-365 chrX 135399069 135399254 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 2732 NR_104652 100506790 Hs.161358 NR_104652 ENSG00000229015 LOC100506790 - uncharacterized LOC100506790 ncRNA 158.667-361 chrX 117423806 117424085 + 1 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 549793 NM_033495 90293 Hs.348262 NM_033495 ENSG00000003096 KLHL13 BKLHD2 kelch like family member 13 protein-coding 214.667-25 chr11 73544115 73544493 + 1 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) L1MB8|LINE|L1 53808 NM_015159 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 118.333-35 chr10 98804811 98805004 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1MA3|LINE|L1 119661 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 164.667-219 chr7 28025244 28025481 + 1 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR -155095 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-137 chr22 28544890 28545118 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MER41B|LTR|ERV1 85135 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 179.333-194 chr9 22465578 22465777 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 18853 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 153.333-183 chr2 5045623 5045832 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -389505 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 155.333-70 chr12 12629295 12629549 + 1 NA intron (NM_001310, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 17546 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 179.333-157 chr5 109123583 109123933 + 1 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) intron (NR_146155, intron 17 of 19) 199152 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 234.667-8 chr10 13697065 13697398 + 1 NA intron (NM_001318336, intron 13 of 23) AluSx|SINE|Alu 10336 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 146.667-92 chr13 94106671 94106920 + 1 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) intron (NM_005708, intron 4 of 8) 81196 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-37 chr11 40725339 40725617 + 1 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) AluY|SINE|Alu -432348 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 118.333-63 chr14 43131967 43132114 + 1 NA Intergenic Intergenic 1375243 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 152.333-293 chr5 30243579 30243733 + 1 NA Intergenic Intergenic 363096 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 211.333-70 chr15 63888889 63889235 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -18043 NR_029944 494334 NR_029944 ENSG00000199156 MIR422A MIRN422A microRNA 422a ncRNA 151.667-93 chr13 19964415 19964637 + 1 NA intron (NM_197968, intron 2 of 24) AluJo|SINE|Alu 4712 NR_148365 7750 Hs.507433 NM_003453 ENSG00000121741 ZMYM2 FIM|MYM|RAMP|SCLL|ZNF198 zinc finger MYM-type containing 2 protein-coding 141.333-177 chr4 85539065 85539304 + 1 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) intron (NM_001025616, intron 1 of 9) 64034 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 197.333-236 chr8 107415468 107415711 + 1 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) -79074 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 213.333-86 chr2 16657522 16657879 + 1 NA intron (NM_030797, intron 1 of 11) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 8134 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 155.333-402 chr8 124175840 124176033 + 1 NA Intergenic Intergenic -4414 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 211.333-162 chr4 41523207 41523602 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 2 of 25) MER58A|DNA|hAT-Charlie -14753 NM_001330672 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 172.333-157 chr6 50110037 50110233 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -60206 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 184.667-80 chr3 55612703 55612948 + 1 NA intron (NR_132749, intron 16 of 17) L1MB8|LINE|L1 46644 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 191.667-130 chr8 133622851 133623151 + 1 NA Intergenic Intergenic -51114 NM_003033 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 137.333-2 chr1 43406679 43406937 + 1 NA intron (NM_015284, intron 4 of 70) MIR|SINE|MIR 16909 NM_001365999 23334 Hs.643560 NM_015284 ENSG00000198198 SZT2 C1orf84|EIEE18|KIAA0467|SZT2A|SZT2B SZT2 subunit of KICSTOR complex protein-coding 229.667-16 chr11 94058307 94058673 + 1 NA intron (NM_001098672, intron 2 of 19) intron (NM_001098672, intron 2 of 19) 37136 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 146.667-201 chr20 59861650 59861819 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 71903 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 147.333-284 chr6 141229488 141229738 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 545799 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 175.667-153 chr9 130326450 130326641 + 1 NA intron (NM_001291815, intron 21 of 97) intron (NM_001291815, intron 21 of 97) 60785 NM_001291815 256158 Hs.32194 NM_144655 ENSG00000148357 HMCN2 - hemicentin 2 protein-coding 269.667-60 chrX 100649787 100650288 + 1 NA intron (NM_014467, intron 2 of 10) intron (NM_014467, intron 2 of 10) 5838 NM_014467 27286 Hs.306339 NM_014467 ENSG00000102359 SRPX2 BPP|CBPS|PMGX|RESDX|SRPUL sushi repeat containing protein X-linked 2 protein-coding 133.333-110 chr3 109946380 109946539 + 1 NA Intergenic Intergenic 343631 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 153.333-210 chr2 122113974 122114137 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 358404 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 169.667-190 chr7 1572874 1573134 + 1 NA intron (NR_021487, intron 1 of 5) AluSq2|SINE|Alu 2931 NR_027329 114796 Hs.436146 NR_021487 ENSG00000230487 PSMG3-AS1 - PSMG3 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 249.333-20 chr11 74857867 74858225 + 1 NA intron (NM_001270381, intron 9 of 15) L1MCc|LINE|L1 91045 NM_001270380 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 213.333-120 chr22 34276036 34276467 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -353363 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 161.667-55 chr12 46165819 46166059 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 100577 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 243.333-14 chr11 103171773 103172250 + 1 NA intron (NM_001377, intron 34 of 88) intron (NM_001377, intron 34 of 88) 62585 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 222.667-44 chr2 143168137 143168497 + 1 NA intron (NM_018460, intron 2 of 13) AluJr4|SINE|Alu 38898 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 176.667-146 chr8 87058645 87058855 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 192335 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 217.333-29 chr10 118788517 118788980 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -33778 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 181.333-182 chr8 119046858 119047157 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) intron (NM_001324095, intron 3 of 7) -20240 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 138.667-114 chr2 184867896 184868071 + 1 NA intron (NM_194250, intron 2 of 3) intron (NM_194250, intron 2 of 3) 269454 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 191.667-49 chr14 71039619 71039988 + 1 NA intron (NM_014982, intron 19 of 35) MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 132344 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 150.333-9 chr1 93482296 93482603 + 1 NA intron (NM_001024948, intron 1 of 13) intron (NM_001024948, intron 1 of 13) 34318 NM_001024948 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 147.333-102 chr14 53224795 53225079 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 71583 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 134.333-86 chr2 112599791 112599960 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 15021 NM_001304354 84269 Hs.375707 NM_032309 ENSG00000125611 CHCHD5 C2orf9|CHTM1|MIC14|MIX14 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 5 protein-coding 168.333-118 chr20 44982315 44982513 + 1 NA intron (NM_001352385, intron 4 of 11) AluJr|SINE|Alu 15902 NM_006282 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 269.667-3 chr1 225626468 225627004 + 1 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) Tigger8|DNA|TcMar-Tigger 26387 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 148.667-384 chr8 115829782 115829947 + 1 NA Intergenic Intergenic -160889 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 418.333-15 chr9 34142931 34143696 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -16615 NM_015397 25853 Hs.493750 NM_015397 ENSG00000198876 DCAF12 CT102|KIAA1892|TCC52|WDR40A DDB1 and CUL4 associated factor 12 protein-coding 172.667-148 chr7 43905911 43906096 + 1 NA intron (NM_001077664, intron 1 of 5) CpG 593 NM_001204871 100534592 NM_001204871 ENSG00000270617 URGCP-MRPS24 - URGCP-MRPS24 readthrough protein-coding 128.333-48 chr12 29521932 29522150 + 1 NA intron (NM_001367875, intron 13 of 19) intron (NM_001367875, intron 13 of 19) -22348 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 158.667-223 chr3 178098713 178098946 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 281964 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 157.667-16 chr1 171974437 171974725 + 1 NA intron (NM_001278252, intron 2 of 14) intron (NM_001278252, intron 2 of 14) 110389 NR_046845 100874284 NR_046845 ENSG00000233540 DNM3-IT1 - DNM3 intronic transcript 1 ncRNA 122.667-154 chr5 102749791 102750004 + 1 NA Intergenic Intergenic -4886 NM_001319943 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 223.667-22 chr14 86940578 86941038 + 1 NA Intergenic Intergenic 35030 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 173.333-118 chr3 31131057 31131280 + 1 NA Intergenic Intergenic 30619 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 122.667-110 chr22 26205721 26205956 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 36364 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 225.667-14 chr11 36853972 36854420 + 1 NA Intergenic Intergenic -255917 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 145.667-248 chr6 67997371 67997540 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -57896 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 165.667-49 chr14 54139117 54139429 + 1 NA Intergenic Intergenic -182382 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 183.333-43 chr14 59739681 59739932 + 1 NA intron (NM_021136, intron 2 of 8) intron (NM_021136, intron 2 of 8) -92786 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 130.333-2 chr1 15863625 15863834 + 1 NA intron (NM_015001, intron 1 of 14) AluJb|SINE|Alu -15582 NR_024279 729614 Hs.119298 NR_024279 ENSG00000179743 FLJ37453 - uncharacterized LOC729614 ncRNA 156.667-71 chr11 132181594 132181853 + 1 NA intron (NM_016522, intron 2 of 6) intron (NM_016522, intron 2 of 6) -102579 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 180.333-4 chr1 103932032 103932370 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -140822 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 169.333-78 chr14 57911211 57911389 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -45208 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 215.667-127 chr9 73084624 73084950 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -67078 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 149.333-349 chr6 132476840 132477195 + 1 NA intron (NM_001326579, intron 2 of 9) intron (NM_001326579, intron 2 of 9) 35766 NM_001326578 8417 Hs.593148 NM_003569 ENSG00000079950 STX7 - syntaxin 7 protein-coding 211.333-205 chr6 63191195 63191507 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 128626 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 151.667-12 chr1 88944462 88944702 + 1 NA intron (NM_001008661, intron 11 of 13) MIRb|SINE|MIR 48047 NM_001008661 56267 Hs.481898 NM_001008661 ENSG00000137944 KYAT3 CCBL2|KAT3|KATIII kynurenine aminotransferase 3 protein-coding 267.333-20 chr12 12954252 12954727 + 1 NA intron (NR_149067, intron 1 of 2) intron (NR_149067, intron 1 of 2) -4105 NM_018654 55507 Hs.644599 NM_018654 ENSG00000111291 GPRC5D - G protein-coupled receptor class C group 5 member D protein-coding 169.667-26 chr11 9269256 9269516 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -4036 NM_001243254 23258 Hs.501857 NM_015213 ENSG00000184014 DENND5A EIEE49|RAB6IP1 DENN domain containing 5A protein-coding 281.333-26 chr17 59682594 59682966 + 1 NA exon (NM_004859, exon 23 of 32) exon (NM_004859, exon 23 of 32) 24818 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 172.333-162 chr7 1773699 1774034 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -31556 NR_120509 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 195.667-20 chr11 81224541 81224813 + 1 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -461874 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 257.333-61 chr3 14976048 14976583 + 1 NA intron (NM_003298, intron 1 of 14) intron (NM_003298, intron 1 of 14) -27874 NR_046251 100505641 Hs.517821 NR_046251 ENSG00000225733 FGD5-AS1 - FGD5 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-90 chr14 59981933 59982124 + 1 NA exon (NM_001355272, exon 16 of 33) exon (NM_001355272, exon 16 of 33) 62315 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 291.667-27 chr5 39994436 39994933 + 1 NA Intergenic Intergenic -57607 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 206.333-166 chr8 119172113 119172438 + 1 NA Intergenic Intergenic -36088 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 244.667-4 chr1 87688809 87689246 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -317372 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 184.333-106 chr3 95823630 95823862 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -140553 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 117.333-101 chr2 76047154 76047339 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -336331 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 159.333-99 chr14 84497812 84497994 + 1 NA Intergenic Intergenic -774029 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 172.333-171 chr7 121839950 121840342 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -33015 NM_001369396 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 251.333-2 chr1 81364920 81365372 + 1 NA intron (NM_001366003, intron 2 of 27) intron (NM_001366003, intron 2 of 27) 58751 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 115.333-144 chr3 132738838 132739017 + 1 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) MIRb|SINE|MIR -16468 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 144.333-89 chr16 64345689 64345947 + 1 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 776245 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 160.667-259 chr6 11287111 11287423 + 1 NA intron (NM_001142393, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu -54585 NM_001271033 4739 Hs.37982 NM_006403 ENSG00000111859 NEDD9 CAS-L|CAS2|CASL|CASS2|HEF1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 protein-coding 149.667-167 chr18 6349051 6349206 + 1 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) L1ME3A|LINE|L1 9902 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 208.333-54 chr17 31172071 31172410 + 1 NA intron (NM_001042492, intron 5 of 57) AluJr|SINE|Alu 77263 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 158.667-122 chr17 29415529 29415690 + 1 NA intron (NM_025142, intron 1 of 17) L1MB5|LINE|L1 24684 NM_020791 57551 Hs.597434 NM_020791 ENSG00000160551 TAOK1 KFC-B|MAP3K16|MARKK|PSK-2|PSK2|TAO1|hKFC-B|hTAOK1 TAO kinase 1 protein-coding 151.667-272 chr5 38904710 38904896 + 1 NA intron (NM_003999, intron 9 of 17) intron (NM_003999, intron 9 of 17) 58791 NM_003999 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 184.333-85 chr2 187990351 187990558 + 1 NA Intergenic Intergenic 297237 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 159.667-33 chr1 217093885 217094098 + 1 NA intron (NM_001134285, intron 1 of 8) AluJr4|SINE|Alu -3423 NM_001350122 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 144.333-157 chr22 42664258 42664432 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -14953 NM_000398 1727 Hs.561064 NM_000398 ENSG00000100243 CYB5R3 B5R|DIA1 cytochrome b5 reductase 3 protein-coding 300.333-51 chr9 75665537 75665891 + 1 NA Intergenic Intergenic -224930 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 146.333-231 chr4 63496556 63496781 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 912782 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 237.667-46 chr20 20935900 20936184 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 170316 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 373.667-8 chr2 175162754 175163286 + 1 NA intron (NR_045773, intron 1 of 13) AluY|SINE|Alu 4689 NR_030630 100126350 NR_030630 ENSG00000215973 MIR933 MIRN933|hsa-mir-933|mir-933 microRNA 933 ncRNA 151.333-380 chr7 7941161 7941327 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 27508 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 135.333-154 chr6 2014405 2014575 + 1 NA intron (NM_001253846, intron 4 of 10) L1MCa|LINE|L1 161501 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 242.333-95 chr8 29048247 29048683 + 1 NA intron (NM_001324388, intron 8 of 9) intron (NM_001324388, intron 8 of 9) 157151 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 201.333-117 chr15 92129556 92129792 + 1 NA intron (NR_135775, intron 7 of 10) intron (NR_135775, intron 7 of 10) -264207 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 167.333-76 chr14 46502068 46502339 + 1 NA TTS (NR_102701) TTS (NR_102701) 30844 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 146.333-322 chr8 79342643 79342838 + 1 NA Intergenic Intergenic 10552 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 182.667-87 chr22 39096974 39097339 + 1 NA promoter-TSS (NM_001166003) promoter-TSS (NM_001166003) -68 NM_001166004 164668 Hs.440515 NM_181773 ENSG00000100298 APOBEC3H A3H|ARP-10|ARP10 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3H protein-coding 278.667-20 chr18 10360467 10360812 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 53731 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 231.333-60 chr2 113789806 113790207 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -33364 NM_001330317 80255 Hs.355655 NM_025181 ENSG00000115084 SLC35F5 - solute carrier family 35 member F5 protein-coding 144.333-52 chr12 95719664 95719828 + 1 NA intron (NM_001329701, intron 3 of 9) intron (NM_001329701, intron 3 of 9) 70449 NM_001329702 59277 Hs.201034 NM_021229 ENSG00000074527 NTN4 PRO3091 netrin 4 protein-coding 113.333-257 chr8 81619373 81619602 + 1 NA intron (NR_146081, intron 6 of 7) LTR56|LTR|ERV1 11790 NR_146081 650747 NR_146081 IMPA1P1 IMPA1P inositol monophosphatase 1 pseudogene 1 pseudo 250.667-72 chr7 77207871 77208160 + 1 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) L2b|LINE|L2 -8196 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 138.667-168 chr5 91695330 91695483 + 1 NA Intergenic Intergenic -312089 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 199.333-203 chr4 78185653 78185910 + 1 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) intron (NM_001166133, intron 2 of 41) -103204 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 159.667-228 chr4 42162876 42163043 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -10304 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 216.333-3 chr1 8702179 8702528 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) intron (NM_001042681, intron 1 of 22) 115287 NM_012102 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 160.667-96 chr14 88219856 88220019 + 1 NA intron (NM_138317, intron 4 of 6) intron (NM_138317, intron 4 of 6) 50974 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 231.667-28 chr2 32368440 32368945 + 1 NA intron (NM_016252, intron 1 of 73) AluSz|SINE|Alu 11664 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 166.667-196 chr6 39750689 39750996 + 1 NA Intergenic Intergenic -25419 NM_001351503 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 306.333-9 chr11 30906385 30906889 + 1 NA exon (NM_020869, exon 11 of 20) exon (NM_020869, exon 11 of 20) 86049 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 192.333-123 chr4 52845852 52846138 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -16322 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 243.333-101 chr6 155325768 155326149 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -11474 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 135.667-81 chr2 6939828 6940052 + 1 NA intron (NR_146069, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 6856 NM_001349182 9781 Hs.22146 NM_014746 ENSG00000151692 RNF144A RNF144|UBCE7IP4|hUIP4 ring finger protein 144A protein-coding 138.667-139 chr3 144121297 144121445 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 148290 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 219.667-48 chr21 25801437 25801787 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -65958 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 167.667-185 chr6 82884046 82884264 + 1 NA Intergenic Intergenic 181686 NR_146807 90025 Hs.148609 NM_198920 ENSG00000118420 UBE3D C6orf157|H10BH|UBE2CBP|YJR141W ubiquitin protein ligase E3D protein-coding 253.667-59 chr5 119926992 119927399 + 1 NA Intergenic Intergenic 297636 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 186.333-53 chr14 83271197 83271541 + 1 NA Intergenic Intergenic 628737 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 140.333-62 chr14 47580241 47580433 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 94617 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 155.333-212 chr22 22239225 22239543 + 1 NA Intergenic Intergenic -5402 NM_007128 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 130.667-122 chr2 202380260 202380423 + 1 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) intron (NM_001204, intron 1 of 12) 4014 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 152.667-177 chr2 56414297 56414458 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -228607 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 137.667-34 chr10 129632019 129632219 + 1 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 164878 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 254.333-12 chr12 52310632 52311093 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 10536 NM_002282 3889 Hs.720768 NM_002282 ENSG00000170523 KRT83 EKVP5|HB3|Hb-3|KRTHB3|MNLIX keratin 83 protein-coding 231.333-115 chr7 155220869 155221141 + 1 NA Intergenic Intergenic -76767 NM_001346593 3638 Hs.520819 NM_005542 ENSG00000186480 INSIG1 CL6 insulin induced gene 1 protein-coding 127.333-159 chr6 93848748 93848938 + 1 NA Intergenic Intergenic 130540 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 155.333-79 chr12 62996222 62996484 + 1 NA Intergenic Intergenic -61203 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 178.333-174 chr8 120936714 120936920 + 1 NA Intergenic Intergenic -124771 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 153.667-102 chr12 121066405 121066704 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -27312 NM_001261825 8638 Hs.118633 NM_003733 ENSG00000135114 OASL OASL1|OASLd|TRIP-14|TRIP14|p59 OASL|p59-OASL|p59OASL 2'-5'-oligoadenylate synthetase like protein-coding 270.333-14 chr11 99146585 99147020 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) AluJb|SINE|Alu 125853 NM_001243270 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 138.333-100 chr2 180817416 180817665 + 1 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) intron (NR_104324, intron 3 of 4) 125436 NR_104323 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 155.667-198 chr21 19764913 19765108 + 1 NA Intergenic Intergenic 134745 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 192.667-100 chr20 56376141 56376487 + 1 NA intron (NM_198433, intron 8 of 10) intron (NM_198433, intron 8 of 10) 15901 NM_198433 6790 Hs.250822 NM_003600 ENSG00000087586 AURKA AIK|ARK1|AURA|BTAK|PPP1R47|STK15|STK6|STK7 aurora kinase A protein-coding 150.667-128 chr15 27685937 27686108 + 1 NA Intergenic Intergenic 413293 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 270.333-52 chr6 22538622 22538935 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -30788 NM_138574 154150 Hs.629246 NM_138574 ENSG00000112273 HDGFL1 HRP-1|Hdgfrp1|PWWP1|dJ309H15.1 HDGF like 1 protein-coding 259.667-29 chr2 11456895 11457353 + 1 NA intron (NM_001278276, intron 2 of 7) intron (NM_001278276, intron 2 of 7) 9037 NR_103490 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 189.333-79 chr18 10520509 10520913 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -5316 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 276.667-60 chr5 141195191 141195548 + 1 NA 3' UTR (NM_018930, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_018930, exon 1 of 1) 3016 NM_018930 56126 Hs.657953 NM_018930 ENSG00000120324 PCDHB10 PCDH-BETA10|PCHB10 protocadherin beta 10 protein-coding 186.667-5 chr1 167310274 167310552 + 1 NA intron (NR_037163, intron 2 of 16) L1MEi|LINE|L1 -18657 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 176.667-154 chr9 30665948 30666285 + 1 NA Intergenic Intergenic -257662 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 235.667-69 chr9 79598165 79598684 + 1 NA intron (NM_001351556, intron 4 of 18) intron (NM_001351556, intron 4 of 18) 25247 NM_001351563 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 140.667-231 chr8 90948555 90948751 + 1 NA intron (NM_022351, intron 10 of 12) intron (NM_022351, intron 10 of 12) 36424 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 137.333-77 chr18 44189483 44189753 + 1 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 342079 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 147.333-244 chr4 86921818 86921986 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 12948 NR_038841 100506746 Hs.657766 NR_038841 AFF1-AS1 - AFF1 antisense RNA 1 ncRNA 184.333-159 chr8 130665607 130665901 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -222080 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 149.333-64 chr10 98637022 98637191 + 1 NA intron (NM_021828, intron 7 of 11) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -190143 NM_001322476 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 168.333-124 chr22 25727634 25727827 + 1 NA 3' UTR (NM_005160, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_005160, exon 21 of 21) -14458 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 218.333-27 chr12 7297743 7298191 + 1 NA Intergenic MER4C|LTR|ERV1 -6365 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 183.667-69 chr2 12597276 12597682 + 1 NA Intergenic Intergenic -119393 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 159.333-130 chr18 58429859 58430049 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -21120 NR_029667 406906 NR_029667 ENSG00000284440 MIR122 MIR122A|MIRN122|MIRN122A|hsa-mir-122|miRNA122|miRNA122A|mir-122 microRNA 122 ncRNA 254.667-19 chr12 66411393 66411796 + 1 NA intron (NM_001366722, intron 15 of 24) L1PA11|LINE|L1 109049 NR_135081 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 257.333-29 chr13 58708451 58708932 + 1 NA Intergenic Intergenic -475574 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 164.333-232 chr8 14221216 14221384 + 1 NA intron (NM_139167, intron 4 of 7) intron (NM_139167, intron 4 of 7) 591610 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 166.667-216 chr7 42852355 42852537 + 1 NA Intergenic Intergenic 59397 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 136.667-11 chr1 197984703 197984854 + 1 NA Intergenic Intergenic 67406 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 170.333-231 chr9 84052379 84052567 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -10970 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 181.667-107 chr4 60339794 60340036 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -582704 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 137.333-109 chr20 8397698 8397936 + 1 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) L1MC5a|LINE|L1 149113 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 152.333-7 chr1 48017657 48017945 + 1 NA Intergenic Intergenic -20416 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 213.333-166 chr5 128332024 128332409 + 1 NA intron (NM_001999, intron 32 of 64) intron (NM_001999, intron 32 of 64) 206029 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 161.667-40 chr11 39486390 39486631 + 1 NA Intergenic Intergenic 806620 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 155.333-369 chr7 68434139 68434321 + 1 NA Intergenic Intergenic 413977 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 237.333-17 chr10 116541055 116541476 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4666 NM_000936 5406 Hs.501135 NM_000936 ENSG00000175535 PNLIP PL|PNLIPD|PTL pancreatic lipase protein-coding 173.667-44 chr14 45810224 45810448 + 1 NA Intergenic Intergenic -94734 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 188.333-101 chr3 162973144 162973384 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 330037 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 118.667-11 chr1 152331733 152331972 + 1 NA intron (NR_103778, intron 2 of 6) intron (NR_103778, intron 2 of 6) -5216 NR_103779 339400 Hs.23783 NR_103778 ENSG00000237975 FLG-AS1 - FLG antisense RNA 1 ncRNA 305.667-23 chr22 44905768 44906246 + 1 NA intron (NR_134535, intron 5 of 11) intron (NR_134535, intron 5 of 11) 97612 NR_147506 101927551 Hs.683911 NR_147506 ENSG00000230922 LOC101927551 - uncharacterized LOC101927551 ncRNA 149.333-379 chr7 129688922 129689207 + 1 NA intron (NM_005011, intron 4 of 10) intron (NM_005011, intron 4 of 10) 58986 NM_001040110 4899 Hs.654363 NM_005011 ENSG00000106459 NRF1 ALPHA-PAL nuclear respiratory factor 1 protein-coding 189.667-17 chr10 23245555 23245905 + 1 NA intron (NM_001365862, intron 12 of 15) L1PA15|LINE|L1 53418 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 160.667-201 chr3 95219640 95219847 + 1 NA Intergenic Intergenic 281480 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 215.333-119 chr22 28594765 28594997 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 84984 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 162.333-266 chr8 138866276 138866599 + 1 NA intron (NM_152888, intron 3 of 64) intron (NM_152888, intron 3 of 64) 47604 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 158.333-86 chr14 60661644 60661902 + 1 NA Intergenic Intergenic -12296 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 188.333-30 chr11 66511124 66511402 + 1 NA intron (NM_024649, intron 3 of 16) intron (NM_024649, intron 3 of 16) 628 NM_024649 582 Hs.502915 NM_024649 ENSG00000174483 BBS1 BBS2L2 Bardet-Biedl syndrome 1 protein-coding 150.667-59 chr11 9304063 9304245 + 1 NA intron (NR_028491, intron 1 of 7) intron (NR_028491, intron 1 of 7) 10439 NM_001165030 440026 Hs.594563 NM_015012 ENSG00000166471 TMEM41B - transmembrane protein 41B protein-coding 310.333-37 chr8 64803962 64804357 + 1 NA Intergenic Intergenic -5422 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 118.667-52 chr12 19314409 19314624 + 1 NA intron (NM_001143821, intron 14 of 27) intron (NM_001143821, intron 14 of 27) 109191 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 284.333-34 chr4 32178671 32179022 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -156424 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 238.333-91 chr8 88338140 88338435 + 1 NA Intergenic Intergenic -10804 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 282.333-6 chr10 116150054 116150580 + 1 NA intron (NM_145793, intron 3 of 8) intron (NM_145793, intron 3 of 8) 44472 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 155.333-206 chr21 18628661 18628929 + 1 NA intron (NR_109925, intron 2 of 3) L1MCa|LINE|L1 57369 NR_036166 100422920 NR_036166 ENSG00000265841 MIR548X - microRNA 548x ncRNA 146.333-72 chr13 31139327 31139573 + 1 NA intron (NM_006644, intron 14 of 17) intron (NM_006644, intron 14 of 17) 22454 NM_001349704 10808 Hs.743267 NM_006644 ENSG00000120694 HSPH1 HSP105|HSP105A|HSP105B|NY-CO-25 heat shock protein family H (Hsp110) member 1 protein-coding 151.333-275 chr3 34967929 34968141 + 1 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 425988 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 250.667-42 chr2 222615293 222615700 + 1 NA intron (NR_130154, intron 15 of 17) L2a|LINE|L2 40596 NR_130154 10056 Hs.471452 NM_005687 ENSG00000116120 FARSB FARSLB|FRSB|HSPC173|NEDBLLA|PheHB|PheRS|RILDBC phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta protein-coding 124.667-95 chr18 79805341 79805567 + 1 NA Intergenic Intergenic -58214 NM_012283 26251 Hs.247905 NM_012283 ENSG00000178342 KCNG2 KCNF2|KV6.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 2 protein-coding 285.667-45 chr5 61755742 61756246 + 1 NA Intergenic Intergenic -20296 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-126 chr14 71559478 71559648 + 1 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) -26735 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 113.333-83 chr15 60500799 60500956 + 1 NA intron (NM_134260, intron 10 of 11) intron (NM_134260, intron 10 of 11) 21699 NR_120341 101928784 Hs.655155 NR_120339 ENSG00000245534 RORA-AS1 - RORA antisense RNA 1 ncRNA 130.667-153 chr4 55329864 55330054 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -16283 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 236.667-47 chr22 27679345 27679819 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 122174 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 146.333-257 chr5 73520374 73520554 + 1 NA Intergenic Intergenic 22039 NM_001207 689 Hs.591768 NM_001207 ENSG00000145741 BTF3 BETA-NAC|BTF3a|BTF3b|NACB basic transcription factor 3 protein-coding 115.667-186 chr6 713100 713260 + 1 NA Intergenic Intergenic -20039 NR_073064 55770 Hs.484412 NM_018303 ENSG00000112685 EXOC2 SEC5|SEC5L1|Sec5p exocyst complex component 2 protein-coding 160.667-269 chr6 150394464 150394754 + 1 NA intron (NM_001318495, intron 4 of 4) intron (NM_001318495, intron 4 of 4) 25597 NR_134655 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 111.667-207 chr5 95041512 95041755 + 1 NA intron (NM_024717, intron 1 of 22) intron (NM_024717, intron 1 of 22) 40233 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 215.333-114 chr20 62803890 62804153 + 1 NA promoter-TSS (NM_007346) promoter-TSS (NM_007346) -814 NM_007346 11054 Hs.67896 NM_007346 ENSG00000060491 OGFR - opioid growth factor receptor protein-coding 155.667-348 chr8 73259587 73259855 + 1 NA promoter-TSS (NM_001243237) promoter-TSS (NM_001243237) -219 NM_001243237 100130301 Hs.202296 NM_001243237 ENSG00000274443 C8orf89 - chromosome 8 open reading frame 89 protein-coding 254.333-95 chrX 41044245 41044555 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -41045 NM_001039591 8239 Hs.77578 NM_004652 ENSG00000124486 USP9X DFFRX|FAF|FAM|MRX99|MRXS99F ubiquitin specific peptidase 9 X-linked protein-coding 194.333-3 chr1 53807546 53807863 + 1 NA exon (NM_018087, exon 8 of 18) exon (NM_018087, exon 8 of 18) 30592 NM_018087 55706 Hs.476525 NM_018087 ENSG00000058804 NDC1 NET3|TMEM48 NDC1 transmembrane nucleoporin protein-coding 210.667-105 chr5 56570805 56571054 + 1 NA intron (NR_161255, intron 1 of 5) intron (NR_161255, intron 1 of 5) 35327 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 230.333-105 chr6 147844813 147845121 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 336277 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 153.333-415 chr8 94862783 94862938 + 1 NA intron (NR_073445, intron 16 of 27) intron (NR_073445, intron 16 of 27) 32394 NM_057749 9134 Hs.521693 NM_004702 ENSG00000175305 CCNE2 CYCE2 cyclin E2 protein-coding 160.333-226 chr4 169271613 169271801 + 1 NA promoter-TSS (NM_020870) promoter-TSS (NM_020870) -751 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 151.667-81 chr12 31548372 31548665 + 1 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) intron (NM_001308339, intron 1 of 22) -41405 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 120.667-53 chr14 63509054 63509198 + 1 NA promoter-TSS (NM_001282181) promoter-TSS (NM_001282181) -888 NM_001282181 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 166.667-106 chr2 35387225 35387502 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -84042 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 113.333-246 chr7 86294985 86295136 + 1 NA Intergenic Intergenic -348849 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 205.333-105 chr18 5610838 5611177 + 1 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) intron (NM_001281535, intron 3 of 21) 17984 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 170.667-173 chr9 32352270 32352574 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -32181 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 148.667-226 chr20 52117764 52117997 + 1 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) AluJb|SINE|Alu -12396 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 173.333-50 chr13 66497124 66497346 + 1 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) AluSz|SINE|Alu 278985 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 200.667-19 chr10 43455913 43456208 + 1 NA intron (NM_001355444, intron 1 of 3) intron (NM_001355444, intron 1 of 3) 18949 NM_001355450 642819 Hs.719657 NM_001355444 ENSG00000243660 ZNF487 KRBO1|ZNF487P zinc finger protein 487 protein-coding 151.333-225 chr2 171357909 171358094 + 1 NA intron (NM_001321158, intron 2 of 8) L1M2|LINE|L1 75989 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 140.667-179 chr5 25883415 25883584 + 1 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 692546 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 125.667-147 chr5 44487274 44487479 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 22906 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 229.667-52 chr21 29614860 29615132 + 1 NA intron (NM_000830, intron 7 of 16) L2a|LINE|L2 18956 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 307.333-30 chr15 55046726 55047202 + 1 NA Intergenic Intergenic -9783 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 236.667-77 chr6 147615696 147616111 + 1 NA Intergenic Intergenic 107213 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 266.333-21 chr15 87488248 87488576 + 1 NA Intergenic Intergenic -88517 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 153.667-126 chr14 79121655 79121826 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -78242 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 152.333-208 chr20 2169454 2169739 + 1 NA Intergenic Intergenic -37332 NR_161305 388780 Hs.132163 NR_161305 LOC388780 - uncharacterized LOC388780 ncRNA 204.667-72 chr2 75195730 75196033 + 1 NA intron (NM_015727, intron 1 of 3) L1ME4a|LINE|L1 3639 NM_015727 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 154.333-354 chr8 125168257 125168417 + 1 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) intron (NR_146191, intron 5 of 8) 76477 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 208.667-89 chr3 123578423 123578665 + 1 NA intron (NM_001329784, intron 2 of 8) AluJr|SINE|Alu 6073 NM_001329787 201562 Hs.705480 NM_198402 ENSG00000206527 HACD2 PTPLB 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2 protein-coding 150.667-136 chr15 99922669 99922912 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 115767 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 131.333-157 chr6 79055713 79055895 + 1 NA intron (NM_017934, intron 6 of 39) intron (NM_017934, intron 6 of 39) 22450 NM_017934 55023 Hs.511817 NM_017934 ENSG00000146247 PHIP BRWD2|DCAF14|DIDOD|WDR11|ndrp pleckstrin homology domain interacting protein protein-coding 125.667-161 chr5 175161516 175161722 + 1 NA Intergenic Intergenic -165888 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 151.333-235 chr2 208527693 208527931 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -14830 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 305.333-28 chr18 2750661 2751165 + 1 NA intron (NM_015295, intron 32 of 47) intron (NM_015295, intron 32 of 47) 95026 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 152.667-201 chr2 162736228 162736452 + 1 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -32596 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 155.333-418 chrX 70869792 70870063 + 1 NA intron (NM_001003811, intron 5 of 30) intron (NM_001003811, intron 5 of 30) -23632 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 147.333-301 chr7 72036668 72036859 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) L1M4c|LINE|L1 300628 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 170.333-5 chr1 79553366 79553595 + 1 NA Intergenic Intergenic -546750 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 208.333-31 chr12 129494148 129494476 + 1 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) intron (NM_133448, intron 3 of 8) 285711 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 148.333-364 chr7 43355597 43355819 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 4 of 27) L1MA4|LINE|L1 166834 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 198.333-190 chr8 38732287 38732555 + 1 NA intron (NR_148047, intron 1 of 1) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger 3839 NM_001352785 6867 Hs.279245 NM_006283 ENSG00000147526 TACC1 Ga55 transforming acidic coiled-coil containing protein 1 protein-coding 205.667-70 chr2 69624467 69624811 + 1 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) intron (NM_014911, intron 2 of 21) 19100 NM_014911 22848 Hs.468878 NM_014911 ENSG00000115977 AAK1 - AP2 associated kinase 1 protein-coding 277.333-17 chr11 95802526 95802862 + 1 NA intron (NM_014679, intron 2 of 10) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 12196 NM_014679 9702 Hs.101014 NM_014679 ENSG00000166037 CEP57 MVA2|PIG8|TSP57 centrosomal protein 57 protein-coding 150.667-206 chr2 225301467 225301644 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -98155 NM_001371273 139.667-198 chr8 136401241 136401434 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -129461 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 129.333-194 chr8 136677980 136678224 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) L1M3|LINE|L1 147304 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 210.333-174 chr8 125034534 125034977 + 1 NA intron (NM_014846, intron 26 of 28) intron (NM_014846, intron 26 of 28) 36250 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 194.667-99 chr3 116718234 116718477 + 1 NA Intergenic Intergenic 8567 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 193.333-194 chr8 142034347 142034629 + 1 NA Intergenic Intergenic -141851 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 207.333-157 chr2 238807384 238807802 + 1 NA Intergenic Intergenic 40314 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 153.333-362 chr6 62033866 62034142 + 1 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) L1MA2|LINE|L1 252221 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 183.667-40 chr13 63265364 63265563 + 1 NA intron (NR_126409, intron 2 of 6) L1M5|LINE|L1 62631 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 135.333-93 chr2 183269909 183270139 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 145581 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 162.667-171 chr3 30352195 30352398 + 1 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie -166572 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 288.333-12 chr15 77252610 77252903 + 1 NA intron (NM_024776, intron 3 of 7) intron (NM_024776, intron 3 of 7) -27352 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 283.667-20 chr20 753754 754166 + 1 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 14540 NM_033409 113278 Hs.283865 NM_033409 ENSG00000101276 SLC52A3 BVVLS|BVVLS1|C20orf54|RFT2|RFVT3|bA371L19.1|hRFT2 solute carrier family 52 member 3 protein-coding 113.333-242 chr7 55799725 55799908 + 1 NA intron (NM_207366, intron 9 of 9) L1M2|LINE|L1 62936 NM_207366 346288 Hs.453629 NM_207366 ENSG00000154997 SEPTIN14 SEPT14 septin 14 protein-coding 135.333-190 chr8 85852458 85852614 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -24594 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 166.667-144 chr22 47746127 47746358 + 1 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) intron (NR_122046, intron 8 of 8) 114568 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 122.333-187 chr6 110760735 110760902 + 1 NA intron (NM_001300964, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR -53803 NM_001287215 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 223.333-127 chr5 43773626 43773927 + 1 NA Intergenic Intergenic -170546 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 241.667-48 chr21 28889919 28890341 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4757 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 158.333-13 chr1 145879189 145879464 + 1 NA exon (NM_144698, exon 2 of 14) exon (NM_144698, exon 2 of 14) 6540 NM_144698 148741 Hs.710624 NM_144698 ENSG00000198483 ANKRD35 - ankyrin repeat domain 35 protein-coding 160.667-166 chr2 175730135 175730344 + 1 NA Intergenic Intergenic 272028 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 172.333-103 chr22 38049118 38049303 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -8045 NM_001039584 9463 Hs.180871 NM_012407 ENSG00000100151 PICK1 PICK|PRKCABP protein interacting with PRKCA 1 protein-coding 157.333-191 chr2 103001345 103001620 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -17053 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 163.333-147 chr2 107652329 107652684 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -101606 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 167.667-144 chr3 149441175 149441432 + 1 NA Intergenic Intergenic -33394 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 258.667-32 chr15 51939207 51939634 + 1 NA intron (NM_001286430, intron 9 of 9) intron (NM_001286430, intron 9 of 9) -15300 NR_109775 100422556 Hs.664788 NR_109775 LOC100422556 - LEO1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component pseudogene pseudo 161.333-209 chr4 41695864 41696067 + 1 NA intron (NM_001330786, intron 22 of 22) intron (NM_001330786, intron 22 of 22) 53005 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 153.667-277 chr4 28311557 28311817 + 1 NA Intergenic Intergenic -507895 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 175.667-137 chr7 149421938 149422160 + 1 NA Intergenic Intergenic 39013 NM_015694 27153 Hs.38512 NM_015694 ENSG00000196453 ZNF777 - zinc finger protein 777 protein-coding 129.333-181 chr7 118376957 118377112 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 152330 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 193.667-65 chr2 167125850 167126154 + 1 NA intron (NR_046665, intron 1 of 1) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 14953 NR_046665 100874011 NR_046665 XIRP2-AS1 - XIRP2 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-120 chr14 27149820 27149990 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 241263 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 134.333-163 chr8 8788025 8788231 + 1 NA intron (NM_004225, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 86191 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 194.667-169 chrX 88470215 88470521 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -276857 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 180.667-105 chr4 122698417 122698636 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 33932 NR_024041 729338 Hs.647968 NR_024041 CETN4P - centrin 4, pseudogene pseudo 153.667-150 chr17 34868463 34868663 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 92897 NM_001193529 10693 Hs.73072 NM_006584 ENSG00000132141 CCT6B CCT-zeta-2|CCTZ-2|Cctz2|TCP-1-zeta-2|TSA303 chaperonin containing TCP1 subunit 6B protein-coding 283.333-24 chr17 65964446 65964883 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 17 of 26) MER117|DNA|hAT-Charlie -138121 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 164.333-126 chr2 164701012 164701328 + 1 NA intron (NM_001365670, intron 9 of 13) intron (NM_001365670, intron 9 of 13) -13393 NR_033309 100337591 Hs.664357 NR_033309 ENSG00000206869 SNORA70F U70F small nucleolar RNA, H/ACA box 70F snoRNA 169.667-70 chr15 34336243 34336444 + 1 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) intron (NM_001042496, intron 2 of 25) 501 NM_133647 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 192.667-110 chr3 114384338 114384552 + 1 NA promoter-TSS (NM_001164342) promoter-TSS (NM_001164342) -803 NM_001164342 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 198.667-128 chr3 124484092 124484373 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 28 of 59) intron (NM_001024660, intron 28 of 59) -100426 NM_007064 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 145.667-223 chr5 93227481 93227707 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 343749 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 230.333-98 chr5 133453261 133453585 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -25717 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 147.333-330 chr9 24951905 24952166 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -406138 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 166.333-193 chr5 164667776 164668060 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 197639 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 172.333-201 chrX 93912699 93913016 + 1 NA Intergenic Intergenic 238651 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 267.667-71 chr8 137875331 137875671 + 1 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 208044 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 188.333-51 chr15 59654675 59654956 + 1 NA intron (NM_004492, intron 1 of 4) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 2490 NM_001320929 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 173.667-43 chr14 45633849 45634131 + 1 NA Intergenic Intergenic 81612 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 236.667-57 chr4 35152282 35152687 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -882737 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 145.667-178 chr3 98605186 98605412 + 1 NA Intergenic Intergenic -11688 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 138.667-14 chr10 35970730 35970957 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 192541 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 239.333-21 chr11 94585262 94585560 + 1 NA intron (NM_152431, intron 5 of 19) intron (NM_152431, intron 5 of 19) 18043 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 165.667-46 chr14 33795847 33796076 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 9 of 10) intron (NM_001165893, intron 9 of 10) 87024 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 186.667-25 chr11 84344602 84344938 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -27431 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 160.333-205 chr4 33353755 33354023 + 1 NA Intergenic Intergenic 686004 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 247.667-72 chr4 65639257 65639845 + 1 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) L1M4|LINE|L1 29937 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 136.333-193 chr7 54488752 54488944 + 1 NA Intergenic Intergenic -53477 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 241.667-11 chr10 58873978 58874531 + 1 NA Intergenic Intergenic -125264 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 338.333-9 chr18 3670526 3671024 + 1 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 67038 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 149.333-50 chr10 64361844 64362043 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -463585 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 135.333-132 chr4 124604358 124604499 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -45994 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 149.333-253 chr3 102171375 102171590 + 1 NA Intergenic Intergenic 7777 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 200.333-116 chr5 39957232 39957473 + 1 NA Intergenic Intergenic -94939 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 154.667-417 chrX 37891289 37891462 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -43804 NM_006520 6990 Hs.446392 NM_006520 ENSG00000165169 DYNLT3 RP3|TCTE1L|TCTEX1L dynein light chain Tctex-type 3 protein-coding 181.667-76 chr2 181009360 181009702 + 1 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) intron (NM_001278555, intron 3 of 5) 28407 NM_001278554 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 276.333-44 chr4 103402972 103403514 + 1 NA Intergenic Intergenic -21799 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 167.667-94 chr19 2023403 2023707 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -7841 NM_017797 55643 Hs.465543 NM_017797 ENSG00000133243 BTBD2 - BTB domain containing 2 protein-coding 246.333-29 chr14 59030577 59031025 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -157866 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 242.667-32 chr14 69232953 69233388 + 1 NA intron (NM_001193360, intron 5 of 9) intron (NM_001193360, intron 5 of 9) -26988 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 123.333-23 chr1 225393629 225393767 + 1 NA intron (NM_001367479, intron 84 of 85) L1M5|LINE|L1 34340 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 184.333-136 chr7 24554541 24554872 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -18746 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 186.667-121 chr5 165662951 165663272 + 1 NA Intergenic Intergenic 1192832 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 143.667-77 chr14 69209821 69209988 + 1 NA intron (NM_001193360, intron 3 of 9) intron (NM_001193360, intron 3 of 9) 18138 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 213.333-132 chr3 97809333 97809675 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12507 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 169.667-13 chr1 207311102 207311401 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -10427 NR_125349 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 128.667-19 chr10 7076511 7076719 + 1 NA Intergenic Intergenic 110169 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 248.667-101 chr7 94708882 94709318 + 1 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 52730 NM_001184962 23089 Hs.147492 NM_015068 ENSG00000242265 PEG10 EDR|HB-1|MEF3L|Mar2|Mart2|RGAG3|RTL2|SIRH1 paternally expressed 10 protein-coding 211.333-149 chr3 26609857 26610198 + 1 NA Intergenic Intergenic -12779 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 269.333-69 chr5 6296154 6296548 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 40941 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 193.333-46 chr13 39822586 39822855 + 1 NA Intergenic Intergenic -158585 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 198.333-14 chr1 161364139 161364467 + 1 NA TTS (NM_001013625) TTS (NM_001013625) 3580 NM_001013625 257177 Hs.534593 NM_001013625 ENSG00000188931 CFAP126 C1orf192|Flattop|Fltp cilia and flagella associated protein 126 protein-coding 230.667-53 chr3 30570032 30570529 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -36222 NM_001024847 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 227.333-136 chrX 99917325 99917723 + 1 NA Intergenic Intergenic 492749 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 152.667-99 chr14 35195833 35195987 + 1 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) intron (NM_014672, intron 5 of 7) 73358 NM_001256681 9692 Hs.458487 NM_014672 ENSG00000100890 PRORP KIAA0391|MRPP3 protein only RNase P catalytic subunit protein-coding 170.667-55 chr15 61870075 61870393 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 79 of 81) L1MB7|LINE|L1 140316 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 194.667-28 chr11 58655270 58655594 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 32767 NM_000614 1270 Hs.524920 NM_000614 ENSG00000242689 CNTF HCNTF ciliary neurotrophic factor protein-coding 141.333-205 chr6 23578922 23579208 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -547150 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 183.667-39 chr13 42947013 42947317 + 1 NA intron (NM_033255, intron 6 of 10) intron (NM_033255, intron 6 of 10) 45076 NM_001330543 94240 Hs.546467 NM_033255 ENSG00000133106 EPSTI1 BRESI1 epithelial stromal interaction 1 protein-coding 286.667-46 chr9 125936399 125936758 + 1 NA intron (NR_024122, intron 4 of 7) intron (NR_024122, intron 4 of 7) 188395 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 261.666-18 chr7 54820947 54821614 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 61967 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 209.333-166 chr4 38650073 38650441 + 1 NA intron (NR_026804, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu -13942 NM_016531 51274 Hs.298658 NM_016531 ENSG00000109787 KLF3 BKLF Kruppel like factor 3 protein-coding 188.333-146 chr7 79773125 79773354 + 1 NA Intergenic Intergenic 319279 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 114.667-103 chr16 75353782 75354007 + 1 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) intron (NM_006324, intron 5 of 6) 79609 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 199.667-118 chr5 113509383 113509782 + 1 NA Intergenic Intergenic -4112 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 161.333-89 chr14 52927662 52927956 + 1 NA intron (NM_006832, intron 2 of 14) intron (NM_006832, intron 2 of 14) 23241 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 147.333-259 chr5 31011502 31011757 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -182057 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 167.333-66 chr12 49535020 49535307 + 1 NA Intergenic Intergenic -3867 NM_001314030 23416 Hs.64064 NM_012284 ENSG00000135519 KCNH3 BEC1|ELK2|Kv12.2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 3 protein-coding 154.667-404 chr8 136513263 136513470 + 1 NA Intergenic Intergenic -17432 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 173.667-128 chr4 20675190 20675495 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -20940 NR_133933 133015 Hs.479298 NM_145048 ENSG00000163138 PACRGL C4orf28 parkin coregulated like protein-coding 155.333-82 chr12 98376857 98377034 + 1 NA Intergenic Intergenic 80200 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 158.667-85 chr13 29294220 29294532 + 1 NA intron (NM_001033602, intron 4 of 13) L1ME4a|LINE|L1 -134284 NM_015233 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 183.333-37 chr13 69337261 69337490 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 115029 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 124.667-40 chr12 20316555 20316691 + 1 NA Intergenic Intergenic -52622 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 163.333-92 chr14 75825531 75825791 + 1 NA intron (NM_015072, intron 28 of 31) intron (NM_015072, intron 28 of 31) 156334 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 357.333-8 chr2 40946090 40946542 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -433881 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 177.667-9 chr1 164137270 164137584 + 1 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -421933 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 152.333-107 chr14 52723581 52723808 + 1 NA intron (NM_002806, intron 12 of 13) intron (NM_002806, intron 12 of 13) -6472 NM_001130701 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 129.333-74 chr16 52672127 52672382 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -65279 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 231.333-44 chr15 83934911 83935182 + 1 NA intron (NM_207517, intron 17 of 29) L1PB4|LINE|L1 -145141 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 284.333-23 chr2 34321049 34321528 + 1 NA Intergenic Intergenic 254062 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 212.333-54 chr17 48706738 48707058 + 1 NA Intergenic Intergenic 15620 NM_032391 84366 Hs.116467 NM_032391 ENSG00000159182 PRAC1 C17orf92|PRAC PRAC1 small nuclear protein protein-coding 121.333-60 chr15 61286421 61286573 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -57195 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 157.333-185 chr2 72654353 72654517 + 1 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 171598 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 212.333-50 chr15 59951146 59951388 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -53044 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 319.667-11 chr18 13845276 13845688 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 21333 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 180.333-103 chr6 10235330 10235667 + 1 NA Intergenic Intergenic -169004 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 140.667-164 chr4 68047454 68047623 + 1 NA Intergenic Intergenic -5970 NR_046116 550113 Hs.130270 NR_046116 LOC550113 - uncharacterized LOC550113 ncRNA 196.667-167 chr8 137266271 137266668 + 1 NA Intergenic Intergenic 147119 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 238.333-21 chr12 132742881 132743165 + 1 NA intron (NM_015114, intron 6 of 12) intron (NM_015114, intron 6 of 12) 18809 NM_015114 23141 Hs.654628 NM_015114 ENSG00000176915 ANKLE2 KIAA0692|LEMD7|Lem4|MCPH16 ankyrin repeat and LEM domain containing 2 protein-coding 125.333-182 chr9 13940751 13940890 + 1 NA intron (NR_038194, intron 1 of 2) intron (NR_038194, intron 1 of 2) 12849 NR_038194 100113404 Hs.149786 NR_038194 ENSG00000205636 LINC00583 C9orf146 long intergenic non-protein coding RNA 583 ncRNA 198.333-53 chr14 22015123 22015385 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -344237 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 221.333-15 chr10 68875290 68875651 + 1 NA intron (NM_152709, intron 1 of 3) intron (NM_152709, intron 1 of 3) -25845 NM_024045 79009 Hs.522984 NM_024045 ENSG00000107625 DDX50 GU2|GUB|RH-II/GuB|mcdrh DExD-box helicase 50 protein-coding 399.333-17 chr8 117231609 117232275 + 1 NA Intergenic Intergenic 96947 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 175.333-143 chr5 75500424 75500687 + 1 NA intron (NM_031361, intron 2 of 16) intron (NM_031361, intron 2 of 16) 11074 NM_031361 10087 Hs.270437 NM_005713 ENSG00000113163 CERT1 CERT|CERTL|COL4A3BP|GPBP|MRD34|STARD11 ceramide transporter 1 protein-coding 241.667-47 chr21 23673188 23673620 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -288569 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 261.333-41 chr18 49828989 49829395 + 1 NA intron (NM_001080467, intron 39 of 39) AluSx|SINE|Alu 15169 NR_003003 677769 NR_003003 ENSG00000267322 SCARNA17 U91 small Cajal body-specific RNA 17 ncRNA 212.667-54 chr17 53094852 53095144 + 1 NA Intergenic Intergenic 109493 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 152.333-42 chr10 44538607 44538878 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -153645 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 128.667-84 chr19 37739526 37739773 + 1 NA exon (NM_001172689, exon 6 of 6) exon (NM_001172689, exon 6 of 6) -19888 NM_032689 84775 Hs.116622 NM_032689 ENSG00000198182 ZNF607 - zinc finger protein 607 protein-coding 128.667-10 chr1 161942462 161942637 + 1 NA intron (NM_007348, intron 15 of 15) intron (NM_007348, intron 15 of 15) 81916 NM_015441 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 134.667-127 chr22 25117204 25117381 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) -4600 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 233.667-18 chr13 66836147 66836406 + 1 NA intron (NR_046527, intron 1 of 5) intron (NR_046527, intron 1 of 5) 11107 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 141.667-228 chr8 109016501 109016743 + 1 NA Intergenic Intergenic -70006 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 145.667-300 chr8 131799133 131799340 + 1 NA Intergenic Charlie23a|DNA|hAT-Charlie -104857 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 175.333-76 chr2 19438119 19438316 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -79594 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 190.333-148 chr8 139641489 139641821 + 1 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) intron (NR_104210, intron 1 of 3) 61468 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 153.333-95 chr12 55046417 55046630 + 1 NA Intergenic Intergenic 26549 NM_021191 58158 Hs.591024 NM_021191 ENSG00000123307 NEUROD4 ATH-3|ATH3|Atoh3|MATH-3|MATH3|bHLHa4 neuronal differentiation 4 protein-coding 240.333-92 chr8 64752802 64753361 + 1 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) intron (NM_004820, intron 1 of 5) 45656 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 223.333-80 chr2 123414527 123414848 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -341206 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 160.667-254 chr5 155178979 155179201 + 1 NA Intergenic Intergenic 165335 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 113.667-148 chr3 152819469 152819602 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -15596 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 180.667-139 chr7 94954079 94954333 + 1 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) L1MEd|LINE|L1 44308 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 148.333-205 chr2 177912818 177913075 + 1 NA intron (NM_001077197, intron 3 of 20) L1MB8|LINE|L1 9891 NM_001077358 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 163.667-252 chr8 114124226 114124446 + 1 NA Intergenic Intergenic -687397 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 146.667-280 chr6 71172542 71172792 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -116144 NM_024576 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 178.667-159 chr8 61549517 61549794 + 1 NA intron (NM_004318, intron 20 of 24) intron (NM_004318, intron 20 of 24) 140156 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 171.333-133 chr4 48421577 48421794 + 1 NA intron (NM_020846, intron 7 of 7) intron (NM_020846, intron 7 of 7) -61658 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 258.333-5 chr10 23162382 23162758 + 1 NA Intergenic Intergenic -29742 NM_178161 256297 Hs.351503 NM_178161 ENSG00000168267 PTF1A PACA|PAGEN2|PTF1-p48|bHLHa29|p48 pancreas associated transcription factor 1a protein-coding 176.667-66 chr17 51191089 51191309 + 1 NA intron (NM_017643, intron 16 of 16) intron (NM_017643, intron 16 of 16) 24477 NM_001018138 4831 Hs.463456 NM_002512 ENSG00000243678 NME2 NDKB|NDPK-B|NDPKB|NM23-H2|NM23B|PUF NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 protein-coding 184.667-54 chr2 57181086 57181348 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -726434 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 210.333-28 chr11 97298488 97298755 + 1 NA Intergenic Intergenic 790196 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 253.333-83 chr5 44507198 44507521 + 1 NA intron (NR_131946, intron 1 of 2) intron (NR_131946, intron 1 of 2) 2923 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 136.333-150 chr4 108725764 108725987 + 1 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 37178 NM_001331033 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 156.333-308 chr6 51312473 51312750 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -309259 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 215.667-17 chr10 116908442 116908879 + 1 NA intron (NM_001127211, intron 14 of 16) intron (NM_001127211, intron 14 of 16) -58938 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 186.667-133 chr7 17749995 17750277 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 190358 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 187.333-124 chr3 36355368 36355726 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -24940 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 163.333-181 chr3 69089855 69090096 + 1 NA intron (NM_006407, intron 1 of 2) intron (NM_006407, intron 1 of 2) 5038 NM_006407 10550 Hs.518060 NM_006407 ENSG00000144746 ARL6IP5 DERP11|GTRAP3-18|HSPC127|JWA|PRAF3|Yip6b|addicsin|hp22|jmx ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 5 protein-coding 155.667-11 chr1 84564957 84565112 + 1 NA intron (NM_004388, intron 4 of 6) AluJr4|SINE|Alu 9406 NM_004388 1486 Hs.513557 NM_004388 ENSG00000117151 CTBS CTB chitobiase protein-coding 345.333-26 chr3 111355800 111356293 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -186151 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 147.333-75 chr12 8087907 8088119 + 1 NA intron (NM_015509, intron 1 of 7) intron (NM_015509, intron 1 of 7) 5739 NM_015509 25977 Hs.555927 NM_015509 ENSG00000089818 NECAP1 EIEE21 NECAP endocytosis associated 1 protein-coding 147.667-146 chr17 73383352 73383631 + 1 NA intron (NM_001144952, intron 33 of 44) L2a|LINE|L2 -71490 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 151.667-250 chr4 66599266 66599498 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 322558 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 198.333-76 chr16 46956020 46956316 + 1 NA 3' UTR (NM_005880, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_005880, exon 9 of 9) 17506 NM_005880 10294 Hs.368078 NM_005880 ENSG00000069345 DNAJA2 CPR3|DJ3|DJA2|DNAJ|DNJ3|HIRIP4|PRO3015|RDJ2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A2 protein-coding 190.333-127 chr6 42479128 42479361 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27020 NM_033502 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 290.667-13 chr13 63151290 63151628 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 176635 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 153.333-217 chr2 159333576 159333865 + 1 NA intron (NM_001329858, intron 33 of 36) intron (NM_001329858, intron 33 of 36) -47017 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 159.667-18 chr1 93152052 93152257 + 1 NA non-coding (NR_030761, exon 5 of 5) non-coding (NR_030761, exon 5 of 5) 28259 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 139.333-179 chr5 27611874 27612067 + 1 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 139678 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 266.333-9 chr10 91070803 91071191 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 25189 NR_047467 100874184 Hs.512240 NR_047467 LINC00502 - long intergenic non-protein coding RNA 502 ncRNA 153.667-116 chr14 36587665 36587961 + 1 NA Intergenic X6A_LINE|LINE|CR1 -5199 NM_014360 26257 Hs.234763 NM_014360 ENSG00000136327 NKX2-8 NKX2.8|NKX2H|Nkx2-9 NK2 homeobox 8 protein-coding 142.333-219 chr6 63956752 63957053 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 150066 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 115.333-221 chr8 118113128 118113293 + 1 NA Intergenic Intergenic -1391 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 175.667-109 chr4 70284539 70284758 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 42032 NM_005212 1448 Hs.54415 NM_005212 ENSG00000171209 CSN3 CNS10|CSN10|CSNK|KCA casein kappa protein-coding 387.667-10 chr3 97098389 97099158 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) intron (NM_001080448, intron 3 of 17) 284179 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 126.667-105 chr3 51421063 51421301 + 1 NA intron (NR_146065, intron 13 of 25) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 29897 NM_013286 29890 Hs.118738 NM_013286 ENSG00000259956 RBM15B HUMAGCGB|HsOTT3|OTT3 RNA binding motif protein 15B protein-coding 157.667-80 chr12 65915961 65916187 + 1 NA TTS (NM_003484) TTS (NM_003484) -33749 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 210.333-85 chr2 162367028 162367288 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 22790 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 161.667-44 chr11 95779076 95779284 + 1 NA intron (NM_144664, intron 7 of 9) intron (NM_144664, intron 7 of 9) 10602 NM_001330357 143684 Hs.288304 NM_144664 ENSG00000077458 FAM76B - family with sequence similarity 76 member B protein-coding 374.667-13 chr7 35577164 35577756 + 1 NA Intergenic Intergenic 117675 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 175.667-8 chr1 156233639 156233889 + 1 NA intron (NM_001199663, intron 3 of 5) intron (NM_001199663, intron 3 of 5) -8420 NM_199173 632 Hs.654541 NM_199173 ENSG00000242252 BGLAP BGP|OC|OCN bone gamma-carboxyglutamate protein protein-coding 285.333-49 chr4 47181216 47181574 + 1 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 149828 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 199.667-137 chr8 43768001 43768429 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 475773 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 155.333-37 chr10 92938419 92938669 + 1 NA intron (NM_001319195, intron 12 of 21) intron (NM_001319195, intron 12 of 21) 90024 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 208.333-60 chr18 9345352 9345721 + 1 NA intron (NM_020648, intron 2 of 4) L1MB7|LINE|L1 10763 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 163.333-160 chr2 234189428 234189647 + 1 NA Intergenic LTR55|LTR|ERVL? 138835 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 208.333-76 chr2 122577414 122577782 + 1 NA Intergenic Intergenic 495883 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 159.667-205 chr22 35274108 35274343 + 1 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) L2c|LINE|L2 16732 NM_001003681 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 200.333-119 chr5 71753475 71753770 + 1 NA Intergenic Intergenic 34347 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 121.333-86 chr2 69128017 69128262 + 1 NA intron (NM_032208, intron 12 of 17) AluSz|SINE|Alu 24457 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 198.333-164 chr5 72132597 72132895 + 1 NA intron (NM_005909, intron 2 of 6) L1M6|LINE|L1 25271 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 175.667-83 chr2 211342919 211343182 + 1 NA Intergenic Intergenic 725479 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 151.667-120 chr15 23709152 23709388 + 1 NA Intergenic Intergenic -21965 NM_002487 4692 Hs.50130 NM_002487 ENSG00000182636 NDN HsT16328|PWCR necdin, MAGE family member protein-coding 180.333-153 chr9 131828491 131828698 + 1 NA Intergenic Intergenic -88650 NM_001304275 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 126.667-121 chr4 54961984 54962200 + 1 NA Intergenic Intergenic 163503 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 111.667-27 chr10 32730323 32730479 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) intron (NM_001321115, intron 29 of 43) 171071 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 216.333-100 chr3 106986664 106987022 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 253795 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 223.667-64 chr5 14231011 14231387 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 87857 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 355.667-8 chr5 18274635 18275119 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 467603 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 188.333-63 chr18 73921016 73921366 + 1 NA Intergenic Intergenic 226643 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 201.333-19 chr1 190570287 190570664 + 1 NA Intergenic Alu|SINE|Alu -54415 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 347.667-11 chr2 210998522 210998968 + 1 NA Intergenic Intergenic 381174 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 204.667-94 chr3 21134528 21134902 + 1 NA Intergenic Intergenic -271011 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 203.667-73 chr3 1705742 1706055 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -392905 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 171.333-203 chr9 84145935 84146123 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 82586 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 163.667-219 chr6 134447539 134447802 + 1 NA intron (NR_038218, intron 1 of 2) intron (NR_038218, intron 1 of 2) 9280 NR_038219 154092 Hs.223718 NR_038216 LINC01010 - long intergenic non-protein coding RNA 1010 ncRNA 149.667-391 chr8 71961208 71961476 + 1 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 114242 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 155.333-169 chr2 104290820 104291088 + 1 NA Intergenic Intergenic 117378 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 169.333-203 chr5 43616524 43616710 + 1 NA intron (NM_012343, intron 4 of 21) intron (NM_012343, intron 4 of 21) -13387 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 166.333-24 chr10 32509855 32510172 + 1 NA intron (NM_145023, intron 10 of 17) L1MA9|LINE|L1 63873 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 146.333-289 chr6 110348060 110348218 + 1 NA intron (NM_001123364, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 10133 NM_001123364 728464 Hs.634429 NM_001123364 ENSG00000053328 METTL24 C6orf186 methyltransferase like 24 protein-coding 152.667-228 chr22 25634163 25634369 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) intron (NM_001362778, intron 2 of 19) 69591 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 157.333-101 chr14 25092240 25092474 + 1 NA Intergenic Intergenic -42060 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 164.333-23 chr10 24362578 24362829 + 1 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) -86711 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 184.667-56 chr2 60935392 60935592 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 53918 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 113.667-79 chr17 3711942 3712098 + 1 NA Intergenic Intergenic -11883 NM_031965 83903 Hs.534059 NM_031965 ENSG00000177602 HASPIN GSG2 histone H3 associated protein kinase protein-coding 169.333-196 chr5 4323625 4323857 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -449740 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 159.667-38 chr10 15460110 15460275 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -88903 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 237.333-64 chr2 216272244 216272658 + 1 NA intron (NM_020814, intron 3 of 3) intron (NM_020814, intron 3 of 3) 55562 NR_037701 150967 Hs.56876 NM_001199924 ENSG00000260804 LINC01963 PKI55 long intergenic non-protein coding RNA 1963 ncRNA 272.333-15 chr14 76123147 76123777 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -28423 NM_001322031 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 283.333-14 chr12 79202115 79202502 + 1 NA intron (NM_005639, intron 3 of 10) intron (NM_005639, intron 3 of 10) 156616 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 144.333-187 chr4 35189859 35190038 + 1 NA Intergenic Intergenic -920201 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 248.667-52 chr2 13265721 13266034 + 1 NA Intergenic Intergenic -258864 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 178.333-13 chr1 237514012 237514349 + 1 NA intron (NM_001035, intron 24 of 104) intron (NM_001035, intron 24 of 104) 43061 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 177.667-147 chr9 86512646 86512952 + 1 NA Intergenic Intergenic -158389 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 275.333-4 chr1 189850772 189851159 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 625045 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 373.333-15 chr21 30116302 30116828 + 1 NA Intergenic Intergenic 50240 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 173.667-174 chr8 68816518 68816846 + 1 NA intron (NR_146187, intron 13 of 13) intron (NR_146187, intron 13 of 13) 287508 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 199.333-192 chr3 190715327 190715695 + 1 NA Intergenic Intergenic 147183 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 145.667-102 chr15 96255813 96256089 + 1 NA intron (NR_125738, intron 2 of 4) L3|LINE|CR1 -70095 NM_001145155 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 306.667 chr1 11807439 11807913 + 1 NA intron (NM_001256959, intron 2 of 21) intron (NM_001256959, intron 2 of 21) 1485 NM_001286 1185 Hs.193043 NM_001286 ENSG00000011021 CLCN6 CLC-6 chloride voltage-gated channel 6 protein-coding 153.667-250 chr3 53769824 53770101 + 1 NA intron (NM_001128839, intron 30 of 45) intron (NM_001128839, intron 30 of 45) 76457 NM_018397 55349 Hs.126688 NM_018397 ENSG00000016391 CHDH - choline dehydrogenase protein-coding 165.333-220 chr6 49457991 49458277 + 1 NA intron (NM_000255, intron 2 of 12) intron (NM_000255, intron 2 of 12) 5119 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 201.333-72 chr12 20497566 20497867 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -74148 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 148.333-27 chr1 183901940 183902092 + 1 NA intron (NM_001297669, intron 12 of 18) intron (NM_001297669, intron 12 of 18) 96896 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 218.667-18 chr11 9970839 9971092 + 1 NA intron (NM_030962, intron 13 of 39) L3|LINE|CR1 131823 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 149.667-171 chr18 34523293 34523442 + 1 NA intron (NM_001198945, intron 1 of 10) intron (NM_001198945, intron 1 of 10) 30055 NM_032979 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 163.333-244 chr6 67647241 67647453 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -408004 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 210.667-109 chr5 108214993 108215393 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 5 of 8) L1MB5|LINE|L1 166905 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 162.333-96 chr18 912697 912909 + 1 NA TTS (NM_001117) TTS (NM_001117) 7437 NM_001117 116 Hs.531719 NM_001117 ENSG00000141433 ADCYAP1 PACAP adenylate cyclase activating polypeptide 1 protein-coding 144.667-215 chr4 54950422 54950585 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 175092 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 309.333-27 chr18 4020764 4021282 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) LTR8|LTR|ERV1 58670 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 177.667-36 chr12 28949168 28949408 + 1 NA Intergenic Intergenic -199990 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 155.667-252 chr4 85362580 85362738 + 1 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -112491 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 160.667-178 chr20 44439183 44439453 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 11239 NR_109893 101927242 Hs.143307 NR_109893 ENSG00000168746 LINC01430 - long intergenic non-protein coding RNA 1430 ncRNA 169.333-151 chr22 41543787 41544001 + 1 NA intron (NM_001018050, intron 1 of 5) intron (NM_001018050, intron 1 of 5) 576 NM_001018050 171568 Hs.712617 NM_138338 ENSG00000100413 POLR3H RPC22.9|RPC8 RNA polymerase III subunit H protein-coding 311.333-29 chr2 46589748 46590116 + 1 NA intron (NM_173074, intron 5 of 6) intron (NM_173074, intron 5 of 6) -9694 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 263.667-78 chr7 88888829 88889193 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 -93274 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 154.333-203 chr22 48845727 48846039 + 1 NA Intergenic Intergenic -20887 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 331.333-48 chr8 139288466 139288959 + 1 NA Intergenic Intergenic -374671 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 182.333-29 chr11 95884090 95884281 + 1 NA intron (NM_201278, intron 3 of 16) intron (NM_201278, intron 3 of 16) 39922 NM_201281 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 211.667-104 chr6 142737074 142737366 + 1 NA Intergenic Intergenic -99331 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 237.667-21 chr14 62887474 62887789 + 1 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 157827 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 293.333-59 chr7 96271754 96272117 + 1 NA intron (NM_001160210, intron 3 of 17) AluSx1|SINE|Alu 50163 NM_014251 10165 Hs.489190 NM_014251 ENSG00000004864 SLC25A13 ARALAR2|CITRIN|CTLN2 solute carrier family 25 member 13 protein-coding 301.333-22 chr17 71204086 71204467 + 1 NA Intergenic Intergenic -2097 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 155.333-339 chr6 133408032 133408252 + 1 NA intron (NM_172103, intron 3 of 18) intron (NM_172103, intron 3 of 18) 166643 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 158.667-310 chr7 106399967 106400199 + 1 NA Intergenic Intergenic -115100 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 279.333-54 chr3 57790156 57790591 + 1 NA intron (NM_001304420, intron 1 of 21) intron (NM_001304420, intron 1 of 21) 33117 NM_001304421 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 221.333-14 chr10 63514852 63515159 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) L1MC1|LINE|L1 -6396 NM_001001330 221035 Hs.499833 NM_001001330 ENSG00000165476 REEP3 C10orf74|Yip2b receptor accessory protein 3 protein-coding 185.333-202 chrX 50441545 50441836 + 1 NA intron (NM_001013742, intron 1 of 27) intron (NM_001013742, intron 1 of 27) 29135 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 182.667-44 chr14 55200054 55200341 + 1 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -8612 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 230.333-21 chr11 19179838 19180233 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 21948 NM_003476 8048 Hs.83577 NM_003476 ENSG00000129170 CSRP3 CLP|CMD1M|CMH12|CRP3|LMO4|MLP cysteine and glycine rich protein 3 protein-coding 149.667-269 chr3 171328041 171328323 + 1 NA intron (NM_001161563, intron 2 of 31) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 132223 NM_001161566 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 165.667-70 chr17 49608588 49608832 + 1 NA intron (NM_001007230, intron 8 of 11) intron (NM_001007230, intron 8 of 11) 17879 NM_001370732 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 144.667-269 chr6 119385372 119385567 + 1 NA Intergenic Intergenic -35708 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 158.333-109 chr17 31124783 31125002 + 1 NA intron (NM_001042492, intron 1 of 57) AluYh3|SINE|Alu 29915 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 307.667-9 chr11 57367421 57367961 + 1 NA intron (NM_002559, intron 8 of 11) AluSz|SINE|Alu 13459 NM_006093 10394 Hs.251386 NM_006093 ENSG00000156575 PRG3 MBP2|MBPH proteoglycan 3, pro eosinophil major basic protein 2 protein-coding 236.333-19 chr11 81949033 81949393 + 1 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) L1MD3|LINE|L1 -58377 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 176.667-65 chr17 50537277 50537623 + 1 NA non-coding (NR_135675, exon 3 of 3) non-coding (NR_135675, exon 3 of 3) 1304 NR_135675 105371824 Hs.683630 NR_135675 ENSG00000250286 LOC105371824 - uncharacterized LOC105371824 ncRNA 147.667-190 chr2 163333905 163334105 + 1 NA Intergenic Intergenic 402003 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 144.667-236 chr5 40773842 40774077 + 1 NA intron (NM_001355029, intron 2 of 7) HAL1|LINE|L1 -17998 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 254.333-87 chr8 118943639 118944100 + 1 NA intron (NM_002546, intron 1 of 4) intron (NM_002546, intron 1 of 4) 8016 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 155.667-74 chr12 44677127 44677424 + 1 NA intron (NM_006159, intron 13 of 20) intron (NM_006159, intron 13 of 20) 198386 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 217.667-88 chr8 103706557 103707045 + 1 NA intron (NM_001348497, intron 2 of 22) L1MA4|LINE|L1 -112419 NR_145711 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 273.667-29 chr18 38256025 38256541 + 1 NA Intergenic Intergenic 599148 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 159.333-178 chr2 205850881 205851063 + 1 NA Intergenic Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 168471 NM_018534 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 184.667-36 chr15 51456955 51457166 + 1 NA intron (NM_001174116, intron 36 of 42) AluJb|SINE|Alu 79814 NM_001330297 342035 Hs.526441 NM_181789 ENSG00000186417 GLDN CLOM|COLM|CRG-L2|CRGL2|LCCS11|UNC-112 gliomedin protein-coding 188.667-42 chr14 33929802 33929998 + 1 NA intron (NM_001308103, intron 2 of 4) intron (NM_001308103, intron 2 of 4) 21174 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 241.333-16 chr10 69276783 69277165 + 1 NA intron (NM_001322365, intron 2 of 22) L1MEh|LINE|L1 -1522 NM_001358263 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 204.667-106 chr4 40504795 40505246 + 1 NA intron (NM_001098634, intron 2 of 6) intron (NM_001098634, intron 2 of 6) -2901 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 133.333-63 chr17 59566952 59567179 + 1 NA intron (NM_024612, intron 2 of 17) intron (NM_024612, intron 2 of 17) 1455 NM_001166301 79665 Hs.29403 NM_024612 ENSG00000108406 DHX40 ARG147|DDX40|PAD DEAH-box helicase 40 protein-coding 163.667-182 chr4 93085625 93085912 + 1 NA intron (NM_001510, intron 3 of 15) intron (NM_001510, intron 3 of 15) -742985 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 175.333-95 chr2 173233302 173233668 + 1 NA intron (NM_016653, intron 14 of 19) intron (NM_016653, intron 14 of 19) 48551 NR_033882 339751 Hs.570083 NR_033882 ENSG00000238133 MAP3K20-AS1 MLK7-AS1 MAP3K20 antisense RNA 1 ncRNA 268.667-59 chr7 54583799 54584162 + 1 NA Intergenic Intergenic 27010 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 209.333-153 chr3 112446469 112446820 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 52828 NM_001085357 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 269.333-65 chr3 147090591 147091130 + 1 NA Intergenic Intergenic 168937 NR_135561 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 159.667-303 chr7 55281693 55281934 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -26178 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 223.667-85 chr8 112100111 112100452 + 1 NA Intergenic Intergenic -543212 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 248.667-47 chr17 43359288 43359719 + 1 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 29395 NR_027412 100130581 Hs.546897 NR_027412 ENSG00000188825 LINC00910 - long intergenic non-protein coding RNA 910 ncRNA 151.667-112 chr14 67712716 67712904 + 1 NA intron (NM_152443, intron 1 of 8) MER4-int|LTR|ERV1 10924 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 221.667-31 chr14 70230841 70231169 + 1 NA non-coding (NR_135825, exon 4 of 4) non-coding (NR_135825, exon 4 of 4) 16796 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 170.333-37 chr10 96498386 96498605 + 1 NA intron (NM_012465, intron 1 of 20) intron (NM_012465, intron 1 of 20) 15431 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 234.667-46 chr2 14657957 14658356 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 25439 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 439.333-11 chr6 134945266 134946018 + 1 NA intron (NM_001193480, intron 1 of 5) MER117|DNA|hAT-Charlie 4459 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 199.333-63 chr13 88930731 88931006 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 304015 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 154.333-195 chr21 46533731 46533988 + 1 NA intron (NM_001146115, intron 10 of 19) MER3|DNA|hAT-Charlie 71223 NM_006272 6285 Hs.422181 NM_006272 ENSG00000160307 S100B NEF|S100|S100-B|S100beta S100 calcium binding protein B protein-coding 161.333-120 chr17 73966680 73966858 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -138232 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 130.333-68 chr14 82266393 82266583 + 1 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -376144 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 253.667-31 chr2 110204095 110204560 + 1 NA intron (NM_207181, intron 1 of 19) L1ME3G|LINE|L1 686 NM_000272 4867 Hs.280388 NM_000272 ENSG00000144061 NPHP1 JBTS4|NPH1|SLSN1 nephrocystin 1 protein-coding 206.333-92 chr2 161024603 161024856 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -112226 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 150.333-183 chr2 6097273 6097508 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 115412 NR_026833 400940 Hs.378814 NM_207479 LOC400940 - uncharacterized LOC400940 ncRNA 216.333-63 chr18 44297605 44298024 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 233883 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 132.333-94 chr2 186404897 186405054 + 1 NA Intergenic Intergenic -81285 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 185.333-171 chr6 149541306 149541713 + 1 NA intron (NM_139126, intron 2 of 12) intron (NM_139126, intron 2 of 12) 4534 NM_139126 85313 Hs.744238 NM_139126 ENSG00000131013 PPIL4 HDCME13P peptidylprolyl isomerase like 4 protein-coding 126.333-170 chr7 119299611 119299761 + 1 NA Intergenic Intergenic 607689 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 185.667-54 chr18 8254687 8255092 + 1 NA intron (NM_002845, intron 17 of 30) intron (NM_002845, intron 17 of 30) 112145 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 274.333-9 chr11 72536010 72536455 + 1 NA Intergenic Intergenic -34424 NR_126364 101928555 Hs.376950 NR_126364 ENSG00000227467 LINC01537 - long intergenic non-protein coding RNA 1537 ncRNA 152.333-396 chr9 11956670 11956859 + 1 NA Intergenic Intergenic -736621 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 195.667-113 chr6 16301514 16301812 + 1 NA 3' UTR (NM_001128164, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001128164, exon 8 of 8) 63076 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 159.333-57 chr11 15050466 15050714 + 1 NA Intergenic Intergenic -23003 NM_000728 797 Hs.534305 NM_000728 ENSG00000175868 CALCB CALC2|CGRP-II|CGRP2 calcitonin related polypeptide beta protein-coding 156.667-129 chr16 73336284 73336466 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -50430 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 287.667-24 chr20 55656752 55657060 + 1 NA Intergenic Intergenic -229709 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 157.667-114 chr15 94768800 94769060 + 1 NA Intergenic Intergenic -86433 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 207.333-216 chr5 38188187 38188500 + 1 NA Intergenic Intergenic 39863 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 128.667-168 chr7 95911648 95911840 + 1 NA intron (NM_004411, intron 6 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 139238 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 244.667-8 chr1 215956905 215957312 + 1 NA intron (NM_206933, intron 37 of 71) intron (NM_206933, intron 37 of 71) -115357 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 276.333-40 chr3 180014983 180015541 + 1 NA intron (NM_016559, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 21675 NM_001256751 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 186.667-144 chr8 32671773 32672031 + 1 NA intron (NM_001322205, intron 1 of 8) intron (NM_001322205, intron 1 of 8) 24813 NM_001322206 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 123.333-42 chr11 3367587 3367747 + 1 NA intron (NR_046381, intron 4 of 6) intron (NR_046381, intron 4 of 6) 11479 NM_001242843 7748 Hs.386294 NM_007152 ENSG00000005801 ZNF195 HRF1|ZNFP104 zinc finger protein 195 protein-coding 147.333-268 chr5 162603952 162604209 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 536438 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 283.667-4 chr1 194445626 194446064 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 1141100 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 137.667-59 chr14 71152354 71152530 + 1 NA Intergenic Intergenic -168034 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 146.333-279 chr5 180026466 180026637 + 1 NA intron (NM_001280801, intron 2 of 7) intron (NM_001280801, intron 2 of 7) -11154 NR_029885 442908 NR_029885 ENSG00000198995 MIR340 MIRN340|hsa-mir-340|mir-340 microRNA 340 ncRNA 128.333-83 chr18 5350855 5351004 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -53876 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 237.667-25 chr15 67528454 67528862 + 1 NA 3' UTR (NM_001143936, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001143936, exon 2 of 2) -6814 NR_040054 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 144.667-125 chr19 27845599 27845823 + 1 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) HERVFH21-int|LTR|ERV1 -51771 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 255.667-44 chr2 66266882 66267186 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 91294 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 148.333-175 chr19 32338029 32338181 + 1 NA Intergenic Intergenic -7505 NM_001136156 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 247.333-57 chr4 72863498 72863950 + 1 NA Intergenic Intergenic 205992 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 154.333-283 chr5 172488559 172488860 + 1 NA Intergenic Intergenic -34184 NM_001017995 285590 Hs.285666 NM_001017995 ENSG00000174705 SH3PXD2B FAD49|FTHS|HOFI|KIAA1295|TKS4|TSK4 SH3 and PX domains 2B protein-coding 217.667-50 chr2 194901082 194901484 + 1 NA Intergenic Intergenic 170688 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 159.333-153 chr2 56205108 56205344 + 1 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -19456 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 141.667-20 chr1 226293241 226293423 + 1 NA intron (NM_001366240, intron 2 of 12) intron (NM_001366240, intron 2 of 12) 15832 NM_001366245 286826 Hs.120817 NM_173083 ENSG00000183814 LIN9 BARA|BARPsv|Lin-9|TGS|TGS1|TGS2 lin-9 DREAM MuvB core complex component protein-coding 242.333-102 chr8 140332997 140333288 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) AluSg|SINE|Alu 124602 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 146.333-353 chr9 83076600 83076855 + 1 NA Intergenic Intergenic -13585 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 299.667-14 chr2 32935186 32935607 + 1 NA intron (NR_027097, intron 3 of 3) AluSp|SINE|Alu 8269 NR_027097 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 196.333-90 chr2 161997032 161997274 + 1 NA intron (NM_001935, intron 23 of 25) intron (NM_001935, intron 23 of 25) 77062 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 182.667-39 chr14 20371370 20371761 + 1 NA exon (NM_007110, exon 50 of 55) exon (NM_007110, exon 50 of 55) 27951 NM_005484 10038 Hs.409412 NM_005484 ENSG00000129484 PARP2 ADPRT2|ADPRTL2|ADPRTL3|ARTD2|PARP-2|pADPRT-2 poly(ADP-ribose) polymerase 2 protein-coding 167.667-162 chr4 132750625 132750811 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 159629 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 251.333-74 chr3 36545657 36546006 + 1 NA intron (NM_001292049, intron 8 of 8) intron (NM_001292049, intron 8 of 8) 165344 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 137.333-74 chr18 2309810 2309970 + 1 NA Intergenic Intergenic 261615 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 152.667-378 chr8 99209901 99210167 + 1 NA TTS (NM_015243) TTS (NM_015243) 196768 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 232.333-93 chr8 140282631 140282981 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 14 of 22) L1ME4a|LINE|L1 174938 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 184.333-153 chr8 110589805 110590180 + 1 NA Intergenic Intergenic 437441 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 169.333-177 chr4 54088460 54088678 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11594 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 237.667-6 chr10 20056728 20057055 + 1 NA intron (NM_032812, intron 3 of 13) intron (NM_032812, intron 3 of 13) 240459 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 182.667-98 chr3 104040733 104040969 + 1 NA Intergenic Intergenic -516735 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 114.667-225 chr6 93320009 93320158 + 1 NA intron (NM_004440, intron 5 of 16) intron (NM_004440, intron 5 of 16) 99476 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 222.667-85 chr6 158131574 158131836 + 1 NA intron (NM_032861, intron 8 of 16) L1ME4b|LINE|L1 36557 NR_073096 84947 Hs.154706 NM_032861 ENSG00000122335 SERAC1 - serine active site containing 1 protein-coding 168.667-56 chr13 108834582 108834815 + 1 NA intron (NM_015011, intron 9 of 34) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 205087 NM_001198950 23026 Hs.656587 NM_015011 ENSG00000041515 MYO16 MYAP3|MYR8|Myo16b|NYAP3|PPP1R107 myosin XVI protein-coding 157.333-306 chr6 65963281 65963594 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 175558 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 142.667-133 chr22 36350872 36351114 + 1 NA intron (NM_002473, intron 1 of 40) intron (NM_002473, intron 1 of 40) 37074 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 148.667-231 chr21 30915003 30915179 + 1 NA Intergenic Intergenic -33511 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 169.333-87 chr15 71383885 71384069 + 1 NA intron (NM_024817, intron 5 of 16) MER57A-int|LTR|ERV1 -163259 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 169.667-75 chr15 59414348 59414551 + 1 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -23737 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 174.333-31 chr13 31461617 31461827 + 1 NA Intergenic Intergenic 261747 NM_194318 145173 Hs.13205 NM_194318 ENSG00000187676 B3GLCT B3GALTL|B3GTL|B3Glc-T|Gal-T|beta3Glc-T beta 3-glucosyltransferase protein-coding 306.667-8 chr12 47547713 47548053 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 132875 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 236.333-31 chr15 72147023 72147302 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 28759 NM_145204 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 243.333-23 chr12 131808765 131809297 + 1 NA Intergenic CpG -19362 NM_016155 4326 Hs.709245 NM_016155 ENSG00000198598 MMP17 MMP-17|MT4-MMP|MT4MMP|MTMMP4 matrix metallopeptidase 17 protein-coding 149.333-35 chr1 220031397 220031641 + 1 NA intron (NM_004446, intron 5 of 31) L2c|LINE|L2 14986 NM_004446 2058 Hs.497788 NM_004446 ENSG00000136628 EPRS EARS|GLUPRORS|HLD15|PARS|PIG32|QARS|QPRS glutamyl-prolyl-tRNA synthetase protein-coding 284.667-48 chr7 27901637 27902012 + 1 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 161729 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 159.333-317 chr7 120326404 120326686 + 1 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 53370 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 189.667-53 chr15 83041041 83041391 + 1 NA intron (NM_001011885, intron 4 of 6) MIRc|SINE|MIR 26036 NM_001011885 53339 Hs.459149 NM_025238 ENSG00000064726 BTBD1 C15orf1|NS5ATP8 BTB domain containing 1 protein-coding 142.667-24 chr10 92406882 92407054 + 1 NA Intergenic Intergenic -11693 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 179.667-38 chr12 124462725 124462958 + 1 NA intron (NM_001077261, intron 7 of 47) intron (NM_001077261, intron 7 of 47) 104771 NM_006312 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 187.333-88 chr2 13079803 13080009 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -72893 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 157.333-45 chr10 33214575 33214837 + 1 NA intron (NM_001244973, intron 8 of 16) L1MB3|LINE|L1 -97899 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 134.667-2 chr1 46534893 46535048 + 1 NA intron (NM_001357063, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 545 NM_001357063 105378696 NM_001357063 ENSG00000282881 TMEM275 - transmembrane protein 275 protein-coding 197.667-107 chr4 39917849 39918153 + 1 NA intron (NM_001100399, intron 7 of 32) AluJo|SINE|Alu 59910 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 176.333-91 chr2 134468220 134468516 + 1 NA intron (NM_030923, intron 5 of 7) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 214296 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 265.667-44 chr22 20818906 20819304 + 1 NA intron (NM_058004, intron 6 of 54) LTR14|LTR|ERVK 39706 NM_058004 5297 Hs.529438 NM_002650 ENSG00000241973 PI4KA PI4K-ALPHA|PIK4CA|PMGYCHA|pi4K230 phosphatidylinositol 4-kinase alpha protein-coding 145.333-295 chr8 62220204 62220401 + 1 NA Intergenic Intergenic -28552 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 142.333-124 chr2 115157543 115157763 + 1 NA intron (NR_036580, intron 1 of 2) intron (NR_036580, intron 1 of 2) 3690 NR_036580 389023 Hs.97540 NR_036580 ENSG00000235026 DPP10-AS1 - DPP10 antisense RNA 1 ncRNA 145.667-9 chr1 71930106 71930347 + 1 NA intron (NM_173808, intron 2 of 6) intron (NM_173808, intron 2 of 6) -93214 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 143.333-253 chr6 154741270 154741533 + 1 NA intron (NM_014892, intron 1 of 19) intron (NM_014892, intron 1 of 19) 8023 NM_001286199 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 114.667-113 chr18 38769633 38769780 + 1 NA Intergenic Intergenic 852469 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 198.333-77 chr16 63656844 63657063 + 1 NA Intergenic Intergenic 1465110 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 148.667-242 chr3 12389990 12390266 + 1 NA intron (NM_001330615, intron 3 of 5) L1ME3B|LINE|L1 38626 NM_015869 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 156.667-107 chr14 64734146 64734444 + 1 NA intron (NM_001308147, intron 12 of 16) (TTTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 29871 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 167.667-165 chr5 6903999 6904320 + 1 NA Intergenic Intergenic -76238 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 151.333-391 chr7 78299641 78299808 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 9 of 20) L1PA11|LINE|L1 -47518 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 152.667-150 chr18 35713179 35713396 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 58718 NM_020474 2589 Hs.514806 NM_020474 ENSG00000141429 GALNT1 GALNAC-T1 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 197.333-93 chr18 21782918 21783308 + 1 NA intron (NM_020774, intron 6 of 20) L1MA4|LINE|L1 41784 NM_020774 57534 Hs.140903 NM_020774 ENSG00000101752 MIB1 DIP-1|DIP1|LVNC7|MIB|ZZANK2|ZZZ6 mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 145.333-191 chr3 97578413 97578645 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 11 of 17) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 138922 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 186.333-159 chr8 52450609 52450873 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -40862 NM_001352863 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 162.667-56 chr12 47315153 47315386 + 1 NA Intergenic Intergenic -7870 NR_135024 105369747 Hs.88617 NR_135024 LOC105369747 - uncharacterized LOC105369747 ncRNA 163.333-106 chr15 96534873 96535097 + 1 NA Intergenic Intergenic 201220 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 151.333-55 chr10 66232586 66232783 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L1ME3A|LINE|L1 661259 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 166.333-33 chr10 85683710 85683903 + 1 NA intron (NM_017551, intron 12 of 15) L1M5|LINE|L1 106075 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 137.333-42 chr14 33255734 33255917 + 1 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) 316946 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 148.667-262 chr3 165957549 165957745 + 1 NA Intergenic Intergenic -120224 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 214.667-83 chr3 100378409 100378757 + 1 NA intron (NM_014820, intron 5 of 11) L2c|LINE|L2 22506 NM_014820 9868 Hs.227253 NM_014820 ENSG00000154174 TOMM70 TOMM70A|Tom70 translocase of outer mitochondrial membrane 70 protein-coding 160.333-231 chr5 44945561 44945871 + 1 NA Intergenic Intergenic 136769 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 168.667-122 chr20 21241482 21241688 + 1 NA intron (NM_018474, intron 11 of 12) intron (NM_018474, intron 11 of 12) -23296 NR_109956 101929591 Hs.656066 NR_109956 ENSG00000232712 KIZ-AS1 - KIZ antisense RNA 1 ncRNA 231.667-49 chr6 805718 805986 + 1 NA Intergenic Intergenic -62646 NR_110853 101927691 Hs.552556 NR_110853 LOC101927691 - uncharacterized LOC101927691 ncRNA 156.333-70 chr12 13094406 13094678 + 1 NA intron (NM_001080555, intron 1 of 6) intron (NM_001080555, intron 1 of 6) 1133 NM_153823 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 180.333-93 chr4 105000000 105000295 + 1 NA Intergenic Intergenic -145728 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 158.333-151 chr2 101362433 101362745 + 1 NA intron (NM_153836, intron 2 of 3) intron (NM_153836, intron 2 of 3) 24914 NM_153836 200407 Hs.732289 NM_153836 ENSG00000175874 CREG2 - cellular repressor of E1A stimulated genes 2 protein-coding 148.333-291 chr4 110755038 110755246 + 1 NA Intergenic Intergenic 105505 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 168.667-50 chr13 45701341 45701539 + 1 NA promoter-TSS (NR_125786) promoter-TSS (NR_125786) -256 NR_125786 103752581 NR_125786 LINC01055 - long intergenic non-protein coding RNA 1055 ncRNA 124.333-95 chr2 162597336 162597564 + 1 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) L1MA7|LINE|L1 -171486 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 209.333-194 chr5 120168881 120169204 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -295236 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 230.667-87 chr8 74899662 74899973 + 1 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 75283 NM_001324403 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 206.333-72 chr18 6577103 6577430 + 1 NA intron (NR_120518, intron 3 of 5) LTR54B|LTR|ERV1 65850 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 182.667-75 chr2 54071158 54071351 + 1 NA intron (NM_001320587, intron 3 of 5) L1MB8|LINE|L1 -44361 NM_138448 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 132.333-143 chr5 178392282 178392578 + 1 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) intron (NM_173465, intron 2 of 28) -159608 NR_103508 85007 Hs.248746 NM_153373 ENSG00000175309 PHYKPL AGXT2L2|PHLU 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase protein-coding 261.667-26 chr18 2607999 2608344 + 1 NA intron (NM_006101, intron 14 of 16) L1M5|LINE|L1 36614 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 201.667-130 chr9 88390415 88390800 + 1 NA intron (NM_006717, intron 1 of 5) intron (NM_006717, intron 1 of 5) 2163 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 141.333-57 chr13 82162107 82162383 + 1 NA Intergenic Intergenic -935262 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 162.667-104 chr17 65160956 65161215 + 1 NA intron (NM_003835, intron 6 of 18) Plat_L3|LINE|CR1 23715 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 160.333-235 chr5 111519856 111520072 + 1 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) intron (NR_040093, intron 1 of 6) -7367 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 186.333-134 chr6 19175748 19175993 + 1 NA non-coding (NR_110860, exon 3 of 11) non-coding (NR_110860, exon 3 of 11) 4610 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 115.333-165 chr5 7901016 7901158 + 1 NA TTS (NM_001364442) TTS (NM_001364442) 31939 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 155.333-16 chr1 211273654 211273923 + 1 NA intron (NM_001350070, intron 4 of 12) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 13841 NM_018254 55758 Hs.356399 NM_018254 ENSG00000117625 RCOR3 - REST corepressor 3 protein-coding 142.667-109 chr2 168610319 168610563 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 3 of 10) L2c|LINE|L2 27498 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 185.667-7 chr1 236195786 236196064 + 1 NA intron (NM_003272, intron 5 of 6) L1MA1|LINE|L1 53386 NM_003272 7107 Hs.498160 NM_003272 ENSG00000077585 GPR137B TM7SF1 G protein-coupled receptor 137B protein-coding 147.667-155 chr18 77559268 77559467 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 309519 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 151.667-25 chr1 179448260 179448433 + 1 NA intron (NM_144696, intron 16 of 25) intron (NM_144696, intron 16 of 25) 82302 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 210.333-4 chr1 76602301 76602611 + 1 NA intron (NR_146056, intron 4 of 5) intron (NR_146056, intron 4 of 5) 176811 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 148.667-307 chr5 50783588 50783842 + 1 NA intron (NM_024615, intron 9 of 25) intron (NM_024615, intron 9 of 25) 116301 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 171.667-53 chr15 33373603 33373873 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 62771 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 148.333-316 chr5 64361802 64362045 + 1 NA intron (NM_001113561, intron 7 of 7) MER106B|DNA|hAT-Charlie -144092 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 188.333-93 chr22 45098737 45099033 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 53699 NR_038957 100506714 Hs.189902 NR_038956 NUP50-DT NUP50-AS1 NUP50 divergent transcript ncRNA 131.333-9 chr1 113106978 113107189 + 1 NA intron (NM_014813, intron 11 of 17) L1MC4|LINE|L1 33885 NM_001312686 9860 Hs.448972 NM_014813 ENSG00000198799 LRIG2 LIG-2|LIG2|UFS2 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 protein-coding 188.667-14 chr1 174034698 174034920 + 1 NA Intergenic Intergenic -41737 NM_001300852 149041 Hs.30258 NM_172071 ENSG00000135870 RC3H1 RNF198|ROQUIN ring finger and CCCH-type domains 1 protein-coding 237.333-37 chr15 91729106 91729569 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -124371 NM_013272 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 165.667-196 chr8 101096178 101096515 + 1 NA Intergenic Intergenic 44292 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 286.667 chr1 42139792 42140121 + 1 NA Intergenic Intergenic -13454 NM_007102 2981 Hs.32966 NM_007102 ENSG00000044012 GUCA2B GCAP-II|UGN guanylate cyclase activator 2B protein-coding 168.667-134 chr22 26641236 26641407 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -16161 NR_033319 440823 Hs.517502 NR_003491 ENSG00000225783 MIAT C22orf35|GOMAFU|LINC00066|NCRNA00066|RNCR2|lncRNA-MIAT myocardial infarction associated transcript ncRNA 128.667-18 chr1 244440530 244440690 + 1 NA intron (NM_001365073, intron 1 of 12) intron (NM_001365073, intron 1 of 12) 11299 NM_001126 159 Hs.498313 NM_001126 ENSG00000035687 ADSS ADEH|ADSS 2|ADSS2 adenylosuccinate synthase protein-coding 329.333-39 chr4 53100392 53100883 + 1 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 238320 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 158.667-28 chr1 200821162 200821403 + 1 NA intron (NM_001297708, intron 4 of 16) AluJo|SINE|Alu -51699 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 143.333-134 chr2 67002773 67002974 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -80383 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 111.667-187 chr4 102629480 102629660 + 1 NA Intergenic Intergenic -127084 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 153.667-31 chr1 230457569 230457795 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -31350 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 138.333-119 chr3 49053134 49053299 + 1 NA intron (NM_017730, intron 4 of 10) AluY|SINE|Alu -23818 NM_000884 3615 Hs.654400 NM_000884 ENSG00000178035 IMPDH2 IMPD2|IMPDH-II inosine monophosphate dehydrogenase 2 protein-coding 254.667-76 chr7 5676813 5677393 + 1 NA intron (NR_046834, intron 1 of 2) intron (NR_046834, intron 1 of 2) 3358 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 146.333-9 chr1 76710368 76710546 + 1 NA Intergenic Intergenic 68810 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 164.667-208 chr6 136558999 136559180 + 1 NA intron (NM_005923, intron 28 of 29) AluSx|SINE|Alu -8270 NM_001198617 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 155.333-274 chr4 125169325 125169574 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -146963 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 155.333-289 chr5 39795065 39795352 + 1 NA Intergenic Intergenic -257083 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 213.667-85 chr6 128669372 128669694 + 1 NA Intergenic Intergenic -148934 NM_002844 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 158.333-172 chr20 17934264 17934432 + 1 NA Intergenic Intergenic 28598 NR_003045 692086 Hs.680747 NR_003045 ENSG00000212232 SNORD17 HBI-43 small nucleolar RNA, C/D box 17 snoRNA 169.333-109 chr19 40072636 40073009 + 1 NA TTS (NM_001010880) TTS (NM_001010880) -16591 NM_001005851 163131 Hs.101139 NM_001005851 ENSG00000128000 ZNF780B ZNF779 zinc finger protein 780B protein-coding 198.667-182 chr8 83368970 83369227 + 1 NA Intergenic Intergenic -34660 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 177.667-74 chr2 125814967 125815191 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 302906 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 189.667-84 chr20 37722829 37723201 + 1 NA intron (NM_030877, intron 1 of 15) UCON107|DNA|hAT-Tag1 28985 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 178.333-12 chr1 229597657 229597917 + 1 NA intron (NM_014409, intron 4 of 4) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 28260 NM_014409 27097 Hs.270621 NM_014409 ENSG00000135801 TAF5L PAF65B TATA-box binding protein associated factor 5 like protein-coding 198.333-25 chr10 43681521 43681955 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -32857 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 161.667-193 chr4 112844311 112844612 + 1 NA intron (NM_001354275, intron 1 of 43) intron (NM_001354275, intron 1 of 43) -16526 NM_001354261 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 173.333-153 chr5 29743255 29743546 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -137160 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 164.667-155 chr4 30742847 30743167 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 22638 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 168.333-90 chr2 48620110 48620446 + 1 NA intron (NM_001193487, intron 1 of 7) intron (NM_001193487, intron 1 of 7) 2422 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 130.333-74 chr15 69174718 69174875 + 1 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) intron (NM_001324093, intron 2 of 5) 14161 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 146.333-78 chr13 54759304 54759594 + 1 NA Intergenic Intergenic -415005 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 180.333-110 chr6 136690494 136690711 + 1 NA intron (NM_005923, intron 7 of 29) L1ME3Cz|LINE|L1 61488 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 245.667-54 chr5 45071412 45071712 + 1 NA Intergenic Intergenic 262615 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 271.333-14 chr15 59559727 59560067 + 1 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -51886 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 170.333-109 chr2 56470871 56471110 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -285220 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 116.667-66 chr15 85491425 85491602 + 1 NA intron (NM_007200, intron 2 of 36) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 110910 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 167.667-195 chr7 42851691 42851864 + 1 NA Intergenic Intergenic 60066 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 161.333-249 chr6 121923711 121923910 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -475741 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 246.333-104 chr9 38020069 38020456 + 1 NA intron (NM_003028, intron 1 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 48965 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 160.667-305 chr8 88503040 88503294 + 1 NA Intergenic Intergenic -175684 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 132.667-190 chr9 87362184 87362398 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -134937 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 171.333-205 chr9 102270050 102270418 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -249403 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 149.333-99 chr13 27585491 27585758 + 1 NA intron (NM_153371, intron 1 of 9) intron (NM_153371, intron 1 of 9) 34905 NM_153371 222484 Hs.132359 NM_153371 ENSG00000139517 LNX2 PDZRN1 ligand of numb-protein X 2 protein-coding 205.333-70 chr14 51184641 51184983 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -55435 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 194.667-154 chr8 108832833 108833260 + 1 NA Intergenic Intergenic -45452 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 275.667-30 chr2 38108377 38108699 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -22567 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-78 chr12 13213990 13214149 + 1 NA intron (NM_001423, intron 4 of 4) intron (NM_001423, intron 4 of 4) 17343 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 148.667-273 chr4 43629160 43629363 + 1 NA Intergenic Intergenic -136718 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 150.667-243 chr3 87626408 87626579 + 1 NA Intergenic Charlie10b|DNA|hAT-Charlie -166213 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 257.333-12 chr10 64281912 64282390 + 1 NA Intergenic Intergenic -543377 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 178.667-37 chr12 64577687 64577953 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -32675 NR_040718 283349 Hs.643605 NM_178169 ENSG00000153179 RASSF3 RASSF5 Ras association domain family member 3 protein-coding 342.667-14 chr8 31405568 31406099 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -233919 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 216.333-68 chr19 28332861 28333264 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -273626 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 171.667-8 chr1 102685823 102686083 + 1 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 422543 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 111.667-176 chr3 162800094 162800317 + 1 NA Intergenic Intergenic 503096 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 173.667-115 chr3 96909238 96909450 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) intron (NM_001080448, intron 2 of 17) 94750 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 159.667-70 chr12 19031504 19031707 + 1 NA Intergenic Intergenic -98128 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 160.333-26 chr1 170434657 170434869 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -97359 NM_001146039 92344 Hs.183702 NM_152281 ENSG00000120370 GORAB GO|NTKLBP1|SCYL1BP1 golgin, RAB6 interacting protein-coding 242.667-84 chr5 77693910 77694344 + 1 NA intron (NM_004607, intron 2 of 3) intron (NM_004607, intron 2 of 3) -55430 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 199.333-108 chr18 7718117 7718514 + 1 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) L1PB2|LINE|L1 150999 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 213.333-8 chr1 101530700 101531145 + 1 NA Intergenic Intergenic 207085 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 143.667-38 chr11 21869154 21869447 + 1 NA Intergenic Intergenic -323785 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 228.333-54 chr20 8182893 8183335 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) 50848 NM_182734 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 151.333-306 chr4 63263828 63264002 + 1 NA Intergenic Intergenic -1102150 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-79 chr12 27418868 27419135 + 1 NA intron (NM_001248003, intron 14 of 14) intron (NM_001248003, intron 14 of 14) 27633 NR_109975 101928646 Hs.434269 NR_109975 ENSG00000245311 ARNTL2-AS1 - ARNTL2 antisense RNA 1 ncRNA 180.333-87 chr3 130853190 130853474 + 1 NA intron (NM_001199181, intron 1 of 26) MER113|DNA|hAT-Charlie 2737 NM_001199180 27032 Hs.584884 NM_014382 ENSG00000017260 ATP2C1 ATP2C1A|BCPM|HHD|PMR1|SPCA1|hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 protein-coding 199.333-56 chr12 59297997 59298333 + 1 NA Intergenic Intergenic -297864 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 140.333-78 chr16 62458580 62458766 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -422235 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 113.667-112 chr2 167670772 167670922 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -147825 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 163.333-97 chr15 50372642 50372966 + 1 NA Intergenic Intergenic 12475 NR_039862 100616396 NR_039862 ENSG00000284284 MIR4712 - microRNA 4712 ncRNA 216.333-73 chr2 39548170 39548573 + 1 NA intron (NR_037875, intron 5 of 5) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 110955 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 232.333-19 chr12 112415420 112415799 + 1 NA intron (NM_001320141, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu 3226 NM_001320141 6128 Hs.528668 NM_000970 ENSG00000089009 RPL6 L6|SHUJUN-2|TAXREB107|TXREB1 ribosomal protein L6 protein-coding 275.333-50 chr3 178619758 178620093 + 1 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 61075 NM_005832 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 185.333-98 chr2 151555064 151555505 + 1 NA intron (NM_001271208, intron 124 of 182) MIRc|SINE|MIR 145382 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 156.667-288 chr5 143469847 143470064 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -34443 NM_001018077 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 127.333-130 chr4 80748079 80748218 + 1 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -282560 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 132.333-150 chr6 38235248 38235394 + 1 NA intron (NM_052893, intron 10 of 11) intron (NM_052893, intron 10 of 11) -246275 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 179.667-74 chr2 25452728 25453028 + 1 NA intron (NM_001351393, intron 9 of 17) intron (NM_001351393, intron 9 of 17) -110288 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 164.333-223 chr7 19925930 19926244 + 1 NA intron (NR_110114, intron 5 of 5) intron (NR_110114, intron 5 of 5) -152470 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 222.667-45 chr2 177968106 177968470 + 1 NA intron (NM_001077197, intron 3 of 20) intron (NM_001077197, intron 3 of 20) -45451 NM_001077358 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 148.333-109 chr13 75153855 75154016 + 1 NA Intergenic Intergenic 86446 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 175.667-87 chr20 46917508 46917698 + 1 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 22760 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 153.333-47 chr10 56847146 56847374 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 457299 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 216.667-9 chr1 117528705 117528980 + 1 NA TTS (NM_006699) TTS (NM_006699) 76928 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 232.667-54 chr3 192160350 192160667 + 1 NA intron (NM_004113, intron 5 of 5) L2a|LINE|L2 -78122 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 160.667-92 chr14 66498319 66498551 + 1 NA non-coding (NR_024338, exon 11 of 11) non-coding (NR_024338, exon 11 of 11) -8972 NM_020806 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 145.333-209 chr4 35486578 35486730 + 1 NA Intergenic Intergenic 757285 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 132.667-144 chr5 122677888 122678101 + 1 NA intron (NR_109881, intron 8 of 11) AluJb|SINE|Alu 52566 NR_109881 101927379 Hs.536399 NR_109881 ENSG00000251538 LINC02201 - long intergenic non-protein coding RNA 2201 ncRNA 293.667-18 chr16 83702882 83703248 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 9 of 12) intron (NM_001220489, intron 9 of 12) 100911 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 153.333-218 chr2 161431261 161431568 + 1 NA Intergenic Intergenic 15117 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 200.667-85 chr2 147597018 147597312 + 1 NA Intergenic Intergenic -247352 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 203.667-110 chr7 7055322 7055691 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 11539 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 159.333-202 chr22 35076013 35076276 + 1 NA intron (NM_001303508, intron 2 of 4) intron (NM_001303508, intron 2 of 4) 9986 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 191.333-152 chr4 114976236 114976473 + 1 NA intron (NM_022569, intron 3 of 13) intron (NM_022569, intron 3 of 13) 137266 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 217.333-155 chr8 116986620 116986871 + 1 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) intron (NM_001172811, intron 2 of 9) 35770 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 254.333-55 chr3 103306366 103306689 + 1 NA Intergenic Intergenic 217589 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 159.333-212 chr3 82091695 82091899 + 1 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 105655 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 152.667-303 chr5 120592239 120592498 + 1 NA intron (NM_001308088, intron 1 of 3) intron (NM_001308088, intron 1 of 3) 60904 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 197.333-70 chr14 67939225 67939551 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 115796 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 202.333-17 chr1 218235548 218235842 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -49598 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 414.333 chr1 212495968 212496804 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -49308 NR_125985 101929565 NR_125985 ENSG00000228067 LINC01740 - long intergenic non-protein coding RNA 1740 ncRNA 161.667-32 chr11 5546807 5547130 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1445 NM_001005289 390067 Hs.554540 NM_001005289 ENSG00000181616 OR52H1 OR11-41|OR11-45 olfactory receptor family 52 subfamily H member 1 protein-coding 143.667-170 chr3 149897594 149897829 + 1 NA intron (NM_183383, intron 4 of 8) intron (NM_183383, intron 4 of 8) 73184 NM_002628 5217 Hs.91747 NM_002628 ENSG00000070087 PFN2 D3S1319E|PFL profilin 2 protein-coding 427.667-8 chr5 119352530 119353272 + 1 NA intron (NM_001286814, intron 1 of 1) intron (NM_001286814, intron 1 of 1) -1872 NM_001286813 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 157.667-191 chr3 63804632 63804826 + 1 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner -14570 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 163.667-254 chr8 117248196 117248458 + 1 NA Intergenic Intergenic 113332 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 194.333-68 chr2 75868672 75869101 + 1 NA Intergenic Intergenic -157971 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 252.333-3 chr1 114022854 114023165 + 1 NA Intergenic Intergenic 43535 NM_001286352 56944 Hs.9315 NM_020190 ENSG00000116774 OLFML3 HNOEL-iso|OLF44 olfactomedin like 3 protein-coding 146.333-290 chr6 112502020 112502237 + 1 NA Intergenic Intergenic 154798 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 143.667-125 chr2 31322674 31322824 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 88597 NM_014600 30845 Hs.368808 NM_014600 ENSG00000013016 EHD3 PAST3 EH domain containing 3 protein-coding 162.667-5 chr1 82721811 82722107 + 1 NA Intergenic Intergenic -181224 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 194.333-2 chr1 27785946 27786151 + 1 NA intron (NM_177424, intron 1 of 8) intron (NM_177424, intron 1 of 8) 12829 NM_177424 23673 Hs.523855 NM_177424 ENSG00000117758 STX12 STX13|STX14 syntaxin 12 protein-coding 159.333-251 chr5 9540663 9540898 + 1 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) 5295 NM_003966 9037 Hs.27621 NM_003966 ENSG00000112902 SEMA5A SEMAF|semF semaphorin 5A protein-coding 283.667-32 chr6 87272128 87272610 + 1 NA Intergenic Intergenic -50219 NM_001042493 57150 Hs.70769 NM_020425 ENSG00000111850 SMIM8 C6orf162|dJ102H19.2 small integral membrane protein 8 protein-coding 161.667-154 chr20 14168414 14168693 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1MC2|LINE|L1 169059 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 117.667-6 chr1 145545919 145546122 + 1 NA Intergenic Intergenic 61838 NR_104217 101929780 Hs.534675 NR_104217 ENSG00000272150 NBPF25P WI2-925H4.1 NBPF member 25, pseudogene pseudo 112.333-229 chr6 56818696 56818840 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 24897 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 157.667-345 chr8 135907972 135908256 + 1 NA Intergenic Intergenic 450658 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 122.333-126 chr21 10270969 10271101 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -142485 NM_001187 574 Hs.545789 NM_001187 BAGE BAGE1|CT2.1 B melanoma antigen protein-coding 171.333-197 chr8 119609864 119610153 + 1 NA intron (NM_001330600, intron 8 of 25) intron (NM_001330600, intron 8 of 25) -17000 NR_045555 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 149.667-287 chr4 64976314 64976484 + 1 NA intron (NR_033976, intron 2 of 6) CR1-12_AMi|LINE|CR1 28101 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 150.667-56 chr10 127374732 127374893 + 1 NA intron (NM_001290223, intron 35 of 51) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -174537 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 227.667-49 chr3 88602176 88602443 + 1 NA Intergenic Intergenic 263853 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 278.333-3 chr1 45515667 45516132 + 1 NA intron (NM_181696, intron 2 of 5) intron (NM_181696, intron 2 of 5) 5985 NM_181697 5052 Hs.180909 NM_002574 ENSG00000117450 PRDX1 MSP23|NKEF-A|NKEFA|PAG|PAGA|PAGB|PRX1|PRXI|TDPX2 peroxiredoxin 1 protein-coding 256.333-68 chr6 37076461 37076808 + 1 NA Intergenic Intergenic 70979 NM_173558 221472 Hs.509664 NM_173558 ENSG00000146192 FGD2 ZFYVE4 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 protein-coding 161.333-286 chr8 92598493 92598718 + 1 NA intron (NR_125827, intron 3 of 4) L1PA16|LINE|L1 56889 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 153.667-185 chr2 79072003 79072192 + 1 NA Intergenic Intergenic 15896 NM_006507 5968 Hs.4158 NM_006507 ENSG00000172023 REG1B PSPS2|REGH|REGI-BETA|REGL regenerating family member 1 beta protein-coding 193.333-90 chr2 53915319 53915594 + 1 NA intron (NM_014614, intron 20 of 46) AluJo|SINE|Alu -55423 NM_001164165 100302652 Hs.40763 NM_001164165 ENSG00000270898 GPR75-ASB3 ASB-3|ASB3 GPR75-ASB3 readthrough protein-coding 138.333-158 chr5 130979126 130979282 + 1 NA Intergenic Intergenic 186052 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 338.333-22 chr9 20810737 20811239 + 1 NA intron (NM_017794, intron 13 of 45) intron (NM_017794, intron 13 of 45) 24061 NR_145762 109616992 NR_145762 ENSG00000202189 SNORA30B - small nucleolar RNA, H/ACA box 30B snoRNA 201.333-141 chr2 20314299 20314716 + 1 NA intron (NM_001282752, intron 2 of 19) intron (NM_001282752, intron 2 of 19) 12879 NM_001282791 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 236.333-80 chr6 87288981 87289400 + 1 NA intron (NM_198568, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 -33398 NM_001042493 57150 Hs.70769 NM_020425 ENSG00000111850 SMIM8 C6orf162|dJ102H19.2 small integral membrane protein 8 protein-coding 153.667-212 chr2 218627747 218627900 + 1 NA intron (NM_032726, intron 6 of 15) intron (NM_032726, intron 6 of 15) 19924 NM_032726 84812 Hs.632528 NM_032726 ENSG00000115556 PLCD4 - phospholipase C delta 4 protein-coding 153.333 chr1 19356325 19356543 + 1 NA intron (NM_001206540, intron 6 of 9) intron (NM_001206540, intron 6 of 9) 44108 NM_001040125 54896 Hs.647620 NM_017765 ENSG00000040487 SLC66A1 LAAT-1|LAAT1|PQLC2 solute carrier family 66 member 1 protein-coding 301.667-39 chr7 14990029 14990494 + 1 NA Intergenic (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15403 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 157.333-198 chr2 144276906 144277190 + 1 NA intron (NM_001354354, intron 1 of 12) intron (NM_001354354, intron 1 of 12) 17445 NM_001006636 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 254.333-3 chr10 27476231 27476699 + 1 NA Intergenic Intergenic -27709 NM_001256415 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 192.333-59 chr15 84719804 84720125 + 1 NA Intergenic Intergenic -3504 NM_001271919 23478 Hs.9534 NM_014300 ENSG00000140612 SEC11A 1810012E07Rik|SEC11L1|SPC18|SPCS4A|sid2895 SEC11 homolog A, signal peptidase complex subunit protein-coding 181.667-19 chr11 24402748 24403061 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -94149 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 179.333-24 chr10 56577745 56577984 + 1 NA Intergenic Intergenic -216591 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 148.333-120 chr14 54319822 54320080 + 1 NA Intergenic Intergenic -76917 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 236.667-62 chr5 10024775 10025191 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -121159 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 210.333-76 chr2 66415351 66415680 + 1 NA Intergenic Intergenic 17955 NR_046438 730198 Hs.526753 NR_046438 MEIS1-AS3 - MEIS1 antisense RNA 3 ncRNA 246.667-25 chr13 58165772 58166064 + 1 NA promoter-TSS (NR_120416) promoter-TSS (NR_120416) 91 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 208.333-14 chr10 26958126 26958519 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -16321 NR_026795 387644 Hs.529965 NR_026795 ENSG00000283709 FAM238C C10orf51|LINC00202|LINC00202-1|NCRNA00202|bB27G4.1 family with sequence similarity 238 member C ncRNA 364.667-12 chr5 54729689 54730059 + 1 NA intron (NR_104658, intron 1 of 2) intron (NR_104658, intron 1 of 2) 14384 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 147.667-326 chr6 169720151 169720437 + 1 NA intron (NM_018288, intron 2 of 11) L1MB3|LINE|L1 3716 NM_133325 55274 Hs.435933 NM_018288 ENSG00000130024 PHF10 BAF45A|XAP135 PHD finger protein 10 protein-coding 146.667-6 chr1 48371261 48371446 + 1 NA intron (NM_019073, intron 9 of 12) L1MEd|LINE|L1 100851 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 133.667-127 chr6 26183414 26183581 + 1 NA promoter-TSS (NM_003523) promoter-TSS (NM_003523) -299 NM_003523 8344 Hs.534369 NM_003523 ENSG00000274290 HIST1H2BE H2B.h|H2B/h|H2BFH|dJ221C16.8 histone cluster 1 H2B family member e protein-coding 152.667-106 chr14 56134340 56134595 + 1 NA intron (NM_021255, intron 1 of 5) intron (NM_021255, intron 1 of 5) 16056 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 165.333-208 chr5 68591658 68591977 + 1 NA Intergenic Intergenic 299240 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 158.333-199 chr3 36203165 36203385 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -177212 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 232.333-71 chr5 157515549 157516003 + 1 NA intron (NM_033274, intron 7 of 22) intron (NM_033274, intron 7 of 22) -55676 NR_136204 102724404 Hs.570889 NR_136204 LOC102724404 - uncharacterized LOC102724404 ncRNA 154.333-35 chr10 65725525 65725806 + 1 NA intron (NR_120647, intron 4 of 5) intron (NR_120647, intron 4 of 5) 154240 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 315.333-27 chr20 20002416 20003016 + 1 NA TTS (NM_018993) TTS (NM_018993) -14574 NM_181528 51126 Hs.368783 NM_016100 ENSG00000173418 NAA20 NAT3|NAT3P|NAT5|NAT5P|dJ1002M8.1 N(alpha)-acetyltransferase 20, NatB catalytic subunit protein-coding 264.667-18 chr11 91295118 91295538 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -426126 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 289.333-46 chr4 181899002 181899405 + 1 NA Intergenic Intergenic -69230 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 111.667-223 chr6 69993927 69994128 + 1 NA intron (NM_001858, intron 11 of 50) L1PA15|LINE|L1 127471 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 153.333-231 chr2 231568775 231569066 + 1 NA Intergenic Intergenic -23944 NM_152614 165100 Hs.98104 NM_152614 ENSG00000177673 TEX44 C2orf57 testis expressed 44 protein-coding 161.333-223 chr4 147282238 147282402 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 62397 NR_031662 100313938 NR_031662 ENSG00000221369 MIR548G MIRN548G|hsa-mir-548g microRNA 548g ncRNA 175.667-33 chr13 87875562 87875923 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -65222 NR_104059 101930749 Hs.539610 NR_104059 ENSG00000223404 LINC00397 - long intergenic non-protein coding RNA 397 ncRNA 189.333-140 chr3 197106468 197106831 + 1 NA intron (NM_001366216, intron 12 of 23) intron (NM_001366216, intron 12 of 23) -76832 NM_033316 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 150.333-390 chr7 116899095 116899294 + 1 NA intron (NM_006136, intron 4 of 9) intron (NM_006136, intron 4 of 9) 36607 NM_006136 830 Hs.446123 NM_006136 ENSG00000198898 CAPZA2 CAPPA2|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 2 protein-coding 200.333-58 chr17 72454823 72455154 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) MER1A|DNA|hAT-Charlie 112177 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 164.333-95 chr17 71271812 71272052 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -69753 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 152.333-155 chr18 631860 632053 + 1 NA intron (NM_199167, intron 5 of 8) intron (NM_199167, intron 5 of 8) 15256 NM_199167 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 261.667-34 chr2 45835702 45836245 + 1 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) L1ME1|LINE|L1 184298 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 194.667-61 chr2 30638673 30639124 + 1 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) intron (NM_182551, intron 6 of 6) 168548 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 163.667-82 chr16 86245346 86245572 + 1 NA intron (NR_104139, intron 3 of 5) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 40788 NR_104139 101154687 Hs.640512 NR_104139 LINC01081 TCONS00024764|TCONS_00024764 long intergenic non-protein coding RNA 1081 ncRNA 117.667-8 chr1 147395247 147395426 + 1 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) L1MD1|LINE|L1 122539 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 155.667-318 chr7 3349787 3350147 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 48715 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 256.333-88 chr9 31575295 31575612 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -193963 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 261.333-45 chr2 55163452 55163906 + 1 NA Intergenic Intergenic -25848 NM_001321904 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 164.333-63 chr13 87759148 87759424 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 51234 NR_104059 101930749 Hs.539610 NR_104059 ENSG00000223404 LINC00397 - long intergenic non-protein coding RNA 397 ncRNA 130.667-187 chr7 84796761 84796993 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 264401 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 169.333-159 chr3 56829486 56829681 + 1 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) intron (NM_001128615, intron 4 of 12) -27634 NM_019555 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 248.333-57 chr22 24902403 24902698 + 1 NA intron (NM_001098498, intron 19 of 23) AluJr4|SINE|Alu 44145 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 130.667-179 chr6 77191637 77191870 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 272269 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 141.667-89 chr16 59972483 59972730 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 117253 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 152.333-30 chr1 205571578 205571822 + 1 NA intron (NM_181644, intron 1 of 9) intron (NM_181644, intron 1 of 9) -2395 NR_027086 284578 Hs.537020 NR_027086 MFSD4A-AS1 - MFSD4A antisense RNA 1 ncRNA 167.333-188 chr4 66352250 66352538 + 1 NA Intergenic Intergenic 75570 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 165.667-132 chr3 186411173 186411398 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -29060 NR_151710 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 227.667-35 chr2 133118380 133118721 + 1 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) L2c|LINE|L2 -147645 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 179.667-21 chr10 84094002 84094357 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -45330 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 174.667-81 chr2 50925538 50925757 + 1 NA intron (NM_001330088, intron 2 of 17) intron (NM_001330088, intron 2 of 17) 106485 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 155.333-130 chr16 78851096 78851384 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) MamRep605|LTR?|LTR? 749497 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 176.333-155 chr7 38535726 38536011 + 1 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) MER1A|DNA|hAT-Charlie 95505 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 148.333-383 chr8 85231932 85232140 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -11614 NM_001099672 401466 Hs.443072 NM_001099670 ENSG00000176731 RBIS C8orf59 ribosomal biogenesis factor protein-coding 113.333-61 chr12 48263398 48263620 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -60217 NM_001004134 121275 Hs.446790 NM_001004134 ENSG00000172640 OR10AD1 OR10AD1P|OR12-1 olfactory receptor family 10 subfamily AD member 1 protein-coding 260.667-98 chr9 87499599 87500135 + 1 NA intron (NM_004938, intron 2 of 25) intron (NM_004938, intron 2 of 25) 1332 NM_001288729 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 132.667-118 chr4 30601523 30601742 + 1 NA Intergenic Intergenic -118737 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 118.667-65 chr14 20406241 20406380 + 1 NA exon (NM_007110, exon 3 of 55) exon (NM_007110, exon 3 of 55) 7191 NM_001319035 7011 Hs.508835 NM_007110 ENSG00000129566 TEP1 TLP1|TP1|TROVE1|VAULT2|p240 telomerase associated protein 1 protein-coding 142.333-10 chr1 147573775 147573947 + 1 NA intron (NM_004326, intron 1 of 9) MIR3|SINE|MIR 32360 NM_004326 607 Hs.415209 NM_004326 ENSG00000116128 BCL9 LGS BCL9 transcription coactivator protein-coding 148.333-231 chr20 54801171 54801358 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 325671 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 169.667-62 chr14 62543458 62543721 + 1 NA Intergenic Intergenic -403616 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 171.667-54 chr15 48793056 48793364 + 1 NA intron (NM_014985, intron 7 of 25) MIR3|SINE|MIR 17859 NM_014985 22995 Hs.443005 NM_014985 ENSG00000103995 CEP152 MCPH4|MCPH9|SCKL5 centrosomal protein 152 protein-coding 197.667-33 chr12 11586512 11586733 + 1 NA Intergenic Intergenic 38592 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 198.667-41 chr11 116953850 116954213 + 1 NA intron (NM_001281748, intron 3 of 24) intron (NM_001281748, intron 3 of 24) -116081 NM_001318021 335 Hs.93194 NM_000039 ENSG00000118137 APOA1 apo(a) apolipoprotein A1 protein-coding 180.667-59 chr2 17917485 17917699 + 1 NA intron (NM_002252, intron 1 of 2) intron (NM_002252, intron 1 of 2) 38925 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 155.667-279 chr5 74808154 74808428 + 1 NA intron (NM_015566, intron 6 of 12) L1MB4|LINE|L1 -40920 NM_170681 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 293.333-61 chr8 50280282 50280634 + 1 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) MER4D|LTR|ERV1 116327 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 159.667-340 chr9 84486614 84486880 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -118020 NM_022127 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 207.667-25 chr12 51135226 51135528 + 1 NA intron (NM_005653, intron 1 of 14) AluSx1|SINE|Alu 37758 NM_005653 7024 Hs.48849 NM_005653 ENSG00000135457 TFCP2 LBP1C|LSF|LSF1D|SEF|TFCP2C transcription factor CP2 protein-coding 149.333-366 chr7 34730428 34730651 + 1 NA intron (NR_015356, intron 2 of 4) LTR55|LTR|ERVL? 27733 NR_033664 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 138.333-136 chr4 70820680 70820876 + 1 NA 3' UTR (NM_002092, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_002092, exon 10 of 10) 18725 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 153.667-377 chr8 71521469 71521696 + 1 NA intron (NM_001370334, intron 2 of 19) intron (NM_001370334, intron 2 of 19) 26122 NM_001370334 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 273.333-25 chr17 54717367 54717783 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -183116 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 154.333-138 chr19 43321665 43321852 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -27298 NR_026881 23574 Hs.721578 NR_026881 PRG1 - p53-responsive gene 1 ncRNA 121.333-131 chr4 46606484 46606646 + 1 NA Intergenic Intergenic -216437 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 199.667-42 chr14 58406366 58406670 + 1 NA intron (NM_207377, intron 3 of 4) intron (NM_207377, intron 3 of 4) 10588 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 158.667-120 chr16 86448394 86448617 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 60355 NR_036444 400550 Hs.448825 NR_033925 ENSG00000268388 FENDRR FOXF1-AS1|FOXF1AS1|TCONS_00024240|lincFOXF1|onco-lncRNA-21 FOXF1 adjacent non-coding developmental regulatory RNA ncRNA 177.667-54 chr15 69042439 69042650 + 1 NA intron (NM_024505, intron 9 of 15) intron (NM_024505, intron 9 of 15) 27849 NM_024505 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 137.333-104 chr2 156750203 156750390 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 313917 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 157.667-124 chr17 71444081 71444343 + 1 NA Intergenic Intergenic -242033 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 120.667-170 chr8 30271653 30271843 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -112753 NM_001008712 11030 Hs.334587 NM_006867 ENSG00000157110 RBPMS HERMES RNA binding protein, mRNA processing factor protein-coding 164.333-68 chr14 78482754 78482925 + 1 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 79120 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 300.333-52 chrX 42242281 42242878 + 1 NA Intergenic Intergenic -319025 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 214.333-86 chr20 45487942 45488369 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 18402 NM_006103 10406 Hs.2719 NM_006103 ENSG00000101443 WFDC2 EDDM4|HE4|WAP5|dJ461P17.6 WAP four-disulfide core domain 2 protein-coding 163.333-184 chr3 107294761 107295059 + 1 NA intron (NR_028302, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 54218 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 156.333-211 chr20 50724448 50724751 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6981 NM_032521 84612 Hs.589848 NM_032521 ENSG00000124171 PARD6B PAR6B par-6 family cell polarity regulator beta protein-coding 179.333-161 chr5 178570331 178570630 + 1 NA intron (NM_173465, intron 1 of 28) intron (NM_173465, intron 1 of 28) 19913 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 212.667-40 chr14 71116329 71116742 + 1 NA Intergenic Intergenic -203941 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 229.333-112 chr6 151506303 151506620 + 1 NA intron (NM_025059, intron 1 of 10) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 12444 NM_025059 80129 Hs.660044 NM_025059 ENSG00000120262 CCDC170 C6orf97|bA282P11.1 coiled-coil domain containing 170 protein-coding 160.667-249 chr5 109717993 109718317 + 1 NA intron (NM_002372, intron 3 of 21) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 28789 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 128.333-94 chr2 39255373 39255600 + 1 NA intron (NM_003618, intron 31 of 33) L1M5|LINE|L1 -11503 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 151.667-348 chr7 121208299 121208525 + 1 NA intron (NM_001105533, intron 15 of 17) MIRb|SINE|MIR -116955 NM_016087 51384 Hs.272375 NM_016087 ENSG00000002745 WNT16 - Wnt family member 16 protein-coding 150.333-327 chr5 64307845 64308049 + 1 NA intron (NM_001113561, intron 5 of 7) intron (NM_001113561, intron 5 of 7) 142104 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 196.667-161 chr8 100193108 100193438 + 1 NA intron (NM_003114, intron 9 of 18) AluJb|SINE|Alu 34938 NM_003114 6674 Hs.591866 NM_003114 ENSG00000104450 SPAG1 CILD28|CT140|HEL-S-268|HSD-3.8|SP75|TPIS sperm associated antigen 1 protein-coding 152.333-43 chr10 45543198 45543359 + 1 NA intron (NM_145021, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 -7907 NM_001002266 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 154.333-326 chr7 69052909 69053157 + 1 NA Intergenic Intergenic 544591 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 145.333-246 chr5 151617389 151617654 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -48577 NM_001447 2196 Hs.591255 NM_001447 ENSG00000086570 FAT2 CDHF8|CDHR9|HFAT2|MEGF1|SCA45 FAT atypical cadherin 2 protein-coding 140.667-195 chr6 41536430 41536679 + 1 NA intron (NR_126415, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 9689 NR_126417 101060264 Hs.571099 NR_126415 ENSG00000234753 FOXP4-AS1 - FOXP4 antisense RNA 1 ncRNA 201.667-88 chr5 11100160 11100476 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 13 of 20) intron (NM_001288715, intron 13 of 20) -339084 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 286.333-25 chr21 31866059 31866440 + 1 NA Intergenic Intergenic -6771 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 172.667-92 chr20 49663065 49663304 + 1 NA intron (NM_004776, intron 1 of 8) L1ME3A|LINE|L1 50694 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 142.333-201 chr5 119488220 119488393 + 1 NA intron (NM_001199291, intron 9 of 24) MIRc|SINE|MIR 35809 NM_001292028 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 369.667 chr1 113440279 113440882 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) L2c|LINE|L2 50065 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 264.333-10 chr10 119289150 119289744 + 1 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) intron (NM_005308, intron 1 of 15) 81876 NM_005308 2869 Hs.524625 NM_005308 ENSG00000198873 GRK5 FP2025|GPRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 protein-coding 200.333-154 chr8 83699671 83699987 + 1 NA Intergenic Intergenic 296071 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 223.667-51 chr3 142342242 142342668 + 1 NA intron (NM_019001, intron 33 of 41) L1MA3|LINE|L1 105582 NM_019001 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 185.667-121 chr7 118242911 118243223 + 1 NA TTS (NM_019644) TTS (NM_019644) 18363 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 151.333-320 chr4 115022503 115022763 + 1 NA intron (NM_022569, intron 2 of 13) L1PB1|LINE|L1 90987 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 167.667-45 chr12 41892852 41893064 + 1 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger 128769 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 196.333-102 chr22 44086533 44086902 + 1 NA intron (NM_001243385, intron 1 of 12) intron (NM_001243385, intron 1 of 12) 17600 NM_001243385 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 151.333-362 chr6 70151089 70151389 + 1 NA intron (NM_001858, intron 30 of 50) intron (NM_001858, intron 30 of 50) 131958 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 191.333-58 chr14 53422623 53423007 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 269461 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 146.667-118 chr15 94916902 94917070 + 1 NA Intergenic Intergenic 61623 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 152.667-146 chr18 8317673 8317952 + 1 NA intron (NM_002845, intron 19 of 30) intron (NM_002845, intron 19 of 30) 49222 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 211.667-75 chr22 43998518 43998857 + 1 NA promoter-TSS (NM_001003828) promoter-TSS (NM_001003828) -524 NM_001003828 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 155.667-387 chr9 79723485 79723655 + 1 NA intron (NM_001351563, intron 17 of 17) intron (NM_001351563, intron 17 of 17) -100960 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 245.333-68 chr2 173541328 173541619 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 186601 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 223.667-14 chr10 108161358 108161711 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -92241 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 148.333-4 chr1 51369588 51369775 + 1 NA intron (NM_001159969, intron 9 of 12) intron (NM_001159969, intron 9 of 12) -24565 NM_001144832 22996 Hs.112949 NM_001080494 ENSG00000085831 TTC39A C1orf34|DEME-6 tetratricopeptide repeat domain 39A protein-coding 157.667-34 chr10 65129325 65129518 + 1 NA Intergenic Intergenic -204903 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 151.667-119 chr14 87602061 87602216 + 1 NA Intergenic Intergenic 53156 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 238.333-57 chr22 33540096 33540587 + 1 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) intron (NM_133642, intron 6 of 14) -103672 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 179.667-82 chr2 240964003 240964256 + 1 NA non-coding (NR_033841, exon 2 of 9) non-coding (NR_033841, exon 2 of 9) 3322 NR_033841 200772 Hs.647893 NR_033841 ENSG00000233392 LOC200772 - uncharacterized LOC200772 ncRNA 156.333-179 chr2 68129787 68129980 + 1 NA TTS (NM_138458) TTS (NM_138458) 27644 NR_046234 116143 Hs.631877 NM_138458 ENSG00000243667 WDR92 - WD repeat domain 92 protein-coding 261.333-3 chr1 42542886 42543309 + 1 NA intron (NM_001080850, intron 4 of 16) AluSx3|SINE|Alu 10077 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 250.333-19 chr12 110235197 110235569 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -45864 NM_001681 488 Hs.506759 NM_001681 ENSG00000174437 ATP2A2 ATP2B|DAR|DD|SERCA2 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 2 protein-coding 156.333-40 chr10 64994432 64994629 + 1 NA Intergenic Intergenic -70012 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 124.333-15 chr1 238283993 238284150 + 1 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 201946 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 134.333-132 chr4 111546105 111546345 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -599229 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 220.333-14 chr10 31648234 31648525 + 1 NA Intergenic Intergenic -248624 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 153.333-190 chr2 38277698 38277887 + 1 NA Intergenic LTR5_Hs|LTR|ERVK 98738 NM_001330459 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 181.667-143 chr8 60955371 60955687 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 12219 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 147.667-102 chr14 57995070 57995305 + 1 NA Intergenic Intergenic -129095 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 141.333-166 chr4 15589228 15589376 + 1 NA intron (NM_001080522, intron 33 of 37) intron (NM_001080522, intron 33 of 37) 66055 NM_012161 26234 Hs.643433 NM_012161 ENSG00000118564 FBXL5 FBL4|FBL5|FLR1 F-box and leucine rich repeat protein 5 protein-coding 118.333-209 chr8 126571765 126571917 + 1 NA Intergenic Intergenic -13363 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 148.333-71 chr11 63534443 63534719 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -2227 NM_004585 5920 Hs.17466 NM_004585 ENSG00000133321 PLAAT4 HRASLS4|HRSL4|PLA1/2-3|PLAAT-4|RARRES3|RIG1|TIG3 phospholipase A and acyltransferase 4 protein-coding 151.667-73 chr11 112161232 112161446 + 1 NA intron (NM_001243211, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR 2755 NM_001243211 3606 Hs.83077 NM_001562 ENSG00000150782 IL18 IGIF|IL-18|IL-1g|IL1F4 interleukin 18 protein-coding 127.333-41 chr12 128477998 128478243 + 1 NA intron (NM_001136103, intron 2 of 8) intron (NM_001136103, intron 2 of 8) 184028 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 156.333-206 chr20 41853732 41853904 + 1 NA Intergenic Intergenic -235441 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 167.333-114 chr18 1662791 1663118 + 1 NA Intergenic Intergenic -303325 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 170.667-165 chr8 101020779 101021004 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -31163 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 251.667-59 chr3 37992547 37992933 + 1 NA promoter-TSS (NM_015873) promoter-TSS (NM_015873) -847 NM_015873 50853 Hs.103665 NM_015873 ENSG00000136059 VILL - villin like protein-coding 145.667-293 chr8 118039691 118039877 + 1 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 72035 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 214.667-61 chr2 36999744 37000112 + 1 NA intron (NM_019024, intron 33 of 35) AluSx1|SINE|Alu -33392 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 147.667-289 chr5 100242925 100243191 + 1 NA Intergenic MLT1F1-int|LTR|ERVL-MaLR 145196 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 176.667-85 chr2 212208557 212208854 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 217655 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 185.667-70 chr2 118125628 118125884 + 1 NA Intergenic Intergenic 37206 NM_001321332 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 262.333-53 chr21 28583596 28584039 + 1 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 44499 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 154.333-361 chr8 137586670 137586943 + 1 NA Intergenic Intergenic -173218 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 234.333-54 chr4 47157278 47157725 + 1 NA intron (NM_000812, intron 3 of 8) intron (NM_000812, intron 3 of 8) 125934 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 152.667-373 chr8 80589809 80589976 + 1 NA Intergenic Intergenic 103666 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 164.333-26 chr10 63769451 63769621 + 1 NA Intergenic Intergenic -247646 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 190.333-31 chr11 79656076 79656335 + 1 NA Intergenic Intergenic -215175 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 182.333-82 chr2 71279243 71279487 + 1 NA Intergenic Intergenic -52262 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 123.667-189 chr8 135808768 135808971 + 1 NA Intergenic Intergenic 351413 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 233.333-129 chr8 78719311 78719583 + 1 NA non-coding (NR_156423, exon 11 of 11) non-coding (NR_156423, exon 11 of 11) 4927 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 189.667-101 chr3 176908138 176908374 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -91255 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 150.333-302 chr4 69907286 69907499 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -23676 NM_001890 1446 Hs.3155 NM_001890 ENSG00000126545 CSN1S1 CASA|CSN1 casein alpha s1 protein-coding 156.333-271 chr4 106687071 106687371 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 253597 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 145.667-208 chr5 40878803 40879026 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -30583 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 158.667-88 chr13 80887687 80887852 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -130622 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 150.333-5 chr1 61327458 61327730 + 1 NA intron (NM_001134673, intron 3 of 10) L1PB3|LINE|L1 -74076 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 168.333-140 chr4 26400257 26400445 + 1 NA intron (NM_203284, intron 3 of 11) MER20|DNA|hAT-Charlie 79123 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 204.667-157 chr9 69697110 69697387 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -24877 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 149.667-206 chr2 99649260 99649495 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 12 of 23) intron (NM_001025108, intron 12 of 23) -159360 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 147.667-40 chr10 59718885 59719122 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8924 NM_001323977 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 320.333-26 chr7 21951143 21951636 + 1 NA Intergenic Intergenic -5490 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 119.667-119 chr3 97410245 97410439 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 6 of 17) intron (NM_001080448, intron 6 of 17) -29265 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 146.667-326 chr8 42663421 42663609 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -33851 NM_000749 1142 Hs.654576 NM_000749 ENSG00000147432 CHRNB3 - cholinergic receptor nicotinic beta 3 subunit protein-coding 171.667-42 chr12 126564929 126565114 + 1 NA Intergenic Intergenic -115694 NR_147498 283435 Hs.667334 NR_147498 LINC02825 - long intergenic non-protein coding RNA 2825 ncRNA 235.667-13 chr12 41076607 41076882 + 1 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 -111576 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 148.333-105 chr12 115647103 115647313 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 501446 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 239.333-31 chr14 35408158 35408441 + 1 NA Intergenic Intergenic -3545 NM_020529 4792 Hs.81328 NM_020529 ENSG00000100906 NFKBIA EDAID2|IKBA|MAD-3|NFKBI NFKB inhibitor alpha protein-coding 261.667-12 chr12 49779106 49779407 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 37447 NM_001098576 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 138.667-209 chr8 122602080 122602251 + 1 NA Intergenic Intergenic -33521 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 171.333-180 chr7 40323590 40323765 + 1 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) AluJr|SINE|Alu 188701 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 157.333-179 chr2 54732407 54732693 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) L1M4|LINE|L1 7538 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 339.667-3 chr10 54506733 54507275 + 1 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) intron (NR_134503, intron 1 of 5) 20774 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 153.333-235 chr20 5589275 5589442 + 1 NA intron (NM_019593, intron 4 of 19) AluSp|SINE|Alu 21648 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 191.333-172 chr6 38025815 38026047 + 1 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) L1MB8|LINE|L1 206204 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 291.333-10 chr10 105417386 105417818 + 1 NA Intergenic Intergenic 402731 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 116.667-192 chr7 99523884 99524078 + 1 NA intron (NM_145102, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR 17976 NM_001318084 23660 Hs.110839 NM_014569 ENSG00000196652 ZKSCAN5 ZFP-95|ZFP95|ZNF914|ZSCAN37 zinc finger with KRAB and SCAN domains 5 protein-coding 172.333-7 chr1 208886930 208887144 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -85417 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 126.667-85 chr2 151713020 151713177 + 1 NA intron (NM_001271208, intron 10 of 182) intron (NM_001271208, intron 10 of 182) 21378 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 160.667-129 chr18 6976957 6977146 + 1 NA intron (NM_005559, intron 44 of 62) intron (NM_005559, intron 44 of 62) 22374 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 151.333-12 chr1 76095873 76096061 + 1 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 21221 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 128.333-100 chr2 62932943 62933167 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 10 of 22) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 114656 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 192.333-15 chr10 54275545 54275831 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 8 of 34) intron (NM_001354411, intron 8 of 34) -210542 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 215.333-80 chr18 74868528 74868809 + 1 NA intron (NM_017757, intron 3 of 7) intron (NM_017757, intron 3 of 7) 237705 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 151.667-305 chr6 19657995 19658186 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 146669 NR_134649 100506885 Hs.346489 NR_134649 ENSG00000228412 LOC100506885 - uncharacterized LOC100506885 ncRNA 177.667-15 chr1 237601367 237601710 + 1 NA intron (NM_001035, intron 34 of 104) L1MA6|LINE|L1 130419 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 162.333-41 chr11 47488645 47488813 + 1 NA intron (NM_198700, intron 2 of 13) intron (NM_198700, intron 2 of 13) 295 NM_001172640 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 213.333-25 chr10 30868462 30868933 + 1 NA intron (NM_001143771, intron 5 of 7) intron (NM_001143771, intron 5 of 7) 130820 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 151.333-414 chr8 77739925 77740125 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 289328 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 144.667-169 chr20 41086871 41087136 + 1 NA intron (NM_003286, intron 8 of 20) intron (NM_003286, intron 8 of 20) -50540 NM_002660 5335 Hs.268177 NM_002660 ENSG00000124181 PLCG1 NCKAP3|PLC-II|PLC1|PLC148|PLCgamma1 phospholipase C gamma 1 protein-coding 176.667-136 chr7 52776082 52776271 + 1 NA Intergenic Intergenic -259457 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 143.333-197 chr4 36993753 36993999 + 1 NA Intergenic Intergenic -7903 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 151.333-21 chr1 119792206 119792413 + 1 NA Intergenic Intergenic 19151 NM_001159353 83998 Hs.660883 NM_032044 ENSG00000134193 REG4 GISP|REG-IV|RELP regenerating family member 4 protein-coding 157.667-234 chr5 20437902 20438105 + 1 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 132452 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-203 chr4 30469404 30469610 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -250862 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 147.333-20 chr1 151489365 151489591 + 1 NA Intergenic Intergenic -21909 NM_020770 57530 Hs.591464 NM_020770 ENSG00000143375 CGN - cingulin protein-coding 115.333-190 chr6 116800414 116800615 + 1 NA intron (NM_001286355, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 28543 NM_148963 222545 Hs.266745 NM_148963 ENSG00000173612 GPRC6A GPCR|bA86F4.3 G protein-coupled receptor class C group 6 member A protein-coding 183.667-141 chr8 110346414 110346751 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -370811 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 238.667-3 chr1 185039151 185039547 + 1 NA Intergenic Intergenic -6209 NM_007212 6045 Hs.591490 NM_007212 ENSG00000121481 RNF2 BAP-1|BAP1|DING|HIPI3|RING1B|RING2 ring finger protein 2 protein-coding 118.667-193 chr8 101455933 101456079 + 1 NA Intergenic Intergenic -36433 NM_024915 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 131.333-21 chr10 18729939 18730096 + 1 NA Intergenic Intergenic 70586 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 171.333-202 chr9 73523497 73523838 + 1 NA Intergenic Intergenic 371802 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 172.333-107 chr3 37395080 37395265 + 1 NA intron (NM_178344, intron 1 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -4305 NR_126512 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 176.667-98 chr3 28139998 28140291 + 1 NA Intergenic Intergenic -101475 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 181.333-77 chr2 119171835 119172128 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -13230 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 142.333-198 chr5 63146053 63146375 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 567395 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 236.333-67 chr4 51822387 51822780 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -20417 NM_001287757 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 156.333-184 chr2 99819662 99819941 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 7 of 23) intron (NM_001025108, intron 7 of 23) 285782 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 179.667-33 chr12 8799490 8799856 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -22948 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 166.333-103 chr2 18268655 18268863 + 1 NA Intergenic Intergenic 291894 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 224.667-9 chr10 118293397 118293780 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 48736 NM_001134672 63877 Hs.105575 NM_022063 ENSG00000165669 FAM204A C10orf84|bA319I23.1 family with sequence similarity 204 member A protein-coding 174.333-39 chr14 48660247 48660480 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -865349 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 249.333-15 chr10 34182761 34183216 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -410308 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 137.333-154 chr5 60639191 60639455 + 1 NA intron (NM_001145208, intron 6 of 9) intron (NM_001145208, intron 6 of 9) 60843 NM_018369 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 160.667-121 chr17 51052268 51052564 + 1 NA intron (NM_001130527, intron 3 of 29) intron (NM_001130527, intron 3 of 29) -5538 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 339.333-46 chr7 117626002 117626411 + 1 NA intron (NM_000492, intron 21 of 26) intron (NM_000492, intron 21 of 26) -61530 NR_149084 111082987 Hs.583149 NR_149084 ENSG00000232661 CFTR-AS1 BGas CFTR antisense RNA 1 ncRNA 216.667-94 chr6 40825416 40825663 + 1 NA Intergenic Intergenic 197741 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 244.333-68 chr22 28478775 28479195 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L2a|LINE|L2 19116 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 179.667-64 chr17 42203371 42203627 + 1 NA intron (NM_012448, intron 16 of 18) L3|LINE|CR1 -9005 NM_001142623 84514 Hs.38039 NM_032484 ENSG00000167925 GHDC D11LGP1|LGP1 GH3 domain containing protein-coding 256.333-19 chr11 66434053 66434362 + 1 NA TTS (NR_120588) TTS (NR_120588) 4641 NM_170738 65003 Hs.418450 NM_016050 ENSG00000174547 MRPL11 CGI-113|L11MT|MRP-L11 mitochondrial ribosomal protein L11 protein-coding 145.333-187 chr3 70665341 70665509 + 1 NA Intergenic Intergenic -352787 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 243.667-81 chrX 83308967 83309382 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -199116 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 149.333-23 chr1 155923609 155923878 + 1 NA intron (NM_014949, intron 7 of 13) intron (NM_014949, intron 7 of 13) 2343 NR_003005 677771 Hs.678903 NR_003005 ENSG00000281394 SCARNA4 ACA26 small Cajal body-specific RNA 4 ncRNA 317.333-48 chr9 129361711 129362105 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 24985 NR_120686 100506119 Hs.624047 NR_120685 ENSG00000233901 LINC01503 - long intergenic non-protein coding RNA 1503 ncRNA 112.667-192 chr4 71100491 71100677 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -86675 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 145.667-247 chr6 66316210 66316397 + 1 NA Intergenic Intergenic 528424 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 193.667-61 chr2 138054793 138055069 + 1 NA Intergenic Intergenic -46953 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 195.333-94 chr16 85952919 85953220 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 34722 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 259.333-90 chr6 157636899 157637471 + 1 NA intron (NM_024630, intron 5 of 8) intron (NM_024630, intron 5 of 8) 108053 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 150.667-60 chr11 12800040 12800200 + 1 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 125699 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 154.667-359 chr7 14414713 14414896 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -423379 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 129.333-12 chr1 244588524 244588695 + 1 NA intron (NM_001130957, intron 14 of 21) intron (NM_001130957, intron 14 of 21) -64439 NR_123736 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 192.667-158 chr7 43699300 43699711 + 1 NA intron (NR_163914, intron 1 of 8) intron (NR_163914, intron 1 of 8) 30018 NM_001371317 282.667-26 chr21 35005176 35005775 + 1 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) intron (NM_001754, intron 2 of 8) 33951 NR_026812 80215 Hs.672131 NM_025143 RUNX1-IT1 C21orf96 RUNX1 intronic transcript 1 ncRNA 179.333-27 chr10 94361215 94361507 + 1 NA intron (NM_022451, intron 2 of 20) intron (NM_022451, intron 2 of 20) 1578 NM_022451 64318 Hs.74899 NM_022451 ENSG00000173145 NOC3L AD24|C10orf117|FAD24 NOC3 like DNA replication regulator protein-coding 230.333-82 chr4 12400881 12401277 + 1 NA Intergenic Intergenic 177628 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 137.667-93 chr2 55968664 55968982 + 1 NA intron (NR_126406, intron 2 of 2) intron (NR_126406, intron 2 of 2) 14253 NR_029630 406999 NR_029630 ENSG00000207548 MIR217 MIRN217|mir-217 microRNA 217 ncRNA 156.667-98 chr14 40090489 40090654 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -658071 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 190.333-57 chr17 44596310 44596576 + 1 NA Intergenic Intergenic 38959 NM_001466 2535 Hs.142912 NM_001466 ENSG00000180340 FZD2 Fz2|OMOD2|fz-2|fzE2|hFz2 frizzled class receptor 2 protein-coding 248.333-94 chr7 27257964 27258527 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -11016 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 262.333-2 chr1 66670302 66670754 + 1 NA intron (NM_001350218, intron 8 of 22) intron (NM_001350218, intron 8 of 22) 42088 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 153.667-67 chr11 46806635 46806834 + 1 NA intron (NM_001008938, intron 8 of 43) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 39546 NM_001008938 9793 Hs.201253 NM_014756 ENSG00000175216 CKAP5 CHTOG|MSPS|TOG|TOGp|ch-TOG cytoskeleton associated protein 5 protein-coding 159.333-356 chr9 103199238 103199413 + 1 NA intron (NR_121578, intron 7 of 9) intron (NR_121578, intron 7 of 9) 125708 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 168.333-48 chr12 92121714 92122006 + 1 NA intron (NR_132341, intron 1 of 4) intron (NR_132341, intron 1 of 4) 19853 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 204.667-51 chr15 50545189 50545542 + 1 NA intron (NM_203494, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 1301 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 296.333-3 chr1 115164759 115165114 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -75433 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 179.333-37 chr11 43445356 43445661 + 1 NA intron (NM_018259, intron 18 of 23) L1ME4a|LINE|L1 86588 NM_018259 55761 Hs.191186 NM_018259 ENSG00000052841 TTC17 - tetratricopeptide repeat domain 17 protein-coding 249.667-21 chr12 17170150 17170608 + 1 NA Intergenic Intergenic 181632 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 178.667-157 chr7 141365865 141366171 + 1 NA intron (NM_001195278, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR -185392 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 112.667-17 chr1 175027907 175028141 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4569 NR_037606 63931 Hs.654858 NM_022100 ENSG00000120333 MRPS14 COXPD38|DJ262D12.2|HSMRPS14|MRP-S14|S14mt mitochondrial ribosomal protein S14 protein-coding 135.667-11 chr1 216093836 216094072 + 1 NA intron (NM_206933, intron 22 of 71) MIRc|SINE|MIR 21489 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 152.667-380 chr8 102631953 102632184 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 21896 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 117.667-104 chr2 175791218 175791382 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 210967 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 153.667-53 chr10 115270971 115271137 + 1 NA intron (NM_207303, intron 13 of 28) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 177689 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 192.667-177 chr8 125210075 125210431 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) MIR|SINE|MIR 118393 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 209.667-32 chr12 23227680 23227916 + 1 NA Intergenic Intergenic 52162 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 152.667-342 chr7 69315801 69315995 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 281726 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 189.667-98 chr3 95553132 95553570 + 1 NA Intergenic Intergenic 129842 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 181.333-84 chr2 186637563 186637817 + 1 NA intron (NM_001145000, intron 6 of 27) intron (NM_001145000, intron 6 of 27) 37485 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 164.667-151 chr3 169043499 169043839 + 1 NA Intergenic Intergenic 101854 NM_001366472 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 154.667-147 chr18 2594651 2594834 + 1 NA intron (NM_006101, intron 10 of 16) intron (NM_006101, intron 10 of 16) 23185 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 157.667-85 chr12 112201447 112201612 + 1 NA intron (NM_001109662, intron 54 of 75) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -38208 NR_106921 102465519 NR_106921 ENSG00000283793 MIR6861 hsa-mir-6861 microRNA 6861 ncRNA 138.333-152 chr5 88426891 88427096 + 1 NA intron (NR_105021, intron 4 of 5) intron (NR_105021, intron 4 of 5) 12097 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 126.667-93 chr20 31418007 31418318 + 1 NA Intergenic AluYa5|SINE|Alu -5324 NM_001171832 245934 Hs.272294 NM_001011878 ENSG00000204548 DEFB121 DEFB21|ESC42RELC defensin beta 121 protein-coding 204.333-148 chr4 172910706 172911090 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 8 of 12) intron (NM_001034845, intron 8 of 12) -184020 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 198.667-114 chr2 227924059 227924433 + 1 NA TTS (NM_001330004) TTS (NM_001330004) 52615 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 140.667-22 chr1 186958963 186959119 + 1 NA intron (NM_024420, intron 14 of 17) intron (NM_024420, intron 14 of 17) 130092 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 148.333-24 chr1 118442500 118442677 + 1 NA Intergenic Intergenic -257360 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 172.333-105 chr3 1158034 1158290 + 1 NA intron (NM_001289080, intron 2 of 22) L1MA2|LINE|L1 65138 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 325.667-17 chr3 32601556 32602089 + 1 NA Intergenic Intergenic -30898 NM_001329135 51143 Hs.529495 NM_016141 ENSG00000144635 DYNC1LI1 DLC-A|DNCLI1|LIC1 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 protein-coding 146.333-216 chr3 108907935 108908144 + 1 NA exon (NM_005459, exon 4 of 4) exon (NM_005459, exon 4 of 4) 45807 NM_001363884 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 188.667-153 chr8 126094519 126094828 + 1 NA Intergenic Intergenic -143476 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 149.667-49 chr10 44760839 44761064 + 1 NA Intergenic Intergenic -150365 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 123.667-41 chr11 98732218 98732378 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -288651 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 194.333-26 chr11 10523110 10523396 + 1 NA intron (NM_016422, intron 4 of 5) intron (NM_016422, intron 4 of 5) -14067 NM_001190702 100463486 NM_001190702 ENSG00000255823 MTRNR2L8 HN8 MT-RNR2 like 8 protein-coding 130.667-170 chr5 97163120 97163338 + 1 NA intron (NM_018343, intron 9 of 9) intron (NM_018343, intron 9 of 9) 20018 NM_018343 55781 Hs.27021 NM_018343 ENSG00000058729 RIOK2 RIO2 RIO kinase 2 protein-coding 148.667-300 chr5 23002773 23003016 + 1 NA Intergenic Intergenic -149550 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 216.333-15 chr1 220508125 220508519 + 1 NA Intergenic Intergenic -19814 NM_001286128 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 167.667-159 chr4 110499041 110499357 + 1 NA intron (NM_001977, intron 3 of 19) intron (NM_001977, intron 3 of 19) 23044 NM_001977 2028 Hs.435765 NM_001977 ENSG00000138792 ENPEP APA|CD249|gp160 glutamyl aminopeptidase protein-coding 248.667-100 chr7 74367675 74368175 + 1 NA intron (NM_032421, intron 8 of 15) intron (NM_032421, intron 8 of 15) 78450 NM_003388 7461 Hs.647018 NM_003388 ENSG00000106665 CLIP2 CLIP|CLIP-115|CYLN2|WBSCR3|WBSCR4|WSCR3|WSCR4 CAP-Gly domain containing linker protein 2 protein-coding 144.667-136 chr2 62257945 62258140 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 42521 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 177.667-112 chr5 128507186 128507494 + 1 NA intron (NM_001999, intron 5 of 64) MER2|DNA|TcMar-Tigger 30905 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 196.333-169 chr9 2376931 2377225 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 218622 NM_001289400 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 184.333-102 chr3 46205782 46206159 + 1 NA intron (NM_001295, intron 1 of 1) intron (NM_001295, intron 1 of 1) 2343 NM_001295 1230 Hs.301921 NM_001295 ENSG00000163823 CCR1 CD191|CKR-1|CKR1|CMKBR1|HM145|MIP1aR|SCYAR1 C-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 153.333-117 chr14 54427277 54427456 + 1 NA 3' UTR (NM_005776, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_005776, exon 5 of 5) 14008 NM_005776 10175 Hs.294603 NM_005776 ENSG00000100528 CNIH1 CNIH|CNIH-1|CNIL|TGAM77 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 protein-coding 183.333-157 chr8 85142581 85142902 + 1 NA intron (NM_033402, intron 18 of 18) AluSz|SINE|Alu 34300 NR_134311 102723322 Hs.535913 NR_134311 ENSG00000260493 LOC102723322 - uncharacterized LOC102723322 ncRNA 229.667-45 chr2 158112475 158112871 + 1 NA intron (NM_173355, intron 2 of 6) intron (NM_173355, intron 2 of 6) 10803 NM_173355 151531 Hs.128427 NM_173355 ENSG00000007001 UPP2 UDRPASE2|UP2|UPASE2 uridine phosphorylase 2 protein-coding 130.333-137 chr3 116136126 116136289 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -223817 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 152.667-163 chr2 1118156 1118418 + 1 NA intron (NM_018968, intron 4 of 16) L1MA7|LINE|L1 -166895 NR_136151 101060391 Hs.120377 NR_136151 SNTG2-AS1 - SNTG2 antisense RNA 1 ncRNA 420.333-4 chr12 54619180 54619806 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -9031 NR_003039 644076 Hs.483519 NR_003039 ENSG00000257780 GLYCAM1 - glycosylation dependent cell adhesion molecule 1 (pseudogene) pseudo 184.667-126 chr7 122031828 122032055 + 1 NA intron (NM_001206839, intron 15 of 28) intron (NM_001206839, intron 15 of 28) 112308 NM_005763 10157 Hs.156738 NM_005763 ENSG00000008311 AASS LKR/SDH|LKRSDH|LORSDH aminoadipate-semialdehyde synthase protein-coding 347.333-9 chr17 72489121 72489548 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 103470 NR_152515 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 241.667-4 chr1 119147588 119148043 + 1 NA intron (NR_125975, intron 3 of 6) intron (NR_125975, intron 3 of 6) -7143 NM_015836 10352 Hs.523506 NM_015836 ENSG00000116874 WARS2 NEMMLAS|TrpRS|mtTrpRS tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 221.667-43 chr2 145395279 145395627 + 1 NA Intergenic Intergenic 727486 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 285.667-28 chr20 5631623 5631970 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -20790 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 145.333-8 chr1 109013730 109013934 + 1 NA exon (NM_001142550, exon 4 of 15) exon (NM_001142550, exon 4 of 15) 28396 NM_014969 22911 Hs.570055 NM_014969 ENSG00000085433 WDR47 - WD repeat domain 47 protein-coding 194.333-107 chr4 128179608 128179940 + 1 NA intron (NR_146772, intron 14 of 19) intron (NR_146772, intron 14 of 19) 108039 NM_006320 10424 Hs.507910 NM_006320 ENSG00000164040 PGRMC2 DG6|PMBP progesterone receptor membrane component 2 protein-coding 136.333-97 chr2 128108776 128108991 + 1 NA intron (NR_027671, intron 4 of 40) L1ME3B|LINE|L1 17683 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 125.667-16 chr1 233927420 233927608 + 1 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 22838 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 147.667-380 chr8 136577171 136577440 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 46507 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 166.333-212 chr7 64797036 64797276 + 1 NA intron (NR_160271, intron 2 of 2) intron (NR_160271, intron 2 of 2) 2728 NM_001271639 7697 Hs.184080 NM_006524 ENSG00000197008 ZNF138 pHZ-32 zinc finger protein 138 protein-coding 154.333-375 chr9 105641948 105642142 + 1 NA TTS (NM_001198963) TTS (NM_001198963) -20412 NM_005421 6887 Hs.247978 NM_005421 ENSG00000186051 TAL2 - TAL bHLH transcription factor 2 protein-coding 145.333-91 chr14 74016650 74016877 + 1 NA intron (NM_001249, intron 1 of 15) intron (NM_001249, intron 1 of 15) 2525 NM_001321988 957 Hs.655070 NM_001249 ENSG00000187097 ENTPD5 CD39L4|NTPDase-5|PCPH ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (inactive) protein-coding 192.667-64 chr15 59643452 59643770 + 1 NA intron (NM_001320930, intron 4 of 5) AluSx|SINE|Alu 13694 NM_001320929 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 191.333-35 chr11 75707418 75707617 + 1 NA Intergenic Intergenic -10321 NM_025098 80168 Hs.288568 NM_025098 ENSG00000166391 MOGAT2 DGAT2L5|DGAT2L5.|MGAT2|hDC5 monoacylglycerol O-acyltransferase 2 protein-coding 155.667-201 chr21 27059108 27059329 + 1 NA Intergenic Intergenic -92130 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 209.333-10 chr1 119138854 119139091 + 1 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) intron (NM_015836, intron 1 of 5) -1424 NR_125974 101929147 Hs.697821 NR_125974 ENSG00000231365 WARS2-AS1 - WARS2 antisense RNA 1 ncRNA 194.667 chr1 12290855 12291170 + 1 NA exon (NM_018156, exon 23 of 69) exon (NM_018156, exon 23 of 69) 60982 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 247.667-104 chrX 109275198 109275595 + 1 NA Intergenic Intergenic 206690 NM_001522 2986 Hs.123074 NM_001522 ENSG00000101890 GUCY2F CYGF|GC-F|GUC2DL|GUC2F|RETGC-2|ROS-GC2 guanylate cyclase 2F, retinal protein-coding 209.667-19 chr10 31388704 31389108 + 1 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) intron (NM_001323646, intron 4 of 11) 10849 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 152.333-230 chr3 49940662 49940842 + 1 NA intron (NM_001349194, intron 1 of 17) CpG 602 NM_001349193 10180 Hs.696735 NM_005777 ENSG00000004534 RBM6 3G2|DEF-3|DEF3|HLC-11|NY-LU-12|g16 RNA binding motif protein 6 protein-coding 168.333-14 chr1 235702577 235702906 + 1 NA intron (NM_000081, intron 45 of 52) intron (NM_000081, intron 45 of 52) -51987 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 132.333-183 chr8 125786663 125786908 + 1 NA Intergenic Intergenic 164412 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 144.333-214 chr5 80482699 80482871 + 1 NA non-coding (NR_146173, exon 20 of 20) non-coding (NR_146173, exon 20 of 20) -5315 NM_205548 167555 Hs.338182 NM_205548 ENSG00000152380 FAM151B UNQ9217 family with sequence similarity 151 member B protein-coding 194.667-123 chr5 90000468 90000771 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 16101 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 167.667-161 chr4 121735110 121735291 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 29094 NM_001317839 132332 Hs.27524 NM_152399 ENSG00000164112 TMEM155 - transmembrane protein 155 protein-coding 202.667 chr1 8024518 8024931 + 1 NA intron (NM_018948, intron 1 of 3) intron (NM_018948, intron 1 of 3) 1585 NM_018948 54206 Hs.605445 NM_018948 ENSG00000116285 ERRFI1 GENE-33|MIG-6|MIG6|RALT ERBB receptor feedback inhibitor 1 protein-coding 255.667-13 chr11 72464990 72465330 + 1 NA Intergenic Intergenic -30476 NM_001258394 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 160.667-226 chr4 82674919 82675208 + 1 NA intron (NM_024906, intron 3 of 3) L1MC1|LINE|L1 -53626 NR_024088 439934 Hs.457189 NM_001033661 ENSG00000231782 LINC00575 C4orf11 long intergenic non-protein coding RNA 575 ncRNA 158.667-100 chr14 63947743 63947983 + 1 NA intron (NM_015180, intron 6 of 114) L1ME4a|LINE|L1 94859 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 184.667-28 chr13 74358249 74358523 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 60729 NR_144452 100288208 Hs.532467 NM_001013669 ENSG00000177596 LOC100288208 - uncharacterized LOC100288208 ncRNA 142.667-99 chr2 106349068 106349275 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -20574 NR_157576 402096 NR_157576 LOC402096 - anaphase promoting complex subunit 1 pseudogene pseudo 176.333-9 chr1 78064954 78065204 + 1 NA intron (NM_017655, intron 1 of 5) AluJr4|SINE|Alu 19113 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 156.667-363 chrX 15927043 15927364 + 1 NA Intergenic Intergenic -72390 NR_160933 8905 Hs.121592 NM_003916 ENSG00000182287 AP1S2 DC22|MRX59|MRXS21|MRXS5|MRXSF|PGS|SIGMA1B adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2 protein-coding 143.333-183 chr3 70553415 70553566 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -240852 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 281.667-5 chr10 31483276 31483611 + 1 NA intron (NM_001323678, intron 2 of 6) intron (NM_001323678, intron 2 of 6) -83688 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 270.333-61 chr8 41977451 41977799 + 1 NA intron (NM_001305878, intron 6 of 13) MIR3|SINE|MIR -74125 NR_136589 105379393 Hs.742878 NR_136589 LOC105379393 - uncharacterized LOC105379393 ncRNA 207.333-170 chr22 28370733 28371103 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -88951 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 160.667-203 chr3 118473003 118473221 + 1 NA Intergenic Intergenic -168656 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 212.333-141 chr7 78502748 78503129 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 4 of 20) L1MEj|LINE|L1 155696 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 179.333-115 chr21 15970982 15971176 + 1 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -99409 NR_136541 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 222.333-7 chr1 189888142 189888532 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 587673 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 153.667-398 chr8 140200730 140200937 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L1MC3|LINE|L1 -100298 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 170.333-149 chr3 178393976 178394255 + 1 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -25086 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 137.333-93 chr2 49238495 49238714 + 1 NA Intergenic Intergenic -84077 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 208.333-116 chr5 65493154 65493454 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -11384 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 147.667-279 chr5 29818268 29818553 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -62150 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 165.667-57 chr14 72844674 72844928 + 1 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 47848 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 153.333-112 chr14 47917320 47917597 + 1 NA Intergenic Intergenic -122444 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 155.333-173 chr2 122444412 122444567 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 628992 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 215.667-51 chr18 63128176 63128499 + 1 NA 3' UTR (NM_000633, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_000633, exon 3 of 3) 191043 NM_000657 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 352.333-32 chr9 95274814 95275263 + 1 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 42216 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 159.333-200 chr22 25436349 25436553 + 1 NA Intergenic Intergenic -11636 NR_033734 1416 Hs.571835 NR_033733 ENSG00000100058 CRYBB2P1 CRYB2B crystallin beta B2 pseudogene 1 pseudo 260.667-13 chr11 15296614 15297107 + 1 NA Intergenic Intergenic 147758 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 277.667-13 chr13 39804846 39805292 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -140934 NR_036190 100422940 NR_036190 ENSG00000264171 MIR4305 - microRNA 4305 ncRNA 328.333-38 chr9 112734225 112734668 + 1 NA Intergenic Intergenic -16314 NM_001012994 401548 Hs.522350 NM_001012994 ENSG00000148158 SNX30 ATG24A sorting nexin family member 30 protein-coding 238.333-18 chr12 13724810 13725254 + 1 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 255324 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 122.667-51 chr14 67898460 67898593 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MA10|LINE|L1 74934 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 151.333-271 chr3 28070924 28071165 + 1 NA Intergenic MER127|DNA|TcMar-Tigger -170575 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 150.333-271 chr3 112451369 112451539 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 48018 NM_001085357 151888 Hs.445162 NM_181780 ENSG00000186265 BTLA BTLA1|CD272 B and T lymphocyte associated protein-coding 221.333-95 chr3 97952709 97952985 + 1 NA intron (NM_001042533, intron 5 of 9) intron (NM_001042533, intron 5 of 9) 19584 NM_153182 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 181.333-46 chr14 81485237 81485440 + 1 NA intron (NM_005065, intron 18 of 20) AluSx1|SINE|Alu -35181 NR_109999 100506700 Hs.116304 NR_109999 ENSG00000258675 LINC02308 - long intergenic non-protein coding RNA 2308 ncRNA 159.333-108 chr15 89064166 89064462 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -24142 NM_152924 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 230.667-90 chr8 115546114 115546489 + 1 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 121712 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 233.667-29 chr17 70798172 70798535 + 1 NA Intergenic Intergenic 403826 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 167.333-126 chr2 67800058 67800366 + 1 NA intron (NR_110271, intron 2 of 2) intron (NR_110271, intron 2 of 2) 25350 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 203.667-65 chr20 37154414 37154757 + 1 NA intron (NM_213632, intron 8 of 12) AluJo|SINE|Alu -24461 NM_001324302 6185 Hs.370895 NM_002951 ENSG00000118705 RPN2 RIBIIR|RPN-II|RPNII|SWP1 ribophorin II protein-coding 130.333-15 chr1 175026700 175026942 + 1 NA Intergenic Intergenic -3366 NR_037606 63931 Hs.654858 NM_022100 ENSG00000120333 MRPS14 COXPD38|DJ262D12.2|HSMRPS14|MRP-S14|S14mt mitochondrial ribosomal protein S14 protein-coding 264.667-19 chr11 110841359 110841753 + 1 NA Intergenic Intergenic -128367 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 159.667-11 chr1 66693099 66693371 + 1 NA intron (NM_001350218, intron 15 of 22) FLAM_A|SINE|Alu -59224 NM_152665 200132 Hs.479226 NM_152665 ENSG00000152760 TCTEX1D1 - Tctex1 domain containing 1 protein-coding 195.333-110 chr2 68473892 68474122 + 1 NA intron (NM_173545, intron 1 of 9) MER21B|LTR|ERVL 6422 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 151.667-264 chr5 15192254 15192448 + 1 NA non-coding (NR_109944, exon 3 of 3) non-coding (NR_109944, exon 3 of 3) 74209 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 153.667-47 chr10 63219930 63220090 + 1 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 49213 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 146.333-283 chr6 49823079 49823319 + 1 NA intron (NR_110843, intron 3 of 4) intron (NR_110843, intron 3 of 4) 1567 NR_110843 101927048 Hs.742154 NR_110843 LOC101927048 - uncharacterized LOC101927048 ncRNA 161.333-75 chr13 42702322 42702491 + 1 NA Intergenic Intergenic -79144 NM_182508 144809 Hs.16970 NM_182508 ENSG00000179813 FAM216B C13orf30 family with sequence similarity 216 member B protein-coding 202.333-118 chr4 13706450 13706754 + 1 NA intron (NR_121681, intron 2 of 3) intron (NR_121681, intron 2 of 3) 51423 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 144.333-222 chr5 167571844 167572058 + 1 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -1708 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 157.333-30 chr1 180977193 180977456 + 1 NA intron (NM_005819, intron 7 of 7) intron (NM_005819, intron 7 of 7) -22437 NR_145481 103344928 Hs.665319 NR_145481 ENSG00000232586 KIAA1614-AS1 - KIAA1614 antisense RNA 1 ncRNA 143.667-26 chr10 65780787 65781005 + 1 NA Intergenic Intergenic 209471 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 132.333-151 chr6 53101730 53102004 + 1 NA TTS (NM_012347) TTS (NM_012347) 30894 NM_012347 26268 Hs.216653 NM_012347 ENSG00000112146 FBXO9 FBX9|NY-REN-57|VCIA1|dJ341E18.2 F-box protein 9 protein-coding 209.667-64 chr2 74419927 74420228 + 1 NA intron (NM_001316765, intron 1 of 2) L1ME4a|LINE|L1 1542 NM_001316766 388963 Hs.445377 NM_001145054 ENSG00000284308 C2orf81 hCG40743 chromosome 2 open reading frame 81 protein-coding 150.333-295 chr4 35819823 35820020 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 424018 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 242.667-45 chr17 76896942 76897324 + 1 NA intron (NM_144677, intron 3 of 16) AluJb|SINE|Alu 24486 NM_198955 146664 Hs.144531 NM_144677 ENSG00000167889 MGAT5B GnT-IX|GnT-VB alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B protein-coding 201.333-32 chr10 71104882 71105114 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -107572 NM_170744 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 144.667-201 chr3 127404011 127404165 + 1 NA Intergenic Intergenic -13418 NR_110147 101927123 Hs.526761 NR_110147 ENSG00000244215 LINC02016 - long intergenic non-protein coding RNA 2016 ncRNA 150.333-181 chr19 31327415 31327671 + 1 NA intron (NR_138034, intron 1 of 1) intron (NR_138034, intron 1 of 1) 21893 NR_138036 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 151.333-269 chr3 4987396 4987564 + 1 NA Intergenic Intergenic -7519 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 201.333-290 chr8 122549712 122550015 + 1 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 18781 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 215.667-119 chr8 26812100 26812440 + 1 NA intron (NM_001322504, intron 1 of 1) intron (NM_001322504, intron 1 of 1) 53385 NM_033304 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 139.667-42 chr12 75254763 75254949 + 1 NA Intergenic Intergenic 20116 NR_149000 100130268 Hs.524596 NR_149000 ENSG00000254451 LOC100130268 - uncharacterized LOC100130268 ncRNA 190.667-68 chr2 123963067 123963387 + 1 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 61947 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 336.333-10 chr10 75502469 75502949 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) -49749 NR_030337 693191 NR_030337 ENSG00000207583 MIR606 MIRN606|hsa-mir-606 microRNA 606 ncRNA 161.667-95 chr16 48755874 48756066 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -145790 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 142.333-54 chr12 7667447 7667601 + 1 NA intron (NM_001304566, intron 1 of 5) intron (NM_001304566, intron 1 of 5) -1616 NM_001644 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 257.667 chr1 47873730 47874227 + 1 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) intron (NM_001194986, intron 2 of 6) 123407 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 152.667-22 chr1 211436400 211436568 + 1 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 53729 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 153.333-42 chr10 23945245 23945549 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) L1ME2|LINE|L1 250670 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 312.667-19 chr2 13234325 13234734 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -227516 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 151.667-364 chr8 71950624 71950792 + 1 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) intron (NR_033651, intron 1 of 2) -106212 NM_005098 9242 Hs.442619 NM_005098 ENSG00000178860 MSC ABF-1|ABF1|MYOR|bHLHa22 musculin protein-coding 154.333-177 chr2 213242468 213242687 + 1 NA Intergenic Intergenic 41632 NR_161186 100130451 Hs.608433 NR_144752 SPAG16-DT - SPAG16 divergent transcript ncRNA 195.667-61 chr17 58523919 58524285 + 1 NA intron (NM_004574, intron 5 of 11) intron (NM_004574, intron 5 of 11) 3945 NM_001256822 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 276.333-53 chr6 38450366 38450891 + 1 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) intron (NM_001172418, intron 5 of 10) -30968 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-200 chr3 183007192 183007437 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -21396 NM_001308101 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 273.333-23 chr16 72139931 72140520 + 1 NA intron (NM_031293, intron 6 of 20) intron (NM_031293, intron 6 of 20) 31930 NM_031293 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 144.667-22 chr1 224241438 224241669 + 1 NA intron (NM_002533, intron 19 of 22) intron (NM_002533, intron 19 of 22) 15557 NR_031574 100313769 NR_031574 ENSG00000221406 MIR320B2 MIR320B-2|MIRN320B2|mir-320b-2 microRNA 320b-2 ncRNA 161.333-271 chr7 128370598 128370839 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -9028 NM_001114726 401399 Hs.381096 NM_001114726 ENSG00000224940 PRRT4 - proline rich transmembrane protein 4 protein-coding 119.667-24 chr10 129137768 129138015 + 1 NA Intergenic Intergenic 225058 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 168.333-26 chr10 85014746 85015096 + 1 NA Intergenic Intergenic 183984 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 201.667-79 chr3 123145370 123145627 + 1 NA intron (NM_006810, intron 11 of 16) intron (NM_006810, intron 11 of 16) -16296 NR_106960 102465667 NR_106960 ENSG00000284421 MIR7110 hsa-mir-7110 microRNA 7110 ncRNA 219.333-48 chr14 35221448 35221814 + 1 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) intron (NM_014672, intron 5 of 7) -56927 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 143.667-185 chr4 79651908 79652167 + 1 NA Intergenic Intergenic 159444 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 156.667-14 chr1 77999890 78000162 + 1 NA intron (NM_001317100, intron 2 of 3) intron (NM_001317100, intron 2 of 3) -4802 NM_001317103 11080 Hs.13852 NM_007034 ENSG00000162616 DNAJB4 DNAJW|DjB4|HLJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B4 protein-coding 183.667-140 chr8 101247856 101248150 + 1 NA Intergenic Intergenic -41939 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 281.333-47 chr5 17674919 17675426 + 1 NA Intergenic Intergenic -19534 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 149.333-21 chr1 116815678 116815857 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 61337 NM_001328609 914 Hs.523500 NM_001767 ENSG00000116824 CD2 LFA-2|SRBC|T11 CD2 molecule protein-coding 192.667-93 chr2 187730427 187730778 + 1 NA Intergenic Intergenic -176097 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 248.333-29 chr13 108201278 108201686 + 1 NA Intergenic Intergenic 13300 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 224.333-66 chr2 171714800 171715099 + 1 NA intron (NM_001320882, intron 5 of 16) intron (NM_001320882, intron 5 of 16) 27194 NM_001320884 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 132.333-73 chr19 27729140 27729333 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -64195 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 170.667-100 chr20 54655302 54655519 + 1 NA Intergenic LTR53-int|LTR|ERVL 179817 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 155.333-105 chr14 54881545 54881717 + 1 NA intron (NM_001024071, intron 1 of 5) intron (NM_001024071, intron 1 of 5) -3438 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 150.667-353 chr7 68515669 68515930 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 495546 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 155.333-17 chr1 214452865 214453092 + 1 NA intron (NM_005401, intron 2 of 18) intron (NM_005401, intron 2 of 18) 98624 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 210.333-101 chr3 40781144 40781696 + 1 NA Intergenic Intergenic 256460 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 143.667-130 chr2 78629817 78630011 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 84383 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 187.667-123 chr5 120896762 120897030 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 365432 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 158.667-228 chr4 14178206 14178396 + 1 NA Intergenic Intergenic 66333 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 144.333-122 chr2 51002495 51002766 + 1 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 29502 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 184.333-9 chr1 239001630 239001869 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -384819 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 127.667-91 chr2 149090024 149090202 + 1 NA intron (NM_001317004, intron 1 of 6) intron (NM_001317004, intron 1 of 6) 12591 NM_001317004 130576 Hs.357567 NM_177964 ENSG00000150556 LYPD6B CT116|LYPD7 LY6/PLAUR domain containing 6B protein-coding 161.333-103 chr16 7840529 7840744 + 1 NA Intergenic Intergenic 507791 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 153.667-323 chr5 115003610 115003854 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 166176 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 127.667-44 chr14 48949281 48949504 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 636988 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 201.333-169 chr20 32957282 32957591 + 1 NA intron (NM_001143967, intron 23 of 26) L1ME1|LINE|L1 46997 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 249.333-84 chr5 72062787 72063137 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44513 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 250.333-64 chr6 114597833 114598123 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -535101 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 175.333-74 chr19 31438439 31438616 + 1 NA Intergenic Intergenic -89091 NM_020856 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 128.333-204 chr9 73090316 73090511 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -61452 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 313.667-24 chr2 33013456 33014043 + 1 NA intron (NM_206943, intron 2 of 33) intron (NM_206943, intron 2 of 33) 66796 NM_206943 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 149.667-271 chr3 188133580 188133835 + 1 NA Intergenic Intergenic -20191 NM_001167672 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 302.667-15 chr17 66652065 66652368 + 1 NA intron (NM_002737, intron 5 of 16) AluSx|SINE|Alu -134856 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 193.667-103 chr5 83764471 83764753 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -43757 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 162.333-234 chr7 46818104 46818385 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -121122 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 148.667-268 chr4 34947988 34948277 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -678385 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 141.333-27 chr10 74654218 74654436 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) intron (NM_001369124, intron 8 of 9) -125003 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 156.333-129 chr15 93673117 93673322 + 1 NA Intergenic Intergenic -183341 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 169.667-212 chr8 130223233 130223527 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 4 of 29) MIRb|SINE|MIR 73153 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 284.667-28 chr20 55867790 55868216 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 137516 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 258.333-53 chr6 37240464 37240898 + 1 NA intron (NM_145316, intron 1 of 3) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 16918 NM_145316 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 143.333-51 chr11 65936272 65936515 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9251 NM_152762 254187 Hs.350671 NM_152762 ENSG00000175513 TSGA10IP FAM161C testis specific 10 interacting protein protein-coding 153.333-348 chr6 16634141 16634401 + 1 NA intron (NM_000332, intron 4 of 8) intron (NM_000332, intron 4 of 8) 125913 NR_152113 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 146.333-15 chr1 165200715 165200951 + 1 NA Intergenic Intergenic 155408 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 166.667-177 chr5 30767700 30767879 + 1 NA Intergenic Intergenic -425897 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 149.667-152 chr16 77083493 77083655 + 1 NA Intergenic Intergenic -107616 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 252.667-72 chr4 95999510 95999879 + 1 NA Intergenic Intergenic 159601 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 250.333-77 chr8 116696781 116697133 + 1 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 44857 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 143.667-270 chr9 123249095 123249294 + 1 NA intron (NM_018387, intron 1 of 18) AluJb|SINE|Alu 19392 NR_033234 55342 Hs.287659 NM_018387 ENSG00000165209 STRBP HEL162|ILF3L|SPNR|p74 spermatid perinuclear RNA binding protein protein-coding 196.667-64 chr18 62541310 62541609 + 1 NA intron (NR_126534, intron 2 of 14) intron (NR_126534, intron 2 of 14) 18434 NR_126534 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 210.667-74 chr2 208186527 208186836 + 1 NA intron (NM_001099334, intron 2 of 8) intron (NM_001099334, intron 2 of 8) 3349 NM_001099334 389073 Hs.198416 NM_001099334 ENSG00000188674 C2orf80 GONDA1 chromosome 2 open reading frame 80 protein-coding 116.333-176 chr5 87014232 87014481 + 1 NA Intergenic Intergenic 100598 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 148.333-133 chr14 88185376 88185638 + 1 NA 3' UTR (NM_138318, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_138318, exon 7 of 7) 85404 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 191.333-8 chr1 86482596 86482866 + 1 NA intron (NM_001285, intron 5 of 13) intron (NM_001285, intron 5 of 13) 13804 NM_001285 1179 Hs.194659 NM_001285 ENSG00000016490 CLCA1 CACC|CACC1|CLCRG1|CaCC-1|GOB5|hCLCA1|hCaCC-1 chloride channel accessory 1 protein-coding 319.667-21 chr3 90142451 90142939 + 1 NA Intergenic Intergenic 1035074 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 153.333-268 chr3 34251275 34251467 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 452741 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 161.333-268 chr7 89398617 89398840 + 1 NA Intergenic Intergenic -602991 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 161.667-30 chr10 107404010 107404197 + 1 NA Intergenic Intergenic -239397 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 160.333-270 chr8 11162395 11162613 + 1 NA intron (NR_138154, intron 1 of 2) intron (NR_138154, intron 1 of 2) 38862 NR_138152 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 190.667-132 chr7 16033477 16033810 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -176843 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 132.667-14 chr1 229443494 229443680 + 1 NA intron (NM_018230, intron 25 of 25) intron (NM_018230, intron 25 of 25) -9491 NM_001100 58 Hs.1288 NM_001100 ENSG00000143632 ACTA1 ACTA|ASMA|CFTD|CFTD1|CFTDM|MPFD|NEM1|NEM2|NEM3|SHPM actin alpha 1, skeletal muscle protein-coding 178.667-170 chr9 32186824 32187145 + 1 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -197619 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 148.333-339 chr6 56537256 56537471 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 53 of 94) intron (NM_001144770, intron 53 of 94) 105526 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 154.667-163 chr2 20771000 20771262 + 1 NA intron (NM_021925, intron 4 of 6) intron (NM_021925, intron 4 of 6) 51970 NM_021925 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 178.667-134 chr5 117782891 117783190 + 1 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 52679 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 221.667-60 chr4 98416984 98417220 + 1 NA intron (NM_021159, intron 8 of 14) L3|LINE|CR1 155718 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 176.667-45 chr12 45360615 45360891 + 1 NA intron (NM_001025356, intron 8 of 19) L1MB7|LINE|L1 68063 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 230.333-18 chr10 100319176 100319600 + 1 NA intron (NM_016112, intron 2 of 15) MIRb|SINE|MIR 10840 NM_001253837 9033 Hs.159241 NM_016112 ENSG00000107593 PKD2L1 PCL|PKD2L|PKDL|TRPP3 polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel protein-coding 187.333-80 chr17 38988554 38988883 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -21315 NM_001008777 494188 Hs.549536 NM_001008777 ENSG00000204952 FBXO47 - F-box protein 47 protein-coding 174.333-164 chrX 81120337 81120530 + 1 NA intron (NM_030763, intron 2 of 6) intron (NM_030763, intron 2 of 6) 81480 NM_030763 79366 Hs.282204 NM_030763 ENSG00000198157 HMGN5 NBP-45|NSBP1 high mobility group nucleosome binding domain 5 protein-coding 242.667-94 chr7 48640517 48640946 + 1 NA intron (NM_152701, intron 59 of 61) intron (NM_152701, intron 59 of 61) -283816 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 148.667-193 chr2 84930655 84930838 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 25090 NM_021103 9168 Hs.446574 NM_021103 ENSG00000034510 TMSB10 MIG12|TB10 thymosin beta 10 protein-coding 145.333-76 chr13 95368609 95368794 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -64898 NM_182848 9071 Hs.534377 NM_006984 ENSG00000134873 CLDN10 CPETRL3|HELIX|OSP-L|OSPL claudin 10 protein-coding 157.667-155 chr2 181060606 181060862 + 1 NA exon (NM_182678, exon 6 of 7) exon (NM_182678, exon 6 of 7) -63103 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 129.333-159 chr5 116951366 116951585 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -189266 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 198.333-129 chr3 99104448 99104715 + 1 NA Intergenic Intergenic -202886 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 344.333-7 chr2 43336722 43337402 + 1 NA intron (NR_144316, intron 29 of 36) MER102b|DNA|hAT-Charlie 109851 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 159.333-120 chr16 78235125 78235376 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 135596 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 157.333-116 chr15 39843743 39843928 + 1 NA intron (NM_001271854, intron 1 of 3) intron (NM_001271854, intron 1 of 3) -14559 NM_001271855 11245 Hs.37196 NM_007223 ENSG00000166073 GPR176 HB-954 G protein-coupled receptor 176 protein-coding 193.667-12 chr1 159026709 159026917 + 1 NA intron (NM_001206567, intron 5 of 10) L1PBa|LINE|L1 16906 NM_005531 3428 Hs.380250 NM_005531 ENSG00000163565 IFI16 IFNGIP1|PYHIN2 interferon gamma inducible protein 16 protein-coding 127.333-167 chr7 6060032 6060192 + 1 NA promoter-TSS (NM_014413) promoter-TSS (NM_014413) -883 NM_001134335 27102 Hs.520205 NM_014413 ENSG00000086232 EIF2AK1 HCR|HRI eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 protein-coding 156.667-316 chr7 29147647 29147925 + 1 NA intron (NM_001293069, intron 2 of 13) MER115|DNA|hAT-Tip100 1239 NM_001293069 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 212.333-152 chr9 28908542 28908787 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -19709 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 135.333-66 chr17 58964211 58964422 + 1 NA intron (NR_048561, intron 2 of 5) intron (NR_048561, intron 2 of 5) 142564 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 346.667-13 chr6 49915049 49915532 + 1 NA Intergenic Intergenic 34154 NR_163261 403339 Hs.745543 NM_001166478 ENSG00000214643 DEFB133 - defensin beta 133 pseudo 161.333-273 chr7 152651605 152651861 + 1 NA intron (NM_005431, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 24408 NM_005431 7516 Hs.647093 NM_005431 ENSG00000196584 XRCC2 FANCU X-ray repair cross complementing 2 protein-coding 144.667-303 chr8 120995139 120995370 + 1 NA Intergenic Intergenic -183208 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 152.667-257 chr3 147884479 147884637 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -193601 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 137.333-17 chr10 35012352 35012596 + 1 NA intron (NM_003591, intron 19 of 20) intron (NM_003591, intron 19 of 20) 61809 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 269.667-5 chr10 50321310 50321860 + 1 NA intron (NM_147156, intron 8 of 10) intron (NM_147156, intron 8 of 10) -72975 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 152.667-138 chr17 16153818 16153995 + 1 NA promoter-TSS (NR_145787) promoter-TSS (NR_145787) -710 NR_145787 109623477 NR_145787 SNORD163 - small nucleolar RNA, C/D box 163 snoRNA 155.667-185 chr2 201974792 201975072 + 1 NA Intergenic Intergenic -59655 NM_003507 8324 Hs.173859 NM_003507 ENSG00000155760 FZD7 FzE3 frizzled class receptor 7 protein-coding 232.667-44 chr20 44466856 44467265 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1716 NR_132342 140834 Hs.357589 NM_001287807 ENSG00000168746 LINC01620 C20orf62|dJ1013A22.3 long intergenic non-protein coding RNA 1620 ncRNA 199.667-95 chr3 115604713 115604937 + 1 NA Intergenic Intergenic -18685 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 179.333-93 chr2 58965167 58965475 + 1 NA intron (NR_033873, intron 6 of 13) L3|LINE|CR1 -252387 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 148.667-154 chr17 13117369 13117548 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -99394 NM_173717 60528 Hs.434232 NM_018127 ENSG00000006744 ELAC2 COXPD17|ELC2|HPC2 elaC ribonuclease Z 2 protein-coding 114.333-41 chr11 65156410 65156579 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -13660 NM_001008778 387778 Hs.450642 NM_001008778 ENSG00000204710 SPDYC RINGOC|Ringo2 speedy/RINGO cell cycle regulator family member C protein-coding 167.333-78 chr14 52618950 52619145 + 1 NA intron (NR_148417, intron 4 of 7) intron (NR_148417, intron 4 of 7) 66211 NR_148417 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 187.667-37 chr14 33915683 33915947 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 35259 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 250.333 chr1 40066901 40067290 + 1 NA intron (NM_001350484, intron 8 of 13) intron (NM_001350484, intron 8 of 13) 26244 NM_001350481 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 200.333-7 chr10 12443079 12443427 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) intron (NM_001351032, intron 3 of 11) 54271 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 155.667-253 chr4 94130007 94130257 + 1 NA intron (NR_125922, intron 6 of 8) intron (NR_125922, intron 6 of 8) 77424 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 261.667-23 chr16 73217084 73217613 + 1 NA Intergenic Intergenic -72901 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 164.667-192 chr5 101371731 101371915 + 1 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -468541 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 170.667-62 chr17 2438144 2438396 + 1 NA intron (NM_024086, intron 7 of 9) intron (NM_024086, intron 7 of 9) -22834 NR_028335 284009 Hs.632244 NM_001025459 LOC284009 - uncharacterized LOC284009 ncRNA 151.333-206 chr2 55537425 55537587 + 1 NA exon (NM_080667, exon 7 of 10) exon (NM_080667, exon 7 of 10) 17911 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 256.667 chr1 106601855 106602207 + 1 NA Intergenic Intergenic -216208 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 114.333-157 chr4 61102515 61102652 + 1 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -41073 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 227.333-17 chr10 31299779 31300143 + 1 NA Intergenic Intergenic -18456 NM_001323638 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 293.333-68 chr8 141230133 141230688 + 1 NA intron (NM_001286646, intron 1 of 7) intron (NM_001286646, intron 1 of 7) -1836 NM_001286648 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 149.667-33 chr1 180890703 180890938 + 1 NA TTS (NM_001135669) TTS (NM_001135669) -22077 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 168.667-163 chr4 95783968 95784245 + 1 NA Intergenic Intergenic -55987 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 161.667-185 chr4 42343771 42344035 + 1 NA intron (NR_134668, intron 1 of 1) L1MC|LINE|L1 47365 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 226.667-70 chr5 5484381 5484788 + 1 NA intron (NM_015325, intron 17 of 18) intron (NM_015325, intron 17 of 18) 61907 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 124.333-10 chr1 157210355 157210509 + 1 NA Intergenic Intergenic -71841 NM_005240 2117 Hs.105636 NM_005240 ENSG00000117036 ETV3 METS|PE-1|PE1 ETS variant 3 protein-coding 183.333-119 chr4 96828610 96829037 + 1 NA Intergenic Intergenic 518120 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 147.333-133 chr16 62677936 62678107 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -641583 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 278.667-16 chr15 83624615 83625010 + 1 NA Intergenic Intergenic -29311 NM_207517 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 243.667-2 chr1 172597480 172597845 + 1 NA intron (NM_014283, intron 19 of 23) L1MD|LINE|L1 -61346 NM_001302746 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 269.333-32 chr17 70970057 70970636 + 1 NA Intergenic Intergenic 231833 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 141.333-94 chr18 62131108 62131263 + 1 NA intron (NM_176787, intron 14 of 30) intron (NM_176787, intron 14 of 30) 55871 NM_012327 23556 Hs.157031 NM_012327 ENSG00000197563 PIGN MCAHS|MCAHS1|MCD4|MDC4|PIG-N phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N protein-coding 180.333-17 chr11 25505926 25506182 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -683069 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 171.333-141 chr4 188705508 188705733 + 1 NA Intergenic Intergenic -71037 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 125.333-114 chr3 116300870 116301075 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -59052 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 157.667-181 chr22 29197402 29197617 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -8387 NM_001267895 129080 Hs.289106 NM_133455 ENSG00000186998 EMID1 EMI5|EMU1 EMI domain containing 1 protein-coding 152.667-49 chr10 95398126 95398287 + 1 NA intron (NM_001034955, intron 10 of 30) intron (NM_001034955, intron 10 of 30) 42974 NM_001034956 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 128.333-202 chr9 31945441 31945643 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -439061 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 247.667-20 chr11 131844938 131845231 + 1 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 -64840 NM_001352009 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 188.667-91 chr21 28704100 28704347 + 1 NA Intergenic Intergenic 164905 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 159.667-223 chr3 185846529 185846703 + 1 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -21574 NM_006548 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 150.667-150 chr17 74711895 74712184 + 1 NA intron (NR_110298, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 884 NM_001289084 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 227.667-14 chr12 41046053 41046509 + 1 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 137924 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 201.333-126 chr18 769457 769831 + 1 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) L1MEc|LINE|L1 42598 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 190.333-135 chr7 24622940 24623239 + 1 NA intron (NM_016447, intron 2 of 12) L1M4|LINE|L1 49637 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 150.667-402 chr9 123699104 123699369 + 1 NA intron (NM_001352968, intron 4 of 18) intron (NM_001352968, intron 4 of 18) -213614 NR_106972 102465688 NR_106972 ENSG00000274932 MIR7150 hsa-mir-7150 microRNA 7150 ncRNA 189.667-123 chr6 22476062 22476320 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -93375 NM_138574 154150 Hs.629246 NM_138574 ENSG00000112273 HDGFL1 HRP-1|Hdgfrp1|PWWP1|dJ309H15.1 HDGF like 1 protein-coding 191.667-115 chr7 41430797 41431101 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -262970 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 199.667-17 chr10 70791570 70791862 + 1 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 -6297 NM_001318241 219793 Hs.386698 NM_152710 ENSG00000166220 TBATA C10orf27|SPATIAL thymus, brain and testes associated protein-coding 134.667-3 chr1 63995595 63995797 + 1 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 116509 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 139.333-168 chr4 96085358 96085585 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -225232 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 163.333-257 chr7 33813728 33813918 + 1 NA Intergenic Intergenic -91092 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 119.667-149 chr5 44186841 44187097 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -201763 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 203.667-62 chr2 177265985 177266327 + 1 NA Intergenic Intergenic -1025 NM_001313903 4780 Hs.744006 NM_006164 ENSG00000116044 NFE2L2 HEBP1|IMDDHH|NRF2 nuclear factor, erythroid 2 like 2 protein-coding 246.333-10 chr1 224345876 224346307 + 1 NA Intergenic Intergenic -10788 NM_001277200 29097 Hs.445890 NM_014184 ENSG00000143771 CNIH4 CNIH-4|CNIH2|HSPC163 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4 protein-coding 163.667-213 chr6 75069172 75069380 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 59506 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 128.333-23 chr10 27509225 27509416 + 1 NA intron (NM_001256415, intron 1 of 5) intron (NM_001256415, intron 1 of 5) 5016 NM_021252 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 199.333-229 chr5 84706731 84707072 + 1 NA Intergenic Intergenic -322021 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 209.667-88 chr3 194934270 194934640 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -160133 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 113.667-158 chr4 62609045 62609258 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -447386 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 145.333-25 chr1 236080249 236080410 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15239 NM_002508 4811 Hs.356624 NM_002508 ENSG00000116962 NID1 NID nidogen 1 protein-coding 133.333-42 chr12 65618685 65618956 + 1 NA intron (NR_120433, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 15951 NR_146529 105369807 NR_146529 ENSG00000256268 LINC02454 - long intergenic non-protein coding RNA 2454 ncRNA 150.333-404 chr8 77126773 77127012 + 1 NA Intergenic Intergenic -125848 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 150.333-245 chr21 30483909 30484067 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3448 NM_181608 337969 Hs.553692 NM_181608 ENSG00000186965 KRTAP19-2 KAP19.2 keratin associated protein 19-2 protein-coding 162.333-115 chr2 67547865 67548173 + 1 NA Intergenic Intergenic 150686 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 142.667-158 chr4 80502586 80502811 + 1 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) intron (NM_152770, intron 2 of 5) 166978 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 236.333-21 chr11 123692637 123693190 + 1 NA Intergenic Intergenic 38072 NM_001301819 7753 Hs.112556 NM_003455 ENSG00000166261 ZNF202 ZKSCAN10|ZSCAN42 zinc finger protein 202 protein-coding 164.667-182 chr5 21702624 21702877 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -181704 NR_132787 106635539 NR_132787 SNORA105A - small nucleolar RNA, H/ACA box 105A snoRNA 190.333-48 chr14 84908434 84908734 + 1 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL -363348 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 214.333-107 chr4 102051460 102051783 + 1 NA intron (NM_017935, intron 11 of 16) L1M6|LINE|L1 237779 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 140.333-252 chr9 131435495 131435638 + 1 NA intron (NM_013318, intron 2 of 30) AluSx|SINE|Alu 5476 NM_013318 84726 Hs.743955 NM_013318 ENSG00000130723 PRRC2B BAT2L|BAT2L1|KIAA0515|LQFBS-1 proline rich coiled-coil 2B protein-coding 234.333-3 chr1 109212560 109212903 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -1162 NR_034072 6301 Hs.531176 NM_006513 ENSG00000031698 SARS NEDMAS|SERRS|SERS seryl-tRNA synthetase protein-coding 149.667-227 chr2 236858375 236858558 + 1 NA Intergenic Intergenic 197701 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 256.667-45 chr2 121091492 121091889 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 193512 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 180.667-65 chr2 84754745 84755025 + 1 NA intron (NM_001370, intron 63 of 76) L1MB8|LINE|L1 126199 NM_001307978 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 160.333-151 chr2 167584480 167584664 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -234100 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 161.333-39 chr10 81084921 81085229 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 435278 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 135.667-179 chr8 43776281 43776439 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 483918 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 308.667-26 chr3 178914763 178915158 + 1 NA Intergenic Intergenic -54555 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-97 chr18 30101510 30101743 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -197284 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 170.667-123 chr4 73417536 73417720 + 1 NA exon (NM_000477, exon 11 of 15) exon (NM_000477, exon 11 of 15) 13341 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 186.667-149 chr8 78997491 78997796 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 160114 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 145.333-163 chr20 57828218 57828438 + 1 NA Intergenic Intergenic -116792 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 153.333-169 chr18 6076370 6076642 + 1 NA intron (NM_173464, intron 16 of 19) L1ME3A|LINE|L1 -180238 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 140.333-36 chr11 28847101 28847319 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -369662 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 195.667-95 chr4 17479474 17479759 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 32474 NM_000320 5860 Hs.75438 NM_000320 ENSG00000151552 QDPR DHPR|HDHPR|PKU2|SDR33C1 quinoid dihydropteridine reductase protein-coding 251.667-97 chr8 88622805 88623272 + 1 NA Intergenic Intergenic -295555 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 209.667-110 chr8 80242592 80242900 + 1 NA Intergenic Intergenic 1357 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 157.667-273 chr6 27512056 27512328 + 1 NA Intergenic Intergenic -39074 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 285.667-16 chr14 83499989 83500337 + 1 NA Intergenic Intergenic 857531 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 146.333-178 chr20 55425499 55425726 + 1 NA intron (NR_110064, intron 1 of 2) L1ME4b|LINE|L1 1585 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 155.667-287 chr5 96926805 96926962 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9197 NM_005575 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 169.667-81 chr15 81397116 81397331 + 1 NA intron (NR_120365, intron 6 of 6) intron (NR_120365, intron 6 of 6) -23010 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 225.333-28 chr11 68157884 68158211 + 1 NA exon (NM_017635, exon 11 of 11) exon (NM_017635, exon 11 of 11) -36656 NM_212469 1119 Hs.77221 NM_001277 ENSG00000110721 CHKA CHK|CK|CKI|EK choline kinase alpha protein-coding 171.667-146 chr6 146380831 146381115 + 1 NA intron (NM_001278065, intron 6 of 9) L1MA1|LINE|L1 -162860 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 142.667-164 chr4 108469886 108470167 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -87207 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 183.667-11 chr1 145856172 145856443 + 1 NA intron (NM_006099, intron 3 of 13) intron (NM_006099, intron 3 of 13) 2774 NM_006099 10401 Hs.435761 NM_006099 ENSG00000131788 PIAS3 ZMIZ5 protein inhibitor of activated STAT 3 protein-coding 179.333-91 chr2 40626323 40626551 + 1 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -114002 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 150.333-162 chr17 69192140 69192519 + 1 NA intron (NM_080282, intron 17 of 39) AluSc5|SINE|Alu 42683 NR_130736 100133319 NR_130736 ENSG00000278873 PRO1804 - uncharacterized LOC100133319 ncRNA 187.667-80 chr20 1254491 1254699 + 1 NA TTS (NM_001136566) TTS (NM_001136566) -11699 NM_001318234 9751 Hs.323833 NM_014723 ENSG00000101298 SNPH - syntaphilin protein-coding 228.333-69 chr4 71569786 71570052 + 1 NA 3' UTR (NM_001134742, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001134742, exon 25 of 25) 214160 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 149.667-107 chr13 91380365 91380567 + 1 NA Intergenic Intergenic -18155 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 207.667-58 chr2 136140777 136141062 + 1 NA Intergenic Intergenic -22764 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 263.333-65 chr4 92427128 92427716 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 123023 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 148.333-278 chr4 46922073 46922231 + 1 NA 3' UTR (NM_001204266, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001204266, exon 9 of 9) -12907 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 144.333-111 chr19 27927862 27928048 + 1 NA intron (NR_146733, intron 2 of 6) intron (NR_146733, intron 2 of 6) -134015 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 295.667-32 chr7 102837539 102837987 + 1 NA intron (NM_001287150, intron 16 of 18) AluJr|SINE|Alu -75237 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 286.333-34 chr4 78375469 78375881 + 1 NA intron (NM_001166133, intron 25 of 41) intron (NM_001166133, intron 25 of 41) 86690 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 127.333-29 chr10 92312532 92312713 + 1 NA intron (NM_017824, intron 2 of 5) Charlie25|DNA|hAT-Charlie 21455 NM_017824 54708 Hs.573490 NM_017824 ENSG00000198060 MARCH5 MARCH-V|MITOL|RNF153 membrane associated ring-CH-type finger 5 protein-coding 176.667-132 chr7 11827842 11828044 + 1 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) L2c|LINE|L2 4255 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 161.333-79 chr13 74744200 74744409 + 1 NA Intergenic Intergenic 191461 NR_034025 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 167.333-169 chr3 20256024 20256272 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -69915 NM_001199255 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 195.333-2 chr1 33597356 33597659 + 1 NA intron (NM_052896, intron 45 of 69) L1ME3D|LINE|L1 124862 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 150.333-72 chr12 13514834 13515055 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -138199 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 119.333-181 chr5 96465331 96465526 + 1 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) L1M5|LINE|L1 -32180 NM_000439 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 287.333-71 chrX 52014611 52014958 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 48689 NR_102368 101340250 NR_102368 ENSG00000221705 SNORA11E - small nucleolar RNA, H/ACA box 11E snoRNA 160.667-38 chr10 66725769 66726007 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -200148 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 140.667-45 chr10 125583120 125583346 + 1 NA intron (NM_001318133, intron 3 of 3) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 8862 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 163.667-230 chr7 30153082 30153374 + 1 NA intron (NM_152793, intron 2 of 2) intron (NM_152793, intron 2 of 2) 18242 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 169.333-280 chr8 137124835 137125123 + 1 NA Intergenic Intergenic 288609 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 246.333-52 chr2 171670707 171671004 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -16614 NM_001271786 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 189.333-82 chr18 70642461 70642808 + 1 NA non-coding (NR_160904, exon 2 of 3) non-coding (NR_160904, exon 2 of 3) 8320 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 158.333-194 chr3 18801990 18802159 + 1 NA Intergenic Intergenic -346436 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 151.333-273 chr3 30999496 30999719 + 1 NA Intergenic Intergenic -104946 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 304.667-17 chr2 56676444 56676815 + 1 NA Intergenic Intergenic -490859 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 195.667-27 chr12 12273760 12274121 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -6896 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 312.333-16 chr20 15004534 15004943 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -75220 NR_072988 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-254 chr3 114818595 114818761 + 1 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) L1ME4a|LINE|L1 -54355 NR_126422 104413890 Hs.612732 NR_126422 ENSG00000239946 ZBTB20-AS3 - ZBTB20 antisense RNA 3 ncRNA 163.333-132 chr18 60955723 60955976 + 1 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -377581 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 152.333-347 chr6 170195703 170195864 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 35141 NR_125878 102724511 Hs.550045 NR_125878 LOC102724511 - uncharacterized LOC102724511 ncRNA 120.667-6 chr1 59864058 59864209 + 1 NA intron (NM_015888, intron 16 of 21) intron (NM_015888, intron 16 of 21) 49184 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 158.333-97 chr15 63736538 63736907 + 1 NA intron (NM_003922, intron 12 of 77) AluSx|SINE|Alu 97226 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 166.333-119 chr2 78357409 78357711 + 1 NA Intergenic Intergenic -66829 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 155.333-134 chr17 30141272 30141470 + 1 NA intron (NM_032141, intron 2 of 6) L1M5|LINE|L1 -24211 NR_036149 100423003 NR_036149 ENSG00000284399 MIR3184 - microRNA 3184 ncRNA 148.667-285 chr4 79799030 79799198 + 1 NA Intergenic Intergenic -28357 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 206.333-49 chr14 23916381 23916721 + 1 NA Intergenic Intergenic -37219 NM_001282991 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 149.333-210 chr2 215028378 215028652 + 1 NA intron (NR_103740, intron 10 of 54) intron (NR_103740, intron 10 of 54) 3571 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 260.333-73 chr9 15082652 15083127 + 1 NA Intergenic Intergenic 89562 NR_003920 389705 Hs.431257 NR_003920 LOC389705 - histone PARylation factor 1 pseudogene pseudo 158.667-35 chr10 29818369 29818528 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -81512 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 229.667-50 chr20 23477404 23477756 + 1 NA Intergenic Intergenic -13537 NM_001281730 10047 Hs.121602 NM_005492 ENSG00000125815 CST8 CRES|CTES5 cystatin 8 protein-coding 172.667-120 chr5 6740660 6740849 + 1 NA intron (NM_001171805, intron 4 of 12) intron (NM_001171805, intron 4 of 12) 27322 NM_001171805 11044 Hs.481542 NM_006999 ENSG00000112941 TENT4A LAK-1|LAK1|PAPD7|POLK|POLS|TRF4|TRF4-1|TRF41|TUTASE5 terminal nucleotidyltransferase 4A protein-coding 287.333-57 chr6 25779958 25780334 + 1 NA 3' UTR (NM_001286121, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001286121, exon 13 of 13) 25404 NM_005495 10050 Hs.282931 NM_005495 ENSG00000146039 SLC17A4 KAIA2138 solute carrier family 17 member 4 protein-coding 238.667-100 chr9 123852087 123852395 + 1 NA intron (NM_001352968, intron 2 of 18) MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 77885 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 148.333-80 chr12 5252412 5252584 + 1 NA Intergenic Intergenic -9347 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 156.667-244 chr4 73907340 73907607 + 1 NA Intergenic Intergenic 38080 NR_046035 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 244.333-98 chr8 11304354 11304637 + 1 NA intron (NM_015458, intron 3 of 9).2 L3|LINE|CR1 19679 NM_015458 66036 Hs.591395 NM_015458 ENSG00000104643 MTMR9 C8orf9|LIP-STYX|MTMR8 myotubularin related protein 9 protein-coding 238.667-64 chr4 146263837 146264246 + 1 NA intron (NM_001029998, intron 10 of 11) intron (NM_001029998, intron 10 of 11) 49503 NM_001371071 206.667-116 chr5 145553761 145554072 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 281426 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 120.667-165 chr7 89936581 89936739 + 1 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 -182740 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 248.333-24 chr12 68659090 68659398 + 1 NA intron (NM_001010942, intron 7 of 7) intron (NM_001010942, intron 7 of 7) 27615 NR_038930 100507250 Hs.600731 NR_038930 ENSG00000247363 LOC100507250 - uncharacterized LOC100507250 ncRNA 166.667-89 chr17 61884047 61884319 + 1 NA intron (NM_001351695, intron 16 of 24) intron (NM_001351695, intron 16 of 24) -20624 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 165.667-84 chr2 19031806 19032074 + 1 NA Intergenic Intergenic -4969 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 173.333-28 chr10 58304811 58305090 + 1 NA Intergenic Intergenic 24729 NR_158219 112268068 Hs.586671 NR_158219 LOC112268068 - uncharacterized LOC112268068 ncRNA 208.667-97 chr4 46475428 46475810 + 1 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -85491 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 340.333-21 chr8 60214977 60215461 + 1 NA intron (NM_004056, intron 7 of 8) intron (NM_004056, intron 7 of 8) 66181 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 155.333-83 chr12 109032883 109033137 + 1 NA intron (NM_001301175, intron 3 of 15) intron (NM_001301175, intron 3 of 15) 9921 NM_001301175 84749 Hs.486434 NM_032663 ENSG00000135093 USP30 - ubiquitin specific peptidase 30 protein-coding 157.333-151 chr17 53003799 53003973 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 18381 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 171.667-31 chr11 78288667 78288917 + 1 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) L1MD|LINE|L1 53088 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 128.667-41 chr12 25409202 25409387 + 1 NA Intergenic Intergenic 143989 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 180.667-100 chr3 119870695 119870913 + 1 NA intron (NM_002093, intron 8 of 11) intron (NM_002093, intron 8 of 11) 88094 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 163.667-225 chr7 4861215 4861444 + 1 NA exon (NM_020144, exon 1 of 1) exon (NM_020144, exon 1 of 1) 701 NM_020144 56903 Hs.487409 NM_020144 ENSG00000218823 PAPOLB PAPT|TPAP poly(A) polymerase beta protein-coding 130.333-222 chr9 107265033 107265213 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -18156 NM_002874 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 271.333-67 chr8 58338195 58338534 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -66263 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 142.333-175 chr4 48036983 48037219 + 1 NA 3' UTR (NM_207330, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_207330, exon 6 of 6) 20329 NM_207330 152519 Hs.134190 NM_207330 ENSG00000163293 NIPAL1 NPAL1 NIPA like domain containing 1 protein-coding 140.667-211 chr7 25676125 25676354 + 1 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) -5508 NR_157816 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 156.333-371 chr8 139300968 139301137 + 1 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -387011 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 156.667-237 chr4 19366466 19366740 + 1 NA Intergenic Intergenic -885302 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 199.333-171 chr22 29833495 29833860 + 1 NA intron (NM_001369921, intron 2 of 21) intron (NM_001369921, intron 2 of 21) 4597 NM_001369935 84164 Hs.731754 NM_032204 ENSG00000100325 ASCC2 ASC1p100|p100 activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 protein-coding 255.667-16 chr11 102362753 102363111 + 1 NA exon (NM_001256166, exon 4 of 9) exon (NM_001256166, exon 4 of 9) 15558 NM_001256163 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 161.667-241 chr7 80986594 80986910 + 1 NA Intergenic Intergenic -64363 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 148.333-149 chr15 99077726 99077882 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -27276 NM_145728 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 204.333-202 chr8 127905240 127905566 + 1 NA intron (NR_003367, intron 2 of 8) intron (NR_003367, intron 2 of 8) 43320 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 293.667-8 chr10 127180626 127181109 + 1 NA intron (NM_001039762, intron 2 of 5) intron (NM_001039762, intron 2 of 5) 15724 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 141.667-97 chr17 68559062 68559347 + 1 NA promoter-TSS (NR_027751) promoter-TSS (NR_027751) -777 NR_027751 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 167.667-10 chr1 156936194 156936440 + 1 NA promoter-TSS (NR_030527) promoter-TSS (NR_030527) -73 NR_030527 768220 NR_030527 ENSG00000211581 MIR765 MIRN765|hsa-mir-765|mir-765 microRNA 765 ncRNA 317.667-42 chrX 125106843 125107442 + 1 NA Intergenic Intergenic -143325 NM_001163279 10178 Hs.23796 NM_014253 ENSG00000009694 TENM1 ODZ1|ODZ3|TEN-M1|TNM|TNM1|ten-1 teneurin transmembrane protein 1 protein-coding 160.333-72 chr12 29746855 29747131 + 1 NA intron (NM_001367875, intron 5 of 19) intron (NM_001367875, intron 5 of 19) 36949 NM_001367875 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 157.667-261 chr5 123233767 123234003 + 1 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -143569 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 280.333-21 chr2 177240280 177240654 + 1 NA intron (NM_001313903, intron 1 of 4) intron (NM_001313903, intron 1 of 4) 15543 NR_036075 100422824 NR_036075 ENSG00000265396 MIR3128 mir-3128 microRNA 3128 ncRNA 322.667-30 chr7 17734088 17734426 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -175348 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 156.667-48 chr10 72201539 72201720 + 1 NA intron (NM_001369110, intron 4 of 8) AluJo|SINE|Alu 14327 NM_001369088 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 176.667-126 chr6 34894724 34894955 + 1 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) intron (NM_015245, intron 1 of 23) 5584 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 252.667-49 chr2 78352277 78352824 + 1 NA Intergenic Intergenic -61819 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 183.667-83 chr2 207189115 207189573 + 1 NA intron (NR_110283, intron 3 of 3) intron (NR_110283, intron 3 of 3) -22098 NM_001270943 8609 Hs.59908 NM_003709 ENSG00000118263 KLF7 UKLF Kruppel like factor 7 protein-coding 220.333-25 chr11 26315882 26316212 + 1 NA intron (NM_001313726, intron 2 of 27) intron (NM_001313726, intron 2 of 27) -16083 NM_031418 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 168.667-210 chr7 106157360 106157588 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -44898 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 152.333-35 chr10 14410333 14410500 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26160 NR_031668 100302116 NR_031668 ENSG00000221371 MIR1265 MIRN1265|hsa-mir-1265 microRNA 1265 ncRNA 352.333-24 chr7 51737111 51737685 + 1 NA Intergenic Intergenic -344142 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 165.667-58 chr14 84725774 84725985 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -546053 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 146.667-100 chr14 54345117 54345345 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -51637 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 118.333-37 chr10 116323466 116323690 + 1 NA promoter-TSS (NM_198515) promoter-TSS (NM_198515) -870 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 116.333 chr1 8528242 8528411 + 1 NA intron (NM_001042681, intron 7 of 22) L1MC4|LINE|L1 -33413 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 213.667-55 chr3 100072403 100072751 + 1 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 41936 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 143.667-235 chr7 62876894 62877046 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 427086 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 173.667-162 chr7 28672093 28672410 + 1 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) MIR3|SINE|MIR -13882 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 156.333-261 chr4 35478329 35478582 + 1 NA Intergenic Intergenic 765484 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 123.667-115 chr22 47541240 47541404 + 1 NA Intergenic Intergenic -54211 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 201.667-118 chr8 78611477 78611861 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -53166 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 148.333-30 chr1 208714873 208715121 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -13691 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 153.333-37 chr1 246066403 246066670 + 1 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 350876 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 161.333-150 chr2 114048079 114048315 + 1 NA Intergenic Intergenic -68213 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 251.667-3 chr1 73766786 73767127 + 1 NA Intergenic Intergenic 92277 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 141.667-30 chr10 65311740 65311972 + 1 NA Intergenic Intergenic -259569 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 129.667-115 chr3 23030094 23030339 + 1 NA Intergenic Intergenic 172362 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 127.667-126 chr4 59281255 59281407 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 267758 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 162.333-198 chr5 59317028 59317238 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 39837 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 133.333-77 chr2 55187084 55187239 + 1 NA intron (NR_148539, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu -44742 NM_001135592 6233 Hs.311640 NM_002954 ENSG00000143947 RPS27A CEP80|HEL112|S27A|UBA80|UBC|UBCEP1|UBCEP80 ribosomal protein S27a protein-coding 157.667-19 chr1 223312504 223312778 + 1 NA intron (NM_017982, intron 2 of 8) MIRc|SINE|MIR 51535 NM_001037175 55061 Hs.497841 NM_017982 ENSG00000143502 SUSD4 PRO222 sushi domain containing 4 protein-coding 186.333-158 chr8 33228688 33228940 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 244332 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 152.667-141 chr17 68742679 68742906 + 1 NA Intergenic LTR36|LTR|ERV1 114638 NR_110825 101928104 Hs.569826 NR_110825 ENSG00000267659 LINC01482 - long intergenic non-protein coding RNA 1482 ncRNA 244.333-109 chr8 137091237 137091657 + 1 NA Intergenic Intergenic 322141 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 178.333-16 chr10 47291527 47291751 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -8558 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 185.333-162 chr6 14443993 14444382 + 1 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -158733 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 162.667-240 chr6 52990065 52990273 + 1 NA intron (NM_001512, intron 2 of 6) intron (NM_001512, intron 2 of 6) 5115 NM_001512 2941 Hs.485557 NM_001512 ENSG00000170899 GSTA4 GSTA4-4|GTA4 glutathione S-transferase alpha 4 protein-coding 151.333-161 chr16 66178045 66178267 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -188535 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 181.333-75 chr2 86386648 86386829 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -48655 NM_001164730 65055 Hs.368884 NM_022912 ENSG00000068615 REEP1 C2orf23|HMN5B|SPG31|Yip2a receptor accessory protein 1 protein-coding 171.667-129 chr5 28160168 28160384 + 1 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 127389 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 156.333-383 chrX 24068112 24068347 + 1 NA intron (NM_001415, intron 9 of 11) intron (NM_001415, intron 9 of 11) 13273 NM_001415 1968 Hs.539684 NM_001415 ENSG00000130741 EIF2S3 EIF2|EIF2G|EIF2gamma|MEHMO|MRXSBRK|eIF-2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma protein-coding 174.667-9 chr1 116198432 116198744 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 86833 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 148.333-96 chr12 46495670 46495907 + 1 NA intron (NR_125380, intron 3 of 3) intron (NR_125380, intron 3 of 3) 111681 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 203.333-234 chr6 104331852 104332161 + 1 NA Intergenic Intergenic 527540 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 178.667-26 chr10 106029025 106029370 + 1 NA Intergenic Intergenic -110968 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 154.667-273 chr4 65266230 65266486 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -261858 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 128.333-170 chr6 64598959 64599116 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 24 of 43) L2a|LINE|L2 -702381 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 317.667-15 chr16 2050297 2050716 + 1 NA intron (NM_001318831, intron 3 of 37) intron (NM_001318831, intron 3 of 37) 2304 NM_001318832 7249 Hs.90303 NM_000548 ENSG00000103197 TSC2 LAM|PPP1R160|TSC4 TSC complex subunit 2 protein-coding 354.333-16 chr6 120518089 120518571 + 1 NA Intergenic Intergenic 503151 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 147.667-302 chr6 14368023 14368301 + 1 NA Intergenic Intergenic -82708 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 203.667-85 chr4 37759220 37759449 + 1 NA Intergenic Intergenic -67352 NM_018290 55276 Hs.23363 NM_018290 ENSG00000169299 PGM2 MSTP006 phosphoglucomutase 2 protein-coding 114.333-214 chr8 30495584 30495752 + 1 NA intron (NM_001008710, intron 4 of 8) intron (NM_001008710, intron 4 of 8) -110267 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 225.333-35 chr12 80318540 80318915 + 1 NA intron (NM_001368062, intron 37 of 62) intron (NM_001368062, intron 37 of 62) 109274 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 153.667-35 chr10 17119887 17120185 + 1 NA intron (NM_001081, intron 6 of 66) intron (NM_001081, intron 6 of 66) 9781 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 325.333-54 chr9 112576732 112577247 + 1 NA intron (NM_133465, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 -89345 NM_001350649 100133204 Hs.662552 NM_001350649 C9orf147 - chromosome 9 open reading frame 147 protein-coding 125.333-132 chr5 4307666 4307791 + 1 NA Intergenic Intergenic -465753 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 156.667-265 chr5 33555841 33556052 + 1 NA intron (NM_001324512, intron 18 of 21) intron (NM_001324512, intron 18 of 21) 115170 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 202.333-44 chr12 33810524 33810828 + 1 NA Intergenic Intergenic -211820 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 239.333-79 chr4 98710554 98710970 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 51860 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 154.667-414 chr9 101927868 101928044 + 1 NA Intergenic Intergenic -189376 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 307.333-55 chr3 42355927 42356514 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 54390 NM_144634 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 144.333-267 chr8 87985816 87985998 + 1 NA Intergenic Intergenic -111892 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 173.667-86 chr2 121629876 121630103 + 1 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) AluSz|SINE|Alu 19473 NM_015282 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 153.667-407 chr9 85971610 85971802 + 1 NA intron (NM_024635, intron 6 of 22) L2|LINE|L2 30177 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 207.667-78 chr3 129111856 129112081 + 1 NA intron (NM_001204890, intron 11 of 12) AluJb|SINE|Alu 9836 NM_001204886 339122 Hs.381132 NM_198490 ENSG00000172780 RAB43 RAB11B|RAB41 RAB43, member RAS oncogene family protein-coding 135.667-24 chr11 7081575 7081779 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -7321 NM_014469 27288 Hs.121605 NM_014469 ENSG00000170748 RBMXL2 HNRNPG-T|HNRNPGT|HNRPGT RBMX like 2 protein-coding 266.333-58 chr6 119668491 119668846 + 1 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 118860 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 179.333-119 chr22 37864430 37864721 + 1 NA intron (NM_001363785, intron 6 of 11) AluSx1|SINE|Alu 15156 NM_016091 51386 Hs.446852 NM_016091 ENSG00000100129 EIF3L EIF3EIP|EIF3S11|EIF3S6IP|HSPC021|HSPC025|MSTP005 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L protein-coding 264.333-6 chr10 18328771 18329093 + 1 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) intron (NM_000724, intron 1 of 12) -11777 NM_201590 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 396.667-7 chr2 84651156 84651893 + 1 NA intron (NM_001370, intron 33 of 76) L1MDa|LINE|L1 135069 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 268.333-35 chr20 52312862 52313298 + 1 NA Intergenic Intergenic -121095 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 152.667-248 chr3 96564639 96564792 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 204751 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 311.667-6 chr15 82124087 82124513 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 35706 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 189.667-85 chr20 39078774 39079030 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 116558 NM_021931 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 196.333-77 chr18 75189221 75189434 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 16186 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 160.667-145 chr2 80399297 80399595 + 1 NA intron (NM_001282599, intron 2 of 11) intron (NM_001282599, intron 2 of 11) 86067 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 154.667-332 chr6 11977298 11977506 + 1 NA Intergenic Intergenic 23842 NR_125853 101928253 Hs.128163 NR_125853 LOC101928253 - uncharacterized LOC101928253 ncRNA 159.333-112 chr16 22356262 22356451 + 1 NA intron (NM_001802, intron 2 of 4).2 AluSz|SINE|Alu 18263 NM_001802 1039 Hs.513430 NM_001802 ENSG00000140743 CDR2 CDR62|Yo cerebellar degeneration related protein 2 protein-coding 234.333-47 chr3 22522346 22522634 + 1 NA Intergenic Intergenic 565351 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 262.667-18 chr11 125227356 125227692 + 1 NA intron (NM_022062, intron 1 of 12) L1MB3|LINE|L1 62773 NM_022062 63876 Hs.278564 NM_022062 ENSG00000165495 PKNOX2 PREP2 PBX/knotted 1 homeobox 2 protein-coding 154.333-201 chr22 45083989 45084173 + 1 NA Intergenic Intergenic 68503 NR_038957 100506714 Hs.189902 NR_038956 NUP50-DT NUP50-AS1 NUP50 divergent transcript ncRNA 166.667-229 chr8 38297840 38298067 + 1 NA intron (NM_023034, intron 15 of 23) intron (NM_023034, intron 15 of 23) -28721 NM_001354454 84513 Hs.567619 NM_032483 ENSG00000147535 PLPP5 DPPL1|HTPAP|PPAPDC1B phospholipid phosphatase 5 protein-coding 260.667-62 chr4 41640841 41641316 + 1 NA intron (NM_001330786, intron 6 of 22) intron (NM_001330786, intron 6 of 22) 28176 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 157.667-130 chr18 67681928 67682087 + 1 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) L1PB4|LINE|L1 132815 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 151.333-315 chr4 97804869 97805063 + 1 NA intron (NM_174952, intron 9 of 10) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 338510 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 193.667-46 chr15 86157073 86157453 + 1 NA intron (NM_152336, intron 4 of 24) intron (NM_152336, intron 4 of 24) -40546 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 413.667-4 chr2 16893277 16893972 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -227790 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 113.333-250 chr8 15308348 15308501 + 1 NA Intergenic Intergenic -69993 NM_001322879 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 162.333-8 chr1 89917339 89917600 + 1 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 77497 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 141.333-25 chr10 57812240 57812387 + 1 NA Intergenic (TTTAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 455581 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 157.667-74 chr12 43833475 43833768 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2240 NM_001286212 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 153.667-27 chr1 211058164 211058367 + 1 NA intron (NM_002238, intron 5 of 10) L1MA3|LINE|L1 75109 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 129.667-48 chr13 83764888 83765142 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 117378 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 169.667-130 chr3 60828996 60829262 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 4 of 9) L2b|LINE|L2 -211259 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 200.667-92 chr2 217182843 217183124 + 1 NA Intergenic Intergenic -99750 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 154.333-266 chr5 61467511 61467745 + 1 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 135370 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 181.333-173 chr8 89326688 89326998 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 430868 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 153.333-332 chr5 76368544 76368763 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -34632 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 137.333-82 chr19 32210419 32210655 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -104621 NR_110694 101927411 Hs.515337 NR_110694 ENSG00000267204 LINC01782 - long intergenic non-protein coding RNA 1782 ncRNA 115.333-85 chr15 83116047 83116213 + 1 NA intron (NM_001353884, intron 3 of 7) intron (NM_001353884, intron 3 of 7) 8485 NR_148560 53346 Hs.513094 NM_023003 ENSG00000136404 TM6SF1 - transmembrane 6 superfamily member 1 protein-coding 160.667-128 chr18 5486298 5486604 + 1 NA intron (NM_001281535, intron 4 of 21) L1MA4|LINE|L1 54105 NM_001281533 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 169.667-148 chr4 46655088 46655326 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 254038 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 247.667-27 chr13 33111050 33111395 + 1 NA intron (NM_178007, intron 10 of 13) intron (NM_178007, intron 10 of 13) 74869 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 160.667-158 chr2 139672229 139672403 + 1 NA Intergenic LTR73|LTR|ERV1 774992 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 246.333-23 chr12 67303021 67303475 + 1 NA intron (NM_018448, intron 8 of 14) MIR|SINE|MIR 33890 NM_001329674 55832 Hs.546407 NM_018448 ENSG00000111530 CAND1 TIP120|TIP120A cullin associated and neddylation dissociated 1 protein-coding 120.333-91 chr2 34117380 34117551 + 1 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 50239 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 209.333-26 chr11 3632892 3633200 + 1 NA intron (NR_002720, intron 2 of 6) AluSx1|SINE|Alu 6586 NR_002720 7221 Hs.131910 NR_002720 ENSG00000182048 TRPC2 - transient receptor potential cation channel subfamily C member 2 (pseudogene) pseudo 211.333-219 chr7 25424348 25424683 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -196029 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 189.667-91 chr3 45478044 45478335 + 1 NA intron (NM_001368263, intron 9 of 20) intron (NM_001368263, intron 9 of 20) 31356 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 168.333-168 chr5 142641924 142642215 + 1 NA intron (NM_001144935, intron 1 of 3) intron (NM_001144935, intron 1 of 3) 2232 NM_001257210 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 204.667-60 chr18 7356044 7356317 + 1 NA Intergenic Intergenic 104826 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 152.333-316 chr5 140697528 140697792 + 1 NA exon (NM_001363535, exon 12 of 14) exon (NM_001363535, exon 12 of 14) -2787 NM_144723 153527 Hs.350194 NM_144723 ENSG00000146007 ZMAT2 Ptg-12|Snu23 zinc finger matrin-type 2 protein-coding 154.667-175 chr2 72044197 72044377 + 1 NA Intergenic Intergenic 103575 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 121.333-27 chr11 6540687 6540833 + 1 NA intron (NM_144666, intron 18 of 42) L2c|LINE|L2 43464 NM_144666 144132 Hs.720080 NM_144666 ENSG00000179532 DNHD1 C11orf47|CCDC35|DHCD1|DNHD1L dynein heavy chain domain 1 protein-coding 225.333-8 chr10 5830593 5830854 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17174 NM_001115156 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 137.333-205 chr9 30796415 30796622 + 1 NA Intergenic Intergenic -388064 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 229.667-20 chr12 41312243 41312733 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 124168 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 152.667-12 chr1 102022594 102022760 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -25443 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 241.667-34 chr2 80535470 80536023 + 1 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 222367 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 187.333-7 chr1 86771779 86772008 + 1 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 67317 NM_001206652 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 327.333-9 chr12 24270920 24271326 + 1 NA intron (NM_001261414, intron 4 of 16) L1ME3B|LINE|L1 47852 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 179.667-28 chr11 45364081 45364492 + 1 NA Intergenic Intergenic -7111 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 151.333-408 chr8 41976578 41976760 + 1 NA intron (NM_001305878, intron 7 of 13) intron (NM_001305878, intron 7 of 13) -75081 NR_136589 105379393 Hs.742878 NR_136589 LOC105379393 - uncharacterized LOC105379393 ncRNA 220.667-66 chr3 162696551 162696943 + 1 NA Intergenic Intergenic 606554 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 209.667-80 chr3 24499755 24500002 + 1 NA non-coding (NR_046244, exon 2 of 2) non-coding (NR_046244, exon 2 of 2) -4170 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 176.667-67 chr18 7800865 7801159 + 1 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 233696 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 166.333-203 chr6 141319892 141320282 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 636273 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 133.333-66 chr17 73665460 73665728 + 1 NA Intergenic Intergenic -21149 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 161.667-64 chr13 50704239 50704478 + 1 NA Intergenic Intergenic -103497 NR_046551 100874074 Hs.734030 NR_046551 ENSG00000176124 DLEU7-AS1 - DLEU7 antisense RNA 1 ncRNA 156.333-319 chr6 143638910 143639101 + 1 NA intron (NM_014721, intron 1 of 12) intron (NM_014721, intron 1 of 12) 30825 NM_014721 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 152.333-252 chr3 148633266 148633562 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -64457 NM_009585 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 209.333-127 chr2 198308468 198308852 + 1 NA intron (NR_110267, intron 2 of 2) intron (NR_110267, intron 2 of 2) 66437 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 156.333-35 chr10 49393136 49393326 + 1 NA intron (NM_001276451, intron 2 of 6) L1MC4a|LINE|L1 2858 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 358.333-21 chr5 14191377 14191789 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 48241 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 173.333-156 chr5 44161240 44161561 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -227332 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 130.667-125 chr2 218190548 218190772 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -23698 NM_000634 3577 Hs.194778 NM_000634 ENSG00000163464 CXCR1 C-C|C-C-CKR-1|CD128|CD181|CDw128a|CKR-1|CMKAR1|IL8R1|IL8RA|IL8RBA C-X-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 170.333 chr1 24885836 24886031 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 33483 NR_106789 102465437 NR_106789 ENSG00000278034 MIR6731 hsa-mir-6731 microRNA 6731 ncRNA 147.667-385 chr8 144961985 144962221 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -11223 NM_001029976 7564 Hs.493225 NM_006958 ENSG00000170631 ZNF16 HZF1|KOX9 zinc finger protein 16 protein-coding 263.667-77 chr7 88104126 88104450 + 1 NA intron (NM_001324421, intron 4 of 28) L1ME4b|LINE|L1 -112372 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 208.667-127 chr7 56097902 56098284 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -5097 NM_006213 5260 Hs.730821 NM_006213 ENSG00000164776 PHKG1 PHKG phosphorylase kinase catalytic subunit gamma 1 protein-coding 157.667-214 chr4 60112843 60113138 + 1 NA Intergenic Intergenic -809629 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 174.333-119 chr5 60076343 60076529 + 1 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) AluY|SINE|Alu -182710 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 113.667-219 chr8 136334213 136334387 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -196498 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 125.333-107 chr20 58352256 58352422 + 1 NA intron (NM_020673, intron 3 of 6) intron (NM_020673, intron 3 of 6) -36780 NM_004738 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 150.667-211 chr20 23958825 23959011 + 1 NA Intergenic Intergenic 27957 NM_178312 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 267.667-74 chr9 130738762 130739060 + 1 NA intron (NM_007313, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu 25030 NM_007313 25 Hs.431048 NM_005157 ENSG00000097007 ABL1 ABL|CHDSKM|JTK7|bcr/abl|c-ABL|c-ABL1|p150|v-abl ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 119.667-79 chr2 38830989 38831145 + 1 NA intron (NM_001329963, intron 13 of 23) AluJo|SINE|Alu 44867 NM_198963 90957 Hs.468226 NM_198963 ENSG00000163214 DHX57 DDX57 DExH-box helicase 57 protein-coding 235.333-17 chr11 3706579 3706967 + 1 NA intron (NR_157590, intron 20 of 31) intron (NR_157590, intron 20 of 31) -35389 NM_001303034 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 173.333-140 chr4 30610518 30610867 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -109677 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 128.333-97 chr2 49433821 49433970 + 1 NA Intergenic Intergenic -279368 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 157.333-340 chr8 106057346 106057544 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 3058 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 159.667-234 chr4 64381341 64381527 + 1 NA intron (NM_001363796, intron 1 of 11) L1MA4|LINE|L1 28016 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 266.333-24 chr16 6999769 7000266 + 1 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu 226208 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 176.667-119 chr5 37068248 37068548 + 1 NA Intergenic Intergenic -180648 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 166.333-84 chr15 97349071 97349328 + 1 NA Intergenic Intergenic 172612 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 127.667-149 chr6 34857135 34857296 + 1 NA intron (NM_017754, intron 11 of 20) intron (NM_017754, intron 11 of 20) 30827 NM_005643 6882 Hs.112444 NM_005643 ENSG00000064995 TAF11 MGC:15243|PRO2134|TAF2I|TAFII28 TATA-box binding protein associated factor 11 protein-coding 134.333-120 chr3 144451040 144451232 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 478055 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 117.333-4 chr1 57280119 57280354 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 5 of 5) intron (NM_001353980, intron 5 of 5) 142876 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 163.333-214 chr5 20008596 20008782 + 1 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -20489 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 237.667-33 chr18 65955352 65955601 + 1 NA Intergenic Intergenic 204464 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 232.333-16 chr11 121777665 121777993 + 1 NA Intergenic Intergenic 322015 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 325.333-31 chr4 54457469 54457964 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 124824 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 157.667-301 chr7 39264424 39264670 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) intron (NM_001370959, intron 4 of 9) 64587 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 174.333-51 chr18 22844305 22844603 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -57617 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 184.667-71 chr21 30786936 30787219 + 1 NA Intergenic Intergenic 26197 NM_175857 337879 Hs.407655 NM_175857 ENSG00000183640 KRTAP8-1 KAP8.1 keratin associated protein 8-1 protein-coding 146.667-17 chr1 119669395 119669582 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -21222 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 204.667-62 chr18 68641183 68641546 + 1 NA Intergenic Intergenic 73744 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 300.667-23 chr2 140618471 140618948 + 1 NA intron (NM_018557, intron 41 of 90) intron (NM_018557, intron 41 of 90) -32024 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 300.667-26 chr3 13073695 13074062 + 1 NA promoter-TSS (NM_001134382) promoter-TSS (NM_001134382) -449 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 259.667-54 chr4 56823961 56824437 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -2330 NM_021114 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 137.667-156 chr5 158516198 158516470 + 1 NA Intergenic Intergenic -106561 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 189.333-28 chr10 72789905 72790198 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 69022 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 287.667-34 chr6 38120391 38120959 + 1 NA intron (NM_021943, intron 5 of 5) intron (NM_021943, intron 5 of 5) 300948 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 112.667-195 chr4 87643434 87643666 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -6730 NM_004407 1758 Hs.652366 NM_004407 ENSG00000152592 DMP1 ARHP|ARHR|DMP-1 dentin matrix acidic phosphoprotein 1 protein-coding 167.667-16 chr1 224979763 224980038 + 1 NA intron (NM_001349911, intron 8 of 10) L1M1|LINE|L1 50225 NM_001349912 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 235.333-97 chr5 79677316 79677641 + 1 NA intron (NM_001349553, intron 14 of 16) intron (NM_001349553, intron 14 of 16) -12358 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 222.667-83 chr6 109779041 109779339 + 1 NA intron (NM_014845, intron 16 of 22) intron (NM_014845, intron 16 of 22) 87969 NM_014845 9896 Hs.529959 NM_014845 ENSG00000112367 FIG4 ALS11|BTOP|CMT4J|KIAA0274|SAC3|YVS|dJ249I4.1 FIG4 phosphoinositide 5-phosphatase protein-coding 137.667-75 chr17 60707477 60707677 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 4 of 25) L1M4|LINE|L1 29726 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 147.667-156 chr18 77890242 77890408 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 103402 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 300.667-37 chr6 54939710 54940084 + 1 NA exon (NM_001010872, exon 5 of 5) exon (NM_001010872, exon 5 of 5) 93126 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 146.667-223 chr3 120781919 120782112 + 1 NA 3' UTR (NM_005513, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_005513, exon 5 of 5) 39271 NM_005513 2960 Hs.445272 NM_005513 ENSG00000153767 GTF2E1 FE|TF2E1|TFIIE-A general transcription factor IIE subunit 1 protein-coding 156.333-391 chrX 89129171 89129335 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 382028 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 221.333-42 chr15 79816140 79816496 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 80679 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 227.333-101 chr5 32871332 32871719 + 1 NA Intergenic Intergenic -75918 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 203.667 chr1 9196068 9196502 + 1 NA Intergenic Intergenic -13947 NR_132742 106614088 Hs.551837 NR_132742 ENSG00000228526 MIR34AHG - MIR34A host gene ncRNA 164.333-125 chr2 152522109 152522441 + 1 NA intron (NM_052905, intron 2 of 25) L1MC5a|LINE|L1 187101 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 193.667-113 chr6 64629178 64629440 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) L1MC3|LINE|L1 -672109 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 174.333-58 chr2 37331092 37331313 + 1 NA Intergenic Intergenic -13428 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 266.333-25 chr16 71559325 71559821 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -5443 NR_103852 100132529 Hs.710296 NR_103851 ENSG00000260886 TAT-AS1 - TAT antisense RNA 1 ncRNA 305.666-15 chr4 88894756 88895223 + 1 NA intron (NM_014883, intron 6 of 23) intron (NM_014883, intron 6 of 23) -71628 NM_001265579 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 277.333-15 chr11 50551592 50552086 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 142692 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 169.333-64 chr13 30635674 30636005 + 1 NA intron (NM_001321534, intron 1 of 5) intron (NM_001321534, intron 1 of 5) 1624 NM_001321534 10208 Hs.533831 NM_005800 ENSG00000132952 USPL1 C13orf22|D13S106E|bA121O19.1 ubiquitin specific peptidase like 1 protein-coding 148.667-280 chr4 64575752 64575949 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -166390 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 112.333-85 chr16 77687046 77687190 + 1 NA Intergenic Intergenic -35374 NM_001243657 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 152.333-38 chr10 22834531 22834697 + 1 NA Intergenic Intergenic -93410 NM_001282747 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 209.667-101 chr7 37968631 37968895 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 47444 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 162.333-128 chr2 178475643 178475903 + 1 NA intron (NM_181342, intron 2 of 3) L1ME4b|LINE|L1 2827 NM_181342 51661 Hs.410378 NM_016105 ENSG00000079150 FKBP7 FKBP23|PPIase FKBP prolyl isomerase 7 protein-coding 155.667-211 chr3 5164702 5164888 + 1 NA intron (NM_018184, intron 1 of 6) L1MC4|LINE|L1 -22912 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 122.667-135 chr4 58237382 58237596 + 1 NA Intergenic Intergenic 298839 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 126.333-178 chr8 82392983 82393142 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -519042 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 156.667-127 chr16 68462572 68462783 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -14169 NM_018667 55512 Hs.368421 NM_018667 ENSG00000103056 SMPD3 NSMASE2 sphingomyelin phosphodiesterase 3 protein-coding 264.333-47 chr3 86048587 86048914 + 1 NA intron (NM_001256502, intron 9 of 10) intron (NM_001256502, intron 9 of 10) -220700 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 146.333-296 chr6 154936502 154936672 + 1 NA Intergenic MER91B|DNA|hAT-Tip100 83227 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 238.667-76 chr6 24493266 24493547 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1563 NM_001080 7915 Hs.371723 NM_001080 ENSG00000112294 ALDH5A1 SSADH|SSDH aldehyde dehydrogenase 5 family member A1 protein-coding 174.333-72 chr2 224384658 224384856 + 1 NA intron (NM_001122779, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 17237 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 148.333-117 chr14 42042438 42042677 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 435701 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 238.667-99 chr9 102100847 102101228 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -362457 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 158.667-249 chr4 112929671 112929860 + 1 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) intron (NM_001354275, intron 2 of 43) 68778 NM_001354267 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 168.333-86 chr19 39708851 39709087 + 1 NA intron (NM_020129, intron 3 of 3) intron (NM_020129, intron 3 of 3) 4488 NM_203471 56891 Hs.24236 NM_020129 ENSG00000006659 LGALS14 CLC2|PPL13 galectin 14 protein-coding 114.333-231 chr8 120261267 120261461 + 1 NA intron (NM_021110, intron 23 of 47) MIR|SINE|MIR 136262 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 232.333-9 chr10 100948904 100949391 + 1 NA intron (NM_018121, intron 15 of 19) intron (NM_018121, intron 15 of 19) -23382 NM_017893 57715 Hs.591923 NM_017893 ENSG00000095539 SEMA4G - semaphorin 4G protein-coding 142.333-61 chr12 62375453 62375604 + 1 NA intron (NM_001351165, intron 10 of 23) L2c|LINE|L2 -91298 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 163.333-135 chr19 55635039 55635310 + 1 NA Intergenic Intergenic -5828 NM_207115 51157 Hs.631551 NM_016202 ENSG00000213015 ZNF580 - zinc finger protein 580 protein-coding 154.333-271 chr5 99356802 99357101 + 1 NA Intergenic Intergenic -177039 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 141.667-208 chr7 38015597 38015762 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 94360 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 128.667-48 chr12 127479093 127479312 + 1 NA Intergenic Intergenic -139130 NR_110057 101927616 Hs.637827 NR_110057 ENSG00000256362 LINC02375 - long intergenic non-protein coding RNA 2375 ncRNA 341.333-28 chr7 15014137 15014652 + 1 NA Intergenic Intergenic -39536 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 166.333-182 chr5 45387989 45388187 + 1 NA intron (NM_021072, intron 4 of 7) intron (NM_021072, intron 4 of 7) 308292 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 142.333-196 chr5 61485777 61485923 + 1 NA intron (NM_020928, intron 2 of 13) intron (NM_020928, intron 2 of 13) -151910 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 202.333-183 chr8 138639829 138640044 + 1 NA intron (NM_152888, intron 47 of 64) MER67C|LTR|ERV1 -142206 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 223.333-121 chr5 7111253 7111692 + 1 NA Intergenic Intergenic 157882 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 155.667-145 chr19 30195552 30195748 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -176734 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 161.333-243 chr6 51905570 51905745 + 1 NA intron (NM_138694, intron 41 of 66) L2|LINE|L2 181956 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 179.667-150 chr8 141690208 141690533 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 95943 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 153.667-341 chr6 95641351 95641598 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 63939 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 141.333-33 chr11 38544793 38544942 + 1 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR 101489 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 168.333-28 chr10 90956060 90956229 + 1 NA intron (NR_131214, intron 3 of 5) intron (NR_131214, intron 3 of 5) 8844 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 226.667-49 chr2 68314717 68315020 + 1 NA intron (NM_015463, intron 2 of 2) intron (NM_015463, intron 2 of 2) 5183 NM_001111101 25927 Hs.212885 NM_015463 ENSG00000119865 CNRIP1 C2orf32|CRIP1 cannabinoid receptor interacting protein 1 protein-coding 153.667-338 chr6 70207435 70207643 + 1 NA 3' UTR (NM_001858, exon 51 of 51) 3' UTR (NM_001858, exon 51 of 51) 75658 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 215.667-82 chr3 48882289 48882599 + 1 NA intron (NM_000387, intron 3 of 8) intron (NM_000387, intron 3 of 8) 16438 NM_000387 788 Hs.13845 NM_000387 ENSG00000178537 SLC25A20 CAC|CACT solute carrier family 25 member 20 protein-coding 241.333-20 chr10 85261451 85261808 + 1 NA Intergenic Intergenic -62691 NR_120667 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 161.667-199 chr5 43063230 43063391 + 1 NA intron (NR_104651, intron 2 of 2) (AAGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3661 NR_034127 100132356 Hs.726831 NM_175919 LOC100132356 - uncharacterized LOC100132356 ncRNA 213.667-39 chr17 61922547 61922881 + 1 NA intron (NM_001351695, intron 3 of 24) intron (NM_001351695, intron 3 of 24) 5268 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 231.667-18 chr14 80258109 80258399 + 1 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) L1ME3Cz|LINE|L1 -27197 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 168.333-224 chr9 118177019 118177212 + 1 NA Intergenic Intergenic 472712 NM_003266 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 182.333-167 chr9 32789774 32789958 + 1 NA TTS (NM_212558) TTS (NM_212558) 6326 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 221.667-54 chr3 142690586 142690968 + 1 NA intron (NM_001145319, intron 10 of 15) intron (NM_001145319, intron 10 of 15) -33257 NM_001251845 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 147.667-315 chr6 56926681 56926841 + 1 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) intron (NM_001144769, intron 2 of 96) 28069 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 157.667-296 chr7 33394894 33395112 + 1 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 265439 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 158.333-214 chr3 163720291 163720549 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -417119 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 146.667-295 chr6 155374684 155374836 + 1 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -60276 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 145.333-205 chr3 189486726 189487002 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -109882 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 165.667-74 chr17 67989023 67989290 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 4450 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 158.333-303 chr7 79627086 79627255 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 173210 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 145.667-115 chr17 81304128 81304379 + 1 NA non-coding (NR_038080, exon 4 of 4) non-coding (NR_038080, exon 4 of 4) 4995 NR_038080 284185 Hs.631762 NM_178519 LINC00482 C17orf55 long intergenic non-protein coding RNA 482 ncRNA 188.333-4 chr1 80866461 80866833 + 1 NA Intergenic Intergenic 225360 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 160.667-285 chr7 75817684 75817946 + 1 NA intron (NM_001371193, intron 1 of 3) intron (NM_001371193, intron 1 of 3) -4009 NM_002991 6369 Hs.247838 NM_002991 ENSG00000106178 CCL24 Ckb-6|MPIF-2|MPIF2|SCYA24 C-C motif chemokine ligand 24 protein-coding 250.667-75 chr7 94136293 94136647 + 1 NA Intergenic Intergenic -132115 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 162.333-13 chr1 111470137 111470351 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3740 NM_174896 128346 Hs.288010 NM_174896 ENSG00000143110 C1orf162 - chromosome 1 open reading frame 162 protein-coding 319.667-29 chr6 71034775 71035222 + 1 NA Intergenic Intergenic -77938 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 159.333-307 chr7 36765839 36766057 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -41399 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 186.333-74 chr2 81996907 81997111 + 1 NA Intergenic Intergenic -530063 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 179.333-122 chr3 10076077 10076361 + 1 NA intron (NM_001018115, intron 29 of 43) intron (NM_001018115, intron 29 of 43) 32036 NM_173472 115795 Hs.190413 NM_173472 ENSG00000163705 FANCD2OS C3orf24 FANCD2 opposite strand protein-coding 256.667-42 chr2 71632063 71632367 + 1 NA intron (NM_001130987, intron 41 of 55) intron (NM_001130987, intron 41 of 55) 165516 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 142.667-204 chr7 39013798 39013978 + 1 NA promoter-TSS (NR_138047) promoter-TSS (NR_138047) -321 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 174.333-18 chr11 7743551 7743843 + 1 NA Intergenic Intergenic -37220 NM_198185 341277 Hs.532475 NM_198185 ENSG00000183378 OVCH2 OVTN ovochymase 2 (gene/pseudogene) protein-coding 152.333-18 chr1 116516398 116516617 + 1 NA intron (NM_001779, intron 5 of 5) intron (NM_001779, intron 5 of 5) -37681 NR_125972 101929023 Hs.668091 NR_125972 ENSG00000233154 LINC01762 - long intergenic non-protein coding RNA 1762 ncRNA 157.667-183 chr22 35104587 35104907 + 1 NA Intergenic Intergenic 38589 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 224.333-60 chr2 52935747 52936222 + 1 NA Intergenic Intergenic -233369 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 116.333-28 chr10 44307007 44307191 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 14349 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 207.333-20 chr1 199759018 199759265 + 1 NA Intergenic Intergenic -268569 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 281.667-51 chr8 59197281 59197779 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 78320 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 261.333-114 chr9 90822880 90823344 + 1 NA intron (NM_001174168, intron 1 of 12) L1MCb|LINE|L1 -4308 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 148.333-399 chr8 125284463 125284656 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -145799 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 157.667-176 chr21 29839233 29839424 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) AluSz|SINE|Alu 91153 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 264.667-75 chr6 169596028 169596399 + 1 NA intron (NM_182552, intron 23 of 25) L1M8|LINE|L1 105816 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 118.333-143 chr3 185789151 185789365 + 1 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) -21354 NR_049838 100847078 NR_049838 ENSG00000265470 MIR548AQ - microRNA 548aq ncRNA 134.333-26 chr11 28000590 28000759 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -56141 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 170.333-17 chr1 215991263 215991542 + 1 NA intron (NM_206933, intron 35 of 71) intron (NM_206933, intron 35 of 71) -81063 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 145.333-47 chr10 107754622 107754802 + 1 NA Intergenic Intergenic 314581 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 239.333-42 chr17 61657837 61658154 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -66776 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 202.667-31 chr11 64474984 64475283 + 1 NA Intergenic Intergenic 26076 NR_073177 100996455 Hs.634142 NR_073177 ENSG00000181908 LINC02724 - long intergenic non-protein coding RNA 2724 ncRNA 164.333-202 chr5 145693852 145694129 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 141352 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 150.333-53 chr11 11342433 11342649 + 1 NA intron (NM_198516, intron 6 of 10) intron (NM_198516, intron 6 of 10) 10709 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 209.667-82 chr3 40901235 40901642 + 1 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -298067 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 243.333-36 chr15 81685281 81685572 + 1 NA Intergenic Intergenic -311213 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 226.667-54 chr2 193113970 193114268 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 364274 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 113.333-161 chr22 32819855 32820037 + 1 NA intron (NM_000362, intron 1 of 4) intron (NM_000362, intron 1 of 4) 19130 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 276.667-69 chr8 130857007 130857415 + 1 NA intron (NM_001115, intron 9 of 17) L1PA3|LINE|L1 183698 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 300.667-50 chr9 87899055 87899445 + 1 NA intron (NR_149022, intron 3 of 3) L1M4c|LINE|L1 16373 NM_178828 286234 Hs.130672 NM_178828 ENSG00000177992 SPATA31E1 C9orf79|FAM75E1 SPATA31 subfamily E member 1 protein-coding 171.667-116 chr4 7781420 7781616 + 1 NA exon (NM_001134647, exon 13 of 18) exon (NM_001134647, exon 13 of 18) 27428 NR_026892 84740 Hs.663029 NM_032654 ENSG00000272620 AFAP1-AS1 AFAP1-AS|AFAP1AS AFAP1 antisense RNA 1 ncRNA 125.667-48 chr12 61093243 61093440 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 1099498 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 180.333-106 chr6 72452673 72452987 + 1 NA Intergenic Intergenic 86084 NM_001168411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 215.667-44 chr16 72791541 72791831 + 1 NA intron (NM_001164766, intron 8 of 8) intron (NM_001164766, intron 8 of 8) -126716 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 156.333-238 chr3 90004729 90004934 + 1 NA Intergenic Intergenic 897210 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 145.667 chr1 39882868 39883066 + 1 NA intron (NM_017646, intron 1 of 10) intron (NM_017646, intron 1 of 10) 537 NM_017646 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 449.333-2 chr10 66833350 66833971 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) -92376 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 261.333-47 chr2 105335340 105335695 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2023 NM_001286537 79074 Hs.549577 NM_024093 ENSG00000135974 C2orf49 asw chromosome 2 open reading frame 49 protein-coding 147.667-291 chr5 113563055 113563209 + 1 NA intron (NM_001345975, intron 17 of 28) intron (NM_001345975, intron 17 of 28) 49438 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 240.667-84 chr8 123029121 123029451 + 1 NA intron (NM_001330601, intron 1 of 6) intron (NM_001330601, intron 1 of 6) -3514 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 201.667-33 chr14 53011553 53011901 + 1 NA Intergenic Intergenic -60630 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 180.667-115 chr5 153127696 153128005 + 1 NA Intergenic Intergenic -155501 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 193.667-96 chr4 165533043 165533311 + 1 NA Intergenic Intergenic 146935 NR_030304 693163 NR_030304 ENSG00000207559 MIR578 MIRN578|hsa-mir-578 microRNA 578 ncRNA 155.333-350 chr6 164500521 164500825 + 1 NA Intergenic Intergenic 321390 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 260.667-28 chr15 85443850 85444142 + 1 NA intron (NM_007200, intron 1 of 36) intron (NM_007200, intron 1 of 36) 63393 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 165.667-120 chr3 39478272 39478460 + 1 NA intron (NR_103506, intron 1 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 10686 NM_182935 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 317.667-32 chr4 53859906 53860303 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 127178 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 215.333-172 chr6 52157333 52157605 + 1 NA Intergenic Intergenic -6446 NR_131248 101154644 Hs.582788 NR_131248 LINCMD1 LINC-MD1|MIR133BHG long intergenic non-protein coding RNA, muscle differentiation 1 ncRNA 161.333-21 chr1 239057963 239058174 + 1 NA Intergenic LTR84a|LTR|ERVL -328500 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 135.667-45 chr13 37112913 37113147 + 1 NA Intergenic Intergenic -7366 NM_145203 122011 Hs.512897 NM_145203 ENSG00000180138 CSNK1A1L CK1 casein kinase 1 alpha 1 like protein-coding 138.333-214 chrX 143301728 143301959 + 1 NA Intergenic Intergenic 215632 NM_001009609 139067 Hs.447320 NM_001009609 ENSG00000189252 SPANXN3 CT11.8|SPANX-N3 SPANX family member N3 protein-coding 171.333-109 chr3 9600810 9601082 + 1 NA Intergenic Intergenic -47124 NM_198560 375323 Hs.56782 NM_198560 ENSG00000156959 LHFPL4 GARLH4 LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein-coding 158.667-320 chr8 75309779 75309992 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -30996 NR_103849 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 191.667-22 chr11 12467034 12467340 + 1 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) L1MC3|LINE|L1 89616 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 281.333-21 chr15 83432678 83432990 + 1 NA Intergenic Intergenic -14394 NR_136711 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 134.667-77 chr16 59899326 59899481 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 44050 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 227.667-75 chr7 123622503 123622899 + 1 NA intron (NR_111922, intron 2 of 4) intron (NR_111922, intron 2 of 4) 2256 NR_111922 102724555 Hs.83916 NR_111922 ENSG00000230442 LOC102724555 - uncharacterized LOC102724555 ncRNA 133.667-35 chr12 21868644 21868875 + 1 NA intron (NM_005691, intron 16 of 37) intron (NM_005691, intron 16 of 37) 67935 NM_005691 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 234.667-39 chr15 76074036 76074415 + 1 NA intron (NM_152335, intron 1 of 10) intron (NM_152335, intron 1 of 10) 14240 NM_152335 123591 Hs.661411 NM_152335 ENSG00000169758 TMEM266 C15orf27|HVRP1|HsHVRP1|hTMEM266 transmembrane protein 266 protein-coding 197.333-196 chr6 38942498 38942793 + 1 NA intron (NM_001371, intron 78 of 91) intron (NM_001371, intron 78 of 91) 10462 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 173.667-169 chr7 93266792 93267101 + 1 NA intron (NM_001257998, intron 10 of 28) intron (NM_001257998, intron 10 of 28) 34580 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 473.667-4 chr3 49456586 49457304 + 1 NA Intergenic AluYa5|SINE|Alu -11758 NM_001177643 1605 Hs.76111 NM_004393 ENSG00000173402 DAG1 156DAG|A3a|AGRNR|DAG|LGMDR16|MDDGA9|MDDGC7|MDDGC9 dystroglycan 1 protein-coding 176.333-163 chr8 40622334 40622565 + 1 NA intron (NM_001135731, intron 4 of 5) MIR3|SINE|MIR 275377 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 205.333-173 chr4 76698861 76699309 + 1 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 123534 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 148.667-103 chr13 64351644 64351908 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -275765 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 218.333-34 chr14 20709847 20710154 + 1 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 21236 NM_194431 6038 Hs.283749 NM_002937 ENSG00000258818 RNASE4 RAB1|RNS4 ribonuclease A family member 4 protein-coding 242.667-108 chr8 88517286 88517627 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -189973 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 151.333-190 chr19 49641979 49642174 + 1 NA promoter-TSS (NM_021228) promoter-TSS (NM_021228) -133 NM_021228 58506 Hs.103521 NM_021228 ENSG00000126461 SCAF1 SRA1 SR-related CTD associated factor 1 protein-coding 169.333-86 chr15 42952676 42952926 + 1 NA intron (NM_174916, intron 44 of 46) intron (NM_174916, intron 44 of 46) -32023 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 162.667-189 chr4 15372458 15372799 + 1 NA intron (NM_001135170, intron 1 of 2) intron (NM_001135170, intron 1 of 2) -1923 NM_001135171 114905 Hs.153714 NM_031911 ENSG00000163145 C1QTNF7 CTRP7|ZACRP7 C1q and TNF related 7 protein-coding 165.667-9 chr1 206016141 206016448 + 1 NA intron (NM_148964, intron 4 of 7) L1ME3A|LINE|L1 7601 NM_001317331 1510 Hs.644082 NM_001910 ENSG00000196188 CTSE CATE cathepsin E protein-coding 127.667 chr1 38303700 38303960 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -89063 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 169.333-263 chr8 48851536 48851713 + 1 NA Intergenic Intergenic 69805 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 160.667-189 chr3 29019551 29019743 + 1 NA Intergenic Intergenic 261292 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 167.667-216 chr9 18690624 18690940 + 1 NA intron (NM_001040272, intron 13 of 28) intron (NM_001040272, intron 13 of 28) 117476 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 117.667-85 chr2 78405330 78405477 + 1 NA Intergenic Intergenic -114672 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 182.667-51 chr15 51140925 51141173 + 1 NA intron (NR_146310, intron 1 of 2) L1PA10|LINE|L1 -35773 NM_207381 388121 Hs.306343 NM_207381 ENSG00000183578 TNFAIP8L3 TIPE3 TNF alpha induced protein 8 like 3 protein-coding 149.667-325 chr5 96879600 96879821 + 1 NA exon (NM_001130140, exon 2 of 19) exon (NM_001130140, exon 2 of 19) 3771 NM_001130140 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 146.667-273 chr6 36905666 36905906 + 1 NA intron (NM_152734, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 19834 NM_001286637 221477 Hs.433381 NM_152734 ENSG00000198663 C6orf89 BRAP|PS1TP5TP1 chromosome 6 open reading frame 89 protein-coding 145.667-271 chr7 81173651 81173875 + 1 NA Intergenic Intergenic -251374 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 164.667-124 chr20 19894492 19894700 + 1 NA intron (NM_001242581, intron 2 of 11) (GTCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 5030 NM_018993 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 301.667-38 chr6 48917664 48918231 + 1 NA Intergenic Intergenic 545306 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 200.333-158 chr8 114512302 114512602 + 1 NA Intergenic MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR -1075513 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 207.333-129 chr19 41042074 41042391 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -46219 NM_000766 1553 Hs.567252 NM_000766 ENSG00000197838 CYP2A13 CPAD|CYP2A|CYPIIA13 cytochrome P450 family 2 subfamily A member 13 protein-coding 164.333-50 chr12 20165993 20166158 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -38174 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 196.333-69 chr17 74590843 74591083 + 1 NA intron (NM_001302809, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 1320 NM_001115152 100131439 Hs.531099 NM_001115152 ENSG00000204345 CD300LD CD300D|CLM-4|CMRF35-A4|CMRF35A4 CD300 molecule like family member d protein-coding 145.333-190 chr3 89930935 89931161 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 823427 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 148.333-393 chr8 117836966 117837178 + 1 NA intron (NM_000127, intron 2 of 10) intron (NM_000127, intron 2 of 10) 83841 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 248.333-66 chr4 39199253 39199671 + 1 NA intron (NM_025132, intron 5 of 36) intron (NM_025132, intron 5 of 36) 16933 NM_025132 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 149.333-24 chr1 157657134 157657417 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 43494 NM_001320333 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 147.667-119 chr15 96091954 96092170 + 1 NA intron (NR_158193, intron 6 of 7) intron (NR_158193, intron 6 of 7) 35779 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 151.333-205 chr2 53767522 53767742 + 1 NA promoter-TSS (NM_001346127) promoter-TSS (NM_001346127) -151 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 157.667-90 chr13 67541732 67541919 + 1 NA Intergenic Intergenic 169438 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 217.667-34 chr17 29815005 29815382 + 1 NA intron (NM_033389, intron 1 of 14) AluSg|SINE|Alu -53761 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 138.667-81 chr17 30375329 30375489 + 1 NA Intergenic Intergenic -3518 NM_001304 1362 Hs.446079 NM_001304 ENSG00000108582 CPD GP180 carboxypeptidase D protein-coding 126.667-161 chr6 160994588 160994838 + 1 NA intron (NM_005922, intron 1 of 26) AluSg|SINE|Alu 2944 NM_005922 4216 Hs.390428 NM_005922 ENSG00000085511 MAP3K4 MAPKKK4|MEKK 4|MEKK4|MTK1|PRO0412 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 protein-coding 161.333-100 chr15 69339461 69339700 + 1 NA intron (NM_001104554, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu 25177 NM_001104554 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 296.667-49 chr6 11597581 11598074 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 60078 NM_001100829 100113407 Hs.146317 NM_001100829 ENSG00000205269 TMEM170B - transmembrane protein 170B protein-coding 199.333-39 chr11 23530376 23530735 + 1 NA Intergenic Intergenic -111365 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 163.667-132 chr20 24299103 24299283 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 99426 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 138.333-167 chr6 60685398 60685593 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -888635 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 157.667-63 chr11 111558970 111559157 + 1 NA intron (NM_178834, intron 6 of 6) AluSx|SINE|Alu 18555 NM_001258390 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 318.333-15 chr16 51484119 51484441 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -278239 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 175.333-197 chr8 142289911 142290135 + 1 NA intron (NM_001366901, intron 10 of 13) (GGCACCTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 91667 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 230.333-68 chr2 195467585 195467971 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -189180 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 153.333-273 chr3 101082897 101083138 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -89527 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 168.333-153 chr4 109171333 109171529 + 1 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 131227 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 155.333-326 chr6 45221505 45221686 + 1 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1MD2|LINE|L1 -23825 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 326.667-24 chr2 146382875 146383291 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -203974 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 151.667-212 chr3 43986554 43986737 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -127567 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 141.333-84 chr17 75056087 75056231 + 1 NA intron (NM_015353, intron 3 of 5) intron (NM_015353, intron 3 of 5) 8934 NM_015353 23510 Hs.514468 NM_015353 ENSG00000180901 KCTD2 - potassium channel tetramerization domain containing 2 protein-coding 193.667-83 chr3 57404545 57404879 + 1 NA intron (NM_001366028, intron 42 of 73) AluSz|SINE|Alu -112027 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 262.667-56 chr4 57528261 57528721 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 102619 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 118.333-147 chr4 29365059 29365215 + 1 NA Intergenic Intergenic 150845 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 147.333-225 chr3 170093220 170093423 + 1 NA 3' UTR (NM_001308116, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001308116, exon 15 of 15) 55326 NM_014373 26996 Hs.231320 NM_014373 ENSG00000173890 GPR160 GPCR1|GPCR150 G protein-coupled receptor 160 protein-coding 153.667-258 chr3 105224303 105224587 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -142268 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 122.333-134 chr3 16847482 16847638 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -37395 NM_001144382 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 115.333-142 chr3 85878601 85878738 + 1 NA intron (NM_001256502, intron 3 of 10) intron (NM_001256502, intron 3 of 10) -50619 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 145.333-42 chr10 93919271 93919449 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 25382 NR_144336 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 152.667-59 chr11 58625874 58626114 + 1 NA TTS (NR_024091) TTS (NR_024091) 3329 NM_000614 1270 Hs.524920 NM_000614 ENSG00000242689 CNTF HCNTF ciliary neurotrophic factor protein-coding 179.333-20 chr10 29482308 29482625 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 28 of 38) intron (NM_001323599, intron 28 of 38) 62631 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 135.667-30 chr11 80026017 80026216 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -585086 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 133.667-155 chr8 122937039 122937210 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) intron (NM_001362797, intron 3 of 4) 88648 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 160.333-271 chr8 24500358 24500536 + 1 NA intron (NM_003817, intron 18 of 21) intron (NM_003817, intron 18 of 21) 14421 NR_125809 101929315 Hs.125562 NR_125809 ENSG00000253643 LOC101929315 - uncharacterized LOC101929315 ncRNA 119.333-223 chr8 126940071 126940245 + 1 NA Intergenic Intergenic -72996 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 279.333-57 chr3 134307355 134307876 + 1 NA Intergenic Intergenic -5961 NR_146711 105374119 NR_146711 ENSG00000240006 LINC02004 - long intergenic non-protein coding RNA 2004 ncRNA 187.667-13 chr10 56291143 56291401 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 69987 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 112.667-177 chr3 116003175 116003338 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) -98130 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 171.667-88 chr2 159385423 159385680 + 1 NA intron (NM_001329858, intron 22 of 36) intron (NM_001329858, intron 22 of 36) -98848 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 181.667-132 chr6 98238813 98239049 + 1 NA Intergenic Intergenic 214400 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 222.333-61 chr3 53813181 53813536 + 1 NA 3' UTR (NM_000720, exon 49 of 49) 3' UTR (NM_000720, exon 49 of 49) 33061 NM_018397 55349 Hs.126688 NM_018397 ENSG00000016391 CHDH - choline dehydrogenase protein-coding 200.667-156 chr8 107565068 107565363 + 1 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -67297 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 172.333-24 chr10 95074662 95074861 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -5264 NM_001198853 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 302.333-28 chr4 80331398 80331858 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -4092 NM_001206997 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 148.333-66 chr11 30611382 30611567 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -25121 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 158.667-188 chr20 55695414 55695693 + 1 NA Intergenic Intergenic -268356 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 163.333-189 chr3 183081156 183081326 + 1 NA intron (NR_120639, intron 2 of 15) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 18002 NR_120640 56922 Hs.47649 NM_020166 ENSG00000078070 MCCC1 MCC-B|MCCA methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1 protein-coding 178.333-35 chr12 49501224 49501485 + 1 NA intron (NM_001293285, intron 10 of 14) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -37676 NM_001314030 23416 Hs.64064 NM_012284 ENSG00000135519 KCNH3 BEC1|ELK2|Kv12.2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 3 protein-coding 153.333-353 chr6 38995252 38995437 + 1 NA intron (NM_001371, intron 87 of 91) L1M5|LINE|L1 -42237 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 155.667-234 chr3 153145758 153145975 + 1 NA Intergenic Intergenic -16360 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 150.333-376 chr7 11359697 11359961 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 385957 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 144.667-60 chr12 53095342 53095499 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -2247 NM_002178 3489 Hs.274313 NM_002178 ENSG00000167779 IGFBP6 IBP6 insulin like growth factor binding protein 6 protein-coding 166.333-52 chr12 2013428 2013660 + 1 NA Intergenic Intergenic -9009 NR_135060 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 253.667-84 chrX 107919534 107919891 + 1 NA intron (NM_012216, intron 7 of 9) Plat_L3|LINE|CR1 16268 NR_110395 101928335 Hs.657090 NR_110395 ENSG00000236064 LOC101928335 - uncharacterized LOC101928335 ncRNA 140.333-235 chr8 114663670 114663840 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 1004258 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 180.333-41 chr15 92048723 92049097 + 1 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) intron (NR_135775, intron 2 of 10) 194606 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 181.667-21 chr11 60877744 60878032 + 1 NA Intergenic Intergenic 10346 NM_207341 22917 Hs.172130 NM_207341 ENSG00000149506 ZP1 HEL163|OOMD|OOMD1 zona pellucida glycoprotein 1 protein-coding 151.667-79 chr12 15722015 15722195 + 1 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) MER30|DNA|hAT-Charlie 67283 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 153.333-141 chr15 59992610 59992792 + 1 NA Intergenic Intergenic -11610 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 168.333-166 chr5 93461705 93462102 + 1 NA intron (NR_021491, intron 4 of 5) intron (NR_021491, intron 4 of 5) 109440 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-113 chr2 90192856 90193028 + 1 NA Intergenic LTR58|LTR|ERV1 -555035 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 150.333-432 chr9 31462877 31463162 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -81529 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 243.667-75 chr8 126651331 126651634 + 1 NA Intergenic Intergenic -93004 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 117.333-20 chr1 221567631 221567805 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 169182 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 119.333-119 chr19 50991571 50991744 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7593 NM_001243126 5650 Hs.151254 NM_005046 ENSG00000169035 KLK7 PRSS6|SCCE|hK7 kallikrein related peptidase 7 protein-coding 280.667-53 chr7 143304464 143304907 + 1 NA exon (NM_032982, exon 10 of 11) exon (NM_032982, exon 10 of 11) -11426 NR_046453 1180 Hs.121483 NM_000083 ENSG00000188037 CLCN1 CLC1 chloride voltage-gated channel 1 protein-coding 158.667-333 chr8 127475287 127475474 + 1 NA intron (NR_024393, intron 4 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 6759 NR_024393 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 158.333-95 chr15 24813225 24813415 + 1 NA Intergenic Intergenic -10288 NM_001349459 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 284.667-34 chr3 126454461 126454816 + 1 NA intron (NR_104249, intron 6 of 8) L1MC4|LINE|L1 21253 NR_104249 79364 Hs.440049 NM_025112 ENSG00000070476 ZXDC ZXDL ZXD family zinc finger C protein-coding 181.667-112 chr4 90276093 90276288 + 1 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 41159 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 302.667-30 chr6 155002059 155002464 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -88028 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 207.333-197 chr4 56535155 56535377 + 1 NA intron (NM_001256475, intron 1 of 8) LTR2|LTR|ERV1 4660 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 170.667-24 chr11 21745424 21745735 + 1 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -447506 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 174.667-162 chr7 52152685 52152875 + 1 NA Intergenic Intergenic -759524 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 181.667-51 chr17 79837395 79837708 + 1 NA intron (NM_003655, intron 3 of 4) intron (NM_003655, intron 3 of 4) 1889 NM_003655 8535 Hs.405046 NM_003655 ENSG00000141582 CBX4 NBP16|PC2 chromobox 4 protein-coding 134.333-88 chr2 133165926 133166154 + 1 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) intron (NM_207481, intron 5 of 17) -100155 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 150.667-33 chr10 30549005 30549281 + 1 NA Intergenic Intergenic 80610 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 166.667-241 chr9 2156665 2156872 + 1 NA promoter-TSS (NM_001289398) promoter-TSS (NM_001289398) -894 NM_001289398 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 161.333-193 chr3 106276869 106277143 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -407605 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 155.667-361 chr8 102144053 102144249 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 18719 NR_049859 100847001 NR_049859 ENSG00000266756 MIR5680 - microRNA 5680 ncRNA 364.333-2 chr1 118301016 118301709 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -116134 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 151.667-331 chr7 15825468 15825679 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 137195 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 197.667-22 chr10 123339287 123339511 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 184997 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 146.667-56 chr11 59450641 59450918 + 1 NA Intergenic Intergenic -6182 NM_001004708 219983 Hs.553650 NM_001004708 ENSG00000166884 OR4D6 OR11-250 olfactory receptor family 4 subfamily D member 6 protein-coding 222.333-22 chr11 105607623 105607904 + 1 NA Intergenic Intergenic -2310 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 276.667-55 chr5 6413358 6413749 + 1 NA Intergenic Intergenic -35006 NM_032286 84246 Hs.13885 NM_032286 ENSG00000133398 MED10 L6|NUT2|TRG20 mediator complex subunit 10 protein-coding 198.333-135 chr3 180328697 180329009 + 1 NA Intergenic Intergenic -85320 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 174.667-180 chr9 108947842 108948138 + 1 NA intron (NM_003798, intron 15 of 18) intron (NM_003798, intron 15 of 18) 13590 NM_017832 54942 Hs.29276 NM_017832 ENSG00000119328 ABITRAM C9orf6|CG-8|FAM206A|Simiate actin binding transcription modulator protein-coding 156.333-4 chr1 40178375 40178667 + 1 NA intron (NM_012421, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 17134 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 245.667-31 chr2 61995366 61995891 + 1 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) intron (NM_152516, intron 1 of 2) 89986 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 134.667-26 chr10 78530065 78530288 + 1 NA Intergenic Intergenic 262834 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 142.333-211 chr6 20422885 20423066 + 1 NA intron (NM_001243076, intron 1 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 19296 NM_001243076 1871 Hs.269408 NM_001949 ENSG00000112242 E2F3 E2F-3 E2F transcription factor 3 protein-coding 148.667-335 chr6 72501779 72502055 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -119926 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 306.667-22 chr2 88391794 88392512 + 1 NA Intergenic Intergenic 60540 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 159.667-215 chr3 100966010 100966284 + 1 NA intron (NM_001349332, intron 1 of 35) MER126|DNA|DNA 27343 NM_001349330 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 150.333-215 chr2 151994507 151994732 + 1 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) AluSz6|SINE|Alu -20641 NM_001330117 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 167.667-32 chr10 87586384 87586554 + 1 NA Intergenic Intergenic -73409 NM_004670 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 179.333-52 chr12 41636722 41637016 + 1 NA Intergenic Intergenic -127320 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 149.333-261 chr3 132777120 132777407 + 1 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) L1MB8|LINE|L1 -54804 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 179.667-91 chr3 44038920 44039194 + 1 NA Intergenic Intergenic -75155 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 155.333-214 chr22 26406184 26406340 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -22998 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 138.333-115 chr22 23579151 23579421 + 1 NA intron (NM_001369906, intron 1 of 2) intron (NM_001369906, intron 1 of 2) 1004 NM_020070 3543 Hs.348935 NM_020070 ENSG00000128322 IGLL1 14.1|AGM2|CD179b|IGL1|IGL5|IGLJ14.1|IGLL|IGO|IGVPB|VPREB2 immunoglobulin lambda like polypeptide 1 protein-coding 281.667-54 chr8 120144156 120144678 + 1 NA intron (NM_021110, intron 1 of 47) intron (NM_021110, intron 1 of 47) 19315 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 237.667-19 chr14 47178253 47178799 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 3 of 16) intron (NM_001113498, intron 3 of 16) 164720 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 203.333-251 chr7 120972321 120972628 + 1 NA intron (NM_019071, intron 10 of 11) HAL1ME|LINE|L1 -16237 NM_024913 79974 Hs.189652 NM_024913 ENSG00000106034 CPED1 C7orf58 cadherin like and PC-esterase domain containing 1 protein-coding 206.667-95 chr3 183388779 183389241 + 1 NA intron (NM_015078, intron 2 of 29) intron (NM_015078, intron 2 of 29) 39259 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 158.667-248 chr4 110912477 110912736 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -51959 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 165.333-138 chr20 8001176 8001388 + 1 NA intron (NM_021156, intron 3 of 7) L2b|LINE|L2 18479 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 136.333-90 chr2 67183220 67183378 + 1 NA intron (NR_038844, intron 3 of 7) intron (NR_038844, intron 3 of 7) -30109 NR_110568 101927661 Hs.580508 NR_110568 ENSG00000235885 LOC101927661 - uncharacterized LOC101927661 ncRNA 154.667-217 chr20 46539424 46539711 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 11087 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 160.333-228 chr5 19890075 19890349 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -3940 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 223.667-90 chr8 140585955 140586321 + 1 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 49495 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 127.667-75 chr2 22824951 22825100 + 1 NA Intergenic Intergenic 288546 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 240.667-18 chr12 5341675 5342087 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -90227 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 166.667-20 chr1 223862711 223862879 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -16823 NM_005426 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 130.667-167 chr5 92658169 92658317 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 913100 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-402 chrX 51564409 51564575 + 1 NA Intergenic Intergenic 54426 NM_001355276 347549 NM_001355276 ENSG00000224109 CENPVL3 CENPVP3 centromere protein V like 3 protein-coding 413.999-5 chr6 140952005 140953138 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 268757 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 166.333-131 chr2 216049133 216049425 + 1 NA exon (NM_018441, exon 6 of 8) exon (NM_018441, exon 6 of 8) 32530 NM_018441 55825 Hs.281680 NM_018441 ENSG00000115425 PECR DCRRP|HPDHASE|HSA250303|PVIARL|SDR29C1|TERP peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase protein-coding 166.667-206 chr6 123068374 123068582 + 1 NA 3' UTR (NM_001010852, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001010852, exon 6 of 6) 72243 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 148.667-75 chr11 78433833 78434100 + 1 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger -4130 NR_120564 101928865 Hs.407574 NR_120564 ENSG00000251323 LINC02728 - long intergenic non-protein coding RNA 2728 ncRNA 330.333-22 chr7 96788312 96788860 + 1 NA Intergenic Intergenic -78695 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 116.667-61 chr14 90397676 90397836 + 1 NA promoter-TSS (NM_001363670) promoter-TSS (NM_001363670) -494 NM_001363670 801 Hs.282410 NM_006888 ENSG00000198668 CALM1 CALML2|CAM2|CAM3|CAMB|CAMC|CAMI|CAMIII|CPVT4|DD132|LQT14|PHKD|caM calmodulin 1 protein-coding 221.667-61 chr4 168305703 168306080 + 1 NA intron (NM_017631, intron 5 of 37) intron (NM_017631, intron 5 of 37) 12861 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 361.667-14 chr5 13039476 13040162 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -6933 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 223.667-86 chr8 116262282 116262696 + 1 NA intron (NR_046215, intron 2 of 13) intron (NR_046215, intron 2 of 13) 62570 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 209.667-108 chr8 28719780 28720095 + 1 NA intron (NM_001440, intron 3 of 6) intron (NM_001440, intron 3 of 6) 18436 NR_073469 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 272.333-18 chr15 63529848 63530166 + 1 NA intron (NR_046341, intron 2 of 15) AluJb|SINE|Alu 25414 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 251.333-95 chr6 34209279 34209791 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -27338 NM_145901 3159 Hs.518805 NM_002131 ENSG00000137309 HMGA1 HMG-R|HMGA1A|HMGIY high mobility group AT-hook 1 protein-coding 153.667-305 chr5 17290894 17291168 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 73400 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 231.333-109 chr7 40841715 40842287 + 1 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 137938 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 157.667-138 chr2 32161932 32162122 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -3814 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 194.667-84 chr21 33634910 33635309 + 1 NA intron (NM_145858, intron 1 of 12) intron (NM_145858, intron 1 of 12) 6632 NM_145858 9946 Hs.352671 NM_145311 ENSG00000205758 CRYZL1 4P11|QOH-1 crystallin zeta like 1 protein-coding 173.667-190 chr9 36687562 36687759 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 114765 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 174.667-134 chr4 170202655 170202973 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -23777 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 165.333-155 chr22 28872209 28872393 + 1 NA Intergenic Intergenic -11271 NM_001206998 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 154.333-156 chr2 86693329 86693603 + 1 NA intron (NM_001198954, intron 1 of 7) L1ME1|LINE|L1 -26825 NM_022780 64795 Hs.75277 NM_022780 ENSG00000153561 RMND5A CTLH|GID2|GID2A|RMD5|p44CTLH required for meiotic nuclear division 5 homolog A protein-coding 137.333-61 chr16 65683984 65684152 + 1 NA Intergenic Intergenic -107768 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 162.333-112 chr2 54781762 54782051 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) AluJb|SINE|Alu 56894 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 157.333-22 chr1 152332135 152332355 + 1 NA intron (NR_103778, intron 2 of 6) intron (NR_103778, intron 2 of 6) -4823 NR_103779 339400 Hs.23783 NR_103778 ENSG00000237975 FLG-AS1 - FLG antisense RNA 1 ncRNA 152.667-261 chr3 183207549 183207827 + 1 NA exon (NM_015078, exon 23 of 30) exon (NM_015078, exon 23 of 30) -44954 NM_014398 27074 Hs.518448 NM_014398 ENSG00000078081 LAMP3 CD208|DC LAMP|DC-LAMP|DCLAMP|LAMP|LAMP-3|TSC403 lysosomal associated membrane protein 3 protein-coding 164.667-131 chr21 32018915 32019185 + 1 NA Intergenic Intergenic 67245 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 200.667-139 chr6 141155824 141156115 + 1 NA Intergenic Intergenic 472155 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 211.667-56 chr2 43161360 43161634 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -59052 NR_151714 100506047 Hs.127112 NR_151714 LINC02580 - long intergenic non-protein coding RNA 2580 ncRNA 153.333-187 chr2 16368490 16368652 + 1 NA Intergenic Intergenic 297263 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 238.667-62 chr4 115370739 115371108 + 1 NA Intergenic Intergenic -257303 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 261.333-13 chr10 44713407 44713906 + 1 NA Intergenic Intergenic -197660 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 174.667-122 chr4 33642479 33642723 + 1 NA Intergenic Intergenic 397292 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 119.667-169 chr6 100270735 100270945 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 192835 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 163.667-234 chr7 52225347 52225577 + 1 NA Intergenic Intergenic -810171 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 151.333-321 chr4 163446013 163446263 + 1 NA Intergenic Intergenic 27616 NM_032136 84076 Hs.303923 NM_032136 ENSG00000151005 TKTL2 - transketolase like 2 protein-coding 153.333-329 chr5 41456557 41456748 + 1 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 53949 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 217.333-34 chr11 76770637 76770970 + 1 NA Intergenic Intergenic -11510 NM_001258210 25987 Hs.8361 NM_015516 ENSG00000182704 TSKU E2IG4|LRRC54|TSK tsukushi, small leucine rich proteoglycan protein-coding 138.667-187 chr6 168010744 168010941 + 1 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 -7031 NM_005355 3834 Hs.150013 NM_005355 ENSG00000125337 KIF25 KNSL3 kinesin family member 25 protein-coding 268.333-12 chr11 81846986 81847464 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 43611 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 173.667-185 chr8 129900662 129900934 + 1 NA intron (NM_001353243, intron 3 of 13) AluSz6|SINE|Alu 39013 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 158.667-72 chr12 34520970 34521219 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 498598 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 201.333-265 chr7 75735034 75735360 + 1 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) MIRc|SINE|MIR 3744 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 203.333-60 chr12 120338442 120338672 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -10778 NM_000928 5319 Hs.992 NM_000928 ENSG00000170890 PLA2G1B PLA2|PLA2A|PPLA2 phospholipase A2 group IB protein-coding 189.333-36 chr11 60591916 60592113 + 1 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -23737 NR_026946 283197 Hs.372650 NM_174939 ENSG00000181995 LINC00301 C11orf64|NCRNA00301 long intergenic non-protein coding RNA 301 ncRNA 165.667-166 chr5 158895147 158895353 + 1 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 202706 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 148.333-421 chrX 101671205 101671495 + 1 NA Intergenic Intergenic -11500 NM_001282231 9823 Hs.48924 NM_014782 ENSG00000184867 ARMCX2 ALEX2|GASP9 armadillo repeat containing X-linked 2 protein-coding 221.333-68 chr2 111213148 111213456 + 1 NA intron (NR_015395, intron 5 of 6) L1ME1|LINE|L1 92388 NM_138626 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 175.333-24 chr11 108102648 108102941 + 1 NA intron (NM_003478, intron 18 of 18) LTR81A|LTR|Gypsy -18773 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 111.667-222 chr6 64592551 64592726 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 25 of 43) intron (NM_001292009, intron 25 of 43) -708780 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 146.667-226 chr4 19413506 19413755 + 1 NA Intergenic Intergenic -838275 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 147.333-119 chr15 43863911 43864069 + 1 NA intron (NM_024908, intron 12 of 12) HY1|scRNA|scRNA 14181 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 150.667-269 chr4 75050000 75050261 + 1 NA TTS (NM_015393) TTS (NM_015393) 34578 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 129.333-80 chr17 64371855 64372080 + 1 NA intron (NM_000442, intron 4 of 15) intron (NM_000442, intron 4 of 15) 18893 NM_000442 5175 Hs.376675 NM_000442 ENSG00000261371 PECAM1 CD31|CD31/EndoCAM|GPIIA'|PECA1|PECAM-1|endoCAM platelet and endothelial cell adhesion molecule 1 protein-coding 299.333-18 chr13 39399750 39400468 + 1 NA intron (NM_005780, intron 2 of 3) AluSp|SINE|Alu 203084 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 127.667-7 chr1 147601305 147601525 + 1 NA intron (NM_004326, intron 1 of 9) intron (NM_004326, intron 1 of 9) 59914 NM_004326 607 Hs.415209 NM_004326 ENSG00000116128 BCL9 LGS BCL9 transcription coactivator protein-coding 167.333-207 chr5 44244668 44244924 + 1 NA Intergenic Intergenic -143936 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 217.333-8 chr1 107476045 107476284 + 1 NA intron (NM_001113226, intron 6 of 6) intron (NM_001113226, intron 6 of 6) 212335 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 143.333-270 chr7 86021709 86021911 + 1 NA Intergenic Intergenic 600688 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 125.333-130 chr4 116419287 116419478 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 119657 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 196.333-157 chr6 124350752 124351037 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 2 of 6) AluJo|SINE|Alu 67889 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 178.333-96 chr22 21760285 21760596 + 1 NA 3' UTR (NM_002745, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_002745, exon 9 of 9) -24646 NM_013313 29799 Hs.517436 NM_013313 ENSG00000100027 YPEL1 FKSG3 yippee like 1 protein-coding 148.667-206 chr2 171402351 171402533 + 1 NA intron (NM_024770, intron 1 of 9) L1MC3|LINE|L1 31548 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 203.333-117 chr18 69552727 69553025 + 1 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) intron (NM_152721, intron 1 of 7) 82945 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 147.667-106 chr14 68870054 68870218 + 1 NA Intergenic Intergenic -73893 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 221.333-147 chr8 131885519 131885917 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -18375 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 247.667-73 chr4 76308824 76309238 + 1 NA intron (NM_003943, intron 1 of 1) intron (NM_003943, intron 1 of 1) 3005 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 155.667-299 chr6 34385273 34385517 + 1 NA intron (NM_001202470, intron 5 of 8) intron (NM_001202470, intron 5 of 8) 7274 NM_006703 11165 Hs.188882 NM_006703 ENSG00000272325 NUDT3 DIPP|DIPP-1|DIPP1 nudix hydrolase 3 protein-coding 192.667-81 chr2 17537441 17537795 + 1 NA Intergenic Intergenic -2354 NM_001366803 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 155.667-168 chr2 102284815 102285047 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -26571 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 267.333-39 chr17 43306435 43306835 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -6404 NR_002716 6066 NR_002716 ENSG00000274585 RNU2-1 RNU2|U2 RNA, U2 small nuclear 1 snRNA 263.667-79 chr7 113428054 113428499 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -309694 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 169.667-217 chr9 77916043 77916406 + 1 NA intron (NM_002072, intron 2 of 6) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 115587 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 191.333-88 chr17 63011580 63011875 + 1 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) L1M4|LINE|L1 45492 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 145.333-20 chr1 208604236 208604431 + 1 NA Intergenic Intergenic -124355 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 179.667-54 chr15 63456571 63456938 + 1 NA Intergenic Intergenic -47757 NM_001256702 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 121.667-163 chr5 52016755 52016905 + 1 NA intron (NR_147166, intron 3 of 3) intron (NR_147166, intron 3 of 3) 8799 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 180.333-152 chr9 105743312 105743511 + 1 NA intron (NM_018112, intron 4 of 5) intron (NM_018112, intron 4 of 5) 48870 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 162.333-203 chr5 123209113 123209482 + 1 NA Intergenic Intergenic -118981 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 122.333-162 chr4 132621933 132622095 + 1 NA intron (NR_126401, intron 1 of 3) L1M4a2|LINE|L1 30925 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 246.667-30 chr15 63077467 63077853 + 1 NA Intergenic Intergenic -28273 NR_147233 111064646 Hs.602995 NR_147233 TPM1-AS TPM1-AS1 TPM1 antisense RNA ncRNA 128.333-66 chr15 71134196 71134360 + 1 NA Intergenic Intergenic -7171 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 254.333-53 chr3 22824790 22825180 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 377593 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 285.667-49 chr8 30780912 30781325 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 31700 NM_001009552 5516 Hs.491440 NM_004156 ENSG00000104695 PPP2CB PP2Abeta|PP2CB protein phosphatase 2 catalytic subunit beta protein-coding 169.333-218 chr6 9046582 9046860 + 1 NA Intergenic Intergenic 394512 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 163.667-16 chr1 246597708 246597949 + 1 NA intron (NM_152609, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 31372 NM_152609 163882 Hs.368353 NM_152609 ENSG00000162852 CNST C1orf71|PPP1R64 consortin, connexin sorting protein protein-coding 144.667-255 chr6 14183464 14183657 + 1 NA Intergenic Intergenic 65788 NM_004233 9308 Hs.595133 NM_004233 ENSG00000112149 CD83 BL11|HB15 CD83 molecule protein-coding 273.333-22 chr16 3973640 3973966 + 1 NA intron (NM_001116, intron 10 of 10) intron (NM_001116, intron 10 of 10) -23359 NR_120311 102724927 Hs.364739 NR_120311 ENSG00000262185 LOC102724927 - uncharacterized LOC102724927 ncRNA 148.667-238 chr22 48817569 48817856 + 1 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 37417 NR_039761 100616415 NR_039761 ENSG00000266887 MIR4535 - microRNA 4535 ncRNA 160.333-175 chr22 28292541 28292726 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -167236 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 148.333-266 chr3 173669767 173670044 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) intron (NM_001365928, intron 3 of 6) 85471 NM_001365928 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 211.333-217 chr7 4253871 4254106 + 1 NA intron (NM_001079653, intron 18 of 19) L1MB7|LINE|L1 -119151 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 298.667-31 chr9 68978838 68979216 + 1 NA intron (NM_001278253, intron 13 of 13) intron (NM_001278253, intron 13 of 13) -3186 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 169.667-135 chr3 121203654 121203913 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 9 of 27) intron (NM_001348343, intron 9 of 27) 154143 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 250.333-23 chr15 46508454 46508986 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -675369 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 211.333-84 chr17 27279451 27279788 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 14377 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 170.667-174 chr9 73549333 73549576 + 1 NA Intergenic Intergenic 397589 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 186.667-88 chr3 36586873 36587169 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 152840 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 119.333-77 chr12 112089445 112089608 + 1 NA intron (NM_024953, intron 3 of 23) L1ME3F|LINE|L1 19257 NM_024953 80018 Hs.530941 NM_024953 ENSG00000111300 NAA25 C12orf30|MDM20|NAP1 N(alpha)-acetyltransferase 25, NatB auxiliary subunit protein-coding 150.333-281 chr3 171593977 171594215 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -133688 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 172.333-165 chr7 82967488 82967830 + 1 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 195225 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 251.333-45 chr17 63251319 63251826 + 1 NA intron (NM_025185, intron 7 of 25) intron (NM_025185, intron 7 of 25) 188695 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 160.667-222 chr4 47418672 47418917 + 1 NA intron (NM_000812, intron 8 of 8) L2a|LINE|L2 44908 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 163.333-241 chr6 45439813 45440045 + 1 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 17654 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 214.333-81 chr2 151325077 151325461 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -32323 NM_007115 7130 Hs.437322 NM_007115 ENSG00000123610 TNFAIP6 TSG-6|TSG6 TNF alpha induced protein 6 protein-coding 217.333-74 chr2 189143923 189144235 + 1 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) -10968 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 209.667-12 chr1 197792469 197792758 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -17133 NM_001195215 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 148.667-127 chr14 74021210 74021466 + 1 NA intron (NM_025057, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 1989 NM_025057 80127 Hs.644621 NM_025057 ENSG00000119636 BBOF1 C14orf45|CCDC176 basal body orientation factor 1 protein-coding 221.333-28 chr11 115211983 115212448 + 1 NA intron (NM_001301044, intron 7 of 10) intron (NM_001301044, intron 7 of 10) -121362 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 143.667-69 chr14 30956470 30956630 + 1 NA intron (NM_001083893, intron 1 of 17) AluJr4|SINE|Alu 58192 NR_030354 693209 NR_030354 ENSG00000207952 MIR624 MIRN624|hsa-mir-624|mir-624 microRNA 624 ncRNA 144.667-157 chr2 178460278 178460473 + 1 NA exon (NM_001353778, exon 6 of 7) exon (NM_001353778, exon 6 of 7) 7136 NM_001369912 494513 Hs.87734 NM_001042702 ENSG00000204311 PJVK DFNB59 pejvakin protein-coding 263.667-33 chr16 30401474 30401869 + 1 NA Intergenic Intergenic -5743 NM_016643 51333 Hs.148584 NM_016643 ENSG00000179965 ZNF771 DSC43 zinc finger protein 771 protein-coding 377.333-17 chr5 72059081 72059570 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -48150 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 156.667-146 chr18 3304960 3305186 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 42354 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 201.667-22 chr12 25020171 25020661 + 1 NA intron (NM_001321724, intron 7 of 17) L2a|LINE|L2 22841 NM_001321724 645177 Hs.569157 NM_001321724 LOC645177 - uncharacterized LOC645177 protein-coding 220.667-33 chr16 50781761 50782040 + 1 NA intron (NM_015247, intron 11 of 19) intron (NM_015247, intron 11 of 19) -24772 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 114.333-212 chr7 140220271 140220436 + 1 NA Intergenic Intergenic 43092 NR_024451 100134229 Hs.634333 NR_024451 ENSG00000260231 KDM7A-DT JHDM1D-AS1 KDM7A divergent transcript ncRNA 135.333-148 chr5 116567462 116567613 + 1 NA intron (NM_001300780, intron 1 of 19) MIR|SINE|MIR -6881 NR_147170 105379132 NR_147170 SEMA6A-AS2 - SEMA6A antisense RNA 2 ncRNA 133.667-43 chr12 72923204 72923465 + 1 NA Intergenic Intergenic -235856 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 195.667-18 chr11 30373257 30373650 + 1 NA Intergenic Intergenic 50349 NM_152316 120534 Hs.502208 NM_152316 ENSG00000152219 ARL14EP ARF7EP|C11orf46|dJ299F11.1 ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein protein-coding 152.667-21 chr1 198966319 198966590 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -29025 NR_040073 100131234 Hs.711077 NR_040073 MIR181A1HG - MIR181A1 host gene ncRNA 156.333-146 chr17 49045873 49046127 + 1 NA exon (NM_006546, exon 13 of 15) exon (NM_006546, exon 13 of 15) 48615 NM_001160423 10642 Hs.144936 NM_006546 ENSG00000159217 IGF2BP1 CRD-BP|CRDBP|IMP-1|IMP1|VICKZ1|ZBP1 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 protein-coding 187.667-114 chr5 6893373 6893725 + 1 NA Intergenic Intergenic -65628 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 123.667-26 chr1 244693178 244693338 + 1 NA intron (NM_016076, intron 4 of 4) intron (NM_016076, intron 4 of 4) 40132 NM_016076 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 190.333-38 chr12 71524274 71524502 + 1 NA intron (NR_110596, intron 2 of 19) intron (NR_110596, intron 2 of 19) 84590 NM_001277226 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 141.333-42 chr12 10094286 10094429 + 1 NA intron (NM_001297750, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 4628 NM_001297750 51267 Hs.29549 NM_016511 ENSG00000150048 CLEC1A CLEC-1|CLEC1 C-type lectin domain family 1 member A protein-coding 139.333-147 chr3 49396872 49397104 + 1 NA intron (NM_001664, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 14988 NM_001313947 387 Hs.247077 NM_001664 ENSG00000067560 RHOA ARH12|ARHA|RHO12|RHOH12 ras homolog family member A protein-coding 140.333-209 chr6 123148378 123148617 + 1 NA Intergenic Intergenic 152262 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 217.333-103 chr4 10551197 10551443 + 1 NA intron (NM_052964, intron 8 of 18) AluSz|SINE|Alu -93894 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 140.667-9 chr1 78426852 78427049 + 1 NA Intergenic Intergenic -64024 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 165.333-187 chr4 67569706 67569949 + 1 NA intron (NM_012108, intron 1 of 8) AluSz6|SINE|Alu 11100 NM_001317769 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 143.667-13 chr1 183856132 183856384 + 1 NA intron (NM_001297669, intron 4 of 18) intron (NM_001297669, intron 4 of 18) 51138 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 155.667-204 chr21 32382783 32383071 + 1 NA intron (NM_014825, intron 4 of 38) intron (NM_014825, intron 4 of 38) -5605 NR_002996 677846 Hs.712293 NR_002996 ENSG00000200792 SNORA80A ACA67|SNORA80 small nucleolar RNA, H/ACA box 80A snoRNA 153.667-236 chr22 28474855 28475140 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) HAL1|LINE|L1 15128 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 130.333-59 chr13 70936248 70936426 + 1 NA Intergenic Intergenic -78804 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 139.333-226 chr8 133480173 133480336 + 1 NA intron (NM_003033, intron 3 of 8) intron (NM_003033, intron 3 of 8) 91633 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 158.667-68 chr11 112060850 112061118 + 1 NA intron (NM_001931, intron 12 of 13) intron (NM_001931, intron 12 of 13) 13187 NM_138789 120379 Hs.420662 NM_138789 ENSG00000150773 PIH1D2 - PIH1 domain containing 2 protein-coding 138.667-55 chr13 81437650 81437885 + 1 NA Intergenic Intergenic -210784 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 342.667-3 chr15 97095990 97096462 + 1 NA Intergenic Intergenic 312791 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 170.667-3 chr1 14314913 14315124 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 104955 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 125.667-64 chr14 75908505 75908744 + 1 NA intron (NM_015072, intron 31 of 31) MamRep488|DNA|hAT-Tip100 73371 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 189.667-137 chr8 52173091 52173343 + 1 NA intron (NM_014682, intron 9 of 25) intron (NM_014682, intron 9 of 25) -21145 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 237.667-16 chr11 132205160 132205599 + 1 NA intron (NM_016522, intron 2 of 6) intron (NM_016522, intron 2 of 6) -78923 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 158.333-87 chr14 62214271 62214553 + 1 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -74439 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 150.667-10 chr1 108893739 108893889 + 1 NA intron (NM_013296, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu 16829 NM_001321038 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 157.333-3 chr1 21285268 21285540 + 1 NA intron (NM_001113348, intron 2 of 18) intron (NM_001113348, intron 2 of 18) 4811 NM_001113349 1889 Hs.195080 NM_001397 ENSG00000117298 ECE1 ECE endothelin converting enzyme 1 protein-coding 261.333-112 chr9 26737376 26737929 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 155150 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 197.667-138 chr6 152435424 152435676 + 1 NA intron (NM_182961, intron 33 of 145) intron (NM_182961, intron 33 of 145) 55020 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 130.333-134 chr3 102453306 102453451 + 1 NA intron (NM_175056, intron 3 of 10) intron (NM_175056, intron 3 of 10) 18363 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 198.667-97 chr2 24183818 24184123 + 1 NA intron (NM_001040710, intron 5 of 5) L1ME3B|LINE|L1 8917 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 138.667-132 chr3 82307266 82307450 + 1 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) L1M2|LINE|L1 321216 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 179.667-112 chr5 36974501 36974801 + 1 NA intron (NM_015384, intron 8 of 45) intron (NM_015384, intron 8 of 45) 97882 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 360.667-3 chr11 131222520 131223290 + 1 NA Intergenic Intergenic -147710 NM_001352003 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 142.667-161 chr4 89079399 89079668 + 1 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -22348 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 119.333-235 chr9 72516162 72516333 + 1 NA Intergenic Intergenic -5554 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 129.667-110 chr20 16244157 16244286 + 1 NA Intergenic Intergenic -258339 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 171.667-38 chr11 115170917 115171236 + 1 NA 3' UTR (NM_001301043, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001301043, exon 12 of 12) -162501 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 302.333-37 chr8 132819006 132819385 + 1 NA intron (NM_001277196, intron 11 of 19) intron (NM_001277196, intron 11 of 19) 43807 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 307.667-37 chr7 39372477 39373133 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 5 of 9) MER58D|DNA|hAT-Charlie 33541 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 133.667-162 chr9 37644142 37644368 + 1 NA intron (NM_001371224, intron 2 of 16) intron (NM_001371224, intron 2 of 16) -6699 NM_014907 22844 Hs.163990 NM_014907 ENSG00000070601 FRMPD1 FRMD2 FERM and PDZ domain containing 1 protein-coding 154.333-334 chr8 61523813 61524091 + 1 NA intron (NM_004318, intron 22 of 24) AluJr|SINE|Alu 165859 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 269.333-92 chr9 17510636 17511081 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -68208 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 264.667-94 chr9 100462106 100462441 + 1 NA intron (NM_001198812, intron 1 of 9) AluSz|SINE|Alu -10876 NM_003692 8577 Hs.598100 NM_003692 ENSG00000241697 TMEFF1 C9orf2|CT120.1|H7365|TR-1 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 1 protein-coding 171.667-123 chr4 64538155 64538467 + 1 NA Intergenic Intergenic -128851 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 218.667-51 chr2 60200291 60200678 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 182552 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 179.333-84 chr18 9261123 9261443 + 1 NA intron (NM_001204056, intron 8 of 11) MER103C|DNA|hAT-Charlie -73490 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 140.333-255 chrX 100952006 100952153 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -17629 NR_103709 392509 Hs.147237 NM_001162491 ENSG00000174225 ARL13A ARL13|dJ341D10.2 ADP ribosylation factor like GTPase 13A protein-coding 288.333-28 chr4 95184536 95184976 + 1 NA intron (NM_003728, intron 13 of 15) intron (NM_003728, intron 13 of 15) 93265 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 214.667-34 chr12 48182899 48183197 + 1 NA promoter-TSS (NM_001013635) promoter-TSS (NM_001013635) -596 NM_001013635 387856 Hs.251699 NM_001013635 ENSG00000177875 CCDC184 C12orf68 coiled-coil domain containing 184 protein-coding 204.333-169 chr5 165904707 165905071 + 1 NA Intergenic Intergenic 1021481 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 173.667-105 chr22 44727934 44728218 + 1 NA intron (NM_181334, intron 4 of 14) intron (NM_181334, intron 4 of 14) -24482 NM_001017526 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 269.333-72 chr5 124280536 124280878 + 1 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 157813 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 281.667-27 chr2 84188938 84189472 + 1 NA Intergenic Intergenic -101477 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 270.667-24 chr2 32310129 32310465 + 1 NA 3' UTR (NM_032312, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_032312, exon 6 of 6) 32393 NM_032312 84272 Hs.468099 NM_032312 ENSG00000119820 YIPF4 FinGER4|Nbla11189 Yip1 domain family member 4 protein-coding 252.333-29 chr2 48797161 48797662 + 1 NA Intergenic Intergenic -41687 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 169.333-208 chr5 87909188 87909404 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 247254 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 188.667-11 chr1 108768915 108769188 + 1 NA intron (NM_007269, intron 6 of 18) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 22377 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 157.667-154 chr2 176770949 176771234 + 1 NA Intergenic Intergenic 133337 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 130.667-186 chr7 48757765 48757949 + 1 NA Intergenic Intergenic -166690 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 185.667-148 chr9 108268837 108269184 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 586976 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 170.667-182 chrX 82913404 82913763 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -594707 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 155.333-362 chr7 34053904 34054090 + 1 NA intron (NM_133468, intron 9 of 15) L2c|LINE|L2 148458 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 112.667-7 chr1 105357761 105357908 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 261101 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 137.333-97 chr2 62974432 62974703 + 1 NA intron (NM_001354215, intron 15 of 24) L1MC5a|LINE|L1 73144 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 152.667-192 chr2 118179936 118180201 + 1 NA Intergenic Intergenic 6318 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 243.667-38 chr2 73228830 73229392 + 1 NA intron (NM_032319, intron 3 of 4) intron (NM_032319, intron 3 of 4) 4128 NM_032319 84279 Hs.61268 NM_032319 ENSG00000135617 PRADC1 C2orf7|PAP21 protease associated domain containing 1 protein-coding 237.333-117 chr8 76206913 76207282 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -199557 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 134.333-152 chr6 49347015 49347171 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 116160 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 134.333-151 chr6 46156956 46157110 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 13947 NM_001290072 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 163.333-255 chr7 27310902 27311111 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -63777 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 446.667-5 chr14 55824982 55825920 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -28777 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 160.667-310 chr8 120670748 120671046 + 1 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR -90356 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 251.667-52 chr21 28715798 28716218 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 169359 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 148.667-155 chr17 33183829 33184002 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 109073 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 154.667-99 chr14 20326077 20326250 + 1 NA TTS (NR_003693) TTS (NR_003693) 376 NR_003693 100113391 NR_003693 SNORD126 MIR1201|MIRN1201 small nucleolar RNA, C/D box 126 snoRNA 128.667-188 chr8 121957882 121958151 + 1 NA Intergenic (TGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -316576 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 169.667-117 chr2 199488640 199488905 + 1 NA Intergenic Intergenic -17506 NM_015265 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 259.333-97 chr8 42374523 42374837 + 1 NA intron (NM_014420, intron 3 of 3) intron (NM_014420, intron 3 of 3) 2549 NM_014420 27121 Hs.159311 NM_014420 ENSG00000104371 DKK4 DKK-4 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 4 protein-coding 284.667-8 chr11 114076889 114077548 + 1 NA intron (NM_006006, intron 2 of 6) intron (NM_006006, intron 2 of 6) 14007 NM_001354752 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 242.667-99 chr7 114019500 114019979 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -66588 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 182.333-99 chr21 39702596 39702805 + 1 NA Intergenic Intergenic -42707 NM_001080444 150084 Hs.422120 NM_001080444 ENSG00000183067 IGSF5 GSF5|JAM4 immunoglobulin superfamily member 5 protein-coding 215.333-3 chr1 47257757 47258044 + 1 NA intron (NM_001282938, intron 18 of 18) L2b|LINE|L2 -25565 NM_001290403 6886 Hs.705618 NM_003189 ENSG00000162367 TAL1 SCL|TCL5|bHLHa17|tal-1 TAL bHLH transcription factor 1, erythroid differentiation factor protein-coding 148.667-388 chr8 125154594 125154745 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 4 of 7) intron (NM_001349486, intron 4 of 7) 62809 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 138.667-166 chr5 74800436 74800658 + 1 NA intron (NM_015566, intron 10 of 12) intron (NM_015566, intron 10 of 12) -33176 NM_170681 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 158.333-281 chr6 129418941 129419111 + 1 NA intron (NM_000426, intron 40 of 64) L1MA8|LINE|L1 291151 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 324.667-26 chr4 56434151 56434635 + 1 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) intron (NR_156493, intron 1 of 10) 1222 NR_156493 5471 Hs.331420 NM_002703 ENSG00000128059 PPAT ATASE|GPAT|PRAT phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase protein-coding 193.667-115 chr6 97831108 97831490 + 1 NA Intergenic Intergenic -193232 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 166.667-65 chr14 60886518 60886802 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) L1M4c|LINE|L1 94419 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 159.667-104 chr14 85293722 85293945 + 1 NA Intergenic Intergenic 21901 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 127.667-190 chr8 137683732 137683903 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -270229 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 174.667-124 chr4 67808470 67808827 + 1 NA Intergenic Intergenic -52562 NM_000406 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 163.667-268 chrX 47811054 47811278 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -25736 NM_007137 347344 Hs.114246 NM_007137 ENSG00000197779 ZNF81 HFZ20|MRX45|dJ54B20.6 zinc finger protein 81 protein-coding 131.333-188 chr9 11879015 11879183 + 1 NA Intergenic Intergenic -814286 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 159.667-334 chr8 135493865 135494171 + 1 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) L1MCc|LINE|L1 36562 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 137.667-35 chr11 37375334 37375518 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -563175 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 292.333-35 chr5 58725284 58725733 + 1 NA intron (NM_138453, intron 2 of 4) L1M1|LINE|L1 142433 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 145.667-11 chr1 73753814 73754030 + 1 NA Intergenic Intergenic 79243 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 159.333-189 chr20 52933058 52933274 + 1 NA Intergenic Intergenic -39192 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 145.667-4 chr1 48765929 48766151 + 1 NA intron (NR_146232, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 10851 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 118.667-160 chr5 80764890 80765057 + 1 NA intron (NM_002439, intron 13 of 23) intron (NM_002439, intron 13 of 23) -109990 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 160.667-45 chr10 90029627 90029826 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -72353 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 141.333-204 chr6 21135202 21135420 + 1 NA intron (NM_017774, intron 13 of 15) MIRc|SINE|MIR 376581 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 134.667-143 chr4 48636381 48636572 + 1 NA intron (NM_015030, intron 3 of 63) intron (NM_015030, intron 3 of 63) 143823 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 323.333-18 chr2 218363480 218363914 + 1 NA intron (NM_001320865, intron 6 of 9) AluSz|SINE|Alu 4205 NR_110573 101928513 Hs.512386 NR_110573 ENSG00000225062 CATIP-AS1 - CATIP antisense RNA 1 ncRNA 147.667-252 chr4 41411272 41411564 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) FLAM_C|SINE|Alu 50611 NM_001330787 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 130.333-172 chr5 126061215 126061419 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -118260 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 135.333-88 chr2 117915619 117915845 + 1 NA 3' UTR (NM_019044, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_019044, exon 24 of 24) 82001 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 170.333-221 chr8 115924898 115925190 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -256069 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 156.333-147 chr17 63153836 63154130 + 1 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 187748 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 193.333-84 chr2 32248055 32248420 + 1 NA intron (NM_001302504, intron 3 of 7) MER49|LTR|ERV1 16649 NM_001199138 58484 Hs.574741 NM_021209 ENSG00000091106 NLRC4 AIFEC|CARD12|CLAN|CLAN1|CLANA|CLANB|CLANC|CLAND|CLR2.1|FCAS4|IPAF NLR family CARD domain containing 4 protein-coding 156.667-232 chr3 159743641 159743829 + 1 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) L1MD2|LINE|L1 24877 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 231.667-48 chr5 33750112 33750580 + 1 NA TTS (NM_001324511).2 TTS (NM_001324511).2 141644 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 147.333-173 chr2 138488434 138488593 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -13257 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 219.667-80 chr6 3640480 3640921 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 111312 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 158.333-192 chr3 9190081 9190328 + 1 NA intron (NM_014850, intron 1 of 21) intron (NM_014850, intron 1 of 21) -2289 NR_121664 101927416 Hs.475364 NR_121663 ENSG00000228723 SRGAP3-AS2 - SRGAP3 antisense RNA 2 ncRNA 219.333-191 chr9 26623723 26623986 + 1 NA Intergenic Intergenic 268948 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 150.333-371 chr6 138469269 138469556 + 1 NA intron (NM_020464, intron 3 of 6) intron (NM_020464, intron 3 of 6) 30082 NM_001144060 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 138.667-180 chr6 49185168 49185398 + 1 NA Intergenic Intergenic 277970 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 329.667-13 chr20 43905749 43906188 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8884 NM_001098797 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 222.667-95 chr8 104981191 104981527 + 1 NA Intergenic Intergenic -337079 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 289.333-28 chr2 127887393 127887966 + 1 NA Intergenic Intergenic -1739 NM_001199140 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 116.667-203 chr8 103874773 103875013 + 1 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) intron (NR_145711, intron 1 of 21) 55673 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 153.333-271 chr3 89791348 89791554 + 1 NA Intergenic Intergenic 683830 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 262.333-3 chr1 76100254 76100791 + 1 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) L1ME3B|LINE|L1 25776 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 341.667 chr1 70118631 70119022 + 1 NA intron (NM_001370785, intron 26 of 26) intron (NM_001370785, intron 26 of 26) 86753 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 136.667-113 chr3 3624835 3624992 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -174518 NM_001324189 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 201.667-13 chr11 24395895 24396183 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -101014 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 192.667-160 chr7 49955269 49955586 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) AluSg|SINE|Alu 137819 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 224.667-88 chrX 155522980 155523364 + 1 NA intron (NM_018196, intron 3 of 7) L1MD2|LINE|L1 56632 NR_039991 100507404 Hs.638368 NR_039991 ENSG00000224533 TMLHE-AS1 - TMLHE antisense RNA 1 ncRNA 165.667-183 chr6 167914955 167915261 + 1 NA intron (NM_001207008, intron 16 of 31) intron (NM_001207008, intron 16 of 31) 61831 NM_001129895 100128124 Hs.448059 NM_001129895 HGC6.3 - uncharacterized LOC100128124 protein-coding 194.333-17 chr10 16040509 16040883 + 1 NA Intergenic Intergenic -180163 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 325.333-17 chr2 18043559 18044122 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 165173 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 157.667-222 chr4 100714191 100714427 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -39196 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 221.333-31 chr12 68111989 68112283 + 1 NA Intergenic Intergenic 47604 NM_000619 3458 Hs.856 NM_000619 ENSG00000111537 IFNG IFG|IFI interferon gamma protein-coding 192.667-105 chr3 65893462 65893860 + 1 NA promoter-TSS (NR_046575) promoter-TSS (NR_046575) -155 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 209.667-116 chr8 134571756 134572104 + 1 NA intron (NM_020863, intron 10 of 15) L1ME4c|LINE|L1 -26141 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 182.667-42 chr14 47842270 47842616 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -47429 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 248.333-40 chr19 33999880 34000282 + 1 NA Intergenic Intergenic -172423 NM_015578 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 170.333-116 chr2 161235290 161235530 + 1 NA exon (NM_004180, exon 8 of 8) exon (NM_004180, exon 8 of 8) -9329 NR_110164 100996579 Hs.660929 NR_110163 ENSG00000227403 LINC01806 - long intergenic non-protein coding RNA 1806 ncRNA 191.667-24 chr11 29568959 29569165 + 1 NA Intergenic MamRep1894|DNA|hAT -25351 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 188.667-72 chr2 64069760 64070054 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -50479 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 160.333-51 chr10 120230100 120230329 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 125009 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 165.667-30 chr11 78952681 78952987 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 6 of 33) MIRb|SINE|MIR -377970 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 138.667-164 chr5 56459871 56460071 + 1 NA intron (NR_104664, intron 4 of 4) intron (NR_104664, intron 4 of 4) 21798 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 191.667-12 chr10 16203222 16203508 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -233578 NM_001001484 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 166.333-153 chr3 47250884 47251105 + 1 NA promoter-TSS (NR_145712) promoter-TSS (NR_145712) -385 NR_145712 109617025 NR_145712 SNORD13J - small nucleolar RNA, C/D box 13J snoRNA 165.333-252 chr8 126196437 126196703 + 1 NA Intergenic Intergenic -128925 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 134.667-204 chr8 132964151 132964373 + 1 NA intron (NM_003235, intron 29 of 47) intron (NM_003235, intron 29 of 47) 82319 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 192.667-62 chr15 25442253 25442528 + 1 NA Intergenic Intergenic -3334 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 147.667-378 chr8 134512229 134512376 + 1 NA intron (NM_020863, intron 14 of 15) intron (NM_020863, intron 14 of 15) -85769 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 148.333-372 chr7 108817016 108817191 + 1 NA Intergenic Intergenic 67484 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 143.667-256 chr8 125658588 125658791 + 1 NA Intergenic Intergenic 226480 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 132.333-114 chr3 121280779 121280911 + 1 NA intron (NM_001348345, intron 19 of 26) AluJr|SINE|Alu 231205 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 162.667-73 chr13 71612636 71612864 + 1 NA intron (NM_001366712, intron 3 of 11) intron (NM_001366712, intron 3 of 11) 254442 NM_004392 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 206.333-33 chr12 43614900 43615220 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -62857 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 137.667-94 chr2 65414422 65414664 + 1 NA intron (NM_181784, intron 1 of 5) intron (NM_181784, intron 1 of 5) 18056 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 166.333-111 chr2 58775307 58775638 + 1 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 254719 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 145.667-6 chr1 57614268 57614551 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) -189488 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 206.667-109 chr5 30266333 30266650 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 385931 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 269.333-75 chr6 62013560 62014029 + 1 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) intron (NR_146874, intron 3 of 13) 272431 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 129.667-104 chr2 182349772 182349931 + 1 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 77197 NM_001258313 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 120.667-155 chr7 4481405 4481594 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -200796 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 176.333-7 chr1 59408177 59408372 + 1 NA intron (NM_001350794, intron 5 of 14) intron (NM_001350794, intron 5 of 14) 98242 NM_001350794 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 232.333-36 chr17 65877714 65878104 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 20 of 26) L1MA9|LINE|L1 -51366 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 133.667-51 chr14 69873893 69874089 + 1 NA Intergenic Intergenic -5425 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 252.667-32 chr14 71969692 71969999 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MIR3|SINE|MIR 36318 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 119.333-152 chr3 81497190 81497417 + 1 NA intron (NM_000158, intron 15 of 15) intron (NM_000158, intron 15 of 15) 264342 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 164.667-162 chr4 60501869 60502173 + 1 NA Intergenic Intergenic -420598 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 204.333-65 chr15 71016212 71016461 + 1 NA intron (NM_017691, intron 14 of 15) L1M5|LINE|L1 123893 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 153.667-190 chr2 88567285 88567457 + 1 NA intron (NM_004836, intron 14 of 16) intron (NM_004836, intron 14 of 16) 28651 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 156.667-176 chr2 46139153 46139377 + 1 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) L1MC4a|LINE|L1 -158142 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 152.667-332 chr6 149347150 149347373 + 1 NA intron (NM_001369506, intron 2 of 7) intron (NM_001369506, intron 2 of 7) 28961 NM_015093 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 244.667-81 chr5 180750812 180751211 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10953 NM_001001657 134083 Hs.554719 NM_001001657 ENSG00000174339 OR2Y1 OR5-2 olfactory receptor family 2 subfamily Y member 1 protein-coding 152.667-109 chr14 62867264 62867457 + 1 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 178098 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 121.333-3 chr1 19316988 19317134 + 1 NA intron (NM_001040126, intron 2 of 7) intron (NM_001040126, intron 2 of 7) 4735 NM_001040125 54896 Hs.647620 NM_017765 ENSG00000040487 SLC66A1 LAAT-1|LAAT1|PQLC2 solute carrier family 66 member 1 protein-coding 266.333 chr1 17429935 17430340 + 1 NA intron (NM_001136204, intron 1 of 11).2 intron (NM_001136204, intron 1 of 11).2 8399 NM_001136204 55920 Hs.380857 NM_018715 ENSG00000179051 RCC2 TD-60 regulator of chromosome condensation 2 protein-coding 165.333-240 chr7 31764922 31765090 + 1 NA intron (NM_001191059, intron 18 of 18) intron (NM_001191059, intron 18 of 18) 77791 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 171.333-37 chr12 108512906 108513124 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2262 NM_007076 11153 Hs.661891 NM_007076 ENSG00000198855 FICD HIP13|HYPE|UNQ3041 FIC domain containing protein-coding 155.333-416 chr9 122008904 122009178 + 1 NA intron (NM_194252, intron 3 of 3) L1MA8|LINE|L1 84565 NM_001139442 158135 Hs.438937 NM_194252 ENSG00000175764 TTLL11 C9orf20|bA244O19.1 tubulin tyrosine ligase like 11 protein-coding 119.667-62 chr16 59553715 59553929 + 1 NA Intergenic Intergenic 201369 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 148.333-150 chr16 7959769 7960017 + 1 NA Intergenic Intergenic 627048 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 426.333-9 chr9 131942032 131942691 + 1 NA intron (NM_001253881, intron 3 of 6) intron (NM_001253881, intron 3 of 6) 137506 NM_001253882 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 203.333-137 chr2 102932889 102933176 + 1 NA Intergenic Intergenic -37310 NR_135562 105373518 Hs.738351 NR_135562 ENSG00000277527 LINC01796 - long intergenic non-protein coding RNA 1796 ncRNA 142.333-251 chr9 22481851 22481999 + 1 NA Intergenic Intergenic 35101 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 159.333-11 chr1 81426139 81426318 + 1 NA intron (NM_001366004, intron 2 of 27) MER39|LTR|ERV1 119833 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 261.667-57 chr4 106162505 106162853 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 24 of 26) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -140201 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 139.667-166 chr6 167439321 167439520 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 33370 NR_134591 105378127 Hs.58456 NR_134591 LOC105378127 - uncharacterized LOC105378127 ncRNA 148.333-201 chr2 165755892 165756060 + 1 NA intron (NM_004482, intron 7 of 10) MER91A|DNA|hAT-Tip100 38271 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 142.333-106 chr18 10712098 10712302 + 1 NA intron (NM_022068, intron 36 of 51) intron (NM_022068, intron 36 of 51) 47449 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 224.333-43 chr14 75457291 75457588 + 1 NA intron (NM_130469, intron 2 of 3) intron (NM_130469, intron 2 of 3) 25305 NM_001135049 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 155.667-179 chr2 169375734 169375915 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -13290 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 160.333-106 chr14 69954320 69954480 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 3 of 11) AluJr|SINE|Alu -23733 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 266.333-52 chr5 158456039 158456679 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -46586 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 200.667-52 chr15 91977175 91977451 + 1 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) intron (NR_135775, intron 2 of 10) 123009 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 155.667-397 chrX 44361347 44361566 + 1 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -17784 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 149.667-37 chr1 200532583 200532754 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 86170 NM_001305792 9928 Hs.3104 NM_014875 ENSG00000118193 KIF14 MCPH20|MKS12 kinesin family member 14 protein-coding 248.333-96 chr7 93732049 93732433 + 1 NA Intergenic Intergenic 15313 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 154.667-28 chr1 211702153 211702337 + 1 NA Intergenic Intergenic 26483 NR_148994 91548 Hs.367839 NR_148994 LOC91548 - uncharacterized LOC91548 ncRNA 220.667-21 chr12 3323323 3323770 + 1 NA intron (NR_148995, intron 1 of 11) intron (NR_148995, intron 1 of 11) 42576 NR_148995 100128253 Hs.447497 NR_148995 LOC100128253 - uncharacterized LOC100128253 ncRNA 131.667-16 chr10 7065311 7065538 + 1 NA Intergenic Intergenic 121360 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 135.333-124 chr4 52579794 52579953 + 1 NA Intergenic Intergenic 76666 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 142.333-236 chr8 83679831 83680157 + 1 NA Intergenic Intergenic 276236 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 166.667-97 chr18 8664411 8664723 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 43054 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 162.333-208 chr5 167802900 167803193 + 1 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) intron (NM_001080428, intron 1 of 24) 48117 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 159.333-184 chr20 31572615 31572809 + 1 NA intron (NR_046853, intron 2 of 2) intron (NR_046853, intron 2 of 2) 551 NR_046853 100874042 Hs.373741 NR_046853 ENSG00000230613 HM13-AS1 - HM13 antisense RNA 1 ncRNA 155.667-277 chr5 66308951 66309185 + 1 NA Intergenic Intergenic -99622 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 183.333-82 chr2 61265890 61266182 + 1 NA exon (NM_014709, exon 42 of 80) exon (NM_014709, exon 42 of 80) 88618 NR_152216 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 287.333-22 chr14 73685695 73686127 + 1 NA intron (NM_001201366, intron 6 of 8) L1MB3|LINE|L1 28473 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 352.667-32 chrX 117988909 117989390 + 1 NA intron (NM_001168303, intron 1 of 6) intron (NM_001168303, intron 1 of 6) -3736 NM_001168299 90293 Hs.348262 NM_033495 ENSG00000003096 KLHL13 BKLHD2 kelch like family member 13 protein-coding 261.667-74 chr8 132786482 132786938 + 1 NA intron (NM_198513, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 11322 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 155.333-145 chr18 38571782 38572036 + 1 NA Intergenic Intergenic 914774 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 115.333-29 chr10 93085256 93085457 + 1 NA Intergenic Intergenic 11463 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 136.333-174 chr5 155578017 155578237 + 1 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 564372 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 154.333-244 chr4 61530144 61530331 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 328065 NM_001371342 147.333-32 chr1 247155019 247155191 + 1 NA 3' UTR (NM_001297568, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001297568, exon 4 of 4) 16912 NM_003431 7678 Hs.421238 NM_003431 ENSG00000196418 ZNF124 HZF-16|HZF16|ZK7 zinc finger protein 124 protein-coding 156.333-377 chr9 31646364 31646599 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -264991 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 143.667-134 chr2 134941780 134942031 + 1 NA intron (NR_135468, intron 4 of 9) intron (NR_135468, intron 4 of 9) 23083 NR_135468 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 252.333-53 chr4 181505566 181505875 + 1 NA Intergenic Intergenic -240691 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 195.667-110 chr5 115434851 115435200 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 109750 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 195.667-157 chrX 31769263 31769550 + 1 NA intron (NM_000109, intron 51 of 78) intron (NM_000109, intron 51 of 78) -261108 NM_004014 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 155.667-218 chr3 60321692 60321977 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -240925 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 158.667-241 chr4 63120194 63120435 + 1 NA Intergenic Intergenic -958549 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-40 chr10 55941277 55941534 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -313463 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 158.333-265 chr5 140144407 140144634 + 1 NA Intergenic Intergenic -12799 NR_130738 101929719 Hs.150064 NR_130738 ENSG00000254363 LOC101929719 - uncharacterized LOC101929719 ncRNA 168.333-157 chr5 14653908 14654082 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -1613 NR_132981 106635684 NR_132981 SNORD141B - small nucleolar RNA, C/D box 141B snoRNA 181.667-9 chr1 242244892 242245159 + 1 NA intron (NM_001320272, intron 5 of 10) intron (NM_001320272, intron 5 of 10) 204443 NM_001195812 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 123.667-118 chr3 38786697 38786823 + 1 NA intron (NM_006514, intron 3 of 26) L1ME3B|LINE|L1 7250 NM_006514 6336 Hs.250443 NM_006514 ENSG00000185313 SCN10A FEPS2|Nav1.8|PN3|SNS|hPN3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 protein-coding 130.667-163 chr5 30892249 30892424 + 1 NA Intergenic Intergenic -301350 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 162.333-269 chr9 30086251 30086460 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 322099 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 187.333-201 chr8 113556400 113556826 + 1 NA Intergenic Intergenic -119674 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 204.333-45 chr12 32971375 32971693 + 1 NA Intergenic Intergenic -74688 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 318.667-10 chr12 130305625 130306124 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -32013 NM_001190971 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 220.667-27 chr13 83946668 83947027 + 1 NA Intergenic Intergenic -64373 NM_001281503 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 128.667-98 chr2 203648987 203649156 + 1 NA Intergenic Intergenic -57404 NM_001243078 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 259.667-23 chr15 67620427 67620867 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 8 of 21) L1MEd|LINE|L1 71553 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 368.333-4 chr21 33934346 33935060 + 1 NA intron (NR_038883, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu 3489 NR_134558 100506334 Hs.532855 NM_207472 ENSG00000237945 LINC00649 - long intergenic non-protein coding RNA 649 ncRNA 183.333-27 chr11 105754387 105754662 + 1 NA intron (NR_046356, intron 3 of 16) intron (NR_046356, intron 3 of 16) 143818 NR_046356 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 165.333-126 chr2 73947408 73947761 + 1 NA intron (NR_134893, intron 2 of 3) intron (NR_134893, intron 2 of 3) 20704 NM_080916 1716 Hs.469022 NM_001929 ENSG00000114956 DGUOK MTDPS3|NCPH|PEOB4|dGK deoxyguanosine kinase protein-coding 153.333-224 chr2 179960335 179960603 + 1 NA intron (NM_020943, intron 13 of 19) intron (NM_020943, intron 13 of 19) 46828 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 144.333-253 chr7 126697952 126698210 + 1 NA intron (NM_001371085, intron 7 of 10) intron (NM_001371085, intron 7 of 10) 360103 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 181.667-37 chr14 48715131 48715484 + 1 NA Intergenic Intergenic 871073 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 188.333-13 chr1 219577684 219578045 + 1 NA Intergenic Intergenic -20540 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 318.667-28 chr5 78949625 78950274 + 1 NA intron (NM_198709, intron 5 of 7) intron (NM_198709, intron 5 of 7) 35361 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 144.667-266 chr6 75435554 75435719 + 1 NA intron (NR_125859, intron 4 of 8) intron (NR_125859, intron 4 of 8) 7229 NR_039670 100616389 NR_039670 ENSG00000263533 MIR4463 - microRNA 4463 ncRNA 151.667-276 chr5 54484407 54484558 + 1 NA Intergenic Intergenic 28783 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 210.333-32 chr12 53044395 53044686 + 1 NA non-coding (NR_033854, exon 4 of 4) non-coding (NR_033854, exon 4 of 4) -2486 NM_198316 23371 Hs.6147 NM_015319 ENSG00000111077 TNS2 C1-TEN|C1TEN|TENC1 tensin 2 protein-coding 136.333-135 chr3 172045085 172045257 + 1 NA intron (NM_001135095, intron 1 of 25) intron (NM_001135095, intron 1 of 25) 4640 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 156.667-86 chr12 115319332 115319629 + 1 NA Intergenic Intergenic -635305 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 148.333-148 chr15 97084866 97085045 + 1 NA Intergenic Intergenic 301520 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 157.333-228 chr3 74785796 74785975 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -264745 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 153.667-227 chr20 54960745 54960938 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -462202 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 157.333-303 chr6 51806862 51807059 + 1 NA intron (NM_138694, intron 52 of 66) intron (NM_138694, intron 52 of 66) 185090 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 161.333-180 chr3 3670944 3671118 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -128400 NM_001324189 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 205.667-65 chr2 48600590 48600885 + 1 NA intron (NM_172311, intron 3 of 10) intron (NM_172311, intron 3 of 10) -17043 NM_001193487 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 147.667-56 chr11 50465058 50465252 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 56008 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 131.667-203 chr8 122983532 122983690 + 1 NA Intergenic Intergenic 42161 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 150.667-212 chr20 34681697 34681965 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -4546 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 198.333-114 chr20 55547511 55547734 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -120425 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 150.333-343 chr5 130691576 130691747 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 473595 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 220.333-98 chr4 31058397 31058778 + 1 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -112557 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 202.333-150 chr5 156841085 156841391 + 1 NA Intergenic Intergenic -9057 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 283.667-18 chr2 171513221 171513675 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -8785 NM_001256909 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 130.667-115 chr2 144467580 144467785 + 1 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -51932 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 241.333-63 chr21 27541070 27541533 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -181078 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 258.667-95 chr8 87689602 87689990 + 1 NA Intergenic Intergenic 184219 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 260.667-75 chr5 67264310 67264786 + 1 NA Intergenic Intergenic -67749 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 122.667-166 chr6 90656469 90656662 + 1 NA Intergenic Intergenic -69493 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 227.333-109 chr6 117279077 117279363 + 1 NA Intergenic Intergenic 13662 NM_153453 245806 Hs.99324 NM_153453 ENSG00000170162 VGLL2 VGL2|VITO1 vestigial like family member 2 protein-coding 159.333-131 chr18 63462423 63462600 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -14447 NM_002639 5268 Hs.55279 NM_002639 ENSG00000206075 SERPINB5 PI5|maspin serpin family B member 5 protein-coding 173.667-197 chrX 47821911 47822099 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -14897 NM_007137 347344 Hs.114246 NM_007137 ENSG00000197779 ZNF81 HFZ20|MRX45|dJ54B20.6 zinc finger protein 81 protein-coding 234.333-38 chr2 69017808 69018178 + 1 NA intron (NM_032208, intron 1 of 17) intron (NM_032208, intron 1 of 17) 4849 NM_018153 84168 Hs.165859 NM_018153 ENSG00000169604 ANTXR1 ATR|GAPO|TEM8 ANTXR cell adhesion molecule 1 protein-coding 163.333-128 chr18 3038602 3038767 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26737 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 151.667-159 chr2 17547776 17547940 + 1 NA intron (NM_001366806, intron 1 of 3) intron (NM_001366806, intron 1 of 3) 7162 NM_003385 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 299.333-75 chr8 120145120 120145547 + 1 NA intron (NM_021110, intron 1 of 47) L1M5|LINE|L1 20231 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 149.667-110 chr13 113255341 113255605 + 1 NA intron (NM_001008895, intron 18 of 19) L1MC1|LINE|L1 -7447 NR_107042 102465874 NR_107042 ENSG00000277942 MIR8075 hsa-mir-8075 microRNA 8075 ncRNA 208.667-91 chr3 172756888 172757173 + 1 NA exon (NM_001349104, exon 4 of 24) exon (NM_001349104, exon 4 of 24) 6028 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 207.667-10 chr10 75982529 75982887 + 1 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 199947 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 290.667-15 chr14 67709751 67710115 + 1 NA intron (NM_152443, intron 1 of 8) MER4A1|LTR|ERV1 8047 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 143.667-66 chr13 88610980 88611151 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -15788 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 191.667-127 chr8 118219985 118220255 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -108301 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 146.667-95 chr14 32137471 32137624 + 1 NA intron (NM_001030055, intron 3 of 6) L1MB5|LINE|L1 60243 NM_001030055 394 Hs.592313 NM_001173 ENSG00000100852 ARHGAP5 GFI2|RhoGAP5|p190-B|p190BRhoGAP Rho GTPase activating protein 5 protein-coding 219.667-76 chr5 133531280 133531578 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) 81112 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 181.667-109 chr4 77261819 77262063 + 1 NA Intergenic Intergenic 104734 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 168.667-112 chr2 193249870 193250089 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 500134 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 148.667-157 chr17 57688357 57688619 + 1 NA Intergenic Intergenic 56811 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 156.667-271 chr5 80908551 80908819 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -51678 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 173.667-54 chr15 65652794 65652978 + 1 NA intron (NM_001301033, intron 10 of 11) intron (NM_001301033, intron 10 of 11) 10007 NM_001254740 9187 Hs.173092 NM_004727 ENSG00000074621 SLC24A1 CSNB1D|HsT17412|NCKX|NCKX1|RODX solute carrier family 24 member 1 protein-coding 229.667-51 chr21 26364881 26365249 + 1 NA Intergenic Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger -28570 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-44 chr10 109248350 109248511 + 1 NA Intergenic Intergenic 674816 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 251.667-72 chr4 108091974 108092265 + 1 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) intron (NM_001130713, intron 3 of 10) 74678 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 154.333-210 chr3 41452379 41452638 + 1 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) intron (NR_136342, intron 32 of 34) 253003 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 182.667-157 chr8 43656900 43657217 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 364616 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 156.667-215 chr21 32596211 32596371 + 1 NA intron (NM_001350338, intron 5 of 7) MER63D|DNA|hAT-Blackjack -10768 NM_144659 140290 Hs.728804 NM_018277 ENSG00000242220 TCP10L C21orf77|PRED77|TCP10A-1|TCP10A-2 t-complex 10 like protein-coding 144.333-282 chr9 27587784 27587996 + 1 NA Intergenic Intergenic -14024 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 135.333-170 chr7 30330151 30330318 + 1 NA intron (NM_147128, intron 2 of 4) MamRep605|LTR?|LTR? -39816 NR_002186 222161 Hs.112423 NR_002186 DKFZP586I1420 - uncharacterized protein DKFZp586I1420 pseudo 142.667-177 chr5 34854209 34854371 + 1 NA intron (NM_001317949, intron 4 of 10) MIRc|SINE|MIR 14909 NM_001317949 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 150.667-40 chr10 59959378 59959558 + 1 NA non-coding (NR_024340, exon 2 of 2) non-coding (NR_024340, exon 2 of 2) 1445 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 256.333-70 chr6 56085499 56085959 + 1 NA intron (NM_030820, intron 17 of 29) MER5A|DNA|hAT-Charlie 5933 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 249.333-8 chr1 159352235 159352656 + 1 NA Intergenic Intergenic -37786 NM_001004467 441911 Hs.553833 NM_001004467 ENSG00000196266 OR10J3 OR1-25|OR10J3P olfactory receptor family 10 subfamily J member 3 protein-coding 183.667-17 chr1 215576489 215576732 + 1 NA intron (NM_001319294, intron 4 of 17) AluYa5|SINE|Alu 9306 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 225.667-31 chr16 73430470 73430762 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 43811 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 122.333-82 chr18 56403477 56403696 + 1 NA Intergenic Intergenic -212324 NR_148972 642484 NR_148972 ENSG00000206129 LOC642484 - uncharacterized LOC642484 ncRNA 193.667-62 chr2 153158346 153158734 + 1 NA Intergenic Intergenic 320222 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 163.667-212 chr6 67404702 67404871 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -650565 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 155.667-70 chr12 38251045 38251288 + 1 NA Intergenic Intergenic -65608 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 128.333-11 chr1 169739338 169739501 + 1 NA Intergenic Intergenic -5340 NM_000450 6401 Hs.82848 NM_000450 ENSG00000007908 SELE CD62E|ELAM|ELAM1|ESEL|LECAM2 selectin E protein-coding 153.333-136 chr15 55567417 55567712 + 1 NA intron (NM_015617, intron 1 of 2) L1PA16|LINE|L1 20781 NM_001330326 26108 Hs.87194 NM_015617 ENSG00000171016 PYGO1 - pygopus family PHD finger 1 protein-coding 201.333-96 chr14 52007239 52007647 + 1 NA 3' UTR (NM_016039, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_016039, exon 8 of 8) 17897 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 158.333-343 chr9 99932248 99932504 + 1 NA intron (NM_017919, intron 3 of 7) intron (NM_017919, intron 3 of 7) 25722 NM_017919 55014 Hs.704031 NM_017919 ENSG00000136874 STX17 - syntaxin 17 protein-coding 170.667-149 chr6 134118175 134118400 + 1 NA promoter-TSS (NR_037938) promoter-TSS (NR_037938) -607 NR_037938 387065 Hs.571061 NR_037938 HMGA1P7 HMGA1L7 high mobility group AT-hook 1 pseudogene 7 pseudo 235.333-43 chr17 62070452 62070869 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -5382 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 236.333-37 chr17 64746619 64747016 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -33942 NR_106728 102464831 NR_106728 ENSG00000278581 MIR6080 hsa-mir-6080 microRNA 6080 ncRNA 271.333-63 chr7 47430270 47430756 + 1 NA intron (NM_022748, intron 8 of 30) L1M2|LINE|L1 34290 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 158.333-36 chr10 66150518 66150705 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L1MA4|LINE|L1 579186 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 151.667-42 chr10 25337497 25337704 + 1 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) L1ME3A|LINE|L1 -161324 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 142.333-260 chr9 87168421 87168579 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 19856 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 252.667-78 chr5 33989365 33989854 + 1 NA intron (NR_037951, intron 8 of 8) intron (NR_037951, intron 8 of 8) -4916 NM_001012509 51151 Hs.278962 NM_016180 ENSG00000164175 SLC45A2 1A1|AIM1|MATP|OCA4|SHEP5 solute carrier family 45 member 2 protein-coding 125.333-15 chr1 188785323 188785568 + 1 NA Intergenic Intergenic 1341817 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 136.667-172 chr8 11353125 11353294 + 1 NA intron (NR_001578, intron 1 of 8) Charlie1|DNA|hAT-Charlie -5693 NR_147705 100129129 Hs.662094 NR_147705 ENSG00000255020 LOC100129129 - uncharacterized LOC100129129 ncRNA 142.333-129 chr2 166233566 166233754 + 1 NA intron (NM_001365536, intron 20 of 26) intron (NM_001365536, intron 20 of 26) -84499 NM_001353949 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 146.667-38 chr10 65904803 65904981 + 1 NA Intergenic Intergenic 333467 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 153.667-8 chr1 59385682 59385948 + 1 NA intron (NM_001350794, intron 5 of 14) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 75783 NM_001350794 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 159.333-150 chr2 41959280 41959582 + 1 NA Intergenic Intergenic -5625 NR_161189 400950 Hs.738713 NM_001242815 ENSG00000205086 C2orf91 - chromosome 2 open reading frame 91 ncRNA 156.667-88 chr12 127025126 127025351 + 1 NA intron (NR_104646, intron 2 of 6) L2c|LINE|L2 35159 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 190.667-151 chr8 119617349 119617739 + 1 NA exon (NM_001040092, exon 6 of 25) exon (NM_001040092, exon 6 of 25) 21295 NM_001130863 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 185.667-89 chr3 69701253 69701669 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -38003 NM_001354605 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 148.333-166 chr18 4706169 4706355 + 1 NA Intergenic Intergenic -250955 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 203.667-98 chr5 90611784 90612221 + 1 NA intron (NR_003149, intron 1 of 89) intron (NR_003149, intron 1 of 89) 53205 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 151.333-213 chr2 83026733 83026996 + 1 NA Intergenic Intergenic 170061 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 243.667-73 chr8 103553749 103554144 + 1 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1PA15|LINE|L1 -52036 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 189.667-23 chr11 17099766 17100050 + 1 NA exon (NM_002645, exon 26 of 33) exon (NM_002645, exon 26 of 33) -22241 NM_001017 6207 Hs.446588 NM_001017 ENSG00000110700 RPS13 S13 ribosomal protein S13 protein-coding 154.667-153 chr18 45484329 45484612 + 1 NA intron (NR_110899, intron 2 of 7) intron (NR_110899, intron 2 of 7) 22566 NR_110899 101927980 Hs.591058 NR_110899 SLC14A2-AS1 - SLC14A2 antisense RNA 1 ncRNA 158.333-333 chr8 136141384 136141577 + 1 NA Intergenic Intergenic -389318 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 177.333-22 chr10 108722376 108722625 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -653207 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 164.667-133 chr22 24958100 24958393 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -11551 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 127.667-66 chr18 13212518 13212724 + 1 NA Intergenic L1P|LINE|L1 -6139 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 280.333-19 chr2 66194525 66194969 + 1 NA Intergenic Intergenic 163581 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 184.667-47 chr18 37047650 37048003 + 1 NA intron (NM_001353920, intron 7 of 10) intron (NM_001353920, intron 7 of 10) -124012 NR_134585 105372069 Hs.666765 NR_134585 ENSG00000267039 LOC105372069 - uncharacterized LOC105372069 ncRNA 153.333-182 chr2 3122591 3122898 + 1 NA intron (NR_110228, intron 3 of 6) L1M6|LINE|L1 3282 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 172.667-97 chr3 76660377 76660789 + 1 NA Intergenic Intergenic -379516 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 154.667-255 chr3 145183806 145184048 + 1 NA Intergenic Intergenic 885258 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 146.333-325 chr8 98252517 98252688 + 1 NA non-coding (NR_135746, exon 3 of 13) non-coding (NR_135746, exon 3 of 13) 41633 NM_001321635 79815 Hs.309489 NM_024759 ENSG00000104361 NIPAL2 NPAL2 NIPA like domain containing 2 protein-coding 159.333-138 chr19 49560662 49560936 + 1 NA intron (NM_001270960, intron 1 of 8) intron (NM_001270960, intron 1 of 8) 19757 NM_001270960 51070 Hs.7236 NM_015953 ENSG00000142546 NOSIP CGI-25 nitric oxide synthase interacting protein protein-coding 198.333-49 chr12 81831962 81832234 + 1 NA Intergenic Intergenic -72748 NM_003625 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 198.333-92 chr2 37290502 37290772 + 1 NA intron (NM_005813, intron 3 of 17) MIRb|SINE|MIR 26447 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 145.667-24 chr1 218153039 218153212 + 1 NA Intergenic Intergenic 109620 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 266.667-64 chr5 170211301 170211651 + 1 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -12335 NR_108022 100507267 Hs.634846 NR_108022 LINC01187 CTB-27N1.1|KIDR long intergenic non-protein coding RNA 1187 ncRNA 217.333-124 chr5 156230796 156231238 + 1 NA Intergenic Intergenic -95740 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 167.333-167 chr3 4990145 4990497 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -10360 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 297.667-30 chr5 108276075 108276466 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) intron (NM_001163315, intron 4 of 8) 105828 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 201.667-8 chr10 57259753 57260022 + 1 NA Intergenic Intergenic 44672 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 121.667-47 chr12 56349949 56350125 + 1 NA intron (NM_198332, intron 13 of 23) AluSx|SINE|Alu 10070 NM_198332 6773 Hs.530595 NM_005419 ENSG00000170581 STAT2 IMD44|ISGF-3|P113|STAT113 signal transducer and activator of transcription 2 protein-coding 134.333-95 chr2 199603708 199603984 + 1 NA Intergenic CpG -4222 NR_110270 101927641 Hs.549598 NR_110270 ENSG00000238217 LINC01877 - long intergenic non-protein coding RNA 1877 ncRNA 166.667-64 chr14 52882655 52882825 + 1 NA intron (NM_006832, intron 4 of 14) intron (NM_006832, intron 4 of 14) 68310 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 194.333-109 chr4 184016118 184016442 + 1 NA intron (NM_020225, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu 110973 NM_020225 56977 Hs.21958 NM_020225 ENSG00000173320 STOX2 - storkhead box 2 protein-coding 133.333-12 chr1 178942476 178942679 + 1 NA Intergenic Intergenic -71500 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 144.333-129 chr2 96926452 96926606 + 1 NA TTS (NR_110209) TTS (NR_110209) 7423 NR_110209 101927053 Hs.677537 NR_110209 LOC101927053 - uncharacterized LOC101927053 ncRNA 116.667-180 chr6 124660173 124660350 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 4 of 6) intron (NM_001040214, intron 4 of 6) -302284 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 168.667-143 chr3 88331020 88331218 + 1 NA Intergenic Intergenic -7337 NM_001368168 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 137.333-202 chr8 126841336 126841487 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -171743 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 154.333-148 chr2 44846338 44846628 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 92405 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 192.667-157 chr7 39541607 39541899 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -24651 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 152.333-50 chr10 80959314 80959605 + 1 NA Intergenic Intergenic 309662 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 165.333-178 chr3 126047476 126047714 + 1 NA intron (NM_001008486, intron 2 of 10) L1M4c|LINE|L1 9180 NM_001008487 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 153.667-158 chr17 77880284 77880446 + 1 NA non-coding (NR_028337, exon 2 of 2) non-coding (NR_028337, exon 2 of 2) 3722 NR_028337 400624 Hs.514521 NM_001001685 ENSG00000204283 LINC01973 - long intergenic non-protein coding RNA 1973 ncRNA 149.333-11 chr1 65662825 65662978 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -129609 NM_001037341 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 189.667-109 chr4 85811514 85811821 + 1 NA intron (NM_001346093, intron 1 of 6) intron (NM_001346093, intron 1 of 6) -16270 NM_001287805 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 144.667-86 chr14 65445252 65445428 + 1 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -25762 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 232.667-33 chr2 8976506 8976920 + 1 NA intron (NR_135603, intron 1 of 13) intron (NR_135603, intron 1 of 13) 26971 NM_001321265 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 149.667-70 chr11 21646938 21647094 + 1 NA Intergenic ORSL|DNA|hAT-Tip100 -546069 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 113.667-14 chr1 161770655 161770835 + 1 NA intron (NM_007348, intron 1 of 15) L1MC2|LINE|L1 4425 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 165.333-242 chr7 110779351 110779633 + 1 NA intron (NM_001350963, intron 5 of 5) intron (NM_001350963, intron 5 of 5) -311514 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 171.333-8 chr1 112495192 112495397 + 1 NA intron (NM_004185, intron 2 of 5) L1MCa|LINE|L1 -13671 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 222.667-3 chr1 153395361 153395834 + 1 NA intron (NM_001319198, intron 1 of 2) intron (NM_001319198, intron 1 of 2) -4409 NM_001319196 6279 Hs.416073 NM_002964 ENSG00000143546 S100A8 60B8AG|CAGA|CFAG|CGLA|CP-10|L1Ag|MA387|MIF|MRP8|NIF|P8 S100 calcium binding protein A8 protein-coding 119.667-153 chr5 73841783 73841962 + 1 NA intron (NM_001177693, intron 11 of 35) L1ME3E|LINE|L1 28326 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 156.667-292 chr5 169899894 169900171 + 1 NA intron (NM_001346304, intron 1 of 3) intron (NM_001346304, intron 1 of 3) 80463 NM_001129891 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 285.667-7 chr11 111529780 111530129 + 1 NA intron (NM_207430, intron 4 of 6) intron (NM_207430, intron 4 of 6) -10326 NM_001318799 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 219.333-151 chr6 37687421 37687918 + 1 NA intron (NM_153487, intron 1 of 16) FLAM_C|SINE|Alu 10214 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 159.333-282 chr6 52872906 52873087 + 1 NA Intergenic Intergenic -26901 NM_153699 221357 Hs.646984 NM_153699 ENSG00000182793 GSTA5 - glutathione S-transferase alpha 5 protein-coding 173.667-3 chr1 29580340 29580696 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -230404 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 165.333-182 chr3 197985138 197985380 + 1 NA intron (NR_026786, intron 7 of 16) intron (NR_026786, intron 7 of 16) 25042 NR_026787 89782 Hs.518540 NM_033029 ENSG00000185621 LMLN GP63|INV|IX14|LMNL1|MSP leishmanolysin like peptidase protein-coding 255.667-50 chr20 7492979 7493288 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 121525 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 143.333-142 chr2 137910936 137911154 + 1 NA intron (NR_120402, intron 2 of 2) intron (NR_120402, intron 2 of 2) 16887 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 156.333-66 chr11 133902787 133903020 + 1 NA Intergenic Intergenic -1163 NR_024344 283174 Hs.504370 NM_001001873 ENSG00000280237 MIR4697HG LINC00947 MIR4697 host gene ncRNA 158.333-106 chr16 67203879 67204077 + 1 NA TTS (NM_024712) TTS (NM_024712) -1583 NR_029887 442901 NR_029887 ENSG00000207948 MIR328 MIRN328|hsa-mir-328|mir-328 microRNA 328 ncRNA 144.667-38 chr11 29823728 29823958 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 158550 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 185.333-149 chr5 14045266 14045540 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -97939 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 183.667-76 chr2 98298680 98299030 + 1 NA intron (NM_001345864, intron 18 of 21) MER51C|LTR|ERV1 -47300 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 224.667-87 chrX 95954798 95955161 + 1 NA Intergenic Intergenic 382923 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 203.333-112 chr18 7514748 7515017 + 1 NA Intergenic MER90|LTR|ERV1 -52434 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 159.333-192 chr21 15221054 15221231 + 1 NA Intergenic Intergenic -156142 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 122.333-127 chr21 29891477 29891651 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 48432 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 129.333-155 chr5 86053149 86053403 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -229168 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 151.667-204 chr22 42470413 42470712 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -30017 NR_027786 94009 Hs.360940 NM_170694 ENSG00000172250 SERHL BK126B4.1|BK126B4.2|HS126B42|dJ222E13.1 serine hydrolase like (pseudogene) pseudo 213.667-91 chr8 81701058 81701355 + 1 NA TTS (NM_024699) TTS (NM_024699) -6148 NM_001010893 347051 Hs.683849 NM_001010893 ENSG00000253598 SLC10A5 P5 solute carrier family 10 member 5 protein-coding 318.667-24 chr4 57404937 57405262 + 1 NA Intergenic Intergenic -20773 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 144.333-123 chr2 52673796 52674013 + 1 NA Intergenic Intergenic 28711 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 191.667-119 chr8 11723518 11723778 + 1 NA intron (NM_002052, intron 2 of 6) L1MC5|LINE|L1 15792 NM_001308093 2626 Hs.243987 NM_002052 ENSG00000136574 GATA4 ASD2|TACHD|TOF|VSD1 GATA binding protein 4 protein-coding 172.333-80 chr2 25660546 25660839 + 1 NA intron (NM_033147, intron 1 of 19) L1ME3D|LINE|L1 -10470 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 343.333-11 chr15 69190384 69190811 + 1 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) L1MEc|LINE|L1 29962 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 299.667-36 chr7 74183871 74184287 + 1 NA intron (NM_031992, intron 1 of 5) intron (NM_031992, intron 1 of 5) -7119 NR_030321 693175 NR_030321 ENSG00000207741 MIR590 MIRN590|hsa-mir-590|mir-590 microRNA 590 ncRNA 165.667-212 chr9 72016837 72017008 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 43683 NM_001128618 138240 Hs.371235 NM_001128618 ENSG00000204669 C9orf57 - chromosome 9 open reading frame 57 protein-coding 155.333-39 chr10 97179539 97179743 + 1 NA intron (NR_037909, intron 11 of 14) intron (NR_037909, intron 11 of 14) 6318 NM_003061 6585 Hs.632082 NM_003061 ENSG00000187122 SLIT1 MEGF4|SLIL1|SLIT-1|SLIT3 slit guidance ligand 1 protein-coding 121.333-121 chr3 160557867 160558016 + 1 NA intron (NM_002268, intron 1 of 16) AluJo|SINE|Alu 7630 NM_002268 3840 Hs.467866 NM_002268 ENSG00000186432 KPNA4 IPOA3|QIP1|SRP3 karyopherin subunit alpha 4 protein-coding 178.333-25 chr10 119162192 119162416 + 1 NA intron (NM_213649, intron 3 of 13) intron (NM_213649, intron 3 of 13) 3388 NR_110305 119559 Hs.655168 NM_178867 ENSG00000183605 SFXN4 BCRM1|COXPD18|SLC56A4 sideroflexin 4 protein-coding 209.667-72 chr20 7436625 7437012 + 1 NA Intergenic Intergenic 65210 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 130.667-77 chr15 95813095 95813240 + 1 NA Intergenic Intergenic 314674 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 154.333-24 chr1 202941814 202941968 + 1 NA intron (NM_001290553, intron 7 of 7) intron (NM_001290553, intron 7 of 7) -13292 NM_001303051 59349 Hs.706793 NM_021633 ENSG00000117153 KLHL12 C3IP1|DKIR kelch like family member 12 protein-coding 122.333-11 chr1 162068733 162068921 + 1 NA promoter-TSS (NM_001164757) promoter-TSS (NM_001164757) -864 NM_001164757 9722 Hs.731942 NM_014697 ENSG00000198929 NOS1AP 6330408P19Rik|CAPON nitric oxide synthase 1 adaptor protein protein-coding 268.667-49 chr4 107913068 107913575 + 1 NA 3' UTR (NM_001136258, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001136258, exon 7 of 7) -18228 NM_183075 113612 Hs.109087 NM_183075 ENSG00000155016 CYP2U1 P450TEC|SPG49|SPG56 cytochrome P450 family 2 subfamily U member 1 protein-coding 356.667-12 chr4 123394937 123395475 + 1 NA Intergenic Intergenic -1589 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 296.333-23 chr2 198227338 198227755 + 1 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 147551 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 156.667-147 chr18 4111294 4111553 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) L1M4|LINE|L1 149070 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 149.333-145 chr17 60051461 60051672 + 1 NA intron (NM_022070, intron 14 of 19) MIRb|SINE|MIR -8461 NR_039890 100616210 NR_039890 ENSG00000264049 MIR4737 - microRNA 4737 ncRNA 218.667 chr1 15039776 15040166 + 1 NA intron (NM_001370231, intron 4 of 8) intron (NM_001370231, intron 4 of 8) 94052 NM_001017999 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 134.333-52 chr14 70648355 70648558 + 1 NA intron (NM_015351, intron 1 of 2) intron (NM_015351, intron 1 of 2) 6540 NM_015351 23508 Hs.79170 NM_015351 ENSG00000133985 TTC9 TTC9A tetratricopeptide repeat domain 9 protein-coding 214.333-12 chr1 191830722 191831060 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -327571 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 199.333-189 chr3 147222386 147222733 + 1 NA Intergenic Intergenic 169871 NR_040762 84107 Hs.415766 NM_032153 ENSG00000174963 ZIC4 - Zic family member 4 protein-coding 188.333-113 chr4 124277063 124277262 + 1 NA Intergenic Intergenic 281272 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 167.333-281 chrX 73712034 73712328 + 1 NA Intergenic Intergenic -80024 NR_003255 9383 Hs.529901 NR_003255 ENSG00000270641 TSIX LINC00013|NCRNA00013|XIST-AS|XIST-AS1|XISTAS TSIX transcript, XIST antisense RNA ncRNA 158.333-43 chr10 96428256 96428461 + 1 NA intron (NM_012465, intron 5 of 20) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -68993 NM_001284321 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 114.667-137 chr2 122806659 122806868 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 266718 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 134.667-175 chr6 131533232 131533481 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -39870 NR_160934 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 134.333-24 chr10 106814364 106814597 + 1 NA intron (NM_001206569, intron 3 of 25) intron (NM_001206569, intron 3 of 25) 350226 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 149.667-164 chr17 81867771 81867978 + 1 NA non-coding (NR_125441, exon 5 of 5) non-coding (NR_125441, exon 5 of 5) 3123 NM_001301241 396 Hs.159161 NM_004309 ENSG00000141522 ARHGDIA GDIA1|HEL-S-47e|NPHS8|RHOGDI|RHOGDI-1 Rho GDP dissociation inhibitor alpha protein-coding 241.333-37 chr14 31280416 31280701 + 1 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -72765 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 147.333-130 chr16 17488929 17489136 + 1 NA Intergenic MLT2B5|LTR|ERVL -18072 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 160.333-171 chr21 20719307 20719530 + 1 NA Intergenic Intergenic 83690 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 152.333-300 chr5 56510294 56510456 + 1 NA TTS (NR_161255) TTS (NR_161255) -28606 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 249.333-17 chr11 47983272 47983695 + 1 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) 2924 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 113.667-228 chr9 87170480 87170646 + 1 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL 21919 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 160.667-7 chr1 57960087 57960345 + 1 NA intron (NM_021080, intron 1 of 16) MIRb|SINE|MIR 99635 NR_104363 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 189.667-151 chr9 104303078 104303403 + 1 NA Intergenic Intergenic 33011 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 177.667-136 chr8 107803561 107803866 + 1 NA Intergenic Intergenic 278226 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 162.667-112 chr18 29153517 29153736 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -976496 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 171.667-23 chr10 117411571 117411778 + 1 NA Intergenic Intergenic -36234 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 454.667-2 chr14 20312013 20312776 + 1 NA intron (NM_182849, intron 5 of 5) FLAM_C|SINE|Alu -6443 NM_138376 91875 Hs.98553 NM_138376 ENSG00000136319 TTC5 Strap tetratricopeptide repeat domain 5 protein-coding 156.333-345 chr7 113088580 113088825 + 1 NA promoter-TSS (NM_018970) promoter-TSS (NM_018970) -924 NM_018970 54329 Hs.152009 NM_018970 ENSG00000164604 GPR85 SREB|SREB2 G protein-coupled receptor 85 protein-coding 152.333-294 chr5 30453152 30453420 + 1 NA Intergenic Intergenic 572726 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 144.667-149 chr2 133695189 133695347 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -126805 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 303.667-6 chr12 115326076 115326448 + 1 NA Intergenic Intergenic -642087 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 140.333-214 chr7 30327615 30327951 + 1 NA intron (NM_147128, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu -37893 NR_037513 100500883 NR_037513 ENSG00000283237 MIR550B1 - microRNA 550b-1 ncRNA 236.333-59 chr3 77999470 77999870 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 49293 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 163.333-235 chr6 14491654 14491837 + 1 NA Intergenic Intergenic -206291 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 276.667-51 chr3 134162298 134162847 + 1 NA intron (NM_001005861, intron 13 of 14) intron (NM_001005861, intron 13 of 14) 88172 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 152.667-31 chr10 22322792 22323086 + 1 NA intron (NM_005180, intron 1 of 9) intron (NM_005180, intron 1 of 9) 1840 NM_005180 648 Hs.380403 NM_005180 ENSG00000168283 BMI1 FLVI2/BMI1|PCGF4|RNF51|flvi-2/bmi-1 BMI1 proto-oncogene, polycomb ring finger protein-coding 243.667-12 chr11 37026439 37026719 + 1 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -428300 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 139.667-167 chr7 1368985 1369145 + 1 NA Intergenic CpG 90405 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 162.333-81 chr14 98411891 98412166 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -299585 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 221.667-47 chr21 27289768 27290140 + 1 NA Intergenic Intergenic -322866 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 173.333-169 chr5 174542246 174542442 + 1 NA Intergenic Intergenic -182238 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 157.333-147 chr17 39008257 39008428 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 18768 NR_135645 105371766 Hs.311469 NR_135645 ENSG00000266013 LINC02079 - long intergenic non-protein coding RNA 2079 ncRNA 171.333-143 chr5 20965901 20966095 + 1 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR -350463 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 153.667-326 chr5 142761018 142761242 + 1 NA TTS (NR_110558) TTS (NR_110558) -9247 NM_015071 23092 Hs.654668 NM_015071 ENSG00000145819 ARHGAP26 GRAF|GRAF1|OPHN1L|OPHN1L1 Rho GTPase activating protein 26 protein-coding 128.333-104 chr2 103237914 103238065 + 1 NA Intergenic Intergenic -253560 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 231.667-61 chr8 106393082 106393524 + 1 NA intron (NM_018002, intron 2 of 15) intron (NM_018002, intron 2 of 15) -54621 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 300.333-33 chr3 89529441 89530137 + 1 NA Intergenic Intergenic 422168 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 231.333-85 chr5 28319105 28319496 + 1 NA Intergenic Intergenic -31635 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 167.333-242 chr7 38149673 38149915 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -28451 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 251.667-11 chr11 18543824 18544196 + 1 NA intron (NM_001040697, intron 9 of 11) intron (NM_001040697, intron 9 of 11) -17068 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 288.667-26 chr5 124988952 124989273 + 1 NA Intergenic Intergenic -47719 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 155.333-347 chr6 151666912 151667098 + 1 NA Intergenic Intergenic -23491 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 169.667-153 chr4 76700151 76700375 + 1 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 124712 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 112.667-46 chr12 26515073 26515268 + 1 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 318024 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 192.667-22 chr10 21904134 21904348 + 1 NA intron (NM_022365, intron 7 of 11) intron (NM_022365, intron 7 of 11) 99489 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 169.667-118 chr2 239997765 239998019 + 1 NA intron (NR_136157, intron 6 of 7) MER58C|DNA|hAT-Charlie 27450 NR_136157 4705 Hs.277677 NM_004544 ENSG00000130414 NDUFA10 CI-42KD|CI-42k|MC1DN22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A10 protein-coding 133.667-92 chr3 44668605 44668777 + 1 NA intron (NR_157564, intron 1 of 2) intron (NR_157564, intron 1 of 2) 16962 NR_157564 112840933 NR_157564 ZKSCAN7-AS1 - ZKSCAN7 ZNF cluster antisense RNA 1 ncRNA 137.333-40 chr13 92489171 92489339 + 1 NA promoter-TSS (NR_049840) promoter-TSS (NR_049840) -908 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 423.667-7 chr16 10968099 10968715 + 1 NA intron (NM_015226, intron 3 of 22) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 23843 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 170.333-30 chr10 34157847 34158174 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) intron (NM_001184789, intron 20 of 22) -385330 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 148.667-144 chr15 93621569 93621750 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -234901 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 166.333-32 chr10 74829342 74829682 + 1 NA intron (NM_001370142, intron 1 of 16) AluSx|SINE|Alu 2912 NM_001370142 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 323.667-5 chr11 11026248 11026622 + 1 NA Intergenic Intergenic 168218 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 203.667-28 chr14 22471791 22472249 + 1 NA intron (NR_148361, intron 2 of 4) intron (NR_148361, intron 2 of 4) 10939 NR_148361 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 138.333-93 chr2 113110465 113110694 + 1 NA Intergenic Intergenic -7314 NM_173841 3557 Hs.81134 NM_000577 ENSG00000136689 IL1RN DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4 interleukin 1 receptor antagonist protein-coding 135.667-7 chr1 147245977 147246146 + 1 NA intron (NM_001348452, intron 1 of 22) L1MD1|LINE|L1 2919 NM_001348452 9557 Hs.191164 NM_004284 ENSG00000131778 CHD1L ALC1|CHDL chromodomain helicase DNA binding protein 1 like protein-coding 145.333-118 chr18 11033636 11033951 + 1 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) intron (NM_022068, intron 2 of 51) 114969 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 158.667-292 chr6 124188627 124188921 + 1 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -94231 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 221.667-15 chr11 95492886 95493214 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -260575 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 292.333 chr1 85232652 85233099 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 26787 NR_024113 148423 Hs.26226 NM_198077 ENSG00000162642 C1orf52 gm117 chromosome 1 open reading frame 52 protein-coding 163.667-263 chr9 28696653 28696847 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 22555 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 303.333-76 chr8 105867694 105868376 + 1 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) L1M5|LINE|L1 192468 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 212.333-10 chr1 162110982 162111418 + 1 NA intron (NM_014697, intron 1 of 9) intron (NM_014697, intron 1 of 9) 41509 NM_014697 9722 Hs.731942 NM_014697 ENSG00000198929 NOS1AP 6330408P19Rik|CAPON nitric oxide synthase 1 adaptor protein protein-coding 225.667-76 chr8 84398301 84398789 + 1 NA intron (NM_001354319, intron 2 of 8) intron (NM_001354319, intron 2 of 8) -16939 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 201.333-199 chr3 146219404 146219744 + 1 NA intron (NM_001128306, intron 3 of 6) intron (NM_001128306, intron 3 of 6) 31041 NM_001128305 57088 Hs.477869 NM_020353 ENSG00000114698 PLSCR4 TRA1 phospholipid scramblase 4 protein-coding 282.333-29 chr2 29956055 29956406 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -34644 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 195.333-36 chr10 93922068 93922395 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 28253 NR_144336 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 246.667-10 chr1 223005030 223005607 + 1 NA exon (NM_001350630, exon 9 of 9) exon (NM_001350630, exon 9 of 9) 76894 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 119.333-15 chr1 198823321 198823551 + 1 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 35546 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 161.333-279 chr8 48620594 48620810 + 1 NA intron (NR_105004, intron 1 of 1) intron (NR_105004, intron 1 of 1) 299 NR_105004 101929217 Hs.547790 NR_105004 ENSG00000253455 LOC101929217 - uncharacterized LOC101929217 ncRNA 189.333-114 chr20 56084813 56085133 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -79454 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 197.333-200 chr6 102473020 102473305 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 1074177 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 157.667-332 chr8 85621553 85621721 + 1 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 34039 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 163.333-72 chr13 28552915 28553091 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -57875 NM_001160030 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 154.667-137 chr17 10015754 10015915 + 1 NA intron (NM_201432, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 10451 NM_001130831 8522 Hs.462214 NM_003644 ENSG00000007237 GAS7 - growth arrest specific 7 protein-coding 166.667-145 chr22 49544164 49544367 + 1 NA promoter-TSS (NR_037440) promoter-TSS (NR_037440) -799 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 143.667-98 chr17 62343231 62343427 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -26889 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 129.333-183 chr7 127371669 127371851 + 1 NA 3' UTR (NM_176814, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_176814, exon 6 of 6) 20948 NM_176814 168850 Hs.159006 NM_176814 ENSG00000048405 ZNF800 - zinc finger protein 800 protein-coding 256.333-65 chr5 85605175 85605588 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -677063 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 169.667-61 chr14 57373154 57373481 + 1 NA Intergenic Intergenic -17269 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 243.333-59 chr2 228888102 228888604 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -276958 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 214.667-56 chr18 12785333 12785767 + 1 NA TTS (NM_001207013) TTS (NM_001207013) -36128 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 121.667-15 chr1 187925759 187925921 + 1 NA Intergenic Intergenic 482212 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 125.667-70 chr15 67561107 67561270 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 2 of 21) intron (NM_001206804, intron 2 of 21) 12094 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 194.333-97 chr4 73799136 73799396 + 1 NA Intergenic Intergenic -37412 NM_002993 6372 Hs.164021 NM_002993 ENSG00000124875 CXCL6 CKA-3|GCP-2|GCP2|SCYB6 C-X-C motif chemokine ligand 6 protein-coding 147.333-9 chr1 55830781 55830998 + 1 NA Intergenic Intergenic 114074 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 142.333-74 chr13 87248458 87248640 + 1 NA Intergenic Intergenic 336629 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 176.667-22 chr1 222670478 222670774 + 1 NA intron (NM_022831, intron 8 of 9) intron (NM_022831, intron 8 of 9) 26323 NM_001300867 375056 Hs.118474 NM_198551 ENSG00000154305 MIA3 ARNT|D320|TANGO|TANGO1|UNQ6077 MIA SH3 domain ER export factor 3 protein-coding 119.333-73 chr12 75490648 75490861 + 1 NA TTS (NM_007043) TTS (NM_007043) 9999 NM_006851 11010 Hs.205558 NM_006851 ENSG00000139278 GLIPR1 CRISP7|GLIPR|RTVP1 GLI pathogenesis related 1 protein-coding 235.667-4 chr1 175694260 175694587 + 1 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) L2b|LINE|L2 49172 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 157.667-25 chr10 28051972 28052201 + 1 NA non-coding (NR_134517, exon 17 of 17) non-coding (NR_134517, exon 17 of 17) 21292 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 124.667-167 chr5 59172775 59173057 + 1 NA intron (NM_001364602, intron 5 of 5) intron (NM_001364602, intron 5 of 5) 103199 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 190.667-124 chr6 150167587 150167975 + 1 NA intron (NM_030949, intron 1 of 3) intron (NM_030949, intron 1 of 3) 24737 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 279.667-46 chr8 105770539 105771059 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 289704 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 166.333-48 chr11 80165315 80165546 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 597373 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 160.667-280 chr7 43093396 43093581 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -19159 NM_015052 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 140.333-234 chr8 114517121 114517319 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -1080281 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 171.333-64 chr17 54093652 54093841 + 1 NA Intergenic Intergenic 270819 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 147.667-167 chr2 42064627 42064784 + 1 NA Intergenic Intergenic 16684 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 154.333-305 chr6 123381081 123381269 + 1 NA intron (NM_001251987, intron 16 of 20) intron (NM_001251987, intron 16 of 20) -58429 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 150.333-399 chr8 68048049 68048322 + 1 NA intron (NM_024870, intron 8 of 39) intron (NM_024870, intron 8 of 39) 96139 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 174.333-9 chr1 215399002 215399238 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -168184 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 334.333-13 chr14 72153150 72153636 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 219866 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 293.667-40 chr3 23918102 23918641 + 1 NA intron (NM_001253384, intron 2 of 4) intron (NM_001253384, intron 2 of 4) 1239 NM_001253383 6138 Hs.381219 NM_002948 ENSG00000174748 RPL15 DBA12|EC45|L15|RPL10|RPLY10|RPYL10 ribosomal protein L15 protein-coding 241.333-28 chr11 27504456 27504741 + 1 NA intron (NM_018362, intron 1 of 4) MER2|DNA|TcMar-Tigger 2171 NM_018362 55327 Hs.91393 NM_018362 ENSG00000148943 LIN7C LIN-7-C|LIN-7C|MALS-3|MALS3|VELI3 lin-7 homolog C, crumbs cell polarity complex component protein-coding 167.333-40 chr10 48853285 48853572 + 1 NA intron (NM_020945, intron 39 of 61) intron (NM_020945, intron 39 of 61) 60807 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 159.667-89 chr12 114028488 114028696 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -62267 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 328.333-36 chr7 67705738 67706336 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -314216 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 162.667-105 chr17 72979929 72980121 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 4 of 9) intron (NM_001352692, intron 4 of 9) 112663 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 171.333-138 chr4 162006041 162006362 + 1 NA intron (NM_001128428, intron 3 of 14) intron (NM_001128428, intron 3 of 14) -16532 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 161.333-161 chr2 190201062 190201252 + 1 NA 3' UTR (NM_032321, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_032321, exon 2 of 2) 20294 NM_032321 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 166.333-93 chr17 78060503 78060713 + 1 NA intron (NM_018996, intron 4 of 20) AluSz6|SINE|Alu 51191 NR_040071 100131096 Hs.635442 NR_040071 ENSG00000204282 TNRC6C-AS1 TMC6|lnc TNRC6C antisense RNA 1 ncRNA 224.333-36 chr14 46954382 46954711 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 9 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -302765 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 294.667-14 chr14 74117154 74117646 + 1 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) intron (NM_001024674, intron 5 of 5) 32447 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 146.333-7 chr1 71646142 71646398 + 1 NA intron (NM_173808, intron 4 of 6) intron (NM_173808, intron 4 of 6) 190742 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 178.667-9 chr1 118101652 118101837 + 1 NA exon (NM_206996, exon 5 of 49) exon (NM_206996, exon 5 of 49) 83484 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 245.333-61 chr19 48276982 48277308 + 1 NA intron (NM_001369812, intron 3 of 5) AluSx|SINE|Alu 5858 NM_001369812 163071 Hs.511883 NM_153608 ENSG00000178150 ZNF114 - zinc finger protein 114 protein-coding 169.667-206 chr8 76482577 76482876 + 1 NA intron (NR_105006, intron 3 of 5) intron (NR_105006, intron 3 of 5) 76072 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 241.333-3 chr1 80390927 80391350 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -144617 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 177.333-64 chr15 100627454 100627675 + 1 NA intron (NM_198243, intron 4 of 5) intron (NM_198243, intron 4 of 5) 24975 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 156.333-183 chr2 98749787 98749970 + 1 NA Intergenic Intergenic -18746 NM_012214 11320 Hs.177576 NM_012214 ENSG00000071073 MGAT4A GNT-IV|GNT-IVA|GnT-4a alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A protein-coding 155.667-319 chr7 5063999 5064199 + 1 NA exon (NM_021163, exon 5 of 5) exon (NM_021163, exon 5 of 5) -7961 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 214.333-162 chr9 3682460 3682773 + 1 NA intron (NR_121586, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 14530 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 236.667-14 chr11 21654656 21655083 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -538216 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 327.333-19 chr2 53928346 53928915 + 1 NA intron (NM_014614, intron 10 of 46) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 42363 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 235.333-18 chr11 10180391 10180732 + 1 NA intron (NM_030962, intron 2 of 39) L1M1|LINE|L1 113646 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 165.333-246 chr8 72348538 72348729 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -96999 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 186.667-23 chr11 59919091 59919288 + 1 NA Intergenic Intergenic -23690 NR_130719 255649 Hs.722773 NR_130719 OOSP1 - oocyte secreted protein 1 pseudo 196.333-31 chr12 130077523 130077827 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 6340 NR_146538 105370078 NR_146538 LINC02419 - long intergenic non-protein coding RNA 2419 ncRNA 263.333-62 chr4 52995991 52996383 + 1 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 133870 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 139.333-41 chr11 103314661 103314840 + 1 NA intron (NM_001377, intron 79 of 88) intron (NM_001377, intron 79 of 88) 205324 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 168.667-222 chr8 99919891 99920077 + 1 NA Intergenic Intergenic -26277 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 205.333-34 chr10 68653337 68653574 + 1 NA intron (NM_030625, intron 6 of 11) L1M5|LINE|L1 -67784 NM_018237 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 176.333-102 chr21 28928083 28928449 + 1 NA 3' UTR (NM_001320766, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_001320766, exon 29 of 29) -42893 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 127.667-183 chr8 120297770 120297960 + 1 NA intron (NM_021110, intron 35 of 47) MER119|DNA|hAT-Charlie 147285 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 156.667-227 chr3 102461159 102461332 + 1 NA intron (NM_175056, intron 5 of 10) intron (NM_175056, intron 5 of 10) 26230 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 131.667-160 chr5 56019232 56019374 + 1 NA Intergenic Intergenic 24136 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 223.667-33 chr18 77997324 77997596 + 1 NA Intergenic Intergenic -3733 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 198.667-167 chr6 145528246 145528605 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 158452 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 154.333-36 chr10 70161021 70161292 + 1 NA intron (NM_020150, intron 3 of 6) intron (NM_020150, intron 3 of 6) 9358 NM_020150 56681 Hs.499960 NM_020150 ENSG00000079332 SAR1A SAR1|SARA1|Sara|masra2 secretion associated Ras related GTPase 1A protein-coding 167.333-33 chr10 7527168 7527371 + 1 NA Intergenic Intergenic 92404 NM_032817 80760 Hs.498586 NM_030569 ENSG00000123243 ITIH5 ITI-HC5|PP14776 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 5 protein-coding 193.667-59 chr2 30696916 30697203 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 110387 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 132.333-189 chr9 90959167 90959396 + 1 NA Intergenic Intergenic 115851 NR_033912 100129316 Hs.458154 NR_033912 LOC100129316 - uncharacterized LOC100129316 ncRNA 149.667-340 chr6 2081622 2081918 + 1 NA intron (NM_001253846, intron 4 of 10) intron (NM_001253846, intron 4 of 10) 94221 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 273.333-56 chr4 185867589 185867977 + 1 NA intron (NM_021069, intron 1 of 20) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy -55527 NM_003603 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 312.667-34 chr6 70598751 70599216 + 1 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie 32053 NM_145267 135154 Hs.418495 NM_145267 ENSG00000154079 SDHAF4 C6orf57|Sdh8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 4 protein-coding 239.333-25 chr12 73220942 73221291 + 1 NA Intergenic Intergenic 61926 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 151.333-145 chr15 46808384 46808554 + 1 NA Intergenic Intergenic -375620 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 150.333-420 chr8 129112986 129113177 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 128159 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 208.333-48 chr16 10297962 10298392 + 1 NA Intergenic Intergenic -87884 NR_045815 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 158.667-358 chr9 127062868 127063039 + 1 NA intron (NM_001190729, intron 7 of 17) intron (NM_001190729, intron 7 of 17) 59682 NM_012098 23452 Hs.653262 NM_012098 ENSG00000136859 ANGPTL2 ARP2|HARP angiopoietin like 2 protein-coding 148.333-334 chr5 169088047 169088325 + 1 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) intron (NM_003062, intron 4 of 35) 74959 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 254.333-39 chr2 67004855 67005289 + 1 NA Intergenic Intergenic -81374 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 181.667-54 chr18 39182949 39183147 + 1 NA Intergenic (TGATATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 439127 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 151.667-138 chr16 64930174 64930378 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 191787 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 343.667-10 chr4 70788772 70789362 + 1 NA intron (NM_001130709, intron 11 of 11) intron (NM_001130709, intron 11 of 11) 50436 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 254.333-36 chr2 21122715 21123077 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -1090 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 233.667-66 chr6 138948803 138949172 + 1 NA intron (NM_031922, intron 1 of 19) intron (NM_031922, intron 1 of 19) 39274 NM_001286612 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 166.333-55 chr12 38877315 38877495 + 1 NA intron (NM_153634, intron 1 of 19) intron (NM_153634, intron 1 of 19) 28186 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 164.333-247 chr9 26682800 26683040 + 1 NA Intergenic Intergenic 209882 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 157.333-65 chr11 47236788 47236952 + 1 NA intron (NM_000107, intron 7 of 9) intron (NM_000107, intron 7 of 9) -11430 NM_001251935 10062 Hs.438863 NM_005693 ENSG00000025434 NR1H3 LXR-a|LXRA|RLD-1 nuclear receptor subfamily 1 group H member 3 protein-coding 237.333-61 chr2 161445170 161445443 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 29009 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 144.333-81 chr14 71375721 71375907 + 1 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) L1M5|LINE|L1 -22523 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 162.333-257 chr8 107101348 107101626 + 1 NA Intergenic Intergenic 235028 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 170.667-150 chr6 140030520 140030812 + 1 NA intron (NR_121623, intron 1 of 1) L1ME1|LINE|L1 -39405 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 157.333-246 chr3 166731221 166731398 + 1 NA Intergenic Intergenic -167374 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 145.333-70 chr12 84184792 84185053 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 727877 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 205.333-141 chr20 48948190 48948404 + 1 NA intron (NM_006420, intron 3 of 38) L1ME3Cz|LINE|L1 26586 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 215.667-30 chr12 86951503 86951825 + 1 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -112664 NM_001351285 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 316.667-4 chr10 74620491 74620830 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) L1MA5A|LINE|L1 -91336 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 160.333-197 chr3 138880633 138880866 + 1 NA Intergenic Intergenic -45821 NM_006219 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 251.667-34 chr19 48215969 48216270 + 1 NA intron (NR_147707, intron 8 of 10) intron (NR_147707, intron 8 of 10) 24944 NR_033679 22900 Hs.68846 NM_014959 ENSG00000105483 CARD8 CARDINAL|DACAR|DAKAR|NDPP|NDPP1|TUCAN caspase recruitment domain family member 8 protein-coding 220.333-48 chr16 89440659 89441029 + 1 NA intron (NR_110932, intron 1 of 2) intron (NR_110932, intron 1 of 2) 9926 NR_110931 101927817 Hs.667942 NR_110931 LOC101927817 - uncharacterized LOC101927817 ncRNA 151.333-230 chr2 187301842 187302010 + 1 NA Intergenic Intergenic 146326 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 143.667-257 chr8 126627015 126627272 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -68665 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 230.667-86 chr8 68550014 68550411 + 1 NA intron (NR_146186, intron 7 of 12) L1MCa|LINE|L1 -218721 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 134.333-102 chr20 46574169 46574339 + 1 NA intron (NM_001193340, intron 10 of 12) MIR|SINE|MIR -23600 NM_080721 128506 NM_080721 ENSG00000149635 OCSTAMP C20orf123|OC-STAMP|dJ257E24.3 osteoclast stimulatory transmembrane protein protein-coding 148.667-176 chr2 36177762 36177959 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 177710 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 123.667-163 chr5 115828908 115829124 + 1 NA non-coding (NR_033363, exon 5 of 5) non-coding (NR_033363, exon 5 of 5) -12357 NR_136618 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 155.667-153 chr2 24795852 24796099 + 1 NA intron (NM_001322101, intron 2 of 7) intron (NM_001322101, intron 2 of 7) 2550 NR_136183 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 120.333-125 chr3 33391614 33391765 + 1 NA intron (NM_001128160, intron 14 of 14) intron (NM_001128160, intron 14 of 14) 48689 NM_001128160 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 156.333-125 chr15 53217159 53217417 + 1 NA Intergenic Intergenic 100923 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 145.333-222 chr4 106971866 106972139 + 1 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) intron (NM_014421, intron 1 of 3) 64311 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 202.667-69 chr17 47742548 47742917 + 1 NA exon (NM_013351, exon 2 of 6) exon (NM_013351, exon 2 of 6) 9496 NM_013351 30009 Hs.272409 NM_013351 ENSG00000073861 TBX21 T-PET|T-bet|TBET|TBLYM T-box transcription factor 21 protein-coding 153.667-353 chr7 22933480 22933642 + 1 NA TTS (NM_001363466) TTS (NM_001363466) 76948 NR_003075 692210 NR_003075 ENSG00000221740 SNORD93 HBII-336 small nucleolar RNA, C/D box 93 snoRNA 158.667-129 chr17 78905411 78905695 + 1 NA intron (NM_003255, intron 1 of 4) intron (NM_003255, intron 1 of 4) -2352 NM_001243541 100653515 Hs.734636 NM_001243540 ENSG00000178404 CEP295NL DDC8|KIAA1731NL CEP295 N-terminal like protein-coding 307.333-44 chr2 121624651 121625187 + 1 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) L1M4|LINE|L1 24543 NM_015282 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 147.333-112 chr14 72632227 72632378 + 1 NA intron (NM_001280542, intron 8 of 10) L1MD2|LINE|L1 115482 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 238.333-14 chr11 35300834 35301226 + 1 NA intron (NM_001252652, intron 7 of 11) AluJb|SINE|Alu 118528 NM_004171 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 155.333-171 chr2 116856016 116856291 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -958538 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 162.667-111 chr18 7900103 7900311 + 1 NA intron (NM_002845, intron 3 of 30) MER58B|DNA|hAT-Charlie 332891 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 289.333-49 chr5 83532429 83532899 + 1 NA intron (NR_136215, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 29650 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 285.667-40 chr4 53146822 53147314 + 1 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) intron (NM_152540, intron 4 of 8) 218993 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 203.333-263 chr8 83848153 83848491 + 1 NA Intergenic Intergenic -334465 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 164.667-59 chr12 104952797 104953170 + 1 NA intron (NM_001352169, intron 1 of 11) L2c|LINE|L2 5307 NM_001352171 84102 Hs.577463 NM_032148 ENSG00000136052 SLC41A2 SLC41A1-L1 solute carrier family 41 member 2 protein-coding 168.667-164 chr4 109181004 109181186 + 1 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 121563 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 124.333-135 chr4 130242069 130242292 + 1 NA Intergenic Intergenic -134181 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 242.333-73 chr3 150474643 150474989 + 1 NA Intergenic Intergenic 66518 NM_014779 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 116.333-82 chr16 72792034 72792201 + 1 NA intron (NM_001164766, intron 8 of 8) intron (NM_001164766, intron 8 of 8) -127147 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 145.667-182 chr3 111474228 111474529 + 1 NA Intergenic Intergenic -67819 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 203.667-99 chr5 127331016 127331446 + 1 NA intron (NM_001308119, intron 2 of 14) intron (NM_001308119, intron 2 of 14) 40435 NM_001256545 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 153.667-197 chr2 134049666 134049917 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -70144 NM_001371457 334.333-8 chr11 127514882 127515340 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 244041 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 122.667-62 chr16 8073905 8074068 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 515852 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 126.333-72 chr18 2960211 2960406 + 1 NA intron (NM_014646, intron 2 of 19) intron (NM_014646, intron 2 of 19) -13685 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 278.667-18 chr17 38902539 38902945 + 1 NA intron (NR_073384, intron 5 of 7) AluSx|SINE|Alu -12237 NR_106837 102465467 NR_106837 ENSG00000277057 MIR6779 hsa-mir-6779 microRNA 6779 ncRNA 162.333-67 chr14 45031419 45031592 + 1 NA intron (NR_131765, intron 10 of 19) intron (NR_131765, intron 10 of 19) -52611 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 122.333-60 chr14 59700558 59700762 + 1 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) L1MB7|LINE|L1 -53640 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 165.667-203 chr8 122577787 122578074 + 1 NA Intergenic Intergenic -9286 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 116.667-25 chr11 91312825 91313052 + 1 NA Intergenic Intergenic -443736 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 174.333-90 chr3 99550967 99551260 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -87481 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 144.667-325 chr9 106027091 106027354 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 332681 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 192.667-147 chr6 49400053 49400375 + 1 NA Intergenic Intergenic 63039 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 167.667-213 chr8 133251581 133251789 + 1 NA intron (NM_001135242, intron 9 of 15) intron (NM_001135242, intron 9 of 15) 45567 NM_001258432 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 175.333-108 chr21 44501830 44502029 + 1 NA intron (NM_144991, intron 11 of 11) L1M4|LINE|L1 -4115 NR_103707 54082 Hs.570444 NR_103707 ENSG00000235890 TSPEAR-AS1 C21orf31 TSPEAR antisense RNA 1 ncRNA 149.333-232 chr3 21419134 21419398 + 1 NA 3' UTR (NM_024697, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_024697, exon 8 of 8) 13540 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 154.667-251 chr3 115988599 115988802 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) intron (NM_001318915, intron 3 of 8) -83574 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 320.667-14 chr13 56290202 56290800 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -850417 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 246.667-58 chr3 138082227 138082473 + 1 NA intron (NM_001170538, intron 9 of 13) intron (NM_001170538, intron 9 of 13) 31130 NM_001170538 199221 Hs.351403 NM_173543 ENSG00000158163 DZIP1L DZIP2|PKD5 DAZ interacting zinc finger protein 1 like protein-coding 146.667-25 chr1 201762978 201763190 + 1 NA intron (NM_001167738, intron 1 of 26) intron (NM_001167738, intron 1 of 26) 23184 NM_001167738 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 187.667-118 chr5 53505073 53505311 + 1 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR 24563 NM_013409 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 115.333-50 chr12 94133034 94133248 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15436 NM_005761 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 150.333-33 chr10 33616677 33616848 + 1 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 155918 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 198.333-141 chr4 52782890 52783261 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6919 NR_040106 152578 Hs.383806 NR_040106 ENSG00000250302 LINC01618 - long intergenic non-protein coding RNA 1618 ncRNA 161.667-96 chr16 62481397 62481583 + 1 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 -445052 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 159.667-32 chr1 206680810 206681022 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3989 NM_032960 9261 Hs.643566 NM_004759 ENSG00000162889 MAPKAPK2 MAPKAP-K2|MK-2|MK2 MAPK activated protein kinase 2 protein-coding 140.667-104 chr18 69417954 69418213 + 1 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) L1MA4|LINE|L1 17195 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 160.667-90 chr14 64729827 64730072 + 1 NA intron (NM_001308147, intron 3 of 16) intron (NM_001308147, intron 3 of 16) 25525 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 155.333-164 chr2 75927733 75928044 + 1 NA Intergenic Intergenic -216973 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 198.333-152 chr5 9593675 9593895 + 1 NA Intergenic 7SK|RNA|RNA 36566 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 166.667-158 chr4 32767384 32767673 + 1 NA Intergenic Intergenic 416490 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 248.667-73 chr22 30638795 30639109 + 1 NA intron (NM_001318371, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu 3137 NM_001318370 339665 Hs.660384 NM_001001479 ENSG00000100036 SLC35E4 - solute carrier family 35 member E4 protein-coding 169.333-5 chr1 57952797 57952996 + 1 NA intron (NM_021080, intron 1 of 16) L3|LINE|CR1 92315 NR_104363 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 147.667-382 chr8 137380410 137380560 + 1 NA Intergenic Intergenic 33103 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 198.333-79 chr17 49605125 49605406 + 1 NA intron (NM_001007230, intron 10 of 11) intron (NM_001007230, intron 10 of 11) 21324 NM_001370732 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 236.333-51 chr2 211175373 211175700 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 557965 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 154.667-109 chr14 54326530 54326697 + 1 NA Intergenic Intergenic -70255 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 179.667-7 chr1 107839118 107839325 + 1 NA intron (NM_006113, intron 2 of 26) intron (NM_006113, intron 2 of 26) -58002 NR_107006 102465839 NR_107006 ENSG00000275455 MIR7852 hsa-mir-7852 microRNA 7852 ncRNA 157.333-238 chr3 100195465 100195652 + 1 NA Intergenic Intergenic 9734 NR_028358 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 176.667-43 chr12 13877115 13877471 + 1 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) intron (NM_000834, intron 1 of 12) 103063 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 159.333-320 chr8 54092506 54092670 + 1 NA intron (NM_001279356, intron 2 of 7) intron (NM_001279356, intron 2 of 7) 8966 NM_001279360 10434 Hs.744046 NM_006330 ENSG00000120992 LYPLA1 APT-1|APT1|LPL-I|LPL1|hAPT1 lysophospholipase 1 protein-coding 160.333-254 chr6 117362617 117362927 + 1 NA exon (NM_002944, exon 21 of 43) exon (NM_002944, exon 21 of 43) 63083 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 149.667-424 chr9 79481171 79481462 + 1 NA Intergenic Intergenic -90457 NM_001282753 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 415.333 chr11 41962527 41963038 + 1 NA Intergenic Intergenic 122676 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 198.667-151 chr5 64584491 64584776 + 1 NA intron (NM_001271891, intron 1 of 3) intron (NM_001271891, intron 1 of 3) 8983 NM_001271890 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 156.333-228 chr3 34402510 34402731 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 603990 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 156.667-185 chr2 88350674 88350892 + 1 NA Intergenic CpG 101910 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 159.667-259 chr5 68395582 68395808 + 1 NA Intergenic Intergenic 103118 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 150.667-108 chr13 89962926 89963201 + 1 NA Intergenic Intergenic 156654 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 152.333-167 chr2 25906731 25906995 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -28376 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 163.667-39 chr11 94837675 94837881 + 1 NA intron (NM_130847, intron 6 of 12) intron (NM_130847, intron 6 of 12) 69422 NM_001301007 154810 Hs.503594 NM_130847 ENSG00000166025 AMOTL1 JEAP angiomotin like 1 protein-coding 139.333-217 chr8 87366956 87367147 + 1 NA intron (NM_173538, intron 10 of 10) LTR78|LTR|ERV1 500636 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 215.333-75 chr18 6057967 6058348 + 1 NA intron (NM_173464, intron 16 of 19) intron (NM_173464, intron 16 of 19) -162203 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 194.333-64 chr2 52240735 52241044 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -129759 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 115.333-152 chr4 49153137 49153304 + 1 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 166578 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 163.333-200 chr4 71127109 71127343 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -60033 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 164.667-94 chr18 6513078 6513346 + 1 NA intron (NR_120518, intron 1 of 5) intron (NR_120518, intron 1 of 5) 1796 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 149.667-241 chr21 27185200 27185422 + 1 NA Intergenic Intergenic -218223 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 153.667-242 chr3 3920281 3920512 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -119521 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 173.333-67 chr16 26305288 26305520 + 1 NA Intergenic Intergenic 280167 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 231.333-9 chr1 194818603 194819019 + 1 NA Intergenic Intergenic 1269904 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 284.667-4 chr1 170284305 170284806 + 1 NA promoter-TSS (NR_026957) promoter-TSS (NR_026957) -347 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 160.667-60 chr11 87333327 87333519 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 295489 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 155.333-318 chr5 177129861 177130016 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -3141 NM_172349 64324 Hs.106861 NM_022455 ENSG00000165671 NSD1 ARA267|KMT3B|SOTOS|SOTOS1|STO nuclear receptor binding SET domain protein 1 protein-coding 165.333-267 chrX 39481603 39481820 + 1 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -89937 NR_110385 101927449 Hs.553988 NR_110385 ENSG00000236747 LINC01282 - long intergenic non-protein coding RNA 1282 ncRNA 165.667-122 chr3 50799571 50799835 + 1 NA intron (NM_004947, intron 2 of 52) L1M2c|LINE|L1 124623 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 202.333-114 chr3 165500370 165500721 + 1 NA intron (NR_125764, intron 4 of 5) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 293585 NR_125764 103695433 Hs.570689 NR_125764 LINC01322 - long intergenic non-protein coding RNA 1322 ncRNA 150.333-146 chr16 63379835 63380036 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1343497 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 227.667-30 chr17 67216567 67216832 + 1 NA intron (NM_001330447, intron 4 of 32) L2a|LINE|L2 -28077 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 181.333-22 chr11 28152900 28153093 + 1 NA intron (NM_001113528, intron 3 of 6) MER41B|LTR|ERV1 44608 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 150.667-19 chr1 221120122 221120347 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 216062 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 260.333-60 chr7 29562279 29562765 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -1313 NM_001329996 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 326.667-30 chr5 36404259 36404814 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -102634 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 116.667-196 chr8 22748654 22748806 + 1 NA intron (NM_001363233, intron 4 of 6) intron (NM_001363233, intron 4 of 6) -55250 NM_004430 1960 Hs.534313 NM_004430 ENSG00000179388 EGR3 EGR-3|PILOT early growth response 3 protein-coding 150.333-291 chr4 25317900 25318112 + 1 NA intron (NM_001318148, intron 3 of 8) intron (NM_001318148, intron 3 of 8) 5232 NM_024936 29063 Hs.278945 NM_024936 ENSG00000168228 ZCCHC4 HSPC052|ZGRF4 zinc finger CCHC-type containing 4 protein-coding 177.667-14 chr1 234959967 234960275 + 1 NA intron (NR_125945, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 3878 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 196.667-168 chr8 140878868 140879133 + 1 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) intron (NM_001352737, intron 3 of 32) 122004 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 159.667-79 chr12 56622840 56623003 + 1 NA intron (NM_013449, intron 1 of 28) intron (NM_013449, intron 1 of 28) 7405 NM_001300905 11176 Hs.314263 NM_013449 ENSG00000076108 BAZ2A TIP5|WALp3 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A protein-coding 149.333-272 chr4 5636009 5636217 + 1 NA intron (NM_147127, intron 10 of 21) MIR|SINE|MIR 72446 NM_147127 132884 Hs.87306 NM_147127 ENSG00000173040 EVC2 LBN|WAD EvC ciliary complex subunit 2 protein-coding 294.667-21 chr2 22623517 22623891 + 1 NA Intergenic (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 87225 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 234.667-32 chr14 49447494 49447831 + 1 NA Intergenic Intergenic 138718 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 221.667-80 chr8 60012772 60013066 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 268481 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 132.333-179 chr8 82659303 82659501 + 1 NA Intergenic Intergenic -252702 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 122.667-178 chr7 83667926 83668070 + 1 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 -18859 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 150.667-379 chr8 113689222 113689483 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -252413 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 150.667-135 chr15 99021551 99021829 + 1 NA intron (NR_126487, intron 1 of 3) intron (NR_126487, intron 1 of 3) 6986 NR_126487 104564224 Hs.32769 NR_126487 LUNAR1 - leukemia-associated non-coding IGF1R activator RNA 1 ncRNA 179.667-72 chr19 34108997 34109326 + 1 NA Intergenic Intergenic -63343 NM_015578 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 251.667-32 chr18 77843580 77843944 + 1 NA Intergenic Intergenic 149965 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 258.333-59 chr7 79107603 79107905 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 98766 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 198.667-149 chr5 52256004 52256282 + 1 NA Intergenic Intergenic 248112 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 179.333-78 chr17 11052889 11053120 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -188209 NM_001173462 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 154.333-31 chr10 24353263 24353487 + 1 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) 77690 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 356.667-4 chr10 133003358 133003835 + 1 NA Intergenic Intergenic 38062 NR_046231 399829 Hs.252872 NR_046231 ENSG00000240707 LINC01168 - long intergenic non-protein coding RNA 1168 ncRNA 204.333-101 chr2 143703707 143704167 + 1 NA intron (NM_018460, intron 13 of 13) MIR|SINE|MIR -233130 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 121.333-32 chr11 72431549 72431741 + 1 NA intron (NM_030813, intron 1 of 16) intron (NM_030813, intron 1 of 16) 2886 NM_001258393 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 171.667-84 chr2 105676516 105676773 + 1 NA Intergenic Intergenic -66085 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 153.667-229 chr20 55072103 55072325 + 1 NA Intergenic Intergenic -350829 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 177.333-79 chr2 38886846 38887175 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 11048 NM_001145450 729967 Hs.729207 NM_194270 ENSG00000188010 MORN2 BLOCK27|MOPT MORN repeat containing 2 protein-coding 213.333-203 chr7 145693998 145694237 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -858064 NM_001350887 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 246.333-100 chr8 123516200 123516518 + 1 NA intron (NM_148177, intron 1 of 5) intron (NM_148177, intron 1 of 5) 15784 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 176.667-52 chr13 93333747 93334080 + 1 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) L1MA4|LINE|L1 107106 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 178.667-59 chr16 59737157 59737494 + 1 NA Intergenic Intergenic 17866 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 152.667-41 chr10 57885075 57885254 + 1 NA Intergenic Intergenic 382730 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 114.667-227 chr6 116021668 116021868 + 1 NA intron (NM_002031, intron 1 of 7) intron (NM_002031, intron 1 of 7) -16963 NR_027338 728402 Hs.729953 NR_027338 TPI1P3 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 3 pseudo 144.333-262 chr8 68519364 68519609 + 1 NA intron (NR_146187, intron 4 of 13) MER5C|DNA|hAT-Charlie -187995 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 141.667-109 chr2 6372750 6372897 + 1 NA non-coding (NR_110251, exon 1 of 3) non-coding (NR_110251, exon 1 of 3) 2599 NR_110251 101929390 Hs.434407 NR_110251 ENSG00000227007 LINC01247 - long intergenic non-protein coding RNA 1247 ncRNA 175.333-101 chr2 222322657 222323003 + 1 NA intron (NR_136642, intron 1 of 3) intron (NR_136642, intron 1 of 3) 2169 NR_136640 440934 Hs.732732 NR_136638 ENSG00000237732 CT75 - cancer/testis associated transcript 75 ncRNA 248.333-103 chr9 18040316 18040746 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -433622 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 156.333-327 chr7 7195019 7195257 + 1 NA intron (NM_020156, intron 1 of 3) L1PB1|LINE|L1 12523 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 144.667-242 chr5 85300812 85300963 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -916007 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 248.333-33 chr15 90696656 90697061 + 1 NA intron (NR_120372, intron 2 of 3) AluY|SINE|Alu 20282 NR_120372 101926895 Hs.564760 NR_120372 ENSG00000259736 CRTC3-AS1 - CRTC3 antisense RNA 1 ncRNA 283.667-21 chr20 47716612 47716962 + 1 NA intron (NM_198596, intron 3 of 20) AluJr|SINE|Alu 69277 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 168.667-107 chr2 105165086 105165456 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 21158 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 200.333-73 chr2 120719147 120719443 + 1 NA Intergenic Intergenic -16573 NM_001371271 117.333-144 chr4 30606721 30606906 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -113556 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 191.333-41 chr11 115242409 115242731 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -91007 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 250.667-35 chr2 20996405 20996856 + 1 NA Intergenic Intergenic 47443 NM_000384 338 Hs.120759 NM_000384 ENSG00000084674 APOB FLDB|LDLCQ4|apoB-100|apoB-48 apolipoprotein B protein-coding 127.667-197 chr9 89178983 89179144 + 1 NA promoter-TSS (NM_016848) promoter-TSS (NM_016848) -245 NM_016848 53358 Hs.292737 NM_016848 ENSG00000148082 SHC3 N-Shc|NSHC|RAI|SHCC SHC adaptor protein 3 protein-coding 186.667-150 chr8 89860569 89860826 + 1 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 -41171 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 159.667-106 chr15 42845374 42845593 + 1 NA intron (NM_173500, intron 3 of 14) AluSx1|SINE|Alu 75295 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 185.667-143 chr9 24230865 24231132 + 1 NA Intergenic Intergenic 314678 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 155.667-148 chr2 4371429 4371725 + 1 NA Intergenic Intergenic 284645 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 281.333-46 chr5 13009928 13010405 + 1 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 22720 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 141.667-85 chr15 67678987 67679182 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 13 of 21) intron (NM_001206804, intron 13 of 21) 129990 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 124.333-57 chr15 94383074 94383267 + 1 NA intron (NM_018349, intron 11 of 21) intron (NM_018349, intron 11 of 21) 27240 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 129.333-52 chr12 47421519 47421721 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 6612 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 209.667-53 chr16 24336915 24337257 + 1 NA intron (NM_006539, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 81533 NM_006539 10368 Hs.7235 NM_006539 ENSG00000006116 CACNG3 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 3 protein-coding 207.333-18 chr1 184700076 184700512 + 1 NA intron (NM_025191, intron 19 of 19) intron (NM_025191, intron 19 of 19) 54564 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 258.667-73 chr4 163677089 163677397 + 1 NA intron (NM_001166373, intron 4 of 7) L2a|LINE|L2 -63709 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 145.667-85 chr14 72378540 72378790 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) L1MA5A|LINE|L1 -138155 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 207.667-65 chr20 50772315 50772655 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -22409 NM_198799 55653 Hs.381178 NM_017843 ENSG00000124243 BCAS4 CNOL breast carcinoma amplified sequence 4 protein-coding 160.667-82 chr13 112779385 112779634 + 1 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) intron (NM_032189, intron 1 of 28) -24778 NR_046661 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 267.667-14 chr14 77329228 77329588 + 1 NA intron (NM_001363703, intron 6 of 8) intron (NM_001363703, intron 6 of 8) 4869 NM_001363703 2954 Hs.655292 NM_001513 ENSG00000100577 GSTZ1 GSTZ1-1|MAAI|MAAID|MAI glutathione S-transferase zeta 1 protein-coding 166.667-194 chr6 36459971 36460156 + 1 NA intron (NR_104481, intron 1 of 3) intron (NR_104481, intron 1 of 3) 17063 NM_173562 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 121.333-58 chr14 96466901 96467119 + 1 NA intron (NM_001350892, intron 12 of 15) intron (NM_001350892, intron 12 of 15) 35316 NR_122121 730202 Hs.647565 NR_122121 LOC730202 - uncharacterized LOC730202 ncRNA 135.667-61 chr15 68452668 68452883 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -20612 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 151.667-113 chr14 71359595 71359866 + 1 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -38607 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 114.667-228 chr6 129472409 129472547 + 1 NA intron (NM_000426, intron 51 of 64) intron (NM_000426, intron 51 of 64) 237699 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 131.667-17 chr10 12414665 12414811 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) intron (NM_001351032, intron 3 of 11) 25756 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 153.333-298 chr4 61197216 61197517 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -3864 NM_001371343 149.667-194 chr2 55735843 55736076 + 1 NA Intergenic Intergenic -42115 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 165.667-54 chr14 68358520 68358728 + 1 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) L1M5|LINE|L1 270163 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 139.667-158 chr6 2753329 2753506 + 1 NA intron (NM_001347872, intron 1 of 12) intron (NM_001347872, intron 1 of 12) -2495 NM_001012418 340156 Hs.127830 NM_001012418 ENSG00000145949 MYLK4 SgK085 myosin light chain kinase family member 4 protein-coding 147.667-226 chr3 61806572 61806760 + 1 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 245095 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 159.667-337 chr9 9319503 9319686 + 1 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) intron (NM_002839, intron 9 of 45) 461576 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 154.333-373 chr9 94820781 94821016 + 1 NA intron (NM_032823, intron 5 of 14) intron (NM_032823, intron 5 of 14) 10936 NR_031755 100313780 NR_031755 ENSG00000252153 MIR2278 mir-2278 microRNA 2278 ncRNA 154.667-10 chr1 84205849 84206088 + 1 NA TTS (NM_207578) TTS (NM_207578) 24336 NM_001242862 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 303.667-28 chr8 129522024 129522446 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1MA2|LINE|L1 -38093 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 123.667-110 chr22 25542761 25542922 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21834 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 300.667-7 chr14 24218804 24219227 + 1 NA intron (NR_137631, intron 1 of 6) AluSp|SINE|Alu -2945 NM_001199821 145553 Hs.220963 NM_138476 ENSG00000213920 MDP1 FN6PASE|MDP-1 magnesium dependent phosphatase 1 protein-coding 130.333-203 chr8 48287373 48287542 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -264110 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 307.333-40 chr2 38731606 38732097 + 1 NA exon (NM_138801, exon 6 of 7) exon (NM_138801, exon 6 of 7) 19510 NM_001031684 6432 Hs.309090 NM_006276 ENSG00000115875 SRSF7 9G8|AAG3|SFRS7 serine and arginine rich splicing factor 7 protein-coding 303.333-52 chr3 192453898 192454380 + 1 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) AluSc8|SINE|Alu -45090 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 142.333-200 chr5 98555546 98555732 + 1 NA Intergenic Intergenic -212993 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 212.333-55 chr18 6515349 6515666 + 1 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) L1MB2|LINE|L1 4091 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 248.667-9 chr10 34669585 34669909 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 145549 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 286.333-26 chr3 19311512 19311904 + 1 NA intron (NM_144633, intron 3 of 15) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 3223 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 125.667-150 chr5 63644352 63644606 + 1 NA Intergenic Intergenic 317813 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 154.667-35 chr10 15799382 15799668 + 1 NA intron (NM_024948, intron 10 of 14) intron (NM_024948, intron 10 of 14) 60982 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 233.667-31 chr18 2022837 2023122 + 1 NA Intergenic Intergenic 548526 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 238.667-51 chr2 211830387 211830691 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) intron (NM_001042599, intron 3 of 26) 595821 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 170.333-186 chr6 71069996 71070182 + 1 NA Intergenic Intergenic -113029 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 193.667-36 chr12 112282979 112283309 + 1 NA exon (NM_001109662, exon 8 of 76) exon (NM_001109662, exon 8 of 76) 99287 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 148.667-270 chr4 39155453 39155632 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -26987 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 248.333-25 chr12 93490411 93490723 + 1 NA intron (NR_038161, intron 6 of 6) intron (NR_038161, intron 6 of 6) 23053 NR_038161 28977 Hs.199579 NM_014050 ENSG00000198015 MRPL42 HSPC204|L31MT|L42MT|MRP-L31|MRP-L42|MRP-S32|MRPL31|MRPS32|PTD007|RPML31|S32MT mitochondrial ribosomal protein L42 protein-coding 275.667-21 chr15 58136804 58137148 + 1 NA Intergenic Intergenic -1193 NM_001320636 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 198.667-181 chr8 83038763 83039066 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 126810 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 147.333-16 chr1 94851222 94851507 + 1 NA intron (NM_001258340, intron 9 of 14) L2a|LINE|L2 26871 NM_001350223 126969 Hs.483423 NM_152369 ENSG00000143036 SLC44A3 CTL3 solute carrier family 44 member 3 protein-coding 194.333-34 chr12 51687849 51688123 + 1 NA intron (NM_001369788, intron 5 of 25) intron (NM_001369788, intron 5 of 25) 96750 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 250.667-24 chr15 40840673 40841099 + 1 NA intron (NR_146467, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu -3162 NM_003710 6692 Hs.233950 NM_003710 ENSG00000166145 SPINT1 HAI|HAI1|MANSC2 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 1 protein-coding 325.333-55 chrX 47253816 47254298 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 21048 NM_001371072 155.667-233 chr3 144890770 144891005 + 1 NA Intergenic Intergenic 917806 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 126.667-146 chr5 116197049 116197304 + 1 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) L3|LINE|CR1 -58567 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 139.333-9 chr1 108598437 108598645 + 1 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) intron (NM_001010883, intron 1 of 10) 38441 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 163.667-127 chr2 189137184 189137485 + 1 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) -4223 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 125.667-120 chr3 59528061 59528250 + 1 NA Intergenic Intergenic 130342 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 122.333-203 chr8 92734399 92734558 + 1 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) intron (NR_046114, intron 1 of 2) 51582 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 133.333-96 chr21 43313641 43313892 + 1 NA Intergenic Intergenic 18273 NR_103713 100126693 Hs.473952 NR_103713 LINC00322 C21orf136|NCRNA00322 long intergenic non-protein coding RNA 322 ncRNA 167.333-193 chr4 97704047 97704244 + 1 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) MLT2A1|LTR|ERVL 337219 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 218.667-113 chr8 136798187 136798626 + 1 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) L1MA4|LINE|L1 267608 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 152.667-133 chr16 58072425 58072660 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 46788 NM_002428 4324 Hs.80343 NM_002428 ENSG00000102996 MMP15 MMP-15|MT2-MMP|MT2MMP|MTMMP2|SMCP-2 matrix metallopeptidase 15 protein-coding 156.667-364 chrX 70833444 70833702 + 1 NA exon (NM_031276, exon 8 of 30) exon (NM_031276, exon 8 of 30) 12722 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 180.333-43 chr16 55997037 55997255 + 1 NA Intergenic Intergenic -41115 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 181.333-190 chr9 30276101 30276543 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 132132 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 353.667-4 chr13 62304603 62305144 + 1 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 -16432 NR_149075 106144607 Hs.562580 NR_149075 ENSG00000227611 LINC01074 - long intergenic non-protein coding RNA 1074 ncRNA 177.333-18 chr10 71947757 71948072 + 1 NA Intergenic Intergenic -16481 NM_004273 9469 Hs.158304 NM_004273 ENSG00000122863 CHST3 C6ST|C6ST1|HSD carbohydrate sulfotransferase 3 protein-coding 141.667-31 chr10 69700543 69700799 + 1 NA Intergenic Intergenic 70424 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 141.667-152 chr3 174148478 174148728 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) -227807 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 176.333-170 chr8 114403746 114404054 + 1 NA Intergenic Intergenic -966961 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 139.667-115 chr3 62953070 62953335 + 1 NA Intergenic Intergenic -77786 NM_183394 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 147.667-377 chr8 134268646 134268881 + 1 NA Intergenic Intergenic -329308 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 146.333-148 chr2 54925137 54925307 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 25 of 40) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 85050 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 177.333-99 chr21 33524690 33524993 + 1 NA exon (NM_000819, exon 11 of 22) exon (NM_000819, exon 11 of 22) 17276 NM_175085 2618 Hs.473648 NM_000819 ENSG00000159131 GART AIRS|GARS|GARTF|PAIS|PGFT|PRGS phosphoribosylglycinamide formyltransferase, phosphoribosylglycinamide synthetase, phosphoribosylaminoimidazole synthetase protein-coding 147.667-239 chr3 115804721 115804954 + 1 NA 3' UTR (NM_002338, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_002338, exon 7 of 7) 100289 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 169.667-133 chr3 117038508 117038773 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 117209 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 159.333-137 chr19 44504194 44504477 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3813 NM_001278509 7733 Hs.22305 NM_013256 ENSG00000167384 ZNF180 HHZ168 zinc finger protein 180 protein-coding 239.667-52 chr4 81579819 81580097 + 1 NA Intergenic Intergenic -108051 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 168.333-37 chr11 76727074 76727396 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -5446 NR_024042 390226 Hs.440026 NR_024042 GUCY2EP GC-E|GCD|GUCY2E guanylate cyclase 2E, pseudogene pseudo 296.333-19 chr2 15713603 15713974 + 1 NA intron (NR_110201, intron 4 of 5) intron (NR_110201, intron 4 of 5) 23006 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 274.667 chr1 33889756 33890092 + 1 NA intron (NM_052896, intron 5 of 69) intron (NM_052896, intron 5 of 69) 20968 NR_038372 402779 Hs.666207 NR_038372 ENSG00000231163 CSMD2-AS1 - CSMD2 antisense RNA 1 ncRNA 140.667-169 chr4 107139407 107139665 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -103223 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 146.667-139 chr17 80253995 80254259 + 1 NA TTS (NM_001166347) TTS (NM_001166347) -6725 NM_020954 57674 Hs.195642 NM_020914 ENSG00000173821 RNF213 ALO17|C17orf27|KIAA1618|MYMY2|MYSTR|NET57 ring finger protein 213 protein-coding 149.667-209 chr2 102383115 102383293 + 1 NA intron (NM_003855, intron 6 of 10) L1MEg2|LINE|L1 26921 NM_003855 8809 Hs.469521 NM_003855 ENSG00000115604 IL18R1 CD218a|CDw218a|IL-1Rrp|IL18RA|IL1RRP interleukin 18 receptor 1 protein-coding 163.667-128 chr2 189499342 189499520 + 1 NA Intergenic Intergenic 57957 NM_032168 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 187.667-70 chr2 77275471 77275885 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 246698 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 166.667-210 chr6 151385362 151385563 + 1 NA intron (NM_020861, intron 1 of 2) intron (NM_020861, intron 1 of 2) 6097 NM_020861 57621 Hs.520073 NM_020861 ENSG00000181472 ZBTB2 ZNF437 zinc finger and BTB domain containing 2 protein-coding 220.667-42 chr2 28722533 28722850 + 1 NA intron (NR_145832, intron 1 of 1) Zaphod|DNA|hAT-Tip100 13514 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 174.667-33 chr12 39628953 39629249 + 1 NA intron (NM_001031748, intron 1 of 12) intron (NM_001031748, intron 1 of 12) 2918 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 152.333-383 chr8 110320550 110320745 + 1 NA Intergenic Intergenic -344876 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 182.333-6 chr1 67822441 67822710 + 1 NA intron (NM_018841, intron 1 of 3) intron (NM_018841, intron 1 of 3) -9713 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 152.333-350 chr7 19592815 19593118 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 112470 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 163.333-167 chr20 44042658 44042910 + 1 NA intron (NM_001098797, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 96888 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 155.667-85 chr13 78752474 78752711 + 1 NA Intergenic Intergenic 87458 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 157.667-251 chr5 77874369 77874573 + 1 NA Intergenic Intergenic -10185 NR_105012 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 329.333-32 chr3 49536655 49537401 + 1 NA Intergenic Intergenic 17338 NR_038866 100132677 Hs.435651 NR_038866 ENSG00000226913 BSN-DT BSN-AS2 BSN divergent transcript ncRNA 209.667-90 chr4 43394185 43394510 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 98196 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 249.667-63 chr3 121413519 121413934 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 25 of 27) intron (NM_001348343, intron 25 of 27) 132262 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 233.333-109 chr5 120914781 120915166 + 1 NA Intergenic Intergenic 383509 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 197.667-20 chr10 61775519 61775911 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 112754 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 276.667-57 chr5 31560354 31560694 + 1 NA Intergenic Intergenic 28223 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 149.333-280 chr4 64548400 64548624 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -139052 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 119.667-160 chr5 167846699 167846901 + 1 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) intron (NM_001080428, intron 1 of 24) 91871 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 141.333-125 chr2 223491586 223491773 + 1 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 110682 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 143.333-90 chr14 71392087 71392422 + 1 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -6083 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 179.667-48 chr14 70998805 70999021 + 1 NA intron (NM_014982, intron 8 of 35) intron (NM_014982, intron 8 of 35) 91454 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 126.333-28 chr11 71924148 71924344 + 1 NA intron (NR_029192, intron 2 of 6) AluJo|SINE|Alu 4201 NR_029192 100133315 Hs.150324 NR_029192 LOC100133315 - transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2-like pseudo 167.333-211 chr5 97531833 97532098 + 1 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 27269 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 212.667-15 chr10 69958840 69959234 + 1 NA 3' UTR (NM_001130103, exon 40 of 40) 3' UTR (NM_001130103, exon 40 of 40) -93809 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 187.667-119 chr5 80911102 80911399 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -49113 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 154.333-307 chr6 156947920 156948097 + 1 NA intron (NM_020732, intron 5 of 19) intron (NM_020732, intron 5 of 19) -88419 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 199.333-251 chr7 1099708 1099919 + 1 NA intron (NM_001134395, intron 2 of 4) intron (NM_001134395, intron 2 of 4) 11700 NM_001098201 2852 Hs.20961 NM_001505 ENSG00000164850 GPER1 CEPR|CMKRL2|DRY12|FEG-1|GPCR-Br|GPER|GPR30|LERGU|LERGU2|LyGPR|mER G protein-coupled estrogen receptor 1 protein-coding 316.667-29 chr7 28702938 28703354 + 1 NA intron (NM_001011666, intron 1 of 6) L2b|LINE|L2 17013 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 119.667-85 chr2 138507559 138507735 + 1 NA intron (NM_001001664, intron 1 of 10) intron (NM_001001664, intron 1 of 10) 5877 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 174.333-32 chr13 34751684 34751977 + 1 NA Intergenic Intergenic -111145 NR_047036 100874179 Hs.569253 NR_047036 ENSG00000225179 LINC00457 - long intergenic non-protein coding RNA 457 ncRNA 155.667-197 chr20 58924921 58925127 + 1 NA Intergenic (TATTATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 32861 NR_132272 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 187.333-21 chr10 64479946 64480281 + 1 NA Intergenic Intergenic -345415 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 214.667-62 chr2 42168347 42168726 + 1 NA promoter-TSS (NM_019063) promoter-TSS (NM_019063) -817 NM_001145076 27436 Hs.713173 NM_019063 ENSG00000143924 EML4 C2orf2|ELP120|EMAP-4|EMAPL4|ROPP120 EMAP like 4 protein-coding 122.333-5 chr1 86368349 86368601 + 1 NA intron (NM_001366779, intron 9 of 15) L1ME4c|LINE|L1 -10788 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 155.333-301 chr5 86140565 86140763 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -141780 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 129.333-167 chr6 37381758 37381909 + 1 NA intron (NR_046399, intron 7 of 7) intron (NR_046399, intron 7 of 7) 27850 NM_003958 9025 Hs.485278 NM_003958 ENSG00000112130 RNF8 hRNF8 ring finger protein 8 protein-coding 202.333-93 chr2 135976842 135977274 + 1 NA intron (NM_001293312, intron 2 of 14) intron (NM_001293312, intron 2 of 14) -8118 NR_110199 101928243 Hs.602178 NR_110199 ENSG00000231890 DARS-AS1 - DARS antisense RNA 1 ncRNA 147.667-271 chr5 7042072 7042319 + 1 NA Intergenic Intergenic -214274 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 149.333-14 chr1 82719063 82719374 + 1 NA Intergenic Intergenic -183965 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 274.667-51 chr7 103075594 103075999 + 1 NA promoter-TSS (NM_001287150) promoter-TSS (NM_001287150) 656 NM_031905 83787 Hs.287412 NM_031905 ENSG00000170632 ARMC10 PNAS-112|PNAS112|PSEC0198|SVH armadillo repeat containing 10 protein-coding 202.333-161 chr7 28296851 28297163 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -2314 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 272.333-40 chr22 39161340 39161734 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -8857 NM_175709 23492 Hs.356416 NM_175709 ENSG00000100307 CBX7 - chromobox 7 protein-coding 159.667-225 chr4 30389740 30389968 + 1 NA Intergenic (TTAATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -330515 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 206.333-174 chr9 88568794 88569238 + 1 NA intron (NM_145283, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 33838 NM_145283 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 211.333-257 chrX 73455850 73456233 + 1 NA Intergenic Intergenic 8787 NM_005193 1046 Hs.553488 NM_005193 ENSG00000131264 CDX4 - caudal type homeobox 4 protein-coding 153.333-255 chr22 37438491 37438644 + 1 NA Intergenic Intergenic -11088 NM_052906 114794 Hs.344170 NM_052906 ENSG00000166897 ELFN2 LRRC62|PPP1R29 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 172.667-155 chr8 22063453 22063739 + 1 NA intron (NM_001114138, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 -2920 NM_001323400 2039 Hs.106124 NM_001978 ENSG00000158856 DMTN DMT|EPB49 dematin actin binding protein protein-coding 180.333-15 chr10 108014447 108014704 + 1 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 54718 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 153.333-337 chr5 90522968 90523164 + 1 NA intron (NM_198273, intron 2 of 2) intron (NM_198273, intron 2 of 2) 6518 NM_001286812 116068 Hs.136235 NM_198273 ENSG00000176018 LYSMD3 - LysM domain containing 3 protein-coding 341.667-8 chr15 67486314 67486753 + 1 NA intron (NR_147832, intron 15 of 17) intron (NR_147832, intron 15 of 17) 34440 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 153.667 chr1 25921920 25922114 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -15140 NM_203399 3925 Hs.209983 NM_005563 ENSG00000117632 STMN1 C1orf215|LAP18|Lag|OP18|PP17|PP19|PR22|SMN stathmin 1 protein-coding 266.333-51 chr5 140101233 140101509 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 6641 NR_102741 100505636 Hs.438871 NR_102739 ENSG00000245146 MALINC1 LINC01024|MA-linc1 mitosis associated long intergenic non-coding RNA 1 ncRNA 245.667-45 chr3 111977922 111978347 + 1 NA promoter-TSS (NR_073570) promoter-TSS (NR_073570) -892 NR_073571 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 154.667-352 chr6 168519984 168520151 + 1 NA intron (NM_001166412, intron 2 of 12) intron (NM_001166412, intron 2 of 12) 78883 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 252.667-6 chr1 113039141 113039586 + 1 NA intron (NR_103777, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu 33739 NR_103777 100996251 Hs.382067 NR_103777 ENSG00000238198 LRIG2-DT - LRIG2 divergent transcript ncRNA 182.667-56 chr16 65921371 65921709 + 1 NA Intergenic Intergenic -345240 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 224.333-130 chr9 71129354 71129682 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) MIR|SINE|MIR -7897 NM_001366148 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 228.667-85 chrX 22878961 22879384 + 1 NA intron (NR_073010, intron 3 of 11) intron (NR_073010, intron 3 of 11) -120788 NM_182699 168400 Hs.434416 NM_182699 ENSG00000184735 DDX53 CAGE|CT26 DEAD-box helicase 53 protein-coding 182.667-41 chr14 47633949 47634176 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 40892 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 141.333-123 chr2 195816666 195816850 + 1 NA exon (NM_018897, exon 51 of 65) exon (NM_018897, exon 51 of 65) 159532 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 156.667-229 chr3 104763310 104763483 + 1 NA Intergenic Intergenic -603317 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 162.333-32 chr10 68973984 68974192 + 1 NA intron (NM_001256910, intron 10 of 14) L1MC3|LINE|L1 -14715 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 136.333-75 chr16 62325941 62326138 + 1 NA Intergenic Intergenic -289601 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 218.333-22 chr11 26237279 26237649 + 1 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) 48341 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 162.333-276 chr9 91086821 91086990 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -11773 NR_033912 100129316 Hs.458154 NR_033912 LOC100129316 - uncharacterized LOC100129316 ncRNA 161.667-133 chr2 100457390 100457615 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -12980 NM_001011717 129521 Hs.567676 NM_001011717 ENSG00000204640 NMS - neuromedin S protein-coding 231.667-58 chr8 81462087 81462551 + 1 NA promoter-TSS (NM_001080526) promoter-TSS (NM_001080526) -796 NM_001080526 646480 Hs.653176 NM_001080526 ENSG00000205186 FABP9 PERF|PERF15|T-FABP|TLBP fatty acid binding protein 9 protein-coding 157.667-349 chr9 2420986 2421211 + 1 NA Intergenic Intergenic -200689 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 279.667-48 chr8 139588819 139589227 + 1 NA Intergenic Intergenic 114100 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 129.333-34 chr11 31072062 31072243 + 1 NA intron (NM_001367979, intron 18 of 38) L1ME4a|LINE|L1 -79466 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 150.333-157 chr17 52898543 52898760 + 1 NA intron (NR_146899, intron 2 of 2) (CTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 36530 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 198.333-71 chr15 93777315 93777647 + 1 NA Intergenic Intergenic -79079 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 157.667-338 chr8 122589616 122589874 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -21101 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 133.333-13 chr1 182498126 182498348 + 1 NA intron (NM_001366934, intron 10 of 22) L1MC4|LINE|L1 48091 NM_001137669 353299 Hs.121200 NM_032267 ENSG00000121446 RGSL1 RGSL|RGSL2 regulator of G protein signaling like 1 protein-coding 259.333-83 chr5 170386856 170387161 + 1 NA intron (NM_004137, intron 1 of 3) intron (NM_004137, intron 1 of 3) 2359 NM_004137 3779 Hs.484099 NM_004137 ENSG00000145936 KCNMB1 BKbeta1|K(VCA)beta|SLO-BETA|hbeta1|hslo-beta|k(VCA)beta-1|slo-beta-1 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 1 protein-coding 157.333-106 chr14 45772665 45772870 + 1 NA Intergenic Intergenic -57165 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 166.667-143 chr22 33153888 33154159 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 45494 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 143.333-245 chr6 88848161 88848372 + 1 NA intron (NM_001286428, intron 9 of 13) L1ME3Cz|LINE|L1 115352 NM_001286428 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 210.667-17 chr10 33822641 33822979 + 1 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 -50130 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 158.667-86 chr13 66194481 66194769 + 1 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -23625 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 156.333-173 chr2 43234215 43234527 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 36 of 37) intron (NM_001083953, intron 36 of 37) 7160 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 150.333-128 chr15 59375604 59375796 + 1 NA Intergenic X7A_LINE|LINE|CR1 -2829 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 164.667-257 chr9 105011316 105011605 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -83305 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 275.667-31 chr2 63563448 63563926 + 1 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 24790 NM_015910 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 182.333-38 chr13 92183395 92183619 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 168700 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 168.333-65 chr15 71322224 71322442 + 1 NA intron (NM_024817, intron 5 of 16) intron (NM_024817, intron 5 of 16) -133274 NR_120350 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-177 chr17 64638751 64639042 + 1 NA intron (NM_022739, intron 1 of 18) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 23411 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 299.333-70 chr7 65815275 65815709 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -44682 NR_038378 441242 Hs.373941 NM_001013464 ENSG00000272693 LOC441242 - uncharacterized LOC441242 ncRNA 170.333-52 chr12 8496555 8496800 + 1 NA Intergenic Intergenic -16826 NM_080387 338339 Hs.351811 NM_080387 ENSG00000166527 CLEC4D CD368|CLEC-6|CLEC6|CLECSF8|Dectin-3|MCL|MPCL C-type lectin domain family 4 member D protein-coding 184.667-95 chr5 41038986 41039367 + 1 NA intron (NM_173489, intron 20 of 41) intron (NM_173489, intron 20 of 41) 32166 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 168.667-177 chr5 98969689 98969939 + 1 NA intron (NR_151718, intron 1 of 3) intron (NR_151718, intron 1 of 3) -40100 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 176.333-77 chr2 25475350 25475550 + 1 NA intron (NM_033147, intron 10 of 19) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -132860 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 141.333-104 chr2 50752021 50752263 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) -55880 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 255.333-5 chr1 212653230 212653525 + 1 NA Intergenic Intergenic 28903 NM_153606 149647 Hs.129293 NM_153606 ENSG00000162771 FAM71A GARI-L4 family with sequence similarity 71 member A protein-coding 223.333-162 chr8 46873924 46874262 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 33207 NR_027012 497634 Hs.406982 NR_027012 LINC00293 BEYLA|NCRNA00293 long intergenic non-protein coding RNA 293 ncRNA 153.667-290 chr4 58127304 58127513 + 1 NA Intergenic Intergenic 408920 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 152.333-161 chr18 37190019 37190260 + 1 NA intron (NR_136303, intron 10 of 13) intron (NR_136303, intron 10 of 13) -84321 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 235.333-47 chr19 31001906 31002274 + 1 NA Intergenic Intergenic -165420 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 152.667-387 chr8 122723239 122723513 + 1 NA Intergenic Intergenic -29270 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 122.667-146 chr5 8319833 8319982 + 1 NA Intergenic Intergenic 137657 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 197.333-234 chr8 100887923 100888187 + 1 NA Intergenic Intergenic 62516 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 206.667-140 chr8 127503843 127504170 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -21867 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 244.667-96 chr8 83742740 83743179 + 1 NA Intergenic Intergenic 339201 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 155.667-158 chr2 42433046 42433253 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 60833 NM_133329 170850 Hs.352633 NM_133329 ENSG00000171126 KCNG3 KV10.1|KV6.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 3 protein-coding 171.667-102 chr21 30173411 30173693 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6747 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 138.667-121 chr20 50688565 50688726 + 1 NA intron (NM_001290268, intron 1 of 21) intron (NM_001290268, intron 1 of 21) 2897 NM_001290268 140876 Hs.372578 NM_080829 ENSG00000042062 RIPOR3 C20orf175|C20orf176|FAM65C RIPOR family member 3 protein-coding 195.333-128 chr2 203837376 203837855 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -30156 NM_005214 1493 Hs.247824 NM_005214 ENSG00000163599 CTLA4 ALPS5|CD|CD152|CELIAC3|CTLA-4|GRD4|GSE|IDDM12 cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4 protein-coding 148.333-9 chr1 66190758 66191105 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) L1PA4|LINE|L1 -140213 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 264.333-18 chr14 64920344 64920789 + 1 NA intron (NM_001204063, intron 1 of 3) intron (NM_001204063, intron 1 of 3) 6111 NM_001202558 100529261 Hs.325531 NM_001202558 ENSG00000125954 CHURC1-FNTB FNTB|FTase-beta CHURC1-FNTB readthrough protein-coding 255.333-4 chr1 203403949 203404396 + 1 NA Intergenic Intergenic -53050 NM_002023 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 174.667-88 chr2 81797738 81797962 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -330904 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 161.333-59 chr12 24352142 24352311 + 1 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 128955 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-228 chr3 120590190 120590362 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6060 NM_004547 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 198.333-160 chr5 58160460 58160722 + 1 NA Intergenic Intergenic -38250 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 150.333-117 chr14 67579742 67579971 + 1 NA exon (NM_020715, exon 22 of 29) exon (NM_020715, exon 22 of 29) 20412 NM_004569 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 167.667-4 chr1 49436329 49436551 + 1 NA intron (NR_046839, intron 2 of 3) intron (NR_046839, intron 2 of 3) 35645 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 281.667-33 chr3 76253198 76253732 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -467916 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 144.667-15 chr1 118840877 118841096 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 147357 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 140.333-7 chr1 72884620 72884795 + 1 NA Intergenic Intergenic -421463 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 166.667-159 chr4 33589020 33589227 + 1 NA Intergenic Intergenic 450770 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 315.333-50 chr8 25006385 25006780 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -49713 NM_006158 4747 Hs.521461 NM_006158 ENSG00000277586 NEFL CMT1F|CMT2E|CMTDIG|NF-L|NF68|NFL|PPP1R110 neurofilament light protein-coding 135.667-122 chr3 110098992 110099136 + 1 NA Intergenic Intergenic 496236 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 336.333-27 chr5 11572920 11573348 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) MIRb|SINE|MIR 15783 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 204.333-100 chr2 116111144 116111547 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 767530 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 158.667-52 chr10 115154770 115155075 + 1 NA intron (NM_001276282, intron 5 of 7) L1MA4A|LINE|L1 61557 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 127.667-35 chr12 39639267 39639420 + 1 NA intron (NM_001031748, intron 1 of 12) 5S|rRNA|rRNA 13160 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 208.667-59 chr18 9579683 9580123 + 1 NA intron (NR_052003, intron 8 of 19) MER2|DNA|TcMar-Tigger 34656 NM_005134 9989 Hs.743236 NM_005134 ENSG00000154845 PPP4R1 MEG1|PP4(Rmeg)|PP4R1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 protein-coding 185.667-21 chr12 27831566 27831854 + 1 NA Intergenic Intergenic 51477 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 199.333-46 chr11 125737054 125737399 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -9053 NM_138294 160065 Hs.148565 NM_138294 ENSG00000171053 PATE1 PATE prostate and testis expressed 1 protein-coding 251.333-58 chr2 117902159 117902509 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 68603 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 405.333-10 chr8 99953283 99953762 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -51060 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 247.667-63 chr3 114255178 114255481 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -17751 NM_007136 7634 Hs.271079 NM_007136 ENSG00000174255 ZNF80 pT17 zinc finger protein 80 protein-coding 159.667-109 chr15 60638573 60638868 + 1 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) -11190 NM_134260 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 156.667-281 chr5 120973424 120973704 + 1 NA Intergenic Intergenic -348986 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 157.667-49 chr11 23270545 23270736 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 148550 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 131.333-142 chr5 52297671 52297900 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 289754 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 319.333-32 chr7 17762681 17763142 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 177583 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 205.667-121 chr7 3566733 3567104 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1M5|LINE|L1 265666 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 156.333-240 chr3 98702128 98702374 + 1 NA Intergenic Intergenic -29985 NM_001271147 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 169.333-70 chr14 28163764 28164078 + 1 NA Intergenic Intergenic -490700 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 146.333-311 chr7 88899323 88899489 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -103669 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 189.333-13 chr1 93701041 93701449 + 1 NA intron (NM_001261408, intron 3 of 13) intron (NM_001261408, intron 3 of 13) -19408 NM_003567 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 119.667-187 chr9 14483499 14483700 + 1 NA intron (NM_001369458, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 48478 NM_001369459 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 198.333-184 chr7 38306603 38306950 + 1 NA Intergenic Intergenic -33129 NM_001003806 445347 Hs.534032 NM_001003799 TARP CD3G|TCRG|TCRGC1|TCRGC2|TCRGV TCR gamma alternate reading frame protein protein-coding 154.333-163 chr2 113937315 113937481 + 1 NA intron (NM_005721, intron 6 of 11) AluSz6|SINE|Alu -31924 NR_148507 440900 Hs.662205 NR_034128 ENSG00000234199 LINC01191 VIN|lnc-ACTR3 long intergenic non-protein coding RNA 1191 ncRNA 118.333-117 chr2 184087041 184087235 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -291837 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 196.667-80 chr2 188374094 188374336 + 1 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 76723 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 386.333 chr1 191844384 191845159 + 1 NA Intergenic Intergenic -313691 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 166.667-105 chr2 34843574 34843885 + 1 NA Intergenic Intergenic 166172 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 149.333-375 chr7 91618494 91618744 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 262083 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 154.667-144 chr17 73944721 73945010 + 1 NA Intergenic Intergenic -116328 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 142.667-150 chr4 15064923 15065182 + 1 NA intron (NM_182646, intron 9 of 9) L1M5|LINE|L1 62571 NM_182646 132864 Hs.656937 NM_182485 ENSG00000137449 CPEB2 CPE-BP2|CPEB-2|hCPEB-2 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2 protein-coding 149.667-128 chr14 80796091 80796336 + 1 NA intron (NM_152446, intron 13 of 24) AluSz6|SINE|Alu 145525 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 154.667-358 chr7 13062220 13062425 + 1 NA Intergenic Intergenic 374689 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 160.667-288 chr7 82593226 82593392 + 1 NA Intergenic Intergenic -149353 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 260.667-37 chr18 21163560 21163874 + 1 NA Intergenic Intergenic -51904 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 147.333-297 chr7 51118982 51119238 + 1 NA intron (NM_015198, intron 6 of 12) intron (NM_015198, intron 6 of 12) 197699 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 243.333-77 chr3 188560056 188560340 + 1 NA intron (NM_001167672, intron 4 of 9) intron (NM_001167672, intron 4 of 9) 8468 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 244.667-93 chr8 48498804 48499128 + 1 NA Intergenic Intergenic -52601 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 243.667-79 chr9 13220944 13221212 + 1 NA intron (NM_003829, intron 7 of 45) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 58486 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 155.333-419 chrX 76655888 76656096 + 1 NA Intergenic Intergenic 228282 NM_020932 57692 Hs.8453 NM_020932 ENSG00000198934 MAGEE1 DAMAGE|HCA1 MAGE family member E1 protein-coding 150.333-79 chr12 27328385 27328606 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4341 NM_020183 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 173.333-138 chr3 189680370 189680629 + 1 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) L1M3|LINE|L1 49110 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 190.667-5 chr1 45591200 45591553 + 1 NA intron (NM_001195193, intron 2 of 12) AluJr4|SINE|Alu 7335 NM_002482 4678 Hs.319334 NM_002482 ENSG00000132780 NASP FLB7527|HMDRA1|PRO1999 nuclear autoantigenic sperm protein protein-coding 149.667-174 chr18 62197831 62197980 + 1 NA intron (NR_144409, intron 1 of 31) MIRc|SINE|MIR 10650 NR_144406 57614 Hs.465323 NM_020854 ENSG00000134444 RELCH HsT3308|HsT885|KIAA1468 RAB11 binding and LisH domain, coiled-coil and HEAT repeat containing protein-coding 151.667-350 chr8 9620826 9621087 + 1 NA intron (NM_003747, intron 3 of 26) L2a|LINE|L2 65044 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 148.667-156 chr17 51382567 51382845 + 1 NA Intergenic Intergenic 45991 NR_122104 440446 Hs.626751 NR_122104 ENSG00000267452 LINC02072 - long intergenic non-protein coding RNA 2072 ncRNA 211.333-55 chr13 103615203 103615552 + 1 NA Intergenic Intergenic 190177 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 174.667-103 chr20 49081861 49082089 + 1 NA intron (NM_001362762, intron 14 of 24) intron (NM_001362762, intron 14 of 24) 35663 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 236.667-59 chr4 64292094 64292512 + 1 NA intron (NM_001363796, intron 8 of 11) intron (NM_001363796, intron 8 of 11) 117147 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 172.667-102 chr3 192580651 192580922 + 1 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu 65764 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 157.667-173 chr20 57857048 57857242 + 1 NA Intergenic Intergenic -145609 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 148.667-62 chr11 9585802 9585957 + 1 NA intron (NM_003390, intron 8 of 10) L1ME4c|LINE|L1 11192 NM_001143976 7465 Hs.249441 NM_003390 ENSG00000166483 WEE1 WEE1A|WEE1hu WEE1 G2 checkpoint kinase protein-coding 160.333-234 chr5 91082876 91083109 + 1 NA intron (NR_003149, intron 86 of 89) intron (NR_003149, intron 86 of 89) 231410 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 297.667-29 chr5 84726920 84727305 + 1 NA Intergenic Intergenic -342232 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 159.333-297 chr6 152543787 152543948 + 1 NA intron (NM_182961, intron 3 of 145) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 92984 NM_033071 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 167.333-180 chr3 159651262 159651578 + 1 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) intron (NM_001197108, intron 1 of 6) 117192 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 145.667-113 chr17 60495879 60496111 + 1 NA intron (NM_001282476, intron 1 of 11) L1MB7|LINE|L1 30245 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 154.667-128 chr15 70899157 70899318 + 1 NA intron (NM_001199018, intron 4 of 16) intron (NM_001199018, intron 4 of 16) 6794 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 127.333-22 chr1 247779404 247779586 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -21089 NM_012353 26188 Hs.381306 NM_012353 ENSG00000221888 OR1C1 HSTPCR27|OR1-42|OR1.5.10|ORL211|TPCR27 olfactory receptor family 1 subfamily C member 1 protein-coding 168.667-7 chr1 96310982 96311186 + 1 NA intron (NR_110693, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 63041 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 148.333-247 chr3 36522193 36522360 + 1 NA intron (NM_001292049, intron 6 of 8) intron (NM_001292049, intron 6 of 8) 141789 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 171.333-61 chr15 88775000 88775195 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -28339 NM_001369268 176 Hs.2159 NM_001135 ENSG00000157766 ACAN AGC1|AGCAN|CSPG1|CSPGCP|MSK16|SEDK|SSOAOD aggrecan protein-coding 117.333-123 chr20 50753321 50753451 + 1 NA 3' UTR (NM_032521, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_032521, exon 3 of 3) 21806 NM_032521 84612 Hs.589848 NM_032521 ENSG00000124171 PARD6B PAR6B par-6 family cell polarity regulator beta protein-coding 196.333-18 chr11 35912000 35912308 + 1 NA Intergenic Intergenic -31827 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 175.333-161 chr6 119122642 119122919 + 1 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu 26413 NM_001288576 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 176.667-125 chr5 146336424 146336670 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -2292 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 165.333-101 chr17 28192925 28193222 + 1 NA intron (NM_016231, intron 10 of 10) LTR41C|LTR|ERVL -33490 NR_003064 23615 Hs.157195 NM_021093 ENSG00000237575 PYY2 - peptide YY 2 (pseudogene) pseudo 230.333-123 chr8 126300080 126300408 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -25251 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 196.667-126 chr5 131240989 131241320 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -22855 NM_020240 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 144.667-79 chr14 43419069 43419220 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 1088139 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 142.667-98 chr2 99121109 99121272 + 1 NA intron (NM_001349014, intron 1 of 16) L1MD2|LINE|L1 19990 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 149.333-181 chr2 71372055 71372246 + 1 NA intron (NM_001252613, intron 8 of 27) L1M1|LINE|L1 40368 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 169.667-119 chr20 2587646 2587897 + 1 NA intron (NM_080751, intron 7 of 19) L1MA8|LINE|L1 51164 NM_080751 117532 Hs.352626 NM_080751 ENSG00000149488 TMC2 C20orf145 transmembrane channel like 2 protein-coding 170.667-169 chr8 124602546 124602832 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 63566 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 226.333-102 chr7 133636492 133636803 + 1 NA intron (NM_021807, intron 10 of 17) intron (NM_021807, intron 10 of 17) 188241 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 201.333-227 chr5 61516141 61516358 + 1 NA intron (NM_020928, intron 4 of 13) L1MEf|LINE|L1 -121511 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 277.333-88 chrX 54292808 54293253 + 1 NA exon (NM_020922, exon 10 of 24) exon (NM_020922, exon 10 of 24) 64975 NM_020922 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 291.667-25 chr4 71444802 71445435 + 1 NA intron (NM_003759, intron 5 of 22) intron (NM_003759, intron 5 of 22) 106065 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 150.333-329 chr5 69077673 69077847 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -16254 NM_024055 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 125.667-53 chr14 20642426 20642649 + 1 NA promoter-TSS (NM_001001968) promoter-TSS (NM_001001968) -846 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 182.667-154 chr7 78093861 78094067 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 19 of 20) intron (NM_001301128, intron 19 of 20) -253278 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 157.667-180 chr22 26194947 26195231 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 25615 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 125.333-151 chr6 35795297 35795518 + 1 NA intron (NM_001252598, intron 1 of 1) intron (NM_001252598, intron 1 of 1) 1916 NM_001252597 1208 Hs.1340 NM_001832 ENSG00000137392 CLPS - colipase protein-coding 256.667-36 chr19 44739325 44739852 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9120 NM_005178 602 Hs.31210 NM_005178 ENSG00000069399 BCL3 BCL4|D19S37 BCL3 transcription coactivator protein-coding 207.333-174 chr3 10874225 10874532 + 1 NA intron (NM_014229, intron 5 of 13) intron (NM_014229, intron 5 of 13) 58150 NM_014229 6538 Hs.655078 NM_014229 ENSG00000132164 SLC6A11 GAT-3|GAT3|GAT4 solute carrier family 6 member 11 protein-coding 213.333-96 chr2 75390105 75390499 + 1 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -133766 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 202.667-107 chr4 34508469 34508698 + 1 NA Intergenic Intergenic -238836 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 170.667-156 chr7 61928382 61928664 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1375533 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 167.667-37 chr11 66158411 66158579 + 1 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) AluJr|SINE|Alu 88223 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 259.333-81 chr5 78885566 78885878 + 1 NA exon (NM_000046, exon 5 of 8) exon (NM_000046, exon 5 of 8) 99588 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 165.667-8 chr1 197278691 197278919 + 1 NA intron (NM_001193640, intron 1 of 9) intron (NM_001193640, intron 1 of 9) 10553 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 245.333-19 chr11 55005765 55006078 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -256234 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 144.667-270 chr6 125348663 125348912 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -46820 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 126.333-47 chr14 54175245 54175461 + 1 NA Intergenic Intergenic -218462 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 221.333-150 chr8 138678959 138679274 + 1 NA intron (NM_152888, intron 40 of 64) AluJb|SINE|Alu -181386 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 214.333-72 chr2 29412289 29412764 + 1 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 62851 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 317.333-42 chr8 118756682 118757192 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -134974 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 153.333-74 chr11 113968678 113968917 + 1 NA Intergenic Intergenic -6278 NR_046363 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 171.333-132 chr4 45918298 45918568 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 205621 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 153.667-63 chr11 29737065 29737300 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 118380 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 211.333-134 chr20 51128275 51128607 + 1 NA Intergenic Intergenic -105334 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 224.333-124 chr8 57853938 57854247 + 1 NA Intergenic Intergenic 107943 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 235.667-49 chr4 133985331 133985752 + 1 NA Intergenic Intergenic 216248 NM_001114734 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 177.333-162 chr8 25783402 25783652 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 261886 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 137.667-95 chr2 102691073 102691216 + 1 NA intron (NM_003048, intron 5 of 11) intron (NM_003048, intron 5 of 11) 45744 NR_136174 84804 Hs.590898 NM_032718 ENSG00000135953 MFSD9 - major facilitator superfamily domain containing 9 protein-coding 135.333-80 chr2 18497246 18497400 + 1 NA Intergenic Intergenic 63330 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 204.333-61 chr15 45015405 45015713 + 1 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -7636 NM_003104 6652 Hs.878 NM_003104 ENSG00000140263 SORD HEL-S-95n|RDH|SDH|SORD1|XDH sorbitol dehydrogenase protein-coding 187.333-26 chr10 109987121 109987332 + 1 NA intron (NR_038943, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -9147 NM_001320591 120 Hs.501012 NM_001121 ENSG00000148700 ADD3 ADDL|CPSQ3 adducin 3 protein-coding 270.667-19 chr17 69403798 69404216 + 1 NA Intergenic Intergenic -10690 NM_002758 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 112.667-224 chr5 167978280 167978441 + 1 NA intron (NM_001368145, intron 3 of 26) L1MB5|LINE|L1 -187485 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 134.667-201 chr8 126869334 126869501 + 1 NA Intergenic Intergenic -143737 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 166.333-37 chr10 100016173 100016425 + 1 NA Intergenic Intergenic -6352 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 113.333-31 chr10 72600898 72601098 + 1 NA intron (NM_006077, intron 1 of 11) L1ME3B|LINE|L1 25081 NM_001195518 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 146.333-138 chr2 7280167 7280356 + 1 NA Intergenic Intergenic -141000 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 121.667-41 chr11 77442085 77442292 + 1 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) intron (NM_001128620, intron 1 of 15) 31875 NM_001128620 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 268.333-19 chr14 39797769 39798076 + 1 NA Intergenic Intergenic -365422 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 172.667-88 chr2 148235959 148236232 + 1 NA intron (NM_018328, intron 4 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -214491 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 156.667-46 chr10 68546106 68546338 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -14115 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 156.333-108 chr14 48465963 48466170 + 1 NA Intergenic Intergenic -671052 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 113.333-263 chr8 131277288 131277509 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -236489 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 112.333-44 chr11 112467459 112467621 + 1 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -14692 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 127.333-169 chr7 40260407 40260626 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 7 of 12) intron (NM_001193312, intron 7 of 12) 125540 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 195.333-72 chr13 101939912 101940199 + 1 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR -23410 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 151.333-439 chr9 37492982 37493155 + 1 NA intron (NM_001282766, intron 6 of 12) intron (NM_001282766, intron 6 of 12) 7120 NM_022490 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 241.667-62 chr4 97573336 97573748 + 1 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) intron (NM_174952, intron 10 of 10) 206616 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 225.333-77 chr2 38591396 38591810 + 1 NA exon (NM_001142650, exon 3 of 14) exon (NM_001142650, exon 3 of 14) 11325 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 181.667-42 chr15 71492320 71492514 + 1 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) AluSz|SINE|Alu -54819 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 136.333-151 chr4 115475747 115475966 + 1 NA Intergenic Intergenic -362236 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 128.667-104 chr20 51881835 51882004 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -19006 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 116.333-48 chr11 116472265 116472432 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -167074 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 208.333-59 chr18 8828205 8828581 + 1 NA intron (NM_015210, intron 15 of 16) intron (NM_015210, intron 15 of 16) 111012 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 163.667-192 chr5 11469821 11470030 + 1 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 118992 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 120.333-74 chr17 3382816 3382975 + 1 NA Intergenic Intergenic 15515 NM_003553 8387 NM_003553 ENSG00000180016 OR1E1 HGM071|OR13-66|OR17-2|OR17-32|OR1E5|OR1E6|OR1E8P|OR1E9P|OST547 olfactory receptor family 1 subfamily E member 1 protein-coding 143.667-104 chr17 72255818 72256133 + 1 NA Intergenic Intergenic -86836 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 142.667-240 chr9 16847855 16848133 + 1 NA intron (NM_001317940, intron 1 of 5) intron (NM_001317940, intron 1 of 5) 22676 NM_017637 54796 Hs.656581 NM_017637 ENSG00000173068 BNC2 BSN2 basonuclin 2 protein-coding 137.333-19 chr10 59798309 59798558 + 1 NA intron (NM_005436, intron 7 of 8) intron (NM_005436, intron 7 of 8) -44978 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 141.667-138 chr22 46533840 46534077 + 1 NA exon (NM_014246, exon 1 of 35) exon (NM_014246, exon 1 of 35) 3662 NM_014246 9620 Hs.252387 NM_014246 ENSG00000075275 CELSR1 ADGRC1|CDHF9|FMI2|HFMI2|ME2 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 protein-coding 296.667-38 chr3 54180182 54180621 + 1 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 57849 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 179.333-49 chr12 13128720 13128981 + 1 NA Intergenic Intergenic -25183 NM_001367364 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 236.333-60 chr3 94660325 94660598 + 1 NA Intergenic Intergenic -277802 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 160.333-56 chr11 17874251 17874449 + 1 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) MIRb|SINE|MIR 138402 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 150.667-233 chr3 23852134 23852354 + 1 NA intron (NM_003341, intron 3 of 5) L1MB7|LINE|L1 41790 NM_001202476 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 164.333-51 chr12 21742448 21742644 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 32160 NM_004982 3764 Hs.102308 NM_004982 ENSG00000121361 KCNJ8 KIR6.1|uKATP-1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 8 protein-coding 342.333-14 chr2 11309320 11309850 + 1 NA intron (NM_001321643, intron 1 of 32) intron (NM_001321643, intron 1 of 32) 35051 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 146.333-136 chr19 14619169 14619407 + 1 NA 3' UTR (NM_001289159, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001289159, exon 13 of 13) -2925 NR_132784 106635534 NR_132784 SNORA104 - small nucleolar RNA, H/ACA box 104 snoRNA 172.333-48 chr14 51802260 51802448 + 1 NA Intergenic Intergenic -58258 NM_001243773 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 141.667-39 chr10 117944471 117944632 + 1 NA Intergenic Intergenic -102270 NR_026940 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 178.667-10 chr1 150919090 150919333 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7052 NM_001366417 9869 Hs.643565 NM_012432 ENSG00000143379 SETDB1 ESET|H3-K9-HMTase4|KG1T|KMT1E|TDRD21 SET domain bifurcated histone lysine methyltransferase 1 protein-coding 155.333-141 chr18 8020521 8020705 + 1 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 346421 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 197.667-69 chr2 165078667 165078888 + 1 NA Intergenic Intergenic -123252 NM_001351540 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 169.333-119 chr2 84910748 84911068 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 5252 NM_021103 9168 Hs.446574 NM_021103 ENSG00000034510 TMSB10 MIG12|TB10 thymosin beta 10 protein-coding 137.667-101 chr2 186743155 186743331 + 1 NA intron (NM_177454, intron 2 of 7) intron (NM_177454, intron 2 of 7) 49183 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 160.333-84 chr13 28947395 28947599 + 1 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) intron (NM_001366651, intron 2 of 14) -76960 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 181.333-47 chr14 84618988 84619271 + 1 NA Intergenic Intergenic -652803 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 300.667-45 chr8 125974610 125975177 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23696 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 175.667-36 chr14 65295569 65295971 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 39413 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 160.667-216 chr3 191627674 191627940 + 1 NA Intergenic MER66A|LTR|ERV1 166644 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 157.667-134 chr19 42491459 42491748 + 1 NA intron (NR_073180, intron 2 of 2) MER41-int|LTR|ERV1 36878 NM_001712 634 Hs.512682 NM_001712 ENSG00000079385 CEACAM1 BGP|BGP1|BGPI carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 1 protein-coding 173.667-88 chr2 127900043 127900333 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -14248 NM_001199140 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 282.333-30 chr2 101073387 101073920 + 1 NA intron (NM_001102426, intron 2 of 19) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 71364 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 201.333-10 chr1 109433024 109433345 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -6736 NM_001199773 5686 Hs.485246 NM_002790 ENSG00000143106 PSMA5 PSC5|ZETA proteasome subunit alpha 5 protein-coding 135.333-115 chr3 96202302 96202490 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -157568 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 215.667-118 chr8 16391171 16391525 + 1 NA Intergenic Intergenic -198557 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 151.667-134 chr16 28153382 28153639 + 1 NA intron (NM_001270940, intron 8 of 24) intron (NM_001270940, intron 8 of 24) 58455 NM_015171 23214 Hs.460468 NM_015171 ENSG00000169180 XPO6 EXP6|RANBP20 exportin 6 protein-coding 148.333-380 chr8 69034818 69035025 + 1 NA intron (NR_039986, intron 2 of 4) intron (NR_039986, intron 2 of 4) 69269 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 176.667-40 chr12 4265262 4265648 + 1 NA intron (NR_149145, intron 1 of 3) intron (NR_149145, intron 1 of 3) -8307 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 151.333-54 chr10 60713174 60713430 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) L1MCa|LINE|L1 20226 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 220.333-81 chr22 25250548 25250982 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 31126 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 180.333-118 chr7 32505842 32506103 + 1 NA intron (NM_015060, intron 1 of 15) intron (NM_015060, intron 1 of 15) 10483 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 140.333-197 chr6 8481176 8481401 + 1 NA intron (NR_038980, intron 2 of 4) L1ME3D|LINE|L1 45665 NR_038980 100506207 Hs.311049 NR_038979 ENSG00000285219 LOC100506207 - uncharacterized LOC100506207 ncRNA 135.667-172 chr7 48693393 48693555 + 1 NA Intergenic Intergenic -231073 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 174.333-68 chr2 128675105 128675403 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -189346 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 199.333-260 chr7 46438601 46438889 + 1 NA Intergenic Intergenic 258377 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 200.333-93 chr3 83308332 83308769 + 1 NA Intergenic Intergenic 1322408 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 114.667-149 chr20 3963750 3963920 + 1 NA intron (NM_001134337, intron 2 of 5) intron (NM_001134337, intron 2 of 5) -46272 NR_031722 100302282 NR_031722 ENSG00000283320 MIR103B2 MIR103-2-AS|MIR103-2AS|MIRN103-2AS|hsa-mir-103-2-as microRNA 103b-2 ncRNA 190.667-72 chr2 215273978 215274311 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -37915 NM_004044 471 Hs.90280 NM_004044 ENSG00000138363 ATIC AICAR|AICARFT|HEL-S-70p|IMPCHASE|PURH 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase protein-coding 149.333-195 chr2 133520221 133520422 + 1 NA intron (NM_207481, intron 2 of 17) intron (NM_207481, intron 2 of 17) 48142 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 127.333-82 chr2 103877050 103877206 + 1 NA Intergenic Intergenic 531204 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 163.667-244 chr8 27487025 27487242 + 1 NA Intergenic Intergenic -4010 NM_001256482 2053 Hs.212088 NM_001979 ENSG00000120915 EPHX2 ABHD20|CEH|SEH epoxide hydrolase 2 protein-coding 178.667-92 chr21 14158091 14158442 + 1 NA intron (NM_001303000, intron 7 of 9) L1MD2|LINE|L1 48683 NM_198996 149998 Hs.139907 NM_145317 ENSG00000188992 LIPI CT17|LPDL|PLA1C|PRED5|mPA-PLA1 beta lipase I protein-coding 239.333 chr1 10307675 10308007 + 1 NA 3' UTR (NM_183416, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_183416, exon 21 of 21) 8875 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 191.333-94 chr18 6591109 6591451 + 1 NA TTS (NR_120518) TTS (NR_120518) 79864 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 211.333-239 chr8 86626845 86627089 + 1 NA intron (NM_019098, intron 12 of 17) L1PA13|LINE|L1 112532 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 178.333-29 chr11 110200095 110200353 + 1 NA intron (NM_001260493, intron 14 of 15) intron (NM_001260493, intron 14 of 15) 96488 NM_001260494 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 148.333-373 chr7 115209547 115209788 + 1 NA intron (NR_126407, intron 1 of 4) intron (NR_126407, intron 1 of 4) 21688 NR_126407 104355291 NR_126407 ENSG00000233607 LINC01392 - long intergenic non-protein coding RNA 1392 ncRNA 282.333-37 chr4 36688139 36688538 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -46438 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 182.667-114 chr4 30459035 30459259 + 1 NA Intergenic Intergenic -261222 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 245.333-92 chr4 147911279 147911613 + 1 NA intron (NM_024605, intron 12 of 22) AluY|SINE|Alu 128851 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 163.667-31 chr10 108707392 108707564 + 1 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -638185 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 256.333-16 chr10 100310753 100311065 + 1 NA intron (NM_016112, intron 2 of 15) AluSx3|SINE|Alu 19319 NM_001253837 9033 Hs.159241 NM_016112 ENSG00000107593 PKD2L1 PCL|PKD2L|PKDL|TRPP3 polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel protein-coding 149.667-361 chr6 142359515 142359692 + 1 NA intron (NM_198569, intron 2 of 24) L2c|LINE|L2 57596 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 223.667-68 chr5 35508978 35509431 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -108659 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 145.333-73 chr12 123327414 123327583 + 1 NA exon (NM_001167856, exon 13 of 32) exon (NM_001167856, exon 13 of 32) 37345 NR_107039 102466877 NR_107039 ENSG00000284425 MIR8072 hsa-mir-8072 microRNA 8072 ncRNA 168.667-197 chr7 18724152 18724407 + 1 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 215009 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 326.667-22 chr2 57985344 57985712 + 1 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) L1ME3Cz|LINE|L1 -61114 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 144.333-173 chr3 106388626 106388782 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -519303 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 195.333-166 chr5 8786306 8786523 + 1 NA Intergenic Intergenic -53318 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 246.667-65 chr5 20371893 20372194 + 1 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) MIR|SINE|MIR 66492 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-209 chr2 65683386 65683560 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -250874 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 135.667-49 chr14 24779318 24779475 + 1 NA Intergenic Intergenic -145206 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 151.333-303 chr4 47916862 47917057 + 1 NA intron (NR_125879, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR -2292 NR_103795 152518 Hs.646325 NM_152995 ENSG00000170448 NFXL1 CDZFP|HOZFP|OZFP|URCC5 nuclear transcription factor, X-box binding like 1 protein-coding 148.333-359 chr7 32533709 32533887 + 1 NA intron (NM_015060, intron 1 of 15) intron (NM_015060, intron 1 of 15) 38309 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 329.333-27 chr2 223631811 223632390 + 1 NA Intergenic Intergenic -29739 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 234.333-67 chr6 41884721 41884984 + 1 NA intron (NM_018561, intron 2 of 6) intron (NM_018561, intron 2 of 6) 10523 NM_018561 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 129.333-50 chr12 41917599 41917775 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 153498 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 184.333-29 chr13 57722251 57722461 + 1 NA intron (NM_001040429, intron 3 of 3) intron (NM_001040429, intron 3 of 3) 90612 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 123.667-107 chr20 53897131 53897322 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -21517 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 158.333-81 chr14 36435037 36435302 + 1 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 78366 NR_161363 253970 Hs.509165 NM_001101341 ENSG00000229415 SFTA3 NANCI|SFTPH|SP-H|SPH surfactant associated 3 ncRNA 153.333-215 chr2 146528034 146528317 + 1 NA Intergenic Intergenic -58882 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 148.667-272 chr4 42177975 42178124 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -25394 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 244.333-53 chr19 28728281 28728713 + 1 NA promoter-TSS (NR_110759) promoter-TSS (NR_110759) -803 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 184.333-75 chr2 100615352 100615672 + 1 NA Intergenic Intergenic 11773 NR_146956 105373507 NR_146956 LINC01849 - long intergenic non-protein coding RNA 1849 ncRNA 248.333-38 chr18 34539378 34539772 + 1 NA intron (NM_001198945, intron 1 of 10) intron (NM_001198945, intron 1 of 10) 46263 NM_032979 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 167.667-116 chr20 6335891 6336097 + 1 NA Intergenic Intergenic -90738 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 220.333-16 chr10 62451519 62451993 + 1 NA intron (NM_199451, intron 3 of 7) intron (NM_199451, intron 3 of 7) -68692 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 162.667-284 chr8 132311604 132311882 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 135519 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 141.667-114 chr2 38895735 38895986 + 1 NA Intergenic Intergenic 19898 NM_001145450 729967 Hs.729207 NM_194270 ENSG00000188010 MORN2 BLOCK27|MOPT MORN repeat containing 2 protein-coding 150.333-334 chr5 86141335 86141612 + 1 NA Intergenic Intergenic -140971 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 120.333-161 chr5 175598744 175598969 + 1 NA Intergenic Intergenic -59215 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 145.333-307 chr8 122548759 122549039 + 1 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 19745 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 203.667-84 chr4 35690669 35690908 + 1 NA Intergenic Intergenic 553151 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 139.667-208 chr9 76966361 76966587 + 1 NA Intergenic Intergenic -53181 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 133.333-67 chr18 32571824 32572052 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 60275 NR_003558 441818 Hs.549773 NR_003558 ENSG00000260389 WBP11P1 HsT3017 WW domain binding protein 11 pseudogene 1 pseudo 150.667-30 chr10 17496679 17496836 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -42162 NR_144322 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 143.667-260 chr8 132643791 132644067 + 1 NA intron (NR_135912, intron 3 of 11) intron (NR_135912, intron 3 of 11) 31616 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 241.333-51 chr2 46709366 46709848 + 1 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) intron (NM_144949, intron 1 of 1) 10312 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 186.333-116 chr4 79954888 79955098 + 1 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 118236 NM_058172 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 232.333-60 chr4 66805067 66805626 + 1 NA Intergenic Intergenic 528522 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 149.333-380 chr7 131285584 131285855 + 1 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) intron (NM_001145354, intron 2 of 18) 42060 NR_125364 100506881 Hs.660830 NR_125364 ENSG00000236753 MKLN1-AS MKLN1-AS2 MKLN1 antisense RNA ncRNA 199.333-142 chr2 166217846 166218153 + 1 NA intron (NM_001365536, intron 24 of 26) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -68838 NM_001353949 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 204.333-138 chr4 30446594 30446903 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -273621 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 164.667-3 chr1 51708550 51708780 + 1 NA intron (NM_148906, intron 2 of 22) L1MC4a|LINE|L1 -21185 NM_148905 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 159.667-263 chr5 98903014 98903237 + 1 NA intron (NM_001364113, intron 4 of 36) intron (NM_001364113, intron 4 of 36) 23409 NM_001270 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 183.333-44 chr14 60545164 60545499 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 36185 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 124.667-24 chr10 30656518 30656669 + 1 NA Intergenic Intergenic -26840 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 156.333-188 chr2 123106233 123106531 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -32901 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 211.333-28 chr10 96450639 96450920 + 1 NA intron (NM_012465, intron 2 of 20) intron (NM_012465, intron 2 of 20) 63147 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 222.333-8 chr1 234506242 234506580 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 25368 NR_038426 100506795 Hs.448989 NR_038426 ENSG00000231768 LINC01354 - long intergenic non-protein coding RNA 1354 ncRNA 168.667-131 chr22 22333281 22333509 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 35297 NR_027293 96610 Hs.449601 NM_080926 BMS1P20 IGL|IGLV|IGLV1 BMS1 pseudogene 20 pseudo 135.667-100 chr2 133219440 133219637 + 1 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -46657 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 280.333-26 chr3 87533301 87533642 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -256887 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 193.667-27 chr11 115655028 115655245 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 79626 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 135.667-52 chr14 41464516 41464711 + 1 NA Intergenic Intergenic -142243 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 145.333-180 chr3 30763057 30763255 + 1 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) intron (NM_207359, intron 14 of 14) 131505 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 205.667-2 chr1 42820070 42820424 + 1 NA intron (NM_001017922, intron 1 of 11) HAL1|LINE|L1 -2850 NM_199342 374969 Hs.113919 NM_199342 ENSG00000177868 SVBP CCDC23 small vasohibin binding protein protein-coding 168.333-129 chr3 85253330 85253599 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 -132246 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 201.333-75 chr12 39080058 39080385 + 1 NA Intergenic Intergenic -174630 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 211.667-7 chr1 92691077 92691368 + 1 NA intron (NM_001350198, intron 9 of 19) L1MC5a|LINE|L1 93886 NM_001350197 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 154.667-218 chr20 49848104 49848276 + 1 NA intron (NR_048540, intron 5 of 11) AluSp|SINE|Alu -15669 NR_162136 113219455 NR_162136 MIR12122 - microRNA 12122 ncRNA 148.667-247 chr3 45206311 45206467 + 1 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL 19898 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 189.333-172 chr6 75466587 75466829 + 1 NA intron (NR_110608, intron 1 of 1) MER3|DNA|hAT-Charlie 27092 NM_015687 27145 Hs.201488 NM_015687 ENSG00000118407 FILIP1 FILIP filamin A interacting protein 1 protein-coding 159.333-27 chr1 215122273 215122522 + 1 NA intron (NM_001017424, intron 2 of 6) intron (NM_001017424, intron 2 of 6) 39660 NM_001017425 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 236.333-38 chr17 74533705 74533982 + 1 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -2368 NM_174892 124599 Hs.313343 NM_174892 ENSG00000178789 CD300LB CD300b|CLM-7|CLM7|CMRF35-A2|IREM-3|IREM3|TREM-5|TREM5 CD300 molecule like family member b protein-coding 126.333-144 chr5 117929959 117930182 + 1 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) 199709 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 158.667-209 chr3 57094838 57095091 + 1 NA 3' UTR (NM_017563, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_017563, exon 13 of 13) -15696 NM_001128615 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 129.333-79 chr17 62981089 62981239 + 1 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) L2|LINE|L2 14929 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 281.333-3 chr1 203353102 203353571 + 1 NA Intergenic Intergenic -2214 NM_002023 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 186.333-92 chr21 26636949 26637323 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -63850 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 163.667-64 chr14 73213834 73214026 + 1 NA intron (NM_000021, intron 10 of 11) L1M4|LINE|L1 -23576 NR_158677 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 190.667-64 chr2 52869314 52869615 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -166849 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 132.667-32 chr11 42225576 42225722 + 1 NA intron (NR_038309, intron 4 of 5) intron (NR_038309, intron 4 of 5) 28041 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 158.667-140 chr19 12970659 12970818 + 1 NA intron (NM_152654, intron 1 of 1) AluSz6|SINE|Alu 1120 NM_152654 199699 Hs.331981 NM_152654 ENSG00000179284 DAND5 CER2|CERL2|CKTSF1B3|COCO|CRL2|DANTE|GREM3|SP1 DAN domain BMP antagonist family member 5 protein-coding 331.667-4 chr14 62094587 62095016 + 1 NA intron (NM_001367661, intron 8 of 8) LTR33B|LTR|ERVL -22556 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 264.333-7 chr10 52682856 52683316 + 1 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 72318 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 143.667-206 chr5 151228881 151229096 + 1 NA Intergenic Intergenic -4896 NM_015621 26112 Hs.655336 NM_015621 ENSG00000198624 CCDC69 - coiled-coil domain containing 69 protein-coding 149.667-169 chr18 12736574 12736733 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 12769 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 184.667-93 chr4 156656211 156656585 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 315401 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 157.667-100 chr14 57492511 57492761 + 1 NA intron (NM_001283060, intron 1 of 5) intron (NM_001283060, intron 1 of 5) 1221 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 211.667-91 chr5 92981865 92982207 + 1 NA Intergenic Intergenic 589307 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 160.667-261 chr6 28030233 28030545 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -42927 NM_001355425 442179 NM_001355425 OR1F12 OR1F12P|OR1F12Q|OR6-12|hs6M1-35P olfactory receptor family 1 subfamily F member 12 protein-coding 166.667-49 chr12 60861325 60861524 + 1 NA Intergenic Intergenic 1172054 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 116.333-16 chr1 167349907 167350065 + 1 NA intron (NM_001365849, intron 3 of 16) intron (NM_001365849, intron 3 of 16) 20916 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 235.667-65 chr8 131838197 131838525 + 1 NA Intergenic Intergenic -65732 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 167.667-202 chr8 43281418 43281601 + 1 NA Intergenic Intergenic -10933 NM_001005365 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 159.667-39 chr10 15783911 15784094 + 1 NA intron (NM_024948, intron 13 of 14) MIRb|SINE|MIR -63667 NM_001291494 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 165.667-201 chr8 119291354 119291572 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -33708 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 248.333-48 chr2 179838168 179838690 + 1 NA intron (NM_001352808, intron 1 of 10) intron (NM_001352808, intron 1 of 10) 22479 NR_031659 100302172 NR_031659 ENSG00000221240 MIR1258 MIRN1258|hsa-mir-1258|mir-1258 microRNA 1258 ncRNA 184.333-103 chr3 57835946 57836382 + 1 NA intron (NM_001304420, intron 2 of 21) intron (NM_001304420, intron 2 of 21) -53750 NM_001311178 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 163.667-4 chr1 91994504 91994687 + 1 NA intron (NM_001726, intron 15 of 18) AluYa5|SINE|Alu -35390 NM_173567 253152 Hs.201555 NM_173567 ENSG00000172031 EPHX4 ABHD7|EH4|EPHXRP epoxide hydrolase 4 protein-coding 244.333-55 chr2 42307673 42308018 + 1 NA intron (NM_001145076, intron 16 of 21) AluSq2|SINE|Alu 52193 NR_134948 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 191.333-61 chr14 60763557 60763882 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 28958 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 194.333-41 chr14 63660540 63660835 + 1 NA Intergenic Intergenic -18816 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 305.333-4 chr10 25858386 25858828 + 1 NA Intergenic Intergenic 75103 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 155.333-189 chr2 191933130 191933366 + 1 NA Intergenic Intergenic -86160 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 167.333-249 chr7 130027258 130027464 + 1 NA intron (NM_016478, intron 5 of 9) 5S|rRNA|rRNA 24024 NM_001363701 51530 Hs.194157 NM_016478 ENSG00000091732 ZC3HC1 HSPC216|NIPA zinc finger C3HC-type containing 1 protein-coding 130.667-112 chr2 104068549 104068758 + 1 NA Intergenic Intergenic 339679 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 131.667-175 chr6 83648229 83648413 + 1 NA intron (NM_001242792, intron 7 of 28) L1ME1|LINE|L1 60238 NM_001363677 9892 Hs.368046 NM_014841 ENSG00000065609 SNAP91 AP180|CALM synaptosome associated protein 91 protein-coding 326.333-4 chr11 108919105 108919615 + 1 NA intron (NM_004398, intron 17 of 17) X7C_LINE|LINE|CR1 254291 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 510.667-4 chr8 128434798 128435593 + 1 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MIRc|SINE|MIR 129484 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 140.667-60 chr12 20734733 20734894 + 1 NA intron (NM_017435, intron 10 of 14) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 39348 NM_017435 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 124.333-106 chr20 43020279 43020483 + 1 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) intron (NM_133170, intron 1 of 31) 51638 NR_149017 101927138 Hs.666740 NR_149017 ENSG00000227599 LOC101927138 - uncharacterized LOC101927138 ncRNA 167.667-97 chr19 52429743 52429921 + 1 NA intron (NM_001143939, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu 684 NM_001351679 147658 Hs.447583 NM_182512 ENSG00000198633 ZNF534 KRBO3 zinc finger protein 534 protein-coding 149.667-314 chr5 54076804 54077098 + 1 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -125352 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 258.333-78 chrX 37477716 37478205 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -93701 NM_198511 347404 Hs.521932 NM_198511 ENSG00000147036 LANCL3 - LanC like 3 protein-coding 165.667-59 chr15 64536187 64536471 + 1 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 36909 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 127.333-75 chr2 39358205 39358352 + 1 NA intron (NM_003618, intron 2 of 33) L2c|LINE|L2 79007 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 162.333-75 chr14 70163202 70163448 + 1 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR -23783 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 257.333-91 chr7 41390564 41390866 + 1 NA Intergenic Intergenic 289111 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 316.333-8 chr13 86891555 86891946 + 1 NA Intergenic Intergenic -20170 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 153.333-364 chr6 70701756 70702011 + 1 NA intron (NM_001281440, intron 1 of 10) L1MA3|LINE|L1 33353 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 194.333-128 chr5 148263216 148263736 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -5318 NR_138538 153218 Hs.483771 NM_001040129 ENSG00000214510 SPINK13 HBVDNAPTP1|HESPINTOR|LiESP6|SPINK5L3 serine peptidase inhibitor, Kazal type 13 (putative) protein-coding 162.667-60 chr12 67601511 67601810 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -47085 NM_003583 8445 Hs.173135 NM_003583 ENSG00000127334 DYRK2 - dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 2 protein-coding 181.333-74 chr2 79261822 79262085 + 1 NA Intergenic Intergenic -102200 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 233.667-6 chr1 184721389 184721666 + 1 NA intron (NM_025191, intron 8 of 19) intron (NM_025191, intron 8 of 19) 33331 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 253.333-85 chr5 91395140 91395522 + 1 NA intron (NR_027435, intron 1 of 2) intron (NR_027435, intron 1 of 2) -12014 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 152.667-131 chr16 10220256 10220419 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -37429 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 180.667-33 chr12 93957562 93957871 + 1 NA Intergenic Intergenic -14110 NR_135017 105369911 Hs.577495 NR_135017 ENSG00000257283 LOC105369911 - uncharacterized LOC105369911 ncRNA 193.333-66 chr15 96490253 96490501 + 1 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 156612 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 176.333-173 chr8 131975976 131976251 + 1 NA exon (NM_001323553, exon 11 of 23) exon (NM_001323553, exon 11 of 23) 59340 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 166.667-151 chr3 62201649 62201936 + 1 NA intron (NM_002841, intron 11 of 29) intron (NM_002841, intron 11 of 29) 117155 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 151.333-443 chr9 95910106 95910270 + 1 NA intron (NM_020207, intron 4 of 18) L1ME2|LINE|L1 34180 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 136.333-14 chr1 231265923 231266085 + 1 NA intron (NM_001316350, intron 5 of 14) intron (NM_001316350, intron 5 of 14) 24792 NM_001316350 8443 Hs.498028 NM_014236 ENSG00000116906 GNPAT DAP-AT|DAPAT|DHAPAT|RCDP2 glyceronephosphate O-acyltransferase protein-coding 259.667-46 chr3 96711585 96711921 + 1 NA Intergenic Intergenic -102841 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 131.333-32 chr11 18536617 18536806 + 1 NA intron (NM_001040697, intron 9 of 11) intron (NM_001040697, intron 9 of 11) -9769 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 275.333-67 chr6 138028945 138029293 + 1 NA Intergenic Intergenic 78300 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 224.667-4 chr10 25242517 25242913 + 1 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -66439 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 229.667-6 chr1 204860522 204861016 + 1 NA intron (NM_001160332, intron 1 of 27) L1MB5|LINE|L1 32115 NM_001160332 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 300.333-27 chr20 6991245 6991607 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 223740 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 136.333-107 chr2 204499201 204499349 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -46200 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 144.667-328 chrX 66024279 66024473 + 1 NA intron (NM_001257403, intron 6 of 7) intron (NM_001257403, intron 6 of 7) 5506 NR_029637 407008 NR_029637 ENSG00000284567 MIR223 MIRN223|miRNA223|mir-223 microRNA 223 ncRNA 191.667-57 chr17 28297171 28297536 + 1 NA intron (NR_028334, intron 2 of 2) intron (NR_028334, intron 2 of 2) 10029 NR_028334 284085 Hs.371796 NM_173624 ENSG00000265480 KRT18P55 - keratin 18 pseudogene 55 pseudo 244.333-11 chr10 64599180 64599718 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -226079 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 150.667-293 chr5 31512616 31512859 + 1 NA intron (NM_013235, intron 7 of 34) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 19356 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 123.333-237 chrX 50774897 50775143 + 1 NA intron (NR_027121, intron 1 of 9) intron (NR_027121, intron 1 of 9) 39024 NM_020717 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 128.667-111 chr3 9812917 9813228 + 1 NA non-coding (NR_037162, exon 2 of 11) non-coding (NR_037162, exon 2 of 11) 2810 NR_037162 26140 Hs.726435 NM_015644 ENSG00000214021 TTLL3 HOTTL tubulin tyrosine ligase like 3 protein-coding 232.333-18 chr12 17820345 17820745 + 1 NA Intergenic Intergenic 147246 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 121.667-131 chr3 165036860 165037068 + 1 NA intron (NM_001041, intron 21 of 47) intron (NM_001041, intron 21 of 47) 41532 NM_001041 6476 Hs.429596 NM_001041 ENSG00000090402 SI - sucrase-isomaltase protein-coding 170.333-195 chr7 11359247 11359574 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 385538 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 199.667-52 chr15 64040038 64040316 + 1 NA exon (NM_001363730, exon 2 of 10) exon (NM_001363730, exon 2 of 10) 6308 NM_001363730 23604 Hs.237886 NM_014326 ENSG00000035664 DAPK2 DRP-1|DRP1 death associated protein kinase 2 protein-coding 260.333-65 chr7 88584083 88584496 + 1 NA Intergenic Intergenic -175411 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 135.667-80 chr2 5447991 5448214 + 1 NA Intergenic Intergenic 243016 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 133.667-138 chr7 20220027 20220205 + 1 NA intron (NR_134569, intron 3 of 3) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 2539 NR_134569 100506098 Hs.59203 NR_134567 ENSG00000233834 LOC100506098 - uncharacterized LOC100506098 ncRNA 153.333-138 chr15 57820428 57820648 + 1 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack 113824 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 230.667-21 chr16 31671488 31671832 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -28953 NR_024034 100132341 Hs.715792 NM_024048 ENSG00000131797 CLUHP3 C16orf67|KIAA0664L3|KIAA0664P3|URLC3 clustered mitochondria homolog pseudogene 3 pseudo 172.667-131 chr6 19141220 19141435 + 1 NA intron (NR_110860, intron 5 of 10) intron (NR_110860, intron 5 of 10) 39153 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 214.333-97 chr3 94557690 94558040 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -380398 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 155.333-387 chr8 82665805 82666095 + 1 NA Intergenic Intergenic -246154 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 204.667-123 chr5 89072099 89072465 + 1 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) intron (NR_136221, intron 3 of 6) -168177 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 255.333-42 chr17 31366530 31366837 + 1 NA intron (NM_001042492, intron 57 of 57) FLAM_A|SINE|Alu -24992 NM_032932 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 198.667-199 chr9 91683017 91683300 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -46813 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 247.667-76 chr5 16685168 16685550 + 1 NA intron (NM_012334, intron 29 of 40) AluJr4|SINE|Alu -68301 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 195.333-60 chr12 58644906 58645123 + 1 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 53312 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 236.667-38 chr2 35947531 35947968 + 1 NA Intergenic Intergenic 407821 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 132.667-164 chr7 52362289 52362439 + 1 NA Intergenic Intergenic -673269 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 151.667-266 chr5 17738412 17738706 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -68715 NR_134286 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 265.667-32 chr18 69753193 69753677 + 1 NA intron (NM_152721, intron 6 of 7) intron (NM_152721, intron 6 of 7) 194438 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 239.667-10 chr10 112789311 112789703 + 1 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) L1M4a1|LINE|L1 -33989 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 247.667-14 chr10 73922692 73922996 + 1 NA promoter-TSS (NR_160937) promoter-TSS (NR_160937) -67 NR_160938 414236 Hs.585453 NM_001001791 ENSG00000222047 C10orf55 - chromosome 10 open reading frame 55 ncRNA 169.333-90 chr16 31548286 31548486 + 1 NA non-coding (NR_146571, exon 2 of 2) non-coding (NR_146571, exon 2 of 2) 5181 NR_146571 105371173 NR_146571 LINC02190 - long intergenic non-protein coding RNA 2190 ncRNA 192.667-139 chr5 122018518 122018848 + 1 NA intron (NM_152546, intron 4 of 7) L2a|LINE|L2 56708 NM_152546 153443 Hs.107622 NM_152546 ENSG00000151304 SRFBP1 BUD22|P49|Rlb1|STRAP|p49/STRAP serum response factor binding protein 1 protein-coding 176.333-56 chr14 105493454 105493664 + 1 NA intron (NM_001134876, intron 4 of 6) intron (NM_001134876, intron 4 of 6) 2310 NM_001134876 283643 Hs.720306 NM_173608 ENSG00000185347 TEDC1 C14orf80 tubulin epsilon and delta complex 1 protein-coding 217.333-82 chr20 36658519 36658912 + 1 NA intron (NM_032013, intron 13 of 15) intron (NM_032013, intron 13 of 15) -12519 NM_032214 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 174.333-98 chr4 31428853 31429107 + 1 NA Intergenic Intergenic -77564 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 186.667-101 chr4 46066233 46066509 + 1 NA intron (NM_173536, intron 3 of 8) MIR|SINE|MIR 57683 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 316.667-2 chr1 225536835 225537233 + 1 NA intron (NM_001008493, intron 3 of 14) intron (NM_001008493, intron 3 of 14) -108179 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 228.667-13 chr10 107901701 107902059 + 1 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 167413 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 172.333-193 chr9 25238161 25238432 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 440562 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 134.333-107 chr22 24769704 24769943 + 1 NA intron (NR_045648, intron 1 of 21) MER30|DNA|hAT-Charlie 4897 NR_045649 440822 Hs.448343 NM_001008496 ENSG00000184571 PIWIL3 HIWI3 piwi like RNA-mediated gene silencing 3 protein-coding 156.333-117 chr14 85860886 85861048 + 1 NA Intergenic Intergenic -73711 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 182.667-50 chr14 84711193 84711391 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -560640 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 261.667-3 chr1 91310260 91310716 + 1 NA intron (NM_001017975, intron 30 of 38) intron (NM_001017975, intron 30 of 38) 94349 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 163.667-59 chr14 54934501 54934811 + 1 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -31830 NM_000161 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 274.333-58 chr6 133294979 133295353 + 1 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 53667 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 153.333-5 chr1 49932875 49933109 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) L1MA9|LINE|L1 90962 NR_136623 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 150.667-394 chr9 35275446 35275697 + 1 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) intron (NM_006377, intron 7 of 38) -66325 NM_001371188 181.333-95 chr21 22907474 22907785 + 1 NA Intergenic Intergenic -171655 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 222.667-64 chr4 39664412 39664886 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -25784 NM_174921 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 151.333-384 chr7 36110658 36110921 + 1 NA Intergenic Intergenic 15479 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 215.667-21 chr11 57591710 57592137 + 1 NA Intergenic Intergenic -5631 NM_000062 710 Hs.384598 NM_000062 ENSG00000149131 SERPING1 C1IN|C1INH|C1NH|HAE1|HAE2 serpin family G member 1 protein-coding 309.667-2 chr1 46641609 46642085 + 1 NA intron (NM_001042546, intron 6 of 6) L2|LINE|L2 24031 NM_001243728 64756 Hs.100874 NM_022745 ENSG00000123472 ATPAF1 ATP11|ATP11p ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 protein-coding 168.333-77 chr18 4226793 4227119 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) L1MA3|LINE|L1 -37646 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 236.667-23 chr13 84466960 84467447 + 1 NA intron (NR_046871, intron 3 of 6) L1MA9|LINE|L1 -316451 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 325.667 chr10 36228497 36228941 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 450417 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 248.667-48 chr17 47234500 47234825 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -19180 NM_000212 3690 Hs.218040 NM_000212 ENSG00000259207 ITGB3 BDPLT16|BDPLT2|CD61|GP3A|GPIIIa|GT integrin subunit beta 3 protein-coding 165.667-184 chr7 31418882 31419151 + 1 NA Intergenic Intergenic -78290 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 195.333-118 chr2 129398460 129398813 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -124745 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 236.333-27 chr14 60031396 60031708 + 1 NA intron (NR_075071, intron 28 of 32) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -60359 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 196.333-55 chr15 99646773 99647095 + 1 NA intron (NM_001365201, intron 4 of 11) intron (NM_001365201, intron 4 of 11) 13956 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 156.333-315 chr6 89388997 89389299 + 1 NA intron (NM_021244, intron 1 of 6) MER3|DNA|hAT-Charlie 23125 NM_021244 58528 Hs.31712 NM_021244 ENSG00000025039 RRAGD RAGD|bA11D8.2.1 Ras related GTP binding D protein-coding 170.333-79 chr14 85095827 85096129 + 1 NA Intergenic Intergenic -175954 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 153.333-432 chr8 120838253 120838496 + 1 NA Intergenic Intergenic -26328 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 150.333-374 chr7 3258333 3258488 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -42842 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 167.667-182 chr6 66939422 66939707 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -1115787 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 215.667-76 chr22 26396871 26397204 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -32223 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 203.333-287 chrX 88292994 88293313 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -454072 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 198.667-91 chr18 77680013 77680227 + 1 NA Intergenic Intergenic 313607 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 178.333-78 chr2 83166286 83166714 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 309697 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 219.333-175 chr7 108174297 108174628 + 1 NA intron (NM_001371136, intron 25 of 28) intron (NM_001371136, intron 25 of 28) -44101 NM_007356 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 252.667-107 chr9 90621905 90622226 + 1 NA intron (NM_017594, intron 1 of 1) AluJr4|SINE|Alu 20759 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 191.333-111 chr2 69672249 69672652 + 1 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) AluSz6|SINE|Alu 28642 NM_001320698 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 204.333-208 chr9 38018106 38018434 + 1 NA intron (NM_003028, intron 1 of 5) intron (NM_003028, intron 1 of 5) 50957 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 262.333-54 chr22 26218989 26219380 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) MIRc|SINE|MIR 49710 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 124.667-210 chr8 137469199 137469365 + 1 NA Intergenic Intergenic -55694 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 139.667-102 chr20 34535061 34535217 + 1 NA 3' UTR (NM_001319157, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001319157, exon 3 of 3) -11705 NM_181509 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 145.333-107 chr16 83561474 83561681 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) MIR|SINE|MIR 53231 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 121.667-19 chr10 17839498 17839675 + 1 NA intron (NM_002438, intron 4 of 29) FLAM_C|SINE|Alu -5521 NR_030167 574445 NR_030167 ENSG00000207938 MIR511 MIR511-1|MIR511-2|MIRN511-1|MIRN511-2|hsa-mir-511|hsa-mir-511-2|mir-511 microRNA 511 ncRNA 151.333-296 chr4 11665723 11665916 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 103649 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 156.333-344 chr7 110247521 110247739 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -287417 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 212.333-67 chr2 53730107 53730520 + 1 NA intron (NM_001201965, intron 2 of 8) intron (NM_001201965, intron 2 of 8) -37470 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 159.667-135 chr17 58902445 58902677 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 146692 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 173.667-91 chr2 163116233 163116488 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -277593 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 135.333-109 chr3 5831176 5831346 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -581006 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 141.333-13 chr1 217697605 217697873 + 1 NA intron (NM_138796, intron 5 of 10) intron (NM_138796, intron 5 of 10) 66395 NM_138796 128153 Hs.171130 NM_138796 ENSG00000162814 SPATA17 IQCH|MSRG-11|MSRG11 spermatogenesis associated 17 protein-coding 162.333-220 chr6 74784265 74784432 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 344434 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 155.333-23 chr10 43030802 43030961 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 33318 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 268.333-13 chr12 33560160 33560531 + 1 NA Intergenic Intergenic -120526 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 171.667-71 chr18 66914172 66914462 + 1 NA Intergenic Intergenic -167267 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 234.333-9 chr10 13771110 13771456 + 1 NA intron (NM_001318336, intron 5 of 23) AluJr|SINE|Alu -63716 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 155.667-55 chr11 80443787 80444008 + 1 NA Intergenic Intergenic 318906 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 149.333-337 chr6 72026087 72026319 + 1 NA intron (NM_001350411, intron 2 of 3) intron (NM_001350411, intron 2 of 3) 139500 NM_001350411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 141.667-119 chr2 72764742 72764994 + 1 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 61165 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 228.333-68 chr4 43441014 43441288 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 51392 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 399.333-9 chr14 64672813 64673287 + 1 NA Intergenic Intergenic -31374 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 232.333-44 chr2 140357612 140357955 + 1 NA intron (NM_018557, intron 74 of 90) intron (NM_018557, intron 74 of 90) 228902 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 149.333-434 chr9 87156786 87157016 + 1 NA non-coding (NR_161226, exon 2 of 2) non-coding (NR_161226, exon 2 of 2) 8257 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 190.333-54 chr16 89941479 89941808 + 1 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -7088 NM_001242820 54849 Hs.62771 NM_017702 ENSG00000140995 DEF8 - differentially expressed in FDCP 8 homolog protein-coding 161.667-192 chr4 91988244 91988439 + 1 NA Intergenic Intergenic 288961 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 199.667-72 chr2 57226754 57227165 + 1 NA Intergenic Intergenic -680692 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 159.667-142 chr17 70869214 70869448 + 1 NA Intergenic Intergenic 332848 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 130.667-201 chr8 123835515 123835731 + 1 NA Intergenic Intergenic -16364 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 114.333-81 chr16 54653714 54653933 + 1 NA Intergenic Intergenic 194410 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 193.333-150 chr5 86422897 86423222 + 1 NA Intergenic Intergenic 140615 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 308.667-10 chr10 71748572 71749161 + 1 NA 3' UTR (NM_022153, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_022153, exon 7 of 7) -11016 NM_001168390 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 199.333-293 chr9 18278046 18278381 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -195940 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 154.667-228 chr22 44012853 44013022 + 1 NA intron (NM_001003828, intron 2 of 13) AluSx|SINE|Alu -11340 NM_013327 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 176.667-141 chr8 11832220 11832500 + 1 NA intron (NM_001287742, intron 9 of 9) AluJr4|SINE|Alu 23216 NM_001287751 2222 Hs.593928 NM_004462 ENSG00000079459 FDFT1 DGPT|ERG9|SQS|SQSD|SS farnesyl-diphosphate farnesyltransferase 1 protein-coding 192.333-71 chr17 81306284 81306665 + 1 NA intron (NR_038080, intron 2 of 3) intron (NR_038080, intron 2 of 3) 2774 NR_038080 284185 Hs.631762 NM_178519 LINC00482 C17orf55 long intergenic non-protein coding RNA 482 ncRNA 142.667-187 chr6 44637992 44638158 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -86194 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 203.667-46 chr2 8793894 8794334 + 1 NA intron (NM_001348732, intron 11 of 28) intron (NM_001348732, intron 11 of 28) 43499 NM_001348742 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 224.667-48 chr2 220806930 220807339 + 1 NA Intergenic Intergenic 765170 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 215.667-37 chr14 55640201 55640509 + 1 NA intron (NR_073129, intron 15 of 45) intron (NR_073129, intron 15 of 45) 60148 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 123.333-175 chr5 89872828 89873059 + 1 NA Intergenic Intergenic 143777 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 225.667-20 chr12 117053431 117053844 + 1 NA intron (NM_001168325, intron 2 of 6) intron (NM_001168325, intron 2 of 6) 45779 NM_017899 54997 Hs.525709 NM_017899 ENSG00000088992 TESC CHP3|TSC tescalcin protein-coding 121.667-35 chr11 6756615 6756767 + 1 NA Intergenic Intergenic 12266 NM_001004490 338755 Hs.534614 NM_001004490 ENSG00000188124 OR2AG2 OR11-76|OR2AG2P olfactory receptor family 2 subfamily AG member 2 protein-coding 154.667-205 chr2 213044663 213044925 + 1 NA intron (NM_001371277, intron 5 of 6) ERVL-E-int|LTR|ERVL 105643 NM_001371275 116.667-31 chr12 28382744 28382988 + 1 NA intron (NM_001330367, intron 7 of 11) intron (NM_001330367, intron 7 of 11) -192128 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 155.333-222 chr3 18489023 18489325 + 1 NA intron (NR_125803, intron 4 of 6) intron (NR_125803, intron 4 of 6) -43582 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 162.667-207 chr5 24200200 24200366 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 248935 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 231.333-41 chr14 59167093 59167462 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -21390 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 157.667-133 chr19 30313008 30313187 + 1 NA Intergenic Intergenic -59287 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 257.667-66 chr5 45033797 45034167 + 1 NA Intergenic Intergenic 225035 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 204.333-151 chr5 8073646 8073876 + 1 NA Intergenic Intergenic 204613 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 154.667-146 chr18 1410226 1410495 + 1 NA Intergenic Intergenic -50731 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 149.667-140 chr15 58684787 58685044 + 1 NA intron (NM_001320570, intron 2 of 14) MER21C|LTR|ERVL 8692 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 167.667-188 chr6 142954549 142954845 + 1 NA Intergenic Intergenic -9521 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 143.333-301 chr9 20749554 20749741 + 1 NA intron (NM_017794, intron 7 of 45) intron (NM_017794, intron 7 of 45) 33542 NR_030166 574444 NR_030166 ENSG00000207609 MIR491 MIRN491|hsa-mir-491|mir-491 microRNA 491 ncRNA 182.667-18 chr10 55821676 55821978 + 1 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL -193885 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 199.667-153 chr9 101695741 101696109 + 1 NA intron (NM_133445, intron 1 of 8) intron (NM_133445, intron 1 of 8) 42655 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 157.333-36 chr1 235264159 235264334 + 1 NA intron (NR_135074, intron 2 of 24) intron (NR_135074, intron 2 of 24) 63241 NM_001206794 51742 Hs.575782 NM_016374 ENSG00000054267 ARID4B BCAA|BRCAA1|RBBP1L1|RBP1L1|SAP180 AT-rich interaction domain 4B protein-coding 246.333-37 chr16 48785728 48786194 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -175781 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 219.667-23 chr14 84339334 84339756 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -932387 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 247.333-65 chr5 158476309 158476601 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -66682 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 144.667-162 chr2 212941417 212941574 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -15159 NR_039936 100616472 NR_039936 ENSG00000283637 MIR4776-2 mir-4776-2 microRNA 4776-2 ncRNA 192.667-134 chr5 54413377 54413646 + 1 NA intron (NR_126379, intron 4 of 4) intron (NR_126379, intron 4 of 4) -42188 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 152.333-89 chr13 37107377 37107582 + 1 NA Intergenic Intergenic -1815 NM_145203 122011 Hs.512897 NM_145203 ENSG00000180138 CSNK1A1L CK1 casein kinase 1 alpha 1 like protein-coding 219.667-64 chr4 52469143 52469504 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 187216 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 315.667-8 chr15 72047125 72047684 + 1 NA intron (NM_006901, intron 1 of 41) intron (NM_006901, intron 1 of 41) -66854 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 229.333-77 chr3 83856952 83857388 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 1012405 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 161.333-131 chr18 69020158 69020378 + 1 NA intron (NM_001093729, intron 9 of 9) intron (NM_001093729, intron 9 of 9) 222188 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 155.333-381 chr8 50634291 50634458 + 1 NA intron (NR_135797, intron 15 of 20) intron (NR_135797, intron 15 of 20) 470243 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 215.667-91 chr4 32330661 32331043 + 1 NA Intergenic Intergenic -20186 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 181.333-35 chr12 45303247 45303549 + 1 NA intron (NM_001025356, intron 2 of 19) intron (NM_001025356, intron 2 of 19) 10708 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 147.667-4 chr1 57671998 57672248 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) MIRb|SINE|MIR -188458 NR_104362 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 278.667-7 chr11 46182119 46182448 + 1 NA Intergenic Intergenic 10328 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 194.333-136 chr7 22973208 22973450 + 1 NA intron (NM_032581, intron 7 of 10) intron (NM_032581, intron 7 of 10) 40801 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 124.333-131 chr4 72311853 72311993 + 1 NA intron (NM_014243, intron 13 of 21) intron (NM_014243, intron 13 of 21) 257298 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 220.667-12 chr10 12400442 12400733 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 2 of 11) intron (NM_001351032, intron 2 of 11) 11605 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 121.667-85 chr19 30289946 30290146 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -82338 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 118.667-49 chr12 3746761 3746949 + 1 NA intron (NM_001144958, intron 1 of 19) intron (NM_001144958, intron 1 of 19) 6254 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 179.667-68 chr18 9347576 9347959 + 1 NA intron (NM_020648, intron 2 of 4) HAL1|LINE|L1 12994 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 124.667-115 chr2 193252785 193253029 + 1 NA Intergenic Intergenic 503062 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 150.667-13 chr1 166682957 166683254 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 79189 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 213.333-137 chr3 144325657 144326077 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 352786 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 171.667-108 chr22 46423825 46424035 + 1 NA intron (NM_014246, intron 5 of 34) AluSx|SINE|Alu 88216 NM_001282783 55687 Hs.439524 NM_018006 ENSG00000100416 TRMU LCAL3|MTO2|MTU1|TRMT|TRMT1 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase protein-coding 273.333-34 chr2 72115393 72115701 + 1 NA Intergenic Intergenic 32315 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 282.667-42 chr6 126767303 126767666 + 1 NA Intergenic Intergenic 282853 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 150.333-283 chr3 185284784 185284978 + 1 NA intron (NM_001242314, intron 1 of 14) intron (NM_001242314, intron 1 of 14) 1920 NM_001242314 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 234.667-31 chr14 38744902 38745332 + 1 NA Intergenic Intergenic -137479 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 195.333-133 chr20 35577062 35577368 + 1 NA intron (NR_119376, intron 31 of 42) AluJb|SINE|Alu 30347 NR_119376 80307 Hs.72222 NR_001442 ENSG00000088340 FER1L4 C20orf124 fer-1 like family member 4 (pseudogene) pseudo 241.667-41 chr2 142703912 142704468 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -173474 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 127.333-91 chr20 14694309 14694560 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) MIR3|SINE|MIR 140050 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 192.333-110 chr22 28703030 28703389 + 1 NA intron (NM_001257387, intron 9 of 15) MIRb|SINE|MIR -23344 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 140.333-143 chr3 107237364 107237610 + 1 NA intron (NR_028303, intron 1 of 3) L1MC4|LINE|L1 3151 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 152.667-134 chr16 59948167 59948392 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) MER90a|LTR|ERV1 92926 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 200.667-31 chr11 76409042 76409361 + 1 NA intron (NR_130990, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 27878 NM_001347884 100506127 Hs.503319 NM_001013634 ENSG00000179240 GVQW3 - GVQW motif containing 3 protein-coding 169.667-142 chr3 194799567 194799910 + 1 NA Intergenic Intergenic -31029 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 260.333-46 chr5 1977944 1978323 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 90802 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 146.667-145 chr18 65825202 65825477 + 1 NA intron (NM_001362438, intron 6 of 11) intron (NM_001362438, intron 6 of 11) 74327 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 279.667-31 chr3 119916407 119916996 + 1 NA intron (NM_002093, intron 4 of 11) intron (NM_002093, intron 4 of 11) 133991 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 150.667-103 chr13 72493519 72493722 + 1 NA Intergenic Intergenic 234009 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 140.667-69 chr13 94298524 94298679 + 1 NA intron (NM_005708, intron 5 of 8) intron (NM_005708, intron 5 of 8) -110610 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-86 chr20 1740145 1740447 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 39450 NR_037142 100289473 Hs.641525 NR_037142 ENSG00000232528 LOC100289473 - cytoskeleton associated protein 2-like pseudogene pseudo 144.667-315 chr8 134103364 134103528 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 216950 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 161.667-181 chr3 173949213 173949479 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) -28550 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 207.667-48 chr18 47615532 47615827 + 1 NA Intergenic Intergenic 235183 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 410.333-8 chr5 115111157 115111666 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 58497 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 197.667-104 chr4 20445791 20446133 + 1 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) intron (NM_001289135, intron 4 of 35) 53773 NR_037876 100505893 Hs.665305 NR_037876 ENSG00000248228 SLIT2-IT1 - SLIT2 intronic transcript 1 ncRNA 293.333-31 chr2 118697821 118698329 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -95109 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 187.667-144 chr8 108008916 108009188 + 1 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) L1MC5a|LINE|L1 72887 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 206.667-131 chr7 43671969 43672390 + 1 NA intron (NR_163914, intron 1 of 8) L1PA15|LINE|L1 57344 NM_001371317 116.333-124 chr2 154834769 154834950 + 1 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) intron (NM_002239, intron 2 of 2) 136164 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 151.667-253 chr4 93060070 93060302 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 755787 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 150.667-325 chr6 28145825 28146025 + 1 NA intron (NM_001278121, intron 2 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 3714 NM_001278121 7745 Hs.57679 NM_006298 ENSG00000198315 ZKSCAN8 LD5-1|ZNF192|ZSCAN40 zinc finger with KRAB and SCAN domains 8 protein-coding 122.333-34 chr11 62316209 62316352 + 1 NA Intergenic Intergenic -17205 NM_206998 404552 Hs.473247 NM_206998 ENSG00000197745 SCGB1D4 IIS secretoglobin family 1D member 4 protein-coding 347.333-18 chr3 37543660 37544097 + 1 NA intron (NM_002207, intron 15 of 27) intron (NM_002207, intron 15 of 27) 91737 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 163.333-125 chr17 73395151 73395344 + 1 NA exon (NM_001144952, exon 25 of 45) exon (NM_001144952, exon 25 of 45) -83246 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 144.333-101 chr18 12789557 12789827 + 1 NA intron (NM_080423, intron 8 of 8) intron (NM_080423, intron 8 of 8) -40270 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 148.667-361 chr7 103525727 103526015 + 1 NA intron (NM_005045, intron 46 of 64) intron (NM_005045, intron 46 of 64) -79664 NM_206885 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 153.667-225 chr20 45429729 45429903 + 1 NA intron (NR_159957, intron 2 of 3) intron (NR_159957, intron 2 of 3) 2394 NR_159957 105372631 Hs.729907 NR_159957 LOC105372631 - uncharacterized LOC105372631 ncRNA 234.667-110 chr8 77712011 77712448 + 1 NA Intergenic Intergenic 261532 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 195.667-25 chr12 9078972 9079385 + 1 NA intron (NM_000014, intron 25 of 35) MIRb|SINE|MIR 14001 NR_137425 144571 Hs.592432 NR_026971 ENSG00000245105 A2M-AS1 - A2M antisense RNA 1 ncRNA 153.333-79 chr12 1978960 1979182 + 1 NA intron (NM_152640, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 25386 NM_001319292 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 148.667-67 chr11 27447235 27447630 + 1 NA intron (NM_018490, intron 1 of 17) MER41B|LTR|ERV1 -24299 NR_131170 105376671 Hs.568999 NR_131169 ENSG00000254862 LOC105376671 lnc-BBOX1-1 uncharacterized LOC105376671 ncRNA 151.333-268 chr3 3989005 3989206 + 1 NA Intergenic Intergenic -188230 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 191.333-128 chr22 47022589 47022888 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 10 of 12) L1MEc|LINE|L1 -106696 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 230.667-94 chr9 29115830 29116338 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 96215 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 211.333-141 chr22 27740358 27740829 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 61163 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 150.333-114 chr14 61767719 61767918 + 1 NA intron (NM_003082, intron 3 of 9) AluSx1|SINE|Alu 5398 NM_003082 6617 Hs.179312 NM_003082 ENSG00000023608 SNAPC1 PTFgamma|SNAP43 small nuclear RNA activating complex polypeptide 1 protein-coding 144.333-5 chr1 40322876 40323120 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -5712 NM_001852 1298 Hs.418012 NM_001852 ENSG00000049089 COL9A2 DJ39G22.4|EDM2|MED|STL5 collagen type IX alpha 2 chain protein-coding 126.333-181 chr8 130881150 130881309 + 1 NA intron (NM_001115, intron 8 of 17) intron (NM_001115, intron 8 of 17) 159680 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 249.667-62 chr3 119747939 119748410 + 1 NA intron (NM_033364, intron 16 of 17) intron (NM_033364, intron 16 of 17) -32310 NM_033013 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 164.667-165 chr4 84961376 84961692 + 1 NA intron (NM_014991, intron 1 of 67) intron (NM_014991, intron 1 of 67) -4082 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 283.333-79 chr9 32887830 32888123 + 1 NA Intergenic Intergenic 104436 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 165.333-57 chr12 58222437 58222658 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 134655 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 259.333-26 chr12 116842518 116842983 + 1 NA intron (NM_032814, intron 10 of 10) AluSx1|SINE|Alu 38691 NR_073189 8739 Hs.26605 NM_003806 ENSG00000135116 HRK DP5|HARAKIRI harakiri, BCL2 interacting protein protein-coding 150.667-407 chrX 78532717 78532983 + 1 NA Intergenic Intergenic 126478 NM_152694 203430 Hs.134873 NM_152694 ENSG00000179300 RTL3 Mar3|Mart3|SIRH9|ZCCHC5|ZHC5 retrotransposon Gag like 3 protein-coding 390.333-4 chr14 62124808 62125298 + 1 NA intron (NR_015358, intron 2 of 3) intron (NR_015358, intron 2 of 3) 7696 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 121.333-87 chr2 75585422 75585577 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -15780 NM_032181 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 156.333-367 chr8 123614113 123614346 + 1 NA Intergenic Intergenic 39572 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 159.667-316 chr8 79201449 79201617 + 1 NA Intergenic Intergenic -130655 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 474.667-4 chr18 43372463 43373372 + 1 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 -95427 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 112.333-265 chr8 118977894 118978084 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) 25726 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 161.667-195 chr5 7787525 7787760 + 1 NA intron (NM_020546, intron 19 of 24) intron (NM_020546, intron 19 of 24) 63491 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 145.667-66 chr12 65181998 65182275 + 1 NA intron (NM_001167614, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 12553 NM_001167614 23592 Hs.744150 NM_014319 ENSG00000174106 LEMD3 MAN1 LEM domain containing 3 protein-coding 330.667-32 chr9 83427197 83427663 + 1 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) intron (NM_174938, intron 1 of 13) 40312 NM_001244960 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 320.333-7 chr14 43790982 43791533 + 1 NA Intergenic Intergenic 716026 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 149.667-426 chr9 93551308 93551583 + 1 NA intron (NM_001286722, intron 12 of 17) intron (NM_001286722, intron 12 of 17) -25139 NM_005392 5253 Hs.211441 NM_005392 ENSG00000197724 PHF2 CENP-35|GRC5|JHDM1E|KDM7C PHD finger protein 2 protein-coding 212.333-140 chr7 69069128 69069412 + 1 NA Intergenic Intergenic 528354 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 147.333-319 chr8 113249888 113250161 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) (AATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 127128 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 229.667-47 chr2 216080766 216081114 + 1 NA promoter-TSS (NM_001142312) promoter-TSS (NM_001142312) 869 NM_018441 55825 Hs.281680 NM_018441 ENSG00000115425 PECR DCRRP|HPDHASE|HSA250303|PVIARL|SDR29C1|TERP peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase protein-coding 263.667-57 chr3 42258348 42258930 + 1 NA intron (NM_000729, intron 4 of 4) intron (NM_000729, intron 4 of 4) 5308 NM_001174138 885 Hs.458426 NM_000729 ENSG00000187094 CCK - cholecystokinin protein-coding 216.333-17 chr10 39291538 39291973 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 595159 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 258.667-45 chr2 77271884 77272292 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 250288 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 151.667-148 chr17 72232131 72232355 + 1 NA Intergenic Intergenic -110568 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 337.667-9 chr14 67721518 67721994 + 1 NA intron (NM_152443, intron 2 of 8) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19870 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 142.667-35 chr11 112601947 112602224 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -46283 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 227.333-82 chr3 137835148 137835628 + 1 NA Intergenic Intergenic 63477 NR_109987 100507274 Hs.360349 NR_109987 ENSG00000239513 LINC01210 - long intergenic non-protein coding RNA 1210 ncRNA 165.667-138 chr4 42100365 42100613 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 52166 NM_001159547 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 130.667-34 chr10 82331082 82331326 + 1 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -98284 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-82 chr14 84737851 84738300 + 1 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 -533857 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 211.333-182 chr5 54654676 54655018 + 1 NA Intergenic Intergenic 48477 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 178.333-32 chr12 16073262 16073640 + 1 NA Intergenic Intergenic 162119 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 144.333-25 chr10 65094355 65094503 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -169911 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 140.667-32 chr10 44190771 44191033 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -101848 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 311.667-29 chr9 107894679 107895260 + 1 NA Intergenic Intergenic -405200 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 265.667-72 chr8 36164919 36165445 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -454862 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 154.333-248 chr4 95517648 95517882 + 1 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 31208 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 153.333-286 chr4 15482994 15483277 + 1 NA TTS (NM_001164720) TTS (NM_001164720) 13253 NM_001164720 57545 Hs.590928 NM_020785 ENSG00000048342 CC2D2A JBTS9|MKS6 coiled-coil and C2 domain containing 2A protein-coding 287.667-33 chr5 161939670 161940274 + 1 NA intron (NR_126372, intron 1 of 2) L1PA15|LINE|L1 61224 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 211.333-78 chr16 61254117 61254489 + 1 NA Intergenic Intergenic -198537 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 239.667-73 chr8 77818355 77818647 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 367804 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 202.333-184 chr9 27187010 27187444 + 1 NA intron (NM_001290077, intron 8 of 21) intron (NM_001290077, intron 8 of 21) 78086 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 136.667-178 chr8 112255482 112255688 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 57 of 66) intron (NM_001363185, intron 57 of 66) -387908 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 163.333-159 chr2 231044043 231044272 + 1 NA intron (NM_001144994, intron 2 of 2) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 6634 NM_001144994 257407 Hs.526596 NM_001144994 ENSG00000204128 C2orf72 - chromosome 2 open reading frame 72 protein-coding 315.667-6 chr11 104324746 104325098 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -160775 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 357.667-4 chr3 15435143 15435620 + 1 NA intron (NM_033083, intron 4 of 5) intron (NM_033083, intron 4 of 5) 7783 NM_033083 85403 Hs.716733 NM_033083 ENSG00000144597 EAF1 - ELL associated factor 1 protein-coding 145.667-282 chr8 77778052 77778211 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 327434 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 161.667-81 chr14 66758817 66759097 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) LTR25-int|LTR|ERV1 251550 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 147.333-80 chr12 41310848 41311023 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 122615 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 220.667-98 chr7 50421885 50422154 + 1 NA Intergenic Intergenic 28331 NM_001042762 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 221.333-140 chr8 90758680 90759017 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -32927 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 176.333-5 chr1 44434839 44435064 + 1 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 10950 NM_001319957 55182 Hs.456557 NM_018150 ENSG00000187147 RNF220 C1orf164 ring finger protein 220 protein-coding 273.667-9 chr10 6090628 6090949 + 1 NA intron (NM_001145547, intron 1 of 11) intron (NM_001145547, intron 1 of 11) 1442 NM_001145547 84991 Hs.498548 NM_032905 ENSG00000134453 RBM17 SPF45 RNA binding motif protein 17 protein-coding 151.333-256 chr21 34649455 34649608 + 1 NA Intergenic Intergenic -19463 NM_053277 54102 Hs.473695 NM_053277 ENSG00000159212 CLIC6 CLIC1L chloride intracellular channel 6 protein-coding 154.667-272 chr4 59952900 59953193 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 939473 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 375.667-14 chr4 26465913 26466450 + 1 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR 24303 NM_000730 886 Hs.129 NM_000730 ENSG00000163394 CCKAR CCK-A|CCK1-R|CCK1R|CCKRA cholecystokinin A receptor protein-coding 172.333-9 chr1 239818793 239819004 + 1 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) LTR54B|LTR|ERV1 80974 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 250.333-31 chr2 182721093 182721388 + 1 NA intron (NR_073367, intron 4 of 22) intron (NR_073367, intron 4 of 22) 4983 NR_073367 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 190.667-31 chr12 60930279 60930544 + 1 NA Intergenic Intergenic 1241041 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 155.333-314 chr5 169503732 169504009 + 1 NA Intergenic Intergenic -79903 NM_017785 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 215.667-34 chr13 81827558 81827802 + 1 NA Intergenic Intergenic -600697 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 236.667-13 chr10 120036832 120037237 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 78521 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 158.333-198 chr3 32609788 32610019 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -38979 NM_001329135 51143 Hs.529495 NM_016141 ENSG00000144635 DYNC1LI1 DLC-A|DNCLI1|LIC1 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 protein-coding 178.667-91 chr20 46204555 46204856 + 1 NA intron (NM_021248, intron 7 of 11) MIRb|SINE|MIR 86391 NR_126502 958 Hs.472860 NM_001250 ENSG00000101017 CD40 Bp50|CDW40|TNFRSF5|p50 CD40 molecule protein-coding 152.333-79 chr12 24826562 24826788 + 1 NA intron (NM_001178091, intron 9 of 9) L1M2|LINE|L1 75547 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 116.667-92 chr2 34139533 34139680 + 1 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 72380 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 163.667-109 chr2 58332561 58332752 + 1 NA Intergenic Intergenic 56779 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 247.667-17 chr11 84115064 84115479 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 9 of 27) intron (NM_001142699, intron 9 of 27) 158009 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 152.667-149 chr18 32308533 32308699 + 1 NA intron (NM_001242409, intron 3 of 5) intron (NM_001242409, intron 3 of 5) 118577 NM_001308171 4225 Hs.194777 NM_005925 ENSG00000141434 MEP1B - meprin A subunit beta protein-coding 234.667-45 chr19 14822281 14822786 + 1 NA intron (NM_001370485, intron 1 of 4) AluSg4|SINE|Alu 12652 NM_001370481 26659 Hs.137573 NM_017506 ENSG00000188269 OR7A5 HTPCR2 olfactory receptor family 7 subfamily A member 5 protein-coding 141.333-238 chr8 88063982 88064177 + 1 NA intron (NM_005941, intron 7 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie -190064 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 211.667-70 chr2 174101535 174101989 + 1 NA intron (NM_001011708, intron 6 of 9) intron (NM_001011708, intron 6 of 9) 76482 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 235.667-57 chr7 39238875 39239248 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) L1ME3|LINE|L1 90073 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 199.667-114 chr5 66203426 66203709 + 1 NA Intergenic Intergenic 5879 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 127.667-47 chr14 57424785 57425038 + 1 NA Intergenic Intergenic 34325 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 134.667-202 chr8 130873881 130874049 + 1 NA intron (NM_001115, intron 8 of 17) intron (NM_001115, intron 8 of 17) 166944 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 189.667-62 chr17 65831719 65832030 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) L1M3b|LINE|L1 -5331 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 150.667-32 chr10 26974571 26974838 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -32703 NR_026795 387644 Hs.529965 NR_026795 ENSG00000283709 FAM238C C10orf51|LINC00202|LINC00202-1|NCRNA00202|bB27G4.1 family with sequence similarity 238 member C ncRNA 216.333-113 chr5 18132729 18133141 + 1 NA Intergenic Intergenic 325661 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 387.667-3 chr12 3674797 3675372 + 1 NA intron (NM_001144958, intron 6 of 19) intron (NM_001144958, intron 6 of 19) 78025 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 115.667-104 chr18 5916127 5916310 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -20264 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 147.667-362 chr8 92075614 92075886 + 1 NA intron (NM_001198632, intron 1 of 11) intron (NM_001198632, intron 1 of 11) -13116 NM_004349 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 204.667-69 chr2 31809998 31810285 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6161 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 136.333-51 chr14 43893827 43894051 + 1 NA Intergenic Intergenic 613344 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 121.333-67 chr17 43788862 43789100 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 8546 NM_001353400 284067 Hs.252707 NM_001136483 ENSG00000231256 CFAP97D1 C17orf105 CFAP97 domain containing 1 protein-coding 222.667-72 chr5 36175942 36176337 + 1 NA intron (NM_032637, intron 7 of 9) intron (NM_032637, intron 7 of 9) 24028 NM_032637 6502 Hs.23348 NM_005983 ENSG00000145604 SKP2 FBL1|FBXL1|FLB1|p45 S-phase kinase associated protein 2 protein-coding 152.333-85 chr12 43690465 43690617 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 68249 NM_001271826 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 209.667-10 chr1 169262469 169262783 + 1 NA intron (NR_104229, intron 7 of 12) L1PREC2|LINE|L1 105171 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 179.333-121 chr3 5024178 5024486 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -44371 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 186.333-161 chr8 59315002 59315371 + 1 NA Intergenic Intergenic 195976 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 146.333-98 chr14 73402328 73402572 + 1 NA intron (NM_001005743, intron 2 of 12) intron (NM_001005743, intron 2 of 12) 56130 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 249.667-70 chr4 102544487 102544783 + 1 NA intron (NM_003998, intron 5 of 23) intron (NM_003998, intron 5 of 23) -42149 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 151.333-409 chr8 61844236 61844396 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -45523 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 149.667-97 chr12 87586503 87586738 + 1 NA Intergenic Intergenic -182192 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 161.667-5 chr1 66082479 66082646 + 1 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR -31844 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 178.333-94 chr21 28109796 28110035 + 1 NA intron (NR_126010, intron 2 of 4) intron (NR_126010, intron 2 of 4) 19512 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 121.667-100 chr2 179556215 179556380 + 1 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) intron (NR_148056, intron 3 of 9) 6291 NM_001113398 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 158.333-75 chr13 50370349 50370639 + 1 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) L1MB3|LINE|L1 156955 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 154.333-294 chr6 63270901 63271107 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 48973 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 215.333-60 chr15 25158656 25159110 + 1 NA intron (NR_146177, intron 61 of 147) intron (NR_146177, intron 61 of 147) -11840 NR_001291 338433 NR_001291 ENSG00000201831 SNORD115-1 HBII-52-1|RNHBII52 small nucleolar RNA, C/D box 115-1 snoRNA 136.333-47 chr13 76264336 76264588 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -329330 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 259.667-17 chr12 10092604 10092993 + 1 NA intron (NM_001297750, intron 1 of 6) intron (NM_001297750, intron 1 of 6) 6187 NM_001297750 51267 Hs.29549 NM_016511 ENSG00000150048 CLEC1A CLEC-1|CLEC1 C-type lectin domain family 1 member A protein-coding 177.667-24 chr10 96040546 96040738 + 1 NA intron (NR_134320, intron 2 of 3) L1ME4b|LINE|L1 -2941 NM_019084 54619 Hs.596479 NM_019084 ENSG00000107443 CCNJ bA690P14.1 cyclin J protein-coding 145.667-314 chr9 137703201 137703475 + 1 NA intron (NM_001354612, intron 1 of 8) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 84333 NM_001354611 79813 Hs.495511 NM_024757 ENSG00000181090 EHMT1 EHMT1-IT1|EUHMTASE1|Eu-HMTase1|FP13812|GLP|GLP1|KLEFS1|KMT1D euchromatic histone lysine methyltransferase 1 protein-coding 121.667-211 chr8 131870438 131870604 + 1 NA Intergenic Intergenic -33572 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 195.333-27 chr10 24205110 24205464 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) AluSq2|SINE|Alu -3504 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 186.667-112 chr4 176673362 176673700 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 119391 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 156.333-314 chr6 80464312 80464517 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 357743 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 153.333-77 chr11 124961965 124962208 + 1 NA intron (NM_025004, intron 4 of 15) intron (NM_025004, intron 4 of 15) 7884 NM_025004 80071 Hs.287555 NM_025004 ENSG00000149548 CCDC15 - coiled-coil domain containing 15 protein-coding 239.333-108 chr8 135965857 135966176 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 508560 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 142.333-192 chr5 24255110 24255267 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 303840 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 171.667-115 chr3 193866178 193866467 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -22313 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 265.667-45 chr22 46871760 46872319 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) L1ME2|LINE|L1 44003 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 132.333-80 chr2 43415928 43416075 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 28 of 37) intron (NM_001083953, intron 28 of 37) 179973 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 155.667-7 chr1 31445193 31445475 + 1 NA Intergenic Intergenic 31521 NM_001199039 347735 Hs.270655 NM_018565 ENSG00000168528 SERINC2 FKSG84|PRO0899|TDE2|TDE2L serine incorporator 2 protein-coding 155.667-247 chr4 63344093 63344372 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1065218 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 156.667-151 chr18 6573564 6573768 + 1 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) intron (NR_120518, intron 2 of 5) 62250 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 259.667-81 chr7 112300356 112300822 + 1 NA intron (NM_021994, intron 4 of 11) intron (NM_021994, intron 4 of 11) 93894 NM_021994 11179 Hs.655904 NM_021994 ENSG00000198839 ZNF277 NRIF4|ZNF277P zinc finger protein 277 protein-coding 230.333-12 chr10 33553666 33554129 + 1 NA Intergenic Intergenic 218783 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 161.667-144 chr2 180887953 180888260 + 1 NA intron (NR_104324, intron 4 of 4) L1MA4A|LINE|L1 -92279 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 161.333-149 chr2 109519492 109519669 + 1 NA Intergenic Intergenic 94087 NM_001321513 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 124.667-171 chr5 107066613 107066816 + 1 NA Intergenic Intergenic -55700 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 116.667 chr1 20545168 20545365 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -7307 NM_207334 163933 Hs.429179 NM_207334 ENSG00000183114 FAM43B - family with sequence similarity 43 member B protein-coding 210.333-117 chr4 82441190 82441512 + 1 NA intron (NM_021204, intron 1 of 5) AluY|SINE|Alu 10761 NM_021204 58478 Hs.18442 NM_021204 ENSG00000145293 ENOPH1 E1|MASA|MST145|mtnC enolase-phosphatase 1 protein-coding 151.667-80 chr12 18135669 18135926 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -45604 NR_104413 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 191.333-212 chr8 136974044 136974257 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 439438 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 227.667-70 chr7 3237514 3237888 + 1 NA Intergenic Intergenic -63551 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 157.333-165 chr18 13738491 13738736 + 1 NA intron (NM_003799, intron 5 of 11) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 11940 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 140.333-112 chr2 171715491 171715712 + 1 NA intron (NM_001271787, intron 5 of 15) intron (NM_001271787, intron 5 of 15) 27846 NM_001320884 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 149.667-222 chr2 182099002 182099211 + 1 NA intron (NM_001261425, intron 4 of 5) MIRc|SINE|MIR 113253 NM_001261425 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 153.667-89 chr12 30063841 30064056 + 1 NA Intergenic LTR14B|LTR|ERVK -279189 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 317.333-41 chr8 85415755 85416245 + 1 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -22859 NM_005181 761 Hs.82129 NM_005181 ENSG00000164879 CA3 CAIII|Car3 carbonic anhydrase 3 protein-coding 344.667-7 chr19 8030764 8031248 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -21756 NM_005624 6370 Hs.310511 NM_005624 ENSG00000131142 CCL25 Ckb15|SCYA25|TECK C-C motif chemokine ligand 25 protein-coding 150.333-67 chr11 108692683 108692870 + 1 NA intron (NM_004398, intron 8 of 17) AluJr|SINE|Alu 27707 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 150.333-125 chr15 42053463 42053625 + 1 NA Intergenic Intergenic -2841 NM_001206670 123745 Hs.668060 NM_001080490 ENSG00000188089 PLA2G4E - phospholipase A2 group IVE protein-coding 261.333-22 chr12 13130628 13130963 + 1 NA Intergenic Intergenic -27128 NM_001367364 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 210.667-59 chr18 71445358 71445687 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 133434 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 376.667-7 chr20 36289193 36289886 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -16800 NM_001365621 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 180.333-26 chr12 59181876 59182120 + 1 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -261460 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 156.333-253 chr3 177238428 177238668 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -41066 NM_001321194 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 205.667-5 chr1 62796402 62796800 + 1 NA intron (NM_032852, intron 1 of 10) intron (NM_032852, intron 1 of 10) 12469 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 168.333-22 chr10 52987213 52987417 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -215615 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 276.667-11 chr10 88664721 88665137 + 1 NA intron (NM_004190, intron 1 of 9) intron (NM_004190, intron 1 of 9) 487 NM_001198830 8513 Hs.523130 NM_004190 ENSG00000182333 LIPF GL|HGL|HLAL lipase F, gastric type protein-coding 164.667-245 chr8 120909747 120909958 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -97806 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 238.667-30 chr15 58178957 58179357 + 1 NA exon (NM_001320636, exon 5 of 6) exon (NM_001320636, exon 5 of 6) 40776 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 132.667-67 chr17 30253793 30254048 + 1 NA intron (NM_000386, intron 11 of 11) intron (NM_000386, intron 11 of 11) -18223 NM_001045 6532 Hs.29792 NM_001045 ENSG00000108576 SLC6A4 5-HTT|5-HTTLPR|5HTT|HTT|OCD1|SERT|SERT1|hSERT solute carrier family 6 member 4 protein-coding 169.667-94 chr18 6681593 6681835 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -48002 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 166.667-157 chr4 13480365 13480617 + 1 NA intron (NM_001017979, intron 1 of 6) intron (NM_001017979, intron 1 of 6) 3849 NM_004249 9364 Hs.656060 NM_004249 ENSG00000157869 RAB28 CORD18 RAB28, member RAS oncogene family protein-coding 222.667-76 chr5 170282441 170282882 + 1 NA intron (NM_005565, intron 3 of 20) MIR|SINE|MIR 15116 NM_005565 3937 Hs.304475 NM_005565 ENSG00000043462 LCP2 SLP-76|SLP76 lymphocyte cytosolic protein 2 protein-coding 174.333-136 chr6 149154709 149154953 + 1 NA Intergenic Intergenic -63093 NR_125861 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 157.333-158 chr17 71289241 71289567 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -87225 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 187.667-16 chr10 77239699 77239892 + 1 NA intron (NM_001322838, intron 3 of 29) intron (NM_001322838, intron 3 of 29) 98964 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 124.667-16 chr1 175948356 175948560 + 1 NA intron (NM_022457, intron 18 of 19) intron (NM_022457, intron 18 of 19) 20021 NR_162097 113839518 NR_162097 MIR1843 - microRNA 1843 ncRNA 162.667-52 chr12 3346956 3347201 + 1 NA intron (NR_148995, intron 1 of 11) AluSz|SINE|Alu 19044 NR_148995 100128253 Hs.447497 NR_148995 LOC100128253 - uncharacterized LOC100128253 ncRNA 155.333-186 chr2 176903717 176903911 + 1 NA Intergenic Intergenic 266060 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 193.667-70 chr2 224502319 224502737 + 1 NA intron (NM_001257197, intron 9 of 14) MIRc|SINE|MIR 67427 NM_001257198 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 242.667-100 chr7 121589446 121589895 + 1 NA Intergenic Intergenic -193302 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 171.667-99 chr20 51691358 51691622 + 1 NA intron (NM_006045, intron 7 of 27) L2b|LINE|L2 76900 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 156.667-178 chr2 48796137 48796340 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -40514 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 200.667-36 chr13 26139796 26140159 + 1 NA intron (NM_183045, intron 5 of 5) intron (NM_183045, intron 5 of 5) -80455 NR_146971 107984009 NR_146971 LINC00415 - long intergenic non-protein coding RNA 415 ncRNA 118.667-126 chr22 25628759 25628937 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) intron (NM_001362778, intron 2 of 19) 64173 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 220.667-5 chr1 61215434 61215742 + 1 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 37930 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 179.667-63 chr17 40829225 40829447 + 1 NA intron (NR_160886, intron 1 of 2) L1MA3|LINE|L1 -6722 NM_000421 3858 Hs.99936 NM_000421 ENSG00000186395 KRT10 BCIE|BIE|CK10|EHK|K10|KPP keratin 10 protein-coding 246.333-44 chr18 66360115 66360515 + 1 NA Intergenic Intergenic 243775 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 151.667-57 chr11 4479632 4479916 + 1 NA Intergenic Intergenic -9105 NM_001005171 390036 Hs.553726 NM_001005171 ENSG00000196778 OR52K1 OR11-8 olfactory receptor family 52 subfamily K member 1 protein-coding 204.333-37 chr11 60445903 60446136 + 1 NA intron (NM_023945, intron 4 of 4) L1ME3G|LINE|L1 -9790 NM_152866 931 Hs.712553 NM_021950 ENSG00000156738 MS4A1 B1|Bp35|CD20|CVID5|LEU-16|MS4A2|S7 membrane spanning 4-domains A1 protein-coding 157.667-215 chr4 61063098 61063268 + 1 NA Intergenic Intergenic -80473 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 155.333-307 chr5 128435526 128435705 + 1 NA intron (NM_001999, intron 7 of 64) intron (NM_001999, intron 7 of 64) 102630 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 132.667-184 chr8 123349424 123349611 + 1 NA intron (NM_014109, intron 13 of 27) intron (NM_014109, intron 13 of 27) -1387 NR_030382 693130 NR_030382 ENSG00000283172 MIR548D1 MIRN548D1 microRNA 548d-1 ncRNA 304.333-34 chr7 47347755 47348240 + 1 NA intron (NM_022748, intron 17 of 30) intron (NM_022748, intron 17 of 30) 116806 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 173.667-179 chr8 111890468 111890747 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 513968 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 128.667-105 chr20 53809795 53810002 + 1 NA Intergenic Intergenic 65811 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 168.667-28 chr11 19636931 19637159 + 1 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) intron (NM_001111018, intron 1 of 37) 61735 NR_039706 100616118 NR_039706 ENSG00000265210 MIR4486 - microRNA 4486 ncRNA 153.333-437 chr8 139165801 139166085 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -251902 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 153.333-241 chr20 43810538 43810824 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -83679 NM_176791 149699 Hs.447626 NM_176791 ENSG00000124196 GTSF1L C20orf65|FAM112A|dJ1028D15.4 gametocyte specific factor 1 like protein-coding 154.333-322 chr7 44944303 44944524 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 34602 NM_033054 64005 Hs.37617 NM_033054 ENSG00000136286 MYO1G HA2|HLA-HA2|MHAG myosin IG protein-coding 156.667-266 chr5 38428009 38428206 + 1 NA intron (NM_182798, intron 9 of 16) X6A_LINE|LINE|CR1 -17439 NM_182801 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 198.667-24 chr10 69107281 69107578 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -16724 NM_001035260 9559 Hs.499925 NM_004896 ENSG00000122958 VPS26A HB58|Hbeta58|PEP8A|VPS26 VPS26, retromer complex component A protein-coding 154.333-272 chr5 106221494 106221762 + 1 NA Intergenic Intergenic 789386 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 185.333-15 chr10 14580401 14580680 + 1 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -8165 NM_001320735 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 234.667-85 chr4 105194406 105194694 + 1 NA intron (NM_001127208, intron 2 of 10) intron (NM_001127208, intron 2 of 10) 47865 NM_001127208 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 167.667-187 chr6 112124488 112124730 + 1 NA intron (NM_001105206, intron 31 of 38) intron (NM_001105206, intron 31 of 38) 37018 NM_001033564 619208 Hs.591340 NM_001033564 ENSG00000203778 FAM229B C6orf225 family with sequence similarity 229 member B protein-coding 143.333-127 chr2 9867407 9867696 + 1 NA intron (NM_001318977, intron 5 of 13) MamRep605|LTR?|LTR? 24077 NM_005680 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 158.333-251 chr5 19594490 19594785 + 1 NA intron (NM_001349559, intron 6 of 12) L1MB1|LINE|L1 291635 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 278.333-9 chr1 227650333 227650709 + 1 NA intron (NM_178549, intron 3 of 3) L1MA9|LINE|L1 47186 NR_036753 401983 Hs.681816 NR_036753 ZNF847P gm127 zinc finger protein 847, pseudogene pseudo 124.667-32 chr10 106796064 106796219 + 1 NA intron (NM_001206569, intron 3 of 25) intron (NM_001206569, intron 3 of 25) 368565 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 176.333-59 chr15 76453531 76453766 + 1 NA intron (NR_148227, intron 25 of 32) L1MC4|LINE|L1 116875 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 147.667-218 chr22 29990904 29991054 + 1 NA intron (NM_153051, intron 6 of 18) intron (NM_153051, intron 6 of 18) -16070 NR_106876 102466742 NR_106876 ENSG00000275818 MIR6818 hsa-mir-6818 microRNA 6818 ncRNA 201.667-113 chr6 162078562 162078957 + 1 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) intron (NM_004562, intron 4 of 11) 607782 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 144.333-15 chr1 172259099 172259384 + 1 NA intron (NR_146559, intron 16 of 20) L1MA4A|LINE|L1 -114406 NR_038397 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 180.667-149 chr8 121089037 121089319 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -277132 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 141.333-224 chr7 66796246 66796404 + 1 NA intron (NM_001367722, intron 4 of 7) intron (NM_001367722, intron 4 of 7) 40443 NM_001287061 27342 Hs.530053 NM_014504 ENSG00000154710 RABGEF1 RABEX5|RAP1|rabex-5 RAB guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 145.333-141 chr2 125354988 125355291 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 762846 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 246.667 chr1 19987082 19987467 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -6840 NM_000300 5320 Hs.466804 NM_000300 ENSG00000188257 PLA2G2A MOM1|PLA2|PLA2B|PLA2L|PLA2S|PLAS1|sPLA2 phospholipase A2 group IIA protein-coding 163.667-118 chr2 160608275 160608539 + 1 NA Intergenic Intergenic -114600 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 263.333-77 chr7 79134906 79135169 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 126049 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 212.667-53 chr17 44499470 44499713 + 1 NA intron (NM_001002909, intron 1 of 7) intron (NM_001002909, intron 1 of 7) 3815 NM_001002909 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 144.333-77 chr14 64584464 64584623 + 1 NA intron (NM_172365, intron 8 of 11) intron (NM_172365, intron 8 of 11) 34582 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 307.333-74 chr7 53712695 53713095 + 1 NA intron (NR_038371, intron 4 of 5) L1MCa|LINE|L1 99036 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 145.333-286 chr7 139083937 139084195 + 1 NA intron (NM_020119, intron 2 of 12) intron (NM_020119, intron 2 of 12) 25654 NM_024625 56829 Hs.133512 NM_020119 ENSG00000105939 ZC3HAV1 ARTD13|FLB6421|PARP13|ZAP|ZC3H2|ZC3HDC2 zinc finger CCCH-type containing, antiviral 1 protein-coding 206.333-154 chr7 152485928 152486238 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 21959 NR_027387 100128822 Hs.647112 NR_027387 ENSG00000261455 LINC01003 - long intergenic non-protein coding RNA 1003 ncRNA 232.667-12 chr12 12659968 12660380 + 1 NA TTS (NM_006143) TTS (NM_006143) 36009 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 240.667-23 chr13 39260679 39261053 + 1 NA Intergenic Intergenic 222410 NM_001012754 387921 Hs.507783 NM_001012754 ENSG00000188811 NHLRC3 - NHL repeat containing 3 protein-coding 213.667-31 chr14 60492668 60492972 + 1 NA Intergenic Intergenic -6757 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 236.333-2 chr1 23703889 23704409 + 1 NA Intergenic Intergenic 12343 NM_000975 6135 Hs.719951 NM_000975 ENSG00000142676 RPL11 DBA7|GIG34|L11|uL5 ribosomal protein L11 protein-coding 168.333-32 chr11 4674734 4675018 + 1 NA Intergenic Intergenic 22977 NM_030774 81285 Hs.501758 NM_030774 ENSG00000167332 OR51E2 HPRAJ|OR51E3P|OR52A2|PSGR olfactory receptor family 51 subfamily E member 2 protein-coding 229.667-62 chr3 144957326 144957615 + 1 NA Intergenic Intergenic 984389 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 115.667-31 chr10 92030281 92030406 + 1 NA 3' UTR (NM_003972, exon 38 of 38) 3' UTR (NM_003972, exon 38 of 38) 106573 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 238.333-28 chr15 68962955 68963340 + 1 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) AluJo|SINE|Alu 32622 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 148.333-263 chr3 165922032 165922208 + 1 NA Intergenic Intergenic -84697 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 144.333-116 chr2 16439888 16440045 + 1 NA Intergenic Intergenic 225868 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 305.333 chr1 169375683 169376351 + 1 NA intron (NM_003666, intron 2 of 7) intron (NM_003666, intron 2 of 7) 7822 NM_001320973 8548 Hs.130746 NM_003666 ENSG00000117475 BLZF1 GOLGIN-45|JEM-1|JEM-1s|JEM1 basic leucine zipper nuclear factor 1 protein-coding 174.667-21 chr10 29547404 29547605 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 8 of 38) intron (NM_001323599, intron 8 of 38) -2407 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 158.667-37 chr10 33973631 33973825 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -201048 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 138.667-26 chr10 108144520 108144729 + 1 NA Intergenic Intergenic -75331 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 151.667-109 chr14 42668305 42668528 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 1061560 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 138.667-79 chr16 54005996 54006146 + 1 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) intron (NM_001363988, intron 9 of 9) -33322 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 174.667-173 chr8 129526599 129526826 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -42570 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 121.667-194 chr7 93736798 93736969 + 1 NA Intergenic Intergenic 19955 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 224.667-41 chr2 51134005 51134382 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 101592 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 137.333-123 chr3 119488569 119488760 + 1 NA intron (NR_024265, intron 7 of 10) MIRb|SINE|MIR -9883 NM_016589 51300 Hs.477287 NM_016589 ENSG00000113845 TIMMDC1 C3orf1|MC1DN31 translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 protein-coding 166.333-201 chr6 107678240 107678452 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 53804 NM_001286409 256380 Hs.486109 NM_198081 ENSG00000146285 SCML4 dJ47M23.1 Scm polycomb group protein like 4 protein-coding 148.667-56 chr10 92774303 92774524 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -52418 NM_001013848 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 197.333-111 chr2 65139418 65139715 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -9265 NM_015543 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 298.667-18 chr3 83666770 83667296 + 1 NA Intergenic Intergenic 1202542 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 166.333-99 chr19 28393182 28393435 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -213380 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 155.333-317 chr5 175077393 175077624 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -81777 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 182.333-44 chr14 60621578 60621908 + 1 NA Intergenic Intergenic -17473 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 266.667-25 chr14 68567179 68567649 + 1 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) L1MC1|LINE|L1 61373 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 178.667-130 chr5 55596662 55596852 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -61679 NR_103485 8611 Hs.696231 NM_003711 ENSG00000067113 PLPP1 LLP1a|LPP1|PAP-2a|PAP2|PPAP2A phospholipid phosphatase 1 protein-coding 291.667-10 chr11 29321210 29321555 + 1 NA Intergenic Intergenic -273031 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 121.667-206 chr8 108566919 108567065 + 1 NA Intergenic Intergenic 123368 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 166.333-30 chr10 72632903 72633199 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -6860 NM_001363513 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 197.333-107 chr2 52843275 52843615 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -140830 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 246.667-64 chr4 101143518 101144102 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 2 of 12) L2c|LINE|L2 97062 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 150.667-270 chr4 75464839 75464996 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 44379 NR_103725 25898 Hs.48297 NM_015436 ENSG00000163743 RCHY1 ARNIP|CHIMP|PIRH2|PRO1996|RNF199|ZCHY|ZNF363 ring finger and CHY zinc finger domain containing 1 protein-coding 210.667-121 chr7 87664773 87665096 + 1 NA intron (NM_001134406, intron 2 of 9) L1MA9|LINE|L1 36536 NM_138290 154661 Hs.411488 NM_138290 ENSG00000105784 RUNDC3B RPIB9|RPIP9 RUN domain containing 3B protein-coding 123.667-12 chr1 105771538 105771735 + 1 NA Intergenic Intergenic -152701 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 168.333-67 chr15 97106225 97106403 + 1 NA Intergenic Intergenic 322879 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 219.667-86 chr7 9562642 9563002 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -71448 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 166.667-169 chr4 101313785 101314049 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) 16497 NR_031656 100302193 NR_031656 ENSG00000221265 MIR1255A MIRN1255A|hsa-mir-1255a microRNA 1255a ncRNA 154.667-189 chr2 149909697 149909950 + 1 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -50632 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 268.667-9 chr12 112859264 112859629 + 1 NA intron (NR_145127, intron 5 of 22) HAL1b|LINE|L1 -47331 NM_002534 4938 Hs.524760 NM_002534 ENSG00000089127 OAS1 E18/E16|IFI-4|OIAS|OIASI 2'-5'-oligoadenylate synthetase 1 protein-coding 200.667-47 chr14 74837089 74837390 + 1 NA TTS (NM_019589) TTS (NM_019589) 26595 NM_001243007 283571 Hs.675293 NM_001080408 ENSG00000119608 PROX2 PROX-2 prospero homeobox 2 protein-coding 170.667-78 chr2 38407432 38407632 + 1 NA Intergenic Intergenic -23762 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 323.667-4 chr10 59791754 59792172 + 1 NA 3' UTR (NM_005436, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_005436, exon 9 of 9) -38508 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 126.333-102 chr2 236803133 236803366 + 1 NA Intergenic Intergenic 233424 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 151.333-45 chr10 32726442 32726597 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 26 of 43) intron (NM_001321115, intron 26 of 43) 174953 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 208.333-114 chr5 25018410 25018734 + 1 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 172084 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 155.333-237 chr3 126100666 126100834 + 1 NA intron (NM_001164475, intron 1 of 9) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 798 NM_001164475 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 176.333-122 chr4 83821052 83821242 + 1 NA Intergenic Intergenic 285039 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 156.667-208 chr20 43979422 43979674 + 1 NA intron (NM_001098797, intron 2 of 8) L1MA2|LINE|L1 33652 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 192.667-31 chr10 95064514 95064850 + 1 NA intron (NM_001198855, intron 5 of 9) intron (NM_001198855, intron 5 of 9) 4815 NM_001198854 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 213.333-104 chr2 157725869 157726147 + 1 NA Intergenic Intergenic -97144 NM_001111032 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 182.333-104 chr3 18103470 18103734 + 1 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) X2_LINE|LINE|CR1 141050 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 205.667-105 chr4 61288059 61288332 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 86023 NM_001371342 154.667-188 chr2 148349147 148349342 + 1 NA intron (NM_018328, intron 5 of 14) MIR|SINE|MIR -295507 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 270.333-55 chr6 83804999 83805318 + 1 NA Intergenic Intergenic -48108 NM_001009994 134701 Hs.149454 NM_001009994 ENSG00000203877 RIPPLY2 C6orf159|SCDO6|dJ237I15.1 ripply transcriptional repressor 2 protein-coding 247.667-41 chr17 72260751 72261127 + 1 NA Intergenic Intergenic -81872 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 150.333-314 chr4 176070141 176070385 + 1 NA intron (NM_181265, intron 1 of 28) intron (NM_181265, intron 1 of 28) 4422 NM_170710 116966 Hs.532056 NM_170710 ENSG00000150627 WDR17 - WD repeat domain 17 protein-coding 203.667-56 chr2 96542103 96542364 + 1 NA intron (NM_001319092, intron 1 of 6) intron (NM_001319092, intron 1 of 6) 4354 NM_001319092 10865 Hs.920 NM_006673 ENSG00000196843 ARID5A MRF-1|MRF1|RP11-363D14 AT-rich interaction domain 5A protein-coding 150.333-222 chr2 186522746 186522905 + 1 NA Intergenic Intergenic 36565 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 189.333-55 chr14 73226372 73226666 + 1 NA Intergenic Intergenic -10987 NR_158677 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 119.667-141 chr5 17265089 17265241 + 1 NA intron (NM_006317, intron 1 of 1) intron (NM_006317, intron 1 of 1) 47534 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 155.667-10 chr1 60168241 60168459 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -94580 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 208.333-162 chrX 77142450 77142772 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -128079 NR_110406 101928469 Hs.640805 NR_110400 ENSG00000280870 MIR325HG MIR384HG MIR325 host gene ncRNA 279.667-13 chr14 60571424 60571884 + 1 NA Intergenic Intergenic 62508 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 114.333-38 chr11 25840474 25840640 + 1 NA Intergenic Intergenic -348566 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 152.333-129 chr16 1498417 1498619 + 1 NA intron (NM_001351846, intron 5 of 20) AluJr|SINE|Alu 5158 NM_016111 9894 Hs.271044 NM_016111 ENSG00000100726 TELO2 CLK2|TEL2|YHFS telomere maintenance 2 protein-coding 208.667-67 chr2 76001230 76001451 + 1 NA Intergenic Intergenic -290425 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 156.333-370 chr8 138475888 138476119 + 1 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) L1MC1|LINE|L1 21258 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 133.333-80 chr2 75720679 75720921 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -9885 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 188.667-141 chr7 99906105 99906350 + 1 NA intron (NM_033091, intron 3 of 5) L1ME3A|LINE|L1 13303 NM_033091 89122 Hs.50749 NM_033017 ENSG00000146833 TRIM4 RNF87 tripartite motif containing 4 protein-coding 167.333-163 chr22 29564073 29564302 + 1 NA intron (NM_001202502, intron 4 of 9) intron (NM_001202502, intron 4 of 9) -10430 NM_001002877 8563 Hs.75361 NM_003678 ENSG00000100296 THOC5 C22orf19|Fmip|PK1.3|fSAP79 THO complex 5 protein-coding 173.333-158 chr5 63762806 63763011 + 1 NA Intergenic Intergenic 199384 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 155.333-219 chr22 36001478 36001640 + 1 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) AluJr4|SINE|Alu 26978 NM_001349999 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 155.667-331 chr7 79012495 79012705 + 1 NA TTS (NR_046689) TTS (NR_046689) 3612 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 151.333-203 chr2 43796714 43796979 + 1 NA intron (NM_016008, intron 8 of 12) intron (NM_016008, intron 8 of 12) 22807 NM_001348912 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 154.667-70 chr12 11591610 11591777 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 43663 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 249.333-33 chr14 89036433 89036753 + 1 NA Intergenic Intergenic 211942 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 135.667-40 chr12 64051183 64051342 + 1 NA intron (NM_001346201, intron 6 of 21) L1MC5a|LINE|L1 171034 NM_001300940 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 170.333-134 chr22 42734674 42734966 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -13519 NM_001318038 53947 Hs.105956 NM_017436 ENSG00000128274 A4GALT A14GALT|A4GALT1|Gb3S|P(k)|P1|P1PK|PK alpha 1,4-galactosyltransferase (P blood group) protein-coding 154.333-290 chr6 39614443 39614653 + 1 NA intron (NM_001289020, intron 5 of 21) L3|LINE|CR1 110860 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 210.333-26 chr11 77076649 77077003 + 1 NA intron (NM_004055, intron 1 of 12) L1MA8|LINE|L1 9855 NM_004055 726 Hs.248153 NM_004055 ENSG00000149260 CAPN5 ADNIV|HTRA3|VRNI|nCL-3 calpain 5 protein-coding 243.333-44 chr18 66448574 66448868 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 155369 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 180.333-124 chr8 21737119 21737367 + 1 NA intron (NM_001495, intron 4 of 8) AluSx|SINE|Alu 51632 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 124.667-123 chr20 35537148 35537292 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -4858 NM_198398 51614 Hs.472558 NM_015966 ENSG00000125991 ERGIC3 C20orf47|C2orf47|CGI-54|Erv46|NY-BR-84|PRO0989|SDBCAG84|dJ477O4.2 ERGIC and golgi 3 protein-coding 259.667-15 chr11 80808808 80809289 + 1 NA Intergenic Intergenic -46245 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 214.333-141 chr7 33517111 33517639 + 1 NA intron (NM_198428, intron 20 of 22) LTR16C|LTR|ERVL -387540 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 116.333-156 chr4 61989412 61989554 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 18 of 23) intron (NM_001371343, intron 18 of 23) 172282 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 180.667-97 chr3 90473208 90473440 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1365703 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 203.333-55 chr12 67526605 67526964 + 1 NA intron (NR_103861, intron 1 of 2) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 6702 NR_103861 100507175 Hs.505986 NR_103861 ENSG00000203585 LINC02408 - long intergenic non-protein coding RNA 2408 ncRNA 180.667-57 chr19 44256065 44256320 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -3688 NM_001330529 353355 Hs.466891 NM_181756 ENSG00000159915 ZNF233 - zinc finger protein 233 protein-coding 114.667 chr1 13943252 13943387 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 193904 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 154.333-65 chr11 96562524 96562767 + 1 NA Intergenic (ATATATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 54220 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 154.333-233 chr4 1161863 1162080 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 10612 NM_012445 10417 Hs.302963 NM_012445 ENSG00000159674 SPON2 DIL-1|DIL1|M-SPONDIN|MINDIN spondin 2 protein-coding 208.667-83 chr21 23141960 23142198 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 62795 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 212.667-52 chr17 39272992 39273352 + 1 NA intron (NM_001370209, intron 9 of 13) AluSx|SINE|Alu -24228 NR_162098 113839521 NR_162098 MIR548BC - microRNA 548BC ncRNA 140.667-224 chr8 41416728 41416922 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9830 NR_145746 109616980 NR_145746 ENSG00000238936 SNORD65B - small nucleolar RNA, C/D box 65B snoRNA 189.333-72 chr17 54941743 54941950 + 1 NA intron (NM_001321176, intron 12 of 16) intron (NM_001321176, intron 12 of 16) 26808 NR_135677 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 190.333 chr1 15985826 15986036 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -9799 NM_001324138 7709 Hs.433764 NM_003443 ENSG00000116809 ZBTB17 MIZ-1|ZNF151|ZNF60|pHZ-67 zinc finger and BTB domain containing 17 protein-coding 172.667-16 chr1 232164283 232164593 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 238604 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 127.333-187 chr8 48581330 48581553 + 1 NA intron (NR_105002, intron 2 of 3) intron (NR_105002, intron 2 of 3) 29874 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 315.333-46 chr7 40197897 40198385 + 1 NA intron (NM_024728, intron 6 of 14) intron (NM_024728, intron 6 of 14) 63165 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 227.333-16 chr10 25268739 25269111 + 1 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -92649 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 143.667-179 chr4 55433395 55433616 + 1 NA 3' UTR (NM_001267843, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_001267843, exon 24 of 24) 37548 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 199.333-255 chr7 15221981 15222212 + 1 NA intron (NM_001004320, intron 12 of 12) intron (NM_001004320, intron 12 of 12) -247238 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 143.667 chr1 24470004 24470272 + 1 NA non-coding (NR_136506, exon 11 of 11) non-coding (NR_136506, exon 11 of 11) -32206 NM_001251979 11123 Hs.656799 NM_013441 ENSG00000117602 RCAN3 DSCR1L2|MCIP3|RCN3|hRCN3 RCAN family member 3 protein-coding 224.667-31 chr16 48383216 48383670 + 1 NA intron (NM_003031, intron 1 of 1) intron (NM_003031, intron 1 of 1) 1970 NM_003031 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 157.333-80 chr12 32421066 32421253 + 1 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) L3|LINE|CR1 21601 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 146.667-116 chr15 73657370 73657602 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -24097 NM_017455 27020 Hs.744867 NM_012428 ENSG00000156642 NPTN GP55|GP65|SDFR1|SDR1|np55|np65 neuroplastin protein-coding 159.333-362 chrX 65754506 65754759 + 1 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 86978 NM_002444 4478 Hs.87752 NM_002444 ENSG00000147065 MSN HEL70|IMD50 moesin protein-coding 186.667-132 chr7 8369649 8369900 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -63835 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 125.333-180 chr8 123871106 123871334 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) L1MC3|LINE|L1 19233 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 156.333-277 chr5 9819805 9820040 + 1 NA intron (NR_027112, intron 4 of 12) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -34455 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 148.333-243 chr3 21632506 21632773 + 1 NA intron (NM_024697, intron 2 of 7) intron (NM_024697, intron 2 of 7) 89850 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 159.333-73 chr12 95878500 95878692 + 1 NA intron (NM_182496, intron 12 of 15) intron (NM_182496, intron 12 of 15) 19644 NM_003095 6636 Hs.105465 NM_003095 ENSG00000139343 SNRPF SMF|Sm-F|snRNP-F small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F protein-coding 206.667-86 chr3 59486926 59487171 + 1 NA Intergenic Intergenic 171449 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 135.333-161 chr6 99659460 99659661 + 1 NA Intergenic Intergenic 52786 NM_021620 59336 Hs.287386 NM_021620 ENSG00000112238 PRDM13 MU-MB-20.220|PFM10 PR/SET domain 13 protein-coding 212.333-22 chr10 112674325 112674741 + 1 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) 40363 NR_036177 100422909 NR_036177 ENSG00000264763 MIR4295 - microRNA 4295 ncRNA 148.333-33 chr1 241235024 241235182 + 1 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) intron (NM_001282778, intron 2 of 16) 102831 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 217.333-57 chr18 2063621 2063954 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 507718 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 153.667-147 chr16 53245771 53246077 + 1 NA intron (NM_001352157, intron 14 of 37) intron (NM_001352157, intron 14 of 37) 37473 NM_001352158 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 178.333-81 chr2 105030365 105030603 + 1 NA intron (NR_110603, intron 1 of 2) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -7585 NM_182640 64965 Hs.590900 NM_182640 ENSG00000135972 MRPS9 MRP-S9|RPMS9|S9mt mitochondrial ribosomal protein S9 protein-coding 259.333-64 chr22 22726338 22726635 + 1 NA Intergenic Intergenic 80174 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 208.333-94 chr3 29518507 29518821 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) intron (NM_001003792, intron 3 of 13) 237352 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 157.667-99 chr14 52998533 52998729 + 1 NA Intergenic Intergenic -47534 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 152.333-68 chr11 106937508 106937763 + 1 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) intron (NM_001256424, intron 4 of 8) 80841 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 148.667-323 chr5 142702006 142702233 + 1 NA Intergenic Intergenic -4049 NM_001257205 2246 Hs.483635 NM_000800 ENSG00000113578 FGF1 AFGF|ECGF|ECGF-beta|ECGFA|ECGFB|FGF-1|FGF-alpha|FGFA|GLIO703|HBGF-1|HBGF1 fibroblast growth factor 1 protein-coding 236.667-25 chr14 61517776 61518141 + 1 NA intron (NM_006255, intron 10 of 13) intron (NM_006255, intron 10 of 13) 52236 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 119.667-74 chr17 59412855 59413021 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 46855 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 254.333-31 chr18 3391966 3392270 + 1 NA Intergenic Intergenic -19809 NM_174886 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 171.667-2 chr1 41268614 41268845 + 1 NA Intergenic Intergenic -26423 NM_001172218 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 275.667-25 chr17 51584605 51584967 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 149359 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 159.667-212 chr3 61124666 61124838 + 1 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 126700 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 288.667-12 chr15 87371003 87371406 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -205725 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 122.667-145 chr4 171220584 171220829 + 1 NA Intergenic Intergenic 34522 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 154.333-325 chr7 53917039 53917223 + 1 NA Intergenic Intergenic -105200 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 157.333-325 chr7 81636147 81636451 + 1 NA intron (NR_126025, intron 1 of 10) L1MEg|LINE|L1 -10083 NR_126026 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 198.333-136 chr3 188456606 188456964 + 1 NA intron (NM_001167672, intron 2 of 9) intron (NM_001167672, intron 2 of 9) 111881 NR_046623 100873917 Hs.674993 NR_046623 ENSG00000224563 LPP-AS1 - LPP antisense RNA 1 ncRNA 166.333-45 chr11 45156218 45156444 + 1 NA intron (NM_001256695, intron 1 of 7) intron (NM_001256695, intron 1 of 7) 8988 NM_001256696 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 147.667-17 chr1 171267557 171267709 + 1 NA exon (NM_001282693, exon 3 of 9) exon (NM_001282693, exon 3 of 9) 9710 NM_001282692 2326 Hs.1424 NM_002021 ENSG00000010932 FMO1 - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 1 protein-coding 232.667-35 chr2 38694285 38694595 + 1 NA intron (NM_138801, intron 4 of 6) intron (NM_138801, intron 4 of 6) 28326 NM_138801 130589 Hs.435012 NM_138801 ENSG00000143891 GALM BLOCK25|GLAT|HEL-S-63p|IBD1 galactose mutarotase protein-coding 187.333-151 chr5 28580885 28581214 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -293384 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 126.333-48 chr14 60585100 60585362 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -53985 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 195.333-227 chr9 97723849 97724140 + 1 NA intron (NR_147055, intron 6 of 10) intron (NR_147055, intron 6 of 10) -26585 NR_149091 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 149.333-312 chr5 95448718 95448919 + 1 NA intron (NM_152548, intron 9 of 9) intron (NM_152548, intron 9 of 9) 57452 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 230.333-64 chr2 134527818 134528092 + 1 NA intron (NM_030923, intron 4 of 7) intron (NM_030923, intron 4 of 7) 191045 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 219.333-24 chr10 48326551 48326974 + 1 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) L1MC3|LINE|L1 20085 NM_001323320 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 158.667-187 chr20 54944000 54944223 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 468518 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 143.667-268 chr9 99205839 99205991 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 16027 NM_033087 85365 Hs.40919 NM_033087 ENSG00000119523 ALG2 CDG1I|CDGIi|CMS14|CMSTA3|NET38|hALPG2 ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferase protein-coding 146.333-115 chr16 12053744 12053917 + 1 NA intron (NM_032167, intron 8 of 20) MIRb|SINE|MIR 77096 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 212.667-142 chr8 137489050 137489345 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -75609 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 191.333-130 chr3 16596609 16596880 + 1 NA intron (NM_001351, intron 6 of 10) intron (NM_001351, intron 6 of 10) 8046 NM_001190811 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 189.667-110 chr4 150813574 150813900 + 1 NA intron (NM_001367550, intron 31 of 56) intron (NM_001367550, intron 31 of 56) 201530 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 138.333-42 chr11 83565822 83566038 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) intron (NM_001142699, intron 19 of 27) 116495 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 467.667 chr12 5447289 5448147 + 1 NA intron (NM_001102654, intron 1 of 1) intron (NM_001102654, intron 1 of 1) 15610 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 187.667-2 chr1 59811976 59812277 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -2823 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 124.667-185 chr7 34716399 34716610 + 1 NA intron (NM_001300934, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR 41768 NR_033664 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 138.667-170 chr5 117763574 117763766 + 1 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) intron (NR_104997, intron 1 of 2) 33309 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 155.667-3 chr1 14214457 14214639 + 1 NA Intergenic Intergenic 205425 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 306.667-30 chr20 46903066 46903544 + 1 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) intron (NM_172110, intron 1 of 13) 8462 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 155.333-162 chr2 61428369 61428670 + 1 NA intron (NM_014709, intron 1 of 79) L1MC5|LINE|L1 -11142 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 153.333-400 chr8 52363385 52363603 + 1 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) intron (NR_148195, intron 2 of 3) 46262 NM_001352884 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 244.333-43 chr15 60445694 60446060 + 1 NA intron (NR_147171, intron 11 of 16) intron (NR_147171, intron 11 of 16) 33265 NM_024611 79664 Hs.200943 NM_024611 ENSG00000128915 ICE2 BRCC1|NARG2 interactor of little elongation complex ELL subunit 2 protein-coding 206.333-90 chr2 143426227 143426577 + 1 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 296983 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 279.333-28 chr14 32259362 32259920 + 1 NA Intergenic Intergenic -56372 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 129.667-114 chr3 15289414 15289633 + 1 NA intron (NM_001018009, intron 3 of 8) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 35339 NR_046084 100505696 Hs.745026 NR_046084 ENSG00000224660 SH3BP5-AS1 - SH3BP5 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-261 chr5 32786061 32786338 + 1 NA intron (NM_001364460, intron 6 of 6) intron (NM_001364460, intron 6 of 6) 74878 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 147.333-47 chr10 70010012 70010251 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -42715 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 128.667-135 chr4 115319449 115319604 + 1 NA Intergenic Intergenic -205906 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 263.333-69 chr5 31334774 31335193 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 141297 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 140.333-43 chr11 110800029 110800179 + 1 NA Intergenic Intergenic -86915 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 162.333-30 chr10 60097831 60098142 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 29 of 43) MIRb|SINE|MIR 43030 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 200.333-168 chr9 70904934 70905244 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -36037 NM_206948 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 240.667-5 chr1 188552709 188553058 + 1 NA Intergenic Intergenic 1109255 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 273.667-32 chr2 99549066 99549437 + 1 NA 3' UTR (NM_002285, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_002285, exon 24 of 24) -59234 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 147.333-271 chr6 22507616 22507791 + 1 NA Intergenic Intergenic -61863 NM_138574 154150 Hs.629246 NM_138574 ENSG00000112273 HDGFL1 HRP-1|Hdgfrp1|PWWP1|dJ309H15.1 HDGF like 1 protein-coding 157.667-307 chr7 52601633 52601800 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -433917 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 139.667-82 chr2 51573417 51573661 + 1 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 540938 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 154.333-59 chr11 46025780 46026108 + 1 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) L1MC4|LINE|L1 94875 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 115.333-44 chr12 13018349 13018496 + 1 NA intron (NR_149067, intron 2 of 2) intron (NR_149067, intron 2 of 2) 17980 NR_002774 93164 Hs.593282 NR_002774 ENSG00000183935 HTR7P1 HTR7P 5-hydroxytryptamine receptor 7 pseudogene 1 pseudo 174.667-89 chr2 103119147 103119366 + 1 NA Intergenic Intergenic -134827 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 184.667-62 chr2 121832622 121832871 + 1 NA Intergenic Intergenic 77095 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 144.333-239 chr6 136361638 136361983 + 1 NA intron (NM_001198611, intron 10 of 16) intron (NM_001198611, intron 10 of 16) -71959 NM_001077440 9774 Hs.486542 NM_014739 ENSG00000029363 BCLAF1 BTF|bK211L9.1 BCL2 associated transcription factor 1 protein-coding 344.333-25 chr7 107914476 107914859 + 1 NA intron (NM_001289752, intron 7 of 12) intron (NM_001289752, intron 7 of 12) 23484 NM_000108 1738 Hs.131711 NM_000108 ENSG00000091140 DLD DLDD|DLDH|E3|GCSL|LAD|PHE3 dihydrolipoamide dehydrogenase protein-coding 306.333-20 chr17 42955052 42955416 + 1 NA intron (NM_001136042, intron 12 of 16) intron (NM_001136042, intron 12 of 16) 9220 NM_001261434 80755 Hs.317403 NM_001261434 ENSG00000266967 AARSD1 - alanyl-tRNA synthetase domain containing 1 protein-coding 372.667-16 chr3 168586788 168587488 + 1 NA intron (NR_021485, intron 4 of 15) L1MA8|LINE|L1 35284 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 135.667-148 chr5 135819143 135819373 + 1 NA intron (NM_001349335, intron 4 of 10) L1MEf|LINE|L1 -2500 NM_001365196 107986453 NM_001365196 LOC107986453 - uncharacterized LOC107986453 protein-coding 156.333-190 chr2 126812977 126813188 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -85808 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 238.333-34 chr17 65585533 65585819 + 1 NA Intergenic Intergenic -24028 NM_001363813 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 145.333-156 chr20 6945311 6945608 + 1 NA Intergenic Intergenic 177773 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 168.667-192 chr6 164758513 164758711 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 63451 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 169.333-231 chr6 91954850 91955102 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -264548 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 154.667-9 chr1 75158155 75158385 + 1 NA intron (NM_001001933, intron 9 of 9) L1ME3A|LINE|L1 23882 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 148.667-43 chr10 51292869 51293123 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) L2b|LINE|L2 -6577 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 233.667-13 chr12 30859220 30859558 + 1 NA Intergenic Intergenic 63708 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 145.667-112 chr17 52167444 52167647 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -7528 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 172.667-132 chr6 25082287 25082558 + 1 NA intron (NR_002174, intron 12 of 12) intron (NR_002174, intron 12 of 12) -40134 NM_001286446 9750 Hs.559459 NM_014722 ENSG00000111913 RIPOR2 C6orf32|DFNB104|DIFF40|DIFF48|FAM65B|MYONAP|PL48 RHO family interacting cell polarization regulator 2 protein-coding 224.333-79 chr3 61973038 61973411 + 1 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 345723 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 180.667-128 chr6 134004829 134005046 + 1 NA intron (NM_145176, intron 3 of 4) L1MC5|LINE|L1 47687 NM_145176 154091 Hs.486508 NM_145176 ENSG00000146411 SLC2A12 GLUT12|GLUT8 solute carrier family 2 member 12 protein-coding 135.333-101 chr20 25086499 25086679 + 1 NA Intergenic Intergenic -4210 NM_001256272 30813 Hs.274264 NM_014588 ENSG00000100987 VSX1 CAASDS|KTCN|KTCN1|PPCD|PPCD1|PPD|RINX visual system homeobox 1 protein-coding 121.333-73 chr18 11251692 11251953 + 1 NA Intergenic Intergenic -103060 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 162.333-109 chr2 40590596 40590763 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -78244 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 195.667-64 chr19 30306581 30306862 + 1 NA Intergenic Intergenic -65663 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 193.667-9 chr1 105612618 105612851 + 1 NA intron (NR_125955, intron 1 of 3) intron (NR_125955, intron 1 of 3) 6201 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 135.333-147 chr5 108548996 108549153 + 1 NA Intergenic LTR62|LTR|ERVL -166976 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 204.333-157 chr5 57742876 57743298 + 1 NA Intergenic Intergenic 92427 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 148.333-156 chr16 77452239 77452392 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -17281 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 249.667-2 chr1 20236732 20237092 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -6183 NR_147205 105376827 Hs.559701 NR_147205 ENSG00000228105 LINC01757 - long intergenic non-protein coding RNA 1757 ncRNA 120.333-40 chr12 1285745 1285891 + 1 NA intron (NR_027948, intron 14 of 19) L1M5|LINE|L1 -214673 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 143.667-23 chr10 55938830 55939076 + 1 NA Intergenic Intergenic -311011 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 181.333-96 chr22 45051126 45051397 + 1 NA Intergenic Intergenic -41256 NM_138415 112885 Hs.254097 NM_138415 ENSG00000056487 PHF21B BHC80L|PHF4 PHD finger protein 21B protein-coding 248.333-74 chr4 157699099 157699641 + 1 NA Intergenic Intergenic 126880 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 282.333-28 chr19 39218093 39218441 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -14001 NM_001080468 342898 Hs.124123 NM_001080468 ENSG00000179751 SYCN INSSA1|SYL syncollin protein-coding 148.333-23 chr1 116876626 116876890 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -33158 NM_020440 5738 Hs.418093 NM_020440 ENSG00000134247 PTGFRN CD315|CD9P-1|EWI-F|FPRP|SMAP-6 prostaglandin F2 receptor inhibitor protein-coding 166.333-73 chr14 66780748 66780928 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) intron (NM_001024218, intron 3 of 21) 273431 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 296.333-34 chr5 75872373 75872802 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -155150 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 214.667-106 chr7 83541285 83541650 + 1 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 99964 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 204.667-87 chr21 20577302 20577633 + 1 NA Intergenic Intergenic 225641 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 183.667-142 chr8 116183725 116183973 + 1 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 141210 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 274.667-21 chr15 100622536 100622899 + 1 NA intron (NM_198243, intron 4 of 5) L1MA4A|LINE|L1 20128 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 165.333-185 chr4 56755922 56756163 + 1 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 65431 NR_073419 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 120.333-159 chr5 124773211 124773357 + 1 NA Intergenic Intergenic -28172 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 133.667-151 chr8 103772207 103772383 + 1 NA intron (NM_001348497, intron 3 of 22) L1ME2z|LINE|L1 -46925 NR_145711 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 120.333-200 chr9 36526899 36527115 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -45855 NR_046337 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 255.667-78 chr7 26410632 26410938 + 1 NA intron (NR_148503, intron 2 of 6) intron (NR_148503, intron 2 of 6) -11367 NR_136272 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 242.333-58 chr20 52090843 52091204 + 1 NA intron (NM_199427, intron 7 of 8) AluJr|SINE|Alu 14461 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 156.667-216 chr22 25900654 25900928 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 29 of 43) intron (NM_001318245, intron 29 of 43) 158603 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 234.333-88 chr9 3478980 3479339 + 1 NA intron (NM_001282116, intron 1 of 16) L1M4|LINE|L1 10328 NM_001282117 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 275.667-40 chr3 171259631 171260014 + 1 NA intron (NM_001161563, intron 2 of 31) intron (NM_001161563, intron 2 of 31) -153063 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 157.667-148 chr2 115478659 115478990 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) L1MB3|LINE|L1 135009 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 149.333-401 chr8 95265117 95265294 + 1 NA intron (NM_001363260, intron 1 of 4) MER20|DNA|hAT-Charlie -3631 NR_038205 100616530 Hs.554328 NR_038201 ENSG00000253773 C8orf37-AS1 - C8orf37 antisense RNA 1 ncRNA 183.667-113 chr5 14554510 14554761 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -27157 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 160.667-31 chr10 33669265 33669436 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 103330 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 263.333-48 chr2 210959377 210959701 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 341968 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 214.667-128 chr9 93446948 93447307 + 1 NA non-coding (NR_136234, exon 4 of 4) non-coding (NR_136234, exon 4 of 4) 4481 NR_136237 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 181.667-151 chr8 125636315 125636528 + 1 NA Intergenic Intergenic 204212 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 162.667-66 chr13 19688918 19689156 + 1 NA intron (NR_044998, intron 6 of 7) intron (NR_044998, intron 6 of 7) 55378 NM_017520 54737 Hs.269654 NM_017520 ENSG00000196199 MPHOSPH8 HSMPP8|TWA3|mpp8 M-phase phosphoprotein 8 protein-coding 113.333-163 chr22 35290699 35290906 + 1 NA intron (NM_001003681, intron 9 of 10) intron (NM_001003681, intron 9 of 10) -8473 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 299.333-33 chr18 76639750 76640105 + 1 NA promoter-TSS (NR_110784) promoter-TSS (NR_110784) -916 NR_110784 101927651 Hs.569848 NR_110784 LINC01927 - long intergenic non-protein coding RNA 1927 ncRNA 150.333-378 chr7 28774372 28774540 + 1 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 88323 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 214.333-89 chr21 33721638 33721951 + 1 NA intron (NM_001001132, intron 3 of 29) AluSx1|SINE|Alu 79293 NM_001331011 6453 Hs.90221 NM_003024 ENSG00000205726 ITSN1 ITSN|SH3D1A|SH3P17 intersectin 1 protein-coding 153.333-196 chr2 60915886 60916156 + 1 NA intron (NM_002908, intron 4 of 10) intron (NM_002908, intron 4 of 10) 34447 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 214.333-159 chr8 129916432 129916755 + 1 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) intron (NM_001353256, intron 2 of 13) 23218 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 135.667-92 chr2 74782093 74782240 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -50489 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 123.667-172 chr7 78281666 78281823 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 9 of 20) L3|LINE|CR1 -65498 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 141.333-214 chr6 95612740 95612934 + 1 NA Intergenic Intergenic 35302 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 163.667-269 chrX 56834061 56834323 + 1 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -96608 NR_002308 442454 Hs.663220 NR_002308 UQCRBP1 - ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein pseudogene 1 pseudo 229.333-124 chr9 28160832 28161357 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 558211 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 191.667-128 chr8 120162408 120162678 + 1 NA exon (NM_021110, exon 4 of 48) exon (NM_021110, exon 4 of 48) 37441 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 142.667-183 chr5 149911898 149912081 + 1 NA intron (NM_000440, intron 6 of 21) intron (NM_000440, intron 6 of 21) 20988 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 167.333-206 chr5 37606093 37606306 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 226881 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 170.667-126 chr4 100293746 100294050 + 1 NA Intergenic Intergenic 101349 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 164.667-21 chr10 19775470 19775659 + 1 NA Intergenic Intergenic -40868 NM_032812 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 129.667-90 chr2 53501037 53501191 + 1 NA Intergenic Intergenic -266669 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 269.667-53 chr8 31241039 31241586 + 1 NA Intergenic Intergenic -207956 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 191.667-96 chr4 89420553 89420878 + 1 NA Intergenic Intergenic -112915 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 164.333-243 chr8 140582871 140583112 + 1 NA intron (NM_001164623, intron 2 of 17) Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR 52642 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 181.333-122 chr4 62415011 62415281 + 1 NA Intergenic Intergenic -253381 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 169.333-147 chr21 30489521 30489822 + 1 NA Intergenic Intergenic -2235 NM_181608 337969 Hs.553692 NM_181608 ENSG00000186965 KRTAP19-2 KAP19.2 keratin associated protein 19-2 protein-coding 153.667-172 chr2 20018327 20018615 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -5803 NM_002381 4148 Hs.656199 NM_002381 ENSG00000132031 MATN3 DIPOA|EDM5|HOA|OADIP|OS2 matrilin 3 protein-coding 247.333-11 chr10 92152356 92152725 + 1 NA intron (NM_001178137, intron 4 of 9) L1MC5a|LINE|L1 90739 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 149.667-278 chr4 42027507 42027660 + 1 NA intron (NM_006345, intron 6 of 17) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 37053 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 185.667-94 chr3 148000748 148000996 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -77287 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 194.667-12 chr1 178858797 178859030 + 1 NA intron (NM_004673, intron 3 of 5) intron (NM_004673, intron 3 of 5) 12164 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 238.667-56 chr3 105634734 105635096 + 1 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 232676 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 188.667-70 chr2 55878191 55878538 + 1 NA intron (NM_001039349, intron 5 of 10) MIRc|SINE|MIR 45418 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 161.333-46 chr10 123314864 123315132 + 1 NA Intergenic Intergenic 160596 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 161.333-278 chr8 37678470 37678780 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -17157 NM_025069 80139 Hs.288042 NM_025069 ENSG00000183779 ZNF703 NLZ1|ZEPPO1|ZNF503L|ZPO1 zinc finger protein 703 protein-coding 164.333-77 chr15 65906576 65906773 + 1 NA intron (NM_032445, intron 20 of 22) intron (NM_032445, intron 20 of 22) 37183 NM_004663 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 198.667-93 chr19 46614300 46614618 + 1 NA Intergenic Intergenic 10630 NM_000960 5739 Hs.458324 NM_000960 ENSG00000160013 PTGIR IP|PRIPR prostaglandin I2 receptor protein-coding 194.333-22 chr10 72646735 72647052 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -20702 NM_001363513 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 136.667-103 chr2 202666047 202666230 + 1 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) intron (NM_173511, intron 1 of 7) 31169 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 165.667-103 chr20 8255509 8255774 + 1 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) 6937 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 146.667-235 chr4 74390980 74391180 + 1 NA Intergenic Intergenic 25935 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 185.333-80 chr2 24418002 24418259 + 1 NA Intergenic Intergenic -57594 NM_001348182 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 145.333-177 chr3 12634487 12634654 + 1 NA intron (NM_001354691, intron 1 of 16) HAL1|LINE|L1 28938 NM_001354690 5894 Hs.159130 NM_002880 ENSG00000132155 RAF1 CMD1NN|CRAF|NS5|Raf-1|c-Raf Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 195.667-158 chrX 37878751 37879161 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -31385 NM_006520 6990 Hs.446392 NM_006520 ENSG00000165169 DYNLT3 RP3|TCTE1L|TCTEX1L dynein light chain Tctex-type 3 protein-coding 157.333-126 chr15 77236741 77237004 + 1 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -11468 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 153.667-319 chr5 83202276 83202444 + 1 NA intron (NM_001318012, intron 4 of 7) L2b|LINE|L2 124813 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 281.333-71 chr8 119700409 119700690 + 1 NA Intergenic Intergenic -27159 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 331.667-19 chr7 64805292 64805784 + 1 NA intron (NM_001367573, intron 2 of 3) intron (NM_001367573, intron 2 of 3) 11110 NM_001271639 7697 Hs.184080 NM_006524 ENSG00000197008 ZNF138 pHZ-32 zinc finger protein 138 protein-coding 211.333-74 chr16 9233955 9234286 + 1 NA Intergenic Intergenic -121468 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 143.333-35 chr10 56032285 56032483 + 1 NA Intergenic Intergenic 328875 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 129.667-58 chr14 64466296 64466539 + 1 NA intron (NM_004857, intron 1 of 1) intron (NM_004857, intron 1 of 1) 918 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 161.667-187 chr4 48552767 48553043 + 1 NA intron (NM_015030, intron 36 of 63) intron (NM_015030, intron 36 of 63) 62653 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 129.667-163 chr7 93006319 93006468 + 1 NA Intergenic Intergenic 111586 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 147.667-183 chr2 114381190 114381481 + 1 NA Intergenic Intergenic -61306 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 155.667-360 chr8 99570741 99570999 + 1 NA intron (NM_017890, intron 31 of 61) L1MEd|LINE|L1 -34009 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 168.333-89 chr2 23362020 23362224 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -23057 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 153.333-410 chr8 83185768 83185930 + 1 NA Intergenic Intergenic -217909 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 158.333-122 chr18 8894064 8894294 + 1 NA Intergenic Intergenic 176798 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 146.667-329 chr8 74639830 74640032 + 1 NA intron (NR_033830, intron 2 of 5) intron (NR_033830, intron 2 of 5) 40065 NR_033830 441355 Hs.647162 NR_033830 ENSG00000254349 MIR2052HG - MIR2052 host gene ncRNA 149.667-32 chr1 158967482 158967724 + 1 NA intron (NM_198929, intron 7 of 7) L1PA15|LINE|L1 -32373 NM_001364867 3428 Hs.380250 NM_005531 ENSG00000163565 IFI16 IFNGIP1|PYHIN2 interferon gamma inducible protein 16 protein-coding 153.667-327 chr5 143714249 143714517 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 34523 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 140.333-99 chr2 22581244 22581401 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 44843 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 136.333-172 chr5 105844515 105844774 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 745170 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 155.667-127 chr17 11766490 11766650 + 1 NA intron (NM_001372, intron 36 of 68) intron (NM_001372, intron 36 of 68) -116332 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 147.333-324 chr8 129042563 129042774 + 1 NA Intergenic Intergenic -76667 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 129.333-123 chr3 43707815 43708014 + 1 NA intron (NR_158560, intron 3 of 5) AluSz6|SINE|Alu -16320 NM_001346468 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 371.333-11 chr14 69185442 69186014 + 1 NA Intergenic Intergenic -5749 NR_034164 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 302.333-33 chr7 98605015 98605436 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -12060 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 127.333-6 chr1 85234772 85234911 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 24821 NR_024113 148423 Hs.26226 NM_198077 ENSG00000162642 C1orf52 gm117 chromosome 1 open reading frame 52 protein-coding 233.333-57 chr2 28475669 28476176 + 1 NA Intergenic Intergenic -20138 NM_153021 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 190.667-6 chr1 48858588 48858855 + 1 NA intron (NR_136623, intron 5 of 12) L1MB7|LINE|L1 -81752 NM_001302082 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 158.667-17 chr1 115032963 115033200 + 1 NA promoter-TSS (NM_001277991) promoter-TSS (NM_001277991) -865 NM_001277991 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 135.667-175 chr7 102120277 102120497 + 1 NA intron (NM_001913, intron 8 of 22) intron (NM_001913, intron 8 of 22) -164754 NM_020979 10603 Hs.489448 NM_020979 ENSG00000160999 SH2B2 APS SH2B adaptor protein 2 protein-coding 122.333-155 chr4 43257686 43257849 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 234776 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 219.667-98 chr9 136684807 136685256 + 1 NA intron (NM_006412, intron 1 of 5) intron (NM_006412, intron 1 of 5) 2426 NM_006412 10555 Hs.320151 NM_006412 ENSG00000169692 AGPAT2 1-AGPAT2|BSCL|BSCL1|LPAAB|LPAAT-beta 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 2 protein-coding 144.333-195 chr4 106103160 106103380 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 25 of 26) intron (NM_001290768, intron 25 of 26) -80792 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 157.333-92 chr12 100682159 100682432 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 88677 NM_001303131 283431 Hs.20575 NM_174942 ENSG00000139354 GAS2L3 G2L3 growth arrest specific 2 like 3 protein-coding 211.667-12 chr1 214301432 214301803 + 1 NA intron (NM_020197, intron 1 of 11) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 20458 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 160.667-37 chr10 65861650 65861827 + 1 NA Intergenic Intergenic 290313 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 149.667-138 chr15 58376357 58376645 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -55490 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 152.667-365 chr8 68656071 68656357 + 1 NA intron (NR_146187, intron 8 of 13) intron (NR_146187, intron 8 of 13) -324723 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 266.333-33 chr20 49201864 49202266 + 1 NA intron (NM_001319135, intron 1 of 14) AluY|SINE|Alu -13695 NM_001322927 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 143.333-75 chr13 38163902 38164073 + 1 NA Intergenic Intergenic -20755 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 163.333-73 chr13 38794243 38794442 + 1 NA intron (NM_207361, intron 6 of 23) intron (NM_207361, intron 6 of 23) 33249 NR_146963 100874073 Hs.253994 NR_146963 FREM2-AS1 - FREM2 antisense RNA 1 ncRNA 187.333-119 chr22 26669922 26670297 + 1 NA non-coding (NR_003491, exon 5 of 5) non-coding (NR_003491, exon 5 of 5) -2734 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 156.667-207 chr20 40894400 40894690 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -86168 NR_145524 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 153.333-349 chr6 24118242 24118551 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7819 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 239.333-69 chr3 49352642 49352984 + 1 NA Intergenic Intergenic 5540 NM_001329502 2876 Hs.76686 NM_000581 ENSG00000233276 GPX1 GPXD|GSHPX1 glutathione peroxidase 1 protein-coding 128.667-15 chr1 211306812 211306981 + 1 NA intron (NM_001136224, intron 10 of 10) intron (NM_001136224, intron 10 of 10) -19719 NM_004619 7188 Hs.523930 NM_004619 ENSG00000082512 TRAF5 MGC:39780|RNF84 TNF receptor associated factor 5 protein-coding 133.333-184 chr8 105315955 105316241 + 1 NA Intergenic Intergenic -2340 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 181.333-128 chr4 156686474 156686770 + 1 NA Intergenic Intergenic 285177 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 220.333-126 chr7 116659720 116660035 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -12319 NM_001127500 4233 Hs.132966 NM_000245 ENSG00000105976 MET AUTS9|DFNB97|HGFR|RCCP2|c-Met MET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 177.667-102 chr4 117321443 117321677 + 1 NA intron (NR_147151, intron 3 of 6) L1PB1|LINE|L1 39079 NR_147151 105377389 Hs.129401 NR_147151 ENSG00000224932 LINC02262 - long intergenic non-protein coding RNA 2262 ncRNA 196.333-173 chr9 91109726 91110152 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -9123 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 150.333-89 chr12 104980219 104980381 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -6016 NM_152318 121053 Hs.295563 NM_152318 ENSG00000151131 C12orf45 - chromosome 12 open reading frame 45 protein-coding 159.333-210 chr3 74895862 74896058 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -318516 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 235.333-128 chr8 139463462 139463837 + 1 NA Intergenic Intergenic 239474 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 170.333-125 chr20 2621901 2622253 + 1 NA intron (NM_080751, intron 16 of 19) Cheshire|DNA|hAT-Charlie -30555 NR_027700 10528 Hs.376064 NM_006392 ENSG00000101361 NOP56 NOL5A|SCA36 NOP56 ribonucleoprotein protein-coding 136.667-130 chr4 95522192 95522411 + 1 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 26672 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 150.333-169 chr18 4723624 4723880 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -268445 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 160.667-68 chr12 27377978 27378203 + 1 NA intron (NM_020183, intron 4 of 16) MamRep488|DNA|hAT-Tip100 45254 NM_001248002 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 154.333-174 chr2 200752764 200753037 + 1 NA intron (NR_135012, intron 14 of 30) intron (NR_135012, intron 14 of 30) -17723 NR_037886 100507140 Hs.382116 NR_037886 ENSG00000237166 LINC01792 - long intergenic non-protein coding RNA 1792 ncRNA 162.333-4 chr1 46051056 46051315 + 1 NA intron (NM_001303429, intron 6 of 8) L1MB8|LINE|L1 79488 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 231.333-96 chr5 144095328 144095847 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 75072 NM_001271732 81555 Hs.372050 NM_030799 ENSG00000145817 YIPF5 FinGER5|SB140|SMAP-5|SMAP5|YIP1A Yip1 domain family member 5 protein-coding 193.333-51 chr13 111203184 111203518 + 1 NA intron (NM_001320853, intron 1 of 19) intron (NM_001320853, intron 1 of 19) 291 NM_001320853 8874 Hs.508738 NM_003899 ENSG00000102606 ARHGEF7 BETA-PIX|COOL-1|COOL1|Nbla10314|P50|P50BP|P85|P85COOL1|P85SPR|PAK3|PIXB Rho guanine nucleotide exchange factor 7 protein-coding 187.333-125 chr3 45445373 45445726 + 1 NA intron (NM_001368263, intron 5 of 20) intron (NM_001368263, intron 5 of 20) 56973 NM_001368263 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 156.333-6 chr1 43515172 43515330 + 1 NA Intergenic Intergenic -10786 NM_001329138 5792 Hs.272062 NM_002840 ENSG00000142949 PTPRF BNAH2|LAR protein tyrosine phosphatase receptor type F protein-coding 158.667-117 chr16 77172385 77172553 + 1 NA Intergenic Intergenic -18721 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 248.667-82 chr4 87015774 87016125 + 1 NA intron (NM_001313960, intron 1 of 17) AluSq2|SINE|Alu 8948 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 154.333-154 chr2 80000353 80000606 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -133896 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 124.667-61 chr14 71660029 71660235 + 1 NA intron (NM_001354286, intron 10 of 24) intron (NM_001354286, intron 10 of 24) 73834 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 162.333-5 chr1 46107916 46108166 + 1 NA intron (NM_001303427, intron 1 of 9) intron (NM_001303427, intron 1 of 9) 22632 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 333.333-42 chr5 38209465 38209840 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -48907 NM_152403 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 279.667-8 chr12 55851379 55851796 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8651 NM_001272101 4327 Hs.591033 NM_002429 ENSG00000123342 MMP19 CODA|MMP18|RASI-1 matrix metallopeptidase 19 protein-coding 155.667-171 chr2 118265245 118265416 + 1 NA Intergenic Intergenic -78944 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 125.667-172 chr6 158327744 158327930 + 1 NA intron (NM_020245, intron 1 of 13) HAL1|LINE|L1 4855 NR_145798 109623462 NR_145798 SNORA116 - small nucleolar RNA, H/ACA box 116 snoRNA 119.667-114 chr3 59093065 59093224 + 1 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 -43112 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 178.333-47 chr13 92728043 92728284 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -6549 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 234.667-15 chr11 15031379 15031793 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -42007 NM_000728 797 Hs.534305 NM_000728 ENSG00000175868 CALCB CALC2|CGRP-II|CGRP2 calcitonin related polypeptide beta protein-coding 180.333-68 chr22 33998237 33998493 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -75477 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 252.333-37 chr2 166963528 166963915 + 1 NA intron (NM_152381, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 75234 NM_001079810 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 173.333-90 chr2 47320207 47320409 + 1 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu -15007 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 156.333-107 chr14 46310381 46310545 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -160896 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 165.667-5 chr1 86363233 86363453 + 1 NA intron (NM_001366779, intron 9 of 15) L2-1_AMi|LINE|L2 -5656 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 152.333-359 chr7 95057733 95058031 + 1 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 147984 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 167.333-280 chrX 64926817 64927060 + 1 NA intron (NM_001178032, intron 1 of 4) MER8|DNA|TcMar-Tigger 49512 NM_018684 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 218.333-25 chr11 77704897 77705372 + 1 NA intron (NM_016578, intron 5 of 15) intron (NM_016578, intron 5 of 15) -67328 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 190.667-155 chr8 131650769 131651189 + 1 NA Intergenic Intergenic -253114 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 158.333-208 chr3 109605252 109605464 + 1 NA Intergenic Intergenic 2530 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 347.333-33 chr9 115835758 115836202 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 89227 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 285.333-29 chr19 40198785 40199220 + 1 NA intron (NM_002446, intron 2 of 9) AluSx1|SINE|Alu 7576 NM_002446 4294 Hs.466743 NM_002446 ENSG00000130758 MAP3K10 MEKK10|MLK2|MST mitogen-activated protein kinase kinase kinase 10 protein-coding 349.333-8 chr11 75835190 75835642 + 1 NA intron (NM_003369, intron 1 of 14) MIRc|SINE|MIR 20206 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 137.333-54 chr15 96596700 96596953 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 184828 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 237.333-129 chr9 26928292 26928688 + 1 NA intron (NM_001321546, intron 2 of 12) intron (NM_001321546, intron 2 of 12) -18500 NM_001099223 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 151.333-71 chr11 12933725 12933905 + 1 NA intron (NM_021961, intron 12 of 12) MIRb|SINE|MIR 55733 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 165.333-190 chr4 83442717 83442908 + 1 NA intron (NM_001297757, intron 5 of 16) AluJr|SINE|Alu 13011 NM_133636 113510 Hs.480101 NM_133636 ENSG00000163312 HELQ HEL308 helicase, POLQ like protein-coding 247.667-81 chr5 112435260 112435670 + 1 NA Intergenic Intergenic 15882 NR_027706 54508 Hs.591264 NR_027706 ENSG00000278921 EPB41L4A-DT EPB41L4A-AS2 EPB41L4A divergent transcript ncRNA 195.333-26 chr10 18749870 18750157 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 90582 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 159.667-349 chrX 136674841 136675023 + 1 NA intron (NM_001306177, intron 18 of 20) intron (NM_001306177, intron 18 of 20) 26755 NM_000074 959 Hs.592244 NM_000074 ENSG00000102245 CD40LG CD154|CD40L|HIGM1|IGM|IMD3|T-BAM|TNFSF5|TRAP|gp39|hCD40L CD40 ligand protein-coding 200.333-118 chr5 43302177 43302422 + 1 NA intron (NM_002130, intron 1 of 9) intron (NM_002130, intron 1 of 9) 10882 NM_001330663 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 185.667-37 chr15 64177827 64178180 + 1 NA intron (NM_022048, intron 11 of 11) MER5B|DNA|hAT-Charlie -14848 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 146.667-137 chr17 63573208 63573393 + 1 NA intron (NR_073585, intron 1 of 7) U6|snRNA|snRNA 22823 NR_073585 10238 Hs.410596 NM_005828 ENSG00000136485 DCAF7 AN11|HAN11|SWAN-1|WDR68 DDB1 and CUL4 associated factor 7 protein-coding 219.667-31 chr17 51488192 51488477 + 1 NA Intergenic Intergenic 52907 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 129.333-196 chr8 144437449 144437627 + 1 NA intron (NM_013432, intron 13 of 25) AluSx3|SINE|Alu -1919 NR_106953 102466271 NR_106953 ENSG00000276598 MIR6893 hsa-mir-6893 microRNA 6893 ncRNA 227.333-36 chr14 56337218 56337502 + 1 NA Intergenic (ATATTAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -176971 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 349.667-10 chr18 499733 500229 + 1 NA intron (NM_130386, intron 1 of 9) CpG 720 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 155.667-301 chr6 40803909 40804094 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -216637 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 160.667-148 chr2 85950989 85951219 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X 61824 NR_110569 101928113 Hs.625888 NR_110569 ST3GAL5-AS1 - ST3GAL5 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 258.333-48 chr4 39022803 39023172 + 1 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) L1ME2|LINE|L1 9422 NM_024943 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 136.667-86 chr19 37868059 37868312 + 1 NA Intergenic LTR59|LTR|ERV1 -12989 NR_040015 100631378 Hs.726940 NR_040015 ENSG00000225868 LOC100631378 - uncharacterized 100631378 ncRNA 164.333-141 chr20 48172379 48172602 + 1 NA Intergenic Intergenic -182373 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 219.667-92 chr8 63258136 63258549 + 1 NA Intergenic Intergenic 89339 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 144.667-156 chr2 177638325 177638512 + 1 NA intron (NM_001077197, intron 20 of 20) L1MEc|LINE|L1 -19676 NM_152275 92104 Hs.128384 NM_152275 ENSG00000197557 TTC30A IFT70A|TTC30B tetratricopeptide repeat domain 30A protein-coding 131.333-154 chr6 61211975 61212124 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -362081 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 198.333-46 chr12 58560349 58560606 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -31225 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 149.667-429 chr9 115290517 115290721 + 1 NA intron (NR_163556, intron 2 of 7) intron (NR_163556, intron 2 of 7) 148801 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 147.667-42 chr10 64445876 64446051 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -379565 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 213.333-148 chr4 81006808 81007288 + 1 NA Intergenic Intergenic -23660 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 236.667-42 chr2 149645376 149645773 + 1 NA intron (NR_110240, intron 1 of 2) intron (NR_110240, intron 1 of 2) -57799 NM_015702 27249 Hs.5324 NM_015702 ENSG00000168288 MMADHC C2orf25|CL25022|cblD metabolism of cobalamin associated D protein-coding 164.333-94 chr17 67638079 67638292 + 1 NA intron (NM_181671, intron 6 of 9) intron (NM_181671, intron 6 of 9) -79648 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 178.667-150 chr7 7440876 7441148 + 1 NA intron (NM_001037763, intron 20 of 34) intron (NM_001037763, intron 20 of 34) 94861 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 163.333-32 chr10 42575710 42575895 + 1 NA intron (NR_130951, intron 3 of 3) AluSx|SINE|Alu -22932 NR_026777 100129482 Hs.278064 NR_026777 ENSG00000234420 ZNF37BP KOX21|ZNF37B zinc finger protein 37B, pseudogene pseudo 231.333-43 chr15 33556558 33556925 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 10 of 102) intron (NM_001243996, intron 10 of 102) 245774 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 146.667-349 chr9 29238558 29238704 + 1 NA Intergenic Intergenic -25030 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 202.667-82 chr2 153409973 153410271 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 68640 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 116.333-6 chr1 42626155 42626304 + 1 NA intron (NM_001080850, intron 11 of 16) L1MA4A|LINE|L1 -32194 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 162.333-73 chr14 64980800 64981143 + 1 NA intron (NM_001202559, intron 3 of 13) intron (NM_001202559, intron 3 of 13) -5924 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 149.667-116 chr14 50260482 50260671 + 1 NA intron (NM_024884, intron 9 of 9) L1MEd|LINE|L1 -28998 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 157.333-294 chr5 153221778 153222018 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -249549 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 187.667-5 chr1 83713050 83713252 + 1 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) intron (NR_119375, intron 2 of 2) 147395 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 157.333-258 chr4 60938060 60938341 + 1 NA Intergenic Intergenic 15581 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 143.667-34 chr11 12036070 12036368 + 1 NA intron (NR_135109, intron 1 of 1) L1PA15|LINE|L1 5344 NR_135109 105376554 Hs.523483 NR_135109 ENSG00000254486 LINC02547 - long intergenic non-protein coding RNA 2547 ncRNA 147.333-52 chr10 114275643 114275865 + 1 NA intron (NM_001272046, intron 6 of 13) AluSx1|SINE|Alu 36140 NM_001320804 340706 Hs.197741 NM_198496 ENSG00000165816 VWA2 AMACO|CCSP-2|CCSP2|NET42 von Willebrand factor A domain containing 2 protein-coding 119.333-140 chr20 41964243 41964498 + 1 NA Intergenic Intergenic -345993 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 145.667-210 chr5 55669742 55669915 + 1 NA exon (NM_173514, exon 5 of 16) exon (NM_173514, exon 5 of 16) 23225 NM_001258286 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 164.667-244 chr8 119074956 119075135 + 1 NA intron (NM_006438, intron 1 of 5) intron (NM_006438, intron 1 of 5) -6263 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 277.333-62 chr3 58953319 58953785 + 1 NA intron (NR_147234, intron 4 of 10) intron (NR_147234, intron 4 of 10) 96473 NM_001351532 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 148.667-186 chr2 63798396 63798626 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -42453 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 243.333-63 chr21 24288786 24289170 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 32399 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 164.667-181 chr5 17041230 17041472 + 1 NA Intergenic Intergenic -105063 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 162.667-139 chr2 126047489 126047721 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 70380 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 158.667-130 chr18 2593342 2593511 + 1 NA intron (NM_006101, intron 10 of 16) intron (NM_006101, intron 10 of 16) 21869 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 162.667-258 chr7 84754622 84754839 + 1 NA Intergenic Intergenic 222254 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 222.667-53 chr22 45270153 45270632 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -14557 NM_001167574 7380 Hs.632787 NM_006953 ENSG00000100373 UPK3A UP3A|UPIII|UPIIIA|UPK3 uroplakin 3A protein-coding 224.667-82 chr8 113049541 113049920 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 327422 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 202.667-135 chr7 43593403 43593722 + 1 NA intron (NM_004760, intron 1 of 6) L1PB4|LINE|L1 10454 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 246.333-39 chr16 79078840 79079258 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 521688 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 155.667-192 chr2 237868248 237868513 + 1 NA intron (NM_005855, intron 1 of 2) L1M5|LINE|L1 8757 NM_005855 10267 Hs.471783 NM_005855 ENSG00000132329 RAMP1 - receptor activity modifying protein 1 protein-coding 332.667-2 chr1 67693835 67694354 + 1 NA Intergenic Intergenic 8893 NM_001199741 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 161.333-295 chr8 136221141 136221352 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -309552 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 144.333-31 chr10 112200869 112201154 + 1 NA Intergenic Intergenic -17246 NM_020918 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 213.667-73 chr5 19693998 19694330 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 192108 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 220.333-92 chr3 123281004 123281275 + 1 NA Intergenic Intergenic 79196 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 156.667-358 chr9 78397024 78397245 + 1 NA Intergenic Intergenic 100009 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 198.667-191 chr9 10533797 10534276 + 1 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) intron (NM_002839, intron 2 of 45) 78966 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 154.333-273 chr5 114388873 114389068 + 1 NA intron (NM_001278204, intron 2 of 6) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 26651 NM_001278204 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 191.667-21 chr10 123014936 123015191 + 1 NA intron (NM_001609, intron 1 of 10) intron (NM_001609, intron 1 of 10) 6057 NM_001330174 36 Hs.81934 NM_001609 ENSG00000196177 ACADSB 2-MEBCAD|ACAD7|SBCAD acyl-CoA dehydrogenase short/branched chain protein-coding 157.333-95 chr12 118568817 118569052 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 192379 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 166.333-128 chr2 195460670 195460871 + 1 NA Intergenic Intergenic -196188 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 226.333-110 chr8 121078919 121079177 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -267002 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 264.667-77 chr7 7733954 7734553 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -15646 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 231.333-28 chr12 19544787 19545180 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 104384 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 221.667-34 chr15 71420830 71421145 + 1 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) AluSz|SINE|Alu -126249 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 253.667-9 chr10 44180283 44180845 + 1 NA Intergenic Intergenic -112186 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 120.667-115 chr3 88858849 88859016 + 1 NA Intergenic MER6B|DNA|TcMar-Tigger -248689 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 191.333-203 chr8 92362935 92363224 + 1 NA Intergenic Intergenic -259694 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 153.333-124 chr14 66924280 66924495 + 1 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) intron (NM_020806, intron 8 of 22) -265053 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 283.333-71 chr7 44693653 44693978 + 1 NA intron (NM_002541, intron 10 of 22) intron (NM_002541, intron 10 of 22) -54751 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 168.667-128 chr21 30014447 30014654 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -74498 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 222.667-97 chr8 121589056 121589435 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -50101 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 240.667-27 chr15 75584322 75584722 + 1 NA Intergenic Intergenic -5207 NM_002833 5780 Hs.445775 NM_002833 ENSG00000169410 PTPN9 MEG2|PTPMEG2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 9 protein-coding 215.667-29 chr12 63099349 63099728 + 1 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 53272 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 145.667-148 chr2 142313605 142313882 + 1 NA Intergenic Intergenic -182042 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 240.667-30 chr16 59939352 59939741 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) L1MC3|LINE|L1 84193 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 226.333-20 chr12 3368673 3369002 + 1 NA intron (NR_146865, intron 2 of 2) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 729 NR_146865 101930162 Hs.351489 NR_146865 LINC02417 - long intergenic non-protein coding RNA 2417 ncRNA 302.667-4 chr11 64238987 64239395 + 1 NA TTS (NM_001243733) TTS (NM_001243733) -1904 NM_001370367 2286 Hs.227729 NM_004470 ENSG00000173486 FKBP2 FKBP-13|FKBP13|PPIase FKBP prolyl isomerase 2 protein-coding 153.333-291 chr4 32582613 32582776 + 1 NA Intergenic Intergenic 231656 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 131.667-165 chr5 113971315 113971540 + 1 NA Intergenic Intergenic -390643 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 158.333-284 chr6 149084231 149084413 + 1 NA Intergenic Intergenic -51661 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 151.667-142 chr17 26867843 26868056 + 1 NA Intergenic (GAATG)n|Satellite|Satellite 221292 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 280.667-5 chr1 86667738 86668401 + 1 NA intron (NR_135837, intron 4 of 4) L1MA3|LINE|L1 33793 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 142.333-265 chr9 116768970 116769193 + 1 NA intron (NM_014010, intron 12 of 21) intron (NM_014010, intron 12 of 21) 81776 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 122.333-157 chr4 96103978 96104119 + 1 NA Intergenic Intergenic -206655 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 194.667-64 chr2 68998773 68999092 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -14212 NM_053034 84168 Hs.165859 NM_018153 ENSG00000169604 ANTXR1 ATR|GAPO|TEM8 ANTXR cell adhesion molecule 1 protein-coding 158.667-59 chr11 58586171 58586414 + 1 NA intron (NM_001197051, intron 2 of 10) intron (NM_001197051, intron 2 of 10) 7178 NR_024091 386607 Hs.524920 NM_170768 ZFP91-CNTF ZFP91|ZNF757|Zfp-91 ZFP91-CNTF readthrough (NMD candidate) ncRNA 155.667-29 chr1 213440295 213440482 + 1 NA Intergenic Intergenic 389147 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 245.667-73 chr8 88890003 88890346 + 1 NA Intergenic Intergenic -562691 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 250.333-70 chr7 45892260 45892724 + 1 NA intron (NM_000596, intron 3 of 3) intron (NM_000596, intron 3 of 3) 4004 NM_000596 3484 Hs.642938 NM_000596 ENSG00000146678 IGFBP1 AFBP|IBP1|IGF-BP25|PP12|hIGFBP-1 insulin like growth factor binding protein 1 protein-coding 164.333-48 chr12 16822258 16822581 + 1 NA Intergenic Intergenic -166328 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 170.667-81 chr2 53828465 53828737 + 1 NA intron (NM_001164165, intron 1 of 9) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 20604 NR_037453 100500850 NR_037453 ENSG00000265452 MIR3682 mir-3682 microRNA 3682 ncRNA 255.333-77 chr4 119232528 119232987 + 1 NA intron (NM_001371399, intron 2 of 16) L1MD|LINE|L1 20044 NM_001371396 149.667-83 chr12 4267594 4267822 + 1 NA intron (NR_149145, intron 1 of 3) intron (NR_149145, intron 1 of 3) -6054 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 198.333-175 chr6 57188889 57189244 + 1 NA non-coding (NR_103822, exon 4 of 4) non-coding (NR_103822, exon 4 of 4) 16740 NM_004282 9532 Hs.745046 NM_004282 ENSG00000112208 BAG2 BAG-2|dJ417I1.2 BCL2 associated athanogene 2 protein-coding 120.333-37 chr11 93396718 93396909 + 1 NA intron (NM_181645, intron 11 of 13) L2c|LINE|L2 66096 NM_181645 159989 Hs.436625 NM_181645 ENSG00000165325 DEUP1 CCDC67 deuterosome assembly protein 1 protein-coding 160.333-164 chr20 32955563 32955752 + 1 NA intron (NM_001143967, intron 23 of 26) intron (NM_001143967, intron 23 of 26) 48776 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 141.667-108 chr19 54013925 54014101 + 1 NA Intergenic Intergenic 21725 NM_145814 59285 Hs.631560 NM_031897 ENSG00000130433 CACNG6 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 6 protein-coding 172.333-124 chr4 73741891 73742114 + 1 NA exon (NM_001354840, exon 3 of 3) exon (NM_001354840, exon 3 of 3) 1433 NM_001354840 3576 Hs.624 NM_000584 ENSG00000169429 CXCL8 GCP-1|GCP1|IL8|LECT|LUCT|LYNAP|MDNCF|MONAP|NAF|NAP-1|NAP1 C-X-C motif chemokine ligand 8 protein-coding 138.667-63 chr14 75846227 75846433 + 1 NA intron (NM_015072, intron 28 of 31) intron (NM_015072, intron 28 of 31) 135665 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 195.667-9 chr10 60868417 60868705 + 1 NA TTS (NM_001350908) TTS (NM_001350908) 75624 NM_001350910 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 190.333-14 chr10 14673221 14673516 + 1 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) L1MA5|LINE|L1 -68967 NM_001282697 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 283.333-44 chr21 32061628 32062011 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 24476 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 181.333-189 chr9 28823110 28823433 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 40435 NR_030597 100126310 NR_030597 ENSG00000215966 MIR876 MIRN876|hsa-mir-876|mir-876 microRNA 876 ncRNA 182.667-66 chr18 32199416 32199609 + 1 NA intron (NM_005925, intron 5 of 14) intron (NM_005925, intron 5 of 14) 9473 NM_001308171 4225 Hs.194777 NM_005925 ENSG00000141434 MEP1B - meprin A subunit beta protein-coding 157.333-159 chr17 73624307 73624515 + 1 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) AluSz6|SINE|Alu 20034 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 146.333-110 chr15 70876964 70877239 + 1 NA intron (NM_001284357, intron 2 of 16) intron (NM_001284357, intron 2 of 16) 15332 NM_020147 56906 Hs.591123 NM_020147 ENSG00000129028 THAP10 - THAP domain containing 10 protein-coding 244.667-14 chr10 43134631 43135103 + 1 NA Intergenic Intergenic -3578 NR_135077 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 197.667-41 chr14 70589549 70589825 + 1 NA intron (NM_001284210, intron 5 of 6) intron (NM_001284210, intron 5 of 6) 11003 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 180.333-48 chr18 9972443 9972741 + 1 NA Intergenic Intergenic 58576 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 197.333-11 chr1 183893090 183893299 + 1 NA intron (NM_001297669, intron 10 of 18) L2c|LINE|L2 88074 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 283.333-10 chr11 124727942 124728497 + 1 NA Intergenic Intergenic -11723 NM_006176 4900 Hs.524116 NM_006176 ENSG00000154146 NRGN RC3|hng neurogranin protein-coding 268.333-42 chr4 56431752 56432216 + 1 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) intron (NR_156493, intron 1 of 10) 3631 NR_156493 5471 Hs.331420 NM_002703 ENSG00000128059 PPAT ATASE|GPAT|PRAT phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase protein-coding 199.333-271 chr8 55261864 55262233 + 1 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 160020 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 172.667-154 chr7 110019235 110019452 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -59130 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 152.333-413 chrX 85854656 85854832 + 1 NA Intergenic Intergenic 18964 NR_031710 100302171 NR_031710 ENSG00000283435 MIR1321 MIRN1321|hsa-mir-1321 microRNA 1321 ncRNA 144.333-287 chr9 102037627 102037905 + 1 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy -299186 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 149.667-305 chr5 25038523 25038768 + 1 NA Intergenic Intergenic 152011 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 117.667-65 chr16 77259045 77259190 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 59709 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 237.667-31 chr18 9338889 9339178 + 1 NA intron (NM_020648, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu 4260 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 180.667-86 chr21 23235796 23236123 + 1 NA Intergenic Intergenic 148876 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 228.667-14 chr10 120958577 120959069 + 1 NA Intergenic Intergenic 107461 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 199.333-232 chr5 113864999 113865324 + 1 NA Intergenic Intergenic 351467 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 128.667-63 chr15 57181480 57181689 + 1 NA intron (NM_001322154, intron 6 of 20) intron (NM_001322154, intron 6 of 20) -37846 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 156.333-63 chr11 110862226 110862463 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -149155 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 153.667-384 chr8 99250765 99250985 + 1 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) L1MDa|LINE|L1 237609 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 259.333-89 chr6 136796331 136796700 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -4038 NM_005923 4217 Hs.186486 NM_005923 ENSG00000197442 MAP3K5 ASK1|MAPKKK5|MEKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 protein-coding 117.333-25 chr10 90237597 90237740 + 1 NA Intergenic LTR87|LTR|ERVL? -280295 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 179.667-18 chr10 48560095 48560446 + 1 NA intron (NR_144642, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 44803 NR_144645 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 180.667-81 chr20 39509468 39509707 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -284839 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 142.667-72 chr16 5695538 5695859 + 1 NA Intergenic Intergenic 63231 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 254.667-54 chr3 94187157 94187604 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 124319 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 172.333-109 chr3 61136373 61136691 + 1 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 114920 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 147.667-265 chr4 165201113 165201320 + 1 NA Intergenic Intergenic -6345 NM_007246 11275 Hs.388668 NM_007246 ENSG00000109466 KLHL2 ABP-KELCH|MAV|MAYVEN kelch like family member 2 protein-coding 176.667-15 chr1 180881370 180881652 + 1 NA intron (NR_137330, intron 12 of 12) intron (NR_137330, intron 12 of 12) -31386 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 132.333-8 chr1 156214505 156214744 + 1 NA intron (NM_001199664, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 1636 NM_007221 11243 Hs.530479 NM_007221 ENSG00000160783 PMF1 - polyamine modulated factor 1 protein-coding 282.667-32 chr3 130557299 130557642 + 1 NA Intergenic Intergenic -2864 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 119.667-44 chr13 95586817 95586974 + 1 NA intron (NM_014934, intron 19 of 21) intron (NM_014934, intron 19 of 21) 34175 NM_006984 9071 Hs.534377 NM_006984 ENSG00000134873 CLDN10 CPETRL3|HELIX|OSP-L|OSPL claudin 10 protein-coding 299.333-7 chr10 74509926 74510281 + 1 NA intron (NR_120673, intron 2 of 4) L1MA5A|LINE|L1 19221 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 213.667-58 chr3 152461983 152462281 + 1 NA intron (NM_207296, intron 7 of 7) intron (NM_207296, intron 7 of 7) -121142 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 119.667-144 chr5 24279910 24280070 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 328642 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 269.333-73 chr5 145713535 145714045 + 1 NA Intergenic Intergenic 121552 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 200.667-144 chr7 27812324 27812636 + 1 NA intron (NM_001362795, intron 13 of 14) L1ME1|LINE|L1 72385 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 177.667-57 chr16 5693397 5693629 + 1 NA Intergenic Intergenic 61046 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 126.333-145 chr5 177562091 177562386 + 1 NA Intergenic MamGypLTR1d|LTR|Gypsy -7675 NM_001190946 54540 Hs.484289 NM_019057 ENSG00000146067 FAM193B IRIZIO family with sequence similarity 193 member B protein-coding 406.333 chr1 82195350 82195888 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 393166 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 185.333-192 chr8 116684466 116684802 + 1 NA intron (NM_003756, intron 2 of 7) intron (NM_003756, intron 2 of 7) 32534 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 140.333-87 chr18 22907311 22907459 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -25943 NM_002894 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 146.667-312 chr7 82716148 82716344 + 1 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -272290 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 177.667-62 chr17 49894143 49894473 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -46291 NM_001077503 255061 Hs.652130 NM_170685 ENSG00000176358 TAC4 EK|HK-1|HK1|PPT-C tachykinin 4 protein-coding 184.333-149 chr8 59401613 59401911 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 282552 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 155.667-291 chr5 112746947 112747129 + 1 NA intron (NM_001354904, intron 2 of 15) FLAM_C|SINE|Alu 9153 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 136.667-177 chr8 109716052 109716199 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -24334 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 258.333-47 chr4 34034627 34035086 + 1 NA intron (NR_125902, intron 1 of 4) intron (NR_125902, intron 1 of 4) 5037 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 113.333-65 chr12 119160619 119160812 + 1 NA 3' UTR (NM_194286, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_194286, exon 13 of 13) 15769 NR_134996 105370024 Hs.679286 NR_134996 ENSG00000256884 LOC105370024 - uncharacterized LOC105370024 ncRNA 196.333-111 chr3 97196328 97196781 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) L1MA3|LINE|L1 -243053 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 188.333-154 chr8 77269799 77270073 + 1 NA Intergenic Intergenic -180761 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 243.333-37 chr16 51314886 51315417 + 1 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -163879 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 188.333-78 chr2 135186023 135186347 + 1 NA Intergenic Intergenic 49557 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 122.333-57 chr14 54625695 54625850 + 1 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 58160 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 161.667-252 chr8 89802826 89803019 + 1 NA Intergenic Intergenic 45106 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 186.333-111 chr4 32510224 32510502 + 1 NA Intergenic Intergenic 159325 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 163.667-17 chr10 6788035 6788247 + 1 NA intron (NR_038291, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 8543 NR_038291 100507127 Hs.498571 NR_038291 ENSG00000238266 LINC00707 - long intergenic non-protein coding RNA 707 ncRNA 240.667-29 chr16 13502302 13502718 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -417647 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 143.333-233 chr5 134648080 134648271 + 1 NA promoter-TSS (NM_001252231) promoter-TSS (NM_001252231) -610 NM_021982 10802 Hs.595540 NM_021982 ENSG00000113615 SEC24A - SEC24 homolog A, COPII coat complex component protein-coding 157.333-157 chr17 69516799 69517052 + 1 NA intron (NM_001330450, intron 3 of 11) intron (NM_001330450, intron 3 of 11) 14663 NM_001330450 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 146.333-246 chr5 5437955 5438101 + 1 NA intron (NM_015325, intron 3 of 18) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 15351 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 122.333-23 chr10 82576579 82576767 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -343753 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 220.333-65 chr2 108411546 108411870 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 33754 NM_006588 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 148.333-124 chr14 63731597 63731832 + 1 NA Intergenic Intergenic -3649 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 203.667-2 chr1 52442466 52442772 + 1 NA intron (NM_001009881, intron 24 of 29) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 38017 NM_032864 84950 Hs.5301 NM_032284 ENSG00000134748 PRPF38A PRP38A|Prp38 pre-mRNA processing factor 38A protein-coding 148.667-345 chr7 13095660 13095900 + 1 NA Intergenic Intergenic 408147 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 137.333-187 chr7 157495037 157495296 + 1 NA intron (NR_110157, intron 3 of 3) intron (NR_110157, intron 3 of 3) 28935 NR_110157 101927914 Hs.623826 NR_110157 ENSG00000234210 LOC101927914 - uncharacterized LOC101927914 ncRNA 140.333-176 chr5 12452007 12452202 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -122753 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 285.333-40 chr3 25007796 25008312 + 1 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) intron (NM_001290216, intron 2 of 10) 178731 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 338.667-14 chr17 67819421 67819849 + 1 NA Intergenic Intergenic -5868 NM_182641 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 179.667-137 chr8 83563921 83564153 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 160279 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 151.333-115 chr13 65981375 65981543 + 1 NA Intergenic Intergenic -15030 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 210.667-129 chr8 88802689 88802965 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -475344 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 152.667-110 chr14 62996557 62996724 + 1 NA intron (NM_139318, intron 4 of 10) intron (NM_139318, intron 4 of 10) 48818 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 168.667-127 chr21 27822275 27822584 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 100050 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 151.333-301 chr4 44971336 44971526 + 1 NA Intergenic Intergenic -244797 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 147.333-3 chr1 31529687 31529976 + 1 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 11396 NR_027085 284551 Hs.658659 NR_027085 LINC01226 - long intergenic non-protein coding RNA 1226 ncRNA 142.333-66 chr13 33412106 33412351 + 1 NA intron (NM_001243476, intron 5 of 17) L1MD1|LINE|L1 -76962 NR_146541 105370154 NR_146541 LINC02344 - long intergenic non-protein coding RNA 2344 ncRNA 188.333-99 chr3 132508410 132508699 + 1 NA intron (NM_001329126, intron 44 of 56) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -88716 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 176.333-69 chr18 3653026 3653321 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 7 of 11) intron (NM_001242761, intron 7 of 11) 49436 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 164.333-74 chr15 59123067 59123289 + 1 NA intron (NM_004701, intron 7 of 8) intron (NM_004701, intron 7 of 8) 18032 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 326.333-17 chr3 53565205 53565697 + 1 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) intron (NM_001128840, intron 3 of 47) 70840 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 335.333-18 chr17 74706320 74706870 + 1 NA intron (NR_110298, intron 1 of 5) AluSp|SINE|Alu 6328 NM_001289084 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 191.333-57 chr14 48771095 48771396 + 1 NA Intergenic Intergenic 815135 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 239.333-52 chr2 52981402 52981642 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -278907 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 152.667-11 chr1 94155100 94155256 + 1 NA Intergenic Intergenic -34030 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 146.667-188 chr2 214122717 214122928 + 1 NA intron (NR_047660, intron 13 of 14) intron (NR_047660, intron 13 of 14) -288232 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 157.667-186 chr3 19661122 19661426 + 1 NA Intergenic Intergenic 272943 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 184.667-29 chr14 20691086 20691343 + 1 NA intron (NM_194431, intron 1 of 1) intron (NM_194431, intron 1 of 1) 2450 NM_194431 6038 Hs.283749 NM_002937 ENSG00000258818 RNASE4 RAB1|RNS4 ribonuclease A family member 4 protein-coding 121.333-88 chr2 99668054 99668245 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 11 of 23) AluY|SINE|Alu -178132 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 173.333-139 chr4 23174085 23174262 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 460084 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 185.667-3 chr1 179609014 179609216 + 1 NA intron (NM_001199092, intron 1 of 13) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 2888 NM_001199092 163589 Hs.197354 NM_173533 ENSG00000162782 TDRD5 TUDOR3 tudor domain containing 5 protein-coding 185.333-131 chr4 33550368 33550666 + 1 NA Intergenic Intergenic 489376 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 151.333-319 chr4 114911511 114911744 + 1 NA intron (NM_022569, intron 6 of 13) intron (NM_022569, intron 6 of 13) 201993 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 241.333-87 chr6 99566700 99567083 + 1 NA intron (NM_001013399, intron 1 of 11) intron (NM_001013399, intron 1 of 11) 1769 NM_005190 892 Hs.430646 NM_005190 ENSG00000112237 CCNC CycC|SRB11|hSRB11 cyclin C protein-coding 189.667-102 chr3 179618654 179618888 + 1 NA intron (NM_001199957, intron 3 of 3) AluYc|SINE|Alu 13977 NM_001199957 4711 Hs.730674 NM_002492 ENSG00000136521 NDUFB5 CISGDH|SGDH NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B5 protein-coding 239.667-43 chr3 30727790 30728239 + 1 NA 3' UTR (NM_207359, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_207359, exon 15 of 15) 121413 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 160.667-8 chr1 66969789 66969982 + 1 NA intron (NM_001077700, intron 8 of 13) L2|LINE|L2 39629 NM_001077701 57708 Hs.605432 NM_020948 ENSG00000198160 MIER1 ER1|MI-ER1 MIER1 transcriptional regulator protein-coding 150.333-207 chr2 122477115 122477281 + 1 NA Intergenic Intergenic 596283 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 132.333-169 chr7 80617187 80617342 + 1 NA intron (NM_001371080, intron 1 of 10) L1PA13|LINE|L1 -6828 NM_001371078 124.333-7 chr1 95023526 95023740 + 1 NA intron (NM_144988, intron 3 of 3) intron (NM_144988, intron 3 of 3) -37963 NR_132786 101928098 Hs.730090 NR_132786 ENSG00000230427 LOC101928098 - uncharacterized LOC101928098 ncRNA 235.333-89 chr4 115846636 115846924 + 1 NA Intergenic Intergenic -452945 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 173.667-170 chr7 95392621 95393048 + 1 NA intron (NM_000940, intron 2 of 8) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 3541 NM_000940 5446 Hs.440967 NM_000940 ENSG00000105852 PON3 - paraoxonase 3 protein-coding 219.667-57 chr3 194329839 194330167 + 1 NA Intergenic Intergenic -17199 NR_024480 100131551 Hs.128066 NR_024480 ENSG00000214145 LINC00887 HEIRCC long intergenic non-protein coding RNA 887 ncRNA 158.667-5 chr1 51010020 51010281 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 39905 NM_078626 1031 Hs.525324 NM_001262 ENSG00000123080 CDKN2C INK4C|p18|p18-INK4C cyclin dependent kinase inhibitor 2C protein-coding 154.667-191 chr2 159532710 159532939 + 1 NA intron (NM_001329858, intron 2 of 36) intron (NM_001329858, intron 2 of 36) -82470 NR_110587 643072 Hs.632541 NR_110587 LOC643072 - uncharacterized LOC643072 ncRNA 146.667-284 chr6 119561545 119561705 + 1 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 11817 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 121.667-54 chr14 23850231 23850415 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -103447 NM_001282991 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 210.667-45 chr14 81626818 81627153 + 1 NA Intergenic Intergenic -3924 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 201.333-297 chr9 24235445 24235773 + 1 NA Intergenic Intergenic 310067 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 171.333-135 chr4 66934395 66934660 + 1 NA Intergenic Intergenic 487473 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 153.667-300 chr4 112534656 112534893 + 1 NA intron (NR_161159, intron 3 of 3) intron (NR_161159, intron 3 of 3) -18594 NM_024019 63973 Hs.744415 NM_024019 ENSG00000178403 NEUROG2 Atoh4|Math4A|NGN2|bHLHa8|ngn-2 neurogenin 2 protein-coding 139.333-107 chr2 32694165 32694382 + 1 NA intron (NM_017735, intron 9 of 19) intron (NM_017735, intron 9 of 19) 59018 NR_039922 100616219 NR_039922 ENSG00000265057 MIR4765 - microRNA 4765 ncRNA 162.333-141 chr21 16528520 16528841 + 1 NA intron (NR_136546, intron 2 of 2) L1MD1|LINE|L1 -6892 NR_136547 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 153.667-131 chr15 35130294 35130549 + 1 NA Intergenic Intergenic -45013 NM_001355281 388112 Hs.635882 NM_001355281 ENSG00000255192 NANOGP8 NANOGP1|PN8 Nanog homeobox retrogene P8 protein-coding 160.333-165 chr20 37562665 37562862 + 1 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -34832 NM_001167820 10904 Hs.472651 NM_006698 ENSG00000166619 BLCAP BC10 BLCAP apoptosis inducing factor protein-coding 120.667-28 chr11 44627585 44627747 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 62003 NM_002231 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 164.667-214 chr7 3108747 3108946 + 1 NA Intergenic Intergenic 49727 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 213.333-63 chr14 87851319 87851727 + 1 NA Intergenic Intergenic 141659 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 197.667-132 chr6 56648708 56649103 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 9 of 94) intron (NM_001144770, intron 9 of 94) -6016 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 155.667-25 chr1 190778202 190778386 + 1 NA intron (NR_033922, intron 2 of 4) intron (NR_033922, intron 2 of 4) 153404 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 292.667-42 chr8 66871332 66871883 + 1 NA intron (NM_001136160, intron 1 of 13) intron (NM_001136160, intron 1 of 13) 105 NM_001136160 157777 Hs.437006 NM_173518 ENSG00000178460 MCMDC2 C8orf45 minichromosome maintenance domain containing 2 protein-coding 142.333-256 chr9 31391980 31392178 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10589 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 265.667-31 chr18 46134708 46135182 + 1 NA Intergenic Intergenic 30560 NM_138443 115106 Hs.436617 NM_138443 ENSG00000152240 HAUS1 CCDC5|HEI-C|HEIC|HsT1461 HAUS augmin like complex subunit 1 protein-coding 161.333-87 chr14 39074359 39074641 + 1 NA exon (NM_006364, exon 9 of 20) exon (NM_006364, exon 9 of 20) -28640 NR_146545 105370458 NR_146545 ENSG00000258651 SEC23A-AS1 - SEC23A antisense RNA 1 ncRNA 158.333-246 chr4 152302466 152302668 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -35088 NR_104273 102191832 Hs.712524 NR_104273 ENSG00000270751 FBXW7-AS1 DEAR|DEspR FBXW7 antisense RNA 1 ncRNA 169.333-188 chr4 106804706 106804956 + 1 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 231482 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 156.667-20 chr1 110531877 110532034 + 1 NA Intergenic Intergenic -12780 NM_005549 3744 Hs.248140 NM_005549 ENSG00000143105 KCNA10 Kcn1|Kv1.8 potassium voltage-gated channel subfamily A member 10 protein-coding 155.333-358 chr7 32354445 32354637 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) AluJr|SINE|Alu -55213 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 257.667-45 chr2 235949701 235950156 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 12 of 17) intron (NM_001037131, intron 12 of 17) 218458 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 153.667-122 chr14 67365441 67365624 + 1 NA intron (NM_004094, intron 2 of 7) intron (NM_004094, intron 2 of 7) 5204 NM_004094 1965 Hs.151777 NM_004094 ENSG00000134001 EIF2S1 EIF-2|EIF-2A|EIF-2alpha|EIF2|EIF2A eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha protein-coding 142.667-88 chr19 40743022 40743269 + 1 NA intron (NR_148549, intron 5 of 5) intron (NR_148549, intron 5 of 5) 7332 NM_001353805 284325 Hs.585105 NM_198476 ENSG00000188493 C19orf54 - chromosome 19 open reading frame 54 protein-coding 243.667-53 chr4 43881970 43882377 + 1 NA Intergenic Intergenic -134688 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 167.333-268 chr9 9316774 9317006 + 1 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) intron (NM_002839, intron 9 of 45) 458872 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 160.667-165 chr2 172550761 172550980 + 1 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -4503 NR_103731 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 123.333-5 chr1 57134510 57134684 + 1 NA intron (NM_001365793, intron 4 of 14) L1PREC2|LINE|L1 -168457 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 248.667-13 chr10 58356529 58356828 + 1 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) L1ME3G|LINE|L1 21672 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 265.667-65 chr7 14132364 14132844 + 1 NA Intergenic Intergenic -141179 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 155.667-312 chr6 125546418 125546592 + 1 NA Intergenic Intergenic -127848 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 141.333-90 chr18 11674118 11674266 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -15072 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 115.333-8 chr1 84180626 84180825 + 1 NA promoter-TSS (NM_001242862) promoter-TSS (NM_001242862) -907 NM_001242862 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 151.333-436 chr9 26774252 26774442 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 118455 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 139.333-140 chr22 24159913 24160093 + 1 NA intron (NM_012295, intron 29 of 36) intron (NM_012295, intron 29 of 36) -21484 NM_019601 56241 Hs.131819 NM_019601 ENSG00000099994 SUSD2 BK65A6.2|W5C5 sushi domain containing 2 protein-coding 150.333-45 chr10 89435276 89435552 + 1 NA intron (NM_213606, intron 7 of 7) L2|LINE|L2 -20577 NR_120614 101926906 Hs.568874 NR_120614 ENSG00000234452 SLC16A12-AS1 - SLC16A12 antisense RNA 1 ncRNA 132.333-141 chr5 156554401 156554590 + 1 NA intron (NM_001128209, intron 3 of 7) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 227331 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 157.667-165 chr2 228374652 228374830 + 1 NA Intergenic Intergenic -193054 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 278.667-5 chr11 22541090 22541484 + 1 NA Intergenic Intergenic -49268 NR_120583 102723378 Hs.374255 NR_120583 ENSG00000255323 LINC01495 - long intergenic non-protein coding RNA 1495 ncRNA 173.333-51 chr13 72466712 72466948 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 260799 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 164.667-156 chr4 30756816 30757069 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 36573 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 187.667-95 chr3 102543234 102543437 + 1 NA Intergenic Intergenic 108320 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 135.333-45 chr12 43078881 43079110 + 1 NA Intergenic Intergenic -76320 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 177.667-135 chr8 105922743 105922966 + 1 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) L1PA17|LINE|L1 137649 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-258 chr4 126734478 126734665 + 1 NA Intergenic Intergenic -898386 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 256.333 chr1 12719133 12719504 + 1 NA intron (NR_111984, intron 1 of 2) intron (NR_111984, intron 1 of 2) 3203 NR_111984 126767 Hs.464705 NM_001103169 ENSG00000188984 AADACL3 - arylacetamide deacetylase like 3 protein-coding 213.333-193 chr7 54033009 54033306 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -221226 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 168.333-45 chr12 31944602 31944868 + 1 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 -14680 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 154.667-346 chr6 106564563 106564845 + 1 NA intron (NM_001371242, intron 21 of 21) intron (NM_001371242, intron 21 of 21) 52849 NM_001624 202 Hs.724262 NM_001624 ENSG00000112297 CRYBG1 AIM1|ST4 crystallin beta-gamma domain containing 1 protein-coding 157.667-204 chr3 174436229 174436607 + 1 NA Intergenic MER101B|LTR|ERV1 -422916 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 125.667-85 chr18 73064503 73064759 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 195591 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 133.333-97 chr22 25759987 25760159 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 1 of 43) intron (NM_001318245, intron 1 of 43) 17885 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 171.667-92 chr2 220851077 220851316 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 721108 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 150.667-375 chr8 108887726 108887945 + 1 NA Intergenic Intergenic -100241 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 175.333-103 chr20 14850824 14851023 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 78595 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 190.667-81 chr22 49688317 49688577 + 1 NA Intergenic Intergenic -30928 NM_001289922 348645 Hs.133159 NM_198851 ENSG00000188511 C22orf34 - chromosome 22 open reading frame 34 protein-coding 233.667-25 chr16 26333647 26333998 + 1 NA Intergenic Intergenic 308585 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 308.333-13 chr14 62489831 62490513 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -350199 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 188.333-71 chr2 38430233 38430450 + 1 NA promoter-TSS (NR_146454) promoter-TSS (NR_146454) -953 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 219.333-123 chr4 41067484 41067951 + 1 NA intron (NM_173075, intron 3 of 16) L2b|LINE|L2 146825 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 170.667-75 chr2 26326054 26326288 + 1 NA intron (NR_135916, intron 1 of 12) intron (NR_135916, intron 1 of 12) -7069 NM_001145169 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 136.667-100 chr2 178857066 178857337 + 1 NA intron (NM_173648, intron 17 of 23) intron (NM_173648, intron 17 of 23) -49778 NM_133432 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 154.333-320 chr7 30299380 30299633 + 1 NA intron (NM_147128, intron 1 of 4) intron (NM_147128, intron 1 of 4) -9616 NR_037513 100500883 NR_037513 ENSG00000283237 MIR550B1 - microRNA 550b-1 ncRNA 157.667-266 chr5 152362556 152362720 + 1 NA Intergenic Intergenic 42641 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 153.667-59 chr11 12055877 12056067 + 1 NA intron (NR_135109, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu 25097 NR_135109 105376554 Hs.523483 NR_135109 ENSG00000254486 LINC02547 - long intergenic non-protein coding RNA 2547 ncRNA 170.667-44 chr14 49049992 49050241 + 1 NA Intergenic Intergenic 536264 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 152.667-46 chr10 68465766 68465927 + 1 NA intron (NM_001080449, intron 3 of 20) intron (NM_001080449, intron 3 of 20) 6127 NM_001080449 1763 Hs.532446 NM_001080449 ENSG00000138346 DNA2 DNA2L|hDNA2 DNA replication helicase/nuclease 2 protein-coding 159.667-25 chr1 172875182 172875379 + 1 NA Intergenic Intergenic 175683 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 141.667-184 chr5 116923767 116923948 + 1 NA Intergenic Intergenic -161648 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 166.333-106 chr2 30460794 30461109 + 1 NA intron (NM_182551, intron 2 of 6) MER21C|LTR|ERVL 13705 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 256.333-38 chr2 12863139 12863475 + 1 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL 125940 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 188.333 chr1 45668438 45668736 + 1 NA intron (NM_021639, intron 2 of 12) AluSz|SINE|Alu 17946 NM_021639 60313 Hs.238432 NM_021639 ENSG00000159592 GPBP1L1 SP192 GC-rich promoter binding protein 1 like 1 protein-coding 311.333-59 chr8 124130868 124131446 + 1 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) L1PA15|LINE|L1 40365 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 142.667-87 chr19 28480642 28480896 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) AluJb|SINE|Alu -125919 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 181.333-179 chr8 113543620 113543852 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -106797 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 141.667-171 chr5 15599441 15599626 + 1 NA intron (NM_001278317, intron 1 of 3) intron (NM_001278317, intron 1 of 3) 15469 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 146.667-42 chr10 83660038 83660297 + 1 NA Intergenic Intergenic 16922 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 216.333-65 chr18 64183653 64184024 + 1 NA intron (NR_033881, intron 2 of 9) intron (NR_033881, intron 2 of 9) -34812 NR_027245 221241 Hs.567778 NM_152728 ENSG00000179676 LINC00305 C18orf20|HsT1235|NCRNA00305 long intergenic non-protein coding RNA 305 ncRNA 175.333-105 chr21 24513707 24513899 + 1 NA intron (NR_135519, intron 1 of 2) intron (NR_135519, intron 1 of 2) 85063 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 224.333-92 chr5 9460079 9460489 + 1 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -51049 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 179.333-75 chr16 82108831 82109083 + 1 NA Intergenic Intergenic 61267 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 153.333-168 chr18 4113863 4114040 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) L1PA16|LINE|L1 -150651 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 142.667-182 chr5 129555028 129555262 + 1 NA intron (NM_133638, intron 7 of 22) intron (NM_133638, intron 7 of 22) -94456 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 342.333-13 chr19 27951651 27952096 + 1 NA intron (NR_146733, intron 2 of 6) intron (NR_146733, intron 2 of 6) -157933 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 150.333-188 chr2 37510234 37510498 + 1 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 161833 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 346.667-2 chr10 57931456 57931997 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 336168 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 228.333-41 chr19 28213752 28214101 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -392762 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 210.333-47 chr14 85384234 85384517 + 1 NA Intergenic Intergenic -2900 NR_135155 105370605 NR_135155 ENSG00000258814 LINC02329 - long intergenic non-protein coding RNA 2329 ncRNA 152.333-376 chr8 79084243 79084489 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 246837 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 168.667-69 chr15 68701669 68701919 + 1 NA intron (NM_006091, intron 3 of 11) MIR1_Amn|SINE|MIR 60291 NM_001324015 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 156.667-218 chr22 30849463 30849740 + 1 NA intron (NM_001282741, intron 1 of 12) L1ME2|LINE|L1 27085 NM_001282741 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 131.333-138 chr5 13249391 13249564 + 1 NA Intergenic Intergenic -216591 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 437.333-6 chr2 10174919 10175631 + 1 NA intron (NR_161344, intron 3 of 3) L1ME3|LINE|L1 17396 NR_036222 100422929 NR_036222 ENSG00000265418 MIR4261 - microRNA 4261 ncRNA 151.667-65 chr11 65102239 65102439 + 1 NA intron (NR_073519, intron 2 of 9) intron (NR_073519, intron 2 of 9) 6125 NR_073519 738 Hs.277517 NM_013265 ENSG00000149823 VPS51 ANG2|ANG3|C11orf2|C11orf3|FFR VPS51 subunit of GARP complex protein-coding 165.667-220 chrX 39148759 39148962 + 1 NA Intergenic Intergenic 178502 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 244.667-87 chr7 32382765 32383159 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) 45262 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 154.667-357 chr7 10558717 10558980 + 1 NA intron (NR_147499, intron 2 of 2) L1M1|LINE|L1 -143828 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 181.667-13 chr10 50829754 50830076 + 1 NA intron (NM_001370131, intron 5 of 11) intron (NM_001370131, intron 5 of 11) 55712 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 268.667-41 chr22 40643278 40643615 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -6727 NM_001282661 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 171.333-31 chr11 109074870 109075102 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -347204 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 167.333-241 chr7 28296351 28296543 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -2874 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 199.333-289 chr8 134542128 134542547 + 1 NA intron (NM_020863, intron 11 of 15) L1PA15|LINE|L1 -55734 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 172.333-26 chr10 96728430 96728740 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -8071 NM_152309 118788 Hs.310456 NM_152309 ENSG00000155629 PIK3AP1 BCAP phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 protein-coding 238.333-42 chr2 29430101 29430375 + 1 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) L1M4b|LINE|L1 45139 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 169.667-73 chr15 44214086 44214377 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -18937 NR_104455 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 206.667-38 chr14 69577102 69577445 + 1 NA Intergenic Intergenic -2402 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 142.667-165 chr4 108936069 108936265 + 1 NA intron (NR_045756, intron 7 of 35) intron (NR_045756, intron 7 of 35) -173114 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 151.333-75 chr11 27858045 27858211 + 1 NA Intergenic Intergenic -136098 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 165.667-172 chr6 18813185 18813436 + 1 NA Intergenic Intergenic 241526 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 184.667-96 chr5 44874727 44874939 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 65886 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 179.333-140 chr4 80918317 80918612 + 1 NA intron (NM_152770, intron 4 of 5) intron (NM_152770, intron 4 of 5) -112244 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 168.667-62 chr14 65682694 65683006 + 1 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 211748 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 124.667-172 chr5 113018601 113018785 + 1 NA non-coding (NR_038352, exon 9 of 9) non-coding (NR_038352, exon 9 of 9) 41895 NR_038352 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 268.667-48 chr4 100262389 100262710 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -72081 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 124.667-35 chr11 55665094 55665251 + 1 NA promoter-TSS (NM_001004704) promoter-TSS (NM_001004704) 5 NM_001004704 219432 Hs.511921 NM_001004704 ENSG00000181903 OR4C6 OR11-138 olfactory receptor family 4 subfamily C member 6 protein-coding 112.333-140 chr2 198148853 198149060 + 1 NA 3' UTR (NM_006226, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_006226, exon 6 of 6) 226141 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 150.333-364 chr6 92248148 92248346 + 1 NA Intergenic Intergenic -557819 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 199.333-126 chr2 59748171 59748508 + 1 NA Intergenic Intergenic 530631 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 150.333-277 chr3 148860341 148860558 + 1 NA TTS (NM_001871) TTS (NM_001871) -4847 NM_001870 1359 Hs.646 NM_001870 ENSG00000163751 CPA3 MC-CPA carboxypeptidase A3 protein-coding 206.667-105 chr4 162442770 162443097 + 1 NA Intergenic Intergenic -278899 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 154.333-50 chr11 3646584 3646749 + 1 NA intron (NM_004314, intron 1 of 4) intron (NM_004314, intron 1 of 4) 1538 NM_004314 417 Hs.382188 NM_004314 ENSG00000129744 ART1 ART2|ARTC1|CD296|RT6 ADP-ribosyltransferase 1 protein-coding 163.667-231 chr7 35554141 35554385 + 1 NA Intergenic Intergenic 140872 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 130.667-44 chr11 30481893 30482045 + 1 NA intron (NM_001584, intron 3 of 5) intron (NM_001584, intron 3 of 5) 98524 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 240.667-58 chr3 188045025 188045344 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -68777 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 149.667-320 chr5 81745520 81745711 + 1 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) intron (NM_012446, intron 1 of 16) 5638 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 240.667-10 chr10 66934878 66935157 + 1 NA intron (NM_178011, intron 2 of 2) intron (NM_178011, intron 2 of 2) 8981 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 174.667-78 chr2 28865308 28865527 + 1 NA intron (NM_017910, intron 1 of 6) intron (NM_017910, intron 1 of 6) 4892 NM_017910 55006 Hs.468026 NM_017910 ENSG00000171103 TRMT61B - tRNA methyltransferase 61B protein-coding 201.667-123 chr8 122620135 122620409 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -51628 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 151.667-243 chr4 20221741 20221960 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -30055 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 167.667-46 chr12 63182453 63182658 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -29745 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 164.333-112 chr2 39522922 39523194 + 1 NA intron (NR_037875, intron 5 of 5) intron (NR_037875, intron 5 of 5) 85642 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 149.333-315 chr5 108848794 108849079 + 1 NA intron (NR_146155, intron 4 of 19) L1MEc|LINE|L1 -75670 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 255.333-43 chr17 42034637 42034952 + 1 NA intron (NM_001242704, intron 2 of 7) AluSp|SINE|Alu 3232 NM_001242704 201181 Hs.443140 NM_001013624 ENSG00000187595 ZNF385C - zinc finger protein 385C protein-coding 181.333-13 chr10 44927682 44927951 + 1 NA intron (NR_033842, intron 1 of 7) intron (NR_033842, intron 1 of 7) 16479 NM_001123376 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 170.667-116 chr3 179173163 179173479 + 1 NA intron (NM_006218, intron 1 of 20) AluY|SINE|Alu 24964 NM_006218 5290 Hs.553498 NM_006218 ENSG00000121879 PIK3CA CLAPO|CLOVE|CWS5|MCAP|MCM|MCMTC|PI3K|PI3K-alpha|p110-alpha phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha protein-coding 293.333-27 chr2 37370745 37371143 + 1 NA intron (NM_012413, intron 5 of 6) intron (NM_012413, intron 5 of 6) 26314 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 357.667-10 chr5 118901966 118902560 + 1 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) intron (NM_001308081, intron 4 of 5) -72323 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 193.667-56 chr18 722971 723257 + 1 NA 3' UTR (NM_005433, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_005433, exon 12 of 12) -10450 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 131.667-73 chr17 30117164 30117340 + 1 NA promoter-TSS (NR_036149) promoter-TSS (NR_036149) -92 NR_036149 100423003 NR_036149 ENSG00000284399 MIR3184 - microRNA 3184 ncRNA 116.333-10 chr1 79989925 79990129 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -545728 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 221.667-63 chr5 19792062 19792341 + 1 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) MLT2B3|LTR|ERVL 94071 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 244.333-100 chr8 82112455 82112731 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -270307 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 122.667-99 chr2 191553529 191553700 + 1 NA Intergenic Intergenic -124458 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 192.333-32 chr11 82058406 82058792 + 1 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) intron (NR_120571, intron 5 of 7) -167763 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 231.667-56 chr7 82981446 82981794 + 1 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 181264 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 162.667-177 chr3 87249606 87249773 + 1 NA intron (NM_014043, intron 3 of 5) intron (NM_014043, intron 3 of 5) 22380 NM_001244644 25978 Hs.476930 NM_014043 ENSG00000083937 CHMP2B ALS17|CHMP2.5|DMT1|VPS2-2|VPS2B charged multivesicular body protein 2B protein-coding 127.333-38 chr12 48276788 48276979 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -52097 NM_181788 341567 Hs.155833 NM_181788 ENSG00000187166 H1FNT H1.7|H1T2 H1 histone family member N, testis specific protein-coding 176.333-88 chr2 88548562 88548780 + 1 NA intron (NR_110236, intron 2 of 2) intron (NR_110236, intron 2 of 2) 9951 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 116.333-21 chr1 207447786 207447977 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6419 NM_001006658 1380 Hs.445757 NM_001877 ENSG00000117322 CR2 C3DR|CD21|CR|CVID7|SLEB9 complement C3d receptor 2 protein-coding 155.333-157 chr2 24362628 24362859 + 1 NA Intergenic Intergenic -2207 NM_001348182 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 243.667-64 chr6 28147037 28147369 + 1 NA intron (NM_001278121, intron 2 of 6) L1M4|LINE|L1 4992 NM_001278121 7745 Hs.57679 NM_006298 ENSG00000198315 ZKSCAN8 LD5-1|ZNF192|ZSCAN40 zinc finger with KRAB and SCAN domains 8 protein-coding 124.667-48 chr12 56943839 56944043 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -9533 NM_148897 121214 Hs.380178 NM_148897 ENSG00000170426 SDR9C7 ARCI13|RDHS|SDR-O|SDRO short chain dehydrogenase/reductase family 9C member 7 protein-coding 156.333-339 chr7 64669446 64669644 + 1 NA intron (NM_016220, intron 2 of 6) AluSx1|SINE|Alu 3412 NR_104149 51427 Hs.50216 NM_016220 ENSG00000196247 ZNF107 Y8|ZFD25|ZNF588|smap-7 zinc finger protein 107 protein-coding 131.333-70 chr18 49204939 49205125 + 1 NA intron (NM_001353210, intron 13 of 16) AluSx3|SINE|Alu -155264 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 220.667-19 chr11 20957264 20957615 + 1 NA intron (NM_201551, intron 11 of 18) L1MEd|LINE|L1 287853 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 177.667-95 chr4 43541557 43541872 + 1 NA Intergenic Intergenic -49171 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 151.667-282 chr5 89315056 89315291 + 1 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) intron (NR_136219, intron 7 of 9) -411068 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 158.667-299 chr7 24527103 24527390 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -46206 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 164.667-170 chr4 111030911 111031167 + 1 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR -170392 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 164.333-228 chr7 80412457 80412697 + 1 NA Intergenic Intergenic -38138 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 204.333-16 chr1 187374333 187374712 + 1 NA Intergenic LTR40A1|LTR|ERVL -69106 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 150.333-100 chr14 26849836 26849997 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -23217 NR_110041 101927081 Hs.97955 NR_110041 ENSG00000257612 MIR4307HG - MIR4307 host gene ncRNA 215.667-39 chr14 84960505 84960858 + 1 NA Intergenic Intergenic -311251 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 152.667-218 chr20 7578235 7578524 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 206771 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 300.667-8 chr14 41634227 41634644 + 1 NA intron (NM_001346173, intron 1 of 4) intron (NM_001346173, intron 1 of 4) 27579 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 301.667-23 chr2 31472240 31472768 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -57762 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 164.667-74 chr14 61573124 61573406 + 1 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 -2612 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 141.667-45 chr11 46553727 46553956 + 1 NA intron (NM_001267782, intron 1 of 19) intron (NM_001267782, intron 1 of 19) 33603 NR_160027 55626 Hs.654644 NM_017749 ENSG00000110497 AMBRA1 DCAF3|WDR94 autophagy and beclin 1 regulator 1 protein-coding 142.333-194 chr5 57453562 57453765 + 1 NA Intergenic Intergenic 29148 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 224.667-65 chr5 155584509 155584996 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 570997 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 158.333-178 chr20 58717191 58717412 + 1 NA Intergenic Intergenic 24501 NM_024663 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 148.667-243 chr3 22119700 22119891 + 1 NA Intergenic Intergenic 162656 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 156.667-250 chr4 96213920 96214110 + 1 NA Intergenic Intergenic -96688 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 349.667-23 chr8 82188058 82188587 + 1 NA Intergenic Intergenic -346036 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 144.667-147 chr2 109324784 109324935 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -11234 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 195.333-151 chr3 197042199 197042498 + 1 NA TTS (NM_001366205) TTS (NM_001366205) -12531 NM_033316 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 214.667-48 chr15 59877694 59878037 + 1 NA Intergenic Intergenic -126446 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 152.333-232 chr3 56192873 56193081 + 1 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) intron (NR_132749, intron 3 of 17) 275490 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 203.667-102 chr5 161140816 161141247 + 1 NA Intergenic Intergenic -202405 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 187.333-117 chr20 52329545 52330001 + 1 NA Intergenic Intergenic -137788 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 174.333-101 chr4 60363714 60363930 + 1 NA Intergenic Intergenic -558797 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 152.667-120 chr15 37898817 37899059 + 1 NA Intergenic Intergenic -35669 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 212.667-42 chr14 85725545 85725813 + 1 NA Intergenic Intergenic 192330 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 228.333-6 chr1 204720759 204721125 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -35204 NM_006338 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 274.667-36 chr3 107959818 107960163 + 1 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 76785 NR_015394 285205 Hs.134882 NR_015394 ENSG00000240423 LINC00636 - long intergenic non-protein coding RNA 636 ncRNA 204.333-76 chr17 72968192 72968523 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 4 of 9) intron (NM_001352692, intron 4 of 9) 124331 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 140.667-19 chr1 184389596 184389779 + 1 NA intron (NM_030806, intron 1 of 5) intron (NM_030806, intron 1 of 5) 2658 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 185.667-83 chr21 17795603 17795866 + 1 NA intron (NM_001100420, intron 3 of 4) AluJo|SINE|Alu -3225 NR_038870 246312 Hs.473425 NR_038870 ENSG00000240770 C21orf91-OT1 D21S2089E|NCRNA00285 C21orf91 overlapping transcript 1 ncRNA 159.667-23 chr1 151794902 151795222 + 1 NA TTS (NR_146292) TTS (NR_146292) 4313 NR_146293 109729141 Hs.439525 NR_146292 ENSG00000203288 TDRKH-AS1 - TDRKH antisense RNA 1 ncRNA 164.667-102 chr2 11751099 11751340 + 1 NA intron (NM_001349205, intron 1 of 21) L3|LINE|CR1 2686 NM_001349205 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 199.667-78 chr2 170090061 170090351 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -87941 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 212.333-159 chrX 22262085 22262442 + 1 NA intron (NR_073010, intron 5 of 11) MamTip1|DNA|hAT-Tip100 -10650 NM_152577 158506 Hs.132485 NM_152577 ENSG00000175809 CBLL2 CT138|HAKAIL|ZNF645 Cbl proto-oncogene like 2 protein-coding 194.333-67 chr2 74567234 74567486 + 1 NA intron (NM_001321739, intron 7 of 10) intron (NM_001321739, intron 7 of 10) 13200 NM_001318868 1796 Hs.103854 NM_001381 ENSG00000115325 DOK1 P62DOK|pp62 docking protein 1 protein-coding 182.333-151 chr8 40423050 40423265 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -79794 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 242.333-32 chr15 60143287 60143645 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 139155 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 163.333-45 chr10 113402213 113402488 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -148481 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 182.667-103 chr3 136509542 136509871 + 1 NA intron (NM_005862, intron 7 of 33) L2a|LINE|L2 242672 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 159.333-182 chr20 2802167 2802415 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1664 NM_001184699 56265 Hs.659346 NM_019609 ENSG00000088882 CPXM1 CPX1|CPXM carboxypeptidase X, M14 family member 1 protein-coding 270.333-3 chr1 159147965 159148427 + 1 NA Intergenic Intergenic -23419 NM_001346510 57863 Hs.365689 NM_021189 ENSG00000162706 CADM3 BIgR|IGSF4B|NECL1|Necl-1|TSLL1|synCAM3 cell adhesion molecule 3 protein-coding 166.333-50 chr11 108046061 108046236 + 1 NA intron (NM_003478, intron 2 of 18) intron (NM_003478, intron 2 of 18) 37250 NM_003478 8065 Hs.440320 NM_003478 ENSG00000166266 CUL5 CUL-5|VACM-1|VACM1 cullin 5 protein-coding 138.667-113 chr2 184732868 184733122 + 1 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) L1MC2|LINE|L1 134466 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 133.667-41 chr12 62660226 62660419 + 1 NA intron (NM_020700, intron 9 of 9) L1M2|LINE|L1 56636 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 355.333-10 chr15 84922610 84923238 + 1 NA intron (NM_001287761, intron 10 of 14) L2a|LINE|L2 38262 NM_001287762 9154 Hs.459187 NM_004213 ENSG00000156222 SLC28A1 CNT1|HCNT1 solute carrier family 28 member 1 protein-coding 201.333-49 chr11 16905538 16905758 + 1 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) intron (NM_001329630, intron 3 of 26) 20374 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 151.667-288 chr5 121286761 121286929 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -35705 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 233.667-48 chr20 47102215 47102611 + 1 NA intron (NM_172110, intron 9 of 13) intron (NM_172110, intron 9 of 13) -64554 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 168.667-124 chr21 16986916 16987092 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 396767 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 151.333-312 chr4 94615089 94615326 + 1 NA intron (NM_001256426, intron 11 of 16) L2c|LINE|L2 142326 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 147.333-331 chr9 76637086 76637271 + 1 NA intron (NM_001308050, intron 6 of 10) intron (NM_001308050, intron 6 of 10) 55237 NM_001330680 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 172.333-135 chr5 38190870 38191058 + 1 NA Intergenic Intergenic 42484 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 290.333-40 chr6 93953651 93954090 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 235567 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 147.333-234 chr4 46383783 46384002 + 1 NA intron (NM_001114175, intron 2 of 8) intron (NM_001114175, intron 2 of 8) 5487 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 296.667-44 chr5 9457814 9458379 + 1 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) AluY|SINE|Alu -53237 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 112.333-68 chr14 43409222 43409395 + 1 NA Intergenic Intergenic 1097975 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 242.667-98 chr7 110925534 110925892 + 1 NA intron (NM_032549, intron 4 of 5) intron (NM_032549, intron 4 of 5) -165293 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 226.667-88 chr7 85893814 85894209 + 1 NA Intergenic Intergenic 472889 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 164.333-122 chr2 136323304 136323539 + 1 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -205266 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 156.667-351 chr9 15718359 15718539 + 1 NA intron (NM_001355547, intron 10 of 24) L1M1|LINE|L1 154471 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 237.667-62 chr4 111736862 111737328 + 1 NA Intergenic Intergenic -408359 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 183.667-116 chr5 63808048 63808420 + 1 NA Intergenic Intergenic 154058 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 232.667-26 chr17 62014449 62014801 + 1 NA intron (NM_005121, intron 8 of 29) MER3|DNA|hAT-Charlie 50653 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 131.333-201 chrX 87254251 87254458 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -263448 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 140.667-41 chr10 91222306 91222525 + 1 NA intron (NR_046310, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 1752 NM_032373 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 354.333-18 chr7 47999056 47999662 + 1 NA intron (NM_001030019, intron 6 of 9) L1MB8|LINE|L1 -19744 NM_004507 3364 Hs.152983 NM_004507 ENSG00000136273 HUS1 hHUS1 HUS1 checkpoint clamp component protein-coding 235.333-93 chr5 21258108 21258382 + 1 NA Intergenic Intergenic -201235 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 162.667 chr1 19938668 19938924 + 1 NA Intergenic Intergenic -15179 NM_014589 30814 Hs.272372 NM_014589 ENSG00000188784 PLA2G2E GIIE sPLA2|sPLA2-IIE phospholipase A2 group IIE protein-coding 327.333-24 chr20 52216285 52216732 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -24523 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 139.667-191 chr8 106011958 106012201 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 48424 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 116.667-57 chr14 70918950 70919116 + 1 NA intron (NM_014982, intron 1 of 35) AluJr|SINE|Alu 11574 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 264.667-50 chr21 30933726 30934144 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -52355 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 244.333-6 chr1 114545912 114546284 + 1 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -34895 NM_015906 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 218.667-81 chr5 20296311 20296769 + 1 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) AluY|SINE|Alu -9011 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-19 chr1 113801203 113801467 + 1 NA intron (NR_130896, intron 1 of 7) intron (NR_130896, intron 1 of 7) 11141 NM_018364 54665 Hs.486285 NM_018364 ENSG00000081019 RSBN1 KDM9|ROSBIN round spermatid basic protein 1 protein-coding 241.667-7 chr1 171570719 171571147 + 1 NA intron (NM_015172, intron 23 of 33) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -48830 NM_001368164 110806290 NM_001368164 MYOCOS - myocilin opposite strand protein-coding 147.667-94 chr14 21819357 21819515 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -148419 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 216.333-28 chr11 40074047 40074400 + 1 NA Intergenic Intergenic 218907 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 166.667-36 chr11 31503174 31503498 + 1 NA intron (NM_144981, intron 1 of 6) L1ME3A|LINE|L1 6286 NM_001304274 196294 Hs.502223 NM_144981 ENSG00000148950 IMMP1L IMMP1|IMP1|IMP1-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 1 protein-coding 152.333-202 chr2 211037303 211037582 + 1 NA Intergenic Intergenic 419871 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 169.333-13 chr1 191316843 191317079 + 1 NA Intergenic Intergenic -88463 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 164.667-227 chr7 80642457 80642752 + 1 NA intron (NM_001371079, intron 1 of 13) intron (NM_001371079, intron 1 of 13) -3488 NM_001289909 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 149.333-251 chr3 98771603 98771803 + 1 NA intron (NM_001323366, intron 5 of 11) intron (NM_001323366, intron 5 of 11) 8396 NM_001323367 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 188.333-44 chr14 35351547 35351885 + 1 NA Intergenic Intergenic 53038 NM_020529 4792 Hs.81328 NM_020529 ENSG00000100906 NFKBIA EDAID2|IKBA|MAD-3|NFKBI NFKB inhibitor alpha protein-coding 184.667-112 chr6 2656093 2656432 + 1 NA Intergenic Intergenic -21659 NR_131168 154386 Hs.680574 NM_152554 ENSG00000164385 LINC01600 C6orf195|bA145H9.2 long intergenic non-protein coding RNA 1600 ncRNA 201.333-204 chr4 34985899 34986226 + 1 NA Intergenic Intergenic -716315 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 145.333-293 chr8 53069033 53069276 + 1 NA Intergenic Intergenic 129246 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 161.667-149 chr2 221890478 221890794 + 1 NA Intergenic Intergenic -316434 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 165.333-151 chr21 32174353 32174577 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -88170 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 370.667-21 chr4 119169987 119170521 + 1 NA intron (NM_016599, intron 5 of 5) L1MB3|LINE|L1 34470 NM_016599 51778 Hs.732122 NM_016599 ENSG00000172399 MYOZ2 C4orf5|CMH16|CS-1|FATZ-2 myozenin 2 protein-coding 143.667-114 chr18 11655659 11655886 + 1 NA promoter-TSS (NR_106975) promoter-TSS (NR_106975) -831 NR_106975 102465690 NR_106975 ENSG00000283492 MIR7153 hsa-mir-7153|mir-7153 microRNA 7153 ncRNA 185.667-97 chr4 127540507 127540881 + 1 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 -92263 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 213.667-50 chr21 21114589 21114913 + 1 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) -32411 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 188.333-168 chr9 80550303 80550641 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 575449 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 240.333-17 chr10 108168408 108168816 + 1 NA Intergenic Intergenic -99319 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 132.333-112 chr3 95302335 95302552 + 1 NA Intergenic Intergenic 364180 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 190.667-90 chr4 64498965 64499223 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -89634 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 197.667-17 chr10 33538192 33538412 + 1 NA Intergenic Intergenic -203397 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 127.667-147 chr5 169252525 169252735 + 1 NA intron (NM_003062, intron 1 of 35) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 11064 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 132.667-30 chr11 16374341 16374487 + 1 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) intron (NM_001367872, intron 3 of 16) -17868 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 135.333-28 chr10 109325162 109325418 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 597956 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 274.333-53 chr5 29475659 29476137 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -79922 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 133.667-142 chr7 91130628 91130882 + 1 NA intron (NM_012395, intron 13 of 13) intron (NM_012395, intron 13 of 13) -133678 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 150.667-131 chr15 59289908 59290202 + 1 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) MIRb|SINE|MIR 82816 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 183.333-76 chr18 47652367 47652646 + 1 NA Intergenic Intergenic 272010 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 234.667-35 chr14 52438993 52439388 + 1 NA intron (NM_001160047, intron 20 of 20) intron (NM_001160047, intron 20 of 20) 113315 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 173.667-164 chr7 46308889 46309118 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -387731 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 159.667-196 chr20 55682109 55682297 + 1 NA Intergenic Intergenic -255006 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 179.667-27 chr11 26058376 26058653 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -130609 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 179.333-17 chr1 224465611 224465831 + 1 NA intron (NM_001322302, intron 2 of 6) L1MD2|LINE|L1 30872 NR_136297 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 166.333-200 chr6 107059352 107059571 + 1 NA Intergenic Intergenic 31262 NM_016487 51250 Hs.486084 NM_016487 ENSG00000130349 C6orf203 HSPC230|PRED31 chromosome 6 open reading frame 203 protein-coding 244.667-84 chr6 54041696 54042069 + 1 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) 5712 NR_046710 100873951 NR_046710 MLIP-AS1 - MLIP antisense RNA 1 ncRNA 154.333-26 chr1 222602364 222602648 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 12547 NR_110614 100506161 Hs.553851 NR_110613 ENSG00000225265 TAF1A-AS1 - TAF1A antisense RNA 1 ncRNA 209.333-91 chr17 67516378 67516681 + 1 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) intron (NM_181671, intron 1 of 9) -44944 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 143.667-149 chr22 26865307 26865469 + 1 NA intron (NR_146604, intron 3 of 5) L1MA7|LINE|L1 5177 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 148.667-99 chr13 30982763 30982981 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 50216 NM_001353390 122046 Hs.124463 NM_152325 ENSG00000175664 TEX26 C13orf26 testis expressed 26 protein-coding 172.667-48 chr13 31675442 31675641 + 1 NA Intergenic Intergenic -63985 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 278.333-16 chr13 95363573 95363889 + 1 NA Intergenic Intergenic -62280 NM_001105515 10257 Hs.508423 NM_005845 ENSG00000125257 ABCC4 MOAT-B|MOATB|MRP4 ATP binding cassette subfamily C member 4 protein-coding 258.667-17 chr10 127233956 127234268 + 1 NA intron (NM_001290223, intron 27 of 51) intron (NM_001290223, intron 27 of 51) -37521 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 162.667-273 chr8 95293708 95294001 + 1 NA intron (NR_038206, intron 1 of 4) intron (NR_038206, intron 1 of 4) -24653 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 143.667-244 chr8 40030074 40030297 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 95230 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 126.333-127 chr3 196800464 196800652 + 1 NA intron (NM_002577, intron 2 of 14) L1MEf|LINE|L1 60701 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 276.333-32 chr22 25950994 25951614 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 37 of 43) intron (NM_001318245, intron 37 of 43) 209116 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 198.667-56 chr13 90598407 90598615 + 1 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 105223 NR_120414 101927224 Hs.385801 NR_120414 LINC01049 - long intergenic non-protein coding RNA 1049 ncRNA 152.667-339 chr7 29188256 29188416 + 1 NA intron (NM_001371264, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 1721 NM_001371263 151.333-124 chr14 55038692 55038956 + 1 NA intron (NM_199421, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 11588 NM_199421 122809 Hs.744302 NM_080867 ENSG00000180008 SOCS4 SOCS7 suppressor of cytokine signaling 4 protein-coding 182.667-28 chr11 123026768 123027103 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 9369 NR_027288 341056 Hs.620309 NR_027288 LOC341056 - SUMO1 activating enzyme subunit 1 pseudogene pseudo 193.667-33 chr12 60331615 60331828 + 1 NA Intergenic Intergenic 642351 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 198.333-15 chr1 164993816 164994031 + 1 NA Intergenic Intergenic -219282 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 224.333-106 chr6 2646980 2647337 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12555 NR_131168 154386 Hs.680574 NM_152554 ENSG00000164385 LINC01600 C6orf195|bA145H9.2 long intergenic non-protein coding RNA 1600 ncRNA 146.333-298 chr6 162357811 162357964 + 1 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) L1MC2|LINE|L1 -369245 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 149.333-150 chr17 73468780 73468961 + 1 NA intron (NM_001144952, intron 3 of 44) AluSg|SINE|Alu -44813 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 157.667-306 chr7 52205184 52205423 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -812047 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 166.333-123 chr2 124000837 124001069 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 24221 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 145.333-36 chr10 61135322 61135504 + 1 NA Intergenic Intergenic 119138 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 227.333-99 chr5 25790685 25791060 + 1 NA Intergenic Intergenic 599919 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 129.333-174 chr7 51879646 51879843 + 1 NA Intergenic Intergenic -486488 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 154.667-235 chr3 36758824 36759127 + 1 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -19114 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 285.333-31 chr2 70168508 70168864 + 1 NA intron (NR_145969, intron 6 of 8) intron (NR_145969, intron 6 of 8) 22025 NM_001348763 54980 Hs.720049 NM_017880 ENSG00000115998 C2orf42 - chromosome 2 open reading frame 42 protein-coding 274.333-14 chr12 90146402 90146723 + 1 NA Intergenic Intergenic -146756 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 206.333-122 chr4 82260747 82261075 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 113080 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 130.333-186 chr6 147497784 147497994 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -10801 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 179.333-6 chr1 66762402 66762623 + 1 NA intron (NM_152665, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 10053 NM_152665 200132 Hs.479226 NM_152665 ENSG00000152760 TCTEX1D1 - Tctex1 domain containing 1 protein-coding 248.333-49 chr2 211753554 211754037 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 4 of 26) intron (NM_001042599, intron 4 of 26) 672565 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 243.333-85 chr5 7228272 7228558 + 1 NA Intergenic Intergenic 40939 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 176.667-27 chr10 55468830 55469071 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -130092 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 253.667-58 chr5 91854224 91854640 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -471115 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 151.333-33 chr1 202335628 202335799 + 1 NA exon (NM_014176, exon 2 of 7) exon (NM_014176, exon 2 of 7) 6223 NM_014176 29089 Hs.5199 NM_014176 ENSG00000077152 UBE2T FANCT|HSPC150|PIG50 ubiquitin conjugating enzyme E2 T protein-coding 148.333-237 chr21 44731026 44731269 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -19575 NM_144991 54084 Hs.660703 NM_144991 ENSG00000175894 TSPEAR C21orf29|DFNB98|ECTD14|TSP-EAR thrombospondin type laminin G domain and EAR repeats protein-coding 157.667-360 chr9 125469730 125470027 + 1 NA intron (NM_001006619, intron 8 of 10) intron (NM_001006619, intron 8 of 10) 208052 NM_001354293 26130 Hs.42376 NM_015635 ENSG00000165219 GAPVD1 GAPEX5|GAPex-5|RAP6 GTPase activating protein and VPS9 domains 1 protein-coding 160.667-317 chr8 138639138 138639429 + 1 NA intron (NM_152888, intron 47 of 64) MIRb|SINE|MIR -141553 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 192.333-51 chr14 59103604 59103948 + 1 NA Intergenic Intergenic -84891 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 148.667-164 chr18 6042112 6042323 + 1 NA intron (NM_001365767, intron 16 of 16) intron (NM_001365767, intron 16 of 16) -146263 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 151.667-121 chr15 26250284 26250510 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 134584 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 151.667-185 chr20 4011477 4011729 + 1 NA intron (NM_001134338, intron 1 of 6) HAL1|LINE|L1 3955 NM_001134338 11237 Hs.547576 NM_007219 ENSG00000101236 RNF24 G1L ring finger protein 24 protein-coding 164.667-82 chr15 65875710 65875920 + 1 NA intron (NM_004663, intron 1 of 4) intron (NM_004663, intron 1 of 4) 6324 NM_004663 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 167.667-212 chr8 131401827 131402015 + 1 NA Intergenic Intergenic -361012 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 165.667-224 chrX 155417408 155417594 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -34303 NR_036259 100422985 NR_036259 ENSG00000221190 MIR1184-2 - microRNA 1184-2 ncRNA 181.333-149 chr6 40381092 40381319 + 1 NA Intergenic Intergenic 2868 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 355.333 chr1 88418411 88418928 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -265475 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 325.333-39 chr5 126400839 126401434 + 1 NA intron (NM_001146319, intron 1 of 13) L1M3c|LINE|L1 -22010 NM_001146321 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 230.333-120 chr8 115145547 115145923 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 522278 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 128.333-54 chr14 25622913 25623137 + 1 NA Intergenic Intergenic -572728 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 310.667-42 chr9 27651819 27652337 + 1 NA Intergenic Intergenic -78212 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 276.667-30 chr15 95166034 95166553 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 160807 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 128.667-28 chr10 94889424 94889621 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -49136 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 167.667-83 chr17 58831503 58831741 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) HAL1|LINE|L1 75753 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 249.667-96 chr8 66405120 66405580 + 1 NA Intergenic Intergenic 23627 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 221.667-22 chr12 55133047 55133493 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 3501 NM_001005243 441639 Hs.553827 NM_001005243 ENSG00000170605 OR9K2 OR12-2 olfactory receptor family 9 subfamily K member 2 protein-coding 135.333-166 chr7 3733989 3734200 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -395591 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 167.667-35 chr11 28443464 28443765 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 33934 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 149.667-315 chr5 59049307 59049548 + 1 NA intron (NM_006203, intron 5 of 14) intron (NM_006203, intron 5 of 14) -9951 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 223.333-152 chr7 26534668 26534968 + 1 NA non-coding (NR_022006, exon 2 of 2) non-coding (NR_022006, exon 2 of 2) 4007 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 157.667-174 chr20 58755383 58755574 + 1 NA Intergenic Intergenic -17947 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 225.333-33 chr12 65846848 65847270 + 1 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -20085 NR_026825 204010 Hs.558686 NR_026825 ENSG00000241749 RPSAP52 RPSA_17_1251 ribosomal protein SA pseudogene 52 pseudo 150.667-76 chr11 99320726 99320895 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) MLT2B4|LTR|ERVL -235335 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 136.667-170 chr7 92969394 92969545 + 1 NA Intergenic Intergenic -132842 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 113.333-235 chr7 20277775 20277934 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -18854 NR_110117 101927769 Hs.256080 NR_110117 ENSG00000226097 LOC101927769 - uncharacterized LOC101927769 ncRNA 120.667-110 chr21 14698110 14698374 + 1 NA Intergenic Intergenic -55135 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 183.333-90 chr2 221438462 221438915 + 1 NA intron (NM_001363748, intron 11 of 17) AluSz|SINE|Alu 133616 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 131.333-187 chr8 139932567 139932713 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) AluSx|SINE|Alu 167895 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 155.333 chr1 21295470 21295753 + 1 NA intron (NR_038404, intron 2 of 2) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 2321 NR_038404 100506801 Hs.663049 NR_038404 ENSG00000231105 LOC100506801 - uncharacterized LOC100506801 ncRNA 157.667-27 chr10 30534284 30534483 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 95370 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 232.667-16 chr12 97442533 97442994 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -20013 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 236.333-52 chr20 17163878 17164242 + 1 NA Intergenic Intergenic -62047 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 150.333-94 chr13 47808535 47808756 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 123977 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 210.667-52 chr16 21015158 21015488 + 1 NA intron (NM_001347886, intron 41 of 61) L1MC2|LINE|L1 114061 NM_001369644 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 144.667-194 chr3 86346545 86346813 + 1 NA Intergenic Intergenic -135264 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 152.667-296 chr5 81561631 81561813 + 1 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) intron (NM_012446, intron 4 of 16) -167588 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 175.667-123 chr5 175072733 175073079 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -77175 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 182.333-130 chr5 83841464 83841682 + 1 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -120718 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 117.667-69 chr17 31169920 31170104 + 1 NA intron (NM_001042492, intron 5 of 57) intron (NM_001042492, intron 5 of 57) 75035 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 292.667-26 chr4 89170187 89170583 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 57568 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 149.333-69 chr10 124765510 124765782 + 1 NA intron (NM_001304468, intron 4 of 5) intron (NM_001304468, intron 4 of 5) -21268 NM_014661 9679 Hs.129195 NM_014661 ENSG00000189319 FAM53B KIAA0140|bA12J10.2|smp family with sequence similarity 53 member B protein-coding 250.333-66 chr6 136840185 136840469 + 1 NA intron (NM_000288, intron 3 of 9) L1ME3E|LINE|L1 17735 NM_000288 5191 Hs.280932 NM_000288 ENSG00000112357 PEX7 PBD9B|PTS2R|RCDP1|RD peroxisomal biogenesis factor 7 protein-coding 299.333-63 chr6 20071378 20071777 + 1 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy 140892 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 152.667-6 chr1 70967182 70967453 + 1 NA intron (NM_198716, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 -79189 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 161.333-26 chr10 25427783 25428004 + 1 NA intron (NM_020752, intron 4 of 10) intron (NM_020752, intron 4 of 10) -223819 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 283.333-59 chr5 57191954 57192301 + 1 NA intron (NM_001331037, intron 2 of 12) intron (NM_001331037, intron 2 of 12) 16679 NM_001127235 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 114.333-24 chr10 43513752 43513893 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 54637 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 180.667-145 chr8 99057670 99058010 + 1 NA intron (NR_047582, intron 4 of 8) L2|LINE|L2 44574 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 143.333-285 chr8 59561849 59562127 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 442778 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 227.667-12 chr11 119963342 119963684 + 1 NA Intergenic Intergenic 165340 NM_001330382 23650 Hs.504115 NM_012101 ENSG00000137699 TRIM29 ATDC tripartite motif containing 29 protein-coding 300.667-32 chr4 104574858 104575231 + 1 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) intron (NR_125926, intron 1 of 9) -80150 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 149.333-343 chr6 112075165 112075354 + 1 NA intron (NM_016262, intron 8 of 11) AluJb|SINE|Alu 12223 NM_016262 51175 Hs.34851 NM_016262 ENSG00000074935 TUBE1 TUBE|dJ142L7.2 tubulin epsilon 1 protein-coding 163.667-207 chr6 37452005 37452277 + 1 NA intron (NM_015050, intron 6 of 23) MIRb|SINE|MIR 18920 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 145.333-221 chr4 100965290 100965540 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 275457 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 157.333-172 chr2 38592636 38592838 + 1 NA intron (NM_138394, intron 1 of 12) intron (NM_138394, intron 1 of 12) 10191 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 210.667-12 chr10 7945516 7945847 + 1 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 106810 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 164.333-142 chr21 16472578 16472849 + 1 NA intron (NR_136550, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 52418 NR_136550 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 122.667-78 chr18 57201361 57201654 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -30313 NR_149129 105372138 Hs.574448 NR_149129 ENSG00000267726 LINC02565 - long intergenic non-protein coding RNA 2565 ncRNA 240.333-89 chr7 138424531 138424895 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -35546 NM_003852 8805 Hs.490287 NM_003852 ENSG00000122779 TRIM24 PTC6|RNF82|TF1A|TIF1|TIF1A|TIF1ALPHA|hTIF1 tripartite motif containing 24 protein-coding 156.667-21 chr1 114256857 114257167 + 1 NA Intergenic Intergenic -103143 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 165.667-68 chr16 85709465 85709761 + 1 NA intron (NR_161453, intron 2 of 2) intron (NR_161453, intron 2 of 2) -20659 NM_016095 51659 Hs.433180 NM_016095 ENSG00000131153 GINS2 HSPC037|PSF2|Pfs2 GINS complex subunit 2 protein-coding 157.667-57 chr11 81381149 81381420 + 1 NA Intergenic Intergenic 509552 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 146.667-40 chr10 76062366 76062657 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 279750 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 148.333-253 chr3 87791098 87791319 + 1 NA Intergenic Intergenic -1498 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 176.667-38 chr11 96462919 96463102 + 1 NA intron (NR_047481, intron 1 of 4) intron (NR_047481, intron 1 of 4) 43867 NR_047481 100874053 Hs.742044 NR_047481 JRKL-AS1 - JRKL antisense RNA 1 ncRNA 180.333-7 chr1 182278781 182279058 + 1 NA intron (NR_104175, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 35142 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 307.667-38 chr7 49351790 49352227 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -421630 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 165.667-13 chr1 229340142 229340359 + 1 NA intron (NM_145257, intron 2 of 3) intron (NM_145257, intron 2 of 3) 2797 NM_145257 126731 Hs.585011 NM_145257 ENSG00000154429 CCSAP C1orf96|CSAP centriole, cilia and spindle associated protein protein-coding 146.333-44 chr11 6752289 6752454 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 16586 NM_001004490 338755 Hs.534614 NM_001004490 ENSG00000188124 OR2AG2 OR11-76|OR2AG2P olfactory receptor family 2 subfamily AG member 2 protein-coding 161.667-189 chr4 58192294 58192604 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 343879 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 141.333-245 chr8 119002707 119002928 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) 50554 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 385.667-9 chr5 132589779 132590499 + 1 NA intron (NM_005732, intron 9 of 24) intron (NM_005732, intron 9 of 24) 33162 NM_005732 10111 Hs.633509 NM_005732 ENSG00000113522 RAD50 NBSLD|RAD502|hRad50 RAD50 double strand break repair protein protein-coding 243.667-20 chr14 35559234 35559660 + 1 NA intron (NM_014990, intron 38 of 40) intron (NM_014990, intron 38 of 40) 25283 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 152.333-346 chr6 164533381 164533551 + 1 NA Intergenic Intergenic 288597 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 259.333-78 chr5 42806344 42806795 + 1 NA intron (NM_001085486, intron 4 of 5) L2|LINE|L2 5323 NM_005410 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 239.333-27 chr12 132840511 132840896 + 1 NA 3' UTR (NM_001161347, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001161347, exon 16 of 16) -11834 NM_001172557 2802 Hs.507333 NM_005895 ENSG00000090615 GOLGA3 GCP170|MEA-2 golgin A3 protein-coding 119.667-103 chr21 18841978 18842148 + 1 NA Intergenic Intergenic -82251 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 153.333-161 chr17 44933297 44933461 + 1 NA intron (NM_001265577, intron 7 of 15) intron (NM_001265577, intron 7 of 15) 1302 NR_106841 102466734 NR_106841 ENSG00000278223 MIR6783 hsa-mir-6783 microRNA 6783 ncRNA 262.667-69 chr6 54348545 54348853 + 1 NA intron (NM_014464, intron 6 of 10) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 40258 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 153.333-244 chr20 55563244 55563476 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -136163 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 260.333-74 chr9 129658680 129659139 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6738 NM_016307 51450 Hs.660115 NM_016307 ENSG00000167157 PRRX2 PMX2|PRX2 paired related homeobox 2 protein-coding 264.667-49 chr21 20075053 20075515 + 1 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -175529 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 211.667-103 chr6 130273056 130273373 + 1 NA intron (NM_001258275, intron 2 of 13) L1M1|LINE|L1 -50263 NM_001017373 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 152.333-219 chr22 27858325 27858507 + 1 NA exon (NM_001284277, exon 10 of 11) exon (NM_001284277, exon 10 of 11) -56660 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 161.333-93 chr14 60512543 60512845 + 1 NA 3' UTR (NM_007374, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_007374, exon 2 of 2) 3548 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 330.667-31 chr9 71312742 71313210 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) L1MC1|LINE|L1 133995 NM_001366141 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 167.667-209 chr8 122651048 122651286 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 42939 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 157.333-181 chr2 61257324 61257607 + 1 NA intron (NM_014709, intron 44 of 79) intron (NM_014709, intron 44 of 79) 80047 NR_152216 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 167.333-141 chr2 125495227 125495433 + 1 NA Intergenic Intergenic 622655 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 129.333-64 chr14 64167691 64167842 + 1 NA intron (NM_015180, intron 92 of 114) intron (NM_015180, intron 92 of 114) -46378 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 175.333-190 chr8 114482664 114482867 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1045826 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 158.667-218 chr3 117919836 117920145 + 1 NA Intergenic Intergenic -229065 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 138.667 chr1 21254237 21254418 + 1 NA intron (NM_001113347, intron 6 of 16) FLAM_C|SINE|Alu 25288 NM_001113347 1889 Hs.195080 NM_001397 ENSG00000117298 ECE1 ECE endothelin converting enzyme 1 protein-coding 161.667-92 chr15 85444963 85445244 + 1 NA intron (NM_007200, intron 1 of 36) intron (NM_007200, intron 1 of 36) 64500 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 156.333-96 chr13 99658861 99659052 + 1 NA intron (NR_104592, intron 1 of 9) intron (NR_104592, intron 1 of 9) 15897 NR_036191 100422861 NR_036191 ENSG00000263615 MIR4306 mir-4306 microRNA 4306 ncRNA 169.333-141 chr20 33457134 33457457 + 1 NA Intergenic Intergenic -13403 NM_003098 6640 Hs.31121 NM_003098 ENSG00000101400 SNTA1 LQT12|SNT1|TACIP1|dJ1187J4.5 syntrophin alpha 1 protein-coding 169.667-174 chr5 144335674 144335890 + 1 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 130391 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 208.333-79 chr2 160755247 160755567 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -261600 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 229.333-40 chr15 25452394 25452722 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -13502 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 153.667-184 chr2 70963934 70964194 + 1 NA intron (NM_001692, intron 11 of 13) intron (NM_001692, intron 11 of 13) -14381 NM_001369683 79998 Hs.512744 NM_024933 ENSG00000144031 ANKRD53 - ankyrin repeat domain 53 protein-coding 186.333-133 chr5 156625522 156625782 + 1 NA intron (NM_001128209, intron 5 of 7) intron (NM_001128209, intron 5 of 7) -224643 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 285.333-26 chr17 76641529 76641933 + 1 NA intron (NM_001289107, intron 1 of 9) L1ME3G|LINE|L1 2026 NR_110309 55808 Hs.105352 NM_018414 ENSG00000070526 ST6GALNAC1 HSY11339|SIAT7A|ST6GalNAcI|STYI ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 166.333-122 chr2 116863625 116863896 + 1 NA Intergenic Intergenic -950931 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 228.333-75 chr5 34553204 34553567 + 1 NA Intergenic Intergenic -102943 NM_015577 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 128.333-32 chr11 12038151 12038331 + 1 NA intron (NR_135109, intron 1 of 1) L1PA15|LINE|L1 7366 NR_135109 105376554 Hs.523483 NR_135109 ENSG00000254486 LINC02547 - long intergenic non-protein coding RNA 2547 ncRNA 173.667-172 chr8 22652715 22652897 + 1 NA intron (NM_018688, intron 1 of 8) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -10597 NR_027715 80094 Hs.675917 NM_025026 BIN3-IT1 - BIN3 intronic transcript 1 ncRNA 191.333-42 chr12 3508134 3508490 + 1 NA intron (NM_019854, intron 1 of 9) intron (NM_019854, intron 1 of 9) -15493 NR_126055 100129223 Hs.586788 NR_126055 THCAT155 - thyroid cancer-associated transcript 155 ncRNA 123.333-126 chr20 7476620 7476800 + 1 NA Intergenic Intergenic 105102 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 150.667-362 chr8 27769781 27769958 + 1 NA intron (NR_156432, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu 2771 NM_018246 55246 Hs.445512 NM_018246 ENSG00000147419 CCDC25 - coiled-coil domain containing 25 protein-coding 174.667-8 chr1 114779375 114779724 + 1 NA intron (NR_049742, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 1136 NM_001102396 80143 Hs.709277 NM_025073 ENSG00000052723 SIKE1 SIKE suppressor of IKBKE 1 protein-coding 163.667-13 chr1 229220699 229221001 + 1 NA Intergenic (TACCATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -46049 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 121.667-205 chr8 104974036 104974248 + 1 NA Intergenic Intergenic -344296 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 178.333-182 chrX 81878813 81878997 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 676803 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 121.333-9 chr1 114666805 114666963 + 1 NA intron (NM_001256404, intron 1 of 20) intron (NM_001256404, intron 1 of 20) 3165 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 235.333-48 chr19 44319565 44319980 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -14747 NM_004234 9310 Hs.613424 NM_004234 ENSG00000159917 ZNF235 ANF270|HZF6|ZFP93|ZNF270 zinc finger protein 235 protein-coding 145.667-308 chr9 74442183 74442333 + 1 NA Intergenic Intergenic -55077 NM_006914 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 141.667-173 chr5 29657017 29657291 + 1 NA Intergenic Intergenic -223406 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 189.667-42 chr14 43241520 43241871 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 1265588 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 135.333-200 chr8 125564274 125564418 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 132137 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 142.333-22 chr10 52715152 52715326 + 1 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 40165 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 164.333-44 chr11 96605967 96606163 + 1 NA Intergenic Intergenic 97640 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 196.667-95 chr3 56079793 56080065 + 1 NA intron (NR_132749, intron 7 of 17) intron (NR_132749, intron 7 of 17) -227335 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 118.333-59 chr13 92319150 92319304 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 32980 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 242.667-46 chr18 64633581 64633979 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -373725 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 156.333-265 chr4 55807348 55807638 + 1 NA Intergenic Intergenic -12510 NM_001351574 644145 Hs.570825 NM_001351574 ENSG00000250821 EXOC1L - exocyst complex component 1 like protein-coding 264.667-82 chr8 9596329 9596874 + 1 NA intron (NM_003747, intron 2 of 26) intron (NM_003747, intron 2 of 26) 40689 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 146.333-278 chr5 169922922 169923189 + 1 NA intron (NM_001346304, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 57440 NM_001129891 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 151.333-406 chr8 37617858 37618024 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -77841 NM_025069 80139 Hs.288042 NM_025069 ENSG00000183779 ZNF703 NLZ1|ZEPPO1|ZNF503L|ZPO1 zinc finger protein 703 protein-coding 178.667-148 chr6 166113886 166114089 + 1 NA Intergenic Intergenic 16267 NR_147704 729681 Hs.520550 NR_147704 LOC729681 - uncharacterized LOC729681 ncRNA 220.667-44 chr2 65343388 65343705 + 1 NA intron (NM_001128210, intron 2 of 5) intron (NM_001128210, intron 2 of 5) 23232 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 174.333-33 chr13 45251438 45251679 + 1 NA intron (NM_004128, intron 5 of 7) intron (NM_004128, intron 5 of 7) -50513 NM_198404 386618 Hs.23406 NM_198404 ENSG00000180332 KCTD4 bA321C24.3 potassium channel tetramerization domain containing 4 protein-coding 277.333-10 chr10 108187438 108187779 + 1 NA Intergenic Intergenic -118315 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 215.667-67 chr2 178396478 178396822 + 1 NA 3' UTR (NM_001201481, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_001201481, exon 24 of 24) -17009 NR_110204 101927027 Hs.715694 NR_110204 ENSG00000223960 CHROMR CHROME|PRKRA-AS1 cholesterol induced regulator of metabolism RNA ncRNA 210.333-13 chr10 21513124 21513450 + 1 NA TTS (NM_207371) TTS (NM_207371) 12395 NM_207371 387640 Hs.350848 NM_207371 ENSG00000180592 SKIDA1 C10orf140|DLN-1 SKI/DACH domain containing 1 protein-coding 151.333-425 chr8 104942581 104942753 + 1 NA Intergenic Intergenic -353643 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 248.333-9 chr10 15078817 15079187 + 1 NA non-coding (NR_144471, exon 2 of 8) non-coding (NR_144471, exon 2 of 8) 9774 NR_144471 108949267 Hs.723069 NR_144471 ACBD7-DCLRE1CP1 - ACBD7-DCLRE1CP1 readthrough ncRNA 167.333-81 chr14 60949184 60949377 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) intron (NM_001177963, intron 6 of 6) 31799 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 252.667-84 chr5 129109330 129109667 + 1 NA intron (NM_016048, intron 4 of 4) intron (NM_016048, intron 4 of 4) 11810 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 248.333-17 chr11 113242160 113242674 + 1 NA intron (NM_001076682, intron 15 of 18) AluSz|SINE|Alu 31484 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 130.333-43 chr11 36627293 36627497 + 1 NA intron (NM_001276725, intron 2 of 3) LTR86A1|LTR|ERVL -29116 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 272.667-16 chr13 63960800 63961303 + 1 NA Intergenic Intergenic 114960 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 157.333-230 chr3 75105377 75105600 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -108988 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 167.333-203 chr4 181485228 181485461 + 1 NA Intergenic Intergenic -220315 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 251.667-40 chr2 66285121 66285427 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 73054 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 141.333-113 chr2 112218892 112219112 + 1 NA intron (NM_032494, intron 8 of 8) L1M3|LINE|L1 36040 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 128.667-192 chr8 141504484 141504644 + 1 NA intron (NR_160399, intron 1 of 29) L1ME1|LINE|L1 2665 NR_160399 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 183.667-95 chr3 176314892 176315142 + 1 NA Intergenic Intergenic 70466 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 189.333-205 chr8 80066957 80067160 + 1 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) intron (NM_001025253, intron 1 of 7) 13772 NM_001025252 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 294.333-45 chr8 18643637 18644335 + 1 NA intron (NM_015310, intron 10 of 15) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 164881 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 118.667-139 chr3 103206859 103207082 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 317146 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 127.333-52 chr14 84072089 84072291 + 1 NA Intergenic Intergenic -1199742 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 222.667-35 chr17 62719415 62719694 + 1 NA intron (NM_001288780, intron 9 of 10) L1MCa|LINE|L1 13348 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 199.667-30 chr11 96132497 96132852 + 1 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) MamRep605|LTR?|LTR? -208467 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 244.667-51 chr18 55705053 55705492 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -69315 NM_001243226 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 201.333-77 chr12 49481949 49482282 + 1 NA intron (NM_001293285, intron 4 of 14) intron (NM_001293285, intron 4 of 14) -56915 NM_001314030 23416 Hs.64064 NM_012284 ENSG00000135519 KCNH3 BEC1|ELK2|Kv12.2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 3 protein-coding 178.333-154 chr6 90302416 90302723 + 1 NA Intergenic Intergenic -5661 NM_001170794 60468 Hs.269764 NM_021813 ENSG00000112182 BACH2 BTBD25|IMD60 BTB domain and CNC homolog 2 protein-coding 152.333-276 chr4 88695843 88696062 + 1 NA TTS (NM_153757) TTS (NM_153757) 1877 NM_153757 266812 Hs.12554 NM_153757 ENSG00000177432 NAP1L5 DRLM nucleosome assembly protein 1 like 5 protein-coding 206.667-81 chr22 37248885 37249149 + 1 NA Intergenic Intergenic -4748 NM_002872 5880 Hs.517601 NM_002872 ENSG00000128340 RAC2 EN-7|Gx|HSPC022|p21-Rac2 Rac family small GTPase 2 protein-coding 182.333-127 chr5 63877118 63877358 + 1 NA Intergenic Intergenic 85054 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 188.667-157 chr9 33973607 33973948 + 1 NA intron (NM_001370059, intron 6 of 28) L1M4|LINE|L1 -20923 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 122.667-105 chr20 56516495 56516746 + 1 NA intron (NR_160308, intron 1 of 6) intron (NR_160308, intron 1 of 6) -8109 NM_001012971 200232 Hs.504907 NM_001012971 ENSG00000124103 FAM209A C20orf106|dJ1153D9.3 family with sequence similarity 209 member A protein-coding 137.333-189 chr8 33777053 33777266 + 1 NA Intergenic Intergenic -177053 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 229.333-20 chr12 16503241 16503517 + 1 NA Intergenic Intergenic 102000 NM_001243611 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 143.667-85 chr15 72142489 72142672 + 1 NA 3' UTR (NM_145204, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_145204, exon 2 of 2) 24177 NM_145204 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 157.333-75 chr11 124507125 124507392 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 36396 NM_001005195 219858 Hs.553634 NM_001005195 ENSG00000170953 OR8B12 OR11-317 olfactory receptor family 8 subfamily B member 12 protein-coding 187.667-145 chr8 124877134 124877377 + 1 NA Intergenic Intergenic -55197 NR_039809 100616255 NR_039809 ENSG00000263735 MIR4662B - microRNA 4662b ncRNA 140.333-187 chr5 111740056 111740220 + 1 NA TTS (NR_040093) TTS (NR_040093) 16113 NM_001142483 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 112.667-60 chr13 77324239 77324396 + 1 NA intron (NM_015057, intron 1 of 82) intron (NM_015057, intron 1 of 82) 2777 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 454.667-6 chr4 70129464 70130175 + 1 NA Intergenic Intergenic -3785 NR_033311 100337616 Hs.729824 NR_033311 CSN1S2BP CSN1S2B casein alpha s2 like B, pseudogene pseudo 166.333-102 chr2 3822998 3823289 + 1 NA intron (NM_001287444, intron 10 of 10) L1MCc|LINE|L1 116301 NM_001365580 728597 Hs.304233 NM_001287444 ENSG00000214866 DCDC2C - doublecortin domain containing 2C protein-coding 201.667-31 chr14 20897157 20897437 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 5894 NM_002935 6037 Hs.73839 NM_002935 ENSG00000169397 RNASE3 ECP|RAF1|RNS3 ribonuclease A family member 3 protein-coding 150.333-397 chr8 60296951 60297204 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -15677 NM_001321837 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 198.333-75 chr16 34076919 34077249 + 1 NA Intergenic (ATCAAATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -86494 NR_162093 113218496 NR_162093 MIR9901 - microRNA 9901 ncRNA 210.667-107 chr5 68295665 68296099 + 1 NA intron (NM_181524, intron 8 of 9) intron (NM_181524, intron 8 of 9) 3305 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 161.333-205 chr4 8339665 8339922 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 19617 NR_149126 105374374 Hs.145224 NR_149125 ENSG00000249145 LINC02517 - long intergenic non-protein coding RNA 2517 ncRNA 151.333-105 chr12 64563512 64563730 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -46874 NR_040718 283349 Hs.643605 NM_178169 ENSG00000153179 RASSF3 RASSF5 Ras association domain family member 3 protein-coding 187.333-95 chr2 60839202 60839479 + 1 NA Intergenic Intergenic 41974 NR_033980 400957 Hs.170358 NR_033980 ENSG00000228414 LINC01185 - long intergenic non-protein coding RNA 1185 ncRNA 153.667-346 chr6 142218792 142218950 + 1 NA 3' UTR (NM_001286372, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001286372, exon 6 of 6) 71608 NM_016485 51534 Hs.431367 NM_016485 ENSG00000009844 VTA1 C6orf55|DRG-1|DRG1|HSPC228|LIP5|My012|SBP1 vesicle trafficking 1 protein-coding 218.333-119 chr7 133349142 133349390 + 1 NA intron (NM_021807, intron 5 of 17) L1MB3|LINE|L1 58385 NR_106749 102465139 NR_106749 ENSG00000276137 MIR6133 hsa-mir-6133 microRNA 6133 ncRNA 216.667-25 chr11 108711921 108712207 + 1 NA intron (NM_004398, intron 10 of 17) L1MCa|LINE|L1 46995 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 236.333-79 chr6 41606927 41607406 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 8443 NR_039784 100616178 NR_039784 ENSG00000266494 MIR4641 - microRNA 4641 ncRNA 245.333-79 chr3 120091469 120091844 + 1 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 2791 NM_001354596 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 169.333-116 chr2 45186359 45186684 + 1 NA intron (NR_033831, intron 4 of 5) intron (NR_033831, intron 4 of 5) 68420 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 271.667-78 chr9 25161852 25162180 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 516842 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 233.333-45 chr16 84848412 84848668 + 1 NA intron (NM_031476, intron 3 of 14) intron (NM_031476, intron 3 of 14) 28555 NM_031476 83716 Hs.513779 NM_031476 ENSG00000103196 CRISPLD2 CRISP11|LCRISP2|LGL1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 protein-coding 163.667-75 chr16 13351606 13351800 + 1 NA Intergenic Intergenic 450105 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 200.667-15 chr1 211061935 211062262 + 1 NA intron (NM_002238, intron 5 of 10) L1MA3|LINE|L1 71276 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 142.667-70 chr15 85781178 85781343 + 1 NA intron (NM_022480, intron 1 of 2) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -10682 NR_031682 100302121 NR_031682 ENSG00000221634 MIR1276 MIRN1276|hsa-mir-1276|mir-1276 microRNA 1276 ncRNA 235.333-24 chr11 86252895 86253320 + 1 NA intron (NM_001330334, intron 3 of 9) intron (NM_001330334, intron 3 of 9) 8354 NM_003797 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 155.333-310 chr5 151726181 151726387 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 32347 NM_004045 475 Hs.125213 NM_004045 ENSG00000177556 ATOX1 ATX1|HAH1 antioxidant 1 copper chaperone protein-coding 232.667-10 chr11 116221151 116221501 + 1 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -418096 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 185.667-84 chr21 24704622 24704970 + 1 NA Intergenic Intergenic -135754 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 147.667-140 chr17 60960051 60960204 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 282276 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 159.333-272 chr5 103191228 103191451 + 1 NA intron (NM_001345878, intron 27 of 28) intron (NM_001345878, intron 27 of 28) -67424 NM_033211 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 228.333-25 chr14 46646197 46646564 + 1 NA Intergenic Intergenic 5401 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 251.667-50 chr20 40743731 40744035 + 1 NA Intergenic Intergenic -29260 NR_145814 109623474 NR_145814 SNORD154 - small nucleolar RNA, C/D box 154 snoRNA 149.333-28 chr1 185115914 185116165 + 1 NA Intergenic Intergenic 40914 NM_030934 81627 Hs.107149 NM_030934 ENSG00000121486 TRMT1L C1orf25|MST070|MSTP070|TRM1L|bG120K12.3 tRNA methyltransferase 1 like protein-coding 195.667-155 chr9 130558842 130559143 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 20502 NR_027440 100272217 Hs.601255 NR_027440 LOC100272217 - uncharacterized LOC100272217 ncRNA 261.333-94 chr6 54890003 54890426 + 1 NA intron (NM_001010872, intron 2 of 4) intron (NM_001010872, intron 2 of 4) 43443 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 194.333-150 chr8 28945236 28945580 + 1 NA intron (NM_001324393, intron 2 of 11) intron (NM_001324393, intron 2 of 11) 54094 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 343.333 chr1 54160096 54160710 + 1 NA Intergenic Intergenic -7222 NM_201546 200008 NM_201546 ENSG00000157211 CDCP2 - CUB domain containing protein 2 protein-coding 188.333-150 chr8 34582734 34583080 + 1 NA Intergenic Intergenic -201014 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 158.667-286 chr6 66587116 66587275 + 1 NA Intergenic Intergenic 799316 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 168.667-79 chr17 54828354 54828591 + 1 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL -72219 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 230.667-37 chr2 47232544 47232839 + 1 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) intron (NR_110207, intron 1 of 2) -55755 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 155.333-399 chr8 122070911 122071183 + 1 NA Intergenic Intergenic -429607 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 196.333-68 chr17 71389774 71390110 + 1 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -187763 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 210.667-69 chr2 103567626 103568009 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -583388 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 207.667-107 chr6 87372735 87373057 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -24228 NR_026784 63914 Hs.645177 NM_022084 ENSG00000111850 LINC01590 C6orf164|dJ102H19.4 long intergenic non-protein coding RNA 1590 ncRNA 168.333-50 chr12 116495730 116495913 + 1 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -37601 NR_027345 100287569 Hs.441601 NM_207436 ENSG00000196668 LINC00173 NCRNA00173 long intergenic non-protein coding RNA 173 ncRNA 241.333-5 chr1 90749070 90749621 + 1 NA Intergenic Intergenic -32043 NM_020063 343472 Hs.451956 NM_020063 ENSG00000143032 BARHL2 - BarH like homeobox 2 protein-coding 181.333-34 chr12 41584820 41585054 + 1 NA Intergenic Intergenic 147198 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 192.333-96 chr2 146325398 146325773 + 1 NA Intergenic Intergenic -261472 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 256.667-19 chr12 41579939 41580376 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 142418 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 166.333-188 chr5 91200491 91200716 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 113799 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 164.667-8 chr1 90590346 90590644 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -67255 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 159.667-293 chr7 15004537 15004821 + 1 NA Intergenic Intergenic -29821 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 195.333-218 chr8 125770429 125770629 + 1 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger 180668 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 124.667-87 chr17 60517238 60517426 + 1 NA intron (NM_006380, intron 1 of 12) L1ME3A|LINE|L1 8908 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 168.667-171 chr5 42389301 42389614 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -33982 NM_000163 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 169.333-202 chr5 35795489 35795700 + 1 NA intron (NM_024867, intron 32 of 36) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -61297 NR_120485 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 301.667-31 chr3 108664485 108664989 + 1 NA intron (NM_014648, intron 21 of 32) L1MDa|LINE|L1 75015 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 155.667-284 chr5 90793091 90793255 + 1 NA intron (NR_003149, intron 70 of 89) intron (NR_003149, intron 70 of 89) 234376 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 148.667-98 chr12 125168814 125169045 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -17457 NM_001366854 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 215.667-45 chr17 9698225 9698581 + 1 NA intron (NM_001267576, intron 9 of 14) intron (NM_001267576, intron 9 of 14) 52866 NM_001267576 124739 Hs.709621 NM_153210 ENSG00000154914 USP43 - ubiquitin specific peptidase 43 protein-coding 148.667-5 chr1 43719013 43719247 + 1 NA intron (NR_125986, intron 2 of 3) LTR41|LTR|ERVL 8213 NR_125986 101929592 NR_125986 ENSG00000229444 LOC101929592 - uncharacterized LOC101929592 ncRNA 258.667-41 chr19 29198783 29199234 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 14143 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 220.333-116 chr6 23989330 23989739 + 1 NA Intergenic Intergenic -136681 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 285.333-60 chr6 62804486 62804883 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 515293 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 279.667-11 chr13 82442285 82442684 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1215501 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 273.667-36 chr2 181723674 181724221 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -43282 NM_002500 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 128.333-155 chr5 80449117 80449363 + 1 NA intron (NR_146172, intron 10 of 20) intron (NR_146172, intron 10 of 20) -38860 NM_205548 167555 Hs.338182 NM_205548 ENSG00000152380 FAM151B UNQ9217 family with sequence similarity 151 member B protein-coding 164.333-129 chr2 183096020 183096192 + 1 NA non-coding (NR_135688, exon 3 of 3) non-coding (NR_135688, exon 3 of 3) 17359 NM_080876 142679 Hs.132237 NM_080876 ENSG00000162999 DUSP19 DUSP17|LMWDSP3|SKRP1|TS-DSP1 dual specificity phosphatase 19 protein-coding 138.333-206 chr9 31473085 31473297 + 1 NA Intergenic Intergenic -91701 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 155.333-415 chr9 120053883 120054086 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 118924 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 157.333-255 chr4 52386712 52386933 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 269717 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 137.667-48 chr13 43767229 43767395 + 1 NA intron (NM_001347966, intron 1 of 17) intron (NM_001347966, intron 1 of 17) 19660 NM_001347970 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 152.667-298 chr5 94898842 94899005 + 1 NA intron (NM_001297777, intron 8 of 19) intron (NM_001297777, intron 8 of 19) 182943 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 148.333-360 chr7 33584096 33584472 + 1 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) L1M5|LINE|L1 -320631 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 170.333-133 chr22 37205792 37206003 + 1 NA 3' UTR (NM_001278687, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001278687, exon 2 of 2) 4792 NM_001278687 6753 Hs.225995 NM_001051 ENSG00000278195 SSTR3 SS-3-R|SS3-R|SS3R|SSR-28 somatostatin receptor 3 protein-coding 162.333-267 chr8 142952401 142952702 + 1 NA Intergenic Intergenic -34708 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 144.333-169 chr3 80174058 80174259 + 1 NA Intergenic Intergenic -406160 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 162.667-122 chr2 22684175 22684394 + 1 NA Intergenic Intergenic 147805 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 146.667-29 chr10 31569699 31569985 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -170087 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 162.667-285 chr8 135029247 135029559 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 179468 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 247.333-83 chr8 82208515 82208833 + 1 NA Intergenic Intergenic -366388 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 154.333-259 chr5 20379923 20380212 + 1 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 74516 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 202.333-98 chr2 161319121 161319557 + 1 NA intron (NM_005805, intron 3 of 11) intron (NM_005805, intron 3 of 11) 10914 NM_005805 10213 Hs.740477 NM_005805 ENSG00000115233 PSMD14 PAD1|POH1|RPN11 proteasome 26S subunit, non-ATPase 14 protein-coding 125.667-104 chr2 134660693 134660897 + 1 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 58205 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 170.667-168 chr8 123723650 123723980 + 1 NA intron (NM_004306, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 13578 NM_004306 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 145.333-310 chr8 132123907 132124073 + 1 NA 3' UTR (NM_004519, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_004519, exon 15 of 15) -18725 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 196.333-60 chr16 73167274 73167576 + 1 NA Intergenic Intergenic -22978 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 144.333-41 chr11 99572575 99572750 + 1 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 16517 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 250.667-12 chr11 81619904 81620198 + 1 NA Intergenic Intergenic 270785 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 172.667-153 chr7 101957733 101957976 + 1 NA intron (NM_001202544, intron 2 of 21) intron (NM_001202544, intron 2 of 21) 140228 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 192.333-66 chr17 17178352 17178646 + 1 NA intron (NM_201274, intron 21 of 23) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 27834 NM_178836 201164 Hs.729079 NM_178836 ENSG00000179598 PLD6 ZUC phospholipase D family member 6 protein-coding 162.667-271 chr8 87817684 87817893 + 1 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 56227 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 163.667-160 chr3 146206640 146206814 + 1 NA exon (NM_001177304, exon 3 of 6) exon (NM_001177304, exon 3 of 6) 43888 NM_001128305 57088 Hs.477869 NM_020353 ENSG00000114698 PLSCR4 TRA1 phospholipid scramblase 4 protein-coding 135.667-84 chr2 17745229 17745395 + 1 NA intron (NM_024624, intron 2 of 26) L1MD1|LINE|L1 8498 NM_001142286 79677 Hs.526728 NM_024624 ENSG00000163029 SMC6 SMC-6|SMC6L1|hSMC6 structural maintenance of chromosomes 6 protein-coding 234.667-71 chr3 113936060 113936455 + 1 NA intron (NM_001172105, intron 8 of 12) intron (NM_001172105, intron 8 of 12) -11644 NM_001363952 254887 Hs.21902 NM_173570 ENSG00000184307 ZDHHC23 DHHC-23|NIDD zinc finger DHHC-type containing 23 protein-coding 156.667-222 chr3 37979999 37980235 + 1 NA intron (NM_001008392, intron 7 of 7) intron (NM_001008392, intron 7 of 7) 10713 NR_029499 407015 NR_029499 ENSG00000199075 MIR26A1 MIR26A|MIRN26A1|mir-26a-1 microRNA 26a-1 ncRNA 131.667-55 chr14 51849501 51849681 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11021 NM_001243773 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 250.667-19 chr14 68683179 68683479 + 1 NA TTS (NM_001321818) TTS (NM_001321818) -54542 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 156.667-97 chr14 38724899 38725103 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -157595 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 208.333-110 chr4 100537189 100537422 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -19283 NM_001159694 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 155.667-87 chr13 104131049 104131305 + 1 NA Intergenic Intergenic 705977 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 168.667-223 chr8 101871405 101871606 + 1 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) -80536 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 154.667-116 chr14 74812264 74812459 + 1 NA intron (NM_019589, intron 10 of 20) intron (NM_019589, intron 10 of 20) 49045 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 252.333-11 chr11 9122252 9122591 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 28058 NR_027713 283102 Hs.689472 NR_027713 ENSG00000213538 KRT8P41 - keratin 8 pseudogene 41 pseudo 162.333-247 chr8 69260882 69261072 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -156787 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 140.333-105 chr2 98985179 98985517 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -49123 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 173.667-173 chr8 67166286 67166545 + 1 NA intron (NM_001363133, intron 21 of 27) intron (NM_001363133, intron 21 of 27) 82567 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 134.333-40 chr12 104196024 104196197 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -19669 NM_001093771 7296 Hs.654922 NM_003330 ENSG00000198431 TXNRD1 GRIM-12|TR|TR1|TRXR1|TXNR thioredoxin reductase 1 protein-coding 207.333-271 chr8 121747946 121748392 + 1 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL -106729 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 186.333-97 chr3 24434091 24434423 + 1 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -59830 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 126.333-155 chr6 110580938 110581157 + 1 NA Intergenic Intergenic -104434 NM_033125 85413 Hs.520319 NM_033125 ENSG00000004809 SLC22A16 CT2|FLIPT2|HEL-S-18|OAT6|OCT6|OKB1|dJ261K5.1 solute carrier family 22 member 16 protein-coding 196.333-71 chr18 269927 270215 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -2024 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 223.333-7 chr1 92051889 92052199 + 1 NA intron (NM_173567, intron 5 of 6) L1MC5a|LINE|L1 22059 NM_173567 253152 Hs.201555 NM_173567 ENSG00000172031 EPHX4 ABHD7|EH4|EPHXRP epoxide hydrolase 4 protein-coding 187.333-51 chr12 120244039 120244364 + 1 NA intron (NM_002859, intron 1 of 10) intron (NM_002859, intron 1 of 10) 5962 NM_025157 5829 Hs.446336 NM_002859 ENSG00000089159 PXN - paxillin protein-coding 144.333-133 chr2 125388801 125389040 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 729065 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 289.667-30 chr4 157880734 157881224 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -289773 NR_147408 285505 NR_147407 ENSG00000248429 FAM198B-AS1 - FAM198B antisense RNA 1 ncRNA 154.333-124 chr17 65770946 65771229 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) L1MEc|LINE|L1 55364 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 164.333-184 chr4 172425490 172425694 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 263325 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 187.333-207 chr8 134906522 134906833 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 56742 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 187.667-110 chr4 106238729 106239018 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 13 of 26) L1MCa|LINE|L1 -76737 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 112.667-147 chr20 21370792 21370941 + 1 NA intron (NM_001317960, intron 27 of 29) intron (NM_001317960, intron 27 of 29) 26660 NM_033176 644524 NM_033176 ENSG00000125816 NKX2-4 NKX2.4|NKX2D NK2 homeobox 4 protein-coding 112.667-20 chr1 218475245 218475464 + 1 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR 32728 NR_125715 103611157 Hs.133379 NR_125715 ENSG00000281453 TGFB2-OT1 - TGFB2 overlapping transcript 1 ncRNA 146.333-261 chr5 89288738 89289010 + 1 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -384769 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 239.667-71 chr7 97172462 97172871 + 1 NA intron (NM_020186, intron 1 of 1) intron (NM_020186, intron 1 of 1) 56073 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 198.667-47 chr12 27261998 27262291 + 1 NA intron (NM_015000, intron 1 of 13) intron (NM_015000, intron 1 of 13) 17858 NM_015000 23012 Hs.184523 NM_015000 ENSG00000211455 STK38L NDR2 serine/threonine kinase 38 like protein-coding 300.667-9 chr14 49108651 49109254 + 1 NA Intergenic (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 477428 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 299.667-24 chr3 150694848 150695450 + 1 NA intron (NM_001308234, intron 3 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -8415 NR_121675 101928085 Hs.561114 NR_121674 ENSG00000240137 ERICH6-AS1 - ERICH6 antisense RNA 1 ncRNA 255.333-55 chr2 76160265 76160798 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -449616 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 158.667-265 chr5 36640947 36641171 + 1 NA intron (NM_004172, intron 3 of 9) intron (NM_004172, intron 3 of 9) 34453 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 171.333-146 chr5 33077765 33077947 + 1 NA Intergenic Intergenic 130413 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 157.667-304 chr7 48322774 48323064 + 1 NA intron (NM_152701, intron 27 of 61) L1MD2|LINE|L1 151461 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 195.667-71 chr2 40319846 40320188 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 110287 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 139.667-165 chr6 158490536 158490776 + 1 NA intron (NM_020245, intron 9 of 13) L1ME3|LINE|L1 -45780 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 176.333-79 chr2 39741845 39742082 + 1 NA intron (NR_135664, intron 11 of 11) MIR|SINE|MIR 37295 NM_025264 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 169.333-236 chr6 165649322 165649510 + 1 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) intron (NM_006661, intron 1 of 22) 12684 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 150.333-70 chr11 120153269 120153463 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15253 NM_012101 23650 Hs.504115 NM_012101 ENSG00000137699 TRIM29 ATDC tripartite motif containing 29 protein-coding 134.333-96 chr2 215069220 215069452 + 1 NA intron (NR_103740, intron 2 of 54) intron (NR_103740, intron 2 of 54) -37250 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 132.667-137 chr5 43779747 43779895 + 1 NA Intergenic Intergenic -176591 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 185.333-82 chr2 38341364 38341720 + 1 NA intron (NM_001330461, intron 1 of 12) AluJr|SINE|Alu 34988 NM_001330459 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 180.667-31 chr12 78924426 78924667 + 1 NA intron (NM_001291901, intron 1 of 9) L1MC4|LINE|L1 59772 NM_001291901 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 226.667-86 chr7 41784492 41784860 + 1 NA Intergenic Intergenic -81586 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 153.333-370 chr6 162690034 162690270 + 1 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) intron (NM_004562, intron 1 of 11) -36980 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 227.333-114 chr7 37088113 37088377 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) intron (NM_001206480, intron 15 of 21) 90449 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 113.333-86 chr15 68969055 68969191 + 1 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) L1M4|LINE|L1 38598 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 247.333-79 chr7 111326885 111327463 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) L1MB1|LINE|L1 235117 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 152.667-285 chr5 13881278 13881445 + 1 NA intron (NM_001369, intron 21 of 78) L1M3de|LINE|L1 63119 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 251.667-44 chr2 143578651 143579023 + 1 NA intron (NM_018460, intron 11 of 13) intron (NM_018460, intron 11 of 13) -358230 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 128.333-2 chr1 25073054 25073287 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 49667 NR_039623 100616365 NR_039623 ENSG00000264371 MIR4425 - microRNA 4425 ncRNA 213.667-83 chr6 118784588 118785007 + 1 NA Intergenic Intergenic 2089 NR_037662 100287632 Hs.334026 NR_037662 SELENOKP3 - selenoprotein K pseudogene 3 pseudo 278.667-51 chr8 115978216 115978627 + 1 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -309446 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 164.333-3 chr1 98704634 98704956 + 1 NA intron (NR_033716, intron 8 of 8) intron (NR_033716, intron 8 of 8) 43074 NM_001364903 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 144.667-175 chr21 23066451 23066618 + 1 NA Intergenic Intergenic -12750 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 269.667-36 chr22 49618433 49618777 + 1 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) intron (NR_110523, intron 1 of 4) 38914 NR_110522 348645 Hs.133159 NM_198851 ENSG00000188511 C22orf34 - chromosome 22 open reading frame 34 protein-coding 258.333-35 chr2 191565089 191565497 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -112779 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 215.667-4 chr1 155374621 155374967 + 1 NA intron (NM_018489, intron 10 of 27) intron (NM_018489, intron 10 of 27) -28349 NR_030282 693140 NR_030282 ENSG00000283701 MIR555 MIRN555|hsa-mir-555 microRNA 555 ncRNA 161.333-201 chr3 158819249 158819543 + 1 NA intron (NM_022736, intron 7 of 15) intron (NM_022736, intron 7 of 15) 17342 NM_022736 64747 Hs.58663 NM_022736 ENSG00000118855 MFSD1 SMAP4 major facilitator superfamily domain containing 1 protein-coding 118.333-69 chr14 81004953 81005104 + 1 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 49407 NM_000369 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 161.667-184 chr4 36570907 36571259 + 1 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 70817 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 143.333-73 chr13 35456501 35456672 + 1 NA intron (NM_015678, intron 40 of 57) intron (NM_015678, intron 40 of 57) 20103 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 245.667-52 chr4 108962800 108963178 + 1 NA intron (NM_001256074, intron 6 of 31) intron (NM_001256074, intron 6 of 31) -199936 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 334.333-30 chr8 53031693 53032209 + 1 NA Intergenic Intergenic 92043 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 234.667-42 chr16 73282363 73282716 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -104266 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 155.667-349 chr8 73501013 73501282 + 1 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 81073 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 227.333-46 chr16 82997434 82997817 + 1 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) MIR|SINE|MIR -7327 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 170.333-6 chr1 92345867 92346166 + 1 NA intron (NM_024813, intron 11 of 12) intron (NM_024813, intron 11 of 12) 46957 NM_024813 79871 Hs.444421 NM_024813 ENSG00000122484 RPAP2 C1orf82|Rtr1 RNA polymerase II associated protein 2 protein-coding 202.667-46 chr14 36728468 36728701 + 1 NA intron (NM_001171170, intron 5 of 10) intron (NM_001171170, intron 5 of 10) 71016 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 165.333-83 chr15 42439438 42439629 + 1 NA exon (NM_001284307, exon 9 of 20) exon (NM_001284307, exon 9 of 20) 18034 NM_022473 64397 Hs.511143 NM_022473 ENSG00000103994 ZNF106 SH3BP3|ZFP106|ZNF474 zinc finger protein 106 protein-coding 195.333-202 chr7 47192731 47193177 + 1 NA Intergenic Intergenic 271849 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 122.667-70 chr17 57580128 57580323 + 1 NA intron (NM_001322250, intron 7 of 13) intron (NM_001322250, intron 7 of 13) 28187 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 252.667-91 chr6 133967948 133968283 + 1 NA intron (NM_004865, intron 1 of 6) AluSc|SINE|Alu 14891 NM_004865 9519 Hs.486507 NM_004865 ENSG00000028839 TBPL1 MGC:8389|MGC:9620|STUD|TLF|TLP|TRF2 TATA-box binding protein like 1 protein-coding 146.667-217 chr3 98886619 98886777 + 1 NA intron (NM_080927, intron 1 of 15) intron (NM_080927, intron 1 of 15) 14997 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 152.667-344 chr7 82544348 82544543 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -100489 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 114.333-188 chr5 163430222 163430447 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -7237 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 155.333-74 chr12 30162045 30162373 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -377450 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 131.333-107 chr21 24518973 24519122 + 1 NA intron (NR_135519, intron 1 of 2) L1PA10|LINE|L1 90307 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 160.667-71 chr12 41094009 41094260 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -94186 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 284.667 chr1 98760497 98761033 + 1 NA TTS (NM_001364903) TTS (NM_001364903) 99044 NM_001364903 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 155.667-170 chr2 113910432 113910637 + 1 NA intron (NM_001277140, intron 1 of 11) MER21B|LTR|ERVL -19542 NR_110174 101060091 Hs.741753 NR_110174 ACTR3-AS1 - ACTR3 antisense RNA 1 ncRNA 131.333-181 chr8 116641231 116641389 + 1 NA TTS (NM_003756) TTS (NM_003756) -10790 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 292.333-9 chr11 23439558 23440026 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -20602 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 296.667-59 chr8 121479779 121480256 + 1 NA Intergenic Intergenic -159329 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-318 chr5 114019647 114019924 + 1 NA Intergenic Intergenic -342285 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 196.667-62 chr17 79774981 79775283 + 1 NA Intergenic Intergenic -3016 NM_005189 84733 Hs.368410 NM_005189 ENSG00000173894 CBX2 CDCA6|M33|SRXY5 chromobox 2 protein-coding 198.667-187 chr8 127402392 127402809 + 1 NA TTS (NR_109834) TTS (NR_109834) 2201 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 178.667-14 chr1 223860352 223860585 + 1 NA Intergenic Intergenic -14496 NM_005426 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 125.667-128 chr3 191565921 191566122 + 1 NA intron (NR_120606, intron 4 of 6) intron (NR_120606, intron 4 of 6) 104858 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 130.333-184 chr6 122866768 122866949 + 1 NA Intergenic Intergenic 77600 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 167.667-142 chr3 137815772 137815970 + 1 NA Intergenic Intergenic 43960 NR_109987 100507274 Hs.360349 NR_109987 ENSG00000239513 LINC01210 - long intergenic non-protein coding RNA 1210 ncRNA 170.333-196 chr7 13616208 13616463 + 1 NA Intergenic Intergenic 370179 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 153.667-104 chr12 129651688 129651869 + 1 NA intron (NM_133448, intron 2 of 8) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie 252247 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 167.333-11 chr1 92439478 92439732 + 1 NA Intergenic Intergenic 44349 NM_001127215 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 216.333-143 chr8 140656803 140657173 + 1 NA TTS (NM_001316342) TTS (NM_001316342) -21355 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 158.667-355 chr9 95912102 95912286 + 1 NA intron (NM_020207, intron 4 of 18) HAL1|LINE|L1 36186 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 144.667-63 chr12 89685479 89685674 + 1 NA intron (NM_001366520, intron 1 of 21) MER5A|DNA|hAT-Charlie 23262 NM_001366525 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 160.667-112 chr16 65217614 65217829 + 1 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -41148 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 152.667-396 chr9 70854186 70854401 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 3 of 25) intron (NM_001366143, intron 3 of 25) 14759 NM_001366154 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 154.667-416 chr9 111273012 111273250 + 1 NA Intergenic Intergenic -1917 NR_106989 102465800 NR_106989 ENSG00000274263 MIR7702 hsa-mir-7702 microRNA 7702 ncRNA 147.667-317 chr6 63642499 63642722 + 1 NA intron (NM_001290260, intron 1 of 3) intron (NM_001290260, intron 1 of 3) -3916 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 175.667-18 chr10 62944392 62944665 + 1 NA Intergenic Intergenic -125361 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 152.667-349 chr7 98166943 98167137 + 1 NA intron (NM_014916, intron 6 of 13) intron (NM_014916, intron 6 of 13) -45214 NM_177455 168620 Hs.511979 NM_177455 ENSG00000180535 BHLHA15 BHLHB8|MIST1 basic helix-loop-helix family member a15 protein-coding 159.667-191 chr20 15166593 15166800 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) L1MEd|LINE|L1 -30144 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 228.333-12 chr11 59622651 59623149 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -7126 NM_002556 5007 Hs.597091 NM_002556 ENSG00000110048 OSBP OSBP1 oxysterol binding protein protein-coding 234.667-109 chr8 63118712 63118985 + 1 NA Intergenic Intergenic -32795 NM_000370 7274 Hs.69049 NM_000370 ENSG00000137561 TTPA ATTP|AVED|TTP1|alphaTTP alpha tocopherol transfer protein protein-coding 159.333-86 chr14 45920401 45920630 + 1 NA Intergenic Intergenic -143644 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 148.667-212 chr2 207097361 207097620 + 1 NA intron (NR_073108, intron 3 of 4) intron (NR_073108, intron 3 of 4) 12583 NR_036227 100423036 NR_036227 ENSG00000253008 MIR2355 mir-2355 microRNA 2355 ncRNA 201.667-51 chr2 16103952 16104252 + 1 NA Intergenic Intergenic 53675 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 261.667-46 chr22 32889006 32889479 + 1 NA intron (NM_003490, intron 4 of 13) intron (NM_003490, intron 4 of 13) 88426 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 272.333-44 chr3 99399284 99399773 + 1 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -239066 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 146.333-121 chr17 52964552 52964808 + 1 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -20825 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 135.667-137 chr4 167704083 167704250 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -388371 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 248.333 chr1 33040213 33040618 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -3504 NM_001319140 204 Hs.470907 NM_001625 ENSG00000004455 AK2 ADK2 adenylate kinase 2 protein-coding 151.667-351 chr8 19949022 19949244 + 1 NA intron (NM_000237, intron 2 of 9) intron (NM_000237, intron 2 of 9) 9880 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 255.667-27 chr15 71826222 71826688 + 1 NA 3' UTR (NM_006901, exon 42 of 42) 3' UTR (NM_006901, exon 42 of 42) 15901 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 206.667-35 chr13 110378880 110379129 + 1 NA intron (NM_001846, intron 4 of 47) intron (NM_001846, intron 4 of 47) 38046 NR_107040 102465872 NR_107040 ENSG00000276765 MIR8073 hsa-mir-8073 microRNA 8073 ncRNA 185.333-99 chr2 161225602 161225841 + 1 NA intron (NM_001199135, intron 6 of 7) intron (NM_001199135, intron 6 of 7) -19018 NR_110164 100996579 Hs.660929 NR_110163 ENSG00000227403 LINC01806 - long intergenic non-protein coding RNA 1806 ncRNA 152.667-124 chr15 58891614 58891897 + 1 NA intron (NR_135042, intron 12 of 18) MER20B|DNA|hAT-Charlie 41924 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 156.667-277 chr5 110679226 110679393 + 1 NA intron (NM_001039763, intron 1 of 13) L1MC1|LINE|L1 47362 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 154.667-186 chr2 127385492 127385792 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -32778 NM_000312 5624 Hs.224698 NM_000312 ENSG00000115718 PROC APC|PC|PROC1|THPH3|THPH4 protein C, inactivator of coagulation factors Va and VIIIa protein-coding 114.333-203 chr7 8264113 8264297 + 1 NA intron (NR_125740, intron 2 of 5) intron (NR_125740, intron 2 of 5) -1593 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 305.333-40 chr20 52759149 52759462 + 1 NA Intergenic Intergenic 138467 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 144.667-252 chr6 7897670 7897937 + 1 NA intron (NM_030810, intron 3 of 9) intron (NM_030810, intron 3 of 9) 12274 NM_001145549 81567 Hs.150837 NM_022085 ENSG00000239264 TXNDC5 ENDOPDI|ERP46|HCC-2|HCC2|PDIA15|STRF8|UNQ364 thioredoxin domain containing 5 protein-coding 152.667-181 chr2 73847813 73848069 + 1 NA intron (NR_148670, intron 6 of 12) intron (NR_148670, intron 6 of 12) 18974 NM_006463 10617 Hs.469018 NM_006463 ENSG00000124356 STAMBP AMSH|MICCAP STAM binding protein protein-coding 252.667-17 chr11 71202983 71203333 + 1 NA intron (NM_012309, intron 1 of 24) intron (NM_012309, intron 1 of 24) 21638 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 183.667-46 chr14 69896105 69896324 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) 16798 NM_001034852 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 156.333-216 chr21 23065857 23066019 + 1 NA Intergenic Intergenic -13346 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 151.667-208 chr3 25089601 25089790 + 1 NA intron (NM_001290216, intron 3 of 10) intron (NM_001290216, intron 3 of 10) -251107 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 202.667-109 chr4 62145272 62145593 + 1 NA intron (NR_110595, intron 2 of 7) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 16333 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-210 chrX 98909173 98909354 + 1 NA Intergenic Intergenic -1344728 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 123.333-14 chr1 117332601 117332779 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -34759 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 138.667-13 chr10 19874511 19874779 + 1 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 58213 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 236.333-85 chr7 32368010 32368348 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L1MA5A|LINE|L1 60045 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 176.333-33 chr12 20502478 20502688 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 -69281 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 155.333-43 chr10 107637517 107637680 + 1 NA Intergenic Intergenic 431695 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 237.333-11 chr1 228226555 228226969 + 1 NA intron (NM_052843, intron 9 of 80) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -13098 NR_073154 574407 Hs.650039 NM_001025495 ENSG00000162913 OBSCN-AS1 C1orf145 OBSCN antisense RNA 1 ncRNA 168.333-56 chr14 28513643 28513852 + 1 NA Intergenic MER126|DNA|DNA 251572 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 216.667-73 chr3 196412395 196412776 + 1 NA intron (NM_015562, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 -18800 NR_046745 100874034 Hs.617990 NR_046745 UBXN7-AS1 - UBXN7 antisense RNA 1 ncRNA 154.667-97 chr13 109625820 109626065 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -102332 NR_103846 101409253 Hs.578072 NR_103846 ENSG00000234854 LINC00676 - long intergenic non-protein coding RNA 676 ncRNA 144.667-42 chr11 58318914 58319167 + 1 NA Intergenic Intergenic 40029 NM_001005489 219965 NM_001005489 ENSG00000197786 OR5B17 OR11-237|OR5B20P olfactory receptor family 5 subfamily B member 17 protein-coding 157.333-334 chr8 77906743 77906939 + 1 NA Intergenic Intergenic 456144 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 129.667-69 chr16 12784848 12785063 + 1 NA intron (NM_018340, intron 1 of 3) LTR106_Mam|LTR|LTR 18932 NM_001099455 55313 Hs.460002 NM_018340 ENSG00000103381 CPPED1 CSTP1 calcineurin like phosphoesterase domain containing 1 protein-coding 382.333-14 chr4 74189929 74190511 + 1 NA intron (NM_001351314, intron 5 of 9) intron (NM_001351314, intron 5 of 9) 32102 NM_001004346 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 154.667-18 chr1 118826853 118827023 + 1 NA Intergenic Intergenic 161405 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 152.667-17 chr1 156968330 156968484 + 1 NA intron (NM_014784, intron 9 of 39) MIRb|SINE|MIR -32163 NR_030527 768220 NR_030527 ENSG00000211581 MIR765 MIRN765|hsa-mir-765|mir-765 microRNA 765 ncRNA 212.667-86 chr22 37114619 37114932 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -5062 NM_001289000 164656 Hs.370885 NM_153609 ENSG00000187045 TMPRSS6 IRIDA transmembrane serine protease 6 protein-coding 236.667-93 chr8 128939281 128939649 + 1 NA Intergenic Intergenic 26536 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 271.333-61 chr5 162842910 162843462 + 1 NA Intergenic Intergenic -594385 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 153.667-224 chr20 42737982 42738164 + 1 NA intron (NM_133170, intron 6 of 31) MIRb|SINE|MIR 52590 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 150.333-413 chr8 111572350 111572556 + 1 NA Intergenic Intergenic 195814 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 154.667-21 chr1 165618359 165618631 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -12739 NM_004528 4259 Hs.191734 NM_004528 ENSG00000143198 MGST3 GST-III microsomal glutathione S-transferase 3 protein-coding 179.333-171 chr7 28468389 28468690 + 1 NA intron (NM_004904, intron 1 of 10) intron (NM_004904, intron 1 of 10) 32924 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 168.333-8 chr1 110156924 110157142 + 1 NA intron (NM_001010898, intron 1 of 11) intron (NM_001010898, intron 1 of 11) 6539 NM_001010898 388662 Hs.128382 NM_001010898 ENSG00000197106 SLC6A17 MRT48|NTT4 solute carrier family 6 member 17 protein-coding 202.333-22 chr10 34741953 34742397 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 73121 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 174.333-52 chr2 5242117 5242333 + 1 NA Intergenic Intergenic 448893 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 147.667-352 chr8 55258161 55258353 + 1 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) LTR72|LTR|ERV1 156229 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 131.667-106 chr2 210081363 210081571 + 1 NA intron (NM_001307976, intron 5 of 13) L2c|LINE|L2 51545 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 259.667-85 chr8 78722164 78722607 + 1 NA TTS (NR_077236) TTS (NR_077236) 1989 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 232.333-73 chr6 39376229 39376599 + 1 NA intron (NM_001289020, intron 15 of 21) L2b|LINE|L2 -53446 NM_001363784 83795 Hs.287765 NM_032115 ENSG00000095981 KCNK16 K2p16.1|TALK-1|TALK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 16 protein-coding 179.333-139 chr4 80879682 80879987 + 1 NA intron (NM_152770, intron 4 of 5) intron (NM_152770, intron 4 of 5) -150874 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 158.667-154 chr2 54276997 54277240 + 1 NA intron (NM_001320589, intron 4 of 4) L1ME4a|LINE|L1 -20889 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 287.333-24 chr17 28363138 28363690 + 1 NA TTS (NM_001080837) TTS (NM_001080837) 1737 NM_001080837 645832 NM_001080837 ENSG00000274529 SEBOX OG-9|OG9|OG9X SEBOX homeobox protein-coding 154.333-84 chr14 43028502 43028736 + 1 NA Intergenic Intergenic 1421763 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 190.667-87 chr3 178263263 178263530 + 1 NA Intergenic Intergenic -155805 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 191.667-85 chr3 100393748 100394008 + 1 NA intron (NM_014820, intron 1 of 11) intron (NM_014820, intron 1 of 11) 7211 NM_014820 9868 Hs.227253 NM_014820 ENSG00000154174 TOMM70 TOMM70A|Tom70 translocase of outer mitochondrial membrane 70 protein-coding 180.333-64 chr20 10740883 10741127 + 1 NA Intergenic Intergenic -12085 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 163.333-225 chr5 94735790 94736001 + 1 NA intron (NM_001297777, intron 16 of 19) intron (NM_001297777, intron 16 of 19) 117226 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 189.667-15 chr10 7310381 7310623 + 1 NA intron (NM_001029880, intron 4 of 20) intron (NM_001029880, intron 4 of 20) 98839 NM_001018039 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 167.667-6 chr1 73683306 73683649 + 1 NA intron (NR_146300, intron 1 of 3) intron (NR_146300, intron 1 of 3) 8798 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 142.333-23 chr10 60685560 60685782 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) 47857 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 187.333-111 chr2 195582068 195582351 + 1 NA Intergenic Intergenic -74749 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 159.667-97 chr14 52356900 52357114 + 1 NA Intergenic Intergenic 42695 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 129.667-174 chr8 117127627 117127807 + 1 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -7278 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 161.333-129 chr18 36315798 36316044 + 1 NA intron (NM_001281740, intron 1 of 28) intron (NM_001281740, intron 1 of 28) 18208 NM_001281739 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 167.667-137 chr3 71152512 71152746 + 1 NA intron (NR_146142, intron 6 of 19) MIRb|SINE|MIR -20432 NM_001349342 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 189.333-157 chr5 63368759 63369018 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 593404 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 193.667 chr1 24885430 24885720 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 33841 NR_106789 102465437 NR_106789 ENSG00000278034 MIR6731 hsa-mir-6731 microRNA 6731 ncRNA 160.333-272 chr8 28767105 28767280 + 1 NA TTS (NM_001363038) TTS (NM_001363038) 65691 NR_073469 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 150.333-200 chr2 107067262 107067414 + 1 NA Intergenic Intergenic -180229 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 152.333-297 chr5 45249597 45249795 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 440749 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 315.667 chr1 10262279 10262776 + 1 NA intron (NM_001365953, intron 5 of 20) L1ME4c|LINE|L1 31763 NM_001365953 23095 Hs.97858 NM_015074 ENSG00000054523 KIF1B CMT2|CMT2A|CMT2A1|HMSNII|KLP|NBLST1 kinesin family member 1B protein-coding 115.333-103 chr18 61978251 61978462 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -85349 NM_173557 220441 Hs.165062 NM_173557 ENSG00000176641 RNF152 - ring finger protein 152 protein-coding 160.333-264 chr7 68435129 68435435 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 415029 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 212.333-107 chr4 90783398 90783637 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 7 of 10) L1MCb|LINE|L1 548486 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 141.333-159 chr3 122379697 122379964 + 1 NA intron (NM_001017928, intron 1 of 4) intron (NM_001017928, intron 1 of 4) 3401 NM_001308326 131076 Hs.220594 NM_001017928 ENSG00000160124 CCDC58 - coiled-coil domain containing 58 protein-coding 167.333-269 chr9 25330490 25330799 + 1 NA Intergenic Intergenic 348214 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 156.333-198 chr2 198211975 198212156 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 163032 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 344.333-10 chr2 100725946 100726342 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -93995 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 157.333-173 chr2 45227639 45227872 + 1 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) intron (NR_033831, intron 1 of 5) 27186 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 158.667-252 chr4 124248838 124249115 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 309458 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 252.667-41 chr19 6105783 6106080 + 1 NA intron (NM_000635, intron 1 of 17) L2a|LINE|L2 4569 NM_134433 5990 Hs.465709 NM_000635 ENSG00000087903 RFX2 - regulatory factor X2 protein-coding 258.333-43 chr3 15439776 15440227 + 1 NA 3' UTR (NM_033083, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_033083, exon 6 of 6) 12403 NM_033083 85403 Hs.716733 NM_033083 ENSG00000144597 EAF1 - ELL associated factor 1 protein-coding 526.667-2 chr5 26708858 26709676 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 329319 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 259.667-2 chr1 111423247 111423588 + 1 NA intron (NM_002557, intron 5 of 10) intron (NM_002557, intron 5 of 10) 4318 NM_002557 5016 Hs.1154 NM_002557 ENSG00000085465 OVGP1 CHIT5|EGP|MUC9|OGP oviductal glycoprotein 1 protein-coding 182.667-108 chr3 173344019 173344419 + 1 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -51733 NM_001365930 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 286.333-12 chr14 57771233 57771592 + 1 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) intron (NR_159373, intron 1 of 10) 93587 NM_001352013 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 155.667-384 chr9 35352877 35353052 + 1 NA exon (NM_001371187, exon 2 of 33) exon (NM_001371187, exon 2 of 33) 11068 NM_001371187 177.333-70 chr16 89027581 89027869 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -50518 NM_005187 863 Hs.513811 NM_005187 ENSG00000129993 CBFA2T3 ETO2|MTG16|MTGR2|RUNX1T3|ZMYND4 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 3 protein-coding 144.333-235 chr6 110609644 110609894 + 1 NA TTS (NM_015076) TTS (NM_015076) -133156 NM_033125 85413 Hs.520319 NM_033125 ENSG00000004809 SLC22A16 CT2|FLIPT2|HEL-S-18|OAT6|OCT6|OKB1|dJ261K5.1 solute carrier family 22 member 16 protein-coding 183.667-150 chr9 30746779 30747215 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -338543 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 261.667-72 chr8 110498551 110498963 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -522986 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 158.667-67 chr11 100314611 100314883 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 20 of 23) intron (NM_001243270, intron 20 of 23) -372541 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 201.667-74 chr3 41433106 41433333 + 1 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) L1ME3G|LINE|L1 233714 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 160.333-300 chr9 69364846 69365100 + 1 NA intron (NM_001127608, intron 2 of 10) intron (NM_001127608, intron 2 of 10) 35648 NM_004816 9413 Hs.118003 NM_004816 ENSG00000135063 FAM189A2 C9orf61|X123 family with sequence similarity 189 member A2 protein-coding 169.333-183 chr4 72533864 72534158 + 1 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 35210 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 153.333-88 chr12 32221257 32221520 + 1 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 114541 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 152.333-90 chr13 37890584 37890883 + 1 NA Intergenic Intergenic -20308 NM_001135955 7223 Hs.262960 NM_003306 ENSG00000133107 TRPC4 HTRP-4|HTRP4|TRP4 transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 protein-coding 141.333-134 chr20 56203715 56203868 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44941 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 154.667-82 chr12 79763855 79764020 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -72840 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 114.667-7 chr1 115082345 115082583 + 1 NA intron (NM_005725, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 7036 NM_001308316 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 169.333-139 chr20 3587786 3587979 + 1 NA intron (NM_001207047, intron 18 of 24) AluJb|SINE|Alu 75517 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 238.667-72 chr5 108763933 108764293 + 1 NA intron (NR_146155, intron 1 of 19) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 15165 NM_001308038 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 177.333-28 chr11 110998147 110998333 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 99078 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 166.667-130 chr20 7781324 7781611 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 158991 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 229.667-80 chr8 106936491 106936780 + 1 NA Intergenic Intergenic -166391 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 116.667-93 chr2 38024644 38024799 + 1 NA intron (NM_144713, intron 10 of 10) intron (NM_144713, intron 10 of 10) 11620 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 179.667-107 chr4 132585985 132586174 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -5010 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 203.333-66 chr14 23481183 23481524 + 1 NA Intergenic Intergenic 11650 NM_015514 25983 Hs.9043 NM_015514 ENSG00000129460 NGDN C14orf120|CANu1|LCP5|NGD|lpd-2 neuroguidin protein-coding 131.667-139 chr3 130421979 130422186 + 1 NA intron (NM_001278298, intron 27 of 40) intron (NM_001278298, intron 27 of 40) 76566 NM_153264 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 190.333-37 chr12 65122319 65122525 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1117 NM_007191 11197 Hs.284122 NM_007191 ENSG00000156076 WIF1 WIF-1 WNT inhibitory factor 1 protein-coding 153.667-244 chr3 16047862 16048052 + 1 NA Intergenic Intergenic -126723 NM_001319051 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 189.333-81 chr18 23105586 23105870 + 1 NA Intergenic Intergenic -28836 NM_001256438 91768 Hs.11108 NM_138375 ENSG00000134508 CABLES1 CABL1|CABLES|HsT2563|IK3-1 Cdk5 and Abl enzyme substrate 1 protein-coding 175.333-133 chr4 62282044 62282271 + 1 NA Intergenic Intergenic -120392 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-332 chr5 144771950 144772122 + 1 NA Intergenic Intergenic 566645 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 139.667-68 chr17 67058477 67058711 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 14040 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 240.667-36 chr17 55396120 55396516 + 1 NA intron (NM_012329, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR 25517 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 378.667 chr1 104604611 104605164 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 531864 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 133.333-87 chr2 164402876 164403051 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 165532 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 211.333-225 chr7 80042843 80043294 + 1 NA Intergenic Intergenic -91763 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 302.667-18 chr21 45469503 45469987 + 1 NA intron (NM_130445, intron 3 of 42) intron (NM_130445, intron 3 of 42) -8521 NR_106873 102465489 NR_106873 ENSG00000275167 MIR6815 hsa-mir-6815 microRNA 6815 ncRNA 167.667-172 chr5 105272514 105272684 + 1 NA Intergenic Intergenic 173125 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 203.333-21 chr1 242423158 242423509 + 1 NA intron (NM_001320272, intron 2 of 10) intron (NM_001320272, intron 2 of 10) 26135 NM_001195812 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 162.667-234 chr6 37411708 37411898 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -21418 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 152.333-77 chr12 17729657 17729893 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 56476 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 207.667-88 chr4 67139942 67140211 + 1 NA Intergenic Intergenic 281924 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 111.667-261 chr8 118320837 118320999 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -209099 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 165.333-47 chr11 83253351 83253615 + 1 NA intron (NM_001300972, intron 11 of 11) intron (NM_001300972, intron 11 of 11) 32924 NM_021825 60492 Hs.368866 NM_021825 ENSG00000137500 CCDC90B MDS011|MDS025 coiled-coil domain containing 90B protein-coding 194.667-34 chr12 70861166 70861516 + 1 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) intron (NM_002849, intron 2 of 13) 59397 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 242.333-93 chr7 94621363 94621678 + 1 NA intron (NM_001346717, intron 4 of 9) intron (NM_001346717, intron 4 of 9) 34613 NM_001362808 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 265.333-32 chr18 61759253 61759746 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 11323 NR_103449 100996669 Hs.586981 NR_103449 LINC01544 - long intergenic non-protein coding RNA 1544 ncRNA 155.667-65 chr12 20418749 20419042 + 1 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) L1ME4a|LINE|L1 49650 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 195.667-109 chr5 52918226 52918483 + 1 NA intron (NM_181501, intron 15 of 28) intron (NM_181501, intron 15 of 28) -70998 NR_073103 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 208.333-47 chr15 94850868 94851104 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -4377 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 129.333-48 chr12 29113415 29113632 + 1 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -35755 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 199.333-308 chrX 49901543 49901776 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -20937 NM_001272102 1184 Hs.166486 NM_000084 ENSG00000171365 CLCN5 CLC5|CLCK2|ClC-5|DENTS|NPHL1|NPHL2|XLRH|XRN|hCIC-K2 chloride voltage-gated channel 5 protein-coding 295.333-17 chr15 61650981 61651452 + 1 NA Intergenic Intergenic -78702 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 227.333-63 chr2 70475499 70475971 + 1 NA intron (NR_046798, intron 1 of 2) intron (NR_046798, intron 1 of 2) 5905 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 147.667-141 chr17 61091790 61092031 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L1ME3|LINE|L1 275794 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 253.667-6 chr1 150249872 150250316 + 1 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -7680 NM_012113 23632 Hs.528988 NM_012113 ENSG00000118298 CA14 CAXiV carbonic anhydrase 14 protein-coding 172.333-19 chr10 76582930 76583164 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -304997 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 171.333-114 chr3 32039909 32040220 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -58214 NM_001174060 114884 Hs.150122 NM_017784 ENSG00000144645 OSBPL10 ORP10|OSBP9 oxysterol binding protein like 10 protein-coding 248.667-76 chr3 94251473 94251857 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 188604 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 196.667-144 chr7 80273547 80273933 + 1 NA Intergenic MER106A|DNA|hAT-Charlie 100699 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 138.667-184 chr6 126105687 126105862 + 1 NA Intergenic Intergenic 119234 NR_146803 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 143.333-189 chr3 112966143 112966397 + 1 NA intron (NM_138806, intron 1 of 7) intron (NM_138806, intron 1 of 7) 8833 NM_170780 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 122.333-111 chr2 192006356 192006565 + 1 NA intron (NM_001305134, intron 5 of 9) intron (NM_001305134, intron 5 of 9) -159372 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 125.333-139 chr5 67037103 67037317 + 1 NA intron (NM_001297651, intron 1 of 25) FLAM_C|SINE|Alu 32555 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 335.667-11 chr18 2362542 2363079 + 1 NA Intergenic Intergenic 208695 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 139.667-66 chr17 14375374 14375532 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 71713 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 210.667-23 chr10 90994659 90995016 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -38329 NR_134319 105378430 Hs.512240 NR_134319 LOC105378430 - uncharacterized LOC105378430 ncRNA 163.333-232 chr5 152560224 152560455 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -155060 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 211.333-29 chr10 101178652 101178956 + 1 NA intron (NR_120620, intron 2 of 5) MER91B|DNA|hAT-Tip100 2482 NR_120620 101927396 Hs.551648 NR_120620 ENSG00000237579 LINC01514 - long intergenic non-protein coding RNA 1514 ncRNA 167.667-207 chr8 119221537 119221846 + 1 NA exon (NM_052886, exon 2 of 4) exon (NM_052886, exon 2 of 4) 13328 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 141.667-49 chr11 77529862 77530010 + 1 NA Intergenic Intergenic -41153 NR_130930 646029 Hs.609654 NM_001039908 LOC646029 - uncharacterized LOC646029 ncRNA 234.667-48 chr2 15891440 15891733 + 1 NA Intergenic Intergenic -28813 NR_125783 103752554 Hs.269571 NR_125783 ENSG00000223850 MYCNUT MYCNUN|lncUSMycN MYCN upstream transcript ncRNA 283.667-16 chr2 47729230 47729716 + 1 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 -53609 NM_000179 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 133.667-139 chr7 39225988 39226149 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) intron (NM_001370959, intron 4 of 9) 103066 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 163.667-48 chr12 94928529 94928704 + 1 NA Intergenic Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 75081 NM_018838 55967 Hs.506374 NM_018838 ENSG00000184752 NDUFA12 B17.2|DAP13|MC1DN23 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A12 protein-coding 267.333-86 chr7 45028096 45028446 + 1 NA intron (NM_001029835, intron 1 of 9) intron (NM_001029835, intron 1 of 9) 637 NM_001029835 83605 Hs.148272 NM_031443 ENSG00000136280 CCM2 C7orf22|OSM|PP10187 CCM2 scaffold protein protein-coding 187.333-63 chr14 73693787 73694055 + 1 NA intron (NM_001201366, intron 8 of 8) L1ME3A|LINE|L1 20463 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 183.333-49 chr14 78549680 78549988 + 1 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 146115 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 158.667-260 chr5 18701862 18702027 + 1 NA Intergenic Intergenic 894670 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 155.667-79 chr12 128504976 128505208 + 1 NA intron (NM_001136103, intron 2 of 8) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 211000 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 189.667-125 chr6 36612892 36613212 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 9460 NR_037491 100500885 NR_037491 ENSG00000263894 MIR3925 - microRNA 3925 ncRNA 160.333-258 chr7 6183870 6184046 + 1 NA intron (NM_001367581, intron 4 of 13) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -11821 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 305.333-50 chr4 38028278 38028656 + 1 NA intron (NM_001253912, intron 7 of 20) MER30|DNA|hAT-Charlie 68069 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 289.667-8 chr12 15779348 15779708 + 1 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) intron (NM_004447, intron 1 of 20) 9860 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 242.667-16 chr10 94571801 94572087 + 1 NA intron (NM_001289075, intron 7 of 20) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 26156 NM_018063 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 146.667-276 chr6 45137296 45137578 + 1 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1M4a2|LINE|L1 60333 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 162.333-69 chr14 46175595 46175878 + 1 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 111577 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 152.667-304 chr5 121628355 121628547 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -223431 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 145.667-298 chr8 124705762 124705989 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 1 of 14) MER20|DNA|hAT-Charlie 22598 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 205.333-154 chr3 96365675 96365891 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 5819 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 192.667-78 chr18 6936456 6936763 + 1 NA Intergenic Intergenic -6740 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 122.333-92 chr2 65049753 65049938 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -6571 NM_015147 23177 Hs.709257 NM_015147 ENSG00000011523 CEP68 KIAA0582 centrosomal protein 68 protein-coding 183.333-45 chr14 62860380 62860601 + 1 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 184968 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 182.667-37 chr13 95239038 95239315 + 1 NA intron (NM_001105515, intron 3 of 20) L1MC5|LINE|L1 28832 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 200.333-63 chr2 20342256 20342634 + 1 NA intron (NM_001352920, intron 1 of 19) intron (NM_001352920, intron 1 of 19) 8399 NM_001352917 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 149.333-388 chr8 64937528 64937679 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -138866 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 177.333-6 chr1 63115545 63115867 + 1 NA Intergenic Intergenic -103235 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 174.333-8 chr1 208557029 208557358 + 1 NA Intergenic Intergenic -171495 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 244.667-24 chr11 59969113 59969450 + 1 NA non-coding (NR_130719, exon 6 of 9) non-coding (NR_130719, exon 6 of 9) 26402 NR_130719 255649 Hs.722773 NR_130719 OOSP1 - oocyte secreted protein 1 pseudo 152.333-189 chr2 133003858 133004018 + 1 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 88381 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-259 chr3 128706453 128706687 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -19566 NM_004637 7879 Hs.684374 NM_004637 ENSG00000075785 RAB7A PRO2706|RAB7 RAB7A, member RAS oncogene family protein-coding 120.667-103 chr2 207205019 207205210 + 1 NA intron (NR_110283, intron 3 of 3) intron (NR_110283, intron 3 of 3) -34697 NR_146555 105373853 Hs.678559 NR_146555 ENSG00000229647 MYOSLID - myocardin-induced smooth muscle lncRNA, inducer of differentiation ncRNA 291.667-31 chr6 45763487 45764048 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 173830 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 137.667-88 chr2 17039406 17039585 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -373661 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 125.333-116 chr3 173534074 173534227 + 1 NA intron (NM_014932, intron 2 of 6) intron (NM_014932, intron 2 of 6) -50284 NM_001365933 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 155.667-118 chr15 80874174 80874398 + 1 NA intron (NM_001293304, intron 3 of 29) MER102a|DNA|hAT-Charlie -32213 NR_030393 693132 NR_030393 ENSG00000208003 MIR549A MIR549|MIRN549|hsa-mir-549|hsa-mir-549a|mir-549a microRNA 549a ncRNA 126.333-38 chr12 122628476 122628685 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 67419 NR_162150 113218511 NR_162150 MIR9902-2 - microRNA 9902-2 ncRNA 251.333-3 chr1 88652231 88652547 + 1 NA intron (NR_110682, intron 1 of 3) L1MA8|LINE|L1 -31755 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 149.667-198 chr2 68009182 68009338 + 1 NA Intergenic Intergenic 53744 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 189.333-75 chr17 62367310 62367567 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2780 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 216.667-116 chr9 118996696 118997184 + 1 NA Intergenic Intergenic 317269 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 143.333-23 chr10 17555706 17555957 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 61543 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 186.333-76 chr2 95107465 95107674 + 1 NA intron (NR_136152, intron 5 of 10) intron (NR_136152, intron 5 of 10) 13988 NM_001321995 64969 Hs.655259 NM_031902 ENSG00000144029 MRPS5 MRP-S5|S5mt mitochondrial ribosomal protein S5 protein-coding 153.667-363 chr7 83211112 83211389 + 1 NA Intergenic Intergenic -48366 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 152.333-2 chr1 10007223 10007423 + 1 NA intron (NR_138250, intron 2 of 4) FLAM_C|SINE|Alu 10095 NM_052960 116362 Hs.422688 NM_052960 ENSG00000162444 RBP7 CRABP4|CRBP4|CRBPIV retinol binding protein 7 protein-coding 150.667-319 chr5 166642547 166642729 + 1 NA Intergenic Intergenic 283732 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 148.333-238 chr22 26988138 26988415 + 1 NA Intergenic Intergenic 72242 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 198.333-117 chr21 42335318 42335637 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 15517 NM_005423 7032 Hs.2979 NM_005423 ENSG00000160181 TFF2 SML1|SP trefoil factor 2 protein-coding 136.667-85 chr19 34452360 34452524 + 1 NA intron (NM_005499, intron 10 of 16) intron (NM_005499, intron 10 of 16) 24061 NM_005499 10054 Hs.631580 NM_005499 ENSG00000126261 UBA2 ARX|HRIHFB2115|SAE2 ubiquitin like modifier activating enzyme 2 protein-coding 245.333-105 chr7 7331988 7332398 + 1 NA Intergenic Intergenic 77039 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 157.667-192 chr3 64038593 64038877 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -14725 NM_001271780 9861 Hs.152536 NM_014814 ENSG00000163636 PSMD6 Rpn7|S10|SGA-113M|p42A|p44S10 proteasome 26S subunit, non-ATPase 6 protein-coding 118.333-49 chr12 45801811 45801996 + 1 NA intron (NM_152641, intron 3 of 20) L1MC4|LINE|L1 72194 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 146.667-341 chr8 130597535 130597827 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -154007 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 156.333-81 chr12 65447542 65447754 + 1 NA intron (NM_001031679, intron 5 of 6) intron (NM_001031679, intron 5 of 6) 109663 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 205.667-115 chr5 148137347 148137677 + 1 NA TTS (NM_001127698) TTS (NM_001127698) -31034 NM_001001325 408187 Hs.553815 NM_001001325 ENSG00000196800 SPINK14 SPINK5L2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (putative) protein-coding 179.333-189 chr8 122482772 122483084 + 1 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) intron (NR_131202, intron 2 of 3) 85716 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 159.333-168 chr2 137229237 137229457 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 463802 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 156.333-53 chr11 23621128 23621382 + 1 NA Intergenic Intergenic -202065 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 200.333-88 chr22 28548386 28548755 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 88701 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 166.667-136 chr21 20190226 20190417 + 1 NA Intergenic Intergenic 68364 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 163.667-45 chr12 49740776 49740951 + 1 NA promoter-TSS (NM_003217) promoter-TSS (NM_003217) -694 NM_003217 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 158.333-242 chr4 112840328 112840607 + 1 NA intron (NM_001354275, intron 1 of 43) intron (NM_001354275, intron 1 of 43) -20520 NM_001354261 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 145.333-232 chr5 26252112 26252324 + 1 NA Intergenic Intergenic 786368 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 144.333-141 chr2 198442828 198443091 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -67862 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 140.667-59 chr12 10627598 10627846 + 1 NA exon (NM_018423, exon 7 of 11) exon (NM_018423, exon 7 of 11) -14113 NM_001319985 55110 Hs.104650 NM_018048 ENSG00000111196 MAGOHB MGN2|mago|magoh mago homolog B, exon junction complex subunit protein-coding 170.667-9 chr1 119895093 119895387 + 1 NA exon (NM_021794, exon 1 of 1) exon (NM_021794, exon 1 of 1) 1275 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 125.333-72 chr16 83893486 83893761 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -5492 NM_012213 23417 Hs.644610 NM_012213 ENSG00000103150 MLYCD MCD malonyl-CoA decarboxylase protein-coding 148.333-12 chr1 81051723 81051926 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -254368 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 219.667-78 chr6 734236 734562 + 1 NA Intergenic Intergenic -41258 NR_073064 55770 Hs.484412 NM_018303 ENSG00000112685 EXOC2 SEC5|SEC5L1|Sec5p exocyst complex component 2 protein-coding 193.333-53 chr14 49239213 49239513 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 347017 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 222.667-98 chr8 121936291 121936642 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -295026 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 235.333-120 chr8 49224682 49225116 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 152555 NM_001256598 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 178.333-103 chr3 85000930 85001168 + 1 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) 42060 NM_001167675 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 280.333-7 chr12 31878473 31878819 + 1 NA intron (NR_135029, intron 1 of 1) LTR06|LTR|ERV1 8557 NR_135029 105369723 Hs.736954 NR_135029 ENSG00000255760 LINC02422 - long intergenic non-protein coding RNA 2422 ncRNA 226.333-114 chr8 139848710 139849106 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -145785 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 120.667-44 chr13 41894177 41894346 + 1 NA intron (NM_001009814, intron 4 of 25) intron (NM_001009814, intron 4 of 25) 66824 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 130.667-76 chr15 94721755 94721900 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -133536 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 230.333-4 chr1 93152918 93153388 + 1 NA non-coding (NR_030761, exon 5 of 5) non-coding (NR_030761, exon 5 of 5) 27260 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 167.333-172 chr3 76066834 76067073 + 1 NA Intergenic Intergenic -281404 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 265.333-54 chr3 95633442 95633751 + 1 NA Intergenic Intergenic 49597 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 216.333-45 chr14 55049712 55050046 + 1 NA TTS (NM_080867) TTS (NM_080867) -1768 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 193.667-20 chr10 69865475 69865695 + 1 NA intron (NM_001368898, intron 3 of 33) intron (NM_001368898, intron 3 of 33) 63679 NM_080798 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 166.667-35 chr11 22554958 22555203 + 1 NA Intergenic Intergenic -63061 NR_120583 102723378 Hs.374255 NR_120583 ENSG00000255323 LINC01495 - long intergenic non-protein coding RNA 1495 ncRNA 215.333-12 chr1 184308654 184309000 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -78202 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 236.333-54 chr21 29802263 29802700 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 54306 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 282.667-50 chr8 123477082 123477450 + 1 NA Intergenic Intergenic 54877 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 189.333-23 chr1 231060559 231060958 + 1 NA Intergenic Intergenic -20504 NM_198552 375061 Hs.38516 NM_198552 ENSG00000182118 FAM89A C1orf153 family with sequence similarity 89 member A protein-coding 143.333-92 chr14 75908241 75908399 + 1 NA intron (NM_015072, intron 31 of 31) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 73675 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 214.333-146 chr7 47212188 47212627 + 1 NA Intergenic Intergenic 252396 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 201.333-89 chr13 106654425 106654820 + 1 NA intron (NR_047026, intron 1 of 2) intron (NR_047026, intron 1 of 2) 742 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 251.333-117 chr9 75061777 75062195 + 1 NA intron (NM_001330679, intron 9 of 9) intron (NM_001330679, intron 9 of 9) 26169 NM_001330678 54981 Hs.494186 NM_017881 ENSG00000106733 NMRK1 C9orf95|NRK1|bA235O14.2 nicotinamide riboside kinase 1 protein-coding 262.667-43 chr2 171773729 171774034 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 86126 NM_001320884 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 284.667-11 chr12 41332285 41332599 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) L2|LINE|L2 -105297 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 274.667-14 chr12 124144253 124144712 + 1 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) intron (NM_001347902, intron 2 of 4) -144682 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 225.333-60 chr15 61869486 61869853 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 79 of 81) intron (NM_001018088, intron 79 of 81) 139751 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 214.667-71 chr2 159670323 159670751 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 41905 NR_110586 29994 Hs.470369 NM_013450 ENSG00000123636 BAZ2B WALp4 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B protein-coding 201.333-191 chr3 102993753 102994078 + 1 NA Intergenic Intergenic 530201 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 148.333-314 chr5 54245768 54246056 + 1 NA intron (NM_019087, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR 64661 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 263.333-5 chr10 23359706 23360177 + 1 NA Intergenic Intergenic -15144 NM_001365862 256815 Hs.132442 NM_153714 ENSG00000179133 C10orf67 C10orf115|LINC01552 chromosome 10 open reading frame 67 protein-coding 113.667-66 chr14 72510401 72510571 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 14 of 16) intron (NM_001370288, intron 14 of 16) -6334 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 170.667-177 chr9 113213907 113214088 + 1 NA intron (NM_015258, intron 1 of 27) AluJb|SINE|Alu 7280 NM_015258 23307 Hs.522351 NM_015258 ENSG00000119321 FKBP15 FKBP133|KIAA0674|PPP1R76 FKBP prolyl isomerase 15 protein-coding 141.333-234 chr8 38302349 38302590 + 1 NA intron (NM_023034, intron 14 of 23) intron (NM_023034, intron 14 of 23) -33237 NM_001354454 84513 Hs.567619 NM_032483 ENSG00000147535 PLPP5 DPPL1|HTPAP|PPAPDC1B phospholipid phosphatase 5 protein-coding 265.333-23 chr13 103360289 103360616 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -64748 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 236.667-9 chr1 230512065 230512388 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 83357 NR_146479 101927553 Hs.680219 NR_146479 ENSG00000232964 LINC01737 - long intergenic non-protein coding RNA 1737 ncRNA 149.667-264 chr3 118155102 118155256 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -464254 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 204.333-81 chr18 9830727 9831221 + 1 NA intron (NM_006868, intron 5 of 6) L1ME3B|LINE|L1 -54999 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 163.667-95 chr18 64161821 64162046 + 1 NA intron (NR_033881, intron 2 of 9) intron (NR_033881, intron 2 of 9) -12907 NR_027245 221241 Hs.567778 NM_152728 ENSG00000179676 LINC00305 C18orf20|HsT1235|NCRNA00305 long intergenic non-protein coding RNA 305 ncRNA 161.333-255 chr7 9012176 9012433 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 578695 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 150.333-240 chr21 15114608 15114904 + 1 NA Intergenic Intergenic -49756 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 151.667-165 chr2 72805796 72805968 + 1 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) L1MA7|LINE|L1 20151 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 113.667-42 chr12 45753966 45754151 + 1 NA intron (NM_152641, intron 3 of 20) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 24349 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 178.333-101 chr3 78204351 78204678 + 1 NA Intergenic Intergenic -155551 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 184.333-92 chr21 15947545 15947771 + 1 NA Intergenic Intergenic -122830 NR_136541 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 353.333-40 chrX 46044443 46045017 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -193240 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 219.333-126 chr4 57124816 57125219 + 1 NA intron (NR_034081, intron 1 of 4) intron (NR_034081, intron 1 of 4) -14632 NM_001253835 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 248.333-72 chr4 75806039 75806393 + 1 NA intron (NM_003715, intron 19 of 23) AluSz|SINE|Alu 81694 NM_001290049 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 185.667-28 chr13 76829749 76830098 + 1 NA Intergenic Intergenic 56482 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 168.667-111 chr2 158358114 158358342 + 1 NA intron (NM_138803, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR 98525 NM_001301685 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 129.333-146 chr5 6139223 6139389 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 197986 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 126.333-154 chr6 83001027 83001211 + 1 NA intron (NR_146807, intron 9 of 10) AluSp|SINE|Alu 64722 NR_146807 90025 Hs.148609 NM_198920 ENSG00000118420 UBE3D C6orf157|H10BH|UBE2CBP|YJR141W ubiquitin protein ligase E3D protein-coding 207.333-232 chr5 174412561 174412866 + 1 NA intron (NR_125806, intron 1 of 5) intron (NR_125806, intron 1 of 5) 76359 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 153.333-123 chr14 61400097 61400297 + 1 NA intron (NM_006255, intron 2 of 13) intron (NM_006255, intron 2 of 13) 78754 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 147.333-141 chr17 61176548 61176748 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) AluJb|SINE|Alu 191056 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 271.333-33 chr2 142348302 142348737 + 1 NA Intergenic Intergenic -216818 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 128.333-88 chr19 27685035 27685231 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -108298 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 155.333-120 chr15 85635478 85635775 + 1 NA intron (NM_001270546, intron 1 of 28) L1ME1|LINE|L1 15676 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 175.333-203 chr9 36566163 36566343 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -6609 NR_046337 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 150.333-423 chr8 135410040 135410223 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -47325 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 150.667-2 chr1 10282890 10283043 + 1 NA intron (NM_001365953, intron 13 of 20) AluY|SINE|Alu -16000 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 286.667-31 chr5 63234580 63234929 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 655935 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 147.667-109 chr14 86276289 86276481 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 341707 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 222.667-5 chr1 192589664 192589958 + 1 NA Intergenic Intergenic 14038 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 148.667-87 chr12 2313318 2313586 + 1 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 43676 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 266.667-74 chr8 143286009 143286362 + 1 NA Intergenic Intergenic -4485 NR_120683 100507316 Hs.446671 NR_120682 ENSG00000253716 MINCR LINC01604 MYC-induced long non-coding RNA ncRNA 232.333-6 chr10 62520246 62520660 + 1 NA promoter-TSS (NM_199452) promoter-TSS (NM_199452) 5 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 170.333-152 chr3 196494683 196494940 + 1 NA intron (NM_152617, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 8957 NM_152617 165918 Hs.250648 NM_152617 ENSG00000163961 RNF168 hRNF168 ring finger protein 168 protein-coding 154.333-263 chr5 42103909 42104074 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 71354 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 151.333-10 chr1 63458113 63458411 + 1 NA intron (NM_001347145, intron 4 of 7) intron (NM_001347145, intron 4 of 7) 65011 NM_001347145 23421 Hs.166539 NM_014288 ENSG00000142856 ITGB3BP CENP-R|CENPR|HSU37139|NRIF3|TAP20 integrin subunit beta 3 binding protein protein-coding 237.667-5 chr1 212999596 212999894 + 1 NA intron (NM_144567, intron 7 of 8) intron (NM_144567, intron 7 of 8) 15764 NM_001300755 90806 Hs.157078 NM_144567 ENSG00000174606 ANGEL2 Ccr4d|KIAA0759L angel homolog 2 protein-coding 273.667-46 chr5 160222799 160223131 + 1 NA intron (NM_001040442, intron 2 of 5) intron (NM_001040442, intron 2 of 5) -6541 NM_001445 2172 Hs.519719 NM_001445 ENSG00000170231 FABP6 I-15P|I-BABP|I-BALB|I-BAP|ILBP|ILBP3|ILLBP fatty acid binding protein 6 protein-coding 158.667-189 chr21 16660779 16660972 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 70638 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 187.333-9 chr1 155499304 155499532 + 1 NA intron (NM_018489, intron 2 of 27) intron (NM_018489, intron 2 of 27) -62624 NR_147963 645676 Hs.568693 NR_027023 ENSG00000235919 ASH1L-AS1 - ASH1L antisense RNA 1 ncRNA 180.333-91 chr4 71208693 71208927 + 1 NA intron (NM_001098484, intron 1 of 25) intron (NM_001098484, intron 1 of 25) 21524 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 160.333-156 chr2 194768270 194768495 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 37787 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 395.333-8 chr12 1719770 1720395 + 1 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 L2c|LINE|L2 29012 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 273.667-16 chr12 5397715 5398217 + 1 NA Intergenic Intergenic -34142 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 116.667-81 chr17 61536734 61536911 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 54397 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 153.667-136 chr15 71895274 71895468 + 1 NA intron (NM_006901, intron 25 of 41) intron (NM_006901, intron 25 of 41) 84817 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 147.667-339 chr7 79727141 79727291 + 1 NA Intergenic Intergenic 273256 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 147.667-74 chr12 61680023 61680196 + 1 NA Intergenic Intergenic 512730 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 280.667-41 chr5 86614812 86615161 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -2955 NM_001867 1350 Hs.430075 NM_001867 ENSG00000127184 COX7C - cytochrome c oxidase subunit 7C protein-coding 250.667-73 chr7 77768601 77768943 + 1 NA exon (NM_198467, exon 5 of 8) exon (NM_198467, exon 5 of 8) 29662 NM_032936 85025 Hs.19025 NM_032936 ENSG00000135211 TMEM60 C7orf35|DC32 transmembrane protein 60 protein-coding 157.333-312 chr6 164188290 164188447 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -516884 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 152.333-351 chr7 38302837 38303129 + 1 NA Intergenic Intergenic -29336 NM_001003806 445347 Hs.534032 NM_001003799 TARP CD3G|TCRG|TCRGC1|TCRGC2|TCRGV TCR gamma alternate reading frame protein protein-coding 148.667-128 chr15 25994225 25994475 + 1 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) intron (NR_040082, intron 1 of 4) 91990 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 132.667-197 chrX 47995774 47996002 + 1 NA intron (NM_006962, intron 3 of 6) L1MEf|LINE|L1 8101 NM_001178099 7569 Hs.189690 NM_006962 ENSG00000147118 ZNF182 HHZ150|KOX14|ZNF21|Zfp182 zinc finger protein 182 protein-coding 303.667-22 chr7 67604767 67605272 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 269043 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 140.333-18 chr1 191717633 191717887 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -440702 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 248.333-90 chr6 42420636 42420933 + 1 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) intron (NM_001297573, intron 2 of 17) 31267 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 239.667-63 chr5 176958302 176958598 + 1 NA intron (NM_001317961, intron 6 of 14) MIRb|SINE|MIR 47992 NM_016290 51720 Hs.232721 NM_016290 ENSG00000087206 UIMC1 RAP80|X2HRIP110 ubiquitin interaction motif containing 1 protein-coding 225.667-55 chr4 30488142 30488484 + 1 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -232056 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 261.333-81 chr4 145770468 145770781 + 1 NA intron (NM_178835, intron 11 of 14) intron (NM_178835, intron 11 of 14) 90420 NM_001080531 646603 NM_001080531 ENSG00000237136 C4orf51 - chromosome 4 open reading frame 51 protein-coding 136.667-69 chr15 58044868 58045083 + 1 NA intron (NM_170696, intron 1 of 11) intron (NM_170696, intron 1 of 11) -20250 NR_147215 283665 Hs.638961 NR_147215 LOC283665 - uncharacterized LOC283665 ncRNA 147.667-256 chr4 62630281 62630428 + 1 NA Intergenic Intergenic -468589 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 156.333-197 chr2 172988560 172988865 + 1 NA exon (NM_001100397, exon 11 of 28) exon (NM_001100397, exon 11 of 28) 60507 NM_001282901 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 147.333-103 chr14 55444240 55444472 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3811 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 167.333-129 chr2 102689747 102689924 + 1 NA intron (NM_003048, intron 5 of 11) L2|LINE|L2 47053 NR_136174 84804 Hs.590898 NM_032718 ENSG00000135953 MFSD9 - major facilitator superfamily domain containing 9 protein-coding 174.333-13 chr10 29557823 29558121 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 5 of 38) intron (NM_001323599, intron 5 of 38) -12875 NR_030335 693189 NR_030335 ENSG00000207612 MIR604 MIRN604|hsa-mir-604 microRNA 604 ncRNA 157.333-182 chr2 64486796 64486973 + 1 NA intron (NR_147011, intron 1 of 2) (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 531 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 143.667-11 chr1 90761708 90761880 + 1 NA Intergenic Intergenic -44492 NM_020063 343472 Hs.451956 NM_020063 ENSG00000143032 BARHL2 - BarH like homeobox 2 protein-coding 161.333-265 chr7 78323056 78323346 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 9 of 20) intron (NM_001301128, intron 9 of 20) -24041 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 136.333-127 chr3 71569271 71569427 + 1 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) intron (NR_146142, intron 2 of 19) 14379 NR_146143 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 162.667-19 chr10 12385016 12385235 + 1 NA intron (NM_153498, intron 1 of 10) L1MB8|LINE|L1 -3857 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 142.667-26 chr10 96375775 96375963 + 1 NA intron (NM_012465, intron 18 of 20) intron (NM_012465, intron 18 of 20) -16504 NM_001284321 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 376.333-12 chr6 106116594 106117000 + 1 NA Intergenic Intergenic 17856 NM_182907 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 138.333-22 chr10 27276056 27276264 + 1 NA intron (NR_138082, intron 2 of 4) L1PREC2|LINE|L1 17398 NR_138082 101060171 Hs.568842 NR_138082 ARMC4P1 - armadillo repeat containing 4 pseudogene 1 pseudo 153.667-313 chr5 58020811 58021007 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 101432 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 198.667-145 chr5 20278922 20279250 + 1 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) L1MA3|LINE|L1 -26465 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 174.333-42 chr14 89938015 89938230 + 1 NA intron (NM_001284269, intron 3 of 5) intron (NM_001284269, intron 3 of 5) 16414 NM_001284269 90141 Hs.123232 NM_145231 ENSG00000140025 EFCAB11 C14orf143 EF-hand calcium binding domain 11 protein-coding 121.667-181 chr6 109902912 109903100 + 1 NA Intergenic Intergenic -75250 NM_001286099 2830 Hs.46332 NM_005284 ENSG00000146360 GPR6 - G protein-coupled receptor 6 protein-coding 229.667-64 chr4 102225147 102225617 + 1 NA Intergenic Intergenic 98930 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 205.667-137 chr9 79944305 79944694 + 1 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) intron (NR_121213, intron 1 of 2) -30524 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 128.333-46 chr12 16751614 16751772 + 1 NA Intergenic Intergenic -143479 NM_001243609 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 164.333-256 chrX 102786372 102786636 + 1 NA intron (NR_038988, intron 2 of 7) intron (NR_038988, intron 2 of 7) 17351 NR_146590 100287765 Hs.556850 NR_038988 LINC00630 - long intergenic non-protein coding RNA 630 ncRNA 161.333-90 chr14 53672089 53672408 + 1 NA Intergenic Intergenic 276236 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 210.667-102 chr5 30714936 30715267 + 1 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR -478585 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 230.333-9 chr10 11912587 11913008 + 1 NA Intergenic Intergenic -18087 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 326.667-40 chr9 123009965 123010378 + 1 NA intron (NM_012197, intron 10 of 25) intron (NM_012197, intron 10 of 25) -23472 NM_005294 2844 Hs.722039 NM_005294 ENSG00000011454 GPR21 - G protein-coupled receptor 21 protein-coding 233.333-101 chr5 3757204 3757609 + 1 NA Intergenic Intergenic 161574 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 277.333-82 chr7 48881812 48882384 + 1 NA Intergenic Intergenic -42449 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 159.333-252 chr5 10362781 10363026 + 1 NA intron (NM_001270661, intron 1 of 22) L1MB8|LINE|L1 9208 NM_001270660 10299 Hs.432862 NM_005885 ENSG00000145495 MARCH6 DOA10|MARCH-VI|RNF176|TEB4 membrane associated ring-CH-type finger 6 protein-coding 290.667-12 chr13 50258363 50258812 + 1 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) HAL1|LINE|L1 86569 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 238.667-52 chr20 47452113 47452473 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -40149 NR_146496 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 142.667-64 chr15 50921520 50921787 + 1 NA intron (NM_001252127, intron 3 of 20) MIRb|SINE|MIR 12970 NM_001252127 23431 Hs.413366 NM_007347 ENSG00000081014 AP4E1 CPSQ4|SPG51|STUT1 adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1 protein-coding 150.667-329 chr6 39263574 39263770 + 1 NA Intergenic Intergenic -34197 NM_003740 8645 Hs.444448 NM_003740 ENSG00000164626 KCNK5 K2p5.1|KCNK5b|TASK-2|TASK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 5 protein-coding 217.667-72 chr5 16594202 16594562 + 1 NA intron (NM_001034850, intron 1 of 8) intron (NM_001034850, intron 1 of 8) -21544 NR_109946 101929524 Hs.734029 NR_109946 ENSG00000246214 LOC101929524 - uncharacterized LOC101929524 ncRNA 135.667-127 chr4 30951892 30952057 + 1 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -219170 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 236.333-5 chr1 65142979 65143405 + 1 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -4357 NM_203464 205 Hs.10862 NM_013410 ENSG00000162433 AK4 AK 4|AK3|AK3L1|AK3L2 adenylate kinase 4 protein-coding 122.667-157 chr5 115429070 115429221 + 1 NA Intergenic Intergenic 115630 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 234.667-67 chr3 66112640 66113026 + 1 NA Intergenic Intergenic -20777 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 159.667-287 chr6 156702088 156702388 + 1 NA Intergenic Intergenic -75617 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 214.333-61 chr17 48581408 48581751 + 1 NA intron (NM_001330322, intron 1 of 4) intron (NM_001330322, intron 1 of 4) 800 NM_001330322 3213 Hs.654560 NM_002146 ENSG00000120093 HOXB3 HOX2|HOX2G|Hox-2.7 homeobox B3 protein-coding 160.333-243 chr6 39641916 39642163 + 1 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) intron (NM_001289020, intron 3 of 21) 83369 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 120.667-159 chr7 44310752 44310887 + 1 NA intron (NM_172081, intron 1 of 18) L1MB3|LINE|L1 14775 NM_172078 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 133.333-94 chr21 23633433 23633593 + 1 NA Intergenic Intergenic -248678 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 170.333-87 chr16 72790555 72790863 + 1 NA intron (NM_001164766, intron 8 of 8) intron (NM_001164766, intron 8 of 8) -125739 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 146.667-274 chr6 37963467 37963752 + 1 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) L1M1|LINE|L1 143882 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 156.333-279 chr5 33421041 33421237 + 1 NA Intergenic MER131|DNA?|DNA? -19557 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 155.667-103 chr14 71052649 71052838 + 1 NA intron (NM_014982, intron 24 of 35) intron (NM_014982, intron 24 of 35) 145284 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 160.667-24 chr1 224262548 224262717 + 1 NA intron (NM_002533, intron 18 of 22) HAL1|LINE|L1 -5522 NR_031574 100313769 NR_031574 ENSG00000221406 MIR320B2 MIR320B-2|MIRN320B2|mir-320b-2 microRNA 320b-2 ncRNA 140.667-82 chr14 79465176 79465430 + 1 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 185923 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 156.667-349 chr8 139723635 139723920 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -20654 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 221.667-65 chr5 33447772 33448083 + 1 NA intron (NR_047676, intron 3 of 19) intron (NR_047676, intron 3 of 19) 7151 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 134.333-105 chr21 32924604 32924762 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -34205 NR_135522 102724502 Hs.130572 NR_135522 ENSG00000228961 LINC01690 - long intergenic non-protein coding RNA 1690 ncRNA 141.333-216 chr6 123725759 123726040 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -77947 NM_001300737 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 150.667-301 chr5 57045215 57045412 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -93183 NM_001297598 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 166.333-160 chr3 179868744 179869021 + 1 NA intron (NR_146167, intron 6 of 13) LTR49|LTR|ERV1 -29312 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 139.667-201 chr9 19667321 19667500 + 1 NA intron (NM_020344, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 119609 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 150.333-191 chr2 49718953 49719109 + 1 NA Intergenic Intergenic 255172 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 275.667-34 chr20 4241253 4241658 + 1 NA intron (NM_000678, intron 1 of 1) intron (NM_000678, intron 1 of 1) 7832 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 188.667-60 chr17 72682638 72682850 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) intron (NM_001352692, intron 7 of 9) -42272 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 166.667-162 chr4 39714277 39714518 + 1 NA intron (NM_001111113, intron 1 of 4) intron (NM_001111113, intron 1 of 4) 16261 NM_001111112 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 151.333-78 chr11 47042380 47042569 + 1 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) intron (NR_103472, intron 2 of 7) 105713 NM_024113 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 181.333-108 chr3 197232939 197233242 + 1 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) L1M4|LINE|L1 -48959 NM_001204388 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 194.667-30 chr11 102328948 102329227 + 1 NA intron (NM_182962, intron 6 of 9) MER5B|DNA|hAT-Charlie 11603 NM_001165 330 Hs.127799 NM_001165 ENSG00000023445 BIRC3 AIP1|API2|CIAP2|HAIP1|HIAP1|IAP-1|MALT2|MIHC|RNF49|c-IAP2 baculoviral IAP repeat containing 3 protein-coding 152.333-389 chr8 123471892 123472108 + 1 NA Intergenic Intergenic 55226 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 171.667-69 chr18 27892158 27892502 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 144311 NM_001308176 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 186.667-22 chr11 42755081 42755376 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -501538 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 189.333-7 chr1 82985471 82985736 + 1 NA promoter-TSS (NR_110632) promoter-TSS (NR_110632) 605 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 158.333-294 chr7 30957096 30957375 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -6718 NM_000823 2692 Hs.767 NM_000823 ENSG00000106128 GHRHR GHRFR|GRFR|IGHD1B|IGHD4 growth hormone releasing hormone receptor protein-coding 114.333-172 chr5 39469822 39469977 + 1 NA Intergenic Intergenic -44666 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 179.333-53 chr12 101305878 101306172 + 1 NA exon (NM_014503, exon 16 of 62) exon (NM_014503, exon 16 of 62) 25920 NM_014503 27340 Hs.295732 NM_014503 ENSG00000120800 UTP20 1A6/DRIM|DRIM UTP20 small subunit processome component protein-coding 241.667-101 chrX 149700187 149700478 + 1 NA intron (NM_001011544, intron 2 of 4) intron (NM_001011544, intron 2 of 4) -11728 NM_005366 4110 Hs.670252 NM_005366 ENSG00000185247 MAGEA11 CT1.11|MAGE-11|MAGE11|MAGEA-11 MAGE family member A11 protein-coding 320.667-24 chr3 95098584 95099282 + 1 NA Intergenic Intergenic 160670 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 150.667-324 chr5 181112845 181113018 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 12373 NM_001258283 26693 Hs.742585 NM_001258283 ENSG00000185372 OR2V1 OR2V1P|OST265 olfactory receptor family 2 subfamily V member 1 protein-coding 161.333-207 chr4 36630416 36630593 + 1 NA intron (NR_149124, intron 1 of 4) intron (NR_149124, intron 1 of 4) 11396 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 151.667-403 chrX 84229139 84229295 + 1 NA Intergenic Intergenic -3389 NR_031690 100302191 NR_031690 ENSG00000221494 MIR548I4 MIR548I-4|MIRN548I4|hsa-mir-548i-4 microRNA 548i-4 ncRNA 161.667-77 chr14 61269342 61269634 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 11850 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 164.667-126 chr20 47652991 47653214 + 1 NA intron (NM_181659, intron 22 of 22) intron (NM_181659, intron 22 of 22) 132962 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 198.333-172 chr5 162070216 162070535 + 1 NA intron (NM_198904, intron 1 of 9) intron (NM_198904, intron 1 of 9) 2733 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 154.333-139 chr19 47338646 47338897 + 1 NA intron (NM_018485, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 1676 NM_018485 27202 Hs.534412 NM_018485 ENSG00000134830 C5AR2 C5L2|GPF77|GPR77 complement component 5a receptor 2 protein-coding 156.333-290 chr5 107082998 107083299 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -72134 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 212.667-41 chr14 74080115 74080500 + 1 NA intron (NM_001278593, intron 1 of 11) L2c|LINE|L2 4146 NM_001278593 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 193.667-144 chr9 108173559 108173874 + 1 NA Intergenic Intergenic 682270 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 137.333-67 chr17 60364890 60365110 + 1 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) intron (NM_032582, intron 1 of 33) 27133 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 199.667-142 chr8 117013400 117013809 + 1 NA intron (NM_001172813, intron 2 of 10) intron (NM_001172813, intron 2 of 10) 62629 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 125.333-41 chr12 2018693 2018898 + 1 NA Intergenic Intergenic -14260 NR_135060 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 266.667-42 chr2 188491548 188491930 + 1 NA intron (NM_001252669, intron 4 of 8) intron (NM_001252669, intron 4 of 8) 194247 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 137.333-96 chr2 58888607 58888757 + 1 NA intron (NR_033873, intron 3 of 13) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -329026 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 139.667-118 chr3 87710608 87710791 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -82007 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 127.333-74 chr2 14000570 14000805 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 400271 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 196.333-11 chr10 86935495 86935741 + 1 NA TTS (NM_024756) TTS (NM_024756) -20141 NM_001330120 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 159.333-236 chr4 52246230 52246408 + 1 NA Intergenic Intergenic 195015 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 170.333-143 chr3 111410774 111411030 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -131295 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 234.333-40 chr2 160963244 160963533 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -173567 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 276.333-6 chr10 75471663 75472034 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) 40224 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 160.667-239 chr5 32054398 32054620 + 1 NA intron (NM_178140, intron 10 of 24) AluJb|SINE|Alu -118350 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 137.333-122 chr3 90362465 90362711 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1254967 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 156.667-213 chr21 15096788 15097038 + 1 NA Intergenic Intergenic -31913 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 184.667-85 chr4 23798892 23799186 + 1 NA intron (NM_001330752, intron 13 of 13) intron (NM_001330752, intron 13 of 13) 82253 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 233.333-115 chr6 6277348 6277745 + 1 NA intron (NM_000129, intron 3 of 14) MER49|LTR|ERV1 43145 NM_000129 2162 Hs.335513 NM_000129 ENSG00000124491 F13A1 F13A coagulation factor XIII A chain protein-coding 300.333-21 chr2 40967894 40968363 + 1 NA Intergenic Intergenic -455693 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 153.333-13 chr1 101018945 101019237 + 1 NA intron (NM_001077394, intron 3 of 7) intron (NM_001077394, intron 3 of 7) 6693 NM_001077395 51611 Hs.440776 NM_015958 ENSG00000117543 DPH5 AD-018|CGI-30|HSPC143|NPD015 diphthamide biosynthesis 5 protein-coding 139.333-206 chr7 115997396 115997606 + 1 NA intron (NM_012252, intron 1 of 7) L1M1|LINE|L1 -29188 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 217.667-58 chr3 120278946 120279319 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -34837 NM_153002 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 155.333-320 chr5_GL000208v1_random 73999 74249 + 1 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 131.667-220 chrX 103572413 103572584 + 1 NA Intergenic Intergenic -3733 NM_001300901 79921 Hs.194329 NM_024863 ENSG00000133142 TCEAL4 NPD017|WEX7 transcription elongation factor A like 4 protein-coding 140.333-4 chr1 50002682 50002959 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) intron (NM_001323575, intron 1 of 12) 21134 NR_136623 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 155.333-59 chr11 104653027 104653250 + 1 NA Intergenic Intergenic -43836 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 241.333-93 chr7 3517023 3517309 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 215914 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 453.333-3 chr2 37405757 37406379 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 61438 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 191.667-55 chr16 79821112 79821406 + 1 NA Intergenic Intergenic 26010 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 172.333-196 chr9 74001281 74001493 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -370144 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 159.333-232 chr4 33892404 33892733 + 1 NA Intergenic Intergenic 147325 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 162.333-278 chr9 137700617 137700799 + 1 NA intron (NM_001354612, intron 1 of 8) intron (NM_001354612, intron 1 of 8) 81703 NM_001354611 79813 Hs.495511 NM_024757 ENSG00000181090 EHMT1 EHMT1-IT1|EUHMTASE1|Eu-HMTase1|FP13812|GLP|GLP1|KLEFS1|KMT1D euchromatic histone lysine methyltransferase 1 protein-coding 187.333-131 chr3 98916125 98916402 + 1 NA Intergenic Intergenic -14568 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 160.667-179 chr20 45069475 45069743 + 1 NA intron (NM_001352385, intron 11 of 11) intron (NM_001352385, intron 11 of 11) 31518 NM_001322799 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 307.667-24 chr22 40178045 40178602 + 1 NA intron (NM_015088, intron 1 of 20) intron (NM_015088, intron 1 of 20) 398 NM_015088 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 276.667-7 chr1 217699781 217700215 + 1 NA intron (NM_138796, intron 5 of 10) L1MD2|LINE|L1 68654 NM_138796 128153 Hs.171130 NM_138796 ENSG00000162814 SPATA17 IQCH|MSRG-11|MSRG11 spermatogenesis associated 17 protein-coding 223.667-27 chr16 76276055 76276499 + 1 NA Intergenic Intergenic -1124 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 133.333-207 chrX 98758930 98759096 + 1 NA Intergenic Intergenic -1194478 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 234.333-11 chr10 112524468 112524860 + 1 NA intron (NM_001365712, intron 3 of 8) intron (NM_001365712, intron 3 of 8) -77061 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 216.667-38 chr15 72538454 72538887 + 1 NA intron (NM_005744, intron 2 of 13) intron (NM_005744, intron 2 of 13) -48547 NR_030359 693215 NR_030359 ENSG00000283798 MIR630 MIRN630|hsa-mir-630 microRNA 630 ncRNA 260.333-5 chr11 45271601 45271990 + 1 NA intron (NM_001247987, intron 1 of 7) intron (NM_001247987, intron 1 of 7) 14546 NM_020826 57586 Hs.436643 NM_020826 ENSG00000019505 SYT13 - synaptotagmin 13 protein-coding 154.333-240 chr4 41741230 41741411 + 1 NA Intergenic Intergenic 7650 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 251.667-83 chr6 107556897 107557192 + 1 NA intron (NM_018013, intron 4 of 6) intron (NM_018013, intron 4 of 6) 66927 NM_018013 55084 Hs.445244 NM_018013 ENSG00000112320 SOBP JXC1|MRAMS sine oculis binding protein homolog protein-coding 170.333-11 chr1 118811885 118812144 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 176329 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 130.333-107 chr2 128523208 128523411 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -204441 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 194.333-130 chr6 54896960 54897250 + 1 NA intron (NM_001010872, intron 2 of 4) intron (NM_001010872, intron 2 of 4) 50334 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 202.667-32 chr11 88487008 88487271 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -17437 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-106 chr14 38281351 38281545 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -25355 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 141.667-66 chr13 62091975 62092172 + 1 NA Intergenic Intergenic -62525 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 124.667-51 chr12 120860250 120860402 + 1 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) intron (NM_139015, intron 1 of 10) 44032 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 148.667-101 chr13 38130531 38130807 + 1 NA intron (NR_047500, intron 1 of 5) L1PA15|LINE|L1 12563 NR_047500 100874188 Hs.569249 NR_047500 ENSG00000223685 LINC00571 - long intergenic non-protein coding RNA 571 ncRNA 128.333-6 chr1 108643521 108643673 + 1 NA Intergenic Intergenic 17496 NM_001102592 113802 Hs.7962 NM_144584 ENSG00000162639 HENMT1 C1orf59|HEN1 HEN methyltransferase 1 protein-coding 155.333-135 chr17 48267371 48267530 + 1 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -26897 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 149.667-132 chr14 88581680 88581910 + 1 NA intron (NM_001326298, intron 9 of 13) L1MC5|LINE|L1 -12625 NM_207662 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 331.333-47 chr8 89425987 89426367 + 1 NA Intergenic Intergenic 331534 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 197.667-18 chr10 56916372 56916733 + 1 NA Intergenic Intergenic 388007 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 223.667-63 chr5 13090529 13090849 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -57803 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 168.667-232 chr9 32994320 32994509 + 1 NA intron (NR_160921, intron 1 of 7) intron (NR_160921, intron 1 of 7) 7162 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 162.667-173 chr3 64112544 64112757 + 1 NA intron (NM_001370528, intron 7 of 7) L1PA16|LINE|L1 9180 NR_046701 100874242 Hs.668874 NR_046701 PRICKLE2-AS2 - PRICKLE2 antisense RNA 2 ncRNA 149.667-181 chr2 9744691 9744942 + 1 NA Intergenic Intergenic -98626 NM_001318976 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 143.667-76 chr14 68992111 68992286 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 12516 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 158.667-325 chr8 110805166 110805359 + 1 NA Intergenic Intergenic 222171 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 253.333-92 chr6 87340172 87340744 + 1 NA 3' UTR (NM_001042493, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001042493, exon 4 of 4) -4355 NM_001010868 206412 Hs.646309 NM_001010868 ENSG00000203872 C6orf163 - chromosome 6 open reading frame 163 protein-coding 183.333-124 chr5 26254641 26254928 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 783802 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 251.333-92 chr5 168157236 168157750 + 1 NA intron (NM_001368145, intron 11 of 26) L2c|LINE|L2 -8352 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 182.667-122 chr4 108696969 108697350 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 46560 NM_021227 58505 Hs.445803 NM_021227 ENSG00000198856 OSTC DC2 oligosaccharyltransferase complex non-catalytic subunit protein-coding 117.667-155 chr5 96200437 96200596 + 1 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 121378 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 171.333-17 chr1 224406607 224406849 + 1 NA intron (NM_025160, intron 7 of 13) intron (NM_025160, intron 7 of 13) -8417 NR_039896 100616468 NR_039896 ENSG00000266618 MIR4742 mir-4742 microRNA 4742 ncRNA 341.333-27 chr6 126811025 126811705 + 1 NA Intergenic Intergenic -307306 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 152.333-118 chr15 42680479 42680634 + 1 NA intron (NM_020759, intron 20 of 32) AluSz|SINE|Alu 56572 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 256.667-11 chr11 75710051 75710631 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -7497 NM_025098 80168 Hs.288568 NM_025098 ENSG00000166391 MOGAT2 DGAT2L5|DGAT2L5.|MGAT2|hDC5 monoacylglycerol O-acyltransferase 2 protein-coding 220.333-32 chr12 11917405 11917677 + 1 NA Intergenic Intergenic -132320 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 147.333-94 chr13 111919278 111919444 + 1 NA Intergenic Intergenic 25865 NR_120401 101928616 Hs.528450 NR_046992 LINC00354 - long intergenic non-protein coding RNA 354 ncRNA 124.667-134 chr3 23498622 23498802 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) AluSz6|SINE|Alu 295385 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 154.333-217 chr3 76340864 76341045 + 1 NA Intergenic Intergenic -555405 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 207.667-15 chr11 30202460 30202927 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -28321 NM_001018080 2488 Hs.36975 NM_000510 ENSG00000131808 FSHB HH24 follicle stimulating hormone subunit beta protein-coding 235.333-107 chr6 132891977 132892251 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 74895 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 156.667-164 chr2 9545751 9546060 + 1 NA intron (NM_003183, intron 1 of 18) AluJo|SINE|Alu 9925 NM_003183 6868 Hs.404914 NM_003183 ENSG00000151694 ADAM17 ADAM18|CD156B|CSVP|NISBD|NISBD1|TACE ADAM metallopeptidase domain 17 protein-coding 170.667-148 chr6 125239662 125239939 + 1 NA intron (NM_003287, intron 3 of 6) L1PB1|LINE|L1 36089 NM_001318907 7164 Hs.591347 NM_003287 ENSG00000111907 TPD52L1 D53 TPD52 like 1 protein-coding 159.333-111 chr16 7963209 7963384 + 1 NA Intergenic Intergenic 626542 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 145.667-311 chr9 87062764 87062918 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -20715 NR_027471 440173 Hs.127361 NR_027471 ENSG00000269994 LOC440173 - uncharacterized LOC440173 ncRNA 128.333-109 chr2 153591454 153591610 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -112770 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 173.333-199 chr8 76525741 76525951 + 1 NA Intergenic Intergenic 119192 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 231.333-116 chr8 61110502 61110948 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -142977 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 241.333-62 chr21 21898824 21899285 + 1 NA Intergenic Intergenic 152069 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 192.667-42 chr11 124130992 124131296 + 1 NA intron (NM_001130142, intron 11 of 18) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 15694 NM_001130142 4013 Hs.152944 NM_014622 ENSG00000110002 VWA5A BCSC-1|BCSC1|LOH11CR2A von Willebrand factor A domain containing 5A protein-coding 133.333-117 chr3 155243146 155243367 + 1 NA TTS (NR_125399) TTS (NR_125399) 2311 NR_125399 101928190 Hs.121410 NR_125399 ENSG00000241336 LINC01487 - long intergenic non-protein coding RNA 1487 ncRNA 167.333-235 chr6 126159652 126159870 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 173221 NR_146803 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 157.667-142 chr2 52935247 52935486 + 1 NA Intergenic Intergenic -232751 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 132.667-94 chr2 149296116 149296340 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -33757 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 149.667-299 chr5 7383830 7384011 + 1 NA Intergenic Intergenic -12218 NM_020546 108 Hs.481545 NM_020546 ENSG00000078295 ADCY2 AC2|HBAC2 adenylate cyclase 2 protein-coding 145.333-273 chr7 51279242 51279463 + 1 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) intron (NM_015198, intron 1 of 12) 37457 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 193.333-47 chr13 72007661 72007892 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -140572 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 163.333-236 chr6 27552149 27552348 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -79130 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 159.333-216 chr3 107280768 107280975 + 1 NA intron (NR_028302, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 40179 NR_028301 344595 Hs.543039 NR_028301 ENSG00000243701 DUBR DUM|LINC00883|LINC0883 DPPA2 upstream binding RNA ncRNA 204.333-39 chr11 115207054 115207423 + 1 NA intron (NM_001301045, intron 7 of 10) intron (NM_001301045, intron 7 of 10) -126339 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 112.333-81 chr15 82978682 82978859 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -7440 NM_031452 83640 Hs.80624 NM_031452 ENSG00000169612 RAMAC C15orf18|FAM103A1|HsT19360|RAM|RAMMET RNA guanine-7 methyltransferase activating subunit protein-coding 203.667-34 chr16 23905861 23906189 + 1 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) L1ME4b|LINE|L1 70042 NM_212535 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 370.333-8 chr14 21654781 21655295 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -10045 NM_001001912 26686 Hs.547982 NM_001001912 ENSG00000221977 OR4E2 OR14-42 olfactory receptor family 4 subfamily E member 2 protein-coding 160.333-41 chr10 46539949 46540227 + 1 NA Intergenic Intergenic 15983 NM_014696 9721 Hs.523375 NM_014696 ENSG00000204175 GPRIN2 GRIN2|KIAA0514 G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 protein-coding 191.667-117 chr7 66241357 66241700 + 1 NA intron (NM_003596, intron 2 of 5) intron (NM_003596, intron 2 of 5) 36194 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 303.333-33 chr17 60734515 60734920 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) L1MC2|LINE|L1 56866 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 139.333-109 chr2 51801573 51801714 + 1 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) L1M2a1|LINE|L1 -569005 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 133.667-20 chr10 59305332 59305560 + 1 NA intron (NM_001347852, intron 4 of 12) intron (NM_001347852, intron 4 of 12) 57103 NM_198215 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 198.667-23 chr10 68759429 68759797 + 1 NA intron (NR_104262, intron 14 of 23) AluJb|SINE|Alu 4441 NR_003076 692211 NR_003076 ENSG00000283551 SNORD98 HBII-419 small nucleolar RNA, C/D box 98 snoRNA 152.667-27 chr1 240171823 240172137 + 1 NA intron (NM_020066, intron 2 of 17) intron (NM_020066, intron 2 of 17) 80097 NM_001305424 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 162.333-205 chr5 133367714 133367922 + 1 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) intron (NM_015082, intron 4 of 15) 59888 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 142.333-99 chr16 71370244 71370452 + 1 NA intron (NM_001740, intron 1 of 10) intron (NM_001740, intron 1 of 10) 11625 NM_001740 794 Hs.106857 NM_001740 ENSG00000172137 CALB2 CAB29|CAL2|CR calbindin 2 protein-coding 208.333-156 chr8 134213298 134213575 + 1 NA Intergenic Intergenic 326940 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 155.333-207 chr21 28582850 28583080 + 1 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 43647 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 211.333-66 chr14 84087974 84088350 + 1 NA Intergenic Intergenic -1183770 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 265.667-16 chr12 215452 215953 + 1 NA Intergenic Intergenic -1545 NM_001122848 6539 Hs.437174 NM_003044 ENSG00000111181 SLC6A12 BGT-1|BGT1|GAT2 solute carrier family 6 member 12 protein-coding 118.667-162 chr5 130674107 130674272 + 1 NA Intergenic Intergenic 491067 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 168.333-226 chr9 131405896 131406119 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -24083 NM_013318 84726 Hs.743955 NM_013318 ENSG00000130723 PRRC2B BAT2L|BAT2L1|KIAA0515|LQFBS-1 proline rich coiled-coil 2B protein-coding 185.333-58 chr16 8540806 8541182 + 1 NA intron (NM_001290098, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 48844 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 167.333-55 chr11 36863850 36864032 + 1 NA Intergenic Intergenic -265662 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 153.333-178 chr19 50928618 50928808 + 1 NA Intergenic LTR45B|LTR|ERV1 -17975 NR_126566 9622 Hs.218366 NM_004917 ENSG00000167749 KLK4 AI2A1|ARM1|EMSP|EMSP1|KLK-L1|PRSS17|PSTS|kallikrein kallikrein related peptidase 4 protein-coding 250.667-79 chr8 88796897 88797346 + 1 NA Intergenic Intergenic -469638 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 163.667-46 chr12 57031032 57031311 + 1 NA exon (NM_001256041, exon 24 of 29) exon (NM_001256041, exon 24 of 29) -14642 NM_013251 6866 Hs.9730 NM_013251 ENSG00000166863 TAC3 HH10|NKB|NKNB|PRO1155|ZNEUROK1 tachykinin 3 protein-coding 162.333-113 chr2 57489473 57489699 + 1 NA Intergenic Intergenic -418065 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 299.667-29 chr5 144767750 144768335 + 1 NA Intergenic Intergenic 562651 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 217.667-86 chr7 147832222 147832598 + 1 NA intron (NM_014141, intron 12 of 22) Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 160731 NR_133930 105375556 Hs.667432 NR_133929 ENSG00000230190 LOC105375556 - uncharacterized LOC105375556 ncRNA 261.333-92 chr5 165643229 165643544 + 1 NA Intergenic Intergenic 1173107 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 151.333-332 chr5 45459627 45459897 + 1 NA intron (NM_021072, intron 3 of 7) intron (NM_021072, intron 3 of 7) 236618 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 158.667-267 chr5 45619690 45619965 + 1 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) L1MD3|LINE|L1 76553 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 254.667-69 chr5 94411627 94411933 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 15 of 20) AluSg|SINE|Alu 206824 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 137.667-71 chr16 62863884 62864160 + 1 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -827584 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 220.667-101 chr8 29020948 29021329 + 1 NA intron (NM_001324384, intron 6 of 10) AluJr4|SINE|Alu 129824 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 162.667-270 chr8 83990873 83991041 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -191830 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 151.667-232 chr3 138694251 138694525 + 1 NA intron (NM_006219, intron 14 of 23) MER68|LTR|ERVL 13233 NM_001256045 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 214.333-124 chr6 36287072 36287533 + 1 NA intron (NM_001145717, intron 1 of 7) intron (NM_001145717, intron 1 of 7) 16842 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 304.667-20 chr2 165415756 165416245 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -53698 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 261.667-25 chr17 57953860 57954336 + 1 NA intron (NM_001271875, intron 1 of 10) intron (NM_001271875, intron 1 of 10) 1314 NM_001271875 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 215.333-44 chr12 64620917 64621329 + 1 NA intron (NR_040718, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu -1386 NR_030347 693129 NR_030347 ENSG00000207546 MIR548C MIRN548C microRNA 548c ncRNA 120.333-63 chr15 79446685 79446835 + 1 NA intron (NM_015206, intron 1 of 3) L1MEd|LINE|L1 14244 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 178.333-48 chr14 20441852 20442058 + 1 NA Intergenic Intergenic -5789 NM_001365790 123103 Hs.556014 NM_001109997 ENSG00000185271 KLHL33 - kelch like family member 33 protein-coding 127.333-199 chr9 101884957 101885135 + 1 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -146466 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 172.333-181 chr8 90325553 90325800 + 1 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 104188 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 185.333-30 chr11 83634887 83635188 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) intron (NM_001142699, intron 18 of 27) 47388 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 115.667-72 chr14 51543516 51543699 + 1 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 54479 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 177.333-103 chr3 10276215 10276443 + 1 NA intron (NM_014760, intron 4 of 7) intron (NM_014760, intron 4 of 7) -4022 NR_162141 113219470 NR_162141 MIR12127 - microRNA 12127 ncRNA 154.667-226 chr22 22059560 22059776 + 1 NA Intergenic Intergenic -15734 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 142.333-118 chr2 72464959 72465189 + 1 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) intron (NM_001321729, intron 18 of 22) -317212 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 208.667-4 chr1 82075177 82075623 + 1 NA Intergenic Intergenic 272947 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 218.333-88 chr3 128129439 128129766 + 1 NA intron (NM_001319086, intron 1 of 9) L1MB3|LINE|L1 -5790 NM_001319084 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 138.667-173 chr5 169044050 169044210 + 1 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) L1MB7|LINE|L1 30903 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 240.667-60 chr4 46367592 46367913 + 1 NA intron (NM_001114175, intron 2 of 8) intron (NM_001114175, intron 2 of 8) 21627 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 150.667-154 chr18 2797474 2797655 + 1 NA intron (NM_015295, intron 47 of 47) L2a|LINE|L2 -49442 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 218.667-66 chr3 27202226 27202665 + 1 NA exon (NM_152534, exon 25 of 39) exon (NM_152534, exon 25 of 39) 14078 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 126.667-127 chr4 132601268 132601419 + 1 NA intron (NR_126401, intron 1 of 3) L1MCa|LINE|L1 10254 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 179.667-155 chr9 124994996 124995326 + 1 NA intron (NM_173690, intron 14 of 18) intron (NM_173690, intron 14 of 18) -54078 NM_002077 2800 Hs.59504 NM_002077 ENSG00000136935 GOLGA1 golgin-97 golgin A1 protein-coding 145.333-97 chr15 60987791 60988082 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 241366 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 160.667-64 chr11 127985716 127985929 + 1 NA Intergenic Intergenic -222944 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 159.667-314 chr8 77498929 77499158 + 1 NA Intergenic Intergenic 48346 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 139.667-160 chr6 35275786 35275977 + 1 NA intron (NM_001292032, intron 1 of 12) Plat_L3|LINE|CR1 16146 NM_003427 7629 Hs.388024 NM_003427 ENSG00000065029 ZNF76 D6S229E|ZNF523|Zfp523 zinc finger protein 76 protein-coding 271.667-58 chr6 153128748 153129173 + 1 NA intron (NM_012419, intron 1 of 4) intron (NM_012419, intron 1 of 4) 2322 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 317.667-30 chr3 69900911 69901345 + 1 NA intron (NM_198159, intron 2 of 9) intron (NM_198159, intron 2 of 9) 34904 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 184.333-17 chr10 115101158 115101360 + 1 NA intron (NR_074088, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 7894 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 237.333-51 chr19 31342213 31342593 + 1 NA intron (NR_138034, intron 1 of 1) intron (NR_138034, intron 1 of 1) 7033 NR_138036 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 173.667-26 chr10 104768116 104768348 + 1 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) MER5A|DNA|hAT-Charlie -102016 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 235.667-17 chr14 29019344 29019752 + 1 NA Intergenic Intergenic -233761 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 196.333-120 chr3 162540553 162540759 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 762645 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 268.667-11 chr13 88146032 88146419 + 1 NA intron (NR_131919, intron 1 of 4) MER66-int|LTR|ERV1 3358 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 143.333-39 chr10 72557085 72557352 + 1 NA intron (NM_006077, intron 3 of 11) intron (NM_006077, intron 3 of 11) -33232 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 192.333-120 chr4 31495358 31495684 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11023 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 304.667-21 chr20 35464161 35464574 + 1 NA intron (NM_007186, intron 5 of 34) AluJr|SINE|Alu 4384 NM_001318219 11190 Hs.443976 NM_007186 ENSG00000126001 CEP250 C-NAP1|CEP2|CNAP1|CRDHL2 centrosomal protein 250 protein-coding 148.333-387 chr8 95360234 95360411 + 1 NA intron (NR_038209, intron 2 of 3) intron (NR_038209, intron 2 of 3) -91121 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 150.333-260 chr3 40662825 40663110 + 1 NA Intergenic Intergenic 138007 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 140.667-230 chr8 87659595 87659868 + 1 NA Intergenic Intergenic 214284 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 149.667-149 chr16 58531842 58532027 + 1 NA intron (NR_049763, intron 42 of 49) intron (NR_049763, intron 42 of 49) 16455 NR_134583 79918 Hs.731691 NM_024860 ENSG00000103037 SETD6 - SET domain containing 6, protein lysine methyltransferase protein-coding 154.667-331 chr5 158766372 158766677 + 1 NA intron (NM_001324107, intron 10 of 15) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 331432 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 146.333-218 chr3 127460694 127460956 + 1 NA Intergenic Intergenic -70155 NR_110147 101927123 Hs.526761 NR_110147 ENSG00000244215 LINC02016 - long intergenic non-protein coding RNA 2016 ncRNA 146.667-161 chr2 58080886 58081088 + 1 NA intron (NM_001288836, intron 3 of 13) intron (NM_001288836, intron 3 of 13) 34275 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 192.667-99 chr20 39416442 39416658 + 1 NA Intergenic Intergenic -191802 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 119.667-75 chr17 68866953 68867093 + 1 NA TTS (NM_007168) TTS (NM_007168) 88369 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 152.333-365 chr8 14720395 14720692 + 1 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 132967 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 159.333-85 chr14 45640847 45641125 + 1 NA Intergenic Intergenic 74616 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 146.333-187 chr22 27916948 27917095 + 1 NA intron (NM_012399, intron 1 of 11) L2c|LINE|L2 2193 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 117.667-207 chr9 70749367 70749516 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 8 of 25) intron (NM_001366143, intron 8 of 25) 60643 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 209.333-112 chr2 74114239 74114526 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 33530 NM_001035505 388962 Hs.61472 NM_212552 ENSG00000163170 BOLA3 MMDS2 bolA family member 3 protein-coding 166.333-58 chr12 78412245 78412485 + 1 NA Intergenic Intergenic -52619 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 212.667-105 chr5 67068210 67068606 + 1 NA intron (NM_001297651, intron 2 of 25) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 63753 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 157.667-224 chr4 168231102 168231396 + 1 NA intron (NM_017631, intron 33 of 37) L1PB1|LINE|L1 87503 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 149.667-183 chr2 13779381 13779589 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 621473 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 171.333-101 chr2 200286901 200287176 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -18841 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 187.667-100 chr3 178772582 178772791 + 1 NA intron (NR_126560, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 87719 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 170.333-209 chr7 98694059 98694231 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 76860 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 278.667-58 chrX 131425798 131426118 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -118116 NM_001004486 347468 Hs.553711 NM_001004486 ENSG00000171054 OR13H1 ORX1 olfactory receptor family 13 subfamily H member 1 protein-coding 181.667-61 chr19 42393802 42394117 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3169 NR_126041 101930071 Hs.567935 NR_126041 ENSG00000213904 LOC101930071 - uncharacterized LOC101930071 ncRNA 260.333-63 chr7 49391477 49391878 + 1 NA Intergenic Intergenic -381961 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 158.333-267 chr5 161637257 161637561 + 1 NA Intergenic Intergenic -48312 NM_000811 2559 Hs.90791 NM_000811 ENSG00000145863 GABRA6 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha6 subunit protein-coding 321.333-57 chr7 105027859 105028376 + 1 NA intron (NM_182931, intron 1 of 26) intron (NM_182931, intron 1 of 26) 13912 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 135.667-116 chr3 48016896 48017115 + 1 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) AluSz|SINE|Alu 71843 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 147.667-70 chr12 40029843 40030122 + 1 NA intron (NM_052885, intron 2 of 9) intron (NM_052885, intron 2 of 9) 76099 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 230.333-44 chr16 49900839 49901229 + 1 NA Intergenic Intergenic -43115 NM_001271620 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 205.333-190 chr5 118659130 118659589 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 63171 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 148.333-313 chr5 52673879 52674156 + 1 NA Intergenic Intergenic -113899 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 164.333-156 chr3 78001737 78001992 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 47099 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 209.667 chr1 27076721 27076986 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -64003 NM_052943 115572 Hs.632378 NM_052943 ENSG00000158246 TENT5B FAM46B terminal nucleotidyltransferase 5B protein-coding 237.667-73 chr6 57088362 57088707 + 1 NA Intergenic Intergenic -1496 NM_015555 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 202.333-111 chr3 140415356 140415685 + 1 NA intron (NM_022131, intron 4 of 16) L1MA9|LINE|L1 93269 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 113.333-25 chr10 58968770 58969048 + 1 NA Intergenic Intergenic -30609 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 235.333-102 chr5 142276380 142276751 + 1 NA Intergenic Intergenic 41757 NR_131221 100642175 Hs.684549 NR_131221 SPRY4-IT1 SPRIGHTLY SPRY4 intronic transcript 1 ncRNA 170.667-30 chr12 1118262 1118563 + 1 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) intron (NR_027948, intron 6 of 19) 90664 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 161.667-87 chr15 48942845 48943125 + 1 NA intron (NM_203349, intron 1 of 11) intron (NM_203349, intron 1 of 11) 20934 NM_203349 399694 Hs.642615 NM_203349 ENSG00000185634 SHC4 RaLP|SHCD SHC adaptor protein 4 protein-coding 185.333-195 chr9 3164388 3164637 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -17077 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 141.333-95 chr18 70400609 70400754 + 1 NA Intergenic Intergenic -16090 NR_110764 101060542 Hs.586967 NR_110764 ENSG00000266278 LINC01910 - long intergenic non-protein coding RNA 1910 ncRNA 157.667-46 chr11 8872834 8873140 + 1 NA intron (NM_005418, intron 2 of 22) intron (NM_005418, intron 2 of 22) 37964 NM_005418 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 126.667-147 chr5 126693833 126693982 + 1 NA Intergenic Intergenic 62202 NM_207408 389320 Hs.177983 NM_207408 ENSG00000196900 TEX43 C5orf48|Tseg7 testis expressed 43 protein-coding 140.667-105 chr2 4830540 4830797 + 1 NA Intergenic Intergenic -174446 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 146.667-266 chr5 116072044 116072293 + 1 NA Intergenic Intergenic -12857 NM_016144 51397 Hs.483136 NM_016144 ENSG00000145781 COMMD10 PTD002 COMM domain containing 10 protein-coding 167.667-85 chr17 60548001 60548192 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -16450 NR_126009 388406 Hs.368309 NR_126009 ENSG00000267772 LINC01999 - long intergenic non-protein coding RNA 1999 ncRNA 149.667-112 chr14 42416652 42416905 + 1 NA Intergenic Intergenic 809922 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 157.333-314 chr7 4626044 4626251 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -56148 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 367.333-13 chr22 28377772 28378222 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEc|LINE|L1 -81872 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 146.333-137 chr19 30008972 30009204 + 1 NA exon (NM_003796, exon 8 of 11) exon (NM_003796, exon 8 of 11) 66849 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 206.333-38 chr12 87777848 87778171 + 1 NA intron (NR_149056, intron 1 of 3) L1ME3Cz|LINE|L1 6702 NR_033410 400058 Hs.572212 NR_033410 MKRN9P MKRN5|MKRN9|MKRNP6|RNF65|ZNF127L3 makorin ring finger protein 9, pseudogene pseudo 143.667-14 chr1 189043301 189043445 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 1432637 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 257.667-14 chr11 124777138 124777555 + 1 NA intron (NM_001308027, intron 1 of 3) intron (NM_001308027, intron 1 of 3) -1104 NM_001312920 79684 Hs.146079 NM_024631 ENSG00000120458 MSANTD2 C11orf61 Myb/SANT DNA binding domain containing 2 protein-coding 156.333-187 chr2 118944756 118944972 + 1 NA intron (NM_006770, intron 1 of 16) intron (NM_006770, intron 1 of 16) 2695 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 122.333-75 chr18 1672442 1672646 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -312915 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 157.667-41 chr10 112332075 112332337 + 1 NA intron (NR_028134, intron 10 of 18) MIR|SINE|MIR 24389 NR_028134 390003 Hs.534691 NR_028134 ENSG00000243316 GUCY2GP GUCY2G guanylate cyclase 2G, pseudogene pseudo 150.667-389 chr8 135889455 135889650 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 432096 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 186.667-24 chr11 61420187 61420392 + 1 NA intron (NM_001136040, intron 4 of 9) intron (NM_001136040, intron 4 of 9) 9622 NM_024811 79869 Hs.718984 NM_024811 ENSG00000149532 CPSF7 CFIm59 cleavage and polyadenylation specific factor 7 protein-coding 142.333-186 chr4 97360271 97360558 + 1 NA Intergenic Intergenic -6512 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 316.667-7 chr11 48598042 48598512 + 1 NA Intergenic Intergenic 109484 NM_001005512 403253 Hs.554532 NM_001005512 ENSG00000237388 OR4A47 OR11-113 olfactory receptor family 4 subfamily A member 47 protein-coding 154.667-372 chr7 109834975 109835167 + 1 NA Intergenic Intergenic 125142 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 140.333-53 chr12 117723945 117724269 + 1 NA intron (NM_173598, intron 4 of 19) AluSz|SINE|Alu 244883 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 156.667-273 chr5 92656098 92656399 + 1 NA Intergenic Intergenic 915095 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-131 chr18 21975159 21975340 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -143843 NR_110369 102723167 Hs.658808 NR_110369 ENSG00000265142 MIR133A1HG MIR1-2HG MIR133A1 host gene ncRNA 150.333-51 chr11 8025622 8025916 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -9260 NR_125366 103581031 Hs.249366 NR_125366 ENSG00000255420 CASC23 LINC01464 cancer susceptibility 23 ncRNA 177.333-90 chr2 182460939 182461172 + 1 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) MER103C|DNA|hAT-Charlie -34007 NM_001363871 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 171.667-46 chr14 49654942 49655217 + 1 NA exon (NM_001197330, exon 11 of 18) exon (NM_001197330, exon 11 of 18) -19849 NM_018139 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 227.333-69 chr2 238917228 238917687 + 1 NA Intergenic Intergenic 8812 NR_034162 401039 Hs.516791 NM_001001698 ENSG00000227744 LINC01940 - long intergenic non-protein coding RNA 1940 ncRNA 189.333-17 chr1 117517479 117517732 + 1 NA intron (NM_006699, intron 12 of 12) L1MEc|LINE|L1 88165 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 152.667-83 chr12 51953960 51954235 + 1 NA intron (NM_020327, intron 1 of 8) intron (NM_020327, intron 1 of 8) 717 NM_020327 91 Hs.438918 NM_004302 ENSG00000135503 ACVR1B ACTRIB|ACVRLK4|ALK4|SKR2 activin A receptor type 1B protein-coding 117.333-89 chr18 60868933 60869177 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -464375 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 176.333-160 chr7 105187928 105188192 + 1 NA intron (NM_182692, intron 3 of 15) L1MB7|LINE|L1 81017 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 215.667-105 chr6 46199357 46199718 + 1 NA Intergenic Intergenic -28527 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 162.333-91 chr16 78719707 78719914 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 620156 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 242.667-27 chr12 67446012 67446440 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -3667 NR_146500 102724433 NR_146500 ENSG00000256172 LINC02420 - long intergenic non-protein coding RNA 2420 ncRNA 132.333-21 chr10 60945086 60945275 + 1 NA promoter-TSS (NM_001242359) promoter-TSS (NM_001242359) -454 NM_001350911 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 234.667-100 chr7 4692345 4692762 + 1 NA intron (NM_001037165, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 10258 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 146.667-200 chr20 54763241 54763506 + 1 NA Intergenic Intergenic 287780 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 151.667-128 chr15 85469724 85469927 + 1 NA intron (NM_007200, intron 1 of 36) intron (NM_007200, intron 1 of 36) 89222 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 205.333-137 chr2 236304034 236304405 + 1 NA Intergenic Intergenic -39874 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 248.333-36 chr18 13256773 13257169 + 1 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) intron (NM_181482, intron 1 of 5) 17428 NR_146617 147276 Hs.675872 NR_146617 ENSG00000279020 C18orf15 HsT3231 chromosome 18 open reading frame 15 (putative) ncRNA 154.333-324 chr7 50907888 50908051 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -114516 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 153.333-225 chr2 196893596 196893783 + 1 NA intron (NM_001321099, intron 8 of 27) intron (NM_001321099, intron 8 of 27) 33018 NM_024989 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 181.333-104 chr3 113208337 113208558 + 1 NA Intergenic Intergenic -3110 NM_001301867 91653 Hs.591318 NM_033254 ENSG00000144857 BOC CDON2 BOC cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 142.667-68 chr15 63518268 63518451 + 1 NA intron (NM_001256702, intron 1 of 13) intron (NM_001256702, intron 1 of 13) 13766 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 205.667-106 chr4 70383339 70383595 + 1 NA intron (NM_006685, intron 1 of 2) intron (NM_006685, intron 1 of 2) 336 NM_006685 10879 Hs.650650 NM_006685 ENSG00000171201 SMR3B P-B|PBII|PRL3|PROL3|SMR1B submaxillary gland androgen regulated protein 3B protein-coding 112.667-215 chr5 92706606 92706769 + 1 NA Intergenic Intergenic 864656 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 160.667-43 chr10 88980058 88980320 + 1 NA intron (NM_001320855, intron 1 of 8) intron (NM_001320855, intron 1 of 8) -10609 NM_000043 355 Hs.244139 NM_000043 ENSG00000026103 FAS ALPS1A|APO-1|APT1|CD95|FAS1|FASTM|TNFRSF6 Fas cell surface death receptor protein-coding 197.667-68 chr2 121492660 121492979 + 1 NA intron (NM_015282, intron 8 of 38) L1MB8|LINE|L1 -38061 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 144.667-191 chr3 68868991 68869213 + 1 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) L1MA4|LINE|L1 63445 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 185.667-136 chr8 130679281 130679577 + 1 NA Intergenic LTR88c|LTR|Gypsy? -235755 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 145.667-18 chr1 183998830 183999089 + 1 NA intron (NM_001303421, intron 1 of 11) L1ME3D|LINE|L1 38769 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 141.333-253 chr9 27396854 27397015 + 1 NA intron (NM_024761, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR -99784 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 150.667-404 chr9 133338853 133339024 + 1 NA 3' UTR (NM_133640, exon 5 of 5).2 3' UTR (NM_133640, exon 5 of 5).2 -2750 NR_103874 6838 Hs.274430 NM_006753 ENSG00000148296 SURF6 RRP14 surfeit 6 protein-coding 142.667-166 chr4 122288053 122288315 + 1 NA intron (NM_015312, intron 51 of 83) intron (NM_015312, intron 51 of 83) -90827 NM_139243 132612 Hs.518957 NM_139243 ENSG00000164113 ADAD1 Tenr adenosine deaminase domain containing 1 protein-coding 150.333-172 chr18 12699729 12699907 + 1 NA intron (NM_024899, intron 3 of 11) intron (NM_024899, intron 3 of 11) 2905 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 158.667-63 chr11 77865842 77866008 + 1 NA intron (NM_001316962, intron 3 of 4) intron (NM_001316962, intron 3 of 4) 24787 NM_001363564 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 221.333-127 chr6 120740407 120740813 + 1 NA Intergenic Intergenic 593870 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 301.667-13 chr14 99615940 99616318 + 1 NA intron (NM_001329411, intron 1 of 8) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 11591 NM_001329411 84439 Hs.131714 NM_032425 ENSG00000182218 HHIPL1 KIAA1822|UNQ9245 HHIP like 1 protein-coding 172.333-195 chr9 71051742 71051950 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 69775 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 146.667-238 chr4 94455953 94456146 + 1 NA non-coding (NR_046186, exon 3 of 3) non-coding (NR_046186, exon 3 of 3) 4107 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 146.333-242 chr4 141097517 141097795 + 1 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 35813 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 160.333-53 chr11 6583739 6583903 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 19795 NM_015324 23378 Hs.652255 NM_015324 ENSG00000132275 RRP8 KIAA0409|NML ribosomal RNA processing 8 protein-coding 138.333-118 chr3 27412404 27412684 + 1 NA intron (NM_001258380, intron 10 of 23) intron (NM_001258380, intron 10 of 23) -43084 NM_152534 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 168.333-107 chr2 193405851 193406192 + 1 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? 656176 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 180.333-56 chr2 109106294 109106581 + 1 NA Intergenic Intergenic -22768 NM_001099289 344558 Hs.171244 NM_001099289 ENSG00000172985 SH3RF3 POSH2|SH3MD4 SH3 domain containing ring finger 3 protein-coding 224.667-53 chr22 25447935 25448422 + 1 NA promoter-TSS (NR_033733) promoter-TSS (NR_033733) 91 NR_033733 1416 Hs.571835 NR_033733 ENSG00000100058 CRYBB2P1 CRYB2B crystallin beta B2 pseudogene 1 pseudo 263.333-15 chr12 20032220 20032690 + 1 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) intron (NR_040098, intron 2 of 2) 17770 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 248.667-57 chr2 84231726 84232215 + 1 NA Intergenic Intergenic -58712 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 158.333-137 chr2 27633181 27633341 + 1 NA intron (NM_007266, intron 5 of 13) HAL1b|LINE|L1 4211 NM_007266 11321 Hs.18259 NM_007266 ENSG00000198522 GPN1 ATPBD1A|MBDIN|NTPBP|RPAP4|XAB1 GPN-loop GTPase 1 protein-coding 231.667-40 chr20 53375499 53375756 + 1 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) -177143 NR_110051 101927770 NR_110051 LOC101927770 - uncharacterized LOC101927770 ncRNA 120.667-50 chr14 50226962 50227143 + 1 NA intron (NM_006939, intron 1 of 22) intron (NM_006939, intron 1 of 22) 4526 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 235.667-37 chr20 36850678 36851184 + 1 NA intron (NM_080627, intron 1 of 14) L1ME1|LINE|L1 8942 NM_199181 140710 Hs.460807 NM_080627 ENSG00000149639 SOGA1 C20orf117|KIAA0889|SOGA suppressor of glucose, autophagy associated 1 protein-coding 197.667-93 chr3 152356314 152356575 + 1 NA intron (NM_001314057, intron 2 of 11) intron (NM_001314057, intron 2 of 11) -15454 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 240.333-22 chr11 38017551 38018103 + 1 NA Intergenic Intergenic 79226 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 249.667-93 chr7 97456175 97456601 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -275698 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 154.667-63 chr11 73198971 73199129 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -19231 NM_002564 5029 Hs.339 NM_002564 ENSG00000175591 P2RY2 HP2U|P2RU1|P2U|P2U1|P2UR|P2Y2|P2Y2R purinergic receptor P2Y2 protein-coding 190.667-43 chr14 71104602 71104881 + 1 NA intron (NM_014982, intron 32 of 35) AluSc|SINE|Alu 197282 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 196.667-86 chr21 14633619 14633908 + 1 NA intron (NM_001256579, intron 1 of 6) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 9344 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 177.333-25 chr11 39514941 39515277 + 1 NA Intergenic Intergenic 778021 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 143.667-94 chr16 82823715 82823968 + 1 NA non-coding (NR_110938, exon 2 of 3) non-coding (NR_110938, exon 2 of 3) 50522 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 199.333-73 chr14 50289459 50289881 + 1 NA intron (NM_024884, intron 4 of 9) intron (NM_024884, intron 4 of 9) 10276 NR_039726 100616261 NR_039726 ENSG00000264712 MIR4504 - microRNA 4504 ncRNA 153.333-299 chr4 62541920 62542082 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -380236 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 181.333-87 chr2 209441464 209441756 + 1 NA intron (NM_001039538, intron 1 of 14) intron (NM_001039538, intron 1 of 14) 17563 NM_001363910 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 187.667-141 chr8 32019283 32019607 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) L1ME3|LINE|L1 -6291 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 113.333-32 chr10 74667886 74668025 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) intron (NM_001369124, intron 8 of 9) -138631 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 252.333-65 chr6 55106665 55106985 + 1 NA intron (NM_001526, intron 1 of 7) intron (NM_001526, intron 1 of 7) 365 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 267.333-65 chr4 30157063 30157557 + 1 NA Intergenic Intergenic -563059 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 258.667-84 chr6 64359533 64359979 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 552920 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 117.333-81 chr17 59721839 59721987 + 1 NA intron (NM_001329394, intron 1 of 11) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 14259 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 246.333-93 chr7 82845855 82846143 + 1 NA intron (NM_033026, intron 12 of 24) L2a|LINE|L2 316885 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 121.667-38 chr11 22604545 22604738 + 1 NA Intergenic Intergenic 21200 NM_022725 2188 Hs.632151 NM_022725 ENSG00000183161 FANCF FAF FA complementation group F protein-coding 117.333-153 chr4 66769291 66769490 + 1 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 492566 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 169.667-74 chr15 51445773 51445987 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 68634 NM_001330297 342035 Hs.526441 NM_181789 ENSG00000186417 GLDN CLOM|COLM|CRG-L2|CRGL2|LCCS11|UNC-112 gliomedin protein-coding 187.667-25 chr12 9943346 9943737 + 1 NA promoter-TSS (NR_104634) promoter-TSS (NR_104634) -46 NR_104634 100506159 Hs.282397 NR_104634 ENSG00000225231 LINC02470 - long intergenic non-protein coding RNA 2470 ncRNA 297.667-3 chr10 18514717 18515175 + 1 NA intron (NM_201593, intron 7 of 13) intron (NM_201593, intron 7 of 13) 114371 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 210.333-10 chr1 231934588 231935015 + 1 NA intron (NR_126441, intron 1 of 3) intron (NR_126441, intron 1 of 3) 8967 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 168.667-33 chr11 78362730 78362984 + 1 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) L1MEd|LINE|L1 -20977 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 272.667-27 chr2 34632346 34632908 + 1 NA Intergenic Intergenic -44930 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 258.667-6 chr1 160416665 160416999 + 1 NA intron (NM_020335, intron 3 of 7) intron (NM_020335, intron 3 of 7) 16268 NM_020335 57216 Hs.99477 NM_020335 ENSG00000162738 VANGL2 LPP1|LTAP|STB1|STBM|STBM1 VANGL planar cell polarity protein 2 protein-coding 168.667-234 chr9 115280377 115280638 + 1 NA intron (NR_163556, intron 2 of 7) intron (NR_163556, intron 2 of 7) 138689 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 263.667-8 chr1 225707156 225707692 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -54301 NM_001008493 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 137.667-74 chr17 41948796 41948988 + 1 NA intron (NR_146622, intron 8 of 11) AluSx1|SINE|Alu -17903 NM_033133 1267 Hs.273621 NM_033133 ENSG00000173786 CNP CNP1 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase protein-coding 207.667-56 chr2 81617683 81618117 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -150954 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 124.333-31 chr11 106383359 106383506 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 132025 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 230.333-115 chr8 4208052 4208395 + 1 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 786691 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 149.667-161 chr17 68934288 68934564 + 1 NA intron (NM_001288985, intron 5 of 39) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 20966 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 173.333-167 chr5 166837850 166838030 + 1 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 88430 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 130.667-32 chr10 78482335 78482532 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 215091 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 185.667-35 chr15 62515563 62515940 + 1 NA Intergenic Intergenic 129430 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 115.333-53 chr12 125053747 125053965 + 1 NA Intergenic Intergenic -11579 NM_023928 65985 Hs.656073 NM_023928 ENSG00000081760 AACS ACSF1|SUR-5 acetoacetyl-CoA synthetase protein-coding 263.333-30 chr16 8555843 8556290 + 1 NA intron (NR_110736, intron 2 of 3) intron (NR_110736, intron 2 of 3) 33772 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 220.667-46 chr2 104838469 104838809 + 1 NA intron (NR_037883, intron 1 of 3) intron (NR_037883, intron 1 of 3) 12837 NR_037883 100506421 Hs.437281 NR_037883 ENSG00000233639 PANTR1 LINC01158|linc-Brn1a|linc-POU3F3 POU3F3 adjacent non-coding transcript 1 ncRNA 204.333-34 chr11 29728271 29728576 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 109621 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 153.667-193 chr2 102256144 102256297 + 1 NA Intergenic Intergenic -55282 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 242.667-26 chr12 65839431 65839960 + 1 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) L3|LINE|CR1 -12721 NR_026825 204010 Hs.558686 NR_026825 ENSG00000241749 RPSAP52 RPSA_17_1251 ribosomal protein SA pseudogene 52 pseudo 225.667-74 chr8 62042823 62043211 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 153178 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 195.667-65 chr2 3790014 3790312 + 1 NA intron (NM_001287444, intron 10 of 10) intron (NM_001287444, intron 10 of 10) 83321 NM_001365580 728597 Hs.304233 NM_001287444 ENSG00000214866 DCDC2C - doublecortin domain containing 2C protein-coding 248.667-3 chr1 111301929 111302280 + 1 NA intron (NM_021797, intron 1 of 8) L1MB3|LINE|L1 11253 NM_001040623 27159 Hs.128814 NM_021797 ENSG00000134216 CHIA AMCASE|CHIT2|TSA1902 chitinase acidic protein-coding 205.333-15 chr1 91725957 91726303 + 1 NA intron (NR_036634, intron 8 of 17) intron (NR_036634, intron 8 of 17) 160021 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 157.667-106 chr15 26524505 26524670 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 104503 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 168.667-91 chr2 19370474 19370777 + 1 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -12002 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 332.667-19 chr4 30612405 30612917 + 1 NA Intergenic Intergenic -107708 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 168.333-84 chr18 68798730 68798967 + 1 NA intron (NM_024781, intron 1 of 7) intron (NM_024781, intron 1 of 7) 768 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 152.667-157 chr19 16176618 16176837 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3202 NM_054113 117286 Hs.255432 NM_054113 ENSG00000141977 CIB3 KIP3 calcium and integrin binding family member 3 protein-coding 139.667-57 chr14 77483065 77483242 + 1 NA intron (NM_199296, intron 3 of 6) intron (NM_199296, intron 3 of 6) 15663 NM_199296 145501 Hs.29742 NM_182509 ENSG00000100593 ISM2 TAIL1|THSD3 isthmin 2 protein-coding 194.667-89 chr3 4948938 4949375 + 1 NA intron (NR_125916, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu -30281 NM_003670 8553 Hs.744856 NM_003670 ENSG00000134107 BHLHE40 BHLHB2|Clast5|DEC1|HLHB2|SHARP-2|SHARP2|STRA13|Stra14 basic helix-loop-helix family member e40 protein-coding 150.667-250 chr3 187552819 187553098 + 1 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 105912 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 148.667-183 chr2 57254444 57254709 + 1 NA Intergenic Intergenic -653075 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 122.333-128 chr21 31528817 31528965 + 1 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) intron (NM_003253, intron 1 of 28) 30196 NM_003253 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 210.333-20 chr10 130146826 130147178 + 1 NA intron (NM_006541, intron 2 of 10) L1ME4b|LINE|L1 10593 NM_001321980 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 129.333-170 chr6 111516835 111517065 + 1 NA intron (NR_034109, intron 1 of 1) intron (NR_034109, intron 1 of 1) -33235 NM_001286432 5980 Hs.232021 NM_002912 ENSG00000009413 REV3L POLZ|REV3 REV3 like, DNA directed polymerase zeta catalytic subunit protein-coding 119.333-203 chr7 113711277 113711431 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 207655 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 126.333-183 chr8 143874396 143874555 + 1 NA intron (NM_031308, intron 1 of 1) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 3989 NM_031308 83481 Hs.200412 NM_031308 ENSG00000261150 EPPK1 EPIPL|EPIPL1 epiplakin 1 protein-coding 208.667-128 chr7 68777807 68778224 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 757762 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 183.333-98 chr21 26302949 26303288 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -90517 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-338 chr8 121463530 121463810 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -175676 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-361 chr6 56031031 56031220 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 60537 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 145.667-198 chr4 135768783 135768937 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 119233 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 174.333-6 chr1 185883976 185884172 + 1 NA intron (NM_031935, intron 4 of 106) L1MEc|LINE|L1 149683 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 139.333-221 chr8 117332706 117332856 + 1 NA Intergenic Intergenic -187932 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 132.667-40 chr12 59672428 59672580 + 1 NA intron (NM_001270622, intron 2 of 5) L1MEi|LINE|L1 -16866 NR_073055 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 314.667-22 chr18 3298285 3298801 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 35824 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 211.667-3 chr1 35994224 35994567 + 1 NA intron (NM_024852, intron 5 of 18) L1M5|LINE|L1 63290 NM_177422 192669 Hs.657659 NM_024852 ENSG00000126070 AGO3 EIF2C3 argonaute RISC catalytic component 3 protein-coding 207.667-126 chr9 28523999 28524325 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) L1MB8|LINE|L1 195143 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 148.667-6 chr1 51128029 51128353 + 1 NA intron (NM_001136508, intron 3 of 4) L1ME2|LINE|L1 25963 NM_001136508 284546 Hs.176177 NM_001136508 ENSG00000204006 C1orf185 - chromosome 1 open reading frame 185 protein-coding 138.667-116 chr20 6887219 6887402 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 119624 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 203.333-42 chr11 9906600 9906826 + 1 NA intron (NM_030962, intron 16 of 39) intron (NM_030962, intron 16 of 39) 67571 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 190.667-32 chr12 74925567 74925776 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 284077 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 119.667-2 chr1 24845814 24845994 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 73512 NR_106789 102465437 NR_106789 ENSG00000278034 MIR6731 hsa-mir-6731 microRNA 6731 ncRNA 177.667-47 chr14 60764205 60764521 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 29602 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 153.667-80 chr12 5486223 5486501 + 1 NA intron (NM_001102654, intron 1 of 1) intron (NM_001102654, intron 1 of 1) -7770 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 167.333-219 chr5 161200445 161200746 + 1 NA Intergenic Intergenic -261969 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 148.667-337 chr6 102231001 102231188 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 832109 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 261.667-44 chr22 24463877 24464189 + 1 NA intron (NR_028483, intron 3 of 7) AluSx|SINE|Alu 31041 NR_028483 646023 Hs.632761 NM_001039784 ENSG00000178803 ADORA2A-AS1 C22orf45 ADORA2A antisense RNA 1 ncRNA 133.333-194 chr9 29862070 29862267 + 1 NA Intergenic Intergenic 546286 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 243.667-9 chr10 82890171 82890631 + 1 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) intron (NR_163253, intron 6 of 10) -657481 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 164.333-145 chr21 21929905 21930149 + 1 NA Intergenic Intergenic 168432 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 182.333-89 chr2 158485956 158486310 + 1 NA intron (NM_001005476, intron 1 of 20) intron (NM_001005476, intron 1 of 20) 29181 NM_001304969 8502 Hs.407580 NM_003628 ENSG00000144283 PKP4 p0071 plakophilin 4 protein-coding 201.667-12 chr10 94381271 94381568 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -18480 NM_022451 64318 Hs.74899 NM_022451 ENSG00000173145 NOC3L AD24|C10orf117|FAD24 NOC3 like DNA replication regulator protein-coding 148.333-17 chr1 94787804 94788006 + 1 NA intron (NR_160783, intron 1 of 3) L1MC|LINE|L1 32327 NR_160783 101928079 Hs.596857 NR_104131 ENSG00000224081 SLC44A3-AS1 LINC01057|XLOC_000303 SLC44A3 antisense RNA 1 ncRNA 189.667-135 chr7 81704195 81704604 + 1 NA intron (NM_001010932, intron 17 of 17) intron (NM_001010932, intron 17 of 17) -12993 NR_126025 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 204.667-95 chr3 45270874 45271180 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -44740 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 155.667-174 chr2 133410771 133411053 + 1 NA intron (NM_207481, intron 3 of 17) MER5B|DNA|hAT-Charlie 144717 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 129.333-138 chr4 66870639 66870790 + 1 NA Intergenic MER97d|DNA|hAT-Tip100 551286 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 112.667-219 chr5 118771573 118771735 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 175466 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 204.667-96 chr3 76237571 76237962 + 1 NA Intergenic Intergenic -452217 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 261.667-52 chr4 40733859 40734131 + 1 NA Intergenic Intergenic -15960 NM_001330648 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 207.333-284 chrX 50057033 50057434 + 1 NA intron (NM_001127899, intron 4 of 14) MamRep38|DNA|hAT -10355 NM_000084 1184 Hs.166486 NM_000084 ENSG00000171365 CLCN5 CLC5|CLCK2|ClC-5|DENTS|NPHL1|NPHL2|XLRH|XRN|hCIC-K2 chloride voltage-gated channel 5 protein-coding 255.667-23 chr14 68096404 68096882 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 273051 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 200.333-135 chr6 163785435 163785838 + 1 NA Intergenic Intergenic -114152 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 185.333-144 chr4 154352073 154352395 + 1 NA intron (NM_001358235, intron 3 of 19) intron (NM_001358235, intron 3 of 19) 139565 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 156.667-13 chr1 76660316 76660567 + 1 NA Intergenic Intergenic 118826 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 143.667-37 chr11 15482946 15483236 + 1 NA Intergenic Intergenic -160794 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 148.333-283 chr4 58673124 58673311 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -136889 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 140.667-253 chr9 108980996 108981256 + 1 NA intron (NM_003798, intron 6 of 18) intron (NM_003798, intron 6 of 18) 32373 NM_001286974 8727 Hs.58488 NM_003798 ENSG00000119326 CTNNAL1 ACRP|CLLP|alpha-CATU catenin alpha like 1 protein-coding 154.333-316 chr7 23535095 23535349 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -3181 NM_001282758 29896 Hs.445652 NM_013293 ENSG00000164548 TRA2A AWMS1|HSU53209 transformer 2 alpha homolog protein-coding 229.333-71 chr21 27469362 27469642 + 1 NA Intergenic Intergenic -252877 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 158.667-39 chr10 44158096 44158322 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -134541 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 205.333-133 chr2 208732935 208733214 + 1 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) L1PA16|LINE|L1 190432 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 166.667-73 chr15 33407149 33407398 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 96306 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 374.667-4 chr11 113343414 113343839 + 1 NA intron (NM_001318533, intron 12 of 21) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 29043 NM_001352038 54970 Hs.288772 NM_017868 ENSG00000149292 TTC12 TPARM tetratricopeptide repeat domain 12 protein-coding 223.667-62 chr5 7779039 7779450 + 1 NA intron (NM_020546, intron 18 of 24) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 71889 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 270.333-6 chr1 192548047 192548519 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -27490 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 144.667-241 chr5 83714467 83714705 + 1 NA intron (NM_001884, intron 1 of 4) intron (NM_001884, intron 1 of 4) 6269 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 159.667-8 chr1 52001832 52002071 + 1 NA Intergenic Intergenic -11251 NM_002867 5865 Hs.123072 NM_002867 ENSG00000169213 RAB3B - RAB3B, member RAS oncogene family protein-coding 209.333-231 chr8 70965196 70965483 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 296000 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 162.667-241 chr6 71114136 71114375 + 1 NA Intergenic Intergenic -157195 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 151.333-261 chr22 28968205 28968465 + 1 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) L1MEi|LINE|L1 50946 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 198.667-60 chr14 63104967 63105278 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -59664 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 180.667-9 chr1 175853663 175853883 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -23570 NR_125964 101928751 NR_125964 ENSG00000224718 LINC01657 - long intergenic non-protein coding RNA 1657 ncRNA 138.333-133 chr4 52476363 52476514 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 180101 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 144.333-66 chr14 25150099 25150252 + 1 NA Intergenic Intergenic -99878 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 118.667-116 chr2 221565779 221566019 + 1 NA intron (NM_001304537, intron 1 of 16) intron (NM_001304537, intron 1 of 16) 6405 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 323.333-11 chr16 71267911 71268500 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 21197 NM_001324378 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 158.333-256 chr5 54079537 54079697 + 1 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -128018 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 248.333-102 chr8 130714337 130714809 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -270899 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 187.333-166 chr5 142744607 142744952 + 1 NA promoter-TSS (NR_110558) promoter-TSS (NR_110558) -821 NR_110558 101926975 Hs.638583 NR_110558 ENSG00000236714 LINC01844 - long intergenic non-protein coding RNA 1844 ncRNA 164.333-18 chr1 239517316 239517522 + 1 NA intron (NM_001347716, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR -111654 NM_000740 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 151.333-238 chr2 237227461 237227619 + 1 NA Intergenic Intergenic 141651 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 203.333-94 chr15 99301424 99301802 + 1 NA intron (NM_001321677, intron 5 of 8) intron (NM_001321677, intron 5 of 8) 44088 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 208.333-85 chr20 7931602 7931844 + 1 NA intron (NM_017545, intron 2 of 7) intron (NM_017545, intron 2 of 7) 8735 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 209.667-60 chr18 68665437 68665850 + 1 NA Intergenic Intergenic 49465 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 145.667-87 chr14 74161928 74162184 + 1 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) intron (NM_001024674, intron 5 of 5) 77103 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 201.667-56 chr2 97077232 97077458 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 17537 NM_001320849 151313 Hs.567723 NM_199336 ENSG00000144199 FAHD2B - fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 2B protein-coding 155.667-300 chr6 38590046 38590266 + 1 NA intron (NM_052893, intron 5 of 11) L2b|LINE|L2 5911 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 114.667-98 chr16 52551879 52552008 + 1 NA TTS (NR_033920) TTS (NR_033920) -4141 NM_001146188 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 146.667-69 chr12 33680248 33680400 + 1 NA Intergenic Intergenic -240505 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 256.333-34 chr17 71109253 71109824 + 1 NA intron (NR_104152, intron 3 of 3) intron (NR_104152, intron 3 of 3) 92641 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 158.333-290 chr7 18164098 18164266 + 1 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) intron (NM_001321872, intron 2 of 11) -36873 NR_031635 100302140 NR_031635 ENSG00000221393 MIR1302-6 MIRN1302-6|hsa-mir-1302-6 microRNA 1302-6 ncRNA 141.667-224 chr8 78335622 78335859 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -180600 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 155.333-167 chr2 102276176 102276471 + 1 NA Intergenic LTR34|LTR|ERV1 -35179 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 176.333-94 chr2 192278675 192278903 + 1 NA Intergenic Intergenic -83856 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 152.333-227 chr3 23470831 23471105 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 267641 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 275.667-12 chr11 109689416 109689805 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 267420 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 152.333-218 chr22 27705574 27705779 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 96080 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 192.667-152 chr6 125891815 125892211 + 1 NA intron (NM_001199621, intron 9 of 14) intron (NM_001199621, intron 9 of 14) -27242 NM_001199622 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 138.667-215 chr9 36153149 36153304 + 1 NA intron (NM_001287013, intron 4 of 4) intron (NM_001287013, intron 4 of 4) -16162 NM_005893 881 Hs.115460 NM_005893 ENSG00000185972 CCIN BTBD20|KBTBD14 calicin protein-coding 210.667-42 chr14 60302267 60302543 + 1 NA Intergenic Intergenic -20791 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 277.667-28 chr3 35355759 35356117 + 1 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) L1MC2|LINE|L1 38085 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 144.667-61 chr12 58338166 58338387 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 250384 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 124.333-154 chr5 159635887 159636111 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -169723 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 316.333-28 chr8 54628582 54629016 + 1 NA exon (NM_006269, exon 4 of 4) exon (NM_006269, exon 4 of 4) 12703 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 175.333-139 chr5 38966844 38967101 + 1 NA intron (NM_001285439, intron 14 of 38) AluSz6|SINE|Alu 107427 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 234.667-43 chr17 43719681 43719976 + 1 NA Intergenic Intergenic 38963 NM_025237 50964 Hs.349204 NM_025237 ENSG00000167941 SOST CDD|DAND6|SOST1|VBCH sclerostin protein-coding 146.667-164 chr2 62948496 62948807 + 1 NA exon (NM_001354219, exon 13 of 23) exon (NM_001354219, exon 13 of 23) 99060 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 283.333-2 chr1 89023390 89023779 + 1 NA promoter-TSS (NM_001319179) promoter-TSS (NM_001319179) -718 NM_001319179 2635 Hs.720167 NM_018284 ENSG00000117226 GBP3 - guanylate binding protein 3 protein-coding 147.667-81 chr12 109182328 109182506 + 1 NA intron (NM_001093, intron 11 of 52) AluJr|SINE|Alu 65830 NM_001093 32 Hs.234898 NM_001093 ENSG00000076555 ACACB ACC2|ACCB|HACC275 acetyl-CoA carboxylase beta protein-coding 133.333-182 chr8 81508273 81508456 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 23026 NR_144370 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 153.333-405 chr8 75040797 75041028 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 40757 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 136.667-132 chr4 122633575 122633723 + 1 NA intron (NR_104126, intron 7 of 10) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -12583 NM_021803 59067 Hs.567559 NM_021803 ENSG00000138684 IL21 CVID11|IL-21|Za11 interleukin 21 protein-coding 258.333-27 chr2 3164472 3164919 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -38669 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 148.333-3 chr1 42917646 42917906 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 41092 NM_006516 6513 Hs.473721 NM_006516 ENSG00000117394 SLC2A1 CSE|DYT17|DYT18|DYT9|EIG12|GLUT|GLUT-1|GLUT1|GLUT1DS|HTLVR|PED|SDCHCN solute carrier family 2 member 1 protein-coding 182.333-70 chr19 17562268 17562622 + 1 NA intron (NM_024656, intron 3 of 11) AluSz|SINE|Alu 6796 NM_024656 79709 Hs.418795 NM_024656 ENSG00000130309 COLGALT1 BSVD3|ColGalT 1|GLT25D1 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1 protein-coding 208.333-27 chr12 43696143 43696528 + 1 NA Intergenic MamGypLTR3|LTR|Gypsy 62455 NM_001271826 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 150.667-383 chr8 118574768 118575012 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -46111 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 271.667-72 chr8 101319655 101320188 + 1 NA Intergenic Intergenic -48972 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 139.333-18 chr1 234341998 234342165 + 1 NA Intergenic Intergenic 31322 NR_125962 101927765 Hs.596703 NR_125961 ENSG00000231663 COA6-AS1 - COA6 antisense RNA 1 ncRNA 265.333-57 chr3 158742183 158742503 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9857 NM_002888 5918 Hs.131269 NM_002888 ENSG00000118849 RARRES1 LXNL|PERG-1|TIG1 retinoic acid receptor responder 1 protein-coding 164.667-209 chr6 137041438 137041694 + 1 NA intron (NM_001278724, intron 1 of 5) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2746 NM_001278722 53832 Hs.445868 NM_014432 ENSG00000016402 IL20RA CRF2-8|IL-20R-alpha|IL-20R1|IL-20RA interleukin 20 receptor subunit alpha protein-coding 151.333-103 chr12 51106531 51106708 + 1 NA intron (NM_005653, intron 7 of 14) intron (NM_005653, intron 7 of 14) -23023 NR_045072 81566 Hs.524425 NM_030809 ENSG00000110925 CSRNP2 C12orf2|C12orf22|FAM130A1|PPP1R72|TAIP-12 cysteine and serine rich nuclear protein 2 protein-coding 232.333-86 chr8 67192023 67192293 + 1 NA intron (NM_001363133, intron 26 of 27) AluSx|SINE|Alu 108310 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 133.333-140 chr5 15756894 15757119 + 1 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) intron (NM_001278317, intron 2 of 3) -142004 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 152.333-4 chr1 28194383 28194554 + 1 NA promoter-TSS (NM_001164722) promoter-TSS (NM_001164722) -532 NM_001164721 5724 Hs.77542 NM_000952 ENSG00000169403 PTAFR PAFR platelet activating factor receptor protein-coding 252.667-62 chr3 14729031 14729490 + 1 NA intron (NM_001184957, intron 12 of 16) L2b|LINE|L2 54119 NM_032137 84077 Hs.661452 NM_032137 ENSG00000131379 C3orf20 - chromosome 3 open reading frame 20 protein-coding 241.667-76 chr5 88832050 88832338 + 1 NA intron (NM_001131005, intron 2 of 10) intron (NM_001131005, intron 2 of 10) -5006 NM_001364341 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 123.333-170 chr5 45046093 45046358 + 1 NA Intergenic (ATATAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 237278 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 145.333-243 chr5 121877391 121877587 + 1 NA Intergenic Intergenic 25607 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 227.333-122 chr8 24327902 24328188 + 1 NA intron (NM_014265, intron 10 of 22) L1PA13|LINE|L1 33976 NR_130710 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 252.333-67 chr6 97262337 97262656 + 1 NA intron (NM_001350600, intron 8 of 23) AluSz6|SINE|Alu 20720 NM_001350600 253714 Hs.444292 NM_198468 ENSG00000146263 MMS22L C6orf167|dJ39B17.2 MMS22 like, DNA repair protein protein-coding 224.333-19 chr10 89520668 89521097 + 1 NA intron (NM_213606, intron 2 of 7) intron (NM_213606, intron 2 of 7) 14712 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 149.333-154 chr18 7473976 7474230 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13097 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 121.667-59 chr14 69065387 69065637 + 1 NA intron (NM_003861, intron 7 of 8) intron (NM_003861, intron 7 of 8) 85830 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 148.333-61 chr11 18695131 18695408 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3510 NM_153347 144110 Hs.502100 NM_153347 ENSG00000151117 TMEM86A - transmembrane protein 86A protein-coding 251.667-101 chr9 19728324 19728663 + 1 NA intron (NM_020344, intron 1 of 9) intron (NM_020344, intron 1 of 9) 58526 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 123.667-106 chr20 45552198 45552400 + 1 NA intron (NM_130896, intron 5 of 5) intron (NM_130896, intron 5 of 5) -4898 NM_001198986 100526773 Hs.274876 NM_001198986 ENSG00000249139 EPPIN-WFDC6 SPINLW1-WFDC6 EPPIN-WFDC6 readthrough protein-coding 223.333-113 chr4 83113466 83113721 + 1 NA intron (NM_001130715, intron 1 of 3) intron (NM_001130715, intron 1 of 3) 1136 NM_016619 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 165.333-85 chr15 63432797 63433079 + 1 NA intron (NR_120375, intron 6 of 6) intron (NR_120375, intron 6 of 6) 42708 NR_120375 102723344 Hs.569500 NR_120375 LINC02568 - long intergenic non-protein coding RNA 2568 ncRNA 156.667-290 chr5 164405324 164405609 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 61936 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 151.667-150 chr18 10753900 10754090 + 1 NA intron (NM_022068, intron 25 of 51) intron (NM_022068, intron 25 of 51) 5654 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 140.333-240 chr8 123603813 123603977 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 49906 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 199.667-145 chr8 132653101 132653540 + 1 NA intron (NR_135912, intron 3 of 11) L1M4|LINE|L1 22225 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 158.667-151 chr2 32877645 32877894 + 1 NA intron (NR_027098, intron 2 of 5) intron (NR_027098, intron 2 of 5) -49358 NR_027097 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 224.333-12 chr1 240556068 240556424 + 1 NA intron (NM_022469, intron 1 of 1) HAL1|LINE|L1 55909 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 178.667-32 chr11 107840757 107841034 + 1 NA intron (NM_017515, intron 1 of 7) intron (NM_017515, intron 1 of 7) 17892 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 159.333-263 chr5 33338794 33338962 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -101818 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 221.667-6 chr10 59600123 59600627 + 1 NA Intergenic Intergenic 109516 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 283.333-8 chr10 63513630 63513974 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) AluY|SINE|Alu -7599 NM_001001330 221035 Hs.499833 NM_001001330 ENSG00000165476 REEP3 C10orf74|Yip2b receptor accessory protein 3 protein-coding 155.333-423 chrX 139152995 139153211 + 1 NA intron (NM_001139501, intron 2 of 7) L2b|LINE|L2 51920 NM_001139498 2258 Hs.6540 NM_004114 ENSG00000129682 FGF13 FGF-13|FGF2|FHF-2|FHF2|LINC00889 fibroblast growth factor 13 protein-coding 242.667-49 chr2 46408153 46408460 + 1 NA Intergenic Intergenic -14139 NR_146999 105374582 Hs.570163 NR_146999 ENSG00000228100 LINC01820 - long intergenic non-protein coding RNA 1820 ncRNA 160.333-179 chr3 2597486 2597651 + 1 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) intron (NM_175607, intron 4 of 24) -294647 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 216.333-131 chr7 20391579 20391825 + 1 NA intron (NM_002214, intron 7 of 13) intron (NM_002214, intron 7 of 13) -59940 NR_110120 101927811 Hs.285724 NR_110119 ENSG00000271133 LOC101927811 - uncharacterized LOC101927811 ncRNA 229.333-99 chr5 78145796 78146185 + 1 NA intron (NM_003664, intron 14 of 26) intron (NM_003664, intron 14 of 26) 148708 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 247.333-58 chr4 111928427 111928886 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -216798 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 385.667-3 chr12 4706682 4707122 + 1 NA intron (NR_110112, intron 1 of 3) L1MCa|LINE|L1 13200 NR_110112 101929549 Hs.663336 NR_110112 ENSG00000255474 GAU1 GALNT8-DT GALNT8 antisense upstream 1 ncRNA 154.667-224 chr21 34002213 34002376 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 25912 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 131.667-193 chr8 78024401 78024638 + 1 NA Intergenic Intergenic -491821 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 176.333-16 chr10 10705098 10705406 + 1 NA intron (NM_001326317, intron 2 of 14) intron (NM_001326317, intron 2 of 14) 89662 NR_027082 207107 Hs.31562 NR_027082 ENSG00000225383 SFTA1P SFTPF surfactant associated 1, pseudogene pseudo 187.667-36 chr14 29198499 29198801 + 1 NA Intergenic Intergenic -412863 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 217.333-35 chr11 82902906 82903174 + 1 NA intron (NM_001363481, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 -1300 NM_001319214 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 147.333-293 chr7 31085992 31086155 + 1 NA intron (NM_001199637, intron 7 of 13) intron (NM_001199637, intron 7 of 13) 33612 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 129.667-29 chr10 81602642 81602895 + 1 NA Intergenic Intergenic -272426 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 125.667-82 chr18 45040929 45041075 + 1 NA intron (NM_015559, intron 5 of 5) intron (NM_015559, intron 5 of 5) -70836 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 155.667-143 chr18 71841935 71842232 + 1 NA Intergenic Intergenic -59857 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 286.333-18 chr2 14575031 14575404 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -57500 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 144.667-202 chr3 128307357 128307615 + 1 NA intron (NM_021937, intron 4 of 6) intron (NM_021937, intron 4 of 6) -153572 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 225.667-6 chr10 4733658 4734063 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -55790 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 184.333-66 chr18 75960613 75960983 + 1 NA Intergenic Intergenic -162200 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 260.333-71 chr8 113724660 113724977 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -287879 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 124.333-150 chr5 141038173 141038350 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -13115 NM_013340 29930 Hs.278950 NM_013340 ENSG00000171815 PCDHB1 PCDH-BETA1 protocadherin beta 1 protein-coding 130.667-69 chr14 69868644 69868879 + 1 NA Intergenic Looper|DNA|PiggyBac -10655 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 192.333-115 chr3 83986173 83986498 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 883240 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 176.667-80 chr2 168673215 168673533 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 4 of 10) intron (NM_001256126, intron 4 of 10) 90431 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 142.333-144 chr20 49001463 49001621 + 1 NA intron (NM_006420, intron 25 of 38) intron (NM_006420, intron 25 of 38) 44514 NR_110625 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 139.667-180 chr8 37491279 37491465 + 1 NA intron (NR_121620, intron 1 of 6) AluSz6|SINE|Alu 2541 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 158.333-115 chr17 64396828 64396996 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -6052 NM_000442 5175 Hs.376675 NM_000442 ENSG00000261371 PECAM1 CD31|CD31/EndoCAM|GPIIA'|PECA1|PECAM-1|endoCAM platelet and endothelial cell adhesion molecule 1 protein-coding 233.667-75 chr8 119246862 119247132 + 1 NA promoter-TSS (NR_149111) promoter-TSS (NR_149111) -140 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 176.667-107 chr4 13627768 13628078 + 1 NA promoter-TSS (NM_148894) promoter-TSS (NM_148894) 58 NR_049814 100847023 NR_049814 ENSG00000266240 MIR5091 mir-5091 microRNA 5091 ncRNA 136.333-147 chr4 93844874 93845024 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 16196 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 231.333-24 chr11 44310513 44310886 + 1 NA promoter-TSS (NM_021926) promoter-TSS (NM_021926) -560 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 218.667-65 chr3 17259617 17260020 + 1 NA intron (NM_014744, intron 15 of 21) intron (NM_014744, intron 15 of 21) 326622 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 214.333-5 chr1 80750263 80750670 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 109179 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 161.333-68 chr12 69356499 69356756 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -3083 NM_001300950 8089 Hs.4029 NM_006530 ENSG00000127337 YEATS4 4930573H17Rik|B230215M10Rik|GAS41|NUBI-1|YAF9 YEATS domain containing 4 protein-coding 158.333-21 chr1 189262177 189262365 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 1213739 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 219.667-2 chr1 88759265 88759659 + 1 NA intron (NM_006256, intron 2 of 21) L1PA13|LINE|L1 -74258 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 170.333-101 chr18 76587774 76588044 + 1 NA Intergenic Intergenic -31868 NR_120419 400660 Hs.131718 NR_120419 ENSG00000266256 LINC00683 - long intergenic non-protein coding RNA 683 ncRNA 160.333-287 chr8 121047154 121047423 + 1 NA Intergenic Intergenic -235242 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 188.667-139 chr7 67766742 67767039 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -253363 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 163.333-154 chr2 151379733 151379897 + 1 NA promoter-TSS (NR_110248) promoter-TSS (NR_110248) -444 NR_110248 101929319 Hs.639241 NR_110248 LOC101929319 - uncharacterized LOC101929319 ncRNA 184.333-26 chr12 50873342 50873646 + 1 NA intron (NM_182559, intron 3 of 4) L1ME1|LINE|L1 30568 NM_182559 283471 Hs.125571 NM_182559 ENSG00000186452 TMPRSS12 CT151 transmembrane serine protease 12 protein-coding 171.667-44 chr14 30781398 30781716 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -92978 NM_001135058 1690 Hs.21016 NM_004086 ENSG00000100473 COCH COCH-5B2|COCH5B2|DFNA9|DFNB110 cochlin protein-coding 211.333-24 chr10 62514689 62514918 + 1 NA intron (NM_199451, intron 4 of 7) L2c|LINE|L2 -5645 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 157.667-336 chr8 120137760 120137962 + 1 NA intron (NM_021110, intron 1 of 47) FLAM_C|SINE|Alu 12759 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 214.333-33 chr12 41515189 41515583 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 5 of 9) intron (NM_001164595, intron 5 of 9) 77647 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 267.333-25 chr12 78104025 78104367 + 1 NA intron (NM_001024383, intron 12 of 39) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 255550 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 215.667-35 chr13 98609214 98609562 + 1 NA Intergenic Intergenic 32133 NR_046542 100874069 Hs.594160 NR_046542 STK24-AS1 - STK24 antisense RNA 1 ncRNA 297.667-9 chr12 11701551 11702066 + 1 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) intron (NM_001987, intron 1 of 7) 51954 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 217.333-38 chr12 41034364 41034676 + 1 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) intron (NM_001843, intron 23 of 23) 126163 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 148.333-57 chr10 125555794 125555968 + 1 NA Intergenic Intergenic -18490 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 208.333-71 chr2 53771336 53771668 + 1 NA intron (NM_001008708, intron 1 of 2) AluSq|SINE|Alu 3698 NM_001008708 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 119.333-182 chr5 136854696 136854845 + 1 NA Intergenic Intergenic -273427 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 205.333-117 chr2 34256408 34256769 + 1 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 189362 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 166.333-67 chr14 48227094 48227501 + 1 NA Intergenic Intergenic -432283 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 197.667-24 chr11 57478532 57478782 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 18129 NM_178570 349667 Hs.502618 NM_178570 ENSG00000186907 RTN4RL2 NGRH1|NgR2 reticulon 4 receptor like 2 protein-coding 159.333-35 chr10 21797577 21797769 + 1 NA intron (NM_022365, intron 9 of 11) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 206057 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 187.667-138 chr7 126210513 126210723 + 1 NA Intergenic Intergenic 847566 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 204.333-92 chr2 33606541 33606982 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7399 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 118.333-145 chr4 23147177 23147370 + 1 NA Intergenic Intergenic 433184 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 186.667-151 chr9 2009631 2009865 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -5599 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 205.667-82 chr2 222100695 222101069 + 1 NA Intergenic Intergenic -197265 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 218.667-11 chr10 28172672 28172991 + 1 NA intron (NR_134518, intron 2 of 16) intron (NR_134518, intron 2 of 16) -99453 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 145.667-260 chr6 164154813 164154993 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -483419 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 121.667-169 chr5 123217397 123217550 + 1 NA Intergenic Intergenic -127157 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 153.667-78 chr11 115574781 115574942 + 1 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 -70446 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 152.333-261 chr4 19752761 19753038 + 1 NA Intergenic Intergenic -499006 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 159.333-188 chr20 47077784 47078061 + 1 NA intron (NM_172110, intron 7 of 13) intron (NM_172110, intron 7 of 13) -89045 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 283.333-60 chr5 57636163 57636465 + 1 NA Intergenic Intergenic -14346 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 155.667-386 chr9 70275957 70276267 + 1 NA intron (NM_015110, intron 3 of 24) intron (NM_015110, intron 3 of 24) 17134 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 218.333-38 chr14 61999308 61999763 + 1 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) L1ME1|LINE|L1 71840 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 194.333-122 chr5 106020618 106021007 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 921338 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 287.333-8 chr11 4557751 4558311 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 12840 NM_001004137 119772 Hs.553567 NM_001004137 ENSG00000197790 OR52M1 OR11-11|OR52M1P|OR52M3P olfactory receptor family 52 subfamily M member 1 protein-coding 293.333-67 chr8 132094996 132095561 + 1 NA intron (NM_001145095, intron 6 of 15) L1ME3G|LINE|L1 9987 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 176.667-91 chr21 21819486 21819770 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 72643 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 272.333-49 chr4 82446772 82447150 + 1 NA intron (NM_021204, intron 1 of 5) AluYb8|SINE|Alu 16371 NM_021204 58478 Hs.18442 NM_021204 ENSG00000145293 ENOPH1 E1|MASA|MST145|mtnC enolase-phosphatase 1 protein-coding 158.333-2 chr1 28077695 28078001 + 1 NA intron (NM_001282562, intron 1 of 16) intron (NM_001282562, intron 1 of 16) 10762 NM_001990 2140 Hs.185774 NM_001990 ENSG00000158161 EYA3 - EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 protein-coding 153.333-174 chr18 75422154 75422389 + 1 NA intron (NM_001037331, intron 1 of 2) intron (NM_001037331, intron 1 of 2) 5432 NM_001037331 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 151.333-89 chr11 106879137 106879426 + 1 NA intron (NM_001256424, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 139195 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 117.333-199 chr7 116196760 116196913 + 1 NA Intergenic Intergenic -13703 NM_015641 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 178.667-109 chr3 171068639 171069070 + 1 NA exon (NM_001161562, exon 28 of 31) exon (NM_001161562, exon 28 of 31) 37905 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 164.333-17 chr1 237923803 237924080 + 1 NA intron (NR_027247, intron 11 of 11) L1M4|LINE|L1 -33019 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 141.333-76 chr17 32601825 32601980 + 1 NA intron (NM_001303279, intron 21 of 21) intron (NM_001303279, intron 21 of 21) 114909 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 143.333-6 chr1 55999200 55999438 + 1 NA Intergenic Intergenic 54232 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 191.333-120 chr20 32802900 32803257 + 1 NA intron (NM_001207055, intron 18 of 18) intron (NM_001207055, intron 18 of 18) -16876 NM_012325 22919 Hs.472437 NM_012325 ENSG00000101367 MAPRE1 EB1 microtubule associated protein RP/EB family member 1 protein-coding 229.667-49 chr20 12471962 12472328 + 1 NA Intergenic Intergenic 464818 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 188.333-7 chr1 109909209 109909482 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1504 NM_172210 1435 Hs.173894 NM_000757 ENSG00000184371 CSF1 CSF-1|MCSF colony stimulating factor 1 protein-coding 158.667-8 chr1 53483455 53483724 + 1 NA Intergenic Intergenic 24190 NM_033067 63948 Hs.131654 NM_033067 ENSG00000143006 DMRTB1 - DMRT like family B with proline rich C-terminal 1 protein-coding 150.667-112 chr13 114296901 114297051 + 1 NA intron (NR_148485, intron 5 of 6) intron (NR_148485, intron 5 of 6) 14581 NM_001353648 65110 Hs.533855 NM_023011 ENSG00000169062 UPF3A HUPF3A|RENT3A|UPF3 UPF3A regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 158.667-141 chr19 28302097 28302299 + 1 NA Intergenic Intergenic -304490 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 153.667-243 chr3 15942218 15942469 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 68572 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 203.333-184 chr3 176491455 176491742 + 1 NA Intergenic Intergenic -23505 NR_107017 102465858 NR_107017 ENSG00000283333 MIR7977 hsa-mir-7977 microRNA 7977 ncRNA 161.667-169 chr3 74922486 74922720 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -291873 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 189.333-218 chrX 22532305 22532622 + 1 NA intron (NR_073010, intron 4 of 11) L1PB|LINE|L1 259550 NM_152577 158506 Hs.132485 NM_152577 ENSG00000175809 CBLL2 CT138|HAKAIL|ZNF645 Cbl proto-oncogene like 2 protein-coding 241.667-87 chr8 28954367 28954838 + 1 NA intron (NM_001324393, intron 2 of 11) intron (NM_001324393, intron 2 of 11) 63288 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 140.333-239 chr8 122691933 122692106 + 1 NA intron (NR_126348, intron 2 of 3) intron (NR_126348, intron 2 of 3) 2087 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 300.667-46 chr8 127569576 127570045 + 1 NA Intergenic Intergenic -87671 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 200.333-38 chr13_KI270841v1_alt 71222 71552 + 1 NA NA Intergenic NA NA 151.333-333 chr5 46261633 46261814 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -565343 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 241.667-54 chr3 48091782 48092086 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -3086 NM_002375 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 203.667-13 chr10 78065483 78065741 + 1 NA Intergenic Intergenic 31749 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 155.667-58 chr11 96691608 96691903 + 1 NA Intergenic Intergenic 183330 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 162.667-137 chr2 119546964 119547153 + 1 NA intron (NR_073133, intron 2 of 17) MIRb|SINE|MIR 2609 NR_073132 200373 Hs.496753 NM_001029996 ENSG00000163075 CFAP221 FAP221|PCDP1 cilia and flagella associated protein 221 protein-coding 188.333-26 chr11 39250002 39250318 + 1 NA Intergenic Intergenic 601302 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 285.333-7 chr1 224203881 224204241 + 1 NA Intergenic Intergenic 9218 NR_110669 101927143 Hs.638720 NR_110669 ENSG00000232628 LOC101927143 - uncharacterized LOC101927143 ncRNA 226.667-44 chr18 66250253 66250756 + 1 NA Intergenic Intergenic 353586 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 220.667-76 chr5 9684302 9684713 + 1 NA intron (NR_027112, intron 9 of 12) L1MA5|LINE|L1 -54156 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 159.667-330 chr8 121799528 121799767 + 1 NA Intergenic Intergenic -158207 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 168.333-4 chr1 56390756 56390928 + 1 NA Intergenic Intergenic -24121 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 196.333-33 chr13 42373153 42373415 + 1 NA Intergenic Intergenic -51608 NR_135319 105370177 NR_135319 ENSG00000283554 LINC02341 - long intergenic non-protein coding RNA 2341 ncRNA 159.667 chr1 17281148 17281455 + 1 NA intron (NM_016233, intron 15 of 15) L2c|LINE|L2 3412 NR_039768 100616188 NR_039768 ENSG00000266634 MIR3972 - microRNA 3972 ncRNA 164.667-68 chr14 21358959 21359236 + 1 NA intron (NM_007192, intron 19 of 25) AluY|SINE|Alu 24922 NM_007192 11198 Hs.213724 NM_007192 ENSG00000092201 SUPT16H CDC68|FACTP140|SPT16|SPT16/CDC68 SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit protein-coding 173.333-63 chr15 94542281 94542562 + 1 NA Intergenic Intergenic 186491 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 134.667-163 chr5 96033145 96033379 + 1 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) L1M2|LINE|L1 -45876 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 204.333-77 chr17_GL000205v2_random 57174 57458 + 1 NA non-coding (NR_003682, exon 1 of 1) non-coding (NR_003682, exon 1 of 1) 650 NR_003682 403340 Hs.572501 NR_003682 MGC70870 - C-terminal binding protein 2 pseudogene pseudo 124.667-83 chr17 21304029 21304210 + 1 NA intron (NM_001316332, intron 8 of 12) intron (NM_001316332, intron 8 of 12) 16083 NM_002756 5606 Hs.514012 NM_002756 ENSG00000034152 MAP2K3 MAPKK3|MEK3|MKK3|PRKMK3|SAPKK-2|SAPKK2 mitogen-activated protein kinase kinase 3 protein-coding 154.667-123 chr15 57537196 57537407 + 1 NA intron (NM_032866, intron 14 of 18) intron (NM_032866, intron 14 of 18) -54603 NR_104370 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 179.333-178 chr7 90414855 90415120 + 1 NA 3' UTR (NM_001185072, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001185072, exon 4 of 4) 11526 NM_001185073 9069 Hs.731917 NM_012129 ENSG00000157224 CLDN12 - claudin 12 protein-coding 200.333-153 chr8 80876815 80877178 + 1 NA Intergenic Intergenic -2215 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 136.333-86 chr19 36829387 36829533 + 1 NA intron (NM_001242800, intron 1 of 4) L1MB8|LINE|L1 8567 NM_001242802 388536 Hs.282067 NM_206894 ENSG00000197863 ZNF790 - zinc finger protein 790 protein-coding 198.333-191 chr8 55326890 55327180 + 1 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 128286 NR_027765 100133234 Hs.729852 NR_027765 ENSG00000248522 SBF1P1 - SET binding factor 1 pseudogene 1 pseudo 137.667-130 chr3 151374898 151375148 + 1 NA intron (NM_053002, intron 25 of 42) intron (NM_053002, intron 25 of 42) 9789 NM_022788 64805 Hs.591281 NM_022788 ENSG00000169313 P2RY12 ADPG-R|BDPLT8|HORK3|P2T(AC)|P2Y(12)R|P2Y(AC)|P2Y(ADP)|P2Y(cyc)|P2Y12|SP1999 purinergic receptor P2Y12 protein-coding 144.667-234 chr5 37597599 37597807 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 218385 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 291.667-7 chr10 20794119 20794511 + 1 NA intron (NM_001173484, intron 5 of 6) intron (NM_001173484, intron 5 of 6) 103287 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 165.667-35 chr12 16723434 16723692 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -115349 NM_001243609 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 358.333-5 chr1 193734548 193735131 + 1 NA Intergenic Intergenic 430094 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 124.667-43 chr12 39179059 39179271 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 263955 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 223.667-40 chr2 197217335 197217783 + 1 NA intron (NM_153697, intron 1 of 9) intron (NM_153697, intron 1 of 9) 19568 NR_135584 101927596 NR_135584 ENSG00000231621 LOC101927596 - uncharacterized LOC101927596 ncRNA 136.333-27 chr10 113472895 113473123 + 1 NA Intergenic Intergenic -77822 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 233.667-57 chr4 151762645 151762944 + 1 NA Intergenic Intergenic -1771 NM_001363341 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 179.667-93 chr3 101473956 101474155 + 1 NA intron (NM_020654, intron 3 of 23) L1PA13|LINE|L1 39157 NM_020654 57337 Hs.529551 NM_020654 ENSG00000138468 SENP7 - SUMO specific peptidase 7 protein-coding 199.333-254 chr7 15165539 15165885 + 1 NA Intergenic Intergenic -190854 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 183.667-143 chr8 120370598 120370824 + 1 NA intron (NM_021110, intron 47 of 47) intron (NM_021110, intron 47 of 47) 74439 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 259.667-30 chr2 13762159 13762529 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 638614 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 132.667-82 chr2 57905126 57905354 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -2411 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 275.333-18 chr12 98351286 98351672 + 1 NA Intergenic Intergenic 105666 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 353.333-37 chr8 59443920 59444368 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 324934 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 154.333-115 chr16 87884480 87884722 + 1 NA intron (NM_001367225, intron 6 of 6) AluSx1|SINE|Alu -15094 NM_003486 8140 Hs.513797 NM_003486 ENSG00000103257 SLC7A5 4F2LC|CD98|D16S469E|E16|LAT1|MPE16 solute carrier family 7 member 5 protein-coding 178.667-66 chr18 21542887 21543178 + 1 NA intron (NM_052911, intron 8 of 11) intron (NM_052911, intron 8 of 11) 57672 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 270.333-29 chr2 119598896 119599427 + 1 NA intron (NR_073132, intron 7 of 24) intron (NR_073132, intron 7 of 24) 54712 NR_073132 200373 Hs.496753 NM_001029996 ENSG00000163075 CFAP221 FAP221|PCDP1 cilia and flagella associated protein 221 protein-coding 216.667-51 chr2 18126305 18126644 + 1 NA Intergenic Intergenic 247807 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 178.667-40 chr13 23423438 23423630 + 1 NA intron (NR_103450, intron 1 of 1) ALR/Alpha|Satellite|centr 4563 NR_103450 100506680 Hs.253280 NR_103450 ENSG00000229558 SACS-AS1 - SACS antisense RNA 1 ncRNA 174.333-77 chr21 19206152 19206366 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -446447 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 336.667-8 chr10 71109924 71110439 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -102389 NM_170744 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 154.333-56 chr11 40443949 40444123 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -150906 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 190.667-95 chr4 172353703 172354016 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 335058 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 201.333-125 chr17 66205176 66205488 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -13199 NM_001353128 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 192.333-173 chr8 127022648 127022930 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 9635 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 148.333-377 chr8 31412767 31412970 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -226884 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 234.333-56 chr4 120157734 120158305 + 1 NA Intergenic Intergenic -91171 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 146.667-174 chr2 133871061 133871208 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -248801 NM_001371457 160.667-163 chr2 164416165 164416337 + 1 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 152244 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 266.333-19 chr15 77094020 77094319 + 1 NA Intergenic Intergenic -23060 NM_001168412 10099 Hs.744863 NM_005724 ENSG00000140391 TSPAN3 TM4-A|TM4SF8|TSPAN-3 tetraspanin 3 protein-coding 142.333-191 chr5 19844782 19844988 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 41387 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 219.667-94 chr8 110396208 110396592 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -420629 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 155.333-269 chr4 93826119 93826334 + 1 NA Intergenic Intergenic -2527 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 151.333-239 chr2 239925920 239926216 + 1 NA intron (NR_136158, intron 7 of 10) L1MD2|LINE|L1 17026 NR_039949 100616417 NR_039949 ENSG00000264279 MIR4786 mir-4786 microRNA 4786 ncRNA 150.667-203 chr2 220748551 220748710 + 1 NA Intergenic Intergenic 823674 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 125.333-14 chr1 167645109 167645362 + 1 NA intron (NM_001322923, intron 1 of 5) CR1-3_Croc|LINE|CR1 15003 NM_001322924 92241 Hs.493867 NM_052862 ENSG00000198771 RCSD1 CAPZIP|MK2S4 RCSD domain containing 1 protein-coding 241.667-91 chr8 126758327 126758615 + 1 NA Intergenic Intergenic -199993 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 238.333-58 chr22 47587127 47587505 + 1 NA Intergenic Intergenic 44253 NR_033377 400932 Hs.561058 NM_001001693 ENSG00000205634 LINC00898 - long intergenic non-protein coding RNA 898 ncRNA 155.333-30 chr10 67548686 67548853 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 3 of 17) L1M4|LINE|L1 116891 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 126.333-174 chr8 21477354 21477538 + 1 NA Intergenic Intergenic 179207 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 157.333-328 chr7 134941047 134941253 + 1 NA exon (NM_004342, exon 6 of 14) exon (NM_004342, exon 6 of 14) -45358 NM_001367817 340351 Hs.648616 NM_178563 ENSG00000146856 AGBL3 CCP3 ATP/GTP binding protein like 3 protein-coding 164.333-196 chr5 90390315 90390630 + 1 NA Intergenic Intergenic 19314 NM_001297765 1070 Hs.591767 NM_004365 ENSG00000153140 CETN3 CDC31|CEN3 centrin 3 protein-coding 221.333-97 chr3 184718941 184719332 + 1 NA intron (NR_160768, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 6893 NR_160768 107986163 NR_160768 LOC107986163 - uncharacterized LOC107986163 ncRNA 163.667-222 chr6 147709235 147709500 + 1 NA Intergenic Intergenic 200677 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 216.667-36 chr14 86243058 86243399 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 308550 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 213.667-94 chr8 117338440 117338848 + 1 NA Intergenic Intergenic -182069 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 113.333-181 chr3 108745295 108745456 + 1 NA Intergenic Intergenic 11908 NM_032579 84666 Hs.307047 NM_032579 ENSG00000163515 RETNLB FIZZ1|FIZZ2|HXCP2|RELM-beta|RELMb|RELMbeta|XCP2 resistin like beta protein-coding 149.667-229 chr20 7590412 7590595 + 1 NA Intergenic Intergenic 218895 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 203.333-82 chr14 74450684 74450937 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -24600 NM_001105579 646658 Hs.12400 NM_001105579 ENSG00000183379 SYNDIG1L CAPUCIN|DSPC1|IFITMD4|TMEM90A synapse differentiation inducing 1 like protein-coding 189.667-143 chr8 110756645 110756961 + 1 NA Intergenic Intergenic 270630 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 246.333-19 chr10 127735879 127736351 + 1 NA Intergenic Intergenic -1070 NM_207426 399823 Hs.449674 NM_207426 ENSG00000186766 FOXI2 - forkhead box I2 protein-coding 183.333-133 chr5 115579758 115580011 + 1 NA 3' UTR (NM_001164468, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001164468, exon 4 of 4) -22271 NR_109875 101927100 Hs.745340 NR_109874 LOC101927100 - uncharacterized LOC101927100 ncRNA 240.667-75 chr7 48868089 48868516 + 1 NA Intergenic Intergenic -56245 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 157.667-64 chr11 120402622 120402897 + 1 NA intron (NM_001301084, intron 1 of 40) intron (NM_001301084, intron 1 of 40) 17432 NM_001301084 23365 Hs.24598 NM_015313 ENSG00000196914 ARHGEF12 LARG|PRO2792 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 protein-coding 173.667-118 chr3 109111205 109111459 + 1 NA TTS (NR_144461) TTS (NR_144461) 6802 NM_014429 27136 Hs.591296 NM_014429 ENSG00000114487 MORC1 CT33|MORC|ZCW6 MORC family CW-type zinc finger 1 protein-coding 201.333-251 chr6 146730302 146730619 + 1 NA intron (NM_024694, intron 20 of 35) MER67C|LTR|ERV1 73364 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 165.333-81 chr14 78143559 78143745 + 1 NA Intergenic Intergenic -26721 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 233.333-17 chr10 58279736 58280089 + 1 NA intron (NM_018464, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 10750 NM_018464 55847 Hs.370102 NM_018464 ENSG00000122873 CISD1 C10orf70|MDS029|ZCD1|mitoNEET CDGSH iron sulfur domain 1 protein-coding 201.333-41 chr10 114902528 114902795 + 1 NA Intergenic Intergenic -35534 NM_139169 142940 Hs.21187 NM_139169 ENSG00000165832 TRUB1 PUS4 TruB pseudouridine synthase family member 1 protein-coding 149.333-260 chr3 132323263 132323499 + 1 NA intron (NM_001292037, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 5974 NM_001134194 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 228.333-40 chr18 34155312 34155829 + 1 NA intron (NM_001353232, intron 1 of 9) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 66900 NM_001353235 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 171.667-35 chr11 98050673 98050893 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -970166 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 156.333-93 chr13 31705571 31705858 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -33812 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 120.667-138 chr5 53532550 53532707 + 1 NA Intergenic Intergenic -28011 NR_134474 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 128.333-111 chr2 187407031 187407174 + 1 NA intron (NM_005795, intron 1 of 14) intron (NM_005795, intron 1 of 14) 41150 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 155.667-309 chr6 97620437 97620623 + 1 NA intron (NR_110757, intron 3 of 4) HAL1|LINE|L1 314944 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 172.333-147 chr5 145300876 145301073 + 1 NA Intergenic Intergenic 534368 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 161.667-208 chr5 117562757 117563064 + 1 NA intron (NR_046089, intron 5 of 5) L1ME3A|LINE|L1 147398 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 165.333-268 chrX 94548439 94548647 + 1 NA Intergenic Intergenic 514683 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 185.667 chr1 32733625 32734047 + 1 NA Intergenic Intergenic -7994 NM_020888 57648 Hs.591502 NM_020888 ENSG00000162522 KIAA1522 - KIAA1522 protein-coding 150.333-76 chr12 19262872 19263170 + 1 NA intron (NM_001256787, intron 5 of 25) intron (NM_001256787, intron 5 of 25) 57696 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 173.667-41 chr12 127786790 127786967 + 1 NA Intergenic Intergenic -94739 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 155.667-336 chr7 87122019 87122364 + 1 NA Intergenic Intergenic 30126 NR_136252 101927420 Hs.633960 NR_136252 ENSG00000224046 LOC101927420 - uncharacterized LOC101927420 ncRNA 146.667-335 chr8 111742891 111743039 + 1 NA Intergenic Intergenic 366326 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 153.333-22 chr1 152373006 152373212 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -13103 NM_001014342 388698 Hs.156124 NM_001014342 ENSG00000143520 FLG2 IFPS|PSS6 filaggrin family member 2 protein-coding 238.333-53 chr20 11373870 11374234 + 1 NA Intergenic Intergenic -100669 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 177.333-36 chr12 24519202 24519508 + 1 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) L2a|LINE|L2 43136 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 139.667-135 chr4 52194465 52194628 + 1 NA Intergenic Intergenic 143242 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 195.333-206 chr7 89685365 89685759 + 1 NA Intergenic Intergenic -433838 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 237.667-43 chr2 170313908 170314239 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) intron (NM_001083615, intron 7 of 33) 36870 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 207.667-64 chr20 36988897 36989180 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -37195 NM_015474 25939 Hs.580681 NM_015474 ENSG00000101347 SAMHD1 CHBL2|DCIP|HDDC1|MOP-5|SBBI88|hSAMHD1 SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 protein-coding 220.667-68 chr3 190012916 190013239 + 1 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) intron (NM_001134418, intron 1 of 14) 107820 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 217.667-62 chr3 181287919 181288219 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 56332 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 149.667-321 chr5 84959292 84959463 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -574497 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 136.333-145 chr4 55479851 55480007 + 1 NA intron (NM_004898, intron 4 of 22) intron (NM_004898, intron 4 of 22) 66003 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 156.667-312 chr7 21434354 21434544 + 1 NA intron (NM_003112, intron 3 of 5) intron (NM_003112, intron 3 of 5) 6366 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 230.333-20 chr10 123869401 123869804 + 1 NA intron (NM_198148, intron 2 of 13) intron (NM_198148, intron 2 of 13) 22205 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 212.333-142 chr7 80682330 80682692 + 1 NA Intergenic Intergenic 35858 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 125.333-51 chr13 92329046 92329196 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 23086 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 178.667-69 chr18 70138359 70138626 + 1 NA intron (NM_001318520, intron 20 of 47) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 67195 NM_173630 25914 Hs.654809 NM_173630 ENSG00000176225 RTTN MSSP rotatin protein-coding 127.667-50 chr14 86954712 86954921 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 49038 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 203.667-96 chr5 66484749 66485064 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 26698 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 159.667-10 chr1 64529319 64529575 + 1 NA intron (NM_001293274, intron 1 of 25) intron (NM_001293274, intron 1 of 25) 23533 NM_001293274 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 184.333-4 chr1 162401807 162402007 + 1 NA intron (NM_053282, intron 2 of 3) intron (NM_053282, intron 2 of 3) 10229 NM_053282 117157 Hs.350581 NM_053282 ENSG00000198574 SH2D1B EAT2 SH2 domain containing 1B protein-coding 123.667-145 chr4 81152790 81152981 + 1 NA intron (NM_006259, intron 7 of 18) intron (NM_006259, intron 7 of 18) 1272 NM_001282480 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 211.667-58 chr2 67280146 67280488 + 1 NA intron (NR_110564, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR -64998 NR_038844 644838 Hs.145561 NR_038844 ENSG00000236780 LINC01829 - long intergenic non-protein coding RNA 1829 ncRNA 149.333-65 chr10 115431829 115432002 + 1 NA intron (NM_207303, intron 21 of 28) intron (NM_207303, intron 21 of 28) 338550 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 146.333-252 chr5 37820997 37821163 + 1 NA intron (NM_199231, intron 2 of 2) intron (NM_199231, intron 2 of 2) 13742 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 157.667-233 chr5 18850269 18850560 + 1 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 1035858 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 170.333-230 chr9 78091903 78092224 + 1 NA Intergenic Intergenic -60252 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 221.667-7 chr10 73837611 73837910 + 1 NA intron (NR_160046, intron 12 of 19) intron (NR_160046, intron 12 of 19) -25940 NR_160744 8509 Hs.654758 NM_003635 ENSG00000166507 NDST2 HSST2|N-HSST 2|NST2 N-deacetylase and N-sulfotransferase 2 protein-coding 320.333-30 chr9 9710645 9711051 + 1 NA intron (NM_002839, intron 7 of 45) MER6A|DNA|TcMar-Tigger -88544 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 207.333-147 chr2 202148245 202148692 + 1 NA intron (NM_001277372, intron 13 of 23) intron (NM_001277372, intron 13 of 23) -31410 NR_135244 729224 Hs.623895 NR_135243 KIAA2012-AS1 - KIAA2012 antisense RNA 1 ncRNA 158.333-249 chr4 178971176 178971404 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1063354 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 224.667-46 chr2 138738739 138739030 + 1 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 41506 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 124.333-116 chr3 65198037 65198235 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -510136 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 153.333-428 chr8 117561296 117561457 + 1 NA Intergenic Intergenic 40663 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 300.333-24 chr2 107476970 107477313 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -52278 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 122.333-97 chr2 74374021 74374185 + 1 NA intron (NM_004082, intron 6 of 31) intron (NM_004082, intron 6 of 31) 632 NM_001135041 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 142.333-83 chr14 60463124 60463290 + 1 NA intron (NM_174978, intron 11 of 17) L1ME3Cz|LINE|L1 22856 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 249.667-15 chr10 121119439 121120007 + 1 NA Intergenic Intergenic 268361 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 150.667-296 chr5 42891746 42892051 + 1 NA Intergenic Intergenic -79822 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 400.667-14 chr9 83406973 83407657 + 1 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) intron (NM_174938, intron 1 of 13) 60427 NM_001244960 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 250.667-81 chr8 100902852 100903317 + 1 NA Intergenic Intergenic 47487 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 156.333-385 chrX 57174532 57174768 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -37025 NM_019003 54466 Hs.460725 NM_019003 ENSG00000147059 SPIN2A DXF34|SPIN2|TDRD25|dJ323P24.1 spindlin family member 2A protein-coding 150.333-443 chrX 64354470 64354654 + 1 NA intron (NM_017677, intron 4 of 13) L2c|LINE|L2 40890 NM_017677 55613 Hs.442892 NM_017677 ENSG00000102043 MTMR8 - myotubularin related protein 8 protein-coding 169.667-43 chr12 59981986 59982166 + 1 NA Intergenic Intergenic 292706 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 130.333-170 chr5 118299609 118299791 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 17126 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 138.333-45 chr12 22180572 22180783 + 1 NA Intergenic Intergenic 134459 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 136.333-63 chr15 20348320 20348527 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 65679 NR_038836 646096 Hs.448789 NR_038836 ENSG00000259156 CHEK2P2 - checkpoint kinase 2 pseudogene 2 pseudo 154.667-195 chr2 177329244 177329536 + 1 NA intron (NR_026966, intron 5 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -15508 NR_106767 102465255 NR_106767 ENSG00000278418 MIR6512 hsa-mir-6512|mir-6512 microRNA 6512 ncRNA 177.333-157 chr7 98610372 98610601 + 1 NA Intergenic Intergenic -6799 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 153.333-356 chr6 48950335 48950514 + 1 NA Intergenic Intergenic 512829 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 187.333-215 chr9 102267880 102268259 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -251568 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 181.667-93 chr3 46337675 46337863 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -15975 NM_001123041 729230 Hs.511794 NM_001123041 ENSG00000121807 CCR2 CC-CKR-2|CCR-2|CCR2A|CCR2B|CD192|CKR2|CKR2A|CKR2B|CMKBR2|MCP-1-R C-C motif chemokine receptor 2 protein-coding 149.333-432 chr9 38695946 38696168 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 74969 NR_027294 158228 Hs.632652 NR_027294 FAM201A C9orf122 family with sequence similarity 201 member A ncRNA 158.333-184 chr22 25785761 25785977 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 11 of 43) MIR|SINE|MIR 43681 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 150.667-17 chr1 204294298 204294459 + 1 NA intron (NM_014935, intron 1 of 22) intron (NM_014935, intron 1 of 22) 65551 NM_014935 22874 Hs.253146 NM_014935 ENSG00000143850 PLEKHA6 PEPP-3|PEPP3 pleckstrin homology domain containing A6 protein-coding 142.333-167 chr4 11693140 11693366 + 1 NA Intergenic MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR 76215 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 117.333-105 chr2 153780316 153780550 + 1 NA Intergenic Intergenic -91489 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 207.667-125 chr9 23704294 23704747 + 1 NA intron (NM_004432, intron 4 of 6) intron (NM_004432, intron 4 of 6) -32121 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 160.667-48 chr10 102741606 102741774 + 1 NA 3' UTR (NM_178858, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_178858, exon 12 of 12) -2258 NM_001083913 54838 Hs.500897 NM_017787 ENSG00000166272 WBP1L C10orf26|OPA1L|OPAL1 WW domain binding protein 1 like protein-coding 173.667-138 chr4 149415132 149415451 + 1 NA intron (NM_001363507, intron 13 of 13) intron (NM_001363507, intron 13 of 13) 260996 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 208.333-55 chr17 48652026 48652266 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -19587 NR_029582 406972 NR_029582 ENSG00000210741 MIR196A1 MIRN196-1|MIRN196A1|mir-196a-1 microRNA 196a-1 ncRNA 152.667-401 chrX 56706788 56707088 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -22305 NM_001348129 550643 Hs.355559 NM_001348129 ENSG00000204272 NBDY LINC01420|NoBody negative regulator of P-body association protein-coding 305.667-8 chr12 46382034 46382433 + 1 NA Intergenic Intergenic -1443 NR_125379 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 141.333-29 chr10 111780998 111781216 + 1 NA Intergenic Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 402658 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 222.667-19 chr12 97666450 97666817 + 1 NA Intergenic Intergenic 86965 NR_077241 643711 Hs.585557 NR_077240 ENSG00000257501 LOC643711 - platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 pseudogene pseudo 174.333-61 chr2 60775448 60775751 + 1 NA intron (NM_022894, intron 8 of 21) intron (NM_022894, intron 8 of 21) 19331 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 149.333-72 chr11 32848977 32849231 + 1 NA intron (NM_024081, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu 19177 NM_024081 79056 Hs.471695 NM_024081 ENSG00000135378 PRRG4 PRGP4|TMG4 proline rich and Gla domain 4 protein-coding 144.333-72 chr14 51204962 51205122 + 1 NA Intergenic Intergenic -35205 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 173.667-176 chr8 82659910 82660212 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -252043 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 150.333-265 chr3 72817590 72817756 + 1 NA intron (NM_018130, intron 6 of 10) intron (NM_018130, intron 6 of 10) 30772 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 158.667-230 chr4 32035665 32035872 + 1 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -13346 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 140.667-112 chr2 40909168 40909329 + 1 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -396813 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 189.667-105 chr4 53273743 53274011 + 1 NA exon (NM_152540, exon 4 of 9) exon (NM_152540, exon 4 of 9) 92184 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 311.667-5 chr14 70055916 70056613 + 1 NA intron (NM_033262, intron 3 of 7) intron (NM_033262, intron 3 of 7) 23953 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 149.333-236 chr3 32608839 32609038 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -38014 NM_001329135 51143 Hs.529495 NM_016141 ENSG00000144635 DYNC1LI1 DLC-A|DNCLI1|LIC1 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 protein-coding 170.667-8 chr1 95622526 95622804 + 1 NA Intergenic Intergenic 112549 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 224.333-93 chr5 32015995 32016359 + 1 NA intron (NM_178140, intron 6 of 24) intron (NM_178140, intron 6 of 24) -80018 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 142.333-110 chr19 46030436 46030673 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -7501 NM_005091 8993 Hs.137583 NM_005091 ENSG00000008438 PGLYRP1 PGLYRP|PGRP|PGRP-S|PGRPS|TAG7|TNFSF3L peptidoglycan recognition protein 1 protein-coding 290.667-17 chr15 57804368 57804726 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 97833 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 155.667-131 chr17 71197178 71197425 + 1 NA intron (NR_104152, intron 1 of 3) L1PREC2|LINE|L1 4878 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 136.333-22 chr10 56194233 56194408 + 1 NA Intergenic Intergenic 166939 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 161.667-118 chr2 14447033 14447252 + 1 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -46184 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 251.333-83 chr4 125103729 125104080 + 1 NA Intergenic Intergenic -212508 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 268.667-22 chr17 62854167 62854557 + 1 NA Intergenic Intergenic 45860 NR_135634 101927877 Hs.434615 NR_135634 ENSG00000265000 MARCH10-DT - MARCH10 divergent transcript ncRNA 129.667-190 chrX 79593449 79593696 + 1 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -226020 NM_001171581 9452 Hs.17109 NM_004867 ENSG00000078596 ITM2A BRICD2A|E25A integral membrane protein 2A protein-coding 293.333-41 chr22 34119041 34119366 + 1 NA Intergenic (GTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -196315 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 227.333-51 chr18 2975568 2975937 + 1 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) -29129 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 153.333-452 chrX 64764477 64764714 + 1 NA Intergenic Intergenic 211855 NM_018684 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 157.333-338 chr8 88291359 88291534 + 1 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) intron (NM_005941, intron 1 of 9) 36037 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 245.667-76 chr8 121548155 121548704 + 1 NA Intergenic Intergenic -90917 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 220.667-114 chrX 120699030 120699383 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -69056 NM_152692 29071 Hs.643920 NM_152692 ENSG00000171155 C1GALT1C1 C1GALT2|C38H2-L1|COSMC|HSPC067|MST143|TNPS C1GALT1 specific chaperone 1 protein-coding 318.333-34 chr8 134108285 134108968 + 1 NA Intergenic Intergenic 222130 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 242.667-74 chr4 61121077 61121484 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -22376 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 161.667-265 chr8 134114292 134114466 + 1 NA Intergenic Intergenic 227883 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 160.667-51 chr11 14888037 14888344 + 1 NA intron (NM_024514, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 4015 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 134.667-126 chr21 31202808 31202962 + 1 NA intron (NM_001353686, intron 12 of 27) intron (NM_001353686, intron 12 of 27) -41945 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 164.667-35 chr11 43751412 43751590 + 1 NA intron (NM_016142, intron 2 of 10) LTR86B2|LTR|ERVL 70763 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 140.333-15 chr1 164140552 164140720 + 1 NA Intergenic Intergenic -418724 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 156.667-92 chr13 62387918 62388103 + 1 NA Intergenic Intergenic 64353 NR_047038 100874180 Hs.7415 NR_047038 ENSG00000229307 LINC00459 - long intergenic non-protein coding RNA 459 ncRNA 208.333-137 chr7 37969867 37970101 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 48665 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 237.667-44 chr2 190469515 190470022 + 1 NA exon (NM_017694, exon 4 of 8) exon (NM_017694, exon 4 of 8) 61413 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 152.667-79 chr12 30483053 30483219 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 194108 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 270.667-2 chr1 119295506 119295935 + 1 NA Intergenic Intergenic -32532 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 157.667-227 chr5 9036681 9036950 + 1 NA 3' UTR (NM_003966, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_003966, exon 23 of 23) 17080 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 236.667-92 chr8 128178455 128178777 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 28500 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 147.667-349 chr7 121672918 121673167 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -200119 NM_001369396 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 262.333-50 chr2 189502234 189502548 + 1 NA Intergenic Intergenic 60917 NM_032168 84128 Hs.399984 NM_032168 ENSG00000115368 WDR75 NET16|UTP17 WD repeat domain 75 protein-coding 233.667-45 chr2 210255265 210255676 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -30023 NM_001608 33 Hs.471277 NM_001608 ENSG00000115361 ACADL ACAD4|LCAD acyl-CoA dehydrogenase long chain protein-coding 150.667-395 chr9 37217410 37217614 + 1 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 96914 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 151.333-298 chr4 35381661 35381823 + 1 NA Intergenic Intergenic 862197 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 206.333-79 chr2 49093105 49093371 + 1 NA intron (NM_000145, intron 1 of 9) L1ME1|LINE|L1 33635 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 226.667-51 chr2 85336391 85336806 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -8609 NM_001368095 10618 Hs.593382 NM_006464 ENSG00000152291 TGOLN2 TGN38|TGN46|TGN48|TGN51|TTGN2 trans-golgi network protein 2 protein-coding 167.333-25 chr1 177368043 177368272 + 1 NA Intergenic Intergenic 16571 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 265.333-67 chr5 59132085 59132484 + 1 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) intron (NM_001364603, intron 5 of 15) -92808 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 132.333-157 chr6 144957669 144957859 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 552109 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 147.333-262 chr5 57205437 57205584 + 1 NA intron (NM_001331037, intron 2 of 12) L1MB5|LINE|L1 -8564 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 223.667-50 chr3 117733666 117734106 + 1 NA Intergenic LTR89|LTR|ERVL? -42961 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 377.667-7 chr2 184701429 184702064 + 1 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 103217 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 209.333-212 chr6 168982388 168982678 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -18151 NR_136250 105378146 Hs.343631 NR_136248 LOC105378146 - uncharacterized LOC105378146 ncRNA 226.667-41 chr17 56328326 56328692 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 4 of 20) intron (NM_001370326, intron 4 of 20) 175034 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 132.333-83 chr2 58940854 58941028 + 1 NA intron (NR_033873, intron 6 of 13) L1MEc|LINE|L1 -276767 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 215.667-16 chr10 111980870 111981239 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 202711 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 142.667-168 chr4 143080900 143081071 + 1 NA Intergenic Intergenic 103876 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 131.667-121 chr22 25220237 25220423 + 1 NA intron (NM_000496, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 691 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 230.333-130 chrX 81918875 81919143 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 716907 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 161.333-9 chr1 154243059 154243266 + 1 NA intron (NM_001127320, intron 9 of 24) intron (NM_001127320, intron 9 of 24) -16565 NR_145714 109617023 NR_145714 ENSG00000201129 SNORA58B - small nucleolar RNA, H/ACA box 58B snoRNA 168.667-214 chr8 50799796 50800123 + 1 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 635828 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 237.333-74 chr3 20207553 20207999 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -21543 NM_001199255 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 169.333-103 chr18 506898 507141 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6318 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 164.667-29 chr10 115187370 115187542 + 1 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) L1MC4|LINE|L1 94091 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 318.333-21 chr20 55854465 55854986 + 1 NA Intergenic Intergenic 150794 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 239.333-55 chr2 79910189 79910715 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -43869 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 113.333-77 chr14 78098800 78099005 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -71471 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 154.667-119 chr15 22899007 22899161 + 1 NA intron (NM_001033028, intron 7 of 15) AluJr|SINE|Alu 18229 NM_001033028 23191 Hs.26704 NM_014608 ENSG00000273749 CYFIP1 P140SRA-1|SHYC|SRA-1|SRA1 cytoplasmic FMR1 interacting protein 1 protein-coding 180.667-17 chr10 69247366 69247701 + 1 NA exon (NM_025130, exon 9 of 18) exon (NM_025130, exon 9 of 18) -15043 NR_120648 101928994 Hs.562925 NR_120648 ENSG00000229261 LOC101928994 - uncharacterized LOC101928994 ncRNA 181.667-14 chr10 51949869 51950241 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) intron (NM_001098512, intron 5 of 17) -250460 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 184.667-69 chr20 19746801 19747108 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -139567 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 172.667-42 chr12 54464271 54464654 + 1 NA intron (NM_144594, intron 3 of 8) intron (NM_144594, intron 3 of 8) 9140 NM_144594 121355 Hs.524476 NM_144594 ENSG00000170627 GTSF1 Cue110|FAM112B gametocyte specific factor 1 protein-coding 236.333-9 chr1 157603698 157604043 + 1 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie -5785 NM_031282 83417 Hs.120260 NM_031282 ENSG00000163518 FCRL4 CD307d|FCRH4|IGFP2|IRTA1 Fc receptor like 4 protein-coding 227.667-29 chr17 67198626 67198948 + 1 NA intron (NM_001330447, intron 7 of 32) intron (NM_001330447, intron 7 of 32) -45989 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 127.667-162 chr7 39974221 39974373 + 1 NA intron (NM_003718, intron 1 of 13) FLAM_C|SINE|Alu 23937 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 149.333-156 chr18 9727699 9727975 + 1 NA intron (NM_006868, intron 1 of 6) L1MA9|LINE|L1 19536 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 216.667-42 chr17 9777073 9777537 + 1 NA intron (NM_001220493, intron 3 of 5) intron (NM_001220493, intron 3 of 5) 14287 NM_001220493 201140 Hs.61684 NM_001105571 ENSG00000184544 DHRS7C SDR32C2 dehydrogenase/reductase 7C protein-coding 135.333-64 chr17 6551839 6552100 + 1 NA intron (NM_031220, intron 1 of 19) MIR3|SINE|MIR 4586 NM_001165966 83394 Hs.183983 NM_031220 ENSG00000091622 PITPNM3 ACKR6|CORD5|NIR1|RDGBA3 PITPNM family member 3 protein-coding 139.333-59 chr13 30059603 30059763 + 1 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 49192 NR_046998 100874146 Hs.574116 NR_046998 ENSG00000224511 LINC00365 - long intergenic non-protein coding RNA 365 ncRNA 154.667-407 chr9 13496818 13497168 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -65664 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 126.667-159 chr6 142647612 142647783 + 1 NA Intergenic Intergenic -9808 NR_027312 153910 Hs.350819 NR_027311 ENSG00000236366 LOC153910 - uncharacterized LOC153910 ncRNA 173.333-112 chr22 27360001 27360209 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 49454 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 147.667-273 chr5 9748828 9749021 + 1 NA intron (NR_027112, intron 5 of 12) intron (NR_027112, intron 5 of 12) -105453 NR_147004 105374648 Hs.158853 NR_147004 LINC02221 - long intergenic non-protein coding RNA 2221 ncRNA 119.667-53 chr15 57839288 57839466 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 132663 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 356.667-21 chr9 103652902 103653455 + 1 NA Intergenic Intergenic -328145 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 303.667-10 chr17 76235487 76236022 + 1 NA intron (NM_052916, intron 1 of 18) AluJr4|SINE|Alu 4739 NM_052916 114804 Hs.500643 NM_052916 ENSG00000141576 RNF157 - ring finger protein 157 protein-coding 250.333-57 chr5 108282432 108282739 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) L1PB4|LINE|L1 99513 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 192.667-25 chr10 53887053 53887324 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 27 of 34) intron (NM_001354411, intron 27 of 34) -599042 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 359.333-20 chr5 69120893 69121352 + 1 NA intron (NM_022902, intron 12 of 15) FLAM_C|SINE|Alu 27108 NM_022902 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 150.333-185 chr2 13510039 13510219 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -503116 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 210.333-70 chr2 45674317 45674552 + 1 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 22759 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 133.333-144 chr5 40479511 40479751 + 1 NA Intergenic Intergenic -200284 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 128.333-12 chr1 179745978 179746143 + 1 NA intron (NM_001329719, intron 1 of 4) intron (NM_001329719, intron 1 of 4) 2769 NM_001329717 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 150.667-113 chr14 20268657 20268949 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 26011 NM_001004479 390442 Hs.553767 NM_001004479 ENSG00000176198 OR11H4 OR14-36 olfactory receptor family 11 subfamily H member 4 protein-coding 149.333-405 chr8 117148357 117148522 + 1 NA intron (NM_173851, intron 2 of 7) L1ME4a|LINE|L1 13444 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 179.667-145 chr8 106195096 106195396 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -74932 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 207.667-121 chr8 120025048 120025319 + 1 NA intron (NM_022783, intron 8 of 8) intron (NM_022783, intron 8 of 8) -99919 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 122.667-116 chr3 62234146 62234356 + 1 NA intron (NM_002841, intron 14 of 29) L1ME4b|LINE|L1 84696 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 154.333-234 chr4 13590195 13590377 + 1 NA intron (NM_148894, intron 14 of 25) MIRb|SINE|MIR 37439 NM_148894 259282 Hs.744935 NM_148894 ENSG00000038219 BOD1L1 BOD1L|FAM44A biorientation of chromosomes in cell division 1 like 1 protein-coding 158.667-208 chr3 55236397 55236650 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 58351 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 244.667-55 chr2 54831495 54831934 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 6 of 40) intron (NM_001039753, intron 6 of 40) 106702 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 142.667-20 chr10 53162436 53162657 + 1 NA Intergenic Intergenic -390846 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 146.667-324 chr8 4741070 4741299 + 1 NA intron (NM_033225, intron 1 of 69) intron (NM_033225, intron 1 of 69) 253730 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 130.667-87 chr17 51204853 51205124 + 1 NA intron (NM_017643, intron 7 of 16) intron (NM_017643, intron 7 of 16) 38266 NM_001018138 4831 Hs.463456 NM_002512 ENSG00000243678 NME2 NDKB|NDPK-B|NDPKB|NM23-H2|NM23B|PUF NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 protein-coding 156.333-366 chr8 122814038 122814194 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 32461 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 124.667-56 chr14 43573184 43573391 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 933996 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 165.667-208 chr9 28948337 28948527 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -59477 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 209.333-104 chr2 21198333 21198639 + 1 NA Intergenic Intergenic 74500 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 185.667-55 chr18 37656052 37656352 + 1 NA promoter-TSS (NR_036202) promoter-TSS (NR_036202) -933 NR_036202 100422857 NR_036202 ENSG00000266530 MIR4318 - microRNA 4318 ncRNA 285.333-15 chr12 12628062 12628477 + 1 NA intron (NM_001310, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 16393 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 190.333-146 chr8 113691146 113691416 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -254342 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 151.333-158 chr16 48515435 48515702 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 94612 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 262.667-71 chr6 75917629 75918077 + 1 NA non-coding (NR_160538, exon 33 of 33) non-coding (NR_160538, exon 33 of 33) 154809 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 161.333-235 chr5 103708770 103709101 + 1 NA Intergenic Intergenic -146146 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 156.333-33 chr10 29035071 29035295 + 1 NA Intergenic Intergenic 188775 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 152.333-341 chr6 150616768 150617000 + 1 NA intron (NM_001329799, intron 1 of 15) intron (NM_001329799, intron 1 of 15) -16080 NR_138140 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 161.333-53 chr11 108093674 108093922 + 1 NA intron (NM_003478, intron 13 of 18) AluJr|SINE|Alu -27769 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 166.333-167 chr4 89244856 89245030 + 1 NA 3' UTR (NM_198281, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_198281, exon 2 of 2) 62857 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 164.667-5 chr1 77592701 77593015 + 1 NA intron (NM_001308237, intron 4 of 13) L1MEg|LINE|L1 89800 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 213.333-51 chr12 99361292 99361633 + 1 NA intron (NM_152788, intron 12 of 25) intron (NM_152788, intron 12 of 25) -206372 NM_001352189 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 167.667-164 chr5 5365243 5365418 + 1 NA Intergenic Intergenic -57347 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 127.333-26 chr10 63782339 63782549 + 1 NA Intergenic Intergenic -260554 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 127.667-206 chrX 66820371 66820523 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -181149 NM_001199687 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 185.667-29 chr13 85898413 85898621 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -99098 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 283.333-21 chr15 69167233 69167582 + 1 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) intron (NM_001324093, intron 2 of 5) 6772 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 190.667-75 chr20 51997417 51997694 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 107929 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 171.333-201 chr9 3978034 3978225 + 1 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) intron (NM_001042413, intron 4 of 10) 79483 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 161.333-212 chr4 64672854 64673094 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -263514 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 204.333-95 chr2 47354393 47354834 + 1 NA Intergenic Intergenic -9539 NR_110208 101927043 Hs.515976 NR_110207 ENSG00000234690 EPCAM-DT - EPCAM divergent transcript ncRNA 366.667-8 chr20 35610145 35610766 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2893 NR_119376 80307 Hs.72222 NR_001442 ENSG00000088340 FER1L4 C20orf124 fer-1 like family member 4 (pseudogene) pseudo 179.333-159 chr5 112845893 112846164 + 1 NA 3' UTR (NM_001354898, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001354898, exon 16 of 16) -15160 NM_001204196 6728 Hs.637001 NM_003135 ENSG00000153037 SRP19 - signal recognition particle 19 protein-coding 265.333-60 chr4 55143464 55144085 + 1 NA Intergenic Intergenic -18179 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 124.667-107 chr2 140571380 140571577 + 1 NA intron (NM_018557, intron 43 of 90) L1MA5|LINE|L1 15207 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 247.667-8 chr1 219021104 219021532 + 1 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) L1MA3|LINE|L1 -102807 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 162.667-72 chr13 59852335 59852526 + 1 NA intron (NM_001258369, intron 22 of 26) intron (NM_001258369, intron 22 of 26) -160288 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 303.333-79 chr8 121035219 121035675 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -223401 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 310.667-6 chr11 26092669 26093017 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -96280 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 169.333-163 chr3 83319381 83319661 + 1 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 1333379 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 168.333-66 chr15 94340636 94340880 + 1 NA intron (NM_018349, intron 5 of 21) intron (NM_018349, intron 5 of 21) -15172 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 157.667-300 chr7 39198285 39198565 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) 130709 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 233.333-100 chr4 159027232 159027635 + 1 NA intron (NM_152543, intron 1 of 4) intron (NM_152543, intron 1 of 4) 7796 NM_152543 152940 Hs.415576 NM_152543 ENSG00000164123 C4orf45 - chromosome 4 open reading frame 45 protein-coding 119.667-87 chr2 166877815 166878011 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -10574 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 232.667-19 chr13 48209758 48210233 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23211 NM_021999 9445 Hs.643683 NM_021999 ENSG00000136156 ITM2B ABRI|BRI|BRI2|BRICD2B|E25B|E3-16|FBD|RDGCA|imBRI2 integral membrane protein 2B protein-coding 141.333-144 chr22 46200564 46200748 + 1 NA intron (NM_001001928, intron 3 of 7) AluSx1|SINE|Alu 49637 NM_207327 150383 Hs.103110 NM_207327 ENSG00000205643 CDPF1 C22orf40 cysteine rich DPF motif domain containing 1 protein-coding 161.333-128 chr18 35003615 35003787 + 1 NA intron (NM_001143827, intron 1 of 7) intron (NM_001143827, intron 1 of 7) 25333 NM_001143827 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 117.333-29 chr10 115958097 115958243 + 1 NA Intergenic Intergenic 236619 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 120.667-127 chr4 62053076 62053232 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 23 of 23) intron (NM_001371343, intron 23 of 23) 108611 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-353 chr8 3298151 3298356 + 1 NA intron (NM_033225, intron 25 of 69) L1ME3A|LINE|L1 -569802 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 178.333-184 chrX 153807040 153807280 + 1 NA intron (NM_001303514, intron 1 of 5) CpG 12492 NM_006280 6748 Hs.409223 NM_006280 ENSG00000180879 SSR4 CDG1Y|TRAPD signal sequence receptor subunit 4 protein-coding 119.667-89 chr2 171252178 171252363 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -20977 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 119.333-18 chr1 221770920 221771071 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -28819 NR_111940 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 152.333-236 chr3 76155793 76156047 + 1 NA Intergenic Intergenic -370371 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 252.667-40 chr18 13518447 13518884 + 1 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) L1MEd|LINE|L1 58718 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 130.667-121 chr2 200712351 200712516 + 1 NA non-coding (NR_037886, exon 3 of 3) non-coding (NR_037886, exon 3 of 3) 16710 NR_135011 107161151 Hs.148269 NR_135011 AOX3P-AOX2P AOX3/AOX3L1 AOX3P-AOX2P readthrough, transcribed pseudogene pseudo 144.667-296 chr8 84376313 84376519 + 1 NA intron (NM_001354319, intron 2 of 8) intron (NM_001354319, intron 2 of 8) -39068 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 280.667-31 chr3 55449836 55450246 + 1 NA Intergenic Intergenic 31357 NM_001256105 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 195.667-73 chr2 128244155 128244435 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 74573 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 195.667-124 chr6 129875384 129875697 + 1 NA Intergenic Intergenic -14225 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 204.333-83 chr18 40688436 40688861 + 1 NA Intergenic Intergenic 622362 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 165.667-60 chr15 64556065 64556375 + 1 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) AluJo|SINE|Alu 56800 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 263.667-61 chr3 180330966 180331347 + 1 NA Intergenic LTR80B|LTR|ERVL -83017 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 256.667-77 chr6 164974298 164974903 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -152537 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 246.667-72 chr5 95319155 95319600 + 1 NA Intergenic Intergenic -34802 NM_024717 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 206.333-140 chr6 71404204 71404593 + 1 NA promoter-TSS (NR_029504) promoter-TSS (NR_029504) -777 NR_029504 407029 NR_029504 ENSG00000207827 MIR30A MIRN30A|mir-30a microRNA 30a ncRNA 224.667-60 chr4 55823901 55824218 + 1 NA intron (NM_001351574, intron 1 of 2) intron (NM_001351574, intron 1 of 2) 4056 NM_001351575 644145 Hs.570825 NM_001351574 ENSG00000250821 EXOC1L - exocyst complex component 1 like protein-coding 272.667-32 chr2 88030602 88031242 + 1 NA intron (NM_001304526, intron 3 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 24861 NM_001304526 51315 Hs.469254 NM_016618 ENSG00000172086 KRCC1 CHBP2 lysine rich coiled-coil 1 protein-coding 157.667-79 chr12 57457903 57458098 + 1 NA TTS (NM_031479) TTS (NM_031479) -1785 NM_005269 2735 Hs.632702 NM_005269 ENSG00000111087 GLI1 GLI|PAPA8|PPD1 GLI family zinc finger 1 protein-coding 160.667-154 chr2 125207462 125207706 + 1 NA Intergenic Intergenic 910401 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 259.667-66 chr6 3696802 3697223 + 1 NA Intergenic Intergenic 55000 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 153.333-29 chr1 184048891 184049148 + 1 NA Intergenic Intergenic -2711 NM_001300766 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 112.333-175 chr4 35759810 35759999 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 484035 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 115.667-202 chr7 95313337 95313529 + 1 NA intron (NM_000446, intron 4 of 8) intron (NM_000446, intron 4 of 8) 11099 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 162.333-254 chr8 82022094 82022341 + 1 NA Intergenic Intergenic -179931 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 144.333-260 chr8 64037358 64037626 + 1 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 268062 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 214.667-95 chr4 147766907 147767242 + 1 NA intron (NM_024605, intron 1 of 22) AluSx1|SINE|Alu -15521 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 344.333-2 chr1 32793869 32794268 + 1 NA intron (NM_003680, intron 5 of 12) AluSx1|SINE|Alu -23374 NM_001256121 64766 Hs.440880 NM_022753 ENSG00000116497 S100PBP S100PBPR S100P binding protein protein-coding 161.667-125 chr2 61542603 61542902 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -4396 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 149.333-121 chr15 51608159 51608390 + 1 NA intron (NM_001174116, intron 1 of 42) L1PA15|LINE|L1 14497 NM_001174117 23312 Hs.511386 NM_015263 ENSG00000104093 DMXL2 DFNA71|PEPNS|RC3 Dmx like 2 protein-coding 349.333-2 chr1 42464223 42464733 + 1 NA intron (NM_001355227, intron 1 of 18) L3|LINE|CR1 1192 NM_001355227 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 209.667-81 chr3 39339491 39339847 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 9960 NM_005201 1237 Hs.113222 NM_005201 ENSG00000179934 CCR8 CC-CKR-8|CCR-8|CDw198|CKRL1|CMKBR8|CMKBRL2|CY6|GPRCY6|TER1 C-C motif chemokine receptor 8 protein-coding 293.333-23 chr18 72457754 72458067 + 1 NA Intergenic Intergenic 86432 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 309.333-14 chr12 27704107 27704676 + 1 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -6382 NM_001190864 60488 Hs.714076 NM_021821 ENSG00000061794 MRPS35 HDCMD11P|MDS023|MRP-S28|MRPS28 mitochondrial ribosomal protein S35 protein-coding 147.667-393 chr9 115555018 115555167 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 189147 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 147.333-82 chr12 52265327 52265615 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -6963 NR_146088 85349 Hs.584773 NR_146088 ENSG00000135477 KRT87P HBD|KRT121P|KRTHBP4|psihHbD keratin 87 pseudogene pseudo 172.667-91 chr20 45723248 45723499 + 1 NA intron (NM_178455, intron 1 of 2) intron (NM_178455, intron 1 of 2) 1026 NM_178455 391253 Hs.677891 NM_178455 ENSG00000149651 SPINT4 C20orf137|SPINT3|dJ601O1.1 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 protein-coding 254.667-13 chr11 89175855 89176153 + 1 NA Intergenic Intergenic -1871 NM_000372 7299 Hs.503555 NM_000372 ENSG00000077498 TYR ATN|CMM8|OCA1|OCA1A|OCAIA|SHEP3 tyrosinase protein-coding 192.333-174 chr9 11355498 11355798 + 1 NA Intergenic Intergenic 742442 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 139.667-36 chr12 28129491 28129798 + 1 NA Intergenic (AAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -60812 NM_001352084 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 197.333-134 chr20 59213229 59213595 + 1 NA intron (NM_178457, intron 3 of 4) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 22392 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 215.333-40 chr12 4632052 4632323 + 1 NA intron (NM_001278309, intron 4 of 5) LTR37-int|LTR|ERV1 16860 NM_006422 10566 Hs.98397 NM_006422 ENSG00000111254 AKAP3 AKAP 110|AKAP110|CT82|FSP95|HEL159|PRKA3|SOB1 A-kinase anchoring protein 3 protein-coding 145.667-45 chr11 24874846 24875030 + 1 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 377885 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 200.333-34 chr12 112332318 112332658 + 1 NA intron (NM_001109662, intron 1 of 75) AluSx|SINE|Alu 49943 NM_001109662 283450 Hs.530943 NM_173813 ENSG00000173064 HECTD4 C12ord51|C12orf51|HEEL|POTAGE HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 354.667-13 chr21 31634301 31634912 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -25016 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 242.667-91 chr6 22154361 22154784 + 1 NA intron (NR_015410, intron 9 of 11) intron (NR_015410, intron 9 of 11) -7379 NR_034143 729177 Hs.730673 NR_034143 ENSG00000260455 NBAT1 CASC14|NBAT-1 neuroblastoma associated transcript 1 ncRNA 173.667-2 chr1 25723800 25724012 + 1 NA intron (NM_020379, intron 2 of 11) intron (NM_020379, intron 2 of 11) -76287 NM_206926 57190 Hs.323396 NM_020451 ENSG00000162430 SELENON CFTD|MDRS1|RSMD1|RSS|SELN|SEPN1 selenoprotein N protein-coding 139.333-134 chr20 8680367 8680622 + 1 NA intron (NM_182734, intron 9 of 32) intron (NM_182734, intron 9 of 32) -150691 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 193.667-84 chr3 65610123 65610413 + 1 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) intron (NM_001365904, intron 2 of 24) -283548 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 289.333-29 chr2 135557708 135558230 + 1 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) intron (NM_001282799, intron 1 of 22) 26485 NM_001282799 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 191.333-174 chr6 50434158 50434437 + 1 NA Intergenic Intergenic -279247 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 318.667-27 chr5 78300672 78301024 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -6093 NM_003664 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 232.333-85 chr8 19065398 19065774 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -51883 NM_015310 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 152.667-392 chr9 15769157 15769333 + 1 NA intron (NM_001355547, intron 17 of 24) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 205267 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 166.667-67 chr14 64424465 64424650 + 1 NA intron (NM_005956, intron 8 of 27) intron (NM_005956, intron 8 of 27) 36204 NM_001364837 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 156.333-234 chr3 58599452 58599645 + 1 NA intron (NM_001282714, intron 1 of 4) L1ME3A|LINE|L1 -7532 NR_134853 105377108 NR_134853 ENSG00000244383 FAM3D-AS1 lnc-KCTD6-3 FAM3D antisense RNA 1 ncRNA 155.333-235 chr3 108187570 108187830 + 1 NA intron (NM_018010, intron 6 of 10) intron (NM_018010, intron 6 of 10) 34724 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 233.667-80 chr9 100488194 100488570 + 1 NA intron (NM_003692, intron 1 of 9) L1ME4b|LINE|L1 15233 NM_003692 8577 Hs.598100 NM_003692 ENSG00000241697 TMEFF1 C9orf2|CT120.1|H7365|TR-1 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 1 protein-coding 158.667-277 chr5 116832589 116832780 + 1 NA Intergenic Intergenic -70475 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 273.667-3 chr1 93422908 93423331 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -24999 NM_017737 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 299.667-28 chr5 91888867 91889379 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -505806 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 262.667-25 chr14 68343025 68343530 + 1 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) L1M3|LINE|L1 285510 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 218.667-83 chr5 53015792 53016121 + 1 NA intron (NR_073107, intron 1 of 28) L1PA13|LINE|L1 26604 NR_073107 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 159.333-295 chr6 148769059 148769360 + 1 NA intron (NM_005715, intron 1 of 7) intron (NM_005715, intron 1 of 7) 22179 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 157.667-320 chr8 52589376 52589578 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -24047 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 216.333 chr1 4560723 4561119 + 1 NA Intergenic Intergenic -10566 NR_147025 105376679 NR_147025 ENSG00000232596 LINC01646 - long intergenic non-protein coding RNA 1646 ncRNA 149.667-303 chr5 19002061 19002316 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 884084 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 140.667-252 chr9 105999986 106000238 + 1 NA Intergenic Intergenic 305571 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 425.333-10 chr5 88084997 88085488 + 1 NA Intergenic Intergenic 183603 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 186.333-167 chr8 110827584 110827860 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 199711 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 156.667-306 chr6 126738322 126738492 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 253776 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 136.667-153 chr6 34669679 34669868 + 1 NA intron (NM_022758, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 -26381 NR_134625 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 203.333-90 chr15 75614799 75615112 + 1 NA intron (NM_001042581, intron 3 of 8) MIR|SINE|MIR 10770 NM_005701 10073 Hs.21577 NM_005701 ENSG00000169371 SNUPN KPNBL|RNUT1|Snurportin1 snurportin 1 protein-coding 166.333-4 chr1 40616947 40617151 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 48633 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 218.667-44 chr19 40136833 40137162 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -46054 NM_001142579 284323 Hs.115140 NM_001010880 ENSG00000197782 ZNF780A ZNF780 zinc finger protein 780A protein-coding 339.333-47 chr8 82806504 82807148 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -105278 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 164.667-103 chr2 31782239 31782518 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 21602 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 154.333-123 chr17 61574076 61574294 + 1 NA Intergenic Intergenic 17034 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 184.667-87 chr4 30740043 30740282 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 19793 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 152.667-352 chr7 121746142 121746307 + 1 NA Intergenic Intergenic -126937 NM_001369396 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 146.333-86 chr14 45793940 45794187 + 1 NA Intergenic Intergenic -78461 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 244.333-33 chr12 130943340 130943772 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -10351 NM_001330497 283383 Hs.719239 NM_198827 ENSG00000111452 ADGRD1 GPR133|PGR25 adhesion G protein-coupled receptor D1 protein-coding 116.333-119 chr2 88205242 88205451 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 32207 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 204.667-97 chr3 77846966 77847341 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 201810 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 154.667-354 chr7 2613165 2613322 + 1 NA 3' UTR (NM_152558, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_152558, exon 22 of 22) -18743 NM_025250 80727 Hs.440899 NM_025250 ENSG00000136295 TTYH3 - tweety family member 3 protein-coding 338.333-10 chr18 7040465 7041101 + 1 NA intron (NM_005559, intron 9 of 62) L1MB8|LINE|L1 77014 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 255.333-112 chr8 115901994 115902393 + 1 NA Intergenic Intergenic -233218 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 146.667-146 chr18 67115614 67115897 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 34171 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 239.333-29 chr13 83816603 83816915 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 65634 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 126.667-50 chr14 61455653 61455896 + 1 NA intron (NM_006255, intron 7 of 13) intron (NM_006255, intron 7 of 13) 114420 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 162.667-155 chr20 36463158 36463463 + 1 NA intron (NM_183006, intron 1 of 6) MIRc|SINE|MIR 1515 NM_183006 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 161.333-274 chr8 17132296 17132531 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -24069 NM_016353 51201 Hs.728241 NM_016353 ENSG00000104219 ZDHHC2 DHHC2|ZNF372 zinc finger DHHC-type containing 2 protein-coding 156.667-243 chr4 53204735 53204933 + 1 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) HAL1|LINE|L1 161227 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 200.333-163 chr8 139073770 139074210 + 1 NA Intergenic Intergenic -159949 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 144.333-45 chr12 5304357 5304615 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -61335 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 279.333-65 chr5 50724205 50724620 + 1 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) intron (NM_024615, intron 2 of 25) 56998 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 238.667-49 chr2 208325268 208325568 + 1 NA exon (NM_015040, exon 20 of 42) exon (NM_015040, exon 20 of 42) -34274 NM_001309516 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 163.667-12 chr1 228731931 228732101 + 1 NA intron (NR_037962, intron 1 of 2) Charlie14a|DNA|hAT-Charlie -3463 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 162.333-172 chr3 177701561 177701850 + 1 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 -115160 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 157.667-299 chr7 36745354 36745644 + 1 NA Intergenic Intergenic -20950 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 158.667-53 chr10 122175340 122175566 + 1 NA intron (NM_001291878, intron 1 of 16) intron (NM_001291878, intron 1 of 16) 11823 NM_006997 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 159.333-265 chr5 55759780 55760073 + 1 NA intron (NM_024415, intron 3 of 21) intron (NM_024415, intron 3 of 21) -6959 NM_001166534 54514 Hs.223581 NM_019039 ENSG00000152670 DDX4 VASA DEAD-box helicase 4 protein-coding 215.667-60 chr2 102000323 102000675 + 1 NA intron (NR_048564, intron 1 of 8) L3|LINE|CR1 1538 NR_048564 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 319.333-31 chr7 7807341 7807972 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) -89049 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 149.667-255 chr3 69468292 69468441 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -82278 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 269.333 chr1 206740092 206740583 + 1 NA Intergenic Intergenic -30436 NM_153758 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 262.333-63 chr4 64333551 64334029 + 1 NA intron (NM_001363796, intron 2 of 11) AluYb8|SINE|Alu 75660 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 369.333-25 chr7 26554387 26554881 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -15809 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 168.667-116 chr2 220060076 220060345 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -153645 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 159.667-19 chr1 106015631 106015884 + 1 NA intron (NR_146609, intron 3 of 5) intron (NR_146609, intron 3 of 5) 12496 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 152.333-82 chr12 30417908 30418144 + 1 NA Intergenic Intergenic 259218 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 167.667-86 chr17 61603193 61603506 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -12130 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 177.667-144 chr9 69719564 69719857 + 1 NA intron (NM_001366939, intron 5 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 40301 NR_159517 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 243.333-79 chr4 59407798 59408109 + 1 NA Intergenic Intergenic 394380 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 152.333-285 chr4 139522963 139523127 + 1 NA intron (NM_001306199, intron 5 of 7) AluSz|SINE|Alu 33724 NR_131339 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 224.667-19 chr13 62984480 62984967 + 1 NA Intergenic Intergenic -177364 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 224.333-64 chr2 143412668 143413094 + 1 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) L1MEg|LINE|L1 283462 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 153.667-247 chr3 31622077 31622331 + 1 NA exon (NM_178862, exon 10 of 16) exon (NM_178862, exon 10 of 16) -82009 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-260 chr3 98434703 98434900 + 1 NA Intergenic Intergenic -34679 NM_001004736 26339 Hs.621533 NM_001004736 ENSG00000232382 OR5K1 HSHTPCRX10|HTPCRX10|OR3-8 olfactory receptor family 5 subfamily K member 1 protein-coding 165.333-7 chr1 73929689 73929942 + 1 NA Intergenic Intergenic 255136 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 203.333-282 chr9 93884519 93884901 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 65353 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 259.667-55 chr4 59708792 59709187 + 1 NA Intergenic Intergenic 695416 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 144.333-63 chr13 112721289 112721542 + 1 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) intron (NM_032189, intron 1 of 28) 31086 NM_032189 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 140.333-39 chr11 77707881 77708121 + 1 NA intron (NM_016578, intron 5 of 15) L1ME4a|LINE|L1 -70195 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 207.333-221 chr5 96528958 96529241 + 1 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) intron (NR_130776, intron 4 of 4) -95851 NM_000439 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 156.667-91 chr13 55666584 55666771 + 1 NA Intergenic Intergenic 492223 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 147.333-172 chr2 129586160 129586418 + 1 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 291202 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 159.333-13 chr1 90802003 90802208 + 1 NA intron (NR_135038, intron 1 of 2) L1MC1|LINE|L1 34056 NR_147932 105378853 Hs.546492 NR_135038 ENSG00000233593 LINC02609 - long intergenic non-protein coding RNA 2609 ncRNA 128.667-45 chr12 45122710 45122891 + 1 NA Intergenic Intergenic -57389 NR_026583 83956 Hs.650500 NM_032032 RACGAP1P FKSG42 Rac GTPase activating protein 1 pseudogene pseudo 143.333-87 chr14 63111015 63111196 + 1 NA Intergenic Intergenic -65647 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 211.667-107 chr7 40760659 40761091 + 1 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) MIRb|SINE|MIR 219064 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 147.333-276 chr6 73695179 73695533 + 1 NA promoter-TSS (NM_133493) promoter-TSS (NM_133493) -729 NM_001159587 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 161.667-233 chr7 1921685 1921868 + 1 NA intron (NM_001013837, intron 17 of 18) L1MDb|LINE|L1 18795 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 183.333-13 chr10 11322516 11322808 + 1 NA intron (NM_001025076, intron 11 of 13) intron (NM_001025076, intron 11 of 13) 22012 NR_126062 414196 Hs.729598 NM_001012713 CELF2-AS1 C10orf31 CELF2 antisense RNA 1 ncRNA 130.333-63 chr14 46406996 46407156 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -64283 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 197.333-39 chr11 91588075 91588382 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -636806 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 233.333-136 chr9 69957037 69957452 + 1 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -86337 NR_125850 256691 Hs.547172 NM_153267 ENSG00000165072 MAMDC2 - MAM domain containing 2 protein-coding 213.667-26 chr12 5198923 5199268 + 1 NA Intergenic Intergenic 44056 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 180.667-156 chr9 74833290 74833526 + 1 NA intron (NM_017662, intron 6 of 38) L2|LINE|L2 53939 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 221.333-80 chr20 51090929 51091306 + 1 NA Intergenic Intergenic -68010 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 185.333-179 chr7 93479312 93479532 + 1 NA exon (NM_001164737, exon 5 of 16) exon (NM_001164737, exon 5 of 16) 3433 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 163.667-148 chr3 11639071 11639266 + 1 NA intron (NM_014667, intron 2 of 5) intron (NM_014667, intron 2 of 5) 4747 NM_001128219 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 176.333-55 chr14 88570536 88570744 + 1 NA intron (NR_136936, intron 3 of 15) intron (NR_136936, intron 3 of 15) 7293 NM_207661 79882 Hs.684046 NM_024824 ENSG00000100722 ZC3H14 MRT56|MSUT-2|NY-REN-37|SUT2|UKp68 zinc finger CCCH-type containing 14 protein-coding 146.667-48 chr10 110875805 110875967 + 1 NA intron (NM_001199492, intron 1 of 11) intron (NM_001199492, intron 1 of 11) 3958 NM_014456 27250 Hs.711490 NM_014456 ENSG00000150593 PDCD4 H731 programmed cell death 4 protein-coding 142.333-261 chr9 93282728 93282998 + 1 NA intron (NM_001282394, intron 19 of 29) L1MB1|LINE|L1 63440 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 144.667-56 chr12 41605233 41605390 + 1 NA Intergenic Intergenic -158878 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 137.333-80 chr18 63214359 63214584 + 1 NA intron (NM_000633, intron 2 of 2) intron (NM_000633, intron 2 of 2) 104909 NM_000657 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 239.667-59 chr5 51809457 51809759 + 1 NA Intergenic Intergenic -198423 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 275.333-76 chr8 78745748 78746122 + 1 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -21561 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 286.667-6 chr1 194800256 194800724 + 1 NA Intergenic Intergenic 1288225 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 296.667-15 chr14 54644332 54644816 + 1 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 76962 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 221.333-146 chr8 129774855 129775164 + 1 NA intron (NM_031415, intron 3 of 13) L1MA9|LINE|L1 11615 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 176.333-159 chr7 97479492 97479757 + 1 NA Intergenic Intergenic -252462 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 254.667-22 chr14 61023969 61024252 + 1 NA intron (NR_033344, intron 5 of 16) intron (NR_033344, intron 5 of 16) -42420 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 140.333-94 chr19 52293731 52293953 + 1 NA 3' UTR (NM_001010851, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001010851, exon 4 of 4) -3327 NM_001297624 147657 Hs.729317 NM_144684 ENSG00000198464 ZNF480 - zinc finger protein 480 protein-coding 211.333-122 chr2 128224176 128224534 + 1 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 94513 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 160.333-28 chr1 208230662 208230921 + 1 NA intron (NM_025179, intron 1 of 31) intron (NM_025179, intron 1 of 31) 13593 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 157.667-240 chr5 41315941 41316208 + 1 NA intron (NM_001005473, intron 2 of 2) L1MA1|LINE|L1 -54605 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 223.333-10 chr1 152895289 152895659 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -13071 NM_005547 3713 Hs.516439 NM_005547 ENSG00000163207 IVL - involucrin protein-coding 136.333-182 chr6 113158639 113158881 + 1 NA Intergenic Intergenic 274687 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 213.667-48 chr20 53195966 53196304 + 1 NA intron (NM_001193421, intron 1 of 2) intron (NM_001193421, intron 1 of 2) 10852 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 162.333-204 chr5 132763091 132763309 + 1 NA intron (NM_001098811, intron 4 of 9) intron (NM_001098811, intron 4 of 9) 14039 NM_001300799 23176 Hs.522057 NM_015146 ENSG00000164402 SEPTIN8 SEP2|SEPT8 septin 8 protein-coding 148.667-185 chr2 60899547 60899698 + 1 NA intron (NM_002908, intron 3 of 10) intron (NM_002908, intron 3 of 10) 18048 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 121.333-35 chr11 108147347 108147497 + 1 NA 3' UTR (NM_000019, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_000019, exon 12 of 12) 25855 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 290.667-40 chr7 48803331 48803696 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -121034 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 154.333-256 chr5 12923635 12923810 + 1 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 109164 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 142.333-80 chr14 45407144 45407329 + 1 NA Intergenic Intergenic -154034 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 247.333-5 chr10 22854338 22854685 + 1 NA Intergenic Intergenic -73513 NM_001282747 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 253.667-8 chr10 11977899 11978351 + 1 NA intron (NM_080599, intron 9 of 21) intron (NM_080599, intron 9 of 21) 64684 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 223.667-87 chr8 120400647 120401096 + 1 NA intron (NM_014078, intron 6 of 6) L1PA11|LINE|L1 44279 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 155.667-199 chr21 22474031 22474338 + 1 NA Intergenic Intergenic 375567 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 127.667-127 chr4 71786740 71786888 + 1 NA intron (NM_001204306, intron 1 of 13) intron (NM_001204306, intron 1 of 13) -2735 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 156.667-174 chr2 38049972 38050141 + 1 NA intron (NM_144713, intron 10 of 10) MIRb|SINE|MIR -13715 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-280 chr5 43246431 43246744 + 1 NA intron (NR_072980, intron 2 of 3) intron (NR_072980, intron 2 of 3) 53735 NR_072980 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 153.333-103 chr13 25151562 25151806 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 20483 NM_199138 219287 Hs.528335 NM_152704 ENSG00000165566 AMER2 FAM123A APC membrane recruitment protein 2 protein-coding 134.667-100 chr2 71584566 71584776 + 1 NA intron (NM_001130985, intron 30 of 54) L2a|LINE|L2 117972 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 129.333-22 chr10 84056467 84056729 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -82911 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 271.333-73 chr9 82578660 82579063 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 484281 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 138.333-81 chr17 78662325 78662585 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -30398 NR_110849 101928710 Hs.464224 NR_110848 ENSG00000267123 SCAT1 LINC02081|XLOC_012582 S-phase cancer associated transcript 1 ncRNA 150.667-239 chr3 40377890 40378114 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -9182 NM_001248 956 Hs.441145 NM_001248 ENSG00000168032 ENTPD3 CD39L3|HB6|NTPDase-3 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 protein-coding 139.333-5 chr1 72417024 72417234 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -134590 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 154.667-161 chr2 9440838 9441119 + 1 NA intron (NM_016207, intron 8 of 17) intron (NM_016207, intron 8 of 17) 17324 NM_016207 51692 Hs.515972 NM_016207 ENSG00000119203 CPSF3 CPSF-73|CPSF73 cleavage and polyadenylation specific factor 3 protein-coding 156.333-359 chr8 110325727 110326022 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -350103 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 148.667-405 chr9 133124798 133124951 + 1 NA intron (NM_001042368, intron 1 of 17) L1MC5|LINE|L1 -3634 NM_001271776 5900 Hs.106185 NM_006266 ENSG00000160271 RALGDS RGDS|RGF|RalGEF ral guanine nucleotide dissociation stimulator protein-coding 222.333-3 chr1 57442059 57442494 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR -17355 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 152.667-108 chr14 59099186 59099381 + 1 NA Intergenic Intergenic -89384 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 146.667-129 chr17 27708109 27708357 + 1 NA Intergenic Intergenic 77045 NM_002308 3965 Hs.81337 NM_002308 ENSG00000168961 LGALS9 HUAT|LGALS9A galectin 9 protein-coding 136.667-71 chr15 94499876 94500031 + 1 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 144023 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 155.333-373 chr7 139418218 139418440 + 1 NA intron (NM_016019, intron 9 of 9) intron (NM_016019, intron 9 of 9) 9197 NR_033999 100129148 Hs.744449 NR_033999 LOC100129148 - uncharacterized LOC100129148 ncRNA 168.333-62 chr14 87813489 87813715 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -158308 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 233.333-38 chr14 59065170 59065690 + 1 NA Intergenic Intergenic -123237 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 142.667-191 chr6 110089930 110090124 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 89643 NM_003931 8936 Hs.75850 NM_003931 ENSG00000112290 WASF1 SCAR1|WAVE|WAVE1 WASP family member 1 protein-coding 153.333-239 chr20 36509536 36509789 + 1 NA intron (NR_109939, intron 3 of 4) AluJr|SINE|Alu -31857 NM_006097 10398 Hs.504687 NM_006097 ENSG00000101335 MYL9 LC20|MLC-2C|MLC2|MRLC1|MYRL2 myosin light chain 9 protein-coding 158.333-174 chr20 45246643 45246818 + 1 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 7834 NM_003064 6590 Hs.517070 NM_003064 ENSG00000124107 SLPI ALK1|ALP|BLPI|HUSI|HUSI-I|MPI|WAP4|WFDC4 secretory leukocyte peptidase inhibitor protein-coding 143.333-129 chr2 21361130 21361396 + 1 NA Intergenic Intergenic 237277 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 113.667-95 chr2 22992527 22992711 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -392560 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 136.667-75 chr16 66772023 66772276 + 1 NA intron (NM_001136505, intron 13 of 18) intron (NM_001136505, intron 13 of 18) -20321 NM_001323955 1783 Hs.369068 NM_006141 ENSG00000135720 DYNC1LI2 DNCLI2|LIC2 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 2 protein-coding 173.667-12 chr1 210342229 210342573 + 1 NA intron (NM_001170580, intron 1 of 11) intron (NM_001170580, intron 1 of 11) 13035 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 167.333-110 chr17 60720324 60720629 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) intron (NM_001330413, intron 5 of 25) 42625 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 151.333-376 chr6 159172777 159172937 + 1 NA intron (NM_032532, intron 1 of 22) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -2850 NR_121668 101929122 Hs.134215 NR_121668 LOC101929122 - uncharacterized LOC101929122 ncRNA 154.667-64 chr11 79020571 79020835 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 6 of 33) intron (NM_001098816, intron 6 of 33) 381406 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 131.667-8 chr1 78006432 78006629 + 1 NA intron (NM_001317103, intron 1 of 1) intron (NM_001317103, intron 1 of 1) 1591 NM_007034 11080 Hs.13852 NM_007034 ENSG00000162616 DNAJB4 DNAJW|DjB4|HLJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B4 protein-coding 265.667-25 chr15 85351171 85351562 + 1 NA Intergenic Intergenic -29230 NR_106993 102465803 NR_106993 ENSG00000284160 MIR7706 hsa-mir-7706 microRNA 7706 ncRNA 140.333-48 chr12 33892741 33893000 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -129626 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 145.333-111 chr17 27923280 27923446 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -29998 NM_001076680 201229 Hs.687951 NM_001076680 ENSG00000232859 LYRM9 C17orf108|HSD24 LYR motif containing 9 protein-coding 165.667-72 chr17 61217271 61217512 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 150313 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 154.667-192 chr2 164100390 164100550 + 1 NA Intergenic Intergenic -364462 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 115.333-158 chr4 79735028 79735215 + 1 NA Intergenic Intergenic -92350 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 136.667-99 chr2 169966398 169966633 + 1 NA intron (NM_172070, intron 24 of 38) intron (NM_172070, intron 24 of 38) 139007 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 142.667-214 chr8 3150697 3150898 + 1 NA intron (NM_033225, intron 40 of 69) intron (NM_033225, intron 40 of 69) -422346 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 147.333-87 chr12 93319777 93319932 + 1 NA intron (NR_040096, intron 2 of 4) intron (NR_040096, intron 2 of 4) 57882 NR_040096 643339 Hs.741299 NR_040096 LOC643339 - uncharacterized LOC643339 ncRNA 148.667-224 chr20 47609155 47609312 + 1 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) L2c|LINE|L2 107346 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 255.667-52 chr22 39934851 39935331 + 1 NA intron (NM_001291828, intron 1 of 4) Plat_L3|LINE|CR1 8487 NM_001291824 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 164.333-206 chr5 159177981 159178203 + 1 NA intron (NM_001199383, intron 4 of 10) L1M5|LINE|L1 29556 NM_001199382 153830 Hs.349306 NM_144726 ENSG00000145860 RNF145 - ring finger protein 145 protein-coding 147.333-180 chr2 204242087 204242256 + 1 NA Intergenic Intergenic -303304 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 380.333-9 chr6 155004018 155004406 + 1 NA Intergenic Intergenic -86077 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 151.333-43 chr10 24230074 24230281 + 1 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) 21039 NM_019590 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 134.333-114 chr3 45902831 45902987 + 1 NA 3' UTR (NM_001256369, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001256369, exon 4 of 4) 12815 NM_001276379 54585 Hs.30824 NM_020347 ENSG00000163818 LZTFL1 BBS17 leucine zipper transcription factor like 1 protein-coding 169.333-106 chr18 13441229 13441406 + 1 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -13783 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 211.667-81 chr3 100278096 100278336 + 1 NA intron (NM_001199198, intron 1 of 18) intron (NM_001199198, intron 1 of 18) 17224 NM_001199198 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 217.333-119 chr5 62747986 62748459 + 1 NA Intergenic Intergenic 169403 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 126.333-46 chr14 52356435 52356655 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 42233 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 274.667-18 chr14 42502736 42503336 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 896180 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 158.667-354 chr9 88868030 88868205 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -122212 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 152.667-42 chr10 58359758 58359961 + 1 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 24853 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 157.667-213 chr4 56422405 56422703 + 1 NA intron (NR_156493, intron 1 of 10) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 13061 NR_156493 5471 Hs.331420 NM_002703 ENSG00000128059 PPAT ATASE|GPAT|PRAT phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase protein-coding 117.667-160 chr5 171296299 171296446 + 1 NA intron (NM_022897, intron 27 of 27) MIRb|SINE|MIR -12876 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 196.667-99 chr3 95715783 95716010 + 1 NA Intergenic Intergenic -32703 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 150.333-266 chr3 78646598 78646761 + 1 NA intron (NM_001145845, intron 18 of 28) intron (NM_001145845, intron 18 of 28) 372780 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 139.333-135 chr20 33585336 33585553 + 1 NA intron (NM_005093, intron 2 of 11) L1ME4a|LINE|L1 23079 NM_005093 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 137.667-99 chr2 161138281 161138446 + 1 NA intron (NM_004180, intron 1 of 7) MIRc|SINE|MIR 1400 NM_004180 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 230.333-96 chr5 114664880 114665178 + 1 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) intron (NR_130785, intron 3 of 12) 88988 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 165.333-69 chr13 112695293 112695590 + 1 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) intron (NM_032189, intron 1 of 28) 5112 NM_032189 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 180.667-56 chr18 10995691 10995945 + 1 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) intron (NM_022068, intron 2 of 51) 152944 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 162.667-178 chr3 112012944 112013140 + 1 NA intron (NM_001008272, intron 4 of 4) intron (NM_001008272, intron 4 of 4) 13882 NM_001008273 29114 Hs.169330 NM_013259 ENSG00000144834 TAGLN3 NP22|NP24|NP25 transgelin 3 protein-coding 247.667-67 chr3 180860363 180860659 + 1 NA intron (NR_109986, intron 1 of 13) L1PA16|LINE|L1 9667 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 263.667-44 chr2 18075854 18076322 + 1 NA Intergenic Intergenic 197421 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 214.667-92 chr4 102766492 102766827 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -5691 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 190.667-131 chr7 15651519 15651739 + 1 NA intron (NM_005924, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR -16318 NR_134258 105375166 Hs.658822 NR_134258 ENSG00000237070 LOC105375166 - uncharacterized LOC105375166 ncRNA 171.667-137 chr5 136307356 136307669 + 1 NA intron (NR_133682, intron 2 of 3) intron (NR_133682, intron 2 of 3) -5656 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 146.667-39 chr10 68065071 68065241 + 1 NA intron (NM_001278185, intron 3 of 23) L1ME4a|LINE|L1 10127 NM_001278187 26091 Hs.51891 NM_015601 ENSG00000148634 HERC4 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 protein-coding 155.333-345 chr6 144275392 144275631 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16226 NM_007124 7402 Hs.133135 NM_007124 ENSG00000152818 UTRN DMDL|DRP|DRP1 utrophin protein-coding 151.333-50 chr10 43353996 43354285 + 1 NA Intergenic Intergenic -17496 NM_173160 53828 Hs.130497 NM_173160 ENSG00000150201 FXYD4 CHIF FXYD domain containing ion transport regulator 4 protein-coding 144.333-178 chr3 173509910 173510072 + 1 NA intron (NM_014932, intron 2 of 6) intron (NM_014932, intron 2 of 6) -74443 NM_001365933 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 161.667-121 chr2 20570716 20570941 + 1 NA Intergenic Intergenic 21720 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 157.333-19 chr1 113770556 113770745 + 1 NA intron (NR_130896, intron 5 of 7) intron (NR_130896, intron 5 of 7) -10762 NM_001323042 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 152.667-216 chr2 230426323 230426475 + 1 NA intron (NM_001080391, intron 2 of 28) L1ME3G|LINE|L1 9643 NM_001206704 6672 Hs.369056 NM_003113 ENSG00000067066 SP100 lysp100b SP100 nuclear antigen protein-coding 189.667-36 chr13 41272125 41272465 + 1 NA intron (NM_001354073, intron 1 of 14) MER4-int|LTR|ERV1 -8719 NM_004294 9617 Hs.382176 NM_004294 ENSG00000120662 MTRF1 MRF1|MTTRF1|RF1 mitochondrial translation release factor 1 protein-coding 210.333-113 chr4 34959475 34959749 + 1 NA Intergenic Intergenic -689865 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 306.333-26 chr2 210325161 210325675 + 1 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) intron (NR_110606, intron 1 of 4) 706 NR_110606 102724820 Hs.659232 NR_110604 LANCL1-AS1 LANCLOT LANCL1 antisense RNA 1 ncRNA 389.333-4 chr10 28689931 28690361 + 1 NA Intergenic Intergenic 12625 NM_012342 25805 Hs.533336 NM_012342 ENSG00000095739 BAMBI NMA BMP and activin membrane bound inhibitor protein-coding 129.667-155 chr6 134310934 134311079 + 1 NA intron (NM_001143676, intron 1 of 13) intron (NM_001143676, intron 1 of 13) 7052 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 116.667-110 chr20 51612122 51612333 + 1 NA intron (NM_006045, intron 23 of 27) MIRc|SINE|MIR -49388 NM_001258295 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 216.667-6 chr1 74561289 74561756 + 1 NA Intergenic Intergenic -15908 NR_121671 101927320 Hs.662589 NR_121670 ENSG00000234497 ERICH3-AS1 - ERICH3 antisense RNA 1 ncRNA 134.667-131 chr3 41400859 41401112 + 1 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) L1MD2|LINE|L1 201480 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 179.333-54 chr12 133156820 133157117 + 1 NA exon (NM_015394, exon 5 of 5) exon (NM_015394, exon 5 of 5) -24527 NM_001165886 10795 Hs.124047 NM_003415 ENSG00000090612 ZNF268 HZF3 zinc finger protein 268 protein-coding 197.667-23 chr11 40638378 40638676 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -345397 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 155.667-271 chr5 29629329 29629560 + 1 NA Intergenic (TTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -233468 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 205.667-119 chr6 62973200 62973516 + 1 NA Intergenic Intergenic 346619 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 187.667-66 chr2 39195133 39195478 + 1 NA intron (NM_001009565, intron 4 of 7) L1MB4|LINE|L1 34283 NM_001009565 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 265.667-5 chr10 6138863 6139316 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -5832 NM_001323016 5209 Hs.195471 NM_004566 ENSG00000170525 PFKFB3 IPFK2|PFK2|iPFK-2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 3 protein-coding 236.667-96 chr9 104806436 104806921 + 1 NA intron (NM_005502, intron 30 of 49) intron (NM_005502, intron 30 of 49) 42549 NR_130760 55335 Hs.429294 NM_018376 ENSG00000165028 NIPSNAP3B FP944|NIPSNAP3|SNAP1 nipsnap homolog 3B protein-coding 183.333-25 chr11 76963250 76963532 + 1 NA intron (NM_001300954, intron 3 of 10) MER61F|LTR|ERV1 -71007 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 205.667-22 chr11 12029115 12029452 + 1 NA Intergenic MER83|LTR|ERV1 -1592 NR_135109 105376554 Hs.523483 NR_135109 ENSG00000254486 LINC02547 - long intergenic non-protein coding RNA 2547 ncRNA 144.333-58 chr13 61678879 61679165 + 1 NA Intergenic Intergenic -251076 NR_134946 101926951 Hs.732367 NR_134946 ENSG00000279797 LINC02339 - long intergenic non-protein coding RNA 2339 ncRNA 170.333-83 chr15 85868187 85868373 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 42645 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 145.667-157 chr20 24211909 24212157 + 1 NA non-coding (NR_040102, exon 2 of 4) non-coding (NR_040102, exon 2 of 4) 12266 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 148.333-137 chr15 49696363 49696535 + 1 NA Intergenic Intergenic 75401 NM_020234 56986 Hs.127432 NM_020234 ENSG00000104047 DTWD1 MDS009 DTW domain containing 1 protein-coding 154.333-160 chr2 99041679 99042021 + 1 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) L1PB|LINE|L1 99330 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 243.333-64 chr21 27647492 27647772 + 1 NA Intergenic Intergenic -74747 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 158.333-350 chrX 65639947 65640120 + 1 NA Intergenic Intergenic -27621 NM_002444 4478 Hs.87752 NM_002444 ENSG00000147065 MSN HEL70|IMD50 moesin protein-coding 310.333-17 chr15 77851538 77852121 + 1 NA Intergenic Intergenic -30929 NM_001301186 84894 Hs.656765 NM_032808 ENSG00000169783 LINGO1 LERN1|LRRN6A|MRT64|UNQ201 leucine rich repeat and Ig domain containing 1 protein-coding 240.333-39 chr15 60937495 60937775 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 256066 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 135.667-115 chr3 22229473 22229699 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 272447 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 246.333-96 chr8 90913658 90913935 + 1 NA intron (NM_022351, intron 5 of 12) intron (NM_022351, intron 5 of 12) 71281 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 251.667-65 chr3 130578327 130578645 + 1 NA intron (NM_001102608, intron 7 of 35) LTR16D|LTR|ERVL 18152 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 165.667-51 chr14 58897671 58897913 + 1 NA intron (NR_110547, intron 2 of 5) L1M6B|LINE|L1 69504 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 153.667-132 chr15 46150349 46150626 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 445292 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 153.667-271 chr3 162251653 162252023 + 1 NA Intergenic Intergenic 755030 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 162.333-122 chr2 140927705 140927924 + 1 NA intron (NM_018557, intron 20 of 90) AluSx1|SINE|Alu -341129 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 153.333-86 chr12 22409817 22409983 + 1 NA Intergenic Intergenic -75186 NM_003034 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 140.333-193 chr5 158234564 158234846 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 175068 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 193.333-96 chr2 119752738 119753121 + 1 NA Intergenic Intergenic -6993 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 173.667-150 chr6 41754187 41754420 + 1 NA Intergenic Intergenic -6902 NM_001166424 5225 Hs.1867 NM_002630 ENSG00000096088 PGC PEPC|PGII progastricsin protein-coding 170.333-210 chr7 120153409 120153706 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -119618 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 148.667-162 chr17 78011848 78012027 + 1 NA intron (NM_018996, intron 2 of 20) L1ME2z|LINE|L1 7700 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 156.333-246 chr3 118305417 118305725 + 1 NA Intergenic Intergenic -336197 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 138.667-163 chr5 52725308 52725568 + 1 NA Intergenic Intergenic -62478 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 160.667-5 chr1 49152567 49152738 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) intron (NM_001323575, intron 4 of 12) -104759 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 121.667-154 chr5 14842509 14842638 + 1 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) -16561 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 155.667-305 chr6 62282957 62283115 + 1 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 3189 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 261.667-28 chr18 5883945 5884399 + 1 NA Intergenic Intergenic 11782 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 133.333-27 chr10 82279926 82280077 + 1 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -47081 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 202.333-113 chr3 158601358 158601791 + 1 NA intron (NM_022443, intron 5 of 6) AluSg|SINE|Alu 30380 NM_001195433 4291 Hs.85195 NM_022443 ENSG00000178053 MLF1 - myeloid leukemia factor 1 protein-coding 200.667-124 chr4 130924716 130925001 + 1 NA Intergenic Intergenic 548497 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 144.333-279 chr8 130199976 130200142 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) intron (NM_001362925, intron 5 of 29) 96474 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 149.667-14 chr1 76620290 76620527 + 1 NA intron (NR_146056, intron 4 of 5) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 158859 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 250.667-38 chr2 108983029 108983399 + 1 NA intron (NM_022336, intron 1 of 11) intron (NM_022336, intron 1 of 11) 6006 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 147.333-97 chr14 42495788 42496070 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 889073 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 150.667-55 chr10 126646001 126646202 + 1 NA intron (NM_001350922, intron 2 of 8) intron (NM_001350922, intron 2 of 8) 24409 NR_146939 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 265.667-24 chr15 80408301 80408761 + 1 NA intron (NM_014862, intron 1 of 18) intron (NM_014862, intron 1 of 18) 4149 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 158.667-47 chr10 97673447 97673652 + 1 NA intron (NM_018425, intron 8 of 8) intron (NM_018425, intron 8 of 8) 13692 NM_021732 60370 Hs.23918 NM_021732 ENSG00000119986 AVPI1 PP5395|VIP32|VIT32 arginine vasopressin induced 1 protein-coding 336.667-5 chr1 108564515 108565009 + 1 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) AluSx1|SINE|Alu 4662 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 227.333-76 chr22 23705735 23706074 + 1 NA intron (NR_024448, intron 5 of 11) L1MA6|LINE|L1 9488 NM_001329425 266747 Hs.658997 NM_153615 ENSG00000159496 RGL4 Rgr ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 4 protein-coding 215.333-101 chr2 178274121 178274377 + 1 NA intron (NM_001201480, intron 1 of 25) intron (NM_001201480, intron 1 of 25) -45993 NM_145739 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 146.667-8 chr1 62263829 62264087 + 1 NA intron (NM_181712, intron 6 of 9) intron (NM_181712, intron 6 of 9) 55476 NM_001320269 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 151.667-87 chr12 68028056 68028239 + 1 NA Intergenic Intergenic 38702 NR_104125 100885789 Hs.439832 NR_104124 ENSG00000255733 IFNG-AS1 GS1-410F4.2|NEST|Tmevpg1 IFNG antisense RNA 1 ncRNA 135.333-178 chr7 82342773 82342931 + 1 NA intron (NM_000722, intron 2 of 38) intron (NM_000722, intron 2 of 38) 100925 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 118.667-96 chr2 59896489 59896735 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 486424 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 198.333-122 chr3 36961156 36961410 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -16229 NM_001329998 9881 Hs.170999 NM_014831 ENSG00000168016 TRANK1 LBA1 tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 protein-coding 260.667-78 chr5 175369479 175369843 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 74521 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 195.667-130 chr7 54548737 54549033 + 1 NA intron (NM_001317843, intron 3 of 3) intron (NM_001317843, intron 3 of 3) 2721 NR_133927 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 139.333-53 chr12 42084946 42085169 + 1 NA 3' UTR (NM_001099650, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001099650, exon 7 of 7) 59817 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 148.333-361 chr7 38543954 38544105 + 1 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) intron (NM_001635, intron 1 of 20) 87344 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 187.667-103 chr4 33315176 33315518 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 724546 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 228.667-19 chr12 48910105 48910603 + 1 NA intron (NM_001286957, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 6221 NM_001286957 85478 Hs.512805 NM_033124 ENSG00000139537 CCDC65 CFAP250|DRC2|FAP250|NYD-SP28 coiled-coil domain containing 65 protein-coding 284.333-28 chr20 10756661 10757283 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 3882 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 217.333-146 chr8 47207100 47207571 + 1 NA Intergenic Intergenic 18028 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 223.667-35 chr2 18621203 18621691 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -31867 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 182.333-7 chr1 110115120 110115366 + 1 NA Intergenic Intergenic 2800 NM_203412 164153 Hs.374027 NM_203412 ENSG00000186150 UBL4B - ubiquitin like 4B protein-coding 224.333-49 chr15 81331758 81332161 + 1 NA 3' UTR (NM_001080532, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_001080532, exon 22 of 22) 7626 NR_120365 101929655 Hs.696654 NR_120365 TMC3-AS1 - TMC3 antisense RNA 1 ncRNA 208.667-32 chr11 109686984 109687324 + 1 NA Intergenic Intergenic 264964 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 237.333-132 chr9 76815803 76816079 + 1 NA intron (NM_001308048, intron 6 of 17) AluSq|SINE|Alu 51505 NR_132313 50652 Hs.663766 NR_015342 ENSG00000225937 PCA3 DD3|NCRNA00019|PCAT3|PRUNE2-AS1 prostate cancer associated 3 ncRNA 235.333-13 chr10 100221945 100222397 + 1 NA exon (NM_001320928, exon 4 of 21) exon (NM_001320928, exon 4 of 21) 7425 NM_001278 1147 Hs.198998 NM_001278 ENSG00000213341 CHUK IKBKA|IKK-alpha|IKK1|IKKA|NFKBIKA|TCF16 component of inhibitor of nuclear factor kappa B kinase complex protein-coding 145.667-22 chr1 208828775 208829007 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 100203 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 223.667-79 chr7 141084471 141084820 + 1 NA intron (NM_001195278, intron 1 of 3) intron (NM_001195278, intron 1 of 3) 10581 NM_001195278 100507421 Hs.283851 NM_001195278 ENSG00000261115 TMEM178B - transmembrane protein 178B protein-coding 212.667-32 chr12 117673451 117673808 + 1 NA intron (NM_173598, intron 4 of 19) intron (NM_173598, intron 4 of 19) 295361 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 162.667-30 chr10 65868406 65868656 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 297106 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 123.333-60 chr12 65412541 65412713 + 1 NA intron (NM_001031679, intron 5 of 6) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 133640 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 231.333-101 chr6 69068088 69068356 + 1 NA intron (NM_001704, intron 16 of 31) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 432940 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 117.667-103 chr2 162690351 162690499 + 1 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -78511 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 299.333-71 chr7 72190209 72190588 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 2 of 5) MER103C|DNA|hAT-Charlie 146993 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 132.333-59 chr15 44644457 44644605 + 1 NA intron (NM_025137, intron 7 of 39) L1PA15|LINE|L1 19131 NM_001160227 80208 Hs.656271 NM_025137 ENSG00000104133 SPG11 ALS5|CMT2X|KIAA1840 SPG11 vesicle trafficking associated, spatacsin protein-coding 187.333-144 chr4 91489882 91490197 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1MA3|LINE|L1 787263 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 209.667-56 chr18 1760713 1761018 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -401236 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 233.667-56 chr4 105522455 105522787 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -29999 NM_017700 54848 Hs.585224 NM_017700 ENSG00000236699 ARHGEF38 - Rho guanine nucleotide exchange factor 38 protein-coding 254.667-39 chr2 110864229 110864541 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) intron (NM_001371254, intron 10 of 18) 131812 NM_001371254 148.667-230 chr21 22641513 22641662 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -437697 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 196.333-56 chr16 18010893 18011273 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 321579 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 156.667-60 chr11 38185571 38185844 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 247106 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 334.667-7 chr10 87721840 87722294 + 1 NA intron (NM_001015880, intron 8 of 12) intron (NM_001015880, intron 8 of 12) 62189 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 230.667-52 chr3 22533598 22534020 + 1 NA Intergenic Intergenic 576670 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 150.667-310 chr5 98588642 98588822 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -179900 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 167.667-150 chr4 53625348 53625627 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 32531 NR_046827 100873955 Hs.351074 NR_046827 LNX1-AS2 - LNX1 antisense RNA 2 ncRNA 171.333-18 chr1 233099130 233099378 + 1 NA intron (NM_014801, intron 21 of 33) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 148412 NR_138027 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 144.667-91 chr15 39052416 39052586 + 1 NA Intergenic 7SK|RNA|RNA -198168 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 168.667-46 chr12 112602260 112602550 + 1 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) intron (NM_001347952, intron 1 of 21) 27169 NM_001347952 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 151.667-35 chr1 219836758 219836915 + 1 NA Intergenic Intergenic 91815 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 135.333-12 chr1 161531125 161531346 + 1 NA Intergenic Intergenic 6695 NM_002155 3310 Hs.654614 NM_002155 ENSG00000173110 HSPA6 HSP70B' heat shock protein family A (Hsp70) member 6 protein-coding 159.333-14 chr1 93151412 93151580 + 1 NA non-coding (NR_030761, exon 5 of 5) non-coding (NR_030761, exon 5 of 5) 28917 NM_001167830 50999 Hs.482873 NM_016040 ENSG00000117500 TMED5 CGI-100|p24g2|p28 transmembrane p24 trafficking protein 5 protein-coding 205.333-261 chr9 81090525 81090806 + 1 NA Intergenic Intergenic 598870 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 120.667-120 chr3 180155399 180155641 + 1 NA Intergenic Intergenic -118583 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 169.333-237 chr7 2740403 2740634 + 1 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 22622 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 225.667-57 chr4 136777635 136777860 + 1 NA Intergenic Intergenic -416009 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 311.333-45 chr5 23989519 23990235 + 1 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 38529 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 155.333-383 chr8 68265758 68265920 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -64534 NM_001349479 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 155.667-54 chr11 76347800 76348037 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 33047 NR_130898 5612 Hs.503315 NM_004705 ENSG00000137492 THAP12 DAP4|P52rIPK|PRKRIR|THAP0 THAP domain containing 12 protein-coding 197.667-123 chr5 67807347 67807606 + 1 NA Intergenic Intergenic 14263 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 165.667-42 chr13 24751081 24751276 + 1 NA Intergenic Intergenic -12991 NM_031277 56163 Hs.97464 NM_031277 ENSG00000132972 RNF17 Mmip-2|SPATA23|TDRD4 ring finger protein 17 protein-coding 162.667-136 chr2 114682917 114683112 + 1 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 150534 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 191.667-62 chr18 9681528 9681917 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -26579 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 238.333-43 chr2 33741042 33741387 + 1 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) L1PB1|LINE|L1 -12997 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 175.667-52 chr16 60006249 60006443 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 150993 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 285.667-4 chr10 62278895 62279438 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -10322 NM_145307 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 137.667-145 chr4 96996949 96997155 + 1 NA Intergenic Intergenic -369874 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 170.333-21 chr1 231805644 231805897 + 1 NA intron (NM_001164544, intron 8 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 12747 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 335.667-18 chr3 81298598 81299131 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 304996 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 154.333-296 chr6 73132395 73132619 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 9 of 13) intron (NM_001160132, intron 9 of 13) 11007 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 245.333-69 chr2 187845040 187845469 + 1 NA Intergenic Intergenic -290749 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 192.667-37 chr10 121668274 121668670 + 1 NA Intergenic Intergenic -70014 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 198.667-87 chr18 6872371 6872785 + 1 NA intron (NM_001010000, intron 6 of 16) intron (NM_001010000, intron 6 of 16) 38093 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 116.333-115 chr2 40564312 40564575 + 1 NA Intergenic Intergenic -52008 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 266.667-24 chr14 68445657 68446060 + 1 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) intron (NM_133509, intron 9 of 10) 182929 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 156.667-181 chr2 67046706 67046981 + 1 NA Intergenic Intergenic -39603 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 153.667-404 chr9 79361363 79361644 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -210270 NM_001282753 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 121.333-17 chr1 241321692 241321874 + 1 NA intron (NM_001350116, intron 1 of 16) L2b|LINE|L2 34043 NM_001350116 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 224.667-17 chr12 63121779 63122060 + 1 NA Intergenic Intergenic 30891 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 234.667-33 chr14 49477478 49477811 + 1 NA Intergenic Intergenic 108736 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 156.333-298 chr5 150771226 150771403 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -6632 NM_032947 85027 Hs.29444 NM_032947 ENSG00000256235 SMIM3 C5orf62|MST150|NID67 small integral membrane protein 3 protein-coding 147.667-288 chr5 97204173 97204389 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -21034 NM_001159749 55781 Hs.27021 NM_018343 ENSG00000058729 RIOK2 RIO2 RIO kinase 2 protein-coding 160.667-281 chr7 44865054 44865366 + 1 NA Intergenic MER65D|LTR|ERV1 16590 NR_039801 100616393 NR_039801 ENSG00000284261 MIR4657 mir-4657 microRNA 4657 ncRNA 179.667-143 chr8 91283220 91283598 + 1 NA intron (NM_134266, intron 2 of 18) intron (NM_134266, intron 2 of 18) 34090 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 122.667-7 chr1 150115801 150115949 + 1 NA intron (NR_103998, intron 13 of 13) L1ME3|LINE|L1 -33559 NM_001304722 51177 Hs.438824 NM_016274 ENSG00000023902 PLEKHO1 CKIP-1|CKIP1|JBP|OC120 pleckstrin homology domain containing O1 protein-coding 155.667-306 chr6 63625736 63625962 + 1 NA Intergenic Intergenic -9953 NM_001370350 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 210.333-106 chr3 100268064 100268465 + 1 NA intron (NM_001199198, intron 1 of 18) intron (NM_001199198, intron 1 of 18) 7272 NM_001199198 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 164.333-222 chr7 10193211 10193500 + 1 NA Intergenic Intergenic -509321 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 137.667-113 chr20 49249717 49249875 + 1 NA intron (NM_021035, intron 13 of 13) intron (NM_021035, intron 13 of 13) 28261 NM_021035 57169 Hs.371794 NM_021035 ENSG00000124201 ZNFX1 - zinc finger NFX1-type containing 1 protein-coding 178.667-131 chr5 89045234 89045451 + 1 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) intron (NR_136221, intron 3 of 6) -141237 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 208.667-53 chr17 54858584 54858931 + 1 NA Intergenic Intergenic -41934 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 212.667-127 chr7 49898846 49899180 + 1 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) L1MD2|LINE|L1 123680 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 241.667-83 chr6 150430729 150431031 + 1 NA Intergenic Intergenic 61868 NR_134655 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 160.333-141 chr2 37400388 37400564 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 55846 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 115.333-113 chr2 77304685 77304846 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 217611 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 278.667-40 chr4 150177699 150178144 + 1 NA intron (NM_001040260, intron 2 of 15) L1ME3Cz|LINE|L1 99476 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 159.333-328 chr8 95547916 95548145 + 1 NA intron (NR_038207, intron 2 of 2) intron (NR_038207, intron 2 of 2) -278829 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 229.333-43 chr15 71912784 71913106 + 1 NA intron (NM_006901, intron 19 of 41) L1ME3A|LINE|L1 102391 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 141.333-132 chr20 21763141 21763331 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 57572 NM_006192 5075 Hs.122310 NM_006192 ENSG00000125813 PAX1 HUP48|OFC2 paired box 1 protein-coding 310.667-2 chr1 97388007 97388573 + 1 NA intron (NM_000110, intron 14 of 22) L2a|LINE|L2 292367 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 159.667-265 chr5 106026365 106026531 + 1 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy 926974 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 121.667-87 chr2 19986991 19987286 + 1 NA intron (NM_001006657, intron 2 of 27) intron (NM_001006657, intron 2 of 27) 2967 NM_001006657 57539 Hs.205427 NM_020779 ENSG00000118965 WDR35 CED2|IFT121|IFTA1|SRTD7 WD repeat domain 35 protein-coding 149.667-215 chr2 139957228 139957378 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 629382 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 307.333 chr1 44325561 44326004 + 1 NA intron (NM_001301701, intron 2 of 7) AluSz6|SINE|Alu 29475 NM_024066 79033 Hs.731413 NM_024066 ENSG00000117419 ERI3 PINT1|PRNPIP ERI1 exoribonuclease family member 3 protein-coding 295.333-10 chr13 64972977 64973418 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -892850 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 223.333-148 chr6 129029174 129029522 + 1 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 146207 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 151.667-100 chr13 107597940 107598228 + 1 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) -66836 NR_031671 100302286 NR_031671 ENSG00000221650 MIR1267 MIRN1267|hsa-mir-1267 microRNA 1267 ncRNA 129.333-99 chr2 123953411 123953569 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 71684 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 187.333-200 chr8 106309377 106309588 + 1 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) intron (NM_018002, intron 1 of 15) 39304 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 211.333-25 chr10 64676239 64676579 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -149119 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 212.667-143 chr9 10935473 10935836 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 322448 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 209.333-31 chr11 22165791 22166136 + 1 NA Intergenic Intergenic -27122 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 203.333-160 chr22 27847166 27847497 + 1 NA Intergenic Intergenic -45575 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 118.333-97 chr2 33853477 33853746 + 1 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -125394 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 194.333-57 chr18 10889368 10889669 + 1 NA intron (NM_022068, intron 4 of 51) intron (NM_022068, intron 4 of 51) -129869 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 152.333-266 chr4 30945899 30946129 + 1 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -225130 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 151.333-117 chr13 89528290 89528527 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -27899 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 196.333-114 chr3 115307571 115307855 + 1 NA Intergenic Intergenic -160425 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 149.667-280 chr4 43651669 43651833 + 1 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -159208 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 441.333-2 chr14 81524451 81524939 + 1 NA intron (NM_005065, intron 3 of 20) AluSz|SINE|Alu 9158 NM_005065 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 151.667-224 chr3 87586110 87586382 + 1 NA Intergenic Intergenic -206460 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 160.333-92 chr13 96951018 96951226 + 1 NA intron (NR_051966, intron 2 of 2) intron (NR_051966, intron 2 of 2) 33050 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 204.667-105 chr4 39085083 39085388 + 1 NA intron (NM_199039, intron 3 of 9) intron (NM_199039, intron 3 of 9) 23003 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 211.667-28 chr11 102677017 102677254 + 1 NA Intergenic Intergenic 28634 NM_022122 64066 Hs.534479 NM_022122 ENSG00000137675 MMP27 MMP-27 matrix metallopeptidase 27 protein-coding 240.333-78 chr5 125870998 125871339 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -308409 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 149.333-418 chr9 23391558 23391798 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 280721 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 134.667-53 chr14 25553648 25553831 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -503442 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 140.667-182 chr5 30130228 30130400 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 249754 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 147.667 chr1 27812919 27813173 + 1 NA intron (NM_177424, intron 6 of 8) intron (NM_177424, intron 6 of 8) -17736 NM_138558 5511 Hs.533474 NM_002713 ENSG00000117751 PPP1R8 ARD-1|ARD1|NIPP-1|NIPP1|PRO2047 protein phosphatase 1 regulatory subunit 8 protein-coding 214.333-78 chr2 99182505 99182917 + 1 NA intron (NR_028356, intron 1 of 6) intron (NR_028356, intron 1 of 6) 1527 NM_145212 51263 Hs.346736 NM_016503 ENSG00000185414 MRPL30 L28MT|L30MT|MRP-L28|MRP-L30|MRPL28|MRPL28M|RPML28 mitochondrial ribosomal protein L30 protein-coding 121.667-156 chr5 21190756 21190939 + 1 NA Intergenic Intergenic -268633 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 136.667-127 chr4 67667564 67667717 + 1 NA intron (NM_018227, intron 9 of 32) intron (NM_018227, intron 9 of 32) 33515 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 199.667-81 chr2 236043125 236043510 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 15 of 17) L1M5|LINE|L1 125069 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 116.333-154 chr4 55325429 55325581 + 1 NA Intergenic Intergenic -20737 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 152.333-49 chr10 80799664 80799840 + 1 NA Intergenic Intergenic 149955 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 146.333-180 chr20 61715498 61715754 + 1 NA intron (NM_001252339, intron 1 of 14) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 4122 NR_147702 100128310 Hs.683806 NR_147702 ENSG00000179253 LOC100128310 - uncharacterized LOC100128310 ncRNA 330.333-17 chr6 76208352 76208806 + 1 NA Intergenic Intergenic -135901 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 365.333-22 chr5 107301875 107302384 + 1 NA Intergenic Intergenic -291115 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 122.667-50 chr14 66493337 66493480 + 1 NA intron (NR_024338, intron 8 of 10) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 7037 NR_110308 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 221.667-70 chr5 153272535 153272912 + 1 NA Intergenic Intergenic -217801 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 156.333-2 chr1 34533860 34534086 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 135721 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 135.333-189 chr8 84581953 84582195 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) -123853 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 300.333 chr1 159152046 159152433 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -19376 NM_001346510 57863 Hs.365689 NM_021189 ENSG00000162706 CADM3 BIgR|IGSF4B|NECL1|Necl-1|TSLL1|synCAM3 cell adhesion molecule 3 protein-coding 157.667-263 chr5 148984425 148984597 + 1 NA 3' UTR (NM_024577, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_024577, exon 17 of 17) 77898 NR_030310 693169 NR_030310 ENSG00000207714 MIR584 MIRN584|hsa-mir-584 microRNA 584 ncRNA 222.333-42 chr2 43562604 43562871 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 15 of 37) L1M4|LINE|L1 33237 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 143.333-136 chr2 72246904 72247109 + 1 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -99144 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 152.667-277 chr4 80474972 80475149 + 1 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 139340 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 196.667-70 chr2 41043822 41044174 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -531563 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 203.333-219 chr5 122882913 122883134 + 1 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) intron (NM_014035, intron 1 of 6) 37410 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 150.667-148 chr17 71822583 71822829 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 203273 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 169.667-181 chr6 51533003 51533263 + 1 NA Intergenic Intergenic -88737 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 142.667-143 chr3 153360477 153360635 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -123939 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 369.333-18 chr4 63376054 63376637 + 1 NA Intergenic Intergenic 1033105 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 135.667-65 chr15 95556696 95556944 + 1 NA Intergenic Intergenic 123727 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 147.667-6 chr1 76616587 76616809 + 1 NA intron (NR_146056, intron 4 of 5) intron (NR_146056, intron 4 of 5) 162569 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 152.667-284 chr5 10615176 10615416 + 1 NA intron (NM_001164440, intron 1 of 3) L1ME4c|LINE|L1 51226 NM_001164440 651746 Hs.26039 NM_001164440 ENSG00000164236 ANKRD33B - ankyrin repeat domain 33B protein-coding 219.667-15 chr11 104832721 104833031 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 65794 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 176.333-107 chr22 45457148 45457471 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 43616 NM_015653 26150 Hs.475110 NM_015653 ENSG00000128408 RIBC2 C22orf11|TRIB RIB43A domain with coiled-coils 2 protein-coding 220.667-77 chr5 13363440 13363807 + 1 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -330737 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 142.333-159 chr3 77526291 77526437 + 1 NA intron (NM_001290065, intron 6 of 26) intron (NM_001290065, intron 6 of 26) 428352 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 205.333-49 chr12 1876837 1877224 + 1 NA intron (NM_172364, intron 16 of 37).2 intron (NM_172364, intron 16 of 37).2 41622 NM_172364 93589 Hs.13768 NM_172364 ENSG00000151062 CACNA2D4 RCD4 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 4 protein-coding 154.667-34 chr10 13712199 13712414 + 1 NA intron (NM_001318336, intron 11 of 23) AluSz|SINE|Alu -4739 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 161.667-136 chr2 118837712 118837967 + 1 NA Intergenic Intergenic 10344 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 151.333-139 chr14 103513490 103513641 + 1 NA Intergenic Intergenic 9265 NM_001823 1152 Hs.173724 NM_001823 ENSG00000166165 CKB B-CK|BCK|CKBB|CPK-B|HEL-211|HEL-S-29 creatine kinase B protein-coding 151.667-391 chr9 69357207 69357492 + 1 NA intron (NM_001127608, intron 2 of 10) intron (NM_001127608, intron 2 of 10) 28024 NM_004816 9413 Hs.118003 NM_004816 ENSG00000135063 FAM189A2 C9orf61|X123 family with sequence similarity 189 member A2 protein-coding 261.333-31 chr15 26512181 26512630 + 1 NA Intergenic Intergenic 116685 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 181.333-151 chr6 57205710 57206018 + 1 NA intron (NM_001278667, intron 3 of 6) L2|LINE|L2 15597 NM_001278668 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 193.667-108 chr6 26305102 26305434 + 1 NA Intergenic Intergenic -19769 NM_003543 8365 Hs.591790 NM_003543 ENSG00000158406 HIST1H4H H4/h|H4FH histone cluster 1 H4 family member h protein-coding 282.667-14 chr18 69550150 69550675 + 1 NA intron (NM_152721, intron 1 of 7) intron (NM_152721, intron 1 of 7) 80481 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 149.333-68 chr10 121416635 121416901 + 1 NA Intergenic Intergenic 114546 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 380.667-7 chr2 81317832 81318488 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 148786 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 146.333-84 chr14 34766644 34766921 + 1 NA intron (NM_013448, intron 21 of 26) L1MEd|LINE|L1 -51959 NR_028130 1073 Hs.180141 NM_021914 ENSG00000165410 CFL2 NEM7 cofilin 2 protein-coding 152.333-206 chr2 219807154 219807450 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 97587 NR_146975 105373889 Hs.570066 NR_146975 ENSG00000228909 LINC01803 - long intergenic non-protein coding RNA 1803 ncRNA 207.333-237 chr6 40935568 40935853 + 1 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) intron (NR_110873, intron 1 of 5) 87570 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 150.333-411 chr8 107249530 107249683 + 1 NA 3' UTR (NM_001146, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001146, exon 9 of 9) 86909 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 191.333-127 chr22 41859216 41859484 + 1 NA intron (NR_103834, intron 1 of 21) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -24685 NR_157279 112637020 NR_157279 SREBF2-AS1 821D11.7|RP5 SREBF2 antisense RNA 1 ncRNA 148.333-89 chr12 28143621 28143825 + 1 NA Intergenic Intergenic -46733 NM_001352084 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 270.667 chr1 44687311 44687850 + 1 NA intron (NM_001145636, intron 1 of 11) intron (NM_001145636, intron 1 of 11) 12866 NM_001145636 339541 Hs.173679 NM_001004307 ENSG00000198520 ARMH1 C1orf228|NCRNA00082|p40 armadillo like helical domain containing 1 protein-coding 152.333-211 chr20 57725494 57725664 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14043 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 250.667-13 chr12 14689811 14690217 + 1 NA intron (NM_004963, intron 1 of 26) LTR84b|LTR|ERVL 6585 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 165.667-204 chr8 125846116 125846286 + 1 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 104996 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 179.667-116 chr5 172524054 172524322 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 34826 NR_146726 105377728 Hs.131465 NR_146726 LINC01944 CTB-54I1.1 long intergenic non-protein coding RNA 1944 ncRNA 203.333-125 chr2 29174214 29174513 + 1 NA intron (NM_001287528, intron 14 of 14) intron (NM_001287528, intron 14 of 14) 49537 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 163.667-105 chr2 49100969 49101148 + 1 NA intron (NM_000145, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 41455 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 155.667-2 chr1 10292698 10292895 + 1 NA intron (NM_001365953, intron 15 of 20) intron (NM_001365953, intron 15 of 20) -6170 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 151.333-445 chr9 105028272 105028509 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -100235 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 139.667-88 chr2 102442115 102442288 + 1 NA intron (NM_003853, intron 7 of 11) intron (NM_003853, intron 7 of 11) 9912 NR_039930 100616157 NR_039930 ENSG00000264764 MIR4772 mir-4772 microRNA 4772 ncRNA 155.333-422 chrX 122757581 122757742 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -426582 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 151.333-87 chr11 102534956 102535176 + 1 NA Intergenic Intergenic -4319 NM_002423 4316 Hs.2256 NM_002423 ENSG00000137673 MMP7 MMP-7|MPSL1|PUMP-1 matrix metallopeptidase 7 protein-coding 159.667-105 chr15 33501614 33501854 + 1 NA intron (NM_001243996, intron 2 of 102) intron (NM_001243996, intron 2 of 102) 190767 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 183.667-126 chr6 56544769 56545030 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 53 of 94) intron (NM_001144770, intron 53 of 94) 97990 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 149.333-426 chr9 31813446 31813653 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -432059 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 265.667-2 chr1 161324858 161325195 + 1 NA intron (NM_001278172, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 10645 NR_103459 6391 Hs.444472 NM_003001 ENSG00000143252 SDHC CYB560|CYBL|PGL3|QPS1|SDH3 succinate dehydrogenase complex subunit C protein-coding 148.667-61 chr11 4914677 4914943 + 1 NA TTS (NM_001005238) TTS (NM_001005238) 853 NM_001005238 81282 Hs.542302 NM_001005238 ENSG00000176893 OR51G2 OR11-28 olfactory receptor family 51 subfamily G member 2 protein-coding 204.667-98 chr3 96087768 96087999 + 1 NA Intergenic Intergenic -272081 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 154.667-279 chr4 96246135 96246359 + 1 NA Intergenic Intergenic -64456 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 138.333-96 chr2 154655591 154655759 + 1 NA Intergenic Intergenic -42906 NM_001260508 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 205.667-100 chr3 127186730 127187123 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -6205 NM_001007534 285311 Hs.591284 NM_001007534 ENSG00000214324 C3orf56 - chromosome 3 open reading frame 56 protein-coding 235.333-2 chr1 54181062 54181413 + 1 NA intron (NM_001353354, intron 5 of 6) L2c|LINE|L2 18793 NR_148414 606495 Hs.591426 NM_001031672 ENSG00000215883 CYB5RL - cytochrome b5 reductase like protein-coding 277.333-16 chr11 68193348 68193753 + 1 NA intron (NR_161380, intron 1 of 10) intron (NR_161380, intron 1 of 10) 19746 NM_001369433 51111 Hs.632120 NM_016028 ENSG00000110066 KMT5B CGI-85|CGI85|MRD51|SUV420H1 lysine methyltransferase 5B protein-coding 151.667-49 chr10 68108029 68108251 + 1 NA intron (NR_045662, intron 2 of 19) intron (NR_045662, intron 2 of 19) -1293 NM_032578 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 130.667-12 chr1 153262920 153263222 + 1 NA TTS (NM_000427) TTS (NM_000427) 3384 NM_000427 4014 Hs.251680 NM_000427 ENSG00000203782 LOR - loricrin protein-coding 164.667-152 chr4 11439326 11439612 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -10575 NM_005114 9957 Hs.507348 NM_005114 ENSG00000002587 HS3ST1 3OST|3OST1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 1 protein-coding 230.667-85 chr8 51634765 51635196 + 1 NA intron (NM_144651, intron 2 of 22) L1PA16|LINE|L1 174465 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 140.333-146 chr3 123903578 123903736 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -19325 NM_053027 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 154.667-280 chr4 102402169 102402376 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -56790 NM_001135146 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 191.667-82 chr3 137623 137839 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -58865 NM_001253387 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 155.333-20 chr1 247888048 247888209 + 1 NA Intergenic Intergenic -7459 NM_001001957 343171 Hs.269151 NM_001001957 ENSG00000238243 OR2W3 OR2W3P|OR2W8P|OST718 olfactory receptor family 2 subfamily W member 3 protein-coding 213.333-133 chr3 100319116 100319405 + 1 NA intron (NM_001199198, intron 17 of 18) intron (NM_001199198, intron 17 of 18) -15497 NM_020202 56954 Hs.439152 NM_020202 ENSG00000114021 NIT2 HEL-S-8a nitrilase family member 2 protein-coding 244.333-96 chr7 130981933 130982484 + 1 NA intron (NR_109851, intron 4 of 5) intron (NR_109851, intron 4 of 5) 68744 NR_109780 100506860 Hs.635013 NR_109780 LINC00513 - long intergenic non-protein coding RNA 513 ncRNA 149.667-283 chr4 57662438 57662677 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 236685 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 160.667-99 chr15 25665785 25666069 + 1 NA Intergenic Intergenic 182898 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 340.333-14 chr4 83517446 83517934 + 1 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -18224 NM_001256422 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 170.333-235 chrX 85173256 85173462 + 1 NA intron (NM_001367858, intron 2 of 11) intron (NM_001367858, intron 2 of 11) -37347 NR_110651 101928128 Hs.636014 NR_110651 LOC101928128 - uncharacterized LOC101928128 ncRNA 186.333-164 chr8 92509118 92509357 + 1 NA Intergenic Intergenic 146257 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 142.333-9 chr1 112943868 112944134 + 1 NA intron (NM_003051, intron 1 of 4).2 L2a|LINE|L2 12062 NM_001166496 6566 Hs.75231 NM_003051 ENSG00000155380 SLC16A1 HHF7|MCT|MCT1|MCT1D solute carrier family 16 member 1 protein-coding 154.667-374 chr7 134701492 134701654 + 1 NA Intergenic Intergenic 54720 NM_001724 669 Hs.198365 NM_001724 ENSG00000172331 BPGM DPGM|ECYT8 bisphosphoglycerate mutase protein-coding 163.667-180 chr4 81840963 81841213 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -369181 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 153.333-294 chr4 40224171 40224448 + 1 NA intron (NM_001278360, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 27278 NM_004310 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 343.333-34 chr8 31090376 31090779 + 1 NA intron (NM_000553, intron 14 of 34) intron (NM_000553, intron 14 of 34) -57221 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 158.667-92 chr14 27590652 27590908 + 1 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) L1MEc|LINE|L1 -21808 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 135.333-48 chr13 108996267 108996438 + 1 NA intron (NM_015011, intron 21 of 34) L1MC5|LINE|L1 170951 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 167.667-33 chr11 13615322 13615652 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -53181 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 179.667-39 chr12 125597255 125597489 + 1 NA intron (NM_052907, intron 5 of 8) MIRc|SINE|MIR -25080 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 117.667-121 chr3 104917044 104917217 + 1 NA Intergenic Intergenic -449583 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 182.333-97 chr20 49834703 49834922 + 1 NA intron (NR_048539, intron 3 of 13) intron (NR_048539, intron 3 of 13) 21984 NR_048539 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 127.333-105 chr3 29292983 29293225 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 11792 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 152.333-281 chr4 115701271 115701441 + 1 NA Intergenic Intergenic -587736 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 152.333-177 chr2 53383869 53384109 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -383794 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 188.333-108 chr4 60378139 60378551 + 1 NA Intergenic Intergenic -544274 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 180.667-158 chrX 66241781 66242062 + 1 NA intron (NM_001367241, intron 15 of 18) L1PA15|LINE|L1 74171 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 312.667-4 chr1 168906387 168906774 + 1 NA intron (NR_104091, intron 4 of 4) intron (NR_104091, intron 4 of 4) 119639 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 179.667-15 chr1 246599959 246600199 + 1 NA intron (NM_152609, intron 2 of 10) L2b|LINE|L2 33623 NM_152609 163882 Hs.368353 NM_152609 ENSG00000162852 CNST C1orf71|PPP1R64 consortin, connexin sorting protein protein-coding 113.667-237 chrX 155003052 155003190 + 1 NA intron (NM_000132, intron 1 of 25) L1MCa|LINE|L1 19602 NM_000132 2157 Hs.632836 NM_000132 ENSG00000185010 F8 AHF|DXS1253E|F8B|F8C|FVIII|HEMA coagulation factor VIII protein-coding 248.667-85 chr5 34733914 34734442 + 1 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) LTR78B|LTR|ERV1 46619 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 152.667-84 chr12 59287871 59288106 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -308041 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 160.667-114 chr16 71859752 71859953 + 1 NA 3' UTR (NM_001318239, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001318239, exon 7 of 7) 13876 NM_001137675 342371 Hs.743239 NM_001137675 ENSG00000224470 ATXN1L BOAT|BOAT1 ataxin 1 like protein-coding 204.333-25 chr10 51191640 51191847 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) MIRb|SINE|MIR -107830 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 134.333-37 chr12 49839248 49839411 + 1 NA non-coding (NR_027499, exon 3 of 3) non-coding (NR_027499, exon 3 of 3) 3777 NM_181708 144233 Hs.142736 NM_181708 ENSG00000186666 BCDIN3D - BCDIN3 domain containing RNA methyltransferase protein-coding 217.667-90 chr8 123822411 123822770 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -29397 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 146.333-176 chr20 20072574 20072745 + 1 NA intron (NM_015585, intron 3 of 26) intron (NM_015585, intron 3 of 26) 16013 NM_001167816 26074 Hs.729168 NM_015585 ENSG00000089101 CFAP61 C20orf26|CaM-IP3|dJ1002M8.3|dJ1178H5.4 cilia and flagella associated protein 61 protein-coding 165.333-15 chr1 170971597 170971914 + 1 NA exon (NM_025063, exon 8 of 15) exon (NM_025063, exon 8 of 15) 36221 NM_025063 80133 Hs.591489 NM_025063 ENSG00000117501 MROH9 ARMC11|C1orf129 maestro heat like repeat family member 9 protein-coding 127.333-177 chr7 90096326 90096472 + 1 NA intron (NR_110029, intron 2 of 2) intron (NR_110029, intron 2 of 2) -23001 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 135.333-206 chr9 99855223 99855367 + 1 NA intron (NM_006981, intron 7 of 7) L2c|LINE|L2 33410 NM_006981 8013 Hs.279522 NM_006981 ENSG00000119508 NR4A3 CHN|CSMF|MINOR|NOR1|TEC nuclear receptor subfamily 4 group A member 3 protein-coding 287.667-22 chr2 104448241 104448637 + 1 NA intron (NR_015399, intron 1 of 3) intron (NR_015399, intron 1 of 3) 14092 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 160.333-122 chr16 73783775 73784025 + 1 NA Intergenic Intergenic 397095 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 152.667-331 chr6 144838480 144838643 + 1 NA intron (NM_007124, intron 70 of 73) MIR|SINE|MIR 432906 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 281.667-4 chr1 104166835 104167268 + 1 NA Intergenic Intergenic 94028 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 192.333-47 chr14 33974097 33974402 + 1 NA Intergenic Intergenic -23175 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 149.333-185 chr2 84853781 84854045 + 1 NA intron (NM_001307978, intron 2 of 4) AluSx4|SINE|Alu 27171 NM_001307978 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 192.333-34 chr11 115847403 115847739 + 1 NA Intergenic Intergenic -87371 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 240.667-3 chr1 163419201 163419738 + 1 NA Intergenic Intergenic 3722 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 158.667-40 chr10 54179755 54179931 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 14 of 34) intron (NM_001354411, intron 14 of 34) -306387 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 151.667-27 chr1 185750653 185750953 + 1 NA intron (NM_031935, intron 1 of 106) L1MEd|LINE|L1 16412 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 240.333-76 chr5 89359178 89359460 + 1 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) L1MEf|LINE|L1 -455214 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 154.333-103 chr15 62793449 62793674 + 1 NA intron (NM_015059, intron 43 of 55) MIR|SINE|MIR -30396 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 182.667-58 chr16 83875285 83875567 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -23689 NM_012213 23417 Hs.644610 NM_012213 ENSG00000103150 MLYCD MCD malonyl-CoA decarboxylase protein-coding 149.667-185 chr2 16965408 16965597 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -299668 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 254.333-83 chr7 126988717 126989024 + 1 NA intron (NM_001371085, intron 3 of 10) intron (NM_001371085, intron 3 of 10) 69314 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 151.333-194 chr2 21567696 21567879 + 1 NA Intergenic Intergenic 142865 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 118.667-81 chr16 76170623 76170767 + 1 NA Intergenic Intergenic -106706 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 204.667-17 chr10 96706033 96706352 + 1 NA intron (NM_152309, intron 2 of 16) AluYf1|SINE|Alu 14322 NM_152309 118788 Hs.310456 NM_152309 ENSG00000155629 PIK3AP1 BCAP phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 protein-coding 165.333-213 chr5 136710796 136711029 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -345436 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 194.667-4 chr1 41785163 41785561 + 1 NA intron (NM_024503, intron 1 of 8) intron (NM_024503, intron 1 of 8) 133560 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 209.667-23 chr10 83208890 83209216 + 1 NA Intergenic Intergenic 468036 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 234.667-7 chr1 247942100 247942583 + 1 NA intron (NM_001304535, intron 1 of 1) LTR26|LTR|ERV1 5312 NM_175911 284521 Hs.372936 NM_175911 ENSG00000196071 OR2L13 OR2L14 olfactory receptor family 2 subfamily L member 13 protein-coding 155.333-225 chr3 38052219 38052447 + 1 NA intron (NM_007335, intron 2 of 36) intron (NM_007335, intron 2 of 36) 13125 NM_007335 9940 Hs.714499 NM_007335 ENSG00000008226 DLEC1 CFAP81|DLC-1|DLC1|F56 DLEC1 cilia and flagella associated protein protein-coding 198.667-55 chr13 79184317 79184610 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 221758 NM_001286632 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 189.667-48 chr15 61540326 61540688 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -189411 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 181.667-50 chr17 50982228 50982638 + 1 NA intron (NM_001130527, intron 25 of 29) intron (NM_001130527, intron 25 of 29) 64445 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 349.333-29 chr7 77321556 77322137 + 1 NA intron (NM_001350901, intron 21 of 27) MIR|SINE|MIR -93352 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 122.667-37 chr12 27395092 27395361 + 1 NA intron (NR_109975, intron 1 of 3) intron (NR_109975, intron 1 of 3) 51408 NR_109975 101928646 Hs.434269 NR_109975 ENSG00000245311 ARNTL2-AS1 - ARNTL2 antisense RNA 1 ncRNA 190.333-87 chr22 26609144 26609353 + 1 NA intron (NM_001887, intron 3 of 5) intron (NM_001887, intron 3 of 5) 8779 NM_001887 1414 Hs.37135 NM_001887 ENSG00000100122 CRYBB1 CATCN3|CTRCT17 crystallin beta B1 protein-coding 119.333-198 chr7 22694472 22694638 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -29022 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 230.333-6 chr1 118862006 118862368 + 1 NA Intergenic Intergenic 126156 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 164.667-18 chr10 17153189 17153433 + 1 NA intron (NM_001351223, intron 11 of 11) intron (NM_001351223, intron 11 of 11) -23494 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 200.667-111 chr3 102742330 102742695 + 1 NA Intergenic Intergenic 307497 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 138.667-165 chr5 66687149 66687398 + 1 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) L1PA17|LINE|L1 90880 NM_001164664 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 144.667-142 chr2 83639303 83639454 + 1 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 116564 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 151.333-113 chr13 64944909 64945166 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -869026 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 193.667-142 chr9 103179122 103179398 + 1 NA intron (NR_121578, intron 8 of 9) L1PA13|LINE|L1 145773 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 358.333-30 chr8 89162342 89162804 + 1 NA Intergenic Intergenic 595138 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 175.667-131 chr7 669901 670178 + 1 NA intron (NM_001164760, intron 4 of 10) AluYj4|SINE|Alu 42485 NM_002735 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 274.667-27 chr2 72294579 72294988 + 1 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -146921 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 314.333-12 chr17 81721087 81721630 + 1 NA TTS (NM_001270953) TTS (NM_001270953) 9074 NM_012140 1468 Hs.548187 NM_012140 ENSG00000183048 SLC25A10 DIC solute carrier family 25 member 10 protein-coding 168.333-123 chr22 24803256 24803519 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2824 NM_001039948 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 215.667-72 chr20 18398294 18398674 + 1 NA non-coding (NR_160273, exon 14 of 14) non-coding (NR_160273, exon 14 of 14) 19435 NR_034167 440757 Hs.120399 NM_001004344 ENSG00000237282 LINC00851 DZANK1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 851 ncRNA 125.333-55 chr14 47278871 47279036 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) L1ME4b|LINE|L1 64293 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 188.333-88 chr21 19232864 19233134 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -473187 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 164.667-218 chr7 26675674 26675928 + 1 NA intron (NM_003930, intron 11 of 12) intron (NM_003930, intron 11 of 12) 37930 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 131.667-207 chr8 136412095 136412318 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -118592 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 207.667-53 chr2 57987591 57987969 + 1 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) L1ME1|LINE|L1 -58862 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 198.667-119 chr20 34591048 34591478 + 1 NA intron (NM_080476, intron 7 of 11) L1MC4a|LINE|L1 32545 NM_032514 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 211.333-194 chr5 127302349 127302595 + 1 NA intron (NM_001308119, intron 2 of 14) L1MB5|LINE|L1 11676 NM_001256545 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 163.667-173 chr4 35000562 35000760 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -730914 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 191.333-218 chr9 113402424 113402736 + 1 NA Intergenic Intergenic -1242 NM_001003945 210 Hs.1227 NM_000031 ENSG00000148218 ALAD ALADH|PBGS aminolevulinate dehydratase protein-coding 160.667-122 chr17 51093092 51093383 + 1 NA intron (NM_001130527, intron 1 of 29) intron (NM_001130527, intron 1 of 29) 27631 NM_001130528 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 211.333-16 chr1 191652024 191652340 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -423684 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 280.667-35 chr4 165905465 165906009 + 1 NA intron (NM_001204760, intron 1 of 9) intron (NM_001204760, intron 1 of 9) 32500 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 147.333-160 chr2 12207633 12207894 + 1 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 8633 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 126.333-123 chr3 173358402 173358612 + 1 NA Intergenic Intergenic -37445 NM_001365930 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 241.667-92 chr8 128535811 128536223 + 1 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) LTR16A2|LTR|ERVL 28662 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 207.667-20 chr11 114949368 114949672 + 1 NA Intergenic Intergenic 270993 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 276.333-58 chr6 139192163 139192576 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 57289 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 170.667-133 chr5 66269372 66269573 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -60026 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 201.667-40 chr15 72514170 72514571 + 1 NA intron (NM_005744, intron 1 of 13) L1MD3|LINE|L1 40040 NM_005744 25820 Hs.268787 NM_005744 ENSG00000166233 ARIH1 ARI|HARI|HHARI|UBCH7BP ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 230.333-103 chr6 45548196 45548630 + 1 NA 3' UTR (NM_001024630, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001024630, exon 9 of 9) 126138 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 156.333-85 chr12 98725559 98725796 + 1 NA intron (NM_001160, intron 24 of 25) intron (NM_001160, intron 24 of 25) 80377 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 363.667-19 chr8 138721955 138722603 + 1 NA intron (NM_152888, intron 25 of 64) intron (NM_152888, intron 25 of 64) 191762 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 145.333-67 chr12 65842045 65842205 + 1 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -15151 NR_026825 204010 Hs.558686 NR_026825 ENSG00000241749 RPSAP52 RPSA_17_1251 ribosomal protein SA pseudogene 52 pseudo 112.333-90 chr17 39517211 39517370 + 1 NA intron (NM_015083, intron 9 of 13) intron (NM_015083, intron 9 of 13) 55804 NM_016507 51755 Hs.345028 NM_015083 ENSG00000167258 CDK12 CRK7|CRKR|CRKRS cyclin dependent kinase 12 protein-coding 181.667-110 chr4 77844664 77844854 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18071 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 177.667-142 chr9 27965474 27965718 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) intron (NM_001354574, intron 5 of 5) -391730 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 140.667-87 chr15 70870051 70870192 + 1 NA intron (NM_001284357, intron 1 of 16) intron (NM_001284357, intron 1 of 16) -15964 NM_197958 55323 Hs.416755 NM_018357 ENSG00000166173 LARP6 ACHN La ribonucleoprotein domain family member 6 protein-coding 251.333-93 chr6 22679330 22679663 + 1 NA intron (NR_134614, intron 1 of 2) intron (NR_134614, intron 1 of 2) 38428 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 178.667-57 chr16 46825786 46826131 + 1 NA intron (NM_001001436, intron 1 of 3) L1MA2|LINE|L1 5090 NR_145837 388272 Hs.406551 NM_001001436 ENSG00000155330 C16orf87 - chromosome 16 open reading frame 87 protein-coding 239.333-50 chr2 22803451 22803801 + 1 NA Intergenic Intergenic 267147 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 182.667-25 chr11 43986592 43986870 + 1 NA Intergenic Intergenic 44094 NM_001145033 387763 Hs.530443 NM_001145033 ENSG00000187479 C11orf96 AG2 chromosome 11 open reading frame 96 protein-coding 166.667-185 chr5 101608937 101609139 + 1 NA Intergenic ERVL47-int|LTR|ERVL 687246 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 149.333-26 chr1 178877133 178877412 + 1 NA intron (NM_152663, intron 8 of 19) intron (NM_152663, intron 8 of 19) -6195 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 234.667-13 chr10 100204296 100204600 + 1 NA intron (NM_001278, intron 13 of 20) intron (NM_001278, intron 13 of 20) -18419 NR_144759 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 190.667-94 chr4 171021946 171022145 + 1 NA Intergenic Intergenic -18557 NR_038838 100506122 Hs.434205 NR_038838 ENSG00000248872 LINC02431 - long intergenic non-protein coding RNA 2431 ncRNA 325.667-21 chr6 9246626 9247112 + 1 NA Intergenic Intergenic 594660 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 221.333-132 chr7 46099254 46099625 + 1 NA Intergenic Intergenic -178167 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 117.667-74 chr18 2523136 2523351 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 48262 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 226.667-53 chr2 148038461 148038804 + 1 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -17028 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 196.667-37 chr12 38566307 38566694 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 249726 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 158.333-253 chr5 39634126 39634339 + 1 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 113801 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 224.333-89 chr4 78905068 78905444 + 1 NA intron (NM_198892, intron 15 of 15) intron (NM_198892, intron 15 of 15) 34182 NM_001350106 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 198.667-179 chr8 56525379 56525727 + 1 NA intron (NR_038236, intron 1 of 2) MER4CL34|LTR|ERV1 34270 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 134.333-17 chr10 47235063 47235300 + 1 NA Intergenic Intergenic -65016 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 331.667-15 chr3 183675186 183675585 + 1 NA intron (NM_001349426, intron 6 of 6) intron (NM_001349426, intron 6 of 6) -22412 NM_001351371 55689 Hs.632575 NM_018023 ENSG00000163872 YEATS2 - YEATS domain containing 2 protein-coding 281.667-41 chr6 35633668 35634071 + 1 NA intron (NM_001145775, intron 4 of 11) MIRc|SINE|MIR 30920 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 151.667-17 chr1 116847137 116847381 + 1 NA Intergenic Intergenic -62657 NM_020440 5738 Hs.418093 NM_020440 ENSG00000134247 PTGFRN CD315|CD9P-1|EWI-F|FPRP|SMAP-6 prostaglandin F2 receptor inhibitor protein-coding 141.667-142 chr3 41606200 41606474 + 1 NA intron (NR_136342, intron 29 of 34) L1MA5|LINE|L1 355766 NM_001322501 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 173.333-131 chr3 115472232 115472438 + 1 NA Intergenic Intergenic -151175 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 207.333-70 chr12 119708815 119709165 + 1 NA intron (NM_007174, intron 38 of 46) L1MC4|LINE|L1 4734 NR_031589 100302274 NR_031589 ENSG00000283768 MIR1178 MIRN1178|hsa-mir-1178 microRNA 1178 ncRNA 149.667-93 chr12 58152351 58152622 + 1 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL 64594 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 177.667-38 chr12 38148549 38148888 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -168056 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 123.667-51 chr14 31739502 31739662 + 1 NA intron (NM_001201574, intron 1 of 5) L1MC1|LINE|L1 25013 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 148.333-22 chr1 114613714 114613910 + 1 NA intron (NM_001256404, intron 8 of 20) intron (NM_001256404, intron 8 of 20) -32197 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 207.333-155 chr2 221870244 221870525 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -296182 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 170.333-126 chr20 34250097 34250409 + 1 NA Intergenic Intergenic -10112 NM_001672 434 Hs.659995 NM_001672 ENSG00000101440 ASIP AGSW|AGTI|AGTIL|ASP|SHEP9 agouti signaling protein protein-coding 201.667-2 chr1 104081440 104081740 + 1 NA Intergenic Intergenic 8567 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 262.667-53 chr3 5212248 5212722 + 1 NA intron (NM_014674, intron 10 of 11) intron (NM_014674, intron 10 of 11) 24778 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 141.667-214 chr7 106781433 106781688 + 1 NA Intergenic Intergenic -83722 NM_001282426 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 165.333-35 chr10 113500315 113500548 + 1 NA Intergenic Intergenic -50400 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 165.333-214 chr5 145190235 145190435 + 1 NA Intergenic Intergenic 645007 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 151.667-67 chr11 80928681 80928971 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -166023 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 155.667-119 chr15 87335541 87335698 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -241310 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 125.667-152 chr5 93905974 93906125 + 1 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) intron (NR_028080, intron 4 of 8) -164449 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 151.333-131 chr14 66793577 66793750 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) L1M4b|LINE|L1 286256 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 144.333-159 chr3 1677000 1677288 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -421659 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 130.667-25 chr10 49022924 49023084 + 1 NA intron (NM_001031746, intron 7 of 7) intron (NM_001031746, intron 7 of 7) -37417 NR_036182 100422895 NR_036182 ENSG00000264800 MIR4294 - microRNA 4294 ncRNA 452.667-6 chr3 77483852 77484435 + 1 NA intron (NM_001290039, intron 4 of 26) intron (NM_001290039, intron 4 of 26) 386131 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 177.333-106 chr3 79350512 79350880 + 1 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) L1MB8|LINE|L1 -61031 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 223.333-128 chr5 53653751 53654106 + 1 NA intron (NM_001318051, intron 3 of 3) L1MEb|LINE|L1 93289 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 203.333-158 chr21 27190639 27191029 + 1 NA Intergenic Intergenic -223746 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 209.333-34 chr11 44102047 44102446 + 1 NA intron (NM_000401, intron 1 of 13) ERVL-E-int|LTR|ERVL 6049 NM_000401 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 331.333-14 chr12 51677987 51678428 + 1 NA intron (NM_001369788, intron 2 of 25) intron (NM_001369788, intron 2 of 25) 86971 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 183.667-85 chr20 37586545 37586821 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 36436 NR_047461 100861522 Hs.580680 NR_047461 ENSG00000225759 LINC00489 - long intergenic non-protein coding RNA 489 ncRNA 161.667-227 chr6 118482878 118483063 + 1 NA intron (NM_001042475, intron 7 of 12) MER20|DNA|hAT-Charlie -18403 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 225.667-12 chr10 104441841 104442117 + 1 NA intron (NM_001008723, intron 15 of 17) intron (NM_001008723, intron 15 of 17) 38296 NR_120624 101927523 Hs.407539 NR_120624 ENSG00000225768 LINC02620 - long intergenic non-protein coding RNA 2620 ncRNA 152.667-235 chr3 9971962 9972183 + 1 NA intron (NM_018447, intron 6 of 8) intron (NM_018447, intron 6 of 8) -14821 NR_103821 442075 Hs.690469 NM_001013730 EMC3-AS1 - EMC3 antisense RNA 1 ncRNA 147.333-127 chr15 94289660 94289869 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -8437 NM_001159643 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 151.333-353 chr5 149222815 149223122 + 1 NA intron (NM_001370418, intron 7 of 18) intron (NM_001370418, intron 7 of 18) -48870 NM_001323063 134265 Hs.62930 NM_152406 ENSG00000157510 AFAP1L1 - actin filament associated protein 1 like 1 protein-coding 196.667-150 chr7 148055901 148056253 + 1 NA intron (NM_014141, intron 14 of 22) intron (NM_014141, intron 14 of 22) 384398 NR_133930 105375556 Hs.667432 NR_133929 ENSG00000230190 LOC105375556 - uncharacterized LOC105375556 ncRNA 165.333-97 chr17 9533468 9533801 + 1 NA intron (NR_033656, intron 2 of 5) intron (NR_033656, intron 2 of 5) 42186 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 198.333-192 chr8 61876799 61877188 + 1 NA Intergenic Intergenic -12846 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 169.667-59 chr14 51660677 51660858 + 1 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 8857 NM_152330 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 148.667-48 chr10 60975189 60975458 + 1 NA intron (NM_001350906, intron 2 of 12) MamRep605|LTR?|LTR? 25674 NM_001350908 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 116.667-64 chr15 63385363 63385551 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -3347 NM_206925 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 182.667-53 chr15 70664854 70665171 + 1 NA intron (NM_018003, intron 16 of 18) intron (NM_018003, intron 16 of 18) 29763 NR_126482 104548973 NR_126482 ENSG00000280515 SALRNA2 SAL-RNA2|XLOC_025931 senescence associated long non-coding RNA 2 ncRNA 146.667-251 chr5 18614105 18614272 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 806914 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 122.333-99 chr2 103828857 103829089 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 579359 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 129.333-198 chr9 30702651 30702837 + 1 NA Intergenic Intergenic -294290 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 198.333-124 chr3 48928402 48928672 + 1 NA 3' UTR (NM_001349228, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001349228, exon 4 of 4) -9152 NR_161301 646450 Hs.720727 NM_001123040 ENSG00000221883 ARIH2OS C3orf71 ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 2 opposite strand ncRNA 135.667-36 chr12 51315608 51315760 + 1 NA intron (NM_001290007, intron 1 of 12) intron (NM_001290007, intron 1 of 12) 8490 NM_016293 51411 Hs.14770 NM_016293 ENSG00000110934 BIN2 BRAP-1 bridging integrator 2 protein-coding 113.667-60 chr14 54240379 54240582 + 1 NA Intergenic Intergenic -156388 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 190.667-77 chr21 30810131 30810361 + 1 NA Intergenic Intergenic 3028 NM_175857 337879 Hs.407655 NM_175857 ENSG00000183640 KRTAP8-1 KAP8.1 keratin associated protein 8-1 protein-coding 285.333-18 chr13 76741893 76742333 + 1 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 144292 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 427.333-2 chr19 28061758 28062547 + 1 NA Intergenic Intergenic -268212 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 125.333-136 chr5 43294568 43294705 + 1 NA intron (NM_001324222, intron 6 of 9) intron (NM_001324222, intron 6 of 9) 18545 NM_001330663 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 243.333-76 chr3 117834569 117835027 + 1 NA Intergenic Intergenic -143873 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 253.333-41 chr16 82076187 82076560 + 1 NA intron (NM_002153, intron 3 of 4) L1MA3|LINE|L1 41120 NM_002153 3294 Hs.162795 NM_002153 ENSG00000086696 HSD17B2 EDH17B2|HSD17|SDR9C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 2 protein-coding 112.667-205 chr5 13953175 13953320 + 1 NA Intergenic Intergenic -8767 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 158.667-106 chr15 61352992 61353258 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -123823 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 212.667-117 chr5 173571060 173571336 + 1 NA Intergenic Intergenic -8436 NR_027108 285593 Hs.409730 NR_027108 ENSG00000253955 LOC285593 - uncharacterized LOC285593 ncRNA 188.333-130 chr6 65296842 65297112 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 11 of 43) intron (NM_001292009, intron 11 of 43) -4441 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 154.667-351 chr6 159995428 159995625 + 1 NA intron (NM_000876, intron 2 of 47) intron (NM_000876, intron 2 of 47) 12138 NR_047511 100271873 Hs.742166 NR_047511 ENSG00000268257 AIRN AIR|IGF2R-AS|IGF2R-AS1|IGF2RAS|NCRNA00088 antisense of IGF2R non-protein coding RNA ncRNA 180.333-49 chr18 39076914 39077219 + 1 NA Intergenic Intergenic 545109 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 146.667-320 chr7 113040948 113041223 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 45253 NM_001146266 54329 Hs.152009 NM_018970 ENSG00000164604 GPR85 SREB|SREB2 G protein-coupled receptor 85 protein-coding 159.333-156 chr2 65443365 65443544 + 1 NA Intergenic Intergenic -10855 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 157.333-64 chr11 39899664 39899837 + 1 NA Intergenic Intergenic 393380 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 147.667-77 chr12 75297592 75297789 + 1 NA intron (NR_149161, intron 6 of 11) L2b|LINE|L2 32634 NM_001286547 84698 Hs.733835 NM_032606 ENSG00000180881 CAPS2 UG0636c06 calcyphosine 2 protein-coding 163.667-19 chr10 22698800 22699080 + 1 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 15168 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 158.667-66 chr11 96198013 96198181 + 1 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 -143341 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 115.667-49 chr11 122120650 122120805 + 1 NA intron (NR_137184, intron 1 of 1) L1ME1|LINE|L1 -4512 NM_001001786 414899 Hs.686109 NM_001001786 ENSG00000259571 BLID BRCC2 BH3-like motif containing, cell death inducer protein-coding 125.667-73 chr16 12632000 12632163 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -88240 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 178.333-125 chr4 95491456 95491694 + 1 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 57398 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 143.667-113 chr18 10878312 10878493 + 1 NA intron (NM_022068, intron 4 of 51) intron (NM_022068, intron 4 of 51) -118753 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 198.667-72 chr15 70748315 70748538 + 1 NA intron (NM_018003, intron 1 of 18) intron (NM_018003, intron 1 of 18) 15132 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 225.333-36 chr12 117036916 117037170 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -49706 NR_103809 100506551 Hs.657861 NR_103809 ENSG00000257279 LOC100506551 - uncharacterized LOC100506551 ncRNA 242.667-33 chr14 77150557 77150844 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8909 NM_174976 283576 Hs.525485 NM_174976 ENSG00000177108 ZDHHC22 C14orf59 zinc finger DHHC-type containing 22 protein-coding 197.333-208 chr7 25319175 25319588 + 1 NA Intergenic Intergenic -90895 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 158.333-291 chr7 26356739 26357009 + 1 NA intron (NM_001362753, intron 3 of 8) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -4010 NM_001199837 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 400.667-7 chr5 39071247 39071996 + 1 NA intron (NM_001285439, intron 2 of 38) MIRb|SINE|MIR 2778 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 215.667-86 chr3 111566212 111566600 + 1 NA intron (NM_001318889, intron 2 of 7) intron (NM_001318889, intron 2 of 7) 24209 NM_005816 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 140.333-37 chr11 32881406 32881580 + 1 NA Intergenic Intergenic -11318 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 151.333-351 chr5 144561561 144561758 + 1 NA Intergenic L1HS|LINE|L1 356268 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 402.333-17 chr9 130722748 130723287 + 1 NA intron (NM_007313, intron 1 of 10) intron (NM_007313, intron 1 of 10) 9136 NM_007313 25 Hs.431048 NM_005157 ENSG00000097007 ABL1 ABL|CHDSKM|JTK7|bcr/abl|c-ABL|c-ABL1|p150|v-abl ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 314.333-29 chr8 105410498 105411203 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 91307 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 230.667-40 chr2 104011912 104012172 + 1 NA Intergenic (TCCTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 396290 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 160.667-97 chr14 89690269 89690541 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -71240 NM_001085471 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 153.333-229 chr2 224350070 224350350 + 1 NA Intergenic Intergenic 51784 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 135.667-166 chr7 1121072 1121230 + 1 NA intron (NM_001350970, intron 2 of 2) intron (NM_001350970, intron 2 of 2) 17096 NM_001318252 84310 Hs.653258 NM_032350 ENSG00000146540 C7orf50 YCR016W chromosome 7 open reading frame 50 protein-coding 174.333-123 chr5 137018904 137019136 + 1 NA intron (NM_004598, intron 6 of 10) L1M5|LINE|L1 -109177 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 265.333-50 chr22 41025367 41025683 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 48196 NR_132979 106635682 NR_132979 SNORD140 - small nucleolar RNA, C/D box 140 snoRNA 116.667-161 chr5 73670587 73670742 + 1 NA intron (NM_001177693, intron 1 of 35) L1MD2|LINE|L1 44506 NM_001080479 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 186.667-127 chr6 87178824 87179087 + 1 NA intron (NM_015021, intron 1 of 7) intron (NM_015021, intron 1 of 7) 23390 NM_015021 23036 Hs.444800 NM_015021 ENSG00000188994 ZNF292 Nbla00365|ZFP292|ZN-16|Zn-15|bA393I2.3 zinc finger protein 292 protein-coding 207.333-24 chr1 241996961 241997302 + 1 NA intron (NM_001004343, intron 3 of 3) AluSx|SINE|Alu 1967 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 178.667-18 chr10 29922936 29923293 + 1 NA Intergenic Intergenic 136472 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 157.333-282 chr5 69083248 69083486 + 1 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -10647 NM_024055 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 303.333-19 chr13 35280878 35281409 + 1 NA intron (NM_015678, intron 34 of 57) intron (NM_015678, intron 34 of 57) 195546 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 152.333-307 chr5 101090355 101090606 + 1 NA Intergenic Intergenic -187198 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 146.667-237 chr4 86536752 86536966 + 1 NA Intergenic Intergenic 5693 NR_039657 100616463 NR_039657 ENSG00000266515 MIR4452 - microRNA 4452 ncRNA 170.667-7 chr1 81855346 81855582 + 1 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 53011 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 169.333-169 chr3 117198989 117199344 + 1 NA Intergenic Intergenic 277735 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 144.333 chr1 9765013 9765225 + 1 NA intron (NM_001009566, intron 2 of 18) AluSp|SINE|Alu 59407 NM_014944 22883 Hs.29665 NM_014944 ENSG00000171603 CLSTN1 ALC-ALPHA|CDHR12|CST-1|CSTN1|PIK3CD|XB31alpha|alcalpha1|alcalpha2 calsyntenin 1 protein-coding 113.333-68 chr13 100216540 100216756 + 1 NA intron (NR_148031, intron 7 of 22) intron (NR_148031, intron 7 of 22) 127555 NR_148027 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 174.333-144 chr8 42386880 42387134 + 1 NA Intergenic Intergenic -4754 NM_001135694 7419 Hs.699301 NM_005662 ENSG00000078668 VDAC3 HD-VDAC3|VDAC-3 voltage dependent anion channel 3 protein-coding 276.667-58 chr5 65539670 65540106 + 1 NA intron (NM_001349369, intron 6 of 10) intron (NM_001349369, intron 6 of 10) 23280 NM_001267038 64105 Hs.529778 NM_022145 ENSG00000123219 CENPK AF5alpha|CENP-K|FKSG14|P33|Solt centromere protein K protein-coding 177.333-50 chr14 49237679 49238008 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 348537 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 286.333-10 chr14 36057758 36058133 + 1 NA Intergenic Intergenic -12482 NR_073454 101101773 Hs.640678 NR_073454 ENSG00000257585 LINC00609 - long intergenic non-protein coding RNA 609 ncRNA 293.667-13 chr12 45614667 45614969 + 1 NA Intergenic Intergenic 113103 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 148.667-110 chr14 31589479 31589762 + 1 NA intron (NM_001201573, intron 1 of 8) intron (NM_001201573, intron 1 of 8) 11704 NM_001201573 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 148.333-298 chr4 180017455 180017621 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 1141611 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 217.333-100 chr3 150439933 150440292 + 1 NA intron (NR_130136, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 31814 NM_014779 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 189.333-59 chr15 64623149 64623521 + 1 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) intron (NM_015042, intron 2 of 8) 79946 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 192.333-180 chr9 125836810 125837096 + 1 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) L1ME4b|LINE|L1 88770 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 151.333-341 chr5 73528220 73528486 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 29928 NM_001207 689 Hs.591768 NM_001207 ENSG00000145741 BTF3 BETA-NAC|BTF3a|BTF3b|NACB basic transcription factor 3 protein-coding 147.667-400 chrX 78195841 78196106 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -56323 NM_015975 51616 Hs.592248 NM_015975 ENSG00000187325 TAF9B DN-7|DN7|TAF9L|TAFII31L|TFIID-31 TATA-box binding protein associated factor 9b protein-coding 133.333-50 chr14 43489961 43490115 + 1 NA Intergenic Intergenic 1017245 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 265.333-62 chr4 154596001 154596417 + 1 NA Intergenic Intergenic -5467 NM_021871 2243 Hs.351593 NM_000508 ENSG00000171560 FGA Fib2 fibrinogen alpha chain protein-coding 164.667-60 chr12 111222523 111222856 + 1 NA intron (NM_015267, intron 3 of 21) MIRb|SINE|MIR -81453 NR_106818 102465455 NR_106818 ENSG00000273700 MIR6760 hsa-mir-6760 microRNA 6760 ncRNA 213.667-19 chr11 3118640 3119042 + 1 NA intron (NM_020896, intron 7 of 21) AluSx1|SINE|Alu 46469 NM_020896 114879 Hs.436166 NM_020896 ENSG00000021762 OSBPL5 OBPH1|ORP5 oxysterol binding protein like 5 protein-coding 199.667-98 chr3 185903614 185903946 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 34234 NM_004593 6434 Hs.533122 NM_004593 ENSG00000136527 TRA2B Htra2-beta|PPP1R156|SFRS10|SRFS10|TRA2-BETA|TRAN2B transformer 2 beta homolog protein-coding 147.667-312 chr6 51044751 51045013 + 1 NA Intergenic Intergenic 226011 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 233.667-44 chr2 166442725 166443233 + 1 NA intron (NR_045628, intron 13 of 25) intron (NR_045628, intron 13 of 25) 43992 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 169.333-211 chr5 103026477 103026720 + 1 NA intron (NM_001364589, intron 23 of 23) intron (NM_001364589, intron 23 of 23) 93540 NM_001317954 54826 Hs.24088 NM_017676 ENSG00000145723 GIN1 GIN-1|TGIN1|ZH2C2 gypsy retrotransposon integrase 1 protein-coding 252.667-59 chr22 26425102 26425407 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -4006 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 210.667-3 chr1 74143699 74144118 + 1 NA intron (NM_001105659, intron 4 of 7) intron (NM_001105659, intron 4 of 7) 54268 NM_001105659 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 166.667-3 chr1 30991766 30992080 + 1 NA intron (NM_001020658, intron 7 of 21) intron (NM_001020658, intron 7 of 21) -23686 NR_003066 692200 NR_003066 SNORD103C HBII-251|SNORD85 small nucleolar RNA, C/D box 103C snoRNA 194.333-73 chr2 121100007 121100391 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 185003 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 131.333-182 chr8 119303333 119303493 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -21758 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 128.333-149 chr5 7785546 7785779 + 1 NA intron (NM_020546, intron 19 of 24) intron (NM_020546, intron 19 of 24) 65471 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 201.333-286 chr8 113595885 113596189 + 1 NA Intergenic Intergenic -159098 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 161.333-66 chr12 58790043 58790337 + 1 NA intron (NR_126341, intron 1 of 1) L1M3|LINE|L1 -8474 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 155.667-107 chr14 94859652 94859886 + 1 NA Intergenic Intergenic 89127 NR_144432 108868751 NR_144432 GSC-DT DIGIT GSC divergent transcript ncRNA 186.333-166 chr8 101281250 101281610 + 1 NA Intergenic Intergenic -75366 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 148.667-267 chr4 33682025 33682281 + 1 NA Intergenic Intergenic 357740 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 180.333-113 chr7 3681269 3681506 + 1 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1ME3B|LINE|L1 380135 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 169.667-52 chr13 92182280 92182511 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 169812 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 289.333-34 chr21 16240025 16240590 + 1 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) 44461 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 171.333-156 chr5 111929688 111930010 + 1 NA intron (NR_046678, intron 1 of 3) intron (NR_046678, intron 1 of 3) 17341 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 205.333-51 chr12 19291186 19291410 + 1 NA intron (NM_001256470, intron 14 of 31) intron (NM_001256470, intron 14 of 31) 85973 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 129.667-14 chr1 176053302 176053478 + 1 NA intron (NM_022457, intron 11 of 19) L2|LINE|L2 -84850 NR_002998 677679 NR_002998 ENSG00000252906 SCARNA3 HBI-100 small Cajal body-specific RNA 3 ncRNA 141.667-180 chr5 65708864 65709097 + 1 NA intron (NM_019072, intron 3 of 10) AluJb|SINE|Alu 13129 NM_019072 54557 Hs.482301 NM_019072 ENSG00000197860 SGTB SGT2 small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing beta protein-coding 149.333-207 chr2 188438688 188438944 + 1 NA intron (NM_016315, intron 2 of 11) intron (NM_016315, intron 2 of 11) 141324 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 421.333-7 chr7 113566867 113567388 + 1 NA Intergenic Intergenic 351882 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 175.667-21 chr10 118695592 118695960 + 1 NA intron (NM_153810, intron 5 of 8) intron (NM_153810, intron 5 of 8) 59194 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 306.333-7 chr10 81271644 81272000 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -603372 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 239.667-62 chr5 106518880 106519316 + 1 NA Intergenic Intergenic 491916 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 124.333-143 chr5 40804798 40805019 + 1 NA Intergenic Intergenic -6713 NM_001355034 5562 Hs.43322 NM_006251 ENSG00000132356 PRKAA1 AMPK|AMPKa1 protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 1 protein-coding 144.333-183 chr4 30394945 30395212 + 1 NA Intergenic Intergenic -325291 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 120.667-72 chr17 40739391 40739540 + 1 NA Intergenic Intergenic 15866 NM_181534 147183 Hs.55412 NM_181534 ENSG00000204897 KRT25 ARWH3|KRT24IRS1|KRT25A keratin 25 protein-coding 137.333-101 chr2 115502115 115502374 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 5 of 25) intron (NM_001321912, intron 5 of 25) 158429 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 203.333-9 chr1 115406858 115407139 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -68762 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 244.333-28 chr11 116588505 116588798 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -50771 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 275.667-61 chr8 35161801 35162097 + 1 NA Intergenic Intergenic -73526 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 144.333-207 chr5 24222393 24222537 + 1 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 271117 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 274.667-17 chr13 80411619 80412195 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -70781 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 148.333-323 chr5 111451083 111451245 + 1 NA intron (NM_001744, intron 7 of 10) MIR3|SINE|MIR -61062 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 199.333 chr1 10121403 10121766 + 1 NA intron (NM_006048, intron 8 of 26) AluJr4|SINE|Alu 88626 NM_006048 10277 Hs.593974 NM_006048 ENSG00000130939 UBE4B E4|HDNB1|UBOX3|UFD2|UFD2A ubiquitination factor E4B protein-coding 150.333-193 chr2 58208169 58208369 + 1 NA intron (NR_156742, intron 1 of 9) intron (NR_156742, intron 1 of 9) 33111 NM_018062 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 131.667-184 chr7 51579554 51579776 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -186409 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 160.333-173 chr22 26145746 26146014 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -23582 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 170.667-13 chr1 225242621 225242903 + 1 NA intron (NM_001367479, intron 43 of 85) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 185276 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 116.333-106 chr2 8035791 8035942 + 1 NA intron (NR_034135, intron 8 of 8) intron (NR_034135, intron 8 of 8) -59052 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 234.667-73 chr3 123165946 123166274 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 4316 NR_106960 102465667 NR_106960 ENSG00000284421 MIR7110 hsa-mir-7110 microRNA 7110 ncRNA 158.333-287 chr7 1061574 1061757 + 1 NA intron (NM_001134395, intron 2 of 4) intron (NM_001134395, intron 2 of 4) 6295 NM_138445 115330 Hs.585007 NM_138445 ENSG00000164849 GPR146 PGR8 G protein-coupled receptor 146 protein-coding 148.667-343 chr7 7049877 7050065 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 17074 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 167.333-202 chr4 179887197 179887450 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 1271826 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 177.667-96 chr4 56961304 56961558 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 16175 NM_032313 84273 Hs.8715 NM_032313 ENSG00000084092 NOA1 C4orf14|MTG3|hAtNOS1|hNOA1|mAtNOS1 nitric oxide associated 1 protein-coding 213.333-174 chr5 173165312 173165664 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 20957 NM_013980 662 Hs.145726 NM_001205 ENSG00000113734 BNIP1 NIP1|SEC20|TRG-8 BCL2 interacting protein 1 protein-coding 235.333-84 chr4 70337938 70338331 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 3153 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 158.333-38 chr10 71024286 71024474 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 85327 NR_134313 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 152.667-136 chr16 69697466 69697641 + 1 NA 3' UTR (NM_006599, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_006599, exon 14 of 14) 11122 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 143.667-153 chr22 40619146 40619328 + 1 NA intron (NM_020831, intron 1 of 14) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 17482 NM_020831 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 220.333-106 chr4 90497648 90497974 + 1 NA intron (NM_207491, intron 5 of 7) intron (NM_207491, intron 5 of 7) 262780 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 160.333-135 chr18 67638925 67639192 + 1 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR -122338 NM_032160 92126 Hs.124673 NM_032160 ENSG00000171451 DSEL C18orf4|DE-epi2 dermatan sulfate epimerase like protein-coding 163.667-85 chr17 54023416 54023647 + 1 NA Intergenic Intergenic 200604 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 164.333-251 chr9 80020850 80021094 + 1 NA intron (NR_121212, intron 3 of 4) intron (NR_121212, intron 3 of 4) 45949 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 168.333-23 chr10 61898238 61898452 + 1 NA Intergenic Intergenic -3354 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 278.667-38 chr4 59859698 59860238 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 846395 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 148.667-21 chr1 180106017 180106280 + 1 NA intron (NM_014810, intron 37 of 37) intron (NM_014810, intron 37 of 37) -48685 NM_001004128 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 146.667-275 chr6 38849276 38849442 + 1 NA intron (NM_001371, intron 36 of 91) intron (NM_001371, intron 36 of 91) 103748 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 131.667-199 chr8 114629880 114630061 + 1 NA Intergenic Intergenic 1038043 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 147.667-307 chr6 38610411 38610585 + 1 NA intron (NM_001099272, intron 1 of 10) intron (NM_001099272, intron 1 of 10) -14431 NM_152733 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 152.333-110 chr14 66361526 66361680 + 1 NA Intergenic Intergenic -124768 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 121.667-64 chr15 45355622 45355777 + 1 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 22845 NM_001482 2628 Hs.75335 NM_001482 ENSG00000171766 GATM AGAT|AT|CCDS3 glycine amidinotransferase protein-coding 144.667-293 chr8 75221439 75221670 + 1 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 56927 NR_103850 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 158.667-124 chr17 64266040 64266225 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2872 NM_018469 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 300.333-39 chr6 71379098 71379581 + 1 NA Intergenic Intergenic -2308 NR_029598 407032 NR_029598 ENSG00000199094 MIR30C2 MIRN30C2|mir-30c-2 microRNA 30c-2 ncRNA 190.333-118 chr5 68165859 68166226 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -23834 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 192.667-63 chr15 40723224 40723528 + 1 NA intron (NM_133487, intron 6 of 9) L1MB7|LINE|L1 28202 NM_001164269 5888 Hs.631709 NM_002875 ENSG00000051180 RAD51 BRCC5|FANCR|HRAD51|HsRad51|HsT16930|MRMV2|RAD51A|RECA RAD51 recombinase protein-coding 150.333-80 chr12 29844342 29844525 + 1 NA Intergenic Intergenic -59674 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 160.667-104 chr15 56142962 56143141 + 1 NA intron (NM_001370561, intron 6 of 11) intron (NM_001370561, intron 6 of 11) 46881 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 370.667-12 chr2 41064554 41065071 + 1 NA Intergenic Intergenic -552377 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 316.333-17 chr2 81105357 81105762 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 361387 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 141.667-48 chr11 75839425 75839595 + 1 NA intron (NM_003369, intron 1 of 14) intron (NM_003369, intron 1 of 14) 24300 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 209.333-11 chr1 152573139 152573560 + 1 NA Intergenic (TCTACT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6569 NM_178435 353145 Hs.490208 NM_178435 ENSG00000185966 LCE3E LEP17 late cornified envelope 3E protein-coding 146.333-364 chrX 103683876 103684040 + 1 NA intron (NM_001142419, intron 2 of 3) intron (NM_001142419, intron 2 of 3) 2741 NM_012286 9643 Hs.326387 NM_012286 ENSG00000123562 MORF4L2 MORFL2|MRGX mortality factor 4 like 2 protein-coding 254.333-66 chr5 62319770 62320205 + 1 NA intron (NM_001243952, intron 2 of 20) L1ME4b|LINE|L1 13825 NM_001243952 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 145.333-165 chr21 20951946 20952098 + 1 NA Intergenic Intergenic -46387 NM_001352592 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 293.667-25 chr2 45529705 45530145 + 1 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) intron (NM_018079, intron 14 of 20) 81342 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 233.333-4 chr1 98040750 98041294 + 1 NA intron (NR_046105, intron 3 of 4) intron (NR_046105, intron 3 of 4) 4329 NR_039604 100616452 NR_039604 ENSG00000284247 MIR2682 mir-2682 microRNA 2682 ncRNA 148.667-124 chr14 72608602 72608850 + 1 NA Intergenic Intergenic 91906 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 151.333-323 chr4 176179397 176179661 + 1 NA exon (NM_001350727, exon 31 of 31) exon (NM_001350727, exon 31 of 31) 16056 NM_144644 132851 Hs.481235 NM_144644 ENSG00000150628 SPATA4 SPEF1B|TSARG2 spermatogenesis associated 4 protein-coding 166.333-107 chr2 32290749 32291073 + 1 NA intron (NM_032312, intron 2 of 5) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 13007 NM_032312 84272 Hs.468099 NM_032312 ENSG00000119820 YIPF4 FinGER4|Nbla11189 Yip1 domain family member 4 protein-coding 149.333-59 chr10 82785689 82785914 + 1 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -552881 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 312.667-11 chr10 118733998 118734407 + 1 NA intron (NM_153810, intron 1 of 8) intron (NM_153810, intron 1 of 8) 20768 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 250.333-75 chr8 101265099 101265595 + 1 NA Intergenic Intergenic -59283 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 217.667-52 chr20 54455834 54456126 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -19613 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 197.333-32 chr11 45342545 45342757 + 1 NA Intergenic Intergenic -12720 NR_120557 101928812 Hs.444059 NR_120557 ENSG00000254427 LINC02696 - long intergenic non-protein coding RNA 2696 ncRNA 307.333-48 chr2 221529020 221529520 + 1 NA intron (NM_001363748, intron 3 of 17) intron (NM_001363748, intron 3 of 17) 43034 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 314.667-36 chr8 113352579 113353229 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) L2|LINE|L2 24248 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 217.667-6 chr1 180159066 180159415 + 1 NA intron (NM_002826, intron 1 of 11) intron (NM_002826, intron 1 of 11) 4371 NM_002826 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 154.667-406 chr9 5010805 5011098 + 1 NA intron (NM_004972, intron 2 of 24) L1MEf|LINE|L1 25706 NM_004972 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 143.667-39 chr11 29280446 29280621 + 1 NA Intergenic Intergenic -313880 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 147.667-251 chr4 36289766 36290001 + 1 NA intron (NM_001170700, intron 2 of 9) intron (NM_001170700, intron 2 of 9) 8267 NM_001136536 401124 Hs.363407 NM_001136536 ENSG00000197057 DTHD1 - death domain containing 1 protein-coding 208.333-84 chr20 3975193 3975519 + 1 NA intron (NM_001134338, intron 1 of 6) L1MD1|LINE|L1 40202 NM_001134338 11237 Hs.547576 NM_007219 ENSG00000101236 RNF24 G1L ring finger protein 24 protein-coding 225.667-46 chr22 25396218 25396450 + 1 NA Intergenic Intergenic -14757 NM_001135772 91355 Hs.634058 NM_182492 ENSG00000100068 LRP5L - LDL receptor related protein 5 like protein-coding 121.333-145 chr5 72413483 72413671 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 93204 NM_001284403 79810 Hs.126906 NM_024754 ENSG00000049883 PTCD2 - pentatricopeptide repeat domain 2 protein-coding 150.667-16 chr1 203472706 203472977 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2965 NM_201348 5549 Hs.632481 NM_002725 ENSG00000188783 PRELP MST161|MSTP161|SLRR2A proline and arginine rich end leucine rich repeat protein protein-coding 161.333-192 chr3 100649680 100649855 + 1 NA exon (NM_032787, exon 11 of 16) exon (NM_032787, exon 11 of 16) 14229 NM_001308362 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 156.667-278 chr5 110879759 110880001 + 1 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 140873 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 113.333-13 chr1 158384081 158384243 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 15304 NM_001004475 128360 Hs.553588 NM_001004475 ENSG00000186306 OR10T2 OR1-3 olfactory receptor family 10 subfamily T member 2 protein-coding 292.333-29 chr3 33742020 33742612 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -24062 NM_001365627 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 182.333-86 chr2 102295800 102296054 + 1 NA Intergenic Intergenic -15575 NM_001282408 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 151.667-127 chr15 68223757 68223911 + 1 NA intron (NM_017882, intron 1 of 6) AluSq2|SINE|Alu 5894 NM_017882 54982 Hs.584921 NM_017882 ENSG00000128973 CLN6 CLN4A|HsT18960|nclf CLN6 transmembrane ER protein protein-coding 162.667-286 chr8 137305677 137305917 + 1 NA Intergenic (CTTTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 107791 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 135.333-19 chr10 32572123 32572337 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 17 of 43) intron (NM_001321115, intron 17 of 43) 126090 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 137.667-91 chr2 28799196 28799359 + 1 NA exon (NM_002709, exon 8 of 8) exon (NM_002709, exon 8 of 8) -11557 NM_001142634 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 241.333 chr1 60757441 60757797 + 1 NA intron (NR_110628, intron 1 of 5) intron (NR_110628, intron 1 of 5) 67965 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 174.667-55 chr14 70279727 70280034 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -32079 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 185.333-3 chr1 65705802 65706087 + 1 NA Intergenic Intergenic -86566 NM_001037341 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 152.333-382 chr8 103154827 103155110 + 1 NA TTS (NR_036106) TTS (NR_036106) 354 NR_036106 100422992 NR_036106 ENSG00000265657 MIR3151 mir-3151 microRNA 3151 ncRNA 158.667-323 chr8 100784234 100784439 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -62248 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 149.667-237 chr20 56282317 56282520 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 33686 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 221.667-17 chr11 131836422 131836787 + 1 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) intron (NM_001352006, intron 2 of 9) -73320 NM_001352009 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 174.333-153 chr8 131445353 131445555 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -404545 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 204.333-183 chr7 1170803 1171093 + 1 NA Intergenic Intergenic 10163 NR_110070 101927021 Hs.529566 NR_110065 LOC101927021 - uncharacterized LOC101927021 ncRNA 166.333-49 chr11 94557209 94557387 + 1 NA intron (NR_135094, intron 3 of 3) intron (NR_135094, intron 3 of 3) -10070 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 209.667-104 chr7 93753482 93753736 + 1 NA Intergenic Intergenic 36681 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 271.667-55 chr6 13120715 13121330 + 1 NA intron (NM_001322308, intron 4 of 13) intron (NM_001322308, intron 4 of 13) 107468 NM_001322314 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 137.667-90 chr2 25997632 25997832 + 1 NA Intergenic Intergenic -15235 NM_002254 3797 Hs.21611 NM_002254 ENSG00000084731 KIF3C - kinesin family member 3C protein-coding 129.333-16 chr10 43152692 43152912 + 1 NA intron (NM_018590, intron 1 of 7) intron (NM_018590, intron 1 of 7) -2095 NM_001319656 55454 Hs.657569 NM_018590 ENSG00000169826 CSGALNACT2 CHGN2|ChGn-2|GALNACT-2|GALNACT2|PRO0082|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 140.667-52 chr11 81714282 81714561 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 176415 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 344.333-11 chr2 185350475 185351161 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -183746 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 132.667-152 chr6 68810201 68810360 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 174998 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 207.333-5 chr1 51636884 51637170 + 1 NA intron (NM_148906, intron 1 of 22) intron (NM_148906, intron 1 of 22) 19935 NR_036662 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 150.667-378 chr8 111351535 111351787 + 1 NA Intergenic Intergenic -24978 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 155.667-159 chr2 43526389 43526559 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 22 of 37) intron (NM_001083953, intron 22 of 37) 69500 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 157.333-210 chr2 230751054 230751244 + 1 NA intron (NM_001130849, intron 1 of 8) intron (NM_001130849, intron 1 of 8) 37601 NM_001130850 51719 Hs.603930 NM_016289 ENSG00000135932 CAB39 CGI-66|MO25 calcium binding protein 39 protein-coding 147.667-203 chr20 33403828 33404121 + 1 NA Intergenic Intergenic -2405 NM_001278169 51654 Hs.435952 NM_016082 ENSG00000101391 CDK5RAP1 C20orf34|C42|CGI-05|HSPC167 CDK5 regulatory subunit associated protein 1 protein-coding 149.667-175 chr18 64074191 64074395 + 1 NA Intergenic Intergenic -29798 NR_033881 284294 Hs.385642 NR_033881 ENSG00000267134 LINC01924 - long intergenic non-protein coding RNA 1924 ncRNA 167.667-18 chr10 11873518 11873717 + 1 NA intron (NR_038222, intron 2 of 5) intron (NR_038222, intron 2 of 5) 21093 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 156.333-353 chr8 28514022 28514222 + 1 NA intron (NM_017412, intron 3 of 7) intron (NM_017412, intron 3 of 7) -8940 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 352.333-9 chr15 25156524 25157088 + 1 NA intron (NR_146177, intron 61 of 147) L1M5|LINE|L1 -13917 NR_001291 338433 NR_001291 ENSG00000201831 SNORD115-1 HBII-52-1|RNHBII52 small nucleolar RNA, C/D box 115-1 snoRNA 158.333-338 chr9 28050875 28051128 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -477135 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 152.333-222 chr3 2275743 2275895 + 1 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) AluSg|SINE|Alu 36990 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 259.333-44 chr2 63958441 63958973 + 1 NA intron (NM_001005739, intron 7 of 22) AluJr4|SINE|Alu 60721 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 257.333-109 chr8 141484234 141484681 + 1 NA intron (NR_102364, intron 6 of 26) L1ME2|LINE|L1 22772 NR_160399 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 159.667-149 chr18 22125531 22125766 + 1 NA Intergenic Intergenic 43320 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 162.667-87 chr15 57650063 57650362 + 1 NA intron (NR_104367, intron 11 of 15) intron (NR_104367, intron 11 of 15) -56309 NM_001018102 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 249.667-43 chr2 109511828 109512333 + 1 NA Intergenic Intergenic 101587 NM_001321513 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 257.333-63 chr3 26375860 26376333 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -246710 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 153.667-330 chr5 163587055 163587281 + 1 NA Intergenic Intergenic 81549 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 208.333-72 chr2 63729321 63729558 + 1 NA Intergenic Intergenic -111525 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 210.333-97 chr3 32363126 32363447 + 1 NA intron (NM_178868, intron 2 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -28567 NM_181472 112616 Hs.440494 NM_138410 ENSG00000153551 CMTM7 CKLFSF7 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 7 protein-coding 346.667-5 chr2 60586087 60586787 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -32783 NM_018014 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 158.333-279 chr6 117684890 117685128 + 1 NA intron (NM_138459, intron 1 of 4) L1ME4c|LINE|L1 9540 NM_138459 116150 Hs.289008 NM_138459 ENSG00000153989 NUS1 C6orf68|CDG1AA|MGC:7199|MRD55|NgBR|TANGO14 NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit protein-coding 156.333-135 chr16 72745139 72745327 + 1 NA Intergenic Intergenic -80263 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 147.333-66 chr11 39359280 39359554 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 710559 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 157.667-280 chr6 62911040 62911302 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 408806 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 158.667-24 chr1 184276525 184276687 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -110423 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 150.333-28 chr1 230462008 230462192 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -35768 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 182.333-134 chr5 116317917 116318244 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 56490 NR_104675 101927190 Hs.639849 NR_104675 LOC101927190 - uncharacterized LOC101927190 ncRNA 163.667-208 chr6 38534297 38534520 + 1 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) L1MA3|LINE|L1 52812 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 167.667-130 chr22 30970228 30970560 + 1 NA non-coding (NR_152871, exon 1 of 4) non-coding (NR_152871, exon 1 of 4) 1183 NR_152871 55000 Hs.554829 NR_002323 ENSG00000253352 TUG1 LINC00080|NCRNA00080|TI-227H taurine up-regulated 1 ncRNA 200.667-94 chr20 5160331 5160604 + 1 NA intron (NM_003818, intron 1 of 12) intron (NM_003818, intron 1 of 12) 33459 NM_003818 8760 Hs.126857 NM_003818 ENSG00000101290 CDS2 - CDP-diacylglycerol synthase 2 protein-coding 149.333-437 chr9 115304194 115304381 + 1 NA intron (NR_163556, intron 3 of 7) intron (NR_163556, intron 3 of 7) 162469 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 200.667-34 chr12 3571030 3571427 + 1 NA intron (NM_019854, intron 6 of 9) intron (NM_019854, intron 6 of 9) -78409 NR_126055 100129223 Hs.586788 NR_126055 THCAT155 - thyroid cancer-associated transcript 155 ncRNA 123.667-76 chr18 32478003 32478205 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -7222 NM_001242409 64762 Hs.444314 NM_022751 ENSG00000141441 GAREM1 C18orf11|FAM59A|GAREM|Gm944 GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 1 protein-coding 213.333-153 chr5 4743481 4743834 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -29824 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 133.333-193 chr8 136631009 136631188 + 1 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 100300 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 124.667-179 chr6 120159386 120159543 + 1 NA Intergenic Intergenic 144285 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 344.333-22 chr7 15189076 15189689 + 1 NA Intergenic Intergenic -214524 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 175.333-174 chr7 51523115 51523310 + 1 NA Intergenic Intergenic -129956 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 174.667-132 chr4 119236655 119237003 + 1 NA intron (NM_001371395, intron 4 of 18) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 24116 NM_001371396 156.333-356 chr8 88358525 88358714 + 1 NA Intergenic Intergenic -31136 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 167.667-134 chr3 51398516 51398784 + 1 NA TTS (NM_013286) TTS (NM_013286) 7365 NM_013286 29890 Hs.118738 NM_013286 ENSG00000259956 RBM15B HUMAGCGB|HsOTT3|OTT3 RNA binding motif protein 15B protein-coding 215.667-99 chr5 67078951 67079381 + 1 NA intron (NM_001297651, intron 2 of 25) intron (NM_001297651, intron 2 of 25) 74511 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 193.667-55 chr18 647844 648161 + 1 NA intron (NM_199167, intron 8 of 8) L2a|LINE|L2 -9651 NM_001354867 7298 Hs.369762 NM_001071 ENSG00000176890 TYMS HST422|TMS|TS thymidylate synthetase protein-coding 268.667-44 chr3 119529552 119530101 + 1 NA intron (NM_005191, intron 5 of 6) intron (NM_005191, intron 5 of 6) 29788 NM_005191 941 Hs.838 NM_005191 ENSG00000121594 CD80 B7|B7-1|B7.1|BB1|CD28LG|CD28LG1|LAB7 CD80 molecule protein-coding 146.333-152 chr2 79320019 79320192 + 1 NA Intergenic Intergenic -160352 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 167.667-79 chr17 6230349 6230529 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 159825 NM_015253 23302 Hs.370166 NM_015253 ENSG00000179314 WSCD1 - WSC domain containing 1 protein-coding 287.667-13 chr14 20365734 20366299 + 1 NA 3' UTR (NM_007110, exon 55 of 55) 3' UTR (NM_007110, exon 55 of 55) 22402 NM_005484 10038 Hs.409412 NM_005484 ENSG00000129484 PARP2 ADPRT2|ADPRTL2|ADPRTL3|ARTD2|PARP-2|pADPRT-2 poly(ADP-ribose) polymerase 2 protein-coding 123.333-150 chr3 175687278 175687461 + 1 NA intron (NM_207015, intron 11 of 13) intron (NM_207015, intron 11 of 13) 88964 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 235.667-61 chr8 82934078 82934318 + 1 NA intron (NR_134295, intron 2 of 3) L1M3|LINE|L1 22094 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 164.333-47 chr12 13747963 13748211 + 1 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 232269 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 225.667-4 chr1 158649651 158649911 + 1 NA intron (NM_003126, intron 25 of 51) intron (NM_003126, intron 25 of 51) 36934 NM_003126 6708 Hs.119825 NM_003126 ENSG00000163554 SPTA1 EL2|HPP|HS3|SPH3|SPTA spectrin alpha, erythrocytic 1 protein-coding 232.333-37 chr19 39041533 39041799 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9117 NM_178820 126433 Hs.187461 NM_178820 ENSG00000161243 FBXO27 FBG5|Fbx27 F-box protein 27 protein-coding 179.667-124 chr6 154842925 154843231 + 1 NA Intergenic Charlie26a|DNA|hAT-Charlie -10282 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 304.667-7 chr10 123952890 123953194 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -61235 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 151.667-396 chr9 107183141 107183346 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -80255 NR_126029 340512 Hs.432529 NR_126029 ENSG00000230782 LOC340512 - uncharacterized LOC340512 ncRNA 145.333-10 chr1 109731107 109731268 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 9851 NR_024537 2947 Hs.2006 NM_000849 ENSG00000134202 GSTM3 GST5|GSTB|GSTM3-3|GTM3 glutathione S-transferase mu 3 protein-coding 127.667-193 chr9 15471793 15471955 + 1 NA intron (NM_001317898, intron 10 of 10) intron (NM_001317898, intron 10 of 10) 38415 NM_021144 11168 Hs.658434 NM_021144 ENSG00000164985 PSIP1 DFS70|LEDGF|PAIP|PSIP2|p52|p75 PC4 and SFRS1 interacting protein 1 protein-coding 112.667-55 chr12 122492616 122492800 + 1 NA intron (NM_001350935, intron 3 of 10) intron (NM_001350935, intron 3 of 10) 8224 NM_017612 55596 Hs.37706 NM_017612 ENSG00000033030 ZCCHC8 - zinc finger CCHC-type containing 8 protein-coding 269.667-9 chr11 7420007 7420459 + 1 NA intron (NM_175733, intron 5 of 6) intron (NM_175733, intron 5 of 6) 45602 NR_103855 100506258 Hs.661614 NR_103855 ENSG00000251364 LOC100506258 - uncharacterized LOC100506258 ncRNA 196.333-129 chr4 54240225 54240491 + 1 NA intron (NM_001347828, intron 2 of 23) MER66-int|LTR|ERV1 6398 NM_001347830 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 135.333-177 chr7 52832241 52832433 + 1 NA Intergenic Intergenic -203296 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 244.667-36 chr12 111933907 111934202 + 1 NA intron (NR_122119, intron 6 of 8) intron (NR_122119, intron 6 of 8) 34991 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 158.333-114 chr17 61767038 61767210 + 1 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) intron (NM_032043, intron 14 of 19) 96435 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 144.333-94 chr17 34515990 34516171 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 63289 NR_160787 400591 Hs.514090 NM_207454 C17orf102 - chromosome 17 open reading frame 102 ncRNA 176.667-19 chr1 209144983 209145316 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 172695 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 264.667-73 chr6 144983726 144984047 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 578231 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 213.333-190 chr7 38533319 38533738 + 1 NA intron (NM_001635, intron 2 of 20) intron (NM_001635, intron 2 of 20) 97845 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 231.333-46 chr16 53022006 53022311 + 1 NA Intergenic Intergenic 30715 NR_136518 105371267 Hs.147562 NR_136518 ENSG00000277639 LOC105371267 PR-lncRNA-1 p53-regulated lncRNA 1 ncRNA 161.333-3 chr1 54931692 54931939 + 1 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -44620 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 127.667-176 chr8 79876080 79876242 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -4424 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 137.333-4 chr1 60801225 60801388 + 1 NA intron (NR_110628, intron 1 of 5) MIRc|SINE|MIR 24278 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 168.667-132 chr22 25706574 25706750 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 14 of 19) AluSz|SINE|Alu -35526 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 159.667-111 chr15 65513890 65514178 + 1 NA intron (NR_135485, intron 1 of 20) intron (NR_135485, intron 1 of 20) 3240 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 157.333-336 chr8 84170208 84170488 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -12439 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 162.333-88 chr16 67074736 67075023 + 1 NA intron (NM_001755, intron 4 of 5) L1ME3A|LINE|L1 -35062 NM_001320543 80262 Hs.513666 NM_025187 ENSG00000125149 C16orf70 C16orf6|LIN10|lin-10 chromosome 16 open reading frame 70 protein-coding 229.667-32 chr14 89168173 89168500 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 6 of 6) FLAM_C|SINE|Alu 248897 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 127.333-127 chr4 31574306 31574450 + 1 NA Intergenic Intergenic 67834 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 218.333-101 chr5 128093760 128094074 + 1 NA intron (NM_001046, intron 1 of 26) intron (NM_001046, intron 1 of 26) 10151 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 140.333-205 chr6 114452209 114452467 + 1 NA Intergenic Intergenic -389461 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 253.667-60 chr5 150102666 150102968 + 1 NA intron (NM_005211, intron 1 of 21) L1MC|LINE|L1 -10193 NM_001349736 1436 Hs.586219 NM_005211 ENSG00000182578 CSF1R C-FMS|CD115|CSF-1R|CSFR|FIM2|FMS|HDLS|M-CSF-R colony stimulating factor 1 receptor protein-coding 158.333-120 chr18 3495814 3496071 + 1 NA TTS (NM_001242764) TTS (NM_001242764) 29692 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 157.667-113 chr15 91674453 91674697 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -179133 NM_013272 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 156.333-201 chr20 8515084 8515337 + 1 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) intron (NM_182734, intron 3 of 32) 266506 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 153.333-283 chr3 183867553 183867908 + 1 NA intron (NM_001324437, intron 2 of 7) intron (NM_001324437, intron 2 of 7) 17150 NM_001324438 55486 Hs.478469 NM_018622 ENSG00000175193 PARL PRO2207|PSARL|PSARL1|PSENIP2|RHBDS1 presenilin associated rhomboid like protein-coding 154.667-219 chr20 51862190 51862380 + 1 NA intron (NR_110016, intron 1 of 2) intron (NR_110016, intron 1 of 2) 628 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 178.333-181 chrX 77568630 77568839 + 1 NA intron (NM_000489, intron 28 of 34) L1MDa|LINE|L1 121345 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 147.333-286 chr7 6674105 6674294 + 1 NA Intergenic Intergenic 32748 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 239.333-97 chr6 143947933 143948316 + 1 NA exon (NM_001289049, exon 5 of 6) exon (NM_001289049, exon 5 of 6) 13286 NM_001317157 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 153.333-336 chr5 87004894 87005097 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 109959 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 163.333-208 chr4 133392923 133393103 + 1 NA Intergenic Intergenic 243719 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 305.333-34 chr2 88616628 88617055 + 1 NA intron (NM_004836, intron 1 of 16) intron (NM_004836, intron 1 of 16) 8088 NM_001313915 9451 Hs.591589 NM_004836 ENSG00000172071 EIF2AK3 PEK|PERK|WRS eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 protein-coding 153.333-66 chr11 40786398 40786568 + 1 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -493353 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 181.667-95 chr3 79515912 79516143 + 1 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) L1ME4b|LINE|L1 8140 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 235.667-41 chr3 69102786 69103083 + 1 NA intron (NM_006407, intron 2 of 2) intron (NM_006407, intron 2 of 2) 17997 NM_006407 10550 Hs.518060 NM_006407 ENSG00000144746 ARL6IP5 DERP11|GTRAP3-18|HSPC127|JWA|PRAF3|Yip6b|addicsin|hp22|jmx ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 5 protein-coding 201.667-129 chr9 37384715 37384949 + 1 NA Intergenic Intergenic -37864 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 298.333-36 chr5 97457846 97458417 + 1 NA Intergenic Tigger1a_Art|DNA|TcMar-Tigger -46565 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 264.667-62 chr5 32834254 32834629 + 1 NA Intergenic Intergenic -113002 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 173.333-81 chr19 28157923 28158117 + 1 NA Intergenic Intergenic -364080 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 125.333-121 chr4 63664282 63664537 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 745041 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 155.333-191 chr2 200058548 200058749 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -103157 NR_109905 129450 Hs.204619 NM_152382 ENSG00000162971 TYW5 C2orf60|hTYW5 tRNA-yW synthesizing protein 5 protein-coding 217.667-47 chr2 78370618 78370939 + 1 NA Intergenic Intergenic -80047 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 162.667-133 chr2 101580985 101581243 + 1 NA Intergenic Intergenic -106002 NM_001145664 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 176.333-60 chr16 48209865 48210042 + 1 NA intron (NM_001370497, intron 11 of 29) L2a|LINE|L2 22318 NM_033151 85320 Hs.652267 NM_032583 ENSG00000121270 ABCC11 EWWD|MRP8|WW ATP binding cassette subfamily C member 11 protein-coding 150.667-326 chr6 36592486 36592652 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1744 NR_036610 6428 Hs.405144 NM_003017 ENSG00000112081 SRSF3 SFRS3|SRp20 serine and arginine rich splicing factor 3 protein-coding 255.333-54 chr2 72915352 72915631 + 1 NA Intergenic Intergenic -2028 NM_004097 2016 Hs.516090 NM_004097 ENSG00000135638 EMX1 - empty spiracles homeobox 1 protein-coding 152.667-152 chr18 65846306 65846588 + 1 NA intron (NM_001362438, intron 7 of 11) intron (NM_001362438, intron 7 of 11) 95435 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 160.333-295 chr9 20406522 20406728 + 1 NA intron (NM_001286691, intron 5 of 10) intron (NM_001286691, intron 5 of 10) 4613 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 195.667-50 chr15 68886536 68886825 + 1 NA Intergenic Intergenic -43820 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 113.667-235 chrX 87457160 87457379 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -60533 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 217.667-45 chr2 65302086 65302521 + 1 NA Intergenic Intergenic 64475 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 206.333-173 chr9 86923512 86923860 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 23820 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 149.667-190 chr2 27659807 27660143 + 1 NA intron (NM_001282732, intron 2 of 4) intron (NM_001282732, intron 2 of 4) -3496 NM_018158 22950 Hs.306000 NM_018158 ENSG00000163798 SLC4A1AP HLC3 solute carrier family 4 member 1 adaptor protein protein-coding 315.333-39 chr5 128523031 128523373 + 1 NA intron (NM_001999, intron 4 of 64) intron (NM_001999, intron 4 of 64) 15043 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 245.333-97 chr6 16440810 16441247 + 1 NA intron (NM_000332, intron 7 of 8) L1M8|LINE|L1 202441 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 231.333-81 chr4 89581078 89581417 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -255154 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 139.667-2 chr1 59921644 59921847 + 1 NA intron (NM_000775, intron 1 of 8) MER11D|LTR|ERVK 5028 NM_000775 1573 Hs.152096 NM_000775 ENSG00000134716 CYP2J2 CPJ2|CYPIIJ2 cytochrome P450 family 2 subfamily J member 2 protein-coding 219.333-160 chr6 119063354 119063791 + 1 NA intron (NM_001288576, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 5571 NR_030315 693128 NR_030315 ENSG00000207982 MIR548B MIRN548B microRNA 548b ncRNA 113.667-133 chr3 5860010 5860162 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -609831 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 132.333-99 chr2 220739529 220739699 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 832690 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 163.333-247 chr6 125549026 125549220 + 1 NA Intergenic Intergenic -125230 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 167.667-205 chr8 110359535 110359839 + 1 NA Intergenic Intergenic -383916 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 151.667-255 chr4 100960989 100961158 + 1 NA Intergenic Intergenic 279799 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 208.667-118 chr6 49906592 49906948 + 1 NA Intergenic Intergenic -29674 NM_001205220 167 Hs.109620 NM_001131 ENSG00000124812 CRISP1 AEGL1|ARP|CRISP-1|HEL-S-57|HSCRISP1D|HSCRISP1G|HUMARP cysteine rich secretory protein 1 protein-coding 111.667-40 chr10 94341704 94341874 + 1 NA intron (NM_022451, intron 13 of 20) intron (NM_022451, intron 13 of 20) 21150 NM_022451 64318 Hs.74899 NM_022451 ENSG00000173145 NOC3L AD24|C10orf117|FAD24 NOC3 like DNA replication regulator protein-coding 261.333-97 chr7 7851193 7851664 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) L1MB8|LINE|L1 117324 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 164.333-190 chr5 26780322 26780619 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 258116 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 121.333-109 chr3 58951918 58952073 + 1 NA intron (NR_147234, intron 4 of 10) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie 98030 NM_001351532 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 172.333-37 chr11 105554008 105554290 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -55924 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 161.333-239 chr5 158189970 158190241 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 219668 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 146.667-323 chr7 140334784 140335042 + 1 NA non-coding (NR_156489, exon 15 of 15) non-coding (NR_156489, exon 15 of 15) 63617 NR_156491 84255 Hs.446021 NM_032295 ENSG00000157800 SLC37A3 - solute carrier family 37 member 3 protein-coding 209.333-89 chr17 61074483 61074778 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 20 of 25) intron (NM_001330413, intron 20 of 25) 293074 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 135.667-164 chr6 158962936 158963171 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 37134 NM_001346418 83861 Hs.154628 NM_031924 ENSG00000130363 RSPH3 CILD32|RSHL2|RSP3|dJ111C20.1 radial spoke head 3 protein-coding 254.333-56 chr3 178310075 178310526 + 1 NA Intergenic Intergenic -108901 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 317.667-5 chr1 118316903 118317383 + 1 NA Intergenic Intergenic -131915 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 173.667-196 chrX 41140828 41141102 + 1 NA intron (NM_001039591, intron 7 of 44) intron (NM_001039591, intron 7 of 44) 55520 NM_001039590 8239 Hs.77578 NM_004652 ENSG00000124486 USP9X DFFRX|FAF|FAM|MRX99|MRXS99F ubiquitin specific peptidase 9 X-linked protein-coding 192.333-74 chr18 4338097 4338439 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 73666 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 155.333-11 chr1 175849070 175849266 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -28175 NR_125964 101928751 NR_125964 ENSG00000224718 LINC01657 - long intergenic non-protein coding RNA 1657 ncRNA 152.667-327 chr6 56155774 56156054 + 1 NA intron (NR_134849, intron 10 of 29) intron (NR_134849, intron 10 of 29) -64252 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 232.667-77 chr9 26695398 26695913 + 1 NA Intergenic Intergenic 197147 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 209.333-198 chr6 13620341 13620560 + 1 NA exon (NM_001317724, exon 7 of 9) exon (NM_001317724, exon 7 of 9) 5115 NM_016167 51406 Hs.306242 NM_016167 ENSG00000225921 NOL7 C6orf90|PQBP3|RARG-1|dJ223E5.2 nucleolar protein 7 protein-coding 212.667-78 chr2 130299007 130299378 + 1 NA Intergenic Intergenic 42916 NM_001321119 84317 Hs.104203 NM_032357 ENSG00000136710 CCDC115 CDG2O|ccp1 coiled-coil domain containing 115 protein-coding 238.667-37 chr2 22716826 22717298 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 180583 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 224.333-18 chr10 81006717 81007096 + 1 NA Intergenic Intergenic 357109 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 205.667-30 chr11 107200108 107200444 + 1 NA Intergenic Intergenic -181800 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 243.667-32 chr2 18987131 18987446 + 1 NA non-coding (NR_135287, exon 4 of 4) non-coding (NR_135287, exon 4 of 4) 39683 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 115.667-172 chr5 12393090 12393245 + 1 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -181690 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 254.667-4 chr1 198189983 198190413 + 1 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) intron (NM_133494, intron 1 of 9) 33200 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 160.333-123 chr16 79221137 79221327 + 1 NA Intergenic Intergenic 379505 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 173.667-121 chr3 144697959 144698200 + 1 NA Intergenic Intergenic 724998 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 190.667-19 chr10 94581801 94582158 + 1 NA intron (NM_001289068, intron 11 of 21) intron (NM_001289068, intron 11 of 21) 36191 NM_018063 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 189.333-210 chr8 120894093 120894435 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -82218 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 166.667-22 chr10 28415720 28416052 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 79927 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 142.333-177 chr4 58057959 58058156 + 1 NA Intergenic Intergenic 478271 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 156.333-151 chr18 5812406 5812696 + 1 NA Intergenic Intergenic -28144 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 238.333-16 chr11 102830686 102830969 + 1 NA intron (NR_038390, intron 5 of 7) intron (NR_038390, intron 5 of 7) 12782 NM_002422 4314 Hs.375129 NM_002422 ENSG00000149968 MMP3 CHDS6|MMP-3|SL-1|STMY|STMY1|STR1 matrix metallopeptidase 3 protein-coding 159.667-338 chr9 11018543 11018707 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 405419 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 276.667-50 chr3 128677101 128677441 + 1 NA Intergenic Intergenic -26453 NM_002950 6184 Hs.518244 NM_002950 ENSG00000163902 RPN1 OST1|RBPH1 ribophorin I protein-coding 179.333-36 chr11 40700518 40700796 + 1 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -407527 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 196.333-83 chr2 46196740 46197054 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -100510 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 183.667-25 chr10 52507230 52507463 + 1 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -36813 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 223.667-37 chr2 83326182 83326587 + 1 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL -196430 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 134.667-112 chr20 4658975 4659191 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -27373 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 164.333-132 chr2 200461883 200462103 + 1 NA intron (NM_001100423, intron 9 of 12) intron (NM_001100423, intron 9 of 12) 48075 NM_001321547 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 259.667-34 chr2 86423530 86423966 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -17623 NM_018433 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 157.667-319 chr8 42003014 42003203 + 1 NA intron (NM_001305878, intron 2 of 13) LTR50|LTR|ERVL -48642 NR_136589 105379393 Hs.742878 NR_136589 LOC105379393 - uncharacterized LOC105379393 ncRNA 145.667-221 chr5 89167549 89167701 + 1 NA intron (NR_136219, intron 6 of 9) intron (NR_136219, intron 6 of 9) -263520 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 214.333-3 chr1 59918261 59918687 + 1 NA intron (NM_000775, intron 1 of 8) intron (NM_000775, intron 1 of 8) 8299 NM_000775 1573 Hs.152096 NM_000775 ENSG00000134716 CYP2J2 CPJ2|CYPIIJ2 cytochrome P450 family 2 subfamily J member 2 protein-coding 127.667-5 chr1 88816228 88816385 + 1 NA intron (NM_006256, intron 16 of 21) AluSx|SINE|Alu 75261 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 317.333-11 chr14 29501988 29502582 + 1 NA Intergenic Intergenic 424811 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 133.333-114 chr3 138181800 138181979 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -5359 NM_213654 25852 Hs.744868 NM_014154 ENSG00000114098 ARMC8 GID5|HSPC056|S863-2|VID28 armadillo repeat containing 8 protein-coding 164.667-207 chr6 131833080 131833317 + 1 NA intron (NM_006208, intron 1 of 24) L1ME3G|LINE|L1 25178 NM_006208 5167 Hs.527295 NM_006208 ENSG00000197594 ENPP1 ARHR2|COLED|M6S1|NPP1|NPPS|PC-1|PCA1|PDNP1 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 protein-coding 197.333-176 chr5 3131784 3132128 + 1 NA Intergenic Intergenic -45879 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 245.667-17 chr14 27739486 27739781 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -66412 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 159.667-211 chr3 40413429 40413696 + 1 NA intron (NM_001248, intron 5 of 10) (AAAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26378 NM_001291960 956 Hs.441145 NM_001248 ENSG00000168032 ENTPD3 CD39L3|HB6|NTPDase-3 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 protein-coding 146.333-222 chr3 170632733 170632930 + 1 NA intron (NR_135556, intron 2 of 5) intron (NR_135556, intron 2 of 5) -46756 NM_020949 57709 Hs.596660 NM_020949 ENSG00000013293 SLC7A14 PPP1R142 solute carrier family 7 member 14 protein-coding 161.667-130 chr2 72976048 72976249 + 1 NA intron (NM_001330411, intron 11 of 14) intron (NM_001330411, intron 11 of 14) 58629 NM_004097 2016 Hs.516090 NM_004097 ENSG00000135638 EMX1 - empty spiracles homeobox 1 protein-coding 142.333-85 chr14 68182700 68182872 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 359194 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 253.667-79 chr8 136112902 136113259 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -417718 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 115.667-237 chrX 155660394 155660548 + 1 NA intron (NM_001304990, intron 1 of 2) L1PB4|LINE|L1 -47519 NM_018196 55217 Hs.133321 NM_018196 ENSG00000185973 TMLHE AUTSX6|BBOX2|TMLD|TMLH|TMLHED|XAP130 trimethyllysine hydroxylase, epsilon protein-coding 154.333-337 chr8 71603096 71603314 + 1 NA Intergenic Intergenic -55111 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 265.333-2 chr1 110001420 110001911 + 1 NA intron (NM_001242674, intron 1 of 17) L1MC4|LINE|L1 738 NM_001242674 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 207.667-76 chr3 87117345 87117786 + 1 NA intron (NR_104153, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 28285 NR_104153 100846978 Hs.570649 NR_047469 ENSG00000281392 LINC00506 - long intergenic non-protein coding RNA 506 ncRNA 215.667-104 chr6 16804832 16805060 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -43456 NM_001128164 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 242.333-17 chr11 59476949 59477237 + 1 NA promoter-TSS (NM_001004705) promoter-TSS (NM_001004705) -337 NM_001004705 390197 Hs.553756 NM_001004705 ENSG00000254466 OR4D10 OR11-251|OR4D10P|OST711 olfactory receptor family 4 subfamily D member 10 protein-coding 136.667-30 chr11 57595063 57595286 + 1 NA Intergenic Intergenic -2380 NM_000062 710 Hs.384598 NM_000062 ENSG00000149131 SERPING1 C1IN|C1INH|C1NH|HAE1|HAE2 serpin family G member 1 protein-coding 189.333-130 chr3 106839402 106839747 + 1 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 401064 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 259.333-79 chr5 52931601 52932013 + 1 NA intron (NM_181501, intron 21 of 28) intron (NM_181501, intron 21 of 28) -57545 NR_073103 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 325.667-3 chr12 46344354 46344899 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 28147 NM_001307936 54407 Hs.221847 NM_018976 ENSG00000134294 SLC38A2 ATA2|PRO1068|SAT2|SNAT2 solute carrier family 38 member 2 protein-coding 212.333-18 chr10 67550814 67551120 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 3 of 17) LTR1A2|LTR|ERV1 114693 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 123.333-189 chr7 7754737 7754891 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -36207 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 153.333-278 chr3 124795784 124795989 + 1 NA intron (NM_001354766, intron 9 of 13) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 63447 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 152.333-72 chr11 132708934 132709201 + 1 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) intron (NM_001319104, intron 1 of 6) 234570 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 188.667-77 chr2 109394365 109394668 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 3 of 9) intron (NM_001099289, intron 3 of 9) -80891 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 134.667-149 chr4 121059241 121059446 + 1 NA intron (NM_024574, intron 1 of 3) intron (NM_024574, intron 1 of 3) 13192 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 155.333-98 chr13 92841719 92842055 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) L1MC5|LINE|L1 -120273 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 207.333-3 chr1 33576853 33577136 + 1 NA intron (NM_052896, intron 50 of 69) intron (NM_052896, intron 50 of 69) 104349 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 147.667-282 chr5 45176997 45177231 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 368167 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 117.667-45 chr13 110588458 110588604 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -26809 NM_017817 55647 Hs.743563 NM_017817 ENSG00000139832 RAB20 - RAB20, member RAS oncogene family protein-coding 180.667-79 chr20 16586805 16587116 + 1 NA Intergenic Intergenic -13512 NM_001199865 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 157.333-324 chr7 77833031 77833218 + 1 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) intron (NM_001366088, intron 1 of 11) -7004 NM_001366089 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 258.333-80 chrX 143744358 143744737 + 1 NA Intergenic Intergenic -23879 NM_001009615 494119 NM_001009615 ENSG00000268988 SPANXN2 CT11.7|SPANX-N2 SPANX family member N2 protein-coding 190.667-12 chr1 184550566 184550961 + 1 NA intron (NM_030806, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu 163734 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 158.667-73 chr12 40190100 40190397 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 34009 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 159.333-277 chr6 6967015 6967299 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -140586 NM_001168344 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 156.333-42 chr10 71313873 71314085 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -5274 NR_033413 55315 Hs.438419 NM_018344 ENSG00000198246 SLC29A3 ENT3|HCLAP|HJCD|PHID solute carrier family 29 member 3 protein-coding 159.667-143 chr18 2949917 2950152 + 1 NA intron (NM_014646, intron 4 of 19) AluJr4|SINE|Alu -3411 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 210.333-115 chr4 59051568 59051843 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 38132 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 137.667-58 chr14 65931040 65931277 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 460056 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 155.667-396 chrX 14985165 14985359 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 99971 NM_001177475 158747 Hs.744919 NM_152581 ENSG00000130150 MOSPD2 - motile sperm domain containing 2 protein-coding 219.667-28 chr16 74932817 74933170 + 1 NA intron (NM_001324172, intron 8 of 13) intron (NM_001324172, intron 8 of 13) 52130 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 165.667-181 chr6 158589991 158590258 + 1 NA intron (NM_020823, intron 6 of 16) L3|LINE|CR1 -19583 NR_106981 102465694 NR_106981 ENSG00000278571 MIR7161 hsa-mir-7161 microRNA 7161 ncRNA 152.333-186 chr2 121705179 121705347 + 1 NA intron (NR_037857, intron 2 of 3) intron (NR_037857, intron 2 of 3) 31612 NM_032390 84365 Hs.367842 NM_032390 ENSG00000155438 NIFK MKI67IP|Nopp34 nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 protein-coding 170.667-10 chr1 171326743 171326968 + 1 NA intron (NM_002022, intron 5 of 9) LTR56|LTR|ERV1 -12041 NR_002719 7151 Hs.661092 NR_002719 TOP1P1 - DNA topoisomerase I pseudogene 1 pseudo 133.333-58 chr15 58976099 58976367 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -11430 NM_001270528 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 157.333-367 chr9 111389665 111389940 + 1 NA intron (NM_001363756, intron 29 of 48) intron (NM_001363756, intron 29 of 48) -59578 NM_205859 26248 Hs.381312 NM_205859 ENSG00000171133 OR2K2 HSHTPCRH06|HTPCRH06|OR2AN1P|OR2AR1P olfactory receptor family 2 subfamily K member 2 protein-coding 115.667-177 chr5 33011661 33011809 + 1 NA Intergenic Intergenic 64292 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 167.333-58 chr11 115551274 115551517 + 1 NA Intergenic Intergenic -46980 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 212.667-109 chr5 107702847 107703100 + 1 NA Intergenic Intergenic -32036 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 152.667-182 chr2 76268572 76268725 + 1 NA Intergenic Intergenic -557733 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 151.333-349 chr5 116607592 116607773 + 1 NA intron (NR_147170, intron 2 of 2) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -32859 NM_001300780 57556 Hs.156967 NM_020681 ENSG00000092421 SEMA6A HT018|SEMA|SEMA6A1|SEMAQ|VIA semaphorin 6A protein-coding 256.667-71 chr5 121595464 121596015 + 1 NA Intergenic Intergenic -256143 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 212.333-21 chr10 99907610 99908058 + 1 NA intron (NM_015221, intron 6 of 16) intron (NM_015221, intron 6 of 16) 6258 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 185.667-30 chr13 87617299 87617557 + 1 NA intron (NR_033829, intron 1 of 5) intron (NR_033829, intron 1 of 5) 1312 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 272.667-36 chr20 46452028 46452485 + 1 NA Intergenic Intergenic 5387 NR_045983 100130934 Hs.712133 NM_173643 ZNF663P ZNF663 zinc finger protein 663, pseudogene pseudo 203.667-111 chr7 27726102 27726511 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13067 NM_001206901 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 180.333-6 chr1 153100410 153100635 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -5996 NM_001024209 6704 Hs.568518 NM_001024209 ENSG00000203785 SPRR2E - small proline rich protein 2E protein-coding 184.667-86 chr4 30644911 30645300 + 1 NA Intergenic Intergenic -75264 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 248.667-33 chr14 25450190 25450676 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -400136 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 149.333-101 chr13 54541324 54541475 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -229351 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 138.333-180 chr7 33396364 33396524 + 1 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 266880 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 137.667-160 chr6 47947323 47947470 + 1 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) L1MEd|LINE|L1 121293 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 149.667-387 chr8 17113535 17113725 + 1 NA intron (NR_146233, intron 12 of 15) intron (NR_146233, intron 12 of 15) -42852 NM_016353 51201 Hs.728241 NM_016353 ENSG00000104219 ZDHHC2 DHHC2|ZNF372 zinc finger DHHC-type containing 2 protein-coding 118.333-101 chr2 49332868 49333102 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -178458 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 347.667-9 chr2 40514535 40515043 + 1 NA Intergenic Intergenic -2354 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 160.667-180 chr20 53793790 53793976 + 1 NA Intergenic Intergenic 81826 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 154.333-166 chr2 124066204 124066375 + 1 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 41002 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 155.333-18 chr1 226146446 226146694 + 1 NA 3' UTR (NM_022735, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_022735, exon 8 of 8) -1433 NR_146443 107985353 Hs.735455 NR_146443 ENSG00000234478 ACBD3-AS1 - ACBD3 antisense RNA 1 ncRNA 305.333-58 chr5 108564367 108564741 + 1 NA Intergenic LTR68|LTR|ERV1 163707 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 218.333-114 chr7 42742381 42742752 + 1 NA Intergenic Intergenic -36119 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 222.667-42 chr2 106037217 106037643 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -28258 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 166.333-230 chr8 87153878 87154049 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 287548 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 136.667-74 chr16 63201768 63202034 + 1 NA Intergenic Intergenic -1165463 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 278.333-38 chr7 26747043 26747542 + 1 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) intron (NM_003930, intron 4 of 12) 109421 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 190.333-6 chr1 147251270 147251510 + 1 NA intron (NM_001348452, intron 1 of 22) L1MD1|LINE|L1 8248 NM_001348452 9557 Hs.191164 NM_004284 ENSG00000131778 CHD1L ALC1|CHDL chromodomain helicase DNA binding protein 1 like protein-coding 164.333-150 chr3 24167122 24167315 + 1 NA intron (NM_001354708, intron 4 of 9) intron (NM_001354708, intron 4 of 9) 15894 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 237.333-47 chr18 3573077 3573556 + 1 NA intron (NM_001242762, intron 5 of 9) AluSq2|SINE|Alu -20798 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 121.333-119 chr3 147532600 147532779 + 1 NA Intergenic Intergenic 111362 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 208.333-153 chr8 124726610 124726836 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 1 of 14) intron (NM_001282971, intron 1 of 14) 1750 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 182.333-163 chr8 138428658 138428880 + 1 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 68492 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 150.667-385 chr8 122261394 122261594 + 1 NA Intergenic Intergenic 307150 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 136.333-13 chr1 211791314 211791481 + 1 NA intron (NM_014873, intron 3 of 7) L2b|LINE|L2 -38240 NR_135818 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 126.667-176 chr8 90283401 90283612 + 1 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) LTR1D1|LTR|ERV1 62018 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 142.667-202 chr7 34481221 34481481 + 1 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) intron (NR_033665, intron 2 of 3) -176867 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 153.667-178 chr2 54994651 54994843 + 1 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 15525 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 206.333-144 chr6 137931333 137931709 + 1 NA Intergenic Intergenic 14279 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 153.333-233 chr20 2302672 2302855 + 1 NA intron (NM_003245, intron 1 of 12) L1MB5|LINE|L1 6762 NM_003245 7053 Hs.2022 NM_003245 ENSG00000125780 TGM3 TGE|UHS2 transglutaminase 3 protein-coding 152.333-268 chr4 38282420 38282661 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -84374 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 142.333-58 chr12 42520475 42520737 + 1 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) -36596 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 207.667-27 chr12 131934115 131934503 + 1 NA intron (NM_025215, intron 3 of 5) LTR13A|LTR|ERVK 5033 NM_001002019 80324 Hs.592004 NM_025215 ENSG00000177192 PUS1 MLASA1 pseudouridine synthase 1 protein-coding 156.667-152 chr18 6769179 6769356 + 1 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -39405 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 244.333-17 chr11 5155523 5155879 + 1 NA Intergenic Intergenic -3332 NM_012375 23538 Hs.553520 NM_012375 ENSG00000182070 OR52A1 HPFH1OR olfactory receptor family 52 subfamily A member 1 protein-coding 181.667-71 chr2 100738038 100738359 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -81941 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 155.333-158 chr2 28727335 28727494 + 1 NA intron (NR_145832, intron 1 of 1) intron (NR_145832, intron 1 of 1) 8791 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 142.667-16 chr10 4818464 4818714 + 1 NA Intergenic Intergenic -7588 NM_001271021 83592 Hs.657944 NM_031436 ENSG00000165568 AKR1E2 AKR1CL2|AKRDC1|LoopADR|TAKR|hTSP|htAKR aldo-keto reductase family 1 member E2 protein-coding 189.667-70 chr2 60375974 60376356 + 1 NA intron (NR_132991, intron 2 of 3) LTR16|LTR|ERVL 6871 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 162.333-89 chr16 68766338 68766538 + 1 NA intron (NM_001317185, intron 2 of 15) intron (NM_001317185, intron 2 of 15) 29146 NM_001317185 999 Hs.461086 NM_004360 ENSG00000039068 CDH1 Arc-1|BCDS1|CD324|CDHE|ECAD|LCAM|UVO cadherin 1 protein-coding 215.333-106 chr2 201985636 201985952 + 1 NA Intergenic Intergenic -48793 NM_003507 8324 Hs.173859 NM_003507 ENSG00000155760 FZD7 FzE3 frizzled class receptor 7 protein-coding 140.333-34 chr10 110971842 110972005 + 1 NA intron (NM_001269039, intron 2 of 7) intron (NM_001269039, intron 2 of 7) -17003 NR_031614 100313921 NR_031614 ENSG00000221214 MIR548E MIRN548E|hsa-mir-548e microRNA 548e ncRNA 145.667-137 chr2 80192902 80193072 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 111765 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 223.333-63 chr19 40545279 40545613 + 1 NA intron (NM_025213, intron 3 of 9) L1ME3G|LINE|L1 14955 NM_025213 57731 Hs.32706 NM_020971 ENSG00000160460 SPTBN4 CMND|NEDHND|QV|SPNB4|SPTBN3 spectrin beta, non-erythrocytic 4 protein-coding 188.333-94 chr3 44910662 44910958 + 1 NA intron (NM_003241, intron 11 of 13) intron (NM_003241, intron 11 of 13) 36202 NM_003241 7047 Hs.438265 NM_003241 ENSG00000163810 TGM4 TGP|hTGP transglutaminase 4 protein-coding 119.333-4 chr1 40607796 40607941 + 1 NA Intergenic Intergenic 57814 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 219.667-89 chr7 115764693 115765145 + 1 NA Intergenic Intergenic -183478 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 172.333-113 chr3 88827874 88828096 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -279636 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 239.333-58 chr2 180712344 180712665 + 1 NA intron (NR_104323, intron 1 of 5) L1PREC2|LINE|L1 20400 NR_104323 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 146.333-47 chr11 38639251 38639514 + 1 NA intron (NR_120554, intron 1 of 4) L1MA3|LINE|L1 6974 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 150.667-288 chr5 17168631 17168809 + 1 NA intron (NR_027253, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu -12728 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 149.333-29 chr1 196043704 196043994 + 1 NA Intergenic Intergenic 44866 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 149.333-82 chr12 14782868 14783100 + 1 NA Intergenic Intergenic 8648 NM_177925 55766 Hs.524280 NM_018267 ENSG00000246705 H2AFJ H2AJ H2A histone family member J protein-coding 160.333-227 chr5 7871121 7871309 + 1 NA intron (NR_157174, intron 2 of 14) MIRc|SINE|MIR 2067 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 166.333-247 chrX 58314407 58314755 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -403948 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 166.333-61 chr13 76396048 76396228 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -461006 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 156.333-357 chr8 94916412 94916630 + 1 NA intron (NM_001354534, intron 1 of 8) intron (NM_001354534, intron 1 of 8) 20722 NR_148906 137682 Hs.435500 NM_152416 ENSG00000156170 NDUFAF6 C8orf38|MC1DN17 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6 protein-coding 115.667-87 chr15 89995083 89995295 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -6135 NM_198526 374655 Hs.459311 NM_198526 ENSG00000140548 ZNF710 - zinc finger protein 710 protein-coding 155.333-174 chr2 123345983 123346170 + 1 NA Intergenic Intergenic -272595 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 192.667-61 chr14 97938114 97938442 + 1 NA intron (NR_152750, intron 2 of 2) intron (NR_152750, intron 2 of 2) 39846 NR_015430 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 159.667-295 chr7 26319493 26319695 + 1 NA intron (NM_001318199, intron 1 of 6) intron (NM_001318199, intron 1 of 6) 26563 NM_001318199 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 127.333-72 chr19 44104985 44105250 + 1 NA TTS (NR_033341) TTS (NR_033341) 8066 NR_033341 100379224 Hs.585869 NR_033341 ENSG00000186019 LOC100379224 - uncharacterized LOC100379224 ncRNA 165.333-14 chr1 115836713 115837014 + 1 NA 3' UTR (NM_005599, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_005599, exon 3 of 3) 3840 NM_001111061 4808 Hs.46296 NM_005599 ENSG00000177551 NHLH2 HEN2|NSCL2|bHLHa34 nescient helix-loop-helix 2 protein-coding 339.333-19 chr17 55137510 55138014 + 1 NA intron (NM_178509, intron 16 of 17) MIR|SINE|MIR -127198 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 300.333-15 chr15 68168734 68169329 + 1 NA intron (NM_016166, intron 8 of 13) intron (NM_016166, intron 8 of 13) 37079 NR_104583 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 162.333-207 chr5 145769995 145770201 + 1 NA intron (NM_205846, intron 5 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 65244 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 165.667-61 chr15 65884503 65884701 + 1 NA intron (NM_004663, intron 4 of 4) intron (NM_004663, intron 4 of 4) 15111 NM_004663 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 258.333-57 chr7 16935643 16935969 + 1 NA Intergenic Intergenic -53823 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 295.667-24 chr5 98606733 98607135 + 1 NA Intergenic Intergenic -161698 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 174.667-5 chr1 75456166 75456474 + 1 NA intron (NM_001320285, intron 2 of 25) L1PA16|LINE|L1 154794 NM_001320287 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 286.667-30 chr4 155681560 155682003 + 1 NA intron (NM_000856, intron 3 of 10) intron (NM_000856, intron 3 of 10) 14119 NM_001130684 2982 Hs.24258 NM_000856 ENSG00000164116 GUCY1A1 GC-SA3|GUC1A3|GUCA3|GUCSA3|GUCY1A3|MYMY6 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 1 protein-coding 215.333-69 chr16 59370033 59370368 + 1 NA Intergenic Intergenic 384991 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 221.333-94 chr3 87227285 87227764 + 1 NA exon (NM_014043, exon 1 of 6) exon (NM_014043, exon 1 of 6) 215 NM_001244644 25978 Hs.476930 NM_014043 ENSG00000083937 CHMP2B ALS17|CHMP2.5|DMT1|VPS2-2|VPS2B charged multivesicular body protein 2B protein-coding 160.333-118 chr15 92158920 92159146 + 1 NA intron (NM_013272, intron 9 of 9) intron (NM_013272, intron 9 of 9) -234848 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 155.667-280 chr5 75975220 75975529 + 1 NA Intergenic Intergenic -108009 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 145.333-12 chr1 111628559 111628815 + 1 NA intron (NM_001010935, intron 2 of 8) intron (NM_001010935, intron 2 of 8) -8289 NR_160737 107985184 NR_160737 LOC107985184 - uncharacterized LOC107985184 ncRNA 150.333-279 chr3 168195166 168195381 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -54249 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 194.333-43 chr14 71243760 71244046 + 1 NA Intergenic Intergenic -76573 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 147.333-41 chr10 51611280 51611431 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) L1MA4A|LINE|L1 88240 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 210.333-62 chr18 22554356 22554593 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -136559 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 196.333-85 chr2 115469124 115469538 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) intron (NM_001321912, intron 4 of 25) 125516 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 230.333-51 chr18 21586602 21586870 + 1 NA intron (NM_052911, intron 1 of 11) L1M4|LINE|L1 13968 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 296.333-8 chr12 71339540 71339899 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -100079 NM_003667 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 172.333-123 chr4 44029797 44030055 + 1 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 12864 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 158.667-256 chr4 170442981 170443229 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 216514 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 228.333-59 chr3 5342328 5342826 + 1 NA Intergenic Intergenic -92322 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 145.333-5 chr1 90406716 90406955 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -250915 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 158.333-189 chr22 49897335 49897505 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 21018 NM_024105 79087 Hs.526711 NM_024105 ENSG00000182858 ALG12 CDG1G|ECM39|PP14673|hALG12 ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferase protein-coding 148.333-16 chr1 91413048 91413200 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -8287 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 154.667-185 chr2 119084147 119084337 + 1 NA Intergenic Intergenic 74509 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 184.333-140 chr7 85639486 85639769 + 1 NA Intergenic Intergenic 218505 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 212.333-108 chr4 119797305 119797669 + 1 NA Intergenic Intergenic 7028 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 159.667-5 chr1 43403599 43403844 + 1 NA exon (NM_001365999, exon 3 of 72) exon (NM_001365999, exon 3 of 72) 13822 NM_001365999 23334 Hs.643560 NM_015284 ENSG00000198198 SZT2 C1orf84|EIEE18|KIAA0467|SZT2A|SZT2B SZT2 subunit of KICSTOR complex protein-coding 148.333-132 chr14 80178384 80178551 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -32952 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 145.333-264 chr6 140476650 140476805 + 1 NA Intergenic Intergenic -207087 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 184.333-128 chr6 56249284 56249587 + 1 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) L1MB7|LINE|L1 -1855 NM_030820 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 150.667-285 chr4 159639454 159639652 + 1 NA Intergenic Intergenic 138231 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 177.333-38 chr12 42628994 42629215 + 1 NA intron (NR_110042, intron 5 of 5) AluSx1|SINE|Alu 17394 NR_110042 101927058 Hs.434238 NR_110042 ENSG00000257510 LINC02402 - long intergenic non-protein coding RNA 2402 ncRNA 160.333-64 chr11 85232802 85233086 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) intron (NM_001142699, intron 4 of 27) -309523 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 188.667-86 chr2 218868459 218868870 + 1 NA intron (NM_006522, intron 1 of 3) intron (NM_006522, intron 1 of 3) 8859 NM_006522 7475 Hs.29764 NM_006522 ENSG00000115596 WNT6 - Wnt family member 6 protein-coding 239.667-8 chr10 93978783 93979086 + 1 NA Intergenic Intergenic -14997 NM_001288989 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 174.667-143 chr5 85319863 85320134 + 1 NA Intergenic Intergenic -935118 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 194.333-94 chr4 42650138 42650530 + 1 NA intron (NM_001105529, intron 1 of 35) intron (NM_001105529, intron 1 of 35) 6771 NM_006095 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 147.667-229 chr3 71088442 71088626 + 1 NA intron (NR_146142, intron 7 of 19) intron (NR_146142, intron 7 of 19) -23610 NM_001244813 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 143.667-129 chr2 77251657 77251807 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 265767 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 165.667-139 chr4 47818576 47818885 + 1 NA intron (NM_006587, intron 1 of 21) AluJb|SINE|Alu -12615 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 191.333-114 chr2 101642771 101643192 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -54722 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 226.667-27 chr11 130236272 130236568 + 1 NA intron (NR_163264, intron 5 of 10) intron (NR_163264, intron 5 of 10) 76638 NM_021978 6768 Hs.504315 NM_021978 ENSG00000149418 ST14 ARCI11|HAI|MT-SP1|MTSP1|PRSS14|SNC19|TADG15|TMPRSS14 suppression of tumorigenicity 14 protein-coding 114.667-262 chr9 89228955 89229167 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -50243 NM_016848 53358 Hs.292737 NM_016848 ENSG00000148082 SHC3 N-Shc|NSHC|RAI|SHCC SHC adaptor protein 3 protein-coding 299.333-21 chr13 52886256 52886626 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -37801 NM_032949 5100 Hs.19492 NM_002590 ENSG00000136099 PCDH8 ARCADLIN|PAPC protocadherin 8 protein-coding 235.333-11 chr10 37920343 37920664 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 55477 NR_138069 219749 Hs.499429 NM_145011 ENSG00000175395 ZNF25 KOX19|Zfp9 zinc finger protein 25 protein-coding 220.333-135 chr8 141815611 141815846 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -29415 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 206.333-179 chrX 117339536 117339763 + 1 NA Intergenic Intergenic -521789 NR_145523 100126447 Hs.695847 NR_145523 LOC100126447 - uncharacterized LOC100126447 ncRNA 123.667-24 chr1 239812052 239812235 + 1 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 87729 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 184.667-142 chr9 113300779 113301010 + 1 NA intron (NM_001371237, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -1854 NM_145051 138065 Hs.729641 NM_145051 ENSG00000165188 RNF183 - ring finger protein 183 protein-coding 181.333-186 chr8 141587910 141588184 + 1 NA Intergenic Intergenic -80817 NM_207414 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 195.333-53 chr11 109656342 109656636 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 234299 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 351.667-2 chr10 76347067 76347695 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -540663 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 201.333-91 chr14 32223562 32223867 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -20445 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 234.667-40 chr15 100179091 100179480 + 1 NA intron (NM_139057, intron 8 of 21) L1MA3|LINE|L1 162690 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 203.333-70 chr14 32537204 32537493 + 1 NA intron (NM_004274, intron 3 of 13) intron (NM_004274, intron 3 of 13) 208050 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 245.333-124 chr8 127497228 127497546 + 1 NA Intergenic Intergenic -15248 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 131.667-23 chr10 63964105 63964341 + 1 NA Intergenic Intergenic -442333 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 219.667-49 chr21 30220084 30220429 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -4159 NM_199328 9073 Hs.162209 NM_012132 ENSG00000156284 CLDN8 HEL-S-79 claudin 8 protein-coding 116.667-83 chr18 937927 938082 + 1 NA Intergenic Intergenic -10011 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 271.667-52 chr5 41407404 41407733 + 1 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) intron (NM_001005473, intron 1 of 2) 103033 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 145.333-215 chr4 60148646 60148912 + 1 NA Intergenic Intergenic -773840 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 152.333-64 chr11 61386012 61386178 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -6265 NM_001330285 51259 Hs.26745 NM_016499 ENSG00000187049 TMEM216 HSPC244 transmembrane protein 216 protein-coding 222.667-11 chr10 117054790 117055163 + 1 NA intron (NM_001258300, intron 1 of 17) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -49399 NM_001258298 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 198.333-58 chr14 57677292 57677568 + 1 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) L1ME2z|LINE|L1 -183573 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 208.333-103 chr4 44399561 44399847 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 49105 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 146.333-158 chr2 141674490 141674645 + 1 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) MIRb|SINE|MIR 457134 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 463.333-8 chr6 43238200 43238859 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -4952 NM_032538 84630 Hs.485436 NM_032538 ENSG00000146216 TTBK1 BDTK tau tubulin kinase 1 protein-coding 160.667-67 chr12 25062269 25062519 + 1 NA intron (NM_001366547, intron 2 of 22) intron (NM_001366547, intron 2 of 22) 9688 NM_001204127 4033 Hs.124922 NM_006152 ENSG00000118308 LRMP JAW1 lymphoid restricted membrane protein protein-coding 166.667-237 chr8 124211773 124211964 + 1 NA intron (NR_125420, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 35530 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 151.667-211 chr3 41394199 41394386 + 1 NA intron (NM_001322500, intron 35 of 35) intron (NM_001322500, intron 35 of 35) 194787 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 314.667-30 chr5 16480778 16481501 + 1 NA intron (NM_019000, intron 2 of 6) intron (NM_019000, intron 2 of 6) -15339 NM_033414 90441 Hs.60300 NM_033414 ENSG00000173545 ZNF622 ZPR9 zinc finger protein 622 protein-coding 293.333-38 chr20 43314380 43315003 + 1 NA Intergenic Intergenic -124785 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 148.333-81 chr12 6234809 6235079 + 1 NA intron (NM_001769, intron 4 of 7) intron (NM_001769, intron 4 of 7) 34544 NM_001769 928 Hs.114286 NM_001769 ENSG00000010278 CD9 BTCC-1|DRAP-27|MIC3|MRP-1|TSPAN-29|TSPAN29 CD9 molecule protein-coding 143.667-28 chr10 88532224 88532384 + 1 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 51014 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 295.333-30 chr2 185035240 185035541 + 1 NA Intergenic Intergenic 131682 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 200.667-117 chr4 30410581 30410960 + 1 NA Intergenic Intergenic -309599 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 258.667-93 chr7 125343922 125344397 + 1 NA intron (NR_110188, intron 6 of 8) intron (NR_110188, intron 6 of 8) -79868 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 151.667-32 chr1 212354226 212354445 + 1 NA intron (NM_006243, intron 8 of 12) AluJb|SINE|Alu 1517 NR_004389 692157 Hs.707958 NR_004389 ENSG00000201544 SNORA16B U98b small nucleolar RNA, H/ACA box 16B snoRNA 213.667-21 chr11 60982704 60982953 + 1 NA intron (NM_001254751, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 11148 NM_006725 923 Hs.744366 NM_006725 ENSG00000013725 CD6 TP120 CD6 molecule protein-coding 148.667-299 chr5 4847514 4847675 + 1 NA Intergenic Intergenic 74113 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 168.333-174 chr6 36133056 36133256 + 1 NA intron (NR_072996, intron 3 of 9) intron (NR_072996, intron 3 of 9) 2643 NM_002754 5603 Hs.178695 NM_002754 ENSG00000156711 MAPK13 MAPK 13|MAPK-13|PRKM13|SAPK4|p38delta mitogen-activated protein kinase 13 protein-coding 161.667-245 chr8 51136794 51137056 + 1 NA Intergenic Intergenic 672520 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 226.333-115 chr9 21862258 21862730 + 1 NA 3' UTR (NM_002451, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_002451, exon 8 of 8) 59858 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 275.667-3 chr1 98456181 98456518 + 1 NA Intergenic Intergenic -205372 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 242.333-98 chr8 64529866 64530168 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 47246 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 181.667-147 chr8 89979631 89979879 + 1 NA intron (NM_001024688, intron 5 of 16) intron (NM_001024688, intron 5 of 16) 4916 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 199.333-307 chr9 110853447 110853727 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 125325 NM_001369398 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 146.667-22 chr1 190353331 190353505 + 1 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 122592 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 153.667-10 chr1 64135536 64135827 + 1 NA intron (NM_005012, intron 4 of 8) intron (NM_005012, intron 4 of 8) -21890 NR_110665 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 145.667-32 chr10 28580200 28580472 + 1 NA intron (NM_100486, intron 3 of 12) intron (NM_100486, intron 3 of 12) 47218 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 244.333-51 chr17 55735250 55735620 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -3354 NM_001099640 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 144.667-49 chr12 11837037 11837230 + 1 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) intron (NM_001987, intron 2 of 7) 187279 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 324.333-21 chr18 24354291 24354703 + 1 NA intron (NM_080597, intron 4 of 27) L1MCc|LINE|L1 32822 NR_031724 100302195 NR_031724 ENSG00000212051 MIR320C2 MIR320C-2|MIRN320C2|hsa-mir-320c-2|mir-320c-2 microRNA 320c-2 ncRNA 159.333 chr1 9555324 9555488 + 1 NA intron (NM_032315, intron 2 of 6) AluY|SINE|Alu 15941 NM_032315 84275 Hs.568613 NM_032315 ENSG00000171612 SLC25A33 BMSC-MCP|PNC1 solute carrier family 25 member 33 protein-coding 270.333-56 chr6 152961594 152961947 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 21271 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 218.667-14 chr10 90641472 90641961 + 1 NA Intergenic Intergenic -100911 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 180.667-6 chr1 118311624 118311940 + 1 NA Intergenic Intergenic -126554 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 261.333-67 chr3 98373028 98373455 + 1 NA Intergenic Intergenic -17425 NM_001005516 403277 Hs.554709 NM_001005516 ENSG00000206536 OR5K3 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 3 protein-coding 161.333-251 chr6 132937093 132937389 + 1 NA Intergenic Intergenic 120022 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 191.667-72 chr2 183514652 183514912 + 1 NA Intergenic Intergenic 390339 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 148.667-374 chr8 73854709 73854876 + 1 NA intron (NR_073119, intron 1 of 5) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 24070 NM_001271015 55284 Hs.128841 NM_018299 ENSG00000104343 UBE2W UBC-16|UBC16 ubiquitin conjugating enzyme E2 W protein-coding 188.667-101 chr3 47543189 47543526 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29645 NM_001031703 54859 Hs.311100 NM_017713 ENSG00000163832 ELP6 C3orf75|TMEM103 elongator acetyltransferase complex subunit 6 protein-coding 162.667-192 chr4 41064998 41065223 + 1 NA intron (NM_001330658, intron 3 of 15) AluJo|SINE|Alu 149432 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 302.333-17 chr17 47204003 47204392 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -4865 NM_001002841 4635 Hs.463300 NM_002476 ENSG00000198336 MYL4 ALC1|AMLC|GT1|PRO1957 myosin light chain 4 protein-coding 218.667-94 chr6 81355830 81356105 + 1 NA Intergenic Intergenic 396714 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 149.667-133 chr15 25416901 25417060 + 1 NA intron (NM_001354543, intron 2 of 16) L1ME1|LINE|L1 21249 NM_001354526 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 170.667-95 chr20 2155597 2155828 + 1 NA Intergenic Intergenic -51216 NR_161305 388780 Hs.132163 NR_161305 LOC388780 - uncharacterized LOC388780 ncRNA 150.333-168 chr18 2231120 2231308 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 340291 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 149.667-69 chr11 18515359 18515559 + 1 NA intron (NM_006292, intron 3 of 9) L3|LINE|CR1 11483 NM_006292 7251 Hs.523512 NM_006292 ENSG00000074319 TSG101 TSG10|VPS23 tumor susceptibility 101 protein-coding 179.667-83 chr20 5585089 5585429 + 1 NA intron (NM_019593, intron 5 of 19) intron (NM_019593, intron 5 of 19) 25747 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 150.667-320 chr5 170545977 170546129 + 1 NA intron (NM_001278339, intron 1 of 7) L1MEg|LINE|L1 42033 NM_001278339 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 160.333-280 chr8 88940903 88941063 + 1 NA Intergenic Intergenic -613500 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 156.667-149 chr18 5139411 5139599 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 57752 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 235.333-59 chr2 123204527 123204813 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -131189 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 167.667-107 chr2 119652715 119653004 + 1 NA intron (NR_073132, intron 24 of 24) intron (NR_073132, intron 24 of 24) -26308 NM_001105198 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 141.333-231 chr7 145294030 145294250 + 1 NA Intergenic Intergenic -458087 NM_001350887 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 196.667-100 chr3 97880779 97881042 + 1 NA intron (NM_153605, intron 6 of 21) intron (NM_153605, intron 6 of 21) 58899 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 211.333-255 chrX 44414282 44414579 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -70758 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 148.667-135 chr15 61872574 61872773 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 78 of 81) intron (NM_001018088, intron 78 of 81) 142755 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 177.333-77 chr2 13581796 13582033 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -574901 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 221.667-25 chr13 82688940 82689307 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 1193270 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 273.667-34 chr2 152544463 152544973 + 1 NA intron (NM_052905, intron 3 of 25) intron (NM_052905, intron 3 of 25) 172743 NM_001365604 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 160.333-29 chr1 209297426 209297744 + 1 NA Intergenic Intergenic -27871 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 144.333-38 chr11 77624268 77624419 + 1 NA intron (NM_001311202, intron 2 of 4) intron (NM_001311202, intron 2 of 4) 13451 NM_001311201 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 323.667-2 chr10 21734686 21735097 + 1 NA intron (NM_001195626, intron 20 of 22) intron (NM_001195626, intron 20 of 22) 200719 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 152.667-174 chr2 45916098 45916400 + 1 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu 264574 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 248.667-20 chr11 39833573 39833933 + 1 NA Intergenic Intergenic 459377 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 227.333-107 chr6 36781317 36781583 + 1 NA intron (NM_020939, intron 8 of 20) MIRb|SINE|MIR -24041 NM_001314018 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 171.333-96 chr2 176940959 176941174 + 1 NA Intergenic Intergenic 271345 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 189.333-176 chr6 129867164 129867485 + 1 NA Intergenic Intergenic -6009 NM_001010876 253582 NM_001010876 ENSG00000203756 TMEM244 C6orf191|bA174C7.4 transmembrane protein 244 protein-coding 130.667-151 chr4 12767702 12767877 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 544338 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 208.667-28 chr11 28655514 28655870 + 1 NA Intergenic Intergenic -178144 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 159.333-167 chr2 133957276 133957479 + 1 NA Intergenic Intergenic -162558 NM_001371457 164.667-171 chr4 112924519 112924812 + 1 NA intron (NM_001354275, intron 2 of 43) L1ME4a|LINE|L1 63678 NM_001354267 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 176.333-13 chr1 198123497 198123715 + 1 NA Intergenic Intergenic -33392 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 209.333-249 chr9 27709516 27709827 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -135805 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 154.667-394 chr8 106460686 106460871 + 1 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 12854 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 179.333-23 chr10 52533467 52533850 + 1 NA Intergenic Intergenic -63125 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 128.333-85 chr18 6842225 6842535 + 1 NA intron (NM_001010000, intron 2 of 16) AluJr|SINE|Alu 7895 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 148.667-10 chr1 93257283 93257518 + 1 NA intron (NM_001306076, intron 25 of 28) intron (NM_001306076, intron 25 of 28) 76684 NM_001306076 343099 Hs.482873 NM_206886 ENSG00000122483 CCDC18 NY-SAR-41 coiled-coil domain containing 18 protein-coding 195.667-24 chr12 7776233 7776507 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 11154 NM_001145465 360030 Hs.558004 NM_001145465 ENSG00000205857 NANOGNB - NANOG neighbor homeobox protein-coding 156.667-299 chr6 62264182 62264444 + 1 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 21912 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 130.667-88 chr17 52444759 52444917 + 1 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) L1ME3A|LINE|L1 54316 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 148.333-14 chr1 90222911 90223161 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 227926 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 279.333-73 chr9 96145380 96145724 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -29141 NR_132344 158434 Hs.381771 NM_001256408 ENSG00000275465 LOC158434 - uncharacterized LOC158434 ncRNA 223.333-81 chr2 136735775 136736148 + 1 NA Intergenic Intergenic -29584 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 187.667-88 chr3 37681598 37682031 + 1 NA intron (NM_002207, intron 17 of 27) L2a|LINE|L2 179966 NR_110532 101928153 Hs.657314 NR_110531 ENSG00000235257 ITGA9-AS1 - ITGA9 antisense RNA 1 ncRNA 233.333-47 chr17 75342283 75342789 + 1 NA intron (NM_002086, intron 2 of 5) FLAM_C|SINE|Alu -53087 NM_021734 60386 Hs.514470 NM_021734 ENSG00000125454 SLC25A19 DNC|MCPHA|MUP1|THMD3|THMD4|TPC solute carrier family 25 member 19 protein-coding 175.667-70 chr2 46132126 46132462 + 1 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) intron (NM_005400, intron 11 of 14) -165113 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 190.333-110 chr4 186309935 186310377 + 1 NA intron (NR_033900, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu 43967 NM_001354804 2160 Hs.1430 NM_000128 ENSG00000088926 F11 FXI|PTA coagulation factor XI protein-coding 181.667-133 chr6 169150934 169151253 + 1 NA Intergenic Intergenic 11208 NR_132622 101929484 Hs.364166 NR_132622 ENSG00000223485 LINC01615 - long intergenic non-protein coding RNA 1615 ncRNA 143.667-93 chr16 76206323 76206588 + 1 NA Intergenic Intergenic -70946 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 133.667-100 chr3 123924430 123924653 + 1 NA intron (NM_001366336, intron 8 of 8) L1MA7|LINE|L1 36688 NM_001366339 64770 Hs.645028 NM_022757 ENSG00000175455 CCDC14 - coiled-coil domain containing 14 protein-coding 274.667-56 chr8 83319704 83320204 + 1 NA Intergenic Intergenic -83804 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 132.667-12 chr1 209397365 209397581 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 25418 NR_146491 101929476 Hs.568721 NR_146491 LINC01698 - long intergenic non-protein coding RNA 1698 ncRNA 151.333-35 chr1 225167304 225167515 + 1 NA intron (NM_001367479, intron 35 of 85) intron (NM_001367479, intron 35 of 85) 237734 NM_001349912 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 262.333-46 chr2 60484787 60485141 + 1 NA intron (NM_138559, intron 2 of 4) intron (NM_138559, intron 2 of 4) 68534 NM_001365609 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 125.667-137 chr4 108282953 108283144 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 110928 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 113.667-234 chrX 80632770 80632912 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 177036 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 187.667-117 chr5 40669434 40669645 + 1 NA Intergenic Intergenic -10376 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 199.667-3 chr1 49174490 49174794 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) LTR79|LTR|ERVL -82769 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 127.667-46 chr14 56829188 56829344 + 1 NA intron (NR_146411, intron 2 of 2) X2_LINE|LINE|CR1 16108 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 138.333-109 chr20 50259978 50260198 + 1 NA Intergenic Intergenic -7398 NM_001278655 100506115 Hs.235484 NM_001278655 SMIM25 GCRL1|LINC01272 small integral membrane protein 25 protein-coding 190.333-62 chr19 18191545 18191945 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1473 NM_032683 84769 Hs.515254 NM_032683 ENSG00000254858 MPV17L2 FKSG24 MPV17 mitochondrial inner membrane protein like 2 protein-coding 133.333-69 chr18 64957416 64957589 + 1 NA Intergenic Intergenic -697447 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 141.333-88 chr18 5789371 5789514 + 1 NA intron (NR_038839, intron 3 of 4) MER39B|LTR|ERV1 40623 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 331.667-9 chr2 66133348 66133971 + 1 NA Intergenic Intergenic 224669 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 133.667-70 chr2 41925180 41925400 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 8433 NR_110263 101929723 Hs.369330 NR_110262 ENSG00000234362 LINC01914 - long intergenic non-protein coding RNA 1914 ncRNA 158.667-247 chr4 107258714 107258984 + 1 NA Intergenic Intergenic -222536 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 124.333-78 chr2 17383163 17383313 + 1 NA Intergenic Intergenic 135202 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 151.333-107 chr12 74579927 74580182 + 1 NA Intergenic Intergenic 42219 NM_001136262 552889 Hs.744849 NM_001136262 ENSG00000253719 ATXN7L3B lnc-SCA7 ataxin 7 like 3B protein-coding 113.667-154 chr4 26680715 26680897 + 1 NA intron (NM_001292054, intron 8 of 17) intron (NM_001292054, intron 8 of 17) 96722 NM_018317 55296 Hs.479403 NM_018317 ENSG00000109680 TBC1D19 - TBC1 domain family member 19 protein-coding 152.667-60 chr11 69733222 69733411 + 1 NA Intergenic Intergenic -29294 NM_005117 9965 Hs.249200 NM_005117 ENSG00000162344 FGF19 - fibroblast growth factor 19 protein-coding 217.667-25 chr12 37976559 37976940 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -340025 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 165.667-190 chr7 131029909 131030235 + 1 NA intron (NR_109850, intron 3 of 5) intron (NR_109850, intron 3 of 5) 76958 NR_024153 378805 Hs.150556 NM_001085379 ENSG00000231721 LINC-PINT LincRNA-Pint|MKLN1-AS1|PINT long intergenic non-protein coding RNA, p53 induced transcript ncRNA 171.333-90 chr2 138221809 138222009 + 1 NA Intergenic Intergenic 120025 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 203.333-261 chr8 79945013 79945395 + 1 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) -73467 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 163.667-139 chr20 58734918 58735098 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -38417 NR_134566 105372695 Hs.128204 NR_134566 LOC105372695 - uncharacterized LOC105372695 ncRNA 154.333-275 chr5 122610051 122610285 + 1 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -25568 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 166.333-216 chr8 6272935 6273201 + 1 NA Intergenic Intergenic 133480 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 128.333-150 chr5 36296869 36297168 + 1 NA intron (NM_001323279, intron 1 of 12) MLT2D|LTR|ERVL 4884 NM_001323277 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 214.333-130 chr6 146471878 146472362 + 1 NA Intergenic Intergenic -71713 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 245.667-81 chr9 71490735 71491185 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -43989 NM_001366144 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 118.667-189 chr8 64204844 64205040 + 1 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 163616 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 206.667-7 chr1 171115491 171115839 + 1 NA intron (NM_001002294, intron 7 of 8) intron (NM_001002294, intron 7 of 8) -13859 NR_031627 100302178 NR_031627 ENSG00000221390 MIR1295A MIR1295|MIRN1295|hsa-mir-1295|hsa-mir-1295a|mir-1295a microRNA 1295a ncRNA 149.667-307 chr5 36284920 36285072 + 1 NA intron (NM_001323279, intron 1 of 12) intron (NM_001323279, intron 1 of 12) 16906 NM_001323277 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 121.333-141 chr4 180573070 180573287 + 1 NA Intergenic Intergenic 585971 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 195.333-48 chr11 60017763 60018068 + 1 NA Intergenic Intergenic -5888 NM_001368161 107987155 NM_001368161 ENSG00000255393 OOSP4B - oocyte secreted protein family member 4B protein-coding 115.333-209 chr8 16488618 16488775 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -295905 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 129.667-109 chr2 241370156 241370316 + 1 NA intron (NM_014808, intron 1 of 26) L1MA4|LINE|L1 13951 NM_001282983 9855 Hs.726316 NM_014808 ENSG00000006607 FARP2 FIR|FRG|PLEKHC3 FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 protein-coding 125.333-68 chr15 94171722 94171935 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -63890 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 288.333-39 chr8 123029575 123030039 + 1 NA intron (NM_001330601, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu -4035 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 251.333-22 chr12 17847650 17847978 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 174515 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 184.333-162 chr9 29156189 29156491 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 55959 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 184.333-44 chr14 70564300 70564608 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -29450 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 182.333-52 chr15 45719206 45719402 + 1 NA intron (NR_135680, intron 1 of 4) AluSx3|SINE|Alu 14109 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 245.333-58 chr18 53852063 53852480 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -271212 NR_110800 101928167 Hs.382012 NR_110800 ENSG00000260433 LINC01917 - long intergenic non-protein coding RNA 1917 ncRNA 116.333-74 chr15 86952895 86953127 + 1 NA intron (NR_135683, intron 1 of 2) L1P4|LINE|L1 20131 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 201.333-13 chr1 150258120 150258481 + 1 NA intron (NM_012113, intron 1 of 10) intron (NM_012113, intron 1 of 10) 526 NM_012113 23632 Hs.528988 NM_012113 ENSG00000118298 CA14 CAXiV carbonic anhydrase 14 protein-coding 155.333-365 chr7 52198331 52198622 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -805220 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 157.667-9 chr1 95570883 95571061 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 60856 NR_110621 100996635 Hs.639548 NR_110621 ENSG00000228971 LINC02607 - long intergenic non-protein coding RNA 2607 ncRNA 182.333-154 chr8 74487477 74487675 + 1 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) -60967 NR_049860 100847058 NR_049860 ENSG00000266502 MIR5681A - microRNA 5681a ncRNA 192.667-150 chr6 101368548 101368815 + 1 NA Intergenic Intergenic -30304 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 241.667-67 chr4 150327635 150328047 + 1 NA intron (NM_001367550, intron 48 of 56) intron (NM_001367550, intron 48 of 56) 249396 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 153.333-234 chr20 4395008 4395272 + 1 NA Intergenic Intergenic -145853 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 116.333-105 chr2 6596988 6597132 + 1 NA Intergenic Intergenic 36727 NR_110500 102800315 Hs.729713 NR_110498 ENSG00000236172 LINC01246 - long intergenic non-protein coding RNA 1246 ncRNA 153.333-175 chr19 16568799 16569095 + 1 NA intron (NM_024881, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 3468 NM_024881 79939 Hs.620596 NM_024881 ENSG00000127526 SLC35E1 - solute carrier family 35 member E1 protein-coding 166.667-182 chr5 77695912 77696217 + 1 NA intron (NM_004607, intron 2 of 3) intron (NM_004607, intron 2 of 3) -57367 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 154.667-76 chr12 43158379 43158546 + 1 NA intron (NR_146866, intron 1 of 3) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 3147 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 266.667-20 chr12 88540471 88540914 + 1 NA intron (NM_000899, intron 2 of 9) intron (NM_000899, intron 2 of 9) 39779 NM_000899 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 152.667-26 chr1 236597865 236598093 + 1 NA exon (NM_018072, exon 5 of 45) exon (NM_018072, exon 5 of 45) 6537 NM_018072 55127 Hs.708114 NM_018072 ENSG00000119285 HEATR1 BAP28|UTP10 HEAT repeat containing 1 protein-coding 137.667-155 chr5 129508417 129508655 + 1 NA intron (NM_133638, intron 2 of 22) intron (NM_133638, intron 2 of 22) -47847 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 277.667-36 chr4 76328041 76328552 + 1 NA intron (NM_001042784, intron 21 of 23) L2a|LINE|L2 22270 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 190.667-153 chr8 125274530 125274891 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) AluSx|SINE|Alu -155648 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 188.667-115 chr4 72222593 72222920 + 1 NA Intergenic Intergenic 183624 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 155.333-168 chr2 102963176 102963366 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 21158 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 131.333-87 chr2 76221301 76221498 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -510484 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 229.667-28 chr14 58608184 58608454 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -25749 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 152.333-197 chr2 171606137 171606430 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -81186 NM_001271786 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 139.667-183 chr8 58354043 58354278 + 1 NA Intergenic Intergenic -57104 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 166.667-138 chr21 31224145 31224356 + 1 NA intron (NM_001353686, intron 7 of 27) intron (NM_001353686, intron 7 of 27) -63310 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 255.667-37 chr17 71039727 71040103 + 1 NA Intergenic Intergenic 162264 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 220.667-11 chr10 10794583 10795092 + 1 NA promoter-TSS (NR_027082) promoter-TSS (NR_027082) 77 NR_027082 207107 Hs.31562 NR_027082 ENSG00000225383 SFTA1P SFTPF surfactant associated 1, pseudogene pseudo 189.667-104 chr4 30599752 30600130 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -120428 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 157.667-60 chr11 102989046 102989313 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -33447 NM_002427 4322 Hs.2936 NM_002427 ENSG00000137745 MMP13 CLG3|MANDP1|MDST|MMP-13 matrix metallopeptidase 13 protein-coding 161.667-24 chr10 39519546 39519799 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 823076 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 152.333-322 chr6 9031294 9031585 + 1 NA Intergenic Intergenic 379230 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 244.333-88 chr6 66867327 66867763 + 1 NA Intergenic Intergenic 1079666 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 236.333-46 chr2 81216744 81217037 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 250056 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 147.667-397 chrX 54115074 54115307 + 1 NA intron (NM_001300788, intron 10 of 13) L1ME5|LINE|L1 68064 NM_017848 54954 Hs.86045 NM_017848 ENSG00000184083 FAM120C CXorf17|ORF34 family with sequence similarity 120C protein-coding 150.667-322 chr5 178623910 178624072 + 1 NA intron (NM_020666, intron 1 of 12) intron (NM_020666, intron 1 of 12) 3059 NM_020666 57396 Hs.406557 NM_020666 ENSG00000113240 CLK4 - CDC like kinase 4 protein-coding 177.333-114 chr3 155606042 155606313 + 1 NA intron (NM_001349252, intron 2 of 24) HERV35I-int|LTR|ERV1 70166 NM_001130961 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 134.333-38 chr12 77397260 77397416 + 1 NA Intergenic Intergenic -331769 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 168.333-109 chr2 228707558 228707761 + 1 NA Intergenic Intergenic -96264 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 111.667-166 chr3 18459439 18459605 + 1 NA intron (NR_125803, intron 1 of 6) intron (NR_125803, intron 1 of 6) -13930 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 292.333-2 chr1 115146189 115146677 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -56930 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 185.333-95 chr2 114460376 114460777 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 1 of 26) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -1001 NM_001321911 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 155.667-289 chr5 99326502 99326710 + 1 NA Intergenic Intergenic -207384 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 184.333-5 chr1 172782991 172783314 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 124049 NM_000639 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 217.333-109 chr4 108864546 108864875 + 1 NA intron (NM_198721, intron 19 of 36) L2c|LINE|L2 -101657 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 157.333-109 chr14 70104316 70104627 + 1 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) L1M4|LINE|L1 -24254 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 155.667-42 chr10 93345663 93345888 + 1 NA intron (NM_013451, intron 37 of 53) intron (NM_013451, intron 37 of 53) 136559 NM_133337 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 306.333-11 chr11 74646562 74647057 + 1 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac 54227 NR_046410 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 144.667-257 chr6 34620872 34621031 + 1 NA intron (NM_022758, intron 2 of 3) intron (NM_022758, intron 2 of 3) -64618 NM_001252294 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 137.667-143 chr4 93089274 93089488 + 1 NA intron (NM_001510, intron 3 of 15) intron (NM_001510, intron 3 of 15) -739372 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 202.667-84 chr2 173710686 173710979 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 253048 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 326.667-38 chr8 141274953 141275642 + 1 NA Intergenic Intergenic -20668 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 157.333-73 chr11 114049153 114049367 + 1 NA Intergenic Intergenic -10451 NM_001354750 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 219.667-8 chr10 58784463 58784854 + 1 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) MIR|SINE|MIR 69643 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 147.333-260 chr5 53911358 53911537 + 1 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) 40152 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 144.667-33 chr10 109060306 109060478 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 862854 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 177.667-132 chr8 62515442 62515682 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) L1M5|LINE|L1 266708 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 181.667-35 chr14 40242839 40243063 + 1 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 -711760 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 156.333-351 chr8 22527838 22528085 + 1 NA intron (NM_005605, intron 9 of 13) intron (NM_005605, intron 9 of 13) -23966 NM_005775 10174 Hs.528572 NM_005775 ENSG00000120896 SORBS3 SCAM-1|SCAM1|SH3D4 sorbin and SH3 domain containing 3 protein-coding 131.333-45 chr12 81134359 81134633 + 1 NA intron (NM_024560, intron 2 of 15) L2b|LINE|L2 -23892 NR_039848 100616133 NR_039848 ENSG00000265227 MIR4699 - microRNA 4699 ncRNA 118.667-140 chr3 108858798 108859017 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 36121 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 155.333-417 chrX 64028365 64028534 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 177259 NM_152424 139285 Hs.314225 NM_152424 ENSG00000184675 AMER1 FAM123B|OSCS|WTX APC membrane recruitment protein 1 protein-coding 163.333-211 chr5 8081189 8081430 + 1 NA Intergenic Intergenic 212161 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 172.667-135 chr6 49180943 49181239 + 1 NA Intergenic Intergenic 282162 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 148.667-126 chr14 73874522 73874784 + 1 NA TTS (NM_001371334) TTS (NM_001371334) -12206 NM_001242928 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 219.333-183 chr8 100898018 100898304 + 1 NA Intergenic Intergenic 52410 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 140.667-241 chr8 136074293 136074538 + 1 NA Intergenic Intergenic -456383 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 157.667-32 chr10 61044081 61044326 + 1 NA Intergenic Intergenic 27928 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 264.333-36 chr2 30632544 30632966 + 1 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) MIRb|SINE|MIR 174691 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 155.333-271 chr4 104920980 104921148 + 1 NA Intergenic Intergenic -224811 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 263.667-9 chr10 43017915 43018273 + 1 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 20531 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 124.667-78 chr16 60983733 60983898 + 1 NA Intergenic Intergenic 71951 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 166.333-165 chr4 37425181 37425482 + 1 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -28594 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 146.667-97 chr14 41534518 41534705 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -72245 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 182.333-139 chr6 67170336 67170665 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -884851 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 134.667-75 chr16 6383146 6383339 + 1 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) intron (NM_018723, intron 2 of 15) 363539 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 223.333-110 chr4 33896430 33896900 + 1 NA non-coding (NR_125902, exon 5 of 5) non-coding (NR_125902, exon 5 of 5) 143228 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 220.333-59 chr2 28030614 28030974 + 1 NA intron (NM_199193, intron 6 of 13) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 34427 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 164.333-113 chr2 40619682 40619952 + 1 NA Intergenic Intergenic -107382 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 274.667-50 chr7 32361864 32362322 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L2c|LINE|L2 -62765 NM_001322058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 155.667-173 chr2 133128715 133128930 + 1 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) AluSx1|SINE|Alu -137373 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 203.667-109 chr7 5100310 5100693 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 28441 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 195.667-136 chr7 136368118 136368323 + 1 NA Intergenic Intergenic -390861 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 144.333-271 chr8 117409235 117409428 + 1 NA Intergenic Intergenic -111382 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 198.333-174 chr6 20063792 20064107 + 1 NA Intergenic Intergenic 148520 NM_001080480 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 265.667-26 chr16 69022826 69023163 + 1 NA intron (NM_024562, intron 16 of 17) intron (NM_024562, intron 16 of 17) -82659 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 184.667-108 chr5 149857916 149858191 + 1 NA TTS (NM_000440) TTS (NM_000440) 74924 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 499.333-4 chr3 28121413 28122370 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -119728 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 144.667-170 chr20 45623306 45623535 + 1 NA intron (NM_147198, intron 1 of 4) AluSq|SINE|Alu -6319 NM_080753 140832 Hs.199380 NM_080753 ENSG00000180305 WFDC10A C20orf146|WAP10|dJ688G8.3 WAP four-disulfide core domain 10A protein-coding 171.667-150 chr7 1806097 1806269 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 38070 NR_039799 100616160 NR_039799 ENSG00000265089 MIR4655 - microRNA 4655 ncRNA 154.333-32 chr10 55394031 55394297 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) LTR51|LTR|ERV1 -204878 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 173.333-96 chr2 127160370 127160690 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 45237 NM_001001665 339761 Hs.407639 NM_001001665 ENSG00000186684 CYP27C1 - cytochrome P450 family 27 subfamily C member 1 protein-coding 215.333-199 chr8 106599204 106599542 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -58435 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 157.333-326 chr7 88180733 88180996 + 1 NA intron (NM_001324420, intron 27 of 30) intron (NM_001324420, intron 27 of 30) -35796 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 150.333-348 chr5 171167031 171167261 + 1 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) intron (NM_022897, intron 14 of 27) -142102 NM_021025 30012 Hs.249125 NM_021025 ENSG00000164438 TLX3 HOX11L2|RNX T cell leukemia homeobox 3 protein-coding 222.667-43 chr2 138089844 138090231 + 1 NA Intergenic Intergenic -11847 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 192.333-97 chr2 150681467 150681800 + 1 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 52736 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 233.667-46 chr2 220862119 220862560 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 709965 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 168.333-155 chr4 135804524 135804787 + 1 NA Intergenic Intergenic 83438 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 213.333-206 chr8 61499175 61499424 + 1 NA intron (NM_173519, intron 5 of 5) AluJr|SINE|Alu 190512 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 281.667-47 chr7 13108090 13108616 + 1 NA Intergenic Intergenic 420720 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 186.333-32 chr11 77848946 77849244 + 1 NA intron (NM_001316962, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 7957 NM_001363564 28971 Hs.745040 NM_024684 ENSG00000087884 AAMDC C11orf67|CK067|PTD015 adipogenesis associated Mth938 domain containing protein-coding 146.333-284 chr6 52010259 52010453 + 1 NA exon (NM_170724, exon 35 of 61) exon (NM_170724, exon 35 of 61) 77257 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 223.333-108 chr4 30295362 30295599 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -424889 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 156.667-219 chr22 34730145 34730315 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 267686 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 160.333-163 chr20 25535167 25535443 + 1 NA intron (NM_025176, intron 1 of 23) L1MA8|LINE|L1 50226 NM_001318226 22981 Hs.631508 NM_025176 ENSG00000101004 NINL NLP ninein like protein-coding 166.333-69 chr14 57941769 57941971 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -75778 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 190.667-53 chr17 11977708 11977952 + 1 NA 3' UTR (NM_001303281, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001303281, exon 7 of 7) 19542 NM_144680 7566 Hs.370473 NM_144680 ENSG00000154957 ZNF18 HDSG1|KOX11|ZKSCAN6|ZNF535|ZSCAN38|Zfp535 zinc finger protein 18 protein-coding 124.333-65 chr18 1211859 1212004 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 147698 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 136.333-12 chr1 201638608 201638768 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9634 NM_020443 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 173.667-145 chr5 104221852 104222201 + 1 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -659237 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 165.667-219 chr9 123386912 123387209 + 1 NA intron (NM_020946, intron 20 of 21) intron (NM_020946, intron 20 of 21) 15543 NR_030332 693186 NR_030332 ENSG00000207991 MIR601 MIRN601|hsa-mir-601 microRNA 601 ncRNA 242.333-12 chr10 55926594 55926886 + 1 NA Intergenic Intergenic -298798 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 146.333-349 chr9 36461836 36462004 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -60722 NM_194330 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 209.333-234 chr8 89106637 89107005 + 1 NA Intergenic Intergenic 650890 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 255.667-72 chr5 180022865 180023285 + 1 NA intron (NM_001280801, intron 2 of 7) L1MC3|LINE|L1 -7678 NR_029885 442908 NR_029885 ENSG00000198995 MIR340 MIRN340|hsa-mir-340|mir-340 microRNA 340 ncRNA 308.667-31 chr5 22861123 22861744 + 1 NA Intergenic Intergenic -8089 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 181.333-2 chr1 58659474 58659725 + 1 NA 3' UTR (NM_001085487, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001085487, exon 20 of 20) 40463 NM_001085487 114803 Hs.744921 NM_001085487 ENSG00000162601 MYSM1 2A-DUB|2ADUB|BMFS4 Myb like, SWIRM and MPN domains 1 protein-coding 191.667-8 chr1 155305099 155305369 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -3514 NM_001242825 2224 Hs.335918 NM_002004 ENSG00000160752 FDPS FPPS|FPS|POROK9 farnesyl diphosphate synthase protein-coding 131.667-162 chr5 62128472 62128689 + 1 NA Intergenic Intergenic -177582 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 169.667-154 chr4 93493905 93494153 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 11 of 14) intron (NM_001286838, intron 11 of 14) -334724 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 151.333-198 chr2 30156370 30156615 + 1 NA intron (NM_001127401, intron 3 of 4) intron (NM_001127401, intron 3 of 4) 9485 NM_001127401 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 160.667-286 chr7 78028133 78028299 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 20 of 20) intron (NM_001301128, intron 20 of 20) 188086 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 332.667-15 chr2 58256807 58257172 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -15609 NM_001114636 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 144.333-286 chr9 77430714 77430926 + 1 NA intron (NM_004297, intron 4 of 6) intron (NM_004297, intron 4 of 6) -16829 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 206.667-48 chr16 79657191 79657553 + 1 NA Intergenic Intergenic -56635 NM_005360 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 244.333-18 chr11 9433962 9434478 + 1 NA intron (NM_006391, intron 18 of 24) AluSp|SINE|Alu 5454 NR_002962 677808 Hs.689720 NR_002962 ENSG00000201998 SNORA23 ACA23 small nucleolar RNA, H/ACA box 23 snoRNA 149.333-317 chr5 110310817 110311021 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 202996 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 132.333-127 chr4 170763950 170764109 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -20294 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 202.333-40 chr11 102324553 102324878 + 1 NA exon (NM_001165, exon 2 of 9) exon (NM_001165, exon 2 of 9) 7231 NM_001165 330 Hs.127799 NM_001165 ENSG00000023445 BIRC3 AIP1|API2|CIAP2|HAIP1|HIAP1|IAP-1|MALT2|MIHC|RNF49|c-IAP2 baculoviral IAP repeat containing 3 protein-coding 162.333-236 chr7 81126044 81126323 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -203794 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 294.333-12 chr13 59573766 59574098 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -438786 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 174.333-133 chr6 101044854 101045197 + 1 NA Intergenic Intergenic -163653 NM_022091 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 327.667-9 chr14 60719228 60719866 + 1 NA intron (NM_017420, intron 2 of 2) intron (NM_017420, intron 2 of 2) 4804 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 158.667-234 chr4 44929204 44929511 + 1 NA Intergenic Intergenic -202723 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 206.333-56 chr14 67892358 67892668 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) MER77|LTR|ERVL 68921 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 146.333-219 chr3 153182031 153182202 + 1 NA Intergenic Intergenic 19890 NM_002886 5912 Hs.98643 NM_002886 ENSG00000181467 RAP2B - RAP2B, member of RAS oncogene family protein-coding 163.667-97 chr19 7324596 7324894 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24192 NM_001367823 23370 Hs.465761 NM_015318 ENSG00000104880 ARHGEF18 P114-RhoGEF|RP78|SA-RhoGEF|p114RhoGEF Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18 protein-coding 154.667-344 chr6 105403873 105404089 + 1 NA promoter-TSS (NM_002726) promoter-TSS (NM_002726) -899 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 178.667-28 chr11 17179966 17180216 + 1 NA intron (NM_002645, intron 1 of 32) L2a|LINE|L2 27895 NM_002645 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 143.333-207 chr4 85775697 85775919 + 1 NA intron (NM_001025616, intron 3 of 9) intron (NM_001025616, intron 3 of 9) -2990 NM_001042669 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 210.333-143 chr6 37578358 37578672 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -23093 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 144.333-73 chr14 52970426 52970573 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -19402 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 190.667-133 chr7 16812615 16812890 + 1 NA Intergenic Intergenic -7753 NM_006408 10551 Hs.530009 NM_006408 ENSG00000106541 AGR2 AG-2|AG2|GOB-4|HAG-2|HEL-S-116|HPC8|PDIA17|XAG-2 anterior gradient 2, protein disulphide isomerase family member protein-coding 196.667-91 chr22 24452249 24452595 + 1 NA intron (NR_028483, intron 4 of 7) L1ME3Cz|LINE|L1 20303 NM_001278497 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 151.667-158 chr19 57132880 57133118 + 1 NA Intergenic LTR42|LTR|ERVL 12203 NM_052882 114026 Hs.348622 NM_052882 ENSG00000141946 ZIM3 ZNF264|ZNF657 zinc finger imprinted 3 protein-coding 209.333-154 chr3 112954483 112954778 + 1 NA intron (NM_138806, intron 1 of 7) MER21B|LTR|ERVL 20473 NM_170780 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 348.667-22 chr5 100417229 100417859 + 1 NA Intergenic Intergenic -29290 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 154.333-280 chr5 152271786 152272015 + 1 NA Intergenic Intergenic 133379 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 233.333-51 chr18 47123748 47124196 + 1 NA intron (NM_032124, intron 4 of 6) L1ME3|LINE|L1 26528 NM_032124 84064 Hs.465041 NM_032124 ENSG00000167220 HDHD2 3110052N05Rik|HEL-S-301 haloacid dehalogenase like hydrolase domain containing 2 protein-coding 178.667-162 chr8 92516243 92516454 + 1 NA Intergenic Intergenic 139146 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 220.667-53 chr2 178543904 178544180 + 1 NA exon (NM_133432, exon 175 of 192) exon (NM_133432, exon 175 of 192) 20851 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 358.333-22 chr6 21475009 21475460 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 36658 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 219.333-60 chr15 64102792 64103140 + 1 NA intron (NM_003099, intron 1 of 14) AluJb|SINE|Alu 6984 NM_001242933 6642 Hs.188634 NM_003099 ENSG00000028528 SNX1 HsT17379|VPS5 sorting nexin 1 protein-coding 123.667-23 chr1 237696120 237696272 + 1 NA intron (NM_001035, intron 63 of 104) intron (NM_001035, intron 63 of 104) -165979 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 135.667-157 chr6 66051593 66051799 + 1 NA Intergenic Intergenic 263817 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 137.333-181 chr7 48568729 48568905 + 1 NA intron (NM_152701, intron 55 of 61) L1ME3|LINE|L1 -355730 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 230.333-81 chr3 180684793 180685115 + 1 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -5465 NM_181426 339829 Hs.712820 NM_181426 ENSG00000284862 CCDC39 CILD14|FAP59 coiled-coil domain containing 39 protein-coding 224.333-10 chr1 230817144 230817580 + 1 NA Intergenic Intergenic 38645 NM_001136495 84886 Hs.520494 NM_032800 ENSG00000119280 C1orf198 - chromosome 1 open reading frame 198 protein-coding 163.333-145 chr2 78041386 78041692 + 1 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -47191 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 363.667-11 chr4 104391492 104391950 + 1 NA Intergenic Intergenic -99244 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 167.333-196 chr4 121155732 121155907 + 1 NA intron (NM_001128843, intron 7 of 12) intron (NM_001128843, intron 7 of 12) 8502 NM_024873 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 152.667-319 chr6 38250551 38250760 + 1 NA intron (NM_052893, intron 10 of 11) L1M6|LINE|L1 -230941 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 262.333-20 chr12 21698280 21698611 + 1 NA Intergenic Intergenic -40590 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 235.667-68 chr9 36890519 36890917 + 1 NA intron (NR_103999, intron 6 of 8) intron (NR_103999, intron 6 of 8) 2813 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 141.333-160 chr3 134893778 134893978 + 1 NA intron (NM_004441, intron 1 of 15) L2b|LINE|L2 98618 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 265.333-35 chr2 16689707 16690030 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -24034 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 156.333-142 chr17 10690060 10690268 + 1 NA intron (NM_004589, intron 4 of 5) L1MA5|LINE|L1 7369 NM_004589 6341 Hs.14511 NM_004589 ENSG00000133028 SCO1 SCOD1 SCO cytochrome c oxidase assembly protein 1 protein-coding 205.667-122 chr7 10920174 10920407 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 19863 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 171.667-34 chr11 82713357 82713725 + 1 NA Intergenic Intergenic 20323 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 212.667-112 chr5 133331432 133331704 + 1 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) intron (NM_015082, intron 4 of 15) 96138 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 126.667-21 chr10 121113379 121113525 + 1 NA Intergenic Intergenic 262090 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 186.333-73 chr2 69940688 69940956 + 1 NA 3' UTR (NM_002357, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_002357, exon 6 of 6) 21443 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 160.333-9 chr1 56081106 56081279 + 1 NA Intergenic Intergenic 136105 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 164.333-14 chr1 229986431 229986645 + 1 NA Intergenic Intergenic -16179 NR_135116 101927532 Hs.40183 NR_135116 ENSG00000228058 LINC01736 - long intergenic non-protein coding RNA 1736 ncRNA 139.333-136 chr21 18353343 18353538 + 1 NA intron (NM_002772, intron 9 of 24) intron (NM_002772, intron 9 of 24) 50345 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 225.333-89 chr21 23474705 23474974 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -90004 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 277.333-28 chr14 34316376 34316715 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 145695 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 165.333-49 chr11 93897259 93897513 + 1 NA Intergenic Intergenic -46768 NM_001144871 387804 Hs.512252 NM_001144871 ENSG00000214376 VSTM5 C11orf90 V-set and transmembrane domain containing 5 protein-coding 186.667-139 chr7 68481249 68481452 + 1 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 461097 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 227.333-80 chr3 95701796 95702074 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL -18742 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 150.333-223 chr2 190425314 190425543 + 1 NA intron (NM_017694, intron 2 of 7) L1MD1|LINE|L1 17073 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 169.667-66 chr14 99547093 99547410 + 1 NA intron (NM_001144995, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 56956 NM_001144995 317762 Hs.709288 NM_001144995 ENSG00000205476 CCDC85C - coiled-coil domain containing 85C protein-coding 197.667-31 chr12 6541395 6541685 + 1 NA non-coding (NR_036467, exon 9 of 10) non-coding (NR_036467, exon 9 of 10) 6276 NM_001256799 2597 Hs.544577 NM_002046 ENSG00000111640 GAPDH G3PD|GAPD|HEL-S-162eP glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase protein-coding 147.333-62 chr11 17988018 17988174 + 1 NA intron (NR_104040, intron 8 of 11) intron (NR_104040, intron 8 of 11) 24951 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 228.333-62 chr3 71459224 71459684 + 1 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) intron (NR_146142, intron 3 of 19) 82635 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 153.667-387 chr8 107950157 107950405 + 1 NA intron (NM_001282863, intron 4 of 4) intron (NM_001282863, intron 4 of 4) 131658 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 201.667-80 chr3 129652556 129652863 + 1 NA intron (NM_015008, intron 3 of 3) MER4D|LTR|ERV1 36023 NM_015008 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 143.667-199 chr5 35182171 35182339 + 1 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) 48232 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 129.333-93 chr2 69396004 69396205 + 1 NA TTS (NM_001002756) TTS (NM_001002756) -8850 NM_001244710 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 179.333-183 chr8 23595570 23595789 + 1 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 66723 NM_001317814 51312 Hs.596025 NM_016612 ENSG00000147454 SLC25A37 HT015|MFRN|MFRN1|MSC|MSCP|PRO1278|PRO1584|PRO2217 solute carrier family 25 member 37 protein-coding 143.667-237 chr7 98682845 98683155 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 65715 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 147.333-256 chr5 24068540 24068821 + 1 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) MLT2A2|LTR|ERVL 117332 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 271.667-56 chr6 47396424 47396822 + 1 NA Intergenic Intergenic -81166 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 228.667-61 chr4 159572013 159572346 + 1 NA Intergenic ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 205605 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 128.667-178 chr8 62785630 62785793 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) intron (NM_001304533, intron 4 of 6) -192150 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 141.333-20 chr10 31125925 31126181 + 1 NA Intergenic Charlie13a|DNA|hAT-Charlie -61830 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 148.667-163 chr18 787888 788161 + 1 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) intron (NM_005433, intron 1 of 11) 24218 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 203.333-277 chr9 29316981 29317347 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -103563 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 193.333-195 chr9 36194601 36194930 + 1 NA intron (NM_001311204, intron 1 of 4) intron (NM_001311204, intron 1 of 4) 3844 NM_001184760 1211 Hs.522114 NM_001833 ENSG00000122705 CLTA LCA clathrin light chain A protein-coding 130.667-62 chr14 29465769 29465953 + 1 NA Intergenic Intergenic 461235 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 184.667-89 chr4 32883838 32884127 + 1 NA Intergenic Intergenic 532944 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 225.333-135 chr8 140705327 140705664 + 1 NA intron (NR_148037, intron 26 of 34) L1ME2|LINE|L1 13074 NM_001352749 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 147.667-345 chr7 109252510 109252678 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -368007 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 114.667-178 chr3 111930476 111930699 + 1 NA intron (NM_001134437, intron 6 of 17) intron (NM_001134437, intron 6 of 17) -48439 NR_073571 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 169.333-239 chr7 30274800 30275013 + 1 NA intron (NR_136267, intron 1 of 3) intron (NR_136267, intron 1 of 3) -9691 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 199.667-82 chr2 238933353 238933663 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -7239 NR_034162 401039 Hs.516791 NM_001001698 ENSG00000227744 LINC01940 - long intergenic non-protein coding RNA 1940 ncRNA 144.667-39 chr11 44063052 44063332 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -3078 NM_032592 84680 Hs.126706 NM_032592 ENSG00000110455 ACCS ACS|PHACS 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase homolog (inactive) protein-coding 173.333-151 chr4 177589994 177590193 + 1 NA Intergenic Intergenic -138664 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 274.667-53 chr7 114856701 114857042 + 1 NA Intergenic Intergenic -65283 NM_199072 29969 Hs.741413 NM_199072 ENSG00000135272 MDFIC HIC|MDFIC1 MyoD family inhibitor domain containing protein-coding 224.333-67 chr2 177105527 177105929 + 1 NA Intergenic Intergenic 106683 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 172.667-29 chr11 16040508 16040691 + 1 NA intron (NM_033326, intron 12 of 15) intron (NM_033326, intron 12 of 15) -70978 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 171.333-158 chr5 144276726 144276973 + 1 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 71458 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 185.333-121 chr3 39708491 39708726 + 1 NA Intergenic LTR83|LTR|ERVL -100306 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 184.333-18 chr11 31800568 31800776 + 1 NA promoter-TSS (NM_001368930) promoter-TSS (NM_001368930) -11 NM_001368930 5080 Hs.270303 NM_000280 ENSG00000007372 PAX6 AN|AN2|ASGD5|D11S812E|FVH1|MGDA|WAGR paired box 6 protein-coding 143.333-194 chr3 168646818 168647137 + 1 NA intron (NR_021485, intron 5 of 15) intron (NR_021485, intron 5 of 15) 95123 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 153.667-392 chr8 121669817 121670024 + 1 NA Intergenic Intergenic -28480 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 276.333-62 chr8 86533650 86534072 + 1 NA intron (NM_003909, intron 6 of 16) (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 19426 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 154.333-113 chr16 84073419 84073613 + 1 NA intron (NM_003791, intron 12 of 22) L1ME4c|LINE|L1 -31359 NM_001080442 146167 NM_001080442 ENSG00000166558 SLC38A8 FVH2 solute carrier family 38 member 8 protein-coding 168.667-153 chr3 181294095 181294374 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) MIRc|SINE|MIR 62497 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 125.333-98 chr2 209737995 209738139 + 1 NA Intergenic Intergenic -33765 NM_182587 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 182.667-57 chr16 80612183 80612564 + 1 NA intron (NM_152342, intron 5 of 6) intron (NM_152342, intron 5 of 6) -39565 NR_104666 101928276 Hs.149769 NR_104665 ENSG00000260737 LINC01227 - long intergenic non-protein coding RNA 1227 ncRNA 314.667-14 chr13 89964940 89965464 + 1 NA Intergenic Intergenic 154515 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 111.667-6 chr1 40706059 40706228 + 1 NA intron (NM_001142590, intron 2 of 14) intron (NM_001142590, intron 2 of 14) -3223 NM_001308115 4802 Hs.713051 NM_014223 ENSG00000066136 NFYC CBF-C|CBFC|H1TF2A|HAP5|HSM|NF-YC nuclear transcription factor Y subunit gamma protein-coding 131.667-138 chr3 124194543 124194799 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) intron (NM_001024660, intron 1 of 59) 61742 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 187.333-156 chr5 64998316 64998503 + 1 NA intron (NM_005869, intron 13 of 13) intron (NM_005869, intron 13 of 13) 229479 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 196.333-123 chr3 178683468 178683842 + 1 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) MER33|DNA|hAT-Charlie 124805 NM_005832 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 147.333-88 chr12 118332562 118332735 + 1 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) intron (NM_001346490, intron 1 of 21) 27057 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 146.667-255 chr5 32754343 32754541 + 1 NA intron (NM_001364460, intron 2 of 6) intron (NM_001364460, intron 2 of 6) 43121 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 230.667-55 chr3 73654255 73654602 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -29487 NM_015009 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 142.333-91 chr15 90550950 90551171 + 1 NA intron (NM_001042574, intron 2 of 14) intron (NM_001042574, intron 2 of 14) 21137 NM_022769 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 241.667-14 chr11 41409849 41410271 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 49576 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 169.333-255 chr7 98496069 98496379 + 1 NA Intergenic Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger -95134 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 134.667-189 chr7 113737859 113738142 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 181009 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 121.333-111 chr3 96950535 96950679 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) intron (NM_001080448, intron 2 of 17) 136013 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 120.333-12 chr1 163768297 163768445 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -345180 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 417.667-3 chr2 132827115 132827815 + 1 NA intron (NM_207481, intron 11 of 17) L1MA5A|LINE|L1 -88092 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 263.333-19 chr12 63446842 63447162 + 1 NA Intergenic Intergenic 221491 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 159.667-322 chr8 94473279 94473547 + 1 NA intron (NM_012415, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 1702 NM_012415 25788 Hs.30561 NM_006550 ENSG00000197275 RAD54B RDH54 RAD54 homolog B protein-coding 124.333-120 chr3 113612900 113613159 + 1 NA intron (NM_001322299, intron 19 of 24) MER115|DNA|hAT-Tip100 18153 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 172.667-101 chr3 181526483 181526773 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) L1M5|LINE|L1 -83706 NR_004053 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 150.333-91 chr12 116214273 116214456 + 1 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) intron (NM_015335, intron 2 of 30) 62822 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 150.333-29 chr1 231913855 231914029 + 1 NA intron (NM_001164541, intron 9 of 9) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -11892 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 151.667-397 chr9 133011679 133011870 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -8656 NR_132980 106635683 NR_132980 SNORD141A - small nucleolar RNA, C/D box 141A snoRNA 224.333-22 chr10 131459378 131459833 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -147884 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 191.667-79 chr22 23559431 23559740 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 20705 NM_020070 3543 Hs.348935 NM_020070 ENSG00000128322 IGLL1 14.1|AGM2|CD179b|IGL1|IGL5|IGLJ14.1|IGLL|IGO|IGVPB|VPREB2 immunoglobulin lambda like polypeptide 1 protein-coding 153.333-330 chr5 50765293 50765547 + 1 NA intron (NM_024615, intron 7 of 25) intron (NM_024615, intron 7 of 25) 98006 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 184.333-126 chr6 27356450 27356750 + 1 NA Intergenic Intergenic 14925 NR_002722 7754 Hs.8198 NR_002722 ZNF204P ZNF184-Lp|ZNF204|ZNF315P|b24o18.1 zinc finger protein 204, pseudogene pseudo 196.667-136 chr6 133358002 133358327 + 1 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 116665 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 163.333-79 chr14 20687371 20687661 + 1 NA intron (NM_002937, intron 1 of 1) intron (NM_002937, intron 1 of 1) -1248 NM_001097577 283 Hs.283749 NM_001145 ENSG00000214274 ANG ALS9|HEL168|RAA1|RNASE4|RNASE5 angiogenin protein-coding 137.333-136 chr4 101214188 101214372 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) MIR|SINE|MIR 26592 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 243.333-51 chr2 72787658 72788050 + 1 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 38179 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 143.667-42 chr11 76586748 76586914 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 83107 NM_001370188 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 148.667-40 chr10 43785411 43785559 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 4932 NR_002726 10151 Hs.632956 NR_002726 HNRNPA3P1 D10S102|FBRNP|HNRPA3|HNRPA3P1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 1 pseudo 202.667-38 chr12 21289631 21289844 + 1 NA intron (NM_021094, intron 11 of 13) MER21C|LTR|ERVL 45180 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 142.333-70 chr13 55403056 55403230 + 1 NA Intergenic (ATTAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 228689 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 193.667-128 chr7 87375645 87375972 + 1 NA intron (NM_021151, intron 8 of 17) intron (NM_021151, intron 8 of 17) 30144 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 264.333-54 chr4 76137609 76137929 + 1 NA intron (NM_001278603, intron 2 of 10) MER113|DNA|hAT-Charlie 10628 NM_017426 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 200.667-141 chr6 165264942 165265377 + 1 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 44446 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 287.667-11 chr12 40025892 40026460 + 1 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) intron (NM_052885, intron 3 of 9) 79905 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 156.333-284 chr5 72612809 72613063 + 1 NA intron (NR_105007, intron 1 of 2) intron (NR_105007, intron 1 of 2) 47733 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 274.333-44 chr20 41573450 41573868 + 1 NA intron (NM_032221, intron 1 of 36) intron (NM_032221, intron 1 of 36) 44718 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 244.667-11 chr1 246038006 246038411 + 1 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 379204 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 140.333-238 chr8 122336788 122337022 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 231739 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 171.667-118 chr4 31376012 31376204 + 1 NA Intergenic Intergenic -130436 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 164.333-22 chr10 22149390 22149757 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 60410 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 170.333-204 chr7 79738310 79738535 + 1 NA Intergenic Intergenic 284462 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 139.333-104 chr19 46889566 46889725 + 1 NA intron (NM_004491, intron 1 of 6) intron (NM_004491, intron 1 of 6) 28648 NM_004491 2909 Hs.509447 NM_004491 ENSG00000160007 ARHGAP35 GRF-1|GRLF1|P190-A|P190A|p190ARhoGAP|p190RhoGAP Rho GTPase activating protein 35 protein-coding 145.667-302 chr8 134413490 134413658 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -184497 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 136.333-109 chr2 228142345 228142507 + 1 NA intron (NM_030623, intron 1 of 10) AluYc|SINE|Alu 39219 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 156.333-41 chr10 67310797 67311047 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 92488 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 223.333-147 chr6 112320359 112320682 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -26810 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 150.667-234 chr3 27928556 27928746 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -94515 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 246.667-42 chr2 88860870 88861243 + 1 NA Intergenic Intergenic 48686 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 148.333-182 chr2 52507636 52507883 + 1 NA Intergenic Intergenic 137111 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 151.333-22 chr1 150117080 150117356 + 1 NA intron (NR_103998, intron 13 of 13) (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -32216 NM_001304722 51177 Hs.438824 NM_016274 ENSG00000023902 PLEKHO1 CKIP-1|CKIP1|JBP|OC120 pleckstrin homology domain containing O1 protein-coding 153.333-72 chr11 94127421 94127700 + 1 NA Intergenic L2-1_AMi|LINE|L2 -1281 NM_015368 24145 Hs.591976 NM_015368 ENSG00000110218 PANX1 MRS1|PX1|UNQ2529 pannexin 1 protein-coding 321.333-35 chr2 13464122 13464567 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -457331 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 174.333-142 chr7 103655936 103656238 + 1 NA intron (NM_005045, intron 12 of 64) MamRep605|LTR?|LTR? -209880 NM_206885 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 150.333-184 chr2 9300291 9300504 + 1 NA intron (NM_003887, intron 3 of 27) intron (NM_003887, intron 3 of 27) 93585 NM_003887 8853 Hs.555902 NM_003887 ENSG00000151693 ASAP2 AMAP2|CENTB3|DDEF2|PAG3|PAP|Pap-alpha|SHAG1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 135.667-88 chr2 54395137 54395284 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -61117 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 354.667-23 chr8 127139004 127139685 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -57123 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 151.333-377 chr6 161828584 161828830 + 1 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) AluSx1|SINE|Alu 357730 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 156.333-37 chr10 56120361 56120653 + 1 NA Intergenic Intergenic 240752 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 183.333-134 chr5 120849742 120849985 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 318399 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 164.333-20 chr10 9113720 9113972 + 1 NA Intergenic Intergenic -161767 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 151.667-355 chr8 40424729 40424889 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -81446 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 248.667-14 chr10 87046511 87046905 + 1 NA Intergenic Intergenic 26414 NM_001146157 643161 Hs.729945 NM_001146157 ENSG00000188100 FAM25A bA96C23.5 family with sequence similarity 25 member A protein-coding 258.333-60 chr8 49343571 49343950 + 1 NA Intergenic Intergenic 168420 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 118.333-100 chr2 41415482 41415664 + 1 NA Intergenic (TATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -461982 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 159.333-305 chr7 32134968 32135238 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) L2a|LINE|L2 -63667 NM_001322057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 181.667-66 chr2 48281433 48281723 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -33104 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 251.667-85 chr7 25199252 25199542 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -19043 NM_001371352 157.667-5 chr1 76028630 76028896 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 17439 NR_125939 101927342 Hs.216363 NR_125939 LOC101927342 - uncharacterized LOC101927342 ncRNA 170.667-53 chr15 43094542 43094769 + 1 NA intron (NM_174916, intron 1 of 46) L3|LINE|CR1 11383 NM_174916 197131 Hs.591121 NM_174916 ENSG00000159459 UBR1 JBS ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 protein-coding 148.667-275 chr4 45381651 45381833 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -655108 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 161.333-215 chr4 77101454 77101751 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -25613 NM_006835 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 193.333-116 chr3 37574616 37574829 + 1 NA intron (NM_002207, intron 15 of 27) intron (NM_002207, intron 15 of 27) 122581 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 157.667-212 chr4 54617463 54617708 + 1 NA Intergenic Intergenic -10454 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 317.333-16 chr17 58583794 58584226 + 1 NA intron (NM_198393, intron 19 of 32) intron (NM_198393, intron 19 of 32) -39682 NM_001368772 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 152.333-147 chr17 59047463 59047710 + 1 NA intron (NR_148346, intron 16 of 23) intron (NR_148346, intron 16 of 23) 59294 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 129.333-117 chr3 23581733 23581941 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) intron (NM_001370225, intron 5 of 5) -224118 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 174.667-94 chr2 158712365 158712582 + 1 NA intron (NR_135242, intron 1 of 3) L1MD1|LINE|L1 22529 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 203.333-86 chr15 63613649 63614026 + 1 NA intron (NM_003922, intron 76 of 77) AluJo|SINE|Alu -13010 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 155.667-189 chr2 225936362 225936538 + 1 NA Intergenic Intergenic -206344 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 115.667-169 chr4 146038285 146038455 + 1 NA Intergenic Intergenic 83543 NR_038331 100505545 Hs.122199 NR_038331 ENSG00000248809 LINC01095 - long intergenic non-protein coding RNA 1095 ncRNA 304.667-23 chr3 3019322 3019918 + 1 NA intron (NM_175607, intron 14 of 24) L1MC4|LINE|L1 41525 NR_046554 100873975 Hs.581502 NR_046554 CNTN4-AS1 - CNTN4 antisense RNA 1 ncRNA 158.667-264 chr5 33358463 33358766 + 1 NA Intergenic Intergenic -82082 NM_001258437 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 161.333-27 chr10 31984309 31984588 + 1 NA Intergenic Intergenic -55572 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 160.333-66 chr11 111274496 111274660 + 1 NA intron (NM_198498, intron 2 of 4) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -23968 NM_001271458 120376 Hs.31409 NM_001136105 ENSG00000214290 COLCA2 C11orf93|CASC13|LOH11CR1G colorectal cancer associated 2 protein-coding 155.333-253 chr4 29196484 29196779 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -17661 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 123.667-74 chr18 3462570 3462706 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -3612 NR_110428 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 212.333-158 chr9 129128879 129129221 + 1 NA exon (NM_001271832, exon 3 of 9) exon (NM_001271832, exon 3 of 9) 17362 NM_001193397 5524 Hs.400740 NM_021131 ENSG00000119383 PTPA PP2A|PPP2R4|PR53 protein phosphatase 2 phosphatase activator protein-coding 191.333-217 chr9 99455478 99455746 + 1 NA Intergenic Intergenic -80355 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 157.667-270 chr6 4124359 4124572 + 1 NA intron (NM_001085401, intron 4 of 5) intron (NM_001085401, intron 4 of 5) 11003 NM_001166010 10455 Hs.15250 NM_006117 ENSG00000198721 ECI2 ACBD2|DRS-1|DRS1|HCA88|PECI|dJ1013A10.3 enoyl-CoA delta isomerase 2 protein-coding 178.333-179 chr9 94042196 94042454 + 1 NA intron (NM_177995, intron 1 of 9) L1MC3|LINE|L1 11512 NM_177995 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 318.333-19 chr20 14842312 14842871 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 86927 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 228.667-73 chr7 44443594 44443937 + 1 NA intron (NM_015332, intron 2 of 5) intron (NM_015332, intron 2 of 5) 46893 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 299.667-11 chr17 52478728 52479290 + 1 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 88487 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 247.333-13 chr11 68526795 68527084 + 1 NA intron (NM_001352348, intron 3 of 24) intron (NM_001352348, intron 3 of 24) 66187 NM_001164164 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 157.333-141 chr17 9561878 9562053 + 1 NA intron (NM_004853, intron 2 of 7) L1MC5a|LINE|L1 13855 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 141.333-196 chr5 103297259 103297462 + 1 NA Intergenic Intergenic 37936 NM_001316968 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 245.333-59 chr18 64739043 64739444 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -479188 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 148.667-47 chr10 60401419 60401647 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) L1ME4a|LINE|L1 -11658 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 296.667-28 chr2 81376839 81377428 + 1 NA Intergenic Intergenic 89813 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 184.667-133 chr8 74000813 74001010 + 1 NA intron (NM_001195797, intron 1 of 3) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 9519 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 252.333-47 chr3 64547988 64548376 + 1 NA intron (NM_001318781, intron 30 of 38) intron (NM_001318781, intron 30 of 38) -13164 NR_110150 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-290 chr4 70741320 70741553 + 1 NA intron (NM_001345840, intron 1 of 13) intron (NM_001345840, intron 1 of 13) 7026 NM_001345840 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 173.667-61 chr18 39202717 39202902 + 1 NA Intergenic Intergenic 419366 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 145.333-100 chr15 96009552 96009716 + 1 NA Intergenic Intergenic 118207 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 281.667-31 chr22 20859915 20860331 + 1 NA intron (NM_004782, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 1116 NM_004782 9342 Hs.108002 NM_004782 ENSG00000099940 SNAP29 CEDNIK|SNAP-29 synaptosome associated protein 29 protein-coding 210.667-104 chr5 43614077 43614440 + 1 NA intron (NM_012343, intron 3 of 21) MER103C|DNA|hAT-Charlie -11028 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 242.333-80 chr4 116188657 116189089 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -110852 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 169.667-65 chr14 74699393 74699700 + 1 NA intron (NM_001039479, intron 1 of 19) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 13534 NM_001039479 9870 Hs.497417 NM_014821 ENSG00000119682 AREL1 FIEL1|KIAA0317 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 118.333-32 chr10 56232533 56232728 + 1 NA Intergenic Intergenic 128629 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 158.667-215 chr3 90360381 90360550 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1252844 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 235.667-59 chr8 32669415 32669839 + 1 NA intron (NM_001322205, intron 1 of 8) intron (NM_001322205, intron 1 of 8) 22538 NM_001322206 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 189.667-92 chr3 64751791 64752160 + 1 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) L1PA13|LINE|L1 -63975 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 159.667-175 chr2 117951163 117951473 + 1 NA intron (NM_019044, intron 13 of 23) intron (NM_019044, intron 13 of 23) 62752 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 247.333-64 chr5 66522680 66522993 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -11232 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 160.667-34 chr10 52429386 52429671 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 25744 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 132.333-56 chr15 22845065 22845314 + 1 NA 5' UTR (NM_001184889, exon 4 of 10) 5' UTR (NM_001184889, exon 4 of 10) 6548 NM_001008894 81614 Hs.591003 NM_030922 ENSG00000140157 NIPA2 SLC57A2 NIPA magnesium transporter 2 protein-coding 193.333-106 chr2 192589851 192590120 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -159860 NR_002769 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 252.667-83 chr5 124365225 124365810 + 1 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 73003 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 218.333-109 chr6 90971361 90971608 + 1 NA Intergenic Intergenic -384412 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 166.333-173 chr5 12123821 12124159 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -219544 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 163.667-239 chr7 92557017 92557241 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 28334 NM_032120 84060 Hs.21590 NM_032120 ENSG00000127993 RBM48 C7orf64|HSPC304 RNA binding motif protein 48 protein-coding 175.667-146 chr8 84731323 84731599 + 1 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 25534 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 148.667-69 chr11 33230615 33230814 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -25958 NM_001278163 10114 Hs.201918 NM_005734 ENSG00000110422 HIPK3 DYRK6|FIST3|PKY|YAK1 homeodomain interacting protein kinase 3 protein-coding 192.667-98 chr20 15730513 15730764 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) L1PA15|LINE|L1 192676 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 134.667-146 chr4 99720597 99720884 + 1 NA Intergenic Intergenic -66061 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 152.333-28 chr1 195017090 195017397 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 1071472 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 149.667-59 chr10 68115854 68116038 + 1 NA intron (NM_001256268, intron 2 of 23) L2a|LINE|L2 6458 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 221.667-52 chr3 113158817 113159159 + 1 NA intron (NR_110823, intron 2 of 3) intron (NR_110823, intron 2 of 3) 8743 NR_110823 101929717 Hs.638426 NR_110823 ENSG00000243795 LINC02044 - long intergenic non-protein coding RNA 2044 ncRNA 178.333-67 chr18 63132030 63132250 + 1 NA intron (NM_000633, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 187240 NM_000657 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 120.667-111 chr21 25363440 25363601 + 1 NA Intergenic Intergenic 68181 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 147.667-209 chr21 29570622 29570788 + 1 NA intron (NM_000830, intron 14 of 16) intron (NM_000830, intron 14 of 16) -25335 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 188.667-119 chr4 126905386 126905589 + 1 NA Intergenic Intergenic -727470 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 153.333-129 chr14 75429726 75429904 + 1 NA intron (NM_130469, intron 1 of 3) intron (NM_130469, intron 1 of 3) 1458 NM_130469 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 159.667-119 chr16 10237242 10237547 + 1 NA Intergenic Intergenic -54486 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 128.333-114 chr2 198467356 198467505 + 1 NA Intergenic Intergenic -92333 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 150.333-82 chr12 64656366 64656542 + 1 NA intron (NR_040718, intron 1 of 3) L1MB8|LINE|L1 -33849 NR_037515 100500856 NR_037515 ENSG00000266016 MIR548Z - microRNA 548z ncRNA 199.333-100 chr17 65022846 65023063 + 1 NA intron (NM_006572, intron 2 of 3) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 32820 NM_001282425 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 138.667-153 chr4 98776212 98776377 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 117392 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 174.667-37 chr12 75786784 75787035 + 1 NA Intergenic Intergenic 244867 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 365.333-7 chr14 35699474 35700083 + 1 NA intron (NM_014990, intron 16 of 40) intron (NM_014990, intron 16 of 40) 63153 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 172.667-117 chr4 126923742 126924011 + 1 NA Intergenic Intergenic -709081 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 148.333-140 chr15 65061736 65062009 + 1 NA intron (NM_001307930, intron 1 of 3) AluY|SINE|Alu 6119 NM_001307930 51285 Hs.27018 NM_016563 ENSG00000103710 RASL12 RIS RAS like family 12 protein-coding 179.333-68 chr15 58977690 58978032 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -9802 NM_001270528 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 166.667-228 chr8 30689776 30690025 + 1 NA intron (NM_001195102, intron 7 of 11) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -31664 NM_002095 2961 Hs.77100 NM_002095 ENSG00000197265 GTF2E2 FE|TF2E2|TFIIE-B|TTD6 general transcription factor IIE subunit 2 protein-coding 136.667-58 chr14 60562711 60562938 + 1 NA Intergenic Intergenic 53678 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 185.333-158 chr5 108654236 108654597 + 1 NA Intergenic Intergenic 73845 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 150.667-78 chr11 101670984 101671200 + 1 NA Intergenic Intergenic -87085 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 131.333-129 chr4 64027634 64027809 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 381729 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 125.333-152 chr6 38652097 38652256 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -12247 NM_052893 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 124.333-16 chr10 18024247 18024427 + 1 NA intron (NM_001282734, intron 11 of 11) L1PA15|LINE|L1 -13775 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 176.667-100 chr3 51406834 51407028 + 1 NA intron (NR_146065, intron 22 of 25) AluSx|SINE|Alu 15646 NM_013286 29890 Hs.118738 NM_013286 ENSG00000259956 RBM15B HUMAGCGB|HsOTT3|OTT3 RNA binding motif protein 15B protein-coding 357.333-16 chr4 63613336 63614116 + 1 NA Intergenic Intergenic 795724 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 163.667-169 chr4 14322560 14322894 + 1 NA Intergenic Intergenic 210759 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 168.667-185 chr6 43801574 43801763 + 1 NA Intergenic Intergenic 29700 NM_001287044 7422 Hs.73793 NM_003376 ENSG00000112715 VEGFA MVCD1|VEGF|VPF vascular endothelial growth factor A protein-coding 158.333-298 chr7 42532382 42532544 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 173984 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 153.667-91 chr12 50123368 50123557 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 11226 NM_032901 84987 Hs.388645 NM_032901 ENSG00000178449 COX14 C12orf62|PCAG1 cytochrome c oxidase assembly factor COX14 protein-coding 147.667-43 chr10 75588723 75588983 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) L1ME4b|LINE|L1 36395 NR_030337 693191 NR_030337 ENSG00000207583 MIR606 MIRN606|hsa-mir-606 microRNA 606 ncRNA 112.667-166 chr3 29356806 29357030 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 1 of 13) intron (NM_001003792, intron 1 of 13) 75606 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 116.667-200 chr8 90706102 90706288 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -60112 NM_001008495 169200 Hs.567759 NM_001008495 ENSG00000180694 TMEM64 - transmembrane protein 64 protein-coding 220.667-55 chr2 191083222 191083527 + 1 NA intron (NM_003151, intron 3 of 23) LTR16C|LTR|ERVL 61848 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 293.666-3 chr1 117385775 117386271 + 1 NA intron (NM_006699, intron 1 of 12) intron (NM_006699, intron 1 of 12) 18574 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 321.667-8 chr16 64913500 64914099 + 1 NA Intergenic Intergenic 208264 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 160.667-103 chr15 54997464 54997701 + 1 NA Intergenic Intergenic -59165 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 236.333-8 chr1 104102344 104102748 + 1 NA Intergenic Intergenic 29523 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 283.667-36 chr8 116461233 116461667 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -136391 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 225.333-95 chr3 101931465 101931838 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9208 NR_026934 152225 Hs.376768 NR_026934 ENSG00000214407 LINC02085 - long intergenic non-protein coding RNA 2085 ncRNA 131.333-136 chr4 185920879 185921203 + 1 NA intron (NM_001270771, intron 1 of 23) intron (NM_001270771, intron 1 of 23) 35331 NM_001270771 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 240.667-8 chr10 20061154 20061725 + 1 NA intron (NM_032812, intron 3 of 13) L1MC4a|LINE|L1 245007 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 171.667-41 chr12 84685137 84685389 + 1 NA Intergenic Intergenic 227536 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 170.667-147 chr6 96643831 96644087 + 1 NA Intergenic Intergenic 80834 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 124.333-8 chr1 116114525 116114681 + 1 NA intron (NM_152367, intron 2 of 6) L2b|LINE|L2 2848 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 166.333-142 chr22 39871563 39871820 + 1 NA intron (NM_152512, intron 2 of 6) intron (NM_152512, intron 2 of 6) 22069 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 166.333-199 chr6 72223038 72223304 + 1 NA intron (NM_001350474, intron 1 of 21) intron (NM_001350474, intron 1 of 21) 6230 NM_001350471 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 185.333-152 chr5 34691482 34691785 + 1 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) intron (NM_001145525, intron 4 of 19) 4074 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 293.667-5 chr10 24282869 24283522 + 1 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) L1PA17|LINE|L1 7510 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 274.333-25 chr16 12318031 12318356 + 1 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) MIR|SINE|MIR 341459 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 200.667-78 chr2 106188931 106189238 + 1 NA intron (NM_025076, intron 1 of 14) HAL1|LINE|L1 5255 NM_001253875 80146 Hs.469561 NM_025076 ENSG00000115652 UXS1 SDR6E1|UGD UDP-glucuronate decarboxylase 1 protein-coding 164.667-138 chr22 34758198 34758468 + 1 NA non-coding (NR_138042, exon 5 of 5) non-coding (NR_138042, exon 5 of 5) 239583 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 156.333-156 chr18 69051555 69051749 + 1 NA intron (NM_001093729, intron 9 of 9) L1M5|LINE|L1 253572 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 153.667-106 chr13 52344116 52344372 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 9949 NR_120400 103191607 NR_120400 ENSG00000271564 LINC02333 - long intergenic non-protein coding RNA 2333 ncRNA 143.667-222 chr6 156520134 156520396 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 141515 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 149.667-202 chr2 73658723 73658903 + 1 NA intron (NR_003683, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 13894 NR_003683 200420 Hs.739204 NM_145300 ENSG00000163016 ALMS1P1 ALMS1L|ALMS1P ALMS1 pseudogene 1 pseudo 348.333-33 chr8 77981213 77981611 + 1 NA Intergenic Intergenic 530715 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 148.333-369 chr7 82057702 82057912 + 1 NA intron (NM_001302890, intron 10 of 10) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 48630 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 238.333-60 chr3 49900026 49900473 + 1 NA intron (NR_134919, intron 1 of 19) intron (NR_134919, intron 1 of 19) 3388 NM_001318913 4486 Hs.517973 NM_002447 ENSG00000164078 MST1R CD136|CDw136|NPCA3|PTK8|RON macrophage stimulating 1 receptor protein-coding 154.667-7 chr1 60280608 60280785 + 1 NA Intergenic Intergenic -206926 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 187.667-11 chr10 28828445 28828719 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -17826 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 189.333-178 chr6 134938392 134938724 + 1 NA intron (NM_001193480, intron 3 of 5) intron (NM_001193480, intron 3 of 5) 11543 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 325.333-14 chr14 67333018 67333513 + 1 NA 3' UTR (NM_022474, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_022474, exon 15 of 15) 26539 NM_015994 51382 Hs.272630 NM_015994 ENSG00000100554 ATP6V1D ATP6M|VATD|VMA8 ATPase H+ transporting V1 subunit D protein-coding 167.667 chr1 29662039 29662253 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -312032 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 127.667-114 chr3 50987186 50987372 + 1 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) intron (NM_004947, intron 5 of 52) 312199 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 115.667-190 chr6 42078519 42078674 + 1 NA 3' UTR (NM_138572, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_138572, exon 9 of 9) 28072 NM_138572 129685 Hs.520122 NM_138572 ENSG00000137413 TAF8 II|TAF|TAF(II)43|TAFII-43|TAFII43|TBN TATA-box binding protein associated factor 8 protein-coding 153.333-346 chr5 143010005 143010222 + 1 NA intron (NR_146198, intron 11 of 22) intron (NR_146198, intron 11 of 22) -141203 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 298.333-45 chr9 92239411 92239930 + 1 NA intron (NR_073446, intron 29 of 32) L1MDa|LINE|L1 -48514 NM_001350291 138652 Hs.742918 NM_001350291 PRSS47 - serine protease 47 protein-coding 186.667-69 chr2 82196947 82197254 + 1 NA Intergenic Intergenic -659703 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 123.333-83 chr15 79584514 79584654 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 152068 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 211.333-39 chr11 104635389 104635732 + 1 NA Intergenic Intergenic -26258 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 186.667-4 chr1 103291965 103292181 + 1 NA Intergenic Intergenic -183551 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 185.667-96 chr4 48589114 48589457 + 1 NA intron (NM_015030, intron 18 of 63) intron (NM_015030, intron 18 of 63) 99033 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 156.667-283 chr5 125634587 125634752 + 1 NA Intergenic Intergenic 141408 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 226.333-79 chr3 89850550 89850892 + 1 NA Intergenic Intergenic 743100 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 202.667-19 chr10 47162813 47163042 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -137270 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 136.333-189 chr7 36669694 36669911 + 1 NA intron (NM_001177507, intron 2 of 19) MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 54692 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 274.667-19 chr15 44521280 44521649 + 1 NA intron (NM_016396, intron 12 of 12) intron (NM_016396, intron 12 of 12) 15436 NR_034171 645212 Hs.594287 NR_034170 EIF3J-DT EIF3J-AS1 EIF3J divergent transcript ncRNA 115.333-172 chr5 43633240 43633432 + 1 NA intron (NM_012343, intron 7 of 21) L2c|LINE|L2 -30106 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 149.667-253 chr3 4911787 4912040 + 1 NA intron (NR_125916, intron 1 of 2) intron (NR_125916, intron 1 of 2) -5412 NR_125914 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 267.333-58 chr20 57693643 57694107 + 1 NA intron (NM_199171, intron 1 of 3) intron (NM_199171, intron 1 of 3) -3189 NM_001255976 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 254.333-16 chr13 46223613 46224055 + 1 NA intron (NM_001282460, intron 2 of 9) AluSg|SINE|Alu 11906 NM_001282460 220416 Hs.267765 NM_001024609 ENSG00000173988 LRRC63 - leucine rich repeat containing 63 protein-coding 173.667-158 chr6 142901434 142901661 + 1 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 43629 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 256.667-10 chr11 47512787 47513222 + 1 NA intron (NM_001330272, intron 1 of 15) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 10984 NM_001172639 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 273.667-4 chr1 108142336 108142798 + 1 NA intron (NM_013386, intron 8 of 9).2 L1MB4|LINE|L1 50268 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 169.333-225 chr6 53132954 53133181 + 1 NA intron (NM_003643, intron 3 of 5) intron (NM_003643, intron 3 of 5) 15774 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 228.333-42 chr19 35197886 35198287 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 30639 NM_152481 148109 Hs.128069 NM_152481 ENSG00000177558 FAM187B TMEM162 family with sequence similarity 187 member B protein-coding 170.333-19 chr1 224781651 224781861 + 1 NA Intergenic Intergenic -147898 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 225.333-54 chr14 74075369 74075698 + 1 NA intron (NM_001278593, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 8920 NM_001278593 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 130.667-189 chr7 111203420 111203637 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 112401 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 341.667-21 chr7 23819396 23820149 + 1 NA intron (NM_031414, intron 23 of 23) intron (NM_031414, intron 23 of 23) 109553 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 157.667-324 chr8 72543084 72543258 + 1 NA intron (NM_004770, intron 1 of 2) MER20B|DNA|hAT-Charlie 5946 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 223.667-54 chr4 31624301 31624555 + 1 NA Intergenic Intergenic 117884 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 138.667-29 chr10 118430463 118430648 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 73447 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 121.333-165 chr7 31894903 31895122 + 1 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 175395 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 142.667-239 chr8 144907584 144907772 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5501 NM_001363099 58500 Hs.532277 NM_021061 ENSG00000196150 ZNF250 ZFP647|ZNF647 zinc finger protein 250 protein-coding 169.333-59 chr12 101661912 101662081 + 1 NA intron (NM_206821, intron 18 of 28) L4_B_Mam|LINE|RTE-X -35644 NM_020244 56994 Hs.293077 NM_020244 ENSG00000111666 CHPT1 CPT|CPT1 choline phosphotransferase 1 protein-coding 209.333-150 chr3 72862863 72863134 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -14553 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 117.333-196 chr7 89036012 89036176 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) L4_C_Mam|LINE|RTE-X -240357 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 193.333-94 chr2 112593516 112593733 + 1 NA Intergenic Intergenic 8770 NM_001304354 84269 Hs.375707 NM_032309 ENSG00000125611 CHCHD5 C2orf9|CHTM1|MIC14|MIX14 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 5 protein-coding 123.333-99 chr19 31134203 31134351 + 1 NA Intergenic Intergenic -33233 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 226.333-17 chr11 32724562 32724938 + 1 NA intron (NM_001008391, intron 2 of 17) MER102b|DNA|hAT-Charlie 69908 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 243.333-4 chr1 93837693 93837982 + 1 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) intron (NM_001261408, intron 2 of 13) -8995 NR_030621 100126348 NR_030621 ENSG00000211575 MIR760 MIRN760|hsa-mir-760|mir-760 microRNA 760 ncRNA 172.667-112 chr4 87679551 87679795 + 1 NA Intergenic Intergenic 29393 NM_001079911 1758 Hs.652366 NM_004407 ENSG00000152592 DMP1 ARHP|ARHR|DMP-1 dentin matrix acidic phosphoprotein 1 protein-coding 311.333-35 chr3 67416698 67417315 + 1 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) intron (NM_001177599, intron 9 of 10) 191542 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 156.333-91 chr12 119071872 119072180 + 1 NA intron (NM_194286, intron 1 of 12) MIRc|SINE|MIR 90485 NM_194286 84530 Hs.744964 NM_194286 ENSG00000139767 SRRM4 KIAA1853|MU-MB-2.76|nSR100 serine/arginine repetitive matrix 4 protein-coding 187.333-23 chr10 82380856 82381063 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L1ME3B|LINE|L1 -148039 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-410 chr8 99226292 99226466 + 1 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) L2c|LINE|L2 213113 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 157.667-309 chr7 74194918 74195173 + 1 NA intron (NM_031992, intron 5 of 5) intron (NM_031992, intron 5 of 5) 3847 NR_030321 693175 NR_030321 ENSG00000207741 MIR590 MIRN590|hsa-mir-590|mir-590 microRNA 590 ncRNA 143.333-140 chr2 109089482 109089650 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -39639 NM_001099289 344558 Hs.171244 NM_001099289 ENSG00000172985 SH3RF3 POSH2|SH3MD4 SH3 domain containing ring finger 3 protein-coding 164.333-136 chr20 428084 428355 + 1 NA intron (NR_136659, intron 9 of 11) AluSc8|SINE|Alu 19920 NM_006462 10616 Hs.29546 NM_006462 ENSG00000125826 RBCK1 C20orf18|HOIL-1|HOIL1|PBMEI|PGBM1|RBCK2|RNF54|UBCE7IP3|XAP3|XAP4|ZRANB4 RANBP2-type and C3HC4-type zinc finger containing 1 protein-coding 178.667-13 chr1 199582175 199582386 + 1 NA Intergenic Intergenic 433682 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 158.333-324 chr8 117564789 117565008 + 1 NA Intergenic Intergenic 44185 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 121.333-123 chr3 162565124 162565269 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 738105 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 242.333-34 chr16 68743967 68744343 + 1 NA intron (NM_001317185, intron 2 of 15) intron (NM_001317185, intron 2 of 15) 6863 NM_001317185 999 Hs.461086 NM_004360 ENSG00000039068 CDH1 Arc-1|BCDS1|CD324|CDHE|ECAD|LCAM|UVO cadherin 1 protein-coding 235.667-45 chr4 37283279 37283693 + 1 NA intron (NM_001144990, intron 1 of 6) intron (NM_001144990, intron 1 of 6) 38743 NM_001144990 57495 Hs.4280 NM_001144990 ENSG00000174145 NWD2 KIAA1239 NACHT and WD repeat domain containing 2 protein-coding 203.333-129 chr2 48260649 48260972 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -53872 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 180.333-66 chr20 57058915 57059108 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -154685 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 189.333-105 chr2 183870142 183870494 + 1 NA Intergenic Intergenic -508657 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 161.333-42 chr10 93907965 93908245 + 1 NA non-coding (NR_144335, exon 3 of 3) non-coding (NR_144335, exon 3 of 3) 14127 NR_144336 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 158.667-176 chr2 208038253 208038435 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -12817 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 215.667-73 chr20 57335453 57335791 + 1 NA intron (NM_198265, intron 6 of 11) L2c|LINE|L2 5819 NM_198265 23626 Hs.159737 NM_012444 ENSG00000054796 SPO11 CT35|SPATA43|TOPVIA SPO11 initiator of meiotic double stranded breaks protein-coding 211.333-198 chr5 175424765 175425126 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 19237 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 159.333-204 chr3 19195379 19195543 + 1 NA intron (NM_144633, intron 1 of 15) intron (NM_144633, intron 1 of 15) 46951 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 209.667-99 chr7 8600296 8600670 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 166874 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 250.333-36 chr20 58280797 58281221 + 1 NA intron (NR_003505, intron 3 of 16) L1MC2|LINE|L1 28430 NR_003505 55370 Hs.473179 NM_018498 PPP4R1L C20orf192|PPP4R1P1|PRO1085 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 like (pseudogene) pseudo 317.333-4 chr10 33333096 33333492 + 1 NA intron (NM_001244973, intron 1 of 16) intron (NM_001244973, intron 1 of 16) 1373 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 233.667-43 chr2 158322895 158323252 + 1 NA intron (NM_138803, intron 7 of 13) intron (NM_138803, intron 7 of 13) 133680 NM_001301685 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 167.333-266 chr8 136400414 136400672 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -130255 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 176.667-129 chr6 75099645 75099866 + 1 NA intron (NM_080645, intron 43 of 50) intron (NM_080645, intron 43 of 50) 29027 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 242.333-89 chr7 68653686 68653983 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 633581 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 192.333-9 chr1 115545624 115545956 + 1 NA Intergenic Intergenic -96180 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 149.667-82 chr11 121233627 121233860 + 1 NA Intergenic Intergenic -59028 NM_006918 6309 Hs.287749 NM_006918 ENSG00000109929 SC5D ERG3|S5DES|SC5DL sterol-C5-desaturase protein-coding 143.667-109 chr18 5639551 5639736 + 1 NA Intergenic Intergenic -10652 NM_001281535 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 162.333-156 chr3 14086202 14086382 + 1 NA Intergenic Intergenic 38578 NM_001098502 131474 Hs.517815 NM_144636 ENSG00000163528 CHCHD4 MIA40|TIMM40 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4 protein-coding 187.667-125 chr6 41343484 41343730 + 1 NA intron (NM_001199510, intron 5 of 5) LTR54|LTR|ERV1 7999 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 142.333-247 chr8 136509671 136509898 + 1 NA Intergenic Intergenic -21014 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 126.667-125 chr4 109440795 109440963 + 1 NA intron (NM_001042734, intron 1 of 22) intron (NM_001042734, intron 1 of 22) -7062 NR_039978 100533182 Hs.518927 NR_039978 ENSG00000247950 SEC24B-AS1 1/2-SBSRNA4 SEC24B antisense RNA 1 ncRNA 280.667-28 chr17 80103539 80103938 + 1 NA intron (NM_000152, intron 1 of 19) intron (NM_000152, intron 1 of 19) 2157 NM_000152 2548 Hs.1437 NM_000152 ENSG00000171298 GAA LYAG glucosidase alpha, acid protein-coding 214.667-63 chr2 43160995 43161277 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -58691 NR_151714 100506047 Hs.127112 NR_151714 LINC02580 - long intergenic non-protein coding RNA 2580 ncRNA 139.667-25 chr11 9866376 9866561 + 1 NA intron (NM_030962, intron 17 of 39) L1MA4|LINE|L1 27326 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 275.667-32 chr2 115271409 115271954 + 1 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) intron (NM_001321906, intron 2 of 26) -37556 NM_020868 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 236.667-97 chrX 39073589 39073896 + 1 NA Intergenic Intergenic 253620 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 136.333-91 chr2 67363349 67363495 + 1 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -33911 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 161.333-238 chr5 142854390 142854567 + 1 NA intron (NM_001349547, intron 1 of 21) L2a|LINE|L2 14432 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 124.667-93 chr18 60792471 60792672 + 1 NA Intergenic Intergenic -419796 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 127.667-61 chr17 56175332 56175522 + 1 NA intron (NM_153228, intron 1 of 16) intron (NM_153228, intron 1 of 16) 21952 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 158.333-317 chr8 67168604 67168854 + 1 NA intron (NM_001363133, intron 21 of 27) intron (NM_001363133, intron 21 of 27) 84881 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 136.667-82 chr18 4124414 4124608 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) -140091 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 159.667-69 chr12 15691155 15691409 + 1 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) FLAM_C|SINE|Alu 98106 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 166.333-235 chr8 123855101 123855366 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 3246 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 126.667-61 chr16 12395745 12395915 + 1 NA intron (NM_032167, intron 16 of 20) intron (NM_032167, intron 16 of 20) -324491 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 201.667-84 chr4 52720268 52720659 + 1 NA non-coding (NR_145130, exon 3 of 3) non-coding (NR_145130, exon 3 of 3) 7214 NR_003016 677810 Hs.635034 NR_003016 ENSG00000212588 SNORA26 HBI-6 small nucleolar RNA, H/ACA box 26 snoRNA 428.333-5 chr3 59241694 59242279 + 1 NA Intergenic (ATTTTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -191954 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 147.333-138 chr17 42431726 42431952 + 1 NA Intergenic Intergenic -8583 NM_012232 284119 Hs.437191 NM_012232 ENSG00000177469 CAVIN1 CAVIN|CGL4|FKSG13|PTRF|cavin-1 caveolae associated protein 1 protein-coding 355.667-10 chr5 89490021 89490625 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 526397 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 190.667-26 chr12 2278314 2278642 + 1 NA intron (NR_046769, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 8702 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 148.667-244 chr3 36872651 36872854 + 1 NA intron (NM_001329998, intron 9 of 23) HAL1ME|LINE|L1 -50252 NR_147141 105377031 Hs.333862 NR_147141 ENSG00000279727 LINC02033 - long intergenic non-protein coding RNA 2033 ncRNA 315.333-28 chr20 37429165 37429710 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 83309 NM_198291 6714 Hs.195659 NM_005417 ENSG00000197122 SRC ASV|SRC1|THC6|c-SRC|p60-Src SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 203.333-97 chr16 25797754 25798067 + 1 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) intron (NM_006040, intron 1 of 1) 105951 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 252.667-38 chr16 67837614 67838041 + 1 NA intron (NM_025082, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 -4493 NM_020457 57215 Hs.632200 NM_020457 ENSG00000168286 THAP11 CTG-B43a|CTG-B45d|HRIHFB2206|RONIN THAP domain containing 11 protein-coding 178.333-108 chr3 114701311 114701581 + 1 NA intron (NM_001348805, intron 5 of 10) intron (NM_001348805, intron 5 of 10) 42079 NR_039959 100616166 NR_039959 ENSG00000264623 MIR4796 mir-4796 microRNA 4796 ncRNA 151.333-450 chr9 133673546 133673794 + 1 NA intron (NM_001134707, intron 17 of 20) intron (NM_001134707, intron 17 of 20) -16262 NR_102735 138948 Hs.223858 NR_002783 ENSG00000225756 DBH-AS1 NCRNA00118 DBH antisense RNA 1 ncRNA 158.333-197 chr3 30718519 30718701 + 1 NA Intergenic Intergenic 112009 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 198.667-120 chr20 50557864 50558256 + 1 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu -27726 NR_030375 693230 NR_030375 ENSG00000208018 MIR645 MIRN645|hsa-mir-645 microRNA 645 ncRNA 119.667-110 chr3 26535430 26535601 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -87291 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 153.667-395 chr8 128239318 128239623 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 89354 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 181.333-19 chr11 9747680 9748024 + 1 NA intron (NM_015055, intron 9 of 11) intron (NM_015055, intron 9 of 11) -10441 NR_036485 283104 Hs.632156 NR_036485 ENSG00000246273 SBF2-AS1 - SBF2 antisense RNA 1 ncRNA 277.667-29 chr3 47869630 47870189 + 1 NA intron (NM_002375, intron 13 of 18) intron (NM_002375, intron 13 of 18) 20354 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 212.333-150 chr8 120674485 120674822 + 1 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) MIRc|SINE|MIR -86600 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 126.667-46 chr14 45941471 45941655 + 1 NA Intergenic Intergenic -122596 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 366.333-11 chr2 218648015 218648465 + 1 NA intron (NM_001366288, intron 7 of 10) intron (NM_001366288, intron 7 of 10) 11383 NM_001366291 7701 Hs.657969 NM_001105537 ENSG00000115568 ZNF142 HA4654|NEDISHM|pHZ-49 zinc finger protein 142 protein-coding 157.333-125 chr15 71103321 71103552 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -38013 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 220.333-55 chr18 62741756 62742013 + 1 NA intron (NM_194449, intron 1 of 16) L2b|LINE|L2 26343 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 184.667-124 chr7 85309655 85309845 + 1 NA Intergenic AluYh3|SINE|Alu -111372 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 261.667-67 chr7 15846215 15846621 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 158040 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 158.333-308 chr7 109540470 109540687 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 419635 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 275.333-55 chr5 45191145 45191805 + 1 NA Intergenic Intergenic 382528 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 196.667-4 chr1 163808541 163808887 + 1 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -385523 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 117.333-108 chr2 181213466 181213619 + 1 NA intron (NR_130784, intron 1 of 4) intron (NR_130784, intron 1 of 4) 89705 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 131.333-168 chr7 94674898 94675138 + 1 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 18648 NM_001184962 23089 Hs.147492 NM_015068 ENSG00000242265 PEG10 EDR|HB-1|MEF3L|Mar2|Mart2|RGAG3|RTL2|SIRH1 paternally expressed 10 protein-coding 183.667-73 chr2 38989068 38989434 + 1 NA intron (NM_005633, intron 21 of 22) intron (NM_005633, intron 21 of 22) -28907 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 210.667-73 chr2 170377152 170377488 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 9 of 33) intron (NM_001083615, intron 9 of 33) -26377 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 144.667-67 chr13 33556976 33557241 + 1 NA intron (NM_001243476, intron 3 of 17) intron (NM_001243476, intron 3 of 17) 119686 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 293.333-8 chr12 98320215 98320625 + 1 NA Intergenic Intergenic 136725 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 129.333-137 chr4 37515439 37515601 + 1 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 61595 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 234.333-92 chr9 86413093 86413572 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -58922 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 164.667 chr1 20798439 20798624 + 1 NA Intergenic Intergenic -11843 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 222.667-92 chr8 30413024 30413425 + 1 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) AluSz6|SINE|Alu -27823 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 140.333-196 chr5 174407927 174408082 + 1 NA intron (NR_125806, intron 1 of 5) LTR85a|LTR|Gypsy? 71650 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 118.333-33 chr10 58589994 58590204 + 1 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) 77227 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 141.333-11 chr1 189714223 189714441 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 761678 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 263.667-71 chr6 69235334 69235653 + 1 NA intron (NM_001704, intron 19 of 31) intron (NM_001704, intron 19 of 31) 560973 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 250.667-5 chr1 235409883 235410322 + 1 NA intron (NM_001287801, intron 3 of 17).2 AluSx|SINE|Alu 42675 NM_001287801 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 257.667-75 chr7 7682593 7682972 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) 35825 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 166.333-246 chrX 51392362 51392647 + 1 NA Intergenic Intergenic -14444 NM_203407 340602 Hs.97053 NM_203407 ENSG00000187690 EZHIP CXorf67 EZH inhibitory protein protein-coding 131.667-14 chr1 232421959 232422155 + 1 NA intron (NM_020808, intron 16 of 20) intron (NM_020808, intron 16 of 20) 93551 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 151.333-388 chr7 47924240 47924465 + 1 NA intron (NM_138295, intron 7 of 56) LTR8B|LTR|ERV1 24139 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 205.333-195 chr5 154927494 154927765 + 1 NA intron (NM_015465, intron 6 of 27) intron (NM_015465, intron 6 of 27) 10582 NM_015465 25929 Hs.483921 NM_015465 ENSG00000082516 GEMIN5 GEMIN-5 gem nuclear organelle associated protein 5 protein-coding 127.667-83 chr2 72395913 72396067 + 1 NA intron (NM_001321729, intron 18 of 22) intron (NM_001321729, intron 18 of 22) -248128 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 441.667-2 chr5 5057419 5058228 + 1 NA non-coding (NR_026994, exon 3 of 7) non-coding (NR_026994, exon 3 of 7) 20488 NR_134266 105374631 Hs.570964 NR_134266 ENSG00000250529 LINC02121 - long intergenic non-protein coding RNA 2121 ncRNA 151.333-251 chr20 52680970 52681260 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 60277 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 161.333-44 chr10 107931021 107931233 + 1 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 138166 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 137.667-170 chr7 4397930 4398174 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -263215 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 154.667-157 chr19 40316837 40317001 + 1 NA Intergenic Intergenic 31478 NM_001256441 126526 Hs.631557 NM_178830 ENSG00000160392 C19orf47 - chromosome 19 open reading frame 47 protein-coding 180.333-5 chr1 115453762 115454082 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -115686 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 281.667-12 chr11 109453190 109453862 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 31336 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 247.333-77 chr7 90391364 90391652 + 1 NA TTS (NM_033107) TTS (NM_033107) -4784 NR_102424 101409256 NR_102424 LOC101409256 - cell division cycle 42 pseudogene pseudo 154.333-30 chr10 14915897 14916160 + 1 NA intron (NR_110297, intron 15 of 16) L1ME1|LINE|L1 37128 NM_024670 79723 Hs.554883 NM_024670 ENSG00000152455 SUV39H2 KMT1B suppressor of variegation 3-9 homolog 2 protein-coding 131.667-61 chr15 67663440 67663682 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 12 of 21) intron (NM_001206804, intron 12 of 21) 114467 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 195.667-8 chr10 20803537 20803888 + 1 NA intron (NM_001173484, intron 5 of 6) intron (NM_001173484, intron 5 of 6) 93890 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 188.667-87 chr2 238734652 238734887 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 113138 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 184.667-121 chr7 40529728 40529951 + 1 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 394863 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 137.333-194 chr8 83500653 83500856 + 1 NA Intergenic Intergenic 96996 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 165.333-114 chr18 40220316 40220586 + 1 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 154165 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 163.667-130 chr20 7576214 7576525 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 204761 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 158.333-68 chr12 61954311 61954634 + 1 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 238367 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 220.333-44 chr16 25150392 25150721 + 1 NA intron (NM_001032391, intron 4 of 8) AluSp|SINE|Alu -1524 NR_039998 100506655 Hs.657576 NR_039998 ENSG00000260034 LCMT1-AS2 - LCMT1 antisense RNA 2 ncRNA 203.667-3 chr1 117966415 117966721 + 1 NA TTS (NM_006784) TTS (NM_006784) 36829 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 221.667-2 chr1 83040998 83041360 + 1 NA intron (NR_147074, intron 5 of 10) intron (NR_147074, intron 5 of 10) -54971 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 191.667-89 chr3 186649699 186649973 + 1 NA intron (NM_001308079, intron 3 of 4) L1PB4|LINE|L1 9437 NM_001308077 26998 Hs.81073 NM_014375 ENSG00000090512 FETUB 16G2|Gugu|IRL685 fetuin B protein-coding 154.333-277 chr5 130711930 130712176 + 1 NA Intergenic Intergenic 453203 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 162.667-225 chr5 104696246 104696479 + 1 NA Intergenic Intergenic -403112 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 148.667-95 chr12 54312545 54312750 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -11610 NM_001261461 4778 Hs.75643 NM_006163 ENSG00000123405 NFE2 NF-E2|p45 nuclear factor, erythroid 2 protein-coding 265.667-57 chr5 24973189 24973488 + 1 NA Intergenic Intergenic -132755 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 281.333-57 chr6 74720878 74721228 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 407729 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 136.667-8 chr1 118320143 118320345 + 1 NA Intergenic Intergenic -135016 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 231.667-12 chr13 44189688 44190066 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 6323 NR_107046 102465876 NR_107046 ENSG00000276319 MIR8079 hsa-mir-8079 microRNA 8079 ncRNA 315.333-19 chr2 65942968 65943434 + 1 NA Intergenic LTR28C|LTR|ERV1 415127 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 226.333-8 chr10 65804174 65804418 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 232871 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 130.667-113 chr2 126965639 126965848 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 66853 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 116.333-191 chr6 79061461 79061637 + 1 NA intron (NM_017934, intron 4 of 39) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 16705 NM_017934 55023 Hs.511817 NM_017934 ENSG00000146247 PHIP BRWD2|DCAF14|DIDOD|WDR11|ndrp pleckstrin homology domain interacting protein protein-coding 144.667-130 chr2 21736920 21737152 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -26384 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 251.667-24 chr14 78989409 78989863 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -210346 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 248.333-105 chr9 136036935 136037470 + 1 NA intron (NM_144653, intron 2 of 5) intron (NM_144653, intron 2 of 5) 58087 NM_144653 138151 Hs.112895 NM_144653 ENSG00000148411 NACC2 BEND9|BTBD14|BTBD14A|BTBD31|NAC-2|RBB NACC family member 2 protein-coding 156.667-195 chr2 176079081 176079338 + 1 NA TTS (NM_001080458) TTS (NM_001080458) 4753 NM_001080458 344191 Hs.452341 NM_001080458 ENSG00000174279 EVX2 EVX-2 even-skipped homeobox 2 protein-coding 144.667-120 chr18 64188039 64188323 + 1 NA intron (NR_033881, intron 2 of 9) intron (NR_033881, intron 2 of 9) -39155 NR_027245 221241 Hs.567778 NM_152728 ENSG00000179676 LINC00305 C18orf20|HsT1235|NCRNA00305 long intergenic non-protein coding RNA 305 ncRNA 117.333-226 chrX 110263329 110263463 + 1 NA intron (NM_001025580, intron 1 of 4) intron (NM_001025580, intron 1 of 4) -38336 NR_004379 692226 NR_004379 ENSG00000208883 SNORD96B U96b small nucleolar RNA, C/D box 96B snoRNA 181.333-107 chr3 178282403 178282665 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -136667 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 142.333-135 chr2 210552577 210552753 + 1 NA intron (NR_161225, intron 1 of 38) intron (NR_161225, intron 1 of 38) 3540 NR_161225 1373 Hs.149252 NM_001875 ENSG00000021826 CPS1 CPSASE1|PHN carbamoyl-phosphate synthase 1 protein-coding 219.667-44 chr20 20061809 20062271 + 1 NA intron (NM_015585, intron 2 of 26) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 5394 NM_001167816 26074 Hs.729168 NM_015585 ENSG00000089101 CFAP61 C20orf26|CaM-IP3|dJ1002M8.3|dJ1178H5.4 cilia and flagella associated protein 61 protein-coding 296.667-55 chr7 68786368 68786728 + 1 NA Intergenic Intergenic 766295 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 124.667-146 chr4 18587909 18588069 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -566114 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 208.667-136 chr8 37168758 37169016 + 1 NA Intergenic Intergenic 325026 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 153.667-180 chr2 68217581 68217798 + 1 NA intron (NM_000945, intron 1 of 5) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 34843 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 271.667-28 chr14 91876818 91877171 + 1 NA intron (NM_006329, intron 10 of 10) AluJb|SINE|Alu -9458 NM_001128596 123036 Hs.510262 NM_152332 ENSG00000165929 TC2N C14orf47|C2CD1|MTAC2D1|Tac2-N tandem C2 domains, nuclear protein-coding 239.667-25 chr16 10368219 10368499 + 1 NA Intergenic Intergenic -17702 NR_045815 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 247.667-35 chr15 56702089 56702476 + 1 NA intron (NM_001002843, intron 3 of 20) intron (NM_001002843, intron 3 of 20) 31804 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 113.333-202 chr5 13765519 13765685 + 1 NA intron (NM_001369, intron 59 of 78) L1ME3|LINE|L1 178878 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 147.333-49 chr10 95792376 95792530 + 1 NA intron (NR_038444, intron 4 of 5) LTR54|LTR|ERV1 36290 NM_001776 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 348.333-21 chr3 78005555 78006098 + 1 NA Intergenic Intergenic 43137 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 166.667-154 chr3 170126271 170126498 + 1 NA intron (NM_024947, intron 8 of 14) intron (NM_024947, intron 8 of 14) 55349 NM_001308116 80012 Hs.529592 NM_024947 ENSG00000173889 PHC3 EDR3|HPH3 polyhomeotic homolog 3 protein-coding 152.333-410 chr9 132597060 132597226 + 1 NA intron (NR_136309, intron 18 of 18) MIRc|SINE|MIR 14537 NM_020064 56751 Hs.283809 NM_020064 ENSG00000125492 BARHL1 - BarH like homeobox 1 protein-coding 142.333-24 chr10 62641581 62641735 + 1 NA intron (NM_199451, intron 5 of 7) intron (NM_199451, intron 5 of 7) 121210 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 202.333-178 chr8 115799582 115799822 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -130727 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 111.667-254 chr8 78865073 78865289 + 1 NA Intergenic Intergenic 27652 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 237.667-52 chr22 34833320 34833605 + 1 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 164454 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 199.667-157 chrX 97589925 97590363 + 1 NA intron (NM_006729, intron 26 of 26) intron (NM_006729, intron 26 of 26) -25609 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 172.333-108 chr3 57057299 57057497 + 1 NA intron (NM_001128615, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu -3266 NM_181727 353324 Hs.129794 NM_181727 ENSG00000186451 SPATA12 SRG5 spermatogenesis associated 12 protein-coding 124.667-102 chr2 77296884 77297063 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 225403 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 162.667-115 chr19 13965349 13965668 + 1 NA exon (NM_002918, exon 16 of 21) exon (NM_002918, exon 16 of 21) -12116 NM_001146254 79883 Hs.448497 NM_024825 ENSG00000132000 PODNL1 SLRR5B podocan like 1 protein-coding 186.333-45 chr13 58125329 58125621 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -40352 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 151.333-387 chr7 40083627 40083821 + 1 NA intron (NM_003718, intron 11 of 13) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 50898 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 275.333-65 chr6 118685439 118685756 + 1 NA intron (NM_001178035, intron 1 of 13) intron (NM_001178035, intron 1 of 13) 24478 NM_001178035 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 152.333-349 chr7 9549307 9549469 + 1 NA Intergenic Intergenic -84882 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 153.333-158 chr17 28646440 28646669 + 1 NA Intergenic Intergenic -1395 NM_001363827 9703 Hs.151761 NM_014680 ENSG00000007202 KIAA0100 BCOX|BCOX1|CT101|FMP27 KIAA0100 protein-coding 187.333-174 chr6 63822848 63823254 + 1 NA TTS (NR_157848) TTS (NR_157848) 16215 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 288.333-10 chr14 49952396 49952715 + 1 NA Intergenic Intergenic -13844 NR_106724 102464828 NR_106724 ENSG00000278038 MIR6076 hsa-mir-6076 microRNA 6076 ncRNA 116.667-163 chr5 115174105 115174256 + 1 NA intron (NM_001017397, intron 1 of 1) intron (NM_001017397, intron 1 of 1) -4272 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 149.667-26 chr1 112679855 112680017 + 1 NA intron (NM_001321324, intron 2 of 20) L1ME3G|LINE|L1 5198 NM_001369507 4343 Hs.514941 NM_020963 ENSG00000155363 MOV10 fSAP113|gb110 Mov10 RISC complex RNA helicase protein-coding 149.667-333 chr5 145740381 145740567 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 94868 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 124.333-92 chr2 151110233 151110410 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 151542 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 172.333-198 chr9 89587610 89587806 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -17304 NM_006705 10912 Hs.9701 NM_006705 ENSG00000130222 GADD45G CR6|DDIT2|GADD45gamma|GRP17 growth arrest and DNA damage inducible gamma protein-coding 129.333-96 chr2 88003862 88004027 + 1 NA Intergenic Intergenic -18154 NM_001024457 400966 Hs.728970 NM_001024457 ENSG00000187627 RGPD1 RGP1|RGPD2|RanBP2L2 RANBP2 like and GRIP domain containing 1 protein-coding 242.333-72 chr3 106013455 106013871 + 1 NA Intergenic Intergenic -144262 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 165.333-113 chr18 7782151 7782320 + 1 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 214919 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 150.667-44 chr10 70411767 70412063 + 1 NA intron (NM_004096, intron 1 of 2) HAL1|LINE|L1 7770 NM_004096 1979 Hs.621200 NM_004096 ENSG00000148730 EIF4EBP2 4EBP2|PHASII eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 protein-coding 129.667-99 chr2 115621867 115622090 + 1 NA intron (NM_001321912, intron 6 of 25) intron (NM_001321912, intron 6 of 25) 278163 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 169.667-79 chr15 76878789 76879118 + 1 NA intron (NM_001353012, intron 2 of 32) L1MEg|LINE|L1 -17009 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 169.333-50 chr12 32062909 32063133 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -43786 NM_001363603 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 160.667-2 chr1 10208888 10209192 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1530 NM_001365951 23095 Hs.97858 NM_015074 ENSG00000054523 KIF1B CMT2|CMT2A|CMT2A1|HMSNII|KLP|NBLST1 kinesin family member 1B protein-coding 266.667-8 chr1 164782049 164782443 + 1 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) -7605 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 257.333-44 chr17 53517938 53518256 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -304830 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 135.667-174 chr7 93252459 93252647 + 1 NA intron (NM_001257998, intron 3 of 28) intron (NM_001257998, intron 3 of 28) 20187 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 185.667-115 chr7 30709505 30709738 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9518 NM_001202475 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 174.667-91 chr2 124311207 124311518 + 1 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 286075 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 117.667-22 chr11 21865801 21866011 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -327179 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 116.333-56 chr13 67279745 67279918 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -49495 NM_020403 5101 Hs.654709 NM_020403 ENSG00000184226 PCDH9 - protocadherin 9 protein-coding 176.667-48 chr13 20247793 20248025 + 1 NA Intergenic Intergenic -15514 NM_001110221 10804 Hs.511757 NM_006783 ENSG00000121742 GJB6 CX30|DFNA3|DFNA3B|DFNB1B|ECTD2|ED2|EDH|HED|HED2 gap junction protein beta 6 protein-coding 239.667-41 chr2 198811142 198811554 + 1 NA Intergenic Intergenic -436251 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 254.667-67 chr5 60019693 60020052 + 1 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -126146 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 230.667-77 chr7 6439022 6439425 + 1 NA intron (NM_001142936, intron 2 of 12) AluSx3|SINE|Alu 8731 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 505.667-5 chr5 26952936 26953582 + 1 NA intron (NM_016279, intron 2 of 11) intron (NM_016279, intron 2 of 11) 85327 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 132.333-142 chr5 162176219 162176475 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 108705 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 282.667-18 chr2 63913651 63914063 + 1 NA intron (NM_001005739, intron 17 of 22) intron (NM_001005739, intron 17 of 22) 71977 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 275.333-14 chr12 21451272 21451767 + 1 NA intron (NM_001350913, intron 4 of 10) MIR|SINE|MIR 13604 NM_001350912 79912 Hs.709545 NM_024854 ENSG00000121350 PYROXD1 MFM8 pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 protein-coding 233.333-67 chr2 120827690 120828038 + 1 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) L1MB3|LINE|L1 35583 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 158.667-148 chr2 13975340 13975521 + 1 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 425528 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 388.667-2 chr11 36712998 36713442 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -114941 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 157.667-200 chr3 148208823 148209115 + 1 NA Intergenic Intergenic -71922 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 181.667-43 chr15 81352630 81352944 + 1 NA intron (NM_001080532, intron 9 of 21) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 21426 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 304.667 chr1 76893133 76893708 + 1 NA intron (NM_001320274, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 25940 NM_001320273 81849 Hs.149201 NM_030965 ENSG00000117069 ST6GALNAC5 SIAT7-E|SIAT7E|ST6GalNAcV ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5 protein-coding 152.667-291 chr5 33108080 33108283 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -121554 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 148.333-135 chr14 97180774 97180951 + 1 NA Intergenic Intergenic 26005 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 145.667-215 chr5 72887803 72888013 + 1 NA intron (NM_001364293, intron 12 of 24) intron (NM_001364293, intron 12 of 24) 9317 NR_039968 100616152 NR_039968 ENSG00000263593 MIR4804 - microRNA 4804 ncRNA 168.333-7 chr1 90778725 90779049 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 57274 NR_147932 105378853 Hs.546492 NR_135038 ENSG00000233593 LINC02609 - long intergenic non-protein coding RNA 2609 ncRNA 211.667-66 chr2 159401074 159401461 + 1 NA intron (NM_001329858, intron 15 of 36) intron (NM_001329858, intron 15 of 36) -114564 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 235.333-91 chr5 1770946 1771340 + 1 NA Intergenic Intergenic 28694 NM_032479 64979 Hs.719465 NM_032479 ENSG00000171421 MRPL36 BRIP1|L36mt|MRP-L36|PRPL36|RPMJ mitochondrial ribosomal protein L36 protein-coding 332.667-10 chr12 132653018 132653522 + 1 NA intron (NM_006231, intron 29 of 48) AluJo|SINE|Alu 34254 NM_006231 5426 Hs.524871 NM_006231 ENSG00000177084 POLE CRCS12|FILS|IMAGEI|POLE1 DNA polymerase epsilon, catalytic subunit protein-coding 150.667-312 chr5 110034389 110034647 + 1 NA Intergenic Intergenic 151336 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 202.667-100 chr3 108671391 108671786 + 1 NA intron (NM_014648, intron 22 of 32) intron (NM_014648, intron 22 of 32) 81866 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 144.333-171 chr3 102029861 102030048 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 89095 NR_026934 152225 Hs.376768 NR_026934 ENSG00000214407 LINC02085 - long intergenic non-protein coding RNA 2085 ncRNA 200.667-67 chr2 7180674 7181124 + 1 NA Intergenic Intergenic -103019 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 188.667-32 chr12 15958836 15959154 + 1 NA intron (NM_015954, intron 3 of 8) MIR3|SINE|MIR 47663 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 119.333-138 chr2 219368556 219368711 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 18729 NM_001319118 23549 Hs.258551 NM_012100 ENSG00000123992 DNPEP ASPEP|DAP aspartyl aminopeptidase protein-coding 146.667-263 chr5 109159388 109159658 + 1 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) intron (NR_146155, intron 17 of 19) 166846 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 165.667-85 chr2 25404848 25405183 + 1 NA intron (NM_001351385, intron 14 of 17) AluJb|SINE|Alu -62425 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 143.667-78 chr14 72382563 72382794 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) L1ME3D|LINE|L1 -134142 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 283.333-55 chr3 195016788 195017212 + 1 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -77588 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 133.333-74 chr2 31090782 31091029 + 1 NA intron (NM_001329095, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 38735 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 143.667-203 chr5 84784926 84785150 + 1 NA Intergenic Intergenic -400158 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 160.667-119 chr17 32146065 32146378 + 1 NA intron (NM_001288755, intron 1 of 18) L2a|LINE|L2 -3086 NR_136413 105371730 Hs.673781 NR_136413 ENSG00000214708 LOC105371730 - uncharacterized LOC105371730 ncRNA 169.667-112 chr2 132930703 132931030 + 1 NA non-coding (NR_135572, exon 2 of 2) non-coding (NR_135572, exon 2 of 2) 15309 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-4 chr1 45659972 45660129 + 1 NA intron (NM_021639, intron 3 of 12) intron (NM_021639, intron 3 of 12) -13365 NR_026768 728963 Hs.675157 NR_026768 RPS15AP10 RPS15A_4_42 ribosomal protein S15a pseudogene 10 pseudo 142.333-168 chr4 12348908 12349175 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 125590 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 116.333-33 chr10 64981179 64981335 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -56739 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 253.333-35 chr16 31315318 31315863 + 1 NA intron (NM_001145808, intron 14 of 29) AluSx1|SINE|Alu -39586 NM_001286375 3687 Hs.248472 NM_000887 ENSG00000140678 ITGAX CD11C|SLEB6 integrin subunit alpha X protein-coding 139.667-16 chr1 219883647 219883818 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 44919 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 187.333-134 chr3 156989238 156989573 + 1 NA intron (NM_001004316, intron 7 of 12) L1ME4a|LINE|L1 -92436 NR_135546 105374177 Hs.634263 NR_135546 ENSG00000241544 LINC02029 - long intergenic non-protein coding RNA 2029 ncRNA 132.333-28 chr10 121649099 121649375 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -50779 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 163.667-248 chr8 80082659 80082833 + 1 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) intron (NM_001025253, intron 1 of 7) -1915 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 134.667-152 chr5 5042604 5042750 + 1 NA intron (NR_026994, intron 2 of 6) intron (NR_026994, intron 2 of 6) 8318 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 140.667-167 chr4 89766588 89766754 + 1 NA intron (NM_001146054, intron 4 of 5) intron (NM_001146054, intron 4 of 5) -69730 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 271.333-29 chr2 72635599 72635918 + 1 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L1MDa|LINE|L1 190275 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 139.333-146 chr3 47732003 47732275 + 1 NA intron (NM_003074, intron 5 of 27) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 49754 NM_003074 6599 Hs.476179 NM_003074 ENSG00000173473 SMARCC1 BAF155|CRACC1|Rsc8|SRG3|SWI3 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 1 protein-coding 253.333-48 chr18 68831210 68831582 + 1 NA intron (NM_024781, intron 1 of 7) intron (NM_024781, intron 1 of 7) 33316 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 233.333-30 chr12 5530440 5530756 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 36466 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 148.333-159 chr17 4300611 4300795 + 1 NA intron (NM_003342, intron 2 of 5) AluSg4|SINE|Alu -28809 NR_110982 103021295 Hs.741319 NR_110982 LOC103021295 - uncharacterized LOC103021295 ncRNA 157.667-51 chr11 30004178 30004490 + 1 NA Intergenic Intergenic 12696 NM_002233 3739 Hs.592002 NM_002233 ENSG00000182255 KCNA4 HBK4|HK1|HPCN2|HUKII|KCNA4L|KCNA8|KV1.4|MCIDDS|PCN2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 4 protein-coding 135.333-41 chr12 26522871 26523118 + 1 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 310200 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 115.667-24 chr10 41889438 41889591 + 1 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 478531 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 145.667-246 chr6 66156695 66156940 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 368938 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 149.333-42 chr10 31338338 31338577 + 1 NA intron (NM_001323675, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 16797 NM_001323673 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 173.667-140 chr5 25908742 25909062 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 717949 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 185.667-13 chr10 66051338 66051671 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) intron (NM_001127384, intron 15 of 17) 480079 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 156.333-52 chr11 21927535 21927706 + 1 NA Intergenic Intergenic -265465 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 138.333-175 chr7 690256 690489 + 1 NA intron (NM_001164760, intron 2 of 10) L1PA16|LINE|L1 22152 NM_002735 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 141.667-236 chr8 138312806 138312991 + 1 NA intron (NM_015912, intron 2 of 19) L1MA7|LINE|L1 184363 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 160.333-303 chr9 109911283 109911498 + 1 NA intron (NM_053016, intron 3 of 6) intron (NM_053016, intron 3 of 6) 131192 NM_053016 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 139.333-56 chr12 65344097 65344295 + 1 NA intron (NM_001031679, intron 4 of 6) intron (NM_001031679, intron 4 of 6) 65209 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 312.667-6 chr1 230511041 230511483 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 84321 NR_146479 101927553 Hs.680219 NR_146479 ENSG00000232964 LINC01737 - long intergenic non-protein coding RNA 1737 ncRNA 150.333-54 chr11 21805028 21805234 + 1 NA Intergenic Intergenic -387954 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 155.667-353 chr8 83328770 83328927 + 1 NA Intergenic (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -74910 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 188.333-135 chr6 138306150 138306398 + 1 NA intron (NM_020340, intron 22 of 33) L1MEg|LINE|L1 -71369 NM_001368163 110806279 NM_001368163 ENSG00000262543 SMIM28 - small integral membrane protein 28 protein-coding 161.333-282 chr8 71788010 71788244 + 1 NA Intergenic Intergenic -54996 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 169.333-187 chr4 105327296 105327630 + 1 NA intron (NR_126420, intron 2 of 5) intron (NR_126420, intron 2 of 5) 25418 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 275.666 chr11 77562565 77562934 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -8340 NR_130930 646029 Hs.609654 NM_001039908 LOC646029 - uncharacterized LOC646029 ncRNA 140.667-221 chr7 132255962 132256150 + 1 NA intron (NM_020911, intron 4 of 31) intron (NM_020911, intron 4 of 31) -4805 NR_134565 101928807 Hs.552131 NR_134565 LOC101928807 - uncharacterized LOC101928807 ncRNA 339.667-10 chr2 50931343 50931805 + 1 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 100558 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 185.667-76 chr2 169468454 169468693 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10921 NM_152384 129880 Hs.233398 NM_152384 ENSG00000163093 BBS5 - Bardet-Biedl syndrome 5 protein-coding 175.667-14 chr1 226880545 226880879 + 1 NA intron (NM_000447, intron 3 of 12) intron (NM_000447, intron 3 of 12) 10096 NM_000447 5664 Hs.25363 NM_000447 ENSG00000143801 PSEN2 AD3L|AD4|CMD1V|PS2|STM2 presenilin 2 protein-coding 261.667-41 chr2 202404651 202405131 + 1 NA intron (NM_001204, intron 1 of 12) AluJr|SINE|Alu 28564 NM_001204 659 Hs.471119 NM_001204 ENSG00000204217 BMPR2 BMPR-II|BMPR3|BMR2|BRK-3|POVD1|PPH1|T-ALK bone morphogenetic protein receptor type 2 protein-coding 153.333-54 chr10 80695540 80695771 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 45858 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 261.667-2 chr1 62873350 62873665 + 1 NA Intergenic Intergenic 89375 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 257.667-48 chr20 51171018 51171548 + 1 NA Intergenic Intergenic -148176 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 147.333-182 chr2 221713909 221714156 + 1 NA Intergenic Intergenic -139830 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 120.333-106 chr2 170105326 170105499 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -72735 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 142.667-249 chr9 123262834 123263070 + 1 NA intron (NM_018387, intron 1 of 18) intron (NM_018387, intron 1 of 18) 5634 NR_033234 55342 Hs.287659 NM_018387 ENSG00000165209 STRBP HEL162|ILF3L|SPNR|p74 spermatid perinuclear RNA binding protein protein-coding 154.667-66 chr11 100536445 100536618 + 1 NA Intergenic LTR16D2|LTR|ERVL -150757 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 216.667-84 chr5 65329925 65330355 + 1 NA intron (NR_135689, intron 8 of 25) intron (NR_135689, intron 8 of 25) 151780 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 148.667-145 chr16 3445623 3445864 + 1 NA intron (NM_001083601, intron 1 of 7) intron (NM_001083601, intron 1 of 7) 2063 NM_001083601 79903 Hs.513296 NM_024845 ENSG00000122390 NAA60 HAT4|NAT15|NatF|hNaa60 N(alpha)-acetyltransferase 60, NatF catalytic subunit protein-coding 158.333-121 chr18 4644937 4645172 + 1 NA Intergenic Intergenic -189747 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 186.333-43 chr12 123702774 123703010 + 1 NA intron (NM_001143850, intron 14 of 17) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger -9461 NM_012463 23545 Hs.25786 NM_012463 ENSG00000185344 ATP6V0A2 A2|ARCL|ARCL2A|ATP6A2|ATP6N1D|J6B7|RTF|STV1|TJ6|TJ6M|TJ6S|VPH1|WSS ATPase H+ transporting V0 subunit a2 protein-coding 173.667-75 chr2 64739071 64739305 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -85275 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 152.333-279 chr4 98418087 98418256 + 1 NA intron (NM_021159, intron 9 of 14) intron (NM_021159, intron 9 of 14) 156787 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 151.667-199 chr22 22351785 22351996 + 1 NA Intergenic Intergenic 53792 NR_027293 96610 Hs.449601 NM_080926 BMS1P20 IGL|IGLV|IGLV1 BMS1 pseudogene 20 pseudo 113.667-122 chr20 2553533 2553732 + 1 NA intron (NM_080751, intron 2 of 19) L1MC2|LINE|L1 17025 NM_080751 117532 Hs.352626 NM_080751 ENSG00000149488 TMC2 C20orf145 transmembrane channel like 2 protein-coding 150.667-87 chr12 46440870 46441095 + 1 NA intron (NR_125381, intron 2 of 2) intron (NR_125381, intron 2 of 2) 56875 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 232.333-68 chr5 32922670 32922975 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -24621 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 268.333-15 chr13 48890029 48890505 + 1 NA Intergenic Intergenic -85645 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 244.333-101 chr8 86407634 86407973 + 1 NA intron (NM_007013, intron 8 of 24) L1MC2|LINE|L1 65256 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 248.667-43 chr16 12651290 12651592 + 1 NA Intergenic Intergenic -68880 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 201.667-86 chr4 107239869 107240185 + 1 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -203714 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 153.333-59 chr10 121922209 121922410 + 1 NA intron (NM_001288735, intron 1 of 9) intron (NM_001288735, intron 1 of 9) 5722 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 185.333-39 chr12 6854929 6855185 + 1 NA intron (NM_001098536, intron 1 of 19) intron (NM_001098536, intron 1 of 19) 2907 NM_001098536 8078 Hs.631661 NM_003481 ENSG00000111667 USP5 ISOT ubiquitin specific peptidase 5 protein-coding 246.667-29 chr14 60362942 60363312 + 1 NA Intergenic Intergenic 39931 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 145.333-318 chr9 32761716 32761983 + 1 NA Intergenic Intergenic -21691 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 273.333-60 chr5 50761256 50761807 + 1 NA intron (NM_024615, intron 5 of 25) intron (NM_024615, intron 5 of 25) 94117 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 240.333-81 chr6 96854303 96854670 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -17009 NM_001143957 81491 Hs.221364 NM_030784 ENSG00000112218 GPR63 PSP24(beta)|PSP24B G protein-coupled receptor 63 protein-coding 287.667-36 chr8 54696035 54696603 + 1 NA Intergenic Intergenic 80223 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 188.667-132 chr6 151456009 151456273 + 1 NA intron (NM_024573, intron 2 of 4) LTR5_Hs|LTR|ERVK 3675 NM_024573 79624 Hs.15929 NM_024573 ENSG00000146476 ARMT1 C6orf211 acidic residue methyltransferase 1 protein-coding 164.333-128 chr2 170998854 170999120 + 1 NA intron (NM_001136555, intron 16 of 18) AluJr|SINE|Alu 67986 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 149.333-419 chr9 25528888 25529126 + 1 NA Intergenic Intergenic 149851 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 159.667-6 chr1 48717893 48718124 + 1 NA intron (NR_136623, intron 5 of 12) intron (NR_136623, intron 5 of 12) 58883 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 146.333-259 chr5 77392678 77392890 + 1 NA intron (NM_001029854, intron 9 of 20) MER4B-int|LTR|ERV1 99532 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 149.667-304 chr5 24351987 24352236 + 1 NA Intergenic Intergenic 292867 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 149.667-435 chrX 77976193 77976342 + 1 NA intron (NR_104109, intron 2 of 9) intron (NR_104109, intron 2 of 9) -6629 NM_001029891 441531 Hs.632822 NM_001029891 ENSG00000226784 PGAM4 PGAM-B|PGAM1|PGAM3|dJ1000K24.1 phosphoglycerate mutase family member 4 protein-coding 201.333-121 chr16 77702053 77702448 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -20242 NM_001243657 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 390.333-2 chr10 107967599 107968316 + 1 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 101336 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 174.333-88 chr3 79425974 79426168 + 1 NA intron (NR_110133, intron 1 of 2) intron (NR_110133, intron 1 of 2) 14344 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 178.333-116 chr3 194636670 194637004 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3418 NM_001166305 93109 Hs.478729 NM_138399 ENSG00000145014 TMEM44 - transmembrane protein 44 protein-coding 157.667-112 chr15 84883624 84883815 + 1 NA promoter-TSS (NM_201651) promoter-TSS (NM_201651) -942 NM_001287761 9154 Hs.459187 NM_004213 ENSG00000156222 SLC28A1 CNT1|HCNT1 solute carrier family 28 member 1 protein-coding 205.333-136 chr2 214023948 214024210 + 1 NA intron (NR_047660, intron 12 of 14) intron (NR_047660, intron 12 of 14) 266012 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 161.667-114 chr19 37830572 37830912 + 1 NA intron (NR_040015, intron 4 of 5) intron (NR_040015, intron 4 of 5) 13331 NR_040013 644554 Hs.683930 NR_040013 LOC644554 - uncharacterized LOC644554 ncRNA 144.333-100 chr18 7120907 7121115 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3214 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 234.667-53 chr2 121861902 121862411 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 106505 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 398.667-6 chr22 27228430 27229007 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4039 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 162.667-221 chr5 84188632 84188900 + 1 NA intron (NM_001278642, intron 2 of 9) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 196101 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 347.333-23 chr5 119040900 119041363 + 1 NA intron (NR_134250, intron 1 of 2) AluSg|SINE|Alu -3470 NR_134249 105379143 Hs.636285 NR_134249 ENSG00000249494 LOC105379143 - uncharacterized LOC105379143 ncRNA 147.333-86 chr12 72246477 72246703 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -26159 NM_013381 29953 Hs.199814 NM_013381 ENSG00000072657 TRHDE PAP-II|PGPEP2|TRH-DE thyrotropin releasing hormone degrading enzyme protein-coding 136.333-136 chr3 181417096 181417276 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 25300 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 114.667-71 chr13 62372014 62372221 + 1 NA Intergenic Intergenic 48460 NR_047038 100874180 Hs.7415 NR_047038 ENSG00000229307 LINC00459 - long intergenic non-protein coding RNA 459 ncRNA 127.333-108 chr3 56642279 56642445 + 1 NA intron (NM_001365638, intron 14 of 22) intron (NM_001365638, intron 14 of 22) 21684 NM_015224 23272 Hs.116877 NM_015224 ENSG00000163946 TASOR C3orf63|FAM208A|RAP140|TASOR1|se89-1 transcription activation suppressor protein-coding 157.667-341 chr8 130367686 130367942 + 1 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) intron (NM_001247996, intron 2 of 30) -71281 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 304.333-11 chr14 44411484 44411829 + 1 NA Intergenic Intergenic 95627 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 137.667-28 chr10 92127120 92127343 + 1 NA intron (NM_001178137, intron 6 of 9) AluJr|SINE|Alu 116048 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 315.666 chr1 33419913 33420435 + 1 NA Intergenic Intergenic -44581 NM_198040 1912 Hs.524271 NM_004427 ENSG00000134686 PHC2 EDR2|HPH2|PH2 polyhomeotic homolog 2 protein-coding 175.333-198 chr9 4282463 4282896 + 1 NA intron (NM_001042413, intron 2 of 10) MLT2B4|LTR|ERVL 17389 NM_001042413 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 160.667-283 chr7 74148727 74148942 + 1 NA Intergenic MER61E|LTR|ERV1 -25522 NM_022170 7458 Hs.520943 NM_022170 ENSG00000106682 EIF4H WBSCR1|WSCR1|eIF-4H eukaryotic translation initiation factor 4H protein-coding 354.667-3 chr10 27685834 27686395 + 1 NA intron (NM_001242702, intron 5 of 6) intron (NM_001242702, intron 5 of 6) -58501 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 152.667-231 chr22 29907961 29908291 + 1 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) intron (NM_153051, intron 1 of 18) 24952 NM_021090 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 230.333-99 chr5 135773679 135774037 + 1 NA intron (NM_001349335, intron 3 of 10) SATR1|Satellite|Satellite 29217 NR_049867 100847082 NR_049867 ENSG00000265924 MIR5692C1 - microRNA 5692c-1 ncRNA 137.333-171 chr6 42503030 42503276 + 1 NA Intergenic Intergenic -50929 NM_033502 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 301.667-30 chr3 100428585 100429077 + 1 NA intron (NM_001085451, intron 1 of 3) L1ME3|LINE|L1 27292 NM_001085451 348801 Hs.591294 NM_001085451 ENSG00000206535 LNP1 NP3 leukemia NUP98 fusion partner 1 protein-coding 288.333-14 chr16 35763735 35764095 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 17363 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 148.333-254 chr3 99087224 99087480 + 1 NA Intergenic Intergenic -185657 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 147.667-383 chr8 140390869 140391111 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 7 of 22) intron (NM_001160372, intron 7 of 22) 66754 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 119.333-60 chr11 121932174 121932353 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 167581 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 202.333-100 chr2 191325920 191326354 + 1 NA intron (NM_012223, intron 3 of 28) intron (NM_012223, intron 3 of 28) 80733 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 205.333-158 chr3 124255473 124255772 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 3 of 59) intron (NM_001024660, intron 3 of 59) -118710 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 266.667-45 chr3 18850980 18851515 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -297263 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 148.333-179 chr2 25961242 25961444 + 1 NA intron (NM_002254, intron 1 of 7) intron (NM_002254, intron 1 of 7) 21154 NM_002254 3797 Hs.21611 NM_002254 ENSG00000084731 KIF3C - kinesin family member 3C protein-coding 159.667-62 chr11 62365136 62365384 + 1 NA intron (NM_025080, intron 4 of 6) L1MA9|LINE|L1 27812 NM_025080 80150 Hs.535326 NM_025080 ENSG00000162174 ASRGL1 ALP|ALP1|CRASH asparaginase like 1 protein-coding 155.333-357 chr7 23786131 23786310 + 1 NA intron (NM_031414, intron 18 of 23) intron (NM_031414, intron 18 of 23) 76001 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 150.333-178 chr18 75289677 75289932 + 1 NA 3' UTR (NM_001308210, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001308210, exon 2 of 2) 78275 NM_001308210 10194 Hs.284217 NM_005786 ENSG00000179981 TSHZ1 CAA|NY-CO-33|SDCCAG33|TSH1 teashirt zinc finger homeobox 1 protein-coding 202.333-170 chr8 71769952 71770359 + 1 NA Intergenic Intergenic -72968 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 238.333-46 chr2 61757925 61758209 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 95993 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 234.333-77 chr7 83044515 83044925 + 1 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 118164 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 117.667-136 chr4 81133160 81133312 + 1 NA intron (NM_006259, intron 14 of 18) L1MEd|LINE|L1 20921 NM_001282480 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 134.333-97 chr2 218496421 218496602 + 1 NA intron (NM_020935, intron 13 of 25) intron (NM_020935, intron 13 of 25) 71840 NM_020935 57695 Hs.166068 NM_020935 ENSG00000135913 USP37 - ubiquitin specific peptidase 37 protein-coding 238.333-73 chr5 36810018 36810296 + 1 NA Intergenic Intergenic 66537 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 126.667-23 chr11 13177673 13177876 + 1 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -98878 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 233.667-8 chr10 37347012 37347294 + 1 NA TTS (NR_104061) TTS (NR_104061) 37967 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 182.667-16 chr10 31456228 31456419 + 1 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) L1PA7|LINE|L1 -56568 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 334.333-23 chr21 19003537 19003950 + 1 NA Intergenic Intergenic -243931 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 131.667-218 chrX 79108928 79109218 + 1 NA Intergenic Intergenic -61899 NM_032553 84636 Hs.326713 NM_032553 ENSG00000147138 GPR174 FKSG79|GPCR17|LYPSR3 G protein-coupled receptor 174 protein-coding 168.333-130 chr3 88700995 88701225 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 362654 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 146.667-262 chr5 98260148 98260299 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -98984 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 153.667-205 chr2 186028093 186028297 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 58122 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 259.667-26 chr18 34821835 34822149 + 1 NA intron (NM_032980, intron 2 of 13) intron (NM_032980, intron 2 of 13) 3611 NM_032981 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 210.333-104 chr3 97827656 97827909 + 1 NA intron (NM_153605, intron 1 of 21) MIRb|SINE|MIR 5771 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 149.333-20 chr1 113622496 113622731 + 1 NA intron (NM_001142782, intron 8 of 20) intron (NM_001142782, intron 8 of 20) 136542 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 166.333-184 chr5 60060485 60060670 + 1 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) LTR47A|LTR|ERVL -166851 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 186.667-58 chr18 76759767 76760017 + 1 NA Intergenic Intergenic 62403 NR_040024 100131655 Hs.385806 NR_040024 ENSG00000264278 ZNF236-DT - ZNF236 divergent transcript ncRNA 212.667-134 chr8 73090962 73091401 + 1 NA intron (NM_153225, intron 1 of 4) intron (NM_153225, intron 1 of 4) 1991 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 167.333-184 chr4 13707238 13707434 + 1 NA intron (NR_121681, intron 2 of 3) intron (NR_121681, intron 2 of 3) 52157 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 162.667-167 chr22 33408443 33408633 + 1 NA intron (NM_133642, intron 7 of 14) MER65A|LTR|ERV1 28131 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 285.333-68 chr8 29554863 29555342 + 1 NA Intergenic Intergenic 193007 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 112.333-76 chr14 58983911 58984052 + 1 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) L1ME3B|LINE|L1 155693 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 179.333-74 chr16 81944097 81944289 + 1 NA intron (NM_002661, intron 30 of 32) L1ME2z|LINE|L1 67277 NM_145168 93517 Hs.87779 NM_145168 ENSG00000184860 SDR42E1 HSPC105 short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 protein-coding 133.333-166 chr6 148728668 148728837 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -18278 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 252.667-86 chr5 147336938 147337237 + 1 NA intron (NM_001112724, intron 5 of 12) intron (NM_001112724, intron 5 of 12) 102061 NM_001112724 202374 Hs.585069 NM_145001 ENSG00000169302 STK32A YANK1 serine/threonine kinase 32A protein-coding 225.667-80 chr8 139503679 139504199 + 1 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 199184 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 185.667-123 chr8 10078878 10079169 + 1 NA intron (NM_001135670, intron 1 of 4) intron (NM_001135670, intron 1 of 4) -16628 NM_001199729 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 132.333-125 chr4 113167006 113167194 + 1 NA intron (NM_001354241, intron 2 of 45) intron (NM_001354241, intron 2 of 45) 14818 NR_107049 102465878 NR_107049 ENSG00000275810 MIR8082 hsa-mir-8082 microRNA 8082 ncRNA 189.667-90 chr3 15036745 15036956 + 1 NA intron (NM_003298, intron 12 of 14) AluSz|SINE|Alu 28465 NM_022497 64432 Hs.657764 NM_022497 ENSG00000131368 MRPS25 MRP-S25|RPMS25 mitochondrial ribosomal protein S25 protein-coding 122.667-84 chr2 31747155 31747316 + 1 NA Intergenic Intergenic 56745 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 385.333-27 chr8 109273763 109274265 + 1 NA intron (NM_032869, intron 7 of 9) L1MEc|LINE|L1 55919 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 163.333-297 chr9 92860142 92860413 + 1 NA intron (NM_001007101, intron 1 of 3) MER77|LTR|ERVL 17691 NM_001354536 83744 Hs.668378 NM_031486 ENSG00000127081 ZNF484 BA526D8.4 zinc finger protein 484 protein-coding 325.333-6 chr10 49581269 49581760 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -27581 NM_020984 1103 Hs.302002 NM_020549 ENSG00000070748 CHAT CHOACTASE|CMS1A|CMS1A2|CMS6 choline O-acetyltransferase protein-coding 173.333-122 chr3 76929732 76930000 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -110233 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 151.667-18 chr1 151524621 151524863 + 1 NA exon (NM_020770, exon 8 of 21) exon (NM_020770, exon 8 of 21) 13355 NM_020770 57530 Hs.591464 NM_020770 ENSG00000143375 CGN - cingulin protein-coding 165.333-9 chr1 85436051 85436336 + 1 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) 28966 NM_012137 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 171.333-134 chr4 48906892 48907211 + 1 NA promoter-TSS (NM_001286773) promoter-TSS (NM_001286773) -223 NM_001286773 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 204.667-30 chr12 12695211 12695506 + 1 NA intron (NM_006143, intron 2 of 3) intron (NM_006143, intron 2 of 3) 825 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 161.667-183 chr4 35191238 35191441 + 1 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -921592 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 243.667-17 chr13 44659564 44659850 + 1 NA intron (NR_149082, intron 2 of 3) intron (NR_149082, intron 2 of 3) 19338 NR_149082 106144541 Hs.578031 NR_149082 LINC00407 - long intergenic non-protein coding RNA 407 ncRNA 137.667-57 chr14 63477116 63477332 + 1 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 31014 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 152.667-377 chr8 91613271 91613494 + 1 NA Intergenic Intergenic 364063 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 177.667-5 chr1 47429148 47429519 + 1 NA intron (NR_126355, intron 1 of 4) intron (NR_126355, intron 1 of 4) 5308 NR_026878 84793 Hs.127762 NM_032707 ENSG00000237424 FOXD2-AS1 - FOXD2 adjacent opposite strand RNA 1 ncRNA 179.667-87 chr20 51996651 51996891 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 108713 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 115.667-20 chr10 29786488 29786730 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -49673 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 159.667-156 chr19 13641250 13641478 + 1 NA Intergenic Intergenic -90388 NM_001320564 81576 Hs.24998 NM_030818 ENSG00000104957 CCDC130 - coiled-coil domain containing 130 protein-coding 169.333-216 chr5 160648099 160648353 + 1 NA intron (NM_001366652, intron 7 of 24) intron (NM_001366652, intron 7 of 24) 37165 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 167.333-197 chr4 128108081 128108330 + 1 NA 3' UTR (NM_032239, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_032239, exon 9 of 9) 46893 NM_018078 55132 Hs.654971 NM_018078 ENSG00000138709 LARP1B LARP2 La ribonucleoprotein domain family member 1B protein-coding 156.667-261 chr5 24591541 24591750 + 1 NA intron (NM_001362460, intron 2 of 9) intron (NM_001362460, intron 2 of 9) 53333 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 138.333-127 chr3 189754303 189754479 + 1 NA intron (NM_003722, intron 3 of 13) intron (NM_003722, intron 3 of 13) -35268 NM_001329146 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 226.667 chr1 42939777 42940063 + 1 NA intron (NM_006516, intron 2 of 9) AluSx|SINE|Alu 18948 NM_006516 6513 Hs.473721 NM_006516 ENSG00000117394 SLC2A1 CSE|DYT17|DYT18|DYT9|EIG12|GLUT|GLUT-1|GLUT1|GLUT1DS|HTLVR|PED|SDCHCN solute carrier family 2 member 1 protein-coding 154.667-131 chr16 57585086 57585351 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -34520 NM_001290142 9289 Hs.513633 NM_005682 ENSG00000205336 ADGRG1 BFPP|BPPR|GPR56|TM7LN4|TM7XN1 adhesion G protein-coupled receptor G1 protein-coding 161.333-114 chr17 49387492 49387717 + 1 NA Intergenic Intergenic -25131 NM_014897 22834 Hs.463375 NM_014897 ENSG00000198740 ZNF652 - zinc finger protein 652 protein-coding 113.333-240 chr7 52275470 52275605 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -760096 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 220.333-94 chr3 137500392 137500714 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -263762 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 176.667-109 chr4 33529314 33529631 + 1 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL 510421 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 132.333-44 chr12 127910524 127910669 + 1 NA intron (NR_126452, intron 3 of 3) intron (NR_126452, intron 3 of 3) -4814 NR_046392 100862680 Hs.385496 NR_046392 ENSG00000256193 LINC00507 - long intergenic non-protein coding RNA 507 ncRNA 159.667-102 chr14 73677314 73677505 + 1 NA intron (NM_001201366, intron 6 of 8) FLAM_A|SINE|Alu 32423 NM_031427 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 276.667 chr1 85725610 85726080 + 1 NA Intergenic Intergenic -17412 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 116.333-113 chr2 35654685 35654851 + 1 NA Intergenic Ricksha|DNA|MULE-MuDR 183363 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 131.667-172 chr6 56140284 56140433 + 1 NA intron (NM_030820, intron 12 of 29) intron (NM_030820, intron 12 of 29) -48696 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 330.333-14 chr5 104500960 104501470 + 1 NA Intergenic Intergenic -598259 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 189.667-33 chr12 26136930 26137195 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12025 NM_030762 79365 Hs.177841 NM_030762 ENSG00000123095 BHLHE41 BHLHB3|DEC2|SHARP1|hDEC2 basic helix-loop-helix family member e41 protein-coding 171.667-179 chr9 36175734 36176073 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 6515 NM_005893 881 Hs.115460 NM_005893 ENSG00000185972 CCIN BTBD20|KBTBD14 calicin protein-coding 140.667-61 chr12 42739532 42739755 + 1 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 47427 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 165.333-169 chr3 86518211 86518464 + 1 NA Intergenic Intergenic 36394 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 234.333-21 chr12 48676620 48676911 + 1 NA intron (NM_017822, intron 4 of 9) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 5473 NM_017822 54934 Hs.505412 NM_017822 ENSG00000139620 KANSL2 C12orf41|NSL2 KAT8 regulatory NSL complex subunit 2 protein-coding 256.667-88 chr8 142009391 142009765 + 1 NA Intergenic Intergenic -166761 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 160.667-107 chr15 67932477 67932701 + 1 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -92544 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 135.667-123 chr3 120534139 120534378 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -62078 NM_004547 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 219.333-57 chr15 50510174 50510472 + 1 NA 3' UTR (NM_001283049, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001283049, exon 17 of 17) 36343 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 138.667-219 chr9 124237687 124237878 + 1 NA Intergenic Intergenic -19824 NM_001166167 10783 Hs.197071 NM_014397 ENSG00000119408 NEK6 SID6-1512 NIMA related kinase 6 protein-coding 271.667-14 chr11 12765421 12765839 + 1 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 91209 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 158.333-326 chr8 120502641 120502948 + 1 NA intron (NM_022045, intron 15 of 21) intron (NM_022045, intron 15 of 21) 57375 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 162.333-132 chr20 7195581 7195765 + 1 NA intron (NR_110609, intron 3 of 7) intron (NR_110609, intron 3 of 7) 58529 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 167.667-92 chr18 30517038 30517274 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 218246 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 206.333-22 chr11 14289577 14290027 + 1 NA intron (NM_001177314, intron 4 of 5) intron (NM_001177314, intron 4 of 5) 68683 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 124.333-3 chr1 22828639 22828872 + 1 NA intron (NM_004442, intron 3 of 15) intron (NM_004442, intron 3 of 15) 34471 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 114.667-13 chr1 190544892 190545139 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 66464 NR_110717 101929120 Hs.602301 NR_110716 LINC01351 - long intergenic non-protein coding RNA 1351 ncRNA 212.333-119 chr5 98206209 98206482 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -45106 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 245.333-114 chr7 138861314 138861665 + 1 NA intron (NM_020910, intron 15 of 19) intron (NM_020910, intron 15 of 19) -63293 NM_130840 50617 Hs.98967 NM_020632 ENSG00000105929 ATP6V0A4 A4|ATP6N1B|ATP6N2|RDRTA2|RTA1C|RTADR|STV1|VPH1|VPP2 ATPase H+ transporting V0 subunit a4 protein-coding 191.667-26 chr11 76429410 76429805 + 1 NA Intergenic Intergenic -15411 NM_001300943 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 160.667-11 chr1 81361228 81361501 + 1 NA intron (NM_001366003, intron 2 of 27) intron (NM_001366003, intron 2 of 27) 54969 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 174.333-3 chr1 115979762 115979979 + 1 NA intron (NM_018420, intron 1 of 11) intron (NM_018420, intron 1 of 11) -2594 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 179.667-4 chr1 69236490 69236693 + 1 NA Intergenic Intergenic 180693 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 148.333-73 chr11 72948416 72948594 + 1 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) L1M5|LINE|L1 134094 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 113.333-62 chr12 57912993 57913227 + 1 NA Intergenic Intergenic -16628 NR_148947 283387 Hs.727244 NR_148947 ENSG00000245651 LOC283387 - uncharacterized LOC283387 ncRNA 178.667-102 chr3 74979710 74980038 + 1 NA Intergenic Intergenic -234602 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 294.333-25 chr2 173556203 173556696 + 1 NA Intergenic Intergenic 201577 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 203.667-30 chr14 52579568 52579896 + 1 NA intron (NM_001353361, intron 1 of 7) MER68|LTR|ERVL 26896 NR_148417 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 143.333-196 chr4 30386414 30386632 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -333846 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 155.333-121 chr16 9647723 9647929 + 1 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -192321 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 269.333-59 chr3 82283102 82283493 + 1 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) intron (NR_147146, intron 3 of 8) 297155 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 146.667-265 chr5 115814513 115814744 + 1 NA intron (NM_001323565, intron 1 of 5) intron (NM_001323565, intron 1 of 5) 2029 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 161.667-162 chr22 38573283 38573489 + 1 NA Intergenic Intergenic 2886 NR_134627 105373031 Hs.144041 NR_134627 LOC105373031 - uncharacterized LOC105373031 ncRNA 242.333-79 chr4 104679958 104680388 + 1 NA intron (NR_125926, intron 8 of 9) intron (NR_125926, intron 8 of 9) -185279 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 189.333-69 chr17 32424532 32424833 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -19828 NM_001270482 5717 Hs.443379 NM_002815 ENSG00000108671 PSMD11 Rpn6|S9|p44.5 proteasome 26S subunit, non-ATPase 11 protein-coding 244.333-41 chr15 36523033 36523386 + 1 NA Intergenic Intergenic -56417 NM_001321759 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 311.667-3 chr12 14202900 14203378 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -162493 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 135.333-196 chr8 113728950 113729199 + 1 NA Intergenic Intergenic -292135 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 347.667-6 chr15 57126685 57127365 + 1 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) AluSx1|SINE|Alu -92405 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 264.667-12 chr10 8454263 8454770 + 1 NA Intergenic Intergenic 139875 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 141.333-207 chr6 38659519 38659748 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -19704 NM_052893 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 320.667-4 chr1 234320836 234321349 + 1 NA intron (NM_173508, intron 7 of 7) intron (NM_173508, intron 7 of 7) 14625 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 187.667-61 chr18 40439795 40440038 + 1 NA Intergenic Intergenic 373630 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 154.333-335 chr8 63462118 63462348 + 1 NA Intergenic Intergenic -3616 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 197.333-217 chr7 88141375 88141676 + 1 NA intron (NM_001324421, intron 14 of 28) intron (NM_001324421, intron 14 of 28) -75135 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 228.667-59 chr4 85359162 85359457 + 1 NA Intergenic Intergenic -115841 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 212.667-31 chr12 108889940 108890295 + 1 NA intron (NM_001917, intron 4 of 10) L3|LINE|CR1 10025 NM_001917 1610 Hs.113227 NM_001917 ENSG00000110887 DAO DAAO|DAMOX|OXDA D-amino acid oxidase protein-coding 243.667-69 chr7 45992758 45993108 + 1 NA Intergenic Intergenic -71661 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 219.333-84 chr19 9241091 9241452 + 1 NA Intergenic Intergenic -9773 NM_001079935 26648 Hs.129832 NM_001079935 ENSG00000237521 OR7E24 HSHT2|OR19-8|OR7E24P|OR7E24Q olfactory receptor family 7 subfamily E member 24 protein-coding 162.667-42 chr11 7183210 7183470 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -51426 NR_031683 100313774 NR_031683 ENSG00000221703 MIR302E MIRN302E microRNA 302e ncRNA 216.333-144 chr8 141183208 141183566 + 1 NA intron (NM_001362798, intron 17 of 21) AluJb|SINE|Alu 45187 NM_001080431 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 271.333-2 chr1 78778944 78779273 + 1 NA Intergenic Tigger17|DNA|TcMar-Tigger 129277 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 281.667-14 chr12 4670946 4671297 + 1 NA intron (NM_005002, intron 8 of 10) intron (NM_005002, intron 8 of 10) 22007 NM_005002 4704 Hs.75227 NM_005002 ENSG00000139180 NDUFA9 CC6|CI-39k|CI39k|COQ11|MC1DN26|NDUFS2L|SDR22E1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 protein-coding 155.667-124 chr16 13097006 13097246 + 1 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 195528 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 122.333-165 chr5 2085340 2085542 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 198110 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 151.333-19 chr1 110824484 110824769 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -46573 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 127.333-129 chr4 72467392 72467621 + 1 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) L2c|LINE|L2 101715 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 147.667-318 chr6 69917043 69917285 + 1 NA intron (NM_001858, intron 4 of 50) intron (NM_001858, intron 4 of 50) 50608 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 301.667-22 chr2 30834254 30834648 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -27005 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 148.667-81 chr11 109186064 109186272 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -236022 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 184.667-102 chr5 104542408 104542759 + 1 NA Intergenic Intergenic -556891 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 256.667-38 chr2 21216394 21216748 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 92585 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 146.667-224 chr3 133634711 133634878 + 1 NA intron (NM_001363889, intron 14 of 27) L1MC4|LINE|L1 27147 NM_001363889 11073 Hs.593379 NM_007027 ENSG00000163781 TOPBP1 Dpb11|TOP2BP1 DNA topoisomerase II binding protein 1 protein-coding 156.333-127 chr15 80908323 80908650 + 1 NA intron (NM_001293304, intron 13 of 29) intron (NM_001293304, intron 13 of 29) -66413 NR_030393 693132 NR_030393 ENSG00000208003 MIR549A MIR549|MIRN549|hsa-mir-549|hsa-mir-549a|mir-549a microRNA 549a ncRNA 126.667-119 chr4 52227826 52227987 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 176602 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 121.667-161 chr5 43827972 43828124 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -224818 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 150.333-167 chr18 1661964 1662131 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -302418 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 226.667-47 chr2 25490297 25490611 + 1 NA intron (NM_033147, intron 9 of 19) L1ME4a|LINE|L1 -147864 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 148.667-82 chr11 113274294 113274485 + 1 NA promoter-TSS (NR_034101) promoter-TSS (NR_034101) -488 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 175.333-137 chr4 137764484 137764812 + 1 NA Intergenic Intergenic 218917 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 112.667-240 chr6 162188425 162188623 + 1 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) intron (NM_004562, intron 4 of 11) -538608 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 148.667-379 chr8 104820707 104820864 + 1 NA Intergenic Intergenic -231761 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 149.333-67 chr10 118752456 118752719 + 1 NA intron (NM_153810, intron 1 of 8) L1M5|LINE|L1 2383 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 132.667-69 chr17 58421571 58421826 + 1 NA 3' UTR (NM_001080439, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001080439, exon 6 of 6) -4116 NM_017763 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 224.667-85 chr9 33065590 33066014 + 1 NA intron (NM_018225, intron 4 of 11) HAL1|LINE|L1 10872 NM_018225 55234 Hs.655351 NM_018225 ENSG00000122692 SMU1 BWD|SMU-1|fSAP57 SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor protein-coding 285.333-20 chr14 48432722 48433106 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -637900 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 155.667-290 chr5 106065645 106065882 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 945251 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 151.667-381 chr9 3294018 3294234 + 1 NA intron (NM_134428, intron 6 of 17) intron (NM_134428, intron 6 of 17) 101470 NM_002919 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 152.333-263 chr4 30281110 30281344 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -439142 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 152.667-175 chr2 47474164 47474379 + 1 NA intron (NM_000251, intron 11 of 15) intron (NM_000251, intron 11 of 15) -53266 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 183.333-71 chr17 72756283 72756544 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) L1MB3|LINE|L1 -115941 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 152.333-217 chr22 17678545 17678788 + 1 NA intron (NR_073068, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 23004 NR_073069 23786 Hs.631672 NM_015367 ENSG00000099968 BCL2L13 BCL-RAMBO|Bcl2-L-13|MIL1 BCL2 like 13 protein-coding 150.333-234 chr20 33106805 33106962 + 1 NA intron (NM_182519, intron 14 of 15) L2c|LINE|L2 25371 NM_182519 149954 Hs.38961 NM_182519 ENSG00000186191 BPIFB4 C20orf186|LPLUNC4|RY2G5|dJ726C3.5 BPI fold containing family B member 4 protein-coding 153.333-247 chr21 23737447 23737649 + 1 NA Intergenic Intergenic -352713 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 198.667-30 chr10 121641030 121641337 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -42725 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 153.333-375 chr7 6692926 6693239 + 1 NA intron (NM_006956, intron 4 of 5) intron (NM_006956, intron 4 of 5) 13865 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 141.667-123 chr2 161036167 161036419 + 1 NA Intergenic Intergenic -100662 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 150.333-350 chr5 179016902 179017188 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -6759 NM_001136116 345462 Hs.445740 NM_001136116 ENSG00000234284 ZNF879 DKFZp686E2433 zinc finger protein 879 protein-coding 176.333-135 chr5 72069747 72070049 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -37577 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 228.667-82 chr8 119038081 119038396 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) MIRb|SINE|MIR -29009 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 186.333-88 chr20 31489321 31489656 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 3710 NR_024358 140875 Hs.283478 NR_024358 ENSG00000233354 LINC00028 C20orf93|NCRNA00028|dJ1093G12.6 long intergenic non-protein coding RNA 28 ncRNA 213.333-89 chr2 35377555 35377845 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -93705 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 329.333-20 chr2 61877219 61877724 + 1 NA exon (NM_006430, exon 6 of 14) exon (NM_006430, exon 6 of 14) 11185 NM_006430 10575 Hs.421509 NM_006430 ENSG00000115484 CCT4 CCT-DELTA|Cctd|SRB chaperonin containing TCP1 subunit 4 protein-coding 151.333-160 chr16 59845531 59845710 + 1 NA Intergenic Intergenic -9733 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 171.667-25 chr11 17192849 17193072 + 1 NA intron (NM_002645, intron 1 of 32) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 15026 NM_002645 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 122.333-58 chr14 57584422 57584632 + 1 NA intron (NM_001352016, intron 3 of 3) intron (NM_001352016, intron 3 of 3) -90670 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 161.667-58 chr12 112023174 112023343 + 1 NA TTS (NM_001034025) TTS (NM_001034025) 9832 NM_006817 10961 Hs.75841 NM_006817 ENSG00000089248 ERP29 C12orf8|ERp28|ERp31|HEL-S-107|PDI-DB|PDIA9 endoplasmic reticulum protein 29 protein-coding 334.333-2 chr10 56332944 56333658 + 1 NA Intergenic Intergenic 27958 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 338.667-30 chr8 104098292 104098869 + 1 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) intron (NM_001348498, intron 19 of 24) -124755 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 194.667-67 chr2 96165849 96166065 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -20517 NM_004418 1844 Hs.1183 NM_004418 ENSG00000158050 DUSP2 PAC-1|PAC1 dual specificity phosphatase 2 protein-coding 155.333-262 chr4 55260718 55261000 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -85383 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 111.667-132 chr2 68511211 68511408 + 1 NA intron (NM_173545, intron 3 of 9) intron (NM_173545, intron 3 of 9) 43724 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 140.667-188 chr5 115956062 115956231 + 1 NA promoter-TSS (NR_157226) promoter-TSS (NR_157226) -425 NR_157226 107986443 NR_157226 LINCADL LINC-ADAL lincRNA adipogenesis and lipogenesis associated ncRNA 208.667-26 chr10 116873558 116873900 + 1 NA intron (NM_001242699, intron 9 of 13) intron (NM_001242699, intron 9 of 13) -24007 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 252.667-58 chr22 25570456 25570907 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) UCON35|Unknown|Unknown 6006 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 158.333-131 chr19 32234349 32234657 + 1 NA Intergenic Intergenic -111107 NM_001136156 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 201.333-28 chr10 30234666 30234973 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 22967 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 170.667-86 chr2 169394314 169394623 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -31934 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 177.667-20 chr10 61755351 61755625 + 1 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) intron (NM_173554, intron 4 of 6) 92527 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 182.333-4 chr1 59864964 59865232 + 1 NA intron (NM_015888, intron 17 of 21) MIRb|SINE|MIR 50149 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 197.333-131 chr20 38824798 38825069 + 1 NA intron (NM_015568, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu 19236 NM_001172735 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 164.333-226 chr7 43148793 43148982 + 1 NA intron (NR_135295, intron 5 of 6) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -2008 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 119.667-91 chr2 185317417 185317583 + 1 NA Intergenic Intergenic -150428 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 434.333-8 chr9 76098447 76099078 + 1 NA intron (NR_120409, intron 8 of 19) intron (NR_120409, intron 8 of 19) 208089 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 323.667-14 chr2 167488132 167488560 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 300974 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 149.333-33 chr1 208354335 208354593 + 1 NA Intergenic Intergenic -110080 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 203.667-123 chr8 101547742 101548040 + 1 NA intron (NM_024915, intron 2 of 15) intron (NM_024915, intron 2 of 15) 55452 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 139.667-144 chr4 172351457 172351624 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 5 of 12) intron (NM_001034845, intron 5 of 12) 337377 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 137.667-52 chr14 38773093 38773277 + 1 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) intron (NR_039982, intron 4 of 4) -109411 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 221.333-138 chr8 80413409 80413668 + 1 NA Intergenic Intergenic -72055 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 265.667-51 chr3 189601193 189601552 + 1 NA intron (NM_001329964, intron 1 of 13) intron (NM_001329964, intron 1 of 13) 4626 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 262.667-6 chr1 191314910 191315416 + 1 NA Intergenic Intergenic -86665 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 177.667-39 chr12 121948940 121949267 + 1 NA intron (NM_001178003, intron 8 of 17) intron (NM_001178003, intron 8 of 17) 30511 NM_144668 144406 Hs.709837 NM_144668 ENSG00000158023 WDR66 CFAP251|CaM-IP4|SPGF33 WD repeat domain 66 protein-coding 161.667-68 chr14 20056420 20056611 + 1 NA Intergenic Intergenic -3530 NM_001004717 122742 Hs.553574 NM_001004717 ENSG00000176246 OR4L1 OR14-28|OR4L2P olfactory receptor family 4 subfamily L member 1 protein-coding 209.333-97 chr19 28401967 28402327 + 1 NA Intergenic Intergenic -204541 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 127.667-174 chr8 74978028 74978220 + 1 NA Intergenic Intergenic -6381 NM_031461 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 229.667-7 chr1 211473836 211474200 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 18899 NM_183059 343035 Hs.632495 NM_183059 ENSG00000198570 RD3 C1orf36|LCA12 retinal degeneration 3, GUCY2D regulator protein-coding 135.667-53 chr14 54037514 54037675 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -80703 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 145.667-5 chr1 53728862 53729048 + 1 NA intron (NM_001367484, intron 2 of 10) intron (NM_001367484, intron 2 of 10) 5249 NM_147193 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 139.333-132 chr20 4339726 4339878 + 1 NA Intergenic Intergenic -90515 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 134.667-207 chr9 80195163 80195386 + 1 NA Intergenic Intergenic 220251 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 170.333-198 chr7 31406878 31407176 + 1 NA Intergenic Intergenic -66301 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 116.667-177 chr6 70475637 70475786 + 1 NA exon (NM_001351607, exon 8 of 23) exon (NM_001351607, exon 8 of 23) -61753 NR_147708 105377849 Hs.669000 NR_147708 ENSG00000224349 LOC105377849 - uncharacterized LOC105377849 ncRNA 334.333-35 chr9 94883257 94883874 + 1 NA intron (NM_032823, intron 5 of 14) MER57A1|LTR|ERV1 61989 NR_147613 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 162.333-94 chr17 67461030 67461219 + 1 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) LTR16B|LTR|ERVL -10365 NR_037517 100500895 NR_037517 ENSG00000207688 MIR548AA2 - microRNA 548aa-2 ncRNA 223.333-137 chr5 157157117 157157471 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 8970 NM_130899 153745 Hs.666099 NM_130899 ENSG00000170613 FAM71B - family with sequence similarity 71 member B protein-coding 191.333-136 chr3 106503532 106503816 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -634273 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 180.667-154 chr9 10819997 10820343 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 206964 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 196.667 chr1 35017991 35018337 + 1 NA intron (NM_007167, intron 4 of 15) AluJo|SINE|Alu 13781 NM_007167 9204 Hs.533986 NM_007167 ENSG00000163867 ZMYM6 Buster2|MYM|ZBED7|ZNF198L4|ZNF258 zinc finger MYM-type containing 6 protein-coding 168.667-78 chr17 50286485 50286661 + 1 NA intron (NR_125805, intron 1 of 3) intron (NR_125805, intron 1 of 3) 1282 NR_125805 103752589 Hs.612913 NR_125805 ENSG00000251179 TMEM92-AS1 TCONS_00025237|lncRNA-508851 TMEM92 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-5 chr1 42180886 42181071 + 1 NA intron (NM_001198850, intron 12 of 12) intron (NM_001198850, intron 12 of 12) -16233 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 182.667-102 chr3 131345103 131345307 + 1 NA intron (NR_038976, intron 2 of 3) L1MA9|LINE|L1 -16640 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 178.667-151 chr7 37569722 37570055 + 1 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 -113878 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 153.667-255 chr3 95405980 95406261 + 1 NA Intergenic Intergenic 277073 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 156.667-138 chr17 63252256 63252481 + 1 NA intron (NM_025185, intron 7 of 25) L1MA4A|LINE|L1 187899 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 114.333-6 chr1 102602475 102602690 + 1 NA Intergenic Intergenic 505914 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 147.333-220 chr3 117457663 117457828 + 1 NA Intergenic Intergenic 233180 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 119.333-94 chr15 40500895 40501044 + 1 NA Intergenic Intergenic 30008 NM_130468 113189 Hs.442449 NM_130468 ENSG00000169105 CHST14 ATCS|D4ST1|EDSMC1|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 14 protein-coding 131.667-65 chr16 4558991 4559228 + 1 NA intron (NM_001145011, intron 1 of 15) intron (NM_001145011, intron 1 of 15) 2619 NM_001145011 342346 Hs.684212 NM_001145011 ENSG00000205832 C16orf96 - chromosome 16 open reading frame 96 protein-coding 203.333-109 chr18 1224563 1224843 + 1 NA Intergenic Intergenic 134926 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 117.667-176 chr7 34251596 34251811 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 346164 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 199.667-40 chr14 41186851 41187141 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 232285 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 159.667-132 chr17 32672837 32673063 + 1 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) intron (NM_015194, intron 16 of 21) 185957 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 402.667-9 chr6 52603673 52604170 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 26623 NR_103447 401264 Hs.544586 NR_103446 ENSG00000225791 TRAM2-AS1 - TRAM2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 160.667-230 chr4 109373084 109373365 + 1 NA Intergenic Intergenic -60491 NM_001318086 10427 Hs.292472 NM_006323 ENSG00000138802 SEC24B SEC24 SEC24 homolog B, COPII coat complex component protein-coding 120.333-5 chr1 74232507 74232701 + 1 NA intron (NM_001112808, intron 3 of 26) intron (NM_001112808, intron 3 of 26) -2783 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 172.667-70 chr18 47784870 47785115 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 145667 NM_005901 4087 Hs.12253 NM_005901 ENSG00000175387 SMAD2 JV18|JV18-1|MADH2|MADR2|hMAD-2|hSMAD2 SMAD family member 2 protein-coding 212.667-17 chr11 16139525 16139952 + 1 NA intron (NM_033326, intron 6 of 15) L1MC4|LINE|L1 -170117 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 155.667-90 chr14 49790231 49790435 + 1 NA intron (NM_001301732, intron 25 of 31) L1ME3|LINE|L1 22180 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 143.333-49 chr11 43062992 43063194 + 1 NA Intergenic Intergenic 206276 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 189.333-47 chr13 94395150 94395419 + 1 NA intron (NM_005708, intron 7 of 8) intron (NM_005708, intron 7 of 8) 84398 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 173.667-62 chr18 54672441 54672836 + 1 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 81479 NM_173629 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 154.667-306 chr5 29015315 29015583 + 1 NA Intergenic Intergenic -49795 NR_109948 101929645 Hs.531878 NR_109948 LOC101929645 - uncharacterized LOC101929645 ncRNA 207.333-127 chr18 73499930 73500316 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 175182 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 150.667-180 chr2 95563902 95564194 + 1 NA Intergenic Intergenic -27953 NM_138800 129868 Hs.232026 NM_138800 ENSG00000144015 TRIM43 TRIM43A tripartite motif containing 43 protein-coding 252.667-74 chr4 138140895 138141352 + 1 NA intron (NR_038380, intron 3 of 6) intron (NR_038380, intron 3 of 6) -10438 NR_037866 641365 Hs.435630 NR_037866 ENSG00000248307 LINC00616 - long intergenic non-protein coding RNA 616 ncRNA 158.333-171 chr2 232643063 232643355 + 1 NA intron (NM_001308395, intron 2 of 4) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9605 NM_025202 80303 Hs.516769 NM_025202 ENSG00000115468 EFHD1 MST133|MSTP133|PP3051|SWS2 EF-hand domain family member D1 protein-coding 156.333-376 chr9 28022175 28022392 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1MCa|LINE|L1 -448417 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 184.333-131 chr6 98181782 98181978 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 157349 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 152.667-336 chr7 22093167 22093458 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 100433 NM_001367601 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 172.333-177 chr8 77347517 77347727 + 1 NA Intergenic Intergenic -103075 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 144.667-205 chr3 164958941 164959180 + 1 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 119436 NM_001041 6476 Hs.429596 NM_001041 ENSG00000090402 SI - sucrase-isomaltase protein-coding 154.667-399 chr8 125268642 125268872 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -161601 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 206.667-127 chr7 18766193 18766428 + 1 NA intron (NM_058176, intron 14 of 22) intron (NM_058176, intron 14 of 22) 257040 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 156.667-287 chr5 143369642 143369846 + 1 NA intron (NR_157096, intron 1 of 7) MER20|DNA|hAT-Charlie 33539 NM_001364182 2908 Hs.122926 NM_000176 ENSG00000113580 NR3C1 GCCR|GCR|GCRST|GR|GRL nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 protein-coding 168.667-32 chr11 55964799 55965141 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 3493 NM_001005491 282770 Hs.554525 NM_001005491 ENSG00000174970 OR10AG1 OR11-160 olfactory receptor family 10 subfamily AG member 1 protein-coding 149.333-215 chr20 38716622 38716800 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7775 NM_080552 140679 Hs.179080 NM_080552 ENSG00000101438 SLC32A1 VGAT|VIAAT solute carrier family 32 member 1 protein-coding 189.667-69 chr2 59035728 59035984 + 1 NA intron (NR_033873, intron 12 of 13) intron (NR_033873, intron 12 of 13) -181852 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 132.333-75 chr2 15233031 15233202 + 1 NA intron (NR_052013, intron 46 of 50) intron (NR_052013, intron 46 of 50) 328218 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 257.333-80 chr5 63740917 63741329 + 1 NA Intergenic Intergenic 221169 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 143.333-296 chr8 133738456 133738624 + 1 NA Intergenic Intergenic 38812 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 264.667-36 chr18 7044565 7044958 + 1 NA exon (NM_005559, exon 7 of 63) exon (NM_005559, exon 7 of 63) 73036 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 174.333-19 chr11 25946978 25947344 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -241962 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 162.667-46 chr11 33139493 33139715 + 1 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) intron (NM_001326, intron 3 of 20) 21876 NM_001326 1479 Hs.44402 NM_001326 ENSG00000176102 CSTF3 CSTF-77 cleavage stimulation factor subunit 3 protein-coding 161.333-125 chr18 6391806 6392052 + 1 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) L1PB3|LINE|L1 -17504 NR_036205 100422840 NR_036205 ENSG00000283532 MIR4317 - microRNA 4317 ncRNA 111.667-170 chr3 119886649 119886796 + 1 NA intron (NM_002093, intron 7 of 11) L1PA16|LINE|L1 104012 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 145.333 chr1 39459951 39460168 + 1 NA intron (NM_012090, intron 86 of 92) intron (NM_012090, intron 86 of 92) -31577 NM_181809 353500 Hs.472497 NM_181809 ENSG00000183682 BMP8A - bone morphogenetic protein 8a protein-coding 172.667-13 chr1 184897777 184898004 + 1 NA intron (NM_052966, intron 2 of 13) L2a|LINE|L2 76618 NM_052966 116496 Hs.518662 NM_052966 ENSG00000135842 NIBAN1 C1orf24|FAM129A|GIG39|NIBAN niban apoptosis regulator 1 protein-coding 163.333-151 chr2 132724209 132724542 + 1 NA intron (NM_207481, intron 17 of 17) L2a|LINE|L2 -52849 NM_001077427 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 205.333-206 chr6 69639840 69640146 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 156473 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 148.667-79 chr11 88362843 88363010 + 1 NA Intergenic Intergenic -25190 NM_001814 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 138.667-152 chr4 70172178 70172441 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 18072 NM_214711 401137 Hs.518795 NM_214711 ENSG00000187533 PRR27 C4orf40 proline rich 27 protein-coding 142.667-112 chr2 185732594 185732846 + 1 NA intron (NR_110217, intron 1 of 2) intron (NR_110217, intron 1 of 2) 5999 NR_110216 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 161.667-179 chr3 141717068 141717334 + 1 NA intron (NR_136190, intron 7 of 7) L1MEc|LINE|L1 -21008 NR_037702 9616 Hs.134623 NM_014245 ENSG00000114125 RNF7 CKBBP1|ROC2|SAG|rbx2 ring finger protein 7 protein-coding 138.667-224 chrX 152560514 152560719 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -77279 NM_018558 55879 Hs.283081 NM_018558 ENSG00000268089 GABRQ THETA gamma-aminobutyric acid type A receptor theta subunit protein-coding 149.333-233 chr3 26869463 26869742 + 1 NA Intergenic Intergenic 175045 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 279.667-17 chr15 54014101 54014622 + 1 NA exon (NM_001080534, exon 1 of 31) exon (NM_001080534, exon 1 of 31) 1713 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 150.333-377 chr7 19749089 19749374 + 1 NA intron (NM_001366627, intron 1 of 4) intron (NM_001366627, intron 1 of 4) 23550 NM_152774 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 314.333-32 chr8 128190102 128190540 + 1 NA Intergenic Intergenic 40205 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 198.667-81 chr17 60827873 60828205 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 150188 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 224.333-77 chr22 41061715 41062090 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 11819 NR_132979 106635682 NR_132979 SNORD140 - small nucleolar RNA, C/D box 140 snoRNA 341.667-19 chr5 123898162 123898767 + 1 NA Intergenic Intergenic 353047 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 215.667-48 chr18 4444866 4445139 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) 10264 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 150.667-342 chr6 144655111 144655351 + 1 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) intron (NM_007124, intron 50 of 73) 249576 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 160.333-239 chr5 145121922 145122138 + 1 NA Intergenic Intergenic 713312 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 204.333-91 chr2 24105766 24106198 + 1 NA intron (NR_111929, intron 3 of 5) L1PREC2|LINE|L1 17352 NM_199346 375189 Hs.442718 NM_199346 ENSG00000176732 PFN4 - profilin family member 4 protein-coding 164.333-207 chr5 167200590 167200777 + 1 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) intron (NM_001122679, intron 1 of 29) -32282 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 163.333-55 chr11 82563674 82563908 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -159878 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 147.667-217 chr22 28598041 28598325 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MIRc|SINE|MIR 81682 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 314.667-12 chr12 23796809 23797227 + 1 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) 152652 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 159.333-23 chr1 189955714 189955896 + 1 NA Intergenic Intergenic 520205 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 166.667-233 chr8 111807661 111807894 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 431138 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 121.333-63 chr15 87676408 87676571 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 99560 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 112.333-86 chr16 83076168 83076393 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 3 of 12) intron (NM_001220489, intron 3 of 12) -85982 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 174.667-64 chr16 1422370 1422598 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -1737 NM_001272051 283951 Hs.58373 NM_001010878 ENSG00000174109 C16orf91 CCSMST1|URLC5|gs103 chromosome 16 open reading frame 91 protein-coding 136.667-48 chr13 80347194 80347422 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6182 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 145.667-206 chr5 20266377 20266559 + 1 NA intron (NM_001349556, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu -39083 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-243 chr3 44311736 44311978 + 1 NA intron (NM_001145030, intron 16 of 19) L1ME4b|LINE|L1 -26262 NM_001029840 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 168.667-119 chr20 15630039 15630294 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 293148 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 223.333-168 chr8 115514098 115514576 + 1 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) MIR|SINE|MIR 153676 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 195.333-35 chr10 93753584 93753855 + 1 NA Intergenic Intergenic -4090 NM_001308275 9211 Hs.533670 NM_005097 ENSG00000108231 LGI1 ADLTE|ADPAEF|ADPEAF|EPITEMPIN|EPT|ETL1|IB1099 leucine rich glioma inactivated 1 protein-coding 171.333-165 chr6 70798772 70798985 + 1 NA intron (NM_001044305, intron 6 of 10) intron (NM_001044305, intron 6 of 10) 130348 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 189.667-5 chr1 95373621 95373927 + 1 NA Intergenic Intergenic -21667 NR_146486 101928169 NR_146486 LINC01650 - long intergenic non-protein coding RNA 1650 ncRNA 203.667-37 chr16 86175875 86176297 + 1 NA Intergenic Intergenic -20095 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 180.667-71 chr2 145292679 145292877 + 1 NA Intergenic Intergenic 624811 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 123.667-139 chr4 48378737 48378871 + 1 NA intron (NM_020846, intron 3 of 7) intron (NM_020846, intron 3 of 7) 37275 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 132.333-12 chr10 1922096 1922374 + 1 NA Intergenic Intergenic 92113 NR_040253 282980 Hs.576810 NR_040253 ENSG00000234962 LINC00700 - long intergenic non-protein coding RNA 700 ncRNA 198.333-90 chr2 35467927 35468325 + 1 NA Intergenic Intergenic -3279 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 266.667-9 chr1 174450549 174451068 + 1 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) intron (NM_001366446, intron 13 of 25) 2844 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 211.667-114 chr9 19849234 19849560 + 1 NA Intergenic Intergenic -62378 NM_001193288 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 287.333-62 chr7 104547256 104547885 + 1 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 218914 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 296.667-60 chr8 129506270 129506770 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1MD|LINE|L1 -22378 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 158.667-143 chr19 31670814 31671001 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 78626 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 154.667-12 chr1 87771256 87771444 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -399695 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 122.667-109 chr22 22169337 22169545 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -75345 NM_007128 7441 Hs.247979 NM_007128 ENSG00000169575 VPREB1 CD179a|IGI|IGVPB|VPREB V-set pre-B cell surrogate light chain 1 protein-coding 337.667-26 chr8 120092935 120093369 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -31950 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 214.667-110 chr7 134384709 134385027 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -67938 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 146.333-234 chr4 71109100 71109275 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -78072 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 162.333-260 chr8 114838696 114838925 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 829203 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 205.333-94 chr17 49884462 49884711 + 1 NA Intergenic Intergenic -36569 NM_001077503 255061 Hs.652130 NM_170685 ENSG00000176358 TAC4 EK|HK-1|HK1|PPT-C tachykinin 4 protein-coding 164.333-140 chr20 45273972 45274286 + 1 NA Intergenic Intergenic -19565 NM_003064 6590 Hs.517070 NM_003064 ENSG00000124107 SLPI ALK1|ALP|BLPI|HUSI|HUSI-I|MPI|WAP4|WFDC4 secretory leukocyte peptidase inhibitor protein-coding 212.333-46 chr14 63725457 63725707 + 1 NA intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 2483 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 223.667-73 chr6 66861387 66861728 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 1073678 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 164.667-11 chr1 109324046 109324357 + 1 NA intron (NM_001205228, intron 14 of 19) AluSq2|SINE|Alu -17190 NM_001265613 343263 Hs.443402 NM_001010985 ENSG00000221986 MYBPHL - myosin binding protein H like protein-coding 238.667-58 chr3 190984653 190985068 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 106930 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 149.667-13 chr1 70848858 70849147 + 1 NA Intergenic Intergenic 142549 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 159.667-311 chr8 22458255 22458458 + 1 NA intron (NM_005605, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu 17386 NM_001243975 5533 Hs.731683 NM_005605 ENSG00000120910 PPP3CC CALNA3|CNA3|PP2Bgamma protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma protein-coding 139.333-42 chr11 106308477 106308666 + 1 NA Intergenic Intergenic 57164 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 237.667 chr1 102885045 102885492 + 1 NA intron (NM_001854, intron 63 of 66) MER39|LTR|ERV1 223228 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 116.333-202 chr8 55504449 55504633 + 1 NA intron (NM_052898, intron 2 of 2) L1MB3|LINE|L1 16437 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 197.667-48 chr16 18017744 18018040 + 1 NA Intergenic Intergenic 314770 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 396.333-12 chr7 126663454 126664100 + 1 NA intron (NM_001371085, intron 7 of 10) L1PA16|LINE|L1 394407 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 162.667-31 chr10 83748255 83748571 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -71324 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 122.667-24 chr11 27308817 27309023 + 1 NA Intergenic Intergenic 54295 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 284.667-45 chr6 139278010 139278557 + 1 NA intron (NM_153235, intron 2 of 9) intron (NM_153235, intron 2 of 9) 13715 NM_153235 167838 Hs.535820 NM_153235 ENSG00000164440 TXLNB C6orf198|LST001|MDP77|dJ522B19.2 taxilin beta protein-coding 152.333-258 chr3 198029150 198029335 + 1 NA intron (NR_026786, intron 15 of 16) intron (NR_026786, intron 15 of 16) 10225 NR_046669 100873947 Hs.637166 NR_046669 ENSG00000232832 LMLN-AS1 - LMLN antisense RNA 1 ncRNA 123.667-131 chr3 188810630 188810827 + 1 NA intron (NM_001167672, intron 7 of 9) intron (NM_001167672, intron 7 of 9) 121947 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 144.667-158 chr2 178822612 178822779 + 1 NA Intergenic Intergenic -15272 NM_133432 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 115.333-62 chr14 45203163 45203319 + 1 NA TTS (NM_018353) TTS (NM_018353) 49961 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 152.333-251 chr3 144013382 144013681 + 1 NA Intergenic Intergenic 40450 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 271.667-57 chr6 56170902 56171213 + 1 NA non-coding (NR_134850, exon 4 of 31) non-coding (NR_134850, exon 4 of 31) 76523 NR_134849 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 149.333-353 chr6 145275944 145276134 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 410838 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 365.333-18 chr4 61454394 61455049 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 252549 NM_001371342 152.667-194 chr2 125460895 125461158 + 1 NA Intergenic Intergenic 656959 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 197.333-34 chr11 55779706 55780039 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 6434 NM_001001967 390142 Hs.553743 NM_001001967 ENSG00000279761 OR5D13 - olfactory receptor family 5 subfamily D member 13 (gene/pseudogene) protein-coding 154.333-365 chr9 10055485 10055750 + 1 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) intron (NM_002839, intron 3 of 45) 256225 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 223.333-46 chr16 4551129 4551590 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -5131 NM_001145011 342346 Hs.684212 NM_001145011 ENSG00000205832 C16orf96 - chromosome 16 open reading frame 96 protein-coding 136.667-155 chr6 51862526 51862734 + 1 NA intron (NM_138694, intron 48 of 66) intron (NM_138694, intron 48 of 66) 224983 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 115.667-147 chr3 80917400 80917596 + 1 NA Intergenic Intergenic -76370 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 163.667-240 chr7 106354301 106354613 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -69474 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 167.667-72 chr16 51638749 51639014 + 1 NA Intergenic Intergenic -123638 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 265.333-69 chr5 179025427 179025771 + 1 NA intron (NM_001353372, intron 2 of 4) intron (NM_001353372, intron 2 of 4) 1795 NM_001353372 345462 Hs.445740 NM_001136116 ENSG00000234284 ZNF879 DKFZp686E2433 zinc finger protein 879 protein-coding 156.667-143 chr17 76287597 76287784 + 1 NA intron (NM_032134, intron 6 of 18) intron (NM_032134, intron 6 of 18) 19990 NM_032134 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 154.333-363 chr8 138984827 138985025 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -70885 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 154.333-230 chr3 180395727 180395975 + 1 NA Intergenic Intergenic -18322 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 161.667-131 chr2 84657395 84657796 + 1 NA intron (NM_001370, intron 35 of 76) L1MC2|LINE|L1 141140 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 127.333-155 chr6 57127373 57127595 + 1 NA intron (NM_015555, intron 4 of 13) intron (NM_015555, intron 4 of 13) 37296 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 168.333-148 chr4 79404349 79404680 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 3714 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 128.333-60 chr14 69666572 69666791 + 1 NA intron (NM_014734, intron 2 of 5) intron (NM_014734, intron 2 of 5) 55085 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 249.667-52 chr20 42228244 42228647 + 1 NA intron (NM_133170, intron 16 of 31) intron (NM_133170, intron 16 of 31) -457038 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 179.333-192 chr9 8689000 8689247 + 1 NA intron (NM_130392, intron 1 of 30) intron (NM_130392, intron 1 of 30) 44823 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 169.333-93 chr16 80368759 80369055 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) L1ME4a|LINE|L1 -171827 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 156.333-392 chrX 96834965 96835283 + 1 NA intron (NM_007309, intron 4 of 26) intron (NM_007309, intron 4 of 26) -48784 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 158.333-188 chr22 46790918 46791144 + 1 NA intron (NM_001284305, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 17104 NM_001284305 25771 Hs.435044 NM_014346 ENSG00000054611 TBC1D22A C22orf4|HSC79E021 TBC1 domain family member 22A protein-coding 194.667-131 chr5 170272016 170272315 + 1 NA intron (NM_005565, intron 6 of 20) intron (NM_005565, intron 6 of 20) 25612 NM_005565 3937 Hs.304475 NM_005565 ENSG00000043462 LCP2 SLP-76|SLP76 lymphocyte cytosolic protein 2 protein-coding 154.333-57 chr11 42959634 42959864 + 1 NA Intergenic Intergenic 309620 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 221.667-76 chr7 107375427 107375674 + 1 NA intron (NM_181733, intron 7 of 20) L1ME3A|LINE|L1 -94507 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 125.667-23 chr10 51030391 51030589 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) intron (NM_001098512, intron 1 of 17) 38062 NR_120678 102724719 NR_120678 ENSG00000223502 LOC102724719 - uncharacterized LOC102724719 ncRNA 112.333-268 chr8 129839959 129840118 + 1 NA 3' UTR (NM_001353253, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001353253, exon 14 of 14) -53414 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 165.333-65 chr12 116129460 116129699 + 1 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) intron (NM_015335, intron 2 of 30) 19075 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 362.667-23 chr5 154213943 154214431 + 1 NA intron (NM_198321, intron 1 of 11) intron (NM_198321, intron 1 of 11) 23454 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 291.667-35 chr7 137057261 137057574 + 1 NA intron (NR_046103, intron 1 of 3) L1M4a1|LINE|L1 106924 NR_046103 349160 Hs.660713 NR_046103 ENSG00000234352 LOC349160 - uncharacterized LOC349160 ncRNA 119.333-70 chr12 41371529 41371674 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -66138 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 186.667-82 chr20 43847700 43848078 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -46829 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 183.333-80 chr2 29879621 29879812 + 1 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 41870 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 153.667-303 chr4 136356639 136356825 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -443052 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 170.333-203 chr7 79208703 79208952 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L1MA8|LINE|L1 199839 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 161.333-267 chr7 82265455 82265696 + 1 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 178202 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 123.333-61 chr12 66073849 66074011 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -42864 NR_146530 105369810 NR_146530 ENSG00000256259 LINC02425 - long intergenic non-protein coding RNA 2425 ncRNA 150.667-217 chr21 21039154 21039337 + 1 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) L1MA4A|LINE|L1 40836 NM_001352595 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 148.333-232 chr21 20586840 20587039 + 1 NA Intergenic Intergenic 216169 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 173.667-27 chr11 23101614 23101920 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -241293 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 172.667-27 chr11 9973970 9974190 + 1 NA intron (NM_030962, intron 13 of 39) intron (NM_030962, intron 13 of 39) 134938 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 152.333-229 chr3 35470697 35470943 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -76797 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 132.667-52 chr14 57934985 57935142 + 1 NA Intergenic Intergenic -68971 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 168.667-125 chr21 19956396 19956667 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -56776 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 268.667-33 chr2 103699165 103699580 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 708960 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 158.333-152 chr2 108825330 108825555 + 1 NA intron (NM_001351559, intron 10 of 11) L1MB8|LINE|L1 38671 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 159.667-141 chr17 66428482 66428642 + 1 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) AluSz|SINE|Alu -11708 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 186.667-138 chr7 54965113 54965501 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -53710 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 145.333-326 chrX 70676787 70677057 + 1 NA intron (NM_001003811, intron 16 of 30) L1ME1|LINE|L1 169373 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 148.333-82 chr12 8685129 8685298 + 1 NA intron (NR_123740, intron 1 of 8) L1MC|LINE|L1 3536 NM_001352267 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 135.333-204 chr9 83622579 83622758 + 1 NA promoter-TSS (NR_046422) promoter-TSS (NR_046422) -381 NM_001256915 414328 Hs.530261 NM_001001551 ENSG00000148057 IDNK C9orf103|bA522I20.2|hGntK IDNK gluconokinase protein-coding 168.667-4 chr1 63106568 63106784 + 1 NA Intergenic Intergenic -94205 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 294.333-15 chr15 48033643 48034192 + 1 NA Intergenic Intergenic -87073 NM_205850 283652 Hs.710240 NM_205850 ENSG00000188467 SLC24A5 JSX|NCKX5|OCA6|SHEP4 solute carrier family 24 member 5 protein-coding 286.333-29 chr3 89637820 89638179 + 1 NA Intergenic Intergenic 530378 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 148.667-169 chr18 59065257 59065438 + 1 NA Intergenic Intergenic 29668 NR_024021 390858 Hs.716280 NR_024021 OACYLP ACYL3P O-acyltransferase like, pseudogene pseudo 184.333-28 chr12 128349844 128350086 + 1 NA intron (NM_001136103, intron 1 of 8) intron (NM_001136103, intron 1 of 8) 55873 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 262.667-8 chr1 220476285 220476568 + 1 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -51710 NM_001286128 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 207.333-118 chr17 62999877 63000222 + 1 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) L1PA15|LINE|L1 33814 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 157.667-137 chr2 26795508 26795802 + 1 NA Intergenic Intergenic 9599 NM_001809 1058 Hs.1594 NM_001809 ENSG00000115163 CENPA CENP-A|CenH3 centromere protein A protein-coding 209.333-244 chr8 122128935 122129188 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 439583 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 163.333 chr1 9185034 9185319 + 1 NA intron (NR_132738, intron 2 of 2) intron (NR_132738, intron 2 of 2) -2838 NR_132742 106614088 Hs.551837 NR_132742 ENSG00000228526 MIR34AHG - MIR34A host gene ncRNA 148.333-388 chr8 99647386 99647597 + 1 NA intron (NM_017890, intron 34 of 61) AluSx1|SINE|Alu -110630 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 251.333-12 chr10 67154544 67154890 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) 142451 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 276.333-48 chr5 35935662 35936144 + 1 NA intron (NM_144647, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 2719 NM_001042625 133690 Hs.55150 NM_144647 ENSG00000152611 CAPSL - calcyphosine like protein-coding 229.667-42 chr2 79510330 79510769 + 1 NA Intergenic Intergenic -2385 NM_004389 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 197.333-78 chr16 62915999 62916358 + 1 NA Intergenic Intergenic -879740 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 141.667-223 chr8 74719267 74719515 + 1 NA intron (NR_033830, intron 4 of 5) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 13698 NR_031744 100302260 NR_031744 ENSG00000283188 MIR2052 hsa-mir-2052 microRNA 2052 ncRNA 148.333-177 chr2 4994347 4994600 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -338251 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 128.333-169 chr6 40376290 40376463 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -1961 NR_160960 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 194.333-152 chr8 90319875 90320221 + 1 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) intron (NR_051989, intron 2 of 3) 98560 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 232.333-92 chr8 116982767 116983124 + 1 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) intron (NM_001172811, intron 2 of 9) 31970 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 180.333-82 chr3 111344386 111344686 + 1 NA Intergenic Intergenic -197661 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 162.333-12 chr1 108567890 108568054 + 1 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) AluJr|SINE|Alu 7872 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 145.667-136 chr2 78371015 78371173 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -80363 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 151.333-307 chr4 65238605 65238803 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -234204 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 178.333-110 chr3 118539136 118539385 + 1 NA intron (NR_135547, intron 3 of 3) L1MB7|LINE|L1 -102508 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 141.667-92 chr16 78819845 78820204 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 720370 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 160.333-193 chr3 119095125 119095398 + 1 NA intron (NM_152538, intron 3 of 8) intron (NM_152538, intron 3 of 8) 50759 NM_001353322 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 243.667-45 chr2 160904604 160904938 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -232184 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 160.667-225 chr4 77175333 77175612 + 1 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 18265 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 156.667-43 chr10 54507933 54508148 + 1 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 21810 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 152.667-363 chr8 59557448 59557650 + 1 NA Intergenic Intergenic 438339 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 113.333-143 chr2 225664154 225664313 + 1 NA intron (NM_001371273, intron 7 of 7) MER103C|DNA|hAT-Charlie 263347 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 324.667-15 chr19 56423378 56423824 + 1 NA exon (NM_001159861, exon 5 of 5) exon (NM_001159861, exon 5 of 5) 19269 NM_152478 147949 Hs.146854 NM_152478 ENSG00000198440 ZNF583 - zinc finger protein 583 protein-coding 128.333-41 chr11 109259745 109259949 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -162343 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 165.333-6 chr1 54572675 54572917 + 1 NA intron (NM_015547, intron 1 of 16) L3|LINE|CR1 24568 NM_147161 26027 Hs.745173 NM_015547 ENSG00000162390 ACOT11 BFIT|STARD14|THEA|THEM1 acyl-CoA thioesterase 11 protein-coding 287.333-3 chr10 17581398 17581877 + 1 NA Intergenic Intergenic 35737 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 299.667-18 chr2 69248979 69249567 + 1 NA TTS (NM_032208) TTS (NM_032208) 137954 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 362.667-29 chr8 123971498 123972197 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 6 of 40) intron (NM_001039112, intron 6 of 40) 68935 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 184.333-55 chr16 72191600 72191879 + 1 NA Intergenic Intergenic -19289 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 162.667-48 chr11 66222628 66222807 + 1 NA intron (NM_018026, intron 10 of 23) intron (NM_018026, intron 10 of 23) -34577 NM_001134775 64837 Hs.280792 NM_022822 ENSG00000174996 KLC2 - kinesin light chain 2 protein-coding 165.667-133 chr3 191053959 191054203 + 1 NA Intergenic Intergenic -145160 NM_198184 344901 Hs.526794 NM_198184 ENSG00000188729 OSTN MUSCLIN osteocrin protein-coding 149.667-353 chr6 82088424 82088666 + 1 NA intron (NR_149135, intron 1 of 3) intron (NR_149135, intron 1 of 3) 13220 NR_149135 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 161.333-133 chr19 29928803 29929009 + 1 NA intron (NM_001252641, intron 1 of 10) intron (NM_001252641, intron 1 of 10) 5249 NM_001252641 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 154.333-191 chr21 25669673 25669967 + 1 NA intron (NR_072999, intron 1 of 9) intron (NR_072999, intron 1 of 9) 30538 NM_001270407 58494 Hs.517227 NM_021219 ENSG00000154721 JAM2 C21orf43|CD322|JAM-B|JAMB|PRO245|VE-JAM|VEJAM junctional adhesion molecule 2 protein-coding 189.667-113 chr5 29803557 29803835 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -76864 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 152.333-224 chr3 6933266 6933475 + 1 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) intron (NM_000844, intron 1 of 9) -39353 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 183.667-70 chr2 12956762 12957072 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 50096 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 172.333-142 chr5 87358527 87358796 + 1 NA intron (NM_022650, intron 9 of 24) L2a|LINE|L2 -35033 NR_130929 644285 Hs.709256 NR_130929 LOC644285 - uncharacterized LOC644285 ncRNA 123.333-214 chr8 110413229 110413403 + 1 NA Intergenic Intergenic -437545 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 255.667-34 chr17 27967147 27967503 + 1 NA intron (NR_146896, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu 24382 NR_146896 105371708 Hs.385535 NR_146896 LINC01992 - long intergenic non-protein coding RNA 1992 ncRNA 150.667-86 chr12 40040811 40041152 + 1 NA intron (NM_052885, intron 2 of 9) AluSg7|SINE|Alu 65100 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 125.333-159 chr6 112548477 112548747 + 1 NA Intergenic Intergenic 201282 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 163.667-200 chr5 79834508 79834694 + 1 NA Intergenic Intergenic -101978 NR_131226 105616916 Hs.590325 NR_131226 ENSG00000250888 LINC01455 MDONA|TCONS_00009433 long intergenic non-protein coding RNA 1455 ncRNA 164.667-107 chr2 61190302 61190687 + 1 NA intron (NM_014709, intron 77 of 79) intron (NM_014709, intron 77 of 79) 13076 NR_152216 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 162.667-49 chr11 78944137 78944307 + 1 NA intron (NM_001098816, intron 6 of 33) intron (NM_001098816, intron 6 of 33) -369358 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 149.333-387 chr8 51323868 51324151 + 1 NA intron (NM_144651, intron 21 of 22) intron (NM_144651, intron 21 of 22) 485436 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 227.667-83 chr9 114370483 114370842 + 1 NA intron (NM_001317950, intron 4 of 21) intron (NM_001317950, intron 4 of 21) 17320 NM_001317950 80709 Hs.494895 NM_030767 ENSG00000106948 AKNA - AT-hook transcription factor protein-coding 171.333-106 chr21 30851345 30851559 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -21693 NM_181606 337878 Hs.407656 NM_181606 ENSG00000274749 KRTAP7-1 KAP7.1 keratin associated protein 7-1 (gene/pseudogene) protein-coding 155.667-245 chr4 55286903 55287242 + 1 NA Intergenic Intergenic -59170 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 277.667-4 chr1 178909001 178909393 + 1 NA intron (NM_152663, intron 19 of 19) L1PA16|LINE|L1 -38120 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 272.667-46 chr4 61526852 61527197 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 324852 NM_001371342 149.667-289 chr4 70086035 70086202 + 1 NA TTS (NR_003720) TTS (NR_003720) 18732 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 139.667-209 chr9 78847417 78847603 + 1 NA Intergenic Intergenic 298156 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 175.333-9 chr1 229686202 229686498 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 60103 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 195.667-15 chr10 116950616 116950984 + 1 NA intron (NM_001127211, intron 6 of 16) intron (NM_001127211, intron 6 of 16) 54387 NM_018330 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 165.333-73 chr14 55855582 55855823 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -59028 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 210.333-90 chr20 20469521 20469877 + 1 NA intron (NM_020343, intron 37 of 39) intron (NM_020343, intron 37 of 39) 101595 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 154.667 chr1 28569239 28569494 + 1 NA intron (NM_017846, intron 6 of 8) AluJr|SINE|Alu 9456 NR_003077 692212 NR_003077 ENSG00000221539 SNORD99 HBII-420 small nucleolar RNA, C/D box 99 snoRNA 180.333-47 chr17 58714987 58715306 + 1 NA intron (NM_058216, intron 5 of 8) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 22544 NR_103872 5889 Hs.412587 NM_002876 ENSG00000108384 RAD51C BROVCA3|FANCO|R51H3|RAD51L2 RAD51 paralog C protein-coding 169.667-141 chr3 187091585 187091800 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 47804 NM_052969 116832 Hs.647900 NM_052969 ENSG00000163923 RPL39L L39-2|RPL39L1 ribosomal protein L39 like protein-coding 161.333-94 chr14 64533109 64533348 + 1 NA 3' UTR (NM_014950, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_014950, exon 3 of 3) 7140 NR_110550 102723809 Hs.667192 NR_110550 ENSG00000259116 LOC102723809 - uncharacterized LOC102723809 ncRNA 118.333-149 chr4 57085181 57085351 + 1 NA intron (NM_001553, intron 1 of 4) HAL1M8|LINE|L1 -24496 NR_034081 255130 Hs.691061 NR_034081 ENSG00000245067 IGFBP7-AS1 - IGFBP7 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-285 chr3 196358458 196358715 + 1 NA intron (NM_015562, intron 10 of 10) AluJb|SINE|Alu -20166 NR_037950 100534611 Hs.733180 NR_037950 TM4SF19-TCTEX1D2 - TM4SF19-TCTEX1D2 readthrough (NMD candidate) ncRNA 188.667-80 chr2 133121628 133121991 + 1 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) L1ME1|LINE|L1 -144386 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 114.333-158 chr4 79629256 79629412 + 1 NA Intergenic Intergenic 136741 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 320.333-4 chr10 45166724 45167134 + 1 NA intron (NR_033891, intron 2 of 7) AluSc8|SINE|Alu 2915 NR_036112 100422988 NR_036112 ENSG00000263476 MIR3156-1 mir-3156-1 microRNA 3156-1 ncRNA 201.333-9 chr1 96986875 96987194 + 1 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -108889 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 252.667-57 chr21 34503279 34503575 + 1 NA intron (NM_000219, intron 2 of 3) MER21B|LTR|ERVL 7888 NM_001270403 3753 Hs.121495 NM_000219 ENSG00000180509 KCNE1 ISK|JLNS|JLNS2|LQT2/5|LQT5|MinK potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1 protein-coding 246.333-32 chr14 70368461 70369029 + 1 NA 3' UTR (NM_018373, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_018373, exon 4 of 4) -9062 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 119.667-54 chr15 62023184 62023334 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 8 of 81) intron (NM_001018088, intron 8 of 81) 37188 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 203.333-249 chr7 106443537 106443812 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -158691 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 123.333-158 chr4 41771114 41771307 + 1 NA Intergenic Intergenic -22240 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 196.667-159 chr8 91631896 91632233 + 1 NA Intergenic Intergenic 382745 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 196.667-166 chr8 136898035 136898474 + 1 NA TTS (NR_147196) TTS (NR_147196) 367456 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 147.333-334 chr9 115257393 115257562 + 1 NA intron (NR_163556, intron 2 of 7) intron (NR_163556, intron 2 of 7) 115659 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 167.333-67 chr12 50570837 50571058 + 1 NA intron (NM_173602, intron 1 of 37) L2c|LINE|L2 65962 NM_173602 57609 Hs.505516 NM_020849 ENSG00000066084 DIP2B - disco interacting protein 2 homolog B protein-coding 207.333-44 chr11 25617624 25618020 + 1 NA Intergenic Intergenic -571301 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 270.333-49 chr5 21193516 21193960 + 1 NA Intergenic Intergenic -265742 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 151.333-85 chr11 96428328 96428565 + 1 NA Intergenic Intergenic 38433 NM_003772 8690 Hs.105940 NM_003772 ENSG00000183340 JRKL HHMJG JRK like protein-coding 318.333-18 chr2 57645230 57645763 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -262155 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 157.667-303 chr7 44620839 44621074 + 1 NA intron (NM_002541, intron 1 of 22) intron (NM_002541, intron 1 of 22) 14329 NM_002541 4967 Hs.488181 NM_002541 ENSG00000105953 OGDH AKGDH|E1k|OGDC oxoglutarate dehydrogenase protein-coding 163.667-83 chr17 31742894 31743117 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 115957 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 149.667-431 chrX 8075458 8075730 + 1 NA Intergenic Intergenic -51371 NR_030380 723779 NR_030380 ENSG00000207628 MIR651 MIRN651|hsa-mir-651|mir-651 microRNA 651 ncRNA 154.333-182 chr2 237307207 237307482 + 1 NA Intergenic Intergenic 106820 NM_057165 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 114.667-165 chr22 30311934 30312169 + 1 NA intron (NM_001204240, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 14890 NM_031937 83874 Hs.655273 NM_031937 ENSG00000099992 TBC1D10A EPI64|TBC1D10|dJ130H16.1|dJ130H16.2 TBC1 domain family member 10A protein-coding 209.667-57 chr18 7525113 7525421 + 1 NA Intergenic Intergenic -42049 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 270.333-42 chr4 32150399 32150808 + 1 NA intron (NR_125936, intron 2 of 2) intron (NR_125936, intron 2 of 2) -128181 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 117.333-61 chr14 75121498 75121677 + 1 NA intron (NM_033116, intron 2 of 21) AluSz6|SINE|Alu 5461 NM_033116 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 151.333-149 chr15 63062497 63062667 + 1 NA exon (NM_001365782, exon 7 of 8) exon (NM_001365782, exon 7 of 8) -13195 NR_147233 111064646 Hs.602995 NR_147233 TPM1-AS TPM1-AS1 TPM1 antisense RNA ncRNA 163.667-112 chr2 73014242 73014492 + 1 NA intron (NR_138476, intron 6 of 14) L1M5|LINE|L1 44805 NM_001330407 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 212.667-49 chr16 73870064 73870345 + 1 NA Intergenic Intergenic 345317 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 150.333-12 chr1 110097808 110098107 + 1 NA intron (NR_126382, intron 1 of 3) MIR1_Amn|SINE|MIR -14486 NM_203412 164153 Hs.374027 NM_203412 ENSG00000186150 UBL4B - ubiquitin like 4B protein-coding 172.333-18 chr10 63233159 63233340 + 1 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 35974 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 176.333-126 chr4 112191053 112191406 + 1 NA 3' UTR (NM_152400, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_152400, exon 2 of 2) -40558 NR_136622 55435 Hs.435991 NM_018569 ENSG00000138660 AP1AR 2C18|C4orf16|GBAR|PRO0971|gamma-BAR adaptor related protein complex 1 associated regulatory protein protein-coding 211.667-47 chr18 5954934 5955293 + 1 NA non-coding (NR_158610, exon 17 of 17) non-coding (NR_158610, exon 17 of 17) -59159 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 138.667-203 chr8 74149803 74150001 + 1 NA Intergenic Intergenic 158510 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 207.333-164 chr20 51393489 51393715 + 1 NA intron (NM_001258295, intron 9 of 9) intron (NM_001258295, intron 9 of 9) 59375 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 307.333-51 chr22 26868308 26868940 + 1 NA intron (NR_146604, intron 3 of 5) intron (NR_146604, intron 3 of 5) 8413 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 164.667-205 chr6 120179646 120179886 + 1 NA Intergenic Intergenic 164587 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 237.333-100 chr6 70083773 70084255 + 1 NA intron (NM_001858, intron 15 of 50) intron (NM_001858, intron 15 of 50) 199183 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 153.667-36 chr10 17468172 17468345 + 1 NA Intergenic Intergenic -13663 NR_144322 338596 Hs.677766 NM_001004470 ENSG00000148488 ST8SIA6 SIA8F|SIAT8-F|SIAT8F|ST8SIA-VI|ST8SiaVI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 protein-coding 141.667-129 chr20 39943541 39943793 + 1 NA Intergenic Intergenic -60794 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 157.667-54 chr11 46213023 46213301 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 41207 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 128.667-27 chr10 84914651 84914825 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 284167 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 149.333-324 chr5 163263489 163263702 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -173976 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 162.333-280 chrX 38110749 38111025 + 1 NA intron (NM_001163334, intron 13 of 16) intron (NM_001163334, intron 13 of 16) 77353 NM_001163334 94122 Hs.662334 NM_138780 ENSG00000147041 SYTL5 slp5 synaptotagmin like 5 protein-coding 134.333-148 chr6 22341713 22341867 + 1 NA Intergenic Intergenic -38955 NM_001163558 5617 Hs.1905 NM_000948 ENSG00000172179 PRL GHA1 prolactin protein-coding 196.667-104 chr4 30415878 30416087 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -304387 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 179.333-94 chr2 64149714 64150039 + 1 NA Intergenic Charlie13a|DNA|hAT-Charlie -5456 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 144.333-233 chr6 74503169 74503469 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) L1MEd|LINE|L1 433868 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 160.333-97 chr14 51676914 51677287 + 1 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) L1ME3D|LINE|L1 25190 NM_152330 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 176.667-75 chr2 80916350 80916559 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 550492 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 193.667-118 chr6 150575150 150575528 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -24546 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 158.333-268 chr5 164045572 164045843 + 1 NA Intergenic Intergenic 421695 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 118.333-217 chr9 78134758 78134976 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -101208 NM_001330691 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 135.667-50 chr14 34514229 34514489 + 1 NA Intergenic Intergenic 25342 NM_018453 55837 Hs.433269 NM_018453 ENSG00000129518 EAPP BM036|C14orf11 E2F associated phosphoprotein protein-coding 408.667-6 chr21 19934263 19934968 + 1 NA Intergenic Intergenic -34860 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 186.333-75 chr2 85516389 85516642 + 1 NA Intergenic Intergenic 22371 NR_038942 100630918 Hs.66049 NR_038942 PARTICL PARTICLE promoter of MAT2A antisense radiation-induced circulating long non-coding RNA ncRNA 229.667-35 chr15 63172999 63173433 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -15739 NM_015920 51065 Hs.108957 NM_015920 ENSG00000185088 RPS27L - ribosomal protein S27 like protein-coding 155.333-205 chr21 16420155 16420314 + 1 NA promoter-TSS (NR_136550) promoter-TSS (NR_136550) -61 NR_136550 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 240.667-21 chr12 89132114 89132421 + 1 NA Intergenic Intergenic -112575 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 229.667 chr1 43752450 43752899 + 1 NA intron (NM_001270465, intron 2 of 7) AluJb|SINE|Alu -25331 NR_125986 101929592 NR_125986 ENSG00000229444 LOC101929592 - uncharacterized LOC101929592 ncRNA 170.333-27 chr10 30061799 30062014 + 1 NA intron (NM_001350021, intron 1 of 4) intron (NM_001350021, intron 1 of 4) -2320 NM_001350001 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 154.667-242 chr3 99757047 99757224 + 1 NA intron (NM_001850, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -60727 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 156.333-38 chr10 56237407 56237716 + 1 NA Intergenic Intergenic 123698 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 177.333-56 chr14 68450363 68450673 + 1 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) AluSq2|SINE|Alu 178269 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 142.333-26 chr10 68804146 68804434 + 1 NA Intergenic Intergenic -23241 NM_152709 219736 Hs.37636 NM_152709 ENSG00000165730 STOX1 C10orf24 storkhead box 1 protein-coding 206.667-104 chr4 108478914 108479223 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -78165 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 188.667-99 chr22 49774176 49774418 + 1 NA exon (NM_001349940, exon 13 of 13) exon (NM_001349940, exon 13 of 13) 50034 NR_146335 23774 Hs.127950 NM_014577 ENSG00000100425 BRD1 BRL|BRPF1|BRPF2 bromodomain containing 1 protein-coding 169.333-45 chr12 12828763 12829013 + 1 NA intron (NM_201224, intron 10 of 10) L1ME4a|LINE|L1 15542 NM_201224 51202 Hs.719938 NM_016355 ENSG00000213782 DDX47 E4-DBP|HQ0256|MSTP162|RRP3 DEAD-box helicase 47 protein-coding 291.667-18 chr2 180727734 180728096 + 1 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) intron (NR_104324, intron 3 of 4) 35811 NR_104323 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 167.667-26 chr10 67238643 67238812 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 164683 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 306.333-29 chr21 30829654 30830202 + 1 NA promoter-TSS (NM_181606) promoter-TSS (NM_181606) -169 NM_181606 337878 Hs.407656 NM_181606 ENSG00000274749 KRTAP7-1 KAP7.1 keratin associated protein 7-1 (gene/pseudogene) protein-coding 173.333-92 chr2 57814219 57814444 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -93320 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 164.333-10 chr1 201855110 201855421 + 1 NA intron (NM_018085, intron 9 of 23) intron (NM_018085, intron 9 of 23) -8108 NR_106797 102466724 NR_106797 ENSG00000277681 MIR6739 hsa-mir-6739 microRNA 6739 ncRNA 152.667-204 chr2 170839859 170840048 + 1 NA intron (NM_000817, intron 6 of 16) intron (NM_000817, intron 6 of 16) 23066 NM_000817 2571 Hs.420036 NM_000817 ENSG00000128683 GAD1 CPSQ1|GAD|SCP glutamate decarboxylase 1 protein-coding 188.333-48 chr14 73870633 73870955 + 1 NA intron (NM_001371328, intron 3 of 8) intron (NM_001371328, intron 3 of 8) -16065 NM_001242928 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 190.333-47 chr14 61800913 61801285 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -11063 NM_001367650 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 307.333-33 chr16 69842844 69843306 + 1 NA intron (NM_001270453, intron 3 of 20) intron (NM_001270453, intron 3 of 20) 4338 NM_001270453 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 164.333-185 chr5 6405597 6405865 + 1 NA Intergenic Intergenic -27184 NM_032286 84246 Hs.13885 NM_032286 ENSG00000133398 MED10 L6|NUT2|TRG20 mediator complex subunit 10 protein-coding 120.333-111 chr2 195464457 195464693 + 1 NA Intergenic Intergenic -192383 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 153.333-311 chr4 104601503 104601803 + 1 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) L1MA9|LINE|L1 -106759 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 192.667-2 chr1 29475019 29475313 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -125052 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 229.667-69 chr5 141114282 141114590 + 1 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -7382 NM_018938 56131 Hs.591250 NM_018938 ENSG00000081818 PCDHB4 PCDH-BETA4 protocadherin beta 4 protein-coding 142.667-114 chr2 206602980 206603216 + 1 NA intron (NM_003812, intron 24 of 25) intron (NM_003812, intron 24 of 25) -41129 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 152.667-244 chr3 49764039 49764260 + 1 NA intron (NM_153273, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 22045 NM_001242829 9807 Hs.386168 NM_153273 ENSG00000176095 IP6K1 IHPK1|PiUS inositol hexakisphosphate kinase 1 protein-coding 139.667-20 chr10 65499104 65499264 + 1 NA Intergenic Intergenic -72241 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 160.333-24 chr1 169428297 169428469 + 1 NA promoter-TSS (NM_021179) promoter-TSS (NM_021179) -909 NM_001300969 57821 Hs.567557 NM_021179 ENSG00000117477 CCDC181 C1orf114 coiled-coil domain containing 181 protein-coding 163.333-294 chr9 35493357 35493681 + 1 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu 3408 NM_001330740 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 173.333-123 chr3 83836274 83836643 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 1033117 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 123.667-187 chr8 134001939 134002158 + 1 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 115552 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 277.667-45 chr8 36060423 36060863 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -350323 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 231.667-16 chr14 56382304 56382606 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -131876 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 299.667-25 chr4 74108360 74108843 + 1 NA Intergenic (TAATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -9406 NM_002089 2920 Hs.75765 NM_002089 ENSG00000081041 CXCL2 CINC-2a|GRO2|GROb|MGSA-b|MIP-2a|MIP2|MIP2A|SCYB2 C-X-C motif chemokine ligand 2 protein-coding 126.333-180 chr8 115808845 115809030 + 1 NA Intergenic Intergenic -139962 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 214.667-91 chr4 72725097 72725476 + 1 NA Intergenic Intergenic -156065 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 186.333-64 chr18 67006913 67007208 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -74524 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 245.333-71 chr20 32309040 32309476 + 1 NA intron (NM_004798, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 31607 NM_004798 9371 Hs.369670 NM_004798 ENSG00000101350 KIF3B FLA8|HH0048|KLP-11 kinesin family member 3B protein-coding 370.667-29 chr8 120617340 120617811 + 1 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) -143678 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 195.333-119 chr2 138477045 138477335 + 1 NA Intergenic Intergenic -24580 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 207.333-217 chr5 39338613 39338992 + 1 NA intron (NM_001737, intron 4 of 10) intron (NM_001737, intron 4 of 10) 25693 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 147.667-263 chr4 124109648 124109873 + 1 NA Intergenic Intergenic 335496 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 130.333-159 chr4 157784598 157784811 + 1 NA Intergenic Intergenic 212214 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 208.667-70 chr2 104468954 104469233 + 1 NA intron (NR_015399, intron 1 of 3) intron (NR_015399, intron 1 of 3) 34746 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 177.667-150 chr9 93787279 93787534 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -31951 NR_036254 100422927 NR_036254 ENSG00000265347 MIR4291 - microRNA 4291 ncRNA 164.667-243 chr8 118896045 118896277 + 1 NA Intergenic Intergenic 55724 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 283.333-52 chr3 133017106 133017571 + 1 NA Intergenic Intergenic -20950 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 194.667-16 chr1 221445014 221445249 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -108835 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 163.333-81 chr14 49000066 49000235 + 1 NA Intergenic Intergenic 586230 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 285.667-10 chr12 65965416 65965974 + 1 NA 3' UTR (NM_003483, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_003483, exon 5 of 5) 58031 NR_106722 102464827 NR_106722 ENSG00000276878 MIR6074 hsa-mir-6074 microRNA 6074 ncRNA 157.667-289 chr7 6315715 6316015 + 1 NA Intergenic Intergenic 33102 NM_001037163 84792 Hs.696146 NM_001037163 ENSG00000286075 FAM220A ACPIN1|C7orf70|SIPAR family with sequence similarity 220 member A protein-coding 131.333-143 chr5 76859158 76859362 + 1 NA intron (NM_130772, intron 1 of 4) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 9246 NM_130772 170591 Hs.482563 NM_130772 ENSG00000171643 S100Z Gm625|S100-zeta S100 calcium binding protein Z protein-coding 146.333-153 chr2 86434559 86434744 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -6720 NM_018433 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 148.333-154 chr16 61278194 61278438 + 1 NA Intergenic Intergenic -222550 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 176.667-108 chr4 30825106 30825416 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 104892 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 139.333-218 chr8 109645126 109645314 + 1 NA promoter-TSS (NM_001099753) promoter-TSS (NM_001099753) 373 NM_001099751 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 264.667-34 chr17 59805754 59806165 + 1 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) intron (NM_001329400, intron 5 of 9) -35307 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 137.667-127 chr3 101054890 101055040 + 1 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -61475 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 195.333-103 chr2 6811287 6811596 + 1 NA Intergenic Intergenic 29023 NR_126359 104326052 Hs.7155 NR_126359 NRIR lncRNA-CMPK2 negative regulator of interferon response ncRNA 153.667-401 chr9 36351976 36352178 + 1 NA intron (NM_194328, intron 8 of 11) AluSx|SINE|Alu 48192 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 167.333-109 chr17 58078239 58078514 + 1 NA non-coding (NR_110809, exon 3 of 3) non-coding (NR_110809, exon 3 of 3) 4828 NR_110809 101927666 Hs.552237 NR_110809 ENSG00000266290 LOC101927666 - uncharacterized LOC101927666 ncRNA 137.333-83 chr19 45166556 45166814 + 1 NA intron (NM_001270891, intron 1 of 5) intron (NM_001270891, intron 1 of 5) -6535 NM_198478 284353 Hs.299256 NM_198478 NKPD1 - NTPase KAP family P-loop domain containing 1 protein-coding 187.333-179 chr6 144960923 144961244 + 1 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 555428 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 148.333-58 chr11 5042746 5042947 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -3680 NM_001001916 119679 Hs.553558 NM_001001916 ENSG00000205495 OR52J3 OR11-32 olfactory receptor family 52 subfamily J member 3 protein-coding 135.333-172 chr7 41511173 41511340 + 1 NA Intergenic Intergenic -182663 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 162.667-295 chr9 101708684 101708956 + 1 NA intron (NM_133445, intron 1 of 8) intron (NM_133445, intron 1 of 8) 29760 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 187.333-136 chr4 35302773 35302989 + 1 NA Intergenic Intergenic 941058 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 140.333-136 chr3 40546096 40546244 + 1 NA Intergenic Intergenic 21210 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 169.667-84 chr16 48026359 48026563 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 60772 NR_146502 105371238 Hs.743032 NR_146502 LINC02134 - long intergenic non-protein coding RNA 2134 ncRNA 149.667-336 chr5 170839349 170839582 + 1 NA Intergenic Intergenic -22553 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 147.333-227 chr3 184221114 184221379 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9107 NM_138345 90113 Hs.584997 NM_138345 ENSG00000145198 VWA5B2 - von Willebrand factor A domain containing 5B2 protein-coding 248.333-82 chr5 86186560 86186895 + 1 NA Intergenic Intergenic -95717 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 289.667-16 chr18 13758713 13759021 + 1 NA intron (NM_001308263, intron 11 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 32194 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 205.667-127 chr7 127804380 127804611 + 1 NA intron (NM_014390, intron 10 of 23) intron (NM_014390, intron 10 of 23) 152301 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 219.333-53 chr15 25590572 25590979 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -151719 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 155.333-179 chr2 144371684 144371921 + 1 NA Intergenic Intergenic -38733 NM_001354360 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 181.667-119 chr5 56869763 56870077 + 1 NA intron (NM_005921, intron 6 of 19) intron (NM_005921, intron 6 of 19) -39340 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 272.667-51 chr5 26609365 26609725 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 429041 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 115.333-72 chr14 66064330 66064548 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -421932 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 130.667-29 chr10 65160885 65161033 + 1 NA Intergenic Intergenic -236441 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 291.333-67 chr8 80172208 80172824 + 1 NA promoter-TSS (NR_105035) promoter-TSS (NR_105035) -952 NM_001025253 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 150.333-417 chr8 117281206 117281428 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 146322 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 181.667-83 chr20 62994426 62994661 + 1 NA Intergenic Intergenic 12421 NM_080606 128408 Hs.551230 NM_080606 ENSG00000125533 BHLHE23 BETA4|BHLHB4|Beta3b|bA305P22.3 basic helix-loop-helix family member e23 protein-coding 113.667-39 chr12 39834851 39835003 + 1 NA intron (NM_052885, intron 6 of 9) intron (NM_052885, intron 6 of 9) 208744 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 117.667-23 chr11 24127086 24127276 + 1 NA Intergenic Intergenic -369872 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 111.667-142 chr2 186081524 186081732 + 1 NA intron (NR_110218, intron 2 of 5) intron (NR_110218, intron 2 of 5) 4689 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 145.333-85 chr14 59181925 59182196 + 1 NA Intergenic Intergenic -6607 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 217.667-82 chr7 101611400 101611733 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 17730 NM_138403 93408 Hs.247831 NM_138403 ENSG00000106436 MYL10 MYLC2PL|PLRLC myosin light chain 10 protein-coding 168.667-92 chr2 19712097 19712292 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -156660 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 178.667-93 chr21 31039114 31039378 + 1 NA promoter-TSS (NM_001099219) promoter-TSS (NM_001099219) -770 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 121.667-96 chr2 158607483 158607702 + 1 NA intron (NM_001005476, intron 4 of 20) LTR33A|LTR|ERVL 127410 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-308 chr5 29808764 29809042 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -71657 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 136.667-98 chr2 155542317 155542484 + 1 NA Intergenic Intergenic 712531 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 263.667-19 chr13 38572314 38572593 + 1 NA intron (NR_046999, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 4729 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 162.333-194 chr5 32992210 32992397 + 1 NA Intergenic Intergenic 44860 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 138.667-77 chr16 46685168 46685436 + 1 NA intron (NM_018206, intron 1 of 16) intron (NM_018206, intron 1 of 16) 3876 NM_018206 55737 Hs.454528 NM_018206 ENSG00000069329 VPS35 MEM3|PARK17 VPS35 retromer complex component protein-coding 159.333-128 chr18 24389028 24389192 + 1 NA intron (NM_080597, intron 1 of 27) intron (NM_080597, intron 1 of 27) 8714 NM_080597 114876 Hs.370725 NM_018030 ENSG00000141447 OSBPL1A ORP-1|ORP1|OSBPL1B oxysterol binding protein like 1A protein-coding 152.333-291 chr5 24214255 24214435 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 262997 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 153.667-214 chr2 224961690 224961867 + 1 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) AluSc|SINE|Alu -14729 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 189.667-133 chr7 43801483 43801862 + 1 NA intron (NM_001253823, intron 7 of 8) MIRb|SINE|MIR 42992 NM_000712 644 Hs.488143 NM_000712 ENSG00000106605 BLVRA BLVR|BVR|BVRA biliverdin reductase A protein-coding 157.333-307 chr6 78149838 78150118 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 389331 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 197.333-188 chr5 119445491 119445870 + 1 NA Intergenic Intergenic -6817 NM_001292027 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 156.667-30 chr1 200234908 200235176 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 138750 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 244.667-71 chr4 39317743 39318048 + 1 NA intron (NM_001204747, intron 9 of 24) AluY|SINE|Alu 48467 NM_001204747 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 148.333-344 chr6 85814839 85815038 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -136205 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 146.667-102 chr14 57188524 57188754 + 1 NA Intergenic Intergenic 80266 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 167.667-9 chr1 114142604 114142820 + 1 NA intron (NM_001366225, intron 1 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 9728 NM_205848 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 117.667-120 chr3 104806089 104806236 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -560551 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 293.333-7 chr12 34536520 34536961 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 514244 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 191.667-135 chr9 120462109 120462351 + 1 NA intron (NR_073558, intron 18 of 37) intron (NR_073558, intron 18 of 37) 117937 NM_001011649 55755 Hs.269560 NM_018249 ENSG00000136861 CDK5RAP2 C48|Cep215|MCPH3 CDK5 regulatory subunit associated protein 2 protein-coding 194.667-68 chr2 109167396 109167710 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -25965 NR_036223 100422863 NR_036223 ENSG00000264934 MIR4265 - microRNA 4265 ncRNA 156.333-334 chr7 35441258 35441587 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 127567 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 222.333-80 chr6 61619994 61620408 + 1 NA intron (NR_146870, intron 13 of 15) intron (NR_146870, intron 13 of 15) 46071 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 194.333-129 chr6 27228740 27228982 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -18840 NM_005865 10279 Hs.274407 NM_005865 ENSG00000112812 PRSS16 TSSP serine protease 16 protein-coding 151.667-169 chr2 138197372 138197553 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 95578 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 243.667-67 chr6 50885779 50886293 + 1 NA Intergenic Intergenic 67165 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 295.333-22 chr18 55432956 55433574 + 1 NA intron (NM_001348217, intron 4 of 18) MIRb|SINE|MIR -10968 NM_001348213 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 153.667-113 chr13 111039815 111040070 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -55896 NR_120415 101927802 Hs.559193 NR_120415 LINC00368 - long intergenic non-protein coding RNA 368 ncRNA 153.667-12 chr1 71259474 71259681 + 1 NA Intergenic Intergenic 178253 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 174.667-127 chr4 74215640 74215958 + 1 NA intron (NM_001144978, intron 5 of 7) intron (NM_001144978, intron 5 of 7) 57681 NM_001004346 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 170.333-142 chr3 107340525 107340729 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -36812 NM_032600 84692 Hs.164799 NM_032600 ENSG00000138483 CCDC54 NYD-SP17|SP17 coiled-coil domain containing 54 protein-coding 144.333-153 chr21 20545970 20546157 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 257045 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 427.667-3 chr10 43708214 43708894 + 1 NA Intergenic Intergenic -59673 NM_006973 7580 Hs.522885 NM_006973 ENSG00000169740 ZNF32 KOX30 zinc finger protein 32 protein-coding 149.667-50 chr10 52905143 52905313 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -133528 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 156.667-353 chr9 29254085 29254349 + 1 NA Intergenic Intergenic -40616 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 154.333-91 chr14 59185840 59186101 + 1 NA Intergenic Intergenic -2697 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 149.333-322 chr5 136443363 136443556 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -77983 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 270.667-25 chr2 45307229 45307626 + 1 NA Intergenic Intergenic -52486 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 145.667-242 chr6 48806754 48806999 + 1 NA Intergenic Intergenic 656377 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 290.333-10 chr14 45917453 45917885 + 1 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -146490 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 158.667-77 chr12 80998149 80998323 + 1 NA Intergenic Intergenic -60321 NM_004664 8825 Hs.144333 NM_004664 ENSG00000111052 LIN7A LIN-7A|LIN7|MALS-1|MALS1|TIP-33|VELI1 lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component protein-coding 149.667-355 chr6 82739696 82739882 + 1 NA Intergenic Intergenic 326052 NR_146807 90025 Hs.148609 NM_198920 ENSG00000118420 UBE3D C6orf157|H10BH|UBE2CBP|YJR141W ubiquitin protein ligase E3D protein-coding 170.667-21 chr11 13161362 13161671 + 1 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -115136 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 158.667-229 chr4 30857042 30857307 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 136805 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 261.667 chr1 7046434 7046856 + 1 NA intron (NM_001349608, intron 2 of 21) L2c|LINE|L2 261191 NR_146204 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 238.333-25 chr15 61564198 61564498 + 1 NA Intergenic Intergenic -165570 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 140.333-236 chr8 117872922 117873190 + 1 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 47857 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 123.333-35 chr10 68364899 68365124 + 1 NA intron (NR_103476, intron 13 of 18) intron (NR_103476, intron 13 of 18) -32083 NM_022129 64081 Hs.198158 NM_022129 ENSG00000108187 PBLD HEL-S-306|MAWBP|MAWDBP phenazine biosynthesis like protein domain containing protein-coding 176.333-43 chr13 55611395 55611659 + 1 NA Intergenic Intergenic 437073 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 172.333-159 chr6 123088121 123088310 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 91980 NM_001010852 134829 Hs.486361 NM_001010852 ENSG00000146352 CLVS2 C6orf212|C6orf213|RLBP1L2|bA160A10.4 clavesin 2 protein-coding 253.333-28 chr14 85856237 85856696 + 1 NA Intergenic Intergenic -78212 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 189.667-111 chr4 168216978 168217250 + 1 NA intron (NM_017631, intron 37 of 37) intron (NM_017631, intron 37 of 37) 101638 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 132.667-100 chr21 16368620 16368844 + 1 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) AluSz|SINE|Alu -50471 NR_136546 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 153.333-157 chr17 19662586 19662881 + 1 NA intron (NM_001369136, intron 7 of 11) intron (NM_001369136, intron 7 of 11) 13982 NM_001031806 224 Hs.499886 NM_000382 ENSG00000072210 ALDH3A2 ALDH10|FALDH|SLS aldehyde dehydrogenase 3 family member A2 protein-coding 465.667-9 chr8 81004507 81005411 + 1 NA intron (NM_018440, intron 3 of 8) intron (NM_018440, intron 3 of 8) 107109 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 167.333-46 chr10 72219585 72219784 + 1 NA intron (NM_001366791, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu -2550 NM_001369086 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 157.667-141 chr2 40164452 40164643 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 6 of 8) intron (NM_001351483, intron 6 of 8) 246913 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 178.333-105 chr3 104797449 104797693 + 1 NA Intergenic Intergenic -569142 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 156.667-302 chr6 103916921 103917079 + 1 NA Intergenic Intergenic 942546 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 207.667-37 chr15 64712524 64712874 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -9418 NM_001301302 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 115.333-78 chr15 24022039 24022265 + 1 NA intron (NR_126392, intron 4 of 5) L1MC3|LINE|L1 47005 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 175.667-62 chr19 27379869 27380055 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -413469 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 303.333-48 chr2 224915433 224915972 + 1 NA intron (NM_001290263, intron 3 of 55) intron (NM_001290263, intron 3 of 55) 31347 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 157.333-134 chr16 58576916 58577122 + 1 NA intron (NM_206999, intron 13 of 30) intron (NM_206999, intron 13 of 30) -17088 NR_002980 677830 Hs.677515 NR_002980 ENSG00000281910 SNORA50A ACA50|SNORA50|SNORA76A small nucleolar RNA, H/ACA box 50A snoRNA 158.667-344 chr9 31509269 31509443 + 1 NA Intergenic Intergenic -127866 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 156.667-180 chr2 55744883 55745065 + 1 NA Intergenic Intergenic -51130 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 249.667-48 chr2 188851910 188852203 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -61933 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 137.333-139 chr4 113865695 113865864 + 1 NA Intergenic Intergenic -103852 NM_172114 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 161.667-56 chr12 66014981 66015205 + 1 NA Intergenic Intergenic 8633 NR_106722 102464827 NR_106722 ENSG00000276878 MIR6074 hsa-mir-6074 microRNA 6074 ncRNA 247.667-15 chr11 34965879 34966174 + 1 NA intron (NM_003477, intron 5 of 10) intron (NM_003477, intron 5 of 10) 24189 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 159.333-143 chr2 25513070 25513340 + 1 NA intron (NM_033147, intron 9 of 19) intron (NM_033147, intron 9 of 19) 137017 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 168.667-6 chr1 85165552 85165822 + 1 NA intron (NM_032184, intron 5 of 6) intron (NM_032184, intron 5 of 6) 31893 NR_039619 100616481 NR_039619 ENSG00000266110 MIR4423 mir-4423 microRNA 4423 ncRNA 157.667-315 chr7 130093661 130093947 + 1 NA intron (NM_014997, intron 1 of 9) intron (NM_014997, intron 1 of 9) 23270 NM_014997 23008 Hs.520710 NM_014997 ENSG00000128607 KLHDC10 slim kelch domain containing 10 protein-coding 158.333-31 chr10 36154263 36154463 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 376061 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 162.667-141 chr2 139947312 139947531 + 1 NA Intergenic Intergenic 639264 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 191.667-30 chr11 107585351 107585665 + 1 NA Intergenic Intergenic -5583 NM_001308018 55531 Hs.495779 NM_018712 ENSG00000110675 ELMOD1 - ELMO domain containing 1 protein-coding 153.333-122 chr14 60968513 60968705 + 1 NA 3' UTR (NM_002431, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_002431, exon 8 of 8) 12470 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 195.667-76 chr20 31939593 31939961 + 1 NA intron (NR_148013, intron 14 of 16) MIRb|SINE|MIR 12269 NM_030815 81572 Hs.435755 NM_030815 ENSG00000088356 PDRG1 C20orf126|PDRG p53 and DNA damage regulated 1 protein-coding 233.667-47 chr2 241019443 241019896 + 1 NA intron (NM_001080437, intron 1 of 31) HERVL40-int|LTR|ERVL 21051 NM_001080437 25992 Hs.471834 NM_001080437 ENSG00000162804 SNED1 IRE-BP1|SST3|Snep sushi, nidogen and EGF like domains 1 protein-coding 144.333-206 chr5 19852809 19853105 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 33315 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 148.667-28 chr1 222589258 222589440 + 1 NA promoter-TSS (NR_110613) promoter-TSS (NR_110613) -571 NR_110613 100506161 Hs.553851 NR_110613 ENSG00000225265 TAF1A-AS1 - TAF1A antisense RNA 1 ncRNA 138.333-132 chr4 39398220 39398461 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -8590 NM_175737 152831 Hs.90756 NM_175737 ENSG00000134962 KLB BKL klotho beta protein-coding 138.333-112 chr21 22468118 22468329 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 369606 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 162.333-144 chr21 30815870 30816108 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -2715 NM_175857 337879 Hs.407655 NM_175857 ENSG00000183640 KRTAP8-1 KAP8.1 keratin associated protein 8-1 protein-coding 113.333-97 chr16 77287927 77288144 + 1 NA intron (NM_199355, intron 22 of 22) intron (NM_199355, intron 22 of 22) 88627 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 160.667-331 chrX 87435812 87436004 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -81894 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 151.667-102 chr13 114261661 114261877 + 1 NA intron (NM_001330104, intron 13 of 16) intron (NM_001330104, intron 13 of 16) -12059 NR_039724 100616227 NR_039724 ENSG00000265450 MIR4502 - microRNA 4502 ncRNA 123.333-26 chr1 241202811 241202973 + 1 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) MER39B|LTR|ERV1 70620 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 188.667-64 chr18 60463927 60464241 + 1 NA Intergenic Intergenic -91309 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 154.333-69 chr12 65456157 65456336 + 1 NA intron (NM_001031679, intron 6 of 6) intron (NM_001031679, intron 6 of 6) 101065 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 152.667-391 chr8 140906382 140906571 + 1 NA intron (NM_001352700, intron 1 of 34) L1MA4|LINE|L1 94528 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 140.333-160 chr4 76176220 76176417 + 1 NA intron (NM_001204255, intron 2 of 8) intron (NM_001204255, intron 2 of 8) -27803 NR_103781 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 139.667-131 chr4 28018983 28019180 + 1 NA Intergenic Intergenic -800501 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 182.667-20 chr10 112477077 112477396 + 1 NA intron (NM_001365712, intron 3 of 8) intron (NM_001365712, intron 3 of 8) -29633 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 143.333-25 chr10 19082513 19082735 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 2 of 39) L1M4|LINE|L1 33823 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 152.333-36 chr10 16897192 16897424 + 1 NA intron (NM_001081, intron 54 of 66) L1MDb|LINE|L1 -79854 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 161.333-57 chr12 1718621 1718825 + 1 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 27653 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 154.333-151 chr2 53441204 53441490 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -326436 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 302.667-21 chr3 48065780 48066377 + 1 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) intron (NM_002375, intron 1 of 18) 22770 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 158.667-10 chr1 74025490 74025734 + 1 NA TTS (NM_001322315) TTS (NM_001322315) 172564 NM_001105659 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 166.333-64 chr14 21943081 21943280 + 1 NA Intergenic Intergenic -272163 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 312.667-33 chr6 48895107 48895491 + 1 NA Intergenic Intergenic 567954 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 250.667-82 chr8 130880421 130880738 + 1 NA intron (NM_001115, intron 8 of 17) intron (NM_001115, intron 8 of 17) 160330 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 155.333-152 chr19 29847162 29847327 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 35253 NM_001238 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 168.667-150 chr3 163307596 163307820 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -4407 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 151.667-270 chr5 34017967 34018136 + 1 NA non-coding (NR_146599, exon 12 of 12) non-coding (NR_146599, exon 12 of 12) -10001 NM_001167595 23600 Hs.508343 NM_014324 ENSG00000242110 AMACR AMACRD|CBAS4|P504S|RACE|RM alpha-methylacyl-CoA racemase protein-coding 130.333-154 chr4 100203570 100203767 + 1 NA intron (NR_125924, intron 4 of 4) L1ME1|LINE|L1 -13200 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 118.333-50 chr12 71770864 71771024 + 1 NA intron (NM_014999, intron 3 of 6) intron (NM_014999, intron 3 of 6) 16081 NM_014999 23011 Hs.524590 NM_014999 ENSG00000080371 RAB21 - RAB21, member RAS oncogene family protein-coding 199.667-89 chr21 34925305 34925679 + 1 NA intron (NM_001754, intron 2 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -36793 NM_001001890 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 155.667-230 chr3 136007831 136008013 + 1 NA intron (NM_002718, intron 2 of 13) intron (NM_002718, intron 2 of 13) -14820 NM_181897 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 149.667-130 chr14 81715733 81715941 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 27301 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 177.333-159 chr7 136628768 136629083 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -239727 NM_001006630 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 151.333-444 chr9 95915708 95915877 + 1 NA exon (NM_001010895, exon 5 of 14) exon (NM_001010895, exon 5 of 14) 39784 NM_001010895 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 180.667-119 chr6 7483192 7483518 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -58316 NM_001008844 1832 Hs.519873 NM_004415 ENSG00000096696 DSP DCWHKTA|DP desmoplakin protein-coding 162.333-143 chr21 30748083 30748405 + 1 NA promoter-TSS (NM_181617) promoter-TSS (NM_181617) -985 NM_181617 337978 Hs.553699 NM_181617 ENSG00000187026 KRTAP21-2 KAP21.2 keratin associated protein 21-2 protein-coding 154.667-339 chr6 67339533 67339790 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -715690 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 163.667-84 chr17 47754217 47754406 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 21075 NM_013351 30009 Hs.272409 NM_013351 ENSG00000073861 TBX21 T-PET|T-bet|TBET|TBLYM T-box transcription factor 21 protein-coding 255.333-116 chr8 123937338 123937631 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 85497 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 176.667-33 chr11 20188803 20189028 + 1 NA Intergenic Intergenic -28440 NM_001029865 120237 NM_001029865 ENSG00000109851 DBX1 - developing brain homeobox 1 protein-coding 138.667-28 chr10 112755645 112755948 + 1 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) intron (NM_001365713, intron 8 of 8) -67700 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 232.667-28 chr18 40266284 40266631 + 1 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL 200171 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 133.333-46 chr12 122865981 122866322 + 1 NA 3' UTR (NM_024667, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_024667, exon 4 of 4) 29973 NM_024667 79720 Hs.507162 NM_024667 ENSG00000139722 VPS37B - VPS37B subunit of ESCRT-I protein-coding 151.333-65 chr10 108419160 108419317 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -349945 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 216.667-67 chr21 45176554 45176993 + 1 NA intron (NR_027674, intron 4 of 11) intron (NR_027674, intron 4 of 11) 24243 NM_001346687 104 Hs.474018 NM_001112 ENSG00000197381 ADARB1 ADAR2|DRABA2|DRADA2|RED1 adenosine deaminase RNA specific B1 protein-coding 291.667-24 chr3 156890639 156890998 + 1 NA intron (NM_001004316, intron 3 of 12) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 64465 NM_001193283 389170 Hs.478048 NM_001004316 ENSG00000197980 LEKR1 - leucine, glutamate and lysine rich 1 protein-coding 132.667-95 chr2 150904699 150904842 + 1 NA Intergenic Intergenic 275873 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 126.333-125 chr3 195333595 195333896 + 1 NA intron (NM_012287, intron 7 of 22) intron (NM_012287, intron 7 of 22) -62586 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 145.333-315 chr9 22562557 22562732 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -83556 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 166.333-213 chr7 66939004 66939216 + 1 NA intron (NM_017994, intron 1 of 6) L1ME3Cz|LINE|L1 17885 NM_017994 55069 Hs.488478 NM_017994 ENSG00000106609 TMEM248 C7orf42 transmembrane protein 248 protein-coding 264.333-34 chr18 30719036 30719355 + 1 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL 323547 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 192.667-104 chr3 47587247 47587608 + 1 NA 3' UTR (NM_003074, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_003074, exon 28 of 28) -7187 NM_001206942 10675 Hs.45127 NM_006574 ENSG00000114646 CSPG5 NGC chondroitin sulfate proteoglycan 5 protein-coding 167.667-84 chr17 59916546 59916819 + 1 NA intron (NR_161455, intron 4 of 13) HAL1|LINE|L1 23561 NR_161460 6198 Hs.463642 NM_003161 ENSG00000108443 RPS6KB1 PS6K|S6K|S6K-beta-1|S6K1|STK14A|p70 S6KA|p70(S6K)-alpha|p70-S6K|p70-alpha ribosomal protein S6 kinase B1 protein-coding 267.333-7 chr1 171472634 171472959 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -12734 NM_015172 23215 Hs.494614 NM_015172 ENSG00000117523 PRRC2C BAT2-iso|BAT2D1|BAT2L2|XTP2 proline rich coiled-coil 2C protein-coding 248.667-34 chr14 43291969 43292306 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 1215146 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 194.333-104 chr4 109511810 109512220 + 1 NA exon (NM_001318085, exon 9 of 24) exon (NM_001318085, exon 9 of 24) 23317 NR_030302 693161 NR_030302 ENSG00000207988 MIR576 MIRN576|hsa-mir-576 microRNA 576 ncRNA 167.333-54 chr11 32700493 32700733 + 1 NA intron (NM_001008391, intron 5 of 17) MIR3|SINE|MIR 94045 NM_001008391 493860 Hs.706808 NM_001008391 ENSG00000186714 CCDC73 NY-SAR-79 coiled-coil domain containing 73 protein-coding 233.333-71 chr2 192333508 192334030 + 1 NA Intergenic Intergenic -138836 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 112.333-227 chr6 53006961 53007152 + 1 NA intron (NM_014920, intron 12 of 13) L2c|LINE|L2 11436 NR_001445 125050 NR_001445 ENSG00000202198 RN7SK 7SK RNA component of 7SK nuclear ribonucleoprotein snRNA 200.333-9 chr10 45030897 45031189 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 30120 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 137.333-92 chr2 41137734 41137925 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -625394 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 192.333-142 chr5 160444016 160444351 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 22273 NM_001282383 9232 Hs.350966 NM_004219 ENSG00000164611 PTTG1 EAP1|HPTTG|PTTG|TUTR1 PTTG1 regulator of sister chromatid separation, securin protein-coding 303.333-83 chr8 136464158 136464507 + 1 NA Intergenic Intergenic -66466 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 123.333-6 chr1 66674047 66674203 + 1 NA intron (NM_001350218, intron 11 of 22) AluJr|SINE|Alu 45685 NR_036060 100422871 NR_036060 ENSG00000264720 MIR3117 mir-3117 microRNA 3117 ncRNA 149.333-221 chr21 31569322 31569555 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 10205 NM_001321023 150051 Hs.708976 NM_001321023 LOC150051 - uncharacterized LOC150051 protein-coding 173.333-9 chr1 86008926 86009178 + 1 NA intron (NR_146340, intron 20 of 60) L1MC4a|LINE|L1 147419 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 164.667-239 chr8 110590649 110590949 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 436634 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 159.667-101 chr14 70638906 70639136 + 1 NA intron (NR_110071, intron 1 of 2) L1ME4c|LINE|L1 2277 NR_110071 101928075 Hs.737532 NR_110071 ENSG00000245466 LOC101928075 - uncharacterized LOC101928075 ncRNA 151.667-370 chr8 97124374 97124528 + 1 NA intron (NM_016134, intron 7 of 7) L1ME1|LINE|L1 153477 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 149.333-428 chr9 35278760 35279034 + 1 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) L1ME4b|LINE|L1 -62999 NM_001371188 259.667-64 chr5 163063805 163064253 + 1 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -373542 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 149.667-90 chr12 32391511 32391747 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7929 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 144.667-4 chr1 60081672 60081860 + 1 NA Intergenic Intergenic -7996 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 155.333-273 chr4 124401689 124401868 + 1 NA Intergenic Intergenic 156656 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 152.667-28 chr1 242856818 242856983 + 1 NA Intergenic Intergenic 244844 NR_029401 731275 Hs.722350 NR_029401 ENSG00000214837 LINC01347 - long intergenic non-protein coding RNA 1347 ncRNA 172.667-173 chrX 42996606 42996859 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -180262 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 155.333-204 chr20 55475558 55475755 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -48459 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 188.333-164 chr9 27293786 27294012 + 1 NA intron (NM_020641, intron 3 of 7) intron (NM_020641, intron 3 of 7) 3240 NM_001161585 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 287.667-40 chr8 114530698 114531180 + 1 NA Intergenic Intergenic -1094000 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 169.667-140 chr3 182371505 182371796 + 1 NA Intergenic Intergenic 114712 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 151.667-196 chr21 31737835 31738119 + 1 NA Intergenic Intergenic -5859 NM_001145445 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 223.667 chr1 11137596 11137980 + 1 NA intron (NM_004958, intron 36 of 57) intron (NM_004958, intron 36 of 57) -6110 NR_046600 100873935 Hs.679133 NR_046600 ENSG00000225602 MTOR-AS1 - MTOR antisense RNA 1 ncRNA 137.667-162 chr6 57209277 57209517 + 1 NA intron (NM_001278667, intron 2 of 6) intron (NM_001278667, intron 2 of 6) 12064 NM_001278668 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 200.667-80 chr2 117348269 117348512 + 1 NA Intergenic Intergenic -466301 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 212.333-11 chr1 164473712 164474182 + 1 NA Intergenic Intergenic -85413 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 169.667-116 chr2 173370017 173370263 + 1 NA Intergenic Intergenic 15268 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 200.333-144 chr7 99244624 99244960 + 1 NA Intergenic Intergenic -28509 NR_002147 84176 Hs.621401 NR_002147 MYH16 MHC20|MYH16P|MYH5 myosin heavy chain 16 pseudogene pseudo 191.333-141 chr4 28699815 28700202 + 1 NA Intergenic Intergenic -119574 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 155.667-355 chr8 84788376 84788614 + 1 NA intron (NM_001354322, intron 3 of 6) intron (NM_001354322, intron 3 of 6) 82568 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 207.333-150 chr2 213086889 213087344 + 1 NA intron (NM_001371277, intron 3 of 6) intron (NM_001371277, intron 3 of 6) 63321 NM_001371275 156.333-39 chr10 61843599 61843808 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -57996 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 152.333-260 chr4 17315303 17315490 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 5486 NR_145770 109616994 NR_145770 ENSG00000206780 SNORA75B - small nucleolar RNA, H/ACA box 75B snoRNA 167.333-2 chr1 20424201 20424474 + 1 NA intron (NR_033887, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 4457 NR_033887 339505 Hs.633269 NR_033887 LINC01141 - long intergenic non-protein coding RNA 1141 ncRNA 201.333-81 chr13 43462301 43462685 + 1 NA intron (NM_001347968, intron 3 of 17) intron (NM_001347968, intron 3 of 17) 13641 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 113.667-52 chr13 85028650 85028803 + 1 NA Intergenic Intergenic 119331 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 161.333-108 chr16 80320327 80320528 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -220307 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 198.667-99 chr2 32123837 32124055 + 1 NA intron (NM_001363875, intron 6 of 15) L1MC2|LINE|L1 -41895 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 149.333-104 chr13 101593070 101593392 + 1 NA intron (NM_001271754, intron 5 of 10) L1MA6|LINE|L1 103279 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 255.333-121 chr9 76818061 76818359 + 1 NA intron (NM_001308048, intron 6 of 17) intron (NM_001308048, intron 6 of 17) 53774 NR_132313 50652 Hs.663766 NR_015342 ENSG00000225937 PCA3 DD3|NCRNA00019|PCAT3|PRUNE2-AS1 prostate cancer associated 3 ncRNA 482.667-3 chr8 126355977 126356832 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 30909 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 130.333-78 chr15 85628665 85628876 + 1 NA intron (NM_001270546, intron 1 of 28) intron (NM_001270546, intron 1 of 28) 8820 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 163.333-268 chr7 109377502 109377891 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -493109 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 150.667-122 chr14 68248043 68248311 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 380610 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 144.333-134 chr2 129443395 129443648 + 1 NA Intergenic Intergenic -169630 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 147.333-128 chr16 4756790 4756983 + 1 NA intron (NM_021646, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu 10276 NM_001303450 26048 Hs.513316 NM_021646 ENSG00000103199 ZNF500 ZKSCAN18|ZSCAN50 zinc finger protein 500 protein-coding 185.333-115 chr3 10963141 10963404 + 1 NA Intergenic Intergenic -29462 NM_001348250 6529 Hs.443874 NM_003042 ENSG00000157103 SLC6A1 GABATHG|GABATR|GAT1|MAE solute carrier family 6 member 1 protein-coding 239.667-21 chr14 69902410 69902685 + 1 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 23131 NM_001034852 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 153.333-230 chr2 230920610 230920882 + 1 NA intron (NM_005683, intron 1 of 1) intron (NM_005683, intron 1 of 1) 4496 NM_005683 9290 Hs.114545 NM_005683 ENSG00000135898 GPR55 LPIR1 G protein-coupled receptor 55 protein-coding 124.667-148 chr4 32676203 32676368 + 1 NA Intergenic Intergenic 325247 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 219.333-21 chr10 31481933 31482294 + 1 NA intron (NM_001323678, intron 2 of 6) L1MC4a|LINE|L1 -82358 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 152.667-361 chr8 48326555 48326825 + 1 NA Intergenic Intergenic -224877 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 254.333-45 chr2 163737209 163737664 + 1 NA Intergenic Intergenic -1428 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 388.333-4 chr1 155176937 155177491 + 1 NA exon (NM_001282378, exon 4 of 9) exon (NM_001282378, exon 4 of 9) 2460 NM_001256601 80128 Hs.287735 NM_025058 ENSG00000163462 TRIM46 GENEY|TRIFIC tripartite motif containing 46 protein-coding 163.667-92 chr18 13199741 13200015 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -18882 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 190.333-19 chr10 62738097 62738323 + 1 NA Intergenic Intergenic -66510 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 224.333-2 chr1 64706348 64706718 + 1 NA Intergenic Intergenic -38440 NM_001366165 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 166.667-102 chr19 45331548 45331834 + 1 NA Intergenic MER51E|LTR|ERV1 -8816 NM_001824 1158 Hs.334347 NM_001824 ENSG00000104879 CKM CKMM|CPK-M|M-CK creatine kinase, M-type protein-coding 154.333-100 chr14 103061631 103061801 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -4167 NM_006035 9578 Hs.654634 NM_006035 ENSG00000198752 CDC42BPB MRCKB CDC42 binding protein kinase beta protein-coding 256.667-8 chr11 24115544 24115963 + 1 NA Intergenic Intergenic -381300 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 150.333-20 chr1 168224394 168224619 + 1 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -1498 NM_199344 375035 Hs.645435 NM_199344 ENSG00000213064 SFT2D2 UNQ512|dJ747L4.C1.2 SFT2 domain containing 2 protein-coding 193.667-110 chr6 43000505 43000803 + 1 NA intron (NM_006245, intron 2 of 15) intron (NM_006245, intron 2 of 15) 13292 NM_014623 4201 Hs.278362 NM_014623 ENSG00000124733 MEA1 HYS|MEA male-enhanced antigen 1 protein-coding 155.667-388 chr9 96511462 96511624 + 1 NA intron (NM_033331, intron 12 of 13) AluSg7|SINE|Alu 55288 NM_001351569 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 150.667-114 chr14 29259513 29259723 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -473831 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 145.333-74 chr13 76442618 76442770 + 1 NA Intergenic Intergenic 443711 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 158.333-40 chr10 76772363 76772531 + 1 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -115597 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 154.667-319 chr5 122700994 122701210 + 1 NA intron (NR_109881, intron 6 of 11) intron (NR_109881, intron 6 of 11) 29458 NR_109881 101927379 Hs.536399 NR_109881 ENSG00000251538 LINC02201 - long intergenic non-protein coding RNA 2201 ncRNA 170.333-38 chr10 105605094 105605385 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 215094 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 227.667-45 chr3 9511109 9511395 + 1 NA intron (NM_198560, intron 2 of 3) AluY|SINE|Alu 42570 NM_198560 375323 Hs.56782 NM_198560 ENSG00000156959 LHFPL4 GARLH4 LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein-coding 194.333-138 chr7 29463838 29464195 + 1 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) intron (NM_001293072, intron 6 of 12) -15696 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 118.333-87 chr18 5575032 5575181 + 1 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) intron (NM_001281535, intron 3 of 21) -30767 NM_001330557 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 152.667-260 chr3 183034575 183034770 + 1 NA intron (NR_120640, intron 12 of 18) intron (NR_120640, intron 12 of 18) -48754 NM_001308101 54165 Hs.592789 NM_020640 ENSG00000043093 DCUN1D1 DCNL1|DCUN1L1|RP42|SCCRO|SCRO|Tes3 defective in cullin neddylation 1 domain containing 1 protein-coding 195.333-68 chr13 44099730 44100202 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10583 NR_104065 101929212 Hs.534877 NR_104064 ENSG00000227258 SMIM2-AS1 C13orf44-AS1|C3orf81-AS1 SMIM2 antisense RNA 1 ncRNA 278.333-12 chr10 35941362 35941909 + 1 NA Intergenic Intergenic 163333 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 114.667-19 chr1 218603353 218603527 + 1 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) intron (NR_031644, intron 3 of 6) 93345 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 150.333-434 chr9 36607177 36607470 + 1 NA intron (NR_046337, intron 7 of 17) MIR3|SINE|MIR 34428 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 218.333-31 chr12 65232947 65233219 + 1 NA intron (NM_014319, intron 4 of 12) MIR|SINE|MIR -45600 NM_198080 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 137.333-51 chr14 85051425 85051682 + 1 NA Intergenic Intergenic -220379 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 191.667-99 chr4 163116524 163116735 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -23001 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 128.333-123 chr22 46482533 46482694 + 1 NA intron (NM_014246, intron 1 of 34) AluSz6|SINE|Alu 55007 NM_014246 9620 Hs.252387 NM_014246 ENSG00000075275 CELSR1 ADGRC1|CDHF9|FMI2|HFMI2|ME2 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 protein-coding 223.333-120 chr4 137608481 137608752 + 1 NA Intergenic Intergenic 62885 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 249.333-39 chr16 11505547 11505960 + 1 NA intron (NM_001370704, intron 8 of 66) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 21494 NM_001370704 400499 Hs.459937 NM_001370704 ENSG00000188897 LOC400499 - putative uncharacterized protein LOC400499 protein-coding 178.667-49 chr14 60866196 60866523 + 1 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) intron (NM_002431, intron 6 of 7) 114720 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 434.334-5 chr7 65002830 65003514 + 1 NA TTS (NR_145414) TTS (NR_145414) 3515 NM_001007253 2086 Hs.250693 NM_001007253 ENSG00000213462 ERV3-1 ERV-R|ERV3|ERVR|HERV-R|HERVR|envR endogenous retrovirus group 3 member 1, envelope protein-coding 136.667-73 chr16 56055342 56055576 + 1 NA Intergenic Intergenic -99428 NM_001190158 221223 Hs.350800 NM_145024 ENSG00000159398 CES5A CAUXIN|CES4C1|CES5|CES7|HEL126 carboxylesterase 5A protein-coding 150.333-313 chr4 141705478 141705762 + 1 NA intron (NM_172175, intron 3 of 9) L1MA6|LINE|L1 69037 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 210.333-75 chr2 66253009 66253355 + 1 NA Intergenic Intergenic 105146 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 151.333-228 chr2 181185398 181185603 + 1 NA intron (NR_130784, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 61663 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 128.667-170 chr7 108450314 108450533 + 1 NA intron (NM_001371132, intron 1 of 30) intron (NM_001371132, intron 1 of 30) 5974 NM_001193584 4897 Hs.21422 NM_005010 ENSG00000091129 NRCAM - neuronal cell adhesion molecule protein-coding 177.333-174 chr8 126875002 126875262 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -138022 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 133.333-150 chr5 110913188 110913350 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -156811 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 190.333-117 chr5 56875722 56875990 + 1 NA intron (NM_005921, intron 10 of 19) intron (NM_005921, intron 10 of 19) -33404 NR_136556 133383 Hs.85950 NM_153706 ENSG00000155542 SETD9 C5orf35 SET domain containing 9 protein-coding 117.667-10 chr1 194499428 194499579 + 1 NA Intergenic Intergenic 1194758 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 153.333-275 chr3 121721520 121721797 + 1 NA intron (NM_001256486, intron 6 of 21) intron (NM_001256486, intron 6 of 21) 28083 NM_004487 2804 Hs.213389 NM_004487 ENSG00000173230 GOLGB1 GCP|GCP372|GOLIM1 golgin B1 protein-coding 181.667-33 chr13 76855291 76855635 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 30942 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 208.333-62 chr18 59815197 59815524 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -84636 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 257.667-68 chr6 15121767 15122091 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -124140 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 148.667-104 chr13 64379436 64379599 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -303506 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 246.333-50 chr2 123369703 123370283 + 1 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -296512 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 169.333-215 chr5 156824166 156824411 + 1 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -26007 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 152.333-160 chr18 23745749 23745931 + 1 NA intron (NM_001127717, intron 2 of 73) intron (NM_001127717, intron 2 of 73) 56387 NM_198129 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 237.667-4 chr1 200317183 200317478 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 56462 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 148.333-203 chr2 171717665 171717849 + 1 NA intron (NM_001271787, intron 5 of 15) intron (NM_001271787, intron 5 of 15) 30002 NM_001320884 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 175.667-155 chrX 87698910 87699221 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 181263 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 220.667-32 chr15 72324472 72324836 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -4497 NM_052840 60677 Hs.348342 NM_052840 ENSG00000140488 CELF6 BRUNOL6 CUGBP Elav-like family member 6 protein-coding 168.667-16 chr10 21813793 21814033 + 1 NA intron (NM_022365, intron 8 of 11) LTR40b|LTR|ERVL 189817 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 152.333-225 chr3 17363302 17363592 + 1 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 336573 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 146.667-352 chr9 32076499 32076691 + 1 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -308008 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 158.333-235 chr4 95449062 95449306 + 1 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 99789 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 171.333-166 chr6 72943161 72943451 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 24447 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 250.667-64 chr5 81648391 81648842 + 1 NA intron (NM_012446, intron 2 of 16) intron (NM_012446, intron 2 of 16) 102637 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 227.333-71 chr20 5773422 5773682 + 1 NA TTS (NM_001303479) TTS (NM_001303479) 23151 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 150.667-331 chr6 65417393 65417550 + 1 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) intron (NM_198283, intron 4 of 9) 116053 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 177.333-119 chr4 22457380 22457701 + 1 NA intron (NM_145290, intron 3 of 18) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger -57772 NR_162129 113219450 NR_162129 MIR12115 - microRNA 12115 ncRNA 134.667-84 chr17 75059136 75059340 + 1 NA intron (NM_015353, intron 3 of 5) intron (NM_015353, intron 3 of 5) 12013 NM_015353 23510 Hs.514468 NM_015353 ENSG00000180901 KCTD2 - potassium channel tetramerization domain containing 2 protein-coding 138.333-105 chr2 208336711 208336867 + 1 NA intron (NM_015040, intron 27 of 41) intron (NM_015040, intron 27 of 41) -22903 NM_001309516 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 120.333-193 chr8 118936159 118936374 + 1 NA intron (NM_002546, intron 1 of 4) intron (NM_002546, intron 1 of 4) 15619 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 177.667-61 chr17 8173397 8173708 + 1 NA promoter-TSS (NR_033294) promoter-TSS (NR_033294) 36 NR_033294 727676 NR_033294 ENSG00000200463 SNORD118 LCC|U8 small nucleolar RNA, C/D box 118 snoRNA 149.667-366 chr7 29030354 29030605 + 1 NA intron (NM_001371256, intron 16 of 16) intron (NM_001371256, intron 16 of 16) 50512 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 156.667-336 chr8 88570297 88570556 + 1 NA Intergenic Intergenic -242943 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 111.667-21 chr1 223404603 223404837 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 11305 NM_152610 164127 Hs.192090 NM_152610 ENSG00000178395 CCDC185 C1orf65 coiled-coil domain containing 185 protein-coding 129.667-136 chr5 12478083 12478305 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -96663 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 247.667-38 chr16 9173844 9174131 + 1 NA Intergenic Intergenic 82343 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 164.667-63 chr13 86963147 86963363 + 1 NA Intergenic Intergenic 51335 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 117.667-19 chr10 80574443 80574612 + 1 NA intron (NM_207372, intron 3 of 6) intron (NM_207372, intron 3 of 6) 33708 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 298.333-3 chr1 118389499 118389901 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -204472 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 355.667-11 chr5 110428348 110428975 + 1 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) MER67D|LTR|ERV1 85254 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 271.333-30 chr2 99060512 99060866 + 1 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) L1M5|LINE|L1 80491 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 223.667-55 chr4 53936172 53936494 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 50949 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 159.667-195 chr20 55002005 55002285 + 1 NA Intergenic Intergenic -420898 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 326.667-23 chr2 140270798 140271235 + 1 NA intron (NM_018557, intron 85 of 90) intron (NM_018557, intron 85 of 90) 315669 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 238.333-61 chr3 88201649 88202057 + 1 NA Intergenic Intergenic 51894 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 234.667-99 chr6 125310879 125311210 + 1 NA Intergenic Intergenic -9077 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 148.333-303 chr5 24792876 24793133 + 1 NA Intergenic Intergenic 47579 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 225.667-59 chr5 16096718 16097162 + 1 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) intron (NM_001102562, intron 2 of 3) 82851 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 176.333-4 chr1 43831841 43832158 + 1 NA intron (NM_001363573, intron 5 of 10) intron (NM_001363573, intron 5 of 10) -6623 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 157.333-227 chr3 72841676 72841917 + 1 NA intron (NM_018130, intron 3 of 10) MER1B|DNA|hAT-Charlie 6649 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 199.333-252 chr7 5579747 5580104 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12891 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 203.333-132 chr2 70563598 70563937 + 1 NA Intergenic L1M6B|LINE|L1 -9941 NM_001099691 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 162.667-98 chr16 83439565 83439832 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) MER90|LTR|ERV1 -68648 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 198.667-89 chr18 13731261 13731688 + 1 NA intron (NM_003799, intron 2 of 11) intron (NM_003799, intron 2 of 11) 4801 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 133.333-178 chr8 58033381 58033540 + 1 NA intron (NM_147189, intron 2 of 4) L1PA16|LINE|L1 38937 NM_147189 90362 Hs.154652 NM_147189 ENSG00000169122 FAM110B C8orf72 family with sequence similarity 110 member B protein-coding 179.667-10 chr1 188713700 188713904 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 1270174 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 268.667-18 chr15 58498738 58499162 + 1 NA promoter-TSS (NR_120338) promoter-TSS (NR_120338) -215 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 180.333-92 chr4 74728974 74729210 + 1 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 65431 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 308.667-22 chr20 17013590 17014172 + 1 NA Intergenic Intergenic -212226 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 138.333-177 chr7 5624469 5624720 + 1 NA intron (NM_207111, intron 15 of 16) intron (NM_207111, intron 15 of 16) 31778 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 230.667-33 chr19 7409171 7409609 + 1 NA intron (NM_015318, intron 1 of 20) intron (NM_015318, intron 1 of 20) 14245 NM_015318 23370 Hs.465761 NM_015318 ENSG00000104880 ARHGEF18 P114-RhoGEF|RP78|SA-RhoGEF|p114RhoGEF Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18 protein-coding 189.667-108 chr4 74150979 74151323 + 1 NA intron (NM_001351311, intron 2 of 7) intron (NM_001351311, intron 2 of 7) -6957 NM_001144978 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 162.667-38 chr10 119746439 119746642 + 1 NA intron (NM_014937, intron 1 of 19) intron (NM_014937, intron 1 of 19) 20490 NM_014937 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 158.333-166 chr2 172812161 172812466 + 1 NA intron (NM_007023, intron 3 of 30) intron (NM_007023, intron 3 of 30) -9274 NM_001100397 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 200.333-141 chr7 44425471 44425900 + 1 NA intron (NM_015332, intron 3 of 5) AluJr|SINE|Alu 64973 NM_015332 23386 Hs.488171 NM_015332 ENSG00000015676 NUDCD3 NudCL NudC domain containing 3 protein-coding 150.333-190 chr2 41059198 41059365 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -546846 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 172.667-169 chr9 87420803 87420985 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -76334 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 123.667-64 chr15 65105258 65105432 + 1 NA intron (NM_001163692, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 1014 NM_001163692 390595 Hs.659256 NM_001163692 ENSG00000246922 UBAP1L UBAP-1L ubiquitin associated protein 1 like protein-coding 221.333-130 chr7 8764542 8764794 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 331059 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 172.667-116 chr4 106282485 106282669 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 3 of 26) L1MA3|LINE|L1 -33033 NM_001142415 9255 Hs.591680 NM_004757 ENSG00000164022 AIMP1 EMAP2|EMAPII|HLD3|SCYE1|p43 aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 protein-coding 155.333-104 chr14 53225575 53225822 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 72344 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 131.333-47 chr12 116358342 116358535 + 1 NA Intergenic Intergenic 69880 NR_039683 100616309 NR_039683 ENSG00000264037 MIR4472-2 - microRNA 4472-2 ncRNA 240.333-72 chr5 42184048 42184503 + 1 NA Intergenic Intergenic -8930 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 150.667-49 chr10 97739844 97739997 + 1 NA intron (NM_001174122, intron 2 of 8) L1MC5a|LINE|L1 1443 NM_001002261 118813 Hs.744075 NM_144588 ENSG00000155256 ZFYVE27 PROTRUDIN|SPG33 zinc finger FYVE-type containing 27 protein-coding 210.667-81 chr22 35272479 35272901 + 1 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) AluSg|SINE|Alu 15197 NM_001003681 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 145.333-142 chr2 134358470 134358632 + 1 NA intron (NM_001371457, intron 10 of 16) intron (NM_001371457, intron 10 of 16) 104479 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 159.667-113 chr15 80396601 80396908 + 1 NA Intergenic Intergenic -7628 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 155.333-267 chr4 90161173 90161481 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 33794 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 136.667-7 chr1 97441775 97442020 + 1 NA intron (NM_000110, intron 14 of 22) L1ME1|LINE|L1 345974 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 143.667-126 chr2 35405042 35405208 + 1 NA Intergenic Intergenic -66280 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 138.333-126 chr3 187136805 187136983 + 1 NA intron (NM_052969, intron 1 of 2) MER33|DNA|hAT-Charlie 2602 NM_052969 116832 Hs.647900 NM_052969 ENSG00000163923 RPL39L L39-2|RPL39L1 ribosomal protein L39 like protein-coding 135.667-105 chr20 52346865 52347054 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -154974 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 123.667-133 chr4 33776776 33776928 + 1 NA Intergenic Intergenic 263041 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 168.333-29 chr10 109320332 109320534 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 602813 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 163.667-166 chr4 5108924 5109141 + 1 NA intron (NM_001306082, intron 1 of 12) intron (NM_001306082, intron 1 of 12) 57552 NM_001306082 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 206.333-96 chr2 226010338 226010699 + 1 NA Intergenic Intergenic -132276 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 254.667-59 chr4 45380074 45380554 + 1 NA Intergenic Intergenic -653680 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 134.667-103 chr2 127220584 127220747 + 1 NA promoter-TSS (NM_001367502) promoter-TSS (NM_001367502) -366 NM_001367501 339761 Hs.407639 NM_001001665 ENSG00000186684 CYP27C1 - cytochrome P450 family 27 subfamily C member 1 protein-coding 142.333-127 chr2 147588815 147588999 + 1 NA Intergenic Intergenic -255610 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 130.333-201 chr7 159283860 159284023 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -138984 NR_130758 7434 Hs.585052 NM_003382 ENSG00000106018 VIPR2 C16DUPq36.3|DUP7q36.3|PACAP-R-3|PACAP-R3|VIP-R-2|VPAC2|VPAC2R|VPCAP2R vasoactive intestinal peptide receptor 2 protein-coding 157.667-259 chr5 106484412 106484583 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 526517 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 191.333-124 chr21 24571055 24571387 + 1 NA Intergenic Intergenic 142481 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 156.333-49 chr10 116894530 116894823 + 1 NA intron (NM_018330, intron 14 of 14) intron (NM_018330, intron 14 of 14) -44954 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 181.667-59 chr18 69678892 69679170 + 1 NA intron (NM_152721, intron 4 of 7) AluJb|SINE|Alu 209100 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 307.667-18 chr17 45193946 45194263 + 1 NA intron (NR_147507, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu -22619 NR_135646 105371795 Hs.569733 NR_135646 ENSG00000267288 LOC105371795 - uncharacterized LOC105371795 ncRNA 153.333-68 chr11 63134911 63135207 + 1 NA intron (NM_173586, intron 1 of 3) intron (NM_173586, intron 1 of 3) 9162 NM_173586 283238 Hs.375139 NM_173586 ENSG00000197658 SLC22A24 NET46 solute carrier family 22 member 24 protein-coding 261.333-74 chr4 44116175 44116624 + 1 NA Intergenic Intergenic 99337 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 182.667-74 chr2 37241232 37241506 + 1 NA intron (NR_146408, intron 4 of 10) intron (NR_146408, intron 4 of 10) 9711 NM_001350027 55471 Hs.433466 NM_018607 ENSG00000003509 NDUFAF7 C2orf56|MidA|PRO1853 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 7 protein-coding 186.667-134 chr7 21821426 21821733 + 1 NA intron (NM_001277115, intron 65 of 81) L1MA4|LINE|L1 124320 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 153.333-99 chr12 82988374 82988650 + 1 NA intron (NM_152588, intron 8 of 11) HAL1|LINE|L1 301357 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 375.333-22 chr5 2698099 2698518 + 1 NA Intergenic Intergenic -14283 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 151.333-311 chr4 90392730 90392901 + 1 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) intron (NM_207491, intron 3 of 7) 157784 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 326.333-23 chr5 39308773 39309105 + 1 NA intron (NM_001737, intron 7 of 10) intron (NM_001737, intron 7 of 10) -38290 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 201.333-38 chr10 84070116 84070376 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -69263 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 127.667-87 chr2 121544511 121544785 + 1 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) HAL1|LINE|L1 13768 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 158.667-155 chr2 60775086 60775308 + 1 NA intron (NM_022894, intron 8 of 21) intron (NM_022894, intron 8 of 21) 18929 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 170.333-114 chr2 141149332 141149626 + 1 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -562794 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 208.667-74 chr2 135760336 135760673 + 1 NA intron (NM_014607, intron 5 of 12) L3|LINE|CR1 -17860 NR_163478 107985946 Hs.591242 NM_001365239 LOC107985946 - uncharacterized LOC107985946 ncRNA 129.667-132 chr4 168895639 168895832 + 1 NA intron (NM_001367567, intron 3 of 11) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 63640 NM_001367570 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 181.333-153 chr6 74202411 74202680 + 1 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) L1MA5|LINE|L1 133094 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 336.667-17 chr4 55002323 55002764 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 123052 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 143.333-232 chr5 121501658 121501858 + 1 NA Intergenic Intergenic 179208 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 286.333-36 chr5 119094665 119095144 + 1 NA intron (NM_001290321, intron 1 of 43) AluJb|SINE|Alu 23817 NM_001290322 1657 Hs.181042 NM_005509 ENSG00000172869 DMXL1 - Dmx like 1 protein-coding 192.667-114 chr3 169845005 169845279 + 1 NA intron (NM_001277127, intron 8 of 8) L1MD|LINE|L1 23251 NM_001080460 344657 Hs.319484 NM_001080460 ENSG00000188306 LRRIQ4 LRRC64 leucine rich repeats and IQ motif containing 4 protein-coding 150.667-3 chr1 14012684 14012930 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 263392 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 151.667-248 chr4 41441590 41441799 + 1 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) 80887 NM_001330787 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 255.333-7 chr10 49455386 49455671 + 1 NA 3' UTR (NM_000124, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_000124, exon 21 of 21) -59439 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 170.333-180 chr5 178564938 178565258 + 1 NA intron (NM_173465, intron 1 of 28) L1ME4c|LINE|L1 25295 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 149.333-132 chr16 59167042 59167294 + 1 NA Intergenic Intergenic -432852 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 157.333-236 chr3 98352768 98353065 + 1 NA promoter-TSS (NM_001005517) promoter-TSS (NM_001005517) -938 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 133.667-52 chr14 70157750 70157962 + 1 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -29252 NR_135825 646548 NR_135825 LOC646548 - ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene pseudo 140.333-206 chr6 120884520 120884678 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 449881 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 271.667-42 chr2 156960996 156961390 + 1 NA Intergenic Intergenic -296512 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 266.333-65 chrX 39256275 39256709 + 1 NA Intergenic Intergenic 70870 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 158.333-202 chr3 56923285 56923548 + 1 NA intron (NM_001128615, intron 3 of 12) intron (NM_001128615, intron 3 of 12) -6980 NM_001289698 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 253.667-67 chr7 5537112 5537409 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -6659 NM_001101 60 Hs.520640 NM_001101 ENSG00000075624 ACTB BRWS1|PS1TP5BP1 actin beta protein-coding 148.667-195 chr2 102816483 102816634 + 1 NA 3' UTR (NM_144632, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_144632, exon 5 of 5) 54527 NM_144632 130827 Hs.436203 NM_144632 ENSG00000170417 TMEM182 - transmembrane protein 182 protein-coding 163.667-49 chr12 125437072 125437250 + 1 NA intron (NM_052907, intron 3 of 8) intron (NM_052907, intron 3 of 8) 110545 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 235.333-81 chr3 193266798 193267181 + 1 NA intron (NM_020386, intron 3 of 3) intron (NM_020386, intron 3 of 3) 25210 NR_026877 84789 Hs.676481 NM_032703 MGC2889 - uncharacterized protein MGC2889 ncRNA 201.667-71 chr22 46400796 46401025 + 1 NA intron (NM_014246, intron 9 of 34) AluSz6|SINE|Alu 65196 NM_001282783 55687 Hs.439524 NM_018006 ENSG00000100416 TRMU LCAL3|MTO2|MTU1|TRMT|TRMT1 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase protein-coding 312.667-2 chr1 78036889 78037447 + 1 NA Intergenic Intergenic -7802 NM_001304725 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 139.667-170 chr7 27493006 27493187 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -122878 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 272.333-22 chr15 91393606 91394075 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -69499 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 204.667-115 chr5 12418698 12419037 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -155990 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 241.667-98 chr9 85199649 85200033 + 1 NA Intergenic Intergenic 493940 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 163.667-66 chr15 58006884 58007179 + 1 NA intron (NM_170696, intron 4 of 11) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 6992 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 206.667-59 chr2 49541187 49541503 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -386818 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 242.333-81 chr4 136384687 136384982 + 1 NA Intergenic Intergenic -471154 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 163.333-220 chr5 59528542 59528800 + 1 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) L3|LINE|CR1 57827 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 158.667-213 chr3 87994448 87994642 + 1 NA TTS (NM_001322208) TTS (NM_001322208) 11969 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 204.667-11 chr1 187335564 187336028 + 1 NA intron (NR_126347, intron 3 of 3) L1MC3|LINE|L1 -107832 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 123.667-112 chr22 27794553 27794797 + 1 NA intron (NM_002430, intron 1 of 1) intron (NM_002430, intron 1 of 1) 7081 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 158.667-149 chr2 21270713 21270936 + 1 NA Intergenic Intergenic 146838 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 240.333-38 chr14 78603650 78604058 + 1 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 200135 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 195.333-54 chr12 1128059 1128386 + 1 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) L1MEd|LINE|L1 100474 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 165.333-110 chr17 82540662 82540890 + 1 NA intron (NM_004514, intron 1 of 8) intron (NM_004514, intron 1 of 8) 21044 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 169.333-37 chr11 60699317 60699520 + 1 NA promoter-TSS (NM_031457) promoter-TSS (NM_031457) -194 NM_031457 83661 Hs.150878 NM_031457 ENSG00000166959 MS4A8 4SPAN4|CD20L5|MS4A4|MS4A8B membrane spanning 4-domains A8 protein-coding 229.667-53 chr22 43041203 43041601 + 1 NA intron (NR_125362, intron 2 of 2) intron (NR_125362, intron 2 of 2) 2817 NR_125362 100506679 Hs.706553 NR_125362 ENSG00000230319 LOC100506679 - uncharacterized LOC100506679 ncRNA 192.333-81 chr19 28797257 28797484 + 1 NA Intergenic Intergenic -69676 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 147.333-332 chr9 78250592 78250749 + 1 NA intron (NM_001330693, intron 8 of 15) AluSx|SINE|Alu 14595 NM_001349839 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 264.333-74 chr7 119297195 119297514 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 610021 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 150.667-352 chr7 46725957 46726159 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -28936 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 206.667-49 chr17 32702464 32702925 + 1 NA intron (NM_015194, intron 16 of 21) intron (NM_015194, intron 16 of 21) 174430 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 233.333-10 chr1 191044523 191044834 + 1 NA Intergenic Intergenic 183820 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 161.333-97 chr15 26323080 26323372 + 1 NA Intergenic Intergenic 207413 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 128.333-207 chrX 8301060 8301224 + 1 NA Intergenic MER106B|DNA|hAT-Charlie -129875 NM_016378 51480 Hs.279737 NM_016378 ENSG00000177504 VCX2 VCX-2r|VCX2R|VCXB variable charge X-linked 2 protein-coding 177.333-112 chr3 147567598 147567912 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 146428 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 220.667-109 chr8 130787889 130788279 + 1 NA intron (NM_001115, intron 15 of 17) intron (NM_001115, intron 15 of 17) 252825 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 162.667-152 chr2 237416632 237416805 + 1 NA Intergenic Intergenic -2511 NM_004369 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 216.333-118 chr5 168518869 168519197 + 1 NA intron (NM_002887, intron 14 of 14) intron (NM_002887, intron 14 of 14) -10272 NM_001355274 345630 Hs.166262 NM_001355274 ENSG00000188573 FBLL1 - fibrillarin like 1 protein-coding 146.667-353 chr9 37406202 37406499 + 1 NA Intergenic LTR24C|LTR|ERV1 -16346 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 165.333-129 chr2 86686457 86686667 + 1 NA intron (NM_001198954, intron 2 of 7) Charlie6|DNA|hAT-Charlie -33729 NM_022780 64795 Hs.75277 NM_022780 ENSG00000153561 RMND5A CTLH|GID2|GID2A|RMD5|p44CTLH required for meiotic nuclear division 5 homolog A protein-coding 157.667-43 chr10 123040502 123040737 + 1 NA exon (NM_001330174, exon 3 of 10) exon (NM_001330174, exon 3 of 10) 31613 NM_001330174 36 Hs.81934 NM_001609 ENSG00000196177 ACADSB 2-MEBCAD|ACAD7|SBCAD acyl-CoA dehydrogenase short/branched chain protein-coding 146.333-43 chr11 5998657 5998890 + 1 NA Intergenic Intergenic 4419 NM_001005179 120793 Hs.553571 NM_001005179 ENSG00000183389 OR56A4 OR11-49 olfactory receptor family 56 subfamily A member 4 protein-coding 342.333-25 chr5 136178147 136178541 + 1 NA 3' UTR (NM_005903, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_005903, exon 8 of 8) 14818 NM_001350994 389332 Hs.127680 NM_001350994 ENSG00000271824 SMIM32 - small integral membrane protein 32 protein-coding 143.667-75 chr14 67376100 67376328 + 1 NA intron (NM_004094, intron 3 of 7) MIRc|SINE|MIR 15886 NM_004094 1965 Hs.151777 NM_004094 ENSG00000134001 EIF2S1 EIF-2|EIF-2A|EIF-2alpha|EIF2|EIF2A eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha protein-coding 173.667-16 chr10 43231833 43232157 + 1 NA intron (NM_145313, intron 1 of 12) intron (NM_145313, intron 1 of 12) -2256 NM_001282862 221002 Hs.125293 NM_145313 ENSG00000198915 RASGEF1A CG4853 RasGEF domain family member 1A protein-coding 221.667-14 chr11 76589931 76590219 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 79863 NM_001370188 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 268.667-4 chr10 23903512 23903847 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) MER39|LTR|ERV1 208952 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 164.667-199 chr6 43141074 43141370 + 1 NA intron (NM_152882, intron 10 of 18) L1ME4c|LINE|L1 -30047 NM_003131 6722 Hs.520140 NM_003131 ENSG00000112658 SRF MCM1 serum response factor protein-coding 157.667-317 chr8 26884965 26885136 + 1 NA Intergenic Intergenic -17772 NM_000680 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 195.667-147 chr8 113711976 113712238 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -275168 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 169.667-24 chr10 102284850 102285087 + 1 NA intron (NM_001199378, intron 3 of 39) intron (NM_001199378, intron 3 of 39) 39436 NM_001199378 8729 Hs.290243 NM_004193 ENSG00000107862 GBF1 ARF1GEF golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 161.667-43 chr11 92333320 92333594 + 1 NA intron (NM_001367949, intron 1 of 27) intron (NM_001367949, intron 1 of 27) -18639 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 168.333-219 chr9 10455795 10456197 + 1 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) intron (NM_002839, intron 2 of 45) 157006 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 268.333-25 chr16 70158350 70158857 + 1 NA 3' UTR (NM_017990, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_017990, exon 19 of 19) 14845 NR_126007 400541 Hs.461183 NR_126007 ENSG00000247228 LOC400541 - uncharacterized LOC400541 ncRNA 207.667-104 chr6 53042391 53042735 + 1 NA intron (NM_014920, intron 1 of 13) intron (NM_014920, intron 1 of 13) 19239 NM_016513 22858 Hs.417022 NM_014920 ENSG00000112144 ICK ECO|EJM10|LCK2|MRK intestinal cell kinase protein-coding 293.667-55 chr8 4076090 4076498 + 1 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 918620 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 244.333-5 chr1 109999336 109999649 + 1 NA intron (NM_001242673, intron 1 of 16) L1MA9|LINE|L1 -1435 NM_001242674 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 163.667-262 chr9 26952488 26952770 + 1 NA intron (NM_001099222, intron 1 of 19) L1ME4b|LINE|L1 3678 NR_121605 101929602 Hs.127665 NR_121605 ENSG00000234676 IFT74-AS1 - IFT74 antisense RNA 1 ncRNA 236.333-18 chr11 44140962 44141241 + 1 NA intron (NM_207122, intron 7 of 13) MER2|DNA|TcMar-Tigger 44904 NM_000401 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 173.333-103 chr2 221019581 221019968 + 1 NA Intergenic Intergenic 552530 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 209.333-40 chr11 112105977 112106440 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 19335 NM_001276504 6392 Hs.356270 NM_003002 ENSG00000204370 SDHD CBT1|CII-4|CWS3|PGL|PGL1|QPs3|SDH4|cybS succinate dehydrogenase complex subunit D protein-coding 237.667-65 chr5 11900295 11900787 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) (TATTTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3905 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 175.667-69 chr2 35272268 35272505 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -199019 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 209.667-48 chr15 69017470 69017767 + 1 NA intron (NM_024505, intron 1 of 15) MER4B|LTR|ERV1 2923 NM_024505 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 154.667-381 chr8 75900251 75900509 + 1 NA Intergenic Intergenic 360412 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 188.667-142 chr7 100774416 100774782 + 1 NA intron (NR_111919, intron 31 of 46) AluJo|SINE|Alu 41004 NR_111919 7455 Hs.307004 NM_003386 ENSG00000146839 ZAN - zonadhesin (gene/pseudogene) protein-coding 254.333-81 chr7 97292010 97292450 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 175637 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 129.667-17 chr1 246392089 246392253 + 1 NA intron (NM_001167740, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 25241 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 274.333-73 chr8 141840304 141840748 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -54213 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 365.667-13 chr5 44419004 44419531 + 1 NA Intergenic Intergenic -29847 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 194.667-126 chr5 126995275 126995664 + 1 NA intron (NM_178450, intron 1 of 4) intron (NM_178450, intron 1 of 4) 35089 NM_178450 115123 Hs.132441 NM_178450 ENSG00000173926 MARCH3 MARCH-III|RNF173 membrane associated ring-CH-type finger 3 protein-coding 142.333-171 chr4 39096904 39097093 + 1 NA intron (NM_199039, intron 5 of 9) L1MC4|LINE|L1 34766 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 210.667-56 chr16 83754173 83754569 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 10 of 12) L1ME3A|LINE|L1 49605 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 179.333-179 chr7 100847257 100847547 + 1 NA intron (NR_146550, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 5212 NR_146550 105375430 Hs.638778 NR_146550 ENSG00000236305 SLC12A9-AS1 - SLC12A9 antisense RNA 1 ncRNA 127.667-33 chr11 129241826 129241968 + 1 NA intron (NR_145484, intron 1 of 1) HAL1|LINE|L1 41267 NR_145484 399975 NM_207431 LOC399975 - uncharacterized LOC399975 ncRNA 138.333-86 chr2 29119189 29119358 + 1 NA intron (NM_024692, intron 1 of 15) intron (NM_024692, intron 1 of 15) 3858 NM_001287527 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 179.667-113 chr5 56785567 56785762 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -12793 NM_001365184 105378979 NM_001365184 LOC105378979 - growth/differentiation factor 3 protein-coding 144.667-231 chr5 22108681 22108872 + 1 NA intron (NM_004061, intron 4 of 14) intron (NM_004061, intron 4 of 14) -33576 NR_003921 5369 Hs.247975 NM_031887 ENSG00000168967 PMCHL1 - pro-melanin concentrating hormone like 1 (pseudogene) pseudo 173.333 chr1 9344269 9344673 + 1 NA intron (NM_025106, intron 1 of 2) intron (NM_025106, intron 1 of 2) 51577 NM_025106 80176 Hs.8261 NM_025106 ENSG00000171621 SPSB1 SSB-1|SSB1 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1 protein-coding 145.667-25 chr1 233292242 233292427 + 1 NA intron (NM_014801, intron 1 of 33) AluSz|SINE|Alu 3391 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 154.333-276 chr5 126955990 126956175 + 1 NA intron (NM_178450, intron 1 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 74476 NM_178450 115123 Hs.132441 NM_178450 ENSG00000173926 MARCH3 MARCH-III|RNF173 membrane associated ring-CH-type finger 3 protein-coding 241.333-23 chr10 92932513 92932791 + 1 NA intron (NM_001319200, intron 8 of 17) L1MEd|LINE|L1 84132 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 150.333-342 chr5 130268748 130269003 + 1 NA Intergenic Intergenic 364410 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 146.333-74 chr13 40148134 40148395 + 1 NA Intergenic Intergenic -33545 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 124.667-131 chr22 44876300 44876460 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 123822 NM_001198726 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 218.333-5 chr1 116284275 116284555 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -88829 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 206.333-158 chr8 41387728 41388064 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -38759 NR_145746 109616980 NR_145746 ENSG00000238936 SNORD65B - small nucleolar RNA, C/D box 65B snoRNA 224.333-132 chr9 95246427 95246857 + 1 NA intron (NM_001243744, intron 3 of 13) intron (NM_001243744, intron 3 of 13) 70612 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 157.333-289 chr5 112452195 112452411 + 1 NA Intergenic Intergenic 32720 NR_027706 54508 Hs.591264 NR_027706 ENSG00000278921 EPB41L4A-DT EPB41L4A-AS2 EPB41L4A divergent transcript ncRNA 304.667-11 chr14 56751465 56751989 + 1 NA Intergenic Intergenic 53940 NM_172337 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 244.667-54 chr2 18419416 18419897 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 140997 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 136.333-112 chr20 25689359 25689641 + 1 NA intron (NM_015655, intron 1 of 4) L1ME1|LINE|L1 -2561 NM_001290261 26152 Hs.61881 NM_015655 ENSG00000130684 ZNF337 - zinc finger protein 337 protein-coding 223.667-2 chr1 42214857 42215162 + 1 NA intron (NM_001198850, intron 5 of 12) L1MEf|LINE|L1 -50264 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 166.333-206 chr6 154985954 154986189 + 1 NA Intergenic Intergenic -104218 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 233.667 chr1 89902325 89902693 + 1 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 80570 NM_018103 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 169.667-215 chr8 137775558 137775826 + 1 NA Intergenic Intergenic 307853 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 143.333-175 chr3 18818838 18819042 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -329570 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 172.667-56 chr14 58596920 58597151 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -37033 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 166.667-139 chr22 21082627 21082800 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -20303 NR_037566 400892 Hs.745077 NM_207474 BCRP2 BCR-2|BCR2|BCRL2 BCR pseudogene 2 pseudo 234.667-74 chr3 136758975 136759358 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -6788 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 144.667-124 chr19 11669336 11669486 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -2322 NR_002944 664709 Hs.534822 NR_002944 HNRNPA1P10 HNRPA1L-2 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 10 pseudo 153.333-358 chr6 53095526 53095724 + 1 NA exon (NM_012347, exon 11 of 12) exon (NM_012347, exon 11 of 12) 24652 NM_012347 26268 Hs.216653 NM_012347 ENSG00000112146 FBXO9 FBX9|NY-REN-57|VCIA1|dJ341E18.2 F-box protein 9 protein-coding 159.667-110 chr15 62725936 62726173 + 1 NA intron (NM_015059, intron 24 of 55) MIR3|SINE|MIR 78743 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 130.333-89 chr17 60252144 60252423 + 1 NA intron (NM_032582, intron 11 of 33) intron (NM_032582, intron 11 of 33) -20638 NR_002999 677681 NR_002999 ENSG00000252577 SCARNA20 ACA66 small Cajal body-specific RNA 20 ncRNA 124.667-214 chr9 18658888 18659045 + 1 NA intron (NM_052866, intron 8 of 12) L1ME4c|LINE|L1 85660 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 206.667-118 chr5 161679098 161679361 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6492 NM_000811 2559 Hs.90791 NM_000811 ENSG00000145863 GABRA6 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha6 subunit protein-coding 215.333-146 chr4 100422635 100423068 + 1 NA intron (NM_001159694, intron 6 of 10) intron (NM_001159694, intron 6 of 10) -27604 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 156.333-180 chr2 68522891 68523099 + 1 NA intron (NM_173545, intron 5 of 9) L1ME3G|LINE|L1 55410 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 153.667-272 chr3 168710110 168710345 + 1 NA intron (NR_021485, intron 6 of 15) intron (NR_021485, intron 6 of 15) 158373 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 164.667-115 chr2 108876072 108876303 + 1 NA exon (NM_001351544, exon 15 of 15) exon (NM_001351544, exon 15 of 15) 89416 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 154.333-176 chr2 206140964 206141249 + 1 NA intron (NM_001199981, intron 11 of 17) intron (NM_001199981, intron 11 of 17) 18088 NM_001199984 4719 Hs.471207 NM_005006 ENSG00000023228 NDUFS1 CI-75Kd|CI-75k|MC1DN5|PRO1304 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 protein-coding 123.333-88 chr16 79906053 79906202 + 1 NA Intergenic Intergenic 110878 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 149.667-249 chr22 34730906 34731106 + 1 NA Intergenic MER91A|DNA|hAT-Tip100 266910 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 170.333-50 chr11 112977931 112978118 + 1 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -14564 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 134.333-154 chr6 144860737 144860917 + 1 NA Intergenic Intergenic 455172 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 176.333-81 chr2 45566634 45566810 + 1 NA intron (NM_018079, intron 9 of 20) intron (NM_018079, intron 9 of 20) 44545 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 155.333-341 chr6 134261882 134262142 + 1 NA exon (NM_001143676, exon 2 of 14) exon (NM_001143676, exon 2 of 14) 56046 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 177.333-178 chr9 27475439 27475750 + 1 NA intron (NM_024761, intron 1 of 3) L1ME3G|LINE|L1 -48720 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 152.333-231 chr3 51051218 51051389 + 1 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) intron (NM_004947, intron 5 of 52) -333988 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 115.333-222 chr8 119244325 119244490 + 1 NA 3' UTR (NM_052886, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_052886, exon 4 of 4) 2450 NR_149111 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 145.667-61 chr12 48487278 48487542 + 1 NA intron (NM_152319, intron 4 of 8) intron (NM_152319, intron 4 of 8) 4912 NM_152319 121273 Hs.98202 NM_152319 ENSG00000177627 C12orf54 HSD-29|HSD-30 chromosome 12 open reading frame 54 protein-coding 119.667-7 chr1 54857192 54857411 + 1 NA intron (NM_014762, intron 6 of 8) intron (NM_014762, intron 6 of 8) 29894 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 164.667-118 chr2 126521280 126521469 + 1 NA Intergenic Intergenic -134561 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 152.333-381 chr8 102305010 102305234 + 1 NA exon (NM_015902, exon 21 of 59) exon (NM_015902, exon 21 of 59) 65671 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 420.667-9 chr9 34452685 34453329 + 1 NA intron (NM_001184942, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 5563 NM_001184940 203259 Hs.493771 NM_147202 ENSG00000164970 FAM219A C9orf25 family with sequence similarity 219 member A protein-coding 117.667-53 chr15 44050117 44050302 + 1 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) intron (NM_032892, intron 1 of 13) 144237 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 179.333-45 chr11 123720464 123720775 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 10366 NM_001301819 7753 Hs.112556 NM_003455 ENSG00000166261 ZNF202 ZKSCAN10|ZSCAN42 zinc finger protein 202 protein-coding 122.333-185 chr6 72774223 72774413 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) MER58A|DNA|hAT-Charlie 143823 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 222.667-61 chr3 183618799 183619268 + 1 NA Intergenic Intergenic -16590 NM_001349422 54800 Hs.407709 NM_017644 ENSG00000114796 KLHL24 DRE1|EBSSH|KRIP6 kelch like family member 24 protein-coding 218.333-81 chr22 31536394 31536758 + 1 NA intron (NM_001007467, intron 4 of 32) AluSq|SINE|Alu 40040 NM_014775 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 128.333-125 chr3 3960202 3960378 + 1 NA Intergenic Intergenic -159415 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 202.667-35 chr12 1017767 1018072 + 1 NA intron (NR_027948, intron 1 of 19) intron (NR_027948, intron 1 of 19) -9829 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 168.667-20 chr10 59124229 59124528 + 1 NA Intergenic Intergenic 52086 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 166.333-79 chr15 64796831 64797107 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -21380 NM_194272 348093 Hs.436518 NM_194272 ENSG00000166831 RBPMS2 - RNA binding protein, mRNA processing factor 2 protein-coding 138.333-74 chr16 68349590 68349756 + 1 NA intron (NR_147058, intron 14 of 18) AluJo|SINE|Alu 38559 NM_001290018 54496 Hs.640229 NM_019023 ENSG00000132600 PRMT7 SBIDDS protein arginine methyltransferase 7 protein-coding 266.667-19 chr12 39275856 39276320 + 1 NA Intergenic Intergenic 167032 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 139.333-110 chr2 54904477 54904714 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 23 of 40) L2c|LINE|L2 105677 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 132.667-38 chr12 31586629 31586813 + 1 NA intron (NM_001308339, intron 1 of 22) intron (NM_001308339, intron 1 of 22) -3202 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 189.333-93 chr2 63946896 63947104 + 1 NA intron (NM_001005739, intron 9 of 22) L1ME4a|LINE|L1 72428 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 163.667-165 chr4 3314162 3314425 + 1 NA 5' UTR (NM_198229, exon 1 of 18) 5' UTR (NM_198229, exon 1 of 18) 146 NM_198229 6002 Hs.527061 NM_002926 ENSG00000159788 RGS12 - regulator of G protein signaling 12 protein-coding 199.333-245 chr6 104482511 104482825 + 1 NA Intergenic Intergenic 376878 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 165.667-173 chr6 36105463 36105774 + 1 NA intron (NM_139012, intron 10 of 11) intron (NM_139012, intron 10 of 11) -24895 NR_072996 5603 Hs.178695 NM_002754 ENSG00000156711 MAPK13 MAPK 13|MAPK-13|PRKM13|SAPK4|p38delta mitogen-activated protein kinase 13 protein-coding 165.333-263 chr9 29773528 29773780 + 1 NA Intergenic Intergenic -560053 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 377.667-10 chr5 42610697 42611412 + 1 NA intron (NM_001242460, intron 1 of 7) intron (NM_001242460, intron 1 of 7) 45190 NM_001242462 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 122.667-52 chr14 67898731 67898931 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 75239 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 115.667-108 chr2 20348886 20349051 + 1 NA intron (NM_001352920, intron 1 of 19) intron (NM_001352920, intron 1 of 19) 1876 NM_001352917 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 187.667-58 chr18 2438807 2439037 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 132583 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 172.333-57 chr15 70935484 70935733 + 1 NA intron (NM_017691, intron 7 of 15) intron (NM_017691, intron 7 of 15) 43165 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 160.333-131 chr18 2361740 2362033 + 1 NA Intergenic Intergenic 209619 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 146.333-185 chr22 17545961 17546119 + 1 NA intron (NM_001290046, intron 16 of 18) FRAM|SINE|Alu -17399 NM_001303484 83733 Hs.282982 NM_031481 ENSG00000182902 SLC25A18 GC2 solute carrier family 25 member 18 protein-coding 143.667-178 chr4 51920848 51921062 + 1 NA Intergenic Intergenic 77376 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 152.333-371 chr8 57156751 57156924 + 1 NA Intergenic Intergenic -61439 NR_038235 100507651 Hs.371831 NR_038235 ENSG00000253301 LINC01606 - long intergenic non-protein coding RNA 1606 ncRNA 128.667-200 chr9 123133391 123133560 + 1 NA intron (NR_033234, intron 16 of 18) MIR3|SINE|MIR -17998 NR_026677 81571 Hs.708072 NM_030814 ENSG00000236901 MIR600HG C9orf45|GL012|NCRNA00287 MIR600 host gene ncRNA 145.333-259 chr6 68239663 68239828 + 1 NA intron (NR_125854, intron 3 of 3) intron (NR_125854, intron 3 of 3) 90154 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 206.667-80 chr22 27721403 27721652 + 1 NA Intergenic Intergenic 80229 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 183.667-55 chr15 87660701 87660925 + 1 NA Intergenic Intergenic 83884 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 311.333-16 chr13 28023497 28024062 + 1 NA intron (NM_004119, intron 18 of 23) intron (NM_004119, intron 18 of 23) -35142 NM_001105577 646625 Hs.705356 NM_001105577 ENSG00000183463 URAD PRHOXNB ureidoimidazoline (2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-) decarboxylase protein-coding 277.333-68 chr4 137269381 137269833 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -56808 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 160.333-33 chr1 247449133 247449435 + 1 NA TTS (NM_183395) TTS (NM_183395) 2698 NM_001004492 127623 Hs.446999 NM_001004492 ENSG00000177535 OR2B11 - olfactory receptor family 2 subfamily B member 11 protein-coding 402.667-6 chr4 95226664 95227315 + 1 NA intron (NM_003728, intron 7 of 15) intron (NM_003728, intron 7 of 15) 135498 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 297.667-22 chr20 54356133 54356494 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -119280 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 132.667-99 chr20 56651693 56651869 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 22475 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 178.333-64 chr18 7030502 7030787 + 1 NA intron (NM_005559, intron 16 of 62) L1MC4a|LINE|L1 75967 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 230.333-13 chr10 59443129 59443406 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -80086 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 149.667-67 chr10 96814660 96814850 + 1 NA Intergenic Intergenic 14009 NR_030338 693192 NR_030338 ENSG00000207976 MIR607 MIRN607|hsa-mir-607 microRNA 607 ncRNA 142.667-113 chr2 190902580 190902880 + 1 NA intron (NM_014905, intron 5 of 17) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 21909 NM_014905 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 208.333-10 chr1 210174752 210175208 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -57816 NM_019605 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 160.667-49 chr10 106038703 106038962 + 1 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -101333 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 161.333-38 chr10 78665655 78665973 + 1 NA Intergenic Intergenic 398472 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 157.333-139 chr16 74170783 74171058 + 1 NA Intergenic Intergenic 44601 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 216.333-111 chr5 2553798 2554126 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -158629 NR_145480 101234261 NR_145480 ENSG00000281560 LSINCT5 - long stress-induced non-coding transcript 5 ncRNA 146.667-113 chr15 50605976 50606236 + 1 NA intron (NR_149154, intron 20 of 37) AluSg|SINE|Alu -59440 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 121.333-143 chr5 28654943 28655109 + 1 NA Intergenic Intergenic -271844 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 180.333-27 chr12 111705170 111705461 + 1 NA intron (NM_025247, intron 3 of 20) AluJr|SINE|Alu 19262 NM_025247 80724 Hs.331141 NM_025247 ENSG00000111271 ACAD10 - acyl-CoA dehydrogenase family member 10 protein-coding 147.667-196 chr2 225701994 225702222 + 1 NA 3' UTR (NM_001371273, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001371273, exon 8 of 8) 301222 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 142.667-18 chr10 37222710 37222962 + 1 NA intron (NM_052997, intron 34 of 35) intron (NM_052997, intron 34 of 35) -86350 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 191.667-133 chr9 90905806 90906017 + 1 NA Intergenic HERVK13-int|LTR|ERVK 78491 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 179.333-151 chr5 62670679 62670925 + 1 NA Intergenic Intergenic 91983 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 148.333-134 chr14 88746860 88747089 + 1 NA intron (NM_183387, intron 2 of 42) intron (NM_183387, intron 2 of 42) 45979 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 145.333-26 chr1 241281756 241282030 + 1 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) L1MD1|LINE|L1 73933 NM_001350116 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 153.333-284 chr3 187489725 187489886 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 42759 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 157.333-254 chr4 41092541 41092858 + 1 NA intron (NM_173075, intron 3 of 16) AluSx|SINE|Alu 121843 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 127.333-176 chr7 81028294 81028426 + 1 NA Intergenic Intergenic -105971 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 198.333-85 chr18 4586747 4587191 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -131662 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 112.667-36 chr11 21649587 21649756 + 1 NA Intergenic Intergenic -543414 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 208.667-95 chr3 193851333 193851758 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -7536 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 115.333-135 chr3 21395866 21396111 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9738 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 231.333-77 chr4 56835886 56836181 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14164 NM_021114 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 168.667-236 chrX 69068621 69068878 + 1 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie 96704 NM_001032396 64219 Hs.522679 NM_022368 ENSG00000181191 PJA1 PRAJA1|RNF70 praja ring finger ubiquitin ligase 1 protein-coding 173.333-113 chr22 31252901 31253252 + 1 NA intron (NM_001031801, intron 1 of 14) intron (NM_001031801, intron 1 of 14) 4692 NM_001031801 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 216.333-90 chr21 28204565 28204925 + 1 NA intron (NR_126012, intron 3 of 5) LTR33A|LTR|ERVL 23922 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 145.333-329 chrX 77282293 77282438 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -165024 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 173.667-131 chr4 43799961 43800257 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -216752 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 177.667-122 chr6 157914966 157915269 + 1 NA intron (NM_016224, intron 9 of 17) L1ME1|LINE|L1 -66746 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 156.667-84 chr12 84425329 84425605 + 1 NA Intergenic Intergenic 487332 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 121.667-201 chr8 73968800 73969065 + 1 NA intron (NM_001204858, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 2976 NM_001204862 6921 Hs.533437 NM_005648 ENSG00000154582 ELOC SIII|TCEB1 elongin C protein-coding 206.333-18 chr10 95117139 95117455 + 1 NA Intergenic Intergenic -47800 NM_001198853 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 217.333-164 chr9 98147664 98148029 + 1 NA intron (NM_003389, intron 2 of 11) L1MD1|LINE|L1 25046 NM_003389 7464 Hs.113094 NM_003389 ENSG00000106789 CORO2A CLIPINB|IR10|WDR2 coronin 2A protein-coding 162.667-121 chr2 18596039 18596351 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -6615 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 336.333-18 chr2 31553934 31554408 + 1 NA intron (NM_000348, intron 1 of 4) intron (NM_000348, intron 1 of 4) 26767 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 231.333-32 chr12 33130459 33130708 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -233737 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 160.333-286 chr8 117846814 117847087 + 1 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 73963 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 153.667-283 chr4 39591284 39591497 + 1 NA intron (NR_047679, intron 4 of 4) intron (NR_047679, intron 4 of 4) 35731 NM_001317897 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 156.333-354 chr8 63284739 63285063 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 115898 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 384.667 chr11 84849312 84849879 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L2b|LINE|L2 73826 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 188.667-63 chr18 46702271 46702670 + 1 NA intron (NM_001307987, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 -45437 NM_144612 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 206.667-36 chr14 43556274 43556497 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 950898 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 234.667-5 chr1 110371335 110371772 + 1 NA intron (NM_001201548, intron 6 of 6) intron (NM_001201548, intron 6 of 6) 19473 NM_001319220 9122 Hs.351306 NM_004696 ENSG00000168679 SLC16A4 MCT4|MCT5 solute carrier family 16 member 4 protein-coding 218.667-42 chr18 49302848 49303171 + 1 NA intron (NM_001353214, intron 8 of 17) intron (NM_001353214, intron 8 of 17) 157636 NM_001353211 54808 Hs.162996 NM_017653 ENSG00000141627 DYM DMC|SMC dymeclin protein-coding 268.667-54 chr5 60180438 60180832 + 1 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) L2b|LINE|L2 192028 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 324.333-38 chr8 94819099 94819544 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3966 NM_017864 55656 Hs.727669 NM_017864 ENSG00000164941 INTS8 C8orf52|INT8 integrator complex subunit 8 protein-coding 195.667-99 chr4 138191964 138192174 + 1 NA intron (NM_014331, intron 6 of 11) intron (NM_014331, intron 6 of 11) 50280 NM_014331 23657 Hs.390594 NM_014331 ENSG00000151012 SLC7A11 CCBR1|xCT solute carrier family 7 member 11 protein-coding 168.667-235 chr9 137804417 137804716 + 1 NA intron (NM_001354263, intron 18 of 26) L1MEc|LINE|L1 -16160 NR_147508 651337 Hs.603195 NR_147508 ENSG00000255585 LOC651337 - uncharacterized LOC651337 ncRNA 130.667-194 chr8 77266107 77266292 + 1 NA Intergenic Intergenic -184498 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 154.333-378 chrX 84906431 84906707 + 1 NA Intergenic Intergenic -27582 NR_024062 100131816 Hs.460809 NM_178567 ENSG00000229547 UBE2DNL - ubiquitin conjugating enzyme E2 D N-terminal like (pseudogene) pseudo 157.333-183 chr2 65441526 65441707 + 1 NA Intergenic Intergenic -9017 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 268.667-21 chr17 61449234 61449647 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -2982 NM_001321120 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 273.667-14 chr10 111602467 111602786 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 488335 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 250.333-9 chr10 98760197 98760657 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1M3|LINE|L1 164141 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 148.667-235 chr22 39193740 39193895 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -41137 NM_175709 23492 Hs.356416 NM_175709 ENSG00000100307 CBX7 - chromobox 7 protein-coding 218.333-113 chr7 13007121 13007498 + 1 NA Intergenic Intergenic 319676 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 145.333-282 chr7 92055741 92055976 + 1 NA intron (NM_147185, intron 22 of 49) intron (NM_147185, intron 22 of 49) 78619 NM_000786 1595 Hs.417077 NM_000786 ENSG00000001630 CYP51A1 CP51|CYP51|CYPL1|LDM|P450-14DM|P450L1 cytochrome P450 family 51 subfamily A member 1 protein-coding 190.667-33 chr13 21619831 21620148 + 1 NA Intergenic Intergenic -15819 NM_152726 221154 Hs.412103 NM_152726 ENSG00000165487 MICU2 1110008L20Rik|EFHA1 mitochondrial calcium uptake 2 protein-coding 112.333-10 chr1 184000112 184000277 + 1 NA intron (NM_001303421, intron 1 of 11) L1MEd|LINE|L1 37534 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 318.333-4 chr1 237025510 237026004 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -16427 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 141.667-191 chr6 28144174 28144324 + 1 NA intron (NM_001278121, intron 1 of 6) intron (NM_001278121, intron 1 of 6) 2038 NM_001278121 7745 Hs.57679 NM_006298 ENSG00000198315 ZKSCAN8 LD5-1|ZNF192|ZSCAN40 zinc finger with KRAB and SCAN domains 8 protein-coding 220.333-6 chr1 111428264 111428645 + 1 NA promoter-TSS (NM_002557) promoter-TSS (NM_002557) -719 NM_002557 5016 Hs.1154 NM_002557 ENSG00000085465 OVGP1 CHIT5|EGP|MUC9|OGP oviductal glycoprotein 1 protein-coding 201.667-41 chr15 89619763 89620059 + 1 NA intron (NM_001308025, intron 18 of 21) intron (NM_001308025, intron 18 of 21) 35556 NM_198525 374654 Hs.513134 NM_198525 ENSG00000166813 KIF7 ACLS|AGBK|HLS2|JBTS12|UNQ340 kinesin family member 7 protein-coding 131.333-61 chr16 76037913 76038072 + 1 NA Intergenic Intergenic -239409 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 298.667-5 chr10 54172925 54173365 + 1 NA intron (NM_001354411, intron 14 of 34) intron (NM_001354411, intron 14 of 34) -313085 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 245.333-77 chr3 96463226 96463518 + 1 NA Intergenic Intergenic 103408 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 181.333-129 chr4 171307753 171308005 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 121695 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 146.667-3 chr1 39790968 39791163 + 1 NA TTS (NR_135805) TTS (NR_135805) 2089 NR_135805 101929536 Hs.552820 NR_135805 ENSG00000261798 LOC101929536 - uncharacterized LOC101929536 ncRNA 311.333-9 chr10 83119742 83120131 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 557153 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 213.667-45 chr2 233822942 233823284 + 1 NA intron (NM_001367507, intron 34 of 41) intron (NM_001367507, intron 34 of 41) 31422 NM_018410 55355 Hs.532968 NM_018410 ENSG00000123485 HJURP FAKTS|URLC9|hFLEG1 Holliday junction recognition protein protein-coding 122.333-195 chr7 77919592 77919760 + 1 NA intron (NM_001366085, intron 7 of 10) intron (NM_001366085, intron 7 of 10) 79546 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 159.333-127 chr17 77312328 77312605 + 1 NA intron (NM_001113491, intron 2 of 11) intron (NM_001113491, intron 2 of 11) -7049 NM_006640 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 129.667-178 chr8 124092462 124092603 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 34 of 40) intron (NM_001039112, intron 34 of 40) -51750 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 200.333-46 chr15 89718660 89719007 + 1 NA intron (NM_001284395, intron 7 of 16) AluSx|SINE|Alu 28022 NM_001284396 56964 Hs.177557 NM_020212 ENSG00000140527 WDR93 - WD repeat domain 93 protein-coding 130.667-203 chr9 2086426 2086642 + 1 NA intron (NM_001289397, intron 17 of 32) intron (NM_001289397, intron 17 of 32) 64589 NM_001289396 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 198.333-205 chr9 105622787 105623135 + 1 NA intron (NM_001351498, intron 9 of 9) L3|LINE|CR1 -39496 NM_005421 6887 Hs.247978 NM_005421 ENSG00000186051 TAL2 - TAL bHLH transcription factor 2 protein-coding 230.333-25 chr11 100305286 100305764 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 19 of 23) MER102c|DNA|hAT-Charlie -381763 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 188.667-104 chr3 116487665 116487976 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -42333 NM_001318915 4045 Hs.26409 NM_002338 ENSG00000185565 LSAMP IGLON3|LAMP limbic system associated membrane protein protein-coding 154.333-75 chr13 67532353 67532633 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 160106 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 249.333-18 chr11 57428745 57429155 + 1 NA Intergenic Intergenic -1370 NM_017611 29015 Hs.99962 NM_014096 ENSG00000134802 SLC43A3 EEG1|ENBT1|FOAP-13|PRO1659|SEEEG-1 solute carrier family 43 member 3 protein-coding 176.333-63 chr16 77308983 77309253 + 1 NA intron (NM_199355, intron 16 of 22) intron (NM_199355, intron 16 of 22) 109710 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 355.333-35 chr7 50026403 50026966 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 5 of 7) LTR51|LTR|ERV1 66562 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 261.333-30 chr15 26092539 26093123 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -22982 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 127.333-146 chr5 139131939 139132138 + 1 NA intron (NM_022464, intron 1 of 9) intron (NM_022464, intron 1 of 9) 66330 NM_022464 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 240.333-74 chr5 68898426 68898753 + 1 NA Intergenic Intergenic 131338 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 159.333-162 chr2 98353424 98353648 + 1 NA intron (NM_001079878, intron 1 of 6) MER2|DNA|TcMar-Tigger 7080 NM_001079878 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 149.333-193 chr2 122615191 122615454 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 458159 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 147.333-168 chr2 57184835 57184989 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -722739 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 150.667-106 chr13 85230764 85231052 + 1 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie -82851 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 169.667-7 chr1 113939119 113939304 + 1 NA intron (NM_001369807, intron 1 of 15) AluJb|SINE|Alu 9367 NM_001369806 204851 Hs.532363 NM_152696 ENSG00000163349 HIPK1 Myak|Nbak2 homeodomain interacting protein kinase 1 protein-coding 145.333-28 chr10 30997268 30997445 + 1 NA intron (NM_001143766, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 2161 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 161.333-18 chr1 225954274 225954452 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -12871 NM_001172425 7044 Hs.520187 NM_003240 ENSG00000143768 LEFTY2 EBAF|LEFTA|LEFTYA|TGFB4 left-right determination factor 2 protein-coding 277.667-37 chr4 137219255 137219640 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -6648 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 248.667-69 chr2 229840459 229840783 + 1 NA intron (NM_001284216, intron 2 of 38) AluSx1|SINE|Alu 81058 NM_001348334 9320 Hs.572642 NM_004238 ENSG00000153827 TRIP12 MRD49|TRIP-12|ULF thyroid hormone receptor interactor 12 protein-coding 166.667-58 chr13 77307736 77307907 + 1 NA intron (NM_015057, intron 1 of 82) L2|LINE|L2 19273 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 123.667-32 chr10 64859042 64859270 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 33628 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 146.333-14 chr1 118913061 118913345 + 1 NA intron (NM_152380, intron 6 of 7) intron (NM_152380, intron 6 of 7) 75140 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 218.667-98 chr7 15043005 15043448 + 1 NA Intergenic Intergenic -68368 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 203.333-146 chr2 169097535 169097917 + 1 NA Intergenic Intergenic 16619 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 183.333-105 chr3 70263237 70263420 + 1 NA intron (NM_001364676, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 49310 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 156.333-137 chr16 73901842 73902086 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 313557 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 255.333-37 chr15 68472412 68472683 + 1 NA Intergenic Arthur1C|DNA|hAT-Tip100 -40384 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 180.667-142 chr8 69522564 69522821 + 1 NA intron (NR_156414, intron 2 of 20) L2a|LINE|L2 29845 NM_001128206 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 125.667-47 chr12 60465791 60465978 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 776514 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 156.333-140 chr16 86563397 86563695 + 1 NA Intergenic Intergenic -3283 NM_005251 2303 Hs.436448 NM_005251 ENSG00000176692 FOXC2 FKHL14|LD|MFH-1|MFH1 forkhead box C2 protein-coding 218.333-30 chr12 45382750 45383001 + 1 NA intron (NM_001025356, intron 10 of 19) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 90185 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 171.667-163 chr8 92417762 92418057 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 237585 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 249.667-35 chr17 59676219 59676667 + 1 NA intron (NM_001288653, intron 16 of 31) intron (NM_001288653, intron 16 of 31) 31155 NM_016077 51651 Hs.12677 NM_016077 ENSG00000141378 PTRH2 BIT1|CFAP37|CGI-147|IMNEPD|PTH|PTH 2|PTH2 peptidyl-tRNA hydrolase 2 protein-coding 352.333-5 chr11 65070242 65070731 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -11933 NM_005468 10004 Hs.13967 NM_005468 ENSG00000168060 NAALADL1 I100|NAALADASEL N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 1 protein-coding 156.333-218 chr22 26690365 26690641 + 1 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 17660 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 146.333-58 chr12 12561091 12561369 + 1 NA intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 1633 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 124.667-198 chr7 133794626 133794799 + 1 NA intron (NM_021807, intron 10 of 17) intron (NM_021807, intron 10 of 17) 30176 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 215.333-182 chr7 52041454 52041792 + 1 NA Intergenic Intergenic -648367 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 237.667-58 chr4 31171116 31171400 + 1 NA non-coding (NR_125935, exon 1 of 5) non-coding (NR_125935, exon 1 of 5) 114 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 271.333-13 chr14 73463733 73464195 + 1 NA promoter-TSS (NR_135251) promoter-TSS (NR_135251) -322 NR_135251 101928143 Hs.654609 NR_135251 ENSG00000284930 LOC101928143 - uncharacterized LOC101928143 ncRNA 139.667-147 chr5 19851031 19851241 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 35136 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 154.667-90 chr12 123259823 123259996 + 1 NA Intergenic Intergenic 8345 NM_001270434 8099 Hs.433201 NM_004642 ENSG00000111328 CDK2AP1 DOC1|DORC1|ST19|doc-1|p12DOC-1 cyclin dependent kinase 2 associated protein 1 protein-coding 229.667-40 chr2 24475135 24475501 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -15936 NM_003743 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 157.333-174 chr2 45433685 45433846 + 1 NA intron (NM_018079, intron 16 of 20) intron (NM_018079, intron 16 of 20) 177502 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 202.667-26 chr11 25993612 25993897 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -195369 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 130.667-164 chr5 59427900 59428063 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -71011 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 209.333-223 chr7 84282894 84283215 + 1 NA Intergenic Intergenic -88265 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 201.333-157 chr2 166432896 166433304 + 1 NA intron (NM_002976, intron 14 of 24) MER85|DNA|PiggyBac 53871 NR_045628 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 171.667-82 chr2 70039211 70039437 + 1 NA intron (NR_033872, intron 6 of 10) intron (NR_033872, intron 6 of 10) 47691 NR_033872 400960 Hs.683864 NR_033872 ENSG00000179818 PCBP1-AS1 - PCBP1 antisense RNA 1 ncRNA 127.333-117 chr3 126622367 126622532 + 1 NA intron (NM_001173513, intron 11 of 14) intron (NM_001173513, intron 11 of 14) 32675 NM_001173513 114112 Hs.477475 NM_052883 ENSG00000197763 TXNRD3 TGR|TR2|TR2IT1|TRXR3|TXNRD3IT1|TXNRD3NB|TXNRD3NT1 thioredoxin reductase 3 protein-coding 145.667-42 chr10 124730826 124731000 + 1 NA intron (NM_014661, intron 1 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie 13465 NM_014661 9679 Hs.129195 NM_014661 ENSG00000189319 FAM53B KIAA0140|bA12J10.2|smp family with sequence similarity 53 member B protein-coding 212.667-88 chr3 38385612 38385945 + 1 NA intron (NR_146068, intron 12 of 16) L1MC4a|LINE|L1 38993 NM_001349178 9942 Hs.659985 NM_005108 ENSG00000093217 XYLB - xylulokinase protein-coding 254.667-83 chr9 12752408 12752738 + 1 NA intron (NR_125775, intron 3 of 3) L1MD2|LINE|L1 -22447 NM_203403 286343 Hs.445356 NM_203403 ENSG00000153714 LURAP1L C9orf150|HYST0841|LRAP35b|bA3L8.2 leucine rich adaptor protein 1 like protein-coding 207.333-75 chr13 62588419 62588875 + 1 NA Intergenic Intergenic 208045 NR_120404 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 191.667-9 chr1 187038677 187038934 + 1 NA Intergenic Intergenic -54037 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 207.667-28 chr13 113287832 113288117 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -9265 NM_005561 3916 Hs.494419 NM_005561 ENSG00000185896 LAMP1 CD107a|LAMPA|LGP120 lysosomal associated membrane protein 1 protein-coding 145.667-75 chr14 48390648 48390872 + 1 NA Intergenic Intergenic -595746 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 121.667-7 chr1 57123813 57123963 + 1 NA intron (NM_001365793, intron 4 of 14) L1ME4a|LINE|L1 -157748 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 160.667-110 chr15 77306749 77306981 + 1 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) -81461 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 146.667-83 chr12 93097333 93097541 + 1 NA intron (NR_040096, intron 3 of 4) intron (NR_040096, intron 3 of 4) -76929 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 196.667-171 chr9 24287642 24287935 + 1 NA Intergenic Intergenic 257888 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 129.667-95 chr2 76950892 76951125 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -34957 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 211.333-160 chr4 36157814 36158157 + 1 NA intron (NR_146894, intron 15 of 32) intron (NR_146894, intron 15 of 32) 85954 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 173.333-40 chr12 22501047 22501315 + 1 NA intron (NM_001286176, intron 10 of 26) intron (NM_001286176, intron 10 of 26) 43016 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 193.333-97 chr2 121190740 121191030 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 94317 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 244.667-56 chr2 138591025 138591324 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 89404 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 157.333-311 chr6 149070294 149070601 + 1 NA intron (NM_005715, intron 7 of 7) intron (NM_005715, intron 7 of 7) -37786 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 221.333-112 chr5 40728450 40728737 + 1 NA intron (NM_012382, intron 3 of 4) intron (NM_012382, intron 3 of 4) 27368 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 240.667-77 chr7 111995852 111996326 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 4 of 52) intron (NM_001363540, intron 4 of 52) 187584 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 183.667-99 chr4 30289090 30289387 + 1 NA Intergenic Intergenic -431131 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 169.333-256 chr7 100964369 100964597 + 1 NA intron (NM_005960, intron 5 of 11) intron (NM_005960, intron 5 of 11) -5140 NM_001164462 10071 Hs.489355 NM_001164462 ENSG00000205277 MUC12 MUC-11|MUC-12|MUC11 mucin 12, cell surface associated protein-coding 121.333-77 chr2 20157588 20157737 + 1 NA Intergenic Intergenic 67468 NM_002997 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 165.667-162 chr5 134422684 134422850 + 1 NA Intergenic Intergenic -10886 NM_080656 91368 Hs.156506 NM_080656 ENSG00000237190 CDKN2AIPNL C2AIL CDKN2A interacting protein N-terminal like protein-coding 174.333-65 chr2 99608507 99608753 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 12 of 23) intron (NM_001025108, intron 12 of 23) -118613 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 231.333-114 chr7 133821836 133822205 + 1 NA intron (NM_021807, intron 11 of 17) intron (NM_021807, intron 11 of 17) 2868 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 263.667-46 chr2 69091899 69092337 + 1 NA intron (NM_032208, intron 9 of 17) intron (NM_032208, intron 9 of 17) -11564 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 163.333-110 chr16 26796230 26796421 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -270602 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 235.333-27 chr12 11745170 11745498 + 1 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) L3|LINE|CR1 95480 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 124.667-62 chr14 72660423 72660581 + 1 NA TTS (NM_012074) TTS (NM_012074) 143682 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 165.667-100 chr2 241153022 241153230 + 1 NA intron (NM_001282409, intron 1 of 8) intron (NM_001282409, intron 1 of 8) 2659 NM_002712 5510 Hs.36587 NM_002712 ENSG00000115685 PPP1R7 SDS22 protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 protein-coding 150.667-189 chr2 135227463 135227644 + 1 NA intron (NM_001286568, intron 14 of 20) intron (NM_001286568, intron 14 of 20) 90925 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 233.333-8 chr1 165267214 165267465 + 1 NA intron (NM_177398, intron 3 of 8) L1MB5|LINE|L1 88902 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 255.333-103 chr8 28795532 28795899 + 1 NA intron (NR_026826, intron 7 of 14) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 94200 NM_001172562 55756 Hs.162397 NM_018250 ENSG00000104299 INTS9 CPSF2L|INT9|RC74 integrator complex subunit 9 protein-coding 154.333-241 chr4 49097192 49097467 + 1 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 110687 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 207.667-128 chrX 53942452 53942829 + 1 NA TTS (NM_001184898) TTS (NM_001184898) 100507 NM_001184898 23133 Hs.133352 NM_015107 ENSG00000172943 PHF8 JHDM1F|KDM7B|MRXSSD|ZNF422 PHD finger protein 8 protein-coding 164.333-252 chr9 93331102 93331366 + 1 NA 3' UTR (NM_001368813, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001368813, exon 3 of 3) 15069 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 178.333-56 chr15 75962297 75962635 + 1 NA intron (NM_138573, intron 3 of 5) L1M5|LINE|L1 49958 NM_138573 145957 Hs.732438 NM_138573 ENSG00000169752 NRG4 HRG4 neuregulin 4 protein-coding 132.667-59 chr15 81114058 81114265 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -20109 NM_001353365 161502 Hs.130979 NM_173528 ENSG00000156206 CFAP161 C15orf26 cilia and flagella associated protein 161 protein-coding 149.667-248 chr22 32718078 32718370 + 1 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) -82592 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 120.333-89 chr2 11849339 11849459 + 1 NA Intergenic Intergenic -12413 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 122.667-184 chr8 6399289 6399512 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 7148 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 152.333-73 chr12 1128724 1128950 + 1 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) L1MEd|LINE|L1 101089 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 143.333-220 chr5 27847743 27847952 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 375555 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 152.333-250 chr3 138851505 138851760 + 1 NA Intergenic Intergenic -16704 NM_006219 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 205.667-67 chr2 61364264 61364600 + 1 NA intron (NM_014709, intron 10 of 79) L1MB4|LINE|L1 52945 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 156.333-342 chr7 88839088 88839269 + 1 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -43441 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 195.667-37 chr13 66695497 66695746 + 1 NA intron (NM_020403, intron 2 of 3) LTR50|LTR|ERVL -129548 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 175.667-136 chr7 118164451 118164693 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -19592 NM_016200 51691 Hs.655046 NM_016200 ENSG00000128534 LSM8 NAA38 LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated protein-coding 149.333-385 chr8 31134251 31134536 + 1 NA intron (NM_000553, intron 24 of 34) intron (NM_000553, intron 24 of 34) -101037 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 336.667-19 chr5 33774386 33774867 + 1 NA intron (NM_001324511, intron 2 of 2) LTR37B|LTR|ERV1 117364 NM_001324512 81792 Hs.12680 NM_030955 ENSG00000151388 ADAMTS12 PRO4389 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12 protein-coding 163.333-242 chr6 56547932 56548189 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 53 of 94) intron (NM_001144770, intron 53 of 94) 94829 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 155.333-62 chr11 115374956 115375201 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) L1MC5|LINE|L1 -21678 NR_135102 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 159.667-40 chr10 26017774 26017943 + 1 NA intron (NM_001368265, intron 7 of 7) intron (NM_001368265, intron 7 of 7) 83629 NM_017433 53904 Hs.662630 NM_017433 ENSG00000095777 MYO3A DFNB30 myosin IIIA protein-coding 163.333-12 chr1 77744341 77744585 + 1 NA intron (NM_201624, intron 1 of 23) L1MEc|LINE|L1 15389 NM_201626 23032 Hs.480597 NM_015017 ENSG00000077254 USP33 VDU1 ubiquitin specific peptidase 33 protein-coding 123.667-176 chr8 61914157 61914358 + 1 NA Intergenic Intergenic 24418 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 140.333-246 chr9 85956124 85956320 + 1 NA intron (NM_024635, intron 2 of 22) intron (NM_024635, intron 2 of 22) 14693 NM_001321882 60560 Hs.436098 NM_021929 ENSG00000135040 NAA35 EGAP|MAK10|MAK10P|bA379P1.1 N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit protein-coding 283.333-63 chr5 118680072 118680609 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 84152 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 197.333-242 chr8 124526327 124526648 + 1 NA intron (NM_001317889, intron 1 of 12) intron (NM_001317889, intron 1 of 12) 12598 NM_032026 83940 Hs.170568 NM_032026 ENSG00000147687 TATDN1 CDA11 TatD DNase domain containing 1 protein-coding 135.667-3 chr1 32563682 32563976 + 1 NA intron (NR_111980, intron 2 of 3) intron (NR_111980, intron 2 of 3) 24402 NR_111980 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 213.667-68 chr4 76782707 76783032 + 1 NA 3' UTR (NM_020859, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_020859, exon 11 of 11) 115275 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 139.667-154 chr5 95609801 95610058 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -10158 NM_199243 285601 Hs.143315 NM_199243 ENSG00000178015 GPR150 PGR11 G protein-coupled receptor 150 protein-coding 281.333-2 chr1 199405274 199405618 + 1 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 256848 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 159.333-244 chr4 100108548 100108756 + 1 NA Intergenic Intergenic -81381 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 223.667-61 chr4 182151877 182152317 + 1 NA Intergenic Intergenic -7582 NR_027107 90768 Hs.175465 NR_027107 TENM3-AS1 - TENM3 antisense RNA 1 ncRNA 215.667-111 chr6 158876103 158876483 + 1 NA intron (NR_160977, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 6264 NR_160976 100130967 Hs.32804 NM_001195032 C6orf99 - chromosome 6 open reading frame 99 ncRNA 214.333-54 chr16 64516309 64516657 + 1 NA Intergenic Intergenic 605580 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 117.667-135 chr4 65686273 65686448 + 1 NA intron (NR_034138, intron 3 of 3) intron (NR_034138, intron 3 of 3) -15865 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 163.333-134 chr19 28015398 28015677 + 1 NA intron (NR_146733, intron 5 of 6) MamGypLTR2b|LTR|Gypsy -221597 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 154.667-389 chr8 91576692 91576941 + 1 NA Intergenic Intergenic 327497 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 145.667-243 chr6 57251266 57251559 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 11934 NR_109774 100506188 Hs.485640 NR_109774 LOC100506188 - uncharacterized LOC100506188 ncRNA 197.667-144 chr8 22410378 22410688 + 1 NA intron (NM_015359, intron 4 of 8) intron (NM_015359, intron 4 of 8) 17697 NM_001351659 23516 Hs.491232 NM_015359 ENSG00000104635 SLC39A14 HCIN|HMNDYT2|LZT-Hs4|NET34|ZIP14|cig19 solute carrier family 39 member 14 protein-coding 290.333-3 chr10 33528935 33529363 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -194244 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 149.667-16 chr1 84459461 84459743 + 1 NA Intergenic Intergenic -19664 NM_025065 80135 Hs.481202 NM_025065 ENSG00000117133 RPF1 BXDC5 ribosome production factor 1 homolog protein-coding 206.667-89 chr3 89990545 89990812 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 883057 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 136.667-188 chr9 98543066 98543309 + 1 NA intron (NM_005458, intron 2 of 18) intron (NM_005458, intron 2 of 18) 165748 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 156.667-124 chr16 35362631 35362864 + 1 NA promoter-TSS (NR_027080) promoter-TSS (NR_027080) -669 NR_027080 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 250.667-10 chr10 90221651 90221948 + 1 NA Intergenic Intergenic -264426 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 178.667-51 chr14 69415539 69415780 + 1 NA intron (NM_001330185, intron 1 of 5) intron (NM_001330185, intron 1 of 5) 16967 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 269.667-58 chr9 79020700 79021301 + 1 NA Intergenic Intergenic 124666 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 290.667-23 chr2 45219864 45220157 + 1 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 34931 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 125.333-110 chr22 46728191 46728344 + 1 NA intron (NM_022766, intron 1 of 12) intron (NM_022766, intron 1 of 12) 9985 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 120.667-116 chr3 114758677 114758837 + 1 NA intron (NM_001164343, intron 4 of 11) intron (NM_001164343, intron 4 of 11) 350 NM_001164345 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 183.667-138 chr8 83576087 83576357 + 1 NA Intergenic Intergenic 172464 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 147.333-126 chr15 87394126 87394302 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -182715 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 175.333-149 chr5 160669110 160669388 + 1 NA intron (NM_001366652, intron 6 of 24) MIR|SINE|MIR 16142 NM_001366658 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 189.667-22 chr10 117549028 117549386 + 1 NA 3' UTR (NM_001165924, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001165924, exon 2 of 2) -4139 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 196.667-162 chr8 102242469 102242754 + 1 NA intron (NR_125415, intron 1 of 2) intron (NR_125415, intron 1 of 2) 3160 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 183.333-127 chr5 78690614 78690807 + 1 NA Intergenic Intergenic -41938 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 165.667-159 chr5 86485287 86485603 + 1 NA Intergenic Intergenic -132496 NM_001867 1350 Hs.430075 NM_001867 ENSG00000127184 COX7C - cytochrome c oxidase subunit 7C protein-coding 131.667-34 chr11 72518071 72518254 + 1 NA Intergenic Intergenic -52494 NR_126364 101928555 Hs.376950 NR_126364 ENSG00000227467 LINC01537 - long intergenic non-protein coding RNA 1537 ncRNA 155.667-317 chr6 160813701 160813913 + 1 NA Intergenic Intergenic 111614 NM_000301 5340 Hs.143436 NM_000301 ENSG00000122194 PLG - plasminogen protein-coding 159.667-157 chr19 29130710 29130948 + 1 NA Intergenic LTR75_1|LTR|ERV1 82322 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 185.333-129 chr4 20280851 20281191 + 1 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) AluSp|SINE|Alu 29116 NM_001289135 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 162.667-135 chr2 105388318 105388560 + 1 NA intron (NM_201557, intron 1 of 5) intron (NM_201557, intron 1 of 5) 10612 NM_001318899 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 147.667-227 chr3 64230329 64230589 + 1 NA intron (NM_001370528, intron 1 of 7) intron (NM_001370528, intron 1 of 7) -4993 NM_198859 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 286.333-45 chr8 128472226 128472581 + 1 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) L1MC4|LINE|L1 92276 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 166.333-15 chr1 207602691 207602993 + 1 NA intron (NM_000573, intron 27 of 38) L1ME4a|LINE|L1 -42291 NM_175710 1379 Hs.628568 NM_175710 ENSG00000197721 CR1L - complement C3b/C4b receptor 1 like protein-coding 178.333-133 chr5 7254035 7254356 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 15159 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 144.667-292 chr8 56474531 56474796 + 1 NA intron (NR_125813, intron 1 of 3) L1ME3Cz|LINE|L1 -28022 NM_001135690 5179 Hs.339831 NM_006211 ENSG00000181195 PENK PE|PENK-A proenkephalin protein-coding 165.667-191 chr7 138153311 138153558 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 29676 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 197.667-105 chr4 35842329 35842688 + 1 NA Intergenic Intergenic 401431 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 305.667-16 chr2 57677305 57677745 + 1 NA Intergenic Intergenic -230126 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 300.333-14 chr15 64619099 64619609 + 1 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 83927 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 152.667-259 chr3 153829656 153829835 + 1 NA Intergenic Intergenic -67219 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 138.667-65 chr14 84704328 84704497 + 1 NA Intergenic Intergenic -567520 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 141.333-256 chr9 32471382 32471601 + 1 NA intron (NM_014314, intron 14 of 17) L2c|LINE|L2 54705 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 149.333-127 chr15 98587026 98587191 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -61431 NM_000875 3480 Hs.643120 NM_000875 ENSG00000140443 IGF1R CD221|IGFIR|IGFR|JTK13 insulin like growth factor 1 receptor protein-coding 215.333-124 chr3 30013611 30014054 + 1 NA Intergenic Intergenic -79676 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 132.667-120 chr4 33099962 33100218 + 1 NA Intergenic Intergenic 749052 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 134.333-59 chr15 65103734 65103933 + 1 NA intron (NM_001163692, intron 1 of 4) intron (NM_001163692, intron 1 of 4) 2526 NM_001163692 390595 Hs.659256 NM_001163692 ENSG00000246922 UBAP1L UBAP-1L ubiquitin associated protein 1 like protein-coding 215.333-43 chr12 23657830 23658156 + 1 NA intron (NM_152989, intron 10 of 17) intron (NM_152989, intron 10 of 17) -73407 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 189.333-64 chr16 13465503 13465740 + 1 NA Intergenic Intergenic -454536 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 141.333-36 chr11 85394785 85394966 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) LTR47B2|LTR|ERVL 232395 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 208.333-3 chr1 44211466 44211781 + 1 NA Intergenic Intergenic -1848 NM_019100 55929 Hs.8008 NM_019100 ENSG00000178028 DMAP1 DNMAP1|DNMTAP1|EAF2|MEAF2|SWC4 DNA methyltransferase 1 associated protein 1 protein-coding 156.333-276 chr5 3493710 3493884 + 1 NA intron (NR_033898, intron 2 of 4) intron (NR_033898, intron 2 of 4) 10207 NR_104618 102467075 Hs.652949 NR_104618 ENSG00000250716 LINC01017 - long intergenic non-protein coding RNA 1017 ncRNA 150.333-142 chr16 20373076 20373370 + 1 NA intron (NM_174924, intron 5 of 11) intron (NM_174924, intron 5 of 11) -20345 NM_003361 7369 Hs.654425 NM_003361 ENSG00000169344 UMOD ADMCKD2|FJHN|HNFJ|HNFJ1|MCKD2|THGP|THP uromodulin protein-coding 151.667-24 chr1 172015071 172015324 + 1 NA intron (NM_001278252, intron 4 of 14) L1MC1|LINE|L1 -123611 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 304.667-9 chr12 45620174 45620621 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 107524 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 236.667-66 chr5 103948639 103949170 + 1 NA Intergenic Intergenic -386115 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 145.667-277 chr8 51741523 51741693 + 1 NA intron (NM_144651, intron 1 of 22) L1MD2|LINE|L1 67837 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 276.667-33 chr16 61312053 61312535 + 1 NA Intergenic Intergenic -256528 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 157.667-177 chr21 32060569 32060847 + 1 NA Intergenic Intergenic 25587 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 143.667-82 chr15 51548512 51548750 + 1 NA intron (NM_001174116, intron 6 of 42) intron (NM_001174116, intron 6 of 42) 74140 NM_001174117 23312 Hs.511386 NM_015263 ENSG00000104093 DMXL2 DFNA71|PEPNS|RC3 Dmx like 2 protein-coding 205.333-212 chr7 2152509 2152767 + 1 NA intron (NM_001013837, intron 10 of 18) intron (NM_001013837, intron 10 of 18) -63586 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 226.667-10 chr1 179303621 179304056 + 1 NA intron (NM_001252511, intron 2 of 14) intron (NM_001252511, intron 2 of 14) 10041 NM_003101 6646 Hs.445588 NM_003101 ENSG00000057252 SOAT1 ACACT|ACAT|ACAT-1|ACAT1|SOAT|STAT sterol O-acyltransferase 1 protein-coding 153.333-360 chr6 55917486 55917802 + 1 NA Intergenic Intergenic -42054 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 357.333-15 chr4 48502755 48503220 + 1 NA intron (NM_015030, intron 60 of 63) intron (NM_015030, intron 60 of 63) 12735 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 225.667-77 chr8 103833881 103834272 + 1 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) AluJr|SINE|Alu 14856 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 188.667-146 chr8 42242080 42242355 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 28744 NR_125823 101929897 Hs.60288 NR_125823 ENSG00000253408 LOC101929897 - uncharacterized LOC101929897 ncRNA 196.667-165 chr8 125132008 125132287 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) AluJr4|SINE|Alu 40287 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 144.667-25 chr10 36721764 36721935 + 1 NA Intergenic Intergenic -404008 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 164.333-56 chr12 44569858 44570024 + 1 NA intron (NM_006159, intron 16 of 20) intron (NM_006159, intron 16 of 20) 305720 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 227.333-75 chr22 20986820 20987089 + 1 NA intron (NM_006767, intron 3 of 20) intron (NM_006767, intron 3 of 20) 4657 NM_006767 8216 Hs.78788 NM_006767 ENSG00000099949 LZTR1 BTBD29|LZTR-1|NS10|NS2|SWNTS2 leucine zipper like transcription regulator 1 protein-coding 130.333-144 chr4 18656265 18656418 + 1 NA Intergenic Intergenic -634466 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 140.333-217 chr7 52565637 52565812 + 1 NA Intergenic Intergenic -469909 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 330.667-5 chr11 18584037 18584525 + 1 NA intron (NM_001040697, intron 1 of 11) AluJo|SINE|Alu 4453 NM_001297771 55293 Hs.407991 NM_018314 ENSG00000151116 UEVLD ATTP|UEV3 UEV and lactate/malate dehyrogenase domains protein-coding 217.333-163 chr9 73752582 73752915 + 1 NA Intergenic Intergenic 600883 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 158.667-293 chr6 128750206 128750422 + 1 NA Intergenic Intergenic -132824 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 284.667-51 chr7 83110028 83110543 + 1 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 52599 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 207.667-95 chr4 187180471 187180847 + 1 NA Intergenic Intergenic -21327 NR_147159 105377600 Hs.641158 NR_147159 LINC02374 - long intergenic non-protein coding RNA 2374 ncRNA 236.667-29 chr15 59337509 59338050 + 1 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) AluSz|SINE|Alu 35092 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 128.333-77 chr17 57208580 57208830 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -47146 NM_001322250 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 137.333-168 chr6 24059988 24060152 + 1 NA Intergenic Intergenic -66145 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 148.667-189 chr2 73491987 73492171 + 1 NA intron (NM_015120, intron 10 of 22) intron (NM_015120, intron 10 of 22) 34976 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 153.333-440 chr9 27822951 27823148 + 1 NA Intergenic Intergenic -249183 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 161.667-163 chr22 45696803 45696987 + 1 NA intron (NM_013236, intron 3 of 11) intron (NM_013236, intron 3 of 11) 25061 NM_013236 25814 Hs.475125 NM_013236 ENSG00000130638 ATXN10 E46L|HUMEEP|SCA10 ataxin 10 protein-coding 169.667-51 chr13 46731632 46731828 + 1 NA intron (NM_001164213, intron 17 of 18) L2b|LINE|L2 65431 NM_001984 2098 Hs.432491 NM_001984 ENSG00000139684 ESD FGH esterase D protein-coding 168.333-165 chr5 91794409 91794694 + 1 NA Intergenic Intergenic -411234 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 161.333-40 chr10 82476070 82476357 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L1MB3|LINE|L1 -243293 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 171.333-13 chr1 201877291 201877478 + 1 NA 3' UTR (NM_018085, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_018085, exon 24 of 24) -11285 NR_030775 149345 Hs.632471 NM_198149 ENSG00000198892 SHISA4 C1orf40|TMEM58 shisa family member 4 protein-coding 155.333-342 chr6 135703602 135703820 + 1 NA intron (NR_152842, intron 5 of 5) L2a|LINE|L2 -147990 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 192.333-78 chr18 76009109 76009381 + 1 NA Intergenic Intergenic -113753 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 276.333-13 chr14 33605129 33605481 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) L1ME1|LINE|L1 -103632 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 175.333-102 chr2 241100313 241100645 + 1 NA intron (NM_182501, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 1808 NR_138463 130916 Hs.159556 NM_182501 ENSG00000122085 MTERF4 MTERFD2 mitochondrial transcription termination factor 4 protein-coding 161.333-299 chr9 87985923 87986150 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -11256 NM_012119 23552 Hs.522274 NM_012119 ENSG00000156345 CDK20 CCRK|CDCH|P42|PNQALRE cyclin dependent kinase 20 protein-coding 134.667-171 chr6 64976407 64976641 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 14 of 43) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -324894 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 177.667-139 chr8 137321961 137322192 + 1 NA Intergenic Intergenic 91512 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 167.667-19 chr10 13729571 13729772 + 1 NA intron (NM_001318336, intron 11 of 23) intron (NM_001318336, intron 11 of 23) -22104 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 155.667-203 chr21 29795332 29795574 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 47278 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 235.333-5 chr1 179445724 179446169 + 1 NA intron (NM_144696, intron 16 of 25) L1MB8|LINE|L1 79902 NR_073544 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 123.667-165 chr5 144409284 144409461 + 1 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 203981 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 173.667-10 chr1 200023904 200024209 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3654 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 151.333-253 chr20 55377074 55377225 + 1 NA Intergenic Intergenic -45894 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 280.667-57 chr8 111805987 111806487 + 1 NA Intergenic PRIMA4_LTR|LTR|ERV1 429598 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 204.333-4 chr1 36902283 36902626 + 1 NA intron (NM_000831, intron 1 of 15) L1MC1|LINE|L1 132061 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 150.333-86 chr12 85694706 85694987 + 1 NA Intergenic Intergenic 141563 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 195.667-142 chr8 87138704 87139096 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 272485 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 174.333-82 chr22 43727801 43728027 + 1 NA intron (NM_198856, intron 6 of 29) L1PA8|LINE|L1 84391 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 157.333-192 chr2 109703118 109703341 + 1 NA Intergenic Intergenic 88865 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 128.333-138 chr4 54061579 54061755 + 1 NA intron (NM_012110, intron 1 of 5) intron (NM_012110, intron 1 of 5) 2938 NM_012110 26511 Hs.335393 NM_012110 ENSG00000109220 CHIC2 BTL cysteine rich hydrophobic domain 2 protein-coding 168.667-202 chr7 44858374 44858562 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -10342 NM_012412 94239 Hs.488189 NM_012412 ENSG00000105968 H2AFV H2A.Z-2|H2AV H2A histone family member V protein-coding 203.667-137 chr9 94197715 94197942 + 1 NA intron (NR_160773, intron 2 of 2) L1PB3|LINE|L1 6738 NR_046165 158257 Hs.652626 NR_046163 ENSG00000230262 LINC02603 MIRLET7DHG long intergenic non-protein coding RNA 2603 ncRNA 173.333-101 chr2 165065190 165065415 + 1 NA Intergenic Intergenic -109777 NM_001351540 151258 Hs.658702 NM_173512 ENSG00000169507 SLC38A11 AVT2 solute carrier family 38 member 11 protein-coding 149.667-34 chr1 183517453 183517703 + 1 NA intron (NM_001331007, intron 4 of 23) intron (NM_001331007, intron 4 of 23) 45079 NM_201569 9887 Hs.591463 NM_014837 ENSG00000116698 SMG7 C1orf16|EST1C|SGA56M SMG7 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 157.667-172 chr20 55878985 55879222 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 126416 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 206.333-28 chr11 93521429 93521711 + 1 NA intron (NM_020179, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 21821 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 238.667-36 chr19 6328050 6328449 + 1 NA intron (NM_133492, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 5363 NM_133492 125981 Hs.352609 NM_133492 ENSG00000167769 ACER1 ALKCDase1|ASAH3 alkaline ceramidase 1 protein-coding 163.333-205 chr4 98555373 98555639 + 1 NA intron (NM_005723, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 103105 NM_005723 10098 Hs.118118 NM_005723 ENSG00000168785 TSPAN5 NET-4|NET4|TM4SF9|TSPAN-5 tetraspanin 5 protein-coding 150.667-85 chr12 27054449 27054691 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 27952 NM_001080406 728858 Hs.334003 NM_001080406 ENSG00000214700 C12orf71 - chromosome 12 open reading frame 71 protein-coding 201.667-114 chr7 28616417 28616715 + 1 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -69567 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 155.667-282 chr5 80037243 80037519 + 1 NA intron (NM_001306214, intron 1 of 21) intron (NM_001306214, intron 1 of 21) 1358 NM_001306214 7060 Hs.211426 NM_003248 ENSG00000113296 THBS4 TSP-4|TSP4 thrombospondin 4 protein-coding 237.333-50 chr18 56030334 56030605 + 1 NA intron (NR_148972, intron 6 of 8) intron (NR_148972, intron 6 of 8) -11809 NR_146510 102724698 NR_146510 ENSG00000267057 LINC01905 - long intergenic non-protein coding RNA 1905 ncRNA 137.667-159 chr6 47924869 47925126 + 1 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 137929 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 279.667-21 chr18 2985894 2986488 + 1 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) 25756 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 310.333-7 chr1 219274718 219275160 + 1 NA Intergenic Intergenic 99970 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 322.334-5 chr2 154309908 154310406 + 1 NA intron (NM_052917, intron 9 of 12) intron (NM_052917, intron 9 of 12) 147281 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 151.333-135 chr14 86608112 86608347 + 1 NA Intergenic Intergenic -297549 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 161.667-175 chr3 122665198 122665415 + 1 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -15533 NM_017554 54625 Hs.518203 NM_017554 ENSG00000173193 PARP14 ARTD8|BAL2|PARP-14|pART8 poly(ADP-ribose) polymerase family member 14 protein-coding 238.667-45 chr2 108774640 108775053 + 1 NA intron (NM_006267, intron 23 of 28) AluSx1|SINE|Alu -11904 NM_001351544 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 177.667-3 chr1 40988831 40989042 + 1 NA intron (NR_125440, intron 5 of 17) (GCAGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 417 NM_001301237 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 129.667-35 chr11 94788240 94788390 + 1 NA intron (NM_001301007, intron 1 of 11) intron (NM_001301007, intron 1 of 11) 19959 NM_001301007 154810 Hs.503594 NM_130847 ENSG00000166025 AMOTL1 JEAP angiomotin like 1 protein-coding 152.333-282 chr4 120977820 120977980 + 1 NA Intergenic Intergenic -55034 NM_001300823 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 136.333-167 chr5 63072718 63072867 + 1 NA Intergenic Intergenic 493973 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 135.667-130 chr4 60318683 60318901 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -603827 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 148.667-174 chr2 20810528 20810806 + 1 NA intron (NM_021925, intron 1 of 6) intron (NM_021925, intron 1 of 6) 12434 NM_021925 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 151.333-217 chr2 123235112 123235402 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -161776 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 210.667-44 chr14 69866288 69866576 + 1 NA Intergenic Intergenic -12984 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 309.667-21 chr5 22945367 22945868 + 1 NA Intergenic Intergenic -92273 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 148.333-145 chr15 81486736 81486906 + 1 NA Intergenic Intergenic -112608 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 151.667-193 chr20 54492226 54492488 + 1 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) intron (NM_018431, intron 1 of 7) 16764 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 198.333-104 chr2 174927544 174927904 + 1 NA intron (NM_001025201, intron 4 of 12) intron (NM_001025201, intron 4 of 12) 77529 NM_001822 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 211.333-72 chr15 68274742 68275119 + 1 NA Intergenic Intergenic -2815 NM_015322 10116 Hs.362733 NM_015322 ENSG00000169018 FEM1B F1A-ALPHA|F1AA|FEM1-beta fem-1 homolog B protein-coding 147.333-29 chr1 226419824 226420146 + 1 NA Intergenic Intergenic -11892 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 125.667-40 chr11 110286853 110287018 + 1 NA intron (NM_001260493, intron 1 of 15) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 9777 NM_001260494 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 127.333-84 chr2 123159057 123159204 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -85649 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 136.667-28 chr11 8943546 8943703 + 1 NA promoter-TSS (NM_020646) promoter-TSS (NM_020646) -591 NM_020646 56676 Hs.501852 NM_020646 ENSG00000176009 ASCL3 HASH3|SGN1|bHLHa42 achaete-scute family bHLH transcription factor 3 protein-coding 267.333-3 chr1 31912385 31912721 + 1 NA intron (NM_001195101, intron 2 of 4) intron (NM_001195101, intron 2 of 4) 25265 NM_001369860 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 344.333-4 chr12 84273145 84273586 + 1 NA Intergenic Intergenic 639434 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 239.667-66 chr7 14774083 14774601 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) intron (NM_001350717, intron 2 of 24) 67108 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 131.333-197 chr9 112640576 112640738 + 1 NA intron (NM_001287036, intron 3 of 4) L1MEg|LINE|L1 77460 NM_021218 58493 Hs.658575 NM_021218 ENSG00000148153 INIP C9orf80|HSPC043|MISE|SOSSC|SSBIP1|hSSBIP1 INTS3 and NABP interacting protein protein-coding 277.333-83 chr7 114857804 114858135 + 1 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -64185 NM_199072 29969 Hs.741413 NM_199072 ENSG00000135272 MDFIC HIC|MDFIC1 MyoD family inhibitor domain containing protein-coding 226.333-78 chr3 81942064 81942448 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -43886 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 178.667-116 chr4 52072294 52072531 + 1 NA intron (NM_001346103, intron 2 of 8) AluSx|SINE|Alu 21108 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 155.333-215 chr22 27592373 27592618 + 1 NA Intergenic Intergenic 209261 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 190.333-125 chr5 169057116 169057393 + 1 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) intron (NM_003062, intron 4 of 35) 44027 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 183.333-23 chr11 59590020 59590294 + 1 NA intron (NM_002556, intron 9 of 13) intron (NM_002556, intron 9 of 13) 5001 NR_036120 100422880 NR_036120 ENSG00000264559 MIR3162 mir-3162 microRNA 3162 ncRNA 207.333-57 chr12 10205647 10205949 + 1 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL -7079 NM_031412 23710 Hs.524250 NM_031412 ENSG00000139112 GABARAPL1 APG8-LIKE|APG8L|ATG8|ATG8B|ATG8L|GEC1 GABA type A receptor associated protein like 1 protein-coding 163.333-238 chr6 34611950 34612145 + 1 NA intron (NM_022758, intron 2 of 3) intron (NM_022758, intron 2 of 3) -55714 NM_001252294 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 116.667-159 chr5 54475388 54475575 + 1 NA Intergenic Intergenic 19782 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 149.333-420 chr9 26031315 26031483 + 1 NA Intergenic Intergenic -35276 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 149.333-38 chr10 4874568 4874741 + 1 NA intron (NR_026743, intron 10 of 10) L2a|LINE|L2 41619 NR_026743 389932 Hs.631812 NR_026743 AKR1C6P TAKR aldo-keto reductase family 1 member C6, pseudogene pseudo 215.667-26 chr12 5733866 5734204 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 13 of 25) intron (NM_001278596, intron 13 of 25) 211224 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 175.333-106 chr21 29199336 29199689 + 1 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) MER4B|LTR|ERV1 6018 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 151.333-389 chr7 48437330 48437565 + 1 NA intron (NM_152701, intron 42 of 61) L1MB3|LINE|L1 265989 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 222.333-40 chr19 16399030 16399451 + 1 NA intron (NM_021235, intron 16 of 22) intron (NM_021235, intron 16 of 22) 72730 NM_001258374 58513 Hs.654639 NM_021235 ENSG00000127527 EPS15L1 EPS15R epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 like 1 protein-coding 232.333-56 chr3 35599081 35599375 + 1 NA Intergenic Intergenic -40297 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 120.667-48 chr13 109188172 109188379 + 1 NA intron (NM_015011, intron 34 of 34) L1MB7|LINE|L1 -20972 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 123.333-28 chr10 14663419 14663623 + 1 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) intron (NM_001282695, intron 2 of 5) -59120 NM_001282697 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 251.667-53 chr21 30518272 30518698 + 1 NA Intergenic Intergenic -16344 NM_181611 337972 Hs.553694 NM_181611 ENSG00000186977 KRTAP19-5 KAP19.5 keratin associated protein 19-5 protein-coding 141.667-169 chr5 12303488 12303648 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -271289 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 114.333-102 chr2 68549469 68549589 + 1 NA intron (NM_173545, intron 8 of 9) L1MEg|LINE|L1 81944 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 222.667-16 chr12 22164482 22164869 + 1 NA Intergenic Intergenic 118457 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 116.667-42 chr12 127090478 127090654 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -30169 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 184.667-68 chr20 14065017 14065250 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 2 of 17) intron (NM_001351663, intron 2 of 17) 69617 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 146.333-329 chr8 111808125 111808314 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 431580 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 258.333-64 chr8 88543058 88543387 + 1 NA Intergenic Intergenic -215739 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 113.667-118 chr2 186100802 186100952 + 1 NA Intergenic Intergenic -14560 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 175.667-4 chr1 94881138 94881384 + 1 NA intron (NM_001258340, intron 12 of 14) intron (NM_001258340, intron 12 of 14) 44547 NM_001286056 1266 Hs.483454 NM_001839 ENSG00000117519 CNN3 - calponin 3 protein-coding 216.333-16 chr10 34753025 34753403 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 62082 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 131.667-190 chr8 51850499 51850714 + 1 NA intron (NM_001286783, intron 1 of 5) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -41161 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 313.667-17 chr16 49349560 49350044 + 1 NA Intergenic Intergenic -24002 NM_144602 123970 Hs.125875 NM_144602 ENSG00000166152 C16orf78 - chromosome 16 open reading frame 78 protein-coding 231.333-61 chr2 167239459 167239968 + 1 NA intron (NM_001199144, intron 3 of 8) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 52341 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 181.333-41 chr14 28409578 28409898 + 1 NA Intergenic Intergenic 355581 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 167.333-97 chr16 5932948 5933266 + 1 NA Intergenic Intergenic -85917 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 151.333-244 chr20 21138549 21138816 + 1 NA intron (NM_018474, intron 3 of 12) L1MC4|LINE|L1 12600 NM_001352436 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 163.667-22 chr10 56361043 56361286 + 1 NA promoter-TSS (NM_007057) promoter-TSS (NM_007057) 95 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 162.333-82 chr15 23471065 23471291 + 1 NA Intergenic LTR1E|LTR|ERV1 -23935 NM_001304388 283685 NM_182561 ENSG00000174450 GOLGA6L2 CT105 golgin A6 family like 2 protein-coding 219.333-28 chr10 91730827 91731184 + 1 NA Intergenic Intergenic 67191 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 241.667-39 chr2 127709817 127710127 + 1 NA intron (NM_018383, intron 18 of 21) intron (NM_018383, intron 18 of 21) 8475 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 174.333-117 chr5 57345092 57345313 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 131128 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 238.333-78 chr6 66403637 66403923 + 1 NA Intergenic Intergenic 615901 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 202.333-5 chr1 42514674 42515014 + 1 NA intron (NM_001355227, intron 6 of 18) AluSx1|SINE|Alu -18176 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 152.667-286 chr5 14294954 14295151 + 1 NA intron (NM_007118, intron 6 of 56) intron (NM_007118, intron 6 of 56) 151710 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 191.333-46 chr12 78120651 78121014 + 1 NA intron (NM_001024383, intron 15 of 39) intron (NM_001024383, intron 15 of 39) 238914 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 188.333-85 chr2 236517091 236517484 + 1 NA Intergenic Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger -9752 NM_001270584 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 127.333-80 chr2 61825243 61825486 + 1 NA non-coding (NR_037710, exon 6 of 6) non-coding (NR_037710, exon 6 of 6) 28696 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 126.667-124 chr4 79499004 79499210 + 1 NA intron (NR_038826, intron 2 of 3) intron (NR_038826, intron 2 of 3) 6514 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 159.333-78 chr13 44085600 44085812 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -24843 NR_104065 101929212 Hs.534877 NR_104064 ENSG00000227258 SMIM2-AS1 C13orf44-AS1|C3orf81-AS1 SMIM2 antisense RNA 1 ncRNA 147.667-176 chr2 88380623 88380782 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 71991 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 153.667-237 chr22 29144563 29144720 + 1 NA 3' UTR (NM_001039570, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001039570, exon 9 of 9) -61255 NM_001267895 129080 Hs.289106 NM_133455 ENSG00000186998 EMID1 EMI5|EMU1 EMI domain containing 1 protein-coding 150.333-257 chr3 11521899 11522054 + 1 NA intron (NM_001349238, intron 17 of 17) MIR|SINE|MIR 46822 NM_001128221 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 298.333-20 chr2 44273224 44273654 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2041 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 240.667-49 chr2 157057722 157058130 + 1 NA Intergenic Intergenic -199779 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 207.333-202 chr4 93206357 93206676 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 3 of 14) intron (NM_001286838, intron 3 of 14) -622237 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 337.667-19 chr3 124143384 124143868 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) intron (NM_001024660, intron 1 of 59) 10697 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 252.667-50 chr2 139540557 139540863 + 1 NA Intergenic Intergenic 643386 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 149.333-303 chr5 25052401 25052633 + 1 NA Intergenic Intergenic 138139 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 215.667-36 chr14 33623335 33623801 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 -85369 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 209.333-209 chr6 130738135 130738482 + 1 NA Intergenic Intergenic -89097 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 238.333-31 chr17 42440781 42441134 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -17701 NM_012232 284119 Hs.437191 NM_012232 ENSG00000177469 CAVIN1 CAVIN|CGL4|FKSG13|PTRF|cavin-1 caveolae associated protein 1 protein-coding 204.333-56 chr14 69181308 69181624 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -10011 NR_034164 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 115.333-109 chr2 73405654 73405873 + 1 NA intron (NM_015120, intron 1 of 22) L1MA9|LINE|L1 20005 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 150.667-238 chr3 40054542 40054739 + 1 NA intron (NM_001284425, intron 3 of 15) MLT2D|LTR|ERVL -45371 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 201.667-95 chr5 96870742 96870999 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5069 NR_137637 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 214.333-143 chr7 37987146 37987412 + 1 NA Intergenic Intergenic 65960 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 175.333-65 chr17 58870887 58871201 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 115175 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 159.667-47 chr10 64321134 64321336 + 1 NA Intergenic Intergenic -504293 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 121.333-10 chr1 115927678 115927846 + 1 NA intron (NR_125970, intron 2 of 4) MER3|DNA|hAT-Charlie 8386 NR_125969 101928995 Hs.559119 NR_125969 ENSG00000228127 LINC01649 - long intergenic non-protein coding RNA 1649 ncRNA 286.667-43 chr8 106558004 106558474 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -99569 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 174.667-40 chr13 41055688 41056064 + 1 NA intron (NM_001370329, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 5510 NM_001370329 1997 Hs.135646 NM_172373 ENSG00000120690 ELF1 EFTUD1|RIA1 E74 like ETS transcription factor 1 protein-coding 229.667-75 chr7 114851772 114852134 + 1 NA Intergenic Intergenic -70201 NM_199072 29969 Hs.741413 NM_199072 ENSG00000135272 MDFIC HIC|MDFIC1 MyoD family inhibitor domain containing protein-coding 201.667-76 chr3 57500886 57501247 + 1 NA intron (NM_198564, intron 11 of 11) AluJo|SINE|Alu 43278 NM_198564 201625 Hs.201378 NM_178504 ENSG00000174844 DNAH12 DHC3|DLP12|DLP3|DNAH12L|DNAH7L|DNAHC12|DNAHC3|DNHD2|HDHC3|HL-19|HL19 dynein axonemal heavy chain 12 protein-coding 146.333-209 chr3 89106085 89106239 + 1 NA Intergenic Intergenic -1459 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 230.667-75 chr6 153702298 153702741 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -307977 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 164.667-95 chr18 13116339 13116516 + 1 NA exon (NM_032142, exon 43 of 45) exon (NM_032142, exon 43 of 45) -102333 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 159.667-273 chr5 132859829 132859999 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 5447 NM_005260 2661 Hs.25022 NM_005260 ENSG00000164404 GDF9 POF14 growth differentiation factor 9 protein-coding 156.333-349 chr7 144691296 144691577 + 1 NA intron (NM_001042482, intron 3 of 7) L1PA15|LINE|L1 47462 NR_146936 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 181.667-34 chr14 20994712 20995094 + 1 NA TTS (NR_110139) TTS (NR_110139) 4260 NR_110139 101929718 Hs.706252 NR_110139 ENSG00000258471 LOC101929718 - uncharacterized LOC101929718 ncRNA 208.667-60 chr18 60059336 60059704 + 1 NA Intergenic Intergenic 159524 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 145.667-161 chr20 55577501 55577757 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -150432 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 160.667-311 chr8 121233290 121233481 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -405961 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 126.667-68 chr18 13519173 13519329 + 1 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) L1MEd|LINE|L1 59304 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 163.333-108 chr16 18951177 18951397 + 1 NA Intergenic Intergenic -24883 NM_015092 23049 Hs.460179 NM_015092 ENSG00000157106 SMG1 61E3.4|ATX|LIP SMG1 nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase protein-coding 345.333-9 chr14 50283516 50283892 + 1 NA intron (NM_024884, intron 5 of 9) MER2|DNA|TcMar-Tigger 16242 NR_039726 100616261 NR_039726 ENSG00000264712 MIR4504 - microRNA 4504 ncRNA 156.667-70 chr11 115375834 115376050 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -20814 NR_135102 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 187.333-48 chr12 111998305 111998539 + 1 NA intron (NM_138341, intron 2 of 9) MER65C|LTR|ERV1 14743 NM_001193531 89894 Hs.506815 NM_138341 ENSG00000198270 TMEM116 - transmembrane protein 116 protein-coding 172.667-22 chr10 50528785 50528962 + 1 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) intron (NM_147156, intron 2 of 10) 95083 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 117.333-27 chr10 109990807 109991029 + 1 NA intron (NR_038943, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 -5455 NM_001320591 120 Hs.501012 NM_001121 ENSG00000148700 ADD3 ADDL|CPSQ3 adducin 3 protein-coding 150.667-93 chr12 106541528 106541709 + 1 NA intron (NR_040246, intron 1 of 3) AluSz6|SINE|Alu -41289 NM_213594 5992 Hs.388827 NM_002920 ENSG00000111783 RFX4 NYD-SP10 regulatory factor X4 protein-coding 123.667-10 chr1 85152030 85152236 + 1 NA Intergenic Intergenic 18339 NR_039619 100616481 NR_039619 ENSG00000266110 MIR4423 mir-4423 microRNA 4423 ncRNA 133.667-64 chr18 12927240 12927542 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -20593 NM_031216 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 169.667-111 chr2 118447581 118447787 + 1 NA Intergenic Intergenic 155282 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 155.333-89 chr13 34082104 34082313 + 1 NA Intergenic Intergenic 264059 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 127.667-55 chr16 3272989 3273202 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 9327 NR_033904 283876 Hs.592092 NR_033904 ENSG00000281005 LINC00921 - long intergenic non-protein coding RNA 921 ncRNA 306.333-8 chr10 115174611 115175109 + 1 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) L1MB8|LINE|L1 81495 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 183.333-10 chr1 185716406 185716788 + 1 NA Intergenic Intergenic -17794 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 130.333-112 chr2 212727366 212727591 + 1 NA Intergenic Intergenic -67853 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 163.667-68 chr15 62945412 62945670 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -97206 NM_001018004 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 176.667-74 chr2 20248311 20248622 + 1 NA TTS (NM_001352918) TTS (NM_001352918) -23033 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 178.333-169 chr8 88406189 88406471 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -78847 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 149.667-420 chr9 24736460 24736801 + 1 NA Intergenic Intergenic -190733 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 155.333-382 chr8 61296372 61296554 + 1 NA intron (NM_173519, intron 1 of 5) intron (NM_173519, intron 1 of 5) 8493 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 159.333-172 chr2 172091730 172091913 + 1 NA Intergenic Intergenic 6314 NM_178120 1745 Hs.407015 NM_178120 ENSG00000144355 DLX1 - distal-less homeobox 1 protein-coding 182.333-90 chr2 182242230 182242574 + 1 NA promoter-TSS (NM_001258314) promoter-TSS (NM_001258314) -339 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 146.667-78 chr12 71176226 71176443 + 1 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -18335 NM_004616 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 311.333-4 chr1 216250234 216250616 + 1 NA intron (NM_206933, intron 12 of 71) intron (NM_206933, intron 12 of 71) 172971 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 149.333 chr1 29494022 29494267 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -144030 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 160.667-144 chr2 73012100 73012297 + 1 NA intron (NR_138476, intron 6 of 14) L1ME3G|LINE|L1 46974 NM_001330407 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 186.667-64 chr2 62972549 62972898 + 1 NA intron (NM_001354215, intron 15 of 24) intron (NM_001354215, intron 15 of 24) 74988 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 160.667-267 chr6 106541768 106541944 + 1 NA intron (NM_001371242, intron 10 of 21) intron (NM_001371242, intron 10 of 21) 30001 NM_001624 202 Hs.724262 NM_001624 ENSG00000112297 CRYBG1 AIM1|ST4 crystallin beta-gamma domain containing 1 protein-coding 123.667-148 chr4 116269208 116269399 + 1 NA Intergenic Intergenic -30422 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 203.667-45 chr18 65849053 65849372 + 1 NA intron (NM_001362438, intron 7 of 11) intron (NM_001362438, intron 7 of 11) 98200 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 259.667-71 chr7 12418982 12419321 + 1 NA Intergenic Intergenic -15210 NM_001346972 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 145.333-208 chr4 33975816 33976014 + 1 NA intron (NR_125902, intron 2 of 4) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 63978 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 152.667-258 chr3 153458071 153458241 + 1 NA intron (NR_146713, intron 5 of 6) L1MA6|LINE|L1 -26339 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 141.667-148 chr3 112857699 112857874 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -11836 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 141.333-212 chr6 87406186 87406416 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -1671 NM_001031743 154313 Hs.82921 NM_178823 ENSG00000272514 CFAP206 C6orf165|dJ382I10.1 cilia and flagella associated protein 206 protein-coding 250.333-53 chr4 150916993 150917375 + 1 NA intron (NM_001367550, intron 5 of 56) intron (NM_001367550, intron 5 of 56) 98083 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 204.667-54 chr16 68280622 68280898 + 1 NA intron (NM_003983, intron 3 of 10) AluY|SINE|Alu 16234 NM_003983 9057 Hs.679580 NM_003983 ENSG00000103064 SLC7A6 LAT-2|LAT3|y+LAT-2 solute carrier family 7 member 6 protein-coding 148.667-241 chr3 7735625 7735814 + 1 NA intron (NM_181874, intron 10 of 10) MER102c|DNA|hAT-Charlie -200435 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 255.333-93 chr7 3081500 3081989 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -37877 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 163.333-51 chr11 31843644 31843913 + 1 NA intron (NR_033971, intron 1 of 2) L1MD3|LINE|L1 17211 NR_117094 103157000 NR_117094 ENSG00000281880 PAUPAR - PAX6 upstream antisense RNA ncRNA 142.333-188 chr4 180130624 180130885 + 1 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie 1028395 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 156.333-130 chr16 23831494 23831778 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -4347 NM_002738 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 148.667-3 chr1 32472023 32472297 + 1 NA intron (NM_001145720, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 7088 NM_001145720 728116 Hs.647658 NM_001145720 ENSG00000273274 ZBTB8B ZNF916B zinc finger and BTB domain containing 8B protein-coding 151.333-227 chr2 171912011 171912267 + 1 NA Intergenic LTR18B|LTR|ERVL -10286 NR_027862 8520 Hs.632532 NM_003642 ENSG00000128708 HAT1 KAT1 histone acetyltransferase 1 protein-coding 196.333-43 chr14 73807928 73808255 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 20731 NR_109995 100506476 Hs.287299 NR_109995 LOC100506476 - uncharacterized LOC100506476 ncRNA 154.667-110 chr14 56807462 56807641 + 1 NA intron (NR_073034, intron 2 of 3) intron (NR_073034, intron 2 of 3) -1884 NR_073036 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 149.333-417 chr9 12517358 12517597 + 1 NA Intergenic Intergenic -175908 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 217.333-5 chr1 70357681 70357994 + 1 NA intron (NM_001036645, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 3026 NM_001036645 11147 Hs.142245 NM_007071 ENSG00000197568 HHLA3 - HERV-H LTR-associating 3 protein-coding 330.667-8 chr14 36238267 36238780 + 1 NA Intergenic Intergenic -61872 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 162.333-182 chr4 59640849 59641136 + 1 NA Intergenic Intergenic 627419 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 139.667-80 chr19 38836889 38837145 + 1 NA intron (NM_001005335, intron 12 of 12).2 intron (NM_001005335, intron 12 of 12).2 -5223 NM_001398 1891 Hs.196176 NM_001398 ENSG00000104823 ECH1 HPXEL enoyl-CoA hydratase 1 protein-coding 238.667-34 chr17 61420940 61421249 + 1 NA Intergenic Intergenic 9343 NR_160788 388407 Hs.434459 NM_203425 C17orf82 - chromosome 17 open reading frame 82 ncRNA 233.667-3 chr1 150342878 150343341 + 1 NA intron (NM_004698, intron 9 of 15) AluSx|SINE|Alu -21002 NM_001297673 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 165.667-50 chr14 56039749 56040049 + 1 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -78512 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 234.333-36 chr18 71183026 71183422 + 1 NA Intergenic Intergenic 395732 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 176.333-30 chr11 91444160 91444350 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -575053 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 207.333-166 chr21 26864159 26864478 + 1 NA Intergenic Intergenic -18909 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 158.667-190 chr21 27253687 27253947 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -286729 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 145.667-168 chr22 24489713 24489912 + 1 NA intron (NR_028483, intron 1 of 7) L1MA2|LINE|L1 5262 NR_028483 646023 Hs.632761 NM_001039784 ENSG00000178803 ADORA2A-AS1 C22orf45 ADORA2A antisense RNA 1 ncRNA 147.333-263 chr5 58383583 58383836 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 76377 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 158.667-96 chr14 52674208 52674433 + 1 NA intron (NM_014584, intron 4 of 15) AluJr4|SINE|Alu 21238 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 188.667-28 chr11 86247516 86247793 + 1 NA intron (NM_001330334, intron 1 of 9) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 2901 NM_003797 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 241.667-22 chr14 22492232 22492531 + 1 NA Intergenic Intergenic -9422 NR_148361 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 279.333-8 chr1 235245892 235246324 + 1 NA intron (NR_135074, intron 7 of 24) intron (NR_135074, intron 7 of 24) -55992 NR_039908 100616224 NR_039908 ENSG00000263439 MIR4753 mir-4753 microRNA 4753 ncRNA 158.667-317 chr8 49527619 49527930 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -15594 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 143.333-151 chr2 191005161 191005308 + 1 NA intron (NM_007315, intron 5 of 24) L1MC5|LINE|L1 9016 NM_139266 6772 Hs.642990 NM_007315 ENSG00000115415 STAT1 CANDF7|IMD31A|IMD31B|IMD31C|ISGF-3|STAT91 signal transducer and activator of transcription 1 protein-coding 177.667-43 chr13 67393363 67393670 + 1 NA Intergenic Intergenic 21129 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 205.667-6 chr1 68200536 68200895 + 1 NA intron (NM_024911, intron 1 of 11) intron (NM_024911, intron 1 of 11) -17105 NR_031664 100302279 NR_031664 ENSG00000221203 MIR1262 MIRN1262|hsa-mir-1262|mir-1262 microRNA 1262 ncRNA 188.333-95 chr3 51671578 51671787 + 1 NA promoter-TSS (NR_103463) promoter-TSS (NR_103463) 55 NR_103463 51368 Hs.517864 NM_015926 ENSG00000164081 TEX264 ZSIG11 testis expressed 264, ER-phagy receptor protein-coding 133.667-46 chr13 80807020 80807190 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -211286 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 241.667-16 chr11 130495639 130496001 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 46846 NM_139055 170689 Hs.534221 NM_139055 ENSG00000166106 ADAMTS15 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 15 protein-coding 208.667-31 chr11 105942829 105943220 + 1 NA intron (NM_000829, intron 14 of 16) intron (NM_000829, intron 14 of 16) 79216 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 164.333-227 chr7 47906877 47907136 + 1 NA intron (NM_138295, intron 9 of 56) intron (NM_138295, intron 9 of 56) 41485 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 163.667-41 chr11 103903652 103903923 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 53881 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 162.333-52 chr12 40512119 40512307 + 1 NA exon (NM_173600, exon 84 of 174) exon (NM_173600, exon 84 of 174) 118819 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 215.333-207 chr9 35292634 35292915 + 1 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) intron (NM_006377, intron 7 of 38) -49122 NM_001371188 259.333-91 chr7 278777 279154 + 1 NA Intergenic Intergenic 86394 NM_020223 56975 Hs.134742 NM_020223 ENSG00000177706 FAM20C DMP-4|DMP4|G-CK|GEF-CK|RNS FAM20C golgi associated secretory pathway kinase protein-coding 150.667-200 chr2 197930113 197930270 + 1 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 125598 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 157.333-260 chr4 65678908 65679067 + 1 NA intron (NR_034138, intron 2 of 3) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -8492 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 249.333-40 chr16 56304066 56304390 + 1 NA intron (NM_138736, intron 3 of 7) intron (NM_138736, intron 3 of 7) 58708 NR_037499 100500891 NR_037499 ENSG00000265281 MIR3935 - microRNA 3935 ncRNA 149.333-133 chr16 64100460 64100728 + 1 NA Intergenic Intergenic 1021469 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 217.333-145 chr8 23545144 23545543 + 1 NA intron (NM_001317813, intron 2 of 4) intron (NM_001317813, intron 2 of 4) 16387 NM_001317814 51312 Hs.596025 NM_016612 ENSG00000147454 SLC25A37 HT015|MFRN|MFRN1|MSC|MSCP|PRO1278|PRO1584|PRO2217 solute carrier family 25 member 37 protein-coding 182.667-47 chr14 68203967 68204301 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 380542 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 224.667-68 chr6 100333214 100333522 + 1 NA Intergenic Intergenic 130307 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 324.333-16 chr16 12116073 12116694 + 1 NA intron (NM_032167, intron 11 of 20) L1MB5|LINE|L1 139649 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 401.667-5 chr15 74902681 74903412 + 1 NA TTS (NM_002435) TTS (NM_002435) 3805 NR_135844 57184 Hs.367690 NM_020447 ENSG00000178761 FAM219B C15orf17 family with sequence similarity 219 member B protein-coding 122.667-44 chr14 46412700 46412827 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) -58596 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 151.667-304 chr6 18994710 18994900 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 185675 NR_110860 101928519 Hs.551771 NR_110860 LOC101928519 - uncharacterized LOC101928519 ncRNA 378.333-10 chr4 63656230 63656896 + 1 NA Intergenic Intergenic 752887 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 226.333-52 chr18 58002391 58002739 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -41661 NM_015277 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 206.333-99 chr20 4571979 4572306 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -114314 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 208.667-117 chr5 179094508 179094909 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 34335 NM_014594 30832 Hs.272328 NM_014594 ENSG00000177932 ZNF354C KID3 zinc finger protein 354C protein-coding 320.667-34 chr9 25976528 25976993 + 1 NA Intergenic Intergenic -89915 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 126.333-166 chr7 49139129 49139376 + 1 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 214705 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 243.333-115 chr8 119706747 119707175 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -33571 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 189.667-25 chr11 44970031 44970252 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3761 NR_026681 221122 Hs.551656 NR_026681 ENSG00000254654 LINC02685 - long intergenic non-protein coding RNA 2685 ncRNA 199.333-257 chr7 25742930 25743213 + 1 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) 7961 NR_157815 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 187.667-109 chr4 80573775 80574157 + 1 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) L1MA3|LINE|L1 238246 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 200.667-69 chr2 21943193 21943514 + 1 NA Intergenic Intergenic -232701 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 196.333-95 chr2 227998426 227998658 + 1 NA intron (NM_030623, intron 7 of 10) intron (NM_030623, intron 7 of 10) 126911 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 149.667-414 chr8 129555591 129555824 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 19311 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 149.667-223 chr2 184409167 184409361 + 1 NA Intergenic Intergenic 30289 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 117.333-90 chr18 66493066 66493216 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 110949 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 140.333-233 chr8 108509755 108509985 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 66246 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 147.667-57 chr11 68609026 68609234 + 1 NA intron (NR_147971, intron 23 of 24) intron (NR_147971, intron 23 of 24) -75414 NM_015973 51083 Hs.278959 NM_015973 ENSG00000069482 GAL ETL8|GAL-GMAP|GALN|GLNN|GMAP galanin and GMAP prepropeptide protein-coding 163.667-71 chr15 89947359 89947583 + 1 NA Intergenic Intergenic -34519 NM_182616 348110 Hs.6734 NM_182616 ENSG00000242498 ARPIN C15orf38 actin related protein 2/3 complex inhibitor protein-coding 273.333-62 chr5 135412331 135412731 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -12644 NM_004893 9555 Hs.420272 NM_004893 ENSG00000113648 H2AFY H2A.y|H2A/y|H2AF12M|MACROH2A1.1|mH2A1|macroH2A1.2 H2A histone family member Y protein-coding 151.333-396 chr7 82544676 82544827 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -100795 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 182.333-166 chr9 29147306 29147660 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 64816 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 204.667-129 chr5 146228482 146228926 + 1 NA intron (NM_018989, intron 3 of 20) AluJr|SINE|Alu 25099 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 226.333-29 chr14 50413202 50413469 + 1 NA Intergenic Intergenic -16037 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 169.667-88 chr17 39811393 39811628 + 1 NA intron (NM_001257409, intron 2 of 5) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -33285 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 147.667-175 chr2 75027157 75027347 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -63560 NR_049796 100846995 NR_049796 ENSG00000263909 MIR5000 - microRNA 5000 ncRNA 154.333-328 chr7 79799665 79799821 + 1 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -335088 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 159.667-126 chr16 72815481 72815780 + 1 NA intron (NM_001164766, intron 4 of 8) intron (NM_001164766, intron 4 of 8) -150660 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 133.667-145 chr7 124574698 124575008 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 190939 NM_005302 2861 Hs.406094 NM_005302 ENSG00000170775 GPR37 EDNRBL|PAELR|hET(B)R-LP G protein-coupled receptor 37 protein-coding 286.667-29 chr4 93079670 93079987 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) -748925 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 147.667-135 chr17 34418209 34418361 + 1 NA Intergenic Intergenic -55052 NM_002981 6346 Hs.72918 NM_002981 ENSG00000108702 CCL1 I-309|P500|SCYA1|SISe|TCA3 C-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 155.667-382 chr9 29297649 29297900 + 1 NA Intergenic Intergenic -84173 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 337.333-39 chr6 28110474 28110979 + 1 NA Intergenic UCON74|DNA?|DNA? -13830 NM_001320558 80345 Hs.656641 NM_025231 ENSG00000196812 ZSCAN16 ZNF392|ZNF435|dJ265C24.3 zinc finger and SCAN domain containing 16 protein-coding 203.667-59 chr2 153004017 153004424 + 1 NA Intergenic Intergenic 285583 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 232.667-17 chr13 30734802 30735103 + 1 NA promoter-TSS (NM_001629) promoter-TSS (NM_001629) -556 NM_001629 241 Hs.507658 NM_001629 ENSG00000132965 ALOX5AP FLAP arachidonate 5-lipoxygenase activating protein protein-coding 235.667-70 chr9 80434037 80434448 + 1 NA Intergenic Intergenic 459219 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 149.667-349 chr6 70711172 70711372 + 1 NA intron (NM_001281440, intron 1 of 10) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 42742 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 191.333-100 chr2 13025840 13026073 + 1 NA Intergenic Intergenic -18943 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 227.667-67 chr6 124047384 124047696 + 1 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) LTR84b|LTR|ERVL -235465 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 140.667-46 chr11 8507142 8507323 + 1 NA intron (NM_001352388, intron 1 of 14) intron (NM_001352388, intron 1 of 14) 86744 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 150.333-396 chr8 48400645 48400946 + 1 NA Intergenic Intergenic -150772 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 143.333-209 chr4 88899473 88899687 + 1 NA intron (NM_014883, intron 6 of 23) intron (NM_014883, intron 6 of 23) -76219 NM_001265579 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 134.667-206 chr9 71453075 71453277 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -6205 NM_001366144 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 195.667-74 chr2 203663647 203664001 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -42651 NM_001243078 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 138.667-52 chr12 126482705 126482906 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -33478 NR_147498 283435 Hs.667334 NR_147498 LINC02825 - long intergenic non-protein coding RNA 2825 ncRNA 311.667-26 chr8 59389858 59390358 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 270898 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 292.333-33 chr4 106146764 106147106 + 1 NA intron (NM_001290768, intron 24 of 26) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -124457 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 138.667-59 chr14 53529009 53529171 + 1 NA Intergenic Intergenic 375736 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 169.333-42 chr11 111651841 111652062 + 1 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) intron (NM_015191, intron 3 of 14) 49502 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 216.667-91 chr6 12505833 12506111 + 1 NA Intergenic Intergenic 79432 NR_149140 101928309 Hs.639414 NR_149140 ENSG00000234015 LINC02530 - long intergenic non-protein coding RNA 2530 ncRNA 155.667-236 chr3 177208180 177208412 + 1 NA Intergenic MamRep1151|LTR?|LTR? -10814 NM_001321194 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 355.333-21 chr4 34481257 34481991 + 1 NA Intergenic Intergenic -211877 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 220.333-118 chr6 131608456 131608715 + 1 NA intron (NM_015979, intron 12 of 30) intron (NM_015979, intron 12 of 30) 19657 NM_001270521 9439 Hs.29679 NM_004830 ENSG00000112282 MED23 ARC130|CRSP130|CRSP133|CRSP3|DRIP130|MRT18|SUR-2|SUR2 mediator complex subunit 23 protein-coding 341.333-30 chr8 84025843 84026279 + 1 NA Intergenic Intergenic -156726 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 202.667-66 chr17 3785807 3786110 + 1 NA intron (NM_002208, intron 1 of 30) AluY|SINE|Alu 15230 NM_002208 3682 Hs.513867 NM_002208 ENSG00000083457 ITGAE CD103|HUMINAE integrin subunit alpha E protein-coding 240.667-82 chr8 102098668 102098948 + 1 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 25526 NM_001040629 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 290.333-36 chr5 3744836 3745260 + 1 NA Intergenic Intergenic 149216 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 144.667-207 chr3 191892860 191893090 + 1 NA Intergenic Intergenic -345655 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 209.667-76 chr21 44931847 44932171 + 1 NA Intergenic CpG -3194 NM_001127491 3689 Hs.375957 NM_000211 ENSG00000160255 ITGB2 CD18|LAD|LCAMB|LFA-1|MAC-1|MF17|MFI7 integrin subunit beta 2 protein-coding 161.667-62 chr13 23989748 23989973 + 1 NA intron (NR_104595, intron 2 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 10058 NM_001286792 221178 Hs.434298 NM_153023 ENSG00000182957 SPATA13 ARHGEF29|ASEF2 spermatogenesis associated 13 protein-coding 185.333-51 chr14 102401935 102402186 + 1 NA intron (NM_014844, intron 2 of 19) L1MB3|LINE|L1 39119 NM_001172631 9895 Hs.195667 NM_014844 ENSG00000196663 TECPR2 KIAA0329|SPG49 tectonin beta-propeller repeat containing 2 protein-coding 267.667-77 chrX 24071172 24071583 + 1 NA intron (NM_001415, intron 9 of 11) AluSx3|SINE|Alu 16421 NM_001415 1968 Hs.539684 NM_001415 ENSG00000130741 EIF2S3 EIF2|EIF2G|EIF2gamma|MEHMO|MRXSBRK|eIF-2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma protein-coding 154.667-308 chr5 38931900 38932142 + 1 NA intron (NM_003999, intron 16 of 17) intron (NM_003999, intron 16 of 17) 86009 NM_003999 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 174.333-146 chr8 84330127 84330336 + 1 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) L1ME4a|LINE|L1 -85253 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 146.333-292 chr6 126626661 126626932 + 1 NA Intergenic Intergenic 142165 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 154.333-218 chr3 77121363 77121582 + 1 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 23460 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 373.666-3 chr14 53547643 53548454 + 1 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 394694 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 193.333-48 chr13 72940035 72940245 + 1 NA intron (NR_146206, intron 14 of 16) L1ME1|LINE|L1 -114836 NM_001286818 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 158.333-280 chr6 126872284 126872486 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -246286 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 149.667-284 chr4 58480505 58480731 + 1 NA Intergenic Intergenic 55710 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 123.333-82 chr15 64222779 64222980 + 1 NA intron (NM_001329607, intron 4 of 11) intron (NM_001329607, intron 4 of 11) -59724 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 267.333-42 chr17 81094553 81094844 + 1 NA intron (NM_001144888, intron 6 of 13) intron (NM_001144888, intron 6 of 13) 30675 NR_030394 724027 NR_030394 ENSG00000207736 MIR657 MIRN657|hsa-mir-657 microRNA 657 ncRNA 120.333-77 chr17 17054237 17054427 + 1 NA intron (NM_201274, intron 1 of 23) MER6|DNA|TcMar-Tigger 11572 NM_015134 23164 Hs.462341 NM_015134 ENSG00000133030 MPRIP M-RIP|MRIP|RHOIP3|RIP3|p116Rip myosin phosphatase Rho interacting protein protein-coding 146.333-316 chr8 28736504 28736677 + 1 NA intron (NM_001440, intron 4 of 6) intron (NM_001440, intron 4 of 6) 35089 NR_073469 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 149.667-109 chr13 101941917 101942146 + 1 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) intron (NM_175929, intron 1 of 4) -25386 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 138.333-169 chr6 68686515 68686756 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 51353 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 173.667-36 chr12 44479143 44479447 + 1 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 396366 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 250.667-61 chr5 26786008 26786303 + 1 NA Intergenic Intergenic 252431 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 114.333-58 chr12 89025562 89025730 + 1 NA Intergenic Intergenic -5954 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 121.333-28 chr11 37955445 37955688 + 1 NA TTS (NR_135110) TTS (NR_135110) 16965 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 121.333-21 chr10 63005507 63005686 + 1 NA Intergenic Intergenic -127651 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 152.333-180 chr2 59977795 59978062 + 1 NA Intergenic Intergenic 405108 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 129.333-133 chr3 125664687 125664923 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -69308 NM_022776 114885 Hs.477440 NM_022776 ENSG00000144909 OSBPL11 ORP-11|ORP11|OSBP12|TCCCIA00292 oxysterol binding protein like 11 protein-coding 131.333-16 chr1 191497194 191497360 + 1 NA Intergenic Intergenic -268779 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 176.667-13 chr1 172064562 172064850 + 1 NA intron (NM_001278252, intron 10 of 14) intron (NM_001278252, intron 10 of 14) -74102 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 183.333-164 chr8 120422532 120422917 + 1 NA intron (NM_014078, intron 4 of 6) L1MEd|LINE|L1 22426 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 146.333-188 chr22 28587007 28587221 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluSz6|SINE|Alu 92751 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 176.667-147 chr8 109231220 109231582 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 98532 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 164.667-19 chr10 18024565 18024776 + 1 NA intron (NM_001282734, intron 11 of 11) intron (NM_001282734, intron 11 of 11) -14108 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 139.333-4 chr1 70936130 70936283 + 1 NA intron (NR_028293, intron 2 of 4) MER5A|DNA|hAT-Charlie -110300 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 259.333-38 chr16 75519973 75520389 + 1 NA Intergenic Intergenic 14989 NM_024533 23563 Hs.745424 NM_012126 ENSG00000135702 CHST5 I-GlcNAc-6-ST|I-GlcNAc6ST|glcNAc6ST-3|gn6st-3|hIGn6ST carbohydrate sulfotransferase 5 protein-coding 207.667-16 chr11 31830702 31831058 + 1 NA intron (NR_033971, intron 1 of 2) L1ME4b|LINE|L1 4313 NR_117094 103157000 NR_117094 ENSG00000281880 PAUPAR - PAX6 upstream antisense RNA ncRNA 173.667-119 chr3 114334192 114334372 + 1 NA non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) -17529 NR_038993 100131117 Hs.122417 NR_038993 ENSG00000241560 ZBTB20-AS1 - ZBTB20 antisense RNA 1 ncRNA 209.333-247 chr9 5119171 5119411 + 1 NA intron (NM_004972, intron 22 of 24) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 66348 NM_007179 11172 Hs.632648 NM_007179 ENSG00000120210 INSL6 RIF1 insulin like 6 protein-coding 147.667-333 chr7 30596020 30596326 + 1 NA intron (NM_002047, intron 1 of 16) intron (NM_002047, intron 1 of 16) 1295 NM_002047 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 179.333-64 chr14 53188678 53189006 + 1 NA Intergenic Intergenic 35488 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 119.333-230 chr9 7053584 7053800 + 1 NA intron (NM_001353997, intron 17 of 22) intron (NM_001353997, intron 17 of 22) 296342 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 185.667-140 chr8 139943898 139944190 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) L1MEb|LINE|L1 156491 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 206.333-128 chr5 40763716 40764002 + 1 NA intron (NM_006251, intron 8 of 8) intron (NM_006251, intron 8 of 8) -7898 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 140.667-68 chr13 63067739 63067936 + 1 NA Intergenic Intergenic 260257 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 130.333-64 chr14 46622522 46622671 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 29185 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 372.667-5 chr14 52826690 52827225 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -35350 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 215.667-19 chr11 48179746 48180154 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -36860 NM_001005470 119765 Hs.553566 NM_001005470 ENSG00000175619 OR4B1 OR11-106|OST208 olfactory receptor family 4 subfamily B member 1 protein-coding 148.667-53 chr10 81155927 81156077 + 1 NA Intergenic Intergenic 506205 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 119.667-90 chr2 175786109 175786337 + 1 NA Intergenic Intergenic 216044 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 141.667-198 chr6 89784798 89785026 + 1 NA intron (NM_014611, intron 9 of 101) L1MC5a|LINE|L1 34882 NM_014611 23195 Hs.529948 NM_014611 ENSG00000112159 MDN1 Rea1 midasin AAA ATPase 1 protein-coding 148.667-271 chr4 40114800 40115053 + 1 NA intron (NM_001318359, intron 8 of 18) L1MEd|LINE|L1 -57727 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 281.667-45 chr6 140663218 140663715 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -20348 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 153.333-202 chr2 80989749 80989932 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 477106 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 251.333-96 chr6 37764511 37764963 + 1 NA Intergenic Intergenic -54990 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 211.667-14 chr10 19548699 19549143 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 32 of 39) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 179629 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 266.333-62 chr7 138838758 138839331 + 1 NA intron (NM_001164665, intron 19 of 19) intron (NM_001164665, intron 19 of 19) -40848 NM_130840 50617 Hs.98967 NM_020632 ENSG00000105929 ATP6V0A4 A4|ATP6N1B|ATP6N2|RDRTA2|RTA1C|RTADR|STV1|VPH1|VPP2 ATPase H+ transporting V0 subunit a4 protein-coding 228.333-5 chr1 188945157 188945472 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 1501686 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 147.667-241 chr3 123656392 123656591 + 1 NA intron (NM_001321309, intron 23 of 32) L2c|LINE|L2 -33153 NR_046629 100873940 Hs.667316 NR_046629 ENSG00000250174 MYLK-AS2 - MYLK antisense RNA 2 ncRNA 130.667-207 chr9 71944474 71944734 + 1 NA intron (NR_157410, intron 2 of 4) intron (NR_157410, intron 2 of 4) 32965 NM_182505 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 239.333-68 chr3 27931471 27931994 + 1 NA Intergenic Intergenic -97596 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 261.333-24 chr13 107954845 107955203 + 1 NA Intergenic Intergenic -87528 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 203.667-15 chr10 131261522 131261945 + 1 NA intron (NM_174937, intron 3 of 11) L2a|LINE|L2 49988 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 151.667-168 chr2 119647687 119647966 + 1 NA intron (NR_073132, intron 23 of 24) intron (NR_073132, intron 23 of 24) -31341 NM_001105198 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 122.333-4 chr1 82729854 82730063 + 1 NA Intergenic Intergenic -173225 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 154.667-40 chr10 51598880 51599068 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 100621 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 273.333-14 chr12 21427474 21427821 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -10008 NM_024854 79912 Hs.709545 NM_024854 ENSG00000121350 PYROXD1 MFM8 pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 protein-coding 306.667-42 chr8 68784160 68784546 + 1 NA intron (NR_146187, intron 11 of 13) L1MC3|LINE|L1 319837 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 161.333-179 chr3 905727 905893 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -187214 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 195.333-52 chr11 88118959 88119174 + 1 NA intron (NM_022337, intron 2 of 2) intron (NM_022337, intron 2 of 2) 56377 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 151.667-295 chr5 149069267 149069438 + 1 NA intron (NR_122044, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 6035 NR_122044 255187 Hs.149321 NR_122044 ENSG00000250072 SH3TC2-DT - SH3TC2 divergent transcript ncRNA 394.333-8 chr2 81139695 81140366 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 326916 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 113.333-215 chr5 112154750 112154992 + 1 NA intron (NM_001347887, intron 22 of 23) intron (NM_001347887, intron 22 of 23) -5655 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 151.333-418 chr8 82967236 82967401 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 55214 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 126.333-83 chr2 28052990 28053134 + 1 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) intron (NM_199193, intron 7 of 13) 56695 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 121.667-118 chr22 27146068 27146216 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -41374 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 138.667-205 chr8 82756778 82756983 + 1 NA Intergenic Intergenic -155224 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 150.667-249 chr3 154538215 154538507 + 1 NA Intergenic Intergenic -108171 NM_001038705 344758 Hs.376338 NM_001038705 ENSG00000174948 GPR149 IEDA|PGR10|R35 G protein-coupled receptor 149 protein-coding 152.333-394 chr8 140999773 140999974 + 1 NA intron (NM_001352737, intron 1 of 32) intron (NM_001352737, intron 1 of 32) 1131 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 197.667-16 chr10 5694203 5694531 + 1 NA intron (NM_017782, intron 1 of 20) L2a|LINE|L2 9529 NM_017782 54906 Hs.610717 NM_017782 ENSG00000108021 TASOR2 C10orf18|FAM208B|bA318E3.2 transcription activation suppressor family member 2 protein-coding 198.667-160 chr6 58287554 58287915 + 1 NA Intergenic Intergenic -326288 NR_132994 106660612 Hs.561539 NR_125727 ENSG00000215190 LINC00680 - long intergenic non-protein coding RNA 680 ncRNA 306.667-13 chr16 2584897 2585358 + 1 NA intron (NM_001261816, intron 10 of 11) intron (NM_001261816, intron 10 of 11) -18257 NR_015441 652276 Hs.720448 NR_015441 ENSG00000215154 LOC652276 - potassium channel tetramerization domain containing 5 pseudogene pseudo 171.333-99 chr2 183652992 183653202 + 1 NA Intergenic Intergenic 528654 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 204.667-147 chr8 80346793 80347120 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 105567 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 369.667-3 chr13 41226068 41226590 + 1 NA intron (NM_001354074, intron 8 of 9) intron (NM_001354074, intron 8 of 9) -31760 NM_032138 84078 Hs.63841 NM_032138 ENSG00000120696 KBTBD7 - kelch repeat and BTB domain containing 7 protein-coding 276.667-14 chr12 9057814 9058261 + 1 NA non-coding (NR_034140, exon 2 of 3) non-coding (NR_034140, exon 2 of 3) 7033 NR_034140 253128 Hs.408739 NM_001039381 ENSG00000214851 LINC00612 C12orf33 long intergenic non-protein coding RNA 612 ncRNA 208.333-56 chr17 66976706 66977042 + 1 NA intron (NM_014405, intron 1 of 3) intron (NM_014405, intron 1 of 3) 12167 NM_014405 27092 Hs.514423 NM_014405 ENSG00000075461 CACNG4 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 4 protein-coding 155.667-138 chr18 11427613 11427784 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -26780 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 205.667-51 chr15 60994011 60994364 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 235115 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 252.667-105 chr8 144975189 144975624 + 1 NA non-coding (NR_023392, exon 5 of 5) non-coding (NR_023392, exon 5 of 5) -19459 NR_002807 286102 Hs.744580 NR_002807 TMED10P1 S31I125|S31III125|TMED10|TMED10P|TMP21|Tmp-21-I|Tmp21-II|p23|p24delta|p24delta1 transmembrane p24 trafficking protein 10 pseudogene 1 pseudo 150.667-141 chr16 80747752 80748014 + 1 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 56715 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 131.333-109 chr22 28426353 28426572 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -33407 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 244.667-6 chr1 117513830 117514390 + 1 NA intron (NM_006699, intron 12 of 12) AluSx|SINE|Alu 91660 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 152.333-5 chr1 40221391 40221577 + 1 NA intron (NM_012421, intron 5 of 7) L2a|LINE|L2 -26453 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 131.667-70 chr16 75322875 75323157 + 1 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -55009 NM_001170715 9564 Hs.479747 NM_014567 ENSG00000050820 BCAR1 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas BCAR1 scaffold protein, Cas family member protein-coding 255.667-31 chr16 59905229 59905544 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 50033 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 199.667-60 chr17 58135159 58135377 + 1 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -19886 NM_012374 26689 Hs.531188 NM_012374 ENSG00000141194 OR4D1 OR17-23|OR4D3|OR4D4P|TPCR16 olfactory receptor family 4 subfamily D member 1 protein-coding 172.667-69 chr17 69901881 69902185 + 1 NA intron (NR_109971, intron 5 of 5) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -59674 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 190.333-113 chr5 34881355 34881727 + 1 NA intron (NM_001317949, intron 9 of 10) intron (NM_001317949, intron 9 of 10) 33963 NM_002853 5810 Hs.38114 NM_002853 ENSG00000113456 RAD1 HRAD1|REC1 RAD1 checkpoint DNA exonuclease protein-coding 199.333-7 chr1 60852355 60852649 + 1 NA Intergenic Intergenic -26918 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 160.333-214 chr4 66645041 66645315 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 368354 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 173.333-110 chr21 32086445 32086667 + 1 NA promoter-TSS (NR_038033) promoter-TSS (NR_038033) -261 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 186.333-42 chr12 122180038 122180235 + 1 NA intron (NM_152759, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 -2987 NM_001098519 254050 Hs.374856 NM_152759 ENSG00000158113 LRRC43 - leucine rich repeat containing 43 protein-coding 237.333-91 chr5 65518100 65518377 + 1 NA 3' UTR (NM_001349367, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001349367, exon 11 of 11) -36318 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 231.333-72 chr3 111813324 111813673 + 1 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) -45682 NM_145753 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 212.333-43 chr14 51251576 51252055 + 1 NA intron (NM_030755, intron 7 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie 11568 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 214.667-59 chr19 38900403 38900682 + 1 NA promoter-TSS (NM_001193286).2 promoter-TSS (NM_001193286).2 573 NR_040515 4793 Hs.9731 NM_002503 ENSG00000104825 NFKBIB IKBB|TRIP9 NFKB inhibitor beta protein-coding 293.667-47 chr3 187644095 187644689 + 1 NA Intergenic Intergenic 26002 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 149.333-435 chr9 89949850 89950016 + 1 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 -19483 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 158.667-79 chr12 103032694 103032865 + 1 NA Intergenic Intergenic -74338 NM_001354304 5053 Hs.560019 NM_000277 ENSG00000171759 PAH PH|PKU|PKU1 phenylalanine hydroxylase protein-coding 335.667-24 chr7 100822917 100823652 + 1 NA intron (NM_004444, intron 3 of 16) L2b|LINE|L2 -3585 NM_001363494 56996 Hs.521087 NM_020246 ENSG00000146828 SLC12A9 CCC6|CIP1|WO3.3|hCCC6 solute carrier family 12 member 9 protein-coding 148.333-250 chr3 64701834 64702081 + 1 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) intron (NR_038264, intron 1 of 5) -13957 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 170.333-92 chr17 58546547 58546887 + 1 NA intron (NR_110810, intron 4 of 4) FAM|SINE|Alu -2389 NM_001368772 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 382.333-10 chr2 151302172 151302809 + 1 NA Intergenic Intergenic -12822 NM_004688 9111 Hs.54483 NM_004688 ENSG00000123609 NMI - N-myc and STAT interactor protein-coding 233.667-50 chr22 50198750 50199130 + 1 NA non-coding (NR_135275, exon 10 of 10) non-coding (NR_135275, exon 10 of 10) -2071 NM_031454 83642 Hs.365405 NM_031454 ENSG00000073169 SELENOO SELO selenoprotein O protein-coding 124.667-72 chr15 85596732 85596901 + 1 NA intron (NM_007200, intron 8 of 36) intron (NM_007200, intron 8 of 36) -23134 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 218.333-124 chr8 133138138 133138640 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -35787 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 241.333-85 chr5 147648610 147649019 + 1 NA intron (NM_001282282, intron 3 of 20) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 88820 NR_038902 153469 Hs.184323 NR_038902 ENSG00000280780 JAKMIP2-AS1 - JAKMIP2 antisense RNA 1 ncRNA 115.667-160 chr4 48319116 48319337 + 1 NA Intergenic Intergenic -22303 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 194.667-171 chrX 109775248 109775559 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -42011 NM_022977 2182 Hs.268785 NM_004458 ENSG00000068366 ACSL4 ACS4|FACL4|LACS4|MRX63|MRX68 acyl-CoA synthetase long chain family member 4 protein-coding 166.667-31 chr10 120917448 120917756 + 1 NA Intergenic Intergenic 66240 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 157.333-93 chr12 112026939 112027149 + 1 NA 3' UTR (NM_024953, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_024953, exon 24 of 24) 10671 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 164.333-78 chr15 67659132 67659453 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 12 of 21) intron (NM_001206804, intron 12 of 21) 110198 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 180.333-108 chr6 127068760 127069037 + 1 NA Intergenic Intergenic -49773 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 152.333-122 chr15 59373060 59373220 + 1 NA promoter-TSS (NM_004998) promoter-TSS (NM_004998) -269 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 173.333-20 chr1 222716741 222717007 + 1 NA intron (NM_144695, intron 2 of 12) intron (NM_144695, intron 2 of 12) 3553 NM_001288580 148362 Hs.534965 NM_144695 ENSG00000162819 BROX C1orf58 BRO1 domain and CAAX motif containing protein-coding 151.667-278 chr5 73754885 73755052 + 1 NA intron (NM_001177693, intron 4 of 35) AluJr4|SINE|Alu -58578 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 153.333-184 chr2 10069330 10069562 + 1 NA intron (NM_001037160, intron 1 of 2) AluSc|SINE|Alu 10965 NM_001037160 192668 Hs.27092 NM_001037160 ENSG00000205795 CYS1 - cystin 1 protein-coding 174.667-34 chr12 58321120 58321294 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 233315 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 215.333-51 chr13 90503182 90503537 + 1 NA intron (NR_120414, intron 2 of 5) MER77|LTR|ERVL 10071 NR_120414 101927224 Hs.385801 NR_120414 LINC01049 - long intergenic non-protein coding RNA 1049 ncRNA 178.333-115 chr3 188327479 188327677 + 1 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) intron (NM_005578, intron 2 of 10) 102173 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 166.333-215 chr7 100096084 100096386 + 1 NA intron (NM_182776, intron 9 of 13) (AAGAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2161 NR_029831 406900 NR_029831 ENSG00000208036 MIR106B MIRN106B|mir-106b microRNA 106b ncRNA 159.667-150 chr18 22396399 22396677 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 21377 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 301.333-11 chr11 43795216 43795736 + 1 NA intron (NM_016142, intron 3 of 10) intron (NM_016142, intron 3 of 10) -85355 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 350.333-16 chr3 33705505 33705924 + 1 NA intron (NM_001365634, intron 1 of 35) L1MC5|LINE|L1 12540 NM_001365633 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 158.333-8 chr1 58747227 58747472 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 36698 NM_002228 3725 Hs.696684 NM_002228 ENSG00000177606 JUN AP-1|AP1|c-Jun|p39 Jun proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 190.333-33 chr11 109382774 109383163 + 1 NA Intergenic Intergenic -39222 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 251.333-113 chr9 21892076 21892470 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -74866 NR_024274 51198 Hs.721053 NM_016349 CDKN2A-DT C9orf53|CDKN2A-AS1|bA149I2.3 CDKN2A divergent transcript ncRNA 265.333-8 chr10 26157337 26157796 + 1 NA intron (NM_017433, intron 26 of 34) intron (NM_017433, intron 26 of 34) -58741 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 158.667-289 chr6 86172941 86173144 + 1 NA Intergenic Intergenic -494309 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 169.333-291 chr9 108132470 108132794 + 1 NA Intergenic Intergenic -642863 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 169.667-12 chr1 203563194 203563446 + 1 NA Intergenic Intergenic -63467 NM_001001396 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 148.333-307 chr5 34756538 34756824 + 1 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) intron (NM_001145525, intron 4 of 19) 69122 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 133.667-66 chr19 45900830 45901024 + 1 NA intron (NM_001012643, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 1686 NM_001012643 339344 Hs.515478 NM_001012643 ENSG00000176182 MYPOP P42pop Myb related transcription factor, partner of profilin protein-coding 221.667-77 chr7 139920329 139920665 + 1 NA intron (NM_001314028, intron 4 of 12) intron (NM_001314028, intron 4 of 12) 91233 NM_001061 6916 Hs.520757 NM_001061 ENSG00000059377 TBXAS1 BDPLT14|CYP5|CYP5A1|GHOSAL|THAS|TS|TXAS|TXS thromboxane A synthase 1 protein-coding 127.333-16 chr1 201844678 201844841 + 1 NA intron (NM_018085, intron 1 of 23) intron (NM_018085, intron 1 of 23) -15200 NR_046696 100873949 Hs.604842 NR_046696 ENSG00000231871 IPO9-AS1 - IPO9 antisense RNA 1 ncRNA 180.667-40 chr14 33250454 33250808 + 1 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) 311752 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 203.333-19 chr1 220978533 220978922 + 1 NA Intergenic Intergenic -98587 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 155.333-203 chr20 54795523 54795698 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 320017 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 155.667-83 chr13 65717972 65718163 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -147980 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 254.333-24 chr15 54694387 54694704 + 1 NA Intergenic Intergenic -362202 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 357.667-12 chr7 52237527 52238100 + 1 NA Intergenic Intergenic -797820 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 147.333-34 chr10 11814117 11814372 + 1 NA Intergenic Intergenic -9112 NM_153256 254427 Hs.435775 NM_153256 ENSG00000148426 PROSER2 C10orf47 proline and serine rich 2 protein-coding 192.667-51 chr12 104581186 104581501 + 1 NA intron (NM_018413, intron 1 of 2) intron (NM_018413, intron 1 of 2) -10290 NR_037487 100500843 NR_037487 ENSG00000264295 MIR3922 - microRNA 3922 ncRNA 214.667-2 chr1 70400120 70400418 + 1 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -10949 NM_001190463 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 238.333-13 chr11 31130134 31130554 + 1 NA intron (NM_001367979, intron 10 of 38) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -137658 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 183.667-20 chr10 25895838 25896092 + 1 NA Intergenic Intergenic 37745 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 216.667-28 chr12 10583542 10583879 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 16125 NR_028045 10748 Hs.159297 NM_006611 KLRA1P KLRA1|KLRAP1|LY49L|Ly-49L|Ly49 killer cell lectin like receptor A1, pseudogene pseudo 158.667-245 chr4 82676127 82676306 + 1 NA intron (NM_024906, intron 3 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -54779 NR_024088 439934 Hs.457189 NM_001033661 ENSG00000231782 LINC00575 C4orf11 long intergenic non-protein coding RNA 575 ncRNA 165.667-152 chr5 17328877 17329110 + 1 NA Intergenic Intergenic 58317 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 221.667-13 chr11 32152628 32152928 + 1 NA Intergenic Intergenic -8866 NR_132770 106635521 NR_132770 SNORA88 - small nucleolar RNA, H/ACA box 88 snoRNA 232.667-18 chr13 36257953 36258203 + 1 NA intron (NM_001198910, intron 2 of 15) intron (NM_001198910, intron 2 of 15) 39736 NM_001144986 728591 Hs.656745 NM_001144981 ENSG00000242715 CCDC169 C13orf38 coiled-coil domain containing 169 protein-coding 282.667-33 chr4 95025807 95026113 + 1 NA intron (NM_001256792, intron 1 of 10) intron (NM_001256792, intron 1 of 10) -25717 NM_001256793 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 163.667-2 chr1 40582463 40582673 + 1 NA Intergenic Intergenic 50931 NM_152373 127396 Hs.524767 NM_152373 ENSG00000117010 ZNF684 - zinc finger protein 684 protein-coding 192.667-118 chr4 32101354 32101611 + 1 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -79060 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 252.333-68 chr6 167044331 167044637 + 1 NA 3' UTR (NM_194429, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_194429, exon 12 of 12) 45087 NM_007045 11116 Hs.487175 NM_007045 ENSG00000213066 FGFR1OP FOP FGFR1 oncogene partner protein-coding 146.333-130 chr18 35929831 35929986 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 4234 NR_037497 100500864 NR_037497 ENSG00000265641 MIR3929 - microRNA 3929 ncRNA 153.667-68 chr11 57225096 57225371 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 12017 NR_027991 187 Hs.438311 NM_005161 ENSG00000134817 APLNR AGTRL1|APJ|APJR|HG11 apelin receptor protein-coding 169.667-210 chr8 123422278 123422544 + 1 NA intron (NM_018024, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 5637 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 259.333-39 chr18 12675628 12676046 + 1 NA intron (NM_001271989, intron 9 of 10) AluSx1|SINE|Alu 17098 NM_147163 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 115.667-81 chr14 87639299 87639449 + 1 NA intron (NR_146551, intron 1 of 2) intron (NR_146551, intron 1 of 2) 15920 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 162.333-101 chr19 4262488 4262757 + 1 NA intron (NM_018074, intron 6 of 7) intron (NM_018074, intron 6 of 7) 15542 NM_018074 55702 Hs.21811 NM_018074 ENSG00000105248 YJU2 CCDC94 YJU2 splicing factor homolog protein-coding 145.333-252 chr6 37670275 37670509 + 1 NA intron (NM_153487, intron 1 of 16) intron (NM_153487, intron 1 of 16) 27491 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 175.333-97 chr2 187767253 187767555 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -212899 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 167.667-163 chr5 3703078 3703274 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 107344 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 145.333-71 chr12 93822485 93822708 + 1 NA intron (NM_001320100, intron 2 of 2) intron (NM_001320100, intron 2 of 2) -84773 NR_110093 101928731 Hs.659971 NR_110092 ENSG00000258274 LOC101928731 - uncharacterized LOC101928731 ncRNA 182.667-81 chr2 125314432 125314656 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 803441 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 244.667-5 chr1 94399025 94399333 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -19198 NM_001122674 5825 Hs.700576 NM_002858 ENSG00000117528 ABCD3 ABC43|CBAS5|PMP70|PXMP1|ZWS2 ATP binding cassette subfamily D member 3 protein-coding 156.333-286 chr5 83787979 83788220 + 1 NA Intergenic Intergenic -67244 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 158.333-223 chr3 193371524 193371730 + 1 NA intron (NM_198505, intron 1 of 29) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 7126 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 148.333-414 chr9 94896392 94896622 + 1 NA intron (NM_032823, intron 5 of 14) L1MC3|LINE|L1 49047 NR_147613 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 187.333-18 chr10 13319971 13320306 + 1 NA intron (NM_001195604, intron 7 of 7) intron (NM_001195604, intron 7 of 7) -20008 NM_001323083 5264 Hs.498732 NM_006214 ENSG00000107537 PHYH LN1|LNAP1|PAHX|PHYH1|RD phytanoyl-CoA 2-hydroxylase protein-coding 147.333-169 chr2 60074762 60075007 + 1 NA Intergenic Intergenic 308152 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 193.667-99 chr5 18302096 18302374 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 494961 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 215.333-112 chr20 40128045 40128375 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 123749 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 144.333-29 chr10 91759534 91759716 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 38571 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 178.333-140 chr5 71634535 71634777 + 1 NA intron (NM_022132, intron 8 of 16) intron (NM_022132, intron 8 of 16) 47316 NM_001363147 64087 Hs.604789 NM_022132 ENSG00000131844 MCCC2 MCCB methylcrotonoyl-CoA carboxylase 2 protein-coding 271.333-23 chr19 41770096 41770403 + 1 NA intron (NM_002483, intron 5 of 5) AluSx3|SINE|Alu 14719 NM_002483 4680 Hs.466814 NM_002483 ENSG00000086548 CEACAM6 CD66c|CEAL|NCA carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 6 protein-coding 302.333-30 chr5 129431577 129431952 + 1 NA Intergenic Intergenic -28534 NM_133638 171019 Hs.23751 NM_133638 ENSG00000145808 ADAMTS19 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 19 protein-coding 157.333-299 chr6 25671954 25672181 + 1 NA intron (NM_006998, intron 6 of 10) L2c|LINE|L2 19852 NM_006998 10590 Hs.116428 NM_006998 ENSG00000079689 SCGN CALBL|DJ501N12.8|SECRET|SEGN|setagin secretagogin, EF-hand calcium binding protein protein-coding 143.333-133 chr2 50926586 50926847 + 1 NA intron (NM_004801, intron 2 of 21) intron (NM_004801, intron 2 of 21) 105416 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 151.333 chr1 12340737 12340908 + 1 NA intron (NM_015378, intron 40 of 69) intron (NM_015378, intron 40 of 69) 110792 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 164.667-13 chr1 172260396 172260690 + 1 NA intron (NR_146559, intron 16 of 20) L1MA4A|LINE|L1 -115708 NR_038397 100628315 Hs.584880 NR_038397 DNM3OS DNM3-AS1|MIR199A2HG DNM3 opposite strand/antisense RNA ncRNA 116.667-53 chr14 48903207 48903384 + 1 NA Intergenic Intergenic 683085 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 188.667-110 chr4 45930286 45930567 + 1 NA Intergenic Intergenic 193628 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 233.667-30 chr17 78287603 78288094 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -9356 NR_073178 100996291 Hs.744493 NR_073178 ENSG00000204277 LINC01993 - long intergenic non-protein coding RNA 1993 ncRNA 153.333-316 chr4 160009812 160009983 + 1 NA Intergenic Intergenic -232113 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 256.333-57 chr4 12825895 12826293 + 1 NA Intergenic Intergenic 602643 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 199.333-152 chr2 199352502 199352829 + 1 NA intron (NM_001172509, intron 6 of 10) intron (NM_001172509, intron 6 of 10) 105274 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 233.333-123 chr7 51777752 51778143 + 1 NA Intergenic Intergenic -384691 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 163.667-261 chr8 144994166 144994446 + 1 NA promoter-TSS (NR_002807) promoter-TSS (NR_002807) -559 NR_002807 286102 Hs.744580 NR_002807 TMED10P1 S31I125|S31III125|TMED10|TMED10P|TMP21|Tmp-21-I|Tmp21-II|p23|p24delta|p24delta1 transmembrane p24 trafficking protein 10 pseudogene 1 pseudo 167.333-108 chr17 41797220 41797387 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -10535 NM_021991 3728 Hs.514174 NM_002230 ENSG00000173801 JUP CTNNG|DP3|DPIII|PDGB|PKGB junction plakoglobin protein-coding 169.333-99 chr17 59400917 59401132 + 1 NA 3' UTR (NM_001005404, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001005404, exon 5 of 5) 34941 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 163.333-177 chr22 33609906 33610101 + 1 NA intron (NM_133642, intron 4 of 14) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 94917 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 147.333-147 chr18 359254 359415 + 1 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) -91287 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 235.667-24 chr15 69232394 69232715 + 1 NA intron (NM_001324092, intron 2 of 3) intron (NM_001324092, intron 2 of 3) -66358 NM_017705 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 149.667-7 chr1 36710350 36710546 + 1 NA Intergenic Intergenic -227134 NM_156039 1441 Hs.524517 NM_000760 ENSG00000119535 CSF3R CD114|GCSFR|SCN7 colony stimulating factor 3 receptor protein-coding 143.333-93 chr14 77363286 77363523 + 1 NA intron (NM_001346133, intron 1 of 5) L1M1|LINE|L1 10505 NM_001346134 283578 Hs.26403 NM_213601 ENSG00000100580 TMED8 FAM15B transmembrane p24 trafficking protein family member 8 protein-coding 154.333-352 chr8 123435372 123435554 + 1 NA 5' UTR (NM_001283027, exon 4 of 7) 5' UTR (NM_001283027, exon 4 of 7) 18689 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 244.333-38 chr14 80555562 80555852 + 1 NA intron (NM_152446, intron 21 of 24) intron (NM_152446, intron 21 of 24) -324650 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 238.667-38 chr2 25254988 25255315 + 1 NA intron (NR_135490, intron 6 of 23) intron (NR_135490, intron 6 of 23) -2836 NM_153759 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 154.667-25 chr1 199642599 199642875 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -384973 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 149.667-205 chr2 83337593 83337763 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -185136 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 174.667-156 chr7 15891669 15891930 + 1 NA Intergenic Intergenic 203421 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 249.667-103 chr9 4238914 4239259 + 1 NA intron (NM_001042413, intron 2 of 10) L1PA4|LINE|L1 60982 NM_001042413 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 150.333-118 chr14 70262704 70262926 + 1 NA Intergenic Intergenic -15014 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 227.333-74 chr20 37687459 37687862 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6295 NM_001281495 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 173.333-32 chr11 2557266 2557487 + 1 NA intron (NM_181798, intron 2 of 15) L1MC|LINE|L1 95922 NM_181798 3784 Hs.95162 NM_000218 ENSG00000053918 KCNQ1 ATFB1|ATFB3|JLNS1|KCNA8|KCNA9|KVLQT1|Kv1.9|Kv7.1|LQT|LQT1|RWS|SQT2|WRS potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1 protein-coding 146.333-199 chr3 30070368 30070635 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -136345 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 161.667-46 chr11 108295190 108295438 + 1 NA intron (NM_001351834, intron 33 of 63) intron (NM_001351834, intron 33 of 63) 71785 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 272.667-17 chr14 50623797 50624102 + 1 NA intron (NM_015915, intron 11 of 13) AluSx|SINE|Alu 44357 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 168.667-63 chr14 71030597 71030874 + 1 NA intron (NM_014982, intron 16 of 35) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 123276 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 150.667-109 chr13 92948163 92948438 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -97041 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 143.667-67 chr14 19880611 19880761 + 1 NA Intergenic Intergenic 4418 NM_001005501 390431 Hs.551345 NM_001005501 ENSG00000165762 OR4K2 OR14-15 olfactory receptor family 4 subfamily K member 2 protein-coding 173.667-183 chr8 126350924 126351169 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 25551 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 356.667-19 chr8 115259510 115260128 + 1 NA Intergenic Intergenic 408194 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 189.667-13 chr1 230927827 230928087 + 1 NA intron (NM_024525, intron 12 of 22) L1ME3F|LINE|L1 50904 NM_001122835 79573 Hs.424788 NM_024525 ENSG00000143643 TTC13 - tetratricopeptide repeat domain 13 protein-coding 259.333-24 chr12 40929507 40929950 + 1 NA intron (NM_001256064, intron 6 of 15) intron (NM_001256064, intron 6 of 15) 21371 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 163.667-70 chr15 82944198 82944361 + 1 NA intron (NM_004839, intron 1 of 8) intron (NM_004839, intron 1 of 8) 8441 NM_004839 9455 Hs.578443 NM_004839 ENSG00000103942 HOMER2 ACPD|CPD|DFNA68|HOMER-2|VESL-2 homer scaffold protein 2 protein-coding 247.667-99 chr9 24782192 24782650 + 1 NA Intergenic Intergenic -236524 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 140.333-51 chr12 105471596 105471777 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 140995 NM_001145199 387882 Hs.368938 NM_207376 ENSG00000235162 C12orf75 AGD3|OCC-1|OCC1 chromosome 12 open reading frame 75 protein-coding 225.667-70 chr7 21221558 21221911 + 1 NA Intergenic Intergenic -206349 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 130.667-158 chr4 113072209 113072495 + 1 NA intron (NM_001354232, intron 1 of 46) intron (NM_001354232, intron 1 of 46) 22699 NM_001148 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 162.333-117 chr2 111075023 111075291 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 17 of 18) L1MD2|LINE|L1 40431 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 238.333-79 chr6 119980161 119980485 + 1 NA Intergenic Intergenic -34856 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 307.667-19 chr18 5297732 5298235 + 1 NA promoter-TSS (NM_001243704) promoter-TSS (NM_001243704) -930 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 115.667-168 chr4 130247094 130247280 + 1 NA Intergenic Intergenic -129174 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 214.333-115 chr5 40840248 40840633 + 1 NA promoter-TSS (NM_032587) promoter-TSS (NM_032587) -927 NM_032587 84674 Hs.200242 NM_032587 ENSG00000132357 CARD6 CINCIN1 caspase recruitment domain family member 6 protein-coding 302.667-12 chr16 47741750 47742266 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -116573 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 203.333-284 chr9 117570382 117570672 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -78079 NR_109806 101928797 Hs.382317 NR_109806 ENSG00000233569 LOC101928797 - uncharacterized LOC101928797 ncRNA 325.333-22 chr21 28248515 28248941 + 1 NA Intergenic Intergenic -20061 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 141.667-86 chr15 73429105 73429252 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -13986 NM_001348772 283677 Hs.743574 NM_001042367 ENSG00000183324 REC114 C15orf60|CT147 REC114 meiotic recombination protein protein-coding 163.667-27 chr10 72833138 72833368 + 1 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) L1M7|LINE|L1 -60486 NM_152635 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 178.333-153 chr6 69697501 69697827 + 1 NA intron (NM_001367272, intron 13 of 15) intron (NM_001367272, intron 13 of 15) 98802 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 319.333-10 chr14 30894253 30894645 + 1 NA 3' UTR (NM_014574, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_014574, exon 16 of 16) -4641 NR_038356 100506071 Hs.729195 NR_038356 ENSG00000258525 LOC100506071 - uncharacterized LOC100506071 ncRNA 259.667-92 chrX 21225854 21226163 + 1 NA Intergenic Intergenic -148410 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 154.667-225 chr21 39407385 39407608 + 1 NA intron (NR_146618, intron 6 of 13) L1ME3G|LINE|L1 19733 NR_146616 7485 Hs.198308 NM_004627 ENSG00000182093 GET1 CHD5|WRB guided entry of tail-anchored proteins factor 1 protein-coding 149.667-323 chr5 89837762 89837999 + 1 NA Intergenic Intergenic 178840 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 140.333-175 chr5 11773970 11774130 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 130396 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 237.667-37 chr2 37067506 37067900 + 1 NA intron (NM_019024, intron 8 of 35) AluSz|SINE|Alu 16669 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 144.333-277 chr8 125218182 125218420 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 126441 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 176.333-144 chr6 40034129 40034401 + 1 NA Intergenic Intergenic -99803 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 133.333-162 chr6 55328369 55328595 + 1 NA intron (NM_207410, intron 1 of 8) intron (NM_207410, intron 1 of 8) 1013 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 144.667-9 chr1 97778386 97778558 + 1 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) MIRb|SINE|MIR -18449 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 186.667-53 chr17 57707229 57707567 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 37901 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 248.667-54 chr2 31954261 31954662 + 1 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) intron (NR_126034, intron 1 of 6) 56203 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 147.667-254 chr4 52056661 52056826 + 1 NA intron (NM_001346103, intron 1 of 8) intron (NM_001346103, intron 1 of 8) 5439 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 221.333-32 chr13 30829650 30830010 + 1 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 26624 NR_047012 100874158 Hs.577982 NR_047012 ENSG00000237879 LINC00398 - long intergenic non-protein coding RNA 398 ncRNA 150.667-188 chr2 130925628 130925790 + 1 NA intron (NM_001367493, intron 2 of 13) L1ME3B|LINE|L1 88795 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 246.333-82 chr5 131538910 131539206 + 1 NA intron (NM_016340, intron 6 of 27) intron (NM_016340, intron 6 of 27) 96171 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 168.667-186 chr6 51081174 51081385 + 1 NA Intergenic Intergenic 262408 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 228.333-103 chr8 129765805 129766185 + 1 NA intron (NM_031415, intron 3 of 13) intron (NM_031415, intron 3 of 13) 20629 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 155.333-259 chr4 40006078 40006339 + 1 NA Intergenic LTR9|LTR|ERV1 -28252 NM_001100400 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 239.667-11 chr11 37965772 37966227 + 1 NA Intergenic Intergenic 27398 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 111.667-150 chr20 6550579 6550797 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 123956 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 173.333-209 chr8 133396617 133396965 + 1 NA Intergenic Intergenic -99487 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 344.333-3 chr11 84636308 84636906 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 84335 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 128.333-45 chr12 4506363 4506512 + 1 NA intron (NR_144382, intron 5 of 9) intron (NR_144382, intron 5 of 9) 32032 NM_020374 57102 Hs.302977 NM_020374 ENSG00000047621 C12orf4 - chromosome 12 open reading frame 4 protein-coding 149.667 chr1 10633516 10633744 + 1 NA Intergenic Intergenic 158680 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 153.667-358 chr7 44652951 44653128 + 1 NA intron (NM_002541, intron 4 of 22) intron (NM_002541, intron 4 of 22) 46412 NM_002541 4967 Hs.488181 NM_002541 ENSG00000105953 OGDH AKGDH|E1k|OGDC oxoglutarate dehydrogenase protein-coding 159.333-267 chr5 72563344 72563535 + 1 NA intron (NR_105008, intron 1 of 3) intron (NR_105008, intron 1 of 3) 6362 NR_105008 102503427 Hs.429280 NR_105008 LOC102503427 - uncharacterized LOC102503427 ncRNA 151.667-20 chr1 158006155 158006431 + 1 NA intron (NM_001286349, intron 1 of 12) L3b|LINE|CR1 12648 NM_018240 55243 Hs.272234 NM_018240 ENSG00000183853 KIRREL1 KIRREL|NEPH1 kirre like nephrin family adhesion molecule 1 protein-coding 112.333-33 chr11 15994758 15994988 + 1 NA intron (NM_017508, intron 12 of 14) L1MEf|LINE|L1 -25252 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 128.667-102 chr20 13405123 13405335 + 1 NA intron (NM_017714, intron 13 of 13) intron (NM_017714, intron 13 of 13) -165542 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-234 chr22 38598558 38598713 + 1 NA intron (NM_001013647, intron 14 of 16) intron (NM_001013647, intron 14 of 16) 28135 NR_134627 105373031 Hs.144041 NR_134627 LOC105373031 - uncharacterized LOC105373031 ncRNA 174.667-154 chr7 8612242 8612422 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) MamGypsy2-LTR|LTR|Gypsy 178723 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 204.667-102 chr4 14689309 14689656 + 1 NA intron (NR_126435, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 198687 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 160.333-43 chr10 51501341 51501552 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 198149 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 144.667-178 chr21 45213095 45213342 + 1 NA intron (NR_027674, intron 9 of 11) MER5B|DNA|hAT-Charlie -21122 NR_135279 114042 Hs.375832 NR_135279 ENSG00000182586 LINC00334 C21orf89|NCRNA00334 long intergenic non-protein coding RNA 334 ncRNA 167.333-80 chr14 55475441 55475773 + 1 NA Intergenic Intergenic -35062 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 151.667-261 chr4 170163053 170163289 + 1 NA Intergenic Intergenic -63420 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 202.333-131 chr4 97199664 97199998 + 1 NA Intergenic Intergenic -167095 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 277.333-30 chr14 59182337 59182693 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -6152 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 159.667-244 chr4 183285010 183285169 + 1 NA intron (NM_024949, intron 19 of 22) L2a|LINE|L2 35685 NM_001111319 53842 Hs.333179 NM_001111319 ENSG00000177300 CLDN22 CLDN21 claudin 22 protein-coding 201.333-229 chr5 65523879 65524273 + 1 NA intron (NM_001349369, intron 9 of 10) HAL1b|LINE|L1 39092 NM_001267038 64105 Hs.529778 NM_022145 ENSG00000123219 CENPK AF5alpha|CENP-K|FKSG14|P33|Solt centromere protein K protein-coding 144.333-75 chr14 60674383 60674542 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -24985 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 130.667-175 chr5 175566859 175567076 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 88407 NM_001322977 94081 Hs.369440 NM_022754 ENSG00000164466 SFXN1 SLC56A1|TCC sideroflexin 1 protein-coding 204.667-67 chr2 19929268 19929552 + 1 NA intron (NM_001006657, intron 26 of 27) intron (NM_001006657, intron 26 of 27) -27427 NM_001008237 130502 Hs.591547 NM_001008237 ENSG00000183891 TTC32 - tetratricopeptide repeat domain 32 protein-coding 186.667-13 chr10 61405404 61405606 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -47134 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 204.333-175 chr6 61494281 61494581 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -79699 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 242.333-36 chr18 6958235 6958622 + 1 NA intron (NM_005559, intron 55 of 62) intron (NM_005559, intron 55 of 62) 3751 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 208.667-55 chr17 65607364 65607804 + 1 NA Intergenic Intergenic -45936 NM_001363813 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 185.333-65 chr17 60687681 60687959 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 3 of 25) intron (NM_001330413, intron 3 of 25) 9969 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 160.667-175 chr20 17364416 17364685 + 1 NA intron (NM_002594, intron 4 of 11) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 137510 NM_001201529 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 144.333-19 chr10 12135739 12136039 + 1 NA intron (NM_001142628, intron 2 of 10) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -5073 NR_039699 100616488 NR_039699 ENSG00000265653 MIR548AK - microRNA 548ak ncRNA 145.333-113 chr17 41751677 41751883 + 1 NA Intergenic Intergenic -17134 NM_001079871 9001 Hs.158300 NM_003949 ENSG00000173805 HAP1 HAP2|HIP5|HLP|hHLP1 huntingtin associated protein 1 protein-coding 135.333-207 chrX 38124027 38124190 + 1 NA intron (NM_001163334, intron 15 of 16) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 90574 NM_001163334 94122 Hs.662334 NM_138780 ENSG00000147041 SYTL5 slp5 synaptotagmin like 5 protein-coding 151.667-337 chr7 52679690 52679909 + 1 NA Intergenic Intergenic -355834 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 156.333-111 chr14 62861015 62861249 + 1 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 184326 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 243.333-106 chr7 65971275 65971714 + 1 NA intron (NM_001284290, intron 6 of 9) AluSx3|SINE|Alu 10719 NM_001284290 2990 Hs.255230 NM_000181 ENSG00000169919 GUSB BG|MPS7 glucuronidase beta protein-coding 159.667-46 chr10 64243726 64243984 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -581673 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 206.667-110 chr5 36967552 36967985 + 1 NA intron (NM_015384, intron 6 of 45) FLAM_A|SINE|Alu 90999 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 187.333-204 chr8 122404399 122404642 + 1 NA Intergenic Intergenic 164124 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 163.333-30 chr10 19253008 19253222 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 18 of 39) intron (NM_001142308, intron 18 of 39) 204314 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 155.333-371 chr7 109370647 109370918 + 1 NA Intergenic Intergenic -486195 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 231.333-102 chr6 73164366 73164643 + 1 NA intron (NM_001160132, intron 10 of 13) intron (NM_001160132, intron 10 of 13) -20990 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 238.333-20 chr12 41811722 41812111 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 47727 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 187.667-139 chr8 10351619 10351983 + 1 NA intron (NM_001199729, intron 6 of 6) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -122764 NR_120604 101929191 Hs.595262 NR_120604 ENSG00000253641 LINCR-0001 - uncharacterized LINCR-0001 ncRNA 130.333-57 chr12 130322466 130322667 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -15321 NM_001190971 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 233.667-2 chr1 111119914 111120333 + 1 NA intron (NR_146308, intron 7 of 9) intron (NR_146308, intron 7 of 9) -19260 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 251.333-63 chr2 191350630 191351149 + 1 NA intron (NM_012223, intron 7 of 28) intron (NM_012223, intron 7 of 28) 105485 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 152.333-333 chr6 55820091 55820321 + 1 NA intron (NM_001329754, intron 1 of 5) intron (NM_001329754, intron 1 of 5) 55384 NM_001329754 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 155.333-34 chr10 73584868 73585062 + 1 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) intron (NM_001350995, intron 1 of 21) 6377 NR_146997 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 234.667-88 chr5 16592399 16592699 + 1 NA intron (NM_001034850, intron 1 of 8) L1PREC2|LINE|L1 -23377 NR_109946 101929524 Hs.734029 NR_109946 ENSG00000246214 LOC101929524 - uncharacterized LOC101929524 ncRNA 142.333-62 chr12 106940348 106940507 + 1 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -15295 NM_001319663 90488 Hs.257664 NM_152261 ENSG00000151135 TMEM263 C12orf23 transmembrane protein 263 protein-coding 126.333-89 chr2 64982015 64982199 + 1 NA Intergenic Intergenic -6372 NM_001348407 6509 Hs.654352 NM_003038 ENSG00000115902 SLC1A4 ASCT1|SATT|SPATCCM solute carrier family 1 member 4 protein-coding 160.333-119 chr15 100630437 100630635 + 1 NA TTS (NM_024708) TTS (NM_024708) 27947 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 249.667-14 chr10 116639951 116640505 + 1 NA intron (NR_103727, intron 11 of 12) L1PA17|LINE|L1 19275 NM_005396 5408 Hs.423598 NM_005396 ENSG00000266200 PNLIPRP2 PLRP2 pancreatic lipase related protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 134.667-120 chr20 48692099 48692253 + 1 NA intron (NM_020820, intron 8 of 39) AluJo|SINE|Alu 135823 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 272.333-41 chr3 33873125 33873481 + 1 NA Intergenic Intergenic 74673 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 145.667-274 chr7 87492127 87492306 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -16513 NM_018850 5244 Hs.654403 NM_000443 ENSG00000005471 ABCB4 ABC21|GBD1|ICP3|MDR2|MDR2/3|MDR3|PFIC-3|PGY3 ATP binding cassette subfamily B member 4 protein-coding 203.667-44 chr18 46759962 46760181 + 1 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -3018 NM_001307987 29906 Hs.465025 NM_013305 ENSG00000101638 ST8SIA5 SIAT8-E|SIAT8E|ST8SiaV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 protein-coding 153.667-195 chr2 123928863 123929163 + 1 NA Intergenic Intergenic 96161 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 270.667-28 chr2 166626781 166627222 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -140030 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 118.667-61 chr13 22772416 22772567 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 125690 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 221.333-69 chr2 156381029 156381284 + 1 NA Intergenic Intergenic -39036 NR_147695 440918 Hs.641142 NR_147695 FLJ46875 - uncharacterized LOC440918 ncRNA 165.667-114 chr21 28817996 28818278 + 1 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 67230 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 135.333-56 chr14 81892738 81892929 + 1 NA Intergenic Intergenic -149695 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 200.667-136 chr6 101826778 101827147 + 1 NA intron (NM_001166247, intron 9 of 16) intron (NM_001166247, intron 9 of 16) 427977 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 237.667-39 chr2 102438189 102438464 + 1 NA intron (NM_003853, intron 6 of 11) intron (NM_003853, intron 6 of 11) 6037 NR_039930 100616157 NR_039930 ENSG00000264764 MIR4772 mir-4772 microRNA 4772 ncRNA 157.667-197 chr3 132420738 132420914 + 1 NA intron (NM_001329126, intron 1 of 56) L1MCc|LINE|L1 3324 NM_015268 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 137.333-88 chr2 31648105 31648282 + 1 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 -67255 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 306.333-34 chr5 51793332 51793861 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -214435 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 147.333-228 chr3 186453103 186453333 + 1 NA Intergenic Intergenic 12873 NR_151708 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 190.333-84 chr20 44335294 44335531 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -1746 NM_178491 140902 Hs.580807 NM_178491 ENSG00000101074 R3HDML dJ881L22.3 R3H domain containing like protein-coding 252.333-52 chr4 156590529 156590923 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 381073 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 234.333-46 chr20 13922716 13923055 + 1 NA intron (NR_073206, intron 3 of 20) intron (NR_073206, intron 3 of 20) 67729 NR_073206 80343 Hs.590879 NM_025229 ENSG00000101251 SEL1L2 C20orf50|sel-1L2 SEL1L2 adaptor subunit of ERAD E3 ligase protein-coding 243.667-7 chr10 9797928 9798426 + 1 NA Intergenic Intergenic -260545 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 319.667-13 chr2 44438104 44438517 + 1 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 76363 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 167.667-105 chr2 83634346 83634647 + 1 NA Intergenic Intergenic 111682 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 143.333-26 chr10 19725745 19725992 + 1 NA intron (NR_120646, intron 1 of 4) L1MB4|LINE|L1 2682 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 194.667-161 chr9 28432433 28432747 + 1 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 286715 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 153.333-137 chr15 57639638 57639928 + 1 NA intron (NR_104370, intron 10 of 11) intron (NR_104370, intron 10 of 11) 47879 NM_001018090 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 223.333-95 chr21 22585049 22585442 + 1 NA Intergenic Intergenic 486628 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 149.333-348 chr6 127439009 127439262 + 1 NA 3' UTR (NM_001012279, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001012279, exon 12 of 12) 20254 NM_014702 9729 Hs.319247 NM_014702 ENSG00000189367 KIAA0408 - KIAA0408 protein-coding 215.333-72 chr17 55929083 55929392 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 178132 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 158.333-118 chr17 72476893 72477071 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 115822 NR_152515 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 162.667-193 chr4 52521206 52521459 + 1 NA Intergenic Intergenic 135207 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 236.667-95 chr9 80329692 80330105 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 354875 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 134.667-4 chr1 67261780 67261990 + 1 NA Intergenic Intergenic -45479 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 303.333-34 chr18 1795367 1795823 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -435966 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 151.667-186 chr20 7159115 7159362 + 1 NA intron (NR_110609, intron 5 of 7) intron (NR_110609, intron 5 of 7) 94964 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 195.667-115 chr6 43203114 43203461 + 1 NA intron (NM_015089, intron 18 of 40) intron (NM_015089, intron 18 of 40) 21091 NM_015089 23113 Hs.485434 NM_015089 ENSG00000112659 CUL9 H7AP1|PARC cullin 9 protein-coding 150.333-388 chr7 106410921 106411149 + 1 NA Intergenic Intergenic -126052 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 112.333-154 chr22 26886351 26886561 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -16836 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 161.333-112 chr17 42719053 42719234 + 1 NA exon (NM_001321082, exon 7 of 20) exon (NM_001321082, exon 7 of 20) -10992 NR_106838 102466195 NR_106838 ENSG00000275273 MIR6780A hsa-mir-6780a microRNA 6780a ncRNA 277.333 chr1 78585631 78585965 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -34650 NM_006820 10964 Hs.744918 NM_006820 ENSG00000137959 IFI44L C1orf29|GS3686 interferon induced protein 44 like protein-coding 149.333-117 chr14 76672150 76672344 + 1 NA Intergenic Intergenic -89221 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 197.333-174 chr4 142752970 142753263 + 1 NA intron (NM_001331040, intron 1 of 25) intron (NM_001331040, intron 1 of 25) 93419 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 118.333-216 chr9 71951006 71951162 + 1 NA intron (NM_001365057, intron 2 of 2) intron (NM_001365057, intron 2 of 2) 39445 NM_182505 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 157.333-207 chr2 218458356 218458533 + 1 NA intron (NM_020935, intron 23 of 25) AluSz6|SINE|Alu 39321 NM_007127 7429 Hs.654595 NM_007127 ENSG00000127831 VIL1 D2S1471|VIL villin 1 protein-coding 151.333-295 chr4 6885630 6885847 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -23706 NM_001113361 57533 Hs.518611 NM_020773 ENSG00000132405 TBC1D14 - TBC1 domain family member 14 protein-coding 162.667-200 chr4 94843299 94843469 + 1 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 85429 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 166.333-133 chr2 240831236 240831456 + 1 NA Intergenic Intergenic -11038 NM_004321 547 Hs.516802 NM_004321 ENSG00000130294 KIF1A ATSV|C2orf20|HSN2C|MRD9|SPG30|UNC104 kinesin family member 1A protein-coding 156.667-155 chr18 12598253 12598426 + 1 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 58393 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 131.667-110 chr20 54646606 54646782 + 1 NA intron (NM_018431, intron 7 of 7) intron (NM_018431, intron 7 of 7) 171101 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 157.667-357 chr9 100697452 100697676 + 1 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack 119485 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 349.333-9 chr11 79759954 79760470 + 1 NA Intergenic Intergenic -319182 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 168.333-152 chr4 92984897 92985122 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) L1MC4a|LINE|L1 680610 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 125.333-168 chr7 77398328 77398500 + 1 NA intron (NM_001350901, intron 1 of 27) intron (NM_001350901, intron 1 of 27) -16784 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 191.667-103 chr5 113905014 113905474 + 1 NA Intergenic Intergenic 391550 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 394.333-17 chr5 63653606 63654425 + 1 NA Intergenic Intergenic 308277 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 219.333-29 chr10 94286520 94286967 + 1 NA intron (NM_001165979, intron 21 of 31) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 327 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 313.667-35 chr4 184408644 184409233 + 1 NA intron (NM_002199, intron 5 of 8) intron (NM_002199, intron 5 of 8) -26632 NR_125933 102723766 Hs.432281 NR_125933 ENSG00000249096 LINC02362 - long intergenic non-protein coding RNA 2362 ncRNA 245.667-41 chr22 27144004 27144364 + 1 NA Intergenic Intergenic -43332 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 169.333-241 chr7 37877889 37878096 + 1 NA intron (NM_016616, intron 12 of 17) L1MD|LINE|L1 29395 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 203.667-29 chr14 49368958 49369240 + 1 NA Intergenic Intergenic 217281 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 144.333-275 chr8 120789120 120789313 + 1 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) L1PB3|LINE|L1 22830 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 143.667-30 chr10 101334723 101334989 + 1 NA Intergenic (TTCCAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -19177 NM_001256856 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 157.333-144 chr17 27812731 27813022 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -12347 NM_000625 4843 Hs.709191 NM_000625 ENSG00000007171 NOS2 HEP-NOS|INOS|NOS|NOS2A nitric oxide synthase 2 protein-coding 233.333-62 chr2 68942387 68942840 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 10280 NM_182536 200504 Hs.16757 NM_182536 ENSG00000183607 GKN2 BRICD1B|GDDR|PRO813|TFIZ1|VLTI465 gastrokine 2 protein-coding 149.667-214 chr2 136560300 136560530 + 1 NA Intergenic Intergenic -205130 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 122.667-60 chr15 87458018 87458170 + 1 NA Intergenic (TCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -118835 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 155.333-413 chr9 87068566 87068780 + 1 NA Intergenic Intergenic 16552 NR_036691 494127 Hs.626316 NR_036691 LOC494127 - NFYC pseudogene pseudo 157.333-170 chr2 28735309 28735529 + 1 NA intron (NR_145832, intron 1 of 1) intron (NR_145832, intron 1 of 1) 786 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 152.333-63 chr11 48303442 48303648 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -2678 NM_001004725 256148 Hs.553657 NM_001004725 ENSG00000176555 OR4S1 OR11-100 olfactory receptor family 4 subfamily S member 1 protein-coding 180.333-63 chr20 10407181 10407531 + 1 NA intron (NR_072977, intron 4 of 4) intron (NR_072977, intron 4 of 4) 24569 NM_018848 8195 Hs.472119 NM_018848 ENSG00000125863 MKKS BBS6|HMCS|KMS|MKS McKusick-Kaufman syndrome protein-coding 290.333-39 chr6 56713805 56714168 + 1 NA intron (NM_001144770, intron 3 of 94) intron (NM_001144770, intron 3 of 94) -71097 NM_001723 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 261.333-26 chr14 52725376 52725838 + 1 NA intron (NR_158967, intron 14 of 14) AluJb|SINE|Alu -4559 NM_001130701 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 158.667-227 chr3 194601835 194602066 + 1 NA intron (NM_138399, intron 9 of 10) intron (NM_138399, intron 9 of 10) 17682 NR_047574 100507297 Hs.586059 NR_047573 TMEM44-AS1 - TMEM44 antisense RNA 1 ncRNA 141.333-248 chr8 130390992 130391204 + 1 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) L1MB3|LINE|L1 52562 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 149.333-22 chr1 151428533 151428706 + 1 NA intron (NM_145796, intron 3 of 16) intron (NM_145796, intron 3 of 16) 13586 NM_207171 23126 Hs.489873 NM_015100 ENSG00000143442 POGZ MRD37|WHSUS|ZNF280E|ZNF635|ZNF635m pogo transposable element derived with ZNF domain protein-coding 284.333-5 chr10 20011324 20011643 + 1 NA intron (NM_001282736, intron 2 of 12) intron (NM_001282736, intron 2 of 12) 195051 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 153.333-176 chr19 28488261 28488435 + 1 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) -118340 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 144.667-31 chr10 73375652 73375916 + 1 NA 3' UTR (NM_001320880, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001320880, exon 13 of 13) -16920 NM_001367801 118491 Hs.591367 NM_145170 ENSG00000156042 CFAP70 TTC18 cilia and flagella associated protein 70 protein-coding 145.667-179 chr3 101508862 101509012 + 1 NA intron (NM_020654, intron 1 of 23) intron (NM_020654, intron 1 of 23) 4275 NM_020654 57337 Hs.529551 NM_020654 ENSG00000138468 SENP7 - SUMO specific peptidase 7 protein-coding 215.333-159 chr5 56135062 56135521 + 1 NA intron (NM_024669, intron 7 of 11) L1MC1|LINE|L1 98039 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 205.667-45 chr14 45199741 45200061 + 1 NA exon (NM_020937, exon 23 of 23) exon (NM_020937, exon 23 of 23) 53301 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 194.333-14 chr1 202105569 202105893 + 1 NA Intergenic Intergenic -17186 NM_004767 9283 Hs.132049 NM_004767 ENSG00000170075 GPR37L1 ET(B)R-LP-2|ETBR-LP-2|ETBRLP2 G protein-coupled receptor 37 like 1 protein-coding 156.667-217 chr22 27155796 27155979 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -31629 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 182.333-17 chr10 27675523 27675788 + 1 NA intron (NM_001242702, intron 5 of 6) intron (NM_001242702, intron 5 of 6) -68960 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 159.667-12 chr1 70491456 70491664 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 80292 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 158.333-327 chr8 120526389 120526682 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 81116 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 173.333-136 chr3 180822766 180823023 + 1 NA intron (NR_109986, intron 2 of 13) L1PA15|LINE|L1 47284 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 152.333-332 chr6 55316581 55316876 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -10741 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 243.333-100 chr6 147790777 147791020 + 1 NA Intergenic Ricksha_b|DNA|MULE-MuDR 282208 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 194.667-151 chr8 86116094 86116339 + 1 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) HAL1ME|LINE|L1 17306 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 162.667-140 chr2 139154083 139154344 + 1 NA Intergenic Intergenic 256889 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 258.667-82 chr5 130699996 130700334 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 465091 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 168.333-221 chr9 36914854 36915056 + 1 NA intron (NR_103999, intron 6 of 8) L1ME4b|LINE|L1 -21424 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 214.667-94 chr4 146952152 146952454 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -6417 NM_031956 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 147.667-401 chrX 78201802 78201965 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -62233 NM_015975 51616 Hs.592248 NM_015975 ENSG00000187325 TAF9B DN-7|DN7|TAF9L|TAFII31L|TFIID-31 TATA-box binding protein associated factor 9b protein-coding 187.667-108 chr4 65743256 65743590 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -72928 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 117.667-157 chr5 146260616 146260857 + 1 NA intron (NM_018989, intron 11 of 20) intron (NM_018989, intron 11 of 20) 57131 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 162.667-206 chr5 13632116 13632298 + 1 NA Intergenic Intergenic 312273 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 240.333-21 chr11 21640337 21640621 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -552606 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 148.333-336 chr6 43022892 43023099 + 1 NA intron (NR_138081, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 1372 NM_033112 88745 Hs.309231 NM_033112 ENSG00000124541 RRP36 C6orf153|dJ20C7.4 ribosomal RNA processing 36 protein-coding 146.667-21 chr1 189694677 189694871 + 1 NA Intergenic Intergenic 781236 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 283.333-9 chr10 83560931 83561533 + 1 NA Intergenic Intergenic 115857 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 129.333-180 chr7 108536335 108536541 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -8260 NM_001256011 50640 Hs.617340 NM_015723 ENSG00000135241 PNPLA8 IPLA2-2|IPLA2G|MMLA|PNPLA-gamma|iPLA2gamma patatin like phospholipase domain containing 8 protein-coding 173.667-30 chr11 65813885 65814062 + 1 NA Intergenic Intergenic -19990 NM_152760 254122 Hs.591950 NM_152760 ENSG00000172803 SNX32 SNX6B sorting nexin 32 protein-coding 168.667-225 chr8 116987498 116987671 + 1 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) intron (NM_001172811, intron 2 of 9) 36609 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 112.667-139 chr2 199170406 199170557 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 287458 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 214.333-136 chr7 8228399 8228636 + 1 NA intron (NM_001350836, intron 4 of 14) intron (NM_001350836, intron 4 of 14) 33535 NM_022307 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 208.333-97 chr3 112936548 112936870 + 1 NA intron (NM_138940, intron 1 of 2) L1PA11|LINE|L1 38394 NM_170780 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 274.667-6 chr10 15592155 15592526 + 1 NA intron (NM_001291494, intron 20 of 28) intron (NM_001291494, intron 20 of 28) 127582 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 168.667-142 chr3 87253320 87253526 + 1 NA exon (NM_001244644, exon 4 of 5) exon (NM_001244644, exon 4 of 5) 23161 NM_001122757 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 197.667-10 chr1 194147803 194148105 + 1 NA Intergenic Intergenic 843209 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 235.667-30 chr18 65418222 65418645 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -331819 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 199.667-140 chr8 92618319 92618619 + 1 NA intron (NR_125827, intron 3 of 4) intron (NR_125827, intron 3 of 4) 37025 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 172.333-185 chr8 109314490 109314724 + 1 NA intron (NM_032869, intron 2 of 9) intron (NM_032869, intron 2 of 9) 15326 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 147.333-74 chr11 133252431 133252602 + 1 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) 279985 NM_001319104 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 187.667-152 chr9 132700247 132700483 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 29901 NM_012204 9329 Hs.22302 NM_012204 ENSG00000125484 GTF3C4 KAT12|TF3C-delta|TFIII90|TFIIIC290|TFIIIC90|TFIIICDELTA general transcription factor IIIC subunit 4 protein-coding 162.333-237 chr7 86427513 86427727 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -216289 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 139.333-128 chr2 223628972 223629164 + 1 NA Intergenic Intergenic -26707 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 115.333-45 chr12 20082311 20082491 + 1 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) intron (NR_040098, intron 2 of 2) 45500 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 164.333-235 chr8 70871445 70871717 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 202242 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 252.667-89 chr6 64400357 64400816 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 28 of 43) intron (NM_001292009, intron 28 of 43) 593750 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 166.667-40 chr11 39594240 39594555 + 1 NA Intergenic Intergenic 698733 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 198.667-73 chr15 71945861 71946116 + 1 NA intron (NM_006901, intron 15 of 41) L1ME1|LINE|L1 135434 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 228.333-46 chr2 70158589 70159052 + 1 NA intron (NR_145968, intron 9 of 10) AluSq10|SINE|Alu 31891 NM_001348763 54980 Hs.720049 NM_017880 ENSG00000115998 C2orf42 - chromosome 2 open reading frame 42 protein-coding 198.333-177 chr6 73988950 73989252 + 1 NA Intergenic Intergenic -80350 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 122.333-73 chr17 54343958 54344163 + 1 NA Intergenic Intergenic 521133 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 206.667-18 chr10 79186029 79186289 + 1 NA intron (NM_020338, intron 4 of 24) intron (NM_020338, intron 4 of 24) 117193 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 285.667-2 chr1 118623654 118624001 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 364516 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 375.667-15 chr5 39557655 39558089 + 1 NA Intergenic Intergenic 37441 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 195.667-159 chrX 101225930 101226297 + 1 NA intron (NM_001939, intron 2 of 23) L1ME4b|LINE|L1 6169 NM_001171184 1821 Hs.159291 NM_001939 ENSG00000102385 DRP2 DRP-2 dystrophin related protein 2 protein-coding 177.667-104 chr4 159866993 159867336 + 1 NA Intergenic Intergenic -89380 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 131.667-170 chr6 47761977 47762177 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -19962 NM_181744 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 149.667-371 chr7 43353682 43353850 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 4 of 27) L1MA4|LINE|L1 168776 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 252.667-64 chr3 69969762 69970229 + 1 NA Intergenic Intergenic -29749 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 177.667-140 chr8 138088782 138088967 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -5329 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 158.667-340 chr9 6169180 6169389 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -45865 NM_001314044 90865 Hs.731660 NM_033439 ENSG00000137033 IL33 C9orf26|DVS27|IL1F11|NF-HEV|NFEHEV interleukin 33 protein-coding 144.667-14 chr1 118051875 118052032 + 1 NA intron (NM_206996, intron 20 of 48) (TATATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 122214 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 275.333-21 chr14 51938494 51938905 + 1 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) -20128 NR_126331 102723604 Hs.667541 NR_126331 ENSG00000258928 LOC102723604 - uncharacterized LOC102723604 ncRNA 187.333-189 chr7 47194229 47194626 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 270376 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 291.333-70 chr8 135036021 135036441 + 1 NA Intergenic Intergenic 186296 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 315.667-9 chr17 73727634 73728045 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -10015 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 276.667-19 chr13 38327359 38327812 + 1 NA Intergenic Intergenic -22266 NR_104584 51569 Hs.643655 NM_016617 ENSG00000120686 UFM1 BM-002|C13orf20|HLD14 ubiquitin fold modifier 1 protein-coding 249.667-4 chr1 115265709 115266163 + 1 NA Intergenic Intergenic -17098 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 207.667-81 chr4 15510313 15510647 + 1 NA intron (NM_001080522, intron 8 of 37) AluJb|SINE|Alu 40598 NM_001164720 57545 Hs.590928 NM_020785 ENSG00000048342 CC2D2A JBTS9|MKS6 coiled-coil and C2 domain containing 2A protein-coding 132.667-196 chrX 47870218 47870447 + 1 NA intron (NM_007137, intron 2 of 4) MER89-int|LTR|ERV1 33430 NM_007137 347344 Hs.114246 NM_007137 ENSG00000197779 ZNF81 HFZ20|MRX45|dJ54B20.6 zinc finger protein 81 protein-coding 244.333-49 chr16 78564291 78564599 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) Tigger12A|DNA|TcMar-Tigger 464791 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 139.333-191 chr6 65014968 65015137 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 13 of 43) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -286366 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 164.333-55 chr12 32626530 32626758 + 1 NA intron (NM_001370297, intron 12 of 14) L2b|LINE|L2 -52556 NM_012063 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 182.333-9 chr1 179840793 179841060 + 1 NA 3' UTR (NM_001349935, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001349935, exon 8 of 8) 27914 NM_001349933 163590 Hs.571797 NM_022347 ENSG00000169905 TOR1AIP2 IFRG15|LULL1|NET9 torsin 1A interacting protein 2 protein-coding 145.333-231 chr5 23659560 23659847 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 152048 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 149.667-177 chr19 41827024 41827236 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 16597 NM_001291419 147719 Hs.98660 NM_173506 ENSG00000273111 LYPD4 SMR LY6/PLAUR domain containing 4 protein-coding 157.667-218 chr4 70369732 70369916 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 9064 NM_012390 26952 Hs.701334 NM_012390 ENSG00000109208 SMR3A P-B1|PBI|PRL5|PROL5 submaxillary gland androgen regulated protein 3A protein-coding 120.667-168 chr7 104990721 104990876 + 1 NA non-coding (NR_039981, exon 1 of 1) non-coding (NR_039981, exon 1 of 1) 367 NR_039981 100216546 Hs.369356 NR_039981 LINC01004 - long intergenic non-protein coding RNA 1004 ncRNA 152.667-356 chr8 17210971 17211171 + 1 NA intron (NM_016353, intron 10 of 12) intron (NM_016353, intron 10 of 12) 35387 NM_001322089 29883 Hs.587465 NM_013354 ENSG00000198791 CNOT7 CAF-1|CAF1|Caf1a|hCAF-1 CCR4-NOT transcription complex subunit 7 protein-coding 213.667-66 chr4 66228624 66228925 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -48050 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 131.667-129 chr3 64373671 64373874 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -105599 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 144.667-213 chr4 33442409 33442599 + 1 NA Intergenic Intergenic 597389 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 215.667-101 chr5 118070323 118070646 + 1 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -212090 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 224.667-61 chr4 124433232 124433508 + 1 NA Intergenic Intergenic 125064 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 195.333-183 chr5 139145245 139145540 + 1 NA intron (NM_022464, intron 1 of 9) L1MB4|LINE|L1 52976 NM_022464 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 179.667-62 chr17 29869704 29869942 + 1 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) intron (NM_001282129, intron 1 of 15) -60080 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 214.333-20 chr10 70594650 70594970 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 7931 NM_001083116 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 151.333-196 chr2 27632118 27632377 + 1 NA intron (NM_007266, intron 4 of 13) intron (NM_007266, intron 4 of 13) 3197 NM_007266 11321 Hs.18259 NM_007266 ENSG00000198522 GPN1 ATPBD1A|MBDIN|NTPBP|RPAP4|XAB1 GPN-loop GTPase 1 protein-coding 159.667-341 chr9 110565637 110565823 + 1 NA intron (NM_153366, intron 1 of 47) intron (NM_153366, intron 1 of 47) 14011 NM_153366 79987 Hs.522334 NM_153366 ENSG00000165124 SVEP1 C9orf13|CCP22|POLYDOM|SEL-OB|SELOB sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 protein-coding 321.667-24 chr8 122187450 122187816 + 1 NA Intergenic Intergenic 381011 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 303.667-12 chr22 25109384 25109787 + 1 NA intron (NR_038941, intron 4 of 4) MIR3|SINE|MIR 3107 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 232.667-32 chr19 18551914 18552315 + 1 NA Intergenic Intergenic -5648 NM_001171949 79036 Hs.714548 NM_024069 ENSG00000105700 KXD1 BORCS4|C10orf50|C19orf50|KXDL|MST096|MSTP096 KxDL motif containing 1 protein-coding 132.667-149 chr5 159787835 159788030 + 1 NA intron (NR_109891, intron 2 of 2) intron (NR_109891, intron 2 of 2) 83452 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 297.667 chr1 100131622 100132089 + 1 NA intron (NM_001304829, intron 1 of 15) MIRc|SINE|MIR 1075 NM_001304829 163786 Hs.591447 NM_194292 ENSG00000156876 SASS6 MCPH14|SAS-6|SAS6 SAS-6 centriolar assembly protein protein-coding 154.667-262 chr3 171821701 171821878 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -11306 NM_002662 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 194.333-124 chr5 128161607 128161963 + 1 NA non-coding (NR_046207, exon 17 of 27) non-coding (NR_046207, exon 17 of 27) 78019 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 147.667-108 chr14 85483950 85484097 + 1 NA Intergenic Intergenic -46002 NR_144387 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 147.333-24 chr1 187991774 187992061 + 1 NA Intergenic Intergenic 548289 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 168.333-143 chr4 38955395 38955666 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 76879 NM_024943 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 187.333-17 chr1 241551729 241551988 + 1 NA intron (NM_003679, intron 4 of 14) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 19480 NM_003679 8564 Hs.731056 NM_003679 ENSG00000117009 KMO dJ317G22.1 kynurenine 3-monooxygenase protein-coding 233.667-11 chr11 34494760 34495104 + 1 NA intron (NM_001422, intron 2 of 6) L2b|LINE|L2 16792 NM_198381 2001 Hs.11713 NM_001422 ENSG00000135374 ELF5 ESE2 E74 like ETS transcription factor 5 protein-coding 202.667-41 chr12 63320396 63320707 + 1 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -167741 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 152.667-10 chr1 80614791 80614956 + 1 NA intron (NR_125940, intron 2 of 3) L1PA15-16|LINE|L1 -26414 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 152.333-121 chr15 58811436 58811716 + 1 NA intron (NM_001040450, intron 4 of 8) LTR33|LTR|ERVL 40274 NM_001040453 54629 Hs.591122 NM_019092 ENSG00000128923 MINDY2 FAM63B MINDY lysine 48 deubiquitinase 2 protein-coding 170.333-75 chr14 64427341 64427595 + 1 NA exon (NM_001364837, exon 12 of 27) exon (NM_001364837, exon 12 of 27) -38031 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 137.667-164 chr6 79492168 79492334 + 1 NA intron (NM_001122769, intron 5 of 7) L1MC5a|LINE|L1 45179 NM_181714 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 283.667-34 chr7 43632185 43632589 + 1 NA non-coding (NR_146941, exon 9 of 10) non-coding (NR_146941, exon 9 of 10) 49279 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 140.667-198 chr6 57435456 57435700 + 1 NA intron (NM_000947, intron 7 of 13) intron (NM_000947, intron 7 of 13) 45446 NR_036097 100422884 NR_036097 ENSG00000212017 MIR548U - microRNA 548u ncRNA 147.333-209 chr3 12724810 12725058 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 34325 NM_001284408 55287 Hs.475502 NM_018306 ENSG00000088726 TMEM40 - transmembrane protein 40 protein-coding 146.667-119 chr16 7851096 7851385 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 518395 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 351.333-12 chr15 94428289 94428789 + 1 NA intron (NM_001159643, intron 16 of 19) L1MEd|LINE|L1 72609 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 158.667-309 chr7 87010040 87010270 + 1 NA intron (NM_001142749, intron 1 of 21) intron (NM_001142749, intron 1 of 21) 30079 NM_001291991 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 148.333-160 chr17 11706434 11706633 + 1 NA intron (NM_001372, intron 26 of 68) intron (NM_001372, intron 26 of 68) 108063 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 148.333-418 chr9 135474500 135474667 + 1 NA Intergenic Intergenic -2334 NR_038969 100506599 Hs.561897 NR_038969 ENSG00000225361 PPP1R26-AS1 - PPP1R26 antisense RNA 1 ncRNA 321.667-3 chr11 120649489 120650154 + 1 NA intron (NM_001282470, intron 1 of 19) intron (NM_001282470, intron 1 of 19) 85385 NM_001282470 2900 Hs.538738 NM_014619 ENSG00000149403 GRIK4 EAA1|GRIK|GluK4|KA1 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 4 protein-coding 155.667-369 chr8 121366905 121367226 + 1 NA Intergenic Intergenic -272281 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 163.667-176 chr4 48079890 48080112 + 1 NA exon (NM_003328, exon 11 of 15) exon (NM_003328, exon 11 of 15) 54249 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 156.333-14 chr1 78854532 78854697 + 1 NA Intergenic Intergenic 152116 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 113.333-142 chr2 218094439 218094625 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 25517 NM_198483 285180 Hs.570069 NM_198483 ENSG00000188282 RUFY4 ZFYVE31 RUN and FYVE domain containing 4 protein-coding 118.333-34 chr10 59684296 59684464 + 1 NA intron (NM_194298, intron 1 of 5) intron (NM_194298, intron 1 of 5) 25511 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 197.667-84 chr3 71392081 71392390 + 1 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) intron (NR_146142, intron 3 of 19) -87464 NM_001244812 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 148.333-128 chr14 70450974 70451154 + 1 NA Intergenic Intergenic -1110 NM_003813 8747 Hs.178748 NM_003813 ENSG00000139985 ADAM21 ADAM 21|ADAM31 ADAM metallopeptidase domain 21 protein-coding 142.333-231 chr8 15851310 15851492 + 1 NA Intergenic Intergenic 311138 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 202.333-143 chr5 59644618 59644845 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -57106 NM_001364604 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 148.333-76 chr11 93554115 93554379 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -10856 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 147.667-16 chr1 166483492 166483646 + 1 NA intron (NR_146890, intron 1 of 2) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 6470 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 143.667-261 chr8 133052696 133052882 + 1 NA intron (NM_001282965, intron 1 of 6) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 -2170 NR_146773 100302522 Hs.658759 NR_146773 PTCSC1 NCRNA00197|PTCSC papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 1 ncRNA 116.333-146 chr3 119918700 119918933 + 1 NA intron (NM_002093, intron 4 of 11) intron (NM_002093, intron 4 of 11) 136106 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 225.333-53 chr14 67666591 67666902 + 1 NA intron (NM_006370, intron 1 of 5) MIR3|SINE|MIR 7886 NM_006370 10490 Hs.741177 NM_006370 ENSG00000100568 VTI1B VTI1|VTI1-LIKE|VTI1L|VTI2|v-SNARE|vti1-rp1 vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B protein-coding 205.333-167 chr4 38431502 38431898 + 1 NA intron (NR_110951, intron 6 of 7) MLT2D|LTR|ERVL 64786 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 154.333-169 chr2 168179650 168179824 + 1 NA intron (NM_013233, intron 2 of 17) intron (NM_013233, intron 2 of 17) 67858 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 240.667 chr1 41869275 41869604 + 1 NA intron (NR_038261, intron 2 of 3) intron (NR_038261, intron 2 of 3) 49483 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 188.333-19 chr10 65089583 65089962 + 1 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -165254 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 149.667-113 chr14 43835098 43835273 + 1 NA Intergenic Intergenic 672098 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 112.667-119 chr2 40053821 40054022 + 1 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 136287 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 198.333-44 chr12 57854687 57855037 + 1 NA Intergenic Intergenic -8133 NM_005730 10106 Hs.524530 NM_005730 ENSG00000175215 CTDSP2 OS4|PSR2|SCP2 CTD small phosphatase 2 protein-coding 162.667-29 chr10 60463947 60464192 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -74194 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 164.667-114 chr2 105588800 105589050 + 1 NA Intergenic Intergenic 21634 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 147.333-109 chr14 66449050 66449250 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -37221 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 217.667-85 chr7 112431467 112431900 + 1 NA intron (NM_001197080, intron 1 of 11) intron (NM_001197080, intron 1 of 11) 8539 NM_001007245 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 184.333-37 chr14 56307285 56307609 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 189036 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 195.333-197 chr7 3086002 3086226 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -42247 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 328.333-37 chr8 123022487 123023141 + 1 NA intron (NM_024295, intron 4 of 7) intron (NM_024295, intron 4 of 7) 2958 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 196.667-160 chr8 92742196 92742566 + 1 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) intron (NR_046114, intron 1 of 2) 43679 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 162.333-108 chr2 36184760 36184968 + 1 NA Intergenic Intergenic 170706 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 155.333-60 chr11 105407958 105408236 + 1 NA Intergenic Intergenic -201976 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 155.667-390 chr9 104160979 104161267 + 1 NA Intergenic Intergenic 66496 NM_001042550 10592 Hs.119023 NM_006444 ENSG00000136824 SMC2 CAP-E|CAPE|SMC-2|SMC2L1 structural maintenance of chromosomes 2 protein-coding 381.667-3 chr15 46737627 46738133 + 1 NA Intergenic Intergenic -446209 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 234.667-77 chr4 1832707 1833244 + 1 NA intron (NM_012318, intron 5 of 13) intron (NM_012318, intron 5 of 13) 23181 NM_012318 3954 Hs.120165 NM_012318 ENSG00000168924 LETM1 SLC55A1 leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1 protein-coding 169.333-28 chr10 91379269 91379580 + 1 NA intron (NR_024467, intron 3 of 4) intron (NR_024467, intron 3 of 4) -29811 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 222.667-34 chr16 79867144 79867653 + 1 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 72149 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 233.333-55 chr2 22943540 22943787 + 1 NA Intergenic Intergenic 407184 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 118.667-198 chr8 130348906 130349051 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) -52445 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 289.667-24 chr3 38363564 38364018 + 1 NA intron (NM_001349178, intron 4 of 19) MIR|SINE|MIR 17006 NM_001349178 9942 Hs.659985 NM_005108 ENSG00000093217 XYLB - xylulokinase protein-coding 172.333-178 chr8 79463052 79463277 + 1 NA Intergenic Intergenic 130976 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 329.333-60 chr9 7215129 7215674 + 1 NA Intergenic (AAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 458051 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 156.333-143 chr17 17103726 17103896 + 1 NA intron (NM_201274, intron 3 of 23) intron (NM_201274, intron 3 of 23) 61051 NM_015134 23164 Hs.462341 NM_015134 ENSG00000133030 MPRIP M-RIP|MRIP|RHOIP3|RIP3|p116Rip myosin phosphatase Rho interacting protein protein-coding 176.333-175 chr8 138193040 138193270 + 1 NA intron (NM_015912, intron 9 of 19) intron (NM_015912, intron 9 of 19) -109610 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 136.333-53 chr14 44516248 44516480 + 1 NA intron (NR_135257, intron 2 of 2) L1PB4|LINE|L1 8955 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 159.333-22 chr1 181706207 181706470 + 1 NA intron (NM_001205293, intron 7 of 47) intron (NM_001205293, intron 7 of 47) 222821 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 200.667-157 chr8 111149517 111149740 + 1 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 86575 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 167.667-98 chr2 28170689 28170907 + 1 NA intron (NR_120504, intron 1 of 2) intron (NR_120504, intron 1 of 2) 36163 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 156.333-157 chr18 69716838 69717035 + 1 NA intron (NM_152721, intron 5 of 7) L1ME2|LINE|L1 230937 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 199.667-34 chr12 110953795 110954132 + 1 NA intron (NR_135002, intron 3 of 3) intron (NR_135002, intron 3 of 3) 3855 NR_135002 105369980 Hs.564357 NR_135001 ENSG00000258240 LOC105369980 - uncharacterized LOC105369980 ncRNA 111.667-15 chr1 109930702 109930905 + 1 NA 3' UTR (NM_172211, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_172211, exon 9 of 9) 19954 NM_000757 1435 Hs.173894 NM_000757 ENSG00000184371 CSF1 CSF-1|MCSF colony stimulating factor 1 protein-coding 138.667-206 chr8 105961562 105961759 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 98843 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 300.333-25 chr2 171975312 171975666 + 1 NA intron (NR_027862, intron 7 of 9) L1M4|LINE|L1 -24464 NR_136276 254042 Hs.298250 NM_199227 ENSG00000172878 METAP1D MAP 1D|MAP1D|MetAP 1D|Metap1l methionyl aminopeptidase type 1D, mitochondrial protein-coding 159.333-279 chr6 50194598 50194807 + 1 NA Intergenic Intergenic -144773 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 194.333-8 chr1 95755705 95755962 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -236235 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 126.667-168 chr7 54637567 54637781 + 1 NA Intergenic Intergenic 80704 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 155.667-215 chr3 37034097 37034313 + 1 NA intron (NM_001167617, intron 13 of 18) L1ME3E|LINE|L1 40855 NM_001354622 4292 Hs.195364 NM_000249 ENSG00000076242 MLH1 COCA2|FCC2|HNPCC|HNPCC2|hMLH1 mutL homolog 1 protein-coding 221.333 chr1 7773340 7773626 + 1 NA exon (NM_004781, exon 2 of 5) exon (NM_004781, exon 2 of 5) 2187 NM_004781 9341 Hs.66708 NM_004781 ENSG00000049245 VAMP3 CEB vesicle associated membrane protein 3 protein-coding 123.667-17 chr1 155882311 155882472 + 1 NA 3' UTR (NM_152280, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_152280, exon 4 of 4) 22824 NM_152280 23208 Hs.32984 NM_152280 ENSG00000132718 SYT11 SYT12|sytXI synaptotagmin 11 protein-coding 215.667-69 chr2 197552996 197553352 + 1 NA 3' UTR (NM_001202485, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001202485, exon 9 of 9) 36876 NM_001204094 25843 Hs.633165 NM_015387 ENSG00000115540 MOB4 2C4D|CGI-95|MOB1|MOB3|MOBKL3|PHOCN|PREI3 MOB family member 4, phocein protein-coding 150.667-23 chr1 239932562 239932794 + 1 NA Intergenic (GTATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -32806 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 187.667-79 chr2 229276856 229277132 + 1 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 -5707 NM_017933 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 169.667-182 chr6 61242556 61242782 + 1 NA Intergenic Intergenic -331461 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 161.333-230 chr5 34902603 34902861 + 1 NA Intergenic Intergenic 12772 NM_002853 5810 Hs.38114 NM_002853 ENSG00000113456 RAD1 HRAD1|REC1 RAD1 checkpoint DNA exonuclease protein-coding 151.667-145 chr17 61047109 61047333 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 20 of 25) intron (NM_001330413, intron 20 of 25) 320483 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 210.667-7 chr1 93265253 93265648 + 1 NA intron (NM_206886, intron 27 of 27) intron (NM_206886, intron 27 of 27) 80361 NR_034089 100131564 Hs.732666 NR_034089 CCDC18-AS1 - CCDC18 antisense RNA 1 ncRNA 189.667-106 chr4 67027704 67028143 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 394077 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 155.333-224 chr3 30112202 30112415 + 1 NA Intergenic (TCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -178152 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-63 chr12 14282436 14282685 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -83072 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 231.333-2 chr1 65436588 65436859 + 1 NA TTS (NM_001198681) TTS (NM_001198681) 16007 NM_001198681 54741 Hs.23581 NM_017526 ENSG00000213625 LEPROT LEPR|OB-RGRP|OBRGRP|VPS55 leptin receptor overlapping transcript protein-coding 189.667-93 chr3 74536053 74536331 + 1 NA Intergenic Intergenic -15052 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 131.667-154 chr5 7841772 7841982 + 1 NA intron (NM_001089584, intron 1 of 2) L1PA11|LINE|L1 9256 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 121.333-49 chr14 36501268 36501419 + 1 NA intron (NR_161365, intron 1 of 4) intron (NR_161365, intron 1 of 4) 12192 NR_161363 253970 Hs.509165 NM_001101341 ENSG00000229415 SFTA3 NANCI|SFTPH|SP-H|SPH surfactant associated 3 ncRNA 140.667-131 chr20 52919483 52919662 + 1 NA Intergenic Intergenic -52786 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 172.333-190 chr8 134812343 134812569 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7511 NR_029599 407033 NR_029599 ENSG00000199153 MIR30D MIRN30D|mir-30d microRNA 30d ncRNA 149.667-334 chr5 154136969 154137225 + 1 NA Intergenic Intergenic -53636 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 269.667-25 chr16 56187889 56188423 + 1 NA intron (NR_027078, intron 1 of 4) intron (NR_027078, intron 1 of 4) 2938 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 197.667-94 chr3 159827622 159828058 + 1 NA intron (NM_001197113, intron 5 of 10) intron (NM_001197113, intron 5 of 10) -12021 NM_001197109 29970 Hs.134665 NM_014575 ENSG00000151967 SCHIP1 SCHIP-1 schwannomin interacting protein 1 protein-coding 114.667-53 chr11 76077303 76077448 + 1 NA intron (NM_003369, intron 13 of 14) intron (NM_003369, intron 13 of 14) 129127 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 152.667-71 chr11 122532603 122532875 + 1 NA Intergenic Intergenic -109868 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 234.667-114 chr9 28372933 28373343 + 1 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 346167 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 264.667-79 chr7 48577291 48577636 + 1 NA intron (NM_152701, intron 55 of 61) L1MCa|LINE|L1 -347084 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 145.333-184 chr3 46554759 46554945 + 1 NA intron (NM_024512, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 -2546 NR_073385 83598 Hs.570630 NR_073385 ENSG00000268324 LRRC2-AS1 LUZP3|LUZP3P|LUZPP1 LRRC2 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-105 chr18 1323641 1323960 + 1 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) intron (NR_023926, intron 2 of 5) 35829 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 138.667-6 chr1 102000388 102000615 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -3267 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 174.667-177 chr9 76163185 76163383 + 1 NA intron (NR_120409, intron 11 of 19) intron (NR_120409, intron 11 of 19) 231142 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 114.667-88 chr14 87721522 87721673 + 1 NA Intergenic Intergenic -66303 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 167.333-3 chr1 23060501 23060772 + 1 NA intron (NM_015013, intron 8 of 18) intron (NM_015013, intron 8 of 18) 16331 NR_036057 100422866 NR_036057 ENSG00000263793 MIR3115 mir-3115 microRNA 3115 ncRNA 152.333-296 chr5 44601039 44601337 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -90906 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 211.333-90 chr17 78076665 78076994 + 1 NA intron (NM_018996, intron 9 of 20) intron (NM_018996, intron 9 of 20) 34970 NR_040071 100131096 Hs.635442 NR_040071 ENSG00000204282 TNRC6C-AS1 TMC6|lnc TNRC6C antisense RNA 1 ncRNA 124.667-161 chr5 13529744 13529943 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 414637 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 146.667-304 chr7 45636803 45636968 + 1 NA intron (NM_001281768, intron 5 of 9) L1ME1|LINE|L1 62517 NM_021116 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 146.667-213 chr3 46651563 46651803 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 39158 NM_001195442 100132146 Hs.679623 NM_001195442 ENSG00000283473 FAM240A - family with sequence similarity 240 member A protein-coding 130.667-7 chr1 74851602 74851795 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -118290 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 143.667-4 chr1 42469197 42469363 + 1 NA intron (NM_001355227, intron 1 of 18) AluJo|SINE|Alu 5994 NM_001355227 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 138.667-124 chr21 45843347 45843513 + 1 NA intron (NM_001348243, intron 3 of 15) L1MC4|LINE|L1 -4720 NM_001348245 54039 Hs.474049 NM_020528 ENSG00000183570 PCBP3 ALPHA-CP3|PCBP3-OT1|PCBP3OT poly(rC) binding protein 3 protein-coding 240.333-4 chr1 161283649 161283930 + 1 NA intron (NM_001102566, intron 2 of 2) intron (NM_001102566, intron 2 of 2) 25044 NM_001102566 654790 Hs.433150 NM_001102566 ENSG00000248485 PCP4L1 IQM1 Purkinje cell protein 4 like 1 protein-coding 171.333-172 chr6 135378690 135378919 + 1 NA intron (NM_017651, intron 22 of 27) intron (NM_017651, intron 22 of 27) 118936 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 320.667-22 chr3 12291823 12292397 + 1 NA intron (NM_001354667, intron 1 of 6) intron (NM_001354667, intron 1 of 6) 3040 NM_001354670 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 374.333-9 chr2 36883215 36883779 + 1 NA intron (NM_003162, intron 9 of 17) intron (NM_003162, intron 9 of 17) 83039 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 211.667-85 chr3 180047307 180047650 + 1 NA Intergenic MERX|DNA|TcMar-Tigger -10541 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 257.333-22 chr11 39289652 39290004 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 640970 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 161.667-211 chr5 130813028 130813387 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 352049 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 136.667-31 chr11 81487074 81487255 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 403672 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 153.667-405 chr9 80393220 80393447 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 418310 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 271.667-22 chr14 26154614 26154945 + 1 NA Intergenic Intergenic 398651 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 125.667-93 chr2 46937497 46937637 + 1 NA intron (NM_001288953, intron 2 of 20) intron (NM_001288953, intron 2 of 20) -3657 NM_001288951 57217 Hs.370603 NM_020458 ENSG00000068724 TTC7A GIDID|MINAT|TTC7 tetratricopeptide repeat domain 7A protein-coding 169.667-126 chr3 26664426 26664649 + 1 NA intron (NM_001317810, intron 2 of 2) LTR16C|LTR|ERVL -30020 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 171.667-56 chr15 67011634 67011913 + 1 NA intron (NR_135686, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR 52409 NR_135686 102723493 Hs.419760 NR_135686 LOC102723493 - uncharacterized LOC102723493 ncRNA 140.333-162 chr4 77768644 77768804 + 1 NA intron (NM_001365006, intron 4 of 11) L1ME3E|LINE|L1 50340 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 158.667-298 chr6 162149379 162149613 + 1 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) AluSz|SINE|Alu -577636 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 227.667-36 chr2 169358867 169359253 + 1 NA intron (NM_004525, intron 1 of 78) intron (NM_004525, intron 1 of 78) 3474 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 244.333-12 chr10 70104543 70104870 + 1 NA intron (NM_018649, intron 7 of 8) intron (NM_018649, intron 7 of 8) 28119 NM_032797 84883 Hs.650680 NM_032797 ENSG00000042286 AIFM2 AMID|PRG3 apoptosis inducing factor mitochondria associated 2 protein-coding 317.667-22 chr2 20241581 20241955 + 1 NA Intergenic Intergenic -16335 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 155.667-320 chr7 9291279 9291439 + 1 NA Intergenic Intergenic -342911 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 136.667-104 chr20 14453524 14453746 + 1 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -100749 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 259.333-53 chr2 153141193 153141649 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 337341 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 271.667-11 chr10 95917044 95917378 + 1 NA intron (NM_001130446, intron 3 of 7) L1MA3|LINE|L1 9246 NM_001130446 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 246.333-12 chr10 51372082 51372499 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) L1M5|LINE|L1 72717 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 252.667-30 chr14 53222270 53222565 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 69063 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 150.667-77 chr11 99517247 99517400 + 1 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) intron (NM_001243271, intron 2 of 20) -38822 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 170.667-124 chr4 74408808 74409108 + 1 NA Intergenic Intergenic -36178 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 196.667-135 chr6 126040538 126040837 + 1 NA intron (NR_146799, intron 13 of 13) intron (NR_146799, intron 13 of 13) 54147 NR_146803 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 189.667-39 chr13 98353158 98353361 + 1 NA intron (NM_005766, intron 3 of 26) L1ME3B|LINE|L1 144735 NR_036129 100422881 NR_036129 ENSG00000263399 MIR3170 mir-3170 microRNA 3170 ncRNA 135.667-111 chr22 41408425 41408670 + 1 NA Intergenic Intergenic 26605 NM_003216 7008 Hs.181159 NM_003216 ENSG00000167074 TEF - TEF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 149.333-61 chr10 89151084 89151306 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 56122 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 122.333-153 chr4 31928888 31929062 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -68404 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 272.667-69 chr9 86079120 86079617 + 1 NA intron (NM_177937, intron 1 of 9) intron (NM_177937, intron 1 of 9) 20190 NM_016548 51280 Hs.494337 NM_016548 ENSG00000135052 GOLM1 C9orf155|GOLPH2|GP73|HEL46|PSEC0257|bA379P1.3 golgi membrane protein 1 protein-coding 313.667-33 chr4 17700229 17700706 + 1 NA intron (NM_015688, intron 5 of 17) L1MEc|LINE|L1 81154 NM_015688 27146 Hs.744951 NM_015688 ENSG00000047662 FAM184B - family with sequence similarity 184 member B protein-coding 114.667-140 chr2 154301520 154301774 + 1 NA intron (NM_052917, intron 9 of 12) intron (NM_052917, intron 9 of 12) 155791 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 151.333-347 chr5 113444565 113444793 + 1 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) intron (NM_001085377, intron 1 of 18) -9690 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 159.333-79 chr13 44859263 44859560 + 1 NA Intergenic Intergenic -49781 NR_038433 144817 Hs.585616 NR_038433 ENSG00000235097 LINC00330 NCRNA00330 long intergenic non-protein coding RNA 330 ncRNA 146.333-301 chr7 18341064 18341250 + 1 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) L1MEc|LINE|L1 51065 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 314.333-2 chr1 184023043 184023488 + 1 NA intron (NM_001303421, intron 1 of 11) intron (NM_001303421, intron 1 of 11) 14463 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 140.333-106 chr2 111645823 111646023 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 125211 NR_039928 100616370 NR_039928 ENSG00000264793 MIR4771-1 - microRNA 4771-1 ncRNA 234.667-65 chr3 12501293 12501599 + 1 NA intron (NM_025265, intron 4 of 11) intron (NM_025265, intron 4 of 11) 16917 NM_001321279 80746 Hs.335550 NM_025265 ENSG00000154743 TSEN2 PCH2B|SEN2|SEN2L tRNA splicing endonuclease subunit 2 protein-coding 137.667-176 chr7 49062393 49062566 + 1 NA Intergenic Intergenic 137932 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 188.333-8 chr1 150785107 150785466 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -19508 NM_001199739 1520 Hs.181301 NM_004079 ENSG00000163131 CTSS - cathepsin S protein-coding 214.667-108 chr7 87735585 87735884 + 1 NA intron (NM_138290, intron 5 of 11) L2a|LINE|L2 -22411 NM_001348944 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 189.333-85 chr2 5131133 5131430 + 1 NA Intergenic Intergenic -475059 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 142.667-245 chr9 88896071 88896300 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -94678 NM_001001938 286223 Hs.585118 NM_001001938 ENSG00000213694 C9orf47 C9orf108|bA791O21.3 chromosome 9 open reading frame 47 protein-coding 154.333-257 chr5 14213369 14213566 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 70125 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 253.333-5 chr1 178128339 178128641 + 1 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) intron (NM_170692, intron 1 of 17) 34386 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 201.667-19 chr11 101123262 101123680 + 1 NA intron (NM_000926, intron 2 of 7) intron (NM_000926, intron 2 of 7) 5592 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 153.667-343 chr6 120167355 120167569 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 152283 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 158.667-193 chr22 22769526 22769805 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -53111 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 162.667-44 chr11 14734809 14735056 + 1 NA intron (NM_000922, intron 1 of 15) L1MC5a|LINE|L1 91128 NM_000922 5140 Hs.445711 NM_000922 ENSG00000152270 PDE3B HcGIP1|cGIPDE1 phosphodiesterase 3B protein-coding 154.333-90 chr14 57780703 57780994 + 1 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) L1PREC2|LINE|L1 84151 NM_001352013 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 150.667-263 chr4 62497180 62497412 + 1 NA Intergenic Intergenic -335531 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 182.333-79 chr2 42056768 42057090 + 1 NA intron (NM_138370, intron 5 of 6) intron (NM_138370, intron 5 of 6) 8908 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 163.667-77 chr16 62548039 62548219 + 1 NA Intergenic Intergenic -511691 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 119.333-99 chr15 81883033 81883236 + 1 NA Intergenic Intergenic 162884 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 204.667-42 chr14 65015462 65015890 + 1 NA exon (NM_001202559, exon 6 of 14) exon (NM_001202559, exon 6 of 14) 28781 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 152.667-116 chr14 69795796 69796018 + 1 NA intron (NM_003049, intron 1 of 4) intron (NM_003049, intron 1 of 4) 1334 NM_003049 6554 Hs.952 NM_003049 ENSG00000100652 SLC10A1 NTCP solute carrier family 10 member 1 protein-coding 192.667-170 chr8 59404245 59404604 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 285214 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 146.333-124 chr17 66816928 66817074 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -18116 NM_145811 27091 Hs.278907 NM_014404 ENSG00000075429 CACNG5 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5 protein-coding 244.333-13 chr10 82149143 82149588 + 1 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 83555 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 212.333-149 chr8 112781061 112781402 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) L1MA3|LINE|L1 137738 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 161.333-92 chr14 60437319 60437566 + 1 NA intron (NM_174978, intron 17 of 17) L2a|LINE|L2 48621 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 134.333-25 chr10 113843946 113844100 + 1 NA intron (NM_001271816, intron 6 of 9) intron (NM_001271816, intron 6 of 9) 10059 NM_014881 9937 Hs.1560 NM_014881 ENSG00000198924 DCLRE1A PSO2|SNM1|SNM1A DNA cross-link repair 1A protein-coding 129.667-9 chr1 113955735 113955895 + 1 NA intron (NM_198268, intron 5 of 15) intron (NM_198268, intron 5 of 15) 1938 NM_181358 204851 Hs.532363 NM_152696 ENSG00000163349 HIPK1 Myak|Nbak2 homeodomain interacting protein kinase 1 protein-coding 171.333-171 chr6 91742989 91743275 + 1 NA Intergenic Intergenic -52704 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 265.667-48 chr3 67482571 67482874 + 1 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) intron (NM_001177599, intron 9 of 10) 171892 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 200.667-166 chr9 35027562 35028008 + 1 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 -13310 NM_001040412 138724 Hs.148250 NM_203299 ENSG00000174038 C9orf131 - chromosome 9 open reading frame 131 protein-coding 177.667-27 chr10 122649928 122650116 + 1 NA Intergenic Intergenic -22860 NM_001364461 112577516 NM_001364461 LOC112577516 - carbohydrate-binding protein AQN-1-like protein-coding 147.333-61 chr11 17915603 17915751 + 1 NA intron (NR_104041, intron 8 of 9) intron (NR_104041, intron 8 of 9) 97370 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 126.667-65 chr17 67466868 67467019 + 1 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) intron (NM_181671, intron 1 of 9) -4546 NR_037517 100500895 NR_037517 ENSG00000207688 MIR548AA2 - microRNA 548aa-2 ncRNA 276.667-43 chr2 224316928 224317465 + 1 NA Intergenic Intergenic 84798 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 141.667-33 chr10 82153126 82153345 + 1 NA intron (NR_163251, intron 2 of 9) L1MA7|LINE|L1 79685 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 190.667-142 chr7 114064235 114064569 + 1 NA Intergenic Intergenic -21925 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 153.667-161 chr18 5360682 5360878 + 1 NA Intergenic MER104|DNA|TcMar-Tc2 -63727 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 145.667-234 chr5 127564606 127564765 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 47045 NM_001286808 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 182.333-66 chr18 22024865 22025058 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 144007 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 186.667-12 chr10 60285226 60285514 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 104505 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 409.667-5 chr22 21035601 21036482 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -1769 NR_030379 693234 NR_030379 ENSG00000207575 MIR649 MIRN649|hsa-mir-649 microRNA 649 ncRNA 230.667-9 chr10 82026365 82026831 + 1 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 148911 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 216.667-96 chr6 125679696 125680023 + 1 NA intron (NR_038906, intron 1 of 3) intron (NR_038906, intron 1 of 3) 5506 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 252.333-21 chr14 80109175 80109526 + 1 NA Intergenic Intergenic -102069 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 191.333-185 chr7 5575135 5575411 + 1 NA Intergenic Intergenic -17543 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 191.667-18 chr10 96697222 96697540 + 1 NA intron (NM_152309, intron 2 of 16) intron (NM_152309, intron 2 of 16) 23133 NM_152309 118788 Hs.310456 NM_152309 ENSG00000155629 PIK3AP1 BCAP phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 protein-coding 196.333-138 chr5 25367375 25367585 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 176527 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 160.333-44 chr10 67354425 67354749 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 48823 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 148.333-400 chr8 127757901 127758158 + 1 NA Intergenic Intergenic 21798 NM_002467 4609 Hs.202453 NM_002467 ENSG00000136997 MYC MRTL|MYCC|bHLHe39|c-Myc MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 272.333-60 chr6 128521563 128522110 + 1 NA Intergenic Intergenic -1237 NM_002844 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 121.333-36 chr11 115207990 115208142 + 1 NA intron (NM_001301045, intron 7 of 10) intron (NM_001301045, intron 7 of 10) -125511 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 223.333-36 chr13 67538021 67538362 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 165804 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 148.667-73 chr11 55347240 55347470 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 4154 NM_001005274 81327 Hs.554530 NM_001005274 ENSG00000181961 OR4A16 OR11-117|OR4A16Q olfactory receptor family 4 subfamily A member 16 protein-coding 215.667-23 chr11 78264410 78264765 + 1 NA intron (NM_012296, intron 2 of 9) AluSq|SINE|Alu 75668 NM_020798 57558 Hs.531249 NM_020798 ENSG00000118369 USP35 - ubiquitin specific peptidase 35 protein-coding 215.667-78 chr22 34029072 34029512 + 1 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -106404 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 142.667-39 chr12 66681676 66681879 + 1 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) intron (NM_001366724, intron 1 of 23) -2701 NM_021150 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 156.333-44 chr10 74297797 74297955 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 121113 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 157.333-105 chr14 39798259 39798459 + 1 NA Intergenic Intergenic -365859 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 145.667-98 chr15 81509614 81509830 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -135509 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 285.667-36 chr3 129821742 129822063 + 1 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu -27290 NM_001349273 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 340.333-8 chr19 27886596 27887142 + 1 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) intron (NR_146734, intron 1 of 7) -92929 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 142.667-81 chr17 56534819 56535044 + 1 NA Intergenic Intergenic -58768 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 327.667-8 chr14 53569497 53569947 + 1 NA Intergenic Intergenic 378762 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 156.667-32 chr1 207367610 207367866 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 46060 NM_001114752 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 154.667-199 chr2 187426950 187427204 + 1 NA intron (NM_005795, intron 1 of 14) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 21175 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 208.333-42 chr15 44416721 44417070 + 1 NA Intergenic Intergenic -10734 NM_016396 51496 Hs.497967 NM_016396 ENSG00000137770 CTDSPL2 HSPC058|HSPC129 CTD small phosphatase like 2 protein-coding 272.667-66 chr8 142023839 142024220 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -152310 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 205.333-134 chr2 209359820 209360141 + 1 NA Intergenic Intergenic -64067 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 125.667-79 chr18 2602819 2603030 + 1 NA intron (NM_006101, intron 13 of 16) L2b|LINE|L2 31367 NM_006101 10403 Hs.414407 NM_006101 ENSG00000080986 NDC80 HEC|HEC1|HsHec1|KNTC2|TID3|hsNDC80 NDC80 kinetochore complex component protein-coding 171.333-95 chr2 173394433 173394659 + 1 NA Intergenic Intergenic 39674 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 152.333-175 chr2 50384841 50385114 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -37221 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 146.667-115 chr15 68491029 68491279 + 1 NA Intergenic Intergenic -27219 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 113.333-52 chr11 86597076 86597293 + 1 NA intron (NM_001014811, intron 1 of 13) intron (NM_001014811, intron 1 of 13) 75014 NM_001014811 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 170.667-28 chr11 85277132 85277333 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) intron (NM_001142699, intron 4 of 27) 350038 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 168.333-60 chr14 72223581 72223817 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 290172 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 127.667-81 chr2 51145808 51146013 + 1 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 113309 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 130.667-20 chr10 17197386 17197534 + 1 NA intron (NM_004412, intron 1 of 10) intron (NM_004412, intron 1 of 10) 4212 NM_001321006 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 181.667-135 chr7 24694083 24694422 + 1 NA TTS (NM_001303037) TTS (NM_001303037) 63212 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 168.333-13 chr1 221218385 221218613 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 117797 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 155.667-182 chr2 180886254 180886514 + 1 NA intron (NR_104324, intron 4 of 4) L1MA4A|LINE|L1 -94001 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 156.333-77 chr12 46009749 46010058 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19329 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 138.667-156 chr4 142522741 142522962 + 1 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) MIRb|SINE|MIR 323684 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 112.333-269 chr8 137209460 137209621 + 1 NA Intergenic Intergenic 204048 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 125.667-108 chr2 199942708 199942850 + 1 NA intron (NM_001039693, intron 3 of 7) intron (NM_001039693, intron 3 of 7) -12538 NR_161377 79568 Hs.154494 NM_024520 ENSG00000162972 MAIP1 C2orf47 matrix AAA peptidase interacting protein 1 protein-coding 158.333-71 chr12 128875971 128876225 + 1 NA intron (NM_144669, intron 2 of 7) intron (NM_144669, intron 2 of 7) 22620 NM_001366886 144423 Hs.655668 NM_144669 ENSG00000151948 GLT1D1 - glycosyltransferase 1 domain containing 1 protein-coding 275.667-59 chr7 116334011 116334565 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -47561 NR_130922 102724434 Hs.667624 NR_130921 ENSG00000237870 LOC102724434 - uncharacterized LOC102724434 ncRNA 122.667-66 chr16 77629239 77629445 + 1 NA Intergenic Intergenic -93150 NM_001243657 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 149.333-125 chr15 85997673 85997905 + 1 NA Intergenic Intergenic -81831 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 143.333-154 chr20 35908046 35908195 + 1 NA intron (NM_016436, intron 10 of 17) intron (NM_016436, intron 10 of 17) 46506 NM_033630 51282 Hs.584909 NM_016558 ENSG00000171222 SCAND1 RAZ1|SDP1 SCAN domain containing 1 protein-coding 237.333-4 chr1 111371104 111371469 + 1 NA Intergenic Intergenic 18565 NR_029429 441897 Hs.568387 NR_029429 ENSG00000227179 PGCP1 - progastricsin pseudogene 1 pseudo 178.667-110 chr3 189541473 189541846 + 1 NA Intergenic Intergenic -55087 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 122.667-112 chr22 34666400 34666566 + 1 NA Intergenic Intergenic 331433 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 194.667-104 chr4 43493228 43493519 + 1 NA promoter-TSS (NR_146993) promoter-TSS (NR_146993) -830 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 158.333-158 chr2 129308718 129308958 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -34947 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 160.333-232 chr5 53986951 53987208 + 1 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -35480 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 161.333-176 chr21 37264935 37265225 + 1 NA intron (NM_001331022, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 2254 NM_006052 10311 Hs.369488 NM_006052 ENSG00000157538 VPS26C DCRA|DSCR3|DSCRA VPS26 endosomal protein sorting factor C protein-coding 118.333-161 chr5 31560075 31560257 + 1 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 27865 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 166.667 chr1 16259787 16260089 + 1 NA intron (NM_018994, intron 4 of 9) MER3|DNA|hAT-Charlie -22755 NM_030907 79363 Hs.546430 NM_030907 ENSG00000132881 CPLANE2 C1orf89|RSG1 ciliogenesis and planar polarity effector 2 protein-coding 181.667-25 chr11 106464540 106464873 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 213299 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 254.333-88 chr8 122229312 122229737 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 339120 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 148.667-399 chr9 123275904 123276093 + 1 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -7412 NM_018387 55342 Hs.287659 NM_018387 ENSG00000165209 STRBP HEL162|ILF3L|SPNR|p74 spermatid perinuclear RNA binding protein protein-coding 223.667-13 chr10 98135658 98135933 + 1 NA intron (NM_001351012, intron 1 of 8) intron (NM_001351012, intron 1 of 8) 1138 NM_014472 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 148.667-385 chr8 118148171 118148376 + 1 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) AluJb|SINE|Alu -36454 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 161.333-151 chr2 114443187 114443431 + 1 NA intron (NM_001321910, intron 1 of 26) intron (NM_001321910, intron 1 of 26) 668 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 163.667-94 chr18 46804882 46805112 + 1 NA non-coding (NR_148702, exon 13 of 13) non-coding (NR_148702, exon 13 of 13) -47944 NM_001307987 29906 Hs.465025 NM_013305 ENSG00000101638 ST8SIA5 SIAT8-E|SIAT8E|ST8SiaV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 protein-coding 129.333-176 chr7 67665230 67665413 + 1 NA Intergenic Intergenic 329345 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 116.333-30 chr10 53180959 53181143 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -409351 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 182.667-121 chr4 93647798 93648078 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) MIR|SINE|MIR -180815 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 164.667-222 chr7 44694876 44695213 + 1 NA intron (NM_002541, intron 12 of 22) intron (NM_002541, intron 12 of 22) -53522 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 186.667-90 chr3 57368273 57368570 + 1 NA intron (NM_001366028, intron 55 of 73) MIRc|SINE|MIR -75736 NM_001142733 142686 Hs.665154 NM_130387 ENSG00000239388 ASB14 - ankyrin repeat and SOCS box containing 14 protein-coding 169.333-273 chr8 124509823 124510093 + 1 NA intron (NM_001317891, intron 3 of 8) AluSz|SINE|Alu -1382 NR_106903 102466200 NR_106903 ENSG00000284087 MIR6844 hsa-mir-6844 microRNA 6844 ncRNA 127.667-98 chr2 186575455 186575622 + 1 NA Intergenic Intergenic -14518 NM_002210 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 195.667-59 chr17 49578942 49579250 + 1 NA exon (NM_007225, exon 2 of 2) exon (NM_007225, exon 2 of 2) 3225 NM_007225 11248 Hs.55069 NM_007225 ENSG00000182575 NXPH3 NPH3 neurexophilin 3 protein-coding 134.667-24 chr10 72174154 72174392 + 1 NA intron (NM_001369110, intron 5 of 8) intron (NM_001369110, intron 5 of 8) 41683 NM_001369088 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 161.333-55 chr11 129856260 129856549 + 1 NA intron (NM_138788, intron 4 of 5) AluSx1|SINE|Alu 36605 NM_006165 4798 Hs.530539 NM_006165 ENSG00000170322 NFRKB INO80G nuclear factor related to kappaB binding protein protein-coding 186.667-99 chr4 30842433 30842687 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 122191 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 212.667-123 chr6 151794386 151794743 + 1 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) MER131|DNA?|DNA? -11109 NM_001291241 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 405.333-6 chr21 33391750 33392641 + 1 NA Intergenic Intergenic -10701 NM_005534 3460 Hs.634632 NM_005534 ENSG00000159128 IFNGR2 AF-1|IFGR2|IFNGT1|IMD28 interferon gamma receptor 2 protein-coding 199.667-131 chr7 83499993 83500251 + 1 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 141309 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 345.333-14 chr18 3400336 3400852 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -11333 NM_174886 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 125.333-93 chr2 74617896 74618057 + 1 NA intron (NM_001321739, intron 2 of 10) intron (NM_001321739, intron 2 of 10) 30061 NM_138804 130951 Hs.348645 NM_138804 ENSG00000159374 M1AP C2orf65|D6Mm5e|SPATA37 meiosis 1 associated protein protein-coding 152.333-311 chr5 111602778 111603021 + 1 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) intron (NR_040093, intron 1 of 6) -90302 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 114.667-188 chr4 30537561 30537705 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -182736 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 132.667-72 chr18 21748927 21749118 + 1 NA intron (NM_020774, intron 1 of 20) AluJr4|SINE|Alu 7693 NM_020774 57534 Hs.140903 NM_020774 ENSG00000101752 MIB1 DIP-1|DIP1|LVNC7|MIB|ZZANK2|ZZZ6 mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 130.667-36 chr10 94006148 94006296 + 1 NA intron (NM_001288989, intron 1 of 32) MIR|SINE|MIR 12291 NM_016341 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 207.667-30 chr14 54174522 54174759 + 1 NA Intergenic Intergenic -217749 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 149.333-264 chr3 144549631 144549780 + 1 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 576624 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 175.333-168 chr7 19579480 19579701 + 1 NA Intergenic Intergenic 125846 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 144.333-3 chr1 33036940 33037197 + 1 NA promoter-TSS (NM_001319143) promoter-TSS (NM_001319143) -157 NM_001319140 204 Hs.470907 NM_001625 ENSG00000004455 AK2 ADK2 adenylate kinase 2 protein-coding 154.667-53 chr10 111509485 111509730 + 1 NA Intergenic Intergenic 395316 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 129.667-164 chr7 105089659 105089805 + 1 NA intron (NM_182931, intron 13 of 26) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 75527 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 182.667-169 chr9 101898443 101898704 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -159993 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 178.667-38 chr12 97445002 97445215 + 1 NA Intergenic Intergenic -17668 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 146.333-265 chr5 103406183 103406344 + 1 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL 135722 NR_104670 102467212 Hs.641885 NR_104670 ENSG00000248757 LINC02115 - long intergenic non-protein coding RNA 2115 ncRNA 187.667-29 chr12 118820442 118820730 + 1 NA intron (NR_134997, intron 2 of 2) intron (NR_134997, intron 2 of 2) 12950 NR_134997 105370016 Hs.550627 NR_134997 ENSG00000255814 LINC02439 - long intergenic non-protein coding RNA 2439 ncRNA 182.667-64 chr18 5053469 5053814 + 1 NA Intergenic Intergenic -27541 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 154.667-62 chr11 40795518 40795744 + 1 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -502501 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 148.667-77 chr11 82331516 82331742 + 1 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1MDa|LINE|L1 72284 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 177.333-19 chr10 83279130 83279340 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 397854 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 292.333-34 chr5 40049885 40050512 + 1 NA Intergenic Intergenic -2093 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 193.333-58 chr14 78304379 78304746 + 1 NA intron (NR_073547, intron 4 of 20) intron (NR_073547, intron 4 of 20) -99157 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 198.333-195 chr8 100583848 100584126 + 1 NA intron (NM_152628, intron 12 of 13) intron (NM_152628, intron 12 of 13) -24228 NM_001270378 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 139.667-93 chr2 161825645 161825882 + 1 NA intron (NM_001354443, intron 4 of 25) intron (NM_001354443, intron 4 of 25) 201347 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 173.333-207 chr8 118838099 118838302 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 113685 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 154.667-39 chr10 51185300 51185504 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 110915 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 150.333-406 chr8 81010776 81011049 + 1 NA intron (NM_018440, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 101156 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 148.333-29 chr1 198307586 198307792 + 1 NA intron (NM_133494, intron 9 of 9) intron (NM_133494, intron 9 of 9) 150691 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 149.333-336 chr6 68681981 68682167 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 46792 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 154.667-85 chr12 96366488 96366787 + 1 NA intron (NM_002595, intron 1 of 16) intron (NM_002595, intron 1 of 16) 33802 NM_001170464 5128 Hs.506415 NM_002595 ENSG00000059758 CDK17 PCTAIRE2|PCTK2 cyclin dependent kinase 17 protein-coding 148.333-100 chr12 73363166 73363343 + 1 NA Intergenic Intergenic 204064 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 144.333-110 chr19 7070337 7070588 + 1 NA intron (NM_024341, intron 1 of 7) intron (NM_024341, intron 1 of 7) 759 NM_001044388 79230 Hs.591380 NM_024341 ENSG00000130544 ZNF557 - zinc finger protein 557 protein-coding 169.333-257 chr7 111554924 111555204 + 1 NA intron (NM_001350959, intron 2 of 7) intron (NM_001350959, intron 2 of 7) 7227 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 202.333-154 chr6 88768483 88768740 + 1 NA intron (NM_001286428, intron 11 of 13) intron (NM_001286428, intron 11 of 13) 195007 NM_001286428 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 179.333-51 chr12 40359649 40360052 + 1 NA intron (NM_198578, intron 47 of 50) intron (NM_198578, intron 47 of 50) -33544 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 199.667-105 chr4 177614012 177614314 + 1 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -114594 NR_028342 285501 Hs.722466 NM_001085490 ENSG00000231171 LINC01098 - long intergenic non-protein coding RNA 1098 ncRNA 156.667-73 chr12 6128775 6128934 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4179 NM_000552 7450 Hs.440848 NM_000552 ENSG00000110799 VWF F8VWF|VWD von Willebrand factor protein-coding 214.333-157 chr8 125185868 125186162 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 94155 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 169.333-292 chrX 8897074 8897334 + 1 NA Intergenic Intergenic -95821 NM_174951 171482 Hs.382062 NM_174951 ENSG00000183304 FAM9A TEX39A family with sequence similarity 9 member A protein-coding 138.333-62 chr14 60789131 60789360 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 54484 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 184.667-84 chr4 983078 983449 + 1 NA intron (NM_134425, intron 2 of 2) MER39B|LTR|ERV1 -3734 NR_110313 3425 Hs.89560 NM_000203 ENSG00000127415 IDUA IDA|MPS1 iduronidase alpha-L- protein-coding 187.333-147 chr4 109173451 109173716 + 1 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 129075 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 157.333-275 chr5 19789248 19789505 + 1 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) MIR|SINE|MIR 96896 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 157.667-330 chr8 82970911 82971146 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 58924 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 229.667-18 chr12 6440790 6441072 + 1 NA intron (NR_015382, intron 5 of 5) AluJo|SINE|Alu -3954 NM_001242 939 Hs.355307 NM_001242 ENSG00000139193 CD27 S152|S152. LPFS2|T14|TNFRSF7|Tp55 CD27 molecule protein-coding 147.333-46 chr10 63533378 63533570 + 1 NA intron (NM_001001330, intron 1 of 7) intron (NM_001001330, intron 1 of 7) -11584 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 184.333-152 chr8 110209368 110209579 + 1 NA Intergenic Intergenic -233702 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 191.667-118 chr7 139145617 139145969 + 1 NA intron (NM_001287512, intron 5 of 14) L1MEg|LINE|L1 12015 NM_001321740 79989 Hs.133020 NM_024926 ENSG00000105948 TTC26 DYF13|IFT56|dyf-13 tetratricopeptide repeat domain 26 protein-coding 176.667-77 chr2 106930312 106930661 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -43377 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 199.667-35 chr12 113176967 113177286 + 1 NA intron (NM_001111322, intron 5 of 19) intron (NM_001111322, intron 5 of 19) 8352 NM_001111322 79039 Hs.506861 NM_024072 ENSG00000123064 DDX54 DP97 DEAD-box helicase 54 protein-coding 350.333-13 chr2 109306648 109307055 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) 6774 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 161.667-160 chr22 34710344 34710645 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 287422 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 168.333-54 chr13 108083557 108083759 + 1 NA Intergenic Intergenic 131124 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 209.667-86 chr3 159475156 159475442 + 1 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 192653 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 242.667-70 chr3 193285344 193285625 + 1 NA intron (NM_198505, intron 26 of 29) L2b|LINE|L2 -21760 NR_046758 100874218 Hs.407490 NR_046758 ATP13A5-AS1 - ATP13A5 antisense RNA 1 ncRNA 148.667-380 chr8 106352123 106352380 + 1 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 82073 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 161.667-61 chr12 125580890 125581057 + 1 NA intron (NM_052907, intron 4 of 8) intron (NM_052907, intron 4 of 8) -41479 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 167.667-204 chr8 105976141 105976336 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 84265 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 122.667-12 chr1 234943175 234943354 + 1 NA Intergenic MER51E|LTR|ERV1 20735 NR_125945 101927851 Hs.520684 NR_125945 ENSG00000238005 LOC101927851 - uncharacterized LOC101927851 ncRNA 236.333-57 chr22 28497972 28498345 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 38289 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 122.333-220 chr9 117886001 117886206 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 181700 NM_003266 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 168.667-17 chr10 22029485 22029809 + 1 NA Intergenic Intergenic -25917 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 156.333-92 chr12 122954945 122955137 + 1 NA intron (NM_001243014, intron 2 of 11) FLAM_A|SINE|Alu 11422 NM_001243013 23457 Hs.511951 NM_019624 ENSG00000150967 ABCB9 EST122234|TAPL ATP binding cassette subfamily B member 9 protein-coding 150.667-260 chr4 47907733 47907948 + 1 NA intron (NR_103795, intron 3 of 23) intron (NR_103795, intron 3 of 23) -6387 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 235.667-6 chr10 103037222 103037733 + 1 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) intron (NM_199076, intron 1 of 6) 116344 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 157.667-219 chr4 73393790 73393979 + 1 NA Intergenic Intergenic -10403 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 396.667-3 chr13 88205104 88205793 + 1 NA intron (NR_131919, intron 1 of 4) intron (NR_131919, intron 1 of 4) 62581 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 223.333-125 chr5 25343553 25343952 + 1 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 152799 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 155.667-109 chr15 44048013 44048277 + 1 NA intron (NM_032892, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 146301 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 175.667-71 chr2 104441223 104441476 + 1 NA intron (NR_015399, intron 1 of 3) intron (NR_015399, intron 1 of 3) 7002 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 147.667-369 chr8 117782806 117783077 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 137972 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 144.333-232 chr6 71197571 71197767 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -91142 NM_024576 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 130.667-129 chr20 9389247 9389412 + 1 NA intron (NM_000933, intron 12 of 35) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 81529 NM_000933 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 144.667-65 chr12 122328723 122328981 + 1 NA intron (NM_198240, intron 13 of 23) AluY|SINE|Alu -62358 NM_001351019 65082 Hs.487883 NM_022916 ENSG00000139719 VPS33A MPSPS VPS33A core subunit of CORVET and HOPS complexes protein-coding 217.667-57 chr3 111044598 111044883 + 1 NA TTS (NR_045114) TTS (NR_045114) 25219 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-305 chr5 122588493 122588716 + 1 NA Intergenic Intergenic -4004 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 152.333-181 chr2 61950327 61950541 + 1 NA intron (NM_152516, intron 1 of 2) intron (NM_152516, intron 1 of 2) 44792 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 183.667-22 chr10 32421388 32421682 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 24521 NR_120660 101929431 Hs.639819 NR_120660 LOC101929431 - uncharacterized LOC101929431 ncRNA 222.667-82 chr6 68694421 68694802 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 59329 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 159.333-44 chr10 66597006 66597263 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) L1M3c|LINE|L1 -328902 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 149.333-143 chr17 56255475 56255702 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 3 of 20) intron (NM_001370326, intron 3 of 20) 102113 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 204.333-163 chr5 78316294 78316598 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -21691 NM_003664 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 143.667-44 chr11 103886101 103886294 + 1 NA Intergenic Intergenic 36291 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 262.333-15 chr10 112051480 112051940 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 132055 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 257.333-69 chr3 179706143 179706575 + 1 NA intron (NM_003940, intron 4 of 20) intron (NM_003940, intron 4 of 20) 53319 NM_003940 8975 Hs.175322 NM_003940 ENSG00000058056 USP13 ISOT3|IsoT-3 ubiquitin specific peptidase 13 protein-coding 152.333-199 chr2 197508328 197508568 + 1 NA intron (NM_001202485, intron 2 of 8) intron (NM_001202485, intron 2 of 8) -7106 NM_199482 25843 Hs.633165 NM_015387 ENSG00000115540 MOB4 2C4D|CGI-95|MOB1|MOB3|MOBKL3|PHOCN|PREI3 MOB family member 4, phocein protein-coding 153.667-34 chr10 12287176 12287351 + 1 NA Intergenic Intergenic -62284 NM_020397 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 137.667-6 chr1 78181021 78181210 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -48484 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 120.333-42 chr12 22128603 22128805 + 1 NA Intergenic Intergenic 82486 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 160.333-140 chr2 36589800 36590057 + 1 NA intron (NM_005102, intron 2 of 7) intron (NM_005102, intron 2 of 7) 8240 NM_005102 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 225.333-3 chr1 51509663 51509947 + 1 NA intron (NM_001981, intron 1 of 24) intron (NM_001981, intron 1 of 24) 9461 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 131.333-125 chr4 44203951 44204123 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 186975 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 342.667-4 chr16 30827976 30828421 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -40993 NM_001080417 23361 Hs.301094 NM_001080417 ENSG00000102870 ZNF629 ZNF|ZNF65 zinc finger protein 629 protein-coding 126.667-54 chr15 55673039 55673255 + 1 NA intron (NM_173814, intron 10 of 19) intron (NM_173814, intron 10 of 19) 70005 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 154.333-297 chr6 75201006 75201208 + 1 NA intron (NM_004370, intron 2 of 65) intron (NM_004370, intron 2 of 65) 4946 NM_004370 1303 Hs.101302 NM_004370 ENSG00000111799 COL12A1 BA209D8.1|BTHLM2|COL12A1L|DJ234P15.1|EDSMYP|UCMD2 collagen type XII alpha 1 chain protein-coding 188.667-143 chr7 112095098 112095359 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 111171 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 148.333-196 chr2 120257583 120257758 + 1 NA intron (NM_002881, intron 1 of 4) intron (NM_002881, intron 1 of 4) 4818 NM_002881 5899 Hs.469820 NM_002881 ENSG00000144118 RALB - RAS like proto-oncogene B protein-coding 264.333-44 chr3 2961510 2961989 + 1 NA intron (NM_175607, intron 13 of 24) intron (NM_175607, intron 13 of 24) 69534 NM_175613 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 164.333-147 chr22 28563599 28563769 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MB5|LINE|L1 103815 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 209.333-229 chr8 68090710 68091165 + 1 NA intron (NM_024870, intron 20 of 39) intron (NM_024870, intron 20 of 39) 138891 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 153.667-125 chr14 78276244 78276412 + 1 NA intron (NR_073547, intron 2 of 20) intron (NR_073547, intron 2 of 20) 105955 NR_158975 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 209.667-8 chr1 80774659 80774990 + 1 NA Intergenic Intergenic 133537 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 195.667-86 chr22 45385847 45386174 + 1 NA intron (NM_148674, intron 11 of 24) MIR|SINE|MIR 27589 NM_148674 27127 Hs.334176 NM_148674 ENSG00000077935 SMC1B SMC1BETA|SMC1L2 structural maintenance of chromosomes 1B protein-coding 243.333-30 chr14 59454598 59455037 + 1 NA Intergenic Intergenic 10563 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 154.333-270 chr5 89094789 89094951 + 1 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -190765 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 267.333-57 chr20 21137534 21137892 + 1 NA intron (NM_018474, intron 3 of 12) L1MC5a|LINE|L1 11631 NM_001352436 55857 Hs.187635 NM_018474 ENSG00000088970 KIZ C20orf19|HT013|Kizuna|NCRNA00153|PLK1S1|RP69 kizuna centrosomal protein protein-coding 174.333-59 chr2 42698255 42698545 + 1 NA intron (NM_001330443, intron 11 of 16) intron (NM_001330443, intron 11 of 16) 65861 NM_148962 165140 Hs.168439 NM_148962 ENSG00000162881 OXER1 GPCR|GPR170|TG1019 oxoeicosanoid receptor 1 protein-coding 132.333-18 chr10 50645173 50645344 + 1 NA Intergenic Intergenic 20307 NR_126411 104355295 Hs.450493 NR_126411 SGMS1-AS1 - SGMS1 antisense RNA 1 ncRNA 259.667-83 chr8 47638406 47638785 + 1 NA intron (NM_001080394, intron 10 of 19) intron (NM_001080394, intron 10 of 19) -15493 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 117.667-167 chr6 71685695 71685860 + 1 NA Intergenic Intergenic -200926 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 170.333-66 chr13 57989607 57989927 + 1 NA Intergenic Intergenic -176060 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 147.333-55 chr10 132220460 132220684 + 1 NA intron (NR_134911, intron 10 of 12) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 28536 NR_134911 282974 Hs.469002 NM_173575 ENSG00000165752 STK32C PKE|YANK3 serine/threonine kinase 32C protein-coding 191.333-90 chr17 72571704 72572084 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 20910 NR_152515 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 144.667-165 chr20 9815323 9815543 + 1 NA intron (NM_177990, intron 1 of 9) intron (NM_177990, intron 1 of 9) 23643 NM_177990 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 177.667-137 chr8 130149897 130150096 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 14 of 29) intron (NM_001362925, intron 14 of 29) -65228 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 155.333-349 chr6 162728944 162729239 + 1 NA intron (NM_001080379, intron 1 of 4) intron (NM_001080379, intron 1 of 4) 1121 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 185.333-57 chr16 2403138 2403371 + 1 NA intron (NR_003574, intron 9 of 16) intron (NR_003574, intron 9 of 16) -26193 NM_001323538 899 Hs.1973 NM_001761 ENSG00000162063 CCNF FBX1|FBXO1 cyclin F protein-coding 307.333-63 chr4 32337286 32338005 + 1 NA Intergenic X6B_LINE|LINE|CR1 -13393 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 346.667 chr1 108770994 108771363 + 1 NA intron (NM_007269, intron 6 of 18) intron (NM_007269, intron 6 of 18) 24504 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 177.333-120 chr4 37358773 37359196 + 1 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -94941 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 197.333-226 chr8 26727885 26728238 + 1 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL 137594 NM_033304 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 168.333-35 chr11 58137462 58137741 + 1 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) intron (NM_001005212, intron 2 of 2) -18157 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 126.333-64 chr16 85917310 85917479 + 1 NA promoter-TSS (NR_106832) promoter-TSS (NR_106832) -953 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 144.333-229 chr6 43459649 43459837 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3111 NM_001286655 65989 Hs.337251 NM_023932 ENSG00000171462 DLK2 DLK-2|EGFL9 delta like non-canonical Notch ligand 2 protein-coding 182.333-40 chr14 30116363 30116701 + 1 NA Intergenic Intergenic -188685 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 158.667-27 chr1 191323896 191324183 + 1 NA Intergenic Intergenic -95541 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 164.333-88 chr16 81554811 81555116 + 1 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) intron (NM_030629, intron 1 of 20) 21061 NR_107008 102465840 NR_107008 ENSG00000277255 MIR7854 hsa-mir-7854 microRNA 7854 ncRNA 158.333-170 chr2 219106087 219106351 + 1 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) intron (NM_024782, intron 5 of 7) -45298 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 138.333-210 chr9 94068502 94068686 + 1 NA intron (NM_177995, intron 2 of 9) L1MC4|LINE|L1 -15835 NM_152422 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 192.667-140 chr5 123781910 123782225 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 236650 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 288.333-38 chr8 47214377 47214759 + 1 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 25261 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 145.333-279 chr7 80928824 80929139 + 1 NA Intergenic Intergenic -6592 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 314.333-19 chr4 37524247 37524738 + 1 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -59741 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 186.333-56 chr15 66638722 66639004 + 1 NA intron (NR_110372, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 56673 NR_110372 102723165 Hs.636703 NR_110372 ENSG00000259471 LINC01169 - long intergenic non-protein coding RNA 1169 ncRNA 166.333-189 chr5 92733092 92733276 + 1 NA Intergenic Intergenic 838159 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 145.333-254 chr6 45076494 45076661 + 1 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 121193 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 187.333-138 chr4 56490425 56490737 + 1 NA exon (NM_006947, exon 15 of 19) exon (NM_006947, exon 15 of 19) -14628 NM_206919 132946 Hs.444449 NM_206919 ENSG00000196503 ARL9 - ADP ribosylation factor like GTPase 9 protein-coding 151.333-433 chr8 133502663 133502967 + 1 NA intron (NM_003033, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 69072 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 329.667-9 chr15 67705140 67705658 + 1 NA intron (NM_002757, intron 16 of 20) L2a|LINE|L2 -120110 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 154.333-93 chr14 60634281 60634491 + 1 NA Intergenic Intergenic -4830 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 146.333-297 chr6 161954658 161954876 + 1 NA intron (NM_004562, intron 6 of 11) intron (NM_004562, intron 6 of 11) 483790 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 165.667-90 chr2 79025040 79025216 + 1 NA promoter-TSS (NM_001270040) promoter-TSS (NM_001270040) -574 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 210.667-20 chr10 60708957 60709213 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) L1MCa|LINE|L1 24443 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 157.667-285 chr6 87620473 87620743 + 1 NA intron (NM_181837, intron 9 of 19) intron (NM_181837, intron 9 of 19) 30541 NM_001197259 23595 Hs.410228 NM_012381 ENSG00000135336 ORC3 LAT|LATHEO|ORC3L origin recognition complex subunit 3 protein-coding 273.333-68 chr7 40799393 40799900 + 1 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) intron (NM_024728, intron 14 of 14) 180293 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 146.667-58 chr11 71207369 71207525 + 1 NA intron (NM_012309, intron 1 of 24) AluSx1|SINE|Alu 17349 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 116.667-205 chr8 120384599 120384756 + 1 NA Intergenic Intergenic 60473 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 162.667-85 chr14 88428384 88428673 + 1 NA intron (NM_001040428, intron 6 of 10) MIRb|SINE|MIR 42871 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 203.333-258 chr8 65450908 65451330 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 111547 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 200.667-99 chr21 22460127 22460439 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 361666 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 162.667-129 chr2 72579242 72579432 + 1 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 246696 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 249.667-87 chr6 144608577 144608868 + 1 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) MER65D|LTR|ERV1 203067 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 233.667-5 chr1 179318650 179318937 + 1 NA intron (NM_001252511, intron 2 of 14) L1MB8|LINE|L1 24996 NM_003101 6646 Hs.445588 NM_003101 ENSG00000057252 SOAT1 ACACT|ACAT|ACAT-1|ACAT1|SOAT|STAT sterol O-acyltransferase 1 protein-coding 153.333-313 chr4 148219172 148219351 + 1 NA intron (NM_000901, intron 3 of 8) L1MB7|LINE|L1 223153 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 154.333-49 chr10 133286422 133286630 + 1 NA intron (NM_001256617, intron 12 of 18) L1M4|LINE|L1 -9658 NM_001164490 101 Hs.501574 NM_001109 ENSG00000151651 ADAM8 CD156|CD156a|MS2 ADAM metallopeptidase domain 8 protein-coding 271.667-77 chr9 22281002 22281476 + 1 NA Intergenic Intergenic -165585 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 124.333-75 chr19 9186585 9186743 + 1 NA exon (NM_175883, exon 1 of 1) exon (NM_175883, exon 1 of 1) 1070 NM_175883 162998 Hs.531755 NM_175883 ENSG00000188000 OR7D2 HTPCRH03|OR19-10|OR19-4 olfactory receptor family 7 subfamily D member 2 protein-coding 160.667-9 chr1 68374709 68374991 + 1 NA Intergenic Intergenic 75104 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 139.667-163 chr6 139982509 139982664 + 1 NA intron (NR_121624, intron 1 of 2) intron (NR_121624, intron 1 of 2) 6267 NR_121623 100507477 Hs.179213 NR_121622 ENSG00000236013 LOC100507477 - uncharacterized LOC100507477 ncRNA 149.667-118 chr14 55262352 55262591 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -8950 NM_017943 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 215.667-113 chr7 36045295 36045615 + 1 NA Intergenic Intergenic -49855 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 250.333-80 chr8 133379381 133379792 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -82282 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 141.333-99 chr2 26911583 26911856 + 1 NA intron (NM_020134, intron 2 of 12) intron (NM_020134, intron 2 of 12) -58918 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 151.667-303 chr6 6359588 6359784 + 1 NA intron (NR_026970, intron 6 of 7) intron (NR_026970, intron 6 of 7) -38995 NM_000129 2162 Hs.335513 NM_000129 ENSG00000124491 F13A1 F13A coagulation factor XIII A chain protein-coding 156.667-132 chr17 43088334 43088638 + 1 NA intron (NR_027676, intron 11 of 22) L1MB3|LINE|L1 35629 NM_007298 672 Hs.194143 NM_007294 ENSG00000012048 BRCA1 BRCAI|BRCC1|BROVCA1|FANCS|IRIS|PNCA4|PPP1R53|PSCP|RNF53 BRCA1 DNA repair associated protein-coding 115.667-181 chr5 98250205 98250362 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -89044 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 203.333-124 chr2 21479214 21479527 + 1 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 231282 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 283.333-27 chr2 4391441 4391829 + 1 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 264587 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 139.667-162 chr6 139476126 139476297 + 1 NA Intergenic Intergenic -1615 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 198.667-28 chr10 94953784 94954098 + 1 NA intron (NM_000771, intron 5 of 8) L1MB5|LINE|L1 15283 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 249.667-39 chr17 80780389 80780813 + 1 NA intron (NM_020761, intron 6 of 33) intron (NM_020761, intron 6 of 33) 25031 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 346.333-9 chr12 94168313 94168742 + 1 NA intron (NM_005761, intron 1 of 30) intron (NM_005761, intron 1 of 30) 19950 NM_005761 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 152.333-137 chr16 75358475 75358756 + 1 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 74888 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 206.667-52 chr17 69960066 69960357 + 1 NA Intergenic Intergenic -1496 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 143.333-225 chr5 62848429 62848726 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 269758 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 148.667-411 chrX 106633804 106633965 + 1 NA intron (NM_001184782, intron 6 of 12) intron (NM_001184782, intron 6 of 12) -5930 NR_039765 100616144 NR_039765 ENSG00000263515 MIR548AN - microRNA 548an ncRNA 153.667-245 chr3 21154670 21154854 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -250964 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 177.333-118 chr4 21326997 21327293 + 1 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) L1MA3|LINE|L1 -23239 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 160.667-209 chr3 177016710 177016897 + 1 NA Intergenic Intergenic 179675 NM_001321193 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 204.667-88 chr21 28539632 28539868 + 1 NA non-coding (NR_026552, exon 1 of 2) non-coding (NR_026552, exon 1 of 2) 432 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 230.333-90 chr5 20542183 20542539 + 1 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 33352 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 142.333-189 chr4 180742923 180743193 + 1 NA Intergenic Intergenic 416091 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 135.667-167 chr7 3385077 3385251 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) MIRc|SINE|MIR 83912 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 208.333-82 chr2 196837705 196838157 + 1 NA 3' UTR (NM_024989, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_024989, exon 27 of 27) -27655 NM_213608 401027 Hs.245666 NM_213608 ENSG00000187944 C2orf66 IIDS6411|UNQ6411 chromosome 2 open reading frame 66 protein-coding 142.333-73 chr13 82395652 82395852 + 1 NA Intergenic Intergenic -1168769 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 126.667-17 chr10 73779598 73779831 + 1 NA Intergenic Intergenic -2334 NM_203298 118487 Hs.181174 NM_203298 ENSG00000172586 CHCHD1 C10orf34|C2360|MRP-S37 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 protein-coding 187.667-51 chr14 89986110 89986320 + 1 NA intron (NM_001008744, intron 9 of 15) MIRb|SINE|MIR 30288 NM_001330205 55775 Hs.209945 NM_018319 ENSG00000042088 TDP1 - tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 protein-coding 166.333-214 chr7 87914218 87914407 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -19831 NM_021721 53616 Hs.256398 NM_004194 ENSG00000008277 ADAM22 ADAM 22|EIEE61|MDC2 ADAM metallopeptidase domain 22 protein-coding 202.667-37 chr12 18015494 18015840 + 1 NA Intergenic Intergenic 74526 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 155.667-304 chr6 60649760 60650066 + 1 NA Intergenic Intergenic -924217 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 273.667-19 chr12 56460696 56461176 + 1 NA Intergenic Intergenic -6279 NM_012064 4284 Hs.574026 NM_012064 ENSG00000135517 MIP AQP0|CTRCT15|LIM1|MIP26|MP26 major intrinsic protein of lens fiber protein-coding 155.333-170 chr2 108549722 108549985 + 1 NA intron (NM_001193483, intron 1 of 9) intron (NM_001193483, intron 1 of 9) 15498 NM_001193483 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 423.667-13 chr5 121156372 121157087 + 1 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -165821 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 151.333-51 chr10 45033873 45034077 + 1 NA Intergenic Intergenic 33052 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 304.667-16 chr2 55183294 55183695 + 1 NA intron (NR_148539, intron 1 of 3) intron (NR_148539, intron 1 of 3) -45663 NM_001321904 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 154.333-374 chr9 104506347 104506621 + 1 NA Intergenic Intergenic 2221 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 135.667-108 chr21 42175882 42176045 + 1 NA Intergenic Intergenic -23726 NM_207627 9619 Hs.124649 NM_004915 ENSG00000160179 ABCG1 ABC8|WHITE1 ATP binding cassette subfamily G member 1 protein-coding 172.333-148 chr5 145758694 145758909 + 1 NA 3' UTR (NM_182960, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_182960, exon 8 of 8) 76541 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 156.333-97 chr13 103596783 103596996 + 1 NA Intergenic Intergenic 171689 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 140.667-236 chr8 125524679 125524988 + 1 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 92624 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 208.333-67 chr2 18791287 18791569 + 1 NA Intergenic Intergenic -201848 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 138.667-222 chrX 50514409 50514633 + 1 NA Intergenic MER52C|LTR|ERV1 -43696 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 170.333-213 chr8 29484901 29485123 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -134328 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 150.333-104 chr14 45673507 45673695 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 42001 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 257.667-58 chr3 120092847 120093153 + 1 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) intron (NM_002093, intron 1 of 11) 1447 NM_001354596 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 166.333-223 chr8 72101385 72101638 + 1 NA Intergenic PABL_B-int|LTR|ERV1 -25927 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 138.333-73 chr16 51870288 51870497 + 1 NA Intergenic Intergenic 107873 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 134.333-85 chr2 78801570 78801770 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -224032 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 254.667-79 chr8 30244218 30244804 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 88142 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 148.333-88 chr12 27801776 27801940 + 1 NA 3' UTR (NM_020782, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_020782, exon 3 of 3) 21625 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 217.667-94 chr9 91186427 91186793 + 1 NA Intergenic Intergenic 67548 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 270.333-53 chr6 34454144 34454586 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -11711 NM_020804 29993 Hs.520087 NM_020804 ENSG00000124507 PACSIN1 SDPI protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 protein-coding 148.333-225 chr20 31671668 31671891 + 1 NA intron (NR_134257, intron 1 of 2) MER106A|DNA|hAT-Charlie 33867 NM_032609 84701 Hs.277101 NM_032609 ENSG00000131055 COX4I2 COX4|COX4-2|COX4B|COX4L2|COXIV-2|dJ857M17.2 cytochrome c oxidase subunit 4I2 protein-coding 202.667-99 chr3 106867011 106867345 + 1 NA Intergenic Intergenic 373460 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 151.333-147 chr15 60980496 60980781 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) L1MB7|LINE|L1 248664 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 172.333-35 chr11 85881527 85881788 + 1 NA intron (NM_001286159, intron 3 of 10) AluJr4|SINE|Alu 26556 NM_173556 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 195.667-19 chr11 36811013 36811269 + 1 NA Intergenic Intergenic -212862 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 152.667-35 chr10 42540674 42540916 + 1 NA intron (NR_026777, intron 5 of 7) L1M4c|LINE|L1 12075 NR_026777 100129482 Hs.278064 NR_026777 ENSG00000234420 ZNF37BP KOX21|ZNF37B zinc finger protein 37B, pseudogene pseudo 173.333-94 chr2 74150651 74150926 + 1 NA non-coding (NR_045634, exon 2 of 2) non-coding (NR_045634, exon 2 of 2) 2807 NR_045634 100507171 Hs.503348 NR_045634 ENSG00000225439 BOLA3-AS1 - BOLA3 divergent transcript ncRNA 216.667-2 chr1 28724355 28724810 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -12039 NM_001173128 51441 Hs.532286 NM_016258 ENSG00000198492 YTHDF2 CAHL|HGRG8|NY-REN-2 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2 protein-coding 148.667-91 chr12 15959278 15959529 + 1 NA intron (NM_015954, intron 3 of 8) intron (NM_015954, intron 3 of 8) 48071 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 133.667-28 chr11 97507023 97507201 + 1 NA Intergenic Intergenic 998687 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 117.333-51 chr14 47403055 47403270 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) L2|LINE|L2 -59916 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 175.667-9 chr1 161260656 161260893 + 1 NA intron (NM_001102566, intron 1 of 2) intron (NM_001102566, intron 1 of 2) 2029 NM_001102566 654790 Hs.433150 NM_001102566 ENSG00000248485 PCP4L1 IQM1 Purkinje cell protein 4 like 1 protein-coding 217.333-97 chr3 117287077 117287422 + 1 NA Intergenic Intergenic 365818 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 209.333-172 chr4 65473671 65473927 + 1 NA intron (NM_001281767, intron 5 of 16) L1PA16|LINE|L1 195689 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 156.333-330 chr7 22245006 22245182 + 1 NA intron (NM_012294, intron 7 of 25) L1MA6|LINE|L1 -50284 NM_001367602 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 177.333-94 chr20 1789839 1790069 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10208 NR_037142 100289473 Hs.641525 NR_037142 ENSG00000232528 LOC100289473 - cytoskeleton associated protein 2-like pseudogene pseudo 143.333-149 chr2 166264947 166265166 + 1 NA intron (NR_110260, intron 7 of 11) L1MA6|LINE|L1 110888 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 202.333-15 chr1 156414893 156415268 + 1 NA intron (NR_135264, intron 2 of 5) intron (NR_135264, intron 2 of 5) 5349 NR_029691 407046 NR_029691 ENSG00000207933 MIR9-1 MIRN9-1|hsa-mir-9-1|miRNA9-1|mir-9-1 microRNA 9-1 ncRNA 225.667-15 chr12 4905305 4905676 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4415 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 158.667-159 chr2 83045534 83045721 + 1 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 188824 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 365.333-23 chr5 148721014 148721516 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -66738 NR_104445 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 197.667-35 chr13 57648525 57648813 + 1 NA intron (NM_001040429, intron 1 of 3) intron (NM_001040429, intron 1 of 3) 16925 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 132.333-2 chr1 35777642 35777810 + 1 NA Intergenic Intergenic -7748 NM_022111 63967 Hs.175613 NM_022111 ENSG00000092853 CLSPN - claspin protein-coding 207.667-119 chr8 118793235 118793517 + 1 NA Intergenic Intergenic 158509 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 237.333-44 chr17 59723508 59723872 + 1 NA intron (NM_001329394, intron 1 of 11) L2|LINE|L2 16036 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 137.667-29 chr10 93262762 93262928 + 1 NA Intergenic Intergenic 188952 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 168.333-41 chr11 125436862 125437145 + 1 NA Intergenic Intergenic -58211 NM_001301851 403312 Hs.450611 NM_203452 LOC403312 - putative uncharacterized protein MGC39545 protein-coding 151.333-324 chr5 4610164 4610317 + 1 NA Intergenic Intergenic -163241 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 186.667-143 chr7 104882184 104882425 + 1 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) AluSx|SINE|Alu 44341 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 150.333-324 chr5 50565055 50565295 + 1 NA Intergenic Intergenic -100756 NM_001178055 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 144.667-273 chr6 147189962 147190136 + 1 NA intron (NR_034115, intron 1 of 10) intron (NR_034115, intron 1 of 10) -14309 NM_001127715 134957 Hs.86320 NM_139244 ENSG00000164506 STXBP5 LGL3|LLGL3|Nbla04300 syntaxin binding protein 5 protein-coding 184.667-132 chr8 71718487 71718740 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -124510 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 211.667-90 chr5 27293154 27293449 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -178991 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 290.667-33 chr5 2871476 2871953 + 1 NA Intergenic Intergenic -46140 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 272.667-64 chr8 119951151 119951660 + 1 NA intron (NM_022783, intron 3 of 8) intron (NM_022783, intron 3 of 8) 77683 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 288.667-5 chr11 103249056 103249413 + 1 NA intron (NM_001377, intron 65 of 88) intron (NM_001377, intron 65 of 88) 139808 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 141.667-213 chr7 105827351 105827540 + 1 NA intron (NM_152749, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 49140 NM_020725 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 160.333-218 chr4 85511630 85511836 + 1 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) AluSp|SINE|Alu 36583 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 202.333-185 chr9 27199199 27199545 + 1 NA intron (NM_001290077, intron 11 of 21) L1ME3Cz|LINE|L1 83421 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 227.667-48 chr3 85631563 85631929 + 1 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) -94736 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 130.667-116 chr2 144630327 144630535 + 1 NA Intergenic Intergenic -37536 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 155.333-112 chr14 77014239 77014440 + 1 NA Intergenic Intergenic 14369 NM_024496 64207 Hs.179260 NM_024496 ENSG00000119669 IRF2BPL C14orf4|EAP1|NEDAMSS interferon regulatory factor 2 binding protein like protein-coding 144.667-46 chr11 102173901 102174186 + 1 NA intron (NM_001282097, intron 3 of 7) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 61595 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 207.667-52 chr2 51998981 51999294 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -371511 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 155.667-125 chr16 82743359 82743527 + 1 NA intron (NM_001220488, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu -29876 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 279.333-14 chr10 96450252 96450598 + 1 NA intron (NM_012465, intron 2 of 20) MER5B|DNA|hAT-Charlie 63501 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 159.667-318 chr8 82318428 82318665 + 1 NA Intergenic Intergenic -476260 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 257.667-46 chr20 13852545 13852943 + 1 NA intron (NM_001363752, intron 15 of 16) intron (NM_001363752, intron 15 of 16) 67716 NR_147982 79133 Hs.472165 NM_024120 ENSG00000101247 NDUFAF5 C20orf7|MC1DN16|bA526K24.2|dJ842G6.1 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5 protein-coding 133.667-36 chr12 24477115 24477293 + 1 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) AluSz|SINE|Alu 85287 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 266.333-12 chr11 65013124 65013661 + 1 NA promoter-TSS (NR_037650) promoter-TSS (NR_037650) -721 NR_037650 100528018 Hs.80132 NR_037650 ENSG00000273003 ARL2-SNX15 - ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate) ncRNA 148.667-316 chr5 99872720 99872994 + 1 NA Intergenic Intergenic 338867 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 167.667-156 chr4 72416052 72416373 + 1 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 153009 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 156.333-270 chr4 104061592 104061788 + 1 NA Intergenic Intergenic -341705 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 168.667-121 chr20 20721988 20722224 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9462 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 165.333-67 chr12 122634444 122634639 + 1 NA Intergenic MER68C|LTR|ERVL 61458 NR_162150 113218511 NR_162150 MIR9902-2 - microRNA 9902-2 ncRNA 217.333-95 chr3 94704465 94704957 + 1 NA Intergenic Intergenic -233552 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 138.333-116 chr22 25592944 25593165 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) L1PA16|LINE|L1 28379 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 137.667-84 chr19 28013221 28013465 + 1 NA intron (NR_146733, intron 5 of 6) intron (NR_146733, intron 5 of 6) -219403 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 142.667-221 chr8 88006583 88006770 + 1 NA Intergenic Intergenic -132661 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 360.333-10 chr2 25923151 25923752 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -44964 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 154.333-29 chr1 241377136 241377468 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -20072 NM_001350115 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 246.667-22 chr12 73371422 73371796 + 1 NA Intergenic Intergenic 212419 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 279.667-40 chr6 71931752 71932364 + 1 NA intron (NM_001350412, intron 1 of 2) L1PA13|LINE|L1 45355 NM_001350411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 216.667-72 chr3 174546631 174547065 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -312486 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 164.667-204 chr6 100507575 100507825 + 1 NA TTS (NM_006828) TTS (NM_006828) -44025 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 147.333-27 chr1 216530735 216530996 + 1 NA intron (NM_001243518, intron 6 of 7) intron (NM_001243518, intron 6 of 7) -107417 NM_206933 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 187.333-78 chr16 83665251 83665555 + 1 NA intron (NM_001220489, intron 7 of 12) intron (NM_001220489, intron 7 of 12) 138573 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 151.333-432 chr8 132223708 132223971 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) -118574 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 160.333-213 chr4 61548424 61548724 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) L1PA15|LINE|L1 346402 NM_001371342 157.333-302 chr6 49459060 49459322 + 1 NA exon (NM_000255, exon 2 of 13) exon (NM_000255, exon 2 of 13) 4062 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 239.333-32 chr14 35445943 35446248 + 1 NA Intergenic Intergenic -41341 NM_020529 4792 Hs.81328 NM_020529 ENSG00000100906 NFKBIA EDAID2|IKBA|MAD-3|NFKBI NFKB inhibitor alpha protein-coding 189.667-139 chr8 67277760 67278122 + 1 NA intron (NM_006421, intron 7 of 38) MER103C|DNA|hAT-Charlie 65840 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 166.667-240 chr8 142059475 142059752 + 1 NA Intergenic Intergenic -116726 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 198.333-102 chr2 158755755 158756059 + 1 NA Intergenic Intergenic -20905 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 216.333-62 chr18 1530828 1531122 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -171346 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 129.333-47 chr12 26830566 26830728 + 1 NA intron (NM_002223, intron 1 of 56) intron (NM_002223, intron 1 of 56) 2547 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 419.333-15 chr7 15462789 15463302 + 1 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) intron (NM_001004320, intron 3 of 12) 98970 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 228.667-56 chr3 40105007 40105302 + 1 NA intron (NM_001284426, intron 1 of 14) HAL1|LINE|L1 5143 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 127.667-99 chr2 193714003 193714230 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -630153 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 204.667-81 chr20 5952622 5952983 + 1 NA intron (NM_182802, intron 3 of 18) LTR33A|LTR|ERVL 2150 NM_032485 84515 Hs.597484 NM_032485 ENSG00000125885 MCM8 C20orf154|POF10|dJ967N21.5 minichromosome maintenance 8 homologous recombination repair factor protein-coding 114.333-91 chr18 10199251 10199455 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 215017 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 145.333-323 chrX 11872112 11872290 + 1 NA intron (NM_001368398, intron 2 of 18) intron (NM_001368398, intron 2 of 18) 49762 NM_001368395 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 148.667-305 chr5 38882763 38882958 + 1 NA intron (NM_003999, intron 4 of 17) MIR|SINE|MIR 36848 NM_003999 9180 Hs.120658 NM_003999 ENSG00000145623 OSMR IL-31R-beta|IL-31RB|OSMRB|PLCA1 oncostatin M receptor protein-coding 152.333-366 chr8 19902267 19902535 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -36852 NM_000237 4023 Hs.180878 NM_000237 ENSG00000175445 LPL HDLCQ11|LIPD lipoprotein lipase protein-coding 165.667-77 chr18 1048043 1048217 + 1 NA Intergenic Intergenic -120137 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 171.667-55 chr15 63156019 63156284 + 1 NA intron (NM_015920, intron 2 of 3) intron (NM_015920, intron 2 of 3) 1326 NM_015920 51065 Hs.108957 NM_015920 ENSG00000185088 RPS27L - ribosomal protein S27 like protein-coding 195.667-103 chr4 160854615 160854991 + 1 NA Intergenic Intergenic -1077019 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 164.667-66 chr13 96081891 96082111 + 1 NA Intergenic Intergenic -8838 NM_153456 266722 Hs.171001 NM_153456 ENSG00000185352 HS6ST3 HS6ST-3 heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 3 protein-coding 145.667-126 chr2 24573100 24573384 + 1 NA intron (NM_001362955, intron 3 of 23) MIR|SINE|MIR -11235 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 112.333-88 chr17 31500618 31500780 + 1 NA intron (NM_001346748, intron 1 of 12) intron (NM_001346748, intron 1 of 12) 12591 NM_001346748 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 199.333-176 chr3 5121474 5121773 + 1 NA promoter-TSS (NM_018184) promoter-TSS (NM_018184) -669 NM_018184 55207 Hs.250009 NM_018184 ENSG00000134108 ARL8B ARL10C|Gie1 ADP ribosylation factor like GTPase 8B protein-coding 144.333-27 chr10 79968184 79968438 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -19206 NM_003019 6441 Hs.253495 NM_003019 ENSG00000133661 SFTPD COLEC7|PSP-D|SFTP4|SP-D surfactant protein D protein-coding 155.333-395 chr8 110960717 110960877 + 1 NA intron (NR_125417, intron 5 of 5) intron (NR_125417, intron 5 of 5) 66636 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 194.667-141 chr7 24586181 24586563 + 1 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) intron (NM_001303037, intron 1 of 11) 12920 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 198.667-107 chr2 145562364 145562697 + 1 NA Intergenic Intergenic 894563 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 146.333-220 chr3 153698910 153699178 + 1 NA intron (NR_146713, intron 2 of 6) intron (NR_146713, intron 2 of 6) 63482 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 281.667-19 chr14 33667523 33667858 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -41247 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 231.333-55 chr2 9563450 9563855 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -7822 NM_003183 6868 Hs.404914 NM_003183 ENSG00000151694 ADAM17 ADAM18|CD156B|CSVP|NISBD|NISBD1|TACE ADAM metallopeptidase domain 17 protein-coding 144.333-99 chr18 4042188 4042362 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 79922 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 258.667-74 chr5 30373456 30373843 + 1 NA Intergenic Intergenic 493089 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 158.333-259 chr5 75188805 75189099 + 1 NA intron (NM_001164443, intron 9 of 24) intron (NM_001164443, intron 9 of 24) 47926 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 192.333-13 chr10 7236229 7236637 + 1 NA intron (NM_001029880, intron 9 of 20) L1MEd|LINE|L1 -49649 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 193.333-185 chr8 72736334 72736691 + 1 NA intron (NR_110656, intron 1 of 2) intron (NR_110656, intron 1 of 2) 4467 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 149.333-358 chr7 6396676 6396841 + 1 NA intron (NM_006908, intron 3 of 5) AluY|SINE|Alu 22231 NM_006908 5879 Hs.413812 NM_006908 ENSG00000136238 RAC1 MIG5|MRD48|Rac-1|TC-25|p21-Rac1 Rac family small GTPase 1 protein-coding 135.333-39 chr11 115622494 115622789 + 1 NA Intergenic Intergenic 112121 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 277.333-14 chr11 47121047 47121453 + 1 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 55629 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 147.333-298 chr7 52510765 52511042 + 1 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie -524730 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 158.333-313 chr8 53094051 53094362 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 154298 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 130.667-61 chr14 22472459 22472723 + 1 NA intron (NR_148361, intron 2 of 4) intron (NR_148361, intron 2 of 4) 10368 NR_148361 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 168.333-209 chr8 80571957 80572256 + 1 NA Intergenic Intergenic 85880 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 185.333-132 chr4 46296694 46296985 + 1 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) HERVL-int|LTR|ERVL 92540 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 166.333-141 chr22 33750066 33750282 + 1 NA intron (NR_038949, intron 9 of 9) MER102b|DNA|hAT-Charlie 25188 NR_038950 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 212.667-97 chr4 41823267 41823743 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 59106 NR_104143 101927074 Hs.611425 NR_104143 ENSG00000245870 LINC00682 - long intergenic non-protein coding RNA 682 ncRNA 330.333-28 chr9 78177508 78178018 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -58312 NM_001330691 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 254.333-72 chr6 74228871 74229288 + 1 NA intron (NR_110856, intron 1 of 3) L1MDa|LINE|L1 159628 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 119.667-11 chr1 114845111 114845254 + 1 NA Intergenic Intergenic -9621 NM_001282542 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 160.667-151 chr2 103994447 103994730 + 1 NA Intergenic Intergenic 413744 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 177.333-145 chr6 131660314 131660584 + 1 NA intron (NR_133007, intron 6 of 23) intron (NR_133007, intron 6 of 23) 23147 NM_005021 5169 Hs.486489 NM_005021 ENSG00000154269 ENPP3 B10|CD203c|NPP3|PD-IBETA|PDNP3 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 3 protein-coding 194.333-117 chr5 36801830 36802112 + 1 NA Intergenic Intergenic 74723 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 129.667-21 chr10 28100375 28100618 + 1 NA intron (NR_134518, intron 10 of 16) intron (NR_134518, intron 10 of 16) -27118 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 145.333-33 chr10 58061198 58061357 + 1 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR 206617 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 209.333-254 chrX 17010579 17010899 + 1 NA intron (NM_001080975, intron 2 of 17) intron (NM_001080975, intron 2 of 17) 64081 NM_001080975 9185 Hs.186810 NM_004726 ENSG00000169891 REPS2 POB1 RALBP1 associated Eps domain containing 2 protein-coding 153.667-148 chr16 64694944 64695108 + 1 NA Intergenic Intergenic 427037 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 234.667-50 chr2 51599172 51599471 + 1 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 566720 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 165.667-222 chrX 82718955 82719185 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -789220 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 148.333-365 chr7 43832640 43832815 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 36790 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 221.333-143 chr8 108920683 108921028 + 1 NA Intergenic Intergenic -133261 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 129.667-172 chr8 107780931 107781115 + 1 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy -283105 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 128.333-147 chr4 181476882 181477046 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -211935 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 123.333-34 chr10 65277475 65277680 + 1 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -293848 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 164.333-225 chr7 42664277 42664523 + 1 NA intron (NR_110833, intron 2 of 2) intron (NR_110833, intron 2 of 2) 42047 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 147.333-317 chr8 75829974 75830206 + 1 NA Intergenic Intergenic 290122 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 212.333-57 chr18 66634444 66634751 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -30507 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 124.333-149 chr5 140879498 140879698 + 1 NA intron (NM_018903, intron 1 of 3) intron (NM_018903, intron 1 of 3) -2526 NM_018904 56136 Hs.199343 NM_018904 ENSG00000239389 PCDHA13 CNR5|CNRN5|CNRS5|CRNR5|PCDH-ALPHA13 protocadherin alpha 13 protein-coding 159.333-159 chr2 80638744 80639013 + 1 NA intron (NM_001320810, intron 12 of 12) intron (NM_001320810, intron 12 of 12) 325499 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 127.667-186 chr8 127238956 127239127 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5596 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 160.333-34 chr10 4216307 4216558 + 1 NA intron (NR_108040, intron 2 of 2) intron (NR_108040, intron 2 of 2) 27480 NR_108040 100652988 Hs.433011 NR_108040 LINC00702 - long intergenic non-protein coding RNA 702 ncRNA 134.333-6 chr1 169346213 169346421 + 1 NA intron (NR_104229, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 21480 NM_013330 29922 Hs.706952 NM_013330 ENSG00000143156 NME7 CFAP67|MN23H7|NDK 7|NDK7|nm23-H7 NME/NM23 family member 7 protein-coding 126.667-187 chrX 97966168 97966399 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -401748 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-20 chr10 677461 677632 + 1 NA intron (NM_014974, intron 1 of 36) intron (NM_014974, intron 1 of 36) 12122 NM_014974 22982 Hs.432397 NM_014974 ENSG00000151240 DIP2C KIAA0934 disco interacting protein 2 homolog C protein-coding 116.333-209 chr8 109087072 109087232 + 1 NA intron (NM_003301, intron 1 of 2) intron (NM_003301, intron 1 of 2) 524 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 161.667-84 chr14 86612359 86612599 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -293299 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 194.333-119 chr5 74156129 74156536 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 151993 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 237.333-30 chr14 49347314 49347831 + 1 NA Intergenic Intergenic 238808 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 147.333-90 chr12 125799302 125799510 + 1 NA Intergenic Intergenic 176954 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 345.333-12 chr14 90115333 90116033 + 1 NA intron (NM_022054, intron 1 of 1) MER58A|DNA|hAT-Charlie 53689 NM_022054 56659 Hs.510191 NM_022054 ENSG00000152315 KCNK13 K2p13.1|THIK-1|THIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 13 protein-coding 145.667-142 chr2 114488761 114488922 + 1 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 27264 NM_001321912 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 153.333-292 chr4 34906260 34906565 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -636665 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 167.667-61 chr14 67891918 67892174 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 68454 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 189.333-148 chr4 99996126 99996483 + 1 NA intron (NR_125923, intron 1 of 3) intron (NR_125923, intron 1 of 3) 45810 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 152.667-399 chr9 126322548 126322701 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4205 NM_001011703 89853 Hs.162659 NM_033446 ENSG00000196814 MVB12B C9orf28|FAM125B multivesicular body subunit 12B protein-coding 271.667-4 chr1 167370974 167371316 + 1 NA intron (NM_001198783, intron 4 of 15) intron (NM_001198783, intron 4 of 15) 42075 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 132.333-30 chr11 41437698 41437875 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) AluSq2|SINE|Alu 21850 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 392.333-2 chr11 22256079 22256587 + 1 NA intron (NM_001142649, intron 13 of 21) intron (NM_001142649, intron 13 of 21) 63157 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 215.333-21 chr10 22328330 22328607 + 1 NA intron (NM_001204062, intron 11 of 13) intron (NM_001204062, intron 11 of 13) 7369 NM_005180 648 Hs.380403 NM_005180 ENSG00000168283 BMI1 FLVI2/BMI1|PCGF4|RNF51|flvi-2/bmi-1 BMI1 proto-oncogene, polycomb ring finger protein-coding 156.667-53 chr10 114964662 114964927 + 1 NA intron (NM_139169, intron 4 of 7) L1ME3|LINE|L1 26599 NM_139169 142940 Hs.21187 NM_139169 ENSG00000165832 TRUB1 PUS4 TruB pseudouridine synthase family member 1 protein-coding 189.667-78 chr2 157933635 157933988 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -57481 NM_001111067 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 204.667-141 chr7 54103691 54103930 + 1 NA Intergenic Intergenic -226887 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 210.333-66 chr2 26834576 26834937 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -13376 NM_020134 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 200.333-5 chr1 220384351 220384676 + 1 NA Intergenic Intergenic -112060 NM_012414 25782 Hs.654849 NM_012414 ENSG00000118873 RAB3GAP2 RAB3-GAP150|RAB3GAP150|SPG69|WARBM2|p150 RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2 protein-coding 241.333-12 chr10 17623763 17624150 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6582 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 184.333-2 chr1 40483253 40483590 + 1 NA intron (NM_001320178, intron 3 of 5) AluJr4|SINE|Alu 6131 NM_001320179 339559 Hs.434385 NM_198494 ENSG00000187815 ZFP69 ZFP69A|ZKSCAN23A|ZNF642|ZSCAN54A ZFP69 zinc finger protein protein-coding 136.667-158 chr6 121255953 121256115 + 1 NA intron (NR_104452, intron 16 of 35) intron (NR_104452, intron 16 of 35) 78446 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 193.333-27 chr10 108556402 108556839 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -487327 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 153.667-58 chr11 9879395 9879595 + 1 NA intron (NM_030962, intron 17 of 39) intron (NM_030962, intron 17 of 39) 40353 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 200.333-57 chr17 65656730 65657159 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 24 of 26) intron (NM_001353129, intron 24 of 26) -95296 NM_001363813 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 167.667-64 chr14 87881006 87881224 + 1 NA Intergenic Intergenic 112067 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 184.667-6 chr1 114493083 114493289 + 1 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) L1MB4|LINE|L1 18017 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 197.333-192 chr5 149710359 149710652 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19805 NM_133263 133522 Hs.483816 NM_133263 ENSG00000155846 PPARGC1B ERRL1|PERC|PGC-1(beta)|PGC1B PPARG coactivator 1 beta protein-coding 252.333-26 chr18 7644681 7645150 + 1 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 77599 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 156.333-313 chr6 77138960 77139122 + 1 NA Intergenic Intergenic 324981 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 148.667-248 chr3 45738565 45738794 + 1 NA intron (NM_001319071, intron 17 of 19) intron (NM_001319071, intron 17 of 19) 49283 NM_001319073 22908 Hs.156509 NM_014016 ENSG00000211456 SACM1L SAC1 SAC1 like phosphatidylinositide phosphatase protein-coding 169.333-248 chr7 78517626 78517982 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 4 of 20) intron (NM_001301128, intron 4 of 20) 170562 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 158.667-273 chr5 84635021 84635293 + 1 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -250277 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 276.333-61 chr8 84103762 84104300 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -78756 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 149.333-281 chr4 71768916 71769113 + 1 NA intron (NM_000583, intron 2 of 12) intron (NM_000583, intron 2 of 12) 15065 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 158.333-24 chr1 222679261 222679463 + 1 NA intron (NM_022831, intron 6 of 9) intron (NM_022831, intron 6 of 9) 33129 NM_022831 64853 Hs.156625 NM_022831 ENSG00000186063 AIDA C1orf80 axin interactor, dorsalization associated protein-coding 210.333-129 chr5 33501313 33501697 + 1 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 60729 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 136.667-102 chr2 194907429 194907705 + 1 NA Intergenic Intergenic 176972 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 154.333-317 chr7 29087544 29087816 + 1 NA intron (NM_001371256, intron 10 of 16) intron (NM_001371256, intron 10 of 16) -37353 NR_120523 101928168 Hs.666750 NR_120523 ENSG00000285412 LOC101928168 - uncharacterized LOC101928168 ncRNA 284.667-43 chr5 127563958 127564358 + 1 NA Intergenic Intergenic 46518 NM_001286808 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 147.667-325 chr6 164332569 164332899 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 489329 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 318.333-14 chr14 88930296 88930881 + 1 NA Intergenic Intergenic 105937 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 147.667-111 chr15 65393993 65394285 + 1 NA intron (NM_020962, intron 9 of 19) MIR3|SINE|MIR -16137 NM_004884 9543 Hs.128292 NM_004884 ENSG00000174498 IGDCC3 HsT18880|PUNC immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3 protein-coding 169.333-153 chr3 5134659 5134916 + 1 NA intron (NM_018184, intron 1 of 6) intron (NM_018184, intron 1 of 6) 12495 NM_018184 55207 Hs.250009 NM_018184 ENSG00000134108 ARL8B ARL10C|Gie1 ADP ribosylation factor like GTPase 8B protein-coding 250.667-8 chr10 77154886 77155468 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 5 of 28) intron (NM_001271519, intron 5 of 28) 14346 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 130.333-109 chr2 179181539 179181687 + 1 NA intron (NM_178123, intron 3 of 17) MIR3|SINE|MIR 83219 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 165.333-256 chr9 13240108 13240335 + 1 NA intron (NM_003829, intron 3 of 45) intron (NM_003829, intron 3 of 45) 39343 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 181.667-125 chr5 120104774 120105091 + 1 NA Intergenic Intergenic -359346 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 260.333-52 chr5 124240691 124241163 + 1 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 197593 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 255.667-10 chr10 102671003 102671412 + 1 NA Intergenic Intergenic 26712 NM_001345950 81603 Hs.336810 NM_030912 ENSG00000171206 TRIM8 GERP|RNF27 tripartite motif containing 8 protein-coding 258.333-32 chr2 57138259 57138735 + 1 NA Intergenic Intergenic -769154 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 302.333-39 chr9 102245476 102245838 + 1 NA Intergenic Intergenic -273980 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 484.333-3 chr8 22537575 22538228 + 1 NA intron (NM_001243975, intron 12 of 12) L1MB8|LINE|L1 -14026 NM_005775 10174 Hs.528572 NM_005775 ENSG00000120896 SORBS3 SCAM-1|SCAM1|SH3D4 sorbin and SH3 domain containing 3 protein-coding 195.667-63 chr18 651438 651791 + 1 NA intron (NM_001012716, intron 1 of 1) intron (NM_001012716, intron 1 of 1) -6039 NM_001354867 7298 Hs.369762 NM_001071 ENSG00000176890 TYMS HST422|TMS|TS thymidylate synthetase protein-coding 215.333-140 chr4 3406678 3407003 + 1 NA intron (NM_002926, intron 4 of 16) intron (NM_002926, intron 4 of 16) -35128 NM_001297439 3083 Hs.104 NM_001528 ENSG00000109758 HGFAC HGFA HGF activator protein-coding 236.667-15 chr11 27068153 27068584 + 1 NA intron (NR_125767, intron 3 of 4) L1PB3|LINE|L1 27553 NM_003986 8424 Hs.591996 NM_003986 ENSG00000129151 BBOX1 BBH|BBOX|G-BBH|gamma-BBH gamma-butyrobetaine hydroxylase 1 protein-coding 121.667-76 chr17 76777862 76778055 + 1 NA intron (NM_001353019, intron 13 of 13) FLAM_C|SINE|Alu -21086 NR_110837 101928514 Hs.617206 NR_110837 ENSG00000267065 LINC02080 - long intergenic non-protein coding RNA 2080 ncRNA 314.667-11 chr11 98044345 98044659 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -976447 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 288.333-17 chr17 76324365 76324894 + 1 NA intron (NM_001366236, intron 7 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -16949 NR_130649 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 178.667-96 chr22 30399983 30400244 + 1 NA intron (NM_001204204, intron 2 of 9) intron (NM_001204204, intron 2 of 9) 3095 NM_012429 23541 Hs.335614 NM_012429 ENSG00000100003 SEC14L2 C22orf6|SPF|TAP|TAP1 SEC14 like lipid binding 2 protein-coding 186.667-19 chr10 101380686 101380972 + 1 NA intron (NM_003939, intron 1 of 13) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 26664 NM_033637 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 138.333-165 chr6 50603595 50603759 + 1 NA Intergenic Intergenic -109867 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 163.333-221 chr5 60644526 60644741 + 1 NA intron (NM_001145208, intron 5 of 9) intron (NM_001145208, intron 5 of 9) 55533 NM_018369 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 171.333-63 chr16 65324138 65324351 + 1 NA intron (NR_027755, intron 7 of 8) intron (NR_027755, intron 7 of 8) -147671 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 181.667-31 chr13 34312226 34312544 + 1 NA Intergenic Intergenic -35658 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 260.333-11 chr12 40252548 40252862 + 1 NA intron (NM_198578, intron 10 of 50) intron (NM_198578, intron 10 of 50) 27708 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 144.667-12 chr1 103410511 103410674 + 1 NA Intergenic Intergenic 114919 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 157.667-226 chr4 184801238 184801534 + 1 NA intron (NM_001995, intron 2 of 20) intron (NM_001995, intron 2 of 20) -2340 NR_003542 643036 Hs.689630 NR_003542 ENSG00000249138 SLED1 - proteoglycan 3, pro eosinophil major basic protein 2 pseudogene pseudo 148.333-290 chr4 103018133 103018338 + 1 NA 3' UTR (NM_001370202, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001370202, exon 13 of 13) 1470 NR_047513 150159 Hs.666728 NM_139173 ENSG00000164037 SLC9B1 NHA1|NHEDC1 solute carrier family 9 member B1 protein-coding 160.667-195 chr3 51521999 51522288 + 1 NA Intergenic Intergenic -16576 NM_001322253 23132 Hs.105399 NM_015106 ENSG00000164080 RAD54L2 ARIP4|HSPC325|SRISNF2L RAD54 like 2 protein-coding 120.667-148 chr6 50501091 50501246 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -212376 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 265.333-93 chr9 100453526 100454047 + 1 NA intron (NM_001198812, intron 1 of 9) intron (NM_001198812, intron 1 of 9) 11880 NM_001198812 100526694 Hs.598100 NM_001198812 MSANTD3-TMEFF1 C9orf2|C9orf3-TMEFF1|C9orf30-TMEFF1|H7365|TMEFF1|TR-1 MSANTD3-TMEFF1 readthrough protein-coding 372.667-14 chr3 125269999 125270438 + 1 NA intron (NM_001348434, intron 6 of 7) intron (NM_001348434, intron 6 of 7) -57453 NM_024628 84561 Hs.658514 NM_024628 ENSG00000221955 SLC12A8 CCC9 solute carrier family 12 member 8 protein-coding 267.333-38 chr16 74630195 74630614 + 1 NA intron (NM_001370536, intron 9 of 11) intron (NM_001370536, intron 9 of 11) -23290 NM_001145666 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 151.333-132 chr14 67021523 67021695 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) intron (NM_001024218, intron 8 of 21) -167831 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 154.667-11 chr1 86642729 86642965 + 1 NA intron (NR_024604, intron 6 of 14) intron (NR_024604, intron 6 of 14) 8571 NR_024604 9629 Hs.673847 NM_004921 ENSG00000153923 CLCA3P CLCA3 chloride channel accessory 3, pseudogene pseudo 158.333-304 chr7 94696919 94697197 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 40688 NM_001184962 23089 Hs.147492 NM_015068 ENSG00000242265 PEG10 EDR|HB-1|MEF3L|Mar2|Mart2|RGAG3|RTL2|SIRH1 paternally expressed 10 protein-coding 182.667-123 chr4 110755620 110755891 + 1 NA Intergenic Intergenic 104892 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 138.333-189 chr7 121968451 121968659 + 1 NA intron (NM_001206839, intron 3 of 28) intron (NM_001206839, intron 3 of 28) 95394 NM_001369395 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 140.333-57 chr13 112914702 112914872 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 53851 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 148.333-331 chr5 137387009 137387240 + 1 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) L1MC1|LINE|L1 112202 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 162.333-72 chr14 64831499 64831696 + 1 NA intron (NM_001355436, intron 1 of 35) L1ME3G|LINE|L1 -8217 NM_001024858 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 198.333-48 chr12 75812767 75813077 + 1 NA Intergenic Intergenic 218854 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 232.333-28 chr15 90202595 90203027 + 1 NA intron (NM_198925, intron 1 of 13) intron (NM_198925, intron 1 of 13) 1481 NM_001324034 10509 Hs.474935 NM_020210 ENSG00000185033 SEMA4B SEMAC|SemC semaphorin 4B protein-coding 158.333-336 chr8 145008008 145008276 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -5243 NR_023392 286101 Hs.367856 NR_023392 ZNF252P ZNF252 zinc finger protein 252, pseudogene pseudo 126.333-27 chr11 56498420 56498626 + 1 NA Intergenic Intergenic -7153 NM_001005282 219484 Hs.554522 NM_001005282 ENSG00000181371 OR5M8 OR11-194 olfactory receptor family 5 subfamily M member 8 protein-coding 145.667-10 chr1 73736076 73736277 + 1 NA non-coding (NR_146300, exon 4 of 4) non-coding (NR_146300, exon 4 of 4) 61497 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 160.333-112 chr15 60701598 60701873 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 20166 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 163.667-141 chr21 28317626 28317867 + 1 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -89079 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 221.333-149 chr8 138318723 138319127 + 1 NA intron (NM_015912, intron 2 of 19) intron (NM_015912, intron 2 of 19) 178336 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 179.333-114 chr20 48714454 48714682 + 1 NA intron (NM_020820, intron 5 of 39) L1M4|LINE|L1 113431 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 154.333-295 chr6 71203058 71203260 + 1 NA Intergenic Intergenic -85652 NM_024576 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 139.667-130 chr3 194138839 194139115 + 1 NA TTS (NM_005524) TTS (NM_005524) 2829 NM_005524 3280 Hs.250666 NM_005524 ENSG00000114315 HES1 HES-1|HHL|HRY|bHLHb39 hes family bHLH transcription factor 1 protein-coding 194.667-113 chr4 92861919 92862224 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) L2a|LINE|L2 557672 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 158.333-289 chr7 7273478 7273648 + 1 NA intron (NR_108073, intron 3 of 3) intron (NR_108073, intron 3 of 3) 18409 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 172.667-37 chr12 23024167 23024347 + 1 NA Intergenic Intergenic -151379 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 173.667-132 chr4 51971383 51971693 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 48825 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 162.333-130 chr2 189854536 189854775 + 1 NA exon (NM_001321048, exon 10 of 14) exon (NM_001321048, exon 10 of 14) 70205 NM_001321048 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 148.667-223 chr20 47034368 47034526 + 1 NA intron (NM_172110, intron 5 of 13) intron (NM_172110, intron 5 of 13) -132520 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 250.667-59 chr4 97052734 97053147 + 1 NA Intergenic Intergenic -313986 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 353.333-3 chr10 32812501 32812914 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 31 of 43) intron (NM_001321115, intron 31 of 43) 88765 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 173.667-6 chr1 118436600 118436853 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -251498 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 134.333-117 chr3 68873976 68874241 + 1 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) intron (NM_001005527, intron 3 of 5) 58439 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 306.667-21 chr2 78125899 78126341 + 1 NA intron (NR_110287, intron 5 of 5) intron (NR_110287, intron 5 of 5) 37390 NR_110287 101927948 Hs.639404 NR_110287 ENSG00000229494 LOC101927948 - uncharacterized LOC101927948 ncRNA 357.667-8 chr5 85288217 85288693 + 1 NA Intergenic Intergenic -903575 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 139.667-185 chr8 82639047 82639211 + 1 NA Intergenic Intergenic -272975 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 204.333-200 chr8 123232152 123232409 + 1 NA intron (NM_001204180, intron 4 of 5) intron (NM_001204180, intron 4 of 5) 9097 NM_032847 84933 Hs.707401 NM_032847 ENSG00000189376 C8orf76 - chromosome 8 open reading frame 76 protein-coding 265.667-52 chr4 55411363 55411859 + 1 NA intron (NR_073070, intron 2 of 6) intron (NR_073070, intron 2 of 6) 15654 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 135.333-138 chr5 29395851 29396107 + 1 NA promoter-TSS (NR_104628) promoter-TSS (NR_104628) -3 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 148.667-283 chr4 68168646 68168855 + 1 NA Intergenic Intergenic -13542 NR_015446 100130017 Hs.582037 NR_015446 ENSG00000250426 FTLP10 - ferritin light chain pseudogene 10 pseudo 163.667-8 chr1 164798507 164798723 + 1 NA intron (NM_001204963, intron 3 of 8) MIR3|SINE|MIR -23974 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 161.333-214 chr4 74380045 74380351 + 1 NA intron (NM_001432, intron 2 of 4) intron (NM_001432, intron 2 of 4) 15053 NM_001432 2069 Hs.115263 NM_001432 ENSG00000124882 EREG EPR|ER|Ep epiregulin protein-coding 155.333-107 chr14 61846005 61846172 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L1MA2|LINE|L1 33385 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 260.667-44 chr2 52117907 52118382 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -252504 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 164.333-30 chr10 88455084 88455409 + 1 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 128072 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 154.333-351 chr8 121762187 121762478 + 1 NA Intergenic Intergenic -120892 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 155.667-358 chr8 98953257 98953523 + 1 NA Intergenic Intergenic 8948 NM_001142462 116039 Hs.253247 NM_053001 ENSG00000164920 OSR2 - odd-skipped related transciption factor 2 protein-coding 147.333-121 chr15 61108179 61108326 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 121050 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 161.333-306 chrX 77990273 77990626 + 1 NA intron (NM_001282224, intron 4 of 21) L1ME4a|LINE|L1 -20811 NM_001029891 441531 Hs.632822 NM_001029891 ENSG00000226784 PGAM4 PGAM-B|PGAM1|PGAM3|dJ1000K24.1 phosphoglycerate mutase family member 4 protein-coding 179.333-77 chr17 3111045 3111316 + 1 NA Intergenic Intergenic -5413 NM_001348201 8389 NM_001348201 OR1E3 OR17-210|OR1E3P olfactory receptor family 1 subfamily E member 3 (gene/pseudogene) protein-coding 121.333-68 chr17 50965523 50965668 + 1 NA 3' UTR (NM_001130528, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_001130528, exon 30 of 30) 81283 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 121.667-89 chr2 40799979 40800143 + 1 NA Intergenic Intergenic -287626 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 327.667-18 chr2 128510215 128510742 + 1 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -191610 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 160.333-54 chr11 8802226 8802460 + 1 NA intron (NR_120590, intron 4 of 4) intron (NR_120590, intron 4 of 4) 8331 NM_213618 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 241.333-43 chr15 98613755 98614247 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -34538 NM_000875 3480 Hs.643120 NM_000875 ENSG00000140443 IGF1R CD221|IGFIR|IGFR|JTK13 insulin like growth factor 1 receptor protein-coding 157.667-297 chr7 34505400 34505576 + 1 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) L1MC4|LINE|L1 -152730 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 128.667-161 chr6 117697311 117697528 + 1 NA intron (NM_138459, intron 3 of 4) L1MA3|LINE|L1 21950 NM_138459 116150 Hs.289008 NM_138459 ENSG00000153989 NUS1 C6orf68|CDG1AA|MGC:7199|MRD55|NgBR|TANGO14 NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit protein-coding 238.667-2 chr1 183630417 183630806 + 1 NA exon (NM_001270439, exon 3 of 4) exon (NM_001270439, exon 3 of 4) 5172 NM_005717 10092 Hs.518609 NM_005717 ENSG00000162704 ARPC5 ARC16|dJ127C7.3|p16-Arc actin related protein 2/3 complex subunit 5 protein-coding 277.333-13 chr11 38020910 38021312 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 82510 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 258.667-42 chr2 14045017 14045460 + 1 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 355720 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 167.667-56 chr14 50959750 50959942 + 1 NA Intergenic MER68B|LTR|ERVL -15363 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 155.667-28 chr1 205103333 205103618 + 1 NA intron (NM_001193273, intron 5 of 13) intron (NM_001193273, intron 5 of 13) 18503 NM_005057 5929 Hs.519230 NM_005057 ENSG00000117222 RBBP5 RBQ3|SWD1 RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 168.333-180 chr6 91475308 91475632 + 1 NA Intergenic Intergenic -46190 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 204.667-74 chr2 112673584 112673991 + 1 NA Intergenic Intergenic 27848 NM_005415 6574 Hs.187946 NM_005415 ENSG00000144136 SLC20A1 GLVR1|Glvr-1|PIT1|PiT-1 solute carrier family 20 member 1 protein-coding 173.667-109 chr3 67435566 67435888 + 1 NA intron (NM_001177599, intron 9 of 10) intron (NM_001177599, intron 9 of 10) 210263 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 173.667-117 chr3 105522024 105522264 + 1 NA intron (NM_001243280, intron 2 of 14) intron (NM_001243280, intron 2 of 14) 155235 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 239.667-74 chr8 83241580 83242002 + 1 NA Intergenic Intergenic -161967 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 150.333-217 chr2 161638498 161638660 + 1 NA intron (NM_001354451, intron 1 of 25) L1MA6|LINE|L1 14163 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 124.667-138 chr3 113449942 113450121 + 1 NA intron (NM_001331078, intron 15 of 17) intron (NM_001331078, intron 15 of 17) -8517 NM_018338 55779 Hs.584936 NM_018338 ENSG00000206530 CFAP44 SPGF20|WDR52 cilia and flagella associated protein 44 protein-coding 192.667-127 chr4 101100352 101100728 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 3 of 12) intron (NM_001130691, intron 3 of 12) 140332 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 149.333-427 chr9 32463359 32463591 + 1 NA intron (NM_014314, intron 16 of 17) intron (NM_014314, intron 16 of 17) 62721 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 123.667-119 chr3 40181669 40181849 + 1 NA intron (NR_033965, intron 2 of 2) intron (NR_033965, intron 2 of 2) 81748 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 206.667-117 chr5 151666014 151666343 + 1 NA intron (NM_001309443, intron 8 of 9) intron (NM_001309443, intron 8 of 9) -10767 NR_109873 101927096 Hs.571023 NR_109873 ENSG00000249035 CLMAT3 CTB-113P19.1|SPARC-AS1 colorectal liver metastasis associated transcript 3 ncRNA 175.333-27 chr12 22694082 22694341 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 69040 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 180.667-146 chr8 111892555 111892849 + 1 NA Intergenic Intergenic 516063 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 254.667-45 chr21 14308891 14309270 + 1 NA Intergenic Intergenic 35281 NR_003087 150000 Hs.366575 NM_138726 ENSG00000243064 ABCC13 ABCC13P|C21orf73|PRED6 ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) pseudo 149.667-48 chr10 33321384 33321556 + 1 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 13197 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 192.333-92 chr2 73780708 73780910 + 1 NA promoter-TSS (NM_003584) promoter-TSS (NM_003584) -652 NM_003584 8446 Hs.14611 NM_003584 ENSG00000144048 DUSP11 PIR1 dual specificity phosphatase 11 protein-coding 153.667-138 chr15 79672654 79672934 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 224203 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 122.333-211 chr8 123106685 123106904 + 1 NA intron (NM_001363149, intron 8 of 21) MER68|LTR|ERVL 33545 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 139.333-11 chr1 174260294 174260491 + 1 NA intron (NM_001366445, intron 7 of 13) intron (NM_001366445, intron 7 of 13) -14708 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 153.667-121 chr14 67106240 67106419 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 12 of 21) L1M2a|LINE|L1 -83111 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 208.667-3 chr1 61768615 61768968 + 1 NA intron (NM_001350145, intron 4 of 43) AluJb|SINE|Alu 26311 NM_176877 10207 Hs.478125 NM_005799 ENSG00000132849 PATJ Cipp|INADL|InaD-like|hINADL PATJ crumbs cell polarity complex component protein-coding 160.333-297 chr9 26675866 26676180 + 1 NA Intergenic U2|snRNA|snRNA 216779 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 339.333-5 chr10 4867092 4867662 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 41170 NM_001040177 83592 Hs.657944 NM_031436 ENSG00000165568 AKR1E2 AKR1CL2|AKRDC1|LoopADR|TAKR|hTSP|htAKR aldo-keto reductase family 1 member E2 protein-coding 252.333-16 chr12 123697058 123697438 + 1 NA intron (NM_001143850, intron 13 of 17) intron (NM_001143850, intron 13 of 17) -15105 NM_012463 23545 Hs.25786 NM_012463 ENSG00000185344 ATP6V0A2 A2|ARCL|ARCL2A|ATP6A2|ATP6N1D|J6B7|RTF|STV1|TJ6|TJ6M|TJ6S|VPH1|WSS ATPase H+ transporting V0 subunit a2 protein-coding 171.667-63 chr16 25723273 25723495 + 1 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) intron (NM_006040, intron 1 of 1) 31425 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 177.333-101 chr22 38549426 38549836 + 1 NA intron (NM_007068, intron 8 of 13) AluSx|SINE|Alu 18778 NM_001278208 11144 Hs.339396 NM_007068 ENSG00000100206 DMC1 DMC1H|LIM15|dJ199H16.1 DNA meiotic recombinase 1 protein-coding 210.333-30 chr12 659817 660153 + 1 NA intron (NM_016533, intron 1 of 3) intron (NM_016533, intron 1 of 3) 3460 NM_016533 4815 Hs.655804 NM_016533 ENSG00000171840 NINJ2 - ninjurin 2 protein-coding 253.667-62 chr6 53175235 53175683 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -26618 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 162.333-71 chr14 60228095 60228393 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -17506 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 291.667-32 chr6 64190965 64191559 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) L1MEg|LINE|L1 384426 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 206.333-102 chr21 16355959 16356267 + 1 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -63090 NR_136546 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 195.333-149 chr3 145968481 145968750 + 1 NA Intergenic Intergenic 100570 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 139.333-142 chr22 50578974 50579141 + 1 NA promoter-TSS (NM_152245) promoter-TSS (NM_152245) -445 NM_001145135 1375 Hs.439777 NM_004377 ENSG00000205560 CPT1B CPT1-M|CPT1M|CPTI|CPTI-M|M-CPT1|MCCPT1|MCPT1 carnitine palmitoyltransferase 1B protein-coding 136.333-10 chr1 189069171 189069380 + 1 NA Intergenic Intergenic 1406735 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 145.333-284 chr7 99318350 99318519 + 1 NA Intergenic MERX|DNA|TcMar-Tigger -7439 NM_001190996 10552 Hs.124126 NM_006409 ENSG00000241685 ARPC1A Arc40|HEL-68|HEL-S-307|SOP2Hs|SOP2L actin related protein 2/3 complex subunit 1A protein-coding 112.667-57 chr13 36854792 36855035 + 1 NA intron (NM_001127217, intron 5 of 6) intron (NM_001127217, intron 5 of 6) 35711 NM_000538 5994 Hs.24422 NM_000538 ENSG00000133111 RFXAP - regulatory factor X associated protein protein-coding 220.333-10 chr1 248085297 248085781 + 1 NA intron (NM_001304535, intron 1 of 1) MER113A|DNA|hAT-Charlie 24857 NM_001004687 391192 Hs.690412 NM_001004687 ENSG00000198128 OR2L3 - olfactory receptor family 2 subfamily L member 3 protein-coding 199.667-102 chr4 64375897 64376111 + 1 NA intron (NM_001363796, intron 1 of 11) intron (NM_001363796, intron 1 of 11) 33446 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 159.667-4 chr1 32611985 32612266 + 1 NA Intergenic Intergenic 38425 NM_001366278 339487 Hs.655921 NM_178547 ENSG00000176261 ZBTB8OS ARCH|ARCH2 zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand protein-coding 254.667-10 chr11 11321456 11321741 + 1 NA intron (NM_001363464, intron 8 of 9) intron (NM_001363464, intron 8 of 9) 31652 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 176.333-65 chr17 64760229 64760451 + 1 NA intron (NR_026899, intron 6 of 12) L1M5|LINE|L1 -20419 NR_106728 102464831 NR_106728 ENSG00000278581 MIR6080 hsa-mir-6080 microRNA 6080 ncRNA 307.333-18 chr11 38465795 38466301 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 180308 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 144.667-311 chr8 130937443 130937649 + 1 NA intron (NM_001115, intron 4 of 17) intron (NM_001115, intron 4 of 17) 103363 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 276.333-49 chr5 122995164 122995501 + 1 NA intron (NM_014035, intron 3 of 6) intron (NM_014035, intron 3 of 6) 41393 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 139.667-195 chr8 125978376 125978528 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -27255 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 235.667-2 chr1 64726198 64726549 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -18600 NM_001366165 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 351.667-15 chr5 43838735 43839455 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -235865 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 176.667-157 chr9 75543963 75544203 + 1 NA Intergenic Intergenic -346561 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 223.333-116 chr4 101118019 101118386 + 1 NA intron (NM_001130691, intron 2 of 12) intron (NM_001130691, intron 2 of 12) 122670 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 161.333-228 chr5 21612897 21613076 + 1 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 153506 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 176.333-142 chr5 160804946 160805178 + 1 NA intron (NM_001366652, intron 1 of 24) MER8|DNA|TcMar-Tigger 47149 NM_001366654 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 253.333-45 chr17 73505064 73505429 + 1 NA intron (NM_001144952, intron 2 of 44) MIRb|SINE|MIR -8437 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 188.333-151 chr8 40233889 40234200 + 1 NA Intergenic Intergenic 80562 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 159.667-75 chr12 42261236 42261486 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22993 NM_001190979 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 152.667-362 chr8 50291676 50291964 + 1 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) L2a|LINE|L2 127689 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 127.667-31 chr11 100226481 100226653 + 1 NA intron (NM_001243270, intron 15 of 23) intron (NM_001243270, intron 15 of 23) -460721 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 129.333-182 chr7 123216510 123216657 + 1 NA Intergenic Intergenic -16612 NM_001324400 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 263.667-2 chr1 31950483 31950797 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -12272 NM_080391 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 143.333-33 chr10 50860276 50860513 + 1 NA intron (NM_001370131, intron 1 of 11) intron (NM_001370131, intron 1 of 11) 25233 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 153.667-302 chr4 123338739 123338965 + 1 NA Intergenic Intergenic -57943 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 148.667-265 chr3 192104680 192104856 + 1 NA Intergenic Intergenic -133862 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 164.333-239 chr8 128340290 128340478 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 190268 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 397.333-4 chr16 4911700 4912381 + 1 NA intron (NM_002705, intron 1 of 21) intron (NM_002705, intron 1 of 21) 25108 NM_002705 5493 Hs.192233 NM_002705 ENSG00000118898 PPL - periplakin protein-coding 197.667-128 chr5 125763543 125763926 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 270473 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 183.667-66 chr18 80248618 80249016 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1303 NM_032510 84552 Hs.654920 NM_032510 ENSG00000178184 PARD6G PAR-6G|PAR6gamma par-6 family cell polarity regulator gamma protein-coding 227.667-10 chr10 107305879 107306293 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -141380 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 178.333-17 chr10 59757084 59757398 + 1 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -3786 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 203.333-153 chr2 219076750 219077196 + 1 NA intron (NM_024782, intron 7 of 7) intron (NM_024782, intron 7 of 7) -16052 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 224.667-44 chr2 124729015 124729405 + 1 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 703923 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 170.333-119 chr2 177145203 177145429 + 1 NA Intergenic Intergenic 67095 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 159.333-257 chr5 18814387 18814613 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 1007226 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 163.333-70 chr12 109062728 109062912 + 1 NA intron (NM_001301175, intron 6 of 15) L1MB3|LINE|L1 -8855 NR_038996 100131733 Hs.660996 NR_038996 USP30-AS1 - USP30 antisense RNA 1 ncRNA 215.667-6 chr1 178549001 178549458 + 1 NA TTS (NR_033186) TTS (NR_033186) 6433 NR_033186 400798 Hs.668085 NM_207467 ENSG00000213057 C1orf220 - chromosome 1 open reading frame 220 (putative) ncRNA 249.333-24 chr12 41278995 41279387 + 1 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) 90871 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 300.333-5 chr1 234434902 234435311 + 1 NA intron (NM_005646, intron 13 of 29) intron (NM_005646, intron 13 of 29) 44073 NM_005646 6894 Hs.498115 NM_005646 ENSG00000059588 TARBP1 TRM3|TRMT3|TRP-185|TRP185 TAR (HIV-1) RNA binding protein 1 protein-coding 198.667-109 chr2 163541393 163541671 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 194476 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 164.667-202 chr6 65559181 65559534 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) AluSz6|SINE|Alu 20447 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 317.333-6 chr11 81511406 81511835 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 379216 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 253.667-5 chr1 108606245 108606783 + 1 NA intron (NM_001010883, intron 3 of 10) intron (NM_001010883, intron 3 of 10) 46414 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 231.667-66 chrX 43389436 43389720 + 1 NA Intergenic Intergenic 212584 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 218.333-112 chr7 4331963 4332313 + 1 NA Intergenic Intergenic -197301 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 167.333-279 chrX 49859745 49859912 + 1 NA Intergenic Intergenic 19528 NR_026742 158572 Hs.408191 NM_001025449 ENSG00000234390 USP27X-AS1 - USP27X antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 162.333-84 chr15 58667960 58668140 + 1 NA intron (NM_001320570, intron 4 of 14) intron (NM_001320570, intron 4 of 14) 25557 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 248.667-22 chr11 97631714 97632011 + 1 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 1123437 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 218.333-83 chr3 38237303 38237675 + 1 NA intron (NM_005109, intron 11 of 17) intron (NM_005109, intron 11 of 17) -28323 NM_004256 9390 Hs.225941 NM_004256 ENSG00000172940 SLC22A13 OAT10|OCTL1|OCTL3|ORCTL-3|ORCTL3 solute carrier family 22 member 13 protein-coding 205.333-267 chrX 99680683 99681169 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 729347 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 186.333-48 chr14 46906039 46906358 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) intron (NM_001113498, intron 10 of 16) -254417 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 246.333-46 chr2 12004858 12005322 + 1 NA Intergenic Intergenic -2026 NR_110196 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 157.667-284 chr6 73980057 73980331 + 1 NA Intergenic Intergenic -89257 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 274.667-52 chr7 104699192 104699485 + 1 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1MB3|LINE|L1 104754 NR_034142 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 159.667-134 chr17 48249463 48249767 + 1 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) AluJb|SINE|Alu -44732 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 195.667-140 chr8 80561544 80561832 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 75462 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 137.333-163 chr5 155200687 155200891 + 1 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 187034 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 341.333-16 chr4 47517071 47517708 + 1 NA intron (NM_020453, intron 3 of 22) AluSx3|SINE|Alu 32114 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 297.667-4 chr10 27886243 27886621 + 1 NA intron (NM_001290021, intron 10 of 13) L1M4|LINE|L1 95439 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 286.667-27 chr4 44641656 44642225 + 1 NA intron (NM_182592, intron 2 of 5) intron (NM_182592, intron 2 of 5) 9701 NM_182592 285525 Hs.596000 NM_182592 ENSG00000177752 YIPF7 FinGER9 Yip1 domain family member 7 protein-coding 278.667-33 chr3 61659767 61660103 + 1 NA intron (NM_002841, intron 1 of 29) intron (NM_002841, intron 1 of 29) 98364 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 122.667-155 chr5 108300581 108300746 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 4 of 8) intron (NM_001163315, intron 4 of 8) 81435 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 158.333-278 chr6 113246254 113246485 + 1 NA Intergenic Intergenic 187078 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 159.667-145 chr18 5365085 5365280 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -68129 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 143.333-217 chr5 19797467 19797629 + 1 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) L1MDa|LINE|L1 88724 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 145.333-260 chr6 78937627 78937859 + 1 NA 3' UTR (NM_017934, exon 40 of 40) 3' UTR (NM_017934, exon 40 of 40) 70192 NM_001010844 134728 Hs.656212 NM_001010844 ENSG00000146243 IRAK1BP1 AIP70|SIMPL interleukin 1 receptor associated kinase 1 binding protein 1 protein-coding 322.667-39 chr9 127639103 127639562 + 1 NA intron (NM_001032221, intron 1 of 18) AluSx1|SINE|Alu 27055 NM_001032221 6812 Hs.288229 NM_003165 ENSG00000136854 STXBP1 MUNC18-1|NSEC1|P67|RBSEC1|UNC18 syntaxin binding protein 1 protein-coding 148.667-133 chr15 55907833 55908001 + 1 NA intron (NM_001329212, intron 5 of 28) intron (NM_001329212, intron 5 of 28) 9214 NM_198400 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 168.667-181 chr5 137038885 137039092 + 1 NA intron (NM_004598, intron 6 of 10) intron (NM_004598, intron 6 of 10) -89209 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 143.667-217 chr6 70407214 70407469 + 1 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -6063 NM_001351599 57579 Hs.211700 NM_020819 ENSG00000082269 FAM135A KIAA1411 family with sequence similarity 135 member A protein-coding 145.333-201 chr3 125478442 125478640 + 1 NA intron (NM_003794, intron 7 of 13) MER103C|DNA|hAT-Charlie 41661 NM_003794 8723 Hs.507243 NM_003794 ENSG00000114520 SNX4 ATG24B sorting nexin 4 protein-coding 194.333-91 chr4 23739299 23739719 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 141783 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 201.667-47 chr18 1561311 1561681 + 1 NA Intergenic Intergenic -201867 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 126.333-184 chr9 11811980 11812159 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -881316 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 182.667-112 chr4 13930493 13930728 + 1 NA non-coding (NR_121681, exon 4 of 4) non-coding (NR_121681, exon 4 of 4) -181358 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 185.333-74 chr18 22607379 22607684 + 1 NA Intergenic Intergenic 179306 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 146.667-160 chr2 57367280 57367540 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -540241 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 221.667-10 chr11 11800784 11801234 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17787 NR_107037 102465870 NR_107037 ENSG00000278529 MIR8070 hsa-mir-8070 microRNA 8070 ncRNA 309.667-17 chr4 61119223 61119690 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24200 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 299.333-58 chr5 35053895 35054305 + 1 NA intron (NM_001204318, intron 6 of 6) L1ME3Cz|LINE|L1 -6151 NM_001306173 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 140.333-55 chr13 64574795 64574960 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -498866 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 142.667-135 chr3 17560966 17561130 + 1 NA intron (NM_001349075, intron 1 of 22) L1ME3B|LINE|L1 138972 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 171.667-100 chr21 25913162 25913395 + 1 NA intron (NM_001136131, intron 11 of 15) intron (NM_001136131, intron 11 of 15) -177624 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 153.333-71 chr11 92106855 92107099 + 1 NA Intergenic Intergenic -118057 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 156.333-12 chr1 61423803 61423975 + 1 NA intron (NM_005595, intron 9 of 9) intron (NM_005595, intron 9 of 9) -170371 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 372.333-15 chr3 189366539 189367116 + 1 NA Intergenic Intergenic -126233 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 148.333-288 chr4 72552731 72552979 + 1 NA intron (NM_014243, intron 2 of 21) L2a|LINE|L2 16366 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 176.333-48 chr14 52527742 52528010 + 1 NA intron (NM_020784, intron 6 of 20) intron (NM_020784, intron 6 of 20) 24629 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 135.667-97 chr2 105729974 105730122 + 1 NA Intergenic Intergenic -14864 NM_003581 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 130.333-135 chr3 103798261 103798475 + 1 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -274252 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 172.667-46 chr12 113319752 113320006 + 1 NA intron (NM_001330466, intron 6 of 14) AluJo|SINE|Alu 15230 NM_001330466 80024 Hs.286194 NM_024959 ENSG00000089060 SLC8B1 NCKX6|NCLX|SLC24A6 solute carrier family 8 member B1 protein-coding 217.333-68 chr2 171330113 171330443 + 1 NA intron (NM_001321158, intron 6 of 8) intron (NM_001321158, intron 6 of 8) -98985 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 230.667-62 chr4 133489127 133489472 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 340005 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 322.333-9 chr14 63394892 63395272 + 1 NA intron (NR_104104, intron 6 of 12) intron (NR_104104, intron 6 of 12) -76147 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 127.333-125 chr3 192990485 192990687 + 1 NA Intergenic Intergenic -72730 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 158.667-7 chr1 52941221 52941415 + 1 NA intron (NM_001193617, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 14042 NM_001193617 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 239.333-75 chr4 47931299 47931571 + 1 NA intron (NR_125879, intron 1 of 2) intron (NR_125879, intron 1 of 2) -16768 NR_103795 152518 Hs.646325 NM_152995 ENSG00000170448 NFXL1 CDZFP|HOZFP|OZFP|URCC5 nuclear transcription factor, X-box binding like 1 protein-coding 189.667-63 chr18 7031901 7032244 + 1 NA exon (NM_005559, exon 16 of 63) exon (NM_005559, exon 16 of 63) 77395 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 161.667-100 chr16 86162202 86162410 + 1 NA Intergenic Intergenic -33875 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 162.667-65 chr12 115272118 115272308 + 1 NA Intergenic Intergenic -588038 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 271.333-68 chr8 75289192 75289662 + 1 NA Intergenic Intergenic -10538 NR_103849 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 156.333-94 chr13 71656752 71656981 + 1 NA intron (NM_080759, intron 2 of 10) (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 210326 NM_004392 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 163.333-116 chr16 78529832 78530119 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) LTR1D1|LTR|ERV1 430321 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 132.667-55 chr14 72530701 72530946 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 15 of 16) intron (NM_001370288, intron 15 of 16) 14003 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 160.333-268 chr7 113532407 113532725 + 1 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 386443 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 139.667-109 chr22 28731702 28731857 + 1 NA intron (NM_001005735, intron 2 of 15) AluJo|SINE|Alu 10041 NM_001005735 11200 Hs.291363 NM_007194 ENSG00000183765 CHEK2 CDS1|CHK2|HuCds1|LFS2|PP1425|RAD53|hCds1 checkpoint kinase 2 protein-coding 203.333-121 chr2 10338922 10339220 + 1 NA intron (NM_001258357, intron 1 of 4) L1MC5|LINE|L1 8908 NM_001258357 3241 Hs.580427 NM_002149 ENSG00000115756 HPCAL1 BDR1|HLP2|VILIP-3 hippocalcin like 1 protein-coding 248.667-89 chr6 36419861 36420182 + 1 NA intron (NM_152990, intron 3 of 4) intron (NM_152990, intron 3 of 4) -22746 NM_001286580 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 326.667-14 chr15 61194985 61195490 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 34065 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 147.333-201 chr22 21838472 21838752 + 1 NA intron (NM_002745, intron 1 of 8) L1MB7|LINE|L1 29068 NM_138957 5594 Hs.431850 NM_002745 ENSG00000100030 MAPK1 ERK|ERK-2|ERK2|ERT1|MAPK2|P42MAPK|PRKM1|PRKM2|p38|p40|p41|p41mapk|p42-MAPK mitogen-activated protein kinase 1 protein-coding 128.667-20 chr10 14776679 14776807 + 1 NA Intergenic Intergenic -1846 NM_001282695 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 177.667-89 chr3 86868773 86868983 + 1 NA Intergenic Intergenic 122271 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 144.667-305 chr8 125179119 125179368 + 1 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) intron (NR_146191, intron 5 of 8) 87383 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 186.333-9 chr1 214915475 214915917 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -89846 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 151.667-7 chr1 64337947 64338245 + 1 NA Intergenic Intergenic -132033 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 235.667 chr1 11066496 11066774 + 1 NA TTS (NM_001001998) TTS (NM_001001998) -6617 NM_003132 6723 Hs.76244 NM_003132 ENSG00000116649 SRM PAPT|SPDSY|SPS1|SRML1 spermidine synthase protein-coding 167.333-21 chr1 164375718 164375899 + 1 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -183552 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 159.333-234 chr4 44667453 44667706 + 1 NA Intergenic Intergenic -10816 NM_001345868 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 251.333-61 chr2 185506835 185507157 + 1 NA Intergenic Intergenic 231723 NR_110216 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 150.667-107 chr13 85911454 85911651 + 1 NA Intergenic Intergenic -112133 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 148.667-324 chr5 161717786 161717981 + 1 NA Intergenic Intergenic 32162 NM_000811 2559 Hs.90791 NM_000811 ENSG00000145863 GABRA6 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha6 subunit protein-coding 149.333-441 chrX 74603939 74604089 + 1 NA intron (NM_016120, intron 1 of 3) AluSg|SINE|Alu 10610 NM_183353 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 167.333-187 chr4 46771893 46772172 + 1 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) L1MA9|LINE|L1 137213 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 300.667-51 chrX 67033486 67033998 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -394444 NM_001199687 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 143.333-294 chr8 127809622 127809809 + 1 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 13753 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 169.333-100 chr17 61010739 61010914 + 1 NA intron (NM_001353144, intron 16 of 25) intron (NM_001353144, intron 16 of 25) 332975 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 165.667-53 chr14 62751317 62751529 + 1 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) PRIMA41-int|LTR|ERV1 294035 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 163.667-186 chr4 113120328 113120656 + 1 NA intron (NM_001354237, intron 1 of 46) intron (NM_001354237, intron 1 of 46) 3795 NM_001354230 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 252.667-31 chr14 71953287 71953638 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) MER58B|DNA|hAT-Charlie 19935 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 332.333-16 chr2 193109025 193109701 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 359518 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 196.667-82 chr2 191903978 191904303 + 1 NA Intergenic Intergenic -57052 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 272.333-23 chr17 2420715 2421243 + 1 NA intron (NM_024086, intron 8 of 9) intron (NM_024086, intron 8 of 9) -5543 NR_028335 284009 Hs.632244 NM_001025459 LOC284009 - uncharacterized LOC284009 ncRNA 192.333-159 chr7 42498384 42498775 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 207868 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 145.667-128 chr2 26870782 26871069 + 1 NA intron (NM_001253724, intron 1 of 12) intron (NM_001253724, intron 1 of 12) 22501 NM_001253724 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 211.667-92 chr5 107501592 107502096 + 1 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 169093 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 241.333-54 chr2 76324167 76324458 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -613397 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 210.667-61 chr19 30393335 30393649 + 1 NA intron (NM_014717, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 21108 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 158.667-348 chr9 35915361 35915545 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 5963 NM_001348107 158376 Hs.302677 NM_001348107 ENSG00000235387 SPAAR LINC00961|SPAR small regulatory polypeptide of amino acid response protein-coding 239.333-60 chr2 186409057 186409445 + 1 NA Intergenic Intergenic -77009 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 171.333-68 chr18 7907173 7907469 + 1 NA intron (NM_002845, intron 4 of 30) intron (NM_002845, intron 4 of 30) 340005 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 121.333-61 chr15 62905581 62905816 + 1 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 81741 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 173.667-116 chr3 97418582 97418869 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 6 of 17) L1ME3F|LINE|L1 -20882 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 166.333-154 chr3 64645943 64646249 + 1 NA intron (NM_001318781, intron 10 of 38) intron (NM_001318781, intron 10 of 38) -38774 NR_038264 100507098 Hs.660881 NR_038264 ENSG00000241684 ADAMTS9-AS2 - ADAMTS9 antisense RNA 2 ncRNA 154.667-350 chr6 157061674 157061858 + 1 NA intron (NM_001363725, intron 2 of 17) intron (NM_001363725, intron 2 of 17) 25339 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 238.333-70 chr4 156721049 156721406 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 250572 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 214.333-35 chr12 83882444 83882892 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 1030131 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 258.667-19 chr11 27185793 27186244 + 1 NA intron (NR_125767, intron 2 of 4) MER20|DNA|hAT-Charlie 32750 NR_125768 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-194 chr2 107186986 107187182 + 1 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) L1PA13|LINE|L1 162441 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 172.333-54 chr14 74158930 74159162 + 1 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) intron (NM_001024674, intron 5 of 5) 74093 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 208.667-48 chr14 72221242 72221661 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 287924 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 150.667-347 chr7 3494285 3494458 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 193119 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 149.333-352 chr6 142352431 142352630 + 1 NA intron (NM_198569, intron 2 of 24) L1PA16|LINE|L1 50523 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 154.667-111 chr14 66170033 66170438 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -316136 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 172.333-69 chr18 3268822 3269067 + 1 NA intron (NM_001144945, intron 1 of 3) intron (NM_001144945, intron 1 of 3) 6225 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 131.667-15 chr1 242799978 242800148 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -275366 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 116.667-188 chr7 43006157 43006369 + 1 NA Intergenic Intergenic 73887 NR_156497 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 277.333-33 chr15 69466811 69467115 + 1 NA Intergenic Intergenic 14145 NM_213725 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 133.333-174 chr7 79633774 79633967 + 1 NA Intergenic Intergenic 179910 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 119.333-130 chr2 109008984 109009150 + 1 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu -19847 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 145.667-118 chr18 6300179 6300421 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) intron (NM_001365769, intron 4 of 16) 43556 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 162.667-123 chr2 25659137 25659374 + 1 NA intron (NM_033147, intron 1 of 19) L1MD|LINE|L1 -9033 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 173.333-29 chr10 64470904 64471147 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -354503 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 152.667-295 chr5 75143081 75143324 + 1 NA intron (NM_001164443, intron 14 of 24) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -90644 NM_001366737 51301 Hs.272404 NM_016591 ENSG00000176928 GCNT4 C2GNT3|LINC01336 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4 protein-coding 227.667-65 chr6 2119826 2120344 + 1 NA intron (NM_001253846, intron 2 of 10) intron (NM_001253846, intron 2 of 10) 55906 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 157.667-56 chr11 66776846 66777060 + 1 NA intron (NM_024650, intron 4 of 16) AluJb|SINE|Alu 32184 NM_001302084 79703 Hs.292088 NM_024650 ENSG00000173715 C11orf80 HYDM4|TOP6BL|TOPOVIBL chromosome 11 open reading frame 80 protein-coding 227.667-46 chr3 35492418 35492806 + 1 NA Intergenic Intergenic -98589 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 339.333-29 chr20 55555594 55556089 + 1 NA Intergenic Intergenic -128644 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 144.333-21 chr10 21830379 21830590 + 1 NA intron (NM_022365, intron 8 of 11) L1MB4|LINE|L1 173246 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 159.333-183 chr20 18778171 18778391 + 1 NA Intergenic Intergenic 15701 NR_026884 29075 Hs.584899 NM_014162 LINC00652 HSPC072 long intergenic non-protein coding RNA 652 ncRNA 167.667-51 chr12 112990269 112990649 + 1 NA intron (NM_002535, intron 2 of 9) MER4D|LTR|ERV1 11940 NM_002535 4939 Hs.414332 NM_002535 ENSG00000111335 OAS2 - 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2 protein-coding 168.333-214 chr8 127718441 127718731 + 1 NA intron (NR_117102, intron 1 of 3) L1ME4a|LINE|L1 15381 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 191.333-211 chr8 135481320 135481521 + 1 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) L2c|LINE|L2 23964 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 203.667-94 chr5 61557010 61557237 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -80637 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 147.667-266 chr4 166113660 166113911 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 240548 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 131.333-30 chr11 13715178 13715351 + 1 NA intron (NM_032228, intron 9 of 11) intron (NM_032228, intron 9 of 11) 46596 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 140.667-229 chr8 86906216 86906362 + 1 NA intron (NM_173538, intron 3 of 10) intron (NM_173538, intron 3 of 10) 39874 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 195.333-141 chr3 40284860 40285214 + 1 NA intron (NR_033965, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 24661 NR_033965 440952 Hs.660388 NR_033965 ENSG00000280739 EIF1B-AS1 - EIF1B antisense RNA 1 ncRNA 117.333-181 chr6 129148435 129148602 + 1 NA intron (NM_000426, intron 6 of 64) intron (NM_000426, intron 6 of 64) 265377 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 233.667-39 chr2 65794510 65794930 + 1 NA Intergenic Intergenic -362121 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 216.333-95 chr3 79252760 79253154 + 1 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -158770 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 145.667-26 chr10 13586417 13586605 + 1 NA promoter-TSS (NM_003675) promoter-TSS (NM_003675) -454 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 125.667-165 chr6 49532047 49532259 + 1 NA Intergenic Intergenic -18515 NR_146855 135398 Hs.722010 NM_153344 ENSG00000197261 C6orf141 - chromosome 6 open reading frame 141 protein-coding 140.333-3 chr1 49233971 49234216 + 1 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) intron (NM_001323575, intron 4 of 12) -23318 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 227.667-6 chr10 17359184 17359459 + 1 NA intron (NM_001004470, intron 4 of 7) intron (NM_001004470, intron 4 of 7) -27615 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 156.333-232 chr3 54617925 54618161 + 1 NA intron (NM_018398, intron 9 of 37) intron (NM_018398, intron 9 of 37) 21814 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 178.333-63 chr17 69356611 69356825 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -29585 NM_172232 23461 Hs.731824 NM_018672 ENSG00000154265 ABCA5 ABC13|EST90625|HTC3 ATP binding cassette subfamily A member 5 protein-coding 157.667-166 chr2 239614189 239614389 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -148571 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 194.667-125 chr5 124736890 124737183 + 1 NA intron (NM_020747, intron 1 of 8) intron (NM_020747, intron 1 of 8) 8076 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 165.333-170 chr3 88313063 88313283 + 1 NA Intergenic Intergenic -25283 NM_001368168 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 320.333-14 chr2 127207182 127207797 + 1 NA intron (NM_001367502, intron 1 of 8) AluSq2|SINE|Alu -1722 NM_001001665 339761 Hs.407639 NM_001001665 ENSG00000186684 CYP27C1 - cytochrome P450 family 27 subfamily C member 1 protein-coding 198.667-10 chr1 188197470 188197691 + 1 NA Intergenic Intergenic 753952 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 172.667-174 chrX 44433008 44433311 + 1 NA Intergenic Intergenic -89487 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 225.333-22 chr11 22143273 22143652 + 1 NA Intergenic Intergenic -49623 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 245.667-49 chr4 47875053 47875525 + 1 NA exon (NM_001278624, exon 18 of 23) exon (NM_001278624, exon 18 of 23) -37183 NM_001278585 10699 Hs.518618 NM_006587 ENSG00000145244 CORIN ATC2|CRN|Lrp4|PEE5|TMPRSS10 corin, serine peptidase protein-coding 157.333-82 chr12 39838483 39838740 + 1 NA intron (NM_052885, intron 6 of 9) intron (NM_052885, intron 6 of 9) 212428 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 143.333-54 chr11 84340743 84340943 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -23504 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 196.333-50 chr15 62569843 62570128 + 1 NA Intergenic Intergenic 75196 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 135.667-190 chr8 126359799 126359967 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 34388 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 220.667-87 chr5 133300879 133301257 + 1 NA intron (NM_015082, intron 6 of 15) intron (NM_015082, intron 6 of 15) 126638 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 149.667-254 chr3 15016204 15016457 + 1 NA intron (NM_003298, intron 5 of 14) intron (NM_003298, intron 5 of 14) 48985 NM_022497 64432 Hs.657764 NM_022497 ENSG00000131368 MRPS25 MRP-S25|RPMS25 mitochondrial ribosomal protein S25 protein-coding 244.667-99 chr9 17565785 17566074 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -13137 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 160.667-258 chr6 7625723 7625990 + 1 NA Intergenic (TTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 35658 NM_152551 154007 Hs.13366 NM_152551 ENSG00000168566 SNRNP48 C6orf151|dJ336K20B.1|dJ512B11.2 small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 48 protein-coding 178.667-36 chr12 52311655 52311872 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 9635 NM_002282 3889 Hs.720768 NM_002282 ENSG00000170523 KRT83 EKVP5|HB3|Hb-3|KRTHB3|MNLIX keratin 83 protein-coding 205.333-82 chr15 66639859 66640338 + 1 NA intron (NR_110372, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR 57908 NR_110372 102723165 Hs.636703 NR_110372 ENSG00000259471 LINC01169 - long intergenic non-protein coding RNA 1169 ncRNA 195.333-194 chr6 74532813 74533103 + 1 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 463507 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 177.333-45 chr13 74268390 74268665 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 37083 NR_144451 100507612 Hs.447508 NR_144451 ENSG00000235532 LINC00402 - long intergenic non-protein coding RNA 402 ncRNA 205.333-63 chr12 128137185 128137502 + 1 NA Intergenic Intergenic 19126 NR_104648 101927694 Hs.524849 NR_104648 ENSG00000256659 LINC02368 - long intergenic non-protein coding RNA 2368 ncRNA 124.333-21 chr10 98155598 98155758 + 1 NA intron (NM_001351012, intron 1 of 8) HAL1|LINE|L1 21021 NM_014472 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 115.333-39 chr11 127349835 127349975 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 78835 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 181.667-27 chr12 18065949 18066173 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 24132 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 134.667-164 chr5 115188244 115188465 + 1 NA Intergenic Intergenic -7808 NM_001017398 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 251.667-88 chr7 93517452 93517889 + 1 NA intron (NM_001164737, intron 2 of 15) intron (NM_001164737, intron 2 of 15) -33651 NR_030164 574442 NR_030164 ENSG00000207656 MIR489 MIRN489|hsa-mir-489|mir-489 microRNA 489 ncRNA 223.667-88 chr8 135479877 135480173 + 1 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 22569 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 147.667-365 chr8 105480461 105480664 + 1 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 161019 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 243.333-29 chr14 47652023 47652359 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 22763 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 146.333-318 chr8 53847389 53847653 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -4210 NM_213619 51606 Hs.491737 NM_015941 ENSG00000047249 ATP6V1H CGI-11|MSTP042|NBP1|SFD|SFDalpha|SFDbeta|VMA13 ATPase H+ transporting V1 subunit H protein-coding 167.667-12 chr1 202998365 202998685 + 1 NA intron (NR_036557, intron 1 of 4) intron (NR_036557, intron 1 of 4) 8740 NR_036557 100506747 Hs.642024 NR_036557 LOC100506747 - alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog pseudo 143.667-192 chr4 166117115 166117332 + 1 NA Intergenic Intergenic 243986 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 241.667-73 chr5 52147257 52147693 + 1 NA Intergenic Intergenic 139444 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 141.333-121 chr2 188186993 188187218 + 1 NA intron (NR_126396, intron 1 of 2) MIRc|SINE|MIR 100586 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 157.667-241 chr5 44780705 44780865 + 1 NA intron (NR_109863, intron 1 of 3) intron (NR_109863, intron 1 of 3) 28008 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 156.333-241 chr3 99682858 99683065 + 1 NA intron (NM_001850, intron 2 of 4) intron (NM_001850, intron 2 of 4) 44367 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 138.667-44 chr12 24710235 24710476 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -126187 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 243.333-38 chr16 71296806 71297302 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -7332 NM_001324377 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 177.333-167 chr8 80125816 80126058 + 1 NA intron (NR_105035, intron 1 of 6) intron (NR_105035, intron 1 of 6) -45106 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 158.667-308 chr7 83183997 83184222 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -21225 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 137.667-89 chr2 22753169 22753390 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 216800 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 221.333-96 chr3 115383482 115383792 + 1 NA Intergenic Intergenic -236349 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 304.333-5 chr1 233377824 233378351 + 1 NA intron (NM_032435, intron 8 of 9) MER1A|DNA|hAT-Charlie 50363 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 152.333-339 chr6 136424404 136424670 + 1 NA intron (NM_001198617, intron 1 of 15) intron (NM_001198617, intron 1 of 15) 42338 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 169.333-269 chr8 102697342 102697516 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 41181 NR_160672 101927245 NR_160672 LOC101927245 - uncharacterized LOC101927245 ncRNA 130.667-147 chr3 123873568 123873727 + 1 NA intron (NM_001321309, intron 2 of 32) intron (NM_001321309, intron 2 of 32) 10685 NM_053025 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 263.667-68 chr5 177530665 177531197 + 1 NA intron (NM_001190946, intron 5 of 8) L2c|LINE|L2 -13970 NM_001321732 51428 Hs.484288 NM_016222 ENSG00000183258 DDX41 ABS|MPLPF DEAD-box helicase 41 protein-coding 134.333-70 chr17 4085908 4086080 + 1 NA intron (NM_015113, intron 15 of 54) intron (NM_015113, intron 15 of 54) 57036 NM_015113 23140 Hs.277624 NM_015113 ENSG00000074755 ZZEF1 ZZZ4 zinc finger ZZ-type and EF-hand domain containing 1 protein-coding 148.333-329 chr5 124018867 124019099 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 419537 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 164.667-104 chr2 38956379 38956610 + 1 NA intron (NM_001145451, intron 11 of 15) intron (NM_001145451, intron 11 of 15) 3850 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 132.333-14 chr10 23865246 23865406 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) L1ME3G|LINE|L1 170599 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 204.333-86 chr18 79139675 79139905 + 1 NA intron (NR_148360, intron 5 of 31) L1MA2|LINE|L1 70396 NM_001306085 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 174.333-121 chr5 95682009 95682237 + 1 NA intron (NR_125328, intron 2 of 7) intron (NR_125328, intron 2 of 7) 868 NM_031952 83890 Hs.50499 NM_031952 ENSG00000145757 SPATA9 NYD-SP16 spermatogenesis associated 9 protein-coding 263.333-71 chr5 43126701 43127021 + 1 NA intron (NM_001330705, intron 3 of 5) L1MD2|LINE|L1 5296 NM_001330713 7690 Hs.535804 NM_003432 ENSG00000172262 ZNF131 ZBTB35|pHZ-10 zinc finger protein 131 protein-coding 149.667-81 chr11 115273131 115273298 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -60363 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 162.333-139 chr20 52036538 52036762 + 1 NA Intergenic Intergenic 68834 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 201.667-75 chr3 43294865 43295175 + 1 NA intron (NM_001330750, intron 1 of 4) intron (NM_001330750, intron 1 of 4) 8480 NM_017719 54861 Hs.476052 NM_017719 ENSG00000163788 SNRK HSNFRK SNF related kinase protein-coding 192.667-84 chr2 41108598 41108997 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -596362 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 131.667-22 chr10 53752901 53753070 + 1 NA Intergenic Intergenic -733245 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 173.333-102 chr2 172574099 172574401 + 1 NA intron (NM_002610, intron 8 of 10) L1MB7|LINE|L1 18160 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 132.333-111 chr3 54786990 54787278 + 1 NA intron (NM_018398, intron 13 of 37) intron (NM_018398, intron 13 of 37) 114121 NR_046666 100874237 Hs.570583 NR_046666 ENSG00000243715 CACNA2D3-AS1 - CACNA2D3 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-90 chr13 40167111 40167368 + 1 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -14570 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 208.333-134 chr6 154588926 154589252 + 1 NA Intergenic Intergenic -78404 NM_001368117 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 335.667-16 chr22 25174092 25174587 + 1 NA exon (NM_001145206, exon 6 of 11) exon (NM_001145206, exon 6 of 11) -25519 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 259.667-86 chr8 83756739 83757194 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 353208 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 163.667-184 chr4 107323424 107323643 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -287220 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 163.667-253 chr8 114703580 114703773 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 964337 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 233.667-49 chr22 17552788 17553061 + 1 NA 3' UTR (NM_001290047, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001290047, exon 19 of 19) -10515 NM_001303484 83733 Hs.282982 NM_031481 ENSG00000182902 SLC25A18 GC2 solute carrier family 25 member 18 protein-coding 190.333-11 chr1 191774824 191775211 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -383445 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 402.333 chr1 119061685 119062398 + 1 NA intron (NR_126447, intron 1 of 1) LTR87|LTR|ERVL? 14636 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 117.667-150 chr5 31306624 31306778 + 1 NA intron (NM_001362435, intron 7 of 10) L2a|LINE|L2 113015 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 136.333-162 chr5 29671859 29672015 + 1 NA Intergenic Intergenic -208623 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 150.667-181 chr2 97689186 97689449 + 1 NA intron (NR_038386, intron 6 of 9) intron (NR_038386, intron 6 of 9) 19574 NM_001351368 728537 Hs.469369 NM_001351368 ENSG00000228486 C2orf92 LINC01125 chromosome 2 open reading frame 92 protein-coding 157.333-150 chr17 50757988 50758229 + 1 NA Intergenic Intergenic 9410 NM_001358683 55018 Hs.389460 NM_017928 ENSG00000167117 ANKRD40CL C17orf73|LINC00483 ANKRD40 C-terminal like protein-coding 177.333-27 chr11 76489112 76489396 + 1 NA intron (NM_001300942, intron 9 of 21) intron (NM_001300942, intron 9 of 21) 44229 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 148.667-178 chr2 40359593 40359844 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 70586 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 253.333-96 chr7 12197762 12198053 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13387 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 219.333-26 chr10 55646624 55647117 + 1 NA Intergenic Intergenic -18928 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 134.667-94 chr2 13469420 13469601 + 1 NA Intergenic Intergenic -462497 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 122.333-138 chr3 112538341 112538501 + 1 NA intron (NM_001278712, intron 7 of 10) intron (NM_001278712, intron 7 of 10) -22899 NM_001348906 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 245.333 chr1 22893754 22894304 + 1 NA intron (NM_001309192, intron 7 of 13) intron (NM_001309192, intron 7 of 13) -30803 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 170.333-103 chr19 29517716 29517908 + 1 NA intron (NR_040029, intron 1 of 9) intron (NR_040029, intron 1 of 9) 7940 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 146.667-184 chr2 193579938 193580085 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -764258 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 173.667-47 chr14 71995760 71996019 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 62362 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 134.667-142 chr3 193265247 193265426 + 1 NA intron (NM_020386, intron 3 of 3) L1MB8|LINE|L1 23557 NR_026877 84789 Hs.676481 NM_032703 MGC2889 - uncharacterized protein MGC2889 ncRNA 145.667-48 chr11 60120442 60120640 + 1 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 31877 NM_000139 2206 Hs.386748 NM_000139 ENSG00000149534 MS4A2 APY|ATOPY|FCER1B|FCERI|IGEL|IGER|IGHER|MS4A1 membrane spanning 4-domains A2 protein-coding 179.667-101 chr4 85535863 85536262 + 1 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 60912 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 155.667-50 chr11 38146331 38146625 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 207877 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 155.667-22 chr1 160444682 160444907 + 1 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 44230 NM_020335 57216 Hs.99477 NM_020335 ENSG00000162738 VANGL2 LPP1|LTAP|STB1|STBM|STBM1 VANGL planar cell polarity protein 2 protein-coding 264.667-93 chr9 98584715 98585268 + 1 NA intron (NM_005458, intron 1 of 18) intron (NM_005458, intron 1 of 18) 123944 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 132.333-55 chr14 89026062 89026222 + 1 NA Intergenic Intergenic 201491 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 167.333-162 chr22 26267275 26267519 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 97923 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 178.333-148 chr6 39670824 39671035 + 1 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) intron (NM_001289020, intron 3 of 21) 54479 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 152.333-393 chr8 140706498 140706740 + 1 NA intron (NR_148037, intron 25 of 34) AluSz6|SINE|Alu 11950 NM_001352749 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 211.667-53 chr2 14424992 14425374 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -24225 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 144.667-204 chr3 154736441 154736635 + 1 NA Intergenic Intergenic -287586 NM_001354642 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 262.333-22 chr13 65573822 65574264 + 1 NA Intergenic Intergenic -292004 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 211.667-21 chr10 75147515 75147825 + 1 NA intron (NM_144660, intron 1 of 4) intron (NM_144660, intron 1 of 4) 36014 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 199.667-90 chr3 14639381 14639771 + 1 NA Intergenic Intergenic -12170 NR_135523 51244 Hs.517820 NM_016474 ENSG00000154781 CCDC174 C3orf19|HSPC212|IHPM|IHPMR coiled-coil domain containing 174 protein-coding 152.333-321 chr5 157776876 157777042 + 1 NA Intergenic Intergenic 33247 NM_173491 134353 Hs.23648 NM_173491 ENSG00000155858 LSM11 - LSM11, U7 small nuclear RNA associated protein-coding 147.333-67 chr11 48029622 48029812 + 1 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) 49158 NM_001098503 5795 Hs.318547 NM_002843 ENSG00000149177 PTPRJ CD148|DEP1|HPTPeta|R-PTP-ETA|SCC1 protein tyrosine phosphatase receptor type J protein-coding 148.667-58 chr10 106305786 106305935 + 1 NA Intergenic Intergenic 165695 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 152.333-67 chr11 88786013 88786278 + 1 NA intron (NM_001143831, intron 2 of 8) intron (NM_001143831, intron 2 of 8) 261927 NM_001143831 2915 Hs.147361 NM_000842 ENSG00000168959 GRM5 GPRC1E|MGLUR5|PPP1R86|mGlu5 glutamate metabotropic receptor 5 protein-coding 159.667-31 chr1 199123328 199123631 + 1 NA Intergenic Intergenic -25119 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 204.667-122 chr5 68343724 68344062 + 1 NA Intergenic Intergenic 51316 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 166.333-3 chr1 40195018 40195283 + 1 NA intron (NM_012421, intron 3 of 7) intron (NM_012421, intron 3 of 7) 33763 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 154.667-129 chr16 48361928 48362147 + 1 NA exon (NM_001006610, exon 2 of 2) exon (NM_001006610, exon 2 of 2) 3850 NM_001006610 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 147.667-83 chr12 124019139 124019430 + 1 NA intron (NM_001347902, intron 2 of 4) L1MEi|LINE|L1 46069 NM_001204298 144348 Hs.524828 NM_152437 ENSG00000179195 ZNF664 ZFOC1|ZNF176 zinc finger protein 664 protein-coding 162.667-37 chr10 114814472 114814646 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7221 NM_020940 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 193.667-100 chr5 36712784 36713056 + 1 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 106314 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 319.666-8 chr14 54407534 54408234 + 1 NA intron (NM_001330173, intron 3 of 8) L1P2|LINE|L1 10877 NM_005192 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 260.667-74 chr5 45784197 45784665 + 1 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 -88051 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 272.333-16 chr15 24003061 24003398 + 1 NA intron (NR_126392, intron 3 of 5) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 28082 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 202.333-134 chr5 7662243 7662567 + 1 NA intron (NM_020546, intron 4 of 24) intron (NM_020546, intron 4 of 24) 188728 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 336.333-20 chr2 82456699 82457137 + 1 NA Intergenic Intergenic -399885 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 150.333-258 chr3 34749040 34749289 + 1 NA Intergenic Intergenic 644859 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 159.333-333 chr8 111259003 111259190 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -22893 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 160.667-299 chr8 48013941 48014185 + 1 NA intron (NM_003350, intron 1 of 3) intron (NM_003350, intron 1 of 3) 5632 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 414.667-2 chr11 112565444 112565887 + 1 NA Intergenic Intergenic -9863 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 161.667-214 chr5 148239343 148239513 + 1 NA intron (NM_001363511, intron 1 of 1) intron (NM_001363511, intron 1 of 1) 903 NM_001363511 105378220 Hs.534838 NM_001363511 ENSG00000248109 MARCOL - MARCO like protein-coding 159.333-361 chrX 64933452 64933630 + 1 NA intron (NM_001178032, intron 1 of 4) L1PBa|LINE|L1 42909 NM_018684 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 300.667-41 chr8 51161620 51162107 + 1 NA Intergenic Intergenic 647582 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 135.667-132 chr4 91902570 91902758 + 1 NA Intergenic LTR80B|LTR|ERVL 374638 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 190.667-17 chr10 57675686 57676104 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -371336 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 242.667-62 chr21 33293340 33293649 + 1 NA intron (NM_000628, intron 6 of 6) intron (NM_000628, intron 6 of 6) 27127 NM_000628 3588 Hs.654593 NM_000628 ENSG00000243646 IL10RB CDW210B|CRF2-4|CRFB4|D21S58|D21S66|IL-10R2 interleukin 10 receptor subunit beta protein-coding 357.333-12 chr22 27366993 27367556 + 1 NA Intergenic Intergenic 56623 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 137.333-149 chr5 21042659 21042827 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -416737 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 224.667-64 chr5 95997439 95997696 + 1 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 35566 NR_130776 101929710 NR_130776 ENSG00000251314 LOC101929710 - uncharacterized LOC101929710 ncRNA 175.667-72 chr2 112180179 112180415 + 1 NA intron (NM_001128165, intron 4 of 6) L1PA14|LINE|L1 41912 NM_001128165 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 157.333-48 chr10 61083632 61083872 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 67477 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 175.667-22 chr11 19152276 19152528 + 1 NA intron (NM_019028, intron 7 of 16) intron (NM_019028, intron 7 of 16) 35234 NM_019028 54503 Hs.188569 NM_019028 ENSG00000177054 ZDHHC13 HIP14L|HIP3RP zinc finger DHHC-type containing 13 protein-coding 268.333-48 chr5 122533198 122533648 + 1 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 51177 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 166.333-25 chr10 34992164 34992340 + 1 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 82031 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 169.667-68 chr15 25993270 25993497 + 1 NA intron (NR_040082, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 91023 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 148.333-376 chr8 22828288 22828567 + 1 NA intron (NM_001363233, intron 3 of 6) L2b|LINE|L2 -49545 NR_125433 101929237 Hs.677838 NR_125433 ENSG00000248738 LOC101929237 - uncharacterized LOC101929237 ncRNA 150.667-256 chr4 33292489 33292753 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 747272 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 210.667-103 chr5 43515149 43515533 + 1 NA promoter-TSS (NM_198566) promoter-TSS (NM_198566) -193 NM_198566 375444 Hs.661641 NM_198566 ENSG00000172244 C5orf34 - chromosome 5 open reading frame 34 protein-coding 156.667-154 chr18 12109657 12109874 + 1 NA intron (NM_001277333, intron 8 of 13) MER58A|DNA|hAT-Charlie 15922 NM_001277333 342850 Hs.448906 NM_001277333 ENSG00000181626 ANKRD62 DKFZp779B1634 ankyrin repeat domain 62 protein-coding 140.667-94 chr17 5289407 5289570 + 1 NA intron (NM_001291581, intron 1 of 16) intron (NM_001291581, intron 1 of 16) 7204 NM_001291582 9135 Hs.584784 NM_004703 ENSG00000029725 RABEP1 RAB5EP|RABPT5 rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 protein-coding 151.333-393 chr7 82044907 82045115 + 1 NA intron (NM_000722, intron 10 of 38) intron (NM_000722, intron 10 of 38) 35834 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 160.333-73 chr12 32141031 32141326 + 1 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) intron (NR_148725, intron 1 of 9) 34331 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 155.333-232 chr3 82121210 82121513 + 1 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 135219 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 206.333-61 chr15 96938979 96939371 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 155740 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 145.667-228 chr5 107048914 107049161 + 1 NA Intergenic Intergenic -38023 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 147.667-356 chr8 76842215 76842435 + 1 NA intron (NM_024721, intron 5 of 10) intron (NM_024721, intron 5 of 10) 124525 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 277.667-3 chr1 170346109 170346431 + 1 NA Intergenic Intergenic -62062 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 146.667-106 chr14 63833488 63833768 + 1 NA Intergenic Intergenic -19337 NM_182914 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 169.333-27 chr10 73106341 73106587 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -3911 NM_001283017 25961 Hs.533657 NM_015901 ENSG00000166321 NUDT13 - nudix hydrolase 13 protein-coding 224.667-62 chr4 145120648 145121032 + 1 NA intron (NM_002940, intron 11 of 17) intron (NM_002940, intron 11 of 17) -22299 NM_001256708 10393 Hs.480876 NM_014885 ENSG00000164162 ANAPC10 APC10|DOC1 anaphase promoting complex subunit 10 protein-coding 260.333-20 chr14 64750483 64750790 + 1 NA TTS (NM_001308147) TTS (NM_001308147) 35050 NR_107009 102465841 NR_107009 ENSG00000284269 MIR7855 hsa-mir-7855 microRNA 7855 ncRNA 152.667-267 chr4 35042719 35043013 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -773119 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 177.333-62 chr15 94104693 94104881 + 1 NA intron (NR_120320, intron 1 of 8) intron (NR_120320, intron 1 of 8) 3151 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 213.667-6 chr1 194605988 194606462 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 1301480 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 238.333-94 chr8 139504609 139505106 + 1 NA Intergenic Intergenic 198266 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 194.333-54 chr17 66093849 66094197 + 1 NA intron (NM_001302891, intron 6 of 24) L1MA8|LINE|L1 97869 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 163.333-59 chr11 106488457 106488669 + 1 NA Intergenic Intergenic 237156 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 159.333-187 chr20 43469616 43469906 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 11865 NM_006275 6431 Hs.684950 NM_006275 ENSG00000124193 SRSF6 B52|HEL-S-91|SFRS6|SRP55 serine and arginine rich splicing factor 6 protein-coding 166.333-209 chr7 16076419 16076630 + 1 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -133962 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 241.333-84 chr5 126265282 126265682 + 1 NA Intergenic LTR27E|LTR|ERV1 19693 NR_105040 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 143.667-5 chr1 43039725 43039976 + 1 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 80801 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 197.333-109 chr2 62180686 62180990 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15277 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 196.667-175 chrX 38297912 38298131 + 1 NA intron (NR_159804, intron 10 of 16) AluSz|SINE|Alu 28931 NR_159808 6103 Hs.61438 NM_000328 ENSG00000156313 RPGR COD1|CORDX1|CRD|PCDX|RP15|RP3|XLRP3|orf15 retinitis pigmentosa GTPase regulator protein-coding 174.333-141 chr7 82591712 82591898 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -147849 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 151.667-64 chr11 63687301 63687516 + 1 NA intron (NR_049750, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 5908 NM_001265591 10313 Hs.743229 NM_006054 ENSG00000133318 RTN3 ASYIP|HAP|NSPL2|NSPLII|RTN3-A1 reticulon 3 protein-coding 208.333-15 chr10 30098536 30098830 + 1 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) intron (NM_001350022, intron 1 of 4) 16811 NM_001350021 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 147.667-136 chr17 34607738 34607942 + 1 NA intron (NM_001304438, intron 1 of 8) MER21C|LTR|ERVL 27091 NM_001304438 124842 Hs.310482 NM_207313 ENSG00000181291 TMEM132E DFNB99 transmembrane protein 132E protein-coding 183.667-7 chr1 92597671 92597985 + 1 NA intron (NM_001350198, intron 18 of 19) AluJr|SINE|Alu -110903 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 282.667-47 chr8 11294602 11295003 + 1 NA intron (NM_015458, intron 1 of 9).2 intron (NM_015458, intron 1 of 9).2 9986 NM_015458 66036 Hs.591395 NM_015458 ENSG00000104643 MTMR9 C8orf9|LIP-STYX|MTMR8 myotubularin related protein 9 protein-coding 165.667-11 chr1 210767648 210767819 + 1 NA intron (NM_002238, intron 10 of 10) intron (NM_002238, intron 10 of 10) 365641 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 145.333-7 chr1 107131804 107131987 + 1 NA Intergenic Intergenic -8193 NM_014917 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 251.333-78 chr3 90562176 90562474 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1454704 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 156.667-80 chr12 41720512 41720691 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -43588 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 251.667-56 chr22 35441459 35441747 + 1 NA Intergenic Intergenic 41463 NM_006739 4174 Hs.517582 NM_006739 ENSG00000100297 MCM5 CDC46|MGORS8|P1-CDC46 minichromosome maintenance complex component 5 protein-coding 186.333-78 chr2 102007536 102007766 + 1 NA intron (NR_048564, intron 1 of 8) MER4C|LTR|ERV1 8690 NR_048564 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 153.333-326 chr5 35392735 35393001 + 1 NA Intergenic Intergenic -162381 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 154.667-356 chr7 8006049 8006356 + 1 NA intron (NM_138426, intron 2 of 7) L2c|LINE|L2 37406 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 150.667-241 chr3 57665189 57665429 + 1 NA intron (NM_152678, intron 4 of 19) intron (NM_152678, intron 4 of 19) 27768 NM_152678 201627 Hs.91085 NM_152678 ENSG00000174839 DENND6A AFI1A|FAM116A DENN domain containing 6A protein-coding 212.333-97 chr3 111632797 111633127 + 1 NA intron (NR_134917, intron 10 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -37616 NM_024508 79413 Hs.136912 NM_024508 ENSG00000177494 ZBED2 - zinc finger BED-type containing 2 protein-coding 144.333-37 chr11 72930185 72930360 + 1 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) MER65C|LTR|ERV1 115861 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 148.667-257 chr3 107750026 107750310 + 1 NA intron (NM_001276286, intron 9 of 16) intron (NM_001276286, intron 9 of 16) 127900 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 151.333-99 chr12 24539229 24539544 + 1 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 23105 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 305.333-14 chr12 2282258 2282861 + 1 NA intron (NR_046769, intron 1 of 2) intron (NR_046769, intron 1 of 2) 12783 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 396.333-4 chr14 73264392 73264862 + 1 NA exon (NM_173462, exon 21 of 26) exon (NM_173462, exon 21 of 26) -18626 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 174.667-30 chr11 34977215 34977582 + 1 NA intron (NM_003477, intron 7 of 10) intron (NM_003477, intron 7 of 10) 35561 NR_039836 100616437 NR_039836 ENSG00000251862 MIR1343 - microRNA 1343 ncRNA 169.333-209 chr5 90640056 90640269 + 1 NA intron (NR_003149, intron 11 of 89) intron (NR_003149, intron 11 of 89) 81365 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 221.333-67 chr2 104706796 104707195 + 1 NA Intergenic Intergenic 50724 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 113.333-81 chr14 101575330 101575507 + 1 NA Intergenic Intergenic 14067 NM_001362 1735 Hs.49322 NM_001362 ENSG00000197406 DIO3 5DIII|D3|DIOIII|TXDI3 iodothyronine deiodinase 3 protein-coding 199.667-27 chr11 29929590 29929851 + 1 NA Intergenic Intergenic 52673 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 115.333-110 chr2 74277600 74277842 + 1 NA intron (NM_133478, intron 8 of 30) L1MC5a|LINE|L1 37304 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 168.667-13 chr1 207511116 207511392 + 1 NA intron (NM_000573, intron 3 of 38) intron (NM_000573, intron 3 of 38) 15097 NM_000573 1378 Hs.334019 NM_000573 ENSG00000203710 CR1 C3BR|C4BR|CD35|KN complement C3b/C4b receptor 1 (Knops blood group) protein-coding 311.667-17 chr4 61030585 61031047 + 1 NA Intergenic Intergenic 108197 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 163.667-5 chr1 109402392 109402647 + 1 NA intron (NM_001199774, intron 8 of 8) MIR|SINE|MIR -4601 NM_002959 6272 Hs.485195 NM_002959 ENSG00000134243 SORT1 Gp95|LDLCQ6|NT3|NTR3 sortilin 1 protein-coding 226.333-41 chr17 28182079 28182567 + 1 NA intron (NM_016231, intron 7 of 10) intron (NM_016231, intron 7 of 10) -44240 NR_003064 23615 Hs.157195 NM_021093 ENSG00000237575 PYY2 - peptide YY 2 (pseudogene) pseudo 157.667-89 chr13 60564519 60564738 + 1 NA intron (NM_030794, intron 12 of 13) MIR3|SINE|MIR -108327 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 183.667-131 chr7 21438946 21439238 + 1 NA intron (NM_003112, intron 3 of 5) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 11009 NM_001326542 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 112.667-105 chr19 46556105 46556261 + 1 NA intron (NM_001370550, intron 1 of 2) LTR37-int|LTR|ERV1 44733 NM_001370550 100506012 Hs.671661 NM_001205281 ENSG00000230510 PPP5D1 - PPP5 tetratricopeptide repeat domain containing 1 protein-coding 241.667-99 chr9 99441838 99442311 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -66817 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 221.333-154 chr9 94441452 94441725 + 1 NA intron (NM_032558, intron 5 of 11) intron (NM_032558, intron 5 of 11) 67019 NM_032558 84641 Hs.555996 NM_032558 ENSG00000148110 MFSD14B HIATL1 major facilitator superfamily domain containing 14B protein-coding 277.667-2 chr1 119636903 119637440 + 1 NA intron (NM_001080470, intron 1 of 2) intron (NM_001080470, intron 1 of 2) 11095 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 131.667-76 chr17 67537215 67537388 + 1 NA intron (NM_181671, intron 2 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 -65716 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 234.667-64 chr20 44278306 44278631 + 1 NA intron (NM_001256737, intron 5 of 5) AluSz|SINE|Alu 31160 NM_024034 78997 Hs.517059 NM_024034 ENSG00000124194 GDAP1L1 dJ881L22.1|dJ995J12.1.1 ganglioside induced differentiation associated protein 1 like 1 protein-coding 213.333-59 chr14 64841546 64841788 + 1 NA intron (NM_001355436, intron 1 of 35) intron (NM_001355436, intron 1 of 35) -18287 NM_001024858 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 127.667-14 chr10 44218145 44218316 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -74520 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 400.333-20 chr8 84496694 84497357 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 81541 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 165.333-124 chr2 55238768 55239073 + 1 NA intron (NM_001005369, intron 15 of 16) intron (NM_001005369, intron 15 of 16) 4756 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 267.667-40 chr3 9741674 9742206 + 1 NA intron (NM_001003694, intron 5 of 13) intron (NM_001003694, intron 5 of 13) -8004 NM_001354648 4968 Hs.380271 NM_002542 ENSG00000114026 OGG1 HMMH|HOGG1|MUTM|OGH1 8-oxoguanine DNA glycosylase protein-coding 144.333-254 chr7 128661309 128661566 + 1 NA TTS (NR_024368) TTS (NR_024368) -10829 NM_001128926 346653 Hs.445236 NM_001012454 ENSG00000205085 FAM71F2 FAM137B family with sequence similarity 71 member F2 protein-coding 146.667-124 chr16 66682624 66682917 + 1 NA intron (NM_181521, intron 1 of 3) intron (NM_181521, intron 1 of 3) 13973 NM_178818 146223 Hs.643961 NM_178818 ENSG00000183723 CMTM4 CKLFSF4 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4 protein-coding 227.333-123 chr8 26829639 26829916 + 1 NA intron (NM_001322504, intron 1 of 1) intron (NM_001322504, intron 1 of 1) 35878 NM_033304 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 202.333-54 chr13 86012477 86012763 + 1 NA Intergenic Intergenic -213201 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 164.333-62 chr13 63067099 63067376 + 1 NA Intergenic Intergenic -259878 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 209.667-100 chr7 33387939 33388229 + 1 NA exon (NM_001348037, exon 18 of 21) exon (NM_001348037, exon 18 of 21) 258520 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 242.667-104 chr8 45999486 46000065 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 617868 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 244.667-13 chr10 36634755 36635043 + 1 NA Intergenic Intergenic -490958 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 227.333-34 chr13 99246672 99246928 + 1 NA intron (NR_026644, intron 4 of 8) intron (NR_026644, intron 4 of 8) 11628 NM_001098200 2841 Hs.741589 NM_005292 ENSG00000125245 GPR18 - G protein-coupled receptor 18 protein-coding 149.667-384 chr7 145247523 145247800 + 1 NA Intergenic Intergenic -411608 NM_001350887 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 248.333-30 chr14 49242473 49242925 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 343681 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 282.333-35 chr4 177377 177826 + 1 NA intron (NR_110527, intron 3 of 4) MER50-int|LTR|ERV1 -34999 NR_027481 642280 Hs.673877 NM_001039758 ENSG00000198155 ZNF876P - zinc finger protein 876, pseudogene pseudo 159.333-41 chr10 47434547 47434820 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -20208 NR_134499 105378292 Hs.131331 NR_134499 LOC105378292 - uncharacterized LOC105378292 ncRNA 196.667-28 chr11 72890653 72891073 + 1 NA intron (NM_014824, intron 10 of 19) intron (NM_014824, intron 10 of 19) 76452 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 123.667-193 chr9 23214274 23214439 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 458043 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 442.333 chr1 28301514 28302168 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -27199 NM_001127350 54797 Hs.479911 NM_017638 ENSG00000130772 MED18 SRB5|p28b mediator complex subunit 18 protein-coding 139.333-195 chr6 148091978 148092234 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -180222 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 233.667-41 chr2 141955024 141955330 + 1 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) MER53|DNA|hAT 176524 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 283.333-38 chr2 237740122 237740604 + 1 NA intron (NM_001137550, intron 11 of 23) AluJr|SINE|Alu 48158 NM_001137552 9208 Hs.471779 NM_004735 ENSG00000124831 LRRFIP1 FLAP-1|FLAP1|FLIIAP1|GCF-2|GCF2|HUFI-1|TRIP LRR binding FLII interacting protein 1 protein-coding 196.667-114 chr4 181146245 181146541 + 1 NA intron (NR_033918, intron 2 of 2) intron (NR_033918, intron 2 of 2) 12756 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 258.667-100 chr8 138202658 138203125 + 1 NA intron (NM_015912, intron 7 of 19) intron (NM_015912, intron 7 of 19) -119346 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 222.667-89 chr7 50755430 50755743 + 1 NA intron (NM_001371008, intron 1 of 15) intron (NM_001371008, intron 1 of 15) -23233 NM_001001549 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 124.333-79 chr2 27970779 27970940 + 1 NA intron (NM_199193, intron 4 of 13) L1MC5|LINE|L1 -25508 NR_036230 100422965 NR_036230 ENSG00000265321 MIR4263 - microRNA 4263 ncRNA 162.667-63 chr12 75551805 75552100 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -40343 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 145.667-235 chr5 132839468 132839626 + 1 NA Intergenic Intergenic -8900 NM_001172700 134549 Hs.519574 NM_133456 ENSG00000164403 SHROOM1 APXL2 shroom family member 1 protein-coding 171.667-19 chr10 51847469 51847705 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) intron (NM_001098512, intron 4 of 17) -147992 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 150.333-349 chr5 173872154 173872442 + 1 NA Intergenic Intergenic -16051 NM_001308189 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 189.333-132 chr3 114244940 114245276 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -7530 NM_007136 7634 Hs.271079 NM_007136 ENSG00000174255 ZNF80 pT17 zinc finger protein 80 protein-coding 156.333-76 chr12 32579885 32580069 + 1 NA intron (NM_001370298, intron 3 of 16) intron (NM_001370298, intron 3 of 16) 45684 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 124.667-52 chr12 124202855 124203011 + 1 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) intron (NM_001347902, intron 3 of 4) -86231 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 161.333-80 chr13 75952383 75952669 + 1 NA Intergenic Intergenic -17394 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 148.333-86 chr12 21360083 21360290 + 1 NA intron (NM_001329201, intron 1 of 2) L1MA10|LINE|L1 5226 NM_001329201 3375 Hs.46835 NM_000415 ENSG00000121351 IAPP DAP|IAP islet amyloid polypeptide protein-coding 166.667-188 chr5 121514082 121514279 + 1 NA Intergenic Intergenic 191630 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 147.667-353 chr8 68119164 68119322 + 1 NA intron (NM_024870, intron 27 of 39) intron (NM_024870, intron 27 of 39) 167197 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 135.667-51 chr14 39662768 39662964 + 1 NA Intergenic Intergenic -230366 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 170.333-8 chr1 105364879 105365165 + 1 NA Intergenic Intergenic 253913 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 250.333-28 chr18 3192465 3192799 + 1 NA intron (NM_019856, intron 3 of 36) intron (NM_019856, intron 3 of 36) 27336 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 166.333-77 chr15 53257328 53257581 + 1 NA Intergenic Intergenic 141089 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 194.667-14 chr1 191715529 191715766 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -442815 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 270.667-50 chr7 106002004 106002540 + 1 NA intron (NM_152750, intron 7 of 18) MER39|LTR|ERV1 39008 NM_152750 222256 Hs.150120 NM_152750 ENSG00000128536 CDHR3 CDH28 cadherin related family member 3 protein-coding 156.667-240 chr4 39321160 39321357 + 1 NA intron (NM_001204747, intron 8 of 24) intron (NM_001204747, intron 8 of 24) 45104 NM_001204747 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 278.667-22 chr2 26126610 26127002 + 1 NA intron (NM_016131, intron 3 of 5) intron (NM_016131, intron 3 of 5) -46282 NM_001168241 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 248.667-5 chr1 182128635 182129019 + 1 NA Intergenic Intergenic -67115 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 228.667-36 chr19 36940154 36940577 + 1 NA intron (NM_001204839, intron 5 of 8) intron (NM_001204839, intron 5 of 8) 24033 NM_001204835 374900 Hs.404220 NM_198539 ENSG00000198453 ZNF568 ZFP568 zinc finger protein 568 protein-coding 155.333-119 chr15 64291231 64291400 + 1 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) AluSq2|SINE|Alu 64858 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 338.667-20 chr3 71002218 71002860 + 1 NA intron (NM_001244812, intron 7 of 15) intron (NM_001244812, intron 7 of 15) 62385 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 372.667-18 chr4 104810425 104811163 + 1 NA Intergenic Intergenic -315900 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 158.667-11 chr1 83706612 83706836 + 1 NA intron (NR_119375, intron 2 of 2) intron (NR_119375, intron 2 of 2) 153822 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 190.667-65 chr2 72883595 72883850 + 1 NA Intergenic Intergenic -3686 NM_003124 6697 Hs.301540 NM_003124 ENSG00000116096 SPR SDR38C1 sepiapterin reductase protein-coding 170.333-212 chr8 25449500 25449783 + 1 NA intron (NM_017634, intron 1 of 11) MER3|DNA|hAT-Charlie 8792 NM_017634 54793 Hs.72071 NM_017634 ENSG00000104756 KCTD9 BTBD27 potassium channel tetramerization domain containing 9 protein-coding 154.667-249 chr3 114965491 114965660 + 1 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) L1MA8|LINE|L1 -64950 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 132.667-106 chr3 47030267 47030469 + 1 NA intron (NR_146158, intron 19 of 21) L1M4a1|LINE|L1 18826 NR_024046 100129354 Hs.201522 NR_024046 NRADDP - neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene pseudo 196.667-21 chr10 97500439 97500850 + 1 NA intron (NM_024954, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 1720 NM_024954 80019 Hs.500724 NM_024954 ENSG00000165886 UBTD1 - ubiquitin domain containing 1 protein-coding 329.667-20 chr8 117406509 117406928 + 1 NA Intergenic Intergenic -113995 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 191.667-2 chr1 43907927 43908162 + 1 NA intron (NM_001270461, intron 8 of 8) L2b|LINE|L2 -25276 NM_057090 9048 Hs.632404 NM_003976 ENSG00000117407 ARTN ART|ENOVIN|EVN|NBN artemin protein-coding 204.333-139 chr4 54358072 54358351 + 1 NA Intergenic Intergenic 25319 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 153.667-268 chr3 140217066 140217270 + 1 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) intron (NM_022131, intron 2 of 16) 281983 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 147.333-84 chr12 59181138 59181400 + 1 NA Intergenic Intergenic -260731 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 151.667-384 chr9 14903207 14903477 + 1 NA intron (NM_001370065, intron 1 of 7) intron (NM_001370065, intron 1 of 7) 7086 NM_001370065 158326 Hs.50850 NM_144966 ENSG00000164946 FREM1 BNAR|C9orf143|C9orf145|C9orf154|MOTA|TILRR|TRIGNO2 FRAS1 related extracellular matrix 1 protein-coding 240.333-34 chr14 24924536 24924871 + 1 NA intron (NM_001351943, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 124297 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 178.667-53 chr15 39570521 39570845 + 1 NA Intergenic (ATTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10396 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 182.667-91 chr3 44078653 44078942 + 1 NA Intergenic Intergenic -35415 NR_029700 406929 NR_029700 ENSG00000207954 MIR138-1 MIRN138-1|mir-138-1 microRNA 138-1 ncRNA 212.667-100 chr5 7040615 7040887 + 1 NA Intergenic Intergenic -212830 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 153.333-308 chr4 93674521 93674730 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -154128 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 146.667-169 chr2 86435249 86435423 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -6035 NM_018433 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 181.333-159 chr7 20210795 20211093 + 1 NA intron (NM_182762, intron 1 of 6) intron (NM_182762, intron 1 of 6) 6440 NM_182762 346389 Hs.598388 NM_182762 ENSG00000183742 MACC1 7A5|SH3BP4L MET transcriptional regulator MACC1 protein-coding 172.667-31 chr11 25556578 25556780 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -632444 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 149.667-421 chr9 29654222 29654415 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -440717 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 152.333-364 chr8 10310156 10310352 + 1 NA intron (NM_001199729, intron 5 of 6) intron (NM_001199729, intron 5 of 6) -164311 NR_120604 101929191 Hs.595262 NR_120604 ENSG00000253641 LINCR-0001 - uncharacterized LINCR-0001 ncRNA 163.667-155 chr3 96560814 96561038 + 1 NA Intergenic Intergenic 200962 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 344.667-15 chr4 154043095 154043541 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -254235 NM_003013 6423 Hs.481022 NM_003013 ENSG00000145423 SFRP2 FRP-2|SARP1|SDF-5 secreted frizzled related protein 2 protein-coding 348.333-39 chrX 148988618 148989265 + 1 NA intron (NM_001170628, intron 17 of 17) MIR|SINE|MIR 269850 NM_001170628 2334 Hs.496911 NM_002025 ENSG00000155966 AFF2 FMR2|FMR2P|FRAXE|MRX2|OX19 AF4/FMR2 family member 2 protein-coding 217.333-118 chr5 58595365 58595609 + 1 NA intron (NM_138453, intron 1 of 4) intron (NM_138453, intron 1 of 4) 12412 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 181.333-51 chr15 79448740 79449024 + 1 NA intron (NM_015206, intron 1 of 3) intron (NM_015206, intron 1 of 3) 16366 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 264.667-10 chr1 203666358 203666719 + 1 NA intron (NM_001365784, intron 1 of 20) intron (NM_001365784, intron 1 of 20) 38601 NM_001365784 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 143.667-176 chr4 38375096 38375353 + 1 NA intron (NR_149123, intron 1 of 1) intron (NR_149123, intron 1 of 1) 8310 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 126.667-120 chr4 52717456 52717684 + 1 NA intron (NR_145129, intron 4 of 4) intron (NR_145129, intron 4 of 4) 4321 NR_003016 677810 Hs.635034 NR_003016 ENSG00000212588 SNORA26 HBI-6 small nucleolar RNA, H/ACA box 26 snoRNA 218.667-105 chr8 63552878 63553330 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 87255 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 180.667-153 chr8 140996406 140996783 + 1 NA intron (NM_001352737, intron 1 of 32) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 4410 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 154.667-154 chr18 66576347 66576578 + 1 NA intron (NM_001271028, intron 1 of 9) intron (NM_001271028, intron 1 of 9) 27628 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 166.333-177 chr5 17145697 17145935 + 1 NA intron (NR_027253, intron 2 of 2) intron (NR_027253, intron 2 of 2) 10176 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 151.667-59 chr11 22255323 22255519 + 1 NA exon (NM_213599, exon 13 of 22) exon (NM_213599, exon 13 of 22) 62245 NM_213599 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 308.667-13 chr14 44611413 44611817 + 1 NA Intergenic Intergenic 104206 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 130.333-85 chr16 78072273 78072543 + 1 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL -27246 NR_120435 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 154.667-45 chr10 65476672 65476948 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -94615 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 135.667-74 chr17 43157580 43157844 + 1 NA intron (NR_110868, intron 1 of 1) AluSc8|SINE|Alu 12691 NR_110868 101929767 Hs.640892 NR_110868 LOC101929767 - uncharacterized LOC101929767 ncRNA 155.333-332 chr6 65946422 65946579 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 158621 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 204.667-152 chr8 132874754 132875015 + 1 NA intron (NM_003235, intron 5 of 47) MER102c|DNA|hAT-Charlie 7926 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 165.667-34 chr12 6126807 6127012 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -2234 NM_000552 7450 Hs.440848 NM_000552 ENSG00000110799 VWF F8VWF|VWD von Willebrand factor protein-coding 313.333-30 chr4 81097935 81098487 + 1 NA intron (NM_006259, intron 17 of 18) MLT2A1|LTR|ERVL 55946 NM_001282480 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 149.333-60 chr10 88019764 88020021 + 1 NA Intergenic Intergenic 156267 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 154.667-115 chr14 69456726 69456909 + 1 NA intron (NM_001252150, intron 6 of 6) intron (NM_001252150, intron 6 of 6) -27911 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 190.333-115 chr5 50690242 50690547 + 1 NA intron (NM_024615, intron 2 of 25) intron (NM_024615, intron 2 of 25) 22980 NM_001331028 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 300.667-43 chr8 84706454 84706774 + 1 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 687 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 179.333-41 chr11 86923990 86924213 + 1 NA intron (NR_120592, intron 2 of 2) intron (NR_120592, intron 2 of 2) 31294 NM_012193 8322 Hs.591968 NM_012193 ENSG00000174804 FZD4 CD344|EVR1|FEVR|FZD4S|Fz-4|Fz4|FzE4|GPCR|hFz4 frizzled class receptor 4 protein-coding 154.333-208 chr3 30247536 30247719 + 1 NA Intergenic Intergenic -271241 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 168.333-91 chr2 50402398 50402602 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -54744 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 235.667-12 chr12 41030595 41030879 + 1 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) intron (NM_001843, intron 23 of 23) 122380 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 212.667-67 chr2 29914306 29914706 + 1 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 7080 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 131.333-155 chr6 61717966 61718212 + 1 NA intron (NR_146872, intron 7 of 9) MIRb|SINE|MIR 143959 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 262.333-30 chr15 68984392 68984704 + 1 NA intron (NR_033672, intron 2 of 16) HERV1_LTRa|LTR|ERV1 -30147 NM_001184779 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 245.333-34 chr12 125404994 125405317 + 1 NA intron (NM_052907, intron 2 of 8) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 78539 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 141.667-182 chr5 83160881 83161074 + 1 NA intron (NM_001318012, intron 3 of 7) MIRb|SINE|MIR 83430 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 161.667-230 chr6 160481185 160481473 + 1 NA intron (NR_028092, intron 7 of 9) L1MEf|LINE|L1 29795 NR_028092 80350 Hs.654503 NM_024492 ENSG00000213071 LPAL2 APOA2|APOAL|APOARGC|apo(a)rg-C lipoprotein(a) like 2, pseudogene pseudo 370.333-20 chr4 7118423 7118903 + 1 NA Intergenic (GATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15287 NR_027441 730971 Hs.591718 NR_027441 LINC02447 - long intergenic non-protein coding RNA 2447 ncRNA 167.333-272 chr9 32449080 32449327 + 1 NA intron (NM_001278352, intron 21 of 21) intron (NM_001278352, intron 21 of 21) 64560 NM_001362840 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 228.333-33 chr17 49188535 49188897 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 20665 NM_031498 2793 Hs.181781 NM_031498 ENSG00000167083 GNGT2 G-GAMMA-8|G-GAMMA-C|GNG8|GNG9|GNGT8 G protein subunit gamma transducin 2 protein-coding 196.333-162 chr7 87624635 87624967 + 1 NA intron (NM_001348945, intron 2 of 31) intron (NM_001348945, intron 2 of 31) -3597 NM_001134406 154661 Hs.411488 NM_138290 ENSG00000105784 RUNDC3B RPIB9|RPIP9 RUN domain containing 3B protein-coding 122.667-38 chr12 40635234 40635395 + 1 NA Intergenic Intergenic -57125 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 204.333-35 chr11 40840914 40841288 + 1 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -547971 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 149.333-316 chr5 109174497 109174754 + 1 NA intron (NR_146155, intron 17 of 19) intron (NR_146155, intron 17 of 19) 151744 NR_149040 285638 Hs.532104 NR_149040 ENSG00000249476 LOC285638 - uncharacterized LOC285638 ncRNA 139.667-43 chr12 89453249 89453561 + 1 NA intron (NM_172240, intron 10 of 11) intron (NM_172240, intron 10 of 11) 71391 NM_003774 8693 Hs.25130 NM_003774 ENSG00000257594 GALNT4 GALNAC-T4|GALNACT4 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4 protein-coding 128.333-185 chr7 107569637 107569899 + 1 NA intron (NM_001371364, intron 3 of 14).2 L1MB2|LINE|L1 -5254 NM_001161520 10466 Hs.239631 NM_006348 ENSG00000164597 COG5 CDG2I|GOLTC1|GTC90 component of oligomeric golgi complex 5 protein-coding 147.667-283 chr5 54989868 54990134 + 1 NA Intergenic Intergenic -4408 NM_001135604 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 157.667-361 chr9 129812807 129813115 + 1 NA TTS (NM_000113) TTS (NM_000113) 9777 NR_134113 27348 Hs.252682 NM_014506 ENSG00000136816 TOR1B DQ1 torsin family 1 member B protein-coding 231.333-121 chr8 131289225 131289628 + 1 NA Intergenic Intergenic -248517 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 338.333-6 chr17 44799347 44799741 + 1 NA 3' UTR (NM_005497, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_005497, exon 3 of 3) 30743 NM_005497 10052 Hs.712052 NM_005497 ENSG00000182963 GJC1 CX45|GJA7 gap junction protein gamma 1 protein-coding 153.667-128 chr14 81689753 81690057 + 1 NA Intergenic Intergenic 53233 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 168.667-97 chr2 31962322 31962624 + 1 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) intron (NR_126034, intron 1 of 6) 48191 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 136.667-117 chr3 95229720 95229924 + 1 NA Intergenic Intergenic 291559 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 146.333-61 chr12 16950988 16951195 + 1 NA Intergenic Intergenic -37656 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 237.667-41 chr2 120666432 120666990 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -69157 NM_001371271 204.667-134 chr6 119662676 119663143 + 1 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 113101 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 149.667-36 chr1 191210411 191210640 + 1 NA Intergenic Intergenic 17973 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 159.667-68 chr11 112718688 112718880 + 1 NA Intergenic Intergenic -162982 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 192.333-25 chr10 103753588 103753814 + 1 NA intron (NR_038940, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 6922 NR_038940 100505839 Hs.655149 NR_038940 ENSG00000280693 SH3PXD2A-AS1 - SH3PXD2A antisense RNA 1 ncRNA 267.667-55 chr5 123104871 123105190 + 1 NA intron (NM_001136239, intron 3 of 7) intron (NM_001136239, intron 3 of 7) -14714 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 164.333-43 chr11 82774395 82774585 + 1 NA Intergenic Intergenic -40626 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 155.333-163 chr2 63317658 63317906 + 1 NA intron (NR_148704, intron 13 of 18) L1PA15|LINE|L1 120225 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 151.667-39 chr10 17737915 17738126 + 1 NA Intergenic Intergenic -14181 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 176.667-102 chr3 78919542 78919767 + 1 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 99805 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 142.333-149 chr22 27104225 27104485 + 1 NA Intergenic Intergenic -43837 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 169.333-4 chr1 51840784 51840993 + 1 NA intron (NM_001101662, intron 1 of 30) intron (NM_001101662, intron 1 of 30) -4486 NR_031580 100313892 NR_031580 ENSG00000283899 MIR761 hsa-mir-761 microRNA 761 ncRNA 170.333-154 chr4 38718745 38718975 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -54232 NR_026804 79667 Hs.29725 NM_024614 ENSG00000231160 KLF3-AS1 - KLF3 antisense RNA 1 ncRNA 152.333-21 chr1 161145563 161145774 + 1 NA Intergenic Intergenic -8310 NM_016406 51506 Hs.301412 NM_016406 ENSG00000143222 UFC1 HSPC155|NEDSG ubiquitin-fold modifier conjugating enzyme 1 protein-coding 222.667-40 chr2 49902290 49902651 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 71733 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 244.333-46 chr16 53940665 53941173 + 1 NA intron (NM_001363894, intron 9 of 9) intron (NM_001363894, intron 9 of 9) -98474 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 151.333-345 chr5 93956253 93956494 + 1 NA intron (NR_028080, intron 4 of 8) intron (NR_028080, intron 4 of 8) 155290 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 256.667-27 chr14 62188923 62189404 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -49190 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 144.667-122 chr18 79825751 79825937 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -37824 NM_012283 26251 Hs.247905 NM_012283 ENSG00000178342 KCNG2 KCNF2|KV6.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 2 protein-coding 270.667-48 chr7 65906836 65907196 + 1 NA intron (NM_001284342, intron 1 of 1) intron (NM_001284342, intron 1 of 1) 33942 NM_001284342 154807 Hs.427232 NM_173517 ENSG00000196715 VKORC1L1 - vitamin K epoxide reductase complex subunit 1 like 1 protein-coding 149.667-62 chr10 73594758 73594907 + 1 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) intron (NM_001350995, intron 1 of 21) -3490 NR_135249 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 149.333-361 chr7 13982210 13982424 + 1 NA intron (NM_001370556, intron 3 of 11) intron (NM_001370556, intron 3 of 11) 4197 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 130.667-133 chr20 54219261 54219420 + 1 NA 3' UTR (NM_002623, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_002623, exon 4 of 4) 11253 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 159.333-314 chr7 85668242 85668505 + 1 NA Intergenic Intergenic 247251 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 279.333-53 chr3 54126179 54126581 + 1 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 3828 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 162.667-4 chr1 79017619 79017852 + 1 NA Intergenic Intergenic -11005 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 261.667-13 chr13 27129522 27130143 + 1 NA intron (NR_046547, intron 1 of 2) intron (NR_046547, intron 1 of 2) 4299 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 218.667-95 chr6 86179748 86180186 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -501234 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 122.667-69 chr17 10310684 10310915 + 1 NA intron (NM_003802, intron 33 of 40) intron (NM_003802, intron 33 of 40) 62207 NM_003802 8735 Hs.711142 NM_003802 ENSG00000006788 MYH13 MyHC-IIL|MyHC-eo myosin heavy chain 13 protein-coding 174.333-156 chr8 142729823 142730072 + 1 NA intron (NR_156431, intron 2 of 2) HERVIP10B3-int|LTR|ERV1 2724 NM_016647 51337 Hs.368402 NM_016647 ENSG00000130193 THEM6 C8orf55|DSCD75 thioesterase superfamily member 6 protein-coding 151.333-226 chr2 171659171 171659456 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -28156 NM_001271786 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 182.667-15 chr10 17990771 17991007 + 1 NA intron (NM_001282734, intron 6 of 11) intron (NM_001282734, intron 6 of 11) 19673 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 120.333-172 chr7 83450458 83450639 + 1 NA intron (NM_001178129, intron 4 of 16) L1ME3A|LINE|L1 190883 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 223.667-67 chr5 33471097 33471468 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 30506 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 156.667-8 chr1 52646517 52646783 + 1 NA intron (NR_135156, intron 3 of 5) Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger 13482 NR_135156 348378 Hs.424589 NM_001042693 ENSG00000182183 SHISAL2A FAM159A|PRO7171|WWLS2783 shisa like 2A protein-coding 156.667-39 chr10 28818282 28818477 + 1 NA Intergenic Intergenic -22329 NR_038374 100507605 Hs.119207 NR_038374 ENSG00000235824 LINC00837 - long intergenic non-protein coding RNA 837 ncRNA 149.333-392 chr8 78658728 78658910 + 1 NA Intergenic Intergenic -7270 NM_016010 51101 Hs.271876 NM_016010 ENSG00000104427 ZC2HC1A C8orf70|CGI-62|FAM164A zinc finger C2HC-type containing 1A protein-coding 176.333-93 chr2 192051193 192051409 + 1 NA intron (NM_001305134, intron 5 of 9) intron (NM_001305134, intron 5 of 9) 143632 NM_016192 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 385.333-17 chr2 63476458 63476993 + 1 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) intron (NR_148704, intron 7 of 18) -38718 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 139.333-77 chr15 26786196 26786404 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -12537 NM_021912 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 149.667-410 chr8 120160669 120160926 + 1 NA intron (NM_021110, intron 3 of 47) MER103C|DNA|hAT-Charlie 35695 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 201.333-175 chr21 30678252 30678510 + 1 NA Intergenic Intergenic 35517 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 176.333-76 chr2 24713294 24713532 + 1 NA intron (NM_001362950, intron 14 of 23) HAL1|LINE|L1 -79702 NM_024322 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 207.667-80 chr3 158229710 158230080 + 1 NA intron (NM_001271838, intron 4 of 9) L1MC4|LINE|L1 119806 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 153.667-289 chr4 56912998 56913151 + 1 NA intron (NM_001193508, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 4161 NM_001193508 5978 Hs.307836 NM_005612 ENSG00000084093 REST DFNA27|GINGF5|HGF5|NRSF|WT6|XBR RE1 silencing transcription factor protein-coding 307.333-13 chr10 62339909 62340374 + 1 NA non-coding (NR_104162, exon 4 of 4) non-coding (NR_104162, exon 4 of 4) -34016 NM_199450 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 305.333-6 chr10 44376638 44377244 + 1 NA TTS (NM_199168) TTS (NM_199168) 8156 NM_001178134 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 275.667-27 chr18 37325452 37325944 + 1 NA intron (NM_001353724, intron 2 of 12) L2b|LINE|L2 51238 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 171.667-52 chr14 69429194 69429467 + 1 NA intron (NM_001330185, intron 2 of 5) L1MD2|LINE|L1 30638 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 228.333-80 chr5 77838210 77838598 + 1 NA Intergenic Intergenic -46252 NR_105012 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 159.667-64 chr11 72552693 72553037 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17791 NR_126364 101928555 Hs.376950 NR_126364 ENSG00000227467 LINC01537 - long intergenic non-protein coding RNA 1537 ncRNA 284.667-18 chr14 66863934 66864540 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) L1MA2|LINE|L1 -325203 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 143.333-282 chr8 53298792 53299006 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -47202 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 203.667-75 chr3 27281492 27281930 + 1 NA intron (NM_152534, intron 23 of 38) HAL1|LINE|L1 -65188 NM_001031741 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 204.667-37 chr14 25037007 25037288 + 1 NA intron (NM_001304476, intron 1 of 6) intron (NM_001304476, intron 1 of 6) 11853 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 148.333-218 chr2 232049369 232049605 + 1 NA intron (NR_046477, intron 5 of 18) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 87774 NR_046477 129563 Hs.732236 NM_152383 ENSG00000144535 DIS3L2 FAM6A|PRLMNS|hDIS3L2 DIS3 like 3'-5' exoribonuclease 2 protein-coding 197.667-43 chr14 79052642 79052946 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -147188 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 163.333-15 chr1 118968724 118968932 + 1 NA intron (NM_152380, intron 1 of 7) intron (NM_152380, intron 1 of 7) 19515 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 265.333-20 chr13 27689308 27689632 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 67578 NM_015972 51082 Hs.507584 NM_015972 ENSG00000186184 POLR1D AC19|POLR1C|RPA16|RPA9|RPAC2|RPC16|RPO1-3|TCS2 RNA polymerase I and III subunit D protein-coding 149.667-153 chr16 89483930 89484113 + 1 NA intron (NM_001256182, intron 1 of 13) intron (NM_001256182, intron 1 of 13) 6540 NM_013275 29123 Hs.335003 NM_013275 ENSG00000167522 ANKRD11 ANCO-1|ANCO1|LZ16|T13 ankyrin repeat domain 11 protein-coding 224.667-79 chr8 35802864 35803351 + 1 NA Intergenic Intergenic -92787 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 355.333-33 chr6 103209659 103210129 + 1 NA Intergenic Intergenic 1649652 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 125.667-5 chr1 48756622 48756847 + 1 NA intron (NM_024603, intron 3 of 5) intron (NM_024603, intron 3 of 5) 20157 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 168.333-223 chr9 113698402 113698651 + 1 NA Intergenic Intergenic 104397 NM_001276262 5998 Hs.494875 NM_017790 ENSG00000138835 RGS3 C2PA|RGP3 regulator of G protein signaling 3 protein-coding 114.667-18 chr1 215006705 215006837 + 1 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) intron (NM_001017424, intron 1 of 6) 1229 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 147.333-292 chr7 29188601 29188798 + 1 NA intron (NM_001371264, intron 1 of 15) intron (NM_001371264, intron 1 of 15) 1358 NM_001371263 170.667-99 chr20 51753154 51753400 + 1 NA intron (NM_006045, intron 1 of 27) AluSx4|SINE|Alu 15113 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 227.333-116 chr7 39151859 39152238 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -138481 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 175.333-179 chr7 131160765 131160990 + 1 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) intron (NM_001145354, intron 2 of 18) 50783 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 171.333-196 chr8 109488172 109488502 + 1 NA intron (NM_177531, intron 59 of 77) L1MC5|LINE|L1 -51363 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 386.667-7 chr2 79809703 79810405 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) L1P2|LINE|L1 56529 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 184.333-79 chr2 145764246 145764626 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -822621 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 309.667-31 chr9 31871377 31871902 + 1 NA Intergenic Intergenic -490149 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 151.667-117 chr14 76955427 76955686 + 1 NA Intergenic Intergenic -4082 NR_133913 105370578 Hs.574184 NR_133913 ENSG00000258602 LINC01629 linc-KIAA1737-2 long intergenic non-protein coding RNA 1629 ncRNA 164.333-173 chr4 55108616 55108840 + 1 NA intron (NM_002253, intron 9 of 29) (CTCCTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16867 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 167.667-76 chr16 82860640 82860818 + 1 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) intron (NM_001220490, intron 2 of 12) 87410 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 141.667 chr1 29774226 29774417 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 263291 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 279.333-15 chr10 125542321 125542862 + 1 NA Intergenic Intergenic -31780 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 212.667-145 chr9 90894758 90895065 + 1 NA intron (NM_001174167, intron 13 of 13) intron (NM_001174167, intron 13 of 13) 67491 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 235.333-40 chr17 28478880 28479195 + 1 NA intron (NM_001145975, intron 1 of 11) AluJo|SINE|Alu 5393 NM_003984 9058 Hs.102307 NM_003984 ENSG00000007216 SLC13A2 NADC1|NaCT|NaDC-1|SDCT1 solute carrier family 13 member 2 protein-coding 233.333-107 chr5 81898907 81899286 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -72927 NM_031482 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 252.333-24 chr17 48743890 48744186 + 1 NA Intergenic Intergenic -15289 NM_006361 10481 Hs.66731 NM_006361 ENSG00000159184 HOXB13 HPC9|PSGD homeobox B13 protein-coding 133.333-205 chrX 36875159 36875346 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -133107 NM_001013736 442444 Hs.535216 NM_001013736 ENSG00000198173 FAM47C - family with sequence similarity 47 member C protein-coding 156.333-255 chr3 179496406 179496695 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -45080 NM_021629 59345 Hs.173030 NM_021629 ENSG00000114450 GNB4 CMTD1F G protein subunit beta 4 protein-coding 178.667-56 chr16 1720245 1720529 + 1 NA intron (NM_001040439, intron 1 of 30) L1ME4a|LINE|L1 14192 NM_001040439 23162 Hs.207763 NM_015133 ENSG00000138834 MAPK8IP3 JIP-3|JIP3|JSAP1|NEDBA|SYD2|syd mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 3 protein-coding 232.333-90 chr8 99712383 99712744 + 1 NA intron (NM_017890, intron 36 of 61) intron (NM_017890, intron 36 of 61) -175702 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 147.667-120 chr15 98873755 98873939 + 1 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) 89421 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 149.667-422 chr9 31246585 31246807 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 134794 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 167.667-68 chr15 78105394 78105594 + 1 NA intron (NM_001271889, intron 3 of 3) intron (NM_001271889, intron 3 of 3) 12909 NM_001101404 646892 Hs.569511 NM_001101404 ENSG00000183476 SH2D7 - SH2 domain containing 7 protein-coding 198.667-142 chr4 141995353 141995784 + 1 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 358985 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 162.667-261 chr8 42171171 42171373 + 1 NA TTS (NM_001134296) TTS (NM_001134296) 18209 NM_006803 10947 Hs.654529 NM_006803 ENSG00000070718 AP3M2 AP47B|CLA20|P47B adaptor related protein complex 3 subunit mu 2 protein-coding 148.333-408 chr9 23968606 23968767 + 1 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -118085 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 214.667-40 chr14 45786200 45786594 + 1 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 -70795 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 260.333-8 chr12 15282266 15282592 + 1 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -40079 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 211.333-226 chr7 83751364 83751652 + 1 NA Intergenic Intergenic -102369 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 159.333-266 chr5 65729546 65729750 + 1 NA intron (NM_020726, intron 1 of 12) AluSx3|SINE|Alu 7443 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 156.333-365 chr8 122217163 122217394 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 351366 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 145.667-192 chr4 54556939 54557109 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 50107 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 215.333-27 chr10 103054605 103054916 + 1 NA intron (NM_199076, intron 3 of 6) intron (NM_199076, intron 3 of 6) 99061 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 293.667-34 chr20 45955634 45956091 + 1 NA intron (NM_022095, intron 17 of 27) L1ME4a|LINE|L1 16341 NM_022095 63925 Hs.174193 NM_022095 ENSG00000198026 ZNF335 MCPH10|NIF-1|NIF1|NIF2 zinc finger protein 335 protein-coding 156.667-131 chr17 9450032 9450201 + 1 NA intron (NM_004853, intron 6 of 7) AluSz|SINE|Alu 125704 NM_004853 9482 Hs.431109 NM_004853 ENSG00000170310 STX8 CARB syntaxin 8 protein-coding 141.333-183 chr4 169955626 169955857 + 1 NA intron (NR_037878, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 20161 NR_037878 100506085 Hs.649173 NR_037878 ENSG00000248319 LINC02275 - long intergenic non-protein coding RNA 2275 ncRNA 188.333-167 chr9 71470163 71470387 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -23304 NM_001366144 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 118.667-34 chr10 94029586 94029773 + 1 NA intron (NM_001288989, intron 1 of 32) intron (NM_001288989, intron 1 of 32) 35748 NM_016341 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 149.333-290 chr4 124369802 124370047 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 188510 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 297.667-33 chr6 63912931 63913329 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 35 of 43) intron (NM_001292009, intron 35 of 43) 106294 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 240.333-2 chr1 22911725 22912006 + 1 NA intron (NM_004442, intron 14 of 15) intron (NM_004442, intron 14 of 15) -48639 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 202.667-28 chr11 57689041 57689344 + 1 NA intron (NM_015457, intron 4 of 11) intron (NM_015457, intron 4 of 11) 21078 NM_015457 25921 Hs.27239 NM_015457 ENSG00000156599 ZDHHC5 DHHC5|ZNF375 zinc finger DHHC-type containing 5 protein-coding 159.667-251 chr5 19217098 19217342 + 1 NA Intergenic Intergenic 669052 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 254.667-33 chr18 79820323 79820622 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -43196 NM_012283 26251 Hs.247905 NM_012283 ENSG00000178342 KCNG2 KCNF2|KV6.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 2 protein-coding 265.667-30 chr17 79971021 79971517 + 1 NA intron (NM_019020, intron 3 of 11) AluSx|SINE|Alu -20416 NM_001271846 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 174.333-14 chr10 56210226 56210440 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 150926 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 123.333-30 chr10 44212069 44212244 + 1 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 -80594 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 148.667-310 chr5 61648986 61649195 + 1 NA intron (NR_126524, intron 2 of 3) intron (NR_126524, intron 2 of 3) 11309 NR_126525 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 118.333-82 chr16 80732143 80732328 + 1 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) MER104|DNA|TcMar-Tc2 72363 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 159.667-257 chr5 53453999 53454286 + 1 NA Intergenic Intergenic -26487 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 216.667-53 chr2 20736540 20736879 + 1 NA intron (NR_104233, intron 3 of 4) MER34C_|LTR|ERV1 69565 NM_182828 151449 Hs.447688 NM_182828 ENSG00000143869 GDF7 BMP12 growth differentiation factor 7 protein-coding 121.333-187 chr8 136907246 136907437 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 376543 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 122.667-101 chr20 33651246 33651444 + 1 NA Intergenic Intergenic -10982 NM_080825 128864 Hs.324104 NM_080825 ENSG00000149609 C20orf144 dJ63M2.6 chromosome 20 open reading frame 144 protein-coding 218.667-72 chr3 177947253 177947618 + 1 NA Intergenic MER129|LTR?|LTR? 130570 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 150.333-384 chr7 70193346 70193527 + 1 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) MIRb|SINE|MIR 594961 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 124.333-39 chr12 81823171 81823328 + 1 NA Intergenic Intergenic -63899 NM_003625 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 148.667-359 chr7 80894499 80894758 + 1 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) intron (NM_006379, intron 2 of 17) 24423 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 128.333-69 chr16 4107903 4108110 + 1 NA intron (NM_001116, intron 2 of 10) intron (NM_001116, intron 2 of 10) 8436 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 376.667-10 chr6 64730070 64730858 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -570954 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 136.333-119 chr22 45777151 45777387 + 1 NA intron (NM_013236, intron 9 of 11) intron (NM_013236, intron 9 of 11) 16745 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 168.333-200 chr7 111779294 111779620 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 35 of 52) AluSz6|SINE|Alu -29048 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 166.333-168 chr4 126099956 126100189 + 1 NA Intergenic Intergenic 592813 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 152.667-187 chr2 89800643 89800818 + 1 NA Intergenic Intergenic -162823 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 165.333-76 chr14 62848491 62848663 + 1 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) intron (NM_139318, intron 8 of 10) 196881 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 302.667-31 chr6 162616270 162616955 + 1 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) intron (NM_004562, intron 1 of 11) -110520 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 198.333-69 chr15 71284705 71284993 + 1 NA intron (NM_024817, intron 5 of 16) intron (NM_024817, intron 5 of 16) -95790 NR_120350 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 148.667-60 chr11 4123412 4123607 + 1 NA intron (NM_001318064, intron 11 of 17) intron (NM_001318064, intron 11 of 17) 7431 NM_001318065 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 219.333-168 chr7 43255633 43255970 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 2 of 27) L2b|LINE|L2 104906 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 191.667-78 chr21 17759586 17759862 + 1 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 32785 NR_038871 246312 Hs.473425 NR_038870 ENSG00000240770 C21orf91-OT1 D21S2089E|NCRNA00285 C21orf91 overlapping transcript 1 ncRNA 189.667-118 chr5 125962149 125962349 + 1 NA Intergenic (AGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -217328 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 203.667-18 chr11 40351064 40351417 + 1 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L1MA3|LINE|L1 -58110 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 162.333-78 chr14 75723246 75723497 + 1 NA intron (NM_015072, intron 12 of 31) intron (NM_015072, intron 12 of 31) 62125 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 220.333-108 chr4 132919154 132919543 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 229768 NR_125885 101927359 Hs.649960 NR_125885 ENSG00000250241 LOC101927359 - uncharacterized LOC101927359 ncRNA 157.667-169 chr20 35578326 35578502 + 1 NA intron (NR_119376, intron 31 of 42) AluY|SINE|Alu 29148 NR_119376 80307 Hs.72222 NR_001442 ENSG00000088340 FER1L4 C20orf124 fer-1 like family member 4 (pseudogene) pseudo 129.667-124 chr3 173593302 173593508 + 1 NA intron (NM_001365928, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 8971 NM_001365928 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 117.333-152 chr4 61055926 61056105 + 1 NA Intergenic Intergenic -87641 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 258.333-50 chr4 141515784 141516093 + 1 NA Intergenic Intergenic -120645 NM_000585 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 161.333-275 chr8 17632894 17633185 + 1 NA intron (NM_006207, intron 5 of 6) intron (NM_006207, intron 5 of 6) 43462 NM_001330470 57509 Hs.7946 NM_020749 ENSG00000129422 MTUS1 ATBP|ATIP|ATIP3|ICIS|MP44|MTSG1 microtubule associated scaffold protein 1 protein-coding 280.333-5 chr10 133496409 133497022 + 1 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -30648 NM_000773 1571 Hs.12907 NM_000773 ENSG00000130649 CYP2E1 CPE1|CYP2E|P450-J|P450C2E cytochrome P450 family 2 subfamily E member 1 protein-coding 415.667-8 chr6 54413438 54414039 + 1 NA Intergenic Intergenic 105297 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 133.667-119 chr5 66474724 66474964 + 1 NA Intergenic Intergenic 36760 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 201.333-2 chr1 11169679 11170045 + 1 NA intron (NM_004958, intron 28 of 57) intron (NM_004958, intron 28 of 57) -19493 NM_021146 10218 Hs.146559 NM_021146 ENSG00000171819 ANGPTL7 AngX|CDT6|dJ647M16.1 angiopoietin like 7 protein-coding 182.667-73 chr2 35292468 35292665 + 1 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 -178839 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 198.667-184 chr8 98997252 98997683 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15799 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 153.333-281 chr3 173376615 173376850 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -19220 NM_001365930 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 156.333-122 chr15 35914713 35914955 + 1 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL -12022 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 187.667-57 chr17 69591385 69591742 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -2424 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 112.333-77 chr14 69144715 69144882 + 1 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) intron (NM_003861, intron 1 of 8) 7801 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 146.667-153 chr2 29996990 29997278 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -75548 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 203.333-209 chr5 67544408 67544752 + 1 NA Intergenic Intergenic 102209 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 165.333-43 chr11 74604690 74604939 + 1 NA intron (NM_001363597, intron 3 of 11) intron (NM_001363597, intron 3 of 11) 12232 NR_046410 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 161.667-142 chr2 166123510 166123692 + 1 NA intron (NR_110260, intron 2 of 11) intron (NR_110260, intron 2 of 11) 4419 NM_006920 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 146.333-244 chr4 150426036 150426310 + 1 NA intron (NM_001367550, intron 46 of 56) intron (NM_001367550, intron 46 of 56) -152916 NR_149035 729558 Hs.647978 NR_149035 ENSG00000249690 LOC729558 - uncharacterized LOC729558 ncRNA 187.333-150 chr5 21826146 21826403 + 1 NA intron (NM_004061, intron 8 of 14) L2|LINE|L2 -58180 NR_132787 106635539 NR_132787 SNORA105A - small nucleolar RNA, H/ACA box 105A snoRNA 166.667-17 chr1 160133674 160133865 + 1 NA intron (NM_000702, intron 13 of 22) MIR3|SINE|MIR -17793 NM_144699 480 Hs.662219 NM_144699 ENSG00000132681 ATP1A4 ATP1A1|ATP1AL2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 4 protein-coding 172.667-41 chr12 54317808 54318028 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -7213 NR_073424 22818 Hs.505652 NM_016057 ENSG00000111481 COPZ1 CGI-120|COPZ|HSPC181|zeta-COP|zeta1-COP coatomer protein complex subunit zeta 1 protein-coding 151.667-354 chr8 32976341 32976586 + 1 NA Intergenic Intergenic 254628 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 221.667-42 chr2 68969286 68969514 + 1 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 -5173 NM_019617 56287 Hs.69319 NM_019617 ENSG00000169605 GKN1 AMP18|BRICD1|CA11|FOV|foveolin gastrokine 1 protein-coding 142.667-186 chr6 40606461 40606728 + 1 NA Intergenic Intergenic -19230 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 175.667-20 chr10 110188460 110188682 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -19034 NM_130439 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 151.333-162 chr16 68514323 68514486 + 1 NA Intergenic Intergenic -24809 NM_001305204 146198 Hs.461074 NM_133458 ENSG00000184939 ZFP90 FIK|NK10|ZNF756|zfp-90 ZFP90 zinc finger protein protein-coding 176.333-58 chr15 57493617 57493808 + 1 NA intron (NM_032866, intron 8 of 18) intron (NM_032866, intron 8 of 18) -98192 NR_104370 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 424.667-2 chr1 209257364 209258061 + 1 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -67744 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 191.333-153 chr5 16670573 16670963 + 1 NA exon (NM_012334, exon 39 of 41) exon (NM_012334, exon 39 of 41) -53710 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 153.667-314 chr5 63546741 63547030 + 1 NA Intergenic Intergenic 415407 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 263.333-33 chr17 40399955 40400439 + 1 NA intron (NM_001067, intron 23 of 34) intron (NM_001067, intron 23 of 34) 17699 NM_001067 7153 Hs.156346 NM_001067 ENSG00000131747 TOP2A TOP2|TP2A DNA topoisomerase II alpha protein-coding 208.333-157 chr9 38427940 38428285 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -3658 NM_001007563 347252 Hs.349705 NM_001007563 ENSG00000137142 IGFBPL1 IGFBP-RP4|IGFBPRP4|bA113O24.1 insulin like growth factor binding protein like 1 protein-coding 220.667-104 chr8 86747194 86747626 + 1 NA Intergenic Intergenic -3735 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 162.667-227 chr5 109768701 109769004 + 1 NA intron (NM_002372, intron 6 of 21) intron (NM_002372, intron 6 of 21) 79486 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 177.333-9 chr1 113040134 113040328 + 1 NA intron (NR_103777, intron 2 of 2) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 32871 NR_103777 100996251 Hs.382067 NR_103777 ENSG00000238198 LRIG2-DT - LRIG2 divergent transcript ncRNA 152.667-78 chr12 23634507 23634761 + 1 NA intron (NM_152989, intron 11 of 17) intron (NM_152989, intron 11 of 17) -50048 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 217.667-78 chr7 3207181 3207537 + 1 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -48786 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 188.667-123 chr5 44708714 44708963 + 1 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 99955 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 188.333-139 chr7 9629108 9629314 + 1 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -5059 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 265.667-11 chr10 74467572 74468049 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) intron (NM_001369124, intron 6 of 9) 61514 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 156.333-168 chr2 18818856 18819049 + 1 NA Intergenic Intergenic 208019 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 139.333-54 chr12 42358430 42358596 + 1 NA intron (NM_001364830, intron 3 of 6) AluJo|SINE|Alu 26715 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 134.333-160 chr7 75674140 75674361 + 1 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) L1MB3|LINE|L1 64691 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 203.667-47 chr2 21569876 21570209 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 140610 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 161.667-166 chr3 37370650 37370854 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -15517 NM_178344 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 253.333-98 chr7 25082257 25082587 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 42939 NM_018947 54205 Hs.437060 NM_018947 ENSG00000172115 CYCS CYC|HCS|THC4 cytochrome c, somatic protein-coding 236.333-81 chr6 118866702 118867144 + 1 NA intron (NM_017696, intron 6 of 11) L1M3de|LINE|L1 -27229 NM_014034 25842 Hs.292316 NM_014034 ENSG00000111875 ASF1A CGI-98|CIA|HSPC146 anti-silencing function 1A histone chaperone protein-coding 312.667 chr1 52235264 52235788 + 1 NA intron (NM_007324, intron 3 of 17) intron (NM_007324, intron 3 of 17) 93432 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 198.333-204 chr9 89407217 89407630 + 1 NA intron (NM_001371194, intron 2 of 15) intron (NM_001371194, intron 2 of 15) 72467 NM_001371200 291.333-29 chr17 60790041 60790444 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) intron (NM_001330413, intron 6 of 25) 112391 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 180.667-44 chr14 60539025 60539308 + 1 NA Intergenic Intergenic 30020 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 157.333-63 chr11 24909170 24909437 + 1 NA intron (NM_001009909, intron 6 of 11) intron (NM_001009909, intron 6 of 11) 412250 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 201.333-102 chr14 70397449 70397742 + 1 NA intron (NM_001202549, intron 1 of 4) MER52D|LTR|ERV1 19495 NM_001202549 100529257 Hs.443661 NM_001202547 ENSG00000258644 SYNJ2BP-COX16 - SYNJ2BP-COX16 readthrough protein-coding 148.333-407 chr9 21750656 21750939 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -51839 NM_002451 4507 Hs.193268 NM_002451 ENSG00000099810 MTAP BDMF|DMSFH|DMSMFH|HEL-249|LGMBF|MSAP|c86fus methylthioadenosine phosphorylase protein-coding 134.333-14 chr10 21991731 21991960 + 1 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 11885 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 145.333-276 chr7 79183639 79183816 + 1 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L1MA7|LINE|L1 174739 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 168.333-104 chr2 181218834 181219070 + 1 NA intron (NR_130784, intron 1 of 4) intron (NR_130784, intron 1 of 4) 86700 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 223.333-22 chr10 130182479 130182808 + 1 NA Intergenic Intergenic 46234 NM_001321980 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 310.667-3 chr1 168018687 168019297 + 1 NA intron (NM_001198956, intron 11 of 21) intron (NM_001198956, intron 11 of 21) 20332 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 162.667-128 chr2 72131224 72131448 + 1 NA 3' UTR (NM_019885, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_019885, exon 6 of 6) 16526 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 207.333-172 chr22 42285741 42286164 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -2025 NM_005650 6942 Hs.475018 NM_005650 ENSG00000100207 TCF20 AR1|DDVIBA|SPBP|TCF-20 transcription factor 20 protein-coding 197.667-151 chr8 122182795 122183107 + 1 NA Intergenic Intergenic 385693 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 192.667-71 chr17 26852747 26853032 + 1 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 236352 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 254.667-24 chr15 41453128 41453694 + 1 NA intron (NM_015138, intron 3 of 17) intron (NM_015138, intron 3 of 17) 36307 NM_015138 23168 Hs.511096 NM_015138 ENSG00000137815 RTF1 GTL7|KIAA0252 RTF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component protein-coding 159.667-206 chr22 37624143 37624411 + 1 NA intron (NM_001001560, intron 9 of 14) L2a|LINE|L2 15237 NM_001172688 26088 Hs.499158 NM_013365 ENSG00000100083 GGA1 - golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1 protein-coding 224.333-105 chr5 151368432 151368828 + 1 NA Intergenic Intergenic -21071 NM_181776 153201 Hs.483877 NM_181776 ENSG00000186335 SLC36A2 PAT2|TRAMD1 solute carrier family 36 member 2 protein-coding 127.333-116 chr3 120801601 120801824 + 1 NA Intergenic Intergenic 34645 NR_135571 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 260.333-27 chr19 13596316 13596632 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -89995 NM_001174080 773 Hs.501632 NM_000068 ENSG00000141837 CACNA1A APCA|BI|CACNL1A4|CAV2.1|EA2|EIEE42|FHM|HPCA|MHP|MHP1|SCA6 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A protein-coding 217.333-141 chr7 113320772 113321089 + 1 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -202348 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 208.333-28 chr12 59110646 59110952 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -190261 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 155.667-72 chr12 40322940 40323245 + 1 NA intron (NM_198578, intron 37 of 50) intron (NM_198578, intron 37 of 50) -70302 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 240.667-12 chr10 83011090 83011542 + 1 NA Intergenic Intergenic 665773 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 167.667-149 chr4 42517477 42517760 + 1 NA intron (NM_001105529, intron 21 of 35) intron (NM_001105529, intron 21 of 35) 120130 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 143.333-68 chr12 77129284 77129501 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -63823 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 168.333-139 chr4 23838036 23838297 + 1 NA intron (NM_001330752, intron 3 of 13) intron (NM_001330752, intron 3 of 13) 43126 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 178.667-126 chr5 32791193 32791505 + 1 NA 3' UTR (NM_001204376, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001204376, exon 8 of 8) 80028 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 128.667-54 chr14 47261713 47261862 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 81459 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 204.333-15 chr1 181496744 181497044 + 1 NA intron (NM_001205293, intron 1 of 47) UCON105|Unknown|Unknown 13377 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 194.667-108 chr4 66477505 66477868 + 1 NA Intergenic Intergenic 200862 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 205.333-47 chr11 104872305 104872652 + 1 NA Intergenic Intergenic 26192 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 167.667-140 chr3 113681392 113681674 + 1 NA intron (NM_001009899, intron 1 of 6) L1M1|LINE|L1 15109 NM_001009899 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 153.667-344 chr6 121347268 121347466 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -12638 NM_001367759 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 181.333-144 chr5 114960599 114960894 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -187333 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 265.333-79 chr7 113159215 113159516 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -40783 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 171.667-148 chr6 156604506 156604831 + 1 NA Intergenic Intergenic -173187 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 142.333-178 chr4 63121065 63121293 + 1 NA Intergenic Intergenic -959414 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 130.333-185 chr6 133515281 133515433 + 1 NA exon (NM_001301012, exon 15 of 18) exon (NM_001301012, exon 15 of 18) 273858 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 279.666-3 chr10 15158994 15159567 + 1 NA intron (NM_001308295, intron 1 of 12) (GACAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3933 NR_036506 100192204 Hs.714691 NR_036506 ENSG00000206448 PPIAP30 - peptidylprolyl isomerase A pseudogene 30 pseudo 127.667-11 chr1 224773487 224773775 + 1 NA Intergenic Intergenic -156023 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 118.667-121 chr20 48994697 48994882 + 1 NA intron (NM_006420, intron 22 of 38) intron (NM_006420, intron 22 of 38) 51267 NR_110625 102723483 Hs.209000 NR_110624 ENSG00000227431 CSE1L-AS1 - CSE1L antisense RNA 1 ncRNA 156.333-393 chrX 150869779 150870047 + 1 NA intron (NM_001242614, intron 1 of 11) intron (NM_001242614, intron 1 of 11) 28755 NM_134446 83692 Hs.522805 NM_031462 ENSG00000102181 CD99L2 CD99B|MIC2L1 CD99 molecule like 2 protein-coding 145.333-77 chr14 29726449 29726639 + 1 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 200552 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 150.333-389 chr7 113844182 113844376 + 1 NA Intergenic Intergenic 74730 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 127.667-96 chr2 173986323 173986526 + 1 NA Intergenic Intergenic -20722 NM_001172712 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 308.333-5 chr10 21641374 21641894 + 1 NA intron (NM_001195626, intron 8 of 22) AluJo|SINE|Alu 107462 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 178.667-113 chr4 33941531 33941822 + 1 NA intron (NR_125902, intron 4 of 4) intron (NR_125902, intron 4 of 4) 98217 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 164.667-149 chr3 128502258 128502570 + 1 NA non-coding (NR_125398, exon 3 of 3) non-coding (NR_125398, exon 3 of 3) -5421 NR_026954 90246 Hs.635164 NR_026954 LOC90246 - uncharacterized LOC90246 ncRNA 149.667-3 chr1 25122200 25122392 + 1 NA Intergenic Intergenic 98793 NR_039623 100616365 NR_039623 ENSG00000264371 MIR4425 - microRNA 4425 ncRNA 162.333-116 chr2 99214366 99214599 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 33298 NM_145212 51263 Hs.346736 NM_016503 ENSG00000185414 MRPL30 L28MT|L30MT|MRP-L28|MRP-L30|MRPL28|MRPL28M|RPML28 mitochondrial ribosomal protein L30 protein-coding 145.667-267 chr7 34402211 34402434 + 1 NA intron (NR_033665, intron 3 of 3) L1ME4a|LINE|L1 -255896 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 130.333-126 chr3 10123228 10123384 + 1 NA intron (NM_018462, intron 1 of 2) intron (NM_018462, intron 1 of 2) 7631 NM_018462 55845 Hs.649307 NM_018462 ENSG00000254999 BRK1 C3orf10|HSPC300|MDS027|hHBrk1 BRICK1 subunit of SCAR/WAVE actin nucleating complex protein-coding 162.667-119 chr2 4649351 4649700 + 1 NA intron (NR_034134, intron 3 of 4) intron (NR_034134, intron 3 of 4) 6697 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 340.667-2 chr1 179532155 179532700 + 1 NA intron (NR_073544, intron 23 of 25) intron (NR_073544, intron 23 of 25) 43521 NM_001297575 7827 Hs.412710 NM_014625 ENSG00000116218 NPHS2 PDCN|SRN1 NPHS2 stomatin family member, podocin protein-coding 198.667-125 chr22 44501110 44501468 + 1 NA Intergenic LTR45|LTR|ERV1 -3056 NM_032287 84247 Hs.744991 NM_032287 ENSG00000188636 RTL6 LDOC1L|Mar6|Mart6|SIRH3|dJ1033E15.2 retrotransposon Gag like 6 protein-coding 262.333-13 chr10 60535442 60535754 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) 37358 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 130.667-181 chr7 3179304 3179499 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -20828 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 167.667-67 chr15 65468285 65468496 + 1 NA intron (NR_135485, intron 12 of 20) AluJo|SINE|Alu -45443 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 166.667-173 chr4 154482040 154482232 + 1 NA intron (NM_001358235, intron 1 of 19) intron (NM_001358235, intron 1 of 19) 9663 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 164.667-166 chr4 89266708 89266875 + 1 NA intron (NM_198281, intron 1 of 1) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 41009 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 125.667-121 chr3 84042378 84042597 + 1 NA Intergenic Intergenic 827088 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 163.333-65 chr12 49363607 49363947 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -3128 NM_001293286 65244 Hs.654826 NM_023071 ENSG00000123352 SPATS2 Nbla00526|P59SCR|SCR59|SPATA10 spermatogenesis associated serine rich 2 protein-coding 288.333-5 chr10 62794196 62794630 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10307 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 162.333-148 chr22 25849611 25849804 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 20 of 43) MIR|SINE|MIR 107519 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 300.667-5 chr12 112179486 112179803 + 1 NA intron (NM_001109662, intron 62 of 75) intron (NM_001109662, intron 62 of 75) -16323 NR_106921 102465519 NR_106921 ENSG00000283793 MIR6861 hsa-mir-6861 microRNA 6861 ncRNA 130.333-48 chr11 115292652 115292918 + 1 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) MIRc|SINE|MIR -40792 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 293.667-31 chr2 209655344 209656011 + 1 NA intron (NM_001039538, intron 5 of 14) intron (NM_001039538, intron 5 of 14) 75998 NM_031845 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 216.333-23 chr10 111530574 111530936 + 1 NA Intergenic Intergenic 416464 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 141.333-54 chr13 41850905 41851073 + 1 NA intron (NM_001009814, intron 12 of 25) L1M3e|LINE|L1 110096 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 157.333-359 chr9 71006230 71006456 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) L1MA6|LINE|L1 115278 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 215.333-174 chr6 71157384 71157759 + 1 NA Intergenic Intergenic -131240 NM_024576 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 199.667-73 chr2 61331085 61331428 + 1 NA intron (NM_014709, intron 20 of 79) intron (NM_014709, intron 20 of 79) 86121 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 210.333-114 chr4 56691742 56692202 + 1 NA Intergenic Intergenic -10266 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 189.667-100 chr3 136448263 136448514 + 1 NA intron (NM_005862, intron 14 of 33) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 198048 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 177.667-151 chr9 108493242 108493602 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 362564 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 187.667-124 chr5 163808267 163808483 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 302756 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 202.667-2 chr1 40294874 40295328 + 1 NA TTS (NM_005857) TTS (NM_005857) 22185 NM_001852 1298 Hs.418012 NM_001852 ENSG00000049089 COL9A2 DJ39G22.4|EDM2|MED|STL5 collagen type IX alpha 2 chain protein-coding 195.333-79 chr14 64897272 64897574 + 1 NA Intergenic Intergenic -16938 NM_001202559 100529261 Hs.325531 NM_001202558 ENSG00000125954 CHURC1-FNTB FNTB|FTase-beta CHURC1-FNTB readthrough protein-coding 302.333-22 chr22 26949375 26949833 + 1 NA Intergenic Intergenic 46312 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 426.333-7 chr8 133399042 133399655 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -102044 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 177.667-148 chr9 89528053 89528367 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -30237 NM_001371194 244.667-80 chr5 159318970 159319320 + 1 NA intron (NM_002187, intron 5 of 7) intron (NM_002187, intron 5 of 7) 11328 NM_002187 3593 Hs.674 NM_002187 ENSG00000113302 IL12B CLMF|CLMF2|IL-12B|IMD28|IMD29|NKSF|NKSF2 interleukin 12B protein-coding 283.667-22 chr22 17215223 17215568 + 1 NA intron (NM_001282225, intron 1 of 9) AluSg|SINE|Alu 4040 NM_001282226 51816 Hs.170310 NM_017424 ENSG00000093072 ADA2 ADGF|CECR1|IDGFL|PAN|SNEDS|VAIHS adenosine deaminase 2 protein-coding 239.333-40 chr17 19373749 19374107 + 1 NA intron (NM_001368769, intron 1 of 6) intron (NM_001368769, intron 1 of 6) -3793 NM_139033 5598 Hs.150136 NM_002749 ENSG00000166484 MAPK7 BMK1|ERK4|ERK5|PRKM7 mitogen-activated protein kinase 7 protein-coding 301.667-42 chr8 120719308 120719645 + 1 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) -41777 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 159.667-80 chr12 60905902 60906116 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 1216639 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 157.667-125 chr18 6821403 6821626 + 1 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -12971 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 134.667-172 chr6 70122160 70122307 + 1 NA intron (NM_001858, intron 17 of 50) intron (NM_001858, intron 17 of 50) 160964 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 184.333-31 chr13 106911645 106911901 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 257893 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 307.667-23 chr22 27905666 27906238 + 1 NA intron (NM_001284278, intron 3 of 11) intron (NM_001284278, intron 3 of 11) 13262 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 277.667-52 chrX 103262909 103263246 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -7884 NM_001006684 90843 Hs.389734 NM_153333 ENSG00000180964 TCEAL8 WEX3 transcription elongation factor A like 8 protein-coding 244.333-78 chr4 171949783 171950215 + 1 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) L1MEd|LINE|L1 -136392 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 173.333-152 chr5 9893589 9893949 + 1 NA intron (NR_027112, intron 2 of 12) intron (NR_027112, intron 2 of 12) 10055 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 154.333-347 chr8 109207095 109207257 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 120548 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 150.667-295 chr5 33237934 33238184 + 1 NA intron (NR_147008, intron 1 of 3) intron (NR_147008, intron 1 of 3) 8324 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 183.333-46 chr14 65308140 65308523 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 26852 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 168.333-131 chr3 110587120 110587322 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 482738 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 168.667-118 chr2 236037390 236037668 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 14 of 17) AluJr|SINE|Alu 130857 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 411.667-10 chr9 122551336 122551930 + 1 NA Intergenic Intergenic -1479 NM_001004457 138882 Hs.632682 NM_001004457 ENSG00000171501 OR1N2 OR9-23 olfactory receptor family 1 subfamily N member 2 protein-coding 265.333-91 chr8 143446896 143447286 + 1 NA intron (NM_015117, intron 9 of 11) intron (NM_015117, intron 9 of 11) -16359 NM_201589 389692 NM_201589 ENSG00000182759 MAFA INSDM|RIPE3b1|hMafA MAF bZIP transcription factor A protein-coding 166.333-248 chrX 96036279 96036533 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 301496 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 241.667-65 chr4 106981453 106981811 + 1 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) intron (NM_014421, intron 1 of 3) 54681 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 197.333-2 chr1 43153463 43153800 + 1 NA intron (NM_001101376, intron 3 of 3) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 5727 NM_001101376 440585 Hs.657614 NM_001101376 ENSG00000186973 FAM183A - family with sequence similarity 183 member A protein-coding 186.333-63 chr18 22343370 22343616 + 1 NA Intergenic Intergenic 74422 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 158.667-225 chr3 187083267 187083461 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 44646 NM_001353916 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 170.667-141 chr5 173996027 173996262 + 1 NA intron (NM_001144954, intron 1 of 4) intron (NM_001144954, intron 1 of 4) 6974 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 258.667-67 chr3 187566133 187566622 + 1 NA Intergenic Intergenic 104017 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 160.333-71 chr12 19039991 19040245 + 1 NA Intergenic Intergenic -89615 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 215.333-78 chr18 34312396 34312719 + 1 NA Intergenic Intergenic -89006 NM_003787 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 145.333-299 chr8 81936295 81936531 + 1 NA Intergenic Intergenic -94127 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 356.333-26 chr8 134346474 134346931 + 1 NA Intergenic Intergenic -251369 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 202.333-145 chr5 80912181 80912493 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -48026 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 246.333-48 chr2 15498029 15498332 + 1 NA intron (NR_052013, intron 11 of 50) intron (NR_052013, intron 11 of 50) 63154 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 133.667-104 chr3 170374259 170374494 + 1 NA intron (NM_001145097, intron 1 of 5) intron (NM_001145097, intron 1 of 5) 14753 NM_001145097 6498 Hs.536655 NM_005414 ENSG00000136603 SKIL SNO|SnoA|SnoI|SnoN SKI like proto-oncogene protein-coding 177.333-176 chr9 5425938 5426252 + 1 NA intron (NM_018465, intron 3 of 5) intron (NM_018465, intron 3 of 5) 11830 NM_018465 55848 Hs.584242 NM_018465 ENSG00000107020 PLGRKT AD025|C9orf46|MDS030|PLG-RKT|Plg-R(KT) plasminogen receptor with a C-terminal lysine protein-coding 144.667-131 chr2 25651597 25651851 + 1 NA intron (NM_033147, intron 2 of 19) intron (NM_033147, intron 2 of 19) -1502 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 158.667-195 chr22 34212356 34212542 + 1 NA Intergenic Intergenic -289561 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 219.333-44 chr12 132912820 132913101 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 25118 NR_110919 101928530 Hs.560003 NR_110919 ENSG00000236617 LOC101928530 - uncharacterized LOC101928530 ncRNA 135.333-25 chr10 82332613 82332836 + 1 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -99804 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 306.667-15 chr16 78453471 78453962 + 1 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 354062 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 158.333-18 chr1 181303718 181303914 + 1 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 67428 NR_046249 100287948 Hs.742594 NR_046249 ENSG00000179452 LINC01699 GM140 long intergenic non-protein coding RNA 1699 ncRNA 124.333-126 chr4 36645033 36645207 + 1 NA Intergenic Intergenic -3220 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 317.667-35 chr5 116961846 116962284 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -199856 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 146.667-44 chr10 98425820 98426098 + 1 NA exon (NM_001322477, exon 12 of 20) exon (NM_001322477, exon 12 of 20) 5401 NR_039833 100616482 NR_039833 ENSG00000264610 MIR4685 - microRNA 4685 ncRNA 193.667-71 chr20 11849297 11849606 + 1 NA intron (NR_110635, intron 1 of 1) intron (NR_110635, intron 1 of 1) 21264 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 142.333-245 chr8 126237046 126237211 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -88367 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 166.667-250 chrX 148924711 148924983 + 1 NA intron (NM_001170628, intron 6 of 17) intron (NM_001170628, intron 6 of 17) 205756 NM_001170628 2334 Hs.496911 NM_002025 ENSG00000155966 AFF2 FMR2|FMR2P|FRAXE|MRX2|OX19 AF4/FMR2 family member 2 protein-coding 198.333-43 chr12 14912492 14912918 + 1 NA Intergenic Intergenic 16420 NM_001300784 121506 Hs.162143 NM_152321 ENSG00000139055 ERP27 C12orf46|PDIA8 endoplasmic reticulum protein 27 protein-coding 157.667-104 chr14 74027121 74027337 + 1 NA intron (NM_025057, intron 2 of 11) AluSx|SINE|Alu 7880 NM_025057 80127 Hs.644621 NM_025057 ENSG00000119636 BBOF1 C14orf45|CCDC176 basal body orientation factor 1 protein-coding 115.333-217 chr8 86515898 86516078 + 1 NA intron (NM_003909, intron 2 of 16) intron (NM_003909, intron 2 of 16) 1553 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 221.667-24 chr12 101939926 101940299 + 1 NA Intergenic Intergenic 62532 NM_018370 55332 Hs.525634 NM_018370 ENSG00000136048 DRAM1 DRAM DNA damage regulated autophagy modulator 1 protein-coding 204.333-50 chr14 51656543 51656950 + 1 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) intron (NM_001267046, intron 1 of 13) 4836 NM_152330 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 291.667-12 chr11 72971493 72971918 + 1 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 157294 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 160.667-335 chrX 131642649 131642957 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 98729 NM_001004486 347468 Hs.553711 NM_001004486 ENSG00000171054 OR13H1 ORX1 olfactory receptor family 13 subfamily H member 1 protein-coding 169.333-145 chr21 20484989 20485190 + 1 NA Intergenic Intergenic -226404 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 145.667-80 chr14 61839132 61839386 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 26556 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 115.667-234 chrX 78336947 78337198 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -9381 NM_001282186 10800 Hs.733809 NM_006639 ENSG00000173198 CYSLTR1 CYSLT1|CYSLT1R|CYSLTR|HMTMF81 cysteinyl leukotriene receptor 1 protein-coding 173.333-100 chr2 160000655 160000932 + 1 NA intron (NM_001007267, intron 11 of 26) L1MB3|LINE|L1 61822 NM_001195641 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 155.333-58 chr11 97947953 97948142 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -1072902 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 255.667-66 chr4 119017047 119017436 + 1 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) intron (NM_001128934, intron 1 of 4) -118543 NM_016599 51778 Hs.732122 NM_016599 ENSG00000172399 MYOZ2 C4orf5|CMH16|CS-1|FATZ-2 myozenin 2 protein-coding 143.333-17 chr1 211685753 211685920 + 1 NA intron (NR_148994, intron 3 of 3) intron (NR_148994, intron 3 of 3) 10074 NR_148994 91548 Hs.367839 NR_148994 LOC91548 - uncharacterized LOC91548 ncRNA 153.667-383 chr8 92381016 92381216 + 1 NA Intergenic Intergenic 274378 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 211.333-228 chr8 21254934 21255218 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -43163 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 154.667-30 chr1 218711226 218711457 + 1 NA intron (NR_031644, intron 4 of 6) intron (NR_031644, intron 4 of 6) 201246 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 186.333-86 chr2 202963387 202963794 + 1 NA intron (NR_136330, intron 8 of 14) MER1A|DNA|hAT-Charlie -51289 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 117.333-212 chr8 127280965 127281118 + 1 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 36404 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 151.333-60 chr10 80312435 80312679 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -22899 NM_000429 4143 Hs.282670 NM_000429 ENSG00000151224 MAT1A MAT|MATA1|SAMS|SAMS1 methionine adenosyltransferase 1A protein-coding 121.667-171 chr5 139665252 139665428 + 1 NA intron (NM_001317207, intron 1 of 2) intron (NM_001317207, intron 1 of 2) 5785 NM_001317206 51523 Hs.189119 NM_016463 ENSG00000171604 CXXC5 CF5|HSPC195|RINF|WID CXXC finger protein 5 protein-coding 200.667-101 chr22 21769033 21769268 + 1 NA 3' UTR (NM_138957, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_138957, exon 8 of 8) -33356 NM_013313 29799 Hs.517436 NM_013313 ENSG00000100027 YPEL1 FKSG3 yippee like 1 protein-coding 143.333-202 chr4 48601977 48602216 + 1 NA exon (NM_015030, exon 13 of 64) exon (NM_015030, exon 13 of 64) 111844 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 165.333-145 chr20 49900187 49900454 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 13419 NM_001135773 9825 Hs.48513 NM_006038 ENSG00000158480 SPATA2 PD1|PPP1R145|tamo spermatogenesis associated 2 protein-coding 169.333-54 chr12 65081625 65081822 + 1 NA intron (NM_007191, intron 2 of 9) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 39582 NM_007191 11197 Hs.284122 NM_007191 ENSG00000156076 WIF1 WIF-1 WNT inhibitory factor 1 protein-coding 239.667-32 chr18 6273802 6274114 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 17214 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-37 chr12 61173081 61173382 + 1 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 1019608 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 285.667-30 chr21 29274722 29275182 + 1 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -23970 NM_001186 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 211.667-45 chr17 19264297 19264543 + 1 NA intron (NM_001102664, intron 1 of 7) intron (NM_001102664, intron 1 of 7) -6973 NR_046824 100874309 Hs.733657 NR_046824 EPN2-IT1 - EPN2 intronic transcript 1 ncRNA 137.667-177 chr7 79675400 79675569 + 1 NA Intergenic Intergenic 221524 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 416.333-6 chr14 72595442 72596144 + 1 NA Intergenic Intergenic 78973 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 186.333-172 chr8 134604206 134604540 + 1 NA intron (NM_020863, intron 5 of 15) intron (NM_020863, intron 5 of 15) 6302 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 158.667-244 chr4 81039400 81039581 + 1 NA intron (NM_001201, intron 1 of 2) intron (NM_001201, intron 1 of 2) 8782 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 185.333-18 chr10 37261228 37261434 + 1 NA Intergenic Intergenic -47855 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 229.667-10 chr10 24226507 24226812 + 1 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) AluSc8|SINE|Alu 17521 NM_019590 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 228.333-10 chr10 124528540 124528828 + 1 NA intron (NM_022126, intron 6 of 6) intron (NM_022126, intron 6 of 6) 66861 NM_001318331 64077 Hs.527748 NM_022126 ENSG00000107902 LHPP HDHD2B phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase protein-coding 315.333-25 chr20 7664119 7664625 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 276086 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 161.333-36 chr10 74970211 74970381 + 1 NA intron (NM_001370144, intron 6 of 15) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -51437 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 156.667-179 chr2 51958880 51959120 + 1 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -411648 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 180.333-100 chr5 133050282 133050634 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -1555 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 211.333-164 chr4 44299381 44299706 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) AluSc5|SINE|Alu 149266 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 266.333-63 chr8 13338651 13339157 + 1 NA intron (NM_024767, intron 4 of 4) intron (NM_024767, intron 4 of 4) -62120 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 152.333-71 chr11 114117898 114118082 + 1 NA intron (NM_006006, intron 2 of 6) intron (NM_006006, intron 2 of 6) 54779 NM_001354752 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 154.333-180 chr2 234922017 234922320 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -29849 NM_014521 23677 Hs.516777 NM_014521 ENSG00000130147 SH3BP4 BOG25|TTP SH3 domain binding protein 4 protein-coding 195.333-75 chr14 25708279 25708627 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -658156 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 149.333-97 chr12 120817048 120817334 + 1 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu 87167 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 168.667-24 chr10 64923823 64924132 + 1 NA intron (NR_134456, intron 1 of 1) L1M2|LINE|L1 541 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 137.333-41 chr13 98711715 98711880 + 1 NA intron (NM_005073, intron 11 of 22) intron (NM_005073, intron 11 of 22) 40875 NM_005073 6564 Hs.436893 NM_005073 ENSG00000088386 SLC15A1 HPECT1|HPEPT1|PEPT1 solute carrier family 15 member 1 protein-coding 170.333-232 chr9 91823857 91824073 + 1 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) intron (NM_001318204, intron 1 of 7) 126263 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 150.333-219 chr2 169483619 169483791 + 1 NA intron (NM_152384, intron 2 of 11) intron (NM_152384, intron 2 of 11) 4211 NM_152384 129880 Hs.233398 NM_152384 ENSG00000163093 BBS5 - Bardet-Biedl syndrome 5 protein-coding 269.333-13 chr12 18374704 18374990 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 13 of 32) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 113307 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 118.667-80 chr16 68203121 68203267 + 1 NA intron (NM_173165, intron 9 of 9) intron (NM_173165, intron 9 of 9) 30305 NR_106831 102466194 NR_106831 ENSG00000284259 MIR6773 hsa-mir-6773 microRNA 6773 ncRNA 172.667-81 chr2 63491437 63491744 + 1 NA intron (NR_148704, intron 3 of 18) HAL1|LINE|L1 -53583 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 307.333-49 chr20 59516647 59516973 + 1 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu -60699 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 196.333-164 chr8 82805423 82805691 + 1 NA Intergenic Intergenic -106547 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 129.667-186 chr9 90349937 90350107 + 1 NA intron (NR_109795, intron 2 of 2) L1PA15|LINE|L1 83467 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 334.333-18 chr18 34181669 34182198 + 1 NA intron (NM_001353232, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 40537 NM_001353235 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 299.333-45 chr2 221005379 221005685 + 1 NA Intergenic Intergenic 566772 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 140.667-107 chr2 15508333 15508583 + 1 NA intron (NR_052013, intron 10 of 50) intron (NR_052013, intron 10 of 50) 52876 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 165.667-44 chr14 25563807 25563984 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -513598 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 159.333-339 chr8 122633898 122634081 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 60117 NR_126348 104266958 Hs.575540 NR_126348 ENSG00000253819 LINC01151 - long intergenic non-protein coding RNA 1151 ncRNA 193.667-15 chr1 221665084 221665377 + 1 NA Intergenic Intergenic 71670 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 219.667-45 chr20 36416953 36417308 + 1 NA intron (NM_001365621, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 -44338 NM_001042486 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 187.333-35 chr11 107517735 107517984 + 1 NA intron (NM_138775, intron 10 of 11) L1MA8|LINE|L1 47876 NM_001301010 91801 Hs.503763 NM_138775 ENSG00000137760 ALKBH8 ABH8|TRM9|TRMT9|TRMT9A alkB homolog 8, tRNA methyltransferase protein-coding 146.333-54 chr11 107989275 107989474 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -19524 NM_003478 8065 Hs.440320 NM_003478 ENSG00000166266 CUL5 CUL-5|VACM-1|VACM1 cullin 5 protein-coding 112.333-11 chr1 200731608 200731765 + 1 NA Intergenic MER57C1|LTR|ERV1 -7886 NM_001297707 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 166.333-196 chr6 39404230 39404418 + 1 NA intron (NM_001289024, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 27066 NM_001289024 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 192.333-43 chr12 107114742 107115039 + 1 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -21341 NM_004075 1407 Hs.151573 NM_004075 ENSG00000008405 CRY1 DSPD|PHLL1 cryptochrome circadian regulator 1 protein-coding 210.667-87 chr3 72383602 72383981 + 1 NA intron (NM_012234, intron 1 of 3) intron (NM_012234, intron 1 of 3) 62832 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 196.333-170 chr9 71311514 71311872 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) L1MC1|LINE|L1 135278 NM_001366141 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 144.667-54 chr12 40076585 40076857 + 1 NA intron (NM_052885, intron 1 of 9) L1PA15|LINE|L1 29360 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 348.333-8 chr10 116495429 116495924 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -50255 NM_000936 5406 Hs.501135 NM_000936 ENSG00000175535 PNLIP PL|PNLIPD|PTL pancreatic lipase protein-coding 129.333-124 chr3 64729848 64730065 + 1 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -41956 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 238.667-65 chr5 4130995 4131279 + 1 NA Intergenic Intergenic 535305 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 417.667-6 chr3 19129276 19129892 + 1 NA Intergenic Intergenic -18926 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 149.667-343 chr6 37877708 37877991 + 1 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 58122 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 138.667-84 chr17 80556334 80556567 + 1 NA intron (NM_020761, intron 1 of 33) AluJb|SINE|Alu 11612 NM_020761 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 124.333-151 chr5 150610660 150610956 + 1 NA intron (NM_001166208, intron 1 of 2) intron (NM_001166208, intron 1 of 2) -6836 NM_001166209 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 148.333-280 chr4 48819178 48819333 + 1 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -11788 NM_001079841 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 151.333-201 chr2 43053503 43053664 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -14040 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 340.333-6 chr16 80869006 80869441 + 1 NA intron (NR_131948, intron 1 of 2) L1MD2|LINE|L1 23373 NR_131948 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 240.667-51 chr2 236061937 236062307 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 16 of 17) intron (NM_001037131, intron 16 of 17) 106264 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 202.333-103 chr20 58560655 58561081 + 1 NA intron (NR_034147, intron 6 of 6) L1MEf|LINE|L1 -45469 NM_001304787 164284 Hs.119286 NM_153360 ENSG00000198768 APCDD1L - APC down-regulated 1 like protein-coding 157.667-292 chr7 15198344 15198602 + 1 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -223615 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 122.333-194 chr7 75675683 75675881 + 1 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) AluJr4|SINE|Alu 63159 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 136.333-39 chr12 14366525 14366677 + 1 NA intron (NM_001286515, intron 1 of 12) intron (NM_001286515, intron 1 of 12) 919 NM_001286514 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 206.667-34 chr13 102518582 102519018 + 1 NA Intergenic Intergenic -78186 NM_003291 7174 Hs.432424 NM_003291 ENSG00000134900 TPP2 TPP-2|TPP-II|TPPII tripeptidyl peptidase 2 protein-coding 160.333-16 chr1 76568875 76569109 + 1 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) intron (NM_001349109, intron 3 of 3) 210275 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 145.333-309 chr8 129659149 129659386 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 20972 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 196.667-60 chr17 60367914 60368325 + 1 NA intron (NM_032582, intron 1 of 33) intron (NM_032582, intron 1 of 33) 24014 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 152.667-307 chr5 148657528 148657755 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -3114 NR_104445 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 151.667-205 chr3 10254076 10254330 + 1 NA intron (NM_014760, intron 2 of 7) intron (NM_014760, intron 2 of 7) 5744 NM_014760 9797 Hs.475401 NM_014760 ENSG00000157014 TATDN2 - TatD DNase domain containing 2 protein-coding 246.667-102 chr8 124409038 124409451 + 1 NA Intergenic Intergenic -36545 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 176.333-181 chr9 101900204 101900443 + 1 NA Intergenic Intergenic -161743 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 173.333-73 chr17 58216824 58217025 + 1 NA intron (NM_001321269, intron 2 of 16) MIRb|SINE|MIR 2331 NM_001330397 54903 Hs.408843 NM_017777 ENSG00000011143 MKS1 BBS13|JBTS28|MES|MKS|POC12 MKS transition zone complex subunit 1 protein-coding 161.667-48 chr12 1559280 1559541 + 1 NA Intergenic Intergenic -27218 NR_160736 107984507 NR_160736 LOC107984507 - uncharacterized LOC107984507 ncRNA 161.667-155 chr20 21062761 21062948 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 43504 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 237.667-48 chr20 40456387 40456712 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 232687 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 139.667-119 chr3 93856571 93856715 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 117438 NM_001314077 5627 Hs.64016 NM_000313 ENSG00000184500 PROS1 PROS|PS21|PS22|PS23|PS24|PS25|PSA|THPH5|THPH6 protein S protein-coding 164.667-135 chr22 26911371 26911658 + 1 NA intron (NR_110540, intron 2 of 2) intron (NR_110540, intron 2 of 2) 8222 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 204.333-171 chr6 21508180 21508408 + 1 NA intron (NR_103790, intron 1 of 3) Plat_L3|LINE|CR1 3598 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 173.667-11 chr1 200516664 200516854 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 102079 NM_001305792 9928 Hs.3104 NM_014875 ENSG00000118193 KIF14 MCPH20|MKS12 kinesin family member 14 protein-coding 276.667-38 chr2 73715472 73715903 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14347 NR_132338 51471 Hs.278983 NM_016347 ENSG00000204872 NAT8B CML2|Hcml2|NAT8BP N-acetyltransferase 8B (putative, gene/pseudogene) protein-coding 223.667-58 chr4 108533950 108534338 + 1 NA Intergenic Intergenic -23089 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 137.333-33 chr12 14997997 14998240 + 1 NA Intergenic Intergenic -3715 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 151.667-236 chr3 157399422 157399670 + 1 NA intron (NM_024621, intron 6 of 13) intron (NM_024621, intron 6 of 13) -37304 NM_002852 5806 Hs.591286 NM_002852 ENSG00000163661 PTX3 TNFAIP5|TSG-14 pentraxin 3 protein-coding 165.667-154 chr5 19699110 19699329 + 1 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 187053 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 266.667-27 chr15 56156938 56157239 + 1 NA intron (NM_001368073, intron 2 of 8) intron (NM_001368073, intron 2 of 8) 32844 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 153.333-211 chr2 128012521 128012730 + 1 NA intron (NM_001330303, intron 6 of 19) intron (NM_001330303, intron 6 of 19) 14670 NM_001145928 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 208.333-81 chr2 167167948 167168344 + 1 NA intron (NM_152381, intron 3 of 10) L1MC1|LINE|L1 -19226 NM_001199145 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 162.333-167 chr3 106106092 106106256 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -236773 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 326.333-35 chr8 99511775 99512275 + 1 NA intron (NM_017890, intron 29 of 61) intron (NM_017890, intron 29 of 61) 24705 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 262.333-72 chr6 108060978 108061471 + 1 NA intron (NM_014028, intron 2 of 5) intron (NM_014028, intron 2 of 5) 13517 NM_014028 28962 Hs.226780 NM_014028 ENSG00000081087 OSTM1 GIPN|GL|HSPC019|OPTB5 osteoclastogenesis associated transmembrane protein 1 protein-coding 173.333-222 chrX 79179753 79180158 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 8983 NM_032553 84636 Hs.326713 NM_032553 ENSG00000147138 GPR174 FKSG79|GPCR17|LYPSR3 G protein-coupled receptor 174 protein-coding 169.333-274 chr8 125136423 125136609 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) intron (NM_001349486, intron 3 of 7) 44656 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 145.667-64 chr12 62777628 62777869 + 1 NA intron (NM_020700, intron 4 of 9) intron (NM_020700, intron 4 of 9) 157402 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 213.667-14 chr10 44191067 44191398 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -101518 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 123.667-122 chr3 83766725 83766914 + 1 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 1102756 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 186.333-25 chr11 12778787 12779001 + 1 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 104473 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 242.667-41 chr16 80507236 80507533 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -33350 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 161.333-116 chr17 61436296 61436506 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -16021 NM_001321120 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 311.333-44 chr5 15148360 15148821 + 1 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 117970 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 231.667-67 chrX 71517419 71517757 + 1 NA intron (NR_104396, intron 1 of 2) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -15516 NM_181673 8473 Hs.405410 NM_003605 ENSG00000147162 OGT HINCUT-1|HRNT1|MRX106|O-GLCNAC|OGT1 O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase protein-coding 146.333-151 chr2 74604884 74605053 + 1 NA intron (NM_001321739, intron 4 of 10) AluSx|SINE|Alu 43069 NM_138804 130951 Hs.348645 NM_138804 ENSG00000159374 M1AP C2orf65|D6Mm5e|SPATA37 meiosis 1 associated protein protein-coding 189.333-32 chr10 94945738 94945997 + 1 NA intron (NM_000771, intron 3 of 8) L1PA8|LINE|L1 7209 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 219.667-33 chr17 63830161 63830550 + 1 NA exon (NM_002805, exon 6 of 12) exon (NM_002805, exon 6 of 12) 2671 NM_001199163 5705 Hs.79387 NM_002805 ENSG00000087191 PSMC5 S8|SUG-1|SUG1|TBP10|TRIP1|p45|p45/SUG proteasome 26S subunit, ATPase 5 protein-coding 178.333-50 chr14 61301184 61301402 + 1 NA Intergenic Intergenic -19955 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 181.333-126 chr4 72337576 72337813 + 1 NA intron (NM_014243, intron 5 of 21) intron (NM_014243, intron 5 of 21) 231527 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 267.667-42 chr3 148190874 148191332 + 1 NA Intergenic Intergenic -89788 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 261.333-27 chr14 60319241 60319796 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -3678 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 187.333-170 chr5 170522172 170522367 + 1 NA intron (NM_001278339, intron 1 of 7) intron (NM_001278339, intron 1 of 7) 18249 NM_001278339 30820 Hs.484111 NM_014592 ENSG00000182132 KCNIP1 KCHIP1|VABP potassium voltage-gated channel interacting protein 1 protein-coding 323.333-26 chr5 37660281 37660813 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) L1M5|LINE|L1 174275 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 156.667-157 chr18 13995181 13995480 + 1 NA Intergenic Intergenic -79623 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 145.667-54 chr12 6246840 6247036 + 1 NA Intergenic Intergenic 46538 NM_001769 928 Hs.114286 NM_001769 ENSG00000010278 CD9 BTCC-1|DRAP-27|MIC3|MRP-1|TSPAN-29|TSPAN29 CD9 molecule protein-coding 251.667-87 chr7 83767071 83767495 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -118144 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 153.333-33 chr1 214348425 214348666 + 1 NA TTS (NM_005401) TTS (NM_005401) 67386 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 175.333-54 chr15 45996740 45997038 + 1 NA Intergenic Intergenic 291694 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 151.667-28 chr1 196074649 196074949 + 1 NA intron (NR_146895, intron 1 of 3) intron (NR_146895, intron 1 of 3) 13916 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 296.333-28 chr3 44271049 44271553 + 1 NA intron (NM_001145030, intron 8 of 19) L1ME3A|LINE|L1 29415 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 162.333-213 chr6 41901998 41902245 + 1 NA Intergenic Intergenic -6746 NM_018561 25862 Hs.593575 NM_018561 ENSG00000164663 USP49 - ubiquitin specific peptidase 49 protein-coding 170.667-54 chr15 60420890 60421227 + 1 NA non-coding (NR_147171, exon 17 of 17) non-coding (NR_147171, exon 17 of 17) -23072 NM_004039 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 257.333-103 chr8 121550041 121550508 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -89072 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 132.667-46 chr13 79199507 79199734 + 1 NA Intergenic Intergenic 206601 NM_001286632 64062 Hs.558528 NM_018605 ENSG00000139746 RBM26 ARRS2|C13orf10|PPP1R132|PRO1777|SE70-2|ZC3H17 RNA binding motif protein 26 protein-coding 191.333-181 chr6 144585297 144585510 + 1 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) intron (NM_007124, intron 50 of 73) 179748 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 163.667-86 chr17 55612260 55612548 + 1 NA Intergenic Intergenic 110460 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 159.333-196 chr21 30473381 30473542 + 1 NA Intergenic Intergenic 6906 NM_181607 337882 Hs.61552 NM_181607 ENSG00000184351 KRTAP19-1 KAP19.1 keratin associated protein 19-1 protein-coding 278.333-7 chr1 220559706 220560062 + 1 NA intron (NM_018650, intron 1 of 17) L2|LINE|L2 31701 NM_001286124 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 182.333-110 chr4 18449139 18449452 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -427420 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 145.333-93 chr14 77833794 77834076 + 1 NA intron (NM_001366490, intron 4 of 11) intron (NM_001366490, intron 4 of 11) 33826 NR_158987 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 251.333-18 chr11 9361875 9362397 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -22516 NM_006391 10527 Hs.744911 NM_006391 ENSG00000205339 IPO7 Imp7|RANBP7 importin 7 protein-coding 193.667-38 chr12 131748516 131748794 + 1 NA intron (NM_004592, intron 7 of 17) intron (NM_004592, intron 7 of 17) 37565 NM_004592 6433 Hs.308171 NM_004592 ENSG00000061936 SFSWAP SFRS8|SWAP splicing factor SWAP protein-coding 261.333-90 chr5 141528150 141528670 + 1 NA intron (NM_005219, intron 23 of 27) intron (NM_005219, intron 23 of 27) -29901 NR_038333 100505658 Hs.655458 NR_038333 ENSG00000246422 LOC100505658 - uncharacterized LOC100505658 ncRNA 137.333-180 chr7 47518697 47518949 + 1 NA intron (NM_022748, intron 2 of 30) MIR|SINE|MIR -54020 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 163.333-190 chr3 183280477 183280709 + 1 NA intron (NM_015078, intron 14 of 29) AluSx|SINE|Alu 27340 NM_032047 84002 Hs.718506 NM_032047 ENSG00000176597 B3GNT5 B3GN-T5|beta3Gn-T5 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 protein-coding 158.667-9 chr1 54717091 54717371 + 1 NA intron (NM_004623, intron 2 of 9) intron (NM_004623, intron 2 of 9) 1370 NM_004623 7268 Hs.412482 NM_004623 ENSG00000243725 TTC4 CNS1 tetratricopeptide repeat domain 4 protein-coding 158.667-331 chr8 126352509 126352802 + 1 NA Intergenic Intergenic 27160 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 136.667-60 chr14 65920591 65920751 + 1 NA Intergenic Intergenic 449569 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 179.667-80 chr2 189761374 189761624 + 1 NA exon (NM_001354347, exon 2 of 9) exon (NM_001354347, exon 2 of 9) -1281 NR_102429 101409258 Hs.738558 NR_102429 OSGEPL1-AS1 - OSGEPL1 antisense RNA 1 ncRNA 147.667-95 chr14 30011159 30011308 + 1 NA Intergenic Intergenic -83386 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 126.333-101 chr2 225897375 225897520 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -245347 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 156.333-208 chr20 45271607 45271888 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -17183 NM_003064 6590 Hs.517070 NM_003064 ENSG00000124107 SLPI ALK1|ALP|BLPI|HUSI|HUSI-I|MPI|WAP4|WFDC4 secretory leukocyte peptidase inhibitor protein-coding 112.333-65 chr14 21705113 21705350 + 1 NA Intergenic Intergenic -34214 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 192.333-53 chr14 61914786 61915087 + 1 NA intron (NM_001367661, intron 2 of 8) L2|LINE|L2 -12759 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 153.667-396 chr8 133563367 133563577 + 1 NA intron (NM_003033, intron 1 of 8) LTR54|LTR|ERV1 8415 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 160.667-306 chr8 100314357 100314574 + 1 NA intron (NM_001280539, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR -4512 NM_183419 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 192.333-48 chr14 49018480 49018823 + 1 NA Intergenic Intergenic 567729 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 210.333-72 chr2 50499553 50499906 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 13 of 22) AluSx1|SINE|Alu -151973 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 156.333-109 chr14 53462281 53462540 + 1 NA Intergenic Intergenic 309056 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 201.667-37 chr15 59942097 59942469 + 1 NA Intergenic Intergenic -62028 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 168.333-92 chr2 57730961 57731144 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -176599 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 265.333-41 chr2 124602425 124602782 + 1 NA intron (NM_130773, intron 11 of 23) AluJr|SINE|Alu 577316 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 244.333-89 chr6 71312441 71312796 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 23807 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 158.667-144 chr19 32962367 32962650 + 1 NA intron (NM_032816, intron 2 of 18) L1MEc|LINE|L1 9450 NM_032816 84902 Hs.599703 NM_032816 ENSG00000121289 CEP89 CCDC123|CEP123 centrosomal protein 89 protein-coding 160.667-176 chr20 17984982 17985238 + 1 NA intron (NM_001310338, intron 4 of 5) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 16092 NM_052865 92667 Hs.320823 NM_052865 ENSG00000125871 MGME1 C20orf72|DDK1|MTDPS11|bA504H3.4 mitochondrial genome maintenance exonuclease 1 protein-coding 159.667-77 chr12 45495537 45495746 + 1 NA Intergenic Intergenic 202951 NM_001142678 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 142.333-84 chr14 67079149 67079297 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 10 of 21) L1MB8|LINE|L1 -110217 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 196.667-109 chr4 92542920 92543290 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 238706 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 255.333-39 chr16 61816207 61816567 + 1 NA intron (NM_001796, intron 7 of 11) intron (NM_001796, intron 7 of 11) 220051 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 151.333-365 chr6 90447405 90447578 + 1 NA Intergenic Intergenic 134749 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 163.667-135 chr20 50314335 50314592 + 1 NA non-coding (NR_034124, exon 5 of 5) non-coding (NR_034124, exon 5 of 5) 6879 NR_109950 101927586 Hs.637665 NR_109950 ENSG00000233077 LINC01271 - long intergenic non-protein coding RNA 1271 ncRNA 259.667-3 chr1 154033137 154033603 + 1 NA intron (NM_001159484, intron 27 of 37) L1MA3|LINE|L1 42608 NM_001030 6232 Hs.546291 NM_001030 ENSG00000177954 RPS27 DBA17|MPS-1|MPS1|S27 ribosomal protein S27 protein-coding 178.333-121 chr4 47542858 47543208 + 1 NA intron (NM_020453, intron 9 of 22) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 57758 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 218.333-108 chr6 90479034 90479279 + 1 NA Intergenic Intergenic 107916 NM_145332 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 158.667-83 chr13 24781902 24782060 + 1 NA intron (NM_031277, intron 6 of 35) intron (NM_031277, intron 6 of 35) 17812 NM_001184993 56163 Hs.97464 NM_031277 ENSG00000132972 RNF17 Mmip-2|SPATA23|TDRD4 ring finger protein 17 protein-coding 161.333-304 chrX 56834371 56834563 + 1 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -96883 NR_002308 442454 Hs.663220 NR_002308 UQCRBP1 - ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein pseudogene 1 pseudo 191.667-108 chr6 52414760 52415000 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -5462 NM_018100 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 247.333-66 chr5 168483383 168483794 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -2883 NM_002887 5917 Hs.654907 NM_002887 ENSG00000113643 RARS ArgRS|DALRD1|HLD9 arginyl-tRNA synthetase protein-coding 153.667-263 chr3 115832549 115832853 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 7 of 8) intron (NM_001318915, intron 7 of 8) 72425 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 155.667-217 chr3 55082157 55082386 + 1 NA Intergenic Intergenic -95901 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 128.667-65 chr15 71021276 71021440 + 1 NA intron (NM_017691, intron 14 of 15) L1MEd|LINE|L1 -120091 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 236.333-88 chr7 92912918 92913414 + 1 NA intron (NR_110086, intron 4 of 4) intron (NR_110086, intron 4 of 4) -76539 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 169.333-83 chr14 63878487 63878805 + 1 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) AluSx1|SINE|Alu 25642 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 174.333-161 chrX 65547147 65547393 + 1 NA Intergenic Intergenic 5151 NR_033742 83957 Hs.652967 NR_033742 ENSG00000227942 FRMD8P1 - FERM domain containing 8 pseudogene 1 pseudo 211.333-199 chr5 178213590 178213866 + 1 NA intron (NR_103508, intron 7 of 9) intron (NR_103508, intron 7 of 9) 9195 NM_031266 3182 Hs.591731 NM_004499 ENSG00000197451 HNRNPAB ABBP1|HNRPAB heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B protein-coding 253.333-36 chr16 52013724 52014107 + 1 NA Intergenic Intergenic 60020 NM_001242473 388276 Hs.534669 NM_001242473 C16orf97 - chromosome 16 open reading frame 97 protein-coding 206.333-137 chr5 157876298 157876536 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -17272 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 150.667-129 chr15 44248436 44248739 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -40132 NM_177974 113201 Hs.512867 NM_138423 ENSG00000166734 CASC4 H63 cancer susceptibility 4 protein-coding 151.667-283 chr5 92816117 92816283 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 755143 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-269 chr3 50846724 50846906 + 1 NA intron (NM_004947, intron 3 of 52) L1PA15-16|LINE|L1 171735 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 159.333-114 chr16 59900924 59901200 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 45709 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 126.667-24 chr11 18959841 18960044 + 1 NA Intergenic Intergenic -24940 NM_147199 259249 Hs.711459 NM_147199 ENSG00000170255 MRGPRX1 GPCR|MGRG2|MRGX1|SNSR4 MAS related GPR family member X1 protein-coding 224.333-9 chr1 174755786 174756156 + 1 NA intron (NM_001366451, intron 3 of 12) MIR|SINE|MIR -43767 NM_001366456 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 157.333-201 chr2 172510431 172510757 + 1 NA Intergenic Intergenic -44572 NR_157573 101929947 Hs.710861 NR_157573 ITGA6-AS1 - ITGA6 antisense RNA 1 ncRNA 205.667-135 chr8 141114150 141114457 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -14286 NM_001352891 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 267.667-19 chr16 22654004 22654464 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 108536 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 145.667-240 chr5 167475241 167475531 + 1 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -98273 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 443.333-7 chr4 42059772 42060492 + 1 NA intron (NM_006345, intron 9 of 17) L1ME3G|LINE|L1 69602 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 147.667-314 chr6 54420520 54420706 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 112172 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 175.333-66 chr17 60090305 60090539 + 1 NA Intergenic Intergenic -1955 NR_030732 645638 Hs.463652 NR_030732 ENSG00000261040 WFDC21P LNCDC|linc-DC|lnc-DC WAP four-disulfide core domain 21, pseudogene pseudo 199.333-68 chr14 43069385 43069683 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 1437749 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 312.667-13 chr12 85008740 85009271 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 27272 NM_001100917 144448 Hs.156962 NM_001100917 ENSG00000231738 TSPAN19 - tetraspanin 19 protein-coding 275.333-78 chr8 109274662 109275128 + 1 NA intron (NM_032869, intron 7 of 9) intron (NM_032869, intron 7 of 9) 55038 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 181.667-127 chr5 165857439 165857721 + 1 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 1068790 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 199.333-167 chr21 22690375 22690764 + 1 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 -388715 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 156.333-88 chr12 118446593 118446752 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 70117 NM_022491 64426 Hs.416630 NM_022491 ENSG00000111707 SUDS3 SAP45|SDS3 SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component protein-coding 240.667-44 chr2 57047120 57047551 + 1 NA Intergenic Intergenic -860316 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 245.667-42 chr3 10794535 10794976 + 1 NA Intergenic Intergenic -21473 NM_001317406 6538 Hs.655078 NM_014229 ENSG00000132164 SLC6A11 GAT-3|GAT3|GAT4 solute carrier family 6 member 11 protein-coding 166.333-5 chr1 43214266 43214516 + 1 NA intron (NM_001195831, intron 11 of 23) L1MD1|LINE|L1 -41821 NM_001159936 10969 Hs.346868 NM_006824 ENSG00000117395 EBNA1BP2 EBP2|NOBP|P40 EBNA1 binding protein 2 protein-coding 136.333-143 chr4 39353661 39353984 + 1 NA intron (NM_001204747, intron 1 of 24) intron (NM_001204747, intron 1 of 24) 12540 NM_001204747 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 117.667-169 chr6 81750935 81751113 + 1 NA intron (NM_017633, intron 2 of 2) intron (NM_017633, intron 2 of 2) 1657 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 172.667-143 chr7 16148374 16148564 + 1 NA intron (NM_001101426, intron 9 of 9) L1MA5|LINE|L1 -62017 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 173.333-146 chr4 80708224 80708560 + 1 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -322316 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 116.333-118 chr2 57074510 57074656 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -833068 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 224.333-73 chr20 62788219 62788640 + 1 NA Intergenic Intergenic -8044 NR_136405 55257 Hs.443260 NM_018270 ENSG00000101189 MRGBP C20orf20|Eaf7|MRG15BP|URCC4 MRG domain binding protein protein-coding 250.333-42 chr3 60907125 60907418 + 1 NA intron (NR_148922, intron 3 of 3) L1MC4|LINE|L1 -289401 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 123.333-38 chr10 76415892 76416077 + 1 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -472060 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 129.333-105 chr20 41385395 41385564 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -18661 NM_052846 90187 Hs.726525 NM_052846 ENSG00000183798 EMILIN3 C20orf130|EMILIN5|dJ620E11.4 elastin microfibril interfacer 3 protein-coding 158.333-101 chr15 69357080 69357250 + 1 NA intron (NM_001104554, intron 2 of 8) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 42762 NM_001104554 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 131.667-118 chr21 32706601 32706800 + 1 NA intron (NM_203446, intron 2 of 32) intron (NM_203446, intron 2 of 32) 21221 NM_001160306 8867 Hs.473632 NM_003895 ENSG00000159082 SYNJ1 EIEE53|INPP5G|PARK20 synaptojanin 1 protein-coding 191.667-121 chr8 40095719 40095959 + 1 NA Intergenic Intergenic -57643 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 289.667-12 chr14 63411041 63411397 + 1 NA intron (NR_104104, intron 4 of 12) L3|LINE|CR1 -92284 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 143.667-91 chr16 75808855 75809018 + 1 NA Intergenic Intergenic -82446 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 254.667-66 chr5 51473178 51473525 + 1 NA Intergenic Intergenic 89903 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 288.667-10 chr14 27725753 27726112 + 1 NA Intergenic Intergenic -52711 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 249.333-86 chr5 115445401 115445707 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 99221 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 212.667-103 chr5 42532766 42533145 + 1 NA intron (NM_001242400, intron 2 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 -15088 NM_001242402 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 166.667-44 chr11 104310980 104311267 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -146976 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 200.333-87 chr22 28266717 28267043 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -192989 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 291.333-73 chr9 99345592 99346008 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 29457 NR_102270 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 137.333-112 chr20 55139208 55139370 + 1 NA Intergenic Intergenic -283754 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 245.333-74 chr20 59488568 59489005 + 1 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -88723 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 242.333-43 chr2 33207510 33208081 + 1 NA intron (NM_206943, intron 7 of 33) intron (NM_206943, intron 7 of 33) 73198 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 161.333-257 chr7 23164919 23165181 + 1 NA intron (NM_001031710, intron 7 of 10) intron (NM_001031710, intron 7 of 10) -16998 NM_001370444 11097 Hs.408241 NM_007342 ENSG00000136243 NUP42 CG1|NLP-1|NLP_1|NUPL2|hCG1 nucleoporin 42 protein-coding 152.333-135 chr16 62422791 62423008 + 1 NA Intergenic Intergenic -386461 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 159.667-151 chr18 31615434 31615618 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 23759 NM_000371 7276 Hs.427202 NM_000371 ENSG00000118271 TTR ATTR|CTS|CTS1|HEL111|HsT2651|PALB|TBPA transthyretin protein-coding 162.333-215 chr6 62001527 62001802 + 1 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) intron (NR_146874, intron 3 of 13) 284561 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 169.333-128 chr2 160044588 160044839 + 1 NA intron (NM_001007267, intron 2 of 26) intron (NM_001007267, intron 2 of 26) 17902 NM_001195641 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 143.667-188 chr4 142836636 142836805 + 1 NA intron (NM_001331040, intron 1 of 25) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9815 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 150.333-71 chr12 1136270 1136424 + 1 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) intron (NR_027948, intron 6 of 19) 108599 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 159.667-92 chr13 62528387 62528610 + 1 NA Intergenic Intergenic 204841 NR_047038 100874180 Hs.7415 NR_047038 ENSG00000229307 LINC00459 - long intergenic non-protein coding RNA 459 ncRNA 182.667-159 chr8 76790418 76790729 + 1 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -107298 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-125 chr15 66522848 66523005 + 1 NA intron (NM_001287823, intron 6 of 17) AluSz|SINE|Alu 17600 NM_001287823 55055 Hs.21331 NM_017975 ENSG00000174442 ZWILCH KNTC1AP|hZwilch zwilch kinetochore protein protein-coding 158.333-341 chr9 37310729 37310931 + 1 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) AluJr|SINE|Alu -111866 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 239.333-103 chr8 32359236 32359673 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -81292 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 162.667-170 chr22 44177088 44177270 + 1 NA intron (NM_001137605, intron 1 of 13) L1MC4|LINE|L1 -3746 NM_022141 64098 Hs.658995 NM_022141 ENSG00000138964 PARVG - parvin gamma protein-coding 231.333-63 chr20 575592 575964 + 1 NA Intergenic Intergenic -31988 NM_177560 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 154.667-172 chr2 56541177 56541439 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -355538 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 157.333-31 chr1 185470792 185471049 + 1 NA Intergenic Intergenic -135881 NR_038424 100288079 Hs.131220 NR_038424 ENSG00000261024 GS1-279B7.1 - microtubule associated protein 1 light chain 3 beta pseudogene pseudo 181.333-44 chr14 63943189 63943534 + 1 NA intron (NM_015180, intron 6 of 114) intron (NM_015180, intron 6 of 114) 90357 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 114.667-179 chr3 114525741 114525900 + 1 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 72227 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 151.667-301 chr5 164404685 164404907 + 1 NA Intergenic MER106B|DNA|hAT-Charlie 62606 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 195.667-46 chr14 69763599 69763972 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -3357 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 197.667-47 chr15 99681443 99681721 + 1 NA TTS (NM_001365211) TTS (NM_001365211) 48604 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 198.667-2 chr1 76264086 76264429 + 1 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 189511 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 153.667-105 chr13 35226393 35226640 + 1 NA intron (NM_015678, intron 33 of 57) intron (NM_015678, intron 33 of 57) 250173 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 150.667-82 chr12 4922147 4922304 + 1 NA Intergenic Intergenic 12320 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 236.333-55 chr21 30736800 30737191 + 1 NA Intergenic Intergenic 10264 NM_181617 337978 Hs.553699 NM_181617 ENSG00000187026 KRTAP21-2 KAP21.2 keratin associated protein 21-2 protein-coding 211.667-60 chr2 77036678 77037100 + 1 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 50924 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 197.333-245 chr9 79797838 79798161 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -26531 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 173.333-172 chr6 63272230 63272453 + 1 NA Intergenic Intergenic 47636 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 531.667-2 chr5 57482351 57483223 + 1 NA promoter-TSS (NM_001017992) promoter-TSS (NM_001017992) 24 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 146.333-19 chr1 221585552 221585721 + 1 NA Intergenic Intergenic 151264 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 232.667-34 chr2 30274762 30275132 + 1 NA Intergenic Intergenic 43413 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 242.667-59 chr2 240562851 240563137 + 1 NA 3' UTR (NM_001370465, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001370465, exon 2 of 2) -1884 NR_148696 51281 Hs.656615 NM_016552 ENSG00000144504 ANKMY1 ZMYND13 ankyrin repeat and MYND domain containing 1 protein-coding 224.667-86 chrX 21162527 21163066 + 1 NA Intergenic Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 -211622 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 158.333-30 chr10 24082112 24082341 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -126565 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 175.333-7 chr1 176969631 176969963 + 1 NA intron (NM_207108, intron 8 of 21) intron (NM_207108, intron 8 of 21) 59648 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 149.667-233 chr20 32346280 32346561 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -11924 NM_001164603 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 307.667-21 chr2 152158500 152159008 + 1 NA intron (NM_005843, intron 1 of 13) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 17009 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 153.333-357 chr6 49798802 49798985 + 1 NA Intergenic Intergenic -11608 NM_138733 5232 Hs.367727 NM_138733 ENSG00000170950 PGK2 HEL-S-272|PGKB|PGKPS|dJ417L20.2 phosphoglycerate kinase 2 protein-coding 170.667-59 chr15 87650173 87650357 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 73336 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 154.333-153 chr2 72465496 72465674 + 1 NA intron (NM_001321730, intron 16 of 21) MER103C|DNA|hAT-Charlie -317723 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 132.333-70 chr18 12399817 12399986 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -8028 NM_001142405 10650 Hs.514718 NM_006553 ENSG00000141391 PRELID3A C18orf43|HFL-EDDG1|SLMO1 PRELI domain containing 3A protein-coding 180.333-32 chr14 54107278 54107593 + 1 NA Intergenic Intergenic -150544 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 140.667-89 chr15 86658154 86658307 + 1 NA intron (NM_152336, intron 22 of 24) intron (NM_152336, intron 22 of 24) -274650 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 156.667-9 chr1 59420579 59420751 + 1 NA intron (NM_001350794, intron 5 of 14) MER121|DNA|hAT? -94965 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 218.667-59 chr20 13589793 13590048 + 1 NA intron (NM_017714, intron 4 of 13) AluJo|SINE|Alu 49012 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 204.667-59 chr17 72823363 72823710 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -183064 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 171.667-98 chr20 44999716 44999910 + 1 NA intron (NM_001352385, intron 7 of 11) intron (NM_001352385, intron 7 of 11) 33301 NM_006282 6789 Hs.472838 NM_006282 ENSG00000101109 STK4 KRS2|MST1|YSK3 serine/threonine kinase 4 protein-coding 236.333-63 chr3 174988793 174989228 + 1 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 126232 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 240.333-87 chr7 93279073 93279358 + 1 NA intron (NM_001257998, intron 13 of 28) intron (NM_001257998, intron 13 of 28) 46849 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 198.333-16 chr1 200724051 200724377 + 1 NA Intergenic Intergenic -15358 NM_001297707 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 219.667-62 chr4 44276008 44276274 + 1 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) MER97a|DNA|hAT-Tip100 172668 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 182.333-68 chr18 60986463 60986667 + 1 NA Intergenic Intergenic -346865 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 289.333-20 chr17 43575128 43575472 + 1 NA Intergenic LTR89|LTR|ERVL? -28960 NM_001261437 2118 Hs.434059 NM_001986 ENSG00000175832 ETV4 E1A-F|E1AF|PEA3|PEAS3 ETS variant 4 protein-coding 296.667-10 chr12 18716877 18717215 + 1 NA intron (NM_033123, intron 5 of 14) intron (NM_033123, intron 5 of 14) 20463 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 148.333-342 chr6 68938707 68938959 + 1 NA intron (NM_001704, intron 5 of 31) intron (NM_001704, intron 5 of 31) 303551 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 138.667-160 chr5 32788664 32788883 + 1 NA 3' UTR (NM_001204376, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001204376, exon 8 of 8) 77452 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 177.333-61 chr15 63310894 63311084 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 33384 NM_031301 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 141.333-208 chr6 51698563 51698757 + 1 NA intron (NM_138694, intron 60 of 66) intron (NM_138694, intron 60 of 66) 76790 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 143.667-182 chr4 72895785 72896006 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 173821 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 203.667-122 chr8 86271041 86271268 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -40773 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 361.333-11 chr2 45545565 45546068 + 1 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) intron (NM_018079, intron 14 of 20) 65451 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 540.333-2 chr2 54813198 54814049 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 2 of 40) intron (NM_001039753, intron 2 of 40) 88611 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 185.667-53 chr18 4280451 4280715 + 1 NA intron (NR_036489, intron 2 of 2) intron (NR_036489, intron 2 of 2) 15981 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 166.333-225 chr8 78544843 78545103 + 1 NA intron (NR_125389, intron 2 of 2) L1ME4c|LINE|L1 13530 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 147.667-19 chr1 177684022 177684291 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -16368 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 183.667-137 chr8 79015152 79015483 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 177788 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 151.667-90 chr12 87089816 87089978 + 1 NA Intergenic Intergenic -240842 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 158.333-285 chr6 157907856 157908058 + 1 NA intron (NM_016224, intron 7 of 17) intron (NM_016224, intron 7 of 17) -73906 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 192.667-90 chr2 88547598 88547961 + 1 NA intron (NR_110236, intron 2 of 2) MER5B|DNA|hAT-Charlie 9059 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 224.333-85 chr3 182847688 182848023 + 1 NA intron (NM_014616, intron 9 of 29) intron (NM_014616, intron 9 of 29) 54351 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 215.333-91 chr2 109249278 109249522 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) 64225 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 221.333-141 chr8 106916656 106916908 + 1 NA Intergenic Intergenic -146538 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 147.667-278 chr5 20031958 20032226 + 1 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -43892 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 160.667-188 chr3 9633873 9634161 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -15488 NM_001077525 64419 Hs.475382 NM_022485 ENSG00000163719 MTMR14 C3orf29 myotubularin related protein 14 protein-coding 184.667-30 chr14 46143735 46144005 + 1 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) intron (NR_102702, intron 1 of 3) 79711 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 157.667-282 chr6 64601294 64601555 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 24 of 43) L2b|LINE|L2 -699994 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 154.333-136 chr19 27683544 27683827 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -109746 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 162.667-147 chr2 177144180 177144410 + 1 NA Intergenic Intergenic 68116 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 125.667-42 chr11 117702435 117702601 + 1 NA intron (NM_020693, intron 3 of 32) L2c|LINE|L2 94698 NM_001367904 57453 Hs.659513 NM_020693 ENSG00000177103 DSCAML1 DSCAM2 DS cell adhesion molecule like 1 protein-coding 144.333-64 chr13 114256682 114256833 + 1 NA intron (NM_001318518, intron 12 of 16) intron (NM_001318518, intron 12 of 16) 12252 NR_049839 100847035 NR_049839 ENSG00000264539 MIR548AR - microRNA 548ar ncRNA 131.333-31 chr11 13945019 13945205 + 1 NA Intergenic Intergenic -17611 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 152.667-311 chr5 160571514 160571725 + 1 NA intron (NM_001366652, intron 23 of 24) L1MEd|LINE|L1 86267 NR_029701 406938 NR_029701 ENSG00000283733 MIR146A MIRN146|MIRN146A|miR-146a|miRNA146A microRNA 146a ncRNA 235.333-134 chr9 122459436 122459930 + 1 NA Intergenic Intergenic 18243 NM_001004451 347168 Hs.632692 NM_001004451 ENSG00000136834 OR1J1 OR9-18|hg32 olfactory receptor family 1 subfamily J member 1 protein-coding 175.667-99 chr3 104981158 104981458 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -385405 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 130.333-169 chr5 102623868 102624017 + 1 NA intron (NR_103755, intron 1 of 2) intron (NR_103755, intron 1 of 2) 42574 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 152.667-54 chr11 13849596 13849771 + 1 NA intron (NR_149109, intron 3 of 3) intron (NR_149109, intron 3 of 3) 20933 NR_149109 105376561 Hs.512244 NR_149109 ENSG00000254930 LINC02545 - long intergenic non-protein coding RNA 2545 ncRNA 158.667-33 chr10 23900615 23900855 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 206008 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 224.333-55 chr17 56775295 56775626 + 1 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie 58460 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 385.666-9 chr7 18496356 18497163 + 1 NA intron (NM_058176, intron 1 of 22) intron (NM_058176, intron 1 of 22) 497 NM_058176 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 129.667-182 chr8 137225047 137225299 + 1 NA Intergenic Intergenic 188415 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 182.333-147 chr7 75622627 75622947 + 1 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) AluJo|SINE|Alu -94664 NR_028059 5387 Hs.659871 NM_005395 ENSG00000127957 PMS2P3 PMS2L3|PMS2L9|PMS5|PMSR3 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 3 pseudo 416.333-3 chr10 12468027 12468727 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) intron (NM_001351032, intron 3 of 11) 79395 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 347.667 chr1 24133367 24133942 + 1 NA intron (NM_021258, intron 4 of 6) intron (NM_021258, intron 4 of 6) 9486 NM_021258 58985 Hs.110915 NM_021258 ENSG00000142677 IL22RA1 CRF2-9|IL22R|IL22R1 interleukin 22 receptor subunit alpha 1 protein-coding 154.667-313 chr5 59626795 59627086 + 1 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -39315 NM_001364604 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 146.333-223 chr3 177176195 177176370 + 1 NA intron (NM_001321194, intron 1 of 16) AluSx|SINE|Alu 20196 NM_001321193 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 167.667-206 chr8 118870377 118870596 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 81399 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 256.667-57 chr3 98229631 98229997 + 1 NA Intergenic Intergenic -34430 NM_001005479 79295 Hs.554712 NM_001005479 ENSG00000230301 OR5H6 OR3-11 olfactory receptor family 5 subfamily H member 6 (gene/pseudogene) protein-coding 248.667-95 chr7 26494955 26495250 + 1 NA non-coding (NR_148499, exon 5 of 7) non-coding (NR_148499, exon 5 of 7) 43723 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 203.333-267 chr8 109122222 109122552 + 1 NA TTS (NM_003301) TTS (NM_003301) 35759 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 148.667-370 chr8 53316762 53317001 + 1 NA Intergenic Intergenic -65184 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 239.667-29 chr17 31892028 31892499 + 1 NA exon (NM_018428, exon 6 of 19) exon (NM_018428, exon 6 of 19) 9445 NM_018428 55813 Hs.589862 NM_018428 ENSG00000108651 UTP6 C17orf40|HCA66 UTP6 small subunit processome component protein-coding 201.667-16 chr11 72058065 72058382 + 1 NA intron (NR_104476, intron 2 of 24) intron (NR_104476, intron 2 of 24) 14079 NR_036123 100422953 NR_036123 ENSG00000263742 MIR3165 mir-3165 microRNA 3165 ncRNA 139.333-87 chr17 11275513 11275709 + 1 NA intron (NM_001173461, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 34188 NM_001173461 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 162.333-85 chr15 76643840 76644142 + 1 NA intron (NR_148227, intron 21 of 32) intron (NR_148227, intron 21 of 32) 57344 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 136.333-220 chr9 77057426 77057612 + 1 NA Intergenic Intergenic 37864 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 135.667-48 chr13 92487118 92487332 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -2938 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 259.667-47 chr3 116853636 116854102 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3502 NR_039649 100616485 NR_039649 ENSG00000265433 MIR4447 - microRNA 4447 ncRNA 179.667-125 chr7 30357080 30357302 + 1 NA intron (NM_147128, intron 3 of 4) L1M5|LINE|L1 -12859 NR_002186 222161 Hs.112423 NR_002186 DKFZP586I1420 - uncharacterized protein DKFZp586I1420 pseudo 146.333-253 chr5 40587897 40588076 + 1 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -91929 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 145.333-200 chr3 123247221 123247458 + 1 NA intron (NM_012430, intron 5 of 6) intron (NM_012430, intron 5 of 6) 45396 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 227.333-21 chr10 81458986 81459361 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -416021 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 356.333-2 chr1 103245565 103246143 + 1 NA Intergenic Intergenic -137332 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 229.333-10 chr1 239432736 239433040 + 1 NA intron (NM_001347716, intron 1 of 7) intron (NM_001347716, intron 1 of 7) 46320 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 154.667-124 chr15 60752800 60752981 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 71321 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 251.333-7 chr10 8796443 8796767 + 1 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -101384 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 196.667-111 chr4 102679477 102679738 + 1 NA intron (NM_005908, intron 7 of 16) Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 81361 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 270.667-55 chr8 88808471 88809027 + 1 NA Intergenic Intergenic -481266 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 149.333-351 chr6 142239813 142239994 + 1 NA Intergenic Intergenic -62016 NM_001032394 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 273.667-40 chr3 76350178 76350526 + 1 NA Intergenic Intergenic -564803 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 168.333-112 chr2 238517216 238517405 + 1 NA intron (NR_037809, intron 2 of 2) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 38189 NR_037809 151171 Hs.652076 NR_037809 ENSG00000225493 LINC01107 - long intergenic non-protein coding RNA 1107 ncRNA 147.333-311 chr8 32438590 32438912 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) L1MD1|LINE|L1 -1995 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 116.667-124 chr3 1621574 1621808 + 1 NA Intergenic Intergenic -477112 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 158.667-175 chr2 208036108 208036370 + 1 NA Intergenic (AAAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -10712 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 119.333-144 chr21 31055256 31055403 + 1 NA Intergenic MER76|LTR|ERVL -16853 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 255.333-89 chr6 36110033 36110361 + 1 NA 3' UTR (NM_001315, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001315, exon 12 of 12) -20316 NR_072996 5603 Hs.178695 NM_002754 ENSG00000156711 MAPK13 MAPK 13|MAPK-13|PRKM13|SAPK4|p38delta mitogen-activated protein kinase 13 protein-coding 174.667-108 chr21 45167254 45167629 + 1 NA intron (NM_001346687, intron 1 of 11) intron (NM_001346687, intron 1 of 11) 14911 NM_001346687 104 Hs.474018 NM_001112 ENSG00000197381 ADARB1 ADAR2|DRABA2|DRADA2|RED1 adenosine deaminase RNA specific B1 protein-coding 201.333-200 chr3 160354878 160355136 + 1 NA intron (NM_001190242, intron 7 of 18) intron (NM_001190242, intron 7 of 18) 28759 NM_001190242 57560 Hs.478095 NM_020800 ENSG00000068885 IFT80 ATD2|SRTD2|WDR56 intraflagellar transport 80 protein-coding 242.333-61 chr22 27511345 27511763 + 1 NA Intergenic Intergenic 200903 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 169.333-174 chr4 41661711 41661891 + 1 NA intron (NM_001330786, intron 11 of 22) intron (NM_001330786, intron 11 of 22) 48899 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 157.333-337 chr8 87254141 87254431 + 1 NA intron (NM_173538, intron 6 of 10) L2c|LINE|L2 387871 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 300.667-29 chr4 69598869 69599427 + 1 NA intron (NM_001105677, intron 2 of 5) intron (NM_001105677, intron 2 of 5) 40494 NM_001105677 574537 Hs.225950 NM_001105677 ENSG00000271271 UGT2A2 - UDP glucuronosyltransferase family 2 member A2 protein-coding 115.667-131 chr20 5568304 5568491 + 1 NA intron (NM_019593, intron 12 of 19) intron (NM_019593, intron 12 of 19) 42609 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 151.667-256 chr4 109542231 109542500 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17881 NM_017918 55013 Hs.234149 NM_017918 ENSG00000005059 MCUB CCDC109B mitochondrial calcium uniporter dominant negative beta subunit protein-coding 176.333-180 chr9 86200812 86201068 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 55093 NM_001276368 389766 Hs.632073 NM_001010907 ENSG00000187753 C9orf153 bA507D14.1 chromosome 9 open reading frame 153 protein-coding 174.333-40 chr14 65438449 65438765 + 1 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 25877 NR_038170 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 248.333-63 chr3 146176240 146176574 + 1 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -14912 NM_000935 5352 Hs.477866 NM_000935 ENSG00000152952 PLOD2 BRKS2|LH2|TLH procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 protein-coding 179.667-89 chr3 30154152 30154449 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -220144 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 443.333-3 chr12 19661864 19662655 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 221660 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 164.333-138 chr20 17352743 17352950 + 1 NA intron (NM_002594, intron 2 of 11) L1PA16|LINE|L1 125806 NM_001201529 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 147.667-243 chr3 157205742 157206009 + 1 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -45115 NM_001308185 57018 Hs.4859 NM_020307 ENSG00000163660 CCNL1 ANIA6A|BM-001|PRO1073|ania-6a cyclin L1 protein-coding 141.333-156 chr3 110285345 110285622 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 682655 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 153.333-366 chr6 78344525 78344808 + 1 NA Intergenic Intergenic 194643 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 160.333-307 chrX 95867163 95867349 + 1 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 470646 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 185.333-100 chr2 188328603 188328942 + 1 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 31280 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 168.333-159 chr5 53262924 53263119 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 153179 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 215.333-10 chr1 180406792 180407039 + 1 NA intron (NM_032360, intron 5 of 7) intron (NM_032360, intron 5 of 7) 31475 NR_036067 100423032 NR_036067 ENSG00000265435 MIR3121 mir-3121 microRNA 3121 ncRNA 256.667-92 chr9 70576996 70577402 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 21 of 25) L2a|LINE|L2 -162542 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 128.333-129 chr3 94591856 94592032 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -346319 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 159.333-180 chr2 220822696 220823045 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 749434 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 170.667-45 chr14 69227876 69228145 + 1 NA intron (NR_034165, intron 4 of 10) intron (NR_034165, intron 4 of 10) -32148 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 169.333-251 chr7 87232431 87232738 + 1 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -11997 NR_138030 79161 Hs.619593 NM_024315 ENSG00000135185 TMEM243 C7orf23|MM-TRAG|MMTRAG transmembrane protein 243 protein-coding 154.667-411 chr9 76584410 76584694 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 83919 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 158.667-15 chr1 100102282 100102541 + 1 NA intron (NM_001304829, intron 13 of 15) AluSz6|SINE|Alu 30519 NM_001304829 163786 Hs.591447 NM_194292 ENSG00000156876 SASS6 MCPH14|SAS-6|SAS6 SAS-6 centriolar assembly protein protein-coding 152.667-52 chr10 113376435 113376678 + 1 NA Intergenic Intergenic -174275 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 211.667-46 chr17 75101855 75102274 + 1 NA intron (NM_004695, intron 5 of 6) MIRc|SINE|MIR -7905 NM_001304272 79637 Hs.413047 NM_024585 ENSG00000125449 ARMC7 - armadillo repeat containing 7 protein-coding 209.333-210 chr6 133475811 133476134 + 1 NA intron (NM_001370459, intron 9 of 17) intron (NM_001370459, intron 9 of 17) 234473 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 140.333-49 chr12 38730044 38730258 + 1 NA intron (NM_153634, intron 11 of 19) intron (NM_153634, intron 11 of 19) 175440 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 251.667-68 chr4 44065339 44065779 + 1 NA Intergenic Intergenic 48497 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 186.333-13 chr10 31805235 31805483 + 1 NA TTS (NM_001270699) TTS (NM_001270699) 103567 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 213.333-85 chr2 13373548 13373801 + 1 NA Intergenic Intergenic -366661 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 186.333-62 chr18 5331677 5332099 + 1 NA Intergenic Intergenic -34835 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 150.333-292 chr4 31538016 31538281 + 1 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) L1M2|LINE|L1 31604 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 344.333-6 chr15 99761269 99761700 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -28040 NM_001284422 145748 Hs.562568 NM_152449 ENSG00000183060 LYSMD4 - LysM domain containing 4 protein-coding 285.333-43 chr3 120629450 120629747 + 1 NA intron (NM_000187, intron 13 of 13) L1PREC2|LINE|L1 33262 NM_001168331 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 150.667-123 chr14 70573385 70573545 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 27225 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 150.333-436 chr9 85857343 85857639 + 1 NA Intergenic Intergenic 51489 NR_029410 389765 Hs.715986 NR_029410 LOC389765 - kinesin family member 27 pseudogene pseudo 163.333-263 chr7 55973044 55973252 + 1 NA intron (NM_001202469, intron 1 of 7) intron (NM_001202469, intron 1 of 7) 8563 NM_001202469 2631 Hs.591069 NM_001483 ENSG00000146729 NIPSNAP2 GBAS nipsnap homolog 2 protein-coding 150.333-341 chr5 122139786 122139987 + 1 NA intron (NM_207317, intron 1 of 1) intron (NM_207317, intron 1 of 1) 10340 NM_207317 133923 Hs.729673 NM_207317 ENSG00000164185 ZNF474 - zinc finger protein 474 protein-coding 120.333-98 chr2 88963613 88963763 + 1 NA Intergenic Intergenic 151318 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 125.333-35 chr11 34296653 34296874 + 1 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 61247 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 215.333-84 chr2 32318084 32318586 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -38693 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 262.667-52 chr22 27685492 27685972 + 1 NA Intergenic Intergenic 116024 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 158.667-182 chr2 226383717 226384004 + 1 NA Intergenic Intergenic 241066 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 334.333-25 chr3 135152597 135153111 + 1 NA intron (NM_004441, intron 5 of 15) LTR16B2|LTR|ERVL 357594 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 173.333-95 chr2 120378155 120378354 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 32118 NM_002193 3625 Hs.1735 NM_002193 ENSG00000163083 INHBB - inhibin subunit beta B protein-coding 153.667-70 chr11 58425715 58426000 + 1 NA Intergenic Intergenic -2544 NM_001005566 390190 Hs.553753 NM_001005566 ENSG00000172365 OR5B2 OR11-240|OST073 olfactory receptor family 5 subfamily B member 2 protein-coding 158.667-164 chr2 119116984 119117295 + 1 NA Intergenic Intergenic 41612 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 159.333-102 chr15 61423478 61423757 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -194315 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 217.667-83 chr7 103817270 103817677 + 1 NA intron (NM_005045, intron 3 of 64) intron (NM_005045, intron 3 of 64) 172043 NM_173054 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 199.667-46 chr14 60770307 60770795 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) L1MB2|LINE|L1 35790 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 177.333-41 chr12 64693684 64693867 + 1 NA intron (NR_040718, intron 3 of 3) intron (NR_040718, intron 3 of 3) 65631 NM_002076 2799 Hs.334534 NM_002076 ENSG00000135677 GNS G6S glucosamine (N-acetyl)-6-sulfatase protein-coding 126.333-69 chr17 71214247 71214479 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -12184 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 158.333-84 chr14 51780610 51780889 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 63466 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 147.333-45 chr10 62100850 62101196 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 51666 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 167.333-191 chr4 79833431 79833646 + 1 NA intron (NR_026555, intron 1 of 1) MIR3|SINE|MIR 6067 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 121.667-176 chr5 180973511 180973674 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -15254 NM_197975 10917 Hs.225949 NM_006707 ENSG00000168903 BTNL3 BTN9.1|BTNLR butyrophilin like 3 protein-coding 113.333-195 chr4 101727925 101728163 + 1 NA Intergenic Intergenic -62563 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 171.333-41 chr13 94093789 94094132 + 1 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) intron (NM_005708, intron 4 of 8) 94031 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-336 chr5 99110649 99110871 + 1 NA Intergenic Intergenic -181046 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 213.667-37 chr17 41156595 41156953 + 1 NA intron (NM_001277332, intron 1 of 5) L1MD2|LINE|L1 3974 NM_032524 84616 Hs.307022 NM_032524 ENSG00000171396 KRTAP4-4 KAP4.13|KAP4.4|KRTAP4-13|KRTAP4.13|KRTAP4.4 keratin associated protein 4-4 protein-coding 167.667-153 chr4 62815530 62815821 + 1 NA Intergenic Intergenic -653910 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 199.667-86 chr20 58243005 58243264 + 1 NA intron (NR_003505, intron 10 of 16) intron (NR_003505, intron 10 of 16) -14481 NM_001304369 140731 Hs.266571 NM_080674 ENSG00000124227 ANKRD60 C20orf86|bA196N14.3 ankyrin repeat domain 60 protein-coding 138.333-194 chr8 78282104 78282264 + 1 NA Intergenic Intergenic -234156 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 121.333-55 chr14 77072215 77072417 + 1 NA intron (NR_110553, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 3875 NR_110553 102724190 Hs.562528 NR_110553 ENSG00000258819 LINC02289 - long intergenic non-protein coding RNA 2289 ncRNA 158.333-182 chr22 20077590 20077879 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -2498 NM_001190326 54487 Hs.643452 NM_022720 ENSG00000128191 DGCR8 C22orf12|DGCRK6|Gy1|pasha DGCR8 microprocessor complex subunit protein-coding 158.667-217 chr3 114969404 114969719 + 1 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) intron (NM_001348805, intron 3 of 10) -68936 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 146.667-107 chr14 64680673 64680920 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -23628 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 318.667-26 chr5 53951662 53952097 + 1 NA promoter-TSS (NR_030307) promoter-TSS (NR_030307) -280 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 161.667-220 chr6 14824764 14824961 + 1 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -421207 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 207.667-18 chr11 97587701 97587913 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 1079382 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 196.667-96 chr3 71253566 71253994 + 1 NA intron (NR_146142, intron 5 of 19) intron (NR_146142, intron 5 of 19) -8703 NM_001244814 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 128.333-203 chr9 72410067 72410227 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44939 NM_001102421 7763 Hs.406096 NM_006007 ENSG00000107372 ZFAND5 ZA20D2|ZFAND5A|ZNF216 zinc finger AN1-type containing 5 protein-coding 139.333-154 chr3 129012025 129012338 + 1 NA intron (NM_024768, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR -8179 NM_001348521 57501 Hs.518247 NM_020741 ENSG00000114656 KIAA1257 - KIAA1257 protein-coding 134.667-41 chr12 9202132 9202324 + 1 NA intron (NM_002864, intron 4 of 35) intron (NM_002864, intron 4 of 35) 6167 NM_002864 5858 Hs.707491 NM_002864 ENSG00000126838 PZP CPAMD6 PZP alpha-2-macroglobulin like protein-coding 151.333-174 chr17 43446722 43446957 + 1 NA intron (NR_146952, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 2033 NR_031751 100313779 NR_031751 ENSG00000284344 MIR2117 - microRNA 2117 ncRNA 223.667-25 chr15 75396495 75396868 + 1 NA intron (NM_015477, intron 12 of 20) MIR|SINE|MIR -28054 NM_001256494 4123 Hs.26232 NM_006715 ENSG00000140400 MAN2C1 MAN6A8|MANA|MANA1 mannosidase alpha class 2C member 1 protein-coding 289.667-23 chr20 38785342 38785672 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -20190 NM_015568 26051 Hs.45719 NM_015568 ENSG00000101445 PPP1R16B ANKRD4|TIMAP protein phosphatase 1 regulatory subunit 16B protein-coding 156.333-161 chr19 30238551 30238799 + 1 NA Intergenic (TCTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -133709 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 140.333-61 chr14 47271551 47271781 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 71580 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 156.333-227 chr3 24225028 24225309 + 1 NA intron (NM_001354714, intron 2 of 8) intron (NM_001354714, intron 2 of 8) 73844 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 158.667-90 chr13 95422237 95422541 + 1 NA Intergenic Intergenic -11210 NM_182848 9071 Hs.534377 NM_006984 ENSG00000134873 CLDN10 CPETRL3|HELIX|OSP-L|OSPL claudin 10 protein-coding 247.333-69 chr6 55415864 55416159 + 1 NA Intergenic Intergenic 88542 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 146.667-298 chr7 10638591 10638757 + 1 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 -64002 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 190.667-104 chr5 99305430 99305707 + 1 NA Intergenic Intergenic -228422 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 226.333-62 chr2 110782341 110782720 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 2 of 18) Mam_R4|LINE|Dong-R4 49957 NM_001371254 183.333-41 chr14 43849448 43849803 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 657658 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 194.667-27 chr11 57013814 57014104 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -23575 NR_036445 219525 Hs.554519 NR_036445 ENSG00000283307 OR5AK4P PJCG3 olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene pseudo 201.667-55 chr2 64762311 64762704 + 1 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 101124 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 261.333-12 chr10 41726580 41726893 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 641309 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 231.667-46 chr3 150971605 150972015 + 1 NA promoter-TSS (NR_024066) promoter-TSS (NR_024066) -868 NR_024066 116933 Hs.570680 NR_024066 CLRN1-AS1 CLRN1OS|UCRP CLRN1 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-52 chr10 49063988 49064219 + 1 NA intron (NM_001031746, intron 5 of 7) L1ME1|LINE|L1 51419 NM_001031746 196740 Hs.522928 NM_144984 ENSG00000165633 VSTM4 C10orf72 V-set and transmembrane domain containing 4 protein-coding 147.667-198 chr20 3321951 3322200 + 1 NA intron (NM_001009984, intron 16 of 36) intron (NM_001009984, intron 16 of 36) -82885 NM_001363745 83959 Hs.105607 NM_032034 ENSG00000088836 SLC4A11 BTR1|CDPD1|CHED|CHED2|NABC1|dJ794I6.2 solute carrier family 4 member 11 protein-coding 230.667-14 chr13 61054859 61055308 + 1 NA Intergenic Intergenic 144797 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 210.667-31 chr12 40494498 40494855 + 1 NA intron (NM_173600, intron 59 of 173) AluSc|SINE|Alu 101282 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 209.667-54 chr16 81231806 81232161 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6706 NM_017429 53630 Hs.212172 NM_017429 ENSG00000135697 BCO1 BCDO|BCDO1|BCMO|BCMO1|BCO beta-carotene oxygenase 1 protein-coding 207.667-73 chr3 13721375 13721758 + 1 NA intron (NR_027103, intron 4 of 5) L1M4b|LINE|L1 70845 NR_027103 285375 Hs.319969 NR_027103 ENSG00000224514 LINC00620 - long intergenic non-protein coding RNA 620 ncRNA 198.667-70 chr15 58690030 58690344 + 1 NA TTS (NR_073415) TTS (NR_073415) 3420 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 162.333-10 chr1 102657530 102657846 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 450808 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 156.667-141 chr17 72079318 72079520 + 1 NA TTS (NR_103737) TTS (NR_103737) 7086 NR_110827 101928205 Hs.620808 NR_110827 ENSG00000226101 LINC02097 - long intergenic non-protein coding RNA 2097 ncRNA 123.333-48 chr11 78145035 78145283 + 1 NA intron (NR_102280, intron 2 of 3) intron (NR_102280, intron 2 of 3) 5366 NR_102280 100289388 Hs.628183 NM_203432 ENSG00000246174 KCTD21-AS1 - KCTD21 antisense RNA 1 ncRNA 228.667-78 chr8 70708633 70708985 + 1 NA intron (NM_001287259, intron 5 of 5) L1PA15|LINE|L1 39470 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 150.333-85 chr12 82943948 82944122 + 1 NA intron (NM_152588, intron 4 of 11) L2b|LINE|L2 256880 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 124.667-81 chr16 80270935 80271090 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -269722 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 246.333-88 chr6 87290827 87291257 + 1 NA intron (NM_198568, intron 2 of 2) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -31546 NM_001042493 57150 Hs.70769 NM_020425 ENSG00000111850 SMIM8 C6orf162|dJ102H19.2 small integral membrane protein 8 protein-coding 227.667-27 chr16 86079577 86079997 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -116394 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 153.333-163 chr17 61191287 61191519 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L1MEi|LINE|L1 176301 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 115.667-216 chr8 122150950 122151098 + 1 NA Intergenic Intergenic 417620 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 138.667-211 chr8 140377295 140377433 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 7 of 22) AluSq|SINE|Alu 80380 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 148.667-20 chr1 179347826 179348000 + 1 NA intron (NM_001252512, intron 11 of 14) intron (NM_001252512, intron 11 of 14) -18058 NM_144696 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 261.333-60 chr21 27257362 27257969 + 1 NA Intergenic Intergenic -290577 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 156.667-15 chr1 78544476 78544701 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 53614 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 208.667-107 chr5 2933605 2934024 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 15960 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 147.333-183 chr2 222179832 222180011 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -118226 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 227.667-4 chr1 214994038 214994384 + 1 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -11331 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 207.333-92 chr14 68544707 68545043 + 1 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 83912 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 147.667-113 chr15 66557031 66557307 + 1 NA intron (NM_001278562, intron 7 of 11) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 8328 NM_207338 197021 Hs.680983 NM_207338 ENSG00000188501 LCTL KLG|KLPH lactase like protein-coding 152.333-116 chr15 37448715 37448936 + 1 NA Intergenic Intergenic -347514 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 153.333-53 chr10 77428470 77428697 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 77711 NR_126365 101929286 Hs.568867 NR_126365 KCNMA1-AS3 - KCNMA1 antisense RNA 3 ncRNA 154.667-65 chr11 99650868 99651103 + 1 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 94840 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 159.333-321 chr8 65639753 65640038 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4758 NM_001145839 9650 Hs.584788 NM_014637 ENSG00000066855 MTFR1 CHPPR|FAM54A2 mitochondrial fission regulator 1 protein-coding 129.333-197 chr9 6436830 6436988 + 1 NA intron (NM_152896, intron 3 of 15) L3|LINE|CR1 23710 NM_152896 115426 Hs.493401 NM_152896 ENSG00000147854 UHRF2 NIRF|RNF107|TDRD23|URF2 ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 protein-coding 135.667-85 chr2 32859113 32859267 + 1 NA intron (NR_027098, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu 33757 NR_027098 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 313.667-14 chr15 43351760 43352215 + 1 NA 3' UTR (NM_001159280, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001159280, exon 12 of 12) 18073 NM_152455 146050 Hs.418287 NM_152455 ENSG00000140265 ZSCAN29 ZNF690|Zfp690 zinc finger and SCAN domain containing 29 protein-coding 163.333-75 chr13 51382426 51382593 + 1 NA intron (NM_001306091, intron 11 of 19) intron (NM_001306091, intron 11 of 19) -33870 NR_049878 100847003 NR_049878 ENSG00000266072 MIR5693 - microRNA 5693 ncRNA 163.333-48 chr11 10818872 10819063 + 1 NA intron (NR_120540, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 9670 NR_120540 101928053 Hs.637773 NR_120540 ENSG00000246308 LOC101928053 - uncharacterized LOC101928053 ncRNA 167.667-143 chr3 147493102 147493277 + 1 NA intron (NR_121655, intron 1 of 2) intron (NR_121655, intron 1 of 2) 71862 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 169.667-95 chr18 9193716 9193936 + 1 NA intron (NM_001204056, intron 2 of 11) intron (NM_001204056, intron 2 of 11) 56263 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 137.333-116 chr22 22090140 22090457 + 1 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -46364 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 156.667-348 chr8 136876614 136876857 + 1 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) intron (NR_147196, intron 4 of 5) 345937 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 214.333-22 chr10 88644027 88644448 + 1 NA Intergenic Intergenic -20205 NM_004190 8513 Hs.523130 NM_004190 ENSG00000182333 LIPF GL|HGL|HLAL lipase F, gastric type protein-coding 234.667-97 chr6 77001375 77001836 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -407982 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 153.333-303 chr4 84199141 84199404 + 1 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 99897 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 152.667-302 chr5 111951143 111951327 + 1 NA intron (NR_046678, intron 2 of 3) L1ME3C|LINE|L1 25697 NM_001142475 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 196.667-118 chr5 17436167 17436456 + 1 NA promoter-TSS (NR_134273) promoter-TSS (NR_134273) -426 NR_134273 101929544 Hs.23725 NR_134273 ENSG00000248455 LINC02217 - long intergenic non-protein coding RNA 2217 ncRNA 182.333-47 chr14 70826646 70826885 + 1 NA Intergenic Intergenic -17252 NM_033141 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 165.333-166 chr3 57697435 57697601 + 1 NA TTS (NR_135550) TTS (NR_135550) 4313 NR_135550 101929159 Hs.434396 NR_135550 ENSG00000241933 DENND6A-DT - DENND6A divergent transcript ncRNA 145.667-272 chr7 82469747 82469892 + 1 NA Intergenic Intergenic -25863 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 140.667-121 chr2 89846020 89846302 + 1 NA Intergenic Intergenic -208254 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 214.667-26 chr11 81970806 81971127 + 1 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) L1MCb|LINE|L1 -80130 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 179.667-30 chr11 77367498 77367811 + 1 NA intron (NM_001128620, intron 5 of 15) HAL1|LINE|L1 -65988 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 299.333-25 chr14 53456577 53457112 + 1 NA Intergenic Intergenic 303490 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 129.333-163 chr5 156290559 156290813 + 1 NA Intergenic Intergenic -36071 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 152.667-376 chr8 85515849 85516019 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -51019 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-202 chr4 70361528 70361748 + 1 NA intron (NM_012390, intron 1 of 2) intron (NM_012390, intron 1 of 2) 878 NM_012390 26952 Hs.701334 NM_012390 ENSG00000109208 SMR3A P-B1|PBI|PRL5|PROL5 submaxillary gland androgen regulated protein 3A protein-coding 193.333-141 chr4 106601482 106601877 + 1 NA Intergenic Intergenic 168055 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 135.333-63 chr16 80512679 80512834 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) MIRb|SINE|MIR -27978 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 185.333-120 chr3 38207013 38207275 + 1 NA intron (NM_005109, intron 4 of 17) MER58A|DNA|hAT-Charlie 41607 NM_005109 9943 Hs.475970 NM_005109 ENSG00000172939 OXSR1 OSR1 oxidative stress responsive kinase 1 protein-coding 190.667-54 chr17 34933114 34933374 + 1 NA intron (NM_006584, intron 10 of 13) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 28216 NM_001193529 10693 Hs.73072 NM_006584 ENSG00000132141 CCT6B CCT-zeta-2|CCTZ-2|Cctz2|TCP-1-zeta-2|TSA303 chaperonin containing TCP1 subunit 6B protein-coding 144.667-109 chr16 78011659 78011858 + 1 NA Intergenic Intergenic -10790 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 137.667-36 chr11 72984650 72984861 + 1 NA intron (NM_014824, intron 7 of 19) intron (NM_014824, intron 7 of 19) 157563 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 126.667-108 chr3 98398347 98398497 + 1 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 7756 NM_001005516 403277 Hs.554709 NM_001005516 ENSG00000206536 OR5K3 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 3 protein-coding 153.333-41 chr10 20832631 20832845 + 1 NA intron (NM_006393, intron 14 of 27) intron (NM_006393, intron 14 of 27) 64864 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 237.333-62 chr2 179267986 179268335 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -3328 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 165.667-186 chr7 31597224 31597462 + 1 NA intron (NM_194300, intron 8 of 12) L1ME3Cz|LINE|L1 44341 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 190.667-111 chr6 48724931 48725233 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -656393 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 176.333-47 chr14 52448154 52448411 + 1 NA intron (NM_001160047, intron 18 of 20) L1MA3|LINE|L1 104223 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 230.333-56 chr2 38523177 38523465 + 1 NA Intergenic Intergenic -7581 NR_110259 101929596 Hs.537341 NR_110259 LINC02613 - long intergenic non-protein coding RNA 2613 ncRNA 257.333-52 chr2 54157604 54158151 + 1 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 34594 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 143.333-67 chr12 56747232 56747386 + 1 NA intron (NM_000946, intron 2 of 12) intron (NM_000946, intron 2 of 12) 5014 NM_000946 5557 Hs.534339 NM_000946 ENSG00000198056 PRIM1 p49 DNA primase subunit 1 protein-coding 244.667-18 chr10 107886240 107886557 + 1 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) L1MA3|LINE|L1 182895 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 198.667-49 chr12 78839069 78839443 + 1 NA Intergenic Intergenic -24726 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 153.333-270 chr3 89533384 89533626 + 1 NA Intergenic Intergenic 425884 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 186.667-70 chr2 85595328 85595696 + 1 NA promoter-TSS (NM_016494) promoter-TSS (NM_016494) -233 NM_016494 51255 Hs.356187 NM_016494 ENSG00000168894 RNF181 HSPC238 ring finger protein 181 protein-coding 217.667-92 chr9 25182669 25183018 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 496015 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 225.667-52 chr3 116691487 116691883 + 1 NA Intergenic Intergenic -18103 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 150.333-161 chr17 66308544 66308729 + 1 NA intron (NM_002737, intron 2 of 16) intron (NM_002737, intron 2 of 16) 6023 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 166.333-89 chr17 21291394 21291691 + 1 NA intron (NM_002756, intron 1 of 11) intron (NM_002756, intron 1 of 11) 3506 NM_002756 5606 Hs.514012 NM_002756 ENSG00000034152 MAP2K3 MAPKK3|MEK3|MKK3|PRKMK3|SAPKK-2|SAPKK2 mitogen-activated protein kinase kinase 3 protein-coding 162.667-281 chr8 121615723 121615993 + 1 NA intron (NM_005328, intron 3 of 3) intron (NM_005328, intron 3 of 3) -23488 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 322.333-5 chr11 43047743 43048078 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 221459 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 227.667-51 chr3 100735858 100736211 + 1 NA intron (NM_001007565, intron 5 of 7) intron (NM_001007565, intron 5 of 7) 26492 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 122.333-122 chr20 16987196 16987398 + 1 NA Intergenic Intergenic -238810 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 143.333-264 chr7 38646420 38646687 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14986 NM_139316 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 185.333-34 chr11 107011899 107012230 + 1 NA intron (NM_001256424, intron 1 of 8) intron (NM_001256424, intron 1 of 8) 6412 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 249.333-74 chr4 40039882 40040263 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -16778 NM_018177 55728 Hs.391463 NM_018177 ENSG00000078177 N4BP2 B3BP NEDD4 binding protein 2 protein-coding 168.333-31 chr10 126320612 126320789 + 1 NA intron (NM_001288974, intron 2 of 18) intron (NM_001288974, intron 2 of 18) 67777 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 210.667-49 chr15 72031290 72031531 + 1 NA intron (NM_006901, intron 3 of 41) AluSx3|SINE|Alu -82848 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 141.667-126 chr2 197344321 197344474 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -33617 NR_160034 91526 Hs.432706 NM_153697 ENSG00000065413 ANKRD44 PP6-ARS-B ankyrin repeat domain 44 protein-coding 147.667-246 chr3 193358811 193359083 + 1 NA intron (NM_198505, intron 5 of 29) intron (NM_198505, intron 5 of 29) 19806 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 223.333-109 chr4 30803630 30804051 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 83471 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 137.667-197 chrX 29490397 29490553 + 1 NA intron (NM_014271, intron 5 of 10) AluSz6|SINE|Alu -83803 NR_049877 100847047 NR_049877 ENSG00000264090 MIR4666B - microRNA 4666b ncRNA 128.333-73 chr16 71514559 71514747 + 1 NA intron (NR_135172, intron 1 of 1) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 842 NR_135172 105371335 Hs.564879 NR_135171 ENSG00000260520 LOC105371335 - uncharacterized LOC105371335 ncRNA 178.333-163 chr7 77802971 77803179 + 1 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) CR1_Mam|LINE|CR1 4104 NM_001366086 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 130.333-81 chr15 95128068 95128308 + 1 NA Intergenic Intergenic 198912 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 258.333-77 chr9 95442350 95442911 + 1 NA TTS (NM_001083606) TTS (NM_001083606) -20979 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 209.333-2 chr1 28339001 28339450 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 10185 NM_017638 54797 Hs.479911 NM_017638 ENSG00000130772 MED18 SRB5|p28b mediator complex subunit 18 protein-coding 372.333-22 chr7 98979129 98979885 + 1 NA intron (NM_003496, intron 56 of 70) MER2|DNA|TcMar-Tigger -33658 NR_110102 101927550 Hs.636663 NR_110102 LOC101927550 - uncharacterized LOC101927550 ncRNA 160.667-200 chr3 90648437 90648642 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1540918 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 218.333-52 chr17 58545421 58545789 + 1 NA intron (NR_110810, intron 4 of 4) MIR3|SINE|MIR -1277 NM_001368772 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 348.333-25 chr5 35961750 35962401 + 1 NA 3' UTR (NM_001171873, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001171873, exon 6 of 6) 23274 NR_104630 100506406 Hs.116864 NR_104630 ENSG00000249748 LOC100506406 - uncharacterized LOC100506406 ncRNA 290.333-42 chr6 140370877 140371388 + 1 NA Intergenic Intergenic 165880 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 151.333-397 chr7 86173373 86173544 + 1 NA Intergenic Intergenic -470451 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 142.333-137 chr20 2541139 2541336 + 1 NA intron (NM_080751, intron 2 of 19) L1ME4a|LINE|L1 4630 NM_080751 117532 Hs.352626 NM_080751 ENSG00000149488 TMC2 C20orf145 transmembrane channel like 2 protein-coding 264.667-92 chr9 96474006 96474351 + 1 NA intron (NM_014282, intron 5 of 7) intron (NM_014282, intron 5 of 7) 24009 NM_014282 22927 Hs.494567 NM_014282 ENSG00000130956 HABP4 IHABP-4|IHABP4|Ki-1/57|SERBP1L hyaluronan binding protein 4 protein-coding 271.667-70 chr8 79609915 79610401 + 1 NA promoter-TSS (NM_001199214) promoter-TSS (NM_001199214) -959 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 176.333-162 chr8 37089929 37090282 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 305731 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 435.334-3 chr7 43624695 43625479 + 1 NA 3' UTR (NM_004760, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_004760, exon 7 of 7) 41979 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 154.333-54 chr11 33139149 33139364 + 1 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) intron (NM_001326, intron 3 of 20) 22224 NM_001326 1479 Hs.44402 NM_001326 ENSG00000176102 CSTF3 CSTF-77 cleavage stimulation factor subunit 3 protein-coding 265.667-27 chr16 87939769 87940148 + 1 NA Intergenic (GATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3429 NM_001367225 763 Hs.177446 NM_001739 ENSG00000174990 CA5A CA5|CA5AD|CAV|CAVA|GS1-21A4.1 carbonic anhydrase 5A protein-coding 190.333-78 chr2 171219097 171219351 + 1 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 12069 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 142.667-40 chr12 75720465 75720643 + 1 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -208945 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 154.333-76 chr13 74565940 74566227 + 1 NA Intergenic Intergenic 13240 NR_034025 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 356.667-5 chr10 133341775 133342211 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -5097 NM_015722 50632 Hs.148680 NM_015722 ENSG00000130643 CALY DRD1IP|NSG3 calcyon neuron specific vesicular protein protein-coding 160.333-174 chr22 28176833 28177078 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L1MC2|LINE|L1 -256343 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 212.333-64 chr2 22754179 22754477 + 1 NA Intergenic Intergenic 217849 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 151.333-379 chr7 6245435 6245599 + 1 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) 27107 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 150.333-83 chr12 66643296 66643472 + 1 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) L1ME4a|LINE|L1 35692 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 184.667-22 chr11 103198712 103199027 + 1 NA intron (NM_001377, intron 48 of 88) intron (NM_001377, intron 48 of 88) 89443 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 182.667-119 chr4 84882086 84882412 + 1 NA intron (NM_014991, intron 3 of 67) intron (NM_014991, intron 3 of 67) -83367 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 159.667-260 chr5 74090338 74090629 + 1 NA Intergenic Intergenic 217842 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 215.333-163 chr5 93270821 93271177 + 1 NA Intergenic Intergenic 300344 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 138.333-104 chr2 200039504 200039733 + 1 NA Intergenic Intergenic -84127 NR_109905 129450 Hs.204619 NM_152382 ENSG00000162971 TYW5 C2orf60|hTYW5 tRNA-yW synthesizing protein 5 protein-coding 139.333-162 chr4 33338906 33339143 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 700869 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 117.667-168 chr6 76607500 76607672 + 1 NA Intergenic Intergenic -13963 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 188.333-103 chr4 30450016 30450266 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -270228 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 154.333-112 chr16 57822049 57822322 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 11548 NM_001278081 388282 Hs.434720 NM_001278081 LOC388282 - uncharacterized LOC388282 protein-coding 188.333-40 chr12 93399106 93399403 + 1 NA exon (NM_001301023, exon 5 of 5) exon (NM_001301023, exon 5 of 5) 20676 NM_001301024 11163 Hs.506325 NM_019094 ENSG00000173598 NUDT4 DIPP-2B|DIPP2|DIPP2alpha|DIPP2beta|HDCMB47P|NUDT4B nudix hydrolase 4 protein-coding 237.333-49 chr18 7330045 7330477 + 1 NA Intergenic Intergenic 99157 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 145.333-244 chr5 122062520 122062797 + 1 NA TTS (NM_002317) TTS (NM_002317) 14516 NM_001317073 4015 Hs.102267 NM_002317 ENSG00000113083 LOX AAT10 lysyl oxidase protein-coding 219.667-77 chr5 134231244 134231735 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -5416 NM_002715 5515 Hs.105818 NM_002715 ENSG00000113575 PPP2CA NEDLBA|PP2Ac|PP2CA|PP2Calpha|RP-C protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha protein-coding 296.667-33 chr2 209813713 209814078 + 1 NA intron (NM_032504, intron 8 of 63) intron (NM_032504, intron 8 of 63) 41902 NM_032504 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 162.667-59 chr12 66052109 66052422 + 1 NA Intergenic Intergenic -21199 NR_146530 105369810 NR_146530 ENSG00000256259 LINC02425 - long intergenic non-protein coding RNA 2425 ncRNA 207.667-116 chr7 133489066 133489310 + 1 NA intron (NM_021807, intron 9 of 17) L1ME3E|LINE|L1 198307 NR_106749 102465139 NR_106749 ENSG00000276137 MIR6133 hsa-mir-6133 microRNA 6133 ncRNA 160.667-136 chr2 6888198 6888503 + 1 NA intron (NM_080657, intron 3 of 5) intron (NM_080657, intron 3 of 5) 10573 NM_080657 91543 Hs.17518 NM_080657 ENSG00000134321 RSAD2 2510004L01Rik|cig33|cig5|vig1 radical S-adenosyl methionine domain containing 2 protein-coding 133.667-96 chr3 74956631 74956850 + 1 NA Intergenic Intergenic -257736 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 130.667-152 chr4 48874654 48874893 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -14570 NR_146806 100861517 Hs.661065 NR_146806 ENSG00000248256 OCIAD1-AS1 - OCIAD1 antisense RNA 1 ncRNA 198.333-72 chr16 12326317 12326731 + 1 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) MER58A|DNA|hAT-Charlie 349790 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 147.333-193 chr20 55448862 55449118 + 1 NA Intergenic Intergenic -21793 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 130.667-33 chr10 78506327 78506546 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 239094 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 152.333-117 chr15 39149719 39149953 + 1 NA Intergenic Intergenic -100833 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 205.333-2 chr1 26655349 26655608 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 38653 NR_135804 101928728 Hs.128770 NR_135804 ENSG00000260063 LOC101928728 - uncharacterized LOC101928728 ncRNA 147.667-328 chr7 4687735 4687943 + 1 NA intron (NM_001037165, intron 1 of 8) intron (NM_001037165, intron 1 of 8) 5544 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 163.333-119 chr17 1504988 1505322 + 1 NA intron (NM_001135642, intron 9 of 13) AluJr|SINE|Alu 11457 NM_016532 51763 Hs.632238 NM_016532 ENSG00000132376 INPP5K MDCCAID|PPS|SKIP inositol polyphosphate-5-phosphatase K protein-coding 173.667-21 chr10 75653901 75654103 + 1 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) 6493 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 163.667-223 chr6 157940414 157940613 + 1 NA intron (NM_016224, intron 16 of 17) AluSx1|SINE|Alu -41350 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 172.333-67 chr17 61944092 61944298 + 1 NA 3' UTR (NM_005121, exon 30 of 30) 3' UTR (NM_005121, exon 30 of 30) -16213 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 362.667-21 chr3 138191754 138192195 + 1 NA intron (NM_001363942, intron 2 of 21) L1MD2|LINE|L1 4443 NM_001267042 25852 Hs.744868 NM_014154 ENSG00000114098 ARMC8 GID5|HSPC056|S863-2|VID28 armadillo repeat containing 8 protein-coding 140.667-38 chr10 79478785 79479031 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 32074 NR_136625 729815 Hs.564060 NR_136624 ENSG00000235705 LOC729815 - uncharacterized LOC729815 ncRNA 244.333-52 chr18 63538283 63538621 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -17708 NM_001307928 89777 Hs.348541 NM_080474 ENSG00000166634 SERPINB12 YUKOPIN serpin family B member 12 protein-coding 192.667-129 chr4 109809763 109810155 + 1 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger -5551 NM_032993 54433 Hs.69851 NM_018983 ENSG00000109534 GAR1 NOLA1 GAR1 ribonucleoprotein protein-coding 196.667-176 chrX 56992358 56992723 + 1 NA 3' UTR (NM_001010862, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001010862, exon 2 of 2) 3001 NR_027139 169981 Hs.522672 NM_001010862 ENSG00000204271 SPIN3 SPIN-3|TDRD27|bA445O16.1 spindlin family member 3 protein-coding 141.667-94 chr17 52454071 52454340 + 1 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) intron (NR_146898, intron 1 of 3) 63683 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 146.333-211 chr3 97484197 97484452 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 10 of 17) intron (NM_001080448, intron 10 of 17) 44717 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 184.667-136 chr8 104634800 104635037 + 1 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -45894 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 134.333-134 chr5 7049557 7049789 + 1 NA Intergenic Intergenic 219681 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 172.333-70 chr18 5316695 5317029 + 1 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -19809 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 249.333-67 chr3 87802682 87803125 + 1 NA intron (NM_001322208, intron 1 of 2) intron (NM_001322208, intron 1 of 2) 10197 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 163.333-83 chr14 52538911 52539079 + 1 NA intron (NM_001160047, intron 4 of 20) intron (NM_001160047, intron 4 of 20) 13510 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 278.667-10 chr11 132538171 132538694 + 1 NA intron (NM_002545, intron 2 of 6) L1MB7|LINE|L1 254130 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 161.333-64 chr12 39168662 39168871 + 1 NA Intergenic LTR108e_Mam|LTR|ERVL -263175 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 153.667-46 chr10 57328617 57328771 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -24135 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 147.333-174 chr2 146453808 146453999 + 1 NA Intergenic Intergenic -133154 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 197.333-249 chr9 132915419 132915750 + 1 NA intron (NM_000368, intron 8 of 22) intron (NM_000368, intron 8 of 22) 29032 NM_001162427 7248 Hs.370854 NM_000368 ENSG00000165699 TSC1 LAM|TSC TSC complex subunit 1 protein-coding 198.333-91 chr2 36220629 36220835 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 134838 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 149.333-301 chr5 13580604 13580806 + 1 NA Intergenic Intergenic 363775 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 222.667-25 chr14 41309202 41309446 + 1 NA Intergenic Intergenic -297532 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 373.333-26 chr7 130281713 130282278 + 1 NA intron (NM_001869, intron 9 of 10) intron (NM_001869, intron 9 of 10) -11139 NM_016352 51200 Hs.93764 NM_016352 ENSG00000128510 CPA4 CPA3 carboxypeptidase A4 protein-coding 272.667-19 chr15 41531063 41531539 + 1 NA intron (NM_015540, intron 6 of 24) intron (NM_015540, intron 6 of 24) 12956 NM_015540 26015 Hs.371045 NM_015540 ENSG00000103932 RPAP1 - RNA polymerase II associated protein 1 protein-coding 295.333-8 chr12 76455782 76456454 + 1 NA intron (NM_001319652, intron 5 of 25) intron (NM_001319652, intron 5 of 25) -32833 NM_001319655 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 118.333-24 chr1 236263056 236263212 + 1 NA intron (NM_019891, intron 2 of 15) LTR16A|LTR|ERVL 18824 NM_019891 56605 Hs.558519 NM_019891 ENSG00000086619 ERO1B ERO1LB|Ero1beta endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 beta protein-coding 185.333-47 chr14 61881616 61881864 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 -45955 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 130.667-157 chr4 101896290 101896496 + 1 NA intron (NM_017935, intron 6 of 16) intron (NM_017935, intron 6 of 16) 82551 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 167.333-105 chr17 30183109 30183426 + 1 NA intron (NM_032141, intron 6 of 6) intron (NM_032141, intron 6 of 6) 52430 NM_001045 6532 Hs.29792 NM_001045 ENSG00000108576 SLC6A4 5-HTT|5-HTTLPR|5HTT|HTT|OCD1|SERT|SERT1|hSERT solute carrier family 6 member 4 protein-coding 181.333-10 chr10 16976678 16976977 + 1 NA intron (NM_001081, intron 31 of 66) L1MEg|LINE|L1 152990 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 167.667-90 chr17 79660710 79661004 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 46392 NR_039893 100616170 NR_039893 ENSG00000266665 MIR4739 mir-4739 microRNA 4739 ncRNA 217.333-18 chr1 234686472 234686816 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -37398 NR_038856 100506810 Hs.586634 NR_038856 ENSG00000227630 LINC01132 - long intergenic non-protein coding RNA 1132 ncRNA 143.333-55 chr11 123328125 123328401 + 1 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -30159 NM_001367419 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 141.667-47 chr11 67081862 67082085 + 1 NA Intergenic Intergenic 25126 NM_014578 29984 Hs.15114 NM_014578 ENSG00000173156 RHOD ARHD|RHOHP1|RHOM|Rho ras homolog family member D protein-coding 119.667-95 chr2 217684713 217684899 + 1 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 71787 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 174.667-174 chr8 136150886 136151205 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -379753 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 153.333-444 chr9 90881912 90882184 + 1 NA intron (NM_001174167, intron 11 of 13) intron (NM_001174167, intron 11 of 13) 54628 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 152.667-348 chr7 96170670 96170840 + 1 NA intron (NM_001160210, intron 12 of 17) intron (NM_001160210, intron 12 of 17) 49001 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 167.333-49 chr10 95577275 95577467 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16000 NM_015385 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 167.333-48 chr10 88726012 88726191 + 1 NA intron (NM_001080518, intron 1 of 8) LTR33|LTR|ERVL 1557 NM_001080518 643414 Hs.632092 NM_001080518 ENSG00000204021 LIPK LIPL2|bA186O14.2 lipase family member K protein-coding 129.667-133 chr4 174204888 174205070 + 1 NA intron (NR_125896, intron 1 of 4) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 15419 NR_125896 101928509 Hs.147719 NR_125896 ENSG00000248174 LINC02268 - long intergenic non-protein coding RNA 2268 ncRNA 199.333-48 chr12 341281 341690 + 1 NA intron (NM_001042603, intron 10 of 27) intron (NM_001042603, intron 10 of 27) 47835 NM_001042603 5927 Hs.76272 NM_005056 ENSG00000073614 KDM5A RBBP-2|RBBP2|RBP2 lysine demethylase 5A protein-coding 159.667-207 chr22 40906495 40906723 + 1 NA intron (NM_022098, intron 4 of 9) MER20|DNA|hAT-Charlie -44496 NM_145174 150353 Hs.585042 NM_145174 ENSG00000172404 DNAJB7 DJ5|HSC3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B7 protein-coding 158.667-232 chr4 41637363 41637530 + 1 NA intron (NM_001330672, intron 13 of 31) AluSz6|SINE|Alu 24544 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 185.333-194 chr8 123991967 123992279 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 12 of 40) L1PB3|LINE|L1 48659 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 237.667-63 chr4 114760760 114761040 + 1 NA Intergenic Intergenic 104141 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 196.667-34 chr12 5499920 5500232 + 1 NA Intergenic Intergenic 5944 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 215.667-88 chr3 135509790 135510056 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -455805 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 137.333-22 chr10 123201093 123201259 + 1 NA Intergenic Intergenic 46774 NM_004725 9184 Hs.418533 NM_004725 ENSG00000154473 BUB3 BUB3L|hBUB3 BUB3 mitotic checkpoint protein protein-coding 170.333-47 chr11 84706678 84706876 + 1 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 14165 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 131.333-169 chr7 97659935 97660090 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -72074 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 150.667-374 chr8 108020762 108021009 + 1 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 61054 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 163.667-247 chr8 79514521 79514772 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -96471 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 145.667-268 chr7 50007486 50007733 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 6 of 7) L1M4|LINE|L1 85637 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 137.667-179 chr7 92654724 92654949 + 1 NA intron (NM_001259, intron 5 of 7) L1M6|LINE|L1 -64446 NR_109929 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 379.667-10 chr7 40301165 40301800 + 1 NA intron (NM_024728, intron 8 of 14) intron (NM_024728, intron 8 of 14) 166506 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 233.333-81 chr22 33138267 33138555 + 1 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 29882 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 236.333-95 chr9 17343544 17343972 + 1 NA intron (NM_001365029, intron 12 of 25) L1MB8|LINE|L1 208718 NM_001365029 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 154.333-314 chr7 11880696 11880909 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -48604 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 163.333-126 chr17 78452026 78452189 + 1 NA intron (NM_173628, intron 65 of 80) intron (NM_173628, intron 65 of 80) -32803 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 187.667-140 chr8 23373361 23373724 + 1 NA intron (NM_002318, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 30578 NM_002318 4017 Hs.626637 NM_002318 ENSG00000134013 LOXL2 LOR|LOR2|WS9-14 lysyl oxidase like 2 protein-coding 250.667-2 chr1 92521406 92521856 + 1 NA intron (NM_001350198, intron 19 of 19) AluSz|SINE|Alu -34706 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 206.667-76 chr21 27305510 27305877 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -338605 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 159.333-353 chr9 73152106 73152321 + 1 NA intron (NM_000700, intron 1 of 12) intron (NM_000700, intron 1 of 12) 348 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 321.333-29 chr15 70220017 70220437 + 1 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger -122310 NM_001282980 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 136.333-187 chr7 6580693 6580864 + 1 NA intron (NM_001371296, intron 3 of 7) AluJo|SINE|Alu 3324 NM_001371296 250.667-76 chr7 111495307 111495632 + 1 NA intron (NM_032549, intron 2 of 5) intron (NM_032549, intron 2 of 5) 66822 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 162.667-16 chr1 215813471 215813752 + 1 NA intron (NM_206933, intron 49 of 71) intron (NM_206933, intron 49 of 71) 246307 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 190.333-75 chr2 139258000 139258355 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 360853 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 147.333-218 chr3 102233800 102234040 + 1 NA Intergenic Intergenic 70215 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 147.333-305 chr7 125979827 125980011 + 1 NA Intergenic Intergenic -715628 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 153.667-246 chr3 28444829 28445097 + 1 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) HERVL-int|LTR|ERVL 95814 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 292.667-28 chr5 12531007 12531410 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -43649 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 259.667-67 chr6 42044005 42044375 + 1 NA intron (NM_001287434, intron 1 of 4) intron (NM_001287434, intron 1 of 4) 4704 NM_001287434 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 154.333-41 chr10 83888577 83888791 + 1 NA Intergenic Intergenic -211595 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 136.667-123 chr3 181675969 181676258 + 1 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) intron (NR_075090, intron 2 of 2) -35812 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 169.667-187 chr6 108540896 108541076 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18839 NM_201559 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 167.333-119 chr18 32663470 32663747 + 1 NA Intergenic Intergenic 109415 NM_020805 57565 Hs.446164 NM_020805 ENSG00000197705 KLHL14 - kelch like family member 14 protein-coding 168.333-205 chr8 35904623 35904844 + 1 NA Intergenic Intergenic -194413 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 123.667-81 chr2 22804151 22804364 + 1 NA Intergenic Intergenic 267778 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 165.333-78 chr14 67710157 67710441 + 1 NA intron (NM_152443, intron 1 of 8) MER4-int|LTR|ERV1 8413 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 188.667-48 chr15 51407750 51407969 + 1 NA 3' UTR (NM_181789, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_181789, exon 10 of 10) 30613 NM_001330297 342035 Hs.526441 NM_181789 ENSG00000186417 GLDN CLOM|COLM|CRG-L2|CRGL2|LCCS11|UNC-112 gliomedin protein-coding 318.667-5 chr10 92405898 92406224 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -12600 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 369.667-8 chr22 28383667 28384124 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L2a|LINE|L2 -75974 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 175.667-105 chr3 191848024 191848299 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 386998 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 120.333-158 chr5 116631037 116631186 + 1 NA Intergenic Intergenic -56288 NM_001300780 57556 Hs.156967 NM_020681 ENSG00000092421 SEMA6A HT018|SEMA|SEMA6A1|SEMAQ|VIA semaphorin 6A protein-coding 144.333-196 chr4 113508394 113508562 + 1 NA intron (NM_001321591, intron 13 of 19) intron (NM_001321591, intron 13 of 19) 215639 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 187.667-111 chr4 107161562 107161899 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -125417 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 187.333-19 chr10 23795691 23795946 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) LTR39|LTR|ERV1 101091 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 284.667-15 chr14 50233594 50234079 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2258 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 182.667-72 chr2 10759626 10759985 + 1 NA intron (NM_001039362, intron 4 of 13) intron (NM_001039362, intron 4 of 13) 38175 NM_144583 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 148.333-348 chr6 165288280 165288574 + 1 NA intron (NM_144980, intron 7 of 8) L1PA10|LINE|L1 21178 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 179.333-31 chr10 110230161 110230400 + 1 NA intron (NM_001008541, intron 2 of 4) intron (NM_001008541, intron 2 of 4) 4284 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 212.333-82 chr2 234711582 234712036 + 1 NA intron (NR_132376, intron 2 of 2) intron (NR_132376, intron 2 of 2) 29141 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 196.667-45 chr14 60545598 60545871 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 36588 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 181.333-120 chr4 59613435 59613762 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 600025 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 195.333-101 chr18 56016467 56016662 + 1 NA intron (NR_148972, intron 8 of 8) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -25714 NR_146510 102724698 NR_146510 ENSG00000267057 LINC01905 - long intergenic non-protein coding RNA 1905 ncRNA 183.667-117 chr5 73770244 73770509 + 1 NA intron (NM_001177693, intron 4 of 35) intron (NM_001177693, intron 4 of 35) -43170 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 162.333-62 chr13 98792841 98793096 + 1 NA TTS (NM_001366684) TTS (NM_001366684) -39116 NR_046663 100874096 Hs.578066 NR_046663 ENSG00000229918 DOCK9-AS1 - DOCK9 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-278 chr8 33684487 33684807 + 1 NA Intergenic Intergenic -84541 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 169.667-177 chr6 17328387 17328705 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 45845 NM_153020 221662 Hs.519904 NM_153020 ENSG00000112183 RBM24 RNPC6|dJ259A10.1 RNA binding motif protein 24 protein-coding 149.667-4 chr1 25940321 25940610 + 1 NA Intergenic Intergenic -33588 NM_203399 3925 Hs.209983 NM_005563 ENSG00000117632 STMN1 C1orf215|LAP18|Lag|OP18|PP17|PP19|PR22|SMN stathmin 1 protein-coding 187.333-194 chr8 49493940 49494278 + 1 NA Intergenic Intergenic 18071 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 283.333-40 chr20 19886164 19886484 + 1 NA promoter-TSS (NM_001242581) promoter-TSS (NM_001242581) -197 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 146.333-56 chr11 121808057 121808295 + 1 NA Intergenic Intergenic 291668 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 238.667-94 chr9 12572370 12572684 + 1 NA Intergenic Intergenic -120858 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 153.667-324 chr5 122792132 122792402 + 1 NA intron (NM_001278199, intron 1 of 14) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 17187 NM_003100 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 231.333-56 chr2 39385836 39386331 + 1 NA intron (NM_003618, intron 1 of 33) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 51202 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 210.667-76 chr2 229997431 229997730 + 1 NA intron (NM_174899, intron 3 of 3) AluSx1|SINE|Alu 71344 NM_152527 151473 Hs.504317 NM_152527 ENSG00000163053 SLC16A14 MCT14 solute carrier family 16 member 14 protein-coding 151.333-290 chr3 158928542 158928807 + 1 NA Intergenic Intergenic 126620 NM_022736 64747 Hs.58663 NM_022736 ENSG00000118855 MFSD1 SMAP4 major facilitator superfamily domain containing 1 protein-coding 174.667-96 chr2 168676082 168676260 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 4 of 10) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 93228 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 252.667-55 chr20 35381700 35382206 + 1 NA exon (NM_199487, exon 4 of 9) exon (NM_199487, exon 4 of 9) 30020 NM_018244 55245 Hs.726290 NM_018244 ENSG00000101019 UQCC1 BFZB|C20orf44|CBP3|UQCC ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 1 protein-coding 148.667-12 chr1 100762253 100762476 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 42622 NM_001078 7412 Hs.109225 NM_001078 ENSG00000162692 VCAM1 CD106|INCAM-100 vascular cell adhesion molecule 1 protein-coding 126.333-163 chr7 37370115 37370332 + 1 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) LTR48|LTR|ERV1 -16555 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 282.667-49 chr8 121072633 121073036 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -260788 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 209.333-54 chr14 37961234 37961671 + 1 NA Intergenic Intergenic -59328 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 141.333-187 chr5 37707492 37707650 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 13 of 17) intron (NM_001345998, intron 13 of 17) 127251 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 153.333-186 chr2 12959792 12959973 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 47131 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 146.667-232 chr4 52549913 52550133 + 1 NA Intergenic Intergenic 106516 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 212.667-68 chr2 44119492 44119857 + 1 NA Intergenic Intergenic -49129 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 158.333-233 chr4 89027585 89027869 + 1 NA intron (NM_014883, intron 2 of 23) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 29458 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 167.333-13 chr1 97559307 97559523 + 1 NA intron (NM_000110, intron 11 of 22) intron (NM_000110, intron 11 of 22) -237506 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 242.333-88 chr6 81417011 81417476 + 1 NA Intergenic Intergenic 335438 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 178.667-108 chr3 169632502 169632692 + 1 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) intron (NM_001366473, intron 1 of 15) 31115 NM_001205194 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 126.333-78 chr19 51705021 51705147 + 1 NA intron (NR_024330, intron 7 of 7) intron (NR_024330, intron 7 of 7) -11628 NR_108100 102238594 Hs.640185 NR_108100 ENSG00000269959 SPACA6P-AS LINC01129 SPACA6P antisense RNA ncRNA 165.667-200 chr8 118138924 118139162 + 1 NA intron (NR_146234, intron 5 of 5) LTR67B|LTR|ERVL -27224 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 128.667-117 chr3 78611046 78611282 + 1 NA intron (NM_002941, intron 28 of 30) intron (NM_002941, intron 28 of 30) 408295 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 164.333-199 chr5 101427402 101427624 + 1 NA Intergenic Intergenic -524231 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 112.667-265 chr8 80537190 80537345 + 1 NA Intergenic Intergenic 51041 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 159.333-103 chr15 68438145 68438376 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -6097 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 259.667-65 chr5 164779885 164780323 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 309825 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 188.333-54 chr16 21014316 21014586 + 1 NA intron (NM_001347886, intron 41 of 61) L1MC2|LINE|L1 113189 NM_001369644 57149 Hs.745012 NM_020424 ENSG00000102897 LYRM1 A211C6.1 LYR motif containing 1 protein-coding 141.333-221 chr7 28471733 28471998 + 1 NA intron (NM_004904, intron 1 of 10) intron (NM_004904, intron 1 of 10) 36250 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 223.333-47 chr16 12821126 12821467 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -17409 NM_018340 55313 Hs.460002 NM_018340 ENSG00000103381 CPPED1 CSTP1 calcineurin like phosphoesterase domain containing 1 protein-coding 151.667-173 chr2 156516130 156516326 + 1 NA intron (NM_000408, intron 6 of 16) intron (NM_000408, intron 6 of 16) 79849 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 162.333-34 chr10 124430551 124430724 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11661 NM_000274 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 148.667-177 chr2 38106658 38106809 + 1 NA Intergenic Intergenic -24372 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 155.667-258 chr4 117177612 117177904 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -92182 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 153.667-186 chr2 81166405 81166651 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 300418 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 184.333-94 chr22 25635882 25636215 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) L1MC4|LINE|L1 71373 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 307.333-38 chr19 36901300 36901711 + 1 NA intron (NM_001037232, intron 5 of 5) L1MB8|LINE|L1 14534 NM_001171979 374899 Hs.720312 NM_001037232 ENSG00000185869 ZNF829 - zinc finger protein 829 protein-coding 152.333-403 chr9 93300769 93300979 + 1 NA intron (NM_006648, intron 25 of 28) intron (NM_006648, intron 25 of 28) 45429 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 166.333-202 chr6 138832325 138832617 + 1 NA intron (NM_001077706, intron 4 of 21) intron (NM_001077706, intron 4 of 21) 36360 NM_001195037 345930 Hs.660603 NM_001077706 ENSG00000203734 ECT2L ARHGEF32|C6orf91|FBXO49|LFDH|dJ509I19.2|dJ509I19.3|dJ509I19.5 epithelial cell transforming 2 like protein-coding 150.667-168 chr2 26210802 26211033 + 1 NA intron (NM_000182, intron 10 of 19) intron (NM_000182, intron 10 of 19) 30201 NM_001191033 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 160.667-20 chr1 191858719 191858881 + 1 NA Intergenic Intergenic -299662 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 219.667-29 chr17 15267485 15267745 + 1 NA Intergenic Intergenic -2289 NM_001330143 5376 Hs.372031 NM_000304 ENSG00000109099 PMP22 CIDP|CMT1A|CMT1E|DSS|GAS-3|GAS3|HMSNIA|HNPP|Sp110 peripheral myelin protein 22 protein-coding 217.333-39 chr12 96912711 96913051 + 1 NA intron (NM_001135175, intron 3 of 14) intron (NM_001135175, intron 3 of 14) 5415 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 147.667-357 chr8 78896628 78896882 + 1 NA Intergenic Intergenic 59226 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 114.333-59 chr12 96442138 96442354 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -41807 NM_002595 5128 Hs.506415 NM_002595 ENSG00000059758 CDK17 PCTAIRE2|PCTK2 cyclin dependent kinase 17 protein-coding 197.667-110 chr4 74169895 74170189 + 1 NA intron (NM_001351310, intron 3 of 8) L1M5|LINE|L1 11924 NM_001004346 441024 Hs.721011 NM_001004346 ENSG00000163738 MTHFD2L - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2 like protein-coding 122.667-163 chr6 56137723 56137883 + 1 NA intron (NM_030820, intron 12 of 29) X8_LINE|LINE|CR1 -46141 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 168.667-34 chr11 90377124 90377307 + 1 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) L1PA11|LINE|L1 125983 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 268.667-5 chr10 103058333 103058780 + 1 NA intron (NM_199076, intron 4 of 6) intron (NM_199076, intron 4 of 6) 95265 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 251.333-108 chr8 126785276 126785623 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -226971 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 176.333-191 chrX 152430394 152430570 + 1 NA intron (NM_000808, intron 1 of 9) intron (NM_000808, intron 1 of 9) 20833 NM_000808 2556 Hs.123024 NM_000808 ENSG00000011677 GABRA3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha3 subunit protein-coding 169.333-46 chr12 19003519 19003822 + 1 NA Intergenic Intergenic -126063 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 149.333-123 chr15 62627212 62627450 + 1 NA Intergenic Intergenic 17850 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 183.333-84 chr2 152713926 152714252 + 1 NA intron (NM_001354432, intron 3 of 27) intron (NM_001354432, intron 3 of 27) 3372 NM_001365604 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 262.333-10 chr10 17395096 17395423 + 1 NA intron (NM_001004470, intron 2 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 8323 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 112.333-87 chr17 29544064 29544256 + 1 NA 3' UTR (NM_020791, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_020791, exon 20 of 20) 22877 NM_198147 116236 Hs.106510 NM_198147 ENSG00000168792 ABHD15 - abhydrolase domain containing 15 protein-coding 175.667-97 chr3 78897783 78897980 + 1 NA intron (NM_002941, intron 4 of 30) intron (NM_002941, intron 4 of 30) 121578 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 187.667-104 chr4 42985472 42985793 + 1 NA intron (NM_001080476, intron 2 of 3) intron (NM_001080476, intron 2 of 3) 92366 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 214.667-127 chr9 93194098 93194522 + 1 NA intron (NM_006648, intron 1 of 28) L1MC2|LINE|L1 9380 NM_006648 65268 Hs.654856 NM_006648 ENSG00000165238 WNK2 NY-CO-43|P/OKcl.13|PRKWNK2|SDCCAG43 WNK lysine deficient protein kinase 2 protein-coding 156.333-104 chr14 43817743 43818043 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 689390 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 216.333-71 chr2 29140759 29141069 + 1 NA intron (NM_001287528, intron 6 of 14) L1PA17|LINE|L1 25499 NM_001287527 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 225.667 chr1 63193543 63193841 + 1 NA intron (NR_038252, intron 5 of 11) MIRc|SINE|MIR 123565 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 158.333-344 chr9 101609515 101609722 + 1 NA intron (NM_133445, intron 6 of 8) intron (NM_133445, intron 6 of 8) -14649 NM_147180 5535 Hs.151167 NM_147180 ENSG00000188386 PPP3R2 PPP3RL protein phosphatase 3 regulatory subunit B, beta protein-coding 140.667-181 chr5 28455893 28456177 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -168370 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 138.667-133 chr3 98277534 98277747 + 1 NA Intergenic Intergenic -5248 NM_001005482 79310 Hs.554711 NM_001005482 ENSG00000197938 OR5H2 OR3-10 olfactory receptor family 5 subfamily H member 2 protein-coding 260.333-41 chr4 89650024 89650484 + 1 NA Intergenic Intergenic -186147 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 193.667-123 chr7 18772155 18772381 + 1 NA intron (NM_058176, intron 15 of 22) intron (NM_058176, intron 15 of 22) 262998 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 237.667-56 chr3 115232174 115232625 + 1 NA Intergenic Intergenic -85111 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 258.667-49 chr2 159960340 159960822 + 1 NA intron (NM_001007267, intron 20 of 26) intron (NM_001007267, intron 20 of 26) -55825 NM_002349 4065 Hs.153563 NM_002349 ENSG00000054219 LY75 CD205|CLEC13B|DEC-205|GP200-MR6|LY-75 lymphocyte antigen 75 protein-coding 161.667-78 chr14 65013276 65013606 + 1 NA intron (NM_002028, intron 3 of 11) MER102b|DNA|hAT-Charlie 26546 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 215.667-63 chr2 145315517 145315885 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 647734 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 130.667-51 chr11 113462004 113462193 + 1 NA intron (NM_016574, intron 1 of 6) intron (NM_016574, intron 1 of 6) -12010 NR_036183 100422855 NR_036183 ENSG00000265140 MIR4301 - microRNA 4301 ncRNA 143.667-243 chr8 14120974 14121132 + 1 NA intron (NM_001322880, intron 4 of 6) L1ME4a|LINE|L1 491363 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 199.667-24 chr10 132095775 132096096 + 1 NA intron (NM_001323086, intron 1 of 23) intron (NM_001323086, intron 1 of 23) 29989 NM_001323088 282973 Hs.106254 NM_194303 ENSG00000188385 JAKMIP3 C10orf14|C10orf39|Jamip3|NECC2|bA140A10.5 Janus kinase and microtubule interacting protein 3 protein-coding 169.333-53 chr12 46133971 46134190 + 1 NA Intergenic LTR80B|LTR|ERVL 132436 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 170.333-225 chr8 136965552 136965882 + 1 NA Intergenic Intergenic 434919 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 131.667-181 chr7 46371506 46371772 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 325483 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 147.667-320 chr6 118653187 118653429 + 1 NA intron (NM_001178035, intron 1 of 13) intron (NM_001178035, intron 1 of 13) -1717 NM_206921 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 255.333-78 chr4 131407349 131407659 + 1 NA Intergenic Intergenic -357334 NR_125883 101927305 Hs.507924 NR_125883 SNHG27 - small nucleolar RNA host gene 27 ncRNA 244.667-37 chr12 127850907 127851193 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -30567 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 270.333-60 chr8 28559957 28560607 + 1 NA intron (NM_017412, intron 7 of 7) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -55100 NR_036250 100422903 NR_036250 ENSG00000265251 MIR4288 - microRNA 4288 ncRNA 138.333-4 chr1 52308936 52309084 + 1 NA intron (NM_007324, intron 12 of 17) intron (NM_007324, intron 12 of 17) 57195 NM_032449 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 265.333-52 chr3 56386434 56386799 + 1 NA intron (NR_132749, intron 2 of 17) intron (NR_132749, intron 2 of 17) 81851 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 250.667-16 chr13 112684563 112684899 + 1 NA TTS (NM_207440) TTS (NM_207440) -5598 NM_015205 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 203.667-60 chr2 165584460 165584824 + 1 NA intron (NM_024969, intron 1 of 4) intron (NM_024969, intron 1 of 4) 12306 NM_024969 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 195.667-101 chr4 147415468 147415688 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -65339 NM_001166055 1909 Hs.183713 NM_001957 ENSG00000151617 EDNRA ET-A|ETA|ETA-R|ETAR|ETRA|MFDA|hET-AR endothelin receptor type A protein-coding 124.333-167 chr7 6409949 6410129 + 1 NA intron (NM_001142936, intron 12 of 12) intron (NM_001142936, intron 12 of 12) 35512 NM_006908 5879 Hs.413812 NM_006908 ENSG00000136238 RAC1 MIG5|MRD48|Rac-1|TC-25|p21-Rac1 Rac family small GTPase 1 protein-coding 258.667-46 chr2 79241260 79241673 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -81713 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 209.667-44 chr14 55520213 55520597 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 59687 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 191.667-86 chr3 134479798 134480090 + 1 NA intron (NM_001242375, intron 2 of 2) intron (NM_001242375, intron 2 of 2) -5780 NM_001353109 80254 Hs.443301 NM_025180 ENSG00000182923 CEP63 SCKL6 centrosomal protein 63 protein-coding 144.333-92 chr17 32172028 32172231 + 1 NA intron (NM_001033566, intron 2 of 19) intron (NM_001033566, intron 2 of 19) -20558 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 146.667-64 chr11 113925873 113926039 + 1 NA intron (NM_006028, intron 2 of 8) L1MB7|LINE|L1 17115 NM_001363563 9177 Hs.241377 NM_006028 ENSG00000149305 HTR3B 5-HT3B 5-hydroxytryptamine receptor 3B protein-coding 144.333-245 chr7 39401904 39402140 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 5 of 9) intron (NM_001370959, intron 5 of 9) 4324 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-212 chr4 61250394 61250555 + 1 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 48302 NM_001371342 187.333-11 chr1 186172189 186172441 + 1 NA intron (NM_031935, intron 102 of 106) intron (NM_031935, intron 102 of 106) -123958 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 157.333-317 chr7 20233876 20234044 + 1 NA Intergenic Intergenic 16383 NR_134569 100506098 Hs.59203 NR_134567 ENSG00000233834 LOC100506098 - uncharacterized LOC100506098 ncRNA 215.333-155 chr5 42145455 42145728 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 29754 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 159.333-62 chr11 125927169 125927401 + 1 NA 3' UTR (NM_001330438, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001330438, exon 12 of 12) -18771 NM_001365077 338667 Hs.730137 NM_001365077 VSIG10L2 - V-set and immunoglobulin domain containing 10 like 2 protein-coding 156.333-119 chr14 88080071 88080302 + 1 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) intron (NR_046094, intron 2 of 3) -53874 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 145.667-73 chr14 47504131 47504341 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -160990 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 319.667-27 chr5 166197095 166197617 + 1 NA Intergenic (TTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 729014 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 354.667 chr1 44511059 44511508 + 1 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) -34210 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 126.333-8 chr1 111639210 111639376 + 1 NA intron (NM_001010935, intron 2 of 8) intron (NM_001010935, intron 2 of 8) -18895 NR_160737 107985184 NR_160737 LOC107985184 - uncharacterized LOC107985184 ncRNA 196.333-99 chr20 45387110 45387351 + 1 NA intron (NR_003189, intron 3 of 5) L1MC|LINE|L1 -8905 NM_014477 27296 Hs.710271 NM_014477 ENSG00000124251 TP53TG5 C20orf10|CLG01 TP53 target 5 protein-coding 172.333-137 chr5 52809604 52809784 + 1 NA intron (NM_181501, intron 1 of 28) AluSz|SINE|Alu 21778 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 217.667-16 chr10 90065748 90066089 + 1 NA Intergenic Intergenic -108545 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 154.667-363 chr7 38132105 38132260 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -46063 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 176.333-85 chr2 71242819 71242995 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -15804 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 156.333-113 chr14 71055903 71056078 + 1 NA intron (NM_014982, intron 25 of 35) intron (NM_014982, intron 25 of 35) 148531 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 151.667-395 chr9 103592165 103592389 + 1 NA Intergenic Intergenic -267244 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 290.667-31 chr4 48649334 48649727 + 1 NA intron (NM_015030, intron 3 of 63) intron (NM_015030, intron 3 of 63) 130769 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 164.667-54 chr12 47933780 47934034 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -28876 NM_001017535 7421 Hs.524368 NM_000376 ENSG00000111424 VDR NR1I1|PPP1R163 vitamin D receptor protein-coding 121.667-63 chr15 34933608 34933815 + 1 NA intron (NM_014691, intron 10 of 34) intron (NM_014691, intron 10 of 34) 36031 NM_014691 9716 Hs.510958 NM_014691 ENSG00000021776 AQR IBP160|fSAP164 aquarius intron-binding spliceosomal factor protein-coding 282.667-11 chr17 71057888 71058323 + 1 NA Intergenic Intergenic 144074 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 169.333-219 chr6 14501452 14501633 + 1 NA Intergenic Intergenic -216088 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 206.667-103 chr4 76679593 76679860 + 1 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) intron (NM_020859, intron 2 of 10) 104175 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 186.333-67 chr2 13790127 13790464 + 1 NA Intergenic Intergenic 610663 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 114.667-155 chr20 50179622 50179844 + 1 NA Intergenic Intergenic 7163 NR_109943 101927541 Hs.570391 NR_109943 ENSG00000231742 LINC01273 - long intergenic non-protein coding RNA 1273 ncRNA 149.333-342 chr6 111510012 111510216 + 1 NA intron (NR_034109, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR -26399 NM_001286432 5980 Hs.232021 NM_002912 ENSG00000009413 REV3L POLZ|REV3 REV3 like, DNA directed polymerase zeta catalytic subunit protein-coding 150.667-209 chr20 6281064 6281225 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -145588 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 139.667-174 chr7 101661965 101662204 + 1 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger -32788 NM_138403 93408 Hs.247831 NM_138403 ENSG00000106436 MYL10 MYLC2PL|PLRLC myosin light chain 10 protein-coding 200.333-30 chr12 41610766 41610992 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -153310 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 162.667-188 chr4 11152973 11153143 + 1 NA Intergenic LTR55|LTR|ERVL? -215769 NR_030298 693157 NR_030298 ENSG00000207716 MIR572 MIRN572|hsa-mir-572 microRNA 572 ncRNA 250.333-58 chr5 110980165 110980542 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -89727 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 184.333-62 chr18 64306985 64307260 + 1 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) intron (NR_033881, intron 5 of 9) -47067 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 271.333-40 chr22 21999738 22000064 + 1 NA intron (NR_135291, intron 4 of 6) intron (NR_135291, intron 4 of 6) -17114 NM_001349852 8940 Hs.436401 NM_003935 ENSG00000100038 TOP3B TOP3B1 DNA topoisomerase III beta protein-coding 166.667-225 chr7 127436863 127437170 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -39867 NR_110024 100506682 Hs.148450 NR_110024 ENSG00000226770 LOC100506682 - uncharacterized LOC100506682 ncRNA 166.667-199 chr6 65388984 65389162 + 1 NA intron (NM_198283, intron 6 of 9) L2a|LINE|L2 87655 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 128.667-195 chr9 81802402 81802549 + 1 NA Intergenic Intergenic -110962 NR_026851 347127 Hs.215235 NM_198509 ENSG00000240632 SPATA31D5P FAM75D5|FAM75D5P SPATA31 subfamily D member 5, pseudogene pseudo 156.667-235 chr3 187554846 187555011 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 107882 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 139.333-144 chr3 9303370 9303600 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 53729 NR_146969 101927440 NR_146969 ENSG00000235830 SRGAP3-AS4 - SRGAP3 antisense RNA 4 ncRNA 215.667-117 chr7 143512106 143512425 + 1 NA promoter-TSS (NR_145518).2 promoter-TSS (NR_145518).2 -254 NM_001348289 392133 NM_001348289 ENSG00000176510 OR10AC1 OR10AC1P olfactory receptor family 10 subfamily AC member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 135.667-126 chr4 30487831 30487979 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -232464 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 117.333-36 chr11 20052727 20052881 + 1 NA intron (NM_182964, intron 17 of 37) intron (NM_182964, intron 17 of 37) -3501 NR_046672 100874014 Hs.557916 NR_046672 ENSG00000254453 NAV2-AS2 - NAV2 antisense RNA 2 ncRNA 166.667-244 chr9 32378505 32378721 + 1 NA Intergenic Intergenic -5990 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 229.333-117 chr8 83390564 83391045 + 1 NA Intergenic Intergenic -12954 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 214.333-56 chr16 73722639 73722901 + 1 NA Intergenic Intergenic 335965 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 150.667-367 chr8 69533981 69534242 + 1 NA intron (NR_156414, intron 2 of 20) intron (NR_156414, intron 2 of 20) 41264 NM_001128206 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 195.667-151 chr8 140465733 140466047 + 1 NA Intergenic MER65D|LTR|ERV1 -7311 NM_031466 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 269.667-47 chr7 30352029 30352347 + 1 NA intron (NM_147128, intron 2 of 4) intron (NM_147128, intron 2 of 4) -17862 NR_002186 222161 Hs.112423 NR_002186 DKFZP586I1420 - uncharacterized protein DKFZp586I1420 pseudo 185.333-190 chr8 104712389 104712670 + 1 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -123505 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 173.333-15 chr1 161151840 161152021 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2048 NM_016406 51506 Hs.301412 NM_016406 ENSG00000143222 UFC1 HSPC155|NEDSG ubiquitin-fold modifier conjugating enzyme 1 protein-coding 140.667-157 chr4 23759511 23759756 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 121659 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 234.667-70 chr3 111856127 111856478 + 1 NA intron (NM_001134437, intron 2 of 17) intron (NM_001134437, intron 2 of 17) -2878 NM_145753 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 178.333-152 chr6 55087563 55087788 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -18785 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 237.333-94 chr5 175008808 175009089 + 1 NA Intergenic Intergenic -13217 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 374.667-3 chr10 66336672 66337128 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -589136 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 332.333-22 chr5 149457519 149457929 + 1 NA Intergenic Intergenic 27078 NR_029686 406937 NR_029686 ENSG00000276365 MIR145 MIRN145|miR-145|miRNA145 microRNA 145 ncRNA 223.667-26 chr15 101574715 101575001 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 39481 NR_147041 101927505 Hs.578394 NR_147041 LINC02348 - long intergenic non-protein coding RNA 2348 ncRNA 202.667-158 chr9 92096955 92097305 + 1 NA intron (NM_001368273, intron 4 of 15) L1MB7|LINE|L1 18283 NM_001281303 10558 Hs.90458 NM_006415 ENSG00000090054 SPTLC1 HSAN1|HSN1|LBC1|LCB1|SPT1|SPTI serine palmitoyltransferase long chain base subunit 1 protein-coding 123.333-104 chr2 75777649 75777796 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -66807 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 145.333-175 chr3 5189011 5189194 + 1 NA intron (NM_014674, intron 1 of 11) intron (NM_014674, intron 1 of 11) 1395 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 158.333-203 chr3 66196272 66196585 + 1 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) MER90a|LTR|ERV1 -24314 NR_028475 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 174.667-133 chr4 168211635 168211868 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 107001 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 277.667-5 chr1 225505588 225506056 + 1 NA intron (NM_001008493, intron 11 of 14) intron (NM_001008493, intron 11 of 14) -76967 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 169.667-108 chr2 79351648 79351870 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 149085 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 147.667-316 chr6 62925952 62926222 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 393890 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 193.667-73 chr20 35847294 35847554 + 1 NA exon (NM_016436, exon 4 of 18) exon (NM_016436, exon 4 of 18) 75409 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 232.667-7 chr10 90601644 90601940 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -60987 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 193.667-68 chr2 202996203 202996568 + 1 NA Intergenic Intergenic -18494 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 154.667-51 chr10 98023555 98023737 + 1 NA intron (NM_001206528, intron 1 of 14) intron (NM_001206528, intron 1 of 14) 6975 NM_018058 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 317.333-40 chr7 135403151 135403590 + 1 NA intron (NM_013316, intron 7 of 10) intron (NM_013316, intron 7 of 10) 106732 NM_013316 4850 Hs.490224 NM_013316 ENSG00000080802 CNOT4 CLONE243|NOT4|NOT4H CCR4-NOT transcription complex subunit 4 protein-coding 163.667-33 chr11 3137580 3137790 + 1 NA intron (NM_145638, intron 1 of 20) AluJr|SINE|Alu 27625 NM_020896 114879 Hs.436166 NM_020896 ENSG00000021762 OSBPL5 OBPH1|ORP5 oxysterol binding protein like 5 protein-coding 165.333-171 chr3 95493330 95493524 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 189766 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 216.333-121 chr6 37227431 37227760 + 1 NA intron (NM_145316, intron 1 of 3) AluSx3|SINE|Alu 30004 NM_145316 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 168.667-55 chr13 107950662 107950883 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -83276 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 146.333-35 chr10 102759690 102759836 + 1 NA intron (NM_001083913, intron 1 of 3) FAM|SINE|Alu 15815 NM_001083913 54838 Hs.500897 NM_017787 ENSG00000166272 WBP1L C10orf26|OPA1L|OPAL1 WW domain binding protein 1 like protein-coding 254.333-60 chr4 57993392 57993781 + 1 NA Intergenic Intergenic 542742 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 157.333-142 chr17 26883458 26883688 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 205668 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 224.667-42 chr2 57811803 57812142 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -95679 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 235.333-68 chr3 8841944 8842379 + 1 NA Intergenic Intergenic -72547 NM_001354653 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 135.667-62 chr15 70862625 70862864 + 1 NA intron (NM_001284357, intron 1 of 16) LTR86B2|LTR|ERVL -8587 NM_197958 55323 Hs.416755 NM_018357 ENSG00000166173 LARP6 ACHN La ribonucleoprotein domain family member 6 protein-coding 191.667-114 chr7 27683620 27683942 + 1 NA Intergenic Intergenic -20898 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 208.333-24 chr12 4691454 4691796 + 1 NA 3' UTR (NM_005002, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_005002, exon 11 of 11) 28477 NR_110112 101929549 Hs.663336 NR_110112 ENSG00000255474 GAU1 GALNT8-DT GALNT8 antisense upstream 1 ncRNA 160.667-157 chr2 138454496 138454740 + 1 NA Intergenic Intergenic -47152 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 140.333-65 chr14 64668252 64668393 + 1 NA Intergenic Intergenic -36102 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 131.667-211 chr9 24721820 24722088 + 1 NA Intergenic Intergenic -176057 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 167.667-111 chr2 163857158 163857436 + 1 NA Intergenic Intergenic -121289 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 170.333-25 chr10 19045753 19045961 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -2944 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 273.667-11 chr10 54596696 54597204 + 1 NA intron (NR_134503, intron 2 of 5) L1PA16|LINE|L1 11007 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 157.667-147 chr2 104290311 104290569 + 1 NA Intergenic Intergenic 117892 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 160.333-240 chr5 146172572 146172861 + 1 NA exon (NM_001317964, exon 3 of 31) exon (NM_001317964, exon 3 of 31) 9934 NM_020117 51520 Hs.432674 NM_016460 ENSG00000133706 LARS HSPC192|ILFS1|LARS1|LEURS|LEUS|LFIS|LRS|PIG44|RNTLS|hr025Cl leucyl-tRNA synthetase protein-coding 289.667-9 chr12 96521049 96521550 + 1 NA intron (NM_001306084, intron 6 of 67) intron (NM_001306084, intron 6 of 67) 31722 NM_001306084 144535 Hs.382121 NM_198520 ENSG00000188596 CFAP54 C12orf55|C12orf63 cilia and flagella associated protein 54 protein-coding 139.333-51 chr12 20051586 20051799 + 1 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 37007 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 134.667-113 chr20 5249612 5249772 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 67040 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 163.667-206 chr6 10847546 10847753 + 1 NA Intergenic Intergenic -9094 NM_001242385 4117 Hs.446125 NM_005906 ENSG00000111837 MAK RP62 male germ cell associated kinase protein-coding 160.667-167 chr2 190002177 190002532 + 1 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 60375 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 192.667-159 chr7 47123800 47124147 + 1 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 340830 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 191.667-97 chr4 104636821 104637158 + 1 NA intron (NR_125926, intron 1 of 9) intron (NR_125926, intron 1 of 9) -142095 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 260.333-64 chr7 49963987 49964395 + 1 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) L1MD|LINE|L1 129055 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 229.667-12 chr10 72472481 72472774 + 1 NA intron (NM_001195519, intron 3 of 6) intron (NM_001195519, intron 3 of 6) 51359 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 270.333-48 chr5 20498365 20498691 + 1 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 77185 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 117.333-92 chr19 32515555 32515798 + 1 NA Intergenic Intergenic -65514 NM_004708 9141 Hs.443831 NM_004708 ENSG00000105185 PDCD5 TFAR19 programmed cell death 5 protein-coding 224.333-57 chr18 11394359 11394693 + 1 NA Intergenic Intergenic -59952 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 170.333-160 chr4 91515236 91515438 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1PA15|LINE|L1 761965 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 207.333-143 chr2 164525198 164525527 + 1 NA intron (NM_004490, intron 4 of 13) MIRc|SINE|MIR 43133 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 150.333-23 chr1 179341999 179342238 + 1 NA non-coding (NR_045530, exon 6 of 14) non-coding (NR_045530, exon 6 of 14) -23853 NM_144696 126859 Hs.658505 NM_144696 ENSG00000162779 AXDND1 C1orf125 axonemal dynein light chain domain containing 1 protein-coding 267.333-97 chr9 120207097 120207575 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 37714 NR_029604 406939 NR_029604 ENSG00000207814 MIR147A MIR147|MIRN147|hsa-mir-147a microRNA 147a ncRNA 137.333-117 chr22 25860542 25860753 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 21 of 43) L1M4a2|LINE|L1 118459 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 262.333-38 chr18 13076940 13077323 + 1 NA intron (NM_032142, intron 30 of 44) intron (NM_032142, intron 30 of 44) 85769 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 182.667-60 chr16 86653702 86653937 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 68140 NR_135181 101928614 Hs.399823 NR_135181 ENSG00000260026 LINC02189 - long intergenic non-protein coding RNA 2189 ncRNA 165.667-205 chr8 137531876 137532120 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -118410 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 145.667-86 chr14 73922119 73922347 + 1 NA intron (NR_040251, intron 10 of 11) intron (NR_040251, intron 10 of 11) -27701 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 174.333-54 chr2 10111255 10111555 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11163 NM_001165931 6241 Hs.226390 NM_001034 ENSG00000171848 RRM2 R2|RR2|RR2M ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 protein-coding 189.333-10 chr1 90445909 90446118 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -211737 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 159.333-107 chr15 88498849 88499037 + 1 NA Intergenic Intergenic 31235 NM_001321976 64963 Hs.111286 NM_022839 ENSG00000181991 MRPS11 HCC-2|MRP-S11|S11mt mitochondrial ribosomal protein S11 protein-coding 187.333-182 chr6 156632149 156632482 + 1 NA Intergenic Intergenic -145540 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 157.667-203 chr3 172123019 172123177 + 1 NA intron (NM_001135095, intron 2 of 25) AluJr|SINE|Alu 82567 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 178.333-151 chr6 51183607 51183957 + 1 NA Intergenic Intergenic 364911 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 171.333-48 chr14 60195797 60196109 + 1 NA Intergenic Intergenic -26089 NM_001322280 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 162.333-35 chr10 125404631 125404893 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -169609 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 204.333-203 chr8 130285505 130285783 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 10889 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 119.667-98 chr20 32439546 32439710 + 1 NA TTS (NM_001363734) TTS (NM_001363734) 43862 NM_001351680 140688 Hs.516978 NM_080616 ENSG00000197183 NOL4L C20orf112|C20orf113 nucleolar protein 4 like protein-coding 144.667-135 chr2 53016848 53017056 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -314337 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 182.667-128 chr5 38266765 38266953 + 1 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) intron (NM_152403, intron 1 of 21) 8300 NM_001205301 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 169.667-20 chr10 64940435 64940630 + 1 NA Intergenic Intergenic -16014 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 122.333-154 chr4 32547561 32547710 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 196597 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 150.333-225 chr2 205113962 205114120 + 1 NA intron (NM_205863, intron 6 of 21) intron (NM_205863, intron 6 of 21) -568459 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 161.333-86 chr14 34826006 34826314 + 1 NA intron (NM_013448, intron 3 of 26) intron (NM_013448, intron 3 of 26) -48031 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 127.667-107 chr21 20203897 20204079 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 54697 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 154.667-400 chr8 130099949 130100189 + 1 NA intron (NM_018482, intron 24 of 29) L1MA5|LINE|L1 -15301 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 172.667-84 chr2 117035045 117035263 + 1 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -779537 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 166.667-218 chr7 54689349 54689547 + 1 NA Intergenic Intergenic 69763 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 159.667-139 chr17 63315631 63315942 + 1 NA intron (NM_025185, intron 9 of 25) intron (NM_025185, intron 9 of 25) 124481 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 169.333-89 chr16 20011012 20011228 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 62658 NM_001002911 124274 Hs.446875 NM_001002911 ENSG00000180269 GPR139 GPRg1|PGR3 G protein-coupled receptor 139 protein-coding 290.333-34 chr4 61117935 61118326 + 1 NA Intergenic Intergenic -25526 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 148.667-29 chr1 224185242 224185495 + 1 NA intron (NM_001321542, intron 1 of 2) FAM|SINE|Alu 1688 NM_001321542 8560 Hs.299878 NM_003676 ENSG00000143753 DEGS1 DEGS|DEGS-1|DES1|Des-1|FADS7|HLD18|MIG15|MLD delta 4-desaturase, sphingolipid 1 protein-coding 115.333-123 chr2 230242660 230242793 + 1 NA intron (NM_001278453, intron 4 of 23) L2|LINE|L2 16990 NM_001005176 11262 Hs.632549 NM_007237 ENSG00000079263 SP140 LYSP100|LYSP100-A|LYSP100-B SP140 nuclear body protein protein-coding 147.667-233 chr3 97884220 97884495 + 1 NA intron (NM_153605, intron 7 of 21) intron (NM_153605, intron 7 of 21) 62346 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 155.333-258 chr4 37155681 37155975 + 1 NA Intergenic Intergenic 86163 NR_039965 100616435 NR_039965 ENSG00000264319 MIR4801 - microRNA 4801 ncRNA 348.333-10 chr12 7912065 7912505 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21089 NM_001286237 144195 Hs.655169 NM_153449 ENSG00000173262 SLC2A14 GLUT14|SLC2A3P3 solute carrier family 2 member 14 protein-coding 171.667-157 chr7 108472575 108472746 + 1 NA exon (NM_001256008, exon 10 of 10) exon (NM_001256008, exon 10 of 10) -15940 NM_001371119 113.667-109 chr2 143896520 143896685 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -40465 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 260.667-55 chr20 56446518 56446951 + 1 NA intron (NM_001164116, intron 4 of 6) MER5B|DNA|hAT-Charlie -21851 NM_001283035 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 148.667-71 chr11 46205765 46205915 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 33885 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 184.333-74 chr2 68973353 68973606 + 1 NA Intergenic Intergenic -1094 NM_019617 56287 Hs.69319 NM_019617 ENSG00000169605 GKN1 AMP18|BRICD1|CA11|FOV|foveolin gastrokine 1 protein-coding 142.333-157 chr3 58397614 58397835 + 1 NA intron (NM_017771, intron 11 of 17) intron (NM_017771, intron 11 of 17) 36108 NM_000925 5162 Hs.161357 NM_000925 ENSG00000168291 PDHB PDHBD|PDHE1-B|PDHE1B|PHE1B pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit protein-coding 261.667-69 chr7 94077190 94077608 + 1 NA Intergenic Intergenic -73044 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 205.333-28 chr10 21974636 21974971 + 1 NA intron (NM_022365, intron 1 of 11) intron (NM_022365, intron 1 of 11) 28927 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 174.333-22 chr12 7517753 7518020 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -14068 NM_203416 9332 Hs.504641 NM_004244 ENSG00000177575 CD163 M130|MM130|SCARI1 CD163 molecule protein-coding 196.333-38 chr14 57356598 57356876 + 1 NA Intergenic Intergenic -33849 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 163.333-174 chr22 26487544 26487831 + 1 NA intron (NM_001013694, intron 2 of 6) intron (NM_001013694, intron 2 of 6) 3810 NM_001013694 402055 Hs.709914 NM_001013694 ENSG00000100104 SRRD HC/HCC|SRR1L SRR1 domain containing protein-coding 159.333-64 chr12 12202340 12202502 + 1 NA intron (NM_002336, intron 3 of 22).2 AluJb|SINE|Alu 64623 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 246.667-28 chr14 53938791 53939189 + 1 NA Intergenic Intergenic 9494 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 193.333-113 chr20 45212082 45212367 + 1 NA Intergenic Intergenic 5191 NM_003007 6406 Hs.1968 NM_003007 ENSG00000124233 SEMG1 CT103|SEMG|SGI|dJ172H20.2 semenogelin 1 protein-coding 212.333-109 chr4 159226870 159227112 + 1 NA promoter-TSS (NM_001351726) promoter-TSS (NM_001351726) -641 NM_001351726 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 232.333-89 chr8 91261857 91262239 + 1 NA intron (NM_134266, intron 2 of 18) intron (NM_134266, intron 2 of 18) 12729 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 210.667-41 chr14 54705633 54705866 + 1 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) intron (NM_001161576, intron 2 of 10) -49084 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 217.667-7 chr1 188530628 188530971 + 1 NA Intergenic Intergenic 1087171 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 159.333-219 chr3 135115337 135115583 + 1 NA intron (NM_004441, intron 4 of 15) L2b|LINE|L2 320200 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 190.333-137 chr7 69970097 69970353 + 1 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) L2c|LINE|L2 371750 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 202.667-83 chr2 162117001 162117383 + 1 NA intron (NR_110255, intron 1 of 3) intron (NR_110255, intron 1 of 3) 2751 NR_110255 101929532 Hs.639883 NR_110255 ENSG00000236841 LOC101929532 - uncharacterized LOC101929532 ncRNA 203.667-125 chr8 115825940 115826281 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -157135 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 155.667-260 chr4 147838510 147838707 + 1 NA intron (NM_024605, intron 3 of 22) AluJb|SINE|Alu 56013 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 277.667-10 chr12 53413464 53413954 + 1 NA 3' UTR (NM_001251825, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001251825, exon 6 of 6) -10146 NM_020547 269 Hs.659889 NM_020547 ENSG00000135409 AMHR2 AMHR|MISR2|MISRII|MRII anti-Mullerian hormone receptor type 2 protein-coding 171.333-5 chr1 77723495 77723701 + 1 NA intron (NM_015017, intron 12 of 24) intron (NM_015017, intron 12 of 24) 36254 NM_201626 23032 Hs.480597 NM_015017 ENSG00000077254 USP33 VDU1 ubiquitin specific peptidase 33 protein-coding 262.333-52 chr2 213954824 213955183 + 1 NA intron (NR_047660, intron 11 of 14) L1MB7|LINE|L1 196936 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 155.333-278 chr4 163835783 163836065 + 1 NA intron (NM_001166373, intron 3 of 7) intron (NM_001166373, intron 3 of 7) -222390 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 151.667-336 chr7 46883395 46883570 + 1 NA Intergenic Intergenic -186360 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 159.667-315 chr8 78880015 78880344 + 1 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 42650 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 496.667-5 chr6 96729395 96730177 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 107691 NM_030784 81491 Hs.221364 NM_030784 ENSG00000112218 GPR63 PSP24(beta)|PSP24B G protein-coupled receptor 63 protein-coding 144.667-192 chr3 71376258 71376461 + 1 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) intron (NR_146142, intron 3 of 19) -71588 NM_001244812 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 164.667-198 chr6 36003259 36003427 + 1 NA intron (NM_001193476, intron 3 of 19) L1M5|LINE|L1 21157 NM_138718 116369 Hs.435836 NM_052961 ENSG00000112053 SLC26A8 SPGF3|TAT1 solute carrier family 26 member 8 protein-coding 370.333-22 chr5 159477667 159478359 + 1 NA Intergenic Intergenic -11737 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 161.333-198 chr3 136154337 136154514 + 1 NA intron (NM_018133, intron 1 of 1) intron (NM_018133, intron 1 of 1) 40043 NM_001145417 55167 Hs.18631 NM_018133 ENSG00000174579 MSL2 MSL-2|MSL2L1|RNF184 MSL complex subunit 2 protein-coding 311.667-13 chr20 25257165 25257646 + 1 NA intron (NM_002862, intron 1 of 19) intron (NM_002862, intron 1 of 19) 9320 NM_002862 5834 Hs.368157 NM_002862 ENSG00000100994 PYGB GPBB glycogen phosphorylase B protein-coding 157.667-4 chr1 69549897 69550160 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17306 NM_001330635 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 146.667-197 chr20 46425482 46425732 + 1 NA intron (NR_146919, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 -18556 NM_182764 63916 Hs.210469 NM_022086 ENSG00000062598 ELMO2 CED-12|CED12|Ced-12A|ELMO-2|VMPI engulfment and cell motility 2 protein-coding 230.333-74 chr22 44778893 44779403 + 1 NA intron (NM_181335, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu 26590 NM_001198726 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 258.667-97 chr8 94740034 94740497 + 1 NA intron (NM_181787, intron 6 of 18) intron (NM_181787, intron 6 of 18) 20365 NM_181787 286148 Hs.567828 NM_181787 ENSG00000156162 DPY19L4 - dpy-19 like 4 protein-coding 271.333-51 chr4 35201830 35202155 + 1 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -932245 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 168.333-82 chr18 22304514 22304777 + 1 NA Intergenic Intergenic 113270 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 299.333-9 chr11 54825236 54825693 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 118632 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 148.667-353 chr7 54614873 54615084 + 1 NA Intergenic Intergenic 58008 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 151.667-404 chrX 107860642 107860924 + 1 NA intron (NM_052817, intron 3 of 9) MIR|SINE|MIR 34917 NM_052817 11043 Hs.12256 NM_012216 ENSG00000080561 MID2 FXY2|MRX101|RNF60|TRIM1 midline 2 protein-coding 167.333-205 chr5 18034615 18034840 + 1 NA Intergenic Intergenic 227453 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 320.667-15 chr14 62362510 62363022 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -222793 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 207.667-96 chr5 26539625 26539977 + 1 NA Intergenic Intergenic 498785 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 231.333-79 chr4 67196536 67196899 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 225283 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 289.333-32 chr2 222842750 222843264 + 1 NA Intergenic Intergenic -18029 NM_004457 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 154.667-170 chr2 48474800 48475017 + 1 NA intron (NR_024188, intron 12 of 21) MIRc|SINE|MIR 34139 NM_001193475 129285 Hs.654619 NM_152994 ENSG00000162869 PPP1R21 CCDC128|KLRAQ1 protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 protein-coding 134.667-205 chr9 4831941 4832175 + 1 NA intron (NM_005772, intron 3 of 8) intron (NM_005772, intron 3 of 8) -7711 NM_001286701 10171 Hs.194121 NM_005772 ENSG00000120158 RCL1 RNAC|RPCL1 RNA terminal phosphate cyclase like 1 protein-coding 134.333-182 chr8 128185828 128185981 + 1 NA Intergenic Intergenic 35788 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 208.333-65 chr19 36835437 36835724 + 1 NA intron (NM_001242800, intron 1 of 4) intron (NM_001242800, intron 1 of 4) 2447 NM_001242802 388536 Hs.282067 NM_206894 ENSG00000197863 ZNF790 - zinc finger protein 790 protein-coding 165.333-4 chr1 45693864 45694065 + 1 NA TTS (NM_001145349) TTS (NM_001145349) 5783 NM_016486 51249 Hs.699548 NM_016486 ENSG00000159596 TMEM69 C1orf154 transmembrane protein 69 protein-coding 145.667-266 chr7 28747077 28747357 + 1 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 61084 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 176.333-6 chr1 44573754 44574011 + 1 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu 28389 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 179.667-31 chr11 96344674 96344866 + 1 NA Intergenic Intergenic -1575 NM_032427 84441 Hs.428214 NM_032427 ENSG00000184384 MAML2 MAM-3|MAM2|MAM3|MLL-MAML2 mastermind like transcriptional coactivator 2 protein-coding 155.333-48 chr10 133511676 133511871 + 1 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -15590 NM_000773 1571 Hs.12907 NM_000773 ENSG00000130649 CYP2E1 CPE1|CYP2E|P450-J|P450C2E cytochrome P450 family 2 subfamily E member 1 protein-coding 173.333-57 chr14 53385612 53385839 + 1 NA Intergenic Intergenic 232371 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 146.667-209 chr3 6843433 6843595 + 1 NA Intergenic Intergenic -17601 NM_181874 2917 Hs.606393 NM_000844 ENSG00000196277 GRM7 GLUR7|GPRC1G|MGLU7|MGLUR7|PPP1R87 glutamate metabotropic receptor 7 protein-coding 195.667-4 chr1 199065715 199066139 + 1 NA intron (NR_126351, intron 2 of 2) intron (NR_126351, intron 2 of 2) -46963 NR_110525 102800316 Hs.568480 NR_110525 LINC01222 TCONS_00000112 long intergenic non-protein coding RNA 1222 ncRNA 150.333-233 chr20 18268720 18268994 + 1 NA Intergenic Intergenic -19371 NM_001283000 7692 Hs.472221 NM_003434 ENSG00000125846 ZNF133 ZNF150|pHZ-13|pHZ-66 zinc finger protein 133 protein-coding 123.667-146 chr4 84728625 84728825 + 1 NA intron (NM_014991, intron 44 of 67) intron (NM_014991, intron 44 of 67) 145598 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 216.333-96 chr3 89364113 89364460 + 1 NA intron (NM_182644, intron 5 of 6) intron (NM_182644, intron 5 of 6) 256665 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 291.667-4 chr1 174956530 174957015 + 1 NA intron (NM_001366451, intron 5 of 12) AluSx1|SINE|Alu -2511 NR_121196 101928696 Hs.666680 NR_121196 ENSG00000229531 LOC101928696 - uncharacterized LOC101928696 ncRNA 154.667-149 chr18 3708760 3708940 + 1 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) intron (NM_001308390, intron 4 of 10) 105113 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 213.667-30 chr13 103308202 103308711 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -116744 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 153.333-287 chr4 27854313 27854468 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 636911 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 154.333-102 chr15 58901465 58901730 + 1 NA intron (NR_135042, intron 4 of 18) intron (NR_135042, intron 4 of 18) 32082 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 176.667-130 chr6 168639601 168639809 + 1 NA intron (NM_001166412, intron 9 of 12) intron (NM_001166412, intron 9 of 12) 198521 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 171.667-153 chr7 33771511 33771846 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -133237 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 203.667-54 chr2 76719805 76720111 + 1 NA Intergenic Intergenic -266007 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 201.667-20 chr12 4783282 4783654 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -25708 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 159.333-158 chr2 72714493 72714782 + 1 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR 111396 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 144.667-275 chr6 151995449 151995625 + 1 NA intron (NM_001122741, intron 5 of 8) intron (NM_001122741, intron 5 of 8) 172750 NM_001347702 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 151.333-146 chr15 50997473 50997733 + 1 NA exon (NM_007347, exon 18 of 21) exon (NM_007347, exon 18 of 21) -39885 NR_146310 109729174 NR_146310 ENSG00000259240 MIR4713HG - MIR4713 host gene ncRNA 133.667-69 chr2 18795527 18795719 + 1 NA Intergenic Intergenic -206043 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 333.667-13 chr3 84388336 84388766 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 481024 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 151.333-265 chr22 45385009 45385162 + 1 NA intron (NM_148674, intron 11 of 24) Tigger11a|DNA|TcMar-Tigger 28514 NM_148674 27127 Hs.334176 NM_148674 ENSG00000077935 SMC1B SMC1BETA|SMC1L2 structural maintenance of chromosomes 1B protein-coding 184.333-56 chr17 44115085 44115317 + 1 NA promoter-TSS (NR_136415) promoter-TSS (NR_136415) -711 NR_136415 105371789 Hs.579304 NR_136415 ENSG00000267638 LOC105371789 - uncharacterized LOC105371789 ncRNA 140.333-2 chr1 44590523 44590730 + 1 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) 45133 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 132.667-186 chr8 129072511 129072730 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -106619 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 161.667-264 chr8 133954642 133954967 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 68308 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 160.333-98 chr14 53037632 53037829 + 1 NA 3' UTR (NM_001160147, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001160147, exon 13 of 13) -86633 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 156.667-3 chr1 27801113 27801282 + 1 NA intron (NM_177424, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 27978 NM_177424 23673 Hs.523855 NM_177424 ENSG00000117758 STX12 STX13|STX14 syntaxin 12 protein-coding 227.667-44 chr21 39933887 39934167 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 66589 NM_006198 5121 Hs.80296 NM_006198 ENSG00000183036 PCP4 PEP-19 Purkinje cell protein 4 protein-coding 145.667-231 chr5 114182813 114183091 + 1 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -179118 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 169.333-30 chr10 96278215 96278536 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6799 NM_001114094 29760 Hs.665244 NM_013314 ENSG00000095585 BLNK AGM4|BASH|BLNK-S|LY57|SLP-65|SLP65|bca B cell linker protein-coding 130.667-134 chr20 62144700 62144937 + 1 NA intron (NM_198935, intron 1 of 10) intron (NM_198935, intron 1 of 10) 1049 NM_198935 26039 Hs.154429 NM_015558 ENSG00000184402 SS18L1 CREST|LP2261 SS18L1 subunit of BAF chromatin remodeling complex protein-coding 113.667-134 chr3 27290283 27290519 + 1 NA intron (NM_152534, intron 20 of 38) intron (NM_152534, intron 20 of 38) -73878 NM_001031741 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 240.333-75 chr5 84818822 84819347 + 1 NA Intergenic Intergenic -434204 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 138.667-115 chr2 190087323 190087501 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -24683 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 235.667-23 chr14 100760896 100761324 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 34218 NM_001317172 8788 Hs.116631 NM_003836 ENSG00000185559 DLK1 DLK|DLK-1|Delta1|FA1|PREF1|Pref-1|ZOG|pG2 delta like non-canonical Notch ligand 1 protein-coding 193.333-181 chr7 141910321 141910545 + 1 NA Intergenic Intergenic -8443 NM_001001656 130075 Hs.690171 NM_001001656 ENSG00000258083 OR9A4 - olfactory receptor family 9 subfamily A member 4 protein-coding 149.333-304 chr5 30138572 30138843 + 1 NA Intergenic Intergenic 258147 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 148.333-235 chr21 30740764 30740923 + 1 NA Intergenic Intergenic 6416 NM_181617 337978 Hs.553699 NM_181617 ENSG00000187026 KRTAP21-2 KAP21.2 keratin associated protein 21-2 protein-coding 172.333-28 chr10 103114470 103114685 + 1 NA intron (NM_001351176, intron 2 of 17) intron (NM_001351176, intron 2 of 17) 39244 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 139.667-161 chr6 94428886 94429146 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 710713 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 150.667-139 chr16 51692998 51693181 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -69430 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 155.667-270 chr5 29000465 29000620 + 1 NA Intergenic Intergenic -64702 NR_109948 101929645 Hs.531878 NR_109948 LOC101929645 - uncharacterized LOC101929645 ncRNA 148.667-225 chr20 48608261 48608475 + 1 NA Intergenic Intergenic 219631 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 117.333-178 chr6 49273165 49273411 + 1 NA Intergenic Intergenic 189965 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 157.667-245 chr5 65565195 65565369 + 1 NA intron (NM_001278926, intron 2 of 11) intron (NM_001278926, intron 2 of 11) 1986 NM_015342 23398 Hs.121432 NM_015342 ENSG00000113593 PPWD1 - peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1 protein-coding 139.667-178 chr8 16905958 16906120 + 1 NA Intergenic Intergenic 96306 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 141.333-45 chr12 39610168 39610352 + 1 NA intron (NM_005164, intron 2 of 9) intron (NM_005164, intron 2 of 9) 9543 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 278.667-36 chr3 123215944 123216492 + 1 NA intron (NM_012430, intron 2 of 6) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 14275 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 206.667-9 chr1 195882529 195882818 + 1 NA Intergenic Intergenic 206042 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 157.667-111 chr15 74696144 74696393 + 1 NA promoter-TSS (NM_001351379) promoter-TSS (NM_001351379) -244 NM_001142444 80153 Hs.96852 NM_025083 ENSG00000179151 EDC3 LSM16|MRT50|YJDC|YJEFN2|hYjeF_N2-15q23 enhancer of mRNA decapping 3 protein-coding 158.667-71 chr12 28472327 28472521 + 1 NA intron (NM_001352082, intron 12 of 13) Cheshire|DNA|hAT-Charlie -281686 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 179.667-37 chr12 122532454 122532686 + 1 NA intron (NM_014708, intron 2 of 63) intron (NM_014708, intron 2 of 63) 5321 NM_014708 9735 Hs.300559 NM_014708 ENSG00000184445 KNTC1 ROD kinetochore associated 1 protein-coding 299.333-27 chr15 81020197 81020774 + 1 NA Intergenic Intergenic 19562 NM_022566 59274 Hs.513071 NM_022566 ENSG00000140406 TLNRD1 MESDC1 talin rod domain containing 1 protein-coding 267.333-49 chr2 132649965 132650451 + 1 NA intron (NM_144586, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 19997 NM_001321234 116372 Hs.432395 NM_144586 ENSG00000150551 LYPD1 LYPDC1|PHTS LY6/PLAUR domain containing 1 protein-coding 182.667-11 chr1 189676708 189677063 + 1 NA Intergenic LTR48B|LTR|ERV1 799125 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 143.333-255 chr7 15255880 15256055 + 1 NA intron (NM_001004320, intron 12 of 12) L2a|LINE|L2 -281109 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 285.333-17 chr12 51581486 51582000 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -9490 NM_014191 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 338.333 chr1 162652767 162653484 + 1 NA intron (NM_006182, intron 1 of 17) AluJb|SINE|Alu 20661 NM_001014796 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 417.333-14 chr7 86079340 86079979 + 1 NA Intergenic Intergenic -564250 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 154.333-213 chr3 65524196 65524485 + 1 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) intron (NM_001365904, intron 2 of 24) -369476 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 152.333-113 chr14 69225155 69225427 + 1 NA intron (NR_034165, intron 4 of 10) intron (NR_034165, intron 4 of 10) 33525 NM_001193362 55218 Hs.533878 NM_018199 ENSG00000081177 EXD2 C14orf114|EXDL2 exonuclease 3'-5' domain containing 2 protein-coding 168.333-190 chr7 20824030 20824249 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -3159 NR_026673 222901 Hs.722187 NR_026673 ENSG00000219451 RPL23P8 RPL23_4_790 ribosomal protein L23 pseudogene 8 pseudo 250.667-32 chr16 73670945 73671505 + 1 NA Intergenic Intergenic 284420 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 150.333-204 chr2 117763362 117763528 + 1 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 -51246 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 202.667-54 chr14 71323494 71323769 + 1 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) 3155 NM_001354289 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 149.667-399 chr8 87854479 87854709 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 19421 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 152.667-309 chr5 153070450 153070602 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -98177 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 161.333-8 chr1 93842579 93842886 + 1 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) intron (NM_001261408, intron 2 of 13) -4100 NR_030621 100126348 NR_030621 ENSG00000211575 MIR760 MIRN760|hsa-mir-760|mir-760 microRNA 760 ncRNA 112.333-267 chr8 126474722 126474884 + 1 NA Intergenic Intergenic 83675 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 161.333-211 chr4 57808983 57809190 + 1 NA Intergenic AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 383214 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 220.667-85 chr5 99604593 99604946 + 1 NA Intergenic Intergenic 70779 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 147.667-244 chr3 173241977 173242134 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -100820 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 230.333-129 chrX 53350975 53351393 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -29834 NM_001111125 23096 Hs.496138 NM_015075 ENSG00000124313 IQSEC2 BRAG1|IQ-ArfGEF|MRX1|MRX18|MRX78 IQ motif and Sec7 domain 2 protein-coding 149.667-302 chr5 16759601 16759803 + 1 NA intron (NM_012334, intron 17 of 40) intron (NM_012334, intron 17 of 40) -142644 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 203.333-20 chr1 225820833 225821150 + 1 NA intron (NM_001291163, intron 1 of 8) intron (NM_001291163, intron 1 of 8) -4363 NM_000120 2052 Hs.89649 NM_000120 ENSG00000143819 EPHX1 EPHX|EPOX|HYL1|MEH epoxide hydrolase 1 protein-coding 154.667-365 chr7 39243849 39244115 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) intron (NM_001370959, intron 4 of 9) 85152 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 185.667-67 chr2 37445000 37445278 + 1 NA Intergenic Intergenic 100509 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 204.333-82 chr18 12668896 12669330 + 1 NA intron (NR_073537, intron 12 of 12) AluSq|SINE|Alu 10374 NM_147163 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 216.333-67 chr19 27778149 27778453 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -15130 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 137.333-186 chr7 157255185 157255356 + 1 NA intron (NM_014671, intron 21 of 22) L1M5|LINE|L1 -81734 NM_001363676 10049 Hs.490745 NM_005494 ENSG00000105993 DNAJB6 DJ4|DnaJ|HHDJ1|HSJ-2|HSJ2|LGMD1D|LGMD1E|LGMDD1|MRJ|MSJ-1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6 protein-coding 152.667-264 chr4 30846788 30846953 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 126501 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 191.333-82 chr16 55280573 55280977 + 1 NA Intergenic Intergenic -43784 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 130.667-180 chr6 129005855 129006081 + 1 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 122827 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 122.667-192 chr8 91854033 91854187 + 1 NA Intergenic Intergenic 163570 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 203.667-106 chr6 94012268 94012604 + 1 NA Intergenic Intergenic 294133 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 226.333-85 chr4 10415720 10415978 + 1 NA Intergenic Intergenic 41577 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 185.333-81 chr2 33004393 33004707 + 1 NA intron (NM_206943, intron 2 of 33) AluSz|SINE|Alu 57597 NM_206943 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 202.333-68 chr15 96746709 96747025 + 1 NA Intergenic Intergenic 34787 NR_102754 100652749 Hs.303588 NR_102753 ENSG00000259282 SPATA8-AS1 - SPATA8 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 244.667-66 chr3 89846322 89846669 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 738874 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 117.333-125 chr22 21890495 21890651 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -22893 NM_002745 5594 Hs.431850 NM_002745 ENSG00000100030 MAPK1 ERK|ERK-2|ERK2|ERT1|MAPK2|P42MAPK|PRKM1|PRKM2|p38|p40|p41|p41mapk|p42-MAPK mitogen-activated protein kinase 1 protein-coding 153.333-382 chr7 50680203 50680402 + 1 NA intron (NM_001371009, intron 2 of 15) intron (NM_001371009, intron 2 of 15) 24999 NM_001001550 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 209.333-190 chr5 59149327 59149651 + 1 NA intron (NM_001364603, intron 5 of 15) intron (NM_001364603, intron 5 of 15) -110013 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 147.667-399 chrX 63951802 63951967 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -165797 NR_031567 100302115 NR_031567 ENSG00000222532 MIR1468 MIRN1468|hsa-mir-1468|mir-1468 microRNA 1468 ncRNA 130.667-109 chr2 68889718 68889925 + 1 NA Intergenic Intergenic -18424 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 144.333-283 chr9 30610467 30610631 + 1 NA Intergenic Intergenic -202095 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 185.667-63 chr2 21228418 21228665 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 104555 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 155.333-86 chr12 127026756 127026983 + 1 NA intron (NR_104646, intron 2 of 6) intron (NR_104646, intron 2 of 6) 33528 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 122.667-152 chr5 38788531 38788708 + 1 NA intron (NR_109951, intron 2 of 3) L1MC4|LINE|L1 57210 NR_109951 101929768 Hs.546623 NR_109951 OSMR-AS1 CTD-2127H9.1 OSMR antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 296.333-38 chr7 43459532 43459997 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 11 of 27) AluSx|SINE|Alu 62778 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 180.333-53 chr2 63850904 63851107 + 1 NA intron (NM_006759, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 9125 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 132.333-37 chr11 127571275 127571465 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 300300 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 134.667-11 chr1 234037164 234037344 + 1 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 132578 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 152.333-329 chr6 40461068 40461220 + 1 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 82807 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 151.667-70 chr11 96707707 96707954 + 1 NA Intergenic Intergenic 199405 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 169.667-166 chr5 64019696 64020008 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -57560 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 148.333-405 chr9 10595989 10596234 + 1 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) MIRb|SINE|MIR 16891 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 150.667-369 chr8 71623169 71623421 + 1 NA Intergenic Intergenic -75201 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 158.667-210 chr3 67609865 67610124 + 1 NA intron (NM_001177599, intron 1 of 10) L1MC4a|LINE|L1 44620 NM_003848 8801 Hs.644919 NM_003848 ENSG00000172340 SUCLG2 G-SCS|GBETA|GTPSCS succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit protein-coding 164.667-120 chr2 220767075 220767332 + 1 NA Intergenic Intergenic 805101 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 256.333-2 chr1 19381518 19381879 + 1 NA intron (NM_001206540, intron 3 of 9) AluSx3|SINE|Alu 69372 NM_001040125 54896 Hs.647620 NM_017765 ENSG00000040487 SLC66A1 LAAT-1|LAAT1|PQLC2 solute carrier family 66 member 1 protein-coding 123.333-10 chr1 88272981 88273138 + 1 NA Intergenic Intergenic -411085 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 134.667-160 chr5 85858511 85858709 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -423834 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 148.667-130 chr15 36545917 36546117 + 1 NA Intergenic Intergenic -33609 NM_001321759 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 162.333-173 chr3 185224833 185225134 + 1 NA intron (NM_001966, intron 4 of 6) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 28289 NR_106712 100847054 NR_106712 ENSG00000264614 MIR5588 - microRNA 5588 ncRNA 174.667-150 chr6 17256118 17256423 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -25091 NM_001143942 221662 Hs.519904 NM_153020 ENSG00000112183 RBM24 RNPC6|dJ259A10.1 RNA binding motif protein 24 protein-coding 182.333-156 chr8 80841099 80841439 + 1 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) intron (NM_001033723, intron 1 of 8) 33199 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 171.333-54 chr14 88548056 88548276 + 1 NA intron (NM_007039, intron 2 of 18) L2|LINE|L2 6841 NM_007039 11099 Hs.437040 NM_007039 ENSG00000070778 PTPN21 PTPD1|PTPRL10 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 21 protein-coding 141.667-158 chr4 30805487 30805706 + 1 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 85227 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 203.333-174 chr3 90059468 90059793 + 1 NA Intergenic Intergenic 952009 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 159.333-53 chr10 96521203 96521429 + 1 NA 3' UTR (NM_020123, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_020123, exon 15 of 15) -7390 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 138.667-167 chr5 91506758 91506916 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -123520 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 234.667-119 chr9 108609833 108610131 + 1 NA Intergenic Intergenic 246004 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 124.667-196 chr7 118735358 118735524 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 510737 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 186.333-22 chr10 89558865 89559214 + 1 NA Intergenic LTR9B|LTR|ERV1 -23445 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 114.667-219 chr5 151999846 152000074 + 1 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) L1M6|LINE|L1 41062 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 227.333-37 chr14 85769273 85769691 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -165196 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 114.333-178 chr5 73913227 73913355 + 1 NA intron (NM_001177693, intron 35 of 35) intron (NM_001177693, intron 35 of 35) 99745 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 160.667-52 chr11 33275535 33275746 + 1 NA intron (NM_001278162, intron 1 of 15) intron (NM_001278162, intron 1 of 15) 17309 NM_001278162 10114 Hs.201918 NM_005734 ENSG00000110422 HIPK3 DYRK6|FIST3|PKY|YAK1 homeodomain interacting protein kinase 3 protein-coding 400.667-3 chr2 235868785 235869377 + 1 NA intron (NM_001037131, intron 9 of 17) intron (NM_001037131, intron 9 of 17) 299305 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 158.333-124 chr18 14116135 14116303 + 1 NA intron (NM_145287, intron 2 of 2) L1MB2|LINE|L1 16216 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 231.667-9 chr12 34311988 34312286 + 1 NA Intergenic GSATII|Satellite|centr 289641 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 139.333-67 chr13 102513937 102514101 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -82967 NM_003291 7174 Hs.432424 NM_003291 ENSG00000134900 TPP2 TPP-2|TPP-II|TPPII tripeptidyl peptidase 2 protein-coding 267.667-69 chr8 77715384 77715711 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 264850 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 206.667-106 chr5 5966258 5966561 + 1 NA Intergenic Intergenic 370883 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 244.667-44 chr16 24204025 24204409 + 1 NA TTS (NR_106996) TTS (NR_106996) 1101 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 197.333-137 chr21 31300864 31301192 + 1 NA intron (NM_001353686, intron 2 of 27) intron (NM_001353686, intron 2 of 27) 43326 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 224.333-125 chr8 93759883 93760391 + 1 NA intron (NM_001142301, intron 4 of 28) L1M5|LINE|L1 5243 NR_024522 91147 Hs.116240 NM_153704 ENSG00000164953 TMEM67 JBTS6|MECKELIN|MKS3|NPHP11|TNEM67 transmembrane protein 67 protein-coding 197.667-65 chr2 54528460 54528746 + 1 NA promoter-TSS (NR_002229) promoter-TSS (NR_002229) -619 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 225.333-86 chr2 204951673 204951958 + 1 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 406340 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 161.333-219 chr4 96790597 96790886 + 1 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 480038 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 166.667-5 chr1 51944368 51944553 + 1 NA intron (NM_002867, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 46240 NM_002867 5865 Hs.123072 NM_002867 ENSG00000169213 RAB3B - RAB3B, member RAS oncogene family protein-coding 197.667-156 chr9 74848163 74848583 + 1 NA intron (NM_017662, intron 3 of 38) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 38974 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 157.667-246 chr5 67086376 67086643 + 1 NA intron (NM_001297651, intron 2 of 25) intron (NM_001297651, intron 2 of 25) 81854 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 161.333 chr1 23587428 23587738 + 1 NA Intergenic Intergenic -28082 NM_002167 3399 Hs.76884 NM_002167 ENSG00000117318 ID3 HEIR-1|bHLHb25 inhibitor of DNA binding 3, HLH protein protein-coding 163.667-111 chr2 67892390 67892660 + 1 NA Intergenic Intergenic -66963 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 160.667-161 chr2 149259706 149259867 + 1 NA Intergenic Intergenic -70199 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 243.667-74 chr8 121986689 121987105 + 1 NA Intergenic Intergenic -345457 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 246.333-15 chr10 94416109 94416579 + 1 NA intron (NM_015188, intron 1 of 12) L3|LINE|CR1 13803 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 130.333-174 chr5 144668610 144668778 + 1 NA Intergenic Intergenic 463303 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 152.667-283 chr4 127967251 127967451 + 1 NA intron (NM_001366044, intron 2 of 11) MIRb|SINE|MIR -1388 NM_152778 256471 Hs.480701 NM_152778 ENSG00000164073 MFSD8 CCMD|CLN7 major facilitator superfamily domain containing 8 protein-coding 156.333-295 chr5 145164273 145164561 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 670925 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 165.333-229 chr6 71773842 71774126 + 1 NA Intergenic Intergenic -112719 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 160.667-240 chr5 35585388 35585694 + 1 NA Intergenic Intergenic -32322 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 147.667-39 chr10 59520318 59520490 + 1 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -157223 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 138.333-83 chr18 75948994 75949206 + 1 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -173898 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 166.667-134 chr20 55010887 55011132 + 1 NA Intergenic Intergenic -412034 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 160.333-47 chr10 83807179 83807386 + 1 NA Intergenic Intergenic -130193 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 168.333-5 chr1 67294034 67294253 + 1 NA Intergenic Intergenic -13221 NM_001258214 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 145.333-313 chr9 8183078 8183266 + 1 NA Intergenic Intergenic -383394 NM_001318058 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 164.667-159 chr4 38804163 38804362 + 1 NA intron (NM_003263, intron 2 of 3) intron (NM_003263, intron 2 of 3) 529 NM_003263 7096 Hs.621817 NM_003263 ENSG00000174125 TLR1 CD281|TIL|TIL. LPRS5|rsc786 toll like receptor 1 protein-coding 241.333-33 chr12 71708872 71709383 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 23045 NM_018279 55266 Hs.644802 NM_018279 ENSG00000139291 TMEM19 - transmembrane protein 19 protein-coding 146.333-332 chr8 116201100 116201294 + 1 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) L1MB4|LINE|L1 123862 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 211.333-11 chr1 99124726 99125023 + 1 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu -120013 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 227.333-121 chr7 123127557 123127893 + 1 NA intron (NM_022444, intron 10 of 14) intron (NM_022444, intron 10 of 14) 72244 NM_022444 6561 Hs.489849 NM_022444 ENSG00000081800 SLC13A1 NAS1|NaSi-1 solute carrier family 13 member 1 protein-coding 172.667-17 chr10 5190604 5190910 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -5570 NR_027916 340811 Hs.282513 NM_001007536 ENSG00000264006 AKR1C8P AKR1CL1 aldo-keto reductase family 1 member C8, pseudogene pseudo 111.667-155 chr20 34478862 34478997 + 1 NA intron (NM_001257137, intron 18 of 25) intron (NM_001257137, intron 18 of 25) 12604 NR_030374 693229 NR_030374 ENSG00000207997 MIR644A MIR644|MIRN644|hsa-mir-644|hsa-mir-644a microRNA 644a ncRNA 307.333-19 chr11 63857928 63858416 + 1 NA intron (NM_001163296, intron 1 of 16) AluSz6|SINE|Alu 19062 NM_001163297 2011 Hs.567261 NM_004954 ENSG00000072518 MARK2 EMK-1|EMK1|PAR-1|Par-1b|Par1b microtubule affinity regulating kinase 2 protein-coding 165.333-239 chr7 27732560 27732835 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6676 NM_001206901 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 264.333-28 chr17 19798394 19798798 + 1 NA intron (NM_014683, intron 17 of 26) intron (NM_014683, intron 17 of 26) -50298 NM_001330150 218 Hs.531682 NM_000691 ENSG00000108602 ALDH3A1 ALDH3|ALDHIII aldehyde dehydrogenase 3 family member A1 protein-coding 250.333-20 chr13 19835089 19835439 + 1 NA intron (NM_001142684, intron 7 of 7) AluJr|SINE|Alu 28372 NM_001039650 9205 Hs.530988 NM_014242 ENSG00000132950 ZMYM5 HSPC050|MYM|ZNF198L1|ZNF237 zinc finger MYM-type containing 5 protein-coding 165.333-92 chr16 22314644 22314931 + 1 NA intron (NR_047581, intron 8 of 20) intron (NR_047581, intron 8 of 20) 17378 NM_001258036 55718 Hs.460298 NM_018119 ENSG00000058600 POLR3E RPC5|SIN RNA polymerase III subunit E protein-coding 266.333-39 chr3 152333548 152334038 + 1 NA intron (NM_207296, intron 1 of 7) intron (NM_207296, intron 1 of 7) 7197 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 133.333-33 chr11 40995225 40995487 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 464280 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 126.667-163 chr7 10838674 10838848 + 1 NA Intergenic Intergenic -58817 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 144.333-13 chr1 150892016 150892218 + 1 NA intron (NR_148929, intron 1 of 1) intron (NR_148929, intron 1 of 1) 4864 NR_148929 100996521 Hs.208452 NR_148929 CTXND2 - cortexin domain containing 2 ncRNA 145.333-54 chr11 83810911 83811131 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) intron (NM_001142699, intron 17 of 27) -128596 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 154.333-321 chr7 40349501 40349661 + 1 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) intron (NM_024728, intron 9 of 14) 214605 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 152.333-375 chr8 71969754 71969976 + 1 NA intron (NR_033652, intron 4 of 4) L1PA16|LINE|L1 105719 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 128.667-64 chr15 58296538 58296792 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -135326 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 165.333-61 chr12 99955146 99955339 + 1 NA intron (NM_152788, intron 1 of 25) intron (NM_152788, intron 1 of 25) 29412 NM_001352186 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 152.667-24 chr1 224818169 224818393 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -111373 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 207.667-47 chr18 10042783 10043156 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 128953 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 188.333-73 chr2 47817341 47817637 + 1 NA intron (NM_025133, intron 16 of 22) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 33534 NM_001281494 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 236.333-6 chr1 74625240 74625569 + 1 NA non-coding (NR_121671, exon 3 of 3) non-coding (NR_121671, exon 3 of 3) 35669 NR_121670 101927320 Hs.662589 NR_121670 ENSG00000234497 ERICH3-AS1 - ERICH3 antisense RNA 1 ncRNA 243.333-10 chr10 69677966 69678274 + 1 NA Intergenic Intergenic 47873 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 189.667-82 chr2 221421409 221421683 + 1 NA intron (NM_001363748, intron 17 of 17) intron (NM_001363748, intron 17 of 17) 150758 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 335.667-14 chr2 55057937 55058538 + 1 NA intron (NM_001321904, intron 2 of 9) intron (NM_001321904, intron 2 of 9) -6965 NM_001321859 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 155.333-386 chr8 80333529 80333757 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 92254 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 130.667-70 chr14 102435771 102435922 + 1 NA intron (NM_014844, intron 9 of 19) intron (NM_014844, intron 9 of 19) 72905 NM_001172631 9895 Hs.195667 NM_014844 ENSG00000196663 TECPR2 KIAA0329|SPG49 tectonin beta-propeller repeat containing 2 protein-coding 187.667-87 chr3 35372683 35372944 + 1 NA intron (NR_110817, intron 1 of 3) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 21210 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 194.333-142 chr7 46255868 46256145 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -334734 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 166.667-56 chr13 54086222 54086469 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 46526 NR_108063 100507428 Hs.351262 NR_108062 ENSG00000234787 LINC00458 LncRNA-ES3 long intergenic non-protein coding RNA 458 ncRNA 251.667-25 chr16 24312348 24312644 + 1 NA intron (NM_006539, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR 56943 NM_006539 10368 Hs.7235 NM_006539 ENSG00000006116 CACNG3 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 3 protein-coding 242.667-9 chr1 174523741 174524276 + 1 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) L1MA4A|LINE|L1 76044 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 165.667-142 chr4 62918810 62919061 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -757170 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 147.333-152 chr18 22523596 22523861 + 1 NA Intergenic Intergenic -105813 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 152.667-53 chr10 124455847 124456031 + 1 NA Intergenic Intergenic -5884 NM_001167880 64077 Hs.527748 NM_022126 ENSG00000107902 LHPP HDHD2B phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase protein-coding 246.333-16 chr10 96408287 96408582 + 1 NA intron (NM_012465, intron 9 of 20) intron (NM_012465, intron 9 of 20) -49069 NM_001284321 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 212.333-128 chr6 128719304 128719669 + 1 NA Intergenic Intergenic -163652 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 205.333-36 chr10 74690623 74690932 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) L2c|LINE|L2 -134478 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 125.667-187 chr8 81830940 81831154 + 1 NA intron (NM_001348189, intron 4 of 9) L1PA16|LINE|L1 11138 NR_145472 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 204.333-72 chr16 89703093 89703443 + 1 NA Intergenic Intergenic -1563 NM_152339 124044 Hs.374556 NM_152339 ENSG00000158792 SPATA2L C16orf76|tamo spermatogenesis associated 2 like protein-coding 196.333-91 chr2 164483477 164483807 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 84853 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 155.667-338 chr7 96183567 96183812 + 1 NA intron (NM_001160210, intron 11 of 17) intron (NM_001160210, intron 11 of 17) 36067 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 216.333-106 chr4 37616620 37617060 + 1 NA intron (NM_001085400, intron 6 of 6) intron (NM_001085400, intron 6 of 6) 32607 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 232.667-64 chr5 24676285 24676650 + 1 NA Intergenic Intergenic -31489 NM_001362460 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 174.333-122 chr5 128873230 128873472 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -91776 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 208.333-8 chr1 196721164 196721471 + 1 NA intron (NM_000186, intron 11 of 21) intron (NM_000186, intron 11 of 21) -53483 NM_021023 10878 Hs.709217 NM_021023 ENSG00000116785 CFHR3 CFHL3|DOWN16|FHR-3|FHR3|HLF4 complement factor H related 3 protein-coding 181.667-5 chr1 154983041 154983323 + 1 NA promoter-TSS (NM_001184892) promoter-TSS (NM_001184892) -162 NM_025207 80308 Hs.118666 NM_025207 ENSG00000160688 FLAD1 FAD1|FADS|LSMFLAD|PP591 flavin adenine dinucleotide synthetase 1 protein-coding 154.667-236 chr3 37418941 37419103 + 1 NA TTS (NM_178344) TTS (NM_178344) 7884 NM_001302832 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 154.333-349 chr8 117307084 117307391 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 172242 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 302.667-19 chr22 25832298 25832841 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 15 of 43) L1MB3|LINE|L1 90381 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 209.333-59 chr14 55539750 55540142 + 1 NA Intergenic Intergenic 40146 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 257.333-6 chr1 160760303 160760614 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 21211 NM_001282590 57823 Hs.517265 NM_021181 ENSG00000026751 SLAMF7 19A|CD319|CRACC|CS1 SLAM family member 7 protein-coding 178.333-75 chr2 70818788 70819068 + 1 NA intron (NM_001321308, intron 3 of 6) L1ME1|LINE|L1 1671 NM_173535 165530 Hs.681239 NM_173535 ENSG00000152672 CLEC4F CLECSF13|KCLR C-type lectin domain family 4 member F protein-coding 147.333-299 chr7 52915800 52916032 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -119717 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 212.667-90 chr3 85711659 85712059 + 1 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) -14623 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 195.333-50 chr11 73607876 73608092 + 1 NA Intergenic Intergenic -9872 NM_001286051 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 143.667-79 chr14 73191058 73191352 + 1 NA intron (NM_000021, intron 6 of 11) intron (NM_000021, intron 6 of 11) -46301 NR_158677 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 157.333-49 chr10 74910327 74910589 + 1 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) L3|LINE|CR1 -2328 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 272.333-61 chr6 134010247 134010579 + 1 NA intron (NM_145176, intron 2 of 4) intron (NM_145176, intron 2 of 4) 42211 NM_145176 154091 Hs.486508 NM_145176 ENSG00000146411 SLC2A12 GLUT12|GLUT8 solute carrier family 2 member 12 protein-coding 174.333-23 chr12 14799206 14799548 + 1 NA intron (NM_016312, intron 4 of 11) MER102c|DNA|hAT-Charlie 4101 NM_016312 51729 Hs.655138 NM_016312 ENSG00000084463 WBP11 NPWBP|PPP1R165|SIPP1|WBP-11 WW domain binding protein 11 protein-coding 229.333-16 chr11 75952581 75952895 + 1 NA intron (NM_003369, intron 6 of 14) L1ME2|LINE|L1 137528 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 211.333-97 chr18 75553581 75553938 + 1 NA Intergenic Intergenic -126056 NM_001303482 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 167.333-236 chr6 131195572 131195781 + 1 NA intron (NM_016377, intron 5 of 7) L1M1|LINE|L1 -54728 NM_004842 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 297.333-59 chrX 132907858 132908210 + 1 NA intron (NM_001077188, intron 3 of 5) L1MB8|LINE|L1 53336 NM_147175 90161 Hs.385956 NM_147175 ENSG00000171004 HS6ST2 MRXSPM heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 protein-coding 159.333-5 chr1 34599491 34599651 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 70123 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 207.333-244 chr6 118809089 118809368 + 1 NA Intergenic Intergenic 26520 NR_037662 100287632 Hs.334026 NR_037662 SELENOKP3 - selenoprotein K pseudogene 3 pseudo 163.333-251 chr7 3499127 3499363 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 197993 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 194.333-126 chr5 132194214 132194580 + 1 NA intron (NM_001365681, intron 13 of 13) intron (NM_001365681, intron 13 of 13) 9521 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 246.667-35 chr16 85188812 85189124 + 1 NA Intergenic Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -18828 NR_162142 113219463 NR_162142 MIR12128 - microRNA 12128 ncRNA 155.333-275 chr4 133622191 133622431 + 1 NA Intergenic Intergenic 473017 NM_020815 57575 Hs.192859 NM_020815 ENSG00000138650 PCDH10 OL-PCDH|PCDH19 protocadherin 10 protein-coding 153.333-8 chr1 58484842 58485036 + 1 NA intron (NM_145243, intron 8 of 8) L1MC1|LINE|L1 61787 NM_145243 115209 Hs.425769 NM_145243 ENSG00000162600 OMA1 2010001O09Rik|DAB1|MPRP-1|MPRP1|YKR087C|ZMPOMA1|peptidase OMA1 zinc metallopeptidase protein-coding 169.667-178 chr6 35841863 35842088 + 1 NA intron (NM_003137, intron 14 of 15) intron (NM_003137, intron 14 of 15) 36623 NM_182548 222662 Hs.367947 NM_182548 ENSG00000197753 LHFPL5 DFNB67|TMHS|dJ510O8.8 LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein-coding 161.333-196 chr3 124954002 124954266 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -19383 NM_033049 56667 Hs.5940 NM_033049 ENSG00000173702 MUC13 DRCC1|MUC-13 mucin 13, cell surface associated protein-coding 177.667-33 chr12 19372704 19373002 + 1 NA 3' UTR (NM_001143821, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_001143821, exon 28 of 28) -66639 NM_001363736 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 251.333-115 chr9 36956037 36956421 + 1 NA intron (NR_104000, intron 6 of 9) intron (NR_104000, intron 6 of 9) -62698 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 302.333-24 chr3 28389953 28390329 + 1 NA intron (NM_001324170, intron 1 of 6) intron (NM_001324170, intron 1 of 6) 40992 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 162.333-256 chr8 89972333 89972525 + 1 NA intron (NM_001024688, intron 6 of 16) intron (NM_001024688, intron 6 of 16) 12242 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 135.333-152 chr5 156978569 156978755 + 1 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -15436 NM_001146726 91937 Hs.334907 NM_138379 ENSG00000145850 TIMD4 SMUCKLER|TIM4 T cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 protein-coding 224.333-25 chr11 43865379 43865737 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -15273 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 163.333-118 chr16 86246925 86247106 + 1 NA intron (NR_104139, intron 3 of 5) intron (NR_104139, intron 3 of 5) 39232 NR_104139 101154687 Hs.640512 NR_104139 LINC01081 TCONS00024764|TCONS_00024764 long intergenic non-protein coding RNA 1081 ncRNA 153.667-317 chr5 79422340 79422498 + 1 NA intron (NM_004272, intron 5 of 8) intron (NM_004272, intron 5 of 8) 91417 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 148.667-46 chr10 54945577 54945828 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) intron (NM_001354404, intron 3 of 34) -144411 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 158.333-6 chr1 42100004 42100227 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -53295 NM_007102 2981 Hs.32966 NM_007102 ENSG00000044012 GUCA2B GCAP-II|UGN guanylate cyclase activator 2B protein-coding 147.333-158 chr19 52198306 52198457 + 1 NA intron (NM_014225, intron 1 of 14) intron (NM_014225, intron 1 of 14) -2815 NM_001363656 5518 Hs.467192 NM_014225 ENSG00000105568 PPP2R1A MRD36|PP2A-Aalpha|PP2AA|PP2AAALPHA|PR65A protein phosphatase 2 scaffold subunit Aalpha protein-coding 142.667-77 chr17 2127204 2127461 + 1 NA intron (NM_001256827, intron 6 of 11) L1MB4|LINE|L1 -38571 NM_001282326 23293 Hs.448342 NM_017575 ENSG00000070366 SMG6 C17orf31|EST1A|SMG-6|hSMG5/7a SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 153.333-101 chr12 116169865 116170018 + 1 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) AluJr|SINE|Alu -21287 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 242.333-60 chr21 18116601 18117119 + 1 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) intron (NM_001204178, intron 2 of 5) -127973 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 219.667-16 chr12 23102197 23102513 + 1 NA Intergenic Intergenic -73281 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 122.333-76 chr18 4841873 4842019 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -239236 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 170.667-88 chr2 182815720 182815919 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 50818 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 160.667-196 chr3 53075081 53075317 + 1 NA Intergenic Intergenic -29126 NM_016329 51460 Hs.343679 NM_016329 ENSG00000163935 SFMBT1 RU1|SFMBT|hSFMBT Scm like with four mbt domains 1 protein-coding 150.667-147 chr17 69174912 69175076 + 1 NA intron (NM_080282, intron 24 of 39) intron (NM_080282, intron 24 of 39) -33099 NM_080284 23460 Hs.709514 NM_080284 ENSG00000154262 ABCA6 EST155051 ATP binding cassette subfamily A member 6 protein-coding 156.333-363 chr8 117136664 117136839 + 1 NA intron (NM_173851, intron 1 of 7) intron (NM_173851, intron 1 of 7) 1756 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 163.667-168 chr4 9902290 9902555 + 1 NA intron (NM_001001290, intron 9 of 12) intron (NM_001001290, intron 9 of 12) 119075 NM_020041 56606 Hs.444612 NM_020041 ENSG00000109667 SLC2A9 GLUT9|GLUTX|UAQTL2|URATv1 solute carrier family 2 member 9 protein-coding 158.667-172 chr2 182548801 182549073 + 1 NA Intergenic Intergenic -26092 NM_001003683 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 310.667-33 chr5 34715857 34716365 + 1 NA intron (NM_001145525, intron 4 of 19) intron (NM_001145525, intron 4 of 19) 28552 NM_001145523 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 151.333-76 chr11 41905272 41905557 + 1 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 180044 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 147.333-336 chr9 134027829 134027980 + 1 NA 3' UTR (NM_001355256, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001355256, exon 3 of 3) 2423 NM_001355256 266655 Hs.654869 NM_001355256 ENSG00000235106 BRD3OS LINC00094|LP2477|NCRNA00094 BRD3 opposite strand protein-coding 136.667-67 chr15 34593432 34593631 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -9961 NR_027410 440270 Hs.720151 NM_001023567 ENSG00000215252 GOLGA8B GOLGA5 golgin A8 family member B protein-coding 136.333-29 chr10 125420715 125420897 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -153565 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 273.333-41 chr22 31875093 31875427 + 1 NA intron (NR_157128, intron 35 of 40) intron (NR_157128, intron 35 of 40) 63194 NM_001302819 25775 Hs.627602 NM_015372 ENSG00000128254 C22orf24 HSN44A4A chromosome 22 open reading frame 24 protein-coding 204.667-125 chr5 105235119 105235428 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 135799 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 161.667-8 chr1 80805950 80806240 + 1 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 164808 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 153.333-398 chr8 40195647 40195819 + 1 NA Intergenic Intergenic 42251 NM_020130 56892 Hs.591849 NM_020130 ENSG00000176907 TCIM C8orf4|TC-1|TC1 transcriptional and immune response regulator protein-coding 167.667-31 chr10 86184312 86184532 + 1 NA intron (NM_017551, intron 3 of 15) L1ME1|LINE|L1 80366 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 189.667-112 chr5 14228135 14228495 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 84973 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 162.667-219 chr5 76125774 76126097 + 1 NA intron (NM_014979, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu 42552 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 114.333-239 chr9 71981591 71981760 + 1 NA intron (NR_157409, intron 4 of 4) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie 70036 NM_182505 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 225.667-21 chr13 55394239 55394623 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 219977 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 157.667-121 chr17 33667224 33667517 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -133610 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 136.333-48 chr13 82361740 82361932 + 1 NA Intergenic Intergenic -1134853 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 162.667-118 chr19 41211578 41211813 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -7528 NM_021913 558 Hs.590970 NM_001699 ENSG00000167601 AXL ARK|JTK11|Tyro7|UFO AXL receptor tyrosine kinase protein-coding 156.667-338 chr8 91035098 91035274 + 1 NA intron (NM_018710, intron 1 of 6) intron (NM_018710, intron 1 of 6) 5673 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 147.667-225 chr3 61093714 61093975 + 1 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 157608 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 208.667-79 chr21 16120080 16120355 + 1 NA intron (NR_111005, intron 1 of 6) L1MEg|LINE|L1 49103 NR_111005 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 151.333-412 chr8 69274801 69274972 + 1 NA Intergenic Intergenic -170696 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 144.667-143 chr2 95039680 95039898 + 1 NA intron (NM_022440, intron 1 of 1) intron (NM_022440, intron 1 of 1) 14081 NM_002371 4118 Hs.80395 NM_002371 ENSG00000172005 MAL MVP17|VIP17 mal, T cell differentiation protein protein-coding 148.667-282 chr4 65742695 65742891 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -72298 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 154.667-167 chr2 43694675 43694906 + 1 NA intron (NM_172069, intron 5 of 29) intron (NM_172069, intron 5 of 29) -18361 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 181.333-81 chr2 150921715 150922100 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 293010 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 170.333-155 chr4 40598569 40598879 + 1 NA intron (NM_001371114, intron 1 of 5) intron (NM_001371114, intron 1 of 5) 31140 NM_001098634 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 258.667-54 chr20 25121675 25122049 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 26131 NR_027093 284798 Hs.334934 NR_027091 ENSG00000230725 LOC284798 - uncharacterized LOC284798 ncRNA 278.333-4 chr1 61993592 61994100 + 1 NA intron (NM_001350145, intron 28 of 43) intron (NM_001350145, intron 28 of 43) -84940 NR_036058 100422902 NR_036058 ENSG00000263908 MIR3116-1 - microRNA 3116-1 ncRNA 440.333-4 chr2 70019513 70020279 + 1 NA intron (NR_033872, intron 7 of 10) L1MA8|LINE|L1 -57631 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 200.333-48 chr16 9969648 9969923 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) MER20|DNA|hAT-Charlie 212282 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 297.667-14 chr15 69950645 69951025 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 115601 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 190.333-74 chr2 125454707 125455056 + 1 NA Intergenic Intergenic 663104 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 174.667-169 chr8 85129663 85129972 + 1 NA intron (NM_033402, intron 10 of 18) intron (NM_033402, intron 10 of 18) 22579 NM_033402 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 141.667-17 chr1 208396806 208397076 + 1 NA Intergenic Intergenic -152557 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 153.667-265 chr3 125360486 125360649 + 1 NA intron (NM_001348427, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu -3287 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 156.333-360 chr8 111213152 111213369 + 1 NA intron (NR_125418, intron 1 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 22943 NR_125418 101927487 Hs.630004 NR_125418 ENSG00000253103 LINC01609 - long intergenic non-protein coding RNA 1609 ncRNA 123.667-108 chr20 63395241 63395423 + 1 NA Intergenic Intergenic -33936 NM_000744 1137 Hs.10734 NM_000744 ENSG00000101204 CHRNA4 BFNC|EBN|EBN1|NACHR|NACHRA4|NACRA4 cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit protein-coding 257.667-38 chr2 41727742 41728051 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -149659 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 150.667-248 chr3 149593511 149593685 + 1 NA intron (NM_001348362, intron 5 of 9) intron (NM_001348362, intron 5 of 9) 64427 NM_015472 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 219.333-36 chr11 103169997 103170450 + 1 NA exon (NM_001080463, exon 33 of 90) exon (NM_001080463, exon 33 of 90) 60797 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 274.333-40 chr2 149515897 149516239 + 1 NA Intergenic Intergenic -71290 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 309.667-18 chr4 71051890 71052362 + 1 NA Intergenic Intergenic 58477 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 162.333-2 chr1 28704073 28704249 + 1 NA intron (NM_001319674, intron 7 of 9) intron (NM_001319674, intron 7 of 9) -32460 NM_001173128 51441 Hs.532286 NM_016258 ENSG00000198492 YTHDF2 CAHL|HGRG8|NY-REN-2 YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2 protein-coding 178.333-28 chr11 100399768 100400133 + 1 NA Intergenic Intergenic -287338 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 189.667-21 chr10 84772539 84772745 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 347473 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 118.333-119 chr2 234414605 234414761 + 1 NA Intergenic Intergenic 39912 NR_146988 105373934 Hs.471685 NR_146988 ENSG00000231682 LINC01891 - long intergenic non-protein coding RNA 1891 ncRNA 206.333-81 chr2 55312548 55312862 + 1 NA intron (NM_001254943, intron 22 of 33) intron (NM_001254943, intron 22 of 33) 30386 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 156.333-158 chr18 75793258 75793535 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -80993 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 171.667-67 chr17 76375209 76375416 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7892 NM_001355139 8877 Hs.68061 NM_021972 ENSG00000176170 SPHK1 SPHK sphingosine kinase 1 protein-coding 167.667-65 chr15 61556273 61556471 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -173546 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 118.667-10 chr1 151681727 151681944 + 1 NA intron (NM_030918, intron 7 of 11) intron (NM_030918, intron 7 of 11) 34968 NM_001291106 11189 Hs.26047 NM_007185 ENSG00000159409 CELF3 BRUNOL1|CAGH4|ERDA4|ETR-1|TNRC4 CUGBP Elav-like family member 3 protein-coding 121.667-116 chr21 17868954 17869146 + 1 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 16558 NR_024354 54075 Hs.404306 NR_024354 CHODL-AS1 C21orf39|NCRNA00157 CHODL antisense RNA 1 ncRNA 167.667-128 chr22 17600735 17600933 + 1 NA intron (NM_001039367, intron 4 of 7) intron (NM_001039367, intron 4 of 7) -11642 NM_001288707 101929372 Hs.629929 NM_001288707 LOC101929372 - uncharacterized LOC101929372 protein-coding 299.333-60 chr5 125522486 125522908 + 1 NA intron (NR_109887, intron 3 of 3) intron (NR_109887, intron 3 of 3) 29436 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 170.333-184 chr6 50511238 50511430 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -202210 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 147.667-181 chr2 104032122 104032276 + 1 NA Intergenic Intergenic 376133 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 111.667-189 chr4 121783276 121783436 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -17956 NM_001317837 132332 Hs.27524 NM_152399 ENSG00000164112 TMEM155 - transmembrane protein 155 protein-coding 181.667-85 chr21 16933064 16933418 + 1 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie 343004 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 153.667-65 chr11 41479452 41479605 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -19876 NM_001258419 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 152.333-288 chr4 172698991 172699331 + 1 NA intron (NR_125894, intron 1 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -10244 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 175.333-212 chrX 103262224 103262476 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -7157 NM_001006684 90843 Hs.389734 NM_153333 ENSG00000180964 TCEAL8 WEX3 transcription elongation factor A like 8 protein-coding 165.333-264 chr9 31012061 31012298 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 369311 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 155.667-167 chr2 96873782 96873964 + 1 NA Intergenic Intergenic -3793 NM_017789 54910 Hs.516220 NM_017789 ENSG00000168758 SEMA4C M-SEMA-F|SEMACL1|SEMAF|SEMAI semaphorin 4C protein-coding 140.667-42 chr10 108265303 108265453 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -196085 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 140.667-203 chr6 155568151 155568331 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 53397 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 179.667-133 chr8 67489212 67489572 + 1 NA intron (NM_020361, intron 6 of 10) L1ME3C|LINE|L1 145558 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 141.333-55 chr13 59167692 59167902 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -844921 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 176.333-121 chr4 78937845 78938034 + 1 NA intron (NR_146465, intron 1 of 6) intron (NR_146465, intron 1 of 6) 1499 NM_001350106 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 155.667-330 chr7 48568947 48569125 + 1 NA intron (NM_152701, intron 55 of 61) L1ME3|LINE|L1 -355511 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 154.333-116 chr17 29673649 29673837 + 1 NA TTS (NM_001282130) TTS (NM_001282130) -52320 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 198.333-6 chr1 47659881 47660238 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -222742 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 205.333-8 chr1 44867681 44868110 + 1 NA intron (NM_020365, intron 10 of 11) AluJr|SINE|Alu -24642 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 159.667-153 chr18 64665885 64666072 + 1 NA Intergenic Intergenic -405923 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 219.333-47 chr14 26472862 26473165 + 1 NA intron (NM_001366391, intron 4 of 5) intron (NM_001366391, intron 4 of 5) 80417 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 204.333-42 chr11 118493668 118494002 + 1 NA intron (NM_005933, intron 16 of 35) AluSz|SINE|Alu -33598 NM_001346097 143941 Hs.653449 NM_001080441 ENSG00000172425 TTC36 HBP21 tetratricopeptide repeat domain 36 protein-coding 142.667-223 chr8 107284289 107284522 + 1 NA intron (NM_001199859, intron 7 of 8) intron (NM_001199859, intron 7 of 8) 52110 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 199.333-302 chr9 91223514 91223917 + 1 NA intron (NM_001698, intron 6 of 9) L1MB2|LINE|L1 104653 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 227.667-15 chr12 107115300 107115827 + 1 NA Intergenic MamGypLTR2b|LTR|Gypsy -22014 NM_004075 1407 Hs.151573 NM_004075 ENSG00000008405 CRY1 DSPD|PHLL1 cryptochrome circadian regulator 1 protein-coding 129.333-192 chr8 136299031 136299212 + 1 NA Intergenic Intergenic -231677 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 142.667-85 chr19 27355150 27355314 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -438199 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 194.667-23 chr10 83178675 83178970 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 498267 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 157.667-8 chr1 90416488 90416733 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -241140 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 262.333-79 chr8 121858259 121858586 + 1 NA Intergenic Intergenic -216982 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 168.333-81 chr18 22143998 22144199 + 1 NA Intergenic Intergenic 24870 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 309.333-30 chr2 17998777 17999289 + 1 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 120366 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 112.667-88 chr16 80338761 80338928 + 1 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -201890 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 157.333-7 chr1 55118102 55118292 + 1 NA intron (NM_015306, intron 38 of 67) L1MB3|LINE|L1 77975 NR_110451 255738 Hs.18844 NM_174936 ENSG00000169174 PCSK9 FH3|HCHOLA3|LDLCQ1|NARC-1|NARC1|PC9 proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 protein-coding 153.667-216 chr2 236536160 236536332 + 1 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -28711 NM_001270584 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 196.333-40 chr14 62888049 62888335 + 1 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 157266 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 150.333-163 chr17 69835394 69835549 + 1 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) intron (NR_109972, intron 3 of 4) -126236 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 192.667-68 chr16 65087055 65087282 + 1 NA intron (NM_001330576, intron 1 of 11) intron (NM_001330576, intron 1 of 11) 34895 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 274.333-41 chr2 171536919 171537290 + 1 NA intron (NM_001127383, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 14630 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 167.333-213 chr5 108650776 108650955 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 77396 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 170.333-122 chr2 209437320 209437493 + 1 NA intron (NM_001039538, intron 1 of 14) intron (NM_001039538, intron 1 of 14) 13359 NM_001363910 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 131.333-200 chrX 85045031 85045232 + 1 NA intron (NM_198450, intron 1 of 8) intron (NM_198450, intron 1 of 8) 41254 NM_198450 139322 Hs.512181 NM_198450 ENSG00000155008 APOOL CXorf33|FAM121A|MICOS27|Mic27|UNQ8193 apolipoprotein O like protein-coding 156.333-87 chr12 111086086 111086392 + 1 NA intron (NM_015267, intron 1 of 21) intron (NM_015267, intron 1 of 21) -13765 NM_001370598 23316 Hs.124953 NM_015267 ENSG00000111249 CUX2 CDP2|CUTL2|EIEE67 cut like homeobox 2 protein-coding 154.333-179 chr2 224540689 224540983 + 1 NA intron (NM_001257197, intron 1 of 14) L1PA8A|LINE|L1 29119 NM_001257198 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 154.667-401 chr8 132457843 132458050 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR -10684 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 145.333-99 chr15 77480454 77480649 + 1 NA intron (NM_001304505, intron 9 of 9) AluJo|SINE|Alu -45044 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 131.667-185 chr7 86781608 86781756 + 1 NA intron (NM_001363522, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 137768 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 316.333-20 chr22 45087442 45087907 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 64910 NR_038957 100506714 Hs.189902 NR_038956 NUP50-DT NUP50-AS1 NUP50 divergent transcript ncRNA 161.333-67 chr12 59096740 59097020 + 1 NA Intergenic Intergenic -176342 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 140.667-76 chr14 49528816 49528973 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 57486 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 156.333-101 chr14 31675658 31675834 + 1 NA intron (NR_120408, intron 6 of 9) intron (NR_120408, intron 6 of 9) -38823 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 218.333-51 chr17 54596815 54597187 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -303690 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 160.667-10 chr1 76715373 76715602 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 63780 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 148.667-139 chr15 68542976 68543195 + 1 NA intron (NM_001324014, intron 2 of 12) intron (NM_001324014, intron 2 of 12) 24712 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 151.667-281 chr5 85484136 85484438 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -798157 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 261.333-66 chr3 76271176 76271511 + 1 NA Intergenic Intergenic -485794 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 432.667-4 chr14 96704284 96705159 + 1 NA Intergenic Intergenic -36470 NR_146552 105370646 NR_146552 ENSG00000258979 LINC02299 - long intergenic non-protein coding RNA 2299 ncRNA 263.333-4 chr10 11825655 11825956 + 1 NA intron (NM_153256, intron 1 of 3) intron (NM_153256, intron 1 of 3) 2449 NM_153256 254427 Hs.435775 NM_153256 ENSG00000148426 PROSER2 C10orf47 proline and serine rich 2 protein-coding 148.667-394 chr8 139412038 139412282 + 1 NA Intergenic Intergenic 290963 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 169.333-155 chr3 21598657 21598897 + 1 NA intron (NM_024697, intron 2 of 7) intron (NM_024697, intron 2 of 7) 55988 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 130.667-124 chr2 213790687 213790830 + 1 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) 32691 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 169.333-12 chr1 184237630 184237819 + 1 NA Intergenic Intergenic -149305 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 155.333-146 chr18 39934099 39934343 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 92512 NR_151703 105372079 NR_151703 ENSG00000283503 LINC01902 - long intergenic non-protein coding RNA 1902 ncRNA 114.333-208 chr7 38828789 38828959 + 1 NA intron (NM_080631, intron 4 of 27) intron (NM_080631, intron 4 of 27) 80317 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 148.667-142 chr15 83434402 83434635 + 1 NA Intergenic Intergenic -12710 NR_136711 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 293.333-54 chr6 51289520 51289937 + 1 NA Intergenic Intergenic -332142 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 162.667-255 chr7 53749293 53749488 + 1 NA intron (NR_038371, intron 4 of 5) L1PA15|LINE|L1 62541 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 133.333-16 chr1 195555996 195556141 + 1 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 532647 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 261.667-55 chr4 98002365 98002827 + 1 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) intron (NM_174952, intron 5 of 10) 140880 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 203.667-121 chr8 80389221 80389525 + 1 NA Intergenic Intergenic -96220 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 142.667-100 chr2 111964153 111964346 + 1 NA intron (NM_006343, intron 4 of 18) L1MC3|LINE|L1 65642 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 163.667-189 chr4 154746778 154747099 + 1 NA intron (NM_001301645, intron 2 of 2) intron (NM_001301645, intron 2 of 2) 2938 NM_004744 9227 Hs.658427 NM_004744 ENSG00000121207 LRAT LCA14 lecithin retinol acyltransferase protein-coding 137.333-197 chr8 101655777 101656046 + 1 NA intron (NM_024915, intron 14 of 15) L2a|LINE|L2 135058 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 213.667-82 chr6 88322075 88322473 + 1 NA Intergenic Intergenic -154925 NM_001370547 1268 Hs.75110 NM_016083 ENSG00000118432 CNR1 CANN6|CB-R|CB1|CB1A|CB1K5|CB1R|CNR cannabinoid receptor 1 protein-coding 154.667-304 chr5 22557567 22557730 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 295696 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 306.333-35 chr5 61388860 61389339 + 1 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 56841 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 231.667-11 chr12 92230297 92230691 + 1 NA Intergenic Intergenic 84409 NR_135037 101928617 Hs.434392 NR_135036 LOC101928617 - uncharacterized LOC101928617 ncRNA 208.667-24 chr10 84105483 84105932 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -33802 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 247.667-96 chr8 83417673 83417961 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 14059 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 137.667-10 chr1 112440485 112440696 + 1 NA intron (NM_018704, intron 3 of 5) MER112|DNA|hAT-Charlie 21243 NR_036210 100422976 NR_036210 ENSG00000283296 MIR4256 - microRNA 4256 ncRNA 150.667-197 chr2 191146550 191146727 + 1 NA exon (NM_001243835, exon 3 of 24) exon (NM_001243835, exon 3 of 24) 4356 NM_003151 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 163.667-67 chr15 58537254 58537492 + 1 NA intron (NM_000236, intron 1 of 8) intron (NM_000236, intron 1 of 8) -38638 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 186.333-173 chr9 31109155 31109435 + 1 NA Intergenic Intergenic 272195 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 143.333-126 chr19 32664223 32664406 + 1 NA intron (NM_032139, intron 1 of 28) FAM|SINE|Alu 10866 NM_032139 84079 Hs.59236 NM_032139 ENSG00000105186 ANKRD27 PP12899|VARP ankyrin repeat domain 27 protein-coding 131.333-173 chr8 38192686 38192983 + 1 NA intron (NM_004874, intron 2 of 4) intron (NM_004874, intron 2 of 4) 15979 NM_004874 9530 Hs.194726 NM_004874 ENSG00000156735 BAG4 BAG-4|SODD BCL2 associated athanogene 4 protein-coding 197.333-147 chr3 61467312 61467555 + 1 NA Intergenic Intergenic -94138 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 136.333-49 chr13 86915264 86915414 + 1 NA intron (NR_132371, intron 1 of 1) L1M5|LINE|L1 3419 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 162.667-25 chr10 33906815 33907105 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -134280 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 219.333-37 chr11 129474125 129474438 + 1 NA Intergenic Intergenic 98433 NM_003658 8538 Hs.591944 NM_003658 ENSG00000043039 BARX2 - BARX homeobox 2 protein-coding 190.667-121 chr6 114364049 114364269 + 1 NA Intergenic Intergenic -301282 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 283.667-7 chr12 12402792 12403252 + 1 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 45944 NM_001330356 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 248.667 chr1 18752929 18753399 + 1 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 106497 NM_152232 80834 Hs.553548 NM_152232 ENSG00000179002 TAS1R2 GPR71|T1R2|TR2 taste 1 receptor member 2 protein-coding 149.333-93 chr12 57290264 57290416 + 1 NA intron (NM_001351215, intron 9 of 22) intron (NM_001351215, intron 9 of 22) -39153 NR_104422 246329 Hs.417595 NM_145064 ENSG00000185482 STAC3 MYPBB|NAM SH3 and cysteine rich domain 3 protein-coding 167.667-29 chr10 77673542 77673786 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -35856 NM_001271521 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 137.333-106 chr2 190905601 190905795 + 1 NA intron (NM_014905, intron 6 of 17) intron (NM_014905, intron 6 of 17) 24877 NM_014905 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 158.333-316 chr8 64408898 64409144 + 1 NA Intergenic Intergenic 29872 NR_029669 406908 NR_029669 ENSG00000207816 MIR124-2 MIRN124-2|MIRN124A2|mir-124-2 microRNA 124-2 ncRNA 147.333-77 chr12 14837569 14837866 + 1 NA intron (NM_021071, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 5809 NM_021071 420 Hs.591158 NM_021071 ENSG00000111339 ART4 ARTC4|CD297|DO|DO/ART4|DOK1 ADP-ribosyltransferase 4 (Dombrock blood group) protein-coding 118.333-105 chr2 69914664 69914819 + 1 NA promoter-TSS (NM_002357) promoter-TSS (NM_002357) -300 NM_001202514 4084 Hs.468908 NM_002357 ENSG00000059728 MXD1 BHLHC58|MAD|MAD1 MAX dimerization protein 1 protein-coding 140.333-89 chr19 30962762 30962994 + 1 NA Intergenic Intergenic -204632 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 163.333-201 chr4 76078409 76078705 + 1 NA intron (NM_001130017, intron 2 of 9) intron (NM_001130017, intron 2 of 9) 3862 NM_001179 419 Hs.24976 NM_001179 ENSG00000156219 ART3 ARTC3 ADP-ribosyltransferase 3 protein-coding 123.333-81 chr15 52632650 52632815 + 1 NA intron (NM_019600, intron 2 of 12) intron (NM_019600, intron 2 of 12) 19308 NM_001286495 56204 Hs.152385 NM_019600 ENSG00000047346 FAM214A KIAA1370 family with sequence similarity 214 member A protein-coding 201.333-138 chr19 37509597 37509892 + 1 NA intron (NM_001013659, intron 2 of 7) L1ME3A|LINE|L1 -2657 NR_110723 101927720 Hs.18070 NR_110723 ENSG00000266916 ZNF793-AS1 - ZNF793 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 254.667-8 chr10 95591340 95591680 + 1 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 -30139 NM_015385 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 155.667-164 chr2 58102981 58103275 + 1 NA intron (NM_001130483, intron 7 of 13) L1P4|LINE|L1 56416 NM_001130481 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 172.333-122 chr4 42740556 42740842 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -83594 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 192.667-82 chr2 28178312 28178596 + 1 NA intron (NR_120504, intron 1 of 2) L1MA4A|LINE|L1 28507 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 128.667-196 chr9 91266864 91267018 + 1 NA intron (NM_001698, intron 6 of 9) intron (NM_001698, intron 6 of 9) 94983 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 186.333-20 chr10 79991475 79991787 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -42526 NM_003019 6441 Hs.253495 NM_003019 ENSG00000133661 SFTPD COLEC7|PSP-D|SFTP4|SP-D surfactant protein D protein-coding 113.333-14 chr1 160240193 160240405 + 1 NA non-coding (NR_028106, exon 4 of 4) non-coding (NR_028106, exon 4 of 4) -21450 NR_147618 100287049 Hs.657648 NR_147618 ENSG00000228606 LOC100287049 - uncharacterized LOC100287049 ncRNA 149.667-146 chr15 89252593 89252805 + 1 NA intron (NM_001113378, intron 2 of 37) AluSx|SINE|Alu 8720 NM_018193 55215 Hs.513126 NM_018193 ENSG00000140525 FANCI KIAA1794 FA complementation group I protein-coding 257.333-19 chr10 123455000 123455580 + 1 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -211065 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 198.667-92 chr19 28375442 28375737 + 1 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -231099 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 168.667-8 chr1 113176785 113176970 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 29376 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 376.667-13 chr7 1537146 1537678 + 1 NA intron (NM_002360, intron 1 of 2) intron (NM_002360, intron 1 of 2) -2532 NR_149036 100128653 Hs.656985 NR_149036 LOC100128653 - uncharacterized LOC100128653 ncRNA 206.667-132 chr7 70928095 70928390 + 1 NA Intergenic Intergenic -203902 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 205.333-98 chr17 60646630 60646968 + 1 NA intron (NM_003620, intron 3 of 5) intron (NM_003620, intron 3 of 5) -31052 NM_001099432 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 149.333-96 chr12 73324883 73325032 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 165767 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 118.667-31 chr10 75737555 75737716 + 1 NA intron (NR_132791, intron 1 of 2) intron (NR_132791, intron 1 of 2) 25180 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 129.333-201 chr9 78485533 78485701 + 1 NA Intergenic Intergenic 188492 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 244.333-64 chr20 35110818 35111115 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18151 NM_199368 26133 Hs.168073 NM_015638 ENSG00000100991 TRPC4AP C20orf188|PPP1R158|TRRP4AP|TRUSS transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein protein-coding 184.333-144 chr7 112701927 112702128 + 1 NA intron (NR_110158, intron 7 of 7) intron (NR_110158, intron 7 of 7) 79646 NR_110158 101928012 Hs.521131 NR_110158 ENSG00000223646 LOC101928012 - uncharacterized LOC101928012 ncRNA 220.667-105 chr8 91100246 91100557 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2218 NR_148895 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 147.333-68 chr11 58095714 58095879 + 1 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 23648 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 146.333-49 chr11 79485110 79485272 + 1 NA Intergenic Intergenic -44161 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 156.333-221 chr22 34965319 34965547 + 1 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 32483 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 174.667-2 chr1 38198430 38198615 + 1 NA Intergenic Intergenic 16245 NR_038928 339442 Hs.434245 NR_038928 ENSG00000237290 LINC01343 - long intergenic non-protein coding RNA 1343 ncRNA 140.667-79 chr14 61854842 61855120 + 1 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) intron (NM_001367656, intron 1 of 7) 42278 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 177.333-48 chr14 42681272 42681507 + 1 NA Intergenic Intergenic 1074533 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 206.333-67 chr17 53301548 53301808 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 316173 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 180.333-127 chr8 50031605 50031809 + 1 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) L1MA3|LINE|L1 120300 NR_135796 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 140.333-117 chr2 228281317 228281527 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -99735 NM_001142644 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 185.333-67 chr17 68810585 68810785 + 1 NA Intergenic Intergenic 144707 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 156.667-205 chr20 25127157 25127352 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 20739 NR_027093 284798 Hs.334934 NR_027091 ENSG00000230725 LOC284798 - uncharacterized LOC284798 ncRNA 146.333-64 chr12 42501654 42501843 + 1 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) -17738 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 215.333-153 chr5 30434928 30435281 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 554544 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 159.667-67 chr11 86715327 86715507 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -42781 NM_001161586 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 246.667-84 chr7 13334790 13335148 + 1 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 647336 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 189.667-72 chr2 97002562 97002803 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16102 NM_001122646 51252 Hs.107922 NM_016490 ENSG00000168754 FAM178B - family with sequence similarity 178 member B protein-coding 156.333-141 chr17 497397 497704 + 1 NA Intergenic Intergenic -51610 NM_182705 359845 Hs.345588 NM_182705 ENSG00000183688 RFLNB CFM1|FAM101B refilin B protein-coding 145.667-245 chr6 65146856 65147133 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) L1MD|LINE|L1 -154424 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 147.667-96 chr14 34269467 34269710 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 192652 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 267.667-3 chr1 185610322 185610840 + 1 NA intron (NR_110793, intron 2 of 3) L1MA2|LINE|L1 17907 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 166.667-68 chr14 67035717 67035918 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 9 of 21) L1MB2|LINE|L1 -153623 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 150.667-246 chr3 131314743 131314998 + 1 NA intron (NM_001353043, intron 17 of 17) intron (NM_001353043, intron 17 of 17) -46975 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 206.667-27 chr12 16830761 16831029 + 1 NA Intergenic Intergenic -157852 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 168.667-64 chr14 71253599 71253900 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -66727 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 146.667-193 chr20 23489597 23489826 + 1 NA Intergenic Intergenic -1406 NM_001281730 10047 Hs.121602 NM_005492 ENSG00000125815 CST8 CRES|CTES5 cystatin 8 protein-coding 160.667-74 chr12 49319719 49320033 + 1 NA intron (NR_120449, intron 2 of 7) intron (NR_120449, intron 2 of 7) -3379 NM_001278324 10024 Hs.524399 NM_005480 ENSG00000135451 TROAP TASTIN trophinin associated protein protein-coding 155.667-137 chr18 6089794 6090044 + 1 NA intron (NM_001365766, intron 15 of 16) MIRc|SINE|MIR -166825 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 294.333-2 chr1 187014532 187014932 + 1 NA Intergenic Intergenic -78110 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 139.333-172 chr4 113121960 113122114 + 1 NA intron (NM_001354237, intron 1 of 46) intron (NM_001354237, intron 1 of 46) 5340 NM_001354230 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 172.333-114 chr3 105735781 105736143 + 1 NA intron (NR_135809, intron 8 of 18) intron (NR_135809, intron 8 of 18) 131629 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 130.333-173 chr5 139514112 139514283 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -31439 NM_001301738 340061 Hs.379754 NM_198282 ENSG00000184584 TMEM173 ERIS|MITA|MPYS|NET23|SAVI|STING|STING-beta|hMITA|hSTING transmembrane protein 173 protein-coding 147.333-44 chr10 61351655 61351845 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -100889 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 225.667-47 chr22 25756874 25757244 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 1 of 43) AluSz6|SINE|Alu 14871 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 157.333-286 chr5 105500086 105500292 + 1 NA Intergenic Intergenic 400715 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 138.667-200 chr8 53490861 53491016 + 1 NA Intergenic Intergenic 33027 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 111.667 chr1 15930067 15930276 + 1 NA exon (NM_015001, exon 11 of 15) exon (NM_015001, exon 11 of 15) 45961 NM_001242884 7709 Hs.433764 NM_003443 ENSG00000116809 ZBTB17 MIZ-1|ZNF151|ZNF60|pHZ-67 zinc finger and BTB domain containing 17 protein-coding 184.333-14 chr10 69848347 69848649 + 1 NA intron (NM_001368898, intron 3 of 33) MIRb|SINE|MIR 46592 NM_080798 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 364.667-8 chr15 59834645 59835347 + 1 NA Intergenic Intergenic -145676 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 283.333-41 chr20 45666169 45666570 + 1 NA intron (NM_147197, intron 2 of 4) L1PA3|LINE|L1 3870 NM_147197 259239 Hs.374924 NM_147197 ENSG00000180083 WFDC11 WAP11 WAP four-disulfide core domain 11 protein-coding 159.667-21 chr1 112581772 112581934 + 1 NA intron (NM_017744, intron 9 of 14) intron (NM_017744, intron 9 of 14) 37288 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 133.667-63 chr18 11550274 11550465 + 1 NA Intergenic HERV3-int|LTR|ERV1 -59189 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 187.667-52 chr15 27287329 27287566 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 -126128 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 162.333-33 chr10 77048169 77048391 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 14 of 28) MER5C|DNA|hAT-Charlie -92551 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 159.333-45 chr10 72495690 72496004 + 1 NA intron (NM_001195519, intron 1 of 6) intron (NM_001195519, intron 1 of 6) 28139 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 155.667-383 chr9 31095252 31095524 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 286102 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 195.333-74 chr14 21311695 21311982 + 1 NA exon (NM_020366, exon 8 of 24) exon (NM_020366, exon 8 of 24) 23861 NM_020366 57096 Hs.126035 NM_020366 ENSG00000092200 RPGRIP1 CORD13|LCA6|RGI1|RGRIP|RPGRIP|RPGRIP1d RPGR interacting protein 1 protein-coding 220.333-125 chr7 95723655 95723967 + 1 NA Intergenic Intergenic -48695 NM_001278422 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 166.333-175 chr5 14816939 14817333 + 1 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) intron (NM_054027, intron 1 of 11) 8876 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 147.667-41 chr10 63100023 63100238 + 1 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -33117 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 152.333-298 chr5 54397450 54397634 + 1 NA intron (NR_126379, intron 1 of 4) (TTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -58157 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 135.667-163 chr6 151902081 151902241 + 1 NA intron (NM_001122741, intron 4 of 8) intron (NM_001122741, intron 4 of 8) 93054 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 201.333-71 chr12 15657518 15657829 + 1 NA intron (NM_004447, intron 12 of 20) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 111062 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 319.667-12 chr2 41397075 41397636 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -480200 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 158.667-25 chr1 190064391 190064717 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 411456 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 182.667-12 chr1 190816660 190816850 + 1 NA Intergenic Intergenic 191865 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 220.333-49 chr17 54254527 54254959 + 1 NA Intergenic Intergenic 431816 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 159.333-292 chr6 128795676 128795959 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -87321 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 155.667-297 chr6 515117 515297 + 1 NA intron (NM_018303, intron 23 of 27) intron (NM_018303, intron 23 of 27) 123455 NM_001195286 3662 Hs.401013 NM_002460 ENSG00000137265 IRF4 LSIRF|MUM1|NF-EM5|SHEP8 interferon regulatory factor 4 protein-coding 177.333-86 chr2 120736174 120736389 + 1 NA 5' UTR (NM_001371271, exon 1 of 14) 5' UTR (NM_001371271, exon 1 of 14) 413 NM_001371271 147.333-78 chr12 24701674 24701946 + 1 NA Intergenic Intergenic -117642 NR_029451 144360 Hs.350668 NM_144667 ENSG00000197503 LINC00477 C12orf67|FAM191B long intergenic non-protein coding RNA 477 ncRNA 149.333-364 chr7 20565779 20565949 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -49803 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 245.333-73 chr20 55512720 55513113 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -85719 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 157.667-343 chr8 132303019 132303395 + 1 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 144055 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 132.667-13 chr1 217546670 217546879 + 1 NA intron (NM_018040, intron 5 of 9) L1PA13|LINE|L1 84316 NM_001297754 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 218.667-23 chr11 128057749 128058001 + 1 NA Intergenic LTR88a|LTR|Gypsy? -150891 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 301.667-36 chr5 79971042 79971622 + 1 NA Intergenic CR1-16_AMi|LINE|CR1 19930 NM_001010891 345778 Hs.531418 NM_001010891 ENSG00000177034 MTX3 - metaxin 3 protein-coding 170.667-132 chr5 36593014 36593349 + 1 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -13174 NM_001166696 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 152.333-128 chr15 86872930 86873192 + 1 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -59819 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 370.333-5 chr10 108332634 108333280 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -263664 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 143.667-40 chr11 45503567 45503790 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 132281 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 194.333-6 chr1 78717164 78717556 + 1 NA Intergenic Intergenic 67529 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 118.333-153 chr4 73104203 73104355 + 1 NA intron (NM_032217, intron 24 of 33) LTR79|LTR|ERVL -34520 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 140.667-183 chr5 53089999 53090208 + 1 NA intron (NR_073106, intron 29 of 29) intron (NR_073106, intron 29 of 29) 19654 NM_004531 4338 Hs.163645 NM_004531 ENSG00000164172 MOCS2 MCBPE|MOCO1|MOCODB|MPTS molybdenum cofactor synthesis 2 protein-coding 205.333-238 chr8 72918083 72918386 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) -90630 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 148.667-301 chr5 24351593 24351763 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 293300 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 153.667-16 chr1 105001816 105002037 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 617009 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 175.333-39 chr14 43742830 43743059 + 1 NA Intergenic Intergenic 764339 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 180.333-31 chr13 43319884 43320202 + 1 NA intron (NM_001347966, intron 12 of 17) intron (NM_001347966, intron 12 of 17) -128809 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 154.333-150 chr2 50788496 50788707 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) (GA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -92339 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 143.333-62 chr12 23925620 23925853 + 1 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) 23934 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 231.333-3 chr1 105920574 105920868 + 1 NA Intergenic Intergenic 107532 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 185.333-102 chr2 199300484 199300741 + 1 NA intron (NM_001172509, intron 10 of 10) intron (NM_001172509, intron 10 of 10) 157327 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 308.667-47 chr9 137067965 137068348 + 1 NA intron (NM_178448, intron 1 of 5) intron (NM_178448, intron 1 of 5) 2401 NM_178448 89958 Hs.19322 NM_178448 ENSG00000186193 SAPCD2 C9orf140|p42.3 suppressor APC domain containing 2 protein-coding 179.333-87 chr18 77038200 77038390 + 1 NA intron (NM_001025100, intron 3 of 3) intron (NM_001025100, intron 3 of 3) -21240 NM_001025081 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 142.667-23 chr10 76657826 76658104 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -230079 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-135 chr19 27832796 27833044 + 1 NA intron (NR_146734, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -38980 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 292.667-30 chr5 32817418 32817710 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 106243 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 155.333-71 chr12 22181602 22181801 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 135483 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 227.333-58 chr2 24864551 24864932 + 1 NA intron (NM_001320613, intron 3 of 21) L1MB4|LINE|L1 55496 NM_004036 109 Hs.467898 NM_004036 ENSG00000138031 ADCY3 AC-III|AC3|BMIQ19 adenylate cyclase 3 protein-coding 167.667-126 chr21 15562301 15562495 + 1 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL -167536 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 192.667-97 chr20 9926341 9926590 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -59868 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 156.667-352 chr9 17883227 17883500 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 304297 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 227.667-55 chr4 80577677 80578154 + 1 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) intron (NM_152770, intron 2 of 5) 242195 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 207.333-206 chr4 113408222 113408539 + 1 NA Intergenic Intergenic 115541 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 194.333-144 chr7 72133233 72133586 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 2 of 5) L1MC4|LINE|L1 203982 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 249.333-66 chr3 71015214 71015584 + 1 NA intron (NM_001244812, intron 7 of 15) intron (NM_001244812, intron 7 of 15) 49525 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 254.333-4 chr10 60241368 60241723 + 1 NA intron (NM_001204403, intron 8 of 43) MIR3|SINE|MIR -100529 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 150.667-236 chr3 39421896 39422161 + 1 NA Intergenic Intergenic 10974 NR_002324 6044 Hs.449909 NR_002324 ENSG00000202363 SNORA62 E2|E2-1|RNE2|RNU108 small nucleolar RNA, H/ACA box 62 snoRNA 157.667-187 chr3 25756608 25756848 + 1 NA intron (NM_018297, intron 3 of 11) intron (NM_018297, intron 3 of 11) 26715 NM_018297 55768 Hs.368960 NM_018297 ENSG00000151092 NGLY1 CDDG|CDG1V|PNG1|PNGase N-glycanase 1 protein-coding 173.667-177 chr8 86430486 86430896 + 1 NA intron (NM_007013, intron 11 of 24) intron (NM_007013, intron 11 of 24) 77995 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 170.667-119 chr3 192644811 192645113 + 1 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 82579 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 190.667-99 chr5 44340888 44341216 + 1 NA intron (NM_004465, intron 1 of 2) intron (NM_004465, intron 1 of 2) -47680 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 275.667-70 chrX 8186861 8187337 + 1 NA Intergenic Intergenic -15832 NM_016378 51480 Hs.279737 NM_016378 ENSG00000177504 VCX2 VCX-2r|VCX2R|VCXB variable charge X-linked 2 protein-coding 172.667-4 chr1 45336192 45336453 + 1 NA intron (NM_012222, intron 1 of 15) AluJo|SINE|Alu 3635 NM_001048174 4595 Hs.271353 NM_012222 ENSG00000132781 MUTYH MYH mutY DNA glycosylase protein-coding 176.333-168 chr8 102623816 102624029 + 1 NA Intergenic Intergenic 30042 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 255.333-17 chr11 84473487 84473897 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -156353 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 151.333-193 chr2 1982108 1982393 + 1 NA intron (NM_015025, intron 5 of 24) intron (NM_015025, intron 5 of 24) -237735 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 176.667-124 chr5 137915110 137915387 + 1 NA intron (NM_001300921, intron 8 of 14) L1M4c|LINE|L1 25791 NM_014386 27039 Hs.716884 NM_014386 ENSG00000078795 PKD2L2 TRPP5 polycystin 2 like 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 267.667-20 chr16 80941800 80942190 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -49399 NR_131947 100996425 Hs.125350 NR_131947 ENSG00000260896 ARLNC1 LINC02170|PRCAT47 androgen receptor regulated long noncoding RNA 1 ncRNA 148.667-115 chr14 50404417 50404576 + 1 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -7198 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 271.667-50 chr4 45039330 45039714 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -312888 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 141.333-108 chr2 74349922 74350182 + 1 NA Intergenic Intergenic -6636 NM_133478 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 212.667-62 chr18 9984291 9984663 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 70461 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 286.333-16 chr17 77649732 77650157 + 1 NA Intergenic LTR22C0|LTR|ERVK 78615 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 167.667-60 chr14 64857280 64857560 + 1 NA intron (NM_001355436, intron 1 of 35) AluJb|SINE|Alu 22487 NM_001355436 6710 Hs.417303 NM_000347 ENSG00000070182 SPTB EL3|HS2|HSPTB1|SPH2 spectrin beta, erythrocytic protein-coding 184.333-160 chr8 138001359 138001639 + 1 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) L1PA12|LINE|L1 82046 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 124.333-109 chr21 30634770 30634977 + 1 NA promoter-TSS (NM_181616) promoter-TSS (NM_181616) -333 NM_181616 337976 Hs.553698 NM_181616 ENSG00000184032 KRTAP20-2 KAP20.2 keratin associated protein 20-2 protein-coding 167.667-42 chr12 4633348 4633554 + 1 NA intron (NM_001278309, intron 4 of 5) intron (NM_001278309, intron 4 of 5) 15596 NM_006422 10566 Hs.98397 NM_006422 ENSG00000111254 AKAP3 AKAP 110|AKAP110|CT82|FSP95|HEL159|PRKA3|SOB1 A-kinase anchoring protein 3 protein-coding 215.667-7 chr1 210266475 210266765 + 1 NA Intergenic AluYi6|SINE|Alu -32735 NR_024337 574036 Hs.446946 NR_024337 ENSG00000203706 SERTAD4-AS1 C1orf133 SERTAD4 antisense RNA 1 ncRNA 112.333-255 chr8 30390729 30390861 + 1 NA intron (NM_001008710, intron 1 of 8) intron (NM_001008710, intron 1 of 8) -5394 NR_046205 100128750 Hs.126813 NR_046205 ENSG00000254109 RBPMS-AS1 - RBPMS antisense RNA 1 ncRNA 317.667-17 chr17 19434201 19434743 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 23240 NM_007148 7732 Hs.189482 NM_007148 ENSG00000128482 RNF112 BFP|ZNF179 ring finger protein 112 protein-coding 160.667-205 chr3 124239135 124239395 + 1 NA intron (NM_001024660, intron 3 of 59) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 106336 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 188.333-116 chr5 5471589 5471799 + 1 NA intron (NM_015325, intron 15 of 18) intron (NM_015325, intron 15 of 18) 49017 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 128.333-157 chr5 90553744 90553886 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -4982 NR_003149 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 160.333-107 chr14 72185973 72186243 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MIRb|SINE|MIR 252581 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 151.667-234 chr3 144687084 144687317 + 1 NA Intergenic Intergenic 714119 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 154.333-145 chr2 39282808 39283060 + 1 NA intron (NM_003618, intron 21 of 33) L1ME3G|LINE|L1 -38951 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 252.667-34 chr15 71759517 71759994 + 1 NA intron (NM_001286429, intron 9 of 11) intron (NM_001286429, intron 9 of 11) -50799 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 148.667-213 chr2 207422139 207422380 + 1 NA Intergenic Intergenic -107703 NR_135473 1385 Hs.516646 NM_004379 ENSG00000118260 CREB1 CREB|CREB-1 cAMP responsive element binding protein 1 protein-coding 168.667-5 chr1 69164324 69164513 + 1 NA intron (NR_146608, intron 3 of 4) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 108520 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 156.667-325 chr7 119302381 119302681 + 1 NA Intergenic Intergenic 604844 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 194.667-87 chr3 1637634 1637949 + 1 NA Intergenic Intergenic -461012 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 145.333-55 chr11 88598969 88599274 + 1 NA intron (NM_001143831, intron 4 of 8) intron (NM_001143831, intron 4 of 8) 94545 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 275.333-75 chr8 60773749 60774174 + 1 NA intron (NM_017780, intron 2 of 37) intron (NM_017780, intron 2 of 37) 32702 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 158.667-160 chr2 84386323 84386610 + 1 NA Intergenic Intergenic 72814 NM_003849 8802 Hs.270428 NM_003849 ENSG00000163541 SUCLG1 GALPHA|MTDPS9|SUCLA1 succinate-CoA ligase alpha subunit protein-coding 123.667-192 chr9 23104351 23104518 + 1 NA Intergenic Intergenic 458234 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 141.667-117 chr2 62998081 62998338 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 19 of 22) intron (NM_001142615, intron 19 of 22) 49502 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 116.667-141 chr4 23581080 23581277 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 300114 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 257.333-75 chr5 17013822 17014153 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -77699 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 160.667-106 chr15 67694022 67694226 + 1 NA intron (NM_001206804, intron 15 of 21) intron (NM_001206804, intron 15 of 21) -131385 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 174.333-148 chr8 105931359 105931638 + 1 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L2|LINE|L2 129005 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 179.667-55 chr15 94371654 94371896 + 1 NA intron (NM_018349, intron 11 of 21) AluSx1|SINE|Alu 15845 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 185.333-42 chr13 39350150 39350516 + 1 NA intron (NM_005780, intron 3 of 3) intron (NM_005780, intron 3 of 3) 252860 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 207.667-77 chr3 114416229 114416640 + 1 NA intron (NM_001348805, intron 7 of 10) intron (NM_001348805, intron 7 of 10) -32792 NM_001164342 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 264.667-16 chr11 33316567 33316886 + 1 NA intron (NM_001278162, intron 2 of 15) AluJr|SINE|Alu 58395 NM_001278162 10114 Hs.201918 NM_005734 ENSG00000110422 HIPK3 DYRK6|FIST3|PKY|YAK1 homeodomain interacting protein kinase 3 protein-coding 301.667-9 chr11 111568069 111568409 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 27731 NM_001258390 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 338.667-19 chr2 69836991 69837414 + 1 NA intron (NM_178439, intron 1 of 13) intron (NM_178439, intron 1 of 13) 7542 NM_178439 64395 Hs.293971 NM_178439 ENSG00000087338 GMCL1 BTBD13|GCL|GCL1|SPATA29 germ cell-less 1, spermatogenesis associated protein-coding 238.333-23 chr14 63928408 63928720 + 1 NA intron (NM_015180, intron 2 of 114) intron (NM_015180, intron 2 of 114) 75560 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 130.333-165 chr5 45869669 45869878 + 1 NA Intergenic Intergenic -173393 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 118.333-98 chr2 35388358 35388554 + 1 NA Intergenic Intergenic -82949 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 150.667-124 chr14 70865825 70865988 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -41553 NM_014982 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 148.667-210 chr2 201802525 201802731 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -3801 NM_139158 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 155.333-94 chr13 69954112 69954325 + 1 NA intron (NM_001286725, intron 2 of 9) intron (NM_001286725, intron 2 of 9) -152995 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 159.333-294 chr6 144809768 144809991 + 1 NA intron (NM_007124, intron 64 of 73) MER39|LTR|ERV1 404224 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 218.667-82 chr5 52354794 52355175 + 1 NA Intergenic Intergenic 346953 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 321.667-18 chr5 106094462 106094906 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 916330 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 229.667-82 chr9 23024342 23024703 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 378322 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 130.333-188 chr7 28211416 28211704 + 1 NA intron (NR_034097, intron 2 of 3) L1MC4|LINE|L1 -30765 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 170.333-26 chr10 20855508 20855686 + 1 NA intron (NM_006393, intron 9 of 27) intron (NM_006393, intron 9 of 27) 42005 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 177.333-123 chr4 94961391 94961736 + 1 NA intron (NM_001203, intron 2 of 12) intron (NM_001203, intron 2 of 12) -34669 NM_001256792 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 205.333-4 chr1 37603513 37603928 + 1 NA Intergenic Intergenic -7735 NM_001323623 29889 Hs.75528 NM_013285 ENSG00000134697 GNL2 HUMAUANTIG|NGP1|Ngp-1|Nog2|Nug2 G protein nucleolar 2 protein-coding 155.667-401 chrX 97805866 97806114 + 1 NA Intergenic Intergenic -241455 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 122.333-96 chr2 73446107 73446290 + 1 NA intron (NM_015120, intron 7 of 22) intron (NM_015120, intron 7 of 22) -10905 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 200.667-61 chr18 6501810 6502145 + 1 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 -9439 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 145.333-223 chr4 113830761 113831007 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -68957 NM_172114 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 160.667-160 chr2 141990055 141990336 + 1 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 141506 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 148.333-178 chr2 20817971 20818171 + 1 NA intron (NM_021925, intron 1 of 6) L1MD2|LINE|L1 5030 NM_021925 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 156.667-341 chr8 117005159 117005349 + 1 NA intron (NM_001172811, intron 2 of 9) intron (NM_001172811, intron 2 of 9) 54279 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 190.667-36 chr14 25213082 25213442 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -162965 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 153.667-261 chr3 111842126 111842385 + 1 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) -16925 NM_145753 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 355.333-38 chr8 117682707 117683434 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 162357 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 170.333-159 chr4 86178256 86178478 + 1 NA intron (NM_001318069, intron 3 of 13) intron (NM_001318069, intron 3 of 13) 58561 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 137.667-65 chr15 44953938 44954133 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2652 NM_152448 145645 Hs.567701 NM_152448 ENSG00000167014 TERB2 C15orf43 telomere repeat binding bouquet formation protein 2 protein-coding 220.333-24 chr11 12522096 12522424 + 1 NA intron (NM_018222, intron 12 of 12) intron (NM_018222, intron 12 of 12) 144689 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 150.667-371 chr8 77473467 77473659 + 1 NA intron (NR_125830, intron 2 of 2) intron (NR_125830, intron 2 of 2) 22866 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 129.333-40 chr12 5582316 5582512 + 1 NA intron (NM_001278596, intron 21 of 25) intron (NM_001278596, intron 21 of 25) 88282 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 191.333-19 chr10 18598132 18598441 + 1 NA intron (NM_182543, intron 6 of 10) LTR7B|LTR|ERV1 53301 NM_001351118 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 256.333-56 chr3 189473872 189474313 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -122654 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 223.333-79 chr2 113011731 113012115 + 1 NA Intergenic Intergenic 6464 NM_014440 27179 Hs.278910 NM_014440 ENSG00000136694 IL36A FIL1|FIL1(EPSILON)|FIL1E|IL-1F6|IL1(EPSILON)|IL1F6 interleukin 36 alpha protein-coding 235.667-32 chr2 63475197 63475546 + 1 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) intron (NR_148704, intron 7 of 18) -37364 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 123.667-144 chr4 80194733 80194940 + 1 NA intron (NM_020226, intron 3 of 9) intron (NM_020226, intron 3 of 9) -2667 NM_001099403 56978 Hs.373642 NM_020226 ENSG00000152784 PRDM8 EPM10|KMT8D|PFM5 PR/SET domain 8 protein-coding 259.667-53 chr4 46838478 46838936 + 1 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) intron (NM_130902, intron 2 of 2) 70538 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 247.333-62 chr5 37938870 37939237 + 1 NA Intergenic Intergenic -9438 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 234.333-30 chr15 64652929 64653309 + 1 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) intron (NM_015042, intron 2 of 8) 50162 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 148.667-369 chr8 52598037 52598283 + 1 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -32730 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 151.333-417 chr8 82632547 82632712 + 1 NA Intergenic Intergenic -279475 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 156.667-204 chr20 10926565 10926776 + 1 NA Intergenic Intergenic -17398 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 208.667-130 chr7 83194605 83194902 + 1 NA Intergenic Intergenic -31869 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 262.667-2 chr1 52529270 52529737 + 1 NA intron (NM_001009881, intron 1 of 29) intron (NM_001009881, intron 1 of 29) 23587 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 163.333-95 chr14 100958537 100958800 + 1 NA intron (NR_146000, intron 24 of 50) intron (NR_146000, intron 24 of 50) 1502 NR_003198 767582 NR_003198 ENSG00000201263 SNORD114-6 14q(II-6) small nucleolar RNA, C/D box 114-6 snoRNA 134.667-125 chr21 29476136 29476315 + 1 NA Intergenic Intergenic -19822 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 159.333-82 chr14 29764872 29765180 + 1 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 162070 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 267.667-72 chr9 37559137 37559476 + 1 NA intron (NM_012166, intron 1 of 10) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 17074 NM_012166 26267 Hs.709527 NM_012166 ENSG00000147912 FBXO10 FBX10|PRMT11 F-box protein 10 protein-coding 296.667-30 chr2 112513078 112513644 + 1 NA intron (NM_153712, intron 5 of 6) L1MEf|LINE|L1 -28554 NM_001137604 84172 Hs.745127 NM_019014 ENSG00000125630 POLR1B RPA135|RPA2|Rpo1-2 RNA polymerase I subunit B protein-coding 148.667-23 chr1 195400377 195400638 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 688208 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 185.333-2 chr1 24645888 24646093 + 1 NA non-coding (NR_159380, exon 2 of 19) non-coding (NR_159380, exon 2 of 19) 2411 NM_001366596 10250 Hs.18192 NM_005839 ENSG00000133226 SRRM1 160-KD|POP101|SRM160 serine and arginine repetitive matrix 1 protein-coding 282.333-54 chr6 168007212 168007611 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -10334 NR_103750 100505879 Hs.225962 NM_014354 ENSG00000229921 KIF25-AS1 C6orf54|HGC6.1.1|NCRNA00300 KIF25 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-88 chr12 19807297 19807483 + 1 NA Intergenic Intergenic -207295 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 330.667-30 chr8 124307647 124308178 + 1 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -60514 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 208.333-111 chr4 108047632 108048068 + 1 NA 3' UTR (NM_016269, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_016269, exon 12 of 12) 43186 NM_001331027 3033 Hs.438289 NM_005327 ENSG00000138796 HADH HAD|HADH1|HADHSC|HCDH|HHF4|MSCHAD|SCHAD hydroxyacyl-CoA dehydrogenase protein-coding 230.667-18 chr15 75930188 75930465 + 1 NA 3' UTR (NM_012170, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_012170, exon 6 of 6) 26448 NM_147188 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 189.333-30 chr10 77498796 77499169 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) MIR|SINE|MIR 138826 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 324.333-25 chr2 100941674 100942333 + 1 NA intron (NM_002518, intron 5 of 20) intron (NM_002518, intron 5 of 20) 35158 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 157.333-167 chr19 35888792 35889015 + 1 NA intron (NM_032721, intron 11 of 11) AluSx|SINE|Alu 10834 NM_001321831 84807 Hs.466531 NM_032721 ENSG00000167604 NFKBID IkBNS|IkappaBNS|TA-NFKBH NFKB inhibitor delta protein-coding 134.333-186 chr9 87272396 87272574 + 1 NA Intergenic Intergenic 123841 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 169.667-77 chr15 76125864 76126098 + 1 NA intron (NM_152335, intron 1 of 10) L1MA9|LINE|L1 55505 NR_120360 101929439 Hs.631721 NR_120360 ENSG00000259422 LOC101929439 - uncharacterized LOC101929439 ncRNA 237.333-96 chr6 9279978 9280398 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 627979 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 127.667-143 chr5 85417801 85417956 + 1 NA Intergenic Intergenic -864566 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 119.333-188 chr6 56245639 56245811 + 1 NA intron (NM_001318751, intron 1 of 30) MIRb|SINE|MIR 1855 NR_134849 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 122.667-65 chr16 74148737 74149031 + 1 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 66637 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 158.333-250 chr5 1310708 1310918 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1436 NR_039662 100616235 NR_039662 ENSG00000263670 MIR4457 mir-4457 microRNA 4457 ncRNA 143.333-211 chr4 105786648 105786879 + 1 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) L1M4|LINE|L1 40409 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 228.667-63 chr5 57633202 57633581 + 1 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -17269 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 337.667-14 chr2 104782124 104782587 + 1 NA Intergenic Intergenic -24636 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 219.667-34 chr17 64090298 64090547 + 1 NA intron (NM_001433, intron 2 of 21) intron (NM_001433, intron 2 of 21) 39722 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 155.333-41 chr10 100219001 100219166 + 1 NA exon (NM_001320928, exon 7 of 21) exon (NM_001320928, exon 7 of 21) 10513 NM_001278 1147 Hs.198998 NM_001278 ENSG00000213341 CHUK IKBKA|IKK-alpha|IKK1|IKKA|NFKBIKA|TCF16 component of inhibitor of nuclear factor kappa B kinase complex protein-coding 224.667-66 chr6 50818072 50818337 + 1 NA promoter-TSS (NM_003221) promoter-TSS (NM_003221) -667 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 149.333-374 chr7 88423257 88423532 + 1 NA Intergenic Intergenic -116500 NM_001205316 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 152.333-203 chr2 212159708 212159880 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 266566 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 142.333-185 chr4 84057521 84057704 + 1 NA intron (NR_125909, intron 7 of 8) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 241557 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 305.667-28 chr4 100169158 100169716 + 1 NA Intergenic (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -20596 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 131.333-8 chr1 104244627 104244783 + 1 NA Intergenic Intergenic 171682 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 199.667-25 chr11 10885049 10885348 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 26981 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 200.667-130 chr5 109440561 109440875 + 1 NA Intergenic Intergenic -30744 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 164.333-167 chr4 20386958 20387253 + 1 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -5084 NR_037876 100505893 Hs.665305 NR_037876 ENSG00000248228 SLIT2-IT1 - SLIT2 intronic transcript 1 ncRNA 185.333-91 chr2 81868860 81869111 + 1 NA Intergenic Intergenic -402039 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 147.333-164 chr2 40622334 40622588 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -110026 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 147.333-73 chr11 112973797 112973979 + 1 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -10428 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 152.667-200 chr2 162121573 162121837 + 1 NA intron (NR_110255, intron 1 of 3) intron (NR_110255, intron 1 of 3) 7264 NR_110255 101929532 Hs.639883 NR_110255 ENSG00000236841 LOC101929532 - uncharacterized LOC101929532 ncRNA 260.667-85 chr7 95749677 95749991 + 1 NA Intergenic Intergenic -22672 NM_001278422 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 241.333-26 chr10 119947961 119948412 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -10327 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 166.333-242 chr9 102829614 102829946 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -165553 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 178.667-11 chr1 164380888 164381091 + 1 NA Intergenic Intergenic -178371 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 219.333-19 chr10 18127568 18127931 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12675 NM_001167945 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 147.667-234 chr3 101273271 101273499 + 1 NA intron (NM_016247, intron 7 of 18) intron (NM_016247, intron 7 of 18) 47190 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 187.333-113 chr2 202082007 202082361 + 1 NA intron (NM_001277372, intron 2 of 23) L1MB3|LINE|L1 8929 NM_001367720 100652824 Hs.686898 NM_001080445 ENSG00000182329 KIAA2012 - KIAA2012 protein-coding 146.333-285 chr6 54825453 54825701 + 1 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -21194 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 152.333-370 chr8 53165117 53165341 + 1 NA Intergenic Intergenic 86408 NM_001318497 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 161.667-37 chr11 24567019 24567256 + 1 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) AluSc|SINE|Alu 70084 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 160.667-287 chr7 81192117 81192352 + 1 NA Intergenic Intergenic -269845 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 155.333-389 chr8 87154184 87154481 + 1 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L2c|LINE|L2 287917 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 143.667-241 chr8 3629390 3629589 + 1 NA intron (NM_033225, intron 7 of 69) intron (NM_033225, intron 7 of 69) -901038 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 155.333-26 chr10 62155352 62155523 + 1 NA Intergenic Intergenic 106080 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 194.667-45 chr16 60853902 60854308 + 1 NA Intergenic Intergenic 201661 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 112.333-98 chr17 63316776 63316952 + 1 NA intron (NM_025185, intron 9 of 25) intron (NM_025185, intron 9 of 25) 123403 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 148.333-308 chr5 36207710 36207984 + 1 NA intron (NM_001085411, intron 7 of 11) intron (NM_001085411, intron 7 of 11) 33544 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 155.333-198 chr20 34978143 34978343 + 1 NA intron (NM_020884, intron 5 of 44) intron (NM_020884, intron 5 of 44) -12133 NR_030223 574501 NR_030223 ENSG00000207635 MIR499A MIR499|MIRN499|hsa-mir-499a|mir-499a microRNA 499a ncRNA 283.333-75 chr8 107618808 107619150 + 1 NA Intergenic Intergenic -121061 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 166.333-39 chr10 124410275 124410580 + 1 NA intron (NM_001171814, intron 1 of 8) L1MC4|LINE|L1 8496 NM_001322969 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 144.667-43 chr11 59724361 59724644 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10657 NM_001005324 390201 Hs.589001 NM_001005324 ENSG00000172289 OR10V1 OR11-256 olfactory receptor family 10 subfamily V member 1 protein-coding 210.333-46 chr14 69665658 69666008 + 1 NA intron (NM_014734, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 54237 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 265.333-3 chr1 150627153 150627561 + 1 NA exon (NM_207168, exon 2 of 2) exon (NM_207168, exon 2 of 2) 1776 NM_207047 2029 Hs.632456 NM_004436 ENSG00000143420 ENSA ARPP-19e endosulfine alpha protein-coding 275.333-32 chr2 32437661 32438294 + 1 NA intron (NM_016252, intron 15 of 73) FLAM_C|SINE|Alu 80949 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 317.667 chr1 45343344 45343788 + 1 NA TTS (NM_001320800) TTS (NM_001320800) -3096 NM_001293192 4595 Hs.271353 NM_012222 ENSG00000132781 MUTYH MYH mutY DNA glycosylase protein-coding 139.667-176 chr7 111773109 111773263 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 36 of 52) intron (NM_001363540, intron 36 of 52) -35319 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 223.667-81 chr8 68951292 68951721 + 1 NA intron (NR_039986, intron 3 of 4) L1MEc|LINE|L1 152684 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 237.333-65 chr20 8089496 8090010 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -42513 NM_015192 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 201.333-189 chr3 86603135 86603364 + 1 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 121306 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 149.333-277 chr4 54012086 54012267 + 1 NA intron (NM_012110, intron 5 of 5) AluJr|SINE|Alu -24894 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 124.333-119 chr3 90667979 90668144 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1560440 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 132.333-133 chr5 76631550 76631700 + 1 NA intron (NM_006633, intron 14 of 35) intron (NM_006633, intron 14 of 35) -8222 NM_001256566 2151 Hs.42502 NM_004101 ENSG00000164220 F2RL2 PAR-3|PAR3 coagulation factor II thrombin receptor like 2 protein-coding 141.667-244 chr9 60655395 60655541 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -258939 NM_001113541 727905 Hs.645497 NM_001113541 ENSG00000276581 SPATA31A5 FAM75A5 SPATA31 subfamily A member 5 protein-coding 154.667-150 chr18 24131541 24131702 + 1 NA intron (NM_001135993, intron 12 of 13) AluSx1|SINE|Alu -7335 NM_001308231 26256 Hs.511983 NM_012189 ENSG00000154040 CABYR CABYRa|CABYRc|CABYRc/d|CABYRe|CBP86|CT88|FSP-2|FSP2 calcium binding tyrosine phosphorylation regulated protein-coding 226.667-61 chr3 98082419 98082719 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -4604 NM_054106 81050 Hs.554715 NM_054106 ENSG00000196578 OR5AC2 HSA1 olfactory receptor family 5 subfamily AC member 2 protein-coding 182.667-97 chr3 85553509 85553764 + 1 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie 48577 NM_001256505 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 161.333-225 chr4 185163457 185163736 + 1 NA intron (NM_020827, intron 4 of 4) intron (NM_020827, intron 4 of 4) 20330 NM_001151 291 Hs.246506 NM_001151 ENSG00000151729 SLC25A4 AAC1|ANT|ANT 1|ANT1|MTDPS12|MTDPS12A|PEO2|PEO3|PEOA2|T1 solute carrier family 25 member 4 protein-coding 171.667-155 chr7 52437679 52437866 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -597861 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 161.667-66 chr13 112530523 112530831 + 1 NA intron (NM_006322, intron 11 of 21) intron (NM_006322, intron 11 of 21) 57476 NM_001286278 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 174.333-66 chr2 108192464 108192799 + 1 NA intron (NR_131251, intron 1 of 4) L1ME3A|LINE|L1 25210 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 140.667-194 chr6 38024860 38025135 + 1 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 205270 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 195.667-39 chr14 28486351 28486639 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 278824 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 278.333-8 chr1 224320361 224320698 + 1 NA intron (NM_206840, intron 1 of 21) AluSx1|SINE|Alu 9643 NM_002533 4931 Hs.497867 NM_002533 ENSG00000143748 NVL NVL2 nuclear VCP like protein-coding 194.333-50 chr16 84404253 84404613 + 1 NA intron (NM_014861, intron 2 of 26) L1MB3|LINE|L1 -2155 NM_001291454 9914 Hs.6168 NM_014861 ENSG00000064270 ATP2C2 SPCA2 ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2 protein-coding 186.333-39 chr12 46575133 46575319 + 1 NA intron (NR_125377, intron 3 of 3) intron (NR_125377, intron 3 of 3) 191119 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 144.667-249 chr5 156167888 156168067 + 1 NA Intergenic Intergenic -158780 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 172.333-127 chr4 115607954 115608290 + 1 NA Intergenic Intergenic -494502 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 152.667-147 chr18 8984183 8984447 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -118384 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 148.333-123 chr14 63513674 63513944 + 1 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) -5571 NM_001282181 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 235.333-94 chr5 25604310 25604665 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 413534 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 277.667-26 chr20 46740840 46741353 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 31447 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 259.667-31 chr2 33879279 33879590 + 1 NA intron (NR_126403, intron 2 of 5) MER2|DNA|TcMar-Tigger -151217 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 233.333-34 chr12 72384428 72384827 + 1 NA intron (NM_013381, intron 3 of 18) intron (NM_013381, intron 3 of 18) -111118 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 166.667-178 chr5 36236509 36236754 + 1 NA intron (NM_001287341, intron 1 of 12) intron (NM_001287341, intron 1 of 12) 4760 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 135.333-157 chr6 28434162 28434344 + 1 NA 3' UTR (NM_001012455, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001012455, exon 4 of 4) 9238 NM_001012455 222696 Hs.721841 NM_001012455 ENSG00000187987 ZSCAN23 ZNF390|ZNF453|dJ29K1.3|dJ29K1.3.1 zinc finger and SCAN domain containing 23 protein-coding 188.667-93 chr21 30121462 30121799 + 1 NA Intergenic Intergenic 45175 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 155.667-265 chr5 16771733 16771888 + 1 NA intron (NM_012334, intron 9 of 40) AluJb|SINE|Alu -154752 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 262.667-16 chr11 87307785 87308082 + 1 NA intron (NR_033149, intron 8 of 13) L2a|LINE|L2 269999 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 128.333-113 chr2 190439990 190440205 + 1 NA intron (NM_017694, intron 3 of 7) intron (NM_017694, intron 3 of 7) 31742 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 122.333-55 chr14 47913492 47913651 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -118557 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 154.333-221 chr3 105190384 105190593 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -176225 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 151.333-233 chr2 194311025 194311252 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -33131 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 142.667-120 chr20 4595951 4596171 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -90395 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 155.333-266 chr4 82061721 82061959 + 1 NA Intergenic MER127|DNA|TcMar-Tigger 312151 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 182.333-136 chr5 175131499 175131810 + 1 NA Intergenic Intergenic -135923 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 160.667-169 chr2 214531925 214532194 + 1 NA intron (NR_047698, intron 2 of 3) intron (NR_047698, intron 2 of 3) 21877 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 194.333-162 chr9 124064512 124064712 + 1 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 52844 NM_004789 9355 Hs.696425 NM_004789 ENSG00000106689 LHX2 LH2|hLhx2 LIM homeobox 2 protein-coding 197.667-124 chr5 88351948 88352255 + 1 NA intron (NR_105019, intron 6 of 7) intron (NR_105019, intron 6 of 7) -40094 NR_105020 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 202.667-79 chr2 62727909 62728311 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 2 of 22) LTR35|LTR|ERV1 21213 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 111.667-133 chr2 80688971 80689094 + 1 NA Intergenic Intergenic 375653 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 266.667-47 chr3 69367580 69367886 + 1 NA intron (NM_015123, intron 1 of 22) L1ME3G|LINE|L1 18355 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 229.667-70 chr6 43583203 43583613 + 1 NA intron (NM_001291969, intron 2 of 8) intron (NM_001291969, intron 2 of 8) 7223 NM_001291970 5429 Hs.655467 NM_006502 ENSG00000170734 POLH RAD30|RAD30A|XP-V|XPV DNA polymerase eta protein-coding 237.667-35 chr2 13550560 13550893 + 1 NA Intergenic Intergenic -543713 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 156.667-118 chr15 64638128 64638319 + 1 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) L1ME3A|LINE|L1 65058 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 167.667-93 chr18 64306371 64306645 + 1 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) L2a|LINE|L2 -46453 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 152.667-386 chr8 121198670 121198849 + 1 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -386713 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 311.667-28 chr9 79893425 79893811 + 1 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) intron (NR_121213, intron 1 of 2) 69088 NR_121213 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 188.333-111 chr4 75994334 75994548 + 1 NA intron (NR_125906, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 -3479 NM_001288984 55153 Hs.632604 NM_018115 ENSG00000198301 SDAD1 - SDA1 domain containing 1 protein-coding 148.333-180 chr2 26332063 26332223 + 1 NA intron (NR_135916, intron 1 of 12) intron (NR_135916, intron 1 of 12) -13041 NM_001145169 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 159.333-211 chr3 79782450 79782610 + 1 NA Intergenic Intergenic -14532 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 150.667-161 chr18 66022958 66023109 + 1 NA Intergenic Intergenic 272021 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 133.667-19 chr10 57616558 57616816 + 1 NA Intergenic Intergenic -312128 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 261.667-77 chr9 35283797 35284248 + 1 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) AluSz|SINE|Alu -57874 NM_001371188 146.667-75 chr12 61819396 61819692 + 1 NA intron (NM_178539, intron 2 of 4) intron (NM_178539, intron 2 of 4) 373295 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 149.667-345 chr6 53033085 53033273 + 1 NA intron (NM_014920, intron 3 of 13) intron (NM_014920, intron 3 of 13) 28623 NM_016513 22858 Hs.417022 NM_014920 ENSG00000112144 ICK ECO|EJM10|LCK2|MRK intestinal cell kinase protein-coding 178.333-160 chr6 159331205 159331439 + 1 NA Intergenic Intergenic -52209 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 151.333-266 chr22 48951485 48951651 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 84798 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 311.333-50 chr7 23801531 23801982 + 1 NA intron (NM_001260505, intron 22 of 22) L1ME1|LINE|L1 91537 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 169.667-129 chr3 47159828 47160040 + 1 NA intron (NR_146158, intron 1 of 21) AluSg4|SINE|Alu 4043 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 203.333-157 chr21 14272776 14273077 + 1 NA promoter-TSS (NR_003088) promoter-TSS (NR_003088) -873 NR_003088 150000 Hs.366575 NM_138726 ENSG00000243064 ABCC13 ABCC13P|C21orf73|PRED6 ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) pseudo 151.333-257 chr22 19159982 19160223 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -9819 NM_005315 2928 Hs.534318 NM_005315 ENSG00000063515 GSC2 GSCL goosecoid homeobox 2 protein-coding 147.667-384 chr8 140866297 140866549 + 1 NA intron (NM_001352737, intron 3 of 32) MIRb|SINE|MIR -133770 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 113.333-205 chr5 25410576 25410721 + 1 NA Intergenic Intergenic 219695 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 145.333-98 chr15 65885520 65885722 + 1 NA intron (NM_004663, intron 4 of 4) intron (NM_004663, intron 4 of 4) 16130 NM_004663 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 155.667-213 chr3 23966921 23967193 + 1 NA intron (NM_005126, intron 6 of 7) AluSq2|SINE|Alu 20936 NM_001145425 9975 Hs.37288 NM_005126 ENSG00000174738 NR1D2 BD73|EAR-1R|REVERBB|REVERBbeta|RVR nuclear receptor subfamily 1 group D member 2 protein-coding 120.667-68 chr16 48755189 48755410 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -145119 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 165.667-95 chr2 159311661 159311946 + 1 NA Intergenic Intergenic -25100 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 197.667-19 chr10 57493221 57493638 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -188870 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 140.667-210 chr7 22733255 22733403 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -5709 NR_131935 541472 Hs.512234 NR_131935 ENSG00000179428 LOC541472 - uncharacterized LOC541472 ncRNA 203.667-136 chr9 70743468 70743851 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 8 of 25) intron (NM_001366143, intron 8 of 25) 66425 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 128.333-118 chr20 10643131 10643335 + 1 NA intron (NM_000214, intron 20 of 25) intron (NM_000214, intron 20 of 25) 6462 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 279.333-16 chr11 44648939 44649578 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -77704 NM_130783 90139 Hs.385634 NM_130783 ENSG00000157570 TSPAN18 TSPAN tetraspanin 18 protein-coding 158.333-57 chr11 105680936 105681219 + 1 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) intron (NR_046356, intron 2 of 16) 70371 NR_046356 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 193.667-109 chr6 35588210 35588574 + 1 NA intron (NM_001145777, intron 6 of 6) intron (NM_001145777, intron 6 of 6) -75496 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 161.667-161 chr22 37783273 37783550 + 1 NA Intergenic Intergenic -21696 NM_005318 3005 Hs.745024 NM_005318 ENSG00000189060 H1F0 H10|H1FV H1 histone family member 0 protein-coding 197.333-27 chr10 116763415 116763694 + 1 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) intron (NM_001330164, intron 2 of 12) -20988 NM_025015 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 383.333-3 chr14 60149009 60149648 + 1 NA intron (NM_016029, intron 6 of 6) intron (NM_016029, intron 6 of 6) 16070 NM_016029 51635 Hs.59719 NM_016029 ENSG00000100612 DHRS7 CGI-86|SDR34C1|retDSR4|retSDR4 dehydrogenase/reductase 7 protein-coding 153.333-204 chr2 88292387 88292576 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 119342 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 155.333-292 chr5 61823990 61824196 + 1 NA Intergenic Intergenic -88395 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 199.667-45 chr14 59504028 59504367 + 1 NA TTS (NM_001164399) TTS (NM_001164399) 19680 NM_016475 51528 Hs.446850 NM_016475 ENSG00000050130 JKAMP C14orf100|C24orf100|CDA06|HSPC213|HSPC327|JAMP JNK1/MAPK8 associated membrane protein protein-coding 141.667-53 chr11 110690369 110690610 + 1 NA intron (NM_020809, intron 3 of 15) intron (NM_020809, intron 3 of 15) 21336 NM_001258415 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 142.667-173 chr5 10958864 10959042 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -197719 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 133.333-38 chr12 32134512 32134674 + 1 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 27746 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 198.667-171 chr7 47666628 47666922 + 1 NA Intergenic Intergenic 11531 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 188.333-29 chr11 60494448 60494716 + 1 NA intron (NM_017716, intron 1 of 6) intron (NM_017716, intron 1 of 6) 1804 NM_017716 54860 Hs.272789 NM_017716 ENSG00000071203 MS4A12 Ms4a10 membrane spanning 4-domains A12 protein-coding 231.333-66 chr22 26730380 26730907 + 1 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) MER77|LTR|ERVL 57800 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 126.333-96 chr2 155439121 155439341 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 740536 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 325.333-28 chr4 36372106 36372577 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 54087 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 190.333-52 chr16 5068861 5069210 + 1 NA Intergenic Intergenic -2774 NM_019109 56052 Hs.592086 NM_019109 ENSG00000033011 ALG1 CDG1K|HMAT1|HMT-1|HMT1|MT-1|Mat-1|hMat-1 ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase protein-coding 160.333-35 chr10 12062390 12062644 + 1 NA Intergenic Intergenic -6437 NM_018706 55526 Hs.104980 NM_018706 ENSG00000181192 DHTKD1 AMOXAD|CMT2Q dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1 protein-coding 211.333-155 chr3 179341468 179341706 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -6122 NM_033540 55669 Hs.478383 NM_017927 ENSG00000171109 MFN1 hfzo1|hfzo2 mitofusin 1 protein-coding 171.333-103 chr20 35773493 35773834 + 1 NA intron (NM_016436, intron 1 of 17) intron (NM_016436, intron 1 of 17) 1648 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 184.333-42 chr14 62335355 62335649 + 1 NA Intergenic Intergenic -195529 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 159.667-194 chr20 49440294 49440611 + 1 NA intron (NM_004975, intron 1 of 1) L1ME4b|LINE|L1 42216 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 149.333-219 chr21 22741826 22742043 + 1 NA Intergenic Intergenic -337350 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 127.333-103 chr3 17427993 17428158 + 1 NA intron (NM_001349091, intron 2 of 19) intron (NM_001349091, intron 2 of 19) 271945 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 155.667-261 chr4 154207692 154207971 + 1 NA Intergenic Intergenic 283968 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 117.667-188 chr8 48562246 48562452 + 1 NA intron (NR_105002, intron 2 of 3) L1MD2|LINE|L1 10782 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 184.333-61 chr18 13742643 13742912 + 1 NA intron (NM_003799, intron 8 of 11) intron (NM_003799, intron 8 of 11) 16104 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 173.667-136 chr4 93903142 93903398 + 1 NA Intergenic Intergenic 74517 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 185.667-78 chr2 187387077 187387351 + 1 NA intron (NM_001369435, intron 4 of 15) intron (NM_001369435, intron 4 of 15) 61038 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 159.333-76 chr13 20246348 20246635 + 1 NA Intergenic Intergenic -14096 NM_001110221 10804 Hs.511757 NM_006783 ENSG00000121742 GJB6 CX30|DFNA3|DFNA3B|DFNB1B|ECTD2|ED2|EDH|HED|HED2 gap junction protein beta 6 protein-coding 156.333-175 chr2 47899464 47899734 + 1 NA intron (NM_001190274, intron 1 of 22) MIRb|SINE|MIR 6194 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 152.333-325 chr6 35673989 35674203 + 1 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) -9307 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 246.667-63 chr4 89503307 89503646 + 1 NA Intergenic Intergenic -195676 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 151.667-62 chr11 38659263 38659551 + 1 NA Intergenic Intergenic 10549 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 175.333-23 chr11 74691764 74692091 + 1 NA Intergenic Intergenic 19440 NM_001304417 25884 Hs.432379 NM_015424 ENSG00000054938 CHRDL2 BNF1|CHL2 chordin like 2 protein-coding 191.667-15 chr10 48432483 48432769 + 1 NA intron (NM_001323331, intron 12 of 12) intron (NM_001323331, intron 12 of 12) 31014 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 145.333-287 chr7 159264311 159264534 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -119465 NR_130758 7434 Hs.585052 NM_003382 ENSG00000106018 VIPR2 C16DUPq36.3|DUP7q36.3|PACAP-R-3|PACAP-R3|VIP-R-2|VPAC2|VPAC2R|VPCAP2R vasoactive intestinal peptide receptor 2 protein-coding 174.333-62 chr2 64769853 64770192 + 1 NA Intergenic Intergenic 93609 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 192.333-149 chr6 111217890 111218188 + 1 NA intron (NM_018593, intron 4 of 5) intron (NM_018593, intron 4 of 5) -41300 NM_153369 91749 Hs.400572 NM_153369 ENSG00000173214 MFSD4B KIAA1919|NaGLT1 major facilitator superfamily domain containing 4B protein-coding 185.333-138 chr4 66318291 66318605 + 1 NA Intergenic Intergenic 41624 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 217.333-67 chr2 152685535 152685774 + 1 NA intron (NM_001365601, intron 5 of 24) intron (NM_001365601, intron 5 of 24) 31807 NM_001365604 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 244.667-3 chr1 84120783 84121123 + 1 NA intron (NM_002731, intron 1 of 9) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -23318 NM_001300916 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 112.333-251 chr7 91247557 91247781 + 1 NA Intergenic Intergenic -16764 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 261.667-37 chr2 67340530 67340925 + 1 NA Intergenic Intergenic -56606 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 173.667-9 chr1 169156587 169156860 + 1 NA intron (NR_104229, intron 12 of 12) intron (NR_104229, intron 12 of 12) 50033 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 323.667-17 chr3 20173359 20173938 + 1 NA promoter-TSS (NR_132785) promoter-TSS (NR_132785) -638 NR_132785 100874028 Hs.105153 NR_046723 ENSG00000231304 SGO1-AS1 SGOL1-AS1 SGO1 antisense RNA 1 ncRNA 233.667-64 chr6 126064696 126065121 + 1 NA intron (NR_146804, intron 16 of 16) intron (NR_146804, intron 16 of 16) 78368 NR_146803 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 195.333-95 chr17 3389879 3390181 + 1 NA Intergenic Intergenic 8380 NM_003553 8387 NM_003553 ENSG00000180016 OR1E1 HGM071|OR13-66|OR17-2|OR17-32|OR1E5|OR1E6|OR1E8P|OR1E9P|OST547 olfactory receptor family 1 subfamily E member 1 protein-coding 203.333-268 chr8 111024033 111024348 + 1 NA intron (NR_125417, intron 1 of 5) intron (NR_125417, intron 1 of 5) 3243 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 161.667-134 chr2 109273865 109274108 + 1 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) 39639 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 156.667-187 chr2 117011524 117011693 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -803083 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 147.333-307 chr8 14528193 14528385 + 1 NA intron (NM_001322881, intron 2 of 6) intron (NM_001322881, intron 2 of 6) 325221 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 143.667-33 chr10 122932021 122932234 + 1 NA 3' UTR (NM_024942, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_024942, exon 6 of 6) 21517 NM_001029888 118670 Hs.369829 NM_001029888 ENSG00000203795 FAM24A - family with sequence similarity 24 member A protein-coding 150.333-155 chr17 49524228 49524488 + 1 NA intron (NR_103773, intron 1 of 2) intron (NR_103773, intron 1 of 2) 13541 NR_106751 102465141 NR_106751 ENSG00000277478 MIR6165 hsa-mir-6165 microRNA 6165 ncRNA 116.667-65 chr15 66555850 66556065 + 1 NA intron (NM_001278562, intron 7 of 11) L1MB2|LINE|L1 9540 NM_207338 197021 Hs.680983 NM_207338 ENSG00000188501 LCTL KLG|KLPH lactase like protein-coding 246.333-17 chr10 108039641 108040040 + 1 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) LTR10B1|LTR|ERV1 29453 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 180.333-12 chr10 74028653 74028834 + 1 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) intron (NM_014000, intron 1 of 21) 30627 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 212.333-111 chr5 14616633 14616941 + 1 NA TTS (NM_019018) TTS (NM_019018) 34995 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 150.333-330 chr5 72936723 72936944 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -19208 NM_138782 115548 Hs.165762 NM_138782 ENSG00000157107 FCHO2 - FCH domain only 2 protein-coding 160.333-59 chr11 26249375 26249663 + 1 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) 38488 NR_132968 105376599 Hs.125537 NR_132968 ENSG00000254819 ANO3-AS1 - ANO3 antisense RNA 1 ncRNA 137.333-127 chr4 11049703 11049940 + 1 NA Intergenic Intergenic -319006 NR_030298 693157 NR_030298 ENSG00000207716 MIR572 MIRN572|hsa-mir-572 microRNA 572 ncRNA 114.667-50 chr11 47617400 47617626 + 1 NA 3' UTR (NM_001317231, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001317231, exon 13 of 13) -23102 NM_031909 114900 Hs.662633 NM_031909 ENSG00000172247 C1QTNF4 CTRP4|ZACRP4 C1q and TNF related 4 protein-coding 157.667-258 chr5 97089752 97089946 + 1 NA Intergenic Intergenic 52762 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 136.667-55 chr14 50461325 50461634 + 1 NA intron (NM_198794, intron 13 of 31) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -64181 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 169.333-136 chr2 216719104 216719340 + 1 NA Intergenic Intergenic -23673 NM_000599 3488 Hs.607212 NM_000599 ENSG00000115461 IGFBP5 IBP5 insulin like growth factor binding protein 5 protein-coding 269.667-56 chr8 110777401 110777697 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 249884 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 207.667-62 chr2 232264164 232264468 + 1 NA intron (NR_046477, intron 12 of 18) intron (NR_046477, intron 12 of 18) 91663 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 149.333-34 chr1 218666044 218666238 + 1 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 156046 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 224.333-27 chr11 92513637 92514035 + 1 NA intron (NM_001008781, intron 1 of 24) intron (NM_001008781, intron 1 of 24) 161740 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 238.333-10 chr10 125695943 125696244 + 1 NA intron (NR_033848, intron 2 of 4) intron (NR_033848, intron 2 of 4) 12850 NR_033848 283038 Hs.144911 NR_033848 ENSG00000228021 LOC283038 - uncharacterized LOC283038 ncRNA 168.333-220 chr9 16767426 16767627 + 1 NA intron (NM_017637, intron 1 of 6) intron (NM_017637, intron 1 of 6) 40712 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 191.333-163 chr5 119002195 119002519 + 1 NA intron (NR_134249, intron 7 of 8) intron (NR_134249, intron 7 of 8) -13810 NM_173666 285605 Hs.655891 NM_173666 ENSG00000169570 DTWD2 - DTW domain containing 2 protein-coding 211.667-64 chr2 140811664 140811937 + 1 NA intron (NM_018557, intron 32 of 90) intron (NM_018557, intron 32 of 90) -225115 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 216.667-39 chr15 85048333 85048716 + 1 NA intron (NM_173454, intron 1 of 20) intron (NM_173454, intron 1 of 20) 66550 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 128.667-106 chr21 18277491 18277654 + 1 NA intron (NM_002772, intron 23 of 24) intron (NM_002772, intron 23 of 24) 31697 NM_001204174 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 218.333-103 chr6 37193066 37193318 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 23040 NM_001243186 5292 Hs.81170 NM_002648 ENSG00000137193 PIM1 PIM Pim-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 145.667-130 chr2 55591839 55592076 + 1 NA intron (NM_020463, intron 4 of 14) intron (NM_020463, intron 4 of 14) 25665 NM_001282850 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 292.333-27 chr20 58600865 58601403 + 1 NA intron (NR_034147, intron 6 of 6) L1MB8|LINE|L1 -33638 NR_125359 79160 Hs.280135 NR_125359 ENSG00000268941 LINC01711 - long intergenic non-protein coding RNA 1711 ncRNA 185.333-178 chr7 91135474 91135687 + 1 NA intron (NM_012395, intron 13 of 13) intron (NM_012395, intron 13 of 13) -128853 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 181.333-36 chr12 46625740 46625953 + 1 NA intron (NR_125377, intron 3 of 3) intron (NR_125377, intron 3 of 3) 200151 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 157.667-73 chr12 42008961 42009275 + 1 NA Intergenic Intergenic 135756 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 169.333-224 chr6 48548357 48548566 + 1 NA Intergenic Intergenic -479772 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 239.667-34 chr18 60509157 60509593 + 1 NA Intergenic Intergenic -136600 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 178.333-128 chr4 130261013 130261264 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -115223 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 124.333-28 chr11 81409609 81409793 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 481135 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 143.667-232 chr7 49042937 49043182 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 118512 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 159.667-91 chr13 20593326 20593489 + 1 NA intron (NR_148465, intron 6 of 20) MIR|SINE|MIR 26250 NM_001353575 8100 Hs.187376 NM_006531 ENSG00000032742 IFT88 D13S1056E|DAF19|TG737|TTC10|hTg737 intraflagellar transport 88 protein-coding 143.667-72 chr14 48376536 48376746 + 1 NA Intergenic Intergenic -581627 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 164.333-241 chr8 132628558 132628854 + 1 NA intron (NR_135913, intron 4 of 10) intron (NR_135913, intron 4 of 10) 46839 NR_135913 23639 Hs.591865 NM_012472 ENSG00000129295 LRRC6 CILD19|LRTP|TSLRP leucine rich repeat containing 6 protein-coding 146.667-256 chr5 52150584 52150807 + 1 NA Intergenic Intergenic 142664 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 152.667-50 chr10 100785727 100785911 + 1 NA intron (NM_003988, intron 5 of 10) MIRb|SINE|MIR 40108 NM_003987 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 281.667-55 chr8 122814351 122814821 + 1 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 32931 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 179.333-129 chr3 126237510 126237787 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -56462 NM_001270364 10840 Hs.434435 NM_012190 ENSG00000144908 ALDH1L1 10-FTHFDH|10-fTHF|FDH|FTHFD aldehyde dehydrogenase 1 family member L1 protein-coding 167.667-41 chr11 105188918 105189150 + 1 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -49265 NM_021571 59082 Hs.56279 NM_021571 ENSG00000255501 CARD18 ICEBERG|UNQ5804|pseudo-ICE caspase recruitment domain family member 18 protein-coding 145.333-174 chr3 2832865 2833187 + 1 NA intron (NM_175607, intron 7 of 24) intron (NM_175607, intron 7 of 24) -59189 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 253.333-82 chr5 19246639 19246991 + 1 NA Intergenic Intergenic 639457 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 248.667-37 chr14 56027826 56028137 + 1 NA Intergenic Intergenic -90430 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 162.333-226 chr6 132838994 132839300 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 21928 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 163.667-196 chr5 29516374 29516627 + 1 NA Intergenic Intergenic -120524 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 151.667-184 chr2 231152449 231152676 + 1 NA intron (NM_001191037, intron 18 of 23) MIRb|SINE|MIR -27520 NM_001320758 3357 Hs.421649 NM_000867 ENSG00000135914 HTR2B 5-HT(2B)|5-HT-2B|5-HT2B 5-hydroxytryptamine receptor 2B protein-coding 198.667-166 chr6 117170798 117171055 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -94632 NM_182645 245806 Hs.99324 NM_153453 ENSG00000170162 VGLL2 VGL2|VITO1 vestigial like family member 2 protein-coding 175.667-24 chr11 26360779 26360958 + 1 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) intron (NM_031418, intron 1 of 26) 28738 NM_031418 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 211.667-39 chr14 38776421 38776729 + 1 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) intron (NR_039982, intron 4 of 4) -106021 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 150.333-264 chr3 66172916 66173133 + 1 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 39414 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 202.667-49 chr14 52807407 52807661 + 1 NA Intergenic Intergenic -15927 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 155.667-126 chr16 82997909 82998185 + 1 NA intron (NM_001220490, intron 2 of 12) intron (NM_001220490, intron 2 of 12) -7749 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 195.333-96 chr17 11661853 11662153 + 1 NA intron (NM_001372, intron 14 of 68) L1ME2|LINE|L1 63533 NM_001372 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 131.333-73 chr19 18286908 18287039 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 4896 NR_036155 100422833 NR_036155 ENSG00000267959 MIR3188 mir-3188 microRNA 3188 ncRNA 247.667-89 chr7 90718841 90719154 + 1 NA intron (NM_001287136, intron 1 of 13) intron (NM_001287136, intron 1 of 13) 9181 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 160.333-160 chr2 225157161 225157518 + 1 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -114871 NM_014689 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 160.333-104 chr14 68538866 68539040 + 1 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 89834 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 124.667-21 chr10 4383335 4383486 + 1 NA promoter-TSS (NR_108054) promoter-TSS (NR_108054) -836 NR_108055 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 212.667-18 chr11 18089583 18090056 + 1 NA intron (NM_138421, intron 6 of 11) AluJo|SINE|Alu 16263 NM_138421 113174 Hs.591998 NM_138421 ENSG00000166788 SAAL1 SPACIA1 serum amyloid A like 1 protein-coding 229.333-49 chr17 17786902 17787220 + 1 NA intron (NM_030665, intron 2 of 5) AluSp|SINE|Alu -7532 NR_024007 140771 Hs.352643 NM_144774 ENSG00000226746 SMCR5 NCRNA00034 Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 5 ncRNA 241.333-71 chr3 161628008 161628493 + 1 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL 131442 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 157.667-232 chr5 18058585 18058821 + 1 NA Intergenic Intergenic 251429 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 158.667-282 chr6 37313755 37313991 + 1 NA exon (NM_017772, exon 10 of 13) exon (NM_017772, exon 10 of 13) -40110 NM_183078 9025 Hs.485278 NM_003958 ENSG00000112130 RNF8 hRNF8 ring finger protein 8 protein-coding 185.333-125 chr3 160762220 160762423 + 1 NA intron (NM_139245, intron 1 of 3) intron (NM_139245, intron 1 of 3) 6090 NM_139245 151742 Hs.389027 NM_139245 ENSG00000163590 PPM1L PP2C-epsilon|PP2CE|PPM1-LIKE protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L protein-coding 140.333-245 chr9 26855015 26855215 + 1 NA intron (NM_001167575, intron 5 of 5) L1MC2|LINE|L1 37687 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 175.333-204 chr9 72429690 72430043 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -64658 NM_001102421 7763 Hs.406096 NM_006007 ENSG00000107372 ZFAND5 ZA20D2|ZFAND5A|ZNF216 zinc finger AN1-type containing 5 protein-coding 218.667-21 chr11 123493342 123493677 + 1 NA intron (NM_001367419, intron 2 of 20) intron (NM_001367419, intron 2 of 20) -16407 NM_001330396 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 215.667-103 chr5 163442755 163443004 + 1 NA intron (NM_199246, intron 7 of 7) intron (NM_199246, intron 7 of 7) 5284 NM_004060 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 148.667-64 chr11 19188348 19188543 + 1 NA intron (NM_003476, intron 2 of 5) intron (NM_003476, intron 2 of 5) 13538 NM_003476 8048 Hs.83577 NM_003476 ENSG00000129170 CSRP3 CLP|CMD1M|CMH12|CRP3|LMO4|MLP cysteine and glycine rich protein 3 protein-coding 130.333-17 chr1 187028501 187028685 + 1 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -64249 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 230.667-38 chr2 67087307 67087640 + 1 NA intron (NR_110564, intron 1 of 4) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 1027 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 203.667-16 chr11 8116295 8116547 + 1 NA intron (NM_001135109, intron 1 of 1) L1MA8|LINE|L1 35059 NM_177972 7275 Hs.568986 NM_003320 ENSG00000166402 TUB RDOB|rd5 TUB bipartite transcription factor protein-coding 162.333-126 chr2 168612552 168612775 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 3 of 10) intron (NM_001256126, intron 3 of 10) 29720 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 137.667-115 chr21 30732885 30733039 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -14185 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 289.333-48 chr5 42240797 42241328 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -65717 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 221.667-21 chr12 33480149 33480548 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -40529 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 134.667-43 chr12 21127872 21128075 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3221 NM_006446 10599 Hs.449738 NM_006446 ENSG00000134538 SLCO1B1 HBLRR|LST-1|LST1|OATP-C|OATP1B1|OATP2|OATPC|SLC21A6 solute carrier organic anion transporter family member 1B1 protein-coding 144.667-219 chr4 95646597 95646746 + 1 NA Intergenic Intergenic -97698 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 259.667-56 chr4 84392344 84392804 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -93405 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 242.333-75 chr4 30445582 30445877 + 1 NA Intergenic Intergenic -274640 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 180.667-106 chr4 128556656 128556975 + 1 NA Intergenic Intergenic 128799 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 339.333-34 chr3 181532617 181533200 + 1 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) -77426 NR_004053 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 313.333-8 chr12 18827534 18827966 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 89631 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 279.667-36 chr5 55995964 55996509 + 1 NA intron (NR_102755, intron 1 of 1) intron (NR_102755, intron 1 of 1) 1069 NR_102755 441072 Hs.482141 NR_102755 ENSG00000227908 FLJ31104 - uncharacterized LOC441072 ncRNA 194.667-18 chr10 31533369 31533785 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -133822 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 282.333-22 chr17 76333843 76334411 + 1 NA intron (NM_001330503, intron 2 of 8) intron (NM_001330503, intron 2 of 8) 19789 NM_001330503 5635 Hs.77498 NM_002766 ENSG00000161542 PRPSAP1 PAP39 phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 1 protein-coding 142.667-243 chr9 71346965 71347138 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 99920 NM_001366141 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 199.333-216 chr4 169783637 169784046 + 1 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite -25897 NM_017867 54969 Hs.406756 NM_017867 ENSG00000056050 HPF1 C4orf27 histone PARylation factor 1 protein-coding 149.333-218 chr21 22036114 22036388 + 1 NA intron (NR_109959, intron 4 of 5) L1PA13|LINE|L1 62208 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 201.667-98 chr6 13793162 13793451 + 1 NA intron (NM_001031713, intron 7 of 8) L1MB3|LINE|L1 21254 NM_001031713 63933 Hs.214043 NM_022102 ENSG00000050393 MCUR1 C6orf79|CCDC90A|FMP32 mitochondrial calcium uniporter regulator 1 protein-coding 168.667-155 chr3 189622560 189622835 + 1 NA intron (NM_001329964, intron 1 of 13) MIRc|SINE|MIR -8692 NM_001329144 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 162.667-251 chr6 169131204 169131487 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 30956 NR_132622 101929484 Hs.364166 NR_132622 ENSG00000223485 LINC01615 - long intergenic non-protein coding RNA 1615 ncRNA 132.667-111 chr3 135664864 135665034 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -300779 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 160.333-52 chr10 125021821 125022144 + 1 NA intron (NM_001290214, intron 3 of 10) intron (NM_001290214, intron 3 of 10) 6089 NM_022802 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 163.667-120 chr2 163290144 163290383 + 1 NA Intergenic Intergenic 445745 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 193.333-151 chr5 93626665 93626976 + 1 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -6032 NR_031754 100313887 NR_031754 ENSG00000284336 MIR2277 mir-2277 microRNA 2277 ncRNA 241.667-9 chr10 23981658 23982100 + 1 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -226912 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 137.333-138 chr4 113511697 113511860 + 1 NA intron (NM_001221, intron 12 of 18) intron (NM_001221, intron 12 of 18) 218939 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 203.333-4 chr1 35676070 35676349 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -34683 NM_001199779 5690 Hs.471441 NM_002794 ENSG00000126067 PSMB2 HC7-I proteasome subunit beta 2 protein-coding 164.333-254 chrX 27921886 27922199 + 1 NA Intergenic Intergenic 59407 NM_001017930 139425 Hs.447365 NM_001017930 ENSG00000226372 DCAF8L1 WDR42B DDB1 and CUL4 associated factor 8 like 1 protein-coding 141.667-2 chr1 30115045 30115306 + 1 NA Intergenic Intergenic -77563 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 352.667-24 chr5 155832761 155833204 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -493775 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 160.667-289 chr7 88723729 88723987 + 1 NA Intergenic Intergenic -35842 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 151.333-245 chr20 33368008 33368180 + 1 NA intron (NM_001365728, intron 12 of 14) MIR|SINE|MIR 33425 NM_016408 51654 Hs.435952 NM_016082 ENSG00000101391 CDK5RAP1 C20orf34|C42|CGI-05|HSPC167 CDK5 regulatory subunit associated protein 1 protein-coding 116.333-77 chr16 24595301 24595459 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -14825 NM_001351850 27327 Hs.655057 NM_014494 ENSG00000090905 TNRC6A CAGH26|FAME6|GW1|GW182|TNRC6 trinucleotide repeat containing adaptor 6A protein-coding 255.667-59 chr3 181658823 181659146 + 1 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 48650 NR_075089 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 151.333-108 chr12 110304447 110304632 + 1 NA intron (NM_170665, intron 5 of 19) L1MB7|LINE|L1 23292 NM_170665 488 Hs.506759 NM_001681 ENSG00000174437 ATP2A2 ATP2B|DAR|DD|SERCA2 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 2 protein-coding 164.333-16 chr1 235915446 235915726 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -31873 NR_102436 1130 Hs.532411 NM_000081 ENSG00000143669 LYST CHS|CHS1 lysosomal trafficking regulator protein-coding 126.333-26 chr11 54944181 54944347 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 237432 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 154.333-18 chr1 147726313 147726528 + 1 NA Intergenic Intergenic 34182 NM_181703 2702 Hs.447968 NM_005266 ENSG00000265107 GJA5 ATFB11|CX40 gap junction protein alpha 5 protein-coding 238.333-82 chr7 3519076 3519484 + 1 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MA5A|LINE|L1 218028 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 148.333-84 chr12 12757483 12757673 + 1 NA intron (NM_001130415, intron 1 of 1) L1ME3A|LINE|L1 -7071 NR_030344 693198 NR_030344 ENSG00000207983 MIR613 MIRN613|hsa-mir-613 microRNA 613 ncRNA 140.333-75 chr16 12695235 12695470 + 1 NA intron (NM_001099455, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu -24969 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 179.333-10 chr1 115344469 115344689 + 1 NA intron (NR_157569, intron 1 of 1) intron (NR_157569, intron 1 of 1) -6343 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 147.667-59 chr11 96357403 96357597 + 1 NA intron (NM_024725, intron 9 of 9) intron (NM_024725, intron 9 of 9) -14305 NM_032427 84441 Hs.428214 NM_032427 ENSG00000184384 MAML2 MAM-3|MAM2|MAM3|MLL-MAML2 mastermind like transcriptional coactivator 2 protein-coding 139.333-34 chr11 59947090 59947237 + 1 NA intron (NR_130719, intron 2 of 8) intron (NR_130719, intron 2 of 8) 4284 NR_130719 255649 Hs.722773 NR_130719 OOSP1 - oocyte secreted protein 1 pseudo 149.667-350 chr6 71531716 71531895 + 1 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL 110778 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 118.667-76 chr15 97214932 97215123 + 1 NA Intergenic Intergenic 306784 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 148.333-43 chr10 32647793 32647946 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 21 of 43) L1PA16|LINE|L1 201729 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 268.667-57 chr6 64759522 64759945 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -541685 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 182.333-28 chr11 81648647 81648851 + 1 NA Intergenic Intergenic 242087 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 159.667-13 chr1 78391214 78391482 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -99626 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 151.667-372 chr8 107161322 107161571 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 175069 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 177.333-59 chr15 34276688 34276901 + 1 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 42026 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 307.333-65 chr4 120753751 120754207 + 1 NA intron (NM_001300824, intron 12 of 13) intron (NM_001300824, intron 12 of 13) 168887 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 163.333-26 chr1 231500713 231500977 + 1 NA Intergenic Intergenic -24320 NR_033826 645339 Hs.382049 NR_033826 SNRPD2P2 - small nuclear ribonucleoprotein D2 pseudogene 2 pseudo 265.667-4 chr1 242825078 242825509 + 1 NA Intergenic Intergenic 276451 NR_029401 731275 Hs.722350 NR_029401 ENSG00000214837 LINC01347 - long intergenic non-protein coding RNA 1347 ncRNA 215.667-55 chr19 34894949 34895230 + 1 NA intron (NR_046222, intron 1 of 2) L1MDa|LINE|L1 3854 NR_046222 100652909 Hs.374015 NR_046222 ENSG00000271649 LINC00904 - long intergenic non-protein coding RNA 904 ncRNA 151.333-18 chr1 96228537 96228753 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 145480 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 155.333-75 chr12 31717550 31717817 + 1 NA intron (NR_103522, intron 2 of 8) intron (NR_103522, intron 2 of 8) 11338 NM_001113402 196394 Hs.585084 NM_001113402 ENSG00000151743 AMN1 - antagonist of mitotic exit network 1 homolog protein-coding 172.333-17 chr10 55988637 55988919 + 1 NA Intergenic Intergenic -360836 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 149.333-415 chr8 142893495 142893748 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -13801 NM_000497 1584 Hs.184927 NM_000497 ENSG00000160882 CYP11B1 CPN1|CYP11B|FHI|P450C11 cytochrome P450 family 11 subfamily B member 1 protein-coding 157.667-29 chr10 57334253 57334472 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29803 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 119.333-6 chr1 43033820 43034008 + 1 NA Intergenic Intergenic 74865 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-342 chr5 77049229 77049426 + 1 NA intron (NM_018046, intron 8 of 13) intron (NM_018046, intron 8 of 13) 18923 NM_018046 55109 Hs.634849 NM_018046 ENSG00000164252 AGGF1 GPATC7|GPATCH7|HSU84971|HUS84971|VG5Q angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1 protein-coding 189.667-65 chr19 56319774 56320149 + 1 NA intron (NM_001322072, intron 2 of 6) intron (NM_001322072, intron 2 of 6) -5122 NM_001322074 79149 Hs.177688 NM_024303 ENSG00000131848 ZSCAN5A ZNF495|ZSCAN5 zinc finger and SCAN domain containing 5A protein-coding 199.667-122 chr6 67463496 67463834 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -591686 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 186.333-109 chr3 185318681 185318941 + 1 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) L1ME3E|LINE|L1 35850 NM_001242314 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 208.667-84 chr22 34238686 34238984 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -315947 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 135.333-107 chr22 30177901 30178092 + 1 NA TTS (NM_001329458) TTS (NM_001329458) -61198 NR_149070 110806283 NR_149070 ENSG00000232530 LIF-AS1 Lnc-LIF-AS LIF antisense RNA 1 ncRNA 200.333-103 chr4 48850975 48851281 + 1 NA TTS (NR_146806) TTS (NR_146806) 9075 NR_146806 100861517 Hs.661065 NR_146806 ENSG00000248256 OCIAD1-AS1 - OCIAD1 antisense RNA 1 ncRNA 349.667-20 chr5 25922806 25923239 + 1 NA Intergenic Intergenic 732069 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 143.667-198 chr5 29993730 29993946 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 113278 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 325.333-7 chr10 66613685 66614362 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -312013 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 183.333-26 chr11 82373873 82374172 + 1 NA intron (NR_120571, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 29891 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 114.333-134 chr20 42318526 42318755 + 1 NA intron (NM_133170, intron 11 of 31) intron (NM_133170, intron 11 of 31) -366843 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 243.667-24 chr14 80076360 80076831 + 1 NA Intergenic Intergenic -134824 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-76 chr12 22328839 22329016 + 1 NA intron (NM_003034, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 5787 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 153.667-397 chr8 135895701 135895944 + 1 NA Intergenic Intergenic 438366 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 159.333-270 chr5 82475268 82475456 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 195900 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 152.333-125 chr15 67989587 67989759 + 1 NA Intergenic Intergenic -64506 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 201.667-110 chr6 150699255 150699601 + 1 NA intron (NM_001329800, intron 1 of 15) intron (NM_001329800, intron 1 of 15) 15781 NM_001329798 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 150.333-402 chr8 76802452 76802620 + 1 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -119261 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-352 chr7 10120682 10120987 + 1 NA Intergenic Intergenic 486564 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 277.333-85 chr8 138506917 138507335 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -9396 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 295.667-30 chr7 22693354 22693738 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -28013 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 245.333-70 chr2 206198257 206198545 + 1 NA intron (NM_001098199, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR -4975 NR_104359 101669764 Hs.574781 NR_104359 GPR1-AS GPR1-AS1|GPR1AS GPR1 antisense RNA ncRNA 147.333-265 chr5 90038982 90039167 + 1 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -22354 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 183.333-112 chr4 38996420 38996634 + 1 NA intron (NM_001303228, intron 2 of 6) AluSx1|SINE|Alu 35882 NM_024943 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 204.667-148 chr8 83044419 83044809 + 1 NA Intergenic Intergenic 132510 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 119.333-179 chr5 89935245 89935408 + 1 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack 81394 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 160.333-124 chr17 26666571 26666859 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 422526 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 182.333-14 chr10 16070715 16070962 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -210305 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 245.667-27 chr19 43912222 43912662 + 1 NA TTS (NM_003425) TTS (NM_003425) -10639 NR_038334 100505715 Hs.76561 NR_038334 ENSG00000267058 LOC100505715 - uncharacterized LOC100505715 ncRNA 148.667-179 chr2 41904819 41905076 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 27392 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 300.333-38 chr5 72851810 72852338 + 1 NA intron (NM_001364295, intron 3 of 23) intron (NM_001364295, intron 3 of 23) 3935 NM_001364294 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 158.333-134 chr19 55200822 55201054 + 1 NA intron (NM_002842, intron 6 of 19) AluY|SINE|Alu 8563 NM_002842 5794 Hs.179770 NM_002842 ENSG00000080031 PTPRH R-PTP-H|SAP1 protein tyrosine phosphatase receptor type H protein-coding 117.333-222 chr9 112306983 112307152 + 1 NA intron (NM_001244896, intron 1 of 12) intron (NM_001244896, intron 1 of 12) 25959 NM_001244898 9991 Hs.269988 NM_005156 ENSG00000119314 PTBP3 ROD1 polypyrimidine tract binding protein 3 protein-coding 128.333-52 chr13 66913151 66913327 + 1 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) intron (NM_001318372, intron 2 of 4) -64150 NR_046636 100874086 Hs.577908 NR_046636 ENSG00000225263 PCDH9-AS3 - PCDH9 antisense RNA 3 ncRNA 140.667-124 chr2 118947311 118947592 + 1 NA intron (NM_006770, intron 1 of 16) FAM|SINE|Alu 5282 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 121.667-36 chr11 9367786 9367955 + 1 NA Intergenic Intergenic -16782 NM_006391 10527 Hs.744911 NM_006391 ENSG00000205339 IPO7 Imp7|RANBP7 importin 7 protein-coding 119.667-156 chr5 101681655 101681810 + 1 NA Intergenic Intergenic 614552 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 145.667-252 chr6 75212397 75212660 + 1 NA Intergenic Intergenic -6475 NM_080645 1303 Hs.101302 NM_004370 ENSG00000111799 COL12A1 BA209D8.1|BTHLM2|COL12A1L|DJ234P15.1|EDSMYP|UCMD2 collagen type XII alpha 1 chain protein-coding 131.333-2 chr1 27539927 27540094 + 1 NA intron (NM_001029882, intron 6 of 6) intron (NM_001029882, intron 6 of 6) -49843 NM_001201404 10163 Hs.469244 NM_006990 ENSG00000158195 WASF2 IMD2|SCAR2|WASF4|WAVE2|dJ393P12.2 WASP family member 2 protein-coding 144.667-161 chr2 210781929 210782177 + 1 NA Intergenic Intergenic 164482 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 151.333-289 chr3 138478037 138478320 + 1 NA non-coding (NR_136409, exon 23 of 23) non-coding (NR_136409, exon 23 of 23) 43562 NM_001322834 83850 Hs.477711 NM_031913 ENSG00000158220 ESYT3 CHR3SYT|E-Syt3|FAM62C extended synaptotagmin 3 protein-coding 147.333-181 chr2 217019767 217019938 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 149080 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 191.333-137 chr3 186437388 186437749 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2777 NR_151710 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 125.667-131 chr4 45377495 45377695 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -650961 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 120.667-100 chr2 124222773 124222928 + 1 NA intron (NM_130773, intron 2 of 23) intron (NM_130773, intron 2 of 23) 197563 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 158.333-224 chr3 197330140 197330303 + 1 NA Intergenic Intergenic -30900 NM_001366203 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 222.333-56 chr22 22834007 22834418 + 1 NA Intergenic Intergenic 11436 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 172.667-110 chr4 79385165 79385402 + 1 NA Intergenic Intergenic 22945 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 239.333-30 chr13 87395437 87395722 + 1 NA Intergenic Intergenic 223161 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 206.667-115 chr5 91722545 91722819 + 1 NA Intergenic Intergenic -339365 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 188.667-16 chr1 229906631 229906915 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -12865 NR_146475 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 233.333-99 chr4 119473609 119474084 + 1 NA intron (NR_037630, intron 5 of 8) intron (NR_037630, intron 5 of 8) 19063 NR_037630 645513 Hs.677546 NR_037630 ENSG00000245958 LOC645513 - septin 7 pseudogene pseudo 136.333-7 chr1 109171037 109171304 + 1 NA intron (NM_001284352, intron 2 of 20) MIRb|SINE|MIR -15379 NM_001284353 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 136.667-121 chr3 134579675 134579844 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 71259 NM_001366276 339855 Hs.146730 NM_178554 ENSG00000174611 KY MFM7 kyphoscoliosis peptidase protein-coding 154.667-104 chr14 42661723 42661941 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 1054976 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 227.667-40 chr20 11997723 11997999 + 1 NA Intergenic Intergenic 79968 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 280.667-12 chr10 43860756 43861251 + 1 NA intron (NR_038268, intron 1 of 4) intron (NR_038268, intron 1 of 4) 1592 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 229.667-38 chr18 12475481 12475864 + 1 NA intron (NM_020148, intron 9 of 15) intron (NM_020148, intron 9 of 15) 42898 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 162.333-98 chr18 8343731 8343910 + 1 NA intron (NM_002845, intron 21 of 30) intron (NM_002845, intron 21 of 30) 23214 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 149.667-405 chr8 104021076 104021252 + 1 NA intron (NR_145710, intron 24 of 29) intron (NR_145710, intron 24 of 29) 201944 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 207.667-29 chr14 37493058 37493480 + 1 NA intron (NM_138731, intron 12 of 13) intron (NM_138731, intron 12 of 13) 101980 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 178.667-128 chr5 43563859 43564122 + 1 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -6571 NM_183323 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 265.333-83 chr8 72971784 72972261 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -36842 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 137.667-60 chr14 73814139 73814282 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 15925 NR_135238 100506498 Hs.569330 NR_135238 ENSG00000258586 LINC02274 - long intergenic non-protein coding RNA 2274 ncRNA 248.667-81 chr4 61518357 61518820 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) intron (NM_001371343, intron 4 of 23) 316416 NM_001371342 180.333-24 chr12 28685390 28685693 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -463737 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 232.667-75 chr8 72721676 72721948 + 1 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) -10233 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 157.333-189 chr2 83097333 83097586 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 240656 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 159.333-38 chr10 25685531 25685798 + 1 NA intron (NR_108067, intron 2 of 4) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 33952 NR_108069 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 143.333-236 chr5 175601257 175601555 + 1 NA Intergenic (TATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -56665 NR_160284 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 223.667-24 chr15 57659825 57660163 + 1 NA intron (NR_104367, intron 11 of 15) L1MC5|LINE|L1 -46527 NM_001018102 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 155.667-160 chr2 44146457 44146622 + 1 NA Intergenic Intergenic -22264 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 166.667-91 chr17 70741105 70741403 + 1 NA Intergenic Intergenic 460925 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 227.667-32 chr2 28437037 28437514 + 1 NA Intergenic Intergenic -42603 NR_103831 403150 Hs.562970 NR_103831 ENSG00000229951 FLJ31356 - uncharacterized protein FLJ31356 ncRNA 141.333-124 chr2 209053740 209053996 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -370179 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 266.333-26 chr17 40041947 40042273 + 1 NA intron (NR_052017, intron 3 of 24) L2|LINE|L2 12298 NM_014815 9862 Hs.462983 NM_014815 ENSG00000008838 MED24 ARC100|CRSP100|CRSP4|DRIP100|MED5|THRAP4|TRAP100 mediator complex subunit 24 protein-coding 220.333-130 chr8 108549768 108550087 + 1 NA Intergenic Intergenic 106303 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 130.333-164 chr5 45039236 45039401 + 1 NA Intergenic Intergenic 230371 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 229.333-64 chr2 55785108 55785410 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -91415 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 164.667-163 chr4 65609845 65610046 + 1 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) intron (NM_001281767, intron 2 of 16) 59543 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 282.333-46 chr5 61670095 61670462 + 1 NA intron (NR_109910, intron 6 of 7) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 28154 NR_109910 101928651 Hs.662309 NR_109910 ENSG00000248529 LOC101928651 - uncharacterized LOC101928651 ncRNA 144.333-243 chr7 9994087 9994341 + 1 NA Intergenic Intergenic 359944 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 149.333-31 chr1 200587068 200587261 + 1 NA intron (NM_014875, intron 18 of 29) intron (NM_014875, intron 18 of 29) 31674 NM_001305792 9928 Hs.3104 NM_014875 ENSG00000118193 KIF14 MCPH20|MKS12 kinesin family member 14 protein-coding 137.667-107 chr2 222158724 222159000 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -139285 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 202.667-27 chr11 37132867 37133157 + 1 NA Intergenic Intergenic -534733 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 181.333-91 chr20 46224915 46225160 + 1 NA intron (NM_021248, intron 4 of 11) L2c|LINE|L2 83461 NM_021248 64405 Hs.472861 NM_021248 ENSG00000149654 CDH22 C20orf25|dJ998H6.1 cadherin 22 protein-coding 153.333-394 chr7 137610467 137610643 + 1 NA intron (NM_001321710, intron 8 of 32) intron (NM_001321710, intron 8 of 32) 235777 NM_001321709 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 241.667-57 chr3 171463775 171464127 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -3543 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 136.333-30 chr11 9026136 9026310 + 1 NA intron (NM_001170690, intron 15 of 17) MIRb|SINE|MIR -22222 NM_020645 56675 Hs.523467 NM_020645 ENSG00000175352 NRIP3 C11orf14|NY-SAR-105 nuclear receptor interacting protein 3 protein-coding 288.333-35 chr7 51179751 51180237 + 1 NA intron (NM_015198, intron 5 of 12) LTR49-int|LTR|ERV1 136815 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 207.333-257 chr7 93309539 93309843 + 1 NA intron (NM_001257998, intron 20 of 28) intron (NM_001257998, intron 20 of 28) 77325 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 127.667-20 chr10 78382021 78382217 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie 114777 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 246.333-87 chr6 68238006 68238299 + 1 NA intron (NR_125854, intron 3 of 3) intron (NR_125854, intron 3 of 3) 91747 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 231.333-13 chr1 247606841 247607225 + 1 NA TTS (NM_001001914) TTS (NM_001001914) 1447 NM_001001914 81469 Hs.653227 NM_001001914 ENSG00000177476 OR2G3 OR1-33 olfactory receptor family 2 subfamily G member 3 protein-coding 142.667-151 chr4 31247259 31247420 + 1 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 76195 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 273.333-19 chr14 20867806 20868225 + 1 NA Intergenic Intergenic -23388 NM_002935 6037 Hs.73839 NM_002935 ENSG00000169397 RNASE3 ECP|RAF1|RNS3 ribonuclease A family member 3 protein-coding 154.333-377 chr9 130179184 130179488 + 1 NA intron (NM_014286, intron 1 of 7) L1ME4a|LINE|L1 6932 NM_014286 23413 Hs.642946 NM_014286 ENSG00000107130 NCS1 FLUP|FREQ neuronal calcium sensor 1 protein-coding 162.667-71 chr13 58722877 58723104 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -489873 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 316.667-31 chr8 28762397 28762870 + 1 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 61132 NR_073469 2137 Hs.491354 NM_001440 ENSG00000012232 EXTL3 BOTV|EXTL1L|EXTR1|ISDNA|REGR|RPR exostosin like glycosyltransferase 3 protein-coding 147.333-81 chr12 42487380 42487609 + 1 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) -3484 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 239.333-109 chr8 140431971 140432337 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 4 of 22) intron (NM_001160372, intron 4 of 22) 25590 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 130.333-6 chr1 33683521 33683731 + 1 NA intron (NM_052896, intron 25 of 69) intron (NM_052896, intron 25 of 69) -176849 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 220.667-100 chr8 14068801 14069104 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 439262 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 187.333-96 chr2 61357587 61357932 + 1 NA intron (NM_014709, intron 10 of 79) AluJr4|SINE|Alu 59618 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 279.667-49 chr9 83582269 83582597 + 1 NA Intergenic Intergenic -40616 NM_001256915 414328 Hs.530261 NM_001001551 ENSG00000148057 IDNK C9orf103|bA522I20.2|hGntK IDNK gluconokinase protein-coding 140.667-225 chr8 49040032 49040209 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -14216 NM_001256596 492307 Hs.49890 NM_001007176 ENSG00000168333 PPDPFL C8orf22 pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor like protein-coding 224.667-3 chr1 227274868 227275224 + 1 NA intron (NM_001366019, intron 1 of 36) L1MEd|LINE|L1 43446 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 153.333-118 chr14 58333985 58334212 + 1 NA intron (NM_002892, intron 11 of 23) intron (NM_002892, intron 11 of 23) 35543 NM_002892 5926 Hs.161000 NM_002892 ENSG00000032219 ARID4A RBBP-1|RBBP1|RBP-1|RBP1 AT-rich interaction domain 4A protein-coding 151.333-27 chr1 163845902 163846125 + 1 NA Intergenic Intergenic -422822 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 174.667-61 chr15 82661618 82662041 + 1 NA exon (NM_001348441, exon 2 of 4) exon (NM_001348441, exon 2 of 4) 846 NM_001348441 8120 Hs.199593 NM_004644 ENSG00000103723 AP3B2 EIEE48|NAPTB adaptor related protein complex 3 subunit beta 2 protein-coding 218.333-36 chr14 34308552 34308800 + 1 NA Intergenic Intergenic 153564 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 177.667-138 chr8 134141991 134142279 + 1 NA Intergenic Intergenic 255639 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 131.667-212 chr9 30660002 30660154 + 1 NA Intergenic Intergenic -251624 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 131.333-195 chr9 87136673 87136905 + 1 NA Intergenic Intergenic -11855 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 227.667-41 chr20 44415369 44415658 + 1 NA intron (NM_001287183, intron 6 of 10) intron (NM_001287183, intron 6 of 10) 7393 NR_037419 100500813 NR_037419 ENSG00000266151 MIR3646 - microRNA 3646 ncRNA 159.333-19 chr1 174194642 174194831 + 1 NA intron (NM_001366445, intron 1 of 13) intron (NM_001366445, intron 1 of 13) 35216 NR_158981 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 155.333-122 chr16 10620068 10620291 + 1 NA Intergenic Intergenic -39581 NM_001424 2013 Hs.531561 NM_001424 ENSG00000213853 EMP2 XMP epithelial membrane protein 2 protein-coding 145.667-289 chr8 100008445 100008657 + 1 NA exon (NM_001286693, exon 13 of 26) exon (NM_001286693, exon 13 of 26) 3969 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 146.333-127 chr18 11157896 11158065 + 1 NA Intergenic Intergenic -9218 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 157.333-357 chr9 24603674 24603865 + 1 NA Intergenic MER124|DNA?|DNA? -57872 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 148.667-391 chr8 128501244 128501511 + 1 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 63302 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 184.333-166 chrX 68319341 68319697 + 1 NA intron (NM_002547, intron 2 of 24) AluJb|SINE|Alu 113976 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 132.333-9 chr1 186128924 186129178 + 1 NA intron (NM_031935, intron 83 of 106) intron (NM_031935, intron 83 of 106) -167222 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 155.333-336 chr6 115637720 115637962 + 1 NA intron (NR_134602, intron 1 of 3) intron (NR_134602, intron 1 of 3) 5994 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 193.667-37 chr12 124773583 124773852 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 65954 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 182.667-139 chr5 133747483 133747721 + 1 NA Intergenic Intergenic -135061 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 208.667-34 chr11 121321929 121322219 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 29206 NM_001024956 6309 Hs.287749 NM_006918 ENSG00000109929 SC5D ERG3|S5DES|SC5DL sterol-C5-desaturase protein-coding 186.333-54 chr15 57675207 57675585 + 1 NA intron (NM_001018091, intron 12 of 12) L2c|LINE|L2 -31125 NM_001018102 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 152.333-9 chr1 63666204 63666380 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 43076 NM_001172818 5236 Hs.1869 NM_002633 ENSG00000079739 PGM1 CDG1T|GSD14 phosphoglucomutase 1 protein-coding 176.333-73 chr2 9636642 9636943 + 1 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -5795 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 186.333-4 chr1 91981193 91981417 + 1 NA exon (NM_001242807, exon 10 of 18) exon (NM_001242807, exon 10 of 18) 29153 NM_001726 676 Hs.482520 NM_001726 ENSG00000137948 BRDT BRD6|CT9|SPGF21 bromodomain testis associated protein-coding 136.333-104 chr2 183959266 183959444 + 1 NA Intergenic Intergenic -419620 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 222.333-18 chr11 33571980 33572318 + 1 NA intron (NM_012194, intron 9 of 20) AluSz6|SINE|Alu 128591 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 148.333-230 chr20 51723199 51723435 + 1 NA intron (NM_006045, intron 3 of 27) L1PB1|LINE|L1 45073 NM_006045 10079 Hs.649234 NM_006045 ENSG00000054793 ATP9A ATPIIA ATPase phospholipid transporting 9A (putative) protein-coding 263.667-82 chr9 29255255 29255753 + 1 NA Intergenic Intergenic -41903 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 144.333-90 chr16 76677077 76677230 + 1 NA Intergenic MER65D|LTR|ERV1 42155 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 157.667-149 chr2 123183252 123183512 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -109901 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 205.667-43 chr13 109201783 109202063 + 1 NA intron (NM_015011, intron 34 of 34) L1PB1|LINE|L1 -34620 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 147.333 chr1 11987968 11988115 + 1 NA intron (NM_014874, intron 2 of 18) intron (NM_014874, intron 2 of 18) 7860 NM_001127660 9927 Hs.376681 NM_014874 ENSG00000116688 MFN2 CMT2A|CMT2A2|CMT2A2A|CMT2A2B|CPRP1|HMSN6A|HSG|MARF mitofusin 2 protein-coding 151.667-153 chr18 45277079 45277264 + 1 NA intron (NM_001371319, intron 4 of 23) intron (NM_001371319, intron 4 of 23) 64176 NM_001242692 8170 Hs.710927 NM_007163 ENSG00000132874 SLC14A2 HUT2|UT-A2|UT2|UTA|UTR|hUT-A6 solute carrier family 14 member 2 protein-coding 152.333-198 chr2 181709207 181709390 + 1 NA Intergenic Intergenic -28633 NM_002500 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 160.333-46 chr10 74737850 74738043 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -87309 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 163.333-44 chr10 100954066 100954290 + 1 NA intron (NM_018121, intron 17 of 19) AluJo|SINE|Alu -18351 NM_017893 57715 Hs.591923 NM_017893 ENSG00000095539 SEMA4G - semaphorin 4G protein-coding 237.667-12 chr10 121193552 121194008 + 1 NA Intergenic Intergenic 337534 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 220.333-41 chr15 65259373 65259622 + 1 NA exon (NM_017851, exon 6 of 6) exon (NM_017851, exon 6 of 6) 26094 NR_145768 109617003 NR_145768 ENSG00000206903 SNORA24B - small nucleolar RNA, H/ACA box 24B snoRNA 158.333-276 chr6 70348830 70349100 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -45237 NR_125857 101928353 NR_125857 EVADR - uncharacterized LOC101928353 ncRNA 253.333-120 chrX 106262820 106263178 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 94694 NM_001171020 139221 Hs.592221 NM_152423 ENSG00000157502 PWWP3B MUM1L1 PWWP domain containing 3B protein-coding 121.667-66 chr15 56224881 56225029 + 1 NA intron (NM_001370561, intron 4 of 11) intron (NM_001370561, intron 4 of 11) 18924 NM_001368073 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 172.667-105 chr4 44680365 44680547 + 1 NA exon (NM_021927, exon 2 of 17) exon (NM_021927, exon 2 of 17) 2036 NM_021927 60558 Hs.546419 NM_021927 ENSG00000151806 GUF1 EF-4|EF4|EIEE40 GUF1 homolog, GTPase protein-coding 146.333-67 chr12 120944100 120944266 + 1 NA Intergenic Intergenic 28109 NR_024345 283460 Hs.612351 NR_024345 ENSG00000241388 HNF1A-AS1 C12orf27|HAS1|NCRNA00262 HNF1A antisense RNA 1 ncRNA 167.333-255 chr8 79487764 79488002 + 1 NA Intergenic Intergenic -123234 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 269.667-42 chr6 15062372 15062851 + 1 NA Intergenic Intergenic -183458 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 153.667-256 chr3 95571417 95571713 + 1 NA Intergenic Intergenic 111628 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 151.333-61 chr10 82031916 82032096 + 1 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 154319 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 141.333-10 chr1 172039212 172039442 + 1 NA intron (NM_001278252, intron 7 of 14) intron (NM_001278252, intron 7 of 14) -99481 NR_036066 100422882 NR_036066 ENSG00000283152 MIR3120 mir-3120 microRNA 3120 ncRNA 186.333-15 chr10 52757007 52757291 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -1745 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 175.667-13 chr1 220959763 220959998 + 1 NA Intergenic Intergenic -79740 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 163.667-146 chr22 38154357 38154635 + 1 NA intron (NM_001349869, intron 2 of 16) L1M1|LINE|L1 27334 NM_001004426 8398 Hs.170479 NM_003560 ENSG00000184381 PLA2G6 CaI-PLA2|GVI|INAD1|IPLA2-VIA|NBIA2|NBIA2A|NBIA2B|PARK14|PLA2|PNPLA9|iPLA2|iPLA2beta phospholipase A2 group VI protein-coding 124.667-133 chr3 18858604 18858838 + 1 NA Intergenic Intergenic -289789 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 141.333-127 chr2 225789383 225789559 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -353323 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 128.667-169 chr7 107203406 107203614 + 1 NA TTS (NM_012257).2 TTS (NM_012257).2 34507 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 252.333-15 chr12 86114621 86114929 + 1 NA intron (NM_001351286, intron 4 of 7) intron (NM_001351286, intron 4 of 7) 141616 NM_001351289 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 152.667-64 chr11 82360647 82360803 + 1 NA intron (NR_120571, intron 1 of 7) intron (NR_120571, intron 1 of 7) 43188 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 164.333-161 chr3 107781140 107781408 + 1 NA intron (NM_020235, intron 13 of 16) intron (NM_020235, intron 13 of 16) 96794 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 205.333-264 chr9 126991685 126992028 + 1 NA intron (NM_001190729, intron 4 of 17) intron (NM_001190729, intron 4 of 17) 29631 NM_001366401 9649 Hs.432842 NM_014636 ENSG00000136828 RALGPS1 RALGEF2|RALGPS1A Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1 protein-coding 226.333-31 chr14 66007319 66007744 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -478840 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 164.333-73 chr15 41690344 41690663 + 1 NA intron (NM_001164273, intron 2 of 23) L1MB8|LINE|L1 -1082 NR_030356 693211 NR_030356 ENSG00000207766 MIR626 MIRN626|hsa-mir-626 microRNA 626 ncRNA 250.333-62 chr6 37467286 37467674 + 1 NA intron (NM_015050, intron 13 of 23) L1MEf|LINE|L1 32413 NM_138493 154467 Hs.284207 NM_138493 ENSG00000198937 CCDC167 C6orf129|HSPC265 coiled-coil domain containing 167 protein-coding 184.333-98 chr3 19137763 19138084 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10587 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 205.333-19 chr1 171411736 171412137 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 73040 NR_002719 7151 Hs.661092 NR_002719 TOP1P1 - DNA topoisomerase I pseudogene 1 pseudo 157.333-21 chr1 115003155 115003437 + 1 NA Intergenic Intergenic -26528 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 306.333-13 chr12 3806824 3807323 + 1 NA Intergenic Intergenic -53964 NM_001144958 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 447.667-5 chr6 35646694 35647214 + 1 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) 17835 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 147.667-116 chr15 89610746 89611003 + 1 NA intron (NM_001308025, intron 15 of 21) L1M4|LINE|L1 35287 NM_001308025 90381 Hs.441708 NM_152259 ENSG00000140534 TICRR C15orf42|SLD3|Treslin TOPBP1 interacting checkpoint and replication regulator protein-coding 284.333-7 chr11 12277934 12278313 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -8777 NM_032867 84953 Hs.60371 NM_032867 ENSG00000133816 MICALCL Ebitein1 MICAL C-terminal like protein-coding 123.333-68 chr13 70720131 70720356 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -294898 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 147.667-103 chr14 60464613 60464901 + 1 NA intron (NM_174978, intron 11 of 17) L1MEi|LINE|L1 21306 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 197.333-84 chr17 54789734 54790054 + 1 NA Intergenic Intergenic -110797 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 167.667-168 chr5 61713829 61714206 + 1 NA intron (NR_126524, intron 3 of 3) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -15585 NR_109910 101928651 Hs.662309 NR_109910 ENSG00000248529 LOC101928651 - uncharacterized LOC101928651 ncRNA 114.333-95 chr19 10153087 10153280 + 1 NA intron (NM_001379, intron 21 of 39) L1ME3Cz|LINE|L1 -33284 NM_003755 8666 Hs.529059 NM_003755 ENSG00000130811 EIF3G EIF3-P42|EIF3S4|eIF3-delta|eIF3-p44 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G protein-coding 256.667-49 chr2 188726684 188727017 + 1 NA Intergenic (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 63273 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 314.667 chr1 60553028 60553487 + 1 NA intron (NR_146508, intron 4 of 7) L1MEg|LINE|L1 69428 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 140.333-174 chr5 7919566 7919789 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 50529 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 143.667-20 chr10 31339189 31339404 + 1 NA intron (NM_001323675, intron 1 of 6) intron (NM_001323675, intron 1 of 6) 17636 NM_001323673 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 142.667-56 chr14 67591553 67591742 + 1 NA intron (NM_004569, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu 8621 NM_004569 5283 Hs.553497 NM_004569 ENSG00000100564 PIGH GPI-H phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class H protein-coding 171.667-126 chr4 116129832 116130218 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -169700 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 141.333-26 chr10 74438571 74438779 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) intron (NM_001369124, intron 6 of 9) 90649 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 137.333-53 chr15 66712759 66712969 + 1 NA intron (NM_005585, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 10628 NR_027654 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 264.333-57 chr4 112598523 112599101 + 1 NA intron (NM_001350397, intron 9 of 26) AluJb|SINE|Alu -38152 NM_001267039 51574 Hs.713663 NM_015454 ENSG00000174720 LARP7 ALAZS|HDCMA18P|PIP7S La ribonucleoprotein domain family member 7 protein-coding 265.333-74 chr7 15591525 15592044 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -29769 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 282.667-2 chr10 60905530 60906070 + 1 NA intron (NM_001350906, intron 5 of 12) intron (NM_001350906, intron 5 of 12) 38385 NM_001350910 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 141.667-56 chr12 40216249 40216404 + 1 NA Intergenic Intergenic -8671 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 247.667-48 chr2 58945319 58945678 + 1 NA intron (NR_033873, intron 6 of 13) L1MEc|LINE|L1 -272210 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 158.333-96 chr15 55673550 55673796 + 1 NA exon (NM_173814, exon 10 of 20) exon (NM_173814, exon 10 of 20) 69479 NM_173814 283659 Hs.130957 NM_173814 ENSG00000166450 PRTG IGDCC5 protogenin protein-coding 168.667-226 chr8 117269627 117269902 + 1 NA Intergenic Intergenic 134769 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 209.667-70 chr2 157897865 157898197 + 1 NA Intergenic Intergenic -21701 NM_001111067 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 136.667-59 chr14 64186700 64186934 + 1 NA intron (NM_015180, intron 97 of 114) intron (NM_015180, intron 97 of 114) -27327 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 157.333-42 chr10 24448934 24449216 + 1 NA promoter-TSS (NM_001282769) promoter-TSS (NM_001282769) -339 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 158.667-363 chrX 132199959 132200187 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 17960 NM_021183 57826 Hs.119889 NM_021183 ENSG00000123728 RAP2C - RAP2C, member of RAS oncogene family protein-coding 156.333-68 chr12 2038016 2038279 + 1 NA Intergenic Intergenic -10205 NR_046768 100874369 Hs.208723 NR_046768 ENSG00000256257 CACNA1C-IT2 - CACNA1C intronic transcript 2 ncRNA 190.333-79 chr2 206518946 206519170 + 1 NA intron (NM_003812, intron 3 of 25) intron (NM_003812, intron 3 of 25) 75526 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 150.667-302 chr5 61522419 61522606 + 1 NA intron (NM_020928, intron 5 of 13) intron (NM_020928, intron 5 of 13) -115248 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 148.333-345 chr6 119994270 119994561 + 1 NA Intergenic Intergenic -20764 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 160.667-159 chr2 140316354 140316654 + 1 NA intron (NM_018557, intron 82 of 90) intron (NM_018557, intron 82 of 90) 270181 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 188.667-13 chr1 163985906 163986229 + 1 NA Intergenic Intergenic -562876 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 149.333-409 chr8 130181635 130181785 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 7 of 29) intron (NM_001362925, intron 7 of 29) -96942 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 206.667-50 chr17 61174506 61174821 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L1MA7|LINE|L1 193041 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 117.667-125 chr3 182553934 182554178 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -46932 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 172.667-59 chr15 62202956 62203178 + 1 NA non-coding (NR_148210, exon 1 of 4) non-coding (NR_148210, exon 1 of 4) 251 NR_148210 107984784 Hs.591131 NR_148210 ENSG00000259697 LOC107984784 - uncharacterized LOC107984784 ncRNA 118.667-195 chr8 110737114 110737240 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 290256 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 161.333-181 chr3 16293559 16293730 + 1 NA intron (NM_001330670, intron 5 of 8) L1MB8|LINE|L1 28432 NM_138381 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 149.667-156 chr17 47151467 47151678 + 1 NA intron (NM_001256, intron 9 of 18) intron (NM_001256, intron 9 of 18) 37723 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 211.333-9 chr1 96031695 96031985 + 1 NA Intergenic Intergenic 39772 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 156.667-55 chr10 122043189 122043400 + 1 NA intron (NM_206862, intron 2 of 22) intron (NM_206862, intron 2 of 22) 54131 NM_206862 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 228.667-9 chr10 68319862 68320188 + 1 NA intron (NM_001033083, intron 1 of 8) AluSp|SINE|Alu -11668 NM_001322445 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 172.333-154 chr6 37351011 37351282 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -2837 NM_183078 9025 Hs.485278 NM_003958 ENSG00000112130 RNF8 hRNF8 ring finger protein 8 protein-coding 155.667-163 chr2 56872977 56873213 + 1 NA Intergenic Intergenic -687325 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 207.667-102 chr5 169679548 169679947 + 1 NA intron (NR_156756, intron 6 of 52) intron (NR_156756, intron 6 of 52) 42472 NM_004946 1794 Hs.586174 NM_004946 ENSG00000134516 DOCK2 IMD40 dedicator of cytokinesis 2 protein-coding 217.667-75 chr6 4184522 4184926 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 5305 NR_125874 102724096 Hs.571140 NR_125874 LOC102724096 - uncharacterized LOC102724096 ncRNA 295.667-34 chr8 88508569 88508907 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -181255 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 155.667-51 chr11 57828083 57828304 + 1 NA Intergenic Intergenic 66391 NM_001206890 1500 Hs.166011 NM_001331 ENSG00000198561 CTNND1 BCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN) catenin delta 1 protein-coding 236.667-74 chr6 115296325 115296673 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 347336 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 261.667-16 chr13 92744722 92745080 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -23287 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 206.333-101 chr21 14526568 14526804 + 1 NA intron (NM_001286523, intron 1 of 8) intron (NM_001286523, intron 1 of 8) 19629 NM_022136 64092 Hs.473341 NM_022136 ENSG00000155307 SAMSN1 HACS1|NASH1|SASH2|SH3D6B|SLy2 SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 protein-coding 166.333-27 chr10 51780946 51781127 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -81441 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 150.333-412 chr8 107265018 107265191 + 1 NA intron (NM_001199859, intron 7 of 8) intron (NM_001199859, intron 7 of 8) 71411 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 168.667-105 chr2 101809059 101809372 + 1 NA intron (NM_145686, intron 3 of 30) intron (NM_145686, intron 3 of 30) 111508 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 165.333-203 chr5 38339299 38339629 + 1 NA intron (NM_152403, intron 3 of 21) intron (NM_152403, intron 3 of 21) -48478 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 165.333-62 chr12 100239505 100239824 + 1 NA TTS (NM_001364818) TTS (NM_001364818) 27415 NM_152317 120863 Hs.653118 NM_152317 ENSG00000166153 DEPDC4 DEP.4 DEP domain containing 4 protein-coding 140.667-158 chr4 36166710 36166868 + 1 NA intron (NR_146894, intron 10 of 32) intron (NR_146894, intron 10 of 32) 77150 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 121.333-127 chr4 32187354 32187543 + 1 NA Intergenic Intergenic -163590 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 156.667-62 chr11 73711723 73712008 + 1 NA intron (NM_198896, intron 5 of 7) L1MC5|LINE|L1 48228 NM_001243719 5870 Hs.503222 NM_002869 ENSG00000175582 RAB6A RAB6 RAB6A, member RAS oncogene family protein-coding 162.667-43 chr11 11743692 11743868 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 39442 NR_107037 102465870 NR_107037 ENSG00000278529 MIR8070 hsa-mir-8070 microRNA 8070 ncRNA 131.333-164 chr7 42726500 42726705 + 1 NA Intergenic Intergenic -20155 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 156.667-272 chr5 89089405 89089579 + 1 NA intron (NR_136221, intron 3 of 6) intron (NR_136221, intron 3 of 6) -185387 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 147.667-303 chr6 16132919 16133173 + 1 NA intron (NM_013262, intron 2 of 6) intron (NM_013262, intron 2 of 6) 3960 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 184.667-72 chr21 43027507 43027853 + 1 NA intron (NM_004571, intron 9 of 10) AluSc|SINE|Alu 40724 NM_001321072 875 Hs.533013 NM_000071 ENSG00000160200 CBS CBSL|HIP4 cystathionine-beta-synthase protein-coding 137.333-108 chr20 1888968 1889200 + 1 NA Intergenic Intergenic -5083 NM_001330728 140885 Hs.581021 NM_080792 ENSG00000198053 SIRPA BIT|CD172A|MFR|MYD-1|P84|PTPNS1|SHPS1|SIRP signal regulatory protein alpha protein-coding 166.333-130 chr2 215917877 215918151 + 1 NA Intergenic Intergenic -74478 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 158.333-179 chr20 62078719 62078943 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13021 NM_003185 6874 Hs.18857 NM_003185 ENSG00000130699 TAF4 TAF2C|TAF2C1|TAF4A|TAFII130|TAFII135 TATA-box binding protein associated factor 4 protein-coding 146.667-185 chr2 196098043 196098291 + 1 NA Intergenic Intergenic -29330 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 139.333-189 chr6 36065573 36065740 + 1 NA intron (NM_139012, intron 3 of 11) intron (NM_139012, intron 3 of 11) 37848 NM_139013 1432 Hs.485233 NM_001315 ENSG00000112062 MAPK14 CSBP|CSBP1|CSBP2|CSPB1|EXIP|Mxi2|PRKM14|PRKM15|RK|SAPK2A|p38|p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 protein-coding 177.667-85 chr21 20766867 20767176 + 1 NA intron (NR_109786, intron 6 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 36087 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 155.333-110 chr14 66487588 66487753 + 1 NA intron (NM_001351576, intron 2 of 9) intron (NM_001351576, intron 2 of 9) 1299 NR_110308 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 178.667-34 chr12 29827042 29827220 + 1 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -42372 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 150.667-284 chr4 157646149 157646302 + 1 NA Intergenic Intergenic 73735 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 237.333-5 chr1 115682142 115682551 + 1 NA intron (NM_001172411, intron 4 of 7) intron (NM_001172411, intron 4 of 7) 39717 NM_001172412 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 119.667-60 chr15 92396864 92397030 + 1 NA intron (NM_001330416, intron 1 of 4) intron (NM_001330416, intron 1 of 4) 3060 NM_001330416 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 142.333-105 chr18 8195861 8196116 + 1 NA intron (NM_002845, intron 14 of 30) intron (NM_002845, intron 14 of 30) 171046 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 148.667-66 chr11 22742891 22743115 + 1 NA intron (NM_005256, intron 4 of 6) intron (NM_005256, intron 4 of 6) 68229 NM_005256 2620 Hs.711297 NM_005256 ENSG00000148935 GAS2 GAS-2 growth arrest specific 2 protein-coding 231.333-86 chr5 36965404 36965651 + 1 NA intron (NM_015384, intron 6 of 45) L1MA4|LINE|L1 88758 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 171.667-22 chr10 91109040 91109247 + 1 NA Intergenic Intergenic 43937 NR_002779 119369 Hs.441287 NR_002779 NUDT9P1 C10orf98|bA56M3.1 nudix hydrolase 9 pseudogene 1 pseudo 298.333-9 chr14 53314251 53314682 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 161112 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 215.333-32 chr11 48086911 48087253 + 1 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) -9700 NR_036119 100423000 NR_036119 ENSG00000263693 MIR3161 - microRNA 3161 ncRNA 150.667-38 chr10 50512060 50512220 + 1 NA intron (NM_147156, intron 3 of 10) intron (NM_147156, intron 3 of 10) 111816 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 210.667-78 chr20 59714724 59715011 + 1 NA intron (NM_001199506, intron 1 of 12) L1ME3A|LINE|L1 -6343 NM_183244 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 195.333-176 chr5 65912336 65912665 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -14054 NM_001006600 55914 Hs.591774 NM_018695 ENSG00000112851 ERBIN ERBB2IP|HEL-S-78|LAP2 erbb2 interacting protein protein-coding 318.667-16 chr17 62994891 62995324 + 1 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) Looper|DNA|PiggyBac 28872 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 157.333-10 chr1 71577425 71577619 + 1 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) intron (NM_173808, intron 6 of 6) 259490 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 166.333-60 chr12 131217739 131218007 + 1 NA Intergenic Intergenic 52862 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 159.667-271 chr5 130004950 130005140 + 1 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 100580 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 119.333-97 chr15 71584826 71585023 + 1 NA intron (NM_001286429, intron 1 of 11) L1MA9|LINE|L1 37688 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 167.333-175 chr3 83931393 83931698 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 938030 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 212.667-107 chr5 94551966 94552283 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 2 of 20) L1M2|LINE|L1 66480 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 309.333-18 chr14 67228292 67228791 + 1 NA TTS (NM_173526) TTS (NM_173526) -12894 NM_022474 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 153.667-85 chr12 19605003 19605218 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 164511 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 154.333-196 chr22 25149192 25149386 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) -36597 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 214.667-24 chr11 68775501 68775846 + 1 NA intron (NM_001031847, intron 12 of 18) intron (NM_001031847, intron 12 of 18) -24153 NM_004923 9633 Hs.145932 NM_004923 ENSG00000132749 TESMIN CXCDC2|MTL5|MTLT testis expressed metallothionein like protein protein-coding 133.333-127 chr4 60670845 60670993 + 1 NA Intergenic Intergenic -251700 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 206.667-53 chr18 1898097 1898333 + 1 NA Intergenic Intergenic -538586 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 236.667-80 chr7 25315608 25315911 + 1 NA Intergenic Intergenic -87273 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 202.333-10 chr1 71593937 71594263 + 1 NA intron (NM_173808, intron 5 of 6) intron (NM_173808, intron 5 of 6) 242912 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 139.333-84 chr16 54934226 54934465 + 1 NA 3' UTR (NM_001252197, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001252197, exon 3 of 3) 3146 NM_001252197 10265 Hs.435730 NM_005853 ENSG00000176842 IRX5 HMMS|IRX-2a|IRXB2 iroquois homeobox 5 protein-coding 150.667-354 chr7 86649454 86649673 + 1 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 5649 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 235.667-36 chr2 226130142 226130562 + 1 NA Intergenic Intergenic -12442 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 143.333-166 chr22 24489972 24490140 + 1 NA intron (NR_028483, intron 1 of 7) L1MA2|LINE|L1 5018 NR_028483 646023 Hs.632761 NM_001039784 ENSG00000178803 ADORA2A-AS1 C22orf45 ADORA2A antisense RNA 1 ncRNA 163.667-121 chr2 164028802 164029038 + 1 NA Intergenic Intergenic -292912 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 155.333-113 chr14 79293956 79294221 + 1 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 14708 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 119.333-101 chr16 8053718 8053887 + 1 NA Intergenic Intergenic 536036 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 153.667-30 chr1 229323350 229323543 + 1 NA 3' UTR (NM_145257, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_145257, exon 4 of 4) 19064 NM_006542 10638 Hs.296169 NM_006542 ENSG00000213029 SPHAR - S-phase response (cyclin related) protein-coding 150.667-79 chr11 102705537 102705747 + 1 NA exon (NM_022122, exon 1 of 10) exon (NM_022122, exon 1 of 10) 127 NM_022122 64066 Hs.534479 NM_022122 ENSG00000137675 MMP27 MMP-27 matrix metallopeptidase 27 protein-coding 201.667-109 chr6 150643959 150644303 + 1 NA intron (NM_001329804, intron 2 of 17) intron (NM_001329804, intron 2 of 17) 11167 NR_138140 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 160.667-312 chr8 121550795 121550960 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -88469 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 158.667-34 chr10 27138427 27138609 + 1 NA intron (NM_001253866, intron 3 of 17) L1M5|LINE|L1 15866 NM_014263 10730 Hs.74647 NM_014263 ENSG00000136758 YME1L1 FTSH|MEG4|OPA11|PAMP|YME1L YME1 like 1 ATPase protein-coding 182.333-75 chr2 13914419 13914714 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 486392 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 177.667-98 chr4 62065966 62066211 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 23 of 23) intron (NM_001371343, intron 23 of 23) 95677 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 152.667-126 chr15 86708791 86709029 + 1 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -223970 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 209.667-95 chr5 117617232 117617552 + 1 NA Intergenic Intergenic -112969 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 175.333-140 chr5 53574213 53574566 + 1 NA intron (NR_134475, intron 2 of 5) L1MB8|LINE|L1 13750 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 193.667-45 chr14 81298504 81298808 + 1 NA intron (NM_001366850, intron 5 of 7) intron (NM_001366850, intron 5 of 7) -77266 NM_201595 2957 Hs.592334 NM_015859 ENSG00000165417 GTF2A1 TF2A1|TFIIA|TFIIA-42|TFIIAL general transcription factor IIA subunit 1 protein-coding 268.333-55 chr8 122136247 122136569 + 1 NA Intergenic Intergenic 432236 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 150.667-405 chrX 40652579 40652818 + 1 NA intron (NM_004229, intron 30 of 30) intron (NM_004229, intron 30 of 30) -5137 NM_144970 159013 Hs.495961 NM_144970 ENSG00000185753 CXorf38 - chromosome X open reading frame 38 protein-coding 162.333-265 chr8 138443119 138443430 + 1 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 53987 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 186.667-92 chr3 97313003 97313311 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) L1MA7|LINE|L1 -126450 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 201.333-267 chr7 85598424 85598804 + 1 NA Intergenic Intergenic 177492 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 162.333-176 chr3 196609349 196609629 + 1 NA Intergenic Intergenic 23098 NR_132101 101929769 Hs.518527 NR_132101 ENSG00000232065 LINC01063 - long intergenic non-protein coding RNA 1063 ncRNA 284.667-61 chrX 20888984 20889323 + 1 NA Intergenic Intergenic -485265 NM_001330770 22866 Hs.555917 NM_014927 ENSG00000149970 CNKSR2 CNK2|KSR2|MAGUIN|MRXSHG connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 protein-coding 161.667-117 chr2 11768197 11768398 + 1 NA TTS (NR_036071) TTS (NR_036071) 853 NR_036071 100422862 NR_036071 ENSG00000265056 MIR548S - microRNA 548s ncRNA 202.667-119 chr5 102315651 102316034 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -19558 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 134.667-176 chr6 136149290 136149535 + 1 NA intron (NM_018945, intron 5 of 12) intron (NM_018945, intron 5 of 12) -76585 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 144.667-221 chr4 112005100 112005289 + 1 NA Intergenic Intergenic -140260 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 153.333-185 chr2 10110662 10110868 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -11803 NM_001165931 6241 Hs.226390 NM_001034 ENSG00000171848 RRM2 R2|RR2|RR2M ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 protein-coding 184.333-39 chr14 60007988 60008264 + 1 NA exon (NM_001355272, exon 23 of 33) exon (NM_001355272, exon 23 of 33) -83785 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 157.333-58 chr10 108723269 108723429 + 1 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -654056 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 299.667-33 chr7 7910515 7910904 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 58043 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 143.667-135 chr2 148838633 148838867 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -36477 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 223.667-10 chr10 48682605 48682912 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -2115 NM_001370153 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 157.667-93 chr13 100395923 100396123 + 1 NA intron (NR_148027, intron 20 of 23) intron (NR_148027, intron 20 of 23) 84992 NR_047686 100885777 Hs.662554 NR_047686 PCCA-AS1 - PCCA antisense RNA 1 ncRNA 204.333-152 chr5 12791486 12791722 + 1 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 123745 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 175.667-91 chr22 45205264 45205463 + 1 NA intron (NM_001009880, intron 4 of 9) intron (NM_001009880, intron 4 of 9) -4344 NR_031651 100302149 NR_031651 ENSG00000221598 MIR1249 MIRN1249|hsa-mir-1249 microRNA 1249 ncRNA 166.333-220 chr8 65807303 65807612 + 1 NA intron (NM_001242318, intron 1 of 12) L1M4|LINE|L1 -18400 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 143.333-111 chr16 85756572 85756740 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5560 NR_161452 404550 Hs.461655 NM_206967 ENSG00000154102 C16orf74 - chromosome 16 open reading frame 74 protein-coding 161.667-219 chr6 13665970 13666279 + 1 NA intron (NM_005493, intron 2 of 13) L1ME2z|LINE|L1 45711 NM_005493 10048 Hs.708182 NM_005493 ENSG00000010017 RANBP9 BPM-L|BPM90|RANBPM|RanBP7 RAN binding protein 9 protein-coding 163.667-79 chr16 71517931 71518099 + 1 NA TTS (NR_135171) TTS (NR_135171) 4204 NR_135172 105371335 Hs.564879 NR_135171 ENSG00000260520 LOC105371335 - uncharacterized LOC105371335 ncRNA 135.667-146 chr5 124999529 124999830 + 1 NA Intergenic Intergenic -37152 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 308.333-31 chr5 124389088 124389670 + 1 NA intron (NR_125774, intron 3 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 49141 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 201.333-156 chr2 166104978 166105261 + 1 NA intron (NR_110260, intron 2 of 11) intron (NR_110260, intron 2 of 11) 22901 NM_006920 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 214.333-161 chr8 142720500 142720905 + 1 NA intron (NR_038925, intron 1 of 2) intron (NR_038925, intron 1 of 2) 6271 NR_038925 100288181 Hs.716823 NR_038925 ENSG00000253741 LNCOC1 Lnc-OC1 lncRNA associated with ovarian cancer 1 ncRNA 146.333-331 chr8 113521163 113521347 + 1 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -84316 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 161.667-137 chr2 121634956 121635245 + 1 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) FRAM|SINE|Alu 14362 NM_015282 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 151.667-122 chr15 47254086 47254256 + 1 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) L1MA6|LINE|L1 70082 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 297.333-42 chr4 55199086 55199586 + 1 NA Intergenic Ricksha_b|DNA|MULE-MuDR -73741 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 187.667-116 chr5 18089044 18089347 + 1 NA Intergenic Intergenic 281921 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 244.667-26 chr11 91198829 91199153 + 1 NA Intergenic Intergenic -329789 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 180.333-40 chr15 70540661 70540902 + 1 NA Intergenic Intergenic -34853 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 249.667-3 chr1 51973486 51973835 + 1 NA intron (NM_002867, intron 2 of 4) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 17040 NM_002867 5865 Hs.123072 NM_002867 ENSG00000169213 RAB3B - RAB3B, member RAS oncogene family protein-coding 149.667-352 chr6 80725859 80726049 + 1 NA Intergenic Intergenic 619283 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 238.333-39 chr19 48247596 48248014 + 1 NA intron (NM_001351782, intron 3 of 14) intron (NM_001351782, intron 3 of 14) 1828 NR_033678 22900 Hs.68846 NM_014959 ENSG00000105483 CARD8 CARDINAL|DACAR|DAKAR|NDPP|NDPP1|TUCAN caspase recruitment domain family member 8 protein-coding 317.333-32 chr5 111903233 111903629 + 1 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -9077 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 153.667-142 chr15 100038937 100039108 + 1 NA intron (NM_139057, intron 18 of 21) L1MB8|LINE|L1 231999 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 157.333-292 chr5 145739148 145739436 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 96050 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 244.667-97 chr8 88107845 88108231 + 1 NA intron (NM_005941, intron 6 of 9) intron (NM_005941, intron 6 of 9) 219445 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 245.333-96 chr5 54634569 54635031 + 1 NA Intergenic Intergenic 68524 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 152.667-273 chr4 45967930 45968215 + 1 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 155982 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 173.667-71 chr2 44802203 44802443 + 1 NA Intergenic CpG 136565 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 126.333-94 chr2 134585723 134585956 + 1 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 133161 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 213.667-52 chr22 19627925 19628263 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -61255 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 208.333-101 chr4 30639361 30639677 + 1 NA Intergenic Intergenic -80850 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 169.667-48 chr13 29290140 29290386 + 1 NA intron (NM_001033602, intron 4 of 13) intron (NM_001033602, intron 4 of 13) -138397 NM_015233 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 229.667-63 chr4 66170771 66171112 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -105883 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 188.333-41 chr12 114595369 114595609 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 88686 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 165.333-148 chr21 16858569 16858808 + 1 NA Intergenic Intergenic 268451 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 164.333-238 chr8 105816742 105816986 + 1 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) L1MA1|LINE|L1 243639 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 189.333-184 chr7 23405227 23405430 + 1 NA intron (NM_006547, intron 3 of 14) L1MB2|LINE|L1 8882 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 140.333-190 chr5 126615567 126615838 + 1 NA intron (NM_032177, intron 3 of 4) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 14755 NM_032177 51808 Hs.555731 NM_032177 ENSG00000164902 PHAX RNUXA phosphorylated adaptor for RNA export protein-coding 149.333-329 chr6 5340579 5340766 + 1 NA intron (NM_006567, intron 1 of 6) intron (NM_006567, intron 1 of 6) 79159 NM_006567 10667 Hs.484547 NM_006567 ENSG00000145982 FARS2 COXPD14|FARS1|HSPC320|PheRS|SPG77|mtPheRS phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 192.667-165 chr7 100202884 100203141 + 1 NA intron (NM_178831, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 -16236 NM_024070 79037 Hs.729356 NM_024070 ENSG00000213413 PVRIG C7orf15|CD112R PVR related immunoglobulin domain containing protein-coding 401.333-15 chr3 8802438 8803046 + 1 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -33128 NM_001354653 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 333.333-9 chr10 76953332 76953880 + 1 NA intron (NM_001161353, intron 20 of 27) intron (NM_001161353, intron 20 of 27) 65562 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 257.333-36 chr14 79286660 79287015 + 1 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) MIRc|SINE|MIR 7457 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 154.667-281 chr4 103881559 103881725 + 1 NA Intergenic Intergenic -161657 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 131.333-27 chr10 65182443 65182672 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -258039 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 214.333-96 chr3 71713200 71713601 + 1 NA intron (NM_173359, intron 2 of 7) intron (NM_173359, intron 2 of 7) 12002 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 267.333-6 chr1 97759771 97760254 + 1 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) intron (NM_000110, intron 3 of 22) -36909 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 202.667-98 chr3 84540939 84541268 + 1 NA Intergenic Intergenic 328472 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 153.667-73 chr11 75931269 75931449 + 1 NA intron (NM_003369, intron 6 of 14) L2c|LINE|L2 116149 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 146.667-142 chr18 4120406 4120678 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) -144060 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 376.333-9 chr2 213294009 213294496 + 1 NA intron (NR_047659, intron 2 of 17) intron (NR_047659, intron 2 of 17) 9788 NR_047660 79582 Hs.743365 NM_024532 ENSG00000144451 SPAG16 PF20|WDR29 sperm associated antigen 16 protein-coding 263.667-16 chr12 53411537 53412076 + 1 NA 3' UTR (NM_001251825, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001251825, exon 6 of 6) -12049 NM_020547 269 Hs.659889 NM_020547 ENSG00000135409 AMHR2 AMHR|MISR2|MISRII|MRII anti-Mullerian hormone receptor type 2 protein-coding 189.667-18 chr10 26563804 26564170 + 1 NA intron (NM_019043, intron 14 of 14) intron (NM_019043, intron 14 of 14) 15320 NR_134472 101929117 Hs.127031 NR_134472 LOC101929117 - uncharacterized LOC101929117 ncRNA 198.667-169 chr7 7278202 7278643 + 1 NA TTS (NR_108073) TTS (NR_108073) 23268 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 157.667-339 chr8 127935154 127935409 + 1 NA intron (NR_003367, intron 2 of 8) intron (NR_003367, intron 2 of 8) 13442 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 226.333-38 chr16 73859617 73860096 + 1 NA Intergenic Intergenic 355665 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 199.333-199 chr4 53538462 53538834 + 1 NA intron (NM_001126328, intron 2 of 10) intron (NM_001126328, intron 2 of 10) 19621 NM_032622 84708 Hs.518760 NM_032622 ENSG00000072201 LNX1 LNX|MPDZ|PDZRN2 ligand of numb-protein X 1 protein-coding 157.667-153 chr2 175275119 175275343 + 1 NA Intergenic Intergenic -93521 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 150.333-218 chr2 169416413 169416575 + 1 NA Intergenic Intergenic -53960 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 334.333-34 chr9 18902190 18902631 + 1 NA intron (NM_001040272, intron 26 of 28) L1ME3A|LINE|L1 130799 NM_153707 158297 Hs.731593 NM_153707 ENSG00000155875 SAXO1 C9orf138|FAM154A stabilizer of axonemal microtubules 1 protein-coding 155.667-340 chr7 113635591 113635749 + 1 NA Intergenic Intergenic 283339 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 121.333-114 chr3 111483932 111484093 + 1 NA Intergenic Intergenic -58185 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 151.667-151 chr18 12909625 12909828 + 1 NA Intergenic Intergenic -25391 NM_080423 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 184.333-137 chr7 32570564 32570794 + 1 NA intron (NM_015060, intron 11 of 15) AluSq2|SINE|Alu 75190 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 216.333-79 chr2 77621688 77621947 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -99384 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 153.333-63 chr11 22140668 22140827 + 1 NA Intergenic Intergenic -52338 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 163.333-237 chr6 34146697 34146915 + 1 NA promoter-TSS (NM_001256811) promoter-TSS (NM_001256811) -669 NM_001256811 2914 Hs.429018 NM_000841 ENSG00000124493 GRM4 GPRC1D|MGLUR4|mGlu4 glutamate metabotropic receptor 4 protein-coding 131.333-147 chr5 144172177 144172414 + 1 NA intron (NM_020768, intron 1 of 3) L1MA4|LINE|L1 1422 NM_020768 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 246.333-56 chr22 26676724 26677151 + 1 NA TTS (NR_003491) TTS (NR_003491) 4094 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 153.667-228 chr20 55055683 55056077 + 1 NA Intergenic (CTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -367163 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 156.667-38 chr10 27217740 27217920 + 1 NA intron (NM_001352582, intron 6 of 11) intron (NM_001352582, intron 6 of 11) 22656 NM_001301252 91452 Hs.530597 NM_145698 ENSG00000107897 ACBD5 - acyl-CoA binding domain containing 5 protein-coding 155.333-243 chr3 172840528 172840717 + 1 NA Intergenic Intergenic 89620 NM_001349099 1894 Hs.518299 NM_018098 ENSG00000114346 ECT2 ARHGEF31 epithelial cell transforming 2 protein-coding 190.333-123 chr5 125460222 125460629 + 1 NA Intergenic Intergenic -32836 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 237.333-9 chr1 214173961 214174367 + 1 NA Intergenic Intergenic -106995 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 407.667-6 chr12 121961635 121962136 + 1 NA intron (NM_001178003, intron 14 of 17) intron (NM_001178003, intron 14 of 17) 43293 NM_144668 144406 Hs.709837 NM_144668 ENSG00000158023 WDR66 CFAP251|CaM-IP4|SPGF33 WD repeat domain 66 protein-coding 165.667-199 chr8 118085867 118086091 + 1 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 25840 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 192.667-121 chr4 59287382 59287617 + 1 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 273926 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 180.667-2 chr1 29087996 29088185 + 1 NA intron (NM_001166007, intron 13 of 17) AluSx|SINE|Alu 34411 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 270.333-8 chr10 32479457 32479865 + 1 NA intron (NR_109826, intron 9 of 16) L1M4c|LINE|L1 33521 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 195.667-13 chr10 93389806 93390142 + 1 NA intron (NM_133337, intron 16 of 52) L3|LINE|CR1 92360 NM_133337 26509 Hs.602086 NM_013451 ENSG00000138119 MYOF FER1L3 myoferlin protein-coding 148.333-300 chr4 187336027 187336203 + 1 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) intron (NR_038931, intron 1 of 4) -34533 NR_149103 105377602 Hs.582096 NR_149103 ENSG00000250042 LINC02514 - long intergenic non-protein coding RNA 2514 ncRNA 145.333-253 chr6 42530819 42531010 + 1 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -33108 NM_015255 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 152.333-195 chr2 163232424 163232702 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -393796 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 163.333-269 chr7 117186925 117187115 + 1 NA intron (NR_002332, intron 2 of 8) intron (NR_002332, intron 2 of 8) 4339 NR_002332 93655 Hs.368131 NR_002332 ENSG00000004866 ST7-OT3 NCRNA00026|ST7|ST7OT3 ST7 overlapping transcript 3 ncRNA 182.333-159 chr8 109999164 109999460 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -23541 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 212.667-138 chr8 118684316 118684681 + 1 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) intron (NR_038210, intron 3 of 4) -62535 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 285.667-21 chr2 55581233 55581577 + 1 NA intron (NM_020463, intron 8 of 14) intron (NM_020463, intron 8 of 14) 36217 NM_001282850 57223 Hs.516182 NM_020463 ENSG00000275052 PPP4R3B FLFL2|PP4R3B|PSY2|SMEK2|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B protein-coding 217.333-41 chr13 82942572 82942896 + 1 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 939659 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 345.333-10 chr14 55508531 55509028 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -68234 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 166.333-244 chrX 11598743 11599065 + 1 NA intron (NR_109776, intron 1 of 14) AluJb|SINE|Alu 67016 NR_109776 395 Hs.435291 NM_001174 ENSG00000047648 ARHGAP6 RHOGAP6|RHOGAPX-1 Rho GTPase activating protein 6 protein-coding 287.333-49 chr5 30881925 30882495 + 1 NA Intergenic Intergenic -311476 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 173.667-38 chr12 58714144 58714497 + 1 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) L1MEh|LINE|L1 67396 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 223.333-165 chr8 58201892 58202206 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 70052 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 150.667-358 chr7 109397438 109397659 + 1 NA Intergenic MER68B|LTR|ERVL -512961 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 153.333-100 chr12 115363585 115363882 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -679558 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 149.667-63 chr10 84628863 84629123 + 1 NA Intergenic Intergenic 203824 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 150.667-292 chr5 28510343 28510617 + 1 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -222815 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 186.333-149 chr7 50766533 50766814 + 1 NA intron (NM_001001555, intron 1 of 16) intron (NM_001001555, intron 1 of 16) 16223 NM_001371009 179.667-32 chr12 1162705 1163022 + 1 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) intron (NR_027948, intron 7 of 19) 135115 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 172.333-41 chr12 63972782 63972956 + 1 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) AluSx1|SINE|Alu 128169 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 142.333-119 chr2 76657225 76657477 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -328614 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 157.667-312 chr7 111132722 111132955 + 1 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 41711 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 326.667-9 chr11 39947980 39948498 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 344891 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 249.667 chr1 7997743 7998026 + 1 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 28425 NM_018948 54206 Hs.605445 NM_018948 ENSG00000116285 ERRFI1 GENE-33|MIG-6|MIG6|RALT ERBB receptor feedback inhibitor 1 protein-coding 176.667-104 chr3 96958510 96958752 + 1 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) L1MB7|LINE|L1 144037 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 251.333-43 chr17 57164593 57164953 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 69284 NM_001370427 8165 Hs.463506 NM_003488 ENSG00000121057 AKAP1 AKAP|AKAP121|AKAP149|AKAP84|D-AKAP1|PPP1R43|PRKA1|SAKAP84|TDRD17 A-kinase anchoring protein 1 protein-coding 169.667-2 chr1 45749662 45749896 + 1 NA intron (NM_001145349, intron 1 of 9) AluYj4|SINE|Alu 874 NM_005897 3652 Hs.744252 NM_005897 ENSG00000197429 IPP KLHL27 intracisternal A particle-promoted polypeptide protein-coding 238.333-68 chr4 70062011 70062297 + 1 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -5232 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 166.333-46 chr11 58736730 58736932 + 1 NA Intergenic Intergenic -4857 NM_005838 10249 Hs.145384 NM_005838 ENSG00000149124 GLYAT ACGNAT|CAT|GAT glycine-N-acyltransferase protein-coding 129.667-128 chr4 94035644 94035836 + 1 NA Intergenic Intergenic 171816 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 131.333-174 chr8 60382280 60382426 + 1 NA Intergenic Intergenic 31465 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 156.667-158 chr18 23528870 23529075 + 1 NA intron (NM_001318707, intron 11 of 16) AluSp|SINE|Alu 25461 NM_013326 29919 Hs.464779 NM_013326 ENSG00000141452 RMC1 C18orf8|HsT2591|MIC1|Mic-1|WDR98 regulator of MON1-CCZ1 protein-coding 120.333-137 chr4 18059478 18059635 + 1 NA Intergenic Intergenic -37681 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 171.667-20 chr10 59640813 59641143 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 68913 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 352.333-23 chr6 121457986 121458360 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 22527 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 146.333-20 chr1 232646655 232646844 + 1 NA Intergenic Intergenic -71322 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 146.667-163 chr2 62335078 62335253 + 1 NA Intergenic Intergenic 119644 NM_001319075 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 295.333-11 chr14 43815946 43816299 + 1 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 691161 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 175.333-184 chr8 67579464 67579747 + 1 NA intron (NM_020361, intron 2 of 10) intron (NM_020361, intron 2 of 10) 166755 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 132.667-42 chr12 72537871 72538074 + 1 NA intron (NM_013381, intron 6 of 18) intron (NM_013381, intron 6 of 18) -264463 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 169.333-200 chr5 32084711 32084934 + 1 NA intron (NM_178140, intron 19 of 24) intron (NM_178140, intron 19 of 24) 89497 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 153.333-206 chr2 98997518 98997798 + 1 NA non-coding (NR_146001, exon 19 of 19) non-coding (NR_146001, exon 19 of 19) -61433 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 161.333-127 chr18 34637945 34638252 + 1 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) intron (NM_001198939, intron 1 of 21) 44763 NM_001128175 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 179.333-7 chr1 70141875 70142088 + 1 NA 3' UTR (NM_001366841, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001366841, exon 27 of 27) 63598 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 145.667-134 chr2 67499972 67500140 + 1 NA Intergenic Intergenic 102723 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 264.333-3 chr1 57595957 57596327 + 1 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) -171221 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 152.333-286 chr4 153735862 153736104 + 1 NA intron (NM_173662, intron 3 of 8) L1MC3|LINE|L1 24041 NM_173662 285533 Hs.388364 NM_173662 ENSG00000145428 RNF175 - ring finger protein 175 protein-coding 149.667-306 chr5 32193880 32194052 + 1 NA Intergenic Intergenic -19647 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 165.667-117 chr22 49319085 49319306 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 224271 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 118.333-113 chr2 125670323 125670531 + 1 NA Intergenic Intergenic 447558 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 179.333-106 chr2 188794139 188794438 + 1 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -4165 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 230.666-14 chr12 63060927 63061510 + 1 NA Intergenic Intergenic 91592 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 258.667-64 chr3 105497110 105497423 + 1 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 130357 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 151.333-81 chr11 78527574 78527790 + 1 NA intron (NM_024678, intron 6 of 13) intron (NM_024678, intron 6 of 13) -5494 NR_120566 101928896 Hs.659055 NR_120566 ENSG00000255084 LOC101928896 - uncharacterized LOC101928896 ncRNA 141.333-182 chr4 158343476 158343664 + 1 NA Intergenic Intergenic 133084 NM_018342 55314 Hs.176227 NM_018342 ENSG00000164124 TMEM144 - transmembrane protein 144 protein-coding 172.333-184 chr8 101951298 101951613 + 1 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) intron (NM_001040624, intron 3 of 7) -32977 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 153.333-267 chr3 31987444 31987734 + 1 NA intron (NM_001137674, intron 1 of 1) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -5739 NM_001174060 114884 Hs.150122 NM_017784 ENSG00000144645 OSBPL10 ORP10|OSBP9 oxysterol binding protein like 10 protein-coding 259.667-45 chr3 63288381 63288714 + 1 NA intron (NM_001130003, intron 2 of 5) intron (NM_001130003, intron 2 of 5) 10239 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 234.333-51 chr3 98351834 98352106 + 1 NA Intergenic Intergenic -1884 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 219.333-131 chr4 165612339 165612769 + 1 NA Intergenic Intergenic -72085 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 154.333-255 chr5 8597934 8598120 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 137102 NR_039663 100616142 NR_039663 ENSG00000284000 MIR4458 mir-4458 microRNA 4458 ncRNA 150.333-351 chr6 2340902 2341098 + 1 NA intron (NR_046229, intron 4 of 6) L1MA5A|LINE|L1 95247 NR_046229 100508120 Hs.188825 NR_046229 GMDS-DT GMDS-AS1 GMDS divergent transcript ncRNA 236.333-16 chr10 78723348 78723805 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 343872 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 194.667-83 chr21 28551480 28551775 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 12309 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 180.667-55 chr18 5054227 5054548 + 1 NA Intergenic Intergenic -26795 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 245.333-35 chr13 38544257 38544635 + 1 NA intron (NR_126377, intron 2 of 2) intron (NR_126377, intron 2 of 2) -23278 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 146.667-336 chr8 116773332 116773489 + 1 NA 3' UTR (NM_032334, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_032334, exon 3 of 3) 6886 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 282.667-37 chr5 22680361 22680844 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 172742 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 307.667-33 chr5 160954083 160954569 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -15700 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 245.333-129 chr9 93070361 93070862 + 1 NA intron (NM_001287005, intron 2 of 5) intron (NM_001287005, intron 2 of 5) 11910 NM_001287008 203328 Hs.88417 NM_145006 ENSG00000157303 SUSD3 - sushi domain containing 3 protein-coding 112.667-279 chr9 32259932 32260083 + 1 NA Intergenic Intergenic -124596 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 203.333-135 chr2 75845687 75846002 + 1 NA Intergenic Intergenic -134929 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 143.333-249 chr6 125273180 125273440 + 1 NA Intergenic HERVL18-int|LTR|ERVL 28657 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 219.333-164 chr7 15847436 15847868 + 1 NA Intergenic Intergenic 159274 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 141.667-234 chr8 129361157 129361348 + 1 NA intron (NR_130920, intron 3 of 3) intron (NR_130920, intron 3 of 3) -120012 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 183.333-100 chr21 42977140 42977484 + 1 NA intron (NM_004571, intron 1 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 2750 NM_001320694 5316 Hs.431043 NM_004571 ENSG00000160199 PKNOX1 PREP1|pkonx1c PBX/knotted 1 homeobox 1 protein-coding 213.333-90 chr2 41205085 41205454 + 1 NA Intergenic Intergenic -672286 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 175.333-150 chr5 170671472 170671761 + 1 NA intron (NM_001278340, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 9854 NR_136214 105377716 Hs.570880 NR_136214 ENSG00000253591 LOC105377716 - uncharacterized LOC105377716 ncRNA 188.333-157 chr8 114647570 114647837 + 1 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 1020310 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 176.667-17 chr1 200967322 200967617 + 1 NA TTS (NR_147176) TTS (NR_147176) 38525 NR_147176 647215 Hs.576504 NR_147176 ENSG00000233217 MROH3P C1orf81 maestro heat like repeat family member 3, pseudogene pseudo 189.667-68 chr2 47514695 47515028 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12676 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 141.333-142 chr22 32265082 32265367 + 1 NA intron (NR_149072, intron 2 of 3) AluJr4|SINE|Alu -9877 NM_014227 6527 Hs.130101 NM_014227 ENSG00000100191 SLC5A4 DJ90G24.4|SAAT1|SGLT3 solute carrier family 5 member 4 protein-coding 198.667-32 chr11 21895186 21895487 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -297749 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 161.333-43 chr10 100109996 100110238 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -28248 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 213.667-56 chr3 105193618 105194041 + 1 NA Intergenic Intergenic -172884 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 244.333-66 chr22 17417628 17417942 + 1 NA intron (NM_001290047, intron 1 of 18) AluSz|SINE|Alu 48325 NM_001290047 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 193.667-60 chr2 126480553 126480840 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -175239 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 159.333-283 chr6 53740550 53740839 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -54311 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 227.667-68 chr6 157396124 157396476 + 1 NA intron (NM_024630, intron 1 of 8) intron (NM_024630, intron 1 of 8) 15110 NM_153746 79683 Hs.596214 NM_024630 ENSG00000175048 ZDHHC14 NEW1CP zinc finger DHHC-type containing 14 protein-coding 152.333-164 chr19 48158365 48158650 + 1 NA intron (NR_135500, intron 3 of 27) LTR50|LTR|ERVL 11837 NR_135497 3978 Hs.1770 NM_000234 ENSG00000105486 LIG1 - DNA ligase 1 protein-coding 211.333-169 chr4 70085572 70085885 + 1 NA TTS (NR_003720) TTS (NR_003720) 18342 NR_003720 286828 Hs.631945 NR_003720 ENSG00000234124 CSN1S2AP CSN1S2A casein alpha s2 like A, pseudogene pseudo 140.333-172 chr4 174947302 174947466 + 1 NA intron (NM_001130704, intron 3 of 3) L1PA15|LINE|L1 29026 NM_001278127 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 147.333-309 chr8 22344689 22344851 + 1 NA intron (NM_001330480, intron 20 of 21) AluJb|SINE|Alu -22508 NM_001351656 23516 Hs.491232 NM_015359 ENSG00000104635 SLC39A14 HCIN|HMNDYT2|LZT-Hs4|NET34|ZIP14|cig19 solute carrier family 39 member 14 protein-coding 140.667-228 chr8 80846594 80846749 + 1 NA intron (NM_001033723, intron 1 of 8) L3b|LINE|CR1 27797 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 161.333-111 chr17 33367440 33367629 + 1 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -74546 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 301.667-3 chr1 90178509 90178967 + 1 NA Intergenic Intergenic 183628 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 150.333-241 chr21 18812736 18812961 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -53036 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 199.333-113 chr18 50249945 50250283 + 1 NA intron (NM_145020, intron 5 of 7) AluJb|SINE|Alu 16381 NM_145020 220136 Hs.658630 NM_145020 ENSG00000172361 CFAP53 CCDC11|HTX6 cilia and flagella associated protein 53 protein-coding 158.333-227 chr4 41111402 41111604 + 1 NA intron (NM_173075, intron 2 of 16) intron (NM_173075, intron 2 of 16) 103039 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 212.667-120 chr6 39748307 39748553 + 1 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 -23007 NM_001351503 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 111.667-137 chr2 118651673 118651905 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -48823 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 183.667-149 chr9 28472452 28472774 + 1 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 246692 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 148.333-75 chr11 83551005 83551195 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) MIRb|SINE|MIR 131325 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 143.333-91 chr14 73370284 73370475 + 1 NA intron (NM_001005743, intron 2 of 12) intron (NM_001005743, intron 2 of 12) 88201 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 152.333-330 chr6 53251008 53251192 + 1 NA Intergenic Intergenic -25893 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 147.333-134 chr16 66405099 66405317 + 1 NA TTS (NM_001795) TTS (NM_001795) -3316 NR_046242 100505865 Hs.314372 NR_046242 LINC00920 - long intergenic non-protein coding RNA 920 ncRNA 272.333-12 chr12 58774274 58774689 + 1 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 7235 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 128.333-183 chr7 91602228 91602387 + 1 NA Intergenic Intergenic 278395 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 174.667-71 chr18 6926198 6926443 + 1 NA intron (NR_034100, intron 5 of 6) AluJr|SINE|Alu 3549 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 154.667-132 chr16 64927453 64927672 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 194501 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 228.333-29 chr14 54415023 54415329 + 1 NA intron (NM_001330173, intron 5 of 8) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 18169 NM_005192 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 161.333-25 chr10 20511980 20512145 + 1 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -39908 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 246.667-2 chr1 39575429 39575842 + 1 NA intron (NM_001135654, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 1155 NM_001135653 8761 Hs.169900 NM_003819 ENSG00000090621 PABPC4 APP-1|APP1|PABP4|iPABP poly(A) binding protein cytoplasmic 4 protein-coding 188.667-21 chr10 111788187 111788424 + 1 NA Intergenic Intergenic 395460 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 191.333-200 chr8 81857719 81857925 + 1 NA Intergenic Intergenic -15536 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 143.667-24 chr10 63757592 63757858 + 1 NA Intergenic Intergenic -235835 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 140.333-27 chr10 37148373 37148590 + 1 NA intron (NM_052997, intron 9 of 35) intron (NM_052997, intron 9 of 35) 22624 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 148.667-255 chr3 89894454 89894723 + 1 NA Intergenic Intergenic 786967 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 377.333-9 chr2 98879735 98880363 + 1 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) intron (NM_207362, intron 1 of 9) 56176 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 135.333-127 chr4 90331594 90331821 + 1 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) intron (NM_207491, intron 3 of 7) 96676 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 111.667-46 chr11 22363793 22363977 + 1 NA intron (NM_020346, intron 6 of 11) intron (NM_020346, intron 6 of 11) 25504 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 286.667-19 chr2 88262063 88262637 + 1 NA Intergenic Intergenic 89211 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 158.667-104 chr14 86132265 86132520 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 197714 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 171.667-109 chr3 11181085 11181294 + 1 NA intron (NM_001098212, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 26696 NM_001098212 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 137.333-79 chr18 53933304 53933495 + 1 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 289013 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 233.333-112 chr5 130428599 130428865 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 524267 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 187.667-69 chr2 63178430 63178742 + 1 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) L1MB2|LINE|L1 -59044 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 186.667-49 chr16 73068832 73069175 + 1 NA Intergenic Intergenic -9982 NM_001164766 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 119.333-71 chr12 58626269 58626416 + 1 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) intron (NR_120452, intron 1 of 7) 34640 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 231.333-65 chr20 38206826 38207231 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -40520 NM_001323316 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 240.667-65 chr5 37581168 37581462 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) MIR|SINE|MIR 201997 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 143.333-293 chr8 119897559 119897821 + 1 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 23968 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 231.333-23 chr11 33835734 33836256 + 1 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 33883 NM_001142316 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 178.333-158 chr6 142880827 142881149 + 1 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 64188 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 157.667-276 chr6 40372078 40372366 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -6115 NR_160960 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 209.333-146 chr3 20129336 20129712 + 1 NA intron (NM_003884, intron 11 of 17) AluSx|SINE|Alu -8041 NR_036086 100422901 NR_036086 ENSG00000266745 MIR3135A MIR3135|hsa-mir-3135a microRNA 3135a ncRNA 156.333-260 chr4 30443203 30443367 + 1 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -277084 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 355.333-2 chr1 90647532 90647984 + 1 NA Intergenic Intergenic -9992 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 171.333-36 chr12 38579021 38579335 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 262404 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 168.333-142 chr4 37377078 37377312 + 1 NA intron (NM_001144990, intron 3 of 6) intron (NM_001144990, intron 3 of 6) -76730 NM_001104629 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 261.667-47 chr3 4495411 4495861 + 1 NA intron (NM_001168272, intron 2 of 60) intron (NM_001168272, intron 2 of 60) 2288 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 156.667-95 chr13 92276444 92276686 + 1 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 75642 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 279.667-22 chr18 10552459 10553130 + 1 NA TTS (NM_003826) TTS (NM_003826) 26767 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 256.333-7 chr1 92651369 92651825 + 1 NA intron (NM_005665, intron 11 of 17) AluYa5|SINE|Alu 133511 NM_001350197 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 135.333-23 chr10 74346330 74346481 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) intron (NM_001369124, intron 4 of 9) 169642 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 153.333-65 chr11 38124954 38125214 + 1 NA Intergenic Intergenic 186483 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 218.333-46 chr16 26237351 26237679 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 212278 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 214.333-85 chr20 43537611 43537879 + 1 NA intron (NM_032107, intron 19 of 21) intron (NM_032107, intron 19 of 21) -21282 NM_170693 10110 Hs.300863 NM_016276 ENSG00000101049 SGK2 H-SGK2|dJ138B7.2 serum/glucocorticoid regulated kinase 2 protein-coding 162.333-111 chr2 47322306 47322610 + 1 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) intron (NR_110207, intron 1 of 2) -12857 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 203.333-89 chr15 72185629 72185923 + 1 NA intron (NM_001012642, intron 1 of 11) L1ME4b|LINE|L1 12011 NM_001012642 196996 Hs.596332 NM_001012642 ENSG00000175318 GRAMD2A GRAMD2 GRAM domain containing 2A protein-coding 229.333-78 chr3 88804991 88805474 + 1 NA Intergenic Intergenic -302389 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 148.333-191 chr2 100818036 100818212 + 1 NA Intergenic Intergenic -2015 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 148.333-116 chr14 36903782 36904043 + 1 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) 48479 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 157.667-139 chr2 35382987 35383285 + 1 NA Intergenic Intergenic -88269 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 253.667-38 chr22 33608590 33608981 + 1 NA intron (NM_133642, intron 4 of 14) MIR|SINE|MIR 96135 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 136.667-26 chr10 115630201 115630359 + 1 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) L1MA9|LINE|L1 536915 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 248.333-93 chr6 131681905 131682208 + 1 NA intron (NR_133007, intron 11 of 23) AluSx1|SINE|Alu 19345 NM_030908 79541 Hs.486488 NM_030908 ENSG00000180658 OR2A4 OR2A10 olfactory receptor family 2 subfamily A member 4 protein-coding 167.333-254 chr8 73289338 73289651 + 1 NA TTS (NM_000971) TTS (NM_000971) 4139 NM_000971 6129 Hs.421257 NM_000971 ENSG00000147604 RPL7 L7|humL7-1 ribosomal protein L7 protein-coding 166.333-118 chr2 75702757 75702955 + 1 NA intron (NM_001201335, intron 2 of 2) intron (NM_001201335, intron 2 of 2) 8059 NM_001201334 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 171.333-126 chr3 188691563 188691878 + 1 NA intron (NM_005578, intron 6 of 10) MIR3|SINE|MIR 2939 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 279.333-12 chr10 61668594 61668971 + 1 NA intron (NM_173554, intron 1 of 6) MER96B|DNA|hAT-Tip100 5821 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 240.667-74 chr7 44390003 44390319 + 1 NA intron (NM_015332, intron 5 of 5) AluSx|SINE|Alu -64530 NM_172079 816 Hs.351887 NM_001220 ENSG00000058404 CAMK2B CAM2|CAMK2|CAMKB|MRD54 calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta protein-coding 128.333-151 chr5 36711056 36711283 + 1 NA Intergenic Intergenic 104563 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 159.333-342 chr8 135331675 135331934 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 97673 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 197.667-108 chr4 48520191 48520415 + 1 NA intron (NM_015030, intron 55 of 63) intron (NM_015030, intron 55 of 63) 30051 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 222.333-28 chr13 93483643 93483985 + 1 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) intron (NM_005708, intron 1 of 8) 257007 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 254.333-70 chr5 173605182 173605491 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 11314 NM_138369 91272 Hs.425091 NM_138369 ENSG00000145919 BOD1 FAM44B biorientation of chromosomes in cell division 1 protein-coding 213.333-208 chr8 78642105 78642498 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -23788 NM_016010 51101 Hs.271876 NM_016010 ENSG00000104427 ZC2HC1A C8orf70|CGI-62|FAM164A zinc finger C2HC-type containing 1A protein-coding 138.667-74 chr15 91610100 91610366 + 1 NA Intergenic Intergenic 146894 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 163.333-8 chr1 69786058 69786370 + 1 NA intron (NM_001370785, intron 3 of 26) L1MEd|LINE|L1 -133108 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 317.667-7 chr10 55735763 55736326 + 1 NA Intergenic Intergenic -108102 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 199.667-117 chr5 71956270 71956649 + 1 NA Intergenic Intergenic -151016 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 196.667-43 chr14 46151133 46151555 + 1 NA intron (NR_102702, intron 1 of 3) L1PA11|LINE|L1 87185 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 147.667-118 chr15 90644820 90645044 + 1 NA 3' UTR (NM_022769, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_022769, exon 15 of 15) -15302 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 151.667-203 chr22 35243766 35243928 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -12791 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 130.667-73 chr15 63061271 63061522 + 1 NA intron (NM_000366, intron 6 of 9) intron (NM_000366, intron 6 of 9) -12009 NR_147233 111064646 Hs.602995 NR_147233 TPM1-AS TPM1-AS1 TPM1 antisense RNA ncRNA 158.667-257 chr5 9659727 9659962 + 1 NA intron (NR_027112, intron 10 of 12) intron (NR_027112, intron 10 of 12) -29493 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 139.333-201 chr7 75961607 75961844 + 1 NA intron (NM_000941, intron 2 of 15) L1MC5|LINE|L1 17942 NR_002955 677801 Hs.689708 NR_002955 ENSG00000201643 SNORA14A ACA14a small nucleolar RNA, H/ACA box 14A snoRNA 250.333-35 chr20 33994920 33995217 + 1 NA promoter-TSS (NR_109885) promoter-TSS (NR_109885) -701 NR_109886 101926888 Hs.405849 NR_109885 ENSG00000285230 RALY-AS1 - RALY antisense RNA 1 ncRNA 191.333-154 chr5 24942640 24942960 + 1 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -102217 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 211.333-165 chr4 47438616 47439008 + 1 NA Intergenic Intergenic 24890 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 216.667-61 chr2 181580153 181580557 + 1 NA intron (NR_027690, intron 2 of 11) intron (NR_027690, intron 2 of 11) 76750 NM_201548 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 180.667-46 chr15 85900896 85901121 + 1 NA Intergenic Intergenic 75373 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 165.333-39 chr11 15458939 15459229 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -184801 NM_001293172 102724957 Hs.512245 NM_001293172 LOC102724957 - uncharacterized LOC102724957 protein-coding 151.667-53 chr10 109080434 109080733 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 842663 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 142.333-3 chr1 44195740 44195985 + 1 NA Intergenic MER66C|LTR|ERV1 -17609 NM_019100 55929 Hs.8008 NM_019100 ENSG00000178028 DMAP1 DNMAP1|DNMTAP1|EAF2|MEAF2|SWC4 DNA methyltransferase 1 associated protein 1 protein-coding 227.333-57 chr2 21600481 21600746 + 1 NA Intergenic Intergenic 110039 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 238.333-19 chr12 23795850 23796344 + 1 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) intron (NM_152989, intron 6 of 17) 153573 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 122.333-12 chr1 162316369 162316545 + 1 NA intron (NM_014697, intron 4 of 9) intron (NM_014697, intron 4 of 9) -26089 NR_030283 693141 NR_030283 ENSG00000207729 MIR556 MIRN556|hsa-mir-556|mir-556 microRNA 556 ncRNA 164.333-109 chr2 8123779 8124103 + 1 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) AluYb8|SINE|Alu -147127 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 170.667-162 chr8 61400158 61400376 + 1 NA intron (NM_173519, intron 3 of 5) L1PA11|LINE|L1 112297 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 166.333-96 chr18 21258433 21258657 + 1 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 16303 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 226.667-46 chr19 57040939 57041341 + 1 NA Intergenic Intergenic -79001 NM_020903 57663 Hs.515632 NM_020903 ENSG00000131864 USP29 HOM-TES-84/86 ubiquitin specific peptidase 29 protein-coding 170.667-42 chr14 24929929 24930244 + 1 NA intron (NM_001351943, intron 3 of 6) intron (NM_001351943, intron 3 of 6) 118914 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 113.333-147 chr2 239572509 239572716 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 170864 NR_135577 101928111 Hs.534680 NR_135575 ENSG00000222020 HDAC4-AS1 - HDAC4 antisense RNA 1 ncRNA 135.667-55 chr14 70921847 70922038 + 1 NA intron (NM_014982, intron 1 of 35) intron (NM_014982, intron 1 of 35) 14483 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 207.333-40 chr10 114033116 114033454 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -10581 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 158.667-135 chr18 40599438 40599651 + 1 NA Intergenic Intergenic 533258 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 158.333-56 chr11 90151166 90151358 + 1 NA intron (NM_001300930, intron 5 of 17) MIR|SINE|MIR 16599 NM_001300930 10003 Hs.112482 NM_005467 ENSG00000077616 NAALAD2 GCPIII|GPCIII|NAADALASE2|NAALADASE2 N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2 protein-coding 132.333-57 chr15 34760944 34761142 + 1 NA intron (NR_120329, intron 1 of 2) intron (NR_120329, intron 1 of 2) 5959 NR_120329 101928174 Hs.680670 NR_120329 ENSG00000250007 LOC101928174 - uncharacterized LOC101928174 ncRNA 364.667-2 chr1 236944456 236944980 + 1 NA Intergenic Intergenic 59723 NM_001276687 645745 Hs.632513 NM_001039954 ENSG00000244020 MT1HL1 MT1P2 metallothionein 1H like 1 protein-coding 154.333-74 chr13 60367789 60367943 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -28591 NM_030794 81550 Hs.525061 NM_030794 ENSG00000083544 TDRD3 - tudor domain containing 3 protein-coding 159.333-161 chr2 85219523 85219714 + 1 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) FLAM_C|SINE|Alu 5966 NR_136323 102724579 Hs.669216 NR_136323 LOC102724579 - uncharacterized LOC102724579 ncRNA 211.667-106 chr7 14424230 14424684 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) L2a|LINE|L2 416993 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 124.667-6 chr1 64653891 64654076 + 1 NA intron (NM_020925, intron 11 of 26) intron (NM_020925, intron 11 of 26) 74136 NR_039957 100616338 NR_039957 ENSG00000264470 MIR4794 - microRNA 4794 ncRNA 157.333-53 chr10 98920136 98920441 + 1 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) LTR16B1|LTR|ERVL 4280 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 149.667-39 chr1 210203851 210204131 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -28805 NM_019605 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 237.667-66 chr5 45220215 45220507 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 411414 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 113.667-22 chr10 58471216 58471345 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -41592 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 274.667-61 chr9 34673763 34674094 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7872 NM_001320037 730098 Hs.459590 NM_001320037 ENSG00000187186 LOC730098 - uncharacterized LOC730098 protein-coding 144.333-208 chr5 43493215 43493396 + 1 NA intron (NM_198566, intron 8 of 12) intron (NM_198566, intron 8 of 12) -9440 NM_022483 64417 Hs.732093 NM_022483 ENSG00000151881 TMEM267 C5orf28 transmembrane protein 267 protein-coding 137.667-8 chr1 107265189 107265430 + 1 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 117240 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 318.333-33 chr8 117789427 117789923 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 131238 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 195.667-131 chr7 72320705 72321084 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 16497 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 178.667-133 chr5 111846452 111846811 + 1 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -65877 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 152.667-224 chr20 44549542 44549806 + 1 NA intron (NM_007066, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 17799 NM_007066 11142 Hs.472831 NM_007066 ENSG00000168734 PKIG PKI-gamma cAMP-dependent protein kinase inhibitor gamma protein-coding 237.667-47 chr20 34384464 34384826 + 1 NA intron (NM_001257137, intron 2 of 25) intron (NM_001257137, intron 2 of 25) 21372 NM_001257138 83737 Hs.632272 NM_031483 ENSG00000078747 ITCH ADMFD|AIF4|AIP4|NAPP1 itchy E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 198.333-30 chr10 121187547 121187867 + 1 NA Intergenic Intergenic 336345 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 190.333-116 chr5 55991483 55991791 + 1 NA intron (NR_157112, intron 1 of 17) intron (NR_157112, intron 1 of 17) 3326 NM_001364276 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 154.667-282 chr4 115117573 115117803 + 1 NA Intergenic Intergenic -4068 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 282.333-27 chr19 34924335 34924710 + 1 NA intron (NR_110749, intron 1 of 2) intron (NR_110749, intron 1 of 2) 2304 NR_110749 102723513 Hs.149702 NR_110749 ZNF30-AS1 - ZNF30 antisense RNA 1 ncRNA 113.667-63 chr14 64466783 64466951 + 1 NA intron (NM_004857, intron 1 of 1) intron (NM_004857, intron 1 of 1) 1368 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 153.333-216 chr2 158615280 158615463 + 1 NA intron (NM_001005476, intron 4 of 20) intron (NM_001005476, intron 4 of 20) 119631 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 231.667-20 chr16 10338158 10338557 + 1 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -47704 NR_045815 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 208.333-120 chr5 135897597 135898018 + 1 NA Intergenic Intergenic -1966 NM_000590 3578 Hs.960 NM_000590 ENSG00000145839 IL9 HP40|IL-9|P40 interleukin 9 protein-coding 173.667-107 chr3 64243645 64243985 + 1 NA intron (NM_001370528, intron 1 of 7) intron (NM_001370528, intron 1 of 7) -18349 NM_198859 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 363.667-9 chr4 88828450 88828949 + 1 NA intron (NM_014883, intron 7 of 23) intron (NM_014883, intron 7 of 23) -5338 NM_001265579 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 224.333-108 chr6 12688756 12689050 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -27864 NM_001322308 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 279.667-50 chr9 111715835 111716316 + 1 NA intron (NM_173521, intron 14 of 25) intron (NM_173521, intron 14 of 25) 43461 NM_001080551 158401 Hs.428209 NM_173521 ENSG00000165181 SHOC1 C9orf84|ZIP2|ZIP2H shortage in chiasmata 1 protein-coding 128.667-193 chr8 142901227 142901460 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 16500 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 229.667-73 chr7 8470414 8470678 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 36937 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 162.333-24 chr10 22154899 22155093 + 1 NA Intergenic Intergenic 54987 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 139.667-79 chr19 28162058 28162323 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -368250 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 140.333-159 chr4 59201966 59202204 + 1 NA Intergenic Intergenic 188512 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 150.333-108 chr14 50787475 50787747 + 1 NA intron (NM_016350, intron 5 of 28) intron (NM_016350, intron 5 of 28) -34186 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 153.667-179 chr2 64751032 64751186 + 1 NA Intergenic CpG -97196 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 260.667-22 chr15 23511150 23511456 + 1 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 50828 NR_039731 100616275 NR_039731 ENSG00000265673 MIR4508 mir-4508 microRNA 4508 ncRNA 158.333-252 chr5 23392014 23392198 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -115503 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 259.333-106 chrX 52984178 52984570 + 1 NA intron (NM_001242492, intron 1 of 4) MER68|LTR|ERVL 11098 NM_001242495 29057 Hs.6451 NM_014138 ENSG00000268350 FAM156A PRO0659|TMEM29 family with sequence similarity 156 member A protein-coding 203.667-130 chr8 124794256 124794563 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -27576 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 152.333-96 chr13 80506302 80506525 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -165287 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 111.667-262 chr8 130996843 130996993 + 1 NA intron (NM_001115, intron 1 of 17) L1ME4a|LINE|L1 43991 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 131.333-83 chr2 50733962 50734106 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) MER20|DNA|hAT-Charlie -37772 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 133.333-116 chr3 152146738 152146925 + 1 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL 58598 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 311.667 chr1 90009093 90009564 + 1 NA intron (NM_001320185, intron 5 of 11) intron (NM_001320185, intron 5 of 11) 14218 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 132.667-44 chr12 122768441 122768591 + 1 NA intron (NM_003677, intron 6 of 7) intron (NM_003677, intron 6 of 7) -6056 NM_201435 84660 Hs.592008 NM_032573 ENSG00000130783 CCDC62 CT109|ERAP75|TSP-NY coiled-coil domain containing 62 protein-coding 144.667-113 chr17 63016541 63016730 + 1 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) L1M4|LINE|L1 50400 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 216.333-120 chr6 35585994 35586351 + 1 NA 3' UTR (NM_001145777, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001145777, exon 7 of 7) -73276 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 284.667-62 chrX 88278114 88278560 + 1 NA Intergenic Intergenic -468888 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 320.667-31 chr8 27525391 27525934 + 1 NA intron (NM_001979, intron 12 of 18) intron (NM_001979, intron 12 of 18) 34519 NM_001256484 2053 Hs.212088 NM_001979 ENSG00000120915 EPHX2 ABHD20|CEH|SEH epoxide hydrolase 2 protein-coding 138.333-190 chr7 135038381 135038636 + 1 NA intron (NR_160300, intron 8 of 16) intron (NR_160300, intron 8 of 16) 52000 NM_001367812 340351 Hs.648616 NM_178563 ENSG00000146856 AGBL3 CCP3 ATP/GTP binding protein like 3 protein-coding 204.667-12 chr1 200239734 200240071 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 133890 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 271.333-12 chr12 65572748 65573089 + 1 NA intron (NR_120434, intron 3 of 4) AluSx1|SINE|Alu -15607 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 207.333-83 chr14 39282975 39283273 + 1 NA intron (NM_001354157, intron 4 of 22) L1MA9|LINE|L1 15739 NM_203355 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 189.667-34 chr12 57707803 57708178 + 1 NA intron (NM_001017956, intron 5 of 13) AluJr|SINE|Alu 13858 NM_006812 10956 Hs.527861 NM_006812 ENSG00000135506 OS9 ERLEC2|OS-9 OS9 endoplasmic reticulum lectin protein-coding 167.333-221 chr6 15780136 15780347 + 1 NA Intergenic Intergenic -117183 NM_001271669 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 276.667-5 chr1 210907166 210907695 + 1 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) intron (NM_002238, intron 7 of 10) 225944 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 180.667-58 chr19 56658419 56658665 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 13215 NM_001005850 90485 Hs.458438 NM_001005850 ENSG00000127903 ZNF835 BC37295_3 zinc finger protein 835 protein-coding 162.333-105 chr2 13512582 13512812 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -505684 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 170.333-234 chr9 110082490 110082801 + 1 NA intron (NM_001004065, intron 1 of 3) HAL1|LINE|L1 34047 NM_001004065 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 250.333-51 chr4 89859882 89860339 + 1 NA Intergenic Intergenic -19401 NM_001371403 179.333-203 chrX 98953824 98954053 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -1389403 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 192.667-156 chr7 25322833 25323121 + 1 NA Intergenic Intergenic -94491 NM_022150 64111 Hs.60473 NM_022150 ENSG00000105954 NPVF C7orf9|RFRP neuropeptide VF precursor protein-coding 161.333-147 chr2 102644588 102644774 + 1 NA intron (NM_003048, intron 1 of 11) L1PA8|LINE|L1 25128 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 230.667-23 chr16 74141804 74142127 + 1 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL 73556 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 152.667-65 chr11 85224111 85224338 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) intron (NM_001142699, intron 4 of 27) -300803 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 150.333-326 chr5 63904013 63904249 + 1 NA Intergenic Intergenic 58161 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 378.667-21 chr7 51561227 51561846 + 1 NA Intergenic Intergenic -168280 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 157.667-91 chr13 84700691 84700857 + 1 NA Intergenic Intergenic -82880 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 130.667-144 chr3 86986663 86986938 + 1 NA intron (NM_001320493, intron 1 of 3) intron (NM_001320493, intron 1 of 3) 4349 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 163.333-77 chr13 61381212 61381447 + 1 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 34193 NM_022843 64881 Hs.391781 NM_022843 ENSG00000280165 PCDH20 PCDH13 protocadherin 20 protein-coding 309.667-10 chr16 77380660 77381101 + 1 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) AluSx|SINE|Alu 54154 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 353.667-5 chr14 56488668 56489220 + 1 NA Intergenic Intergenic -25387 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 351.333-8 chr14 34813067 34813680 + 1 NA intron (NM_013448, intron 4 of 26) AluJb|SINE|Alu -60818 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 160.333-236 chr5 116965880 116966042 + 1 NA Intergenic Intergenic -203752 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 199.667-14 chr10 61254754 61255193 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -197666 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 257.333-88 chr6 134638715 134639028 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -98866 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 247.667-24 chr12 64985908 64986207 + 1 NA intron (NR_146276, intron 1 of 3) MER57A-int|LTR|ERV1 6234 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 153.667-381 chr8 88923891 88924151 + 1 NA Intergenic Intergenic -596538 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 166.667-55 chr13 30287523 30287797 + 1 NA intron (NM_032116, intron 1 of 10) intron (NM_032116, intron 1 of 10) 19351 NM_001014380 84056 Hs.243596 NM_032116 ENSG00000102781 KATNAL1 - katanin catalytic subunit A1 like 1 protein-coding 128.667-4 chr1 58615690 58615914 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -38550 NM_002353 4070 Hs.23582 NM_002353 ENSG00000184292 TACSTD2 EGP-1|EGP1|GA733-1|GA7331|GP50|M1S1|TROP2 tumor associated calcium signal transducer 2 protein-coding 154.333-46 chr10 116026598 116026765 + 1 NA Intergenic Intergenic 168108 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 271.333-41 chr22 26364989 26365364 + 1 NA intron (NM_001184777, intron 12 of 14) intron (NM_001184777, intron 12 of 14) -64084 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 130.333-41 chr10 116861834 116862028 + 1 NA intron (NM_001242699, intron 6 of 13) intron (NM_001242699, intron 6 of 13) -12209 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 272.333-36 chr2 185658559 185659068 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 79906 NR_110216 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 266.667-35 chr2 9769690 9770196 + 1 NA Intergenic Intergenic -73499 NM_001318976 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 202.667-81 chr2 98258365 98258703 + 1 NA intron (NM_001345864, intron 15 of 21) L1MB5|LINE|L1 -87621 NM_001298 1261 Hs.234785 NM_001298 ENSG00000144191 CNGA3 ACHM2|CCNC1|CCNCa|CCNCalpha|CNCG3|CNG3 cyclic nucleotide gated channel alpha 3 protein-coding 307.667-5 chr1 220248675 220249083 + 1 NA intron (NM_012414, intron 1 of 34) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 18836 NR_001587 6791 Hs.654849 NR_001587 AURKAP1 AURKAPS1|AurAps1|STK6P aurora kinase A pseudogene 1 pseudo 211.667-115 chr9 24568880 24569159 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -23122 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 316.333-6 chr12 43299712 43300469 + 1 NA Intergenic Intergenic 144775 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 223.667-6 chr1 101579390 101579650 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 255683 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 209.333-3 chr1 29027950 29028198 + 1 NA intron (NM_001166007, intron 7 of 17) AluSp|SINE|Alu 94427 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 160.667-263 chr6 64687053 64687220 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) L1MEf|LINE|L1 -614282 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 148.333-47 chr10 59166586 59166811 + 1 NA Intergenic Intergenic 9766 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 164.667-229 chr7 112153775 112153968 + 1 NA intron (NM_001363540, intron 1 of 52) intron (NM_001363540, intron 1 of 52) 52528 NM_014705 9732 Hs.654652 NM_014705 ENSG00000128512 DOCK4 - dedicator of cytokinesis 4 protein-coding 211.667-97 chr6 46675007 46675453 + 1 NA intron (NM_001204051, intron 8 of 8) LTR101_Mam|LTR|ERVL -5038 NR_144468 221400 Hs.656983 NM_001010870 ENSG00000180113 TDRD6 CT41.2|NY-CO-45|SPATA36|TDR2|bA446F17.4 tudor domain containing 6 protein-coding 195.667-92 chr3 98649166 98649560 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -55752 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 226.667-59 chr3 80612177 80612524 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -152547 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 214.667-65 chr2 59537407 59537720 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 319855 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 236.667-68 chr5 143759265 143759570 + 1 NA Intergenic Intergenic -52744 NM_021182 57824 Hs.158320 NM_021182 ENSG00000158497 HMHB1 HB-1|HB-1Y|HLA-HB1 histocompatibility minor HB-1 protein-coding 176.667-56 chr14 66051764 66051952 + 1 NA Intergenic Intergenic -434513 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 219.333-110 chr21 45753742 45754029 + 1 NA intron (NM_001348243, intron 2 of 15) L1MC5a|LINE|L1 5871 NM_001348243 54039 Hs.474049 NM_020528 ENSG00000183570 PCBP3 ALPHA-CP3|PCBP3-OT1|PCBP3OT poly(rC) binding protein 3 protein-coding 192.667-175 chr8 115208847 115209102 + 1 NA Intergenic MER34C2|LTR|ERV1 459039 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 231.333-50 chr17 72441114 72441385 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 98438 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 161.333-159 chr2 154060955 154061174 + 1 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) L1MC4|LINE|L1 116670 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 124.333-9 chr1 151277005 151277190 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4425 NM_001304764 57592 Hs.186756 NM_020832 ENSG00000143373 ZNF687 PDB6 zinc finger protein 687 protein-coding 174.333-149 chr8 106180876 106181155 + 1 NA Intergenic Intergenic -89163 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 151.667-380 chr8 139617678 139617857 + 1 NA 3' UTR (NM_001282534, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001282534, exon 2 of 2) 85356 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 193.667-137 chr8 117170698 117171044 + 1 NA intron (NM_173851, intron 6 of 7) intron (NM_173851, intron 6 of 7) 35876 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 185.667-95 chr3 178964995 178965268 + 1 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -104726 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 129.333-37 chr11 105835456 105835621 + 1 NA intron (NR_046356, intron 3 of 16) intron (NR_046356, intron 3 of 16) 186702 NM_032424 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 366.333-3 chr1 109962350 109962919 + 1 NA Intergenic Intergenic -22131 NM_006621 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 187.667-10 chr10 22177691 22177963 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 32156 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 183.667-133 chr7 87852715 87853031 + 1 NA intron (NM_018843, intron 5 of 11) L1MD1|LINE|L1 23487 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 210.667-50 chr15 98485072 98485294 + 1 NA intron (NM_182562, intron 3 of 6) intron (NM_182562, intron 3 of 6) 29153 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 129.333-9 chr1 224230569 224230736 + 1 NA intron (NM_002533, intron 22 of 22) intron (NM_002533, intron 22 of 22) 11039 NR_110668 101927164 Hs.710128 NR_110668 ENSG00000237101 LOC101927164 - uncharacterized LOC101927164 ncRNA 158.333-286 chr6 164699807 164699979 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 122170 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 146.667-354 chr9 76121278 76121548 + 1 NA intron (NR_120409, intron 9 of 19) intron (NR_120409, intron 9 of 19) 230740 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 237.333-82 chr4 98354265 98354688 + 1 NA intron (NM_001100430, intron 4 of 12) intron (NM_001100430, intron 4 of 12) 93092 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 145.667-229 chr5 107749712 107749871 + 1 NA Intergenic Intergenic -78854 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 183.333-89 chr2 203122602 203122861 + 1 NA intron (NM_001114132, intron 18 of 54) L2c|LINE|L2 107852 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 134.667-64 chr14 74944492 74944687 + 1 NA intron (NM_001207012, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu 11175 NM_001207012 5228 Hs.252820 NM_002632 ENSG00000119630 PGF D12S1900|PGFL|PIGF|PLGF|PlGF-2|SHGC-10760 placental growth factor protein-coding 134.333-66 chr16 26085171 26085374 + 1 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) intron (NM_006040, intron 1 of 1) 60035 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 146.333-262 chr5 91542071 91542288 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -158862 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 159.333-346 chr9 10469632 10469794 + 1 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) L1MA4|LINE|L1 143289 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 182.333-50 chr14 103352394 103352703 + 1 NA Intergenic Looper|DNA|PiggyBac 14699 NR_002964 677811 Hs.658237 NR_002964 ENSG00000272533 SNORA28 ACA28 small nucleolar RNA, H/ACA box 28 snoRNA 139.667-164 chr6 146780814 146780958 + 1 NA intron (NM_024694, intron 29 of 35) L1M4|LINE|L1 22938 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 157.667-253 chr5 82442103 82442394 + 1 NA Intergenic Intergenic 162786 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 204.667-4 chr1 43427679 43428000 + 1 NA intron (NM_015284, intron 25 of 70) intron (NM_015284, intron 25 of 70) -20700 NR_106793 102465440 NR_106793 ENSG00000274975 MIR6735 hsa-mir-6735 microRNA 6735 ncRNA 146.333-245 chr4 169983926 169984075 + 1 NA Intergenic Intergenic -8098 NR_037878 100506085 Hs.649173 NR_037878 ENSG00000248319 LINC02275 - long intergenic non-protein coding RNA 2275 ncRNA 380.333-15 chr9 31394075 31394592 + 1 NA Intergenic Intergenic -12843 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 164.333 chr1 21766033 21766199 + 1 NA intron (NM_001350167, intron 1 of 26) AluSz6|SINE|Alu 17033 NM_001350168 84196 Hs.467524 NM_032236 ENSG00000090686 USP48 RAP1GA1|USP31 ubiquitin specific peptidase 48 protein-coding 199.333-186 chr3 101671848 101672102 + 1 NA intron (NM_014415, intron 2 of 10) intron (NM_014415, intron 2 of 10) -4455 NR_024407 100009676 Hs.743292 NR_024407 ENSG00000256628 ZBTB11-AS1 - ZBTB11 antisense RNA 1 ncRNA 281.667-24 chr17 60892218 60892581 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 10 of 25) AluSp|SINE|Alu 214548 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 207.333-179 chr3 43333694 43334142 + 1 NA intron (NM_001100594, intron 3 of 5) AluSg|SINE|Alu 18044 NR_046757 100873954 Hs.600984 NR_046757 SNRK-AS1 - SNRK antisense RNA 1 ncRNA 153.333-48 chr10 63476832 63477132 + 1 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) L1ME1|LINE|L1 -11005 NM_032776 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 144.667-80 chr14 47291067 47291343 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 52041 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 153.333-142 chr15 64400739 64400917 + 1 NA intron (NM_001321924, intron 5 of 12) intron (NM_001321924, intron 5 of 12) 12992 NM_016213 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 143.333-203 chr4 57459211 57459417 + 1 NA intron (NR_125907, intron 4 of 5) intron (NR_125907, intron 4 of 5) 33442 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 350.333-2 chr1 220659499 220660068 + 1 NA intron (NM_018650, intron 17 of 17) MIR3|SINE|MIR -30580 NM_024709 79762 Hs.519839 NM_024709 ENSG00000162817 C1orf115 - chromosome 1 open reading frame 115 protein-coding 259.333-82 chr5 131514444 131514813 + 1 NA intron (NM_016340, intron 7 of 27) L1MEf|LINE|L1 120601 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 137.333-192 chr8 68030859 68031167 + 1 NA intron (NM_024870, intron 6 of 39) intron (NM_024870, intron 6 of 39) 78967 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 197.333-103 chr2 41964518 41964781 + 1 NA Intergenic Intergenic -10843 NR_161189 400950 Hs.738713 NM_001242815 ENSG00000205086 C2orf91 - chromosome 2 open reading frame 91 ncRNA 143.667-259 chr8 130262693 130262895 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 33739 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 191.333-199 chr8 61654643 61655026 + 1 NA intron (NM_032468, intron 4 of 14) intron (NM_032468, intron 4 of 14) 34977 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 177.667-113 chr5 161256143 161256453 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 291826 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 261.333-105 chr8 114561924 114562361 + 1 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 1105871 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 254.333-58 chr4 32823289 32823691 + 1 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 472452 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 147.667-370 chr8 121175750 121175947 + 1 NA Intergenic Intergenic -363802 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 167.333-84 chr14 81148596 81148968 + 1 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 54052 NR_003021 677845 Hs.693251 NR_003021 ENSG00000221303 SNORA79 ACA65|SNORA79A small nucleolar RNA, H/ACA box 79 snoRNA 302.667-29 chr6 146989724 146990246 + 1 NA intron (NR_034115, intron 6 of 10) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -168940 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 161.333-137 chr19 49563975 49564168 + 1 NA intron (NM_001270960, intron 1 of 8) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 16485 NM_001270960 51070 Hs.7236 NM_015953 ENSG00000142546 NOSIP CGI-25 nitric oxide synthase interacting protein protein-coding 186.333-12 chr10 26564369 26564619 + 1 NA intron (NM_019043, intron 14 of 14) intron (NM_019043, intron 14 of 14) 14813 NR_134472 101929117 Hs.127031 NR_134472 LOC101929117 - uncharacterized LOC101929117 ncRNA 135.667-20 chr10 80158298 80158556 + 1 NA intron (NM_145869, intron 14 of 16) intron (NM_145869, intron 14 of 16) 25697 NM_001012973 219348 Hs.204947 NM_001012973 ENSG00000189129 PLAC9 - placenta associated 9 protein-coding 189.667-43 chr14 64057744 64058151 + 1 NA intron (NM_015180, intron 49 of 114) L1MA2|LINE|L1 37178 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 291.667-19 chr2 186049745 186050217 + 1 NA intron (NR_110218, intron 3 of 5) intron (NR_110218, intron 3 of 5) 36336 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 165.333-167 chr3 81789864 81790050 + 1 NA Intergenic Intergenic -28312 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 197.333-209 chr7 30044519 30044869 + 1 NA promoter-TSS (NM_001363474) promoter-TSS (NM_001363474) -391 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 136.667-6 chr1 88914896 88915096 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -23429 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 149.333-62 chr10 92863194 92863360 + 1 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) LTR37-int|LTR|ERV1 14757 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 213.333-114 chr20 56400405 56400651 + 1 NA intron (NM_001033521, intron 5 of 5) intron (NM_001033521, intron 5 of 5) 7883 NM_001033522 1477 Hs.172865 NM_001324 ENSG00000101138 CSTF1 CstF-50|CstFp50 cleavage stimulation factor subunit 1 protein-coding 141.667-247 chr9 78536121 78536351 + 1 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie 239111 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 215.667-80 chr3 23547036 23547356 + 1 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) intron (NM_001370225, intron 5 of 5) -258759 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 218.667-74 chr4 31812721 31813139 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -184449 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 151.333-159 chr16 59404256 59404454 + 1 NA Intergenic Intergenic 350836 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 269.333-2 chr10 27725780 27726310 + 1 NA intron (NM_001242702, intron 5 of 6) intron (NM_001242702, intron 5 of 6) -18570 NR_121652 101929202 Hs.568843 NR_121652 MKX-AS1 - MKX antisense RNA 1 ncRNA 142.333-209 chr5 157115133 157115320 + 1 NA Intergenic Intergenic -6182 NM_032782 84868 Hs.710500 NM_032782 ENSG00000135077 HAVCR2 CD366|HAVcr-2|KIM-3|SPTCL|TIM3|TIMD-3|TIMD3|Tim-3 hepatitis A virus cellular receptor 2 protein-coding 203.333-138 chr2 105009445 105009799 + 1 NA intron (NR_110603, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 -28447 NM_182640 64965 Hs.590900 NM_182640 ENSG00000135972 MRPS9 MRP-S9|RPMS9|S9mt mitochondrial ribosomal protein S9 protein-coding 139.333-69 chr14 46338186 46338336 + 1 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) MER66B|LTR|ERV1 -133098 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 146.667-68 chr12 15737835 15738128 + 1 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) L1MC5|LINE|L1 51407 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 271.667-75 chr8 131959698 131960266 + 1 NA intron (NR_136616, intron 8 of 23) L1MEd|LINE|L1 43209 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 317.667-18 chr17 31807747 31808394 + 1 NA Intergenic Helitron1Nb_Mam|RC|Helitron 50892 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 140.333-46 chr12 27666238 27666445 + 1 NA intron (NM_003622, intron 12 of 29) intron (NM_003622, intron 12 of 29) -30106 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 256.667-3 chr1 149996343 149996661 + 1 NA intron (NM_020205, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 14224 NM_020205 56957 Hs.98322 NM_020205 ENSG00000264522 OTUD7B CEZANNE|ZA20D1 OTU deubiquitinase 7B protein-coding 142.667-28 chr11 33327958 33328184 + 1 NA intron (NM_001278162, intron 2 of 15) intron (NM_001278162, intron 2 of 15) -48037 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 283.667-38 chrX 66049679 66050075 + 1 NA Intergenic Intergenic -9752 NM_001184830 11326 Hs.8904 NM_007268 ENSG00000155659 VSIG4 CRIg|Z39IG V-set and immunoglobulin domain containing 4 protein-coding 245.667-24 chr18 5302141 5302457 + 1 NA Intergenic Intergenic -5246 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 154.667-397 chr8 119126907 119127208 + 1 NA Intergenic MLT1K-int|LTR|ERVL-MaLR -58275 NR_134297 101927513 Hs.676598 NR_134297 ENSG00000254278 LOC101927513 - uncharacterized LOC101927513 ncRNA 163.333-195 chr4 32374419 32374700 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 23521 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 314.333-8 chr13 65563421 65563872 + 1 NA Intergenic Intergenic -302401 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 152.667-202 chr2 166555231 166555385 + 1 NA Intergenic Intergenic -68337 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 129.667-63 chr15 60596204 60596420 + 1 NA intron (NM_134260, intron 1 of 11) intron (NM_134260, intron 1 of 11) -3786 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 127.333-31 chr11 44029779 44029992 + 1 NA Intergenic Intergenic -18096 NM_001363113 390110 Hs.558851 NM_001031854 ENSG00000205126 ACCSL - 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase homolog (inactive) like protein-coding 217.333-86 chr22 32395212 32395537 + 1 NA intron (NM_014306, intron 8 of 11) intron (NM_014306, intron 8 of 11) 16873 NM_014306 51493 Hs.474643 NM_014306 ENSG00000100220 RTCB C22orf28|DJ149A16.6|FAAP|HSPC117 RNA 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH ligase protein-coding 170.667-90 chr2 195980435 195980718 + 1 NA intron (NM_018897, intron 15 of 64) L1MA3|LINE|L1 88261 NM_018897 56171 Hs.97403 NM_018897 ENSG00000118997 DNAH7 - dynein axonemal heavy chain 7 protein-coding 212.333-144 chr7 131011325 131011719 + 1 NA intron (NR_109850, intron 3 of 5) intron (NR_109850, intron 3 of 5) 95508 NR_024153 378805 Hs.150556 NM_001085379 ENSG00000231721 LINC-PINT LincRNA-Pint|MKLN1-AS1|PINT long intergenic non-protein coding RNA, p53 induced transcript ncRNA 167.667-136 chr3 66086237 66086410 + 1 NA Intergenic Intergenic -47287 NM_173471 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 151.333-32 chr1 202333616 202333817 + 1 NA intron (NM_001310326, intron 3 of 6) L1ME2z|LINE|L1 8220 NM_014176 29089 Hs.5199 NM_014176 ENSG00000077152 UBE2T FANCT|HSPC150|PIG50 ubiquitin conjugating enzyme E2 T protein-coding 156.667-337 chr8 88863729 88863927 + 1 NA Intergenic Intergenic -536345 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 263.333-82 chr8 80188580 80188984 + 1 NA Intergenic MER89-int|LTR|ERV1 -17218 NM_001025253 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 171.333-204 chr9 86291379 86291725 + 1 NA intron (NM_001185059, intron 26 of 26) AluSq2|SINE|Alu -9014 NM_030940 81689 Hs.449291 NM_030940 ENSG00000135070 ISCA1 HBLD2|ISA1|MMDS5|hIscA iron-sulfur cluster assembly 1 protein-coding 150.667-247 chr3 134728146 134728325 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -67025 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 195.667-114 chr6 35586987 35587288 + 1 NA intron (NM_001145777, intron 6 of 6) intron (NM_001145777, intron 6 of 6) -74241 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 314.334-4 chr2 161256800 161257392 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -2453 NR_110593 101929512 Hs.666488 NR_110593 LOC101929512 - uncharacterized LOC101929512 ncRNA 252.667-15 chr11 17566595 17566954 + 1 NA intron (NM_001277269, intron 14 of 54) L1MC3|LINE|L1 19401 NM_001277269 340990 Hs.688380 NM_198497 ENSG00000188162 OTOG DFNB18B|MLEMP|OTGN otogelin protein-coding 154.667-197 chr2 185056248 185056444 + 1 NA Intergenic Intergenic 110726 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 187.333-185 chr7 19123581 19123972 + 1 NA Intergenic Intergenic -6140 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 228.333-26 chr14 50248275 50248656 + 1 NA intron (NM_024884, intron 9 of 9) MIR|SINE|MIR -16887 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 167.667-198 chr7 94540246 94540482 + 1 NA intron (NM_001363428, intron 10 of 17) intron (NM_001363428, intron 10 of 17) 30555 NM_022900 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 338.333-17 chr7 42052691 42053173 + 1 NA intron (NM_000168, intron 4 of 14) intron (NM_000168, intron 4 of 14) 184277 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 149.667-316 chr5 62091136 62091430 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -214879 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 153.667-18 chr1 106561380 106561682 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -256708 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 126.333-42 chr13 69516173 69516381 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 293931 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 174.667-68 chr17 16151290 16151612 + 1 NA intron (NM_001190440, intron 7 of 44) intron (NM_001190440, intron 7 of 44) 1745 NR_145787 109623477 NR_145787 SNORD163 - small nucleolar RNA, C/D box 163 snoRNA 134.667-82 chr17 63783298 63783490 + 1 NA intron (NM_007372, intron 2 of 18) intron (NM_007372, intron 2 of 18) 9205 NM_007372 11325 Hs.702010 NM_007372 ENSG00000198231 DDX42 DDX42P|RHELP|RNAHP|SF3B8|SF3b125 DEAD-box helicase 42 protein-coding 299.667-30 chr5 157037485 157037989 + 1 NA intron (NM_001173393, intron 6 of 8) intron (NM_001173393, intron 6 of 8) 20504 NM_012206 26762 Hs.129711 NM_012206 ENSG00000113249 HAVCR1 CD365|HAVCR|HAVCR-1|KIM-1|KIM1|TIM|TIM-1|TIM1|TIMD-1|TIMD1 hepatitis A virus cellular receptor 1 protein-coding 301.333-28 chr2 194063407 194063875 + 1 NA Intergenic Intergenic -280628 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 182.333-24 chr11 46667720 46667972 + 1 NA exon (NM_001205121, exon 13 of 17) exon (NM_001205121, exon 13 of 17) 32773 NM_004308 392 Hs.138860 NM_004308 ENSG00000175220 ARHGAP1 CDC42GAP|RHOGAP|RHOGAP1|p50rhoGAP Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 183.667-54 chr15 76671603 76671919 + 1 NA intron (NR_148227, intron 20 of 32) AluY|SINE|Alu 85114 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 170.333-121 chr2 190908273 190908519 + 1 NA intron (NM_014905, intron 6 of 17) intron (NM_014905, intron 6 of 17) 27575 NM_014905 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 316.333-18 chr2 105438067 105438536 + 1 NA intron (NM_201557, intron 1 of 5) intron (NM_201557, intron 1 of 5) 212 NM_001318897 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 432.667-2 chr10 126367397 126368012 + 1 NA intron (NM_001288974, intron 1 of 18) L1MEg|LINE|L1 20773 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 143.667-105 chr17 72565122 72565272 + 1 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) L1ME4c|LINE|L1 27607 NR_152515 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 160.333-78 chr12 77439289 77439592 + 1 NA Intergenic Intergenic -373871 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 151.667-316 chr6 90434298 90434456 + 1 NA Intergenic Intergenic 121635 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 155.333-100 chr14 36136866 36137040 + 1 NA intron (NR_049735, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 39698 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 138.667-17 chr10 66011171 66011442 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 15 of 17) intron (NM_001127384, intron 15 of 17) 439881 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 240.333-51 chr2 157423873 157424238 + 1 NA intron (NM_004288, intron 6 of 7) L1MEi|LINE|L1 20034 NM_004288 9595 Hs.270 NM_004288 ENSG00000115165 CYTIP B3-1|CASP|CYBR|CYTHIP|HE|PSCDBP cytohesin 1 interacting protein protein-coding 333.667 chr1 952967 953523 + 1 NA exon (NM_015658, exon 9 of 19) exon (NM_015658, exon 9 of 19) 6011 NM_015658 26155 Hs.405987 NM_015658 ENSG00000188976 NOC2L NET15|NET7|NIR|PPP1R112 NOC2 like nucleolar associated transcriptional repressor protein-coding 159.333-43 chr10 51892418 51892630 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) intron (NM_001098512, intron 4 of 17) -192929 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 139.667-194 chr8 120984614 120984753 + 1 NA Intergenic Intergenic -172637 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 184.667-137 chr8 111710275 111710544 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 333770 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 175.667-138 chr8 9636679 9637072 + 1 NA intron (NM_003747, intron 3 of 26) intron (NM_003747, intron 3 of 26) 80963 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 226.333 chr1 10024587 10024904 + 1 NA Intergenic Intergenic -8213 NM_001105562 10277 Hs.593974 NM_006048 ENSG00000130939 UBE4B E4|HDNB1|UBOX3|UFD2|UFD2A ubiquitination factor E4B protein-coding 141.333-118 chr2 145262168 145262411 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 594322 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 208.667-37 chr12 46338543 46338807 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 34098 NM_001307936 54407 Hs.221847 NM_018976 ENSG00000134294 SLC38A2 ATA2|PRO1068|SAT2|SNAT2 solute carrier family 38 member 2 protein-coding 142.333-208 chr5 155711801 155712041 + 1 NA Intergenic Intergenic -614836 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 251.667-80 chr5 67744267 67744713 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -48723 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 220.667-47 chr2 116119468 116119937 + 1 NA Intergenic Intergenic 775887 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 233.333-106 chr5 78177923 78178324 + 1 NA intron (NM_003664, intron 8 of 26) MIRc|SINE|MIR 116575 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 157.667-92 chr13 94391791 94392006 + 1 NA intron (NM_005708, intron 7 of 8) L1MB3|LINE|L1 87784 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 256.333-21 chr11 111688005 111688451 + 1 NA intron (NM_015191, intron 4 of 14) intron (NM_015191, intron 4 of 14) 78161 NM_181699 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 153.333-147 chr15 76274114 76274357 + 1 NA intron (NM_000126, intron 9 of 11) intron (NM_000126, intron 9 of 11) -14083 NR_028510 7302 Hs.684881 NR_002721 TYRO3P - TYRO3P protein tyrosine kinase pseudogene pseudo 247.333-12 chr10 114068193 114068570 + 1 NA Intergenic Intergenic 24515 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 159.667-242 chr4 139788176 139788364 + 1 NA intron (NM_018717, intron 2 of 4) intron (NM_018717, intron 2 of 4) 122451 NM_001204368 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 193.667-102 chr5 54593915 54594343 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 76370 NM_001102575 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 147.667-18 chr1 174231195 174231473 + 1 NA non-coding (NR_158982, exon 4 of 27) non-coding (NR_158982, exon 4 of 27) -43766 NM_001366449 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 148.333-215 chr2 227474616 227474886 + 1 NA intron (NM_004504, intron 1 of 12) intron (NM_004504, intron 1 of 12) 2579 NM_001135187 3267 Hs.352962 NM_004504 ENSG00000173744 AGFG1 HRB|RAB|RIP ArfGAP with FG repeats 1 protein-coding 155.667-346 chr8 56820098 56820288 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 173674 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 214.667-117 chr8 88952201 88952588 + 1 NA Intergenic Intergenic -624911 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 148.333-99 chr12 70658225 70658409 + 1 NA intron (NM_130846, intron 8 of 9) L2c|LINE|L2 -20888 NM_001330204 5787 Hs.201030 NM_002837 ENSG00000127329 PTPRB HPTP-BETA|HPTPB|PTPB|R-PTP-BETA|VEPTP protein tyrosine phosphatase receptor type B protein-coding 157.333-250 chr4 12326098 12326327 + 1 NA Intergenic Intergenic 102761 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 266.333-2 chr1 118839247 118839651 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 148894 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 144.667-298 chr8 90120706 90120964 + 1 NA Intergenic Intergenic -37956 NM_004929 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 140.333-26 chr10 33137804 33138018 + 1 NA Intergenic Intergenic -21104 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 219.333-174 chr7 103290653 103291008 + 1 NA Intergenic Intergenic -6605 NM_004279 9512 Hs.184211 NM_004279 ENSG00000105819 PMPCB Beta-MPP|MPP11|MPPB|MPPP52|P-52 peptidase, mitochondrial processing beta subunit protein-coding 120.667-143 chr5 102175903 102176097 + 1 NA Intergenic Intergenic 120284 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 164.667-4 chr1 74466543 74466724 + 1 NA intron (NM_015978, intron 21 of 24) intron (NM_015978, intron 21 of 24) 16807 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 138.667-182 chr6 103349624 103349815 + 1 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 1509827 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 134.667-29 chr10 107979662 107979813 + 1 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 89556 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 116.333-155 chr4 61081168 61081363 + 1 NA Intergenic Intergenic -62391 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 146.333-92 chr14 59567864 59568138 + 1 NA intron (NM_001164399, intron 4 of 19) intron (NM_001164399, intron 4 of 19) 8811 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 237.667-77 chr7 88447610 88448124 + 1 NA Intergenic Intergenic -140973 NM_001205316 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 270.667-18 chr17 49233908 49234226 + 1 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -3280 NM_178500 162466 Hs.405607 NM_178500 ENSG00000173868 PHOSPHO1 - phosphoethanolamine/phosphocholine phosphatase protein-coding 179.667-29 chr11 75871961 75872255 + 1 NA intron (NM_003369, intron 3 of 14) intron (NM_003369, intron 3 of 14) 56898 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 255.333-91 chr6 145779443 145779884 + 1 NA intron (NR_038246, intron 1 of 2) L1MEf|LINE|L1 35132 NM_001348092 84085 Hs.421095 NM_032145 ENSG00000118496 FBXO30 Fbx30 F-box protein 30 protein-coding 161.333-172 chr21 16068618 16068790 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -1784 NR_136541 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 266.667-66 chr6 80383143 80383581 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 276691 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 145.333-160 chr20 45718819 45719001 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -3437 NM_178455 391253 Hs.677891 NM_178455 ENSG00000149651 SPINT4 C20orf137|SPINT3|dJ601O1.1 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 protein-coding 124.333-189 chrUn_KI270438v1 97375 97515 + 1 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 171.667-80 chr2 44954290 44954528 + 1 NA Intergenic Intergenic -12531 NR_103786 100506108 Hs.503113 NR_103785 ENSG00000236502 SIX3-AS1 SIX3OS SIX3 antisense RNA 1 ncRNA 200.667-83 chr2 125022029 125022432 + 1 NA Intergenic Intergenic 996943 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 167.333-209 chr5 91312904 91313172 + 1 NA intron (NR_103549, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 1364 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 126.667-20 chr10 112810414 112810658 + 1 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -12960 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 157.333-83 chr12 42393535 42393736 + 1 NA exon (NM_001364824, exon 7 of 9) exon (NM_001364824, exon 7 of 9) 61837 NM_001364834 51535 Hs.444157 NM_016488 ENSG00000134283 PPHLN1 CR|HSPC206|HSPC232 periphilin 1 protein-coding 161.667-273 chr9 103979226 103979506 + 1 NA Intergenic LTR16B1|LTR|ERVL -20343 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 150.667-31 chr10 19861711 19862008 + 1 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 45427 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 159.667-213 chr3 76689013 76689193 + 1 NA Intergenic Intergenic -350996 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 149.333-18 chr1 111436995 111437243 + 1 NA Intergenic Intergenic -9384 NM_002557 5016 Hs.1154 NM_002557 ENSG00000085465 OVGP1 CHIT5|EGP|MUC9|OGP oviductal glycoprotein 1 protein-coding 227.333-133 chr9 131715953 131716404 + 1 NA intron (NM_001304275, intron 1 of 23) intron (NM_001304275, intron 1 of 23) -6336 NM_198679 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 392.333-7 chr4 37633274 37633887 + 1 NA intron (NM_001085400, intron 5 of 6) intron (NM_001085400, intron 5 of 6) 49347 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 155.667-136 chr18 2782926 2783098 + 1 NA intron (NM_015295, intron 44 of 47) intron (NM_015295, intron 44 of 47) -63994 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 146.333-114 chr16 7892804 7892954 + 1 NA Intergenic Intergenic 560034 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 206.333-141 chr6 74699311 74699618 + 1 NA Intergenic Intergenic 429318 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 196.667-115 chr4 182829295 182829549 + 1 NA Intergenic Intergenic 87831 NM_001351744 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 205.333-20 chr1 200230813 200231176 + 1 NA Intergenic Intergenic 142798 NR_040064 554279 Hs.434694 NR_040064 ENSG00000203721 LINC00862 C1orf98|SMIM16 long intergenic non-protein coding RNA 862 ncRNA 189.667-55 chr16 5516111 5516509 + 1 NA Intergenic Intergenic 99940 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 160.333-211 chr4 60578166 60578328 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -344372 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 211.667-94 chr5 120724746 120725108 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 193463 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 192.667-179 chr8 129455005 129455384 + 1 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 28948 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 199.333-172 chr22 31714207 31714430 + 1 NA exon (NM_173566, exon 4 of 9) exon (NM_173566, exon 4 of 9) 35814 NM_173566 253143 Hs.438906 NM_173566 ENSG00000183530 PRR14L C22orf30 proline rich 14 like protein-coding 143.667-2 chr1 37584577 37584728 + 1 NA intron (NM_001323624, intron 4 of 14) L1MB3|LINE|L1 11285 NM_013285 29889 Hs.75528 NM_013285 ENSG00000134697 GNL2 HUMAUANTIG|NGP1|Ngp-1|Nog2|Nug2 G protein nucleolar 2 protein-coding 142.667-197 chr6 158446870 158447059 + 1 NA intron (NM_020245, intron 3 of 13) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -89472 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 175.333-112 chr22 38150944 38151148 + 1 NA intron (NM_001349869, intron 2 of 16) AluSz|SINE|Alu 30784 NM_001004426 8398 Hs.170479 NM_003560 ENSG00000184381 PLA2G6 CaI-PLA2|GVI|INAD1|IPLA2-VIA|NBIA2|NBIA2A|NBIA2B|PARK14|PLA2|PNPLA9|iPLA2|iPLA2beta phospholipase A2 group VI protein-coding 175.333-36 chr13 100865955 100866251 + 1 NA intron (NR_047687, intron 2 of 7) L1MA9|LINE|L1 78261 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 150.333-133 chr15 70295978 70296230 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -198187 NM_001282980 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 158.667-181 chr2 222863733 222863939 + 1 NA intron (NM_001354159, intron 1 of 14) intron (NM_001354159, intron 1 of 14) 2800 NM_001354159 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 159.667-129 chr17 9943487 9943673 + 1 NA intron (NM_003644, intron 2 of 9) intron (NM_003644, intron 2 of 9) 15915 NM_003644 8522 Hs.462214 NM_003644 ENSG00000007237 GAS7 - growth arrest specific 7 protein-coding 263.667-40 chr18 1634514 1634930 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -275093 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 141.333-72 chr15 97598564 97598745 + 1 NA Intergenic Intergenic -37956 NR_110756 101927310 Hs.560324 NR_110756 ENSG00000259582 LOC101927310 - uncharacterized LOC101927310 ncRNA 154.667-413 chr9 84861193 84861350 + 1 NA intron (NM_001018065, intron 13 of 14) intron (NM_001018065, intron 13 of 14) 155370 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 152.667-232 chr22 31665407 31665689 + 1 NA Intergenic Intergenic -2984 NM_001326411 23761 Hs.420559 NM_014338 ENSG00000241878 PISD DJ858B16|PSD|PSDC|PSSC|dJ858B16.2 phosphatidylserine decarboxylase protein-coding 199.333-183 chr3 84670509 84670912 + 1 NA intron (NR_033860, intron 18 of 20) intron (NR_033860, intron 18 of 20) 198865 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 144.667-248 chr5 155767961 155768228 + 1 NA Intergenic Intergenic -558663 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 198.667-177 chr7 106265882 106266213 + 1 NA intron (NM_005746, intron 6 of 10) MIRc|SINE|MIR 18936 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 136.667-108 chr21 30519492 30519683 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -17446 NM_181611 337972 Hs.553694 NM_181611 ENSG00000186977 KRTAP19-5 KAP19.5 keratin associated protein 19-5 protein-coding 111.667-61 chr12 38040604 38040770 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -276087 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 178.667-82 chr2 121979686 121979879 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 224131 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 252.333-74 chr8 52294216 52294598 + 1 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) intron (NR_148195, intron 2 of 3) -39915 NM_001352849 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 116.667-98 chr2 82652333 82652507 + 1 NA Intergenic Intergenic -204383 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 200.667-84 chr2 127335705 127336008 + 1 NA intron (NM_006609, intron 4 of 15) intron (NM_006609, intron 4 of 15) 7373 NM_006609 10746 Hs.145605 NM_006609 ENSG00000169967 MAP3K2 MEKK2|MEKK2B mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 protein-coding 173.667-198 chrX 95207130 95207338 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -144008 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 237.667-18 chr14 31502542 31502916 + 1 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -14690 NM_001197184 2856 Hs.727479 NM_001197184 ENSG00000214943 GPR33 - G protein-coupled receptor 33 (gene/pseudogene) protein-coding 145.667-58 chr12 39719921 39720100 + 1 NA intron (NR_135051, intron 12 of 18) intron (NR_135051, intron 12 of 18) 93827 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 230.333-27 chr12 27297698 27297963 + 1 NA exon (NM_015000, exon 2 of 14) exon (NM_015000, exon 2 of 14) -35006 NM_020183 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 298.667-26 chr7 55299484 55299901 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -44057 NR_110426 102725541 Hs.590524 NR_110426 ELDR Fabl|LINC01156 EGFR long non-coding downstream RNA ncRNA 163.333-111 chr16 27659873 27660159 + 1 NA intron (NM_015202, intron 6 of 27) intron (NM_015202, intron 6 of 27) 59013 NR_147898 100128079 Hs.610277 NR_147898 LOC100128079 - uncharacterized LOC100128079 ncRNA 168.333-176 chr6 52539935 52540217 + 1 NA intron (NM_012288, intron 1 of 10) intron (NM_012288, intron 1 of 10) 36984 NM_012288 9697 Hs.520182 NM_012288 ENSG00000065308 TRAM2 - translocation associated membrane protein 2 protein-coding 131.667-99 chr2 125286179 125286444 + 1 NA Intergenic Intergenic 831674 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 342.667-15 chr8 82059426 82059971 + 1 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -217412 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 151.667-22 chr1 168674968 168675258 + 1 NA Intergenic Intergenic 54093 NM_001937 1805 Hs.80552 NM_001937 ENSG00000143196 DPT TRAMP dermatopontin protein-coding 148.333-13 chr1 84044214 84044400 + 1 NA Intergenic Intergenic -33668 NM_002731 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 131.667-3 chr1 42480938 42481113 + 1 NA intron (NM_001355227, intron 2 of 18) AluJr|SINE|Alu 17739 NM_001355227 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 177.667-94 chr4 38023629 38023847 + 1 NA intron (NM_001253912, intron 6 of 20) L1MB3|LINE|L1 63340 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 156.333-292 chr5 118615404 118615643 + 1 NA intron (NR_104998, intron 4 of 4) intron (NR_104998, intron 4 of 4) 19335 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 145.333-324 chrX 40376523 40376707 + 1 NA Intergenic Intergenic 113698 NR_110386 101927476 Hs.522607 NR_110386 ENSG00000236393 LOC101927476 - uncharacterized LOC101927476 ncRNA 142.667-142 chr3 152233408 152233649 + 1 NA Intergenic Intergenic -28099 NR_136178 101928166 NR_136178 LOC101928166 - uncharacterized LOC101928166 ncRNA 204.667-103 chr4 32679764 32680096 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 328892 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 151.333-386 chr7 39484704 39484897 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -78454 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 158.667-207 chr3 45972365 45972621 + 1 NA intron (NM_024513, intron 6 of 17) MIRc|SINE|MIR 23331 NM_024513 79443 Hs.200227 NM_024513 ENSG00000163820 FYCO1 CATC2|CTRCT18|RUFY3|ZFYVE7 FYVE and coiled-coil domain containing 1 protein-coding 154.667-98 chr14 19915467 19915638 + 1 NA Intergenic Intergenic -5055 NM_001005483 79317 Hs.554585 NM_001005483 ENSG00000176281 OR4K5 OR14-16 olfactory receptor family 4 subfamily K member 5 protein-coding 286.667-17 chr19 43610339 43610696 + 1 NA intron (NM_182498, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 -1571 NM_001145641 100170229 Hs.722032 NM_001145641 ENSG00000226763 SRRM5 ZNF576 serine/arginine repetitive matrix 5 protein-coding 180.333-86 chr3 121947268 121947555 + 1 NA Intergenic Intergenic 53010 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 158.333-306 chr7 102852179 102852450 + 1 NA intron (NM_001287150, intron 16 of 18) intron (NM_001287150, intron 16 of 18) -60686 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 292.333-40 chr7 35322387 35322839 + 1 NA intron (NR_038864, intron 1 of 2) LTR16A|LTR|ERVL 8758 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 165.333-152 chr21 36797063 36797237 + 1 NA intron (NM_001352515, intron 6 of 10) AluSz|SINE|Alu 98035 NM_005069 6493 Hs.146186 NM_005069 ENSG00000159263 SIM2 HMC13F06|HMC29C01|SIM|bHLHe15 SIM bHLH transcription factor 2 protein-coding 159.333-248 chr5 2065691 2065863 + 1 NA Intergenic Intergenic 178446 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 163.333-18 chr1 181610790 181611192 + 1 NA intron (NM_001205293, intron 6 of 47) MIRb|SINE|MIR 127474 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 149.667-184 chr2 15017526 15017759 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 384925 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 160.333-108 chr15 36215529 36215755 + 1 NA Intergenic Intergenic 288786 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 365.667-7 chr15 65680672 65681281 + 1 NA intron (NM_005848, intron 22 of 31) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 15960 NR_145750 109617020 NR_145750 ENSG00000238311 SNORD13E - small nucleolar RNA, C/D box 13E snoRNA 242.333-51 chr2 138908547 138909061 + 1 NA Intergenic Intergenic 11480 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 213.667-92 chr8 104660659 104661007 + 1 NA Intergenic Intergenic -71809 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 216.667-106 chr8 118408642 118409014 + 1 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) intron (NM_001349811, intron 3 of 4) -212173 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 219.667-4 chr1 158766744 158767027 + 1 NA promoter-TSS (NM_001005185) promoter-TSS (NM_001005185) -203 NM_001005185 128372 Hs.553592 NM_001005185 ENSG00000197403 OR6N1 OR1-22 olfactory receptor family 6 subfamily N member 1 protein-coding 212.333-49 chr14 87133208 87133568 + 1 NA Intergenic Intergenic 227610 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 119.333-202 chr7 80926548 80926706 + 1 NA Intergenic LTR12|LTR|ERV1 -4238 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 211.667-38 chr13 82358955 82359212 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1132100 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 159.333-269 chr5 79543905 79544136 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -29886 NM_004272 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 209.667-39 chr12 119517494 119517752 + 1 NA intron (NM_178499, intron 8 of 13) intron (NM_178499, intron 8 of 13) -76151 NM_001136534 387890 Hs.530965 NM_001136534 ENSG00000224982 TMEM233 DSPB2|IFITMD2 transmembrane protein 233 protein-coding 159.333-191 chr20 62878378 62878561 + 1 NA 3' UTR (NM_001193369, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001193369, exon 16 of 16) 4434 NR_145839 109623463 NR_145839 SNORA117 - small nucleolar RNA, H/ACA box 117 snoRNA 175.667-59 chr18 43205179 43205504 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 72149 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 211.333-61 chr14 58621253 58621693 + 1 NA Intergenic Intergenic -12595 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 160.333-189 chr3 88200267 88200590 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 50469 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 134.333-192 chrX 129757974 129758242 + 1 NA intron (NM_003399, intron 14 of 20) intron (NM_003399, intron 14 of 20) 19129 NM_003399 7512 Hs.170499 NM_003399 ENSG00000122121 XPNPEP2 AEACEI|APP2 X-prolyl aminopeptidase 2 protein-coding 186.667-20 chr10 106252623 106252953 + 1 NA Intergenic Intergenic 112623 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 157.333-71 chr11 105628571 105628759 + 1 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 17959 NR_046356 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 130.667-21 chr10 21818745 21818894 + 1 NA intron (NM_022365, intron 8 of 11) intron (NM_022365, intron 8 of 11) 184911 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 267.667-2 chr1 37058342 37058661 + 1 NA Intergenic Intergenic -23986 NM_000831 2899 Hs.128848 NM_000831 ENSG00000163873 GRIK3 EAA5|GLR7|GLUR7|GluK3|GluR7a glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 3 protein-coding 142.667-195 chr6 126732354 126732526 + 1 NA Intergenic Intergenic 247809 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 159.333-113 chr16 56974328 56974487 + 1 NA intron (NM_000078, intron 9 of 15) AluJr|SINE|Alu 12457 NM_001286085 1071 Hs.89538 NM_000078 ENSG00000087237 CETP BPIFF|HDLCQ10 cholesteryl ester transfer protein protein-coding 127.333-79 chr2 61345256 61345460 + 1 NA intron (NM_014709, intron 15 of 79) intron (NM_014709, intron 15 of 79) 72019 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 268.667-60 chr8 31519534 31519884 + 1 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -120043 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 112.333-14 chr1 216739530 216739692 + 1 NA intron (NM_001243513, intron 1 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie -16139 NM_001243519 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 162.667-162 chr21 24801325 24801591 + 1 NA Intergenic Intergenic -39092 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 153.333-236 chr20 7226899 7227157 + 1 NA intron (NR_110609, intron 3 of 7) AluJb|SINE|Alu 27174 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 334.333-10 chr12 57143511 57144045 + 1 NA TTS (NR_131938) TTS (NR_131938) 3841 NR_131938 105751187 Hs.609540 NR_131938 ENSG00000259125 LRP1-AS - LRP1 antisense RNA ncRNA 226.667-85 chr7 34707323 34707666 + 1 NA intron (NM_001300934, intron 2 of 6) intron (NM_001300934, intron 2 of 6) 49255 NM_001300935 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 162.667-272 chr8 89027758 89027957 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -700374 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 207.667-33 chr14 78639680 78640152 + 1 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) MIRc|SINE|MIR 236197 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 117.333-97 chr2 51819855 51819990 + 1 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) intron (NR_135237, intron 6 of 10) -550726 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 309.333-3 chr1 158367532 158368106 + 1 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 13925 NM_001185108 913 Hs.249217 NM_030893 ENSG00000158488 CD1E CD1A|R2 CD1e molecule protein-coding 170.333-36 chr10 90960002 90960202 + 1 NA intron (NR_131214, intron 3 of 5) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 12802 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 206.667-123 chr6 157928330 157928565 + 1 NA intron (NM_016224, intron 11 of 17) intron (NM_016224, intron 11 of 17) -53416 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 149.333-192 chr2 119530883 119531082 + 1 NA Intergenic tRNA-Glu-GAG_|tRNA|tRNA -6530 NM_002980 6344 Hs.42091 NM_002980 ENSG00000080293 SCTR SR secretin receptor protein-coding 374.334-3 chr8 86890129 86890754 + 1 NA intron (NM_173538, intron 2 of 10) L1MA7|LINE|L1 24026 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 133.667-17 chr10 17558277 17558499 + 1 NA Intergenic Intergenic 58986 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 152.667-188 chr2 100281034 100281290 + 1 NA 3' UTR (NM_198461, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_198461, exon 12 of 12) 41571 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 194.333-4 chr1 54086786 54087104 + 1 NA intron (NM_153035, intron 3 of 4) intron (NM_153035, intron 3 of 4) 32866 NR_039942 100616315 NR_039942 ENSG00000283749 MIR4781 mir-4781 microRNA 4781 ncRNA 158.333-55 chr11 43290579 43290877 + 1 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -21268 NM_001142931 8539 Hs.435771 NM_006595 ENSG00000166181 API5 AAC-11|AAC11 apoptosis inhibitor 5 protein-coding 152.667-66 chr11 96786614 96786815 + 1 NA Intergenic Intergenic 278289 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 157.333-171 chr2 37095350 37095672 + 1 NA exon (NM_174931, exon 8 of 9) exon (NM_174931, exon 8 of 9) 11060 NM_001278505 253635 Hs.595250 NM_174931 ENSG00000152133 GPATCH11 CCDC75|CENP-Y|CENPY G-patch domain containing 11 protein-coding 123.333-147 chr3 113844794 113844960 + 1 NA intron (NM_017577, intron 2 of 17) intron (NM_017577, intron 2 of 17) 6089 NM_017577 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 152.333-34 chr10 12799627 12799838 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 8 of 11) intron (NM_001351032, intron 8 of 11) -74379 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 156.667-64 chr11 77025465 77025662 + 1 NA 3' UTR (NM_018367, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_018367, exon 11 of 11) -8835 NM_138706 192134 Hs.352622 NM_138706 ENSG00000198488 B3GNT6 B3Gn-T6|BGnT-6|beta-1,3-Gn-T6|beta3Gn-T6 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 protein-coding 173.667-160 chr7 17750681 17750897 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 189705 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 155.667-31 chr1 225036985 225037179 + 1 NA intron (NM_001367479, intron 11 of 85) L1PA14|LINE|L1 107407 NM_001349912 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 261.333-63 chr3 21989246 21989808 + 1 NA Intergenic Intergenic 32388 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 157.333-154 chr17 58880210 58880381 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) MER34|LTR|ERV1 124426 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 163.333-27 chr10 7965920 7966087 + 1 NA intron (NM_031923, intron 3 of 6) intron (NM_031923, intron 3 of 6) 86488 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 191.333-98 chr18 63813413 63813708 + 1 NA Intergenic Intergenic 35783 NM_001261830 8710 Hs.138202 NM_003784 ENSG00000166396 SERPINB7 MEGSIN|PPKN|TP55 serpin family B member 7 protein-coding 188.333-66 chr2 16308892 16309097 + 1 NA Intergenic Intergenic 258567 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 150.667-133 chr15 68942286 68942547 + 1 NA intron (NM_001184780, intron 1 of 15) L1M4|LINE|L1 11891 NM_001184780 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 151.667 chr1 22458688 22458955 + 1 NA intron (NM_001083621, intron 2 of 18) AluJr|SINE|Alu 6970 NM_014870 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 196.333-3 chr1 77665175 77665448 + 1 NA intron (NM_001308237, intron 1 of 13) intron (NM_001308237, intron 1 of 13) 17347 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 206.333-121 chr4 66896815 66897093 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 525046 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 262.333-77 chr8 109282196 109282513 + 1 NA intron (NM_032869, intron 5 of 9) L1PA16|LINE|L1 47579 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 157.667-107 chr15 36485764 36485938 + 1 NA Intergenic Intergenic -93775 NM_001321759 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 158.667-142 chr19 30440112 30440347 + 1 NA intron (NM_014717, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 67845 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 151.333-363 chr6 75488804 75489103 + 1 NA intron (NR_110608, intron 1 of 1) intron (NR_110608, intron 1 of 1) 4847 NM_015687 27145 Hs.201488 NM_015687 ENSG00000118407 FILIP1 FILIP filamin A interacting protein 1 protein-coding 146.667-293 chr6 151367457 151367679 + 1 NA intron (NM_020861, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 23991 NM_020861 57621 Hs.520073 NM_020861 ENSG00000181472 ZBTB2 ZNF437 zinc finger and BTB domain containing 2 protein-coding 151.333-36 chr1 225579074 225579273 + 1 NA intron (NM_001008493, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 73950 NM_018212 55740 Hs.497893 NM_018212 ENSG00000154380 ENAH ENA|MENA|NDPP1 ENAH actin regulator protein-coding 192.667-138 chr5 108125080 108125343 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) L1MA3|LINE|L1 256887 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 170.667-68 chr18 5277283 5277486 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 18342 NM_001243702 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 184.667-116 chr6 114171621 114171846 + 1 NA intron (NR_125845, intron 6 of 9) MIRc|SINE|MIR -108856 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 135.667-87 chr2 43516776 43516947 + 1 NA intron (NM_001083953, intron 22 of 37) intron (NM_001083953, intron 22 of 37) 79113 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 287.333-9 chr11 5558790 5559200 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -13472 NM_001005289 390067 Hs.554540 NM_001005289 ENSG00000181616 OR52H1 OR11-41|OR11-45 olfactory receptor family 52 subfamily H member 1 protein-coding 163.667-136 chr20 53129984 53130199 + 1 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) -55192 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 174.667-146 chr5 122798737 122799001 + 1 NA intron (NM_003100, intron 2 of 14) L2a|LINE|L2 23789 NM_003100 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 264.333-50 chr3 111350610 111351107 + 1 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -191339 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 174.667-85 chr2 74558928 74559157 + 1 NA intron (NM_001281296, intron 9 of 9) intron (NM_001281296, intron 9 of 9) 4882 NM_001318868 1796 Hs.103854 NM_001381 ENSG00000115325 DOK1 P62DOK|pp62 docking protein 1 protein-coding 154.333-173 chr2 194683929 194684114 + 1 NA Intergenic Intergenic -46574 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 125.667-6 chr1 71634018 71634277 + 1 NA intron (NM_173808, intron 4 of 6) intron (NM_173808, intron 4 of 6) 202865 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 126.667-141 chr5 85652736 85652950 + 1 NA Intergenic Intergenic -629601 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 227.333-137 chrX 105463155 105463475 + 1 NA intron (NM_017416, intron 5 of 10) intron (NM_017416, intron 5 of 10) -242622 NM_031274 56157 Hs.567543 NM_031274 ENSG00000268629 TEX13A - testis expressed 13A protein-coding 162.333-22 chr10 15453704 15454001 + 1 NA Intergenic Intergenic -82563 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 297.333-50 chr7 48260983 48261419 + 1 NA intron (NM_152701, intron 15 of 61) intron (NM_152701, intron 15 of 61) 89743 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 374.333-11 chr4 169141037 169141525 + 1 NA intron (NM_020870, intron 4 of 11) intron (NM_020870, intron 4 of 11) 129675 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 243.333-84 chr5 4789977 4790516 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 16765 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 224.667-81 chr8 94543915 94544280 + 1 NA intron (NM_015496, intron 1 of 23) intron (NM_015496, intron 1 of 23) 9372 NM_015496 25962 Hs.202238 NM_015496 ENSG00000164944 VIRMA KIAA1429|MSTP054|fSAP121 vir like m6A methyltransferase associated protein-coding 146.333-75 chr13 43749077 43749272 + 1 NA intron (NM_001347969, intron 1 of 16) intron (NM_001347969, intron 1 of 16) 37798 NM_001347970 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 276.667-21 chr13 72165729 72166165 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -298743 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 148.333-357 chr7 26045283 26045515 + 1 NA Intergenic Intergenic -95413 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 201.667-97 chr5 140871923 140872298 + 1 NA TTS (NM_031861) TTS (NM_031861) -3198 NM_031864 56137 Hs.199343 NM_018903 ENSG00000251664 PCDHA12 PCDH-ALPHA12 protocadherin alpha 12 protein-coding 162.333-157 chr3 27949649 27949829 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -115603 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 167.667-180 chr6 35727819 35728112 + 1 NA intron (NR_027117, intron 9 of 9) CpG 618 NM_001145775 2289 Hs.407190 NM_004117 ENSG00000096060 FKBP5 AIG6|FKBP51|FKBP54|P54|PPIase|Ptg-10 FKBP prolyl isomerase 5 protein-coding 205.667-21 chr10 121138686 121139012 + 1 NA Intergenic Intergenic 287487 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 149.333-250 chr3 96697805 96697998 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -116693 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 265.667-20 chr14 68706936 68707411 + 1 NA Intergenic Intergenic -78386 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 291.333-40 chr2 180859734 180860063 + 1 NA intron (NR_104324, intron 4 of 4) MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -120487 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 118.667-79 chr16 11848854 11849029 + 1 NA intron (NM_015659, intron 2 of 8) AluSz6|SINE|Alu 2601 NM_015659 26156 Hs.401842 NM_015659 ENSG00000171490 RSL1D1 CSIG|L12|PBK1|UTP30 ribosomal L1 domain containing 1 protein-coding 120.667-21 chr10 74670460 74670610 + 1 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) intron (NM_001369124, intron 9 of 9) -141211 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 141.667-207 chr7 33975753 33975965 + 1 NA intron (NM_133468, intron 7 of 15) intron (NM_133468, intron 7 of 15) 70320 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 209.667-91 chr5 14209093 14209427 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 65918 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 159.333-4 chr1 28546013 28546243 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6889 NR_003109 54952 Hs.533626 NM_017846 ENSG00000180098 TRNAU1AP PRO1902|SECP43|TRSPAP1 tRNA selenocysteine 1 associated protein 1 protein-coding 213.667-61 chr3 184970311 184970693 + 1 NA intron (NM_001009921, intron 38 of 46) L2c|LINE|L2 157995 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 227.333-118 chr7 94452279 94452545 + 1 NA Intergenic Intergenic -57397 NM_001363426 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 143.667-228 chr7 11294897 11295083 + 1 NA Intergenic Intergenic 321118 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 151.667-342 chr7 99111516 99111787 + 1 NA intron (NM_020429, intron 1 of 18) L1M4|LINE|L1 32457 NM_001199847 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 245.333-119 chr8 107935654 107936180 + 1 NA intron (NM_001282863, intron 4 of 4) L1MA4A|LINE|L1 146022 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 220.333-80 chr21 32230860 32231210 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 48014 NM_018944 54069 Hs.190518 NM_018944 ENSG00000159055 MIS18A B28|C21orf45|C21orf46|FASP1|MIS18alpha|hMis18alpha MIS18 kinetochore protein A protein-coding 118.667-56 chr12 51499261 51499412 + 1 NA intron (NM_001039960, intron 22 of 24) intron (NM_001039960, intron 22 of 24) 74219 NM_001258403 9498 Hs.4749 NM_004858 ENSG00000050438 SLC4A8 NBC3|NDCBE solute carrier family 4 member 8 protein-coding 134.667-124 chr21 25809059 25809259 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -73505 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 129.667-125 chr3 192896000 192896203 + 1 NA intron (NM_178496, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 21755 NM_178496 151963 Hs.151443 NM_178496 ENSG00000180611 MB21D2 C3orf59 Mab-21 domain containing 2 protein-coding 161.667-177 chr3 134117001 134117207 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -59456 NR_135574 100507210 Hs.669052 NR_135574 ENSG00000243832 LINC02000 - long intergenic non-protein coding RNA 2000 ncRNA 143.333-192 chr3 133507616 133507841 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -16582 NR_135277 85003 Hs.659202 NR_135276 ENSG00000249993 BFSP2-AS1 - BFSP2 antisense RNA 1 ncRNA 249.333-107 chrX 83100097 83100395 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -408044 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 206.667-12 chr1 239128579 239128932 + 1 NA Intergenic (AGATTTAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -257813 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 178.667-138 chr5 169831391 169831695 + 1 NA intron (NR_156756, intron 26 of 52) intron (NR_156756, intron 26 of 52) 148952 NM_001129891 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 155.333-160 chr2 57601353 57601528 + 1 NA Intergenic Intergenic -306211 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 160.667-224 chr4 73270746 73271057 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -12103 NM_198889 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 217.667-89 chr8 112914197 112914531 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 8 of 66) intron (NM_001363185, intron 8 of 66) 270871 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 126.333-165 chr7 46829192 46829365 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -132156 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 151.667-393 chr9 79112429 79112592 + 1 NA Intergenic Intergenic 33156 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 151.667-388 chr9 26816796 26816966 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 75921 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 186.667-79 chr2 221470460 221470696 + 1 NA intron (NM_001363748, intron 5 of 17) intron (NM_001363748, intron 5 of 17) 101726 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 149.333-88 chr12 33506945 33507200 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -67253 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 166.333-104 chr2 21587449 21587643 + 1 NA Intergenic Intergenic 123106 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 154.333-286 chr6 14562306 14562555 + 1 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL -276976 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 133.333-180 chr8 79633800 79634006 + 1 NA intron (NM_007029, intron 1 of 4) intron (NM_007029, intron 1 of 4) 22786 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 162.333-66 chr14 40508745 40509001 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -445838 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 152.667-160 chr19 46092985 46093211 + 1 NA Intergenic Intergenic -15469 NR_163177 444882 Hs.531310 NM_001002923 ENSG00000204869 IGFL4 - IGF like family member 4 protein-coding 144.333-78 chr14 68251175 68251429 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 377485 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 155.667-275 chr5 64179202 64179490 + 1 NA intron (NM_001113561, intron 1 of 7) L1ME3Cz|LINE|L1 13503 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 186.333-169 chr8 124297748 124298002 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -50477 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 163.333-287 chr8 117676939 117677229 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 156371 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 196.667-9 chr1 242500664 242500955 + 1 NA intron (NM_001320272, intron 2 of 10) intron (NM_001320272, intron 2 of 10) 23887 NM_152666 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 195.333-21 chr1 209498175 209498536 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 66222 NR_029622 406988 NR_029622 ENSG00000284485 MIR205 MIRN205|mir-205 microRNA 205 ncRNA 345.667-10 chr18 11038876 11039428 + 1 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) intron (NM_022068, intron 2 of 51) 109610 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 146.667-297 chr7 4394168 4394409 + 1 NA Intergenic (TCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -259451 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 272.333-66 chrX 105782094 105782421 + 1 NA Intergenic Intergenic -40282 NM_198465 203447 Hs.209527 NM_198465 ENSG00000123572 NRK NESK Nik related kinase protein-coding 304.667-18 chr2 62449677 62450255 + 1 NA Intergenic Intergenic 56229 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 143.333-174 chr3 15156198 15156437 + 1 NA Intergenic Intergenic 49642 NR_027927 344875 Hs.722756 NR_027927 ENSG00000230524 COL6A4P1 COL6A4|COL6A4P|DIVA|DVWA|VWA6 collagen type VI alpha 4 pseudogene 1 pseudo 225.667-33 chr17 62371604 62371888 + 1 NA intron (NM_001144933, intron 1 of 11) intron (NM_001144933, intron 1 of 11) 1528 NM_001144933 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 141.333-251 chr9 18414564 18414740 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -59501 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 165.667-89 chr2 41418595 41418860 + 1 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -458828 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 172.333-192 chr9 16594517 16594905 + 1 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) MIRc|SINE|MIR -132103 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-7 chr1 96718428 96718596 + 1 NA Intergenic Intergenic -3093 NM_001300988 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 169.333-284 chr9 32156677 32156935 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -227797 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 268.667-34 chr2 107323354 107323725 + 1 NA intron (NR_049853, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 25986 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 157.667-264 chr5 149876037 149876236 + 1 NA intron (NM_000440, intron 17 of 21) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 56841 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 136.333-158 chr5 2085912 2086049 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 198649 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 142.333-248 chr9 7605371 7605710 + 1 NA Intergenic Intergenic 194238 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 136.667-145 chr5 89605238 89605385 + 1 NA Intergenic Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 411409 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 295.333-59 chr9 85725419 85726023 + 1 NA intron (NM_015239, intron 1 of 25) AluJo|SINE|Alu 16308 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 228.333-43 chr19 40679891 40680199 + 1 NA intron (NM_001289979, intron 5 of 8) intron (NM_001289979, intron 5 of 8) 10119 NM_001289980 9253 Hs.326953 NM_004756 ENSG00000105245 NUMBL CAG3A|CTG3a|NBL|NUMB-R|NUMBLIKE|NUMBR|TNRC23 NUMB like endocytic adaptor protein protein-coding 226.667-57 chr21 32065698 32066057 + 1 NA Intergenic Intergenic 20418 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 154.667-77 chr12 45568925 45569176 + 1 NA Intergenic Intergenic 158871 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 165.667-223 chrX 112138806 112139097 + 1 NA intron (NM_001004308, intron 2 of 2) L1MD3|LINE|L1 55926 NM_001004308 340595 Hs.368140 NM_001004308 ENSG00000187823 RTL4 Mar4|Mart4|SIRH11|ZCCHC16 retrotransposon Gag like 4 protein-coding 150.333-208 chr2 123554293 123554500 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 470778 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 457.667-5 chr5 85502136 85502722 + 1 NA Intergenic Intergenic -780015 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 153.667-310 chr5 33602046 33602344 + 1 NA intron (NM_001324512, intron 14 of 21) intron (NM_001324512, intron 14 of 21) 161419 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 307.333-76 chr8 28144814 28145402 + 1 NA intron (NM_018091, intron 10 of 14) intron (NM_018091, intron 10 of 14) 51969 NM_001284220 55140 Hs.491336 NM_018091 ENSG00000134014 ELP3 KAT9 elongator acetyltransferase complex subunit 3 protein-coding 261.667-32 chr19 11234521 11234839 + 1 NA intron (NM_001367830, intron 21 of 48) MIR|SINE|MIR -4939 NM_018687 55908 Hs.534467 NM_018687 ENSG00000130173 ANGPTL8 C19orf80|PRO1185|PVPA599|RIFL|TD26 angiopoietin like 8 protein-coding 193.667-18 chr10 66119077 66119480 + 1 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) 547853 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 150.333-74 chr12 15003648 15003897 + 1 NA intron (NR_120466, intron 2 of 3) intron (NR_120466, intron 2 of 3) 1939 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 362.667-12 chr2 75438460 75438985 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -85346 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 151.667-287 chr5 112312755 112312947 + 1 NA intron (NM_001347887, intron 1 of 23) intron (NM_001347887, intron 1 of 23) 84568 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 119.667-143 chr5 23860583 23860722 + 1 NA Intergenic Intergenic -90696 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 143.667-242 chr8 13140280 13140538 + 1 NA intron (NM_001348082, intron 5 of 16) AluJo|SINE|Alu -7120 NM_006094 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 158.333-23 chr1 196541911 196542196 + 1 NA intron (NM_001287820, intron 1 of 26) intron (NM_001287820, intron 1 of 26) 40428 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 188.333-100 chr3 159835991 159836255 + 1 NA intron (NM_001197113, intron 5 of 10) intron (NM_001197113, intron 5 of 10) -3738 NM_001197109 29970 Hs.134665 NM_014575 ENSG00000151967 SCHIP1 SCHIP-1 schwannomin interacting protein 1 protein-coding 201.333-304 chr9 135424602 135424861 + 1 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 47518 NR_038969 100506599 Hs.561897 NR_038969 ENSG00000225361 PPP1R26-AS1 - PPP1R26 antisense RNA 1 ncRNA 148.333-260 chr3 123030239 123030481 + 1 NA Intergenic Intergenic -1755 NR_046079 54437 Hs.210870 NM_018987 ENSG00000082684 SEMA5B SEMAG|SemG semaphorin 5B protein-coding 167.333-36 chr10 21202651 21202834 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 28440 NR_046284 100128511 Hs.635827 NR_046283 ENSG00000231920 NEBL-AS1 - NEBL antisense RNA 1 ncRNA 243.333-32 chr14 63650225 63650637 + 1 NA Intergenic Intergenic -8560 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 216.333-140 chr8 121126206 121126527 + 1 NA Intergenic Intergenic -314320 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 151.333-219 chr2 124239263 124239453 + 1 NA intron (NM_130773, intron 2 of 23) intron (NM_130773, intron 2 of 23) 214071 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 125.333-155 chr6 54758173 54758329 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -88520 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 200.333-91 chr3 14164707 14164999 + 1 NA non-coding (NR_148950, exon 7 of 15) non-coding (NR_148950, exon 7 of 15) 13748 NR_148950 7508 Hs.475538 NM_004628 ENSG00000154767 XPC RAD4|XP3|XPCC|p125 XPC complex subunit, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 146.333-356 chr9 116545755 116546008 + 1 NA intron (NR_033973, intron 4 of 11) intron (NR_033973, intron 4 of 11) 41598 NR_033973 100128505 Hs.675821 NR_033973 ENSG00000229105 ASTN2-AS1 - ASTN2 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-5 chr1 41159808 41160010 + 1 NA non-coding (NR_135092, exon 3 of 16) non-coding (NR_135092, exon 3 of 16) 1523 NM_001031694 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 154.333-224 chr3 109789710 109789884 + 1 NA Intergenic Intergenic 186969 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 175.333-188 chr8 99729618 99729937 + 1 NA intron (NM_017890, intron 39 of 61) intron (NM_017890, intron 39 of 61) 163930 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 155.667-333 chr7 80858129 80858389 + 1 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) MER5A|DNA|hAT-Charlie 60792 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 184.333-129 chr6 63310814 63311058 + 1 NA intron (NM_001143940, intron 1 of 4) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 9041 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 132.667-3 chr1 64179620 64179790 + 1 NA 3' UTR (NM_005012, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_005012, exon 9 of 9) -23918 NM_152489 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 184.667-70 chr20 35657990 35658291 + 1 NA intron (NM_001198840, intron 1 of 1) MIR3|SINE|MIR -4231 NM_003915 8904 Hs.246413 NM_003915 ENSG00000214078 CPNE1 COPN1|CPN1 copine 1 protein-coding 242.333-94 chr7 96326272 96326615 + 1 NA Intergenic Intergenic -4296 NM_001160210 10165 Hs.489190 NM_014251 ENSG00000004864 SLC25A13 ARALAR2|CITRIN|CTLN2 solute carrier family 25 member 13 protein-coding 117.333-46 chr12 106221845 106222056 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 26070 NM_006825 10970 Hs.74368 NM_006825 ENSG00000136026 CKAP4 CLIMP-63|ERGIC-63|p63 cytoskeleton associated protein 4 protein-coding 165.333-188 chr4 71236659 71236879 + 1 NA intron (NM_001098484, intron 2 of 25) intron (NM_001098484, intron 2 of 25) 49483 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 211.333-89 chr17 69979657 69980003 + 1 NA intron (NR_110875, intron 2 of 4) intron (NR_110875, intron 2 of 4) 18123 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 117.333-44 chr12 26458513 26458697 + 1 NA intron (NM_002223, intron 45 of 56) intron (NM_002223, intron 45 of 56) 263032 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 134.333-33 chr11 119900320 119900524 + 1 NA Intergenic Intergenic 170839 NR_120587 102724301 Hs.637640 NR_120587 ENSG00000254854 LOC102724301 - uncharacterized LOC102724301 ncRNA 144.333-102 chr18 13701554 13701733 + 1 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) MER57-int|LTR|ERV1 24915 NM_152352 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 273.667-23 chr15 52013696 52014088 + 1 NA intron (NR_156732, intron 1 of 1) intron (NR_156732, intron 1 of 1) 5203 NR_156732 112543478 NR_156732 MAPK6-DT lncMAPK6 MAPK6 divergent transcript ncRNA 156.667-110 chr14 71403070 71403280 + 1 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) 4838 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 333.333-51 chr8 53037674 53038104 + 1 NA Intergenic Intergenic 97981 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 224.667-47 chr2 216767745 216768072 + 1 NA Intergenic Intergenic -72359 NM_000599 3488 Hs.607212 NM_000599 ENSG00000115461 IGFBP5 IBP5 insulin like growth factor binding protein 5 protein-coding 259.333-2 chr1 65587344 65587796 + 1 NA intron (NM_001003679, intron 5 of 19) MIRc|SINE|MIR 61881 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 331.667-6 chr17 40776264 40776760 + 1 NA TTS (NM_181537) TTS (NM_181537) -4353 NM_181539 353288 Hs.592133 NM_181539 ENSG00000186393 KRT26 CK26|K25|K25IRS2|K26|KRT25B keratin 26 protein-coding 188.667-37 chr12 101476605 101476820 + 1 NA intron (NM_152323, intron 1 of 5) intron (NM_152323, intron 1 of 5) 1376 NM_152323 121599 Hs.577097 NM_152323 ENSG00000166211 SPIC SPI-C Spi-C transcription factor protein-coding 146.333-235 chr4 78939880 78940154 + 1 NA promoter-TSS (NR_146462) promoter-TSS (NR_146462) -579 NR_146464 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 160.667-300 chr8 62261393 62261553 + 1 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 12619 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 140.667-47 chr11 26802385 26802629 + 1 NA Intergenic Intergenic -80447 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 144.667-229 chr5 3566582 3566821 + 1 NA Intergenic Intergenic -29131 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 233.333-104 chr5 55254336 55254859 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -20880 NR_125347 10309 Hs.3041 NM_021147 ENSG00000152669 CCNO CCNU|CILD29|UDG2 cyclin O protein-coding 199.333-34 chr10 106553346 106553646 + 1 NA Intergenic Intergenic 413331 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 189.333-220 chrX 89189396 89189761 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 442353 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 255.667-71 chr5 65648909 65649250 + 1 NA intron (NM_001365342, intron 4 of 10) AluJb|SINE|Alu 24052 NM_001365341 112441434 NM_001365341 SHLD3 CTC-534A2.2|RINN1 shieldin complex subunit 3 protein-coding 168.667-221 chr8 99607389 99607561 + 1 NA intron (NM_017890, intron 33 of 61) intron (NM_017890, intron 33 of 61) -70614 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 156.667-72 chr12 1185171 1185392 + 1 NA intron (NR_027948, intron 10 of 19) AluJr4|SINE|Alu 157533 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 163.333-129 chr18 6344657 6344964 + 1 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) L1MA10|LINE|L1 14220 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 175.667-127 chr6 130732307 130732608 + 1 NA Intergenic MER57E2|LTR|ERV1 -94948 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 154.667-183 chr2 109634356 109634512 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 20070 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 197.333-67 chr14 60535988 60536305 + 1 NA Intergenic Intergenic 27000 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 153.333-207 chr2 101653620 101653920 + 1 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 -43933 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 133.333-138 chr4 170137278 170137494 + 1 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL -46999 NM_001286683 51166 Hs.529735 NM_016228 ENSG00000109576 AADAT KAT2|KATII|KYAT2 aminoadipate aminotransferase protein-coding 244.333-85 chr5 77279534 77280100 + 1 NA intron (NM_001029853, intron 1 of 20) intron (NM_001029853, intron 1 of 20) 69137 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 141.667-249 chr9 89397933 89398172 + 1 NA intron (NM_001371200, intron 7 of 20) LTR28B|LTR|ERV1 79201 NM_001282690 79048 Hs.59804 NM_024077 ENSG00000187742 SECISBP2 SBP2 SECIS binding protein 2 protein-coding 150.333-154 chr17 48232802 48233044 + 1 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -61424 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 226.333-9 chr10 67947329 67947679 + 1 NA intron (NM_022079, intron 20 of 25) L1M4|LINE|L1 56102 NM_001314049 23411 Hs.369779 NM_012238 ENSG00000096717 SIRT1 SIR2|SIR2L1|SIR2alpha sirtuin 1 protein-coding 155.667-398 chrX 55195068 55195244 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -11549 NR_132964 106635544 NR_132964 SNORA109 - small nucleolar RNA, H/ACA box 109 snoRNA 196.667-89 chr21 31584604 31584962 + 1 NA Intergenic Intergenic 25550 NM_001321023 150051 Hs.708976 NM_001321023 LOC150051 - uncharacterized LOC150051 protein-coding 199.667-63 chr18 6227858 6228082 + 1 NA intron (NM_001365769, intron 10 of 16) intron (NM_001365769, intron 10 of 16) -28774 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 121.667-117 chr21 25166466 25166682 + 1 NA Intergenic Intergenic 265127 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 120.667-102 chr2 162350656 162350791 + 1 NA intron (NM_001330271, intron 2 of 7) intron (NM_001330271, intron 2 of 7) 6355 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 145.333-240 chr5 100808110 100808334 + 1 NA 3' UTR (NM_005668, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_005668, exon 5 of 5) 8343 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 158.667-98 chr14 57995683 57995910 + 1 NA Intergenic Intergenic -129704 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 148.333-119 chr14 49133427 49133661 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 452836 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 305.667 chr1 27687959 27688404 + 1 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL -15989 NM_022873 2537 Hs.523847 NM_002038 ENSG00000126709 IFI6 6-16|FAM14C|G1P3|IFI-6-16|IFI616 interferon alpha inducible protein 6 protein-coding 203.333-260 chr8 74562685 74563008 + 1 NA Intergenic Intergenic -14237 NR_049871 100847091 NR_049871 ENSG00000283505 MIR5681B - microRNA 5681b ncRNA 280.667-52 chr7 98915078 98915583 + 1 NA intron (NM_003496, intron 18 of 70) AluSq2|SINE|Alu 33633 NR_132754 106633801 NR_132754 SCARNA28 ZL1 small Cajal body-specific RNA 28 ncRNA 158.667-163 chr2 106077048 106077321 + 1 NA intron (NM_032411, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 11496 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 205.667-44 chr13 112584373 112584814 + 1 NA intron (NM_006322, intron 1 of 21) MER20B|DNA|hAT-Charlie 3560 NM_001286278 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 192.667-16 chr1 218636277 218636689 + 1 NA intron (NR_031644, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 126388 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 152.333-373 chr8 65557833 65558102 + 1 NA intron (NR_033893, intron 1 of 4) intron (NR_033893, intron 1 of 4) 4699 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 141.667-188 chr5 173983029 173983201 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -6055 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 146.333-37 chr10 111514856 111515033 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 400653 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 245.667-57 chr5 107738798 107739274 + 1 NA Intergenic Intergenic -68099 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 220.667-15 chr10 97408454 97408765 + 1 NA Intergenic Intergenic -7239 NM_001145114 23223 Hs.434251 NM_015179 ENSG00000052749 RRP12 KIAA0690 ribosomal RNA processing 12 homolog protein-coding 154.667-361 chr7 29162742 29162953 + 1 NA intron (NM_001293069, intron 2 of 13) L1MD2|LINE|L1 16300 NM_001293069 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 228.667-46 chr2 191120259 191120648 + 1 NA intron (NM_003151, intron 3 of 23) AluJb|SINE|Alu 30541 NM_003151 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 202.667-20 chr10 82448899 82449289 + 1 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -216174 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 291.667-40 chr9 28300201 28300634 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) intron (NM_001354574, intron 4 of 5) 418888 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 175.667-35 chr13 101760457 101760716 + 1 NA intron (NM_175929, intron 3 of 4) intron (NM_175929, intron 3 of 4) 156059 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 115.667-152 chr3 177971745 177971894 + 1 NA Intergenic Intergenic 154954 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 272.333-48 chr4 70218790 70219121 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -7169 NM_152997 260436 Hs.733448 NM_152997 ENSG00000181617 FDCSP C4orf7|FDC-SP follicular dendritic cell secreted protein protein-coding 373.333-20 chr3 132145274 132145820 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -105941 NM_153429 131034 Hs.199877 NM_130808 ENSG00000196353 CPNE4 COPN4|CPN4 copine 4 protein-coding 150.667-357 chr7 105282332 105282623 + 1 NA intron (NM_001350746, intron 2 of 14) L1MB7|LINE|L1 -13400 NM_001350739 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 161.333-216 chr4 77489339 77489655 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -22256 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 181.667-87 chr21 25446789 25447036 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -15211 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 246.667-44 chr2 135563370 135563744 + 1 NA intron (NM_001282799, intron 1 of 22) intron (NM_001282799, intron 1 of 22) -22795 NM_001354199 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 129.667-150 chr6 69970108 69970340 + 1 NA intron (NM_001858, intron 11 of 50) intron (NM_001858, intron 11 of 50) 103668 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 151.333-143 chr15 45328298 45328539 + 1 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -49196 NR_120335 101928414 NR_120335 ENSG00000259520 LOC101928414 - uncharacterized LOC101928414 ncRNA 156.667-311 chr7 12517558 12517788 + 1 NA intron (NR_136263, intron 1 of 3) L1MA4A|LINE|L1 13276 NR_136263 102725191 Hs.602382 NR_136261 ENSG00000226690 LOC102725191 - uncharacterized LOC102725191 ncRNA 148.333-362 chr7 38857784 38857966 + 1 NA intron (NM_014396, intron 4 of 28) MER4D1|LTR|ERV1 51316 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 141.667-175 chr5 34572955 34573115 + 1 NA Intergenic Intergenic -83293 NM_015577 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 163.667-191 chr4 186562885 186563094 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -7422 NM_005958 4543 Hs.243467 NM_005958 ENSG00000168412 MTNR1A MEL-1A-R|MT1 melatonin receptor 1A protein-coding 160.333-83 chr13 24890052 24890378 + 1 NA intron (NR_047594, intron 10 of 17) L1ME2z|LINE|L1 32646 NR_047595 55835 Hs.513379 NM_018451 ENSG00000151849 CENPJ BM032|CENP-J|CPAP|LAP|LIP1|MCPH6|SASS4|SCKL4|Sas-4 centromere protein J protein-coding 139.333-215 chr8 82305394 82305587 + 1 NA Intergenic Intergenic -463204 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 311.333-62 chrX 66036128 66036511 + 1 NA intron (NM_001257403, intron 1 of 7) intron (NM_001257403, intron 1 of 7) 3761 NM_007268 11326 Hs.8904 NM_007268 ENSG00000155659 VSIG4 CRIg|Z39IG V-set and immunoglobulin domain containing 4 protein-coding 215.667-9 chr1 219327743 219328006 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 152905 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 161.667-18 chr1 187263850 187264073 + 1 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) 171119 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 160.333-70 chr11 132174398 132174598 + 1 NA intron (NM_016522, intron 2 of 6) intron (NM_016522, intron 2 of 6) -109804 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 184.667-143 chr9 123814650 123814882 + 1 NA intron (NM_001352968, intron 2 of 18) intron (NM_001352968, intron 2 of 18) 115360 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 154.667-58 chr11 10296509 10296725 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -2410 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 115.333-83 chr15 63076681 63076930 + 1 NA Intergenic Intergenic -27418 NR_147233 111064646 Hs.602995 NR_147233 TPM1-AS TPM1-AS1 TPM1 antisense RNA ncRNA 149.667-298 chr5 2233736 2233953 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 78357 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 138.667-207 chr8 106613763 106613940 + 1 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -43957 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 193.667-35 chr12 70859095 70859429 + 1 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) MER5B|DNA|hAT-Charlie 61476 NM_002849 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 303.667-9 chr16 47427830 47428352 + 1 NA intron (NM_030790, intron 6 of 17) AluJb|SINE|Alu 32972 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 264.667-66 chr5 76710461 76710844 + 1 NA Intergenic Intergenic -1751 NR_028375 100302746 NR_028375 NCRUPAR NCRNA00193|ncR-uPAR non-protein coding RNA, upstream of F2R/PAR1 ncRNA 299.667-8 chr14 45896546 45896914 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -167429 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 151.667-34 chr1 219649193 219649358 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -36130 NM_001355457 643136 Hs.647764 NM_001085394 ENSG00000215817 ZC3H11B ZC3HDC11B zinc finger CCCH-type containing 11B protein-coding 145.333-206 chr4 27432473 27432652 + 1 NA Intergenic Intergenic 215083 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 192.667-112 chr3 130424030 130424293 + 1 NA intron (NM_001278298, intron 29 of 40) intron (NM_001278298, intron 29 of 40) 78645 NM_153264 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 153.333-228 chr2 224258922 224259123 + 1 NA Intergenic Intergenic 142972 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 232.667-69 chr6 143994934 143995322 + 1 NA intron (NM_001289040, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 13131 NM_001080954 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 178.667-115 chr4 47462898 47463186 + 1 NA intron (NM_001329668, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 660 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 146.333-126 chr17 70253650 70253822 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 84201 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 293.667-57 chr8 76793048 76793444 + 1 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -109971 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 169.333-249 chr7 80464768 80464984 + 1 NA intron (NM_001102386, intron 5 of 7) intron (NM_001102386, intron 5 of 7) 47188 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 228.333-51 chr2 142106933 142107285 + 1 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 24592 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 163.667-103 chr2 42415201 42415371 + 1 NA Intergenic Intergenic -46329 NM_001319036 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 139.667-12 chr1 168081507 168081734 + 1 NA 3' UTR (NM_001349634, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001349634, exon 8 of 8) 54816 NM_001267612 23432 Hs.271809 NM_007369 ENSG00000143147 GPR161 RE2 G protein-coupled receptor 161 protein-coding 151.667-386 chr9 20870178 20870368 + 1 NA intron (NM_017794, intron 20 of 45) intron (NM_017794, intron 20 of 45) 83346 NR_145762 109616992 NR_145762 ENSG00000202189 SNORA30B - small nucleolar RNA, H/ACA box 30B snoRNA 181.333-6 chr1 203316562 203316920 + 1 NA Intergenic Intergenic 11222 NM_006763 7832 Hs.519162 NM_006763 ENSG00000159388 BTG2 APRO1|PC3|TIS21 BTG anti-proliferation factor 2 protein-coding 134.667-71 chr15 64604669 64604865 + 1 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 98514 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 169.667-220 chrX 66352233 66352499 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 184616 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 152.333-270 chr4 61194931 61195214 + 1 NA Intergenic Intergenic -6158 NM_001371343 254.667-75 chr6 147901930 147902524 + 1 NA Intergenic Intergenic -370101 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 143.667-47 chr12 1278785 1278958 + 1 NA intron (NR_027948, intron 14 of 19) intron (NR_027948, intron 14 of 19) -221620 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 276.333-28 chr2 203131790 203132382 + 1 NA exon (NM_001114132, exon 25 of 55) exon (NM_001114132, exon 25 of 55) -106355 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 192.667-188 chrX 83336001 83336354 + 1 NA Intergenic Intergenic -172113 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 165.667-6 chr1 99962620 99962821 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -7276 NM_001271684 23443 Hs.448979 NM_012243 ENSG00000117620 SLC35A3 AMRS solute carrier family 35 member A3 protein-coding 148.667-16 chr1 151955670 151955839 + 1 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 38105 NM_002966 6281 Hs.143873 NM_002966 ENSG00000197747 S100A10 42C|ANX2L|ANX2LG|CAL1L|CLP11|Ca[1]|GP11|P11|p10 S100 calcium binding protein A10 protein-coding 199.667-59 chr17 43780269 43780498 + 1 NA promoter-TSS (NM_001353400) promoter-TSS (NM_001353400) -52 NM_001136483 284067 Hs.252707 NM_001136483 ENSG00000231256 CFAP97D1 C17orf105 CFAP97 domain containing 1 protein-coding 147.333-8 chr1 47015004 47015256 + 1 NA intron (NM_001320290, intron 1 of 11) intron (NM_001320290, intron 1 of 11) -8539 NM_178033 260293 Hs.439760 NM_178033 ENSG00000186377 CYP4X1 CYPIVX1 cytochrome P450 family 4 subfamily X member 1 protein-coding 191.667-33 chr11 128246472 128246776 + 1 NA Intergenic Intergenic 37858 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 150.333-22 chr1 177937567 177937864 + 1 NA intron (NM_033127, intron 18 of 25) (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 32207 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 229.333-81 chr3 128303528 128303919 + 1 NA intron (NM_021937, intron 4 of 6) L1M5|LINE|L1 -149809 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 142.333-125 chr2 133223876 133224063 + 1 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -42226 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 326.667-15 chr15 62945810 62946379 + 1 NA Intergenic Intergenic -96653 NM_001018004 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 214.333-24 chr10 123523504 123523802 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -142702 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 237.333-110 chr7 33337754 33338196 + 1 NA intron (NM_198428, intron 10 of 22) intron (NM_198428, intron 10 of 22) 208411 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 151.333-419 chr8 84822278 84822443 + 1 NA intron (NM_001287244, intron 3 of 7) intron (NM_001287244, intron 3 of 7) 116433 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 251.333-14 chr10 90612284 90612743 + 1 NA Intergenic Intergenic -71708 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 116.333-76 chr15 92906827 92906997 + 1 NA intron (NM_001042572, intron 2 of 12) intron (NM_001042572, intron 2 of 12) 2513 NR_036136 100422995 NR_036136 ENSG00000284324 MIR3175 mir-3175 microRNA 3175 ncRNA 270.667-36 chr4 28772084 28772451 + 1 NA Intergenic Intergenic -47315 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 135.333-165 chr6 157121191 157121370 + 1 NA intron (NM_020732, intron 7 of 19) intron (NM_020732, intron 7 of 19) 84853 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 172.667-150 chr7 51523785 51524022 + 1 NA Intergenic Intergenic -130647 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 148.333-79 chr11 126532688 126532888 + 1 NA intron (NM_001301097, intron 2 of 15) intron (NM_001301097, intron 2 of 15) -119990 NR_120532 101929427 Hs.600341 NR_120532 ENSG00000254607 LOC101929427 - uncharacterized LOC101929427 ncRNA 164.667-71 chr14 49303885 49304084 + 1 NA Intergenic Intergenic 282396 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 271.667-25 chr14 52252230 52252655 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -15256 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 177.333-137 chr5 169928458 169928728 + 1 NA intron (NM_001346304, intron 1 of 3) intron (NM_001346304, intron 1 of 3) 51902 NM_001129891 100131897 Hs.721917 NM_001129891 ENSG00000204767 INSYN2B C5orf57|FAM196B inhibitory synaptic factor family member 2B protein-coding 120.333-171 chr7 47185603 47185763 + 1 NA Intergenic Intergenic 279120 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 155.333-114 chr15 26917423 26917593 + 1 NA intron (NM_001165037, intron 7 of 10) L1M3d|LINE|L1 50382 NM_001165037 2558 Hs.24969 NM_000810 ENSG00000186297 GABRA5 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit protein-coding 152.333-69 chr11 108252443 108252667 + 1 NA intron (NM_001351834, intron 12 of 63) intron (NM_001351834, intron 12 of 63) 29026 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 267.333-43 chr18 5100341 5100698 + 1 NA Intergenic LTR29|LTR|ERV1 19337 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 169.333-20 chr10 28593016 28593250 + 1 NA intron (NM_100486, intron 6 of 12) intron (NM_100486, intron 6 of 12) 60015 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 230.333-111 chr7 101403988 101404334 + 1 NA intron (NM_133457, intron 1 of 12) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 41286 NM_001278563 136227 Hs.654854 NM_133457 ENSG00000160963 COL26A1 EMI6|EMID2|EMU2|SH2B collagen type XXVI alpha 1 chain protein-coding 159.333-312 chr7 80993325 80993492 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -71019 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 252.667-60 chr22 34829101 34829482 + 1 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 168625 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 260.667-86 chr7 134375141 134375558 + 1 NA Intergenic Intergenic -58419 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 249.333-56 chr2 121042273 121042732 + 1 NA Intergenic Intergenic 242700 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 181.667-12 chr10 36180681 36180953 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 402515 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 152.667-214 chr2 225753349 225753627 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 352602 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 147.667-84 chr13 28944023 28944282 + 1 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) L1MA4|LINE|L1 -80305 NM_001033602 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 233.333-54 chr18 78098362 78098728 + 1 NA Intergenic Intergenic -104818 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 150.667-198 chr2 193675539 193675711 + 1 NA Intergenic Intergenic -668644 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 167.667-217 chr9 71117793 71118042 + 1 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 3704 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 175.667-55 chr17 48338288 48338554 + 1 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) AluSq2|SINE|Alu 44074 NR_131239 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 116.333-132 chr21 26301705 26301859 + 1 NA Intergenic Tigger6b|DNA|TcMar-Tigger -91853 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 190.333-53 chr16 50850709 50851066 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -27886 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 213.333-183 chr6 144960050 144960401 + 1 NA Intergenic Intergenic 554570 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 123.667-129 chr3 168361831 168362056 + 1 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) intron (NR_021485, intron 3 of 15) 112421 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 123.667-11 chr1 101525031 101525189 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 201273 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 212.667-8 chr1 176636231 176636512 + 1 NA intron (NM_021936, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 173196 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 291.333-7 chr10 58380677 58381173 + 1 NA Intergenic Intergenic -4218 NM_001270782 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 154.667-212 chr2 221969712 221969915 + 1 NA Intergenic Intergenic -328334 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 257.333-31 chr14 44849312 44849780 + 1 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -47729 NM_001017923 122525 Hs.82098 NM_001017923 ENSG00000179476 C14orf28 DRIP-1|DRIP1|c14_5270 chromosome 14 open reading frame 28 protein-coding 209.333-115 chr2 86784907 86785236 + 1 NA non-coding (NR_027353, exon 7 of 7) non-coding (NR_027353, exon 7 of 7) 6643 NM_001768 925 Hs.85258 NM_001768 ENSG00000153563 CD8A CD8|Leu2|p32 CD8a molecule protein-coding 167.333-116 chr18 5806665 5806865 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -33930 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 187.333-162 chr5 112118686 112119071 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -41648 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 159.333-9 chr1 62853055 62853362 + 1 NA intron (NM_178221, intron 10 of 10) HAL1|LINE|L1 69076 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 329.667-14 chr5 24376064 24376635 + 1 NA Intergenic Intergenic 268629 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 284.667-9 chr11 129849254 129849656 + 1 NA intron (NM_001331210, intron 2 of 6) MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR 33607 NM_138788 120224 Hs.504301 NM_138788 ENSG00000151715 TMEM45B - transmembrane protein 45B protein-coding 163.667-228 chr7 11896013 11896288 + 1 NA Intergenic Intergenic -63952 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 169.333-118 chr2 72223718 72223999 + 1 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -75996 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 169.333-168 chr3 109476947 109477157 + 1 NA intron (NR_109841, intron 4 of 4) AluJo|SINE|Alu 67062 NR_109842 401082 Hs.477089 NM_001145553 ENSG00000228980 LINC01205 - long intergenic non-protein coding RNA 1205 ncRNA 246.333-91 chr7 40927938 40928399 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 51771 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 135.667-119 chr3 85625357 85625557 + 1 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) -101025 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 198.333-189 chr8 12809575 12809857 + 1 NA intron (NR_102423, intron 1 of 1) L1PA3|LINE|L1 1762 NR_015383 340357 Hs.434302 NR_015383 ENSG00000254813 LOC340357 - uncharacterized LOC340357 ncRNA 176.333-97 chr20 35236455 35236786 + 1 NA intron (NM_001355008, intron 2 of 14) intron (NM_001355008, intron 2 of 14) 9930 NM_006690 10893 Hs.715494 NM_006690 ENSG00000125966 MMP24 MMP-24|MMP25|MT-MMP 5|MT-MMP5|MT5-MMP|MT5MMP|MTMMP5 matrix metallopeptidase 24 protein-coding 144.333-146 chr2 217619755 217619950 + 1 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 136741 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 187.667-82 chr20 55238848 55239156 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -184041 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 152.667-347 chr7 91259123 91259294 + 1 NA Intergenic Intergenic -5225 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 265.333-47 chr21 19352126 19352453 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 547466 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 316.667-12 chr14 73214975 73215328 + 1 NA intron (NM_000021, intron 10 of 11) AluSz|SINE|Alu -22355 NR_158677 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 194.333-114 chr5 18920209 18920526 + 1 NA Intergenic Intergenic 965905 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 184.667-92 chr4 91048733 91049093 + 1 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) intron (NM_001145065, intron 9 of 10) 813882 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 149.667-163 chr17 77650994 77651268 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 77428 NR_104134 100132174 Hs.640110 NR_104134 ENSG00000267790 LINC01987 - long intergenic non-protein coding RNA 1987 ncRNA 159.667-115 chr15 85900564 85900861 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 75077 NR_049805 100847084 NR_049805 ENSG00000264406 MIR548AP - microRNA 548ap ncRNA 192.333-137 chr5 29715379 29715746 + 1 NA Intergenic Intergenic -164998 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 198.667-12 chr1 207497535 207497978 + 1 NA intron (NM_000573, intron 1 of 38) intron (NM_000573, intron 1 of 38) 1599 NM_000573 1378 Hs.334019 NM_000573 ENSG00000203710 CR1 C3BR|C4BR|CD35|KN complement C3b/C4b receptor 1 (Knops blood group) protein-coding 223.333-101 chr3 12227553 12227985 + 1 NA Intergenic Intergenic -59716 NM_001354666 5468 Hs.162646 NM_005037 ENSG00000132170 PPARG CIMT1|GLM1|NR1C3|PPARG1|PPARG2|PPARgamma peroxisome proliferator activated receptor gamma protein-coding 153.667-56 chr10 128271927 128272100 + 1 NA Intergenic Intergenic -13937 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 141.667-136 chr22 20883877 20884161 + 1 NA intron (NM_004782, intron 4 of 4) intron (NM_004782, intron 4 of 4) 25012 NM_004782 9342 Hs.108002 NM_004782 ENSG00000099940 SNAP29 CEDNIK|SNAP-29 synaptosome associated protein 29 protein-coding 229.333-113 chr7 11932737 11933093 + 1 NA Intergenic Intergenic -100717 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 212.667-135 chr8 102668440 102668863 + 1 NA intron (NR_160672, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu 12403 NR_160672 101927245 NR_160672 LOC101927245 - uncharacterized LOC101927245 ncRNA 144.333-278 chr8 127817786 127818027 + 1 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 21944 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 218.333-44 chr16 9809061 9809367 + 1 NA intron (NM_001134408, intron 10 of 13) AluSz|SINE|Alu -353709 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 159.667-86 chr12 89842933 89843259 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -104597 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 143.667-210 chr6 40370363 40370534 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -7889 NR_160960 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 113.667-81 chr17 49660993 49661203 + 1 NA intron (NM_001007229, intron 1 of 10) intron (NM_001007229, intron 1 of 10) -14580 NM_001370731 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 164.333-143 chr21 19015114 19015301 + 1 NA Intergenic Intergenic -255395 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 197.333-181 chr5 72251629 72251976 + 1 NA intron (NM_001286748, intron 4 of 11) intron (NM_001286748, intron 4 of 11) 68438 NM_001286751 23107 Hs.482491 NM_015084 ENSG00000113048 MRPS27 MRP-S27|S27mt mitochondrial ribosomal protein S27 protein-coding 129.333-131 chr3 108316164 108316389 + 1 NA intron (NM_001282557, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 4491 NM_001282557 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 197.667-157 chrX 28542057 28542309 + 1 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -45263 NM_014271 11141 Hs.658912 NM_014271 ENSG00000169306 IL1RAPL1 IL-1-RAPL-1|IL-1RAPL-1|IL1R8|IL1RAPL|IL1RAPL-1|MRX10|MRX21|MRX34|OPHN4|TIGIRR-2 interleukin 1 receptor accessory protein like 1 protein-coding 158.333-177 chr20 56494715 56494995 + 1 NA intron (NR_160308, intron 6 of 6) intron (NR_160308, intron 6 of 6) 26270 NM_016407 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 180.667-53 chr18 1849510 1849774 + 1 NA Intergenic Intergenic -490013 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 211.333-18 chr1 206981219 206981528 + 1 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -10748 NM_032029 83953 Hs.145519 NM_032029 ENSG00000162897 FCAMR CD351|FCA/MR|FKSG87 Fc fragment of IgA and IgM receptor protein-coding 261.333-118 chr9 114533240 114533691 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -27992 NM_015404 25861 Hs.93836 NM_015404 ENSG00000095397 WHRN CIP98|DFNB31|PDZD7B|USH2D|WI whirlin protein-coding 189.667-79 chr2 183023079 183023289 + 1 NA intron (NM_013436, intron 2 of 30) intron (NM_013436, intron 2 of 30) 15273 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 174.333-124 chr5 148338434 148338742 + 1 NA exon (NM_001040433, exon 3 of 4) exon (NM_001040433, exon 3 of 4) 3029 NM_001040433 643394 Hs.631798 NM_001040433 ENSG00000204909 SPINK9 LEKTI2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 9 protein-coding 202.667-113 chr4 154094916 154095217 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -305983 NM_003013 6423 Hs.481022 NM_003013 ENSG00000145423 SFRP2 FRP-2|SARP1|SDF-5 secreted frizzled related protein 2 protein-coding 116.667-10 chr1 113828217 113828357 + 1 NA intron (NM_012411, intron 16 of 18) L1MC5a|LINE|L1 15675 NR_125965 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 249.667-27 chr14 50526991 50527337 + 1 NA intron (NM_198794, intron 2 of 31) AluSc5|SINE|Alu 5405 NM_006575 11183 Hs.130491 NM_006575 ENSG00000012983 MAP4K5 GCKR|KHS|KHS1|MAPKKKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 protein-coding 149.333-242 chr3 59328148 59328423 + 1 NA Intergenic Intergenic -278253 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 123.667-100 chr2 213653321 213653521 + 1 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) -104646 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 241.667-44 chr2 212638015 212638406 + 1 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL -99408 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 148.667-166 chr18 22892071 22892410 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -41088 NM_002894 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 153.333-259 chr3 12007680 12007872 + 1 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) intron (NM_133625, intron 1 of 12) 3385 NM_133625 6854 Hs.445503 NM_003178 ENSG00000157152 SYN2 SYNII synapsin II protein-coding 262.333-24 chr14 60991392 60991919 + 1 NA intron (NR_033344, intron 3 of 16) L2a|LINE|L2 -9965 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 162.667-201 chr4 99580240 99580409 + 1 NA intron (NM_000253, intron 2 of 18) AluSx|SINE|Alu 16246 NM_001300785 4547 Hs.195799 NM_000253 ENSG00000138823 MTTP ABL|MTP microsomal triglyceride transfer protein protein-coding 155.667-227 chr3 122322731 122323008 + 1 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy -2379 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 151.667-114 chr14 75297182 75297556 + 1 NA TTS (NR_038421) TTS (NR_038421) 2965 NR_038421 731223 Hs.534624 NR_038421 LINC01220 - long intergenic non-protein coding RNA 1220 ncRNA 197.667-72 chr2 200705867 200706299 + 1 NA intron (NR_135011, intron 2 of 31) intron (NR_135011, intron 2 of 31) 10360 NR_135011 107161151 Hs.148269 NR_135011 AOX3P-AOX2P AOX3/AOX3L1 AOX3P-AOX2P readthrough, transcribed pseudogene pseudo 154.333-171 chr2 191042353 191042577 + 1 NA intron (NM_003151, intron 14 of 23) L1MC5a|LINE|L1 20939 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 154.333-143 chr2 19900533 19900752 + 1 NA intron (NM_001008237, intron 1 of 2) intron (NM_001008237, intron 1 of 2) 1341 NM_001008237 130502 Hs.591547 NM_001008237 ENSG00000183891 TTC32 - tetratricopeptide repeat domain 32 protein-coding 168.667-138 chr3 23924123 23924440 + 1 NA 3' UTR (NM_001253384, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001253384, exon 5 of 5) 7149 NM_001253383 6138 Hs.381219 NM_002948 ENSG00000174748 RPL15 DBA12|EC45|L15|RPL10|RPLY10|RPYL10 ribosomal protein L15 protein-coding 148.333-242 chr3 18922865 18923096 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -225530 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 180.667-123 chr6 66938970 66939225 + 1 NA Intergenic Intergenic -1116254 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 276.333-29 chr20 32046470 32046939 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5538 NM_002110 3055 Hs.655210 NM_002110 ENSG00000101336 HCK JTK9|p59Hck|p61Hck HCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 167.667-54 chr14 46836016 46836236 + 1 NA Intergenic Intergenic -184345 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 232.333-8 chr10 96105078 96105444 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -15026 NR_134320 728558 Hs.538374 NR_038444 ENSG00000226688 ENTPD1-AS1 - ENTPD1 antisense RNA 1 ncRNA 164.333-127 chr2 168638724 168638916 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 4 of 10) intron (NM_001256126, intron 4 of 10) 55877 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 149.667-204 chr2 82076857 82077153 + 1 NA Intergenic Intergenic -610059 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 196.667-103 chr3 195924317 195924649 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -15474 NM_005781 10188 Hs.518513 NM_005781 ENSG00000061938 TNK2 ACK|ACK-1|ACK1|p21cdc42Hs tyrosine kinase non receptor 2 protein-coding 180.333-42 chr16 27090295 27090601 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 23521 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 188.667-108 chr3 190396253 190396536 + 1 NA intron (NM_006580, intron 1 of 4) intron (NM_006580, intron 1 of 4) 8522 NM_006580 10686 Hs.251391 NM_006580 ENSG00000113946 CLDN16 HOMG3|PCLN1 claudin 16 protein-coding 157.333-13 chr1 91057957 91058129 + 1 NA Intergenic Intergenic -35788 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 140.667-255 chr9 131203805 131204077 + 1 NA intron (NM_001318324, intron 30 of 35) intron (NM_001318324, intron 30 of 35) 13802 NM_001318325 8021 Hs.654530 NM_005085 ENSG00000126883 NUP214 CAIN|CAN nucleoporin 214 protein-coding 198.667-64 chr14 80792224 80792487 + 1 NA intron (NM_152446, intron 14 of 24) intron (NM_152446, intron 14 of 24) 149383 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 169.667-192 chr7 24604612 24604858 + 1 NA intron (NM_001303037, intron 1 of 11) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 31283 NM_001303037 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 182.667-8 chr1 119014913 119015182 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13642 NR_135035 105378933 Hs.599652 NR_135034 ENSG00000226172 LOC105378933 - uncharacterized LOC105378933 ncRNA 160.333-18 chr1 85877636 85877862 + 1 NA intron (NM_152890, intron 32 of 59) (CATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -169316 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 226.667-24 chr11 46805980 46806274 + 1 NA intron (NM_001008938, intron 8 of 43) intron (NM_001008938, intron 8 of 43) 40153 NM_001008938 9793 Hs.201253 NM_014756 ENSG00000175216 CKAP5 CHTOG|MSPS|TOG|TOGp|ch-TOG cytoskeleton associated protein 5 protein-coding 170.667-115 chr3 162180669 162180886 + 1 NA Intergenic Intergenic 683969 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 359.333-5 chr12 96783263 96783724 + 1 NA intron (NM_001306084, intron 60 of 67) L1ME3Cz|LINE|L1 -123764 NM_001135177 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 164.333-114 chr2 46164931 46165265 + 1 NA intron (NM_005400, intron 14 of 14) intron (NM_005400, intron 14 of 14) -132309 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 146.667-325 chr8 20494268 20494466 + 1 NA Intergenic Intergenic 120559 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 228.667-32 chr17 65854449 65854761 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 20 of 26) intron (NM_001353129, intron 20 of 26) -28062 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 201.333-133 chr18 46617011 46617234 + 1 NA intron (NM_144612, intron 5 of 39) L1MEd|LINE|L1 39911 NM_144612 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 167.667-171 chr5 83807011 83807209 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -86255 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 210.333-60 chr18 12522656 12522990 + 1 NA intron (NM_020148, intron 4 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 90049 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 173.333-208 chr8 120566682 120566911 + 1 NA intron (NM_021021, intron 4 of 6) intron (NM_021021, intron 4 of 6) 121377 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 163.333-172 chr21 37005527 37005844 + 1 NA promoter-TSS (NM_001317768) promoter-TSS (NM_001317768) -465 NM_001317768 53820 Hs.254560 NM_018962 ENSG00000183145 RIPPLY3 DSCR6 ripply transcriptional repressor 3 protein-coding 207.667-50 chr2 13032083 13032447 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -25252 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 143.667-62 chr12 120785008 120785243 + 1 NA intron (NM_139015, intron 3 of 10) AluJr|SINE|Alu 59299 NM_000017 35 Hs.507076 NM_000017 ENSG00000122971 ACADS ACAD3|SCAD acyl-CoA dehydrogenase short chain protein-coding 190.333-80 chr2 222167853 222168239 + 1 NA Intergenic Intergenic -130101 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 192.333-125 chr4 67527036 67527421 + 1 NA intron (NR_155754, intron 5 of 18) L1MDb|LINE|L1 18275 NR_155754 1060 Hs.479867 NM_001812 ENSG00000145241 CENPC CENP-C|CENPC1|MIF2|hcp-4 centromere protein C protein-coding 150.667-54 chr10 118728414 118728587 + 1 NA intron (NM_153810, intron 3 of 8) AluSc|SINE|Alu 26470 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 286.333-3 chr10 9822315 9822751 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -236189 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 274.333-10 chr11 81390964 81391499 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 499605 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 181.333-94 chr21 21462974 21463221 + 1 NA intron (NM_001352592, intron 13 of 18) intron (NM_001352592, intron 13 of 18) 274222 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 195.333-92 chr16 65467830 65468123 + 1 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) L1ME2|LINE|L1 108324 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 180.667-11 chr10 17935384 17935757 + 1 NA Intergenic Intergenic -16269 NM_001282733 221074 Hs.350895 NM_152725 ENSG00000148482 SLC39A12 LZT-Hs8|ZIP-12|bA570F3.1 solute carrier family 39 member 12 protein-coding 159.667-261 chr5 95563359 95563585 + 1 NA intron (NM_198150, intron 1 of 7) intron (NM_198150, intron 1 of 7) 8371 NM_198150 153642 Hs.585051 NM_198150 ENSG00000164291 ARSK TSULF arylsulfatase family member K protein-coding 160.333-267 chr7 99335875 99336097 + 1 NA intron (NM_001190996, intron 2 of 9) intron (NM_001190996, intron 2 of 9) 10088 NM_006409 10552 Hs.124126 NM_006409 ENSG00000241685 ARPC1A Arc40|HEL-68|HEL-S-307|SOP2Hs|SOP2L actin related protein 2/3 complex subunit 1A protein-coding 154.333-129 chr18 8275042 8275247 + 1 NA intron (NM_002845, intron 17 of 30) intron (NM_002845, intron 17 of 30) 91890 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 307.667-17 chr16 81222249 81222746 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2103 NR_126532 114780 Hs.413525 NM_052892 ENSG00000166473 PKD1L2 PC1L2 polycystin 1 like 2 (gene/pseudogene) protein-coding 211.333-129 chr2 233066184 233066481 + 1 NA intron (NM_001017915, intron 1 of 26).2 intron (NM_001017915, intron 1 of 26).2 5990 NM_001017915 3635 Hs.262886 NM_005541 ENSG00000168918 INPP5D SHIP|SHIP-1|SHIP1|SIP-145|hp51CN|p150Ship inositol polyphosphate-5-phosphatase D protein-coding 244.667-33 chr12 56530713 56531003 + 1 NA intron (NM_002898, intron 1 of 13) intron (NM_002898, intron 1 of 13) 9038 NM_002898 5939 Hs.505729 NM_002898 ENSG00000076067 RBMS2 SCR3 RNA binding motif single stranded interacting protein 2 protein-coding 142.333-225 chr7 26715214 26715461 + 1 NA intron (NM_003930, intron 9 of 12) L1MEd|LINE|L1 77466 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 161.333-152 chr2 116041165 116041446 + 1 NA Intergenic Intergenic 697490 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 140.667-28 chr10 31049704 31049935 + 1 NA Intergenic Intergenic -17882 NM_182755 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 194.333-151 chr8 60029485 60029876 + 1 NA Intergenic UCON84|Unknown|Unknown 251720 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 167.333-127 chr2 81909496 81909816 + 1 NA Intergenic Intergenic -442710 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 154.333-252 chr4 117476924 117477117 + 1 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 48622 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 199.333-177 chr3 29843242 29843540 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) intron (NM_001003792, intron 6 of 13) 90765 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 245.333-51 chr15 89941345 89941681 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -28561 NM_182616 348110 Hs.6734 NM_182616 ENSG00000242498 ARPIN C15orf38 actin related protein 2/3 complex inhibitor protein-coding 151.333-249 chr20 47807549 47807717 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -21017 NM_198596 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 149.333-238 chr3 38498933 38499154 + 1 NA intron (NR_153325, intron 3 of 6) L1M4|LINE|L1 2703 NM_005107 9941 Hs.517897 NM_005107 ENSG00000157036 EXOG ENDOGL1|ENDOGL2|ENGL|ENGL-a|ENGL-b|ENGLA|ENGLB exo/endonuclease G protein-coding 177.667-80 chr2 205863081 205863272 + 1 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie 180675 NM_018534 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 211.667-25 chr11 12233026 12233365 + 1 NA intron (NR_144420, intron 15 of 27) MIRc|SINE|MIR -53705 NM_032867 84953 Hs.60371 NM_032867 ENSG00000133816 MICALCL Ebitein1 MICAL C-terminal like protein-coding 124.667-145 chr3 193793130 193793335 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 50777 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 199.667-139 chr8 91606023 91606416 + 1 NA Intergenic Intergenic 356900 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 291.667 chr1 45026734 45027370 + 1 NA intron (NM_020883, intron 11 of 13) L1MC2|LINE|L1 14798 NR_158185 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 164.333-209 chr5 174890319 174890533 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 105305 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 201.333-132 chr18 43180145 43180459 + 1 NA Intergenic Intergenic -64610 NM_001272077 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 306.667-37 chr6 39024727 39025296 + 1 NA intron (NM_001371, intron 90 of 91) intron (NM_001371, intron 90 of 91) -23770 NM_002062 2740 Hs.351883 NM_002062 ENSG00000112164 GLP1R GLP-1|GLP-1-R|GLP-1R glucagon like peptide 1 receptor protein-coding 280.333-10 chr13 41130654 41131164 + 1 NA exon (NM_152903, exon 1 of 1) exon (NM_152903, exon 1 of 1) 1893 NM_152903 89890 Hs.534040 NM_152903 ENSG00000165572 KBTBD6 - kelch repeat and BTB domain containing 6 protein-coding 135.333-185 chr8 67060545 67060806 + 1 NA intron (NM_006837, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 1458 NM_006837 10987 Hs.491912 NM_006837 ENSG00000121022 COPS5 CSN5|JAB1|MOV-34|SGN5 COP9 signalosome subunit 5 protein-coding 149.333-161 chr19 29819482 29819698 + 1 NA intron (NM_001322261, intron 6 of 10) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 7599 NM_001238 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 340.667-13 chr2 226565368 226565946 + 1 NA Intergenic (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 93136 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 242.333-35 chr17 40047676 40048070 + 1 NA intron (NR_052017, intron 3 of 24) AluSq2|SINE|Alu 6535 NM_014815 9862 Hs.462983 NM_014815 ENSG00000008838 MED24 ARC100|CRSP100|CRSP4|DRIP100|MED5|THRAP4|TRAP100 mediator complex subunit 24 protein-coding 247.667-50 chr2 101887642 101888034 + 1 NA exon (NM_145687, exon 29 of 31) exon (NM_145687, exon 29 of 31) -95627 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 155.667-385 chr9 40925590 40925785 + 1 NA Intergenic CER|Satellite|Satellite 3405 NR_031629 100302167 NR_031629 ENSG00000275377 MIR1299 MIRN1299|hsa-mir-1299 microRNA 1299 ncRNA 168.333-115 chr20 20455258 20455512 + 1 NA intron (NM_020343, intron 37 of 39) intron (NM_020343, intron 37 of 39) 87281 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 184.667-131 chr8 56437035 56437370 + 1 NA Intergenic Intergenic -8605 NR_125813 101929415 Hs.701520 NR_125813 ENSG00000254254 LOC101929415 - uncharacterized LOC101929415 ncRNA 158.333-113 chr17 59255910 59256132 + 1 NA intron (NM_182569, intron 4 of 9) AluJb|SINE|Alu 35510 NM_001165993 284161 Hs.631744 NM_182569 ENSG00000153982 GDPD1 GDE4 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 protein-coding 161.333-197 chr3 128641056 128641243 + 1 NA intron (NM_002950, intron 2 of 9) intron (NM_002950, intron 2 of 9) 9669 NM_002950 6184 Hs.518244 NM_002950 ENSG00000163902 RPN1 OST1|RBPH1 ribophorin I protein-coding 200.333-32 chr12 80893740 80893964 + 1 NA intron (NM_004664, intron 1 of 5) intron (NM_004664, intron 1 of 5) 41981 NR_030349 693203 NR_030349 ENSG00000208022 MIR618 MIRN618|hsa-mir-618|mir-618 microRNA 618 ncRNA 169.333-34 chr11 9185692 9186060 + 1 NA intron (NR_145966, intron 5 of 21) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 79450 NR_145966 23258 Hs.501857 NM_015213 ENSG00000184014 DENND5A EIEE49|RAB6IP1 DENN domain containing 5A protein-coding 166.667-51 chr12 102484023 102484218 + 1 NA Intergenic Intergenic -3557 NM_000618 3479 Hs.160562 NM_000618 ENSG00000017427 IGF1 IGF|IGF-I|IGFI|MGF insulin like growth factor 1 protein-coding 264.333-11 chr11 33602052 33602524 + 1 NA intron (NM_012194, intron 13 of 20) intron (NM_012194, intron 13 of 20) 98452 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 138.333-124 chr3 109825170 109825334 + 1 NA Intergenic Intergenic 222424 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 211.667-8 chr1 112783666 112783880 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 63206 NM_001004440 284467 Hs.439116 NM_182759 ENSG00000184599 TAFA3 FAM19A3|TAFA-3 TAFA chemokine like family member 3 protein-coding 244.667-90 chr7 93766398 93766689 + 1 NA Intergenic Intergenic 49615 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 162.667-249 chr6 142192731 142192939 + 1 NA intron (NM_001286371, intron 5 of 6) L1MC4|LINE|L1 45572 NM_016485 51534 Hs.431367 NM_016485 ENSG00000009844 VTA1 C6orf55|DRG-1|DRG1|HSPC228|LIP5|My012|SBP1 vesicle trafficking 1 protein-coding 262.667-22 chr12 105152152 105152626 + 1 NA exon (NM_015275, exon 26 of 33) exon (NM_015275, exon 26 of 33) 44658 NM_015275 23325 Hs.12144 NM_015275 ENSG00000136051 WASHC4 KIAA1033|MRT43|SWIP WASH complex subunit 4 protein-coding 199.667-49 chr15 39159920 39160132 + 1 NA Intergenic Intergenic -90643 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 208.667-108 chr5 6392749 6393142 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -14398 NM_032286 84246 Hs.13885 NM_032286 ENSG00000133398 MED10 L6|NUT2|TRG20 mediator complex subunit 10 protein-coding 321.667-23 chr8 84435763 84436400 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) L1PB1|LINE|L1 20597 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 229.333-76 chr3 49990363 49990601 + 1 NA intron (NM_001349190, intron 4 of 18) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 50332 NM_001349193 10180 Hs.696735 NM_005777 ENSG00000004534 RBM6 3G2|DEF-3|DEF3|HLC-11|NY-LU-12|g16 RNA binding motif protein 6 protein-coding 172.333-119 chr3 183495976 183496212 + 1 NA intron (NM_130446, intron 4 of 6) intron (NM_130446, intron 4 of 6) 42280 NR_145763 109617007 NR_145763 ENSG00000199363 SNORA63E - small nucleolar RNA, H/ACA box 63E snoRNA 226.667-55 chr20 4774931 4775181 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -34388 NR_024268 149830 Hs.126516 NM_177549 ENSG00000180259 PRNT M8 prion locus lncRNA, testis expressed ncRNA 236.333-70 chr4 67707125 67707462 + 1 NA intron (NR_015439, intron 1 of 1) L1MA4|LINE|L1 6015 NR_015439 550112 Hs.479879 NR_015439 ENSG00000248049 UBA6-AS1 - UBA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 190.333-55 chr17 14361534 14361776 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 57915 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 159.667-305 chr7 87154123 87154375 + 1 NA 5' UTR (NM_021145, exon 2 of 20) 5' UTR (NM_021145, exon 2 of 20) 1695 NM_021145 9988 Hs.196129 NM_021145 ENSG00000135164 DMTF1 DMP1|DMTF|MRUL|hDMP1 cyclin D binding myb like transcription factor 1 protein-coding 149.667-115 chr14 47489716 47489984 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -146604 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 145.333-227 chr4 138985324 138985536 + 1 NA intron (NR_133945, intron 2 of 2) L1MD1|LINE|L1 27216 NR_133945 105377448 Hs.200280 NR_133945 ENSG00000250195 LOC105377448 - uncharacterized LOC105377448 ncRNA 264.667-57 chr3 135617127 135617636 + 1 NA Intergenic Intergenic -348347 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 120.667-83 chr18 64566007 64566229 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -306063 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 153.667-181 chr2 69092495 69092768 + 1 NA intron (NM_032208, intron 9 of 17) intron (NM_032208, intron 9 of 17) -11051 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 152.667-393 chr9 24909900 24910133 + 1 NA Intergenic Intergenic -364119 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 137.667-82 chr18 9668735 9668954 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -39457 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 170.333-91 chr17 57867870 57868198 + 1 NA intron (NM_001271875, intron 8 of 10) intron (NM_001271875, intron 8 of 10) -17990 NM_016070 51649 Hs.5836 NM_016070 ENSG00000181610 MRPS23 CGI-138|HSPC329|MRP-S23 mitochondrial ribosomal protein S23 protein-coding 193.667-121 chr7 4667873 4668208 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -14255 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 294.667-7 chr10 114658551 114659050 + 1 NA promoter-TSS (NM_002313) promoter-TSS (NM_002313) -525 NM_002313 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 155.333-353 chr7 14717680 14717990 + 1 NA intron (NM_001350717, intron 6 of 24) intron (NM_001350717, intron 6 of 24) 123615 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 202.333-138 chr5 22518165 22518443 + 1 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 -304454 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 151.667-308 chr6 50838849 50839015 + 1 NA intron (NM_003221, intron 5 of 6) intron (NM_003221, intron 5 of 6) 20061 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 158.667-346 chr9 35073487 35073688 + 1 NA promoter-TSS (NM_007126) promoter-TSS (NM_007126) -919 NM_001354927 7415 Hs.529782 NM_007126 ENSG00000165280 VCP CDC48|TERA|p97 valosin containing protein protein-coding 190.333-94 chr3 127845851 127846203 + 1 NA Intergenic Intergenic -22777 NM_001003794 11343 Hs.277035 NM_007283 ENSG00000074416 MGLL HU-K5|HUK5|MAGL|MGL monoglyceride lipase protein-coding 148.667-125 chr14 72708937 72709213 + 1 NA intron (NM_001280544, intron 6 of 9) intron (NM_001280544, intron 6 of 9) 183574 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 194.333-28 chr11 21761384 21761654 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -431566 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 149.667-108 chr13 97577877 97578086 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 143812 NM_021033 5911 Hs.508480 NM_021033 ENSG00000125249 RAP2A K-REV|KREV|RAP2|RbBP-30 RAP2A, member of RAS oncogene family protein-coding 287.333-54 chr5 76399048 76399723 + 1 NA Intergenic Intergenic -3900 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 253.333-116 chr9 9123376 9123678 + 1 NA intron (NM_002839, intron 10 of 45) intron (NM_002839, intron 10 of 45) 265509 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 287.667-31 chr5 51134732 51135196 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -164777 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 142.333-267 chr9 131659406 131659607 + 1 NA intron (NM_001304275, intron 1 of 23) AluJb|SINE|Alu 50336 NM_198679 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 161.667-275 chr9 112005867 112006117 + 1 NA Intergenic Intergenic 73892 NR_039814 100616114 NR_039814 ENSG00000266315 MIR4668 mir-4668 microRNA 4668 ncRNA 177.333-173 chr8 125272316 125272631 + 1 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -157885 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 155.667-175 chr2 137059833 137060034 + 1 NA intron (NM_001316349, intron 3 of 27) L1MC2|LINE|L1 294388 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 152.333-51 chr10 81393250 81393429 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -481855 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 178.333-65 chr18 11605989 11606209 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -3459 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 313.333-34 chr5 104260500 104261135 + 1 NA Intergenic 7SLRNA|srpRNA|srpRNA -698028 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 157.667-65 chr11 130690202 130690403 + 1 NA intron (NM_001271983, intron 1 of 2) intron (NM_001271983, intron 1 of 2) 17346 NM_001271983 283171 Hs.376151 NM_001271983 C11orf44 - chromosome 11 open reading frame 44 protein-coding 150.333-177 chr18 28173932 28174105 + 1 NA intron (NM_001792, intron 1 of 15) intron (NM_001792, intron 1 of 15) 3112 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 223.667-46 chr22 28434223 28434593 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluSz|SINE|Alu -25461 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 112.667-181 chr4 29723636 29723833 + 1 NA Intergenic Intergenic 509442 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 202.333-189 chrX 100448546 100448976 + 1 NA Intergenic Intergenic -38488 NM_001105243 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 133.667-132 chr6 105948609 105948825 + 1 NA Intergenic Intergenic -137619 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 152.667-88 chr12 96660664 96660816 + 1 NA intron (NM_001306084, intron 38 of 67) MER21B|LTR|ERVL 171163 NM_001306084 144535 Hs.382121 NM_198520 ENSG00000188596 CFAP54 C12orf55|C12orf63 cilia and flagella associated protein 54 protein-coding 156.333-245 chr3 116383615 116383912 + 1 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) 23739 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 143.333-141 chr2 126090202 126090452 + 1 NA Intergenic Intergenic 27658 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 126.333-128 chr4 1197719 1197862 + 1 NA non-coding (NR_024569, exon 4 of 4) non-coding (NR_024569, exon 4 of 4) 11172 NM_001199021 10417 Hs.302963 NM_012445 ENSG00000159674 SPON2 DIL-1|DIL1|M-SPONDIN|MINDIN spondin 2 protein-coding 147.333-191 chr20 40674809 40675012 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 14326 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 269.333-79 chr7 36322676 36323010 + 1 NA Intergenic Intergenic 44397 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 116.667-151 chr4 130175611 130175797 + 1 NA Intergenic Intergenic -200657 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 115.333-114 chr2 77602349 77602560 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -80021 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 139.333-161 chr4 12825582 12825857 + 1 NA Intergenic Intergenic 602268 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 157.667-351 chr9 28174659 28174826 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L2c|LINE|L2 544563 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 191.333-209 chr8 125464357 125464739 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 32339 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 162.667-287 chr8 137667765 137668025 + 1 NA Intergenic Intergenic -254307 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 196.667-33 chr12 1888917 1889236 + 1 NA intron (NM_172364, intron 6 of 37).2 L1MEd|LINE|L1 29576 NM_172364 93589 Hs.13768 NM_172364 ENSG00000151062 CACNA2D4 RCD4 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 4 protein-coding 204.333-80 chr18 9205052 9205421 + 1 NA intron (NM_015208, intron 4 of 12) intron (NM_015208, intron 4 of 12) 67673 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 182.333-62 chr16 75497070 75497285 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -1736 NM_021615 4166 Hs.655622 NM_021615 ENSG00000183196 CHST6 C-GlcNAc6ST|GST4-beta|MCDC1|glcNAc6ST-5|gn6st-5|hCGn6ST carbohydrate sulfotransferase 6 protein-coding 259.667-35 chr2 96292213 96292716 + 1 NA intron (NM_014014, intron 16 of 44) intron (NM_014014, intron 16 of 44) 13082 NM_014014 23020 Hs.246112 NM_014014 ENSG00000144028 SNRNP200 ASCC3L1|BRR2|HELIC2|RP33|U5-200KD small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200 protein-coding 158.667-263 chr5 25791645 25791868 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 600803 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 236.667-22 chr13 49199789 49200065 + 1 NA intron (NM_001079673, intron 23 of 25) intron (NM_001079673, intron 23 of 25) -20411 NM_001507 2862 Hs.248126 NM_001507 ENSG00000102539 MLNR GPR38|MTLR1 motilin receptor protein-coding 214.333-79 chr2 123986324 123986640 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 38692 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 145.333-225 chr4 136673772 136674075 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -519833 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 138.333-38 chr11 47502847 47503049 + 1 NA intron (NM_001330272, intron 1 of 15) intron (NM_001330272, intron 1 of 15) -8427 NM_198700 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 168.667-45 chr12 97909729 97909947 + 1 NA Intergenic Intergenic 29283 NR_039716 100616287 NR_039716 ENSG00000265861 MIR4495 - microRNA 4495 ncRNA 141.667-242 chr9 33062899 33063044 + 1 NA intron (NM_018225, intron 4 of 11) intron (NM_018225, intron 4 of 11) 13703 NM_018225 55234 Hs.655351 NM_018225 ENSG00000122692 SMU1 BWD|SMU-1|fSAP57 SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor protein-coding 301.333-10 chr10 104857810 104858184 + 1 NA intron (NM_014978, intron 2 of 26) intron (NM_014978, intron 2 of 26) -191781 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 130.333-38 chr10 113831226 113831427 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 22756 NM_014881 9937 Hs.1560 NM_014881 ENSG00000198924 DCLRE1A PSO2|SNM1|SNM1A DNA cross-link repair 1A protein-coding 195.667-42 chr14 56723138 56723506 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 82345 NM_172337 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 190.333-86 chr22 25703154 25703424 + 1 NA intron (NM_001362778, intron 12 of 19) intron (NM_001362778, intron 12 of 19) -38899 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 155.333-180 chr2 147194024 147194203 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 607056 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 203.333-230 chr6 40188598 40188945 + 1 NA Intergenic Intergenic 167235 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 162.667-278 chr8 115221983 115222179 + 1 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 445932 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 184.333-71 chr2 19558439 19558673 + 1 NA Intergenic Intergenic -199933 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 186.333-8 chr1 181999965 182000235 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 61612 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 155.667-339 chr7 104099357 104099663 + 1 NA Intergenic Intergenic 108503 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 393.667-7 chr2 13351479 13352055 + 1 NA Intergenic Intergenic -344754 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 156.667-201 chr2 230037805 230038091 + 1 NA intron (NM_152527, intron 4 of 4) intron (NM_152527, intron 4 of 4) 30976 NM_152527 151473 Hs.504317 NM_152527 ENSG00000163053 SLC16A14 MCT14 solute carrier family 16 member 14 protein-coding 390.667-17 chr9 75297526 75298038 + 1 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 209268 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 197.667-113 chr4 109497711 109498105 + 1 NA intron (NM_001300813, intron 7 of 24) L1ME3A|LINE|L1 9210 NR_030302 693161 NR_030302 ENSG00000207988 MIR576 MIRN576|hsa-mir-576 microRNA 576 ncRNA 265.333-30 chr18 4495751 4496170 + 1 NA Intergenic Intergenic -40653 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 183.667-92 chr3 134486828 134487061 + 1 NA promoter-TSS (NM_001242374) promoter-TSS (NM_001242374) 771 NR_148352 80254 Hs.443301 NM_025180 ENSG00000182923 CEP63 SCKL6 centrosomal protein 63 protein-coding 121.333-65 chr16 11076959 11077134 + 1 NA intron (NM_015226, intron 18 of 22) intron (NM_015226, intron 18 of 22) 132482 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 153.667-266 chr3 130777998 130778214 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -31277 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 213.667-47 chr20 48275135 48275432 + 1 NA Intergenic Intergenic -84628 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 174.333-154 chr8 136454094 136454275 + 1 NA Intergenic MER61A|LTR|ERV1 -76614 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 151.333-192 chr19 57451031 57451258 + 1 NA Intergenic Intergenic 5595 NM_020633 57191 Hs.677423 NM_020633 ENSG00000178201 VN1R1 V1RL1|VNR19I1|ZVNH1|ZVNR1 vomeronasal 1 receptor 1 protein-coding 150.333-445 chrX 97535613 97535836 + 1 NA intron (NR_125391, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 28811 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 228.333-67 chr4 36184658 36184986 + 1 NA intron (NR_146894, intron 8 of 32) Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 59117 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 240.333-25 chr11 77619700 77619987 + 1 NA intron (NM_001311201, intron 4 of 5) intron (NM_001311201, intron 4 of 5) 17951 NM_001311201 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 154.667-155 chr18 76255682 76255981 + 1 NA Intergenic (AG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 46321 NR_146507 105372207 Hs.303880 NR_146507 LINC01893 - long intergenic non-protein coding RNA 1893 ncRNA 118.333-114 chr2 128069145 128069299 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -21978 NM_020120 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 197.667-103 chr3 194168050 194168340 + 1 NA Intergenic Intergenic 32047 NM_005524 3280 Hs.250666 NM_005524 ENSG00000114315 HES1 HES-1|HHL|HRY|bHLHb39 hes family bHLH transcription factor 1 protein-coding 209.333-69 chr14 89387351 89387590 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 29763 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 233.333-29 chr11 71346272 71346713 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 76862 NR_038862 399923 Hs.128191 NM_001001680 ENSG00000172900 FLJ42102 - uncharacterized LOC399923 ncRNA 162.667-230 chr5 120811249 120811557 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 279939 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 169.333-92 chr16 68267687 68267980 + 1 NA intron (NM_003983, intron 2 of 10) MER21B|LTR|ERVL 3307 NM_003983 9057 Hs.679580 NM_003983 ENSG00000103064 SLC7A6 LAT-2|LAT3|y+LAT-2 solute carrier family 7 member 6 protein-coding 171.333-25 chr10 104595872 104596123 + 1 NA Intergenic Intergenic -45293 NM_014978 22986 Hs.671950 NM_014978 ENSG00000156395 SORCS3 SORCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 3 protein-coding 133.667-148 chr8 72213235 72213475 + 1 NA non-coding (NR_033867, exon 15 of 20) non-coding (NR_033867, exon 15 of 20) 38279 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 249.333-78 chr4 155992745 155993227 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -39120 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 187.667-32 chr13 98205446 98205823 + 1 NA intron (NM_005766, intron 1 of 26) AluY|SINE|Alu -2890 NR_036129 100422881 NR_036129 ENSG00000263399 MIR3170 mir-3170 microRNA 3170 ncRNA 154.667-412 chr9 79541181 79541473 + 1 NA Intergenic Intergenic -30446 NM_001282753 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 201.333-14 chr1 161804500 161805007 + 1 NA intron (NM_007348, intron 7 of 15) intron (NM_007348, intron 7 of 15) 38433 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 269.333-90 chr8 123249893 123250320 + 1 NA non-coding (NR_037874, exon 3 of 3) non-coding (NR_037874, exon 3 of 3) -8729 NM_032847 84933 Hs.707401 NM_032847 ENSG00000189376 C8orf76 - chromosome 8 open reading frame 76 protein-coding 137.333-157 chr5 82669284 82669469 + 1 NA Intergenic Intergenic -170779 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 241.667-88 chr8 52828943 52829288 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -110793 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 153.667-280 chr4 34260937 34261196 + 1 NA intron (NR_147184, intron 1 of 3) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8681 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 164.667-197 chr5 173354969 173355243 + 1 NA Intergenic Intergenic 7651 NR_107023 102465862 NR_107023 ENSG00000274994 MIR8056 hsa-mir-8056 microRNA 8056 ncRNA 244.333-32 chr12 94655666 94655952 + 1 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -5252 NM_020698 57458 Hs.370410 NM_020698 ENSG00000057704 TMCC3 - transmembrane and coiled-coil domain family 3 protein-coding 195.667-128 chr7 33152697 33153046 + 1 NA intron (NM_001348038, intron 3 of 22) intron (NM_001348038, intron 3 of 22) 23307 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 161.667-255 chr8 98022630 98022878 + 1 NA intron (NM_002380, intron 13 of 18) MIRb|SINE|MIR 19463 NR_002581 26775 Hs.684855 NR_002581 ENSG00000207067 SNORA72 RNU72|U72 small nucleolar RNA, H/ACA box 72 snoRNA 176.333-185 chr9 132829890 132830145 + 1 NA intron (NM_001317959, intron 6 of 14) L1ME4a|LINE|L1 -48327 NR_133631 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 151.667-183 chr2 224803764 224803953 + 1 NA intron (NM_001290263, intron 39 of 55) intron (NM_001290263, intron 39 of 55) 143191 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 176.667-142 chr8 36354870 36355051 + 1 NA Intergenic Intergenic -429414 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 219.333-33 chr11 40109481 40109814 + 1 NA Intergenic Intergenic 183483 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 164.667-75 chr14 67112550 67112760 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 14 of 21) intron (NM_001024218, intron 14 of 21) -76785 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 144.333-216 chr5 97100668 97100915 + 1 NA intron (NM_153234, intron 4 of 5) intron (NM_153234, intron 4 of 5) 41820 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 125.333-63 chr15 39652332 39652582 + 1 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) intron (NM_152597, intron 10 of 11) 71378 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 153.667-43 chr10 50999240 50999467 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 8465 NM_001098512 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 296.333-43 chr8 104031724 104032157 + 1 NA intron (NR_145710, intron 24 of 29) intron (NR_145710, intron 24 of 29) -191395 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 149.333-172 chr2 40988232 40988408 + 1 NA Intergenic Intergenic -475885 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 163.333-209 chr4 165793186 165793419 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -50231 NR_121677 101928131 Hs.406479 NR_121677 LOC101928131 - uncharacterized LOC101928131 ncRNA 171.333-154 chr5 104845824 104846092 + 1 NA Intergenic Intergenic -253516 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 207.667-42 chr17 8053295 8053601 + 1 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 14389 NM_001039131 247 Hs.111256 NM_001141 ENSG00000179593 ALOX15B 15-LOX-2 arachidonate 15-lipoxygenase type B protein-coding 148.333-382 chr8 84916223 84916485 + 1 NA intron (NM_001287244, intron 7 of 7) intron (NM_001287244, intron 7 of 7) -190884 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 215.667-112 chr7 20258057 20258299 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -38530 NR_110117 101927769 Hs.256080 NR_110117 ENSG00000226097 LOC101927769 - uncharacterized LOC101927769 ncRNA 140.667-106 chr2 12535486 12535673 + 1 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) -181293 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 237.667-54 chr3 88785612 88786129 + 1 NA Intergenic Intergenic -321751 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 210.333-63 chr18 70349380 70349786 + 1 NA intron (NR_126336, intron 3 of 3) intron (NR_126336, intron 3 of 3) -11403 NR_146458 102724895 NR_146458 LIVAR lnc18q22.2 liver cell viability associated lncRNA ncRNA 153.333-108 chr13 112021316 112021615 + 1 NA intron (NR_120392, intron 1 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -45684 NM_005986 6656 NM_005986 ENSG00000182968 SOX1 - SRY-box transcription factor 1 protein-coding 235.667-27 chr17 70283192 70283489 + 1 NA Intergenic Intergenic 113805 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 181.333-92 chr20 50737143 50737494 + 1 NA intron (NM_032521, intron 1 of 2) intron (NM_032521, intron 1 of 2) 5738 NM_032521 84612 Hs.589848 NM_032521 ENSG00000124171 PARD6B PAR6B par-6 family cell polarity regulator beta protein-coding 225.667-67 chr6 117636281 117636687 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -33973 NM_020399 57120 Hs.191539 NM_020399 ENSG00000047932 GOPC CAL|FIG|GOPC1|PIST|dJ94G16.2 golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing protein-coding 159.333-16 chr1 150519107 150519272 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 3432 NR_051960 100874054 Hs.576460 NR_051960 ENSG00000228126 FALEC FAL1|LINC00568|ncRNA-a1 focally amplified long non-coding RNA in epithelial cancer ncRNA 131.333-121 chr4 21030724 21030899 + 1 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) -46802 NM_001363504 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 162.667-125 chr2 48752218 48752387 + 1 NA intron (NM_000233, intron 1 of 10) intron (NM_000233, intron 1 of 10) 3422 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 330.333-10 chr2 59494654 59495134 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 277186 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 146.333-183 chr21 29925442 29925607 + 1 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 14472 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 169.667-121 chr20 39469517 39469851 + 1 NA Intergenic Intergenic -244936 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 183.667-156 chrX 99253348 99253546 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 1156826 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 181.667-94 chr3 61755562 61755795 + 1 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) L2b|LINE|L2 194107 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 211.333-107 chr2 36850373 36850669 + 1 NA intron (NM_003162, intron 16 of 17) intron (NM_003162, intron 16 of 17) 116015 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 140.333-216 chr7 49465824 49465978 + 1 NA Intergenic Intergenic -307737 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 294.667-59 chr9 82470351 82470892 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 481849 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 270.333-45 chr4 119040362 119040779 + 1 NA 3' UTR (NM_001128933, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001128933, exon 4 of 4) -95214 NM_016599 51778 Hs.732122 NM_016599 ENSG00000172399 MYOZ2 C4orf5|CMH16|CS-1|FATZ-2 myozenin 2 protein-coding 112.667-40 chr11 44952678 44952900 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -1483 NM_001318385 9537 Hs.554791 NM_006034 ENSG00000175274 TP53I11 PIG11 tumor protein p53 inducible protein 11 protein-coding 168.333-149 chr4 80718255 80718565 + 1 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -312298 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 340.333-2 chr1 103100613 103101050 + 1 NA intron (NM_001854, intron 1 of 66) MIR|SINE|MIR 7665 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 334.667-3 chr1 189490135 189490644 + 1 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 985621 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 141.333-189 chr5 53596451 53596663 + 1 NA intron (NR_134475, intron 2 of 5) intron (NR_134475, intron 2 of 5) 35918 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 122.667-140 chr4 112034580 112034754 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -110787 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 192.667-29 chr10 92512819 92513164 + 1 NA intron (NM_001322794, intron 4 of 23) MIR|SINE|MIR -15230 NM_001165946 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 306.333-22 chr18 9378559 9378974 + 1 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 43993 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 203.667-89 chr4 101484315 101484639 + 1 NA Intergenic Intergenic 136700 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 209.667-71 chr2 189018363 189018715 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 22909 NR_037401 100500837 NR_037401 ENSG00000284180 MIR3606 mir-3606 microRNA 3606 ncRNA 145.333-61 chr11 127350577 127350779 + 1 NA Intergenic Intergenic 79608 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 211.667-67 chr2 159773474 159773930 + 1 NA intron (NM_001198764, intron 4 of 4) intron (NM_001198764, intron 4 of 4) 24506 NM_014880 9936 Hs.130014 NM_014880 ENSG00000241399 CD302 BIMLEC|CLEC13A|DCL-1|DCL1 CD302 molecule protein-coding 150.333-101 chr14 29905244 29905517 + 1 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) intron (NM_001330069, intron 1 of 18) 21716 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 159.667-321 chr8 93599831 93600140 + 1 NA intron (NR_033858, intron 5 of 10) intron (NR_033858, intron 5 of 10) 100448 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 255.667-70 chr5 43735311 43735737 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -132294 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 126.333-143 chr5 110322703 110322889 + 1 NA Intergenic Intergenic 191119 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 219.667-79 chr6 1158700 1159252 + 1 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -57644 NR_027115 285768 Hs.209463 NR_027115 LINC01622 - long intergenic non-protein coding RNA 1622 ncRNA 165.667-28 chr11 50684629 50684828 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 275581 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 156.667-192 chr2 168458077 168458348 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 1 of 10) intron (NM_001256126, intron 1 of 10) 1940 NM_203463 253782 Hs.506829 NM_203463 ENSG00000172292 CERS6 CERS5|LASS6 ceramide synthase 6 protein-coding 214.667-31 chr12 23696409 23696830 + 1 NA intron (NM_152989, intron 9 of 17) L1ME1|LINE|L1 -112033 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 161.667-108 chr17 71901450 71901711 + 1 NA Intergenic (CCTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 124399 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 224.333-50 chr15 88446819 88447109 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 20424 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 165.667-176 chr6 46760106 46760333 + 1 NA Intergenic Intergenic 13302 NM_001162435 100287718 Hs.736491 NM_001162435 ENSG00000230062 ANKRD66 - ankyrin repeat domain 66 protein-coding 226.333-105 chr8 54093632 54094016 + 1 NA intron (NM_001279356, intron 2 of 7) intron (NM_001279356, intron 2 of 7) 7730 NM_001279360 10434 Hs.744046 NM_006330 ENSG00000120992 LYPLA1 APT-1|APT1|LPL-I|LPL1|hAPT1 lysophospholipase 1 protein-coding 145.667-146 chr2 134339099 134339268 + 1 NA intron (NM_001371457, intron 7 of 16) intron (NM_001371457, intron 7 of 16) 85111 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 296.667-65 chrX 102706285 102706659 + 1 NA intron (NR_146585, intron 2 of 6) intron (NR_146585, intron 2 of 6) -5578 NR_146587 100528062 Hs.522729 NM_001199818 ENSG00000286237 ARMCX5-GPRASP2 ARMCX5-GPRASP2-BHLHB9-LINC00630|bHLHb9|p60TRP ARMCX5-GPRASP2 readthrough protein-coding 348.333-9 chr11 95508750 95509274 + 1 NA Intergenic Intergenic -276537 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 200.667-108 chr3 59881157 59881459 + 1 NA intron (NM_001354590, intron 7 of 8) intron (NM_001354590, intron 7 of 8) 199601 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 162.333-159 chr3 50609104 50609375 + 1 NA intron (NM_145071, intron 1 of 2) intron (NM_145071, intron 1 of 2) 2535 NM_013324 1154 Hs.655334 NM_013324 ENSG00000114737 CISH BACTS2|CIS|CIS-1|G18|SOCS cytokine inducible SH2 containing protein protein-coding 159.667-237 chr4 85935253 85935485 + 1 NA intron (NM_031305, intron 1 of 6) intron (NM_031305, intron 1 of 6) 5353 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 152.333-120 chr15 51869022 51869300 + 1 NA intron (NM_014547, intron 2 of 9) intron (NM_014547, intron 2 of 9) 39508 NM_014547 29766 Hs.4998 NM_014547 ENSG00000138594 TMOD3 UTMOD tropomodulin 3 protein-coding 147.333-238 chr4 70776016 70776188 + 1 NA intron (NM_001130709, intron 7 of 11) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 41692 NM_001345840 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 118.667-23 chr10 41910564 41910719 + 1 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 457404 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 347.333-24 chr6 35635618 35636272 + 1 NA intron (NM_001145775, intron 4 of 11) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 28844 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 263.333-49 chr2 226297554 226297885 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 154925 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 228.667-29 chr17 14804387 14804659 + 1 NA Intergenic Intergenic -210282 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 324.667-36 chr7 81149783 81150287 + 1 NA Intergenic Intergenic -227646 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 172.667-61 chr15 83195412 83195722 + 1 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) intron (NM_016073, intron 1 of 5) 12256 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 153.667-42 chr10 48974518 48974747 + 1 NA intron (NM_020945, intron 57 of 61) intron (NM_020945, intron 57 of 61) 10955 NR_036182 100422895 NR_036182 ENSG00000264800 MIR4294 - microRNA 4294 ncRNA 204.667-9 chr1 150420979 150421328 + 1 NA intron (NM_015203, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 57042 NM_001297674 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 213.333-106 chr2 164357222 164357644 + 1 NA Intergenic Intergenic 211062 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 144.333-2 chr1 23060861 23061028 + 1 NA intron (NM_015013, intron 8 of 18) intron (NM_015013, intron 8 of 18) 16639 NR_036057 100422866 NR_036057 ENSG00000263793 MIR3115 mir-3115 microRNA 3115 ncRNA 150.667-252 chr3 190819630 190819924 + 1 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 42917 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 174.667-117 chr3 101711176 101711397 + 1 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie -1148 NR_002941 285359 Hs.720825 NR_002941 PDCL3P4 - PDCL3 pseudogene 4 pseudo 175.667-10 chr1 164729682 164729903 + 1 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 44849 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 188.667-79 chr2 125377572 125377778 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 740310 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 151.333-24 chr1 152878157 152878444 + 1 NA promoter-TSS (NM_030663) promoter-TSS (NM_030663) -22 NM_030663 4184 Hs.111850 NM_030663 ENSG00000163206 SMCP HSMCSGEN1|MCS|MCSP sperm mitochondria associated cysteine rich protein protein-coding 153.333-85 chr12 19222971 19223203 + 1 NA intron (NM_001256787, intron 1 of 25) Kanga1b|DNA|TcMar-Tc2 17762 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 212.667-69 chr2 45878424 45878866 + 1 NA intron (NM_005400, intron 2 of 14) intron (NM_005400, intron 2 of 14) 226970 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 152.667-220 chr20 19880765 19880994 + 1 NA Intergenic Intergenic -5642 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 156.333-283 chr5 72189216 72189409 + 1 NA intron (NM_001324255, intron 3 of 5) L3|LINE|CR1 9525 NM_001324255 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 169.333-44 chr12 12456001 12456300 + 1 NA intron (NM_001300742, intron 3 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 3 of 3).2 99072 NM_001330356 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 129.333-200 chr9 37395586 37395738 + 1 NA Intergenic Intergenic -27034 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 149.333-162 chr19 30225019 30225218 + 1 NA Intergenic Intergenic -147266 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 164.333-152 chr3 29462463 29462662 + 1 NA intron (NM_001003792, intron 2 of 13) intron (NM_001003792, intron 2 of 13) 181250 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 136.667-181 chr8 127261527 127261684 + 1 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) L1MA7|LINE|L1 16968 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 269.667-52 chr7 109167288 109167696 + 1 NA Intergenic Intergenic -282905 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 166.667-201 chr6 73648303 73648496 + 1 NA intron (NM_012434, intron 1 of 10) intron (NM_012434, intron 1 of 10) 5593 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 163.333-21 chr1 184358848 184359169 + 1 NA Intergenic Intergenic -28021 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 170.333-161 chr4 102848992 102849326 + 1 NA intron (NM_181890, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 19734 NM_181890 7323 Hs.518773 NM_003340 ENSG00000109332 UBE2D3 E2(17)KB3|UBC4/5|UBCH5C ubiquitin conjugating enzyme E2 D3 protein-coding 169.667-115 chr2 156864088 156864417 + 1 NA Intergenic Intergenic -393453 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 222.333-16 chr11 28700914 28701284 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -223551 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 411.666-9 chr8 36258238 36259069 + 1 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 -525721 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 162.667-256 chr7 68071048 68071283 + 1 NA Intergenic Intergenic 50912 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 189.667-136 chr7 86472568 86472849 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -171201 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 165.667-156 chr5 38390747 38391087 + 1 NA intron (NM_152403, intron 6 of 21) L1MEd|LINE|L1 12554 NR_102750 100506475 Hs.662304 NR_102749 ENSG00000248572 EGFLAM-AS2 - EGFLAM antisense RNA 2 ncRNA 248.333-35 chr16 30154654 30155012 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -28577 NM_001193333 11151 Hs.415067 NM_007074 ENSG00000102879 CORO1A CLABP|CLIPINA|HCORO1|IMD8|TACO|p57 coronin 1A protein-coding 157.667-252 chr5 80151471 80151645 + 1 NA intron (NR_126061, intron 8 of 13) AluJr|SINE|Alu -67893 NR_109930 101929215 NR_109930 ENSG00000249825 CTD-2201I18.1 - uncharacterized LOC101929215 ncRNA 167.333-274 chr9 37599049 37599250 + 1 NA Intergenic AluYk4|SINE|Alu -4080 NM_001371224 149.333-319 chr5 128772600 128772780 + 1 NA Intergenic Intergenic -192437 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 187.333-64 chr14 74928098 74928355 + 1 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -4966 NM_001370256 83694 Hs.414481 NM_031464 ENSG00000198208 RPS6KL1 RSKL2 ribosomal protein S6 kinase like 1 protein-coding 159.667-313 chr8 59396841 59397004 + 1 NA Intergenic Intergenic 277712 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 167.667-34 chr11 28162580 28162778 + 1 NA intron (NM_001113528, intron 3 of 6) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 54291 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 233.333-127 chr8 50976141 50976617 + 1 NA Intergenic Intergenic 812248 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 117.333-227 chrX 135363563 135363719 + 1 NA TTS (NM_152695) TTS (NM_152695) 18845 NM_152695 203523 Hs.28780 NM_152695 ENSG00000173275 ZNF449 ZSCAN19 zinc finger protein 449 protein-coding 335.333-20 chr18 6687178 6687719 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -42268 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 284.333-41 chr8 51236603 51237130 + 1 NA Intergenic Intergenic 572579 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 121.333-64 chr15 94464335 94464460 + 1 NA intron (NM_018349, intron 19 of 21) L1MEd|LINE|L1 108467 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 163.333-114 chr16 75196924 75197100 + 1 NA Intergenic Intergenic 10149 NM_001025200 440387 Hs.610926 NM_001025200 ENSG00000168928 CTRB2 - chymotrypsinogen B2 protein-coding 147.667-187 chr2 125394663 125394876 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 723216 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 156.333-375 chr9 27866295 27866499 + 1 NA Intergenic Intergenic -292531 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 142.667-86 chr19 27666256 27666435 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -127086 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 294.333-46 chr8 27804137 27804860 + 1 NA 3' UTR (NM_001017420, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001017420, exon 11 of 11) 29944 NM_001017420 157570 Hs.99480 NM_001017420 ENSG00000171320 ESCO2 2410004I17Rik|EFO2|EFO2p|RBS|hEFO2 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 protein-coding 163.667-227 chr7 7850030 7850275 + 1 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 118600 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 188.333-12 chr1 185669227 185669517 + 1 NA Intergenic Intergenic -40884 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 125.667-20 chr10 33875351 33875545 + 1 NA Intergenic Intergenic -102768 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 149.333-360 chr7 13297479 13297711 + 1 NA Intergenic Intergenic 609962 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 152.333-212 chr21 24778599 24778757 + 1 NA Intergenic Intergenic -61872 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 171.333-75 chr2 40363286 40363569 + 1 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 66877 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 165.333-63 chr12 103481631 103481820 + 1 NA intron (NR_103526, intron 1 of 10) L1MEd|LINE|L1 14243 NM_198521 374470 Hs.534649 NM_198521 ENSG00000179088 C12orf42 - chromosome 12 open reading frame 42 protein-coding 153.667-79 chr11 127501766 127502022 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 230824 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 196.667-47 chr14 73787636 73788042 + 1 NA promoter-TSS (NM_001043318) promoter-TSS (NM_001043318) 479 NR_109995 100506476 Hs.287299 NR_109995 LOC100506476 - uncharacterized LOC100506476 ncRNA 204.333-207 chr9 22853708 22854035 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 207671 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 132.667-129 chr4 79003950 79004194 + 1 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) intron (NR_038342, intron 2 of 5) 32324 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 144.333-142 chr2 198806975 198807244 + 1 NA Intergenic Intergenic -432012 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 236.333-71 chr4 71181567 71181901 + 1 NA Intergenic Intergenic -5525 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 276.667-35 chr18 12676294 12676570 + 1 NA intron (NM_001271989, intron 9 of 10) AluJb|SINE|Alu 17693 NM_147163 56984 Hs.464652 NM_020232 ENSG00000128789 PSMG2 CLAST3|HCCA3|HsT1707|MDS003|PAC2|TNFSF5IP1 proteasome assembly chaperone 2 protein-coding 252.667-19 chr12 1127037 1127493 + 1 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) L1ME4c|LINE|L1 99517 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 152.333-187 chr2 123581451 123581740 + 1 NA Intergenic Intergenic 443579 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 157.667-144 chr2 79586047 79586256 + 1 NA intron (NM_001282598, intron 1 of 17) intron (NM_001282598, intron 1 of 17) 62968 NM_001282598 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 300.667-4 chr11 19501800 19502262 + 1 NA TTS (NR_049725) TTS (NR_049725) 5198 NR_049725 100874012 Hs.434602 NR_049725 ENSG00000255043 NAV2-AS5 - NAV2 antisense RNA 5 ncRNA 138.333-154 chr5 101568893 101569218 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -665773 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 145.667-176 chr3 88381951 88382105 + 1 NA intron (NM_001368167, intron 2 of 2) intron (NM_001368167, intron 2 of 2) 43572 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 223.333-53 chr17 61512377 61512725 + 1 NA Intergenic (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 56063 NM_018488 9496 Hs.143907 NM_018488 ENSG00000121075 TBX4 ICPPS|SPS T-box transcription factor 4 protein-coding 209.667-61 chr2 56101862 56102149 + 1 NA Intergenic Intergenic -11623 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 150.333-338 chr5 109892318 109892497 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 9225 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 150.667-145 chr17 57435462 57435713 + 1 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 88010 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 278.667-48 chr6 150724197 150724664 + 1 NA intron (NM_001329803, intron 1 of 13) intron (NM_001329803, intron 1 of 13) 3331 NM_001329801 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 155.333-6 chr1 73869189 73869385 + 1 NA Intergenic Intergenic 194608 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 251.667-70 chr4 69527480 69527912 + 1 NA Intergenic Intergenic -1682 NM_001297616 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 153.667-26 chr1 210125006 210125176 + 1 NA intron (NM_153262, intron 6 of 7) L1PA17|LINE|L1 -107705 NM_019605 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 166.667-117 chr2 148176372 148176641 + 1 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu -154902 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 150.333-372 chr6 143566419 143566626 + 1 NA intron (NR_027113, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 2817 NR_027113 285740 Hs.432656 NR_027113 ENSG00000235740 PHACTR2-AS1 - PHACTR2 antisense RNA 1 ncRNA 307.333-21 chr12 31929313 31929816 + 1 NA Intergenic PABL_B|LTR|ERV1 -29851 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 168.667-184 chr6 35797748 35797931 + 1 NA promoter-TSS (NM_001252598) promoter-TSS (NM_001252598) -495 NM_001252598 1208 Hs.1340 NM_001832 ENSG00000137392 CLPS - colipase protein-coding 150.667-155 chr18 3985493 3985677 + 1 NA intron (NR_102696, intron 1 of 4) intron (NR_102696, intron 1 of 4) 23232 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 149.333-176 chr2 59390151 59390372 + 1 NA Intergenic Intergenic 172553 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 214.333-32 chr12 37847447 37847784 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -469159 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 145.667-236 chr5 143598149 143598405 + 1 NA Intergenic LTR73|LTR|ERV1 -81583 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 159.333-276 chr5 166369161 166369352 + 1 NA Intergenic Intergenic 557114 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 302.333-10 chr10 70051003 70051586 + 1 NA Intergenic Intergenic -1552 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 294.333-20 chr18 76912728 76913176 + 1 NA intron (NM_001306089, intron 17 of 30) intron (NM_001306089, intron 17 of 30) 88792 NM_007345 7776 Hs.719137 NM_007345 ENSG00000130856 ZNF236 ZNF236A|ZNF236B zinc finger protein 236 protein-coding 127.667-141 chr5 63504035 63504198 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 458176 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 268.667-16 chr14 80509462 80509893 + 1 NA intron (NM_152446, intron 23 of 24) L1M1|LINE|L1 -278620 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 155.667-14 chr1 92867239 92867507 + 1 NA intron (NM_001252269, intron 1 of 3) intron (NM_001252269, intron 1 of 3) 9777 NM_001252271 388650 Hs.180946 NM_001006605 ENSG00000154511 DIPK1A FAM69A divergent protein kinase domain 1A protein-coding 149.667-251 chr22 42826181 42826386 + 1 NA intron (NM_001142293, intron 6 of 14) intron (NM_001142293, intron 6 of 14) 30990 NM_014570 26286 Hs.685225 NM_014570 ENSG00000242247 ARFGAP3 ARFGAP1 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 3 protein-coding 128.333-65 chr15 67509612 67509760 + 1 NA intron (NR_040051, intron 2 of 5) intron (NR_040051, intron 2 of 5) 11287 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 182.667-109 chr3 178125448 178125707 + 1 NA Intergenic Intergenic -293624 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 195.667-84 chr22 27978406 27978676 + 1 NA 3' UTR (NM_001145418, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_001145418, exon 23 of 23) -57929 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 159.333-104 chr15 76254800 76254995 + 1 NA intron (NM_000126, intron 9 of 11) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 5255 NR_028510 7302 Hs.684881 NR_002721 TYRO3P - TYRO3P protein tyrosine kinase pseudogene pseudo 129.333-94 chr2 81435122 81435358 + 1 NA Intergenic Intergenic 31706 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 309.667-30 chr8 136496238 136496624 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -34367 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 224.333-70 chr2 240757989 240758483 + 1 NA intron (NM_001244008, intron 26 of 48) intron (NM_001244008, intron 26 of 48) 61983 NM_001330289 547 Hs.516802 NM_004321 ENSG00000130294 KIF1A ATSV|C2orf20|HSN2C|MRD9|SPG30|UNC104 kinesin family member 1A protein-coding 153.667-382 chr8 92180325 92180537 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -77046 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 127.667-86 chr2 105713946 105714138 + 1 NA Intergenic Intergenic -30870 NM_003581 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 146.667-279 chr6 70201033 70201189 + 1 NA intron (NM_001858, intron 49 of 50) intron (NM_001858, intron 49 of 50) 82086 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 151.667-249 chr4 61669432 61669709 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) intron (NM_001371343, intron 5 of 23) 467398 NM_001371342 174.333-116 chr5 55064447 55064782 + 1 NA Intergenic Intergenic -38032 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 234.667-113 chr9 7094219 7094635 + 1 NA intron (NM_001353997, intron 17 of 22) intron (NM_001353997, intron 17 of 22) 337077 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 150.333-339 chr5 120249057 120249311 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -215094 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 174.667-83 chr2 67842715 67843037 + 1 NA Intergenic Intergenic -17314 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 180.667-83 chr20 60897765 60898077 + 1 NA Intergenic Intergenic -181143 NR_109919 100506470 Hs.125674 NR_109919 ENSG00000229606 LINC01718 - long intergenic non-protein coding RNA 1718 ncRNA 213.667-53 chr22 34022087 34022464 + 1 NA Intergenic Intergenic -99387 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 267.667-51 chr5 52394600 52394958 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 386748 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 147.667-323 chr6 140727087 140727362 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 43410 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 205.333-199 chr6 37609135 37609410 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -53850 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 139.333-20 chr10 50312428 50312587 + 1 NA intron (NM_147156, intron 8 of 10) HAL1|LINE|L1 -63897 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 147.667-257 chr4 81459577 81459754 + 1 NA intron (NM_152545, intron 1 of 13) intron (NM_152545, intron 1 of 13) 12242 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 151.667-47 chr10 39131013 39131268 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 434544 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 145.667-76 chr14 49421389 49421567 + 1 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 164902 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 219.667-10 chr10 99439010 99439413 + 1 NA Intergenic Intergenic -8587 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 180.667-68 chr2 116658822 116659029 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -1155766 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 219.667-91 chr8 17231137 17231575 + 1 NA TTS (NM_001322089) TTS (NM_001322089) 15102 NM_001322089 29883 Hs.587465 NM_013354 ENSG00000198791 CNOT7 CAF-1|CAF1|Caf1a|hCAF-1 CCR4-NOT transcription complex subunit 7 protein-coding 191.667-80 chr22 25051579 25051863 + 1 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) MIR3|SINE|MIR 23747 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 146.667-245 chr5 9476037 9476219 + 1 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) L1MC4a|LINE|L1 -35205 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 291.333-49 chr4 137138620 137139159 + 1 NA intron (NR_149105, intron 1 of 3) intron (NR_149105, intron 1 of 3) -54867 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 169.667-10 chr1 166573924 166574136 + 1 NA Intergenic Intergenic -29886 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 203.667-128 chr8 122609287 122609594 + 1 NA Intergenic Intergenic -40796 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 159.333-313 chr7 82907099 82907273 + 1 NA intron (NM_033026, intron 8 of 24) intron (NM_033026, intron 8 of 24) 255698 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 121.333-124 chr3 163768981 163769187 + 1 NA Intergenic Intergenic 402472 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 181.667-26 chr11 112954050 112954289 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -7251 NM_001242607 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 120.667-149 chr6 54378083 54378266 + 1 NA intron (NM_014464, intron 9 of 10) intron (NM_014464, intron 9 of 10) 69733 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 172.333-62 chr16 74438060 74438258 + 1 NA Intergenic Intergenic -16689 NM_001011880 497190 Hs.454670 NM_001011880 ENSG00000140839 CLEC18B MRCL2 C-type lectin domain family 18 member B protein-coding 229.667-31 chr14 72822472 72822834 + 1 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) L1ME4b|LINE|L1 69996 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 157.333-253 chr4 30262976 30263250 + 1 NA Intergenic Intergenic -457256 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 170.667-16 chr10 12394581 12394756 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 2 of 11) intron (NM_001351032, intron 2 of 11) 5686 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 221.333-18 chr10 91017551 91017930 + 1 NA Intergenic Intergenic -15426 NR_134319 105378430 Hs.512240 NR_134319 LOC105378430 - uncharacterized LOC105378430 ncRNA 170.333-48 chr11 97497206 97497473 + 1 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 988914 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 173.333-30 chr10 104941584 104941890 + 1 NA intron (NM_014978, intron 3 of 26) intron (NM_014978, intron 3 of 26) -275521 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 138.667-82 chr17 39788644 39788884 + 1 NA intron (NM_001257411, intron 3 of 5) MER129|LTR?|LTR? -10539 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 156.667-197 chr2 207970348 207970584 + 1 NA intron (NM_001080475, intron 3 of 7) intron (NM_001080475, intron 3 of 7) 55061 NM_001080475 389072 Hs.159188 NM_001080475 ENSG00000178385 PLEKHM3 DAPR|PLEKHM1L pleckstrin homology domain containing M3 protein-coding 173.667-124 chr3 182606673 182606891 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -99658 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 139.667-8 chr1 115577673 115577812 + 1 NA Intergenic Intergenic -64228 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 149.667-411 chr8 120739953 120740107 + 1 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) -21223 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 165.333-174 chr3 105694142 105694413 + 1 NA intron (NR_135809, intron 13 of 18) intron (NR_135809, intron 13 of 18) 173314 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 131.333-131 chr4 86545017 86545269 + 1 NA Intergenic Intergenic -2591 NR_039657 100616463 NR_039657 ENSG00000266515 MIR4452 - microRNA 4452 ncRNA 173.333-97 chr2 134758081 134758294 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -39187 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 150.333-50 chr11 7041563 7041815 + 1 NA intron (NM_176822, intron 3 of 11) intron (NM_176822, intron 3 of 11) 21220 NM_176822 338323 Hs.449637 NM_176822 ENSG00000158077 NLRP14 CLR11.2|GC-LRR|NALP14|NOD5|PAN8 NLR family pyrin domain containing 14 protein-coding 162.667-20 chr10 14527197 14527399 + 1 NA intron (NM_001282699, intron 2 of 3) intron (NM_001282699, intron 2 of 3) 5416 NM_001320741 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 183.333-163 chr8 118728421 118728789 + 1 NA Intergenic Intergenic -106642 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 219.667-95 chr8 135587285 135587554 + 1 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) intron (NM_006558, intron 6 of 8) 129963 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 203.333-27 chr10 35374361 35374707 + 1 NA intron (NM_001282852, intron 1 of 8) intron (NM_001282852, intron 1 of 8) 37660 NM_001282852 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 143.333-84 chr14 56617021 56617262 + 1 NA intron (NM_017799, intron 8 of 15) intron (NM_017799, intron 8 of 15) 37343 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 173.333-17 chr1 190780803 190780984 + 1 NA intron (NR_033922, intron 2 of 4) intron (NR_033922, intron 2 of 4) 156003 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 146.333-132 chr18 63342508 63342710 + 1 NA intron (NM_002035, intron 7 of 9) intron (NM_002035, intron 7 of 9) -23229 NM_000633 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 164.333-31 chr10 97730691 97730894 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -6329 NM_001174121 118813 Hs.744075 NM_144588 ENSG00000155256 ZFYVE27 PROTRUDIN|SPG33 zinc finger FYVE-type containing 27 protein-coding 153.667-75 chr11 90512816 90513078 + 1 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) intron (NR_104190, intron 1 of 6) 42910 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 240.667-6 chr1 201636689 201636982 + 1 NA Intergenic Intergenic -11487 NM_020443 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 176.333-111 chr3 109625366 109625674 + 1 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie 22692 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 140.333-121 chr20 31055111 31055354 + 1 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -202432 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 335.333-21 chr19 50181545 50182024 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -18503 NM_152358 126123 Hs.414175 NM_152358 ENSG00000161652 IZUMO2 C19orf41|PLAL6978|PRO21961|SCRL IZUMO family member 2 protein-coding 166.333-180 chr5 23310866 23311088 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -196632 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 175.667-149 chr9 28671019 28671353 + 1 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 48119 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 154.333-223 chr3 108248327 108248611 + 1 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -26045 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 170.333-82 chr15 78588251 78588430 + 1 NA exon (NM_000745, exon 4 of 6) exon (NM_000745, exon 4 of 6) 22820 NM_000745 1138 Hs.1614 NM_000745 ENSG00000169684 CHRNA5 LNCR2 cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit protein-coding 289.667-7 chr11 85212086 85212427 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) intron (NM_001142699, intron 4 of 27) -288835 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 155.667-38 chr10 71668645 71668973 + 1 NA intron (NM_022124, intron 13 of 67) intron (NM_022124, intron 13 of 67) 50969 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 124.333-48 chr14 50678583 50678814 + 1 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -10392 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 153.333-189 chr2 25882186 25882469 + 1 NA Intergenic Intergenic -3840 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 114.667-39 chr10 110573020 110573169 + 1 NA intron (NM_005445, intron 2 of 28) intron (NM_005445, intron 2 of 28) 5403 NM_005445 9126 Hs.24485 NM_005445 ENSG00000108055 SMC3 BAM|BMH|CDLS3|CSPG6|HCAP|SMC3L1 structural maintenance of chromosomes 3 protein-coding 131.667-98 chr2 122759886 122760094 + 1 NA Intergenic Intergenic 313491 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 152.333-255 chr3 161577009 161577173 + 1 NA Intergenic Intergenic 80283 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 154.333-318 chr7 29612547 29612797 + 1 NA Intergenic Intergenic 47139 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 231.333-51 chr18 39078590 39078988 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 543386 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 155.667-26 chr1 197608402 197608586 + 1 NA intron (NR_125340, intron 11 of 19) intron (NR_125340, intron 11 of 19) 166986 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 297.667-41 chr9 18231112 18231481 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -242857 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 195.667-149 chr8 129561820 129562173 + 1 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 13022 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 287.667-27 chr3 65066099 65066642 + 1 NA Intergenic Intergenic -378370 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 385.333-18 chr3 36385202 36385691 + 1 NA intron (NM_001292049, intron 1 of 8) L1ME4a|LINE|L1 4959 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 172.333-152 chr6 36066167 36066394 + 1 NA intron (NM_139012, intron 3 of 11) intron (NM_139012, intron 3 of 11) 38472 NM_139013 1432 Hs.485233 NM_001315 ENSG00000112062 MAPK14 CSBP|CSBP1|CSBP2|CSPB1|EXIP|Mxi2|PRKM14|PRKM15|RK|SAPK2A|p38|p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 protein-coding 137.667-16 chr1 218048041 218048295 + 1 NA intron (NR_110794, intron 2 of 3) intron (NR_110794, intron 2 of 3) 4663 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 319.667-33 chr8 144435485 144435971 + 1 NA promoter-TSS (NR_106953) promoter-TSS (NR_106953) -109 NR_106953 102466271 NR_106953 ENSG00000276598 MIR6893 hsa-mir-6893 microRNA 6893 ncRNA 350.667-9 chr2 231466559 231466948 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -2269 NM_005381 4691 Hs.79110 NM_005381 ENSG00000115053 NCL C23|Nsr1 nucleolin protein-coding 131.667-149 chr4 95325302 95325456 + 1 NA intron (NM_003728, intron 2 of 15) intron (NM_003728, intron 2 of 15) 223594 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 117.333-80 chr17 32194461 32194683 + 1 NA intron (NM_001033566, intron 11 of 19) MER20|DNA|hAT-Charlie -43001 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 178.333-89 chr2 226668961 226669373 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -10374 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 140.667-97 chr17 65511257 65511499 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 50270 NM_004655 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 248.333-19 chr12 20104955 20105379 + 1 NA Intergenic Intergenic 22734 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 126.333-106 chr20 35144786 35144937 + 1 NA intron (NM_001145025, intron 2 of 9) intron (NM_001145025, intron 2 of 9) 2475 NM_018217 55741 Hs.720177 NM_018217 ENSG00000088298 EDEM2 C20orf31|C20orf49|bA4204.1 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 2 protein-coding 147.667-394 chr9 136027355 136027682 + 1 NA intron (NM_144653, intron 2 of 5) L1ME1|LINE|L1 -66145 NM_016172 10422 Hs.9194 NM_016172 ENSG00000130560 UBAC1 GBDR1|KPC2|UBADC1 UBA domain containing 1 protein-coding 238.667-17 chr12 38984434 38984756 + 1 NA Intergenic Intergenic -79004 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 310.333-12 chr12 24286943 24287298 + 1 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 63849 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 112.333-27 chr10 92331780 92331904 + 1 NA intron (NM_017824, intron 2 of 5) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 40675 NM_017824 54708 Hs.573490 NM_017824 ENSG00000198060 MARCH5 MARCH-V|MITOL|RNF153 membrane associated ring-CH-type finger 5 protein-coding 152.333-119 chr15 46050969 46051252 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 345915 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 169.667-165 chr5 44432242 44432455 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -42928 NM_004465 2255 Hs.248049 NM_004465 ENSG00000070193 FGF10 - fibroblast growth factor 10 protein-coding 140.667-55 chr11 97557618 97557815 + 1 NA Intergenic Intergenic 1049291 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 157.667-75 chr12 44873285 44873467 + 1 NA intron (NM_006159, intron 3 of 20) intron (NM_006159, intron 3 of 20) 2285 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 152.333-358 chr7 79968247 79968552 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -166432 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 179.667-5 chr1 76621619 76621848 + 1 NA intron (NR_146056, intron 4 of 5) intron (NR_146056, intron 4 of 5) 157534 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 152.667-203 chr2 168574946 168575198 + 1 NA intron (NM_001256126, intron 3 of 10) intron (NM_001256126, intron 3 of 10) -7871 NR_039933 100616356 NR_039933 ENSG00000265694 MIR4774 - microRNA 4774 ncRNA 192.333-65 chr16 64190871 64191141 + 1 NA Intergenic Intergenic 931057 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 134.667-59 chr14 59924068 59924221 + 1 NA intron (NR_075071, intron 1 of 32) intron (NR_075071, intron 1 of 32) 4431 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 249.667-68 chr4 73400116 73400533 + 1 NA Intergenic Intergenic -3963 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 212.667-139 chr8 126875620 126875986 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -137351 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 294.667-29 chr20 54431809 54432272 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -43553 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 159.667-255 chr5 50654569 50654751 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -11271 NM_001178055 79668 Hs.369581 NM_024615 ENSG00000151883 PARP8 ARTD16|pART16 poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 protein-coding 153.667-156 chr17 66638990 66639222 + 1 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) L2|LINE|L2 -147966 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 147.667-114 chr15 67332652 67332849 + 1 NA intron (NM_001322475, intron 3 of 17) intron (NM_001322475, intron 3 of 17) -77552 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 158.333-42 chr10 92506381 92506624 + 1 NA exon (NM_001322793, exon 10 of 25) exon (NM_001322793, exon 10 of 25) -8741 NM_001165946 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 146.333-26 chr10 53662269 53662511 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -823840 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 184.667-34 chr14 81886027 81886309 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -143030 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 181.667-3 chr1 110554169 110554495 + 1 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -35157 NM_005549 3744 Hs.248140 NM_005549 ENSG00000143105 KCNA10 Kcn1|Kv1.8 potassium voltage-gated channel subfamily A member 10 protein-coding 153.667-288 chr4 51864221 51864383 + 1 NA intron (NM_001040402, intron 3 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie 20723 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 187.667-98 chr3 155803800 155804052 + 1 NA intron (NM_001308229, intron 1 of 4) AluSq2|SINE|Alu 2352 NM_001308229 285315 Hs.350846 NM_173657 ENSG00000174928 C3orf33 AC3-33 chromosome 3 open reading frame 33 protein-coding 206.333-159 chr8 54163297 54163629 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 28222 NM_014175 29088 Hs.18349 NM_014175 ENSG00000137547 MRPL15 HSPC145|L15mt|MRP-L15|MRP-L7|RPML7 mitochondrial ribosomal protein L15 protein-coding 155.667-43 chr10 109785110 109785434 + 1 NA Intergenic Intergenic 137974 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 139.667-39 chr12 56506213 56506432 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -6543 NR_132789 106635541 NR_132789 SNORA105C - small nucleolar RNA, H/ACA box 105C snoRNA 160.667-219 chr4 31971644 31971983 + 1 NA Intergenic Intergenic -25566 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 181.667-98 chr3 144989250 144989472 + 1 NA Intergenic Intergenic 1016280 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 196.667-15 chr10 63939893 63940237 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -418175 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 241.333-73 chr4 36238296 36238639 + 1 NA intron (NR_146894, intron 1 of 32) intron (NR_146894, intron 1 of 32) 5472 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 181.333-154 chr6 107134788 107134976 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -19367 NM_001367314 57673 Hs.418045 NM_001080450 ENSG00000178409 BEND3 KIAA1553 BEN domain containing 3 protein-coding 238.333-33 chr17 63385258 63385584 + 1 NA intron (NM_025185, intron 14 of 25) intron (NM_025185, intron 14 of 25) 54846 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 125.667-78 chr17 58408897 58409096 + 1 NA intron (NM_001305544, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 -6275 NM_001305545 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 200.667-4 chr1 39641526 39641947 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2093 NM_014571 26508 Hs.472566 NM_014571 ENSG00000163909 HEYL HESR3|HEY3|HRT3|bHLHb33 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif like protein-coding 146.667-305 chr7 46021070 46021308 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -99917 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 150.333-7 chr1 75195394 75195597 + 1 NA Intergenic Intergenic 61107 NM_001256114 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 241.667-25 chr15 48295950 48296306 + 1 NA intron (NM_001184832, intron 24 of 26) intron (NM_001184832, intron 24 of 26) -34967 NM_001330286 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 156.667-228 chr3 103488154 103488424 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 35827 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 158.333-80 chr14 26045189 26045466 + 1 NA Intergenic Intergenic 508103 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 126.333-77 chr19 51568182 51568321 + 1 NA Intergenic Intergenic -3032 NM_007147 7728 Hs.119014 NM_007147 ENSG00000105497 ZNF175 OTK18 zinc finger protein 175 protein-coding 204.667-47 chr14 89022758 89022995 + 1 NA Intergenic Intergenic 198225 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 236.667-85 chr7 96495309 96495630 + 1 NA intron (NR_163951, intron 3 of 4) intron (NR_163951, intron 3 of 4) 8054 NR_163949 154.667-274 chr4 67839024 67839226 + 1 NA intron (NM_004262, intron 4 of 9) L2|LINE|L2 44877 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 160.333-225 chr4 161677191 161677354 + 1 NA intron (NM_001128428, intron 6 of 14) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -345461 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 169.667-25 chr10 104753455 104753719 + 1 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) MER124|DNA?|DNA? -87371 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 192.667-80 chr19 6978752 6979013 + 1 NA intron (NR_024075, intron 6 of 15) L1M5|LINE|L1 11964 NR_024075 326342 Hs.688043 NM_001080498 ENSG00000268758 ADGRE4P EMR4|EMR4P|FIRE|GPR127|PGR16 adhesion G protein-coupled receptor E4, pseudogene pseudo 275.667-15 chr12 18275994 18276431 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 1 of 32) intron (NM_001288774, intron 1 of 32) 14672 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 145.333-102 chr16 7894762 7894986 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 562029 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 150.333-303 chr4 70005855 70006017 + 1 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 9970 NM_003154 6779 Hs.654495 NM_003154 ENSG00000126549 STATH STR statherin protein-coding 176.333-11 chr1 179584957 179585178 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -6546 NM_001349923 163589 Hs.197354 NM_173533 ENSG00000162782 TDRD5 TUDOR3 tudor domain containing 5 protein-coding 136.667-89 chr2 36676420 36676634 + 1 NA Intergenic Intergenic -20163 NM_001177969 5212 Hs.137415 NM_053276 ENSG00000205221 VIT VIT1 vitrin protein-coding 153.333-7 chr1 52986373 52986532 + 1 NA intron (NM_001193600, intron 9 of 14) intron (NM_001193600, intron 9 of 14) -28485 NM_001007099 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 119.333-175 chr5 72465531 72465706 + 1 NA intron (NM_152625, intron 1 of 4) intron (NM_152625, intron 1 of 4) 41792 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 145.667-207 chr5 20680201 20680358 + 1 NA intron (NR_149120, intron 3 of 11) intron (NR_149120, intron 3 of 11) -64744 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 330.667-10 chr18 7042999 7043425 + 1 NA intron (NM_005559, intron 8 of 62) intron (NM_005559, intron 8 of 62) 74585 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 172.333-129 chr4 137347201 137347532 + 1 NA Intergenic Intergenic -134567 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 233.667-63 chr6 22695069 22695374 + 1 NA intron (NR_134614, intron 1 of 2) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 22703 NR_134613 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 137.667-33 chr10 126109023 126109211 + 1 NA intron (NM_001288974, intron 7 of 18) intron (NM_001288974, intron 7 of 18) -135844 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 180.333-156 chrX 80678547 80678826 + 1 NA intron (NM_153252, intron 40 of 40) L2a|LINE|L2 131191 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 267.333-34 chr15 87680754 87681101 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 103998 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 126.333-80 chr2 22271151 22271316 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -265246 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 261.333-5 chr1 93471514 93471828 + 1 NA intron (NM_001024948, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 23540 NM_001024948 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 155.667-75 chr12 55982314 55982493 + 1 NA intron (NM_002868, intron 1 of 5) intron (NM_002868, intron 1 of 5) 8325 NM_002868 5869 Hs.157659 NM_002868 ENSG00000111540 RAB5B - RAB5B, member RAS oncogene family protein-coding 223.333-56 chr17 71381007 71381328 + 1 NA Intergenic Intergenic -178988 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 199.333-161 chr20 10924046 10924257 + 1 NA Intergenic Intergenic -14879 NR_109866 101929413 Hs.385604 NR_109866 ENSG00000232900 LOC101929413 - uncharacterized LOC101929413 ncRNA 127.667-156 chr6 152722757 152722954 + 1 NA 3' UTR (NM_025107, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_025107, exon 2 of 2) 24960 NM_025107 80177 Hs.18160 NM_025107 ENSG00000120279 MYCT1 MTLC MYC target 1 protein-coding 151.667-219 chr3 62491010 62491257 + 1 NA intron (NM_003716, intron 21 of 29) intron (NM_003716, intron 21 of 29) -117583 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 153.667-400 chr9 8187639 8187814 + 1 NA Intergenic Intergenic -387948 NM_001318058 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 129.333-173 chr7 43275297 43275462 + 1 NA intron (NM_001287059, intron 2 of 27) L1ME4a|LINE|L1 124484 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 271.667-20 chr12 122082400 122082844 + 1 NA intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 3866 NM_014938 22877 Hs.437153 NM_014938 ENSG00000175727 MLXIP MIR|MONDOA|bHLHe36 MLX interacting protein protein-coding 220.667-94 chr6 137658231 137658599 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -7231 NR_125867 102723649 Hs.129235 NR_125867 LOC102723649 - uncharacterized LOC102723649 ncRNA 155.333-412 chr9 74284465 74284652 + 1 NA Intergenic Intergenic -86973 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 113.333-127 chr2 64547122 64547261 + 1 NA intron (NM_001002243, intron 1 of 8) L1MC4|LINE|L1 21678 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 154.667-203 chr2 203913236 203913411 + 1 NA Intergenic Intergenic -23425 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 240.667-87 chr9 73434920 73435438 + 1 NA Intergenic Intergenic 283314 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 166.333-101 chr19 40372691 40373007 + 1 NA intron (NM_001031696, intron 9 of 12) AluJr|SINE|Alu 3003 NR_106854 102465477 NR_106854 ENSG00000275652 MIR6796 hsa-mir-6796 microRNA 6796 ncRNA 175.333-49 chr14 82412408 82412693 + 1 NA Intergenic Intergenic -230082 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 182.333-11 chr1 215790419 215790753 + 1 NA intron (NM_206933, intron 50 of 71) intron (NM_206933, intron 50 of 71) 223282 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 236.333-28 chr14 62664816 62665118 + 1 NA Intergenic Intergenic 380491 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 232.333-4 chr1 111084457 111085005 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -54652 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 292.667-20 chr20 19067044 19067465 + 1 NA Intergenic Intergenic -145388 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 164.333-58 chr12 56897960 56898283 + 1 NA Intergenic Intergenic 36287 NM_148897 121214 Hs.380178 NM_148897 ENSG00000170426 SDR9C7 ARCI13|RDHS|SDR-O|SDRO short chain dehydrogenase/reductase family 9C member 7 protein-coding 332.333-26 chr9 28459805 28460415 + 1 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) intron (NM_152570, intron 3 of 6) 259195 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 138.667-93 chr2 6746898 6747060 + 1 NA intron (NR_038369, intron 1 of 5) intron (NR_038369, intron 1 of 5) 23332 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 223.333-34 chr12 45941338 45941691 + 1 NA intron (NM_004719, intron 6 of 14) L1MA9|LINE|L1 49060 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 214.667-19 chr10 100066162 100066511 + 1 NA intron (NM_001308, intron 3 of 8) intron (NM_001308, intron 3 of 8) 15533 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 186.333-55 chr15 60274830 60275086 + 1 NA Intergenic Intergenic 123028 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 135.333-59 chr15 98994632 98994787 + 1 NA intron (NM_001167902, intron 2 of 4) L1MEd|LINE|L1 10947 NM_001102612 145814 Hs.592021 NM_001102612 ENSG00000183571 PGPEP1L - pyroglutamyl-peptidase I like protein-coding 125.667-31 chr11 17991737 17991897 + 1 NA intron (NR_104040, intron 7 of 11) intron (NR_104040, intron 7 of 11) 21230 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 165.667-195 chr8 89771865 89772106 + 1 NA intron (NM_003821, intron 5 of 10) intron (NM_003821, intron 5 of 10) 14169 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 152.333-95 chr13 80480352 80480545 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -139322 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 246.667-31 chr15 76389931 76390227 + 1 NA intron (NR_148227, intron 28 of 32) AluJr|SINE|Alu 53306 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 114.333-12 chr1 156275144 156275327 + 1 NA intron (NM_015327, intron 4 of 21) intron (NM_015327, intron 4 of 21) 7590 NM_015327 23381 Hs.516837 NM_015327 ENSG00000198952 SMG5 EST1B|LPTS-RP1|LPTSRP1|SMG-5 SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 261.667-17 chr14 60717056 60717388 + 1 NA intron (NM_017420, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu 7129 NM_017420 51804 Hs.97849 NM_017420 ENSG00000100625 SIX4 AREC3 SIX homeobox 4 protein-coding 171.333-182 chr7 62919215 62919550 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 384674 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 239.333-77 chr4 72330518 72330949 + 1 NA intron (NM_014243, intron 5 of 21) intron (NM_014243, intron 5 of 21) 238488 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 156.333-182 chr2 88057455 88057735 + 1 NA Intergenic Intergenic -1812 NM_016618 51315 Hs.469254 NM_016618 ENSG00000172086 KRCC1 CHBP2 lysine rich coiled-coil 1 protein-coding 159.667-30 chr1 197936890 197937066 + 1 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 19606 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 212.333-133 chr6 169561562 169561853 + 1 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) L1MEc|LINE|L1 140322 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 148.667-31 chr1 229713073 229713222 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 86900 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 386.667-9 chr5 149343520 149343976 + 1 NA TTS (NM_001146337) TTS (NM_001146337) -1751 NM_152407 134266 Hs.511816 NM_152407 ENSG00000164284 GRPEL2 Mt-GrpE#2 GrpE like 2, mitochondrial protein-coding 152.333-11 chr1 70178006 70178188 + 1 NA intron (NM_017768, intron 6 of 14) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 27482 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 158.667-250 chr4 113996570 113996884 + 1 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -17080 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 154.333-250 chr4 107181097 107181264 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -144867 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 148.667-170 chr19 44429849 44430124 + 1 NA exon (NM_014518, exon 6 of 6) exon (NM_014518, exon 6 of 6) 18486 NM_014518 7772 Hs.709348 NM_014518 ENSG00000278318 ZNF229 - zinc finger protein 229 protein-coding 140.333-85 chr17 75282915 75283110 + 1 NA intron (NM_001126121, intron 5 of 7) AluSc|SINE|Alu 6421 NM_001126121 60386 Hs.514470 NM_021734 ENSG00000125454 SLC25A19 DNC|MCPHA|MUP1|THMD3|THMD4|TPC solute carrier family 25 member 19 protein-coding 149.667-210 chr2 103740846 103741137 + 1 NA Intergenic MER105|DNA|hAT-Charlie 667341 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 354.333-6 chr14 62968687 62969137 + 1 NA intron (NM_139318, intron 6 of 10) intron (NM_139318, intron 6 of 10) 76546 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 155.667-39 chr10 72834874 72835086 + 1 NA intron (NM_138357, intron 2 of 7) intron (NM_138357, intron 2 of 7) -58759 NM_152635 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 126.333-74 chr18 41015842 41016069 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 504722 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 144.333-201 chr4 168699026 168699194 + 1 NA intron (NM_001166108, intron 8 of 21) AluSx1|SINE|Alu 67532 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 353.333-15 chr15 42258370 42259010 + 1 NA 3' UTR (NM_001110503, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001110503, exon 7 of 7) 14743 NM_015497 25963 Hs.511138 NM_015497 ENSG00000103978 TMEM87A - transmembrane protein 87A protein-coding 248.667-2 chr1 110652313 110652606 + 1 NA Intergenic Intergenic 19316 NR_109846 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 182.667-84 chr21 15659084 15659308 + 1 NA Intergenic Intergenic -70738 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 141.333-18 chr10 21867511 21867690 + 1 NA intron (NM_022365, intron 8 of 11) MER41E|LTR|ERV1 136130 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 334.667-21 chr4 20139474 20139922 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -112207 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 231.667-50 chr6 45412860 45413238 + 1 NA intron (NM_001015051, intron 2 of 7) AluSz|SINE|Alu -9226 NM_001369405 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 246.667-46 chr2 190182349 190182707 + 1 NA intron (NM_032321, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 1665 NM_032321 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 161.667-50 chr12 18260009 18260289 + 1 NA Intergenic Intergenic -1391 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 148.667-281 chr4 64611197 64611466 + 1 NA Intergenic Intergenic -201871 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 140.667-245 chr9 22294074 22294340 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -152617 NM_022160 63951 Hs.371976 NM_022160 ENSG00000176399 DMRTA1 DMO|DMRT4 DMRT like family A1 protein-coding 222.333-20 chr11 80227671 80228029 + 1 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 534953 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 262.333-31 chr15 71299997 71300462 + 1 NA intron (NM_024817, intron 5 of 16) intron (NM_024817, intron 5 of 16) -111170 NR_120350 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 179.667-46 chr14 56053963 56054356 + 1 NA Intergenic Intergenic -64252 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 249.333-51 chr2 62578225 62578535 + 1 NA Intergenic Intergenic -72185 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 296.667-35 chr21 21482836 21483308 + 1 NA intron (NM_001352592, intron 16 of 18) intron (NM_001352592, intron 16 of 18) 254247 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 134.667-199 chr8 123308682 123308895 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -33247 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 255.333-82 chr5 36793872 36794173 + 1 NA Intergenic Intergenic 82672 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 167.667-157 chr4 84647947 84648140 + 1 NA intron (NM_001263, intron 12 of 12) intron (NM_001263, intron 12 of 12) 64916 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 181.667-69 chr2 98925455 98925817 + 1 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) intron (NM_207362, intron 1 of 9) 10589 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 133.333-176 chr8 40389523 40389784 + 1 NA Intergenic Intergenic -46290 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 172.333-183 chr8 100698255 100698493 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 4650 NR_106992 102466854 NR_106992 ENSG00000284570 MIR7705 hsa-mir-7705 microRNA 7705 ncRNA 117.667-190 chr8 82231257 82231495 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -389090 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 166.667-137 chr21 26402568 26402860 + 1 NA intron (NR_135516, intron 1 of 3) intron (NR_135516, intron 1 of 3) -3229 NR_135515 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 191.333-64 chr14 66891291 66891668 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1MB4|LINE|L1 -297961 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 189.667-127 chr6 45428455 45428750 + 1 NA intron (NM_001015051, intron 3 of 7) intron (NM_001015051, intron 3 of 7) 6327 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 147.333-2 chr1 21726981 21727160 + 1 NA TTS (NM_001032730) TTS (NM_001032730) 56079 NM_001350168 84196 Hs.467524 NM_032236 ENSG00000090686 USP48 RAP1GA1|USP31 ubiquitin specific peptidase 48 protein-coding 240.333-27 chr12 28118816 28119203 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -71447 NM_001352084 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 153.667-211 chr2 217685580 217685763 + 1 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 70922 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 239.667-51 chr4 64464604 64465055 + 1 NA Intergenic Intergenic -55369 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 333.667-8 chr14 60814291 60814961 + 1 NA intron (NM_001177963, intron 5 of 6) intron (NM_001177963, intron 5 of 6) 79865 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 155.667-40 chr10 83068996 83069297 + 1 NA Intergenic Intergenic 607943 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 152.333-115 chr14 86341124 86341291 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 406529 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 271.333-38 chr20 32726157 32726536 + 1 NA intron (NM_001099339, intron 3 of 8) AluSg|SINE|Alu 17662 NM_053041 149951 Hs.408427 NM_053041 ENSG00000149600 COMMD7 C20orf92|dJ1085F17.3 COMM domain containing 7 protein-coding 188.333-131 chr6 99343644 99343913 + 1 NA intron (NM_001346530, intron 1 of 5) intron (NM_001346530, intron 1 of 5) 5896 NM_032511 84553 Hs.573245 NM_032511 ENSG00000146267 FAXC C6orf168|dJ273F20 failed axon connections homolog, metaxin like GST domain containing protein-coding 142.333-52 chr12 4537478 4537713 + 1 NA intron (NR_144380, intron 1 of 10) intron (NR_144380, intron 1 of 10) 874 NM_020374 57102 Hs.302977 NM_020374 ENSG00000047621 C12orf4 - chromosome 12 open reading frame 4 protein-coding 154.667-340 chr6 70407845 70408002 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -5481 NM_001351599 57579 Hs.211700 NM_020819 ENSG00000082269 FAM135A KIAA1411 family with sequence similarity 135 member A protein-coding 199.333-281 chr8 116029095 116029455 + 1 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 295784 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 148.333-214 chr2 222280693 222280946 + 1 NA intron (NM_181457, intron 4 of 7) intron (NM_181457, intron 4 of 7) -17328 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 210.667-117 chr7 19129395 19129780 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -11951 NM_000474 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 229.667-30 chr14 72171701 72172129 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MIR|SINE|MIR 238388 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 283.667-3 chr1 165066547 165066958 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 289489 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 160.333-191 chr3 88347450 88347735 + 1 NA intron (NM_001368167, intron 2 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 9136 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 255.333-90 chr6 142824055 142824448 + 1 NA intron (NM_006734, intron 2 of 9) Zaphod|DNA|hAT-Tip100 120925 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 150.333-289 chr4 19922632 19922853 + 1 NA Intergenic Intergenic -329163 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 187.667-39 chr14 37871540 37871806 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 30451 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 167.333-143 chr2 155304916 155305108 + 1 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 606317 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 312.333-5 chr12 50680299 50680814 + 1 NA intron (NM_173602, intron 8 of 37) intron (NM_173602, intron 8 of 37) -83545 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 143.333-123 chr19 7889318 7889521 + 1 NA intron (NM_001268285, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 909 NM_025061 80131 Hs.501511 NM_025061 ENSG00000171017 LRRC8E - leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit E protein-coding 153.667-151 chr17 40449270 40449424 + 1 NA intron (NM_001552, intron 1 of 3) FLAM_C|SINE|Alu 5897 NM_001552 3487 Hs.462998 NM_001552 ENSG00000141753 IGFBP4 BP-4|HT29-IGFBP|IBP4|IGFBP-4 insulin like growth factor binding protein 4 protein-coding 164.667-58 chr12 86008353 86008561 + 1 NA intron (NM_001351291, intron 4 of 7) L1MC4|LINE|L1 134162 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 149.333-229 chr3 4208120 4208283 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -95103 NM_001320677 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 259.667-73 chr7 39453668 39454125 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 8 of 9) intron (NM_001370959, intron 8 of 9) -47550 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 219.667-26 chr15 75877656 75877905 + 1 NA intron (NM_001284382, intron 5 of 11) intron (NM_001284382, intron 5 of 11) -26079 NM_012170 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 274.333-5 chr10 72424990 72425535 + 1 NA intron (NM_001195519, intron 3 of 6) intron (NM_001195519, intron 3 of 6) -70343 NM_001002762 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 163.667-183 chr4 99036425 99036603 + 1 NA intron (NM_015143, intron 4 of 10) L1ME4b|LINE|L1 39127 NR_037455 100500867 NR_037455 ENSG00000265213 MIR3684 - microRNA 3684 ncRNA 231.333-38 chr12 121836324 121836719 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 22338 NM_002150 3242 Hs.2899 NM_002150 ENSG00000158104 HPD 4-HPPD|4HPPD|GLOD3|HPPDASE|PPD 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase protein-coding 158.333-212 chr3 131086201 131086364 + 1 NA intron (NM_001353043, intron 4 of 17) L1MC4a|LINE|L1 58554 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 270.667-5 chr1 213751405 213751725 + 1 NA Intergenic Intergenic -173184 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 125.333-99 chr2 214801963 214802130 + 1 NA intron (NM_001282545, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu 7637 NM_001282545 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 139.667-31 chr11 103363486 103363659 + 1 NA intron (NM_001377, intron 83 of 88) intron (NM_001377, intron 83 of 88) 254146 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 180.667-3 chr1 79311707 79312095 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -305171 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 120.333-156 chr5 114584969 114585216 + 1 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) L1M2|LINE|L1 9051 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 254.667-3 chr1 71603456 71603863 + 1 NA intron (NM_173808, intron 5 of 6) intron (NM_173808, intron 5 of 6) 233353 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 170.333-223 chr8 119771641 119771955 + 1 NA intron (NM_003184, intron 18 of 25) L1PA15-16|LINE|L1 61043 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 155.667-238 chr3 187658646 187658830 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 11656 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 187.333-43 chr12 13214838 13215193 + 1 NA 3' UTR (NM_001423, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001423, exon 5 of 5) 18289 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 169.333-193 chr4 165699576 165699751 + 1 NA intron (NR_121676, intron 3 of 5) intron (NR_121676, intron 3 of 5) 15024 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 176.333-18 chr10 61650595 61650806 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -12229 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 224.667-8 chr10 113565229 113565693 + 1 NA intron (NM_004132, intron 1 of 12) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 12408 NM_004132 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 209.333-12 chr1 207205740 207206005 + 1 NA Intergenic Intergenic 101639 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 139.333-186 chr5 122386006 122386151 + 1 NA intron (NM_001308107, intron 1 of 8) MARNA|DNA|TcMar-Mariner -5011 NR_131761 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 164.667-47 chr12 10589536 10589832 + 1 NA intron (NR_028045, intron 6 of 6) intron (NR_028045, intron 6 of 6) 10151 NR_028045 10748 Hs.159297 NM_006611 KLRA1P KLRA1|KLRAP1|LY49L|Ly-49L|Ly49 killer cell lectin like receptor A1, pseudogene pseudo 175.667-15 chr1 247244499 247244766 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -11440 NR_160309 317705 Hs.553686 NM_173858 ENSG00000197617 VN1R5 V1RL5 vomeronasal 1 receptor 5 (gene/pseudogene) protein-coding 288.667-13 chr19 49838392 49838829 + 1 NA TTS (NR_040037) TTS (NR_040037) 6592 NR_106858 102465480 NR_106858 ENSG00000284114 MIR6800 hsa-mir-6800 microRNA 6800 ncRNA 163.667-53 chr13 76190397 76190581 + 1 NA Intergenic LTR12C|LTR|ERV1 -255357 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 162.333-161 chr3 60142374 60142683 + 1 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) AluJr|SINE|Alu -61619 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 232.333-80 chr7 29997719 29998200 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7670 NM_001145514 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 156.333-214 chr20 56649278 56649453 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 20059 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 125.667-77 chr17 35153424 35153629 + 1 NA intron (NM_001033576, intron 5 of 19) intron (NM_001033576, intron 5 of 19) 5262 NM_001308281 146862 Hs.379636 NM_173167 ENSG00000141161 UNC45B CMYA4|CTRCT43|SMUNC45|UNC-45B|UNC45 unc-45 myosin chaperone B protein-coding 189.333-165 chr5 161458563 161458918 + 1 NA intron (NM_000813, intron 5 of 9) MIR|SINE|MIR 89384 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 185.667-82 chr20 59606974 59607187 + 1 NA intron (NM_080672, intron 1 of 12) intron (NM_080672, intron 1 of 12) 2540 NM_080672 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 151.333-188 chr19 41210117 41210375 + 1 NA Intergenic Intergenic -8977 NM_021913 558 Hs.590970 NM_001699 ENSG00000167601 AXL ARK|JTK11|Tyro7|UFO AXL receptor tyrosine kinase protein-coding 158.333-260 chr5 86012894 86013052 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -269471 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 156.333-262 chr4 36832195 36832378 + 1 NA Intergenic Intergenic -169493 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 129.667-149 chr6 66693684 66693817 + 1 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie 905871 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 239.667-26 chr16 23207297 23207781 + 1 NA intron (NM_001039, intron 6 of 12) intron (NM_001039, intron 6 of 12) 24794 NM_001039 6340 Hs.371727 NM_001039 ENSG00000166828 SCNN1G BESC3|ENaCg|ENaCgamma|LDLS2|PHA1|SCNEG sodium channel epithelial 1 gamma subunit protein-coding 142.333-128 chr2 152353606 152353765 + 1 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) MIRb|SINE|MIR 18511 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 148.667-312 chr5 80688729 80688950 + 1 NA intron (NM_002439, intron 8 of 23) intron (NM_002439, intron 8 of 23) -33856 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 148.333-19 chr1 103148233 103148396 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -39792 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 149.667-225 chr2 205240993 205241204 + 1 NA intron (NM_205863, intron 15 of 21) intron (NM_205863, intron 15 of 21) -441402 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 139.333-193 chr6 111181234 111181380 + 1 NA intron (NM_018593, intron 3 of 5) MIRb|SINE|MIR 67473 NR_145796 109623478 NR_145796 SNORD166 - small nucleolar RNA, C/D box 166 snoRNA 159.333-206 chr3 34842286 34842534 + 1 NA Intergenic MER5C|DNA|hAT-Charlie 551613 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 243.667-59 chr5 18688691 18689053 + 1 NA Intergenic Intergenic 881598 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 155.667-112 chr15 61207175 61207349 + 1 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 22040 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 153.333-245 chr20 56910215 56910378 + 1 NA Intergenic Intergenic 280990 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 151.333-128 chr14 58562432 58562632 + 1 NA Intergenic Intergenic -71536 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 155.667-24 chr1 175066490 175066791 + 1 NA Intergenic Intergenic -1193 NM_022093 63923 Hs.156369 NM_022093 ENSG00000120332 TNN TN-W tenascin N protein-coding 157.333-259 chr4 60988236 60988399 + 1 NA Intergenic Intergenic 65698 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 227.333-93 chr4 107563401 107563787 + 1 NA Intergenic Intergenic 156640 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 135.667-89 chr2 65096426 65096605 + 1 NA intron (NM_004161, intron 3 of 5) intron (NM_004161, intron 3 of 5) 33591 NM_004161 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 528.666-2 chr2 38882533 38883290 + 1 NA TTS (NM_001145450) TTS (NM_001145450) 6949 NM_001145450 729967 Hs.729207 NM_194270 ENSG00000188010 MORN2 BLOCK27|MOPT MORN repeat containing 2 protein-coding 155.333-144 chr18 30791381 30791671 + 1 NA Intergenic Intergenic 251216 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 159.667-270 chr5 122306673 122306973 + 1 NA Intergenic MER92C|LTR|ERV1 -4868 NR_131762 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 204.667-118 chr5 42657247 42657679 + 1 NA intron (NM_001242403, intron 3 of 9) intron (NM_001242403, intron 3 of 9) 91599 NM_001242462 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 142.667-248 chr9 115630138 115630356 + 1 NA Intergenic Intergenic 113992 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 131.667-19 chr10 18026028 18026176 + 1 NA intron (NM_001282734, intron 11 of 11) L1MC1|LINE|L1 -15540 NR_038419 100129213 Hs.568816 NR_038419 ENSG00000226083 SLC39A12-AS1 - SLC39A12 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-385 chr8 74403382 74403650 + 1 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) 53113 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 227.667-76 chr7 139205913 139206176 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -25193 NM_173569 254048 Hs.153458 NM_173569 ENSG00000157741 UBN2 - ubinuclein 2 protein-coding 234.667-75 chr3 158378653 158379070 + 1 NA intron (NM_001271838, intron 6 of 9) L1ME1|LINE|L1 -147847 NR_148407 110599565 NR_148407 UC.134 - long non-coding RNA uc.134 ncRNA 246.667-87 chr7 96782879 96783191 + 1 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -73144 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 179.333-145 chr4 142774690 142775028 + 1 NA intron (NM_001331040, intron 1 of 25) L1MC3|LINE|L1 71676 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 162.333-119 chr2 121358400 121358703 + 1 NA intron (NM_015282, intron 36 of 38) intron (NM_015282, intron 36 of 38) -73349 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 155.667-81 chr13 53564703 53564950 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -250593 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 158.667-132 chr18 7370064 7370263 + 1 NA Intergenic Intergenic 90843 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 135.667-145 chr5 91462431 91462657 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -79227 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 153.333-27 chr1 178701748 178701922 + 1 NA Intergenic Intergenic -23312 NM_001286247 55103 Hs.632485 NM_018037 ENSG00000116191 RALGPS2 dJ595C2.1 Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2 protein-coding 150.333-95 chr13 70758226 70758392 + 1 NA Intergenic Intergenic -256832 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 157.667-221 chr4 97939686 97939981 + 1 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) L1PREC2|LINE|L1 203643 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 151.667-72 chr11 100756504 100756706 + 1 NA intron (NM_001367945, intron 1 of 25) intron (NM_001367945, intron 1 of 25) -68650 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 161.667-105 chr17 64575336 64575525 + 1 NA intron (NM_022739, intron 9 of 18) AluSz|SINE|Alu 68453 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 143.333-275 chr7 106265613 106265801 + 1 NA intron (NM_005746, intron 6 of 10) intron (NM_005746, intron 6 of 10) 19276 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 146.333-286 chr6 58073660 58073816 + 1 NA Intergenic Intergenic -112292 NR_132994 106660612 Hs.561539 NR_125727 ENSG00000215190 LINC00680 - long intergenic non-protein coding RNA 680 ncRNA 171.667-5 chr1 59243493 59243673 + 1 NA Intergenic Intergenic -53230 NM_001350798 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 162.333-264 chr8 131535117 131535370 + 1 NA Intergenic Intergenic -368850 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 207.333-227 chr5 133179485 133179749 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 127604 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 246.667-108 chrX 52243674 52243994 + 1 NA Intergenic (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 53212 NR_102368 101340250 NR_102368 ENSG00000221705 SNORA11E - small nucleolar RNA, H/ACA box 11E snoRNA 203.667-105 chr6 55020596 55020816 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -85754 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 154.667-5 chr1 55075551 55075836 + 1 NA intron (NM_015306, intron 62 of 67) AluJr|SINE|Alu 35471 NR_110451 255738 Hs.18844 NM_174936 ENSG00000169174 PCSK9 FH3|HCHOLA3|LDLCQ1|NARC-1|NARC1|PC9 proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 protein-coding 149.333-359 chr7 7434414 7434655 + 1 NA intron (NM_001037763, intron 23 of 34) intron (NM_001037763, intron 23 of 34) 101339 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 156.333-191 chr2 129015917 129016155 + 1 NA Intergenic Intergenic 151436 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 175.667-40 chr14 75817004 75817296 + 1 NA intron (NM_015072, intron 27 of 31) AluSc|SINE|Alu 155904 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 309.333-26 chr17 60338307 60338699 + 1 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) AluJb|SINE|Alu 53630 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 167.333-28 chr1 192673888 192674154 + 1 NA Intergenic Intergenic 37874 NM_002927 6003 Hs.497220 NM_002927 ENSG00000127074 RGS13 - regulator of G protein signaling 13 protein-coding 171.333-12 chr1 187789770 187790089 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 346301 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 310.333-34 chr6 98960307 98960709 + 1 NA Intergenic Intergenic -12502 NM_012160 26235 Hs.536850 NM_012160 ENSG00000112234 FBXL4 FBL4|FBL5|MTDPS13 F-box and leucine rich repeat protein 4 protein-coding 262.333-62 chr4 52346366 52346700 + 1 NA Intergenic PRIMA41-int|LTR|ERV1 295229 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 238.333-72 chr5 15085062 15085550 + 1 NA Intergenic Intergenic 181254 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 243.667-25 chr14 88228432 88228868 + 1 NA intron (NM_138317, intron 3 of 6) intron (NM_138317, intron 3 of 6) 42261 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 304.667-41 chr9 85182460 85182995 + 1 NA Intergenic Intergenic 476826 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 161.333-247 chr6 108548575 108548920 + 1 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -11078 NM_201559 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 208.333-50 chr16 49806024 49806338 + 1 NA intron (NM_001271620, intron 1 of 7) intron (NM_001271620, intron 1 of 7) 16557 NM_015069 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 146.667-231 chr4 48196808 48197069 + 1 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) intron (NM_003215, intron 2 of 17) -62688 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 147.667-82 chr12 114052756 114052994 + 1 NA Intergenic Intergenic -86550 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 131.333-137 chr5 6730599 6730779 + 1 NA intron (NM_001171805, intron 1 of 12) intron (NM_001171805, intron 1 of 12) 17257 NM_001171805 11044 Hs.481542 NM_006999 ENSG00000112941 TENT4A LAK-1|LAK1|PAPD7|POLK|POLS|TRF4|TRF4-1|TRF41|TUTASE5 terminal nucleotidyltransferase 4A protein-coding 257.667-12 chr10 102216273 102216581 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -9872 NM_152310 83401 Hs.302130 NM_152310 ENSG00000119915 ELOVL3 CIG-30|CIG30 ELOVL fatty acid elongase 3 protein-coding 171.333-19 chr10 18383674 18383870 + 1 NA intron (NM_201590, intron 1 of 12) AluSx|SINE|Alu -16803 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 181.333-147 chr5 164634505 164634825 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 164386 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 207.333-171 chr22 33692177 33692580 + 1 NA intron (NM_133642, intron 2 of 14) AluSx1|SINE|Alu 12542 NR_145833 109616998 NR_145833 ENSG00000253007 SNORA50B - small nucleolar RNA, H/ACA box 50B snoRNA 147.667-160 chr2 14911634 14911841 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 279020 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 165.667-48 chr14 45386778 45387038 + 1 NA Intergenic Intergenic -133706 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 251.667-84 chr6 155300766 155301340 + 1 NA intron (NR_146725, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu 13431 NM_001350502 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 161.667-257 chr8 108348192 108348400 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -95287 NM_001329495 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 159.667-184 chr2 217484439 217484602 + 1 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) intron (NR_026597, intron 2 of 12) 201787 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-3 chr1 27810130 27810345 + 1 NA intron (NM_177424, intron 4 of 8) intron (NM_177424, intron 4 of 8) -20545 NM_138558 5511 Hs.533474 NM_002713 ENSG00000117751 PPP1R8 ARD-1|ARD1|NIPP-1|NIPP1|PRO2047 protein phosphatase 1 regulatory subunit 8 protein-coding 148.667-287 chr4 87009802 87010008 + 1 NA intron (NM_001313960, intron 1 of 17) intron (NM_001313960, intron 1 of 17) 2904 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 148.667-296 chr4 183978286 183978531 + 1 NA intron (NM_020225, intron 1 of 3) L1PB4|LINE|L1 73101 NM_020225 56977 Hs.21958 NM_020225 ENSG00000173320 STOX2 - storkhead box 2 protein-coding 229.333-115 chr7 24915753 24916152 + 1 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) L1ME4b|LINE|L1 -23331 NM_145322 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 253.333 chr1 93562810 93563279 + 1 NA intron (NM_001308251, intron 7 of 7) intron (NM_001308251, intron 7 of 7) 22118 NM_001308251 8412 Hs.36958 NM_003567 ENSG00000137936 BCAR3 AND-34|NSP2|SH2D3B BCAR3 adaptor protein, NSP family member protein-coding 228.333-93 chr7 103328435 103328909 + 1 NA intron (NM_001362668, intron 3 of 17) L1ME4c|LINE|L1 16095 NM_014377 27000 Hs.558476 NM_014377 ENSG00000105821 DNAJC2 MPHOSPH11|MPP11|ZRF1|ZUO1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C2 protein-coding 148.667-346 chr7 16396119 16396268 + 1 NA intron (NM_001101426, intron 2 of 9) intron (NM_001101426, intron 2 of 9) 25345 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 372.667-19 chr5 65585980 65586779 + 1 NA intron (NM_001278929, intron 9 of 9) intron (NM_001278929, intron 9 of 9) 23083 NM_015342 23398 Hs.121432 NM_015342 ENSG00000113593 PPWD1 - peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1 protein-coding 174.667-166 chr8 71489376 71489761 + 1 NA intron (NM_001370334, intron 2 of 19) intron (NM_001370334, intron 2 of 19) 58136 NM_001370334 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 138.333-139 chr4 151142492 151142659 + 1 NA intron (NM_001009555, intron 13 of 20) intron (NM_001009555, intron 13 of 20) 32977 NM_001128924 152503 Hs.744983 NM_001009555 ENSG00000109686 SH3D19 EBP|EVE1|Eve-1|Kryn|SH3P19 SH3 domain containing 19 protein-coding 159.667-120 chr16 13514134 13514368 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -405906 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 137.333-102 chr2 122204297 122204454 + 1 NA Intergenic Intergenic 448724 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 198.333-54 chr14 22447611 22447883 + 1 NA intron (NR_148361, intron 2 of 4) intron (NR_148361, intron 2 of 4) -14994 NR_148362 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 251.667-63 chr3 121399960 121400289 + 1 NA intron (NM_001348343, intron 23 of 27) MER45C|DNA|hAT-Tip100 145864 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 286.333 chr1 230938851 230939249 + 1 NA intron (NM_024525, intron 8 of 22) L2c|LINE|L2 39811 NM_001122835 79573 Hs.424788 NM_024525 ENSG00000143643 TTC13 - tetratricopeptide repeat domain 13 protein-coding 136.667-107 chr21 17916676 17916829 + 1 NA promoter-TSS (NM_001204175) promoter-TSS (NM_001204175) -588 NM_001204177 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 210.333-37 chr13 42263760 42264156 + 1 NA Intergenic Intergenic -8194 NM_016248 11215 Hs.105105 NM_016248 ENSG00000023516 AKAP11 AKAP-11|AKAP220|PPP1R44|PRKA11 A-kinase anchoring protein 11 protein-coding 181.333-71 chr19 46673588 46673826 + 1 NA TTS (NM_001079880) TTS (NM_001079880) 12229 NR_040041 100506068 Hs.434327 NR_040041 ENSG00000245598 DACT3-AS1 - DACT3 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-210 chr2 207076973 207077253 + 1 NA non-coding (NR_073108, exon 5 of 5) non-coding (NR_073108, exon 5 of 5) 32960 NR_036227 100423036 NR_036227 ENSG00000253008 MIR2355 mir-2355 microRNA 2355 ncRNA 160.667-274 chr7 28386361 28386565 + 1 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) L1MEd|LINE|L1 -26055 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 155.333-380 chr8 46628375 46628570 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -10829 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 131.333-163 chr7 28318749 28318927 + 1 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) intron (NM_182899, intron 1 of 9) 19517 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 242.667-17 chr10 95536687 95537189 + 1 NA intron (NM_001290295, intron 1 of 24) intron (NM_001290295, intron 1 of 24) 24433 NM_001290294 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 181.667-45 chr16 11467934 11468196 + 1 NA intron (NR_110907, intron 1 of 2) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 2805 NR_110907 101927131 Hs.569654 NR_110907 ENSG00000262999 LOC101927131 - uncharacterized LOC101927131 ncRNA 159.667-281 chr6 55568153 55568326 + 1 NA intron (NM_001287746, intron 1 of 9) intron (NM_001287746, intron 1 of 9) 10975 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 148.333-402 chr8 132813567 132813784 + 1 NA TTS (NM_198513) TTS (NM_198513) 38287 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 192.333-139 chr5 54119461 54119710 + 1 NA intron (NM_019087, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 -167986 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 153.333-338 chr5 99461140 99461435 + 1 NA Intergenic Intergenic -72703 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 170.667-139 chr5 152273803 152274055 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 131350 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 147.333-116 chr14 82518685 82518895 + 1 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 -123842 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 116.667-169 chr5 151821516 151821669 + 1 NA TTS (NM_001292000) TTS (NM_001292000) -49416 NR_132345 100652758 Hs.587054 NM_001278082 LOC100652758 - uncharacterized LOC100652758 ncRNA 212.667-66 chr2 26819414 26819659 + 1 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -28596 NM_020134 56896 Hs.299315 NM_020134 ENSG00000157851 DPYSL5 CRAM|CRMP-5|CRMP5|Ulip6 dihydropyrimidinase like 5 protein-coding 170.333-67 chr13 78557290 78557499 + 1 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) -38728 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 117.333-65 chr15 42985146 42985297 + 1 NA intron (NM_174916, intron 35 of 46) intron (NM_174916, intron 35 of 46) -64443 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 126.667-30 chr12 18430373 18430605 + 1 NA intron (NM_001288774, intron 18 of 32) L2a|LINE|L2 168949 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 187.667-86 chr3 22472709 22473080 + 1 NA Intergenic Intergenic 515755 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 312.667-21 chr2 119915204 119915934 + 1 NA intron (NM_002830, intron 11 of 26) intron (NM_002830, intron 11 of 26) -97508 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 181.667-150 chr8 124410191 124410560 + 1 NA Intergenic Intergenic -37676 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 147.667-191 chr2 168113913 168114198 + 1 NA intron (NM_013233, intron 10 of 17) (ATCAGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 133540 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 211.333-128 chr2 231779008 231779264 + 1 NA non-coding (NR_110994, exon 2 of 2) non-coding (NR_110994, exon 2 of 2) 2146 NR_110994 5147 Hs.516808 NM_002601 ENSG00000156973 PDE6D JBTS22|PDED phosphodiesterase 6D protein-coding 159.667-163 chr2 41227472 41227660 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -649989 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 194.333-11 chr1 152333401 152333707 + 1 NA intron (NR_103778, intron 3 of 6) intron (NR_103778, intron 3 of 6) -3514 NR_103779 339400 Hs.23783 NR_103778 ENSG00000237975 FLG-AS1 - FLG antisense RNA 1 ncRNA 149.667-87 chr12 15969476 15969633 + 1 NA intron (NM_001300779, intron 5 of 7) intron (NM_001300779, intron 5 of 7) 58222 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 152.333-101 chr14 38380706 38380907 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -124713 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 226.667-19 chr10 58345360 58345816 + 1 NA intron (NM_003338, intron 1 of 6) intron (NM_003338, intron 1 of 6) 10582 NM_003338 7321 Hs.129683 NM_003338 ENSG00000072401 UBE2D1 E2(17)KB1|SFT|UBC4/5|UBCH5|UBCH5A ubiquitin conjugating enzyme E2 D1 protein-coding 198.333-67 chr15 63706204 63706683 + 1 NA intron (NM_003922, intron 25 of 77) intron (NM_003922, intron 25 of 77) -105616 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 129.333-78 chr17 42960277 42960473 + 1 NA intron (NM_001136042, intron 8 of 16) L2a|LINE|L2 4079 NM_001261434 80755 Hs.317403 NM_001261434 ENSG00000266967 AARSD1 - alanyl-tRNA synthetase domain containing 1 protein-coding 166.333-229 chr8 85090618 85090846 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -16506 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 113.333-51 chr11 81928731 81928915 + 1 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -37987 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 151.667-252 chr4 73107661 73107873 + 1 NA intron (NM_032217, intron 24 of 33) L2a|LINE|L2 -38008 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 154.333-235 chr4 23939857 23940122 + 1 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) intron (NM_001330752, intron 2 of 13) -49942 NM_013261 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 150.333-347 chr5 160412953 160413155 + 1 NA intron (NM_001364517, intron 5 of 15) intron (NM_001364517, intron 5 of 15) 6027 NM_001364520 10569 Hs.435342 NM_006425 ENSG00000164609 SLU7 9G8|hSlu7 SLU7 homolog, splicing factor protein-coding 139.667-129 chr3 185365069 185365297 + 1 NA intron (NM_004721, intron 1 of 13) intron (NM_004721, intron 1 of 13) 2047 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 211.667-54 chr2 26919441 26919893 + 1 NA intron (NM_020134, intron 2 of 12) intron (NM_020134, intron 2 of 12) -50970 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 116.667-173 chr6 27687346 27687547 + 1 NA Intergenic Intergenic -6589 NR_038294 100507173 Hs.635987 NR_038292 ENSG00000281706 LINC01012 - long intergenic non-protein coding RNA 1012 ncRNA 131.333-191 chr9 32467328 32467479 + 1 NA intron (NM_014314, intron 15 of 17) L2|LINE|L2 58793 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 154.333-94 chr14 65093549 65093710 + 1 NA intron (NR_045122, intron 2 of 2) intron (NR_045122, intron 2 of 2) 3711 NR_045122 100506321 Hs.711267 NR_045122 ENSG00000259118 LOC100506321 - uncharacterized LOC100506321 ncRNA 233.667-59 chr5 23981083 23981355 + 1 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) L1PA11|LINE|L1 29871 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 302.333-14 chr12 124011018 124011538 + 1 NA intron (NM_001204298, intron 3 of 4) intron (NM_001204298, intron 3 of 4) 38063 NM_001204298 144348 Hs.524828 NM_152437 ENSG00000179195 ZNF664 ZFOC1|ZNF176 zinc finger protein 664 protein-coding 115.667-52 chr12 11527046 11527191 + 1 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -20912 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 259.667-14 chr11 59163707 59164046 + 1 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -7554 NM_001300727 23220 Hs.523696 NM_015177 ENSG00000110042 DTX4 RNF155 deltex E3 ubiquitin ligase 4 protein-coding 333.333-13 chr10 104730657 104731062 + 1 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -64643 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 254.333-74 chr6 125825093 125825530 + 1 NA intron (NM_001199621, intron 2 of 14) AluJr4|SINE|Alu -6453 NR_126386 104355145 Hs.590370 NR_126386 ENSG00000232131 NCOA7-AS1 - NCOA7 antisense RNA 1 ncRNA 142.333-34 chr11 8855222 8855390 + 1 NA intron (NM_005418, intron 2 of 22) intron (NM_005418, intron 2 of 22) -43971 NM_139157 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 155.667-71 chr12 39882883 39883042 + 1 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) intron (NM_052885, intron 4 of 9) 223119 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 232.333-29 chr15 95787873 95788171 + 1 NA Intergenic Intergenic 339819 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 261.333-11 chr10 8993315 8993911 + 1 NA Intergenic Intergenic 95624 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 138.333-179 chr7 27166528 27166676 + 1 NA intron (NR_037940, intron 1 of 2) CpG-25664 -1065 NM_152739 3205 Hs.659350 NM_152739 ENSG00000078399 HOXA9 ABD-B|HOX1|HOX1.7|HOX1G homeobox A9 protein-coding 161.333-6 chr1 82853226 82853416 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -49862 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 143.333-204 chr4 58774058 58774280 + 1 NA Intergenic Intergenic -210113 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 185.333-147 chr4 188248299 188248570 + 1 NA Intergenic Intergenic 108993 NM_178556 339976 Hs.348618 NM_178556 ENSG00000184108 TRIML1 RNF209 tripartite motif family like 1 protein-coding 137.667-102 chr2 198093177 198093335 + 1 NA intron (NM_006226, intron 3 of 5) L1MC2|LINE|L1 281841 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 159.333-147 chr2 37686334 37686513 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -13888 NM_001270436 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 176.333-146 chr6 62933158 62933351 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 386723 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 219.667-60 chr4 34317884 34318183 + 1 NA Intergenic Intergenic -48286 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 192.667-181 chr8 136363145 136363360 + 1 NA Intergenic LTR40A1|LTR|ERVL -167546 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 173.333-145 chr4 61172185 61172397 + 1 NA Intergenic Intergenic 28635 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 233.667-55 chr4 39088912 39089201 + 1 NA intron (NM_199039, intron 4 of 9) L2c|LINE|L2 26824 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 279.333-41 chr2 68364339 68364926 + 1 NA promoter-TSS (NM_002664) promoter-TSS (NM_002664) -650 NM_002664 5341 Hs.468840 NM_002664 ENSG00000115956 PLEK P47 pleckstrin protein-coding 154.667-42 chr10 54952493 54952745 + 1 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L1MC2|LINE|L1 -151328 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 122.333-36 chr11 84028029 84028172 + 1 NA intron (NM_001142699, intron 11 of 27) intron (NM_001142699, intron 11 of 27) 245180 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 216.333-7 chr1 114911655 114911986 + 1 NA intron (NM_001282542, intron 18 of 30) intron (NM_001282542, intron 18 of 30) 56957 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 150.333-145 chr16 60024232 60024394 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 168960 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 199.333-249 chr6 145530826 145531141 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 155894 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 187.667-137 chr7 107487282 107487654 + 1 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) AluJr4|SINE|Alu 17411 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 141.333-194 chr5 87491677 87491867 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -78739 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 223.333-76 chr2 103974180 103974668 + 1 NA Intergenic Intergenic 433908 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 229.333-26 chr12 52746506 52746842 + 1 NA Intergenic Intergenic 30671 NM_015848 51350 Hs.654392 NM_015848 ENSG00000185069 KRT76 HUMCYT2A|KRT2B|KRT2P keratin 76 protein-coding 202.333-78 chr18 13025469 13025819 + 1 NA intron (NM_032142, intron 9 of 44) L1MB2|LINE|L1 34282 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 208.333-40 chr14 66131519 66131785 + 1 NA Intergenic Intergenic -354719 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 147.667-26 chr1 210201317 210201584 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -31346 NM_019605 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 148.667-386 chr8 122413978 122414170 + 1 NA TTS (NR_131202) TTS (NR_131202) 154570 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 166.333-249 chrX 97662376 97662606 + 1 NA Intergenic Intergenic -97956 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 264.667-4 chr1 106208913 106209523 + 1 NA Intergenic Intergenic -180965 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 152.667-68 chr11 101912760 101913022 + 1 NA intron (NM_178127, intron 1 of 8) MER49|LTR|ERV1 -2119 NM_001363543 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 236.667-91 chr8 112089302 112089573 + 1 NA Intergenic Intergenic -554056 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 238.333-93 chr8 124071669 124072026 + 1 NA intron (NM_001039112, intron 31 of 40) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -31065 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-425 chr9 84243724 84243943 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 96925 NR_037638 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 216.667-45 chr17 62881787 62882056 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -62294 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 153.667-19 chr1 150356780 150357020 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7211 NM_001297673 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 138.667-146 chr4 44028764 44029009 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 11824 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 195.667-17 chr11 13942606 13942906 + 1 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -17893 NR_135052 101928132 Hs.568970 NR_135052 ENSG00000254438 LINC02683 - long intergenic non-protein coding RNA 2683 ncRNA 280.333-41 chr7 37642884 37643388 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -40630 NM_001329994 353345 Hs.563492 NM_181791 ENSG00000187037 GPR141 PGR13 G protein-coupled receptor 141 protein-coding 285.667-31 chr22 33813361 33813699 + 1 NA intron (NM_001362953, intron 1 of 14) intron (NM_001362953, intron 1 of 14) 88544 NR_038950 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 112.333-250 chr7 90844829 90845013 + 1 NA intron (NM_012395, intron 4 of 13) intron (NM_012395, intron 4 of 13) 135105 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 318.667-34 chr9 69901193 69901633 + 1 NA intron (NM_001010940, intron 5 of 5) AluY|SINE|Alu 80596 NM_001308084 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 188.333-112 chr4 108147195 108147465 + 1 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) intron (NM_001130713, intron 3 of 10) 19467 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 153.667-199 chr2 142708930 142709108 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -168645 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 235.667-21 chr14 72008429 72008800 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 75087 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 168.333-93 chr2 59333864 59334185 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 116316 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 139.667-71 chr18 2558293 2558607 + 1 NA intron (NM_022840, intron 3 of 8) L1MEc|LINE|L1 13055 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 241.667-93 chr8 131352853 131353396 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -312215 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 151.333-322 chr4 169639220 169639437 + 1 NA intron (NM_173872, intron 2 of 13) AluJo|SINE|Alu 18750 NM_173872 1182 Hs.481186 NM_001829 ENSG00000109572 CLCN3 CLC3|ClC-3 chloride voltage-gated channel 3 protein-coding 158.333-17 chr1 175431054 175431305 + 1 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) -238192 NM_001162893 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 503.333-5 chr6 70255096 70255747 + 1 NA intron (NM_001851, intron 21 of 37) intron (NM_001851, intron 21 of 37) 27776 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 213.667-69 chr4 102591097 102591398 + 1 NA intron (NM_003998, intron 11 of 23) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -88761 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 174.333-67 chr2 124415171 124415489 + 1 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 390043 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 119.333-174 chr5 60127512 60127769 + 1 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) L2b|LINE|L2 -233914 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 185.667-18 chr11 33895149 33895358 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3177 NM_005574 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 145.333-22 chr1 219064369 219064612 + 1 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) L1ME1|LINE|L1 109298 NR_038845 643723 Hs.519774 NR_038845 LYPLAL1-DT LYPLAL1-AS1 LYPLAL1 divergent transcript ncRNA 170.667-152 chr7 16708959 16709136 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -44708 NM_014399 27075 Hs.364544 NM_014399 ENSG00000106537 TSPAN13 NET-6|NET6|TM4SF13 tetraspanin 13 protein-coding 362.667-2 chr1 24447565 24448018 + 1 NA intron (NM_001322857, intron 5 of 11) MER91A|DNA|hAT-Tip100 31766 NM_001322857 57185 Hs.523442 NM_020448 ENSG00000001461 NIPAL3 DJ462O23.2|NPAL3 NIPA like domain containing 3 protein-coding 202.333-112 chr3 151462509 151462902 + 1 NA Intergenic Intergenic -3996 NM_178822 285313 Hs.58561 NM_178822 ENSG00000152580 IGSF10 CMF608 immunoglobulin superfamily member 10 protein-coding 223.667-17 chr13 106922818 106923314 + 1 NA Intergenic LTR83|LTR|ERVL 269186 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 235.667-46 chr4 55047677 55047955 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 77779 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 155.333-172 chr2 121559619 121559785 + 1 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) L1MB7|LINE|L1 28822 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 242.333-46 chr2 57440023 57440556 + 1 NA Intergenic Intergenic -467362 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 273.667-41 chr4 82908847 82909375 + 1 NA intron (NM_001317776, intron 5 of 5) AluSg|SINE|Alu -8195 NR_034075 100499177 Hs.728916 NR_034075 ENSG00000251022 THAP9-AS1 - THAP9 antisense RNA 1 ncRNA 331.334-15 chr8 126769063 126769627 + 1 NA Intergenic Intergenic -210867 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 163.667-76 chr16 23893876 23894063 + 1 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 57986 NM_212535 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 358.333-29 chr8 85378793 85379510 + 1 NA Intergenic Intergenic -1038 NM_001128830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 148.333-343 chr6 84433294 84433467 + 1 NA intron (NR_132100, intron 4 of 4) intron (NR_132100, intron 4 of 4) 41549 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 217.333-138 chr7 41264464 41264724 + 1 NA Intergenic Intergenic 162990 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 149.667-240 chr21 26048404 26048560 + 1 NA intron (NM_001136131, intron 5 of 15) MER30|DNA|hAT-Charlie 91908 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 240.667-50 chr2 212799034 212799436 + 1 NA intron (NR_131941, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 3904 NR_131941 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 210.333-6 chr1 110935880 110936116 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 27924 NM_018372 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 141.667-154 chr3 189593075 189593245 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -3586 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 150.667-201 chr2 208166017 208166217 + 1 NA intron (NM_001099334, intron 8 of 8) L1MC4|LINE|L1 -2528 NM_014617 1418 Hs.122566 NM_014617 ENSG00000168582 CRYGA CRY-g-A|CRYG1|CRYG5 crystallin gamma A protein-coding 139.333-159 chr3 189464197 189464431 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -132432 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 182.667-94 chr3 63052972 63053266 + 1 NA Intergenic Intergenic -49569 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 153.667-393 chr8 122119581 122119776 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 448966 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 242.667-39 chr16 51936541 51936866 + 1 NA Intergenic Intergenic 137232 NM_001242473 388276 Hs.534669 NM_001242473 C16orf97 - chromosome 16 open reading frame 97 protein-coding 247.667-91 chr7 94128491 94128814 + 1 NA Intergenic Intergenic -124297 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 200.333-47 chr15 101301179 101301616 + 1 NA Intergenic Intergenic -6149 NM_003090 6627 Hs.528763 NM_003090 ENSG00000131876 SNRPA1 Lea1|U2A' small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A' protein-coding 153.333-30 chr1 188396399 188396634 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 952888 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 176.667-122 chr5 75391629 75391899 + 1 NA intron (NM_031361, intron 10 of 16) intron (NM_031361, intron 10 of 16) 54544 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 220.333-64 chr2 48507944 48508292 + 1 NA intron (NR_024188, intron 19 of 21) intron (NR_024188, intron 19 of 21) -21807 NM_001198593 286749 Hs.732016 NM_172311 ENSG00000068781 STON1-GTF2A1L ALF|GTF2A1L|GTF2A1LF|SALF STON1-GTF2A1L readthrough protein-coding 242.333-21 chr12 39828461 39828950 + 1 NA intron (NR_135051, intron 18 of 18) intron (NR_135051, intron 18 of 18) 202522 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 234.667-72 chr3 114688690 114689241 + 1 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) 54560 NR_039959 100616166 NR_039959 ENSG00000264623 MIR4796 mir-4796 microRNA 4796 ncRNA 309.333-37 chr2 53948642 53949115 + 1 NA intron (NM_014614, intron 2 of 46) intron (NM_014614, intron 2 of 46) 22115 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 205.667-84 chr20 48756451 48756894 + 1 NA intron (NM_020820, intron 1 of 39) L2a|LINE|L2 71327 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 243.333-54 chr2 103478955 103479332 + 1 NA Intergenic AluYh3|SINE|Alu -494714 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 180.333-121 chr7 116249503 116249743 + 1 NA intron (NM_015641, intron 3 of 6) intron (NM_015641, intron 3 of 6) 26670 NM_152829 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 165.667-98 chr2 172220349 172220667 + 1 NA Intergenic Intergenic 117502 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 305.333-15 chr12 8644885 8645397 + 1 NA TTS (NM_001297710) TTS (NM_001297710) 17685 NM_003480 8076 Hs.512842 NM_003480 ENSG00000197614 MFAP5 AAT9|MAGP-2|MAGP2|MFAP-5|MP25 microfibril associated protein 5 protein-coding 153.333-373 chr7 1155292 1155461 + 1 NA intron (NR_158186, intron 4 of 4) intron (NR_158186, intron 4 of 4) 4820 NM_001365381 90637 Hs.648111 NM_182491 ENSG00000178381 ZFAND2A AIRAP zinc finger AN1-type containing 2A protein-coding 207.333-169 chr21 29751655 29752052 + 1 NA intron (NR_027021, intron 2 of 4) intron (NR_027021, intron 2 of 4) 3678 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 177.333-113 chr3 151857478 151857681 + 1 NA intron (NR_110203, intron 1 of 2) AluSq2|SINE|Alu -16064 NM_033050 56670 Hs.133181 NM_033050 ENSG00000198829 SUCNR1 GPR91 succinate receptor 1 protein-coding 155.667-140 chr18 21551259 21551495 + 1 NA intron (NM_052911, intron 8 of 11) AluY|SINE|Alu 49327 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 159.333-259 chr5 28515733 28516078 + 1 NA Intergenic Intergenic -228240 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 155.667-97 chr14 62796911 62797099 + 1 NA intron (NM_139318, intron 9 of 10) MER4A1|LTR|ERV1 248453 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 166.667-239 chr8 140406151 140406400 + 1 NA intron (NM_001321646, intron 4 of 21) intron (NM_001321646, intron 4 of 21) 51469 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 191.333-52 chr13 60452859 60453256 + 1 NA intron (NM_030794, intron 3 of 13) L1MEd|LINE|L1 55837 NM_001146070 81550 Hs.525061 NM_030794 ENSG00000083544 TDRD3 - tudor domain containing 3 protein-coding 216.667-88 chr5 132141173 132141420 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -43580 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 113.667-205 chr7 115669064 115669298 + 1 NA Intergenic Intergenic -87740 NR_145801 109623459 NR_145801 ENSG00000202377 SNORA25B - small nucleolar RNA, H/ACA box 25B snoRNA 179.667-6 chr1 95955012 95955259 + 1 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -36933 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 156.333-289 chr5 104487079 104487260 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -612305 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 158.333-240 chr4 109632352 109632597 + 1 NA intron (NM_017918, intron 1 of 7) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 70971 NM_032992 839 Hs.654616 NM_001226 ENSG00000138794 CASP6 MCH2 caspase 6 protein-coding 117.667-198 chr8 118487057 118487259 + 1 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -133843 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 176.333-139 chr5 94814402 94814656 + 1 NA intron (NM_001002796, intron 17 of 22) intron (NM_001002796, intron 17 of 22) 195860 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 267.333-83 chr7 26634074 26634573 + 1 NA Intergenic Intergenic -3548 NR_161202 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 211.333-170 chr4 72237132 72237373 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 198120 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 149.333-58 chr10 79109360 79109607 + 1 NA intron (NM_020338, intron 1 of 24) intron (NM_020338, intron 1 of 24) 40517 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 226.667-58 chr3 11241523 11241871 + 1 NA intron (NM_001098211, intron 1 of 1) AluY|SINE|Alu -11002 NM_000861 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 199.333-58 chr12 117326228 117326456 + 1 NA intron (NM_000620, intron 2 of 28) AluSx|SINE|Alu -16932 NM_001204214 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 211.333-98 chr18 77241021 77241306 + 1 NA Intergenic Intergenic -8685 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 138.667-100 chr2 43795613 43795873 + 1 NA TTS (NM_015522) TTS (NM_015522) 21704 NM_001348912 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 170.667-61 chr16 68083936 68084147 + 1 NA Intergenic Intergenic -1329 NM_173165 4775 Hs.436585 NM_004555 ENSG00000072736 NFATC3 NF-AT4c|NFAT4|NFATX nuclear factor of activated T cells 3 protein-coding 149.333-77 chr11 90369582 90369747 + 1 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) HAL1|LINE|L1 118432 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 174.333-78 chr21 19320065 19320252 + 1 NA Intergenic Intergenic -560346 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 138.667-198 chr8 32015150 32015375 + 1 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -10474 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 154.667-17 chr1 116384181 116384385 + 1 NA intron (NM_001160234, intron 2 of 22) intron (NM_001160234, intron 2 of 22) 913 NM_001160234 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 215.333-83 chr2 22698554 22698897 + 1 NA Intergenic Intergenic 162246 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 148.333-404 chr9 2451311 2451482 + 1 NA Intergenic Intergenic -170391 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 214.667-122 chr8 127538967 127539350 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -57019 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 237.333-126 chr8 131201785 131202133 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -161050 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 167.333-89 chr15 36411358 36411562 + 1 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -168166 NM_001321759 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 382.333-5 chr19 56561447 56562141 + 1 NA Intergenic Intergenic -5674 NM_001001668 388566 Hs.204449 NM_001001668 ENSG00000197016 ZNF470 CZF-1 zinc finger protein 470 protein-coding 140.333-163 chr4 78295342 78295496 + 1 NA intron (NM_001166133, intron 14 of 41) L1ME3G|LINE|L1 6434 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 152.667-186 chr2 88837252 88837432 + 1 NA Intergenic Intergenic 24972 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 256.333-33 chr17 22242621 22243139 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 39885 NR_144546 23666 Hs.499916 NR_144546 ENSG00000263563 UBBP4 - ubiquitin B pseudogene 4 pseudo 146.667-270 chr5 154897116 154897314 + 1 NA intron (NM_015465, intron 23 of 27) intron (NM_015465, intron 23 of 27) 38588 NM_001301077 9337 Hs.26703 NM_004779 ENSG00000155508 CNOT8 CAF1|CALIF|Caf1b|POP2|hCAF1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 protein-coding 138.667-162 chr5 50288901 50289116 + 1 NA Intergenic Intergenic 152280 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 173.333-75 chr17 64456033 64456258 + 1 NA intron (NM_001291316, intron 3 of 8) MIRb|SINE|MIR 7030 NM_001369493 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 236.333-61 chr3 129179331 129179651 + 1 NA intron (NM_001127196, intron 1 of 4) intron (NM_001127196, intron 1 of 4) 4405 NM_001127196 7555 Hs.518249 NM_003418 ENSG00000169714 CNBP CNBP1|DM2|PROMM|RNF163|ZCCHC22|ZNF9 CCHC-type zinc finger nucleic acid binding protein protein-coding 156.333-47 chr10 97957482 97957747 + 1 NA intron (NM_001206528, intron 2 of 14) MIR|SINE|MIR 73007 NM_018058 55118 Hs.500736 NM_018058 ENSG00000095713 CRTAC1 ASPIC|ASPIC1|CEP-68|CEP68|LOTUS cartilage acidic protein 1 protein-coding 139.667-214 chr9 99946105 99946300 + 1 NA intron (NM_017919, intron 3 of 7) MER2|DNA|TcMar-Tigger 39548 NM_017919 55014 Hs.704031 NM_017919 ENSG00000136874 STX17 - syntaxin 17 protein-coding 177.333-168 chr8 84426088 84426354 + 1 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) L1MA9|LINE|L1 10737 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 233.667-14 chr12 51558264 51558686 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -32758 NM_014191 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 129.667-51 chr14 20652413 20652653 + 1 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -10842 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 213.667-49 chr20 56154894 56155226 + 1 NA Intergenic Intergenic -93672 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 156.667-186 chr2 99122096 99122278 + 1 NA intron (NM_001349014, intron 1 of 16) L1MD2|LINE|L1 18993 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 134.333-77 chr18 59338072 59338222 + 1 NA intron (NM_005570, intron 10 of 12) intron (NM_005570, intron 10 of 12) -19498 NM_181654 339302 Hs.449884 NM_181654 ENSG00000166569 CPLX4 CPX-IV|CPXIV complexin 4 protein-coding 154.333-43 chr10 105392752 105393004 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 427455 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 153.667-149 chr16 75421825 75422001 + 1 NA intron (NM_006324, intron 1 of 6) MER2|DNA|TcMar-Tigger 11590 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 159.333-332 chr8 110672558 110672770 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 354769 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 150.667-151 chr17 76985036 76985193 + 1 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -15915 NR_136417 105371899 Hs.634683 NR_136416 ENSG00000267568 LOC105371899 - uncharacterized LOC105371899 ncRNA 263.333-23 chr14 68857812 68858219 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -61772 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 224.667-22 chr14 58114744 58115099 + 1 NA intron (NM_001001872, intron 4 of 7) L1PA15|LINE|L1 37292 NM_001001872 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 245.333-33 chr12 114722648 114722993 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -38645 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 173.333-80 chr18 55476532 55476771 + 1 NA intron (NM_001348217, intron 2 of 18) AluJb|SINE|Alu -2570 NR_039754 100616290 NR_039754 ENSG00000264571 MIR4529 - microRNA 4529 ncRNA 199.333-175 chr22 38118118 38118412 + 1 NA intron (NM_001199562, intron 11 of 15) MER57D|LTR|ERV1 -7581 NM_025045 80115 Hs.474822 NM_025045 ENSG00000128298 BAIAP2L2 - BAI1 associated protein 2 like 2 protein-coding 118.333-79 chr16 25906610 25906845 + 1 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) intron (NM_006040, intron 1 of 1) -118510 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 166.333-127 chr2 181796932 181797148 + 1 NA Intergenic Intergenic -94690 NM_001287503 6744 Hs.196983 NM_006751 ENSG00000138434 ITPRID2 CS-1|CS1|KRAP|SPAG13|SSFA2 ITPR interacting domain containing 2 protein-coding 238.667-19 chr12 106374776 106375254 + 1 NA intron (NM_001160708, intron 6 of 27) L1MEd|LINE|L1 16933 NM_001160708 55703 Hs.62696 NM_018082 ENSG00000013503 POLR3B C128|HLD8|INMAP|RPC2 RNA polymerase III subunit B protein-coding 192.333-182 chrX 116824160 116824404 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -6422 NR_145523 100126447 Hs.695847 NR_145523 LOC100126447 - uncharacterized LOC100126447 ncRNA 159.333-10 chr1 68354572 68354789 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 95274 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 138.333-204 chr9 5099626 5099796 + 1 NA intron (NM_004972, intron 22 of 24) intron (NM_004972, intron 22 of 24) 58018 NM_001322204 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 165.333-91 chr16 11893599 11893880 + 1 NA intron (NM_002094, intron 5 of 14) intron (NM_002094, intron 5 of 14) 22217 NM_002094 2935 Hs.528780 NM_002094 ENSG00000103342 GSPT1 551G9.2|ETF3A|GST1|eRF3a G1 to S phase transition 1 protein-coding 119.333-46 chr11 29505348 29505527 + 1 NA Intergenic Intergenic -88976 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 168.667-65 chr14 73867925 73868100 + 1 NA intron (NM_001371328, intron 3 of 8) AluSx|SINE|Alu 16065 NM_001371328 204.667-33 chr12 54075012 54075342 + 1 NA intron (NR_026655, intron 1 of 1) intron (NR_026655, intron 1 of 1) 6646 NR_026658 100240735 Hs.635297 NR_026658 ENSG00000250654 LOC100240735 - uncharacterized LOC100240735 ncRNA 168.667-129 chr21 32745563 32745738 + 1 NA exon (NM_013329, exon 12 of 16) exon (NM_013329, exon 12 of 16) 17536 NR_038879 100506215 Hs.657123 NR_038879 ENSG00000238197 PAXBP1-AS1 GCFC1-AS1 PAXBP1 antisense RNA 1 ncRNA 185.667-119 chr7 95694697 95695070 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -77623 NM_001278422 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 138.667-128 chr3 41990981 41991219 + 1 NA Intergenic Intergenic -28997 NM_001322500 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 235.667-55 chr7 11411016 11411324 + 1 NA intron (NM_015204, intron 18 of 26) intron (NM_015204, intron 18 of 26) 421028 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 132.333-117 chr4 30589199 30589377 + 1 NA Intergenic Intergenic -131081 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 155.333-260 chr4 44729305 44729601 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -2819 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 223.333-83 chr2 144491287 144491627 + 1 NA intron (NM_001171653, intron 2 of 8) intron (NM_001171653, intron 2 of 8) -28157 NR_040248 100303491 Hs.560789 NR_040248 ENSG00000238057 ZEB2-AS1 ZEB2-AS|ZEB2AS|ZEB2NAT ZEB2 antisense RNA 1 ncRNA 160.667-313 chr8 122112000 122112173 + 1 NA Intergenic Intergenic 456558 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 238.667-26 chr14 55303196 55303550 + 1 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 31219 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 144.333-284 chr9 31258875 31259032 + 1 NA Intergenic Intergenic 122537 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 153.667-359 chr7 46484276 46484430 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 212769 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 205.667-66 chr2 57989059 57989330 + 1 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) L1MEd|LINE|L1 -57448 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 142.333-161 chr3 83683427 83683607 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 1186058 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 209.667-89 chr3 196744046 196744380 + 1 NA intron (NM_002577, intron 1 of 14) FLAM_C|SINE|Alu 4356 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 156.333-48 chr10 116862513 116862813 + 1 NA intron (NM_001242699, intron 6 of 13) intron (NM_001242699, intron 6 of 13) -12941 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 318.333-27 chr4 139359586 139359986 + 1 NA exon (NM_057175, exon 12 of 20) exon (NM_057175, exon 12 of 20) -57235 NM_001184987 4717 Hs.84549 NM_002494 ENSG00000109390 NDUFC1 KFYI NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C1 protein-coding 157.667-86 chr12 129650166 129650456 + 1 NA intron (NM_133448, intron 2 of 8) L1ME3C|LINE|L1 253714 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 146.667-272 chr5 169092575 169092734 + 1 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 79427 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 184.667-39 chr16 69891396 69891613 + 1 NA intron (NM_001270453, intron 5 of 20) intron (NM_001270453, intron 5 of 20) -33535 NM_199424 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 230.667-10 chr10 103161613 103161996 + 1 NA intron (NM_001351187, intron 3 of 21) L1MB7|LINE|L1 -7983 NM_001351191 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 162.333-227 chr6 148018830 148019033 + 1 NA Intergenic Intergenic -253397 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 354.667-11 chr2 36176636 36177056 + 1 NA Intergenic Intergenic 178724 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 191.333-15 chr1 212629246 212629542 + 1 NA Intergenic Intergenic 4920 NM_153606 149647 Hs.129293 NM_153606 ENSG00000162771 FAM71A GARI-L4 family with sequence similarity 71 member A protein-coding 117.667-12 chr1 214563109 214563350 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -11627 NM_005401 5784 Hs.193557 NM_005401 ENSG00000152104 PTPN14 CATLPH|PEZ|PTP36 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 14 protein-coding 160.333-196 chr3 128160126 128160317 + 1 NA intron (NM_021937, intron 1 of 6) intron (NM_021937, intron 1 of 6) -6307 NM_001319086 8607 Hs.272822 NM_003707 ENSG00000175792 RUVBL1 ECP-54|ECP54|INO80H|NMP 238|NMP238|PONTIN|Pontin52|RVB1|TIH1|TIP49|TIP49A RuvB like AAA ATPase 1 protein-coding 162.667-248 chr6 130289701 130289935 + 1 NA intron (NM_001258275, intron 2 of 13) intron (NM_001258275, intron 2 of 13) -66867 NM_001017373 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 216.667-99 chr7 83387963 83388344 + 1 NA intron (NM_001178129, intron 14 of 16) AluSg|SINE|Alu -225269 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 296.333-10 chr14 30720589 30721049 + 1 NA intron (NM_016106, intron 21 of 24) MER2|DNA|TcMar-Tigger 98500 NM_001257376 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 145.667-209 chr5 44502668 44502917 + 1 NA intron (NR_131946, intron 1 of 2) intron (NR_131946, intron 1 of 2) 7490 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 226.667-80 chr6 73127689 73128114 + 1 NA intron (NM_001160134, intron 9 of 11) AluSx|SINE|Alu 15613 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-29 chr1 200712472 200712640 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -27016 NM_001297707 23271 Hs.23585 NM_203459 ENSG00000118200 CAMSAP2 CAMSAP1L1 calmodulin regulated spectrin associated protein family member 2 protein-coding 304.667-25 chr3 31924535 31924947 + 1 NA intron (NM_001174060, intron 1 of 10) MER58A|DNA|hAT-Charlie -57009 NM_001137674 344787 Hs.585139 NM_001137674 ENSG00000197385 ZNF860 - zinc finger protein 860 protein-coding 161.333-19 chr1 226206952 226207217 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -16580 NM_031944 83881 Hs.282079 NM_031944 ENSG00000185155 MIXL1 MILD1|MIX|MIXL Mix paired-like homeobox protein-coding 160.667-206 chr3 128383748 128383931 + 1 NA intron (NM_021937, intron 6 of 6) MER102a|DNA|hAT-Charlie -79755 NR_037890 285224 Hs.683815 NR_037890 ENSG00000242049 DNAJB8-AS1 - DNAJB8 antisense RNA 1 ncRNA 242.667-3 chr1 64769940 64770255 + 1 NA intron (NM_001366165, intron 2 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 25022 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 248.333-14 chr11 6678654 6678966 + 1 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 4530 NM_022061 63875 Hs.523456 NM_022061 ENSG00000158042 MRPL17 L17mt|LIP2|MRP-L17|MRP-L26|RPL17L|RPML26 mitochondrial ribosomal protein L17 protein-coding 265.333-34 chr18 79428374 79428702 + 1 NA intron (NM_001278672, intron 2 of 8) intron (NM_001278672, intron 2 of 8) 28239 NM_001278672 4772 Hs.534074 NM_006162 ENSG00000131196 NFATC1 NF-ATC|NF-ATc1.2|NFAT2|NFATc nuclear factor of activated T cells 1 protein-coding 185.333-176 chr7 41078862 41079178 + 1 NA Intergenic Intergenic -22584 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 191.333-75 chr15 62543017 62543341 + 1 NA Intergenic Intergenic 102002 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 363.667 chr1 219440719 219441143 + 1 NA intron (NR_135822, intron 2 of 3) L1MC5|LINE|L1 116393 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 128.667-11 chr1 163371285 163371498 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 49437 NM_031423 83540 Hs.651950 NM_031423 ENSG00000143228 NUF2 CDCA1|CT106|NUF2R NUF2 component of NDC80 kinetochore complex protein-coding 243.667-3 chr1 174052319 174052691 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -59433 NM_001300852 149041 Hs.30258 NM_172071 ENSG00000135870 RC3H1 RNF198|ROQUIN ring finger and CCCH-type domains 1 protein-coding 155.333-325 chr6 36823662 36823860 + 1 NA intron (NM_020939, intron 1 of 20) MIR|SINE|MIR 15683 NM_001314017 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 228.333-95 chr8 18592233 18592615 + 1 NA intron (NM_015310, intron 12 of 15) L1M3d|LINE|L1 201142 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 153.333-262 chr3 20441448 20441715 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 99113 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 222.667-100 chr9 70197021 70197324 + 1 NA intron (NM_153267, intron 11 of 13) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -21284 NR_040076 100507244 Hs.556816 NR_040076 ENSG00000204706 MAMDC2-AS1 - MAMDC2 antisense RNA 1 ncRNA 308.333-10 chr11 28380770 28381272 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 96527 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 155.667-392 chr9 118763013 118763231 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 83451 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 126.667-59 chr15 75408494 75408642 + 1 NA intron (NM_015477, intron 8 of 20) intron (NM_015477, intron 8 of 20) -39941 NM_001256494 4123 Hs.26232 NM_006715 ENSG00000140400 MAN2C1 MAN6A8|MANA|MANA1 mannosidase alpha class 2C member 1 protein-coding 143.333-3 chr1 33400206 33400491 + 1 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -24755 NM_198040 1912 Hs.524271 NM_004427 ENSG00000134686 PHC2 EDR2|HPH2|PH2 polyhomeotic homolog 2 protein-coding 166.667-226 chr7 140898808 140899060 + 1 NA intron (NR_148928, intron 1 of 17) L1ME3B|LINE|L1 25995 NM_004333 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 177.667-6 chr1 68431873 68432099 + 1 NA intron (NM_000329, intron 10 of 13) intron (NM_000329, intron 10 of 13) 17968 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 193.667-94 chr4 88833162 88833508 + 1 NA intron (NM_014883, intron 7 of 23) L1PA10|LINE|L1 -9974 NM_001265579 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 193.667-89 chr3 175094951 175095297 + 1 NA intron (NR_046390, intron 2 of 3) intron (NR_046390, intron 2 of 3) 20118 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 145.333-135 chr2 75457135 75457308 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 -66847 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 154.333-48 chr10 126701907 126702071 + 1 NA Intergenic Intergenic -31479 NM_001350923 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 165.333-121 chr2 44102832 44103126 + 1 NA Intergenic Intergenic -65824 NM_177969 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 151.667-140 chr16 80588038 80588223 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -15322 NR_104666 101928276 Hs.149769 NR_104665 ENSG00000260737 LINC01227 - long intergenic non-protein coding RNA 1227 ncRNA 171.667-178 chr9 32654320 32654593 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -18787 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 236.333-69 chr4 60285566 60286006 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -636833 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 163.667-107 chr2 54459675 54459846 + 1 NA intron (NM_003128, intron 1 of 35) intron (NM_003128, intron 1 of 35) 3433 NM_003128 6711 Hs.503178 NM_003128 ENSG00000115306 SPTBN1 ELF|HEL102|SPTB2|betaSpII spectrin beta, non-erythrocytic 1 protein-coding 226.667-32 chr13 30634756 30635163 + 1 NA intron (NM_001321534, intron 1 of 5) L1ME3F|LINE|L1 744 NM_001321534 10208 Hs.533831 NM_005800 ENSG00000132952 USPL1 C13orf22|D13S106E|bA121O19.1 ubiquitin specific peptidase like 1 protein-coding 156.333-22 chr1 181568569 181568787 + 1 NA intron (NM_001205293, intron 3 of 47) AluJr|SINE|Alu 85161 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 160.667-86 chr14 37028701 37029012 + 1 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -76465 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 124.333-53 chr14 80512601 80512882 + 1 NA intron (NM_152446, intron 23 of 24) L1M1|LINE|L1 -281684 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 276.667-3 chr1 206454960 206455299 + 1 NA 3' UTR (NM_001300952, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001300952, exon 20 of 20) -15347 NM_001193321 9641 Hs.321045 NM_014002 ENSG00000263528 IKBKE IKK-E|IKK-i|IKKE|IKKI inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit epsilon protein-coding 180.667-112 chr5 30735219 30735511 + 1 NA Intergenic Intergenic -458321 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 147.333-178 chr2 173034314 173034502 + 1 NA intron (NM_001282901, intron 21 of 24) intron (NM_001282901, intron 21 of 24) -41438 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 236.667-31 chr15 83307703 83308118 + 1 NA Intergenic Intergenic -23246 NM_001717 646 Hs.459153 NM_001717 ENSG00000169594 BNC1 BNC|BSN1|HsT19447 basonuclin 1 protein-coding 251.667-9 chr10 45475110 45475585 + 1 NA intron (NM_001282866, intron 3 of 7) L1MA4A|LINE|L1 -22226 NR_120674 102724323 Hs.559151 NR_120674 ENSG00000231964 LOC102724323 - uncharacterized LOC102724323 ncRNA 157.333-268 chr4 108983269 108983447 + 1 NA intron (NM_198721, intron 5 of 36) intron (NM_198721, intron 5 of 36) -220305 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 162.667-26 chr10 34474312 34474503 + 1 NA intron (NM_001184789, intron 3 of 22) intron (NM_001184789, intron 3 of 22) 340889 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 136.667-53 chr14 44788414 44788582 + 1 NA intron (NR_146457, intron 2 of 4) intron (NR_146457, intron 2 of 4) 10628 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 351.333-9 chr14 39868510 39868988 + 1 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -436249 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 132.667-70 chr17 58773177 58773356 + 1 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 17397 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 159.667-327 chr8 117784586 117784781 + 1 NA Intergenic Intergenic 136230 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 182.667-69 chr19 45274092 45274293 + 1 NA intron (NM_001199867, intron 8 of 16) AluY|SINE|Alu 22921 NM_001199867 57787 Hs.34314 NM_031417 ENSG00000007047 MARK4 MARK4L|MARK4S|MARKL1|MARKL1L|PAR-1D microtubule affinity regulating kinase 4 protein-coding 150.333-63 chr11 65441133 65441333 + 1 NA non-coding (NR_131012, exon 1 of 1) non-coding (NR_131012, exon 1 of 1) -3225 NR_030343 693197 NR_030343 ENSG00000283791 MIR612 MIRN612|hsa-mir-612 microRNA 612 ncRNA 181.667-152 chr9 37452108 37452446 + 1 NA intron (NM_014872, intron 1 of 1) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 13173 NM_014872 9925 Hs.161276 NM_014872 ENSG00000168795 ZBTB5 - zinc finger and BTB domain containing 5 protein-coding 145.333-300 chr8 87256373 87256572 + 1 NA intron (NM_173538, intron 6 of 10) intron (NM_173538, intron 6 of 10) 390057 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 183.667-145 chr8 133291269 133291548 + 1 NA intron (NM_006096, intron 1 of 15) intron (NM_006096, intron 1 of 15) 5844 NM_001258432 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 149.333-199 chr2 158196527 158196713 + 1 NA intron (NM_138803, intron 11 of 13) intron (NM_138803, intron 11 of 13) 29970 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 180.667-14 chr10 63220294 63220637 + 1 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 48758 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 330.333-2 chr10 16011486 16011887 + 1 NA Intergenic Intergenic -151153 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 317.333-22 chr2 71490238 71490735 + 1 NA intron (NM_001130985, intron 3 of 54) AluSq2|SINE|Alu 23787 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 160.333-192 chr3 99905600 99905784 + 1 NA intron (NM_001042459, intron 4 of 4) L1ME3|LINE|L1 -29489 NM_001282794 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 190.333-91 chr3 77924672 77925019 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 124118 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 185.333-172 chr7 6594670 6594929 + 1 NA intron (NM_024067, intron 3 of 5) AluSz|SINE|Alu 4778 NM_024067 79034 Hs.487511 NM_024067 ENSG00000146576 C7orf26 - chromosome 7 open reading frame 26 protein-coding 263.333-26 chr15 58284898 58285307 + 1 NA Intergenic Intergenic 146721 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 214.667-82 chr3 85936898 85937236 + 1 NA intron (NM_001256502, intron 7 of 10) intron (NM_001256502, intron 7 of 10) -109017 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 184.667-7 chr1 150491747 150491960 + 1 NA promoter-TSS (NR_106938) promoter-TSS (NR_106938) -492 NR_106938 102465529 NR_106938 ENSG00000283933 MIR6878 hsa-mir-6878 microRNA 6878 ncRNA 227.667-63 chr5 120469327 120469586 + 1 NA intron (NM_001308087, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 3825 NM_001308087 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 158.333-140 chr2 37374124 37374396 + 1 NA TTS (NM_012413) TTS (NM_012413) 29630 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 155.667-178 chr2 143479135 143479447 + 1 NA intron (NM_018460, intron 8 of 13) intron (NM_018460, intron 8 of 13) 349872 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 356.333-13 chr15 59860626 59861029 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -143484 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 199.333-66 chr14 39124955 39125385 + 1 NA intron (NM_001009183, intron 6 of 8) MIR|SINE|MIR 10886 NM_001009182 8487 Hs.652307 NM_003616 ENSG00000092208 GEMIN2 SIP1|SIP1-delta gem nuclear organelle associated protein 2 protein-coding 184.667-114 chr6 90904235 90904487 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -317289 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 146.667-207 chr22 25907033 25907352 + 1 NA intron (NM_001318245, intron 31 of 43) intron (NM_001318245, intron 31 of 43) 165004 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 147.667-137 chr17 55989354 55989545 + 1 NA Intergenic Intergenic -164026 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 112.667-171 chr3 89270726 89270914 + 1 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 163199 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 225.667-36 chr2 21386848 21387135 + 1 NA Intergenic Intergenic 263005 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 162.667-89 chr15 76692036 76692348 + 1 NA intron (NR_148227, intron 20 of 32) intron (NR_148227, intron 20 of 32) 105545 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 229.333-61 chr2 29382376 29382776 + 1 NA intron (NM_004304, intron 5 of 28) intron (NM_004304, intron 5 of 28) 92801 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 151.333-189 chr19 48445942 48446211 + 1 NA promoter-TSS (NM_031485) promoter-TSS (NM_031485) 93 NM_031485 83743 Hs.400625 NM_031485 ENSG00000105447 GRWD1 CDW4|GRWD|RRB1|WDR28 glutamate rich WD repeat containing 1 protein-coding 155.333-220 chr22 45435366 45435577 + 1 NA Intergenic Intergenic 21778 NM_015653 26150 Hs.475110 NM_015653 ENSG00000128408 RIBC2 C22orf11|TRIB RIB43A domain with coiled-coils 2 protein-coding 280.667-50 chr7 33620205 33620503 + 1 NA intron (NM_001348041, intron 22 of 22) L1ME3E|LINE|L1 -284561 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 153.333-90 chr12 39573704 39573878 + 1 NA exon (NM_005164, exon 9 of 10) exon (NM_005164, exon 9 of 10) 46012 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 130.333-75 chr15 81496216 81496426 + 1 NA Intergenic Intergenic -122108 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 193.333-174 chr7 91362895 91363229 + 1 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 98629 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 181.333-131 chr5 9041546 9041846 + 1 NA 3' UTR (NM_003966, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_003966, exon 23 of 23) 12199 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 192.333-178 chr9 81124855 81125177 + 1 NA Intergenic Intergenic 564519 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 379.333-17 chr9 98020462 98021027 + 1 NA Intergenic Intergenic -35988 NM_018946 54187 Hs.522310 NM_018946 ENSG00000095380 NANS HEL-S-100|SAS|SEMDCG|SEMDG N-acetylneuraminate synthase protein-coding 248.667-108 chr9 16719071 16719408 + 1 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) intron (NM_001317940, intron 2 of 5) -7575 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 353.333-12 chr12 48701651 48702243 + 1 NA intron (NM_001240, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 14760 NM_001240 904 Hs.92308 NM_001240 ENSG00000129315 CCNT1 CCNT|CYCT1|HIVE1 cyclin T1 protein-coding 242.333-19 chr11 93632951 93633310 + 1 NA Intergenic Intergenic -28552 NM_033395 85459 Hs.458418 NM_033395 ENSG00000166004 CEP295 KIAA1731 centrosomal protein 295 protein-coding 206.667-145 chr9 9999535 9999948 + 1 NA intron (NM_002839, intron 4 of 45) HUERS-P3-int|LTR|ERV1 200349 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 167.667-193 chr7 24740857 24741076 + 1 NA intron (NM_004403, intron 3 of 9) intron (NM_004403, intron 3 of 9) 16498 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 149.667-281 chr4 43923406 43923567 + 1 NA Intergenic Intergenic -93375 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 191.667-3 chr1 67144565 67144872 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -9748 NM_001276351 400757 Hs.666621 NM_001013674 ENSG00000203963 C1orf141 - chromosome 1 open reading frame 141 protein-coding 155.333-287 chr5 37662777 37663053 + 1 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 171907 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 170.333-81 chr15 63306782 63307158 + 1 NA 3' UTR (NM_001145646, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001145646, exon 5 of 5) 29365 NM_031301 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 188.667-152 chr8 120604223 120604560 + 1 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) -156862 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 148.667-412 chrX 113203083 113203331 + 1 NA intron (NR_110399, intron 3 of 3) L1PA10|LINE|L1 160480 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 211.333-146 chr22 49432295 49432577 + 1 NA intron (NR_110522, intron 1 of 2) intron (NR_110522, intron 1 of 2) 111030 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 168.667-190 chr6 131826113 131826340 + 1 NA intron (NM_006208, intron 1 of 24) intron (NM_006208, intron 1 of 24) 18206 NM_006208 5167 Hs.527295 NM_006208 ENSG00000197594 ENPP1 ARHR2|COLED|M6S1|NPP1|NPPS|PC-1|PCA1|PDNP1 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 protein-coding 128.333-31 chr11 10807533 10807729 + 1 NA 5' UTR (NM_001172705, exon 1 of 22) 5' UTR (NM_001172705, exon 1 of 22) 365 NM_001172705 1982 Hs.183684 NM_001418 ENSG00000110321 EIF4G2 AAG1|DAP5|NAT1|P97 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 protein-coding 237.667-53 chr3 47122689 47123094 + 1 NA exon (NM_001349370, exon 2 of 20) exon (NM_001349370, exon 2 of 20) 41086 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 159.667-344 chrX 50928153 50928380 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 17531 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 242.667-64 chr22 17453713 17454033 + 1 NA intron (NM_001290047, intron 1 of 18) LTR10C|LTR|ERV1 84413 NM_001290047 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 236.667-11 chr10 34945496 34945869 + 1 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 128601 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 147.333-252 chr5 13973852 13973999 + 1 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 -29445 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 240.333-98 chr9 23646606 23647037 + 1 NA intron (NR_121602, intron 9 of 27) intron (NR_121602, intron 9 of 27) 25578 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 266.333-17 chr15 39007584 39008176 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -242789 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 240.333-64 chr3 34236189 34236622 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 437775 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 227.667-54 chr4 39899702 39900090 + 1 NA intron (NM_001100399, intron 14 of 32) intron (NM_001100399, intron 14 of 32) 78015 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 252.667-8 chr1 181667201 181667502 + 1 NA intron (NM_001205293, intron 7 of 47) intron (NM_001205293, intron 7 of 47) 183834 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 222.667-77 chr5 177043582 177043913 + 1 NA intron (NM_001308219, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 21051 NM_001308218 23567 Hs.484259 NM_012279 ENSG00000113761 ZNF346 JAZ|Zfp346 zinc finger protein 346 protein-coding 169.333-165 chr3 94515473 94515770 + 1 NA Intergenic Intergenic -422642 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 214.333-34 chr12 65462905 65463150 + 1 NA intron (NM_001031679, intron 6 of 6) intron (NM_001031679, intron 6 of 6) 94284 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 158.333-90 chr14 69707024 69707343 + 1 NA intron (NM_014734, intron 4 of 5) L1MC4|LINE|L1 -59959 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 350.667-16 chrX 68093523 68093990 + 1 NA intron (NM_002547, intron 19 of 24) L1MD|LINE|L1 339739 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 115.333-169 chr5 30472971 30473211 + 1 NA Intergenic Intergenic 592531 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 156.333-372 chr8 141146270 141146454 + 1 NA intron (NM_001362798, intron 5 of 21) intron (NM_001362798, intron 5 of 21) 17773 NR_148197 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 146.333-248 chr5 27442005 27442219 + 1 NA Intergenic Intergenic -30180 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 148.333-302 chr5 12408688 12408917 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -166055 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 166.667-133 chr20 38196795 38197037 + 1 NA Intergenic Intergenic -30408 NM_001323316 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 226.333-64 chr2 126776807 126777231 + 1 NA Intergenic Intergenic 120861 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 245.667-26 chr18 60587029 60587438 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -214458 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 213.333-23 chr10 27883872 27884233 + 1 NA intron (NM_001290021, intron 10 of 13) L1M4|LINE|L1 97819 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 168.667-11 chr1 178550184 178550404 + 1 NA Intergenic Intergenic 7498 NR_033186 400798 Hs.668085 NM_207467 ENSG00000213057 C1orf220 - chromosome 1 open reading frame 220 (putative) ncRNA 182.667-118 chr4 53957547 53957772 + 1 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 29623 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 137.333-94 chr2 50298062 50298265 + 1 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 49591 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 132.667-62 chr16 8273537 8273760 + 1 NA Intergenic Intergenic 316190 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 169.333-72 chr14 35322507 35322889 + 1 NA Intergenic Intergenic 30316 NM_002791 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 219.667-19 chr12 62286913 62287312 + 1 NA intron (NR_147080, intron 1 of 19) L1PA17|LINE|L1 26708 NM_001351163 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 220.667-111 chr9 33196914 33197227 + 1 NA Intergenic Intergenic 29211 NR_108108 101929639 Hs.545818 NR_108108 ENSG00000233554 B4GALT1-AS1 - B4GALT1 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-191 chr5 89906432 89906649 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 110180 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 194.667-166 chrX 6336955 6337238 + 1 NA Intergenic Intergenic 46867 NR_039927 100616373 NR_039927 ENSG00000265284 MIR4770 - microRNA 4770 ncRNA 147.667-274 chr5 11898171 11898374 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 6174 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 159.333-83 chr14 34331513 34331781 + 1 NA Intergenic Intergenic 130593 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 151.333-305 chr4 58044802 58045006 + 1 NA Intergenic Intergenic 491424 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 124.333-47 chr14 45015410 45015543 + 1 NA intron (NM_001308120, intron 7 of 19) intron (NM_001308120, intron 7 of 19) 53286 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 337.667-15 chr3 14012430 14013097 + 1 NA intron (NR_002223, intron 1 of 2) L1PB1|LINE|L1 75456 NR_002223 348825 Hs.529180 NR_002223 ENSG00000180438 TPRXL TPRX3P tetrapeptide repeat homeobox like pseudo 153.333-9 chr1 62724033 62724273 + 1 NA Intergenic Intergenic -35767 NM_001367561 85440 Hs.744927 NM_033407 ENSG00000116641 DOCK7 EIEE23|ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 protein-coding 159.333-68 chr12 33558868 33559032 + 1 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -119131 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 250.667-6 chr10 28536618 28537064 + 1 NA intron (NM_100486, intron 3 of 12) intron (NM_100486, intron 3 of 12) 3723 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 134.667-52 chr13 87265934 87266113 + 1 NA Intergenic Intergenic 352717 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 135.667-23 chr10 129357701 129357862 + 1 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -109460 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 156.667-159 chr18 27560307 27560589 + 1 NA Intergenic Intergenic -217792 NR_134589 105372038 Hs.722107 NR_134589 ENSG00000264151 LOC105372038 - uncharacterized LOC105372038 ncRNA 172.333-22 chr10 86495141 86495410 + 1 NA intron (NM_001318328, intron 4 of 18) AluJb|SINE|Alu 26509 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 198.667-98 chr2 29226578 29227013 + 1 NA intron (NM_004304, intron 18 of 28) intron (NM_004304, intron 18 of 28) -2895 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 156.667-330 chr8 41841584 41841877 + 1 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) L1MA10|LINE|L1 -44108 NM_000037 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 157.333-221 chr21 31681190 31681417 + 1 NA intron (NM_020706, intron 19 of 19) intron (NM_020706, intron 19 of 19) 21681 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 139.333-220 chr8 115743261 115743544 + 1 NA Intergenic Intergenic -74427 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 153.333-197 chr2 62423958 62424228 + 1 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 82102 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 151.667-48 chr10 65570205 65570505 + 1 NA Intergenic Intergenic -1070 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 134.667-173 chr6 84665793 84666001 + 1 NA Intergenic Intergenic -23561 NR_125875 102724201 Hs.667523 NR_125875 ENSG00000228290 TBX18-AS1 - TBX18 antisense RNA 1 ncRNA 204.667-61 chr18 8117532 8117888 + 1 NA intron (NM_002845, intron 13 of 30) intron (NM_002845, intron 13 of 30) 249324 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 143.333-79 chr14 37442180 37442345 + 1 NA intron (NM_138731, intron 12 of 13) L1PB4|LINE|L1 152987 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 157.667-262 chr5 144772755 144772926 + 1 NA Intergenic Intergenic 567449 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 193.667-92 chr4 46996029 46996291 + 1 NA Intergenic Intergenic -2579 NM_001204266 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 161.333-178 chr22 47452291 47452659 + 1 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 34636 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 129.667-62 chr14 72247881 72248083 + 1 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -268838 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 157.333-47 chr10 57638836 57639046 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -334382 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 278.333-35 chr5 84366340 84366857 + 1 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 18269 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 126.667-142 chr5 86325454 86325683 + 1 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 43124 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 221.333-125 chr6 110460007 110460380 + 1 NA intron (NM_033125, intron 1 of 7) intron (NM_033125, intron 1 of 7) 16420 NM_033125 85413 Hs.520319 NM_033125 ENSG00000004809 SLC22A16 CT2|FLIPT2|HEL-S-18|OAT6|OCT6|OKB1|dJ261K5.1 solute carrier family 22 member 16 protein-coding 126.667-155 chr6 113107092 113107253 + 1 NA Intergenic Intergenic 326275 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 264.667-37 chr18 9413222 9413592 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -62106 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 182.333-34 chr12 127014447 127014726 + 1 NA intron (NR_104646, intron 2 of 6) intron (NR_104646, intron 2 of 6) 45811 NR_104646 101927592 Hs.385663 NR_104646 ENSG00000249345 LINC02405 - long intergenic non-protein coding RNA 2405 ncRNA 122.667-202 chr8 138472330 138472516 + 1 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 24838 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 262.667-40 chr2 139593656 139594072 + 1 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 696540 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 145.333-158 chr20 41819162 41819352 + 1 NA Intergenic Intergenic -200880 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 148.667-302 chr5 26453626 26453821 + 1 NA Intergenic Intergenic 584863 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 263.333-21 chr14 59038875 59039202 + 1 NA Intergenic Intergenic -149629 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 149.333-296 chr4 168370742 168370985 + 1 NA intron (NM_001345927, intron 36 of 37) intron (NM_001345927, intron 36 of 37) -52111 NM_017631 55601 Hs.591710 NM_017631 ENSG00000137628 DDX60 - DExD/H-box helicase 60 protein-coding 163.667-257 chr8 129019650 129019925 + 1 NA Intergenic Intergenic -53786 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 158.333-207 chr3 109313525 109313812 + 1 NA intron (NM_138815, intron 2 of 8) intron (NM_138815, intron 2 of 8) 2849 NM_138815 151871 Hs.351113 NM_138815 ENSG00000163530 DPPA2 CT100|ECAT15-2|PESCRG1 developmental pluripotency associated 2 protein-coding 215.333-167 chr5 111117349 111117787 + 1 NA intron (NM_139281, intron 16 of 22) MIR|SINE|MIR 25396 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 166.333-158 chr3 105867304 105867486 + 1 NA intron (NR_135809, intron 2 of 18) intron (NR_135809, intron 2 of 18) 196 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 113.333-138 chr2 188453648 188453829 + 1 NA intron (NM_016315, intron 2 of 11) intron (NM_016315, intron 2 of 11) 156246 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 116.667-214 chr9 36113774 36113912 + 1 NA intron (NM_021111, intron 16 of 20) L1ME4b|LINE|L1 -22693 NR_104637 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 159.667-348 chrX 100989646 100989951 + 1 NA intron (NR_103708, intron 8 of 8) intron (NR_103708, intron 8 of 8) 20090 NR_103708 392509 Hs.147237 NM_001162491 ENSG00000174225 ARL13A ARL13|dJ341D10.2 ADP ribosylation factor like GTPase 13A protein-coding 154.667-418 chrX 37899162 37899339 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -51679 NM_006520 6990 Hs.446392 NM_006520 ENSG00000165169 DYNLT3 RP3|TCTE1L|TCTEX1L dynein light chain Tctex-type 3 protein-coding 153.667-411 chr9 130818592 130818785 + 1 NA intron (NM_007313, intron 1 of 10) L1ME1|LINE|L1 -16566 NM_005157 25 Hs.431048 NM_005157 ENSG00000097007 ABL1 ABL|CHDSKM|JTK7|bcr/abl|c-ABL|c-ABL1|p150|v-abl ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 165.333-244 chr7 113634840 113635066 + 1 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 284056 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 123.333-155 chr4 7404966 7405175 + 1 NA intron (NM_020777, intron 2 of 26) L1PB4|LINE|L1 29860 NM_001085382 768239 Hs.662523 NM_001085382 ENSG00000178597 PSAPL1 - prosaposin like 1 (gene/pseudogene) protein-coding 146.667-192 chr20 18673748 18673907 + 1 NA TTS (NR_109955) TTS (NR_109955) 24881 NR_109955 101929526 Hs.639402 NR_109955 ENSG00000233993 LOC101929526 - uncharacterized LOC101929526 ncRNA 155.667-133 chr17 74447412 74447570 + 1 NA TTS (NM_022036) TTS (NM_022036) 13794 NM_018653 55890 Hs.446438 NM_018653 ENSG00000170412 GPRC5C RAIG-3|RAIG3 G protein-coupled receptor class C group 5 member C protein-coding 120.667 chr1 9507607 9507762 + 1 NA Intergenic Intergenic -31781 NM_032315 84275 Hs.568613 NM_032315 ENSG00000171612 SLC25A33 BMSC-MCP|PNC1 solute carrier family 25 member 33 protein-coding 153.667-182 chr2 69195811 69196049 + 1 NA intron (NM_032208, intron 17 of 17) intron (NM_032208, intron 17 of 17) 92248 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 283.667-24 chr3 142523948 142524355 + 1 NA exon (NM_001184, exon 22 of 47) exon (NM_001184, exon 22 of 47) 54582 NM_001354579 545 Hs.271791 NM_001184 ENSG00000175054 ATR FCTCS|FRP1|MEC1|SCKL|SCKL1 ATR serine/threonine kinase protein-coding 277.667-31 chr3 105010979 105011342 + 1 NA Intergenic Intergenic -355553 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 141.667-219 chr8 29644720 29644916 + 1 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 103291 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 125.333-47 chr12 66835810 66835961 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -31616 NM_001366723 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 227.333-94 chr4 117563619 117563925 + 1 NA intron (NR_125757, intron 2 of 3) intron (NR_125757, intron 2 of 3) 135374 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 189.333-12 chr1 93045423 93045770 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -33639 NM_001164391 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 135.333-78 chr2 13345128 13345359 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -338230 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 149.333-187 chr2 99177431 99177588 + 1 NA intron (NM_001320419, intron 1 of 5) L1MA6|LINE|L1 3549 NM_001320419 129531 Hs.14222 NM_138798 ENSG00000158411 MITD1 - microtubule interacting and trafficking domain containing 1 protein-coding 256.667-39 chr2 31889974 31890284 + 1 NA intron (NM_001301852, intron 5 of 7) intron (NM_001301852, intron 5 of 7) -86149 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 242.333-97 chr8 54229143 54229431 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 94046 NM_014175 29088 Hs.18349 NM_014175 ENSG00000137547 MRPL15 HSPC145|L15mt|MRP-L15|MRP-L7|RPML7 mitochondrial ribosomal protein L15 protein-coding 152.333-331 chr6 53625225 53625408 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -3064 NR_125841 101927171 Hs.334005 NR_125841 ENSG00000235899 LINC01564 TCONS_00011314|XLOC_005327 long intergenic non-protein coding RNA 1564 ncRNA 191.333-151 chr4 114741590 114741838 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 84955 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 158.333-180 chr21 32706231 32706442 + 1 NA intron (NM_203446, intron 2 of 32) L1MC4|LINE|L1 21585 NM_001160306 8867 Hs.473632 NM_003895 ENSG00000159082 SYNJ1 EIEE53|INPP5G|PARK20 synaptojanin 1 protein-coding 245.333-21 chr11 74931835 74932191 + 1 NA intron (NM_001270380, intron 5 of 14) L1ME3Cz|LINE|L1 17078 NM_001270380 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 262.333-69 chr6 19838887 19839162 + 1 NA intron (NM_001546, intron 2 of 2) CpG-23244 1654 NM_001546 3400 Hs.519601 NM_001546 ENSG00000172201 ID4 IDB4|bHLHb27 inhibitor of DNA binding 4, HLH protein protein-coding 151.667-15 chr1 106780890 106781094 + 1 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -37247 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 225.333-92 chr22 28609221 28609681 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1PA6|LINE|L1 70414 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 150.333-38 chr10 65041193 65041401 + 1 NA Intergenic Intergenic -116779 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 156.667-17 chr1 84363166 84363439 + 1 NA Intergenic Intergenic 21499 NR_003927 391051 Hs.647646 NR_003927 UOX UOXP|URICASE urate oxidase (pseudogene) pseudo 155.667-328 chr7 36115214 36115395 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 19994 NR_108089 101928618 Hs.561704 NR_108089 ENSG00000261184 LOC101928618 - uncharacterized LOC101928618 ncRNA 162.333-223 chr6 112162550 112162742 + 1 NA intron (NM_001105206, intron 13 of 38) L2a|LINE|L2 -73950 NR_121193 101927640 Hs.510007 NR_121193 LOC101927640 - uncharacterized LOC101927640 ncRNA 313.333-7 chr11 93854231 93854844 + 1 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -3919 NM_001144871 387804 Hs.512252 NM_001144871 ENSG00000214376 VSTM5 C11orf90 V-set and transmembrane domain containing 5 protein-coding 142.667-176 chr5 24149590 24149822 + 1 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) AluJr4|SINE|Alu 198358 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 224.667-43 chr2 99869590 99869946 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 235815 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 214.667-129 chr9 103924770 103925009 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -74820 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 186.333-94 chr22 47704474 47704762 + 1 NA non-coding (NR_122046, exon 7 of 9) non-coding (NR_122046, exon 7 of 9) 72944 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 150.333-131 chr15 66452761 66452950 + 1 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) intron (NM_002755, intron 5 of 10) 44179 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 164.333-90 chr17 22284646 22284946 + 1 NA Intergenic Intergenic -13968 NR_028336 284123 Hs.348578 NM_203392 ENSG00000178130 FAM27E5 FAM27L family with sequence similarity E5 ncRNA 155.333-255 chr4 31494320 31494544 + 1 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -12112 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 151.333-270 chr3 7667256 7667545 + 1 NA intron (NM_000844, intron 8 of 9) intron (NM_000844, intron 8 of 9) -132116 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 211.333-209 chr6 99978889 99979266 + 1 NA intron (NM_032503, intron 1 of 5) MER91B|DNA|hAT-Tip100 -14961 NR_038384 728012 Hs.434366 NR_038384 ENSG00000229315 MCHR2-AS1 - MCHR2 antisense RNA 1 ncRNA 228.333-44 chr2 11662133 11662413 + 1 NA intron (NM_012344, intron 1 of 3) intron (NM_012344, intron 1 of 3) 7922 NM_012344 23620 Hs.131138 NM_012344 ENSG00000169006 NTSR2 NTR2 neurotensin receptor 2 protein-coding 146.667-105 chr14 62841835 62842016 + 1 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) intron (NM_139318, intron 8 of 10) 203533 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 127.667-34 chr12 34532103 34532290 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 509700 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 113.333-67 chr13 92982460 92982630 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -62796 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 200.667-33 chr12 290218 290513 + 1 NA intron (NM_001042603, intron 27 of 27) intron (NM_001042603, intron 27 of 27) -27492 NM_001190997 6540 Hs.504398 NM_016615 ENSG00000010379 SLC6A13 GAT-2|GAT2|GAT3 solute carrier family 6 member 13 protein-coding 144.333-184 chr4 32522794 32523036 + 1 NA Intergenic Intergenic 171877 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 201.667-100 chr6 35609475 35609831 + 1 NA intron (NM_001145775, intron 6 of 11) HAL1ME|LINE|L1 55136 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 208.667-69 chr2 99445126 99445527 + 1 NA intron (NR_135652, intron 4 of 21) intron (NR_135652, intron 4 of 21) 44691 NM_001037872 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 186.667-8 chr1 216123613 216123816 + 1 NA intron (NM_206933, intron 21 of 71) intron (NM_206933, intron 21 of 71) 51249 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 238.333-38 chr19 28168044 28168584 + 1 NA Intergenic Intergenic -374374 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 314.667-21 chr17 66182156 66182628 + 1 NA intron (NM_001353129, intron 2 of 26) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 9500 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 152.667-315 chr6 9624200 9624357 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -780224 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 205.667-99 chr3 117187230 117187494 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 265931 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 149.333-429 chr9 35358092 35358332 + 1 NA intron (NM_001371187, intron 2 of 32) L1MB3|LINE|L1 16316 NM_001371187 226.667-78 chr6 4571735 4572181 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -38607 NR_122107 497048 Hs.591355 NM_001011540 ENSG00000205444 KU-MEL-3 - uncharacterized LOC497048 ncRNA 139.333-237 chrX 73860401 73860563 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -7729 NR_001564 7503 Hs.529901 NR_001564 ENSG00000229807 XIST DXS1089|DXS399E|LINC00001|NCRNA00001|SXI1|swd66 X inactive specific transcript ncRNA 197.667-52 chr17 70892931 70893235 + 1 NA Intergenic Intergenic 309096 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 176.667-2 chr1 22956348 22956706 + 1 NA intron (NM_001289974, intron 6 of 7) intron (NM_001289974, intron 6 of 7) 16339 NM_001289974 646262 NM_001289974 ENSG00000215906 LACTBL1 - lactamase beta like 1 protein-coding 162.333-229 chr6 165791905 165792221 + 1 NA Intergenic Intergenic -129783 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 154.667-391 chr8 102177230 102177511 + 1 NA Intergenic Intergenic 51938 NR_049859 100847001 NR_049859 ENSG00000266756 MIR5680 - microRNA 5680 ncRNA 176.333-52 chr14 67165067 67165342 + 1 NA exon (NM_020806, exon 20 of 23) exon (NM_020806, exon 20 of 23) -24236 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 208.333-160 chr9 106491090 106491583 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -109592 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 159.333-173 chr2 173828249 173828500 + 1 NA Intergenic Intergenic 135506 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 148.333-54 chr10 107935558 107935761 + 1 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 133634 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 284.667-17 chr14 64367281 64367926 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -19992 NR_033777 441687 Hs.685242 NR_033777 TEX21P - testis expressed 21, pseudogene pseudo 150.333-153 chr17 43129789 43130020 + 1 NA intron (NR_138145, intron 1 of 7) intron (NR_138145, intron 1 of 7) 4347 NR_138145 10230 Hs.373818 NM_005821 ENSG00000198496 NBR2 NCRNA00192 neighbor of BRCA1 lncRNA 2 ncRNA 163.667-217 chr6 117350861 117351157 + 1 NA intron (NM_002944, intron 26 of 42) L1MC1|LINE|L1 74846 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 123.667-199 chrX 110512066 110512214 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8172 NR_002718 6998 Hs.592361 NR_002718 ENSG00000225366 TDGF1P3 CR-3|CRIPTO|CRIPTO-3|CRIPTO3|TDGF1|TDGF2|TDGF3 teratocarcinoma-derived growth factor 1 pseudogene 3 pseudo 279.667-7 chr12 30344807 30345183 + 1 NA Intergenic Intergenic 332249 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 213.667-87 chr7 47645219 47645646 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -9812 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 143.667-219 chr6 122796681 122796888 + 1 NA intron (NM_006714, intron 2 of 7) intron (NM_006714, intron 2 of 7) 7526 NM_006714 10924 Hs.486357 NM_006714 ENSG00000172594 SMPDL3A ASM3A|ASML3a|yR36GH4.1 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A protein-coding 233.667-28 chr17 40397349 40397666 + 1 NA intron (NM_001067, intron 27 of 34) AluSz|SINE|Alu 20389 NM_001067 7153 Hs.156346 NM_001067 ENSG00000131747 TOP2A TOP2|TP2A DNA topoisomerase II alpha protein-coding 227.333-85 chr4 31348048 31348343 + 1 NA Intergenic Intergenic -158349 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 191.667-43 chr13 54256664 54256940 + 1 NA Intergenic Intergenic 55246 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 160.333-250 chr6 93545177 93545364 + 1 NA Intergenic Intergenic -125688 NM_001288630 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 214.667-84 chr3 106566952 106567333 + 1 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 673496 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 181.333-137 chr5 60451938 60452154 + 1 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) -35667 NR_024617 25859 Hs.146312 NM_001039499 ENSG00000152931 PART1 NCRNA00206 prostate androgen-regulated transcript 1 ncRNA 122.667-21 chr10 114109528 114109674 + 1 NA Intergenic Intergenic 64578 NR_031747 100302224 NR_031747 ENSG00000284442 MIR2110 hsa-mir-2110|mir-2110 microRNA 2110 ncRNA 213.667-29 chr12 122281393 122281755 + 1 NA intron (NM_198240, intron 19 of 23) AluJr|SINE|Alu -15080 NM_001351019 65082 Hs.487883 NM_022916 ENSG00000139719 VPS33A MPSPS VPS33A core subunit of CORVET and HOPS complexes protein-coding 174.667-15 chr1 204636958 204637209 + 1 NA intron (NM_201630, intron 1 of 1) L1ME2z|LINE|L1 48655 NM_201630 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 253.667-20 chr14 61318481 61318796 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -2805 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 160.333-85 chr13 45430520 45430766 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12188 NM_001286806 253512 Hs.591230 NM_001010875 ENSG00000174032 SLC25A30 KMCP1 solute carrier family 25 member 30 protein-coding 150.667-39 chr10 53287596 53287808 + 1 NA Intergenic Intergenic -516002 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 151.667-275 chr5 49599529 49599802 + 1 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite 841623 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 166.333-28 chr10 53757426 53757717 + 1 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -728659 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 187.333-216 chr9 122488462 122488750 + 1 NA Intergenic Intergenic -10680 NM_001004451 347168 Hs.632692 NM_001004451 ENSG00000136834 OR1J1 OR9-18|hg32 olfactory receptor family 1 subfamily J member 1 protein-coding 148.667-362 chr7 106182310 106182459 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -69808 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 161.667-251 chr8 85967644 85967928 + 1 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 101882 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 201.333-108 chr14 85057092 85057330 + 1 NA Intergenic Intergenic -214721 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 123.667-200 chrX 153362824 153363057 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 10911 NR_135656 105373378 Hs.719349 NR_135656 ENSG00000063587 LOC105373378 - uncharacterized LOC105373378 ncRNA 158.333-219 chr3 186346502 186346698 + 1 NA intron (NM_001346, intron 1 of 24) intron (NM_001346, intron 1 of 24) 15634 NM_001080744 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 158.333-302 chr7 71804084 71804330 + 1 NA intron (NM_001363460, intron 5 of 5) intron (NM_001363460, intron 5 of 5) -496437 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 382.333-20 chr8 121293971 121294427 + 1 NA Intergenic Intergenic -345147 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 229.667-65 chr4 123935939 123936439 + 1 NA Intergenic Intergenic 161925 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 258.667-56 chr21 30032658 30033112 + 1 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -92833 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 164.667-20 chr10 19134592 19134844 + 1 NA intron (NM_001142308, intron 9 of 39) intron (NM_001142308, intron 9 of 39) 85917 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 443.334 chr15 67425148 67425766 + 1 NA intron (NM_001322471, intron 11 of 13) AluSx4|SINE|Alu 95516 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 197.333-52 chr12 85860948 85861307 + 1 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -13168 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 149.333-389 chr8 66752123 66752354 + 1 NA intron (NM_001033578, intron 1 of 16) intron (NM_001033578, intron 1 of 16) 15796 NR_002734 26255 Hs.647156 NR_002734 ENSG00000213005 PTTG3P PTTG3|rcPTTG1 pituitary tumor-transforming 3, pseudogene pseudo 178.667-171 chr9 37876297 37876581 + 1 NA Intergenic Intergenic 27688 NM_033412 92014 Hs.634120 NM_033412 ENSG00000122696 SLC25A51 CG7943|MCART1 solute carrier family 25 member 51 protein-coding 260.333-47 chr5 11652674 11652989 + 1 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) L1MA9|LINE|L1 -63765 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 156.667-355 chr9 34232647 34232906 + 1 NA intron (NM_001171202, intron 2 of 5) intron (NM_001171202, intron 2 of 5) 53733 NM_016525 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 220.667-65 chr3 121685048 121685326 + 1 NA intron (NM_001256486, intron 14 of 21) HAL1|LINE|L1 -24284 NM_001292041 3059 Hs.14601 NM_005335 ENSG00000180353 HCLS1 CTTNL|HS1|lckBP1|p75 hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 protein-coding 178.333-24 chr10 97934631 97934846 + 1 NA intron (NM_001206528, intron 3 of 14) intron (NM_001206528, intron 3 of 14) -58841 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 173.667-142 chr5 75495985 75496261 + 1 NA intron (NM_031361, intron 2 of 16) L1ME1|LINE|L1 15506 NM_031361 10087 Hs.270437 NM_005713 ENSG00000113163 CERT1 CERT|CERTL|COL4A3BP|GPBP|MRD34|STARD11 ceramide transporter 1 protein-coding 159.667-347 chrX 82936858 82937017 + 1 NA Intergenic Intergenic -571353 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 160.667-321 chr9 13581927 13582113 + 1 NA Intergenic Intergenic -150691 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 157.333-102 chr14 30512064 30512280 + 1 NA intron (NR_151720, intron 3 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -46951 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 245.667-16 chr14 23683611 23683947 + 1 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 47415 NM_182908 10202 Hs.272499 NM_005794 ENSG00000100867 DHRS2 HEP27|SDR25C1 dehydrogenase/reductase 2 protein-coding 145.333-140 chr2 121013864 121014064 + 1 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 221683 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 206.667-13 chr10 12343073 12343431 + 1 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -6295 NM_020397 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 247.333-15 chr11 82490411 82490703 + 1 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -86644 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 188.333-132 chr6 128838180 128838379 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -44859 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 185.333-140 chr4 85544475 85544681 + 1 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) intron (NM_001025616, intron 1 of 9) 69428 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 236.667-3 chr1 48393058 48393446 + 1 NA intron (NM_019073, intron 8 of 12) L1MC4|LINE|L1 78952 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 189.333-21 chr1 189607324 189607513 + 1 NA Intergenic Intergenic 868592 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 173.667-68 chr2 25440410 25440730 + 1 NA intron (NM_033147, intron 12 of 19) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -97980 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 312.667-23 chr3 7100480 7100865 + 1 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) L1ME2|LINE|L1 -206655 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 222.333-96 chr8 123164220 123164672 + 1 NA intron (NM_001363151, intron 19 of 19) AluSz|SINE|Alu -14601 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 130.333-171 chr5 121732463 121732628 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -119337 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 355.667-2 chr11 13618353 13618919 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -50032 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 229.667-77 chr8 75895203 75895575 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 355421 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 246.667-24 chr13 53845981 53846272 + 1 NA intron (NR_047488, intron 4 of 5) intron (NR_047488, intron 4 of 5) 30707 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 192.333-67 chr17 19855656 19855940 + 1 NA intron (NM_014683, intron 3 of 26) intron (NM_014683, intron 3 of 26) 12138 NM_001142610 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 148.333-394 chr8 119265263 119265417 + 1 NA Intergenic Intergenic -18483 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 306.667-34 chr4 154395718 154396101 + 1 NA intron (NM_001358235, intron 1 of 19) intron (NM_001358235, intron 1 of 19) 95890 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 252.333-62 chr5 131388395 131388699 + 1 NA intron (NM_001038702, intron 3 of 4) intron (NM_001038702, intron 3 of 4) 124538 NM_001038702 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 124.667-112 chr2 158960663 158960800 + 1 NA Intergenic Intergenic -7903 NM_001350065 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 123.333-112 chr2 121255494 121255644 + 1 NA intron (NM_014553, intron 2 of 14) MIRb|SINE|MIR 29633 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 211.667-116 chr9 91339610 91339941 + 1 NA intron (NM_001698, intron 3 of 9) intron (NM_001698, intron 3 of 9) 22149 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 173.667-81 chr2 78346974 78347351 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -56431 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 148.333-121 chr14 55763914 55764203 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -2187 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 150.333-112 chr14 57191072 57191319 + 1 NA Intergenic Intergenic 77710 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 283.333-49 chr3 100098525 100098915 + 1 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) intron (NM_001042459, intron 1 of 4) 15793 NM_182909 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 151.333-394 chr7 82199905 82200194 + 1 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) L1ME2|LINE|L1 190872 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 153.667-93 chr12 66498350 66498549 + 1 NA intron (NM_001366722, intron 7 of 24) MIRb|SINE|MIR 180627 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 244.333-112 chr9 119775843 119776277 + 1 NA Intergenic Intergenic -159000 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 206.667-31 chr12 114950722 114951136 + 1 NA Intergenic Intergenic -266754 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 161.333-252 chr6 155636169 155636479 + 1 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 121480 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 212.333-78 chr2 193127421 193127749 + 1 NA Intergenic Intergenic 377740 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 174.333-81 chr22 43558126 43558434 + 1 NA intron (NM_198856, intron 24 of 29) L1M5|LINE|L1 42026 NR_046563 100874197 Hs.627997 NR_046563 EFCAB6-AS1 - EFCAB6 antisense RNA 1 ncRNA 216.667-14 chr10 100338533 100338884 + 1 NA Intergenic Intergenic -8480 NM_016112 9033 Hs.159241 NM_016112 ENSG00000107593 PKD2L1 PCL|PKD2L|PKDL|TRPP3 polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel protein-coding 170.333-112 chr2 105041477 105041766 + 1 NA intron (NM_182640, intron 1 of 10) intron (NM_182640, intron 1 of 10) -3125 NR_110603 102724691 Hs.606390 NR_110603 ENSG00000224509 LOC102724691 - uncharacterized LOC102724691 ncRNA 343.667-9 chr3 97760216 97760662 + 1 NA 3' UTR (NM_001080448, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001080448, exon 18 of 18) -4082 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 155.333-229 chr3 57632491 57632761 + 1 NA intron (NM_152678, intron 15 of 19) intron (NM_152678, intron 15 of 19) 34837 NR_132370 106144532 Hs.667207 NR_132369 ENSG00000272146 ARF4-AS1 - ARF4 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-135 chr16 59791003 59791205 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -35913 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 179.667-144 chr8 91681280 91681615 + 1 NA Intergenic Intergenic 336233 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 118.667-63 chr13 81270307 81270452 + 1 NA Intergenic Intergenic -43396 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 181.333-9 chr10 13481063 13481342 + 1 NA intron (NM_001370075, intron 4 of 8) intron (NM_001370075, intron 4 of 8) 21774 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 154.667-327 chr5 150839114 150839320 + 1 NA Intergenic Intergenic -7304 NM_001346557 345611 Hs.519680 NM_001145805 ENSG00000237693 IRGM IFI1|IRGM1|LRG-47|LRG47 immunity related GTPase M protein-coding 127.333-122 chr3 173335157 173335320 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -60714 NM_001365930 22871 Hs.478289 NM_014932 ENSG00000169760 NLGN1 NL1 neuroligin 1 protein-coding 112.333-277 chr9 78126986 78127162 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -95263 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 178.333-21 chr10 89773372 89773636 + 1 NA intron (NM_016195, intron 32 of 32) intron (NM_016195, intron 32 of 32) -55989 NR_038382 643529 Hs.618956 NR_038382 ENSG00000232229 LINC00865 - long intergenic non-protein coding RNA 865 ncRNA 123.667-73 chr17 60940414 60940582 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 13 of 25) intron (NM_001330413, intron 13 of 25) 262647 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 146.667-317 chr7 103060267 103060516 + 1 NA intron (NR_105043, intron 1 of 20) intron (NR_105043, intron 1 of 20) 14177 NM_145032 222235 Hs.660029 NM_145032 ENSG00000161040 FBXL13 DRC6|Fbl13 F-box and leucine rich repeat protein 13 protein-coding 162.667-70 chr13 47488039 47488227 + 1 NA Intergenic Intergenic 444489 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 153.667-146 chr16 28114869 28115126 + 1 NA intron (NM_001270940, intron 16 of 24) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -51283 NM_001323901 146395 Hs.91910 NM_144675 ENSG00000169181 GSG1L PRO19651 GSG1 like protein-coding 201.667-81 chr3 186348969 186349369 + 1 NA intron (NM_001346, intron 1 of 24) AluJb|SINE|Alu 13065 NM_001080744 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 139.333-148 chr3 79379677 79379826 + 1 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -31976 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 120.667-30 chr11 77766275 77766457 + 1 NA intron (NM_016578, intron 1 of 15) intron (NM_016578, intron 1 of 15) 54468 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 182.333-122 chr5 36487328 36487652 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -118865 NM_001166696 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 303.667-16 chr3 101843605 101844029 + 1 NA intron (NM_001005474, intron 2 of 12) Charlie1|DNA|hAT-Charlie -5697 NM_031419 64332 Hs.319171 NM_031419 ENSG00000144802 NFKBIZ IKBZ|INAP|MAIL NFKB inhibitor zeta protein-coding 189.667-83 chr2 227991776 227992134 + 1 NA intron (NM_030623, intron 8 of 10) intron (NM_030623, intron 8 of 10) 120324 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 218.667-41 chr18 22915709 22915974 + 1 NA Intergenic Intergenic -17487 NM_002894 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 262.667-12 chr10 81511229 81511689 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -363735 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 181.667-81 chr20 42397927 42398190 + 1 NA intron (NM_133170, intron 9 of 31) MIRb|SINE|MIR -287425 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 230.333-106 chr7 3246306 3246675 + 1 NA Intergenic Intergenic -54762 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 126.333-5 chr1 90110880 90111114 + 1 NA Intergenic Intergenic 115887 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 133.667-84 chr20 37198585 37198810 + 1 NA intron (NM_002951, intron 3 of 16) intron (NM_002951, intron 3 of 16) -19149 NM_213632 140699 Hs.349125 NM_152503 ENSG00000101353 MROH8 C20orf131|C20orf132 maestro heat like repeat family member 8 protein-coding 210.667-99 chr4 60076608 60076959 + 1 NA Intergenic Intergenic -845836 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 155.667-293 chr5 150327997 150328164 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -25175 NM_001012301 340075 Hs.591252 NM_001012301 ENSG00000183876 ARSI ASI|SPG66 arylsulfatase family member I protein-coding 196.333-72 chr18 1029023 1029314 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -101175 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 321.667-26 chrX 43760735 43761285 + 1 NA Intergenic Intergenic 106103 NM_000240 4128 Hs.183109 NM_000240 ENSG00000189221 MAOA BRNRS|MAO-A monoamine oxidase A protein-coding 233.333-75 chr21 16506163 16506571 + 1 NA intron (NR_136546, intron 2 of 2) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -29205 NR_136547 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 152.667-395 chr9 32009482 32009679 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -375023 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 151.667-37 chr10 16845695 16845866 + 1 NA intron (NM_001081, intron 60 of 66) intron (NM_001081, intron 60 of 66) -28326 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 116.667-111 chr20 56288786 56288936 + 1 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 40129 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 183.667-104 chr4 71218985 71219293 + 1 NA intron (NM_001098484, intron 1 of 25) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 31853 NM_001134742 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 144.667-256 chr6 20456967 20457208 + 1 NA intron (NM_001243076, intron 1 of 6) intron (NM_001243076, intron 1 of 6) 53408 NM_001243076 1871 Hs.269408 NM_001949 ENSG00000112242 E2F3 E2F-3 E2F transcription factor 3 protein-coding 166.333-78 chr15 57414062 57414250 + 1 NA intron (NM_032866, intron 1 of 18) intron (NM_032866, intron 1 of 18) 37651 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 157.667-355 chr9 74470266 74470524 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26940 NM_006914 6096 Hs.494178 NM_006914 ENSG00000198963 RORB EIG15|NR1F2|ROR-BETA|RZR-BETA|RZRB|bA133M9.1 RAR related orphan receptor B protein-coding 152.667-369 chr8 72989866 72990142 + 1 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -18860 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 157.667-231 chr5 16493717 16493891 + 1 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) intron (NM_001034850, intron 3 of 8) 15194 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 167.333-56 chr11 42436618 42436845 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -183041 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 154.333-67 chr12 12641614 12641768 + 1 NA intron (NM_001310, intron 3 of 3) intron (NM_001310, intron 3 of 3) 29815 NM_001310 1389 Hs.591156 NM_001310 ENSG00000111269 CREBL2 - cAMP responsive element binding protein like 2 protein-coding 125.667-163 chr6 36161299 36161545 + 1 NA Intergenic Intergenic 30909 NM_002754 5603 Hs.178695 NM_002754 ENSG00000156711 MAPK13 MAPK 13|MAPK-13|PRKM13|SAPK4|p38delta mitogen-activated protein kinase 13 protein-coding 206.333-146 chr7 39216449 39216693 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 4 of 9) L1ME1|LINE|L1 112563 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 146.667-282 chr6 78963573 78963821 + 1 NA intron (NM_017934, intron 29 of 39) intron (NM_017934, intron 29 of 39) 96146 NM_001010844 134728 Hs.656212 NM_001010844 ENSG00000146243 IRAK1BP1 AIP70|SIMPL interleukin 1 receptor associated kinase 1 binding protein 1 protein-coding 218.667-69 chr3 157831900 157832346 + 1 NA Intergenic Intergenic 274040 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 181.333-157 chr7 10250984 10251251 + 1 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -451559 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 140.333-54 chr12 129223758 129223938 + 1 NA intron (NM_133448, intron 4 of 8) HAL1ME|LINE|L1 15247 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 156.667-296 chr6 47032232 47032411 + 1 NA intron (NM_153840, intron 1 of 14) intron (NM_153840, intron 1 of 14) 10011 NM_153840 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 156.333-272 chr4 140325318 140325627 + 1 NA intron (NR_033939, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 -17971 NM_001153446 60592 Hs.480815 NM_032547 ENSG00000153130 SCOC HRIHFB2072|SCOCO|UNC-69 short coiled-coil protein protein-coding 139.667-182 chr8 49331242 49331396 + 1 NA Intergenic Intergenic 180861 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 162.333-29 chr10 56406298 56406510 + 1 NA Intergenic Intergenic -45131 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 223.667-43 chr21 31019804 31020053 + 1 NA Intergenic MamGypLTR1c|LTR|Gypsy 18548 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 245.667-78 chr9 24797888 24798450 + 1 NA Intergenic Intergenic -252272 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 142.333-56 chr12 29561005 29561167 + 1 NA intron (NM_001367875, intron 11 of 19) intron (NM_001367875, intron 11 of 19) -61393 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 306.333-21 chr17 81992324 81992884 + 1 NA intron (NR_045351, intron 3 of 14) intron (NR_045351, intron 3 of 14) 14975 NR_045351 79058 Hs.298351 NM_024083 ENSG00000169696 ASPSCR1 ASPCR1|ASPL|ASPS|RCC17|TUG|UBXD9|UBXN9 ASPSCR1 tether for SLC2A4, UBX domain containing protein-coding 125.667-13 chr1 154957941 154958124 + 1 NA 3' UTR (NM_138300, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_138300, exon 3 of 3) -1933 NM_020524 57326 Hs.505806 NM_020524 ENSG00000163346 PBXIP1 HPIP PBX homeobox interacting protein 1 protein-coding 273.333-77 chr9 135044808 135045158 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -30522 NM_006334 10439 Hs.522484 NM_006334 ENSG00000130558 OLFM1 AMY|NOE1|NOELIN1|OlfA olfactomedin 1 protein-coding 269.333-94 chr9 34226653 34226980 + 1 NA intron (NM_001171202, intron 2 of 5) L1MCc|LINE|L1 47773 NM_016525 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 189.667-26 chr11 77079101 77079328 + 1 NA intron (NM_004055, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu 12243 NM_004055 726 Hs.248153 NM_004055 ENSG00000149260 CAPN5 ADNIV|HTRA3|VRNI|nCL-3 calpain 5 protein-coding 147.667-374 chr8 130384155 130384355 + 1 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) intron (NM_001247996, intron 2 of 30) 59405 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 148.333-115 chr14 35749959 35750162 + 1 NA intron (NM_014990, intron 9 of 40) intron (NM_014990, intron 9 of 40) 12871 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 168.333-186 chr6 150384420 150384642 + 1 NA intron (NM_001318495, intron 1 of 4) intron (NM_001318495, intron 1 of 4) 15519 NR_134655 389434 Hs.310225 NM_203395 ENSG00000009765 IYD C6orf71|DEHAL1|IYD-1|TDH4 iodotyrosine deiodinase protein-coding 161.333-280 chr8 61835846 61836153 + 1 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -53840 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 195.667-48 chr15 27396563 27396859 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) L1ME1|LINE|L1 -235392 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 300.333-46 chr7 96994608 96995030 + 1 NA intron (NR_015448, intron 1 of 2) intron (NR_015448, intron 1 of 2) -10734 NM_005222 1750 Hs.249196 NM_005222 ENSG00000006377 DLX6 - distal-less homeobox 6 protein-coding 113.333-114 chr19 33348143 33348358 + 1 NA Intergenic Intergenic -25459 NM_001806 1054 Hs.429666 NM_001806 ENSG00000153879 CEBPG GPE1BP|IG/EBP-1 CCAAT enhancer binding protein gamma protein-coding 154.333-323 chr7 48667447 48667732 + 1 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -256958 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 172.667-20 chr10 33785783 33786133 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -13278 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 154.667-140 chr17 53794288 53794543 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -28512 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 200.333-29 chr12 32450743 32451064 + 1 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) intron (NM_001370298, intron 1 of 16) -35069 NM_001330374 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 158.667-285 chr6 41115158 41115340 + 1 NA intron (NR_026938, intron 6 of 22) AluSx|SINE|Alu 14215 NR_026938 221442 Hs.374076 NM_001010871 ENSG00000161912 ADCY10P1 - ADCY10 pseudogene 1 pseudo 202.667-14 chr10 12398172 12398488 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 2 of 11) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 9348 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 165.667-217 chr9 103616664 103616915 + 1 NA Intergenic Intergenic -291756 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 206.667-64 chr2 110774141 110774561 + 1 NA intron (NM_001371254, intron 2 of 18) L2a|LINE|L2 41778 NM_001371254 271.667-46 chr3 102343481 102344004 + 1 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -91273 NM_001329788 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 152.333-309 chr5 108354148 108354395 + 1 NA intron (NM_001163315, intron 3 of 8) L1MC1|LINE|L1 27827 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 236.333-66 chr3 186446705 186447138 + 1 NA Intergenic Charlie14a|DNA|hAT-Charlie 6576 NR_151708 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 324.667-7 chr12 80644058 80644509 + 1 NA intron (NM_001145026, intron 35 of 44) intron (NM_001145026, intron 35 of 44) -63351 NM_002469 4618 Hs.35937 NM_002469 ENSG00000111046 MYF6 CNM3|MRF4|bHLHc4|myf-6 myogenic factor 6 protein-coding 274.333-46 chr22 24903825 24904331 + 1 NA intron (NM_001098498, intron 19 of 23) MIR|SINE|MIR 42617 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 152.667-29 chr10 6572676 6572845 + 1 NA intron (NM_001323265, intron 1 of 17) L1PA10|LINE|L1 7516 NM_001323266 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 130.667-156 chr4 93950981 93951146 + 1 NA Intergenic Intergenic 122310 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 178.333-2 chr1 32127767 32128104 + 1 NA intron (NM_012316, intron 1 of 13) intron (NM_012316, intron 1 of 13) 19879 NM_012316 23633 Hs.470588 NM_012316 ENSG00000025800 KPNA6 IPOA7|KPNA7 karyopherin subunit alpha 6 protein-coding 324.667-40 chr8 89812625 89812955 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 54974 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 148.667-45 chr10 53424259 53424407 + 1 NA Intergenic Intergenic -652633 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 152.667-211 chr2 212473713 212473881 + 1 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) -47437 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 140.667-99 chr18 2054491 2054670 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 516925 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 157.667-359 chr9 116096458 116096694 + 1 NA Intergenic Intergenic -57215 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 190.333-71 chr2 100006624 100006939 + 1 NA exon (NM_002285, exon 6 of 24) exon (NM_002285, exon 6 of 24) 98802 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 179.667-19 chr10 61255900 61256223 + 1 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -196578 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 122.333-101 chr2 104747519 104747767 + 1 NA intron (NR_038231, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 10076 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 178.667-19 chr10 35062690 35062943 + 1 NA intron (NM_003591, intron 3 of 20) AluJb|SINE|Alu 11467 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 153.333-344 chr5 133547855 133548135 + 1 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) MER21C|LTR|ERVL 64546 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 234.667-101 chr7 11340639 11341186 + 1 NA Intergenic Intergenic 367040 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 114.667-166 chr22 30997711 30997957 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 28623 NR_152871 55000 Hs.554829 NR_002323 ENSG00000253352 TUG1 LINC00080|NCRNA00080|TI-227H taurine up-regulated 1 ncRNA 150.333-92 chr13 32727303 32727461 + 1 NA intron (NM_015032, intron 19 of 34) L1MEf|LINE|L1 140930 NM_015032 23047 Hs.744901 NM_015032 ENSG00000083642 PDS5B APRIN|AS3|CG008 PDS5 cohesin associated factor B protein-coding 188.333-45 chr14 56464348 56464695 + 1 NA Intergenic LTR45B|LTR|ERV1 -49810 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 219.333-39 chr12 42438031 42438517 + 1 NA intron (NM_016488, intron 9 of 12) L1MC2|LINE|L1 45341 NM_001144881 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 150.333-415 chr8 115336424 115336690 + 1 NA Intergenic Intergenic 331456 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 134.667-37 chr11 87249415 87249569 + 1 NA intron (NR_033149, intron 5 of 13) L1MA3|LINE|L1 211558 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 114.667-229 chr6 136654887 136655034 + 1 NA intron (NM_005923, intron 10 of 29) L1ME3G|LINE|L1 25846 NR_125858 101928461 Hs.666518 NR_125858 LOC101928461 - uncharacterized LOC101928461 ncRNA 180.667-141 chr8 6960655 6961038 + 1 NA promoter-TSS (NR_073408) promoter-TSS (NR_073408) -685 NR_073408 449492 Hs.552565 NR_073408 ENSG00000233238 DEFA9P DEFAP2 defensin alpha 9, pseudogene pseudo 144.333-185 chr4 33066937 33067129 + 1 NA Intergenic Intergenic 715995 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 231.667-30 chr2 57967538 57967829 + 1 NA intron (NM_001288838, intron 1 of 15) MIR3|SINE|MIR 60032 NM_001288837 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 183.667-59 chr16 53676939 53677285 + 1 NA intron (NM_001127897, intron 6 of 24) intron (NM_001127897, intron 6 of 24) 26747 NM_015272 23322 Hs.298382 NM_015272 ENSG00000103494 RPGRIP1L CORS3|FTM|JBTS7|MKS5|NPHP8|PPP1R134 RPGRIP1 like protein-coding 171.667-95 chr20 15227915 15228155 + 1 NA intron (NM_001033087, intron 1 of 13) intron (NM_001033087, intron 1 of 13) 31195 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 144.667-187 chr3 8630483 8630666 + 1 NA intron (NR_046358, intron 7 of 12) intron (NR_046358, intron 7 of 12) 14224 NR_046358 51066 Hs.736935 NM_015931 ENSG00000125046 SSUH2 C3orf32|SSU-2|fls485 ssu-2 homolog protein-coding 464.667-3 chr2 138865066 138866007 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -31788 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 141.667-140 chr3 19433126 19433388 + 1 NA intron (NM_144633, intron 7 of 15) intron (NM_144633, intron 7 of 15) -118326 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 148.667-349 chr7 33571258 33571536 + 1 NA intron (NR_145411, intron 22 of 23) intron (NR_145411, intron 22 of 23) -333518 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 161.333-263 chr7 53059410 53059589 + 1 NA Intergenic Intergenic 23866 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 230.333-107 chr7 13646318 13646784 + 1 NA Intergenic Intergenic 339963 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 125.667-3 chr1 24647331 24647518 + 1 NA non-coding (NR_159385, exon 4 of 19) non-coding (NR_159385, exon 4 of 19) 3845 NM_001366596 10250 Hs.18192 NM_005839 ENSG00000133226 SRRM1 160-KD|POP101|SRM160 serine and arginine repetitive matrix 1 protein-coding 125.667-117 chr3 7081089 7081274 + 1 NA intron (NM_000844, intron 1 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -187164 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 151.667-11 chr1 77156157 77156364 + 1 NA intron (NM_005482, intron 8 of 10) intron (NM_005482, intron 8 of 10) 63170 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 150.667-100 chr13 57408880 57409033 + 1 NA Intergenic Intergenic -222788 NM_001040429 27253 Hs.106511 NM_014459 ENSG00000118946 PCDH17 PCDH68|PCH68 protocadherin 17 protein-coding 146.333-65 chr12 112141788 112141960 + 1 NA intron (NM_006700, intron 5 of 11) MIRb|SINE|MIR 16314 NM_006700 10906 Hs.5148 NM_006700 ENSG00000135148 TRAFD1 FLN29 TRAF-type zinc finger domain containing 1 protein-coding 201.667-14 chr11 45358356 45358690 + 1 NA Intergenic Intergenic 3152 NR_120558 101928812 Hs.444059 NR_120557 ENSG00000254427 LINC02696 - long intergenic non-protein coding RNA 2696 ncRNA 143.333-160 chr21 16876795 16877019 + 1 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 286670 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 137.333-34 chr12 34424160 34424357 + 1 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 401762 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 222.667-88 chr7 42043863 42044184 + 1 NA intron (NM_000168, intron 6 of 14) intron (NM_000168, intron 6 of 14) 193186 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 211.667-18 chr10 52562462 52562827 + 1 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) -92111 NR_120641 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 156.667-6 chr1 46372956 46373157 + 1 NA Intergenic MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR -21261 NM_001441 2166 Hs.720143 NM_001441 ENSG00000117480 FAAH FAAH-1|PSAB fatty acid amide hydrolase protein-coding 204.667-127 chr5 118427857 118428154 + 1 NA intron (NR_104610, intron 9 of 9) intron (NR_104610, intron 9 of 9) 134112 NR_104610 101927280 Hs.543951 NR_104610 LINC02208 HRAT56 long intergenic non-protein coding RNA 2208 ncRNA 125.333-125 chr4 89639820 89639973 + 1 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -196505 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 178.667-123 chr4 111639551 111639868 + 1 NA Intergenic (AAAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -505745 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 277.333-41 chr18 72311708 72312158 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 232409 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 142.333-152 chr3 11200277 11200455 + 1 NA intron (NM_001098212, intron 1 of 1) intron (NM_001098212, intron 1 of 1) -25615 NM_001098211 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 148.333-48 chr10 61616710 61616877 + 1 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -46136 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 142.333-63 chr12 118001294 118001532 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15248 NM_001346815 5985 Hs.731908 NM_007370 ENSG00000111445 RFC5 RFC36 replication factor C subunit 5 protein-coding 251.667-23 chr14 71534613 71534994 + 1 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) intron (NM_001354289, intron 5 of 23) 46942 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 123.333-145 chr3 89827745 89827967 + 1 NA Intergenic L5|LINE|RTE-X 720235 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 242.667-86 chr5 94448122 94448444 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 13 of 20) X7A_LINE|LINE|CR1 170321 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 163.667-246 chr8 46806313 46806555 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 -34452 NR_027012 497634 Hs.406982 NR_027012 LINC00293 BEYLA|NCRNA00293 long intergenic non-protein coding RNA 293 ncRNA 234.333-72 chr7 16394688 16394964 + 1 NA intron (NM_001101426, intron 2 of 9) intron (NM_001101426, intron 2 of 9) 26712 NR_160656 729920 Hs.636502 NM_001101417 ENSG00000214960 CRPPA ISPD|LGMDR20|MDDGA7|MDDGC7|Nip|hISPD CDP-L-ribitol pyrophosphorylase A protein-coding 226.333-36 chr15 63166293 63166557 + 1 NA Intergenic Intergenic -8948 NM_015920 51065 Hs.108957 NM_015920 ENSG00000185088 RPS27L - ribosomal protein S27 like protein-coding 141.667-99 chr17 78696997 78697198 + 1 NA intron (NM_004762, intron 9 of 12) intron (NM_004762, intron 9 of 12) 19935 NM_001292019 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 154.333-186 chr20 49067252 49067505 + 1 NA intron (NM_001362762, intron 6 of 24) intron (NM_001362762, intron 6 of 24) 21066 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 187.667-115 chr5 17704384 17704662 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -48885 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 154.667-362 chr7 36409511 36409799 + 1 NA intron (NM_001284302, intron 5 of 22) intron (NM_001284302, intron 5 of 22) -19298 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 229.667-81 chr8 133524276 133524526 + 1 NA intron (NM_003033, intron 2 of 8) intron (NM_003033, intron 2 of 8) 47486 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 158.333-311 chr8 42709866 42710052 + 1 NA intron (NM_001347717, intron 3 of 6) intron (NM_001347717, intron 3 of 6) 12583 NM_001347717 1142 Hs.654576 NM_000749 ENSG00000147432 CHRNB3 - cholinergic receptor nicotinic beta 3 subunit protein-coding 204.667-85 chr20 36659954 36660332 + 1 NA intron (NM_032013, intron 13 of 15) AluSc8|SINE|Alu -13947 NM_032214 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 178.667-89 chr2 234217671 234217868 + 1 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 167067 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 148.667-329 chr6 36056701 36056889 + 1 NA intron (NM_139012, intron 2 of 11) intron (NM_139012, intron 2 of 11) 28987 NM_139013 1432 Hs.485233 NM_001315 ENSG00000112062 MAPK14 CSBP|CSBP1|CSBP2|CSPB1|EXIP|Mxi2|PRKM14|PRKM15|RK|SAPK2A|p38|p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 protein-coding 242.667-113 chr9 116709573 116709978 + 1 NA intron (NM_014010, intron 15 of 21) LTR53-int|LTR|ERVL 22470 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 209.333-45 chr12 31605351 31605666 + 1 NA intron (NR_046909, intron 2 of 2) intron (NR_046909, intron 2 of 2) -14372 NM_144973 160518 Hs.118166 NM_144973 ENSG00000170456 DENND5B - DENN domain containing 5B protein-coding 257.667-3 chr1 214282689 214283147 + 1 NA intron (NM_020197, intron 1 of 11) intron (NM_020197, intron 1 of 11) 1759 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 190.667-30 chr12 42129847 42130177 + 1 NA intron (NM_173601, intron 1 of 7) intron (NM_173601, intron 1 of 7) 14862 NM_173601 283464 Hs.259347 NM_173601 ENSG00000151233 GXYLT1 GLT8D3 glucoside xylosyltransferase 1 protein-coding 133.333-146 chr5 45680482 45680705 + 1 NA intron (NM_021072, intron 1 of 7) intron (NM_021072, intron 1 of 7) 15787 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 142.667-73 chr16 23842924 23843213 + 1 NA intron (NM_002738, intron 2 of 16) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 7085 NM_212535 5579 Hs.460355 NM_002738 ENSG00000166501 PRKCB PKC-beta|PKCB|PKCI(2)|PKCbeta|PRKCB1|PRKCB2 protein kinase C beta protein-coding 191.667-52 chr15 74675549 74675921 + 1 NA intron (NM_025083, intron 1 of 6) AluY|SINE|Alu 20289 NM_001351378 80153 Hs.96852 NM_025083 ENSG00000179151 EDC3 LSM16|MRT50|YJDC|YJEFN2|hYjeF_N2-15q23 enhancer of mRNA decapping 3 protein-coding 181.333-110 chr4 30219514 30219732 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -500746 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 160.333-279 chr8 86050563 86050868 + 1 NA intron (NM_033126, intron 2 of 2) intron (NM_033126, intron 2 of 2) 18953 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 159.667-277 chr5 173869738 173869966 + 1 NA Intergenic Intergenic -18497 NM_001308189 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 195.333-31 chr10 57960606 57960895 + 1 NA Intergenic Intergenic 307144 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 156.667-77 chr12 28133729 28133924 + 1 NA Intergenic Intergenic -56630 NM_001352084 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 156.333-34 chr10 47092101 47092421 + 1 NA Intergenic Intergenic 180539 NM_001352524 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 173.667-125 chr3 183682739 183683095 + 1 NA non-coding (NR_146169, exon 6 of 6) non-coding (NR_146169, exon 6 of 6) -14880 NM_001351371 55689 Hs.632575 NM_018023 ENSG00000163872 YEATS2 - YEATS domain containing 2 protein-coding 147.667-180 chr2 99953782 99954003 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 151691 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 188.333-109 chr4 65615595 65615883 + 1 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) L1MD2|LINE|L1 53749 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 174.667-29 chr11 26087577 26087833 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -101418 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 165.333-37 chr10 128536708 128536931 + 1 NA Intergenic Intergenic 250869 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 222.333-89 chr7 54575506 54575760 + 1 NA Intergenic Intergenic 18663 NR_038994 285878 Hs.335933 NR_038994 ENSG00000224223 VSTM2A-OT1 GS1-18A18.1 VSTM2A overlapping transcript 1 ncRNA 215.667-43 chr16 50328399 50328746 + 1 NA intron (NM_013263, intron 9 of 16) intron (NM_013263, intron 9 of 16) 35956 NR_106829 102465462 NR_106829 ENSG00000274969 MIR6771 hsa-mir-6771 microRNA 6771 ncRNA 195.667-132 chr7 80427575 80427770 + 1 NA Intergenic Intergenic -53233 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 216.333-55 chr16 48148446 48148755 + 1 NA Intergenic Intergenic -1830 NM_033226 94160 Hs.410111 NM_033226 ENSG00000140798 ABCC12 MRP9 ATP binding cassette subfamily C member 12 protein-coding 135.333-151 chr5 134937526 134937673 + 1 NA intron (NM_032151, intron 2 of 3) intron (NM_032151, intron 2 of 3) -30308 NM_178019 347732 Hs.631804 NM_178019 ENSG00000152705 CATSPER3 CACRC cation channel sperm associated 3 protein-coding 208.667-27 chr10 125455922 125456199 + 1 NA Intergenic Intergenic -118311 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 212.333-127 chr6 91284665 91285030 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -236813 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 225.333-55 chr14 87220590 87220899 + 1 NA Intergenic Intergenic 314966 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 145.667-31 chr10 25560063 25560240 + 1 NA intron (NM_020752, intron 6 of 10) intron (NM_020752, intron 6 of 10) -91561 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 205.333-180 chr5 12607230 12607692 + 1 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) AluSz6|SINE|Alu 32604 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 150.667-349 chr7 10036084 10036290 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 401917 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 134.333-61 chr15 69564061 69564219 + 1 NA intron (NR_026979, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 2420 NR_026979 145837 Hs.410126 NR_026979 DRAIC - downregulated RNA in cancer, inhibitor of cell invasion and migration ncRNA 151.333-152 chr15 77149675 77149943 + 1 NA intron (NM_024776, intron 6 of 7) AluJb|SINE|Alu 75595 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 263.333-66 chr4 94666480 94666968 + 1 NA 3' UTR (NM_001256425, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001256425, exon 12 of 12) 90809 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 154.333-342 chr8 101262028 101262212 + 1 NA Intergenic Intergenic -56056 NM_001267709 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 141.333-62 chr14 26607434 26607696 + 1 NA intron (NR_147061, intron 1 of 6) intron (NR_147061, intron 1 of 6) 8918 NR_147061 102725045 Hs.143441 NR_147061 LINC02588 C14orf22|NOVA1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2588 ncRNA 307.333-36 chr18 31189815 31190262 + 1 NA Intergenic Intergenic -27182 NM_004948 1823 Hs.567260 NM_004948 ENSG00000134765 DSC1 CDHF1|DG2/DG3 desmocollin 1 protein-coding 119.333-164 chr4 137782703 137782938 + 1 NA Intergenic Intergenic 237089 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 232.333-59 chr3 148011715 148012148 + 1 NA Intergenic Intergenic -66228 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 245.667-34 chr2 119028853 119029144 + 1 NA Intergenic Intergenic 86829 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 234.667-84 chr4 105121477 105121872 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -24201 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 152.667-223 chr20 33444931 33445223 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1185 NM_003098 6640 Hs.31121 NM_003098 ENSG00000101400 SNTA1 LQT12|SNT1|TACIP1|dJ1187J4.5 syntrophin alpha 1 protein-coding 226.333-14 chr11 28057093 28057593 + 1 NA TTS (NR_030341) TTS (NR_030341) 528 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 135.667-140 chr5 28789175 28789320 + 1 NA Intergenic Intergenic -137623 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 204.667-93 chr22 49588477 49588730 + 1 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) intron (NR_110523, intron 1 of 4) -45137 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 140.333-76 chr16 24531562 24531785 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -7893 NM_006910 5930 Hs.188553 NM_006910 ENSG00000122257 RBBP6 MY038|P2P-R|PACT|RBQ-1|SNAMA RB binding protein 6, ubiquitin ligase protein-coding 173.333-141 chr4 44052589 44052802 + 1 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 35633 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 141.667-130 chr20 40914657 40914915 + 1 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -65927 NR_145524 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 143.333-216 chr5 13595223 13595384 + 1 NA Intergenic L1M6B|LINE|L1 349177 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 217.667-15 chr10 75054857 75055143 + 1 NA intron (NM_001003892, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 3583 NM_001003892 338599 Hs.535090 NM_001003892 ENSG00000188716 DUPD1 DUSP27|FMDSP dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 protein-coding 153.667-238 chr22 34949038 34949220 + 1 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) L1PA17|LINE|L1 48787 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 121.333-48 chr14 21906790 21906958 + 1 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -235857 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 187.667-67 chr2 59941511 59941855 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 441353 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 197.333-6 chr1 113097485 113097776 + 1 NA intron (NM_014813, intron 8 of 17) intron (NM_014813, intron 8 of 17) 24432 NM_001312686 9860 Hs.448972 NM_014813 ENSG00000198799 LRIG2 LIG-2|LIG2|UFS2 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 protein-coding 255.333-113 chr8 117225724 117226251 + 1 NA Intergenic Intergenic 90992 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 150.667-330 chr6 45069936 45070132 + 1 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 127736 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 136.333-140 chr4 26436219 26436377 + 1 NA Intergenic Intergenic 54186 NM_000730 886 Hs.129 NM_000730 ENSG00000163394 CCKAR CCK-A|CCK1-R|CCK1R|CCKRA cholecystokinin A receptor protein-coding 300.333-43 chr7 52447107 52447713 + 1 NA Intergenic Intergenic -588223 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 177.333-128 chr5 8983848 8984069 + 1 NA Intergenic Intergenic 69937 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 186.333-50 chr14 56646844 56647171 + 1 NA intron (NM_017799, intron 15 of 15) intron (NM_017799, intron 15 of 15) 67209 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 211.667-95 chr5 148796974 148797272 + 1 NA Intergenic Intergenic -29470 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 275.333-34 chr2 105183374 105183751 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 39449 NR_136172 105373984 Hs.570237 NR_136172 ENSG00000226508 LINC01918 - long intergenic non-protein coding RNA 1918 ncRNA 150.667-259 chr4 47428043 47428229 + 1 NA Intergenic Intergenic 35566 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 157.333-133 chr16 53872094 53872303 + 1 NA intron (NR_156761, intron 3 of 4) L1MEf|LINE|L1 -167195 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 278.667-8 chr11 87501141 87501650 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 218016 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 216.333-139 chr8 99256939 99257181 + 1 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) intron (NM_017890, intron 17 of 61) 243794 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 137.667-133 chr3 192635385 192635537 + 1 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 92080 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 164.333-75 chr15 61942984 61943158 + 1 NA intron (NM_001018088, intron 45 of 81) L1PA16|LINE|L1 117376 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 153.667-86 chr12 21504234 21504480 + 1 NA intron (NM_016072, intron 1 of 4) intron (NM_016072, intron 1 of 4) 2568 NM_016072 51026 Hs.62275 NM_016072 ENSG00000111711 GOLT1B CGI-141|GCT2|GOT1|GOT1B|YMR292W golgi transport 1B protein-coding 206.667-69 chr2 182500699 182501018 + 1 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) 21668 NM_005019 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 194.333-98 chr4 75935010 75935371 + 1 NA intron (NM_001363719, intron 3 of 8) intron (NM_001363719, intron 3 of 8) 5823 NM_001363719 27163 Hs.437365 NM_014435 ENSG00000138744 NAAA ASAHL|PLT N-acylethanolamine acid amidase protein-coding 156.667-112 chr14 78553034 78553264 + 1 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 149430 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 174.667-84 chr2 73252348 73252593 + 1 NA intron (NM_001009570, intron 6 of 6) intron (NM_001009570, intron 6 of 6) 18162 NM_006429 10574 Hs.368149 NM_006429 ENSG00000135624 CCT7 CCTETA|CCTH|NIP7-1|TCP1ETA chaperonin containing TCP1 subunit 7 protein-coding 212.667-92 chr3 115457445 115457793 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -165891 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 204.333-172 chr6 44779161 44779497 + 1 NA Intergenic Intergenic -227448 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 195.667-104 chr5 14800326 14800612 + 1 NA intron (NM_054027, intron 1 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 25543 NR_039780 100616271 NR_039780 ENSG00000264792 MIR4637 - microRNA 4637 ncRNA 391.667 chr1 6724536 6725218 + 1 NA intron (NR_104620, intron 1 of 1) MER130|DNA|DNA 132 NR_104620 100505887 Hs.250839 NR_104620 LINC01672 NMR long intergenic non-protein coding RNA 1672 ncRNA 151.333-184 chr18 76692006 76692243 + 1 NA intron (NR_122073, intron 1 of 1) intron (NR_122073, intron 1 of 1) 2095 NR_122073 400661 Hs.514963 NR_122073 ENSG00000276397 LINC01879 - long intergenic non-protein coding RNA 1879 ncRNA 156.333-387 chrX 76713737 76714027 + 1 NA intron (NR_110400, intron 1 of 3) intron (NR_110400, intron 1 of 3) 205478 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 129.667-103 chr2 159426305 159426486 + 1 NA intron (NM_001329858, intron 12 of 36) intron (NM_001329858, intron 12 of 36) -139692 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 230.667-69 chr6 55052357 55052657 + 1 NA Intergenic Intergenic -53953 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 142.667-163 chr4 96716267 96716519 + 1 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 405690 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 230.333-57 chr2 39029370 39029841 + 1 NA intron (NM_005633, intron 8 of 22) AluJb|SINE|Alu -69261 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 194.667-10 chr1 152034736 152034995 + 1 NA intron (NM_005620, intron 1 of 2) intron (NM_005620, intron 1 of 2) 2139 NM_005620 6282 Hs.417004 NM_005620 ENSG00000163191 S100A11 HEL-S-43|MLN70|S100C S100 calcium binding protein A11 protein-coding 221.333-49 chr18 3301253 3301638 + 1 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 38726 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 270.333-18 chr13 44799997 44800326 + 1 NA non-coding (NR_038433, exon 3 of 3) non-coding (NR_038433, exon 3 of 3) 9469 NR_038433 144817 Hs.585616 NR_038433 ENSG00000235097 LINC00330 NCRNA00330 long intergenic non-protein coding RNA 330 ncRNA 274.333-56 chr6 68682755 68683177 + 1 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) AluSx1|SINE|Alu 47684 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 248.333-87 chr5 158330203 158330646 + 1 NA intron (NR_109888, intron 5 of 6) L1MC2|LINE|L1 79349 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 219.333-32 chr11 25659630 25659882 + 1 NA Intergenic Intergenic -529367 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 178.333-40 chr12 87311132 87311393 + 1 NA Intergenic Intergenic -19477 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 318.667-6 chr10 99477612 99477979 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -47171 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 163.333-127 chr18 1999301 1999598 + 1 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 572056 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 118.333-167 chr5 89748340 89748495 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 268303 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 187.333-172 chr5 180732916 180733313 + 1 NA Intergenic Intergenic 6944 NM_001001657 134083 Hs.554719 NM_001001657 ENSG00000174339 OR2Y1 OR5-2 olfactory receptor family 2 subfamily Y member 1 protein-coding 248.667-92 chr6 89110771 89111246 + 1 NA intron (NM_080743, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 7063 NM_080743 135295 Hs.254414 NM_080743 ENSG00000154548 SRSF12 SFRS13B|SFRS19|SRrp35 serine and arginine rich splicing factor 12 protein-coding 170.333-85 chr16 20396845 20397018 + 1 NA intron (NM_174924, intron 2 of 11) intron (NM_174924, intron 2 of 11) 7806 NM_174924 204474 Hs.376025 NM_174924 ENSG00000169340 PDILT PDIA7 protein disulfide isomerase like, testis expressed protein-coding 260.667-69 chr5 17139549 17139888 + 1 NA intron (NR_027253, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 16274 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 163.667-29 chr10 87717810 87718042 + 1 NA intron (NM_004670, intron 7 of 11) intron (NM_004670, intron 7 of 11) 58048 NM_001015880 9060 Hs.524491 NM_004670 ENSG00000198682 PAPSS2 ATPSK2|BCYM4|SK2 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2 protein-coding 137.333-15 chr10 17635359 17635568 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 8455 NR_110370 102723166 Hs.547311 NR_110370 ENSG00000260589 STAM-AS1 locus3182 STAM antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 287.333-5 chr10 36518662 36519013 + 1 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -607020 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 161.667-47 chr11 114060227 114060531 + 1 NA promoter-TSS (NM_001018011) intron (NM_006006, intron 1 of 6) -128 NM_001018011 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 200.667-129 chr5 88286655 88287045 + 1 NA intron (NR_105019, intron 3 of 7) L3|LINE|CR1 17834 NR_105019 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 247.667-83 chr5 175554857 175555298 + 1 NA Intergenic MER61B|LTR|ERV1 76517 NM_001322977 94081 Hs.369440 NM_022754 ENSG00000164466 SFXN1 SLC56A1|TCC sideroflexin 1 protein-coding 294.667-31 chr21 29567686 29568222 + 1 NA intron (NM_000830, intron 14 of 16) intron (NM_000830, intron 14 of 16) -28086 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 232.667-42 chr20 32017124 32017409 + 1 NA intron (NM_080625, intron 2 of 8) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 6828 NM_080625 140706 Hs.382151 NM_080625 ENSG00000101331 CCM2L C20orf160|dJ310O13.5 CCM2 like scaffold protein protein-coding 248.333-32 chr15 88408299 88408830 + 1 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 58824 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 231.333-93 chr5 123485651 123486024 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -26262 NM_001031812 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 173.667-95 chr20 17464708 17464922 + 1 NA intron (NM_002594, intron 10 of 11) L1ME3A|LINE|L1 66564 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 156.667-225 chr3 81135721 81135926 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 141955 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 202.333-99 chr2 181626707 181627001 + 1 NA intron (NR_027690, intron 1 of 11) intron (NR_027690, intron 1 of 11) 30251 NM_201548 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 200.667-44 chr14 59041489 59041867 + 1 NA Intergenic Intergenic -146989 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 257.333-57 chr20 7785311 7785568 + 1 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 155019 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 119.667-147 chr5 30744805 30745032 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -448768 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 122.333-47 chr12 100072787 100073015 + 1 NA intron (NM_001006947, intron 11 of 12) intron (NM_001006947, intron 11 of 12) 69973 NM_015054 23074 Hs.572154 NM_015054 ENSG00000111647 UHRF1BP1L SHIP164 UHRF1 binding protein 1 like protein-coding 169.333-48 chr12 26499676 26499958 + 1 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 304244 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 158.667-255 chr4 167664161 167664406 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -428254 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 155.333-305 chr5 119925051 119925358 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 295645 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 151.667-99 chr13 100190271 100190466 + 1 NA intron (NR_148031, intron 6 of 22) intron (NR_148031, intron 6 of 22) 101275 NR_148027 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 151.333-410 chr8 63977312 63977533 + 1 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 207992 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 225.667-88 chrX 70809279 70809635 + 1 NA intron (NM_001003811, intron 9 of 30) HAL1|LINE|L1 36838 NR_145758 109617015 NR_145758 ENSG00000280704 SNORD3E - small nucleolar RNA, C/D box 3E snoRNA 189.667-117 chr5 119273668 119274001 + 1 NA intron (NM_001077654, intron 1 of 1) intron (NM_001077654, intron 1 of 1) 5075 NM_001077654 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 159.333-217 chr3 108325492 108325692 + 1 NA intron (NM_001282557, intron 1 of 9) intron (NM_001282557, intron 1 of 9) 13807 NM_001282557 11148 Hs.225968 NM_007072 ENSG00000114455 HHLA2 B7-H5|B7-H7|B7H7|B7y HERV-H LTR-associating 2 protein-coding 319.333-20 chr20 25347502 25348030 + 1 NA intron (NM_001042472, intron 1 of 12) intron (NM_001042472, intron 1 of 12) 43069 NM_001042472 26090 Hs.441550 NM_015600 ENSG00000100997 ABHD12 ABHD12A|BEM46L2|C20orf22|PHARC|dJ965G21.2|hABHD12 abhydrolase domain containing 12 protein-coding 154.333-350 chr8 120470571 120470838 + 1 NA intron (NM_022045, intron 10 of 21) intron (NM_022045, intron 10 of 21) 25285 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 152.667-313 chr5 174161479 174161778 + 1 NA Intergenic Intergenic 115922 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 201.667-127 chr9 8232790 8233224 + 1 NA Intergenic Intergenic -433229 NM_001318058 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 114.333-96 chr19 27967122 27967288 + 1 NA intron (NR_146734, intron 5 of 7) L1PA13|LINE|L1 -173265 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 228.333-113 chrX 103584585 103585083 + 1 NA promoter-TSS (NM_024863) promoter-TSS (NM_024863) -651 NM_001305841 79921 Hs.194329 NM_024863 ENSG00000133142 TCEAL4 NPD017|WEX7 transcription elongation factor A like 4 protein-coding 181.333-124 chr4 65143176 65143368 + 1 NA Intergenic Intergenic -138772 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 339.667-8 chr18 73077869 73078296 + 1 NA Intergenic Intergenic 186416 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 162.667-224 chr5 90805712 90805922 + 1 NA intron (NR_003149, intron 72 of 89) intron (NR_003149, intron 72 of 89) 247020 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 151.667-369 chr8 92147227 92147431 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -43944 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 167.667-78 chr17 1911868 1912050 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 81954 NM_001355121 6117 Hs.461925 NM_002945 ENSG00000132383 RPA1 HSSB|MST075|REPA1|RF-A|RP-A|RPA70 replication protein A1 protein-coding 146.333-251 chr5 28948179 28948351 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 21395 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 250.667-41 chr2 177147088 177147404 + 1 NA Intergenic Intergenic 65165 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 162.667-68 chr13 30081999 30082163 + 1 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 26794 NR_046998 100874146 Hs.574116 NR_046998 ENSG00000224511 LINC00365 - long intergenic non-protein coding RNA 365 ncRNA 128.667-183 chr8 90802580 90802790 + 1 NA intron (NM_022351, intron 2 of 12) intron (NM_022351, intron 2 of 12) 10910 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 189.333-27 chr10 56842055 56842324 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 462370 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 253.333-4 chr1 173144318 173144756 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 60995 NM_001297562 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 155.333-199 chr20 39574430 39574655 + 1 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -349794 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 143.667-127 chr2 37013240 37013519 + 1 NA intron (NM_019024, intron 27 of 35) intron (NM_019024, intron 27 of 35) -46843 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 261.333-103 chr8 91206405 91206728 + 1 NA intron (NM_001354470, intron 3 of 3) intron (NM_001354470, intron 3 of 3) 1081 NR_039805 100616245 NR_039805 ENSG00000266194 MIR4661 - microRNA 4661 ncRNA 206.667-19 chr10 103319805 103320257 + 1 NA intron (NM_001011663, intron 8 of 9) AluSc|SINE|Alu 31109 NM_032154 84108 Hs.335808 NM_032154 ENSG00000156374 PCGF6 MBLR|RNF134 polycomb group ring finger 6 protein-coding 282.667-41 chr6 69743490 69743950 + 1 NA intron (NM_001367272, intron 5 of 15) intron (NM_001367272, intron 5 of 15) 52746 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 322.667-15 chr21 20251036 20251588 + 1 NA Intergenic Intergenic 7373 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 180.667-45 chr15 80354481 80354687 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -12779 NR_033833 283688 Hs.525933 NR_033833 ENSG00000259361 LINC00927 - long intergenic non-protein coding RNA 927 ncRNA 143.333-250 chr6 134337064 134337237 + 1 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -19092 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 236.667-94 chr9 14631193 14631577 + 1 NA intron (NR_148717, intron 9 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 62047 NM_001354126 340481 Hs.649522 NM_178566 ENSG00000175893 ZDHHC21 DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097 zinc finger DHHC-type containing 21 protein-coding 141.667-220 chr8 46844523 46844784 + 1 NA intron (NR_027012, intron 4 of 11) BSR/Beta|Satellite|Satellite 3767 NR_027012 497634 Hs.406982 NR_027012 LINC00293 BEYLA|NCRNA00293 long intergenic non-protein coding RNA 293 ncRNA 149.333-225 chr22 33784337 33784576 + 1 NA intron (NM_001362953, intron 1 of 14) intron (NM_001362953, intron 1 of 14) 59470 NR_038950 100506195 Hs.658872 NR_038949 ENSG00000224973 LARGE-AS1 - LARGE antisense RNA 1 ncRNA 388.333-11 chr20 61539882 61540696 + 1 NA intron (NM_001252338, intron 1 of 14) intron (NM_001252338, intron 1 of 14) 40868 NM_001252338 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 175.333-189 chr8 102759563 102759907 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -47087 NR_149020 401472 NR_149020 GASAL1 GASL1 growth arrest associated lncRNA 1 ncRNA 217.333-154 chr8 115053264 115053510 + 1 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 614626 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 294.667-35 chr3 195158505 195158998 + 1 NA intron (NM_152531, intron 2 of 3) intron (NM_152531, intron 2 of 3) 10880 NR_102711 101410543 Hs.658170 NR_102710 ENSG00000230266 XXYLT1-AS2 - XXYLT1 antisense RNA 2 ncRNA 135.333-84 chr2 46585176 46585352 + 1 NA TTS (NM_012249) TTS (NM_012249) -5026 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 155.667-154 chr2 25167336 25167607 + 1 NA intron (NM_001319204, intron 1 of 3) intron (NM_001319204, intron 1 of 3) 1109 NM_001319204 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 162.333-243 chr8 26759420 26759660 + 1 NA intron (NM_001322502, intron 1 of 1) intron (NM_001322502, intron 1 of 1) 106115 NM_033304 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 160.333-253 chr6 108419379 108419695 + 1 NA intron (NM_145315, intron 7 of 12) intron (NM_145315, intron 7 of 12) 124483 NM_145315 246269 Hs.259666 NM_145315 ENSG00000135537 AFG1L AFG1|LACE1|c222389 AFG1 like ATPase protein-coding 119.667-107 chr22 40933571 40933796 + 1 NA TTS (NM_022098) TTS (NM_022098) -17695 NM_014248 9978 Hs.474949 NM_014248 ENSG00000100387 RBX1 BA554C12.1|RNF75|ROC1 ring-box 1 protein-coding 149.667-432 chrX 22931148 22931387 + 1 NA intron (NR_073010, intron 3 of 11) intron (NR_073010, intron 3 of 11) -68693 NM_182699 168400 Hs.434416 NM_182699 ENSG00000184735 DDX53 CAGE|CT26 DEAD-box helicase 53 protein-coding 121.333-2 chr1 14417276 14417452 + 1 NA intron (NR_149058, intron 1 of 4) intron (NR_149058, intron 1 of 4) 2609 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 138.667-72 chr15 66467529 66467698 + 1 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) AluSx1|SINE|Alu 29421 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 172.333-76 chr18 77899277 77899513 + 1 NA Intergenic Intergenic 94332 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 212.667-70 chr2 46662073 46662468 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -36690 NM_014011 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 249.333-50 chr2 32630566 32630869 + 1 NA intron (NM_017735, intron 2 of 19) intron (NM_017735, intron 2 of 19) 2667 NM_017735 55622 Hs.468125 NM_017735 ENSG00000018699 TTC27 - tetratricopeptide repeat domain 27 protein-coding 136.333-84 chr18 39611649 39611818 + 1 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) intron (NR_024391, intron 2 of 3) 10442 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 173.667-53 chr15 60419702 60419973 + 1 NA non-coding (NR_147171, exon 17 of 17) non-coding (NR_147171, exon 17 of 17) -21851 NM_004039 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 147.333-264 chr5 74546782 74546985 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -9907 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 165.333-198 chr4 163891656 163891926 + 1 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) -278257 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 253.667-55 chr5 51876038 51876478 + 1 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -131773 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 130.667-15 chr1 184358310 184358477 + 1 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -28636 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 145.333-281 chr7 89767688 89767871 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -351621 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 217.667-14 chr10 62215877 62216174 + 1 NA intron (NM_145307, intron 9 of 11) intron (NM_145307, intron 9 of 11) 52819 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 159.667-116 chr15 93912401 93912710 + 1 NA intron (NR_120320, intron 8 of 8) intron (NR_120320, intron 8 of 8) 11854 NR_120323 101927129 Hs.652658 NR_120322 ENSG00000258785 LINC01580 - long intergenic non-protein coding RNA 1580 ncRNA 204.333-64 chr15 70874676 70875059 + 1 NA intron (NM_001284357, intron 2 of 16) L2a|LINE|L2 17566 NM_020147 56906 Hs.591123 NM_020147 ENSG00000129028 THAP10 - THAP domain containing 10 protein-coding 164.333-255 chrX 77052965 77053144 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -38522 NR_110406 101928469 Hs.640805 NR_110400 ENSG00000280870 MIR325HG MIR384HG MIR325 host gene ncRNA 162.667-280 chr8 119324165 119324418 + 1 NA promoter-TSS (NR_106755) promoter-TSS (NR_106755) -880 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 166.667-24 chr10 51749505 51749795 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -50055 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 167.333-146 chr2 203111791 203112036 + 1 NA intron (NM_001114132, intron 14 of 54) intron (NM_001114132, intron 14 of 54) 97034 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 130.667-100 chr19 13302518 13302734 + 1 NA intron (NM_001127222, intron 17 of 46) intron (NM_001127222, intron 17 of 46) 152215 NM_004907 9592 Hs.501629 NM_004907 ENSG00000160888 IER2 ETR101 immediate early response 2 protein-coding 159.667-107 chr15 47805157 47805410 + 1 NA intron (NR_120336, intron 3 of 4) intron (NR_120336, intron 3 of 4) 40953 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 146.333-182 chr21 26510146 26510389 + 1 NA intron (NR_135516, intron 3 of 3) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 63019 NM_052954 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 204.333-131 chr3 127897134 127897574 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17878 NM_207335 166348 Hs.132087 NM_207335 ENSG00000187715 KBTBD12 KLHDC6 kelch repeat and BTB domain containing 12 protein-coding 178.667-45 chr13 88943425 88943633 + 1 NA Intergenic AluSq4|SINE|Alu -291762 NR_047025 100874172 Hs.569291 NR_047025 LINC00440 - long intergenic non-protein coding RNA 440 ncRNA 152.667-325 chr6 53577675 53577832 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4478 NR_110840 101927136 Hs.509788 NR_110840 ENSG00000231683 LOC101927136 - uncharacterized LOC101927136 ncRNA 175.667-74 chr2 123919124 123919311 + 1 NA Intergenic Intergenic 105957 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 182.333-67 chr18 28830333 28830593 + 1 NA Intergenic Intergenic -653333 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 209.667-55 chr18 293709 294079 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -25847 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 149.333-421 chr9 28197376 28197638 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1M5|LINE|L1 521798 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 148.667-188 chr2 64906904 64907063 + 1 NA intron (NR_036586, intron 1 of 2) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 25464 NR_036586 400958 Hs.591565 NR_036586 LINC02245 - long intergenic non-protein coding RNA 2245 ncRNA 206.333-155 chr8 8962635 8963017 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -40071 NM_001354636 90459 Hs.20000 NM_153332 ENSG00000104626 ERI1 3'HEXO|HEXO|THEX1 exoribonuclease 1 protein-coding 196.667-67 chr2 5526727 5526991 + 1 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 164259 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 205.667-19 chr10 114057252 114057522 + 1 NA Intergenic Intergenic 13521 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 215.333-48 chr13 76227370 76227729 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -292417 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 159.667-136 chr17 61099521 61099771 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 268058 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 146.667-35 chr10 52166984 52167169 + 1 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 147052 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 159.667-331 chr8 126186794 126187013 + 1 NA Intergenic Intergenic -138592 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 171.333-89 chr2 134143563 134143875 + 1 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) intron (NM_001371457, intron 1 of 16) 16594 NR_037450 100500878 NR_037450 ENSG00000263813 MIR3679 mir-3679 microRNA 3679 ncRNA 272.667-10 chr10 115065573 115065995 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -27581 NM_001276282 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 176.333-106 chr22 44021415 44021737 + 1 NA intron (NM_001003828, intron 2 of 13) MER21B|LTR|ERVL -2701 NM_013327 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 183.333-58 chr16 11845549 11845886 + 1 NA intron (NM_015659, intron 5 of 8) intron (NM_015659, intron 5 of 8) 5825 NM_015659 26156 Hs.401842 NM_015659 ENSG00000171490 RSL1D1 CSIG|L12|PBK1|UTP30 ribosomal L1 domain containing 1 protein-coding 307.333-83 chr9 30528832 30529244 + 1 NA Intergenic Intergenic -120584 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 137.667-189 chr8 124555034 124555275 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 14 of 14) intron (NM_001282971, intron 14 of 14) 16031 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 151.333-325 chr5 14260690 14260921 + 1 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) intron (NM_007118, intron 1 of 56) 117463 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 229.333-60 chr2 27858152 27858514 + 1 NA intron (NM_022128, intron 2 of 7) L1MB5|LINE|L1 -30376 NM_001329112 9577 Hs.258314 NM_004899 ENSG00000158019 BABAM2 BRCC4|BRCC45|BRE BRISC and BRCA1 A complex member 2 protein-coding 188.333-173 chrX 87197688 87198090 + 1 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -319913 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 125.333-3 chr1 55095518 55095695 + 1 NA intron (NM_015306, intron 50 of 67) intron (NM_015306, intron 50 of 67) 55384 NR_110451 255738 Hs.18844 NM_174936 ENSG00000169174 PCSK9 FH3|HCHOLA3|LDLCQ1|NARC-1|NARC1|PC9 proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 protein-coding 166.333-8 chr1 73657797 73657975 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -16793 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 192.667-18 chr1 233074219 233074431 + 1 NA intron (NM_014801, intron 23 of 33) AluYa5|SINE|Alu 123483 NR_138027 84284 Hs.642715 NM_032324 ENSG00000135778 NTPCR C1orf57|HCR-NTPase|THEP1 nucleoside-triphosphatase, cancer-related protein-coding 179.333-190 chr8 137156602 137156802 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 256886 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 140.333-151 chr3 135708152 135708356 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -257474 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 163.667-264 chr9 94103172 94103468 + 1 NA intron (NM_152422, intron 7 of 8) MIRb|SINE|MIR 18856 NM_001253829 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 337.333-26 chr21 24081115 24081671 + 1 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 239984 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 207.333-8 chr1 82878233 82878562 + 1 NA Intergenic Intergenic -24786 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 198.333-203 chr9 28190042 28190262 + 1 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 529153 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 293.667-37 chr22 28190733 28191099 + 1 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -268953 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 156.667-96 chr14 24732619 24732888 + 1 NA Intergenic Intergenic -98563 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 208.667-112 chr5 96119867 96120290 + 1 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 40940 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 163.667-151 chr3 45748447 45748642 + 1 NA Intergenic Intergenic 47992 NM_020208 54716 Hs.413095 NM_020208 ENSG00000163817 SLC6A20 SIT1|XT3|Xtrp3 solute carrier family 6 member 20 protein-coding 180.333-114 chr7 5749427 5749652 + 1 NA intron (NM_207111, intron 3 of 16) MER31-int|LTR|ERV1 32124 NM_207111 54476 Hs.487458 NM_019011 ENSG00000011275 RNF216 CAHH|TRIAD3|U7I1|UBCE7IP1|ZIN ring finger protein 216 protein-coding 130.333-46 chr11 69232223 69232487 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -60793 NR_104161 338694 Hs.564235 NR_104161 ENSG00000261070 LOC338694 - uncharacterized LOC338694 ncRNA 152.333-37 chr10 17206893 17207137 + 1 NA Intergenic Intergenic -4944 NM_001351223 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 155.333-286 chr5 34979316 34979491 + 1 NA Intergenic Intergenic 49810 NM_194283 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 170.667-11 chr1 213387309 213387500 + 1 NA Intergenic Intergenic 336163 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 228.333-70 chr4 145774093 145774453 + 1 NA intron (NM_178835, intron 11 of 14) intron (NM_178835, intron 11 of 14) 94069 NM_001080531 646603 NM_001080531 ENSG00000237136 C4orf51 - chromosome 4 open reading frame 51 protein-coding 211.333-87 chr17 59312613 59312848 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18925 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 162.333-268 chr9 14719813 14720075 + 1 NA 3' UTR (NM_005454, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_005454, exon 2 of 2) 2789 NM_005454 9350 Hs.248204 NM_005454 ENSG00000147869 CER1 DAND4 cerberus 1, DAN family BMP antagonist protein-coding 206.333-169 chr9 9240752 9241107 + 1 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) LTR49-int|LTR|ERV1 382911 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 211.333-178 chr5 14343656 14344017 + 1 NA intron (NM_007118, intron 11 of 56) L1MD2|LINE|L1 -120147 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 155.667-20 chr1 152445107 152445332 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -30956 NM_016190 49860 Hs.242057 NM_016190 ENSG00000143536 CRNN C1orf10|DRC1|PDRC1|SEP53 cornulin protein-coding 122.333-191 chr7 32459769 32459911 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -1346 NR_038454 100130673 Hs.609282 NR_038454 LOC100130673 - phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 2 pseudogene pseudo 226.333-63 chr2 122328248 122328709 + 1 NA Intergenic Intergenic 572827 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 246.667-49 chr20 43359844 43360136 + 1 NA Intergenic Intergenic -97906 NR_034009 6431 Hs.684950 NM_006275 ENSG00000124193 SRSF6 B52|HEL-S-91|SFRS6|SRP55 serine and arginine rich splicing factor 6 protein-coding 171.667-12 chr1 183345194 183345378 + 1 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) MSTC|LTR|ERVL-MaLR -40412 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 158.333-230 chr4 72007741 72007992 + 1 NA Intergenic Intergenic -23938 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 145.667-119 chr18 6864753 6864967 + 1 NA intron (NM_001010000, intron 4 of 16) AluJo|SINE|Alu 30375 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 147.333-185 chr20 7937719 7937958 + 1 NA intron (NM_017545, intron 1 of 7) intron (NM_017545, intron 1 of 7) 2620 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 174.333-120 chr5 94417932 94418291 + 1 NA intron (NM_001145678, intron 14 of 20) intron (NM_001145678, intron 14 of 20) 200493 NM_001145678 285600 Hs.425123 NM_173665 ENSG00000185261 KIAA0825 C5orf36 KIAA0825 protein-coding 154.333-62 chr11 62511537 62511710 + 1 NA intron (NM_024060, intron 4 of 5) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 34041 NM_001346446 79026 Hs.502756 NM_001620 ENSG00000124942 AHNAK AHNAKRS|PM227 AHNAK nucleoprotein protein-coding 276.333-18 chr16 47518467 47518805 + 1 NA intron (NM_001031835, intron 7 of 31) intron (NM_001031835, intron 7 of 31) 57305 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 287.667-19 chr18 1846254 1846612 + 1 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR -486804 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 207.333-77 chr13 81495329 81495635 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -268499 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 238.667-53 chr20 55182682 55183015 + 1 NA Intergenic Intergenic -240195 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 241.667-8 chr1 215037833 215038267 + 1 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) L1MEj|LINE|L1 32508 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 144.333-250 chr7 93902136 93902354 + 1 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL -4322 NM_021955 2792 Hs.732212 NM_021955 ENSG00000127928 GNGT1 GNG1 G protein subunit gamma transducin 1 protein-coding 162.667-148 chr2 185277787 185277973 + 1 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -110808 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 207.333-272 chr8 124487436 124487750 + 1 NA TTS (NR_027427) TTS (NR_027427) 12826 NM_007218 11236 Hs.744151 NM_007218 ENSG00000170881 RNF139 HRCA1|RCA1|TRC8 ring finger protein 139 protein-coding 157.333-9 chr1 64015277 64015475 + 1 NA intron (NM_005012, intron 2 of 8) intron (NM_005012, intron 2 of 8) 96829 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 125.667-45 chr12 42745715 42745882 + 1 NA Intergenic Intergenic 53582 NR_135028 105369739 Hs.126660 NR_135028 ENSG00000257114 LINC02450 - long intergenic non-protein coding RNA 2450 ncRNA 160.667-126 chr18 2046612 2046824 + 1 NA Intergenic Intergenic 524787 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 162.667-233 chr6 13157334 13157541 + 1 NA intron (NM_001322308, intron 4 of 13) L2b|LINE|L2 126005 NR_134859 100130357 Hs.484678 NM_001242698 LOC100130357 - uncharacterized LOC100130357 ncRNA 152.667-270 chr4 42205964 42206226 + 1 NA Intergenic CR1-16_AMi|LINE|CR1 -53440 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 207.333-28 chr10 55876172 55876537 + 1 NA Intergenic Intergenic -248412 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 194.667-69 chr2 115316138 115316412 + 1 NA intron (NM_001321909, intron 2 of 24) intron (NM_001321909, intron 2 of 24) 7038 NM_001321907 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 200.333-22 chr11 86318887 86319102 + 1 NA non-coding (NR_136324, exon 3 of 6) non-coding (NR_136324, exon 3 of 6) 16754 NR_136324 51501 Hs.283322 NM_016401 ENSG00000149196 HIKESHI C11orf73|HLD13|HSPC138|HSPC179|L7RN6|OPI10 heat shock protein nuclear import factor hikeshi protein-coding 122.333-143 chr3 150443588 150443832 + 1 NA intron (NR_130136, intron 3 of 4) intron (NR_130136, intron 3 of 4) 35412 NM_014779 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 183.667-106 chr4 73857170 73857516 + 1 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 4047 NM_002620 5197 Hs.72933 NM_002620 ENSG00000109272 PF4V1 CXCL4L1|CXCL4V1|PF4-ALT|PF4A|SCYB4V1 platelet factor 4 variant 1 protein-coding 177.667-101 chr4 116975364 116975719 + 1 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 110035 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 149.667-258 chr3 88530516 88530676 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 192140 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 163.667-218 chr6 134415864 134416103 + 1 NA Intergenic Intergenic -21733 NR_038216 154092 Hs.223718 NR_038216 LINC01010 - long intergenic non-protein coding RNA 1010 ncRNA 152.667-13 chr1 114723397 114723704 + 1 NA intron (NM_001007553, intron 16 of 19) intron (NM_001007553, intron 16 of 19) -6779 NM_002524 4893 Hs.486502 NM_002524 ENSG00000213281 NRAS ALPS4|CMNS|N-ras|NCMS|NRAS1|NS6 NRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 388.667-9 chr3 20895174 20895774 + 1 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -510252 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 141.667-98 chr17 69381655 69381824 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -32958 NM_002758 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 182.333-160 chr8 119493846 119494172 + 1 NA Intergenic Intergenic 77563 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 151.667-343 chr7 103510763 103510984 + 1 NA exon (NM_173054, exon 51 of 64) exon (NM_173054, exon 51 of 64) -64666 NM_206885 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 216.667-79 chr4 62560795 62561118 + 1 NA Intergenic Intergenic -399191 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 282.333-64 chrX 50007554 50008113 + 1 NA promoter-TSS (NR_030224) promoter-TSS (NR_030224) -598 NR_030224 574502 NR_030224 ENSG00000207785 MIR500A MIR500|MIRN500|hsa-mir-500|hsa-mir-500a|mir-500a microRNA 500a ncRNA 143.667-207 chr6 2891895 2892049 + 1 NA exon (NM_004155, exon 6 of 7) exon (NM_004155, exon 6 of 7) 7984 NR_110841 101927730 Hs.104879 NR_110841 LOC101927730 - uncharacterized LOC101927730 ncRNA 189.667-77 chr2 155001028 155001302 + 1 NA Intergenic Intergenic 302470 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 171.667-171 chr8 124579179 124579447 + 1 NA intron (NM_001363294, intron 6 of 13) L1MB7|LINE|L1 40190 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 151.667-149 chr17 82123441 82123612 + 1 NA intron (NM_001367828, intron 16 of 16) L1ME4b|LINE|L1 -25290 NM_004104 2194 Hs.83190 NM_004104 ENSG00000169710 FASN FAS|OA-519|SDR27X1 fatty acid synthase protein-coding 204.333-10 chr1 108944125 108944467 + 1 NA intron (NM_001048210, intron 4 of 11) AluJr4|SINE|Alu 6152 NM_001278202 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 177.333-177 chr9 20825928 20826213 + 1 NA intron (NM_017794, intron 17 of 45) intron (NM_017794, intron 17 of 45) 39143 NR_145762 109616992 NR_145762 ENSG00000202189 SNORA30B - small nucleolar RNA, H/ACA box 30B snoRNA 181.667-8 chr1 233895595 233895829 + 1 NA Intergenic Intergenic -8964 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 267.333-12 chr10 56202894 56203496 + 1 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 158064 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 216.333-93 chr22 30271928 30272406 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5316 NM_020530 5008 Hs.248156 NM_020530 ENSG00000099985 OSM - oncostatin M protein-coding 159.333-343 chr8 139479092 139479343 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 223906 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 302.333-12 chr11 97089414 97090050 + 1 NA Intergenic Intergenic 581307 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 125.333-23 chr10 36831968 36832198 + 1 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -293774 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 230.333-41 chr15 19984828 19985309 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -297676 NR_038836 646096 Hs.448789 NR_038836 ENSG00000259156 CHEK2P2 - checkpoint kinase 2 pseudogene 2 pseudo 158.667-342 chr9 29988573 29988792 + 1 NA Intergenic Intergenic 419772 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 198.333-94 chr2 62985965 62986403 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 15 of 22) intron (NM_001142615, intron 15 of 22) 61527 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 176.333-145 chr6 43588662 43588962 + 1 NA intron (NM_006502, intron 4 of 10) intron (NM_006502, intron 4 of 10) 12627 NM_001291970 5429 Hs.655467 NM_006502 ENSG00000170734 POLH RAD30|RAD30A|XP-V|XPV DNA polymerase eta protein-coding 141.667-176 chr5 40846913 40847157 + 1 NA intron (NM_032587, intron 2 of 2) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 5668 NM_032587 84674 Hs.200242 NM_032587 ENSG00000132357 CARD6 CINCIN1 caspase recruitment domain family member 6 protein-coding 119.667-8 chr1 67137043 67137244 + 1 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -2173 NM_001276351 400757 Hs.666621 NM_001013674 ENSG00000203963 C1orf141 - chromosome 1 open reading frame 141 protein-coding 242.667-19 chr11 18573048 18573384 + 1 NA intron (NM_001261382, intron 2 of 10) intron (NM_001261382, intron 2 of 10) 6302 NM_001261385 55293 Hs.407991 NM_018314 ENSG00000151116 UEVLD ATTP|UEV3 UEV and lactate/malate dehyrogenase domains protein-coding 289.333-31 chr2 170304849 170305261 + 1 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) L1ME3G|LINE|L1 45888 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 125.333-9 chr1 97489322 97489489 + 1 NA intron (NM_000110, intron 13 of 22) intron (NM_000110, intron 13 of 22) -307516 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 281.667-23 chr17 60712679 60713197 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) LTR48B|LTR|ERV1 35087 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 243.667-36 chr2 52986147 52986692 + 1 NA Intergenic Intergenic -283804 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 153.667-66 chr11 41608011 41608282 + 1 NA Intergenic Intergenic -106422 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 198.333-32 chr11 65283363 65283632 + 1 NA intron (NM_002689, intron 10 of 17) AluSg|SINE|Alu 21535 NM_002689 23649 Hs.201897 NM_002689 ENSG00000014138 POLA2 - DNA polymerase alpha 2, accessory subunit protein-coding 207.667-26 chr12 54650695 54651011 + 1 NA Intergenic Intergenic -2488 NM_001300854 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 144.667-2 chr1 38529514 38529688 + 1 NA Intergenic Intergenic 54405 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 250.667-77 chr8 60447115 60447508 + 1 NA Intergenic Intergenic -33493 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 172.333-194 chr9 68986175 68986358 + 1 NA intron (NM_001278253, intron 13 of 13) L1MB8|LINE|L1 -10425 NR_110647 101927069 Hs.663405 NR_110647 LOC101927069 - uncharacterized LOC101927069 ncRNA 250.667-7 chr10 48312267 48312558 + 1 NA intron (NM_001323327, intron 2 of 12) intron (NM_001323327, intron 2 of 12) 5735 NM_001323320 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 217.667-63 chr4 31483812 31484095 + 1 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -22591 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 302.667-27 chr5 36888586 36889031 + 1 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) intron (NM_015384, intron 1 of 45) 12039 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 144.667-318 chr9 15364036 15364257 + 1 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -56786 NM_001168341 158219 Hs.563630 NM_152574 ENSG00000155158 TTC39B C9orf52 tetratricopeptide repeat domain 39B protein-coding 209.667-85 chr3 134216313 134216604 + 1 NA intron (NM_001005861, intron 2 of 14) intron (NM_001005861, intron 2 of 14) 34286 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 189.667-29 chr11 126846816 126847161 + 1 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) MER41-int|LTR|ERV1 -93758 NR_046986 100874251 Hs.319053 NR_046986 ENSG00000254960 KIRREL3-AS2 - KIRREL3 antisense RNA 2 ncRNA 169.333-286 chr9 81281343 81281654 + 1 NA Intergenic Intergenic 408037 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 201.667-52 chr2 21389558 21389840 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 265713 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 156.667-113 chr14 89323785 89324064 + 1 NA intron (NM_001085471, intron 3 of 6) MIR|SINE|MIR 93309 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 223.667-19 chr14 66716263 66716631 + 1 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) L1PBa|LINE|L1 209040 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 197.667-27 chr11 90676573 90676894 + 1 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -120876 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 207.333-248 chr7 15288465 15288818 + 1 NA intron (NM_001004320, intron 12 of 12) intron (NM_001004320, intron 12 of 12) 273374 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 148.667-26 chr1 216320291 216320497 + 1 NA intron (NM_206933, intron 9 of 71) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 103002 NM_007123 7399 Hs.655974 NM_007123 ENSG00000042781 USH2A RP39|US2|USH2|dJ1111A8.1 usherin protein-coding 194.667-117 chr5 20509006 20509300 + 1 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) L1MA8|LINE|L1 66560 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 138.667-157 chr4 163610059 163610214 + 1 NA intron (NM_017923, intron 1 of 3) intron (NM_017923, intron 1 of 3) 3398 NM_017923 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 137.667-136 chr4 30109168 30109351 + 1 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -611110 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 155.333-155 chr2 8144872 8145100 + 1 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) intron (NR_034135, intron 7 of 8) -168172 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 152.667-190 chr2 107816542 107816773 + 1 NA intron (NR_126370, intron 3 of 4) MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 10112 NR_024439 729121 Hs.386155 NR_024439 ENSG00000230651 RGPD4-AS1 - RGPD4 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 137.667-126 chr3 95506824 95507041 + 1 NA Intergenic Intergenic 176261 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 165.333-42 chr11 41925810 41926058 + 1 NA Intergenic Intergenic 159524 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 186.333-121 chr5 23480170 23480402 + 1 NA Intergenic Intergenic -27323 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 220.667-57 chr20 25006245 25006555 + 1 NA 3' UTR (NM_001252675, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001252675, exon 14 of 14) -13649 NM_020531 57136 Hs.472330 NM_020531 ENSG00000101474 APMAP BSCv|C20orf3 adipocyte plasma membrane associated protein protein-coding 152.667-144 chr18 1062275 1062499 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -134394 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 161.333-222 chr4 129486653 129486935 + 1 NA Intergenic Intergenic 284684 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 144.667-217 chr4 59449219 59449394 + 1 NA Intergenic Intergenic 435733 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 138.333-174 chr6 137578168 137578363 + 1 NA Intergenic Intergenic -83871 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 171.667-13 chr1 219235892 219236156 + 1 NA Intergenic Intergenic 61055 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 117.667-172 chr6 147360525 147360675 + 1 NA intron (NM_139244, intron 21 of 25) intron (NM_139244, intron 21 of 25) -148090 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 208.667-82 chr21 20289236 20289519 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -30692 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 174.333-34 chr13 71926065 71926267 + 1 NA Intergenic Intergenic -58962 NM_080759 1602 Hs.129452 NM_004392 ENSG00000276644 DACH1 DACH dachshund family transcription factor 1 protein-coding 225.333-81 chr2 144646587 144646964 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -21192 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 140.667-154 chr3 186415681 186415893 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -24558 NR_151710 107986164 Hs.131227 NR_151708 ENSG00000234548 LINC02020 - long intergenic non-protein coding RNA 2020 ncRNA 186.333-160 chr8 55594651 55594925 + 1 NA Intergenic Intergenic -73810 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 150.667-323 chr5 180838475 180838671 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -6955 NR_045680 100859930 Hs.655606 NR_045680 ENSG00000278970 HEIH HCCAT2|LINC-HEIH|LINC00848|lncRNA-HEIH hepatocellular carcinoma up-regulated EZH2-associated long non-coding RNA ncRNA 222.333-95 chr8 108336346 108336663 + 1 NA Intergenic Intergenic -87787 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 158.333-295 chr7 30970131 30970357 + 1 NA intron (NM_000823, intron 4 of 12) intron (NM_000823, intron 4 of 12) 6291 NM_000823 2692 Hs.767 NM_000823 ENSG00000106128 GHRHR GHRFR|GRFR|IGHD1B|IGHD4 growth hormone releasing hormone receptor protein-coding 159.333-48 chr10 77084721 77084890 + 1 NA intron (NM_001271519, intron 11 of 28) intron (NM_001271519, intron 11 of 28) -56026 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 111.667-90 chr15 69804105 69804271 + 1 NA Intergenic Intergenic -31046 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 187.667-84 chr20 63127345 63127731 + 1 NA Intergenic Intergenic -25219 NR_003245 768097 Hs.635159 NR_003245 ENSG00000231133 HAR1B HAR1R|LINC00065|NCRNA00065 highly accelerated region 1B ncRNA 243.333-90 chr5 73644685 73645031 + 1 NA intron (NM_001177693, intron 1 of 35) intron (NM_001177693, intron 1 of 35) 18700 NM_001080479 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 154.667-245 chr3 106083301 106083489 + 1 NA Intergenic Intergenic -213994 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 192.333-85 chr2 35379930 35380136 + 1 NA Intergenic Intergenic -91372 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 217.333-152 chr8 100014086 100014457 + 1 NA intron (NM_015668, intron 14 of 27) intron (NM_015668, intron 14 of 27) 9689 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 158.333-346 chr9 105040466 105040674 + 1 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -112415 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 159.667-253 chr5 23780986 23781309 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -170201 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 263.667-32 chr15 94992740 94993171 + 1 NA Intergenic Intergenic 137592 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 195.333-168 chr5 19239888 19240187 + 1 NA Intergenic Intergenic 646235 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 232.333-54 chr22 27634908 27635429 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 166588 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 204.667-31 chr12 13828459 13828776 + 1 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) L1MEc|LINE|L1 151739 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 177.333-2 chr1 19980258 19980573 + 1 NA promoter-TSS (NM_000300) promoter-TSS (NM_000300) 19 NM_001161728 5320 Hs.466804 NM_000300 ENSG00000188257 PLA2G2A MOM1|PLA2|PLA2B|PLA2L|PLA2S|PLAS1|sPLA2 phospholipase A2 group IIA protein-coding 260.667-15 chr11 112321761 112322204 + 1 NA intron (NR_126004, intron 2 of 3) intron (NR_126004, intron 2 of 3) 51233 NR_126004 283140 Hs.651827 NR_126004 ENSG00000250303 LINC02762 - long intergenic non-protein coding RNA 2762 ncRNA 154.667-298 chr5 18033180 18033391 + 1 NA Intergenic Intergenic 226011 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 164.667-193 chr5 124725691 124725932 + 1 NA intron (NM_020747, intron 1 of 8) L2|LINE|L2 19301 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 281.667-20 chr14 36729338 36729793 + 1 NA exon (NM_030631, exon 5 of 10) exon (NM_030631, exon 5 of 10) 71997 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 393.667-2 chr11 27084569 27085126 + 1 NA intron (NR_125767, intron 3 of 4) intron (NR_125767, intron 3 of 4) 44032 NM_003986 8424 Hs.591996 NM_003986 ENSG00000129151 BBOX1 BBH|BBOX|G-BBH|gamma-BBH gamma-butyrobetaine hydroxylase 1 protein-coding 280.333-8 chr12 59275040 59275465 + 1 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -320777 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 177.667-106 chr4 188717677 188717979 + 1 NA Intergenic Intergenic -58829 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 155.333-296 chr5 72334019 72334280 + 1 NA intron (NM_001284405, intron 4 of 8) AluJr|SINE|Alu 13776 NM_001284403 79810 Hs.126906 NM_024754 ENSG00000049883 PTCD2 - pentatricopeptide repeat domain 2 protein-coding 186.667-100 chr4 32541230 32541488 + 1 NA Intergenic Intergenic 190321 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 218.333-98 chr5 81255457 81255756 + 1 NA intron (NM_001099735, intron 5 of 9) intron (NM_001099735, intron 5 of 9) 22284 NM_001099735 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 163.333-266 chr7 104476834 104477026 + 1 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 148274 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 120.333-169 chr7 35396489 35396691 + 1 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 82735 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 250.667-29 chr15 89874310 89874643 + 1 NA intron (NM_001199058, intron 7 of 9) L1M3|LINE|L1 9554 NR_049807 100846993 NR_049807 ENSG00000264796 MIR5009 - microRNA 5009 ncRNA 141.333-69 chr14 77775927 77776153 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -14884 NM_001318844 22938 Hs.445498 NM_012245 ENSG00000100603 SNW1 Bx42|FUN20|NCOA-62|PRPF45|Prp45|SKIIP|SKIP|SKIP1 SNW domain containing 1 protein-coding 202.667-103 chr3 148365966 148366296 + 1 NA intron (NR_146712, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR 85240 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 136.667-63 chr14 88279580 88279741 + 1 NA intron (NM_021161, intron 1 of 6) MER53|DNA|hAT -8749 NM_138318 54207 Hs.560255 NM_021161 ENSG00000100433 KCNK10 K2p10.1|PPP1R97|TREK-2|TREK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 10 protein-coding 146.667-173 chr2 122781525 122781672 + 1 NA Intergenic Intergenic 291883 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 155.333-420 chrX 83576570 83576744 + 1 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL 68367 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 131.667-217 chrUn_KI270467v1 3697 3914 + 1 NA NA SAR|Satellite|Satellite NA NA 207.333-265 chr8 42117070 42117494 + 1 NA Intergenic Intergenic -35664 NM_001134296 10947 Hs.654529 NM_006803 ENSG00000070718 AP3M2 AP47B|CLA20|P47B adaptor related protein complex 3 subunit mu 2 protein-coding 150.667-104 chr13 72662996 72663172 + 1 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 64545 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 266.333-35 chr22 19457646 19458136 + 1 NA intron (NM_001035247, intron 7 of 11) intron (NM_001035247, intron 7 of 11) -9659 NM_001166242 128977 Hs.659565 NM_173793 ENSG00000242259 C22orf39 - chromosome 22 open reading frame 39 protein-coding 305.667-35 chr6 163131523 163131989 + 1 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) MIRc|SINE|MIR 60246 NR_122120 729658 Hs.728991 NR_122120 PACRG-AS3 - PACRG antisense RNA 3 ncRNA 145.333-217 chr4 81560460 81560663 + 1 NA Intergenic Intergenic -88654 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 192.333-126 chr4 75833244 75833612 + 1 NA Intergenic Intergenic 69024 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 162.667-90 chr15 86669084 86669432 + 1 NA intron (NM_152336, intron 22 of 24) L1MEd|LINE|L1 -263622 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 159.667-131 chr17 32169463 32169722 + 1 NA intron (NM_001288755, intron 1 of 18) L1M5|LINE|L1 -18021 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 161.333-135 chr19 30254987 30255167 + 1 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA -117307 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 215.667-33 chr13 64628108 64628421 + 1 NA Intergenic Intergenic -552253 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 145.667-17 chr1 168516081 168516299 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -20546 NR_125956 101928565 Hs.563806 NR_125956 ENSG00000228697 LOC101928565 - uncharacterized LOC101928565 ncRNA 150.667-75 chr11 95903809 95904081 + 1 NA intron (NM_016156, intron 1 of 14) AluSc8|SINE|Alu 20162 NM_201281 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 158.667-97 chr14 54823816 54824041 + 1 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 54265 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 381.667-10 chr7 121148859 121149357 + 1 NA intron (NM_001105533, intron 15 of 17) intron (NM_001105533, intron 15 of 17) 159717 NM_001105533 79974 Hs.189652 NM_024913 ENSG00000106034 CPED1 C7orf58 cadherin like and PC-esterase domain containing 1 protein-coding 145.333-132 chr2 70309750 70309946 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -7781 NM_001329755 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 416.333-8 chr20 45571098 45571713 + 1 NA intron (NM_130896, intron 1 of 5) L1MA7|LINE|L1 7879 NM_181510 90199 Hs.116128 NM_130896 ENSG00000158901 WFDC8 C20orf170|HEL-S-292|WAP8|dJ461P17.1 WAP four-disulfide core domain 8 protein-coding 210.333-166 chr8 71602040 71602335 + 1 NA Intergenic Intergenic -54093 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 198.667-8 chr1 161897561 161897892 + 1 NA intron (NM_007348, intron 14 of 15) MER33|DNA|hAT-Charlie 126739 NM_015441 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 199.667-127 chr7 31518864 31519218 + 1 NA intron (NR_047565, intron 1 of 13) MIR3|SINE|MIR 1677 NR_047565 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 331.333-42 chr7 9560363 9560817 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -73680 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 147.333-195 chr21 27193083 27193355 + 1 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -226131 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 162.667-263 chr8 52405256 52405430 + 1 NA 3' UTR (NM_001352879, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001352879, exon 3 of 3) 4413 NM_001352884 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 169.667-109 chr2 108349875 108350210 + 1 NA intron (NR_037191, intron 3 of 3) intron (NR_037191, intron 3 of 3) 27804 NR_037191 151234 Hs.447681 NR_037191 ENSG00000237223 SULT1C2P1 SULT1C1P sulfotransferase family 1C member 2 pseudogene 1 pseudo 173.333-147 chr4 80966535 80966790 + 1 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -64046 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 212.333-145 chr8 47634523 47634937 + 1 NA intron (NM_001080394, intron 10 of 19) intron (NM_001080394, intron 10 of 19) -19358 NM_001352959 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 166.333-100 chr19 36460997 36461167 + 1 NA intron (NM_001145345, intron 4 of 4) MER102a|DNA|hAT-Charlie 28353 NM_032838 84924 Hs.533939 NM_032838 ENSG00000186017 ZNF566 - zinc finger protein 566 protein-coding 385.333-22 chr5 104441112 104441614 + 1 NA Intergenic Intergenic -658111 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 207.667-36 chr15 44128116 44128438 + 1 NA intron (NM_001286490, intron 1 of 15) AluSq2|SINE|Alu 66169 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 180.333-35 chr14 68600921 68601154 + 1 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 27750 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 151.667-321 chr6 129261689 129261845 + 1 NA intron (NM_000426, intron 15 of 64) intron (NM_000426, intron 15 of 64) 378626 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 165.667-14 chr10 21489553 21489775 + 1 NA Intergenic Intergenic 6977 NR_031736 100302129 NR_031736 ENSG00000222071 MIR1915 MIRN1915|hsa-mir-1915 microRNA 1915 ncRNA 173.333-99 chr2 147920459 147920780 + 1 NA intron (NM_001278579, intron 9 of 11) L3b|LINE|CR1 75590 NM_001616 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 149.333-83 chr12 19980326 19980585 + 1 NA Intergenic Intergenic -34230 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 136.667-92 chr2 73908059 73908248 + 1 NA intron (NM_001615, intron 3 of 8) LTR33|LTR|ERVL 15145 NM_001615 72 Hs.516105 NM_001615 ENSG00000163017 ACTG2 ACT|ACTA3|ACTE|ACTL3|ACTSG|VSCM actin gamma 2, smooth muscle protein-coding 151.667-362 chr8 67953911 67954207 + 1 NA intron (NM_024870, intron 1 of 39) intron (NM_024870, intron 1 of 39) 2013 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 145.667-306 chr9 30974742 30974888 + 1 NA Intergenic Intergenic 406675 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 221.667-57 chr4 45756896 45757212 + 1 NA Intergenic Intergenic 367000 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 167.667-222 chrX 36310012 36310229 + 1 NA intron (NM_001304548, intron 55 of 63) intron (NM_001304548, intron 55 of 63) 130172 NR_110412 101928627 Hs.590831 NR_110412 ENSG00000226484 LOC101928627 - uncharacterized LOC101928627 ncRNA 335.333-41 chr5 119323645 119324193 + 1 NA intron (NM_001286815, intron 2 of 2) intron (NM_001286815, intron 2 of 2) -9256 NM_001286814 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 147.667-335 chr7 53210698 53210860 + 1 NA Intergenic Intergenic 175146 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 198.667-22 chr10 66974938 66975233 + 1 NA intron (NM_178011, intron 2 of 2) intron (NM_178011, intron 2 of 2) 37068 NR_111911 101928961 Hs.687014 NR_111911 LOC101928961 - uncharacterized LOC101928961 ncRNA 167.333-259 chr8 90068910 90069127 + 1 NA exon (NM_004929, exon 5 of 11) exon (NM_004929, exon 5 of 11) 13861 NM_001366795 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 214.333-129 chr6 143623374 143623823 + 1 NA intron (NM_014721, intron 1 of 12) (AAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 15418 NM_014721 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 151.333-437 chr9 28614789 28615044 + 1 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 104389 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 192.333-138 chr5 45667539 45667780 + 1 NA intron (NM_021072, intron 1 of 7) intron (NM_021072, intron 1 of 7) 28721 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 254.333-33 chr18 43809705 43810149 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -532437 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 248.667-40 chr15 59259073 59259592 + 1 NA intron (NM_004998, intron 3 of 27) MER57A-int|LTR|ERV1 52489 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 128.667-191 chr8 140113785 140113964 + 1 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -13339 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 113.333-75 chr14 63041183 63041378 + 1 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) intron (NM_139318, intron 1 of 10) 4178 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 229.333-88 chr4 96120825 96121146 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -189718 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 163.667-259 chr8 134003219 134003419 + 1 NA Intergenic Intergenic 116823 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 263.667-70 chr6 65646077 65646440 + 1 NA intron (NM_001292009, intron 1 of 43) L1PB1|LINE|L1 60967 NM_001292009 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 193.667-39 chr13 74122190 74122472 + 1 NA intron (NM_007249, intron 1 of 7) L1MEf|LINE|L1 11598 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 156.667-79 chr12 39912366 39912651 + 1 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) intron (NM_052885, intron 4 of 9) 193573 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 154.667-3 chr1 42576050 42576318 + 1 NA intron (NM_001080850, intron 7 of 16) L2c|LINE|L2 43164 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 205.667-9 chr1 157912259 157912663 + 1 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -13506 NR_135760 105371458 Hs.591494 NR_135760 ENSG00000236957 LOC105371458 - uncharacterized LOC105371458 ncRNA 156.333-390 chrX 83555538 83555697 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 47327 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 154.333-25 chr1 211278162 211278399 + 1 NA intron (NM_018254, intron 5 of 10) intron (NM_018254, intron 5 of 10) 18333 NM_018254 55758 Hs.356399 NM_018254 ENSG00000117625 RCOR3 - REST corepressor 3 protein-coding 156.667-122 chr15 81885083 81885261 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 160846 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 155.333-9 chr1 111116984 111117286 + 1 NA TTS (NM_001349882) TTS (NM_001349882) -22248 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 169.333-164 chr3 87198064 87198287 + 1 NA Intergenic Intergenic 28102 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 117.333-43 chr12 11799389 11799547 + 1 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) intron (NM_001987, intron 2 of 7) 149614 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 264.333-53 chr4 74780276 74780596 + 1 NA intron (NM_001316963, intron 1 of 4) intron (NM_001316963, intron 1 of 4) 14087 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 119.667-69 chr17 48654679 48654872 + 1 NA Intergenic (AGAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -22216 NR_029582 406972 NR_029582 ENSG00000210741 MIR196A1 MIRN196-1|MIRN196A1|mir-196a-1 microRNA 196a-1 ncRNA 149.333-341 chr6 102572853 102573073 + 1 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 1173978 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 260.667-33 chr17 1831260 1831586 + 1 NA intron (NM_001355120, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 1418 NM_001355121 6117 Hs.461925 NM_002945 ENSG00000132383 RPA1 HSSB|MST075|REPA1|RF-A|RP-A|RPA70 replication protein A1 protein-coding 179.667-105 chr4 124811580 124811838 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -98977 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 215.667-12 chr10 22947458 22947770 + 1 NA intron (NM_001282745, intron 3 of 18) L1MC3|LINE|L1 19561 NM_001282746 219681 Hs.659807 NM_173081 ENSG00000165309 ARMC3 CT81|KU-CT-1 armadillo repeat containing 3 protein-coding 250.667-65 chr5 109433589 109433989 + 1 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -23815 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 157.333-290 chr5 127505449 127505618 + 1 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12107 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 253.667-75 chr8 72282630 72283125 + 1 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -31243 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 125.333-49 chr13 67421721 67421901 + 1 NA Intergenic Intergenic 49424 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 339.667-4 chr12 33472371 33472906 + 1 NA Intergenic Intergenic -32819 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 156.667-102 chr14 48823030 48823312 + 1 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 763209 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 174.333-73 chr20 36670510 36670761 + 1 NA intron (NM_032013, intron 9 of 15) intron (NM_032013, intron 9 of 15) -24439 NM_032214 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 218.667-115 chr9 12714062 12714369 + 1 NA intron (NR_125775, intron 3 of 3) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 20830 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 146.667-23 chr1 190559589 190559824 + 1 NA Intergenic Intergenic -65184 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 114.667-14 chr1 204694308 204694523 + 1 NA Intergenic Intergenic -8677 NM_006338 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 158.667-134 chr18 21567716 21567920 + 1 NA intron (NM_052911, intron 5 of 11) intron (NM_052911, intron 5 of 11) 32886 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 186.667-145 chr8 52926901 52927217 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12849 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 153.333-107 chr13 93676897 93677087 + 1 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) intron (NM_005708, intron 2 of 8) 181481 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 200.333-134 chr6 105844611 105845021 + 1 NA Intergenic Intergenic -241520 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 158.333-255 chr5 51401363 51401569 + 1 NA Intergenic Intergenic 18018 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 230.333 chr1 42069099 42069442 + 1 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -33336 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 227.333-64 chr2 88421578 88422029 + 1 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 30890 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 174.667-164 chr7 107369670 107369991 + 1 NA intron (NM_181733, intron 8 of 20) L1M5|LINE|L1 -100227 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 341.667-2 chr1 95127467 95127902 + 1 NA intron (NM_001199691, intron 1 of 7) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 9761 NM_001199691 100527978 Hs.483512 NM_001199691 ENSG00000271092 TLCD4-RWDD3 TMEM56-RWDD3 TLCD4-RWDD3 readthrough protein-coding 310.667-37 chr6 140299908 140300275 + 1 NA Intergenic Intergenic 94839 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 213.667-65 chr4 62478729 62479012 + 1 NA Intergenic Intergenic -317105 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 175.667-104 chr3 146898729 146898994 + 1 NA Intergenic Intergenic -23062 NR_135560 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 120.333-41 chr12 4571627 4571846 + 1 NA intron (NM_001371301, intron 2 of 14) MER33|DNA|hAT-Charlie 9528 NM_001371301 213.333-77 chr17 56447828 56448240 + 1 NA intron (NM_001370326, intron 10 of 20) intron (NM_001370326, intron 10 of 20) -145665 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 146.333-273 chr5 155763192 155763338 + 1 NA Intergenic Intergenic -563492 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 143.333-182 chr3 68849784 68849953 + 1 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) intron (NM_001005527, intron 3 of 5) 82679 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 184.667-65 chr2 154694798 154695124 + 1 NA Intergenic Intergenic -3620 NM_001260508 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 270.667-12 chr12 104583674 104584061 + 1 NA intron (NM_018413, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu -7766 NR_037487 100500843 NR_037487 ENSG00000264295 MIR3922 - microRNA 3922 ncRNA 162.333-58 chr12 97090878 97091096 + 1 NA Intergenic Intergenic 183521 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 162.333-36 chr11 8606315 8606620 + 1 NA Intergenic Intergenic -12239 NM_001352390 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 166.333-222 chr8 67180035 67180204 + 1 NA intron (NM_001363133, intron 25 of 27) intron (NM_001363133, intron 25 of 27) 96271 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 139.667-188 chr8 87344960 87345181 + 1 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) intron (NM_173538, intron 8 of 10) 478655 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 129.333-72 chr16 12304813 12305006 + 1 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) intron (NM_032167, intron 15 of 20) 328175 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 153.333-426 chr8 115942600 115942845 + 1 NA Intergenic Intergenic -273747 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 136.333-46 chr13 45393794 45393939 + 1 NA 3' UTR (NM_001286806, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001286806, exon 9 of 9) -24296 NR_047031 100874259 Hs.658038 NR_047031 ENSG00000251015 SLC25A30-AS1 - SLC25A30 antisense RNA 1 ncRNA 275.667-6 chr1 177773832 177774296 + 1 NA Intergenic MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR 73540 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 158.667-64 chr11 82108337 82108525 + 1 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1PB4|LINE|L1 -217595 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 259.667-88 chr8 118851654 118851955 + 1 NA Intergenic Intergenic 100081 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 137.333-14 chr10 12776692 12776961 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 7 of 11) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -51473 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 174.667-157 chr7 23266648 23266896 + 1 NA intron (NM_001005340, intron 7 of 10) intron (NM_001005340, intron 7 of 10) 19997 NM_002510 10457 Hs.190495 NM_002510 ENSG00000136235 GPNMB HGFIN|NMB|PLCA3 glycoprotein nmb protein-coding 152.667-103 chr14 47575413 47575590 + 1 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 99453 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 294.333-51 chr9 124613741 124614308 + 1 NA intron (NM_033334, intron 2 of 9) L1MEc|LINE|L1 -44412 NR_038975 100379345 Hs.660412 NR_038975 ENSG00000224020 MIR181A2HG - MIR181A2 host gene ncRNA 250.333-68 chr7 1635445 1635746 + 1 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 21125 NR_001288 260341 Hs.534596 NR_001288 TFAMP1 MTTF1|TCF6L1 transcription factor A, mitochondrial pseudogene 1 pseudo 115.667-35 chr10 125880458 125880621 + 1 NA intron (NM_018180, intron 1 of 10) intron (NM_018180, intron 1 of 10) 753 NM_018180 55760 Hs.370292 NM_018180 ENSG00000089876 DHX32 DDX32|DHLP1 DEAH-box helicase 32 (putative) protein-coding 161.333-171 chr20 52553747 52553921 + 1 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -67004 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 287.667-8 chr11 11777791 11778282 + 1 NA Intergenic Intergenic 5186 NR_107037 102465870 NR_107037 ENSG00000278529 MIR8070 hsa-mir-8070 microRNA 8070 ncRNA 187.667-28 chr12 60011195 60011624 + 1 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 322039 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 243.333-6 chr1 181888455 181888741 + 1 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 173114 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 141.333-2 chr1 41725711 41725917 + 1 NA intron (NM_024503, intron 1 of 8) ORSL-2b|DNA|hAT-Tip100 193108 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 162.333-146 chr22 25012910 25013144 + 1 NA Intergenic Intergenic -14947 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 183.333-156 chr8 71250278 71250621 + 1 NA intron (NM_001370335, intron 14 of 20) intron (NM_001370335, intron 14 of 20) 106257 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 194.667-20 chr10 32727536 32727796 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 27 of 43) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 173806 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 179.333-123 chr3 37501187 37501382 + 1 NA intron (NM_002207, intron 5 of 27) intron (NM_002207, intron 5 of 27) 49143 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 209.333-33 chr11 41228592 41229065 + 1 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 230808 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 141.333-140 chr22 31890338 31890490 + 1 NA intron (NR_146296, intron 38 of 42) intron (NR_146296, intron 38 of 42) 48040 NM_001302819 25775 Hs.627602 NM_015372 ENSG00000128254 C22orf24 HSN44A4A chromosome 22 open reading frame 24 protein-coding 216.667-92 chr6 36225925 36226298 + 1 NA intron (NM_015695, intron 11 of 12) L1ME4a|LINE|L1 -17057 NM_173676 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 162.333-255 chr8 89475007 89475324 + 1 NA Intergenic Intergenic 282546 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 372.333-18 chr4 97431703 97432140 + 1 NA intron (NR_102713, intron 1 of 5) L1MB3|LINE|L1 64995 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 236.333-75 chr5 23532473 23532767 + 1 NA Intergenic Intergenic 24965 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 161.667-132 chr2 99933233 99933470 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) L1PA8|LINE|L1 172232 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 198.667-155 chr5 147584595 147584940 + 1 NA TTS (NM_001270941) TTS (NM_001270941) 24773 NR_038902 153469 Hs.184323 NR_038902 ENSG00000280780 JAKMIP2-AS1 - JAKMIP2 antisense RNA 1 ncRNA 231.333-52 chr18 41033915 41034254 + 1 NA Intergenic Intergenic 486593 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 166.333-241 chr9 94247507 94247739 + 1 NA intron (NR_160773, intron 1 of 2) L1MDa|LINE|L1 -11643 NM_003448 169841 Hs.387623 NM_003448 ENSG00000175787 ZNF169 - zinc finger protein 169 protein-coding 146.667-133 chr17 30337671 30337941 + 1 NA Intergenic Intergenic -3749 NM_206832 388364 Hs.371005 NM_206832 ENSG00000182271 TMIGD1 TMIGD|UNQ9372 transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 protein-coding 149.667-276 chr4 35850606 35850899 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 393187 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 137.333-39 chr12 125738709 125738938 + 1 NA Intergenic Intergenic 116371 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 182.667-95 chr3 66396494 66396719 + 1 NA intron (NM_015541, intron 11 of 18) intron (NM_015541, intron 11 of 18) 103815 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 163.333-234 chr6 5119909 5120098 + 1 NA intron (NR_104417, intron 2 of 3) AluSx4|SINE|Alu 28319 NR_037462 100500900 NR_037462 ENSG00000265083 MIR3691 mir-3691 microRNA 3691 ncRNA 222.667-9 chr10 97272173 97272420 + 1 NA intron (NM_032900, intron 1 of 11) AluSx|SINE|Alu -1639 NM_001256423 84986 Hs.80305 NM_032900 ENSG00000213390 ARHGAP19 - Rho GTPase activating protein 19 protein-coding 258.667-29 chr14 66377136 66377496 + 1 NA Intergenic Intergenic -109055 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 157.333-358 chr9 31339596 31339862 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 41761 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 151.333-424 chr8 99157174 99157444 + 1 NA intron (NM_017890, intron 15 of 61) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 144043 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 259.333-105 chr9 107628437 107628874 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -138886 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 332.333-8 chr10 105912398 105912991 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -92361 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 174.667-120 chr3 191999427 191999653 + 1 NA Intergenic Intergenic -239090 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 152.333-174 chr2 46741527 46741803 + 1 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) L1ME3B|LINE|L1 42370 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 130.667-148 chr3 129444029 129444200 + 1 NA intron (NM_052990, intron 1 of 26) MIRc|SINE|MIR 3890 NM_052985 55764 Hs.655284 NM_018262 ENSG00000163913 IFT122 CED|CED1|SPG|WDR10|WDR10p|WDR140 intraflagellar transport 122 protein-coding 341.333-32 chr8 130569870 130570502 + 1 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -126512 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 151.333-64 chr10 94413255 94413468 + 1 NA intron (NM_015188, intron 1 of 12) intron (NM_015188, intron 1 of 12) 10820 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 146.667-109 chr14 73588110 73588326 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -3488 NM_152331 122970 Hs.49433 NM_152331 ENSG00000177465 ACOT4 PTE-Ib|PTE1B|PTE2B acyl-CoA thioesterase 4 protein-coding 158.333-176 chr20 53816019 53816297 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 59551 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 149.333-306 chr5 65521008 65521246 + 1 NA intron (NM_001267038, intron 10 of 10) intron (NM_001267038, intron 10 of 10) -39207 NR_135689 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 162.333-15 chr1 152205724 152205990 + 1 NA Intergenic Intergenic 18339 NM_001009931 388697 Hs.490162 NM_001009931 ENSG00000197915 HRNR FLG3|S100A16|S100a18 hornerin protein-coding 211.333-187 chr5 97117109 97117497 + 1 NA intron (NM_153234, intron 2 of 5) intron (NM_153234, intron 2 of 5) 25308 NM_153234 167410 Hs.656702 NM_153234 ENSG00000145721 LIX1 C5orf11|Lft limb and CNS expressed 1 protein-coding 169.333-265 chr8 69306010 69306323 + 1 NA Intergenic Intergenic 142078 NR_110433 100505739 Hs.127115 NR_110433 LINC01603 - long intergenic non-protein coding RNA 1603 ncRNA 153.333-296 chr4 59177855 59178145 + 1 NA Intergenic Intergenic 164427 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 226.333-40 chr16 87923371 87923734 + 1 NA intron (NM_001739, intron 2 of 6) intron (NM_001739, intron 2 of 6) 12977 NR_159798 763 Hs.177446 NM_001739 ENSG00000174990 CA5A CA5|CA5AD|CAV|CAVA|GS1-21A4.1 carbonic anhydrase 5A protein-coding 182.333-165 chr9 26916003 26916289 + 1 NA intron (NM_001321546, intron 9 of 12) intron (NM_001321546, intron 9 of 12) -23318 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 184.333-165 chr9 105290455 105290668 + 1 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) intron (NM_001330731, intron 1 of 15) 45910 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 232.333-62 chr4 80292748 80293035 + 1 NA Intergenic Intergenic 24626 NM_001291812 2250 Hs.37055 NM_004464 ENSG00000138675 FGF5 HBGF-5|Smag-82|TCMGLY fibroblast growth factor 5 protein-coding 340.667-21 chr9 33346667 33347199 + 1 NA intron (NM_002504, intron 14 of 23) intron (NM_002504, intron 14 of 23) 55635 NM_001170 364 Hs.455323 NM_001170 ENSG00000165269 AQP7 AQP7L|AQPap|GLYCQTL aquaporin 7 protein-coding 180.333-19 chr11 107224884 107225166 + 1 NA Intergenic Intergenic -206549 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 195.667-7 chr10 12813443 12813672 + 1 NA intron (NM_001351032, intron 8 of 11) intron (NM_001351032, intron 8 of 11) -88204 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 257.667-89 chrX 47294078 47294637 + 1 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 61348 NM_001371072 144.667-297 chr8 86849902 86850072 + 1 NA Intergenic Intergenic -16428 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 173.667-55 chr15 72013803 72014109 + 1 NA intron (NM_006901, intron 6 of 41) AluSz6|SINE|Alu -100302 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 237.333-38 chr16 6073807 6074363 + 1 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) AluY|SINE|Alu 54382 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 142.333-28 chr10 91112602 91112800 + 1 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 40379 NR_002779 119369 Hs.441287 NR_002779 NUDT9P1 C10orf98|bA56M3.1 nudix hydrolase 9 pseudogene 1 pseudo 188.333-149 chr8 24766814 24767188 + 1 NA Intergenic Intergenic -146760 NM_005382 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 113.667-207 chr8 77360480 77360691 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -90112 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 168.667-149 chr3 160199551 160199784 + 1 NA intron (NR_108088, intron 1 of 9) AluJo|SINE|Alu 7425 NR_108088 101928376 Hs.565865 NR_108088 ENSG00000244040 IL12A-AS1 ILAS1-AS1 IL12A antisense RNA 1 ncRNA 210.333-102 chr3 83073842 83074158 + 1 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 1087858 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 159.667-44 chr10 62961348 62961603 + 1 NA Intergenic Intergenic -142308 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 324.667-21 chr2 211017640 211017981 + 1 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 400239 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 157.333-269 chr4 125425147 125425397 + 1 NA intron (NM_001291303, intron 6 of 16) intron (NM_001291303, intron 6 of 16) -81987 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 287.667-41 chr8 132770702 132771085 + 1 NA Intergenic Intergenic -4465 NM_198513 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 176.333-51 chr14 63497779 63498111 + 1 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 10293 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 158.667-49 chr10 109624321 109624506 + 1 NA Intergenic Intergenic 298833 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 165.333-31 chr10 73102732 73102947 + 1 NA Intergenic Intergenic -5865 NM_000917 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 150.333-44 chr10 88994427 88994675 + 1 NA intron (NR_135314, intron 1 of 8) intron (NR_135314, intron 1 of 8) -1576 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 211.333-233 chr8 72271600 72271862 + 1 NA Intergenic MER66A|LTR|ERV1 -20097 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 155.667-115 chr15 64442432 64442590 + 1 NA intron (NM_001321924, intron 11 of 12) AluJb|SINE|Alu 54675 NM_016213 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 269.667 chr1 119122676 119123122 + 1 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) L1PB1|LINE|L1 -17497 NR_125974 101929147 Hs.697821 NR_125974 ENSG00000231365 WARS2-AS1 - WARS2 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-151 chr18 77145224 77145424 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -12541 NM_001025101 4155 Hs.551713 NM_002385 ENSG00000197971 MBP - myelin basic protein protein-coding 149.333-347 chr6 125498299 125498564 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -175922 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 178.333-9 chr1 180265211 180265425 + 1 NA intron (NM_033343, intron 2 of 5) intron (NM_033343, intron 2 of 5) 9363 NR_037642 100527964 Hs.496545 NR_037642 ENSG00000230124 LHX4-AS1 - LHX4 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-121 chr3 144097615 144097861 + 1 NA Intergenic Intergenic 124657 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 154.333-130 chr18 9082729 9082930 + 1 NA Intergenic Intergenic -19870 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 158.333-257 chr5 63479966 63480234 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 482192 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 160.333-105 chr14 69432963 69433197 + 1 NA intron (NM_001330185, intron 2 of 5) L1PA16|LINE|L1 34388 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 206.333-75 chr18 45097510 45097771 + 1 NA Intergenic Intergenic -70323 NM_001371319 257.333-26 chr12 39952588 39952901 + 1 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) intron (NM_052885, intron 3 of 9) 153337 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 154.667-216 chr20 39029128 39029329 + 1 NA intron (NM_021931, intron 19 of 21) intron (NM_021931, intron 19 of 21) 66884 NM_021931 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 245.667-11 chr12 39468306 39468631 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -25348 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 288.667-25 chr5 102322923 102323278 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -26816 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 183.333-174 chr9 92343193 92343554 + 1 NA intron (NM_001286969, intron 2 of 6) intron (NM_001286969, intron 2 of 6) 17420 NM_001012267 401541 Hs.713775 NM_001012267 ENSG00000188312 CENPP CENP-P centromere protein P protein-coding 148.667-289 chr4 97358318 97358541 + 1 NA Intergenic (TATGTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8497 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-199 chr22 24964221 24964393 + 1 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -17612 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 157.333-155 chr17 61048775 61048952 + 1 NA intron (NM_001330413, intron 20 of 25) L1MEc|LINE|L1 318841 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 195.333-67 chr12 125958190 125958407 + 1 NA TTS (NR_034132) TTS (NR_034132) 25076 NR_034132 400084 Hs.156191 NR_034132 ENSG00000249267 LINC00939 - long intergenic non-protein coding RNA 939 ncRNA 258.333-24 chr17 63139338 63139745 + 1 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) AluSz6|SINE|Alu 173306 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 284.333-21 chr2 5343580 5343929 + 1 NA Intergenic Intergenic 347364 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 153.667-17 chr1 106093191 106093372 + 1 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -65028 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 246.667-59 chr3 148020551 148020855 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -57456 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 135.333-114 chr3 59175210 59175404 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -125275 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 157.333-341 chr8 106727564 106727788 + 1 NA intron (NM_001198535, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 1569 NM_001198535 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 168.667-133 chr22 26269102 26269355 + 1 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) MER5A|DNA|hAT-Charlie 99754 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 188.333-18 chr10 61793161 61793416 + 1 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -108411 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 114.333-182 chr5 118903941 118904135 + 1 NA intron (NM_001308081, intron 4 of 5) intron (NM_001308081, intron 4 of 5) -70548 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 212.667-44 chr15 57280520 57280859 + 1 NA intron (NM_207038, intron 18 of 19) FLAM_A|SINE|Alu -2032 NR_145748 109616990 NR_145748 ENSG00000239035 SNORD13D - small nucleolar RNA, C/D box 13D snoRNA 241.333-105 chr9 76622206 76622482 + 1 NA intron (NM_001308050, intron 9 of 10) intron (NM_001308050, intron 9 of 10) 70071 NM_001330680 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 274.333-33 chr18 2647653 2648150 + 1 NA Intergenic Intergenic 7494 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 156.667-327 chr7 151581361 151581604 + 1 NA intron (NM_016203, intron 6 of 15) intron (NM_016203, intron 6 of 15) 50776 NM_024429 51422 Hs.647072 NM_016203 ENSG00000106617 PRKAG2 AAKG|AAKG2|CMH6|H91620p|WPWS protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma 2 protein-coding 290.333-37 chr5 104484084 104484493 + 1 NA Intergenic Intergenic -615186 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 149.667-201 chr2 72922610 72922824 + 1 NA intron (NM_004097, intron 1 of 2) intron (NM_004097, intron 1 of 2) 5198 NM_004097 2016 Hs.516090 NM_004097 ENSG00000135638 EMX1 - empty spiracles homeobox 1 protein-coding 240.333-26 chr12 4975802 4976200 + 1 NA Intergenic Intergenic 66096 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 163.333-136 chr19 56252437 56252652 + 1 NA intron (NM_001322061, intron 2 of 6) LTR52|LTR|ERVL -20204 NM_001354658 100506374 Hs.631532 NM_001354658 ENSG00000267710 EDDM13 - epididymal protein 13 protein-coding 232.667-80 chrX 56544281 56544589 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -19158 NM_013444 29978 Hs.179309 NM_013444 ENSG00000188021 UBQLN2 ALS15|CHAP1|DSK2|HRIHFB2157|N4BP4|PLIC2 ubiquilin 2 protein-coding 127.667-172 chr7 159326073 159326295 + 1 NA Intergenic Intergenic -181227 NR_130758 7434 Hs.585052 NM_003382 ENSG00000106018 VIPR2 C16DUPq36.3|DUP7q36.3|PACAP-R-3|PACAP-R3|VIP-R-2|VPAC2|VPAC2R|VPCAP2R vasoactive intestinal peptide receptor 2 protein-coding 148.667-352 chr7 45555223 45555398 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -18830 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 153.667-21 chr1 176205355 176205584 + 1 NA intron (NM_022457, intron 1 of 19) intron (NM_022457, intron 1 of 19) 1775 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 149.667-357 chr6 105394249 105394504 + 1 NA intron (NM_002726, intron 2 of 14) L1MD|LINE|L1 8706 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 150.667-120 chr14 59546911 59547117 + 1 NA intron (NM_001164399, intron 8 of 19) AluJo|SINE|Alu 29798 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 155.667-122 chr16 5226192 5226433 + 1 NA Intergenic Intergenic -128492 NM_001289029 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 162.667-55 chr12 38849228 38849403 + 1 NA intron (NM_153634, intron 3 of 19) intron (NM_153634, intron 3 of 19) 56276 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 156.333-102 chr14 34679659 34679843 + 1 NA Intergenic Intergenic 34066 NM_021914 1073 Hs.180141 NM_021914 ENSG00000165410 CFL2 NEM7 cofilin 2 protein-coding 213.333-98 chr2 108840259 108840598 + 1 NA intron (NM_144978, intron 11 of 14) L1MDa|LINE|L1 53657 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 185.667-142 chr9 12375685 12375898 + 1 NA Intergenic Intergenic -317594 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 173.333-37 chr11 114770608 114770827 + 1 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 92190 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 153.667-294 chr4 74034864 74035064 + 1 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 3725 NM_002090 2921 Hs.89690 NM_002090 ENSG00000163734 CXCL3 CINC-2b|GRO3|GROg|MIP-2b|MIP2B|SCYB3 C-X-C motif chemokine ligand 3 protein-coding 273.333-31 chr2 18525197 18525509 + 1 NA Intergenic Intergenic 35300 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 152.667-245 chr3 64902667 64902929 + 1 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) L3|LINE|CR1 -214798 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 147.333-48 chr10 78815717 78815912 + 1 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 251634 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 128.667-75 chr17 49367598 49367821 + 1 NA intron (NR_110883, intron 2 of 4) intron (NR_110883, intron 2 of 4) -5236 NM_014897 22834 Hs.463375 NM_014897 ENSG00000198740 ZNF652 - zinc finger protein 652 protein-coding 117.333-220 chr9 34299541 34299761 + 1 NA intron (NM_194313, intron 3 of 12) L1ME4b|LINE|L1 29617 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 146.667-81 chr12 83701688 83701894 + 1 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 1014636 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 130.667-26 chr10 59253447 59253629 + 1 NA intron (NM_001347852, intron 11 of 12) intron (NM_001347852, intron 11 of 12) 76071 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 147.667-195 chr2 213763907 213764144 + 1 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) 5958 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 147.333-12 chr1 63985591 63985738 + 1 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) AluJo|SINE|Alu 126541 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 157.667-257 chr5 91191856 91192182 + 1 NA Intergenic Intergenic 122383 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 334.333-31 chr8 80401680 80402305 + 1 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -83601 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 139.667-171 chr7 38085655 38085890 + 1 NA Intergenic LTR102_Mam|LTR|ERVL -92473 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 174.667-54 chr14 64316637 64316874 + 1 NA intron (NM_001291712, intron 2 of 13) AluSz|SINE|Alu 21795 NM_001291723 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 198.667-20 chr10 52452479 52452747 + 1 NA intron (NR_120641, intron 3 of 3) intron (NR_120641, intron 3 of 3) 2659 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 212.667-47 chr16 22923000 22923331 + 1 NA Intergenic Intergenic 109003 NM_006043 9956 Hs.115830 NM_006043 ENSG00000122254 HS3ST2 30ST2|3OST2 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 2 protein-coding 146.667-332 chr8 88413766 88413945 + 1 NA Intergenic Intergenic -86372 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 151.333-181 chr18 13205908 13206116 + 1 NA Intergenic Intergenic -12748 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 145.333-186 chr3 57627890 57628170 + 1 NA 3' UTR (NM_152678, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_152678, exon 20 of 20) 30241 NR_132370 106144532 Hs.667207 NR_132369 ENSG00000272146 ARF4-AS1 - ARF4 antisense RNA 1 ncRNA 259.333-29 chr13 112045754 112046165 + 1 NA intron (NR_120392, intron 1 of 3) intron (NR_120392, intron 1 of 3) -21190 NM_005986 6656 NM_005986 ENSG00000182968 SOX1 - SRY-box transcription factor 1 protein-coding 148.333-74 chr11 81026660 81026892 + 1 NA Intergenic Intergenic -263973 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 193.667-57 chr18 3644596 3644915 + 1 NA intron (NM_001242761, intron 7 of 11) L1ME4b|LINE|L1 41018 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 216.333-128 chr6 158791914 158792203 + 1 NA intron (NM_003379, intron 1 of 12) intron (NM_003379, intron 1 of 12) -25921 NR_102425 101409257 Hs.571207 NR_102425 ENSG00000233893 EZR-AS1 - EZR antisense RNA 1 ncRNA 222.667-32 chr15 64313850 64314292 + 1 NA intron (NM_001329606, intron 1 of 11) intron (NM_001329606, intron 1 of 11) 42102 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 160.667-63 chr11 108847590 108847831 + 1 NA intron (NM_004398, intron 15 of 17) intron (NM_004398, intron 15 of 17) 182641 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 195.667-54 chr16 89231679 89231965 + 1 NA non-coding (NR_037705, exon 6 of 6) non-coding (NR_037705, exon 6 of 6) 14119 NR_037705 197320 Hs.647385 NM_182531 ENSG00000170100 ZNF778 - zinc finger protein 778 protein-coding 369.667-9 chr22 29179357 29180225 + 1 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -26105 NM_001267895 129080 Hs.289106 NM_133455 ENSG00000186998 EMID1 EMI5|EMU1 EMI domain containing 1 protein-coding 339.333-8 chr10 86879861 86880212 + 1 NA intron (NM_004329, intron 3 of 12) MLT1L-int|LTR|ERVL-MaLR -75723 NM_001330120 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 186.333-81 chr2 120073205 120073496 + 1 NA intron (NM_001330307, intron 4 of 16) intron (NM_001330307, intron 4 of 16) 60273 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 186.667-52 chr17 53844101 53844330 + 1 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 21288 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 176.333-172 chr8 125514585 125514773 + 1 NA Intergenic Intergenic 82470 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 150.333-194 chr2 60793265 60793435 + 1 NA intron (NM_022894, intron 17 of 21) AluJr|SINE|Alu 37082 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 130.333-190 chr7 33707410 33707636 + 1 NA Intergenic Intergenic -197392 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 147.667-79 chr12 93925216 93925363 + 1 NA intron (NR_135017, intron 1 of 2) L1MEh|LINE|L1 18317 NR_135017 105369911 Hs.577495 NR_135017 ENSG00000257283 LOC105369911 - uncharacterized LOC105369911 ncRNA 150.333-320 chr5 28145383 28145626 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 142161 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 154.333-39 chr10 81537310 81537565 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -337757 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 163.667-62 chr14 72975737 72975907 + 1 NA intron (NM_178441, intron 5 of 8) intron (NM_178441, intron 5 of 8) 11134 NM_178441 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 349.667-13 chr21 26747350 26747897 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 97786 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 118.333-18 chr1 159970372 159970563 + 1 NA intron (NR_038849, intron 1 of 2) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 9243 NR_038849 100505633 Hs.445045 NR_038849 ENSG00000224259 LINC01133 - long intergenic non-protein coding RNA 1133 ncRNA 173.333-135 chr3 166724192 166724444 + 1 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -174365 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 221.667-5 chr1 228423391 228423766 + 1 NA Intergenic Intergenic 1747 NM_003493 8290 Hs.248171 NM_003493 ENSG00000168148 HIST3H3 H3.4|H3/g|H3FT|H3t histone cluster 3 H3 protein-coding 117.667-185 chr8 15651962 15652128 + 1 NA intron (NM_001356429, intron 3 of 10) MIR|SINE|MIR 111782 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 213.333-88 chr2 31197755 31198017 + 1 NA intron (NM_001145122, intron 7 of 21) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 19629 NM_001145122 440854 Hs.468059 NM_001145122 ENSG00000214711 CAPN14 - calpain 14 protein-coding 151.667-298 chr5 152336421 152336615 + 1 NA Intergenic Intergenic 68761 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 242.333-7 chr1 178815131 178815604 + 1 NA intron (NM_152663, intron 6 of 19) AluSx|SINE|Alu 55710 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 139.667-81 chr2 32498326 32498556 + 1 NA intron (NM_016252, intron 45 of 73) L1MEc|LINE|L1 -33712 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 139.333-13 chr1 180186279 180186515 + 1 NA intron (NM_002826, intron 8 of 11) intron (NM_002826, intron 8 of 11) 31528 NM_002826 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 159.333-105 chr15 83773761 83773942 + 1 NA intron (NM_207517, intron 4 of 29) intron (NM_207517, intron 4 of 29) 119728 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 173.667-113 chr3 83015275 83015557 + 1 NA Intergenic Intergenic 1029274 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 280.667-3 chr1 55545788 55546133 + 1 NA Intergenic Intergenic 320319 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 161.333-164 chr2 229203562 229203804 + 1 NA intron (NM_001100818, intron 1 of 2) intron (NM_001100818, intron 1 of 2) 28409 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 212.667-83 chr21 27464227 27464482 + 1 NA Intergenic Intergenic -258025 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 168.667-15 chr10 15057420 15057599 + 1 NA intron (NM_018324, intron 4 of 8) AluSx|SINE|Alu 13566 NM_018324 55301 Hs.24309 NM_018324 ENSG00000152463 OLAH AURA1|SAST|TE2|THEDC1 oleoyl-ACP hydrolase protein-coding 224.667-45 chr2 129624362 129624696 + 1 NA Intergenic Intergenic 252962 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 149.333-245 chr3 77595038 77595315 + 1 NA exon (NM_002942, exon 18 of 26) exon (NM_002942, exon 18 of 26) 453787 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 180.667-103 chr4 34946593 34946922 + 1 NA Intergenic Intergenic -677010 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 287.667-3 chr1 228766655 228767113 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 31405 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 163.667-126 chr2 188310786 188311095 + 1 NA intron (NR_045563, intron 2 of 12) intron (NR_045563, intron 2 of 12) 13448 NR_030287 693146 NR_030287 ENSG00000207951 MIR561 MIRN561|hsa-mir-561|mir-561 microRNA 561 ncRNA 262.333-51 chr2 200408926 200409294 + 1 NA intron (NM_001100423, intron 3 of 12) intron (NM_001100423, intron 3 of 12) 100160 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 151.667-378 chr8 130280992 130281172 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) MIRb|SINE|MIR 15451 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 144.333-177 chr3 161888382 161888655 + 1 NA Intergenic Intergenic 391710 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 148.333-354 chr7 8586154 8586351 + 1 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 152643 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 153.667-165 chr18 49284554 49284734 + 1 NA intron (NM_001353210, intron 9 of 16) MIRb|SINE|MIR 176001 NM_001353211 54808 Hs.162996 NM_017653 ENSG00000141627 DYM DMC|SMC dymeclin protein-coding 321.333-21 chr14 38795919 38796342 + 1 NA intron (NR_039982, intron 4 of 4) intron (NR_039982, intron 4 of 4) -86466 NR_135256 105370457 Hs.128254 NR_135256 LOC105370457 - uncharacterized LOC105370457 ncRNA 199.333-77 chr14 64614654 64614953 + 1 NA Intergenic Intergenic 64842 NM_172365 145376 Hs.144696 NM_172365 ENSG00000165807 PPP1R36 C14orf50 protein phosphatase 1 regulatory subunit 36 protein-coding 134.333-185 chr9 26887852 26888025 + 1 NA intron (NM_024828, intron 1 of 5) intron (NM_024828, intron 1 of 5) 4864 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 198.667-78 chr16 86067847 86068167 + 1 NA Intergenic Intergenic -128174 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 192.333-14 chr10 29721835 29722054 + 1 NA intron (NM_001323599, intron 1 of 38) intron (NM_001323599, intron 1 of 38) 13857 NM_003174 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 147.333-91 chr13 48841751 48842028 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -134023 NM_001079673 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 149.333-439 chr9 130113309 130113590 + 1 NA intron (NM_001136558, intron 15 of 18) AluJr|SINE|Alu 30770 NR_135124 401554 Hs.522437 NR_135124 ENSG00000196979 GPRACR LncGPR107 GPR107 adjacent cis regulating lncRNA ncRNA 320.667-12 chr12 53358921 53359320 + 1 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -14327 NM_001300837 121340 Hs.209402 NM_152860 ENSG00000170374 SP7 OI11|OI12|OSX|osterix Sp7 transcription factor protein-coding 321.667-12 chr22 19590164 19590577 + 1 NA Intergenic Intergenic -23531 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 176.333-86 chr2 74379785 74380123 + 1 NA intron (NR_033935, intron 1 of 26) intron (NR_033935, intron 1 of 26) 401 NM_001135040 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 163.667-44 chr12 13257158 13257321 + 1 NA Intergenic Intergenic 60513 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 245.333-78 chr3 99163752 99164048 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -262205 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 152.333-210 chr20 51151725 51152019 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -128765 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 173.333-39 chr12 8825795 8826144 + 1 NA intron (NM_144670, intron 3 of 35) L1MA3|LINE|L1 3348 NM_144670 144568 Hs.620532 NM_144670 ENSG00000166535 A2ML1 CPAMD9|OMS|p170 alpha-2-macroglobulin like 1 protein-coding 147.333-196 chr21 31197810 31198042 + 1 NA intron (NM_001353686, intron 12 of 27) intron (NM_001353686, intron 12 of 27) -36986 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 142.667-234 chr8 128522940 128523147 + 1 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 41636 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 151.667-335 chr7 38036460 38036748 + 1 NA Intergenic Intergenic 115285 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 225.667-54 chr4 15039728 15040107 + 1 NA intron (NM_182646, intron 4 of 9) intron (NM_182646, intron 4 of 9) 37436 NM_182646 132864 Hs.656937 NM_182485 ENSG00000137449 CPEB2 CPE-BP2|CPEB-2|hCPEB-2 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2 protein-coding 228.667-23 chr14 53056126 53056569 + 1 NA intron (NM_030637, intron 9 of 11) intron (NM_030637, intron 9 of 11) 96976 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 190.667-67 chr2 104572355 104572744 + 1 NA Intergenic Intergenic -62040 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 157.333-240 chr3 100976079 100976286 + 1 NA intron (NM_001349332, intron 1 of 35) intron (NM_001349332, intron 1 of 35) 17308 NM_001349330 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 166.667-124 chr2 187511698 187511964 + 1 NA intron (NM_006287, intron 1 of 7) Harlequin-int|LTR|ERV1 42604 NM_001329240 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 161.667-19 chr1 189942262 189942510 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 533624 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 364.667-10 chr4 58247470 58248162 + 1 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 288512 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 125.667-65 chr14 78992833 78992987 + 1 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -207072 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 131.667-169 chr6 43291687 43291835 + 1 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -6499 NM_006672 10864 Hs.485438 NM_006672 ENSG00000137204 SLC22A7 NLT|OAT2|hOAT11 solute carrier family 22 member 7 protein-coding 202.333-132 chr4 122105371 122105608 + 1 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -65114 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 206.667-96 chr3 186935087 186935359 + 1 NA intron (NM_173216, intron 1 of 7) L1PREC2|LINE|L1 4697 NM_173217 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 228.333-2 chr1 117977514 117977925 + 1 NA intron (NM_206996, intron 43 of 48) L2a|LINE|L2 47980 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 167.333-218 chr5 159802308 159802483 + 1 NA intron (NR_109891, intron 2 of 2) intron (NR_109891, intron 2 of 2) 68989 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 194.667-19 chr10 32620976 32621283 + 1 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) MER94|DNA|hAT-Blackjack 174989 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 191.667-71 chr2 174525092 174525293 + 1 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 32880 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 159.333-77 chr13 29808453 29808638 + 1 NA intron (NM_007106, intron 1 of 4) intron (NM_007106, intron 1 of 4) 42072 NM_007106 5412 Hs.145575 NM_007106 ENSG00000122042 UBL3 HCG-1|PNSC1 ubiquitin like 3 protein-coding 223.667-32 chr17 64008970 64009322 + 1 NA intron (NM_001099788, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 -2223 NM_000873 3384 Hs.431460 NM_000873 ENSG00000108622 ICAM2 CD102 intercellular adhesion molecule 2 protein-coding 155.667-111 chr15 50055149 50055321 + 1 NA intron (NR_073597, intron 3 of 26) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 58144 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 207.667-40 chr16 67441061 67441405 + 1 NA intron (NM_004691, intron 4 of 7) intron (NM_004691, intron 4 of 7) 10112 NM_000196 3291 Hs.1376 NM_000196 ENSG00000176387 HSD11B2 AME|AME1|HSD11K|HSD2|SDR9C3 hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2 protein-coding 194.333-10 chr1 119164069 119164374 + 1 NA intron (NR_125975, intron 4 of 6) AluSx1|SINE|Alu -23549 NM_015836 10352 Hs.523506 NM_015836 ENSG00000116874 WARS2 NEMMLAS|TrpRS|mtTrpRS tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 236.333-65 chr3 185238931 185239283 + 1 NA intron (NM_001966, intron 2 of 6) L1PB4|LINE|L1 14165 NR_106712 100847054 NR_106712 ENSG00000264614 MIR5588 - microRNA 5588 ncRNA 198.667-36 chr11 58129509 58129848 + 1 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) L2a|LINE|L2 -10234 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 216.333-151 chr9 108108994 108109431 + 1 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -619443 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 160.667-153 chr2 120004201 120004448 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -8753 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 239.667-80 chr9 100269904 100270177 + 1 NA intron (NR_134606, intron 11 of 16) MIRb|SINE|MIR 82531 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 385.667-10 chr6 2169390 2169959 + 1 NA intron (NM_001500, intron 1 of 10) intron (NM_001500, intron 1 of 10) 6317 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 152.667-129 chr15 99154034 99154196 + 1 NA intron (NR_109947, intron 11 of 12) L1M5|LINE|L1 49035 NM_015286 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 300.667-30 chr4 86599948 86600305 + 1 NA intron (NM_080685, intron 1 of 47) intron (NM_080685, intron 1 of 47) 5811 NM_006264 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 167.667-215 chr8 141955326 141955608 + 1 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -169154 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 208.333-57 chr17 77536508 77536830 + 1 NA TTS (NR_148967) TTS (NR_148967) 9668 NR_148967 400622 Hs.514516 NR_148967 LOC400622 - uncharacterized LOC400622 ncRNA 193.333-183 chr8 49344919 49345324 + 1 NA Intergenic Intergenic 167059 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 173.667-50 chr14 88710023 88710223 + 1 NA intron (NM_183387, intron 10 of 42) intron (NM_183387, intron 10 of 42) 82830 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 150.667-158 chr18 39015903 39016053 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 606197 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 152.333-387 chr8 118169235 118169485 + 1 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) intron (NR_146234, intron 4 of 5) -57541 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 194.667-140 chr7 9330196 9330486 + 1 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -303929 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 173.333-84 chr2 6963001 6963209 + 1 NA intron (NM_001349186, intron 2 of 7) intron (NM_001349186, intron 2 of 7) 30021 NM_001349182 9781 Hs.22146 NM_014746 ENSG00000151692 RNF144A RNF144|UBCE7IP4|hUIP4 ring finger protein 144A protein-coding 225.333-113 chr5 169029372 169029679 + 1 NA intron (NR_109897, intron 2 of 4) intron (NR_109897, intron 2 of 4) 16298 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 125.333-147 chr5 120648169 120648332 + 1 NA intron (NM_001308088, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 116786 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 151.333-343 chr5 80576374 80576554 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6184 NM_001004441 340120 Hs.519404 NM_001004441 ENSG00000189127 ANKRD34B DP58 ankyrin repeat domain 34B protein-coding 159.333-116 chr16 73634037 73634251 + 1 NA Intergenic Intergenic 247339 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 140.667-23 chr1 190602160 190602358 + 1 NA Intergenic Intergenic -22631 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 163.333-165 chr20 36061897 36062089 + 1 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -11033 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 132.667-11 chr1 192524764 192524934 + 1 NA Intergenic Intergenic -50924 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 191.333-142 chr4 30347256 30347635 + 1 NA Intergenic Intergenic -372924 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 176.667-7 chr1 66472145 66472464 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -61289 NM_001308203 84251 Hs.132121 NM_032291 ENSG00000118473 SGIP1 - SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1 protein-coding 140.333-201 chr6 79114553 79114765 + 1 NA Intergenic Intergenic -36405 NM_017934 55023 Hs.511817 NM_017934 ENSG00000146247 PHIP BRWD2|DCAF14|DIDOD|WDR11|ndrp pleckstrin homology domain interacting protein protein-coding 119.333-82 chr14 51243409 51243564 + 1 NA intron (NM_030755, intron 1 of 7) intron (NM_030755, intron 1 of 7) 3239 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 261.333-20 chr11 68107857 68108307 + 1 NA intron (NM_001277, intron 1 of 11) intron (NM_001277, intron 1 of 11) 13306 NM_001277 1119 Hs.77221 NM_001277 ENSG00000110721 CHKA CHK|CK|CKI|EK choline kinase alpha protein-coding 145.333-268 chr6 162857500 162857721 + 1 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) intron (NM_001080379, intron 2 of 4) 129640 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 147.667-8 chr1 94016663 94016901 + 1 NA intron (NM_000350, intron 36 of 49) L1MC4|LINE|L1 104366 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 196.667-7 chr1 212698312 212698590 + 1 NA intron (NM_018664, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 1389 NM_018664 55509 Hs.62919 NM_018664 ENSG00000123685 BATF3 JDP1|JUNDM1|SNFT basic leucine zipper ATF-like transcription factor 3 protein-coding 158.333-270 chr6 34507388 34507748 + 1 NA intron (NM_020804, intron 1 of 9) L1MB1|LINE|L1 -7304 NM_001199583 29993 Hs.520087 NM_020804 ENSG00000124507 PACSIN1 SDPI protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 protein-coding 160.667-245 chr5 54402376 54402641 + 1 NA intron (NR_126379, intron 2 of 4) MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR -53191 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 182.667-4 chr1 81578098 81578341 + 1 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) intron (NM_001366008, intron 2 of 26) -20517 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 217.667-33 chr16 87426474 87426712 + 1 NA intron (NM_015144, intron 3 of 12) intron (NM_015144, intron 3 of 12) 34257 NM_022818 81631 Hs.356061 NM_022818 ENSG00000140941 MAP1LC3B ATG8F|LC3B|MAP1A/1BLC3|MAP1LC3B-a microtubule associated protein 1 light chain 3 beta protein-coding 267.667-54 chr5 96694943 96695403 + 1 NA intron (NM_001330629, intron 2 of 30) MIR|SINE|MIR -7487 NM_173060 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 114.333-221 chr8 87513229 87513451 + 1 NA Intergenic Intergenic 360675 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 298.333-25 chr22 38873769 38874157 + 1 NA Intergenic Intergenic -1747 NM_014292 23466 Hs.592201 NM_014292 ENSG00000183741 CBX6 - chromobox 6 protein-coding 150.667-142 chr17 14215688 14215906 + 1 NA Intergenic L2b|LINE|L2 21065 NM_001348781 146822 Hs.447556 NM_001007530 ENSG00000223510 CDRT15 - CMT1A duplicated region transcript 15 protein-coding 193.667-66 chr2 188154341 188154672 + 1 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 133185 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 432.667-8 chr3 106238162 106238857 + 1 NA Intergenic Intergenic -369108 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 131.333-127 chr4 61672982 61673141 + 1 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) L1MA9|LINE|L1 470889 NM_001371342 161.667-101 chr17 19903691 19903882 + 1 NA TTS (NM_001330152) TTS (NM_001330152) -35850 NM_014683 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 166.333-56 chr12 39148986 39149266 + 1 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -243535 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 150.667-282 chr4 142914199 142914349 + 1 NA Intergenic Intergenic -67739 NM_001101669 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 209.667-34 chr12 75951717 75952078 + 1 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 79879 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 225.333-96 chr4 32874747 32875045 + 1 NA Intergenic Intergenic 523858 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 262.333-44 chr2 54953518 54953861 + 1 NA intron (NM_001039753, intron 30 of 40) AluSx|SINE|Alu 56583 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 183.333-83 chr2 62509801 62510087 + 1 NA Intergenic Intergenic -3749 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 223.333-129 chr5 75628321 75628821 + 1 NA intron (NM_001276713, intron 5 of 13) intron (NM_001276713, intron 5 of 13) 17095 NM_001276713 728780 Hs.370455 NM_001271529 ENSG00000189045 ANKDD1B - ankyrin repeat and death domain containing 1B protein-coding 159.333-348 chr9 27748172 27748457 + 1 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -174448 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 151.333-67 chr10 108897793 108897975 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -828591 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 364.667-7 chr15 27444148 27444662 + 1 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) L1MEg|LINE|L1 -283086 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 156.667-82 chr12 64115018 64115188 + 1 NA intron (NM_001346201, intron 17 of 21) LTR37A|LTR|ERV1 107193 NM_001300940 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 123.667-120 chr3 40570857 40571100 + 1 NA Intergenic Intergenic 46018 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 120.333-102 chr2 151615652 151615821 + 1 NA intron (NM_001271208, intron 76 of 182) intron (NM_001271208, intron 76 of 182) 118740 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 145.333-219 chr4 87509201 87509369 + 1 NA intron (NM_001128310, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 20218 NM_001128310 8404 Hs.62886 NM_004684 ENSG00000152583 SPARCL1 MAST 9|MAST9|PIG33|SC1 SPARC like 1 protein-coding 261.333-111 chr9 23422779 23423152 + 1 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 249434 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 113.667-156 chr4 48844007 48844170 + 1 NA intron (NM_001079839, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 12782 NM_001168254 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 129.333-104 chr20 36290520 36290681 + 1 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -15739 NM_001365621 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 205.333-64 chr13 51942237 51942473 + 1 NA intron (NM_001005918, intron 11 of 16) intron (NM_001005918, intron 11 of 16) 69095 NM_000053 540 Hs.492280 NM_000053 ENSG00000123191 ATP7B PWD|WC1|WD|WND ATPase copper transporting beta protein-coding 153.333-110 chr14 45465403 45465557 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -212278 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 227.667-43 chr21 30330813 30331308 + 1 NA Intergenic Intergenic 6634 NM_001077711 643812 Hs.580881 NM_001077711 ENSG00000206107 KRTAP27-1 - keratin associated protein 27-1 protein-coding 171.333-78 chr2 66641405 66641582 + 1 NA intron (NR_110156, intron 1 of 5) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 61734 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 219.667-35 chr17 69695877 69696206 + 1 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) MER83|LTR|ERV1 102054 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 157.333-318 chr7 39140429 39140656 + 1 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -126975 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 153.333-223 chr2 174643644 174643851 + 1 NA intron (NM_001077269, intron 1 of 7) intron (NM_001077269, intron 1 of 7) -9142 NM_003387 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 119.667-82 chr2 74291916 74292103 + 1 NA intron (NM_133478, intron 7 of 30) MIRb|SINE|MIR 23016 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 140.333-126 chr20 59517948 59518203 + 1 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -59434 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 220.667-108 chr8 130439950 130440193 + 1 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) L2b|LINE|L2 3589 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 252.667-20 chr12 23587771 23588088 + 1 NA intron (NM_152989, intron 12 of 17) intron (NM_152989, intron 12 of 17) -3343 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 161.667-127 chr2 62845959 62846129 + 1 NA intron (NM_001142615, intron 7 of 22) intron (NM_001142615, intron 7 of 22) 139147 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 145.667-291 chr8 109955709 109955865 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 19984 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 423.333-8 chr7 85112676 85113226 + 1 NA intron (NM_152754, intron 1 of 16) intron (NM_152754, intron 1 of 16) 8980 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 209.667-113 chr8 117402122 117402365 + 1 NA Intergenic Intergenic -118470 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 150.333-299 chr4 62783737 62783904 + 1 NA Intergenic Intergenic -622055 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 192.333-35 chr11 132787361 132787720 + 1 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) MIRc|SINE|MIR 156097 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 206.333-52 chr14 34607463 34607781 + 1 NA intron (NM_001366519, intron 3 of 12) intron (NM_001366519, intron 3 of 12) 22526 NR_159357 58533 Hs.276523 NM_021249 ENSG00000129515 SNX6 MSTP010|TFAF2 sorting nexin 6 protein-coding 151.333-127 chr14 57934603 57934774 + 1 NA Intergenic Intergenic -68596 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 218.667-93 chr6 65449816 65450275 + 1 NA intron (NM_198283, intron 4 of 9) intron (NM_198283, intron 4 of 9) 129759 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 295.333-15 chr14 67189104 67189459 + 1 NA promoter-TSS (NM_173526) promoter-TSS (NM_173526) -159 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 159.333-360 chrX 43522944 43523219 + 1 NA Intergenic Intergenic -131826 NM_001270458 4128 Hs.183109 NM_000240 ENSG00000189221 MAOA BRNRS|MAO-A monoamine oxidase A protein-coding 194.667-133 chr6 37751130 37751511 + 1 NA Intergenic Intergenic -53437 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 155.667-222 chr3 75869917 75870122 + 1 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -84470 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 171.667-62 chr16 19989365 19989679 + 1 NA Intergenic (CTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 84256 NM_001002911 124274 Hs.446875 NM_001002911 ENSG00000180269 GPR139 GPRg1|PGR3 G protein-coupled receptor 139 protein-coding 155.667-359 chr8 99179994 99180269 + 1 NA intron (NM_017890, intron 16 of 61) intron (NM_017890, intron 16 of 61) 166865 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 214.667-125 chr9 1093238 1093719 + 1 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 41991 NM_001370532 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 153.667-286 chr4 48725498 48725705 + 1 NA intron (NM_015030, intron 1 of 63) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 54698 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 194.333-103 chr4 102654714 102655058 + 1 NA intron (NM_005908, intron 12 of 16) L1MB8|LINE|L1 106082 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 140.667-149 chr3 110619828 110619988 + 1 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 450051 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-74 chr13 50241507 50241674 + 1 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 69572 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 170.333-168 chr4 182135890 182136149 + 1 NA Intergenic Intergenic 8496 NR_125905 90768 Hs.175465 NR_027107 TENM3-AS1 - TENM3 antisense RNA 1 ncRNA 176.333-166 chr8 76998498 76998774 + 1 NA intron (NM_001172086, intron 2 of 4) intron (NM_001172086, intron 2 of 4) 1442 NM_000318 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 225.333-93 chr22 38482902 38483275 + 1 NA TTS (NM_001098504) TTS (NM_001098504) 14992 NM_006855 11015 Hs.745072 NM_006855 ENSG00000100196 KDELR3 ERD2L3 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3 protein-coding 217.333-14 chr1 184966007 184966482 + 1 NA intron (NM_052966, intron 1 of 13) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 8264 NM_052966 116496 Hs.518662 NM_052966 ENSG00000135842 NIBAN1 C1orf24|FAM129A|GIG39|NIBAN niban apoptosis regulator 1 protein-coding 158.667-254 chr4 167001351 167001513 + 1 NA intron (NM_001204354, intron 2 of 9) L1MB8|LINE|L1 232994 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 147.333-338 chrX 93843198 93843372 + 1 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 169079 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 198.667-115 chr20 576049 576439 + 1 NA Intergenic Intergenic -32454 NM_177560 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 151.333-355 chr6 6144847 6145129 + 1 NA 3' UTR (NM_000129, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_000129, exon 15 of 15) -24346 NR_049863 100847034 NR_049863 ENSG00000283616 MIR5683 - microRNA 5683 ncRNA 201.667-101 chr6 38825533 38825813 + 1 NA intron (NM_001371, intron 27 of 91) intron (NM_001371, intron 27 of 91) 110362 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 172.333-83 chr2 118753514 118753839 + 1 NA Intergenic Intergenic 94507 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 218.667-71 chr3 176272395 176272648 + 1 NA Intergenic Intergenic 27970 NR_031687 100302204 NR_031687 ENSG00000221737 MIR548I1 MIR548I-1|MIRN548I1|hsa-mir-548i-1|mir-548i-1 microRNA 548i-1 ncRNA 126.667-128 chr4 144341447 144341663 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -200837 NM_001308190 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 230.667 chr1 10827792 10828063 + 1 NA Intergenic Intergenic -31281 NM_017766 54897 Hs.439894 NM_017766 ENSG00000130940 CASZ1 CAS11|CST|SRG|ZNF693|dJ734G22.1 castor zinc finger 1 protein-coding 129.333-140 chr4 69653101 69653251 + 1 NA promoter-TSS (NM_006798) promoter-TSS (NM_006798) 71 NM_001252274 10941 Hs.225950 NM_006798 ENSG00000173610 UGT2A1 UDPGT2A1 UDP glucuronosyltransferase family 2 member A1 complex locus protein-coding 186.333-99 chr3 58765876 58766136 + 1 NA intron (NM_001351532, intron 14 of 14) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -58465 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 311.667-19 chr4 86750260 86750646 + 1 NA intron (NM_080684, intron 17 of 44) intron (NM_080684, intron 17 of 44) 98931 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 209.333-170 chr4 54375078 54375471 + 1 NA Intergenic Intergenic 42382 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 153.333-222 chr2 172201132 172201301 + 1 NA Intergenic Intergenic 98210 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 171.333-94 chr2 169286911 169287107 + 1 NA intron (NM_004525, intron 9 of 78) intron (NM_004525, intron 9 of 78) 75525 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 160.333-138 chr2 27653142 27653310 + 1 NA 3' UTR (NM_001282729, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001282729, exon 6 of 6) -10245 NM_018158 22950 Hs.306000 NM_018158 ENSG00000163798 SLC4A1AP HLC3 solute carrier family 4 member 1 adaptor protein protein-coding 145.667-138 chr2 99923718 99923920 + 1 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 181764 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 347.667-4 chr12 20005844 20006304 + 1 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -8611 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 202.667-148 chr8 124633793 124634184 + 1 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 94485 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 150.333-438 chr9 102402436 102402590 + 1 NA Intergenic Intergenic -117124 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 209.667-27 chr11 79737719 79738079 + 1 NA Intergenic Intergenic -296869 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 264.333-55 chr4 86176128 86176501 + 1 NA intron (NM_001318069, intron 3 of 13) intron (NM_001318069, intron 3 of 13) 56508 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 295.333-37 chr3 24885111 24885663 + 1 NA intron (NM_001290216, intron 2 of 10) L3|LINE|CR1 56064 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 172.667-125 chr5 133615037 133615349 + 1 NA Intergenic Intergenic -2652 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 137.667-54 chr14 48480384 48480657 + 1 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -685506 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 153.333-379 chr7 19139621 19139872 + 1 NA Intergenic Intergenic 5675 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 196.667-27 chr11 63016763 63017030 + 1 NA Intergenic Intergenic -1051 NM_001184732 9376 Hs.266223 NM_004254 ENSG00000149452 SLC22A8 OAT3 solute carrier family 22 member 8 protein-coding 152.667-98 chr14 33792411 33792579 + 1 NA intron (NM_001165893, intron 8 of 10) intron (NM_001165893, intron 8 of 10) 83558 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 361.667-2 chr12 18700866 18701310 + 1 NA intron (NM_033123, intron 9 of 14) AluSx|SINE|Alu 36421 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 156.667-42 chr10 50301231 50301449 + 1 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -52730 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 114.667-184 chr3 190098175 190098318 + 1 NA intron (NM_001134418, intron 1 of 14) MIR1_Amn|SINE|MIR 22651 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 122.333-148 chr3 182636609 182636778 + 1 NA Intergenic Intergenic -129569 NR_134941 105374244 Hs.130176 NR_134941 ENSG00000244247 LINC01995 - long intergenic non-protein coding RNA 1995 ncRNA 139.667-128 chr3 185247156 185247340 + 1 NA intron (NM_001966, intron 2 of 6) intron (NM_001966, intron 2 of 6) 6024 NR_106712 100847054 NR_106712 ENSG00000264614 MIR5588 - microRNA 5588 ncRNA 145.333-78 chr14 39147857 39148078 + 1 NA 3' UTR (NM_177452, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_177452, exon 5 of 5) 22366 NM_177452 122553 Hs.13303 NM_177452 ENSG00000182400 TRAPPC6B NEDMEBA|TPC6 trafficking protein particle complex 6B protein-coding 172.333-189 chr8 121161051 121161345 + 1 NA Intergenic Intergenic -349152 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 257.667-54 chr22 26515285 26515610 + 1 NA TTS (NR_144529) TTS (NR_144529) 2915 NR_144529 100507599 Hs.405877 NR_144529 LOC100507599 - uncharacterized LOC100507599 ncRNA 395.667-9 chr8 67650424 67651147 + 1 NA intron (NM_020361, intron 1 of 10) intron (NM_020361, intron 1 of 10) 95575 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 173.667-191 chr9 37448187 37448493 + 1 NA intron (NM_014872, intron 1 of 1) intron (NM_014872, intron 1 of 1) 17110 NM_014872 9925 Hs.161276 NM_014872 ENSG00000168795 ZBTB5 - zinc finger and BTB domain containing 5 protein-coding 275.667-49 chr6 45371530 45372004 + 1 NA intron (NM_181356, intron 1 of 12) intron (NM_181356, intron 1 of 12) 5751 NR_146635 8464 Hs.368325 NM_003599 ENSG00000196284 SUPT3H SPT3|SPT3L SPT3 homolog, SAGA and STAGA complex component protein-coding 178.667-43 chr13 61035994 61036273 + 1 NA Intergenic Intergenic 163747 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 247.667-60 chr3 32994123 32994391 + 1 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 42613 NM_005508 1233 Hs.184926 NM_005508 ENSG00000183813 CCR4 CC-CKR-4|CD194|CKR4|CMKBR4|ChemR13|HGCN:14099|K5-5 C-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 301.667-33 chr5 60788892 60789541 + 1 NA intron (NM_001104558, intron 1 of 7) L1ME4b|LINE|L1 55053 NM_001297617 79993 Hs.274256 NM_024930 ENSG00000164181 ELOVL7 - ELOVL fatty acid elongase 7 protein-coding 160.333-91 chr13 95614317 95614509 + 1 NA intron (NM_014934, intron 10 of 21) intron (NM_014934, intron 10 of 21) 30293 NM_198968 22873 Hs.656580 NM_014934 ENSG00000134874 DZIP1 DZIP|DZIPt1 DAZ interacting zinc finger protein 1 protein-coding 156.667-320 chr7 42277757 42277981 + 1 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -40660 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 136.667-165 chr7 11623439 11623710 + 1 NA intron (NM_015204, intron 2 of 26) intron (NM_015204, intron 2 of 26) 208624 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 151.333-411 chr8 67144345 67144623 + 1 NA intron (NM_001363133, intron 15 of 27) AluJb|SINE|Alu 60636 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 153.667-408 chr9 97678915 97679183 + 1 NA intron (NR_149094, intron 5 of 6) L1MC4|LINE|L1 18360 NR_149093 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 151.333-381 chr7 18131856 18132037 + 1 NA intron (NM_001204144, intron 1 of 12) intron (NM_001204144, intron 1 of 12) -4637 NR_031635 100302140 NR_031635 ENSG00000221393 MIR1302-6 MIRN1302-6|hsa-mir-1302-6 microRNA 1302-6 ncRNA 146.667-80 chr12 76336529 76336734 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 11784 NM_024685 79738 Hs.96322 NM_024685 ENSG00000179941 BBS10 C12orf58 Bardet-Biedl syndrome 10 protein-coding 226.333-74 chr22 39539539 39539901 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6972 NM_194326 91582 Hs.526933 NM_194326 ENSG00000187051 RPS19BP1 AROS|S19BP ribosomal protein S19 binding protein 1 protein-coding 218.333-10 chr1 211335076 211335318 + 1 NA intron (NM_001319207, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 8364 NM_001033910 7188 Hs.523930 NM_004619 ENSG00000082512 TRAF5 MGC:39780|RNF84 TNF receptor associated factor 5 protein-coding 263.667-48 chr2 147129824 147130266 + 1 NA Intergenic Intergenic 542988 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 378.667-22 chr8 82962705 82963368 + 1 NA Intergenic Intergenic 50932 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 153.333-436 chr8 137545267 137545559 + 1 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -131825 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 216.667-105 chr8 115912064 115912304 + 1 NA Intergenic Intergenic -243209 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 226.333-89 chr4 94034102 94034408 + 1 NA Intergenic Intergenic 173301 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 216.667-66 chr21 30339958 30340296 + 1 NA Intergenic Intergenic -2433 NM_001077711 643812 Hs.580881 NM_001077711 ENSG00000206107 KRTAP27-1 - keratin associated protein 27-1 protein-coding 162.667-41 chr11 3732587 3732929 + 1 NA intron (NR_157590, intron 13 of 31) intron (NR_157590, intron 13 of 31) -61374 NM_001303034 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 156.667-171 chr2 29886734 29886891 + 1 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) MIRb|SINE|MIR 34774 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 218.667-9 chr1 206592157 206592440 + 1 NA intron (NM_006893, intron 14 of 14) L2c|LINE|L2 20167 NM_006893 1939 Hs.497581 NM_006893 ENSG00000143486 EIF2D HCA56|LGTN eukaryotic translation initiation factor 2D protein-coding 153.667-45 chr10 57157398 57157670 + 1 NA Intergenic Intergenic 147025 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 153.333-81 chr12 9208837 9209074 + 1 NA promoter-TSS (NM_002864) promoter-TSS (NM_002864) -560 NM_002864 5858 Hs.707491 NM_002864 ENSG00000126838 PZP CPAMD6 PZP alpha-2-macroglobulin like protein-coding 199.667-41 chr14 47743395 47743800 + 1 NA Intergenic Intergenic 17507 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 208.667-52 chr16 59951800 59952015 + 1 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) intron (NR_110917, intron 1 of 3) 96554 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 195.667-78 chr21 28869813 28870078 + 1 NA Intergenic Intergenic 15422 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 345.333-13 chr17 73043188 73043628 + 1 NA intron (NM_001352692, intron 3 of 9) MER5B|DNA|hAT-Charlie 49280 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 279.667-12 chr14 51697847 51698288 + 1 NA intron (NM_001042481, intron 3 of 14) intron (NM_001042481, intron 3 of 14) -19216 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 137.333-134 chr4 56078323 56078522 + 1 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -91773 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 154.667-342 chr6 90702847 90703050 + 1 NA Intergenic Intergenic -115876 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 157.667-152 chr2 155551547 155551825 + 1 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 703245 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 245.333-31 chr12 107106765 107107141 + 1 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -13404 NM_004075 1407 Hs.151573 NM_004075 ENSG00000008405 CRY1 DSPD|PHLL1 cryptochrome circadian regulator 1 protein-coding 224.667-24 chr14 70765335 70765664 + 1 NA intron (NM_001284231, intron 1 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 17953 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 225.333-61 chr15 62287763 62288052 + 1 NA Intergenic Intergenic 16827 NR_107034 102465869 NR_107034 ENSG00000277919 MIR8067 hsa-mir-8067 microRNA 8067 ncRNA 410.333-11 chr8 60811825 60812645 + 1 NA intron (NM_017780, intron 7 of 37) L1MC4a|LINE|L1 70976 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 279.333-61 chr4 79577714 79578089 + 1 NA Intergenic Intergenic 85308 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 150.333-408 chr8 96357962 96358183 + 1 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 28576 NR_125829 102724804 Hs.571415 NR_125828 ENSG00000253105 LOC102724804 - uncharacterized LOC102724804 ncRNA 257.667-36 chr2 29772933 29773460 + 1 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 148390 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 152.333-362 chr7 146459984 146460173 + 1 NA Intergenic Intergenic -314193 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 151.667-269 chr5 29762242 29762433 + 1 NA Intergenic Intergenic -118223 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 211.667-37 chr13 25393945 25394395 + 1 NA intron (NM_016529, intron 1 of 36) intron (NM_016529, intron 1 of 36) 22196 NM_016529 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 157.667-164 chr2 224354205 224354362 + 1 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 47711 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 315.667-10 chr18 58001722 58002218 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -42256 NM_015277 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 146.333-139 chr2 9127180 9127359 + 1 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -79496 NM_001135191 8853 Hs.555902 NM_003887 ENSG00000151693 ASAP2 AMAP2|CENTB3|DDEF2|PAG3|PAP|Pap-alpha|SHAG1 ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 190.667-110 chr6 46372330 46372561 + 1 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) intron (NM_001251973, intron 2 of 4) -46553 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 293.667-42 chr3 54881766 54882165 + 1 NA intron (NM_018398, intron 21 of 37) intron (NM_018398, intron 21 of 37) 19290 NR_046666 100874237 Hs.570583 NR_046666 ENSG00000243715 CACNA2D3-AS1 - CACNA2D3 antisense RNA 1 ncRNA 114.667-200 chr5 15997615 15997760 + 1 NA Intergenic Intergenic 62505 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 189.667-152 chr9 115613344 115613715 + 1 NA Intergenic Intergenic 130710 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 148.667-258 chr3 115214307 115214590 + 1 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -67160 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 163.333-123 chr17 69751688 69752060 + 1 NA intron (NR_109972, intron 3 of 4) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 157887 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 232.667-3 chr1 240984441 240984838 + 1 NA intron (NM_001350116, intron 3 of 16) intron (NM_001350116, intron 3 of 16) -147633 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 182.333-13 chr1 247855323 247855627 + 1 NA Intergenic Intergenic -1712 NM_015431 25893 Hs.269151 NM_015431 ENSG00000162722 TRIM58 BIA2 tripartite motif containing 58 protein-coding 127.667-78 chr2 45574047 45574237 + 1 NA intron (NM_018079, intron 8 of 20) intron (NM_018079, intron 8 of 20) 37125 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 150.333-39 chr10 68401367 68401605 + 1 NA intron (NR_103476, intron 3 of 18) intron (NR_103476, intron 3 of 18) 5703 NM_017987 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 128.667-33 chr11 32973793 32973998 + 1 NA intron (NM_001076786, intron 11 of 12) L1MA8|LINE|L1 -41983 NM_001077242 91614 Hs.280990 NM_139160 ENSG00000121690 DEPDC7 TR2|dJ85M6.4 DEP domain containing 7 protein-coding 199.667-123 chr6 152293286 152293630 + 1 NA intron (NM_182961, intron 95 of 145) intron (NM_182961, intron 95 of 145) -87072 NR_120501 100505475 Hs.571203 NR_120501 SYNE1-AS1 - SYNE1 antisense RNA 1 ncRNA 129.333-119 chr3 33182292 33182440 + 1 NA intron (NM_015551, intron 3 of 4) L1MC1|LINE|L1 36444 NM_015551 26032 Hs.196647 NM_015551 ENSG00000173705 SUSD5 - sushi domain containing 5 protein-coding 180.667-21 chr11 26008488 26008820 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -180469 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 262.333-19 chr11 75061626 75062162 + 1 NA Intergenic Intergenic 34996 NM_001005285 341152 Hs.554515 NM_001005285 ENSG00000171561 OR2AT4 OR11-265 olfactory receptor family 2 subfamily AT member 4 protein-coding 150.667-343 chr6 144658916 144659086 + 1 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) intron (NM_007124, intron 50 of 73) 253346 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 145.667-82 chr14 62533168 62533460 + 1 NA Intergenic Intergenic -393341 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 207.667-13 chr10 90106187 90106628 + 1 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -149034 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 151.333-133 chr14 75414922 75415269 + 1 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -12629 NM_001135047 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 157.667-331 chr8 83434251 83434424 + 1 NA Intergenic Intergenic 30579 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 199.667-79 chr2 201996082 201996386 + 1 NA Intergenic Intergenic -38353 NM_003507 8324 Hs.173859 NM_003507 ENSG00000155760 FZD7 FzE3 frizzled class receptor 7 protein-coding 129.333-56 chr13 54227280 54227539 + 1 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 84639 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 148.333-284 chr4 60320296 60320529 + 1 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -602207 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 163.333-253 chr7 17824255 17824611 + 1 NA intron (NM_001350862, intron 17 of 25) intron (NM_001350862, intron 17 of 25) 116061 NM_015132 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 115.667-195 chr6 159978819 159979036 + 1 NA intron (NM_000876, intron 1 of 47) intron (NM_000876, intron 1 of 47) 9828 NM_000876 3482 Hs.487062 NM_000876 ENSG00000197081 IGF2R CD222|CI-M6PR|CIMPR|M6P-R|M6P/IGF2R|MPR 300|MPR1|MPR300|MPRI insulin like growth factor 2 receptor protein-coding 164.333-102 chr18 60373491 60373750 + 1 NA promoter-TSS (NM_005912) promoter-TSS (NM_005912) -845 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 177.667-123 chr7 7568358 7568641 + 1 NA intron (NM_001370078, intron 1 of 8) intron (NM_001370078, intron 1 of 8) 473 NM_001370078 54468 Hs.520215 NM_019005 ENSG00000164654 MIOS MIO|Sea4|Yulink meiosis regulator for oocyte development protein-coding 176.333-179 chr9 73433167 73433503 + 1 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 281470 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 167.333-106 chr17 31740968 31741139 + 1 NA Intergenic Intergenic 117909 NM_001330176 55352 Hs.462729 NM_018405 ENSG00000172301 COPRS C17orf79|COPR5|HSA272196|TTP1 coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator protein-coding 226.667-77 chr6 1480918 1481307 + 1 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -90701 NR_106778 102466720 NR_106778 ENSG00000275859 MIR6720 hsa-mir-6720|mir-6720 microRNA 6720 ncRNA 205.667-95 chr3 87888370 87888721 + 1 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) intron (NM_001322210, intron 2 of 2) -94031 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 163.667-194 chr5 23216587 23216759 + 1 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -290936 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 180.667-18 chr10 86261328 86261599 + 1 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) L2a|LINE|L2 3325 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 140.667-62 chr12 48308005 48308169 + 1 NA Intergenic Intergenic -20893 NM_181788 341567 Hs.155833 NM_181788 ENSG00000187166 H1FNT H1.7|H1T2 H1 histone family member N, testis specific protein-coding 160.667-265 chr6 72563465 72563767 + 1 NA Intergenic Intergenic -58227 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 240.667-9 chr10 33628082 33628434 + 1 NA Intergenic Intergenic 144422 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 172.333-52 chr14 65553580 65553768 + 1 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) L1MCc|LINE|L1 82572 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 137.333-120 chr3 49519524 49519727 + 1 NA intron (NM_001177640, intron 3 of 3) intron (NM_001177640, intron 3 of 3) 34741 NR_038866 100132677 Hs.435651 NR_038866 ENSG00000226913 BSN-DT BSN-AS2 BSN divergent transcript ncRNA 164.333-98 chr17 77846366 77846635 + 1 NA Intergenic Intergenic 37587 NR_028337 400624 Hs.514521 NM_001001685 ENSG00000204283 LINC01973 - long intergenic non-protein coding RNA 1973 ncRNA 149.333-85 chr12 28846989 28847254 + 1 NA Intergenic Intergenic -302157 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 143.667-275 chrX 64264229 64264473 + 1 NA Intergenic Intergenic -33744 NM_130388 142689 Hs.56281 NM_130388 ENSG00000198881 ASB12 - ankyrin repeat and SOCS box containing 12 protein-coding 158.333-234 chr4 92609641 92609807 + 1 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 305325 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 144.333-164 chr3 33497336 33497556 + 1 NA 3' UTR (NM_001207044, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_001207044, exon 33 of 33) -57041 NM_001128161 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 192.667-14 chr1 198223410 198223700 + 1 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 66557 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 188.333-138 chr7 3213332 3213689 + 1 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -54937 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 187.333-187 chr7 27967262 27967605 + 1 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) -213024 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-83 chr11 91963538 91963775 + 1 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -261378 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 111.667-152 chr20 8624978 8625129 + 1 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) intron (NM_182734, intron 3 of 32) -206132 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 234.667-57 chr2 156903735 156904060 + 1 NA Intergenic Intergenic -353808 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 273.667-28 chr17 53300664 53300995 + 1 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 315324 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 146.333-109 chr15 70684147 70684448 + 1 NA exon (NM_001008224, exon 8 of 19) exon (NM_001008224, exon 8 of 19) 17985 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 140.667-25 chr1 201439836 201439993 + 1 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -18184 NM_003281 7135 Hs.320890 NM_003281 ENSG00000159173 TNNI1 SSTNI|TNN1 troponin I1, slow skeletal type protein-coding 122.333-170 chr5 21652586 21652759 + 1 NA Intergenic (ATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 193192 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 206.667-72 chr2 224238095 224238395 + 1 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 163749 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 160.333-291 chr8 133164869 133165032 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -26089 NM_080838 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 278.333-48 chr8 137905128 137905502 + 1 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 178230 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 138.333-173 chr6 119875745 119875982 + 1 NA Intergenic Intergenic -139316 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 289.667-11 chr12 116168890 116169241 + 1 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) intron (NM_015335, intron 2 of 30) -20411 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 160.667-181 chr20 58438309 58438702 + 1 NA intron (NM_004738, intron 3 of 5) AluJo|SINE|Alu 49276 NR_036633 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 213.333-109 chr2 218814927 218815261 + 1 NA 3' UTR (NM_000784, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_000784, exon 9 of 9) -7996 NR_128707 103504730 NR_128707 ENSG00000283639 MIR9500 hsa-mir-9500 microRNA 9500 ncRNA 163.667-106 chr2 51698840 51699026 + 1 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 666332 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 199.667-55 chr16 10882874 10883180 + 1 NA intron (NR_104444, intron 1 of 17) intron (NR_104444, intron 1 of 17) 5825 NM_001286403 4261 Hs.592051 NM_000246 ENSG00000179583 CIITA C2TA|CIITAIV|MHC2TA|NLRA class II major histocompatibility complex transactivator protein-coding 167.667-211 chr8 126910454 126910701 + 1 NA Intergenic Intergenic -102577 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 138.667-218 chr9 101538162 101538336 + 1 NA intron (NM_019592, intron 2 of 19) L2c|LINE|L2 4396 NM_019592 56254 Hs.729085 NM_019592 ENSG00000155827 RNF20 BRE1|BRE1A|hBRE1 ring finger protein 20 protein-coding 155.333-370 chr7 101304810 101304968 + 1 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -3418 NR_110115 101927746 NR_110115 LOC101927746 - uncharacterized LOC101927746 ncRNA 223.667-49 chr3 110094508 110094871 + 1 NA Intergenic L2a|LINE|L2 491861 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 207.667-83 chr4 31398412 31398742 + 1 NA Intergenic Intergenic -107967 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 153.333-272 chr3 89842235 89842512 + 1 NA Intergenic Intergenic 734752 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 154.667-141 chr17 54027921 54028078 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 205072 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 211.667-35 chr12 64702755 64703138 + 1 NA Intergenic Intergenic 56460 NM_002076 2799 Hs.334534 NM_002076 ENSG00000135677 GNS G6S glucosamine (N-acetyl)-6-sulfatase protein-coding 174.333-92 chr3 136641399 136641608 + 1 NA intron (NM_005862, intron 1 of 33) L1MC4a|LINE|L1 110875 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 165.667-33 chr11 129425990 129426216 + 1 NA intron (NM_003658, intron 1 of 3) intron (NM_003658, intron 1 of 3) 50255 NM_003658 8538 Hs.591944 NM_003658 ENSG00000043039 BARX2 - BARX homeobox 2 protein-coding 197.333-82 chr17 53449142 53449557 + 1 NA Intergenic Intergenic -373578 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 137.667-64 chr14 96534871 96535151 + 1 NA 3' UTR (NM_001252006, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001252006, exon 9 of 9) 32146 NM_001293628 10914 Hs.253726 NM_032632 ENSG00000090060 PAPOLA PAP|PAP-alpha poly(A) polymerase alpha protein-coding 138.333-188 chr7 112970074 112970252 + 1 NA intron (NR_110162, intron 4 of 5) AluJr|SINE|Alu 25480 NR_110162 101928036 Hs.120006 NR_110162 ENSG00000234520 HRAT17 - heart tissue-associated transcript 17 ncRNA 177.333-35 chr12 21772685 21772970 + 1 NA intron (NM_004982, intron 2 of 2) intron (NM_004982, intron 2 of 2) 1879 NM_004982 3764 Hs.102308 NM_004982 ENSG00000121361 KCNJ8 KIR6.1|uKATP-1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 8 protein-coding 165.667-97 chr2 161397486 161397662 + 1 NA intron (NM_005805, intron 10 of 11) intron (NM_005805, intron 10 of 11) -18723 NM_006593 10716 Hs.210862 NM_006593 ENSG00000136535 TBR1 IDDAS|TBR-1|TES-56 T-box brain transcription factor 1 protein-coding 192.333-38 chr12 7937916 7938201 + 1 NA Intergenic Intergenic -1871 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 154.333-368 chr9 73341178 73341350 + 1 NA Intergenic Intergenic 189399 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 242.667-21 chr11 92113306 92113633 + 1 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -111565 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 217.667-53 chr20 55308102 55308390 + 1 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -114797 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 166.667-207 chr6 124483211 124483456 + 1 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) intron (NM_001300738, intron 4 of 7) 200328 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 202.333-58 chr14 67970619 67971061 + 1 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 147248 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 199.667-76 chr2 84901529 84901920 + 1 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -3932 NM_021103 9168 Hs.446574 NM_021103 ENSG00000034510 TMSB10 MIG12|TB10 thymosin beta 10 protein-coding 151.333-49 chr10 38497729 38497986 + 1 NA Intergenic Intergenic 69711 NR_024497 399744 Hs.497951 NM_001013665 LINC00999 - long intergenic non-protein coding RNA 999 ncRNA 160.667-111 chr16 53216898 53217169 + 1 NA intron (NM_001352157, intron 2 of 37) L1MC4a|LINE|L1 8582 NM_001352158 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 216.333-154 chrX 93595719 93596113 + 1 NA Intergenic Intergenic 77662 NM_004538 4675 Hs.21365 NM_004538 ENSG00000186310 NAP1L3 MB20|NPL3 nucleosome assembly protein 1 like 3 protein-coding 151.667-246 chr4 35511381 35511640 + 1 NA Intergenic Intergenic 732429 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 157.667-250 chr5 73558127 73558293 + 1 NA intron (NM_023039, intron 3 of 8) FLAM_C|SINE|Alu 7429 NM_023039 57763 Hs.239154 NM_023039 ENSG00000164331 ANKRA2 ANKRA ankyrin repeat family A member 2 protein-coding 154.667-227 chr22 26061288 26061584 + 1 NA Intergenic Intergenic -108026 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 162.667-194 chr4 58605340 58605570 + 1 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -69127 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 258.333-18 chr13 47734730 47735073 + 1 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 197721 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 149.667-79 chr11 104852649 104852805 + 1 NA Intergenic Intergenic 45943 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 153.333-240 chr20 41091215 41091410 + 1 NA intron (NM_003286, intron 8 of 20) L1MC5a|LINE|L1 -46231 NM_002660 5335 Hs.268177 NM_002660 ENSG00000124181 PLCG1 NCKAP3|PLC-II|PLC1|PLC148|PLCgamma1 phospholipase C gamma 1 protein-coding 152.333-134 chr16 56799475 56799689 + 1 NA intron (NM_014669, intron 4 of 21) intron (NM_014669, intron 4 of 21) 16126 NM_001242796 9688 Hs.276878 NM_014669 ENSG00000102900 NUP93 NIC96 nucleoporin 93 protein-coding 199.333-96 chr17 41457475 41457702 + 1 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 9798 NM_002278 3882 Hs.41752 NM_002278 ENSG00000108759 KRT32 HA2|HKA2|KRTHA2|hHa2 keratin 32 protein-coding 206.667-57 chr2 4742656 4743009 + 1 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -86610 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 123.333-173 chr5 72003717 72003884 + 1 NA Intergenic Intergenic -103675 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 242.667-110 chr9 31582106 31582433 + 1 NA Intergenic Intergenic -200779 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 175.667-3 chr1 80364332 80364617 + 1 NA Intergenic Intergenic -171281 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 150.667-11 chr1 114394391 114394573 + 1 NA 3' UTR (NM_033020, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_033020, exon 19 of 19) 116721 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 183.333-126 chr5 35311478 35311757 + 1 NA Intergenic Intergenic -81130 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 150.333-68 chr11 110136184 110136474 + 1 NA intron (NM_033390, intron 1 of 5) intron (NM_033390, intron 1 of 5) 42937 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 146.667-191 chr20 836598 836789 + 1 NA intron (NM_207121, intron 1 of 1) L1MB3|LINE|L1 640 NM_207121 83541 Hs.574822 NM_031424 ENSG00000125898 FAM110A C20orf55|F10|bA371L19.3 family with sequence similarity 110 member A protein-coding 127.333-200 chr9 138085367 138085524 + 1 NA intron (NM_001243812, intron 35 of 45) L1MA5|LINE|L1 -40374 NR_121582 101928786 Hs.678847 NR_121582 LOC101928786 - uncharacterized LOC101928786 ncRNA 229.333-38 chr14 81037545 81037879 + 1 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) L1MA6|LINE|L1 82091 NM_000369 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 189.667-88 chr20 57343766 57344145 + 1 NA TTS (NM_012444) TTS (NM_012444) -7300 NM_003610 8480 Hs.371698 NM_003610 ENSG00000101146 RAE1 Gle2|MIG14|MRNP41|Mnrp41|dJ481F12.3|dJ800J21.1 ribonucleic acid export 1 protein-coding 325.667-20 chr5 181152790 181153263 + 1 NA Intergenic Intergenic -1917 NM_206880 285659 Hs.553681 NM_206880 ENSG00000182613 OR2V2 OR2V3|OST713 olfactory receptor family 2 subfamily V member 2 protein-coding 206.333-7 chr1 170301560 170301877 + 1 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -17510 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 201.667-106 chr6 90992351 90992673 + 1 NA Intergenic Intergenic -405440 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 122.667-203 chr9 13156049 13156201 + 1 NA intron (NM_003829, intron 24 of 45) MIRb|SINE|MIR 123439 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 160.667-81 chr13 77350626 77350940 + 1 NA Intergenic Intergenic -23689 NM_015057 23077 Hs.591221 NM_015057 ENSG00000005810 MYCBP2 Myc-bp2|PAM|PHR1|Phr MYC binding protein 2 protein-coding 183.667-77 chr2 104828693 104828994 + 1 NA intron (NR_037883, intron 1 of 3) intron (NR_037883, intron 1 of 3) 22633 NR_037883 100506421 Hs.437281 NR_037883 ENSG00000233639 PANTR1 LINC01158|linc-Brn1a|linc-POU3F3 POU3F3 adjacent non-coding transcript 1 ncRNA 267.667-6 chr10 28430698 28431255 + 1 NA Intergenic L2|LINE|L2 64837 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 145.333-304 chr8 112789831 112790003 + 1 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 146424 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 209.333-126 chr2 196787379 196787728 + 1 NA intron (NM_012086, intron 6 of 17) L2a|LINE|L2 12130 NM_001206774 9330 Hs.470996 NM_012086 ENSG00000119041 GTF3C3 TFIIIC102|TFIIICgamma|TFiiiC2-102 general transcription factor IIIC subunit 3 protein-coding 190.667-88 chr4 41636392 41636729 + 1 NA intron (NM_001330672, intron 13 of 31) intron (NM_001330672, intron 13 of 31) 23658 NM_001330983 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 159.333-61 chr11 63650787 63650961 + 1 NA intron (NM_015459, intron 5 of 12) Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 20502 NM_015459 25923 Hs.356719 NM_015459 ENSG00000184743 ATL3 HSN1F atlastin GTPase 3 protein-coding 170.667-50 chr14 88807141 88807448 + 1 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14341 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 119.667 chr1 15756639 15756849 + 1 NA intron (NM_001350151, intron 1 of 9) intron (NM_001350151, intron 1 of 9) 106 NM_001350151 54751 Hs.530101 NM_017556 ENSG00000162458 FBLIM1 CAL|FBLP-1|FBLP1 filamin binding LIM protein 1 protein-coding 169.667-93 chr17 77190337 77190549 + 1 NA intron (NM_001144001, intron 1 of 14) L1MD1|LINE|L1 5230 NM_001144001 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 125.333-100 chr2 239647417 239647594 + 1 NA Intergenic Intergenic -115355 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 140.667-192 chr5 163478998 163479166 + 1 NA intron (NM_012484, intron 12 of 17) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA 14976 NR_109892 101927813 Hs.726818 NR_109892 HMMR-AS1 - HMMR antisense RNA 1 ncRNA 160.333-198 chr3 162265256 162265566 + 1 NA Intergenic Intergenic 768603 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 165.333-26 chr10 46039964 46040140 + 1 NA exon (NM_002443, exon 2 of 4) exon (NM_002443, exon 2 of 4) 6217 NM_138634 4477 Hs.255462 NM_002443 ENSG00000263639 MSMB HPC13|IGBF|MSP|MSPB|PN44|PRPS|PSP|PSP-94|PSP57|PSP94 microseminoprotein beta protein-coding 146.667-337 chr8 118992372 118992673 + 1 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) 40259 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 149.333-357 chr7 4668446 4668718 + 1 NA Intergenic Intergenic -13713 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 209.333-131 chr20 12414200 12414450 + 1 NA Intergenic Intergenic 496432 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 230.667-17 chr15 33272308 33272609 + 1 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -24903 NR_046005 100652857 Hs.439998 NR_046005 TMCO5B - transmembrane and coiled-coil domains 5B (pseudogene) pseudo 117.667-5 chr1 115272379 115272679 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10505 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 221.667-64 chr5 23730822 23731288 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -220293 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 143.333-223 chr5 45801538 45801831 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105304 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 201-22 chr10 107707652 107708156 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 361389 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 181.333-60 chr17 59416754 59417216 + 0.666667 NA Intergenic MER9a2|LTR|ERVK 50902 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 186.667-147 chr8 64736634 64737057 + 0.666667 NA intron (NM_004820, intron 1 of 5) intron (NM_004820, intron 1 of 5) 61892 NM_001324112 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 112.667-107 chr19 51892497 51892827 + 0.666667 NA intron (NM_023074, intron 4 of 4) intron (NM_023074, intron 4 of 4) 4637 NR_110733 101928571 Hs.553920 NR_110733 ENSG00000268095 ZNF649-AS1 - ZNF649 antisense RNA 1 ncRNA 224.667-18 chr13 53467643 53468154 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -315998 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 129.667-22 chr10 33285486 33285771 + 0.666667 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) AluSx|SINE|Alu 49039 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 214.666-55 chr6 3462177 3462785 + 0.666667 NA intron (NR_147844, intron 1 of 1) intron (NR_147844, intron 1 of 1) -5922 NM_015482 63027 Hs.713588 NM_015482 ENSG00000137266 SLC22A23 C6orf85 solute carrier family 22 member 23 protein-coding 181.333-135 chr5 51004863 51005268 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34878 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 149.667-65 chr10 90433410 90433706 + 0.666667 NA intron (NR_110657, intron 3 of 6) intron (NR_110657, intron 3 of 6) 107247 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 192-27 chr10 119580756 119581219 + 0.666667 NA intron (NM_001323964, intron 5 of 12) intron (NM_001323964, intron 5 of 12) 16042 NM_001033925 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 120.667-25 chr10 128354464 128354782 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 68673 NR_120619 101927381 Hs.523342 NR_120619 ENSG00000280953 LINC01163 TCONS_00017722 long intergenic non-protein coding RNA 1163 ncRNA 131.333-28 chr10 74941949 74942180 + 0.666667 NA intron (NM_001370144, intron 3 of 15) AluSx1|SINE|Alu 29278 NR_134476 101929165 Hs.670533 NR_134476 LOC101929165 - uncharacterized LOC101929165 ncRNA 157-85 chr3 30416408 30416722 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102303 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 119.333-213 chr8 81095125 81095356 + 0.666667 NA intron (NM_018440, intron 1 of 8) intron (NM_018440, intron 1 of 8) 16828 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 237.333-81 chr3 189121909 189122415 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49809 NM_198485 285386 Hs.729544 NM_198485 ENSG00000188001 TPRG1 FAM79B tumor protein p63 regulated 1 protein-coding 187.667-142 chr8 98732071 98732485 + 0.666667 NA intron (NM_006281, intron 4 of 10) HAL1ME|LINE|L1 93393 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 117.333-217 chr9 18184240 18184516 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -289775 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 141.667-43 chr11 29622467 29622801 + 0.666667 NA intron (NR_149106, intron 1 of 2) intron (NR_149106, intron 1 of 2) 3832 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 151.333-369 chr6 132422386 132422791 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -21113 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 142.333-230 chr7 130956447 130956719 + 0.666667 NA intron (NR_024153, intron 3 of 4) intron (NR_024153, intron 3 of 4) 43119 NR_109780 100506860 Hs.635013 NR_109780 LINC00513 - long intergenic non-protein coding RNA 513 ncRNA 192-123 chr6 69110017 69110439 + 0.666667 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) AluSg4|SINE|Alu 474946 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 175.333-60 chr16 65029972 65030351 + 0.666667 NA intron (NM_001797, intron 2 of 12) intron (NM_001797, intron 2 of 12) 91902 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 221.667-44 chr2 241604061 241604563 + 0.666667 NA intron (NM_001164356, intron 2 of 4) AluSp|SINE|Alu 13189 NM_001164356 51078 Hs.435759 NM_015963 ENSG00000176946 THAP4 CGI-36|Nb(III)|PP238 THAP domain containing 4 protein-coding 160-78 chr3 127867451 127867783 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -44367 NM_001003794 11343 Hs.277035 NM_007283 ENSG00000074416 MGLL HU-K5|HUK5|MAGL|MGL monoglyceride lipase protein-coding 115.667-60 chr12 75470613 75470939 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9979 NM_006851 11010 Hs.205558 NM_006851 ENSG00000139278 GLIPR1 CRISP7|GLIPR|RTVP1 GLI pathogenesis related 1 protein-coding 113-147 chr3 197946861 197947114 + 0.666667 NA intron (NM_001323029, intron 2 of 11) AluSq2|SINE|Alu 2938 NM_001323027 84223 Hs.591675 NM_032263 ENSG00000114473 IQCG CFAP122|DRC9 IQ motif containing G protein-coding 123.333-98 chr18 72600358 72600603 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56138 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 117.667-67 chr16 88922663 88922878 + 0.666667 NA intron (NM_005187, intron 1 of 11) intron (NM_005187, intron 1 of 11) -17267 NM_001290330 100129697 Hs.689377 NM_001290330 LOC100129697 - uncharacterized LOC100129697 protein-coding 156-62 chr19 30170282 30170617 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -201935 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 125.667-63 chr14 70225388 70225608 + 0.666667 NA intron (NR_135825, intron 2 of 3) LTR1|LTR|ERV1 22303 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 156.333-60 chr11 103400168 103400586 + 0.666667 NA intron (NM_001377, intron 84 of 88) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 290951 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 158.667-357 chr9 117577329 117577792 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -71046 NR_109806 101928797 Hs.382317 NR_109806 ENSG00000233569 LOC101928797 - uncharacterized LOC101928797 ncRNA 191-83 chr9 125766440 125766945 + 0.666667 NA intron (NR_024122, intron 2 of 7) intron (NR_024122, intron 2 of 7) 18509 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 198.667-39 chr11 103287876 103288306 + 0.666667 NA intron (NM_001377, intron 75 of 88) intron (NM_001377, intron 75 of 88) 178665 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 121-52 chr16 52666096 52666393 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59269 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 176.667-76 chr2 103633581 103634054 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -649388 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 129-127 chr8 83240280 83240568 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -163334 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 209-95 chr5 146127773 146128360 + 0.666667 NA intron (NM_016460, intron 26 of 30) intron (NM_016460, intron 26 of 30) -22489 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 180.667-124 chr6 70721885 70722228 + 0.666667 NA intron (NM_001281440, intron 1 of 10) L1MC4|LINE|L1 53526 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 148-56 chr17 58683074 58683385 + 0.666667 NA intron (NM_031272, intron 1 of 31) AluSz|SINE|Alu 8826 NM_031272 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 228-10 chr10 35012895 35013332 + 0.666667 NA intron (NM_003591, intron 19 of 20) AluY|SINE|Alu 61170 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 144.667-227 chr5 2964068 2964393 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 46376 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 138-69 chr20 35274716 35275005 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_006690, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_006690, exon 9 of 9) 3262 NM_001355003 101410538 Hs.356273 NM_001355003 ENSG00000126005 MMP24OS MMP24-AS1 MMP24 opposite strand protein-coding 117.667-177 chr7 43573633 43573919 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -9332 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 144-42 chr12 67969732 67970010 + 0.666667 NA non-coding (NR_120456, exon 3 of 3) non-coding (NR_120456, exon 3 of 3) -19574 NR_104124 100885789 Hs.439832 NR_104124 ENSG00000255733 IFNG-AS1 GS1-410F4.2|NEST|Tmevpg1 IFNG antisense RNA 1 ncRNA 121.333 chr1 12066609 12066826 + 0.666667 NA intron (NM_001281430, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu 3340 NM_001281430 943 Hs.1314 NM_001243 ENSG00000120949 TNFRSF8 CD30|D1S166E|Ki-1 TNF receptor superfamily member 8 protein-coding 112-88 chr17 71089844 71090158 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 112178 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 115.667-109 chr2 37066893 37067146 + 0.666667 NA intron (NM_019024, intron 8 of 35) AluSz6|SINE|Alu 17353 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 132-48 chr16 60735313 60735581 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 320319 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 130-22 chr11 56638206 56638558 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 4057 NM_001002925 338675 Hs.449692 NM_001002925 ENSG00000172464 OR5AP2 OR9J1 olfactory receptor family 5 subfamily AP member 2 protein-coding 177.667-103 chr4 123639324 123639644 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10507 NR_027105 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 134.333-32 chr11 114866824 114867101 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 188435 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 128.667-163 chr6 153953184 153953489 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -57160 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 142.667-36 chr12 15701288 15701568 + 0.666667 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) MIR|SINE|MIR 87960 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 231.333-98 chr5 168619288 168619819 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -40185 NM_024594 79646 Hs.388400 NM_024594 ENSG00000120137 PANK3 - pantothenate kinase 3 protein-coding 159.333-214 chr3 102628045 102628415 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 193215 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 244-81 chr5 15532905 15533472 + 0.666667 NA intron (NM_001278317, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 31750 NM_001278317 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 278-33 chr3 81256584 81257248 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 263048 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 141.333-4 chr1 68291291 68291580 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -58889 NM_001002292 79971 Hs.647659 NM_024911 ENSG00000116729 WLS C1orf139|EVI|GPR177|MRP|mig-14 Wnt ligand secretion mediator protein-coding 232.333-30 chr16 49720180 49720599 + 0.666667 NA intron (NM_001271620, intron 3 of 7) intron (NM_001271620, intron 3 of 7) -56065 NM_001330533 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 120.333-207 chrX 129394834 129395060 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 128543 NM_001282874 6594 Hs.152292 NM_003069 ENSG00000102038 SMARCA1 ISWI|NURF140|SNF2L|SNF2L1|SNF2LB|SNF2LT|SWI|SWI2|hSNF2L SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1 protein-coding 196.667-119 chr5 33259937 33260321 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30394 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 148.667-266 chr4 28718867 28719154 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -100572 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 156.333-200 chr2 219695543 219695942 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 68112 NM_005070 6508 Hs.1176 NM_005070 ENSG00000114923 SLC4A3 AE3|CAE3/BAE3|SLC2C solute carrier family 4 member 3 protein-coding 167.333-5 chr1 45651924 45652277 + 0.666667 NA intron (NM_021639, intron 6 of 12) MER20|DNA|hAT-Charlie -5415 NR_026768 728963 Hs.675157 NR_026768 RPS15AP10 RPS15A_4_42 ribosomal protein S15a pseudogene 10 pseudo 166.667-114 chr2 84019594 84019918 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -270926 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 128-74 chr3 186482873 186483233 + 0.666667 NA intron (NR_033844, intron 2 of 7) MER31-int|LTR|ERV1 10608 NR_033844 253573 Hs.97386 NR_033844 ENSG00000224406 LINC02052 - long intergenic non-protein coding RNA 2052 ncRNA 154.333-215 chr3 68944120 68944380 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -11640 NM_001005527 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 180.667-140 chr7 100482803 100483173 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_173564) promoter-TSS (NM_173564) -939 NM_173564 222950 Hs.320086 NM_173564 ENSG00000166924 NYAP1 C7orf51 neuronal tyrosine phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 1 protein-coding 170-26 chr12 20117138 20117635 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10515 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 252-107 chr8 114465370 114465819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1028655 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 155-126 chr8 69495382 69495687 + 0.666667 NA intron (NR_156414, intron 1 of 20) intron (NR_156414, intron 1 of 20) 2687 NM_001128206 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 162.333-201 chr5 83850920 83851257 + 0.666667 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL -130233 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 269.666-2 chr1 115143267 115144024 + 0.666667 NA Intergenic Charlie22a|DNA|hAT-Charlie -54142 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 166.667-175 chr5 18764872 18765214 + 0.666667 NA Intergenic AluYb8|SINE|Alu 957769 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 112.333-144 chr20 8919611 8919914 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88577 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 166.333-114 chr2 63920138 63920477 + 0.666667 NA intron (NM_001005739, intron 14 of 22) intron (NM_001005739, intron 14 of 22) 78427 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 142-50 chr15 100518494 100518905 + 0.666667 NA intron (NM_001290341, intron 3 of 13) intron (NM_001290341, intron 3 of 13) 25587 NM_001290342 204219 Hs.662371 NM_178842 ENSG00000154227 CERS3 ARCI9|LASS3 ceramide synthase 3 protein-coding 162.667-299 chrX 45461732 45462037 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -43504 NR_104645 101927528 Hs.550772 NR_104644 ENSG00000229563 LINC01204 - long intergenic non-protein coding RNA 1204 ncRNA 236.333-47 chr2 121474401 121474943 + 0.666667 NA intron (NM_015282, intron 8 of 38) AluY|SINE|Alu -56208 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 154.333-200 chr22 42475317 42475619 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -25111 NR_027786 94009 Hs.360940 NM_170694 ENSG00000172250 SERHL BK126B4.1|BK126B4.2|HS126B42|dJ222E13.1 serine hydrolase like (pseudogene) pseudo 126.333-98 chr2 202832566 202832795 + 0.666667 NA intron (NM_001288622, intron 1 of 12) AluJr4|SINE|Alu -3446 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 197.667-51 chr17 60430500 60430938 + 0.666667 NA intron (NM_181707, intron 5 of 5) AluSz|SINE|Alu 8230 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 168.667-19 chr10 53645013 53645456 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -840996 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 112.667-189 chr4 65708043 65708246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37649 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 134.333-165 chr8 24232643 24233041 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61198 NM_021777 10863 Hs.174030 NM_014265 ENSG00000042980 ADAM28 ADAM 28|MDC-L|MDCL|eMDC II|eMDCII ADAM metallopeptidase domain 28 protein-coding 134.667-90 chr19 28139992 28140249 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -346180 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 122.333-199 chr8 41940039 41940256 + 0.666667 NA intron (NM_006766, intron 15 of 16) intron (NM_006766, intron 15 of 16) -43406 NM_001142446 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 127-71 chr5 25459418 25459738 + 0.666667 NA Intergenic (TTAATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 268625 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 176-89 chr7 93259526 93260006 + 0.666667 NA intron (NM_001257998, intron 10 of 28) intron (NM_001257998, intron 10 of 28) 27400 NM_017667 55610 Hs.202424 NM_017667 ENSG00000004766 VPS50 CCDC132|VPS54L VPS50 subunit of EARP/GARPII complex protein-coding 203.667-113 chr7 33846171 33846542 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58559 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 228.667-40 chr2 60100051 60100536 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282743 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 145-11 chr10 56170474 56170834 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 190605 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 113.333-132 chr2 126283868 126284123 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166010 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 146.667-121 chr16 48854702 48854995 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -244668 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 112.333-28 chr10 110402113 110402283 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -95709 NM_004419 1847 Hs.2128 NM_004419 ENSG00000138166 DUSP5 DUSP|HVH3 dual specificity phosphatase 5 protein-coding 211.333-85 chr17 44981830 44982310 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13767 NM_006688 10882 Hs.134012 NM_006688 ENSG00000131094 C1QL1 C1QRF|C1QTNF14|CRF|CTRP14 complement C1q like 1 protein-coding 174-47 chr2 18348717 18349191 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 211699 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 200.333-60 chr18 12862043 12862555 + 0.666667 NA intron (NM_080423, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu -21337 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 153.333-359 chr6 54930096 54930396 + 0.666667 NA intron (NM_001010872, intron 4 of 4) HAL1|LINE|L1 83475 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 173.667-114 chr3 84051557 84051940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 817827 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 140-32 chr13 68712429 68712676 + 0.666667 NA Intergenic MER54B|LTR|ERVL 172773 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 112.667-267 chr8 90693289 90693501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47312 NM_001008495 169200 Hs.567759 NM_001008495 ENSG00000180694 TMEM64 - transmembrane protein 64 protein-coding 111.667-44 chr11 14012574 14012741 + 0.666667 NA intron (NM_006108, intron 2 of 15) L2b|LINE|L2 49934 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 119-112 chr4 97046916 97047247 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -319845 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 128-31 chr17 41884881 41885197 + 0.666667 NA intron (NM_198830, intron 17 of 27) AluSz|SINE|Alu -19616 NM_018143 55175 Hs.13268 NM_018143 ENSG00000178502 KLHL11 - kelch like family member 11 protein-coding 144.667-100 chr15 74345806 74346169 + 0.666667 NA intron (NM_001099773, intron 2 of 8) L1ME3F|LINE|L1 -15565 NR_045207 729739 Hs.742028 NR_045207 ENSG00000260266 PPIAP46 - peptidylprolyl isomerase A pseudogene 46 pseudo 149-61 chr18 36738155 36738540 + 0.666667 NA intron (NM_001281740, intron 20 of 28) L1ME1|LINE|L1 -74929 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 138.333-69 chr15 32993979 32994346 + 0.666667 NA intron (NM_001277313, intron 7 of 20) intron (NM_001277313, intron 7 of 20) 74012 NM_001103184 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 120.667-61 chr15 59242827 59243077 + 0.666667 NA intron (NM_004998, intron 4 of 27) intron (NM_004998, intron 4 of 27) 36109 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 247.666-28 chr5 57175125 57175794 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001127235) promoter-TSS (NM_001127235) 11 NM_001127235 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 142-132 chr6 132218493 132218888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 84712 NR_038981 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 131.667-97 chr2 119043030 119043292 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 100992 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 113.667-13 chr1 119041647 119041934 + 0.666667 NA intron (NM_015836, intron 4 of 5) intron (NM_015836, intron 4 of 5) -5615 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 117.667-139 chr4 98646205 98646464 + 0.666667 NA intron (NM_005723, intron 1 of 7) intron (NM_005723, intron 1 of 7) 12277 NM_005723 10098 Hs.118118 NM_005723 ENSG00000168785 TSPAN5 NET-4|NET4|TM4SF9|TSPAN-5 tetraspanin 5 protein-coding 116.333-45 chr11 96965059 96965309 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 456759 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 187-81 chr7 85227840 85228342 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106160 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 112-45 chr12 70341444 70341742 + 0.666667 NA intron (NM_001199302, intron 12 of 16) L2a|LINE|L2 -24697 NM_014505 27345 Hs.525529 NM_014505 ENSG00000135643 KCNMB4 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 protein-coding 133.333-188 chr8 125912791 125913057 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 38273 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 146-130 chr7 75587146 75587571 + 0.666667 NA intron (NM_005338, intron 4 of 30) AluSx|SINE|Alu -59235 NR_028059 5387 Hs.659871 NM_005395 ENSG00000127957 PMS2P3 PMS2L3|PMS2L9|PMS5|PMSR3 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 3 pseudo 146-47 chr17 71083323 71083723 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 118656 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 177-17 chr12 100082701 100083074 + 0.666667 NA intron (NM_001006947, intron 11 of 12) intron (NM_001006947, intron 11 of 12) 59987 NM_015054 23074 Hs.572154 NM_015054 ENSG00000111647 UHRF1BP1L SHIP164 UHRF1 binding protein 1 like protein-coding 112.667-118 chr2 39162596 39162797 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42233 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 128.667-145 chr5 77048213 77048570 + 0.666667 NA intron (NM_018046, intron 7 of 13) AluSz|SINE|Alu 17987 NM_018046 55109 Hs.634849 NM_018046 ENSG00000164252 AGGF1 GPATC7|GPATCH7|HSU84971|HUS84971|VG5Q angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1 protein-coding 116-132 chr6 26502646 26502842 + 0.666667 NA intron (NM_001732, intron 3 of 7) intron (NM_001732, intron 3 of 7) 2441 NM_001732 696 Hs.153058 NM_001732 ENSG00000124557 BTN1A1 BT|BTN|BTN1 butyrophilin subfamily 1 member A1 protein-coding 151.333-73 chr11 18866398 18866700 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 68453 NM_147199 259249 Hs.711459 NM_147199 ENSG00000170255 MRGPRX1 GPCR|MGRG2|MRGX1|SNSR4 MAS related GPR family member X1 protein-coding 122.333-158 chr4 99736014 99736220 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -80710 NM_001306151 27071 Hs.436271 NM_014395 ENSG00000070190 DAPP1 BAM32 dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 protein-coding 146-150 chr9 127187442 127187873 + 0.666667 NA intron (NM_001190729, intron 11 of 17) intron (NM_001190729, intron 11 of 17) -65022 NM_012098 23452 Hs.653262 NM_012098 ENSG00000136859 ANGPTL2 ARP2|HARP angiopoietin like 2 protein-coding 232-76 chr6 38063170 38063810 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 3 of 5) MER20|DNA|hAT-Charlie 243763 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 169.333-172 chr3 184257251 184257596 + 0.666667 NA intron (NM_014693, intron 1 of 18) intron (NM_014693, intron 1 of 18) 4130 NM_033259 94032 Hs.585003 NM_033259 ENSG00000163888 CAMK2N2 CAM-KIIN|CAMKIIN calcium/calmodulin dependent protein kinase II inhibitor 2 protein-coding 112-168 chr5 59224992 59225315 + 0.666667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) L1MB1|LINE|L1 50962 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 177.333-122 chr4 59227056 59227404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 213657 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 144.667-35 chr10 125937696 125938063 + 0.666667 NA intron (NM_001363549, intron 1 of 10) L1MC5a|LINE|L1 35394 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 169-44 chr2 70549057 70549361 + 0.666667 NA intron (NM_003236, intron 1 of 5) intron (NM_003236, intron 1 of 5) 4237 NM_001308159 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 158-85 chr3 4341541 4341932 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38432 NM_001320676 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 249-16 chr11 26646255 26646727 + 0.666667 NA intron (NM_031418, intron 23 of 26) L1ME3Cz|LINE|L1 -74228 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 162.333-83 chr15 36148367 36148678 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 221666 NR_039735 100616293 NR_039735 ENSG00000265098 MIR4510 mir-4510 microRNA 4510 ncRNA 113-184 chr6 102425595 102425812 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 1026718 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 160.333-233 chr5 57123347 57123765 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50392 NM_001331037 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 156.333-82 chr12 82432111 82432424 + 0.666667 NA intron (NR_144942, intron 6 of 10) intron (NR_144942, intron 6 of 10) -73462 NR_033192 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 236.333-62 chr3 136538226 136538839 + 0.666667 NA intron (NM_005862, intron 6 of 33) AluSx|SINE|Alu 213846 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 120-118 chr5 149388895 149389197 + 0.666667 NA intron (NM_001317987, intron 1 of 2) intron (NM_001317987, intron 1 of 2) -9754 NM_014443 27190 Hs.156979 NM_014443 ENSG00000127743 IL17B IL-17B|IL-20|NIRF|ZCYTO7 interleukin 17B protein-coding 138.667-214 chr9 30462801 30463135 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -54514 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 129-20 chr10 105530026 105530319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 290161 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 177-9 chr10 98439197 98439551 + 0.666667 NA intron (NM_001322476, intron 3 of 19) THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -6947 NR_134451 101927278 Hs.434883 NR_134451 LOC101927278 - uncharacterized LOC101927278 ncRNA 125.333-73 chr17 13490160 13490476 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53328 NR_031679 100302287 NR_031679 ENSG00000221698 MIR548H3 MIR548H-3|MIRN548H3|hsa-mir-548h-3 microRNA 548h-3 ncRNA 123-53 chr17 49779273 49779510 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9290 NM_001199155 11143 Hs.21907 NM_007067 ENSG00000136504 KAT7 HBO1|HBOA|MYST2|ZC2HC7 lysine acetyltransferase 7 protein-coding 118.333-55 chr13 47459913 47460218 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 472557 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 119.333-108 chr17 43683585 43683827 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21784 NM_004527 4222 Hs.438 NM_004527 ENSG00000005102 MEOX1 KFS2|MOX1 mesenchyme homeobox 1 protein-coding 140.333-212 chr7 3768145 3768422 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -361402 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 132.333-197 chrX 103061425 103061644 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 2637 NM_018476 55859 Hs.334370 NM_018476 ENSG00000133169 BEX1 BEX2|HBEX2|HGR74-h brain expressed X-linked 1 protein-coding 165-31 chr18 3563831 3564175 + 0.666667 NA intron (NM_001242762, intron 6 of 9) L1MCa|LINE|L1 -30111 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 147.333-251 chr5 12110210 12110512 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -205915 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 261-53 chr7 92569510 92570220 + 0.666667 NA non-coding (NR_109929, exon 9 of 11) non-coding (NR_109929, exon 9 of 11) 20184 NM_001288584 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 226.333-107 chr8 76989870 76990274 + 0.666667 NA intron (NM_001172086, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 10006 NM_000318 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 148.333-248 chr3 44666392 44666762 + 0.666667 NA intron (NR_157564, intron 1 of 2) intron (NR_157564, intron 1 of 2) 17845 NM_003420 7584 Hs.288658 NM_003420 ENSG00000169981 ZNF35 HF.10|HF10|Zfp105 zinc finger protein 35 protein-coding 139-60 chr3 52749176 52749461 + 0.666667 NA intron (NM_001348412, intron 7 of 14) AluSz|SINE|Alu 21622 NM_001348414 6787 Hs.631921 NM_003157 ENSG00000114904 NEK4 NRK2|STK2|pp12301 NIMA related kinase 4 protein-coding 218.333-115 chr7 53781025 53781621 + 0.666667 NA intron (NR_038371, intron 1 of 5) intron (NR_038371, intron 1 of 5) 30608 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 114.333-114 chr2 128169255 128169528 + 0.666667 NA intron (NR_027671, intron 26 of 40) AluJr|SINE|Alu 78191 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 208.667-153 chrX 85100719 85101221 + 0.666667 NA intron (NM_001367858, intron 8 of 11) L1MB4|LINE|L1 7998 NM_001012980 340562 Hs.640783 NM_001012980 ENSG00000184788 SATL1 - spermidine/spermine N1-acetyl transferase like 1 protein-coding 242-60 chr5 85580924 85581564 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -701200 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 121-28 chr11 111724682 111724954 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_015191, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_015191, exon 15 of 15) 41571 NM_181699 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 137-88 chr6 28197390 28197668 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 21400 NR_002936 222699 Hs.161441 NR_002936 TOB2P1 TOB2P|TOB4p|p373c6.3 transducer of ERBB2, 2 pseudogene 1 pseudo 112.333-118 chr2 38453522 38453722 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 22328 NR_146454 100996902 Hs.128280 NR_146454 ENSG00000235009 LINC01883 - long intergenic non-protein coding RNA 1883 ncRNA 115.333-3 chr1 45552969 45553165 + 0.666667 NA intron (NM_001202414, intron 3 of 10) AluSx|SINE|Alu 2241 NM_001202414 10327 Hs.474584 NM_006066 ENSG00000117448 AKR1A1 ALDR1|ALR|ARM|DD3|HEL-S-6 aldo-keto reductase family 1 member A1 protein-coding 292.667-31 chr5 56398944 56399480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 82557 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 182.667-137 chr5 122800843 122801234 + 0.666667 NA intron (NM_003100, intron 3 of 14) intron (NM_003100, intron 3 of 14) 25958 NM_003100 6643 Hs.125352 NM_003100 ENSG00000205302 SNX2 TRG-9 sorting nexin 2 protein-coding 118.667-176 chr7 29390605 29390917 + 0.666667 NA intron (NM_001293072, intron 3 of 12) intron (NM_001293072, intron 3 of 12) -88951 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 151.667-69 chr11 94563327 94563681 + 0.666667 NA intron (NR_135094, intron 3 of 3) intron (NR_135094, intron 3 of 3) -3864 NM_152431 143689 Hs.660188 NM_152431 ENSG00000134627 PIWIL4 HIWI2|MIWI2 piwi like RNA-mediated gene silencing 4 protein-coding 207-119 chr8 110526252 110526644 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 500985 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 144-144 chr7 21524293 21524578 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18604 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 164-83 chr4 32421111 32421544 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 70289 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 162.333-166 chr3 99418202 99418521 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -220233 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 182-64 chr22 46530638 46531028 + 0.666667 NA intron (NM_014246, intron 1 of 34) intron (NM_014246, intron 1 of 34) 6787 NM_014246 9620 Hs.252387 NM_014246 ENSG00000075275 CELSR1 ADGRC1|CDHF9|FMI2|HFMI2|ME2 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 protein-coding 136.333-94 chr2 77391700 77391969 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MER4D0|LTR|ERV1 130542 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 130.667-103 chr2 7701327 7701605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 198189 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 157-103 chr5 33601202 33601658 + 0.666667 NA intron (NM_001324512, intron 14 of 21) intron (NM_001324512, intron 14 of 21) 160654 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 123.667-124 chr3 100219019 100219227 + 0.666667 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR 33299 NR_028358 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 127-24 chr10 121723982 121724258 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -125662 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 205.667-111 chr5 66017651 66018175 + 0.666667 NA intron (NM_001253697, intron 7 of 25) L1MA4|LINE|L1 -72340 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 133.333-195 chr9 33023777 33024067 + 0.666667 NA intron (NM_001368996, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 1198 NM_001368996 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 125-130 chrX 81630005 81630232 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 428016 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 152.667-210 chr2 204279727 204280100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -265562 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 214.333-19 chr10 59214439 59214915 + 0.666667 NA intron (NM_001143774, intron 1 of 4) L1MC5|LINE|L1 37210 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 134-86 chr5 68858351 68858731 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 171386 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 117-50 chr15 63759983 63760223 + 0.666667 NA intron (NM_003922, intron 3 of 77) L1MC5|LINE|L1 73845 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 113-69 chr15 64972745 64972991 + 0.666667 NA intron (NM_001127889, intron 5 of 8) AluY|SINE|Alu 16602 NM_001127889 51324 Hs.242458 NM_016630 ENSG00000090487 SPG21 ABHD21|ACP33|BM-019|GL010|MAST SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin protein-coding 122.667-57 chr15 33397159 33397389 + 0.666667 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) MER49|LTR|ERV1 86307 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 158-129 chr7 50384454 50384754 + 0.666667 NA intron (NM_001220768, intron 4 of 4) intron (NM_001220768, intron 4 of 4) 65556 NM_001291841 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 153.667-217 chr20 5712975 5713299 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -37250 NM_001303478 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 123-108 chr6 143441858 143442216 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001286259, exon 1 of 6) 5' UTR (NM_001286259, exon 1 of 6) 640 NM_001286259 134637 Hs.709561 NM_182503 ENSG00000189007 ADAT2 DEADC1|TAD2|dJ20N2|dJ20N2.1 adenosine deaminase tRNA specific 2 protein-coding 151.667-63 chr11 46001566 46001877 + 0.666667 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 79065 NM_001300721 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 139-23 chr12 7807973 7808379 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18774 NM_024865 79923 Hs.635882 NM_024865 ENSG00000111704 NANOG - Nanog homeobox protein-coding 196-21 chr10 52240413 52240751 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) intron (NM_001098512, intron 9 of 17) 73546 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 181.667-154 chrX 67881099 67881546 + 0.666667 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 336699 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 174.333-11 chr1 246339588 246339958 + 0.666667 NA intron (NM_022743, intron 2 of 11) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 77639 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 230.333-128 chr9 92014281 92014757 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -64291 NM_001318204 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 163-74 chr6 28247802 28248273 + 0.666667 NA intron (NM_019110, intron 3 of 4) intron (NM_019110, intron 3 of 4) 4232 NM_019110 387032 Hs.44720 NM_019110 ENSG00000187626 ZKSCAN4 P1P373C6|ZNF307|ZNF427|ZSCAN36 zinc finger with KRAB and SCAN domains 4 protein-coding 213.667-54 chr3 49574019 49574380 + 0.666667 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 19722 NM_003458 8927 Hs.194684 NM_003458 ENSG00000164061 BSN ZNF231 bassoon presynaptic cytomatrix protein protein-coding 257.333-105 chr8 132458221 132458807 + 0.666667 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) AluSz|SINE|Alu -11252 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 169.333-233 chr6 125860733 125861092 + 0.666667 NA intron (NM_181782, intron 3 of 15) intron (NM_181782, intron 3 of 15) -42054 NR_126386 104355145 Hs.590370 NR_126386 ENSG00000232131 NCOA7-AS1 - NCOA7 antisense RNA 1 ncRNA 124-68 chr2 181013464 181013810 + 0.666667 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 32513 NM_001278554 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 198.333-29 chr10 120878264 120878698 + 0.666667 NA intron (NM_018117, intron 12 of 28) intron (NM_018117, intron 12 of 28) 27119 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 144.667-121 chr18 76415294 76415719 + 0.666667 NA intron (NM_014643, intron 3 of 6) intron (NM_014643, intron 3 of 6) -76146 NR_136504 101927989 Hs.665186 NR_136504 ENSG00000265778 LOC101927989 - uncharacterized LOC101927989 ncRNA 120.667-42 chr12 109428197 109428412 + 0.666667 NA intron (NM_001101421, intron 18 of 30) intron (NM_001101421, intron 18 of 30) 39585 NM_001101421 283446 Hs.512008 NM_173597 ENSG00000174527 MYO1H - myosin IH protein-coding 120.667-133 chr4 148973971 148974328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31771 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 122.333-69 chr16 61650344 61650575 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001796, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001796, exon 12 of 12) 385979 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 160-110 chr7 79843177 79843494 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -291496 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 200-145 chr6 124977124 124977567 + 0.666667 NA intron (NR_136734, intron 2 of 6) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -6023 NR_104440 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 147.333-207 chr22 43231480 43231855 + 0.666667 NA intron (NM_173050, intron 8 of 21) (CCCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18993 NR_134632 105373051 Hs.629290 NR_134632 ENSG00000236272 LOC105373051 - uncharacterized LOC105373051 ncRNA 126.667-137 chr5 39492124 39492406 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -28166 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 130-46 chr17 41444758 41445078 + 0.666667 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -3574 NM_006771 8687 Hs.248188 NM_006771 ENSG00000171360 KRT38 HA8|KRTHA8|hHa8 keratin 38 protein-coding 130-121 chr7 46386379 46386752 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 310557 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 129-125 chr8 81073368 81073739 + 0.666667 NA intron (NM_018440, intron 1 of 8) intron (NM_018440, intron 1 of 8) 38515 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 252.667-10 chr1 199029428 199030049 + 0.666667 NA intron (NR_126351, intron 1 of 2) intron (NR_126351, intron 1 of 2) -10774 NR_110525 102800316 Hs.568480 NR_110525 LINC01222 TCONS_00000112 long intergenic non-protein coding RNA 1222 ncRNA 120-24 chr11 86274253 86274483 + 0.666667 NA intron (NM_001308007, intron 10 of 12) L1MD1|LINE|L1 -3965 NR_106813 102465452 NR_106813 ENSG00000283744 MIR6755 hsa-mir-6755 microRNA 6755 ncRNA 153.333-26 chr1 173480844 173481164 + 0.666667 NA intron (NM_004905, intron 1 of 4) intron (NM_004905, intron 1 of 4) 3669 NM_004905 9588 Hs.120 NM_004905 ENSG00000117592 PRDX6 1-Cys|AOP2|HEL-S-128m|NSGPx|PRX|aiPLA2|p29 peroxiredoxin 6 protein-coding 169.667-87 chr17 33066082 33066466 + 0.666667 NA intron (NM_183377, intron 3 of 9) intron (NM_183377, intron 3 of 9) 73423 NM_001317225 124912 Hs.434112 NM_173847 ENSG00000141316 SPACA3 ALLP17|CT54|LYC3|LYZC|LYZL3|SLLP1 sperm acrosome associated 3 protein-coding 124.667-29 chr10 66585332 66585546 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) L1PB3|LINE|L1 -340597 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 132.333-5 chr1 62800328 62800549 + 0.666667 NA intron (NM_032852, intron 1 of 10) intron (NM_032852, intron 1 of 10) 16306 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 170.667-43 chr14 44947933 44948349 + 0.666667 NA intron (NM_017658, intron 1 of 4) intron (NM_017658, intron 1 of 4) 13344 NM_001308112 54813 Hs.550906 NM_017658 ENSG00000179454 KLHL28 BTBD5 kelch like family member 28 protein-coding 150.667-308 chr5 92481318 92481598 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 1089885 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 119.333-103 chr16 20802429 20802731 + 0.666667 NA intron (NM_080663, intron 4 of 10) AluJr|SINE|Alu 3892 NM_001142725 112479 Hs.248437 NM_080663 ENSG00000196678 ERI2 EXOD1|ZGRF5 ERI1 exoribonuclease family member 2 protein-coding 153.333-43 chr10 28785813 28786120 + 0.666667 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 10084 NR_038375 100507605 Hs.119207 NR_038374 ENSG00000235824 LINC00837 - long intergenic non-protein coding RNA 837 ncRNA 127.333-14 chr1 192036644 192036977 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -121652 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 121-138 chr8 121227953 121228160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -411290 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 202.667-136 chr7 47138201 47138602 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 326402 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 119.333-55 chr11 84698509 84698824 + 0.666667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 22276 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 138.333-144 chr5 36522751 36523023 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -83468 NM_001166696 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 133.333-17 chr1 195932080 195932369 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 156491 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 116-115 chr4 35061633 35061975 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -792057 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 149.333-157 chr18 22754490 22754830 + 0.666667 NA intron (NR_110782, intron 1 of 1) intron (NR_110782, intron 1 of 1) 32177 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 132.333-115 chr3 157934304 157934634 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 171694 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 132.667-83 chr2 58333059 58333295 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 57300 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 137-32 chr15 53526336 53526696 + 0.666667 NA intron (NM_182758, intron 18 of 19) Mam_R4|LINE|Dong-R4 14336 NR_102336 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 190-38 chr14 74072209 74072602 + 0.666667 NA intron (NM_001278593, intron 3 of 11) intron (NM_001278593, intron 3 of 11) 12048 NM_001278593 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 165.333-94 chr16 64592292 64592707 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 529564 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 119.667-117 chr3 81051030 81051209 + 0.666667 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) L1MA9|LINE|L1 57251 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 148.667-239 chr22 49499858 49500151 + 0.666667 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 43462 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 182-94 chr6 135494893 135495196 + 0.666667 NA intron (NM_001134830, intron 1 of 26) intron (NM_001134830, intron 1 of 26) 2696 NM_001134831 54806 Hs.386684 NM_017651 ENSG00000135541 AHI1 AHI-1|JBTS3|ORF1|dJ71N10.1 Abelson helper integration site 1 protein-coding 115.333-218 chr8 91556557 91556789 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 307354 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 168.667-100 chr2 47503636 47503974 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23732 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 148.667-52 chr10 75665368 75665609 + 0.666667 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) 17979 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 152-110 chr4 19667201 19667566 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -584522 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 113.333-90 chr15 93897258 93897515 + 0.666667 NA intron (NR_138083, intron 3 of 3) intron (NR_138083, intron 3 of 3) 3213 NR_138083 283682 Hs.134687 NR_138083 LINC01579 - long intergenic non-protein coding RNA 1579 ncRNA 126-18 chr11 113149966 113150170 + 0.666667 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) 123833 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 149-139 chr7 143458499 143458839 + 0.666667 NA intron (NR_033897, intron 2 of 4) intron (NR_033897, intron 2 of 4) 15216 NM_177437 338398 Hs.688222 NM_177437 ENSG00000185899 TAS2R60 T2R56|T2R60 taste 2 receptor member 60 protein-coding 140.333-10 chr1 86888581 86888994 + 0.666667 NA intron (NR_144512, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu 25339 NM_004261 9403 Hs.362728 NM_004261 ENSG00000183291 SELENOF SEP15 selenoprotein F protein-coding 243.667-6 chr1 221678372 221678993 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 58218 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 147-136 chr8 18035001 18035347 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 48022 NM_001363743 427 Hs.527412 NM_004315 ENSG00000104763 ASAH1 AC|ACDase|ASAH|PHP|PHP32|SMAPME N-acylsphingosine amidohydrolase 1 protein-coding 172.333-136 chr5 45636187 45636493 + 0.666667 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 60040 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 149.333-391 chr8 78084384 78084793 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -431752 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 124.333-179 chr8 117469802 117470025 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -50800 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 138-75 chr3 50749754 50750120 + 0.666667 NA intron (NM_004947, intron 1 of 52) intron (NM_004947, intron 1 of 52) 74857 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 112-17 chr10 55155200 55155474 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) intron (NM_001354404, intron 3 of 34) -354046 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 144.667-186 chr3 8591918 8592235 + 0.666667 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 20294 NR_024065 29931 Hs.433151 NM_013343 LINC00312 ERR-10|ERR10|LMCD1DN|LOH3CR2A|NAG-7|NAG7|NCRNA00312 long intergenic non-protein coding RNA 312 ncRNA 157.667-358 chr9 112885637 112886100 + 0.666667 NA intron (NM_033051, intron 3 of 3) intron (NM_033051, intron 3 of 3) 5008 NM_033051 57864 Hs.512668 NM_033051 ENSG00000119457 SLC46A2 Ly110|TSCOT solute carrier family 46 member 2 protein-coding 119.333-67 chr12 15041846 15042177 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40178 NR_120466 101928340 Hs.401232 NR_120466 ENSG00000255727 LINC01489 - long intergenic non-protein coding RNA 1489 ncRNA 138-59 chr2 118982004 118982271 + 0.666667 NA intron (NM_006770, intron 10 of 16) intron (NM_006770, intron 10 of 16) 39968 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 281.333-63 chr7 81496624 81497437 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64789 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 179-24 chr12 124734849 124735209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 104642 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 187-16 chr12 11932282 11932680 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117380 NM_001370268 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 237-41 chr2 182706636 182707237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9321 NR_073365 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 163.667-140 chr21 18143404 18143731 + 0.666667 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR -101266 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 149.333-423 chr9 29502159 29502549 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -288753 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 159.333-15 chr1 119281290 119281588 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46813 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 140.333-84 chr17 62562021 62562387 + 0.666667 NA intron (NM_001284363, intron 8 of 19) AluSz|SINE|Alu -65466 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 132.667-31 chr11 35280782 35281014 + 0.666667 NA exon (NM_004171, exon 9 of 11) exon (NM_004171, exon 9 of 11) 117948 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 183.667-45 chr14 63692967 63693427 + 0.666667 NA intron (NM_030791, intron 2 of 2).2 AluJb|SINE|Alu 34868 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 153.667-307 chr5 28444437 28444751 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -156929 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 146.333-337 chr8 122304154 122304526 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 264304 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 142-137 chr7 13356301 13356638 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 630045 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 117.333-139 chr3 167378564 167378905 + 0.666667 NA intron (NM_001199202, intron 1 of 20) intron (NM_001199202, intron 1 of 20) 1549 NM_001199202 79740 Hs.478143 NM_024687 ENSG00000169064 ZBBX - zinc finger B-box domain containing protein-coding 112.333-192 chr4 100516250 100516481 + 0.666667 NA intron (NM_001159694, intron 1 of 10) intron (NM_001159694, intron 1 of 10) 1657 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 204-61 chr14 73737923 73738508 + 0.666667 NA intron (NM_001367710, intron 2 of 12) AluSg|SINE|Alu -20532 NR_039727 100616158 NR_039727 ENSG00000264741 MIR4505 mir-4505 microRNA 4505 ncRNA 136-9 chr10 29849628 29849902 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -112829 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 183.667-109 chr4 100570981 100571418 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53177 NM_001159694 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 115.667-89 chr16 3332232 3332519 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -23514 NM_012368 4993 Hs.258574 NM_012368 ENSG00000168158 OR2C1 OLFmf3|OR2C2P olfactory receptor family 2 subfamily C member 1 protein-coding 118.333-90 chr18 62677432 62677722 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37964 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 157-116 chr6 85577631 85578097 + 0.666667 NA intron (NM_001350539, intron 1 of 28) L2c|LINE|L2 15994 NM_153816 57231 Hs.485871 NM_020468 ENSG00000135317 SNX14 RGS-PX2|SCAR20 sorting nexin 14 protein-coding 207-69 chr2 179968571 179968882 + 0.666667 NA intron (NM_020943, intron 11 of 19) AluSg|SINE|Alu 38571 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 161.333-289 chr8 107446550 107446946 + 0.666667 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) L2c|LINE|L2 51170 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 159.667-202 chr22 26552455 26552803 + 0.666667 NA intron (NM_001362923, intron 1 of 7) MER58A|DNA|hAT-Charlie 2694 NR_031615 100313914 NR_031615 ENSG00000221760 MIR548J MIRN548J|hsa-mir-548j microRNA 548j ncRNA 141-92 chr8 88455112 88455448 + 0.666667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -127797 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 159.333-146 chr2 37679318 37679636 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6942 NM_001270436 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 162.667-254 chr7 46835883 46836206 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -138922 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 159-83 chr3 158392052 158392403 + 0.666667 NA intron (NM_001271838, intron 6 of 9) intron (NM_001271838, intron 6 of 9) -134481 NR_148407 110599565 NR_148407 UC.134 - long non-coding RNA uc.134 ncRNA 159.333-115 chr16 62194798 62195124 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -158523 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 116-141 chr7 7939120 7939399 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 29493 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 207-42 chr15 56734625 56734983 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001288588) promoter-TSS (NM_001288588) -718 NM_001002843 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 125.333-145 chr5 119341259 119341530 + 0.666667 NA intron (NM_001286814, intron 1 of 1) intron (NM_001286814, intron 1 of 1) 8219 NM_001286814 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 174-90 chr7 43851248 43851649 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 18069 NM_032014 64951 Hs.284286 NM_032014 ENSG00000062582 MRPS24 HSPC335|MRP-S24|S24mt|bMRP-47|bMRP47 mitochondrial ribosomal protein S24 protein-coding 122.667-144 chr4 160101185 160101486 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -323551 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 196.333-130 chr4 61220483 61220924 + 0.666667 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 18531 NM_001371342 122.333-17 chr10 11954682 11954886 + 0.666667 NA intron (NM_080599, intron 14 of 21) FLAM_C|SINE|Alu -60074 NR_038222 219731 Hs.576787 NR_038222 ENSG00000225778 PROSER2-AS1 - PROSER2 antisense RNA 1 ncRNA 186.667-155 chr9 121997270 121997659 + 0.666667 NA intron (NM_194252, intron 3 of 3) intron (NM_194252, intron 3 of 3) 96142 NM_001139442 158135 Hs.438937 NM_194252 ENSG00000175764 TTLL11 C9orf20|bA244O19.1 tubulin tyrosine ligase like 11 protein-coding 197-36 chr14 92676592 92677122 + 0.666667 NA intron (NM_024832, intron 8 of 9) L2c|LINE|L2 71770 NM_001363696 5641 Hs.18069 NM_005606 ENSG00000100600 LGMN AEP|LGMN1|PRSC1 legumain protein-coding 146-139 chr8 107041100 107041416 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -271014 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 142.333-51 chr12 3209196 3209478 + 0.666667 NA intron (NM_001168320, intron 2 of 7) L1ME3E|LINE|L1 131958 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 188-121 chr9 105270385 105270852 + 0.666667 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 25967 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 131-73 chr4 176974799 176975075 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 99235 NR_149104 105377556 NR_149104 ENSG00000250263 LINC02509 - long intergenic non-protein coding RNA 2509 ncRNA 185.333-16 chr10 19115091 19115492 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 5 of 39) intron (NM_001142308, intron 5 of 39) 66490 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 127.667-112 chr3 28803770 28803996 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 228605 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 115.667-220 chr8 137788227 137788423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 295220 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 118-86 chr3 7455246 7455574 + 0.666667 NA intron (NM_000844, intron 6 of 9) L1MC4a|LINE|L1 79874 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 146.667-125 chr16 85677460 85677808 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_016095, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_016095, exon 5 of 5) 11320 NM_016095 51659 Hs.433180 NM_016095 ENSG00000131153 GINS2 HSPC037|PSF2|Pfs2 GINS complex subunit 2 protein-coding 113-149 chr4 33206597 33206844 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 833173 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 130.333-88 chr17 56629154 56629376 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35566 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 169-6 chr1 235481343 235481652 + 0.666667 NA intron (NM_152490, intron 4 of 11) AluJb|SINE|Alu 22955 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 126.667-98 chr21 30908091 30908366 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -26648 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 132-18 chr10 54709108 54709412 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) 91971 NM_001142763 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 197.333-206 chr7 5997472 5997888 + 0.666667 NA intron (NM_001322013, intron 5 of 13) AluJo|SINE|Alu 11369 NM_001322008 5395 Hs.632637 NM_000535 ENSG00000122512 PMS2 HNPCC4|MLH4|PMS2CL|PMSL2 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component protein-coding 160.667-141 chr2 50121408 50121735 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) MER2|DNA|TcMar-Tigger -147368 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 180.333-99 chr5 124838377 124838769 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93461 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 125-24 chr11 73098404 73098661 + 0.666667 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) L1M4|LINE|L1 43786 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 119-95 chr22 36374389 36374639 + 0.666667 NA intron (NM_002473, intron 1 of 40) AluSx|SINE|Alu 13553 NM_002473 4627 Hs.474751 NM_002473 ENSG00000100345 MYH9 BDPLT6|DFNA17|EPSTS|FTNS|MATINS|MHA|NMHC-II-A|NMMHC-IIA|NMMHCA myosin heavy chain 9 protein-coding 224.667-32 chr17 59464698 59465111 + 0.666667 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 61953 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 193.333-167 chr7 46623203 46623536 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 73753 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 153.667-171 chr2 11679523 11679838 + 0.666667 NA intron (NM_001349207, intron 1 of 20) intron (NM_001349207, intron 1 of 20) 2136 NM_001349207 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 132.667-65 chr16 60029886 60030124 + 0.666667 NA intron (NR_110917, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 174652 NR_110917 101927580 Hs.552235 NR_110917 ENSG00000261807 LINC02141 - long intergenic non-protein coding RNA 2141 ncRNA 172.333-84 chr2 119158930 119159302 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_182528) promoter-TSS (NM_182528) -365 NM_182528 165257 Hs.433493 NM_182528 ENSG00000144119 C1QL2 C1QTNF10|CTRP10 complement C1q like 2 protein-coding 140.667-109 chr2 27761019 27761283 + 0.666667 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -10566 NM_145330 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 155-24 chr12 387782 388236 + 0.666667 NA intron (NM_001042603, intron 1 of 27) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 1311 NM_001042603 5927 Hs.76272 NM_005056 ENSG00000073614 KDM5A RBBP-2|RBBP2|RBP2 lysine demethylase 5A protein-coding 120.667-82 chr18 59378745 59379027 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19621 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 124-59 chr2 33188949 33189169 + 0.666667 NA intron (NM_206943, intron 7 of 33) MER58A|DNA|hAT-Charlie 54462 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 146-142 chr8 119705033 119705462 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -31857 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 124.667-153 chr4 109225325 109225684 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) L1PB4|LINE|L1 77154 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 232-93 chr9 73770815 73771462 + 0.666667 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR -600393 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 113-89 chr18 6932003 6932240 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2252 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 141-68 chr5 93810188 93810493 + 0.666667 NA intron (NM_032042, intron 8 of 10) MIR|SINE|MIR -68740 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 122.667-104 chr20 52321241 52321491 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129381 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 146.667-196 chr20 45381284 45381608 + 0.666667 NA intron (NR_003189, intron 3 of 5) AluSz|SINE|Alu -3121 NM_014477 27296 Hs.710271 NM_014477 ENSG00000124251 TP53TG5 C20orf10|CLG01 TP53 target 5 protein-coding 124-3 chr1 52482588 52482874 + 0.666667 NA intron (NM_001009881, intron 9 of 29) AluJb|SINE|Alu 70359 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 160-77 chr3 81823192 81823516 + 0.666667 NA Intergenic Charlie17a|DNA|hAT-Charlie -61709 NM_000158 2632 Hs.436062 NM_000158 ENSG00000114480 GBE1 APBD|GBE|GSD4 1,4-alpha-glucan branching enzyme 1 protein-coding 203.333-103 chr17 14325534 14326117 + 0.666667 NA intron (NR_130138, intron 1 of 2) intron (NR_130138, intron 1 of 2) 22085 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 169.333-227 chr6 57122856 57123296 + 0.666667 NA intron (NR_110742, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 32888 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 132.667-133 chr4 151355883 151356137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53166 NM_001348694 729830 Hs.633810 NM_001109977 ENSG00000164142 FAM160A1 - family with sequence similarity 160 member A1 protein-coding 129.667-120 chr3 81173076 81173425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 179382 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 164.667-235 chr8 60637953 60638246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40641 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 144.667-159 chr2 191919461 191919720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72502 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 124-57 chr2 16449543 16449788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 216169 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 151-73 chr20 58310630 58310922 + 0.666667 NA intron (NM_020673, intron 1 of 6) intron (NM_020673, intron 1 of 6) 1061 NM_020673 57403 Hs.529044 NM_020673 ENSG00000124209 RAB22A - RAB22A, member RAS oncogene family protein-coding 188.333-128 chr6 55465500 55466056 + 0.666667 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) L1M5|LINE|L1 113436 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 193.333-31 chr11 4958616 4959019 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3104 NM_001004748 401667 Hs.553805 NM_001004748 ENSG00000205496 OR51A2 - olfactory receptor family 51 subfamily A member 2 protein-coding 118-131 chr8 81629373 81629638 + 0.666667 NA intron (NR_146081, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 1772 NR_146081 650747 NR_146081 IMPA1P1 IMPA1P inositol monophosphatase 1 pseudogene 1 pseudo 194-69 chr2 33093509 33093900 + 0.666667 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) intron (NM_206943, intron 3 of 33) -40893 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 111.667-32 chr10 57260533 57260772 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43907 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 205.333-218 chr7 32447817 32448346 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 10413 NR_038454 100130673 Hs.609282 NR_038454 LOC100130673 - phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 2 pseudogene pseudo 122.333-186 chr6 75042152 75042416 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 86498 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 125.333-28 chr10 85110005 85110342 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88732 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 114-33 chr14 54144761 54145011 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -187995 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 172-107 chr7 108663400 108663784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 93718 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 129.333-101 chr2 198564718 198565071 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -189797 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 125.667-71 chr15 68384308 68384550 + 0.666667 NA intron (NM_001004439, intron 2 of 29) intron (NM_001004439, intron 2 of 29) 47734 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 117.667-47 chr14 28985913 28986127 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -200233 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 119.333-24 chr10 5767564 5767904 + 0.666667 NA intron (NM_001494, intron 8 of 10) intron (NM_001494, intron 8 of 10) 45700 NM_001494 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 157-39 chr13 75698221 75698533 + 0.666667 NA intron (NM_001306080, intron 1 of 30) AluJr|SINE|Alu -61943 NM_001366633 4008 Hs.207631 NM_005358 ENSG00000136153 LMO7 FBX20|FBXO20|LMO7b|LOMP LIM domain 7 protein-coding 131.667-195 chr8 91450497 91450878 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 201368 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 248.333-28 chr13 85797506 85798076 + 0.666667 NA intron (NM_032229, intron 1 of 1) intron (NM_032229, intron 1 of 1) 1628 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 208-5 chr1 69629998 69630535 + 0.666667 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) intron (NM_001366842, intron 1 of 7) 60925 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 181.667-17 chr11 6087862 6088380 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -19563 NM_001005181 196335 Hs.632154 NM_001005181 ENSG00000180919 OR56B4 OR11-67 olfactory receptor family 56 subfamily B member 4 protein-coding 150-5 chr1 111578658 111578942 + 0.666667 NA intron (NM_001370216, intron 1 of 7) MER21C|LTR|ERVL -14797 NM_001302680 57413 Hs.281342 NM_020683 ENSG00000121933 TMIGD3 AD026 transmembrane and immunoglobulin domain containing 3 protein-coding 126.333-4 chr1 84273856 84274206 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -24507 NM_001010971 148418 Hs.591445 NM_001010971 ENSG00000203943 SAMD13 HSD-41|HSD-42 sterile alpha motif domain containing 13 protein-coding 141.667-44 chr11 34506168 34506468 + 0.666667 NA intron (NM_001422, intron 1 of 6) L1PA16|LINE|L1 5406 NM_198381 2001 Hs.11713 NM_001422 ENSG00000135374 ELF5 ESE2 E74 like ETS transcription factor 5 protein-coding 118-67 chr2 42379384 42379683 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -10576 NM_001319036 9167 Hs.339639 NM_004718 ENSG00000115944 COX7A2L COX7AR|COX7RP|EB1|SIG81 cytochrome c oxidase subunit 7A2 like protein-coding 135.333-180 chr7 86954411 86954690 + 0.666667 NA intron (NM_001291990, intron 2 of 21) intron (NM_001291990, intron 2 of 21) 11349 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 151-3 chr1 53406113 53406423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33752 NR_002314 163742 Hs.99394 NR_002314 ENSG00000236253 SLC25A3P1 - solute carrier family 25 member 3 pseudogene 1 pseudo 248.667-59 chr2 123927673 123928145 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 97265 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 153-27 chr12 12282244 12282646 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -15401 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 161.667-135 chr2 112321193 112321594 + 0.666667 NA intron (NM_198581, intron 7 of 11) intron (NM_198581, intron 7 of 11) 45796 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 115-65 chr15 59920888 59921138 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -83298 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 257.666-8 chr15 62099103 62099819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32484 NM_207322 145741 Hs.202656 NM_207322 ENSG00000198535 C2CD4A FAM148A|NLF1 C2 calcium dependent domain containing 4A protein-coding 165.667-210 chr9 32913533 32913866 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 87877 NM_001195249 54840 Hs.20158 NM_017692 ENSG00000137074 APTX AOA|AOA1|AXA1|EAOH|EOAHA|FHA-HIT aprataxin protein-coding 139-63 chr3 117611218 117611505 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 79564 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 148-105 chr3 97298196 97298496 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -141261 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 157-97 chr4 147541536 147541940 + 0.666667 NA intron (NR_045958, intron 6 of 6) intron (NR_045958, intron 6 of 6) 60641 NR_148964 1909 Hs.183713 NM_001957 ENSG00000151617 EDNRA ET-A|ETA|ETA-R|ETAR|ETRA|MFDA|hET-AR endothelin receptor type A protein-coding 120.333-66 chr15 92913131 92913466 + 0.666667 NA intron (NM_001042572, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR 8899 NR_036136 100422995 NR_036136 ENSG00000284324 MIR3175 mir-3175 microRNA 3175 ncRNA 122.667-17 chr10 90197352 90197592 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -240099 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 184-51 chr2 103325168 103325579 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -340944 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 160.667-334 chrX 101031593 101032027 + 0.666667 NA intron (NM_001167972, intron 6 of 12) HAL1|LINE|L1 20301 NM_024917 79979 Hs.496501 NM_024917 ENSG00000188917 TRMT2B CXorf34|dJ341D10.3 tRNA methyltransferase 2 homolog B protein-coding 152.333-92 chr13 44589823 44590115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13404 NM_001243799 8848 Hs.436383 NM_006022 ENSG00000102804 TSC22D1 Ptg-2|TGFB1I4|TSC22 TSC22 domain family member 1 protein-coding 203-81 chr5 84809135 84809644 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -424509 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 122-12 chr10 29398334 29398575 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -11080 NR_110923 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 142-88 chr3 68718158 68718524 + 0.666667 NA Intergenic L1MDb|LINE|L1 214206 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 121.667-191 chr7 48218847 48219112 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 3 of 61) intron (NM_152701, intron 3 of 61) 47521 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 124.333-20 chr10 58379332 58379626 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5664 NM_001270782 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 143.667-46 chr11 116760328 116760607 + 0.666667 NA intron (NM_032725, intron 5 of 9) intron (NM_032725, intron 5 of 9) 12520 NM_032725 84811 Hs.437341 NM_032725 ENSG00000137656 BUD13 Cwc26|fSAP71 BUD13 homolog protein-coding 229.667-33 chr14 89178297 89178833 + 0.666667 NA intron (NM_001085471, intron 6 of 6) intron (NM_001085471, intron 6 of 6) 238668 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 131.667-133 chr3 104082302 104082614 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -558342 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 150.333-235 chr20 46415062 46415389 + 0.666667 NA intron (NR_146919, intron 1 of 3) LTR50|LTR|ERVL -8174 NM_182764 63916 Hs.210469 NM_022086 ENSG00000062598 ELMO2 CED-12|CED12|Ced-12A|ELMO-2|VMPI engulfment and cell motility 2 protein-coding 158-97 chr4 100347535 100347847 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 47556 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 134-115 chr9 80955444 80955768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 733929 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 127.333-113 chr3 97417075 97417322 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 6 of 17) intron (NM_001080448, intron 6 of 17) -22409 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 161-82 chr5 127484860 127485196 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -32612 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 182.667-165 chr9 20731977 20732358 + 0.666667 NA intron (NM_017794, intron 6 of 45) L2b|LINE|L2 16062 NR_030166 574444 NR_030166 ENSG00000207609 MIR491 MIRN491|hsa-mir-491|mir-491 microRNA 491 ncRNA 181.333-21 chr11 19244321 19244749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2880 NM_001256372 79733 Hs.523526 NM_024680 ENSG00000129173 E2F8 E2F-8 E2F transcription factor 8 protein-coding 142.667-189 chr6 55694128 55694402 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115051 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 133.333-199 chr9 94978038 94978295 + 0.666667 NA intron (NM_032823, intron 8 of 14) intron (NM_032823, intron 8 of 14) -32612 NR_147614 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 149.667-375 chr7 84112671 84113002 + 0.666667 NA intron (NM_006080, intron 3 of 16) intron (NM_006080, intron 3 of 16) 81953 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 139-9 chr1 218447333 218447629 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) intron (NR_031644, intron 2 of 6) 4855 NR_125715 103611157 Hs.133379 NR_125715 ENSG00000281453 TGFB2-OT1 - TGFB2 overlapping transcript 1 ncRNA 147.667-37 chr10 55530586 55531020 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -68239 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 144.333-198 chr4 122038986 122039324 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87095 NM_001130698 7222 Hs.150981 NM_003305 ENSG00000138741 TRPC3 SCA41|TRP3 transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 protein-coding 175.667-88 chr20 54701802 54702318 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 226467 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 121-25 chr11 40868761 40869022 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -575761 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 146.333-159 chr2 145923746 145924049 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -663160 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 149.667-40 chr1 215068019 215068306 + 0.666667 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) intron (NM_001017424, intron 1 of 6) -14575 NM_014217 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 152.333-353 chr7 46020242 46020617 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -99157 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 177.667-73 chr2 112297049 112297448 + 0.666667 NA intron (NM_198581, intron 1 of 11) L1MC5|LINE|L1 21651 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 181.333-103 chr3 105829997 105830377 + 0.666667 NA intron (NR_135809, intron 3 of 18) intron (NR_135809, intron 3 of 18) 37404 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 171-51 chr3 1606200 1606691 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -492358 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 132.667-37 chr12 30663068 30663426 + 0.666667 NA intron (NM_006390, intron 14 of 24) MIR3|SINE|MIR 13997 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 151.333-114 chr13 65446960 65447335 + 0.666667 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -418900 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 193.333-41 chr11 105621485 105621955 + 0.666667 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) L1ME4b|LINE|L1 11014 NR_046356 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 192.667-87 chr2 61550111 61550554 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11976 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 122.667-182 chr7 119099755 119100044 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 807476 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 186.333-117 chr4 88468289 88468828 + 0.666667 NA intron (NM_016323, intron 8 of 22) intron (NM_016323, intron 8 of 22) 11439 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 134.667-116 chr20 39857119 39857508 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -147148 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 167.667-48 chr12 92328325 92328757 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -92990 NR_027932 574028 Hs.730377 NM_001025233 ENSG00000257127 CLLU1 - chronic lymphocytic leukemia up-regulated 1 ncRNA 119-70 chr18 60195152 60195383 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR1a|LTR|Gypsy 177508 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 220.667-2 chr1 17929654 17930131 + 0.666667 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -135765 NR_125946 101927876 Hs.522954 NR_125946 ENSG00000261781 LINC01654 - long intergenic non-protein coding RNA 1654 ncRNA 239-44 chr3 126051118 126051680 + 0.666667 NA intron (NM_001164475, intron 1 of 9) intron (NM_001164475, intron 1 of 9) 5376 NM_001008487 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 154-38 chr12 33469954 33470317 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30316 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 150.667-359 chr7 113961913 113962338 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43116 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 142.333-143 chr20 48566661 48567035 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 206937 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 121-58 chr17 59062169 59062517 + 0.666667 NA intron (NR_148346, intron 11 of 23) HAL1M8|LINE|L1 44537 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 112.333-203 chr5 43313441 43313627 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001330663) promoter-TSS (NM_001330663) -122 NM_001324220 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 136-90 chr6 12018506 12018773 + 0.666667 NA intron (NM_002114, intron 2 of 8) intron (NM_002114, intron 2 of 8) 6327 NM_002114 3096 Hs.567284 NM_002114 ENSG00000095951 HIVEP1 CIRIP|CRYBP1|GAAP|MBP-1|PRDII-BF1|Schnurri-1|ZAS1|ZNF40|ZNF40A human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 protein-coding 202-150 chr5 105660365 105660851 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 561134 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 157.667-11 chr1 100683941 100684260 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35540 NM_001199834 7412 Hs.109225 NM_001078 ENSG00000162692 VCAM1 CD106|INCAM-100 vascular cell adhesion molecule 1 protein-coding 213-37 chr19 32384173 32384670 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014910, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_014910, exon 6 of 6) 21118 NR_046201 400684 Hs.438766 NR_046201 ENSG00000267213 LOC400684 - uncharacterized LOC400684 ncRNA 114.667-122 chr2 26782610 26782822 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -3299 NM_001042426 1058 Hs.1594 NM_001809 ENSG00000115163 CENPA CENP-A|CenH3 centromere protein A protein-coding 176.667-106 chr3 186496082 186496468 + 0.666667 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -2614 NR_033844 253573 Hs.97386 NR_033844 ENSG00000224406 LINC02052 - long intergenic non-protein coding RNA 2052 ncRNA 199.667-66 chr18 70026852 70027356 + 0.666667 NA intron (NM_001318520, intron 42 of 47) intron (NM_001318520, intron 42 of 47) -70305 NM_001303619 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 137.333-198 chr8 107343754 107344035 + 0.666667 NA intron (NM_001199859, intron 2 of 8) AluJo|SINE|Alu -7379 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 242.667-13 chr1 240949997 240950599 + 0.666667 NA intron (NM_001350116, intron 4 of 16) L1MC3|LINE|L1 -181974 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 131.333-18 chr1 210242097 210242338 + 0.666667 NA exon (NM_019605, exon 4 of 4) exon (NM_019605, exon 4 of 4) -8332 NR_024337 574036 Hs.446946 NR_024337 ENSG00000203706 SERTAD4-AS1 C1orf133 SERTAD4 antisense RNA 1 ncRNA 262.667-62 chr5 67097105 67097685 + 0.666667 NA intron (NM_001297651, intron 4 of 25) MIR|SINE|MIR 92740 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 129-58 chr18 72014927 72015177 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -232826 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 113.667-196 chr7 51953951 51954190 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -560814 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 219.667-9 chr10 61603338 61603905 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -59308 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 118-33 chr14 48970566 48970807 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 615694 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 138.333-88 chr2 35066158 35066478 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 388761 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 189.667-44 chr14 66756076 66756573 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) MIRc|SINE|MIR 248917 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 157.667-216 chr4 62657329 62657644 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -495721 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 258.667-58 chr22 34243060 34243714 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -320499 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 140.667-74 chr14 41422954 41423228 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -183765 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 183.333-129 chr5 86920804 86921211 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 174189 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 260-16 chr11 16432996 16433550 + 0.666667 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) intron (NM_001367872, intron 3 of 16) -24417 NM_001145811 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 187-6 chr1 166302408 166302782 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -135840 NR_135199 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 191-22 chr16 11195438 11195861 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 60533 NM_003745 8651 Hs.50640 NM_003745 ENSG00000185338 SOCS1 CIS1|CISH1|JAB|SOCS-1|SSI-1|SSI1|TIP-3|TIP3 suppressor of cytokine signaling 1 protein-coding 118.667-141 chr3 143212014 143212231 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 92351 NM_004267 9435 Hs.8786 NM_004267 ENSG00000175040 CHST2 C6ST|GST-2|GST2|Gn6ST-1|HEL-S-75|glcNAc6ST-1 carbohydrate sulfotransferase 2 protein-coding 136-26 chr13 96209505 96209785 + 0.666667 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 118806 NM_153456 266722 Hs.171001 NM_153456 ENSG00000185352 HS6ST3 HS6ST-3 heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 3 protein-coding 195.333-81 chr14 72418835 72419270 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -97768 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 128-72 chr3 80943062 80943325 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50675 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 125-7 chr1 173315369 173315722 + 0.666667 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) intron (NR_037845, intron 2 of 2) -108214 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 139.333-224 chr8 126296685 126296948 + 0.666667 NA Intergenic (CTCACC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28679 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 153.667-226 chr20 50900216 50900552 + 0.666667 NA intron (NM_001282532, intron 3 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 9407 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 175-17 chr11 114543553 114543944 + 0.666667 NA intron (NM_152315, intron 2 of 5) L1MC3|LINE|L1 16133 NM_001367953 120400 Hs.550126 NM_152315 ENSG00000095110 NXPE1 FAM55A neurexophilin and PC-esterase domain family member 1 protein-coding 121.333-57 chr14 89678206 89678543 + 0.666667 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -59209 NM_001085471 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 125-12 chr10 30890429 30890702 + 0.666667 NA intron (NM_001143766, intron 5 of 7) L2|LINE|L2 108952 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 140.667-43 chr10 121772542 121772810 + 0.666667 NA intron (NM_001001976, intron 11 of 11) intron (NM_001001976, intron 11 of 11) 155355 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 168-8 chr10 12900016 12900373 + 0.666667 NA intron (NM_001282658, intron 6 of 6) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 101519 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 309.667-22 chr5 122504163 122504710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25349 NR_051996 153163 Hs.679757 NR_051996 ENSG00000250328 MGC32805 - uncharacterized LOC153163 ncRNA 131.333-38 chr11 97650122 97650429 + 0.666667 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 1141850 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 148.667-86 chr12 1120315 1120609 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) intron (NR_027948, intron 6 of 19) 92714 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 149.667-311 chr5 44736108 44736379 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72550 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 112.667-276 chr9 4491581 4491875 + 0.666667 NA intron (NM_004170, intron 1 of 11) intron (NM_004170, intron 1 of 11) 1260 NM_004170 6505 Hs.444915 NM_004170 ENSG00000106688 SLC1A1 DCBXA|EAAC1|EAAT3|SCZD18 solute carrier family 1 member 1 protein-coding 131.667-157 chr5 22422006 22422240 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) L1PA10|LINE|L1 -208273 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 118.333-57 chr13 51506541 51506816 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -45911 NR_039852 100616423 NR_039852 ENSG00000266611 MIR4703 - microRNA 4703 ncRNA 119-77 chr2 104877496 104877775 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5040 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 134.667-192 chr8 61893411 61893733 + 0.666667 NA intron (NR_149085, intron 3 of 3) intron (NR_149085, intron 3 of 3) 3733 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 147-134 chr7 112865814 112866157 + 0.666667 NA intron (NM_152556, intron 3 of 4) intron (NM_152556, intron 3 of 4) 73890 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 194-150 chr9 13578544 13579039 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -147462 NR_033863 401492 Hs.632651 NR_033863 ENSG00000270547 LINC01235 - long intergenic non-protein coding RNA 1235 ncRNA 145-3 chr1 84304211 84304492 + 0.666667 NA intron (NM_001134663, intron 2 of 3) MER3|DNA|hAT-Charlie 1700 NM_001134664 148418 Hs.591445 NM_001010971 ENSG00000203943 SAMD13 HSD-41|HSD-42 sterile alpha motif domain containing 13 protein-coding 186.667-122 chr5 170970768 170971161 + 0.666667 NA intron (NM_022897, intron 14 of 27) intron (NM_022897, intron 14 of 27) 108946 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 139-91 chr6 123937606 123937891 + 0.666667 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) intron (NM_001040214, intron 1 of 6) 133883 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 134.667-73 chr15 69948822 69949131 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 113742 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 145.667-275 chr7 100961667 100961921 + 0.666667 NA intron (NM_005960, intron 3 of 11) AluSx1|SINE|Alu -7829 NM_001164462 10071 Hs.489355 NM_001164462 ENSG00000205277 MUC12 MUC-11|MUC-12|MUC11 mucin 12, cell surface associated protein-coding 127-13 chr10 10697745 10697993 + 0.666667 NA intron (NM_001326317, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu 97045 NR_027082 207107 Hs.31562 NR_027082 ENSG00000225383 SFTA1P SFTPF surfactant associated 1, pseudogene pseudo 115.667-232 chr9 132158836 132159109 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -3086 NM_032536 84628 Hs.163642 NM_032536 ENSG00000196358 NTNG2 LHLL9381|Lmnt2|NTNG1|bA479K20.1 netrin G2 protein-coding 163.333-23 chr1 202356901 202357217 + 0.666667 NA intron (NM_002481, intron 1 of 23) AluSq2|SINE|Alu 8357 NM_001167857 4660 Hs.444403 NM_002481 ENSG00000077157 PPP1R12B MYPT2|PP1bp55 protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B protein-coding 113.333-182 chr3 128937879 128938117 + 0.666667 NA intron (NM_001348520, intron 9 of 14) AluSx1|SINE|Alu 53899 NM_001348523 57501 Hs.518247 NM_020741 ENSG00000114656 KIAA1257 - KIAA1257 protein-coding 146.333-271 chr5 128876024 128876295 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88968 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 144-15 chr10 55171815 55172193 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -370713 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 125.667-129 chr4 25383389 25383689 + 0.666667 NA intron (NM_013367, intron 4 of 28) intron (NM_013367, intron 4 of 28) 6276 NM_001286756 29945 Hs.152173 NM_013367 ENSG00000053900 ANAPC4 APC4 anaphase promoting complex subunit 4 protein-coding 184-126 chrX 12559827 12560238 + 0.666667 NA intron (NM_001368400, intron 1 of 15) intron (NM_001368400, intron 1 of 15) 61352 NM_001368400 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 148-3 chr1 27387110 27387507 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3975 NM_001330448 388611 Hs.664836 NM_207397 ENSG00000174950 CD164L2 EAPG6122|UNQ6122 CD164 molecule like 2 protein-coding 143.333-16 chr1 166000702 166001073 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 92966 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 145.667-56 chr12 23632539 23632871 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 11 of 17) intron (NM_152989, intron 11 of 17) -48119 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 117.333-216 chr8 144385816 144386013 + 0.666667 NA intron (NM_174922, intron 3 of 14) AluY|SINE|Alu 8316 NR_030635 100126351 NR_030635 ENSG00000284310 MIR939 MIRN939|hsa-mir-939|mir-939 microRNA 939 ncRNA 165.667-2 chr1 50311482 50311825 + 0.666667 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 111790 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 134.667-32 chr11 4097512 4097756 + 0.666667 NA intron (NM_001318064, intron 1 of 17) AluSc8|SINE|Alu 2835 NM_001033 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 244.333-99 chr8 29024281 29024921 + 0.666667 NA intron (NM_001324384, intron 6 of 10) intron (NM_001324384, intron 6 of 10) 133287 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 149-151 chr8 128026126 128026527 + 0.666667 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 17428 NR_031611 100302170 NR_031611 ENSG00000283200 MIR1206 MIRN1206|hsa-mir-1206 microRNA 1206 ncRNA 214.333-41 chr14 44488774 44489329 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 18232 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 113.667-15 chr1 161788103 161788286 + 0.666667 NA intron (NM_007348, intron 4 of 15) L1M5|LINE|L1 21874 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 141.333-28 chr10 81717464 81717839 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -157543 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 181-68 chr7 4891770 4892188 + 0.666667 NA TTS (NR_072989) TTS (NR_072989) -8263 NM_018059 55698 Hs.667336 NM_018059 ENSG00000157927 RADIL RASIP2 Rap associating with DIL domain protein-coding 293-23 chr2 6883459 6884026 + 0.666667 NA intron (NM_080657, intron 2 of 5) intron (NM_080657, intron 2 of 5) 5965 NM_080657 91543 Hs.17518 NM_080657 ENSG00000134321 RSAD2 2510004L01Rik|cig33|cig5|vig1 radical S-adenosyl methionine domain containing 2 protein-coding 124.667-92 chr18 55695189 55695536 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59405 NM_001243226 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 175.667-41 chr14 76031571 76031945 + 0.666667 NA intron (NR_045664, intron 3 of 7) intron (NR_045664, intron 3 of 7) 45995 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 155-36 chr15 33714867 33715176 + 0.666667 NA intron (NM_001243996, intron 43 of 102) intron (NM_001243996, intron 43 of 102) -253476 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 222.333-60 chr3 51611951 51612447 + 0.666667 NA intron (NM_001322253, intron 4 of 23) AluSx1|SINE|Alu -58976 NM_001243727 51368 Hs.517864 NM_015926 ENSG00000164081 TEX264 ZSIG11 testis expressed 264, ER-phagy receptor protein-coding 114-3 chr1 22913298 22913638 + 0.666667 NA exon (NM_001309193, exon 16 of 17) exon (NM_001309193, exon 16 of 17) -50242 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 192.333-39 chr12 10041406 10041710 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_207345, exon 2 of 9) 5' UTR (NM_207345, exon 2 of 9) 10876 NM_207345 283420 Hs.531189 NM_207345 ENSG00000197992 CLEC9A CD370|DNGR-1|DNGR1|UNQ9341 C-type lectin domain containing 9A protein-coding 175-83 chr9 136998613 136998977 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2227 NM_004669 9022 Hs.64746 NM_004669 ENSG00000169583 CLIC3 - chloride intracellular channel 3 protein-coding 170-97 chr5 118415893 118416214 + 0.666667 NA intron (NR_104610, intron 9 of 9) L1M5|LINE|L1 133479 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 114-26 chr12 88643845 88644144 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63521 NM_003994 4254 Hs.1048 NM_000899 ENSG00000049130 KITLG DCUA|DFNA69|FPH2|FPHH|KL-1|Kitl|MGF|SCF|SF|SHEP7|SLF KIT ligand protein-coding 136.667-148 chr5 125675505 125675879 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 182431 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 120.667-40 chr12 63943110 63943447 + 0.666667 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) L2b|LINE|L2 98578 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 173-97 chr8 112192841 112193204 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -450471 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 225.667-69 chr6 149297495 149297990 + 0.666667 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu -19970 NM_001369506 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 158.333-211 chr3 123921516 123921940 + 0.666667 NA intron (NM_001366336, intron 8 of 8) MER30|DNA|hAT-Charlie -37396 NM_053027 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 155-59 chr2 25109187 25109519 + 0.666667 NA intron (NM_014971, intron 4 of 22) L1MB5|LINE|L1 59227 NM_001319204 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 116.667-45 chr13 36814162 36814363 + 0.666667 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -4940 NM_000538 5994 Hs.24422 NM_000538 ENSG00000133111 RFXAP - regulatory factor X associated protein protein-coding 152.333-194 chr2 158646383 158646819 + 0.666667 NA intron (NM_001005476, intron 11 of 20) intron (NM_001005476, intron 11 of 20) 88401 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 112.667-277 chr9 24376572 24376908 + 0.666667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 168936 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 118-20 chr12 43839968 43840280 + 0.666667 NA intron (NM_001286213, intron 1 of 6) intron (NM_001286213, intron 1 of 6) 4043 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 168-80 chr4 42475576 42475873 + 0.666667 NA intron (NM_001105529, intron 24 of 35) MIR|SINE|MIR 78236 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 146-102 chr4 127040190 127040577 + 0.666667 NA Intergenic (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -592574 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 246-42 chr17 76779528 76779961 + 0.666667 NA TTS (NM_001353018) TTS (NM_001353018) -19300 NR_110837 101928514 Hs.617206 NR_110837 ENSG00000267065 LINC02080 - long intergenic non-protein coding RNA 2080 ncRNA 212.333-2 chr1 24970089 24970545 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5307 NM_001320672 864 Hs.170019 NM_004350 ENSG00000020633 RUNX3 AML2|CBFA3|PEBP2aC RUNX family transcription factor 3 protein-coding 200.333-86 chr21 45231655 45232174 + 0.666667 NA Intergenic (TGAATAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2426 NR_135279 114042 Hs.375832 NR_135279 ENSG00000182586 LINC00334 C21orf89|NCRNA00334 long intergenic non-protein coding RNA 334 ncRNA 169.333-131 chr2 184512823 184513150 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85543 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 112.333-196 chr4 158961208 158961481 + 0.666667 NA intron (NM_152543, intron 2 of 4) intron (NM_152543, intron 2 of 4) 73885 NM_152543 152940 Hs.415576 NM_152543 ENSG00000164123 C4orf45 - chromosome 4 open reading frame 45 protein-coding 226.333-35 chr15 62027823 62028372 + 0.666667 NA intron (NM_001018088, intron 6 of 81) L2a|LINE|L2 32350 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 116.333-151 chr4 31190816 31191007 + 0.666667 NA intron (NR_125935, intron 2 of 4) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 19767 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 152.667-123 chr15 47585385 47585661 + 0.666667 NA intron (NM_001198999, intron 3 of 19) intron (NM_001198999, intron 3 of 19) -131982 NM_001358351 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 118-60 chr18 5749491 5749750 + 0.666667 NA intron (NR_038839, intron 1 of 4) intron (NR_038839, intron 1 of 4) 801 NR_038839 645355 Hs.632356 NR_038839 ENSG00000261738 MIR3976HG LINC01469 MIR3976 host gene ncRNA 129.333-128 chr3 101206115 101206414 + 0.666667 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 114311 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 150.667-313 chr5 113373383 113373695 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 2 of 18) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 61450 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 124-103 chr6 28170604 28170921 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 9001 NR_103448 651302 Hs.172143 NM_001145129 ENSG00000226314 ZNF192P1 ZNF389|ZNF389P|dJ265C24.4 zinc finger protein 192 pseudogene 1 pseudo 144.333-136 chr2 144349376 144349798 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16518 NM_001354360 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 146-110 chr5 97654805 97655180 + 0.666667 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) intron (NR_105028, intron 2 of 3) 150296 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 121.667-78 chr18 1728317 1728527 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -368793 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 113-92 chr18 59422869 59423164 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63751 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 120.667-4 chr1 41971732 41972022 + 0.666667 NA intron (NR_038261, intron 1 of 3) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -52955 NM_001127714 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 117-101 chr4 44765999 44766177 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39454 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 174-64 chr3 32022459 32022813 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -40786 NM_001174060 114884 Hs.150122 NM_017784 ENSG00000144645 OSBPL10 ORP10|OSBP9 oxysterol binding protein like 10 protein-coding 201-72 chr22 42630541 42631136 + 0.666667 NA intron (NM_007326, intron 4 of 8) intron (NM_007326, intron 4 of 8) 9763 NM_001165877 267020 Hs.664737 NM_001165877 ENSG00000249222 ATP5MGL ATP5K2|ATP5L2 ATP synthase membrane subunit g like protein-coding 187.667 chr1 53031069 53031420 + 0.666667 NA intron (NM_001007250, intron 2 of 3) intron (NM_001007250, intron 2 of 3) 16306 NM_001007250 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 168.667-152 chr3 180059763 180060186 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23037 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 157-59 chr2 53860512 53860969 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001164165) promoter-TSS (NM_001164165) -707 NM_001164165 100302652 Hs.40763 NM_001164165 ENSG00000270898 GPR75-ASB3 ASB-3|ASB3 GPR75-ASB3 readthrough protein-coding 153-152 chr9 27523264 27523678 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_020124) promoter-TSS (NM_020124) -843 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 132-29 chr12 28440214 28440478 + 0.666667 NA intron (NM_001352082, intron 9 of 13) intron (NM_001352082, intron 9 of 13) -249608 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 117.333-209 chr8 99536375 99536580 + 0.666667 NA TTS (NR_030596) TTS (NR_030596) 253 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 136.333-100 chr2 154016823 154017167 + 0.666667 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) intron (NM_052917, intron 3 of 12) 72601 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 121-109 chr4 89485162 89485445 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -177503 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 163-3 chr1 150422409 150422724 + 0.666667 NA intron (NM_015203, intron 2 of 10) MER102b|DNA|hAT-Charlie 58455 NM_001297674 23248 Hs.213666 NM_015203 ENSG00000163125 RPRD2 HSPC099|KIAA0460 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 protein-coding 149.667-370 chr7 41753641 41753939 + 0.666667 NA intron (NR_027118, intron 2 of 3) MER41A|LTR|ERV1 -50700 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 253.667-29 chr2 65369749 65370312 + 0.666667 NA intron (NM_181784, intron 1 of 5) intron (NM_181784, intron 1 of 5) -3252 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 247.667-45 chr2 12416702 12417235 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 217838 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 122.667-131 chr3 187930422 187930780 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 45806 NR_135537 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 122.333-159 chr4 105582317 105582548 + 0.666667 NA intron (NM_001242729, intron 1 of 13) L1MB3|LINE|L1 20841 NR_046840 100874374 Hs.668908 NR_046840 ENSG00000249885 ARHGEF38-IT1 - ARHGEF38 intronic transcript 1 ncRNA 113.333-123 chr2 45842541 45842820 + 0.666667 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) MER20|DNA|hAT-Charlie 191005 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 198.667-88 chr18 7994632 7995056 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) L1MA4|LINE|L1 372190 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 119.333-22 chr1 232052230 232052496 + 0.666667 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL 126529 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 165.667-158 chr5 74899013 74899372 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -32226 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 136.333-157 chr4 147614380 147614662 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -2876 NM_018241 55751 Hs.203896 NM_018241 ENSG00000164168 TMEM184C TMEM34 transmembrane protein 184C protein-coding 121.667-46 chr12 46624933 46625287 + 0.666667 NA intron (NR_125377, intron 3 of 3) intron (NR_125377, intron 3 of 3) 200887 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 169.333-154 chr3 16723839 16724278 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118635 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 131.333-165 chr7 67353249 67353474 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 17385 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 155.667-41 chr10 89052967 89053273 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -10216 NR_039826 100616128 NR_039826 ENSG00000283664 MIR4679-1 - microRNA 4679-1 ncRNA 138-50 chr18 3491031 3491332 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 24931 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 114.333-15 chr1 202921724 202921986 + 0.666667 NA intron (NM_001303109, intron 2 of 9) intron (NM_001303109, intron 2 of 9) 5379 NM_021633 59349 Hs.706793 NM_021633 ENSG00000117153 KLHL12 C3IP1|DKIR kelch like family member 12 protein-coding 143.667-193 chr4 171578788 171579071 + 0.666667 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 59834 NR_147157 105377536 Hs.550719 NR_147157 ENSG00000249297 LINC02174 - long intergenic non-protein coding RNA 2174 ncRNA 121-73 chr2 133082299 133082615 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 166900 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 165.667-153 chr5 19620810 19621250 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 5 of 12) intron (NM_001349559, intron 5 of 12) 265242 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 197.667-62 chr2 33398362 33398873 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001166266, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_001166266, exon 29 of 29) -19899 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 112.667-89 chr16 85415408 85415655 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109206 NR_049816 100847022 NR_049816 ENSG00000266307 MIR5093 - microRNA 5093 ncRNA 152-49 chr13 44047750 44048055 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25567 NR_026955 121838 Hs.201441 NR_026955 LINC00284 NCRNA00284 long intergenic non-protein coding RNA 284 ncRNA 143-101 chr5 161509297 161509619 + 0.666667 NA intron (NM_000813, intron 4 of 9) L2c|LINE|L2 38666 NM_021911 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 199.667-57 chr16 57687580 57688115 + 0.666667 NA intron (NM_001308360, intron 10 of 10) L1MEi|LINE|L1 -6959 NM_032269 84229 Hs.513635 NM_032269 ENSG00000159625 DRC7 C16orf50|CCDC135|CFAP50|FAP50 dynein regulatory complex subunit 7 protein-coding 175-81 chr8 144469301 144469745 + 0.666667 NA exon (NM_145754, exon 12 of 17) exon (NM_145754, exon 12 of 17) 3186 NM_145754 90990 Hs.528713 NM_145754 ENSG00000167702 KIFC2 - kinesin family member C2 protein-coding 167-79 chr4 125048893 125049298 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -267317 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 147.333-283 chr6 134803014 134803333 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 146928 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 123.667-13 chr1 107720896 107721149 + 0.666667 NA intron (NM_006113, intron 15 of 26) intron (NM_006113, intron 15 of 26) -32523 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 176.333-54 chr14 85316188 85316651 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44487 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 165-24 chr14 45291313 45291692 + 0.666667 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger -38300 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 113.333-20 chr1 218774833 218775071 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 4 of 6) intron (NR_031644, intron 4 of 6) 143559 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 195.333-187 chr6 6923078 6923482 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -184463 NM_001168344 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 135-106 chr8 63938447 63938840 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) HAL1|LINE|L1 169213 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 297.667-32 chr6 55372076 55372797 + 0.666667 NA intron (NM_207410, intron 6 of 8) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 44967 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 121.667-31 chr10 88791800 88792148 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -10756 NM_001128215 340654 Hs.55118 NM_001128215 ENSG00000173239 LIPM LIPL3|bA304I5.1 lipase family member M protein-coding 115.333-210 chr8 21792582 21792806 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3819 NM_001495 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 128.333-9 chr1 117283369 117283648 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11958 NR_126408 104355292 Hs.576446 NR_126408 ENSG00000235202 LINC01525 lnc-MAN1A2-1 long intergenic non-protein coding RNA 1525 ncRNA 143.333-40 chr10 75310235 75310614 + 0.666667 NA intron (NR_038226, intron 2 of 3) L1MDa|LINE|L1 14041 NR_038225 253264 Hs.662111 NR_038223 ENSG00000226051 ZNF503-AS1 - ZNF503 antisense RNA 1 ncRNA 147-60 chr18 23647433 23647694 + 0.666667 NA intron (NM_173505, intron 2 of 9) AluSq10|SINE|Alu 15348 NM_173505 147463 Hs.355689 NM_173505 ENSG00000154065 ANKRD29 - ankyrin repeat domain 29 protein-coding 178.667-168 chr8 144762071 144762514 + 0.666667 NA Intergenic MER66D|LTR|ERV1 -6761 NM_138367 90987 Hs.534516 NM_138367 ENSG00000198169 ZNF251 - zinc finger protein 251 protein-coding 179.333-100 chr2 122991262 122991626 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 82037 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 115.667-73 chr14 51790829 51791092 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -69652 NM_001243773 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 163.667-232 chr7 40156244 40156560 + 0.666667 NA intron (NM_024728, intron 1 of 14) AluY|SINE|Alu 21426 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 150-40 chr14 34678741 34679023 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 34935 NM_021914 1073 Hs.180141 NM_021914 ENSG00000165410 CFL2 NEM7 cofilin 2 protein-coding 157-107 chr5 149175129 149175448 + 0.666667 NA intron (NM_001370418, intron 1 of 18) intron (NM_001370418, intron 1 of 18) 33557 NM_001370418 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 141.333-227 chr7 96407780 96408161 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85823 NM_001160210 10165 Hs.489190 NM_014251 ENSG00000004864 SLC25A13 ARALAR2|CITRIN|CTLN2 solute carrier family 25 member 13 protein-coding 131.667-126 chr3 38210081 38210331 + 0.666667 NA intron (NM_005109, intron 4 of 17) intron (NM_005109, intron 4 of 17) 44669 NM_005109 9943 Hs.475970 NM_005109 ENSG00000172939 OXSR1 OSR1 oxidative stress responsive kinase 1 protein-coding 185.667-146 chr9 74860918 74861361 + 0.666667 NA intron (NM_017662, intron 1 of 38) L2c|LINE|L2 26208 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 178-4 chr1 66700965 66701298 + 0.666667 NA intron (NM_001350218, intron 16 of 22) intron (NM_001350218, intron 16 of 22) -51328 NM_152665 200132 Hs.479226 NM_152665 ENSG00000152760 TCTEX1D1 - Tctex1 domain containing 1 protein-coding 118.667-144 chr3 159286595 159286786 + 0.666667 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) L1PA15|LINE|L1 4044 NR_037483 100500803 NR_037483 ENSG00000263634 MIR3919 - microRNA 3919 ncRNA 115.667-208 chr8 50651933 50652243 + 0.666667 NA intron (NR_135797, intron 15 of 20) L1ME3B|LINE|L1 487957 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 322.333-20 chr3 118551354 118552050 + 0.666667 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) intron (NR_135547, intron 2 of 3) -90066 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 125.667-125 chr3 111166460 111166784 + 0.666667 NA intron (NM_001243288, intron 7 of 8) intron (NM_001243288, intron 7 of 8) 94806 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 187.667-85 chr22 24080724 24081141 + 0.666667 NA intron (NM_012295, intron 19 of 36) L1ME3Cz|LINE|L1 69562 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 228.333-55 chr20 24062974 24063485 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -74450 NM_178311 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 157-53 chr17 68909052 68909376 + 0.666667 NA intron (NM_001288985, intron 17 of 39) MER58A|DNA|hAT-Charlie 46178 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 132-73 chr20 52183407 52183734 + 0.666667 NA intron (NM_199427, intron 2 of 8) intron (NM_199427, intron 2 of 8) 8209 NM_199426 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 160-81 chr3 185414880 185415277 + 0.666667 NA intron (NM_004721, intron 1 of 13) intron (NM_004721, intron 1 of 13) 51942 NM_004721 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 154.667-379 chr8 61340571 61340874 + 0.666667 NA intron (NM_173519, intron 2 of 5) L1MA8|LINE|L1 52752 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 143.333-12 chr1 153284341 153284610 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 24788 NM_000427 4014 Hs.251680 NM_000427 ENSG00000203782 LOR - loricrin protein-coding 169.333-98 chr17 44249654 44250009 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_000342, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_000342, exon 20 of 20) 18304 NM_000342 6521 Hs.210751 NM_000342 ENSG00000004939 SLC4A1 AE1|BND3|CD233|CHC|DI|EMPB3|EPB3|FR|RTA1A|SAO|SPH4|SW|WD|WD1|WR solute carrier family 4 member 1 (Diego blood group) protein-coding 208.333-150 chr8 118187386 118187858 + 0.666667 NA intron (NR_146234, intron 4 of 5) intron (NR_146234, intron 4 of 5) -75803 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 116.333-96 chr18 3288235 3288430 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 25613 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 122.333-136 chr3 21688407 21688696 + 0.666667 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) intron (NM_024697, intron 1 of 7) 62659 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 132.667-77 chr2 22190679 22191036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -345622 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 158.667-30 chr1 221679993 221680457 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 56675 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 122.333-91 chr2 52055475 52055706 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -315058 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 117.333-17 chr1 209221355 209221552 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104003 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 121.667-135 chr3 192517773 192518045 + 0.666667 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 2887 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 227.333-45 chr16 82425159 82425714 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201533 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 112.667-129 chr2 83054751 83055011 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 198078 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 150.667 chr1 9145693 9146034 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 5914 NR_029610 407040 NR_029610 ENSG00000284357 MIR34A MIRN34A|miRNA34A|mir-34|mir-34a microRNA 34a ncRNA 115.667-174 chr5 27214988 27215247 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -176531 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 146-46 chr17 66119436 66119770 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 6 of 26) L1ME1|LINE|L1 72289 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 222.333-48 chr2 125432135 125432701 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 685567 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 151.667-126 chr15 66318292 66318668 + 0.666667 NA exon (NM_001323945, exon 8 of 17) exon (NM_001323945, exon 8 of 17) 24665 NM_001323945 115752 Hs.446251 NM_133375 ENSG00000166938 DIS3L DIS3L1 DIS3 like exosome 3'-5' exoribonuclease protein-coding 135.667-68 chr16 55349605 55349872 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25179 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 145.667-28 chr10 21366929 21367252 + 0.666667 NA intron (NR_155751, intron 3 of 4) AluSq2|SINE|Alu 5860 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 132.333-156 chr6 134665413 134665664 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -125533 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 137.667 chr1 19519668 19519962 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -34276 NM_004930 832 Hs.432760 NM_004930 ENSG00000077549 CAPZB CAPB|CAPPB|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit beta protein-coding 133.333-22 chr10 23888798 23889067 + 0.666667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) L1ME2|LINE|L1 194205 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 197.667-96 chr3 164269397 164269807 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98046 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 114.667-252 chr8 133637063 133637377 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 46846 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 130.667-145 chr3 110304555 110304912 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 701905 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 167.333-148 chr2 214088091 214088435 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 12 of 14) intron (NR_047660, intron 12 of 14) -322791 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 117.333-198 chr7 104078026 104078263 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88486 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 146.667-203 chr21 24992804 24993147 + 0.666667 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) HUERS-P3-int|LTR|ERV1 152425 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 113.333-60 chr12 33366602 33366912 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 73062 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 158.333-345 chr9 102515799 102516112 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3682 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 157-14 chr1 237341107 237341419 + 0.666667 NA intron (NM_001035, intron 3 of 104) intron (NM_001035, intron 3 of 104) -129856 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 221.333-66 chr2 102033973 102034503 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35277 NR_048564 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 227-24 chr2 37268562 37269056 + 0.666667 NA intron (NM_005813, intron 12 of 17) L2a|LINE|L2 37151 NM_001350027 55471 Hs.433466 NM_018607 ENSG00000003509 NDUFAF7 C2orf56|MidA|PRO1853 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 7 protein-coding 285.666-9 chr7 11473080 11473894 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 8 of 26) intron (NM_015204, intron 8 of 26) 358711 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 263.333-24 chr14 78213915 78214614 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 1 of 20) L2b|LINE|L2 43891 NR_158975 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 148.667-274 chr4 44292795 44293088 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 155868 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 156-123 chr6 99183930 99184242 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 59477 NR_039672 100616347 NR_039672 ENSG00000265226 MIR548AI - microRNA 548ai ncRNA 129-40 chr15 74641222 74641536 + 0.666667 NA intron (NM_001142443, intron 7 of 9) intron (NM_001142443, intron 7 of 9) 26385 NM_001130028 1198 Hs.511790 NM_001292 ENSG00000179335 CLK3 PHCLK3|PHCLK3/152 CDC like kinase 3 protein-coding 125.667-41 chr11 110698075 110698390 + 0.666667 NA intron (NM_001258416, intron 1 of 15) L1PB4|LINE|L1 13593 NM_001258415 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 170.333-108 chr2 46447999 46448360 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 18989 NR_103805 101805491 Hs.304781 NR_103805 ENSG00000187600 LINC02583 - long intergenic non-protein coding RNA 2583 ncRNA 121-41 chr14 41977301 41977609 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 370599 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 165-30 chr18 3469565 3469984 + 0.666667 NA intron (NR_110429, intron 2 of 2) MIR3|SINE|MIR 3524 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 138.333-8 chr1 169370851 169371197 + 0.666667 NA intron (NM_003666, intron 2 of 7) intron (NM_003666, intron 2 of 7) 2829 NM_001320973 8548 Hs.130746 NM_003666 ENSG00000117475 BLZF1 GOLGIN-45|JEM-1|JEM-1s|JEM1 basic leucine zipper nuclear factor 1 protein-coding 150.333-285 chr3 194246372 194246650 + 0.666667 NA intron (NR_125403, intron 1 of 2) intron (NR_125403, intron 1 of 2) -1137 NR_125402 101929337 Hs.548086 NR_125402 ENSG00000238097 LINC02037 - long intergenic non-protein coding RNA 2037 ncRNA 115.667-61 chr12 79582483 79582680 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 107999 NM_001354732 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 144.667-173 chr20 56487325 56487573 + 0.666667 NA intron (NM_001283036, intron 5 of 8) intron (NM_001283036, intron 5 of 8) 18864 NM_016407 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 162.333-64 chr14 20673494 20673824 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -10518 NM_001145 283 Hs.283749 NM_001145 ENSG00000214274 ANG ALS9|HEL168|RAA1|RNASE4|RNASE5 angiogenin protein-coding 131.333-36 chr11 62385543 62385846 + 0.666667 NA intron (NM_025080, intron 4 of 6) AluSq2|SINE|Alu -33339 NM_003357 7356 Hs.523732 NM_003357 ENSG00000149021 SCGB1A1 CC10|CC16|CCPBP|CCSP|UGB|UP-1|UP1 secretoglobin family 1A member 1 protein-coding 113-124 chr20 13898926 13899227 + 0.666667 NA intron (NR_073206, intron 6 of 20) intron (NR_073206, intron 6 of 20) 91538 NR_073206 80343 Hs.590879 NM_025229 ENSG00000101251 SEL1L2 C20orf50|sel-1L2 SEL1L2 adaptor subunit of ERAD E3 ligase protein-coding 119.333-28 chr10 34272097 34272308 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 19 of 22) L1MD1|LINE|L1 -499522 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 172.667-170 chr9 88439809 88440158 + 0.666667 NA intron (NM_006717, intron 2 of 5) L1MC1|LINE|L1 51539 NM_006717 10927 Hs.146804 NM_006717 ENSG00000106723 SPIN1 SPIN|TDRD24 spindlin 1 protein-coding 130-15 chr10 81982594 81982923 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 105071 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 146.333-21 chr1 237935718 237936064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44969 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 192.333-172 chr8 112705832 112706202 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) intron (NM_001363185, intron 11 of 66) 62524 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 341-12 chr15 69489282 69489955 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36800 NM_213725 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 125.333-118 chr4 51944181 51944489 + 0.666667 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 76028 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 201.667-120 chr8 106747630 106748155 + 0.666667 NA intron (NM_181354, intron 13 of 13) intron (NM_181354, intron 13 of 13) 21785 NM_001198535 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 146-138 chr8 84339132 84339561 + 0.666667 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) MER1A|DNA|hAT-Charlie -76138 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 182.667-62 chr17 72666415 72666848 + 0.666667 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) intron (NM_001352692, intron 7 of 9) -26159 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 232-4 chr1 67825156 67825704 + 0.666667 NA intron (NM_018841, intron 1 of 3) intron (NM_018841, intron 1 of 3) -6858 NR_040077 100289178 Hs.677603 NR_040077 ENSG00000232284 GNG12-AS1 - GNG12, DIRAS3 and WLS antisense RNA 1 ncRNA 217.667-59 chr3 133633645 133634140 + 0.666667 NA intron (NM_001363889, intron 14 of 27) L2|LINE|L2 28049 NM_001363889 11073 Hs.593379 NM_007027 ENSG00000163781 TOPBP1 Dpb11|TOP2BP1 DNA topoisomerase II binding protein 1 protein-coding 117-146 chr8 110546965 110547182 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 480360 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 118.333-92 chr19 1946075 1946327 + 0.666667 NA intron (NM_001319, intron 1 of 11) intron (NM_001319, intron 1 of 11) 5029 NM_001319 1455 Hs.651905 NM_001319 ENSG00000133275 CSNK1G2 CK1g2 casein kinase 1 gamma 2 protein-coding 115-90 chr2 119976824 119977047 + 0.666667 NA intron (NM_002830, intron 26 of 26) intron (NM_002830, intron 26 of 26) -36142 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 135.667-184 chr8 88613961 88614263 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -286629 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 136.333-219 chr9 69683517 69683899 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11337 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 142-28 chr12 47566333 47566603 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 139562 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 158.333-26 chr1 234778435 234778805 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18564 NR_148962 100130249 Hs.617350 NR_148962 ENSG00000279261 PP2672 - uncharacterized LOC100130249 ncRNA 179.667-140 chr8 86722296 86722796 + 0.666667 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) MLT2B4|LTR|ERVL 21129 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 148.333-332 chr5 137800651 137800999 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_002713) promoter-TSS (NR_002713) -368 NR_002713 4888 Hs.643466 NR_002713 ENSG00000226306 NPY6R NPY1RL|NPY6RP|PP2|Y2B neuropeptide Y receptor Y6 (pseudogene) pseudo 165-44 chr2 218456657 218457026 + 0.666667 NA intron (NM_020935, intron 24 of 25) AluSz|SINE|Alu 37718 NM_007127 7429 Hs.654595 NM_007127 ENSG00000127831 VIL1 D2S1471|VIL villin 1 protein-coding 253.333-100 chr7 46089866 46090558 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -168940 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 120-49 chr17 61760221 61760494 + 0.666667 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) L1MA7|LINE|L1 103202 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 170.333-53 chr12 12093646 12094132 + 0.666667 NA intron (NM_001370269, intron 6 of 7) AluJb|SINE|Alu -18063 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 201.333-130 chr18 8926494 8927034 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -175935 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 169.667-213 chr8 130611655 130612127 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -168217 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 204.667-159 chrX 72513176 72513697 + 0.666667 NA intron (NM_001166448, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu 59407 NR_051952 55869 Hs.310536 NM_018486 ENSG00000147099 HDAC8 CDA07|CDLS5|HD8|HDACL1|KDAC8|MRXS6|RPD3|WTS histone deacetylase 8 protein-coding 114-16 chr11 101012810 101013000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 78631 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 187.333-2 chr1 44830550 44831058 + 0.666667 NA intron (NM_003738, intron 6 of 21) intron (NM_003738, intron 6 of 21) 12140 NM_001166292 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 143.333-235 chr5 158737951 158738311 + 0.666667 NA intron (NM_001324107, intron 10 of 15) intron (NM_001324107, intron 10 of 15) -328358 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 194.667-55 chr18 42338319 42338868 + 0.666667 NA intron (NR_046174, intron 4 of 9) intron (NR_046174, intron 4 of 9) 151925 NR_046174 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 128.667-30 chr10 114208730 114209074 + 0.666667 NA intron (NM_198795, intron 11 of 25) AluSc|SINE|Alu 29549 NM_001365891 56165 Hs.333132 NM_198795 ENSG00000095627 TDRD1 CT41.1 tudor domain containing 1 protein-coding 152.333-401 chr9 31666695 31667006 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -285360 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 159.667-17 chr1 92207132 92207516 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -10591 NM_001012425 388649 Hs.558823 NM_001012425 ENSG00000203910 C1orf146 - chromosome 1 open reading frame 146 protein-coding 122.333-141 chr3 118714297 118714622 + 0.666667 NA intron (NR_135547, intron 1 of 3) L1MC4a|LINE|L1 72691 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 113-127 chr21 18747558 18747817 + 0.666667 NA intron (NR_109925, intron 1 of 3) L1ME3D|LINE|L1 12125 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 190-92 chr4 67820494 67820908 + 0.666667 NA TTS (NM_004262) TTS (NM_004262) 63301 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 154.333-269 chr5 86767886 86768209 + 0.666667 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 21229 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 161-104 chr8 130032467 130032916 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -15562 NM_001353269 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 219-63 chr3 175952045 175952583 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -175981 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-135 chr5 20497341 20497739 + 0.666667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 78173 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 126.333-100 chr2 220163906 220164222 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -257499 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 174-111 chr9 112105957 112106279 + 0.666667 NA intron (NM_022486, intron 8 of 16) AluSz6|SINE|Alu 69179 NM_001282643 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 115.667-110 chr2 38861359 38861651 + 0.666667 NA exon (NM_198963, exon 5 of 24) exon (NM_198963, exon 5 of 24) 14429 NM_198963 90957 Hs.468226 NM_198963 ENSG00000163214 DHX57 DDX57 DExH-box helicase 57 protein-coding 135-76 chr4 59550097 59550468 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 536709 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 138.333-176 chr7 4321296 4321574 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -186598 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 119.667-97 chr2 232855428 232855676 + 0.666667 NA intron (NM_015575, intron 30 of 30) intron (NM_015575, intron 30 of 30) -13462 NM_001346122 389084 Hs.657509 NM_206895 ENSG00000182600 SNORC ASCL830|C2orf82|UNQ830 secondary ossification center associated regulator of chondrocyte maturation protein-coding 112.667-32 chr10 117972623 117972899 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74060 NR_026940 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 158.333-196 chr3 27583124 27583509 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -98932 NM_001321107 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 129-112 chr6 100074657 100075009 + 0.666667 NA intron (NR_038384, intron 2 of 2) intron (NR_038384, intron 2 of 2) -80595 NM_032503 84539 Hs.591342 NM_032503 ENSG00000152034 MCHR2 GPR145|GPRv17|MCH-2R|MCH-R2|MCH2|MCH2R|MCHR-2|SLT melanin concentrating hormone receptor 2 protein-coding 114-18 chr11 108812424 108812707 + 0.666667 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) intron (NM_004398, intron 13 of 17) 147496 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 115.667-183 chr5 113840441 113840688 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 326870 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 159-115 chr7 107644396 107644722 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16269 NM_000441 5172 Hs.571246 NM_000441 ENSG00000091137 SLC26A4 DFNB4|EVA|PDS|TDH2B solute carrier family 26 member 4 protein-coding 119-61 chr16 79193237 79193441 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 407398 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 209.667-93 chr5 52065917 52066425 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 58140 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 226-31 chr17 47778806 47779329 + 0.666667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 42727 NM_145798 114881 Hs.463320 NM_017731 ENSG00000006025 OSBPL7 ORP7 oxysterol binding protein like 7 protein-coding 113-26 chr11 10002544 10002822 + 0.666667 NA exon (NM_030962, exon 7 of 40) exon (NM_030962, exon 7 of 40) 163541 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 182.667-143 chr6 27920162 27920570 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -7970 NM_033057 81697 Hs.307111 NM_033057 ENSG00000168131 OR2B2 OR2B2Q|OR2B9|OR6-1|dJ193B12.4|hs6M1-10 olfactory receptor family 2 subfamily B member 2 protein-coding 145.333-245 chr5 123260671 123261021 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 162746 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 162-12 chr10 22769237 22769666 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54873 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 154.333-81 chr14 42727384 42727735 + 0.666667 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL 1120703 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 116.667-116 chr22 25911426 25911672 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 33 of 43) intron (NM_001318245, intron 33 of 43) 169361 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 173-41 chr18 69895639 69896148 + 0.666667 NA exon (NM_001303619, exon 2 of 5) exon (NM_001303619, exon 2 of 5) 51980 NM_001303618 10666 Hs.660130 NM_006566 ENSG00000150637 CD226 DNAM-1|DNAM1|PTA1|TLiSA1 CD226 molecule protein-coding 116.333-39 chr11 8660500 8660813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1820 NM_014818 9866 Hs.130836 NM_014818 ENSG00000166436 TRIM66 C11orf29|TIF1D|TIF1DELTA tripartite motif containing 66 protein-coding 193.667-136 chr8 110157713 110158100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -182135 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 169.667-179 chr6 46725979 46726326 + 0.666667 NA intron (NM_001168357, intron 1 of 11) MER39B|LTR|ERV1 9223 NM_005084 7941 Hs.584823 NM_005084 ENSG00000146070 PLA2G7 LDL-PLA2|LP-PLA2|PAFAD|PAFAH phospholipase A2 group VII protein-coding 142-166 chr9 99843320 99843636 + 0.666667 NA intron (NM_006981, intron 5 of 7) MER5A|DNA|hAT-Charlie 21593 NM_006981 8013 Hs.279522 NM_006981 ENSG00000119508 NR4A3 CHN|CSMF|MINOR|NOR1|TEC nuclear receptor subfamily 4 group A member 3 protein-coding 112-43 chr12 46694161 46694411 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 131711 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 131-92 chr7 70883332 70883718 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -248619 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 161.667-91 chr15 85096312 85096668 + 0.666667 NA intron (NM_001243137, intron 8 of 21) L1MB7|LINE|L1 114516 NM_173454 5151 Hs.9333 NM_002605 ENSG00000073417 PDE8A HsT19550 phosphodiesterase 8A protein-coding 152-78 chr18 57307789 57308156 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -44585 NM_015879 51046 Hs.23172 NM_015879 ENSG00000177511 ST8SIA3 SIAT8C|ST8SiaIII ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3 protein-coding 141.333-225 chr7 80600291 80600559 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1782 NM_001371080 148.667-180 chr2 48138715 48139043 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -175803 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 122.333-192 chr7 52574357 52574628 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -461141 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 128-81 chr4 82141635 82141848 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 232250 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 173.333-98 chr2 137437771 137438093 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 14 of 27) intron (NM_001316349, intron 14 of 27) 490000 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 125.333-62 chr14 98882067 98882330 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 170585 NR_161367 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 112-146 chr3 197167665 197167875 + 0.666667 NA intron (NM_001290983, intron 5 of 25) L1MA10|LINE|L1 16102 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 131.667-111 chr20 56908126 56908368 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 278941 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 199-57 chr2 167291415 167291869 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 104270 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 199.333-285 chr8 129495115 129495457 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2b|LINE|L2 -11144 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 262-40 chr2 50112039 50112559 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) L3|LINE|CR1 -138096 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 139.333-6 chr1 73797865 73798263 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 123385 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 181.667-79 chr2 219042902 219043276 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1538 NM_001278295 255101 Hs.147762 NM_152389 ENSG00000181378 CFAP65 CCDC108 cilia and flagella associated protein 65 protein-coding 122.667-205 chr9 27255865 27256059 + 0.666667 NA intron (NR_026679, intron 15 of 16) L1PA7|LINE|L1 26831 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 158-79 chr20 8593928 8594236 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) AluJr|SINE|Alu -237103 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 136-66 chr3 113847926 113848257 + 0.666667 NA intron (NM_017577, intron 2 of 17) intron (NM_017577, intron 2 of 17) 9303 NM_017577 54762 Hs.24583 NM_017577 ENSG00000178075 GRAMD1C - GRAM domain containing 1C protein-coding 153.667-380 chr8 88119236 88119542 + 0.666667 NA intron (NM_005941, intron 4 of 9) intron (NM_005941, intron 4 of 9) 208094 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 177-43 chr20 50036722 50037076 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 4730 NR_051976 100887755 Hs.195705 NR_051976 TRERNA1 LINC00651|treRNA translation regulatory long non-coding RNA 1 ncRNA 183.667-124 chr6 2829972 2830470 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 11642 NM_030666 1992 Hs.381167 NM_030666 ENSG00000021355 SERPINB1 EI|ELANH2|HEL-S-27|HEL57|LEI|M/NEI|MNEI|PI-2|PI2 serpin family B member 1 protein-coding 151.333-302 chr4 45155930 45156228 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -429445 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 114-172 chr8 141019808 141020000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17825 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 160-125 chr8 129666762 129667155 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 13281 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 137-77 chr4 171984928 171985177 + 0.666667 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) LTR16C|LTR|ERVL -171445 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 111.667-118 chr18 65742367 65742553 + 0.666667 NA Intergenic MER102a|DNA|hAT-Charlie -7792 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 162.667-303 chrX 100470249 100470654 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -60178 NM_001105243 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 171.667-3 chr1 45065181 45065572 + 0.666667 NA intron (NM_020883, intron 2 of 13) intron (NM_020883, intron 2 of 13) 53122 NR_158185 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 202.333-121 chr4 37287428 37287936 + 0.666667 NA intron (NM_001144990, intron 1 of 6) L1P3b|LINE|L1 42939 NM_001144990 57495 Hs.4280 NM_001144990 ENSG00000174145 NWD2 KIAA1239 NACHT and WD repeat domain containing 2 protein-coding 165.333-77 chr14 63173479 63173831 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30788 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 114-44 chr15 59163106 59163355 + 0.666667 NA exon (NM_004998, exon 23 of 28) exon (NM_004998, exon 23 of 28) 8032 NR_031750 100313886 NR_031750 ENSG00000253030 MIR2116 mir-2116 microRNA 2116 ncRNA 150-79 chr2 150642134 150642403 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13371 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 123.333-159 chr4 48945052 48945381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38388 NM_001286773 132299 Hs.95835 NM_152398 ENSG00000145247 OCIAD2 - OCIA domain containing 2 protein-coding 142.333-94 chr15 100194730 100195154 + 0.666667 NA intron (NM_139057, intron 8 of 21) intron (NM_139057, intron 8 of 21) 147033 NM_139057 170691 Hs.513200 NM_139057 ENSG00000140470 ADAMTS17 WMS4 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 protein-coding 227-55 chr7 118722123 118722659 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 497687 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 147.333-110 chr14 66928863 66929184 + 0.666667 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) L1MA3|LINE|L1 -260417 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 117.667-66 chr16 85330529 85330845 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24362 NR_049816 100847022 NR_049816 ENSG00000266307 MIR5093 - microRNA 5093 ncRNA 131-81 chr5 130477899 130478224 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 573596 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 186.667-6 chr1 173011201 173011610 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 39558 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 149-97 chr4 6846681 6847105 + 0.666667 NA intron (NM_001100590, intron 3 of 8) intron (NM_001100590, intron 3 of 8) -62551 NM_001113361 57533 Hs.518611 NM_020773 ENSG00000132405 TBC1D14 - TBC1 domain family member 14 protein-coding 152.667-196 chr2 137002748 137003146 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) intron (NM_001316349, intron 2 of 27) 237402 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 145.333-15 chr1 167238420 167238705 + 0.666667 NA intron (NM_001198786, intron 1 of 14) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 17676 NR_037163 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 143.667-156 chr3 39376978 39377301 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6231 NM_001354798 54977 Hs.369615 NM_017875 ENSG00000144659 SLC25A38 SIDBA2 solute carrier family 25 member 38 protein-coding 222-36 chr17 63154275 63154746 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 188275 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 115-136 chr6 61794192 61794516 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR 220224 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 113.667-161 chr4 90111314 90111502 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16125 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 117.333-203 chr8 57046282 57046563 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52555 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 158.333-126 chr18 34118192 34118612 + 0.666667 NA intron (NM_001353232, intron 2 of 9) intron (NM_001353232, intron 2 of 9) -69790 NM_001353236 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 134.333-136 chr5 33330900 33331293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 101361 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 173-65 chr4 74579484 74579901 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 134556 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 123.667-125 chr3 107511048 107511335 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11771 NM_001142568 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 174.667-39 chr12 125309684 125310046 + 0.666667 NA intron (NM_001366854, intron 1 of 8) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -16751 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 145.667-166 chr21 27458702 27459082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -263487 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 118.667-153 chr4 176487278 176487530 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 167438 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 152.667-9 chr1 77907060 77907362 + 0.666667 NA intron (NM_001172309, intron 1 of 11) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -17672 NR_103535 374987 Hs.632414 NM_199343 ENSG00000235927 NEXN-AS1 C1orf118 NEXN antisense RNA 1 ncRNA 163.667-145 chr22 28924096 28924438 + 0.666667 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) intron (NM_032173, intron 1 of 8) 6878 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 153-110 chr5 27892465 27892786 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 395040 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 138-52 chr19 31459574 31459876 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -110289 NM_020856 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 185.333-25 chr11 26849458 26849909 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127623 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 175.667-49 chr15 71710347 71710693 + 0.666667 NA intron (NM_001286429, intron 2 of 11) intron (NM_001286429, intron 2 of 11) -18981 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 111.667-263 chr8 134222941 134223268 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 336608 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 203.333-64 chr13 100885851 100886298 + 0.666667 NA intron (NR_047687, intron 2 of 7) AluSg4|SINE|Alu 58290 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 112-11 chr1 228026793 228027005 + 0.666667 NA intron (NM_033131, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu 19901 NM_033131 89780 Hs.336930 NM_033131 ENSG00000154342 WNT3A - Wnt family member 3A protein-coding 149.333-234 chr3 27494910 27495293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10717 NM_001321107 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 126-55 chr2 105493886 105494252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55556 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 149.333-80 chr11 115571743 115572110 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -67511 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 131-61 chr3 52218971 52219234 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7061 NM_017442 54106 Hs.87968 NM_017442 ENSG00000239732 TLR9 CD289 toll like receptor 9 protein-coding 137.333-125 chr3 179288043 179288349 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21146 NM_001163677 27094 Hs.591285 NM_014407 ENSG00000171121 KCNMB3 BKBETA3|HBETA3|K(VCA)BETA-3|KCNMB2|KCNMBL|SLO-BETA-3|SLOBETA3 potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 3 protein-coding 209.333-132 chr20 33507204 33507655 + 0.666667 NA intron (NM_001032999, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 17333 NM_001032999 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 151.333-294 chr3 194697241 194697548 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11027 NR_037891 100507391 Hs.590099 NR_037891 ENSG00000237222 LINC01968 - long intergenic non-protein coding RNA 1968 ncRNA 117.333-94 chr19 46257440 46257778 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 27867 NM_198541 374918 Hs.546554 NM_198541 ENSG00000188293 IGFL1 APRG644|UNQ644 IGF like family member 1 protein-coding 175-25 chr14 97667147 97667656 + 0.666667 NA intron (NR_033943, intron 2 of 3) intron (NR_033943, intron 2 of 3) 19257 NR_033943 100129345 Hs.23632 NR_033943 ENSG00000197176 LINC02291 - long intergenic non-protein coding RNA 2291 ncRNA 179-97 chr8 77985508 77985991 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -530591 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 133.667-147 chr8 69008416 69008668 + 0.666667 NA intron (NR_039986, intron 2 of 4) L1ME5|LINE|L1 95648 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 200-7 chr1 98467438 98467953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -194026 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 120-86 chr3 59887244 59887593 + 0.666667 NA intron (NR_135491, intron 5 of 6) intron (NR_135491, intron 5 of 6) 193491 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 137-91 chr6 65230282 65230679 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -70938 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 115.333-128 chr21 34784788 34785090 + 0.666667 NA TTS (NR_038885) TTS (NR_038885) 39114 NR_038886 100506385 Hs.120179 NR_038885 ENSG00000234380 LINC01426 lincRNA-uc002yug.2 long intergenic non-protein coding RNA 1426 ncRNA 220.333-38 chr14 20057579 20057922 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -2295 NM_001004717 122742 Hs.553574 NM_001004717 ENSG00000176246 OR4L1 OR14-28|OR4L2P olfactory receptor family 4 subfamily L member 1 protein-coding 148.333-190 chr2 97925281 97925663 + 0.666667 NA intron (NM_015348, intron 2 of 40) intron (NM_015348, intron 2 of 40) 70476 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 113.333-167 chr3 21003898 21004229 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -401663 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 221.333-104 chr4 145233672 145234231 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53362 NM_001366058 54726 Hs.270851 NM_017493 ENSG00000164164 OTUD4 DUBA6|HIN1|HSHIN1 OTU deubiquitinase 4 protein-coding 116.333-133 chr21 26402067 26402274 + 0.666667 NA intron (NR_135516, intron 1 of 3) intron (NR_135516, intron 1 of 3) -3773 NR_135515 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 164.667-236 chr8 65477581 65478050 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 84851 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 126.333-119 chr3 97587171 97587463 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 11 of 17) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 147710 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 138-91 chr5 68686661 68686964 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 343115 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 111.667-125 chr2 17181658 17181887 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 336668 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 169.667-63 chr14 72369083 72369429 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -147564 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 113.667-33 chr11 111204492 111204713 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -41123 NM_198498 341032 Hs.298685 NM_198498 ENSG00000150750 C11orf53 - chromosome 11 open reading frame 53 protein-coding 202.667-68 chr17 43398165 43398720 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001661) promoter-TSS (NM_001661) -551 NM_001661 379 Hs.183153 NM_001661 ENSG00000175906 ARL4D ARF4L|ARL6 ADP ribosylation factor like GTPase 4D protein-coding 149.667-385 chr8 14802772 14803094 + 0.666667 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) MER83C|LTR|ERV1 50577 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 116.333-63 chr14 50030474 50030665 + 0.666667 NA intron (NR_131171, intron 6 of 8) AluJb|SINE|Alu -23049 NR_126498 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 161.667-116 chr2 643579 643975 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32927 NM_001352681 129787 Hs.6729 NM_152834 ENSG00000151353 TMEM18 lncND transmembrane protein 18 protein-coding 183.667-122 chr5 139891989 139892493 + 0.666667 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) intron (NM_013983, intron 1 of 10) 96433 NM_032289 84249 Hs.21963 NM_032289 ENSG00000146005 PSD2 EFA6C pleckstrin and Sec7 domain containing 2 protein-coding 168.333-141 chr4 33245542 33245925 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 794160 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 224.333-56 chr17 68813689 68814201 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 141447 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 117-77 chr2 64152167 64152481 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7904 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 148-50 chr15 95792947 95793243 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 334746 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 156.667-172 chr2 33065262 33065583 + 0.666667 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) AluJr4|SINE|Alu -69175 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 151-27 chr12 58099546 58099900 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 11831 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 182.667-79 chr2 71734902 71735327 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 268415 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 137.667-141 chr4 74662401 74662700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 131973 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 151.333-403 chr8 25578880 25579200 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 119807 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 115.667-111 chr2 41123162 41123355 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -610823 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 245.333-115 chr8 11202463 11203020 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_173683).2 promoter-TSS (NM_173683).2 -908 NM_173683 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 157.333-61 chr10 121148367 121148699 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 297171 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 142.667-66 chr15 60180075 60180445 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 175949 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 241.667-100 chrX 63406144 63406615 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -55047 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 115.667-5 chr1 91624114 91624322 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 123110 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 146.333-38 chr10 113834209 113834502 + 0.666667 NA TTS (NM_014881) TTS (NM_014881) 19727 NM_014881 9937 Hs.1560 NM_014881 ENSG00000198924 DCLRE1A PSO2|SNM1|SNM1A DNA cross-link repair 1A protein-coding 132.667-121 chr4 33937604 33937934 + 0.666667 NA intron (NR_125902, intron 4 of 4) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 102124 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 136.333-6 chr1 106632957 106633196 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -185163 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 165.333-241 chr7 83874761 83875163 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -225823 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 120-8 chr1 226231945 226232279 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001366241, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001366241, exon 15 of 15) 8448 NM_001282402 83881 Hs.282079 NM_031944 ENSG00000185155 MIXL1 MILD1|MIX|MIXL Mix paired-like homeobox protein-coding 149.667-263 chr3 109626421 109626830 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23797 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 114-182 chrX 95102565 95102761 + 0.666667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -39437 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 155.667-259 chr4 125098508 125098944 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -217686 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 145.667-57 chr12 24460084 24460374 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 102262 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 112-108 chr2 102056878 102057174 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13364 NM_001320978 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 172.667-123 chr5 72898719 72899221 + 0.666667 NA intron (NM_001364293, intron 20 of 24) intron (NM_001364293, intron 20 of 24) 20379 NR_039968 100616152 NR_039968 ENSG00000263593 MIR4804 - microRNA 4804 ncRNA 139.333-210 chr8 27742237 27742492 + 0.666667 NA intron (NM_001304529, intron 5 of 6) (AAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 30276 NM_018246 55246 Hs.445512 NM_018246 ENSG00000147419 CCDC25 - coiled-coil domain containing 25 protein-coding 213.667-46 chr20 1719074 1719410 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 60504 NR_037142 100289473 Hs.641525 NR_037142 ENSG00000232528 LOC100289473 - cytoskeleton associated protein 2-like pseudogene pseudo 123.333-122 chr2 205432874 205433133 + 0.666667 NA intron (NM_205863, intron 19 of 21) intron (NM_205863, intron 19 of 21) -249497 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 153-156 chr9 107085981 107086352 + 0.666667 NA intron (NR_126029, intron 3 of 4) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 16822 NR_126029 340512 Hs.432529 NR_126029 ENSG00000230782 LOC340512 - uncharacterized LOC340512 ncRNA 118.667-204 chr9 96559392 96559594 + 0.666667 NA intron (NR_147239, intron 4 of 14) intron (NR_147239, intron 4 of 14) 7338 NM_001351569 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 147.667-262 chr4 121015849 121016270 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 56476 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 173.667-120 chr3 142783796 142784159 + 0.666667 NA intron (NM_001251845, intron 6 of 12) intron (NM_001251845, intron 6 of 12) 59553 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 262-19 chr14 62921585 62922227 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) intron (NM_139318, intron 7 of 10) 123552 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 141.333-249 chr9 3305345 3305640 + 0.666667 NA intron (NM_134428, intron 5 of 17) intron (NM_134428, intron 5 of 17) 90104 NM_002919 5991 Hs.136829 NM_002919 ENSG00000080298 RFX3 - regulatory factor X3 protein-coding 119.333-9 chr1 80111963 80112186 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -423681 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 130.333-122 chr22 26715538 26715910 + 0.666667 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) intron (NR_110543, intron 1 of 5) 42881 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 142.667-145 chr3 156524103 156524409 + 0.666667 NA intron (NM_172159, intron 12 of 13) intron (NM_172159, intron 12 of 13) 29869 NM_001308205 6747 Hs.518346 NM_007107 ENSG00000114850 SSR3 TRAPG signal sequence receptor subunit 3 protein-coding 140-98 chr6 123296204 123296514 + 0.666667 NA intron (NM_006073, intron 24 of 40) intron (NM_006073, intron 24 of 40) -143245 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 148-139 chr5 180084092 180084452 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -12513 NM_001280801 55819 Hs.484363 NM_018434 ENSG00000113269 RNF130 G1RZFP|GOLIATH|GP ring finger protein 130 protein-coding 214.667-42 chr14 72022415 72022851 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MIRb|SINE|MIR 89106 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 155.333-61 chr11 105620035 105620331 + 0.666667 NA intron (NR_046356, intron 2 of 16) L2a|LINE|L2 9477 NR_046356 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 209-98 chr5 168552822 168553409 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_024594, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_024594, exon 7 of 7) -7789 NR_031721 100302238 NR_031721 ENSG00000283612 MIR103B1 MIR103-1AS|MIRN103-1AS|hsa-mir-103-1-as microRNA 103b-1 ncRNA 126.667-149 chr6 6546240 6546466 + 0.666667 NA intron (NR_026970, intron 3 of 7) CpG -42367 NM_004271 9450 Hs.653138 NM_004271 ENSG00000112799 LY86 MD-1|MD1|MMD-1|dJ80N2.1 lymphocyte antigen 86 protein-coding 147-56 chr17 71249707 71250089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47719 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 121-132 chr7 45243947 45244156 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 86260 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 152.667-118 chr14 75170504 75170816 + 0.666667 NA intron (NM_006827, intron 1 of 4) L1MC5a|LINE|L1 5952 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 146-104 chr5 9330688 9330990 + 0.666667 NA intron (NM_003966, intron 4 of 22) intron (NM_003966, intron 4 of 22) -180494 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 197-51 chr2 10507850 10508267 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 58330 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 158.667-297 chr6 156747679 156748027 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30002 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 155.667-379 chr9 20815938 20816342 + 0.666667 NA intron (NM_017794, intron 13 of 45) intron (NM_017794, intron 13 of 45) 29213 NR_145762 109616992 NR_145762 ENSG00000202189 SNORA30B - small nucleolar RNA, H/ACA box 30B snoRNA 112-101 chr2 40285503 40285692 + 0.666667 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 144707 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 119.333-106 chr16 77496761 77496983 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -61838 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 169.667-137 chr3 128644489 128644916 + 0.666667 NA intron (NM_002950, intron 2 of 9) FLAM_C|SINE|Alu 6116 NM_002950 6184 Hs.518244 NM_002950 ENSG00000163902 RPN1 OST1|RBPH1 ribophorin I protein-coding 187-14 chr11 70195789 70196193 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7172 NM_003824 8772 Hs.86131 NM_003824 ENSG00000168040 FADD GIG3|MORT1 Fas associated via death domain protein-coding 125.333-39 chr11 128114509 128114764 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -94130 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 131-76 chr5 17848511 17848806 + 0.666667 NA intron (NR_134286, intron 2 of 7) intron (NR_134286, intron 2 of 7) 41384 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 112.333-168 chr3 131148511 131148751 + 0.666667 NA intron (NM_001353032, intron 7 of 14) intron (NM_001353032, intron 7 of 14) 120903 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 138-80 chr3 152616824 152617091 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -218174 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 132.667-43 chr12 90128595 90128951 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -164545 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 175.333-25 chr12 15163848 15164333 + 0.666667 NA intron (NM_032918, intron 2 of 4) LTR33A|LTR|ERVL 12167 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 120.333-62 chr15 69591696 69592001 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_126437) promoter-TSS (NR_126437) -352 NR_126438 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 160.667-257 chr5 176463913 176464317 + 0.666667 NA intron (NM_014613, intron 1 of 10) intron (NM_014613, intron 1 of 10) 15730 NM_014613 23197 Hs.484242 NM_014613 ENSG00000113194 FAF2 ETEA|UBXD8|UBXN3B Fas associated factor family member 2 protein-coding 130.333-120 chr22 19711630 19711978 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2699 NM_002688 5413 Hs.728762 NM_002688 ENSG00000184702 SEPTIN5 CDCREL|CDCREL-1|CDCREL1|H5|HCDCREL-1|PNUTL1|SEPT5 septin 5 protein-coding 259.333-11 chr1 237032512 237033062 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9397 NM_001035 6262 Hs.109514 NM_001035 ENSG00000198626 RYR2 ARVC2|ARVD2|RYR-2|RyR|VTSIP ryanodine receptor 2 protein-coding 159.333-36 chr10 22228201 22228531 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -18383 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 154-112 chr4 170173986 170174292 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -52452 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 125.667-21 chr10 36505503 36505725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -620243 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 111.667-18 chr1 191173916 191174247 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 54417 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 190.333-102 chr4 17588404 17588833 + 0.666667 NA intron (NM_015907, intron 6 of 12) MIRb|SINE|MIR 11314 NM_015907 51056 Hs.570791 NM_015907 ENSG00000002549 LAP3 HEL-S-106|LAP|LAPEP|PEPS leucine aminopeptidase 3 protein-coding 121-46 chr14 55220092 55220336 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -28629 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 140.333-110 chr2 125402375 125402736 + 0.666667 NA Intergenic SVA_A|Retroposon|SVA 715430 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 120.333-112 chr2 202613303 202613625 + 0.666667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -21505 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 116.667-158 chr5 39652802 39653079 + 0.666667 NA Intergenic LTR12|LTR|ERV1 132509 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 177.333-4 chr1 44941979 44942356 + 0.666667 NA intron (NM_001166588, intron 3 of 9) intron (NM_001166588, intron 3 of 9) 44428 NM_020365 8891 Hs.533549 NM_020365 ENSG00000070785 EIF2B3 EIF-2B|EIF2Bgamma eukaryotic translation initiation factor 2B subunit gamma protein-coding 170-69 chr20 34951090 34951449 + 0.666667 NA intron (NM_000178, intron 2 of 12) L1ME3G|LINE|L1 4366 NM_001322495 2937 Hs.82327 NM_000178 ENSG00000100983 GSS GSHS|HEL-S-64p|HEL-S-88n glutathione synthetase protein-coding 116.333-180 chr5 115510919 115511168 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 33732 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 174.333-139 chr7 43636426 43636793 + 0.666667 NA intron (NR_163914, intron 7 of 8) intron (NR_163914, intron 7 of 8) 53501 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 148-21 chr10 95413309 95413615 + 0.666667 NA intron (NM_001034957, intron 4 of 21) intron (NM_001034957, intron 4 of 21) 27718 NM_001034956 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 136-34 chr14 59653573 59653928 + 0.666667 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) L1MB7|LINE|L1 -6730 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 111.667-92 chr15 85781625 85781833 + 0.666667 NA intron (NM_022480, intron 1 of 2) AluSq|SINE|Alu -11151 NR_031682 100302121 NR_031682 ENSG00000221634 MIR1276 MIRN1276|hsa-mir-1276|mir-1276 microRNA 1276 ncRNA 137.333-160 chr5 110240453 110240764 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 273307 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 167.333-15 chr1 116776217 116776668 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 22012 NM_001328609 914 Hs.523500 NM_001767 ENSG00000116824 CD2 LFA-2|SRBC|T11 CD2 molecule protein-coding 126-80 chr4 48533349 48533680 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 49 of 63) intron (NM_015030, intron 49 of 63) 43262 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 159.667-254 chr5 35756276 35756591 + 0.666667 NA intron (NM_024867, intron 24 of 36) L3|LINE|CR1 -100458 NR_120485 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 144.333-192 chr4 88774711 88775124 + 0.666667 NA intron (NM_001015045, intron 5 of 17) L2|LINE|L2 48444 NM_001265580 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 136.667-152 chr6 27031947 27032216 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11775 NR_026776 100270746 Hs.590428 NR_026776 LOC100270746 - uncharacterized LOC100270746 ncRNA 112.667-29 chr10 62992383 62992603 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140754 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 114-118 chr5 73984054 73984358 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 170660 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 116.333-167 chr5 28381903 28382092 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -94332 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 116-80 chr2 109546235 109546522 + 0.666667 NA intron (NM_001321508, intron 5 of 5) intron (NM_001321508, intron 5 of 5) 67289 NM_001321513 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 143-43 chr14 75844463 75844796 + 0.666667 NA intron (NM_015072, intron 28 of 31) MIRb|SINE|MIR 137366 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 118.667-40 chr11 9518281 9518593 + 0.666667 NA intron (NM_001282656, intron 14 of 15) AluSq|SINE|Alu -55233 NM_003390 7465 Hs.249441 NM_003390 ENSG00000166483 WEE1 WEE1A|WEE1hu WEE1 G2 checkpoint kinase protein-coding 267.666-15 chr3 192819879 192820632 + 0.666667 NA intron (NM_178496, intron 1 of 1) intron (NM_178496, intron 1 of 1) -92714 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 249-58 chr5 36409171 36409691 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -107529 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 167.333-68 chr12 52705255 52705637 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1922 NM_175078 374454 Hs.334989 NM_175078 ENSG00000189182 KRT77 K1B|KRT1B keratin 77 protein-coding 133-19 chr12 24837110 24837348 + 0.666667 NA intron (NM_001178091, intron 6 of 9) intron (NM_001178091, intron 6 of 9) 64993 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 131.333-6 chr1 73224897 73225172 + 0.666667 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -81136 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 137-41 chr2 20258214 20258564 + 0.666667 NA intron (NM_001282790, intron 13 of 18) intron (NM_001282790, intron 13 of 18) -32956 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 196-47 chr14 53163834 53164313 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 10719 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 148.333-301 chr5 4196123 4196496 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -577172 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 112.667-123 chr2 66701796 66702010 + 0.666667 NA intron (NR_110264, intron 1 of 2) intron (NR_110264, intron 1 of 2) 1324 NR_110264 101927577 Hs.380543 NR_110264 ENSG00000237179 LINC01797 - long intergenic non-protein coding RNA 1797 ncRNA 152-151 chr8 54489842 54490249 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32110 NM_022454 64321 Hs.98367 NM_022454 ENSG00000164736 SOX17 VUR3 SRY-box transcription factor 17 protein-coding 154-123 chr6 55063275 55063695 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42975 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 176.333-74 chr2 11996324 11996705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10602 NR_110196 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 181.667-90 chr3 18902794 18903208 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -245509 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 182.333-128 chr5 64304315 64304648 + 0.666667 NA intron (NM_001113561, intron 5 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 138638 NM_001323292 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 120.667-76 chr17 77625176 77625387 + 0.666667 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu 78340 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 190.333-73 chr2 124156236 124156601 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 131131 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 168-28 chr14 39169550 39169964 + 0.666667 NA intron (NM_001079537, intron 1 of 5) intron (NM_001079537, intron 1 of 5) 576 NM_177452 122553 Hs.13303 NM_177452 ENSG00000182400 TRAPPC6B NEDMEBA|TPC6 trafficking protein particle complex 6B protein-coding 130-88 chr4 168975604 168975838 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 34534 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 178-75 chr22 41305198 41305530 + 0.666667 NA intron (NM_017590, intron 1 of 22) AluSx1|SINE|Alu -2995 NM_001317930 5905 Hs.183800 NM_002883 ENSG00000100401 RANGAP1 Fug1|RANGAP|SD Ran GTPase activating protein 1 protein-coding 113.333-175 chr3 63426607 63426809 + 0.666667 NA intron (NR_046677, intron 4 of 4) LTR75_1|LTR|ERV1 -16604 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 224.333-119 chr7 65224799 65225321 + 0.666667 NA intron (NR_146906, intron 15 of 17) MER57A-int|LTR|ERV1 84030 NR_146905 285905 Hs.567827 NM_182596 ENSG00000164669 INTS4P1 INTS4L1 integrator complex subunit 4 pseudogene 1 pseudo 174.667-76 chr19 53693568 53693922 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_030190) promoter-TSS (NR_030190) -648 NR_030190 574468 NR_030190 ENSG00000207580 MIR526B MIRN526B microRNA 526b ncRNA 163.333-158 chr2 201280904 201281237 + 0.666667 NA intron (NR_111983, intron 7 of 8) AluSz6|SINE|Alu 20534 NM_033356 841 Hs.599762 NM_001228 ENSG00000064012 CASP8 ALPS2B|CAP4|Casp-8|FLICE|MACH|MCH5 caspase 8 protein-coding 194-47 chr15 84792641 84793201 + 0.666667 NA intron (NM_014630, intron 5 of 10) intron (NM_014630, intron 5 of 10) -23759 NM_020778 57538 Hs.459183 NM_020778 ENSG00000136383 ALPK3 CMH27|MAK|MIDORI alpha kinase 3 protein-coding 135.667-34 chr12 19431925 19432222 + 0.666667 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? -7419 NM_001363736 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 211 chr1 43640127 43640547 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9812 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 113.667-124 chr21 16210508 16210693 + 0.666667 NA intron (NR_136543, intron 1 of 4) intron (NR_136543, intron 1 of 4) 16221 NR_027791 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 218-117 chr8 138174610 138175126 + 0.666667 NA intron (NM_015912, intron 11 of 19) L2a|LINE|L2 -91323 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 138-24 chr12 2337937 2338201 + 0.666667 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 68293 NR_046769 100874370 Hs.653548 NR_046769 CACNA1C-IT3 - CACNA1C intronic transcript 3 ncRNA 156.333-329 chr7 9836027 9836313 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 201900 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 113.333-232 chr6 137396927 137397149 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 97356 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 112-170 chr5 67591839 67592160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54790 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 169.333-41 chr11 86667903 86668229 + 0.666667 NA intron (NM_001014811, intron 1 of 13) intron (NM_001014811, intron 1 of 13) 4132 NM_001014811 10873 Hs.199743 NM_006680 ENSG00000151376 ME3 NADP-ME malic enzyme 3 protein-coding 134-78 chr4 45321492 45321730 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -594977 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 190.333-45 chr14 41274066 41274587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 319615 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 128-50 chr2 123438277 123438575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -364945 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 159-121 chr8 118381495 118381813 + 0.666667 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -239347 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 121.333-157 chr6 64746209 64746485 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -555071 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 158-111 chr5 128135197 128135558 + 0.666667 NA intron (NM_001046, intron 6 of 26) intron (NM_001046, intron 6 of 26) 51611 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 197-21 chr10 87061746 87062284 + 0.666667 NA intron (NM_001318905, intron 9 of 15) AluSc|SINE|Alu 32072 NM_001318902 2746 Hs.500409 NM_005271 ENSG00000148672 GLUD1 GDH|GDH1|GLUD glutamate dehydrogenase 1 protein-coding 179-21 chr12 28153817 28154332 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -36382 NM_001352084 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 198-10 chr1 205875533 205876101 + 0.666667 NA intron (NR_046097, intron 1 of 2) intron (NR_046097, intron 1 of 2) 13738 NR_046097 284581 NR_046097 LOC284581 - uncharacterized LOC284581 ncRNA 164-25 chr12 1293727 1294164 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) intron (NR_027948, intron 15 of 19) -206546 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 143.667-201 chr5 52930516 52930862 + 0.666667 NA intron (NM_181501, intron 21 of 28) intron (NM_181501, intron 21 of 28) -58663 NR_073103 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 198.333-131 chr3 120479737 120480243 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -28998 NM_007085 11167 Hs.269512 NM_007085 ENSG00000163430 FSTL1 FRP|FSL1|MIR198|OCC-1|OCC1|tsc36 follistatin like 1 protein-coding 129-37 chr15 43401395 43401603 + 0.666667 NA intron (NM_014444, intron 14 of 17) intron (NM_014444, intron 14 of 17) 30398 NM_014444 27229 Hs.584887 NM_014444 ENSG00000137822 TUBGCP4 76P|GCP-4|GCP4|Grip76|MCCRP3 tubulin gamma complex associated protein 4 protein-coding 164.667-216 chr7 8661961 8662208 + 0.666667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 228475 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 172.333-79 chr2 10158687 10159093 + 0.666667 NA intron (NR_161344, intron 3 of 3) intron (NR_161344, intron 3 of 3) 17508 NR_161344 348738 Hs.454981 NR_161344 ENSG00000171848 C2orf48 - chromosome 2 open reading frame 48 ncRNA 309-3 chr1 109323125 109323750 + 0.666667 NA intron (NM_001205228, intron 14 of 19) intron (NM_001205228, intron 14 of 19) -16426 NM_001265613 343263 Hs.443402 NM_001010985 ENSG00000221986 MYBPHL - myosin binding protein H like protein-coding 143.333-176 chr3 28484265 28484546 + 0.666667 NA intron (NM_001040432, intron 5 of 9) L1MC1|LINE|L1 -90873 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 164-37 chr14 89196528 89196990 + 0.666667 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 220474 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 155.333-54 chr11 77395941 77396246 + 0.666667 NA intron (NM_001128620, intron 1 of 15) intron (NM_001128620, intron 1 of 15) 77970 NM_001128620 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 198.667-63 chr14 73931474 73932023 + 0.666667 NA TTS (NM_152445) TTS (NM_152445) -18186 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 117.667-82 chr2 68299695 68299988 + 0.666667 NA intron (NM_015463, intron 2 of 2) intron (NM_015463, intron 2 of 2) 20210 NM_001111101 25927 Hs.212885 NM_015463 ENSG00000119865 CNRIP1 C2orf32|CRIP1 cannabinoid receptor interacting protein 1 protein-coding 152.333-156 chr18 1753476 1753803 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -394010 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 188-61 chr2 212574964 212575330 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -36345 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 131.667-93 chr2 64057304 64057559 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38003 NM_016516 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 128-46 chr2 97740045 97740262 + 0.666667 NA TTS (NM_001079) TTS (NM_001079) 5747 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 136.333-218 chr9 34908473 34908776 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12860 NM_001309427 100129969 Hs.571602 NM_001309426 ENSG00000187791 FAM205C FAM205CP family with sequence similarity 205 member C protein-coding 121-21 chr10 92029951 92030216 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_003972, exon 38 of 38) 3' UTR (NM_003972, exon 38 of 38) 106313 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 241.667-28 chr16 76503429 76503889 + 0.666667 NA intron (NR_136213, intron 15 of 23) L1PA5|LINE|L1 -131339 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 157.333-310 chr6 141250545 141250946 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 566931 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 148.333-226 chr20 47302194 47302480 + 0.666667 NA intron (NM_001281774, intron 4 of 23) AluSx|SINE|Alu -16165 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 116.333-22 chr1 213181952 213182298 + 0.666667 NA intron (NR_146209, intron 8 of 11) L1MDa|LINE|L1 130884 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 146-10 chr10 56532719 56533076 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -171624 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 116-119 chr4 118848588 118848776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1999 NM_001286754 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 167.667-131 chr3 45241358 45241707 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15245 NM_015444 25907 Hs.740403 NM_015444 ENSG00000249992 TMEM158 BBP|RIS1|p40BBP transmembrane protein 158 (gene/pseudogene) protein-coding 172.333-90 chr2 182056499 182056953 + 0.666667 NA intron (NM_001261425, intron 2 of 5) intron (NM_001261425, intron 2 of 5) 70873 NM_001261425 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 137.667-142 chr4 82499928 82500321 + 0.666667 NA intron (NM_001080506, intron 5 of 7) intron (NM_001080506, intron 5 of 7) 61864 NM_001353455 441027 Hs.507676 NM_001080506 ENSG00000249242 TMEM150C TTN3 transmembrane protein 150C protein-coding 124.667-173 chr5 116140109 116140334 + 0.666667 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) L1MA9|LINE|L1 54759 NM_001308080 51397 Hs.483136 NM_016144 ENSG00000145781 COMMD10 PTD002 COMM domain containing 10 protein-coding 115-8 chr1 115249033 115249282 + 0.666667 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -33877 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 120.333-30 chr11 1236676 1236967 + 0.666667 NA intron (NM_002458, intron 24 of 48) intron (NM_002458, intron 24 of 48) 12855 NR_157183 112577518 NR_157183 MUC5B-AS1 - MUC5B antisense RNA 1 ncRNA 139.333-76 chr14 87121096 87121420 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 215480 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 115.333-219 chr8 98224015 98224321 + 0.666667 NA intron (NR_135747, intron 4 of 11) L1ME4b|LINE|L1 70067 NM_001321635 79815 Hs.309489 NM_024759 ENSG00000104361 NIPAL2 NPAL2 NIPA like domain containing 2 protein-coding 134-69 chr3 97565083 97565331 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 11 of 17) intron (NM_001080448, intron 11 of 17) 125600 NM_001278300 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 114.667-256 chr9 27067382 27067681 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41610 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 198.333-70 chr15 81812285 81812699 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 233526 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 159.333-8 chr1 54212369 54212825 + 0.666667 NA exon (NM_016491, exon 5 of 7) exon (NM_016491, exon 5 of 7) 12430 NM_016491 51253 Hs.584908 NM_016491 ENSG00000116221 MRPL37 L2mt|L37mt|MRP-L2|MRP-L37|MRPL2|RPML2 mitochondrial ribosomal protein L37 protein-coding 142-2 chr1 57828714 57829090 + 0.666667 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -31679 NR_104362 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 117-9 chr1 201619255 201619484 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28953 NM_020443 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 116.667-50 chr14 37623035 37623370 + 0.666667 NA intron (NM_001310135, intron 3 of 32) intron (NM_001310135, intron 3 of 32) 27573 NM_001310135 319089 Hs.659936 NM_001007795 ENSG00000139865 TTC6 C14orf25|NCRNA00291 tetratricopeptide repeat domain 6 protein-coding 156.333-112 chr14 66830959 66831281 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) intron (NM_001024218, intron 4 of 21) 323713 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 155.667-157 chr2 37126021 37126403 + 0.666667 NA intron (NM_001135652, intron 8 of 13) intron (NM_001135652, intron 8 of 13) 21610 NM_001135652 5610 Hs.131431 NM_002759 ENSG00000055332 EIF2AK2 EIF2AK1|PKR|PPP1R83|PRKR eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 protein-coding 119.667-17 chr1 246869930 246870227 + 0.666667 NA intron (NM_015446, intron 24 of 35) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 61280 NM_015446 25909 Hs.300887 NM_015446 ENSG00000153207 AHCTF1 ELYS|MST108|MSTP108|TMBS62 AT-hook containing transcription factor 1 protein-coding 173-102 chr9 73721096 73721448 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 569407 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 220-99 chr6 7847786 7848156 + 0.666667 NA intron (NM_001718, intron 2 of 6) intron (NM_001718, intron 2 of 6) 62106 NM_001145549 81567 Hs.150837 NM_022085 ENSG00000239264 TXNDC5 ENDOPDI|ERP46|HCC-2|HCC2|PDIA15|STRF8|UNQ364 thioredoxin domain containing 5 protein-coding 139.667-205 chr9 37372575 37372836 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49991 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 119.333-232 chr9 27095308 27095533 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -13721 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 147-19 chr10 114538781 114539190 + 0.666667 NA intron (NM_001352440, intron 6 of 20) intron (NM_001352440, intron 6 of 20) -12072 NM_001322890 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 258.667-60 chr3 16123975 16124425 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -50480 NM_001319051 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 156-36 chr12 39445678 39445994 + 0.666667 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -2716 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 113.667-164 chr4 119726748 119727018 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 77632 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 151.667-206 chr3 19751259 19751677 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 182749 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 164-94 chr5 137493374 137493716 + 0.666667 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) intron (NM_004598, intron 2 of 10) 5781 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 164.333-64 chr14 29978048 29978390 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -50372 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 146-21 chr12 12072576 12072980 + 0.666667 NA intron (NM_030766, intron 1 of 5) intron (NM_030766, intron 1 of 5) 1310 NM_138722 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 128-107 chr7 33155264 33155513 + 0.666667 NA intron (NM_001348038, intron 3 of 22) intron (NM_001348038, intron 3 of 22) 25824 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 240.333-18 chr11 6335507 6336076 + 0.666667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -15290 NM_145040 112464 Hs.434044 NM_145040 ENSG00000170955 CAVIN3 HSRBC|PRKCDBP|SRBC|cavin-3 caveolae associated protein 3 protein-coding 214.666-40 chr20 45072123 45072752 + 0.666667 NA intron (NM_001352385, intron 11 of 11) L2a|LINE|L2 28690 NM_001322799 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 239.667-20 chr14 62909693 62910245 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) L2a|LINE|L2 135489 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 153.667-221 chr20 39030469 39030840 + 0.666667 NA intron (NM_021931, intron 19 of 21) intron (NM_021931, intron 19 of 21) 68310 NM_021931 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 170.667-4 chr1 34995047 34995369 + 0.666667 NA intron (NM_007167, intron 14 of 15) intron (NM_007167, intron 14 of 15) -9861 NM_001195156 100506144 Hs.533986 NM_001195156 ENSG00000243749 TMEM35B ZMYM6NB transmembrane protein 35B protein-coding 114.333-228 chr8 112318781 112319018 + 0.666667 NA exon (NM_198124, exon 48 of 72) exon (NM_198124, exon 48 of 72) -324594 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 111.667-28 chr10 32754220 32754450 + 0.666667 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) intron (NM_001321115, intron 29 of 43) 147137 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 125-81 chr4 65225198 65225431 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -220814 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 185-18 chr14 58002657 58003158 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001001872, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001001872, exon 8 of 8) -136815 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 113.333-24 chr10 52670695 52670915 + 0.666667 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 84599 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 173.667-64 chr19 28739894 28740317 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -12411 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 156-60 chr17 67968667 67968977 + 0.666667 NA intron (NM_182641, intron 26 of 27) intron (NM_182641, intron 26 of 27) 24784 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 134.667-170 chr6 55278168 55278417 + 0.666667 NA intron (NM_001526, intron 6 of 7) UCON1|Unknown|Unknown -49177 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 159.667-308 chr7 101750312 101750632 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -65535 NM_181500 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 179.333-19 chr10 8778936 8779338 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118852 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 112.333-185 chr4 72363384 72363702 + 0.666667 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) L1M5|LINE|L1 205678 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 192.333-36 chr11 133037496 133037972 + 0.666667 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) -93966 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 145-33 chr14 74710523 74710898 + 0.666667 NA intron (NM_001039479, intron 1 of 19) intron (NM_001039479, intron 1 of 19) 2370 NM_001039479 9870 Hs.497417 NM_014821 ENSG00000119682 AREL1 FIEL1|KIAA0317 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 144-8 chr1 210005267 210005697 + 0.666667 NA intron (NM_001146261, intron 3 of 9) intron (NM_001146261, intron 3 of 9) 67265 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 144-162 chr9 110473609 110473886 + 0.666667 NA intron (NM_153366, intron 14 of 47) MER104|DNA|TcMar-Tc2 105994 NM_153366 79987 Hs.522334 NM_153366 ENSG00000165124 SVEP1 C9orf13|CCP22|POLYDOM|SEL-OB|SELOB sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 protein-coding 125.667-52 chr13 49736215 49736478 + 0.666667 NA intron (NM_002267, intron 2 of 16) intron (NM_002267, intron 2 of 16) -44859 NR_103802 84650 Hs.433278 NM_032565 ENSG00000123179 EBPL EBRP EBP like protein-coding 161.333-170 chr20 46659310 46659697 + 0.666667 NA intron (NM_001193340, intron 2 of 12) AluJb|SINE|Alu -8044 NM_001193339 64849 Hs.655498 NM_022829 ENSG00000158296 SLC13A3 ARLIAK|NADC3|SDCT2 solute carrier family 13 member 3 protein-coding 125.667-153 chr5 94628728 94628952 + 0.666667 NA exon (NM_032290, exon 2 of 21) exon (NM_032290, exon 2 of 21) 10171 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 151.333-292 chr3 185729226 185729625 + 0.666667 NA intron (NR_126326, intron 7 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 16173 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 173-98 chr8 113263598 113264053 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 113327 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 178.667-142 chr6 73088867 73089264 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 5 of 13) intron (NM_001160132, intron 5 of 13) 54449 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 134.667-101 chr2 72749177 72749428 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 76731 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 142.667-241 chr9 36457939 36458193 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56868 NM_194330 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 148.333-108 chr13 45026169 45026553 + 0.666667 NA intron (NM_001316952, intron 7 of 8) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 36823 NM_018559 55425 Hs.731811 NM_018559 ENSG00000133114 GPALPP1 AD029|KIAA1704|LSR7|bA245H20.2 GPALPP motifs containing 1 protein-coding 206-11 chr1 158627458 158627772 + 0.666667 NA intron (NM_003126, intron 40 of 51) intron (NM_003126, intron 40 of 51) 21176 NM_001004478 128368 Hs.553590 NM_001004478 ENSG00000198967 OR10Z1 OR1-15 olfactory receptor family 10 subfamily Z member 1 protein-coding 152.333-62 chr11 30570481 30570847 + 0.666667 NA intron (NM_001584, intron 1 of 5) intron (NM_001584, intron 1 of 5) 9829 NM_001584 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 136-24 chr13 45630215 45630485 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14611 NM_182542 220081 Hs.668747 NM_182542 ENSG00000165837 ERICH6B FAM194B glutamate rich 6B protein-coding 115.667-235 chrX 83787165 83787345 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -73871 NM_001271680 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 169-38 chr17 63141971 63142311 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) L1M4|LINE|L1 175906 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 152.333-406 chr9 110253185 110253475 + 0.666667 NA intron (NM_003329, intron 1 of 4) intron (NM_003329, intron 1 of 4) 3177 NM_001244938 7295 Hs.435136 NM_003329 ENSG00000136810 TXN TRDX|TRX|TRX1 thioredoxin protein-coding 189.333-216 chr9 71997992 71998356 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 62431 NM_001128618 138240 Hs.371235 NM_001128618 ENSG00000204669 C9orf57 - chromosome 9 open reading frame 57 protein-coding 118-35 chr14 54606678 54606951 + 0.666667 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) 39202 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 116.667-113 chr21 24760955 24761151 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79497 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 135.667-102 chr2 156188732 156189127 + 0.666667 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) L3|LINE|CR1 66002 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 150.333-251 chr22 28757821 28758192 + 0.666667 NA TTS (NM_172002) TTS (NM_172002) -14668 NM_001284263 150275 Hs.406460 NM_173510 ENSG00000159873 CCDC117 dJ366L4.1 coiled-coil domain containing 117 protein-coding 188.333-120 chr5 54777773 54778284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33770 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 123.667-161 chr5 101680820 101681028 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 615360 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 141.333-261 chrX 15471451 15471809 + 0.666667 NA intron (NM_001018109, intron 3 of 9) intron (NM_001018109, intron 3 of 9) 19679 NR_037859 100532742 Hs.495728 NR_037859 PIR-FIGF - PIR-FIGF readthrough ncRNA 159 chr1 1032791 1033210 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001364727) promoter-TSS (NM_001364727) -993 NM_001364727 375790 Hs.273330 NM_198576 ENSG00000188157 AGRN AGRIN|CMS8|CMSPPD agrin protein-coding 170-56 chr19 44641051 44641465 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2540 NM_001135770 5817 Hs.171844 NM_006505 ENSG00000073008 PVR CD155|HVED|NECL5|Necl-5|PVS|TAGE4 PVR cell adhesion molecule protein-coding 111.667-165 chr22 43225430 43225658 + 0.666667 NA intron (NM_173050, intron 10 of 21) AluSg|SINE|Alu 12870 NR_134632 105373051 Hs.629290 NR_134632 ENSG00000236272 LOC105373051 - uncharacterized LOC105373051 ncRNA 120.333-19 chr10 25645503 25645784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6069 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 125.667-201 chr9 110238831 110239046 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 17569 NM_001244938 7295 Hs.435136 NM_003329 ENSG00000136810 TXN TRDX|TRX|TRX1 thioredoxin protein-coding 129-43 chr16 13801066 13801410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118919 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 129.667-173 chr8 113059584 113059967 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 317377 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 138.333-205 chr9 17025481 17025699 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109450 NM_001286984 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 148.333-34 chr10 8200563 8200857 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 67595 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 244.333-44 chr15 64379603 64380160 + 0.666667 NA intron (NR_109934, intron 2 of 3) intron (NR_109934, intron 2 of 3) 1560 NM_001029989 9768 Hs.81892 NM_014736 ENSG00000166803 PCLAF KIAA0101|L5|NS5ATP9|OEATC|OEATC-1|OEATC1|PAF|PAF15|p15(PAF)|p15/PAF|p15PAF PCNA clamp associated factor protein-coding 162.667-262 chr8 50632845 50633188 + 0.666667 NA intron (NR_135797, intron 15 of 20) HERVL40-int|LTR|ERVL 468885 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 132-102 chr5 92112517 92112815 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -729349 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 112.333-23 chr10 51632922 51633252 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 66508 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 146.667-131 chr17 28890299 28890570 + 0.666667 NA intron (NM_004475, intron 1 of 10) AluY|SINE|Alu 7299 NM_004475 2319 Hs.514038 NM_004475 ENSG00000132589 FLOT2 ECS-1|ECS1|ESA|ESA1|M17S1 flotillin 2 protein-coding 223.667-39 chr2 185076260 185076746 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 90569 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 160.667-266 chr6 100287259 100287587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 176252 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 154.667-8 chr1 61103345 61103655 + 0.666667 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 20939 NM_005595 4774 Hs.740757 NM_005595 ENSG00000162599 NFIA BRMUTD|CTF|NF-I/A|NF1-A|NFI-A|NFI-L nuclear factor I A protein-coding 153-51 chr15 60211488 60211834 + 0.666667 NA Intergenic Chap1_Mam|DNA|hAT-Charlie 186325 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 113.333-8 chr1 94996966 94997220 + 0.666667 NA intron (NM_144988, intron 3 of 3) intron (NM_144988, intron 3 of 3) -64503 NR_132786 101928098 Hs.730090 NR_132786 ENSG00000230427 LOC101928098 - uncharacterized LOC101928098 ncRNA 163.667-122 chr2 171563539 171563850 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 41220 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 157-51 chr17 55729844 55730257 + 0.666667 NA intron (NM_001099640, intron 1 of 3) intron (NM_001099640, intron 1 of 3) 2031 NM_001099640 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 122.667-133 chr3 193322747 193323049 + 0.666667 NA intron (NM_198505, intron 14 of 29) intron (NM_198505, intron 14 of 29) 15654 NR_046758 100874218 Hs.407490 NR_046758 ATP13A5-AS1 - ATP13A5 antisense RNA 1 ncRNA 115.667-212 chr8 84276896 84277228 + 0.666667 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) 92396 NM_001100391 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 202-58 chr15 101307364 101307950 + 0.666667 NA non-coding (NR_045387, exon 1 of 1) non-coding (NR_045387, exon 1 of 1) 1647 NR_045387 100507472 Hs.498494 NR_045387 LOC100507472 - uncharacterized LOC100507472 ncRNA 118.333-46 chr11 108881620 108881818 + 0.666667 NA intron (NM_004398, intron 16 of 17) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 216650 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 113.333-239 chr7 43603950 43604203 + 0.666667 NA intron (NM_004760, intron 2 of 6) intron (NM_004760, intron 2 of 6) 20968 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 174-26 chr13 89958522 89958958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 160977 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 171.667-161 chr8 80275069 80275434 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 33862 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 199.667-154 chr9 108977309 108977753 + 0.666667 NA intron (NM_003798, intron 7 of 18) L2a|LINE|L2 35968 NM_001286974 8727 Hs.58488 NM_003798 ENSG00000119326 CTNNAL1 ACRP|CLLP|alpha-CATU catenin alpha like 1 protein-coding 128-113 chr8 12918431 12918787 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -27064 NM_020844 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 186-13 chr10 22069896 22070371 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -66403 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 137.667-171 chr7 19022868 19023123 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 94641 NR_149001 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 113.333-221 chr5 180569574 180569785 + 0.666667 NA intron (NM_001370474, intron 9 of 10) intron (NM_001370474, intron 9 of 10) 21820 NM_052863 92304 Hs.62492 NM_052863 ENSG00000161055 SCGB3A1 HIN-1|HIN1|LU105|PnSP-2|UGRP2 secretoglobin family 3A member 1 protein-coding 155.667-220 chr3 64552088 64552406 + 0.666667 NA intron (NM_001318781, intron 29 of 38) intron (NM_001318781, intron 29 of 38) -9099 NR_110150 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 229-57 chr6 28150222 28150706 + 0.666667 NA intron (NM_001278121, intron 4 of 6) L1MC4|LINE|L1 8253 NM_001278121 7745 Hs.57679 NM_006298 ENSG00000198315 ZKSCAN8 LD5-1|ZNF192|ZSCAN40 zinc finger with KRAB and SCAN domains 8 protein-coding 191-14 chr12 18976198 18976713 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -153278 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 112.333-280 chr9 111349459 111349633 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19322 NM_205859 26248 Hs.381312 NM_205859 ENSG00000171133 OR2K2 HSHTPCRH06|HTPCRH06|OR2AN1P|OR2AR1P olfactory receptor family 2 subfamily K member 2 protein-coding 237-64 chr6 39516914 39517524 + 0.666667 NA intron (NM_001289021, intron 12 of 21) intron (NM_001289021, intron 12 of 21) -85829 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 142.333-65 chr13 31497397 31497666 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -241995 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 112.667-256 chr7 128873908 128874175 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 7711 NM_001195150 100130705 Hs.641532 NM_001195150 ENSG00000272899 ATP6V1FNB - ATP6V1F neighbor protein-coding 117-99 chr4 32565113 32565334 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 214185 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 123.333-207 chr8 68193571 68193791 + 0.666667 NA intron (NM_024870, intron 37 of 39) intron (NM_024870, intron 37 of 39) -136692 NM_001349479 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 207.667-60 chr2 181329602 181330024 + 0.666667 NA intron (NR_130784, intron 3 of 4) L1PA14|LINE|L1 -24161 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 171.333-187 chr7 139580066 139580363 + 0.666667 NA intron (NM_001113239, intron 13 of 14) intron (NM_001113239, intron 13 of 14) 56529 NM_001080511 154790 Hs.57806 NM_001080511 ENSG00000236279 CLEC2L - C-type lectin domain family 2 member L protein-coding 198.333 chr1 20311334 20311675 + 0.666667 NA intron (NM_001039500, intron 2 of 21) intron (NM_001039500, intron 2 of 21) 20629 NM_001039500 127731 Hs.205178 NM_144623 ENSG00000158816 VWA5B1 - von Willebrand factor A domain containing 5B1 protein-coding 161.667-260 chr8 117229980 117230336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 95163 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 149-108 chr5 15283814 15284169 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -17431 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 193-26 chr15 94054999 94055434 + 0.666667 NA intron (NR_120320, intron 2 of 8) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 52722 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 235.667-50 chr4 175384230 175384832 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 403145 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 150-151 chr8 130299754 130300074 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) -3381 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 138-101 chr6 129236901 129237268 + 0.666667 NA intron (NM_000426, intron 12 of 64) MIR|SINE|MIR 353943 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 152-81 chr2 30811341 30811620 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4034 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 159.333-106 chr15 86728959 86729285 + 0.666667 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -203758 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 165.667-17 chr10 55557715 55558043 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -41163 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 113.667-54 chr13 109910376 109910667 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -123938 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 114.667-144 chr2 171893377 171893696 + 0.666667 NA intron (NR_047549, intron 1 of 16) intron (NR_047549, intron 1 of 16) 708 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 140.667-77 chr14 49558706 49559089 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 27483 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 140.333-13 chr1 119220068 119220445 + 0.666667 NA intron (NR_125975, intron 4 of 6) L1MC5|LINE|L1 -79584 NM_015836 10352 Hs.523506 NM_015836 ENSG00000116874 WARS2 NEMMLAS|TrpRS|mtTrpRS tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 154.667-55 chr10 120508161 120508600 + 0.666667 NA intron (NM_001318169, intron 2 of 2) intron (NM_001318169, intron 2 of 2) 51426 NM_001318169 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 142.333-136 chr2 228593188 228593464 + 0.666667 NA intron (NR_151716, intron 1 of 3) intron (NR_151716, intron 1 of 3) 18069 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 176-103 chr8 111928736 111929193 + 0.666667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 552325 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 139.667-117 chr3 82773561 82773835 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 787556 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 132.333-124 chr4 103129350 103129570 + 0.666667 NA intron (NM_001813, intron 42 of 48) AluSg|SINE|Alu -29626 NM_020139 56898 Hs.124696 NM_020139 ENSG00000164039 BDH2 DHRS6|EFA6R|PRO20933|SDR15C1|UCPA-OR|UNQ6308 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 2 protein-coding 123.333-123 chr2 234865251 234865603 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -86590 NM_014521 23677 Hs.516777 NM_014521 ENSG00000130147 SH3BP4 BOG25|TTP SH3 domain binding protein 4 protein-coding 141.667-27 chr10 52632811 52633109 + 0.666667 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 122444 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 157.333-247 chr3 178594225 178594649 + 0.666667 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) L2|LINE|L2 35587 NM_005832 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 112.667-247 chr7 52665811 52666115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -369670 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 169-23 chr13 53955494 53955906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140281 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 203.333-87 chr15 64626248 64626636 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) intron (NM_015042, intron 2 of 8) 76839 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 200.667-128 chr5 75822809 75823331 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -105633 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 112-142 chr3 164124966 164125198 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 46474 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 129.667-189 chr9 137895150 137895482 + 0.666667 NA intron (NM_001243812, intron 3 of 45) L1MD1|LINE|L1 -2746 NR_121583 100133077 Hs.640081 NR_121583 ENSG00000203987 LOC100133077 - uncharacterized LOC100133077 ncRNA 113.333-226 chr6 85703463 85703768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24882 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 154-30 chr11 96879936 96880331 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 371708 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 140.667-75 chr14 48307522 48307907 + 0.666667 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -512700 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 116.667-26 chr11 100585828 100586115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101317 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 141.333-105 chr2 53137151 53137568 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -434744 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 143.333-80 chr14 47544209 47544584 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 130558 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 115.333-63 chr14 46576544 46576869 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75075 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 149.333-413 chr8 140976399 140976762 + 0.666667 NA intron (NM_001352719, intron 1 of 32) intron (NM_001352719, intron 1 of 32) 24424 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 176.333-167 chr8 79218337 79218666 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -113687 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 122.333-164 chr4 170147528 170147844 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -57299 NM_001286683 51166 Hs.529735 NM_016228 ENSG00000109576 AADAT KAT2|KATII|KYAT2 aminoadipate aminotransferase protein-coding 119-96 chr3 24116812 24117031 + 0.666667 NA TTS (NM_001128177) TTS (NM_001128177) -13674 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 112-157 chr4 96313248 96313458 + 0.666667 NA intron (NR_147149, intron 1 of 3) intron (NR_147149, intron 1 of 3) 2650 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 162.667-231 chr5 156773539 156774005 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -76523 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 158.333-41 chr10 89638004 89638385 + 0.666667 NA intron (NM_148977, intron 1 of 6) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 5722 NM_148978 53354 Hs.163555 NM_138316 ENSG00000152782 PANK1 PANK pantothenate kinase 1 protein-coding 116-19 chr10 53482236 53482568 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -710702 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 199.333-197 chr4 47683769 47684178 + 0.666667 NA intron (NM_006587, intron 6 of 21) MIR3|SINE|MIR 31304 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 159-43 chr16 74843971 74844334 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -69332 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 133.667-128 chr6 38346172 38346501 + 0.666667 NA intron (NM_052893, intron 7 of 11) intron (NM_052893, intron 7 of 11) -135260 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 128.667-103 chr20 20828838 20829063 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -116306 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 112-27 chr11 28409897 28410080 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 67560 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 169.667-167 chr5 78990090 78990449 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -4311 NM_198709 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 134.667-129 chr22 38432785 38433003 + 0.666667 NA intron (NM_152868, intron 1 of 1) AluSz6|SINE|Alu 11134 NM_004981 3761 Hs.32505 NM_004981 ENSG00000168135 KCNJ4 HIR|HIRK2|HRK1|IRK-3|IRK3|Kir2.3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 4 protein-coding 150-97 chr3 72089931 72090323 + 0.666667 NA intron (NR_104116, intron 2 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 10328 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 187-24 chr16 72494588 72494986 + 0.666667 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) AluSp|SINE|Alu 170183 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 113.333-40 chr11 10360490 10360797 + 0.666667 NA intron (NR_103765, intron 2 of 3) AluJr4|SINE|Alu 52330 NR_103765 100130460 Hs.501890 NR_103765 CAND1.11 - uncharacterized LOC100130460 ncRNA 112.333-195 chr4 150526333 150526566 + 0.666667 NA intron (NM_001367550, intron 40 of 56) intron (NM_001367550, intron 40 of 56) -52640 NR_149035 729558 Hs.647978 NR_149035 ENSG00000249690 LOC729558 - uncharacterized LOC729558 ncRNA 143-83 chr3 85259306 85259693 + 0.666667 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -126211 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 167.333-38 chr10 39051915 39052259 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 355491 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 165.667-136 chr4 10518036 10518474 + 0.666667 NA intron (NM_052964, intron 15 of 18) intron (NM_052964, intron 15 of 18) -60829 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 187.667-134 chr7 40027520 40027864 + 0.666667 NA intron (NM_003718, intron 5 of 13) intron (NM_003718, intron 5 of 13) 77332 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 168.333-33 chr11 17876923 17877410 + 0.666667 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) L2a|LINE|L2 135881 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 161-65 chr4 30880537 30880945 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 160372 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 267.333-36 chr15 95145383 95146139 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 181339 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 130.333-102 chr2 68951338 68951575 + 0.666667 NA intron (NM_182536, intron 1 of 5) intron (NM_182536, intron 1 of 5) 1437 NM_182536 200504 Hs.16757 NM_182536 ENSG00000183607 GKN2 BRICD1B|GDDR|PRO813|TFIZ1|VLTI465 gastrokine 2 protein-coding 247.333-16 chr11 91971152 91971755 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -253581 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 112.333-180 chr4 56480951 56481131 + 0.666667 NA intron (NR_151856, intron 8 of 19) intron (NR_151856, intron 8 of 19) 13424 NM_001267722 6731 Hs.237825 NM_006947 ENSG00000174780 SRP72 BMFF|BMFS1|HEL103 signal recognition particle 72 protein-coding 113.333-128 chr2 80287752 80287942 + 0.666667 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) 16905 NM_178839 347730 Hs.591580 NM_178839 ENSG00000162951 LRRTM1 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 protein-coding 146.667-330 chr8 80738085 80738421 + 0.666667 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) L1MD3|LINE|L1 136215 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 168.667-217 chr8 73629732 73630093 + 0.666667 NA intron (NM_001164383, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu 116928 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 177.667-134 chr8 87073050 87073467 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1PA10|LINE|L1 206843 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 111.667-245 chr7 98755164 98755396 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 114734 NM_001134450 222865 Hs.270753 NM_152913 ENSG00000166448 TMEM130 - transmembrane protein 130 protein-coding 111.667-2 chr1 16616740 16616926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3228 NM_017940 55672 Hs.467587 NM_017940 ENSG00000219481 NBPF1 AB13|AB14|AB23|AD2|NBG|NBPF NBPF member 1 protein-coding 194.667-110 chr4 70919358 70919719 + 0.666667 NA intron (NM_173468, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 17169 NM_173468 92597 Hs.691454 NM_173468 ENSG00000173542 MOB1B MATS2|MOB4A|MOBKL1A MOB kinase activator 1B protein-coding 195.333-70 chr13 85769663 85770095 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 29540 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 139.333-188 chr6 28454752 28455110 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -11440 NM_001012455 222696 Hs.721841 NM_001012455 ENSG00000187987 ZSCAN23 ZNF390|ZNF453|dJ29K1.3|dJ29K1.3.1 zinc finger and SCAN domain containing 23 protein-coding 115.333-134 chr3 21149345 21149676 + 0.666667 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -256216 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 189.333-84 chr19 34755097 34755508 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 17913 NM_001007248 148103 Hs.590961 NM_001007247 ENSG00000153896 ZNF599 - zinc finger protein 599 protein-coding 155.333-165 chr2 85528087 85528391 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10647 NR_038942 100630918 Hs.66049 NR_038942 PARTICL PARTICLE promoter of MAT2A antisense radiation-induced circulating long non-coding RNA ncRNA 121.667-183 chr6 131882644 131882935 + 0.666667 NA intron (NM_006208, intron 21 of 24) intron (NM_006208, intron 21 of 24) 68583 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 171.667-74 chr19 39819125 39819469 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 10505 NR_106777 102465974 NR_106777 ENSG00000277759 MIR6719 hsa-mir-6719 microRNA 6719 ncRNA 253-61 chr6 90368370 90368871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55878 NR_039671 100616109 NR_039671 ENSG00000266760 MIR4464 mir-4464 microRNA 4464 ncRNA 122.333-46 chr12 70598847 70599062 + 0.666667 NA intron (NM_001109754, intron 4 of 33) intron (NM_001109754, intron 4 of 33) 11070 NM_002837 5787 Hs.201030 NM_002837 ENSG00000127329 PTPRB HPTP-BETA|HPTPB|PTPB|R-PTP-BETA|VEPTP protein tyrosine phosphatase receptor type B protein-coding 126.333-29 chr11 108831829 108832058 + 0.666667 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) intron (NM_004398, intron 13 of 17) 166874 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 115-48 chr13 21425468 21425753 + 0.666667 NA intron (NM_001286638, intron 1 of 10) intron (NM_001286638, intron 1 of 10) 33693 NR_104486 253832 Hs.564611 NM_153251 ENSG00000180776 ZDHHC20 4933421L13Rik|DHHC-20|DHHC20 zinc finger DHHC-type containing 20 protein-coding 156.333-128 chr15 83958691 83959095 + 0.666667 NA intron (NM_207517, intron 19 of 29) L1M8|LINE|L1 -121294 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 135-13 chr11 13916658 13916927 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 8071 NR_135052 101928132 Hs.568970 NR_135052 ENSG00000254438 LINC02683 - long intergenic non-protein coding RNA 2683 ncRNA 131.333-84 chr2 55996799 55997028 + 0.666667 NA intron (NR_126406, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 3882 NR_030623 100126319 NR_030623 ENSG00000211520 MIR216B MIRN216B|mir-216b microRNA 216b ncRNA 143-6 chr1 75423188 75423608 + 0.666667 NA intron (NM_001320285, intron 2 of 25) intron (NM_001320285, intron 2 of 25) 187716 NM_001320287 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 112.333-173 chr4 18039863 18040073 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18093 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 131.333-108 chr22 27270218 27270470 + 0.666667 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -40307 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 150-68 chr19 39003353 39003639 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27754 NM_024907 115290 Hs.531770 NM_024907 ENSG00000269190 FBXO17 FBG4|FBX26|FBXO26|Fbx17 F-box protein 17 protein-coding 176.333-80 chr2 41261335 41261803 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -615986 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 166.333-152 chr3 46270920 46271258 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28629 NM_001164680 1232 Hs.506190 NM_001837 ENSG00000183625 CCR3 CC-CKR-3|CD193|CKR3|CMKBR3 C-C motif chemokine receptor 3 protein-coding 216-13 chr10 122383812 122384441 + 0.666667 NA intron (NM_001001974, intron 1 of 11) L1MC5a|LINE|L1 -1943 NM_001195608 59338 Hs.643512 NM_021622 ENSG00000107679 PLEKHA1 TAPP1 pleckstrin homology domain containing A1 protein-coding 142-68 chr2 179907130 179907543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45724 NM_152520 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 232-22 chr12 51157483 51157959 + 0.666667 NA intron (NM_005653, intron 1 of 14) AluSx|SINE|Alu 15414 NM_005653 7024 Hs.48849 NM_005653 ENSG00000135457 TFCP2 LBP1C|LSF|LSF1D|SEF|TFCP2C transcription factor CP2 protein-coding 182.333-39 chr13 103650545 103650950 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 225547 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 147.333-274 chr6 37176425 37176707 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 6414 NM_001243186 5292 Hs.81170 NM_002648 ENSG00000137193 PIM1 PIM Pim-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 186.333-130 chr5 109729588 109729991 + 0.666667 NA intron (NM_002372, intron 4 of 21) AluSx|SINE|Alu 40423 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 122-54 chr2 129390737 129391005 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -116980 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 117.333-169 chr5 72461914 72462166 + 0.666667 NA intron (NM_152625, intron 1 of 4) intron (NM_152625, intron 1 of 4) 45370 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 230.667-57 chr3 187435220 187435815 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11529 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 129.667-97 chr2 100380965 100381296 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36538 NM_004854 9486 Hs.516370 NM_004854 ENSG00000115526 CHST10 HNK-1ST|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 10 protein-coding 216.333-39 chr12 25416839 25417376 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 136176 NM_152590 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 182-97 chr6 157324920 157325317 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_018452) promoter-TSS (NM_018452) -859 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 216.333-101 chr3 164938578 164939051 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -107334 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 161-51 chr20 53681535 53681836 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 73331 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 388-8 chr17 31306621 31307456 + 0.666667 NA intron (NM_006495, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 7016 NM_006495 2124 Hs.5509 NM_006495 ENSG00000185862 EVI2B CD361|D17S376|EVDB ecotropic viral integration site 2B protein-coding 126.333-17 chr10 23435420 23435677 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -3721 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 141-69 chr5 130530937 130531194 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 626600 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 203.333-215 chr5 83177666 83178137 + 0.666667 NA intron (NM_001318012, intron 3 of 7) L2|LINE|L2 100354 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 125-71 chr3 8153023 8153255 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136832 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 140.333-250 chr9 115323230 115323496 + 0.666667 NA intron (NR_163556, intron 4 of 7) L2c|LINE|L2 181545 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 157.333-12 chr1 89586933 89587324 + 0.666667 NA intron (NM_015350, intron 8 of 8) L3|LINE|CR1 45766 NR_033981 400761 Hs.741594 NR_033981 ENSG00000231999 LRRC8C-DT - LRRC8C divergent transcript ncRNA 114.667-107 chr17 62919189 62919381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24930 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 124.667-117 chr2 230095876 230096196 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -27112 NM_152527 151473 Hs.504317 NM_152527 ENSG00000163053 SLC16A14 MCT14 solute carrier family 16 member 14 protein-coding 128-91 chr5 27539529 27539818 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 67381 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 122-18 chr10 128722416 128722726 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190262 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 160.667-66 chr12 9735436 9735813 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg1|LINE|L1 -2325 NM_001267701 160365 Hs.560087 NM_172004 ENSG00000184293 CLECL1 DCAL-1|DCAL1 C-type lectin like 1 protein-coding 155.333-330 chr6 56747715 56748067 + 0.666667 NA intron (NM_001144770, intron 2 of 94) intron (NM_001144770, intron 2 of 94) 95774 NM_183380 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 133-18 chr12 13567418 13567725 + 0.666667 NA intron (NM_000834, intron 11 of 12) intron (NM_000834, intron 11 of 12) -190826 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 144-11 chr10 6074285 6074611 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12078 NM_000417 3559 Hs.231367 NM_000417 ENSG00000134460 IL2RA CD25|IDDM10|IL2R|IMD41|TCGFR|p55 interleukin 2 receptor subunit alpha protein-coding 145.667-195 chr4 87298665 87298970 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1766 NR_049891 100847027 NR_049891 ENSG00000263981 MIR5705 - microRNA 5705 ncRNA 116.667-125 chr3 3900295 3900506 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -99525 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 120-67 chr2 69330036 69330374 + 0.666667 NA intron (NM_002056, intron 14 of 18) AluJb|SINE|Alu 57022 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 128.333-121 chr21 22304137 22304450 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 205676 NR_038400 54143 Hs.352631 NR_038400 ENSG00000184856 LINC00308 C21orf74|NCRNA00308|PRED16 long intergenic non-protein coding RNA 308 ncRNA 135-121 chrX 40814679 40814958 + 0.666667 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 18378 NR_027761 100132831 Hs.729923 NR_027761 LOC100132831 - A20-binding inhibitor of NF-kappaB activation 2 pseudogene pseudo 166-5 chr1 84514633 84515011 + 0.666667 NA intron (NM_001310156, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu -8241 NM_005274 2787 Hs.645427 NM_005274 ENSG00000174021 GNG5 - G protein subunit gamma 5 protein-coding 118.333-128 chr3 26815348 26815585 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 120909 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 135.667-99 chr2 110674368 110674758 + 0.666667 NA intron (NM_001278617, intron 1 of 23) intron (NM_001278617, intron 1 of 23) 3500 NM_004336 699 Hs.469649 NM_004336 ENSG00000169679 BUB1 BUB1A|BUB1L|hBUB1 BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase protein-coding 128.333-49 chr12 30493320 30493659 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 183755 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 143.333-284 chr8 53911281 53911676 + 0.666667 NA intron (NR_104579, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 30606 NR_104578 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 119-48 chr14 70292042 70292237 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44338 NR_003951 145241 Hs.712468 NR_003951 ENSG00000235812 ADAM21P1 ADAM21P ADAM metallopeptidase domain 21 pseudogene 1 pseudo 167-63 chr2 225930178 225930457 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -212477 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 132.333-35 chr11 87682015 87682261 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 37273 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 161.333-187 chr3 88565465 88565755 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 227154 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 136.333-88 chr2 60219573 60219908 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 163296 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 151-48 chr18 56506653 56506944 + 0.666667 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 131794 NR_024546 9352 Hs.114412 NM_004786 ENSG00000091164 TXNL1 HEL-S-114|TRP32|TXL-1|TXNL|Txl thioredoxin like 1 protein-coding 155.333-65 chr12 785078 785388 + 0.666667 NA intron (NM_001184985, intron 1 of 27) HAL1|LINE|L1 32310 NM_213655 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 151-54 chr2 45741672 45742113 + 0.666667 NA intron (NM_005400, intron 1 of 14) intron (NM_005400, intron 1 of 14) 90217 NM_005400 5581 Hs.580351 NM_005400 ENSG00000171132 PRKCE PKCE|nPKC-epsilon protein kinase C epsilon protein-coding 192.667-146 chr6 27832673 27833189 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -1404 NM_003541 8362 Hs.528055 NM_003541 ENSG00000273542 HIST1H4K H4/d|H4F2iii|H4FD|dJ160A22.1 histone cluster 1 H4 family member k protein-coding 159.333-170 chr2 161555216 161555600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47506 NR_077058 285116 Hs.470435 NR_077058 AHCTF1P1 AHCTF1P|ELYS-like AT-hook containing transcription factor 1 pseudogene 1 pseudo 161.667-171 chr3 100799238 100799548 + 0.666667 NA intron (NM_001349332, intron 20 of 35) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 89851 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 164-92 chr5 121309482 121309819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12900 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 143.333-185 chr3 82856300 82856593 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 870304 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 127-72 chr5 62290943 62291182 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -15100 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 176.333-20 chr10 67314557 67314979 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 88642 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 142.667-228 chr8 122932571 122932993 + 0.666667 NA intron (NM_001362797, intron 3 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 92990 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 137.333-23 chr11 29939225 29939585 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42988 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 178.333-168 chr7 120567069 120567477 + 0.666667 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 290871 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 150.667-306 chr5 85532094 85532413 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -750191 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 138.667-176 chr6 1096561 1096834 + 0.666667 NA intron (NR_027116, intron 1 of 3) L1MC5|LINE|L1 4635 NR_027116 285768 Hs.209463 NR_027115 LINC01622 - long intergenic non-protein coding RNA 1622 ncRNA 124.333-121 chr3 131190734 131191014 + 0.666667 NA intron (NM_001353043, intron 14 of 17) HAL1b|LINE|L1 163146 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 131-27 chr14 53448821 53449097 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 295605 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 149.333-230 chr3 6493219 6493548 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 312066 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 129-8 chr1 197441145 197441425 + 0.666667 NA intron (NM_001193640, intron 8 of 9) L2a|LINE|L2 173033 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 154.333-279 chr5 144236369 144236802 + 0.666667 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 31194 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 216-123 chr8 118765105 118765570 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143374 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 146.333-117 chr16 35440043 35440356 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40397 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 163-36 chr18 62823257 62823595 + 0.666667 NA intron (NM_194449, intron 1 of 16) AluJr|SINE|Alu 107885 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 144.333-289 chr9 128880100 128880441 + 0.666667 NA intron (NM_001352997, intron 1 of 13) MIRc|SINE|MIR 1680 NM_004059 883 Hs.495250 NM_004059 ENSG00000171097 KYAT1 CCBL1|GTK|KAT1|KATI kynurenine aminotransferase 1 protein-coding 146-113 chr5 151595862 151596204 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27089 NM_001447 2196 Hs.591255 NM_001447 ENSG00000086570 FAT2 CDHF8|CDHR9|HFAT2|MEGF1|SCA45 FAT atypical cadherin 2 protein-coding 150.667-202 chr2 220738659 220738949 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -832239 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 133.333-53 chr14 66478764 66479034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7472 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 149.333-368 chr7 40296227 40296521 + 0.666667 NA intron (NM_024728, intron 8 of 14) intron (NM_024728, intron 8 of 14) 161398 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 139-74 chr4 83532141 83532417 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3635 NM_001256422 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 172.333-46 chr13 67668172 67668653 + 0.666667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 296025 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 170-95 chr5 69144314 69144790 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -16256 NR_145732 109616958 NR_145732 ENSG00000280894 SNORA50D - small nucleolar RNA, H/ACA box 50D snoRNA 126-35 chr15 63591386 63591740 + 0.666667 NA non-coding (NR_046341, exon 16 of 16) non-coding (NR_046341, exon 16 of 16) -5824 NM_203373 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 115.333-173 chr5 44481950 44482212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28201 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 153.667-231 chr21 18406943 18407291 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3332 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 123.667-25 chr1 241882455 241882746 + 0.666667 NA intron (NM_001319224, intron 13 of 14) intron (NM_001319224, intron 13 of 14) 33869 NM_003686 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 140.333-185 chr5 86202109 86202487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80146 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 170.667-80 chr2 40252104 40252494 + 0.666667 NA intron (NR_038441, intron 4 of 4) intron (NR_038441, intron 4 of 4) 178005 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 228-92 chr8 105703649 105704259 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) LTR52|LTR|ERVL 356549 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 154-90 chr3 49621667 49622072 + 0.666667 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) intron (NM_003458, intron 1 of 11) -52482 NM_001640 327 Hs.517969 NM_001640 ENSG00000164062 APEH AARE|ACPH|APH|D3F15S2|D3S48E|DNF15S2|OPH acylaminoacyl-peptide hydrolase protein-coding 232.667-43 chr20 44000383 44000817 + 0.666667 NA intron (NM_001098797, intron 2 of 8) L2|LINE|L2 54704 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 122.667-206 chr9 30698887 30699247 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -290613 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 194-136 chr8 8718521 8718957 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16802 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 156.667-359 chr9 95793443 95793759 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -82090 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 159.333-357 chr9 110017318 110017723 + 0.666667 NA intron (NM_147150, intron 7 of 9) intron (NM_147150, intron 7 of 9) -31078 NM_001198656 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 149.667-376 chr7 88638335 88638768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -121149 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 163-27 chr15 68447845 68448186 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15852 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 113-141 chr3 114089292 114089483 + 0.666667 NA TTS (NM_001256836) TTS (NM_001256836) 32650 NM_001256836 79691 Hs.477162 NM_024638 ENSG00000151576 QTRT2 QTRTD1 queuine tRNA-ribosyltransferase accessory subunit 2 protein-coding 113-129 chr22 34877355 34877636 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 120421 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 158.333-146 chr2 68622019 68622294 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -21432 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 165-70 chr4 128517411 128517748 + 0.666667 NA intron (NR_125882, intron 8 of 8) intron (NR_125882, intron 8 of 8) 89563 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 179.333-113 chr20 15292857 15293228 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 6 of 17) L3|LINE|CR1 96202 NM_001351664 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 144.333-156 chr21 26539265 26539560 + 0.666667 NA intron (NR_135515, intron 2 of 3) HAL1|LINE|L1 33874 NM_052954 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 114-135 chr6 52224225 52224525 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20125 NM_052872 112744 Hs.272295 NM_052872 ENSG00000112116 IL17F CANDF6|IL-17F|ML-1|ML1 interleukin 17F protein-coding 117-142 chr8 79623334 79623571 + 0.666667 NA intron (NM_007029, intron 1 of 4) intron (NM_007029, intron 1 of 4) 12335 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 215.333-164 chr5 100574709 100575316 + 0.666667 NA intron (NM_198507, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 39638 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 132.667-162 chr7 33306609 33306930 + 0.666667 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) intron (NM_198428, intron 9 of 22) 177205 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 124-60 chr2 51387236 51387583 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 354808 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 112.667-5 chr1 93451101 93451290 + 0.666667 NA intron (NM_001024948, intron 1 of 13) intron (NM_001024948, intron 1 of 13) 3064 NM_001024948 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 123-99 chr5 103138328 103138569 + 0.666667 NA exon (NM_001345876, exon 5 of 29) exon (NM_001345876, exon 5 of 29) 18147 NM_001281471 23262 Hs.212046 NM_015216 ENSG00000145725 PPIP5K2 CFAP160|DFNB100|HISPPD1|IP7K2|VIP2 diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 2 protein-coding 154-110 chr4 141960582 141960889 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 324152 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 160.333-45 chr10 73943298 73943641 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -20692 NR_160938 414236 Hs.585453 NM_001001791 ENSG00000222047 C10orf55 - chromosome 10 open reading frame 55 ncRNA 132.333-52 chr14 69700328 69700666 + 0.666667 NA intron (NM_014734, intron 2 of 5) intron (NM_014734, intron 2 of 5) -66645 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 170-127 chr9 94131833 94132276 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -43903 NR_029476 406881 NR_029476 ENSG00000199165 MIRLET7A1 LET7A1|MIRNLET7A1|let-7a-1 microRNA let-7a-1 ncRNA 112.333-240 chr7 3082415 3082649 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -38665 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 188.667-109 chr4 40128019 40128422 + 0.666667 NA intron (NM_001318359, intron 13 of 18) intron (NM_001318359, intron 13 of 18) -62860 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 163.333-207 chr4 124370472 124370955 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 187721 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 151.333-3 chr1 22857357 22857747 + 0.666667 NA intron (NM_004442, intron 3 of 15) MER81|DNA|hAT-Blackjack 5674 NR_036214 100422914 NR_036214 ENSG00000264014 MIR4253 - microRNA 4253 ncRNA 153.333-212 chr2 130385964 130386303 + 0.666667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 30077 NM_014369 26469 Hs.516390 NM_014369 ENSG00000072135 PTPN18 BDP1|PTP-HSCF protein tyrosine phosphatase non-receptor type 18 protein-coding 178.333-173 chr8 118220607 118220994 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -108981 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 136-46 chr18 10555752 10556098 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 29898 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 174.667-109 chr22 31710836 31711303 + 0.666667 NA intron (NM_173566, intron 4 of 8) intron (NM_173566, intron 4 of 8) 39063 NM_173566 253143 Hs.438906 NM_173566 ENSG00000183530 PRR14L C22orf30 proline rich 14 like protein-coding 121.333-122 chr3 161463564 161463812 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -33120 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 153-11 chr10 31365944 31366254 + 0.666667 NA intron (NM_001368169, intron 1 of 1) intron (NM_001368169, intron 1 of 1) 33656 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 209.667-62 chr2 61508745 61509204 + 0.666667 NA intron (NM_003400, intron 4 of 24) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 29382 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 161.333-173 chr21 20591870 20592301 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 211023 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 250-35 chr18 58799613 58800289 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13929 NR_146904 105372147 Hs.210837 NR_146904 ENSG00000267593 LINC01926 - long intergenic non-protein coding RNA 1926 ncRNA 172-32 chr12 29898219 29898592 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -113646 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 157.333-5 chr1 30262595 30262973 + 0.666667 NA Intergenic MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 -225172 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 137.667-151 chr5 86209804 86210117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72484 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 202.667-55 chr14 87723490 87723825 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68363 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 181.333-83 chr2 182195488 182195886 + 0.666667 NA intron (NM_005019, intron 10 of 14) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 46376 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 149-104 chr4 101121906 101122274 + 0.666667 NA intron (NM_001130691, intron 2 of 12) intron (NM_001130691, intron 2 of 12) 118782 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 117.333-174 chr5 109396130 109396404 + 0.666667 NA intron (NM_014819, intron 1 of 9) L1MEd|LINE|L1 13707 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 118-71 chr2 153379228 153379417 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 99440 NM_019845 56475 Hs.100890 NM_019845 ENSG00000177519 RPRM REPRIMO reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator homolog protein-coding 147.667-107 chr14 74187138 74187436 + 0.666667 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR -52162 NM_182894 338917 Hs.449771 NM_182894 ENSG00000119614 VSX2 CHX10|HOX10|MCOP2|MCOPCB3|RET1 visual system homeobox 2 protein-coding 120-126 chr6 137737105 137737315 + 0.666667 NA intron (NR_121618, intron 1 of 2) L1MA8|LINE|L1 1827 NR_121619 100507406 Hs.556703 NR_121618 ENSG00000234956 LINC02539 - long intergenic non-protein coding RNA 2539 ncRNA 115.667-44 chr11 74482221 74482418 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11066 NM_001319240 100287896 Hs.591971 NM_198519 LOC100287896 - uncharacterized LOC100287896 protein-coding 122.667-134 chr4 3355194 3355428 + 0.666667 NA intron (NM_002926, intron 3 of 16) L1ME3B|LINE|L1 -14887 NM_198227 6002 Hs.527061 NM_002926 ENSG00000159788 RGS12 - regulator of G protein signaling 12 protein-coding 152.667-93 chr13 20223848 20224230 + 0.666667 NA intron (NM_001370092, intron 4 of 4) intron (NM_001370092, intron 4 of 4) 7194 NM_006783 10804 Hs.511757 NM_006783 ENSG00000121742 GJB6 CX30|DFNA3|DFNA3B|DFNB1B|ECTD2|ED2|EDH|HED|HED2 gap junction protein beta 6 protein-coding 205.667-85 chr20 51389289 51389718 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001258297, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001258297, exon 10 of 10) 63474 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 115-143 chr7 40566958 40567266 + 0.666667 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 412827 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 141.333-241 chr8 97254501 97254922 + 0.666667 NA intron (NR_125390, intron 2 of 2) intron (NR_125390, intron 2 of 2) 23217 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 203.667-80 chr3 123404077 123404519 + 0.666667 NA intron (NM_183357, intron 1 of 20) intron (NM_183357, intron 1 of 20) 12044 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 208.333-163 chrX 143196669 143197078 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 170945 NM_001009613 441525 Hs.535082 NM_001009613 ENSG00000189326 SPANXN4 CT11.9 SPANX family member N4 protein-coding 130-82 chr4 94533911 94534144 + 0.666667 NA intron (NM_001011516, intron 3 of 9) intron (NM_001011516, intron 3 of 9) 82085 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 181-66 chr6 130725100 130725422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102144 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 164.333-27 chr10 64804029 64804367 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -21330 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 119.667-39 chr12 76574338 76574522 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -14659 NM_020841 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 133-40 chr2 39362660 39362930 + 0.666667 NA intron (NM_003618, intron 2 of 33) L1MB1|LINE|L1 74490 NM_003618 8491 Hs.655750 NM_003618 ENSG00000011566 MAP4K3 GLK|MAPKKKK3|MEKKK 3|MEKKK3|RAB8IPL1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 protein-coding 157.667-116 chr16 7879336 7879635 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 546640 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 115.333 chr1 13784686 13784937 + 0.666667 NA intron (NM_012231, intron 8 of 9) intron (NM_012231, intron 8 of 9) 35396 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 161.333-31 chr10 59377281 59377678 + 0.666667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -14298 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 191-77 chr8 123736892 123737277 + 0.666667 NA intron (NM_001003954, intron 1 of 11) AluSq|SINE|Alu 309 NM_004306 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 153.333-152 chr16 13263707 13264092 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 362301 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 202.333-12 chr1 105435053 105435386 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 183716 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 116-110 chr3 101225738 101226047 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_016247, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_016247, exon 19 of 19) 94683 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 117-78 chr2 84546782 84547004 + 0.666667 NA intron (NM_001370, intron 5 of 76) intron (NM_001370, intron 5 of 76) 30438 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 162.667-77 chr14 35073595 35074052 + 0.666667 NA intron (NM_001079519, intron 4 of 6) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -7258 NR_110415 101927178 Hs.617139 NR_110415 ENSG00000151327 LOC101927178 - uncharacterized LOC101927178 ncRNA 167-61 chr2 129090290 129090624 + 0.666667 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 183434 NR_122042 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 115-113 chr3 74362362 74362557 + 0.666667 NA intron (NM_020872, intron 9 of 21) intron (NM_020872, intron 9 of 21) 158681 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 166-84 chr4 35007175 35007554 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -737617 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 124-46 chr16 27599177 27599470 + 0.666667 NA intron (NM_015202, intron 2 of 27) intron (NM_015202, intron 2 of 27) 49179 NM_015202 23247 Hs.460459 NM_015202 ENSG00000047578 KIAA0556 JBTS26 KIAA0556 protein-coding 126.333-149 chr6 43610900 43611161 + 0.666667 NA intron (NM_001291970, intron 10 of 10) intron (NM_001291970, intron 10 of 10) 16323 NM_001286216 54676 Hs.485449 NM_019096 ENSG00000172432 GTPBP2 JABELS GTP binding protein 2 protein-coding 162.333-202 chr5 120083488 120083837 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -380616 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 116.333-20 chr1 203373001 203373240 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21998 NM_002023 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 161.667-279 chrX 99733513 99733857 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 676588 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 123.667-104 chr20 25125218 25125532 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 22618 NR_027093 284798 Hs.334934 NR_027091 ENSG00000230725 LOC284798 - uncharacterized LOC284798 ncRNA 174.667-23 chr10 36086364 36086824 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 308292 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 124.333-138 chr5 14980526 14980832 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -108901 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 145.333-321 chr9 107484098 107484391 + 0.666667 NA TTS (NM_004235) TTS (NM_004235) 5525 NM_004235 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 214.333-10 chr1 178308975 178309413 + 0.666667 NA intron (NM_170692, intron 3 of 17) intron (NM_170692, intron 3 of 17) -32257 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 170.667-176 chr9 112743856 112744352 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6656 NM_001012994 401548 Hs.522350 NM_001012994 ENSG00000148158 SNX30 ATG24A sorting nexin family member 30 protein-coding 175-23 chr14 69695767 69696232 + 0.666667 NA intron (NM_014734, intron 2 of 5) intron (NM_014734, intron 2 of 5) -71143 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 129.667-130 chr4 117808964 117809190 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -25324 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 218.667-80 chr5 12909984 12910507 + 0.666667 NA intron (NR_147005, intron 3 of 4) intron (NR_147005, intron 3 of 4) 122641 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 137-45 chr2 62416452 62416801 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 89569 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 191.333-187 chr7 30058340 30058723 + 0.666667 NA intron (NM_001363473, intron 9 of 12) L1ME2|LINE|L1 13446 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 228.333-106 chr9 11880400 11881005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -812683 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 128.333-30 chr10 120727636 120727877 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 123423 NR_033850 283089 Hs.568750 NR_033850 ENSG00000227165 WDR11-AS1 - WDR11 antisense RNA 1 ncRNA 183.333-6 chr1 92335330 92335735 + 0.666667 NA intron (NM_024813, intron 9 of 12) L1ME4a|LINE|L1 36473 NM_024813 79871 Hs.444421 NM_024813 ENSG00000122484 RPAP2 C1orf82|Rtr1 RNA polymerase II associated protein 2 protein-coding 127-102 chr9 70881153 70881464 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -12256 NM_206948 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 149.333-258 chr3 124114392 124114707 + 0.666667 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) intron (NM_001024660, intron 1 of 59) -18380 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 149-48 chr15 71129331 71129630 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11969 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 162.333-17 chr1 204917649 204917983 + 0.666667 NA intron (NM_001160332, intron 1 of 27) L1MC5|LINE|L1 -26410 NM_001160331 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 251-37 chr2 75334308 75334917 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -135092 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 171.333-14 chr1 210287707 210288104 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -40347 NM_001122834 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 147.333-340 chrX 131573334 131573663 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 29424 NM_001004486 347468 Hs.553711 NM_001004486 ENSG00000171054 OR13H1 ORX1 olfactory receptor family 13 subfamily H member 1 protein-coding 198.333-42 chr12 12688521 12688967 + 0.666667 NA intron (NM_006143, intron 2 of 3) intron (NM_006143, intron 2 of 3) 7439 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 130.667-210 chrX 12431201 12431508 + 0.666667 NA intron (NM_001368402, intron 2 of 17) intron (NM_001368402, intron 2 of 17) -67326 NM_001368400 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 130-19 chr10 106478743 106478984 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 338698 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 178.667-90 chr20 4515509 4515880 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -170762 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 148-107 chr3 107850160 107850535 + 0.666667 NA non-coding (NR_015414, exon 7 of 11) non-coding (NR_015414, exon 7 of 11) 27721 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 146.667-346 chr8 139178465 139178756 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -264569 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 116.667-157 chr5 38028793 38029053 + 0.666667 NA non-coding (NR_147009, exon 2 of 3) non-coding (NR_147009, exon 2 of 3) 3226 NR_147009 105374731 Hs.570981 NR_147009 ENSG00000248461 LINC02107 - long intergenic non-protein coding RNA 2107 ncRNA 178.667-147 chr6 157568095 157568518 + 0.666667 NA intron (NM_024630, intron 2 of 8) L1ME4a|LINE|L1 39174 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 175.333-122 chr3 106495820 106496293 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -626655 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 181.333-38 chr12 117170324 117170786 + 0.666667 NA intron (NM_015002, intron 7 of 11) L1ME3C|LINE|L1 19915 NM_015002 23014 Hs.740376 NM_015002 ENSG00000135108 FBXO21 FBX21 F-box protein 21 protein-coding 171.667-180 chr9 36657192 36657504 + 0.666667 NA exon (NM_001256690, exon 11 of 16) exon (NM_001256690, exon 11 of 16) 84453 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 165.333-192 chr4 96803685 96804141 + 0.666667 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) L1MB3|LINE|L1 493210 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 136-51 chr2 102017612 102017848 + 0.666667 NA intron (NR_048564, intron 4 of 8) MER58B|DNA|hAT-Charlie 18769 NR_048564 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 210-140 chr7 81401417 81401938 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL 160142 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 120-119 chr6 6629927 6630183 + 0.666667 NA intron (NM_004271, intron 3 of 4) L1ME4a|LINE|L1 -7229 NR_026970 285780 Hs.655737 NM_173675 ENSG00000216863 LY86-AS1 LY86-AS|LY86AS LY86 antisense RNA 1 ncRNA 116-126 chr5 101212868 101213209 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -309756 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 153-130 chr7 84442189 84442575 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -90094 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 122.667-113 chr22 35431666 35431884 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31635 NM_006739 4174 Hs.517582 NM_006739 ENSG00000100297 MCM5 CDC46|MGORS8|P1-CDC46 minichromosome maintenance complex component 5 protein-coding 121.667-68 chr15 90506196 90506463 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -23594 NM_001042574 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 125-3 chr1 73226224 73226539 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79789 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 124.667-215 chr9 77089851 77090142 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 70341 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 155.667-235 chr3 168163253 168163535 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -67470 NM_001308155 27333 Hs.143600 NM_014498 ENSG00000173905 GOLIM4 GIMPC|GOLPH4|GPP130|P138 golgi integral membrane protein 4 protein-coding 150.333-98 chr14 25006265 25006709 + 0.666667 NA intron (NM_001351940, intron 1 of 6) intron (NM_001351940, intron 1 of 6) 42513 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 126.333-70 chr17 75686937 75687256 + 0.666667 NA intron (NR_126037, intron 3 of 8) intron (NR_126037, intron 3 of 8) 19758 NM_013260 29115 Hs.655088 NM_013260 ENSG00000161526 SAP30BP HCNGP|HTRG|HTRP SAP30 binding protein protein-coding 117.333-42 chr12 2871437 2871646 + 0.666667 NA intron (NM_202003, intron 3 of 7) AluJb|SINE|Alu -4724 NR_046433 83695 Hs.198853 NM_001252499 ENSG00000171792 RHNO1 C12orf32|HKMT1188|RHINO RAD9-HUS1-RAD1 interacting nuclear orphan 1 protein-coding 111.667-177 chr3 162873986 162874244 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 429186 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 118-34 chr14 52981248 52981547 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30300 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 139.667-215 chr9 104580838 104581207 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 11854 NM_001004483 138802 Hs.553599 NM_001004483 ENSG00000186943 OR13C8 OR37H|OR9-10 olfactory receptor family 13 subfamily C member 8 protein-coding 170.667-105 chr22 26708657 26709104 + 0.666667 NA intron (NR_110543, intron 1 of 5) intron (NR_110543, intron 1 of 5) 36037 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 184-69 chr3 168273631 168274102 + 0.666667 NA intron (NR_021485, intron 1 of 15) intron (NR_021485, intron 1 of 15) 24344 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 158.667-171 chr2 175930818 175931146 + 0.666667 NA intron (NM_001305010, intron 11 of 11) intron (NM_001305010, intron 11 of 11) 71285 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 115.667-151 chr3 167618781 167619071 + 0.666667 NA intron (NM_001366158, intron 2 of 15) intron (NM_001366158, intron 2 of 15) 35016 NM_001366158 151790 Hs.213762 NM_178824 ENSG00000174776 WDR49 - WD repeat domain 49 protein-coding 148-64 chr18 14044178 14044488 + 0.666667 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 88102 NM_145287 162655 Hs.352635 NM_145287 ENSG00000175322 ZNF519 HsT2362 zinc finger protein 519 protein-coding 199-123 chr8 136819743 136820175 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 289161 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 148.667-80 chr11 108336538 108336834 + 0.666667 NA intron (NM_001351834, intron 57 of 63) L1MC4a|LINE|L1 113157 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 124-82 chr4 17765146 17765365 + 0.666667 NA intron (NM_015688, intron 1 of 17) intron (NM_015688, intron 1 of 17) 16366 NM_015688 27146 Hs.744951 NM_015688 ENSG00000047662 FAM184B - family with sequence similarity 184 member B protein-coding 123.333-111 chr2 114435030 114435383 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7435 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 158-137 chr8 81858202 81858543 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -16086 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 123.667-57 chr14 60032774 60033064 + 0.666667 NA intron (NR_075071, intron 29 of 32) intron (NR_075071, intron 29 of 32) -58992 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 164.333-38 chr11 42506463 42506709 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -252896 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 234.333-62 chr5 101073565 101074130 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -170565 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 142.667-238 chr8 141750708 141751122 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 35398 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 155-38 chr15 70898565 70898848 + 0.666667 NA intron (NM_001199018, intron 4 of 16) AluJb|SINE|Alu 6263 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 155.333-329 chr6 53409838 53410213 + 0.666667 NA Intergenic Tigger5|DNA|TcMar-Tigger -60846 NM_001242831 60481 Hs.520189 NM_021814 ENSG00000012660 ELOVL5 HELO1|SCA38|dJ483K16.1 ELOVL fatty acid elongase 5 protein-coding 113.667-184 chr6 37958307 37958611 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 138732 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 130.333-72 chr15 40212773 40213034 + 0.666667 NA intron (NM_001211, intron 19 of 22) L1MC5|LINE|L1 -4525 NM_001128628 106821730 Hs.732375 NM_001128628 ENSG00000259288 BUB1B-PAK6 PAK-5|PAK-6|PAK5|PAK6 BUB1B-PAK6 readthrough protein-coding 179.667-26 chr11 18165200 18165584 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -7445 NM_054032 117196 Hs.632138 NM_054032 ENSG00000179817 MRGPRX4 GPCR|MRGX4|SNSR6 MAS related GPR family member X4 protein-coding 151.667-111 chr14 64526123 64526431 + 0.666667 NA intron (NM_014950, intron 2 of 2) intron (NM_014950, intron 2 of 2) 14091 NR_110550 102723809 Hs.667192 NR_110550 ENSG00000259116 LOC102723809 - uncharacterized LOC102723809 ncRNA 134.667-79 chr16 85675644 85675903 + 0.666667 NA TTS (NM_016095) TTS (NM_016095) 13181 NM_016095 51659 Hs.433180 NM_016095 ENSG00000131153 GINS2 HSPC037|PSF2|Pfs2 GINS complex subunit 2 protein-coding 167.667-132 chr3 45834736 45835099 + 0.666667 NA intron (NM_001276379, intron 4 of 9) intron (NM_001276379, intron 4 of 9) 7202 NM_020347 54585 Hs.30824 NM_020347 ENSG00000163818 LZTFL1 BBS17 leucine zipper transcription factor like 1 protein-coding 115-106 chr22 24779966 24780227 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -5376 NM_001008496 440822 Hs.448343 NM_001008496 ENSG00000184571 PIWIL3 HIWI3 piwi like RNA-mediated gene silencing 3 protein-coding 203.666-52 chr8 104334778 104335374 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -4720 NM_001257317 81501 Hs.652230 NM_030788 ENSG00000164935 DCSTAMP FIND|TM7SF4|hDC-STAMP dendrocyte expressed seven transmembrane protein protein-coding 220.667-45 chr2 67512226 67512750 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 115155 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 223-20 chr14 81447487 81447984 + 0.666667 NA intron (NR_109999, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 2422 NR_109999 100506700 Hs.116304 NR_109999 ENSG00000258675 LINC02308 - long intergenic non-protein coding RNA 2308 ncRNA 147.667-310 chr6 47568389 47568790 + 0.666667 NA intron (NM_012120, intron 5 of 17) AluSx3|SINE|Alu -87883 NM_001368115 222611 Hs.724860 NM_153839 ENSG00000164393 ADGRF2 GPR111|PGR20|hGPCR35 adhesion G protein-coupled receptor F2 protein-coding 194.667-165 chr9 80729034 80729517 + 0.666667 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 754252 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 118-61 chr18 49797229 49797572 + 0.666667 NA intron (NM_006111, intron 3 of 9) intron (NM_006111, intron 3 of 9) 16133 NM_006111 10449 Hs.200136 NM_006111 ENSG00000167315 ACAA2 DSAEC acetyl-CoA acyltransferase 2 protein-coding 121-124 chr6 85795094 85795324 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -116476 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 167-2 chr1 42153582 42153938 + 0.666667 NA intron (NM_007102, intron 1 of 2) intron (NM_007102, intron 1 of 2) 350 NM_007102 2981 Hs.32966 NM_007102 ENSG00000044012 GUCA2B GCAP-II|UGN guanylate cyclase activator 2B protein-coding 179.333-8 chr1 83953782 83954251 + 0.666667 NA intron (NM_024686, intron 1 of 20) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 45116 NM_001350215 79739 Hs.445826 NM_024686 ENSG00000137941 TTLL7 - tubulin tyrosine ligase like 7 protein-coding 180.333-151 chr9 83962558 83962857 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5721 NM_001317997 84267 Hs.208914 NM_032307 ENSG00000165118 C9orf64 - chromosome 9 open reading frame 64 protein-coding 113-206 chr8 108511771 108511961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 68242 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 139.333-124 chr2 203648422 203648800 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -57864 NM_001243078 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 170-115 chr8 11904845 11905117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36894 NM_147782 1508 Hs.520898 NM_001908 ENSG00000164733 CTSB APPS|CPSB|RECEUP cathepsin B protein-coding 192.333-163 chr8 59115882 59116314 + 0.666667 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 3049 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 117-57 chr17 670236 670479 + 0.666667 NA intron (NM_001366254, intron 4 of 19).2 intron (NM_001366254, intron 4 of 19).2 44482 NM_001128159 55275 Hs.461819 NM_018289 ENSG00000141252 VPS53 HCCS1|PCH2E|hVps53L|pp13624 VPS53 subunit of GARP complex protein-coding 117.333-156 chr4 99028242 99028440 + 0.666667 NA intron (NM_015143, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 30954 NR_037455 100500867 NR_037455 ENSG00000265213 MIR3684 - microRNA 3684 ncRNA 113-95 chr19 48288084 48288351 + 0.666667 NA TTS (NM_153608) TTS (NM_153608) 16930 NM_001369812 163071 Hs.511883 NM_153608 ENSG00000178150 ZNF114 - zinc finger protein 114 protein-coding 214.333-52 chr15 95105576 95106063 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 221281 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 192.667-38 chr11 21969740 21970191 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -223120 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 125.333-77 chr18 42694671 42694894 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 420903 NM_002930 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 154.667-348 chr6 119222456 119222750 + 0.666667 NA intron (NM_005907, intron 6 of 12) AluJo|SINE|Alu -73410 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 157-31 chr12 54520181 54520567 + 0.666667 NA intron (NM_001184976, intron 16 of 30) intron (NM_001184976, intron 16 of 30) 21596 NM_001184976 3071 Hs.182014 NM_005337 ENSG00000123338 NCKAP1L HEM1 NCK associated protein 1 like protein-coding 115-45 chr12 63966003 63966243 + 0.666667 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) intron (NM_001346201, intron 1 of 21) 121423 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 156-11 chr1 163788385 163788643 + 0.666667 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -365323 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 147.333-60 chr11 14754849 14755258 + 0.666667 NA intron (NM_000922, intron 1 of 15) Cheshire|DNA|hAT-Charlie 111249 NM_000922 5140 Hs.445711 NM_000922 ENSG00000152270 PDE3B HcGIP1|cGIPDE1 phosphodiesterase 3B protein-coding 119.333-75 chr12 82056069 82056376 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 102503 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 124-80 chr3 140418857 140419107 + 0.666667 NA intron (NM_022131, intron 4 of 16) intron (NM_022131, intron 4 of 16) 89807 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 159.667-192 chr20 41499502 41499835 + 0.666667 NA intron (NM_032221, intron 5 of 36) intron (NM_032221, intron 5 of 36) 118709 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 123-25 chr11 27956844 27957066 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -99860 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 189 chr1 41172350 41172728 + 0.666667 NA intron (NM_001172218, intron 2 of 15) L1MA5|LINE|L1 -9522 NM_001172221 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 160.667-62 chr11 97641537 97641872 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 1133279 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 123-77 chr3 76352626 76352858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -567193 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 164.667-150 chr3 139790331 139790794 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -112512 NM_001320511 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 112.333-62 chr13 70307435 70307620 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -199034 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 194.333-18 chr10 26110216 26110650 + 0.666667 NA intron (NM_017433, intron 17 of 34) intron (NM_017433, intron 17 of 34) -105874 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 146.667-210 chr3 7750213 7750539 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -215092 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 118.333-162 chr5 36195421 36195644 + 0.666667 NA intron (NM_001085411, intron 11 of 11) intron (NM_001085411, intron 11 of 11) 43421 NM_032637 6502 Hs.23348 NM_005983 ENSG00000145604 SKP2 FBL1|FBXL1|FLB1|p45 S-phase kinase associated protein 2 protein-coding 161.333-58 chr12 5850898 5851287 + 0.666667 NA intron (NM_001278596, intron 4 of 25) MIRc|SINE|MIR 94167 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 216.667-13 chr10 99051048 99051506 + 0.666667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -126709 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 165.333-234 chr6 162825185 162825586 + 0.666667 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) L1MEd|LINE|L1 97415 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 141.667-125 chr2 186722480 186722763 + 0.666667 NA intron (NM_177454, intron 1 of 7) intron (NM_177454, intron 1 of 7) 28561 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 195.667-49 chr15 58727767 58728157 + 0.666667 NA intron (NM_001320570, intron 1 of 14) L1MEc|LINE|L1 21745 NM_001110 102 Hs.172028 NM_001110 ENSG00000137845 ADAM10 AD10|AD18|CD156c|CDw156|HsT18717|MADM|RAK|kuz ADAM metallopeptidase domain 10 protein-coding 126-21 chr12 59718556 59718788 + 0.666667 NA intron (NM_001270623, intron 3 of 5) intron (NM_001270623, intron 3 of 5) 29302 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 118.333-19 chr1 160240641 160240906 + 0.666667 NA intron (NR_028104, intron 2 of 12) intron (NR_028104, intron 2 of 12) -20976 NR_147618 100287049 Hs.657648 NR_147618 ENSG00000228606 LOC100287049 - uncharacterized LOC100287049 ncRNA 132-118 chr8 105953120 105953456 + 0.666667 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 107215 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 193.333-136 chr4 53221154 53221555 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) intron (NM_152540, intron 4 of 8) 144707 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 135.333-110 chr3 9222941 9223177 + 0.666667 NA intron (NM_014850, intron 1 of 21) intron (NM_014850, intron 1 of 21) 6164 NR_103443 100288831 Hs.694646 NR_103443 ENSG00000227929 SRGAP3-AS3 - SRGAP3 antisense RNA 3 ncRNA 149.667-170 chr18 32531228 32531544 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19723 NR_003558 441818 Hs.549773 NR_003558 ENSG00000260389 WBP11P1 HsT3017 WW domain binding protein 11 pseudogene 1 pseudo 159-21 chr11 42596611 42596934 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -343082 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 212.333-94 chr3 29510952 29511443 + 0.666667 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) AluSc8|SINE|Alu 229885 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 152.667-161 chr19 48017464 48017845 + 0.666667 NA intron (NM_022142, intron 4 of 6) AluJr|SINE|Alu 23022 NM_022142 64100 Hs.104894 NM_022142 ENSG00000169393 ELSPBP1 E12|EDDM12|EL149|HE12 epididymal sperm binding protein 1 protein-coding 122-103 chr6 7127731 7127999 + 0.666667 NA intron (NM_001003699, intron 1 of 12) intron (NM_001003699, intron 1 of 12) 19904 NM_001003698 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 224.667-36 chr2 15588457 15588806 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3237 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 161.667-226 chr6 96832981 96833312 + 0.666667 NA intron (NM_001143957, intron 1 of 2) intron (NM_001143957, intron 1 of 2) 4331 NM_030784 81491 Hs.221364 NM_030784 ENSG00000112218 GPR63 PSP24(beta)|PSP24B G protein-coupled receptor 63 protein-coding 166-31 chr12 30756672 30757100 + 0.666667 NA intron (NR_135046, intron 1 of 1) Tigger11a|DNA|TcMar-Tigger 1812 NR_135046 645485 Hs.232332 NR_135046 ENSG00000246331 LOC645485 - uncharacterized LOC645485 ncRNA 190.667-4 chr1 33991888 33992230 + 0.666667 NA intron (NM_052896, intron 3 of 69) L1ME3G|LINE|L1 123103 NR_038372 402779 Hs.666207 NR_038372 ENSG00000231163 CSMD2-AS1 - CSMD2 antisense RNA 1 ncRNA 117.667-36 chr12 38018710 38018934 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -297952 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 160.667-6 chr1 51570796 51571185 + 0.666667 NA intron (NR_161259, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 12741 NR_161259 441884 NR_161259 CALR4P - calreticulin 4, pseudogene pseudo 113-171 chr5 88431403 88431693 + 0.666667 NA intron (NR_105021, intron 2 of 5) THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 7542 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 170-67 chr20 12131836 12132214 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 214132 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 174.667-31 chr11 58114082 58114546 + 0.666667 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) intron (NM_001005212, intron 2 of 2) 5130 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 127.667-28 chr11 40822921 40823240 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) L1ME3|LINE|L1 -529950 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 159-122 chr9 31187082 31187456 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 194221 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 189.333-120 chr22 38553609 38554123 + 0.666667 NA intron (NM_001363017, intron 6 of 11) AluSx3|SINE|Alu 14543 NM_001278208 11144 Hs.339396 NM_007068 ENSG00000100206 DMC1 DMC1H|LIM15|dJ199H16.1 DNA meiotic recombinase 1 protein-coding 135.333-44 chr12 42218915 42219174 + 0.666667 NA intron (NR_135140, intron 2 of 6) intron (NR_135140, intron 2 of 6) 19324 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 214.333-158 chr8 129676327 129676857 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 3647 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 136-30 chr14 47585397 47585643 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) MIR|SINE|MIR 89434 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 151.667-14 chr1 97325660 97325943 + 0.666667 NA intron (NM_000110, intron 16 of 22) intron (NM_000110, intron 16 of 22) 229878 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 127-14 chr10 12222119 12222473 + 0.666667 NA intron (NM_006023, intron 6 of 12) intron (NM_006023, intron 6 of 12) 26108 NM_006023 8872 Hs.412842 NM_006023 ENSG00000151465 CDC123 C10orf7|D123 cell division cycle 123 protein-coding 140-46 chr16 7834198 7834595 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 501551 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 149.667-127 chr14 80168696 80169002 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42570 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 142.333-204 chr5 126739935 126740228 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 36405 NR_134485 102723557 Hs.582207 NR_134485 ENSG00000251072 LMNB1-DT - LMNB1 divergent transcript ncRNA 151-131 chr8 135450011 135450305 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7298 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 146-7 chr10 20690010 20690375 + 0.666667 NA Intergenic MER53|DNA|hAT 138222 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 175-28 chr15 72079153 72079524 + 0.666667 NA intron (NM_006901, intron 1 of 41) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -34920 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 177-36 chr2 22832960 22833486 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 296744 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 120-88 chr3 97240131 97240338 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 4 of 17) intron (NM_001080448, intron 4 of 17) -199373 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 136.333-66 chr15 57807418 57807666 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 100828 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 177.333-158 chr7 130514622 130515049 + 0.666667 NA intron (NM_012133, intron 20 of 23) intron (NM_012133, intron 20 of 23) 18724 NR_029899 442904 NR_029899 ENSG00000199043 MIR335 MIRN335|hsa-mir-335|miRNA335|mir-335 microRNA 335 ncRNA 124-31 chr12 6889898 6890138 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_135083) promoter-TSS (NR_135083) -660 NR_135083 105369632 Hs.670096 NR_135083 ENSG00000111671 LOC105369632 - uncharacterized LOC105369632 ncRNA 255.333-8 chr10 61823590 61824038 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -77885 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 115.667-38 chr11 13895580 13895796 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25072 NR_149109 105376561 Hs.512244 NR_149109 ENSG00000254930 LINC02545 - long intergenic non-protein coding RNA 2545 ncRNA 153-148 chr8 124603474 124603894 + 0.666667 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 64561 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 207-84 chr4 10687416 10687880 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2880 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 129.667-169 chr8 54443969 54444211 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13845 NM_022454 64321 Hs.98367 NM_022454 ENSG00000164736 SOX17 VUR3 SRY-box transcription factor 17 protein-coding 131.333-135 chr4 182485245 182485601 + 0.666667 NA intron (NM_001080477, intron 3 of 27) intron (NM_001080477, intron 3 of 27) 242021 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 190-105 chr5 164862685 164863101 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 392614 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 138.667-98 chr2 37422155 37422437 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 77666 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 197.667-143 chr7 140775255 140775785 + 0.666667 NA intron (NR_148928, intron 14 of 17) AluSp|SINE|Alu -78443 NR_024454 100134713 Hs.534141 NR_024454 ENSG00000240889 NDUFB2-AS1 - NDUFB2 antisense RNA 1 ncRNA 134-15 chr10 66927855 66928127 + 0.666667 NA exon (NM_178011, exon 2 of 3) exon (NM_178011, exon 2 of 3) 1955 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 131-78 chr5 81225807 81226172 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_006909, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_006909, exon 27 of 27) -7331 NM_001099736 1160 Hs.80691 NM_001825 ENSG00000131730 CKMT2 SMTCK creatine kinase, mitochondrial 2 protein-coding 207.333-110 chr16 35441158 35441773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 39131 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 113.333-148 chr20 7790873 7791150 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 149447 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 123.333-174 chr5 82262713 82263059 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15468 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 196-59 chr16 2919811 2920148 + 0.666667 NA intron (NM_020912, intron 2 of 8) intron (NM_020912, intron 2 of 8) 8000 NM_032296 84256 Hs.655321 NM_020912 ENSG00000059122 FLYWCH1 - FLYWCH-type zinc finger 1 protein-coding 189.666-40 chrX 155016987 155017535 + 0.666667 NA intron (NM_000132, intron 1 of 25) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 5462 NM_000132 2157 Hs.632836 NM_000132 ENSG00000185010 F8 AHF|DXS1253E|F8B|F8C|FVIII|HEMA coagulation factor VIII protein-coding 175.333-157 chr6 61857953 61858318 + 0.666667 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 284005 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 120.333-160 chr5 165712998 165713284 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 1213229 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 138.667-108 chr2 96923225 96923558 + 0.666667 NA intron (NM_001122646, intron 10 of 16) intron (NM_001122646, intron 10 of 16) 4285 NR_110209 101927053 Hs.677537 NR_110209 LOC101927053 - uncharacterized LOC101927053 ncRNA 230.333-43 chr16 27660652 27661220 + 0.666667 NA intron (NM_015202, intron 6 of 27) L2a|LINE|L2 58093 NR_147898 100128079 Hs.610277 NR_147898 LOC100128079 - uncharacterized LOC100128079 ncRNA 210.667-85 chr3 71119969 71120439 + 0.666667 NA intron (NR_146142, intron 6 of 19) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 10382 NM_001370548 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 166-127 chrX 75391513 75392006 + 0.666667 NA intron (NM_001146256, intron 9 of 10) L1MA3|LINE|L1 117674 NM_145052 139596 Hs.91612 NM_145052 ENSG00000094841 UPRT FUR1|UPP uracil phosphoribosyltransferase homolog protein-coding 140.667-141 chr22 27938154 27938479 + 0.666667 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu -17704 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 113-54 chr14 53673785 53673975 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 274604 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 291-16 chr14 71562690 71563405 + 0.666667 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) L2a|LINE|L2 -23251 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 225-27 chr16 24038208 24038841 + 0.666667 NA intron (NM_002738, intron 5 of 16) MIRc|SINE|MIR -164592 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 155.333-67 chr12 1251843 1252224 + 0.666667 NA intron (NR_027946, intron 13 of 18) L1MA4|LINE|L1 224285 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 116-4 chr1 51391488 51391821 + 0.666667 NA intron (NM_001159969, intron 9 of 12) L2a|LINE|L2 30441 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 132.667-116 chr4 6337703 6337954 + 0.666667 NA intron (NM_001206994, intron 7 of 9) intron (NM_001206994, intron 7 of 9) 44040 NM_181876 5522 Hs.479069 NM_020416 ENSG00000074211 PPP2R2C B55-GAMMA|B55gamma|IMYPNO|IMYPNO1|PR52|PR55G protein phosphatase 2 regulatory subunit Bgamma protein-coding 153-115 chr5 161801060 161801371 + 0.666667 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -45976 NM_000806 2554 Hs.175934 NM_000806 ENSG00000022355 GABRA1 ECA4|EIEE19|EJM|EJM5 gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit protein-coding 147-73 chr2 149420715 149421096 + 0.666667 NA intron (NM_194317, intron 1 of 4) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 90318 NM_194317 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 115.333-75 chr14 70498580 70498758 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -14913 NR_037933 317760 Hs.188369 NR_037933 ENSG00000259158 ADAM20P1 C14orf55 ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene 1 pseudo 119-57 chr16 13036376 13036595 + 0.666667 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) intron (NM_001145204, intron 2 of 4) 134887 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 129.667-126 chr4 38573488 38573712 + 0.666667 NA non-coding (NR_146991, exon 3 of 3) non-coding (NR_146991, exon 3 of 3) 9597 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 122.667-5 chr1 50774799 50775128 + 0.666667 NA intron (NM_007051, intron 4 of 18) intron (NM_007051, intron 4 of 18) 185304 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 171.333-84 chr2 75992274 75992613 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -281528 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 123.667-167 chr6 86213741 86213957 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -535116 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 245.333-10 chr1 222747554 222748083 + 0.666667 NA intron (NM_207468, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 8134 NM_001324080 400823 Hs.697608 NM_207468 ENSG00000197520 FAM177B - family with sequence similarity 177 member B protein-coding 135.333-160 chr6 96133532 96133843 + 0.666667 NA intron (NM_006581, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 117713 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 194-24 chr12 1709889 1710337 + 0.666667 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 LTR12F|LTR|ERV1 19043 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 181-34 chr19 40312419 40312908 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -27318 NM_001243027 208 Hs.631535 NM_001626 ENSG00000105221 AKT2 HIHGHH|PKBB|PKBBETA|PRKBB|RAC-BETA AKT serine/threonine kinase 2 protein-coding 142.333-18 chr10 37344330 37344601 + 0.666667 NA intron (NR_104061, intron 4 of 4) L1M2|LINE|L1 35279 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 257.667-20 chr14 60479320 60479872 + 0.666667 NA intron (NM_174978, intron 4 of 17) intron (NM_174978, intron 4 of 17) 6467 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 208-6 chr1 70140988 70141475 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001366841, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001366841, exon 27 of 27) 64348 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 232.333-82 chr7 82524010 82524640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80369 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 209.333-84 chr16 51814684 51815177 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 52411 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 146.333-186 chr22 26338817 26339129 + 0.666667 NA intron (NM_001184776, intron 9 of 14) AluJr4|SINE|Alu -90287 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 151.667-394 chr9 94229265 94229598 + 0.666667 NA intron (NR_160773, intron 1 of 2) L1MB4|LINE|L1 -24865 NR_046163 158257 Hs.652626 NR_046163 ENSG00000230262 LINC02603 MIRLET7DHG long intergenic non-protein coding RNA 2603 ncRNA 148.333-363 chr7 42731100 42731440 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -24823 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 130.667-13 chr1 156444196 156444442 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14771 NR_135260 10485 Hs.380027 NM_006365 ENSG00000125462 C1orf61 CROC4 chromosome 1 open reading frame 61 protein-coding 112.333-208 chr5 73995611 73995798 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 182158 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 139.667-86 chr2 64453381 64453678 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_014181) promoter-TSS (NM_014181) -633 NM_014181 29094 Hs.372208 NM_014181 ENSG00000119862 LGALSL GRP|HSPC159 galectin like protein-coding 171.333-195 chr8 86562662 86562950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48371 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 126.333-120 chr3 115096322 115096651 + 0.666667 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) 3822 NM_001348804 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 111.667-221 chr6 53145947 53146199 + 0.666667 NA intron (NM_003643, intron 1 of 5) intron (NM_003643, intron 1 of 5) 2768 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 163.667-73 chr16 5326420 5326755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -228767 NM_001289029 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 139.667-5 chr1 103778026 103778287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28315 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 127.667-208 chrX 107195955 107196255 + 0.666667 NA intron (NM_017681, intron 1 of 8) intron (NM_017681, intron 1 of 8) 10328 NR_033676 54830 Hs.163629 NM_017681 ENSG00000198088 NUP62CL - nucleoporin 62 C-terminal like protein-coding 201.333-196 chr3 122746118 122746463 + 0.666667 NA intron (NM_001320728, intron 5 of 6) L1M4|LINE|L1 47541 NM_024610 79663 Hs.29169 NM_024610 ENSG00000169087 HSPBAP1 PASS1 HSPB1 associated protein 1 protein-coding 162.333-90 chr16 70794524 70794890 + 0.666667 NA intron (NM_018052, intron 1 of 18) MER102c|DNA|hAT-Charlie 6451 NM_018052 55697 Hs.445061 NM_018052 ENSG00000103043 VAC14 ArPIKfyve|TAX1BP2|TRX VAC14 component of PIKFYVE complex protein-coding 156.333-114 chr14 77389178 77389482 + 0.666667 NA intron (NM_001010860, intron 2 of 2) intron (NM_001010860, intron 2 of 2) 11952 NM_001010860 161394 Hs.421961 NM_001010860 ENSG00000100583 SAMD15 C14orf174|FAM15A sterile alpha motif domain containing 15 protein-coding 195.667-129 chr7 34981722 34982149 + 0.666667 NA intron (NM_015283, intron 7 of 21) AluSz6|SINE|Alu -41101 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 200.667-97 chr21 18840354 18840778 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -80754 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 126.667-117 chr3 197060899 197061144 + 0.666667 NA intron (NM_001366216, intron 21 of 23) AluSz|SINE|Alu -31204 NM_033316 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 255.333-105 chr8 61491875 61492473 + 0.666667 NA intron (NM_173519, intron 5 of 5) MER33|DNA|hAT-Charlie 197637 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 182.333-149 chr8 19480680 19481154 + 0.666667 NA intron (NM_001130518, intron 4 of 9) intron (NM_001130518, intron 4 of 9) 121628 NM_001354499 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 158.333-147 chr2 71515251 71515602 + 0.666667 NA intron (NM_001130985, intron 7 of 54) intron (NM_001130985, intron 7 of 54) 48727 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 114-157 chr8 3385962 3386202 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 18 of 69) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger -657631 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 190.667-98 chr5 21131600 21132129 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -327616 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 121.667-99 chr2 174112906 174113128 + 0.666667 NA intron (NM_001011708, intron 6 of 9) AluSq2|SINE|Alu 87737 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 191.333-87 chr17 59128688 59129249 + 0.666667 NA intron (NM_182620, intron 2 of 3) intron (NM_182620, intron 2 of 3) 8904 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 138.667-68 chr15 44246686 44246944 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41904 NM_177974 113201 Hs.512867 NM_138423 ENSG00000166734 CASC4 H63 cancer susceptibility 4 protein-coding 153-30 chr12 40735644 40735989 + 0.666667 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) L1M7|LINE|L1 43374 NM_001256063 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 118-66 chr2 31985914 31986195 + 0.666667 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) HY1|scRNA|scRNA 24610 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 118.333-26 chr10 16091457 16091671 + 0.666667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -231031 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 165.667-146 chr4 91410472 91410778 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 866677 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 115.667-178 chr5 41365450 41365789 + 0.666667 NA intron (NM_001005473, intron 2 of 2) intron (NM_001005473, intron 2 of 2) -104150 NM_001115131 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 174-89 chr7 43473083 43473553 + 0.666667 NA intron (NM_001287059, intron 14 of 27) MSTA1|LTR|ERVL-MaLR 49224 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 130.333-36 chr10 79932286 79932534 + 0.666667 NA TTS (NR_033857) TTS (NR_033857) 12232 NR_002724 8512 Hs.733579 NR_002724 ENSG00000242600 MBL1P COLEC3P|MBL1P1 mannose binding lectin 1, pseudogene pseudo 123-76 chr3 64909254 64909471 + 0.666667 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) intron (NR_038264, intron 4 of 5) -221362 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 134.667-111 chr2 230187128 230187396 + 0.666667 NA intron (NM_080424, intron 10 of 18) L1PB3|LINE|L1 32722 NM_004510 3431 Hs.145150 NM_004509 ENSG00000135899 SP110 IFI41|IFI75|IPR1|VODI SP110 nuclear body protein protein-coding 123.333-76 chr14 47932604 47932819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -137697 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 113.333-225 chr6 40964287 40964478 + 0.666667 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) intron (NR_110873, intron 1 of 5) 58898 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 120.333-27 chr10 117203266 117203515 + 0.666667 NA intron (NM_181840, intron 2 of 2) intron (NM_181840, intron 2 of 2) 5901 NM_181840 338567 Hs.449650 NM_181840 ENSG00000186795 KCNK18 K2p18.1|MGR13|TRESK|TRESK-2|TRESK2|TRIK potassium two pore domain channel subfamily K member 18 protein-coding 147.333-15 chr1 93598965 93599380 + 0.666667 NA non-coding (NR_034091, exon 4 of 4) non-coding (NR_034091, exon 4 of 4) 7204 NR_034091 100129046 Hs.729244 NR_034091 LOC100129046 - uncharacterized LOC100129046 ncRNA 128.667-201 chr9 129092830 129093165 + 0.666667 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 11886 NM_001135917 57171 Hs.21701 NM_020438 ENSG00000167130 DOLPP1 LSFR2 dolichyldiphosphatase 1 protein-coding 114.667-77 chr14 44802482 44802780 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3505 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 146.667-77 chr12 66034936 66035230 + 0.666667 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger -4017 NR_146530 105369810 NR_146530 ENSG00000256259 LINC02425 - long intergenic non-protein coding RNA 2425 ncRNA 146.667-195 chr20 39402636 39403029 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -178084 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 192.333-84 chr2 22700273 22700570 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 163942 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 130-77 chr3 81979162 81979446 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -6838 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 128-36 chr17 66780085 66780418 + 0.666667 NA intron (NM_002737, intron 14 of 16) intron (NM_002737, intron 14 of 16) -6821 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 160-9 chr1 170257208 170257540 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 26834 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 136.333-129 chr3 112536430 112536732 + 0.666667 NA exon (NM_022488, exon 10 of 12) exon (NM_022488, exon 10 of 12) -24739 NM_001348906 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 125.667-124 chr3 110326203 110326472 + 0.666667 NA Intergenic (TCACACC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 723509 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 185.666-21 chr6 138574530 138575073 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2232 NM_020464 57224 Hs.652741 NM_020464 ENSG00000135540 NHSL1 C6orf63 NHS like 1 protein-coding 133.667-161 chr9 32594019 32594366 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -21008 NM_001199987 4712 Hs.493668 NM_002493 ENSG00000165264 NDUFB6 B17|CI NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B6 protein-coding 112.667-121 chr2 58841256 58841461 + 0.666667 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) MIRb|SINE|MIR 320605 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 228.333-86 chr7 1782192 1782611 + 0.666667 NA Intergenic MER66A|LTR|ERV1 -40091 NR_120509 101927125 Hs.633957 NR_120508 ENSG00000236081 ELFN1-AS1 MYCLo-2 ELFN1 antisense RNA 1 ncRNA 202.333-72 chr16 72991735 72992171 + 0.666667 NA intron (NM_006885, intron 1 of 9) intron (NM_006885, intron 1 of 9) 56175 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 227-10 chr10 87935289 87935812 + 0.666667 NA intron (NM_001304717, intron 6 of 9) Charlie24|DNA|hAT-Charlie 71925 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 112.667-198 chr4 147835578 147835782 + 0.666667 NA intron (NM_024605, intron 3 of 22) intron (NM_024605, intron 3 of 22) 53085 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 152-39 chr12 13221945 13222218 + 0.666667 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 25355 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 124.667-54 chr14 37564661 37564971 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30433 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 346-20 chr22 27525209 27525992 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 214949 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 221.333-157 chrX 41701774 41702417 + 0.666667 NA intron (NM_003688, intron 5 of 26) intron (NM_003688, intron 5 of 26) 13122 NM_005300 2857 Hs.495989 NM_005300 ENSG00000171659 GPR34 LYPSR1 G protein-coupled receptor 34 protein-coding 111.667-55 chr12 3390212 3390472 + 0.666667 NA intron (NM_001256536, intron 1 of 9) intron (NM_001256536, intron 1 of 9) 8993 NM_001256536 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 163-86 chr8 71401682 71401972 + 0.666667 NA intron (NM_001370336, intron 2 of 17) intron (NM_001370336, intron 2 of 17) -39758 NM_000503 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 201.333-109 chr14 91442130 91442437 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24463 NM_001080414 440193 Hs.525536 NM_001080414 ENSG00000015133 CCDC88C DAPLE|HKRP2|HYC1|KIAA1509|SCA40 coiled-coil domain containing 88C protein-coding 152.333-248 chr3 130391664 130391985 + 0.666667 NA intron (NM_001278298, intron 7 of 40) MIR3|SINE|MIR 46308 NM_153264 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 168.667-99 chr2 43389114 43389466 + 0.666667 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 162079 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 140-99 chr6 129513183 129513555 + 0.666667 NA intron (NM_000426, intron 63 of 64) intron (NM_000426, intron 63 of 64) 196808 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 162.333-258 chr8 108249255 108249699 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001568) promoter-TSS (NM_001568) -760 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 152.667-114 chr14 68845637 68846000 + 0.666667 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -49575 NM_001244701 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 116-89 chr2 189169186 189169374 + 0.666667 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) 10481 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 151.667-358 chr8 52678715 52679014 + 0.666667 NA intron (NM_001083617, intron 5 of 23) MIRc|SINE|MIR 35571 NM_014781 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 122-20 chr11 15039720 15039933 + 0.666667 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -33767 NM_000728 797 Hs.534305 NM_000728 ENSG00000175868 CALCB CALC2|CGRP-II|CGRP2 calcitonin related polypeptide beta protein-coding 148-8 chr1 104710144 104710542 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 637320 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 179.667-146 chr8 132574094 132574532 + 0.666667 NA intron (NR_135913, intron 10 of 10) MER68|LTR|ERVL -12834 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 122.333-44 chr12 55662467 55662688 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -19159 NM_152637 196410 Hs.51483 NM_152637 ENSG00000170439 METTL7B ALDI methyltransferase like 7B protein-coding 201-112 chr8 124470010 124470527 + 0.666667 NA intron (NR_108047, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu 4086 NR_108048 101927612 Hs.633137 NR_108047 ENSG00000245149 RNF139-AS1 - RNF139 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 116.667-72 chr16 86764216 86764487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42260 NR_135183 102724344 Hs.585769 NR_135182 ENSG00000261175 LINC02188 - long intergenic non-protein coding RNA 2188 ncRNA 112.333-147 chr20 49096884 49097065 + 0.666667 NA TTS (NM_001256135) TTS (NM_001256135) 50662 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 119-29 chr11 83774487 83774827 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 18 of 27) intron (NM_001142699, intron 18 of 27) -92232 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 142.667-136 chr3 83855352 83855715 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 1014042 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 119.333-122 chr2 24040443 24040758 + 0.666667 NA intron (NM_025203, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 6791 NM_025203 80304 Hs.24624 NM_025203 ENSG00000163026 WDCP C2orf44|MMAP|PP384 WD repeat and coiled coil containing protein-coding 138.667-144 chr4 31550419 31550701 + 0.666667 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) intron (NR_149121, intron 1 of 2) 44016 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 214.333-103 chr3 185470739 185471193 + 0.666667 NA intron (NM_004721, intron 10 of 13) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 28069 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 148.333-97 chr12 63933256 63933594 + 0.666667 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) intron (NM_001346201, intron 1 of 21) 88725 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 302.333-26 chr4 54772737 54773190 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 115035 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 115.667-236 chrX 145650412 145650649 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -167299 NM_032539 84631 Hs.106688 NM_032539 ENSG00000185985 SLITRK2 CXorf1|CXorf2|SLITL1|TMEM257 SLIT and NTRK like family member 2 protein-coding 124.667-76 chr16 12270294 12270532 + 0.666667 NA intron (NM_032167, intron 14 of 20) intron (NM_032167, intron 14 of 20) 293679 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 198-51 chr14 71698850 71699366 + 0.666667 NA exon (NM_001354287, exon 14 of 24) exon (NM_001354287, exon 14 of 24) 112810 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 134.667-161 chr5 87891796 87892032 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 229872 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 214-138 chr8 126978318 126978937 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -34527 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 154.667-214 chr2 236342026 236342418 + 0.666667 NA intron (NM_001270584, intron 15 of 17) intron (NM_001270584, intron 15 of 17) -77877 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 133.333-177 chr8 52795084 52795334 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -80743 NM_001083617 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 124.333-171 chr7 108740877 108741097 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 143600 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 150.667-96 chr12 117840883 117841203 + 0.666667 NA intron (NM_173598, intron 3 of 19) intron (NM_173598, intron 3 of 19) 127947 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 139.333-213 chr8 79207667 79207930 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -124390 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 114.333-77 chr16 6260759 6260992 + 0.666667 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) AluSz|SINE|Alu 241172 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 167.333-9 chr1 69911427 69911856 + 0.666667 NA intron (NM_001370785, intron 7 of 26) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -7681 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 186.333-51 chr14 67655996 67656412 + 0.666667 NA intron (NM_006370, intron 4 of 5) AluSx|SINE|Alu 18428 NM_006370 10490 Hs.741177 NM_006370 ENSG00000100568 VTI1B VTI1|VTI1-LIKE|VTI1L|VTI2|v-SNARE|vti1-rp1 vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B protein-coding 238-3 chr1 105729543 105730249 + 0.666667 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -110961 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 143.333-52 chr11 83193430 83193720 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_149009) promoter-TSS (NR_149009) 94 NR_149011 100506282 Hs.585502 NM_018705 LOC100506282 - uncharacterized LOC100506282 ncRNA 219.667-38 chr2 15407773 15408265 + 0.666667 NA intron (NR_052013, intron 25 of 50) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 153315 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 214.667-38 chr13 42695496 42695957 + 0.666667 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -85824 NM_182508 144809 Hs.16970 NM_182508 ENSG00000179813 FAM216B C13orf30 family with sequence similarity 216 member B protein-coding 111.667-109 chr17 72476103 72476369 + 0.666667 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 116568 NR_152515 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 141.333-198 chr5 155916366 155916637 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -410256 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 114.667-174 chr3 94096263 94096438 + 0.666667 NA intron (NM_022072, intron 5 of 5) intron (NM_022072, intron 5 of 5) 33289 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 251-55 chr4 114056639 114057220 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -77282 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 132.667-64 chr16 56207832 56208072 + 0.666667 NA intron (NM_138736, intron 2 of 7) L1ME3B|LINE|L1 -13427 NR_026889 26077 Hs.721567 NR_026889 ENSG00000261439 DKFZP434H168 - uncharacterized LOC26077 ncRNA 159-81 chr3 114495722 114496145 + 0.666667 NA intron (NR_121661, intron 1 of 2) intron (NR_121661, intron 1 of 2) 42340 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 277.333-36 chr16 61307257 61307864 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -251794 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 151-99 chr5 11047439 11047737 + 0.666667 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) intron (NM_001288715, intron 15 of 20) -286354 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 124.667-39 chr12 1164010 1164299 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 7 of 19) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 136406 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 128.333-72 chr16 51508302 51508647 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -254045 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 115.333-213 chr8 55131733 55131930 + 0.666667 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 29803 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 331.667-8 chr18 6543371 6544036 + 0.666667 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) intron (NR_120518, intron 2 of 5) 32287 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 144-56 chr14 78166533 78166871 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3671 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 116-69 chr2 21581879 21582133 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 128646 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 129-68 chr2 198378676 198379025 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3753 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 165.333-141 chr20 43956900 43957348 + 0.666667 NA intron (NM_032883, intron 2 of 9) L1M5|LINE|L1 11228 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 150-159 chr9 90312620 90313007 + 0.666667 NA intron (NR_109795, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 120676 NR_109795 101927873 Hs.598482 NR_109795 ENSG00000231107 LINC01508 - long intergenic non-protein coding RNA 1508 ncRNA 119-147 chr9 34784835 34785103 + 0.666667 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 53617 NR_024481 389715 Hs.713965 NM_001126494 FAM205BP C9orf144|C9orf144A|FAM205B transmembrane protein C9orf144B pseudogene pseudo 125-26 chr12 4063992 4064192 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -190644 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 237-34 chr17 72758069 72758464 + 0.666667 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -117794 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 173.667-35 chr12 40869254 40869623 + 0.666667 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) AluJo|SINE|Alu -38919 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 112-112 chr2 154850044 154850232 + 0.666667 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) intron (NM_002239, intron 2 of 2) 151443 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 119.333-118 chr19 32384765 32385086 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014910, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_014910, exon 6 of 6) 20614 NR_046201 400684 Hs.438766 NR_046201 ENSG00000267213 LOC400684 - uncharacterized LOC400684 ncRNA 140.667-138 chr21 32648427 32648805 + 0.666667 NA intron (NM_203446, intron 23 of 32) L2b|LINE|L2 -35745 NM_001350335 56683 Hs.5811 NM_017835 ENSG00000159079 CFAP298 C21orf48|C21orf59|CILD26|FBB18|Kur cilia and flagella associated protein 298 protein-coding 146.667-363 chrX 103076409 103076773 + 0.666667 NA intron (NM_022052, intron 18 of 19) PRIMA4_LTR|LTR|ERV1 -12420 NM_018476 55859 Hs.334370 NM_018476 ENSG00000133169 BEX1 BEX2|HBEX2|HGR74-h brain expressed X-linked 1 protein-coding 136-87 chr5 127647252 127647534 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1628 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 146-54 chr2 18587529 18587877 + 0.666667 NA intron (NM_001199104, intron 1 of 10) intron (NM_001199104, intron 1 of 10) 1866 NM_001199087 93034 Hs.744358 NM_033253 ENSG00000185013 NT5C1B AIRP|CN-IB|CN1B 5'-nucleotidase, cytosolic IB protein-coding 134.333-113 chr3 27156078 27156424 + 0.666667 NA intron (NM_001304384, intron 10 of 16) L1PB1|LINE|L1 60272 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 130.667-19 chr10 2673090 2673389 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -171777 NR_136146 105376351 Hs.343482 NR_136146 LINC02645 - long intergenic non-protein coding RNA 2645 ncRNA 204.333-74 chr17 59038590 59039027 + 0.666667 NA intron (NR_148346, intron 17 of 23) MER49|LTR|ERV1 68072 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 141-73 chr6 38592301 38592590 + 0.666667 NA intron (NM_052893, intron 5 of 11) intron (NM_052893, intron 5 of 11) 3622 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 212-18 chr1 242206745 242207271 + 0.666667 NA intron (NM_001320272, intron 6 of 10) MLT2C1|LTR|ERVL -207910 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 155-134 chr9 99877859 99878165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28589 NR_038853 441461 Hs.163155 NR_038853 ENSG00000255145 STX17-AS1 - STX17 antisense RNA 1 ncRNA 142-59 chr17 77847810 77848179 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36093 NR_028337 400624 Hs.514521 NM_001001685 ENSG00000204283 LINC01973 - long intergenic non-protein coding RNA 1973 ncRNA 132.333-22 chr10 62171335 62171662 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 97346 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 165.667-129 chr3 140062785 140063185 + 0.666667 NA intron (NM_022131, intron 1 of 16) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 127800 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 131-47 chr2 33981751 33982096 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 -85303 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 152.333-397 chr9 27523802 27524124 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_020124) promoter-TSS (NM_020124) -351 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 125-85 chr5 31321447 31321657 + 0.666667 NA intron (NM_004932, intron 11 of 11) MIRb|SINE|MIR 127866 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 165.333-112 chr18 5061823 5062158 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -19192 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 145.333-203 chr3 180150140 180150472 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -113369 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 143-80 chr3 20545903 20546329 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 203648 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 179-53 chr2 146218498 146218933 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -368342 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 184.333-95 chr22 34827778 34828287 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 169884 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 210.667-70 chr2 112640041 112640468 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3926 NR_033871 400999 Hs.585221 NR_033871 FLJ42351 - uncharacterized LOC400999 ncRNA 175.666-27 chr9 90714592 90715111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72027 NM_017594 54769 Hs.165636 NM_017594 ENSG00000165023 DIRAS2 Di-Ras2 DIRAS family GTPase 2 protein-coding 120.667-112 chr22 16928133 16928392 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 79960 NR_159481 128954 Hs.434113 NM_001037814 ENSG00000215568 GAB4 - GRB2 associated binding protein family member 4 protein-coding 153.667-23 chr1 183942313 183942664 + 0.666667 NA intron (NM_015101, intron 10 of 11) Charlie5|DNA|hAT-Charlie 95240 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 115.667-63 chr12 131173825 131174060 + 0.666667 NA intron (NR_026670, intron 1 of 4) MER75|DNA|PiggyBac 8931 NR_026670 116437 Hs.675497 NR_026670 ENSG00000204603 LINC01257 - long intergenic non-protein coding RNA 1257 ncRNA 126-22 chr12 66334801 66335038 + 0.666667 NA intron (NM_001370285, intron 12 of 12) L2a|LINE|L2 32374 NR_135081 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 152-77 chr18 55286732 55287034 + 0.666667 NA intron (NM_001243228, intron 8 of 19) intron (NM_001243228, intron 8 of 19) 15777 NM_001243236 6925 Hs.605153 NM_003199 ENSG00000196628 TCF4 E2-2|FECD3|ITF-2|ITF2|PTHS|SEF-2|SEF2|SEF2-1|SEF2-1A|SEF2-1B|SEF2-1D|TCF-4|bHLHb19 transcription factor 4 protein-coding 120-34 chr12 94512073 94512409 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49548 NR_049885 100847031 NR_049885 ENSG00000266099 MIR5700 - microRNA 5700 ncRNA 140.333-184 chr5 77413748 77414025 + 0.666667 NA intron (NM_001029851, intron 14 of 18) intron (NM_001029851, intron 14 of 18) 78430 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 120-84 chr3 27437389 27437615 + 0.666667 NA non-coding (NR_135544, exon 4 of 25) non-coding (NR_135544, exon 4 of 25) 19276 NM_001258380 9497 Hs.250072 NM_003615 ENSG00000033867 SLC4A7 NBC2|NBC3|NBCN1|SBC2|SLC4A6 solute carrier family 4 member 7 protein-coding 159.667-214 chr3 85559281 85559616 + 0.666667 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) 54389 NM_001256505 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 159-111 chr7 88464119 88464459 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -157395 NM_001205316 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 150.333-16 chr1 152377279 152377586 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -17426 NM_001014342 388698 Hs.156124 NM_001014342 ENSG00000143520 FLG2 IFPS|PSS6 filaggrin family member 2 protein-coding 203.667-104 chr6 45839193 45839641 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 98180 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 181.667-153 chr9 69564628 69565142 + 0.666667 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) L1M3|LINE|L1 107486 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 128.333-171 chr6 64736404 64736630 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -564901 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 113.667-199 chr7 90222834 90223053 + 0.666667 NA intron (NM_001244944, intron 2 of 5) intron (NM_001244944, intron 2 of 5) 9123 NM_001040666 261729 Hs.489051 NM_152999 ENSG00000157214 STEAP2 IPCA1|PCANAP1|PUMPCn|STAMP1|STMP STEAP2 metalloreductase protein-coding 115.667-2 chr1 42351502 42351758 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -15750 NM_001198850 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 157.333-217 chr20 51400638 51400949 + 0.666667 NA intron (NM_012340, intron 9 of 10) MIRb|SINE|MIR 52184 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 120.333-32 chr11 37482597 37482956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -455825 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 114-161 chr8 27548484 27548655 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 57426 NM_001256484 2053 Hs.212088 NM_001979 ENSG00000120915 EPHX2 ABHD20|CEH|SEH epoxide hydrolase 2 protein-coding 161-33 chr17 12517707 12518184 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -32023 NR_034145 284034 Hs.376614 NR_034144 ENSG00000179136 LINC00670 - long intergenic non-protein coding RNA 670 ncRNA 148.667-153 chr17 8228791 8229148 + 0.666667 NA intron (NR_046431, intron 19 of 21) intron (NR_046431, intron 19 of 21) -4926 NR_026951 284029 Hs.121692 NM_173621 ENSG00000178977 LINC00324 C17orf44|NCRNA00324 long intergenic non-protein coding RNA 324 ncRNA 122.667-53 chr14 69931841 69932109 + 0.666667 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) -46158 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 204-71 chr16 23161076 23161550 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12043 NM_020718 57478 Hs.183817 NM_020718 ENSG00000103404 USP31 - ubiquitin specific peptidase 31 protein-coding 155.333-183 chr2 163656924 163657371 + 0.666667 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 78861 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 160-80 chr3 170081737 170082114 + 0.666667 NA intron (NM_014373, intron 3 of 3) L1PREC2|LINE|L1 43930 NM_014373 26996 Hs.231320 NM_014373 ENSG00000173890 GPR160 GPCR1|GPCR150 G protein-coupled receptor 160 protein-coding 162.333-279 chrX 13148157 13148613 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103765 NM_174901 171484 Hs.667546 NM_174901 ENSG00000187268 FAM9C TEX39C family with sequence similarity 9 member C protein-coding 154.667-256 chr3 155485358 155485673 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_146955) promoter-TSS (NR_146955) -288 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 216.333-52 chr15 93837581 93838194 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18673 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 159.333-237 chr4 62676076 62676482 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -514514 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 140-47 chr16 53690326 53690738 + 0.666667 NA intron (NM_001127897, intron 4 of 24) FLAM_A|SINE|Alu 13327 NM_015272 23322 Hs.298382 NM_015272 ENSG00000103494 RPGRIP1L CORS3|FTM|JBTS7|MKS5|NPHP8|PPP1R134 RPGRIP1 like protein-coding 164.667-172 chr4 113687637 113688007 + 0.666667 NA intron (NM_001321585, intron 2 of 19) intron (NM_001321585, intron 2 of 19) 73916 NM_001321592 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 166.333-83 chr15 90864893 90865329 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3477 NM_002569 5045 Hs.513153 NM_002569 ENSG00000140564 FURIN FUR|PACE|PCSK3|SPC1 furin, paired basic amino acid cleaving enzyme protein-coding 174.667-18 chr1 240797287 240797657 + 0.666667 NA intron (NM_001350116, intron 16 of 16) AluSq2|SINE|Alu -185317 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 121-127 chr6 161275237 161275511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1313 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 151.667-162 chr2 39056093 39056399 + 0.666667 NA intron (NM_005633, intron 4 of 22) AluSx3|SINE|Alu 64217 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 125.667-156 chr5 113707002 113707303 + 0.666667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 193458 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 145.333-277 chr7 79735325 79735586 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 281495 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 142.667-152 chr4 41568314 41568687 + 0.666667 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) intron (NM_001330786, intron 1 of 22) 30343 NM_001330786 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 209.333-70 chr14 101554861 101555282 + 0.666667 NA intron (NR_152588, intron 1 of 1) intron (NR_152588, intron 1 of 1) 5351 NR_152591 64150 Hs.525597 NR_002770 ENSG00000258498 DIO3OS C14orf134|DIO3-AS1|DIO3-OS|NCRNA00041 DIO3 opposite strand upstream RNA ncRNA 167.333-151 chr20 14416204 14416510 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -78690 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 154-60 chr15 70975806 70976242 + 0.666667 NA intron (NM_017691, intron 9 of 15) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 83581 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 196-156 chr6 51494370 51494692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127339 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 116.667-119 chr22 27951270 27951549 + 0.666667 NA intron (NR_026963, intron 2 of 4) L1MA7|LINE|L1 -30797 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 147.333-215 chr3 96018761 96019076 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -335725 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 135.333-199 chr8 119302159 119302461 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -22861 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 133.333 chr1 8581058 8581297 + 0.666667 NA intron (NM_001042681, intron 4 of 22) L1ME2z|LINE|L1 -86264 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 114.333-219 chr8 68784943 68785142 + 0.666667 NA intron (NR_146187, intron 11 of 13) L1MC3|LINE|L1 319148 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 134.333-62 chr15 70173900 70174176 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76121 NM_001282980 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 117.667-71 chr17 56862453 56862749 + 0.666667 NA intron (NM_003647, intron 11 of 11) intron (NM_003647, intron 11 of 11) 22312 NR_027025 246754 Hs.720736 NR_027025 MTVR2 - mouse mammary tumor virus receptor homolog 2 pseudo 154.667-250 chr3 115111813 115112158 + 0.666667 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) 11562 NR_046877 100874131 NR_046877 ENSG00000242767 ZBTB20-AS4 - ZBTB20 antisense RNA 4 ncRNA 149-73 chr20 4928449 4928749 + 0.666667 NA intron (NM_005116, intron 3 of 16) intron (NM_005116, intron 3 of 16) 72911 NM_005116 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 116-103 chr3 36751963 36752157 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -12199 NM_033403 85443 Hs.631907 NM_033403 ENSG00000163673 DCLK3 CLR|DCAMKL3|DCDC3C|DCK3 doublecortin like kinase 3 protein-coding 111.667-181 chr4 31181444 31181716 + 0.666667 NA intron (NR_125935, intron 2 of 4) intron (NR_125935, intron 2 of 4) 10436 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 129.333-109 chr21 16890660 16891037 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 300611 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 166.333-157 chr3 101350658 101351009 + 0.666667 NA intron (NM_020654, intron 12 of 23) intron (NM_020654, intron 12 of 23) -30258 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 172.667-6 chr1 47254574 47254927 + 0.666667 NA intron (NM_001282938, intron 18 of 18) AluJb|SINE|Alu -22415 NM_001290403 6886 Hs.705618 NM_003189 ENSG00000162367 TAL1 SCL|TCL5|bHLHa17|tal-1 TAL bHLH transcription factor 1, erythroid differentiation factor protein-coding 149.333-383 chr8 8940562 8940897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47099 NM_004225 9258 Hs.379414 NM_004225 ENSG00000147324 MFHAS1 LRRC65|MASL1|ROCO4 malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 protein-coding 116-163 chr9 84541825 84542071 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -126510 NM_006180 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 121.333-81 chr2 42494437 42494756 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001282755) promoter-TSS (NM_001282755) 27 NM_001282755 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 156.667-357 chr9 73539631 73540001 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 387951 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 141.333-117 chr2 127550312 127550723 + 0.666667 NA intron (NM_001080527, intron 1 of 46) AluSz6|SINE|Alu 14715 NM_001080527 4648 Hs.154578 NM_183371 ENSG00000169994 MYO7B - myosin VIIB protein-coding 142.667-222 chr8 100366246 100366523 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16379 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 161.667-263 chr8 131602175 131602595 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -301708 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 155.333-53 chr11 74437735 74438053 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29661 NM_005472 10008 Hs.523899 NM_005472 ENSG00000175538 KCNE3 BRGDA6|HOKPP|HYPP|MiRP2 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 3 protein-coding 201.333-222 chr5 24771633 24772031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 68751 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 180-102 chr7 83148409 83148753 + 0.666667 NA intron (NM_033026, intron 2 of 24) intron (NM_033026, intron 2 of 24) 14303 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 120.667-158 chr7 38615438 38615679 + 0.666667 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) intron (NM_001635, intron 1 of 20) 15815 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 138.333-166 chr6 57247509 57247801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15691 NR_109774 100506188 Hs.485640 NR_109774 LOC100506188 - uncharacterized LOC100506188 ncRNA 117-28 chr11 19147888 19148135 + 0.666667 NA intron (NM_019028, intron 4 of 16) intron (NM_019028, intron 4 of 16) 30843 NM_019028 54503 Hs.188569 NM_019028 ENSG00000177054 ZDHHC13 HIP14L|HIP3RP zinc finger DHHC-type containing 13 protein-coding 146.333-46 chr11 27984433 27984705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72246 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 165.667-62 chr15 77333526 77333876 + 0.666667 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) L1MC|LINE|L1 86403 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 115.667-26 chr10 56382042 56382290 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -20893 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 160.667-93 chr14 70661798 70662165 + 0.666667 NA intron (NM_015351, intron 1 of 2) LTR104_Mam|LTR|Gypsy 20065 NM_015351 23508 Hs.79170 NM_015351 ENSG00000133985 TTC9 TTC9A tetratricopeptide repeat domain 9 protein-coding 170.667-58 chr15 69200271 69200741 + 0.666667 NA intron (NM_001324094, intron 2 of 5) intron (NM_001324094, intron 2 of 5) 39871 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 142-32 chr13 22983356 22983659 + 0.666667 NA Intergenic MER11D|LTR|ERVK -67138 NR_138043 100996930 Hs.380803 NR_138043 LINC00621 - long intergenic non-protein coding RNA 621 ncRNA 148.333-398 chr8 125056597 125056933 + 0.666667 NA exon (NM_001330609, exon 15 of 28) exon (NM_001330609, exon 15 of 28) 35027 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 199.667-96 chr3 126457747 126458179 + 0.666667 NA TTS (NM_001040653) TTS (NM_001040653) 17928 NR_104249 79364 Hs.440049 NM_025112 ENSG00000070476 ZXDC ZXDL ZXD family zinc finger C protein-coding 155.333-298 chr5 78321182 78321586 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26629 NM_003664 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 134.667-174 chr6 106954071 106954332 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19838 NM_001291739 100133941 Hs.644105 NM_013230 ENSG00000272398 CD24 CD24A CD24 molecule protein-coding 205.667-47 chr14 63961217 63961684 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 8 of 114) intron (NM_015180, intron 8 of 114) 108446 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 168.667-3 chr1 43085300 43085788 + 0.666667 NA Intergenic LTR7|LTR|ERV1 -62360 NM_001101376 440585 Hs.657614 NM_001101376 ENSG00000186973 FAM183A - family with sequence similarity 183 member A protein-coding 163.667-61 chr14 69439806 69440264 + 0.666667 NA intron (NM_001330185, intron 2 of 5) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 41343 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 175.667-5 chr1 103792955 103793345 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 43309 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 123-132 chr9 6765245 6765552 + 0.666667 NA intron (NR_148680, intron 1 of 21) L2c|LINE|L2 8048 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 233.667-36 chr2 31414843 31415421 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_000379) promoter-TSS (NM_000379) -390 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 117.333-205 chr8 62561894 62562143 + 0.666667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 313164 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 114.667-100 chr16 68956205 68956511 + 0.666667 NA intron (NM_024562, intron 14 of 17) intron (NM_024562, intron 14 of 17) 112827 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 124.667-88 chr17 79551949 79552271 + 0.666667 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) intron (NM_001350451, intron 1 of 14) -35962 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 152-146 chr7 64670222 64670497 + 0.666667 NA intron (NM_016220, intron 2 of 6) MER92B|LTR|ERV1 4226 NR_104149 51427 Hs.50216 NM_016220 ENSG00000196247 ZNF107 Y8|ZFD25|ZNF588|smap-7 zinc finger protein 107 protein-coding 173-37 chr18 4155523 4155883 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) intron (NM_001242761, intron 1 of 11) -108899 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 123-104 chr5 161784102 161784337 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -62972 NM_000806 2554 Hs.175934 NM_000806 ENSG00000022355 GABRA1 ECA4|EIEE19|EJM|EJM5 gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit protein-coding 131.667-132 chr3 101241871 101242198 + 0.666667 NA intron (NM_016247, intron 14 of 18) AluSq2|SINE|Alu 78541 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 124.667-169 chr5 81065490 81065779 + 0.666667 NA intron (NM_006909, intron 2 of 26) HAL1ME|LINE|L1 -104727 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 124.333-46 chr14 40639129 40639492 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -315401 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 153-157 chrUn_KI270589v1 43698 44027 + 0.666667 NA NA (CATTC)n|Satellite|Satellite NA NA 113-102 chr2 46486825 46487120 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7407 NM_001145051 388946 Hs.733348 NM_001145051 ENSG00000284701 TMEM247 - transmembrane protein 247 protein-coding 173.333-3 chr1 15648010 15648515 + 0.666667 NA intron (NM_032341, intron 6 of 9) intron (NM_032341, intron 6 of 9) -11451 NM_006511 6248 Hs.239459 NM_006511 ENSG00000215695 RSC1A1 RS1 regulator of solute carriers 1 protein-coding 132.333-135 chr5 126184001 126184350 + 0.666667 NA intron (NR_105042, intron 1 of 3) intron (NR_105042, intron 1 of 3) 4598 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 145-44 chr19 30506167 30506517 + 0.666667 NA intron (NM_014717, intron 2 of 4) intron (NM_014717, intron 2 of 4) 133958 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 176-87 chr7 54051580 54051982 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -239850 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 131.667-77 chr17 72226661 72226906 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 105763 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 131-55 chr20 42095861 42096132 + 0.666667 NA intron (NM_133170, intron 28 of 31) intron (NM_133170, intron 28 of 31) -477619 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 135-77 chr4 65333178 65333427 + 0.666667 NA intron (NM_001281767, intron 16 of 16) L2a|LINE|L2 -328802 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 113-78 chr16 61592246 61592487 + 0.666667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 444072 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 166.333-210 chr7 38653097 38653548 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -21755 NM_139316 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 149.667-243 chr21 34367944 34368231 + 0.666667 NA intron (NM_172201, intron 1 of 1) L2b|LINE|L2 4063 NM_172201 9992 Hs.551521 NM_172201 ENSG00000159197 KCNE2 ATFB4|LQT5|LQT6|MIRP1 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 2 protein-coding 126.667-169 chr7 88187109 88187313 + 0.666667 NA intron (NM_001324419, intron 30 of 31) intron (NM_001324419, intron 30 of 31) -29449 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 121-122 chr6 23476643 23476859 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -649464 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 147.333-96 chr14 29287812 29288099 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -502168 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 112-103 chr2 49759692 49759937 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 214389 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 131.667-79 chr18 8645753 8646033 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 36448 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 257.333-85 chr6 2102191 2102807 + 0.666667 NA intron (NM_001253846, intron 4 of 10) intron (NM_001253846, intron 4 of 10) 73492 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 220.333-97 chr4 26672760 26673265 + 0.666667 NA intron (NM_001292054, intron 7 of 17) intron (NM_001292054, intron 7 of 17) 88928 NM_018317 55296 Hs.479403 NM_018317 ENSG00000109680 TBC1D19 - TBC1 domain family member 19 protein-coding 204.333-205 chr8 141617233 141617706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -110239 NM_207414 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 126.667-33 chr12 32760471 32760781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4729 NM_001040436 51067 Hs.505231 NM_015936 ENSG00000139131 YARS2 CGI-04|MLASA2|MT-TYRRS|TYRRS tyrosyl-tRNA synthetase 2 protein-coding 158.333-238 chr4 109044343 109044667 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 4 of 36) intron (NM_198721, intron 4 of 36) 258153 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 146.667-186 chr2 206777528 206777826 + 0.666667 NA intron (NM_001136193, intron 7 of 11) L1MB1|LINE|L1 -5557 NR_036078 100423002 NR_036078 ENSG00000263468 MIR3130-2 MIR3130-4|mir-3130-2 microRNA 3130-2 ncRNA 161.667-140 chr2 150029309 150029656 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -170291 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 130.333-93 chr17 71464598 71464910 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -262575 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 165.667-106 chr20 35257128 35257462 + 0.666667 NA intron (NM_006690, intron 4 of 8) intron (NM_006690, intron 4 of 8) 20827 NM_001355003 101410538 Hs.356273 NM_001355003 ENSG00000126005 MMP24OS MMP24-AS1 MMP24 opposite strand protein-coding 161.333-33 chr10 64805960 64806366 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -19365 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 125-103 chr6 136218459 136218786 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31689 NM_138419 113115 Hs.121536 NM_138419 ENSG00000146410 MTFR2 DUFD1|FAM54A mitochondrial fission regulator 2 protein-coding 120-68 chr2 82481755 82482025 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -374913 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 129.667-43 chr12 128405946 128406288 + 0.666667 NA intron (NM_001136103, intron 1 of 8) intron (NM_001136103, intron 1 of 8) 112025 NR_037406 100500817 NR_037406 ENSG00000265635 MIR3612 - microRNA 3612 ncRNA 118-2 chr1 108739462 108739729 + 0.666667 NA intron (NM_001144937, intron 11 of 12) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -7079 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 164-53 chr2 19779442 19779769 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -89249 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 162.333-46 chr11 126495850 126496249 + 0.666667 NA intron (NM_001301097, intron 4 of 15) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 89962 NM_001254759 6484 Hs.591947 NM_006278 ENSG00000110080 ST3GAL4 CGS23|NANTA3|SAT3|SIAT4|SIAT4C|ST-4|ST3GalA.2|ST3GalIV|STZ|gal-NAc6S ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4 protein-coding 149.333-274 chr4 42274386 42274741 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 116705 NR_134668 105374428 Hs.245131 NR_134668 ENSG00000250781 LOC105374428 - uncharacterized LOC105374428 ncRNA 177.666-4 chr12 115866904 115867434 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 281485 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 123-120 chr8 50663814 50664009 + 0.666667 NA intron (NR_135797, intron 17 of 20) L2|LINE|L2 499780 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 138.333-111 chr20 61180298 61180667 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -71779 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 128.667-160 chr6 75300455 75300818 + 0.666667 NA intron (NM_001300866, intron 6 of 6) intron (NM_001300866, intron 6 of 6) 15622 NR_040081 100506804 Hs.743708 NR_040081 LOC100506804 - uncharacterized LOC100506804 ncRNA 150-133 chr7 87995421 87995713 + 0.666667 NA intron (NM_001324421, intron 3 of 28) MER5A|DNA|hAT-Charlie 61316 NM_001324417 53616 Hs.256398 NM_004194 ENSG00000008277 ADAM22 ADAM 22|EIEE61|MDC2 ADAM metallopeptidase domain 22 protein-coding 111.667-78 chr14 20126861 20127169 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 9547 NM_001004715 390436 NM_001004715 ENSG00000176230 OR4K17 OR14-29 olfactory receptor family 4 subfamily K member 17 protein-coding 190.333-51 chr15 66978450 66978773 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -22096 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 118.333-170 chr5 127875417 127875712 + 0.666667 NA exon (NM_001317938, exon 6 of 7) exon (NM_001317938, exon 6 of 7) 172175 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 130.667-78 chr16 13134076 13134380 + 0.666667 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) MIR|SINE|MIR 232630 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 237-57 chr5 26091877 26092364 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 901167 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 141.667-162 chr4 62377927 62378196 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -216296 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 157.667-291 chr7 14744005 14744398 + 0.666667 NA intron (NM_001350724, intron 3 of 24) MER41-int|LTR|ERV1 97249 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 120-123 chr6 71215251 71215461 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73455 NM_024576 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 273.667-13 chr10 79239269 79239787 + 0.666667 NA intron (NM_020338, intron 7 of 24) intron (NM_020338, intron 7 of 24) -107941 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 254.333-76 chr7 4652033 4652532 + 0.666667 NA Intergenic (TCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -30013 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 142-13 chr1 229631753 229632116 + 0.666667 NA intron (NM_014777, intron 2 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 5687 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 137.333-37 chr12 121170867 121171107 + 0.666667 NA intron (NR_033953, intron 7 of 10) intron (NR_033953, intron 7 of 10) 38111 NR_033950 5027 Hs.439682 NM_002562 ENSG00000089041 P2RX7 P2X7 purinergic receptor P2X 7 protein-coding 130.333-129 chr3 44656152 44656515 + 0.666667 NA intron (NM_003420, intron 3 of 3) intron (NM_003420, intron 3 of 3) 7601 NM_003420 7584 Hs.288658 NM_003420 ENSG00000169981 ZNF35 HF.10|HF10|Zfp105 zinc finger protein 35 protein-coding 173.667-151 chr6 54377057 54377429 + 0.666667 NA intron (NM_014464, intron 9 of 10) AluSz|SINE|Alu 68802 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 414.666-13 chr6 35366569 35367567 + 0.666667 NA intron (NM_001171819, intron 2 of 6) intron (NM_001171819, intron 2 of 6) 24510 NM_006238 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 217-19 chr14 40046119 40046747 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -613933 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 128-100 chr6 161334682 161335013 + 0.666667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -60786 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 133.333-113 chr3 136293587 136293872 + 0.666667 NA intron (NM_000532, intron 6 of 14) intron (NM_000532, intron 6 of 14) 43389 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 197.667-136 chr6 122611201 122611641 + 0.666667 NA intron (NM_181795, intron 1 of 4) (AAAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1016 NM_181795 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 176.667-73 chr2 10351784 10352082 + 0.666667 NA intron (NM_001258357, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu -16745 NM_001258358 3241 Hs.580427 NM_002149 ENSG00000115756 HPCAL1 BDR1|HLP2|VILIP-3 hippocalcin like 1 protein-coding 219.667-39 chr2 63973473 63973904 + 0.666667 NA intron (NM_001005739, intron 3 of 22) AluJr4|SINE|Alu 45740 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 119.333-96 chr15 68863712 68864008 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -42965 NM_006305 8125 Hs.458747 NM_006305 ENSG00000140350 ANP32A C15orf1|HPPCn|I1PP2A|LANP|MAPM|PHAP1|PHAPI|PP32 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A protein-coding 153-112 chr5 58108331 58108647 + 0.666667 NA intron (NR_104669, intron 4 of 4) intron (NR_104669, intron 4 of 4) 13852 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 164-28 chr12 39822893 39823237 + 0.666667 NA intron (NR_135051, intron 18 of 18) intron (NR_135051, intron 18 of 18) 196882 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 177.667-63 chr17 52371111 52371526 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -19204 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 250.333-11 chr11 47125507 47126236 + 0.666667 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) AluSz6|SINE|Alu 51008 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 270-20 chr17 44436405 44437016 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001304943, exon 1 of 5) 5' UTR (NM_001304943, exon 1 of 5) 141 NM_001304943 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 245.667-66 chr7 86564671 86565241 + 0.666667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -78953 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 111.667-265 chr9 3687114 3687305 + 0.666667 NA intron (NR_121586, intron 3 of 4) intron (NR_121586, intron 3 of 4) 19123 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 168.667-57 chr14 36251879 36252362 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 68517 NM_016586 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 152.667-151 chr18 36112655 36112956 + 0.666667 NA intron (NM_012319, intron 7 of 9) intron (NM_012319, intron 7 of 9) 16535 NM_012319 25800 Hs.79136 NM_012319 ENSG00000141424 SLC39A6 LIV-1|ZIP6 solute carrier family 39 member 6 protein-coding 141.667-68 chr13 102805576 102805933 + 0.666667 NA intron (NM_017693, intron 2 of 10) L1MB8|LINE|L1 -1392 NM_001204425 100533467 Hs.258429 NM_001204425 ENSG00000134899 BIVM-ERCC5 ERCC5-202 BIVM-ERCC5 readthrough protein-coding 150.667-174 chr2 55447698 55448004 + 0.666667 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -27995 NM_018084 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 195-71 chr3 46010581 46011051 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -14992 NM_024513 79443 Hs.200227 NM_024513 ENSG00000163820 FYCO1 CATC2|CTRCT18|RUFY3|ZFYVE7 FYVE and coiled-coil domain containing 1 protein-coding 120.333-46 chr13 33119875 33120104 + 0.666667 NA intron (NM_178007, intron 7 of 13) intron (NM_178007, intron 7 of 13) 66102 NM_178007 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 140.667-114 chr2 43491652 43492043 + 0.666667 NA intron (NM_001083953, intron 25 of 37) intron (NM_001083953, intron 25 of 37) 104127 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 246.667-11 chr10 10321188 10321757 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 140877 NR_120637 101928322 Hs.576789 NR_120637 ENSG00000270111 CELF2-DT - CELF2 divergent transript ncRNA 129.667-26 chr10 56263497 56263735 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 97643 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 201-118 chr9 94252072 94252579 + 0.666667 NA intron (NR_160773, intron 1 of 2) L1MDa|LINE|L1 -6941 NM_003448 169841 Hs.387623 NM_003448 ENSG00000175787 ZNF169 - zinc finger protein 169 protein-coding 137.333-29 chr11 88149060 88149321 + 0.666667 NA intron (NM_022337, intron 2 of 2) intron (NM_022337, intron 2 of 2) 26253 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 161-70 chr4 106958990 106959458 + 0.666667 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) intron (NM_014421, intron 1 of 3) 77089 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 140.333-178 chr5 39314155 39314498 + 0.666667 NA intron (NM_001737, intron 6 of 10) AluSp|SINE|Alu -43677 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 183.333-168 chr9 22637276 22637672 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8726 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 211.667-20 chr10 62062238 62062714 + 0.666667 NA intron (NM_001244638, intron 4 of 6) intron (NM_001244638, intron 4 of 6) 13119 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 149-119 chr5 129076683 129076975 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -17920 NM_016048 51015 Hs.483296 NM_016048 ENSG00000066583 ISOC1 CGI-111 isochorismatase domain containing 1 protein-coding 113-105 chr2 75014754 75014998 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 56233 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 140-12 chr1 169435572 169435845 + 0.666667 NA intron (NM_001300968, intron 2 of 6) intron (NM_001300968, intron 2 of 6) -8234 NM_001300969 57821 Hs.567557 NM_021179 ENSG00000117477 CCDC181 C1orf114 coiled-coil domain containing 181 protein-coding 159.333-264 chr5 33615573 33616012 + 0.666667 NA intron (NM_001324512, intron 13 of 21) intron (NM_001324512, intron 13 of 21) 175016 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 122-34 chr14 68671974 68672262 + 0.666667 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) -43331 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 194.667-91 chr3 26284528 26284986 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -338049 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 161-21 chr14 47976637 47977031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -181820 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 157-130 chr8 61079305 61079623 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111716 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 112.333-3 chr1 32555281 32555495 + 0.666667 NA intron (NR_111980, intron 2 of 3) AluY|SINE|Alu 15961 NR_111980 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 125.333-128 chr4 103147518 103147822 + 0.666667 NA intron (NM_001813, intron 28 of 48) intron (NM_001813, intron 28 of 48) -47836 NM_020139 56898 Hs.124696 NM_020139 ENSG00000164039 BDH2 DHRS6|EFA6R|PRO20933|SDR15C1|UCPA-OR|UNQ6308 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 2 protein-coding 155.333-190 chr2 198594715 198595030 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219775 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 141.333-51 chr13 20026439 20026726 + 0.666667 NA intron (NM_197968, intron 7 of 24) intron (NM_197968, intron 7 of 24) 66768 NR_148365 7750 Hs.507433 NM_003453 ENSG00000121741 ZMYM2 FIM|MYM|RAMP|SCLL|ZNF198 zinc finger MYM-type containing 2 protein-coding 149.333-205 chr2 186903194 186903510 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54182 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 116.333-108 chr2 24940246 24940504 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20138 NM_001320613 109 Hs.467898 NM_004036 ENSG00000138031 ADCY3 AC-III|AC3|BMIQ19 adenylate cyclase 3 protein-coding 153-131 chr7 93960515 93960854 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 38949 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 165-50 chr21 29411742 29412083 + 0.666667 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 39411 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 161.667-235 chr7 7156713 7157086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25716 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 128.667-184 chr8 97993547 97993853 + 0.666667 NA intron (NM_001317748, intron 6 of 17) intron (NM_001317748, intron 6 of 17) 48517 NR_002581 26775 Hs.684855 NR_002581 ENSG00000207067 SNORA72 RNU72|U72 small nucleolar RNA, H/ACA box 72 snoRNA 127.333-172 chr7 45235526 45235829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 77886 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 129.667-185 chr9 85492659 85492987 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 249206 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 202.333-166 chr7 111881117 111881657 + 0.666667 NA intron (NM_001363540, intron 16 of 52) L1MA2|LINE|L1 72882 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 134.333-104 chr21 31951255 31951642 + 0.666667 NA intron (NM_014586, intron 4 of 10) intron (NM_014586, intron 4 of 10) 78428 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 167.667-201 chr8 15232827 15233198 + 0.666667 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 5419 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 126-125 chr9 105537053 105537415 + 0.666667 NA intron (NM_001287191, intron 12 of 13) intron (NM_001287191, intron 12 of 13) 17410 NR_104269 26134 Hs.113150 NR_104269 ENSG00000229419 RALGAPA1P1 GARNL2|GARNL2P|RALGAPA1P|bA235C23.1 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1 pseudogene 1 pseudo 123.667-162 chr5 104996487 104996721 + 0.666667 NA Intergenic (AATATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -102870 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 146.667-135 chr17 40782879 40783173 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_181537) promoter-TSS (NM_181537) -476 NM_181537 342574 Hs.59363 NM_181537 ENSG00000171446 KRT27 K25IRS3|KRT25C keratin 27 protein-coding 134.333-73 chr17 52871095 52871423 + 0.666667 NA intron (NR_146899, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 9138 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 137.667-44 chr12 51138219 51138494 + 0.666667 NA intron (NM_005653, intron 1 of 14) AluSz|SINE|Alu 34779 NM_005653 7024 Hs.48849 NM_005653 ENSG00000135457 TFCP2 LBP1C|LSF|LSF1D|SEF|TFCP2C transcription factor CP2 protein-coding 202.667-21 chr10 87749361 87749714 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 68694 NM_001321968 84896 Hs.435948 NM_032810 ENSG00000138138 ATAD1 AFDC1|FNP001|HKPX4|THORASE ATPase family AAA domain containing 1 protein-coding 131.333-48 chr13 111221274 111221608 + 0.666667 NA intron (NM_001330597, intron 5 of 18) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18381 NM_001320853 8874 Hs.508738 NM_003899 ENSG00000102606 ARHGEF7 BETA-PIX|COOL-1|COOL1|Nbla10314|P50|P50BP|P85|P85COOL1|P85SPR|PAK3|PIXB Rho guanine nucleotide exchange factor 7 protein-coding 140.333-73 chr15 68696142 68696437 + 0.666667 NA intron (NM_006091, intron 3 of 11) AluSz|SINE|Alu 54786 NM_001324015 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 168.333-16 chr1 244596984 244597475 + 0.666667 NA intron (NM_001130957, intron 17 of 21) L2|LINE|L2 -55819 NR_123736 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 196-57 chr15 87721303 87721876 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 144660 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 115.667-205 chr8 41891908 41892098 + 0.666667 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) MamRep4096|DNA|hAT-Tip100 4738 NM_001142446 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 152.667-310 chr5 158129751 158130151 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -270806 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 165.333-177 chr3 120434317 120434805 + 0.666667 NA intron (NM_007085, intron 2 of 10) MER103C|DNA|hAT-Charlie 16431 NM_007085 11167 Hs.269512 NM_007085 ENSG00000163430 FSTL1 FRP|FSL1|MIR198|OCC-1|OCC1|tsc36 follistatin like 1 protein-coding 117.667-195 chr8 108156920 108157204 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -73442 NM_178565 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 138.667-39 chr12 1521390 1521757 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 10619 NR_160736 107984507 NR_160736 LOC107984507 - uncharacterized LOC107984507 ncRNA 155-135 chr9 112437813 112438198 + 0.666667 NA intron (NR_036651, intron 5 of 9) AluSx3|SINE|Alu -48822 NM_133465 158405 Hs.656619 NM_133465 ENSG00000165185 KIAA1958 - KIAA1958 protein-coding 114.667-154 chr20 39165843 39166086 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 58784 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 163-24 chr14 81419234 81419686 + 0.666667 NA intron (NM_001366850, intron 2 of 7) intron (NM_001366850, intron 2 of 7) 8315 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 114.333-87 chr17 59130931 59131196 + 0.666667 NA intron (NM_182620, intron 2 of 3) intron (NM_182620, intron 2 of 3) 6809 NR_030411 768216 NR_030411 ENSG00000211514 MIR454 MIRN454|hsa-mir-454|mir-454 microRNA 454 ncRNA 205-13 chr10 48224783 48225325 + 0.666667 NA intron (NM_001018071, intron 10 of 28) intron (NM_001018071, intron 10 of 28) 26703 NM_001318191 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 144.333-124 chr2 68741250 68741533 + 0.666667 NA intron (NM_001364821, intron 1 of 10) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 6014 NM_001364821 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 119.667-142 chr5 20124648 20124957 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -136602 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 269.333-68 chr4 164824275 164825052 + 0.666667 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -52515 NM_001297550 100506013 Hs.105196 NM_001297550 ENSG00000248329 APELA ELA|Ende|tdl apelin receptor early endogenous ligand protein-coding 205.333-235 chr8 59000283 59000789 + 0.666667 NA intron (NM_014729, intron 1 of 8) intron (NM_014729, intron 1 of 8) 118611 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 131.667-68 chr16 30951325 30951527 + 0.666667 NA intron (NM_152288, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 2358 NM_152288 93129 Hs.745104 NM_152288 ENSG00000175938 ORAI3 TMEM142C ORAI calcium release-activated calcium modulator 3 protein-coding 188.667-33 chr12 28797753 28798174 + 0.666667 NA Intergenic MER124|DNA?|DNA? -351315 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 118.333-4 chr1 56105848 56106162 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 160918 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 114.667-168 chr22 47483016 47483234 + 0.666667 NA intron (NR_109967, intron 1 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 3986 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 152.333-241 chr3 109924163 109924561 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 321534 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 152-84 chr2 64413363 64413684 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40639 NM_014181 29094 Hs.372208 NM_014181 ENSG00000119862 LGALSL GRP|HSPC159 galectin like protein-coding 137.333-27 chr11 82712817 82713089 + 0.666667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 20911 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 234-10 chr11 39012199 39012661 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 363572 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 139.667-181 chr8 41642702 41642951 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4533 NM_152568 157848 NM_152568 ENSG00000165066 NKX6-3 NKX6.3 NK6 homeobox 3 protein-coding 115.667-187 chr6 2017850 2018049 + 0.666667 NA intron (NM_001253846, intron 4 of 10) intron (NM_001253846, intron 4 of 10) 158042 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 117-31 chr11 36294505 36294725 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -1673 NM_001160167 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 119.333-64 chr12 5408398 5408679 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -23570 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 128.333-168 chr6 37937281 37937485 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) AluSc5|SINE|Alu 117656 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 235.667-72 chrX 69542315 69542768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37306 NM_015686 27112 Hs.87619 NM_015686 ENSG00000130054 FAM155B CXorf63|TED|TMEM28|bB57D9.1 family with sequence similarity 155 member B protein-coding 136.333-3 chr1 44611986 44612291 + 0.666667 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) 58918 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 207-22 chr12 5553453 5553884 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 59536 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 120.667-22 chr10 84401765 84402006 + 0.666667 NA intron (NM_018999, intron 3 of 10) MER54B|LTR|ERVL -23054 NM_001284243 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 126.333-151 chr6 53753661 53753963 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41193 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 173.667-161 chr7 27615667 27616036 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_122122) promoter-TSS (NR_122122) -123 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 146.333-42 chr10_GL383545v1_alt 42147 42514 + 0.666667 NA intron (NR_138082, intron 1 of 1) intron (NR_138082, intron 1 of 1) 39312 NR_138082 101060171 Hs.568842 NR_138082 ARMC4P1 - armadillo repeat containing 4 pseudogene 1 pseudo 150.667-173 chr2 50355275 50355640 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) L2|LINE|L2 -7701 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 122-60 chr2 220690532 220690853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -784127 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 208-82 chr2 130948356 130948813 + 0.666667 NA intron (NM_001367493, intron 4 of 13) intron (NM_001367493, intron 4 of 13) 111670 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 227.667-3 chr1 165238174 165238651 + 0.666667 NA intron (NM_177398, intron 4 of 8) intron (NM_177398, intron 4 of 8) 117829 NM_001174069 4009 Hs.667312 NM_177398 ENSG00000162761 LMX1A LMX1|LMX1.1 LIM homeobox transcription factor 1 alpha protein-coding 170.333-54 chr12 27836306 27836807 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 56323 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 151.333-231 chr2 192311881 192312181 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117098 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 158.667-118 chr16 82599001 82599407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27765 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 171.667-83 chr2 100421073 100421343 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -3540 NM_004854 9486 Hs.516370 NM_004854 ENSG00000115526 CHST10 HNK-1ST|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 10 protein-coding 119-22 chr10 99021410 99021612 + 0.666667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) -96943 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 145.667-276 chr7 107488939 107489261 + 0.666667 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) intron (NM_181733, intron 6 of 20) 19043 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 235.667-31 chr2 23327390 23327873 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57548 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 227.667-39 chr2 227466169 227466715 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5690 NR_049888 100847081 NR_049888 ENSG00000284092 MIR5703 mir-5703 microRNA 5703 ncRNA 111.667-163 chr22 36746689 36746872 + 0.666667 NA intron (NR_134623, intron 2 of 3) intron (NR_134623, intron 2 of 3) 29339 NR_033531 11020 Hs.415172 NM_006860 ENSG00000100360 IFT27 BBS19|RABL4|RAYL intraflagellar transport 27 protein-coding 121.333-175 chr8 74032962 74033261 + 0.666667 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 41719 NM_015364 23643 Hs.726603 NM_015364 ENSG00000154589 LY96 ESOP-1|MD-2|MD2|ly-96 lymphocyte antigen 96 protein-coding 136-58 chr20 45047963 45048223 + 0.666667 NA intron (NM_006282, intron 10 of 10) intron (NM_006282, intron 10 of 10) 53034 NM_001322799 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 127.333-142 chr5 123126962 123127288 + 0.666667 NA intron (NM_001136239, intron 3 of 7) AluSx|SINE|Alu -36809 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 191-81 chr9 88686783 88687201 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 58913 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 153-104 chr4 70697102 70697373 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7700 NM_001130709 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 135-23 chr12 122530937 122531317 + 0.666667 NA intron (NM_014708, intron 2 of 63) intron (NM_014708, intron 2 of 63) 3878 NM_014708 9735 Hs.300559 NM_014708 ENSG00000184445 KNTC1 ROD kinetochore associated 1 protein-coding 133.667-115 chr4 113885391 113885625 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 94139 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 154.667-127 chr15 69871557 69871885 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36487 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 305-27 chr7 9509809 9510404 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -124164 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 170.333-13 chr1 164146595 164147068 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -412529 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 121.333-189 chr9 21309738 21310032 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4572 NM_002169 3442 Hs.37113 NM_002169 ENSG00000147873 IFNA5 IFN-alpha-5|IFN-alphaG|INA5|INFA5|leIF G interferon alpha 5 protein-coding 138-87 chr4 185474066 185474433 + 0.666667 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 -2516 NM_001145411 256309 Hs.41101 NM_152775 ENSG00000168491 CCDC110 CT52|KM-HN-1|KMHN1 coiled-coil domain containing 110 protein-coding 134.667-61 chr14 63132400 63132792 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -71847 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 265.333-26 chr14 84598605 84599242 + 0.666667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -673009 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 186.333-19 chr10 77538156 77538668 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 99396 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 155-91 chr3 95813307 95813678 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -130299 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 125-35 chr14 51219019 51219312 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21082 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 228.667-27 chr15 75722241 75722775 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1533 NM_175881 161753 Hs.144348 NM_175881 ENSG00000182950 ODF3L1 - outer dense fiber of sperm tails 3 like 1 protein-coding 301-2 chr1 34028307 34028881 + 0.666667 NA intron (NM_052896, intron 3 of 69) intron (NM_052896, intron 3 of 69) 136680 NM_001281956 114784 Hs.656915 NM_052896 ENSG00000121904 CSMD2 dJ1007G16.1|dJ1007G16.2|dJ947L8.1 CUB and Sushi multiple domains 2 protein-coding 143.333-63 chr12 32345843 32346143 + 0.666667 NA intron (NR_148725, intron 8 of 9) AluJb|SINE|Alu -53565 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 144.667-105 chr16 19559204 19559545 + 0.666667 NA intron (NM_001300743, intron 1 of 27) intron (NM_001300743, intron 1 of 27) 3671 NR_158161 57020 Hs.654964 NM_020314 ENSG00000103544 VPS35L C16orf62 VPS35 endosomal protein sorting factor like protein-coding 136.333-183 chr6 118950969 118951251 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -15948 NM_153255 254394 Hs.279008 NM_017696 ENSG00000111877 MCM9 C6orf61|MCMDC1|ODG4|dJ329L24.1|dJ329L24.3 minichromosome maintenance 9 homologous recombination repair factor protein-coding 148.667 chr1 20851183 20851532 + 0.666667 NA exon (NM_001198801, exon 26 of 35) exon (NM_001198801, exon 26 of 35) -64669 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 160.333-61 chr11 71998096 71998385 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_005699) promoter-TSS (NM_005699) -669 NM_001039660 10068 Hs.591967 NM_005699 ENSG00000137496 IL18BP IL18BPa interleukin 18 binding protein protein-coding 204.333-164 chr5 82040087 82040471 + 0.666667 NA intron (NM_031482, intron 2 of 7) L1ME4c|LINE|L1 68256 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 231-17 chr16 5845565 5846007 + 0.666667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -173238 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 123-121 chr8 56347742 56348012 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -27101 NM_001318050 195814 Hs.170673 NM_138969 ENSG00000170786 SDR16C5 EPHD-2|RDH#2|RDH-E2|RDHE2|retSDR2 short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 5 protein-coding 134.333-41 chr12 112056482 112056834 + 0.666667 NA intron (NM_024953, intron 13 of 23) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -18943 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 131.667-31 chr11 8653136 8653375 + 0.666667 NA intron (NM_014818, intron 1 of 19) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 5581 NM_014818 9866 Hs.130836 NM_014818 ENSG00000166436 TRIM66 C11orf29|TIF1D|TIF1DELTA tripartite motif containing 66 protein-coding 195-29 chr12 4661834 4662267 + 0.666667 NA intron (NM_005002, intron 5 of 10) L2a|LINE|L2 12936 NM_005002 4704 Hs.75227 NM_005002 ENSG00000139180 NDUFA9 CC6|CI-39k|CI39k|COQ11|MC1DN26|NDUFS2L|SDR22E1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 protein-coding 150.333-440 chr9 120996899 120997211 + 0.666667 NA intron (NM_001735, intron 21 of 40) intron (NM_001735, intron 21 of 40) -44224 NR_148450 110599590 NR_148450 C5-OT1 C5T1LNCRNA C5 3' UTR overlapping transcript 1 ncRNA 141.667-12 chr1 173106676 173107093 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -55921 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 174.667-121 chr4 30298344 30298792 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -421801 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 113-163 chr4 168065938 168066155 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26491 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 147.667-245 chr3 178890297 178890611 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -30049 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 172.667-104 chr4 39938813 39939277 + 0.666667 NA intron (NM_001100399, intron 2 of 32) intron (NM_001100399, intron 2 of 32) 38866 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 126-68 chr22 39986915 39987116 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7939 NM_138435 113828 Hs.26192 NM_138435 ENSG00000133477 FAM83F - family with sequence similarity 83 member F protein-coding 180-4 chr1 89962850 89963262 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31910 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 115.667-34 chr10 111284362 111284541 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 170160 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 148-59 chr17 71435732 71436147 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -233760 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 122-135 chr9 136072666 136073013 + 0.666667 NA intron (NM_144653, intron 1 of 5) AluSp|SINE|Alu 22450 NM_144653 138151 Hs.112895 NM_144653 ENSG00000148411 NACC2 BEND9|BTBD14|BTBD14A|BTBD31|NAC-2|RBB NACC family member 2 protein-coding 152.333-337 chr6 93430929 93431243 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -11504 NM_001288630 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 147-76 chr2 195046915 195047261 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 316493 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 130.333-69 chr14 84019849 84020081 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -1251967 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 121.333-72 chr17 64498185 64498544 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001320595, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001320595, exon 14 of 14) -1310 NM_007215 11232 Hs.437009 NM_007215 ENSG00000256525 POLG2 HP55|MTPOLB|PEOA4|POLB|POLG-BETA|POLGB DNA polymerase gamma 2, accessory subunit protein-coding 122.667-56 chr14 97223092 97223428 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 68403 NR_146554 105370648 NR_146554 ENSG00000259110 LINC02304 - long intergenic non-protein coding RNA 2304 ncRNA 234.333-52 chr3 113627244 113627631 + 0.666667 NA intron (NR_136285, intron 20 of 20) L2a|LINE|L2 32561 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 142.667-60 chr14 95559046 95559327 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -14376 NR_146450 100506999 Hs.112858 NR_146449 ENSG00000258390 LINC02318 - long intergenic non-protein coding RNA 2318 ncRNA 148.333-52 chr10 84516812 84517154 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001284243, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001284243, exon 8 of 8) 91814 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 131-101 chr8 66526616 66526915 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33199 NM_152765 254778 Hs.268869 NM_152765 ENSG00000169085 VXN C8orf46 vexin protein-coding 131-59 chr21 35068002 35068266 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18836 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 157.667-17 chr1 179576531 179576952 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_014625) promoter-TSS (NM_014625) -789 NM_014625 7827 Hs.412710 NM_014625 ENSG00000116218 NPHS2 PDCN|SRN1 NPHS2 stomatin family member, podocin protein-coding 160.333-37 chr10 30011226 30011555 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48196 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 138.333-44 chr11 129045537 129045813 + 0.666667 NA intron (NM_001142685, intron 9 of 21) intron (NM_001142685, intron 9 of 21) -21487 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 159.333-324 chr8 86901453 86901850 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 2 of 10) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 35236 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 111.667-51 chr11 86201540 86201805 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42712 NM_001330334 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 225.667-43 chr2 203454324 203454824 + 0.666667 NA intron (NM_001329728, intron 11 of 15) intron (NM_001329728, intron 11 of 15) 80727 NM_203365 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 118-51 chr16 81025903 81026080 + 0.666667 NA intron (NM_001100624, intron 8 of 10) AluSx1|SINE|Alu -9851 NM_015251 23300 Hs.16349 NM_015251 ENSG00000166454 ATMIN ASCIZ|ZNF822 ATM interactor protein-coding 151.333-56 chr10 67460512 67460809 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) -57250 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 144.667-41 chr11 55660392 55660626 + 0.666667 NA Intergenic (ATGGTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4658 NM_001004704 219432 Hs.511921 NM_001004704 ENSG00000181903 OR4C6 OR11-138 olfactory receptor family 4 subfamily C member 6 protein-coding 169-52 chr20 13734692 13735081 + 0.666667 NA intron (NM_001276380, intron 9 of 13) MIRc|SINE|MIR 50000 NM_016649 51575 Hs.369284 NM_016649 ENSG00000089048 ESF1 ABTAP|C20orf6|HDCMC28P|bA526K24.1 ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog protein-coding 134.333-44 chr13 99013223 99013473 + 0.666667 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) AluJr4|SINE|Alu 2437 NM_001366678 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 161.333-258 chr7 27364555 27365033 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117565 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 175.333-158 chr6 69375298 69375734 + 0.666667 NA intron (NM_001704, intron 30 of 31) intron (NM_001704, intron 30 of 31) 420950 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 169.333-23 chr10 45620995 45621332 + 0.666667 NA intron (NM_174890, intron 8 of 9) intron (NM_174890, intron 8 of 9) -26257 NM_145021 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 207-14 chr10 97643614 97644094 + 0.666667 NA intron (NM_018425, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 3168 NM_018425 55361 Hs.25300 NM_018425 ENSG00000155252 PI4K2A PI4KII|PIK42A phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha protein-coding 141.667-102 chr18 14913839 14914176 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -32260 NR_104164 400644 Hs.514732 NR_104164 ENSG00000266554 LINC01443 - long intergenic non-protein coding RNA 1443 ncRNA 153-9 chr10 15254447 15254748 + 0.666667 NA intron (NM_001010924, intron 4 of 7) intron (NM_001010924, intron 4 of 7) -85904 NM_004808 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 173-53 chr20 49826203 49826652 + 0.666667 NA intron (NR_048539, intron 3 of 13) intron (NR_048539, intron 3 of 13) 13599 NR_048539 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 154-125 chr6 107969726 107970044 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11677 NM_007214 11231 Hs.26904 NM_007214 ENSG00000025796 SEC63 DNAJC23|ERdj2|PCLD2|PRO2507|SEC63L SEC63 homolog, protein translocation regulator protein-coding 112.333-119 chr2 39001862 39002134 + 0.666667 NA intron (NM_005633, intron 17 of 22) intron (NM_005633, intron 17 of 22) -41654 NR_028386 375196 Hs.659035 NR_028386 ENSG00000269210 LOC375196 - uncharacterized LOC375196 ncRNA 147.667-350 chr7 146533698 146533919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -240463 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 137.667-62 chr14 87486358 87486718 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 168756 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 142.333-153 chr3 22909783 22910204 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 292585 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 198.333-68 chr15 68723396 68723828 + 0.666667 NA intron (NM_006091, intron 11 of 11) AluSg7|SINE|Alu 78313 NR_036197 100422971 NR_036197 ENSG00000265195 MIR4312 - microRNA 4312 ncRNA 212.333-86 chr20 47777395 47777943 + 0.666667 NA intron (NM_198596, intron 1 of 20) intron (NM_198596, intron 1 of 20) 8395 NM_018837 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 232-41 chr2 39677409 39677975 + 0.666667 NA intron (NM_152390, intron 1 of 3) intron (NM_152390, intron 1 of 3) 11775 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 147-8 chr1 221569809 221570176 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 166908 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 161.333-229 chr5 23381727 23382057 + 0.666667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -125717 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 123.333-205 chr8 23595941 23596178 + 0.666667 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 67103 NM_001317814 51312 Hs.596025 NM_016612 ENSG00000147454 SLC25A37 HT015|MFRN|MFRN1|MSC|MSCP|PRO1278|PRO1584|PRO2217 solute carrier family 25 member 37 protein-coding 229-55 chr5 153657909 153658484 + 0.666667 NA intron (NM_000827, intron 5 of 15) intron (NM_000827, intron 5 of 15) 166024 NM_001258021 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 160.667-26 chr10 9653358 9653671 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -357921 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 196.333-23 chr12 4123033 4123349 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -150571 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 150.667-393 chr9 24981750 24982035 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -435995 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 138.667-109 chr2 104455059 104455320 + 0.666667 NA intron (NR_015399, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 20842 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 155-55 chr18 12386882 12387238 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9784 NM_006796 10939 Hs.726355 NM_006796 ENSG00000141385 AFG3L2 SCA28|SPAX5 AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2 protein-coding 183-84 chr5 38181836 38182208 + 0.666667 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) 33542 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 146.667-257 chr5 54203114 54203456 + 0.666667 NA intron (NM_019087, intron 1 of 4) intron (NM_019087, intron 1 of 4) 107288 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 145.667-285 chr8 83347536 83347823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56079 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 150.333-387 chr7 105401605 105402030 + 0.666667 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -12427 NM_001350742 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 113.333-198 chr4 111954761 111955063 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190542 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 138.333-68 chr14 91360894 91361190 + 0.666667 NA intron (NM_001080414, intron 3 of 29) AluJo|SINE|Alu 56778 NM_001080414 440193 Hs.525536 NM_001080414 ENSG00000015133 CCDC88C DAPLE|HKRP2|HYC1|KIAA1509|SCA40 coiled-coil domain containing 88C protein-coding 158.667-18 chr1 119301813 119302141 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26275 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 195.667-31 chr12 59394711 59395132 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -201108 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 132.333-36 chr11 115992087 115992454 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -232070 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 113-22 chr10 73938514 73938696 + 0.666667 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -15828 NR_160938 414236 Hs.585453 NM_001001791 ENSG00000222047 C10orf55 - chromosome 10 open reading frame 55 ncRNA 161.667-186 chr4 48349123 48349538 + 0.666667 NA intron (NM_020846, intron 1 of 7) intron (NM_020846, intron 1 of 7) 7801 NM_020846 57606 Hs.479677 NM_020846 ENSG00000109171 SLAIN2 KIAA1458 SLAIN motif family member 2 protein-coding 200.667-167 chr9 86460550 86460899 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106314 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 147.333-314 chr8 35630385 35630676 + 0.666667 NA intron (NM_001322818, intron 4 of 16) intron (NM_001322818, intron 4 of 16) 79790 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 171.333-104 chr20 44320020 44320457 + 0.666667 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 -9036 NM_001080472 128486 Hs.632269 NM_001080472 ENSG00000197296 FITM2 C20orf142|Fit2|dJ881L22.2 fat storage inducing transmembrane protein 2 protein-coding 115.333-9 chr1 87772989 87773319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -401499 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 144.667-110 chr17 42888176 42888460 + 0.666667 NA intron (NR_027254, intron 2 of 5) AluJo|SINE|Alu 10416 NR_027254 388387 Hs.632257 NM_207388 ENSG00000213373 LINC00671 - long intergenic non-protein coding RNA 671 ncRNA 178-117 chr9 11121243 11121541 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 508186 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 194.667-15 chr1 194071107 194071525 + 0.666667 NA Intergenic UCON93|Unknown|Unknown 766571 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 133.333-9 chr1 116014744 116015028 + 0.666667 NA intron (NM_018420, intron 2 of 11) intron (NM_018420, intron 2 of 11) -37610 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 159.667-63 chr11 63626087 63626467 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001290048, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001290048, exon 13 of 13) -11808 NM_001128203 11145 Hs.502775 NM_007069 ENSG00000176485 PLAAT3 AdPLA|H-REV107|H-REV107-1|HRASLS3|HREV107|HREV107-1|HREV107-3|HRSL3|PLA2G16|PLAAT-3 phospholipase A and acyltransferase 3 protein-coding 172.333-61 chr16 57143519 57143874 + 0.666667 NA intron (NM_152727, intron 14 of 15) intron (NM_152727, intron 14 of 15) 38854 NM_001354098 80011 Hs.396740 NM_024946 ENSG00000172775 FAM192A C16orf94|CDA018|CDA10|NIP30|PIP30 family with sequence similarity 192 member A protein-coding 187.333-143 chr4 91324526 91325076 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 952501 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 131.333-159 chr6 127540486 127540830 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21634 NM_001012279 387104 Hs.319247 NM_001012279 ENSG00000255330 SOGA3 C6orf174|dJ403A15.3 SOGA family member 3 protein-coding 156.667-52 chr10 111505952 111506266 + 0.666667 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 391818 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 115.333-46 chr12 27917081 27917296 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 52788 NM_198964 5744 Hs.591159 NM_002820 ENSG00000087494 PTHLH BDE2|HHM|PLP|PTHR|PTHRP parathyroid hormone like hormone protein-coding 200-175 chr9 6631007 6631547 + 0.666667 NA intron (NM_000170, intron 2 of 24) intron (NM_000170, intron 2 of 24) 14415 NM_000170 2731 Hs.584238 NM_000170 ENSG00000178445 GLDC GCE|GCSP|HYGN1 glycine decarboxylase protein-coding 265-22 chr15 43000072 43000504 + 0.666667 NA intron (NM_174916, intron 32 of 46) intron (NM_174916, intron 32 of 46) -79510 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 194-95 chr3 125655334 125655842 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60091 NM_022776 114885 Hs.477440 NM_022776 ENSG00000144909 OSBPL11 ORP-11|ORP11|OSBP12|TCCCIA00292 oxysterol binding protein like 11 protein-coding 248-30 chr16 62927232 62927787 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -891071 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 139-87 chr6 68228054 68228352 + 0.666667 NA intron (NR_125854, intron 3 of 3) intron (NR_125854, intron 3 of 3) 101696 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 119.667-188 chr9 30128833 30129098 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 279489 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 149.333-289 chr4 118951056 118951356 + 0.666667 NA intron (NM_001128934, intron 1 of 4) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 62352 NM_001128933 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 147.667-2 chr1 34065318 34065600 + 0.666667 NA intron (NM_052896, intron 2 of 69) intron (NM_052896, intron 2 of 69) 99815 NM_001281956 114784 Hs.656915 NM_052896 ENSG00000121904 CSMD2 dJ1007G16.1|dJ1007G16.2|dJ947L8.1 CUB and Sushi multiple domains 2 protein-coding 197.667-25 chr11 82816688 82817237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -83098 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 162-57 chr18 13970810 13971188 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55292 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 118-75 chr2 237333139 237333345 + 0.666667 NA intron (NM_057166, intron 39 of 40) intron (NM_057166, intron 39 of 40) 80922 NM_057165 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 180.667-42 chr14 45683994 45684432 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 31389 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 172.667-33 chr11 31133080 31133452 + 0.666667 NA intron (NM_001367979, intron 10 of 38) intron (NM_001367979, intron 10 of 38) -140580 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 149.667-430 chrUn_GL000216v2 173747 174027 + 0.666667 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 146-100 chr4 121364034 121364287 + 0.666667 NA intron (NM_198179, intron 1 of 5) intron (NM_198179, intron 1 of 5) 16858 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 115.667-86 chr15 89586071 89586333 + 0.666667 NA intron (NM_001308025, intron 4 of 21) intron (NM_001308025, intron 4 of 21) 10615 NM_001308025 90381 Hs.441708 NM_152259 ENSG00000140534 TICRR C15orf42|SLD3|Treslin TOPBP1 interacting checkpoint and replication regulator protein-coding 122-87 chr4 85801589 85801915 + 0.666667 NA intron (NM_001346093, intron 1 of 6) intron (NM_001346093, intron 1 of 6) 22954 NM_001346093 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 150-56 chr16 75985903 75986256 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -259589 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 135-16 chr11 78290167 78290432 + 0.666667 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) intron (NM_080491, intron 1 of 9) 51581 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 158.667-216 chr3 106799917 106800239 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 440560 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 153.333-263 chr3 20579867 20580175 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 237553 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 151.667-105 chr14 33778371 33778673 + 0.666667 NA exon (NM_173159, exon 9 of 12) exon (NM_173159, exon 9 of 12) 69585 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 218.667-47 chr2 21589781 21590286 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 120619 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 325-5 chr1 247196781 247197415 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 4962 NR_037480 100500849 NR_037480 ENSG00000283881 MIR3916 mir-3916 microRNA 3916 ncRNA 154.333-199 chr22 41537612 41537954 + 0.666667 NA intron (NM_001018050, intron 2 of 5) intron (NM_001018050, intron 2 of 5) 6687 NM_001018050 171568 Hs.712617 NM_138338 ENSG00000100413 POLR3H RPC22.9|RPC8 RNA polymerase III subunit H protein-coding 200.667-102 chr22 27318389 27318821 + 0.666667 NA TTS (NR_134581) TTS (NR_134581) 7954 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 129-93 chr4 118694297 118694613 + 0.666667 NA exon (NM_020961, exon 6 of 11) exon (NM_020961, exon 6 of 11) 9063 NM_020961 57721 Hs.596872 NM_020961 ENSG00000145388 METTL14 hMETTL14 methyltransferase like 14 protein-coding 233-12 chr11 34241605 34242144 + 0.666667 NA intron (NM_145804, intron 1 of 16) intron (NM_145804, intron 1 of 16) 116136 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 206-176 chr8 12787463 12787977 + 0.666667 NA intron (NR_152742, intron 2 of 4) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -6520 NR_102423 101409254 Hs.571476 NR_102423 ENSG00000255494 LINC00681 - long intergenic non-protein coding RNA 681 ncRNA 239.667-44 chr3 110166342 110166768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 563727 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 136.667-33 chr11 87557815 87558068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 161470 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 157.333-156 chr17 66604156 66604515 + 0.666667 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -182737 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 139-85 chr5 112985923 112986315 + 0.666667 NA intron (NM_152624, intron 2 of 10) intron (NM_152624, intron 2 of 10) 9321 NR_038352 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 210.667-114 chr6 130593203 130593601 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 156285 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 130-94 chr5 66758416 66758764 + 0.666667 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) intron (NM_001290228, intron 1 of 4) -70183 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 173-72 chr5 23069703 23070069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -216542 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 184-67 chr3 45096325 45096762 + 0.666667 NA intron (NM_022842, intron 4 of 8) AluSx|SINE|Alu 49835 NM_022842 64866 Hs.476093 NM_022842 ENSG00000163814 CDCP1 CD318|SIMA135|TRASK CUB domain containing protein 1 protein-coding 143-106 chr6 131831352 131831691 + 0.666667 NA intron (NM_006208, intron 1 of 24) L1MC3|LINE|L1 23501 NM_006208 5167 Hs.527295 NM_006208 ENSG00000197594 ENPP1 ARHR2|COLED|M6S1|NPP1|NPPS|PC-1|PCA1|PDNP1 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 protein-coding 167.667-109 chr2 140086150 140086531 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 500345 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 131.667-27 chr10 88280719 88280980 + 0.666667 NA intron (NM_018363, intron 6 of 6) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 302469 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 153.333-416 chr8 100989519 100989964 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -36359 NM_003406 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 138.667-53 chr13 52458094 52458371 + 0.666667 NA intron (NM_001286687, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 2260 NM_001286686 26586 Hs.444028 NM_018204 ENSG00000136108 CKAP2 LB1|TMAP|se20-10 cytoskeleton associated protein 2 protein-coding 164-18 chr10 94615937 94616353 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -67584 NM_001128925 1562 Hs.511872 NM_000772 ENSG00000108242 CYP2C18 CPCI|CYP2C|CYP2C17|P450-6B/29C|P450IIC17 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 18 protein-coding 154-122 chr6 53254299 53254672 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22508 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 120-51 chr18 1104131 1104480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -176312 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 201-96 chr6 43511286 43511771 + 0.666667 NA TTS (NM_015388) TTS (NM_015388) -1182 NM_001271882 221424 Hs.445552 NM_001012974 ENSG00000204052 LRRC73 C6orf154 leucine rich repeat containing 73 protein-coding 112.667-173 chr3 98056003 98056176 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20785 NM_001105580 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 194.333-70 chr2 84128614 84129074 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -161838 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 117.667-115 chr3 49569882 49570150 + 0.666667 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) intron (NM_003458, intron 1 of 11) 15539 NM_003458 8927 Hs.194684 NM_003458 ENSG00000164061 BSN ZNF231 bassoon presynaptic cytomatrix protein protein-coding 199.667-11 chr10 29577312 29577811 + 0.666667 NA intron (NM_001323599, intron 3 of 38) L1PB2|LINE|L1 24785 NR_030634 100126327 NR_030634 ENSG00000216035 MIR938 MIRN938|hsa-mir-938 microRNA 938 ncRNA 156.667-354 chr9 32862809 32863118 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 79423 NM_212558 401498 Hs.522063 NM_212558 ENSG00000188133 TMEM215 - transmembrane protein 215 protein-coding 137.667-109 chr20 33467364 33467674 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -22577 NM_001032999 9139 Hs.153934 NM_005093 ENSG00000078699 CBFA2T2 EHT|MTGR1|ZMYND3|p85 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 2 protein-coding 121.333-134 chr4 78429956 78430304 + 0.666667 NA intron (NM_001166133, intron 36 of 41) intron (NM_001166133, intron 36 of 41) -121640 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 167.333-194 chr4 104785759 104786148 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -291059 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 189-76 chr5 121815181 121815575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36504 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 112-107 chr2 81707114 81707291 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -240256 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 113-12 chr1 181602566 181602879 + 0.666667 NA intron (NM_001205293, intron 6 of 47) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 119205 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 146.667-30 chr10 33238010 33238308 + 0.666667 NA intron (NM_001244973, intron 6 of 16) intron (NM_001244973, intron 6 of 16) 96508 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 204.667-64 chr19 41301242 41301604 + 0.666667 NA intron (NM_144732, intron 10 of 14) intron (NM_144732, intron 10 of 14) -8749 NM_052848 90324 Hs.437497 NM_052848 ENSG00000142039 CCDC97 - coiled-coil domain containing 97 protein-coding 139.333-133 chr20 8678914 8679309 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 9 of 32) intron (NM_182734, intron 9 of 32) -152074 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 180.667-19 chr10 119579629 119580142 + 0.666667 NA intron (NM_001323970, intron 7 of 12) intron (NM_001323970, intron 7 of 12) 17144 NM_001033925 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 140-101 chr6 152857662 152857932 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 107000 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 198.333-139 chr4 34348984 34349405 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79447 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 127.667-119 chr3 103324193 103324476 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 199782 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 178-20 chr10 84717236 84717674 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 292286 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 193-46 chr2 69286190 69286625 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 100820 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 221.333-92 chr3 52593125 52593724 + 0.666667 NA intron (NM_001366074, intron 20 of 30) AluSz6|SINE|Alu 56819 NM_001124767 440957 Hs.660577 NM_001124767 ENSG00000168273 SMIM4 C3orf78 small integral membrane protein 4 protein-coding 158.333-167 chr2 177405757 177406125 + 0.666667 NA intron (NM_003659, intron 1 of 19) intron (NM_003659, intron 1 of 19) 13168 NM_003659 8540 Hs.516543 NM_003659 ENSG00000018510 AGPS ADAP-S|ADAS|ADHAPS|ADPS|ALDHPSY|RCDP3 alkylglycerone phosphate synthase protein-coding 114.333-68 chr14 36496527 36496744 + 0.666667 NA intron (NR_161365, intron 1 of 4) intron (NR_161365, intron 1 of 4) 16900 NR_161363 253970 Hs.509165 NM_001101341 ENSG00000229415 SFTA3 NANCI|SFTPH|SP-H|SPH surfactant associated 3 ncRNA 144.333-224 chr6 2471745 2472043 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -162606 NR_149118 105374885 NR_149118 LINC02521 - long intergenic non-protein coding RNA 2521 ncRNA 112.667-108 chr19 52111450 52111748 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15834 NM_001369827 284371 Hs.665751 NM_001136499 ENSG00000197608 ZNF841 - zinc finger protein 841 protein-coding 211-86 chr6 73555624 73556155 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -34857 NM_001402 1915 Hs.535192 NM_001402 ENSG00000156508 EEF1A1 CCS-3|CCS3|EE1A1|EEF-1|EEF1A|EF-Tu|EF1A|GRAF-1EF|HNGC:16303|LENG7|PTI1|eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 protein-coding 119-47 chr14 69944539 69944850 + 0.666667 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) -33439 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 184.333-64 chr18 71418792 71419248 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 159936 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 161.667-138 chr2 123125994 123126323 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52677 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 123-95 chr5 18751608 18751960 + 0.666667 NA Intergenic (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 944510 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 296.333-12 chr14 58200625 58201340 + 0.666667 NA intron (NM_018477, intron 1 of 12) intron (NM_018477, intron 1 of 12) 833 NM_018477 55860 Hs.509451 NM_018477 ENSG00000131966 ACTR10 ACTR11|Arp10|Arp11|HARP11 actin related protein 10 protein-coding 149.333-36 chr1 222904112 222904489 + 0.666667 NA intron (NM_001350630, intron 2 of 8) intron (NM_001350630, intron 2 of 8) -24124 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 132.333-48 chr13 105990996 105991387 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 284361 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 151-53 chr2 14528466 14528777 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104096 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 122-41 chr15 50305699 50305912 + 0.666667 NA intron (NM_016654, intron 2 of 8) AluJo|SINE|Alu -40079 NM_002112 3067 Hs.1481 NM_002112 ENSG00000140287 HDC - histidine decarboxylase protein-coding 152-106 chr3 69043225 69043607 + 0.666667 NA intron (NM_007114, intron 4 of 16) AluJb|SINE|Alu 5619 NR_036087 100422859 NR_036087 ENSG00000265355 MIR3136 mir-3136 microRNA 3136 ncRNA 167.333-260 chr8 101620640 101621138 + 0.666667 NA intron (NM_024915, intron 9 of 15) L1M8|LINE|L1 128450 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 140-78 chr4 82952181 82952598 + 0.666667 NA intron (NM_001288996, intron 2 of 10) L1MB3|LINE|L1 -51473 NR_034075 100499177 Hs.728916 NR_034075 ENSG00000251022 THAP9-AS1 - THAP9 antisense RNA 1 ncRNA 235.667-67 chr9 35030170 35030572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10724 NM_001040412 138724 Hs.148250 NM_203299 ENSG00000174038 C9orf131 - chromosome 9 open reading frame 131 protein-coding 169-29 chr14 74991352 74991749 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -11371 NM_014239 8892 Hs.409137 NM_014239 ENSG00000119718 EIF2B2 EIF-2Bbeta|EIF2B eukaryotic translation initiation factor 2B subunit beta protein-coding 149.667-195 chr2 57859943 57860229 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -47565 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 113-186 chr6 134671856 134672057 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -131951 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 265.333-7 chr10 10953302 10953882 + 0.666667 NA intron (NM_001326319, intron 4 of 16) L1ME4b|LINE|L1 -1429 NR_015413 254312 Hs.498620 NR_015413 ENSG00000229240 LINC00710 - long intergenic non-protein coding RNA 710 ncRNA 198.667-25 chr10 70189100 70189561 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -18816 NM_001142648 56681 Hs.499960 NM_020150 ENSG00000079332 SAR1A SAR1|SARA1|Sara|masra2 secretion associated Ras related GTPase 1A protein-coding 244.333-59 chr2 70360193 70360662 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58360 NM_001329755 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 147.667-216 chr22 28364614 28364907 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -95109 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 158-57 chr16 87204773 87205088 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7185 NR_110939 101928708 Hs.585717 NR_110939 ENSG00000261095 LOC101928708 - uncharacterized LOC101928708 ncRNA 135-99 chr7 32040932 32041320 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) MIRb|SINE|MIR 29281 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 258.667-18 chr11 11528752 11529233 + 0.666667 NA intron (NM_001363464, intron 1 of 9) intron (NM_001363464, intron 1 of 9) 93013 NM_001363464 374378 Hs.655152 NM_198516 ENSG00000110328 GALNT18 GALNACT18|GALNT15|GALNTL4|GalNAc-T15|GalNAc-T18 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18 protein-coding 167.667-81 chr17 21876053 21876429 + 0.666667 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 183718 NM_001194958 100134444 Hs.200629 NM_001194958 ENSG00000260458 KCNJ18 KIR2.6|TTPP2 potassium voltage-gated channel subfamily J member 18 protein-coding 117-49 chr15 60872760 60873010 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 191316 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 132.667-134 chr4 179709640 179709913 + 0.666667 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 1449373 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 122.333-26 chr10 121255480 121255733 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 275708 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 123.667-101 chr2 214518898 214519135 + 0.666667 NA intron (NR_047698, intron 1 of 3) UCON71_Crp|Unknown|Unknown 8834 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 145-74 chr3 110172305 110172590 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 569619 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 156.333-185 chr2 103031847 103032256 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47622 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 117-126 chr6 107356644 107356893 + 0.666667 NA intron (NM_020381, intron 1 of 7) intron (NM_020381, intron 1 of 7) 102796 NM_020381 57107 Hs.745008 NM_020381 ENSG00000164494 PDSS2 C6orf210|COQ10D3|COQ1B|DLP1|bA59I9.3|hDLP1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 2 protein-coding 169.667-64 chr14 74085843 74086196 + 0.666667 NA intron (NM_001024674, intron 1 of 5) intron (NM_001024674, intron 1 of 5) 1066 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 119-45 chr14 58644032 58644349 + 0.666667 NA intron (NM_001079520, intron 3 of 3) intron (NM_001079520, intron 3 of 3) 5353 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 114.667-230 chr6 137502624 137502923 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -8379 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 130-9 chr10 16934191 16934545 + 0.666667 NA intron (NM_001081, intron 39 of 66) intron (NM_001081, intron 39 of 66) -116914 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 127.667-18 chr10 72287315 72287554 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 13510 NM_019058 54541 Hs.744875 NM_019058 ENSG00000168209 DDIT4 Dig2|REDD-1|REDD1 DNA damage inducible transcript 4 protein-coding 177-68 chr6 62111466 62111887 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 2 of 13) AluJr|SINE|Alu 174549 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 151.667-299 chr5 157820277 157820635 + 0.666667 NA intron (NM_001195556, intron 1 of 11) intron (NM_001195556, intron 1 of 11) 38689 NM_014666 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 133.667-152 chr8 113076111 113076406 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 300894 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 124.667-119 chr20 6626673 6626918 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109341 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 142-47 chr15 41761274 41761579 + 0.666667 NA intron (NM_001164273, intron 20 of 23) intron (NM_001164273, intron 20 of 23) -13058 NM_001265611 23005 Hs.513661 NM_014994 ENSG00000137802 MAPKBP1 JNKBP-1|JNKBP1|NPHP20 mitogen-activated protein kinase binding protein 1 protein-coding 140.667-256 chrX 15996309 15996723 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -127049 NM_005314 2925 Hs.567282 NM_005314 ENSG00000126010 GRPR BB2|BB2R gastrin releasing peptide receptor protein-coding 172.667-160 chr8 80529344 80529686 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43289 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 156.333-332 chr7 27932541 27932840 + 0.666667 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) 192595 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 187-20 chr14 43628194 43628738 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 878817 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 122-28 chr12 40148854 40149079 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7273 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 215.667-14 chr10 46013891 46014428 + 0.666667 NA intron (NM_005437, intron 5 of 9) AluSx1|SINE|Alu 5378 NM_001145262 8031 Hs.643658 NM_005437 ENSG00000266412 NCOA4 ARA70|ELE1|PTC3|RFG nuclear receptor coactivator 4 protein-coding 120-57 chr18 70322556 70322884 + 0.666667 NA intron (NM_004232, intron 1 of 1) intron (NM_004232, intron 1 of 1) -12719 NR_126336 101927481 Hs.633706 NR_126336 ENSG00000266258 LINC01909 - long intergenic non-protein coding RNA 1909 ncRNA 162-94 chr4 88009988 88010286 + 0.666667 NA intron (NR_156488, intron 1 of 13) FRAM|SINE|Alu 2502 NR_156488 5311 Hs.181272 NM_000297 ENSG00000118762 PKD2 APKD2|PC2|PKD4|Pc-2|TRPP2 polycystin 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 197-17 chr10 49765333 49765744 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -3159 NM_001347826 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 118.333-185 chr6 159164577 159164803 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4710 NM_032532 84624 Hs.520525 NM_032532 ENSG00000164694 FNDC1 AGS8|FNDC2|MEL4B3|bA243O10.1|dJ322A24.1 fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 112-81 chr17 21163393 21163710 + 0.666667 NA intron (NM_015510, intron 1 of 6) intron (NM_015510, intron 1 of 6) -2636 NM_001330159 25979 Hs.386989 NM_015510 ENSG00000109016 DHRS7B CGI-93|SDR32C1 dehydrogenase/reductase 7B protein-coding 207-131 chr9 131609700 131610156 + 0.666667 NA intron (NM_198679, intron 11 of 23) AluJb|SINE|Alu 64405 NM_001365666 642515 NM_001365666 ENSG00000283526 PRRT1B DSPD2|IFITMD8 proline rich transmembrane protein 1B protein-coding 154-27 chr11 62933639 62933956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12434 NM_000738 1128 Hs.632119 NM_000738 ENSG00000168539 CHRM1 HM1|M1|M1R cholinergic receptor muscarinic 1 protein-coding 128-51 chr2 163648482 163648736 + 0.666667 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 87399 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 123.667-153 chr5 39751810 39752084 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 231516 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 130.667-85 chr17 5609878 5610225 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -25542 NM_001033053 22861 Hs.652273 NM_014922 ENSG00000091592 NLRP1 AIADK|CARD7|CIDED|CLR17.1|DEFCAP|DEFCAP-L/S|MSPC|NAC|NALP1|PP1044|SLEV1|VAMAS1 NLR family pyrin domain containing 1 protein-coding 153.667-339 chr6 71669115 71669569 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -217361 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 203.333-148 chr2 181778566 181779045 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98140 NM_002500 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 129-39 chr15 64430944 64431225 + 0.666667 NA intron (NM_001321924, intron 11 of 12) intron (NM_001321924, intron 11 of 12) 43248 NM_016213 9325 Hs.500340 NM_016213 ENSG00000103671 TRIP4 ASC-1|ASC1|HsT17391|MDCDC|SMABF1|ZC2HC5 thyroid hormone receptor interactor 4 protein-coding 126-50 chr19 47136150 47136443 + 0.666667 NA intron (NR_027280, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 5461 NM_001145714 10055 Hs.515500 NM_005500 ENSG00000142230 SAE1 AOS1|HSPC140|SUA1|UBLE1A SUMO1 activating enzyme subunit 1 protein-coding 129.333-49 chr12 34421639 34421932 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 399289 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 128-18 chr12 29928699 29929078 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -144129 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 155-14 chr10 50898140 50898487 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -12638 NM_001198819 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 197.667-76 chr20 56814560 56814880 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 185414 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 149.667-111 chr14 40484481 40484778 + 0.666667 NA Intergenic UCON60|Unknown|Unknown -470082 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 132.667-17 chr10 21310419 21310791 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 62345 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 176.333-31 chr11 98834387 98834801 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -186355 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 171-80 chr9 29132082 29132542 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) MER51A|LTR|ERV1 79987 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 112-205 chr8 129344607 129344806 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103466 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 113.333-208 chr5 59297767 59298004 + 0.666667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -21770 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 184.333-51 chr15 62933242 62933586 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -109333 NM_001018004 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 150-111 chr5 32991542 32991942 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44299 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 219-34 chr17 44218075 44218570 + 0.666667 NA intron (NR_045058, intron 1 of 20) intron (NR_045058, intron 1 of 20) 1353 NM_014233 7343 Hs.89781 NM_014233 ENSG00000108312 UBTF CONDBA|NOR-90|UBF|UBF-1|UBF1|UBF2 upstream binding transcription factor protein-coding 199.667-150 chr9 28988092 28988599 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1MA7|LINE|L1 -99390 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 117.333-88 chr18 42052059 42052370 + 0.666667 NA intron (NM_001308020, intron 20 of 23) intron (NM_001308020, intron 20 of 23) 96980 NM_001308020 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 219-30 chr16 3302920 3303488 + 0.666667 NA intron (NM_033208, intron 1 of 1) intron (NM_033208, intron 1 of 1) -2202 NM_153028 7627 Hs.513292 NM_153028 ENSG00000162086 ZNF75A - zinc finger protein 75a protein-coding 244.667-59 chr2 226781132 226781668 + 0.666667 NA intron (NM_005544, intron 1 of 1) intron (NM_005544, intron 1 of 1) 17390 NM_005544 3667 Hs.471508 NM_005544 ENSG00000169047 IRS1 HIRS-1 insulin receptor substrate 1 protein-coding 113-56 chr14 54734916 54735140 + 0.666667 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) intron (NM_001161576, intron 2 of 10) -19805 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 129.667-92 chr2 65416670 65416975 + 0.666667 NA intron (NM_181784, intron 1 of 5) intron (NM_181784, intron 1 of 5) 15777 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 123.667-155 chr5 43012037 43012263 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6661 NR_104649 648987 Hs.649468 NR_034085 ENSG00000177738 LOC648987 - uncharacterized LOC648987 ncRNA 155-128 chr8 78704633 78704942 + 0.666667 NA intron (NM_016010, intron 7 of 8) L1PA13|LINE|L1 19587 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 113.667-34 chr11 112491520 112491714 + 0.666667 NA intron (NR_120559, intron 2 of 2) intron (NR_120559, intron 2 of 2) 7272 NR_120560 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 147-75 chr2 172301281 172301568 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -125912 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 124-51 chr18 78198853 78199168 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -205283 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 158.333-98 chr15 64701628 64702038 + 0.666667 NA intron (NM_002537, intron 1 of 4) intron (NM_002537, intron 1 of 4) 1448 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 115-75 chr17 57224293 57224622 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -31394 NM_001322250 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 133.667-146 chr8 20296144 20296352 + 0.666667 NA intron (NM_021020, intron 1 of 3) intron (NM_021020, intron 1 of 3) 7715 NM_021020 11178 Hs.521432 NM_021020 ENSG00000061337 LZTS1 F37|FEZ1 leucine zipper tumor suppressor 1 protein-coding 192.333-150 chr6 113502022 113502401 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68764 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 254.333-78 chr7 48552948 48553445 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 55 of 61) L1MA3|LINE|L1 -371351 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 187.667-24 chr11 128729603 128730135 + 0.666667 NA intron (NM_002017, intron 1 of 8) intron (NM_002017, intron 1 of 8) -33846 NR_038908 100507392 Hs.657715 NR_038908 ENSG00000254703 SENCR FLI1-AS1|lncRNA9 smooth muscle and endothelial cell enriched migration/differentiation-associated lncRNA ncRNA 185.333-200 chr9 112565111 112565546 + 0.666667 NA intron (NM_133465, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu -77684 NM_001350649 100133204 Hs.662552 NM_001350649 C9orf147 - chromosome 9 open reading frame 147 protein-coding 124-111 chr7 73498961 73499165 + 0.666667 NA intron (NM_001370402, intron 3 of 18) AluSz|SINE|Alu 23230 NM_001370402 9031 Hs.743372 NM_023005 ENSG00000009954 BAZ1B WBSCR10|WBSCR9|WSTF bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B protein-coding 113.333-194 chr4 94483900 94484180 + 0.666667 NA intron (NM_001256428, intron 2 of 11) intron (NM_001256428, intron 2 of 11) 32098 NM_001256429 10611 Hs.480311 NM_006457 ENSG00000163110 PDLIM5 ENH|ENH1|L9|LIM PDZ and LIM domain 5 protein-coding 228.333-23 chr13 32150101 32150641 + 0.666667 NA intron (NM_023037, intron 14 of 60) intron (NM_023037, intron 14 of 60) 118597 NM_023037 10129 Hs.507669 NM_023037 ENSG00000073910 FRY 13CDNA73|214K23.2|C13orf14|CG003|bA207N4.2|bA37E23.1 FRY microtubule binding protein protein-coding 154-101 chr3 195010189 195010511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84238 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 181.333-58 chr17 48477009 48477329 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32336 NR_110804 101927166 Hs.149244 NR_110804 LOC101927166 - uncharacterized LOC101927166 ncRNA 153-133 chr7 98979980 98980391 + 0.666667 NA intron (NM_003496, intron 56 of 70) intron (NM_003496, intron 56 of 70) -32980 NR_110102 101927550 Hs.636663 NR_110102 LOC101927550 - uncharacterized LOC101927550 ncRNA 128-123 chr8 133075645 133075937 + 0.666667 NA intron (NM_001045556, intron 1 of 8) L1MC4|LINE|L1 -15437 NM_006748 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 144-24 chr11 15811504 15811865 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 157937 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 143.333-71 chr12 94755767 94756158 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78436 NR_030171 574449 NR_030171 ENSG00000283998 MIR492 MIRN492|hsa-mir-492 microRNA 492 ncRNA 128.333-156 chr5 89836470 89836800 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 180085 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 154-11 chr1 238795589 238795913 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -309734 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 151-65 chr2 164363578 164363872 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 204770 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 152.333-132 chr16 51666302 51666602 + 0.666667 NA Intergenic (AAACAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -96067 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 151.667-291 chr5 127819867 127820169 + 0.666667 NA intron (NM_001317938, intron 5 of 6) intron (NM_001317938, intron 5 of 6) 116629 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 201.333-122 chr16 83724873 83725339 + 0.666667 NA intron (NM_001220489, intron 9 of 12) L2c|LINE|L2 78870 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 146.333-93 chr14 65226822 65227253 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -4690 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 141.667-69 chr14 28382380 28382749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 382755 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 113-20 chr10 65598640 65598847 + 0.666667 NA intron (NR_120647, intron 2 of 5) AluJb|SINE|Alu 27318 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 191-35 chr2 220276802 220277277 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -370474 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 144.667-253 chr6 12765872 12766155 + 0.666667 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) intron (NM_001322308, intron 3 of 13) 47314 NM_001322310 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 245.333-24 chr11 100250036 100250548 + 0.666667 NA intron (NM_001243270, intron 15 of 23) intron (NM_001243270, intron 15 of 23) -436996 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 115-38 chr12 18398487 18398704 + 0.666667 NA intron (NM_001288774, intron 15 of 32) intron (NM_001288774, intron 15 of 32) 137055 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 149.333-424 chr9 29520974 29521291 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -307531 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 112.667-191 chr4 70357674 70357925 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2961 NM_012390 26952 Hs.701334 NM_012390 ENSG00000109208 SMR3A P-B1|PBI|PRL5|PROL5 submaxillary gland androgen regulated protein 3A protein-coding 116.667-129 chr3 65476394 65476605 + 0.666667 NA intron (NM_001365904, intron 4 of 24) intron (NM_001365904, intron 4 of 24) -417317 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 236-20 chr14 39208577 39209124 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -25065 NM_054024 4253 Hs.287694 NM_005930 ENSG00000150527 MIA2 CTAGE5|MEA6|MGEA|MGEA11|MGEA6|TALI MIA SH3 domain ER export factor 2 protein-coding 221-66 chr8 19592060 19592646 + 0.666667 NA intron (NM_001130518, intron 2 of 9) L1MC4|LINE|L1 10192 NM_001354499 55790 Hs.613729 NM_018371 ENSG00000147408 CSGALNACT1 CSGalNAcT-1|ChGn|ChGn-1|beta4GalNAcT chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 114.333-168 chr5 19062644 19062860 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 823520 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 121-88 chr22 44108742 44109043 + 0.666667 NA intron (NM_001243386, intron 3 of 11) LTR7Y|LTR|ERV1 39775 NM_001243385 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 188.667-19 chr10 28257941 28258373 + 0.666667 NA intron (NM_173496, intron 2 of 18) intron (NM_173496, intron 2 of 18) 23966 NM_173496 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 136.667-65 chr15 24601304 24601621 + 0.666667 NA Intergenic MER83B-int|LTR|ERV1 43305 NR_026646 791114 Hs.720900 NR_026646 ENSG00000259905 PWRN1 NCRNA00198 Prader-Willi region non-protein coding RNA 1 ncRNA 133.667-109 chr4 48991355 48991656 + 0.666667 NA exon (NM_025087, exon 3 of 16) exon (NM_025087, exon 3 of 16) 4863 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 132 chr1 17325904 17326234 + 0.666667 NA intron (NM_012387, intron 1 of 15).2 L1MEd|LINE|L1 17872 NM_012387 23569 Hs.522969 NM_012387 ENSG00000159339 PADI4 PAD|PAD4|PADI5|PDI4|PDI5 peptidyl arginine deiminase 4 protein-coding 164-74 chr22 38851708 38852167 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -7909 NM_014293 23467 Hs.91622 NM_014293 ENSG00000221890 NPTXR NPR neuronal pentraxin receptor protein-coding 121-110 chr4 104701813 104702024 + 0.666667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -207024 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 166.667-86 chr17 33222175 33222513 + 0.666667 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L1MB8|LINE|L1 70644 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 166.667-238 chr8 135865788 135866135 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 408505 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 178-2 chr1 41643979 41644326 + 0.666667 NA intron (NM_001127714, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -159469 NR_126098 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 144.333-107 chr18 61180775 61181063 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -152511 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 169.333-221 chr6 34386279 34386653 + 0.666667 NA intron (NM_001202470, intron 5 of 8) L2c|LINE|L2 6203 NM_006703 11165 Hs.188882 NM_006703 ENSG00000272325 NUDT3 DIPP|DIPP-1|DIPP1 nudix hydrolase 3 protein-coding 132.667-16 chr10 19096072 19096386 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 4 of 39) intron (NM_001142308, intron 4 of 39) 47428 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 139-43 chr18 76126708 76126943 + 0.666667 NA non-coding (NR_040034, exon 3 of 6) non-coding (NR_040034, exon 3 of 6) 3827 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 237.667-64 chr4 179963985 179964403 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1194955 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 157-27 chr11 40449675 40449997 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -156706 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 182.667-30 chr12 38637107 38637405 + 0.666667 NA Intergenic HERV17-int|LTR|ERV1 268335 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 116.667-147 chr4 71595884 71596089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 188093 NM_000583 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 119-109 chr4 22847478 22847796 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 133548 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 115.667-193 chr6 69073784 69074000 + 0.666667 NA intron (NM_001704, intron 16 of 31) LTR78|LTR|ERV1 438610 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 158-14 chr10 85005483 85005935 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 193196 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 174.667-97 chr2 192412183 192412609 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -217463 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 143.667-162 chr3 97687299 97687585 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -77079 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 208.667-17 chr10 19316782 19317307 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 21 of 39) L1MA2|LINE|L1 268243 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 127.667-52 chr15 54720732 54721029 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -335867 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 213.333-37 chr11 126387693 126388131 + 0.666667 NA intron (NM_001348396, intron 2 of 11) intron (NM_001348396, intron 2 of 11) -15504 NM_001254758 6484 Hs.591947 NM_006278 ENSG00000110080 ST3GAL4 CGS23|NANTA3|SAT3|SIAT4|SIAT4C|ST-4|ST3GalA.2|ST3GalIV|STZ|gal-NAc6S ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4 protein-coding 146-5 chr1 71453229 71453505 + 0.666667 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) intron (NM_173808, intron 6 of 6) 372043 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 112.333-272 chr9 12570207 12570509 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -123027 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 157.333-323 chr7 75624427 75624847 + 0.666667 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) intron (NM_005338, intron 1 of 30) -96514 NR_028059 5387 Hs.659871 NM_005395 ENSG00000127957 PMS2P3 PMS2L3|PMS2L9|PMS5|PMSR3 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 3 pseudo 156-67 chr2 24020591 24020939 + 0.666667 NA intron (NM_001346880, intron 6 of 13) AluJb|SINE|Alu 10680 NM_001346880 388931 Hs.407482 NM_001080473 ENSG00000205639 MFSD2B - major facilitator superfamily domain containing 2B protein-coding 281.667-40 chr5 165332896 165333511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 862924 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 149.333-263 chr3 138940042 138940331 + 0.666667 NA intron (NR_121649, intron 2 of 2) CpG 3834 NR_121649 103344930 Hs.195033 NR_121649 ENSG00000244578 LINC01391 - long intergenic non-protein coding RNA 1391 ncRNA 208.667-151 chr9 130582764 130583186 + 0.666667 NA intron (NM_003934, intron 1 of 18) intron (NM_003934, intron 1 of 18) 3398 NM_003934 8939 Hs.98751 NM_003934 ENSG00000107164 FUBP3 FBP3 far upstream element binding protein 3 protein-coding 145-126 chr9 29674495 29674871 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -461082 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 147.667-30 chr1 228857059 228857487 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 121794 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 137.667-56 chr14 61968651 61968931 + 0.666667 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 41096 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 169-84 chr5 111437580 111438042 + 0.666667 NA intron (NM_001744, intron 5 of 10) L2c|LINE|L2 -74415 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 143.667-110 chr18 6580982 6581367 + 0.666667 NA intron (NR_120518, intron 3 of 5) intron (NR_120518, intron 3 of 5) 69758 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 111.667-124 chr2 14493274 14493476 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -92417 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 170.333-61 chr13 21572273 21572603 + 0.666667 NA intron (NM_152726, intron 1 of 11) LTR34|LTR|ERV1 31732 NM_152726 221154 Hs.412103 NM_152726 ENSG00000165487 MICU2 1110008L20Rik|EFHA1 mitochondrial calcium uptake 2 protein-coding 111.667-39 chr10 88992950 88993139 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_028371) promoter-TSS (NR_028371) -69 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 123.333-40 chr10 85002657 85002987 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 196083 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 136.333-122 chr3 20666207 20666470 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 323870 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 124-22 chr10 119423835 119424138 + 0.666667 NA intron (NM_005308, intron 5 of 15) L2b|LINE|L2 46014 NR_039829 100616398 NR_039829 ENSG00000265719 MIR4681 - microRNA 4681 ncRNA 209-3 chr1 85409811 85410276 + 0.666667 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu -5537 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 172-15 chr1 199520383 199520763 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 371975 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 117-27 chr10 126674895 126675175 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4525 NM_001350923 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 199.667-28 chr11 72532470 72532970 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -37936 NR_126364 101928555 Hs.376950 NR_126364 ENSG00000227467 LINC01537 - long intergenic non-protein coding RNA 1537 ncRNA 154-119 chr6 10006140 10006516 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -398174 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 195.667-75 chr20 24416100 24416554 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52872 NM_001323606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 160.333-74 chr12 37988059 37988373 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -328558 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 233.667-76 chr8 120816654 120817281 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4921 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 150.667-190 chr2 140382860 140383163 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 67 of 90) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 203674 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 130.667-185 chr7 41404169 41404448 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -289611 NR_027118 285954 Hs.656869 NR_027118 ENSG00000224116 INHBA-AS1 - INHBA antisense RNA 1 ncRNA 185.333-164 chr6 54384356 54384893 + 0.666667 NA intron (NM_014464, intron 10 of 10) L1ME3|LINE|L1 76183 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 150.667-130 chr15 56504053 56504350 + 0.666667 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 -39064 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 142-99 chr4 36039373 36039742 + 0.666667 NA intron (NR_146893, intron 35 of 36) intron (NR_146893, intron 35 of 36) 204382 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 263.333-29 chr15 69318755 69319258 + 0.666667 NA intron (NM_001104554, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 4603 NM_001104554 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 149.667-73 chr11 40530523 40530953 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -237608 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 155.333-379 chr8 41368140 41368519 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -58326 NR_145746 109616980 NR_145746 ENSG00000238936 SNORD65B - small nucleolar RNA, C/D box 65B snoRNA 179.333-170 chr7 24949717 24950095 + 0.666667 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) LTR16E1|LTR|ERVL 30272 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 131.667-41 chr12 24364696 24364971 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 141562 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 151-92 chr4 72376240 72376568 + 0.666667 NA intron (NM_014243, intron 4 of 21) intron (NM_014243, intron 4 of 21) 192817 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 117.333-3 chr1 53948187 53948391 + 0.666667 NA intron (NM_001256409, intron 2 of 8) intron (NM_001256409, intron 2 of 8) 1939 NM_052940 115353 Hs.40094 NM_052940 ENSG00000116212 LRRC42 dJ167A19.4 leucine rich repeat containing 42 protein-coding 133.667-18 chr10 22277238 22277540 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 25317 NR_038921 100130992 Hs.48501 NR_038921 LOC100130992 - uncharacterized LOC100130992 ncRNA 233.333-133 chr8 115864708 115865195 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -195976 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 130.333-151 chr4 81930138 81930381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 443732 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 131.667-60 chr15 50760804 50761135 + 0.666667 NA intron (NM_032802, intron 1 of 14) intron (NM_032802, intron 1 of 14) 4737 NM_032802 84888 Hs.401537 NM_032802 ENSG00000138600 SPPL2A IMP3|PSL2 signal peptide peptidase like 2A protein-coding 135-71 chr3 178515210 178515529 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -21067 NM_181361 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 281.667-22 chr17 22286694 22287234 + 0.666667 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -11800 NR_028336 284123 Hs.348578 NM_203392 ENSG00000178130 FAM27E5 FAM27L family with sequence similarity E5 ncRNA 148.333-287 chr4 72003005 72003295 + 0.666667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -28654 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 151.667-332 chr7 28096637 28096915 + 0.666667 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -83681 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 121.667-8 chr1 61631823 61632033 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -22314 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 138.333-182 chr7 46318364 46318776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 378552 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 177-21 chr13 112533529 112533947 + 0.666667 NA intron (NM_006322, intron 11 of 21) intron (NM_006322, intron 11 of 21) 54415 NM_001286278 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 129-66 chr2 183447992 183448285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 323695 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 148-88 chr2 177716576 177716892 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 13 of 20) intron (NM_001077197, intron 13 of 20) 43412 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 118-47 chr15 59846138 59846426 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -156962 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 169.667-72 chr15 43476477 43476825 + 0.666667 NA intron (NM_001355001, intron 8 of 28) intron (NM_001355001, intron 8 of 28) 16505 NM_001141979 7158 Hs.440968 NM_005657 ENSG00000067369 TP53BP1 53BP1|TDRD30|p202|p53BP1 tumor protein p53 binding protein 1 protein-coding 152-95 chr21 28467744 28468138 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -71377 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 201.333-150 chr2 102066079 102066570 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -4066 NM_001320978 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 188-38 chr16 78222559 78223073 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 123162 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 128.667-16 chr1 233250128 233250361 + 0.666667 NA intron (NM_014801, intron 8 of 33) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 45481 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 118-115 chr6 142288861 142289111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12933 NM_001032394 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 169.667-132 chr3 87466590 87466915 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -190168 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 114-62 chr18 49036978 49037198 + 0.666667 NA intron (NR_148999, intron 3 of 4) AluSx1|SINE|Alu 12680 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 117.667-52 chr14 76999723 76999930 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 28882 NM_024496 64207 Hs.179260 NM_024496 ENSG00000119669 IRF2BPL C14orf4|EAP1|NEDAMSS interferon regulatory factor 2 binding protein like protein-coding 309-16 chr17 70287942 70288499 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 118685 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 113-191 chr6 159197362 159197612 + 0.666667 NA exon (NM_032532, exon 2 of 23) exon (NM_032532, exon 2 of 23) -27480 NR_121668 101929122 Hs.134215 NR_121668 LOC101929122 - uncharacterized LOC101929122 ncRNA 118.333-140 chr3 120627544 120627821 + 0.666667 NA TTS (NM_000187) TTS (NM_000187) 31346 NM_001168331 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 144.667-62 chr12 75549423 75549759 + 0.666667 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack -37982 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 145-99 chr5 156332344 156332759 + 0.666667 NA intron (NM_172244, intron 2 of 7) MER105|DNA|hAT-Charlie 5387 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 131.333-103 chr20 54153307 54153560 + 0.666667 NA TTS (NM_001128915) TTS (NM_001128915) 20553 NM_000782 1591 Hs.89663 NM_000782 ENSG00000019186 CYP24A1 CP24|CYP24|HCAI|HCINF1|P450-CC24 cytochrome P450 family 24 subfamily A member 1 protein-coding 150.667-74 chr11 93127522 93127871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69730 NM_001286139 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 164 chr1 20528223 20528604 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20262 NM_024544 79594 Hs.10101 NM_024544 ENSG00000090432 MUL1 C1orf166|GIDE|MAPL|MULAN|RNF218 mitochondrial E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 153.667-370 chr8 26486531 26486867 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27173 NM_007257 10687 Hs.591838 NM_007257 ENSG00000240694 PNMA2 MA2|MM2|RGAG2 PNMA family member 2 protein-coding 138.333-140 chr4 182493060 182493325 + 0.666667 NA intron (NM_001080477, intron 3 of 27) intron (NM_001080477, intron 3 of 27) 249790 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 175.333-88 chr2 67211295 67211792 + 0.666667 NA intron (NR_038844, intron 1 of 7) AluSz6|SINE|Alu -1865 NR_110568 101927661 Hs.580508 NR_110568 ENSG00000235885 LOC101927661 - uncharacterized LOC101927661 ncRNA 156-116 chr5 97318603 97319008 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -135558 NM_001159749 55781 Hs.27021 NM_018343 ENSG00000058729 RIOK2 RIO2 RIO kinase 2 protein-coding 239.667-40 chr2 181602019 181602468 + 0.666667 NA intron (NR_027690, intron 2 of 11) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 54862 NM_201548 375298 Hs.732358 NM_201548 ENSG00000188452 CERKL RP26 ceramide kinase like protein-coding 125.333-126 chr4 89780979 89781318 + 0.666667 NA intron (NM_001146054, intron 4 of 5) intron (NM_001146054, intron 4 of 5) -55253 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 164-97 chr6 27729018 27729371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32550 NR_038929 100131289 Hs.200573 NR_038929 LOC100131289 - uncharacterized LOC100131289 ncRNA 136.333-213 chr8 133720337 133720663 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36434 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 169-4 chr1 159102041 159102376 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -25307 NM_001348247 9447 Hs.733411 NM_004833 ENSG00000163568 AIM2 PYHIN4 absent in melanoma 2 protein-coding 114.333-156 chr4 40876107 40876348 + 0.666667 NA intron (NM_173075, intron 11 of 16) L1ME1|LINE|L1 -19035 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 146.333-330 chr8 112077455 112077798 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -565867 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 126.667-51 chr14 64681758 64682008 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22541 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 220-22 chr11 32866569 32867126 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -25964 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 162-14 chr10 59515382 59515721 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy -152370 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 193-36 chr18 6084413 6084985 + 0.666667 NA intron (NM_001365766, intron 15 of 16) L2c|LINE|L2 -172045 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 116.333-11 chr1 100215344 100215651 + 0.666667 NA intron (NM_001918, intron 6 of 10) intron (NM_001918, intron 6 of 10) 34337 NM_001918 1629 Hs.709187 NM_001918 ENSG00000137992 DBT BCATE2|BCKAD-E2|BCKADE2|BCOADC-E2|E2|E2B dihydrolipoamide branched chain transacylase E2 protein-coding 115.667-198 chr7 36358383 36358582 + 0.666667 NA intron (NM_001100425, intron 2 of 6) intron (NM_001100425, intron 2 of 6) 8758 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 135-57 chr20 45490349 45490725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20784 NM_006103 10406 Hs.2719 NM_006103 ENSG00000101443 WFDC2 EDDM4|HE4|WAP5|dJ461P17.6 WAP four-disulfide core domain 2 protein-coding 180-58 chr2 198805776 198806157 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -430869 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 210.667-24 chr10 106343322 106343726 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 203359 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 113.333-169 chr3 34926868 34927205 + 0.666667 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 466987 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 422.333-7 chr5 154350750 154351509 + 0.666667 NA intron (NM_198321, intron 4 of 11) MIR|SINE|MIR 4023 NR_031626 100302181 NR_031626 ENSG00000221430 MIR1294 MIRN1294|hsa-mir-1294|mir-1294 microRNA 1294 ncRNA 179.667-12 chr1 217181028 217181403 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43513 NM_001243510 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 128-61 chr20 60230247 60230525 + 0.666667 NA intron (NR_046099, intron 3 of 4) intron (NR_046099, intron 3 of 4) -78088 NR_030376 693231 NR_030376 ENSG00000207802 MIR646 MIRN646|hsa-mir-646 microRNA 646 ncRNA 123.667-35 chr10 96857429 96857639 + 0.666667 NA intron (NM_001170766, intron 2 of 8) L2|LINE|L2 24589 NM_032440 84458 Hs.427927 NM_015652 ENSG00000196233 LCOR C10orf12|MLR2 ligand dependent nuclear receptor corepressor protein-coding 118-48 chr16 5227582 5227874 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129908 NM_001289029 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 144.667-155 chr2 174618299 174618666 + 0.666667 NA intron (NM_001077269, intron 1 of 7) intron (NM_001077269, intron 1 of 7) 16123 NM_003387 7456 Hs.128067 NM_003387 ENSG00000115935 WIPF1 PRPL-2|WAS2|WASPIP|WIP WAS/WASL interacting protein family member 1 protein-coding 140.667-93 chr16 61027487 61027907 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL 28069 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 153.667-72 chr11 74550183 74550577 + 0.666667 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -42202 NM_006591 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 131.667-148 chr4 85221954 85222193 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -253077 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 219.667-14 chr11 101062472 101062894 + 0.666667 NA non-coding (NR_073142, exon 3 of 7) non-coding (NR_073142, exon 3 of 7) 66380 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 114.333-61 chr12 117791641 117791890 + 0.666667 NA intron (NM_173598, intron 3 of 19) intron (NM_173598, intron 3 of 19) 177225 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 209-45 chr14 64091713 64092329 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 60 of 114) intron (NM_015180, intron 60 of 114) 3104 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 137.333-140 chr4 123206000 123206254 + 0.666667 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) intron (NM_001345856, intron 14 of 15) -190668 NM_199327 10252 Hs.744854 NM_005841 ENSG00000164056 SPRY1 hSPRY1 sprouty RTK signaling antagonist 1 protein-coding 126.333-191 chr9 132843700 132843967 + 0.666667 NA intron (NM_001317959, intron 6 of 14) intron (NM_001317959, intron 6 of 14) -34511 NR_133631 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 119-44 chr14 49172759 49173056 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 413473 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 153.333-368 chr6 122638337 122638632 + 0.666667 NA intron (NM_032471, intron 2 of 3) intron (NM_032471, intron 2 of 3) -14245 NM_001270395 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 160-92 chr4 188778976 188779391 + 0.666667 NA intron (NR_149102, intron 1 of 2) intron (NR_149102, intron 1 of 2) 2526 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 193.667-124 chr7 28561926 28562384 + 0.666667 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) intron (NM_182899, intron 3 of 9) -123978 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 134-9 chr1 194064400 194064728 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 759819 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 150.333-344 chr5 132840251 132840582 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9769 NM_001172700 134549 Hs.519574 NM_133456 ENSG00000164403 SHROOM1 APXL2 shroom family member 1 protein-coding 137-82 chr5 88450453 88450801 + 0.666667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -11537 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 161-89 chr6 121840331 121840690 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 404864 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 206.666-96 chr5 20195753 20196350 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -109500 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 125-23 chr11 22475629 22475859 + 0.666667 NA intron (NR_120583, intron 2 of 3) intron (NR_120583, intron 2 of 3) 16275 NR_120583 102723378 Hs.374255 NR_120583 ENSG00000255323 LINC01495 - long intergenic non-protein coding RNA 1495 ncRNA 197-5 chr1 116388054 116388491 + 0.666667 NA intron (NM_001160234, intron 5 of 22) intron (NM_001160234, intron 5 of 22) 4902 NM_001160234 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 134-116 chr9 117699419 117699719 + 0.666667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -4834 NM_138557 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 176-78 chr5 110810948 110811364 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72149 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 155-68 chr2 124365795 124366179 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 340700 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 151.667-365 chr8 81637901 81638301 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -6824 NR_146081 650747 NR_146081 IMPA1P1 IMPA1P inositol monophosphatase 1 pseudogene 1 pseudo 204.667-58 chr17 70291127 70291594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121825 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 208-98 chr22 25634597 25635118 + 0.666667 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) intron (NM_001362778, intron 2 of 19) 70182 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 128-112 chr7 131386578 131386881 + 0.666667 NA intron (NM_001321316, intron 2 of 17) intron (NM_001321316, intron 2 of 17) 58853 NM_013255 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 118.667-42 chr11 50481306 50481645 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 72328 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 147.667-281 chr5 41807755 41808126 + 0.666667 NA intron (NM_001364301, intron 7 of 16) intron (NM_001364301, intron 7 of 16) 35717 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 131.333-198 chr9 115813439 115813788 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -69374 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 191.667-131 chr9 8486543 8486956 + 0.666667 NA intron (NM_002839, intron 27 of 45) MIRb|SINE|MIR 247197 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 160-115 chr8 54813822 54814166 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 197898 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 203.667-21 chr11 100960308 100960869 + 0.666667 NA intron (NM_001367945, intron 15 of 25) intron (NM_001367945, intron 15 of 25) 26314 NR_145747 109616988 NR_145747 SNORD13I - small nucleolar RNA, C/D box 13I snoRNA 114-167 chr8 85292636 85292959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47339 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 163.667-20 chr10 33377264 33377583 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42518 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 151.667-55 chr10 123961136 123961526 + 0.666667 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 -69524 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 208 chr1 10361640 10362102 + 0.666667 NA intron (NM_001365951, intron 40 of 48) intron (NM_001365951, intron 40 of 48) -37193 NM_001304452 5226 Hs.464071 NM_002631 ENSG00000142657 PGD 6PGD phosphogluconate dehydrogenase protein-coding 126.667-182 chr9 83123679 83124000 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -60697 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 183.667-57 chr15 97423989 97424339 + 0.666667 NA intron (NR_120324, intron 3 of 4) intron (NR_120324, intron 3 of 4) 97647 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 111.667-100 chr17 30113971 30114231 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -2706 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 260-39 chr2 119433638 119434252 + 0.666667 NA intron (NM_183240, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 2091 NM_183240 140738 Hs.26216 NM_183240 ENSG00000171227 TMEM37 PR|PR1 transmembrane protein 37 protein-coding 223.333-75 chr2 99417333 99417808 + 0.666667 NA intron (NR_135652, intron 12 of 21) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 72447 NM_001037872 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 152-108 chr3 136019634 136019931 + 0.666667 NA intron (NM_002718, intron 2 of 13) intron (NM_002718, intron 2 of 13) -2960 NM_181897 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 155.667-208 chr22 38463407 38463775 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4471 NM_016657 11015 Hs.745072 NM_006855 ENSG00000100196 KDELR3 ERD2L3 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3 protein-coding 252-110 chr8 121870070 121870708 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -228949 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 119-99 chr3 56365509 56365850 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 2 of 17) MER58B|DNA|hAT-Charlie 102788 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 145.667-53 chr11 108605682 108605982 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12064 NM_015065 23086 Hs.28540 NM_015065 ENSG00000110723 EXPH5 SLAC2-B|SLAC2B exophilin 5 protein-coding 207.667-91 chr4 109734378 109734829 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -4533 NM_030821 81579 Hs.389452 NM_030821 ENSG00000123739 PLA2G12A GXII|PLA2G12|ROSSY phospholipase A2 group XIIA protein-coding 132-61 chr2 74647340 74647709 + 0.666667 NA intron (NM_001321739, intron 1 of 10) ORSL|DNA|hAT-Tip100 513 NM_138804 130951 Hs.348645 NM_138804 ENSG00000159374 M1AP C2orf65|D6Mm5e|SPATA37 meiosis 1 associated protein protein-coding 112-147 chr4 18789446 18789724 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -767710 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 169.333-97 chr17 40656232 40656641 + 0.666667 NA exon (NM_152349, exon 6 of 6) exon (NM_152349, exon 6 of 6) -8618 NM_003079 6605 Hs.743978 NM_003079 ENSG00000073584 SMARCE1 BAF57|CSS5 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 protein-coding 178.333-144 chr5 112967048 112967576 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -9486 NM_152624 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 224-60 chr3 100184443 100185008 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1099 NR_028357 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 149.667-382 chr7 114947017 114947407 + 0.666667 NA intron (NM_001166345, intron 3 of 4) intron (NM_001166345, intron 3 of 4) 25058 NM_001166345 29969 Hs.741413 NM_199072 ENSG00000135272 MDFIC HIC|MDFIC1 MyoD family inhibitor domain containing protein-coding 127.333-55 chr15 60019843 60020097 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 15659 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 165.333-75 chr14 61367065 61367488 + 0.666667 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 45833 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 142.333-253 chr9 28243056 28243353 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) AluSx1|SINE|Alu 476101 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 180-14 chr10 83166476 83166854 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 510424 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 127.333-135 chr4 168505222 168505519 + 0.666667 NA intron (NM_001166108, intron 1 of 21) intron (NM_001166108, intron 1 of 21) 8318 NM_001166108 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 122-29 chr12 120047336 120047541 + 0.666667 NA intron (NR_147894, intron 3 of 8) MIRc|SINE|MIR 57594 NR_147892 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 193.667-139 chr8 123529952 123530416 + 0.666667 NA intron (NM_148177, intron 1 of 5) intron (NM_148177, intron 1 of 5) 1959 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 119-143 chr8 99072736 99072973 + 0.666667 NA intron (NR_047582, intron 4 of 8) L1M2|LINE|L1 59588 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 126.667-86 chr2 154789325 154789598 + 0.666667 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) intron (NM_002239, intron 2 of 2) 90766 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 120.667-73 chr17 62029266 62029487 + 0.666667 NA intron (NM_005121, intron 8 of 29) intron (NM_005121, intron 8 of 29) 35902 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 128.667-77 chr17 64487718 64487952 + 0.666667 NA intron (NM_007215, intron 4 of 7) FLAM_C|SINE|Alu 9219 NM_007215 11232 Hs.437009 NM_007215 ENSG00000256525 POLG2 HP55|MTPOLB|PEOA4|POLB|POLG-BETA|POLGB DNA polymerase gamma 2, accessory subunit protein-coding 150.667-43 chr10 70217810 70218114 + 0.666667 NA intron (NM_021129, intron 3 of 10) intron (NM_021129, intron 3 of 10) 15467 NM_021129 5464 Hs.437403 NM_021129 ENSG00000180817 PPA1 HEL-S-66p|IOPPP|PP|PP1|SID6-8061 pyrophosphatase (inorganic) 1 protein-coding 263-48 chr4 185040467 185040946 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11190 NR_147059 101928877 Hs.246506 NR_147059 ENSG00000250754 LINC02436 - long intergenic non-protein coding RNA 2436 ncRNA 168.333-151 chr4 86543682 86544046 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1312 NR_039657 100616463 NR_039657 ENSG00000266515 MIR4452 - microRNA 4452 ncRNA 127.667-182 chr8 117552923 117553219 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32358 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 269.333-51 chr2 174771156 174771891 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7051 NM_001039523 1134 Hs.434479 NM_000079 ENSG00000138435 CHRNA1 ACHRA|ACHRD|CHRNA|CMS1A|CMS1B|CMS2A|FCCMS|SCCMS cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunit protein-coding 115.667-142 chr22 33391496 33391703 + 0.666667 NA intron (NM_133642, intron 7 of 14) intron (NM_133642, intron 7 of 14) 45070 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 167.667-178 chr5 164017142 164017596 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 450033 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 197-72 chr3 59017650 59017945 + 0.666667 NA non-coding (NR_110820, exon 3 of 3) non-coding (NR_110820, exon 3 of 3) 32228 NM_001351532 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 185.667-81 chr20 5031287 5031665 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21163 NM_203327 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 156.667-167 chr2 21917385 21917765 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -206923 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 220-52 chr18 74591298 74591810 + 0.666667 NA TTS (NR_024484) TTS (NR_024484) 6281 NR_024484 400657 Hs.61508 NM_001008234 ENSG00000264247 LINC00909 - long intergenic non-protein coding RNA 909 ncRNA 184.667-135 chr8 90879937 90880369 + 0.666667 NA intron (NM_022351, intron 4 of 12) intron (NM_022351, intron 4 of 12) 88378 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 112-169 chr5 61186067 61186268 + 0.666667 NA intron (NR_109908, intron 3 of 3) intron (NR_109908, intron 3 of 3) -23699 NM_001048249 643155 Hs.508479 NM_001048249 ENSG00000188725 SMIM15 C5orf43 small integral membrane protein 15 protein-coding 133.667-111 chr4 71075973 71076334 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 82504 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 116.667-164 chr5 124158020 124158366 + 0.666667 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 280327 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 114.333-165 chr4 180773913 180774123 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 385131 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 142-76 chr20 55912056 55912451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 93266 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 117-47 chr14 85088312 85088544 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -183504 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 132-24 chr11 41240339 41240634 + 0.666667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 219150 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 246.333-18 chr10 116098819 116099412 + 0.666667 NA intron (NM_145793, intron 4 of 8) MIR|SINE|MIR 95674 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 210.333-144 chr6 38121513 38122030 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 5 of 5) L1MC4|LINE|L1 302044 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 152-62 chr15 60167431 60167795 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 163302 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 118-98 chr4 88405430 88405763 + 0.666667 NA exon (NM_017912, exon 10 of 23) exon (NM_017912, exon 10 of 23) 26857 NM_017912 55008 Hs.529317 NM_017912 ENSG00000138642 HERC6 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6 protein-coding 191-49 chr5 68261120 68261568 + 0.666667 NA intron (NM_181523, intron 2 of 15) MIR3|SINE|MIR -27175 NM_181524 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 152.333-158 chr18 13592979 13593391 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) AluSz|SINE|Alu -17929 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 183.333-155 chr8 69200180 69200650 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -96225 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 171.667-26 chr11 24079072 24079433 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -417801 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 131-36 chr16 76926608 76926880 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 57808 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 137-62 chr3 100574046 100574398 + 0.666667 NA intron (NM_001363876, intron 6 of 6) L1PA4|LINE|L1 -35379 NM_032787 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 127.667-200 chr9 115998199 115998515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73150 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 229.667-78 chr8 85956698 85957229 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 112705 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 149-152 chr8 129443231 129443622 + 0.666667 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 40716 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 230.667-45 chr2 191503260 191503654 + 0.666667 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -174615 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 167.333-47 chr10 79055070 79055503 + 0.666667 NA intron (NR_024431, intron 3 of 9) AluJr|SINE|Alu 12162 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 158.667-302 chr7 43595069 43595415 + 0.666667 NA intron (NM_004760, intron 1 of 6) intron (NM_004760, intron 1 of 6) 12134 NM_004760 9263 Hs.709489 NM_004760 ENSG00000164543 STK17A DRAK1 serine/threonine kinase 17a protein-coding 169-60 chr22 40173204 40173659 + 0.666667 NA intron (NM_001024843, intron 4 of 23) L1M5|LINE|L1 -4494 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 141.333-136 chr21 25704994 25705394 + 0.666667 NA intron (NM_001270407, intron 5 of 8) intron (NM_001270407, intron 5 of 8) -29778 NM_001197297 2551 Hs.473470 NM_002040 ENSG00000154727 GABPA E4TF1-60|E4TF1A|NFT2|NRF2|NRF2A|RCH04A07 GA binding protein transcription factor subunit alpha protein-coding 188-10 chr1 160330891 160331309 + 0.666667 NA intron (NM_001098398, intron 6 of 32) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 12150 NM_001098398 1314 Hs.162121 NM_004371 ENSG00000122218 COPA AILJK|HEP-COP|alpha-COP coatomer protein complex subunit alpha protein-coding 216-25 chr13 92565818 92566337 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 75914 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 179.667-115 chr5 146208721 146209166 + 0.666667 NA intron (NM_018989, intron 1 of 20) intron (NM_018989, intron 1 of 20) 5338 NM_018989 54439 Hs.61441 NM_018989 ENSG00000091009 RBM27 ARRS1|Psc1|ZC3H18|ZC3H20 RNA binding motif protein 27 protein-coding 154.667-320 chr5 128053350 128053658 + 0.666667 NA intron (NR_152812, intron 4 of 4) MER1B|DNA|hAT-Charlie 29671 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 180.667-126 chr6 114196809 114197324 + 0.666667 NA intron (NR_125845, intron 8 of 9) intron (NR_125845, intron 8 of 9) -134189 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 196.667-16 chr10 69191889 69192409 + 0.666667 NA intron (NM_001323588, intron 6 of 13) intron (NM_001323588, intron 6 of 13) 11915 NM_003171 6832 Hs.106469 NM_003171 ENSG00000156502 SUPV3L1 SUV3 Suv3 like RNA helicase protein-coding 123.667-137 chr4 39994545 39994881 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16757 NM_001100400 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 136.667-119 chr3 108096990 108097361 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -6087 NM_198793 961 Hs.446414 NM_001777 ENSG00000196776 CD47 IAP|MER6|OA3 CD47 molecule protein-coding 137-79 chr5 32708219 32708579 + 0.666667 NA intron (NM_001364458, intron 1 of 7) intron (NM_001364458, intron 1 of 7) -2238 NM_001204376 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 170.333-148 chr3 171965806 171966091 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -65208 NR_046852 100874219 Hs.730556 NR_046852 ENSG00000234717 TMEM212-AS1 - TMEM212 antisense RNA 1 ncRNA 170.333-175 chr5 107940409 107940771 + 0.666667 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) intron (NM_001163315, intron 7 of 8) -269653 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 116.667-27 chr11 122448760 122448966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25992 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 146.667-333 chr8 89334386 89334714 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 423161 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 151.667-260 chr4 162787948 162788368 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 305470 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 164-13 chr10 47123168 47123597 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -176815 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 124-42 chr15 80222018 80222365 + 0.666667 NA intron (NM_001352888, intron 1 of 2) intron (NM_001352888, intron 1 of 2) 30022 NM_001352888 100996492 Hs.20034 NM_001352888 ENSG00000259417 CTXND1 LINC01314 cortexin domain containing 1 protein-coding 112.667-281 chr9 95310074 95310327 + 0.666667 NA intron (NM_001243744, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu 7054 NM_001243743 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 114-110 chr4 114498832 114499122 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -99425 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 132.333-84 chr2 63569307 63569602 + 0.666667 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) intron (NR_148705, intron 1 of 16) 19023 NM_015910 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 125.667-175 chr7 26855987 26856221 + 0.666667 NA intron (NM_003930, intron 1 of 12) intron (NM_003930, intron 1 of 12) 1619 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 161.333-2 chr1 32040052 32040430 + 0.666667 NA intron (NR_073498, intron 8 of 8) AluSq2|SINE|Alu 26373 NR_073498 10657 Hs.445893 NM_006559 ENSG00000121774 KHDRBS1 Sam68|p62|p68 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 1 protein-coding 119.333-151 chr3 78629368 78629703 + 0.666667 NA intron (NM_002941, intron 25 of 30) AluJr|SINE|Alu 389924 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 126.333-135 chr4 147214696 147215027 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 129856 NR_031662 100313938 NR_031662 ENSG00000221369 MIR548G MIRN548G|hsa-mir-548g microRNA 548g ncRNA 153-145 chr8 87067976 87068361 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 201753 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 120 chr1 7618135 7618450 + 0.666667 NA intron (NM_001349608, intron 5 of 21) intron (NM_001349608, intron 5 of 21) -51438 NM_001349614 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 145.667-295 chr8 121301997 121302361 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -337167 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 316-18 chr16 53752054 53752855 + 0.666667 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 48298 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 164.333-170 chr4 32942109 32942438 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 591235 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 183.667-9 chr1 106266757 106267068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -238659 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 164.333-45 chr11 104661294 104661574 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -52132 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 123-110 chr6 150069038 150069299 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_024518) promoter-TSS (NM_024518) -47 NM_024518 79465 Hs.15422 NM_024518 ENSG00000131019 ULBP3 N2DL-3|NKG2DL3|RAET1N UL16 binding protein 3 protein-coding 112.333-164 chr3 101364793 101365022 + 0.666667 NA exon (NM_001282803, exon 7 of 21) exon (NM_001282803, exon 7 of 21) -44332 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 135.333-73 chr18 33427090 33427490 + 0.666667 NA intron (NM_001308126, intron 2 of 23) intron (NM_001308126, intron 2 of 23) 13281 NM_001371121 120.333-120 chr21 35298965 35299154 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -249761 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 193.333-166 chr7 35839518 35839882 + 0.666667 NA intron (NM_001363715, intron 3 of 13) AluSg7|SINE|Alu 38481 NM_001363715 989 Hs.191346 NM_001788 ENSG00000122545 SEPTIN7 CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A septin 7 protein-coding 168.333-201 chr7 114079527 114079977 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6575 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 167-71 chr3 38941495 38941864 + 0.666667 NA intron (NM_014139, intron 3 of 25) L1ME1|LINE|L1 8882 NM_014139 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 113.667-97 chr2 27687937 27688241 + 0.666667 NA intron (NM_018158, intron 11 of 13) intron (NM_018158, intron 11 of 13) -24249 NM_001282730 9913 Hs.6232 NM_014860 ENSG00000119760 SUPT7L SPT7L|STAF65|STAF65(gamma)|STAF65G|SUPT7H SPT7 like, STAGA complex gamma subunit protein-coding 120.667-56 chr14 81238843 81239131 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17597 NM_201595 2957 Hs.592334 NM_015859 ENSG00000165417 GTF2A1 TF2A1|TFIIA|TFIIA-42|TFIIAL general transcription factor IIA subunit 1 protein-coding 150-4 chr1 94172797 94173213 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001328667, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_001328667, exon 22 of 22) -51857 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 150.667-126 chr14 76295526 76295819 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -75675 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 189-59 chr3 4744312 4744726 + 0.666667 NA intron (NM_001168272, intron 43 of 60) MER58A|DNA|hAT-Charlie 7071 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 123.333-232 chr9 78259229 78259590 + 0.666667 NA intron (NM_001349840, intron 11 of 15) L1ME3B|LINE|L1 23334 NM_001349839 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 192.667-4 chr1 68949223 68949705 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -106434 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 143-100 chr5 158821589 158821964 + 0.666667 NA intron (NM_001324107, intron 8 of 15) intron (NM_001324107, intron 8 of 15) 276180 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 161.333-118 chr17 70901762 70902047 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H-int|LTR|ERVL-MaLR 300275 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 116.333-207 chr8 89470176 89470501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 287373 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 132.667-179 chr8 92116631 92116963 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13412 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 122-65 chr20 60029155 60029353 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -26671 NR_161291 284756 Hs.335319 NR_126504 ENSG00000176659 C20orf197 - chromosome 20 open reading frame 197 ncRNA 154-65 chr16 8290610 8290921 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 299073 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 141.667-134 chr21 21275342 21275610 + 0.666667 NA intron (NM_001352592, intron 2 of 18) AluY|SINE|Alu 128314 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 114.333-237 chr9 30386765 30387009 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21567 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 161.333-233 chr5 82168437 82168763 + 0.666667 NA intron (NM_031482, intron 4 of 7) intron (NM_031482, intron 4 of 7) 109754 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 176.667-93 chr22 19353009 19353379 + 0.666667 NA intron (NM_003325, intron 23 of 24) intron (NM_003325, intron 23 of 24) -61475 NM_007098 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 134.333-126 chr4 48970800 48971134 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -15308 NM_025087 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 150.333-182 chr19 32456175 32456468 + 0.666667 NA intron (NM_207325, intron 10 of 18) AluJo|SINE|Alu 50196 NM_207325 147991 Hs.194392 NM_207325 ENSG00000178904 DPY19L3 - dpy-19 like C-mannosyltransferase 3 protein-coding 132-82 chr3 97738571 97738801 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 16 of 17) intron (NM_001080448, intron 16 of 17) -25835 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 126-71 chr3 97801246 97801559 + 0.666667 NA TTS (NR_136595) TTS (NR_136595) -20609 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 116.333-172 chr5 55467008 55467289 + 0.666667 NA intron (NR_103485, intron 4 of 6) intron (NR_103485, intron 4 of 6) 41778 NR_049869 100847019 NR_049869 ENSG00000265135 MIR5687 - microRNA 5687 ncRNA 131.333-66 chr17 55204070 55204334 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -60758 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 183.667-41 chr13 99068785 99069184 + 0.666667 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) intron (NM_015296, intron 1 of 55) 17710 NM_015296 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 162.333-160 chr3 57252017 57252340 + 0.666667 NA intron (NM_012096, intron 11 of 21) intron (NM_012096, intron 11 of 21) -17388 NR_135535 105377102 Hs.745243 NR_135535 LOC105377102 - uncharacterized LOC105377102 ncRNA 120.667-65 chr15 82178748 82179081 + 0.666667 NA intron (NM_001040610, intron 13 of 17) AluJo|SINE|Alu 83614 NM_001322845 79631 Hs.459114 NM_024580 ENSG00000140598 EFL1 EFTUD1|FAM42A|HsT19294|RIA1|SDS2 elongation factor like GTPase 1 protein-coding 176.667-69 chr18 30550986 30551326 + 0.666667 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 252246 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 148-150 chr6 140837137 140837429 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 153469 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 136.667-2 chr1 29328171 29328413 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 21822 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 118.667-125 chr21 42425871 42426154 + 0.666667 NA intron (NM_018961, intron 7 of 14) MLT2D|LTR|ERVL 22110 NM_001243467 53347 Hs.473912 NM_018961 ENSG00000160185 UBASH3A CLIP4|STS-2|TULA|TULA-1 ubiquitin associated and SH3 domain containing A protein-coding 181.333-82 chr2 155678829 155679271 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 575881 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 160.333-75 chr12 48615968 48616417 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 38326 NR_002968 677815 Hs.689717 NR_002968 ENSG00000221491 SNORA2C ACA34|MIR1291|SNORA34 small nucleolar RNA, H/ACA box 2C snoRNA 179-17 chr11 34624084 34624461 + 0.666667 NA intron (NM_012153, intron 1 of 8) intron (NM_012153, intron 1 of 8) 3179 NM_001206615 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 136.667-20 chr10 62643124 62643394 + 0.666667 NA intron (NM_199451, intron 5 of 7) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 122811 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 115.667-170 chr5 5162751 5163022 + 0.666667 NA intron (NM_139056, intron 3 of 22) intron (NM_139056, intron 3 of 22) 22556 NR_136935 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 183 chr1 12434739 12435114 + 0.666667 NA intron (NM_015378, intron 65 of 69) intron (NM_015378, intron 65 of 69) -72320 NR_003022 677882 Hs.658450 NR_003022 ENSG00000266079 SNORA59B ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59B snoRNA 137.333-204 chr9 26241860 26242206 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 175358 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 146.667-343 chr8 136831269 136831573 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) intron (NR_147196, intron 4 of 5) 300623 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 149.333-45 chr10 48617863 48618301 + 0.666667 NA intron (NM_001347738, intron 2 of 10) L1M4|LINE|L1 -12951 NM_001347737 58504 Hs.655672 NM_021226 ENSG00000128805 ARHGAP22 RhoGAP2|RhoGap22 Rho GTPase activating protein 22 protein-coding 191.667-106 chr6 35848187 35848660 + 0.666667 NA intron (NM_003137, intron 13 of 15) AluJo|SINE|Alu 43071 NM_182548 222662 Hs.367947 NM_182548 ENSG00000197753 LHFPL5 DFNB67|TMHS|dJ510O8.8 LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein-coding 125.667-202 chr9 115689776 115690025 + 0.666667 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 54339 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 173.333-7 chr1 62730029 62730355 + 0.666667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -41806 NM_001367561 85440 Hs.744927 NM_033407 ENSG00000116641 DOCK7 EIEE23|ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 protein-coding 156-118 chr5 114338520 114338881 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23370 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 132.667-2 chr1 39829931 39830250 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 41114 NR_135805 101929536 Hs.552820 NR_135805 ENSG00000261798 LOC101929536 - uncharacterized LOC101929536 ncRNA 112.333 chr1 11545447 11545760 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -63928 NR_104624 101929181 Hs.568616 NR_104624 ENSG00000235643 LINC01647 - long intergenic non-protein coding RNA 1647 ncRNA 143.667-245 chr8 51340571 51340951 + 0.666667 NA intron (NM_144651, intron 20 of 22) intron (NM_144651, intron 20 of 22) 468684 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 207.333-60 chr12 29363286 29363785 + 0.666667 NA intron (NM_016570, intron 5 of 13) intron (NM_016570, intron 5 of 13) 17637 NM_016570 51290 Hs.339453 NM_016570 ENSG00000087502 ERGIC2 CDA14|Erv41|PTX1|cd002 ERGIC and golgi 2 protein-coding 117-131 chr7 48057471 48057714 + 0.666667 NA intron (NM_001100159, intron 8 of 8) L1MA7|LINE|L1 22049 NM_001267866 136288 Hs.258357 NM_001100159 ENSG00000164746 C7orf57 - chromosome 7 open reading frame 57 protein-coding 166.333-34 chr10 91243033 91243436 + 0.666667 NA intron (NM_001256549, intron 3 of 9) intron (NM_001256549, intron 3 of 9) 22571 NM_032373 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 143.667-31 chr10 115769850 115770122 + 0.666667 NA intron (NM_207303, intron 27 of 28) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 424803 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 143.667-172 chr3 165030118 165030521 + 0.666667 NA intron (NM_001041, intron 25 of 47) intron (NM_001041, intron 25 of 47) 48177 NM_001041 6476 Hs.429596 NM_001041 ENSG00000090402 SI - sucrase-isomaltase protein-coding 116-147 chr7 50906399 50906585 + 0.666667 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -113039 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 116-158 chr8 122822960 122823209 + 0.666667 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 41429 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 126.667-156 chr6 116547172 116547398 + 0.666667 NA intron (NM_153036, intron 2 of 2) intron (NM_153036, intron 2 of 2) -1601 NM_001139444 100128327 Hs.134795 NM_001139444 ENSG00000173626 TRAPPC3L BET3L|bA259P20.2 trafficking protein particle complex 3 like protein-coding 173.667-18 chr10 63833873 63834237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -312165 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 154.333-189 chr21 15256132 15256534 + 0.666667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -191333 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 176-32 chr14 62790792 62791211 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 9 of 10) L1MA9|LINE|L1 254457 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 136-32 chr14 49401809 49402063 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 184444 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 114-37 chr14 61615241 61615469 + 0.666667 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -44702 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 156-94 chr3 184003340 184003735 + 0.666667 NA intron (NR_135125, intron 2 of 6) MIRc|SINE|MIR -2801 NR_046570 100873982 Hs.570696 NR_046570 ENSG00000223882 ABCC5-AS1 - ABCC5 antisense RNA 1 ncRNA 198.667-3 chr1 82561182 82561696 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -341744 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 142-128 chr6 100785937 100786302 + 0.666667 NA intron (NM_006828, intron 8 of 41) intron (NM_006828, intron 8 of 41) 95210 NM_006828 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 117-71 chr18 22503256 22503491 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85458 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 177.333-136 chr5 167033887 167034300 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39149 NM_001122679 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 195-72 chr3 99883884 99884216 + 0.666667 NA intron (NM_001042459, intron 4 of 4) intron (NM_001042459, intron 4 of 4) -7847 NM_001282794 11259 Hs.104672 NM_014890 ENSG00000168386 FILIP1L DOC-1|DOC1|GIP130|GIP90 filamin A interacting protein 1 like protein-coding 213.667-63 chr4 45873324 45873813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 250486 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 167-19 chr10 125516254 125516581 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57954 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 129.667-188 chr9 103123117 103123346 + 0.666667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 127898 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 222.333-43 chr2 62159429 62159875 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -36463 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 186.667-110 chr4 150810593 150810990 + 0.666667 NA intron (NM_001367550, intron 31 of 56) AluJr|SINE|Alu 204476 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 205.333-111 chr19 30005344 30005796 + 0.666667 NA intron (NM_001252641, intron 5 of 10) intron (NM_001252641, intron 5 of 10) 63331 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 132.667-68 chr17 58292841 58293101 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -12036 NM_000250 4353 Hs.458272 NM_000250 ENSG00000005381 MPO - myeloperoxidase protein-coding 129.667-131 chr4 159793313 159793653 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15699 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 163.667-190 chr4 163305859 163306299 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 26517 NM_000909 4886 Hs.519057 NM_000909 ENSG00000164128 NPY1R NPY1-R|NPYR neuropeptide Y receptor Y1 protein-coding 182.667-140 chr5 151867167 151867535 + 0.666667 NA intron (NM_000171, intron 3 of 8) intron (NM_000171, intron 3 of 8) 57500 NM_000171 2741 Hs.121490 NM_000171 ENSG00000145888 GLRA1 HKPX1|STHE glycine receptor alpha 1 protein-coding 174.333-95 chr3 176935090 176935586 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118337 NR_110819 101928684 Hs.639352 NR_110819 ENSG00000228308 LINC01209 - long intergenic non-protein coding RNA 1209 ncRNA 144-110 chr3 90359670 90359953 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1252190 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 119.333-95 chr15 62720930 62721128 + 0.666667 NA intron (NM_015059, intron 22 of 55) intron (NM_015059, intron 22 of 55) 73718 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 117-72 chr18 51224563 51224889 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -27045 NM_016626 51320 Hs.465144 NM_016626 ENSG00000176624 MEX3C BM-013|MEX-3C|RKHD2|RNF194 mex-3 RNA binding family member C protein-coding 162-59 chr19 57638556 57638947 + 0.666667 NA intron (NM_001322306, intron 3 of 4) L1MB3|LINE|L1 5583 NM_198855 10520 Hs.590977 NM_006385 ENSG00000121417 ZNF211 C2H2-25|CH2H2-25|ZNF-25 zinc finger protein 211 protein-coding 111.667-247 chr7 117314445 117314710 + 0.666667 NA intron (NM_003391, intron 3 of 4) intron (NM_003391, intron 3 of 4) 8481 NR_024047 7472 Hs.567356 NM_003391 ENSG00000105989 WNT2 INT1L1|IRP Wnt family member 2 protein-coding 119-122 chr5 74298252 74298489 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9955 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 135-119 chr9 70564822 70565143 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 21 of 25) intron (NM_001366143, intron 21 of 25) -150325 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 116-162 chr9 84310403 84310679 + 0.666667 NA non-coding (NR_037638, exon 3 of 19) non-coding (NR_037638, exon 3 of 19) 30217 NR_037638 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 140.667-145 chr3 62261873 62262151 + 0.666667 NA non-coding (NR_038281, exon 5 of 5) non-coding (NR_038281, exon 5 of 5) 56935 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 133-84 chr6 146753094 146753334 + 0.666667 NA intron (NM_024694, intron 27 of 35) L1ME4a|LINE|L1 50610 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 123-128 chr8 124459664 124459908 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8966 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 120-142 chr8 140356218 140356502 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) intron (NM_001160372, intron 9 of 22) 101384 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 122.667-115 chr3 2890134 2890480 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 10 of 24) intron (NM_175607, intron 10 of 24) -1908 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 159.333-255 chr5 14939103 14939381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -67464 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 143-82 chr3 53439500 53439777 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -54973 NM_001128840 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 203.333-8 chr1 105649801 105650146 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31038 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 119-91 chr20 48479738 48479963 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 119939 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 126.333-68 chr17 60689132 60689426 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 3 of 25) AluSz6|SINE|Alu 11428 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 169.667-203 chr8 60791963 60792265 + 0.666667 NA intron (NM_017780, intron 3 of 37) MIRc|SINE|MIR 50855 NM_001316690 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 137.333-45 chr14 66389945 66390272 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -96263 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 147.667-215 chr22 26719868 26720281 + 0.666667 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) intron (NR_110543, intron 2 of 5) 47231 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 135.333-4 chr1 62401391 62401686 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34766 NM_001017415 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 206-13 chr1 180592411 180592965 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 33714 NR_125716 148756 NR_125716 ENSG00000236719 OVAAL LINC01131|OVAL ovarian adenocarcinoma amplified long non-coding RNA ncRNA 113-86 chr17 60942692 60942914 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 13 of 25) intron (NM_001330413, intron 13 of 25) 264952 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 121.667-106 chr2 239688980 239689305 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73718 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 200.667-75 chr2 72347106 72347584 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 17 of 19) intron (NR_135774, intron 17 of 19) -199483 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 149.667-188 chr2 25871168 25871526 + 0.666667 NA intron (NM_018263, intron 1 of 11) intron (NM_018263, intron 1 of 11) 7140 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 153-79 chr2 183028357 183028677 + 0.666667 NA intron (NM_205842, intron 1 of 31) intron (NM_205842, intron 1 of 31) 9940 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 127-70 chr5 17355107 17355312 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 32101 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 136.667-150 chr5 135516764 135517045 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 19060 NM_006161 4762 Hs.248149 NM_006161 ENSG00000181965 NEUROG1 AKA|Math4C|NEUROD3|bHLHa6|ngn1 neurogenin 1 protein-coding 137.333-128 chr4 23107000 23107350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 393086 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 177-4 chr1 169128954 169129414 + 0.666667 NA intron (NM_001677, intron 4 of 5) intron (NM_001677, intron 4 of 5) 22494 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 112.667-180 chr3 181040109 181040413 + 0.666667 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 -16419 NR_075091 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 130.333-67 chr14 66856811 66857199 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) L1M4|LINE|L1 -332435 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 141.667-10 chr1 119113557 119113831 + 0.666667 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 -26702 NR_125974 101929147 Hs.697821 NR_125974 ENSG00000231365 WARS2-AS1 - WARS2 antisense RNA 1 ncRNA 168.333-204 chr8 4371006 4371407 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) L1PA16|LINE|L1 623708 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 118-82 chr21 32168388 32168590 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -82194 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 281.667-30 chr22 17493052 17493582 + 0.666667 NA intron (NM_001290046, intron 2 of 18) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -70122 NM_001303484 83733 Hs.282982 NM_031481 ENSG00000182902 SLC25A18 GC2 solute carrier family 25 member 18 protein-coding 125.667-97 chr2 69419675 69419936 + 0.666667 NA intron (NR_045632, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 17630 NR_045631 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 143.667-63 chr12 123785686 123786017 + 0.666667 NA exon (NM_207437, exon 9 of 78) exon (NM_207437, exon 9 of 78) 23356 NM_207437 196385 Hs.622654 NM_207437 ENSG00000197653 DNAH10 - dynein axonemal heavy chain 10 protein-coding 141-65 chr5 57721487 57721762 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 70964 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 143-98 chr5 141984647 141984956 + 0.666667 NA intron (NM_001201365, intron 7 of 8) intron (NM_001201365, intron 7 of 8) 15696 NM_183401 9604 Hs.483616 NM_004290 ENSG00000013561 RNF14 ARA54|HFB30|HRIHFB2038|TRIAD2 ring finger protein 14 protein-coding 159.333-186 chr20 41101906 41102239 + 0.666667 NA intron (NM_003286, intron 13 of 20) intron (NM_003286, intron 13 of 20) -35471 NM_002660 5335 Hs.268177 NM_002660 ENSG00000124181 PLCG1 NCKAP3|PLC-II|PLC1|PLC148|PLCgamma1 phospholipase C gamma 1 protein-coding 234.667-103 chr7 21214072 21214643 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -213726 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 133.667-80 chr2 160206403 160206730 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -6253 NM_001282354 3694 Hs.470399 NM_000888 ENSG00000115221 ITGB6 AI1H integrin subunit beta 6 protein-coding 137.667-147 chr4 160450535 160450793 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -672880 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 152.333-287 chr4 163437047 163437382 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36540 NM_032136 84076 Hs.303923 NM_032136 ENSG00000151005 TKTL2 - transketolase like 2 protein-coding 139.667-177 chr7 114413191 114413592 + 0.666667 NA intron (NR_033766, intron 2 of 19) intron (NR_033766, intron 2 of 19) -1424 NM_014491 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 136.333-196 chr7 105022464 105022820 + 0.666667 NA intron (NM_182931, intron 1 of 26) L1MC4|LINE|L1 8437 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 198-53 chr14 75112096 75112545 + 0.666667 NA intron (NM_033116, intron 8 of 21) intron (NM_033116, intron 8 of 21) 14728 NM_033116 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 129-36 chr15 23967593 23967953 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -7374 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 115-49 chr13 35793786 35794050 + 0.666667 NA intron (NM_001195415, intron 11 of 13) intron (NM_001195415, intron 11 of 13) 61749 NM_001195416 9201 Hs.507755 NM_004734 ENSG00000133083 DCLK1 CL1|CLICK1|DCAMKL1|DCDC3A|DCLK doublecortin like kinase 1 protein-coding 140.667-63 chr12 59418827 59419149 + 0.666667 NA Intergenic MER67A|LTR|ERV1 -177041 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 174.333-63 chr2 68506274 68506679 + 0.666667 NA intron (NM_173545, intron 3 of 9) intron (NM_173545, intron 3 of 9) 38891 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 249-11 chr10 70476925 70477558 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1526 NM_014431 27143 Hs.202351 NM_014431 ENSG00000107719 PALD1 KIAA1274|PALD phosphatase domain containing paladin 1 protein-coding 122.667-126 chr3 152976088 152976347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141086 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 198.667-135 chr4 45215720 45216242 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -489347 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 124-113 chr8 61796714 61797051 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 82094 NR_039680 100616484 NR_039680 ENSG00000264408 MIR4470 mir-4470 microRNA 4470 ncRNA 124.333-77 chr2 10818160 10818464 + 0.666667 NA intron (NM_001282704, intron 3 of 14) AluJr|SINE|Alu -5473 NM_001282707 10130 Hs.212102 NM_005742 ENSG00000143870 PDIA6 ERP5|P5|TXNDC7 protein disulfide isomerase family A member 6 protein-coding 230.333-72 chr21 31104499 31105007 + 0.666667 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 56187 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 150.333-90 chr12 115574716 115575041 + 0.666667 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 573776 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 128.667-6 chr1 78510626 78510931 + 0.666667 NA intron (NM_001039585, intron 3 of 3) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 19804 NM_001039585 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 114-75 chr2 189091143 189091372 + 0.666667 NA intron (NM_000393, intron 7 of 53) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 41854 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 118.667-131 chr3 30914154 30914349 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19590 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 230 chr1 40407760 40408327 + 0.666667 NA intron (NM_022733, intron 2 of 9) intron (NM_022733, intron 2 of 9) 11243 NM_001198980 64744 Hs.15200 NM_022733 ENSG00000084070 SMAP2 SMAP1L small ArfGAP2 protein-coding 208-109 chr3 117162134 117162521 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 240896 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 197.333-169 chr4 76729357 76729802 + 0.666667 NA intron (NM_020859, intron 3 of 10) intron (NM_020859, intron 3 of 10) 154028 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 199-46 chr2 53023895 53024369 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -321517 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 282.333-20 chr16 74930502 74931100 + 0.666667 NA intron (NM_001324172, intron 8 of 13) AluSx|SINE|Alu 54322 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 165.333-18 chr1 222080564 222080898 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -102211 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 205-105 chr8 133330752 133331098 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -33621 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 205.666-46 chr5 128180612 128181189 + 0.666667 NA non-coding (NR_046207, exon 23 of 27) non-coding (NR_046207, exon 23 of 27) 97134 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 168-57 chr2 162843411 162843696 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4786 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 187.333-60 chr14 47274368 47274863 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) L1MB8|LINE|L1 68631 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 188.667-159 chrX 153426716 153427020 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 8545 NM_001136273 139735 Hs.534554 NM_001136273 ENSG00000189420 ZFP92 ZNF897 ZFP92 zinc finger protein protein-coding 117.333-99 chr2 61832510 61832740 + 0.666667 NA intron (NR_037710, intron 4 of 5) MER1B|DNA|hAT-Charlie 21435 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 127.333-32 chr11 47327179 47327392 + 0.666667 NA intron (NM_130476, intron 31 of 32) intron (NM_130476, intron 31 of 32) 25417 NM_000256 4607 Hs.524906 NM_000256 ENSG00000134571 MYBPC3 CMD1MM|CMH4|FHC|LVNC10|MYBP-C myosin binding protein C, cardiac protein-coding 152-41 chr12 21477812 21478133 + 0.666667 NA intron (NM_002907, intron 6 of 14) intron (NM_002907, intron 6 of 14) 23663 NM_002907 5965 Hs.235069 NM_002907 ENSG00000004700 RECQL RECQL1|RecQ1 RecQ like helicase protein-coding 221-16 chr12 1031596 1032019 + 0.666667 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) intron (NR_027949, intron 2 of 15) 4059 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 159.333-190 chr20 53933868 53934179 + 0.666667 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -58314 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 143.667-51 chr12 10557026 10557448 + 0.666667 NA intron (NR_146456, intron 1 of 2) intron (NR_146456, intron 1 of 2) 3858 NR_146455 101060038 NR_146455 LINC02446 - long intergenic non-protein coding RNA 2446 ncRNA 139.333-39 chr11 85844404 85844689 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10555 NM_001286159 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 145.333-228 chr4 174839946 174840246 + 0.666667 NA intron (NR_125900, intron 2 of 4) L1ME3F|LINE|L1 8368 NR_125900 101928551 Hs.721287 NR_125900 LOC101928551 - uncharacterized LOC101928551 ncRNA 159.333-117 chr16 74642263 74642656 + 0.666667 NA intron (NM_001370543, intron 6 of 12) intron (NM_001370543, intron 6 of 12) 24418 NM_001370536 55159 Hs.567525 NM_018124 ENSG00000168411 RFWD3 FANCW|RNF201 ring finger and WD repeat domain 3 protein-coding 153-52 chr15 76534118 76534436 + 0.666667 NA intron (NR_148227, intron 23 of 32) intron (NR_148227, intron 23 of 32) -52370 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 183-43 chr15 33356205 33356614 + 0.666667 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 45442 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 132.333-17 chr10 47018023 47018400 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 106489 NM_001352524 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 158.333-263 chr5 114650675 114651011 + 0.666667 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) intron (NR_130785, intron 3 of 12) 74802 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 142.333-203 chr5 126687449 126687835 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55937 NM_207408 389320 Hs.177983 NM_207408 ENSG00000196900 TEX43 C5orf48|Tseg7 testis expressed 43 protein-coding 131.667-142 chr4 17325569 17325904 + 0.666667 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -4854 NR_145770 109616994 NR_145770 ENSG00000206780 SNORA75B - small nucleolar RNA, H/ACA box 75B snoRNA 184-104 chr7 80438299 80438575 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -63998 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 150.333-428 chr8 139944433 139944735 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 19 of 22) L1MEb|LINE|L1 155951 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 202.333-83 chr2 5789617 5790168 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22704 NR_146954 105373400 Hs.97467 NR_146954 ENSG00000237266 LINC01810 - long intergenic non-protein coding RNA 1810 ncRNA 157.333-208 chr2 227287825 227288260 + 0.666667 NA intron (NM_000091, intron 34 of 51) intron (NM_000091, intron 34 of 51) 37122 NR_102371 654841 Hs.659982 NR_102371 ENSG00000236432 LOC654841 - uncharacterized LOC654841 ncRNA 164.333-242 chr8 136210831 136211220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -319773 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 162.667-269 chr8 83186823 83187133 + 0.666667 NA Intergenic (TTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -216780 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 164.667-46 chr12 8584079 8584437 + 0.666667 NA Intergenic SVA_D|Retroposon|SVA 28601 NM_001330343 57379 Hs.149342 NM_020661 ENSG00000111732 AICDA AID|ARP2|CDA2|HEL-S-284|HIGM2 activation induced cytidine deaminase protein-coding 189.333-8 chr1 86566903 86567320 + 0.666667 NA intron (NM_012128, intron 6 of 13) intron (NM_012128, intron 6 of 13) 20033 NM_012128 22802 Hs.567422 NM_012128 ENSG00000016602 CLCA4 CaCC|CaCC2 chloride channel accessory 4 protein-coding 137.333-7 chr1 111706423 111706808 + 0.666667 NA intron (NM_001370216, intron 6 of 7) intron (NM_001370216, intron 6 of 7) 32780 NM_019099 55924 Hs.193406 NM_019099 ENSG00000197852 INKA2 C1orf183|FAM212B inka box actin regulator 2 protein-coding 129.667-78 chr17 59791395 59791596 + 0.666667 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) AluSz|SINE|Alu -49771 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 113.667-194 chr7 7240489 7240703 + 0.666667 NA intron (NM_020156, intron 3 of 3) intron (NM_020156, intron 3 of 3) -14558 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 162.667-35 chr10 102946467 102946926 + 0.666667 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) intron (NM_199076, intron 1 of 6) -28361 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 200.333-95 chr3 103252253 103252702 + 0.666667 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL 271639 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 188.333-58 chr17 59440385 59440686 + 0.666667 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 74452 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 150.667-332 chr6 70373349 70373772 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20642 NR_125857 101928353 NR_125857 EVADR - uncharacterized LOC101928353 ncRNA 140-122 chr8 118046911 118047328 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) MER5B|DNA|hAT-Charlie 64700 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 115-10 chr1 150648556 150648774 + 0.666667 NA exon (NM_018178, exon 5 of 5) exon (NM_018178, exon 5 of 5) -19043 NM_207044 2029 Hs.632456 NM_004436 ENSG00000143420 ENSA ARPP-19e endosulfine alpha protein-coding 112.667-106 chr19 47860945 47861122 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25282 NM_003167 6822 Hs.515835 NM_003167 ENSG00000105398 SULT2A1 DHEA-ST|DHEAS|HST|ST2|ST2A1|ST2A3|STD|hSTa sulfotransferase family 2A member 1 protein-coding 115.667-107 chr18 62610520 62610720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 87595 NR_126534 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 146.667-172 chr2 115522507 115522894 + 0.666667 NA intron (NM_001321912, intron 5 of 25) intron (NM_001321912, intron 5 of 25) 178885 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 217-55 chr20 12201111 12201588 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 283456 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 124.667-162 chr5 24641690 24642020 + 0.666667 NA intron (NM_001362460, intron 1 of 9) intron (NM_001362460, intron 1 of 9) 3123 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 176-10 chr1 173267024 173267405 + 0.666667 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) Charlie25|DNA|hAT-Charlie -59883 NM_003326 7292 Hs.181097 NM_003326 ENSG00000117586 TNFSF4 CD134L|CD252|GP34|OX-40L|OX4OL|TNLG2B|TXGP1 TNF superfamily member 4 protein-coding 188.667-66 chr18 75307935 75308316 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 96596 NM_001308210 10194 Hs.284217 NM_005786 ENSG00000179981 TSHZ1 CAA|NY-CO-33|SDCCAG33|TSH1 teashirt zinc finger homeobox 1 protein-coding 122-76 chr3 106049821 106050128 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -180573 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 118.667-112 chr2 191314836 191315068 + 0.666667 NA intron (NM_012223, intron 3 of 28) intron (NM_012223, intron 3 of 28) 69548 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 162.667-232 chr6 3693638 3693976 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58205 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 202.667-102 chr3 138040048 138040505 + 0.666667 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 30111 NM_016369 51208 Hs.655324 NM_016369 ENSG00000066405 CLDN18 SFTA5|SFTPJ claudin 18 protein-coding 160.333-142 chr2 69193731 69194117 + 0.666667 NA intron (NM_032208, intron 17 of 17) intron (NM_032208, intron 17 of 17) 90242 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 141-11 chr10 119354426 119354652 + 0.666667 NA intron (NM_005308, intron 2 of 15) AluJb|SINE|Alu -23433 NR_039829 100616398 NR_039829 ENSG00000265719 MIR4681 - microRNA 4681 ncRNA 220-54 chr2 20238126 20238639 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12949 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 149.333-248 chr3 88685894 88686274 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 347628 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 148.333-142 chr15 67850044 67850366 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -10160 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 116-164 chr9 95467073 95467295 + 0.666667 NA exon (NM_001083606, exon 15 of 24) exon (NM_001083606, exon 15 of 24) 3575 NR_038982 100507346 Hs.661847 NR_038982 LOC100507346 - uncharacterized LOC100507346 ncRNA 170.333-146 chr3 142524760 142525183 + 0.666667 NA intron (NM_001354579, intron 20 of 45) intron (NM_001354579, intron 20 of 45) 53762 NM_001354579 545 Hs.271791 NM_001184 ENSG00000175054 ATR FCTCS|FRP1|MEC1|SCKL|SCKL1 ATR serine/threonine kinase protein-coding 163.333-300 chrX 45110169 45110478 + 0.666667 NA intron (NR_111960, intron 27 of 27) intron (NR_111960, intron 27 of 27) 90553 NM_024689 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 150-57 chr16 80685883 80686250 + 0.666667 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR -113258 NR_104666 101928276 Hs.149769 NR_104665 ENSG00000260737 LINC01227 - long intergenic non-protein coding RNA 1227 ncRNA 130.333-155 chr4 100875154 100875383 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -200155 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 141.333-43 chr12 22443764 22444151 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 100240 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 198.333-206 chr9 124270839 124271234 + 0.666667 NA intron (NM_001166168, intron 1 of 9) intron (NM_001166168, intron 1 of 9) -9868 NR_149024 613206 Hs.197071 NM_001033016 ENSG00000235204 LOC613206 - uncharacterized LOC613206 ncRNA 144-124 chr4 62723723 62723964 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -562078 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 154.333-106 chr15 70405631 70405924 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 100151 NR_146562 105370880 NR_146562 ENSG00000259473 LINC02205 - long intergenic non-protein coding RNA 2205 ncRNA 116.333-138 chr3 423948 424241 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -38299 NR_110739 101927193 Hs.677744 NR_110739 ENSG00000234661 CHL1-AS1 - CHL1 antisense RNA 1 ncRNA 114.667-27 chr10 28250486 28250707 + 0.666667 NA intron (NR_134518, intron 1 of 16) intron (NR_134518, intron 1 of 16) 31527 NM_173496 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 127-99 chr8 119175486 119175705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32768 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 130-78 chr3 104753084 104753446 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -613448 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 123.667-190 chr8 140863824 140864104 + 0.666667 NA intron (NR_148037, intron 6 of 34) intron (NR_148037, intron 6 of 34) -131311 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 170.667-31 chr12 70377490 70377846 + 0.666667 NA intron (NM_014505, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 11378 NM_014505 27345 Hs.525529 NM_014505 ENSG00000135643 KCNMB4 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4 protein-coding 136.667-43 chr12 123572563 123572830 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 11631 NR_110049 101927415 Hs.636524 NR_110049 TMED2-DT - TMED2 divergent transcript ncRNA 140.333-228 chr8 62982704 62982978 + 0.666667 NA non-coding (NR_027378, exon 1 of 1) non-coding (NR_027378, exon 1 of 1) 4980 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 145.333-298 chr8 81098729 81099002 + 0.666667 NA intron (NM_018440, intron 1 of 8) intron (NM_018440, intron 1 of 8) 13203 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 157-139 chr9 105914899 105915319 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 220568 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 147.333-146 chr17 73363735 73363984 + 0.666667 NA intron (NM_001144952, intron 38 of 44) intron (NM_001144952, intron 38 of 44) -51858 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 116.667-211 chr8 131052331 131052566 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11539 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 120-106 chr5 51505939 51506223 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 122633 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 127-65 chr4 32994633 32994953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 643755 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 282-43 chr6 143194266 143194841 + 0.666667 NA intron (NM_001366354, intron 3 of 4) intron (NM_001366354, intron 3 of 4) 29771 NM_001366361 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 127.333-115 chr3 113168725 113168934 + 0.666667 NA Intergenic MER121|DNA|hAT? -1098 NR_110823 101929717 Hs.638426 NR_110823 ENSG00000243795 LINC02044 - long intergenic non-protein coding RNA 2044 ncRNA 197-10 chr1 185092651 185093093 + 0.666667 NA intron (NM_007212, intron 3 of 6) intron (NM_007212, intron 3 of 6) 47314 NM_007212 6045 Hs.591490 NM_007212 ENSG00000121481 RNF2 BAP-1|BAP1|DING|HIPI3|RING1B|RING2 ring finger protein 2 protein-coding 128.333-126 chr3 10559841 10560136 + 0.666667 NA intron (NM_001353564, intron 1 of 20) intron (NM_001353564, intron 1 of 20) -54402 NM_001330611 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 120.333-65 chr15 91315034 91315246 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -148199 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 140.667-12 chr1 95271266 95271506 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 37176 NM_015485 25950 Hs.483512 NM_015485 ENSG00000122481 RWDD3 RSUME RWD domain containing 3 protein-coding 141-27 chr14 55653261 55653619 + 0.666667 NA intron (NR_073129, intron 28 of 45) intron (NR_073129, intron 28 of 45) 73233 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 178.667-64 chr17 75212536 75212967 + 0.666667 NA intron (NM_001303276, intron 3 of 17) AluJb|SINE|Alu 7072 NM_024844 79902 Hs.362817 NM_024844 ENSG00000125450 NUP85 FROUNT|NPHS17|Nup75 nucleoporin 85 protein-coding 124.333-86 chr2 74868150 74868366 + 0.666667 NA intron (NM_000189, intron 3 of 17) intron (NM_000189, intron 3 of 17) 35603 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 193.333-34 chr11 37211940 37212366 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -613874 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 142.667-207 chr7 68036121 68036471 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16043 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 141.667-192 chr6 36400495 36400848 + 0.666667 NA intron (NM_152990, intron 3 of 4) intron (NM_152990, intron 3 of 4) -12871 NM_001207041 51513 Hs.272398 NM_016135 ENSG00000010030 ETV7 TEL-2|TEL2|TELB ETS variant 7 protein-coding 120.667-71 chr17 40719288 40719500 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15642 NM_019016 192666 Hs.87383 NM_019016 ENSG00000167916 KRT24 K24|KA24 keratin 24 protein-coding 125-20 chr10 121935620 121935948 + 0.666667 NA intron (NR_120495, intron 1 of 1) LTR22A|LTR|ERVK -6983 NM_001288736 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 216.333-124 chr6 56957952 56958454 + 0.666667 NA intron (NM_001318539, intron 1 of 3) intron (NM_001318539, intron 1 of 3) 3096 NM_152731 221336 Hs.582993 NM_152731 ENSG00000151917 BEND6 C6orf65 BEN domain containing 6 protein-coding 220.667-48 chr2 136383970 136384483 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -266071 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 126.333-115 chr3 36031776 36032004 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 287414 NR_029824 406916 NR_029824 ENSG00000207625 MIR128-2 MIR128B|MIRN128-2|MIRN128B|mir-128-2|mir-128b microRNA 128-2 ncRNA 124.333-29 chr11 82329595 82329815 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1MDa|LINE|L1 74208 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 131.667-86 chr2 16866181 16866415 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -200464 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 125.667-115 chr22 37384860 37385230 + 0.666667 NA intron (NM_052906, intron 2 of 2) intron (NM_052906, intron 2 of 2) -30206 NR_110515 100506271 Hs.220558 NR_110515 ENSG00000237862 LOC100506271 - uncharacterized LOC100506271 ncRNA 245-78 chr9 32544678 32545213 + 0.666667 NA intron (NM_001195622, intron 1 of 1) intron (NM_001195622, intron 1 of 1) -6199 NM_001349118 100129250 Hs.664395 NM_001349118 ENSG00000235453 SMIM27 C9orf133|TOPORS-AS1 small integral membrane protein 27 protein-coding 150-45 chr14 57053574 57053981 + 0.666667 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 215128 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 158.333-133 chr19 47894260 47894642 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8136 NM_003167 6822 Hs.515835 NM_003167 ENSG00000105398 SULT2A1 DHEA-ST|DHEAS|HST|ST2|ST2A1|ST2A3|STD|hSTa sulfotransferase family 2A member 1 protein-coding 203.333-155 chr20 42800961 42801390 + 0.666667 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) intron (NM_133170, intron 2 of 31) 115692 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 141-100 chr9 133318976 133319353 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 17024 NM_006753 6838 Hs.274430 NM_006753 ENSG00000148296 SURF6 RRP14 surfeit 6 protein-coding 187.667-93 chr3 96273631 96274094 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -86102 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 136.333-5 chr1 96235901 96236181 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 138084 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 140-74 chr3 165848018 165848333 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -10752 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 117-80 chr2 114556685 114557002 + 0.666667 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) L2a|LINE|L2 95266 NM_001321912 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 226-96 chr9 31927750 31928310 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -456573 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 169.667-46 chr12 82919440 82919758 + 0.666667 NA intron (NM_152588, intron 3 of 11) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 232444 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 116.333-116 chr2 42182509 42182805 + 0.666667 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) intron (NM_001145076, intron 1 of 21) -12426 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 206-47 chr13 44011359 44011683 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -10814 NR_026955 121838 Hs.201441 NR_026955 LINC00284 NCRNA00284 long intergenic non-protein coding RNA 284 ncRNA 147.333-31 chr1 234688986 234689418 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -34840 NR_038856 100506810 Hs.586634 NR_038856 ENSG00000227630 LINC01132 - long intergenic non-protein coding RNA 1132 ncRNA 235.667-53 chr6 50963510 50963913 + 0.666667 NA Intergenic LTR73|LTR|ERV1 144840 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 145.333-13 chr1 112889618 112889915 + 0.666667 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 7716 NR_162120 113218506 NR_162120 MIR11399 - microRNA 11399 ncRNA 112.333-129 chr2 88259894 88260115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 86865 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 139-82 chr5 53342291 53342660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -138154 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 259.333-25 chr12 114655094 114655740 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28758 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 159.667-118 chr15 94948121 94948523 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 92959 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 132.333-13 chr10 9241029 9241396 + 0.666667 NA intron (NR_120635, intron 4 of 4) intron (NR_120635, intron 4 of 4) -34401 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 139-89 chr6 108453386 108453619 + 0.666667 NA intron (NR_136553, intron 4 of 8) intron (NR_136553, intron 4 of 8) -106323 NM_201559 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 168.667-231 chr8 137798246 137798594 + 0.666667 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 285125 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 308-28 chr2 227569932 227570690 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 48344 NR_149019 729968 Hs.689550 NR_149019 LOC729968 - spore coat protein SP96 ncRNA 180.667-76 chr2 227479016 227479375 + 0.666667 NA intron (NM_004504, intron 1 of 12) intron (NM_004504, intron 1 of 12) 7023 NM_001135187 3267 Hs.352962 NM_004504 ENSG00000173744 AGFG1 HRB|RAB|RIP ArfGAP with FG repeats 1 protein-coding 122.333-210 chr8 120194252 120194519 + 0.666667 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 69283 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 176-3 chr1 68947773 68948134 + 0.666667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -107945 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 113.333-218 chr5 149905693 149905871 + 0.666667 NA intron (NM_000440, intron 7 of 21) intron (NM_000440, intron 7 of 21) 27195 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 173-21 chr13 26324793 26325151 + 0.666667 NA intron (NM_001318368, intron 1 of 12) intron (NM_001318368, intron 1 of 12) 70843 NM_001260 1024 Hs.382306 NM_001260 ENSG00000132964 CDK8 K35 cyclin dependent kinase 8 protein-coding 156-91 chr3 127283622 127283950 + 0.666667 NA TTS (NM_001362810) TTS (NM_001362810) 4260 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 152-147 chr7 77516567 77516944 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -20540 NM_002835 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 247.333-44 chr2 122244227 122244873 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 488899 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 217.333-50 chr16 54757861 54758384 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 90111 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 164.667-9 chr1 94587471 94587866 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43966 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 114.667-74 chr13 102886903 102887222 + 0.666667 NA intron (NR_026965, intron 2 of 3) intron (NR_026965, intron 2 of 3) 6963 NR_026965 121952 Hs.660773 NR_026965 ENSG00000250878 METTL21EP METTL21CP1 methyltransferase like 21E, pseudogene pseudo 151-64 chr2 146650281 146650699 + 0.666667 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 63433 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 377.333-12 chr2 168162116 168162988 + 0.666667 NA intron (NM_013233, intron 4 of 17) intron (NM_013233, intron 4 of 17) 85043 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 127-9 chr1 173981208 173981434 + 0.666667 NA intron (NM_001300852, intron 4 of 18) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 11751 NM_001300850 149041 Hs.30258 NM_172071 ENSG00000135870 RC3H1 RNF198|ROQUIN ring finger and CCCH-type domains 1 protein-coding 114-72 chr2 117917751 117917956 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_019044, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_019044, exon 24 of 24) 84122 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 184.333-116 chr4 140462924 140463297 + 0.666667 NA intron (NM_001277353, intron 6 of 10) L1PBa|LINE|L1 35183 NM_001277353 152586 Hs.189067 NM_001034840 ENSG00000205301 MGAT4D GnT1IP MGAT4 family member D protein-coding 167.667-25 chr10 51492864 51493200 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 193459 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 140-93 chr5 156693665 156693969 + 0.666667 NA intron (NM_001128209, intron 6 of 7) intron (NM_001128209, intron 6 of 7) -156478 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 114-138 chr6 119153020 119153344 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -3989 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 122-89 chr4 108201542 108201901 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 29601 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 157.667-30 chr10 57392891 57393270 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88521 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 189.667-2 chr1 39241761 39242182 + 0.666667 NA intron (NM_012090, intron 2 of 92) intron (NM_012090, intron 2 of 92) 157804 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 213-58 chr4 24107477 24107931 + 0.666667 NA intron (NR_148982, intron 1 of 13) L2c|LINE|L2 -217657 NM_013261 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 156.667-94 chr13 84178755 84179211 + 0.666667 NA intron (NR_046871, intron 1 of 6) intron (NR_046871, intron 1 of 6) 38381 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 160-134 chrX 99266615 99267006 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 1143463 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 175.333-8 chr1 217583450 217583923 + 0.666667 NA intron (NM_018040, intron 5 of 9) L1MEd|LINE|L1 47404 NM_001297754 55105 Hs.362343 NM_018040 ENSG00000092978 GPATCH2 CT110|GPATC2|PPP1R30|Pfa1 G-patch domain containing 2 protein-coding 210-120 chr5 92130694 92131041 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -747550 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 155.333-47 chr10 128184790 128185102 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -58523 NM_001145966 4288 Hs.80976 NM_002417 ENSG00000148773 MKI67 KIA|MIB-|MIB-1|PPP1R105 marker of proliferation Ki-67 protein-coding 149.333-124 chr15 80338426 80338734 + 0.666667 NA intron (NR_033833, intron 1 of 2) L1ME4b|LINE|L1 3225 NR_033833 283688 Hs.525933 NR_033833 ENSG00000259361 LINC00927 - long intergenic non-protein coding RNA 927 ncRNA 263.333-45 chr2 180143635 180144114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136577 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 157.333-175 chr2 46850396 46850705 + 0.666667 NA intron (NR_024452, intron 1 of 2) intron (NR_024452, intron 1 of 2) 22686 NR_024452 100134259 Hs.114449 NR_024452 ENSG00000239332 LINC01119 - long intergenic non-protein coding RNA 1119 ncRNA 140.333-221 chr7 109623554 109623836 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 336518 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 144.667-92 chr15 39553304 39553581 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27637 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 244-93 chr7 47373702 47374408 + 0.666667 NA intron (NM_022748, intron 16 of 30) intron (NM_022748, intron 16 of 30) 90748 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 158.667-125 chr17 65851701 65852165 + 0.666667 NA exon (NM_001353127, exon 21 of 27) exon (NM_001353127, exon 21 of 27) -25390 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 181.667-18 chr11 6310860 6311215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9464 NM_145040 112464 Hs.434044 NM_145040 ENSG00000170955 CAVIN3 HSRBC|PRKCDBP|SRBC|cavin-3 caveolae associated protein 3 protein-coding 120-102 chr5 18779506 18779851 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 972404 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 117.333-49 chr13 113638945 113639203 + 0.666667 NA intron (NM_007111, intron 11 of 11) intron (NM_007111, intron 11 of 11) 19124 NM_000705 496 Hs.434202 NM_000705 ENSG00000186009 ATP4B ATP6B ATPase H+/K+ transporting subunit beta protein-coding 187.667-42 chr14 55571799 55572141 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 8122 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 161-97 chr8 21034495 21034799 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 60661 NR_033894 286114 Hs.651884 NR_033894 ENSG00000253199 LINC02153 - long intergenic non-protein coding RNA 2153 ncRNA 169.333-158 chr3 32419822 32420184 + 0.666667 NA intron (NM_138410, intron 1 of 4) intron (NM_138410, intron 1 of 4) 28150 NM_138410 112616 Hs.440494 NM_138410 ENSG00000153551 CMTM7 CKLFSF7 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 7 protein-coding 166-44 chr15 40326008 40326377 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001301268, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_001301268, exon 1 of 1) 2500 NM_001301268 100505573 Hs.530791 NM_001301268 ENSG00000259330 INAFM2 LINC00984|OGU1 InaF motif containing 2 protein-coding 119.333-141 chr20 53024209 53024440 + 0.666667 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) 51966 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 164-26 chr12 27146770 27147079 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -64402 NM_001080406 728858 Hs.334003 NM_001080406 ENSG00000214700 C12orf71 - chromosome 12 open reading frame 71 protein-coding 148.667-377 chr8 84869832 84870125 + 0.666667 NA intron (NM_001287244, intron 5 of 7) intron (NM_001287244, intron 5 of 7) 164051 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 113.333-23 chr10 51602209 51602383 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 97299 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 207-55 chr17 82511367 82511795 + 0.666667 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 -8151 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 169-62 chr3 642433 642920 + 0.666667 NA intron (NR_110118, intron 1 of 3) intron (NR_110118, intron 1 of 3) 50571 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 146-153 chrX 50886045 50886402 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24512 NM_005448 9210 Hs.532692 NM_005448 ENSG00000130385 BMP15 GDF9B|ODG2|POF4 bone morphogenetic protein 15 protein-coding 113.667-107 chr2 117513760 117513954 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -300834 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 113.667-115 chr2 174827440 174827628 + 0.666667 NA intron (NM_001025201, intron 7 of 12) L2|LINE|L2 20084 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 133-7 chr10 66520864 66521134 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -405037 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 117.667-25 chr11 37333826 37334026 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -604675 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 178-83 chr4 66286220 66286612 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 9592 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 231.333-26 chr11 106431431 106431833 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 180225 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 178.333-52 chr14 74122881 74123321 + 0.666667 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) L2|LINE|L2 38148 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 139.333-27 chr10 115044730 115044997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48502 NM_001276282 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 143-15 chr10 30521293 30521578 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 86789 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 112-78 chr16 47885618 47885870 + 0.666667 NA intron (NR_110650, intron 4 of 5) MIR|SINE|MIR 1386 NR_110649 100507534 Hs.407601 NR_110649 ENSG00000261325 LINC02192 - long intergenic non-protein coding RNA 2192 ncRNA 124-15 chr1 207803759 207804029 + 0.666667 NA intron (NR_135299, intron 5 of 5) intron (NR_135299, intron 5 of 5) -1371 NR_029518 407025 NR_029518 ENSG00000284203 MIR29B2 MIRN29B2 microRNA 29b-2 ncRNA 223.333-145 chr6 77025994 77026574 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -432661 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 153-74 chr2 74537179 74537544 + 0.666667 NA intron (NM_032603, intron 4 of 13) intron (NM_032603, intron 4 of 13) -7655 NR_126511 550 Hs.411480 NM_181575 ENSG00000115307 AUP1 - AUP1 lipid droplet regulating VLDL assembly factor protein-coding 149.333-37 chr1 248707631 248707952 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10729 NR_125950 101928226 NR_125950 LYPD9P - LY6/PLAUR domain containing 9, pseudogene pseudo 200.667-122 chr4 107061855 107062358 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -25793 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 113.667-208 chr8 83256512 83256712 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -147146 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 147-68 chr2 74056023 74056437 + 0.666667 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) intron (NM_001287491, intron 4 of 11) 53538 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 169.667-78 chr15 76779318 76779732 + 0.666667 NA intron (NM_001353011, intron 9 of 32) L1MDa|LINE|L1 82419 NM_001145923 49855 Hs.458986 NM_020843 ENSG00000140386 SCAPER IDDRP|MSTP063|ZNF291|Zfp291 S-phase cyclin A associated protein in the ER protein-coding 203.667-27 chr13 92317763 92318197 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 34227 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 154-154 chrX 27401258 27401573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61926 NM_207319 139420 Hs.350673 NM_207319 ENSG00000224960 PPP4R3C FLFL3P|PPP4R3CP|SMEK3P|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3C protein-coding 155-137 chrX 78023897 78024256 + 0.666667 NA intron (NM_001282224, intron 13 of 21) L1PA17|LINE|L1 -54438 NM_001029891 441531 Hs.632822 NM_001029891 ENSG00000226784 PGAM4 PGAM-B|PGAM1|PGAM3|dJ1000K24.1 phosphoglycerate mutase family member 4 protein-coding 229.666-16 chr2 65715481 65716121 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -283202 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 223.667-59 chr4 110850033 110850424 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10419 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 143-33 chr12 50523116 50523401 + 0.666667 NA intron (NM_173602, intron 1 of 37) MER2|DNA|TcMar-Tigger 18273 NM_173602 57609 Hs.505516 NM_020849 ENSG00000066084 DIP2B - disco interacting protein 2 homolog B protein-coding 166-68 chr2 180487426 180487865 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -204459 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 136.667-169 chr7 84020093 84020364 + 0.666667 NA intron (NM_006080, intron 6 of 16) AluSx|SINE|Alu 174561 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 139-73 chr4 61189225 61189491 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -11872 NM_001371343 129.667-10 chr1 156799311 156799631 + 0.666667 NA intron (NM_005973, intron 6 of 6) L2c|LINE|L2 -16279 NM_001007792 4914 Hs.406293 NM_002529 ENSG00000198400 NTRK1 MTC|TRK|TRK1|TRKA|Trk-A|p140-TrkA neurotrophic receptor tyrosine kinase 1 protein-coding 151.333-84 chr11 91999624 92000033 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -225206 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 126.667-75 chr2 56108289 56108589 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18057 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 198-46 chr14 34918031 34918616 + 0.666667 NA intron (NR_151701, intron 4 of 4) AluSx|SINE|Alu -21599 NR_002937 280655 Hs.639271 NR_002937 IGBP1P1 C14orf19 immunoglobulin (CD79A) binding protein 1 pseudogene 1 pseudo 156.667-342 chr8 123300136 123300500 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -24777 NR_037873 11244 Hs.521800 NM_007222 ENSG00000165156 ZHX1 - zinc fingers and homeoboxes 1 protein-coding 160-99 chr5 77451287 77451640 + 0.666667 NA intron (NM_018268, intron 6 of 12) intron (NM_018268, intron 6 of 12) 40853 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 112.667-285 chrX 86370687 86370976 + 0.666667 NA intron (NM_001139515, intron 1 of 11) intron (NM_001139515, intron 1 of 11) 107863 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 168.667-10 chr1 177476086 177476495 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 124704 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 207.333-276 chr9 16118475 16118953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 134393 NM_001271829 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 142-74 chr20 47073590 47073865 + 0.666667 NA intron (NM_172110, intron 6 of 13) LTR16C|LTR|ERVL -93240 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 197-32 chr13 94313525 94314056 + 0.666667 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) intron (NM_005708, intron 6 of 8) -125799 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 142-127 chr6 85374299 85374643 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 15715 NR_134634 101928820 Hs.587370 NR_134633 ENSG00000234155 LINC02535 - long intergenic non-protein coding RNA 2535 ncRNA 153.667-29 chr1 220114569 220114863 + 0.666667 NA intron (NM_018060, intron 12 of 22) intron (NM_018060, intron 12 of 22) 3246 NR_029628 406997 NR_029628 ENSG00000207590 MIR215 MIRN215|miRNA215|mir-215 microRNA 215 ncRNA 147.667-73 chr12 58483968 58484258 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -107589 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 146.667-54 chr11 37628984 37629363 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -309428 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 157.667-272 chr6 16080378 16080656 + 0.666667 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger -48569 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 136.667-25 chr10 106888651 106889013 + 0.666667 NA intron (NM_001206569, intron 2 of 25) intron (NM_001206569, intron 2 of 25) 275874 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 123-42 chr15 40653402 40653675 + 0.666667 NA intron (NM_144508, intron 21 of 25) L2c|LINE|L2 41567 NR_040058 100505648 Hs.586876 NR_040058 ENSG00000245849 RAD51-AS1 TODRA RAD51 antisense RNA 1 ncRNA 127.667-204 chrX 57237866 57238161 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -48664 NM_001353840 158584 Hs.496205 NM_174912 ENSG00000165591 FAAH2 AMDD fatty acid amide hydrolase 2 protein-coding 131.667-158 chr5 35365161 35365484 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -134835 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 143.667-57 chr12 73438725 73438999 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 279672 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 125.333-50 chr13 89981241 89981536 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 138329 NR_047489 100874187 Hs.564526 NR_047489 ENSG00000261446 LINC00559 - long intergenic non-protein coding RNA 559 ncRNA 150.667-57 chr11 2441113 2441427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3721 NM_000218 3784 Hs.95162 NM_000218 ENSG00000053918 KCNQ1 ATFB1|ATFB3|JLNS1|KCNA8|KCNA9|KVLQT1|Kv1.9|Kv7.1|LQT|LQT1|RWS|SQT2|WRS potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1 protein-coding 123-73 chr22 43674028 43674328 + 0.666667 NA intron (NM_198856, intron 11 of 29) intron (NM_198856, intron 11 of 29) 138127 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 169.667-152 chr4 76378247 76378587 + 0.666667 NA intron (NM_001042784, intron 8 of 23) intron (NM_001042784, intron 8 of 23) 28888 NM_001042784 339965 Hs.529680 NM_178555 ENSG00000163749 CCDC158 - coiled-coil domain containing 158 protein-coding 113.667-162 chr4 99906643 99906917 + 0.666667 NA intron (NM_001031723, intron 4 of 7) intron (NM_001031723, intron 4 of 7) -12234 NM_001243736 8649 Hs.433332 NM_021970 ENSG00000109270 LAMTOR3 MAP2K1IP1|MAPBP|MAPKSP1|MP1|PRO0633|Ragulator3 late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 protein-coding 143.667-254 chr8 122255021 122255397 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 313435 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 164.667-186 chr5 42261456 42261834 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -86300 NR_104636 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 147.333-302 chr7 81839962 81840322 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -70095 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 125-22 chr11 8010182 8010407 + 0.666667 NA TTS (NR_125366) TTS (NR_125366) 6215 NR_125366 103581031 Hs.249366 NR_125366 ENSG00000255420 CASC23 LINC01464 cancer susceptibility 23 ncRNA 179.333-92 chr2 45165934 45166336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88806 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 139-70 chr4 31847798 31848117 + 0.666667 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 -149422 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 143.333-237 chr6 10912831 10913118 + 0.666667 NA intron (NM_001040274, intron 14 of 29) intron (NM_001040274, intron 14 of 29) 25922 NM_001040274 221711 Hs.729128 NM_194299 ENSG00000153157 SYCP2L C6orf177|NO145|dJ62D2.1 synaptonemal complex protein 2 like protein-coding 131.333-15 chr1 180950757 180951146 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_020950, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_020950, exon 9 of 9) 3936 NR_145481 103344928 Hs.665319 NR_145481 ENSG00000232586 KIAA1614-AS1 - KIAA1614 antisense RNA 1 ncRNA 147.667-130 chr16 79558547 79558904 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42012 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 159.667-167 chr2 59626036 59626425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 408522 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 157.333-163 chr18 4107513 4107830 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) L1MB8|LINE|L1 145318 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 121.333-158 chr6 71308469 71308658 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_024576, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_024576, exon 7 of 7) 19752 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 123.333-106 chr2 86064235 86064456 + 0.666667 NA intron (NM_015425, intron 14 of 33) intron (NM_015425, intron 14 of 33) 41541 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 170.667-71 chr19 50032255 50032611 + 0.666667 NA intron (NM_015428, intron 2 of 4) intron (NM_015428, intron 2 of 4) 6428 NM_001308424 25888 Hs.440553 NM_015428 ENSG00000142528 ZNF473 ZFP100|ZN473 zinc finger protein 473 protein-coding 140.333-56 chr13 64732444 64732710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -656566 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 156.333-324 chr6 160203584 160203898 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 55080 NM_003058 6582 Hs.436385 NM_003058 ENSG00000112499 SLC22A2 OCT2 solute carrier family 22 member 2 protein-coding 184.667-57 chr2 83258092 83258550 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -264493 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 176-99 chr8 78090417 78090781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -425741 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 139-67 chr3 168299272 168299590 + 0.666667 NA intron (NR_021485, intron 1 of 15) intron (NR_021485, intron 1 of 15) 49909 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 194.333-158 chr8 136157878 136158343 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -372688 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 124.667-181 chr6 148700069 148700372 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46810 NM_005715 10090 Hs.657370 NM_005715 ENSG00000111962 UST 2OST uronyl 2-sulfotransferase protein-coding 214.333-120 chr5 145662312 145662841 + 0.666667 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 172766 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 138.333-54 chr13 80507749 80508069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166783 NM_005842 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 166-129 chrX 88454552 88454894 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -292502 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 166.667-28 chr10 104411147 104411607 + 0.666667 NA intron (NM_001008723, intron 15 of 17) L1MEd|LINE|L1 57544 NM_001008723 159686 Hs.253576 NM_001008723 ENSG00000120051 CFAP58 C10orf80|CCDC147|bA127L20.4|bA127L20.5|bA554P13.1 cilia and flagella associated protein 58 protein-coding 176-60 chr3 131448140 131448487 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 30920 NR_002985 677836 Hs.735762 NR_002985 SNORA58 ACA58|SNORA58B small nucleolar RNA, H/ACA box 58 snoRNA 134.667-155 chr5 26163936 26164195 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 874521 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 181.333-127 chr4 104713945 104714395 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219276 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 116.333-217 chr9 25124302 25124573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 554421 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 134-16 chr10 69707485 69707729 + 0.666667 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 77360 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 134-37 chr17 49799252 49799505 + 0.666667 NA intron (NM_007067, intron 4 of 14) AluSx1|SINE|Alu 10697 NM_001199157 11143 Hs.21907 NM_007067 ENSG00000136504 KAT7 HBO1|HBOA|MYST2|ZC2HC7 lysine acetyltransferase 7 protein-coding 112.333-230 chr6 61666738 61666959 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 10 of 13) intron (NR_146874, intron 10 of 13) 92718 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 177-83 chr9 103753789 103754230 + 0.666667 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -245700 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 169.667-189 chr6 157043514 157043812 + 0.666667 NA intron (NM_001363725, intron 2 of 17) intron (NM_001363725, intron 2 of 17) 7236 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 218.333-6 chr1 117973654 117974172 + 0.666667 NA intron (NM_206996, intron 43 of 48) L1PA17|LINE|L1 44174 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 143-79 chr22 17950082 17950339 + 0.666667 NA intron (NM_015241, intron 1 of 31) AluSz6|SINE|Alu 30751 NR_030378 693233 NR_030378 ENSG00000207780 MIR648 MIRN648|hsa-mir-648 microRNA 648 ncRNA 125-25 chr11 95196115 95196421 + 0.666667 NA intron (NM_001271594, intron 1 of 8) intron (NM_001271594, intron 1 of 8) -33918 NR_110295 100129203 Hs.191599 NR_110295 LOC100129203 - uncharacterized LOC100129203 ncRNA 137.667-194 chr9 101813357 101813690 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -74943 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 156-10 chr1 88116007 88116355 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -567963 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 125.667-126 chr3 177620954 177621296 + 0.666667 NA intron (NR_047568, intron 2 of 3) intron (NR_047568, intron 2 of 3) 179204 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 136.667-45 chr13 46798785 46799183 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -1823 NM_001984 2098 Hs.432491 NM_001984 ENSG00000139684 ESD FGH esterase D protein-coding 170.333-69 chr14 38030627 38031040 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -128709 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 141.667-232 chr8 126135338 126135735 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -184339 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 196-171 chr7 84906275 84906715 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 215436 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 153.667-232 chr21 23217165 23217541 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 138069 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 171-49 chr22 24825628 24826053 + 0.666667 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) intron (NM_001098498, intron 2 of 23) 19619 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 159-88 chr4 44479718 44480103 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL -31101 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 173-52 chr20 35432188 35432544 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_161326) promoter-TSS (NR_161326) -663 NR_161326 554250 Hs.711481 NM_001350519 ENSG00000204183 GDF5OS - growth differentiation factor 5 opposite strand ncRNA 114.333-225 chr8 102934538 102934777 + 0.666667 NA intron (NR_126339, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 70386 NR_126338 100506753 Hs.602901 NR_126338 AZIN1-AS1 - AZIN1 antisense RNA 1 ncRNA 256.333-8 chr1 104327001 104327702 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 254328 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 187-19 chr13 83266025 83266343 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 616209 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 244-24 chr11 82131717 82132348 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) intron (NR_120571, intron 3 of 7) -241196 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 164-22 chr10 115143491 115143889 + 0.666667 NA intron (NM_001276282, intron 5 of 7) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 50325 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 179.333-174 chr7 80492458 80492850 + 0.666667 NA intron (NM_001102386, intron 2 of 7) L1ME4a|LINE|L1 19410 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 241.667-80 chr6 54014653 54015240 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3970 NM_138569 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 172.333-75 chr18 74110501 74110860 + 0.666667 NA intron (NM_001142958, intron 8 of 9) L1MCa|LINE|L1 37154 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 151-75 chr21 30868760 30869058 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 12671 NM_175858 337880 Hs.407654 NM_175858 ENSG00000182591 KRTAP11-1 HACL-1|HACL1|KAP11.1 keratin associated protein 11-1 protein-coding 140.667-11 chr1 92021131 92021397 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8721 NM_173567 253152 Hs.201555 NM_173567 ENSG00000172031 EPHX4 ABHD7|EH4|EPHXRP epoxide hydrolase 4 protein-coding 151-18 chr10 89835525 89835925 + 0.666667 NA intron (NR_038382, intron 3 of 3) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 6232 NR_038382 643529 Hs.618956 NR_038382 ENSG00000232229 LINC00865 - long intergenic non-protein coding RNA 865 ncRNA 151.333-287 chr3 124472721 124473168 + 0.666667 NA intron (NM_001024660, intron 25 of 59) intron (NM_001024660, intron 25 of 59) 98612 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 269.333-11 chr11 106121396 106121897 + 0.666667 NA intron (NR_135099, intron 1 of 2) LTR36|LTR|ERV1 10470 NR_135099 105369473 Hs.524010 NR_135099 ENSG00000254580 LINC02719 - long intergenic non-protein coding RNA 2719 ncRNA 162.667-179 chr3 135992653 135992976 + 0.666667 NA intron (NM_001190447, intron 1 of 12) L2|LINE|L2 27086 NM_002718 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 161.333-231 chr5 64460640 64460957 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -45217 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 197-114 chr7 83619100 83619572 + 0.666667 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) MER53|DNA|hAT 22095 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 112.333-278 chr9 97520407 97520623 + 0.666667 NA intron (NM_003275, intron 1 of 9) intron (NM_003275, intron 1 of 9) 18849 NM_003275 7111 Hs.404289 NM_003275 ENSG00000136842 TMOD1 D9S57E|ETMOD|TMOD tropomodulin 1 protein-coding 193.333-184 chr8 61152114 61152662 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -135582 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 132-93 chr4 114380730 114381025 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -217525 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 142-67 chr2 178737829 178738211 + 0.666667 NA intron (NM_001256850, intron 47 of 312) intron (NM_001256850, intron 47 of 312) -38906 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 162.667-217 chr5 60930606 60930941 + 0.666667 NA intron (NM_001007234, intron 1 of 5) intron (NM_001007234, intron 1 of 5) 14297 NM_001007234 1161 Hs.435237 NM_000082 ENSG00000049167 ERCC8 CKN1|CSA|UVSS2 ERCC excision repair 8, CSA ubiquitin ligase complex subunit protein-coding 211.667-42 chr15 63038864 63039300 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3665 NM_001018004 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 208.666-27 chr12 15109803 15110411 + 0.666667 NA intron (NM_032918, intron 4 of 4) intron (NM_032918, intron 4 of 4) -41816 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 188.667-9 chr1 93738313 93738724 + 0.666667 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) intron (NM_001261408, intron 2 of 13) 36865 NR_148965 723788 Hs.659312 NR_148965 ENSG00000137936 MIG7 - mig-7 ncRNA 156-79 chr20 21450147 21450584 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -52839 NM_033176 644524 NM_033176 ENSG00000125816 NKX2-4 NKX2.4|NKX2D NK2 homeobox 4 protein-coding 130-41 chr15 81744926 81745278 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 300916 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 173.667-94 chr2 191432822 191433214 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 187614 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 128.667-44 chr12 42321093 42321327 + 0.666667 NA intron (NM_033114, intron 3 of 7) L2b|LINE|L2 2649 NR_107005 102467003 NR_107005 ENSG00000278520 MIR7851 hsa-mir-7851 microRNA 7851 ncRNA 111.667-240 chr7 79177749 79178030 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 168901 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 210.333-157 chr7 30587653 30588124 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -6847 NM_001316772 2617 Hs.404321 NM_002047 ENSG00000106105 GARS CMT2D|DSMAV|GlyRS|HMN5|SMAD1 glycyl-tRNA synthetase protein-coding 117.667-21 chr11 2310303 2310594 + 0.666667 NA intron (NM_139022, intron 4 of 9) intron (NM_139022, intron 4 of 9) -7308 NR_138249 29125 Hs.559181 NM_014144 ENSG00000110665 C11orf21 - chromosome 11 open reading frame 21 protein-coding 145.667-60 chr12 48351407 48351731 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_152320) promoter-TSS (NM_152320) -323 NM_001172682 121274 Hs.23492 NM_152320 ENSG00000167528 ZNF641 - zinc finger protein 641 protein-coding 146.667-307 chr7 48283277 48283573 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 19 of 61) G-rich|Low_complexity|Low_complexity 111967 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 163.333-122 chr17 54012429 54012802 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 189688 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 134.333-103 chr20 55297609 55297904 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -125287 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 114.333-127 chr20 3559359 3559590 + 0.666667 NA exon (NM_139321, exon 7 of 29) exon (NM_139321, exon 7 of 29) 88456 NM_001207047 8455 Hs.276252 NM_012070 ENSG00000088812 ATRN DPPT-L|MGCA attractin protein-coding 119.333-221 chr8 125238727 125239018 + 0.666667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) 147012 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 223.333-38 chr14 54321846 54322242 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -74824 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 115.333-48 chr12 62054415 62054663 + 0.666667 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 138300 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 119.667-86 chr2 140692687 140692898 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 41 of 90) L1ME3C|LINE|L1 -106107 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 125.667-168 chr6 120194493 120194791 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 179463 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 199-98 chr6 141718015 141718516 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 370534 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 174.667-26 chr10 66397084 66397491 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) intron (NM_001127384, intron 11 of 17) -528749 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 139-38 chr15 71451548 71451865 + 0.666667 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) LTR81C|LTR|Gypsy -95530 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 180-123 chr9 136748246 136748591 + 0.666667 NA exon (NM_198946, exon 1 of 7) exon (NM_198946, exon 1 of 7) 107 NM_198946 158062 Hs.522504 NM_198946 ENSG00000267206 LCN6 LCN5|UNQ643|hLcn5 lipocalin 6 protein-coding 124.333-132 chr4 85651135 85651451 + 0.666667 NA intron (NM_001025616, intron 2 of 9) L2b|LINE|L2 -71175 NR_039656 100616349 NR_039656 ENSG00000266421 MIR4451 mir-4451 microRNA 4451 ncRNA 179.333-124 chr3 37895257 37895636 + 0.666667 NA intron (NM_001008392, intron 1 of 7) L1MEb|LINE|L1 33566 NM_001008392 10217 Hs.475963 NM_005808 ENSG00000144677 CTDSPL C3orf8|HYA22|PSR1|RBSP3|SCP3 CTD small phosphatase like protein-coding 220.667-86 chr5 127435721 127436203 + 0.666667 NA intron (NM_001256545, intron 16 of 24) intron (NM_001256545, intron 16 of 24) -81678 NM_130809 133619 Hs.483259 NM_130809 ENSG00000164244 PRRC1 - proline rich coiled-coil 1 protein-coding 169.333-36 chr11 43805365 43805743 + 0.666667 NA intron (NM_016142, intron 4 of 10) intron (NM_016142, intron 4 of 10) -75277 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 133.333-49 chr14 40251272 40251670 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -703240 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 120-66 chr2 64408376 64408604 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45672 NM_014181 29094 Hs.372208 NM_014181 ENSG00000119862 LGALSL GRP|HSPC159 galectin like protein-coding 271-56 chr9 101968513 101969138 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -230245 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 162-64 chr2 67995329 67995789 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 67445 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 189-36 chr17 31505082 31505545 + 0.666667 NA intron (NM_001346748, intron 1 of 12) L1M5|LINE|L1 17205 NM_001346748 84440 Hs.406788 NM_032932 ENSG00000131242 RAB11FIP4 FIP4-Rab11|RAB11-FIP4 RAB11 family interacting protein 4 protein-coding 152.333-192 chr2 149463371 149463738 + 0.666667 NA intron (NM_194317, intron 3 of 4) L1MD1|LINE|L1 -123804 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 150.333-21 chr1 171122217 171122532 + 0.666667 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL -15366 NR_002601 388714 Hs.448988 NR_002601 ENSG00000117507 FMO6P FMO6 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 6, pseudogene pseudo 123-31 chr11 107794967 107795187 + 0.666667 NA intron (NM_017515, intron 7 of 7) L1MA4A|LINE|L1 63710 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 285.667-17 chr16 47740712 47741295 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -117578 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 163.333-16 chr1 161678623 161678955 + 0.666667 NA TTS (NM_001002275) TTS (NM_001002275) 6463 NR_002595 641311 Hs.625293 NR_002595 ENSG00000213075 RPL31P11 RPL31_1_108 ribosomal protein L31 pseudogene 11 pseudo 141.333-180 chr4 98064360 98064644 + 0.666667 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) intron (NM_174952, intron 5 of 10) 78974 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 119.333-59 chr11 107158641 107158932 + 0.666667 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -140310 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 165.333-16 chr1 180556105 180556459 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -2692 NR_125716 148756 NR_125716 ENSG00000236719 OVAAL LINC01131|OVAL ovarian adenocarcinoma amplified long non-coding RNA ncRNA 178-70 chr2 238588534 238588894 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33215 NR_037809 151171 Hs.652076 NR_037809 ENSG00000225493 LINC01107 - long intergenic non-protein coding RNA 1107 ncRNA 116.333-121 chr2 129736770 129737104 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140554 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 151.333-335 chr5 57339521 57339853 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 125613 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 135.333-61 chr16 13827843 13828082 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -92195 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 157.333-332 chr8 62936861 62937300 + 0.666667 NA intron (NR_130764, intron 5 of 6) L1M5|LINE|L1 -40781 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 230.333-85 chr4 109179281 109179874 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 123081 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 287.667-18 chr17 75110987 75111580 + 0.666667 NA intron (NM_024585, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu 1314 NM_001304271 79637 Hs.413047 NM_024585 ENSG00000125449 ARMC7 - armadillo repeat containing 7 protein-coding 151.333-372 chr6 142123794 142124089 + 0.666667 NA intron (NM_001324308, intron 1 of 2) L1MEc|LINE|L1 -9218 NM_001358410 100126572 NM_001358410 ENSG00000203733 GJE1 CX23 gap junction protein epsilon 1 protein-coding 208.667-85 chr3 1941279 1941784 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -157272 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 164-82 chr4 30914817 30915170 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 194624 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 148.667-184 chr2 60788248 60788541 + 0.666667 NA intron (NM_022894, intron 15 of 21) AluSz|SINE|Alu 32126 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 124-5 chr1 80436366 80436652 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -99246 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 118-58 chr18 1631523 1631709 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -271987 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 179.667-8 chr1 112669376 112669715 + 0.666667 NA exon (NM_006135, exon 9 of 10) exon (NM_006135, exon 9 of 10) -4767 NM_001286072 4343 Hs.514941 NM_020963 ENSG00000155363 MOV10 fSAP113|gb110 Mov10 RISC complex RNA helicase protein-coding 118.333-146 chr4 24032686 24032962 + 0.666667 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) L2c|LINE|L2 -142777 NM_013261 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 181.333-160 chr7 26870360 26870788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5984 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 148.333-251 chr3 67212840 67213136 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12476 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 118-37 chr14 57720469 57720697 + 0.666667 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) L1MA2|LINE|L1 144416 NM_001352013 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 111.667-114 chr18 12752804 12753070 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -3515 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 158-61 chr17 55488418 55488735 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -66741 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 126.667-47 chr14 51826945 51827298 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -33491 NM_001243773 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 162.333-248 chr8 69876095 69876557 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -41348 NM_030958 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 174.667-165 chr7 133665992 133666347 + 0.666667 NA intron (NM_021807, intron 10 of 17) intron (NM_021807, intron 10 of 17) 158719 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 176.667-14 chr1 180087074 180087532 + 0.666667 NA intron (NM_014810, intron 31 of 37) intron (NM_014810, intron 31 of 37) -67530 NM_001004128 5768 Hs.719176 NM_002826 ENSG00000116260 QSOX1 Q6|QSCN6 quiescin sulfhydryl oxidase 1 protein-coding 152-19 chr10 34131830 34132112 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) MIRc|SINE|MIR -359291 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 123.667-54 chr14 53050410 53050645 + 0.666667 NA intron (NM_030637, intron 11 of 11) intron (NM_030637, intron 11 of 11) -99430 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 123-39 chr14 70612469 70612668 + 0.666667 NA intron (NR_110071, intron 2 of 2) MER76|LTR|ERVL -11878 NM_001284210 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 162-37 chr13 107724368 107724763 + 0.666667 NA intron (NM_001080396, intron 1 of 2) intron (NM_001080396, intron 1 of 2) 110893 NR_046848 100874375 Hs.653972 NR_046848 FAM155A-IT1 - FAM155A intronic transcript 1 ncRNA 136-56 chr2 239989522 239989810 + 0.666667 NA intron (NM_001322019, intron 9 of 9) intron (NM_001322019, intron 9 of 9) 35676 NR_136157 4705 Hs.277677 NM_004544 ENSG00000130414 NDUFA10 CI-42KD|CI-42k|MC1DN22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A10 protein-coding 148-109 chr3 174395684 174396031 + 0.666667 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -463477 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 144.333-221 chr5 156343516 156343799 + 0.666667 NA intron (NM_172244, intron 2 of 7) intron (NM_172244, intron 2 of 7) 16493 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 122.333-214 chr8 138023147 138023398 + 0.666667 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 60273 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 136.333-93 chr2 73936701 73937079 + 0.666667 NA intron (NR_134897, intron 2 of 5) L2c|LINE|L2 10010 NM_080916 1716 Hs.469022 NM_001929 ENSG00000114956 DGUOK MTDPS3|NCPH|PEOB4|dGK deoxyguanosine kinase protein-coding 158.667-194 chr22 29000113 29000405 + 0.666667 NA intron (NM_001206998, intron 2 of 8) intron (NM_001206998, intron 2 of 8) 31217 NR_046851 100874123 Hs.674708 NR_046851 ENSG00000177993 ZNRF3-AS1 - ZNRF3 antisense RNA 1 ncRNA 118-57 chr17 71419421 71419667 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -217365 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 124-21 chr10 80521062 80521293 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001351267, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001351267, exon 11 of 11) 14765 NR_120661 101929574 Hs.593663 NR_120661 ENSG00000226659 LOC101929574 - uncharacterized LOC101929574 ncRNA 237.667-81 chr8 131242262 131242715 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201579 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 166-53 chr17 56922549 56922872 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -8661 NM_005082 7706 Hs.528952 NM_005082 ENSG00000121060 TRIM25 EFP|RNF147|Z147|ZNF147 tripartite motif containing 25 protein-coding 138-47 chr17 67676129 67676362 + 0.666667 NA intron (NM_012417, intron 8 of 8) intron (NM_012417, intron 8 of 8) -41588 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 179.667-110 chr5 13802773 13803241 + 0.666667 NA intron (NM_001369, intron 47 of 78) intron (NM_001369, intron 47 of 78) 141473 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 207.333-269 chr8 110902581 110903038 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 124624 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 138-6 chr1 170647164 170647485 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16807 NM_006902 5396 Hs.283416 NM_006902 ENSG00000116132 PRRX1 AGOTC|PHOX1|PMX1|PRX-1|PRX1 paired related homeobox 1 protein-coding 181.667-40 chr15 60219131 60219622 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 178610 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 178-76 chr22 49666501 49667018 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9240 NM_001289922 348645 Hs.133159 NM_198851 ENSG00000188511 C22orf34 - chromosome 22 open reading frame 34 protein-coding 193-17 chr11 95404900 95405394 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -172672 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 121.333-79 chr2 29240231 29240442 + 0.666667 NA intron (NM_004304, intron 12 of 28) MIR|SINE|MIR -16436 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 114.667-59 chr12 13200485 13200706 + 0.666667 NA intron (NM_001423, intron 1 of 4) intron (NM_001423, intron 1 of 4) 3869 NM_001423 2012 Hs.719042 NM_001423 ENSG00000134531 EMP1 CL-20|EMP-1|TMP epithelial membrane protein 1 protein-coding 149-117 chr5 115307089 115307523 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -10652 NM_001040440 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 123.333-231 chr9 71968098 71968283 + 0.666667 NA intron (NM_001365057, intron 2 of 2) L1MEc|LINE|L1 56551 NM_182505 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 146.667-168 chr2 76845884 76846301 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MER8|DNA|TcMar-Tigger -139873 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 117-123 chr6 40124560 40124858 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -190247 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 140.667-128 chr2 204232392 204232691 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 295793 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 256.333-31 chr14 100092355 100092816 + 0.666667 NA intron (NM_001330221, intron 2 of 13) AluSq2|SINE|Alu 16929 NR_039601 100616247 NR_039601 ENSG00000265154 MIR151B - microRNA 151b ncRNA 127-92 chr8 3076799 3077045 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 49 of 69) L1PB4|LINE|L1 -348471 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 132.333-7 chr1 109611693 109611985 + 0.666667 NA intron (NM_005272, intron 1 of 7) intron (NM_005272, intron 1 of 7) 1245 NM_005272 2780 Hs.36973 NM_005272 ENSG00000134183 GNAT2 ACHM4|GNATC G protein subunit alpha transducin 2 protein-coding 185.667-120 chr7 101782149 101782638 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33614 NM_181500 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 278.667-44 chr6 37812761 37813466 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6614 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 170.333-207 chr7 97437316 97437660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -294598 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 174.667-176 chr9 22801963 22802387 + 0.666667 NA intron (NR_038977, intron 4 of 5) L1M3a|LINE|L1 155975 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 220.333-115 chr6 5663715 5664067 + 0.666667 NA intron (NM_006567, intron 6 of 6) intron (NM_006567, intron 6 of 6) 31381 NR_110842 101927950 Hs.571136 NR_110842 ENSG00000270174 LOC101927950 - uncharacterized LOC101927950 ncRNA 113.333-120 chr2 39090279 39090474 + 0.666667 NA intron (NM_005633, intron 1 of 22) intron (NM_005633, intron 1 of 22) 30087 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 116-86 chr2 178188293 178188494 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6088 NM_001201482 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 143.333-165 chr21 30505167 30505451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3168 NM_181611 337972 Hs.553694 NM_181611 ENSG00000186977 KRTAP19-5 KAP19.5 keratin associated protein 19-5 protein-coding 276.667-18 chr13 22355248 22355752 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 145215 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 316.333-25 chr6 51430770 51431476 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190747 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 133.333-148 chr5 72618303 72618562 + 0.666667 NA intron (NR_105007, intron 1 of 2) intron (NR_105007, intron 1 of 2) 42237 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 175.333-109 chr22 30660562 30661085 + 0.666667 NA TTS (NM_152511) TTS (NM_152511) 7052 NM_152511 150290 Hs.517544 NM_152511 ENSG00000167065 DUSP18 DSP18|DUSP20|LMWDSP20 dual specificity phosphatase 18 protein-coding 119.333-25 chr10 14177542 14177890 + 0.666667 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 103432 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 185.333-161 chr6 13355660 13356046 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27270 NM_001318805 51256 Hs.484678 NM_016495 ENSG00000145979 TBC1D7 MGCPH|PIG51|TBC7 TBC1 domain family member 7 protein-coding 133.333-55 chr14 77081616 77081979 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -5606 NR_110553 102724190 Hs.562528 NR_110553 ENSG00000258819 LINC02289 - long intergenic non-protein coding RNA 2289 ncRNA 127.667-13 chr10 20038516 20038877 + 0.666667 NA intron (NM_001282736, intron 2 of 12) intron (NM_001282736, intron 2 of 12) 222264 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 123.667-60 chr14 77997084 77997306 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -173178 NR_158974 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 150.667-127 chr14 90880345 90880690 + 0.666667 NA intron (NM_001322237, intron 14 of 16) L1MB3|LINE|L1 -64087 NM_001010854 145567 Hs.655697 NM_001010854 ENSG00000165914 TTC7B TTC7L1|c14_5685 tetratricopeptide repeat domain 7B protein-coding 181.333-78 chr2 127402963 127403355 + 0.666667 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie -15261 NM_000312 5624 Hs.224698 NM_000312 ENSG00000115718 PROC APC|PC|PROC1|THPH3|THPH4 protein C, inactivator of coagulation factors Va and VIIIa protein-coding 136.667-142 chr5 52391551 52391899 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 383694 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 160.667-95 chr14 79288081 79288525 + 0.666667 NA intron (NM_001105250, intron 1 of 6) intron (NM_001105250, intron 1 of 6) 8923 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 177.333-13 chr1 223881845 223882249 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -36075 NM_005426 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 167-27 chr12 14840892 14841328 + 0.666667 NA exon (NM_001354646, exon 2 of 2) exon (NM_001354646, exon 2 of 2) 2416 NM_021071 420 Hs.591158 NM_021071 ENSG00000111339 ART4 ARTC4|CD297|DO|DO/ART4|DOK1 ADP-ribosyltransferase 4 (Dombrock blood group) protein-coding 127.667-103 chr20 56823233 56823476 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 194048 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 114.667-45 chr11 30914857 30915076 + 0.666667 NA intron (NM_001367979, intron 27 of 38) L1MC5a|LINE|L1 77720 NM_020869 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 152.667-388 chr8 124479854 124480132 + 0.666667 NA intron (NM_007218, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 5226 NM_007218 11236 Hs.744151 NM_007218 ENSG00000170881 RNF139 HRCA1|RCA1|TRC8 ring finger protein 139 protein-coding 112.333-46 chr11 132570488 132570663 + 0.666667 NA intron (NM_002545, intron 2 of 6) L1MEd|LINE|L1 286273 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 124.333-45 chr14 40616614 40616888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -337960 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 124.333-64 chr17 66232692 66232922 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -3392 NM_000042 350 Hs.445358 NM_000042 ENSG00000091583 APOH B2G1|B2GP1|BG apolipoprotein H protein-coding 115-160 chr9 108778885 108779141 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76973 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 147-63 chr2 48178458 48178794 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -136056 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 257-4 chr10 75024527 75025225 + 0.666667 NA intron (NM_001370144, intron 14 of 15) intron (NM_001370144, intron 14 of 15) 3143 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 118.667-37 chr10 104451465 104451808 + 0.666667 NA intron (NM_001008723, intron 17 of 17) intron (NM_001008723, intron 17 of 17) 28639 NR_120624 101927523 Hs.407539 NR_120624 ENSG00000225768 LINC02620 - long intergenic non-protein coding RNA 2620 ncRNA 127.333-21 chr1 240249367 240249716 + 0.666667 NA intron (NM_020066, intron 6 of 17) L1MA4A|LINE|L1 157658 NM_001305424 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 157.667-82 chr12 84613860 84614186 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 298776 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 128.667-143 chr5 72476066 72476333 + 0.666667 NA intron (NM_152625, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 31211 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 112.667-83 chr16 58945009 58945284 + 0.666667 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -210830 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 140.667-189 chr5 118392203 118392567 + 0.666667 NA intron (NR_104610, intron 9 of 9) intron (NR_104610, intron 9 of 9) 109811 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 131.333-33 chr11 22640936 22641224 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -15239 NM_022725 2188 Hs.632151 NM_022725 ENSG00000183161 FANCF FAF FA complementation group F protein-coding 227.666-2 chr10 6988590 6989266 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 197856 NR_132972 106635547 NR_132972 SNORD129 - small nucleolar RNA, C/D box 129 snoRNA 135.667-194 chr8 141539062 141539320 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31961 NM_207414 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 163.333-227 chr5 115820581 115820916 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4089 NR_136618 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 219.333-188 chr9 6536783 6537271 + 0.666667 NA intron (NM_000170, intron 22 of 24) intron (NM_000170, intron 22 of 24) 108665 NM_000170 2731 Hs.584238 NM_000170 ENSG00000178445 GLDC GCE|GCSP|HYGN1 glycine decarboxylase protein-coding 127.333-147 chr5 144981174 144981512 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 775952 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 133.667-38 chr12 34409298 34409642 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 386974 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 131.667-216 chr9 130141232 130141470 + 0.666667 NA non-coding (NR_135124, exon 2 of 2) non-coding (NR_135124, exon 2 of 2) 2868 NR_135124 401554 Hs.522437 NR_135124 ENSG00000196979 GPRACR LncGPR107 GPR107 adjacent cis regulating lncRNA ncRNA 167.667-141 chr3 122489172 122489617 + 0.666667 NA intron (NR_026698, intron 2 of 14) AluJr|SINE|Alu 25545 NR_026698 3836 Hs.161008 NM_002264 ENSG00000114030 KPNA1 IPOA5|NPI-1|RCH2|SRP1 karyopherin subunit alpha 1 protein-coding 111.667-52 chr11 107934474 107934710 + 0.666667 NA intron (NM_017516, intron 1 of 1) intron (NM_017516, intron 1 of 1) 6144 NM_017516 54734 Hs.354906 NM_017516 ENSG00000179331 RAB39A RAB39 RAB39A, member RAS oncogene family protein-coding 219.667-40 chr2 76849474 76849968 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -136244 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 131.667-136 chr3 120153258 120153585 + 0.666667 NA Intergenic MER126|DNA|DNA -58974 NM_001146156 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 151-41 chr15 67441729 67442066 + 0.666667 NA intron (NR_040052, intron 3 of 5) L1PBa1|LINE|L1 79076 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 169.333-49 chr12 31802131 31802572 + 0.666667 NA Intergenic MER4E1|LTR|ERV1 -10053 NM_001013699 440093 Hs.448697 NM_001013699 ENSG00000188375 H3F3C H3.5 H3 histone family member 3C protein-coding 158.667-212 chr3 83821609 83821962 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1047790 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 211.333-147 chr3 7242502 7242953 + 0.666667 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) 292557 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 160.333-130 chr17 66544067 66544443 + 0.666667 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -127401 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 125.667-180 chr7 107015693 107016051 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -28833 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 139.667-69 chr17 76221700 76221991 + 0.666667 NA intron (NM_052916, intron 1 of 18) L1MB5|LINE|L1 18648 NM_052916 114804 Hs.500643 NM_052916 ENSG00000141576 RNF157 - ring finger protein 157 protein-coding 154.333-98 chr14 73236964 73237407 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_173462) promoter-TSS (NM_173462) -321 NR_158677 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 147.667-260 chr4 93533573 93534002 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 12 of 14) L2a|LINE|L2 -294966 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 148.667-306 chr5 42890050 42890333 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D2|LTR|ERVL -78115 NM_001093726 6414 Hs.275775 NM_005410 ENSG00000250722 SELENOP SELP|SEPP|SEPP1|SeP selenoprotein P protein-coding 169.333-95 chr17 6747202 6747573 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -8060 NM_001353135 54739 Hs.441975 NM_017523 ENSG00000132530 XAF1 BIRC4BP|HSXIAPAF1|XIAPAF1 XIAP associated factor 1 protein-coding 113-80 chr16 73864812 73865062 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 350584 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 132.667-150 chr6 2693293 2693604 + 0.666667 NA intron (NM_001012418, intron 2 of 12) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 57474 NM_001012418 340156 Hs.127830 NM_001012418 ENSG00000145949 MYLK4 SgK085 myosin light chain kinase family member 4 protein-coding 159.333-132 chr18 71330918 71331252 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 247871 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 124.333-73 chr18 60135042 60135252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 235151 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 126.667-95 chr20 54121065 54121295 + 0.666667 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -50415 NM_001316361 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 163-84 chr8 32937514 32937789 + 0.666667 NA Intergenic Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger 215816 NM_001322197 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 260-10 chr1 242421280 242421917 + 0.666667 NA intron (NM_001320272, intron 2 of 10) intron (NM_001320272, intron 2 of 10) 27870 NM_001195812 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 209.333-144 chr22 37900713 37901324 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -5279 NM_033386 85377 Hs.517610 NM_033386 ENSG00000100139 MICALL1 MICAL-L1|MIRAB13 MICAL like 1 protein-coding 116-97 chr22 25852671 25852990 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 21 of 43) MIR|SINE|MIR 110642 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 151-121 chr7 36604837 36605168 + 0.666667 NA intron (NM_001177507, intron 10 of 19) intron (NM_001177507, intron 10 of 19) -4882 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 134.667-165 chr5 126019673 126019920 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -159781 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 120.333-180 chr8 52516342 52516681 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48919 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 130.333-118 chr21 28955087 28955390 + 0.666667 NA intron (NM_015565, intron 16 of 29) FLAM_C|SINE|Alu 37639 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 112-193 chr8 11230634 11230861 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -28914 NM_173683 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 177-54 chr3 168520228 168520570 + 0.666667 NA intron (NR_021485, intron 4 of 15) intron (NR_021485, intron 4 of 15) -31455 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 137.667-7 chr1 90884804 90885154 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33220 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 147.667-212 chr21 40381471 40381769 + 0.666667 NA intron (NR_073202, intron 3 of 32) intron (NR_073202, intron 3 of 32) -1463 NR_038898 100506492 Hs.667053 NR_038896 ENSG00000235123 DSCAM-AS1 M41 DSCAM antisense RNA 1 ncRNA 245-17 chr14 35883231 35883791 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 57173 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 216-85 chr3 135756864 135757353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208620 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 164.667-136 chr22 26971317 26971635 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 68184 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 125.333-123 chr4 75956046 75956277 + 0.666667 NA intron (NM_001288984, intron 20 of 21) intron (NM_001288984, intron 20 of 21) -15148 NM_014435 27163 Hs.437365 NM_014435 ENSG00000138744 NAAA ASAHL|PLT N-acylethanolamine acid amidase protein-coding 144-153 chr8 113055835 113056265 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) intron (NM_001363185, intron 5 of 66) 321102 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 150-48 chr14 83551199 83551484 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 908709 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 158.333-5 chr1 40247485 40247820 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001008740) promoter-TSS (NM_001008740) -285 NM_001008740 127391 Hs.406265 NM_001008740 ENSG00000188800 TMCO2 dJ39G22.2 transmembrane and coiled-coil domains 2 protein-coding 113-57 chr14 59839272 59839528 + 0.666667 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 31376 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 154.333-298 chr6 94365964 94366405 + 0.666667 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 647881 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 170-73 chr3 19362948 19363326 + 0.666667 NA intron (NM_144633, intron 5 of 15) intron (NM_144633, intron 5 of 15) -48206 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 198.666-85 chr6 117797071 117797660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109899 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 115.667-120 chr2 128331641 128331858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12881 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 133.667-144 chr7 95639335 95639645 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42974 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 164.333-110 chr2 28603741 28604118 + 0.666667 NA intron (NR_138141, intron 19 of 35) intron (NR_138141, intron 19 of 35) 37572 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 205-99 chr8 82602326 82602784 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -309549 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 155-19 chr11 21197158 21197592 + 0.666667 NA intron (NM_201551, intron 13 of 18) intron (NM_201551, intron 13 of 18) 527789 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 137.667-103 chr2 208162538 208162842 + 0.666667 NA intron (NM_014617, intron 2 of 2) AluSp|SINE|Alu 899 NM_014617 1418 Hs.122566 NM_014617 ENSG00000168582 CRYGA CRY-g-A|CRYG1|CRYG5 crystallin gamma A protein-coding 210-23 chr11 35462269 35462844 + 0.666667 NA intron (NM_015430, intron 6 of 11) intron (NM_015430, intron 6 of 11) -42498 NM_001252652 6506 Hs.502338 NM_004171 ENSG00000110436 SLC1A2 EAAT2|EIEE41|GLT-1|HBGT solute carrier family 1 member 2 protein-coding 157.667-209 chr4 40089163 40089562 + 0.666667 NA intron (NM_001318359, intron 2 of 18) L1MD1|LINE|L1 -32163 NR_027277 344967 Hs.534633 NR_027277 ENSG00000205794 LOC344967 - acyl-CoA thioesterase 7 pseudogene pseudo 169.667-16 chr10 20817753 20818111 + 0.666667 NA intron (NM_006393, intron 20 of 27) intron (NM_006393, intron 20 of 27) 79670 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 130-89 chr5 23675214 23675552 + 0.666667 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 167728 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 115.333-11 chr1 105715530 105715820 + 0.666667 NA Intergenic (AATTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -96740 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 166-87 chr4 59840859 59841225 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 827469 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 245.667-44 chr3 105362871 105363460 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3548 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 117.667-164 chr6 55338965 55339274 + 0.666667 NA intron (NM_207410, intron 3 of 8) L2c|LINE|L2 11650 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 204.667-13 chr1 209514843 209515303 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68641 NM_020439 57172 Hs.199068 NM_020439 ENSG00000008118 CAMK1G CLICK3|CLICKIII|VWS1|dJ272L16.1 calcium/calmodulin dependent protein kinase IG protein-coding 155.333-406 chr8 133880550 133880970 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -5736 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 175-6 chr1 182209307 182209717 + 0.666667 NA intron (NR_104175, intron 2 of 2) intron (NR_104175, intron 2 of 2) 104549 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 126-77 chr3 156696054 156696415 + 0.666667 NA intron (NM_015508, intron 4 of 5) intron (NM_015508, intron 4 of 5) 19570 NM_001184718 25976 Hs.744050 NM_015508 ENSG00000163659 TIPARP ARTD14|PARP7|pART14 TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase protein-coding 173.333-180 chr7 16706672 16707039 + 0.666667 NA TTS (NM_001159767) TTS (NM_001159767) 45641 NM_001362719 28969 Hs.487635 NM_014038 ENSG00000136261 BZW2 HSPC028|MST017|MSTP017 basic leucine zipper and W2 domains 2 protein-coding 126.667-165 chr7 31762857 31763084 + 0.666667 NA intron (NM_001191059, intron 18 of 18) MER5B|DNA|hAT-Charlie 75755 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 271-43 chr8 53627730 53628336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104068 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 123-54 chr17 52802668 52802920 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -59327 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 239.667-75 chr8 109879352 109879788 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 96201 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 115-110 chr3 39488790 39488992 + 0.666667 NA intron (NR_103506, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 -13175 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 205-107 chr9 34641263 34641850 + 0.666667 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 -3730 NM_001282208 10280 Hs.522087 NM_005866 ENSG00000147955 SIGMAR1 ALS16|DSMA2|OPRS1|SIG-1R|SR-BP|SR-BP1|SRBP|hSigmaR1|sigma1R sigma non-opioid intracellular receptor 1 protein-coding 118.667-113 chr2 200486020 200486272 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23922 NM_001321547 130535 Hs.605775 NM_152387 ENSG00000155729 KCTD18 6530404F10Rik potassium channel tetramerization domain containing 18 protein-coding 115.333-188 chr6 87519605 87519817 + 0.666667 NA intron (NR_146759, intron 10 of 16) intron (NR_146759, intron 10 of 16) 46737 NM_006416 10559 Hs.423163 NM_006416 ENSG00000164414 SLC35A1 CDG2F|CMPST|CST|hCST solute carrier family 35 member A1 protein-coding 173-70 chr5 12903383 12903752 + 0.666667 NA intron (NR_147005, intron 3 of 4) L1M5|LINE|L1 129319 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 151.333-313 chr4 95685850 95686212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -137058 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 150.333 chr1 12460259 12460555 + 0.666667 NA intron (NM_015378, intron 67 of 69) intron (NM_015378, intron 67 of 69) -46839 NR_003022 677882 Hs.658450 NR_003022 ENSG00000266079 SNORA59B ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59B snoRNA 127.667-151 chr6 57018268 57018537 + 0.666667 NA intron (NM_152731, intron 5 of 6) intron (NM_152731, intron 5 of 6) -28130 NM_001286275 57691 Hs.709521 NM_020931 ENSG00000168116 KIAA1586 - KIAA1586 protein-coding 158.667-339 chr8 139311362 139311703 + 0.666667 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL 391591 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 198.333-134 chr3 175554116 175554627 + 0.666667 NA intron (NM_207015, intron 9 of 13) intron (NM_207015, intron 9 of 13) 184831 NR_039952 100616395 NR_039952 ENSG00000264974 MIR4789 - microRNA 4789 ncRNA 128-44 chr2 52706049 52706303 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3561 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 133.333-51 chr14 47393515 47393851 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 -50437 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 182-78 chr4 59358587 59358903 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 345172 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 130.667-46 chr11 33881936 33882287 + 0.666667 NA intron (NM_005574, intron 1 of 5) intron (NM_005574, intron 1 of 5) 9965 NM_005574 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 155.667-351 chr8 79851647 79851956 + 0.666667 NA intron (NR_110954, intron 2 of 5) HAL1|LINE|L1 19936 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 185.667-129 chr8 90352770 90353246 + 0.666667 NA intron (NR_051989, intron 3 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 131520 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 134-53 chr2 168784076 168784470 + 0.666667 NA intron (NR_045786, intron 1 of 3) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 2156 NR_045786 100861402 Hs.506829 NR_045786 ENSG00000227617 CERS6-AS1 - CERS6 antisense RNA 1 ncRNA 216-86 chr3 167036382 167036953 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 137984 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 158.333-310 chr8 25626304 25626628 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 167233 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 152.333-15 chr1 90721962 90722314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4836 NM_020063 343472 Hs.451956 NM_020063 ENSG00000143032 BARHL2 - BarH like homeobox 2 protein-coding 147.667-261 chr4 117891285 117891588 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 57035 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 197.333-120 chr2 150368343 150368819 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -111574 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 154.667-364 chr7 38776230 38776595 + 0.666667 NA intron (NM_014396, intron 11 of 28) intron (NM_014396, intron 11 of 28) -89323 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 148.667-132 chr15 48141458 48141892 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001301210, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001301210, exon 16 of 16) 20685 NM_205850 283652 Hs.710240 NM_205850 ENSG00000188467 SLC24A5 JSX|NCKX5|OCA6|SHEP4 solute carrier family 24 member 5 protein-coding 116.667-4 chr1 46038367 46038682 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 92149 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 125-82 chr4 88630173 88630386 + 0.666667 NA intron (NM_001318505, intron 3 of 8) intron (NM_001318505, intron 3 of 8) 37799 NM_014606 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 114-9 chr10 51639537 51639831 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 59911 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 129.333-188 chr8 117009351 117009607 + 0.666667 NA intron (NM_001172813, intron 2 of 10) intron (NM_001172813, intron 2 of 10) 58504 NM_001172813 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 124.333-128 chr4 55498981 55499295 + 0.666667 NA intron (NM_004898, intron 2 of 22) L1MEf|LINE|L1 46794 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 125.333-54 chr13 114019369 114019725 + 0.666667 NA intron (NM_001320821, intron 11 of 25).2 intron (NM_001320821, intron 11 of 25).2 -45471 NM_001365455 100507747 Hs.704267 NM_001365455 ENSG00000283199 C13orf46 - chromosome 13 open reading frame 46 protein-coding 125.667-22 chr10 43846021 43846288 + 0.666667 NA intron (NR_033923, intron 2 of 2) intron (NR_033923, intron 2 of 2) 848 NR_033923 414260 Hs.351856 NR_033923 ENSG00000226808 LINC00619 C10orf136|bA168P8.1 long intergenic non-protein coding RNA 619 ncRNA 159.667-51 chr10 73979009 73979347 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -18936 NM_014000 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 150.333-121 chr14 85748697 85749000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -185830 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 143.333-158 chr20 54229362 54229656 + 0.666667 NA Intergenic ORSL|DNA|hAT-Tip100 21422 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 262-43 chr2 127305766 127306319 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_006609, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_006609, exon 16 of 16) -11866 NM_000122 2071 Hs.469872 NM_000122 ENSG00000163161 ERCC3 BTF2|GTF2H|RAD25|TFIIH|TTD2|XPB ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit protein-coding 225.333-71 chr18 26463718 26464341 + 0.666667 NA intron (NM_001258221, intron 3 of 4) intron (NM_001258221, intron 3 of 4) 41034 NR_110762 100506787 Hs.734746 NR_110762 LINC01543 - long intergenic non-protein coding RNA 1543 ncRNA 162-87 chr3 159078608 159079025 + 0.666667 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 9497 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 154-47 chr13 76338001 76338307 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -403022 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 161-48 chr2 210091436 210091786 + 0.666667 NA intron (NM_001307976, intron 5 of 13) L1MEd|LINE|L1 61689 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 151-114 chr6 27748011 27748422 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -13528 NR_038929 100131289 Hs.200573 NR_038929 LOC100131289 - uncharacterized LOC100131289 ncRNA 148-90 chr20 7207621 7207982 + 0.666667 NA intron (NR_110609, intron 3 of 7) intron (NR_110609, intron 3 of 7) 46401 NR_110609 101929265 Hs.637730 NR_110609 ENSG00000228888 LINC01428 - long intergenic non-protein coding RNA 1428 ncRNA 148.667-264 chr3 181421108 181421407 + 0.666667 NA TTS (NR_125407) TTS (NR_125407) 21229 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 132-54 chr18 4976238 4976502 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -104812 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 169.667-92 chr17 69325185 69325495 + 0.666667 NA intron (NM_172232, intron 1 of 38) intron (NM_172232, intron 1 of 38) 1793 NM_172232 23461 Hs.731824 NM_018672 ENSG00000154265 ABCA5 ABC13|EST90625|HTC3 ATP binding cassette subfamily A member 5 protein-coding 141.667-87 chr15 88880809 88881159 + 0.666667 NA intron (NM_001307952, intron 4 of 5) MER102c|DNA|hAT-Charlie 14560 NM_178232 145864 Hs.447530 NM_178232 ENSG00000140511 HAPLN3 EXLD1|HsT19883 hyaluronan and proteoglycan link protein 3 protein-coding 118.667-75 chr15 77196445 77196735 + 0.666667 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) intron (NM_024776, intron 4 of 7) 28814 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 144-4 chr1 83833131 83833443 + 0.666667 NA intron (NR_119374, intron 2 of 2) L1MB5|LINE|L1 27259 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 183-2 chr1 14304409 14304909 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 115314 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 128-78 chr4 39052546 39052865 + 0.666667 NA intron (NM_001171654, intron 1 of 10) intron (NM_001171654, intron 1 of 10) 7874 NM_001171654 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 191.333-159 chr5 78823189 78823701 + 0.666667 NA intron (NM_198709, intron 7 of 7) intron (NM_198709, intron 7 of 7) 161865 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 201.333-33 chr10 71580339 71580659 + 0.666667 NA intron (NM_052836, intron 9 of 12) MER117|DNA|hAT-Charlie -68579 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 137.667-157 chr5 161189874 161190261 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -251441 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 147.667-112 chr15 65528087 65528432 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -2204 NM_016395 51495 Hs.512973 NM_016395 ENSG00000074696 HACD3 B-IND1|BIND1|HSPC121|PTPLAD1 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 protein-coding 164.333-188 chr5 16118600 16119015 + 0.666667 NA intron (NM_001102562, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 60984 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 133-95 chr8 123234751 123235039 + 0.666667 NA intron (NM_001204180, intron 4 of 5) AluSz|SINE|Alu 6482 NM_032847 84933 Hs.707401 NM_032847 ENSG00000189376 C8orf76 - chromosome 8 open reading frame 76 protein-coding 150-10 chr1 220314943 220315251 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42644 NM_012414 25782 Hs.654849 NM_012414 ENSG00000118873 RAB3GAP2 RAB3-GAP150|RAB3GAP150|SPG69|WARBM2|p150 RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2 protein-coding 122-45 chr17 69294909 69295226 + 0.666667 NA intron (NM_018672, intron 9 of 37) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 20566 NM_018672 23461 Hs.731824 NM_018672 ENSG00000154265 ABCA5 ABC13|EST90625|HTC3 ATP binding cassette subfamily A member 5 protein-coding 112-104 chr2 56695386 56695682 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -509764 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 127.333-140 chr5 52716784 52717133 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -70958 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 174.667-69 chr17 33917849 33918262 + 0.666667 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 238751 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 128.667-82 chr18 42528919 42529207 + 0.666667 NA intron (NR_046454, intron 6 of 6) intron (NR_046454, intron 6 of 6) 342395 NR_046174 284260 Hs.652819 NR_046174 ENSG00000267586 LINC00907 - long intergenic non-protein coding RNA 907 ncRNA 214.667-81 chr3 64244145 64244581 + 0.666667 NA intron (NM_001370528, intron 1 of 7) intron (NM_001370528, intron 1 of 7) -18897 NM_198859 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 140-28 chr12 8571124 8571407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30360 NM_014358 26253 Hs.236516 NM_014358 ENSG00000166523 CLEC4E CLECSF9|MINCLE C-type lectin domain family 4 member E protein-coding 199-14 chr10 100002915 100003449 + 0.666667 NA intron (NM_015221, intron 1 of 16) AluSc8|SINE|Alu 6765 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 126.333-140 chr5 19701537 19701859 + 0.666667 NA intron (NM_001349562, intron 5 of 13) intron (NM_001349562, intron 5 of 13) 184574 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 153-114 chr5 103682320 103682627 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -119684 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 157.667-69 chr12 11633295 11633740 + 0.666667 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -16337 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 162.667-264 chr8 61872339 61872675 + 0.666667 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -17332 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 177.333-98 chr21 23586284 23586656 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201635 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 195.333-59 chr12 56643303 56643676 + 0.666667 NA TTS (NR_003046) TTS (NR_003046) 265 NR_003046 692090 NR_003046 SNORD59B U59B small nucleolar RNA, C/D box 59B snoRNA 118.333-85 chr17 62722307 62722509 + 0.666667 NA intron (NM_001288780, intron 9 of 10) intron (NM_001288780, intron 9 of 10) 16202 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 195.667-41 chr14 35278396 35278826 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001282234) promoter-TSS (NM_001282234) 53 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 189.667-150 chr9 88467243 88467667 + 0.666667 NA intron (NM_006717, intron 4 of 5) intron (NM_006717, intron 4 of 5) -67646 NM_001161625 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 133-47 chr2 186447145 186447386 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -38995 NM_018471 55854 Hs.741180 NM_018471 ENSG00000065548 ZC3H15 HT010|LEREPO4|MSTP012 zinc finger CCCH-type containing 15 protein-coding 125-106 chr7 80073331 80073622 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -61355 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 143.667-221 chr6 153466595 153466960 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -335495 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 137-25 chr13 112718693 112719011 + 0.666667 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) AluSq2|SINE|Alu 28523 NM_032189 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 142.667-149 chr3 193836936 193837225 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 6929 NR_146718 105374285 Hs.552531 NR_146718 LINC02038 - long intergenic non-protein coding RNA 2038 ncRNA 174-77 chr5 22711248 22711688 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 141876 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 144.667-134 chr2 36605018 36605425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7053 NM_001042548 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 152.333-185 chr2 88973314 88973594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 161084 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 115-27 chr10 56230775 56231114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 130315 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 179-22 chr12 43786572 43787099 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001351342, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001351342, exon 12 of 12) 19482 NM_001242397 5756 Hs.189075 NM_002822 ENSG00000151239 TWF1 A6|PTK9 twinfilin actin binding protein 1 protein-coding 115.667-55 chr12 25175707 25175941 + 0.666667 NA intron (NR_147909, intron 1 of 14) AluSx3|SINE|Alu 19336 NM_001204101 55259 Hs.407771 NM_018272 ENSG00000118307 CASC1 LAS1|PPP1R54 cancer susceptibility 1 protein-coding 113.667-172 chr5 114256999 114257333 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -104904 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 165.333-58 chr12 77179989 77180426 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114638 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 174.333-125 chr5 150583274 150583649 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -17615 NM_001166208 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 117-3 chr1 78655298 78655588 + 0.666667 NA non-coding (NR_135640, exon 4 of 6) non-coding (NR_135640, exon 4 of 6) 5612 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 200.667-82 chr2 122900600 122900952 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 172705 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 115.667-136 chr20 55524870 55525093 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -97784 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 200.667-6 chr1 66992814 66993283 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61100 NM_015139 23169 Hs.213642 NM_015139 ENSG00000116704 SLC35D1 SHNKND|UGTREL7 solute carrier family 35 member D1 protein-coding 164-88 chr4 99465975 99466443 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -30699 NM_000673 131 Hs.389 NM_000673 ENSG00000196344 ADH7 ADH4 alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide protein-coding 124.333-32 chr11 116000345 116000557 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -240251 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 175-53 chr3 61495934 61496359 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65425 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 114.333-112 chr2 127182251 127182580 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 23352 NM_001001665 339761 Hs.407639 NM_001001665 ENSG00000186684 CYP27C1 - cytochrome P450 family 27 subfamily C member 1 protein-coding 170.333-167 chr4 180339810 180340163 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 819163 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 118.333-10 chr1 94697103 94697300 + 0.666667 NA intron (NR_160779, intron 2 of 5) AluSz6|SINE|Alu 48699 NR_039620 100616321 NR_039620 ENSG00000263526 MIR378G - microRNA 378g ncRNA 135-114 chr8 122990686 122991083 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 34888 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 114-154 chr7 131124935 131125205 + 0.666667 NA intron (NM_001145354, intron 1 of 18) intron (NM_001145354, intron 1 of 18) 14976 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 118.333-141 chr3 130657868 130658220 + 0.666667 NA intron (NM_001102608, intron 32 of 35) intron (NM_001102608, intron 32 of 35) 88785 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 149.333-175 chr2 44226426 44226702 + 0.666667 NA intron (NM_177968, intron 5 of 5) MER5B|DNA|hAT-Charlie -48916 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 125.333-166 chr7 45915053 45915334 + 0.666667 NA intron (NM_001013398, intron 3 of 4) intron (NM_001013398, intron 3 of 4) 6079 NM_000598 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 154-155 chrX 88871124 88871465 + 0.666667 NA Intergenic MER73|LTR|ERVL 124069 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 158.333-273 chr6 53844911 53845337 + 0.666667 NA intron (NM_018214, intron 2 of 13) AluSg|SINE|Alu 50119 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 144-151 chr8 98745596 98745926 + 0.666667 NA intron (NM_006281, intron 4 of 10) L1MEg|LINE|L1 79910 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 154.667-162 chr2 18200487 18200898 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 322025 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 137.333-64 chr17 29143816 29144083 + 0.666667 NA intron (NM_001346765, intron 2 of 42) intron (NM_001346765, intron 2 of 42) -3560 NM_001346768 399687 Hs.462590 NM_078471 ENSG00000196535 MYO18A MAJN|MYSPDZ|SP-R210|SPR210 myosin XVIIIA protein-coding 159-66 chr2 164518594 164518943 + 0.666667 NA intron (NM_004490, intron 6 of 13) L1PB1|LINE|L1 49727 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 147.333-306 chr7 158541303 158541669 + 0.666667 NA exon (NM_001308268, exon 1 of 23) exon (NM_001308268, exon 1 of 23) 290 NM_001308268 5799 Hs.490789 NM_002847 ENSG00000155093 PTPRN2 IA-2beta|IAR|ICAAR|PTPRP|R-PTP-N2 protein tyrosine phosphatase receptor type N2 protein-coding 119.333-243 chrX 69488560 69488787 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -16562 NM_015686 27112 Hs.87619 NM_015686 ENSG00000130054 FAM155B CXorf63|TED|TMEM28|bB57D9.1 family with sequence similarity 155 member B protein-coding 167-88 chr6 15393384 15393842 + 0.666667 NA intron (NM_004973, intron 2 of 17) intron (NM_004973, intron 2 of 17) 144758 NM_001267040 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 186-71 chr4 40184540 40184980 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6320 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 154.667-165 chr2 39941530 39941940 + 0.666667 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 24101 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 160.667-241 chr5 40688151 40688561 + 0.666667 NA intron (NM_000958, intron 2 of 2) intron (NM_000958, intron 2 of 2) 8441 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 117.333-137 chr3 105337798 105338005 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -28812 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 218.333-15 chr10 86843779 86844276 + 0.666667 NA intron (NM_004329, intron 2 of 12) intron (NM_004329, intron 2 of 12) 87388 NM_004329 657 Hs.524477 NM_004329 ENSG00000107779 BMPR1A 10q23del|ACVRLK3|ALK3|CD292|SKR5 bone morphogenetic protein receptor type 1A protein-coding 150.667-48 chr10 88621181 88621483 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 34570 NM_001010939 142910 Hs.440959 NM_001010939 ENSG00000204022 LIPJ LIPL1|bA425M17.2 lipase family member J protein-coding 128.333-28 chr10 56791365 56791708 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -430263 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 256-7 chr1 232397406 232398165 + 0.666667 NA TTS (NM_020808) TTS (NM_020808) 117823 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 180-28 chr13 82299678 82300124 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1072918 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 189.333-71 chr17 40632995 40633391 + 0.666667 NA intron (NM_003079, intron 7 of 10) AluSq|SINE|Alu 14625 NM_003079 6605 Hs.743978 NM_003079 ENSG00000073584 SMARCE1 BAF57|CSS5 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 protein-coding 189.333-206 chr8 101777781 101778340 + 0.666667 NA intron (NM_001040625, intron 4 of 6) intron (NM_001040625, intron 4 of 6) 12909 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 175-7 chr1 192052457 192052979 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -105744 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 145.333-292 chr8 37334671 37334944 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 159106 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 143.667-48 chr12 4765607 4765913 + 0.666667 NA intron (NM_017417, intron 10 of 10) intron (NM_017417, intron 10 of 10) -43416 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 163.333-264 chr7 69541906 69542367 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 55488 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 120.333-119 chr21 31171451 31171737 + 0.666667 NA intron (NM_001353686, intron 15 of 27) intron (NM_001353686, intron 15 of 27) -10654 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 155.333-236 chr3 110053967 110054378 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 451344 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 170-16 chr11 77673761 77674112 + 0.666667 NA intron (NM_016578, intron 14 of 15) L1MC4|LINE|L1 -36130 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 113.667-18 chr1 212294643 212294831 + 0.666667 NA intron (NM_006243, intron 1 of 12) L2c|LINE|L2 -7121 NM_001199756 5525 Hs.744012 NM_006243 ENSG00000066027 PPP2R5A B56A|B56alpha|PR61A protein phosphatase 2 regulatory subunit B'alpha protein-coding 185.667-34 chr15 54820744 54821155 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -235798 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 119.667-108 chr3 1870864 1871049 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -227847 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 132.667-18 chr10 24131467 24131765 + 0.666667 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) intron (NM_001098500, intron 2 of 18) -77175 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 173.333-119 chr3 39757547 39758042 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51120 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 187-3 chr1 101904486 101904819 + 0.666667 NA intron (NM_058170, intron 1 of 5) intron (NM_058170, intron 1 of 5) 32640 NR_033424 94236 Hs.606193 NR_033424 DNAJA1P5 HEJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A1 pseudogene 5 pseudo 147.667-286 chr5 77701265 77701540 + 0.666667 NA intron (NM_004607, intron 2 of 3) L1PB1|LINE|L1 -62705 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 147.667-100 chr14 52411103 52411394 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96936 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 135-19 chr12 55673467 55673719 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8143 NM_152637 196410 Hs.51483 NM_152637 ENSG00000170439 METTL7B ALDI methyltransferase like 7B protein-coding 164.333-165 chr4 1008309 1008658 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3143 NM_001004356 53834 Hs.193326 NM_021923 ENSG00000127418 FGFRL1 FGFR-5|FGFR5|FHFR fibroblast growth factor receptor like 1 protein-coding 298.333-7 chr12 12385157 12385830 + 0.666667 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 L1ME1|LINE|L1 28415 NM_001330356 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 149.333-266 chr3 151542254 151542690 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23523 NR_049818 100847036 NR_049818 ENSG00000264330 MIR5186 - microRNA 5186 ncRNA 224-32 chr16 83604996 83605559 + 0.666667 NA intron (NM_001220489, intron 7 of 12) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 96931 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 153-82 chr20 24026914 24027187 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38271 NM_178311 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 143.667-15 chr1 218839271 218839681 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 79035 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 140.667-44 chr10 124543870 124544267 + 0.666667 NA intron (NM_022126, intron 6 of 6) intron (NM_022126, intron 6 of 6) 82245 NM_001318331 64077 Hs.527748 NM_022126 ENSG00000107902 LHPP HDHD2B phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase protein-coding 112.333-137 chr2 174320350 174320618 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5543 NR_038897 285084 Hs.275398 NR_038897 ENSG00000231453 LINC01305 - long intergenic non-protein coding RNA 1305 ncRNA 138.333-40 chr11 61822411 61822724 + 0.666667 NA intron (NM_001281502, intron 1 of 11) intron (NM_001281502, intron 1 of 11) -5564 NM_013402 3992 Hs.503546 NM_013402 ENSG00000149485 FADS1 D5D|FADS6|FADSD5|LLCDL1|TU12 fatty acid desaturase 1 protein-coding 113-137 chr3 51735072 51735305 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 28120 NM_001349117 2912 Hs.121510 NM_000839 ENSG00000164082 GRM2 GLUR2|GPRC1B|MGLUR2|mGlu2 glutamate metabotropic receptor 2 protein-coding 153.667-333 chr6 40523164 40523480 + 0.666667 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 64042 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 117-18 chr10 42362643 42362880 + 0.666667 NA intron (NR_024380, intron 1 of 2) MER21C|LTR|ERVL 5284 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 242.333-62 chr22 41482148 41482711 + 0.666667 NA intron (NM_001098, intron 1 of 17) intron (NM_001098, intron 1 of 17) 13312 NM_001098 50 Hs.643610 NM_001098 ENSG00000100412 ACO2 ACONM|HEL-S-284|ICRD|OCA8|OPA9 aconitase 2 protein-coding 150.667-345 chr6 154813754 154814050 + 0.666667 NA intron (NM_014892, intron 12 of 19) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -39458 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 140.333-30 chr10 73297502 73297826 + 0.666667 NA intron (NM_001367801, intron 15 of 27) MIR3|SINE|MIR 44923 NR_134460 414245 Hs.568860 NR_038373 ENSG00000227540 DNAJC9-AS1 C10orf103|bA537A6.3 DNAJC9 antisense RNA 1 ncRNA 176.333-87 chr2 85794501 85795007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11077 NR_106719 102466516 NR_106719 ENSG00000278783 MIR6071 hsa-mir-6071 microRNA 6071 ncRNA 163.667-21 chr10 35309029 35309377 + 0.666667 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) intron (NM_181698, intron 3 of 11) -27306 NM_001282854 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 148-106 chr3 97368603 97368882 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -70865 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 122.667-209 chr9 77615044 77615248 + 0.666667 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) intron (NM_004297, intron 1 of 6) 33176 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 214-126 chr7 48145243 48145586 + 0.666667 NA Intergenic MER4E1|LTR|ERV1 -26044 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 133.667-67 chr19 50596842 50597175 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -7955 NR_004384 100126781 Hs.707968 NR_004384 SNAR-F - small NF90 (ILF3) associated RNA F snRNA 124.667-165 chr5 46173443 46173709 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -477196 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 152-161 chrX 54007656 54007961 + 0.666667 NA intron (NM_001184898, intron 8 of 21) L1MB7|LINE|L1 35339 NM_001184898 23133 Hs.133352 NM_015107 ENSG00000172943 PHF8 JHDM1F|KDM7B|MRXSSD|ZNF422 PHD finger protein 8 protein-coding 118.667-146 chr4 30422027 30422335 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -298188 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 111.667-86 chr15 45422705 45422958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7698 NM_032413 84419 Hs.112242 NM_032413 ENSG00000166920 C15orf48 FOAP-11|MIR147BHG|NMES1 chromosome 15 open reading frame 48 protein-coding 116.333-131 chr21 14729812 14730130 + 0.666667 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL -86864 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 234.667-56 chr2 141784882 141785510 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) L3|LINE|CR1 346505 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 180.333-75 chr3 44353944 44354385 + 0.666667 NA intron (NM_001282914, intron 1 of 10) L1MC1|LINE|L1 15398 NM_001282914 285343 Hs.55131 NM_173826 ENSG00000179152 TCAIM C3orf23|TOAG-1|TOAG1 T cell activation inhibitor, mitochondrial protein-coding 148.333-304 chr5 27270600 27270926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201529 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 240.333-37 chr14 73210490 73210917 + 0.666667 NA intron (NM_000021, intron 9 of 11) Arthur1A|DNA|hAT-Tip100 -26803 NR_158677 89932 Hs.509909 NM_173462 ENSG00000100767 PAPLN PPN papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein protein-coding 143.333-305 chr9 82767931 82768213 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 295070 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 130-25 chr12 31850858 31851233 + 0.666667 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 36158 NR_135029 105369723 Hs.736954 NR_135029 ENSG00000255760 LINC02422 - long intergenic non-protein coding RNA 2422 ncRNA 115.667-8 chr1 151350140 151350431 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2992 NM_000449 5993 Hs.632472 NM_000449 ENSG00000143390 RFX5 - regulatory factor X5 protein-coding 205-96 chr8 66184230 66184626 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5964 NM_000756 1392 Hs.75294 NM_000756 ENSG00000147571 CRH CRF|CRH1 corticotropin releasing hormone protein-coding 114-47 chr15 73266270 73266545 + 0.666667 NA exon (NM_001172623, exon 16 of 28) exon (NM_001172623, exon 16 of 28) -33503 NR_162148 113219462 NR_162148 MIR12135 - microRNA 12135 ncRNA 124-30 chr12 2932647 2932970 + 0.666667 NA intron (NM_003324, intron 6 of 10) FLAM_A|SINE|Alu -26589 NM_201441 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 149.667-309 chr5 36536935 36537328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69224 NM_001166696 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 188-120 chr9 96066157 96066695 + 0.666667 NA intron (NR_033838, intron 1 of 8) intron (NR_033838, intron 1 of 8) 587 NR_033838 158435 Hs.652615 NR_033838 LOC158435 - uncharacterized LOC158435 ncRNA 129.333-60 chr14 23881794 23882073 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -71837 NM_001282991 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 118.667-119 chr20 20602492 20602750 + 0.666667 NA intron (NM_020343, intron 15 of 39) intron (NM_020343, intron 15 of 39) 110023 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 148-36 chr12 110033490 110033853 + 0.666667 NA intron (NM_033121, intron 12 of 14) intron (NM_033121, intron 12 of 14) 14976 NR_148516 400073 Hs.44817 NM_207435 ENSG00000174456 C12orf76 - chromosome 12 open reading frame 76 protein-coding 144-108 chr3 72815911 72816267 + 0.666667 NA intron (NM_018130, intron 7 of 10) intron (NM_018130, intron 7 of 10) 32356 NM_018130 55164 Hs.606584 NM_018130 ENSG00000144736 SHQ1 GRIM-1|Shq1p SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor protein-coding 124.667-120 chr20 16480104 16480372 + 0.666667 NA intron (NM_001199866, intron 12 of 22) intron (NM_001199866, intron 12 of 22) 93210 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 184-45 chr18 47392166 47392615 + 0.666667 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) intron (NR_147192, intron 1 of 2) 11894 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 137.667-180 chr7 94383184 94383444 + 0.666667 NA intron (NR_147206, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 8878 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 117.333-22 chr10 31857790 31857978 + 0.666667 NA intron (NM_001270696, intron 4 of 17) L1MEd|LINE|L1 51042 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 173.333-220 chrX 46768359 46768748 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9435 NM_001257291 84679 Hs.91389 NM_032591 ENSG00000065923 SLC9A7 MRX108|NHE-7|NHE7|SLC9A6 solute carrier family 9 member A7 protein-coding 116-77 chr2 88877882 88878119 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 65630 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 190.333-141 chr8 56814204 56814695 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 179418 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 153.333-61 chr11 17698532 17698858 + 0.666667 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -1756 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 185-10 chr11 81692062 81692465 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 198573 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 116-100 chr22 45188063 45188403 + 0.666667 NA TTS (NM_007172) TTS (NM_007172) 3379 NR_146602 105373064 NR_146602 LOC105373064 - uncharacterized LOC105373064 ncRNA 111.667-208 chr5 106304101 106304293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 706817 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 133-9 chr10 76885931 76886233 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002247, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_002247, exon 27 of 27) -1962 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 115-86 chr2 50648832 50649075 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 47309 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 126.333-122 chr3 139853517 139853751 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -81551 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 158-112 chr5 149130329 149130753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10906 NM_014945 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 180.667-63 chr2 54758944 54759462 + 0.666667 NA intron (NM_001039753, intron 1 of 40) intron (NM_001039753, intron 1 of 40) 34191 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 172.667-133 chr6 41268486 41268882 + 0.666667 NA intron (NR_136332, intron 4 of 4) MIR3|SINE|MIR 17998 NM_018643 54210 Hs.283022 NM_018643 ENSG00000124731 TREM1 CD354|TREM-1 triggering receptor expressed on myeloid cells 1 protein-coding 120-109 chr5 66555161 66555383 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -41121 NM_001290228 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 203.333-186 chr3 181687642 181688098 + 0.666667 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) intron (NR_075090, intron 2 of 2) -24055 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 119.667-151 chr5 53323142 53323379 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -157369 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 146.667-26 chr1 205552504 205552794 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -16365 NM_181644 148808 Hs.567714 NM_181644 ENSG00000174514 MFSD4A MFSD4|UNQ3064 major facilitator superfamily domain containing 4A protein-coding 172.667-85 chr2 133924636 133924941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -195147 NM_001371457 199.667-119 chr6 47356833 47357284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47153 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 134.333-94 chr2 169822947 169823333 + 0.666667 NA intron (NM_001293187, intron 2 of 7) AluJo|SINE|Alu 1765 NM_014168 29081 Hs.470553 NM_014168 ENSG00000138382 METTL5 HSPC133 methyltransferase like 5 protein-coding 117-128 chr7 14379358 14379589 + 0.666667 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -388048 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 111.667-87 chr15 49648927 49649248 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001144955, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001144955, exon 5 of 5) 28039 NM_020234 56986 Hs.127432 NM_020234 ENSG00000104047 DTWD1 MDS009 DTW domain containing 1 protein-coding 122-33 chr14 51649403 51649698 + 0.666667 NA TTS (NR_037676) TTS (NR_037676) 2194 NR_037676 145438 Hs.645410 NR_037676 ENSG00000273888 FRMD6-AS1 C14orf82 FRMD6 antisense RNA 1 ncRNA 157.667-350 chr9 2722592 2722912 + 0.666667 NA intron (NM_133497, intron 1 of 1) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 5242 NM_133497 169522 Hs.622675 NM_133497 ENSG00000168263 KCNV2 KV11.1|Kv8.2|RCD3B potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 2 protein-coding 116-56 chr16 17380575 17380872 + 0.666667 NA intron (NM_022166, intron 1 of 11) L1MB3|LINE|L1 90237 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 160.667-270 chr7 4448823 4449140 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -233314 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 201.667-39 chr15 71898472 71898929 + 0.666667 NA exon (NM_006901, exon 25 of 42) exon (NM_006901, exon 25 of 42) 88146 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 126-28 chr13 94579045 94579410 + 0.666667 NA intron (NM_001304430, intron 7 of 11) intron (NM_001304430, intron 7 of 11) 16925 NM_001304430 23483 Hs.12393 NM_014305 ENSG00000088451 TGDS CATMANS|SDR2E1|TDPGD TDP-glucose 4,6-dehydratase protein-coding 113.667-31 chr11 74903556 74903828 + 0.666667 NA intron (NM_001270381, intron 8 of 15) AluY|SINE|Alu 45399 NM_001270380 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 166-30 chr11 110845326 110845739 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -132343 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 156-13 chr1 179653283 179653557 + 0.666667 NA intron (NM_001199091, intron 13 of 16) intron (NM_001199091, intron 13 of 16) 47193 NM_001199092 163589 Hs.197354 NM_173533 ENSG00000162782 TDRD5 TUDOR3 tudor domain containing 5 protein-coding 121.333-46 chr13 82649167 82649467 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1233076 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 141-54 chr3 131560239 131560535 + 0.666667 NA intron (NM_130808, intron 11 of 15) intron (NM_130808, intron 11 of 15) -57416 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 291.667-33 chr7 52226088 52226596 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -809291 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 153-103 chr4 64392739 64393045 + 0.666667 NA intron (NM_001363796, intron 1 of 11) MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 16558 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 186.667-128 chr6 92261463 92261960 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -571283 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 216-3 chr1 113055465 113055954 + 0.666667 NA intron (NR_103777, intron 1 of 2) intron (NR_103777, intron 1 of 2) 17393 NR_103777 100996251 Hs.382067 NR_103777 ENSG00000238198 LRIG2-DT - LRIG2 divergent transcript ncRNA 164-127 chr9 74211779 74212125 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -159579 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 157.333-115 chr15 35639221 35639679 + 0.666667 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) L1PA13|LINE|L1 93255 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 160.667-120 chr17 44888156 44888488 + 0.666667 NA intron (NM_001142605, intron 1 of 26) MER20|DNA|hAT-Charlie 11046 NM_001258353 9343 Hs.151787 NM_004247 ENSG00000108883 EFTUD2 MFDGA|MFDM|SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 protein-coding 143.333-288 chr8 105526576 105526863 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 207176 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 144.667-310 chr8 129851956 129852273 + 0.666667 NA intron (NM_001353307, intron 10 of 13) intron (NM_001353307, intron 10 of 13) -65490 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 169.333-222 chr6 37707218 37707545 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9498 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 125.333-8 chr1 85690650 85690855 + 0.666667 NA intron (NM_017953, intron 5 of 9) AluSz|SINE|Alu 17681 NM_001170670 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 154.667-377 chr8 21740724 21741052 + 0.666667 NA intron (NM_001495, intron 4 of 8) intron (NM_001495, intron 4 of 8) 47987 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 139.333-175 chr4 153493487 153493875 + 0.666667 NA intron (NM_001131007, intron 3 of 34) MIR|SINE|MIR 27321 NM_001131007 23240 Hs.732450 NM_015196 ENSG00000121210 TMEM131L KIAA0922 transmembrane 131 like protein-coding 116.333-159 chr4 91271185 91271442 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1PB1|LINE|L1 1005989 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 162.333-49 chr12 26334925 26335231 + 0.666667 NA TTS (NM_002223) TTS (NM_002223) 139505 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 113-111 chr2 123280161 123280462 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -206830 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 154-52 chr14 38905220 38905531 + 0.666667 NA intron (NR_039982, intron 1 of 4) intron (NR_039982, intron 1 of 4) 11507 NR_039982 283547 Hs.675941 NR_039982 ENSG00000259070 LINC00639 - long intergenic non-protein coding RNA 639 ncRNA 164.667-194 chr5 133891657 133892109 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21794 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 124.667-121 chr20 34641913 34642137 + 0.666667 NA intron (NM_080476, intron 4 of 11) intron (NM_080476, intron 4 of 11) 35260 NM_080476 128869 Hs.253319 NM_080476 ENSG00000101464 PIGU CDC91L1|GAB1 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U protein-coding 120.333-28 chr10 130100665 130100892 + 0.666667 NA intron (NM_001355042, intron 1 of 3) L1MEc|LINE|L1 -5231 NR_044994 119437 Hs.620802 NR_044994 ENSG00000233122 CTAGE7P CTAGE7|CTAGEP|bA500G10.2|rcCTAGE5 CTAGE family member 7, pseudogene pseudo 148.667-404 chr9 133014933 133015240 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -5344 NR_132980 106635683 NR_132980 SNORD141A - small nucleolar RNA, C/D box 141A snoRNA 155.333-408 chr9 2986951 2987263 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143012 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 126.667-174 chr8 84208288 84208562 + 0.666667 NA intron (NM_001354323, intron 1 of 7) intron (NM_001354323, intron 1 of 7) 23759 NM_001100391 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 122-44 chr17 31564714 31564996 + 0.666667 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 4859 NR_029710 406968 NR_029710 ENSG00000207614 MIR193A MIRN193|MIRN193A|mir-193a microRNA 193a ncRNA 131.333-53 chr14 55749306 55749570 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -16807 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 130-69 chr20 58598205 58598442 + 0.666667 NA intron (NR_034147, intron 6 of 6) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -36449 NR_125359 79160 Hs.280135 NR_125359 ENSG00000268941 LINC01711 - long intergenic non-protein coding RNA 1711 ncRNA 131-83 chr5 139219140 139219446 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20925 NM_001037633 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 152.667-44 chr10 61113109 61113356 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 96957 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 158-94 chr4 53599953 53600275 + 0.666667 NA intron (NR_046827, intron 1 of 1) intron (NR_046827, intron 1 of 1) 7158 NR_046827 100873955 Hs.351074 NR_046827 LNX1-AS2 - LNX1 antisense RNA 2 ncRNA 169.667-160 chr4 146781897 146782241 + 0.666667 NA intron (NR_133922, intron 12 of 13) intron (NR_133922, intron 12 of 13) 143176 NM_004575 5458 Hs.266 NM_004575 ENSG00000151615 POU4F2 BRN3.2|BRN3B|Brn-3b POU class 4 homeobox 2 protein-coding 270.333-37 chr3 99801628 99802379 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15859 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 173-42 chr2 21811927 21812359 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -101491 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 166.333-82 chr15 89980759 89981079 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -20405 NM_198526 374655 Hs.459311 NM_198526 ENSG00000140548 ZNF710 - zinc finger protein 710 protein-coding 139-112 chr9 4034550 4034908 + 0.666667 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) intron (NM_001042413, intron 4 of 10) 117454 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 144.667-47 chr11 104171338 104171661 + 0.666667 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -7352 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 166-92 chr4 96143162 96143577 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -167334 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 207.667-110 chr7 675848 676329 + 0.666667 NA intron (NM_001164760, intron 4 of 10) intron (NM_001164760, intron 4 of 10) 36436 NM_002735 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 130-113 chr6 129634253 129634517 + 0.666667 NA intron (NM_033515, intron 3 of 14) intron (NM_033515, intron 3 of 14) 75792 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 116-51 chr15 62663481 62663786 + 0.666667 NA intron (NM_015059, intron 6 of 55) L1ME3Cz|LINE|L1 16322 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 144.333-288 chr9 108923537 108923882 + 0.666667 NA intron (NM_001330749, intron 5 of 34) MIR3|SINE|MIR 10415 NM_003640 8518 Hs.494738 NM_003640 ENSG00000070061 ELP1 DYS|FD|IKAP|IKBKAP|IKI3|TOT1 elongator complex protein 1 protein-coding 197.333-143 chr22 34913242 34913556 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 84517 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 139.667-153 chr5 93371322 93371658 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 199853 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-182 chr2 12371093 12371369 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) 172101 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 142.667-30 chr11 69742814 69743189 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32340 NM_002007 2249 Hs.1755 NM_002007 ENSG00000075388 FGF4 FGF-4|HBGF-4|HST|HST-1|HSTF-1|HSTF1|K-FGF|KFGF fibroblast growth factor 4 protein-coding 163.333-179 chr3 46716784 46717189 + 0.666667 NA intron (NM_013270, intron 2 of 5) intron (NM_013270, intron 2 of 5) 883 NM_013270 29122 Hs.120365 NM_013270 ENSG00000283706 PRSS50 CT20|TSP50 serine protease 50 protein-coding 174.333-127 chr5 178483812 178484170 + 0.666667 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) AluSq2|SINE|Alu 106402 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 117.333-172 chr5 95456308 95456515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65045 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 124-115 chr8 107151930 107152189 + 0.666667 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger 184456 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 123-79 chr3 115783586 115783847 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121410 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 269.333-81 chr7 46656657 46657140 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 40224 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 191.667-32 chr11 125220181 125220679 + 0.666667 NA intron (NM_022062, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 55679 NM_022062 63876 Hs.278564 NM_022062 ENSG00000165495 PKNOX2 PREP2 PBX/knotted 1 homeobox 2 protein-coding 112.667-94 chr17 49190425 49190656 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18841 NM_031498 2793 Hs.181781 NM_031498 ENSG00000167083 GNGT2 G-GAMMA-8|G-GAMMA-C|GNG8|GNG9|GNGT8 G protein subunit gamma transducin 2 protein-coding 144-18 chr10 83583557 83583831 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 93395 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 151-80 chr3 33157115 33157394 + 0.666667 NA intron (NM_015551, intron 4 of 4) intron (NM_015551, intron 4 of 4) 43296 NM_006371 10491 Hs.517888 NM_006371 ENSG00000170275 CRTAP CASP|LEPREL3|OI7|P3H5 cartilage associated protein protein-coding 169.333-254 chr7 92856455 92856807 + 0.666667 NA intron (NR_110087, intron 2 of 2) intron (NR_110087, intron 2 of 2) -20004 NM_001145306 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 146.667-120 chr16 47513197 47513488 + 0.666667 NA intron (NM_001031835, intron 6 of 31) intron (NM_001031835, intron 6 of 31) 52011 NM_001031835 5257 Hs.78060 NM_000293 ENSG00000102893 PHKB - phosphorylase kinase regulatory subunit beta protein-coding 135.667-98 chr2 107514131 107514533 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -15087 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 156.333-236 chr3 86368599 86369040 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -113124 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 174.333-135 chr6 136481502 136481875 + 0.666667 NA intron (NM_001198617, intron 1 of 15) L1MA3|LINE|L1 -14813 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 161-81 chr5 94869471 94869909 + 0.666667 NA intron (NM_001297777, intron 14 of 19) intron (NM_001297777, intron 14 of 19) 212176 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 227.333-2 chr1 40018113 40018523 + 0.666667 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -21747 NM_001350480 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 153.667-279 chr4 32324981 32325299 + 0.666667 NA Intergenic MER83B-int|LTR|ERV1 -25898 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 229-67 chr8 117391001 117391420 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -129503 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 132.333-139 chr5 142843576 142843828 + 0.666667 NA intron (NM_001349547, intron 1 of 21) intron (NM_001349547, intron 1 of 21) 25208 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 219.333-23 chr10 39434091 39434608 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 737753 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 150-14 chr10 62810217 62810518 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5647 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 148-104 chr3 85615957 85616251 + 0.666667 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) -110378 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 166.667-165 chr4 64991649 64992068 + 0.666667 NA intron (NR_033976, intron 1 of 6) L1MB2|LINE|L1 12642 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 127-101 chr8 137764791 137765078 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 318611 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 195.333-32 chr10 65405127 65405559 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166082 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 162.333-272 chr9 69022583 69022917 + 0.666667 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -8627 NM_002732 5568 Hs.158029 NM_002732 ENSG00000165059 PRKACG BDPLT19|KAPG|PKACg protein kinase cAMP-activated catalytic subunit gamma protein-coding 145.333-269 chr7 11104060 11104482 + 0.666667 NA non-coding (NR_033435, exon 16 of 16) non-coding (NR_033435, exon 16 of 16) 130399 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 114.667-141 chr2 159425508 159425763 + 0.666667 NA intron (NM_001329858, intron 12 of 36) intron (NM_001329858, intron 12 of 36) -138932 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 170.667-34 chr12 115197198 115197640 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -513244 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 159.333-195 chr21 19771119 19771462 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 128465 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 114.667-21 chr1 234562667 234562888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30998 NR_038426 100506795 Hs.448989 NR_038426 ENSG00000231768 LINC01354 - long intergenic non-protein coding RNA 1354 ncRNA 295.333-50 chr5 30980820 30981415 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -212569 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 156.333-58 chr11 71176001 71176317 + 0.666667 NA intron (NM_012309, intron 1 of 24) L1MEc|LINE|L1 48637 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 159.667-72 chr12 32026761 32027073 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 67502 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 154-137 chr8 56841909 56842243 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 151791 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 130.333-76 chr15 81497043 81497425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -123021 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 116.333-18 chr1 199791885 199792143 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -235696 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 123.667-7 chr1 71442317 71442615 + 0.666667 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) AluSz|SINE|Alu 361142 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 154-66 chr16 9307628 9307979 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -47785 NR_135195 101927009 Hs.537273 NR_135195 ENSG00000261617 LINC02177 - long intergenic non-protein coding RNA 2177 ncRNA 132.333-6 chr1 71685472 71685766 + 0.666667 NA intron (NM_173808, intron 4 of 6) intron (NM_173808, intron 4 of 6) 151393 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 111.667-130 chr2 63426755 63426937 + 0.666667 NA intron (NR_148704, intron 10 of 18) L1PA16|LINE|L1 11161 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 121-68 chr2 68496351 68496547 + 0.666667 NA intron (NM_173545, intron 2 of 9) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 28864 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 180.333-122 chr8 12999237 12999690 + 0.666667 NA intron (NM_020844, intron 2 of 4) L1MA10|LINE|L1 -12801 NM_001099677 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 129.667-89 chr2 46708911 46709282 + 0.666667 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) AluSc|SINE|Alu 9801 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 231.666-18 chr3 57734541 57735225 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -22373 NM_001304420 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 169.333-31 chr10 102211769 102212117 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -14356 NM_152310 83401 Hs.302130 NM_152310 ENSG00000119915 ELOVL3 CIG-30|CIG30 ELOVL fatty acid elongase 3 protein-coding 112-130 chr22 28357008 28357316 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MIRc|SINE|MIR -102707 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 188.333-140 chr7 11249490 11249919 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 275832 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 112.667-93 chr17 44452822 44453004 + 0.666667 NA intron (NM_001304942, intron 2 of 6) AluJb|SINE|Alu -16062 NM_001304943 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 136-63 chr3 76609001 76609320 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -430939 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 131-82 chr5 133101160 133101380 + 0.666667 NA intron (NM_002154, intron 16 of 18) L1MC5|LINE|L1 49257 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 113-104 chr2 56271872 56272176 + 0.666667 NA intron (NM_001348516, intron 2 of 2) intron (NM_001348516, intron 2 of 2) -86254 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 127-15 chr10 15315471 15315705 + 0.666667 NA intron (NM_001010924, intron 1 of 7) intron (NM_001010924, intron 1 of 7) 55701 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 143.333-113 chr17 20913277 20913550 + 0.666667 NA intron (NR_160710, intron 3 of 4) AluSz|SINE|Alu -7615 NR_160711 440416 Hs.661076 NR_104185 ENSG00000233098 CCDC144NL-AS1 - CCDC144NL antisense RNA 1 ncRNA 167-37 chr14 27072779 27073121 + 0.666667 NA Intergenic LTR86B1|LTR|ERVL 164308 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 120-145 chr9 37311232 37311447 + 0.666667 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) intron (NR_110317, intron 4 of 7) -111357 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 127.333-132 chr4 84921055 84921289 + 0.666667 NA intron (NM_014991, intron 2 of 67) intron (NM_014991, intron 2 of 67) -44444 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 124.667-82 chr17 19965354 19965689 + 0.666667 NA intron (NM_007202, intron 2 of 14) intron (NM_007202, intron 2 of 14) 12307 NM_007202 11216 Hs.642676 NM_007202 ENSG00000108599 AKAP10 AKAP-10|D-AKAP-2|D-AKAP2|PRKA10 A-kinase anchoring protein 10 protein-coding 182.667-19 chr10 95043893 95044348 + 0.666667 NA intron (NM_001198855, intron 7 of 9) intron (NM_001198855, intron 7 of 9) 25377 NM_001198854 1558 Hs.709188 NM_000770 ENSG00000138115 CYP2C8 CPC8|CYP2C8DM|CYPIIC8|MP-12/MP-20 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 8 protein-coding 131.333-133 chr4 92470093 92470314 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 165804 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 111.667-101 chr17 35078226 35078446 + 0.666667 NA intron (NR_037713, intron 1 of 6) AluJo|SINE|Alu 10890 NR_037713 117584 Hs.13680 NM_057178 ENSG00000092871 RFFL CARP-2|CARP2|FRING|RIFIFYLIN|RNF189|RNF34L ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 143.333-97 chr15 43272834 43273094 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -6036 NM_004245 9333 Hs.129719 NM_004245 ENSG00000104055 TGM5 PSS2|TGASE5|TGASEX|TGM6|TGMX|TGX transglutaminase 5 protein-coding 188.667-57 chr17 49730655 49731112 + 0.666667 NA intron (NM_030802, intron 2 of 7) intron (NM_030802, intron 2 of 7) -22919 NM_005827 10237 Hs.154073 NM_005827 ENSG00000121073 SLC35B1 UGTREL1 solute carrier family 35 member B1 protein-coding 116.667-195 chr7 107302060 107302265 + 0.666667 NA intron (NM_181733, intron 11 of 20) L1ME1|LINE|L1 133159 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 151.333-236 chr2 209324291 209324720 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -99542 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 251-25 chr15 69486695 69487323 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 34191 NM_213725 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 115-57 chr14 47598185 47598463 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) L1MB4|LINE|L1 76630 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 153.333-4 chr1 47293883 47294233 + 0.666667 NA intron (NM_001282938, intron 9 of 18) intron (NM_001282938, intron 9 of 18) 20089 NM_003035 6491 Hs.525198 NM_003035 ENSG00000123473 STIL MCPH7|SIL STIL centriolar assembly protein protein-coding 210.667-14 chr10 15846777 15847226 + 0.666667 NA intron (NM_024948, intron 2 of 14) AluY|SINE|Alu 13506 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 158-19 chr11 11405515 11405835 + 0.666667 NA intron (NM_001363464, intron 3 of 9) intron (NM_001363464, intron 3 of 9) -52425 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 190.333-12 chr1 203402549 203402927 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51616 NM_002023 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 138.667-158 chr5 14974213 14974568 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -102612 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 163-12 chr11 55144884 55145290 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -117068 NM_024114 79097 Hs.195715 NM_024114 ENSG00000150244 TRIM48 RNF101 tripartite motif containing 48 protein-coding 118.333-28 chr10 25126803 25126992 + 0.666667 NA intron (NR_120649, intron 6 of 7) intron (NR_120649, intron 6 of 7) 13839 NR_120649 101929025 Hs.553324 NR_120649 ENSG00000231422 LINC01516 - long intergenic non-protein coding RNA 1516 ncRNA 152.667-179 chr2 62170138 62170441 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -25826 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 134-93 chr7 5545006 5545335 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14569 NM_001101 60 Hs.520640 NM_001101 ENSG00000075624 ACTB BRWS1|PS1TP5BP1 actin beta protein-coding 148.667-90 chr12 15541940 15542342 + 0.666667 NA intron (NM_030667, intron 12 of 26) LTR84a|LTR|ERVL -4470 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 120.333-33 chr11 38618411 38618646 + 0.666667 NA intron (NR_120554, intron 4 of 4) L2|LINE|L2 27828 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 123.667-22 chr1 227294893 227295119 + 0.666667 NA intron (NM_001366019, intron 1 of 36) intron (NM_001366019, intron 1 of 36) 23486 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 142.667-92 chr2 35830815 35831165 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 359585 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 134-50 chr2 73387882 73388174 + 0.666667 NA intron (NM_015120, intron 1 of 22) L2b|LINE|L2 2270 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 154.667-343 chr6 104193133 104193475 + 0.666667 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 666242 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 137.667-186 chr8 104489540 104489828 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001135703, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001135703, exon 6 of 6) -5219 NR_030330 693127 NR_030330 ENSG00000208032 MIR548A3 MIRN548A3 microRNA 548a-3 ncRNA 126-101 chr6 75254388 75254699 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_018247, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_018247, exon 7 of 7) -4245 NM_001865 1347 Hs.70312 NM_001865 ENSG00000112695 COX7A2 COX7AL|COX7AL1|COXVIIAL|COXVIIa-L|VIIAL cytochrome c oxidase subunit 7A2 protein-coding 179.333-97 chr2 78307863 78308253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17327 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 184-30 chr15 56077475 56077807 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84029 NM_006154 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 111.667-131 chr2 65518150 65518453 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85702 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 136.333-37 chr11 119679273 119679562 + 0.666667 NA intron (NM_203285, intron 1 of 7) intron (NM_203285, intron 1 of 7) 49783 NM_203286 5818 Hs.334846 NM_002855 ENSG00000110400 NECTIN1 CD111|CLPED1|ED4|HIgR|HV1S|HVEC|OFC7|PRR|PRR1|PVRL1|PVRR|PVRR1|SK-12|nectin-1 nectin cell adhesion molecule 1 protein-coding 139.667-179 chr8 25597643 25598027 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 138602 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 115.667-71 chr14 45336818 45337012 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -83713 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 213.333-134 chr3 106118898 106119400 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -249748 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 160.667-50 chr10 124959446 124959827 + 0.666667 NA intron (NM_017580, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 17513 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 126-106 chr7 42844990 42845203 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66747 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 148.667-381 chr8 111462118 111462507 + 0.666667 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) intron (NR_146282, intron 2 of 3) 85673 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 182-41 chr18 6845104 6845564 + 0.666667 NA intron (NM_001010000, intron 2 of 16) AluJr4|SINE|Alu 10849 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 120.667-93 chr2 47706513 47706842 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -76405 NM_000179 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 193.333-36 chr11 88217672 88218249 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 41458 NR_036124 100423040 NR_036124 ENSG00000266581 MIR3166 - microRNA 3166 ncRNA 278-70 chr8 120742023 120742541 + 0.666667 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) intron (NM_021021, intron 1 of 6) -18971 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 185.667-50 chr18 877748 878087 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26954 NM_001099733 116 Hs.531719 NM_001117 ENSG00000141433 ADCYAP1 PACAP adenylate cyclase activating polypeptide 1 protein-coding 149.667-313 chr5 52907471 52907850 + 0.666667 NA intron (NM_181501, intron 12 of 28) intron (NM_181501, intron 12 of 28) -81692 NR_073103 3673 Hs.482077 NM_002203 ENSG00000164171 ITGA2 BR|CD49B|GPIa|HPA-5|VLA-2|VLAA2 integrin subunit alpha 2 protein-coding 125.333-7 chr1 84550262 84550547 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004388, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_004388, exon 7 of 7) 24036 NM_004388 1486 Hs.513557 NM_004388 ENSG00000117151 CTBS CTB chitobiase protein-coding 172-84 chr4 82700664 82701034 + 0.666667 NA intron (NM_001037582, intron 2 of 4) L1MCa|LINE|L1 52581 NR_030301 693160 NR_030301 ENSG00000207746 MIR575 MIRN575|hsa-mir-575 microRNA 575 ncRNA 134.333-98 chr2 232755691 232755988 + 0.666667 NA intron (NM_015575, intron 7 of 30) intron (NM_015575, intron 7 of 30) 20726 NM_002242 3769 Hs.467338 NM_002242 ENSG00000115474 KCNJ13 KIR1.4|KIR7.1|LCA16|SVD potassium voltage-gated channel subfamily J member 13 protein-coding 154-126 chr6 116578249 116578547 + 0.666667 NA intron (NM_001007464, intron 2 of 7) intron (NM_001007464, intron 2 of 7) 6894 NM_016104 51389 Hs.532164 NM_015952 ENSG00000111832 RWDD1 CGI-24|PTD013 RWD domain containing 1 protein-coding 162.333-140 chr21 14959860 14960194 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41359 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 132.667-126 chr4 45620262 45620589 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 503629 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 187.333-103 chr2 98009706 98010182 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -13996 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 213.333-29 chr10 110787203 110787689 + 0.666667 NA intron (NM_001134363, intron 5 of 13) intron (NM_001134363, intron 5 of 13) 83458 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 235.667-66 chr9 27889165 27889666 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -315549 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 112.333-270 chr8 138388487 138388761 + 0.666667 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) L1MC1|LINE|L1 108637 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 169.667-139 chr3 133669928 133670247 + 0.666667 NA intron (NM_001354703, intron 1 of 22) intron (NM_001354703, intron 1 of 22) 8089 NM_001354703 7018 Hs.518267 NM_001063 ENSG00000091513 TF HEL-S-71p|PRO1557|PRO2086|TFQTL1 transferrin protein-coding 114.333-10 chr1 151506779 151507072 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4462 NM_020770 57530 Hs.591464 NM_020770 ENSG00000143375 CGN - cingulin protein-coding 182-13 chr1 246283240 246283734 + 0.666667 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 133925 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 113-210 chr8 120245668 120245860 + 0.666667 NA intron (NM_021110, intron 20 of 47) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 120662 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 188.333-20 chr10 106205528 106205941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65569 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 147.333-245 chr4 90765443 90765774 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 7 of 10) L2a|LINE|L2 530577 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 170.333-199 chr7 41079521 41079776 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -21956 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 226.667-4 chr1 93029106 93029694 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49835 NM_001164391 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 118.667-187 chr8 42340159 42340447 + 0.666667 NA intron (NM_002690, intron 2 of 13) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 1809 NM_002690 5423 Hs.654484 NM_002690 ENSG00000070501 POLB - DNA polymerase beta protein-coding 153.667-134 chr15 58414429 58414733 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17410 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 192.667-119 chr4 32659522 32659948 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 308697 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 161.333-262 chr7 52165147 52165493 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -772064 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 131-98 chr8 60114305 60114616 + 0.666667 NA Intergenic (ATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 166940 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 228.667-77 chr7 96824455 96824972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114822 NM_006304 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 160.667-28 chr10 19912105 19912546 + 0.666667 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 95893 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 124-58 chr2 17217325 17217689 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 300933 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 123.333-132 chr21 15477127 15477344 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -252699 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 128.333-210 chrX 88445294 88445597 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -301780 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 112.667-48 chr12 30460461 30460699 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 216664 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 179.667-25 chr10 115912755 115913149 + 0.666667 NA intron (NM_207303, intron 28 of 28) MIRc|SINE|MIR 281837 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 131.333-93 chr2 121281219 121281459 + 0.666667 NA intron (NM_014553, intron 1 of 14) intron (NM_014553, intron 1 of 14) 3863 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 224.667-30 chr16 26953336 26953816 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -113351 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 132-43 chr14 54060926 54061226 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -104185 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 115.333-191 chr6 118908795 118909032 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014034, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_014034, exon 4 of 4) 14761 NM_014034 25842 Hs.292316 NM_014034 ENSG00000111875 ASF1A CGI-98|CIA|HSPC146 anti-silencing function 1A histone chaperone protein-coding 134-75 chr4 33291410 33291764 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 748306 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 154.333-226 chr3 123777018 123777341 + 0.666667 NA intron (NM_053025, intron 4 of 33) intron (NM_053025, intron 4 of 33) 87535 NR_046629 100873940 Hs.667316 NR_046629 ENSG00000250174 MYLK-AS2 - MYLK antisense RNA 2 ncRNA 162.667-236 chr6 38026452 38026923 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) AluSx3|SINE|Alu 206960 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 292.333-32 chr4 73191857 73192543 + 0.666667 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) L2a|LINE|L2 30857 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 184.333-141 chr7 86794002 86794406 + 0.666667 NA intron (NM_001363522, intron 3 of 4) intron (NM_001363522, intron 3 of 4) 150290 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 145.667-35 chr10 65968051 65968398 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 16 of 17) AluJb|SINE|Alu 396799 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 156.667-121 chr15 79835664 79836021 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61155 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 156.333-205 chr20 35797622 35798003 + 0.666667 NA intron (NM_016436, intron 1 of 17) AluSc|SINE|Alu 25797 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 126-54 chr2 75429543 75429773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -94410 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 159-18 chr11 6857597 6857966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11974 NM_001004460 341276 Hs.371762 NM_001004460 ENSG00000170790 OR10A2 OR10A2P|OR11-82|OR11-86|OST363 olfactory receptor family 10 subfamily A member 2 protein-coding 145-54 chr2 145660119 145660419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -926788 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 184.333 chr1 27329275 27329587 + 0.666667 NA intron (NM_032125, intron 1 of 5) L1ME3|LINE|L1 5557 NR_033926 644961 Hs.660887 NR_033926 ACTG1P20 - actin gamma 1 pseudogene 20 pseudo 112.333-54 chr12 57680268 57680504 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -13569 NM_001261422 10956 Hs.527861 NM_006812 ENSG00000135506 OS9 ERLEC2|OS-9 OS9 endoplasmic reticulum lectin protein-coding 149.333-54 chr10 68965077 68965375 + 0.666667 NA intron (NM_001256910, intron 4 of 14) intron (NM_001256910, intron 4 of 14) 8786 NM_001256910 9188 Hs.223141 NM_004728 ENSG00000165732 DDX21 GUA|GURDB|RH-II/GU|RH-II/GuA DExD-box helicase 21 protein-coding 129-80 chr3 16631275 16631497 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -25963 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 129.333-92 chr2 50266876 50267106 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 80763 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 144.333-68 chr14 40265431 40265695 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -689148 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 153.667-97 chr12 89716333 89716630 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -7115 NM_001366531 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 115-67 chr15 94110087 94110404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2307 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 127.333-171 chr7 43520309 43520569 + 0.666667 NA intron (NR_038276, intron 1 of 2) intron (NR_038276, intron 1 of 2) 2103 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 166-33 chr12 43059061 43059435 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -96067 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 116.667-182 chr7 1513137 1513417 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -8888 NM_001080453 26173 Hs.532188 NM_001080453 ENSG00000164880 INTS1 INT1|NET28 integrator complex subunit 1 protein-coding 202.333-107 chr3 19642548 19642931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 291478 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 122.333-146 chr3 166240675 166240980 + 0.666667 NA Intergenic (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -403404 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 183.667-93 chr3 157331739 157332167 + 0.666667 NA intron (NM_024621, intron 9 of 13) MIR|SINE|MIR -104897 NM_002852 5806 Hs.591286 NM_002852 ENSG00000163661 PTX3 TNFAIP5|TSG-14 pentraxin 3 protein-coding 161.667-266 chr9 325131 325447 + 0.666667 NA intron (NM_001193536, intron 6 of 46) intron (NM_001193536, intron 6 of 46) 52241 NM_001193536 81704 Hs.132599 NM_203447 ENSG00000107099 DOCK8 HEL-205|MRD2|ZIR8 dedicator of cytokinesis 8 protein-coding 135.667-193 chr8 140667009 140667275 + 0.666667 NA intron (NR_148037, intron 33 of 34) L1MB3|LINE|L1 -31509 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 178.333-72 chr2 32479661 32480081 + 0.666667 NA intron (NM_016252, intron 37 of 73) intron (NM_016252, intron 37 of 73) -52282 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 177-44 chr22 20792624 20793026 + 0.666667 NA intron (NM_058004, intron 19 of 54) intron (NM_058004, intron 19 of 54) 18712 NM_000185 3053 Hs.474270 NM_000185 ENSG00000099937 SERPIND1 D22S673|HC2|HCF2|HCII|HLS2|LS2|THPH10 serpin family D member 1 protein-coding 223.667-70 chr5 55635895 55636352 + 0.666667 NA intron (NM_001349385, intron 11 of 14) intron (NM_001349385, intron 11 of 14) 56930 NM_001258286 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 164.333-179 chr4 99141982 99142441 + 0.666667 NA intron (NM_001306171, intron 3 of 9) intron (NM_001306171, intron 3 of 9) 2087 NM_000670 127 Hs.1219 NM_000670 ENSG00000198099 ADH4 ADH-2|HEL-S-4 alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide protein-coding 111.667-270 chr9 27924243 27924541 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -350526 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 148.333-40 chr10 12340743 12341157 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8597 NM_020397 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 156.333-389 chrX 82434539 82434842 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -1073600 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 137.333 chr1 26271566 26271841 + 0.666667 NA intron (NM_022778, intron 10 of 13) intron (NM_022778, intron 10 of 13) 2424 NM_001281518 64793 Hs.63795 NM_022778 ENSG00000130695 CEP85 CCDC21 centrosomal protein 85 protein-coding 208.667-137 chr8 42788006 42788587 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -19510 NM_004198 8973 Hs.103128 NM_004198 ENSG00000147434 CHRNA6 CHNRA6 cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit protein-coding 147.333-7 chr1 43463140 43463518 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9340 NM_001190880 81888 Hs.709864 NM_031207 ENSG00000178922 HYI HT036 hydroxypyruvate isomerase (putative) protein-coding 112.333-74 chr14 52120000 52120183 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -51032 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 138.667-91 chr19 43654182 43654502 + 0.666667 NA intron (NM_001005377, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 -14492 NM_145296 199731 Hs.370984 NM_145296 ENSG00000105767 CADM4 IGSF4C|NECL4|Necl-4|TSLL2|synCAM4 cell adhesion molecule 4 protein-coding 129.667-76 chr17 51837995 51838237 + 0.666667 NA intron (NM_001082533, intron 4 of 9) intron (NM_001082533, intron 4 of 9) 320598 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 161.667 chr1 40896456 40896754 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34242 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 160.333-166 chr20 37816245 37816568 + 0.666667 NA intron (NM_001281495, intron 12 of 16) MIRc|SINE|MIR -86721 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 169.333-122 chr2 103290104 103290572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -305909 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 212.667-99 chr4 83071094 83071602 + 0.666667 NA intron (NM_016129, intron 9 of 9) intron (NM_016129, intron 9 of 9) 36165 NM_016129 51138 Hs.190384 NM_016129 ENSG00000138663 COPS4 CSN4|SGN4 COP9 signalosome subunit 4 protein-coding 149.333-398 chr8 91858367 91858795 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 159099 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 136.333-26 chr10 106792866 106793187 + 0.666667 NA intron (NM_001206569, intron 3 of 25) intron (NM_001206569, intron 3 of 25) 371680 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 143.333-14 chr1 158294757 158295059 + 0.666667 NA TTS (NM_001765) TTS (NM_001765) 4985 NM_001765 911 Hs.132448 NM_001765 ENSG00000158481 CD1C BDCA1|CD1|CD1A|R7 CD1c molecule protein-coding 117.667-102 chr2 157931236 157931453 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -55014 NM_001111067 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 123.333-198 chr7 50648524 50648729 + 0.666667 NA intron (NM_001350816, intron 6 of 17) intron (NM_001350816, intron 6 of 17) 56675 NM_001001550 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 117.333-191 chr7 51436751 51437012 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -43625 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 216.333-74 chr2 46914885 46915466 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001288953) promoter-TSS (NM_001288953) 631 NM_001171509 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 150.333-335 chr5 98112149 98112458 + 0.666667 NA intron (NR_146477, intron 3 of 4) intron (NR_146477, intron 3 of 4) 48936 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 174-91 chr7 130960568 130960958 + 0.666667 NA intron (NR_109852, intron 4 of 5) intron (NR_109852, intron 4 of 5) 47299 NR_109780 100506860 Hs.635013 NR_109780 LINC00513 - long intergenic non-protein coding RNA 513 ncRNA 115-64 chr14 90466527 90466795 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 11431 NR_033986 400238 Hs.131037 NR_033986 ENSG00000233208 LINC00642 - long intergenic non-protein coding RNA 642 ncRNA 114-63 chr18 50079873 50080166 + 0.666667 NA intron (NM_001080467, intron 1 of 39) L1MB4|LINE|L1 46544 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 122.333-62 chr15 39911078 39911413 + 0.666667 NA intron (NM_001271854, intron 1 of 3) intron (NM_001271854, intron 1 of 3) 9647 NM_001271854 11245 Hs.37196 NM_007223 ENSG00000166073 GPR176 HB-954 G protein-coupled receptor 176 protein-coding 129.333-110 chr21 25941618 25941883 + 0.666667 NA intron (NM_001136131, intron 11 of 15) AluSg|SINE|Alu 198640 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 169-18 chr12 42490063 42490479 + 0.666667 NA intron (NM_153026, intron 1 of 7) intron (NM_153026, intron 1 of 7) -6261 NM_001144882 144165 Hs.524348 NM_153026 ENSG00000139174 PRICKLE1 EPM1B|RILP prickle planar cell polarity protein 1 protein-coding 151.333-354 chr5 150336470 150336756 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21026 NM_001135243 6949 Hs.519672 NM_000356 ENSG00000070814 TCOF1 MFD1|TCS|TCS1|treacle treacle ribosome biogenesis factor 1 protein-coding 172.333-167 chr7 91973870 91974155 + 0.666667 NA intron (NM_147185, intron 2 of 49) intron (NM_147185, intron 2 of 49) 33137 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 146.667-242 chr4 141144647 141144984 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11346 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 117-155 chrX 38005599 38005922 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_138780) promoter-TSS (NM_138780) -793 NM_001163335 94122 Hs.662334 NM_138780 ENSG00000147041 SYTL5 slp5 synaptotagmin like 5 protein-coding 150.333-309 chr4 103791142 103791426 + 0.666667 NA Intergenic HUERS-P3b-int|LTR|ERV1 -71299 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 160-4 chr1 79660277 79660595 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -653706 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 141.667-42 chr11 28132749 28133037 + 0.666667 NA intron (NM_001113528, intron 3 of 6) intron (NM_001113528, intron 3 of 6) 24505 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 125.667-60 chr14 56029882 56030128 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -88406 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 162.667-301 chrX 85256235 85256579 + 0.666667 NA intron (NM_001330574, intron 5 of 10) intron (NM_001330574, intron 5 of 10) 12416 NM_001330574 7552 Hs.326801 NM_021998 ENSG00000147180 ZNF711 CMPX1|MRX97|ZNF4|ZNF5|ZNF6|Zfp711|dJ75N13.1 zinc finger protein 711 protein-coding 137.667-42 chr12 26918364 26918627 + 0.666667 NA intron (NM_018164, intron 8 of 16) intron (NM_018164, intron 8 of 16) 19486 NM_018164 55726 Hs.505077 NM_018164 ENSG00000064102 INTS13 ASUN|C12orf11|GCT1|Mat89Bb|NET48|SPATA30 integrator complex subunit 13 protein-coding 146.667-202 chr21 15738052 15738471 + 0.666667 NA intron (NM_001352560, intron 1 of 23) L1M5|LINE|L1 8279 NM_013396 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 126.333-158 chr6 146993115 146993377 + 0.666667 NA intron (NR_034115, intron 6 of 10) L1ME3E|LINE|L1 -165679 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 119-92 chr21 15155111 15155438 + 0.666667 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -90274 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 140.667-216 chr7 56196982 56197326 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80737 NM_001145712 389493 Hs.177948 NM_001145712 ENSG00000185290 NUPR2 NUPR1L nuclear protein 2, transcriptional regulator protein-coding 144.667-304 chr8 125040996 125041288 + 0.666667 NA intron (NM_014846, intron 23 of 28) intron (NM_014846, intron 23 of 28) 42637 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 130.333-110 chr2 181054957 181055238 + 0.666667 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) L2-3_Crp|LINE|L2 -68740 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 201.667 chr1 63021346 63021693 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9048 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 165.667-141 chr4 56404556 56404909 + 0.666667 NA intron (NR_156493, intron 3 of 10) intron (NR_156493, intron 3 of 10) -17224 NM_001286672 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 113.667-121 chr20 861256 861576 + 0.666667 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 16773 NM_031424 83541 Hs.574822 NM_031424 ENSG00000125898 FAM110A C20orf55|F10|bA371L19.3 family with sequence similarity 110 member A protein-coding 188.333-75 chr2 76532070 76532466 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -453697 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 150.333-353 chr6 25895182 25895476 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21086 NM_001098486 10786 Hs.327179 NM_006632 ENSG00000124564 SLC17A3 GOUT4|NPT4|UAQTL4 solute carrier family 17 member 3 protein-coding 118-11 chr10 69489652 69489941 + 0.666667 NA intron (NM_012339, intron 3 of 7) intron (NM_012339, intron 3 of 7) 38329 NR_147091 23555 Hs.499941 NM_012339 ENSG00000099282 TSPAN15 2700063A19Rik|NET-7|NET7|TM4SF15 tetraspanin 15 protein-coding 246.333-6 chr1 168234923 168235595 + 0.666667 NA intron (NM_199344, intron 4 of 7) intron (NM_199344, intron 4 of 7) 9255 NM_199344 375035 Hs.645435 NM_199344 ENSG00000213064 SFT2D2 UNQ512|dJ747L4.C1.2 SFT2 domain containing 2 protein-coding 168-46 chr18 78223358 78223728 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -229816 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 132.333-27 chr10 121100075 121100302 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 248826 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 175-32 chr17 34136139 34136500 + 0.666667 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) MER4D|LTR|ERV1 20487 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 203-84 chr5 115611385 115611806 + 0.666667 NA intron (NR_109875, intron 2 of 2) intron (NR_109875, intron 2 of 2) -9116 NM_021649 353376 Hs.718838 NM_021649 ENSG00000243414 TICAM2 MyD88-4|TICAM-2|TIRAP3|TIRP|TRAM toll like receptor adaptor molecule 2 protein-coding 204.333-145 chr4 129890928 129891386 + 0.666667 NA intron (NR_151713, intron 11 of 16) intron (NR_151713, intron 11 of 16) 119538 NR_151713 107986313 Hs.112740 NR_151713 ENSG00000249618 LINC02465 - long intergenic non-protein coding RNA 2465 ncRNA 127-30 chr14 48141397 48141658 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -346513 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 142.667-206 chr7 56606686 56606973 + 0.666667 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -68699 NR_108099 101928401 Hs.385614 NR_108099 ENSG00000233288 LOC101928401 - uncharacterized LOC101928401 ncRNA 154.667-81 chr12 76042246 76042566 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004537, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_004537, exon 15 of 15) -10630 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 133.667-45 chr12 114561366 114561618 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 122683 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 259-15 chr14 81041675 81042152 + 0.666667 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 86292 NM_000369 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 254.667-37 chr2 90067117 90067713 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -429508 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 223-42 chr3 34612901 34613566 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 780790 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 113.667-24 chr10 88096603 88096825 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 233089 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 135.667-41 chr12 107147425 107147677 + 0.666667 NA Intergenic LTR101_Mam|LTR|ERVL -54002 NM_004075 1407 Hs.151573 NM_004075 ENSG00000008405 CRY1 DSPD|PHLL1 cryptochrome circadian regulator 1 protein-coding 158.333-34 chr10 52195196 52195509 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) intron (NM_001098512, intron 9 of 17) 118776 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 196.666-100 chr7 85131132 85131692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9481 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 157-5 chr1 67480390 67480820 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -50203 NM_015640 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 195 chr1 43848732 43849211 + 0.666667 NA intron (NM_001270466, intron 4 of 4) L1MEc|LINE|L1 10349 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 149.333-279 chr4 58510737 58511029 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25445 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 170-24 chr12 14579286 14579775 + 0.666667 NA intron (NR_120465, intron 2 of 5) intron (NR_120465, intron 2 of 5) -11647 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 118.333-16 chr1 116348514 116348838 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24568 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 134.667-40 chr11 109677701 109678084 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 255702 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 146.667-66 chr11 122683916 122684207 + 0.666667 NA intron (NM_001363365, intron 1 of 13) intron (NM_001363365, intron 1 of 13) 28339 NM_001363365 84959 Hs.444075 NM_032873 ENSG00000154127 UBASH3B STS-1|STS1|TULA-2|TULA2|p70 ubiquitin associated and SH3 domain containing B protein-coding 153.667-409 chr9 100751529 100751810 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 173590 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 172-14 chr1 186219798 186220221 + 0.666667 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 -76264 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 177.667-108 chr5 31437582 31438021 + 0.666667 NA intron (NM_013235, intron 22 of 34) L2c|LINE|L2 94292 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 156-37 chr12 42322450 42322865 + 0.666667 NA intron (NM_033114, intron 2 of 7) intron (NM_033114, intron 2 of 7) 1202 NR_107005 102467003 NR_107005 ENSG00000278520 MIR7851 hsa-mir-7851 microRNA 7851 ncRNA 219.666-41 chr7 61106819 61107431 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 2196931 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 158.667-76 chr12 55943558 55944004 + 0.666667 NA intron (NR_147027, intron 19 of 25) intron (NR_147027, intron 19 of 25) 7773 NM_001351037 1606 Hs.524488 NM_001345 ENSG00000065357 DGKA DAGK|DAGK1|DGK-alpha diacylglycerol kinase alpha protein-coding 112.667-125 chr2 70601861 70602140 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -48174 NM_001099691 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 259.333-40 chr2 360246 360694 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 44186 NR_146953 105373350 NR_146953 LINC01865 - long intergenic non-protein coding RNA 1865 ncRNA 185-14 chr12 4711474 4711794 + 0.666667 NA intron (NR_110112, intron 1 of 3) intron (NR_110112, intron 1 of 3) 8468 NR_110112 101929549 Hs.663336 NR_110112 ENSG00000255474 GAU1 GALNT8-DT GALNT8 antisense upstream 1 ncRNA 134.333-121 chr3 172440736 172441039 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 7569 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 173.667-139 chr5 17296957 17297317 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger 79506 NM_006317 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 163.667-98 chr19 41092507 41092841 + 0.666667 NA intron (NM_000766, intron 5 of 8) MIRb|SINE|MIR 4223 NM_000766 1553 Hs.567252 NM_000766 ENSG00000197838 CYP2A13 CPAD|CYP2A|CYPIIA13 cytochrome P450 family 2 subfamily A member 13 protein-coding 189-43 chr2 138823576 138824084 + 0.666667 NA Intergenic L1M3b|LINE|L1 -43440 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 138.667-136 chr3 128347231 128347496 + 0.666667 NA intron (NM_021937, intron 5 of 6) L1MEj|LINE|L1 -116231 NR_037890 285224 Hs.683815 NR_037890 ENSG00000242049 DNAJB8-AS1 - DNAJB8 antisense RNA 1 ncRNA 135-110 chr8 91143782 91144039 + 0.666667 NA intron (NR_148895, intron 7 of 10) MIRc|SINE|MIR 41291 NM_001354470 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 136.333-216 chr8 140316368 140316743 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 9 of 22) L1MA6|LINE|L1 141189 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 140-11 chr1 156978536 156978888 + 0.666667 NA intron (NM_014784, intron 5 of 39) intron (NM_014784, intron 5 of 39) -42468 NR_030527 768220 NR_030527 ENSG00000211581 MIR765 MIRN765|hsa-mir-765|mir-765 microRNA 765 ncRNA 166-19 chr10 18654456 18654854 + 0.666667 NA intron (NM_001351116, intron 2 of 11) AluSx4|SINE|Alu -3068 NM_182543 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 165-96 chr8 100646243 100646722 + 0.666667 NA intron (NM_152628, intron 2 of 13) LTR49|LTR|ERV1 3183 NM_152628 169166 Hs.567758 NM_152628 ENSG00000174226 SNX31 - sorting nexin 31 protein-coding 125.333-11 chr1 111713828 111714044 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001010935, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001010935, exon 9 of 9) 25459 NM_019099 55924 Hs.193406 NM_019099 ENSG00000197852 INKA2 C1orf183|FAM212B inka box actin regulator 2 protein-coding 170.333-120 chr2 190632674 190633069 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -16024 NM_001321313 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 212.333-62 chr2 18084128 18084476 + 0.666667 NA Intergenic HERVP71A-int|LTR|ERV1 205635 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 159-58 chr2 68966614 68966936 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -7798 NM_019617 56287 Hs.69319 NM_019617 ENSG00000169605 GKN1 AMP18|BRICD1|CA11|FOV|foveolin gastrokine 1 protein-coding 187-18 chr12 59083725 59084213 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -163431 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 143.667-141 chr20 46841197 46841477 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53287 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 119-131 chr6 141999124 141999448 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 89513 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 119-94 chr22 27920870 27921173 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_036169) promoter-TSS (NR_036169) -409 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 126-89 chr5 26823901 26824270 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 214501 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 125-66 chr21 27369697 27369902 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -352580 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 140.333-80 chr17 31322576 31322909 + 0.666667 NA intron (NM_001042492, intron 36 of 57) intron (NM_001042492, intron 36 of 57) -1120 NM_014210 2123 Hs.591198 NM_014210 ENSG00000126860 EVI2A EVDA|EVI-2A|EVI2 ecotropic viral integration site 2A protein-coding 158.667-329 chr8 120240503 120240851 + 0.666667 NA intron (NM_021110, intron 19 of 47) intron (NM_021110, intron 19 of 47) 115575 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 148.333-401 chr8 127982038 127982346 + 0.666667 NA intron (NR_003367, intron 3 of 8) MIR|SINE|MIR 21559 NR_031610 100302161 NR_031610 ENSG00000221771 MIR1205 MIRN1205|hsa-mir-1205 microRNA 1205 ncRNA 224-56 chr3 7249028 7249372 + 0.666667 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 286084 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 224.333-63 chr2 88369364 88369851 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 83086 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 114-121 chr5 91597687 91598004 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -214528 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 116-81 chr2 120409513 120409822 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 56682 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 207-7 chr1 172292069 172292527 + 0.666667 NA intron (NR_146559, intron 16 of 20) MIRb|SINE|MIR -128387 NM_139240 92346 Hs.517991 NM_139240 ENSG00000180999 C1orf105 - chromosome 1 open reading frame 105 protein-coding 140-52 chr18 40425567 40425847 + 0.666667 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 359421 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 123.667-128 chr3 115839800 115840072 + 0.666667 NA intron (NM_001318915, intron 6 of 8) intron (NM_001318915, intron 6 of 8) 65190 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 150-106 chr4 117877603 117877987 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 43394 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 143-27 chr11 120985012 120985351 + 0.666667 NA intron (NM_001282470, intron 19 of 19) intron (NM_001282470, intron 19 of 19) -27142 NR_133004 101929208 Hs.662310 NR_133004 LOC101929208 - uncharacterized LOC101929208 ncRNA 112.667-28 chr10 36365784 36366069 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 587624 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 124.667-100 chr2 71708900 71709220 + 0.666667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie 242361 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 131.333-101 chr20 44355042 44355274 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001287184) promoter-TSS (NM_001287184) -541 NM_001030003 3172 Hs.116462 NM_000457 ENSG00000101076 HNF4A FRTS4|HNF4|HNF4a7|HNF4a8|HNF4a9|HNF4alpha|MODY|MODY1|NR2A1|NR2A21|TCF|TCF14 hepatocyte nuclear factor 4 alpha protein-coding 154.667-326 chr5 150344735 150345159 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12692 NM_001135243 6949 Hs.519672 NM_000356 ENSG00000070814 TCOF1 MFD1|TCS|TCS1|treacle treacle ribosome biogenesis factor 1 protein-coding 113.333-64 chr12 79701300 79701499 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10302 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 156-83 chr22 32658539 32658867 + 0.666667 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) -142113 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 148-146 chr6 125382363 125382657 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80543 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 111.667-138 chr2 138332418 138332605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -169259 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 180-113 chr8 109962150 109962534 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 13429 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 187.667-23 chr11 90988411 90988815 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -119411 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 136.333-124 chr3 31154353 31154665 + 0.666667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 7278 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 141.333-154 chr3 100210226 100210524 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24551 NR_028358 644444 Hs.652353 NR_028357 ENSG00000235156 TMEM30CP CDC50C|TMEM30C transmembrane protein 30C, pseudogene pseudo 112.333-193 chr4 122611412 122611708 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_021803, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_021803, exon 5 of 5) -7423 NR_104126 100996941 Hs.439487 NR_104126 ENSG00000227145 IL21-AS1 - IL21 antisense RNA 1 ncRNA 159-8 chr1 108087660 108088029 + 0.666667 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy 104991 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 167-94 chr7 51490311 51490661 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -97230 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 125.333-129 chr4 107982344 107982563 + 0.666667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -7261 NM_001184705 3033 Hs.438289 NM_005327 ENSG00000138796 HADH HAD|HADH1|HADHSC|HCDH|HHF4|MSCHAD|SCHAD hydroxyacyl-CoA dehydrogenase protein-coding 196.333-6 chr1 107639161 107639603 + 0.666667 NA intron (NM_006113, intron 20 of 26) L1ME1|LINE|L1 49117 NM_001079874 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 140-73 chr3 142331633 142331994 + 0.666667 NA intron (NM_019001, intron 36 of 41) AluJb|SINE|Alu -106228 NR_033289 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 141.333-139 chr22 30087701 30087974 + 0.666667 NA intron (NM_001329457, intron 2 of 11) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 7373 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 132.667-143 chr5 116190369 116190658 + 0.666667 NA non-coding (NR_146218, exon 7 of 7) non-coding (NR_146218, exon 7 of 7) -65230 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 130.667-66 chr14 55336124 55336447 + 0.666667 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) intron (NM_152231, intron 1 of 1) 64131 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 120.333-195 chr8 127280438 127280703 + 0.666667 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) intron (NR_117099, intron 1 of 3) 35933 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 221-35 chr2 101555323 101555828 + 0.666667 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -80463 NM_001145664 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 125.667-116 chr22 48550224 48550584 + 0.666667 NA intron (NM_001082967, intron 1 of 3) intron (NM_001082967, intron 1 of 3) -3017 NR_038917 284933 Hs.159057 NR_038917 ENSG00000281732 LOC284933 - uncharacterized LOC284933 ncRNA 189-75 chr5 75731403 75731779 + 0.666667 NA TTS (NR_149046) TTS (NR_149046) -14154 NM_001099271 134359 Hs.432726 NM_152408 ENSG00000152359 POC5 C5orf37 POC5 centriolar protein protein-coding 158-41 chr13 113064341 113064736 + 0.666667 NA intron (NM_001366646, intron 4 of 27) intron (NM_001366646, intron 4 of 27) 19892 NM_001366646 23263 Hs.170422 NM_024979 ENSG00000126217 MCF2L ARHGEF14|DBS|OST MCF.2 cell line derived transforming sequence like protein-coding 155.667-221 chr3 65847600 65847913 + 0.666667 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -46060 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 329.333-16 chr17 51173161 51173898 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 6807 NM_001018138 4831 Hs.463456 NM_002512 ENSG00000243678 NME2 NDKB|NDPK-B|NDPKB|NM23-H2|NM23B|PUF NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 protein-coding 118-74 chr2 225843475 225843705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -299204 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 196.667-79 chr2 188114632 188115071 + 0.666667 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) intron (NR_126396, intron 2 of 2) 172840 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 123.667-97 chr2 176435006 176435317 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 165719 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 118.667-145 chr4 15197652 15197855 + 0.666667 NA intron (NR_125911, intron 2 of 5) intron (NR_125911, intron 2 of 5) -142235 NM_001135170 114905 Hs.153714 NM_031911 ENSG00000163145 C1QTNF7 CTRP7|ZACRP7 C1q and TNF related 7 protein-coding 201-42 chr15 93111654 93112015 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -22623 NM_020211 56963 Hs.271277 NM_020211 ENSG00000182175 RGMA RGM repulsive guidance molecule BMP co-receptor a protein-coding 181-83 chrX 150914585 150914954 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -15953 NM_001184808 83692 Hs.522805 NM_031462 ENSG00000102181 CD99L2 CD99B|MIC2L1 CD99 molecule like 2 protein-coding 146.333-41 chr10 125247863 125248154 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86978 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 117-91 chr21 26541964 26542158 + 0.666667 NA intron (NR_135515, intron 2 of 3) L1MEf|LINE|L1 31225 NM_052954 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 215.667-47 chr17 74810284 74810708 + 0.666667 NA intron (NM_017728, intron 8 of 9) intron (NM_017728, intron 8 of 9) 33997 NM_001321264 54868 Hs.370262 NM_017728 ENSG00000109066 TMEM104 - transmembrane protein 104 protein-coding 133-68 chr4 64786662 64786917 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 217711 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 208.667-12 chr1 178217117 178217591 + 0.666667 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) L1MC1|LINE|L1 123250 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 212-108 chr3 115084528 115084875 + 0.666667 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) intron (NM_001348800, intron 1 of 11) -13287 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 160.333-81 chr13 21956924 21957350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78977 NR_047040 100874182 Hs.148951 NR_047040 ENSG00000226722 LINC00424 - long intergenic non-protein coding RNA 424 ncRNA 227-62 chr9 102243207 102243714 + 0.666667 NA Intergenic MER101B|LTR|ERV1 -276177 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 119.333-245 chrX 97657919 97658135 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -93492 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 161.333-91 chr14 54164817 54165241 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208138 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 145.333-181 chr3 40556464 40556857 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 31700 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 116.333-110 chr2 29994171 29994468 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -72733 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 128.667-96 chr2 160211192 160211483 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11024 NM_001282354 3694 Hs.470399 NM_000888 ENSG00000115221 ITGB6 AI1H integrin subunit beta 6 protein-coding 152-52 chr13 93473511 93473862 + 0.666667 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) MER52A|LTR|ERV1 246879 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 114-150 chr7 98507013 98507281 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -106057 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 181.667-68 chr2 69289044 69289454 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 97978 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 143-110 chr7 7634892 7635177 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -5718 NM_001302349 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 162.667-13 chr1 195440556 195440947 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 647964 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 161.333-20 chr1 238200141 238200492 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 285701 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 134.667-194 chr8 78210226 78210599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -305928 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 138.333-120 chr3 49384782 49385180 + 0.666667 NA intron (NM_001664, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu -26381 NM_001329455 2876 Hs.76686 NM_000581 ENSG00000233276 GPX1 GPXD|GSHPX1 glutathione peroxidase 1 protein-coding 133-54 chr20 20735759 20736078 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -23274 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 140.333-96 chr2 16381880 16382223 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 283783 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 141.333-70 chr15 58661329 58661600 + 0.666667 NA intron (NM_001320570, intron 5 of 14) L1MA2|LINE|L1 32143 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 138.667-174 chr5 174391294 174391601 + 0.666667 NA intron (NR_125806, intron 1 of 5) intron (NR_125806, intron 1 of 5) 55093 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 185-63 chr6 155746428 155746766 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -200200 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 146-122 chr7 11183175 11183526 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 209478 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 129.667-11 chr1 157471342 157471604 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 81042 NM_031281 83416 Hs.415950 NM_031281 ENSG00000143297 FCRL5 BXMAS1|CD307|CD307e|FCRH5|IRTA2|PRO820 Fc receptor like 5 protein-coding 124.667-211 chr8 141819952 141820269 + 0.666667 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 -33797 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 146-49 chr18 43466580 43466990 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -189295 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 125.333-164 chr6 169397791 169398146 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143854 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 112-141 chr3 140649476 140649713 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -28470 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 165.667-198 chr8 108308232 108308573 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -59685 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 156-93 chr3 163443327 163443611 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -140168 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 264-36 chr4 12041656 12042164 + 0.666667 NA Intergenic MER85|DNA|PiggyBac -181541 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 137.667-182 chr7 120879824 120880115 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -21825 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 138-108 chr7 31686556 31686939 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_006658) promoter-TSS (NM_006658) -270 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 163.333-175 chr22 26882116 26882460 + 0.666667 NA TTS (NR_146604) TTS (NR_146604) -21004 NR_110540 101929539 Hs.517505 NR_110540 ENSG00000235271 LINC01422 - long intergenic non-protein coding RNA 1422 ncRNA 144.667-76 chr14 28721068 28721469 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 44051 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-19 chr1 164696479 164696777 + 0.666667 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 78013 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 154-36 chr12 28872748 28873147 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -276331 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 112.667-14 chr1 161339174 161339470 + 0.666667 NA intron (NM_003001, intron 3 of 5) AluJr|SINE|Alu 24941 NR_103459 6391 Hs.444472 NM_003001 ENSG00000143252 SDHC CYB560|CYBL|PGL3|QPS1|SDH3 succinate dehydrogenase complex subunit C protein-coding 114.667-16 chr1 209606096 209606287 + 0.666667 NA intron (NM_020439, intron 5 of 12) intron (NM_020439, intron 5 of 12) 17319 NR_036213 100422894 NR_036213 ENSG00000283876 MIR4260 - microRNA 4260 ncRNA 169-93 chr6 124706578 124706887 + 0.666667 NA intron (NM_001040214, intron 4 of 6) intron (NM_001040214, intron 4 of 6) -255813 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 116-82 chr2 126332123 126332463 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -214308 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 225.333-7 chr1 213558945 213559582 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -365486 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 113-217 chrX 46047832 46048108 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -196480 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 186-77 chr4 155989209 155989555 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35516 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 229-48 chr4 148507308 148507750 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62831 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 119-64 chr17 80891303 80891603 + 0.666667 NA intron (NM_020761, intron 17 of 33) intron (NM_020761, intron 17 of 33) 79760 NR_148968 400627 Hs.591201 NR_148968 ENSG00000261924 LOC400627 - uncharacterized LOC400627 ncRNA 206.333-98 chr20 1484909 1485492 + 0.666667 NA intron (NM_001122962, intron 1 of 4) L1MA4A|LINE|L1 6220 NM_001122962 284759 Hs.721685 NM_001122962 ENSG00000196209 SIRPB2 PTPN1L|PTPNS1L3|dJ776F14.2 signal regulatory protein beta 2 protein-coding 152.333-144 chr17 42593464 42593774 + 0.666667 NA intron (NM_178126, intron 1 of 8) AluYh3|SINE|Alu 15755 NM_178126 162427 Hs.632262 NM_178126 ENSG00000141699 RETREG3 FAM134C reticulophagy regulator family member 3 protein-coding 111.667-235 chr7 30429872 30430115 + 0.666667 NA intron (NM_006092, intron 12 of 13) AluSc8|SINE|Alu 39108 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 119.333-134 chr2 175381297 175381524 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -199700 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 177.667-118 chr6 86759082 86759463 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -178256 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 140.667-34 chr10 53769855 53770113 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -716246 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 197-61 chr2 191062515 191062853 + 0.666667 NA intron (NM_003151, intron 9 of 23) intron (NM_003151, intron 9 of 23) 41158 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 136.333-120 chr3 11303415 11303780 + 0.666667 NA intron (NM_001136031, intron 3 of 17) AluYj4|SINE|Alu 31200 NM_001349237 10533 Hs.38032 NM_006395 ENSG00000197548 ATG7 APG7-LIKE|APG7L|GSA7 autophagy related 7 protein-coding 144-86 chr20 41657200 41657571 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -39008 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 123-83 chr3 170570469 170570748 + 0.666667 NA intron (NM_020949, intron 1 of 7) intron (NM_020949, intron 1 of 7) 15467 NM_020949 57709 Hs.596660 NM_020949 ENSG00000013293 SLC7A14 PPP1R142 solute carrier family 7 member 14 protein-coding 151.333-210 chr2 68605828 68606114 + 0.666667 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -37617 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 155-18 chr10 114775329 114775696 + 0.666667 NA intron (NR_120628, intron 1 of 2) intron (NR_120628, intron 1 of 2) -7208 NM_001322884 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 123.667-27 chr1 246190075 246190393 + 0.666667 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) MIRb|SINE|MIR 227178 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 193.667-42 chr14 68016216 68016540 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 192786 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 151.667-160 chr2 18627604 18627909 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -38176 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 270-35 chr21 28072920 28073690 + 0.666667 NA intron (NR_126010, intron 1 of 4) intron (NR_126010, intron 1 of 4) -17098 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 119-80 chr2 134354767 134355064 + 0.666667 NA intron (NM_001371457, intron 10 of 16) intron (NM_001371457, intron 10 of 16) 100843 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 129.667-3 chr1 64994939 64995273 + 0.666667 NA intron (NR_119383, intron 1 of 6) intron (NR_119383, intron 1 of 6) 7370 NR_119383 101927084 Hs.734218 NR_119383 ENSG00000226891 LINC01359 - long intergenic non-protein coding RNA 1359 ncRNA 130-44 chr16 80342599 80342918 + 0.666667 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -197976 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 206-30 chr11 22917507 22917981 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57270 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 153.667-309 chr5 30927263 30927628 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -266241 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 139.667-83 chr2 54532775 54533044 + 0.666667 NA intron (NM_003128, intron 2 of 35) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 3687 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 262.666-27 chr8 103164428 103165209 + 0.666667 NA intron (NR_109954, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 7322 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 141.333-260 chr9 102507234 102507498 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12271 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 186-99 chr8 127199731 127200121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2299 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 168-98 chr7 3262777 3263194 + 0.666667 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -38267 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 172-46 chr15 65482050 65482420 + 0.666667 NA intron (NR_135485, intron 8 of 20) AluJb|SINE|Alu 35039 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 197.333-119 chr2 150001241 150001767 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142313 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 113-182 chr6 72609357 72609628 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12351 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 140.333-150 chr3 131847283 131847561 + 0.666667 NA intron (NM_130808, intron 2 of 15) intron (NM_130808, intron 2 of 15) 138509 NR_049890 100847040 NR_049890 ENSG00000265859 MIR5704 - microRNA 5704 ncRNA 159.667-7 chr1 49540212 49540581 + 0.666667 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) L2b|LINE|L2 -68311 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 176.333-34 chr12 22561360 22561808 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -17038 NM_001286177 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 136-75 chr4 59491170 59491524 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 477774 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 121-134 chr7 79048778 79049092 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 39947 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 113.333-247 chr7 93101240 93101523 + 0.666667 NA exon (NM_001193307, exon 2 of 2) exon (NM_001193307, exon 2 of 2) 16598 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 116.333-193 chr7 7736591 7736938 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -18157 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 116.333-171 chr5 53385812 53386025 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -94711 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 146-6 chr1 85549467 85549757 + 0.666667 NA intron (NM_001134445, intron 1 of 6) intron (NM_001134445, intron 1 of 6) 28588 NM_001134445 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 113.667-214 chr8 128172935 128173265 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22984 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 184-40 chr17 6052740 6053189 + 0.666667 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -17650 NM_015253 23302 Hs.370166 NM_015253 ENSG00000179314 WSCD1 - WSC domain containing 1 protein-coding 216-10 chr1 247194410 247195048 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 7331 NR_037480 100500849 NR_037480 ENSG00000283881 MIR3916 mir-3916 microRNA 3916 ncRNA 175-43 chr2 51074114 51074514 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 41713 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 244.333-14 chr10 89099401 89100065 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36322 NR_039827 100616192 NR_039827 ENSG00000265375 MIR4679-2 - microRNA 4679-2 ncRNA 227.667-33 chr2 32266252 32266633 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001302504) promoter-TSS (NM_001302504) -699 NM_021209 58484 Hs.574741 NM_021209 ENSG00000091106 NLRC4 AIFEC|CARD12|CLAN|CLAN1|CLANA|CLANB|CLANC|CLAND|CLR2.1|FCAS4|IPAF NLR family CARD domain containing 4 protein-coding 166-131 chrX 115183724 115184163 + 0.666667 NA intron (NM_001243963, intron 3 of 19) intron (NM_001243963, intron 3 of 19) -5457 NM_001145346 139804 Hs.376008 NM_152425 ENSG00000175718 RBMXL3 CXorf55 RBMX like 3 protein-coding 161-30 chr15 80425886 80426363 + 0.666667 NA intron (NM_014862, intron 1 of 18) intron (NM_014862, intron 1 of 18) 21742 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 243 chr1 2023161 2023721 + 0.666667 NA intron (NM_000815, intron 1 of 8) intron (NM_000815, intron 1 of 8) 4096 NM_000815 2563 Hs.113882 NM_000815 ENSG00000187730 GABRD EIG10|EJM7|GEFSP5 gamma-aminobutyric acid type A receptor delta subunit protein-coding 139.333-86 chr17 7531706 7532109 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -17151 NR_037146 8742 Hs.54673 NM_003809 ENSG00000239697 TNFSF12 APO3L|DR3LG|TNLG4A|TWEAK TNF superfamily member 12 protein-coding 162.667-114 chr18 65784551 65784992 + 0.666667 NA intron (NM_001362438, intron 2 of 11) intron (NM_001362438, intron 2 of 11) 33759 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 114.667-17 chr1 211410218 211410426 + 0.666667 NA intron (NR_026761, intron 4 of 5) L1MB7|LINE|L1 27567 NR_026761 84791 Hs.523932 NM_032705 LINC00467 C1orf97 long intergenic non-protein coding RNA 467 ncRNA 146.333-39 chr10 117209075 117209438 + 0.666667 NA intron (NM_181840, intron 2 of 2) intron (NM_181840, intron 2 of 2) 11767 NM_181840 338567 Hs.449650 NM_181840 ENSG00000186795 KCNK18 K2p18.1|MGR13|TRESK|TRESK-2|TRESK2|TRIK potassium two pore domain channel subfamily K member 18 protein-coding 136.333-35 chr11 101903000 101903342 + 0.666667 NA intron (NM_178127, intron 5 of 8) intron (NM_178127, intron 5 of 8) -11839 NM_001363543 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 118.333-121 chr20 38092574 38092775 + 0.666667 NA TTS (NM_021215) TTS (NM_021215) 58928 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 115.667-6 chr1 96629843 96630025 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -91671 NM_001300988 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 155-83 chr21 30517206 30517539 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15231 NM_181611 337972 Hs.553694 NM_181611 ENSG00000186977 KRTAP19-5 KAP19.5 keratin associated protein 19-5 protein-coding 181-56 chr4 76824553 76825026 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 73355 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 202.667-139 chr7 89182309 89182796 + 0.666667 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -386815 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 114-78 chr20 22072258 22072446 + 0.666667 NA intron (NR_038394, intron 2 of 3) intron (NR_038394, intron 2 of 3) 18262 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 144.667-224 chr4 125251590 125252008 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64613 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 208.333-32 chr13 76961220 76961646 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 12922 NM_001258406 730249 Hs.160789 NM_001258406 ENSG00000102794 ACOD1 CAD|IRG1 aconitate decarboxylase 1 protein-coding 151.333-429 chr8 122043433 122043713 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -402133 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 135.333-21 chr10 57080333 57080717 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 224034 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 128.667-12 chr1 180797930 180798182 + 0.666667 NA intron (NR_137330, intron 3 of 12) intron (NR_137330, intron 3 of 12) -114841 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 170.333-41 chr10 120510765 120511168 + 0.666667 NA intron (NM_001318169, intron 2 of 2) intron (NM_001318169, intron 2 of 2) 54012 NM_001318169 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 141.667-84 chr15 60076068 60076322 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71884 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 130-35 chr14 60618053 60618360 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21010 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 166-16 chr1 219913476 219913914 + 0.666667 NA TTS (NR_046437) TTS (NR_046437) 14956 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 177.333-46 chr13 109111552 109111946 + 0.666667 NA intron (NM_015011, intron 28 of 34) AluSc8|SINE|Alu 55554 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 144.333-115 chr2 6508327 6508711 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 125268 NR_110500 102800315 Hs.729713 NR_110498 ENSG00000236172 LINC01246 - long intergenic non-protein coding RNA 1246 ncRNA 209.667-63 chr2 73771627 73772162 + 0.666667 NA intron (NM_003584, intron 4 of 8) AluY|SINE|Alu 8263 NM_003584 8446 Hs.14611 NM_003584 ENSG00000144048 DUSP11 PIR1 dual specificity phosphatase 11 protein-coding 145.667-103 chr15 97518283 97518574 + 0.666667 NA intron (NR_120324, intron 1 of 4) intron (NR_120324, intron 1 of 4) 3383 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 214.667-14 chr10 34758211 34758784 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 56799 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 143.667-151 chr22 28292038 28292325 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) intron (NM_001145418, intron 5 of 22) -167688 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 113-99 chr2 23862954 23863184 + 0.666667 NA intron (NR_125717, intron 12 of 28) intron (NR_125717, intron 12 of 28) 64054 NM_017552 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 186-101 chr8 131907634 131907941 + 0.666667 NA intron (NM_001323555, intron 1 of 22) intron (NM_001323555, intron 1 of 22) 3694 NR_136615 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 147-55 chr17 52622558 52622844 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 232179 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 186.333-31 chr11 76144652 76145097 + 0.666667 NA TTS (NM_003369) TTS (NM_003369) 61628 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 154-56 chr14 92733995 92734304 + 0.666667 NA intron (NM_005606, intron 1 of 13) MIRc|SINE|MIR 14478 NM_001363696 5641 Hs.18069 NM_005606 ENSG00000100600 LGMN AEP|LGMN1|PRSC1 legumain protein-coding 113.333-10 chr1 115892169 115892374 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27105 NR_125969 101928995 Hs.559119 NR_125969 ENSG00000228127 LINC01649 - long intergenic non-protein coding RNA 1649 ncRNA 188.333-31 chr11 82959221 82959645 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -57693 NM_001319214 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 116.667-189 chr7 61775971 61776200 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1527971 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 128-97 chr5 172617166 172617439 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23961 NM_001142651 54492 Hs.91521 NM_001142651 ENSG00000214357 NEURL1B NEURL3|RNF67B|hNeur2|neur2 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B protein-coding 173-45 chr2 37974381 37974793 + 0.666667 NA intron (NM_001170793, intron 2 of 9) intron (NM_001170793, intron 2 of 9) 24123 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 186.333-119 chr5 8012331 8012779 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 143407 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 154.333-346 chr8 108347627 108347971 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -95784 NM_001329495 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 116-55 chr15 97903024 97903299 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28732 NR_024173 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 202.333-3 chr1 32654043 32654438 + 0.666667 NA intron (NM_005610, intron 2 of 11) AluJb|SINE|Alu 2882 NM_001135256 5928 Hs.16003 NM_005610 ENSG00000162521 RBBP4 NURF55|RBAP48|lin-53 RB binding protein 4, chromatin remodeling factor protein-coding 172.667-128 chr5 165990852 165991267 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 935311 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 147.333-236 chr4 60936747 60937010 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14259 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 125.667-99 chr2 101912975 101913323 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -70316 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 149.333-376 chr7 104764782 104765206 + 0.666667 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) intron (NM_199000, intron 2 of 2) 39098 NR_034142 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 135-88 chr5 104252149 104252453 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -689512 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 116.333-218 chr9 86636802 86637039 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -282510 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 180.333-59 chr2 176375465 176375839 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 106210 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 167-7 chr1 217353042 217353377 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -215507 NM_001243510 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 136.333-197 chr7 106728187 106728483 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -67177 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 139.667-141 chr4 109963433 109963707 + 0.666667 NA intron (NM_001357021, intron 8 of 19) intron (NM_001357021, intron 8 of 19) 50687 NM_001178131 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 144-14 chr10 37522120 37522353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 80695 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 199.667-53 chr15 66697081 66697426 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4983 NM_005585 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 173-90 chr7 97317605 97317994 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 201206 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 247.333-90 chr8 133557993 133558432 + 0.666667 NA intron (NM_003033, intron 1 of 8) intron (NM_003033, intron 1 of 8) 13675 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 154.333-2 chr1 25427177 25427561 + 0.666667 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -3489 NM_001282564 55219 Hs.189782 NM_018202 ENSG00000204178 MACO1 MACOILIN|TMEM57 macoilin 1 protein-coding 177.667-155 chrX 97347867 97348207 + 0.666667 NA intron (NM_007309, intron 23 of 26) intron (NM_007309, intron 23 of 26) 216498 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 111.667-59 chr12 26442983 26443279 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 46 of 56) intron (NM_002223, intron 46 of 56) 247558 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 146.333-45 chr11 9411848 9412284 + 0.666667 NA intron (NM_006391, intron 4 of 24) intron (NM_006391, intron 4 of 24) -16700 NR_002962 677808 Hs.689720 NR_002962 ENSG00000201998 SNORA23 ACA23 small nucleolar RNA, H/ACA box 23 snoRNA 117.333-211 chr8 119624788 119625106 + 0.666667 NA intron (NM_001330600, intron 3 of 25) intron (NM_001330600, intron 3 of 25) 13892 NM_001130863 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 113.667-70 chr15 74219459 74219700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9874 NM_001199040 64220 Hs.24553 NM_022369 ENSG00000137868 STRA6 MCOPCB8|MCOPS9|PP14296 stimulated by retinoic acid 6 protein-coding 132.667-174 chr8 42394911 42395159 + 0.666667 NA intron (NM_001135694, intron 3 of 9) intron (NM_001135694, intron 3 of 9) 3155 NM_005662 7419 Hs.699301 NM_005662 ENSG00000078668 VDAC3 HD-VDAC3|VDAC-3 voltage dependent anion channel 3 protein-coding 136.333-9 chr1 147432073 147432292 + 0.666667 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) intron (NR_038423, intron 3 of 3) 85693 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 136.667-190 chrX 85520462 85520726 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140929 NM_001307940 79983 Hs.267038 NM_024921 ENSG00000124429 POF1B POF|POF2B POF1B actin binding protein protein-coding 145.333-168 chr21 27443180 27443448 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -279065 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 201.333-79 chr12 109146411 109146832 + 0.666667 NA intron (NM_001093, intron 2 of 52) MER45A|DNA|hAT-Tip100 30034 NM_001093 32 Hs.234898 NM_001093 ENSG00000076555 ACACB ACC2|ACCB|HACC275 acetyl-CoA carboxylase beta protein-coding 114.667-64 chr12 69575012 69575321 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_006654, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_006654, exon 10 of 10) -9557 NR_037476 100500868 NR_037476 ENSG00000283677 MIR3913-2 mir-3913-2 microRNA 3913-2 ncRNA 159.333-330 chr8 103821119 103821590 + 0.666667 NA intron (NR_145711, intron 1 of 21) intron (NR_145711, intron 1 of 21) 2134 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 146.333-190 chr22 35040745 35041120 + 0.666667 NA Intergenic Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger -25226 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 116.667-51 chr14 46702191 46702415 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50522 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 145.667-104 chr16 10698147 10698437 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3362 NM_144674 146279 Hs.143519 NM_144674 ENSG00000153060 TEKT5 CT149 tektin 5 protein-coding 165.333-70 chr14 23095771 23096147 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001164815) promoter-TSS (NM_001164815) -345 NM_014977 22985 Hs.124490 NM_014977 ENSG00000100813 ACIN1 ACINUS|ACN|fSAP152 apoptotic chromatin condensation inducer 1 protein-coding 184.667-8 chr1 151115764 151116253 + 0.666667 NA intron (NM_001323912, intron 6 of 7) AluSx|SINE|Alu 30623 NM_001178061 10500 Hs.516316 NM_030913 ENSG00000143434 SEMA6C SEMAY|m-SemaY|m-SemaY2 semaphorin 6C protein-coding 117-96 chr3 144179268 144179602 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 206354 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 234.333-61 chr5 83662495 83662952 + 0.666667 NA intron (NM_001884, intron 2 of 4) intron (NM_001884, intron 2 of 4) 58132 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 122.667-86 chr2 40538845 40539150 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -26562 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 150-108 chr4 162123120 162123561 + 0.666667 NA intron (NM_001128428, intron 1 of 14) intron (NM_001128428, intron 1 of 14) 40660 NM_020116 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 163.667-88 chr17 73779856 73780137 + 0.666667 NA intron (NR_027146, intron 2 of 3) intron (NR_027146, intron 2 of 3) -6826 NR_040020 400620 Hs.348644 NR_040020 ENSG00000234721 LINC02092 - long intergenic non-protein coding RNA 2092 ncRNA 197.667-11 chr1 198095853 198096271 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60936 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 112.667-150 chr20 45744564 45744855 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 22362 NM_178455 391253 Hs.677891 NM_178455 ENSG00000149651 SPINT4 C20orf137|SPINT3|dJ601O1.1 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 protein-coding 255-24 chr12 21560748 21561481 + 0.666667 NA intron (NM_021957, intron 7 of 15) MIRb|SINE|MIR 33189 NR_135188 80763 Hs.130692 NM_030572 ENSG00000134548 SPX C12orf39 spexin hormone protein-coding 409-10 chr5 25819303 25820364 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 628880 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 144-117 chr3 168256924 168257308 + 0.666667 NA intron (NR_021485, intron 1 of 15) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 7594 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 166.333-22 chr10 17701554 17701882 + 0.666667 NA intron (NM_001324284, intron 10 of 14) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -50483 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 154.667-142 chr17 62660195 62660566 + 0.666667 NA intron (NM_006039, intron 1 of 29) L1MEb|LINE|L1 32710 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 136-60 chr22 28378627 28378928 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEc|LINE|L1 -81092 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 229-18 chr12 78847281 78847734 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16475 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 138.667-99 chr2 40758197 40758522 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -245924 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 260-50 chr22 34736597 34737023 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 261106 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 166.667-245 chr9 93151474 93151813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17392 NM_004148 4814 Hs.494457 NM_004148 ENSG00000131669 NINJ1 NIN1|NINJURIN ninjurin 1 protein-coding 169.333-107 chr18 73737613 73738045 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 410005 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 193-20 chr13 45544426 45544824 + 0.666667 NA intron (NM_182542, intron 14 of 14) intron (NM_182542, intron 14 of 14) 71114 NM_182542 220081 Hs.668747 NM_182542 ENSG00000165837 ERICH6B FAM194B glutamate rich 6B protein-coding 143.333-139 chr2 104001378 104001646 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 406820 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 164-44 chr17 44493925 44494237 + 0.666667 NA intron (NM_001002909, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 9325 NM_001002909 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 113-82 chr17 29920515 29920817 + 0.666667 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) intron (NM_001282129, intron 1 of 15) -9237 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 113-196 chr7 91873895 91874108 + 0.666667 NA exon (NM_006980, exon 3 of 3) exon (NM_006980, exon 3 of 3) 6701 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 190.667-128 chr7 6214695 6215237 + 0.666667 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) -42829 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 245.333-14 chr10 73399046 73399564 + 0.666667 NA intron (NM_001320879, intron 1 of 11) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 14753 NM_001156 310 Hs.631827 NM_001156 ENSG00000138279 ANXA7 ANX7|SNX|SYNEXIN annexin A7 protein-coding 147-109 chr5 41006207 41006502 + 0.666667 NA intron (NM_173489, intron 34 of 41) L1PB1|LINE|L1 64988 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 178-9 chr1 114437782 114438148 + 0.666667 NA intron (NM_015906, intron 4 of 19) FLAM_A|SINE|Alu 73238 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 153.667-38 chr10 24817702 24818003 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -93965 NM_020824 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 118.667-168 chr6 79564915 79565216 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27635 NM_001122769 167691 Hs.21945 NM_181714 ENSG00000135338 LCA5 C6orf152 lebercilin LCA5 protein-coding 132-95 chr4 173547906 173548130 + 0.666667 NA intron (NR_136195, intron 3 of 4) intron (NR_136195, intron 3 of 4) 17560 NR_003679 79804 Hs.61435 NR_003679 ENSG00000237125 HAND2-AS1 DEIN|NBLA00301|UPH HAND2 antisense RNA 1 ncRNA 181.333-197 chrX 100361428 100361791 + 0.666667 NA intron (NM_020766, intron 2 of 4) MIRc|SINE|MIR 48664 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 173.333-164 chr5 156942616 156942966 + 0.666667 NA intron (NM_001146726, intron 4 of 7) intron (NM_001146726, intron 4 of 7) 20435 NM_138379 91937 Hs.334907 NM_138379 ENSG00000145850 TIMD4 SMUCKLER|TIM4 T cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 protein-coding 117-108 chr4 142282103 142282309 + 0.666667 NA intron (NM_001331040, intron 9 of 25) L2a|LINE|L2 564329 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 193-29 chr16 76374315 76374725 + 0.666667 NA intron (NR_136213, intron 3 of 23) intron (NR_136213, intron 3 of 23) 64668 NM_138994 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 155.667-89 chr14 47091740 47092054 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 251349 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 150-51 chr15 83303668 83304092 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19216 NM_001717 646 Hs.459153 NM_001717 ENSG00000169594 BNC1 BNC|BSN1|HsT19447 basonuclin 1 protein-coding 171-39 chr20 13207544 13207971 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -13517 NM_080826 140862 Hs.559353 NM_080826 ENSG00000101230 ISM1 C20orf82|ISM|Isthmin|bA149I18.1|dJ1077I2.1 isthmin 1 protein-coding 160.333-186 chr3 69320247 69320566 + 0.666667 NA intron (NM_015123, intron 1 of 22) AluJo|SINE|Alu 65682 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 186.333-115 chr4 72438670 72439111 + 0.666667 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 130331 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 125.333-86 chr2 33494821 33495029 + 0.666667 NA intron (NM_001349975, intron 3 of 19) intron (NM_001349975, intron 3 of 19) 18276 NM_001349980 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 206.333-76 chr18 79801746 79802080 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61755 NM_012283 26251 Hs.247905 NM_012283 ENSG00000178342 KCNG2 KCNF2|KV6.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 2 protein-coding 149-111 chr5 19527746 19528059 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 9 of 12) intron (NM_001349559, intron 9 of 12) 358370 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 181-10 chr11 91007469 91007865 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR -138465 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 120.667-106 chr20 37401199 37401384 + 0.666667 NA intron (NM_198291, intron 10 of 13) AluJo|SINE|Alu 55163 NM_198291 6714 Hs.195659 NM_005417 ENSG00000197122 SRC ASV|SRC1|THC6|c-SRC|p60-Src SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 143.667-53 chr12 14634188 14634607 + 0.666667 NA intron (NM_004963, intron 19 of 26) L1MA4A|LINE|L1 62202 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 190.667-141 chr7 107033700 107034115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10798 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 200.667-123 chr4 111273976 111274436 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -413559 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 224.667-58 chr3 157116484 157117035 + 0.666667 NA intron (NR_034007, intron 1 of 3) intron (NR_034007, intron 1 of 3) 6243 NR_034007 339894 Hs.478050 NR_034007 ENSG00000243629 LINC00880 - long intergenic non-protein coding RNA 880 ncRNA 116.667-215 chr9 71468179 71468527 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -21382 NM_001366144 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 112-52 chr13 72993820 72993998 + 0.666667 NA intron (NM_006346, intron 16 of 17) intron (NM_006346, intron 16 of 17) -61067 NM_001286818 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 148-55 chr17 51059516 51059923 + 0.666667 NA intron (NM_001130527, intron 2 of 29) AluSg|SINE|Alu -12841 NM_001251971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 160-91 chr4 144259174 144259568 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -118653 NM_001308190 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 232.667-62 chr5 20407051 20407457 + 0.666667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) L1MB2|LINE|L1 101703 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 181.667-137 chr7 75728116 75728546 + 0.666667 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) intron (NM_005338, intron 1 of 30) 10610 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 119.667-118 chr3 95848551 95848884 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -165524 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 207-61 chr2 46729563 46730100 + 0.666667 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 30536 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 131.667-40 chr12 18559174 18559520 + 0.666667 NA intron (NM_001288774, intron 26 of 32) L1M8|LINE|L1 178162 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 187-5 chr1 152648142 152648638 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7087 NR_145430 388699 Hs.516420 NR_145430 LINC00302 C1orf46|NCRNA00302|xp33 long intergenic non-protein coding RNA 302 ncRNA 143.667-19 chr10 30713625 30713990 + 0.666667 NA intron (NR_036438, intron 9 of 9) AluJb|SINE|Alu -9412 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 193.667-32 chr12 26387887 26388301 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 54 of 56) intron (NM_002223, intron 54 of 56) 192521 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 135.667-79 chr19 15895553 15895862 + 0.666667 NA intron (NM_001082, intron 2 of 12) MLT2B2|LTR|ERVL 2367 NM_001082 8529 Hs.558423 NM_001082 ENSG00000186115 CYP4F2 CPF2 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 2 protein-coding 163.667-197 chr5 32124335 32124774 + 0.666667 NA TTS (NM_022130) TTS (NM_022130) 49765 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 124.667-67 chr15 50293619 50293916 + 0.666667 NA intron (NM_016654, intron 6 of 8) intron (NM_016654, intron 6 of 8) -28041 NM_002112 3067 Hs.1481 NM_002112 ENSG00000140287 HDC - histidine decarboxylase protein-coding 144.333-50 chr12 46564870 46565148 + 0.666667 NA intron (NR_125380, intron 3 of 3) L1MA5A|LINE|L1 180902 NR_125381 100288798 Hs.525922 NR_125377 LOC100288798 - uncharacterized LOC100288798 ncRNA 154.333-131 chr18 11125050 11125402 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 1 of 51) intron (NM_022068, intron 1 of 51) 23536 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 146.333-112 chr15 84637460 84637829 + 0.666667 NA intron (NR_004859, intron 3 of 4) L1PA7|LINE|L1 6184 NR_004859 54581 Hs.658114 NM_022050 SCAND2P SCAND2 SCAN domain containing 2 pseudogene pseudo 143.667-7 chr1 61637571 61637903 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16505 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 157.667-366 chrX 136770276 136770601 + 0.666667 NA intron (NM_004840, intron 2 of 21) L1M4|LINE|L1 -2623 NM_001306177 9459 Hs.522795 NM_004840 ENSG00000129675 ARHGEF6 COOL2|Cool-2|MRX46|PIXA|alpha-PIX|alphaPIX Rac/Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 111.667-34 chr10 63591294 63591535 + 0.666667 NA intron (NM_001001330, intron 2 of 7) intron (NM_001001330, intron 2 of 7) -69524 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 119.667-190 chr9 72960300 72960516 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -7355 NM_000689 216 Hs.76392 NM_000689 ENSG00000165092 ALDH1A1 ALDC|ALDH-E1|ALDH1|ALDH11|HEL-9|HEL-S-53e|HEL12|PUMB1|RALDH1 aldehyde dehydrogenase 1 family member A1 protein-coding 126.333-160 chr6 157559383 157559659 + 0.666667 NA intron (NM_024630, intron 2 of 8) intron (NM_024630, intron 2 of 8) 30389 NR_037463 100500899 NR_037463 ENSG00000266617 MIR3692 - microRNA 3692 ncRNA 141.667-127 chr2 220927270 220927591 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 644874 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 154.333-359 chr8 135579335 135579670 + 0.666667 NA intron (NM_006558, intron 5 of 8) AluSz|SINE|Alu 122046 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 147-115 chr5 119919922 119920216 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 290510 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 174.667-20 chr10 15684341 15684705 + 0.666667 NA intron (NM_001291494, intron 3 of 28) AluJb|SINE|Alu 35399 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 118-13 chr10 131563437 131563767 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 226597 NR_038365 399827 Hs.523353 NM_001001677 ENSG00000189275 LINC01164 - long intergenic non-protein coding RNA 1164 ncRNA 171-63 chr5 11061174 11061609 + 0.666667 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) L2a|LINE|L2 -300157 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 139-46 chr2 11839716 11840004 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -2874 NR_036226 100422996 NR_036226 ENSG00000265172 MIR4262 - microRNA 4262 ncRNA 114-93 chr3 134275244 134275578 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -24667 NM_001005861 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 133-83 chr6 80471265 80471546 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 364734 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 185.667-99 chr5 19311770 19312077 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 574349 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 130.333-166 chr5 50323426 50323647 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 117752 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 118.667-155 chr5 35554565 35554819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63171 NM_024867 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 168.333-47 chr12 83794076 83794506 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 1107136 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 149.667-21 chr1 101490090 101490416 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 166416 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 118-118 chr7 8201061 8201352 + 0.666667 NA intron (NM_001350836, intron 7 of 14) LTR81A|LTR|Gypsy 60846 NM_022307 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 116.667-43 chr12 129438202 129438458 + 0.666667 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) L1ME3|LINE|L1 229729 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 140.667-126 chr2 146917472 146917735 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 330546 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 158.333-186 chr22 35119060 35119348 + 0.666667 NA TTS (NR_126356) TTS (NR_126356) 53046 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 166.667-168 chr4 77834550 77834907 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14459 NM_001365006 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 147.667-44 chr10 93269696 93270061 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 195985 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 122.333-67 chr16 53018014 53018225 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 34754 NR_136518 105371267 Hs.147562 NR_136518 ENSG00000277639 LOC105371267 PR-lncRNA-1 p53-regulated lncRNA 1 ncRNA 125.667-11 chr1 117617442 117617698 + 0.666667 NA intron (NM_017709, intron 1 of 1) intron (NM_017709, intron 1 of 1) 11522 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 122-55 chr2 172200066 172200323 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 97188 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 172.667-58 chr15 57923252 57923649 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90573 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 148-84 chr2 147333658 147333953 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -510712 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 183.333-97 chr21 15202829 15203375 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -138102 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 158-73 chr2 121169262 121169717 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 115713 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 168-89 chr5 37976055 37976495 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27784 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 215.333-105 chr2 199535227 199535687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64191 NM_015265 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 148.333-68 chr11 41214143 41214435 + 0.666667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 245347 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 270-32 chr2 231556464 231556975 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -26274 NM_006056 10316 Hs.471619 NM_006056 ENSG00000171596 NMUR1 (FM-3)|FM-3|FM3|GPC-R|GPR66|NMU1R neuromedin U receptor 1 protein-coding 156.667-270 chr5 74846591 74846952 + 0.666667 NA intron (NM_015566, intron 1 of 12) AluJo|SINE|Alu -19122 NR_134288 441086 Hs.653007 NR_134288 LOC441086 - uncharacterized LOC441086 ncRNA 130.667-98 chr18 71859332 71859540 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -77210 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 133.667-98 chr3 119402652 119402930 + 0.666667 NA intron (NM_020754, intron 10 of 11) intron (NM_020754, intron 10 of 11) 60824 NM_018266 55254 Hs.594171 NM_018266 ENSG00000176142 TMEM39A - transmembrane protein 39A protein-coding 183-75 chr3 47062766 47063271 + 0.666667 NA intron (NR_146158, intron 14 of 21) MER8|DNA|TcMar-Tigger 51476 NR_024046 100129354 Hs.201522 NR_024046 NRADDP - neurotrophin receptor associated death domain, pseudogene pseudo 147.333-326 chr8 135083864 135084296 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -150051 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 143.667-60 chr12 108341027 108341303 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -1854 NM_004072 1240 Hs.197143 NM_004072 ENSG00000174600 CMKLR1 CHEMERINR|ChemR23|DEZ|RVER1 chemerin chemokine-like receptor 1 protein-coding 221.333-3 chr1 49396269 49396625 + 0.666667 NA intron (NR_046839, intron 3 of 3) intron (NR_046839, intron 3 of 3) 75638 NR_046839 100874313 Hs.551277 NR_046839 ENSG00000225623 AGBL4-IT1 - AGBL4 intronic transcript 1 ncRNA 122.667-120 chr3 105320619 105320972 + 0.666667 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X -45918 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 128.667-199 chr9 106815419 106815655 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47629 NM_021224 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 218-73 chr3 22823434 22823921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 378901 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 132.667-158 chr7 14457219 14457490 + 0.666667 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) 384096 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 165-64 chr4 39707960 39708296 + 0.666667 NA intron (NM_001111113, intron 1 of 4) AluSp|SINE|Alu 9992 NM_001111112 3093 Hs.50308 NM_005339 ENSG00000078140 UBE2K E2-25K|HIP2|HYPG|LIG|UBC1 ubiquitin conjugating enzyme E2 K protein-coding 169-79 chr4 152671118 152671612 + 0.666667 NA intron (NM_152680, intron 1 of 6) L2c|LINE|L2 8632 NM_152680 201799 Hs.518900 NM_152680 ENSG00000170006 TMEM154 - transmembrane protein 154 protein-coding 173.333-24 chr10 29268649 29269050 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20221 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 147-45 chr15 24750089 24750374 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73377 NM_001349459 6638 Hs.564847 NM_003097 ENSG00000128739 SNRPN HCERN3|PWCR|RT-LI|SM-D|SMN|SNRNP-N|SNURF-SNRPN|sm-N small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N protein-coding 159.333-205 chr3 21034820 21035160 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -370736 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 223.333-49 chr17 7832196 7832702 + 0.666667 NA intron (NM_020877, intron 82 of 85) AluSq2|SINE|Alu -7457 NM_001348716 23135 Hs.223678 NM_001080424 ENSG00000132510 KDM6B JMJD3 lysine demethylase 6B protein-coding 112-44 chr12 64446385 64446575 + 0.666667 NA intron (NM_007235, intron 24 of 24) intron (NM_007235, intron 24 of 24) -5640 NM_013254 29110 Hs.505874 NM_013254 ENSG00000183735 TBK1 FTDALS4|IIAE8|NAK|T2K TANK binding kinase 1 protein-coding 136.333-176 chr5 171416850 171417098 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2673 NM_003862 8817 Hs.87191 NM_003862 ENSG00000156427 FGF18 FGF-18|ZFGF5 fibroblast growth factor 18 protein-coding 168.333-135 chr3 164851130 164851502 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19836 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 191.333-11 chr1 112686115 112686542 + 0.666667 NA intron (NM_001321324, intron 2 of 20) intron (NM_001321324, intron 2 of 20) 11590 NM_001369507 4343 Hs.514941 NM_020963 ENSG00000155363 MOV10 fSAP113|gb110 Mov10 RISC complex RNA helicase protein-coding 113-214 chr9 82317962 82318155 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 329286 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 143-90 chr4 99744616 99744983 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -72028 NM_001306151 27071 Hs.436271 NM_014395 ENSG00000070190 DAPP1 BAM32 dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 protein-coding 180.667-16 chr10 64972926 64973285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48587 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 170-21 chr11 111476477 111476827 + 0.666667 NA intron (NM_017589, intron 5 of 5) intron (NM_017589, intron 5 of 5) -33950 NR_147706 728196 Hs.363156 NR_147706 ENSG00000286028 LOC728196 - uncharacterized LOC728196 ncRNA 224.333-21 chr10 118401333 118401826 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 44471 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 137.333-28 chr11 86360745 86361143 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13792 NM_021827 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 125-65 chr21 15014593 15014812 + 0.666667 NA intron (NM_003489, intron 2 of 3) intron (NM_003489, intron 2 of 3) 50298 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 112-151 chr4 47344104 47344293 + 0.666667 NA intron (NM_000812, intron 5 of 8) intron (NM_000812, intron 5 of 8) 119504 NM_017845 54951 Hs.23956 NM_017845 ENSG00000169019 COMMD8 - COMM domain containing 8 protein-coding 170.667-101 chr20 58963508 58963865 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -17570 NM_198976 51497 Hs.517148 NM_016397 ENSG00000101158 NELFCD HSPC130|NELF-C|NELF-D|TH1|TH1L negative elongation factor complex member C/D protein-coding 145-30 chr14 53452717 53453064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 299536 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 193.333-138 chr4 69082614 69083041 + 0.666667 NA intron (NM_001349568, intron 1 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -13647 NM_001330719 7364 Hs.654424 NM_001074 ENSG00000171234 UGT2B7 UDPGT 2B7|UDPGT 2B9|UDPGT2B7|UDPGTH2|UDPGTh-2|UGT2B9 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B7 protein-coding 222-95 chr8 52386016 52386594 + 0.666667 NA intron (NR_148195, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 23451 NM_001352884 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 115.667-218 chr8 129255941 129256124 + 0.666667 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -14792 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 114-103 chr4 74771381 74771650 + 0.666667 NA intron (NM_001316963, intron 1 of 4) intron (NM_001316963, intron 1 of 4) 23008 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 118.333-80 chr16 52176991 52177314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -81412 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 169-24 chr13 74303008 74303366 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71743 NR_144451 100507612 Hs.447508 NR_144451 ENSG00000235532 LINC00402 - long intergenic non-protein coding RNA 402 ncRNA 159.667-299 chr7 42736353 42736689 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -30074 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 236.333-4 chr1 52810039 52810605 + 0.666667 NA intron (NM_024646, intron 10 of 13) L1MB3|LINE|L1 -32438 NM_001004339 440590 Hs.658458 NM_001004339 ENSG00000203995 ZYG11A ZYG11 zyg-11 family member A, cell cycle regulator protein-coding 176.667-94 chr22 46424330 46424708 + 0.666667 NA intron (NM_014246, intron 5 of 34) L1MD1|LINE|L1 88805 NM_001282783 55687 Hs.439524 NM_018006 ENSG00000100416 TRMU LCAL3|MTO2|MTU1|TRMT|TRMT1 tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase protein-coding 142-15 chr10 18772031 18772427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 112798 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 124.333-166 chr7 1460067 1460354 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_182924) promoter-TSS (NM_182924) -740 NM_182924 79778 Hs.376617 NM_024723 ENSG00000164877 MICALL2 JRAB|MICAL-L2 MICAL like 2 protein-coding 186-106 chr9 112940900 112941313 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50230 NM_033051 57864 Hs.512668 NM_033051 ENSG00000119457 SLC46A2 Ly110|TSCOT solute carrier family 46 member 2 protein-coding 115.667-80 chr14 81585921 81586111 + 0.666667 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 37045 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 182.333-105 chr3 37582702 37583189 + 0.666667 NA intron (NM_002207, intron 15 of 27) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 130804 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 176.667-139 chr7 109556556 109556983 + 0.666667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 403444 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 158.667-201 chr3 17338364 17338706 + 0.666667 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) intron (NM_014744, intron 13 of 21) 361485 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 151.667-344 chr7 105241081 105241429 + 0.666667 NA intron (NM_182692, intron 2 of 15) MIRb|SINE|MIR 27822 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 261-13 chr10 114836252 114836818 + 0.666667 NA intron (NM_001135051, intron 5 of 16) intron (NM_001135051, intron 5 of 16) 14755 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 145.667-222 chr5 90949043 90949313 + 0.666667 NA intron (NR_003149, intron 83 of 89) L1ME3|LINE|L1 365224 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 161-52 chr20 57376673 57376989 + 0.666667 NA intron (NM_003610, intron 11 of 11) intron (NM_003610, intron 11 of 11) -14565 NM_017495 55544 Hs.236361 NM_017495 ENSG00000132819 RBM38 HSRNASEB|RNPC1|SEB4B|SEB4D|dJ800J21.2 RNA binding motif protein 38 protein-coding 250-97 chrX 49037475 49038186 + 0.666667 NA intron (NM_001282142, intron 5 of 9) intron (NM_001282142, intron 5 of 9) 5527 NM_006521 7030 Hs.730740 NM_006521 ENSG00000068323 TFE3 RCCP2|RCCX1|TFEA|bHLHe33 transcription factor binding to IGHM enhancer 3 protein-coding 131-60 chr21 38125935 38126193 + 0.666667 NA intron (NR_026839, intron 2 of 2) intron (NR_026839, intron 2 of 2) 4613 NR_026838 84677 Hs.733345 NM_032589 ENSG00000198054 DSCR8 C21orf65|CT25.1a|CT25.1b|MMA-1|MMA-1a|MMA-1b|MMA1|MTAG2 Down syndrome critical region 8 ncRNA 217-84 chr7 49939760 49940188 + 0.666667 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) MER101B|LTR|ERV1 153272 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 114.667-182 chr3 175169004 175169242 + 0.666667 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) -53881 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 155-23 chr11 104089128 104089454 + 0.666667 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) intron (NM_025208, intron 1 of 6) 52651 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 146.333-206 chr3 70670942 70671354 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -358510 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 150-21 chr11 5058381 5058752 + 0.666667 NA TTS (NM_001005164) TTS (NM_001005164) 1061 NM_001005164 119678 Hs.553557 NM_001005164 ENSG00000176787 OR52E2 - olfactory receptor family 52 subfamily E member 2 protein-coding 129-46 chr17 71288882 71289158 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86841 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 196.667-128 chr5 170893919 170894358 + 0.666667 NA intron (NM_022897, intron 4 of 27) intron (NM_022897, intron 4 of 27) 32120 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 115.667-233 chrX 55588056 55588290 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -35227 NM_198451 139628 Hs.364260 NM_198451 ENSG00000189299 FOXR2 FOXN6 forkhead box R2 protein-coding 178.667-79 chr2 89772968 89773405 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -135279 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 139.667-110 chr22 35265974 35266325 + 0.666667 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) intron (NM_001003681, intron 5 of 10) 8656 NM_001003681 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 125.667-133 chr4 66687829 66688071 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 411126 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 148-87 chr2 177138796 177139215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73406 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 159.333-29 chr1 220819271 220819654 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_022746, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_022746, exon 7 of 7) -4809 NR_157260 106481171 NR_157260 RNU6ATAC35P - RNA, U6atac small nuclear 35, pseudogene pseudo 113-112 chr2 148025395 148025616 + 0.666667 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -3901 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 130.333-91 chr17 69942491 69942812 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19056 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 124.333-170 chr7 92016404 92016671 + 0.666667 NA intron (NM_147185, intron 11 of 49) intron (NM_147185, intron 11 of 49) 75662 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 142.667-201 chr7 22067292 22067626 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -121560 NM_001127371 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 166.667-195 chr6 39604168 39604532 + 0.666667 NA intron (NM_001289020, intron 6 of 21) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 121058 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 189.667-6 chr1 107304244 107304647 + 0.666667 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 156376 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 121-12 chr10 30117552 30117839 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -2201 NM_001350022 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 114-91 chr3 111124683 111125012 + 0.666667 NA intron (NM_001243288, intron 4 of 8) L2b|LINE|L2 53031 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 193.333-69 chr16 28196692 28197121 + 0.666667 NA intron (NM_015171, intron 1 of 23) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 15059 NM_015171 23214 Hs.460468 NM_015171 ENSG00000169180 XPO6 EXP6|RANBP20 exportin 6 protein-coding 174.667-46 chr14 37614309 37614673 + 0.666667 NA intron (NM_001310135, intron 2 of 32) L1ME1|LINE|L1 18862 NM_001310135 319089 Hs.659936 NM_001007795 ENSG00000139865 TTC6 C14orf25|NCRNA00291 tetratricopeptide repeat domain 6 protein-coding 222-92 chr8 16926859 16927436 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75198 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 169-43 chr2 62154987 62155475 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -40884 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 199.333-187 chr3 116887160 116887616 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -34043 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 129.667-66 chr15 77353136 77353364 + 0.666667 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 66854 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 151.667-383 chr9 14639694 14640109 + 0.666667 NA non-coding (NR_148716, exon 8 of 11) non-coding (NR_148716, exon 8 of 11) 53531 NM_001354126 340481 Hs.649522 NM_178566 ENSG00000175893 ZDHHC21 DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097 zinc finger DHHC-type containing 21 protein-coding 214.333-80 chr2 146078631 146079188 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -508148 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 135.667-17 chr10 59572439 59572711 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 137316 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 111.667-73 chr12 126817500 126817759 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45367 NR_033878 387895 Hs.534660 NR_033878 LINC00944 - long intergenic non-protein coding RNA 944 ncRNA 185.667-80 chr2 238089501 238090018 + 0.666667 NA intron (NM_016510, intron 7 of 11) L1MDa|LINE|L1 -10581 NM_194312 339768 Hs.127724 NM_194312 ENSG00000144488 ESPNL - espin like protein-coding 199-125 chr8 139404844 139405183 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 298110 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 154-43 chr12 77764565 77764980 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66122 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 208-137 chr5 87781421 87781779 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 119558 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 120.667-90 chr2 43695014 43695277 + 0.666667 NA exon (NM_172069, exon 6 of 30) exon (NM_172069, exon 6 of 30) -18716 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 133-61 chr3 101316203 101316517 + 0.666667 NA intron (NM_016247, intron 2 of 18) L1ME1|LINE|L1 4215 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 161.667-6 chr1 66706657 66707008 + 0.666667 NA intron (NM_001350218, intron 16 of 22) intron (NM_001350218, intron 16 of 22) -45627 NM_152665 200132 Hs.479226 NM_152665 ENSG00000152760 TCTEX1D1 - Tctex1 domain containing 1 protein-coding 153.667-62 chr11 17332704 17333028 + 0.666667 NA TTS (NM_005013) TTS (NM_005013) -18934 NM_001202439 374383 Hs.146274 NM_001009913 ENSG00000188211 NCR3LG1 B7-H6|B7H6|DKFZp686O24166 natural killer cell cytotoxicity receptor 3 ligand 1 protein-coding 165-12 chr11 18619547 18619910 + 0.666667 NA intron (NM_194285, intron 1 of 5) AluSc5|SINE|Alu 14614 NM_194285 144108 Hs.738650 NM_194285 ENSG00000179119 SPTY2D1 Spt2 SPT2 chromatin protein domain containing 1 protein-coding 162.667-252 chr7 13981078 13981538 + 0.666667 NA intron (NM_001370556, intron 3 of 11) intron (NM_001370556, intron 3 of 11) 5206 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 140.333-194 chr5 163405803 163406087 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31626 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 183.667-21 chr10 32239281 32239644 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 107696 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 163.667-216 chr6 113272743 113273028 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 160562 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 298-35 chr18 8026085 8026639 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 340672 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 123-33 chr12 4916275 4916556 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_000217, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_000217, exon 2 of 2) 6510 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 114.667-96 chr16 7093959 7094137 + 0.666667 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) intron (NM_018723, intron 4 of 15) -238797 NM_145892 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 186.333-41 chr12 88254229 88254594 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 112104 NM_001366579 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 119.333-47 chr11 38940609 38940796 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 291844 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 175.666-13 chr20 45839379 45839901 + 0.666667 NA intron (NM_033421, intron 3 of 3) AluJr|SINE|Alu 5841 NM_152897 90203 Hs.472854 NM_033421 ENSG00000124104 SNX21 C20orf161|PP3993|SNX-L|dJ337O18.4 sorting nexin family member 21 protein-coding 114.667-10 chr1 162234230 162234464 + 0.666667 NA intron (NM_014697, intron 2 of 9) intron (NM_014697, intron 2 of 9) 77240 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 251-85 chr8 90484080 90484785 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 121631 NR_104062 101937451 Hs.583685 NR_104062 ENSG00000253799 LINC01030 - long intergenic non-protein coding RNA 1030 ncRNA 154-85 chr20 56048413 56048720 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -43047 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 116.667-2 chr1 38874754 38874990 + 0.666667 NA non-coding (NR_037633, exon 2 of 6) non-coding (NR_037633, exon 2 of 6) 1471 NR_135048 105378663 Hs.585419 NR_135048 ENSG00000228436 LOC105378663 - uncharacterized LOC105378663 ncRNA 151-128 chr8 114728631 114729069 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 939163 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 213.667-36 chr16 88945905 88946387 + 0.666667 NA intron (NM_001290330, intron 1 of 1) AluSx|SINE|Alu -4796 NM_175931 863 Hs.513811 NM_005187 ENSG00000129993 CBFA2T3 ETO2|MTG16|MTGR2|RUNX1T3|ZMYND4 CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 3 protein-coding 167.667-2 chr1 38140162 38140545 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51122 NR_037432 100500801 NR_037432 ENSG00000265596 MIR3659 mir-3659 microRNA 3659 ncRNA 210.333-43 chr14 31066860 31067209 + 0.666667 NA intron (NM_001128126, intron 2 of 5) AluSq2|SINE|Alu 40391 NM_001254728 11154 Hs.293411 NM_007077 ENSG00000100478 AP4S1 AP47B|CLA20|CLAPS4|CPSQ6|SPG52 adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1 protein-coding 126.333-36 chr12 38687864 38688128 + 0.666667 NA intron (NM_153634, intron 15 of 19) intron (NM_153634, intron 15 of 19) 217595 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 245.667-14 chr13 31247005 31247574 + 0.666667 NA intron (NM_194318, intron 5 of 14) AluSc|SINE|Alu 47314 NM_194318 145173 Hs.13205 NM_194318 ENSG00000187676 B3GLCT B3GALTL|B3GTL|B3Glc-T|Gal-T|beta3Glc-T beta 3-glucosyltransferase protein-coding 218.333-78 chr20 37157717 37158086 + 0.666667 NA exon (NM_213631, exon 8 of 14) exon (NM_213631, exon 8 of 14) -21145 NM_001324302 6185 Hs.370895 NM_002951 ENSG00000118705 RPN2 RIBIIR|RPN-II|RPNII|SWP1 ribophorin II protein-coding 119.333-238 chr9 102111788 102112017 + 0.666667 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 -373322 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 184.667-41 chr17 28619144 28619574 + 0.666667 NA intron (NM_001363826, intron 30 of 37) FLAM_C|SINE|Alu -5174 NM_001174103 124923 Hs.729077 NM_144610 ENSG00000167524 RSKR SGK494 ribosomal protein S6 kinase related protein-coding 119.333-162 chr4 93964438 93964666 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 135799 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 145.333-38 chr10 65095808 65096106 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -171439 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 149.667-363 chr7 3577328 3577638 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 276231 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 146.667-159 chr2 52711835 52712267 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9436 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 127-77 chr5 155951787 155952130 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -374799 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 231.333-120 chr8 112560478 112561019 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 22 of 66) intron (NM_001363185, intron 22 of 66) -82745 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 163.333-96 chr15 45867712 45868133 + 0.666667 NA intron (NR_135680, intron 2 of 4) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 162727 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 263.333-2 chr1 184913419 184914203 + 0.666667 NA intron (NM_052966, intron 1 of 13) intron (NM_052966, intron 1 of 13) 60697 NM_052966 116496 Hs.518662 NM_052966 ENSG00000135842 NIBAN1 C1orf24|FAM129A|GIG39|NIBAN niban apoptosis regulator 1 protein-coding 146-67 chr2 211350492 211350920 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 733135 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 128.667-76 chr17 54459005 54459332 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -441523 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 128.667-93 chr2 121931042 121931275 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 175507 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 171-58 chr4 19389803 19390173 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -861917 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 128.333-133 chr3 156113899 156114264 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6467 NM_001308217 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 116.333-29 chr10 48947937 48948271 + 0.666667 NA intron (NM_020945, intron 51 of 61) intron (NM_020945, intron 51 of 61) -33869 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 148.333-249 chr3 54050739 54051095 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71635 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 208-18 chr10 19888628 19889013 + 0.666667 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 72388 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 182-42 chr18 13741072 13741470 + 0.666667 NA intron (NM_003799, intron 6 of 11) intron (NM_003799, intron 6 of 11) 14598 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 141-22 chr12 113027601 113028016 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -30049 NM_004416 1840 Hs.372152 NM_004416 ENSG00000135144 DTX1 RNF140|hDx-1 deltex E3 ubiquitin ligase 1 protein-coding 116.667-78 chr17 48425461 48425649 + 0.666667 NA intron (NM_001075099, intron 1 of 12) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 4659 NM_003726 8631 Hs.316931 NM_003726 ENSG00000141293 SKAP1 HEL-S-81p|SCAP1|SKAP55 src kinase associated phosphoprotein 1 protein-coding 147.667-360 chr8 88850750 88851099 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -523441 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 121-75 chr2 163632802 163633163 + 0.666667 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) AluJr|SINE|Alu 103026 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 186-83 chr5 102288736 102289127 + 0.666667 NA intron (NM_180991, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 7353 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 150.333-294 chr4 35057346 35057675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -787763 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 122-25 chr12 7917911 7918149 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 18157 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 143-18 chr10 66273016 66273391 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -652833 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 112-129 chr22 24121683 24121900 + 0.666667 NA intron (NM_012295, intron 28 of 36) intron (NM_012295, intron 28 of 36) -59696 NM_019601 56241 Hs.131819 NM_019601 ENSG00000099994 SUSD2 BK65A6.2|W5C5 sushi domain containing 2 protein-coding 177.667-44 chr14 36925341 36925807 + 0.666667 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu 26817 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 117.667-146 chr5 10122231 10122523 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 127511 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 112.667-43 chr11 105589502 105589757 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20444 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 131.667-144 chr4 59390899 59391193 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 377473 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 143.667-95 chr16 87096598 87096813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38921 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 146.333-150 chr2 69121490 69121821 + 0.666667 NA intron (NM_032208, intron 10 of 17) intron (NM_032208, intron 10 of 17) 17973 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 139.333-21 chr10 54009871 54010153 + 0.666667 NA intron (NM_001354411, intron 21 of 34) L1PA16|LINE|L1 -476218 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 188.667-81 chr2 162219764 162220166 + 0.666667 NA intron (NM_004460, intron 6 of 25) intron (NM_004460, intron 6 of 25) 23480 NM_004460 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 175.333-58 chr16 3938979 3939373 + 0.666667 NA Intergenic CpG 11268 NR_120311 102724927 Hs.364739 NR_120311 ENSG00000262185 LOC102724927 - uncharacterized LOC102724927 ncRNA 192-59 chr15 58048029 58048462 + 0.666667 NA intron (NM_170696, intron 1 of 11) intron (NM_170696, intron 1 of 11) -16980 NR_147215 283665 Hs.638961 NR_147215 LOC283665 - uncharacterized LOC283665 ncRNA 173.333-134 chr3 149066783 149067151 + 0.666667 NA intron (NM_001318935, intron 8 of 25) intron (NM_001318935, intron 8 of 25) -19365 NR_046648 100873945 Hs.742423 NR_046648 ENSG00000239718 HLTF-AS1 - HLTF antisense RNA 1 ncRNA 117.667-96 chr2 129386184 129386475 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -112438 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 156.667-267 chr5 39739625 39739953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 219358 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 189-62 chr3 65800384 65800909 + 0.666667 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -93170 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 192.667-65 chr15 89295937 89296378 + 0.666667 NA intron (NM_001113378, intron 24 of 37) AluSx|SINE|Alu 30653 NR_106824 102466983 NR_106824 ENSG00000275101 MIR6766 hsa-mir-6766 microRNA 6766 ncRNA 203-61 chr21 37116460 37116858 + 0.666667 NA intron (NM_003316, intron 11 of 45) AluSz|SINE|Alu 33712 NM_003316 7267 Hs.368214 NM_003316 ENSG00000182670 TTC3 DCRR1|RNF105|TPRDIII tetratricopeptide repeat domain 3 protein-coding 146.667-239 chr4 103561681 103562110 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 136853 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 191.333-113 chr2 79450143 79450517 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 50514 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 134.667-144 chr4 74877041 74877439 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -55876 NM_015393 25849 Hs.105460 NM_015393 ENSG00000169116 PARM1 Cipar1|DKFZP564O0823|PARM-1|WSC4 prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 protein-coding 149.333-74 chr11 77771666 77772055 + 0.666667 NA intron (NM_016578, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 48974 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 118-140 chr9 85210062 85210315 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 504287 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 155.333-375 chr8 11943157 11943473 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31284 NM_001033018 613210 Hs.558285 NM_001033018 ENSG00000205884 DEFB136 DEFB137 defensin beta 136 protein-coding 122.333-78 chr18 6948663 6949006 + 0.666667 NA intron (NM_005559, intron 59 of 62) intron (NM_005559, intron 59 of 62) -5843 NR_126040 101927188 Hs.680444 NR_126040 ENSG00000265069 LOC101927188 - uncharacterized LOC101927188 ncRNA 145-110 chr7 52153277 52153653 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -760209 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 230-69 chr7 124745557 124746066 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_005302, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_005302, exon 2 of 2) 19981 NM_005302 2861 Hs.406094 NM_005302 ENSG00000170775 GPR37 EDNRBL|PAELR|hET(B)R-LP G protein-coupled receptor 37 protein-coding 114.333-196 chr6 113444052 113444384 + 0.666667 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -10771 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 174-95 chr8 63002203 63002716 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24598 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 158.667-296 chr6 149061331 149061706 + 0.666667 NA intron (NM_005715, intron 7 of 7) intron (NM_005715, intron 7 of 7) -28857 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 158-64 chr18 648608 649050 + 0.666667 NA TTS (NM_001012716) TTS (NM_001012716) -8824 NM_001354867 7298 Hs.369762 NM_001071 ENSG00000176890 TYMS HST422|TMS|TS thymidylate synthetase protein-coding 169-17 chr12 28787142 28787570 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -361922 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 169.667-21 chr10 76827894 76828375 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -59910 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 193-70 chr4 105478155 105478584 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -4299 NM_006903 27068 Hs.654957 NM_006903 ENSG00000138777 PPA2 HSPC124|SCFAI|SCFI|SID6-306 pyrophosphatase (inorganic) 2 protein-coding 123.333-114 chr2 144521330 144521622 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_110570) promoter-TSS (NR_110570) -392 NR_110570 101928455 Hs.333693 NR_110570 LINC01412 - long intergenic non-protein coding RNA 1412 ncRNA 149-34 chr12 97228892 97229225 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -233718 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 184.333-83 chr2 167638622 167639058 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -179832 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 141.667-166 chr4 102550022 102550389 + 0.666667 NA intron (NM_003998, intron 5 of 23) L1MC4|LINE|L1 -47719 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 144.667-323 chr9 80588633 80588907 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 613747 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 173-12 chr11 11103643 11104014 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 245611 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 154-109 chr4 119606648 119606945 + 0.666667 NA exon (NM_001083, exon 2 of 21) exon (NM_001083, exon 2 of 21) 20941 NM_033430 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 166-118 chr8 112373711 112374012 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 34 of 66) intron (NM_001363185, intron 34 of 66) -269632 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 162-3 chr1 96829468 96829816 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107004 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 118.333-44 chr11 101753296 101753567 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -161579 NM_001363543 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 152-73 chr17 63082976 63083323 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) ERVL-E-int|LTR|ERVL 116914 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 176.333-136 chr5 77058962 77059449 + 0.666667 NA intron (NM_018046, intron 11 of 13) intron (NM_018046, intron 11 of 13) 21366 NR_003014 677828 Hs.693249 NR_003014 ENSG00000238961 SNORA47 HBI-115 small nucleolar RNA, H/ACA box 47 snoRNA 119.667-70 chr17 49725511 49725816 + 0.666667 NA intron (NM_030802, intron 2 of 7) L2a|LINE|L2 -17699 NM_005827 10237 Hs.154073 NM_005827 ENSG00000121073 SLC35B1 UGTREL1 solute carrier family 35 member B1 protein-coding 117.333-35 chr11 16936885 16937087 + 0.666667 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) MIRc|SINE|MIR -10964 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 149.667-300 chr5 14011520 14011884 + 0.666667 NA Intergenic CpG -67222 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 151.667-45 chr10 35041276 35041547 + 0.666667 NA intron (NM_003591, intron 8 of 20) intron (NM_003591, intron 8 of 20) 32872 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 258.667-103 chr9 128515356 128515946 + 0.666667 NA intron (NM_001499, intron 3 of 13) intron (NM_001499, intron 3 of 13) 10959 NM_001003722 2733 Hs.522418 NM_001499 ENSG00000119392 GLE1 CAAHC|CAAHD|GLE1L|LCCS|LCCS1|hGLE1 GLE1 RNA export mediator protein-coding 130-105 chr6 27608575 27608870 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -85313 NR_038294 100507173 Hs.635987 NR_038292 ENSG00000281706 LINC01012 - long intergenic non-protein coding RNA 1012 ncRNA 203-55 chr2 140585742 140586276 + 0.666667 NA TTS (NR_106979) TTS (NR_106979) 676 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 202-129 chr4 53057657 53058108 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 195565 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 179-86 chr6 63643867 63644177 + 0.666667 NA intron (NM_001290260, intron 1 of 3) intron (NM_001290260, intron 1 of 3) -2504 NM_015153 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 167-33 chr13 80764737 80765178 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -253434 NR_125770 103724386 Hs.539622 NR_125770 LINC00377 TCONS_00021861 long intergenic non-protein coding RNA 377 ncRNA 183.333-138 chr6 6385134 6385613 + 0.666667 NA intron (NR_026970, intron 4 of 7) MER3|DNA|hAT-Charlie -64682 NM_000129 2162 Hs.335513 NM_000129 ENSG00000124491 F13A1 F13A coagulation factor XIII A chain protein-coding 143.667-84 chr15 61658359 61658667 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -71405 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 141-89 chr8 68077144 68077487 + 0.666667 NA intron (NM_024870, intron 14 of 39) intron (NM_024870, intron 14 of 39) 125269 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 156.333-239 chr3 98494154 98494500 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3354 NM_001004737 402135 Hs.632558 NM_001004737 ENSG00000231861 OR5K2 OR3-9 olfactory receptor family 5 subfamily K member 2 protein-coding 130.333-133 chr3 100252076 100252328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8790 NM_018309 55773 Hs.477003 NM_018309 ENSG00000036054 TBC1D23 NS4ATP1|PCH11 TBC1 domain family member 23 protein-coding 139.667-126 chr3 171983137 171983487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56266 NM_022763 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 147.333-248 chr4 133069773 133070097 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 79181 NR_125885 101927359 Hs.649960 NR_125885 ENSG00000250241 LOC101927359 - uncharacterized LOC101927359 ncRNA 217.667-12 chr10 56373853 56374350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12828 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 175-42 chr2 38373504 38373991 + 0.666667 NA intron (NM_001330462, intron 1 of 13) intron (NM_001330462, intron 1 of 13) 2783 NM_001330459 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 160.333-39 chr10 32274966 32275296 + 0.666667 NA intron (NM_001272004, intron 10 of 13) intron (NM_001272004, intron 10 of 13) 72027 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 121.667-22 chr10 58917823 58918038 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -81588 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 261.333-28 chr14 75537079 75537720 + 0.666667 NA intron (NM_006399, intron 2 of 2) intron (NM_006399, intron 2 of 2) 14930 NM_006399 10538 Hs.509964 NM_006399 ENSG00000156127 BATF B-ATF|BATF1|SFA-2|SFA2 basic leucine zipper ATF-like transcription factor protein-coding 217-52 chr2 236280996 236281429 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -16867 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 123-111 chr6 151860713 151861038 + 0.666667 NA intron (NM_001291230, intron 3 of 8) intron (NM_001291230, intron 3 of 8) 51768 NM_001328100 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 196-34 chr12 32706395 32706948 + 0.666667 NA intron (NM_001330380, intron 3 of 18) intron (NM_001330380, intron 3 of 18) 27370 NM_012062 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 113.667-171 chr5 65655093 65655402 + 0.666667 NA intron (NM_001365342, intron 6 of 10) intron (NM_001365342, intron 6 of 10) 30220 NM_001365341 112441434 NM_001365341 SHLD3 CTC-534A2.2|RINN1 shieldin complex subunit 3 protein-coding 125.667-95 chr2 52384456 52384706 + 0.666667 NA intron (NR_135239, intron 2 of 2) intron (NR_135239, intron 2 of 2) 13933 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 170.667-17 chr10 37552339 37552744 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 50390 NM_001190489 100288485 Hs.727092 NM_001190489 ENSG00000256892 MTRNR2L7 HN7 MT-RNR2 like 7 protein-coding 149.667-262 chr3 104458899 104459206 + 0.666667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -907661 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 147.333-288 chr7 9741798 9742137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107697 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 123-137 chrX 47090318 47090601 + 0.666667 NA intron (NM_001282848, intron 5 of 7) intron (NM_001282848, intron 5 of 7) 12016 NM_152869 9104 Hs.77854 NM_004683 ENSG00000130988 RGN GNL|HEL-S-41|RC|SMP30 regucalcin protein-coding 131.333-54 chr14 61336328 61336646 + 0.666667 NA intron (NM_006255, intron 1 of 13) intron (NM_006255, intron 1 of 13) 15044 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 138.333-33 chr10 84242068 84242356 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_015613) promoter-TSS (NM_015613) -666 NM_015613 26103 Hs.226000 NM_015613 ENSG00000148602 LRIT1 FIGLER9|LRRC21|PAL leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 1 protein-coding 161.667-146 chr2 204526594 204526920 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -18718 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 129.333-73 chr16 20667655 20667881 + 0.666667 NA intron (NM_001318890, intron 6 of 13) L1PA16|LINE|L1 23488 NM_052956 116285 Hs.306812 NM_052956 ENSG00000166743 ACSM1 BUCS1|MACS1 acyl-CoA synthetase medium chain family member 1 protein-coding 123.333-12 chr1 109017255 109017459 + 0.666667 NA intron (NM_014969, intron 3 of 14) AluJb|SINE|Alu 24871 NM_014969 22911 Hs.570055 NM_014969 ENSG00000085433 WDR47 - WD repeat domain 47 protein-coding 127.333-150 chr5 157558234 157558516 + 0.666667 NA intron (NM_033274, intron 3 of 22) intron (NM_033274, intron 3 of 22) 17400 NM_033274 8728 Hs.483944 NM_023038 ENSG00000135074 ADAM19 FKSG34|MADDAM|MLTNB ADAM metallopeptidase domain 19 protein-coding 195.333-162 chr4 95406930 95407423 + 0.666667 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 141797 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 148-17 chr10 55330048 55330341 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -268848 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 155.667-362 chr8 103455583 103455914 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 40362 NM_015420 25879 Hs.532265 NM_015420 ENSG00000164934 DCAF13 GM83|HSPC064|Sof1|WDSOF1 DDB1 and CUL4 associated factor 13 protein-coding 193.666-39 chr5 71949727 71950294 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -157465 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 237.333-137 chrX 25096612 25097161 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -80921 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 123-38 chr14 60817137 60817357 + 0.666667 NA intron (NM_001177963, intron 5 of 6) intron (NM_001177963, intron 5 of 6) 82486 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 175.667-56 chr17 62600486 62600867 + 0.666667 NA exon (NM_001284333, exon 19 of 23) exon (NM_001284333, exon 19 of 23) -26994 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 152-45 chr12 80138371 80138677 + 0.666667 NA intron (NM_001368062, intron 5 of 62) intron (NM_001368062, intron 5 of 62) 38987 NM_001368062 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 130-56 chr2 103941177 103941426 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 467031 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 189.667-99 chr3 111887210 111887624 + 0.666667 NA intron (NM_001134437, intron 3 of 17) LTR37-int|LTR|ERV1 27590 NM_001134439 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 203-19 chr11 72441298 72441742 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -6836 NM_001258394 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 181-52 chr3 114337495 114337863 + 0.666667 NA non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) non-coding (NR_121662, exon 7 of 7) -14132 NR_038993 100131117 Hs.122417 NR_038993 ENSG00000241560 ZBTB20-AS1 - ZBTB20 antisense RNA 1 ncRNA 206-3 chr1 40668855 40669424 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3457 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 142-77 chr21 26360942 26361350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32489 NR_135516 100996571 Hs.570432 NR_135515 ENSG00000197934 CYYR1-AS1 - cysteine and tyrosine rich 1 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-124 chr14 73911805 73912135 + 0.666667 NA intron (NR_040251, intron 8 of 11) L1MC5a|LINE|L1 25111 NM_001242927 57862 Hs.270869 NM_021188 ENSG00000119725 ZNF410 APA-1|APA1 zinc finger protein 410 protein-coding 115.333-223 chr8 121003832 121004016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -191878 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 117.333-40 chr11 104279750 104279951 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -115703 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 152.667-359 chr8 31305371 31305679 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -272169 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 160-10 chr1 171679283 171679758 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26832 NM_000261 4653 Hs.436037 NM_000261 ENSG00000034971 MYOC GLC1A|GPOA|JOAG|JOAG1|TIGR myocilin protein-coding 149-115 chr5 80674020 80674300 + 0.666667 NA intron (NM_002439, intron 6 of 23) intron (NM_002439, intron 6 of 23) -19177 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 161.333-23 chr1 241276322 241276724 + 0.666667 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) intron (NM_001282778, intron 2 of 16) 79303 NM_001350116 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 153-123 chr6 163827658 163828097 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -156393 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 135.667-21 chr10 83679434 83679714 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2485 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 138.667-83 chr17 70561152 70561413 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 391747 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 249.667-59 chr3 9541348 9541828 + 0.666667 NA intron (NM_198560, intron 2 of 3) AluSx|SINE|Alu 12234 NM_198560 375323 Hs.56782 NM_198560 ENSG00000156959 LHFPL4 GARLH4 LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein-coding 182.333-45 chr14 65138656 65139150 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -36208 NR_073137 4149 Hs.285354 NM_002382 ENSG00000125952 MAX bHLHd4 MYC associated factor X protein-coding 168.667-67 chr15 61798695 61799148 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69003 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 158.333-104 chr15 93865160 93865601 + 0.666667 NA non-coding (NR_120321, exon 2 of 4) non-coding (NR_120321, exon 2 of 4) 8820 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 142.667-59 chr14 91454007 91454369 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36368 NM_001080414 440193 Hs.525536 NM_001080414 ENSG00000015133 CCDC88C DAPLE|HKRP2|HYC1|KIAA1509|SCA40 coiled-coil domain containing 88C protein-coding 145-117 chr8 58389426 58389785 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -21659 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 140-56 chr2 32435310 32435713 + 0.666667 NA exon (NM_016252, exon 14 of 74) exon (NM_016252, exon 14 of 74) 78483 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 151-34 chr13 114309242 114309546 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5109 NM_001164145 283489 Hs.7542 NM_032436 ENSG00000198824 CHAMP1 C13orf8|CAMP|CHAMP|MRD40|ZNF828 chromosome alignment maintaining phosphoprotein 1 protein-coding 144-25 chr11 43045231 43045621 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 223943 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 151.667-323 chr6 132095027 132095307 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20096 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 129-19 chr10 97183599 97183943 + 0.666667 NA intron (NR_037909, intron 11 of 14) intron (NR_037909, intron 11 of 14) 2188 NM_003061 6585 Hs.632082 NM_003061 ENSG00000187122 SLIT1 MEGF4|SLIL1|SLIT-1|SLIT3 slit guidance ligand 1 protein-coding 140.333-133 chr22 34457230 34457501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -534477 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 152.667-135 chr16 66633174 66633602 + 0.666667 NA intron (NM_181521, intron 2 of 3) intron (NM_181521, intron 2 of 3) 28657 NR_037619 123920 Hs.298198 NM_144601 ENSG00000140931 CMTM3 BNAS2|CKLFSF3 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3 protein-coding 166.333-217 chr8 21562581 21563038 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 226066 NM_001165038 2675 Hs.441202 NM_001495 ENSG00000168546 GFRA2 GDNFRB|NRTNR-ALPHA|NTNRA|RETL2|TRNR2 GDNF family receptor alpha 2 protein-coding 124.333-71 chr18 46496582 46496940 + 0.666667 NA intron (NM_001145472, intron 19 of 23) AluSz|SINE|Alu 22325 NM_001173129 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 117.333-12 chr1 151319760 151320011 + 0.666667 NA intron (NM_001369626, intron 1 of 12) intron (NM_001369626, intron 1 of 12) 7531 NM_001330721 5298 Hs.632465 NM_002651 ENSG00000143393 PI4KB NPIK|PI4K-BETA|PI4K92|PI4KBETA|PI4KIIIBETA|PIK4CB phosphatidylinositol 4-kinase beta protein-coding 221.333-137 chr8 70486348 70486854 + 0.666667 NA TTS (NR_110653) TTS (NR_110653) 15467 NR_110653 101926892 Hs.367827 NR_110653 ENSG00000253967 LOC101926892 - uncharacterized LOC101926892 ncRNA 150.333-367 chr6 114193409 114193771 + 0.666667 NA intron (NR_125845, intron 8 of 9) MIR|SINE|MIR -130713 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 160-47 chr15 88751200 88751607 + 0.666667 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -52033 NM_001369268 176 Hs.2159 NM_001135 ENSG00000157766 ACAN AGC1|AGCAN|CSPG1|CSPGCP|MSK16|SEDK|SSOAOD aggrecan protein-coding 164.333-103 chr18 65722049 65722391 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -28032 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 131.667-56 chr14 59584132 59584458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7483 NM_001164399 729665 NM_001164399 ENSG00000151838 CCDC175 C14orf38|c14_5395 coiled-coil domain containing 175 protein-coding 256.333-13 chr10 58123930 58124398 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 143730 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 155.667-237 chr3 185979888 185980188 + 0.666667 NA non-coding (NR_151491, exon 4 of 4) non-coding (NR_151491, exon 4 of 4) 20095 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 181-29 chr15 62127369 62127871 + 0.666667 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 37665 NM_001007595 388125 Hs.144372 NM_001007595 ENSG00000205502 C2CD4B FAM148B|NLF2 C2 calcium dependent domain containing 4B protein-coding 139.667-61 chr15 71903641 71904041 + 0.666667 NA intron (NM_006901, intron 21 of 41) intron (NM_006901, intron 21 of 41) 93287 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 117.667-3 chr1 73506502 73506695 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -168081 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 218.667-116 chrX 46634502 46635010 + 0.666667 NA intron (NM_001257291, intron 13 of 16) intron (NM_001257291, intron 13 of 16) 60991 NM_019886 56548 Hs.129955 NM_019886 ENSG00000147119 CHST7 C6ST-2|GST-5 carbohydrate sulfotransferase 7 protein-coding 152.333-216 chr21 29804700 29805049 + 0.666667 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) MIR|SINE|MIR 56699 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-46 chr13 74175132 74175402 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -41338 NM_007249 11278 Hs.373857 NM_007249 ENSG00000118922 KLF12 AP-2rep|AP2REP|HSPC122 Kruppel like factor 12 protein-coding 189.667-130 chr7 4034340 4034874 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 17 of 44) L1MC5a|LINE|L1 -95078 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 143.667-171 chr3 150367732 150368036 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -40414 NM_001303264 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 129-84 chr3 32825215 32825465 + 0.666667 NA intron (NM_001039111, intron 1 of 3) intron (NM_001039111, intron 1 of 3) 7343 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 153-81 chr20 16427548 16427853 + 0.666667 NA intron (NM_001199866, intron 14 of 22) intron (NM_001199866, intron 14 of 22) 145748 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 125.667-130 chr4 39300333 39300524 + 0.666667 NA intron (NM_001204747, intron 19 of 24) intron (NM_001204747, intron 19 of 24) 65934 NM_001204747 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 126-29 chr14 22549373 22549675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7538 NR_146543 105370400 NR_146543 ENSG00000259054 LINC02332 - long intergenic non-protein coding RNA 2332 ncRNA 159-126 chrX 84755993 84756380 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -177965 NR_024062 100131816 Hs.460809 NM_178567 ENSG00000229547 UBE2DNL - ubiquitin conjugating enzyme E2 D N-terminal like (pseudogene) pseudo 116-49 chr15 48695610 48695795 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49914 NM_000138 2200 Hs.591133 NM_000138 ENSG00000166147 FBN1 ACMICD|ECTOL1|FBN|GPHYSD2|MASS|MFLS|MFS1|OCTD|SGS|SSKS|WMS|WMS2 fibrillin 1 protein-coding 216-118 chr7 93193526 93194158 + 0.666667 NA intron (NM_001346642, intron 8 of 9) intron (NM_001346642, intron 8 of 9) 25729 NM_001288810 253012 Hs.443169 NM_198151 ENSG00000188175 HEPACAM2 MIKI HEPACAM family member 2 protein-coding 176.667-79 chr2 158601646 158602070 + 0.666667 NA intron (NM_001005476, intron 3 of 20) intron (NM_001005476, intron 3 of 20) 133144 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 122-108 chr6 145256827 145257078 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 429925 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 185.667-57 chr18 55134551 55135009 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10474 NR_110743 101927229 Hs.638474 NR_110743 ENSG00000267013 LINC01929 - long intergenic non-protein coding RNA 1929 ncRNA 155.667-380 chr9 26899475 26899906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6862 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 162-77 chr22 24951707 24952088 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5202 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 221.667-33 chr15 50342222 50342739 + 0.666667 NA intron (NM_016654, intron 1 of 8) intron (NM_016654, intron 1 of 8) -11694 NR_024490 100129387 Hs.659360 NR_024490 GABPB1-AS1 - GABPB1 antisense RNA 1 ncRNA 126-74 chr3 114312536 114312803 + 0.666667 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 3900 NR_030293 693153 NR_030293 ENSG00000284134 MIR568 MIRN568|hsa-mir-568 microRNA 568 ncRNA 118.333-86 chr18 1128385 1128613 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -200506 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 162.333-240 chr7 98683250 98683732 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 66206 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 145-124 chr8 129818218 129818590 + 0.666667 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -31780 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 204-204 chr9 12616436 12616876 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76729 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 204.333-186 chr7 55351333 55351827 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -13868 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 124-13 chr1 197681413 197681690 + 0.666667 NA intron (NR_125340, intron 3 of 19) intron (NR_125340, intron 3 of 19) 93929 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 113.667-150 chr3 183673038 183673255 + 0.666667 NA intron (NM_001349426, intron 6 of 6) AluSz|SINE|Alu -24651 NM_001351371 55689 Hs.632575 NM_018023 ENSG00000163872 YEATS2 - YEATS domain containing 2 protein-coding 117-62 chr17 71532751 71532964 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -330678 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 150.667-281 chr4 139472222 139472522 + 0.666667 NA intron (NM_031296, intron 1 of 1) intron (NM_031296, intron 1 of 1) 18251 NM_031296 83452 Hs.591679 NM_031296 ENSG00000172007 RAB33B SMC2 RAB33B, member RAS oncogene family protein-coding 168.333-189 chr7 20282289 20282650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14239 NR_110117 101927769 Hs.256080 NR_110117 ENSG00000226097 LOC101927769 - uncharacterized LOC101927769 ncRNA 169.333-88 chr16 11704473 11704835 + 0.666667 NA intron (NM_001303447, intron 5 of 12) L1MC4a|LINE|L1 36199 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 147-101 chr4 62752389 62752684 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -590771 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 144-113 chr3 110545743 110546016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 524080 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 113-79 chr16 69526977 69527314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38723 NR_031719 100302119 NR_031719 ENSG00000223109 MIR1538 MIRN1538|hsa-mir-1538 microRNA 1538 ncRNA 113.333-84 chr15 60892837 60893076 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 211387 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 159.333-59 chr11 35969918 35970249 + 0.666667 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 26021 NM_174902 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 113.667-229 chr9 94516658 94516934 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -38249 NR_121569 101928099 Hs.674409 NR_121566 PCAT7 PCAN-R2 prostate cancer associated transcript 7 ncRNA 133-64 chr3 134409385 134409725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28272 NR_039951 100616281 NR_039951 ENSG00000284561 MIR4788 - microRNA 4788 ncRNA 190.667-76 chr21 19452710 19453111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 446845 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 195-48 chr17 26647068 26647504 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 441955 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 141.333-252 chr9 20413529 20413806 + 0.666667 NA intron (NM_001286691, intron 5 of 10) intron (NM_001286691, intron 5 of 10) -2429 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 164.333-61 chr12 126569399 126569746 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -120245 NR_147498 283435 Hs.667334 NR_147498 LINC02825 - long intergenic non-protein coding RNA 2825 ncRNA 219.333-72 chr17 6632983 6633424 + 0.666667 NA intron (NR_147088, intron 2 of 17) L1MC4|LINE|L1 7508 NM_001351225 9851 Hs.28070 NM_014804 ENSG00000198920 KIAA0753 MNR|OFIP KIAA0753 protein-coding 186.333-132 chr5 133224082 133224578 + 0.666667 NA intron (NM_015082, intron 10 of 15) intron (NM_015082, intron 10 of 15) 172317 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 122.667-25 chr11 29993429 29993786 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -11214 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 350.333-17 chr3 175191513 175192296 + 0.666667 NA intron (NM_207015, intron 2 of 13) intron (NM_207015, intron 2 of 13) -76662 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 226.333-96 chr5 9505373 9505898 + 0.666667 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -5698 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 113.667-215 chr8 128475713 128476006 + 0.666667 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 88820 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 155.333-223 chr3 28446754 28447061 + 0.666667 NA intron (NM_001324170, intron 3 of 6) L1MB3|LINE|L1 97758 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 123.333-85 chr16 6258679 6258969 + 0.666667 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) L1MA2|LINE|L1 239121 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 231.667-2 chr1 49031416 49031913 + 0.666667 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) L1M4|LINE|L1 -225747 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 116-47 chr14 103474589 103474797 + 0.666667 NA intron (NM_001128920, intron 12 of 15) intron (NM_001128920, intron 12 of 15) 48137 NM_001823 1152 Hs.173724 NM_001823 ENSG00000166165 CKB B-CK|BCK|CKBB|CPK-B|HEL-211|HEL-S-29 creatine kinase B protein-coding 138-65 chr20 1261727 1261991 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -4435 NM_001318234 9751 Hs.323833 NM_014723 ENSG00000101298 SNPH - syntaphilin protein-coding 135.667-66 chr15 96395879 96396249 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62299 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 133.333-165 chr6 137672843 137673095 + 0.666667 NA intron (NR_125867, intron 2 of 3) Zaphod|DNA|hAT-Tip100 7323 NR_125867 102723649 Hs.129235 NR_125867 LOC102723649 - uncharacterized LOC102723649 ncRNA 145-5 chr1 117887543 117887820 + 0.666667 NA intron (NM_001135589, intron 9 of 12) intron (NM_001135589, intron 9 of 12) 41940 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 120.667-74 chr17 65360195 65360408 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -97240 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 127.333-35 chr12 10734654 10734921 + 0.666667 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy -11464 NM_001145426 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 136-36 chr15 76437348 76437678 + 0.666667 NA intron (NR_148227, intron 25 of 32) intron (NR_148227, intron 25 of 32) 100740 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 209 chr1 32574585 32575078 + 0.666667 NA intron (NR_111980, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 35404 NR_111980 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 164.333-52 chr12 24903740 24904068 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001178093) promoter-TSS (NM_001178093) -837 NM_001178093 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 170.667-175 chr9 94806402 94806758 + 0.666667 NA intron (NM_032823, intron 5 of 14) intron (NM_032823, intron 5 of 14) -3382 NR_031755 100313780 NR_031755 ENSG00000252153 MIR2278 mir-2278 microRNA 2278 ncRNA 277.333-67 chr4 111161872 111162676 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -301627 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 138-128 chr9 84815667 84815934 + 0.666667 NA TTS (NM_001369552) TTS (NM_001369552) 109899 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 158.333-191 chr3 4996703 4997164 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16972 NR_037903 100507582 Hs.434505 NR_037903 ENSG00000235831 BHLHE40-AS1 - BHLHE40 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-272 chr7 94626977 94627254 + 0.666667 NA intron (NM_001346717, intron 3 of 9) intron (NM_001346717, intron 3 of 9) 29018 NM_001362808 8910 Hs.371199 NM_003919 ENSG00000127990 SGCE DYT11|ESG|epsilon-SG sarcoglycan epsilon protein-coding 132.667-48 chr14 48136518 48136856 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -341673 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 124.333-186 chr9 33896744 33896957 + 0.666667 NA intron (NM_017811, intron 2 of 4) L1MB5|LINE|L1 37514 NM_001282530 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 127.667-59 chr17 39485561 39485855 + 0.666667 NA intron (NM_015083, intron 2 of 13) AluSc|SINE|Alu 24222 NM_016507 51755 Hs.345028 NM_015083 ENSG00000167258 CDK12 CRK7|CRKR|CRKRS cyclin dependent kinase 12 protein-coding 140-5 chr1 74908879 74909165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -175614 NM_001130043 1429 Hs.83114 NM_001889 ENSG00000116791 CRYZ - crystallin zeta protein-coding 127.333-104 chr3 28947205 28947491 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 333591 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 123.333-70 chr13 103062605 103062935 + 0.666667 NA intron (NM_000452, intron 1 of 5) intron (NM_000452, intron 1 of 5) 3647 NM_000452 6555 Hs.194783 NM_000452 ENSG00000125255 SLC10A2 ASBT|IBAT|ISBT|NTCP2|PBAM solute carrier family 10 member 2 protein-coding 120-4 chr1 116847462 116847798 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62286 NM_020440 5738 Hs.418093 NM_020440 ENSG00000134247 PTGFRN CD315|CD9P-1|EWI-F|FPRP|SMAP-6 prostaglandin F2 receptor inhibitor protein-coding 210.333-96 chr3 32076465 32077070 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -29744 NM_015141 23171 Hs.82432 NM_015141 ENSG00000152642 GPD1L GPD1-L glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like protein-coding 156-3 chr1 43769213 43769571 + 0.666667 NA intron (NM_001270465, intron 2 of 7) L1M5|LINE|L1 -42049 NR_125986 101929592 NR_125986 ENSG00000229444 LOC101929592 - uncharacterized LOC101929592 ncRNA 156.667-35 chr1 215647748 215648055 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 66 of 71) intron (NM_206933, intron 66 of 71) 80597 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 130.667-6 chr1 66810910 66811226 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR1d|LTR|Gypsy -9809 NM_005478 10022 Hs.251380 NM_005478 ENSG00000172410 INSL5 PRO182|UNQ156 insulin like 5 protein-coding 225-59 chr7 87834298 87834887 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_018843, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_018843, exon 12 of 12) 41768 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 118.333-151 chr4 63793847 63794152 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 615451 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 183-100 chr8 126173202 126173598 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -152095 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 133-66 chr4 2416527 2416738 + 0.666667 NA intron (NM_020972, intron 1 of 12) CpG 2013 NM_001172656 57732 Hs.292056 NM_020972 ENSG00000159733 ZFYVE28 LST2|LYST2 zinc finger FYVE-type containing 28 protein-coding 228.333-27 chr14 53920865 53921400 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27352 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 204.333-189 chr7 86682390 86682829 + 0.666667 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 38695 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 161-61 chr3 133362837 133363189 + 0.666667 NA intron (NM_001282865, intron 2 of 3) intron (NM_001282865, intron 2 of 3) -37043 NM_003571 8419 Hs.659862 NM_003571 ENSG00000170819 BFSP2 CP47|CP49|CTRCT12|LIFL-L|PHAKOSIN beaded filament structural protein 2 protein-coding 155-26 chr12 112779918 112780211 + 0.666667 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -11474 NM_001347953 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 121-34 chr12 43511863 43512154 + 0.666667 NA intron (NM_025003, intron 3 of 38) intron (NM_025003, intron 3 of 38) 40195 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 179-75 chr5 10703124 10703490 + 0.666667 NA intron (NM_004394, intron 2 of 3) intron (NM_004394, intron 2 of 3) 57927 NM_004394 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 189-8 chr10 20804442 20804843 + 0.666667 NA intron (NM_001173484, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 92960 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 176.333-42 chr13 22356740 22357206 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 146688 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 160.667-223 chr4 67920603 67921021 + 0.666667 NA intron (NM_001114387, intron 7 of 9) L1PA12|LINE|L1 -36810 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 178.333-69 chr19 30274964 30275313 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -97246 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 192.667-133 chr4 164738327 164738864 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -15536 NM_001352885 100505989 Hs.328236 NM_001352885 ENSG00000248771 SMIM31 LINC01207 small integral membrane protein 31 protein-coding 215.333-178 chr6 145478479 145478978 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 208149 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 114.333-108 chr2 105013852 105014083 + 0.666667 NA intron (NR_110603, intron 1 of 2) L1PB1|LINE|L1 -24102 NM_182640 64965 Hs.590900 NM_182640 ENSG00000135972 MRPS9 MRP-S9|RPMS9|S9mt mitochondrial ribosomal protein S9 protein-coding 134-7 chr1 154662678 154662969 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34826 NM_001365045 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 172-45 chr14 84097305 84097653 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1174453 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 150-13 chr10 54501471 54501788 + 0.666667 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) intron (NR_134503, intron 1 of 5) 15399 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 187-77 chr6 157912845 157913255 + 0.666667 NA intron (NM_016224, intron 9 of 17) intron (NM_016224, intron 9 of 17) -68813 NM_003898 8871 Hs.434494 NM_003898 ENSG00000078269 SYNJ2 INPP5H synaptojanin 2 protein-coding 157-76 chr2 211884916 211885225 + 0.666667 NA intron (NM_001042599, intron 3 of 26) intron (NM_001042599, intron 3 of 26) 541290 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 251-27 chr16 51198268 51198828 + 0.666667 NA intron (NR_039672, intron 5 of 6) (TTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -47276 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 183.667-157 chrX 152334234 152334728 + 0.666667 NA intron (NM_000808, intron 3 of 9) L1M4|LINE|L1 57818 NR_029521 406897 NR_029521 ENSG00000207957 MIR105-1 MIRN105-1|mir-105-1 microRNA 105-1 ncRNA 229.333-72 chr22 21040656 21041127 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 3358 NR_002829 440799 Hs.640665 NR_002829 P2RX6P - purinergic receptor P2X 6 pseudogene pseudo 136-106 chr8 135865348 135865666 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 408051 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 127.667-153 chr6 138358927 138359158 + 0.666667 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -18601 NM_001368163 110806279 NM_001368163 ENSG00000262543 SMIM28 - small integral membrane protein 28 protein-coding 130-96 chr5 104092820 104093084 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -530163 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 149.667-329 chr5 117704781 117705131 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25405 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 112.667-6 chr1 94408709 94408935 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -9555 NM_001122674 5825 Hs.700576 NM_002858 ENSG00000117528 ABCD3 ABC43|CBAS5|PMP70|PXMP1|ZWS2 ATP binding cassette subfamily D member 3 protein-coding 220.667-93 chr6 129496400 129496872 + 0.666667 NA intron (NM_000426, intron 58 of 64) intron (NM_000426, intron 58 of 64) 213541 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 175.333-12 chr10 13091153 13091579 + 0.666667 NA intron (NM_001282658, intron 3 of 6) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 8623 NM_001282658 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 160-39 chr14 49624968 49625293 + 0.666667 NA TTS (NM_018139) TTS (NM_018139) 4331 NM_002408 4247 Hs.93338 NM_002408 ENSG00000168282 MGAT2 CDG2A|CDGS2|GLCNACTII|GNT-II|GNT2 mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 112.333-43 chr11 109434798 109435077 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12747 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 168.667-61 chr14 62357418 62357772 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -217622 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 260.333-16 chr13 105400843 105401442 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64725 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 156.667-313 chr7 24973153 24973457 + 0.666667 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) 6873 NM_015550 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 186-68 chr3 134189979 134190407 + 0.666667 NA intron (NM_001005861, intron 8 of 14) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 60551 NM_002958 6259 Hs.654562 NM_002958 ENSG00000163785 RYK D3S3195|JTK5|JTK5A|RYK1 receptor like tyrosine kinase protein-coding 201.333-236 chr6 38788974 38789437 + 0.666667 NA intron (NM_001371, intron 17 of 91) intron (NM_001371, intron 17 of 91) 73894 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 214.333-7 chr1 113405561 113406105 + 0.666667 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 15318 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 179-31 chr15 57107007 57107396 + 0.666667 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) L1MC1|LINE|L1 -112229 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 135.333-5 chr1 63176378 63176618 + 0.666667 NA intron (NR_038252, intron 6 of 11) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 140759 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 113-172 chr5 100457118 100457308 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68959 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 227.667-26 chr16 72569251 72569777 + 0.666667 NA intron (NR_159370, intron 2 of 5) intron (NR_159370, intron 2 of 5) 95456 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 119.333-169 chr5 32484598 32484842 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -39980 NM_016107 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 126.667-131 chr4 180601439 180601727 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 557566 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 141-55 chr3 151838656 151838868 + 0.666667 NA intron (NR_110203, intron 1 of 2) AluSc8|SINE|Alu 24646 NM_001086 13 Hs.506908 NM_001086 ENSG00000114771 AADAC CES5A1|DAC arylacetamide deacetylase protein-coding 152.667-63 chr11 82138604 82138999 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L1PA17|LINE|L1 -247965 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 163.333-164 chr20 32680784 32681111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7006 NM_182584 284805 Hs.353262 NM_182584 ENSG00000198547 C20orf203 - chromosome 20 open reading frame 203 protein-coding 263.333-13 chr11 109208357 109208997 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -213513 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 159.667-226 chr4 33271301 33271627 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 768429 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 131.333-202 chrX 124621573 124621860 + 0.666667 NA intron (NM_014253, intron 11 of 30) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 275434 NM_002351 4068 Hs.349094 NM_002351 ENSG00000183918 SH2D1A DSHP|EBVS|IMD5|LYP|MTCP1|SAP|SAP/SH2D1A|XLP|XLPD|XLPD1 SH2 domain containing 1A protein-coding 119.333-45 chr11 9803310 9803491 + 0.666667 NA intron (NM_030962, intron 32 of 39) intron (NM_030962, intron 32 of 39) -35742 NR_120539 101928008 Hs.585524 NR_120539 ENSG00000255476 LOC101928008 - uncharacterized LOC101928008 ncRNA 133.333-56 chr14 77352934 77353226 + 0.666667 NA intron (NM_001346133, intron 1 of 5) intron (NM_001346133, intron 1 of 5) 20829 NM_001346134 283578 Hs.26403 NM_213601 ENSG00000100580 TMED8 FAM15B transmembrane p24 trafficking protein family member 8 protein-coding 144.333-181 chr4 17333892 17334302 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13215 NR_145770 109616994 NR_145770 ENSG00000206780 SNORA75B - small nucleolar RNA, H/ACA box 75B snoRNA 120.667-43 chr13 20908691 20909037 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -6090 NM_022459 64328 Hs.507452 NM_022459 ENSG00000132953 XPO4 exp4 exportin 4 protein-coding 113.333-15 chr1 162268993 162269326 + 0.666667 NA intron (NM_014697, intron 2 of 9) intron (NM_014697, intron 2 of 9) -73387 NR_030283 693141 NR_030283 ENSG00000207729 MIR556 MIRN556|hsa-mir-556|mir-556 microRNA 556 ncRNA 142.667-132 chr22 36021828 36022108 + 0.666667 NA intron (NM_001082578, intron 1 of 13) intron (NM_001082578, intron 1 of 13) 6569 NM_001349999 23543 Hs.282998 NM_014309 ENSG00000100320 RBFOX2 FOX2|Fox-2|HNRBP2|HRNBP2|RBM9|RTA|dJ106I20.3|fxh RNA binding fox-1 homolog 2 protein-coding 122.667-143 chr4 157795053 157795339 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 222706 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 130-76 chr3 56198326 56198561 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) L2|LINE|L2 270024 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 129.333-166 chr6 35161986 35162316 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20741 NM_001261821 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 185-16 chr12 85408932 85409320 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 128906 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 158-101 chr5 19811401 19811745 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 74699 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 184-37 chr16 52528218 52528635 + 0.666667 NA intron (NM_001146188, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 18717 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 147.333-4 chr1 36370160 36370456 + 0.666667 NA intron (NM_032017, intron 1 of 11) intron (NM_032017, intron 1 of 11) 15616 NM_001282546 83931 Hs.471768 NM_032017 ENSG00000196182 STK40 SHIK|SgK495 serine/threonine kinase 40 protein-coding 153-39 chr13 43479003 43479282 + 0.666667 NA intron (NM_001347968, intron 3 of 17) (AGGCAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 30290 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 195-28 chr11 119773175 119773524 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43766 NR_120587 102724301 Hs.637640 NR_120587 ENSG00000254854 LOC102724301 - uncharacterized LOC102724301 ncRNA 154.333-304 chr6 122393149 122393440 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -6257 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 220-33 chr13 33683838 33684348 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7299 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 123.667-169 chr6 140612691 140612956 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -70991 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 146-146 chr9 3278390 3278745 + 0.666667 NA intron (NM_134428, intron 8 of 17) intron (NM_134428, intron 8 of 17) 96978 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 119-107 chr3 117122525 117122846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 201254 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 115-15 chr1 171023202 171023430 + 0.666667 NA intron (NM_001163629, intron 17 of 21) intron (NM_001163629, intron 17 of 21) -67589 NM_001319173 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 122-104 chr6 38946478 38946661 + 0.666667 NA intron (NM_001371, intron 79 of 91) AluSx3|SINE|Alu 6538 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 146.333-210 chr3 96477836 96478133 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 118020 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 248.667-91 chr6 73731016 73731663 + 0.666667 NA intron (NM_001159587, intron 4 of 32) L2a|LINE|L2 35136 NM_133493 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 206.667-74 chr20 24255011 24255474 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55475 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 147.667-132 chr17 12871640 12871955 + 0.666667 NA intron (NM_001321164, intron 1 of 20) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 45545 NR_039747 100616494 NR_039747 ENSG00000265503 MIR1269B - microRNA 1269b ncRNA 156.667-329 chr8 26716609 26716949 + 0.666667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 138374 NM_001244604 1808 Hs.593187 NM_001386 ENSG00000092964 DPYSL2 CRMP-2|CRMP2|DHPRP2|DRP-2|DRP2|N2A3|ULIP-2|ULIP2 dihydropyrimidinase like 2 protein-coding 125.333-150 chr5 180068666 180068901 + 0.666667 NA intron (NM_001280801, intron 1 of 7) intron (NM_001280801, intron 1 of 7) 2976 NM_018434 55819 Hs.484363 NM_018434 ENSG00000113269 RNF130 G1RZFP|GOLIATH|GP ring finger protein 130 protein-coding 150-146 chr8 122584441 122584878 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16015 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 247.666-2 chr10 19916171 19916877 + 0.666667 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 100092 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 167-91 chr7 10777407 10777709 + 0.666667 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) L1PA5|LINE|L1 2386 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 135-22 chr12 110913818 110914067 + 0.666667 NA intron (NM_000432, intron 4 of 6) AluSz|SINE|Alu 6658 NM_000432 4633 Hs.75535 NM_000432 ENSG00000111245 MYL2 CMH10|MLC-2s/v|MLC2 myosin light chain 2 protein-coding 167-8 chr10 13511460 13511800 + 0.666667 NA intron (NM_001370075, intron 1 of 8) intron (NM_001370075, intron 1 of 8) -8654 NM_001100912 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 141-5 chr1 113152140 113152522 + 0.666667 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu 53922 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 112.667-269 chr8 121747213 121747539 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -105936 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 196.333-84 chr2 47549693 47550187 + 0.666667 NA intron (NM_022055, intron 1 of 1) AluSg4|SINE|Alu 20391 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 156.333-199 chr2 211666096 211666414 + 0.666667 NA intron (NM_001042599, intron 14 of 26) intron (NM_001042599, intron 14 of 26) 760105 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 147.333-6 chr1 40187485 40187830 + 0.666667 NA intron (NM_012421, intron 1 of 7) intron (NM_012421, intron 1 of 7) 26270 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 125-78 chr3 169017271 169017559 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 115470 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 152.667-265 chr4 31552086 31552483 + 0.666667 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) MER58B|DNA|hAT-Charlie 45740 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 115.333-226 chr8 137545976 137546221 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132510 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 189.667-52 chr15 79302733 79303194 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -8099 NM_001363735 23423 Hs.71608 NM_007364 ENSG00000166557 TMED3 C15orf22|P24B|p24g4|p24gamma4|p26 transmembrane p24 trafficking protein 3 protein-coding 112.667-133 chr2 148777881 148778082 + 0.666667 NA intron (NM_015630, intron 10 of 13) L3b|LINE|CR1 -97246 NM_004522 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 168.667-195 chr7 15163914 15164303 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -189250 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 150.667-364 chr8 39379692 39380036 + 0.666667 NA intron (NR_001448, intron 9 of 14) intron (NR_001448, intron 9 of 14) 65201 NR_001448 255926 Hs.369765 NM_001040073 ENSG00000196115 ADAM5 ADAM5P|TMDCII ADAM metallopeptidase domain 5 (pseudogene) pseudo 132.667-130 chr4 89916199 89916429 + 0.666667 NA intron (NM_001371403, intron 4 of 8) intron (NM_001371403, intron 4 of 8) 21460 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 142-107 chr4 90282817 90283127 + 0.666667 NA intron (NM_207491, intron 1 of 7) Eulor2A|DNA?|DNA? 47941 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 126-100 chr6 64388034 64388273 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 29 of 43) intron (NM_001292009, intron 29 of 43) 581317 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 325.667-19 chr4 55605930 55606552 + 0.666667 NA intron (NR_120489, intron 5 of 8) intron (NR_120489, intron 5 of 8) -13996 NM_152401 132954 Hs.223712 NM_152401 ENSG00000163440 PDCL2 GCPHLP phosducin like 2 protein-coding 148.333-305 chr5 30180090 30180390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 299680 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 209.333-233 chr8 79644159 79644618 + 0.666667 NA intron (NM_007029, intron 3 of 4) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 33271 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 140-26 chr11 109654624 109654958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 232601 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 189-12 chr11 4423532 4424024 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25517 NM_001005172 119774 Hs.553568 NM_001005172 ENSG00000181963 OR52K2 OR11-7 olfactory receptor family 52 subfamily K member 2 protein-coding 112-156 chr4 87262682 87262910 + 0.666667 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 37787 NR_049891 100847027 NR_049891 ENSG00000263981 MIR5705 - microRNA 5705 ncRNA 148.333-127 chr14 68728405 68728800 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 65312 NM_001244698 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 186-48 chr2 120506826 120507328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40728 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 156-130 chr7 14378867 14379270 + 0.666667 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -387643 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 226.667-87 chr7 67383664 67384176 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 47944 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 191.667-38 chr12 28471251 28471703 + 0.666667 NA intron (NM_001352082, intron 12 of 13) HAL1|LINE|L1 -280739 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 154.667-44 chr10 59507969 59508361 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -144984 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 128-10 chr10 85465898 85466114 + 0.666667 NA intron (NR_120671, intron 4 of 5) L1M1|LINE|L1 16414 NR_120671 101929684 Hs.554059 NR_120671 ENSG00000230962 LINC01520 - long intergenic non-protein coding RNA 1520 ncRNA 140.667-206 chr6 162525069 162525416 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) MIRc|SINE|MIR -201890 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 122-90 chr4 166425819 166426152 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 552748 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 204-45 chr12 7348882 7349348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44783 NM_001080454 341392 Hs.450804 NM_001080454 ENSG00000215009 ACSM4 - acyl-CoA synthetase medium chain family member 4 protein-coding 115-22 chr10 7502525 7502863 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91208 NM_001029880 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 192.333-136 chr5 15502838 15503352 + 0.666667 NA intron (NM_001278317, intron 1 of 3) MER57A1|LTR|ERV1 1657 NM_001278317 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 127.333-98 chr21 32380815 32381051 + 0.666667 NA intron (NM_014825, intron 4 of 38) intron (NM_014825, intron 4 of 38) -3611 NR_002996 677846 Hs.712293 NR_002996 ENSG00000200792 SNORA80A ACA67|SNORA80 small nucleolar RNA, H/ACA box 80A snoRNA 213.333-67 chr15 92171332 92171777 + 0.666667 NA intron (NM_001145044, intron 10 of 10) intron (NM_001145044, intron 10 of 10) -222327 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 210.667-101 chr4 102628071 102628556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -125827 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 118.333-132 chr3 47719605 47719860 + 0.666667 NA intron (NM_003074, intron 7 of 27) intron (NM_003074, intron 7 of 27) -58038 NR_145791 109623484 NR_145791 SNORD146 - small nucleolar RNA, C/D box 146 snoRNA 133.667-47 chr14 35015737 35015986 + 0.666667 NA intron (NM_003136, intron 11 of 15) L2b|LINE|L2 -29046 NM_001079519 283635 Hs.446357 NM_173607 ENSG00000151327 FAM177A1 C14orf24 family with sequence similarity 177 member A1 protein-coding 276.333-42 chr4 72748815 72749446 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -179909 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 166-65 chr2 141134832 141135298 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) intron (NM_018557, intron 7 of 90) -548380 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 152.667-293 chr5 66425322 66425671 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 86108 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 248-46 chr21 27539600 27540020 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -182569 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 137.333-72 chr17 77151124 77151434 + 0.666667 NA intron (NM_001143999, intron 3 of 16) intron (NM_001143999, intron 3 of 16) 10310 NM_001143998 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 111.667-194 chr5 5505894 5506090 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83315 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 156-30 chr11 104530937 104531246 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 78211 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 154.333-97 chr14 69259110 69259509 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001168368) promoter-TSS (NM_001168368) -849 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 137.333-199 chr8 109170279 109170564 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 83793 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 146-74 chr21 30557562 30557998 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 3533 NM_181614 337974 Hs.553696 NM_181614 ENSG00000244362 KRTAP19-7 KAP19.7 keratin associated protein 19-7 protein-coding 132.667-63 chr16 14179711 14180091 + 0.666667 NA intron (NM_001308142, intron 3 of 16) Charlie10|DNA|hAT-Charlie -6785 NM_001365411 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 127.333-49 chr14 59821019 59821264 + 0.666667 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) L1PA14|LINE|L1 49635 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 139.667-47 chr13 59681916 59682211 + 0.666667 NA intron (NM_001258366, intron 26 of 26) intron (NM_001258366, intron 26 of 26) -330655 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 119.667-198 chrX 113898858 113899158 + 0.666667 NA intron (NR_131204, intron 1 of 2) LTR9|LTR|ERV1 39210 NR_131204 105463123 Hs.550218 NR_131204 XACT - X active specific transcript ncRNA 134.667-25 chr10 72316852 72317137 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 37925 NM_017626 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 185.667-24 chr12 83324866 83325341 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 637948 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 113.333-5 chr1 65972092 65972337 + 0.666667 NA intron (NM_002600, intron 3 of 16) intron (NM_002600, intron 3 of 16) -20402 NM_001037340 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 147.333-222 chr3 127937399 127937716 + 0.666667 NA intron (NM_001370224, intron 4 of 6) L1MEd|LINE|L1 22325 NM_001370224 166348 Hs.132087 NM_207335 ENSG00000187715 KBTBD12 KLHDC6 kelch repeat and BTB domain containing 12 protein-coding 115.667-149 chr3 113739489 113739720 + 0.666667 NA intron (NM_025146, intron 1 of 4) intron (NM_025146, intron 1 of 4) 6645 NM_025146 80218 Hs.372378 NM_025146 ENSG00000121579 NAA50 MAK3|NAT13|NAT13P|NAT5|NAT5P|SAN|hNaa50p N(alpha)-acetyltransferase 50, NatE catalytic subunit protein-coding 170-94 chr4 178539035 178539359 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -631261 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 172-39 chr13 46696089 46696461 + 0.666667 NA intron (NM_001164213, intron 9 of 18) intron (NM_001164213, intron 9 of 18) 100886 NM_001984 2098 Hs.432491 NM_001984 ENSG00000139684 ESD FGH esterase D protein-coding 123.333-220 chr8 127946797 127947052 + 0.666667 NA non-coding (NR_103558, exon 1 of 1) non-coding (NR_103558, exon 1 of 1) 1799 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 137.667-116 chr22 47759530 47759808 + 0.666667 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) intron (NR_122046, intron 8 of 8) 127995 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 146.667-110 chr15 26646759 26647020 + 0.666667 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) AluY|SINE|Alu -17799 NR_103801 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 119.333-42 chr10 100078264 100078490 + 0.666667 NA intron (NM_001308, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 3492 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 172.333-121 chr4 35904650 35905010 + 0.666667 NA Intergenic LTR47B2|LTR|ERVL 339109 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 147.667-15 chr1 156967266 156967558 + 0.666667 NA intron (NM_014784, intron 10 of 39) L3|LINE|CR1 -31168 NR_030527 768220 NR_030527 ENSG00000211581 MIR765 MIRN765|hsa-mir-765|mir-765 microRNA 765 ncRNA 197.333-4 chr1 81764854 81765259 + 0.666667 NA intron (NM_001366008, intron 4 of 26) intron (NM_001366008, intron 4 of 26) -35320 NM_001366005 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 130-85 chr4 127180268 127180504 + 0.666667 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -452571 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 160-102 chr5 122193958 122194276 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 33941 NM_001195535 100505841 Hs.733368 NM_001195535 LOC100505841 - zinc finger protein 474-like protein-coding 131-14 chr10 57853298 57853557 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 414467 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 163.333-156 chr2 163983509 163983813 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -247653 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 155.333-211 chr22 17411357 17411716 + 0.666667 NA intron (NM_001290047, intron 1 of 18) intron (NM_001290047, intron 1 of 18) 42076 NM_001290047 27443 Hs.231895 NM_031413 ENSG00000099954 CECR2 - CECR2 histone acetyl-lysine reader protein-coding 199.333-3 chr1 38385827 38386280 + 0.666667 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -89143 NR_146761 105378656 Hs.128924 NR_146761 ENSG00000238063 LINC01685 - long intergenic non-protein coding RNA 1685 ncRNA 119-121 chr5 52457941 52458235 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -329828 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 165.333-156 chr22 30068956 30069288 + 0.666667 NA intron (NR_110541, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 11135 NR_110541 101929664 Hs.592197 NR_110541 HORMAD2-AS1 MTMR3-AS1 HORMAD2 and MTMR3 antisense RNA 1 ncRNA 173.333-42 chr12 32142468 32142830 + 0.666667 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 35802 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 120.333-174 chr7 83971076 83971399 + 0.666667 NA intron (NM_006080, intron 15 of 16) AluSq2|SINE|Alu 223552 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 155-29 chr14 40739650 40739971 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -214901 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 178.667-144 chr6 102619894 102620275 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 1221099 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 112.667-168 chr3 46484228 46484404 + 0.666667 NA intron (NM_001321122, intron 1 of 19) intron (NM_001321122, intron 1 of 19) 918 NM_001321122 4057 Hs.529517 NM_002343 ENSG00000012223 LTF GIG12|HEL110|HLF2|LF lactotransferrin protein-coding 146.667-122 chr16 56178255 56178587 + 0.666667 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) AluY|SINE|Alu 12673 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 270.667-40 chr5 58085159 58085620 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36952 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 190.666-46 chr6 63610822 63611378 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24702 NM_001370350 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 113.667-98 chr2 46099400 46099684 + 0.666667 NA intron (NM_005400, intron 11 of 14) intron (NM_005400, intron 11 of 14) -197865 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 193.333-20 chr10 25147956 25148442 + 0.666667 NA intron (NR_120649, intron 6 of 7) intron (NR_120649, intron 6 of 7) -26802 NM_020752 57512 Hs.499108 NM_020752 ENSG00000151025 GPR158 - G protein-coupled receptor 158 protein-coding 122.333-189 chr7 4546844 4547078 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -135334 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 192.333-130 chr4 97261556 97262021 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105138 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 171.333-10 chr1 155731430 155731916 + 0.666667 NA intron (NM_001199850, intron 9 of 11) intron (NM_001199850, intron 9 of 11) -14095 NR_024117 100129405 Hs.656361 NR_024117 MSTO2P MSTO2 misato family member 2, pseudogene pseudo 155.667-146 chr19 33181690 33182006 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12482 NM_002333 4037 Hs.515340 NM_002333 ENSG00000130881 LRP3 - LDL receptor related protein 3 protein-coding 171-40 chr20 13773412 13773723 + 0.666667 NA intron (NM_001276380, intron 4 of 13) intron (NM_001276380, intron 4 of 13) 11319 NM_016649 51575 Hs.369284 NM_016649 ENSG00000089048 ESF1 ABTAP|C20orf6|HDCMC28P|bA526K24.1 ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog protein-coding 115.333-206 chr8 4847075 4847294 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 1 of 69) intron (NM_033225, intron 1 of 69) 147730 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 128-88 chr4 172257172 172257433 + 0.666667 NA intron (NM_001034845, intron 3 of 12) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 431615 NR_125895 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 203.333-18 chr1 220648465 220648908 + 0.666667 NA intron (NM_018650, intron 13 of 17) intron (NM_018650, intron 13 of 17) -41677 NM_024709 79762 Hs.519839 NM_024709 ENSG00000162817 C1orf115 - chromosome 1 open reading frame 115 protein-coding 190.667-140 chr7 105655646 105656096 + 0.666667 NA intron (NM_001318229, intron 3 of 9) intron (NM_001318229, intron 3 of 9) 23284 NM_001318229 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 165.333-255 chr8 142179095 142179531 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 2974 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 131.333-102 chr20 47299536 47299802 + 0.666667 NA intron (NM_001281774, intron 4 of 23) AluSc8|SINE|Alu -18833 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 187.333-163 chr5 119002556 119002900 + 0.666667 NA intron (NR_134249, intron 7 of 8) AluSx|SINE|Alu -14181 NM_173666 285605 Hs.655891 NM_173666 ENSG00000169570 DTWD2 - DTW domain containing 2 protein-coding 144.333-97 chr17 65992858 65993191 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 17 of 26) L1PA10|LINE|L1 -166481 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 164.333-5 chr1 161944898 161945275 + 0.666667 NA intron (NM_007348, intron 15 of 15) MIR|SINE|MIR 79379 NM_015441 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 244-50 chr2 65073884 65074469 + 0.666667 NA intron (NR_134966, intron 3 of 5) intron (NR_134966, intron 3 of 5) 17760 NM_001319100 23177 Hs.709257 NM_015147 ENSG00000011523 CEP68 KIAA0582 centrosomal protein 68 protein-coding 112.667-248 chr7 55464803 55465021 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 61968 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 154.333-161 chr2 110687044 110687395 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -9112 NM_001278617 699 Hs.469649 NM_004336 ENSG00000169679 BUB1 BUB1A|BUB1L|hBUB1 BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase protein-coding 134.333-119 chr3 114978059 114978336 + 0.666667 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) intron (NM_015642, intron 1 of 9) -77572 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 306.333-47 chr9 82404647 82405452 + 0.666667 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 416277 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 171.333-177 chr7 24011862 24012282 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -272118 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 117-116 chr5 103434080 103434320 + 0.666667 NA Intergenic MER52C|LTR|ERV1 107785 NR_104670 102467212 Hs.641885 NR_104670 ENSG00000248757 LINC02115 - long intergenic non-protein coding RNA 2115 ncRNA 179.667-73 chr19 49654014 49654332 + 0.666667 NA intron (NM_021228, intron 7 of 10) intron (NM_021228, intron 7 of 10) -10969 NM_138639 83596 Hs.289052 NM_138639 ENSG00000126453 BCL2L12 - BCL2 like 12 protein-coding 147.667-93 chr13 94350906 94351260 + 0.666667 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) intron (NM_005708, intron 6 of 8) 128599 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 148-38 chr13 25516259 25516629 + 0.666667 NA intron (NM_016529, intron 2 of 36) intron (NM_016529, intron 2 of 36) 47670 NM_001313741 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 161.667-164 chr3 16291823 16292171 + 0.666667 NA intron (NM_001330670, intron 5 of 8) L1MB8|LINE|L1 26785 NM_138381 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 113.667-213 chr8 123092922 123093256 + 0.666667 NA intron (NM_001363149, intron 4 of 21) AluSx1|SINE|Alu 19840 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 182-8 chr1 119114090 119114465 + 0.666667 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) intron (NM_015836, intron 1 of 5) -26119 NR_125974 101929147 Hs.697821 NR_125974 ENSG00000231365 WARS2-AS1 - WARS2 antisense RNA 1 ncRNA 144-47 chr14 25570713 25571072 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -520595 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 137.667-24 chr10 44291091 44291347 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -1531 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 189.333-90 chr2 41449487 41449937 + 0.666667 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -427843 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 143.667-128 chr2 38069225 38069600 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_000104, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_000104, exon 3 of 3) 6769 NM_000104 1545 Hs.154654 NM_000104 ENSG00000138061 CYP1B1 ASGD6|CP1B|CYPIB1|GLC3A|P4501B1 cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 protein-coding 114.667-109 chr17 65352240 65352430 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -105206 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 116.333-19 chr1 201745447 201745771 + 0.666667 NA intron (NM_001167738, intron 1 of 26) MIRb|SINE|MIR 5709 NM_001167738 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 170.667-64 chr17 67198178 67198579 + 0.666667 NA intron (NM_001330447, intron 7 of 32) intron (NM_001330447, intron 7 of 32) -46398 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 168.667-35 chr11 109590700 109591030 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 168675 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 154-13 chr10 24705863 24706173 + 0.666667 NA intron (NM_001367447, intron 2 of 24) intron (NM_001367447, intron 2 of 24) 16730 NM_001367454 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 141.333-110 chr2 83559690 83559964 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37013 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 152-60 chr15 41681033 41681341 + 0.666667 NA intron (NM_001164273, intron 2 of 23) HAL1|LINE|L1 -10398 NR_030356 693211 NR_030356 ENSG00000207766 MIR626 MIRN626|hsa-mir-626 microRNA 626 ncRNA 113.667-101 chr2 58912017 58912250 + 0.666667 NA intron (NR_033873, intron 3 of 13) intron (NR_033873, intron 3 of 13) -305575 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 130-28 chr12 111985040 111985376 + 0.666667 NA intron (NM_001294314, intron 4 of 12) L1MB3|LINE|L1 27957 NM_001193531 89894 Hs.506815 NM_138341 ENSG00000198270 TMEM116 - transmembrane protein 116 protein-coding 111.667-167 chr3 45804712 45804942 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -8291 NM_022405 54716 Hs.413095 NM_020208 ENSG00000163817 SLC6A20 SIT1|XT3|Xtrp3 solute carrier family 6 member 20 protein-coding 160-97 chr5 61177177 61177503 + 0.666667 NA intron (NR_109908, intron 1 of 3) intron (NR_109908, intron 1 of 3) -14872 NM_001048249 643155 Hs.508479 NM_001048249 ENSG00000188725 SMIM15 C5orf43 small integral membrane protein 15 protein-coding 173.667-23 chr10 85266137 85266503 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -67382 NR_120667 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 114-17 chr11 107439589 107439826 + 0.666667 NA intron (NM_152434, intron 5 of 17) L2b|LINE|L2 18139 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 118.333-152 chr4 70740046 70740240 + 0.666667 NA intron (NM_001345840, intron 1 of 13) intron (NM_001345840, intron 1 of 13) 5733 NM_001345840 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 182.667-149 chr6 157146598 157147106 + 0.666667 NA intron (NM_020732, intron 8 of 19) intron (NM_020732, intron 8 of 19) 110425 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 125.667-88 chr2 16757929 16758185 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -92223 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 195.667-26 chr12 12181808 12182330 + 0.666667 NA intron (NM_002336, intron 5 of 22).2 intron (NM_002336, intron 5 of 22).2 70117 NR_128710 103504734 NR_128710 ENSG00000283475 MIR1244-4 hsa-mir-1244-4 microRNA 1244-4 ncRNA 181.667-128 chr5 167244605 167245017 + 0.666667 NA intron (NM_001122679, intron 1 of 29) intron (NM_001122679, intron 1 of 29) -76410 NR_134280 101927908 NR_134280 ENSG00000253469 LOC101927908 - uncharacterized LOC101927908 ncRNA 119.667-116 chr3 70397704 70397947 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -85187 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 136.333-105 chr2 188961792 188962192 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -12381 NM_000090 1281 Hs.443625 NM_000090 ENSG00000168542 COL3A1 EDS4A|EDSVASC|PMGEDSV collagen type III alpha 1 chain protein-coding 200-2 chr1 51048019 51048480 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -11588 NR_039617 100616189 NR_039617 ENSG00000265538 MIR4421 - microRNA 4421 ncRNA 168.667-18 chr10 48352018 48352446 + 0.666667 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) L1MD2|LINE|L1 45555 NM_001323320 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 146.667-176 chr2 138870836 138871205 + 0.666667 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -26304 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 208.667-15 chr10 7703529 7703938 + 0.666667 NA intron (NM_002216, intron 1 of 20) intron (NM_002216, intron 1 of 20) 417 NM_002216 3698 Hs.75285 NM_002216 ENSG00000151655 ITIH2 H2P|SHAP inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 2 protein-coding 167.333-199 chr4 149464106 149464506 + 0.666667 NA intron (NM_001363507, intron 12 of 13) intron (NM_001363507, intron 12 of 13) 310011 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 114.333-153 chr3 189217274 189217494 + 0.666667 NA intron (NM_198485, intron 3 of 5) intron (NM_198485, intron 3 of 5) 23210 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 170.333-76 chr14 78697704 78698071 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 6 of 20) intron (NR_073547, intron 6 of 20) 294168 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 115.667-91 chr16 61404022 61404283 + 0.666667 NA Intergenic UCON7|DNA?|DNA? -348386 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 149-112 chr5 26750769 26751090 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 287657 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 119-26 chr11 11815019 11815241 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -26293 NM_001330208 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 157-65 chr2 127349184 127349487 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6106 NM_006609 10746 Hs.145605 NM_006609 ENSG00000169967 MAP3K2 MEKK2|MEKK2B mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 protein-coding 286-22 chr18 21022373 21023067 + 0.666667 NA intron (NM_005406, intron 11 of 32) LTR33|LTR|ERVL 89093 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 130.667-114 chr2 136203494 136203801 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -85492 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 129-111 chr6 81812238 81812475 + 0.666667 NA TTS (NR_126363) TTS (NR_126363) 1836 NR_126363 101928770 Hs.586239 NR_126363 ENSG00000224995 LINC01526 Lnc-FAM46A-1 long intergenic non-protein coding RNA 1526 ncRNA 202-197 chr9 74978822 74979265 + 0.666667 NA intron (NR_121183, intron 2 of 4) HERVL40-int|LTR|ERVL 26078 NR_121183 101927380 Hs.257556 NR_121183 CARNMT1-AS1 C9orf41-AS1 CARNMT1 antisense RNA 1 ncRNA 175.667-128 chr6 147947846 147948228 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -324291 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 114.333-149 chr3 106376035 106376206 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -506719 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 130.333-178 chr6 41470529 41470841 + 0.666667 NA Intergenic CpG -31759 NR_120347 103106903 Hs.563396 NR_120347 ENSG00000226917 LINC01276 - long intergenic non-protein coding RNA 1276 ncRNA 130.333-153 chr4 87168107 87168483 + 0.666667 NA intron (NM_001292006, intron 8 of 9) intron (NM_001292006, intron 8 of 9) 51973 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 147.667-3 chr1 42311622 42311895 + 0.666667 NA intron (NM_001198850, intron 1 of 12) MIRc|SINE|MIR 23197 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 152-143 chr7 28403393 28403730 + 0.666667 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR -8957 NM_182898 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 148-2 chr1 21033795 21034091 + 0.666667 NA intron (NM_003760, intron 2 of 31) AluJr4|SINE|Alu -45511 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 188-100 chr7 48111320 48111742 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22266 NM_001287429 7378 Hs.488240 NM_003364 ENSG00000183696 UPP1 UDRPASE|UP|UPASE|UPP uridine phosphorylase 1 protein-coding 210-89 chr22 35003482 35003967 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5808 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 115-68 chr15 94518204 94518386 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 162365 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 138.667-21 chr10 89084834 89085138 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -21575 NR_039827 100616192 NR_039827 ENSG00000265375 MIR4679-2 - microRNA 4679-2 ncRNA 115.333-181 chr5 177571598 177571870 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -17171 NM_001190946 54540 Hs.484289 NM_019057 ENSG00000146067 FAM193B IRIZIO family with sequence similarity 193 member B protein-coding 114.667-29 chr10 36657054 36657229 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -468716 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 186.667-76 chr2 155582443 155582817 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 672301 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 290.667-45 chr9 131209795 131210503 + 0.666667 NA intron (NM_001318324, intron 30 of 35) intron (NM_001318324, intron 30 of 35) 20010 NM_001318325 8021 Hs.654530 NM_005085 ENSG00000126883 NUP214 CAIN|CAN nucleoporin 214 protein-coding 113.333-93 chr16 55574791 55575037 + 0.666667 NA intron (NM_017839, intron 12 of 13) intron (NM_017839, intron 12 of 13) 8230 NM_032330 84290 Hs.660027 NM_032330 ENSG00000256812 CAPNS2 CSS2 calpain small subunit 2 protein-coding 162.333-209 chr5 168906492 168906818 + 0.666667 NA intron (NM_003062, intron 4 of 35) intron (NM_003062, intron 4 of 35) -106572 NR_109897 728095 Hs.145601 NR_109897 LOC728095 - uncharacterized LOC728095 ncRNA 183.667-12 chr1 152489020 152489318 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -21634 NM_178438 254910 Hs.516410 NM_178438 ENSG00000186207 LCE5A LEP18|SPRL5A late cornified envelope 5A protein-coding 130.333-105 chr2 105466046 105466277 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27648 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 134-52 chr2 136851958 136852309 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 86588 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 190.333-13 chr10 13844406 13844876 + 0.666667 NA intron (NM_001318336, intron 2 of 23) intron (NM_001318336, intron 2 of 23) 127255 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 125-122 chr9 2162306 2162588 + 0.666667 NA intron (NM_001289397, intron 28 of 32) intron (NM_001289397, intron 28 of 32) 3991 NM_001289400 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 180.333-135 chr8 74632165 74632499 + 0.666667 NA intron (NR_033830, intron 2 of 5) intron (NR_033830, intron 2 of 5) 32466 NR_033830 441355 Hs.647162 NR_033830 ENSG00000254349 MIR2052HG - MIR2052 host gene ncRNA 162.667-257 chr7 75547891 75548364 + 0.666667 NA intron (NM_005338, intron 23 of 30) AluSg|SINE|Alu -20004 NR_028059 5387 Hs.659871 NM_005395 ENSG00000127957 PMS2P3 PMS2L3|PMS2L9|PMS5|PMSR3 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 3 pseudo 152.667-318 chr6 18074223 18074577 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 48277 NM_198586 378884 Hs.348351 NM_198586 ENSG00000187566 NHLRC1 EPM2A|EPM2B|MALIN|bA204B7.2 NHL repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 141.333-59 chr13 100251448 100251723 + 0.666667 NA intron (NM_001352612, intron 8 of 21) L1MC4|LINE|L1 162492 NR_148027 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 121-141 chr8 142044082 142044335 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -132131 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 181.667-16 chr10 116875133 116875536 + 0.666667 NA intron (NM_001242699, intron 10 of 13) intron (NM_001242699, intron 10 of 13) -25612 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 145-57 chr2 227121417 227121761 + 0.666667 NA intron (NM_000092, intron 4 of 47) AluJb|SINE|Alu 42970 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 121.667-56 chr14 50846299 50846620 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15338 NM_020921 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 133-13 chr11 8579566 8579804 + 0.666667 NA intron (NM_001289058, intron 1 of 13) intron (NM_001289058, intron 1 of 13) 14291 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 141-40 chr19 29154094 29154424 + 0.666667 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 58892 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 148.667-137 chr15 67176716 67177081 + 0.666667 NA intron (NM_001145103, intron 5 of 8) intron (NM_001145103, intron 5 of 8) 10743 NM_001145104 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 185-70 chr7 92639432 92639959 + 0.666667 NA intron (NM_001259, intron 5 of 7) intron (NM_001259, intron 5 of 7) -49305 NR_109929 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 230.333-46 chr17 9086709 9087260 + 0.666667 NA intron (NM_004822, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 65474 NM_004822 9423 Hs.660885 NM_004822 ENSG00000065320 NTN1 MRMV4|NTN1L netrin 1 protein-coding 139.333-202 chr7 80361393 80361684 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12901 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 114.333-226 chr8 103530115 103530378 + 0.666667 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1MEg|LINE|L1 -28336 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 168.667-42 chr12 41544677 41545070 + 0.666667 NA intron (NM_001164595, intron 5 of 9) MIR|SINE|MIR 107134 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 237.333-2 chr1 97940815 97941293 + 0.666667 NA intron (NR_146275, intron 1 of 1) L1MC3|LINE|L1 686 NR_146275 109729128 NR_146275 LINC01930 - long intergenic non-protein coding RNA 1930 ncRNA 125.667-171 chr6 140087980 140088311 + 0.666667 NA intron (NR_121622, intron 3 of 3) intron (NR_121622, intron 3 of 3) -96884 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 138.667-178 chr6 21526152 21526417 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14392 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 169.667-44 chr12 65409696 65410075 + 0.666667 NA intron (NM_001031679, intron 5 of 6) intron (NM_001031679, intron 5 of 6) 130898 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 182.667-163 chr8 117357020 117357523 + 0.666667 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL -163442 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 114-97 chr4 35638074 35638373 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 605716 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 130.333-207 chr8 84565123 84565400 + 0.666667 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L3|LINE|CR1 -140666 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 113.333-33 chr10 88337721 88338023 + 0.666667 NA intron (NM_018363, intron 5 of 6) intron (NM_018363, intron 5 of 6) 245446 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 114.667-20 chr1 225935585 225935847 + 0.666667 NA TTS (NM_001172425) TTS (NM_001172425) 5504 NM_003240 7044 Hs.520187 NM_003240 ENSG00000143768 LEFTY2 EBAF|LEFTA|LEFTYA|TGFB4 left-right determination factor 2 protein-coding 174-4 chr1 221232645 221233042 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 103453 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 114.333-27 chr10 61444768 61444976 + 0.666667 NA intron (NR_134508, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR -7767 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-170 chr2 11326255 11326571 + 0.666667 NA intron (NM_001321643, intron 1 of 32) L2|LINE|L2 18223 NM_004850 9475 Hs.681743 NM_004850 ENSG00000134318 ROCK2 ROCK-II Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2 protein-coding 118.333-138 chr3 95521362 95521613 + 0.666667 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 161706 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 143.333-163 chr21 20282547 20282835 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -24006 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 125-40 chr15 85533539 85533762 + 0.666667 NA exon (NM_006738, exon 4 of 37) exon (NM_006738, exon 4 of 37) -86300 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 156-28 chr11 82135902 82136330 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) L2a|LINE|L2 -245280 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 143.667-22 chr10 55598717 55599000 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001190478) promoter-TSS (NM_001190478) -184 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 157.667-268 chr5 164905957 164906257 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 435828 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 313-12 chr13 95340654 95341173 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -39462 NM_001105515 10257 Hs.508423 NM_005845 ENSG00000125257 ABCC4 MOAT-B|MOATB|MRP4 ATP binding cassette subfamily C member 4 protein-coding 208-168 chr8 89983940 89984372 + 0.666667 NA intron (NM_001024688, intron 1 of 16) CpG 515 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 118.667-118 chr20 13232296 13232621 + 0.666667 NA intron (NM_080826, intron 1 of 5) L1ME1|LINE|L1 7229 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 114.667-80 chr14 51310116 51310366 + 0.666667 NA intron (NR_145423, intron 1 of 1) intron (NR_145423, intron 1 of 1) 18144 NR_145423 161342 NR_145423 ENSG00000258955 LINC00519 C14orf30|c14_5317 long intergenic non-protein coding RNA 519 ncRNA 175.667-107 chr4 62620790 62621248 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -459254 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-35 chr1 187198919 187199279 + 0.666667 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 106257 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 138.667-175 chr6 698288 698633 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -5319 NR_073064 55770 Hs.484412 NM_018303 ENSG00000112685 EXOC2 SEC5|SEC5L1|Sec5p exocyst complex component 2 protein-coding 165.333-199 chr4 185971096 185971540 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14946 NM_021069 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 159-7 chr1 105231956 105232368 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 386773 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 150.333-17 chr1 155463680 155463987 + 0.666667 NA intron (NM_018489, intron 3 of 27) intron (NM_018489, intron 3 of 27) 30653 NR_034180 645682 Hs.632482 NR_034180 ENSG00000237872 POU5F1P4 OCT3|OCT4|OTF-3|OTF3|Oct-3|Oct-4|Oct4-pg4|POU5F1|POU5FLC1 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 pseudo 176.333-50 chr14 63009425 63009917 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 2 of 10) intron (NM_139318, intron 2 of 10) 35787 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 156.333-331 chr7 26797087 26797470 + 0.666667 NA intron (NM_003930, intron 4 of 12) L1MA1|LINE|L1 60445 NM_001303468 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 124.333-156 chr6 17858853 17859114 + 0.666667 NA intron (NM_001105567, intron 4 of 36) intron (NM_001105567, intron 4 of 36) 128652 NM_001105568 63971 Hs.94499 NM_022113 ENSG00000137177 KIF13A RBKIN|bA500C11.2 kinesin family member 13A protein-coding 155.333-176 chr2 136050470 136050803 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64952 NM_001293312 1615 Hs.503787 NM_001349 ENSG00000115866 DARS HBSL|aspRS aspartyl-tRNA synthetase protein-coding 147-137 chr8 22454351 22454784 + 0.666667 NA intron (NM_005605, intron 1 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 13597 NM_001243975 5533 Hs.731683 NM_005605 ENSG00000120910 PPP3CC CALNA3|CNA3|PP2Bgamma protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma protein-coding 183.667-151 chr9 37224256 37224783 + 0.666667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) L1ME1|LINE|L1 103921 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 153.333-75 chr11 116080040 116080333 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -319986 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 127.667-113 chr3 47970865 47971161 + 0.666667 NA intron (NM_002375, intron 3 of 18) intron (NM_002375, intron 3 of 18) 117835 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 141.667-137 chr22 29089919 29090292 + 0.666667 NA intron (NM_001039570, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 17070 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 147.333-203 chr22 26400163 26400475 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28941 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 152.333-412 chrX 43865052 43865448 + 0.666667 NA intron (NM_000898, intron 1 of 14) L1MB7|LINE|L1 17200 NM_000898 4129 Hs.654473 NM_000898 ENSG00000069535 MAOB - monoamine oxidase B protein-coding 149.667-386 chr8 16710461 16710814 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 291708 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 134.667-198 chr8 123153410 123153704 + 0.666667 NA intron (NM_001363151, intron 19 of 19) intron (NM_001363151, intron 19 of 19) -25490 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 115.333-54 chr13 26571709 26572007 + 0.666667 NA intron (NM_006646, intron 1 of 9) L1MC4a|LINE|L1 14155 NM_001291965 10810 Hs.618732 NM_006646 ENSG00000132970 WASF3 Brush-1|SCAR3|WAVE3 WASP family member 3 protein-coding 135-73 chr4 17989003 17989350 + 0.666667 NA intron (NR_158566, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 32579 NR_136669 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 119.333-139 chr20 13637159 13637465 + 0.666667 NA intron (NM_017714, intron 1 of 13) L1MB7|LINE|L1 1620 NM_017714 55617 Hs.348297 NM_017714 ENSG00000089123 TASP1 C20orf13|dJ585I14.2 taspase 1 protein-coding 118.667-206 chrX 96397642 96397842 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59840 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 175-3 chr1 83764743 83765183 + 0.666667 NA intron (NR_119375, intron 1 of 2) intron (NR_119375, intron 1 of 2) 95583 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 128.333-51 chr12 97013813 97014180 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106530 NM_001135175 121441 Hs.270084 NM_152905 ENSG00000139350 NEDD1 GCP-WD|TUBGCP7 NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor protein-coding 111.667-112 chr18 2529531 2529836 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 41822 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 157.333-178 chr2 50202101 50202407 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) AluY|SINE|Alu 145500 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 118-83 chr22 20785830 20786098 + 0.666667 NA intron (NM_000185, intron 3 of 4) intron (NM_000185, intron 3 of 4) 11851 NM_000185 3053 Hs.474270 NM_000185 ENSG00000099937 SERPIND1 D22S673|HC2|HCF2|HCII|HLS2|LS2|THPH10 serpin family D member 1 protein-coding 191.667-28 chr11 81685878 81686294 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 204750 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 221-24 chr15 87525323 87525822 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -51357 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 196-138 chr5 3714446 3714890 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 118836 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 187.667-131 chr6 143271924 143272333 + 0.666667 NA intron (NM_001366354, intron 3 of 4) intron (NM_001366354, intron 3 of 4) 107346 NM_001366361 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 162.333-164 chr3 96725992 96726371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88413 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 127.667-148 chr6 4270929 4271249 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -81060 NR_125874 102724096 Hs.571140 NR_125874 LOC102724096 - uncharacterized LOC102724096 ncRNA 126-79 chr4 38708116 38708480 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -43670 NR_026804 79667 Hs.29725 NM_024614 ENSG00000231160 KLF3-AS1 - KLF3 antisense RNA 1 ncRNA 152-88 chr2 147541674 147541999 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -302681 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 139.333-126 chr2 216160699 216161066 + 0.666667 NA intron (NM_021141, intron 15 of 20) AluJo|SINE|Alu 51534 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 167.666-9 chr4 144476089 144476590 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 169680 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 124-63 chr2 99050374 99050597 + 0.666667 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger 90695 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 215.667-116 chr7 129574067 129574642 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37366 NM_001293164 4899 Hs.654363 NM_005011 ENSG00000106459 NRF1 ALPHA-PAL nuclear respiratory factor 1 protein-coding 112-162 chr5 14564584 14564908 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -17046 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 163.333-90 chr14 66763750 66764213 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 2 of 21) MER1A|DNA|hAT-Charlie 256574 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 166-35 chr12 55093633 55093954 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35976 NM_001005243 441639 Hs.553827 NM_001005243 ENSG00000170605 OR9K2 OR12-2 olfactory receptor family 9 subfamily K member 2 protein-coding 146-78 chr22 28134911 28135315 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) L1MDa|LINE|L1 -214501 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 131-75 chr5 12318700 12319003 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -256006 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 169.333-115 chr2 43777433 43777799 + 0.666667 NA intron (NM_016008, intron 2 of 12) LTR86A1|LTR|ERVL 3577 NM_001348912 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 209.333-14 chr10 5173255 5173612 + 0.666667 NA intron (NR_027916, intron 1 of 7) LTR19-int|LTR|ERV1 11754 NR_027916 340811 Hs.282513 NM_001007536 ENSG00000264006 AKR1C8P AKR1CL1 aldo-keto reductase family 1 member C8, pseudogene pseudo 119.667-171 chr6 152867137 152867338 + 0.666667 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie 115804 NM_012177 26271 Hs.520506 NM_012177 ENSG00000112029 FBXO5 EMI1|FBX5|Fbxo31 F-box protein 5 protein-coding 133.333-171 chr7 35246090 35246327 + 0.666667 NA intron (NM_001166220, intron 3 of 5) intron (NM_001166220, intron 3 of 5) 7892 NM_001166220 57057 Hs.404167 NM_020417 ENSG00000164532 TBX20 ASD4 T-box transcription factor 20 protein-coding 146-56 chr2 44924962 44925290 + 0.666667 NA intron (NR_147195, intron 1 of 1) intron (NR_147195, intron 1 of 1) 13762 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 123.333-216 chr8 112008872 112009072 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 632333 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 118.667-179 chr7 48980835 48981080 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 56410 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 238.333-36 chr18 62565463 62565982 + 0.666667 NA intron (NR_126534, intron 11 of 14) intron (NR_126534, intron 11 of 14) 42697 NR_126534 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 148.333-46 chr10 57141465 57141898 + 0.666667 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 162878 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 122.667-14 chr10 28056495 28056841 + 0.666667 NA intron (NR_134517, intron 15 of 16) intron (NR_134517, intron 15 of 16) 16710 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 135-83 chr5 25693072 25693331 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 502248 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 166-89 chr4 67844761 67845196 + 0.666667 NA intron (NM_004262, intron 3 of 9) HAL1b|LINE|L1 39024 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 173.667-67 chr2 11033614 11034033 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 98353 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 218.666-40 chr2 55780568 55781192 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87036 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 111.667-97 chr16 69934475 69934642 + 0.666667 NA intron (NM_199424, intron 7 of 13) intron (NM_199424, intron 7 of 13) 1477 NR_029681 406932 NR_029681 ENSG00000208017 MIR140 MIRN140|miRNA140|mir-140 microRNA 140 ncRNA 129.667-40 chr12 56696294 56696644 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8061 NM_001282604 10728 Hs.50425 NM_006601 ENSG00000110958 PTGES3 P23|TEBP|cPGES prostaglandin E synthase 3 protein-coding 112.667-188 chr4 63873382 63873590 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 535964 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 145.667-111 chr17 50029194 50029526 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 26379 NR_038230 284080 Hs.274864 NR_038230 ENSG00000246640 PICART1 - p53 inducible cancer associated RNA transcript 1 ncRNA 186.667-60 chr2 13254309 13254667 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -247475 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 144-66 chr18 47112173 47112535 + 0.666667 NA intron (NM_032124, intron 6 of 6) MIR3|SINE|MIR 38146 NM_032124 84064 Hs.465041 NM_032124 ENSG00000167220 HDHD2 3110052N05Rik|HEL-S-301 haloacid dehalogenase like hydrolase domain containing 2 protein-coding 205.333-239 chr8 73682811 73683413 + 0.666667 NA intron (NM_001164382, intron 3 of 13) L1PB1|LINE|L1 63728 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 119.333-87 chr14 63494009 63494324 + 0.666667 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) L1ME4b|LINE|L1 14072 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 136-86 chr5 84704358 84704708 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -319653 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 154-92 chr3 96658325 96658706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -156079 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 162.667-145 chr2 169910805 169911180 + 0.666667 NA intron (NM_172070, intron 10 of 38) intron (NM_172070, intron 10 of 38) 83484 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 196-129 chr3 186562911 186563278 + 0.666667 NA intron (NM_001286749, intron 1 of 6) intron (NM_001286749, intron 1 of 6) 4245 NM_018138 55171 Hs.518469 NM_018138 ENSG00000113838 TBCCD1 - TBCC domain containing 1 protein-coding 124.333-182 chr8 129645431 129645659 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 34694 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 134.667-187 chr7 90922179 90922484 + 0.666667 NA intron (NM_012395, intron 7 of 13) intron (NM_012395, intron 7 of 13) 212515 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 112.333-158 chr3 30299046 30299224 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219733 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 198.667-102 chr2 81151384 81151828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 315340 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 158.333-339 chr9 28054248 28054691 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -480603 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 155.667-365 chr8 112269260 112269557 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 55 of 66) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -374085 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 130.667-60 chr14 21828398 21828709 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -157536 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 219.333-154 chr6 44942379 44942950 + 0.666667 NA intron (NM_181356, intron 11 of 12) FLAM_A|SINE|Alu 255106 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 134.333-71 chr17 15018616 15018870 + 0.666667 NA intron (NR_135638, intron 1 of 1) intron (NR_135638, intron 1 of 1) 3938 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 114.333-49 chr12 4128475 4128762 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -145144 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 188.333-16 chr10 5844246 5844682 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -30915 NM_001115156 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 163.667-209 chr6 45434512 45434860 + 0.666667 NA intron (NM_001015051, intron 4 of 7) intron (NM_001015051, intron 4 of 7) 12411 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 161.333-136 chr19 33283530 33283903 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 18818 NM_001287424 1050 Hs.76171 NM_004364 ENSG00000245848 CEBPA C/EBP-alpha|CEBP CCAAT enhancer binding protein alpha protein-coding 174.333-126 chr5 160148960 160149248 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -29654 NM_052927 114825 Hs.744960 NM_052927 ENSG00000170234 PWWP2A MST101 PWWP domain containing 2A protein-coding 179.333-164 chr6 87310280 87310654 + 0.666667 NA intron (NM_198568, intron 2 of 2) L1ME3A|LINE|L1 -12121 NM_001042493 57150 Hs.70769 NM_020425 ENSG00000111850 SMIM8 C6orf162|dJ102H19.2 small integral membrane protein 8 protein-coding 129.333-75 chr17 2257935 2258230 + 0.666667 NA intron (NM_017575, intron 8 of 18) intron (NM_017575, intron 8 of 18) 8103 NM_001256827 23293 Hs.448342 NM_017575 ENSG00000070366 SMG6 C17orf31|EST1A|SMG-6|hSMG5/7a SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 175-31 chr16 52186775 52187248 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71553 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 123-4 chr1 57656527 57656779 + 0.666667 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -203928 NR_104362 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-84 chr12 49384060 49384405 + 0.666667 NA intron (NM_023071, intron 2 of 13) AluJr|SINE|Alu -4942 NR_033267 100335030 Hs.687044 NR_033267 LOC100335030 - FGFR1 oncogene partner 2 pseudogene pseudo 162.333-19 chr1 234428774 234429158 + 0.666667 NA intron (NM_005646, intron 17 of 29) intron (NM_005646, intron 17 of 29) 50213 NM_005646 6894 Hs.498115 NM_005646 ENSG00000059588 TARBP1 TRM3|TRMT3|TRP-185|TRP185 TAR (HIV-1) RNA binding protein 1 protein-coding 232-72 chr5 74828469 74829013 + 0.666667 NA intron (NR_046462, intron 4 of 11) HAL1|LINE|L1 -37152 NR_134288 441086 Hs.653007 NR_134288 LOC441086 - uncharacterized LOC441086 ncRNA 143.333-231 chr5 111006257 111006594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63655 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 165-19 chr12 78638992 78639384 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -224794 NM_001135805 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 155.667-162 chr2 49394292 49394584 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -239911 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 149-42 chr14 53860240 53860621 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 88054 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 184.333-32 chr14 33628661 33629050 + 0.666667 NA intron (NM_001165893, intron 4 of 10) intron (NM_001165893, intron 4 of 10) -80082 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 185.667-93 chr3 132886361 132886760 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -151728 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 164.333-187 chr5 13761591 13761931 + 0.666667 NA intron (NM_001369, intron 60 of 78) intron (NM_001369, intron 60 of 78) 182719 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 281.667-18 chr14 32944535 32945142 + 0.666667 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) intron (NM_001165893, intron 1 of 10) 5959 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 146.667-155 chr2 38506468 38506802 + 0.666667 NA intron (NR_110259, intron 1 of 4) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 9105 NR_110259 101929596 Hs.537341 NR_110259 LINC02613 - long intergenic non-protein coding RNA 2613 ncRNA 152-37 chr12 1330477 1330810 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) intron (NR_027948, intron 15 of 19) -169848 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 112.333-50 chr12 29259199 29259511 + 0.666667 NA intron (NM_001271784, intron 1 of 10) MER20|DNA|hAT-Charlie 35689 NM_018099 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 185.667-141 chr8 143183150 143183557 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22699 NM_001130478 4062 Hs.159590 NM_002347 ENSG00000176956 LY6H NMLY6 lymphocyte antigen 6 family member H protein-coding 173.667-90 chr2 159030816 159031164 + 0.666667 NA intron (NM_001350063, intron 2 of 24) intron (NM_001350063, intron 2 of 24) 62350 NR_146421 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 156.333-242 chr3 108662590 108662901 + 0.666667 NA intron (NM_014648, intron 21 of 32) intron (NM_014648, intron 21 of 32) 73023 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 116-61 chr17 68313455 68313800 + 0.666667 NA intron (NM_001352899, intron 2 of 12) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 21492 NM_001352901 22901 Hs.437249 NM_014960 ENSG00000141337 ARSG USH4 arylsulfatase G protein-coding 116.667-77 chr17 30102539 30102754 + 0.666667 NA intron (NM_198529, intron 22 of 22) intron (NM_198529, intron 22 of 22) -14161 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 158-82 chr21 37236133 37236457 + 0.666667 NA intron (NM_001331021, intron 2 of 6) MIRc|SINE|MIR 27792 NR_026719 257203 Hs.505159 NM_148675 ENSG00000230366 DSCR9 NCRNA00038 Down syndrome critical region 9 ncRNA 129-34 chr14 63194248 63194461 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -10089 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 125.667-191 chr8 118316567 118316764 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) L1ME3A|LINE|L1 -204846 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 151.667-235 chr3 153928539 153928857 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -166172 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 173.667-73 chr2 53864685 53865100 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014614, exon 47 of 47) 3' UTR (NM_014614, exon 47 of 47) -4859 NM_001164165 100302652 Hs.40763 NM_001164165 ENSG00000270898 GPR75-ASB3 ASB-3|ASB3 GPR75-ASB3 readthrough protein-coding 167-54 chr2 12126982 12127326 + 0.666667 NA intron (NR_110197, intron 3 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -71976 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 208.667-9 chr1 162664310 162664669 + 0.666667 NA intron (NM_006182, intron 2 of 17) L1ME4a|LINE|L1 32025 NM_001014796 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 227.667 chr1 155587866 155588439 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -22018 NM_001350783 55154 Hs.656547 NM_018116 ENSG00000125459 MSTO1 LST005|MMYAT|MST misato mitochondrial distribution and morphology regulator 1 protein-coding 114-95 chr3 180159362 180159538 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -122513 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 127.333-195 chr8 136062074 136062311 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -468606 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 140-115 chr8 64302674 64302920 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 65761 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 171.333-56 chr14 101670348 101670790 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -59868 NR_026774 145200 Hs.150840 NR_026774 ENSG00000258512 LINC00239 C14orf72|NCRNA00239 long intergenic non-protein coding RNA 239 ncRNA 197.333-179 chr5 41707887 41708419 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 135504 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 166.667-131 chr20 21092698 21093167 + 0.666667 NA intron (NR_147212, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 13426 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 201.667-126 chr8 139773861 139774366 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) intron (NM_001160372, intron 21 of 22) -70990 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 118.667-110 chr2 160878312 160878550 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -258524 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 213-53 chr3 74114428 74114813 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 305376 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 117.333-102 chr2 100999763 101000044 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2326 NM_001098577 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 125.667-136 chr4 102434469 102434752 + 0.666667 NA intron (NR_136202, intron 2 of 4) L1MA9|LINE|L1 -66749 NM_001165412 4790 Hs.618430 NM_003998 ENSG00000109320 NFKB1 CVID12|EBP-1|KBF1|NF-kB1|NF-kappa-B1|NF-kappaB|NFKB-p105|NFKB-p50|NFkappaB|p105|p50 nuclear factor kappa B subunit 1 protein-coding 172.333-168 chr7 98161247 98161609 + 0.666667 NA intron (NM_014916, intron 6 of 13) intron (NM_014916, intron 6 of 13) -50826 NM_177455 168620 Hs.511979 NM_177455 ENSG00000180535 BHLHA15 BHLHB8|MIST1 basic helix-loop-helix family member a15 protein-coding 112.667-37 chr11 21732647 21732948 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -460288 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 149.667-261 chr3 100614777 100615147 + 0.666667 NA intron (NM_032787, intron 1 of 15) intron (NM_032787, intron 1 of 15) 5361 NM_032787 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 119-11 chr1 210276506 210276730 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -42733 NR_024337 574036 Hs.446946 NR_024337 ENSG00000203706 SERTAD4-AS1 C1orf133 SERTAD4 antisense RNA 1 ncRNA 192.667-23 chr10 24669111 24669539 + 0.666667 NA intron (NM_001367447, intron 3 of 24) intron (NM_001367447, intron 3 of 24) -46482 NM_001367455 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 171.667-21 chr10 61627199 61627702 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -35479 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 205.667-87 chr22 24850658 24851191 + 0.666667 NA intron (NM_001098498, intron 5 of 23) AluY|SINE|Alu 44703 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 141-76 chr6 95198405 95198685 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 378906 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 216.333-5 chr1 65639839 65640320 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 114390 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 146.667-318 chr7 108514111 108514397 + 0.666667 NA exon (NM_001256008, exon 3 of 10) exon (NM_001256008, exon 3 of 10) 11881 NM_001256009 50640 Hs.617340 NM_015723 ENSG00000135241 PNPLA8 IPLA2-2|IPLA2G|MMLA|PNPLA-gamma|iPLA2gamma patatin like phospholipase domain containing 8 protein-coding 112-186 chr6 109206061 109206315 + 0.666667 NA intron (NR_152435, intron 9 of 45) intron (NR_152435, intron 9 of 45) 40357 NR_152435 221262 Hs.373914 NM_173671 ENSG00000203799 CCDC162P C6orf183|C6orf184|C6orf185|CCDC162 coiled-coil domain containing 162, pseudogene pseudo 158.667-38 chr10 39073285 39073639 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 376866 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 120-14 chr10 70814460 70814745 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1346 NM_003901 8879 Hs.499984 NM_003901 ENSG00000166224 SGPL1 NPHS14|S1PL|SPL sphingosine-1-phosphate lyase 1 protein-coding 129.333-90 chr2 35787741 35788125 + 0.666667 NA Intergenic LTR18A|LTR|ERVL 316528 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 124.333-113 chr3 30135595 30135901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201592 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 195-84 chr5 55952056 55952469 + 0.666667 NA non-coding (NR_120480, exon 13 of 18) non-coding (NR_120480, exon 13 of 18) 42701 NM_001364276 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 113.667-165 chr4 154073702 154073927 + 0.666667 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -284731 NM_003013 6423 Hs.481022 NM_003013 ENSG00000145423 SFRP2 FRP-2|SARP1|SDF-5 secreted frizzled related protein 2 protein-coding 130-66 chr2 226211939 226212238 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69294 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 147.333-145 chr17 68008964 68009397 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -15574 NM_181655 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 200-123 chr5 21637676 21638076 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 178396 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 148.667-201 chr2 148666904 148667209 + 0.666667 NA intron (NM_015630, intron 1 of 13) intron (NM_015630, intron 1 of 13) 22305 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 207-78 chr3 101528121 101528487 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 9437 NR_036433 131909 Hs.518125 NR_036433 FAM172BP FAM172B family with sequence similarity 172 member B, pseudogene pseudo 162.333-131 chr2 217118296 217118776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -164197 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 144.333-54 chr12 119650852 119651244 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17085 NM_006253 5564 Hs.741184 NM_006253 ENSG00000111725 PRKAB1 AMPK|HAMPKb protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1 protein-coding 138.333-85 chr2 21400356 21400643 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 276513 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 150.333-394 chr8 46508851 46509286 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 108575 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 171.667-76 chr2 31393044 31393417 + 0.666667 NA intron (NM_000379, intron 6 of 35) L1MC1|LINE|L1 21512 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 204.333-58 chr14 82059794 82060341 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -316929 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 167.333-265 chr8 130864839 130865141 + 0.666667 NA intron (NM_001115, intron 9 of 17) L1MC3|LINE|L1 175919 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 193.667-131 chr7 146071747 146072181 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -702307 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 147.333-190 chr20 39179893 39180190 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 44707 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 175.333-18 chr10 99909806 99910197 + 0.666667 NA intron (NM_015221, intron 4 of 16) intron (NM_015221, intron 4 of 16) 4091 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 217-92 chr8 144798597 144799116 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_213605) promoter-TSS (NM_213605) -20 NR_134284 340385 Hs.521942 NM_213605 ENSG00000197363 ZNF517 - zinc finger protein 517 protein-coding 220.667 chr1 9966698 9967179 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_049882) promoter-TSS (NR_049882) -443 NR_049882 100847055 NR_049882 ENSG00000265521 MIR5697 - microRNA 5697 ncRNA 154.333-72 chr12 98418629 98418936 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38363 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 119.667-29 chr11 46100051 46100376 + 0.666667 NA intron (NR_147890, intron 1 of 18) intron (NR_147890, intron 1 of 18) 20606 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 264-15 chr12 9096270 9096823 + 0.666667 NA intron (NM_000014, intron 15 of 35) intron (NM_000014, intron 15 of 35) 19683 NM_001347425 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 147-138 chr8 40830679 40831040 + 0.666667 NA intron (NM_024645, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 66967 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 188.333-98 chr3 124850722 124851024 + 0.666667 NA intron (NM_001354766, intron 3 of 13) intron (NM_001354766, intron 3 of 13) 36492 NM_002213 3693 Hs.13155 NM_002213 ENSG00000082781 ITGB5 - integrin subunit beta 5 protein-coding 278-27 chr22 28424568 28425069 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -35051 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 125.333-56 chr14 51508008 51508343 + 0.666667 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) intron (NM_001042481, intron 1 of 14) 19047 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 125.333-25 chr10 62777156 62777385 + 0.666667 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -27450 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 121.333-171 chr7 85152810 85153020 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30984 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 206-186 chr8 119229522 119229850 + 0.666667 NA intron (NR_149114, intron 3 of 5) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 17171 NR_149111 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 180.333-23 chr12 23068613 23068988 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106836 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 218-6 chr1 175516282 175516751 + 0.666667 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) intron (NM_003285, intron 2 of 22) 227079 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 114-169 chr8 103510640 103510910 + 0.666667 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -8865 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 150-49 chr14 84776195 84776499 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -495585 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 155-132 chr8 120590875 120591271 + 0.666667 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) intron (NM_021021, intron 3 of 6) 145654 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 190-66 chr2 135147981 135148386 + 0.666667 NA intron (NM_001172435, intron 17 of 24) intron (NM_001172435, intron 17 of 24) 11555 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 115-82 chr2 41399156 41399489 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -478233 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 176.333-8 chr1 68617119 68617579 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -120267 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 147.333-105 chr14 60346431 60346778 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23408 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 163-95 chrX 82500234 82500673 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -1007837 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 207.333 chr1 13435292 13435758 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25075 NM_001099852 645425 NM_001099852 ENSG00000204478 PRAMEF20 PRAMEF21 PRAME family member 20 protein-coding 148-61 chr18 10807032 10807337 + 0.666667 NA exon (NM_022068, exon 8 of 52) exon (NM_022068, exon 8 of 52) -47535 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 114.667-158 chr21 14205743 14205999 + 0.666667 NA intron (NM_001303000, intron 1 of 9) intron (NM_001303000, intron 1 of 9) 1078 NM_198996 149998 Hs.139907 NM_145317 ENSG00000188992 LIPI CT17|LPDL|PLA1C|PRED5|mPA-PLA1 beta lipase I protein-coding 209.333-95 chr18 74686299 74686650 + 0.666667 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) intron (NM_001146190, intron 2 of 3) 55511 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 148.333-204 chr2 173430850 173431138 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76122 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 149.667-19 chr1 94317145 94317470 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -69561 NM_001328664 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 159-114 chr7 104341673 104341948 + 0.666667 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 13154 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 161.667-204 chr5 71644999 71645333 + 0.666667 NA intron (NM_022132, intron 12 of 16) intron (NM_022132, intron 12 of 16) 57826 NM_001363147 64087 Hs.604789 NM_022132 ENSG00000131844 MCCC2 MCCB methylcrotonoyl-CoA carboxylase 2 protein-coding 121.333-78 chr2 25451782 25452048 + 0.666667 NA intron (NM_001351393, intron 9 of 17) intron (NM_001351393, intron 9 of 17) -109325 NM_175630 1788 Hs.515840 NM_022552 ENSG00000119772 DNMT3A DNMT3A2|M.HsaIIIA|TBRS DNA methyltransferase 3 alpha protein-coding 227.333-11 chr1 199926211 199926701 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101254 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 158.333-128 chr18 75456727 75457041 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29181 NM_001303482 284274 Hs.666744 NM_001037331 ENSG00000206026 SMIM21 C18orf62 small integral membrane protein 21 protein-coding 112.333-256 chr8 48761431 48761622 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -26215 NR_157026 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 161.667-280 chrX 122894384 122894786 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -289658 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 132-90 chr4 76299499 76299722 + 0.666667 NA intron (NM_001242939, intron 6 of 6) intron (NM_001242939, intron 6 of 6) -6416 NM_003943 8987 Hs.109590 NM_003943 ENSG00000118804 STBD1 GENEX3414|GENX-3414 starch binding domain 1 protein-coding 130.333-11 chr1 99193126 99193418 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71020 NM_001166252 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 153.333-307 chr4 90365568 90365905 + 0.666667 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) intron (NM_207491, intron 3 of 7) 130705 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 113-18 chr10 62486403 62486581 + 0.666667 NA intron (NM_199451, intron 4 of 7) AluSx1|SINE|Alu -33956 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 114.667-193 chr4 59047026 59047359 + 0.666667 NA TTS (NR_133942) TTS (NR_133942) 33619 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 130.333-100 chr2 51083798 51084148 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) intron (NR_135237, intron 2 of 10) 51372 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 178.333-113 chr3 155424418 155424804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61192 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 192.667-113 chr3 146593683 146594215 + 0.666667 NA exon (NM_001321245, exon 4 of 8) exon (NM_001321245, exon 4 of 8) 12267 NM_001321245 389158 Hs.254692 NM_001085420 ENSG00000231213 PLSCR5 - phospholipid scramblase family member 5 protein-coding 146.667-358 chr9 133181568 133181999 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17869 NM_001282632 26301 Hs.495419 NM_021996 ENSG00000148288 GBGT1 A3GALNT|FS|UNQ2513 globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (FORS blood group) protein-coding 111.667-158 chr20 46731726 46731943 + 0.666667 NA intron (NM_030777, intron 4 of 4) intron (NM_030777, intron 4 of 4) 22185 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 156.667-214 chr21 26528965 26529244 + 0.666667 NA intron (NR_135515, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 44182 NM_052954 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 207.667-24 chr12 47580094 47580433 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 125767 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 151-133 chr9 23627706 23628034 + 0.666667 NA intron (NR_121602, intron 9 of 27) intron (NR_121602, intron 9 of 27) 44529 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 112.333-38 chr11 79302558 79302760 + 0.666667 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) intron (NM_001098816, intron 1 of 33) 99450 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 115.667-164 chr4 75826557 75826865 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 75741 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 168.667-188 chr6 63768256 63768723 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 40 of 43) L1PA16|LINE|L1 -38347 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 147.667-127 chr16 73052767 73053206 + 0.666667 NA intron (NM_001164766, intron 1 of 8) intron (NM_001164766, intron 1 of 8) -4858 NM_006885 463 Hs.598297 NM_006885 ENSG00000140836 ZFHX3 ATBF1|ATBT|ZNF927 zinc finger homeobox 3 protein-coding 116.333-91 chr17 60760475 60760670 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) L1MA4A|LINE|L1 82721 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 278.333-15 chr12 56534509 56535024 + 0.666667 NA intron (NM_002898, intron 1 of 13) AluY|SINE|Alu 12946 NM_002898 5939 Hs.505729 NM_002898 ENSG00000076067 RBMS2 SCR3 RNA binding motif single stranded interacting protein 2 protein-coding 123-52 chr17 38856091 38856437 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2543 NM_000978 9349 Hs.406300 NM_000978 ENSG00000125691 RPL23 L23|rpL17 ribosomal protein L23 protein-coding 150.333-73 chr12 14173597 14174022 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -191823 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 120-76 chr20 41784846 41785040 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166566 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 180.333-13 chr10 76645971 76646301 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -241908 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 210.333-61 chr18 12551584 12552027 + 0.666667 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) L1MA3|LINE|L1 104927 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 160.667-242 chr5 41418234 41418539 + 0.666667 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) Charlie16a|DNA|hAT-Charlie 92215 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 145.667-95 chr15 58256469 58256843 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 118275 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 195.333-108 chr2 55805404 55805946 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111831 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 254.667-82 chr8 104008305 104008788 + 0.666667 NA intron (NM_001348500, intron 15 of 20) intron (NM_001348500, intron 15 of 20) 189326 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 115.333-28 chr10 92072136 92072470 + 0.666667 NA intron (NM_001178137, intron 9 of 9) intron (NM_001178137, intron 9 of 9) 148533 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 129.667-37 chr12 24800054 24800433 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 101979 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 143.333-114 chr17 29229955 29230242 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -16759 NM_005208 1411 Hs.46275 NM_005208 ENSG00000108255 CRYBA1 CRYB1|CTRCT10 crystallin beta A1 protein-coding 183-51 chr19 19660478 19660876 + 0.666667 NA intron (NM_020410, intron 1 of 25) AluY|SINE|Alu 2999 NM_020410 57130 Hs.501794 NM_020410 ENSG00000105726 ATP13A1 ATP13A|CGI-152 ATPase 13A1 protein-coding 122.333-129 chr21 45826302 45826580 + 0.666667 NA intron (NM_001348243, intron 3 of 15) L1ME2|LINE|L1 9978 NR_038876 100129027 Hs.689591 NR_038876 ENSG00000205424 LOC100129027 - uncharacterized LOC100129027 ncRNA 137.667-86 chr2 13615593 13615851 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -608709 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 157.333-366 chr9 106350007 106350386 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -250732 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 282.333-65 chrX 84155932 84156588 + 0.666667 NA intron (NM_014496, intron 2 of 21) intron (NM_014496, intron 2 of 21) 31675 NM_001330512 27330 Hs.234478 NM_014496 ENSG00000072133 RPS6KA6 PP90RSK4|RSK-4|RSK4|S6K-alpha-6|p90RSK6 ribosomal protein S6 kinase A6 protein-coding 145.333-149 chr2 172771870 172772288 + 0.666667 NA intron (NM_007023, intron 1 of 30) AluJb|SINE|Alu -35873 NR_026995 91149 Hs.711021 NR_026995 ENSG00000228016 RAPGEF4-AS1 - RAPGEF4 antisense RNA 1 ncRNA 114.333-32 chr10 90094416 90094668 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -137169 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 149-70 chr2 154305798 154306130 + 0.666667 NA intron (NM_052917, intron 9 of 12) intron (NM_052917, intron 9 of 12) 151474 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 163.667-100 chr2 22024712 22025135 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -314271 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 167.667-59 chr14 60064768 60065217 + 0.666667 NA TTS (NM_001355272) TTS (NM_001355272) -26919 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 144-129 chr5 59887857 59888274 + 0.666667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) MIR3|SINE|MIR 5661 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 147.333-258 chr5 28594886 28595178 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -307367 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 123-75 chr3 42142662 42142908 + 0.666667 NA intron (NM_001349247, intron 2 of 16) intron (NM_001349247, intron 2 of 16) -6450 NM_001349249 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 146.667-205 chr21 29532944 29533322 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37086 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 164.333-99 chr18 3558197 3558613 + 0.666667 NA intron (NM_001242762, intron 6 of 9) AluSz|SINE|Alu -35709 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 136.667-84 chr18 8666571 8666922 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40875 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 138-122 chr8 124502655 124503018 + 0.666667 NA intron (NM_001146160, intron 7 of 9) AluJr|SINE|Alu 5740 NR_106903 102466200 NR_106903 ENSG00000284087 MIR6844 hsa-mir-6844 microRNA 6844 ncRNA 160.667-91 chr14 66324305 66324604 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -161917 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 133.333-167 chr7 6170295 6170609 + 0.666667 NA intron (NM_001367581, intron 10 of 13) CpG 1685 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 173-71 chr5 17456178 17456552 + 0.666667 NA intron (NR_134270, intron 1 of 2) intron (NR_134270, intron 1 of 2) 12355 NR_134271 102723526 NR_134270 ENSG00000249662 LINC02218 - long intergenic non-protein coding RNA 2218 ncRNA 166-51 chr17 42396120 42396497 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7813 NM_139276 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 125.667-112 chr21 31686937 31687298 + 0.666667 NA intron (NM_020706, intron 16 of 19) intron (NM_020706, intron 16 of 19) 27495 NM_000454 6647 Hs.443914 NM_000454 ENSG00000142168 SOD1 ALS|ALS1|HEL-S-44|IPOA|SOD|hSod1|homodimer superoxide dismutase 1 protein-coding 151.333-104 chr12 59628893 59629255 + 0.666667 NA intron (NM_001270623, intron 1 of 5) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 33045 NM_001270623 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 144.333-30 chr10 103402765 103403043 + 0.666667 NA intron (NM_014976, intron 3 of 35) AluJb|SINE|Alu 6278 NM_014976 22984 Hs.239499 NM_014976 ENSG00000148843 PDCD11 ALG-4|ALG4|NFBP|RRP5 programmed cell death 11 protein-coding 198.333-157 chr5 28620056 28620543 + 0.666667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -306571 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 180-9 chr1 215397660 215398090 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -169429 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 112-165 chr5 42139753 42139999 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35469 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 114.333-204 chr7 30154685 30154909 + 0.666667 NA intron (NM_152793, intron 2 of 2) intron (NM_152793, intron 2 of 2) 19811 NM_152793 222166 Hs.200100 NM_152793 ENSG00000180354 MTURN C7orf41|Ells1 maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog protein-coding 112-116 chr2 165943561 165943846 + 0.666667 NA intron (NM_024753, intron 4 of 28) intron (NM_024753, intron 4 of 28) 9846 NR_038984 100506134 Hs.672319 NR_038983 TTC21B-AS1 - TTC21B antisense RNA 1 ncRNA 159-26 chr11 81993517 81993827 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) L1MC4|LINE|L1 -102836 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 125-34 chr14 34841519 34841887 + 0.666667 NA intron (NM_013448, intron 3 of 26) intron (NM_013448, intron 3 of 26) -32488 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 143.667-92 chr16 75868908 75869246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142587 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 216.333-51 chr15 91636810 91637200 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 173666 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 293.667-16 chr14 84113974 84114559 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -1157666 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 162-56 chr18 13944236 13944568 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28695 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 176.333-35 chr12 26280873 26281256 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 85491 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 121-139 chr8 127178493 127178781 + 0.666667 NA Intergenic (ATGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 18990 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 162-30 chr12 84808241 84808675 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 104341 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 122.333-9 chr1 114222503 114222852 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -68808 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 156.333-131 chr16 53767018 53767333 + 0.666667 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) intron (NM_001363897, intron 1 of 7) 63019 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 145.333-291 chr8 25265100 25265376 + 0.666667 NA intron (NM_024940, intron 2 of 51) MER5B|DNA|hAT-Charlie -80164 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 136.333-24 chr10 100320653 100320949 + 0.666667 NA intron (NM_016112, intron 2 of 15) L1ME4c|LINE|L1 9427 NM_001253837 9033 Hs.159241 NM_016112 ENSG00000107593 PKD2L1 PCL|PKD2L|PKDL|TRPP3 polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel protein-coding 162.667-279 chr8 118994449 118994801 + 0.666667 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 42362 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 159.667-127 chr16 80113933 80114260 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 318847 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 239.333-57 chr2 130892999 130893358 + 0.666667 NA intron (NM_001367493, intron 1 of 13) intron (NM_001367493, intron 1 of 13) 56264 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 195-17 chr10 71670514 71670960 + 0.666667 NA intron (NM_022124, intron 13 of 67) L2|LINE|L2 49041 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 127-22 chr10 116329870 116330157 + 0.666667 NA intron (NM_198515, intron 3 of 8) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 5565 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 168.333-169 chr5 155860270 155860625 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -466310 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 184.333-49 chr15 61359443 61359859 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -130349 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 152-120 chr4 188953571 188954003 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 177130 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 128.333-50 chr12 82427114 82427334 + 0.666667 NA intron (NR_144941, intron 6 of 11) L2|LINE|L2 -68419 NR_033192 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 112-8 chr1 98780162 98780350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 118535 NM_001364903 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 113-189 chr6 155238893 155239126 + 0.666667 NA intron (NR_146725, intron 6 of 8) intron (NR_146725, intron 6 of 8) 22043 NM_001010927 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 115.667-100 chr17 74714000 74714181 + 0.666667 NA intron (NM_175738, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu -1167 NM_001289083 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 221-74 chrX 109200774 109201135 + 0.666667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie 281132 NM_001522 2986 Hs.123074 NM_001522 ENSG00000101890 GUCY2F CYGF|GC-F|GUC2DL|GUC2F|RETGC-2|ROS-GC2 guanylate cyclase 2F, retinal protein-coding 159-77 chr3 20797838 20798312 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 455607 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 149.667-238 chr20 60049537 60049901 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -6206 NR_161291 284756 Hs.335319 NR_126504 ENSG00000176659 C20orf197 - chromosome 20 open reading frame 197 ncRNA 199.333-304 chr9 106908365 106908906 + 0.666667 NA intron (NM_001347997, intron 1 of 12) L1MC4|LINE|L1 45469 NM_001347997 58499 Hs.370379 NM_021224 ENSG00000148143 ZNF462 ZFPIP|Zfp462 zinc finger protein 462 protein-coding 223.333-57 chr17 76106821 76107178 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3212 NM_001145299 23265 Hs.514496 NM_015219 ENSG00000182473 EXOC7 2-5-3p|BLOM4|EX070|EXO70|EXOC1|Exo70p|YJL085W exocyst complex component 7 protein-coding 123.333 chr1 13528822 13529115 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -14965 NM_001010847 126755 Hs.657356 NM_001010847 ENSG00000162494 LRRC38 - leucine rich repeat containing 38 protein-coding 235.333-92 chr5 17437495 17438035 + 0.666667 NA intron (NR_134273, intron 1 of 1) AluSc5|SINE|Alu 1028 NR_134273 101929544 Hs.23725 NR_134273 ENSG00000248455 LINC02217 - long intergenic non-protein coding RNA 2217 ncRNA 112.333-218 chr5 147952654 147952902 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -46240 NM_206966 389336 Hs.660038 NM_206966 ENSG00000178776 C5orf46 SSSP1 chromosome 5 open reading frame 46 protein-coding 192-64 chr17 73763873 73764329 + 0.666667 NA intron (NR_027146, intron 2 of 3) intron (NR_027146, intron 2 of 3) -22721 NR_040020 400620 Hs.348644 NR_040020 ENSG00000234721 LINC02092 - long intergenic non-protein coding RNA 2092 ncRNA 121.333-150 chr5 113166862 113167136 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) L3b|LINE|CR1 127939 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 194.667-58 chr2 11756964 11757420 + 0.666667 NA intron (NM_001349204, intron 2 of 21) intron (NM_001349204, intron 2 of 21) 8659 NM_001349205 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 183-36 chr14 35594011 35594390 + 0.666667 NA intron (NM_014990, intron 36 of 40) L1MA9|LINE|L1 60036 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 214-6 chr1 101229644 101230194 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 6609 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 119-5 chr1 111115944 111116123 + 0.666667 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -23350 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 159.333-222 chr3 146142170 146142496 + 0.666667 NA intron (NM_182943, intron 1 of 19) intron (NM_182943, intron 1 of 19) 18851 NM_182943 5352 Hs.477866 NM_000935 ENSG00000152952 PLOD2 BRKS2|LH2|TLH procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 protein-coding 113-213 chr9 73943869 73944093 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -427550 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 269.667-28 chr2 23367734 23368263 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -17181 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 142.333-104 chr17 69537647 69538000 + 0.666667 NA intron (NM_001330450, intron 11 of 11) intron (NM_001330450, intron 11 of 11) 35561 NM_001330450 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 139.667-51 chr14 36535912 36536184 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -15816 NM_001079668 7080 Hs.94367 NM_003317 ENSG00000136352 NKX2-1 BCH|BHC|NK-2|NKX2.1|NKX2A|NMTC1|T/EBP|TEBP|TITF1|TTF-1|TTF1 NK2 homeobox 1 protein-coding 156.667-47 chr10 69288256 69288565 + 0.666667 NA intron (NM_033500, intron 2 of 21) FRAM|SINE|Alu 9914 NM_001358263 3098 Hs.370365 NM_000188 ENSG00000156515 HK1 HK|HK1-ta|HK1-tb|HK1-tc|HKD|HKI|HMSNR|HXK1|RP79|hexokinase hexokinase 1 protein-coding 162.667-130 chr2 73429045 73429436 + 0.666667 NA intron (NM_015120, intron 6 of 22) intron (NM_015120, intron 6 of 22) -27863 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 122-81 chr3 172182552 172182764 + 0.666667 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 142127 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 114-107 chr4 89405205 89405404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -97504 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 143.333-100 chr15 54117046 54117377 + 0.666667 NA intron (NM_001329919, intron 2 of 31) L1MA4|LINE|L1 104563 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 146.333-328 chr8 108520045 108520313 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 76555 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 122-78 chr3 132865078 132865342 + 0.666667 NA intron (NR_002811, intron 10 of 10) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -142751 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 199.333-90 chr16 23521741 23522142 + 0.666667 NA TTS (NR_003501) TTS (NR_003501) -11447 NM_015044 23062 Hs.460336 NM_015044 ENSG00000103365 GGA2 VEAR golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2 protein-coding 115.667-4 chr1 67680834 67681179 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4195 NM_001199742 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 245.333-112 chr7 91166238 91166834 + 0.666667 NA intron (NM_012395, intron 13 of 13) intron (NM_012395, intron 13 of 13) -97897 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 174.667-6 chr1 94596788 94597202 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 53293 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 117.667-54 chr15 44635770 44636069 + 0.666667 NA intron (NM_025137, intron 7 of 39) AluSx|SINE|Alu 27743 NM_001160227 80208 Hs.656271 NM_025137 ENSG00000104133 SPG11 ALS5|CMT2X|KIAA1840 SPG11 vesicle trafficking associated, spatacsin protein-coding 160.667-202 chr3 114789120 114789383 + 0.666667 NA intron (NM_001164343, intron 4 of 11) intron (NM_001164343, intron 4 of 11) -30144 NM_001164344 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 148-113 chr4 55482050 55482324 + 0.666667 NA intron (NM_004898, intron 4 of 22) L1PA16|LINE|L1 63745 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 190-127 chr8 127220799 127221293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1778 NR_108049 100507056 Hs.343864 NR_108049 CCAT1 CARLO5|CARLo-5|onco-lncRNA-40 colon cancer associated transcript 1 ncRNA 122.333-95 chr2 69651471 69651667 + 0.666667 NA intron (NM_001320698, intron 1 of 14) AluY|SINE|Alu 7761 NM_001320698 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 156.333-145 chr17 42380741 42381169 + 0.666667 NA intron (NM_213662, intron 1 of 23) MIRb|SINE|MIR 7487 NM_001369514 6774 Hs.463059 NM_003150 ENSG00000168610 STAT3 ADMIO|ADMIO1|APRF|HIES signal transducer and activator of transcription 3 protein-coding 143.333-184 chr3 79947709 79948011 + 0.666667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -179862 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 158-148 chrX 34061563 34061996 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 70551 NM_203408 158724 Hs.143268 NM_203408 ENSG00000185448 FAM47A - family with sequence similarity 47 member A protein-coding 123.333-92 chr17 61157650 61157873 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 209943 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 144.333-193 chr4 92519288 92519666 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 215078 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 128-69 chr3 30545527 30545844 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 26817 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 145-40 chr16 74016232 74016514 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 199148 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 112.667-86 chr16 73255494 73255700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111150 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 210.333-17 chr10 82303080 82303416 + 0.666667 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) L1MEj|LINE|L1 -70328 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 129-122 chr7 28709852 28710211 + 0.666667 NA intron (NM_001011666, intron 1 of 6) intron (NM_001011666, intron 1 of 6) 23898 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 205-104 chr8 127614791 127615327 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 118908 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 123.333-230 chr9 68660620 68660865 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -44498 NM_003558 8395 Hs.534371 NM_003558 ENSG00000107242 PIP5K1B MSS4|STM7 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 beta protein-coding 123.667-2 chr1 31908259 31908444 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001369859, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001369859, exon 7 of 7) 29467 NM_001369860 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 131-3 chr1 73645088 73645445 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29413 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 131.333-194 chr9 76056969 76057237 + 0.666667 NA intron (NR_120409, intron 5 of 19) intron (NR_120409, intron 5 of 19) 166430 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 238.667-29 chr15 26310428 26310818 + 0.666667 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 194810 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 155-86 chr3 38699246 38699552 + 0.666667 NA intron (NM_006514, intron 26 of 26) intron (NM_006514, intron 26 of 26) -49712 NM_001160160 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 156-33 chr12 13343057 13343363 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 33535 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 118.333-131 chr3 45960609 45960907 + 0.666667 NA intron (NM_024513, intron 11 of 17) L1MC5|LINE|L1 17294 NM_006564 10663 Hs.34526 NM_006564 ENSG00000172215 CXCR6 BONZO|CD186|STRL33|TYMSTR C-X-C motif chemokine receptor 6 protein-coding 188.667-76 chr2 100338011 100338361 + 0.666667 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -15453 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 143.333-271 chr7 93739497 93739819 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 22730 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 161.667-73 chr14 51097055 51097376 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1511 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 144.667-145 chr2 101334003 101334309 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 24706 NR_049881 100847007 NR_049881 ENSG00000264857 MIR5696 - microRNA 5696 ncRNA 135.667-43 chr13 31650796 31651054 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -88601 NM_130806 122042 Hs.680763 NM_130806 ENSG00000133105 RXFP2 GPR106|GREAT|INSL3R|LGR8|LGR8.1|RXFPR2 relaxin family peptide receptor 2 protein-coding 156.333-303 chr6 34720488 34720923 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 23760 NR_134626 101929243 Hs.643498 NR_134625 ENSG00000272288 LOC101929243 - uncharacterized LOC101929243 ncRNA 121-90 chr3 28951670 28951898 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 329155 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 158.333-275 chr6 54354130 54354515 + 0.666667 NA intron (NM_014464, intron 8 of 10) intron (NM_014464, intron 8 of 10) 45881 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 145.333-155 chr2 224832956 224833328 + 0.666667 NA intron (NM_001290263, intron 26 of 55) L2a|LINE|L2 113907 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 137-78 chr5 22396702 22396987 + 0.666667 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) LTR45C|LTR|ERV1 -182994 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 156-84 chr22 39795507 39795920 + 0.666667 NA intron (NM_152512, intron 5 of 6) AluJo|SINE|Alu 98047 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 162.667-289 chr9 3253034 3253402 + 0.666667 NA intron (NM_134428, intron 15 of 17) intron (NM_134428, intron 15 of 17) 71629 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 188.333-28 chr11 59461475 59462000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4776 NM_001004708 219983 Hs.553650 NM_001004708 ENSG00000166884 OR4D6 OR11-250 olfactory receptor family 4 subfamily D member 6 protein-coding 236.667-37 chr2 12166122 12166645 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 2 of 5) MLT2A1|LTR|ERVL -32747 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 119-38 chr12 117748030 117748314 + 0.666667 NA intron (NM_173598, intron 4 of 19) L1MA7|LINE|L1 220818 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 236.333-34 chr17 42038159 42038681 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001242704) promoter-TSS (NM_001242704) -394 NM_001242704 201181 Hs.443140 NM_001013624 ENSG00000187595 ZNF385C - zinc finger protein 385C protein-coding 147-121 chr6 74453816 74454101 + 0.666667 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) LTR50|LTR|ERVL 384507 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 117-136 chr7 109049628 109049875 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -165164 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 114.333-193 chr6 52592636 52592874 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 15457 NR_103447 401264 Hs.544586 NR_103446 ENSG00000225791 TRAM2-AS1 - TRAM2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 115.667-69 chr14 31749783 31750064 + 0.666667 NA intron (NM_001201574, intron 1 of 5) L1M2|LINE|L1 35354 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 217.333-131 chr6 96913023 96913657 + 0.666667 NA intron (NM_001323258, intron 2 of 7) intron (NM_001323258, intron 2 of 7) -11280 NM_001286251 114792 Hs.45056 NM_052904 ENSG00000186231 KLHL32 BKLHD5|KIAA1900|UG0030H05|dJ21F7.1 kelch like family member 32 protein-coding 114.333-85 chr17 31166904 31167091 + 0.666667 NA intron (NM_001042492, intron 4 of 57) intron (NM_001042492, intron 4 of 57) 72020 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 132.333-165 chr7 58106854 58107089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 656794 NM_001159279 441234 Hs.533121 NM_001159279 ENSG00000182111 ZNF716 - zinc finger protein 716 protein-coding 144-121 chr4 54838196 54838611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 180475 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 143.667-155 chr3 33355540 33355814 + 0.666667 NA intron (NR_146129, intron 4 of 15) intron (NR_146129, intron 4 of 15) 78235 NR_146133 25827 Hs.475872 NM_012157 ENSG00000153558 FBXL2 FBL2|FBL3 F-box and leucine rich repeat protein 2 protein-coding 141.667-197 chr6 80381791 80382168 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 275308 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 173.333-77 chr18 3160669 3161051 + 0.666667 NA intron (NM_019856, intron 10 of 36) intron (NM_019856, intron 10 of 36) 59108 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 207-40 chr14 71063412 71063901 + 0.666667 NA intron (NM_014982, intron 26 of 35) intron (NM_014982, intron 26 of 35) 156197 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 183.667-50 chr15 64498224 64498746 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_015042) promoter-TSS (NM_015042) -935 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 142-109 chr4 158443775 158444032 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77811 NM_001253730 59350 Hs.591686 NM_021634 ENSG00000171509 RXFP1 LGR7|RXFPR1 relaxin family peptide receptor 1 protein-coding 196.333-81 chr2 37729977 37730394 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57650 NM_001270436 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 125.333-13 chr1 160679874 160680202 + 0.666667 NA TTS (NM_001256030) TTS (NM_001256030) 31784 NM_001778 962 Hs.243564 NM_001778 ENSG00000117091 CD48 BCM1|BLAST|BLAST1|MEM-102|SLAMF2|hCD48|mCD48 CD48 molecule protein-coding 135.667-32 chr12 10731395 10731716 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8232 NM_001145426 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 172.667-103 chr4 23019042 23019458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 305161 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 205-75 chr5 167609752 167610318 + 0.666667 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) MER21B|LTR|ERVL 36376 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 180.667-66 chr2 111927741 111928131 + 0.666667 NA intron (NM_006343, intron 1 of 18) intron (NM_006343, intron 1 of 18) 29329 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 135.667-16 chr10 56996684 56997038 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 307698 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 134.667-150 chr4 125538082 125538442 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31003 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 124.333-108 chr20 63845442 63845739 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -14326 NM_001369741 140685 Hs.585028 NM_025224 ENSG00000130584 ZBTB46 BTBD4|BZEL|RINZF|ZNF340|dJ583P15.7|dJ583P15.8 zinc finger and BTB domain containing 46 protein-coding 166.667-141 chr22 27344188 27344610 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 33748 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 112-40 chr12 4271187 4271361 + 0.666667 NA intron (NR_149145, intron 1 of 3) CpG -2488 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 192.333-93 chr2 106002027 106002464 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -63443 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 204.333-67 chr16 9540401 9540975 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85183 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 117-143 chr8 80783781 80783969 + 0.666667 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) L1MC1|LINE|L1 90593 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 221.666 chr1 13996208 13996844 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 247111 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 147.667-166 chr2 36964603 36964905 + 0.666667 NA intron (NM_003162, intron 1 of 17) L2a|LINE|L2 1782 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 186-51 chr2 145608653 145609133 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 940926 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 112.667-78 chr15 79579624 79579840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 147216 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 185-72 chr7 124553745 124554151 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201852 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 157.333-346 chr8 120155970 120156294 + 0.666667 NA intron (NM_021110, intron 2 of 47) intron (NM_021110, intron 2 of 47) 31030 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 163.667-26 chr10 68928571 68928911 + 0.666667 NA intron (NM_024045, intron 8 of 14) intron (NM_024045, intron 8 of 14) 27426 NM_024045 79009 Hs.522984 NM_024045 ENSG00000107625 DDX50 GU2|GUB|RH-II/GuB|mcdrh DExD-box helicase 50 protein-coding 113-205 chr8 94964300 94964586 + 0.666667 NA intron (NM_001354534, intron 2 of 8) AluJo|SINE|Alu 14883 NR_148907 137682 Hs.435500 NM_152416 ENSG00000156170 NDUFAF6 C8orf38|MC1DN17 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6 protein-coding 194.667-26 chr11 39780104 39780543 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 512807 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 129.667-82 chr19 3408061 3408348 + 0.666667 NA intron (NM_001245002, intron 2 of 10) intron (NM_001245002, intron 2 of 10) 41621 NM_001245002 4782 Hs.170131 NM_005597 ENSG00000141905 NFIC CTF|CTF5|NF-I|NFI nuclear factor I C protein-coding 160.667-42 chr10 85750525 85750859 + 0.666667 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) L1M5|LINE|L1 172961 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 153-122 chr6 153245698 153246012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114573 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 125.667-12 chr1 119675177 119675403 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27024 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 124.667-4 chr1 48714638 48714829 + 0.666667 NA intron (NR_136623, intron 5 of 12) L2a|LINE|L2 62158 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 134.333-184 chr8 140977836 140978092 + 0.666667 NA intron (NM_001352719, intron 1 of 32) L1PA4|LINE|L1 23040 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 140.667-197 chr6 57315909 57316254 + 0.666667 NA intron (NM_001282488, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 1276 NM_001282488 5558 Hs.654580 NM_000947 ENSG00000146143 PRIM2 PRIM2A|p58 DNA primase subunit 2 protein-coding 155-17 chr10 102054638 102055013 + 0.666667 NA intron (NM_024541, intron 1 of 25) AluSq2|SINE|Alu 1348 NM_024541 79591 Hs.16004 NM_024541 ENSG00000120029 ARMH3 C10orf76 armadillo like helical domain containing 3 protein-coding 164.667-201 chr6 53792017 53792434 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -2780 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 138.333-98 chr2 158753544 158753915 + 0.666667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -18727 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-101 chr2 73180013 73180290 + 0.666667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -22423 NM_001134462 344022 Hs.694384 NM_001134462 ENSG00000214513 NOTO - notochord homeobox protein-coding 135.667-46 chr13 66485709 66485954 + 0.666667 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) AluSq2|SINE|Alu 267581 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 243.667-49 chr3 65487105 65487520 + 0.666667 NA intron (NM_001365904, intron 3 of 24) L2b|LINE|L2 -406504 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 115.667-99 chr17 70135106 70135328 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001291622, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001291622, exon 6 of 6) 30372 NM_001291623 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 142.333-16 chr1 248343910 248344217 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4712 NM_001001918 127066 Hs.553583 NM_001001918 ENSG00000177174 OR14C36 OR5BF1 olfactory receptor family 14 subfamily C member 36 protein-coding 132-69 chr20 7324927 7325264 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17663 NR_135005 101929288 Hs.738005 NR_135005 ENSG00000261249 LINC01751 - long intergenic non-protein coding RNA 1751 ncRNA 159.667-279 chr6 36946364 36946750 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1706 NM_001199159 221476 Hs.25391 NM_153370 ENSG00000164530 PI16 CD364|CRISP9|MSMBBP|PSPBP peptidase inhibitor 16 protein-coding 179.333-102 chr2 148285007 148285460 + 0.666667 NA intron (NM_018328, intron 4 of 14) intron (NM_018328, intron 4 of 14) -263629 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 153-76 chr2 126952192 126952600 + 0.666667 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 53506 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 164-8 chr1 116450696 116451135 + 0.666667 NA intron (NR_125972, intron 2 of 3) intron (NR_125972, intron 2 of 3) 27911 NR_125973 101929023 Hs.668091 NR_125972 ENSG00000233154 LINC01762 - long intergenic non-protein coding RNA 1762 ncRNA 200-140 chr5 163555193 163555725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49840 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 295-31 chr3 105396365 105396928 + 0.666667 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 29737 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 191.333-24 chr10 49142196 49142696 + 0.666667 NA intron (NR_038973, intron 3 of 5) LTR51|LTR|ERV1 -8426 NM_001164484 170370 Hs.646291 NM_001164484 ENSG00000172538 FAM170B C10orf73 family with sequence similarity 170 member B protein-coding 126.667-135 chr5 34844675 34844965 + 0.666667 NA intron (NM_001317949, intron 2 of 10) intron (NM_001317949, intron 2 of 10) 5439 NM_001317949 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 204.666-88 chr7 66213249 66213853 + 0.666667 NA intron (NM_003596, intron 1 of 5) AluY|SINE|Alu 8217 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 201-117 chr9 92790330 92790782 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 17531 NR_136301 101929748 Hs.551296 NR_136301 LOC101929748 - uncharacterized LOC101929748 ncRNA 147.667-110 chr14 86806129 86806417 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -99505 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 191.333-70 chr15 33245188 33245600 + 0.666667 NA intron (NR_046005, intron 3 of 8) intron (NR_046005, intron 3 of 8) 2161 NR_046005 100652857 Hs.439998 NR_046005 TMCO5B - transmembrane and coiled-coil domains 5B (pseudogene) pseudo 212.333-30 chr12 19231905 19232498 + 0.666667 NA intron (NM_001256787, intron 1 of 25) intron (NM_001256787, intron 1 of 25) 26876 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 122-77 chr3 127646904 127647171 + 0.666667 NA intron (NM_015720, intron 2 of 7) intron (NM_015720, intron 2 of 7) 17852 NM_015720 50512 Hs.591290 NM_015720 ENSG00000114631 PODXL2 EG|PODLX2 podocalyxin like 2 protein-coding 115.333-68 chr14 55646060 55646247 + 0.666667 NA intron (NR_073129, intron 19 of 45) intron (NR_073129, intron 19 of 45) 65946 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 201-88 chr5 25954210 25954648 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 763476 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 244.667-72 chr4 82509988 82510412 + 0.666667 NA intron (NM_001353454, intron 1 of 7) AluSc8|SINE|Alu 51788 NM_001353455 441027 Hs.507676 NM_001080506 ENSG00000249242 TMEM150C TTN3 transmembrane protein 150C protein-coding 132-70 chr20 8574973 8575242 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) MIR3|SINE|MIR -256078 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 135.667-107 chr20 61433252 61433468 + 0.666667 NA intron (NM_001794, intron 2 of 15) L1ME1|LINE|L1 -66061 NM_001252338 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 184.333-89 chr20 49859589 49860016 + 0.666667 NA intron (NR_048539, intron 7 of 13) intron (NR_048539, intron 7 of 13) -4057 NR_162136 113219455 NR_162136 MIR12122 - microRNA 12122 ncRNA 127.333-166 chr7 3681602 3681821 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L2a|LINE|L2 380459 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 122-35 chr14 74395871 74396100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30225 NM_001105579 646658 Hs.12400 NM_001105579 ENSG00000183379 SYNDIG1L CAPUCIN|DSPC1|IFITMD4|TMEM90A synapse differentiation inducing 1 like protein-coding 183.333-117 chr4 82089546 82090022 + 0.666667 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL 284207 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 121.667-32 chr10 100855881 100856164 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -56941 NM_001243770 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 131-43 chr18 41752249 41752551 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -202834 NM_002647 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 187.333-56 chr13 95537872 95538339 + 0.666667 NA intron (NM_182848, intron 1 of 4) intron (NM_182848, intron 1 of 4) -4195 NR_046533 100874194 Hs.569229 NR_046533 ENSG00000223392 CLDN10-AS1 - CLDN10 antisense RNA 1 ncRNA 153-149 chr8 135392266 135392637 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -65005 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 165.667-83 chr2 13155707 13155977 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -148829 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 156.667-206 chr20 32705161 32705602 + 0.666667 NA intron (NM_001099339, intron 5 of 8) AluY|SINE|Alu -31440 NM_182584 284805 Hs.353262 NM_182584 ENSG00000198547 C20orf203 - chromosome 20 open reading frame 203 protein-coding 157.333-344 chr8 117958337 117958712 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -37611 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 149.667-322 chr5 89830340 89830650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 186225 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 113.667-123 chr20 47592879 47593099 + 0.666667 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) AluSq|SINE|Alu 91102 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 146.333-68 chr12 126780365 126780657 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8249 NR_033878 387895 Hs.534660 NR_033878 LINC00944 - long intergenic non-protein coding RNA 944 ncRNA 157.333-354 chr8 137939624 137939946 + 0.666667 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 143760 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 133.667-50 chr14 45115959 45116271 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_017922, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_017922, exon 14 of 14) 5240 NR_003691 100113389 Hs.712501 NR_003691 ENSG00000239043 SNORD127 - small nucleolar RNA, C/D box 127 snoRNA 200-8 chr1 111694190 111694671 + 0.666667 NA intron (NM_001370216, intron 2 of 7) intron (NM_001370216, intron 2 of 7) 29636 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 128-42 chr2 43813902 43814111 + 0.666667 NA intron (NM_022436, intron 12 of 12) AluSz6|SINE|Alu 24833 NM_022436 64240 Hs.132992 NM_022436 ENSG00000138075 ABCG5 STSL ATP binding cassette subfamily G member 5 protein-coding 165-79 chr5 97657648 97657989 + 0.666667 NA intron (NR_105028, intron 2 of 3) intron (NR_105028, intron 2 of 3) 153122 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 193-40 chr2 16929371 16929807 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -263755 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 162.333-74 chr14 64985698 64986014 + 0.666667 NA intron (NM_001202559, intron 3 of 13) AluJr|SINE|Alu -1039 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 119-3 chr1 68885224 68885473 + 0.666667 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -170550 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 121-83 chr20 20751048 20751354 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38557 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 121.667-84 chr19 17575702 17575939 + 0.666667 NA intron (NM_024656, intron 6 of 11) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 20171 NM_024656 79709 Hs.418795 NM_024656 ENSG00000130309 COLGALT1 BSVD3|ColGalT 1|GLT25D1 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1 protein-coding 160.667-168 chr2 202089851 202090175 + 0.666667 NA intron (NR_135244, intron 3 of 3) MER117|DNA|hAT-Charlie 16758 NM_001367720 100652824 Hs.686898 NM_001080445 ENSG00000182329 KIAA2012 - KIAA2012 protein-coding 182.333-57 chr15 81181055 81181415 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15644 NM_001352685 3603 Hs.459095 NM_004513 ENSG00000172349 IL16 LCF|NIL16|PRIL16|prIL-16 interleukin 16 protein-coding 148.667-175 chr2 30103546 30103932 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43268 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 118-113 chr6 55169792 55170093 + 0.666667 NA intron (NM_001526, intron 1 of 7) intron (NM_001526, intron 1 of 7) 63482 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 124.333-107 chr20 56422388 56422715 + 0.666667 NA intron (NM_001164116, intron 2 of 6) intron (NM_001164116, intron 2 of 6) 10291 NM_001164115 57091 Hs.473144 NM_020356 ENSG00000087589 CASS4 C20orf32|CAS4|HEFL|HEPL Cas scaffold protein family member 4 protein-coding 160.667-77 chr12 129364304 129364585 + 0.666667 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) intron (NM_133448, intron 3 of 8) 155843 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 146.333-102 chr15 47449783 47450208 + 0.666667 NA intron (NM_001198999, intron 2 of 19) intron (NM_001198999, intron 2 of 19) 265906 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 184.333-86 chr2 196295788 196296319 + 0.666667 NA intron (NM_020760, intron 13 of 28) intron (NM_020760, intron 13 of 28) 36029 NR_110226 101927482 Hs.191841 NR_110225 HECW2-AS1 - HECW2 antisense RNA 1 ncRNA 148.333-233 chr21 23402707 23402978 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18007 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 116-79 chr2 108035339 108035609 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 17281 NR_135071 107178918 NR_135071 ENSG00000231221 LINC01593 - long intergenic non-protein coding RNA 1593 ncRNA 212-61 chr15 80388274 80388901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15795 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 118.667-174 chr6 163568673 163568963 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_206855, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_206855, exon 6 of 6) 102666 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 179.667-126 chr7 71400722 71401026 + 0.666667 NA intron (NM_022479, intron 3 of 10) L2|LINE|L2 -93104 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 115.333-24 chr10 59445851 59446151 + 0.666667 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -82820 NM_001347842 220965 Hs.607594 NM_198215 ENSG00000148541 FAM13C FAM13C1 family with sequence similarity 13 member C protein-coding 173-20 chr12 45613748 45614039 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 114028 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 176-39 chr16 17545479 17545824 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -74691 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 116.333-85 chr17 27216365 27216551 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 77538 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 227.667-58 chr5 20063135 20063563 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) (TTTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -75149 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 151.667-363 chr8 69687440 69687797 + 0.666667 NA intron (NM_001146009, intron 4 of 7) L1ME4a|LINE|L1 94718 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 114.667-217 chr5 129167293 129167543 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 69730 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 130.667-10 chr1 93813193 93813447 + 0.666667 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) intron (NM_001261408, intron 2 of 13) -33512 NR_030621 100126348 NR_030621 ENSG00000211575 MIR760 MIRN760|hsa-mir-760|mir-760 microRNA 760 ncRNA 159.667-291 chr7 7747815 7748149 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -29375 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 122.333-50 chr13 55603758 55604099 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 429474 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 114.667-125 chr2 33600756 33601023 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1527 NM_001304538 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 204.667-48 chr15 36550652 36551104 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28748 NM_001321759 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 196.667-41 chr14 35157229 35157692 + 0.666667 NA intron (NM_014672, intron 4 of 7) intron (NM_014672, intron 4 of 7) 34908 NM_001256681 9692 Hs.458487 NM_014672 ENSG00000100890 PRORP KIAA0391|MRPP3 protein only RNase P catalytic subunit protein-coding 174-96 chr8 76649813 76650201 + 0.666667 NA intron (NR_024360, intron 2 of 3) L1MC1|LINE|L1 -31240 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 197.666-2 chr1 157826229 157826800 + 0.666667 NA TTS (NM_001347698) TTS (NM_001347698) -6394 NM_001159397 115350 Hs.656112 NM_052938 ENSG00000163534 FCRL1 CD307a|FCRH1|IFGP1|IRTA5 Fc receptor like 1 protein-coding 200.667-100 chr21 28768158 28768596 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 116990 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 130-135 chr9 106674748 106675029 + 0.666667 NA intron (NR_104145, intron 6 of 6) intron (NR_104145, intron 6 of 6) 58830 NR_104145 100996590 Hs.147110 NR_104145 ENSG00000234323 LINC01505 - long intergenic non-protein coding RNA 1505 ncRNA 150.333-419 chr8 120173464 120173761 + 0.666667 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) (ATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 48510 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 141-12 chr10 125450817 125451186 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -123370 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 131.333-41 chr12 8991268 8991649 + 0.666667 NA intron (NM_001329102, intron 2 of 5) L1ME4b|LINE|L1 1833 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 126-37 chr16 14282019 14282246 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -20156 NR_132983 100129781 Hs.190748 NR_132983 MIR193BHG - MIR193B host gene ncRNA 117.667-32 chr12 3404036 3404232 + 0.666667 NA intron (NM_001256536, intron 1 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 22785 NM_001256536 56341 Hs.504530 NM_019854 ENSG00000111218 PRMT8 HRMT1L3|HRMT1L4 protein arginine methyltransferase 8 protein-coding 152-144 chr7 33274135 33274430 + 0.666667 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) intron (NM_198428, intron 9 of 22) 144718 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 170.667-128 chr4 114346920 114347282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -251301 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 153-42 chr13 70044155 70044476 + 0.666667 NA intron (NM_020866, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 -62898 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 114.667-190 chr4 46250452 46250756 + 0.666667 NA exon (NM_001330690, exon 11 of 11) exon (NM_001330690, exon 11 of 11) -126550 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 137.333-30 chr11 104487051 104487344 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 122105 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 114.333-60 chr12 113810027 113810204 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -36432 NR_110025 100506465 Hs.211461 NR_110025 ENSG00000249550 LINC01234 LCAL84|onco-lncRNA-32 long intergenic non-protein coding RNA 1234 ncRNA 175.333-144 chr5 78609515 78609892 + 0.666667 NA intron (NM_005779, intron 2 of 4) intron (NM_005779, intron 2 of 4) 39069 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 131-74 chr4 185528936 185529284 + 0.666667 NA intron (NM_001114107, intron 1 of 6) intron (NM_001114107, intron 1 of 6) 6448 NM_001257963 27295 Hs.701364 NM_014476 ENSG00000154553 PDLIM3 ALP PDZ and LIM domain 3 protein-coding 131.667-67 chr16 20783160 20783408 + 0.666667 NA intron (NM_005622, intron 7 of 13) MER21C|LTR|ERVL 19270 NM_005622 6296 Hs.706754 NM_005622 ENSG00000005187 ACSM3 SA|SAH acyl-CoA synthetase medium chain family member 3 protein-coding 140-67 chr2 203781009 203781266 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 74498 NM_006139 940 Hs.443123 NM_006139 ENSG00000178562 CD28 Tp44 CD28 molecule protein-coding 140.667-207 chr7 2309607 2309991 + 0.666667 NA intron (NM_013321, intron 1 of 10) intron (NM_013321, intron 1 of 10) 4642 NM_013321 29886 Hs.584900 NM_013321 ENSG00000106266 SNX8 Mvp1 sorting nexin 8 protein-coding 151.667-110 chr14 48324060 48324395 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -529213 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 141.333-78 chr17 59754724 59755016 + 0.666667 NA intron (NM_001329401, intron 4 of 9) intron (NM_001329401, intron 4 of 9) 47216 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 158.667-43 chr10 76893374 76893688 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 26 of 28) AluSx1|SINE|Alu 5487 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 175.667-44 chr14 88045689 88046053 + 0.666667 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) L2|LINE|L2 -19559 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 157.333-244 chr3 137126812 137127266 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 169056 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 118.333-200 chr8 20243106 20243441 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 30262 NM_001362884 11178 Hs.521432 NM_021020 ENSG00000061337 LZTS1 F37|FEZ1 leucine zipper tumor suppressor 1 protein-coding 152.667-247 chr3 89758876 89759154 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 651394 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 136.333-43 chr12 60577766 60578160 + 0.666667 NA Intergenic LTR22|LTR|ERVK 888593 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 275-34 chr3 127602196 127602721 + 0.666667 NA intron (NR_073375, intron 2 of 15) MIR1_Amn|SINE|MIR 4047 NM_004526 4171 Hs.477481 NM_004526 ENSG00000073111 MCM2 BM28|CCNL1|CDCL1|D3S3194|DFNA70|MITOTIN|cdc19 minichromosome maintenance complex component 2 protein-coding 162.333-188 chr4 130026301 130026754 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 254908 NR_151713 107986313 Hs.112740 NR_151713 ENSG00000249618 LINC02465 - long intergenic non-protein coding RNA 2465 ncRNA 150-153 chr8 138027067 138027398 + 0.666667 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 56313 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 167.667-210 chr8 123516883 123517249 + 0.666667 NA intron (NM_148177, intron 1 of 5) intron (NM_148177, intron 1 of 5) 15077 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 161.333-227 chr5 16899715 16900153 + 0.666667 NA intron (NM_012334, intron 1 of 40) AluSx1|SINE|Alu 36354 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 189.333-91 chr2 44853078 44853543 + 0.666667 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 85578 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 292.666-3 chr1 199531811 199532652 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 383633 NR_147896 400800 Hs.369324 NR_147896 ENSG00000231718 LINC02789 - long intergenic non-protein coding RNA 2789 ncRNA 149-149 chr8 118434003 118434407 + 0.666667 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) intron (NM_001349811, intron 3 of 4) -186796 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 206.667-135 chr8 22536031 22536477 + 0.666667 NA intron (NM_001243975, intron 12 of 12) intron (NM_001243975, intron 12 of 12) -15673 NM_005775 10174 Hs.528572 NM_005775 ENSG00000120896 SORBS3 SCAM-1|SCAM1|SH3D4 sorbin and SH3 domain containing 3 protein-coding 255.333-96 chr7 51803512 51804161 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -410580 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 209.333-25 chr10 96781960 96782430 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 31929 NR_026712 728658 Hs.645344 NR_026712 ENSG00000236552 RPL13AP5 RPL13A_8_1086|bA196N24.2 ribosomal protein L13a pseudogene 5 pseudo 138.333-199 chr8 127675593 127675870 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58236 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 143.333-46 chr11 10282107 10282378 + 0.666667 NA intron (NM_030962, intron 1 of 39) L2|LINE|L2 11965 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 159.333-246 chr4 173251541 173251841 + 0.666667 NA intron (NM_017423, intron 2 of 11) intron (NM_017423, intron 2 of 11) -16469 NR_036093 100422849 NR_036093 ENSG00000221296 MIR548T - microRNA 548t ncRNA 143-23 chr11 49575195 49575472 + 0.666667 NA intron (NR_027044, intron 1 of 6) intron (NR_027044, intron 1 of 6) 16805 NR_027044 440040 Hs.655746 NR_027044 ENSG00000205035 LOC440040 - glutamate metabotropic receptor 5 pseudogene pseudo 157.333-4 chr1 27939653 27940091 + 0.666667 NA intron (NM_001009568, intron 1 of 6) AluJr4|SINE|Alu 4872 NM_014474 27293 Hs.123659 NM_014474 ENSG00000130768 SMPDL3B ASML3B sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3B protein-coding 167.667-115 chr2 239855369 239855712 + 0.666667 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 87554 NR_039949 100616417 NR_039949 ENSG00000264279 MIR4786 mir-4786 microRNA 4786 ncRNA 114-149 chr7 98296195 98296460 + 0.666667 NA intron (NM_018842, intron 12 of 13) intron (NM_018842, intron 12 of 13) 14641 NM_001159491 25798 Hs.567438 NM_015379 ENSG00000164713 BRI3 I3 brain protein I3 protein-coding 165-94 chr8 61524748 61525161 + 0.666667 NA intron (NM_004318, intron 22 of 24) intron (NM_004318, intron 22 of 24) 164857 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 282.333-57 chr8 5036433 5037016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41810 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 114.333-142 chr3 23539300 23539485 + 0.666667 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) intron (NM_001370225, intron 5 of 5) -266563 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 113-162 chr4 160782207 160782466 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -1004552 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 205.667-10 chr1 160189326 160189779 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1023 NM_001231 844 Hs.632476 NM_001231 ENSG00000143318 CASQ1 CASQ|PDIB1|VMCQA calsequestrin 1 protein-coding 120.667-105 chr20 32810854 32811175 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8940 NM_012325 22919 Hs.472437 NM_012325 ENSG00000101367 MAPRE1 EB1 microtubule associated protein RP/EB family member 1 protein-coding 141-51 chr3 43433627 43433936 + 0.666667 NA intron (NM_001346464, intron 12 of 13) intron (NM_001346464, intron 12 of 13) -81819 NR_046757 100873954 Hs.600984 NR_046757 SNRK-AS1 - SNRK antisense RNA 1 ncRNA 200.333-159 chr8 119157234 119157762 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50865 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 181.667-108 chr4 73533813 73534118 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25162 NR_046377 728040 Hs.640574 NR_046377 ENSG00000250436 LINC02499 - long intergenic non-protein coding RNA 2499 ncRNA 138.667-179 chr6 41638598 41638887 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_005586, exon 2 of 5) 5' UTR (NM_005586, exon 2 of 5) 274 NM_001300805 4188 Hs.520119 NM_005586 ENSG00000112559 MDFI I-MF|I-mfa MyoD family inhibitor protein-coding 149-7 chr1 145913149 145913569 + 0.666667 NA intron (NM_001184795, intron 3 of 3) L1MA9|LINE|L1 -3170 NM_001303041 8515 Hs.158237 NM_003637 ENSG00000143127 ITGA10 PRO827 integrin subunit alpha 10 protein-coding 141.667-185 chr5 130084302 130084586 + 0.666667 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) MER4D1|LTR|ERV1 179979 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 124.333-72 chr18 56083166 56083358 + 0.666667 NA TTS (NR_040025) TTS (NR_040025) 40984 NR_146511 102724698 NR_146510 ENSG00000267057 LINC01905 - long intergenic non-protein coding RNA 1905 ncRNA 126-26 chr13 47398366 47398586 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -501400 NM_001165947 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 132-67 chr2 237342671 237342990 + 0.666667 NA intron (NM_057166, intron 33 of 40) intron (NM_057166, intron 33 of 40) 71334 NM_057165 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 167.667-225 chrX 81168140 81168504 + 0.666667 NA intron (NM_030763, intron 1 of 6) MamGyp-int|LTR|Gypsy 33591 NM_030763 79366 Hs.282204 NM_030763 ENSG00000198157 HMGN5 NBP-45|NSBP1 high mobility group nucleosome binding domain 5 protein-coding 176-17 chr11 17446776 17447203 + 0.666667 NA intron (NR_147094, intron 8 of 37) intron (NR_147094, intron 8 of 37) 29856 NM_001287174 6833 Hs.54470 NM_000352 ENSG00000006071 ABCC8 ABC36|HHF1|HI|HRINS|MRP8|PHHI|SUR|SUR1|SUR1delta2|TNDM2 ATP binding cassette subfamily C member 8 protein-coding 152.333-314 chr5 132523239 132523549 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 20128 NM_000879 3567 Hs.2247 NM_000879 ENSG00000113525 IL5 EDF|IL-5|TRF interleukin 5 protein-coding 129-108 chr6 17517572 17517838 + 0.666667 NA intron (NM_006366, intron 7 of 12) AluSq|SINE|Alu -6440 NR_110855 101928491 Hs.622876 NR_110855 LOC101928491 - uncharacterized LOC101928491 ncRNA 194.333-23 chr10 78072354 78072743 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 38685 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 202.333-70 chr16 65499531 65499962 + 0.666667 NA intron (NR_027755, intron 2 of 8) intron (NR_027755, intron 2 of 8) 76554 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 142.667-47 chr13 60966005 60966283 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 233736 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 114-8 chr1 164619818 164620084 + 0.666667 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 60229 NM_001353130 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 168-23 chr12 69983066 69983458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 158035 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 124.333-12 chr1 186943723 186944090 + 0.666667 NA intron (NM_024420, intron 10 of 17) L2|LINE|L2 114957 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 171.667-27 chr11 33114892 33115285 + 0.666667 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) intron (NM_001326, intron 3 of 20) 38938 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 128.333-103 chr2 99976550 99976827 + 0.666667 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) intron (NM_001025108, intron 6 of 23) 128895 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 164.333-108 chr19 47259197 47259552 + 0.666667 NA intron (NM_015603, intron 3 of 11) L2b|LINE|L2 2849 NM_015603 26093 Hs.227782 NM_015603 ENSG00000105321 CCDC9 - coiled-coil domain containing 9 protein-coding 116.333-216 chr9 16407741 16408000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -131557 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 121.333-13 chr1 202215447 202215664 + 0.666667 NA intron (NM_001017404, intron 1 of 15) intron (NM_001017404, intron 1 of 15) 1400 NM_001017404 59352 Hs.497402 NM_021636 ENSG00000133067 LGR6 GPCR|VTS20631 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 6 protein-coding 137.333-118 chr22 26739448 26739775 + 0.666667 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR 66768 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 143-113 chr7 29215542 29215947 + 0.666667 NA intron (NM_001293072, intron 1 of 12) intron (NM_001293072, intron 1 of 12) -6774 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 176.333-117 chr4 44243861 44244181 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 204788 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 197-86 chr4 166476372 166476794 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 603346 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 206-192 chr9 83104374 83104941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41515 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 114-94 chr3 171615740 171615962 + 0.666667 NA intron (NM_002662, intron 24 of 26) L1ME3D|LINE|L1 -155443 NR_027767 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 124-36 chr14 53400872 53401240 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 247702 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 183.333-35 chr12 127948388 127948878 + 0.666667 NA intron (NR_046392, intron 3 of 4) intron (NR_046392, intron 3 of 4) 33223 NR_046392 100862680 Hs.385496 NR_046392 ENSG00000256193 LINC00507 - long intergenic non-protein coding RNA 507 ncRNA 178.333-86 chr2 168346862 168347222 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -99447 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 202.667-65 chr16 76139453 76139947 + 0.666667 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 -137701 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 159.667-336 chr9 3795241 3795574 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103239 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 147.333-246 chr4 105097456 105097699 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -48298 NM_017628 54790 Hs.367639 NM_017628 ENSG00000168769 TET2 KIAA1546|MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 protein-coding 168.667-203 chr7 47788678 47789045 + 0.666667 NA intron (NM_138295, intron 56 of 56) AluY|SINE|Alu -6430 NR_161268 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 142-144 chr7 52798083 52798386 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -237399 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 124-6 chr1 82604537 82604801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -298514 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 196.333-21 chr11 91881390 91881871 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -343404 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 130.333-44 chr11 37708038 37708348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -230408 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 169.667-145 chr4 35266911 35267351 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 976808 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 159.667-99 chr14 62188252 62188548 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48427 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 126.667-28 chr12 9970832 9971168 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_138337) promoter-TSS (NM_138337) -409 NM_201623 160364 Hs.190519 NM_138337 ENSG00000172322 CLEC12A CD371|CLL-1|CLL1|DCAL-2|MICL C-type lectin domain family 12 member A protein-coding 157.333-235 chr3 97680697 97681021 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -83662 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 117.333-204 chr8 59287253 59287451 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 168142 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 124.333-111 chr22 22053188 22053392 + 0.666667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -9356 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 113.667-16 chr1 180322041 180322251 + 0.666667 NA intron (NM_032360, intron 6 of 7) L1MA2|LINE|L1 -47465 NR_037642 100527964 Hs.496545 NR_037642 ENSG00000230124 LHX4-AS1 - LHX4 antisense RNA 1 ncRNA 146-145 chr8 141600559 141600945 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93522 NM_207414 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 144.667-277 chr7 2706193 2706492 + 0.666667 NA intron (NM_133463, intron 3 of 6) AluJo|SINE|Alu 18140 NM_001321766 155185 Hs.42221 NM_133463 ENSG00000174945 AMZ1 - archaelysin family metallopeptidase 1 protein-coding 122.333-145 chr3 164573808 164574008 + 0.666667 NA Intergenic (CCACTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 257572 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 166.667-236 chr8 121855734 121856091 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -214472 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 177-70 chr6 92908668 92909171 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 510640 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 111.667-13 chr1 88718692 88718926 + 0.666667 NA intron (NM_001320708, intron 1 of 20) intron (NM_001320708, intron 1 of 20) -33605 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 128.667-83 chr19 34654069 34654453 + 0.666667 NA intron (NR_027620, intron 1 of 3) intron (NR_027620, intron 1 of 3) 8388 NR_045208 100130342 Hs.679909 NR_045208 SCGB2B3P C2B|SCGB4A3P secretoglobin family 2B member 3, pseudogene pseudo 131.667-102 chr2 170298058 170298352 + 0.666667 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 52738 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 113.667-84 chr17 78972495 78972819 + 0.666667 NA exon (NM_005567, exon 6 of 6) exon (NM_005567, exon 6 of 6) 7266 NM_005567 3959 Hs.514535 NM_005567 ENSG00000108679 LGALS3BP 90K|BTBD17B|CyCAP|M2BP|MAC-2-BP|TANGO10B|gp90 galectin 3 binding protein protein-coding 137.333-6 chr1 98181331 98181722 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29185 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 113.333-244 chr7 77837046 77837291 + 0.666667 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) intron (NM_001366088, intron 1 of 11) -2960 NM_001366089 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 198.667-111 chr2 169167305 169167795 + 0.666667 NA intron (NM_004525, intron 61 of 78) intron (NM_004525, intron 61 of 78) 86443 NM_001142271 10170 Hs.179608 NM_005771 ENSG00000073737 DHRS9 3-alpha-HSD|3ALPHA-HSD|RDH-E2|RDH-TBE|RDH15|RDHL|RDHTBE|RETSDR8|SDR9C4 dehydrogenase/reductase 9 protein-coding 121-97 chr3 108581925 108582127 + 0.666667 NA intron (NM_020890, intron 4 of 20) intron (NM_020890, intron 4 of 20) 7412 NM_020890 57650 Hs.591308 NM_020890 ENSG00000163507 CIP2A KIAA1524|p90 cell proliferation regulating inhibitor of protein phosphatase 2A protein-coding 229-24 chr16 7028118 7028724 + 0.666667 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) AluSp|SINE|Alu 254612 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 216-19 chr12 14109366 14109821 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129237 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 141.333-106 chr2 57823842 57824143 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -83659 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 112.667-11 chr1 156291211 156291496 + 0.666667 NA intron (NM_001323617, intron 1 of 22) intron (NM_001323617, intron 1 of 22) 145 NM_001323617 23381 Hs.516837 NM_015327 ENSG00000198952 SMG5 EST1B|LPTS-RP1|LPTSRP1|SMG-5 SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 140-104 chr7 29856891 29857200 + 0.666667 NA intron (NM_001080529, intron 2 of 8) intron (NM_001080529, intron 2 of 8) 50491 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 141.667-13 chr1 179980034 179980298 + 0.666667 NA intron (NM_014810, intron 1 of 37) L1MA5A|LINE|L1 25356 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 190 chr1 43695365 43695761 + 0.666667 NA intron (NM_014663, intron 18 of 21) L2|LINE|L2 11778 NR_033827 100132774 Hs.655569 NR_033827 KDM4A-AS1 - KDM4A antisense RNA 1 ncRNA 168-83 chr4 87995341 87995705 + 0.666667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -12112 NM_000297 5311 Hs.181272 NM_000297 ENSG00000118762 PKD2 APKD2|PC2|PKD4|Pc-2|TRPP2 polycystin 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 229.666-20 chr3 101502352 101503013 + 0.666667 NA intron (NM_020654, intron 1 of 23) AluJb|SINE|Alu 10530 NM_020654 57337 Hs.529551 NM_020654 ENSG00000138468 SENP7 - SUMO specific peptidase 7 protein-coding 158.333-7 chr1 53796639 53796968 + 0.666667 NA exon (NM_018087, exon 13 of 18) exon (NM_018087, exon 13 of 18) 41493 NM_018087 55706 Hs.476525 NM_018087 ENSG00000058804 NDC1 NET3|TMEM48 NDC1 transmembrane nucleoporin protein-coding 153.667-39 chr10 27170363 27170721 + 0.666667 NA exon (NM_032844, exon 8 of 12) exon (NM_032844, exon 8 of 12) 15718 NM_001172303 84930 Hs.276905 NM_032844 ENSG00000120539 MASTL GREATWALL|GW|GWL|MAST-L|THC2 microtubule associated serine/threonine kinase like protein-coding 153.667-173 chr2 37478313 37478634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 133843 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 185.667-23 chr12 80553087 80553553 + 0.666667 NA intron (NM_001145026, intron 25 of 44) intron (NM_001145026, intron 25 of 44) 109085 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 130.333-47 chr11 113632978 113633330 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73154 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 147.667-142 chr17 61875486 61875782 + 0.666667 NA intron (NM_001351695, intron 18 of 24) intron (NM_001351695, intron 18 of 24) -12075 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 146.667-303 chr7 43368575 43368863 + 0.666667 NA intron (NM_001287059, intron 5 of 27) intron (NM_001287059, intron 5 of 27) 153823 NR_038276 100506895 Hs.676047 NR_038276 ENSG00000231638 LUARIS SCAT6|lncRNA32 lncRNA upregulator of antiviral response interferon signaling ncRNA 148.333-396 chr8 123537827 123538115 + 0.666667 NA intron (NM_058229, intron 1 of 8) intron (NM_058229, intron 1 of 8) 3235 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 123.667-175 chr7 145313598 145313809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -477650 NM_001350887 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 136.333-8 chr1 119083211 119083430 + 0.666667 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 35915 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 173.667-59 chr18 10801244 10801668 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 9 of 51) intron (NM_022068, intron 9 of 51) -41807 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 114.667-260 chr9 38144640 38144870 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75528 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 135-30 chr14 44605789 44606068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 98519 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 136.667-61 chr14 68042176 68042549 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 218770 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 119-37 chr12 105031701 105031973 + 0.666667 NA exon (NM_001034173, exon 20 of 23) exon (NM_001034173, exon 20 of 23) 45521 NM_152318 121053 Hs.295563 NM_152318 ENSG00000151131 C12orf45 - chromosome 12 open reading frame 45 protein-coding 120.333-39 chr11 121978935 121979131 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 120811 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 169.333-162 chr3 79209450 79209847 + 0.666667 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) L1PB2|LINE|L1 -190189 NM_133631 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 193-77 chr5 142142781 142143311 + 0.666667 NA intron (NM_030571, intron 6 of 7) intron (NM_030571, intron 6 of 7) 34267 NM_030571 80762 Hs.9788 NM_030571 ENSG00000131507 NDFIP1 N4WBP5 Nedd4 family interacting protein 1 protein-coding 125.333-113 chr3 113515010 113515215 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_144718) promoter-TSS (NM_144718) 44 NM_144718 152185 Hs.477144 NM_144718 ENSG00000163611 SPICE1 CCDC52|SPICE spindle and centriole associated protein 1 protein-coding 149-22 chr10 99465845 99466155 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -35376 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 120.667-174 chr8 125546997 125547337 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 114958 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 154.667-233 chr3 7191039 7191340 + 0.666667 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) -297172 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 153.333-277 chr3 124793850 124794200 + 0.666667 NA intron (NM_001354766, intron 9 of 13) intron (NM_001354766, intron 9 of 13) 61586 NR_036088 100422864 NR_036088 ENSG00000265981 MIR544B - microRNA 544b ncRNA 127.667-49 chr14 70052967 70053343 + 0.666667 NA intron (NR_104122, intron 2 of 5) intron (NR_104122, intron 2 of 5) 27062 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 187.667-113 chr4_GL383527v1_alt 129146 129557 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10868 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 124.667-207 chr8 121802391 121802669 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -161090 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 209.333-205 chr6 78376945 78377382 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 162146 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 113.333-39 chr11 8326003 8326200 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57314 NM_001270428 4004 Hs.654426 NM_002315 ENSG00000166407 LMO1 RBTN1|RHOM1|TTG1 LIM domain only 1 protein-coding 165.333-143 chr20 47106170 47106458 + 0.666667 NA intron (NM_172110, intron 9 of 13) L2b|LINE|L2 -60653 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 136.333-92 chr2 70537153 70537485 + 0.666667 NA intron (NM_003236, intron 1 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 16127 NM_001308159 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 145-20 chr12 20379531 20379884 + 0.666667 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) 10462 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 156.667-220 chr22 42588650 42589103 + 0.666667 NA intron (NR_103820, intron 7 of 8) AluSp|SINE|Alu -6865 NR_002184 91695 Hs.534041 NR_002184 ENSG00000182841 RRP7BP RRP7B|dJ222E13.2 ribosomal RNA processing 7 homolog B, pseudogene pseudo 182.667-168 chr9 98112354 98112757 + 0.666667 NA intron (NM_033219, intron 1 of 6) AluSg|SINE|Alu 6667 NM_014788 9830 Hs.575631 NM_014788 ENSG00000106785 TRIM14 - tripartite motif containing 14 protein-coding 128.667-34 chr11 40557119 40557389 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -264124 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 124.667-151 chr4 71296582 71296888 + 0.666667 NA intron (NM_001098484, intron 3 of 25) intron (NM_001098484, intron 3 of 25) -42318 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 157.667-230 chr5 14714849 14715248 + 0.666667 NA non-coding (NR_046285, exon 1 of 2) non-coding (NR_046285, exon 1 of 2) 2354 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 132.333-39 chr12 18730356 18730686 + 0.666667 NA intron (NM_001330774, intron 3 of 14) intron (NM_001330774, intron 3 of 14) 6988 NM_001330769 89869 Hs.97542 NM_033123 ENSG00000139151 PLCZ1 NYD-SP27|PLC-zeta-1|PLCzeta|SPGF17 phospholipase C zeta 1 protein-coding 241.333-8 chr1 110791245 110791631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79761 NM_001040033 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 290.333-5 chr11 32938351 32938834 + 0.666667 NA intron (NM_001076786, intron 4 of 12) intron (NM_001076786, intron 4 of 12) 45781 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 120.333-7 chr1 86058304 86058501 + 0.666667 NA intron (NR_146341, intron 9 of 60) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 98069 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 147-67 chr2 71788898 71789170 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 322335 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 182.667-148 chr6 89438183 89438539 + 0.666667 NA intron (NM_001242809, intron 1 of 15) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 5183 NM_014942 22881 Hs.702213 NM_014942 ENSG00000135299 ANKRD6 - ankyrin repeat domain 6 protein-coding 112.333-18 chr10 14209781 14210093 + 0.666667 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 120947 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 153-106 chr5 5068862 5069221 + 0.666667 NA TTS (NR_134266) TTS (NR_134266) 9270 NR_134266 105374631 Hs.570964 NR_134266 ENSG00000250529 LINC02121 - long intergenic non-protein coding RNA 2121 ncRNA 129-52 chr18 3617999 3618333 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 7 of 11) intron (NM_001242761, intron 7 of 11) 14429 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 210.333-79 chr2 103304154 103304570 + 0.666667 NA Intergenic Eulor11|DNA|DNA -319933 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 141.333-37 chr11 85703542 85703868 + 0.666667 NA intron (NM_001365832, intron 3 of 6) L1MEg|LINE|L1 15389 NM_001365835 54843 Hs.369520 NM_032379 ENSG00000137501 SYTL2 CHR11SYT|EXO4|PPP1R151|SGA72M|SLP2|SLP2A synaptotagmin like 2 protein-coding 243.333-8 chr10 11552318 11552832 + 0.666667 NA intron (NM_014688, intron 2 of 14) intron (NM_014688, intron 2 of 14) -20295 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 184-89 chr5 128920296 128920704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44627 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 174.333-110 chr5 4027346 4027748 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 431715 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 217.667-27 chr12 41502855 41503305 + 0.666667 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) intron (NM_013377, intron 1 of 7) 65341 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 152.333-157 chr18 6760757 6761067 + 0.666667 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) intron (NM_001366230, intron 1 of 17) -31050 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 159.333-208 chr3 56030390 56030739 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 7 of 17) L1MD2|LINE|L1 -177970 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 179-23 chr12 91303450 91303737 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -120776 NM_001920 1634 Hs.156316 NM_001920 ENSG00000011465 DCN CSCD|DSPG2|PG40|PGII|PGS2|SLRR1B decorin protein-coding 125.667-24 chr10 52867661 52867901 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -96081 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 195-65 chr2 168376349 168376911 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -79642 NM_001256126 253782 Hs.506829 NM_203463 ENSG00000172292 CERS6 CERS5|LASS6 ceramide synthase 6 protein-coding 192.333-100 chr2 234638075 234638364 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -44449 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 148.333-62 chr11 19232680 19233098 + 0.666667 NA intron (NM_001256372, intron 6 of 12) intron (NM_001256372, intron 6 of 12) 8056 NM_024680 79733 Hs.523526 NM_024680 ENSG00000129173 E2F8 E2F-8 E2F transcription factor 8 protein-coding 246.667-48 chr2 230484188 230484830 + 0.666667 NA intron (NM_001080391, intron 17 of 28) L1M8|LINE|L1 67753 NM_001206704 6672 Hs.369056 NM_003113 ENSG00000067066 SP100 lysp100b SP100 nuclear antigen protein-coding 112-185 chr6 102148915 102149196 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 750070 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 138.333-59 chr14 52744747 52745076 + 0.666667 NA intron (NM_001130701, intron 3 of 11) intron (NM_001130701, intron 3 of 11) 14745 NM_145251 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 144.667-32 chr10 104853955 104854263 + 0.666667 NA intron (NM_014978, intron 2 of 26) intron (NM_014978, intron 2 of 26) -187893 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 231.333-91 chr5 113511888 113512439 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -1531 NM_001345976 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 129.333-35 chr11 63080117 63080378 + 0.666667 NA intron (NM_001136506, intron 9 of 9) intron (NM_001136506, intron 9 of 9) 63974 NM_173586 283238 Hs.375139 NM_173586 ENSG00000197658 SLC22A24 NET46 solute carrier family 22 member 24 protein-coding 129.333-36 chr11 102741010 102741361 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -16231 NM_002424 4317 Hs.161839 NM_002424 ENSG00000118113 MMP8 CLG1|HNC|MMP-8|PMNL-CL matrix metallopeptidase 8 protein-coding 211.667-105 chr6 146351131 146351480 + 0.666667 NA intron (NM_001278065, intron 4 of 9) intron (NM_001278065, intron 4 of 9) -192528 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 117.333-142 chr4 16851172 16851360 + 0.666667 NA intron (NM_001304435, intron 1 of 7) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 47379 NM_001130834 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 149.333-136 chr17 19445149 19445549 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 34117 NM_007148 7732 Hs.189482 NM_007148 ENSG00000128482 RNF112 BFP|ZNF179 ring finger protein 112 protein-coding 122.333-35 chr11 76111634 76111927 + 0.666667 NA intron (NM_003369, intron 13 of 14) HAL1|LINE|L1 94722 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 127.333-148 chr5 154421890 154422102 + 0.666667 NA intron (NR_037897, intron 2 of 2) intron (NR_037897, intron 2 of 2) 23826 NR_037897 386627 Hs.652021 NR_037897 SAP30L-AS1 GALNT10-AS1 SAP30L antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 201.333-62 chr11 114485876 114486331 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 46636 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 183-7 chr1 167655525 167655819 + 0.666667 NA intron (NM_001322923, intron 1 of 5) intron (NM_001322923, intron 1 of 5) 25440 NM_001322924 92241 Hs.493867 NM_052862 ENSG00000198771 RCSD1 CAPZIP|MK2S4 RCSD domain containing 1 protein-coding 180.333-134 chr8 70296004 70296384 + 0.666667 NA intron (NM_001321711, intron 2 of 21) L2a|LINE|L2 107196 NM_001321713 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 136.333-61 chr14 97032571 97032969 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 89191 NR_104113 145249 Hs.592323 NR_104113 ENSG00000225163 LINC00618 C14orf63 long intergenic non-protein coding RNA 618 ncRNA 212-159 chr9 95853001 95853485 + 0.666667 NA intron (NR_023390, intron 1 of 2) intron (NR_023390, intron 1 of 2) -22448 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 143-69 chr2 98116662 98116948 + 0.666667 NA intron (NR_144296, intron 3 of 28) L1P4e|LINE|L1 29638 NR_144296 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 115.333-106 chr19 30492606 30492857 + 0.666667 NA intron (NM_014717, intron 2 of 4) intron (NM_014717, intron 2 of 4) 120347 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 152.667-225 chr21 23384327 23384711 + 0.666667 NA intron (NR_040254, intron 1 of 4) L1M4|LINE|L1 316 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 149.333-116 chr14 68006800 68007157 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MB7|LINE|L1 183386 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 129.667-34 chr11 84496107 84496357 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -178893 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 154-69 chr17 29174662 29174977 + 0.666667 NA intron (NM_078471, intron 1 of 41) AluSz|SINE|Alu 1954 NM_001346767 399687 Hs.462590 NM_078471 ENSG00000196535 MYO18A MAJN|MYSPDZ|SP-R210|SPR210 myosin XVIIIA protein-coding 139.667-113 chr3 17820214 17820601 + 0.666667 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 77463 NR_135536 105376975 Hs.543238 NR_135536 LOC105376975 - uncharacterized LOC105376975 ncRNA 184.667-129 chr8 51950748 51951158 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51767 NM_001286782 115294 Hs.671268 NM_052937 ENSG00000168300 PCMTD1 - protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 protein-coding 157-128 chr8 32536209 32536484 + 0.666667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -11864 NM_013958 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 123.333-199 chr7 72411444 72411775 + 0.666667 NA intron (NM_031468, intron 1 of 6) L1MC5a|LINE|L1 729 NM_031468 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 119.333-159 chr4 37754904 37755165 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -68658 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 154.667-254 chr3 141423840 141424193 + 0.666667 NA intron (NM_001080412, intron 7 of 7) intron (NM_001080412, intron 7 of 7) 21667 NM_001350100 253461 Hs.518301 NM_152535 ENSG00000177311 ZBTB38 CIBZ|PPP1R171|ZNF921 zinc finger and BTB domain containing 38 protein-coding 123.333-226 chr9 4829533 4829787 + 0.666667 NA intron (NM_005772, intron 3 of 8) intron (NM_005772, intron 3 of 8) -10109 NM_001286701 10171 Hs.194121 NM_005772 ENSG00000120158 RCL1 RNAC|RPCL1 RNA terminal phosphate cyclase like 1 protein-coding 116-15 chr10 21721330 21721594 + 0.666667 NA intron (NM_001195626, intron 14 of 22) intron (NM_001195626, intron 14 of 22) 187290 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 187.667-19 chr10 120015188 120015668 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 56915 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 129.667-83 chr19 15928885 15929152 + 0.666667 NA intron (NM_021187, intron 2 of 11) intron (NM_021187, intron 2 of 11) 5848 NM_001128932 57834 Hs.187393 NM_021187 ENSG00000171903 CYP4F11 CYPIVF11 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 11 protein-coding 174.667-100 chr2 227810697 227811166 + 0.666667 NA Intergenic AluYj4|SINE|Alu -2911 NM_001130046 6364 Hs.75498 NM_004591 ENSG00000115009 CCL20 CKb4|Exodus|LARC|MIP-3-alpha|MIP-3a|MIP3A|SCYA20|ST38 C-C motif chemokine ligand 20 protein-coding 121.333-149 chr5 113051392 113051718 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 15 of 18) AluJo|SINE|Alu 74757 NR_038352 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 137.333-145 chr5 5668641 5668916 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 246101 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 259.333-62 chr21 41487453 41487930 + 0.666667 NA intron (NM_001135099, intron 5 of 13) L1MA8|LINE|L1 20374 NM_001135099 7113 Hs.439309 NM_005656 ENSG00000184012 TMPRSS2 PP9284|PRSS10 transmembrane serine protease 2 protein-coding 297-43 chr8 80587519 80588249 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 101658 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 147.333-273 chr6 27433318 27433639 + 0.666667 NA intron (NR_144688, intron 5 of 8) L1MB4|LINE|L1 39420 NM_001318892 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 147.667-31 chr1 241531803 241532104 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_003679) promoter-TSS (NM_003679) -425 NM_003679 8564 Hs.731056 NM_003679 ENSG00000117009 KMO dJ317G22.1 kynurenine 3-monooxygenase protein-coding 143-91 chr5 27496458 27496749 + 0.666667 NA TTS (NR_038848) TTS (NR_038848) 24311 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 139.333-95 chr17 79109743 79109987 + 0.666667 NA intron (NM_001082575, intron 5 of 14) intron (NM_001082575, intron 5 of 14) 34928 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 251.667-67 chr4 31051914 31052360 + 0.666667 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -119007 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 157-104 chr5 93327159 93327486 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 244021 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 281.333-38 chr3 41974216 41974872 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -12441 NM_001322500 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 119-132 chr6 154821748 154822093 + 0.666667 NA intron (NM_014892, intron 15 of 19) L3|LINE|CR1 -31440 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 134-41 chr18 1201794 1202034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 157715 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 239.667-60 chr5 92701859 92702441 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 869193 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 120-78 chr20 62527689 62527988 + 0.666667 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -22615 NM_178463 128826 Hs.86507 NM_178463 MIR1-1HG C20orf166|MIR133A2HG MIR1-1 host gene protein-coding 204.333-122 chr3 46131607 46132005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76507 NM_001295 1230 Hs.301921 NM_001295 ENSG00000163823 CCR1 CD191|CKR-1|CKR1|CMKBR1|HM145|MIP1aR|SCYAR1 C-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 190.667-7 chr1 58722965 58723442 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -23141 NM_001085487 114803 Hs.744921 NM_001085487 ENSG00000162601 MYSM1 2A-DUB|2ADUB|BMFS4 Myb like, SWIRM and MPN domains 1 protein-coding 201.667-115 chr7 135569089 135569584 + 0.666667 NA intron (NM_015135, intron 1 of 42) AluSx|SINE|Alu 11419 NM_015135 23165 Hs.743250 NM_015135 ENSG00000155561 NUP205 C7orf14|NPHS13 nucleoporin 205 protein-coding 189.667-35 chr12 60485691 60486120 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 796535 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 184-118 chr8 134991250 134991652 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141516 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 166.667-42 chr11 82865186 82865676 + 0.666667 NA intron (NM_005040, intron 1 of 8) intron (NM_005040, intron 1 of 8) 34999 NM_005040 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 124-19 chr10 28416608 28416871 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 79074 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 193.333-60 chr15 53693835 53694283 + 0.666667 NA intron (NM_182758, intron 13 of 19) intron (NM_182758, intron 13 of 19) 65604 NM_182758 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 144.667-89 chr14 89883319 89883601 + 0.666667 NA intron (NM_001284269, intron 5 of 5) MER2|DNA|TcMar-Tigger 71076 NM_001284269 90141 Hs.123232 NM_145231 ENSG00000140025 EFCAB11 C14orf143 EF-hand calcium binding domain 11 protein-coding 121.333-103 chr20 64279437 64279676 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10829 NR_040415 140849 Hs.745565 NR_040415 LINC00266-1 C20orf69|NCRNA00266|NCRNA00266-1|bA476I15.3 long intergenic non-protein coding RNA 266-1 ncRNA 116.667-20 chr11 24836034 24836342 + 0.666667 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) MIR|SINE|MIR 339135 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 205-72 chr5 64751310 64751773 + 0.666667 NA intron (NM_173829, intron 2 of 4) intron (NM_173829, intron 2 of 4) 17150 NM_173829 285672 Hs.69504 NM_173829 ENSG00000153006 SREK1IP1 P18SRP|SFRS12IP1 SREK1 interacting protein 1 protein-coding 117-88 chr20 34360312 34360588 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2823 NM_031483 83737 Hs.632272 NM_031483 ENSG00000078747 ITCH ADMFD|AIF4|AIP4|NAPP1 itchy E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 138.667-159 chr5 29385326 29385712 + 0.666667 NA intron (NR_104628, intron 2 of 4) intron (NR_104628, intron 2 of 4) 10457 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 138.667-19 chr10 69003117 69003370 + 0.666667 NA intron (NM_015634, intron 2 of 6) intron (NM_015634, intron 2 of 6) 14440 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 118-122 chr7 33050111 33050401 + 0.666667 NA intron (NM_001002009, intron 1 of 9) intron (NM_001002009, intron 1 of 9) -9091 NM_001166118 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 128.667-140 chr5 26368196 26368496 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 670240 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 155.667-303 chr6 55059042 55059472 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -47203 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 114-74 chr2 187015304 187015644 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166304 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 178-60 chr19 38208335 38208715 + 0.666667 NA TTS (NM_015073) TTS (NM_015073) 15725 NM_001135155 8193 Hs.631576 NM_004647 ENSG00000011332 DPF1 BAF45b|NEUD4|neuro-d4 double PHD fingers 1 protein-coding 114-108 chr4 91885017 91885197 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 392195 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 134.667-156 chr5 28020086 28020346 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 267449 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 126.667-57 chr15 67218893 67219250 + 0.666667 NA intron (NM_001271885, intron 5 of 9) intron (NM_001271885, intron 5 of 9) 35590 NM_024666 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 119-130 chr6 140653175 140653453 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30500 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 173.667-152 chr6 54595841 54596277 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -250712 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 163.333-138 chr2 25969521 25969833 + 0.666667 NA intron (NM_002254, intron 1 of 7) intron (NM_002254, intron 1 of 7) 12820 NM_002254 3797 Hs.21611 NM_002254 ENSG00000084731 KIF3C - kinesin family member 3C protein-coding 224.333-38 chr14 59281080 59281416 + 0.666667 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) LTR36|LTR|ERV1 17807 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 124.667-47 chr12 51828901 51829205 + 0.666667 NA intron (NM_001013690, intron 1 of 1) intron (NM_001013690, intron 1 of 1) 2864 NM_001013690 401720 Hs.648218 NM_001013690 ENSG00000261308 FIGNL2 - fidgetin like 2 protein-coding 149.333-163 chr2 1777301 1777585 + 0.666667 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 -32928 NM_012293 7837 Hs.332197 NM_012293 ENSG00000130508 PXDN ASGD7|COPOA|D2S448|D2S448E|MG50|PRG2|PXN|VPO peroxidasin protein-coding 116.667-210 chr8 130030665 130030976 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13691 NM_001353269 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 144.333-79 chr14 70323296 70323635 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 36218 NM_001204090 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 169.667-17 chr10 30371540 30372029 + 0.666667 NA non-coding (NR_120609, exon 1 of 12) non-coding (NR_120609, exon 1 of 12) 123 NR_120609 729668 Hs.652158 NR_003524 GOLGA2P6 - GOLGA2 pseudogene 6 pseudo 199-105 chr7 45582030 45582497 + 0.666667 NA intron (NM_001281768, intron 2 of 9) intron (NM_001281768, intron 2 of 9) 7895 NM_021116 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 183-98 chr8 4848758 4849192 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 1 of 69) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 145939 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 119-148 chr9 137050368 137050555 + 0.666667 NA exon (NM_001246, exon 6 of 9) exon (NM_001246, exon 6 of 9) 3600 NM_001246 954 Hs.123036 NM_001246 ENSG00000054179 ENTPD2 CD39L1|NTPDase-2 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 protein-coding 179.667-121 chr6 134735848 134736238 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -196038 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 195.667-68 chr2 30977819 30978259 + 0.666667 NA intron (NM_001253826, intron 3 of 15) intron (NM_001253826, intron 3 of 15) 151601 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 208.667-106 chr4 185386616 185387107 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7863 NM_018409 55805 Hs.558513 NM_018409 ENSG00000109771 LRP2BP - LRP2 binding protein protein-coding 113.667-50 chr13 45521990 45522273 + 0.666667 NA intron (NM_031431, intron 19 of 22) intron (NM_031431, intron 19 of 22) 57192 NM_031431 83548 Hs.507948 NM_031431 ENSG00000136152 COG3 SEC34 component of oligomeric golgi complex 3 protein-coding 219.667-54 chr3 48014173 48014690 + 0.666667 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) intron (NM_002375, intron 1 of 18) 74417 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 144.333-225 chr6 5161130 5161529 + 0.666667 NA intron (NM_001164841, intron 2 of 3) intron (NM_001164841, intron 2 of 3) -13007 NR_037462 100500900 NR_037462 ENSG00000265083 MIR3691 mir-3691 microRNA 3691 ncRNA 199.333-305 chr9 107205791 107206358 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77205 NM_002874 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 139.667-74 chr18 35840630 35840911 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 64156 NR_029616 406963 NR_029616 ENSG00000207797 MIR187 MIRN187|miR-187|miRNA187 microRNA 187 ncRNA 258.333-29 chr2 30133306 30133928 + 0.666667 NA Intergenic LTR36|LTR|ERV1 -13390 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 164-46 chr17 59734262 59734658 + 0.666667 NA intron (NM_001329402, intron 2 of 10) AluJr4|SINE|Alu 26806 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 128.333-188 chr7 130470673 130470961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15358 NM_001253901 4232 Hs.270978 NM_002402 ENSG00000106484 MEST PEG1 mesoderm specific transcript protein-coding 133.333-5 chr1 91889266 91889528 + 0.666667 NA intron (NM_001195684, intron 2 of 17) intron (NM_001195684, intron 2 of 17) -3246 NM_003243 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 116-150 chr8 4051513 4051800 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 943258 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 117.667-34 chr12 21391128 21391357 + 0.666667 NA intron (NM_134431, intron 1 of 15) intron (NM_134431, intron 1 of 15) 4195 NM_134431 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 147-33 chr12 95821511 95821911 + 0.666667 NA intron (NR_135016, intron 1 of 1) intron (NR_135016, intron 1 of 1) 18614 NR_135016 105369920 Hs.145556 NR_135016 ENSG00000258292 LINC02410 - long intergenic non-protein coding RNA 2410 ncRNA 135.667-177 chr7 112386431 112386795 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36531 NM_001197080 3475 Hs.7879 NM_001550 ENSG00000006652 IFRD1 PC4|TIS7 interferon related developmental regulator 1 protein-coding 148.333-259 chr3 118628226 118628594 + 0.666667 NA intron (NR_135547, intron 2 of 3) MER3|DNA|hAT-Charlie -13358 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 191-24 chr18 7660511 7660979 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 93429 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 145.667-55 chr12 21874252 21874541 + 0.666667 NA intron (NM_005691, intron 15 of 37) L1MA10|LINE|L1 62298 NM_005691 10060 Hs.732701 NM_005691 ENSG00000069431 ABCC9 ABC37|ATFB12|CANTU|CMD1O|SUR2 ATP binding cassette subfamily C member 9 protein-coding 233.666-18 chr20 21022583 21023282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83426 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 158.667-168 chr2 157564906 157565244 + 0.666667 NA intron (NM_001111031, intron 2 of 8) L1PA8|LINE|L1 32485 NM_001111031 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 128-39 chr2 28583036 28583311 + 0.666667 NA intron (NR_138141, intron 5 of 35) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 16816 NR_138141 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 120.333-99 chr2 122231841 122232121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 476330 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 113-197 chr7 144738117 144738421 + 0.666667 NA intron (NR_146936, intron 1 of 11) L1MB7|LINE|L1 629 NR_146936 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 117.333-207 chr8 88294210 88294525 + 0.666667 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 33116 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 137-19 chr11 82915027 82915362 + 0.666667 NA intron (NM_001363481, intron 2 of 4) intron (NM_001363481, intron 2 of 4) -13454 NM_001319214 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 181.666-8 chr14 51777266 51777797 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 60248 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 217.667-5 chr1 161757714 161758127 + 0.666667 NA TTS (NM_007240) TTS (NM_007240) 8134 NM_007240 11266 Hs.416216 NM_007240 ENSG00000081721 DUSP12 DUSP1|YVH1 dual specificity phosphatase 12 protein-coding 128.667-113 chr3 23172800 23173094 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29631 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 209.333-78 chr15 90473860 90474315 + 0.666667 NA exon (NM_003870, exon 22 of 38) exon (NM_003870, exon 22 of 38) -55836 NM_001042574 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 153-107 chr5 18338536 18338840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 531414 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 170-82 chr3 133958721 133959208 + 0.666667 NA intron (NM_005630, intron 3 of 13) intron (NM_005630, intron 3 of 13) -29152 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 166.333-181 chr5 24526314 24526654 + 0.666667 NA intron (NM_001362460, intron 5 of 9) intron (NM_001362460, intron 5 of 9) 118494 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 165.333-23 chr10 12789571 12789930 + 0.666667 NA intron (NM_001351032, intron 7 of 11) MIR|SINE|MIR -64397 NR_031752 100313841 NR_031752 ENSG00000221331 MIR548Q - microRNA 548q ncRNA 164.333-195 chr5 67010602 67011036 + 0.666667 NA intron (NM_001297651, intron 1 of 25) intron (NM_001297651, intron 1 of 25) 6164 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 115.667-82 chr15 46623860 46624079 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -560120 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 142-167 chrX 6991457 6991718 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -155703 NM_001320750 412 Hs.522578 NM_000351 ENSG00000101846 STS ARSC|ARSC1|ASC|ES|SSDD|XLI steroid sulfatase protein-coding 183-28 chr12 41354174 41354465 + 0.666667 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -83420 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 115.333-71 chr14 65478346 65478684 + 0.666667 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 7413 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 220-107 chr6 161335129 161335713 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -61360 NM_020133 56895 Hs.353175 NM_020133 ENSG00000026652 AGPAT4 1-AGPAT4|LPAAT-delta|dJ473J16.2 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 protein-coding 149.333-2 chr1 29765259 29765653 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 272156 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 156.667-318 chr7 39631217 39631538 + 0.666667 NA intron (NM_005402, intron 1 of 4) AluJo|SINE|Alu 7805 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 154.667-368 chr7 48270258 48270570 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 16 of 61) intron (NM_152701, intron 16 of 61) 98956 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 123.667-59 chr14 71551722 71552066 + 0.666667 NA intron (NM_001354289, intron 5 of 23) L2a|LINE|L2 -34404 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 232-9 chr1 110104041 110104646 + 0.666667 NA intron (NR_126382, intron 1 of 3) intron (NR_126382, intron 1 of 3) -8100 NM_203412 164153 Hs.374027 NM_203412 ENSG00000186150 UBL4B - ubiquitin like 4B protein-coding 133.333-190 chr8 127707345 127707608 + 0.666667 NA intron (NR_117102, intron 2 of 3) intron (NR_117102, intron 2 of 3) 26491 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 165.333-237 chr7 18680393 18680874 + 0.666667 NA intron (NM_058176, intron 11 of 22) intron (NM_058176, intron 11 of 22) 171363 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 129.667-87 chr2 30545295 30545654 + 0.666667 NA intron (NM_182551, intron 4 of 6) intron (NM_182551, intron 4 of 6) 98228 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 178 chr1 9158041 9158431 + 0.666667 NA intron (NR_132742, intron 1 of 1) AluSq2|SINE|Alu -6459 NR_029610 407040 NR_029610 ENSG00000284357 MIR34A MIRN34A|miRNA34A|mir-34|mir-34a microRNA 34a ncRNA 120-54 chr18 25906689 25906930 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 183804 NM_001007559 6760 Hs.129261 NM_005637 ENSG00000141380 SS18 SSXT|SYT SS18 subunit of BAF chromatin remodeling complex protein-coding 136.333-131 chr3 118371935 118372291 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -269655 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 168.667-114 chr2 209518122 209518536 + 0.666667 NA intron (NM_001039538, intron 2 of 14) intron (NM_001039538, intron 2 of 14) -61007 NM_001363913 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 190.667-89 chr4 44515768 44516186 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -67168 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 117.667-191 chr8 87105198 87105524 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 238946 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 157-141 chrX 42976959 42977410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -199021 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 149.333-15 chr1 92526555 92526990 + 0.666667 NA intron (NM_001350198, intron 19 of 19) L1MC2|LINE|L1 -39847 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 115.667-78 chr14 73828575 73828767 + 0.666667 NA intron (NR_135238, intron 1 of 1) intron (NR_135238, intron 1 of 1) 1464 NR_135238 100506498 Hs.569330 NR_135238 ENSG00000258586 LINC02274 - long intergenic non-protein coding RNA 2274 ncRNA 199.667-88 chr21 28794830 28795273 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90316 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 290.333-49 chr8 138944280 138944857 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -30527 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 214.333-28 chr11 101533102 101533692 + 0.666667 NA intron (NM_004621, intron 1 of 12) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -13492 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 121.667-27 chr10 68709893 68710122 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -11232 NM_018237 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 144.333-238 chr6 132471952 132472325 + 0.666667 NA intron (NM_001326579, intron 4 of 9) intron (NM_001326579, intron 4 of 9) 40645 NM_001326578 8417 Hs.593148 NM_003569 ENSG00000079950 STX7 - syntaxin 7 protein-coding 114-60 chr18 7563798 7564016 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3409 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 248.333-10 chr10 35153280 35153901 + 0.666667 NA intron (NM_001352467, intron 2 of 3) intron (NM_001352467, intron 2 of 3) -13949 NM_001267565 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 187.333-154 chr5 54506788 54507158 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10786 NM_001145427 112574 Hs.432755 NM_052870 ENSG00000178996 SNX18 SH3PX2|SH3PXD3B|SNAG1 sorting nexin 18 protein-coding 123-13 chr1 219448634 219448876 + 0.666667 NA intron (NR_135822, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR 108569 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 131-31 chr14 86803223 86803551 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -102391 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 131.333-110 chr22 45024652 45024997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14819 NM_138415 112885 Hs.254097 NM_138415 ENSG00000056487 PHF21B BHC80L|PHF4 PHD finger protein 21B protein-coding 153.667-281 chr4 34413813 34414102 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -144210 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 159.667-29 chr1 188227247 188227643 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 783817 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 122.667-9 chr1 191646641 191646914 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -418279 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 172.333-82 chr2 74951380 74951796 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -7055 NM_019896 56655 Hs.469060 NM_019896 ENSG00000115350 POLE4 YHHQ1|p12 DNA polymerase epsilon 4, accessory subunit protein-coding 133-69 chr4 70158612 70158924 + 0.666667 NA exon (NM_214711, exon 3 of 5) exon (NM_214711, exon 3 of 5) 4531 NM_214711 401137 Hs.518795 NM_214711 ENSG00000187533 PRR27 C4orf40 proline rich 27 protein-coding 160-69 chr21 35202953 35203371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -153864 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 189.667-89 chr22 40384930 40385397 + 0.666667 NA intron (NR_146415, intron 1 of 20) L2a|LINE|L2 14569 NM_015705 27352 Hs.474914 NM_015705 ENSG00000100359 SGSM3 CIP85|MAP|RABGAP5|RUSC3|RUTBC3|RabGAP-5|rabGAPLP small G protein signaling modulator 3 protein-coding 194.333-133 chr6 103744889 103745315 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1114444 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 114.333-155 chr4 33481830 33482155 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 557901 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 197.667-90 chr3 139784156 139784693 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -106374 NM_001320511 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 156.333-251 chr3 155604754 155605213 + 0.666667 NA intron (NM_001349252, intron 2 of 24) HERV35I-int|LTR|ERV1 71360 NM_001130961 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 164-5 chr1 70881673 70882050 + 0.666667 NA intron (NR_028293, intron 2 of 4) L1PB4|LINE|L1 -164645 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 173.333-43 chr12 43463233 43463635 + 0.666667 NA intron (NM_025003, intron 10 of 38) intron (NM_025003, intron 10 of 38) 88769 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 224.667-11 chr11 35959857 35960222 + 0.666667 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 15977 NM_174902 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 131.333-5 chr1 62486079 62486470 + 0.666667 NA intron (NM_001271999, intron 42 of 48) intron (NM_001271999, intron 42 of 48) 49225 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 120-108 chr5 64531408 64531723 + 0.666667 NA intron (NM_001029875, intron 2 of 5) intron (NM_001029875, intron 2 of 5) 25550 NM_001029875 401190 Hs.657133 NM_001029875 ENSG00000186479 RGS7BP R7BP regulator of G protein signaling 7 binding protein protein-coding 118-134 chr8 143958567 143958905 + 0.666667 NA intron (NM_000445, intron 2 of 32) intron (NM_000445, intron 2 of 32) -4902 NM_201379 5339 Hs.434248 NM_000445 ENSG00000178209 PLEC EBS1|EBSMD|EBSND|EBSO|EBSOG|EBSPA|HD1|LGMD2Q|LGMDR17|PCN|PLEC1|PLEC1b|PLTN plectin protein-coding 166.333-40 chr11 6848427 6848778 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 2919 NM_178168 144124 Hs.447478 NM_178168 ENSG00000166363 OR10A5 JCG6|OR10A1|OR11-403 olfactory receptor family 10 subfamily A member 5 protein-coding 114.667-250 chr8 129842468 129842724 + 0.666667 NA intron (NM_001353307, intron 13 of 13) MER58B|DNA|hAT-Charlie -55972 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 152.333-56 chr10 118666234 118666644 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70791 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 166.667-48 chr12 55396726 55397223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3555 NM_001005518 403282 Hs.554553 NM_001005518 ENSG00000205328 OR6C65 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 65 protein-coding 121-56 chr17 55649878 55650168 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72841 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 163.667-163 chr3 191294825 191295227 + 0.666667 NA intron (NM_198152, intron 4 of 8) AluSx1|SINE|Alu -34368 NM_174908 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 168.667-22 chr10 64012282 64012650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -490576 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 125-94 chr5 168460190 168460493 + 0.666667 NA intron (NM_001161661, intron 19 of 22) MIR|SINE|MIR -26130 NM_002887 5917 Hs.654907 NM_002887 ENSG00000113643 RARS ArgRS|DALRD1|HLD9 arginyl-tRNA synthetase protein-coding 113.667-143 chr3 132294362 132294572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22940 NM_001099 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 198-194 chr9 29006301 29006775 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -117583 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 152.333-201 chr2 208822398 208822674 + 0.666667 NA intron (NR_136588, intron 4 of 5) L1M5|LINE|L1 279894 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 169-33 chr15 34211206 34211572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1293 NM_024713 79768 Hs.633566 NM_024713 ENSG00000134152 KATNBL1 C15orf29 katanin regulatory subunit B1 like 1 protein-coding 156.667-126 chr16 64788770 64789126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 333115 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 149.333-111 chr14 55064066 55064448 + 0.666667 NA intron (NM_144578, intron 3 of 3) AluSz|SINE|Alu 12610 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 144.667-214 chr4 41584953 41585370 + 0.666667 NA intron (NM_001330786, intron 1 of 22) L1MB4|LINE|L1 -27548 NM_001330793 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 129.667-33 chr11 81142961 81143340 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -380347 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 135.667-54 chr14 56292318 56292612 + 0.666667 NA intron (NM_021255, intron 5 of 5) intron (NM_021255, intron 5 of 5) 174054 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 124.667-160 chr5 6040340 6040638 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 296803 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 115.667-47 chr11 111112731 111112923 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15509 NR_149131 105369490 NR_149131 ENSG00000271584 LINC02550 - long intergenic non-protein coding RNA 2550 ncRNA 126.667-134 chr5 31391326 31391659 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140601 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 121.667-42 chr11 99696170 99696490 + 0.666667 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 140185 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 128-122 chr8 119482079 119482374 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 65780 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 202.333-42 chr12 10769391 10769844 + 0.666667 NA intron (NR_120463, intron 2 of 6) intron (NR_120463, intron 2 of 6) 19383 NR_120463 101928162 Hs.112950 NR_120463 ENSG00000256888 LINC02366 - long intergenic non-protein coding RNA 2366 ncRNA 140-88 chr5 79387632 79387925 + 0.666667 NA intron (NM_001277078, intron 5 of 5) intron (NM_001277078, intron 5 of 5) 126058 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 210.666-83 chr5 23978784 23979408 + 0.666667 NA intron (NR_131245, intron 3 of 4) L1PB|LINE|L1 27748 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 162.667-235 chr6 37872015 37872486 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) L1MEb|LINE|L1 52523 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 170-39 chr14 84346330 84346810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -925362 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 130.333-58 chr13 32371874 32372111 + 0.666667 NA intron (NM_000059, intron 20 of 26) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 56138 NR_148476 90634 Hs.732118 NM_052818 ENSG00000139597 N4BP2L1 CG018 NEDD4 binding protein 2 like 1 protein-coding 195-87 chr5 74111715 74112166 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 196385 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 248.333-61 chr3 73503131 73503858 + 0.666667 NA intron (NM_015009, intron 3 of 9) intron (NM_015009, intron 3 of 9) -17828 NR_121660 101927296 Hs.662049 NR_121660 LOC101927296 - uncharacterized LOC101927296 ncRNA 164-35 chr14 54898951 54899418 + 0.666667 NA intron (NM_001024071, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 3640 NM_001024024 2643 Hs.86724 NM_000161 ENSG00000131979 GCH1 DYT14|DYT5|DYT5a|GCH|GTP-CH-1|GTPCH1|HPABH4B GTP cyclohydrolase 1 protein-coding 159.333-335 chr8 119258435 119258773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11747 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 240.667-72 chr6 167972252 167972754 + 0.666667 NA TTS (NM_001366319) TTS (NM_001366319) 4436 NM_001129895 100128124 Hs.448059 NM_001129895 HGC6.3 - uncharacterized LOC100128124 protein-coding 135-5 chr1 171092561 171092902 + 0.666667 NA exon (NM_001319174, exon 2 of 8) exon (NM_001319174, exon 2 of 8) 1826 NM_006894 2328 Hs.445350 NM_006894 ENSG00000007933 FMO3 FMOII|TMAU|dJ127D3.1 flavin containing dimethylaniline monoxygenase 3 protein-coding 148.333-368 chr7 53419285 53419703 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 383861 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 121-89 chr3 16985913 16986157 + 0.666667 NA intron (NM_015184, intron 1 of 5) intron (NM_015184, intron 1 of 5) 52839 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 176.333-62 chr16 74867664 74868181 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -93102 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 140.333-142 chr3 103984077 103984350 + 0.666667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -460097 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 166.333-6 chr1 48556931 48557262 + 0.666667 NA intron (NM_001323575, intron 11 of 12) L2b|LINE|L2 -84888 NM_001286239 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 167.667-167 chr5 44774670 44774956 + 0.666667 NA intron (NR_109865, intron 1 of 2) L1MA2|LINE|L1 33980 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 133-34 chr18 2811160 2811553 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -35650 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 130.333-131 chr3 49558312 49558555 + 0.666667 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) intron (NM_003458, intron 1 of 11) 3956 NM_003458 8927 Hs.194684 NM_003458 ENSG00000164061 BSN ZNF231 bassoon presynaptic cytomatrix protein protein-coding 122.333-108 chr2 176846125 176846458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 208537 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 127.667-43 chr14 48768473 48768709 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 817789 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 149.667-270 chr3 183522179 183522475 + 0.666667 NA intron (NM_130446, intron 2 of 6) AluSx|SINE|Alu -26408 NR_046687 100874019 NR_046687 ENSG00000242522 KLHL6-AS1 - KLHL6 antisense RNA 1 ncRNA 184.667-51 chr2 23572062 23572573 + 0.666667 NA intron (NM_052920, intron 3 of 13) L2c|LINE|L2 187138 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 158.667-111 chr15 88382421 88382741 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 84807 NM_022163 26589 Hs.534261 NM_022163 ENSG00000259494 MRPL46 C15orf4|LIECG2|P2ECSL mitochondrial ribosomal protein L46 protein-coding 168.333-10 chr1 188722407 188722772 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1278961 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 115-125 chr5 36100867 36101091 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001007527, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001007527, exon 18 of 18) -34097 NM_174914 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 147-125 chr6 111412358 111412740 + 0.666667 NA intron (NM_001286431, intron 5 of 34) intron (NM_001286431, intron 5 of 34) -70923 NR_034110 643749 Hs.486228 NR_034108 ENSG00000231889 TRAF3IP2-AS1 C6UAS|C6orf3|NCRNA00248|TRAF3IP2-AS2 TRAF3IP2 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-208 chr2 101143385 101143701 + 0.666667 NA intron (NM_001102426, intron 1 of 19) intron (NM_001102426, intron 1 of 19) 7904 NM_001330348 11138 Hs.442657 NM_007063 ENSG00000204634 TBC1D8 AD3|GRAMD8|HBLP1|TBC1D8A|VRP TBC1 domain family member 8 protein-coding 113.667-43 chr12 87318168 87318480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12415 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 138.333-19 chr10 13456427 13456729 + 0.666667 NA intron (NM_001370075, intron 5 of 8) intron (NM_001370075, intron 5 of 8) 46398 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 116.333-152 chr4 35799986 35800183 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 443855 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 150-80 chr2 156033507 156033799 + 0.666667 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) AluSx3|SINE|Alu 221278 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 117.667-205 chr9 27206095 27206299 + 0.666667 NA intron (NM_001290077, intron 13 of 21) intron (NM_001290077, intron 13 of 21) 76596 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 243.667-70 chr7 57434706 57435128 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15260 NM_001159279 441234 Hs.533121 NM_001159279 ENSG00000182111 ZNF716 - zinc finger protein 716 protein-coding 137-49 chr2 172786597 172786874 + 0.666667 NA intron (NM_007023, intron 1 of 30) AluJr|SINE|Alu -34852 NM_001100397 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 182-60 chr20 9055967 9056373 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -12884 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 112.333-264 chr8 108691653 108691880 + 0.666667 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) intron (NR_136411, intron 1 of 3) 95828 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 132.333-40 chr12 24379610 24379873 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 2 of 17) intron (NM_152989, intron 2 of 17) 156470 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 124.667-152 chr4 97293924 97294140 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -72894 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 170.333-2 chr1 28940549 28940994 + 0.666667 NA intron (NM_001166006, intron 1 of 14) intron (NM_001166006, intron 1 of 14) 26195 NM_001166006 2035 Hs.175437 NM_004437 ENSG00000159023 EPB41 4.1R|EL1|HE erythrocyte membrane protein band 4.1 protein-coding 138.333-172 chr6 119429212 119429613 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61890 NR_046100 285762 Hs.571063 NR_046100 LOC285762 - uncharacterized LOC285762 ncRNA 146.333-70 chr13 27032345 27032603 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -93059 NR_046547 100874070 Hs.524923 NR_046547 USP12-AS1 - USP12 antisense RNA 1 ncRNA 172-20 chr10 105708618 105708978 + 0.666667 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) intron (NR_120625, intron 3 of 3) 111535 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 204 chr1 15566546 15567018 + 0.666667 NA intron (NR_109898, intron 13 of 14) AluJo|SINE|Alu 18269 NM_024758 79814 Hs.461532 NM_024758 ENSG00000116771 AGMAT - agmatinase protein-coding 114.333-224 chr8 97978708 97979007 + 0.666667 NA intron (NM_002380, intron 5 of 18) intron (NM_002380, intron 5 of 18) 63360 NR_002581 26775 Hs.684855 NR_002581 ENSG00000207067 SNORA72 RNU72|U72 small nucleolar RNA, H/ACA box 72 snoRNA 190-42 chr15 42346334 42346842 + 0.666667 NA intron (NM_198141, intron 20 of 23) intron (NM_198141, intron 20 of 23) -12912 NM_173087 825 Hs.143261 NM_000070 ENSG00000092529 CAPN3 CANP3|CANPL3|LGMD2|LGMD2A|LGMDD4|LGMDR1|nCL-1|p94 calpain 3 protein-coding 179.333-69 chr15 62409919 62410314 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 67087 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 150-96 chr3 65707848 65708215 + 0.666667 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -185785 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 179-91 chr7 12172718 12173123 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38374 NM_018374 54664 Hs.396358 NM_018374 ENSG00000106460 TMEM106B HLD16 transmembrane protein 106B protein-coding 123-134 chr9 93066982 93067222 + 0.666667 NA intron (NM_001287008, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 8401 NM_001287008 203328 Hs.88417 NM_145006 ENSG00000157303 SUSD3 - sushi domain containing 3 protein-coding 161.333-52 chr11 100442522 100442828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -244613 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 141.333-232 chr8 20334393 20334745 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -30606 NM_021020 11178 Hs.521432 NM_021020 ENSG00000061337 LZTS1 F37|FEZ1 leucine zipper tumor suppressor 1 protein-coding 128.333-21 chr10 17729261 17729585 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22778 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 112.333-238 chr6 142431962 142432204 + 0.666667 NA intron (NM_198569, intron 22 of 24) intron (NM_198569, intron 22 of 24) 130076 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 112.333-159 chr3 43018345 43018581 + 0.666667 NA intron (NM_001129908, intron 1 of 4) intron (NM_001129908, intron 1 of 4) 39152 NM_001129908 729085 Hs.729533 NM_001129908 ENSG00000144649 GASK1A C3orf41|FAM198A golgi associated kinase 1A protein-coding 120-19 chr11 16796946 16797258 + 0.666667 NA intron (NM_001329630, intron 17 of 26) intron (NM_001329630, intron 17 of 26) 58455 NM_014267 10944 Hs.368226 NM_014267 ENSG00000110696 C11orf58 IMAGE145052|SMAP chromosome 11 open reading frame 58 protein-coding 198.333-52 chr13 108144196 108144548 + 0.666667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 70410 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 134.667-105 chr2 151200081 151200377 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61634 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 271-31 chr20 24800943 24801479 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -148058 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 164.667-110 chr2 78957211 78957601 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68296 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 154.333-28 chr1 235726911 235727298 + 0.666667 NA intron (NM_000081, intron 38 of 52) intron (NM_000081, intron 38 of 52) -76350 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 150-152 chr8 130468107 130468472 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24615 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 161.333-141 chr2 35167471 35167813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -303763 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 172.667-96 chr21 20793384 20793788 + 0.666667 NA intron (NR_109787, intron 1 of 6) LTR48|LTR|ERV1 9522 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 127.667-152 chr6 105443446 105443672 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40477 NM_002726 5550 Hs.436564 NM_002726 ENSG00000085377 PREP PE|PEP prolyl endopeptidase protein-coding 136-78 chr4 93595424 93595665 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 12 of 14) MIRb|SINE|MIR -233209 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 113.333-139 chr2 211691030 211691304 + 0.666667 NA intron (NM_001042599, intron 12 of 26) MIRb|SINE|MIR 735193 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 253.667-69 chr7 43784634 43785229 + 0.666667 NA intron (NM_001253823, intron 3 of 8) intron (NM_001253823, intron 3 of 8) 26251 NM_000712 644 Hs.488143 NM_000712 ENSG00000106605 BLVRA BLVR|BVR|BVRA biliverdin reductase A protein-coding 115.333-208 chr8 11257358 11257608 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -27333 NM_015458 66036 Hs.591395 NM_015458 ENSG00000104643 MTMR9 C8orf9|LIP-STYX|MTMR8 myotubularin related protein 9 protein-coding 199-43 chr2 29555950 29556434 + 0.666667 NA intron (NM_004304, intron 3 of 28) intron (NM_004304, intron 3 of 28) -80815 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 112.333-126 chr2 57750648 57750919 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -156868 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 140-112 chr7 105831111 105831469 + 0.666667 NA intron (NM_152749, intron 2 of 3) intron (NM_152749, intron 2 of 3) 45295 NM_020725 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 207-68 chr2 179763815 179764274 + 0.666667 NA intron (NM_001352809, intron 3 of 10) L1MDa|LINE|L1 -17534 NM_001352817 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 178.333 chr1 21579185 21579661 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 28153 NM_001369803 249 Hs.75431 NM_000478 ENSG00000162551 ALPL AP-TNAP|APTNAP|HOPS|TNALP|TNAP|TNSALP alkaline phosphatase, biomineralization associated protein-coding 179.333-98 chr2 83499779 83500078 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22886 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 144.667-40 chr11 50488215 50488498 + 0.666667 NA Intergenic MER11C|LTR|ERVK 79209 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 133-50 chr2 231071885 231072244 + 0.666667 NA intron (NM_001191037, intron 6 of 23) intron (NM_001191037, intron 6 of 23) 15197 NM_002807 5707 Hs.3887 NM_002807 ENSG00000173692 PSMD1 P112|Rpn2|S1 proteasome 26S subunit, non-ATPase 1 protein-coding 121.667-26 chr10 66813340 66813606 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) -112563 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 115.333-80 chr15 26632291 26632484 + 0.666667 NA intron (NM_000814, intron 3 of 8) intron (NM_000814, intron 3 of 8) -3297 NR_103801 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 122.333-200 chr8 58381538 58381876 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -29557 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 145.667-239 chr5 164550851 164551160 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 80726 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 161.667-206 chr5 98322976 98323309 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -161903 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 223.667-72 chr5 172889521 172889989 + 0.666667 NA intron (NM_001031711, intron 2 of 9) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -25328 NR_162113 113218510 NR_162113 MIR10523 - microRNA 10523 ncRNA 153-85 chr22 19666215 19666605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48093 NM_002688 5413 Hs.728762 NM_002688 ENSG00000184702 SEPTIN5 CDCREL|CDCREL-1|CDCREL1|H5|HCDCREL-1|PNUTL1|SEPT5 septin 5 protein-coding 149-96 chr3 147573509 147573789 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 152322 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 113-25 chr10 106431131 106431320 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 291060 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 148.333-103 chr12 109331565 109331860 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22428 NM_213596 121643 Hs.528316 NM_213596 ENSG00000139445 FOXN4 - forkhead box N4 protein-coding 254.667-30 chr17 29830600 29831080 + 0.666667 NA intron (NM_033389, intron 1 of 14) intron (NM_033389, intron 1 of 14) -69408 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 182.333-135 chr5 122818831 122819226 + 0.666667 NA intron (NM_003100, intron 11 of 14) intron (NM_003100, intron 11 of 14) -26421 NR_146145 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 127.667-199 chr9 111818653 111818871 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -23825 NR_109816 158401 Hs.428209 NM_173521 ENSG00000165181 SHOC1 C9orf84|ZIP2|ZIP2H shortage in chiasmata 1 protein-coding 147.333-100 chr14 52392241 52392538 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 78077 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 143.667-251 chr8 81060517 81060926 + 0.666667 NA intron (NM_018440, intron 2 of 8) intron (NM_018440, intron 2 of 8) 51347 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 136-112 chr9 26629183 26629572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 263425 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 121.333-146 chr5 74083426 74083755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 224735 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 134.333-118 chr3 107314598 107314812 + 0.666667 NA intron (NR_028302, intron 2 of 3) L1PREC2|LINE|L1 -62734 NM_032600 84692 Hs.164799 NM_032600 ENSG00000138483 CCDC54 NYD-SP17|SP17 coiled-coil domain containing 54 protein-coding 161-103 chr8 124683776 124684244 + 0.666667 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 44463 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 142-5 chr1 95152035 95152320 + 0.666667 NA intron (NM_152487, intron 5 of 6) intron (NM_152487, intron 5 of 6) 34254 NM_001199691 100527978 Hs.483512 NM_001199691 ENSG00000271092 TLCD4-RWDD3 TMEM56-RWDD3 TLCD4-RWDD3 readthrough protein-coding 123.333-224 chr8 141138575 141138807 + 0.666667 NA intron (NM_001362798, intron 3 of 21) L1MB5|LINE|L1 10102 NR_148197 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 150.667-160 chr18 63208230 63208459 + 0.666667 NA intron (NM_000633, intron 2 of 2) intron (NM_000633, intron 2 of 2) 111036 NM_000657 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 149.333-43 chr10 31786859 31787271 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 121861 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 213.333-146 chr4 57345674 57346190 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79940 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 159.333-284 chr6 63497445 63497767 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74406 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 127.667-189 chr8 136444454 136444724 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86209 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 144.667-58 chr12 45925930 45926317 + 0.666667 NA intron (NM_004719, intron 11 of 14) intron (NM_004719, intron 11 of 14) 64451 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 139.667-6 chr1 113704098 113704363 + 0.666667 NA intron (NM_001323043, intron 14 of 18) intron (NM_001323043, intron 14 of 18) 54925 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 115.667-130 chr2 234480659 234481002 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 16219 NM_005737 10123 Hs.111554 NM_005737 ENSG00000188042 ARL4C ARL7|LAK ADP ribosylation factor like GTPase 4C protein-coding 219-45 chr2 11478595 11479092 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12666 NM_001278277 1876 Hs.603093 NM_198256 ENSG00000169016 E2F6 E2F-6 E2F transcription factor 6 protein-coding 125.333-52 chr13 103881722 103881959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 456640 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 145-81 chr4 106512479 106512764 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 78997 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 174-101 chr8 130823871 130824189 + 0.666667 NA intron (NM_001115, intron 12 of 17) MIR3|SINE|MIR 216879 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 161-42 chr2 80944056 80944373 + 0.666667 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 522732 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 223-48 chr4 92289113 92289613 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -12061 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 128-35 chr17 66263983 66264219 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -34686 NM_000042 350 Hs.445358 NM_000042 ENSG00000091583 APOH B2G1|B2GP1|BG apolipoprotein H protein-coding 200.667-9 chr1 111169664 111170205 + 0.666667 NA intron (NR_138483, intron 5 of 9) MIRb|SINE|MIR 29711 NR_138483 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 116.333-62 chr14 42708794 42709071 + 0.666667 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 1102076 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 269.667-20 chr14 45643597 45644114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71747 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 148-149 chr6 132556734 132557029 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 4197 NM_053278 83551 Hs.350571 NM_053278 ENSG00000146385 TAAR8 GPR102|TA5|TAR5|TRAR5|TaR-5|TaR-8 trace amine associated receptor 8 protein-coding 183.667-75 chr2 96668964 96669466 + 0.666667 NA intron (NM_001293083, intron 17 of 52) intron (NM_001293083, intron 17 of 52) 26451 NM_001293083 90342 Hs.534025 NM_001077400 ENSG00000249715 FER1L5 - fer-1 like family member 5 protein-coding 145.333-271 chr7 41186278 41186695 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 84882 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 154.667-96 chr13 74708059 74708375 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 155374 NR_034025 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 230.667-20 chr15 97588611 97589214 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28214 NR_110756 101927310 Hs.560324 NR_110756 ENSG00000259582 LOC101927310 - uncharacterized LOC101927310 ncRNA 147.667-97 chr14 35926191 35926607 + 0.666667 NA Intergenic LTR57-int|LTR|ERVL 100061 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 113.333-193 chr4 90314564 90314800 + 0.666667 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) AluJr|SINE|Alu 79651 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 134 chr1 47004866 47005233 + 0.666667 NA intron (NM_001320290, intron 1 of 11) MER51-int|LTR|ERV1 863 NM_001320290 260293 Hs.439760 NM_178033 ENSG00000186377 CYP4X1 CYPIVX1 cytochrome P450 family 4 subfamily X member 1 protein-coding 155-53 chr17 81574502 81574811 + 0.666667 NA intron (NM_001369698, intron 12 of 16) intron (NM_001369698, intron 12 of 16) 2777 NR_130139 55666 Hs.464333 NM_017921 ENSG00000182446 NPLOC4 NPL4 NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor protein-coding 156.667-81 chr12 58791453 58791783 + 0.666667 NA intron (NR_126341, intron 1 of 1) L1MB7|LINE|L1 -9902 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 116.667-13 chr1 215904135 215904385 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 38 of 71) intron (NM_206933, intron 38 of 71) -168205 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 141.667-34 chr10 84978133 84978440 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 220619 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 217-79 chr6 45441000 45441619 + 0.666667 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 19034 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 149.667-99 chr12 117102682 117102982 + 0.666667 NA intron (NR_120464, intron 2 of 2) intron (NR_120464, intron 2 of 2) 3365 NR_120464 101928244 Hs.742266 NR_120464 TESC-AS1 - TESC antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 188.333-10 chr1 173120359 173120878 + 0.666667 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 -69655 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 151.667-139 chr16 73081856 73082303 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10270 NR_027756 283902 Hs.382776 NM_001101347 ENSG00000260880 HCCAT5 FJ222407|HTA hepatocellular carcinoma associated transcript 5 ncRNA 175-69 chr5 81444250 81444608 + 0.666667 NA intron (NM_012446, intron 12 of 16) L2c|LINE|L2 -50295 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 145.333-189 chr3 83390671 83390992 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 1404689 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 216.333-60 chr17 64388832 64389402 + 0.666667 NA intron (NM_000442, intron 2 of 15) intron (NM_000442, intron 2 of 15) 1743 NM_000442 5175 Hs.376675 NM_000442 ENSG00000261371 PECAM1 CD31|CD31/EndoCAM|GPIIA'|PECA1|PECAM-1|endoCAM platelet and endothelial cell adhesion molecule 1 protein-coding 194.667-80 chr20 31069087 31069590 + 0.666667 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -188326 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 122.667-194 chr8 103714539 103714752 + 0.666667 NA intron (NM_001348497, intron 2 of 22) intron (NM_001348497, intron 2 of 22) -104575 NR_145711 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 172.667-47 chr13 24852485 24852868 + 0.666667 NA intron (NM_031277, intron 24 of 35) intron (NM_031277, intron 24 of 35) 70185 NR_047595 55835 Hs.513379 NM_018451 ENSG00000151849 CENPJ BM032|CENP-J|CPAP|LAP|LIP1|MCPH6|SASS4|SCKL4|Sas-4 centromere protein J protein-coding 139-6 chr1 147279545 147279809 + 0.666667 NA intron (NR_145691, intron 12 of 19) intron (NR_145691, intron 12 of 19) 36535 NM_001348452 9557 Hs.191164 NM_004284 ENSG00000131778 CHD1L ALC1|CHDL chromodomain helicase DNA binding protein 1 like protein-coding 133.333-82 chr2 120659242 120659525 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76485 NM_001371271 156.333-207 chr20 43858680 43859089 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -35834 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 204-29 chr10 79263343 79263696 + 0.666667 NA intron (NM_020338, intron 7 of 24) intron (NM_020338, intron 7 of 24) -83950 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 271.667-9 chr10 25086739 25087278 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24729 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 254-17 chr12 64522808 64523268 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 70918 NM_013254 29110 Hs.505874 NM_013254 ENSG00000183735 TBK1 FTDALS4|IIAE8|NAK|T2K TANK binding kinase 1 protein-coding 285-7 chr15 23799956 23800736 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -113041 NM_002487 4692 Hs.50130 NM_002487 ENSG00000182636 NDN HsT16328|PWCR necdin, MAGE family member protein-coding 159.333-139 chr2 7419259 7419630 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1817 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 215.667-42 chr15 81383798 81384210 + 0.666667 NA intron (NR_120365, intron 6 of 6) intron (NR_120365, intron 6 of 6) -9791 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 123-15 chr10 51784272 51784562 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -84822 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 111.667-188 chr4 121442035 121442224 + 0.666667 NA Intergenic L1P2|LINE|L1 -61111 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 114-145 chr7 9558337 9558534 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75835 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 123-94 chr5 17480423 17480646 + 0.666667 NA intron (NR_134270, intron 2 of 2) L2|LINE|L2 36524 NR_134271 102723526 NR_134270 ENSG00000249662 LINC02218 - long intergenic non-protein coding RNA 2218 ncRNA 173.667-76 chr2 68246764 68247156 + 0.666667 NA intron (NM_000945, intron 1 of 5) intron (NM_000945, intron 1 of 5) 5572 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 123-74 chr3 30617764 30618014 + 0.666667 NA intron (NM_003242, intron 1 of 6) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 11288 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 116.667-34 chr12 39862164 39862489 + 0.666667 NA intron (NM_052885, intron 6 of 9) intron (NM_052885, intron 6 of 9) 236143 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 144.667-223 chr4 118280269 118280644 + 0.666667 NA TTS (NR_003584) TTS (NR_003584) 1266 NR_002963 677809 Hs.744742 NR_002963 ENSG00000275994 SNORA24 ACA24|SNORA24A small nucleolar RNA, H/ACA box 24 snoRNA 154-99 chr3 193711266 193711613 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84107 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 138.333-61 chr14 58517643 58517887 + 0.666667 NA intron (NM_001329945, intron 29 of 29) L1ME1|LINE|L1 78084 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 167.333-210 chr5 94317371 94317732 + 0.666667 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -205852 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 149.667-131 chr14 86269097 86269446 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 334593 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 228-93 chr8 113297227 113297679 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) intron (NM_001363185, intron 2 of 66) 79699 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 158-103 chr5 33321226 33321561 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91658 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 178.667-145 chr6 136802127 136802598 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9885 NM_005923 4217 Hs.186486 NM_005923 ENSG00000197442 MAP3K5 ASK1|MAPKKK5|MEKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 protein-coding 116.333-3 chr1 39974908 39975253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19935 NR_109896 84879 Hs.655177 NM_032793 ENSG00000168389 MFSD2A MCPH15|MFSD2|NLS1 major facilitator superfamily domain containing 2A protein-coding 234-5 chr1 108078861 108079412 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113699 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 148.667-35 chr10 13921045 13921296 + 0.666667 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 50726 NM_001318337 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 169.333-79 chr14 57980813 57981240 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114934 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 163-64 chr5 60552588 60552956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56486 NM_001364599 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 156.667-269 chr5 73724240 73724662 + 0.666667 NA intron (NM_001177693, intron 2 of 35) L1ME1|LINE|L1 -89095 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 193-2 chr1 19635163 19635572 + 0.666667 NA intron (NM_001204088, intron 2 of 4) intron (NM_001204088, intron 2 of 4) -7862 NM_182744 4681 Hs.654502 NM_005380 ENSG00000158747 NBL1 D1S1733E|DAN|DAND1|NB|NO3 NBL1, DAN family BMP antagonist protein-coding 128-79 chr4 52996508 52996799 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 134336 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 140.667-152 chr3 131098931 131099338 + 0.666667 NA intron (NM_001353034, intron 5 of 18) L1P4a|LINE|L1 71406 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 134.667-169 chr6 52259853 52260089 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15471 NM_052872 112744 Hs.272295 NM_052872 ENSG00000112116 IL17F CANDF6|IL-17F|ML-1|ML1 interleukin 17F protein-coding 132.333-188 chr9 77589120 77589444 + 0.666667 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) intron (NM_004297, intron 1 of 6) 59040 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 124-86 chr4 40735082 40735378 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -14725 NM_001330648 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 350 chr1 94629037 94629825 + 0.666667 NA intron (NR_160780, intron 4 of 5) MIRc|SINE|MIR 85729 NR_162147 113219466 NR_162147 MIR12133 - microRNA 12133 ncRNA 133.333-23 chr10 28472077 28472424 + 0.666667 NA intron (NR_134496, intron 1 of 2) intron (NR_134496, intron 1 of 2) 23563 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 144-123 chr4 60886944 60887225 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35535 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 152.667-279 chr4 83315505 83315793 + 0.666667 NA intron (NM_001098540, intron 3 of 11) intron (NM_001098540, intron 3 of 11) 19164 NM_001199830 10855 Hs.44227 NM_006665 ENSG00000173083 HPSE HPA|HPA1|HPR1|HPSE1|HSE1 heparanase protein-coding 154-34 chr12 17628588 17628941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39686 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 147.667-159 chr19 49735054 49735394 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 28082 NM_021733 60385 Hs.515858 NM_021733 ENSG00000126467 TSKS PPP1R161|STK22S1|TSKS1|TSSKS testis specific serine kinase substrate protein-coding 164.667-147 chr3 84646332 84646663 + 0.666667 NA intron (NR_033860, intron 19 of 20) L1PA16|LINE|L1 223078 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 126.333-92 chr2 85106317 85106534 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -26967 NM_031283 83439 Hs.516297 NM_031283 ENSG00000152284 TCF7L1 TCF-3|TCF3 transcription factor 7 like 1 protein-coding 195.667-55 chr17 17289696 17290131 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8610 NM_001316357 8533 Hs.6076 NM_003653 ENSG00000141030 COPS3 CSN3|SGN3 COP9 signalosome subunit 3 protein-coding 134.667-138 chr3 108195111 108195357 + 0.666667 NA intron (NM_018010, intron 5 of 10) L1MA4|LINE|L1 27190 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 112.667-2 chr1 62614061 62614322 + 0.666667 NA intron (NM_001367561, intron 14 of 49) intron (NM_001367561, intron 14 of 49) 16671 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 121-5 chr1 103954769 103955068 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -118105 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 114-141 chr6 156323536 156323808 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -55078 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 184.667-16 chr10 55234924 55235363 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -363899 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 169-48 chr2 162744932 162745293 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -23824 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 114-100 chr4 46391305 46391525 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1287 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 189.333-138 chr3 185763686 185764183 + 0.666667 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) 3970 NR_049838 100847078 NR_049838 ENSG00000265470 MIR548AQ - microRNA 548aq ncRNA 246.333-62 chr3 102027322 102027841 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 86722 NR_026934 152225 Hs.376768 NR_026934 ENSG00000214407 LINC02085 - long intergenic non-protein coding RNA 2085 ncRNA 153.667-257 chr3 97682631 97682929 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -81741 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 116.667-67 chr15 96308908 96309245 + 0.666667 NA intron (NR_102744, intron 1 of 1) intron (NR_102744, intron 1 of 1) -16970 NM_001145155 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 149-118 chr5 120149644 120150034 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -314439 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 243-63 chr7 17957388 17957832 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17102 NM_001350868 23161 Hs.487648 NM_015132 ENSG00000071189 SNX13 RGS-PX1 sorting nexin 13 protein-coding 118-28 chr13 35537495 35537742 + 0.666667 NA intron (NM_001204197, intron 1 of 17) L2b|LINE|L2 60869 NM_001204197 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 120.333-44 chr12 87627347 87627688 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -141295 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 151-78 chr22 34898041 34898399 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 99696 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 146.667-268 chr5 139488669 139488954 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6053 NM_001301738 340061 Hs.379754 NM_198282 ENSG00000184584 TMEM173 ERIS|MITA|MPYS|NET23|SAVI|STING|STING-beta|hMITA|hSTING transmembrane protein 173 protein-coding 154.667-48 chr10 83862209 83862550 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -185290 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 171-66 chr5 105520693 105521068 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 421406 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 122-7 chr1 70101049 70101277 + 0.666667 NA intron (NM_001350216, intron 24 of 25) intron (NM_001350216, intron 24 of 25) 104416 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 213.667-78 chr5 87650621 87651057 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11203 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 143.333-188 chr3 107508192 107508471 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14631 NM_001142568 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 148.667-88 chr12 3525115 3525486 + 0.666667 NA intron (NM_019854, intron 1 of 9) intron (NM_019854, intron 1 of 9) -32481 NR_126055 100129223 Hs.586788 NR_126055 THCAT155 - thyroid cancer-associated transcript 155 ncRNA 152.667-281 chr4 109220793 109221169 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 81677 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 112-92 chr18 12345422 12345744 + 0.666667 NA intron (NM_006796, intron 13 of 16) intron (NM_006796, intron 13 of 16) 31693 NM_006796 10939 Hs.726355 NM_006796 ENSG00000141385 AFG3L2 SCA28|SPAX5 AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2 protein-coding 113.667-30 chr11 44109725 44110019 + 0.666667 NA intron (NM_207122, intron 3 of 13) intron (NM_207122, intron 3 of 13) 13675 NM_000401 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 148.333-261 chr3 128527143 128527438 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 19455 NR_026954 90246 Hs.635164 NR_026954 LOC90246 - uncharacterized LOC90246 ncRNA 190-129 chr9 4106734 4107148 + 0.666667 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) intron (NM_001042413, intron 4 of 10) 45242 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 273.666-6 chr11 15382429 15383223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 233724 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 127.667-71 chr18 74783024 74783312 + 0.666667 NA intron (NM_017757, intron 3 of 7) MIRc|SINE|MIR 152205 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 159.667-264 chr5 102034296 102034587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 261843 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 143.333-31 chr10 43799303 43799651 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -9060 NR_002726 10151 Hs.632956 NR_002726 HNRNPA3P1 D10S102|FBRNP|HNRPA3|HNRPA3P1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 1 pseudo 149.333-173 chr2 41208923 41209290 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -668449 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 155-88 chr3 80720666 80720995 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44067 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 160.333-25 chr1 169559462 169559793 + 0.666667 NA intron (NM_000130, intron 4 of 24) intron (NM_000130, intron 4 of 24) 26904 NM_000130 2153 Hs.30054 NM_000130 ENSG00000198734 F5 FVL|PCCF|RPRGL1|THPH2 coagulation factor V protein-coding 157.333-375 chrX 97407361 97407692 + 0.666667 NA intron (NM_007309, intron 25 of 26) intron (NM_007309, intron 25 of 26) 157009 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 158.333-283 chr6 146176139 146176579 + 0.666667 NA intron (NM_001278065, intron 3 of 9) intron (NM_001278065, intron 3 of 9) 147161 NM_001278067 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 128.667-7 chr1 89896690 89896934 + 0.666667 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 74873 NM_018103 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 192.667-187 chrX 39486097 39486577 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -94563 NR_110385 101927449 Hs.553988 NR_110385 ENSG00000236747 LINC01282 - long intergenic non-protein coding RNA 1282 ncRNA 119.667-138 chr4 158880800 158881113 + 0.666667 NA intron (NM_001346043, intron 13 of 15) intron (NM_001346043, intron 13 of 15) 75117 NM_001366843 57600 Hs.652441 NM_020840 ENSG00000052795 FNIP2 FNIPL|MAPO1 folliculin interacting protein 2 protein-coding 117.667-58 chr16 6789671 6789913 + 0.666667 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) L1MC4|LINE|L1 15983 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 119-51 chr14 86322512 86322820 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 387988 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 120-30 chr12 62661510 62661838 + 0.666667 NA intron (NM_020700, intron 9 of 9) AluSz6|SINE|Alu 57988 NR_029661 406891 NR_029661 ENSG00000199179 MIRLET7I LET7I|MIRNLET7I|hsa-let-7i|let-7i microRNA let-7i ncRNA 162.667-84 chr14 86394041 86394285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 459485 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 217.667-70 chr4 115718409 115718868 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -581087 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 185.333-26 chr11 27620106 27620411 + 0.666667 NA intron (NR_102708, intron 2 of 3) intron (NR_102708, intron 2 of 3) 14369 NR_102708 101410541 Hs.471439 NR_102708 ENSG00000254934 LINC00678 - long intergenic non-protein coding RNA 678 ncRNA 248.666-38 chr8 27098644 27099368 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50043 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 121.333-62 chr15 69446006 69446221 + 0.666667 NA intron (NM_001367804, intron 20 of 21) intron (NM_001367804, intron 20 of 21) -6705 NM_001003 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 261.667-9 chr10 101424417 101424988 + 0.666667 NA intron (NM_003939, intron 1 of 13) intron (NM_003939, intron 1 of 13) 70537 NM_033637 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 137-56 chr20 63270102 63270405 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2532 NM_001281483 55738 Hs.25584 NM_018209 ENSG00000101199 ARFGAP1 ARF1GAP|HRIHFB2281 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1 protein-coding 122.333-110 chr2 185060719 185060930 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106248 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 281.667-11 chr11 81962816 81963297 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -72220 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 142.333-214 chr6 50241620 50241986 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -191874 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 142.333-182 chr4 73875575 73875848 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6318 NR_046035 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 212.667-24 chr12 5855838 5856306 + 0.666667 NA intron (NM_001278596, intron 3 of 25) Charlie25|DNA|hAT-Charlie 89187 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 169-109 chr9 75398251 75398614 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 309918 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 160-63 chr2 179408268 179408703 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -143653 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 133.667-58 chr17 17854351 17854642 + 0.666667 NA intron (NM_001288787, intron 11 of 13) AluSz6|SINE|Alu -17485 NM_004176 6720 Hs.592123 NM_004176 ENSG00000072310 SREBF1 SREBP1|bHLHd1 sterol regulatory element binding transcription factor 1 protein-coding 140.333-11 chr1 111221143 111221477 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6349 NM_001025197 1117 Hs.514840 NM_004000 ENSG00000064886 CHI3L2 CHIL2|YKL-39|YKL39 chitinase 3 like 2 protein-coding 154.667-312 chr5 58300486 58300869 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 159409 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 187-83 chr7 121636565 121636948 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -236405 NM_001369396 5803 Hs.489824 NM_002851 ENSG00000106278 PTPRZ1 HPTPZ|HPTPzeta|PTP-ZETA|PTP18|PTPRZ|PTPZ|R-PTP-zeta-2|RPTPB|RPTPbeta|phosphacan protein tyrosine phosphatase receptor type Z1 protein-coding 123.667-68 chr16 49226806 49227088 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 54891 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 147.667-249 chr4 34157759 34158050 + 0.666667 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 111843 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 127-54 chr22 28243773 28244007 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L2a|LINE|L2 -215979 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 118-133 chr8 87875713 87876056 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -1869 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 160-70 chr22 21050990 21051318 + 0.666667 NA intron (NR_027006, intron 4 of 10) AluJr|SINE|Alu 5208 NR_027006 400891 Hs.291198 NM_001013675 ENSG00000187905 LRRC74B - leucine rich repeat containing 74B protein-coding 159.333-316 chr7 88852596 88852878 + 0.666667 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) MIR|SINE|MIR -57000 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 122.333-3 chr1 52271140 52271348 + 0.666667 NA intron (NM_007324, intron 6 of 17) L3|LINE|CR1 94961 NM_032449 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 203.667-20 chr11 96781220 96781611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 272990 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 184.333-57 chr17 52374743 52375048 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15627 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 116.333-125 chr2 166298887 166299172 + 0.666667 NA intron (NR_110260, intron 11 of 11) L2b|LINE|L2 76915 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 171.667-16 chr10 14702537 14702994 + 0.666667 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) intron (NM_031453, intron 1 of 4) 72132 NM_031453 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 127-93 chr8 59659264 59659478 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 540161 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 150.333-64 chr11 66827337 66827783 + 0.666667 NA intron (NM_024650, intron 13 of 16) intron (NM_024650, intron 13 of 16) -15881 NM_005133 9986 Hs.654972 NM_005133 ENSG00000173653 RCE1 FACE2|RCE1A|RCE1B Ras converting CAAX endopeptidase 1 protein-coding 153.667-249 chr3 42008158 42008529 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -46240 NM_001322500 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 168-29 chr14 69435877 69436308 + 0.666667 NA intron (NM_001330185, intron 2 of 5) L1MEf|LINE|L1 37400 NM_001330185 55334 Hs.432690 NM_018375 ENSG00000029364 SLC39A9 ZIP-9|ZIP9 solute carrier family 39 member 9 protein-coding 138.667-30 chr10 120533497 120533760 + 0.666667 NA intron (NM_001030059, intron 5 of 6) L1MB8|LINE|L1 -64321 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 122-26 chr12 8092734 8093039 + 0.666667 NA non-coding (NR_024260, exon 5 of 7) non-coding (NR_024260, exon 5 of 7) 10612 NM_015509 25977 Hs.555927 NM_015509 ENSG00000089818 NECAP1 EIEE21 NECAP endocytosis associated 1 protein-coding 115-147 chr7 104310067 104310354 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18446 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 151.667-241 chr3 191290265 191290604 + 0.666667 NA intron (NM_198152, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR -38960 NM_174908 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 192-121 chr6 41099069 41099498 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002505, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_002505, exon 10 of 10) -1496 NM_001329690 221443 Hs.227457 NM_145063 ENSG00000124596 OARD1 C6orf130|TARG1|dJ34B21.3 O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 protein-coding 143.667-239 chr7 133005057 133005360 + 0.666667 NA intron (NM_001317177, intron 3 of 8) intron (NM_001317177, intron 3 of 8) 29707 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 167.667-166 chr5 38312205 38312587 + 0.666667 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) AluYf1|SINE|Alu -21410 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 167.333-154 chr20 34767744 34768181 + 0.666667 NA intron (NM_001242539, intron 3 of 11) intron (NM_001242539, intron 3 of 11) 14442 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 115.667-139 chr22 22709398 22709647 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 63210 NM_199127 91227 Hs.450000 NM_080839 ENSG00000100121 GGTLC2 GGTL4 gamma-glutamyltransferase light chain 2 protein-coding 123-3 chr1 50035126 50035461 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11339 NM_001323575 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 136.667-192 chrX 152982174 152982460 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 9896 NM_052926 114824 Hs.573567 NM_052926 ENSG00000198883 PNMA5 - PNMA family member 5 protein-coding 114-14 chr11 4019779 4020022 + 0.666667 NA intron (NM_001277962, intron 2 of 12) L1MA6|LINE|L1 -74785 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 157-111 chr6 27289847 27290247 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22185 NM_033482 94026 Hs.729955 NM_033482 ENSG00000158553 POM121L2 POM121-L|POM121L POM121 transmembrane nucleoporin like 2 protein-coding 187.667-17 chr10 92371590 92371895 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -46919 NR_038243 100507674 Hs.568772 NR_038243 MARK2P9 - microtubule affinity regulating kinase 2 pseudogene 9 pseudo 119.667-30 chr11 47500456 47500662 + 0.666667 NA intron (NM_001172639, intron 2 of 15) intron (NM_001172639, intron 2 of 15) -6038 NM_198700 10658 Hs.595333 NM_006560 ENSG00000149187 CELF1 BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50 CUGBP Elav-like family member 1 protein-coding 184.333-138 chr7 53006210 53006605 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -29226 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 159.667-37 chr1 239575920 239576329 + 0.666667 NA intron (NM_001347716, intron 3 of 7) L1MB2|LINE|L1 -52949 NM_000740 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 124.333-105 chr20 41006984 41007240 + 0.666667 NA intron (NR_145525, intron 2 of 2) MER52A|LTR|ERV1 -21710 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 140-102 chr7 13324101 13324482 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 636658 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 145.333-289 chr8 11136956 11137295 + 0.666667 NA intron (NR_138154, intron 1 of 2) intron (NR_138154, intron 1 of 2) 64241 NR_138152 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 130.667-4 chr1 51490812 51491131 + 0.666667 NA intron (NM_001981, intron 1 of 24) L1MD2|LINE|L1 28295 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 135-115 chr8 124809684 124810076 + 0.666667 NA Intergenic (TATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12105 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 117.667-51 chr14 69716956 69717134 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50097 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 145.667-201 chr4 170919739 170920080 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -120693 NR_038838 100506122 Hs.434205 NR_038838 ENSG00000248872 LINC02431 - long intergenic non-protein coding RNA 2431 ncRNA 127.333-37 chr12 16816423 16816753 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -172159 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 164.333-204 chr5 149325829 149326275 + 0.666667 NA intron (NM_152406, intron 15 of 18) L1M4b|LINE|L1 -19447 NM_152407 134266 Hs.511816 NM_152407 ENSG00000164284 GRPEL2 Mt-GrpE#2 GrpE like 2, mitochondrial protein-coding 140.667-88 chr15 73824062 73824456 + 0.666667 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -49305 NM_001286434 161514 Hs.124512 NM_153356 ENSG00000167139 TBC1D21 MgcRabGAP TBC1 domain family member 21 protein-coding 153.667-119 chr14 63489954 63490265 + 0.666667 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 18129 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 112.667-221 chr5 147860351 147860581 + 0.666667 NA Intergenic LTR7|LTR|ERV1 -18245 NM_054023 117156 Hs.483765 NM_054023 ENSG00000164265 SCGB3A2 LU103|PNSP1|UGRP1|pnSP-1 secretoglobin family 3A member 2 protein-coding 170.333-46 chr11 58156857 58157283 + 0.666667 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) intron (NM_001005212, intron 2 of 2) -33364 NM_001005283 219957 Hs.553643 NM_001005283 ENSG00000186513 OR9Q2 OR9Q2P olfactory receptor family 9 subfamily Q member 2 protein-coding 116-22 chr10 80906635 80906893 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 256967 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 142.667-236 chr8 133713157 133713579 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -29302 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 150.333-227 chr2 217722597 217722875 + 0.666667 NA intron (NR_026597, intron 1 of 12) intron (NR_026597, intron 1 of 12) 33857 NR_026597 729582 Hs.572788 NR_026597 DIRC3 - disrupted in renal carcinoma 3 ncRNA 134-60 chr22 33214559 33214901 + 0.666667 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 106201 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 130-75 chr3 26740963 26741226 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 46537 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 125.333-140 chr5 67914140 67914410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121062 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 194-34 chr14 46247844 46248410 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) 183968 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 223-51 chr5 13892148 13892507 + 0.666667 NA intron (NM_001369, intron 16 of 78) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 52153 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 118.667-27 chr10 66842894 66843201 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) -82989 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 199.667-99 chr3 193705664 193706104 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -78552 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 151.667-346 chr7 111205667 111205969 + 0.666667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 114691 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 135-20 chr12 71229681 71229963 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -71823 NM_004616 7103 Hs.170563 NM_004616 ENSG00000127324 TSPAN8 CO-029|TM4SF3 tetraspanin 8 protein-coding 163.333-272 chr7 134724760 134725248 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54630 NM_033138 800 Hs.490203 NM_004342 ENSG00000122786 CALD1 CDM|H-CAD|HCAD|L-CAD|LCAD|NAG22 caldesmon 1 protein-coding 214.333-8 chr1 115489533 115489979 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -151520 NM_002506 4803 Hs.2561 NM_002506 ENSG00000134259 NGF Beta-NGF|HSAN5|NGFB nerve growth factor protein-coding 197-126 chr9 99111472 99111785 + 0.666667 NA intron (NM_004612, intron 1 of 8) AluSx3|SINE|Alu 6515 NM_001130916 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 134.667-153 chr5 14947437 14947819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75850 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 145.667-188 chr4 12250623 12250913 + 0.666667 NA intron (NR_125910, intron 3 of 3) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 27317 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 139-102 chr8 33850160 33850404 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -250176 NM_001305115 78986 Hs.8719 NM_024025 ENSG00000133878 DUSP26 DSP-4|DUSP24|LDP-4|LDP4|MKP-8|MKP8|NATA1|NEAP|SKRP3 dual specificity phosphatase 26 protein-coding 186.333-170 chr8 128338989 128339386 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 189071 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 112-30 chr11 73690164 73690460 + 0.666667 NA intron (NM_001243718, intron 3 of 4) intron (NM_001243718, intron 3 of 4) 41399 NM_001130036 58473 Hs.445489 NM_021200 ENSG00000021300 PLEKHB1 KPL1|PHR1|PHRET1 pleckstrin homology domain containing B1 protein-coding 207-4 chr1 68723186 68723641 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -226331 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 134.333-3 chr1 102337287 102337581 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -340200 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 126.333-54 chr14 69531206 69531446 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001161498, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001161498, exon 13 of 13) 43545 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 124.667-217 chr9 134663866 134664093 + 0.666667 NA intron (NM_001278074, intron 1 of 65) intron (NM_001278074, intron 1 of 65) -11136 NR_138049 414316 Hs.571561 NR_138049 ENSG00000204011 COL5A1-AS1 C9orf104|bA54A22.4 COL5A1 antisense RNA 1 ncRNA 122.667-208 chr9 60591369 60591582 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -322932 NM_001113541 727905 Hs.645497 NM_001113541 ENSG00000276581 SPATA31A5 FAM75A5 SPATA31 subfamily A member 5 protein-coding 187.667-59 chr18 3091137 3091449 + 0.666667 NA intron (NM_019856, intron 25 of 36) AluSq2|SINE|Alu -79346 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 118.667-3 chr1 48984843 48985127 + 0.666667 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) intron (NM_001323575, intron 5 of 12) -208016 NM_001302082 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 192-72 chr2 62015288 62015675 + 0.666667 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) L1MB4|LINE|L1 109839 NM_152516 150684 Hs.468702 NM_152516 ENSG00000173163 COMMD1 C2orf5|MURR1 copper metabolism domain containing 1 protein-coding 142.667-6 chr1 87589419 87589690 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -217899 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 124.667-122 chr20 34727427 34727698 + 0.666667 NA intron (NM_001242539, intron 10 of 11) intron (NM_001242539, intron 10 of 11) 22843 NM_001329431 58476 Hs.516994 NM_021202 ENSG00000078804 TP53INP2 C20orf110|DOR|PIG-U|PIGU|PINH|dJ1181N3.1 tumor protein p53 inducible nuclear protein 2 protein-coding 197.333-21 chr10 65357071 65357530 + 0.666667 NA Intergenic MER107|DNA|hAT-Charlie -214125 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 114-174 chr9 85058090 85058358 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 352323 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 181-7 chr10 105360980 105361444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 459121 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 144-3 chr1 76640641 76641065 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 138414 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 128.667-74 chr17 40518770 40519012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17268 NM_032865 84951 Hs.438292 NM_032865 ENSG00000131746 TNS4 CTEN|PP14434 tensin 4 protein-coding 168.667-66 chr14 74304997 74305484 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -2306 NM_001353601 5826 Hs.94395 NM_005050 ENSG00000119688 ABCD4 ABC41|EST352188|MAHCJ|P70R|P79R|PMP69|PXMP1L ATP binding cassette subfamily D member 4 protein-coding 132.667-39 chr12 43844658 43844938 + 0.666667 NA exon (NM_032256, exon 2 of 8) exon (NM_032256, exon 2 of 8) 8717 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 121.333-182 chr8 124032495 124032735 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 18 of 40) AluJr|SINE|Alu 8167 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 233.333-74 chr20 48942322 48942721 + 0.666667 NA intron (NM_006420, intron 3 of 38) AluSq2|SINE|Alu 20810 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 114.333-199 chr6 152163849 152164121 + 0.666667 NA intron (NM_182961, intron 131 of 145) intron (NM_182961, intron 131 of 145) 4302 NM_001347702 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 187.667-40 chr14 44206252 44206752 + 0.666667 NA Intergenic LTR40c|LTR|ERVL 300781 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 308-42 chr5 54429457 54430031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25955 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 150.333-102 chr14 31791877 31792323 + 0.666667 NA intron (NM_001201573, intron 5 of 8) MIRb|SINE|MIR 77531 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 116-39 chr14 58974935 58975144 + 0.666667 NA intron (NR_110547, intron 4 of 5) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 146751 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 121.667-153 chr5 13717622 13717931 + 0.666667 NA intron (NM_001369, intron 72 of 78) intron (NM_001369, intron 72 of 78) 226704 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 113.333-26 chr10 59028068 59028274 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 28653 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 163-23 chr14 76365381 76365723 + 0.666667 NA Intergenic MER97a|DNA|hAT-Tip100 -5795 NM_004452 2103 Hs.435845 NM_004452 ENSG00000119715 ESRRB DFNB35|ERR2|ERRb|ESRL2|NR3B2 estrogen related receptor beta protein-coding 136.333-207 chr8 85603748 85603998 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51803 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 112-89 chr17 76598472 76598642 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12697 NM_006456 10610 Hs.592105 NM_006456 ENSG00000070731 ST6GALNAC2 SAITL1|SIAT7|SIAT7B|SIATL1|ST6GalNAII|STHM ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 189.333-163 chr5 128142862 128143299 + 0.666667 NA intron (NM_001046, intron 10 of 26) L1MD|LINE|L1 59314 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 206.667-67 chr2 162498722 162499179 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 6 of 15) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 154582 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 289-16 chr22 20508538 20509287 + 0.666667 NA intron (NM_001293237, intron 1 of 16) intron (NM_001293237, intron 1 of 16) 865 NM_001293237 51586 Hs.517421 NM_015889 ENSG00000099917 MED15 ARC105|CAG7A|CTG7A|PCQAP|TIG-1|TIG1|TNRC7 mediator complex subunit 15 protein-coding 111.667-77 chr13 73386110 73386384 + 0.666667 NA Intergenic Mam_R4|LINE|Dong-R4 -177997 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 139.333-102 chr18 67643819 67644156 + 0.666667 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) MER6|DNA|TcMar-Tigger -127267 NM_032160 92126 Hs.124673 NM_032160 ENSG00000171451 DSEL C18orf4|DE-epi2 dermatan sulfate epimerase like protein-coding 153.333-295 chr4 44350877 44351185 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 97778 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 113-66 chr15 59210555 59210807 + 0.666667 NA intron (NM_004998, intron 12 of 27) intron (NM_004998, intron 12 of 27) 3838 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 231.667-51 chr6 53058931 53059449 + 0.666667 NA intron (NM_014920, intron 1 of 13) intron (NM_014920, intron 1 of 13) 2612 NM_016513 22858 Hs.417022 NM_014920 ENSG00000112144 ICK ECO|EJM10|LCK2|MRK intestinal cell kinase protein-coding 154.667-67 chr11 109253852 109254151 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -168189 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 122.667-90 chr2 72634899 72635155 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) L1MDa|LINE|L1 191006 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 148.333-111 chr13 99249761 99250185 + 0.666667 NA intron (NR_026644, intron 4 of 8) L1PA16|LINE|L1 8455 NM_001098200 2841 Hs.741589 NM_005292 ENSG00000125245 GPR18 - G protein-coupled receptor 18 protein-coding 139-69 chr3 192335456 192335773 + 0.666667 NA intron (NM_004113, intron 3 of 5) MIR3|SINE|MIR 73435 NM_021032 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 190-31 chr14 50658484 50658779 + 0.666667 NA intron (NM_021818, intron 2 of 4) intron (NM_021818, intron 2 of 4) 9675 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 123.667-197 chrX 13704563 13704824 + 0.666667 NA intron (NM_004251, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 15565 NM_004251 9367 Hs.495704 NM_004251 ENSG00000123595 RAB9A RAB9 RAB9A, member RAS oncogene family protein-coding 142-12 chr1 217124423 217124796 + 0.666667 NA intron (NM_001134285, intron 1 of 8) intron (NM_001134285, intron 1 of 8) 13093 NM_001243511 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 167-74 chr4 41210010 41210405 + 0.666667 NA intron (NM_173075, intron 1 of 16) MER1B|DNA|hAT-Charlie 4335 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 154.667-159 chr2 2177329 2177721 + 0.666667 NA intron (NM_015025, intron 2 of 24) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -141707 NR_024468 730811 Hs.629472 NR_024468 ENSG00000225619 MYT1L-AS1 - MYT1L antisense RNA 1 ncRNA 154.333-358 chr8 135372864 135373281 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84384 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 158.667-114 chr16 25638401 25638718 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53400 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 196-177 chr8 52072407 52072840 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -121739 NR_134310 101929341 Hs.147170 NR_134310 ENSG00000253551 LOC101929341 - uncharacterized LOC101929341 ncRNA 131.667-66 chr16 12454302 12454671 + 0.666667 NA intron (NM_032167, intron 18 of 20) intron (NM_032167, intron 18 of 20) -265835 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 119-17 chr10 62993562 62993768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -139582 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 239.667-13 chr11 104063480 104063916 + 0.666667 NA intron (NM_025208, intron 1 of 6) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 27058 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 168-90 chr5 76738360 76738797 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 22452 NM_001311313 2149 Hs.482562 NM_001992 ENSG00000181104 F2R CF2R|HTR|PAR-1|PAR1|TR coagulation factor II thrombin receptor protein-coding 130.667-99 chr18 74089295 74089599 + 0.666667 NA intron (NM_001142958, intron 8 of 9) L1PA15|LINE|L1 58387 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 156.667-314 chr7 27172451 27172852 + 0.666667 NA TTS (NR_046609) TTS (NR_046609) 1669 NM_018951 3206 Hs.110637 NM_018951 ENSG00000253293 HOXA10 HOX1|HOX1.8|HOX1H|PL homeobox A10 protein-coding 155.667-48 chr10 120590898 120591171 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -6915 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 144.667-167 chr20 29262723 29263047 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 154076 NR_037925 647476 Hs.274541 NR_037925 FRG2EP - FSHD region gene 2 family member E, pseudogene pseudo 114.333-69 chr14 42873583 42873919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1266895 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 153-139 chr8 2955884 2956209 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 63 of 69) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -227595 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 157-127 chr8 30536709 30537017 + 0.666667 NA intron (NM_001008710, intron 5 of 8) intron (NM_001008710, intron 5 of 8) -101717 NM_001206847 100507341 Hs.659493 NM_001206847 ENSG00000253457 SMIM18 - small integral membrane protein 18 protein-coding 224-95 chr7 12537409 12537929 + 0.666667 NA intron (NR_136263, intron 3 of 3) L1ME3A|LINE|L1 -33051 NR_156701 85477 Hs.633359 NM_033128 ENSG00000006747 SCIN - scinderin protein-coding 150-63 chr17 76541499 76541832 + 0.666667 NA intron (NM_001077620, intron 2 of 4) intron (NM_001077620, intron 2 of 4) 1621 NM_001077620 768206 Hs.634380 NM_001077620 ENSG00000214140 PRCD RP36 photoreceptor disc component protein-coding 145.667-106 chr16 64284172 64284583 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 837686 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 148.333-31 chr1 213426527 213426917 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 375481 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 148.333-72 chr11 72734528 72734824 + 0.666667 NA intron (NM_001040118, intron 1 of 34) MIR|SINE|MIR -12318 NM_001135190 116985 Hs.503165 NM_015242 ENSG00000186635 ARAP1 CENTD2 ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 220.667-90 chr6 10690633 10691142 + 0.666667 NA intron (NM_001145020, intron 1 of 4) intron (NM_001145020, intron 1 of 4) 3722 NM_001145020 347744 Hs.61389 NM_001145020 ENSG00000137434 C6orf52 - chromosome 6 open reading frame 52 protein-coding 156.667-162 chr19 27980190 27980566 + 0.666667 NA intron (NR_146734, intron 6 of 7) intron (NR_146734, intron 6 of 7) -186438 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 170-29 chr13 68647010 68647502 + 0.666667 NA Intergenic LTR80B|LTR|ERVL 238069 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 184.333-52 chr15 67306457 67306735 + 0.666667 NA intron (NM_022784, intron 5 of 5) intron (NM_022784, intron 5 of 5) -51398 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 214.333-154 chr8 84531665 84532162 + 0.666667 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) intron (NM_001354308, intron 3 of 9) 116429 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 116.667-137 chr3 170628747 170629030 + 0.666667 NA intron (NR_135556, intron 2 of 5) intron (NR_135556, intron 2 of 5) -42813 NM_020949 57709 Hs.596660 NM_020949 ENSG00000013293 SLC7A14 PPP1R142 solute carrier family 7 member 14 protein-coding 130.667-83 chr16 81491233 81491540 + 0.666667 NA intron (NM_198390, intron 1 of 20) MIRc|SINE|MIR -3968 NM_030629 80790 Hs.594095 NM_030629 ENSG00000153815 CMIP TCMIP c-Maf inducing protein protein-coding 130.333-8 chr1 78556560 78556791 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -63773 NM_006820 10964 Hs.744918 NM_006820 ENSG00000137959 IFI44L C1orf29|GS3686 interferon induced protein 44 like protein-coding 153.333-226 chr2 206688147 206688594 + 0.666667 NA intron (NM_001093730, intron 9 of 11) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 30026 NM_001093730 391475 Hs.640667 NM_001093730 ENSG00000232125 DYTN - dystrotelin protein-coding 139.667-50 chr14 32216575 32216992 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -13514 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 123.333-219 chr8 124950134 124950337 + 0.666667 NA intron (NR_027321, intron 3 of 3) L1MC4|LINE|L1 8227 NR_027321 157381 Hs.638933 NR_027321 ENSG00000249816 LINC00964 - long intergenic non-protein coding RNA 964 ncRNA 170.667-48 chr14 83262569 83262954 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 620129 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 189-81 chr6 74579091 74579597 + 0.666667 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 509893 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 184-117 chr8 132939890 132940352 + 0.666667 NA intron (NM_003235, intron 25 of 47) MIRb|SINE|MIR 73163 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 143-3 chr1 40349125 40349443 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -24443 NM_022733 64744 Hs.15200 NM_022733 ENSG00000084070 SMAP2 SMAP1L small ArfGAP2 protein-coding 170.667-15 chr10 12227484 12227954 + 0.666667 NA intron (NM_006023, intron 6 of 12) AluSg|SINE|Alu 31531 NM_006023 8872 Hs.412842 NM_006023 ENSG00000151465 CDC123 C10orf7|D123 cell division cycle 123 protein-coding 127.333-36 chr12 13798137 13798343 + 0.666667 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) intron (NM_000834, intron 2 of 12) 182116 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 122-107 chr6 142287285 142287592 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14481 NM_001032394 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 190-119 chr7 119979090 119979641 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -71990 NR_131960 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 153-153 chr9 34207826 34208104 + 0.666667 NA intron (NM_001171203, intron 2 of 7) intron (NM_001171203, intron 2 of 7) 28922 NM_016525 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 168-102 chr7 46364948 46365249 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 332024 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 121.667-13 chr1 90120205 90120427 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 125206 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 142.667-190 chr6 97740682 97740993 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -283694 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 113-148 chr4 30901122 30901372 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 180878 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 116-6 chr1 55015905 55016180 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_057176, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_057176, exon 4 of 4) 17109 NM_057176 7809 Hs.151291 NM_057176 ENSG00000162399 BSND BART|DFNB73 barttin CLCNK type accessory beta subunit protein-coding 113.667-65 chr14 69228393 69228622 + 0.666667 NA intron (NR_034165, intron 4 of 10) intron (NR_034165, intron 4 of 10) -31651 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 150-52 chr15 96414830 96415166 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81233 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 290.333-16 chr17 39290236 39290957 + 0.666667 NA intron (NM_001370208, intron 6 of 14) AluJo|SINE|Alu -6804 NR_162098 113839521 NR_162098 MIR548BC - microRNA 548BC ncRNA 114.667-81 chr14 60081907 60082119 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -9898 NM_022495 64430 Hs.509499 NM_022495 ENSG00000126773 PCNX4 C14orf135|FBP2|PCNXL4 pecanex 4 protein-coding 241.667-43 chr2 203133247 203133789 + 0.666667 NA intron (NM_001114132, intron 26 of 54) intron (NM_001114132, intron 26 of 54) -104923 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 120-132 chr8 41032835 41033036 + 0.666667 NA Intergenic U6|snRNA|snRNA -135109 NM_024645 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 203-89 chr5 151331508 151332032 + 0.666667 NA intron (NM_181776, intron 7 of 9) FLAM_C|SINE|Alu 15789 NM_181776 153201 Hs.483877 NM_181776 ENSG00000186335 SLC36A2 PAT2|TRAMD1 solute carrier family 36 member 2 protein-coding 152.333-209 chr20 13271027 13271383 + 0.666667 NA intron (NM_080826, intron 2 of 5) intron (NM_080826, intron 2 of 5) -31518 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 179.333-134 chr4 42069992 42070391 + 0.666667 NA intron (NM_006345, intron 14 of 17) intron (NM_006345, intron 14 of 17) 79661 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 122.667-164 chr6 62275509 62275747 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 10597 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 245-63 chr6 138313535 138313999 + 0.666667 NA intron (NM_020340, intron 25 of 33) intron (NM_020340, intron 25 of 33) -63876 NM_001368163 110806279 NM_001368163 ENSG00000262543 SMIM28 - small integral membrane protein 28 protein-coding 144-63 chr18 12930937 12931211 + 0.666667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -16910 NM_031216 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 168-71 chr3 125061399 125061744 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5574 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 161.667-7 chr1 69375966 69376297 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -57124 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 141.333-146 chr3 7151637 7151993 + 0.666667 NA intron (NM_000844, intron 2 of 9) intron (NM_000844, intron 2 of 9) -257798 NR_131906 105376946 Hs.616038 NR_131906 ENSG00000237665 GRM7-AS2 - GRM7 antisense RNA 2 ncRNA 125-18 chr10 104695540 104695855 + 0.666667 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) L1ME3G|LINE|L1 -29481 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 180-39 chr15 45252697 45253169 + 0.666667 NA intron (NM_004212, intron 1 of 17) intron (NM_004212, intron 1 of 17) 699 NM_004212 9153 Hs.367833 NM_004212 ENSG00000137860 SLC28A2 CNT2|HCNT2|HsT17153|SPNT1 solute carrier family 28 member 2 protein-coding 132-37 chr14 21901327 21901699 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -230496 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 172-9 chr1 119029036 119029395 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18190 NR_126447 104472716 Hs.689536 NR_126447 WARS2-IT1 - WARS2 intronic transcript 1 ncRNA 224-45 chr2 74063106 74063544 + 0.666667 NA intron (NM_001287491, intron 4 of 11) L1MC4|LINE|L1 60633 NM_001366022 200424 Hs.208546 NM_001287491 ENSG00000187605 TET3 hCG_40738 tet methylcytosine dioxygenase 3 protein-coding 115 chr1 53781785 53781982 + 0.666667 NA intron (NR_033142, intron 15 of 16) intron (NR_033142, intron 15 of 16) -42719 NM_001367484 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 124.333-155 chr5 161601095 161601445 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -52866 NM_000813 2561 Hs.303527 NM_000813 ENSG00000145864 GABRB2 ICEE2 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit protein-coding 111.667-24 chr10 24777815 24778119 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -54080 NM_020824 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 122.667-48 chr14 64368685 64368899 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19561 NM_005956 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 127.667-109 chr22 25541217 25541542 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -23296 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 134-2 chr1 64092981 64093239 + 0.666667 NA intron (NM_005012, intron 4 of 8) intron (NM_005012, intron 4 of 8) 19095 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 199.333-145 chr2 171441933 171442379 + 0.666667 NA intron (NM_001164821, intron 2 of 11) intron (NM_001164821, intron 2 of 11) -7353 NM_024770 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 155-6 chr1 175087094 175087471 + 0.666667 NA intron (NM_022093, intron 6 of 18) MER4C|LTR|ERV1 19449 NM_022093 63923 Hs.156369 NM_022093 ENSG00000120332 TNN TN-W tenascin N protein-coding 120.333-147 chr5 11980085 11980333 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -75763 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 155.333-338 chr6 123495351 123495684 + 0.666667 NA intron (NM_001256020, intron 8 of 8) AluSq2|SINE|Alu 55913 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 132.667-135 chr5 10234601 10234842 + 0.666667 NA intron (NR_047668, intron 3 of 3) intron (NR_047668, intron 3 of 3) 15167 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 122-6 chr1 63135538 63135756 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -123176 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 129.667-42 chr12 114050107 114050390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -83923 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 137.667-135 chr4 17962507 17962776 + 0.666667 NA intron (NR_158567, intron 2 of 4) intron (NR_158567, intron 2 of 4) 59114 NR_136669 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 143.667-140 chr20 13767548 13767820 + 0.666667 NA intron (NM_001276380, intron 7 of 13) intron (NM_001276380, intron 7 of 13) 17202 NM_016649 51575 Hs.369284 NM_016649 ENSG00000089048 ESF1 ABTAP|C20orf6|HDCMC28P|bA526K24.1 ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog protein-coding 194.333-72 chr2 107482576 107483001 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -46631 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 128.333-75 chr16 82795176 82795494 + 0.666667 NA intron (NR_110938, intron 1 of 2) intron (NR_110938, intron 1 of 2) 22016 NR_110938 101928446 Hs.684007 NR_110938 ENSG00000260862 LOC101928446 - uncharacterized LOC101928446 ncRNA 155.333-4 chr1 45453887 45454233 + 0.666667 NA intron (NM_001320800, intron 1 of 9) L1MB2|LINE|L1 37103 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 161-27 chr15 63301374 63301679 + 0.666667 NA intron (NM_031301, intron 4 of 5) intron (NM_031301, intron 4 of 5) 23921 NM_031301 83464 Hs.511703 NM_031301 ENSG00000138613 APH1B APH-1B|PRO1328|PSFL|TAAV688 aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit protein-coding 147.667-150 chr18 3236014 3236307 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11322 NM_001303048 10627 Hs.190086 NM_006471 ENSG00000101608 MYL12A HEL-S-24|MLC-2B|MLCB|MRCL3|MRLC3|MYL2B myosin light chain 12A protein-coding 134.333-190 chr9 105144022 105144293 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -100448 NM_001330731 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 146.667-47 chr10 110402654 110402967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -95097 NM_004419 1847 Hs.2128 NM_004419 ENSG00000138166 DUSP5 DUSP|HVH3 dual specificity phosphatase 5 protein-coding 217.667-76 chr6 10283909 10284315 + 0.666667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -120390 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 145.333-11 chr1 110342569 110342856 + 0.666667 NA intron (NM_001201545, intron 1 of 1) intron (NM_001201545, intron 1 of 1) 3389 NM_022768 64783 Hs.435947 NM_022768 ENSG00000162775 RBM15 OTT|OTT1|SPEN RNA binding motif protein 15 protein-coding 118.333-15 chr1 115079612 115079848 + 0.666667 NA intron (NM_005725, intron 1 of 7) intron (NM_005725, intron 1 of 7) 9770 NM_001308316 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 113-134 chr3 26567478 26567727 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -55204 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 122.333-135 chr3 17759646 17759932 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16845 NR_135536 105376975 Hs.543238 NR_135536 LOC105376975 - uncharacterized LOC105376975 ncRNA 255-85 chr8 119490190 119490892 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 74095 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 123.667-90 chr2 67821223 67821438 + 0.666667 NA intron (NR_110271, intron 2 of 2) intron (NR_110271, intron 2 of 2) 4232 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 200.333-10 chr10 53299603 53300050 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -528126 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 161.667-15 chr1 164617525 164617953 + 0.666667 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 58017 NM_001353130 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 152.667-137 chr17 1792951 1793240 + 0.666667 NA intron (NM_052928, intron 5 of 10) AluJb|SINE|Alu 21424 NM_001329905 5176 Hs.532768 NM_002615 ENSG00000132386 SERPINF1 EPC-1|OI12|OI6|PEDF|PIG35 serpin family F member 1 protein-coding 160.667-302 chr8 79012452 79012803 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 175098 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 129.667-147 chr6 45191272 45191577 + 0.666667 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1MC2|LINE|L1 6346 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 139.333-49 chr12 12456979 12457361 + 0.666667 NA intron (NM_001300742, intron 3 of 3).2 MIRb|SINE|MIR 100092 NM_001330356 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 170-33 chr14 42509387 42509753 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 902714 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 122-71 chr3 24701534 24701881 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -127616 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 137-8 chr10 34659621 34659978 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 155497 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 206.333-108 chr3 25494553 25495019 + 0.666667 NA intron (NR_110892, intron 2 of 6) intron (NR_110892, intron 2 of 6) 36476 NM_001290217 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 164.333-123 chr2 139940599 139940967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 645902 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 118.333-56 chr13 50819192 50819403 + 0.666667 NA intron (NR_046551, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 11442 NR_046551 100874074 Hs.734030 NR_046551 ENSG00000176124 DLEU7-AS1 - DLEU7 antisense RNA 1 ncRNA 168-125 chrX 27387347 27387814 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 75761 NM_207319 139420 Hs.350673 NM_207319 ENSG00000224960 PPP4R3C FLFL3P|PPP4R3CP|SMEK3P|smk1 protein phosphatase 4 regulatory subunit 3C protein-coding 123.333-124 chr2 235435902 235436180 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -58002 NM_014914 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 165.667-180 chr6 153429263 153429627 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -298163 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 126.333-167 chr7 63985406 63985696 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -13255 NR_145488 100419780 Hs.742917 NR_145488 ZNF722P ZNF722 zinc finger protein 722, pseudogene pseudo 120.667-17 chr10 33278258 33278464 + 0.666667 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 56306 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 166.667-109 chr2 54193291 54193567 + 0.666667 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 62800 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 216.667-50 chr19 39610059 39610567 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7789 NM_013268 29124 Hs.23671 NM_013268 ENSG00000105198 LGALS13 GAL13|PLAC8|PP13 galectin 13 protein-coding 118-49 chr16 20775329 20775668 + 0.666667 NA intron (NM_005622, intron 2 of 13) L1MA4A|LINE|L1 11484 NM_005622 6296 Hs.706754 NM_005622 ENSG00000005187 ACSM3 SA|SAH acyl-CoA synthetase medium chain family member 3 protein-coding 232.667-5 chr10 51887189 51887655 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 4 of 17) L1MB1|LINE|L1 -187827 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 122.667-10 chr1 192760007 192760337 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 43844 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 127.667-77 chr2 34194540 34194771 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) L1MEb|LINE|L1 127429 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 215-82 chr8 135898642 135899151 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 441440 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 147.333-162 chr2 19297411 19297823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50812 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 154.667-202 chr2 202561720 202562036 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001204, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001204, exon 13 of 13) -73091 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 127.667-207 chrX 74193590 74193950 + 0.666667 NA intron (NR_028379, intron 5 of 6) L1MA8|LINE|L1 24691 NR_030398 693122 NR_030398 ENSG00000202566 MIR421 MIRN421|hsa-mir-421 microRNA 421 ncRNA 119.333-116 chr18 40775466 40775703 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 709298 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 164-81 chr4 15854859 15855181 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76692 NM_001775 952 Hs.479214 NM_001775 ENSG00000004468 CD38 ADPRC 1|ADPRC1 CD38 molecule protein-coding 162-82 chr3 41317669 41318006 + 0.666667 NA intron (NR_136342, intron 33 of 34) intron (NR_136342, intron 33 of 34) 118332 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 143-19 chr10 80553371 80553638 + 0.666667 NA intron (NM_001145719, intron 1 of 6) intron (NM_001145719, intron 1 of 6) 12685 NM_001145719 387694 Hs.147643 NM_207372 ENSG00000178217 SH2D4B - SH2 domain containing 4B protein-coding 172-48 chr16 87094838 87095203 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 37236 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 161-84 chr5 139644078 139644408 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3056 NM_001317201 51523 Hs.189119 NM_016463 ENSG00000171604 CXXC5 CF5|HSPC195|RINF|WID CXXC finger protein 5 protein-coding 202-35 chr12 67033587 67034053 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 62464 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 200-127 chr5 44566506 44567039 + 0.666667 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac -56490 NR_131946 102723839 Hs.561412 NR_131946 LINC02224 BRCAT107 long intergenic non-protein coding RNA 2224 ncRNA 123.333-152 chr3 181456440 181456747 + 0.666667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) -14107 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 179-18 chr12 1980193 1980707 + 0.666667 NA intron (NM_152640, intron 3 of 8) L1M4|LINE|L1 24007 NM_001319292 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 153.667-230 chr21 17003736 17004162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 413712 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 188-94 chr6 13353118 13353578 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24765 NM_001318805 51256 Hs.484678 NM_016495 ENSG00000145979 TBC1D7 MGCPH|PIG51|TBC7 TBC1 domain family member 7 protein-coding 113-115 chr2 198663143 198663457 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -288203 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 199.667-151 chr9 78817780 78818213 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 327670 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 143.333-118 chr17 74632367 74632729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8810 NM_181449 342510 Hs.158954 NM_181449 ENSG00000186407 CD300E CD300LE|CLM-2|CLM2|CMRF35-A5|IREM-2|IREM2|PIgR-2|PIgR2 CD300e molecule protein-coding 127-89 chr7 40413698 40414007 + 0.666667 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) L1M5|LINE|L1 278876 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 150.333-369 chr6 125264315 125264607 + 0.666667 NA TTS (NM_001300994) TTS (NM_001300994) 37506 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 113-202 chr8 79262061 79262371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69972 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 179.333-21 chr10 41908186 41908495 + 0.666667 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 459705 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 293.667-46 chr3 169452551 169453149 + 0.666667 NA intron (NR_134932, intron 1 of 4) intron (NR_134932, intron 1 of 4) 4983 NR_134932 105374205 NR_134932 ENSG00000241479 LOC105374205 - uncharacterized LOC105374205 ncRNA 153.667-350 chr7 3802346 3802689 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) AluJb|SINE|Alu -327168 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 201.333-295 chr8 141498123 141498595 + 0.666667 NA intron (NR_160399, intron 1 of 29) L1MEc|LINE|L1 8870 NR_160399 389690 Hs.689547 NM_207414 ENSG00000226807 MROH5 - maestro heat like repeat family member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 198-150 chr5 25053190 25053505 + 0.666667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 137309 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 182.333-18 chr10 34910642 34911131 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 95118 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 179.333-197 chr9 78644648 78645044 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 347721 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 174-45 chr18 71640670 71641063 + 0.666667 NA Intergenic LTR28B|LTR|ERV1 -61910 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 118-32 chr14 32664054 32664356 + 0.666667 NA intron (NM_004274, intron 7 of 13) intron (NM_004274, intron 7 of 13) -274674 NM_001164749 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 232-78 chr6 137032892 137033348 + 0.666667 NA intron (NM_001278724, intron 1 of 5) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 11192 NM_001278722 53832 Hs.445868 NM_014432 ENSG00000016402 IL20RA CRF2-8|IL-20R-alpha|IL-20R1|IL-20RA interleukin 20 receptor subunit alpha protein-coding 168.333-43 chr12 9025503 9025870 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 36061 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 211-99 chr9 29807586 29808140 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -594262 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 128.333-186 chr7 110594907 110595222 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -495942 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 196.333-94 chr2 184938094 184938591 + 0.666667 NA exon (NM_194250, exon 4 of 4) exon (NM_194250, exon 4 of 4) 228730 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 116-166 chr9 98252445 98252711 + 0.666667 NA intron (NM_018421, intron 1 of 12) MIRc|SINE|MIR 3071 NM_018421 55357 Hs.371016 NM_018421 ENSG00000095383 TBC1D2 PARIS-1|PARIS1|TBC1D2A TBC1 domain family member 2 protein-coding 126-65 chr21 29830448 29830700 + 0.666667 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) L2b|LINE|L2 82399 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-356 chr6 93576299 93576587 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -127574 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 161.667-207 chr5 114634959 114635401 + 0.666667 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) intron (NR_130785, intron 3 of 12) 59139 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 147.667-338 chr7 78235424 78235805 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 10 of 20) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -111628 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 153.333-69 chr11 85944338 85944782 + 0.666667 NA Intergenic HERVL18-int|LTR|ERVL 89459 NM_173556 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 218.667-26 chr12 102258591 102259102 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -61013 NM_002674 5367 Hs.707990 NM_002674 ENSG00000183395 PMCH MCH|ppMCH pro-melanin concentrating hormone protein-coding 170-111 chr7 40327881 40328316 + 0.666667 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) intron (NM_024728, intron 9 of 14) 193122 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 189.333-155 chr5 50998674 50999220 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -28760 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 142.667-91 chr2 25140206 25140478 + 0.666667 NA intron (NM_014971, intron 16 of 22) intron (NM_014971, intron 16 of 22) 28238 NM_001319204 5443 Hs.1897 NM_000939 ENSG00000115138 POMC ACTH|CLIP|LPH|MSH|NPP|OBAIRH|POC proopiomelanocortin protein-coding 121.667 chr1 21513034 21513273 + 0.666667 NA intron (NM_001177520, intron 1 of 9) MIR3|SINE|MIR 3730 NM_000478 249 Hs.75431 NM_000478 ENSG00000162551 ALPL AP-TNAP|APTNAP|HOPS|TNALP|TNAP|TNSALP alkaline phosphatase, biomineralization associated protein-coding 155.667-151 chr2 22081439 22081762 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -370948 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 126-24 chr12 99472656 99472976 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 10 of 25) intron (NM_152788, intron 10 of 25) -174937 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 292-16 chr14 81408647 81409188 + 0.666667 NA intron (NM_001366850, intron 2 of 7) intron (NM_001366850, intron 2 of 7) 18858 NM_001256430 85439 Hs.14248 NM_033104 ENSG00000140022 STON2 STN2|STNB|STNB2 stonin 2 protein-coding 210.333-59 chr18 935391 935961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7683 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 149-135 chr7 77246678 77247063 + 0.666667 NA intron (NM_020879, intron 4 of 18) MIRb|SINE|MIR -47051 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 153-20 chr11 70788525 70788933 + 0.666667 NA intron (NM_012309, intron 13 of 24) intron (NM_012309, intron 13 of 24) -74061 NR_073536 220070 Hs.326766 NM_145308 ENSG00000171671 SHANK2-AS3 C11orf76 SHANK2 antisense RNA 3 ncRNA 145.333-179 chr3 24562306 24562601 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66745 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 160.333-148 chr2 112238624 112238899 + 0.666667 NA intron (NM_032494, intron 2 of 8) intron (NM_032494, intron 2 of 8) 16281 NM_032494 84524 Hs.418416 NM_032494 ENSG00000144161 ZC3H8 Fliz1|ZC3HDC8 zinc finger CCCH-type containing 8 protein-coding 183.333-149 chr7 29286628 29286973 + 0.666667 NA intron (NM_001293072, intron 1 of 12) intron (NM_001293072, intron 1 of 12) -77830 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 150-33 chr12 56428473 56428858 + 0.666667 NA intron (NR_138471, intron 11 of 28) intron (NR_138471, intron 11 of 28) 20761 NR_138471 8914 Hs.118631 NM_003920 ENSG00000111602 TIMELESS TIM|TIM1|hTIM timeless circadian regulator protein-coding 132-101 chr5 66270574 66270939 + 0.666667 NA Intergenic Tigger5|DNA|TcMar-Tigger -61310 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 125.333-70 chr16 50763281 50763613 + 0.666667 NA intron (NM_015247, intron 7 of 19) L1MB7|LINE|L1 21142 NR_130462 100422972 NR_130462 ENSG00000264947 MIR3181 - microRNA 3181 ncRNA 180.667-52 chr17 80456161 80456616 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20219 NM_002522 4884 Hs.514556 NM_002522 ENSG00000171246 NPTX1 NP1 neuronal pentraxin 1 protein-coding 127.333-95 chr21 17929117 17929460 + 0.666667 NA intron (NM_001204177, intron 1 of 4) intron (NM_001204177, intron 1 of 4) 11948 NM_001204175 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 114.333-169 chr5 19290325 19290628 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 595796 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 201.333-30 chr10 58476634 58476951 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36080 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 114.333-111 chr2 121653437 121653608 + 0.666667 NA intron (NR_037857, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 3533 NR_037856 254128 Hs.712685 NR_037856 ENSG00000236859 NIFK-AS1 - NIFK antisense RNA 1 ncRNA 153.667-340 chr6 93696253 93696565 + 0.666667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -7608 NR_152794 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 172.667-64 chr16 83362887 83363285 + 0.666667 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) intron (NM_001220489, intron 5 of 12) -145260 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 189.667-86 chr20 39155218 39155606 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69336 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 136.333-185 chr6 122192519 122192790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -206897 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 159-108 chr7 30269953 30270272 + 0.666667 NA intron (NR_136267, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 -14485 NM_147128 223082 Hs.263912 NM_147128 ENSG00000180233 ZNRF2 RNF202 zinc and ring finger 2 protein-coding 278.333-10 chr10 26860057 26860550 + 0.666667 NA intron (NM_001178116, intron 1 of 11) CpG 784 NM_001348031 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 149.667-301 chr5 14161906 14162192 + 0.666667 NA intron (NM_007118, intron 1 of 56) MER5B|DNA|hAT-Charlie 18707 NM_007118 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 147-107 chr5 23463689 23463980 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43775 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 125-91 chr5 114196926 114197158 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -165028 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 124.667-127 chr21 23502620 23502849 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -117899 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 179-10 chr1 240177838 240178171 + 0.666667 NA exon (NM_001348094, exon 3 of 15) exon (NM_001348094, exon 3 of 15) 86121 NM_001305424 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 112.667-113 chr2 19704538 19704722 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -164224 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 125-128 chr9 128198352 128198710 + 0.666667 NA intron (NM_012127, intron 1 of 16) intron (NM_012127, intron 1 of 16) -4848 NM_001005336 1759 Hs.522413 NM_004408 ENSG00000106976 DNM1 DNM|EIEE31 dynamin 1 protein-coding 117.667-192 chr8 88888901 88889106 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -561520 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 138.333-66 chr14 72454941 72455249 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 4 of 16) intron (NM_001370288, intron 4 of 16) -61725 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 133.333-40 chr12 41815252 41815602 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51238 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 195.333-211 chr8 30252286 30252782 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 96165 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 134.333-149 chr6 36276436 36276682 + 0.666667 NA intron (NM_001145717, intron 1 of 7) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 6099 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 149.333-335 chr6 67661751 67662152 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -393400 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 149.667-285 chr4 58756321 58756672 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -220168 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 237-27 chr14 46255857 46256328 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 191933 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 204-203 chr9 2741874 2742350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24602 NM_133497 169522 Hs.622675 NM_133497 ENSG00000168263 KCNV2 KV11.1|Kv8.2|RCD3B potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 2 protein-coding 121.667-168 chr5 111475609 111475828 + 0.666667 NA intron (NM_001744, intron 8 of 10) intron (NM_001744, intron 8 of 10) -36508 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 152.333-12 chr1 72954983 72955254 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -351052 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 115.333-32 chr11 10349308 10349583 + 0.666667 NA intron (NR_103765, intron 2 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 41132 NR_103765 100130460 Hs.501890 NR_103765 CAND1.11 - uncharacterized LOC100130460 ncRNA 112.333-211 chr5 100502242 100502428 + 0.666667 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -33039 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 158.333-340 chr9 36961605 36961931 + 0.666667 NA intron (NR_104000, intron 6 of 9) intron (NR_104000, intron 6 of 9) -68237 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 202.667-36 chr12 7903478 7903941 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -12513 NM_001286237 144195 Hs.655169 NM_153449 ENSG00000173262 SLC2A14 GLUT14|SLC2A3P3 solute carrier family 2 member 14 protein-coding 193-12 chr10 94477746 94478037 + 0.666667 NA intron (NM_015188, intron 3 of 12) Tigger11a|DNA|TcMar-Tigger -67876 NM_001289067 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 228-27 chr14 34870758 34871382 + 0.666667 NA intron (NM_013448, intron 2 of 26) intron (NM_013448, intron 2 of 26) -3121 NR_160776 112268124 Hs.509140 NR_160776 LOC112268124 - uncharacterized LOC112268124 ncRNA 244-66 chr22 26999844 27000469 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 60362 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 163.667-6 chr1 116138278 116138622 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 26695 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 206.667-107 chr5 11440397 11440845 + 0.666667 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) intron (NM_001288715, intron 2 of 20) 148296 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 128-66 chr22 40131412 40131645 + 0.666667 NA intron (NM_001024843, intron 3 of 23) intron (NM_001024843, intron 3 of 23) -46397 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 135.333-130 chr4 113969760 113970048 + 0.666667 NA intron (NM_001354211, intron 4 of 6) L2b|LINE|L2 9743 NM_001354211 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 195.667-77 chr21 16684173 16684636 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 94167 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 170-40 chr14 98510905 98511388 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -200467 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 185.333-31 chr11 86950568 86951108 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_012193, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_012193, exon 2 of 2) 4557 NM_012193 8322 Hs.591968 NM_012193 ENSG00000174804 FZD4 CD344|EVR1|FEVR|FZD4S|Fz-4|Fz4|FzE4|GPCR|hFz4 frizzled class receptor 4 protein-coding 194-128 chr7 17191998 17192459 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -106424 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 115.333-129 chr22 19412218 19412436 + 0.666667 NA intron (NM_003325, intron 1 of 24) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 19406 NM_003325 7290 Hs.474206 NM_003325 ENSG00000100084 HIRA DGCR1|TUP1|TUPLE1 histone cell cycle regulator protein-coding 206.333-12 chr10 43563920 43564401 + 0.666667 NA intron (NM_001099283, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 4299 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 142.333-138 chr20 6764785 6765072 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2758 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 166-83 chr3 197122637 197123129 + 0.666667 NA intron (NM_001366216, intron 10 of 23) L1M5|LINE|L1 60989 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 129.333-57 chr13 56734925 56735185 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -405863 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 159.667-176 chr2 120798015 120798333 + 0.666667 NA intron (NM_005270, intron 2 of 13) intron (NM_005270, intron 2 of 13) 5893 NM_005270 2736 Hs.111867 NM_005270 ENSG00000074047 GLI2 CJS|HPE9|PHS2|THP1|THP2 GLI family zinc finger 2 protein-coding 111.667-141 chr2 177456007 177456196 + 0.666667 NA intron (NM_003659, intron 8 of 19) AluJo|SINE|Alu 63328 NM_003659 8540 Hs.516543 NM_003659 ENSG00000018510 AGPS ADAP-S|ADAS|ADHAPS|ADPS|ALDHPSY|RCDP3 alkylglycerone phosphate synthase protein-coding 148.333-185 chr2 59206220 59206514 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -11341 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 151.667-209 chr3 29716248 29716556 + 0.666667 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 217754 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-288 chr4 6675332 6675622 + 0.666667 NA non-coding (NR_158178, exon 2 of 2) non-coding (NR_158178, exon 2 of 2) 1402 NR_158178 93622 Hs.6815 NM_138699 ENSG00000170846 LOC93622 - Morf4 family associated protein 1 like 1 pseudogene pseudo 159.333-20 chr1 178022253 178022661 + 0.666667 NA non-coding (NR_037167, exon 9 of 10) non-coding (NR_037167, exon 9 of 10) 15519 NR_151492 111240474 NM_001356505 CRYZL2P-SEC16B - CRYZL2P-SEC16B readthrough protein-coding 165.667-71 chr17 60968583 60969021 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 14 of 25) L1MA4|LINE|L1 290951 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 152-72 chr17 59306163 59306593 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25277 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 114.667-9 chr1 147580046 147580312 + 0.666667 NA intron (NM_004326, intron 1 of 9) intron (NM_004326, intron 1 of 9) 38678 NM_004326 607 Hs.415209 NM_004326 ENSG00000116128 BCL9 LGS BCL9 transcription coactivator protein-coding 142.333-216 chr6 51971164 51971575 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 35 of 66) intron (NM_138694, intron 35 of 66) 116244 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 230.667-7 chr10 13244160 13244534 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9973 NM_145314 221044 Hs.112998 NM_145314 ENSG00000165623 UCMA C10orf49|GRP|GRP/UCMA upper zone of growth plate and cartilage matrix associated protein-coding 115-119 chr4 68586958 68587222 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -18563 NM_001077 7367 Hs.575083 NM_001077 ENSG00000197888 UGT2B17 BMND12|UDPGT2B17 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B17 protein-coding 112.667-211 chr5 45337316 45337594 + 0.666667 NA intron (NM_021072, intron 5 of 7) intron (NM_021072, intron 5 of 7) 358925 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 153.667-107 chr13 59861835 59862141 + 0.666667 NA intron (NM_001258369, intron 21 of 26) intron (NM_001258369, intron 21 of 26) -150730 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 146.333-333 chr8 118817149 118817470 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 134576 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 117-36 chr12 30405953 30406146 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 271195 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 158.667-13 chr1 86822388 86822746 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91559 NM_004261 9403 Hs.362728 NM_004261 ENSG00000183291 SELENOF SEP15 selenoprotein F protein-coding 116.667-146 chr4 66083751 66084018 + 0.666667 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 -192940 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 112-38 chr12 1931505 1931675 + 0.666667 NA intron (NR_036546, intron 1 of 1) AluJo|SINE|Alu 4986 NR_036546 100271702 Hs.737031 NR_036546 ENSG00000235049 LINC00940 - long intergenic non-protein coding RNA 940 ncRNA 142-152 chr8 74819360 74819633 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -5038 NM_015886 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 218.333-41 chr14 82969209 82969720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 326832 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 163.333-197 chr4 54629381 54629707 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22413 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 131.333-141 chr5 45900947 45901212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -204699 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 117.667-137 chr4 86892422 86892611 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_144645) promoter-TSS (NM_144645) -94 NM_001369889 132989 Hs.339646 NM_144645 ENSG00000163633 C4orf36 - chromosome 4 open reading frame 36 protein-coding 138-125 chr8 132844386 132844730 + 0.666667 NA intron (NM_001277196, intron 19 of 19) intron (NM_001277196, intron 19 of 19) -22400 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 198.333-36 chr11 101575703 101576207 + 0.666667 NA intron (NM_004621, intron 1 of 12) intron (NM_004621, intron 1 of 12) 8052 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 266.667-17 chr12 15817400 15818066 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -28345 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 150.667-278 chr4 128597612 128598011 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 169795 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 166.667-164 chr4 52924731 52925083 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 62590 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 121-140 chr8 140823296 140823505 + 0.666667 NA intron (NR_148037, intron 9 of 34) intron (NR_148037, intron 9 of 34) -90747 NR_029892 442893 NR_029892 ENSG00000254324 MIR151A MIR151|MIRN151|hsa-mir-151|hsa-mir-151a microRNA 151a ncRNA 116.333-137 chr22 44824237 44824433 + 0.666667 NA intron (NM_181335, intron 6 of 11) intron (NM_181335, intron 6 of 11) 71777 NM_001198726 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 270.333-66 chr8 134545258 134545831 + 0.666667 NA intron (NM_020863, intron 11 of 15) L1ME3B|LINE|L1 -52527 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 123-102 chr5 133266941 133267159 + 0.666667 NA intron (NM_015082, intron 6 of 15) intron (NM_015082, intron 6 of 15) 160656 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 193.667-135 chr8 91944761 91945205 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72697 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 231.667-63 chr8 129145417 129145853 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 95605 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 143.333-172 chr22 49142433 49142706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 275799 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 148-170 chr9 99092586 99092853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12394 NM_004612 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 154-89 chr3 43423322 43423625 + 0.666667 NA intron (NM_001204831, intron 11 of 12) L2b|LINE|L2 -71511 NR_046757 100873954 Hs.600984 NR_046757 SNRK-AS1 - SNRK antisense RNA 1 ncRNA 134.333-81 chr2 14611043 14611383 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21504 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 114.333-223 chr8 94183439 94183703 + 0.666667 NA intron (NM_001144663, intron 3 of 17) L1MB7|LINE|L1 24984 NM_004063 1015 Hs.591853 NM_004063 ENSG00000079112 CDH17 CDH16|HPT-1|HPT1 cadherin 17 protein-coding 124-98 chr5 117503372 117503656 + 0.666667 NA intron (NR_046089, intron 3 of 5) intron (NR_046089, intron 3 of 5) 88002 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 160.667-333 chrX 95062238 95062570 + 0.666667 NA TTS (NR_031667) TTS (NR_031667) 822 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 178.333-170 chr8 99642060 99642433 + 0.666667 NA exon (NM_152564, exon 34 of 62) exon (NM_152564, exon 34 of 62) -105385 NR_030596 100126309 NR_030596 ENSG00000216069 MIR875 MIRN875|hsa-mir-875 microRNA 875 ncRNA 130-127 chr8 69296324 69296559 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 151803 NR_110433 100505739 Hs.127115 NR_110433 LINC01603 - long intergenic non-protein coding RNA 1603 ncRNA 190.667-145 chr8 62030834 62031209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141182 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 175.333-129 chr3 172522108 172522449 + 0.666667 NA intron (NM_001190943, intron 1 of 1) intron (NM_001190943, intron 1 of 1) 1152 NM_001190943 8743 Hs.478275 NM_003810 ENSG00000121858 TNFSF10 APO2L|Apo-2L|CD253|TL2|TNLG6A|TRAIL TNF superfamily member 10 protein-coding 168-66 chr3 87222192 87222542 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3910 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 161-4 chr10 41881886 41882199 + 0.666667 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 486003 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 155.667-232 chr3 142794458 142794806 + 0.666667 NA intron (NM_001251845, intron 9 of 12) L1MEc|LINE|L1 70208 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 136.667-114 chr3 15726481 15726776 + 0.666667 NA intron (NM_001349280, intron 5 of 26) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -29257 NR_036085 100422990 NR_036085 ENSG00000264354 MIR3134 - microRNA 3134 ncRNA 220-101 chr6 39108302 39108794 + 0.666667 NA intron (NM_018322, intron 1 of 1) intron (NM_018322, intron 1 of 1) 6638 NM_018322 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 136-16 chr12 14878788 14879183 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6869 NM_000900 4256 Hs.365706 NM_000900 ENSG00000111341 MGP GIG36|MGLAP|NTI matrix Gla protein protein-coding 127.667-67 chr18 14754884 14755211 + 0.666667 NA intron (NR_160272, intron 4 of 29) intron (NR_160272, intron 4 of 29) 6875 NR_160272 374860 Hs.567889 NM_001145029 ENSG00000180777 ANKRD30B NY-BR-1.1 ankyrin repeat domain 30B protein-coding 166-115 chr8 23803239 23803559 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 51407 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 127-38 chr17 65986923 65987154 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 17 of 26) L1M6|LINE|L1 -160495 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 139.667-60 chr15 62893671 62894009 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 69883 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 133-53 chr20 8451416 8451740 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) AluSz|SINE|Alu 202874 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 124.667-218 chr9 135967169 135967508 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5965 NM_016172 10422 Hs.9194 NM_016172 ENSG00000130560 UBAC1 GBDR1|KPC2|UBADC1 UBA domain containing 1 protein-coding 162.667-153 chr20 16128541 16128963 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -142870 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 183-59 chr2 88320510 88320901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 131988 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 122.333-65 chr15 73262254 73262602 + 0.666667 NA intron (NM_002499, intron 15 of 28) L1ME1|LINE|L1 -37482 NR_162148 113219462 NR_162148 MIR12135 - microRNA 12135 ncRNA 257.333-111 chr9 36927555 36928152 + 0.666667 NA intron (NM_001280548, intron 6 of 8) AluSz6|SINE|Alu -34322 NR_039687 100616456 NR_039687 ENSG00000265368 MIR4476 mir-4476 microRNA 4476 ncRNA 198.667-34 chr11 29393073 29393611 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -201071 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 130.667-59 chr13 30705845 30706091 + 0.666667 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -7510 NM_001204406 241 Hs.507658 NM_001629 ENSG00000132965 ALOX5AP FLAP arachidonate 5-lipoxygenase activating protein protein-coding 117.333-98 chr2 60857335 60857556 + 0.666667 NA intron (NR_033980, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 23869 NR_033980 400957 Hs.170358 NR_033980 ENSG00000228414 LINC01185 - long intergenic non-protein coding RNA 1185 ncRNA 112.667-137 chr2 189895855 189896024 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 111489 NM_001321048 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 133.333-11 chr1 167964780 167965028 + 0.666667 NA intron (NM_001198957, intron 2 of 20) L1MC1|LINE|L1 -27832 NM_001143674 25874 Hs.517768 NM_015415 ENSG00000143158 MPC2 BRP44|SLC54A2 mitochondrial pyruvate carrier 2 protein-coding 196-84 chr2 35991226 35991797 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 364059 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 223-32 chr2 37636556 37637067 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35388 NM_001270437 10602 Hs.369574 NM_006449 ENSG00000163171 CDC42EP3 BORG2|CEP3|UB1 CDC42 effector protein 3 protein-coding 177-81 chr9 29717160 29717603 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -503780 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 149.667-433 chrX 26440429 26440778 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117734 NR_001559 139538 Hs.447377 NR_001559 ENSG00000259849 VENTXP1 CT18|NA88A|VENTX2P1 VENT homeobox pseudogene 1 pseudo 119-97 chr3 31379442 31379654 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -153377 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 128.667-66 chr15 72121746 72122052 + 0.666667 NA intron (NM_145204, intron 1 of 1) intron (NM_145204, intron 1 of 1) 3496 NM_145204 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 112.333-181 chr4 56580449 56580681 + 0.666667 NA intron (NM_001256475, intron 5 of 8) L1MB7|LINE|L1 49959 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 179.667-45 chr14 45853958 45854323 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -138538 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 175-65 chr5 7771446 7771787 + 0.666667 NA intron (NM_020546, intron 17 of 24) intron (NM_020546, intron 17 of 24) 79517 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 141-91 chr8 87641729 87642016 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 232143 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 187.333-39 chr12 5696672 5697157 + 0.666667 NA intron (NM_001278596, intron 15 of 25) L1M5|LINE|L1 202782 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 219.667-73 chr5 74738657 74739160 + 0.666667 NA intron (NR_104006, intron 12 of 19) intron (NR_104006, intron 12 of 19) 28209 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 114-82 chr21 44673526 44673713 + 0.666667 NA intron (NM_144991, intron 1 of 11) L1MA4A|LINE|L1 -6692 NM_181684 353323 Hs.567902 NM_181684 ENSG00000221864 KRTAP12-2 KAP12.2|KRTAP12.2 keratin associated protein 12-2 protein-coding 114.667-238 chr7 32110209 32110459 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -38898 NM_001322057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 121.667-115 chr21 15976317 15976621 + 0.666667 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -94019 NR_136541 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 163.333-109 chr16 26739555 26739946 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -327177 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 179.333-46 chr12 1432847 1433312 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 18 of 19) intron (NR_027948, intron 18 of 19) -67412 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 121.333-94 chr2 171231149 171231476 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001136554) promoter-TSS (NM_001136554) -19 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 204-15 chr1 160017168 160017692 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 14560 NM_145167 93183 Hs.552810 NM_145167 ENSG00000143315 PIGM GPI-MT-I phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class M protein-coding 159.333-42 chr10 50839883 50840192 + 0.666667 NA intron (NM_001370131, intron 4 of 11) AluSp|SINE|Alu 45590 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 157.333-39 chr1 247017528 247017907 + 0.666667 NA intron (NR_037894, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu -9660 NM_020394 57116 Hs.669893 NM_020394 ENSG00000197472 ZNF695 SBZF3 zinc finger protein 695 protein-coding 159.333-12 chr1 90096046 90096416 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 101121 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 126.333-162 chr7 1517652 1517894 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -12929 NM_002360 7975 Hs.520612 NM_002360 ENSG00000198517 MAFK NFE2U|P18 MAF bZIP transcription factor K protein-coding 115.667-196 chr7 3896383 3896615 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) L1MEc|LINE|L1 -233186 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 144.333-151 chr21 14550738 14551081 + 0.666667 NA intron (NM_001256370, intron 2 of 8) MamRep605|LTR?|LTR? -4549 NM_001286523 64092 Hs.473341 NM_022136 ENSG00000155307 SAMSN1 HACS1|NASH1|SASH2|SH3D6B|SLy2 SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 protein-coding 155.333-252 chr4 18762178 18762582 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -740505 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 145.667-202 chr5 5688309 5688687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 265821 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 148.667-342 chr7 6511607 6512003 + 0.666667 NA intron (NM_001145118, intron 8 of 21) intron (NM_001145118, intron 8 of 21) -27653 NM_006854 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 154.333-315 chr7 14353414 14353800 + 0.666667 NA intron (NM_001350717, intron 20 of 24) intron (NM_001350717, intron 20 of 24) -362182 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 117-74 chr2 9015835 9016172 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12319 NM_001321267 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 139.333-73 chr14 56588435 56588834 + 0.666667 NA intron (NM_017799, intron 3 of 15) intron (NM_017799, intron 3 of 15) 8836 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 114-142 chr6 159941160 159941483 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27778 NM_000876 3482 Hs.487062 NM_000876 ENSG00000197081 IGF2R CD222|CI-M6PR|CIMPR|M6P-R|M6P/IGF2R|MPR 300|MPR1|MPR300|MPRI insulin like growth factor 2 receptor protein-coding 226.667-22 chr10 121726703 121727201 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -128494 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 133.333-197 chr9 79206248 79206556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60736 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 194.333-58 chr19 9231193 9231733 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -16592 NM_001005191 125958 Hs.446910 NM_001005191 ENSG00000174667 OR7D4 OR19-7|OR19-B|OR19B|OR7D4P|hg105 olfactory receptor family 7 subfamily D member 4 protein-coding 193.667-48 chr16 29733440 29733933 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 12304 NM_175900 283897 Hs.331095 NM_175900 ENSG00000185905 C16orf54 - chromosome 16 open reading frame 54 protein-coding 162.333-39 chr11 33659202 33659661 + 0.666667 NA intron (NM_012194, intron 19 of 20) L1ME3Cz|LINE|L1 41309 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 126.667-112 chr3 141294043 141294274 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_152282, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_152282, exon 8 of 8) -30028 NM_001080412 253461 Hs.518301 NM_152535 ENSG00000177311 ZBTB38 CIBZ|PPP1R171|ZNF921 zinc finger and BTB domain containing 38 protein-coding 127.667-65 chr17 69165122 69165350 + 0.666667 NA intron (NM_080282, intron 26 of 39) intron (NM_080282, intron 26 of 39) -23341 NM_080284 23460 Hs.709514 NM_080284 ENSG00000154262 ABCA6 EST155051 ATP binding cassette subfamily A member 6 protein-coding 141-2 chr1 61774759 61775096 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 6 of 43) L2b|LINE|L2 32447 NM_176877 10207 Hs.478125 NM_005799 ENSG00000132849 PATJ Cipp|INADL|InaD-like|hINADL PATJ crumbs cell polarity complex component protein-coding 150-99 chr3 106428656 106429029 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -559441 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 162.667-176 chr3 74009134 74009562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 200104 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 203.666-51 chr7 30550566 30551146 + 0.666667 NA intron (NR_038889, intron 6 of 6) intron (NR_038889, intron 6 of 6) 26923 NR_038889 401320 Hs.561708 NR_038889 GARS-DT - GARS divergent transcript ncRNA 158.333-148 chr2 72009843 72010163 + 0.666667 NA Intergenic LFSINE_Vert|SINE|tRNA 137859 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 125.667-103 chr2 126924643 126924905 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 25884 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 142.333-187 chr4 119655210 119655527 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26564 NM_001083 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 174-110 chr9 103998265 103998758 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1198 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 149.667-337 chr5 171571577 171571978 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 152130 NM_003862 8817 Hs.87191 NM_003862 ENSG00000156427 FGF18 FGF-18|ZFGF5 fibroblast growth factor 18 protein-coding 142.333-37 chr11 18365240 18365606 + 0.666667 NA intron (NM_001142307, intron 15 of 15) intron (NM_001142307, intron 15 of 15) -22364 NR_036116 100423016 NR_036116 ENSG00000264603 MIR3159 - microRNA 3159 ncRNA 147-66 chr2 69507450 69507742 + 0.666667 NA intron (NM_014911, intron 14 of 21) intron (NM_014911, intron 14 of 21) 12575 NR_003705 100124535 Hs.693447 NR_003705 ENSG00000207016 SNORA36C - small nucleolar RNA, H/ACA box 36C snoRNA 323.667-6 chr11 21798158 21798721 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -394646 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 116.667-197 chr8 80757970 80758202 + 0.666667 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) intron (NM_001033723, intron 2 of 8) 116382 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 170-110 chr7 21252990 21253405 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -174886 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 143.667-174 chr3 185138343 185138721 + 0.666667 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) L1MD1|LINE|L1 14528 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 191-28 chr2 39725867 39726216 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 53217 NM_025264 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 176.666-16 chr20 35728844 35729364 + 0.666667 NA intron (NR_040722, intron 7 of 17) (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 13156 NR_040722 9584 Hs.282901 NM_004902 ENSG00000131051 RBM39 CAPER|CAPERalpha|FSAP59|HCC1|RNPC2 RNA binding motif protein 39 protein-coding 121-77 chr2 198110242 198110588 + 0.666667 NA intron (NM_006226, intron 5 of 5) intron (NM_006226, intron 5 of 5) 264682 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 158.667-303 chr7 51503790 51504116 + 0.666667 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -110697 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 171.333-40 chr13 87063042 87063360 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 151281 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 148.333-299 chr4 184368352 184368681 + 0.666667 NA intron (NR_125933, intron 4 of 6) MER34C_|LTR|ERV1 13790 NR_125934 102723766 Hs.432281 NR_125933 ENSG00000249096 LINC02362 - long intergenic non-protein coding RNA 2362 ncRNA 127.667-69 chr18 55878268 55878548 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 41791 NR_110755 101927273 Hs.434335 NR_110755 ENSG00000260930 LINC01416 - long intergenic non-protein coding RNA 1416 ncRNA 185.333-154 chr5 46234291 46234839 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -538185 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 201.333-44 chr11 2148465 2148896 + 0.666667 NA TTS (NR_028043) TTS (NR_028043) 923 NM_001007139 3481 Hs.272259 NM_000612 ENSG00000167244 IGF2 C11orf43|GRDF|IGF-II|PP9974 insulin like growth factor 2 protein-coding 148.333-282 chr4 53682444 53682740 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -13309 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 171.667-169 chr8 123104220 123104585 + 0.666667 NA intron (NM_001363149, intron 7 of 21) intron (NM_001363149, intron 7 of 21) 31153 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 132-113 chr8 60528130 60528491 + 0.666667 NA intron (NM_001242644, intron 1 of 6) intron (NM_001242644, intron 1 of 6) 11323 NM_002865 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 155.333-239 chr3 139832104 139832410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102928 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 144-38 chr12 26476196 26476507 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 44 of 56) intron (NM_002223, intron 44 of 56) 280778 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 119.667-182 chr8 79936343 79936562 + 0.666667 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) L1ME4a|LINE|L1 -64715 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 178-113 chr8 125064744 125065132 + 0.666667 NA intron (NM_014846, intron 10 of 28) intron (NM_014846, intron 10 of 28) 26854 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 120.333-54 chr14 31969404 31969709 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24703 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 126.333-16 chr10 5917061 5917328 + 0.666667 NA intron (NM_178150, intron 10 of 20) intron (NM_178150, intron 10 of 20) 22808 NM_032807 84893 Hs.498543 NM_032807 ENSG00000134452 FBH1 FBXO18|Fbx18|hFBH1 F-box DNA helicase 1 protein-coding 145.667-132 chr2 61464749 61465141 + 0.666667 NA intron (NM_014709, intron 1 of 79) intron (NM_014709, intron 1 of 79) 6142 NM_014709 9736 Hs.644708 NM_014709 ENSG00000115464 USP34 - ubiquitin specific peptidase 34 protein-coding 133.667-159 chr8 138457470 138457670 + 0.666667 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) intron (NM_001362965, intron 1 of 19) 39691 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 269.333-40 chr2 45991543 45992113 + 0.666667 NA intron (NM_005400, intron 6 of 14) intron (NM_005400, intron 6 of 14) -305579 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 122.333-81 chr18 46960236 46960458 + 0.666667 NA intron (NM_001353904, intron 3 of 13) AluSq2|SINE|Alu 4061 NM_001354366 107983955 Hs.745535 NM_001354366 ENSG00000275553 ELOA3C ELOA3B|TCEB3CL elongin A3 family member C protein-coding 116-148 chr7 92400572 92400788 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_019004, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_019004, exon 20 of 20) 36634 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 163-28 chr15 98668087 98668421 + 0.666667 NA intron (NM_000875, intron 1 of 20) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -17033 NR_126453 104472848 Hs.349049 NR_126453 IRAIN IGF1R-AS IGF1R antisense imprinted non-protein coding RNA ncRNA 115-16 chr1 175491834 175492028 + 0.666667 NA intron (NM_003285, intron 2 of 22) AluY|SINE|Alu 251664 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 157.333-57 chr10 106032941 106033322 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -107034 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 160-25 chr11 3673852 3674176 + 0.666667 NA TTS (NM_001365126) TTS (NM_001365126) -2630 NM_001303034 57053 Hs.732806 NM_020402 ENSG00000129749 CHRNA10 - cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit protein-coding 117.333-194 chr7 75618923 75619181 + 0.666667 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) MER5A|DNA|hAT-Charlie -90929 NR_028059 5387 Hs.659871 NM_005395 ENSG00000127957 PMS2P3 PMS2L3|PMS2L9|PMS5|PMSR3 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 3 pseudo 185.667-22 chr12 64966912 64967418 + 0.666667 NA intron (NR_146276, intron 2 of 3) L1PB|LINE|L1 25126 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 142.667-122 chr20 37329981 37330365 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -14512 NM_005417 6714 Hs.195659 NM_005417 ENSG00000197122 SRC ASV|SRC1|THC6|c-SRC|p60-Src SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 178-119 chr9 28546326 28546709 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) MER39|LTR|ERV1 172788 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 192.667-171 chr8 74922191 74922589 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62115 NM_031461 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 236-76 chr6 38921129 38921827 + 0.666667 NA exon (NM_001206927, exon 71 of 93) exon (NM_001206927, exon 71 of 93) 31629 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 180.333-111 chr6 140444854 140445329 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -238723 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 176.333-186 chrX 17615236 17615658 + 0.666667 NA intron (NM_198270, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -20053 NM_001291868 4810 Hs.201623 NM_198270 ENSG00000188158 NHS CTRCT40|CXN|SCML1 NHS actin remodeling regulator protein-coding 145.333-250 chr6 13029250 13029618 + 0.666667 NA intron (NM_001322314, intron 1 of 12) intron (NM_001322314, intron 1 of 12) 15880 NM_001322314 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 136.667-64 chr14 90781448 90781735 + 0.666667 NA intron (NM_001010854, intron 2 of 19) intron (NM_001010854, intron 2 of 19) 34826 NM_001320421 145567 Hs.655697 NM_001010854 ENSG00000165914 TTC7B TTC7L1|c14_5685 tetratricopeptide repeat domain 7B protein-coding 137-4 chr1 35217697 35217981 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -24694 NR_136702 6421 Hs.355934 NM_005066 ENSG00000116560 SFPQ POMP100|PPP1R140|PSF splicing factor proline and glutamine rich protein-coding 153-34 chr12 98657264 98657688 + 0.666667 NA intron (NM_001160, intron 4 of 25) L2|LINE|L2 12176 NM_181869 317 Hs.552567 NM_001160 ENSG00000120868 APAF1 APAF-1|CED4 apoptotic peptidase activating factor 1 protein-coding 249-32 chr16 69002432 69003084 + 0.666667 NA intron (NM_024562, intron 15 of 17) HERV35I-int|LTR|ERV1 -102895 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 118.333-70 chr14 83429927 83430184 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 787423 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 181.667-23 chr11 94243404 94243706 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -62082 NM_001199206 390243 Hs.553758 NM_001080486 ENSG00000183560 IZUMO1R FOLR4|Folbp3|JUNO IZUMO1 receptor, JUNO protein-coding 130-138 chrX 70036078 70036311 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001399, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001399, exon 8 of 8) 13337 NR_037494 100500887 NR_037494 ENSG00000211991 MIR676 hsa-mir-676|mir-676 microRNA 676 ncRNA 115.667-83 chr15 67137235 67137548 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001145103) promoter-TSS (NM_001145103) -630 NM_001145103 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 132.667-148 chr5 153458238 153458600 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -32105 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 113.333-196 chr4 103679953 103680167 + 0.666667 NA intron (NM_001059, intron 1 of 4) intron (NM_001059, intron 1 of 4) 39925 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 218.333-90 chr3 181682669 181683236 + 0.666667 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) L1MA4|LINE|L1 -28973 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 149.333-406 chr8 117466659 117466960 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53904 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 214.333-23 chr10 100389206 100389714 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 15884 NR_026762 90271 Hs.628088 NR_026762 ENSG00000235823 OLMALINC C10orf75|HI-LNC80|LINC00263|NCRNA00263|OLMALINCAS oligodendrocyte maturation-associated long intergenic non-coding RNA ncRNA 150.667-138 chr16 11412562 11413001 + 0.666667 NA intron (NM_001370704, intron 45 of 66) intron (NM_001370704, intron 45 of 66) -52479 NR_110907 101927131 Hs.569654 NR_110907 ENSG00000262999 LOC101927131 - uncharacterized LOC101927131 ncRNA 121-95 chr3 89798847 89799128 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 691366 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 186.667-152 chr9 33276446 33276886 + 0.666667 NA intron (NM_001195536, intron 6 of 6) intron (NM_001195536, intron 6 of 6) 11617 NM_016410 51510 Hs.635313 NM_016410 ENSG00000086065 CHMP5 C9orf83|CGI-34|HSPC177|PNAS-2|SNF7DC2|Vps60 charged multivesicular body protein 5 protein-coding 151.333-252 chr20 53344467 53344732 + 0.666667 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) intron (NM_173485, intron 2 of 2) 159316 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 117-59 chr17 47243512 47243768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10202 NM_000212 3690 Hs.218040 NM_000212 ENSG00000259207 ITGB3 BDPLT16|BDPLT2|CD61|GP3A|GPIIIa|GT integrin subunit beta 3 protein-coding 152-100 chr22 25640005 25640341 + 0.666667 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) L1ME2|LINE|L1 75498 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 117.667-118 chr3 80644096 80644428 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -120635 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 112.667-210 chr5 41984715 41984891 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 59522 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 148.667-249 chr3 45806055 45806386 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -9684 NM_022405 54716 Hs.413095 NM_020208 ENSG00000163817 SLC6A20 SIT1|XT3|Xtrp3 solute carrier family 6 member 20 protein-coding 118.667-169 chr6 104499332 104499644 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 360058 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 170.667-166 chr8 108477198 108477514 + 0.666667 NA intron (NR_138033, intron 8 of 9) intron (NR_138033, intron 8 of 9) 33732 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 165.333-245 chr8 54131880 54132267 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -3168 NM_014175 29088 Hs.18349 NM_014175 ENSG00000137547 MRPL15 HSPC145|L15mt|MRP-L15|MRP-L7|RPML7 mitochondrial ribosomal protein L15 protein-coding 125.667-179 chr7 101089753 101089966 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_030961, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_030961, exon 3 of 3) 4378 NM_030961 81844 Hs.521092 NM_030961 ENSG00000169871 TRIM56 RNF109 tripartite motif containing 56 protein-coding 112-133 chr3 22961011 22961323 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 241411 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 140-129 chr9 95124725 95125069 + 0.666667 NA intron (NM_001243744, intron 10 of 13) intron (NM_001243744, intron 10 of 13) -38803 NR_036109 100422842 NR_036109 ENSG00000207617 MIR3074 mir-3074 microRNA 3074 ncRNA 146.333-310 chr7 83075279 83075617 + 0.666667 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 87436 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 144-23 chr10 130187008 130187292 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 50741 NM_001321980 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 130.333-114 chr20 14012457 14012765 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 2 of 17) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 17095 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 193.333-120 chr3 58149433 58149914 + 0.666667 NA intron (NM_001164318, intron 36 of 45) intron (NM_001164318, intron 36 of 45) 20962 NR_135534 105377105 Hs.613914 NR_135534 ENSG00000244161 FLNB-AS1 - FLNB antisense RNA 1 ncRNA 117.667-15 chr1 223090759 223091049 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 52344 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 117-79 chr2 106787165 106787366 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 98763 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 136-80 chr4 187329174 187329573 + 0.666667 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) intron (NR_038931, intron 1 of 4) -41275 NR_149103 105377602 Hs.582096 NR_149103 ENSG00000250042 LINC02514 - long intergenic non-protein coding RNA 2514 ncRNA 178.667-84 chr2 159100919 159101206 + 0.666667 NA intron (NM_001350063, intron 4 of 24) intron (NM_001350063, intron 4 of 24) -85773 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 159.333-124 chr17 60997028 60997338 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 15 of 25) MER1B|DNA|hAT-Charlie 319332 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 194.333-100 chr4 87835653 87836059 + 0.666667 NA intron (NM_020203, intron 2 of 3) intron (NM_020203, intron 2 of 3) 1153 NM_001291183 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 146.333-225 chr4 10659508 10659810 + 0.666667 NA intron (NM_052964, intron 2 of 18) intron (NM_052964, intron 2 of 18) 25109 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 112.667-153 chr20 52730305 52730589 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109609 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 182.667-161 chr8 81724725 81725120 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -3618 NR_033193 79752 Hs.655453 NM_024699 ENSG00000104231 ZFAND1 - zinc finger AN1-type containing 1 protein-coding 203-113 chr9 32532117 32532586 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -6155 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 148.667-100 chr13 34491576 34491983 + 0.666667 NA intron (NR_047036, intron 2 of 2) intron (NR_047036, intron 2 of 2) 143736 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 176-40 chr16 83173956 83174419 + 0.666667 NA intron (NM_001220492, intron 5 of 5) intron (NM_001220492, intron 5 of 5) -183889 NR_110937 101928417 Hs.569538 NR_110937 ENSG00000260832 LOC101928417 - uncharacterized LOC101928417 ncRNA 171.667-51 chr14 67128521 67129009 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 16 of 21) AluSg7|SINE|Alu -60675 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 164.667-179 chr5 11057626 11057961 + 0.666667 NA intron (NM_001288715, intron 15 of 20) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -296559 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 123.333-166 chr4 156982964 156983213 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11289 NR_036641 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 191-47 chr5 13730660 13731073 + 0.666667 NA intron (NM_001369, intron 68 of 78) AluSp|SINE|Alu 213614 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 134.333-53 chr14 70989741 70990099 + 0.666667 NA intron (NM_014982, intron 7 of 35) intron (NM_014982, intron 7 of 35) 82461 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 138.667-107 chr2 75582854 75583166 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -13291 NM_032181 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 168.667-103 chr2 78238694 78239059 + 0.666667 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 51855 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 117.333-132 chr3 57680790 57681034 + 0.666667 NA intron (NM_152678, intron 1 of 19) L1MB7|LINE|L1 12165 NM_152678 201627 Hs.91085 NM_152678 ENSG00000174839 DENND6A AFI1A|FAM116A DENN domain containing 6A protein-coding 209.333-140 chr22 21966708 21967183 + 0.666667 NA intron (NR_146277, intron 9 of 17) intron (NR_146277, intron 9 of 17) -14097 NM_014634 9647 Hs.112728 NM_014634 ENSG00000100034 PPM1F CAMKP|CaMKPase|FEM-2|POPX2|hFEM-2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1F protein-coding 147.333-150 chr18 13186778 13187195 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31774 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 188-97 chr6 147762379 147762787 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 253893 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 146.667-359 chrX 24869594 24869904 + 0.666667 NA intron (NM_016937, intron 34 of 36) intron (NM_016937, intron 34 of 36) 125308 NR_003007 677773 Hs.689695 NR_003007 ENSG00000251869 SCARNA23 ACA12 small Cajal body-specific RNA 23 ncRNA 138.667-149 chr4 53159207 53159502 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR 206707 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 153.333-102 chr12 120226473 120226892 + 0.666667 NA intron (NM_002859, intron 1 of 10) intron (NM_002859, intron 1 of 10) 23481 NM_025157 5829 Hs.446336 NM_002859 ENSG00000089159 PXN - paxillin protein-coding 179-44 chr18 10116094 10116480 + 0.666667 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 202271 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 151-40 chr15 26459034 26459420 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 169863 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 185.667-72 chr2 124375901 124376312 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) L3|LINE|CR1 350819 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 209-86 chr4 186830845 186831232 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -107182 NM_005245 2195 Hs.481371 NM_005245 ENSG00000083857 FAT1 CDHF7|CDHR8|FAT|ME5|hFat1 FAT atypical cadherin 1 protein-coding 135.667-180 chr8 50127445 50127694 + 0.666667 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) -36562 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 181.667-30 chr12 118231148 118231553 + 0.666667 NA intron (NM_001346490, intron 10 of 21) intron (NM_001346490, intron 10 of 21) -40815 NM_001346497 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 138.667-4 chr1 86712619 86712970 + 0.666667 NA intron (NM_001206653, intron 1 of 7) intron (NM_001206653, intron 1 of 7) 8218 NM_001206652 51100 Hs.136309 NM_016009 ENSG00000097033 SH3GLB1 Bif-1|CGI-61|PPP1R70|dJ612B15.2 SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B1 protein-coding 153.333-258 chr3 8898685 8899010 + 0.666667 NA intron (NM_020165, intron 11 of 12) intron (NM_020165, intron 11 of 12) 64625 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 123.333-163 chr4 85211931 85212174 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 244568 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 111.667-53 chr11 113994153 113994462 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16807 NM_001161772 3359 Hs.413899 NM_000869 ENSG00000166736 HTR3A 5-HT-3|5-HT3A|5-HT3R|5HT3R|HTR3 5-hydroxytryptamine receptor 3A protein-coding 143-84 chr3 137091794 137092064 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 133946 NM_144717 53833 Hs.61232 NM_144717 ENSG00000174564 IL20RB DIRS1|FNDC6|IL-20R2 interleukin 20 receptor subunit beta protein-coding 165.333-223 chr6 56057071 56057500 + 0.666667 NA non-coding (NR_134850, exon 31 of 31) non-coding (NR_134850, exon 31 of 31) 34377 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 179.333-71 chr15 93532561 93533017 + 0.666667 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger -323771 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 125-90 chr5 105063104 105063468 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36188 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 130.333-224 chrX 51542275 51542599 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -34996 NR_110654 102723426 Hs.584513 NR_110654 LINC01496 - long intergenic non-protein coding RNA 1496 ncRNA 142.333-5 chr1 66192503 66192787 + 0.666667 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) intron (NM_001037340, intron 1 of 14) -139463 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 147-131 chr7 31827771 31828200 + 0.666667 NA intron (NM_001191059, intron 13 of 18) intron (NM_001191059, intron 13 of 18) 140770 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 126.333-190 chr9 88796816 88797085 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -51045 NR_036252 100423015 NR_036252 ENSG00000265873 MIR4289 - microRNA 4289 ncRNA 113.667-204 chr7 107935470 107935685 + 0.666667 NA exon (NM_002291, exon 27 of 34) exon (NM_002291, exon 27 of 34) 44394 NM_000108 1738 Hs.131711 NM_000108 ENSG00000091140 DLD DLDD|DLDH|E3|GCSL|LAD|PHE3 dihydrolipoamide dehydrogenase protein-coding 111.667-5 chr1 35226052 35226339 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -33050 NR_136702 6421 Hs.355934 NM_005066 ENSG00000116560 SFPQ POMP100|PPP1R140|PSF splicing factor proline and glutamine rich protein-coding 111.667-241 chr7 87361734 87362045 + 0.666667 NA intron (NM_021151, intron 6 of 17) intron (NM_021151, intron 6 of 17) 16225 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 114.667-264 chrX 52422581 52422804 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 53671 NM_130777 9502 Hs.409726 NM_130777 ENSG00000155622 XAGE2 CT12.2|GAGED3|XAGE-2|XAGE2B X antigen family member 2 protein-coding 155.333-277 chr4 140690712 140691047 + 0.666667 NA intron (NM_015130, intron 2 of 20) intron (NM_015130, intron 2 of 20) -47799 NR_077215 644962 Hs.676500 NR_077215 TNRC18P1 - trinucleotide repeat containing 18 pseudogene 1 pseudo 125.333-84 chr2 14916950 14917287 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 284401 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 156-151 chrX 142218134 142218539 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -13046 NM_016249 51438 Hs.123536 NM_016249 ENSG00000046774 MAGEC2 CT10|HCA587|MAGEE1 MAGE family member C2 protein-coding 149.333-32 chr1 206089225 206089519 + 0.666667 NA intron (NM_001369490, intron 1 of 5) intron (NM_001369490, intron 1 of 5) 5777 NM_001369490 440712 Hs.662248 NM_001007544 ENSG00000263961 RHEX C1orf186 regulator of hemoglobinization and erythroid cell expansion protein-coding 147.333-294 chr7 31530445 31530783 + 0.666667 NA intron (NM_001257968, intron 1 of 14) intron (NM_001257968, intron 1 of 14) 1152 NM_001257968 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 179.667-47 chr14 67562922 67563326 + 0.666667 NA intron (NM_020715, intron 7 of 28) MIRb|SINE|MIR -29274 NM_001348546 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 126.667-140 chr5 68532787 68533015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 240324 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 112-161 chr4 174595489 174595763 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72728 NM_001145816 3248 Hs.596913 NM_000860 ENSG00000164120 HPGD 15-PGDH|PGDH|PGDH1|PHOAR1|SDR36C1 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase protein-coding 116.333-200 chr7 125004324 125004647 + 0.666667 NA intron (NR_125718, intron 3 of 10) intron (NR_125718, intron 3 of 10) -74502 NR_003103 25913 Hs.31968 NM_015450 ENSG00000128513 POT1 CMM10|GLM9|HPOT1 protection of telomeres 1 protein-coding 131.333-149 chr5 162026042 162026338 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24994 NR_126372 104326188 NR_126372 LINC01202 - long intergenic non-protein coding RNA 1202 ncRNA 158.667-84 chr13 27672529 27672928 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 50836 NM_015972 51082 Hs.507584 NM_015972 ENSG00000186184 POLR1D AC19|POLR1C|RPA16|RPA9|RPAC2|RPC16|RPO1-3|TCS2 RNA polymerase I and III subunit D protein-coding 125.333-48 chr13 22652987 22653188 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 245094 NR_033774 646201 Hs.729338 NR_033774 BASP1P1 - BASP1 pseudogene 1 pseudo 119-36 chr12 52001235 52001557 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5550 NM_181711 160622 Hs.407202 NM_181711 ENSG00000161835 GRASP TAMALIN general receptor for phosphoinositides 1 associated scaffold protein protein-coding 135-54 chr2 230094737 230095031 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -25960 NM_152527 151473 Hs.504317 NM_152527 ENSG00000163053 SLC16A14 MCT14 solute carrier family 16 member 14 protein-coding 123.667-180 chr8 77969651 77969918 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 519087 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 135.333-36 chr11 81005064 81005424 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -242441 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 169.333-18 chr10 16476049 16476382 + 0.666667 NA intron (NM_030664, intron 2 of 5) AluSg|SINE|Alu 39272 NM_001261838 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 140.333-211 chr6 164372863 164373128 + 0.666667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 449068 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 154-44 chr12 85288114 85288419 + 0.666667 NA intron (NM_006982, intron 3 of 3) intron (NM_006982, intron 3 of 3) 8046 NM_006982 8092 Hs.41683 NM_006982 ENSG00000180318 ALX1 CART1|FND3|HEL23 ALX homeobox 1 protein-coding 169.333-267 chr8 76821556 76821972 + 0.666667 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) Zaphod3|DNA|hAT-Tip100 -138489 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 126.667-126 chr4 124125159 124125416 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 351023 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 114.333-67 chr14 27429578 27429763 + 0.666667 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) L1MA4|LINE|L1 -182918 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 160-52 chr19 12365307 12365743 + 0.666667 NA intron (NM_030824, intron 1 of 5) CpG 158 NM_030824 79973 Hs.253193 NM_030824 ENSG00000198342 ZNF442 - zinc finger protein 442 protein-coding 166.667-80 chr16 81859459 81859944 + 0.666667 NA intron (NM_002661, intron 5 of 32) AluY|SINE|Alu 80410 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 153.333-411 chr8 86183659 86183999 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 46552 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 140.333-195 chr5 171874535 171874895 + 0.666667 NA intron (NM_012300, intron 8 of 12) L1MB7|LINE|L1 88843 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 180.333-150 chr9 34213052 34213471 + 0.666667 NA intron (NM_001171203, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu 34218 NM_016525 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 247-17 chr12 17813810 17814363 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140787 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 123-117 chr7 76055247 76055565 + 0.666667 NA intron (NM_005918, intron 2 of 8) intron (NM_005918, intron 2 of 8) 7300 NM_005918 4191 Hs.520967 NM_005918 ENSG00000146701 MDH2 EIEE51|M-MDH|MDH|MGC:3559|MOR1 malate dehydrogenase 2 protein-coding 162.333-186 chr4 87002162 87002570 + 0.666667 NA intron (NM_001166693, intron 2 of 20) AluJr4|SINE|Alu -4622 NM_001313959 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 214-77 chr20 16153246 16153662 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -167572 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 119.667-154 chr5 90224201 90224509 + 0.666667 NA intron (NR_120601, intron 3 of 5) LTR41C|LTR|ERVL 65716 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 135.333-103 chr21 30521100 30521387 + 0.666667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -19102 NM_181611 337972 Hs.553694 NM_181611 ENSG00000186977 KRTAP19-5 KAP19.5 keratin associated protein 19-5 protein-coding 119.667-37 chr12 48170406 48170724 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -13050 NM_024095 140461 Hs.432699 NM_024095 ENSG00000177981 ASB8 PP14212 ankyrin repeat and SOCS box containing 8 protein-coding 116.667-16 chr10 68361344 68361546 + 0.666667 NA intron (NR_103476, intron 15 of 18) L2a|LINE|L2 -28517 NM_022129 64081 Hs.198158 NM_022129 ENSG00000108187 PBLD HEL-S-306|MAWBP|MAWDBP phenazine biosynthesis like protein domain containing protein-coding 226-73 chr5 82213277 82213931 + 0.666667 NA intron (NM_031482, intron 5 of 7) MamRep605|LTR?|LTR? 64750 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 204-107 chr2 177112152 177112642 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 100014 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 176-56 chr22 30919842 30920317 + 0.666667 NA intron (NR_146603, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu 1700 NR_146603 107985544 Hs.638287 NR_146603 LOC107985544 - uncharacterized LOC107985544 ncRNA 140.667-24 chr1 198270565 198270869 + 0.666667 NA intron (NM_133494, intron 5 of 9) intron (NM_133494, intron 5 of 9) 113719 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 150.333-315 chr5 1940742 1941042 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 53561 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 257.333-17 chr10 96192194 96192678 + 0.666667 NA intron (NM_001258442, intron 13 of 13) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 61814 NM_001330734 9849 Hs.600823 NM_014803 ENSG00000177853 ZNF518A ZNF518 zinc finger protein 518A protein-coding 115.333-92 chr17 11877524 11877827 + 0.666667 NA intron (NM_001372, intron 53 of 68) intron (NM_001372, intron 53 of 68) -5227 NM_004662 1770 Hs.567259 NM_001372 ENSG00000007174 DNAH9 CILD40|DNAH17L|DNEL1|DYH9|Dnahc9|HL-20|HL20 dynein axonemal heavy chain 9 protein-coding 151-107 chr5 39604088 39604441 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83833 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 192.667-173 chr8 108751211 108751746 + 0.666667 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) L1M5|LINE|L1 36116 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 141.667-67 chr13 68624575 68624867 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 260604 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 116.667-74 chr17 17488712 17488969 + 0.666667 NA intron (NM_018019, intron 1 of 1) AluSp|SINE|Alu 7555 NM_016084 51655 Hs.25829 NM_016084 ENSG00000108551 RASD1 AGS1|DEXRAS1|MGC:26290 ras related dexamethasone induced 1 protein-coding 168-126 chrX 152494510 152494972 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -43426 NM_000808 2556 Hs.123024 NM_000808 ENSG00000011677 GABRA3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha3 subunit protein-coding 273.333-74 chr9 96338931 96339415 + 0.666667 NA intron (NR_104627, intron 8 of 12) AluSc|SINE|Alu -36997 NM_000197 3293 Hs.477 NM_000197 ENSG00000130948 HSD17B3 EDH17B3|SDR12C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3 protein-coding 177.667-64 chr17 55913318 55913697 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 162402 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 146.333-161 chr2 161969889 161970179 + 0.666667 NA intron (NM_001354443, intron 23 of 25) MER5A|DNA|hAT-Charlie 104181 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 157-13 chr1 226445012 226445418 + 0.666667 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -37122 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 125.333-53 chr13 108035486 108035848 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -168171 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 139.333-72 chr14 52871666 52871969 + 0.666667 NA intron (NM_006832, intron 10 of 14) intron (NM_006832, intron 10 of 14) 79233 NM_006832 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 163-35 chr17 69258957 69259404 + 0.666667 NA intron (NM_018672, intron 27 of 37) L1MB8|LINE|L1 -14365 NM_080282 10349 Hs.25377 NM_080282 ENSG00000154263 ABCA10 EST698739 ATP binding cassette subfamily A member 10 protein-coding 131.667-11 chr1 162231046 162231309 + 0.666667 NA intron (NM_014697, intron 2 of 9) L1MB2|LINE|L1 74070 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 204.333-153 chr5 28153108 28153542 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 134340 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 128.667-119 chr3 90044360 90044615 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 936866 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 136.333-132 chr3 121699201 121699558 + 0.666667 NA intron (NM_001256486, intron 12 of 21) intron (NM_001256486, intron 12 of 21) -38476 NM_001292041 3059 Hs.14601 NM_005335 ENSG00000180353 HCLS1 CTTNL|HS1|lckBP1|p75 hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 protein-coding 112.333-130 chr2 108555547 108555873 + 0.666667 NA intron (NM_001193483, intron 1 of 9) intron (NM_001193483, intron 1 of 9) 21355 NM_001193483 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 204-190 chr8 66672487 66673011 + 0.666667 NA intron (NR_161217, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 5153 NR_161217 56260 Hs.661238 NM_019607 ENSG00000213865 C8orf44 - chromosome 8 open reading frame 44 ncRNA 230-38 chr2 221142298 221142830 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 429740 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 147.667-189 chr2 134389314 134389613 + 0.666667 NA intron (NM_001371457, intron 11 of 16) intron (NM_001371457, intron 11 of 16) 135391 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 167.333-93 chr15 69407237 69407651 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_017705, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_017705, exon 9 of 9) -6905 NM_138555 9493 Hs.270845 NM_004856 ENSG00000137807 KIF23 CHO1|KNSL5|MKLP-1|MKLP1 kinesin family member 23 protein-coding 133-65 chr4 492601 492991 + 0.666667 NA intron (NM_133474, intron 1 of 2) MER4-int|LTR|ERV1 6360 NM_133474 170960 Hs.428360 NM_133474 ENSG00000182903 ZNF721 - zinc finger protein 721 protein-coding 152-135 chr6 133072829 133073230 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15051 NR_026969 285735 Hs.407549 NM_001037231 LINC00326 NCRNA00326 long intergenic non-protein coding RNA 326 ncRNA 175.667-116 chr5 96343974 96344480 + 0.666667 NA intron (NR_130776, intron 3 of 4) intron (NR_130776, intron 3 of 4) 87932 NM_001177875 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 132-27 chr11 74607632 74607865 + 0.666667 NA intron (NM_001363597, intron 3 of 11) AluJb|SINE|Alu 15166 NR_046410 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 217.333-22 chr10 66286062 66286646 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) intron (NM_001127384, intron 12 of 17) -639682 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 145.667-88 chr14 76923482 76923768 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -36013 NR_133913 105370578 Hs.574184 NR_133913 ENSG00000258602 LINC01629 linc-KIAA1737-2 long intergenic non-protein coding RNA 1629 ncRNA 140.667-90 chr15 99368277 99368690 + 0.666667 NA intron (NR_135755, intron 8 of 8) MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR 110958 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 126-108 chr7 132349984 132350286 + 0.666667 NA intron (NM_020911, intron 3 of 31) intron (NM_020911, intron 3 of 31) 89274 NR_134565 101928807 Hs.552131 NR_134565 LOC101928807 - uncharacterized LOC101928807 ncRNA 116.333-181 chr5 120605034 120605235 + 0.666667 NA intron (NM_001308088, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 73670 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 150.667-185 chr2 108537270 108537618 + 0.666667 NA intron (NM_001193483, intron 1 of 9) intron (NM_001193483, intron 1 of 9) 3089 NM_001193483 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 116-120 chr4 160570614 160570858 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -792952 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 134-94 chr7 8004243 8004573 + 0.666667 NA intron (NM_138426, intron 2 of 7) intron (NM_138426, intron 2 of 7) 35612 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 149.333-396 chr8 88389364 88389671 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62034 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 171.333-51 chr14 62617342 62617702 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 427936 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 176.667-26 chr10 52056297 52056781 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 6 of 17) intron (NM_001098512, intron 6 of 17) 257589 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 165.333-25 chr10 22262349 22262748 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 10476 NR_038921 100130992 Hs.48501 NR_038921 LOC100130992 - uncharacterized LOC100130992 ncRNA 150.333-139 chr15 101419686 101419977 + 0.666667 NA intron (NM_138325, intron 6 of 13) intron (NM_138325, intron 6 of 13) 69876 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 187.333-22 chr10 71575038 71575319 + 0.666667 NA intron (NM_052836, intron 8 of 12) intron (NM_052836, intron 8 of 12) -63258 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 192.333-33 chr11 105573827 105574397 + 0.666667 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -35961 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 114.667-94 chr15 66357344 66357589 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_017858) promoter-TSS (NM_017858) -750 NM_001289986 54962 Hs.744308 NM_017858 ENSG00000075131 TIPIN - TIMELESS interacting protein protein-coding 162-86 chr3 150497999 150498337 + 0.666667 NA Intergenic Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 48328 NM_014445 27230 Hs.518326 NM_014445 ENSG00000120742 SERP1 RAMP4 stress associated endoplasmic reticulum protein 1 protein-coding 153.333-114 chr14 49474087 49474386 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 112144 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 185.333-32 chr11 96024037 96024441 + 0.666667 NA intron (NM_032427, intron 2 of 4) MIRc|SINE|MIR -100032 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 121.667-124 chr3 22107964 22108248 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 150967 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 136.333-79 chr17 62805604 62805861 + 0.666667 NA intron (NM_001288780, intron 1 of 10) AluSz|SINE|Alu 908 NM_001100875 162333 Hs.665663 NM_152598 ENSG00000173838 MARCH10 MARCH-X|RNF190 membrane associated ring-CH-type finger 10 protein-coding 148.333-224 chr20 31332065 31332351 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23623 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 157.667-314 chr7 126199661 126199988 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 858360 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 148.333-212 chr2 215048949 215049338 + 0.666667 NA intron (NR_103740, intron 7 of 54) L1PREC2|LINE|L1 -17057 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 118.333-172 chr5 137909744 137910053 + 0.666667 NA intron (NM_001300921, intron 8 of 14) intron (NM_001300921, intron 8 of 14) 20441 NM_014386 27039 Hs.716884 NM_014386 ENSG00000078795 PKD2L2 TRPP5 polycystin 2 like 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 213.333-65 chr15 39659932 39660433 + 0.666667 NA intron (NM_152597, intron 10 of 11) intron (NM_152597, intron 10 of 11) 79103 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 118.333-137 chr3 94423113 94423318 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 360154 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 155-93 chr3 103839257 103839561 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -315293 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 157.333-350 chr8 125777574 125777891 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 173465 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 145.333-308 chr8 127419328 127419629 + 0.666667 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR 3653 NM_001159542 5462 Hs.450254 NM_001159542 ENSG00000212993 POU5F1B OCT4-PG1|OCT4PG1|OTF3C|OTF3P1|POU5F1P1|POU5F1P4|POU5FLC20|POU5FLC8 POU class 5 homeobox 1B protein-coding 152.667-195 chr2 132523831 132524242 + 0.666667 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) MER5A|DNA|hAT-Charlie 90325 NR_162099 113218485 NR_162099 MIR9986 - microRNA 9986 ncRNA 132.333-138 chr5 137927880 137928227 + 0.666667 NA intron (NM_001300921, intron 12 of 14) L1M8|LINE|L1 38596 NM_014386 27039 Hs.716884 NM_014386 ENSG00000078795 PKD2L2 TRPP5 polycystin 2 like 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 122.667-107 chr21 30630358 30630573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4741 NM_181616 337976 Hs.553698 NM_181616 ENSG00000184032 KRTAP20-2 KAP20.2 keratin associated protein 20-2 protein-coding 123.667-72 chr17 56956027 56956239 + 0.666667 NA intron (NM_004645, intron 1 of 6) intron (NM_004645, intron 1 of 6) 4917 NM_004645 8161 Hs.532795 NM_004645 ENSG00000121058 COIL CLN80|p80-coilin coilin protein-coding 134.667-34 chr11 43328127 43328392 + 0.666667 NA intron (NR_024625, intron 9 of 14) intron (NR_024625, intron 9 of 14) 16263 NM_001142930 8539 Hs.435771 NM_006595 ENSG00000166181 API5 AAC-11|AAC11 apoptosis inhibitor 5 protein-coding 190.333-39 chr12 126167954 126168459 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72214 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 151-59 chr2 104712964 104713258 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 44608 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 134.333-127 chr4 74705252 74705614 + 0.666667 NA Intergenic LTR53|LTR|ERVL 89090 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 150.333-362 chr6 75569337 75569666 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -32008 NM_001304792 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 158-69 chr2 57354390 57354706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -553103 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 118.667-41 chr11 41274712 41274944 + 0.666667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) LTR12B|LTR|ERV1 184808 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 113.667-87 chr18 50852657 50852972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26304 NM_002396 4200 Hs.233119 NM_002396 ENSG00000082212 ME2 ODS1 malic enzyme 2 protein-coding 127.333-96 chr21 28716786 28716991 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 168479 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 121.333-185 chr8 130756943 130757157 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 283859 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 151-96 chr4 109202656 109202998 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 99831 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 112-217 chrX 76247696 76247885 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 74728 NM_016500 51260 Hs.370100 NM_016500 ENSG00000102390 PBDC1 CXorf26 polysaccharide biosynthesis domain containing 1 protein-coding 164.667-2 chr1 46093391 46093808 + 0.666667 NA intron (NM_001303427, intron 1 of 9) intron (NM_001303427, intron 1 of 9) 37074 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 116.667-22 chr11 68463150 68463352 + 0.666667 NA intron (NM_001352362, intron 2 of 24) AluSz|SINE|Alu 2499 NM_001164164 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 115-52 chr13 72339014 72339193 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 388526 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 112.333-131 chr2 111929546 111929715 + 0.666667 NA intron (NM_006343, intron 2 of 18) AluSx1|SINE|Alu 31023 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 283-18 chr2 59601832 59602329 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 384372 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 120.667-67 chr16 4224819 4225017 + 0.666667 NA intron (NM_001323667, intron 1 of 6) L1MB7|LINE|L1 17162 NM_001323667 6345 Hs.10041 NM_001098814 ENSG00000185739 SRL SAR sarcalumenin protein-coding 140-2 chr1 42393506 42393900 + 0.666667 NA intron (NM_173642, intron 1 of 4) intron (NM_173642, intron 1 of 4) 12911 NM_173642 284716 Hs.420244 NM_173642 ENSG00000177181 RIMKLA FAM80A|NAAGS|NAAGS-II ribosomal modification protein rimK like family member A protein-coding 127-64 chr4 22770954 22771296 + 0.666667 NA intron (NR_102357, intron 4 of 4) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 57036 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 137.333-89 chr2 33698971 33699299 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -7751 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 120.333-123 chr22 34687204 34687446 + 0.666667 NA Intergenic X6A_LINE|LINE|CR1 310591 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 132.333-167 chr7 73675626 73675981 + 0.666667 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 7650 NM_032317 84277 Hs.647046 NM_032317 ENSG00000176410 DNAJC30 WBSCR18 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C30 protein-coding 121.333-95 chr2 192451756 192452064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -256977 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 173.333-12 chr1 117531016 117531534 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 74495 NR_121626 100996263 Hs.202533 NR_121626 ENSG00000236866 LOC100996263 - uncharacterized LOC100996263 ncRNA 130-132 chr8 118215116 118215381 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie -103429 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 121.333-162 chr6 96118138 96118480 + 0.666667 NA intron (NM_006581, intron 2 of 2) intron (NM_006581, intron 2 of 2) 102335 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 190.667-61 chr2 26658155 26658572 + 0.666667 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -16997 NM_001029881 130106 Hs.591579 NM_001029881 ENSG00000157884 CIB4 KIP4 calcium and integrin binding family member 4 protein-coding 151-47 chr18 21751849 21752223 + 0.666667 NA intron (NM_020774, intron 1 of 20) intron (NM_020774, intron 1 of 20) 10707 NM_020774 57534 Hs.140903 NM_020774 ENSG00000101752 MIB1 DIP-1|DIP1|LVNC7|MIB|ZZANK2|ZZZ6 mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 224.333-69 chr2 235319219 235319743 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -174562 NM_014914 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 142.333-48 chr11 129262639 129262971 + 0.666667 NA intron (NR_145484, intron 1 of 1) intron (NR_145484, intron 1 of 1) 20359 NR_145484 399975 NM_207431 LOC399975 - uncharacterized LOC399975 ncRNA 178-51 chr16 88822702 88823189 + 0.666667 NA intron (NM_001323544, intron 12 of 14) intron (NM_001323544, intron 12 of 14) -11017 NM_001030018 353 Hs.28914 NM_000485 ENSG00000198931 APRT AMP|APRTD adenine phosphoribosyltransferase protein-coding 204-162 chr5 74372066 74372631 + 0.666667 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 49862 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 167-90 chr6 111827117 111827549 + 0.666667 NA intron (NM_153047, intron 2 of 13) intron (NM_153047, intron 2 of 13) 45738 NM_153047 2534 Hs.390567 NM_002037 ENSG00000010810 FYN SLK|SYN|p59-FYN FYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 188.667-83 chr2 181243617 181244117 + 0.666667 NA intron (NR_130784, intron 2 of 4) intron (NR_130784, intron 2 of 4) 61785 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 121-143 chr9 35163507 35163781 + 0.666667 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) intron (NM_006377, intron 1 of 38) 1635 NM_001330653 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 112.667-154 chr20 56424772 56425021 + 0.666667 NA intron (NM_001164116, intron 2 of 6) intron (NM_001164116, intron 2 of 6) 12636 NM_001164115 57091 Hs.473144 NM_020356 ENSG00000087589 CASS4 C20orf32|CAS4|HEFL|HEPL Cas scaffold protein family member 4 protein-coding 151.333-166 chr16 74756452 74756775 + 0.666667 NA intron (NM_024306, intron 1 of 6) intron (NM_024306, intron 1 of 6) 18207 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 116-121 chr5 14107378 14107681 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -35813 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 180.667-24 chr12 3697616 3697907 + 0.666667 NA intron (NM_001144958, intron 3 of 19) intron (NM_001144958, intron 3 of 19) 55348 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 178.667-58 chr16 56901505 56901870 + 0.666667 NA intron (NM_001126108, intron 23 of 25) L2b|LINE|L2 -2577 NR_106923 102466752 NR_106923 ENSG00000283471 MIR6863 hsa-mir-6863 microRNA 6863 ncRNA 125-67 chr22 31784701 31785000 + 0.666667 NA exon (NM_001369903, exon 10 of 42) exon (NM_001369903, exon 10 of 42) 30827 NM_001369901 9681 Hs.435022 NM_014662 ENSG00000100150 DEPDC5 DEP.5|FFEVF|FFEVF1 DEP domain containing 5 protein-coding 217.667-17 chr10 107670128 107670679 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 398890 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 220.333-40 chr15 27786251 27786845 + 0.666667 NA intron (NM_001300984, intron 22 of 22) L1M4a2|LINE|L1 312767 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 231-10 chr12 62295062 62295595 + 0.666667 NA TTS (NM_001351162) TTS (NM_001351162) 34924 NM_001351163 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 145.667-281 chr8 71979007 71979348 + 0.666667 NA intron (NR_033652, intron 4 of 4) intron (NR_033652, intron 4 of 4) 96407 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 242-39 chr2 56592187 56592628 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -406637 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 118.667-166 chr6 43558658 43558979 + 0.666667 NA intron (NR_144392, intron 11 of 32) intron (NR_144392, intron 11 of 32) 17220 NM_020750 57510 Hs.203206 NM_020750 ENSG00000124571 XPO5 exp5 exportin 5 protein-coding 123.333-193 chr7 40654967 40655263 + 0.666667 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) AluJo|SINE|Alu 324824 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 191-54 chr5 89287086 89287381 + 0.666667 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) intron (NR_136219, intron 7 of 9) -383128 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 196.333-59 chr16 69594868 69595335 + 0.666667 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) MLT2A2|LTR|ERVL 29135 NM_138713 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 138.333-138 chr4 110651619 110651888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9630 NM_153427 5308 Hs.643588 NM_000325 ENSG00000164093 PITX2 ARP1|ASGD4|Brx1|IDG2|IGDS|IGDS2|IHG2|IRID2|Otlx2|PTX2|RGS|RIEG|RIEG1|RS paired like homeodomain 2 protein-coding 148.667-227 chr20 56509661 56509975 + 0.666667 NA intron (NR_160308, intron 3 of 6) L1MB7|LINE|L1 -14911 NM_001012971 200232 Hs.504907 NM_001012971 ENSG00000124103 FAM209A C20orf106|dJ1153D9.3 family with sequence similarity 209 member A protein-coding 145.333-161 chr20 47633063 47633444 + 0.666667 NA intron (NM_181659, intron 8 of 22) MER21C|LTR|ERVL 131366 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 189.666-32 chr4 60236095 60236648 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -686248 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 168.667-161 chr4 88784055 88784387 + 0.666667 NA intron (NM_001015045, intron 4 of 17) intron (NM_001015045, intron 4 of 17) 39140 NM_001265580 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 147-50 chr15 92920051 92920373 + 0.666667 NA intron (NM_001042572, intron 2 of 12) intron (NM_001042572, intron 2 of 12) 15813 NR_036136 100422995 NR_036136 ENSG00000284324 MIR3175 mir-3175 microRNA 3175 ncRNA 210.333-112 chr4 26385800 26386160 + 0.666667 NA intron (NM_203284, intron 2 of 11) MIRb|SINE|MIR 64752 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 124-44 chr15 95414905 95415198 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18042 NR_027133 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 166.333-171 chr5 5042125 5042446 + 0.666667 NA intron (NR_026994, intron 2 of 6) X7C_LINE|LINE|CR1 7926 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 148.333-164 chr17 74851356 74851752 + 0.666667 NA intron (NM_001278553, intron 4 of 11) intron (NM_001278553, intron 4 of 11) 8330 NR_103735 2905 Hs.436980 NM_000835 ENSG00000161509 GRIN2C GluN2C|NMDAR2C|NR2C glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C protein-coding 161-85 chr5 175670501 175670844 + 0.666667 NA intron (NR_160284, intron 1 of 3) intron (NR_160284, intron 1 of 3) 12601 NM_001367711 3274 Hs.247885 NM_022304 ENSG00000113749 HRH2 H2R|HH2R histamine receptor H2 protein-coding 126.667-18 chr10 74801688 74802002 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -23410 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 138.667-27 chr10 111724117 111724366 + 0.666667 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 459524 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 120.333-94 chr2 50879748 50879989 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 152264 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 146.333-327 chr8 105064888 105065287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -253351 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 149.333-223 chr22 28468053 28468357 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 8336 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 155.333-367 chr7 62755926 62756242 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 547972 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 220.667-58 chr21 16382879 16383246 + 0.666667 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -36141 NR_136546 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 118.667-192 chr8 90905298 90905590 + 0.666667 NA intron (NM_022351, intron 5 of 12) intron (NM_022351, intron 5 of 12) 79633 NM_001363275 100127983 Hs.733266 NM_001190972 ENSG00000253250 C8orf88 - chromosome 8 open reading frame 88 protein-coding 177.667-22 chr10 89587328 89587782 + 0.666667 NA intron (NM_148977, intron 6 of 6) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 5272 NR_029524 406901 NR_029524 ENSG00000198997 MIR107 MIRN107|miR-107 microRNA 107 ncRNA 154-80 chr2 138701765 138702055 + 0.666667 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 78480 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 162.333-23 chr10 17213673 17214094 + 0.666667 NA TTS (NR_108060) TTS (NR_108060) -11812 NM_001351223 1787 Hs.351665 NM_004412 ENSG00000107614 TRDMT1 DMNT2|DNMT2|MHSAIIP|PUMET|RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1 protein-coding 150-160 chr9 131416832 131417263 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -13043 NM_013318 84726 Hs.743955 NM_013318 ENSG00000130723 PRRC2B BAT2L|BAT2L1|KIAA0515|LQFBS-1 proline rich coiled-coil 2B protein-coding 156.667-83 chr12 77725809 77726131 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -104924 NM_014903 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 116.333-51 chr12 24964291 24964553 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -15321 NM_001178091 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 122.667-200 chr8 131319286 131319520 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -278494 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 178-40 chr12 131843654 131844148 + 0.666667 NA intron (NM_016155, intron 5 of 9) intron (NM_016155, intron 5 of 9) 15508 NM_016155 4326 Hs.709245 NM_016155 ENSG00000198598 MMP17 MMP-17|MT4-MMP|MT4MMP|MTMMP4 matrix metallopeptidase 17 protein-coding 163.667-154 chr3 79938638 79938978 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -170810 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 133.667-26 chr11 21773916 21774168 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -419043 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 134-30 chr15 52630838 52631156 + 0.666667 NA intron (NM_019600, intron 2 of 12) L1ME3D|LINE|L1 21043 NM_001286495 56204 Hs.152385 NM_019600 ENSG00000047346 FAM214A KIAA1370 family with sequence similarity 214 member A protein-coding 169-59 chr22 35187842 35188280 + 0.666667 NA intron (NR_126356, intron 2 of 5) L1PREC2|LINE|L1 42995 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 131-7 chr1 168851447 168851764 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64664 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 185.667-71 chr2 121343541 121344036 + 0.666667 NA intron (NM_015282, intron 38 of 38) L1MB3|LINE|L1 -58586 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 146.333-174 chr2 236523428 236523781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16069 NM_001270584 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 195.333-221 chr8 135465811 135466362 + 0.666667 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) intron (NM_006558, intron 1 of 8) 8630 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 133-72 chr5 31470130 31470407 + 0.666667 NA intron (NM_013235, intron 16 of 34) intron (NM_013235, intron 16 of 34) 61825 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 113-70 chr15 66285589 66285856 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -7587 NM_001323936 115752 Hs.446251 NM_133375 ENSG00000166938 DIS3L DIS3L1 DIS3 like exosome 3'-5' exoribonuclease protein-coding 114.333-147 chr3 100743270 100743476 + 0.666667 NA intron (NM_001007565, intron 6 of 7) intron (NM_001007565, intron 6 of 7) 33831 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 253-59 chr6 40998833 40999291 + 0.666667 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) intron (NR_110873, intron 1 of 5) 24218 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 219-71 chr6 4577398 4577810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32961 NR_122107 497048 Hs.591355 NM_001011540 ENSG00000205444 KU-MEL-3 - uncharacterized LOC497048 ncRNA 141-79 chr6 130699606 130699871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127667 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 143.667-233 chr7 53544046 53544344 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 267736 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 129-18 chr10 68403698 68403989 + 0.666667 NA intron (NM_001278225, intron 1 of 11) AluJr|SINE|Alu 3346 NM_017987 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 118-107 chr5 140027441 140027671 + 0.666667 NA intron (NM_013983, intron 1 of 10) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 15743 NM_013982 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 184.333-84 chr2 180267989 180268308 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -260851 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 146-18 chr11 96001729 96002152 + 0.666667 NA intron (NM_032427, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 -77733 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 143.667-267 chr9 94877020 94877309 + 0.666667 NA intron (NM_032823, intron 5 of 14) intron (NM_032823, intron 5 of 14) 67202 NR_031755 100313780 NR_031755 ENSG00000252153 MIR2278 mir-2278 microRNA 2278 ncRNA 156.333-79 chr12 54571389 54571833 + 0.666667 NA intron (NM_001165975, intron 5 of 14) intron (NM_001165975, intron 5 of 14) 10146 NM_001165975 5153 Hs.530871 NM_000924 ENSG00000123360 PDE1B HEL-S-79p|PDE1B1|PDES1B phosphodiesterase 1B protein-coding 139.667-78 chr18 72318877 72319143 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 225332 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 140.667-96 chr17 65017302 65017610 + 0.666667 NA intron (NM_006572, intron 3 of 3) intron (NM_006572, intron 3 of 3) 38318 NM_001282425 10672 Hs.515018 NM_006572 ENSG00000120063 GNA13 G13 G protein subunit alpha 13 protein-coding 197-95 chr5 122104127 122104626 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25170 NM_207317 133923 Hs.729673 NM_207317 ENSG00000164185 ZNF474 - zinc finger protein 474 protein-coding 137.667-67 chr15 76385677 76386047 + 0.666667 NA intron (NR_148227, intron 28 of 32) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 49089 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 113.333-42 chr11 12364107 12364315 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13360 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 166-105 chr6 155828389 155828730 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118238 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 117.333-74 chr16 49206086 49206365 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75613 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 204-22 chr1 229639627 229640033 + 0.666667 NA intron (NM_014777, intron 4 of 9) intron (NM_014777, intron 4 of 9) 13583 NM_014777 9816 Hs.533628 NM_014777 ENSG00000135763 URB2 KIAA0133|NET10|NPA2 URB2 ribosome biogenesis homolog protein-coding 127.333-8 chr1 106394105 106394414 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -366006 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 125-117 chr8 117133225 117133440 + 0.666667 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -1663 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 112.667-218 chr5 117920534 117920789 + 0.666667 NA intron (NR_104997, intron 1 of 2) L1MA4A|LINE|L1 190300 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 117-51 chr15 94475777 94476016 + 0.666667 NA intron (NM_018349, intron 20 of 21) intron (NM_018349, intron 20 of 21) 119966 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 128.667-14 chr1 195187063 195187427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 901470 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 207.333-101 chr15 68641910 68642513 + 0.666667 NA intron (NM_001324015, intron 1 of 11) MIRc|SINE|MIR 708 NM_001324015 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 137.667-98 chr2 148010076 148010329 + 0.666667 NA intron (NM_001190879, intron 1 of 14) L1MA4|LINE|L1 10535 NM_002552 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 128.667-112 chr3 13424604 13424852 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4406 NM_024923 23225 Hs.475525 NM_024923 ENSG00000132182 NUP210 GP210|POM210 nucleoporin 210 protein-coding 193-85 chr6 94459381 94459947 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 741361 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 130.333-16 chr1 181214354 181214585 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -21919 NR_046249 100287948 Hs.742594 NR_046249 ENSG00000179452 LINC01699 GM140 long intergenic non-protein coding RNA 1699 ncRNA 153-32 chr12 57763558 57763900 + 0.666667 NA exon (NM_000785, exon 8 of 9) exon (NM_000785, exon 8 of 9) 3349 NM_000785 1594 Hs.524528 NM_000785 ENSG00000111012 CYP27B1 CP2B|CYP1|CYP1alpha|CYP27B|P450c1|PDDR|VDD1|VDDR|VDDRI|VDR cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1 protein-coding 180-76 chr4 109479819 109480209 + 0.666667 NA intron (NM_001042734, intron 3 of 22) (TATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -8684 NR_030302 693161 NR_030302 ENSG00000207988 MIR576 MIRN576|hsa-mir-576 microRNA 576 ncRNA 160.667-61 chr11 87726557 87726892 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7313 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 168-77 chr4 26881345 26881801 + 0.666667 NA intron (NM_001169118, intron 1 of 12) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 20732 NM_001169118 57620 Hs.744950 NM_020860 ENSG00000109689 STIM2 - stromal interaction molecule 2 protein-coding 165-71 chr4 147517105 147517579 + 0.666667 NA intron (NM_001166055, intron 2 of 5) intron (NM_001166055, intron 2 of 5) 36245 NR_148964 1909 Hs.183713 NM_001957 ENSG00000151617 EDNRA ET-A|ETA|ETA-R|ETAR|ETRA|MFDA|hET-AR endothelin receptor type A protein-coding 127-94 chr8 81117094 81117374 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5166 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 166.667-189 chr5 138810050 138810507 + 0.666667 NA intron (NM_001323985, intron 4 of 17) intron (NM_001323985, intron 4 of 17) -56354 NR_134244 105379194 Hs.445981 NR_134244 ENSG00000253404 LOC105379194 - uncharacterized LOC105379194 ncRNA 112.333-66 chr14 26844068 26844272 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22050 NR_110033 101927062 NR_110033 ENSG00000257845 LINC02294 - long intergenic non-protein coding RNA 2294 ncRNA 135.333-11 chr1 147607890 147608172 + 0.666667 NA intron (NM_004326, intron 3 of 9) L2b|LINE|L2 62493 NR_136635 51205 Hs.562154 NM_016361 ENSG00000162836 ACP6 ACPL1|LPAP|PACPL1 acid phosphatase 6, lysophosphatidic protein-coding 112.667-227 chr6 49836396 49836667 + 0.666667 NA intron (NM_170609, intron 6 of 6) AluYi6|SINE|Alu -11765 NR_110843 101927048 Hs.742154 NR_110843 LOC101927048 - uncharacterized LOC101927048 ncRNA 118.667-172 chr6 127623988 127624279 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 46959 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 216-11 chr10 72184901 72185347 + 0.666667 NA intron (NM_001369110, intron 5 of 8) L1ME1|LINE|L1 30832 NM_001369088 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 188-108 chr8 11236861 11237266 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -35230 NM_173683 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 118.333-53 chr12 94770637 94770889 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -63635 NR_030171 574449 NR_030171 ENSG00000283998 MIR492 MIRN492|hsa-mir-492 microRNA 492 ncRNA 135.333-186 chr8 80148553 80148875 + 0.666667 NA intron (NR_105035, intron 1 of 6) intron (NR_105035, intron 1 of 6) 22407 NR_105037 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 135-43 chr2 55292843 55293162 + 0.666667 NA intron (NM_001254943, intron 32 of 33) intron (NM_001254943, intron 32 of 33) 10683 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 117-14 chr10 14169070 14169324 + 0.666667 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) intron (NR_134578, intron 2 of 3) 94913 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 171.333-190 chr8 52865216 52865651 + 0.666667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -74475 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 202.667-126 chr5 158970097 158970574 + 0.666667 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 127621 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 180.667-136 chr7 54175963 54176393 + 0.666667 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -154519 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 132-103 chr5 123505562 123505810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6413 NM_001031812 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 173-27 chr14 83374015 83374385 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 731568 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 113-14 chr1 230060281 230060599 + 0.666667 NA intron (NM_001291866, intron 1 of 15) L1MC4a|LINE|L1 2651 NM_001291866 2590 Hs.743964 NM_004481 ENSG00000143641 GALNT2 GalNAc-T2 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 123-21 chr10 128137712 128137910 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11388 NM_001145966 4288 Hs.80976 NM_002417 ENSG00000148773 MKI67 KIA|MIB-|MIB-1|PPP1R105 marker of proliferation Ki-67 protein-coding 122-129 chr9 29418407 29418708 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -204956 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 151-60 chr2 120074472 120074760 + 0.666667 NA intron (NM_001330307, intron 5 of 16) intron (NM_001330307, intron 5 of 16) 61539 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 175.667-57 chr17 64443297 64443772 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5581 NM_001291317 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 139-103 chr8 95486230 95486643 + 0.666667 NA intron (NR_038207, intron 2 of 2) intron (NR_038207, intron 2 of 2) -217235 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 120.333-50 chr13 103569660 103569949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 144604 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 126.667-110 chr3 122568860 122569158 + 0.666667 NA exon (NM_138287, exon 3 of 5) exon (NM_138287, exon 3 of 5) -4225 NM_031458 83666 Hs.518200 NM_031458 ENSG00000138496 PARP9 ARTD9|BAL|BAL1|MGC:7868 poly(ADP-ribose) polymerase family member 9 protein-coding 264-2 chr1 50480406 50481002 + 0.666667 NA intron (NM_007051, intron 17 of 18) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -57261 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 174.333-115 chr5 51464417 51464814 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81167 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 148.333-206 chr2 179958807 179959211 + 0.666667 NA intron (NM_020943, intron 14 of 19) intron (NM_020943, intron 14 of 19) 48288 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 170-51 chr18 10936640 10937062 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) intron (NM_022068, intron 3 of 51) -177202 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 150.333-304 chr4 71092123 71092354 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -95021 NM_001098484 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 185.667-5 chr1 194522643 194523066 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1218109 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 157.333-232 chr3 85316666 85316971 + 0.666667 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) L1MEd|LINE|L1 -68892 NR_049870 100847077 NR_049870 ENSG00000264084 MIR5688 - microRNA 5688 ncRNA 158.333-20 chr1 187573704 187574093 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL 130270 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 246.667-80 chr6 75550597 75551152 + 0.666667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -50635 NM_001304792 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 214-17 chr10 70870467 70870959 + 0.666667 NA intron (NM_003901, intron 9 of 14) MIRc|SINE|MIR 17168 NM_001289797 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 179.667-120 chr6 122727767 122728126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21255 NM_001319042 2173 Hs.26770 NM_001446 ENSG00000164434 FABP7 B-FABP|BLBP|FABPB|MRG fatty acid binding protein 7 protein-coding 123-57 chr18 5913352 5913577 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17510 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 129 chr1 23291190 23291512 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5833 NR_110616 100996511 Hs.99836 NR_110616 LINC01355 - long intergenic non-protein coding RNA 1355 ncRNA 126.667-35 chr12 40583110 40583456 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -109156 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 112-119 chr2 207212645 207212883 + 0.666667 NA intron (NR_110283, intron 3 of 3) intron (NR_110283, intron 3 of 3) -27047 NR_146555 105373853 Hs.678559 NR_146555 ENSG00000229647 MYOSLID - myocardin-induced smooth muscle lncRNA, inducer of differentiation ncRNA 222.333-17 chr11 32919827 32920322 + 0.666667 NA intron (NM_001076786, intron 1 of 12) L1MC3|LINE|L1 27263 NM_001076786 79832 Hs.369368 NM_024774 ENSG00000060749 QSER1 - glutamine and serine rich 1 protein-coding 111.667-9 chr1 55641330 55641504 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 303546 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 117.667-95 chr2 127418824 127419028 + 0.666667 NA intron (NM_000312, intron 1 of 8) intron (NM_000312, intron 1 of 8) 506 NM_000312 5624 Hs.224698 NM_000312 ENSG00000115718 PROC APC|PC|PROC1|THPH3|THPH4 protein C, inactivator of coagulation factors Va and VIIIa protein-coding 136-31 chr14 48214238 48214488 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -419349 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 117.333-10 chr1 104556958 104557149 + 0.666667 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 484030 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 142.667-45 chr13 46521219 46521470 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31826 NM_001164213 23143 Hs.507971 NM_015116 ENSG00000136141 LRCH1 CHDC1|NP81 leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1 protein-coding 148.333-194 chr2 115316673 115317020 + 0.666667 NA intron (NM_001321909, intron 2 of 24) AluJb|SINE|Alu 7609 NM_001321907 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 200.667-28 chr11 11700330 11700853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43869 NR_036184 100423026 NR_036184 ENSG00000266645 MIR4299 - microRNA 4299 ncRNA 132.333-102 chr20 20262525 20262838 + 0.666667 NA intron (NM_015585, intron 20 of 26) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -105423 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 168.667-85 chr18 77937648 77938125 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 55841 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 192.333 chr1 26388077 26388490 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -15489 NM_001114759 257101 Hs.353208 NM_173574 ENSG00000176083 ZNF683 Hobit zinc finger protein 683 protein-coding 126.333-49 chr14 61307062 61307292 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -14266 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 254-62 chr4 188211493 188211960 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 72285 NM_178556 339976 Hs.348618 NM_178556 ENSG00000184108 TRIML1 RNF209 tripartite motif family like 1 protein-coding 169.333-191 chr4 126957452 126957930 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -675266 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 117-102 chr4 52458714 52458920 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 197722 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 117.667-31 chr11 88102796 88103119 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72486 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 124-18 chr10 5130561 5130914 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 36323 NM_003739 8644 Hs.78183 NM_003739 ENSG00000196139 AKR1C3 DD3|DDX|HA1753|HAKRB|HAKRe|HSD17B5|PGFS|hluPGFS aldo-keto reductase family 1 member C3 protein-coding 130.333-26 chr10 13624750 13625091 + 0.666667 NA intron (NM_003675, intron 9 of 9) HAL1|LINE|L1 37955 NM_003675 8559 Hs.660649 NM_003675 ENSG00000165630 PRPF18 PRP18|hPrp18 pre-mRNA processing factor 18 protein-coding 170.333-68 chr13 96899313 96899636 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 84698 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 125.667-89 chr2 22284227 22284548 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -252092 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 175.667-111 chr4 136528351 136528734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -614862 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 156-109 chr5 17339624 17340043 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47477 NR_033975 401177 Hs.508311 NR_033975 ENSG00000250822 LINC02111 - long intergenic non-protein coding RNA 2111 ncRNA 149.333-151 chr17 77209096 77209463 + 0.666667 NA intron (NM_001143999, intron 13 of 16) intron (NM_001143999, intron 13 of 16) 24066 NM_001144001 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 130.333-97 chr2 12227518 12227831 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) LTR84b|LTR|ERVL 28544 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 161-3 chr1 192849140 192849472 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40267 NM_002923 5997 Hs.78944 NM_002923 ENSG00000116741 RGS2 G0S8 regulator of G protein signaling 2 protein-coding 116.667-9 chr1 112925069 112925326 + 0.666667 NA TTS (NR_002796) TTS (NR_002796) 1847 NR_002796 246182 Hs.647691 NR_002796 AKR7A2P1 AFARP1 aldo-keto reductase family 7 member A2 pseudogene 1 pseudo 246.333-74 chr5 58588628 58589046 + 0.666667 NA intron (NM_138453, intron 1 of 4) L1ME2|LINE|L1 5762 NM_138453 115827 Hs.4290 NM_138453 ENSG00000152932 RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family protein-coding 125-45 chr16 78866553 78866925 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 733998 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 152-142 chr7 3691487 3691767 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) 390375 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 210.333-135 chr5 62327531 62328038 + 0.666667 NA intron (NM_001243952, intron 2 of 20) intron (NM_001243952, intron 2 of 20) 21622 NM_001243952 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 146.333-33 chr10 97502185 97502529 + 0.666667 NA intron (NM_024954, intron 1 of 2) intron (NM_024954, intron 1 of 2) 3433 NM_024954 80019 Hs.500724 NM_024954 ENSG00000165886 UBTD1 - ubiquitin domain containing 1 protein-coding 150.667-36 chr10 35633560 35633950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7497 NR_039831 100616500 NR_039831 ENSG00000284265 MIR4683 - microRNA 4683 ncRNA 182.667-55 chr16 54926504 54926952 + 0.666667 NA intron (NR_110453, intron 1 of 5) intron (NR_110453, intron 1 of 5) 2050 NM_001308963 643911 Hs.237396 NM_001308963 CRNDE CRNDEP|LINC00180|NCRNA00180|PNAS-108|lincIRX5 colorectal neoplasia differentially expressed protein-coding 156-51 chr15 57530000 57530319 + 0.666667 NA intron (NM_032866, intron 13 of 18) intron (NM_032866, intron 13 of 18) -61745 NR_104370 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 122.667-15 chr10 34994510 34994856 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 79600 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 112-67 chr15 41208125 41208349 + 0.666667 NA intron (NM_152596, intron 5 of 9) intron (NM_152596, intron 5 of 9) 22520 NM_152596 161829 Hs.307999 NM_152596 ENSG00000178997 EXD1 EXDL1 exonuclease 3'-5' domain containing 1 protein-coding 169-49 chr2 185216984 185217374 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50107 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 232.667-23 chr14 30059586 30059956 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -131924 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 112-28 chr11 35608885 35609172 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9432 NM_014344 24147 Hs.39384 NM_014344 ENSG00000179431 FJX1 - four-jointed box kinase 1 protein-coding 213.333-30 chr10 121109032 121109608 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 257958 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 154.667-139 chr17 51124119 51124581 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3482 NM_003971 9043 Hs.463439 NM_003971 ENSG00000008294 SPAG9 CT89|HLC-6|HLC4|HLC6|JIP-4|JIP4|JLP|PHET|PIG6 sperm associated antigen 9 protein-coding 152-44 chr12 60717929 60718277 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 1028733 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 168.333-164 chr5 91611339 91611683 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -228194 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 159.333-121 chr16 82457754 82458158 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -169013 NM_001257 1012 Hs.654386 NM_001257 ENSG00000140945 CDH13 CDHH|P105 cadherin 13 protein-coding 221.333-106 chr5 1742750 1743321 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -34167 NR_036240 100422966 NR_036240 ENSG00000263746 MIR4277 - microRNA 4277 ncRNA 190.333-4 chr1 37159742 37160144 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -1620 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 169.333-189 chr4 108916737 108917031 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 12 of 36) intron (NM_198721, intron 12 of 36) -153831 NM_001146590 64850 Hs.106576 NM_031279 ENSG00000164089 ETNPPL AGXT2L1 ethanolamine-phosphate phospho-lyase protein-coding 152.333-146 chr17 54926634 54927058 + 0.666667 NA intron (NM_001321173, intron 7 of 9) MIR1_Amn|SINE|MIR 25994 NM_005486 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 143.667-204 chr5 96219912 96220201 + 0.666667 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) intron (NR_130776, intron 1 of 4) 140918 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 186.667-36 chr14 45982413 45982893 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -81506 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 144.667-290 chr8 23506838 23507158 + 0.666667 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -21958 NM_001317813 51312 Hs.596025 NM_016612 ENSG00000147454 SLC25A37 HT015|MFRN|MFRN1|MSC|MSCP|PRO1278|PRO1584|PRO2217 solute carrier family 25 member 37 protein-coding 157.333-293 chr5 148561478 148561930 + 0.666667 NA intron (NM_001040172, intron 1 of 5) intron (NM_001040172, intron 1 of 5) 75357 NM_001286410 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 201-45 chr17 22679387 22679834 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 156499 NM_001190452 100462977 Hs.740185 NM_001190452 ENSG00000256618 MTRNR2L1 HN1 MT-RNR2 like 1 protein-coding 149.333-340 chr6 99282927 99283207 + 0.666667 NA intron (NR_144463, intron 5 of 5) L1ME4a|LINE|L1 66607 NM_032511 84553 Hs.573245 NM_032511 ENSG00000146267 FAXC C6orf168|dJ273F20 failed axon connections homolog, metaxin like GST domain containing protein-coding 152-158 chr8 132493923 132494331 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -13032 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 194.333-9 chr1 115884017 115884506 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35115 NR_125969 101928995 Hs.559119 NR_125969 ENSG00000228127 LINC01649 - long intergenic non-protein coding RNA 1649 ncRNA 320.667-8 chr10 126324874 126325662 + 0.666667 NA intron (NM_001288974, intron 2 of 18) L2|LINE|L2 63209 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 179-82 chr5 178598236 178598751 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -8100 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 117.333-140 chr3 177750522 177750820 + 0.666667 NA intron (NR_047568, intron 3 of 3) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -66194 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 148.333-306 chr5 32256567 32256854 + 0.666667 NA intron (NM_001294344, intron 7 of 13) intron (NM_001294344, intron 7 of 13) 56229 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 125.667-28 chr10 75294288 75294614 + 0.666667 NA intron (NR_120651, intron 1 of 3) intron (NR_120651, intron 1 of 3) -1932 NR_038224 253264 Hs.662111 NR_038223 ENSG00000226051 ZNF503-AS1 - ZNF503 antisense RNA 1 ncRNA 144.333-114 chr19 50865803 50866047 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -7508 NM_001256080 3817 Hs.515560 NM_005551 ENSG00000167751 KLK2 KLK2A2|hGK-1|hK2 kallikrein related peptidase 2 protein-coding 112.333-216 chr5 121391794 121392121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69407 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 429-8 chr3 104062338 104063255 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -538680 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 206.667-112 chr5 55672944 55673328 + 0.666667 NA intron (NM_001349385, intron 3 of 14) intron (NM_001349385, intron 3 of 14) 19917 NM_001258286 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 126-46 chr18 12321845 12322129 + 0.666667 NA intron (NM_001303528, intron 4 of 4) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 13746 NM_001303529 84617 Hs.193491 NM_032525 ENSG00000176014 TUBB6 FPVEPD|HsT1601|TUBB-5 tubulin beta 6 class V protein-coding 195.667-32 chr12 62241754 62242168 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18379 NM_001252079 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 126.667-173 chr8 25722883 25723147 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 263782 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 165.333-64 chr12 115131795 115132134 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -447789 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 125.667-74 chr16 17220674 17220961 + 0.666667 NA intron (NM_022166, intron 3 of 11) intron (NM_022166, intron 3 of 11) 86313 NR_135179 102723692 Hs.737758 NR_135179 ENSG00000261448 LOC102723692 - uncharacterized LOC102723692 ncRNA 175-66 chr5 12753531 12753895 + 0.666667 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) MLT2B3|LTR|ERVL 85854 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 180-89 chr6 107990041 107990460 + 0.666667 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 -32042 NM_007214 11231 Hs.26904 NM_007214 ENSG00000025796 SEC63 DNAJC23|ERdj2|PCLD2|PRO2507|SEC63L SEC63 homolog, protein translocation regulator protein-coding 144.667-37 chr11 19086875 19087199 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26320 NM_054030 117194 Hs.350566 NM_054030 ENSG00000183695 MRGPRX2 MGRG3|MRGX2 MAS related GPR family member X2 protein-coding 176-96 chr8 51488185 51488492 + 0.666667 NA intron (NM_144651, intron 5 of 22) HAL1ME|LINE|L1 321107 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 215.667-22 chr11 72361655 72362168 + 0.666667 NA intron (NM_001258393, intron 3 of 14) L2c|LINE|L2 72620 NM_001258393 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 135.333-15 chr1 206806867 206807070 + 0.666667 NA intron (NM_153758, intron 2 of 6) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -21909 NM_013371 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 178-36 chr12 39956317 39956672 + 0.666667 NA intron (NM_052885, intron 3 of 9) intron (NM_052885, intron 3 of 9) 149587 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 125-5 chr1 118517712 118518047 + 0.666667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -332651 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 112.333-217 chr5 130381452 130381680 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 477101 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 146.667-194 chr20 32355172 32355450 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3033 NM_001164603 171023 Hs.374043 NM_015338 ENSG00000171456 ASXL1 BOPS|MDS ASXL transcriptional regulator 1 protein-coding 144.333-223 chr5 173822399 173822692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31603 NR_108028 101928154 Hs.366725 NR_108028 LINC01485 - long intergenic non-protein coding RNA 1485 ncRNA 137.333-124 chr3 152780434 152780785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54522 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 171.667-94 chr20 14500641 14501005 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 4 of 17) intron (NM_001351663, intron 4 of 17) -53561 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 118-19 chr12 29086405 29086615 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -62768 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 130-34 chr14 46246729 46246964 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L1MB7|LINE|L1 182687 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 160.667-108 chr15 69849125 69849522 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 14089 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 131.667-150 chr4 97582582 97582905 + 0.666667 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) intron (NM_174952, intron 10 of 10) 215817 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 153-45 chr14 48528444 48528766 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -733591 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 138.333-16 chr1 225814132 225814449 + 0.666667 NA intron (NM_001291163, intron 1 of 8) AluJo|SINE|Alu 4156 NM_001291163 2052 Hs.89649 NM_000120 ENSG00000143819 EPHX1 EPHX|EPOX|HYL1|MEH epoxide hydrolase 1 protein-coding 180-74 chr4 83137643 83138013 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23099 NM_001130715 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 158-131 chr7 81413739 81414156 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 147872 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 129.333-53 chr12 53085271 53085572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6031 NM_032840 84926 Hs.343334 NM_032840 ENSG00000167778 SPRYD3 - SPRY domain containing 3 protein-coding 164.333-42 chr11 81389039 81389427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 501603 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 119-10 chr1 203846373 203846593 + 0.666667 NA intron (NM_014827, intron 14 of 19) L2c|LINE|L2 -15116 NR_130746 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 135.667-19 chr10 69590415 69590702 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17136 NM_020999 50674 Hs.532682 NM_020999 ENSG00000122859 NEUROG3 Atoh5|Math4B|NGN-3|bHLHa7|ngn3 neurogenin 3 protein-coding 138.667-172 chr5 133781941 133782248 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -131583 NR_131252 105664404 Hs.582536 NR_131252 ENSG00000249073 WSPAR LncTCF7|TCONS_00009511 WNT signaling pathway activating non-coding RNA ncRNA 130.667-182 chr7 22784086 22784326 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38643 NM_019059 54543 Hs.112318 NM_019059 ENSG00000196683 TOMM7 TOM7 translocase of outer mitochondrial membrane 7 protein-coding 119.667-41 chr12 109033675 109033893 + 0.666667 NA intron (NM_001301175, intron 3 of 15) intron (NM_001301175, intron 3 of 15) 10695 NM_001301175 84749 Hs.486434 NM_032663 ENSG00000135093 USP30 - ubiquitin specific peptidase 30 protein-coding 160-15 chr10 43523028 43523364 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 45263 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 204.667-76 chr2 166073210 166073672 + 0.666667 NA exon (NM_001202435, exon 3 of 28) exon (NM_001202435, exon 3 of 28) -8090 NR_110260 101929680 Hs.662210 NR_110260 ENSG00000236107 SCN1A-AS1 - SCN1A and SCN9A antisense RNA 1 ncRNA 240.333-97 chr8 133537734 133538355 + 0.666667 NA intron (NM_003033, intron 2 of 8) intron (NM_003033, intron 2 of 8) 33843 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 166.667-78 chr16 8094488 8094825 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 495182 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 148.333-286 chr4 67690688 67691007 + 0.666667 NA intron (NM_018227, intron 2 of 32) L1M3|LINE|L1 10308 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 151-19 chr11 20340681 20340937 + 0.666667 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 -22876 NM_006410 10553 Hs.90753 NM_006410 ENSG00000109854 HTATIP2 CC3|SDR44U1|TIP30 HIV-1 Tat interactive protein 2 protein-coding 114.333-33 chr10 90879290 90879574 + 0.666667 NA intron (NM_006413, intron 5 of 10) intron (NM_006413, intron 5 of 10) 7458 NM_001104546 10556 Hs.139120 NM_006413 ENSG00000148688 RPP30 TSG15 ribonuclease P/MRP subunit p30 protein-coding 173.333-191 chr7 96055736 96056155 + 0.666667 NA intron (NM_004411, intron 14 of 16) intron (NM_004411, intron 14 of 16) 163811 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 134-76 chr4 33810856 33811223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 228854 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 120-87 chr3 78380396 78380702 + 0.666667 NA Intergenic LTR88c|LTR|Gypsy? -331586 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 163.333-144 chr2 76593178 76593627 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -392563 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 162.667-22 chr10 17855417 17855901 + 0.666667 NA intron (NM_002438, intron 8 of 29) intron (NM_002438, intron 8 of 29) 10552 NR_030167 574445 NR_030167 ENSG00000207938 MIR511 MIR511-1|MIR511-2|MIRN511-1|MIRN511-2|hsa-mir-511|hsa-mir-511-2|mir-511 microRNA 511 ncRNA 169.333-121 chr2 100274155 100274463 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_198461, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_198461, exon 12 of 12) 48424 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 136.333-36 chr11 116925788 116926073 + 0.666667 NA intron (NM_001366687, intron 4 of 4) intron (NM_001366687, intron 4 of 4) -87980 NM_001318021 335 Hs.93194 NM_000039 ENSG00000118137 APOA1 apo(a) apolipoprotein A1 protein-coding 144-141 chr6 140834887 140835153 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 151206 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 153-40 chr13 49005619 49005915 + 0.666667 NA intron (NR_103528, intron 1 of 25) intron (NR_103528, intron 1 of 25) 29105 NR_103528 22862 Hs.508010 NM_014923 ENSG00000102531 FNDC3A FNDC3|HUGO|bA203I16.1|bA203I16.5 fibronectin type III domain containing 3A protein-coding 156-144 chr8 123732880 123733331 + 0.666667 NA intron (NM_004306, intron 1 of 10) AluJo|SINE|Alu 4288 NM_004306 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 222-4 chr1 170330020 170330612 + 0.666667 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 -46108 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 176.667-101 chr3 76554439 76554773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -485493 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 131.333-39 chr11 120734618 120734859 + 0.666667 NA intron (NM_001282470, intron 2 of 19) L1MA2|LINE|L1 84377 NR_133008 105369532 Hs.694510 NR_133008 LOC105369532 - uncharacterized LOC105369532 ncRNA 123-127 chr8 120492602 120492942 + 0.666667 NA intron (NM_022045, intron 13 of 21) (TTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 47353 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 176.333-147 chr6 72657526 72657908 + 0.666667 NA intron (NR_120503, intron 2 of 3) intron (NR_120503, intron 2 of 3) 27222 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 117.667-84 chr2 74229438 74229734 + 0.666667 NA intron (NM_133478, intron 25 of 30) intron (NM_133478, intron 25 of 30) 30971 NM_006636 10797 Hs.469030 NM_006636 ENSG00000065911 MTHFD2 NMDMC methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase protein-coding 119.333-40 chr10 87919373 87919683 + 0.666667 NA intron (NM_001304718, intron 2 of 8) L1ME1|LINE|L1 55903 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 125-99 chr6 79218847 79219073 + 0.666667 NA intron (NM_138730, intron 1 of 5) L1MEi|LINE|L1 -14714 NR_040671 100288198 Hs.586270 NR_040671 ENSG00000270362 HMGN3-AS1 - HMGN3 antisense RNA 1 ncRNA 162.333-211 chr6 3134649 3135048 + 0.666667 NA intron (NM_004332, intron 4 of 6) AluY|SINE|Alu 16137 NM_004332 670 Hs.10136 NM_004332 ENSG00000137274 BPHL BPH-RP|MCNAA|VACVASE biphenyl hydrolase like protein-coding 142.667-162 chr4 91475492 91475774 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1MA4|LINE|L1 801669 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 142.667-131 chr22 34707284 34707630 + 0.666667 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL 290459 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 159-45 chr16 81089419 81089731 + 0.666667 NA intron (NM_004483, intron 2 of 4) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger 6800 NM_004483 2653 Hs.546256 NM_004483 ENSG00000140905 GCSH GCE|NKH glycine cleavage system protein H protein-coding 120.333-140 chr4 67073997 67074316 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL 347844 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 210 chr1 14298819 14299316 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 120906 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 125-97 chr6 56917578 56917799 + 0.666667 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) intron (NM_001144769, intron 2 of 96) 37142 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 200-166 chr8 61429733 61430227 + 0.666667 NA intron (NM_173519, intron 3 of 5) intron (NM_173519, intron 3 of 5) 142010 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 174.333-41 chr14 74741415 74741797 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -21710 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 243.666-16 chr16 86485483 86486170 + 0.666667 NA intron (NR_033925, intron 1 of 3) LTR81A|LTR|Gypsy 23034 NR_036444 400550 Hs.448825 NR_033925 ENSG00000268388 FENDRR FOXF1-AS1|FOXF1AS1|TCONS_00024240|lincFOXF1|onco-lncRNA-21 FOXF1 adjacent non-coding developmental regulatory RNA ncRNA 214-45 chr16 54342269 54342852 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27898 NR_134924 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 121.667-213 chr8 135595109 135595322 + 0.666667 NA intron (NM_006558, intron 6 of 8) L1ME3A|LINE|L1 137759 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 191.333-22 chr10 28732720 28733171 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -10705 NR_120652 101929218 Hs.224866 NR_120652 LINC01517 - long intergenic non-protein coding RNA 1517 ncRNA 121.667-53 chr14 22768245 22768537 + 0.666667 NA intron (NM_005015, intron 3 of 9) intron (NM_005015, intron 3 of 9) 1703 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 143.333-116 chr17 67622968 67623391 + 0.666667 NA intron (NM_181671, intron 5 of 9) intron (NM_181671, intron 5 of 9) -94654 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 309.667-15 chr3 97038929 97039637 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) L2c|LINE|L2 224689 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 132.333-53 chr14 74292585 74292919 + 0.666667 NA exon (NM_020325, exon 9 of 18) exon (NM_020325, exon 9 of 18) 10182 NM_001353591 5826 Hs.94395 NM_005050 ENSG00000119688 ABCD4 ABC41|EST352188|MAHCJ|P70R|P79R|PMP69|PXMP1L ATP binding cassette subfamily D member 4 protein-coding 169.667-185 chr6 95652197 95652533 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74830 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 118.667-158 chr5 55875215 55875524 + 0.666667 NA intron (NM_001297572, intron 4 of 10) L1MB7|LINE|L1 22047 NM_001242639 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 163.333-245 chr6 77144817 77145269 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 318979 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 157.667-342 chr8 131596967 131597430 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -306895 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 162-112 chr7 75771362 75771755 + 0.666667 NA intron (NM_006072, intron 3 of 3) AluSq2|SINE|Alu 18188 NM_006072 10344 Hs.131342 NM_006072 ENSG00000006606 CCL26 IMAC|MIP-4a|MIP-4alpha|SCYA26|TSC-1 C-C motif chemokine ligand 26 protein-coding 218.667-48 chr2 22785487 22786050 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 249289 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 113.333-166 chr3 8643916 8644103 + 0.666667 NA intron (NM_001256749, intron 1 of 11) intron (NM_001256749, intron 1 of 11) 789 NR_046358 51066 Hs.736935 NM_015931 ENSG00000125046 SSUH2 C3orf32|SSU-2|fls485 ssu-2 homolog protein-coding 138.333-137 chr4 83022321 83022725 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -9582 NM_001115007 132660 Hs.96952 NM_194282 ENSG00000189308 LIN54 CXCDC1|JC8.6|MIP120|TCX1 lin-54 DREAM MuvB core complex component protein-coding 142.667-25 chr10 94630497 94630789 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -53086 NM_001128925 1562 Hs.511872 NM_000772 ENSG00000108242 CYP2C18 CPCI|CYP2C|CYP2C17|P450-6B/29C|P450IIC17 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 18 protein-coding 148.667-172 chr2 13096033 13096369 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -89188 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 164-115 chr8 71424296 71424632 + 0.666667 NA intron (NM_001370336, intron 2 of 17) intron (NM_001370336, intron 2 of 17) -62395 NM_000503 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 118-132 chr8 82050470 82050818 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208358 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 195.667-43 chr14 58707161 58707584 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 68535 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 119-9 chr1 193672089 193672421 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 367510 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 156-80 chr20 33934305 33934687 + 0.666667 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -59415 NM_016732 22913 Hs.136947 NM_007367 ENSG00000125970 RALY HNRPCL2|P542 RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein-coding 122-21 chr11 109584935 109585251 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 162903 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 155.333-378 chr8 37365945 37366242 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 127820 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 156.667-144 chr17 79630337 79630724 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19479 NM_001350451 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 149.667-360 chr6 137815862 137816169 + 0.666667 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? -51244 NM_006290 7128 Hs.211600 NM_006290 ENSG00000118503 TNFAIP3 A20|AISBL|OTUD7C|TNFA1P2 TNF alpha induced protein 3 protein-coding 212-50 chr14 31277208 31277825 + 0.666667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -69723 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 117.333-179 chr6 54956356 54956691 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109752 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 136.333-40 chr12 14647767 14648161 + 0.666667 NA intron (NM_004963, intron 15 of 26) AluSx3|SINE|Alu 48635 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 112.333-228 chr6 54319356 54319577 + 0.666667 NA intron (NM_014464, intron 1 of 10) intron (NM_014464, intron 1 of 10) 11025 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 133-58 chr3 2164673 2164963 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) HAL1ME|LINE|L1 -20577 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 199.667-130 chr7 80882668 80883136 + 0.666667 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) intron (NM_006379, intron 2 of 17) 36149 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 137.667-73 chr17 34486103 34486371 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 93132 NR_160787 400591 Hs.514090 NM_207454 C17orf102 - chromosome 17 open reading frame 102 ncRNA 144.667-288 chr7 111315495 111315777 + 0.666667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 224509 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 143.667-269 chr9 105474922 105475313 + 0.666667 NA intron (NM_001287191, intron 4 of 13) intron (NM_001287191, intron 4 of 13) 27083 NM_001330739 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 284.333-17 chr15 39070036 39070641 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -180331 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 120-104 chr5 44092987 44093221 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -295628 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 127-96 chr8 108459869 108460247 + 0.666667 NA intron (NM_001329494, intron 5 of 7) intron (NM_001329494, intron 5 of 7) 16434 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 236.333-73 chr4 139629862 139630493 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35591 NM_001204367 4258 Hs.81874 NM_002413 ENSG00000085871 MGST2 GST2|MGST-II microsomal glutathione S-transferase 2 protein-coding 155.667-212 chr3 6042939 6043258 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 762351 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 163.333-229 chr5 121423268 121423702 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 100935 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 126.667-107 chr3 88528731 88529070 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 190444 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 119-49 chr14 73079115 73079461 + 0.666667 NA intron (NM_021239, intron 4 of 18) AluSx1|SINE|Alu 20754 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 183.333-22 chr11 58650060 58650540 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 27635 NM_000614 1270 Hs.524920 NM_000614 ENSG00000242689 CNTF HCNTF ciliary neurotrophic factor protein-coding 123.667-78 chr19 16793812 16794087 + 0.666667 NA intron (NM_001007525, intron 14 of 18) AluJo|SINE|Alu -35449 NM_015260 23309 Hs.13999 NM_015260 ENSG00000127511 SIN3B - SIN3 transcription regulator family member B protein-coding 163-9 chr10 89826574 89826944 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2734 NR_038382 643529 Hs.618956 NR_038382 ENSG00000232229 LINC00865 - long intergenic non-protein coding RNA 865 ncRNA 152-136 chr6 137190694 137191088 + 0.666667 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 -17247 NM_181309 116379 Hs.126891 NM_052962 ENSG00000164485 IL22RA2 CRF2-10|CRF2-S1|CRF2X|IL-22BP|IL-22R-alpha-2|IL-22RA2|ZCYTOR16 interleukin 22 receptor subunit alpha 2 protein-coding 162-125 chr8 118713465 118713905 + 0.666667 NA intron (NR_038210, intron 3 of 4) intron (NR_038210, intron 3 of 4) -91722 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 183.333-68 chr17 69975261 69975606 + 0.666667 NA intron (NR_110875, intron 2 of 4) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 13726 NR_110875 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 181.667-2 chr1 61818231 61818719 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 14 of 43) intron (NM_001350145, intron 14 of 43) -27600 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 186-33 chr14 50345340 50345822 + 0.666667 NA intron (NM_001282236, intron 3 of 8) intron (NM_001282236, intron 3 of 8) 33257 NM_001003803 27109 Hs.438489 NM_015684 ENSG00000125375 DMAC2L ATP5S|ATPW|FB|HSU79253 distal membrane arm assembly complex 2 like protein-coding 206.333-111 chr3 71449151 71449607 + 0.666667 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) intron (NR_146142, intron 3 of 19) 92710 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 149-88 chr22 38979850 38980202 + 0.666667 NA intron (NM_001193289, intron 4 of 4) AluSp|SINE|Alu -2321 NM_004900 9582 Hs.226307 NM_004900 ENSG00000179750 APOBEC3B A3B|APOBEC1L|ARCD3|ARP4|DJ742C19.2|PHRBNL|bK150C2.2 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B protein-coding 173-44 chr2 26346188 26346592 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001321975) promoter-TSS (NM_001321975) 247 NR_137633 85465 Hs.189073 NM_033505 ENSG00000138018 SELENOI EPT1|SELI|SEPI selenoprotein I protein-coding 239-18 chr13 64024191 64024859 + 0.666667 NA intron (NR_145420, intron 2 of 5) intron (NR_145420, intron 2 of 5) 51486 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 207.667-51 chr2 39272140 39272627 + 0.666667 NA exon (NM_001270425, exon 25 of 33) exon (NM_001270425, exon 25 of 33) -28400 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 162.667-45 chr11 28143700 28144080 + 0.666667 NA intron (NM_001113528, intron 3 of 6) L2c|LINE|L2 35502 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 129.667-179 chr8 127567793 127568056 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85785 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 146-8 chr10 43572023 43572360 + 0.666667 NA intron (NM_001324353, intron 2 of 4) intron (NM_001324353, intron 2 of 4) 2425 NM_001324350 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 112-42 chr12 18337089 18337286 + 0.666667 NA intron (NM_001288774, intron 8 of 32) intron (NM_001288774, intron 8 of 32) 75647 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 127-20 chr10 69963170 69963513 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -89505 NM_018649 55506 Hs.499953 NM_018649 ENSG00000099284 H2AFY2 macroH2A2 H2A histone family member Y2 protein-coding 128.667-70 chr16 51534120 51534433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -228243 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 146-51 chr18 68852030 68852328 + 0.666667 NA intron (NM_001093729, intron 6 of 9) intron (NM_001093729, intron 6 of 9) 54099 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 122.333-125 chr20 54378386 54378751 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -97025 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 139.667-34 chr12 15783831 15784173 + 0.666667 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) L1MC3|LINE|L1 5386 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 126.333-117 chr3 62046258 62046607 + 0.666667 NA intron (NM_002841, intron 4 of 29) intron (NM_002841, intron 4 of 29) 272515 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 132-19 chr10 66480470 66480760 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) AluSc8|SINE|Alu -445421 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 148-69 chr2 14237615 14237916 + 0.666667 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) intron (NR_103814, intron 2 of 3) 163193 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 185.667-105 chr5 133343296 133343772 + 0.666667 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) intron (NM_015082, intron 4 of 15) 84172 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 144.333-126 chr2 72867190 72867471 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -20078 NM_003124 6697 Hs.301540 NM_003124 ENSG00000116096 SPR SDR38C1 sepiapterin reductase protein-coding 144.333-160 chr3 2786629 2787010 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 6 of 24) intron (NM_175607, intron 6 of 24) -105396 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 146.333-81 chr13 105473663 105474056 + 0.666667 NA intron (NM_172370, intron 3 of 4) intron (NM_172370, intron 3 of 4) 7643 NM_001161812 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 114.333-138 chr21 44571148 44571412 + 0.666667 NA intron (NM_144991, intron 1 of 11) AluJr|SINE|Alu -2449 NM_198687 386672 Hs.567901 NM_198687 ENSG00000215454 KRTAP10-4 KAP10.4|KAP18-4|KRTAP10.4|KRTAP18-4|KRTAP18.4 keratin associated protein 10-4 protein-coding 155.667-347 chr8 64335220 64335559 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 33169 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 113.333-73 chr14 51269818 51270110 + 0.666667 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 29717 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 117.333-103 chr2 104302018 104302279 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 106184 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 137-55 chr20 23100565 23100825 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14371 NM_012072 22918 Hs.97199 NM_012072 ENSG00000125810 CD93 C1QR1|C1qR(P)|C1qRP|CDw93|ECSM3|MXRA4|dJ737E23.1 CD93 molecule protein-coding 167-40 chr15 27520876 27521307 + 0.666667 NA intron (NM_033223, intron 7 of 9) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -359772 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-268 chr5 77228431 77228754 + 0.666667 NA intron (NM_001029853, intron 1 of 20) L2c|LINE|L2 17912 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 212.333-58 chr18 71279055 71279543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 299657 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 127-28 chr13 90766748 90766964 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 159741 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 192-156 chrUn_KI270438v1 106274 106755 + 0.666667 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 155.333-131 chr16 83502454 83502806 + 0.666667 NA intron (NM_001220489, intron 6 of 12) intron (NM_001220489, intron 6 of 12) -5716 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 112.333-112 chr2 17158062 17158350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 360234 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 221.667-20 chr12 22325342 22325887 + 0.666667 NA intron (NM_003034, intron 1 of 4) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 9100 NM_001304450 6489 Hs.408614 NM_003034 ENSG00000111728 ST8SIA1 GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 protein-coding 126.667-102 chr3 1928699 1928925 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -169991 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 117-86 chr2 230760855 230761056 + 0.666667 NA intron (NM_001130850, intron 2 of 8) intron (NM_001130850, intron 2 of 8) 47407 NM_001130850 51719 Hs.603930 NM_016289 ENSG00000135932 CAB39 CGI-66|MO25 calcium binding protein 39 protein-coding 168-53 chr2 79195113 79195538 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35572 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 176.333-75 chr2 24280856 24281205 + 0.666667 NA intron (NM_001348182, intron 16 of 38) AluSq|SINE|Alu 79506 NM_019595 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 153.333-305 chr4 86039776 86040067 + 0.666667 NA intron (NM_001363657, intron 11 of 13) L1M1|LINE|L1 -79885 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 152.333-94 chr13 64067549 64067924 + 0.666667 NA intron (NR_145420, intron 1 of 5) intron (NR_145420, intron 1 of 5) 8275 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 115.667-84 chr15 75978935 75979136 + 0.666667 NA intron (NM_138573, intron 3 of 5) L1MA4|LINE|L1 33389 NM_138573 145957 Hs.732438 NM_138573 ENSG00000169752 NRG4 HRG4 neuregulin 4 protein-coding 117.333-201 chr8 5741657 5741870 + 0.666667 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 664785 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 218.333-87 chr3 115856473 115856839 + 0.666667 NA intron (NM_001318915, intron 3 of 8) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 48470 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 123.333-7 chr1 67757377 67757602 + 0.666667 NA intron (NM_018841, intron 2 of 3) intron (NM_018841, intron 2 of 3) 72288 NM_001199741 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 120.333-108 chr2 183018100 183018280 + 0.666667 NA intron (NM_013436, intron 2 of 30) AluSx1|SINE|Alu 20267 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 172.333-132 chr5 4502659 4503030 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -270637 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 116.667-216 chr9 76328670 76328917 + 0.666667 NA intron (NM_001190482, intron 32 of 36) L1MC4|LINE|L1 65633 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 142.667-104 chr2 138703809 138704182 + 0.666667 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 76395 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 126.333-73 chr18 28553411 28553617 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -376384 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 157-10 chr1 187568682 187569095 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 125260 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 114.667-134 chr2 113931299 113931607 + 0.666667 NA intron (NM_005721, intron 5 of 11) intron (NM_005721, intron 5 of 11) -37869 NR_148507 440900 Hs.662205 NR_034128 ENSG00000234199 LINC01191 VIN|lnc-ACTR3 long intergenic non-protein coding RNA 1191 ncRNA 159.667-122 chr16 24902566 24902913 + 0.666667 NA intron (NR_147939, intron 13 of 18) AluSp|SINE|Alu 56508 NM_052944 115584 Hs.164118 NM_052944 ENSG00000158865 SLC5A11 KST1|RKST1|SGLT6|SMIT2 solute carrier family 5 member 11 protein-coding 111.667-35 chr10 73755301 73755568 + 0.666667 NA intron (NM_198597, intron 3 of 22) AluY|SINE|Alu 11062 NM_198597 9632 Hs.81964 NM_004922 ENSG00000176986 SEC24C - SEC24 homolog C, COPII coat complex component protein-coding 199.333-42 chr11 103917696 103918136 + 0.666667 NA intron (NM_025208, intron 6 of 6) intron (NM_025208, intron 6 of 6) 68010 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 161.333-261 chr7 51618950 51619281 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -225859 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 151.667-66 chr11 79523227 79523574 + 0.666667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -82370 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 177.333-139 chr6 50356200 50356547 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -306444 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 219-23 chr14 61546528 61546938 + 0.666667 NA intron (NM_006255, intron 12 of 13) intron (NM_006255, intron 12 of 13) 23461 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 116.333-88 chr17 58097548 58097756 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 14233 NM_080677 140735 Hs.720595 NM_080677 ENSG00000264364 DYNLL2 DNCL1B|Dlc2|RSPH22 dynein light chain LC8-type 2 protein-coding 184.333-133 chr6 131121465 131121741 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13864 NM_016377 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 211.667-108 chr8 61168197 61168656 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -119544 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 118.667-24 chr10 52334244 52334500 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 20091 NM_012242 22943 Hs.40499 NM_012242 ENSG00000107984 DKK1 DKK-1|SK dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 1 protein-coding 162-63 chr2 56000674 56001035 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_030623) promoter-TSS (NR_030623) -59 NR_030623 100126319 NR_030623 ENSG00000211520 MIR216B MIRN216B|mir-216b microRNA 216b ncRNA 174-52 chr2 56814038 56814542 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -628520 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 118.667-6 chr1 94913436 94913731 + 0.666667 NA intron (NM_001839, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 12225 NM_001286056 1266 Hs.483454 NM_001839 ENSG00000117519 CNN3 - calponin 3 protein-coding 205.333-54 chr12 22494495 22494960 + 0.666667 NA intron (NM_001286176, intron 10 of 26) intron (NM_001286176, intron 10 of 26) 49470 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 125.667-148 chr5 44832359 44832723 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 23594 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 233-34 chr18 75239810 75240216 + 0.666667 NA intron (NM_001308210, intron 1 of 1) intron (NM_001308210, intron 1 of 1) 28484 NM_001308210 10194 Hs.284217 NM_005786 ENSG00000179981 TSHZ1 CAA|NY-CO-33|SDCCAG33|TSH1 teashirt zinc finger homeobox 1 protein-coding 231-61 chr8 66340752 66341126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88038 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 142.667-224 chr8 110586365 110586659 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 440921 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 160.667-220 chr4 32518873 32519319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 168058 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 139-58 chr20 32735284 32735647 + 0.666667 NA intron (NM_053041, intron 1 of 8) AluSz|SINE|Alu 8543 NM_053041 149951 Hs.408427 NM_053041 ENSG00000149600 COMMD7 C20orf92|dJ1085F17.3 COMM domain containing 7 protein-coding 197-88 chr5 22293581 22294025 + 0.666667 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) L1MA8|LINE|L1 -79953 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 154.667-278 chr4 93512334 93512672 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 11 of 14) intron (NM_001286838, intron 11 of 14) -316250 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 114.667-156 chr20 53627448 53627641 + 0.666667 NA intron (NR_134576, intron 2 of 2) AluY|SINE|Alu 19190 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 151-30 chr13 19752465 19752770 + 0.666667 NA intron (NM_001042414, intron 4 of 9) AluSx3|SINE|Alu 30328 NR_156729 55269 Hs.213198 NM_001042414 ENSG00000121390 PSPC1 PSP1 paraspeckle component 1 protein-coding 144.667-233 chr5 28931134 28931428 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4411 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 116-8 chr1 109175406 109175659 + 0.666667 NA intron (NM_001284352, intron 6 of 20) intron (NM_001284352, intron 6 of 20) -11017 NM_001284353 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 130.667-131 chr20 44794168 44794514 + 0.666667 NA intron (NM_001205317, intron 1 of 5) intron (NM_001205317, intron 1 of 5) 16205 NM_182970 140730 Hs.517065 NM_182970 ENSG00000101098 RIMS4 C20orf190|RIM 4|RIM-4|RIM4|RIM4-gamma|RIM4gamma regulating synaptic membrane exocytosis 4 protein-coding 181-63 chr6 14769314 14769611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -476607 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 113.667-3 chr1 22445950 22446251 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -5751 NM_001083621 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 158.667-31 chr1 236774248 236774562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20876 NM_000254 4548 Hs.498187 NM_000254 ENSG00000116984 MTR HMAG|MS|cblG 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase protein-coding 235-30 chr2 30619328 30619918 + 0.666667 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) intron (NM_182551, intron 6 of 6) 172377 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 111.667-146 chr2 203541674 203541959 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -6515 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 121-111 chr5 3022251 3022513 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 104528 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 119-2 chr1 55747318 55747530 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 197539 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 153-5 chr1 119455916 119456274 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40945 NM_000198 3284 Hs.654399 NM_000198 ENSG00000203859 HSD3B2 HSD3B|HSDB|SDR11E2 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2 protein-coding 129-77 chr21 26605265 26605591 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -32142 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 134.667-5 chr1 75884423 75884679 + 0.666667 NA intron (NM_002440, intron 15 of 19) MER20|DNA|hAT-Charlie 47853 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 186-4 chr1 77105378 77105769 + 0.666667 NA intron (NM_005482, intron 10 of 10) L1MEc|LINE|L1 45430 NR_106978 102466995 NR_106978 ENSG00000276081 MIR7156 hsa-mir-7156 microRNA 7156 ncRNA 147.333-318 chr8 91106675 91107092 + 0.666667 NA intron (NM_001354470, intron 1 of 3) AluJr|SINE|Alu 4264 NM_001354470 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 151.667-210 chr3 33400056 33400364 + 0.666667 NA exon (NM_001128161, exon 12 of 17) exon (NM_001128161, exon 12 of 17) 40168 NM_001128160 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 122.333-152 chr4 27847235 27847546 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 629911 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 125.667-59 chr14 53060892 53061251 + 0.666667 NA intron (NM_030637, intron 8 of 11) intron (NM_030637, intron 8 of 11) 92252 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 112.667-69 chr14 68773388 68773646 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20397 NM_001244698 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 114.333-126 chr2 236312890 236313188 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -48694 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 120.667-52 chr14 61690267 61690486 + 0.666667 NA intron (NR_047116, intron 1 of 1) L1MC2|LINE|L1 -5137 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 156.667-319 chr7 40576494 40576817 + 0.666667 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 403284 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 179-39 chr17 52921239 52921617 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 59307 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 145-90 chr5 45177314 45177649 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 368534 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 112.667-41 chr11 98616440 98616766 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -404346 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 124.667-49 chr12 60028872 60029137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 339634 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 157.667-167 chr20 16660977 16661353 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -68861 NM_198220 6629 Hs.280378 NM_003092 ENSG00000125870 SNRPB2 Msl1|U2B'' small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B2 protein-coding 118.333-218 chr9 125956784 125957034 + 0.666667 NA intron (NR_024122, intron 4 of 7) intron (NR_024122, intron 4 of 7) 208726 NM_001134778 5090 Hs.428027 NM_006195 ENSG00000167081 PBX3 - PBX homeobox 3 protein-coding 204-164 chr5 96901931 96902380 + 0.666667 NA intron (NM_001329229, intron 10 of 17) intron (NM_001329229, intron 10 of 17) 26216 NM_001130140 64167 Hs.482910 NM_022350 ENSG00000164308 ERAP2 L-RAP|LRAP endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 protein-coding 158-50 chr15 62449283 62449653 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106439 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 147.667-188 chr2 133256477 133256901 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) intron (NM_207481, intron 4 of 17) -9506 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 211.333-54 chr13 79111955 79112391 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -272123 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 151-86 chr3 116642130 116642551 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -67448 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 176-33 chr14 67906554 67906934 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1PREC2|LINE|L1 83152 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 228.667-41 chr2 99232258 99232683 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 22637 NM_175735 254773 Hs.436468 NM_175735 ENSG00000185674 LYG2 LYGH|LYSG2 lysozyme g2 protein-coding 112-210 chr8 132503277 132503523 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22305 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 163.667-265 chr9 123732055 123732476 + 0.666667 NA intron (NM_001352968, intron 4 of 18) L1ME1|LINE|L1 197861 NM_001352967 57706 Hs.744995 NM_020946 ENSG00000119522 DENND1A FAM31A|KIAA1608 DENN domain containing 1A protein-coding 134-17 chr10 70970553 70970909 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 31678 NR_134313 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 115.667-97 chr17 20948310 20948522 + 0.666667 NA intron (NR_160712, intron 1 of 3) intron (NR_160712, intron 1 of 3) 9850 NR_160717 339260 Hs.661076 NR_123730 ENSG00000233098 LOC339260 - uncharacterized LOC339260 ncRNA 134.667-80 chr17 28540969 28541295 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 11492 NM_001330166 9094 Hs.410455 NM_005148 ENSG00000109103 UNC119 HRG4|IMD13|POC7|POC7A unc-119 lipid binding chaperone protein-coding 144.667-95 chr15 60298184 60298605 + 0.666667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 99592 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 200-147 chr6 153018187 153018634 + 0.666667 NA intron (NM_012419, intron 4 of 4) MIRc|SINE|MIR -15595 NM_001301872 54516 Hs.225836 NM_019041 ENSG00000112031 MTRF1L HMRF1L|MRF1L|mtRF1a mitochondrial translational release factor 1 like protein-coding 126.333-34 chr12 13003936 13004271 + 0.666667 NA non-coding (NR_002774, exon 1 of 1) non-coding (NR_002774, exon 1 of 1) 3661 NR_002774 93164 Hs.593282 NR_002774 ENSG00000183935 HTR7P1 HTR7P 5-hydroxytryptamine receptor 7 pseudogene 1 pseudo 206-172 chr7 79774741 79775175 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 320998 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 151.333-182 chr18 21455659 21456044 + 0.666667 NA intron (NM_001142966, intron 15 of 32) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 144853 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 141-88 chr8 53501217 53501537 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22588 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 161-74 chr4 158147667 158147994 + 0.666667 NA intron (NM_016613, intron 3 of 4) L1MC5|LINE|L1 -22922 NR_147408 285505 NR_147407 ENSG00000248429 FAM198B-AS1 - FAM198B antisense RNA 1 ncRNA 155.667-49 chr10 125951387 125951689 + 0.666667 NA intron (NM_001363549, intron 1 of 10) intron (NM_001363549, intron 1 of 10) 21735 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 133.667-137 chr6 169327135 169327496 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73201 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 149.333-153 chr18 3640668 3641040 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 7 of 11) MIR|SINE|MIR 37117 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 221.333-89 chr3 46353127 46353688 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001123396) promoter-TSS (NM_001123396) -337 NM_001123041 729230 Hs.511794 NM_001123041 ENSG00000121807 CCR2 CC-CKR-2|CCR-2|CCR2A|CCR2B|CD192|CKR2|CKR2A|CKR2B|CMKBR2|MCP-1-R C-C motif chemokine receptor 2 protein-coding 230.667-54 chr3 38489272 38489813 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001106, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001106, exon 11 of 11) -6730 NR_153323 9941 Hs.517897 NM_005107 ENSG00000157036 EXOG ENDOGL1|ENDOGL2|ENGL|ENGL-a|ENGL-b|ENGLA|ENGLB exo/endonuclease G protein-coding 161.667-22 chr1 218556664 218557111 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) intron (NR_031644, intron 2 of 6) 46792 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 218.333-99 chr5 113966526 113967030 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -395292 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 132.333-11 chr1 207485392 207485619 + 0.666667 NA exon (NM_001877, exon 18 of 19) exon (NM_001877, exon 18 of 19) -10623 NM_000651 1378 Hs.334019 NM_000573 ENSG00000203710 CR1 C3BR|C4BR|CD35|KN complement C3b/C4b receptor 1 (Knops blood group) protein-coding 135-25 chr13 56017970 56018268 + 0.666667 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 843665 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 221.333-85 chr21 44092971 44093529 + 0.666667 NA intron (NM_001351709, intron 12 of 15) AluJb|SINE|Alu -14149 NM_001368238 102724159 Hs.449076 NM_001368238 ENSG00000275464 LOC102724159 - periodic tryptophan protein 2 homolog protein-coding 215-71 chr6 50119415 50119893 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69725 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 124.667-79 chr16 70325818 70326133 + 0.666667 NA intron (NM_007242, intron 7 of 11) L1MC4|LINE|L1 20772 NR_039997 100506083 Hs.635008 NR_039997 ENSG00000261777 LOC100506083 - uncharacterized LOC100506083 ncRNA 113-88 chr18 6512609 6512881 + 0.666667 NA intron (NR_120518, intron 1 of 5) intron (NR_120518, intron 1 of 5) 1329 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 117.333-31 chr11 6236106 6236297 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1565 NM_032127 84067 Hs.501793 NM_032127 ENSG00000051009 FAM160A2 C11orf56|FHIP family with sequence similarity 160 member A2 protein-coding 129.667-27 chr10 75534055 75534340 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) -18261 NR_030337 693191 NR_030337 ENSG00000207583 MIR606 MIRN606|hsa-mir-606 microRNA 606 ncRNA 169-74 chr4 56233145 56233501 + 0.666667 NA intron (NM_020722, intron 2 of 10) FLAM_C|SINE|Alu 63128 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 233.333-138 chrX 51585080 51585575 + 0.666667 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 33591 NM_001355276 347549 NM_001355276 ENSG00000224109 CENPVL3 CENPVP3 centromere protein V like 3 protein-coding 212-56 chr14 95609926 95610496 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 36649 NR_146449 100506999 Hs.112858 NR_146449 ENSG00000258390 LINC02318 - long intergenic non-protein coding RNA 2318 ncRNA 128-70 chr3 37589462 37589831 + 0.666667 NA intron (NM_002207, intron 15 of 27) L2a|LINE|L2 137505 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 213.333-113 chr20 55867345 55867719 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 137987 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 144.667-319 chr9 19687736 19688007 + 0.666667 NA intron (NM_020344, intron 1 of 9) intron (NM_020344, intron 1 of 9) 99148 NM_020344 25769 Hs.283014 NM_020344 ENSG00000155886 SLC24A2 NCKX2 solute carrier family 24 member 2 protein-coding 157-83 chr3 11589124 11589444 + 0.666667 NA intron (NM_001128219, intron 2 of 4) intron (NM_001128219, intron 2 of 4) -6928 NM_001128220 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 124-92 chr5 52342894 52343253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 335042 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 189-73 chr5 36059005 36059546 + 0.666667 NA intron (NM_001168316, intron 1 of 5) HERVK14-int|LTR|ERVK 7607 NM_001168316 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 132-66 chr2 201020545 201020776 + 0.666667 NA intron (NM_001321619, intron 4 of 11) L2|LINE|L2 51011 NM_001321618 285172 Hs.24701 NM_173822 ENSG00000155744 FAM126B HYCC2 family with sequence similarity 126 member B protein-coding 229-25 chr16 60444613 60445262 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85144 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 131.333-56 chr14 104940762 104941128 + 0.666667 NA exon (NM_138420, exon 7 of 7) exon (NM_138420, exon 7 of 7) 16066 NM_138790 122618 Hs.407101 NM_138790 ENSG00000166428 PLD4 C14orf175 phospholipase D family member 4 protein-coding 190-21 chr11 106703716 106704251 + 0.666667 NA intron (NM_001256424, intron 8 of 8) intron (NM_001256424, intron 8 of 8) 314493 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 123.667-158 chr5 63347105 63347376 + 0.666667 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 615052 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 181-8 chr10 126879622 126879981 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25608 NM_001380 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 197.667-44 chr14 80165199 80165732 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45954 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 123-12 chr1 216241731 216241996 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 13 of 71) intron (NM_206933, intron 13 of 71) 169398 NR_125992 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 154-48 chr14 22356109 22356495 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 76451 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 156.667-258 chr5 11589587 11589949 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001364128) promoter-TSS (NM_001364128) -702 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 196.333-115 chr3 122889366 122889825 + 0.666667 NA non-coding (NR_024618, exon 1 of 1) non-coding (NR_024618, exon 1 of 1) 3082 NR_024618 100129550 Hs.61558 NR_024618 ENSG00000273033 LINC02035 - long intergenic non-protein coding RNA 2035 ncRNA 160.333-167 chr20 42542414 42542747 + 0.666667 NA intron (NM_133170, intron 7 of 31) L1ME4b|LINE|L1 -142903 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 172.333-2 chr1 23054813 23055249 + 0.666667 NA intron (NM_015013, intron 4 of 18) intron (NM_015013, intron 4 of 18) 10726 NR_036057 100422866 NR_036057 ENSG00000263793 MIR3115 mir-3115 microRNA 3115 ncRNA 124-33 chr13 48309197 48309527 + 0.666667 NA intron (NM_000321, intron 2 of 26) intron (NM_000321, intron 2 of 26) 5615 NM_000321 5925 Hs.408528 NM_000321 ENSG00000139687 RB1 OSRC|PPP1R130|RB|p105-Rb|pRb|pp110 RB transcriptional corepressor 1 protein-coding 269.333-20 chr14 51029282 51030082 + 0.666667 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 66022 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 169-90 chr6 112727776 112728186 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 380651 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 119.667-157 chr5 108739398 108739594 + 0.666667 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger -8401 NM_005246 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 162.667-131 chr2 79265467 79265937 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105949 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 133-79 chr5 113937103 113937456 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 423585 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 115.333-196 chr7 3393812 3394128 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1M1|LINE|L1 92718 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 130.333-119 chr21 29971782 29972068 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -31873 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 181.333-168 chr8 29044527 29044923 + 0.666667 NA intron (NM_001324384, intron 6 of 10) L1ME3G|LINE|L1 153411 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 155-79 chr20 59729436 59729750 + 0.666667 NA intron (NM_183246, intron 1 of 11) intron (NM_183246, intron 1 of 11) 8383 NM_183246 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 153.333-133 chr15 37601117 37601422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -333338 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 216-105 chr6 35200886 35201423 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -12802 NM_152753 222663 Hs.12923 NM_152753 ENSG00000146197 SCUBE3 CEGF3 signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3 protein-coding 123.667-5 chr1 62764597 62764851 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -19382 NM_178221 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 169.667-124 chr22 17671681 17672029 + 0.666667 NA intron (NR_073068, intron 2 of 4) AluSx|SINE|Alu 16193 NR_073069 23786 Hs.631672 NM_015367 ENSG00000099968 BCL2L13 BCL-RAMBO|Bcl2-L-13|MIL1 BCL2 like 13 protein-coding 155.667-205 chr21 35394670 35394972 + 0.666667 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 185943 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 164.667-190 chr5 79280343 79280774 + 0.666667 NA intron (NM_152405, intron 2 of 10) intron (NM_152405, intron 2 of 10) 44427 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 188.667-158 chrX 91356178 91356543 + 0.666667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -78479 NM_080832 140886 Hs.246590 NM_080832 ENSG00000174740 PABPC5 PABP5 poly(A) binding protein cytoplasmic 5 protein-coding 116-40 chr14 60213777 60214056 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -31834 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 213.667-4 chr1 173936143 173936728 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_172071, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_172071, exon 19 of 19) -19057 NM_000488 462 Hs.75599 NM_000488 ENSG00000117601 SERPINC1 AT3|AT3D|ATIII|ATIII-R2|ATIII-T1|ATIII-T2|THPH7 serpin family C member 1 protein-coding 154-82 chr2 186748905 186749221 + 0.666667 NA intron (NM_177454, intron 4 of 7) intron (NM_177454, intron 4 of 7) 55003 NM_177454 165215 Hs.28872 NM_177454 ENSG00000144369 FAM171B KIAA1946 family with sequence similarity 171 member B protein-coding 117.333-117 chr2 238058790 238059046 + 0.666667 NA intron (NR_037904, intron 8 of 18) intron (NR_037904, intron 8 of 18) -2083 NM_016510 51540 Hs.731909 NM_016510 ENSG00000132330 SCLY SCL|hSCL selenocysteine lyase protein-coding 138.333-27 chr10 57469012 57469382 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -164638 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 136.333-126 chr3 47722027 47722277 + 0.666667 NA intron (NM_003074, intron 6 of 27) intron (NM_003074, intron 6 of 27) 59741 NM_003074 6599 Hs.476179 NM_003074 ENSG00000173473 SMARCC1 BAF155|CRACC1|Rsc8|SRG3|SWI3 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 1 protein-coding 156.667-51 chr10 108502760 108503225 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -433699 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 255-3 chr1 54774710 54775116 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -10390 NM_152268 25973 Hs.380169 NM_152268 ENSG00000162396 PARS2 EIEE75|MT-PRORS|proRS prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 124.333-33 chr11 123821269 123821556 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -15063 NM_001005325 390261 Hs.557924 NM_001005325 ENSG00000196099 OR6M1 OR11-271 olfactory receptor family 6 subfamily M member 1 protein-coding 112-26 chr11 28257400 28257587 + 0.666667 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) L1MA2|LINE|L1 149105 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 129.667-25 chr10 50650298 50650677 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25536 NR_126411 104355295 Hs.450493 NR_126411 SGMS1-AS1 - SGMS1 antisense RNA 1 ncRNA 162-121 chr8 109108719 109109047 + 0.666667 NA intron (NM_003301, intron 2 of 2) intron (NM_003301, intron 2 of 2) 22255 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 116.667-109 chr20 48084205 48084386 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -94178 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 295.333-12 chr14 54665713 54666464 + 0.666667 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) -88745 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 147.333-312 chr8 32673320 32673696 + 0.666667 NA intron (NM_001322205, intron 1 of 8) intron (NM_001322205, intron 1 of 8) 26419 NM_001322206 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 111.667-231 chr7 2134213 2134402 + 0.666667 NA intron (NM_001013837, intron 11 of 18) L1MC2|LINE|L1 -45255 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 123-50 chr16 20243655 20243904 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83734 NM_001007240 2813 Hs.53985 NM_001502 ENSG00000169347 GP2 ZAP75 glycoprotein 2 protein-coding 157-94 chr4 37072588 37072974 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71002 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 208.333-46 chr15 81565763 81566264 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -191800 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 133.333-186 chr8 109352161 109352406 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10178 NM_177531 93035 Hs.170128 NM_177531 ENSG00000205038 PKHD1L1 PKHDL1 PKHD1 like 1 protein-coding 171-7 chr1 200847005 200847294 + 0.666667 NA intron (NM_001297708, intron 8 of 16) intron (NM_001297708, intron 8 of 16) -25832 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 136.667-23 chr10 97783971 97784217 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -12095 NM_003015 6425 Hs.279565 NM_003015 ENSG00000120057 SFRP5 SARP3 secreted frizzled related protein 5 protein-coding 220-7 chr1 209375233 209375714 + 0.666667 NA intron (NR_146491, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 3418 NR_146491 101929476 Hs.568721 NR_146491 LINC01698 - long intergenic non-protein coding RNA 1698 ncRNA 200.333-35 chr13 48728026 48728454 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74311 NM_001308469 57105 Hs.253706 NM_020377 ENSG00000152207 CYSLTR2 CYSLT2|CYSLT2R|GPCR21|HG57|HPN321|KPG_011|PSEC0146|hGPCR21 cysteinyl leukotriene receptor 2 protein-coding 115.667-128 chr2 208438440 208438651 + 0.666667 NA intron (NM_005048, intron 4 of 12) intron (NM_005048, intron 4 of 12) 31715 NM_005048 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 143.667-61 chr12 114080677 114080955 + 0.666667 NA Intergenic MER68|LTR|ERVL -114491 NM_016196 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 175.667-143 chr8 73747979 73748404 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001164384) promoter-TSS (NM_001164384) -483 NM_001164384 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 145.667-196 chr4 96043711 96044052 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 203788 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 166-130 chrX 97533696 97534042 + 0.666667 NA intron (NR_125391, intron 1 of 2) intron (NR_125391, intron 1 of 2) 30666 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 190-122 chr8 103571100 103571649 + 0.666667 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) intron (NM_001348497, intron 1 of 22) -69464 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 142.333-179 chr4 63664888 63665204 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 744404 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 183.667-154 chr9 105244240 105244703 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001286730) promoter-TSS (NM_001286730) -134 NM_001330731 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 152-70 chr17 54828751 54829051 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71790 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 113.333-126 chr2 61678096 61678391 + 0.666667 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -139887 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 156-68 chr2 41578435 41578852 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -298912 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 120.333-202 chr9 89802398 89802614 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 162723 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 170.333-64 chr13 32196667 32196994 + 0.666667 NA intron (NM_023037, intron 29 of 60) intron (NM_023037, intron 29 of 60) 115124 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 170-8 chr10 8293830 8294192 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25706 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 215-74 chr6 80273371 80273944 + 0.666667 NA intron (NR_134945, intron 10 of 10) intron (NR_134945, intron 10 of 10) 166986 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 154-111 chr4 169101932 169102335 + 0.666667 NA intron (NM_020870, intron 11 of 11) intron (NM_020870, intron 11 of 11) -91878 NM_032783 84869 Hs.659311 NM_032783 ENSG00000145439 CBR4 SDR45C1 carbonyl reductase 4 protein-coding 112.667-42 chr11 102220431 102220716 + 0.666667 NA intron (NM_001130145, intron 6 of 8) L2|LINE|L2 -96911 NM_182962 330 Hs.127799 NM_001165 ENSG00000023445 BIRC3 AIP1|API2|CIAP2|HAIP1|HIAP1|IAP-1|MALT2|MIHC|RNF49|c-IAP2 baculoviral IAP repeat containing 3 protein-coding 138.667-199 chr8 52242805 52243075 + 0.666667 NA intron (NM_001352881, intron 2 of 2) intron (NM_001352881, intron 2 of 2) 5704 NR_148196 9705 Hs.655499 NM_014682 ENSG00000147488 ST18 NZF-3|NZF3|ZC2H2C3|ZC2HC10|ZNF387 ST18 C2H2C-type zinc finger transcription factor protein-coding 145.667-200 chr4 166170283 166170685 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 297247 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 115-39 chr12 28268940 28269131 + 0.666667 NA intron (NM_001352082, intron 4 of 13) intron (NM_001352082, intron 4 of 13) -78297 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 147.333-51 chr10 111070668 111070958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6216 NM_000681 150 Hs.249159 NM_000681 ENSG00000150594 ADRA2A ADRA2|ADRA2R|ADRAR|ALPHA2AAR|ZNF32 adrenoceptor alpha 2A protein-coding 203.333-88 chr15 69821999 69822417 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13026 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 115-69 chr16 10954502 10954708 + 0.666667 NA intron (NM_015226, intron 1 of 22) MIR|SINE|MIR 10041 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 230-77 chr9 20417720 20418231 + 0.666667 NA intron (NM_001286691, intron 4 of 10) intron (NM_001286691, intron 4 of 10) -6737 NR_039684 100616229 NR_039684 ENSG00000263790 MIR4473 - microRNA 4473 ncRNA 143-12 chr1 183329203 183329485 + 0.666667 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) intron (NM_015039, intron 1 of 10) -24470 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 115.667-217 chr8 124517530 124517860 + 0.666667 NA intron (NM_001317890, intron 2 of 9) intron (NM_001317890, intron 2 of 9) -9119 NR_106903 102466200 NR_106903 ENSG00000284087 MIR6844 hsa-mir-6844 microRNA 6844 ncRNA 181.667-58 chr18 64379551 64379979 + 0.666667 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) intron (NR_033881, intron 5 of 9) -119710 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 145-123 chr8 121687745 121688174 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46519 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 165-48 chr20 34596878 34597201 + 0.666667 NA intron (NM_080476, intron 7 of 11) L1ME2z|LINE|L1 38321 NM_032514 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 153.667-206 chr2 189560645 189560962 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014585, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_014585, exon 8 of 8) 20008 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 142.333-43 chr11 96194336 96194708 + 0.666667 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -146916 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 125-74 chr3 85600162 85600377 + 0.666667 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) MIR3|SINE|MIR 95210 NM_001256505 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 113.333-29 chr10 64797263 64797549 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -28122 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 143.667-21 chr10 34585008 34585293 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 230146 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 176-62 chr4 15838273 15838625 + 0.666667 NA intron (NR_132660, intron 4 of 6) intron (NR_132660, intron 4 of 6) 60121 NM_001775 952 Hs.479214 NM_001775 ENSG00000004468 CD38 ADPRC 1|ADPRC1 CD38 molecule protein-coding 140.333-230 chr8 79757467 79757817 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8833 NM_001282851 23462 Hs.234434 NM_012258 ENSG00000164683 HEY1 BHLHb31|CHF2|HERP2|HESR1|HRT-1|NERP2|OAF1|hHRT1 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1 protein-coding 138-131 chrX 57654837 57655209 + 0.666667 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 25237 NM_001319967 286430 Hs.306842 NM_001319967 ENSG00000215174 NLRP2B CLRX.1|NALP2P|NLRP2P|NOD24|POP4 NLR family pyrin domain containing 2B protein-coding 175.333-107 chr21 30731275 30731665 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12693 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 380.667 chr1 143263163 143263950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 159036 NR_027354 645166 Hs.744183 NR_027354 LSP1P5 - LSP1 pseudogene 5 pseudo 146.333-108 chr15 67559526 67559812 + 0.666667 NA intron (NM_001206804, intron 2 of 21) intron (NM_001206804, intron 2 of 21) 10575 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 140.667-108 chr2 15603046 15603323 + 0.666667 NA intron (NM_004939, intron 7 of 25) intron (NM_004939, intron 7 of 25) 11316 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 221.667 chr1 21899904 21900434 + 0.666667 NA intron (NM_005529, intron 1 of 96) intron (NM_005529, intron 1 of 96) 37141 NM_001291860 3339 Hs.562227 NM_005529 ENSG00000142798 HSPG2 HSPG|PLC|PRCAN|SJA|SJS|SJS1 heparan sulfate proteoglycan 2 protein-coding 191.667-29 chr11 106092423 106092862 + 0.666667 NA intron (NM_015423, intron 4 of 5) L2b|LINE|L2 -14904 NM_152433 143879 Hs.101949 NM_152433 ENSG00000182359 KBTBD3 BKLHD3 kelch repeat and BTB domain containing 3 protein-coding 148-19 chr10 77945420 77945717 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18756 NR_024585 100128292 Hs.547908 NR_024585 DLG5-AS1 - DLG5 antisense RNA 1 ncRNA 122-122 chr8 110001839 110002143 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -26220 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 121.333-148 chr5 106021268 106021525 + 0.666667 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger 921922 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 125.333-124 chr4 77640558 77640787 + 0.666667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 128919 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 160.333-11 chr1 57944180 57944501 + 0.666667 NA intron (NM_021080, intron 1 of 16) L2c|LINE|L2 83759 NR_104363 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 123.333-66 chr13 50708854 50709077 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98890 NR_046551 100874074 Hs.734030 NR_046551 ENSG00000176124 DLEU7-AS1 - DLEU7 antisense RNA 1 ncRNA 132.667-177 chr8 79523519 79523766 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87475 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 161.667-277 chr9 118635018 118635342 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -44491 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 132-115 chr8 78132921 78133270 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -383245 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 121-20 chr10 91944251 91944468 + 0.666667 NA intron (NM_003972, intron 4 of 37) HAL1ME|LINE|L1 20589 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 140.667-140 chr22 25378536 25378856 + 0.666667 NA intron (NM_001135772, intron 1 of 5) intron (NM_001135772, intron 1 of 5) 2881 NM_001135772 91355 Hs.634058 NM_182492 ENSG00000100068 LRP5L - LDL receptor related protein 5 like protein-coding 165-74 chr5 12316945 12317360 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -257705 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 132.333-162 chr7 47923452 47923803 + 0.666667 NA intron (NM_138295, intron 7 of 56) MER51E|LTR|ERV1 24864 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 141.333-173 chr4 73828996 73829250 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7555 NM_002993 6372 Hs.164021 NM_002993 ENSG00000124875 CXCL6 CKA-3|GCP-2|GCP2|SCYB6 C-X-C motif chemokine ligand 6 protein-coding 123.333-127 chr20 10429914 10430213 + 0.666667 NA intron (NR_072977, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 1862 NM_018848 8195 Hs.472119 NM_018848 ENSG00000125863 MKKS BBS6|HMCS|KMS|MKS McKusick-Kaufman syndrome protein-coding 140-103 chr7 14038299 14038634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47041 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 132.667-140 chr5 77450439 77450773 + 0.666667 NA intron (NM_018268, intron 7 of 12) L2c|LINE|L2 41710 NM_018268 55255 Hs.482573 NM_018268 ENSG00000164253 WDR41 MSTP048 WD repeat domain 41 protein-coding 131-105 chr8 86012076 86012423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57419 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 148-91 chr20 7292030 7292407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15214 NR_135005 101929288 Hs.738005 NR_135005 ENSG00000261249 LINC01751 - long intergenic non-protein coding RNA 1751 ncRNA 199.333-206 chr4 90817178 90817579 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 8 of 10) intron (NM_001145065, intron 8 of 10) 582347 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 130.333-29 chr10 58441689 58442002 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 56435 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 143-71 chr2 117482551 117482879 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -331976 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 131-53 chr2 175323816 175324069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142232 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 173-28 chr15 49897685 49898068 + 0.666667 NA intron (NR_073597, intron 21 of 26) intron (NR_073597, intron 21 of 26) 215503 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 168.333-222 chr9 90932127 90932452 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 104869 NM_001174167 6850 Hs.371720 NM_003177 ENSG00000165025 SYK p72-Syk spleen associated tyrosine kinase protein-coding 160.333-8 chr1 54841221 54841547 + 0.666667 NA intron (NM_001110533, intron 9 of 9) intron (NM_001110533, intron 9 of 9) 35321 NM_001110533 163747 Hs.376018 NM_152607 ENSG00000162398 LEXM C1orf177|LEM lymphocyte expansion molecule protein-coding 132.667-193 chr9 127015204 127015450 + 0.666667 NA intron (NM_001190729, intron 4 of 17) MIRb|SINE|MIR 53102 NM_001366401 9649 Hs.432842 NM_014636 ENSG00000136828 RALGPS1 RALGEF2|RALGPS1A Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1 protein-coding 150.667-69 chr11 72756752 72757088 + 0.666667 NA intron (NM_006645, intron 5 of 6) AluSq2|SINE|Alu -4531 NM_001040118 116985 Hs.503165 NM_015242 ENSG00000186635 ARAP1 CENTD2 ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 198.667-5 chr1 101022897 101023343 + 0.666667 NA intron (NM_001077394, intron 2 of 7) AluSx|SINE|Alu 2664 NM_001077395 51611 Hs.440776 NM_015958 ENSG00000117543 DPH5 AD-018|CGI-30|HSPC143|NPD015 diphthamide biosynthesis 5 protein-coding 153.333-320 chr5 5123307 5123756 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16523 NR_109915 101929176 Hs.208717 NR_109915 CTD-2297D10.2 - uncharacterized LOC101929176 ncRNA 198.667-19 chr10 51715763 51716273 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -16423 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 168-33 chr15 50334333 50334710 + 0.666667 NA intron (NM_016654, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu -19653 NR_024490 100129387 Hs.659360 NR_024490 GABPB1-AS1 - GABPB1 antisense RNA 1 ncRNA 204.667-131 chr6 67240326 67240793 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -814792 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 220.333-73 chr20 49925446 49925928 + 0.666667 NA intron (NR_134564, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu 9865 NR_134564 105372653 Hs.589895 NR_134564 LOC105372653 - uncharacterized LOC105372653 ncRNA 177.667-40 chr12 132716550 132716916 + 0.666667 NA intron (NM_138575, intron 2 of 5) intron (NM_138575, intron 2 of 5) 5891 NM_001170543 192111 Hs.102558 NM_138575 ENSG00000247077 PGAM5 BXLBV68 PGAM family member 5, mitochondrial serine/threonine protein phosphatase protein-coding 120.333-168 chr7 33327049 33327340 + 0.666667 NA intron (NM_198428, intron 9 of 22) intron (NM_198428, intron 9 of 22) 197630 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 114-71 chr2 107097117 107097306 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -210102 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 179-56 chr2 206677086 206677449 + 0.666667 NA intron (NM_001093730, intron 9 of 11) intron (NM_001093730, intron 9 of 11) 33040 NM_001102659 200726 NM_001102659 ENSG00000235118 FAM237A - family with sequence similarity 237 member A protein-coding 135-60 chr3 2609077 2609398 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -282978 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 207-123 chr8 124347934 124348397 + 0.666667 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) AluSp|SINE|Alu 24534 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 206-34 chr11 90651824 90652169 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 -96139 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 178-92 chr5 69193942 69194376 + 0.666667 NA intron (NM_022909, intron 2 of 8) intron (NM_022909, intron 2 of 8) 4576 NM_022909 64946 Hs.631967 NM_022909 ENSG00000153044 CENPH - centromere protein H protein-coding 126-3 chr1 166034085 166034335 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 120588 NR_030626 100126349 NR_030626 ENSG00000215952 MIR921 MIRN921|hsa-mir-921 microRNA 921 ncRNA 142-148 chr7 96134824 96135176 + 0.666667 NA intron (NM_001160210, intron 14 of 17) intron (NM_001160210, intron 14 of 17) 84756 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 245.666-22 chr6 35555627 35556334 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43084 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 209-91 chr5 91581709 91582189 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -198632 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 153-29 chr12 40219472 40219871 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -5326 NM_198578 120892 Hs.187636 NM_198578 ENSG00000188906 LRRK2 AURA17|DARDARIN|PARK8|RIPK7|ROCO2 leucine rich repeat kinase 2 protein-coding 135.667-94 chr2 88551634 88551912 + 0.666667 NA intron (NR_110236, intron 2 of 2) AluYj4|SINE|Alu 13053 NR_110236 101928371 Hs.738045 NR_110236 ENSG00000225420 LOC101928371 - uncharacterized LOC101928371 ncRNA 125.333-102 chr20 36543813 36544085 + 0.666667 NA intron (NM_006097, intron 1 of 3) intron (NM_006097, intron 1 of 3) 2430 NM_181526 10398 Hs.504687 NM_006097 ENSG00000101335 MYL9 LC20|MLC-2C|MLC2|MRLC1|MYRL2 myosin light chain 9 protein-coding 123.667-65 chr15 81343214 81343471 + 0.666667 NA exon (NM_001080532, exon 15 of 22) exon (NM_001080532, exon 15 of 22) 19009 NR_120365 101929655 Hs.696654 NR_120365 TMC3-AS1 - TMC3 antisense RNA 1 ncRNA 144-26 chr11 69364813 69365167 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -60665 NM_001319657 102724265 Hs.448669 NM_001319657 LOC102724265 - uncharacterized LOC102724265 protein-coding 141.667-151 chr3 173069462 173069770 + 0.666667 NA intron (NM_031955, intron 2 of 10) L1MA4|LINE|L1 71619 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 112.333-30 chr10 117372265 117372535 + 0.666667 NA intron (NM_173791, intron 1 of 4) intron (NM_173791, intron 1 of 4) 3040 NM_173791 118987 Hs.501149 NM_173791 ENSG00000165650 PDZD8 PDZK8 PDZ domain containing 8 protein-coding 112-9 chr1 175229084 175229323 + 0.666667 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? -36216 NM_001162893 9674 Hs.518138 NM_014656 ENSG00000235750 KIAA0040 - KIAA0040 protein-coding 170.667-37 chr13 23045901 23046357 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129760 NR_138043 100996930 Hs.380803 NR_138043 LINC00621 - long intergenic non-protein coding RNA 621 ncRNA 161-54 chr22 31210055 31210361 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2090 NM_005569 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 145.333-101 chr16 7108589 7108914 + 0.666667 NA intron (NM_018723, intron 4 of 15) L1ME3G|LINE|L1 -224094 NM_145892 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 122-121 chr8 108394599 108394849 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -48859 NM_001329495 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 165.333-131 chr2 127810194 127810554 + 0.666667 NA intron (NM_001006622, intron 1 of 5) intron (NM_001006622, intron 1 of 5) 797 NM_018383 55339 Hs.554831 NM_018383 ENSG00000136709 WDR33 NET14|WDC146 WD repeat domain 33 protein-coding 154-114 chr5 27183158 27183510 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -144748 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 169.667-98 chr19 29855559 29855942 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43759 NM_001238 898 Hs.244723 NM_001238 ENSG00000105173 CCNE1 CCNE|pCCNE1 cyclin E1 protein-coding 121-108 chr4 79043770 79044009 + 0.666667 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) intron (NR_038342, intron 2 of 5) 72141 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 132.667-73 chr18 71618837 71619091 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -40008 NR_038326 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 195.333-91 chr15 76646701 76647234 + 0.666667 NA intron (NR_148227, intron 21 of 32) intron (NR_148227, intron 21 of 32) 60320 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 152.667-43 chr10 59675312 59675749 + 0.666667 NA intron (NM_194298, intron 2 of 5) MER50|LTR|ERV1 34361 NM_001323981 220963 Hs.499709 NM_194298 ENSG00000165449 SLC16A9 C10orf36|MCT9 solute carrier family 16 member 9 protein-coding 112.667-135 chr2 180986774 180987054 + 0.666667 NA intron (NM_001278555, intron 3 of 5) intron (NM_001278555, intron 3 of 5) 5790 NM_001278554 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 128.667-123 chr3 192661108 192661356 + 0.666667 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) L1M6|LINE|L1 66309 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 241.667-2 chr1 82262461 82263063 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 460309 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 153-31 chr12 47462899 47463204 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48043 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 132-78 chr21 29617426 29617706 + 0.666667 NA intron (NM_000830, intron 7 of 16) intron (NM_000830, intron 7 of 16) 21526 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 132.667-128 chr4 67618095 67618459 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_018227, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_018227, exon 33 of 33) 59550 NM_001317769 26228 Hs.435579 NM_012108 ENSG00000035720 STAP1 BRDG1|STAP-1 signal transducing adaptor family member 1 protein-coding 205.667-128 chr7 139157574 139158061 + 0.666667 NA intron (NM_001144920, intron 7 of 16) L1M5|LINE|L1 24039 NM_001321740 79989 Hs.133020 NM_024926 ENSG00000105948 TTC26 DYF13|IFT56|dyf-13 tetratricopeptide repeat domain 26 protein-coding 152-66 chr16 54754230 54754550 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 93843 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 176-43 chr18 50640512 50640880 + 0.666667 NA intron (NM_001292039, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 80609 NM_002747 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 127.333-13 chr1 191289050 191289414 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60734 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 128.333-4 chr1 69483625 69483933 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 50524 NR_147164 105378788 Hs.164441 NR_147164 ENSG00000229639 LINC01758 - long intergenic non-protein coding RNA 1758 ncRNA 160.667-316 chr8 131728871 131729299 + 0.666667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -175008 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 160-34 chr12 83981294 83981634 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 931335 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 165-99 chr9 28669111 28669580 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 49960 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 207.667-57 chr2 117052442 117052859 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -762041 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 120.333-87 chr2 995748 995958 + 0.666667 NA intron (NM_018968, intron 1 of 16) intron (NM_018968, intron 1 of 16) -44461 NR_136151 101060391 Hs.120377 NR_136151 SNTG2-AS1 - SNTG2 antisense RNA 1 ncRNA 134.667-133 chr3 44223676 44223977 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -18060 NM_001145030 375337 Hs.132125 NM_001145030 ENSG00000173769 TOPAZ1 C3orf77 testis and ovary specific PAZ domain containing 1 protein-coding 112-122 chr20 32133094 32133269 + 0.666667 NA intron (NM_001363731, intron 2 of 17) intron (NM_001363731, intron 2 of 17) 23453 NM_001363731 9777 Hs.654665 NM_014742 ENSG00000101337 TM9SF4 dJ836N17.2 transmembrane 9 superfamily member 4 protein-coding 129.333-39 chr11 115607560 115607888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103309 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 255.667-39 chr17 82177421 82178067 + 0.666667 NA intron (NM_001367828, intron 8 of 16) intron (NM_001367828, intron 8 of 16) 35098 NM_198082 284001 Hs.631724 NM_152675 ENSG00000176155 CCDC57 - coiled-coil domain containing 57 protein-coding 148.333-366 chr7 44979929 44980220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1059 NM_033054 64005 Hs.37617 NM_033054 ENSG00000136286 MYO1G HA2|HLA-HA2|MHAG myosin IG protein-coding 175.333-21 chr11 31989614 31990088 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51467 NR_120526 100506675 Hs.446169 NR_120526 ENSG00000254584 LOC100506675 - uncharacterized LOC100506675 ncRNA 214-100 chr4 136020177 136020671 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106744 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 190-115 chr7 51684556 51684973 + 0.666667 NA Intergenic (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -291508 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 167.333-50 chr10 99576749 99577162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43484 NM_031212 81894 Hs.403790 NM_031212 ENSG00000155287 SLC25A28 MFRN2|MRS3/4|MRS4L|NPD016 solute carrier family 25 member 28 protein-coding 162.667-166 chr22 28359248 28359732 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -100379 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 370.667-27 chr8 74544323 74545213 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -3775 NR_049860 100847058 NR_049860 ENSG00000266502 MIR5681A - microRNA 5681a ncRNA 157.667-193 chr3 77826635 77826955 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 222168 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 225-8 chr10 30100980 30101550 + 0.666667 NA intron (NM_001350022, intron 1 of 4) AluSx3|SINE|Alu 14229 NM_001350021 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 189.333-9 chr1 88397205 88397530 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -286777 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 147.333-156 chr19 41702808 41703117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5664 NM_004363 1048 Hs.709196 NM_004363 ENSG00000105388 CEACAM5 CD66e|CEA carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 5 protein-coding 166.333-134 chr20 37832598 37833006 + 0.666667 NA intron (NM_001281495, intron 12 of 16) intron (NM_001281495, intron 12 of 16) -70325 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 133.333-3 chr1 65172674 65173000 + 0.666667 NA intron (NM_001330616, intron 1 of 4) intron (NM_001330616, intron 1 of 4) 23843 NM_001330616 205 Hs.10862 NM_013410 ENSG00000162433 AK4 AK 4|AK3|AK3L1|AK3L2 adenylate kinase 4 protein-coding 166.667-127 chr2 228604785 228605134 + 0.666667 NA intron (NR_151716, intron 1 of 3) intron (NR_151716, intron 1 of 3) 6436 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 115.333-4 chr1 50327365 50327593 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 95964 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 160.667-171 chr2 235585030 235585426 + 0.666667 NA intron (NM_001037131, intron 1 of 17) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -67307 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 132-25 chr11 42241745 42242103 + 0.666667 NA intron (NR_038309, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 11766 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 151.667-157 chr19 51466651 51466951 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -8347 NM_001363548 27181 Hs.447899 NM_014442 ENSG00000105366 SIGLEC8 SAF2|SIGLEC-8|SIGLEC8L sialic acid binding Ig like lectin 8 protein-coding 150.333-272 chr3 115126339 115126688 + 0.666667 NA intron (NM_001348800, intron 1 of 11) L1ME3F|LINE|L1 20775 NM_001348800 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 146-106 chr5 34423699 34424037 + 0.666667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -179144 NR_146599 114899 Hs.171929 NM_030945 ENSG00000082196 C1QTNF3 C1ATNF3|CORCS|CORS|CORS-26|CORS26|CTRP3 C1q and TNF related 3 protein-coding 195.667-133 chr7 82097510 82097948 + 0.666667 NA intron (NM_000722, intron 6 of 38) L2a|LINE|L2 88552 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 125.333-163 chr6 156462101 156462392 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83496 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 154.333-51 chr11 8627322 8627637 + 0.666667 NA intron (NM_014818, intron 10 of 19) MIR|SINE|MIR 31357 NM_014818 9866 Hs.130836 NM_014818 ENSG00000166436 TRIM66 C11orf29|TIF1D|TIF1DELTA tripartite motif containing 66 protein-coding 113.333-63 chr12 58463361 58463690 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -128177 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 163.333-34 chr10 57864635 57864973 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 403090 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 142.333-15 chr1 235458895 235459173 + 0.666667 NA intron (NM_152490, intron 7 of 11) L1ME3Cz|LINE|L1 45418 NM_001277155 148789 Hs.498143 NM_152490 ENSG00000162885 B3GALNT2 B3GalNAc-T2|MDDGA11 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 protein-coding 129.333-4 chr1 112343326 112343560 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52771 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 188-6 chr1 56808591 56809008 + 0.666667 NA intron (NM_001004303, intron 1 of 19) intron (NM_001004303, intron 1 of 19) 10605 NM_001004303 199920 Hs.437655 NM_001004303 ENSG00000187889 FYB2 ARAP|C1orf168 FYN binding protein 2 protein-coding 113.667-51 chr13 65281716 65281913 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -584233 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 233-13 chr11 71932576 71933134 + 0.666667 NA intron (NM_001300926, intron 1 of 6) intron (NM_001300926, intron 1 of 6) 3809 NM_018320 55298 Hs.368554 NM_018320 ENSG00000137522 RNF121 - ring finger protein 121 protein-coding 154.667-156 chr19 13724558 13724993 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6977 NM_001320564 81576 Hs.24998 NM_030818 ENSG00000104957 CCDC130 - coiled-coil domain containing 130 protein-coding 148.667-141 chr15 80972268 80972662 + 0.666667 NA intron (NR_126328, intron 1 of 2) MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 17354 NM_015154 23184 Hs.578450 NM_015154 ENSG00000117899 MESD BOCA|MESDC2 mesoderm development LRP chaperone protein-coding 156.333-148 chr17 74677043 74677378 + 0.666667 NA intron (NM_175738, intron 1 of 8) intron (NM_175738, intron 1 of 8) 6079 NM_175738 326624 Hs.351413 NM_175738 ENSG00000172794 RAB37 - RAB37, member RAS oncogene family protein-coding 181.333-57 chr17 40117175 40117556 + 0.666667 NA Intergenic tRNA-Arg-CGG|tRNA|tRNA -4606 NM_001365921 339287 Hs.532786 NM_001012241 ENSG00000188895 MSL1 MSL-1 MSL complex subunit 1 protein-coding 178-11 chr1 194440565 194441001 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 1136038 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 163-17 chr14 21239004 21239312 + 0.666667 NA intron (NM_001077442, intron 1 of 7) intron (NM_001077442, intron 1 of 7) 30321 NM_031314 3183 Hs.508848 NM_004500 ENSG00000092199 HNRNPC C1|C2|HNRNP|HNRPC|SNRPC heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (C1/C2) protein-coding 126.333-99 chr2 207175831 207176061 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8700 NM_001270943 8609 Hs.59908 NM_003709 ENSG00000118263 KLF7 UKLF Kruppel like factor 7 protein-coding 169.333-61 chr12 110831889 110832202 + 0.666667 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -14942 NM_001286243 160762 Hs.437141 NM_152591 ENSG00000173093 CCDC63 ODA5 coiled-coil domain containing 63 protein-coding 155-130 chr8 100915468 100915810 + 0.666667 NA TTS (NM_001135701) TTS (NM_001135701) 34932 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 181-24 chr14 68339927 68340341 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 288653 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 204-55 chr13 92104654 92105241 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 6 of 7) intron (NM_004466, intron 6 of 7) 247260 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 195-45 chr16 22014367 22014770 + 0.666667 NA intron (NM_001164579, intron 1 of 2) intron (NM_001164579, intron 1 of 2) 6457 NM_001164579 730094 Hs.498890 NM_173501 ENSG00000185716 MOSMO ATTHOG|BC030336|C16orf52 modulator of smoothened protein-coding 190.667-62 chr2 34243936 34244408 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 176946 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 186-11 chr10 4730664 4731168 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -52846 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 159.333-95 chr14 66646839 66647101 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) AluJb|SINE|Alu 139563 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 134.333-161 chr7 84032559 84032955 + 0.666667 NA intron (NM_006080, intron 6 of 16) intron (NM_006080, intron 6 of 16) 162032 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 215.667-83 chr3 70123310 70123774 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 123798 NR_110000 101927152 Hs.382046 NR_110000 ENSG00000240405 SAMMSON LINC01212 survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA ncRNA 149.667-120 chr14 61860847 61861250 + 0.666667 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) L2|LINE|L2 48345 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 138.667-216 chr9 84406912 84407273 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -38365 NM_022127 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 169-41 chr2 24578367 24578716 + 0.666667 NA intron (NM_001362955, intron 3 of 23) intron (NM_001362955, intron 3 of 23) -5936 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 163.667-250 chr8 104582273 104582608 + 0.666667 NA intron (NM_013437, intron 1 of 6) intron (NM_013437, intron 1 of 6) 6584 NM_013437 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 169.667-57 chr14 45626106 45626569 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 89265 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 149.333-213 chr20 486325 486647 + 0.666667 NA intron (NM_001362771, intron 11 of 13) intron (NM_001362771, intron 11 of 13) -23953 NR_111901 128637 Hs.590876 NM_144628 ENSG00000125875 TBC1D20 C20orf140|WARBM4 TBC1 domain family member 20 protein-coding 178.667-125 chr5 13541044 13541354 + 0.666667 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 403281 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 113.667-47 chr12 123166962 123167152 + 0.666667 NA intron (NR_103517, intron 16 of 23) intron (NR_103517, intron 16 of 23) -56568 NM_001300801 57605 Hs.272759 NM_020845 ENSG00000090975 PITPNM2 NIR-3|NIR3|RDGB2|RDGBA2 phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 2 protein-coding 138.333-178 chr7 11795627 11796034 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 36368 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 153.333-105 chr13 30677289 30677594 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36037 NM_001204406 241 Hs.507658 NM_001629 ENSG00000132965 ALOX5AP FLAP arachidonate 5-lipoxygenase activating protein protein-coding 167.667-147 chr4 37638942 37639367 + 0.666667 NA intron (NM_001085400, intron 3 of 6) AluY|SINE|Alu 47222 NM_001085400 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 197.666-38 chr20 47007889 47008460 + 0.666667 NA intron (NM_172110, intron 4 of 13) intron (NM_172110, intron 4 of 13) 113331 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 210.333-68 chr2 32463855 32464339 + 0.666667 NA intron (NM_016252, intron 24 of 73) MER1B|DNA|hAT-Charlie -68056 NR_030285 693143 NR_030285 ENSG00000207653 MIR558 MIRN558|hsa-mir-558 microRNA 558 ncRNA 128.667-31 chr10 126803433 126803771 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL -101807 NM_001380 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 123.333-201 chr7 81816447 81816769 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46561 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 202.667-153 chr9 29412831 29413167 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -199398 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 169.667-32 chr11 35499769 35500178 + 0.666667 NA intron (NM_015430, intron 1 of 11) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 25643 NM_015430 25891 Hs.55044 NM_015430 ENSG00000149090 PAMR1 DKFZP586H2123|FP938|RAMP peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1 protein-coding 168.333-173 chr6 35579825 35580180 + 0.666667 NA TTS (NM_001145777) TTS (NM_001145777) -67106 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 111.667-195 chr5 17948397 17948717 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 141283 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 138-22 chr11 32454775 32455044 + 0.666667 NA intron (NR_120548, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 18870 NR_120546 51352 Hs.567499 NM_015855 ENSG00000183242 WT1-AS WIT-1|WIT1|WT1-AS1|WT1AS WT1 antisense RNA ncRNA 184-107 chr8 98843679 98844094 + 0.666667 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) AluSz|SINE|Alu -18198 NM_006281 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 156.333-394 chrX 151039290 151039612 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 56066 NM_001301228 3149 Hs.19114 NM_005342 ENSG00000029993 HMGB3 HMG-2a|HMG-4|HMG2A|HMG4 high mobility group box 3 protein-coding 192.333-24 chr10 98448478 98448908 + 0.666667 NA intron (NR_134453, intron 1 of 2) AluSx3|SINE|Alu -1730 NM_001322476 3257 Hs.404568 NM_000195 ENSG00000107521 HPS1 BLOC3S1|HPS HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1 protein-coding 138.333-15 chr1 221610968 221611233 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 125800 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 173.333-4 chr1 27781586 27781874 + 0.666667 NA intron (NM_177424, intron 1 of 8) intron (NM_177424, intron 1 of 8) 8511 NM_177424 23673 Hs.523855 NM_177424 ENSG00000117758 STX12 STX13|STX14 syntaxin 12 protein-coding 194.667-59 chr2 12282351 12282786 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 83438 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 129-74 chr20 18388752 18389061 + 0.666667 NA intron (NM_001367611, intron 19 of 20) intron (NM_001367611, intron 19 of 20) 9857 NR_034167 440757 Hs.120399 NM_001004344 ENSG00000237282 LINC00851 DZANK1-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 851 ncRNA 172.333-182 chr8 91430472 91430939 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 181386 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 170.667-142 chr6 34569162 34569654 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -13075 NM_001252294 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 136-77 chr4 77996615 77996927 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -60552 NM_025074 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 165.333-60 chr12 89229776 89230115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 122556 NM_001946 1848 Hs.298654 NM_001946 ENSG00000139318 DUSP6 HH19|MKP3|PYST1 dual specificity phosphatase 6 protein-coding 211.667-76 chr3 44887245 44887699 + 0.666667 NA intron (NM_003241, intron 2 of 13) intron (NM_003241, intron 2 of 13) 12864 NM_003241 7047 Hs.438265 NM_003241 ENSG00000163810 TGM4 TGP|hTGP transglutaminase 4 protein-coding 266.667-53 chr4 49091766 49092412 + 0.666667 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 105447 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 144.667-232 chr5 25864250 25864528 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 673436 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 145.667-233 chr5 126052561 126052971 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -126811 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 187.333-59 chr14 42579353 42579767 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 972704 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 148.333-104 chr12 112098936 112099262 + 0.666667 NA intron (NM_024953, intron 1 of 23) AluSc|SINE|Alu 9684 NM_024953 80018 Hs.530941 NM_024953 ENSG00000111300 NAA25 C12orf30|MDM20|NAP1 N(alpha)-acetyltransferase 25, NatB auxiliary subunit protein-coding 186.333-84 chr2 169818268 169818638 + 0.666667 NA intron (NM_001293187, intron 5 of 7) MER68|LTR|ERVL 2174 NR_145754 109617017 NR_145754 SNORD3K - small nucleolar RNA, C/D box 3K snoRNA 125-93 chr5 154509273 154509577 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -31198 NM_004821 9421 Hs.152531 NM_004821 ENSG00000113196 HAND1 Hxt|Thing1|bHLHa27|eHand heart and neural crest derivatives expressed 1 protein-coding 127.333-180 chr7 133401834 133402136 + 0.666667 NA intron (NM_021807, intron 7 of 17) intron (NM_021807, intron 7 of 17) 111104 NR_106749 102465139 NR_106749 ENSG00000276137 MIR6133 hsa-mir-6133 microRNA 6133 ncRNA 178.667-24 chr10 72357867 72358381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3205 NM_001002762 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 167.333-87 chr14_GL000225v1_random 130240 130600 + 0.666667 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 212-55 chr14 83906197 83906730 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1263831 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 242.667-5 chr1 71136860 71137504 + 0.666667 NA intron (NR_046217, intron 2 of 3) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 55858 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 245.666-5 chr12 19822256 19822975 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -192070 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 157.667-163 chr2 223726963 223727251 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 110475 NR_110906 130340 Hs.632555 NM_178814 ENSG00000152056 AP1S3 PSORS15 adaptor related protein complex 1 subunit sigma 3 protein-coding 112.667-178 chr3 131606421 131606612 + 0.666667 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) intron (NM_130808, intron 7 of 15) -103545 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 154-8 chr1 212507821 212508182 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -37693 NR_125985 101929565 NR_125985 ENSG00000228067 LINC01740 - long intergenic non-protein coding RNA 1740 ncRNA 149-56 chr16 62108615 62108894 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72316 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 147.667-91 chr13 78957648 78957970 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117759 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 128-34 chr17 60842759 60843078 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) AluJr|SINE|Alu 165067 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 138-60 chr2 179017688 179018014 + 0.666667 NA intron (NM_001316745, intron 2 of 11) intron (NM_001316745, intron 2 of 11) 32286 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 149.667-76 chr11 67593332 67593729 + 0.666667 NA Intergenic LTR22A|LTR|ERVK 9935 NM_000852 2950 Hs.523836 NM_000852 ENSG00000084207 GSTP1 DFN7|FAEES3|GST3|GSTP|HEL-S-22|PI glutathione S-transferase pi 1 protein-coding 124.667-204 chr8 79346539 79346804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14483 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 204.667-50 chr15 45678450 45678867 + 0.666667 NA intron (NM_021199, intron 6 of 9) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -26537 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 163.333-288 chr8 121138468 121138827 + 0.666667 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR -326601 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 113.333-107 chr18 28237591 28237872 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60601 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 146.333-17 chr1 187271137 187271488 + 0.666667 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) intron (NR_126347, intron 1 of 3) -172316 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 188.667-134 chr7 15606469 15606897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44668 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 150.667-279 chr4 128766345 128766639 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -43208 NM_199320 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 233.333-130 chr8 84750058 84750652 + 0.666667 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) intron (NM_001287244, intron 1 of 7) 44428 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 209-61 chr2 128575053 128575533 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -256425 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 158.333-49 chr11 18446871 18447273 + 0.666667 NA intron (NM_017448, intron 7 of 7) L2|LINE|L2 -8784 NM_144972 160287 Hs.668877 NM_144972 ENSG00000166800 LDHAL6A LDH6A lactate dehydrogenase A like 6A protein-coding 138.667-195 chr7 125790149 125790436 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -526001 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 169.333-171 chr3 133121895 133122297 + 0.666667 NA intron (NM_001136469, intron 2 of 5) intron (NM_001136469, intron 2 of 5) -2725 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 154.333-214 chr3 66508949 66509401 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8754 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 194-41 chr15 25594400 25594768 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17c|DNA|TcMar-Tigger -155528 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 180-69 chr3 102496975 102497368 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62156 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 118.333-103 chr2 57360902 57361244 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -546578 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 164.667-92 chr17 76371140 76371468 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11900 NM_001355139 8877 Hs.68061 NM_021972 ENSG00000176170 SPHK1 SPHK sphingosine kinase 1 protein-coding 148.667-278 chr4 63125386 63125717 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -963786 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 169.667-170 chr5 94009212 94009571 + 0.666667 NA intron (NR_028080, intron 3 of 8) intron (NR_028080, intron 3 of 8) 102272 NM_032042 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 170.667-96 chr20 8652555 8652960 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 7 of 32) intron (NM_182734, intron 7 of 32) -178428 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 191-78 chr8 131917712 131918216 + 0.666667 NA intron (NM_001323557, intron 1 of 22) intron (NM_001323557, intron 1 of 22) 1191 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 129-4 chr1 108483840 108484187 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 33731 NM_001143987 653149 Hs.712226 NM_001143987 ENSG00000186086 NBPF6 - NBPF member 6 protein-coding 119.333-137 chr2 208271075 208271280 + 0.666667 NA intron (NM_001178000, intron 1 of 11) intron (NM_001178000, intron 1 of 11) 4910 NM_152671 200576 Hs.744997 NM_015040 ENSG00000115020 PIKFYVE CFD|FAB1|HEL37|PIP5K|PIP5K3|ZFYVE29 phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing protein-coding 148.667-294 chr4 158932681 158932975 + 0.666667 NA intron (NM_152543, intron 3 of 4) L1MB7|LINE|L1 102401 NM_152543 152940 Hs.415576 NM_152543 ENSG00000164123 C4orf45 - chromosome 4 open reading frame 45 protein-coding 124.333-165 chr6 169604502 169604721 + 0.666667 NA intron (NM_182552, intron 22 of 25) L1PB4|LINE|L1 97418 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 111.667-269 chr9 27186679 27186928 + 0.666667 NA intron (NM_001290077, intron 8 of 21) intron (NM_001290077, intron 8 of 21) 77662 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 177-84 chr9 105342255 105342642 + 0.666667 NA intron (NM_001330731, intron 4 of 15) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 97797 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 180.667-74 chr2 208885370 208885740 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 342913 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 160.333-274 chr8 62215174 62215414 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -33560 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 331-3 chr1 205548164 205548712 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20576 NM_181644 148808 Hs.567714 NM_181644 ENSG00000174514 MFSD4A MFSD4|UNQ3064 major facilitator superfamily domain containing 4A protein-coding 143.333-254 chr6 169544047 169544336 + 0.666667 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) L1MD|LINE|L1 157838 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 113.667-155 chr4 41968094 41968345 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -13537 NM_001029955 285429 Hs.213307 NM_001029955 ENSG00000182308 DCAF4L1 WDR21B DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 1 protein-coding 182.333-48 chr14 73938609 73939009 + 0.666667 NA intron (NM_152445, intron 5 of 8) intron (NM_152445, intron 5 of 8) -11125 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 136-96 chr7 55514137 55514421 + 0.666667 NA intron (NM_001321242, intron 2 of 4) intron (NM_001321242, intron 2 of 4) 12601 NM_001321251 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 144-58 chr14 82794181 82794479 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 151698 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 168-84 chr4 88162958 88163304 + 0.666667 NA intron (NM_001257386, intron 1 of 15) intron (NM_001257386, intron 1 of 15) -3808 NM_001348989 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 161-66 chr4 47230338 47230765 + 0.666667 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 198984 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 173-89 chr7 71108281 71108725 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -23641 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 203.667-5 chr1 181941763 181942211 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 119725 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 131.333-132 chr4 88321915 88322205 + 0.666667 NA intron (NR_134237, intron 3 of 3) intron (NR_134237, intron 3 of 3) 37130 NR_134237 105369192 Hs.733660 NR_134236 ENSG00000246375 PPM1K-DT - PPM1K divergent transcript ncRNA 117-152 chr9 26379611 26379820 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 313040 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 201-17 chr10 72902832 72903281 + 0.666667 NA intron (NR_130125, intron 3 of 7) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 9317 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 139.667-127 chr3 178100537 178100880 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 283843 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 164.333-169 chr4 31316207 31316691 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 145305 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 201.333-203 chr3 180833711 180834193 + 0.666667 NA intron (NR_109986, intron 2 of 13) intron (NR_109986, intron 2 of 13) 36226 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 117.333-85 chr18 5946370 5946645 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50553 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 161.667-232 chr6 161615422 161615807 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) intron (NM_004562, intron 7 of 11) 144637 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 141.667-120 chr2 74710978 74711273 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 56878 NR_073399 10505 Hs.25887 NM_004263 ENSG00000135622 SEMA4F M-SEMA|PRO2353|S4F|SEMAM|SEMAW|m-Sema-M ssemaphorin 4F protein-coding 116-10 chr1 155153348 155153529 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -12907 NM_153741 54344 Hs.110477 NM_018973 ENSG00000179085 DPM3 CDG1O dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatory protein-coding 122.333-115 chr2 211050001 211050287 + 0.666667 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 432573 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 189-23 chr14 24821686 24822077 + 0.666667 NA intron (NM_001351943, intron 5 of 6) intron (NM_001351943, intron 5 of 6) -187691 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 160.667-191 chr3 33686219 33686554 + 0.666667 NA intron (NM_001365634, intron 5 of 35) MER1B|DNA|hAT-Charlie -26707 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 176.667-47 chr12 117334848 117335229 + 0.666667 NA intron (NM_000620, intron 1 of 28) MIRb|SINE|MIR -25628 NM_001204214 4842 Hs.654410 NM_000620 ENSG00000089250 NOS1 IHPS1|N-NOS|NC-NOS|NOS|bNOS|nNOS nitric oxide synthase 1 protein-coding 124.333-125 chr4 36495662 36495870 + 0.666667 NA TTS (NR_149124) TTS (NR_149124) -69338 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 123-113 chr7 8674963 8675176 + 0.666667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 241460 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 114.333-105 chr2 76446733 76447007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -539095 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 122.333-88 chr2 43906764 43907066 + 0.666667 NA intron (NM_133259, intron 30 of 37) intron (NM_133259, intron 30 of 37) 67944 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 123.333-3 chr1 55301944 55302236 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 76449 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 174-103 chr8 136164243 136164584 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -366385 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 136.333-155 chr4 139604098 139604484 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -47522 NM_030648 80854 Hs.480792 NM_030648 ENSG00000145391 SETD7 KMT7|SET7|SET7/9|SET9 SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase protein-coding 149-41 chr14 47813789 47814128 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -18944 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 112.333-117 chr2 38052869 38053171 + 0.666667 NA intron (NM_144713, intron 10 of 10) Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger -16679 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 172-60 chr2 173602939 173603354 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 248274 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 128.667-173 chr8 22861713 22861927 + 0.666667 NA intron (NM_001363233, intron 3 of 6) intron (NM_001363233, intron 3 of 6) -16152 NR_125433 101929237 Hs.677838 NR_125433 ENSG00000248738 LOC101929237 - uncharacterized LOC101929237 ncRNA 121.667-212 chr8 135171612 135171885 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62383 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 185.667-112 chr6 148555946 148556436 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47040 NM_001346509 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 182-75 chr4 31739790 31740280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 233491 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 118.667-26 chr10 56070594 56070831 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 290547 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 159.667-14 chr1 84763422 84763718 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -73102 NM_001166295 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 144.333-105 chr18 40630504 40630838 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 564385 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 154.333-265 chr5 54194226 54194586 + 0.666667 NA intron (NM_019087, intron 1 of 4) intron (NM_019087, intron 1 of 4) 116167 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 149.333-44 chr10 34095672 34095960 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -323136 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 124.333-14 chr1 211960626 211960893 + 0.666667 NA intron (NM_015434, intron 16 of 19) L1PREC2|LINE|L1 -74794 NM_001286230 51514 Hs.656473 NM_016448 ENSG00000143476 DTL CDT2|DCAF2|L2DTL|RAMP denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog protein-coding 191.333-48 chr12 110746695 110747095 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4004 NM_001244974 5501 Hs.79081 NM_002710 ENSG00000186298 PPP1CC PP-1G|PP1C|PPP1G protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma protein-coding 121-60 chr18 39870938 39871232 + 0.666667 NA intron (NR_151703, intron 6 of 8) intron (NR_151703, intron 6 of 8) 29376 NR_151703 105372079 NR_151703 ENSG00000283503 LINC01902 - long intergenic non-protein coding RNA 1902 ncRNA 112.667-130 chr2 115901058 115901336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 557382 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 147-94 chr3 116583671 116583965 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31345 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 179.667-3 chr1 67138499 67139009 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3784 NM_001276351 400757 Hs.666621 NM_001013674 ENSG00000203963 C1orf141 - chromosome 1 open reading frame 141 protein-coding 121-129 chr7 12673326 12673568 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13380 NM_212460 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 146-116 chr5 168027945 168028243 + 0.666667 NA intron (NM_001080428, intron 3 of 24) intron (NM_001080428, intron 3 of 24) -137751 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 178.333-137 chr5 53636009 53636349 + 0.666667 NA intron (NR_134474, intron 3 of 5) FLAM_A|SINE|Alu 75540 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 179.667-97 chr4 40634769 40635229 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4405 NM_001371114 144.667-279 chr7 27669962 27670342 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7269 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 136.667-21 chr10 68921529 68921830 + 0.666667 NA intron (NM_024045, intron 8 of 14) L1M8|LINE|L1 20364 NM_024045 79009 Hs.522984 NM_024045 ENSG00000107625 DDX50 GU2|GUB|RH-II/GuB|mcdrh DExD-box helicase 50 protein-coding 174.333-28 chr12 49133055 49133444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1854 NM_006082 10376 Hs.524390 NM_006082 ENSG00000123416 TUBA1B K-ALPHA-1 tubulin alpha 1b protein-coding 133.667-3 chr1 38888956 38889259 + 0.666667 NA intron (NM_001304746, intron 6 of 7) AluSx|SINE|Alu -7481 NR_037635 100527950 Hs.591506 NR_037633 GJA9-MYCBP Cx58|Cx59|GJA10|GJA9 GJA9-MYCBP readthrough ncRNA 140.667-150 chr3 124042383 124042655 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -50349 NR_133919 54763 Hs.567516 NM_017578 ENSG00000065371 ROPN1 CT91|ODF6|RHPNAP1|ROPN1A|ropporin rhophilin associated tail protein 1 protein-coding 171.333-30 chr11 100765595 100766024 + 0.666667 NA intron (NM_001367945, intron 1 of 25) intron (NM_001367945, intron 1 of 25) -77854 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 163-63 chr5 18442090 18442415 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 634978 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 114.333-210 chr7 109391078 109391309 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR -506606 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 158-121 chr6 102148236 102148708 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 749487 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 117.333-165 chr5 25982866 25983148 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 792054 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 168.333-137 chr4 15352270 15352742 + 0.666667 NA intron (NM_001135170, intron 1 of 2) intron (NM_001135170, intron 1 of 2) 12518 NM_001135170 114905 Hs.153714 NM_031911 ENSG00000163145 C1QTNF7 CTRP7|ZACRP7 C1q and TNF related 7 protein-coding 141-29 chr15 44117518 44117804 + 0.666667 NA intron (NM_001286490, intron 1 of 15) LTR103_Mam|LTR|ERV1? 76785 NM_001286490 84978 Hs.578544 NM_032892 ENSG00000171877 FRMD5 - FERM domain containing 5 protein-coding 136.333-62 chr14 103818570 103818880 + 0.666667 NA intron (NM_015316, intron 1 of 16) intron (NM_015316, intron 1 of 16) 28850 NM_015316 23368 Hs.709297 NM_015316 ENSG00000088808 PPP1R13B ASPP1|p53BP2-like|p85 protein phosphatase 1 regulatory subunit 13B protein-coding 115.333-205 chr8 3389888 3390131 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 17 of 69) intron (NM_033225, intron 17 of 69) -661558 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 192.333-141 chr5 158233312 158233788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 176223 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 117.667-78 chr19 32842165 32842434 + 0.666667 NA exon (NM_001243036, exon 11 of 13) exon (NM_001243036, exon 11 of 13) 27468 NM_001243036 11136 Hs.743345 NM_014270 ENSG00000021488 SLC7A9 BAT1|CSNU3 solute carrier family 7 member 9 protein-coding 127.333-63 chr17 49369297 49369488 + 0.666667 NA intron (NR_110883, intron 2 of 4) AluJo|SINE|Alu -6919 NM_014897 22834 Hs.463375 NM_014897 ENSG00000198740 ZNF652 - zinc finger protein 652 protein-coding 116.333-78 chr16 25185409 25185648 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -31419 NM_001169 343 Hs.176658 NM_001169 ENSG00000103375 AQP8 AQP-8 aquaporin 8 protein-coding 147.333-123 chr15 70760056 70760403 + 0.666667 NA intron (NM_018003, intron 1 of 18) intron (NM_018003, intron 1 of 18) 3329 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 163.333-273 chr8 9351016 9351360 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26137 NR_040039 157273 Hs.650222 NR_040039 ENSG00000248538 LOC157273 - uncharacterized LOC157273 ncRNA 121-32 chr12 31903330 31903547 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16235 NR_135029 105369723 Hs.736954 NR_135029 ENSG00000255760 LINC02422 - long intergenic non-protein coding RNA 2422 ncRNA 148-120 chr4 117865715 117865989 + 0.666667 NA intron (NR_147154, intron 1 of 1) intron (NR_147154, intron 1 of 1) 31451 NR_147154 105377391 Hs.148448 NR_147154 ENSG00000229565 LINC02264 - long intergenic non-protein coding RNA 2264 ncRNA 152.667-92 chr12 128143366 128143766 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25349 NR_104648 101927694 Hs.524849 NR_104648 ENSG00000256659 LINC02368 - long intergenic non-protein coding RNA 2368 ncRNA 299-12 chr12 49766377 49766984 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24871 NM_001098576 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 156.667-168 chr2 22769269 22769592 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 232951 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 130.333-49 chr11 131943879 131944260 + 0.666667 NA intron (NR_147849, intron 2 of 6) intron (NR_147849, intron 2 of 6) 33251 NR_147854 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 235.666-19 chr8 51679343 51680024 + 0.666667 NA intron (NM_144651, intron 1 of 22) intron (NM_144651, intron 1 of 22) 129762 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 153.333-177 chr19 38046663 38047010 + 0.666667 NA intron (NM_015073, intron 2 of 21) intron (NM_015073, intron 2 of 21) -116260 NR_145800 109623473 NR_145800 SNORD152 - small nucleolar RNA, C/D box 152 snoRNA 134-81 chr4 89136033 89136311 + 0.666667 NA Intergenic Charlie6|DNA|hAT-Charlie 23355 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 113.333-100 chr17 52402036 52402310 + 0.666667 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) intron (NR_146898, intron 1 of 3) 11651 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 180-27 chr13 71138646 71139033 + 0.666667 NA intron (NR_047699, intron 1 of 3) intron (NR_047699, intron 1 of 3) 123698 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 175.333-42 chr14 50652394 50652678 + 0.666667 NA intron (NM_021818, intron 2 of 4) L1MC5a|LINE|L1 15770 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 125.333-57 chr14 56699616 56699880 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 105919 NM_172337 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 151.333-155 chr15 95735763 95736161 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 302869 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 163.667-235 chr7 54249674 54250014 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80853 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 112-172 chr5 77589807 77590057 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 48765 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 156.667-291 chr5 164715965 164716273 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 245840 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 113.333-54 chr11 99723842 99724177 + 0.666667 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 167864 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 136-115 chr9 105182219 105182455 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -62268 NM_001330731 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 118.667-2 chr1 13926674 13926895 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 177369 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 133-60 chr3 73979785 73980091 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 170694 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 182-98 chr7 3313914 3314427 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 12918 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 123.667-105 chr20 45081501 45081770 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19492 NM_001322799 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 142.333-40 chr11 35818404 35818670 + 0.666667 NA TTS (NM_017583) TTS (NM_017583) -125444 NM_001304264 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 145-56 chr2 206998801 206999127 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 59446 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 278.333-39 chr7 27670925 27671522 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -8340 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 121-133 chr7 66911312 66911532 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 7302 NR_136637 644794 Hs.552124 NR_136637 LINC02604 lncHERG long intergenic non-protein coding RNA 2604 ncRNA 195-12 chr10 12051248 12051680 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8294 NM_080599 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 208-53 chr15 46385651 46386027 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 680644 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 188.667-44 chr14 53894229 53894629 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54055 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 200.667-58 chr17 48877383 48877852 + 0.666667 NA intron (NR_135674, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR -15170 NM_001002027 516 Hs.80986 NM_005175 ENSG00000159199 ATP5MC1 ATP5A|ATP5G|ATP5G1 ATP synthase membrane subunit c locus 1 protein-coding 134.333-174 chr8 84175368 84175597 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7305 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 119.333-102 chr16 19055722 19055984 + 0.666667 NA intron (NR_136733, intron 13 of 14) L1PA10|LINE|L1 11630 NR_119382 102723385 Hs.569608 NR_119379 ENSG00000261465 LOC102723385 - uncharacterized LOC102723385 ncRNA 130.667-155 chr4 79729681 79729936 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -97663 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 159-12 chr10 18247540 18247858 + 0.666667 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -13023 NM_001330060 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 174-80 chr5 57471092 57471584 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 11473 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 146-80 chr3 19238658 19239054 + 0.666667 NA intron (NM_144633, intron 1 of 15) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 76075 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 243.666-37 chr7 99848208 99848898 + 0.666667 NA intron (NR_103869, intron 6 of 13) intron (NR_103869, intron 6 of 13) 20540 NM_001278921 64816 Hs.306220 NM_022820 ENSG00000021461 CYP3A43 - cytochrome P450 family 3 subfamily A member 43 protein-coding 114.333-25 chr10 47258287 47258601 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41753 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 159.667-35 chr1 218505797 218506105 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) LOR1b|LTR|ERV1 -4144 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 134.333-63 chr15 71168887 71169173 + 0.666667 NA intron (NR_120349, intron 1 of 1) L1ME3|LINE|L1 20029 NR_120351 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 167-23 chr11 58797409 58797674 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 47163 NM_145016 219970 Hs.254271 NM_145016 ENSG00000156689 GLYATL2 BXMAS2-10|GATF-B glycine-N-acyltransferase like 2 protein-coding 115.667-129 chr2 226957815 226958102 + 0.666667 NA intron (NM_001349069, intron 8 of 8) L1MB8|LINE|L1 121904 NM_032276 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 115-111 chr3 68308414 68308609 + 0.666667 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) intron (NM_001252216, intron 2 of 4) -192126 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 168.333-11 chr1 202666290 202666636 + 0.666667 NA intron (NM_177402, intron 1 of 8) intron (NM_177402, intron 1 of 8) -23010 NM_001136504 127833 Hs.25422 NM_177402 ENSG00000143858 SYT2 CMS7|MYSPC|SytII synaptotagmin 2 protein-coding 199.333-86 chr15 56716828 56717163 + 0.666667 NA intron (NM_001002843, intron 1 of 20) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 17091 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 219-19 chr13 78446683 78447172 + 0.666667 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) -149195 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 139.333-155 chr3 142308132 142308402 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001282857, exon 41 of 41) 3' UTR (NM_001282857, exon 41 of 41) -82682 NR_033289 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 113.667-191 chr6 144724645 144724946 + 0.666667 NA intron (NM_007124, intron 52 of 73) L1MB7|LINE|L1 319140 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 169-72 chr3 175814975 175815396 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38852 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 120-114 chr5 118001945 118002196 + 0.666667 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) 271709 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 143-74 chr2 152667016 152667298 + 0.666667 NA intron (NM_001365601, intron 15 of 24) intron (NM_001365601, intron 15 of 24) 50304 NM_001365604 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 120.333-51 chr14 22345072 22345363 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR 87536 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 167-85 chr5 77601409 77601773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37106 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 170.333-56 chr12 45814149 45814618 + 0.666667 NA intron (NM_152641, intron 4 of 20) AluSx|SINE|Alu 84674 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 139.333-105 chr2 13197445 13197827 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190623 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 127.333-156 chr6 62266011 62266341 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 20049 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 174-27 chr13 93632310 93632684 + 0.666667 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 225976 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 124.667-174 chr6 36569974 36570271 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -22643 NM_001305102 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 140-126 chr9 5573266 5573644 + 0.666667 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -55652 NM_001135920 57589 Hs.211520 NM_020829 ENSG00000107036 RIC1 CIP150|KIAA1432|bA207C16.1 RIC1 homolog, RAB6A GEF complex partner 1 protein-coding 151.667-26 chr1 179898985 179899281 + 0.666667 NA intron (NM_001267578, intron 3 of 9) intron (NM_001267578, intron 3 of 9) 17091 NM_001267578 26092 Hs.496459 NM_015602 ENSG00000143337 TOR1AIP1 LAP1|LAP1B|LGMD2Y torsin 1A interacting protein 1 protein-coding 220.667-97 chr7 42182682 42183141 + 0.666667 NA intron (NM_000168, intron 2 of 14) AluSz6|SINE|Alu 54298 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 146-14 chr10 119737779 119738084 + 0.666667 NA intron (NM_014937, intron 1 of 19) intron (NM_014937, intron 1 of 19) 11881 NM_014937 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 181.333-98 chr3 8025511 8025906 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -9401 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 152.667-394 chr9 31493038 31493359 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111708 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 211.333-196 chr5 145098788 145099278 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 736309 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 113-201 chr8 68425879 68426124 + 0.666667 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) L1MD2|LINE|L1 -94510 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 183.333-62 chr17 47745692 47746098 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_013351, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_013351, exon 6 of 6) 12659 NM_013351 30009 Hs.272409 NM_013351 ENSG00000073861 TBX21 T-PET|T-bet|TBET|TBLYM T-box transcription factor 21 protein-coding 118.333-96 chr2 30093865 30094150 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -53000 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 170.333-10 chr1 114547234 114547583 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 34207 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 192.333-40 chr12 17336062 17336490 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 252802 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 128.667-125 chr4 31587592 31587949 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 81226 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 112.333-201 chr5 29741416 29741627 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -139039 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 130-51 chr19 53238033 53238331 + 0.666667 NA exon (NM_182609, exon 5 of 5) exon (NM_182609, exon 5 of 5) 16668 NM_001317998 342926 Hs.20506 NM_182609 ENSG00000197928 ZNF677 - zinc finger protein 677 protein-coding 192.667-94 chr2 202123790 202124214 + 0.666667 NA intron (NM_001277372, intron 11 of 23) AluSx1|SINE|Alu -6944 NR_135244 729224 Hs.623895 NR_135243 KIAA2012-AS1 - KIAA2012 antisense RNA 1 ncRNA 228-68 chr5 125243055 125243458 + 0.666667 NA intron (NR_109882, intron 4 of 5) L1PA15|LINE|L1 206425 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 144-35 chr12 14448205 14448584 + 0.666667 NA intron (NM_181352, intron 6 of 14) L1MD2|LINE|L1 63113 NM_181352 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 254-58 chr4 86109087 86109559 + 0.666667 NA intron (NM_001363657, intron 4 of 13) L1PA10|LINE|L1 -10483 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 112-7 chr1 94279014 94279259 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31390 NM_001328664 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 175.333-13 chr10 26837534 26837915 + 0.666667 NA intron (NM_001012752, intron 1 of 9) AluSz6|SINE|Alu 23363 NM_001348031 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 231.333-27 chr12 7003811 7004218 + 0.666667 NA intron (NM_005768, intron 1 of 12) intron (NM_005768, intron 1 of 12) 14462 NM_005768 10162 Hs.655248 NM_005768 ENSG00000111684 LPCAT3 C3F|LPCAT|LPLAT 5|LPSAT|MBOAT5|OACT5|nessy lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 protein-coding 189.667-7 chr1 109162867 109163386 + 0.666667 NA intron (NM_020775, intron 2 of 21) intron (NM_020775, intron 2 of 21) -23423 NM_001284353 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 168-25 chr12 132814820 132815294 + 0.666667 NA intron (NM_001172557, intron 3 of 15) intron (NM_001172557, intron 3 of 15) 13332 NM_005895 2802 Hs.507333 NM_005895 ENSG00000090615 GOLGA3 GCP170|MEA-2 golgin A3 protein-coding 162-90 chr4 31048479 31048811 + 0.666667 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -122499 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 150.667-163 chr19 9210463 9210886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4197 NM_001005191 125958 Hs.446910 NM_001005191 ENSG00000174667 OR7D4 OR19-7|OR19-B|OR19B|OR7D4P|hg105 olfactory receptor family 7 subfamily D member 4 protein-coding 133.333-119 chr3 181501283 181501547 + 0.666667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) -58929 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 138-119 chr8 113000542 113000863 + 0.666667 NA intron (NM_198123, intron 6 of 70) L2|LINE|L2 357209 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 119.667-150 chr5 44288638 44288894 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -99966 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-196 chr2 128702940 128703359 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -161451 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 154.333-238 chr4 37953594 37954015 + 0.666667 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) intron (NM_001253912, intron 2 of 20) -6594 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 203.667-38 chr17 11156926 11157389 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -84056 NM_001173462 388336 Hs.592124 NM_175903 ENSG00000188803 SHISA6 - shisa family member 6 protein-coding 118.667-58 chr12 111064412 111064613 + 0.666667 NA intron (NM_015267, intron 1 of 21) intron (NM_015267, intron 1 of 21) 30347 NM_015267 23316 Hs.124953 NM_015267 ENSG00000111249 CUX2 CDP2|CUTL2|EIEE67 cut like homeobox 2 protein-coding 159.333-96 chr14 69511738 69512053 + 0.666667 NA intron (NM_001161498, intron 6 of 12) L1MC1|LINE|L1 27167 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 166-14 chr1 164840159 164840529 + 0.666667 NA intron (NM_001353131, intron 7 of 7) MER53|DNA|hAT -65703 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 166.667-79 chr16 58895406 58895772 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -161273 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 133.333-35 chr11 110488547 110488838 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 58744 NM_004109 2230 Hs.744 NM_004109 ENSG00000137714 FDX1 ADX|FDX|LOH11CR1D ferredoxin 1 protein-coding 129.333-153 chr5 65207217 65207423 + 0.666667 NA intron (NR_135689, intron 21 of 25) intron (NR_135689, intron 21 of 25) 274600 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 164.667-88 chr17 29708134 29708481 + 0.666667 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) AluSx1|SINE|Alu 53125 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 289.667-27 chr4 49153705 49154283 + 0.666667 NA Intergenic (TCCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 167352 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 119.667-105 chr22 31448010 31448271 + 0.666667 NA intron (NM_001164502, intron 11 of 16) intron (NM_001164502, intron 11 of 16) 41416 NM_001164501 56478 Hs.517559 NM_019843 ENSG00000184708 EIF4ENIF1 4E-T|Clast4 eukaryotic translation initiation factor 4E nuclear import factor 1 protein-coding 150.333-170 chr18 5856010 5856327 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15473 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 113-16 chr10 32892509 32892732 + 0.666667 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL 8852 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 133-11 chr10 105804972 105805237 + 0.666667 NA intron (NR_120625, intron 3 of 3) HAL1|LINE|L1 15229 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 116-143 chr7 11275034 11275328 + 0.666667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 301309 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 249-59 chr5 53813411 53814113 + 0.666667 NA intron (NR_147168, intron 1 of 3) intron (NR_147168, intron 1 of 3) 5920 NR_147168 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 175-63 chr4 104678347 104678694 + 0.666667 NA intron (NR_125926, intron 8 of 9) CR1-3_Croc|LINE|CR1 -183626 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 185.667-19 chr11 66121852 66122262 + 0.666667 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 51785 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 140-68 chr2 216125524 216125808 + 0.666667 NA intron (NM_021141, intron 6 of 20) intron (NM_021141, intron 6 of 20) 16318 NM_021141 7520 Hs.388739 NM_021141 ENSG00000079246 XRCC5 KARP-1|KARP1|KU80|KUB2|Ku86|NFIV X-ray repair cross complementing 5 protein-coding 183.667-84 chr20 37363605 37364133 + 0.666667 NA intron (NM_198291, intron 1 of 13) MIR1_Amn|SINE|MIR 17741 NM_198291 6714 Hs.195659 NM_005417 ENSG00000197122 SRC ASV|SRC1|THC6|c-SRC|p60-Src SRC proto-oncogene, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 194.333-137 chr7 28427152 28427520 + 0.666667 NA intron (NM_182898, intron 1 of 10) L1ME4c|LINE|L1 -8279 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 180.333-44 chr16 71195234 71195604 + 0.666667 NA intron (NM_001198543, intron 1 of 18) intron (NM_001198543, intron 1 of 18) 35303 NM_001198542 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 194.333-90 chr3 169672041 169672350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8483 NM_001366473 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 133.333-170 chr7 33436969 33437278 + 0.666667 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 307559 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 187.333-203 chr8 118778945 118779262 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -157140 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 161-6 chr10 64028273 64028680 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -506586 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 179-27 chr14 55409803 55410301 + 0.666667 NA intron (NM_014924, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 1806 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 164.667-6 chr1 79084005 79084424 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77484 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 152.667-323 chr6 52227562 52227974 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16732 NM_052872 112744 Hs.272295 NM_052872 ENSG00000112116 IL17F CANDF6|IL-17F|ML-1|ML1 interleukin 17F protein-coding 170.667-170 chr9 26325504 26325878 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 259016 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 206.667-71 chr2 204705150 204705614 + 0.666667 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) L2a|LINE|L2 159907 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 183.333-78 chr19 30025904 30026254 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 83840 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 129.333-55 chr13 45302873 45303150 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33436 NR_145985 109616966 NR_145726 ENSG00000253051 SNORA31B - small nucleolar RNA, H/ACA box 31B snoRNA 115-142 chr7 39888671 39888859 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60654 NR_158201 112267983 Hs.587424 NR_158201 LOC112267983 - uncharacterized LOC112267983 ncRNA 119-83 chr2 214726768 214727067 + 0.666667 NA non-coding (NR_104212, exon 10 of 10) non-coding (NR_104212, exon 10 of 10) 82766 NM_001282545 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 267.667-24 chr19 27389898 27390517 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -403224 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 144.333-88 chr16 29866217 29866506 + 0.666667 NA intron (NR_015396, intron 5 of 5) L2b|LINE|L2 2527 NR_015396 440356 Hs.448823 NR_015396 ENSG00000214725 CDIPTOSP CDIPT-AS1 CDIP transferase opposite strand, pseudogene ncRNA 147.667-220 chr3 16647400 16647686 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42120 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 156.667-309 chr6 168118443 168118823 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -37076 NR_110312 79981 Hs.266746 NM_024919 ENSG00000153303 FRMD1 bA164L23.1 FERM domain containing 1 protein-coding 148.333-347 chr6 154087495 154087790 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001145287, exon 1 of 4) 5' UTR (NM_001145287, exon 1 of 4) 1135 NM_001285526 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 173.667-15 chr10 19782861 19783268 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33368 NM_032812 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 158-123 chr7 7370893 7371318 + 0.666667 NA intron (NM_001037763, intron 32 of 34) intron (NM_001037763, intron 32 of 34) 115951 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 164.333-12 chr1 210929503 210929825 + 0.666667 NA intron (NM_002238, intron 6 of 10) L1PB1|LINE|L1 203710 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 124-97 chr5 106826078 106826358 + 0.666667 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) intron (NR_104671, intron 2 of 3) 184796 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 159-91 chr4 74018764 74019095 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 19760 NM_002090 2921 Hs.89690 NM_002090 ENSG00000163734 CXCL3 CINC-2b|GRO3|GROg|MIP-2b|MIP2B|SCYB3 C-X-C motif chemokine ligand 3 protein-coding 234.333-14 chr11 50534155 50534596 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 125228 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 259.333-86 chr6 110787391 110787901 + 0.666667 NA intron (NM_001300963, intron 1 of 13) AluJb|SINE|Alu -26975 NM_001287215 262 Hs.159118 NM_001634 ENSG00000123505 AMD1 ADOMETDC|AMD|SAMDC adenosylmethionine decarboxylase 1 protein-coding 130.333-35 chr10 78085524 78085869 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51833 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 150.667-18 chr1 209186517 209186955 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -138720 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 139-114 chr9 22893235 22893543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 247189 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 200.666-90 chr4 102288288 102288877 + 0.666667 NA intron (NM_022154, intron 5 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 35730 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 205.333-252 chr8 125690625 125691091 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 258649 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 219.667-51 chr22 38785324 38785835 + 0.666667 NA intron (NM_005740, intron 1 of 3) intron (NM_005740, intron 1 of 3) 8564 NM_005740 10126 Hs.632766 NM_005740 ENSG00000100246 DNAL4 MRMV3|PIG27 dynein axonemal light chain 4 protein-coding 191-42 chr3 152523520 152523952 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -182746 NR_132656 645843 Hs.632562 NM_001123228 ENSG00000221962 TMEM14EP TMEM14E transmembrane protein 14E, pseudogene pseudo 201.333-281 chr8 88834317 88834759 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -507055 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 148.333-371 chr7 104133316 104133713 + 0.666667 NA intron (NM_002553, intron 13 of 13) L2c|LINE|L2 74499 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 140.667-49 chr11 36633924 36634320 + 0.666667 NA intron (NR_077243, intron 3 of 4) intron (NR_077243, intron 3 of 4) -35843 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 114.667-6 chr1 109423292 109423531 + 0.666667 NA intron (NM_001199774, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 3037 NM_002790 5686 Hs.485246 NM_002790 ENSG00000143106 PSMA5 PSC5|ZETA proteasome subunit alpha 5 protein-coding 163.667-124 chr2 179665022 179665293 + 0.666667 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) intron (NR_148056, intron 3 of 9) -4963 NM_001352812 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 171-64 chr5 30059349 30059752 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 178990 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 214.667-90 chr4 62887242 62887717 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -725714 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 129.333-31 chr11 13965704 13965938 + 0.666667 NA intron (NM_006108, intron 1 of 15) intron (NM_006108, intron 1 of 15) 3098 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 180.667-89 chr22 27003996 27004449 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 56296 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 142.333-190 chr5 10020630 10021038 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117010 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 128-125 chr9 36202632 36202900 + 0.666667 NA intron (NM_001076677, intron 3 of 5) intron (NM_001076677, intron 3 of 5) 11845 NM_001184760 1211 Hs.522114 NM_001833 ENSG00000122705 CLTA LCA clathrin light chain A protein-coding 120-111 chr5 76615443 76615743 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001256566, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001256566, exon 2 of 2) 6498 NM_001285462 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 183-9 chr1 183383841 183384373 + 0.666667 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 34273 NM_015039 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 183.333-47 chr14 65350902 65351327 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -15931 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 131-56 chr20 54709573 54709910 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 234148 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 149.667-178 chr19 49900880 49901219 + 0.666667 NA intron (NR_047577, intron 4 of 10) intron (NR_047577, intron 4 of 10) -4162 NM_152899 259307 Hs.574492 NM_152899 ENSG00000104951 IL4I1 FIG1|LAAO|LAO interleukin 4 induced 1 protein-coding 151.333-255 chr21 31133631 31134070 + 0.666667 NA intron (NM_001353684, intron 8 of 12) AluSc|SINE|Alu 27090 NM_001353684 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 183.667-16 chr1 205909298 205909617 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 19437 NR_046098 284581 NR_046097 LOC284581 - uncharacterized LOC284581 ncRNA 113-211 chr8 125054232 125054548 + 0.666667 NA intron (NM_014846, intron 17 of 28) L1ME5|LINE|L1 37402 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 187.333-14 chr1 227278386 227278798 + 0.666667 NA intron (NM_001366019, intron 1 of 36) intron (NM_001366019, intron 1 of 36) 39900 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 292.333-16 chr15 57910048 57910797 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 103601 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 202.333-92 chr2 133289811 133290276 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 4 of 17) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 23848 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 131.667-53 chr13 90559171 90559558 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 66076 NR_120414 101927224 Hs.385801 NR_120414 LINC01049 - long intergenic non-protein coding RNA 1049 ncRNA 146.333-116 chr16 29950738 29951009 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -11206 NM_001369689 124446 Hs.460574 NM_194280 ENSG00000149932 TMEM219 IGFBP-3R transmembrane protein 219 protein-coding 175-15 chr11 99137571 99137890 + 0.666667 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 116781 NM_001243270 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 222-7 chr1 204392172 204392711 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 19376 NM_032833 84919 Hs.304376 NM_032833 ENSG00000158615 PPP1R15B CREP|MSSGM2 protein phosphatase 1 regulatory subunit 15B protein-coding 130-80 chr4 56442042 56442339 + 0.666667 NA intron (NM_006452, intron 3 of 9) L3|LINE|CR1 5930 NM_001079524 10606 Hs.518774 NM_006452 ENSG00000128050 PAICS ADE2|ADE2H1|AIRC|PAIS phosphoribosylaminoimidazole carboxylase and phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase protein-coding 139-84 chr5 106973634 106973888 + 0.666667 NA intron (NR_104671, intron 1 of 3) intron (NR_104671, intron 1 of 3) 37253 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 208-97 chr22 25382433 25382845 + 0.666667 NA Intergenic (CCTAGCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1062 NM_001135772 91355 Hs.634058 NM_182492 ENSG00000100068 LRP5L - LDL receptor related protein 5 like protein-coding 116.333-38 chr10 102800844 102801135 + 0.666667 NA intron (NM_001083913, intron 2 of 3) intron (NM_001083913, intron 2 of 3) 24768 NM_017787 54838 Hs.500897 NM_017787 ENSG00000166272 WBP1L C10orf26|OPA1L|OPAL1 WW domain binding protein 1 like protein-coding 131.333-176 chr8 73119634 73119947 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26618 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 116-50 chr15 60866159 60866395 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) L1MA4|LINE|L1 184708 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 158-92 chr3 190861488 190861802 + 0.666667 NA intron (NM_001146686, intron 1 of 4) intron (NM_001146686, intron 1 of 4) 1049 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 268-56 chr7 130948702 130949302 + 0.666667 NA intron (NR_024153, intron 3 of 4) intron (NR_024153, intron 3 of 4) 35538 NR_109780 100506860 Hs.635013 NR_109780 LINC00513 - long intergenic non-protein coding RNA 513 ncRNA 188-45 chr17 72794740 72795093 + 0.666667 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -154444 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 196-172 chr7 103396444 103396983 + 0.666667 NA intron (NR_135802, intron 9 of 17) L1MB2|LINE|L1 46498 NR_120443 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 113-131 chr3 1431264 1431469 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 338342 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 185-42 chr22 46682836 46683240 + 0.666667 NA TTS (NM_001366660) TTS (NM_001366660) 55214 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 153-154 chr9 69245387 69245695 + 0.666667 NA intron (NM_001369870, intron 18 of 23) intron (NM_001369870, intron 18 of 23) 40386 NM_001369875 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 133.333-20 chr10 1312177 1312523 + 0.666667 NA intron (NM_018702, intron 3 of 9) intron (NM_018702, intron 3 of 9) 152582 NR_015376 399706 Hs.721191 NM_001010910 ENSG00000229205 LINC00200 C10orf139|NCRNA00200 long intergenic non-protein coding RNA 200 ncRNA 182.667-82 chr2 233487398 233487795 + 0.666667 NA intron (NM_001365479, intron 28 of 31) intron (NM_001365479, intron 28 of 31) 77977 NM_018218 55230 Hs.96513 NM_018218 ENSG00000085982 USP40 - ubiquitin specific peptidase 40 protein-coding 137.667-123 chr3 71471632 71471956 + 0.666667 NA intron (NR_146142, intron 3 of 19) intron (NR_146142, intron 3 of 19) 70295 NR_031697 100302112 NR_031697 ENSG00000221264 MIR1284 MIRN1284|hsa-mir-1284|mir-1284 microRNA 1284 ncRNA 140.333-12 chr1 114607467 114607879 + 0.666667 NA intron (NM_001256404, intron 10 of 20) L2b|LINE|L2 -26058 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 129-30 chr12 85114628 85115010 + 0.666667 NA intron (NM_001079910, intron 15 of 26) intron (NM_001079910, intron 15 of 26) 78468 NM_001079910 84125 Hs.402200 NM_032165 ENSG00000133640 LRRIQ1 - leucine rich repeats and IQ motif containing 1 protein-coding 125-102 chr6 101295807 101296108 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103028 NM_021956 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 141.333-210 chr6 67241777 67242100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -813413 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 398-4 chr14 45025373 45026324 + 0.666667 NA exon (NM_015091, exon 8 of 19) exon (NM_015091, exon 8 of 19) -58268 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 183-83 chr5 36050184 36050670 + 0.666667 NA intron (NM_001168316, intron 2 of 5) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 16455 NM_001168316 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 159-94 chr5 53344626 53344933 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -135850 NM_006350 10468 Hs.9914 NM_006350 ENSG00000134363 FST FS follistatin protein-coding 144.667-259 chr6 42909751 42910025 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -6101 NM_001243169 171558 Hs.169002 NM_138296 ENSG00000171611 PTCRA PT-ALPHA|PTA pre T cell antigen receptor alpha protein-coding 113-106 chr2 80365074 80365390 + 0.666667 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) intron (NM_001282599, intron 1 of 11) 51853 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 117 chr1 40165115 40165302 + 0.666667 NA intron (NM_012421, intron 1 of 7) intron (NM_012421, intron 1 of 7) 3821 NM_012421 6018 Hs.205627 NM_012421 ENSG00000117000 RLF ZN-15L|ZNF292L rearranged L-myc fusion protein-coding 160.333-153 chr2 181495838 181496297 + 0.666667 NA intron (NM_000885, intron 14 of 27) intron (NM_000885, intron 14 of 27) 38681 NM_000885 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 157.667-182 chr22 34827377 34827710 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) LTR16|LTR|ERVL 170373 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 151.333-95 chr12 12777047 12777345 + 0.666667 NA intron (NM_001130415, intron 1 of 1) intron (NM_001130415, intron 1 of 1) -8463 NM_030817 81575 Hs.23388 NM_030817 ENSG00000178878 APOLD1 VERGE apolipoprotein L domain containing 1 protein-coding 160-46 chr15 71774290 71774726 + 0.666667 NA intron (NM_001286429, intron 11 of 11) L1M5|LINE|L1 -36046 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 193-7 chr1 183362160 183362714 + 0.666667 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) L1MB7|LINE|L1 55943 NM_015039 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 155.667-286 chr5 95701168 95701455 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001349303, exon 4 of 9) 5' UTR (NM_001349303, exon 4 of 9) -18301 NR_125328 83890 Hs.50499 NM_031952 ENSG00000145757 SPATA9 NYD-SP16 spermatogenesis associated 9 protein-coding 197.333-166 chr4 60292713 60293131 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -629697 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 116.333-14 chr1 115206588 115206835 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -76323 NR_157569 112840934 NR_157569 NGF-AS1 - NGF antisense RNA 1 ncRNA 157-41 chr14 26307163 26307515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 246091 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 235-6 chr1 160448342 160448772 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 47993 NM_020335 57216 Hs.99477 NM_020335 ENSG00000162738 VANGL2 LPP1|LTAP|STB1|STBM|STBM1 VANGL planar cell polarity protein 2 protein-coding 154-14 chr10 33911889 33912237 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -139383 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 182-67 chr3 77639300 77639644 + 0.666667 NA intron (NM_001290039, intron 25 of 26) L2a|LINE|L2 409491 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 195.667-91 chr3 94914191 94914634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23851 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 178.667-169 chr9 1214292 1214683 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 163000 NM_001370532 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 186-38 chr15 62911592 62912015 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 87846 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 217.667-67 chr4 87276938 87277460 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 23384 NR_049891 100847027 NR_049891 ENSG00000263981 MIR5705 - microRNA 5705 ncRNA 196.667-147 chr7 96522770 96523232 + 0.666667 NA intron (NR_163953, intron 2 of 5) intron (NR_163953, intron 2 of 5) -19478 NR_163948 197-27 chr12 33265617 33266002 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 174010 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 192.667-10 chr1 161934155 161934627 + 0.666667 NA intron (NM_007348, intron 15 of 15) intron (NM_007348, intron 15 of 15) 90074 NM_015441 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 216.667-11 chr1 210080398 210080882 + 0.666667 NA intron (NM_153262, intron 4 of 7) L2c|LINE|L2 142423 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 144.667-151 chr2 141400176 141400498 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 3 of 90) MIRb|SINE|MIR 731364 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 154-136 chr7 131168229 131168601 + 0.666667 NA intron (NM_001145354, intron 2 of 18) intron (NM_001145354, intron 2 of 18) 58321 NM_001145354 4289 Hs.44693 NM_013255 ENSG00000128585 MKLN1 TWA2 muskelin 1 protein-coding 192.667-108 chr3 99236643 99236947 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -335100 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 138-19 chr10 88563247 88563623 + 0.666667 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) L1M5|LINE|L1 19883 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 136.333-44 chr12 90619547 90619868 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -298316 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 212.667-10 chr1 183924694 183925262 + 0.666667 NA intron (NM_001297669, intron 18 of 18) AluSq|SINE|Alu 112750 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 127.667-117 chr3 96722682 96723062 + 0.666667 NA Intergenic MER113|DNA|hAT-Charlie -91722 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 111.667-203 chr5 56182160 56182459 + 0.666667 NA intron (NM_024669, intron 3 of 11) L1MDa|LINE|L1 51021 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 276-14 chr11 113643369 113644061 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62593 NM_001288752 80975 Hs.46720 NM_030770 ENSG00000166682 TMPRSS5 SPINESIN transmembrane serine protease 5 protein-coding 232-28 chr14 59717772 59718178 + 0.666667 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) MER5A|DNA|hAT-Charlie -70955 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 126.667-76 chr2 62382337 62382635 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 123709 NM_198276 200728 Hs.308028 NM_198276 ENSG00000186889 TMEM17 - transmembrane protein 17 protein-coding 113.667-136 chr3 55984112 55984329 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 11 of 17) intron (NR_132749, intron 11 of 17) -131626 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 127.333-170 chr7 42126543 42126890 + 0.666667 NA intron (NM_000168, intron 3 of 14) intron (NM_000168, intron 3 of 14) 110493 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 128.333-160 chr5 127210844 127211060 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79812 NM_001308119 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 184-70 chr3 181343428 181343801 + 0.666667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 98872 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 153-61 chr17 52659426 52659773 + 0.666667 NA Intergenic LTR44|LTR|ERV1 -202522 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 163-50 chr21 25227478 25227849 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 204038 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 152.667-226 chr21 35091388 35091832 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42312 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 112.333-141 chr2 201054126 201054326 + 0.666667 NA intron (NM_001321629, intron 1 of 12) MER68|LTR|ERVL 17445 NM_001321618 285172 Hs.24701 NM_173822 ENSG00000155744 FAM126B HYCC2 family with sequence similarity 126 member B protein-coding 147.667-55 chr11 50402935 50403230 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -6065 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 134.333-137 chr5 40633558 40633793 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -46240 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 151-77 chr22 27173897 27174188 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -13474 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 135.667-149 chr5 144531297 144531582 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 326048 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 152-118 chr4 118187441 118187747 + 0.666667 NA intron (NM_004784, intron 6 of 13) MER57A-int|LTR|ERV1 -91168 NR_003584 100093630 Hs.535762 NR_003584 ENSG00000269893 SNHG8 LINC00060|NCRNA00060 small nucleolar RNA host gene 8 ncRNA 222.333-99 chr9 70484952 70485478 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70558 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 159.667-230 chr4 55921211 55921534 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27573 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 112.667-149 chr20 22940747 22940940 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -94577 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 189.667-107 chr4 69496601 69497111 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001297615) promoter-TSS (NM_001297615) -951 NM_021139 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 165-103 chrX 57533396 57533643 + 0.666667 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -58317 NM_007157 158586 Hs.156257 NM_007157 ENSG00000198455 ZXDB ZNF905|dJ83L6.1 zinc finger X-linked duplicated B protein-coding 121.333-100 chr20 43291551 43291871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101805 NM_007050 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 115.333-108 chr2 41239521 41239855 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -637867 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 195-104 chr8 78529134 78529551 + 0.666667 NA intron (NM_181839, intron 1 of 2) intron (NM_181839, intron 1 of 2) 13002 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 202.333-133 chr4 150322555 150322897 + 0.666667 NA intron (NM_001367550, intron 49 of 56) intron (NM_001367550, intron 49 of 56) 244281 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 167.333-258 chr8 88706538 88706862 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -379217 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 157.667-87 chr13 32177483 32177863 + 0.666667 NA intron (NM_023037, intron 20 of 60) intron (NM_023037, intron 20 of 60) 134281 NM_001136571 646799 Hs.569254 NM_001136571 ENSG00000189167 ZAR1L Z3CXXC7|ZAR2 zygote arrest 1 like protein-coding 120.333-135 chr3 179021417 179021768 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_022470, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_022470, exon 6 of 6) 50217 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 117.333-21 chr10 28913193 28913401 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66889 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 196.333-19 chr11 45677404 45677967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12063 NM_003654 8534 Hs.104576 NM_003654 ENSG00000175264 CHST1 C6ST|GST-1|KS6ST|KSGal6ST|KSST carbohydrate sulfotransferase 1 protein-coding 149.667-326 chr5 98372846 98373129 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -211748 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 150-118 chr5 126019985 126020328 + 0.666667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -159421 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 134.667-67 chr14 87529693 87529956 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 125470 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 131.667-183 chr7 49739839 49740092 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -33673 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 228 chr1 24475622 24476032 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26517 NM_001251979 11123 Hs.656799 NM_013441 ENSG00000117602 RCAN3 DSCR1L2|MCIP3|RCN3|hRCN3 RCAN family member 3 protein-coding 198-195 chr9 31308811 31309137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72516 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 184.667-15 chr10 27827649 27828052 + 0.666667 NA intron (NM_018076, intron 19 of 19) L2c|LINE|L2 -82031 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 202.333-182 chr8 129608830 129609268 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 -34031 NR_130920 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 148-136 chr5 140134671 140135038 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 8917 NM_001007189 492311 Hs.696360 NM_001007189 ENSG00000182700 IGIP C5orf53 IgA inducing protein protein-coding 123-26 chr11 36158664 36158940 + 0.666667 NA intron (NM_001304263, intron 3 of 4) L1MA6|LINE|L1 -80901 NR_135064 101928510 Hs.675857 NR_135064 LOC101928510 - uncharacterized LOC101928510 ncRNA 187.333-77 chr16 74198696 74199118 + 0.666667 NA intron (NR_104657, intron 3 of 3) intron (NR_104657, intron 3 of 3) 16614 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 152.667-381 chr8 113129197 113129462 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 4 of 66) intron (NM_001363185, intron 4 of 66) 247823 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 154.333-21 chr1 184700619 184700983 + 0.666667 NA intron (NM_025191, intron 19 of 19) intron (NM_025191, intron 19 of 19) 54057 NR_135118 80267 Hs.523811 NM_025191 ENSG00000116406 EDEM3 C1orf22 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3 protein-coding 143.667-230 chr7 38693254 38693583 + 0.666667 NA Intergenic Tigger8|DNA|TcMar-Tigger -6329 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 122-95 chr5 54010143 54010383 + 0.666667 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -58664 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 170.333-216 chr8 34874995 34875411 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 91282 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 153-98 chr4 34096098 34096409 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -56360 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 204.667-29 chr12 4182626 4183126 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -90886 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 155.667-155 chr2 32020656 32020950 + 0.666667 NA intron (NM_001321210, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR -9795 NR_126034 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 212.333-113 chr5 36224226 36224775 + 0.666667 NA intron (NM_001085411, intron 4 of 11) AluSz|SINE|Alu 16891 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 149.333-399 chr8 95176620 95176900 + 0.666667 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 39614 NR_046232 619344 Hs.741630 NR_046232 ENSG00000253351 LINC01298 C8orf69 long intergenic non-protein coding RNA 1298 ncRNA 114.333-92 chr18 41541075 41541320 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20520 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 258.333-46 chr4 6993367 6994023 + 0.666667 NA intron (NM_001286805, intron 1 of 11) intron (NM_001286805, intron 1 of 11) 6187 NM_001286805 57533 Hs.518611 NM_020773 ENSG00000132405 TBC1D14 - TBC1 domain family member 14 protein-coding 158.333-85 chr14 54296622 54296968 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -100073 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 179.333-18 chr1 233641738 233642152 + 0.666667 NA intron (NM_002245, intron 1 of 2) MER34B|LTR|ERV1 17793 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 144-59 chr15 67132295 67132710 + 0.666667 NA intron (NM_001145102, intron 1 of 8) intron (NM_001145102, intron 1 of 8) -5519 NM_001145103 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 153-12 chr10 33612466 33612914 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 159990 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 122.333-114 chr2 204015909 204016121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 79267 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 205-32 chr14 71134188 71134642 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -186061 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 114.333-22 chr10 32427514 32427685 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 18457 NR_120660 101929431 Hs.639819 NR_120660 LOC101929431 - uncharacterized LOC101929431 ncRNA 121.333-43 chr12 54596181 54596398 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7630 NM_006741 5502 Hs.505662 NM_006741 ENSG00000135447 PPP1R1A I1|IPP1 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1A protein-coding 130-97 chr5 107089458 107089728 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78579 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 166.333-236 chr8 142714044 142714527 + 0.666667 NA intron (NR_038925, intron 1 of 2) intron (NR_038925, intron 1 of 2) 12688 NR_038925 100288181 Hs.716823 NR_038925 ENSG00000253741 LNCOC1 Lnc-OC1 lncRNA associated with ovarian cancer 1 ncRNA 239.667-24 chr15 63759018 63759533 + 0.666667 NA intron (NM_003922, intron 3 of 77) intron (NM_003922, intron 3 of 77) 74673 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 156-125 chr6 121638778 121639132 + 0.666667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 203309 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 129-14 chr10 27567045 27567301 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 62869 NM_021252 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 150.333-138 chr15 92682529 92682830 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26904 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 174.667-82 chr2 60098758 60099126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 284094 NR_132991 106660609 Hs.565545 NR_132991 ENSG00000228590 MIR4432HG - MIR4432 host gene ncRNA 167-68 chr22 26206058 26206468 + 0.666667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 36789 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 144.667-316 chr8 135084535 135084818 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -149455 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 136.667-124 chr4 33717768 33718139 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 321940 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 255-10 chr10 51400264 51400821 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 100969 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 178-50 chr15 91640685 91641080 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 177543 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 112.333-252 chr7 96858336 96858615 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -147078 NM_005222 1750 Hs.249196 NM_005222 ENSG00000006377 DLX6 - distal-less homeobox 6 protein-coding 117-44 chr13 109917105 109917353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -130646 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 149.667-27 chr1 114324386 114324758 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -170703 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 137.667-105 chr2 213954155 213954507 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 11 of 14) L1MB7|LINE|L1 196264 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 117.333-177 chr5 156006225 156006504 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -320393 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 189.667-80 chr2 197810876 197811279 + 0.666667 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) intron (NM_006226, intron 1 of 5) 6484 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 159.667-55 chr10 97248850 97249310 + 0.666667 NA intron (NM_001204300, intron 5 of 10) intron (NM_001204300, intron 5 of 10) 21577 NM_001256423 84986 Hs.80305 NM_032900 ENSG00000213390 ARHGAP19 - Rho GTPase activating protein 19 protein-coding 136-110 chr9 18255628 18255972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -218353 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 127-45 chr2 59131962 59132173 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -85641 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 260.667-72 chr5 39097652 39098240 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -23547 NM_001285440 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 132-74 chr20 56943110 56943384 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -270449 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 138.667-126 chr3 1205887 1206216 + 0.666667 NA intron (NM_001289080, intron 2 of 22) LTR37A|LTR|ERV1 113027 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 205-29 chr14 30520449 30521039 + 0.666667 NA intron (NR_151720, intron 3 of 3) intron (NR_151720, intron 3 of 3) -38379 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 160-89 chr4 113423686 113424122 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 131065 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 159-13 chr10 28066084 28066446 + 0.666667 NA intron (NR_134518, intron 12 of 16) intron (NR_134518, intron 12 of 16) 7113 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 130.333-196 chr7 77655539 77655870 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 40561 NR_134253 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 127-111 chrX 100599252 100599611 + 0.666667 NA intron (NM_022144, intron 6 of 6) intron (NM_022144, intron 6 of 6) 14495 NM_022144 64102 Hs.132957 NM_022144 ENSG00000000005 TNMD BRICD4|CHM1L|TEM tenomodulin protein-coding 132-104 chr5 131952648 131952983 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001205247, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001205247, exon 21 of 21) -7152 NM_001303622 728637 Hs.631802 NM_001278059 ENSG00000239642 MEIKIN - meiotic kinetochore factor protein-coding 116-27 chr11 33867235 33867534 + 0.666667 NA intron (NM_001142315, intron 2 of 3) intron (NM_001142315, intron 2 of 3) 2494 NM_001142316 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 250.667 chr1 59790887 59791478 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 18387 NR_110627 101926944 Hs.720353 NR_110627 LOC101926944 - uncharacterized LOC101926944 ncRNA 133.667-27 chr11 80750778 80751143 + 0.666667 NA TTS (NR_120570) TTS (NR_120570) 11843 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 149.333-6 chr1 42565370 42565667 + 0.666667 NA intron (NM_001355224, intron 12 of 22) L1MA7|LINE|L1 32498 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 293.667-9 chr11 65844125 65844716 + 0.666667 NA intron (NM_152760, intron 1 of 12) FLAM_C|SINE|Alu 10457 NM_152760 254122 Hs.591950 NM_152760 ENSG00000172803 SNX32 SNX6B sorting nexin 32 protein-coding 197.667-70 chr2 167769062 167769538 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49372 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 172-83 chr4 71524150 71524517 + 0.666667 NA intron (NM_003759, intron 13 of 22) intron (NM_003759, intron 13 of 22) 185280 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 154-2 chr1 51544348 51544666 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -25241 NM_001981 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 199.333-67 chr14 39154208 39154797 + 0.666667 NA intron (NM_001079537, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu 15831 NM_177452 122553 Hs.13303 NM_177452 ENSG00000182400 TRAPPC6B NEDMEBA|TPC6 trafficking protein particle complex 6B protein-coding 140.667-64 chr12 69328296 69328661 + 0.666667 NA Intergenic Charlie20a|DNA|hAT-Charlie -19876 NM_000239 4069 Hs.524579 NM_000239 ENSG00000090382 LYZ LYZF1|LZM lysozyme protein-coding 118-104 chr5 94363319 94363540 + 0.666667 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) intron (NM_001145678, intron 20 of 20) -251730 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 128-38 chr18 4847164 4847385 + 0.666667 NA Intergenic UCON31|Unknown|Unknown -233908 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 176.667-21 chr1 219972647 219973103 + 0.666667 NA intron (NM_004446, intron 29 of 31) MER5B|DNA|hAT-Charlie -44224 NR_046437 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 144-135 chr5 143662595 143662848 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17139 NR_049829 100846991 NR_049829 ENSG00000266478 MIR5197 - microRNA 5197 ncRNA 121.333-132 chr4 54885917 54886126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 228093 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 152.333-237 chr3 78119946 78120315 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71167 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 167.667-191 chr6 159607689 159608147 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 85323 NM_000636 6648 Hs.487046 NM_000636 ENSG00000112096 SOD2 IPO-B|IPOB|MNSOD|MVCD6|Mn-SOD superoxide dismutase 2 protein-coding 179-62 chr22 27178434 27178834 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8882 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 146.333-260 chr5 83073310 83073639 + 0.666667 NA intron (NM_174909, intron 1 of 3) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 3920 NM_174909 153339 Hs.355606 NM_174909 ENSG00000174695 TMEM167A TMEM167 transmembrane protein 167A protein-coding 114.667-38 chr10 85489816 85490140 + 0.666667 NA intron (NR_120671, intron 5 of 5) L1MA9|LINE|L1 40386 NR_120671 101929684 Hs.554059 NR_120671 ENSG00000230962 LINC01520 - long intergenic non-protein coding RNA 1520 ncRNA 122.333-24 chr10 84157248 84157477 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14714 NR_134505 642934 NR_134505 ENSG00000285972 CERNA2 HOST2|lncRNA-HOST2 competing endogenous lncRNA 2 for microRNA let-7b ncRNA 131.667-214 chr9 74328531 74328782 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -42875 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 148.333-270 chr4 7887064 7887407 + 0.666667 NA intron (NM_198595, intron 1 of 16) intron (NM_198595, intron 1 of 16) -14927 NM_001371090 155.333-363 chr7 36951026 36951438 + 0.666667 NA intron (NM_001206480, intron 16 of 21) L2b|LINE|L2 -31800 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 196.333-177 chrX 31733396 31733844 + 0.666667 NA intron (NM_000109, intron 51 of 78) intron (NM_000109, intron 51 of 78) -225322 NM_004014 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 197-85 chr4 151633867 151634328 + 0.666667 NA intron (NM_001109977, intron 8 of 13) L1MB2|LINE|L1 126910 NM_004564 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 153-15 chr10 89803162 89803551 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -26137 NR_038382 643529 Hs.618956 NR_038382 ENSG00000232229 LINC00865 - long intergenic non-protein coding RNA 865 ncRNA 150.667-52 chr10 116477255 116477652 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001011709, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001011709, exon 12 of 12) 49606 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 198.667-161 chr6 62841678 62842167 + 0.666667 NA Intergenic SATR1|Satellite|Satellite 478055 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 143-20 chr10 101637027 101637371 + 0.666667 NA intron (NR_136613, intron 4 of 7) AluY|SINE|Alu -35702 NR_036115 100423033 NR_036115 ENSG00000283558 MIR3158-2 mir-3158-2 microRNA 3158-2 ncRNA 112.333-275 chr9 29037400 29037635 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -148562 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 125-58 chr2 117642132 117642475 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -172388 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 166-66 chr2 156922384 156922721 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -335153 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 114.333-200 chr6 156700400 156700655 + 0.666667 NA Intergenic UCON8|DNA|DNA -77328 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 155.667-248 chr4 72641765 72642171 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72747 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 154.667-84 chr12 90004637 90004961 + 0.666667 NA Intergenic (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 57106 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 148-155 chr8 52903949 52904253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35807 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 249.333-95 chr8 13120734 13121461 + 0.666667 NA intron (NM_001348082, intron 5 of 16) intron (NM_001348082, intron 5 of 16) -4853 NM_001164271 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 146-4 chr1 70320960 70321247 + 0.666667 NA intron (NM_030816, intron 3 of 12) intron (NM_030816, intron 3 of 12) 33619 NM_030816 81573 Hs.744989 NM_030816 ENSG00000118454 ANKRD13C dJ677H15.3 ankyrin repeat domain 13C protein-coding 151.667-373 chr8 110362444 110362859 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -386880 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 118.333-203 chr8 89967675 89967942 + 0.666667 NA intron (NM_001024688, intron 8 of 16) MamRep1527|LTR|LTR 16863 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 151.667-19 chr1 151730379 151730651 + 0.666667 NA TTS (NM_001144956) TTS (NM_001144956) 8993 NM_001144956 284485 Hs.297967 NM_001144956 ENSG00000178796 RIIAD1 C1orf230|NCRNA00166 regulatory subunit of type II PKA R-subunit (RIIa) domain containing 1 protein-coding 146.333-135 chr18 77237267 77237537 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12446 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 136-23 chr13 31950738 31951035 + 0.666667 NA intron (NR_027062, intron 2 of 3) intron (NR_027062, intron 2 of 3) 80753 NR_103839 100507099 Hs.536364 NR_103839 FRY-AS1 - FRY antisense RNA 1 ncRNA 148-13 chr1 210229152 210229523 + 0.666667 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 -3459 NM_019605 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 158-63 chr17 62043849 62044168 + 0.666667 NA intron (NM_005121, intron 3 of 29) intron (NM_005121, intron 3 of 29) 21270 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 139.667-111 chr22 46293412 46293673 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_017931, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_017931, exon 14 of 14) 3118 NR_024009 150384 Hs.348663 NR_024009 ENSG00000277232 GTSE1-DT CN5H6.4|GTSE1-AS1|LL22NC03-5H6.6 GTSE1 divergent transcript ncRNA 156-7 chr1 68523405 68523725 + 0.666667 NA intron (NR_110671, intron 1 of 2) intron (NR_110671, intron 1 of 2) -26483 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 205-64 chr4 4875555 4876162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16193 NM_002448 4487 Hs.424414 NM_002448 ENSG00000163132 MSX1 ECTD3|HOX7|HYD1|STHAG1 msh homeobox 1 protein-coding 145.667-177 chr3 97926466 97926747 + 0.666667 NA intron (NM_153605, intron 17 of 21) L1PA15|LINE|L1 45825 NM_153182 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 135.333-47 chr13 91096023 91096318 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6553 NR_104057 101930747 Hs.112745 NR_104057 LINC00380 - long intergenic non-protein coding RNA 380 ncRNA 166-2 chr1 14827897 14828358 + 0.666667 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) intron (NM_201628, intron 1 of 14) -96002 NM_001018000 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 187-17 chr12 12327765 12328247 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_018050, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_018050, exon 4 of 4) 22236 NM_001363613 54682 Hs.591145 NM_018050 ENSG00000111261 MANSC1 9130403P13Rik|LOH12CR3 MANSC domain containing 1 protein-coding 140.667-235 chr8 124362926 124363245 + 0.666667 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) MER57A-int|LTR|ERV1 9614 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 154.667-209 chr2 219528550 219528854 + 0.666667 NA intron (NM_018674, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 14395 NM_001195731 79586 Hs.516711 NM_024536 ENSG00000123989 CHPF CHSY2|CSS2 chondroitin polymerizing factor protein-coding 174.667-38 chr12 121934180 121934614 + 0.666667 NA intron (NM_001178003, intron 5 of 17) intron (NM_001178003, intron 5 of 17) 15805 NM_144668 144406 Hs.709837 NM_144668 ENSG00000158023 WDR66 CFAP251|CaM-IP4|SPGF33 WD repeat domain 66 protein-coding 174.333-150 chr8 123125066 123125402 + 0.666667 NA intron (NM_001363149, intron 11 of 21) intron (NM_001363149, intron 11 of 21) 51985 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 131.333-59 chr16 52511527 52511828 + 0.666667 NA intron (NM_001080430, intron 1 of 6) intron (NM_001080430, intron 1 of 6) 35466 NM_001080430 27324 Hs.132574 NM_001080430 ENSG00000103460 TOX3 CAGF9|TNRC9 TOX high mobility group box family member 3 protein-coding 129-85 chr3 42933782 42934051 + 0.666667 NA TTS (NR_122033) TTS (NR_122033) -2426 NM_001205272 100506243 Hs.720172 NM_015673 ENSG00000240747 KRBOX1 - KRAB box domain containing 1 protein-coding 256-17 chr11 94906479 94907045 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 66794 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 140-84 chr5 28375226 28375619 + 0.666667 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -87757 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 173-31 chr16 5400106 5400466 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 215964 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 178.667-60 chr16 70313219 70313608 + 0.666667 NA intron (NM_007242, intron 2 of 11) AluJo|SINE|Alu 14360 NM_007242 11269 Hs.221761 NM_007242 ENSG00000157349 DDX19B DBP5|DDX19|RNAh DEAD-box helicase 19B protein-coding 168.333-203 chr8 541375 541853 + 0.666667 NA intron (NM_001256113, intron 1 of 3) L1MC1|LINE|L1 3231 NM_001256113 157695 Hs.289293 NM_175075 ENSG00000180190 TDRP C8orf42|Inm01|TDRP1|TDRP2 testis development related protein protein-coding 138-25 chr12 10102768 10103035 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -3916 NM_001297749 51267 Hs.29549 NM_016511 ENSG00000150048 CLEC1A CLEC-1|CLEC1 C-type lectin domain family 1 member A protein-coding 154.667-338 chr6 62280567 62280874 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 5505 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 142.667-67 chr15 62552061 62552338 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 92982 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 136.667-161 chr6 157041030 157041368 + 0.666667 NA intron (NM_001363725, intron 2 of 17) intron (NM_001363725, intron 2 of 17) 4772 NM_001363725 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 116-58 chr17 5917248 5917521 + 0.666667 NA intron (NR_040000, intron 3 of 3) intron (NR_040000, intron 3 of 3) 145150 NR_040000 339166 Hs.736088 NR_040000 ENSG00000284837 LOC339166 - uncharacterized LOC339166 ncRNA 184-93 chr6 44391266 44391613 + 0.666667 NA intron (NM_001253, intron 2 of 15) AluY|SINE|Alu 3733 NM_001253 988 Hs.485471 NM_001253 ENSG00000096401 CDC5L CDC5|CDC5-LIKE|CEF1|PCDC5RP|dJ319D22.1 cell division cycle 5 like protein-coding 149-128 chr6 44603481 44603775 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51747 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 177.667-58 chr16 74953596 74954060 + 0.666667 NA intron (NM_001324172, intron 3 of 13) AluY|SINE|Alu 31295 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 163.333-14 chr1 112603947 112604351 + 0.666667 NA intron (NM_017744, intron 3 of 14) AluSz|SINE|Alu 14992 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 154.667-130 chr16 56145785 56146089 + 0.666667 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) L1MEd|LINE|L1 45157 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 150.667-396 chr9 72928448 72928789 + 0.666667 NA intron (NM_000689, intron 4 of 12) intron (NM_000689, intron 4 of 12) 24435 NM_000689 216 Hs.76392 NM_000689 ENSG00000165092 ALDH1A1 ALDC|ALDH-E1|ALDH1|ALDH11|HEL-9|HEL-S-53e|HEL12|PUMB1|RALDH1 aldehyde dehydrogenase 1 family member A1 protein-coding 145-84 chr4 146209383 146209769 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4962 NM_001354631 345051 Hs.170876 NM_001354631 ENSG00000250673 REELD1 - reeler domain containing 1 protein-coding 120-53 chr18 8452609 8452949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85745 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 124.667-194 chr7 109393837 109394161 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -509412 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 203.667-8 chr1 196310649 196311173 + 0.666667 NA intron (NM_001287820, intron 19 of 26) L2b|LINE|L2 -222196 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 153.667-100 chr12 115957169 115957593 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 191273 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 169-27 chr14 69444169 69444615 + 0.666667 NA intron (NM_001252148, intron 3 of 5) L1MC4a|LINE|L1 -40336 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 206.667-45 chr16 8306368 8306861 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 283224 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 112.333-247 chr7 46765440 46765625 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68410 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 123.333-90 chr17 56778430 56778634 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 55388 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 200.667-71 chr2 59233352 59233772 + 0.666667 NA intron (NR_110219, intron 1 of 2) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 15854 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 151.667-58 chr11 5618681 5619129 + 0.666667 NA intron (NM_001003819, intron 7 of 13) intron (NM_001003819, intron 7 of 13) -1039 NM_001003827 53840 Hs.729048 NM_021616 ENSG00000258659 TRIM34 IFP1|RNF21 tripartite motif containing 34 protein-coding 163.667-205 chr5 145486385 145486773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 348763 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 155.667-101 chr14 69958256 69958580 + 0.666667 NA intron (NM_001034852, intron 3 of 11) L1M5|LINE|L1 -19715 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 152.333-39 chr10 30486055 30486373 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51568 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 147.667-361 chr8 90671762 90672162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25879 NM_001008495 169200 Hs.567759 NM_001008495 ENSG00000180694 TMEM64 - transmembrane protein 64 protein-coding 233-35 chr2 17098246 17098799 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 419918 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 139-39 chr17 10535187 10535497 + 0.666667 NA exon (NM_017534, exon 18 of 40) exon (NM_017534, exon 18 of 40) 14281 NM_001100112 4620 Hs.667534 NM_017534 ENSG00000125414 MYH2 IBM3|MYH2A|MYHSA2|MYHas8|MYPOP|MyHC-2A|MyHC-IIa myosin heavy chain 2 protein-coding 135-82 chr5 17986616 17986925 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 179496 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 188-22 chr10 97271610 97271929 + 0.666667 NA intron (NM_032900, intron 1 of 11) AluSq4|SINE|Alu -1112 NM_001256423 84986 Hs.80305 NM_032900 ENSG00000213390 ARHGAP19 - Rho GTPase activating protein 19 protein-coding 131.667-49 chr12 124240314 124240569 + 0.666667 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 -48723 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 142.333-12 chr1 185910614 185910915 + 0.666667 NA intron (NM_031935, intron 5 of 106) AluSg|SINE|Alu 176373 NM_031935 83872 Hs.58877 NM_031935 ENSG00000143341 HMCN1 ARMD1|FBLN6|FIBL-6|FIBL6 hemicentin 1 protein-coding 131.667-123 chr22 43957234 43957552 + 0.666667 NA intron (NM_015380, intron 1 of 14) intron (NM_015380, intron 1 of 14) 1951 NM_015380 25813 Hs.505824 NM_015380 ENSG00000100347 SAMM50 CGI-51|OMP85|SAM50|TOB55|TRG-3|YNL026W SAMM50 sorting and assembly machinery component protein-coding 134-12 chr10 31687639 31687885 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 221164 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 155-78 chr20 35481274 35481586 + 0.666667 NA intron (NM_007186, intron 20 of 34) AluJb|SINE|Alu 21447 NM_001318219 11190 Hs.443976 NM_007186 ENSG00000126001 CEP250 C-NAP1|CEP2|CNAP1|CRDHL2 centrosomal protein 250 protein-coding 156.333-280 chr5 35031533 35031852 + 0.666667 NA intron (NM_031900, intron 7 of 13) intron (NM_031900, intron 7 of 13) 16257 NM_031900 64902 Hs.34494 NM_031900 ENSG00000113492 AGXT2 AGT2|BAIBA|DAIBAT alanine--glyoxylate aminotransferase 2 protein-coding 125.667-2 chr1 6676825 6677132 + 0.666667 NA intron (NM_018198, intron 3 of 15) AluSp|SINE|Alu 24838 NM_018198 55735 Hs.462640 NM_018198 ENSG00000007923 DNAJC11 dJ126A5.1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C11 protein-coding 189.333-19 chr1 171276827 171277119 + 0.666667 NA intron (NM_001282694, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 19050 NM_001282692 2326 Hs.1424 NM_002021 ENSG00000010932 FMO1 - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 1 protein-coding 113.333-265 chr8 139076901 139077230 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -163024 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 146.667-281 chr6 75455024 75455305 + 0.666667 NA intron (NR_125859, intron 6 of 8) intron (NR_125859, intron 6 of 8) 26757 NR_039670 100616389 NR_039670 ENSG00000263533 MIR4463 - microRNA 4463 ncRNA 155.667-243 chr4 46587936 46588359 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -198019 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 164.667-187 chr5 61001172 61001622 + 0.666667 NA intron (NM_174889, intron 1 of 3) intron (NM_174889, intron 1 of 3) 56192 NM_174889 91942 Hs.591757 NM_174889 ENSG00000164182 NDUFAF2 B17.2L|MC1DN10|MMTN|NDUFA12L|mimitin NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 protein-coding 152.667-91 chr12 118310913 118311293 + 0.666667 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) intron (NM_001346490, intron 1 of 21) 48602 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 261-17 chr12 8104795 8105349 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -18560 NM_016184 50856 Hs.504657 NM_016184 ENSG00000111729 CLEC4A CD367|CLECSF6|DCIR|DDB27|HDCGC13P|LLIR C-type lectin domain family 4 member A protein-coding 135-101 chr7 33491957 33492241 + 0.666667 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) AluSz|SINE|Alu 362535 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 176.333-24 chr10 88347254 88347551 + 0.666667 NA intron (NM_018363, intron 5 of 6) intron (NM_018363, intron 5 of 6) 235916 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 118.333-111 chr2 104457753 104458030 + 0.666667 NA intron (NR_015399, intron 1 of 3) L1MD2|LINE|L1 23544 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 213.333-60 chr14 81003095 81003523 + 0.666667 NA intron (NM_001142626, intron 1 of 8) L2c|LINE|L2 47688 NM_000369 7253 Hs.160411 NM_000369 ENSG00000165409 TSHR CHNG1|LGR3|hTSHR-I thyroid stimulating hormone receptor protein-coding 170 chr1 51456936 51457369 + 0.666667 NA intron (NM_001981, intron 8 of 24) AluYm1|SINE|Alu -35057 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 114.333-245 chrX 152448760 152448991 + 0.666667 NA intron (NM_000808, intron 1 of 9) intron (NM_000808, intron 1 of 9) 2440 NM_000808 2556 Hs.123024 NM_000808 ENSG00000011677 GABRA3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha3 subunit protein-coding 134.667-147 chr4 112768861 112769212 + 0.666667 NA intron (NM_001354269, intron 1 of 43) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -48961 NM_001354276 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 148.667-219 chr20 34490325 34490637 + 0.666667 NA intron (NM_001257137, intron 23 of 25) AluSc8|SINE|Alu 24156 NR_030374 693229 NR_030374 ENSG00000207997 MIR644A MIR644|MIRN644|hsa-mir-644|hsa-mir-644a microRNA 644a ncRNA 300.667-24 chr20 38171531 38172287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5401 NM_001323316 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 164.333-197 chr5 95298571 95298944 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -14182 NM_024717 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 113.333-79 chr14 86064110 86064337 + 0.666667 NA intron (NR_110155, intron 1 of 3) intron (NR_110155, intron 1 of 3) 129545 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 173-13 chr11 32858064 32858438 + 0.666667 NA TTS (NM_024081) TTS (NM_024081) 28324 NM_024081 79056 Hs.471695 NM_024081 ENSG00000135378 PRRG4 PRGP4|TMG4 proline rich and Gla domain 4 protein-coding 147.333-224 chr3 132991437 132991838 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46651 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 124-89 chr4 115841555 115841773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -458061 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 117.333-190 chr7 46283443 46283728 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -362313 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 198.333-22 chr10 19097782 19098189 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 4 of 39) MER41C|LTR|ERV1 49184 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 119-118 chr5 25803908 25804165 + 0.666667 NA Intergenic THE1-int|LTR|ERVL-MaLR 613083 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 187.333-98 chr2 69333310 69333736 + 0.666667 NA intron (NM_002056, intron 14 of 18) intron (NM_002056, intron 14 of 18) 53704 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 124-24 chr11 26234892 26235097 + 0.666667 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) MLT2B1|LTR|ERVL 45871 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 116-130 chr5 144681064 144681288 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 475785 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 159.333-326 chr8 87676179 87676563 + 0.666667 NA Intergenic MER11B|LTR|ERVK 197644 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 144.667-152 chr2 149481836 149482111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105385 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 136.333-54 chr14 57773652 57773956 + 0.666667 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) intron (NR_159373, intron 1 of 10) 91195 NM_001352013 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 141-39 chr18 58633948 58634234 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5000 NM_052947 115701 Hs.628152 NM_052947 ENSG00000198796 ALPK2 HAK alpha kinase 2 protein-coding 180.667-99 chr3 119607505 119607915 + 0.666667 NA intron (NM_015900, intron 2 of 10) intron (NM_015900, intron 2 of 10) 7439 NM_001293225 51365 Hs.437451 NM_015900 ENSG00000144837 PLA1A PS-PLA1|PSPLA1 phospholipase A1 member A protein-coding 190.667-46 chr14 104113745 104114252 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001080464, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001080464, exon 16 of 16) -3407 NR_029620 406986 NR_029620 ENSG00000207568 MIR203A MIR203|MIRN203|hsa-mir-203a|miR-203|miRNA203|mir-203a microRNA 203a ncRNA 135-10 chr11 6836501 6836859 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -9003 NM_178168 144124 Hs.447478 NM_178168 ENSG00000166363 OR10A5 JCG6|OR10A1|OR11-403 olfactory receptor family 10 subfamily A member 5 protein-coding 204-133 chr3 125310711 125311248 + 0.666667 NA intron (NM_001348436, intron 5 of 8) intron (NM_001348436, intron 5 of 8) 46301 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 155.333-333 chr6 73375988 73376303 + 0.666667 NA Intergenic LTR65|LTR|ERV1 -6353 NM_001080507 441161 Hs.671212 NM_001080507 ENSG00000203907 OOEP C6orf156|FLOPED|HOEP19|KHDC2 oocyte expressed protein protein-coding 194.666-44 chr3 116415737 116416306 + 0.666667 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) 29466 NM_002338 4045 Hs.26409 NM_002338 ENSG00000185565 LSAMP IGLON3|LAMP limbic system associated membrane protein protein-coding 184-94 chr6 65400291 65400772 + 0.666667 NA intron (NM_198283, intron 6 of 9) intron (NM_198283, intron 6 of 9) 99113 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 137.333-46 chr14 67002462 67002676 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) MIR|SINE|MIR -186871 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 167.333-183 chr3 169276208 169276655 + 0.666667 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) AluSx|SINE|Alu -128960 NM_001164000 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 167.333-240 chr7 25998648 25999131 + 0.666667 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -48903 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 119-84 chr2 229773896 229774130 + 0.666667 NA intron (NM_001348330, intron 38 of 41) intron (NM_001348330, intron 38 of 41) -59458 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 203 chr1 45071826 45072304 + 0.666667 NA intron (NM_020883, intron 2 of 13) L1MA2|LINE|L1 59811 NR_158185 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 126-104 chr7 14815688 14815971 + 0.666667 NA intron (NM_001350717, intron 2 of 24) intron (NM_001350717, intron 2 of 24) 25621 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 249.667-7 chr1 229381451 229381979 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38668 NM_145257 126731 Hs.585011 NM_145257 ENSG00000154429 CCSAP C1orf96|CSAP centriole, cilia and spindle associated protein protein-coding 148-95 chr21 23908609 23908913 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 412616 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 133.667 chr1 9052268 9052529 + 0.666667 NA intron (NM_003039, intron 3 of 11) L1MC1|LINE|L1 17237 NM_001328620 6518 Hs.530003 NM_003039 ENSG00000142583 SLC2A5 GLUT-5|GLUT5 solute carrier family 2 member 5 protein-coding 185.667-147 chr9 79210874 79211325 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65433 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 125.667-113 chr22 27878610 27878955 + 0.666667 NA intron (NM_001284278, intron 7 of 11) MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 40432 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 140.667-92 chr16 57295538 57295854 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11024 NM_015993 51090 Hs.632215 NM_015993 ENSG00000102934 PLLP PMLP|TM4SF11 plasmolipin protein-coding 145.667-315 chrX 43213703 43213999 + 0.666667 NA intron (NR_110387, intron 4 of 5) L1PA15|LINE|L1 36857 NR_110387 101927501 Hs.495998 NR_110387 ENSG00000224294 PINCR - p53-induced noncoding RNA ncRNA 141.333-58 chr13 94689288 94689615 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 19035 NR_120417 101927248 NR_120417 LOC101927248 - uncharacterized LOC101927248 ncRNA 209.666-29 chr2 111006768 111007377 + 0.666667 NA intron (NM_001371254, intron 15 of 18) intron (NM_001371254, intron 15 of 18) 108516 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 117-87 chr20 9222450 9222639 + 0.666667 NA intron (NM_182797, intron 1 of 35) MER33|DNA|hAT-Charlie 5154 NM_182797 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 246.333-5 chr1 163090685 163091249 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 19062 NM_001113380 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 142.667-21 chr10 60113431 60113708 + 0.666667 NA intron (NM_001204403, intron 27 of 43) AluJo|SINE|Alu 27447 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 130.667-176 chr6 10131474 10131734 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -272898 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 179.667-100 chr4 83819322 83819660 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 283383 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 130.333-213 chr8 122257018 122257260 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 311505 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 135.667-63 chr15 71765546 71765887 + 0.666667 NA intron (NM_001286429, intron 10 of 11) AluJr|SINE|Alu -44838 NM_014249 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 117-48 chr15 25736570 25736854 + 0.666667 NA intron (NM_024490, intron 2 of 20) intron (NM_024490, intron 2 of 20) 112113 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 118.667 chr1 11395518 11395774 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -83509 NM_020780 57540 Hs.202355 NM_020780 ENSG00000204624 DISP3 PTCHD2 dispatched RND transporter family member 3 protein-coding 236-13 chr11 101425780 101426243 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 93894 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 172.333-68 chr17 63007436 63007870 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 1 of 25) L1ME2z|LINE|L1 41418 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 129.333-145 chr4 177066691 177067038 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 191162 NR_149104 105377556 NR_149104 ENSG00000250263 LINC02509 - long intergenic non-protein coding RNA 2509 ncRNA 118.667-36 chr10 94472055 94472261 + 0.666667 NA intron (NM_015188, intron 2 of 12) AluJo|SINE|Alu 69617 NM_015188 23232 Hs.500598 NM_015188 ENSG00000108239 TBC1D12 - TBC1 domain family member 12 protein-coding 115.667-75 chr14 64007835 64008040 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 31 of 114) AluSx|SINE|Alu 87188 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 111.667-193 chr4 163023429 163023618 + 0.666667 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 70105 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 154-51 chr14 35170377 35170678 + 0.666667 NA intron (NM_014672, intron 4 of 7) L1MEf|LINE|L1 47975 NM_001256681 9692 Hs.458487 NM_014672 ENSG00000100890 PRORP KIAA0391|MRPP3 protein only RNase P catalytic subunit protein-coding 115.667-12 chr1 184303767 184303975 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -83158 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 136.333-175 chr5 159402017 159402360 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 64088 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 141.333-161 chr3 142844994 142845411 + 0.666667 NA intron (NM_013363, intron 3 of 8) L1ME2z|LINE|L1 43881 NM_013363 26577 Hs.8944 NM_013363 ENSG00000163710 PCOLCE2 PCPE2 procollagen C-endopeptidase enhancer 2 protein-coding 112.333-107 chr19 18615381 18615630 + 0.666667 NA intron (NM_012109, intron 3 of 7) MIRb|SINE|MIR 2635 NM_012109 25789 Hs.216226 NM_012109 ENSG00000105696 TMEM59L BSMAP|C19orf4 transmembrane protein 59 like protein-coding 120.667-96 chr2 77816679 77816947 + 0.666667 NA intron (NR_110288, intron 3 of 3) intron (NR_110288, intron 3 of 3) -99121 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 139.667-28 chr11 94446024 94446283 + 0.666667 NA intron (NM_005591, intron 15 of 19) AluSx1|SINE|Alu 20427 NR_031630 100302275 NR_031630 ENSG00000221230 MIR548L MIRN548L|hsa-mir-548l microRNA 548l ncRNA 159.333-140 chr2 9409005 9409392 + 0.666667 NA intron (NM_001319070, intron 2 of 4) intron (NM_001319070, intron 2 of 4) 13393 NM_001319068 9270 Hs.467662 NM_004763 ENSG00000119185 ITGB1BP1 ICAP-1A|ICAP-1B|ICAP-1alpha|ICAP1|ICAP1A|ICAP1B integrin subunit beta 1 binding protein 1 protein-coding 129-119 chr6 154682797 154683075 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -50442 NM_001286189 22828 Hs.591329 NM_014892 ENSG00000213079 SCAF8 RBM16 SR-related CTD associated factor 8 protein-coding 133.667-71 chr2 46750320 46750696 + 0.666667 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) intron (NM_144949, intron 1 of 1) 51213 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 160.333-230 chr5 33013285 33013612 + 0.666667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 66005 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 112.333-190 chr4 87196283 87196595 + 0.666667 NA intron (NM_001292006, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 23829 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 146-57 chr2 54821200 54821491 + 0.666667 NA intron (NM_001039753, intron 4 of 40) L1ME4a|LINE|L1 96333 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 172-87 chr4 176649962 176650288 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 142797 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 126.333-50 chr14 61694622 61694902 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001530) promoter-TSS (NM_001530) -751 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 183.667-120 chr5 101393901 101394354 + 0.666667 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -490845 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 334-20 chr18 74786091 74786765 + 0.666667 NA intron (NM_017757, intron 3 of 7) (CTTATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 155465 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 113-125 chr20 35495738 35495943 + 0.666667 NA intron (NM_007186, intron 24 of 34) L2b|LINE|L2 33812 NM_001145350 140873 Hs.158680 NM_080828 ENSG00000125975 C20orf173 dJ477O4.4 chromosome 20 open reading frame 173 protein-coding 118.667-78 chr16 3333465 3333809 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -22252 NM_012368 4993 Hs.258574 NM_012368 ENSG00000168158 OR2C1 OLFmf3|OR2C2P olfactory receptor family 2 subfamily C member 1 protein-coding 135-4 chr1 52930835 52931130 + 0.666667 NA intron (NM_001193617, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 3706 NM_001193617 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 149.667-339 chr5 178534664 178534940 + 0.666667 NA intron (NM_173465, intron 2 of 28) intron (NM_173465, intron 2 of 28) 55591 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 114.333-2 chr1 62625789 62626017 + 0.666667 NA intron (NM_001367561, intron 11 of 49) L1MB7|LINE|L1 28383 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 237-30 chr14 68462396 68462955 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) FLAM_C|SINE|Alu 166112 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 123.333-236 chr9 132957148 132957366 + 0.666667 NA intron (NM_004188, intron 1 of 10) intron (NM_004188, intron 1 of 10) 11550 NR_049862 100846992 NR_049862 ENSG00000263816 MIR548AW - microRNA 548aw ncRNA 192.667-21 chr10 21619347 21619838 + 0.666667 NA intron (NM_001195626, intron 8 of 22) intron (NM_001195626, intron 8 of 22) 85420 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 150.333-409 chr8 97024767 97025208 + 0.666667 NA intron (NM_016134, intron 5 of 7) intron (NM_016134, intron 5 of 7) 252941 NM_033512 85453 Hs.173094 NM_033512 ENSG00000180543 TSPYL5 - TSPY like 5 protein-coding 151-51 chr19 32556552 32556909 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24460 NM_004708 9141 Hs.443831 NM_004708 ENSG00000105185 PDCD5 TFAR19 programmed cell death 5 protein-coding 124-71 chr20 51421566 51421869 + 0.666667 NA intron (NM_012340, intron 9 of 10) MER102b|DNA|hAT-Charlie 31260 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 156.667-153 chr18 12099630 12099966 + 0.666667 NA intron (NM_001277333, intron 6 of 13) intron (NM_001277333, intron 6 of 13) 5955 NM_001277333 342850 Hs.448906 NM_001277333 ENSG00000181626 ANKRD62 DKFZp779B1634 ankyrin repeat domain 62 protein-coding 183.667-144 chr8 120623766 120624211 + 0.666667 NA intron (NM_021021, intron 3 of 6) AluSz|SINE|Alu -137265 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 220-61 chr2 74609820 74610262 + 0.666667 NA intron (NM_001321739, intron 3 of 10) AluJb|SINE|Alu 37996 NM_138804 130951 Hs.348645 NM_138804 ENSG00000159374 M1AP C2orf65|D6Mm5e|SPATA37 meiosis 1 associated protein protein-coding 138.333-200 chr8 127888582 127888831 + 0.666667 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 60017 NR_103558 641384 Hs.629674 NM_001037234 ENSG00000280055 TMEM75 - transmembrane protein 75 ncRNA 170.667-49 chr14 84743176 84743596 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -528546 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 116.667-160 chr5 60242189 60242420 + 0.666667 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) L1MA3|LINE|L1 130359 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 194.667-5 chr1 49349337 49349762 + 0.666667 NA intron (NR_136623, intron 2 of 12) L2a|LINE|L2 92138 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 151.667-170 chr2 138485294 138485661 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -16293 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 152.333-334 chr6 62237159 62237460 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 48916 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 183.333-115 chr4 66108298 66108747 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -168302 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 142.667-212 chr7 108792659 108792927 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91794 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 162.667-172 chr3 39759007 39759347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49737 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 115-63 chr14 88873113 88873310 + 0.666667 NA intron (NM_001366535, intron 12 of 12) L2a|LINE|L2 48560 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 183.333-144 chr6 122593230 122593691 + 0.666667 NA intron (NM_181794, intron 3 of 6) intron (NM_181794, intron 3 of 6) -16772 NM_032471 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 122.667-172 chr7 27791051 27791360 + 0.666667 NA intron (NM_001362794, intron 8 of 16) intron (NM_001362794, intron 8 of 16) 51110 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 270.333-54 chr6 69258433 69258918 + 0.666667 NA intron (NM_001704, intron 20 of 31) intron (NM_001704, intron 20 of 31) 537791 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 175-49 chr22 30212479 30212874 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -26518 NR_149070 110806283 NR_149070 ENSG00000232530 LIF-AS1 Lnc-LIF-AS LIF antisense RNA 1 ncRNA 126.333-84 chr2 31730484 31730764 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 73356 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 127.667-23 chr10 119718944 119719242 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6954 NM_001243195 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 129.333-33 chr11 29800988 29801364 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 181217 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 161.667-218 chr6 5153029 5153364 + 0.666667 NA intron (NM_001164841, intron 2 of 3) AluSz6|SINE|Alu -4874 NR_037462 100500900 NR_037462 ENSG00000265083 MIR3691 mir-3691 microRNA 3691 ncRNA 150.333-356 chr6 37417695 37418054 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -15347 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 115.667-182 chr5 105652365 105652610 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 553013 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 141.667-235 chr8 130059367 130059715 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 28 of 29) AluJr|SINE|Alu 25227 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 180-93 chr6 158343065 158343448 + 0.666667 NA intron (NM_020245, intron 1 of 13) intron (NM_020245, intron 1 of 13) 20274 NR_145798 109623462 NR_145798 SNORA116 - small nucleolar RNA, H/ACA box 116 snoRNA 126.333-66 chr17 39814665 39815006 + 0.666667 NA intron (NM_001257409, intron 2 of 5) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -36610 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 264.333-78 chr9 14072973 14073457 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107587 NM_001282787 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 152.667-173 chr2 39647235 39647559 + 0.666667 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -18101 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 190-71 chr2 229204998 229205413 + 0.666667 NA intron (NM_001100818, intron 1 of 2) (ACAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 26887 NM_001330156 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 262-79 chr8 105759730 105760285 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) L2a|LINE|L2 300496 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 162.667-134 chr2 101634785 101635029 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62796 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 127.333-196 chr9 19473128 19473427 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 64268 NM_001010887 340485 Hs.41379 NM_001010887 ENSG00000177076 ACER2 ALKCDase2|ASAH3L alkaline ceramidase 2 protein-coding 141.333-228 chr7 111960715 111961013 + 0.666667 NA intron (NM_001363540, intron 8 of 52) L1MA8|LINE|L1 152359 NR_103806 100506413 Hs.677513 NR_103806 ENSG00000225572 DOCK4-AS1 - DOCK4 antisense RNA 1 ncRNA 237.333-106 chr6 142867937 142868432 + 0.666667 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 76992 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 154.333-47 chr10 118909585 118909867 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -119988 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 140-127 chr9 16305928 16306302 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29802 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 207.333-167 chr21 28798624 28798980 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 86565 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 160-127 chr9 23819832 23820179 + 0.666667 NA intron (NM_001351456, intron 2 of 8) intron (NM_001351456, intron 2 of 8) 1304 NM_001351465 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 116.667-209 chr8 129418668 129418963 + 0.666667 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 65327 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 183.333-92 chr20 3793107 3793487 + 0.666667 NA intron (NM_001287517, intron 1 of 15) AluSx1|SINE|Alu -2442 NM_021873 994 Hs.153752 NM_004358 ENSG00000101224 CDC25B - cell division cycle 25B protein-coding 180-26 chr13 20833838 20834276 + 0.666667 NA intron (NM_022459, intron 6 of 22) intron (NM_022459, intron 6 of 22) -60096 NM_001318939 221143 Hs.26674 NM_174928 ENSG00000150456 EEF1AKMT1 ESP13|N6AMT2 EEF1A lysine methyltransferase 1 protein-coding 167.667-100 chr2 42173340 42173822 + 0.666667 NA intron (NM_001145076, intron 1 of 21) AluJo|SINE|Alu -3350 NR_110584 102723824 Hs.639826 NR_110584 LOC102723824 - uncharacterized LOC102723824 ncRNA 170.333-20 chr1 228874156 228874432 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 138815 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 153-62 chr17 58384226 58384517 + 0.666667 NA intron (NM_001305544, intron 2 of 9) intron (NM_001305544, intron 2 of 9) 18350 NM_001305545 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 129-3 chr1 85906291 85906544 + 0.666667 NA intron (NR_146344, intron 28 of 58) intron (NR_146344, intron 28 of 58) -197984 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 154.333-105 chr15 69792730 69793092 + 0.666667 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -42323 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 194.333-153 chr8 112165029 112165569 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -478194 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 167-35 chr13 100161046 100161540 + 0.666667 NA intron (NR_148031, intron 6 of 22) L1ME4b|LINE|L1 72200 NR_148027 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 206-114 chr3 99568388 99568852 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69974 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 227-17 chr12 30947699 30948267 + 0.666667 NA intron (NM_001370301, intron 1 of 6) THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 21079 NM_001080509 441631 Hs.505141 NM_001080509 ENSG00000110900 TSPAN11 VSSW1971 tetraspanin 11 protein-coding 161.667-152 chr20 4931126 4931498 + 0.666667 NA intron (NM_005116, intron 3 of 16) AluJo|SINE|Alu 70198 NM_005116 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 148.333-358 chr7 27178964 27179241 + 0.666667 NA intron (NR_037939, intron 1 of 1) intron (NR_037939, intron 1 of 1) 759 NR_037939 3206 Hs.110637 NM_018951 ENSG00000253293 HOXA10 HOX1|HOX1.8|HOX1H|PL homeobox A10 protein-coding 175.333-99 chr2 198481602 198481996 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106702 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 120.667-145 chr5 118663312 118663569 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 67252 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 125.333-105 chr20 52923927 52924219 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -48285 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 115.333-204 chr7 95672914 95673184 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -76533 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 160.667-174 chr20 12907964 12908415 + 0.666667 NA intron (NR_109868, intron 6 of 11) intron (NR_109868, intron 6 of 11) 28774 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 403.333-6 chr20 9720585 9721459 + 0.666667 NA intron (NM_177990, intron 1 of 9) L1MB5|LINE|L1 118054 NM_177990 57144 Hs.32539 NM_020341 ENSG00000101349 PAK5 PAK7 p21 (RAC1) activated kinase 5 protein-coding 186.333-168 chr8 117661533 117662075 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141091 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 168.333-40 chr11 112723945 112724421 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -168381 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 118-138 chr9 37843494 37843710 + 0.666667 NA intron (NM_001286810, intron 3 of 6) L1MEc|LINE|L1 42805 NM_024345 79269 Hs.118394 NM_024345 ENSG00000122741 DCAF10 WDR32 DDB1 and CUL4 associated factor 10 protein-coding 116 chr1 33968099 33968393 + 0.666667 NA intron (NM_052896, intron 3 of 69) intron (NM_052896, intron 3 of 69) 99290 NR_038372 402779 Hs.666207 NR_038372 ENSG00000231163 CSMD2-AS1 - CSMD2 antisense RNA 1 ncRNA 142-102 chr4 52295297 52295579 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 244134 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 183-87 chr5 153031340 153031762 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59202 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 115-42 chr12 38486082 38486293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 169413 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 112-63 chr14 67979049 67979343 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) UCON74|DNA?|DNA? 155604 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 243.333-110 chr7 100717489 100718048 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2700 NM_000799 2056 Hs.2303 NM_000799 ENSG00000130427 EPO DBAL|ECYT5|EP|MVCD2 erythropoietin protein-coding 138.333-89 chr2 38885826 38886058 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 9980 NM_001145450 729967 Hs.729207 NM_194270 ENSG00000188010 MORN2 BLOCK27|MOPT MORN repeat containing 2 protein-coding 183.333-85 chr2 160122985 160123398 + 0.666667 NA intron (NM_001282355, intron 10 of 12) intron (NM_001282355, intron 10 of 12) -60576 NM_001007267 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 148.333-258 chr3 117019092 117019527 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 97878 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 150.333-226 chr2 207068269 207068651 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 41613 NR_036227 100423036 NR_036227 ENSG00000253008 MIR2355 mir-2355 microRNA 2355 ncRNA 210.333-39 chr13 68274307 68274814 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 610765 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 142.333-215 chr6 50476685 50477001 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -236701 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 134-98 chr7 47134165 47134514 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 330464 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 138-82 chr4 45319859 45320159 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -593375 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 185.333-112 chr20 61558549 61559016 + 0.666667 NA intron (NM_001252338, intron 1 of 14) intron (NM_001252338, intron 1 of 14) -40979 NM_001252339 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 127.667-177 chr8 91052213 91052433 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -11464 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 188.333-64 chr19 28564998 28565519 + 0.666667 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) -41430 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 225.667-41 chr2 128363654 128364219 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45068 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 170.667-36 chr12 129436433 129436814 + 0.666667 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) L1ME3Cz|LINE|L1 228022 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 112-126 chr20 55453567 55453794 + 0.666667 NA Intergenic (TATATTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -26483 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 151.667-78 chr12 13746323 13746632 + 0.666667 NA intron (NM_000834, intron 3 of 12) intron (NM_000834, intron 3 of 12) 233879 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 123.667-84 chr2 37018566 37018830 + 0.666667 NA intron (NM_019024, intron 26 of 35) intron (NM_019024, intron 26 of 35) -52162 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 119.333-207 chr8 57746209 57746406 + 0.666667 NA non-coding (NR_134276, exon 1 of 2) non-coding (NR_134276, exon 1 of 2) 158 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 114.667-223 chr6 52991072 52991357 + 0.666667 NA intron (NM_001512, intron 2 of 6) L1MC5a|LINE|L1 4070 NM_001512 2941 Hs.485557 NM_001512 ENSG00000170899 GSTA4 GSTA4-4|GTA4 glutathione S-transferase alpha 4 protein-coding 184.667-105 chr5 122611717 122612075 + 0.666667 NA Intergenic MER41C|LTR|ERV1 -27296 NR_134281 101927357 Hs.639856 NR_134281 LOC101927357 - uncharacterized LOC101927357 ncRNA 124-16 chr1 219055517 219055749 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) 118155 NR_038845 643723 Hs.519774 NR_038845 LYPLAL1-DT LYPLAL1-AS1 LYPLAL1 divergent transcript ncRNA 142.333-262 chr9 95340999 95341270 + 0.666667 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -23425 NM_000136 2176 Hs.494529 NM_000136 ENSG00000158169 FANCC FA3|FAC|FACC FA complementation group C protein-coding 181.667 chr1 7983020 7983488 + 0.666667 NA intron (NM_001123377, intron 6 of 6) intron (NM_001123377, intron 6 of 6) 21543 NM_007262 11315 Hs.419640 NM_007262 ENSG00000116288 PARK7 DJ-1|DJ1|GATD2|HEL-S-67p Parkinsonism associated deglycase protein-coding 163 chr1 47879399 47879843 + 0.666667 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) intron (NM_001194986, intron 2 of 6) 117764 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 211-80 chr5 31438079 31438503 + 0.666667 NA intron (NM_013235, intron 22 of 34) L2|LINE|L2 93802 NM_013235 29102 Hs.97997 NM_013235 ENSG00000113360 DROSHA ETOHI2|HSA242976|RANSE3L|RN3|RNASE3L|RNASEN drosha ribonuclease III protein-coding 128.667-185 chr8 104305762 104306097 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -33867 NM_001257317 81501 Hs.652230 NM_030788 ENSG00000164935 DCSTAMP FIND|TM7SF4|hDC-STAMP dendrocyte expressed seven transmembrane protein protein-coding 126.667-153 chr6 54011915 54012131 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6893 NM_138569 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 179.667-95 chr3 190808393 190808908 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54044 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 189-53 chr20 51897278 51897640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34546 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 141.333-236 chr8 80455019 80455397 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -30385 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 152.333-326 chr6 35906171 35906492 + 0.666667 NA intron (NR_034069, intron 2 of 15) AluSz6|SINE|Alu 14767 NM_003137 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 155.333-346 chr6 144871326 144871761 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 465888 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 116-14 chr10 19833315 19833510 + 0.666667 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 16980 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 187-34 chr2 112924903 112925378 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9947 NM_173205 27178 Hs.166371 NM_014439 ENSG00000125571 IL37 FIL1|FIL1(ZETA)|FIL1Z|IL-1F7|IL-1H|IL-1H4|IL-1RP1|IL-37|IL1F7|IL1H4|IL1RP1 interleukin 37 protein-coding 122.667-165 chr6 74792494 74792848 + 0.666667 NA Intergenic Charlie17|DNA|hAT-Charlie 336111 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 115-79 chr17 71946372 71946644 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 79471 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 115.333-66 chr14 52773526 52773859 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_145251, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_145251, exon 11 of 11) 17915 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 245.667-59 chr5 137592139 137592658 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 55251 NR_030588 100126343 NR_030588 ENSG00000216009 MIR874 MIRN874|hsa-mir-874|mir-874 microRNA 874 ncRNA 179.667-151 chr8 144782480 144782893 + 0.666667 NA intron (NM_001286769, intron 1 of 5) AluJb|SINE|Alu 4659 NM_001286769 80778 Hs.631854 NM_030580 ENSG00000196378 ZNF34 KOX32 zinc finger protein 34 protein-coding 113.667-223 chr9 19124463 19124667 + 0.666667 NA intron (NR_038064, intron 2 of 6) intron (NR_038064, intron 2 of 6) 2927 NM_001122 123 Hs.3416 NM_001122 ENSG00000147872 PLIN2 ADFP|ADRP perilipin 2 protein-coding 122-62 chr20 20295034 20295335 + 0.666667 NA intron (NM_015585, intron 24 of 26) intron (NM_015585, intron 24 of 26) -72920 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 156-88 chr3 40587010 40587361 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62225 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 145-131 chr9 99112121 99112422 + 0.666667 NA intron (NM_004612, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 7158 NM_001130916 7046 Hs.494622 NM_004612 ENSG00000106799 TGFBR1 AAT5|ACVRLK4|ALK-5|ALK5|ESS1|LDS1|LDS1A|LDS2A|MSSE|SKR4|TBR-i|TBRI|TGFR-1|tbetaR-I transforming growth factor beta receptor 1 protein-coding 126.333-2 chr1 61755147 61755502 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 1 of 43) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 12844 NM_176877 10207 Hs.478125 NM_005799 ENSG00000132849 PATJ Cipp|INADL|InaD-like|hINADL PATJ crumbs cell polarity complex component protein-coding 242-25 chr14 67516999 67517536 + 0.666667 NA intron (NM_001348546, intron 1 of 2) intron (NM_001348546, intron 1 of 2) -1782 NM_001348548 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 195-96 chr7 32274780 32275075 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 24401 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 136.333-201 chr8 64548882 64549167 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28239 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 183.333-102 chr22 49956969 49957484 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3546 NM_001001852 415116 Hs.530381 NM_001001852 ENSG00000198355 PIM3 pim-3 Pim-3 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 122-111 chr7 22893716 22893939 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 37214 NR_003075 692210 NR_003075 ENSG00000221740 SNORD93 HBII-336 small nucleolar RNA, C/D box 93 snoRNA 196.333-86 chr2 116505293 116505753 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 1161708 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 201.667-77 chr3 72333164 72333540 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 113271 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 151.333-16 chr1 89006342 89006782 + 0.666667 NA TTS (NM_001319179) TTS (NM_001319179) -13602 NM_001008662 56267 Hs.481898 NM_001008661 ENSG00000137944 KYAT3 CCBL2|KAT3|KATIII kynurenine aminotransferase 3 protein-coding 122.333-64 chr15 62917593 62917934 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 93806 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 156-45 chr14 66142907 66143243 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -343296 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 217-32 chr17 63071132 63071610 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 2 of 25) AluJr|SINE|Alu 105136 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 126.667-100 chr22 44214765 44214989 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 33952 NM_022141 64098 Hs.658995 NM_022141 ENSG00000138964 PARVG - parvin gamma protein-coding 164.667-231 chr8 10167447 10167748 + 0.666667 NA intron (NM_001199729, intron 2 of 6) intron (NM_001199729, intron 2 of 6) 71946 NM_001135671 4482 Hs.490981 NM_012331 ENSG00000175806 MSRA PMSR methionine sulfoxide reductase A protein-coding 206-65 chr19 38295968 38296432 + 0.666667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -8051 NM_033520 64073 Hs.631544 NM_022125 ENSG00000167644 C19orf33 H2RSP|IMUP|IMUP-1|IMUP-2 chromosome 19 open reading frame 33 protein-coding 151.333-262 chr22 37911067 37911505 + 0.666667 NA intron (NM_033386, intron 1 of 15) intron (NM_033386, intron 1 of 15) 4989 NM_033386 85377 Hs.517610 NM_033386 ENSG00000100139 MICALL1 MICAL-L1|MIRAB13 MICAL like 1 protein-coding 269.333-16 chr12 24376946 24377460 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 2 of 17) MIR|SINE|MIR 153932 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 159.667-297 chr7 36151862 36152333 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1157 NM_030636 80820 Hs.487994 NM_030636 ENSG00000122547 EEPD1 HSPC107 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 protein-coding 181-47 chr3 19893290 19893828 + 0.666667 NA intron (NM_001330688, intron 11 of 14) HERVL40-int|LTR|ERVL 40658 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 127-6 chr1 83526383 83526634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 80454 NR_146478 101927542 Hs.623976 NR_146478 LINC01712 - long intergenic non-protein coding RNA 1712 ncRNA 116.667-97 chr2 71359032 71359233 + 0.666667 NA intron (NM_001252613, intron 3 of 27) intron (NM_001252613, intron 3 of 27) 27350 NM_014497 27332 Hs.434401 NM_014497 ENSG00000075292 ZNF638 NP220|ZFML|Zfp638 zinc finger protein 638 protein-coding 124.333-103 chr20 4832715 4832917 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -9208 NM_014737 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 118.333-193 chr7 78098025 78098279 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 19 of 20) L1ME3Cz|LINE|L1 -249090 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 122-27 chr12 22909992 22910287 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -265497 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 128.333-47 chr12 19963655 19963878 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50919 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 149-18 chr10 53726559 53726913 + 0.666667 NA Intergenic LTR1A1|LTR|ERV1 -759494 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 140-123 chr8 126599158 126599546 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -40874 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 147.667-172 chr2 64238429 64238718 + 0.666667 NA intron (NR_120420, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 10172 NR_120420 100507006 Hs.442789 NR_120420 LOC100507006 - uncharacterized LOC100507006 ncRNA 144.333-252 chr7 111418990 111419236 + 0.666667 NA intron (NM_001350961, intron 4 of 7) intron (NM_001350961, intron 4 of 7) 143178 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 120.333-34 chr11 40250665 40250896 + 0.666667 NA intron (NM_001258419, intron 4 of 6) LTR24B|LTR|ERV1 42350 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 196.333-45 chr14 87141964 87142294 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 236351 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 120.667-152 chr6 96861985 96862183 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24607 NM_001143957 81491 Hs.221364 NM_030784 ENSG00000112218 GPR63 PSP24(beta)|PSP24B G protein-coupled receptor 63 protein-coding 123.333-25 chr1 239799657 239799944 + 0.666667 NA intron (NM_000740, intron 3 of 4) intron (NM_000740, intron 3 of 4) -80681 NR_103776 100506915 Hs.667175 NR_103776 ENSG00000233355 CHRM3-AS2 - CHRM3 antisense RNA 2 ncRNA 192.333-75 chr18 6359550 6359888 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_158611) promoter-TSS (NR_158611) -689 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 147.333-333 chr9 93104178 93104613 + 0.666667 NA intron (NR_134468, intron 1 of 4) L1MB4|LINE|L1 8178 NR_160513 84270 Hs.434213 NM_032310 ENSG00000165233 CARD19 BinCARD|C9orf89 caspase recruitment domain family member 19 protein-coding 116-53 chr15 71281610 71281866 + 0.666667 NA intron (NM_024817, intron 5 of 16) intron (NM_024817, intron 5 of 16) -92679 NR_120350 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 130-52 chr2 7305120 7305407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115998 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 130.667-72 chr15 54008569 54008843 + 0.666667 NA intron (NM_001329919, intron 1 of 31) intron (NM_001329919, intron 1 of 31) -3942 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 152.667-8 chr1 73883962 73884365 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 209484 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 143.333-109 chr16 8539017 8539287 + 0.666667 NA intron (NM_001290098, intron 2 of 2) intron (NM_001290098, intron 2 of 2) 50686 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 197-41 chr16 57327054 57327619 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -31447 NM_002990 6367 Hs.534347 NM_002990 ENSG00000102962 CCL22 A-152E5.1|ABCD-1|DC/B-CK|MDC|SCYA22|STCP-1 C-C motif chemokine ligand 22 protein-coding 138.667-134 chr3 102558778 102559128 + 0.666667 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 123938 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 163-59 chr4 61913424 61913885 + 0.666667 NA intron (NM_001322246, intron 12 of 25) intron (NM_001322246, intron 12 of 25) 248111 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 113-122 chr20 5923558 5923852 + 0.666667 NA exon (NM_001819, exon 4 of 5) exon (NM_001819, exon 4 of 5) 12195 NM_001819 1114 Hs.516874 NM_001819 ENSG00000089199 CHGB SCG1 chromogranin B protein-coding 134-119 chrX 54351225 54351584 + 0.666667 NA intron (NM_001002838, intron 1 of 22) intron (NM_001002838, intron 1 of 22) 6601 NM_020922 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 153.333-38 chr10 8373807 8374145 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -105671 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 169.333-62 chr12 115508322 115508702 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 640142 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 186.667-73 chr2 116056206 116056702 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 712639 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 147-93 chr3 103019688 103020094 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 504225 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 131-24 chr13 101032905 101033165 + 0.666667 NA intron (NR_047687, intron 4 of 7) L1MA2|LINE|L1 -88671 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 162-93 chr4 83226069 83226394 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58564 NM_001358921 27235 Hs.144304 NM_015697 ENSG00000173085 COQ2 CL640|COQ10D1|MSA1|PHB:PPT coenzyme Q2, polyprenyltransferase protein-coding 120.667-151 chr6 71660422 71660666 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -226159 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 183-88 chr5 158977915 158978301 + 0.666667 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 119848 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 141.667-4 chr1 58984187 58984507 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36129 NR_110626 101926925 NR_110626 LINC01358 - long intergenic non-protein coding RNA 1358 ncRNA 142.667-140 chr3 129550223 129550620 + 0.666667 NA intron (NM_001308262, intron 2 of 3) intron (NM_001308262, intron 2 of 3) 2036 NM_001308262 132243 Hs.97358 NM_153833 ENSG00000178804 H1FOO H1.8|H1oo|osH1 H1 histone family member O oocyte specific protein-coding 163.667-125 chr2 181717190 181717516 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -36688 NM_002500 4760 Hs.574626 NM_002500 ENSG00000162992 NEUROD1 BETA2|BHF-1|MODY6|NEUROD|bHLHa3 neuronal differentiation 1 protein-coding 123.333-228 chr9 26414032 26414388 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 347535 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 216.667-12 chr10 59146744 59147230 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 29477 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 226.333-104 chr8 41746982 41747510 + 0.666667 NA intron (NM_020475, intron 2 of 41) intron (NM_020475, intron 2 of 41) 50376 NM_020476 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 164.333-229 chr7 98120049 98120351 + 0.666667 NA intron (NM_014916, intron 1 of 13) intron (NM_014916, intron 1 of 13) 13338 NM_014916 22853 Hs.444179 NM_014916 ENSG00000164715 LMTK2 AATYK2|BREK|KPI-2|KPI2|LMR2|PPP1R100|cprk|hBREK lemur tyrosine kinase 2 protein-coding 186.667-40 chr14 69027606 69027990 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 48116 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 112.667-280 chr9 76175992 76176192 + 0.666667 NA intron (NR_120409, intron 13 of 19) intron (NR_120409, intron 13 of 19) 218334 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 145-102 chr6 49374598 49374887 + 0.666667 NA Intergenic (CATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 88511 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 145.333-114 chr17 59456357 59456645 + 0.666667 NA intron (NR_110813, intron 2 of 2) intron (NR_110813, intron 2 of 2) 70356 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 228.333-71 chr4 163058972 163059362 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 34461 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 175.333-33 chr12 123001172 123001666 + 0.666667 NA intron (NM_020845, intron 7 of 24) L1MB5|LINE|L1 9309 NR_036187 100422931 NR_036187 ENSG00000265526 MIR4304 - microRNA 4304 ncRNA 137.667-153 chr5 117987153 117987419 + 0.666667 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) 256925 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 111.667-79 chr14 47687853 47688107 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -13026 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 165-20 chr13 95141410 95141853 + 0.666667 NA intron (NM_001105515, intron 19 of 20) intron (NM_001105515, intron 19 of 20) -68713 NR_145733 109616987 NR_145733 SNORD13G - small nucleolar RNA, C/D box 13G snoRNA 181.333-100 chr3 88188744 88189132 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38979 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 112-73 chr15 81880660 81880868 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 165254 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 147.667-139 chr17 60692202 60692612 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 4 of 25) AluY|SINE|Alu 14556 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 148-67 chr19 39316045 39316455 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_020862) promoter-TSS (NM_020862) -914 NM_020862 57622 Hs.97860 NM_020862 ENSG00000128011 LRFN1 SALM2 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 138-21 chr11 18724588 18724907 + 0.666667 NA intron (NM_173588, intron 1 of 22) intron (NM_173588, intron 1 of 22) 1441 NR_160413 283284 Hs.434152 NM_173588 ENSG00000179057 IGSF22 IGFN2 immunoglobulin superfamily member 22 protein-coding 116.667-219 chr9 129301359 129301664 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 19095 NR_121587 101929331 Hs.522428 NR_121587 ENSG00000224307 LOC101929331 - uncharacterized LOC101929331 ncRNA 216-20 chr12 49542092 49542539 + 0.666667 NA intron (NM_012284, intron 3 of 14) intron (NM_012284, intron 3 of 14) 3285 NM_012284 23416 Hs.64064 NM_012284 ENSG00000135519 KCNH3 BEC1|ELK2|Kv12.2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 3 protein-coding 116-113 chr3 172059813 172060121 + 0.666667 NA intron (NM_001135095, intron 1 of 25) intron (NM_001135095, intron 1 of 25) 19436 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 143.333-262 chr7 33371563 33371822 + 0.666667 NA intron (NM_198428, intron 17 of 22) intron (NM_198428, intron 17 of 22) 242128 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 165-58 chr3 151351151 151351487 + 0.666667 NA intron (NM_053002, intron 15 of 42) intron (NM_053002, intron 15 of 42) -10497 NM_176876 64805 Hs.591281 NM_022788 ENSG00000169313 P2RY12 ADPG-R|BDPLT8|HORK3|P2T(AC)|P2Y(12)R|P2Y(AC)|P2Y(ADP)|P2Y(cyc)|P2Y12|SP1999 purinergic receptor P2Y12 protein-coding 153-97 chr3 131402938 131403246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21318 NR_033268 131870 Hs.282050 NM_152395 ENSG00000198585 NUDT16 - nudix hydrolase 16 protein-coding 174.667-65 chr16 13322248 13322626 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 420839 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 160.667-197 chr3 57664162 57664491 + 0.666667 NA intron (NM_152678, intron 4 of 19) intron (NM_152678, intron 4 of 19) 28751 NM_152678 201627 Hs.91085 NM_152678 ENSG00000174839 DENND6A AFI1A|FAM116A DENN domain containing 6A protein-coding 156-44 chr14 59213856 59214205 + 0.666667 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) 25363 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 150.667-232 chr3 14348489 14348892 + 0.666667 NA non-coding (NR_110135, exon 3 of 3) non-coding (NR_110135, exon 3 of 3) 3878 NR_110135 101927565 Hs.306905 NR_110135 ENSG00000251576 LINC01267 - long intergenic non-protein coding RNA 1267 ncRNA 146-60 chr2 100557115 100557437 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5717 NM_024065 79031 Hs.469459 NM_024065 ENSG00000115539 PDCL3 HTPHLP|PHLP2A|PHLP3|VIAF|VIAF1 phosducin like 3 protein-coding 130.333-20 chr1 201027910 201028288 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4385 NM_001252100 23046 Hs.169182 NM_017596 ENSG00000116852 KIF21B - kinesin family member 21B protein-coding 187.667-133 chr7 4225040 4225390 + 0.666667 NA intron (NM_001079653, intron 14 of 19) L1MD1|LINE|L1 -90378 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 182.333-2 chr1 47528579 47528973 + 0.666667 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -91459 NR_126355 102724077 Hs.159718 NR_126355 LINC01389 - long intergenic non-protein coding RNA 1389 ncRNA 193-57 chr3 112909902 112910258 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -64130 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 132.667-175 chr8 47456574 47456833 + 0.666667 NA intron (NM_001080394, intron 8 of 19) L1PB1|LINE|L1 195765 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 144.667-240 chr5 77254637 77254922 + 0.666667 NA intron (NM_001029853, intron 1 of 20) intron (NM_001029853, intron 1 of 20) 44099 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 147.667-211 chr21 35816845 35817197 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69424 NR_144547 54036 Hs.228809 NR_144547 PPP1R2P2 - protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 pseudogene 2 pseudo 129-63 chr2 152506856 152507088 + 0.666667 NA intron (NM_052905, intron 1 of 25) MER119|DNA|hAT-Charlie 171798 NM_052905 114793 Hs.654630 NM_052905 ENSG00000157827 FMNL2 FHOD2 formin like 2 protein-coding 142.667-139 chr3 110739798 110740223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 329949 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 147.667-122 chr16 8927688 8927988 + 0.666667 NA intron (NM_003470, intron 2 of 30) AluSx|SINE|Alu 8801 NM_001286458 7874 Hs.386939 NM_003470 ENSG00000187555 USP7 HAUSP|TEF1 ubiquitin specific peptidase 7 protein-coding 153-50 chr15 47744259 47744566 + 0.666667 NA intron (NM_153618, intron 1 of 18) intron (NM_153618, intron 1 of 18) 25923 NM_153619 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 179.333-83 chr18 5091307 5091778 + 0.666667 NA intron (NR_146900, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu 10360 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 136.333-65 chr15 55995614 55995909 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2149 NM_006154 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 228.667-17 chr11 61382055 61382553 + 0.666667 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -10056 NM_001330285 51259 Hs.26745 NM_016499 ENSG00000187049 TMEM216 HSPC244 transmembrane protein 216 protein-coding 126.333-40 chr13 34917851 34918121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24301 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 193.667-143 chr9 108087828 108088240 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -598265 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 202.333-74 chr17 41843366 41843721 + 0.666667 NA intron (NM_152467, intron 2 of 4) intron (NM_152467, intron 2 of 4) 5718 NM_001329596 317719 Hs.127510 NM_152467 ENSG00000161594 KLHL10 SPGF11 kelch like family member 10 protein-coding 186.667-77 chr2 201368795 201369188 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -11593 NM_139163 130540 Hs.107944 NM_139163 ENSG00000155749 FLACC1 ALS2CR12 flagellum associated containing coiled-coil domains 1 protein-coding 210-20 chr10 95315922 95316270 + 0.666667 NA intron (NM_001034955, intron 30 of 30) intron (NM_001034955, intron 30 of 30) -25093 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 127.667-57 chr17 28637915 28638159 + 0.666667 NA exon (NM_001321560, exon 14 of 39) exon (NM_001321560, exon 14 of 39) 7121 NM_001321560 9703 Hs.151761 NM_014680 ENSG00000007202 KIAA0100 BCOX|BCOX1|CT101|FMP27 KIAA0100 protein-coding 158-7 chr1 177417868 177418175 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66435 NR_126001 102724661 Hs.146628 NR_126001 LINC01645 - long intergenic non-protein coding RNA 1645 ncRNA 114-67 chr2 39050745 39051006 + 0.666667 NA intron (NM_005633, intron 6 of 22) intron (NM_005633, intron 6 of 22) 69588 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 219.333-64 chr16 2373026 2373529 + 0.666667 NA intron (NR_003574, intron 5 of 16) L2c|LINE|L2 32355 NR_003574 650655 Hs.376281 NR_003574 ENSG00000238098 ABCA17P ABCA17 ATP binding cassette subfamily A member 17, pseudogene pseudo 132.333-180 chr8 92157036 92157266 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -53766 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 139-105 chr8 102258907 102259176 + 0.666667 NA exon (NM_015902, exon 57 of 59) exon (NM_015902, exon 57 of 59) 19590 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 127.333-99 chr22 24268832 24269073 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1865 NM_001254732 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 112-211 chr9 75277873 75278093 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 189469 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 167.333-134 chr2 111635148 111635555 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 135783 NR_039928 100616370 NR_039928 ENSG00000264793 MIR4771-1 - microRNA 4771-1 ncRNA 127-25 chr11 3954928 3955195 + 0.666667 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) L1ME2|LINE|L1 98999 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 114.333-98 chr2 30603313 30603515 + 0.666667 NA intron (NM_182551, intron 6 of 6) HAL1|LINE|L1 156168 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 156-50 chr15 33923133 33923452 + 0.666667 NA intron (NM_020371, intron 2 of 5) intron (NM_020371, intron 2 of 5) -45205 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 119-120 chr5 41431251 41431535 + 0.666667 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) intron (NM_001005473, intron 1 of 2) 79208 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 124-10 chr1 104993589 104993876 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 625203 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 152.333-246 chr3 124047684 124048019 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -46830 NM_001322988 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 153-22 chr11 116164708 116165089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -404698 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 114.333-222 chr8 91133594 91133770 + 0.666667 NA intron (NR_148895, intron 6 of 10) AluSg|SINE|Alu 31063 NM_001354470 100130742 Hs.733070 NM_001129890 ENSG00000214954 LRRC69 - leucine rich repeat containing 69 protein-coding 145.667-250 chr6 72813387 72813767 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 154176 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 124.667-84 chr17 26792418 26792633 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 296716 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 134.333-124 chr4 39175791 39176048 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -6610 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 140.667-240 chr8 133529024 133529293 + 0.666667 NA intron (NM_003033, intron 2 of 8) intron (NM_003033, intron 2 of 8) 42729 NM_173344 6482 Hs.374257 NM_003033 ENSG00000008513 ST3GAL1 Gal-NAc6S|SIAT4A|SIATFL|ST3GalA|ST3GalA.1|ST3GalIA|ST3GalIA,1|ST3O ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 protein-coding 192.333-52 chr14 60735473 60735921 + 0.666667 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 936 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 149-136 chr7 103298630 103298927 + 0.666667 NA intron (NM_004279, intron 2 of 12) intron (NM_004279, intron 2 of 12) 1343 NM_004279 9512 Hs.184211 NM_004279 ENSG00000105819 PMPCB Beta-MPP|MPP11|MPPB|MPPP52|P-52 peptidase, mitochondrial processing beta subunit protein-coding 151-134 chr9 72821985 72822283 + 0.666667 NA intron (NM_138691, intron 20 of 23) intron (NM_138691, intron 20 of 23) 51975 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 137-84 chr5 94921684 94922007 + 0.666667 NA intron (NM_001002796, intron 7 of 22) intron (NM_001002796, intron 7 of 22) 160021 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 255.667-75 chr6 132011759 132012336 + 0.666667 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -60675 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 167.333-10 chr1 91022557 91023009 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_032186) promoter-TSS (NM_032186) -528 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 142.333-160 chr3 80766729 80767002 + 0.666667 NA intron (NR_147144, intron 1 of 2) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 1968 NR_147144 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 148.333-53 chr10 103822045 103822471 + 0.666667 NA intron (NM_014631, intron 1 of 13) intron (NM_014631, intron 1 of 13) 33148 NM_014631 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 255-53 chr3 32234477 32235089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3896 NM_001320308 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 112.333-170 chr3 136049920 136050133 + 0.666667 NA intron (NM_181897, intron 4 of 12) intron (NM_181897, intron 4 of 12) 27284 NM_181897 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 195.333-203 chr7 49018017 49018446 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 93684 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 204.667-68 chr2 22448762 22449161 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -87518 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 168.667-216 chr8 72105502 72105809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30071 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 237-47 chr3 2779733 2780265 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 6 of 24) intron (NM_175607, intron 6 of 24) -112216 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 160.667-199 chr3 82786507 82786831 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 800527 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 116.667-118 chr22 27297790 27297995 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12759 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 122.667-204 chr9 26460030 26460331 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 393505 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 173.333-174 chr6 69091071 69091486 + 0.666667 NA intron (NM_001704, intron 17 of 31) L1PA13|LINE|L1 455996 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 128.667-175 chr8 30969543 30969869 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -56698 NM_001350162 56154 Hs.458316 NM_001350162 ENSG00000133863 TEX15 CT42|SPGF25 testis expressed 15, meiosis and synapsis associated protein-coding 162.667-80 chr14 58914237 58914658 + 0.666667 NA intron (NR_110547, intron 3 of 5) intron (NR_110547, intron 3 of 5) 86159 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 140-131 chrX 46950115 46950440 + 0.666667 NA intron (NM_014735, intron 1 of 10) L1MB7|LINE|L1 37856 NM_014735 9767 Hs.371977 NM_014735 ENSG00000102221 JADE3 JADE-3|PHF16 jade family PHD finger 3 protein-coding 145-52 chr2 105849581 105849871 + 0.666667 NA intron (NM_003581, intron 2 of 4) intron (NM_003581, intron 2 of 4) -2121 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 168.667-90 chr2 12756723 12757089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19539 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 123.333-135 chr21 29899272 29899584 + 0.666667 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 40568 NM_001320621 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 168-99 chr7 5791069 5791470 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9606 NM_207116 54476 Hs.487458 NM_019011 ENSG00000011275 RNF216 CAHH|TRIAD3|U7I1|UBCE7IP1|ZIN ring finger protein 216 protein-coding 153-3 chr1 58583547 58583857 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6450 NM_002353 4070 Hs.23582 NM_002353 ENSG00000184292 TACSTD2 EGP-1|EGP1|GA733-1|GA7331|GP50|M1S1|TROP2 tumor associated calcium signal transducer 2 protein-coding 205.333-62 chr12 115413201 115413587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -729219 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 167-99 chr8 79194616 79195051 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -137355 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 138-84 chr4 95943628 95943997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 103719 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 115.667-88 chr15 97957014 97957242 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3575 NM_183376 91947 Hs.6093 NM_183376 ENSG00000140450 ARRDC4 - arrestin domain containing 4 protein-coding 158.667-324 chr8 105612713 105613157 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) intron (NM_001362837, intron 4 of 7) 293392 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 205.333-61 chr12 61439547 61439874 + 0.666667 NA Intergenic MamRep1527|LTR|LTR 753129 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 221.333-13 chr10 63498552 63499194 + 0.666667 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) L1MB1|LINE|L1 -22528 NM_001001330 221035 Hs.499833 NM_001001330 ENSG00000165476 REEP3 C10orf74|Yip2b receptor accessory protein 3 protein-coding 162-95 chr4 120030396 120030719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36291 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 218.667-58 chr2 157717155 157717630 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88528 NM_001111032 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 159.667-310 chr8 6018021 6018475 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 388300 NR_040040 100287015 Hs.156928 NR_040040 ENSG00000246089 LOC100287015 - uncharacterized LOC100287015 ncRNA 150.667-213 chr20 34858743 34859046 + 0.666667 NA intron (NM_178026, intron 7 of 14) AluSz|SINE|Alu 13962 NM_178026 2686 Hs.433738 NM_178026 ENSG00000131067 GGT7 D20S101|GGT4|GGTL3|GGTL5 gamma-glutamyltransferase 7 protein-coding 139.333-91 chr17 47618850 47619141 + 0.666667 NA intron (NM_001330257, intron 21 of 23) intron (NM_001330257, intron 21 of 23) -30924 NM_002265 3837 Hs.532793 NM_002265 ENSG00000108424 KPNB1 IMB1|IPO1|IPOB|Impnb|NTF97 karyopherin subunit beta 1 protein-coding 156.667-27 chr1 181458251 181458528 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25128 NM_001205293 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 136.667-38 chr12 62441609 62441942 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -25051 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 118.667-182 chr7 107360856 107361077 + 0.666667 NA intron (NM_181733, intron 10 of 20) MER52A|LTR|ERV1 -109091 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 119.667-132 chr4 67250071 67250293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 171818 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 115.333-84 chr15 63830714 63830966 + 0.666667 NA intron (NM_003922, intron 1 of 77) intron (NM_003922, intron 1 of 77) 3108 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 186.667-154 chr9 113940940 113941364 + 0.666667 NA intron (NM_001318042, intron 1 of 14) intron (NM_001318042, intron 1 of 14) 64843 NM_001318042 114991 Hs.349208 NM_133374 ENSG00000157657 ZNF618 FP13169|NEDD10 zinc finger protein 618 protein-coding 218-47 chr2 48062395 48063007 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -156908 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 124.333-174 chr8 86004288 86004617 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR3a|LTR|Gypsy 65216 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 159.667-269 chr5 119692424 119692736 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 63021 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 195-20 chr10 76368077 76368619 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1PB3|LINE|L1 -519696 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 125-126 chr9 36396031 36396314 + 0.666667 NA intron (NM_194330, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 4097 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 201-73 chr3 2309164 2309669 + 0.666667 NA intron (NM_001206955, intron 1 of 23) L1MB7|LINE|L1 70587 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 207-114 chr8 46850508 46851033 + 0.666667 NA intron (NR_027012, intron 9 of 11) BSR/Beta|Satellite|Satellite 9884 NR_027012 497634 Hs.406982 NR_027012 LINC00293 BEYLA|NCRNA00293 long intergenic non-protein coding RNA 293 ncRNA 150.667-207 chr2 229436490 229436775 + 0.666667 NA intron (NM_139072, intron 8 of 12) L1PA14|LINE|L1 -165345 NM_017933 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 125.333-21 chr10 30554457 30554735 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75157 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 140-85 chr5 51558293 51558547 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 174972 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 147.333-120 chr15 56088948 56089249 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_022841, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_022841, exon 10 of 10) -95486 NM_006154 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 147.667-192 chr2 192445154 192445561 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -250424 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 115.333-42 chr12 10026061 10026303 + 0.666667 NA intron (NR_120484, intron 2 of 2) intron (NR_120484, intron 2 of 2) 4424 NR_120484 102724020 Hs.737731 NR_120484 ENSG00000256803 LOC102724020 - uncharacterized LOC102724020 ncRNA 143-61 chr2 8195785 8196117 + 0.666667 NA intron (NR_034135, intron 7 of 8) intron (NR_034135, intron 7 of 8) 132468 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 135.333-129 chr4 112701114 112701372 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4775 NM_001354269 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 136.667-143 chr5 78014636 78015007 + 0.666667 NA intron (NM_003664, intron 26 of 26) intron (NM_003664, intron 26 of 26) 56574 NR_105013 101929154 Hs.252895 NR_105012 LOC101929154 - uncharacterized LOC101929154 ncRNA 112-110 chr2 117441668 117441882 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -372916 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 181-32 chr17 71060407 71060766 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 141593 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 114-155 chr7 131490554 131490736 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_013255, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_013255, exon 18 of 18) 65983 NM_005397 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 115.333-186 chr6 64805119 64805332 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) intron (NM_001292009, intron 22 of 43) -496193 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 117-141 chr8 77840689 77840946 + 0.666667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 390120 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 128-111 chr7 106754174 106754464 + 0.666667 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -93161 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 127.333-4 chr1 77485777 77486043 + 0.666667 NA intron (NM_012093, intron 9 of 13) AluSz|SINE|Alu 196748 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 145-65 chr22 47433031 47433446 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 53873 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 143-89 chr4 70371231 70371523 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10617 NM_012390 26952 Hs.701334 NM_012390 ENSG00000109208 SMR3A P-B1|PBI|PRL5|PROL5 submaxillary gland androgen regulated protein 3A protein-coding 167-81 chr5 17205240 17205666 + 0.666667 NA intron (NR_027253, intron 1 of 2) intron (NR_027253, intron 1 of 2) -11370 NM_001271606 10409 Hs.201641 NM_006317 ENSG00000176788 BASP1 CAP-23|CAP23|NAP-22|NAP22 brain abundant membrane attached signal protein 1 protein-coding 201.333-208 chr4 53695285 53695836 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_125918) promoter-TSS (NR_125918) -341 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 152.333-344 chr6 155401464 155401736 + 0.666667 NA intron (NM_015718, intron 12 of 13) intron (NM_015718, intron 12 of 13) 54239 NM_015718 50508 Hs.247776 NM_015718 ENSG00000074771 NOX3 GP91-3|MOX-2 NADPH oxidase 3 protein-coding 234.333-68 chr6 60232277 60232909 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -1341537 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 195.333-144 chr3 44506402 44506859 + 0.666667 NA intron (NM_001287349, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 3987 NM_001287349 285346 Hs.648974 NM_001287349 ENSG00000178917 ZNF852 - zinc finger protein 852 protein-coding 227-43 chr4 179144442 179144807 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -1236688 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 159-110 chr7 80453998 80454333 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57899 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 133.333-123 chr4 30384740 30384940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -335529 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 122.333-196 chr7 97079591 97079836 + 0.666667 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -36880 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 155.667-269 chr5 28396709 28397109 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109244 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 180.333-34 chr14 67850412 67850780 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 4 of 10) L1PA15-16|LINE|L1 27004 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 120.333-131 chr3 104241399 104241672 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -717419 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 145.667-30 chr10 22163067 22163491 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 46704 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 229.333-45 chr15 96855146 96855679 + 0.666667 NA Intergenic MER44D|DNA|TcMar-Tigger 71977 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 198.333-74 chr16 27133454 27133949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66774 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 166.667-10 chr1 94227132 94227475 + 0.666667 NA intron (NM_001328665, intron 1 of 21) intron (NM_001328665, intron 1 of 21) 10281 NM_001328666 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 157.333-249 chr3 194792370 194792735 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -23843 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 135.333 chr1 26840550 26840845 + 0.666667 NA intron (NM_032283, intron 2 of 7) AluSx|SINE|Alu 14009 NM_032283 84243 Hs.523710 NM_032283 ENSG00000204160 ZDHHC18 DHHC-18|DHHC18 zinc finger DHHC-type containing 18 protein-coding 174-84 chr6 56641272 56641680 + 0.666667 NA intron (NM_001144770, intron 14 of 94) AluSx1|SINE|Alu 1413 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 219.667-27 chr15 88725251 88725719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77951 NM_001369268 176 Hs.2159 NM_001135 ENSG00000157766 ACAN AGC1|AGCAN|CSPG1|CSPGCP|MSK16|SEDK|SSOAOD aggrecan protein-coding 113.333-154 chr20 58255865 58256074 + 0.666667 NA intron (NR_003505, intron 4 of 16) L1M4a1|LINE|L1 -27316 NM_001304369 140731 Hs.266571 NM_080674 ENSG00000124227 ANKRD60 C20orf86|bA196N14.3 ankyrin repeat domain 60 protein-coding 131.333-71 chr18 52714405 52714648 + 0.666667 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) intron (NM_005215, intron 1 of 28) 374329 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 193-44 chr2 48589766 48590319 + 0.666667 NA intron (NM_172311, intron 2 of 10) intron (NM_172311, intron 2 of 10) 9455 NM_001198594 286749 Hs.732016 NM_172311 ENSG00000068781 STON1-GTF2A1L ALF|GTF2A1L|GTF2A1LF|SALF STON1-GTF2A1L readthrough protein-coding 145-78 chr4 24040730 24041004 + 0.666667 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) intron (NM_001330752, intron 2 of 13) -150820 NM_013261 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 180-25 chr12 19175558 19176005 + 0.666667 NA intron (NM_019012, intron 3 of 25) intron (NM_019012, intron 3 of 25) -29544 NM_001256787 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 144.667-222 chr4 116614714 116614996 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 315130 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 149-45 chr14 70683730 70684150 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14758 NR_125769 103695436 Hs.572296 NR_125769 ENSG00000258689 LINC01269 - long intergenic non-protein coding RNA 1269 ncRNA 246.667-47 chr2 226442475 226442965 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 216073 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 132-52 chr17 73004720 73005087 + 0.666667 NA intron (NM_001352692, intron 4 of 9) intron (NM_001352692, intron 4 of 9) 87785 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 141.667-212 chr7 95266733 95267048 + 0.666667 NA intron (NM_017650, intron 11 of 15) intron (NM_017650, intron 11 of 15) 57642 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 172.333-160 chr6 139592690 139593146 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118322 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 161-9 chr10 121555933 121556245 + 0.666667 NA intron (NR_073009, intron 2 of 16) intron (NR_073009, intron 2 of 16) -24775 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 148.667-228 chr20 56833586 56834019 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 204496 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 184-3 chr1 52549711 52550088 + 0.666667 NA intron (NM_001009881, intron 1 of 29) intron (NM_001009881, intron 1 of 29) 3191 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 168.333-78 chr18 5287754 5288195 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7752 NM_001243702 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 235.666-17 chr5 157287643 157288327 + 0.666667 NA intron (NM_001291721, intron 3 of 29) AluJr|SINE|Alu 18661 NM_014376 26999 Hs.519702 NM_014376 ENSG00000055163 CYFIP2 EIEE65|PIR121 cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 protein-coding 139.667-87 chr2 73363638 73363976 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -21951 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 162.333-42 chr11 73321521 73321856 + 0.666667 NA intron (NM_014786, intron 1 of 20) intron (NM_014786, intron 1 of 20) -12327 NR_147696 100287837 Hs.573929 NR_147696 ENSG00000257038 LOC100287837 - uncharacterized LOC100287837 ncRNA 137-53 chr2 224798516 224798833 + 0.666667 NA intron (NM_001290263, intron 41 of 55) AluJb|SINE|Alu 148375 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 152-57 chr14 70496602 70496901 + 0.666667 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -12995 NR_037933 317760 Hs.188369 NR_037933 ENSG00000259158 ADAM20P1 C14orf55 ADAM metallopeptidase domain 20 pseudogene 1 pseudo 145.667-154 chr20 11286271 11286557 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -13031 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 146.667-246 chr5 9501269 9501569 + 0.666667 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) intron (NM_003966, intron 1 of 22) -9914 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 135.667-83 chr2 16557174 16557504 + 0.666667 NA intron (NM_030797, intron 10 of 11) L2c|LINE|L2 108495 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 115.333-145 chr3 136789508 136789681 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -29425 NM_001097599 80723 Hs.477692 NM_025246 ENSG00000168917 SLC35G2 TMEM22 solute carrier family 35 member G2 protein-coding 118.667-107 chr2 139720966 139721278 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 823798 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 188.667-144 chr7 140999830 141000116 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 14706 NM_016071 51650 Hs.416207 NM_016071 ENSG00000090263 MRPS33 CGI-139|MRP-S33|PTD003|S33mt mitochondrial ribosomal protein S33 protein-coding 160-93 chr5 20096448 20096825 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) L1MEg|LINE|L1 -108436 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 142.667-247 chr9 113047301 113047621 + 0.666667 NA intron (NM_003408, intron 3 of 3) intron (NM_003408, intron 3 of 3) 9263 NM_001282515 7539 Hs.150406 NM_003408 ENSG00000136866 ZFP37 ZNF906|zfp-37 ZFP37 zinc finger protein protein-coding 124-120 chr9 94070615 94070936 + 0.666667 NA intron (NM_177995, intron 2 of 9) L1MC4|LINE|L1 -13654 NM_152422 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 137.667-30 chr10 98727038 98727338 + 0.666667 NA intron (NM_001166245, intron 2 of 9) L1M4a2|LINE|L1 197380 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 119-58 chr16 14234354 14234672 + 0.666667 NA intron (NM_001308142, intron 9 of 16) AluJo|SINE|Alu 47827 NM_001365416 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 150-39 chr14 33559115 33559454 + 0.666667 NA intron (NM_001165893, intron 3 of 10) intron (NM_001165893, intron 3 of 10) -149653 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 130.667-48 chr11 47300623 47300978 + 0.666667 NA intron (NM_130476, intron 22 of 32) L1M2a|LINE|L1 -28690 NR_120569 101928943 Hs.664956 NR_120568 ENSG00000256746 LOC101928943 - uncharacterized LOC101928943 ncRNA 126-94 chr5 98382438 98382719 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -221339 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 166.333 chr1 9214646 9215064 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -19919 NM_004285 9563 Hs.463511 NM_004285 ENSG00000049239 H6PD CORTRD1|G6PDH|GDH hexose-6-phosphate dehydrogenase/glucose 1-dehydrogenase protein-coding 136.333-214 chr8 137903244 137903600 + 0.666667 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 180123 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 140.333-220 chr7 102952661 102952958 + 0.666667 NA intron (NR_105043, intron 9 of 20) AluSz|SINE|Alu -20621 NM_001085386 58160 Hs.621233 NM_001085386 ENSG00000230257 NFE4 NF-E4 nuclear factor, erythroid 4 protein-coding 123-61 chr19 31344902 31345233 + 0.666667 NA intron (NR_138034, intron 1 of 1) intron (NR_138034, intron 1 of 1) 4369 NR_138036 57616 Hs.278436 NM_020856 ENSG00000121297 TSHZ3 TSH3|ZNF537 teashirt zinc finger homeobox 3 protein-coding 120.333-83 chr18 39886502 39886790 + 0.666667 NA non-coding (NR_151703, exon 9 of 9) non-coding (NR_151703, exon 9 of 9) 44937 NR_151703 105372079 NR_151703 ENSG00000283503 LINC01902 - long intergenic non-protein coding RNA 1902 ncRNA 190.333-50 chr15 59092230 59092641 + 0.666667 NA intron (NM_001270529, intron 12 of 13) intron (NM_001270529, intron 12 of 13) -12711 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 119-87 chr20 6644999 6645285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90994 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 168.667-159 chr4 36457048 36457441 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30816 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 145-122 chr8 86944181 86944535 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 77943 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 210-102 chr4 48613394 48613853 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 7 of 63) intron (NM_015030, intron 7 of 63) 123371 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 116.333-140 chr3 28331379 28331613 + 0.666667 NA TTS (NM_001134433) TTS (NM_001134433) -17225 NR_136708 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 197.667-55 chr18 1093091 1093530 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -165317 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 154-129 chr7 8528364 8528677 + 0.666667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 94911 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 129-13 chr10 25545665 25545901 + 0.666667 NA intron (NM_020752, intron 5 of 10) (TCCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -105929 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 144.667-116 chr18 5393437 5393732 + 0.666667 NA intron (NM_001281533, intron 20 of 20) intron (NM_001281533, intron 20 of 20) -96531 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 128.667-21 chr10 30333919 30334189 + 0.666667 NA intron (NM_018109, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 15284 NM_018109 55149 Hs.173946 NM_018109 ENSG00000107951 MTPAP PAPD1|SPAX4|TENT6 mitochondrial poly(A) polymerase protein-coding 126-87 chr4 180312083 180312304 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 846956 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 289-22 chr4 92607284 92607880 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 303183 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 156-82 chr21 25897170 25897491 + 0.666667 NA intron (NM_001136131, intron 14 of 15) AluSx3|SINE|Alu -161676 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 261.333-82 chr5 23719395 23720047 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 212066 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 114.667-52 chr11 75764240 75764537 + 0.666667 NA non-coding (NR_046090, exon 2 of 4) non-coding (NR_046090, exon 2 of 4) 4259 NR_046090 283214 Hs.591972 NR_046090 ENSG00000247867 LOC283214 - uncharacterized LOC283214 ncRNA 202.333-117 chr4 2779730 2780129 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13156 NM_001122681 6452 Hs.167679 NM_003023 ENSG00000087266 SH3BP2 3BP-2|3BP2|CRBM|CRPM|RES4-23 SH3 domain binding protein 2 protein-coding 161.667-10 chr1 94497429 94497886 + 0.666667 NA intron (NM_002858, intron 16 of 22) L1ME4b|LINE|L1 44102 NM_001993 2152 Hs.62192 NM_001993 ENSG00000117525 F3 CD142|TF|TFA coagulation factor III, tissue factor protein-coding 113.667-86 chr18 10252204 10252440 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 162048 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 158.333-123 chr18 9870832 9871265 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14925 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 229.333-6 chr1 96658674 96659100 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -62718 NM_001300988 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 135-104 chr8 22574387 22574621 + 0.666667 NA intron (NM_001018003, intron 9 of 9) intron (NM_001018003, intron 9 of 9) -4237 NM_021630 64236 Hs.632034 NM_021630 ENSG00000120913 PDLIM2 MYSTIQUE|SLIM PDZ and LIM domain 2 protein-coding 123-84 chr4 26353237 26353465 + 0.666667 NA intron (NM_001363577, intron 1 of 10) intron (NM_001363577, intron 1 of 10) 32123 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 113.667-200 chr7 90409527 90409753 + 0.666667 NA intron (NM_001185073, intron 2 of 2) intron (NM_001185073, intron 2 of 2) 6179 NM_001185073 9069 Hs.731917 NM_012129 ENSG00000157224 CLDN12 - claudin 12 protein-coding 129-69 chr2 214656354 214656661 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 146325 NR_047698 100885780 Hs.665982 NR_047698 ENSG00000224257 VWC2L-IT1 - VWC2L intronic transcript 1 ncRNA 118.667-137 chr3 94224210 94224400 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 161244 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 133.333-72 chr2 17044052 17044285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -378334 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 146-17 chr11 94879549 94879897 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 93833 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 129.667-81 chr18 56260922 56261261 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -69829 NR_148972 642484 NR_148972 ENSG00000206129 LOC642484 - uncharacterized LOC642484 ncRNA 194.667-17 chr1 242107911 242108442 + 0.666667 NA intron (NM_001320272, intron 8 of 10) intron (NM_001320272, intron 8 of 10) -109078 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 210-45 chr15 90180777 90181244 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -3910 NM_001324030 10509 Hs.474935 NM_020210 ENSG00000185033 SEMA4B SEMAC|SemC semaphorin 4B protein-coding 122-74 chr3 95446945 95447290 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 236076 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 129.333-18 chr10 58923796 58924010 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -75615 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 150.667-333 chr6 76214668 76215077 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142194 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 124.333-38 chr12 60691997 60692314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1002785 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 119.667-174 chr7 51558638 51558929 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -165527 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 124.333-85 chr2 74783091 74783455 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -49382 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 131.667-141 chr3 192001927 192002167 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -236583 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 212.667-22 chr11 81244511 81244972 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -481938 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 213-57 chr3 184766857 184767293 + 0.666667 NA intron (NR_110043, intron 1 of 2) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 6080 NR_110043 101928992 Hs.507129 NR_110043 ENSG00000229433 LINC02069 - long intergenic non-protein coding RNA 2069 ncRNA 142-118 chr5 91562647 91562975 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -179494 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 198-32 chr11 108232784 108233268 + 0.666667 NA intron (NM_001351834, intron 5 of 63) AluSq2|SINE|Alu 9497 NM_001351836 472 Hs.367437 NM_000051 ENSG00000149311 ATM AT1|ATA|ATC|ATD|ATDC|ATE|TEL1|TELO1 ATM serine/threonine kinase protein-coding 135.667-4 chr1 73004850 73005134 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -301178 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 139.333-22 chr10 63642828 63643190 + 0.666667 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -121119 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 179-77 chr5 37311046 37311480 + 0.666667 NA intron (NM_004298, intron 22 of 34) intron (NM_004298, intron 22 of 34) 59843 NM_001278312 9631 Hs.547696 NM_004298 ENSG00000113569 NUP155 ATFB15|N155 nucleoporin 155 protein-coding 128-62 chr21 14422619 14422936 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -39631 NM_006948 6782 Hs.352341 NM_006948 ENSG00000155304 HSPA13 STCH heat shock protein family A (Hsp70) member 13 protein-coding 148-144 chr6 103378373 103378692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1481014 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 160-73 chr22 36970139 36970598 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5120 NR_038954 100506241 Hs.640023 NR_038954 ENSG00000215403 LL22NC01-81G9.3 - uncharacterized protein FLJ39582-like ncRNA 251-32 chr18 56961371 56962111 + 0.666667 NA intron (NM_015285, intron 25 of 27) intron (NM_015285, intron 25 of 27) 110378 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 158.333-119 chr17 75007135 75007455 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -5375 NM_001545 3396 Hs.407955 NM_001545 ENSG00000167862 MRPL58 DS-1|DS1|ICT1|MRP-L58 mitochondrial ribosomal protein L58 protein-coding 130-36 chr14 66416763 66417114 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -69433 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 152.667-154 chr18 77303901 77304156 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54180 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 119.667-3 chr1 33586788 33587089 + 0.666667 NA intron (NM_052896, intron 46 of 69) intron (NM_052896, intron 46 of 69) 114293 NM_145238 7579 Hs.442705 NM_145238 ENSG00000121903 ZSCAN20 KOX29|ZFP-31|ZNF31|ZNF360 zinc finger and SCAN domain containing 20 protein-coding 122.333-109 chr2 177853910 177854155 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 6 of 20) intron (NM_001077197, intron 6 of 20) 34724 NM_001077196 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 115-60 chr14 56596313 56596508 + 0.666667 NA intron (NM_017799, intron 3 of 15) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16612 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 112.667-23 chr1 238913657 238913848 + 0.666667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -427735 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 196-121 chr3 98345114 98345547 + 0.666667 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 -8524 NM_001005517 403278 Hs.554710 NM_001005517 ENSG00000196098 OR5K4 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 4 protein-coding 139-78 chr4 161808217 161808579 + 0.666667 NA intron (NM_001128428, intron 4 of 14) L1M3|LINE|L1 -214335 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 129.667-105 chr2 191684534 191684817 + 0.666667 NA intron (NR_045623, intron 6 of 6) intron (NR_045623, intron 6 of 6) -5506 NR_131917 105747689 Hs.104972 NR_131917 LOC105747689 - uncharacterized LOC105747689 ncRNA 155.333-64 chr11 128082939 128083236 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -125679 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 223.333-45 chr15 92691937 92692464 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36425 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 193.333-159 chr6 72681936 72682359 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 51652 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 238-66 chr4 49109861 49110490 + 0.666667 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 123533 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 162.667-91 chr15 98534404 98534733 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -20232 NM_182562 283777 Hs.668070 NM_182562 ENSG00000283597 FAM169B - family with sequence similarity 169 member B protein-coding 140.667-7 chr1 70183521 70183805 + 0.666667 NA intron (NM_017768, intron 4 of 14) AluJb|SINE|Alu 21916 NM_017768 55631 Hs.147836 NM_017768 ENSG00000066557 LRRC40 dJ677H15.1 leucine rich repeat containing 40 protein-coding 215.667-52 chr18 66780896 66781356 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -177036 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 123.333-79 chr14 71338006 71338269 + 0.666667 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) 17661 NM_001354289 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 112.667-85 chr16 68827656 68827869 + 0.666667 NA intron (NM_001317185, intron 13 of 15) L2|LINE|L2 -15769 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 133.333-135 chr4 105421867 105422204 + 0.666667 NA intron (NM_176867, intron 1 of 5) AluSz6|SINE|Alu 52027 NM_176869 27068 Hs.654957 NM_006903 ENSG00000138777 PPA2 HSPC124|SCFAI|SCFI|SID6-306 pyrophosphatase (inorganic) 2 protein-coding 132.667-57 chr15 49434658 49434908 + 0.666667 NA intron (NM_002009, intron 2 of 3) intron (NM_002009, intron 2 of 3) 11541 NM_002009 2252 Hs.567268 NM_002009 ENSG00000140285 FGF7 HBGF-7|KGF fibroblast growth factor 7 protein-coding 184-85 chr5 66363860 66364218 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 147565 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 161.667-17 chr1 182235614 182235943 + 0.666667 NA intron (NR_104175, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 78283 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 201-119 chr9 128643916 128644290 + 0.666667 NA intron (NM_052844, intron 1 of 8) MIR|SINE|MIR 12747 NM_052844 89891 Hs.495240 NM_052844 ENSG00000119333 WDR34 DIC5|FAP133|SRTD11|bA216B9.3 WD repeat domain 34 protein-coding 116-165 chr9 97715581 97715799 + 0.666667 NA intron (NR_147055, intron 8 of 10) intron (NR_147055, intron 8 of 10) -18281 NR_149091 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 162-130 chr9 29234300 29234652 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -20875 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 189.333-134 chr3 134429450 134429870 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8167 NR_039951 100616281 NR_039951 ENSG00000284561 MIR4788 - microRNA 4788 ncRNA 151.667-242 chr3 195478059 195478396 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -35207 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 178-49 chr14 105320019 105320382 + 0.666667 NA intron (NM_015197, intron 1 of 23) AluSc|SINE|Alu -4623 NM_001242787 2972 Hs.424484 NM_001519 ENSG00000185024 BRF1 BRF|BRF-1|CFDS|GTF3B|HEL-S-76p|TAF3B2|TAF3C|TAFIII90|TF3B90|TFIIIB90|hBRF BRF1 RNA polymerase III transcription initiation factor subunit protein-coding 156-75 chr2 173493612 173493984 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 138926 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 128-104 chr7 27668119 27668403 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -5378 NM_152740 11112 Hs.406758 NM_152740 ENSG00000106049 HIBADH NS5ATP1 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase protein-coding 216.333-66 chr18 76402388 76402931 + 0.666667 NA intron (NM_014643, intron 3 of 6) CpG -88993 NR_136504 101927989 Hs.665186 NR_136504 ENSG00000265778 LOC101927989 - uncharacterized LOC101927989 ncRNA 135-53 chr2 204117408 204117674 + 0.666667 NA Intergenic LTR1E|LTR|ERV1 180793 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 120-110 chr5 66565302 66565602 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30941 NM_001290228 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 172-2 chr1 40289183 40289548 + 0.666667 NA intron (NM_005857, intron 8 of 9) ERVL-E-int|LTR|ERVL 27921 NM_001852 1298 Hs.418012 NM_001852 ENSG00000049089 COL9A2 DJ39G22.4|EDM2|MED|STL5 collagen type IX alpha 2 chain protein-coding 133.667-25 chr11 10863010 10863273 + 0.666667 NA intron (NR_034137, intron 1 of 2) MamTip3|DNA|hAT-Tip100 4924 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 161.667-236 chr7 15764221 15764555 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76010 NR_110094 101927524 Hs.386790 NR_110094 LINC02587 MEOX2-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2587 ncRNA 113.667-27 chr10 102217102 102217431 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -9033 NM_152310 83401 Hs.302130 NM_152310 ENSG00000119915 ELOVL3 CIG-30|CIG30 ELOVL fatty acid elongase 3 protein-coding 177.333-144 chr6 81601329 81601799 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 151117 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 117-58 chr17 20027083 20027333 + 0.666667 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) L1M4|LINE|L1 17849 NM_001243439 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 141.333-50 chr12 104182154 104182540 + 0.666667 NA Intergenic LTR42|LTR|ERVL -33432 NM_001093771 7296 Hs.654922 NM_003330 ENSG00000198431 TXNRD1 GRIM-12|TR|TR1|TRXR1|TXNR thioredoxin reductase 1 protein-coding 124-118 chr9 34434675 34434896 + 0.666667 NA intron (NM_001184942, intron 1 of 5) intron (NM_001184942, intron 1 of 5) 23785 NM_001184940 203259 Hs.493771 NM_147202 ENSG00000164970 FAM219A C9orf25 family with sequence similarity 219 member A protein-coding 150.667-216 chr20 54039703 54040007 + 0.666667 NA intron (NM_001366297, intron 3 of 8) intron (NM_001366297, intron 3 of 8) 19165 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 151.667-392 chr9 73647554 73647873 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 495848 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 167-84 chr5 66298754 66299156 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -89509 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 133.333-90 chr2 222001511 222001800 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -296492 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 127.333-34 chr11 132060637 132061004 + 0.666667 NA intron (NR_147849, intron 2 of 6) X6B_LINE|LINE|CR1 150002 NR_147854 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 186.667-116 chr5 72609900 72610189 + 0.666667 NA intron (NR_105007, intron 1 of 2) AluSc|SINE|Alu 50625 NR_105007 102477328 Hs.254516 NR_105007 ENSG00000248371 LINC02056 - long intergenic non-protein coding RNA 2056 ncRNA 127-31 chr14 79483600 79483872 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 204356 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 195.333-6 chr1 55261032 55261460 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 35605 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 114.333-164 chr4 159101021 159101214 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2934 NM_001351724 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 166-28 chr11 59476370 59476667 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001004705) promoter-TSS (NM_001004705) -912 NM_001004705 390197 Hs.553756 NM_001004705 ENSG00000254466 OR4D10 OR11-251|OR4D10P|OST711 olfactory receptor family 4 subfamily D member 10 protein-coding 115.333-91 chr16 87563076 87563402 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -38596 NR_073379 57338 Hs.592068 NM_020655 ENSG00000154118 JPH3 CAGL237|HDL2|JP-3|JP3|TNRC22 junctophilin 3 protein-coding 148.667-314 chr5 81998140 81998439 + 0.666667 NA intron (NM_031482, intron 2 of 7) L1PA14|LINE|L1 26266 NM_001131028 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 139.667-3 chr1 90746051 90746458 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -28952 NM_020063 343472 Hs.451956 NM_020063 ENSG00000143032 BARHL2 - BarH like homeobox 2 protein-coding 129-100 chr5 80724624 80724899 + 0.666667 NA intron (NM_002439, intron 8 of 23) intron (NM_002439, intron 8 of 23) -69778 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 207.333-251 chr7 37907942 37908556 + 0.666667 NA intron (NM_003014, intron 5 of 5) intron (NM_003014, intron 5 of 5) 8568 NM_003014 6424 Hs.658169 NM_003014 ENSG00000106483 SFRP4 FRP-4|FRPHE|FRZB-2|PYL|sFRP-4 secreted frizzled related protein 4 protein-coding 173.333-121 chr3 73272186 73272560 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 161622 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 185.333-139 chr4 67543763 67544080 + 0.666667 NA intron (NR_155754, intron 2 of 18) intron (NR_155754, intron 2 of 18) 1582 NR_155754 1060 Hs.479867 NM_001812 ENSG00000145241 CENPC CENP-C|CENPC1|MIF2|hcp-4 centromere protein C protein-coding 158.667-46 chr10 93673827 93674167 + 0.666667 NA intron (NM_145246, intron 12 of 13) MIRb|SINE|MIR 28575 NM_001347713 118924 Hs.586650 NM_145246 ENSG00000148690 FRA10AC1 C10orf4|F26C11.1-like|FRA10A FRA10A associated CGG repeat 1 protein-coding 160.333-204 chr4 31865076 31865428 + 0.666667 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -132127 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 157.667-81 chr12 75311179 75311490 + 0.666667 NA intron (NR_149161, intron 5 of 11) L2a|LINE|L2 18990 NM_001286547 84698 Hs.733835 NM_032606 ENSG00000180881 CAPS2 UG0636c06 calcyphosine 2 protein-coding 237.333-95 chr6 1368635 1369312 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20603 NM_001452 2295 Hs.484423 NM_001452 ENSG00000137273 FOXF2 FKHL6|FREAC-2|FREAC2 forkhead box F2 protein-coding 165.333-211 chr5 112055989 112056394 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -79259 NM_001142474 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 184-120 chr9 25135409 25135826 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 543241 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 126.333-65 chr17 27084616 27084841 + 0.666667 NA intron (NR_135673, intron 1 of 3) L1M2|LINE|L1 4513 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 196.333-66 chr17 69433986 69434535 + 0.666667 NA intron (NM_002758, intron 1 of 11) intron (NM_002758, intron 1 of 11) 19563 NM_002758 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 144-136 chr5 145177732 145178022 + 0.666667 NA Intergenic MER63D|DNA|hAT-Blackjack 657465 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 114.333-148 chr3 105492685 105492965 + 0.666667 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 125916 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 135.333-13 chr1 171770512 171770843 + 0.666667 NA Intergenic LTR57|LTR|ERVL -10983 NM_001007239 51603 Hs.494705 NM_014955 ENSG00000010165 EEF1AKNMT 5630401D24Rik|CGI-01|DFNB26|DFNB26M|KIAA0859|METTL13|feat eEF1A lysine and N-terminal methyltransferase protein-coding 185.667-27 chr12 126073651 126074068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22133 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 116.333-104 chr19 51968646 51968946 + 0.666667 NA intron (NM_021632, intron 3 of 4) intron (NM_021632, intron 3 of 4) 18044 NM_021632 59348 Hs.407694 NM_021632 ENSG00000256683 ZNF350 ZBRK1|ZFQR zinc finger protein 350 protein-coding 135.333-209 chrX 77573425 77573682 + 0.666667 NA intron (NM_000489, intron 28 of 34) L1ME1|LINE|L1 126164 NM_003868 8823 Hs.666364 NM_003868 ENSG00000196468 FGF16 FGF-16|MF4 fibroblast growth factor 16 protein-coding 126.333-121 chr3 119385715 119385987 + 0.666667 NA intron (NM_020754, intron 6 of 11) intron (NM_020754, intron 6 of 11) -63091 NR_046748 100874246 Hs.607097 NR_046748 ENSG00000241155 ARHGAP31-AS1 - ARHGAP31 antisense RNA 1 ncRNA 148.667-123 chr14 69974821 69975152 + 0.666667 NA intron (NM_001034852, intron 3 of 11) intron (NM_001034852, intron 3 of 11) -3147 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 131.333-91 chr2 85506967 85507304 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31751 NR_038942 100630918 Hs.66049 NR_038942 PARTICL PARTICLE promoter of MAT2A antisense radiation-induced circulating long non-coding RNA ncRNA 139-95 chr7 41145093 41145356 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43620 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 177.333-24 chr11 12489726 12490045 + 0.666667 NA intron (NM_018222, intron 4 of 12) L1MEd|LINE|L1 112314 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 132-58 chr2 7524793 7525021 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 103646 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 140.333-131 chr22 26626869 26627178 + 0.666667 NA intron (NM_001886, intron 4 of 5) L1MC3|LINE|L1 5060 NM_001886 1413 Hs.57690 NM_001886 ENSG00000196431 CRYBA4 CTRCT23|CYRBA4|MCOPCT4 crystallin beta A4 protein-coding 132.333-153 chr6 80437729 80438120 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 331253 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 141.667-133 chr20 54221483 54221765 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13537 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 187.333-50 chr12 119468145 119468632 + 0.666667 NA intron (NM_178499, intron 2 of 13) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -125386 NM_001136534 387890 Hs.530965 NM_001136534 ENSG00000224982 TMEM233 DSPB2|IFITMD2 transmembrane protein 233 protein-coding 192.667-144 chr5 181044620 181045106 + 0.666667 NA intron (NM_001308245, intron 1 of 10) intron (NM_001308245, intron 1 of 10) -1379 NR_107056 102465882 NR_107056 ENSG00000277912 MIR8089 hsa-mir-8089 microRNA 8089 ncRNA 175-24 chr14 71919727 71920145 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -12235 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 126-88 chr5 22525930 22526214 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) -312222 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 146.333-342 chr8 127637658 127637937 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96170 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 122.667-2 chr1 43045027 43045261 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 86095 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 162.667-196 chr4 66684972 66685433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 408378 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 189.333-51 chr14 29321635 29322061 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -536061 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 167-25 chr11 83150517 83150941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6402 NM_015885 51585 Hs.128959 NM_015885 ENSG00000165494 PCF11 - PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit protein-coding 196.333-127 chr4 38037302 38037668 + 0.666667 NA intron (NM_001253912, intron 8 of 20) intron (NM_001253912, intron 8 of 20) -72696 NM_001253913 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 152.667-209 chr2 194553201 194553607 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -177191 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 113-157 chr4 64314288 64314502 + 0.666667 NA intron (NM_001363796, intron 5 of 11) intron (NM_001363796, intron 5 of 11) 95055 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 121-142 chr8 143895867 143896106 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -17522 NM_031308 83481 Hs.200412 NM_031308 ENSG00000261150 EPPK1 EPIPL|EPIPL1 epiplakin 1 protein-coding 184.667-3 chr1 68221027 68221405 + 0.666667 NA intron (NM_024911, intron 1 of 11) intron (NM_024911, intron 1 of 11) 11307 NM_024911 79971 Hs.647659 NM_024911 ENSG00000116729 WLS C1orf139|EVI|GPR177|MRP|mig-14 Wnt ligand secretion mediator protein-coding 164-102 chr7 2765291 2765598 + 0.666667 NA TTS (NM_001321766) TTS (NM_001321766) -2304 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 122-137 chrX 42579559 42579916 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 198426 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 126-72 chr3 101682711 101683063 + 0.666667 NA exon (NM_000986, exon 4 of 6) exon (NM_000986, exon 4 of 6) 3831 NM_000986 6152 Hs.477028 NM_000986 ENSG00000114391 RPL24 HEL-S-310|L24 ribosomal protein L24 protein-coding 205.333-6 chr1 43775277 43775741 + 0.666667 NA intron (NM_001270465, intron 2 of 7) AluSq2|SINE|Alu -48166 NR_125986 101929592 NR_125986 ENSG00000229444 LOC101929592 - uncharacterized LOC101929592 ncRNA 153.667-160 chr18 2442818 2443200 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 128496 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 126.667-79 chr2 79728828 79729053 + 0.666667 NA intron (NM_001282598, intron 2 of 17) L1PA3|LINE|L1 -79581 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 172-115 chrX 90088251 90088561 + 0.666667 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 166498 NM_138960 90316 Hs.592220 NM_138960 ENSG00000153779 TGIF2LX TGIFLX TGFB induced factor homeobox 2 like X-linked protein-coding 193.333-75 chr17 69277905 69278388 + 0.666667 NA intron (NM_018672, intron 17 of 37) L1ME3|LINE|L1 -33331 NM_080282 10349 Hs.25377 NM_080282 ENSG00000154263 ABCA10 EST698739 ATP binding cassette subfamily A member 10 protein-coding 125.333-144 chr5 102082806 102083060 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 213351 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 113.333-258 chr8 92206869 92207095 + 0.666667 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 -103597 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 122-64 chr20 39116833 39117128 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 107768 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 122.667-33 chr12 5181529 5181826 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61474 NR_120476 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 166.333-108 chr2 37978500 37978856 + 0.666667 NA intron (NM_001170793, intron 3 of 9) AluJr|SINE|Alu 28214 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 145.667-288 chr8 99723442 99723710 + 0.666667 NA intron (NM_017890, intron 39 of 61) intron (NM_017890, intron 39 of 61) 170131 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 126-110 chr8 47666207 47666482 + 0.666667 NA intron (NM_001352960, intron 3 of 12) MER3|DNA|hAT-Charlie 6680 NM_001352960 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 242.667-43 chr17 5329111 5329559 + 0.666667 NA intron (NM_001291582, intron 2 of 4) AluSq|SINE|Alu 47051 NM_001291582 9135 Hs.584784 NM_004703 ENSG00000029725 RABEP1 RAB5EP|RABPT5 rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 protein-coding 134-105 chr8 56112259 56112573 + 0.666667 NA TTS (NM_005372) TTS (NM_005372) 1566 NM_005372 4342 Hs.533432 NM_005372 ENSG00000172680 MOS MSV MOS proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 129.667-72 chr16 59711408 59711682 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43646 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 143-55 chr17 30964888 30965186 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6002 NM_032322 84282 Hs.29874 NM_032322 ENSG00000181481 RNF135 L13|MMFD|REUL|Riplet ring finger protein 135 protein-coding 149.333-51 chr10 65563857 65564303 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7345 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 117.667-110 chr22 28234122 28234384 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) AluSx1|SINE|Alu -225616 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 187.667-143 chr8 99059092 99059565 + 0.666667 NA intron (NR_047582, intron 4 of 8) AluSx3|SINE|Alu 46062 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 151.333-248 chr20 45596065 45596496 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16996 NM_130896 90199 Hs.116128 NM_130896 ENSG00000158901 WFDC8 C20orf170|HEL-S-292|WAP8|dJ461P17.1 WAP four-disulfide core domain 8 protein-coding 293.333-29 chr2 66120978 66121585 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 237047 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 254.333-68 chr5 125793703 125794223 + 0.666667 NA Intergenic ERVL47-int|LTR|ERVL 300702 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 118.667-93 chr2 11531231 11531556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2652 NM_014668 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 134-99 chr7 51153296 51153653 + 0.666667 NA intron (NM_015198, intron 5 of 12) intron (NM_015198, intron 5 of 12) 163335 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 131.333-29 chr10 107513608 107513816 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -349006 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 174-22 chr12 62450617 62450986 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16025 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 134-14 chr10 43854816 43855028 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -4489 NR_038268 100506835 Hs.462615 NR_038268 ENSG00000226808 LINC00840 - long intergenic non-protein coding RNA 840 ncRNA 199.333-306 chr9 110361202 110361649 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23541 NM_001286947 255220 Hs.147064 NM_001003936 ENSG00000204193 TXNDC8 SPTRX-3|SPTRX3|TRX6|bA427L11.2 thioredoxin domain containing 8 protein-coding 120.333-132 chr3 104746975 104747274 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -619589 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 149.333-159 chr18 59978859 59979283 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 79075 NM_021127 5366 Hs.96 NM_021127 ENSG00000141682 PMAIP1 APR|NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 protein-coding 195-4 chr1 79112346 79112776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105831 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 114-151 chr7 104513617 104513942 + 0.666667 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) MER5B|DNA|hAT-Charlie 185123 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 199.667-110 chr5 24024273 24024621 + 0.666667 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) L1PB1|LINE|L1 73099 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 153.333-55 chr10 103006650 103007072 + 0.666667 NA intron (NM_199076, intron 1 of 6) AluJr|SINE|Alu -88526 NR_160733 107984265 NR_160733 LOC107984265 - uncharacterized LOC107984265 ncRNA 246.667-97 chr8 99443123 99443560 + 0.666667 NA intron (NM_017890, intron 23 of 61) intron (NM_017890, intron 23 of 61) 93389 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 159.667-342 chrX 29852785 29853115 + 0.666667 NA intron (NM_014271, intron 6 of 10) intron (NM_014271, intron 6 of 10) 278672 NR_049877 100847047 NR_049877 ENSG00000264090 MIR4666B - microRNA 4666b ncRNA 132.667-115 chr3 190381637 190381939 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6084 NM_006580 10686 Hs.251391 NM_006580 ENSG00000113946 CLDN16 HOMG3|PCLN1 claudin 16 protein-coding 220.667-112 chr9 37167666 37168038 + 0.666667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) L1MEc|LINE|L1 47254 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 117-85 chr2 219736589 219736933 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109131 NM_005070 6508 Hs.1176 NM_005070 ENSG00000114923 SLC4A3 AE3|CAE3/BAE3|SLC2C solute carrier family 4 member 3 protein-coding 139.333-58 chr13 28287770 28288162 + 0.666667 NA intron (NM_175854, intron 17 of 18) intron (NM_175854, intron 17 of 18) -148792 NR_029383 100288730 Hs.123191 NR_029383 PAN3-AS1 - PAN3 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-316 chr4 99952843 99953280 + 0.666667 NA intron (NR_125923, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 2567 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 160-53 chr19 18767789 18768214 + 0.666667 NA intron (NM_015321, intron 9 of 13) intron (NM_015321, intron 9 of 13) 23304 NM_000095 1311 Hs.1584 NM_000095 ENSG00000105664 COMP EDM1|EPD1|MED|PSACH|THBS5|TSP5 cartilage oligomeric matrix protein protein-coding 145-14 chr10 114490806 114491181 + 0.666667 NA intron (NM_001352440, intron 7 of 20) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 35920 NM_001322898 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 142.667-57 chr14 71317124 71317433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3198 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 133.667-15 chr1 233413404 233413640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 85798 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 122-66 chr21 23357678 23357893 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 27050 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 280.333-33 chr5 68185453 68186034 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -4133 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 140.333-111 chr2 155579437 155579766 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 675330 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 139.667-14 chr1 178397665 178397998 + 0.666667 NA intron (NM_004841, intron 2 of 15) AluJo|SINE|Alu 56380 NM_004841 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 166-38 chr13 102378367 102378779 + 0.666667 NA intron (NM_001321949, intron 1 of 5) intron (NM_001321949, intron 1 of 5) 11043 NR_125912 100874081 Hs.569296 NR_125912 ENSG00000234445 FGF14-AS1 - FGF14 antisense RNA 1 ncRNA 131-99 chr8 64863884 64864259 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65334 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 146.667-327 chr8 62818618 62818972 + 0.666667 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) L2c|LINE|L2 -159066 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 145-85 chr4 186041947 186042375 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26994 NM_003265 7098 Hs.657724 NM_003265 ENSG00000164342 TLR3 CD283|IIAE2 toll like receptor 3 protein-coding 169.333-137 chr2 217203727 217204168 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78786 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 139.333-229 chr9 76980985 76981226 + 0.666667 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -38550 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 212-106 chr3 104263091 104263650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -739254 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 120-127 chr6 139580500 139580710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106009 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 174-5 chr1 246584890 246585263 + 0.666667 NA intron (NM_001139459, intron 1 of 8) L1MEg|LINE|L1 18620 NM_152609 163882 Hs.368353 NM_152609 ENSG00000162852 CNST C1orf71|PPP1R64 consortin, connexin sorting protein protein-coding 149.667-191 chr2 29418542 29418899 + 0.666667 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) L1PB4|LINE|L1 56657 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 152.333-44 chr10 49122948 49123281 + 0.666667 NA intron (NR_038973, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 1275 NR_038973 100506733 Hs.404175 NR_038973 ENSG00000234736 FAM170B-AS1 - FAM170B antisense RNA 1 ncRNA 202.333-55 chr13 99045310 99045639 + 0.666667 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) L1MA8|LINE|L1 -29689 NM_001366677 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 134.333-45 chr13 110250061 110250379 + 0.666667 NA intron (NM_001845, intron 1 of 51) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 56937 NM_001845 1282 Hs.17441 NM_001845 ENSG00000187498 COL4A1 BSVD|BSVD1|RATOR collagen type IV alpha 1 chain protein-coding 112-6 chr1 89578399 89578713 + 0.666667 NA intron (NM_015350, intron 6 of 8) intron (NM_015350, intron 6 of 8) 53718 NM_015350 23507 Hs.482017 NM_015350 ENSG00000197147 LRRC8B TA-LRRP|TALRRP leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B protein-coding 263.667 chr1 27720013 27720540 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5685 NM_001143912 199870 Hs.469359 NM_152660 ENSG00000009780 FAM76A - family with sequence similarity 76 member A protein-coding 136.333-156 chr4 142911382 142911715 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65013 NM_001101669 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 159-6 chr1 62910936 62911245 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 99835 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 115-92 chr2 123790099 123790308 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 234971 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 144-103 chr3 39571051 39571434 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 69176 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 120-45 chr16 2048710 2048959 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001318194) promoter-TSS (NM_001318194) 632 NM_001318832 7249 Hs.90303 NM_000548 ENSG00000103197 TSC2 LAM|PPP1R160|TSC4 TSC complex subunit 2 protein-coding 155.333-142 chr18 9107767 9108064 + 0.666667 NA intron (NM_021074, intron 1 of 7) intron (NM_021074, intron 1 of 7) 5216 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 142-153 chr8 75863586 75863972 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 323811 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 151.667-23 chr1 171569390 171569793 + 0.666667 NA intron (NM_015172, intron 23 of 33) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -50172 NM_001368164 110806290 NM_001368164 MYOCOS - myocilin opposite strand protein-coding 140.667-100 chr18 3746961 3747235 + 0.666667 NA intron (NM_001242762, intron 2 of 9) AluJo|SINE|Alu 98260 NM_001242765 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 111.667-162 chr22 30293087 30293284 + 0.666667 NA intron (NM_031937, intron 8 of 8) MIR|SINE|MIR -3558 NM_001037666 652968 Hs.444950 NM_001037666 ENSG00000239282 CASTOR1 GATSL3 cytosolic arginine sensor for mTORC1 subunit 1 protein-coding 207-25 chr12 54651130 54651701 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -3050 NM_001300854 117159 Hs.350570 NM_053283 ENSG00000161634 DCD AIDD|DCD-1|DSEP|HCAP|PIF dermcidin protein-coding 149.667-232 chr20 24188435 24188741 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -11179 NR_040102 400839 Hs.651965 NR_040102 ENSG00000230133 LINC01721 - long intergenic non-protein coding RNA 1721 ncRNA 180.333-3 chr1 49086282 49086656 + 0.666667 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) L1PA15|LINE|L1 -170942 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 120.333-165 chr6 103907795 103908002 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 951648 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 185-40 chr21 46283583 46283984 + 0.666667 NA exon (NM_003906, exon 2 of 28) exon (NM_003906, exon 2 of 28) 1828 NM_003906 8888 Hs.389037 NM_003906 ENSG00000160294 MCM3AP GANP|MAP80|PNRIID|SAC3 minichromosome maintenance complex component 3 associated protein protein-coding 113-55 chr14 53876040 53876270 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72329 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 242.333-27 chr13 113228459 113229118 + 0.666667 NA intron (NM_001008895, intron 4 of 19) intron (NM_001008895, intron 4 of 19) 19175 NM_001354942 8451 Hs.339735 NM_003589 ENSG00000139842 CUL4A - cullin 4A protein-coding 173-5 chr10 5642060 5642410 + 0.666667 NA intron (NM_024701, intron 4 of 5) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 24360 NR_024581 79754 Hs.445899 NM_024701 ENSG00000196372 ASB13 - ankyrin repeat and SOCS box containing 13 protein-coding 121.667-3 chr1 40504816 40505110 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -3756 NM_001346949 64789 Hs.59584 NM_022774 ENSG00000164002 EXO5 C1orf176|DEM1|Exo V|hExo5 exonuclease 5 protein-coding 347.667-18 chr7 11207743 11208594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 234296 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 157-43 chr14 50823382 50823661 + 0.666667 NA TTS (NR_135258) TTS (NR_135258) 1724 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 187-88 chr8 88025461 88025846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -151638 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 149-131 chr7 26545839 26546128 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7158 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 179-30 chr15 40222614 40222995 + 0.666667 NA intron (NM_001128629, intron 1 of 9) intron (NM_001128629, intron 1 of 9) 5376 NM_001128629 106821730 Hs.732375 NM_001128628 ENSG00000259288 BUB1B-PAK6 PAK-5|PAK-6|PAK5|PAK6 BUB1B-PAK6 readthrough protein-coding 153.667-123 chr14 73767183 73767546 + 0.666667 NA intron (NM_001043318, intron 1 of 11) AluJr|SINE|Alu -7061 NM_001367710 91748 Hs.594157 NM_194278 ENSG00000156030 ELMSAN1 C14orf117|C14orf43|LSR68|MIDEAS|c14_5541 ELM2 and Myb/SANT domain containing 1 protein-coding 162.667-239 chr6 52045232 52045563 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 24 of 66) intron (NM_138694, intron 24 of 66) 42216 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 154-100 chr3 194451437 194451807 + 0.666667 NA intron (NM_001367549, intron 10 of 33) intron (NM_001367549, intron 10 of 33) 16617 NM_024524 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 118.667-68 chr14 73656302 73656554 + 0.666667 NA intron (NM_001201366, intron 3 of 8) intron (NM_001201366, intron 3 of 8) 11442 NM_031427 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 114.333-94 chr18 77826698 77826967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 166895 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 131.333-34 chr11 31274830 31275079 + 0.666667 NA intron (NM_181807, intron 7 of 8) AluSg|SINE|Alu 94785 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 149.333-371 chr7 69068750 69068974 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 528762 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 152.667-343 chr7 81841491 81841927 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -71662 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 242.667-83 chr5 67046813 67047445 + 0.666667 NA intron (NM_001297651, intron 1 of 25) intron (NM_001297651, intron 1 of 25) 42474 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 165-92 chr7 113642961 113643327 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 275865 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 183.333-87 chr2 164446659 164447059 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121636 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 195-56 chr2 3994063 3994455 + 0.666667 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 20098 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 132-36 chr13 95732746 95732975 + 0.666667 NA intron (NM_006260, intron 4 of 11) L1PA2|LINE|L1 55721 NM_006260 5611 Hs.59214 NM_006260 ENSG00000102580 DNAJC3 ACPHD|ERdj6|HP58|P58|P58IPK|PRKRI DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C3 protein-coding 183.667-90 chr3 40610764 40611212 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 86028 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 124-43 chr15 87489091 87489299 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87734 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 185.667-8 chr1 238783586 238784049 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -297800 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 204.333-179 chr6 136442582 136442992 + 0.666667 NA intron (NM_001198617, intron 1 of 15) intron (NM_001198617, intron 1 of 15) 24088 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 166-61 chr2 63905263 63905575 + 0.666667 NA intron (NM_001005739, intron 20 of 22) L1ME1|LINE|L1 63539 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 180-41 chr15 54535121 54535583 + 0.666667 NA intron (NM_001329919, intron 25 of 31) L1PA15|LINE|L1 -521395 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 181-41 chr2 211040285 211040673 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 422908 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 112.667-214 chr5 59195002 59195205 + 0.666667 NA intron (NM_006203, intron 2 of 14) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 81012 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 137.333-58 chr16 10172511 10172880 + 0.666667 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) MER102a|DNA|hAT-Charlie 9372 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 182.333-25 chr11 58221136 58221581 + 0.666667 NA Intergenic (TATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 6613 NM_001004458 219959 Hs.553645 NM_001004458 ENSG00000280204 OR1S1 OR11-232|OST034 olfactory receptor family 1 subfamily S member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 117.667-208 chr9 75815875 75816159 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74627 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 111.667-74 chr13 25502230 25502523 + 0.666667 NA intron (NM_016529, intron 2 of 36) intron (NM_016529, intron 2 of 36) 33602 NM_001313741 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 120.333-187 chr8 86547093 86547298 + 0.666667 NA intron (NM_003909, intron 10 of 16) intron (NM_003909, intron 10 of 16) 32760 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 112.667-81 chr16 48227114 48227362 + 0.666667 NA intron (NM_001370497, intron 4 of 29) AluSx1|SINE|Alu 5033 NM_033151 85320 Hs.652267 NM_032583 ENSG00000121270 ABCC11 EWWD|MRP8|WW ATP binding cassette subfamily C member 11 protein-coding 166.333-62 chr13 91462556 91462900 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) intron (NM_004466, intron 2 of 7) 64107 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 162.333-129 chr2 180512370 180512691 + 0.666667 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 -179574 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 173-7 chr10 33668021 33668401 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 104469 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 151.667-329 chr7 7884862 7885222 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83710 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 135.333-94 chr2 183936470 183936739 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -442371 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 224.333-113 chr7 7607251 7607779 + 0.666667 NA non-coding (NR_163250, exon 12 of 12) non-coding (NR_163250, exon 12 of 12) -33237 NM_001302349 729852 Hs.652371 NM_001302348 ENSG00000219545 UMAD1 RPA3-AS1|RPA3OS UBAP1-MVB12-associated (UMA) domain containing 1 protein-coding 141.333-7 chr1 80714717 80715025 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 73584 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 219.666-4 chr1 232130710 232131343 + 0.666667 NA Intergenic MER61D|LTR|ERV1 205192 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 193-73 chr5 52824366 52824779 + 0.666667 NA intron (NM_181501, intron 1 of 28) AluSz|SINE|Alu 36656 NM_181501 3672 Hs.644352 NM_181501 ENSG00000213949 ITGA1 CD49a|VLA1 integrin subunit alpha 1 protein-coding 113-123 chr20 12850869 12851139 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 85959 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 132.333-108 chr22 26354805 26355041 + 0.666667 NA intron (NM_001184777, intron 12 of 14) intron (NM_001184777, intron 12 of 14) -74337 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 112-55 chr13 108036964 108037188 + 0.666667 NA Intergenic (CT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -169580 NM_001080396 728215 Hs.535394 NM_001080396 ENSG00000204442 FAM155A - family with sequence similarity 155 member A protein-coding 150.333-405 chr8 77322606 77322960 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127914 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 123.333-95 chr17 82481611 82481902 + 0.666667 NA intron (NM_001038618, intron 7 of 10) intron (NM_001038618, intron 7 of 10) 23015 NM_001083608 26502 Hs.256526 NM_012336 ENSG00000141562 NARF IOP2 nuclear prelamin A recognition factor protein-coding 137.667-70 chr16 62578721 62579066 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -542455 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 134-72 chr3 186474423 186474685 + 0.666667 NA intron (NR_033844, intron 3 of 7) MER45R|DNA|hAT-Tip100 19107 NR_033844 253573 Hs.97386 NR_033844 ENSG00000224406 LINC02052 - long intergenic non-protein coding RNA 2052 ncRNA 140-113 chr8 56855320 56855738 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 138338 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 147.667-381 chr8 137302168 137302525 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 111242 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 131.667-173 chr6 65567535 65567848 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 2 of 43) LTR37B|LTR|ERV1 12113 NM_198283 346007 Hs.25067 NM_198283 ENSG00000188107 EYS C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1 eyes shut homolog protein-coding 178.667-101 chr3 69696500 69696874 + 0.666667 NA Intergenic MER66B|LTR|ERV1 -42777 NM_001354605 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 122.667-174 chr7 32213693 32213919 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) 85522 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 158.667-145 chr19 39148882 39149323 + 0.666667 NA intron (NM_001014834, intron 1 of 7) L1MB1|LINE|L1 23316 NM_001014834 10298 Hs.20447 NM_005884 ENSG00000130669 PAK4 - p21 (RAC1) activated kinase 4 protein-coding 121.667-50 chr12 98425206 98425504 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31790 NR_033801 121456 Hs.620643 NR_033801 ENSG00000227825 SLC9A7P1 - solute carrier family 9 member 7 pseudogene 1 pseudo 116-125 chr5 78466595 78466810 + 0.666667 NA intron (NR_110885, intron 7 of 7) L2b|LINE|L2 106085 NR_110885 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 138.333-131 chr4 37974139 37974388 + 0.666667 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) AluJb|SINE|Alu 13865 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 281.667-32 chr22 30956406 30956973 + 0.666667 NA intron (NM_001303257, intron 3 of 25) intron (NM_001303257, intron 3 of 25) 11598 NM_001303257 22880 Hs.555918 NM_014941 ENSG00000133422 MORC2 CMT2Z|ZCW3|ZCWCC1 MORC family CW-type zinc finger 2 protein-coding 158.667-364 chrX 133694160 133694472 + 0.666667 NA intron (NM_001164619, intron 3 of 6) intron (NM_001164619, intron 3 of 6) -203127 NR_148713 110806308 Hs.658628 NR_148713 ENSG00000286096 GPC3-AS1 - GPC3 antisense RNA 1 ncRNA 139-27 chr12 50210105 50210377 + 0.666667 NA intron (NM_016357, intron 4 of 10) AluSz|SINE|Alu -8708 NM_001243775 51474 Hs.525419 NM_016357 ENSG00000050405 LIMA1 EPLIN|LDLCQ8|SREBP3 LIM domain and actin binding 1 protein-coding 123-19 chr10 82764656 82764925 + 0.666667 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -531870 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 122.333-79 chr18 12532088 12532357 + 0.666667 NA intron (NM_020148, intron 4 of 15) intron (NM_020148, intron 4 of 15) 99448 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 115-6 chr1 104129651 104129832 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 56718 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 149.667-139 chr15 58579507 58579797 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -80917 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 152-145 chr7 46687015 46687444 + 0.666667 NA TTS (NR_134575) TTS (NR_134575) 9893 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 145.333-133 chr2 70664176 70664522 + 0.666667 NA intron (NM_001617, intron 15 of 15) intron (NM_001617, intron 15 of 15) 103366 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 135-31 chr14 46434916 46435204 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 -36299 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 140.667-176 chr5 14002802 14003197 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58519 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 155.667-187 chr2 203885681 203886066 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18102 NM_001037631 1493 Hs.247824 NM_005214 ENSG00000163599 CTLA4 ALPS5|CD|CD152|CELIAC3|CTLA-4|GRD4|GSE|IDDM12 cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4 protein-coding 141.333-115 chr2 119410948 119411313 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -20724 NM_183240 140738 Hs.26216 NM_183240 ENSG00000171227 TMEM37 PR|PR1 transmembrane protein 37 protein-coding 130-37 chr14 71105726 71105953 + 0.666667 NA intron (NM_014982, intron 33 of 35) AluYj4|SINE|Alu 198380 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 195.667-70 chr2 37988667 37989099 + 0.666667 NA intron (NM_001170793, intron 4 of 9) intron (NM_001170793, intron 4 of 9) 38419 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 140-121 chr8 115344107 115344450 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 323735 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 139.333-139 chr22 19669327 19669677 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -45001 NM_002688 5413 Hs.728762 NM_002688 ENSG00000184702 SEPTIN5 CDCREL|CDCREL-1|CDCREL1|H5|HCDCREL-1|PNUTL1|SEPT5 septin 5 protein-coding 155.333-313 chr5 156569274 156569665 + 0.666667 NA intron (NM_001128209, intron 3 of 7) AluSx|SINE|Alu 242305 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 167.333-125 chr2 61617578 61617853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79359 NM_003400 7514 Hs.370770 NM_003400 ENSG00000082898 XPO1 CRM-1|CRM1|emb|exp1 exportin 1 protein-coding 123.667-181 chr8 81766836 81767125 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 34532 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 158.667-224 chr3 185117200 185117655 + 0.666667 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 35633 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 150.667-267 chr4 70632823 70633235 + 0.666667 NA intron (NM_031889, intron 5 of 8) Tigger18a|DNA|TcMar-Tigger 4285 NM_031889 10117 Hs.667018 NM_031889 ENSG00000132464 ENAM ADAI|AI1C|AIH2 enamelin protein-coding 170.333-127 chr20 39124850 39125204 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 99721 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 158.667-259 chr5 15173406 15173730 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 92992 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 195.667-105 chr5 18428012 18428418 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 620941 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 135.667-29 chr11 70045423 70045702 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18362 NR_120530 101928443 Hs.313468 NR_120529 ENSG00000248844 LINC02753 - long intergenic non-protein coding RNA 2753 ncRNA 167-47 chr17 47004360 47004805 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -25329 NM_203400 388394 Hs.367999 NM_203400 ENSG00000179673 RPRML - reprimo like protein-coding 132.667-15 chr10 7777642 7777963 + 0.666667 NA intron (NM_012311, intron 5 of 12) AluSx3|SINE|Alu 10191 NR_045609 22944 Hs.397918 NM_012311 ENSG00000151657 KIN BTCD|KIN17|Rts2 Kin17 DNA and RNA binding protein protein-coding 161-43 chr2 96504364 96504687 + 0.666667 NA intron (NR_104346, intron 1 of 3) intron (NR_104346, intron 1 of 3) 832 NM_001285486 93082 Hs.149219 NM_001080535 ENSG00000163121 NEURL3 LINCR|RNF132 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 129.333-63 chr14 53929322 53929558 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 19044 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 158.667-82 chr12 132529272 132529599 + 0.666667 NA intron (NM_001142641, intron 4 of 16) intron (NM_001142641, intron 4 of 16) 39284 NM_001367871 57666 Hs.411138 NM_001142641 ENSG00000112787 FBRSL1 - fibrosin like 1 protein-coding 167-43 chr15 59670291 59670597 + 0.666667 NA intron (NM_001368059, intron 6 of 8) AluJb|SINE|Alu -12929 NM_004492 2958 Hs.512934 NM_004492 ENSG00000140307 GTF2A2 HsT18745|T18745|TF2A2|TFIIA|TFIIA-12|TFIIA-gamma|TFIIAS general transcription factor IIA subunit 2 protein-coding 116.333-4 chr1 40470304 40470607 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6835 NM_001320178 339559 Hs.434385 NM_198494 ENSG00000187815 ZFP69 ZFP69A|ZKSCAN23A|ZNF642|ZSCAN54A ZFP69 zinc finger protein protein-coding 183-82 chr5 28439322 28439755 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -151873 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 233-20 chr13 58445408 58446050 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -212612 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 147.333-277 chr6 112624081 112624361 + 0.666667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 276891 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 135-35 chr16 57166955 57167216 + 0.666667 NA intron (NM_001354088, intron 6 of 7) intron (NM_001354088, intron 6 of 7) 15465 NM_001354098 80011 Hs.396740 NM_024946 ENSG00000172775 FAM192A C16orf94|CDA018|CDA10|NIP30|PIP30 family with sequence similarity 192 member A protein-coding 182-102 chr7 80291224 80291585 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83035 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 210-128 chr5 166694345 166694783 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 231806 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 240.667-56 chr3 121492502 121492971 + 0.666667 NA intron (NM_199420, intron 15 of 29) AluJo|SINE|Alu 53252 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 222.333-39 chr19 6989384 6989998 + 0.666667 NA intron (NR_024075, intron 1 of 15) MER58B|DNA|hAT-Charlie 1155 NR_024075 326342 Hs.688043 NM_001080498 ENSG00000268758 ADGRE4P EMR4|EMR4P|FIRE|GPR127|PGR16 adhesion G protein-coupled receptor E4, pseudogene pseudo 117.333-127 chr22 35289861 35290136 + 0.666667 NA intron (NM_001003681, intron 9 of 10) intron (NM_001003681, intron 9 of 10) -9277 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 135.333-104 chr21 35181374 35181624 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132201 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 141-32 chr16 35760373 35760671 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 13970 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 141-57 chr4 22502090 22502410 + 0.666667 NA intron (NM_145290, intron 1 of 18) intron (NM_145290, intron 1 of 18) -13062 NR_162129 113219450 NR_162129 MIR12115 - microRNA 12115 ncRNA 167.333-275 chr9 93261438 93261762 + 0.666667 NA intron (NM_006648, intron 11 of 28) intron (NM_006648, intron 11 of 28) 76670 NM_006648 65268 Hs.654856 NM_006648 ENSG00000165238 WNK2 NY-CO-43|P/OKcl.13|PRKWNK2|SDCCAG43 WNK lysine deficient protein kinase 2 protein-coding 177-50 chr3 51257669 51258076 + 0.666667 NA intron (NM_004947, intron 22 of 52) intron (NM_004947, intron 22 of 52) -127419 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 131.667-54 chr14 51121678 51121939 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26104 NM_015163 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 201.333-159 chr2 203330608 203331050 + 0.666667 NA intron (NM_001282932, intron 1 of 9) intron (NM_001282932, intron 1 of 9) 2435 NM_001282925 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 152.333-149 chr17 61566655 61567008 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 24388 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 155.333-272 chr4 113327899 113328217 + 0.666667 NA intron (NM_001354272, intron 29 of 45) intron (NM_001354272, intron 29 of 45) 35219 NM_001354281 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 192-53 chr14 65003410 65003805 + 0.666667 NA intron (NM_002028, intron 1 of 11) MER34C_|LTR|ERV1 16712 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 115.667-166 chr4 85822925 85823117 + 0.666667 NA intron (NM_001346093, intron 1 of 6) intron (NM_001346093, intron 1 of 6) -4916 NM_001287805 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 147-90 chr3 59142010 59142286 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -92116 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 210-116 chr5 34847346 34847798 + 0.666667 NA intron (NM_001317949, intron 3 of 10) intron (NM_001317949, intron 3 of 10) 8191 NM_001317949 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 195.667-12 chr10 82340990 82341358 + 0.666667 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -108254 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 162.333-133 chr20 11592403 11592734 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 278147 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 114-177 chr9 116018736 116018919 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -93620 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 170.667-121 chr4 58477758 58478215 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 58342 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 122-102 chr5 154060002 154060253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21160 NM_001135037 4238 Hs.432818 NM_005927 ENSG00000037749 MFAP3 - microfibril associated protein 3 protein-coding 166.333-20 chr1 247734114 247734401 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001355292, exon 3 of 5) 5' UTR (NM_001355292, exon 3 of 5) -4358 NM_001004732 343170 NM_001004732 ENSG00000153230 OR14K1 OR1-39|OR1.5.9|OR5AY1 olfactory receptor family 14 subfamily K member 1 protein-coding 160-98 chr5 66026474 66026830 + 0.666667 NA intron (NM_001253697, intron 13 of 25) MER6B|DNA|TcMar-Tigger -81079 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 185.333-79 chr2 22493418 22493883 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42829 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 143.333-297 chr8 135630531 135630822 + 0.666667 NA intron (NM_006558, intron 7 of 8) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 173220 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 128.667-22 chr10 44573082 44573360 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -188124 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 174-33 chr14 71251368 71251784 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -68900 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 163.333-166 chr20 40951232 40951638 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -29278 NR_145524 100128988 Hs.636443 NR_145524 LOC100128988 - uncharacterized LOC100128988 ncRNA 147-54 chr17 30438719 30439014 + 0.666667 NA intron (NM_001304, intron 8 of 20) L1ME4b|LINE|L1 -38542 NM_001007025 9527 Hs.462680 NM_004871 ENSG00000108587 GOSR1 GOLIM2|GOS-28|GOS28|GOS28/P28|GS28|P28 golgi SNAP receptor complex member 1 protein-coding 196.667-3 chr1 153128033 153128553 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 13200 NR_003062 6702 Hs.2421 NR_003062 SPRR2C - small proline rich protein 2C (pseudogene) pseudo 172-51 chr19 34828045 34828497 + 0.666667 NA intron (NR_033982, intron 4 of 5) L1MC2|LINE|L1 4598 NR_033982 400685 Hs.730118 NR_033982 ENSG00000267767 LINC01801 - long intergenic non-protein coding RNA 1801 ncRNA 136-101 chr8 66325571 66325868 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 103258 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 148-43 chr14 78796697 78797087 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) intron (NR_073547, intron 8 of 20) 393173 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 139.667-18 chr10 34416139 34416507 + 0.666667 NA intron (NM_001184791, intron 4 of 20) intron (NM_001184791, intron 4 of 20) 398973 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 121-39 chr14 22745729 22745945 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -20851 NM_005015 5018 Hs.151134 NM_005015 ENSG00000155463 OXA1L OXA1 OXA1L mitochondrial inner membrane protein protein-coding 130.333-138 chr3 121767922 121768119 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -18253 NM_001256488 2804 Hs.213389 NM_004487 ENSG00000173230 GOLGB1 GCP|GCP372|GOLIM1 golgin B1 protein-coding 112.667-239 chr6 156344927 156345177 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33698 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 200.667-171 chr9 129881628 129882077 + 0.666667 NA TTS (NM_001110303) TTS (NM_001110303) 12247 NR_106914 102466750 NR_106914 ENSG00000276124 MIR6855 hsa-mir-6855 microRNA 6855 ncRNA 125.333-60 chr14 75726347 75726719 + 0.666667 NA intron (NM_015072, intron 12 of 31) L2c|LINE|L2 65287 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 214-66 chr2 56042060 56042550 + 0.666667 NA intron (NR_126406, intron 1 of 2) intron (NR_126406, intron 1 of 2) 5021 NR_126406 104355290 Hs.580331 NR_126406 MIR217HG MIR216AHG|MIR216BHG MIR217 host gene ncRNA 191.333-23 chr10 44488278 44488657 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103370 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 159.333-249 chr5 4113243 4113706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 517642 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 144.333-139 chr2 165502814 165503219 + 0.666667 NA intron (NM_001172173, intron 2 of 6) intron (NM_001172173, intron 2 of 6) 33318 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 193.333-73 chr17 65706941 65707416 + 0.666667 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) intron (NR_126542, intron 2 of 5) 119273 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 117-53 chr16 51377723 51377921 + 0.666667 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) intron (NR_039672, intron 6 of 6) -226550 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 138.667-78 chr16 48362693 48363013 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001348078, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001348078, exon 17 of 17) 3034 NM_001006610 6477 Hs.706828 NM_003031 ENSG00000196470 SIAH1 SIAH1A siah E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 151.333-374 chr6 152779392 152779703 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 28750 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 200.333-69 chr2 65169501 65169941 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -39420 NM_015543 5861 Hs.310645 NM_004161 ENSG00000138069 RAB1A RAB1|YPT1 RAB1A, member RAS oncogene family protein-coding 120.667-163 chr7 86884518 86884701 + 0.666667 NA intron (NM_001291991, intron 20 of 20) intron (NM_001291991, intron 20 of 20) 81290 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 116.667-115 chr22 20470245 20470429 + 0.666667 NA intron (NR_033825, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 25458 NM_032775 84861 Hs.517419 NM_032775 ENSG00000099910 KLHL22 KELCHL kelch like family member 22 protein-coding 160.333-180 chr3 27397104 27397577 + 0.666667 NA intron (NM_001258380, intron 17 of 23) intron (NM_001258380, intron 17 of 23) -27880 NM_152534 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 141.333-131 chr20 5980308 5980579 + 0.666667 NA intron (NM_182802, intron 13 of 18) intron (NM_182802, intron 13 of 18) 25378 NR_110101 101929225 Hs.635771 NR_110101 ENSG00000278719 MCM8-AS1 - MCM8 antisense RNA 1 ncRNA 116.333-223 chrX 83020452 83020754 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -487687 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 127-97 chr8 110580834 110581051 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 446491 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 181.667-67 chr2 66873445 66873940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30744 NR_110169 101060019 Hs.116425 NR_110169 ENSG00000230525 LINC01799 - long intergenic non-protein coding RNA 1799 ncRNA 118.333-13 chr1 113383866 113384100 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6532 NM_152900 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 204.333-178 chr6 122109753 122110237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -289556 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 115-78 chr17 71869214 71869532 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 156606 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 145-61 chr20 55523964 55524274 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -96922 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 119.667-170 chr6 148448798 148449079 + 0.666667 NA intron (NM_001346506, intron 5 of 20) intron (NM_001346506, intron 5 of 20) -59561 NM_001346507 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 148.667-15 chr1 110237289 110237635 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004978, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_004978, exon 4 of 4) 27148 NM_004978 3749 Hs.153521 NM_004978 ENSG00000116396 KCNC4 C1orf30|HKSHIIIC|KSHIIIC|KV3.4 potassium voltage-gated channel subfamily C member 4 protein-coding 112-184 chr6 61710283 61710582 + 0.666667 NA intron (NR_146872, intron 7 of 9) intron (NR_146872, intron 7 of 9) 136302 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 136.667-14 chr1 224047082 224047315 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 54468 NR_136591 100287497 Hs.568390 NR_136590 LOC100287497 - septin 7 pseudogene pseudo 148.667-121 chr14 63450752 63451101 + 0.666667 NA TTS (NM_001354926) TTS (NM_001354926) 57312 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 241.667-49 chr22 25532755 25533303 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -31646 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 135-109 chr8 89503411 89503793 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 254109 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 152.333-317 chr5 141632208 141632603 + 0.666667 NA intron (NR_149166, intron 2 of 12) intron (NR_149166, intron 2 of 12) 4444 NR_149167 8841 Hs.519632 NM_003883 ENSG00000171720 HDAC3 HD3|KDAC3|RPD3|RPD3-2 histone deacetylase 3 protein-coding 115.667-200 chr7 53449301 53449521 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 362520 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 264.333-58 chr4 155697550 155698119 + 0.666667 NA intron (NM_001130685, intron 3 of 9) intron (NM_001130685, intron 3 of 9) 30172 NM_001130684 2982 Hs.24258 NM_000856 ENSG00000164116 GUCY1A1 GC-SA3|GUC1A3|GUCA3|GUCSA3|GUCY1A3|MYMY6 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 1 protein-coding 129-75 chr20 19999896 20000125 + 0.666667 NA intron (NM_001242581, intron 11 of 11) intron (NM_001242581, intron 11 of 11) -17280 NM_181528 51126 Hs.368783 NM_016100 ENSG00000173418 NAA20 NAT3|NAT3P|NAT5|NAT5P|dJ1002M8.1 N(alpha)-acetyltransferase 20, NatB catalytic subunit protein-coding 143.333-167 chr22 26290514 26290833 + 0.666667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) AluJo|SINE|Alu 121199 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 111.667-197 chr5 32425097 32425392 + 0.666667 NA intron (NM_016107, intron 2 of 19) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 19496 NR_144318 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 121.667-110 chr20 9205744 9206056 + 0.666667 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) L1MD2|LINE|L1 -11490 NM_182797 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 158-108 chr5 68484131 68484517 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 191747 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 245-67 chr7 29912139 29912671 + 0.666667 NA intron (NM_001080529, intron 8 of 8) L1MB3|LINE|L1 77396 NM_001145515 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 179-26 chr13 105089458 105089950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -376163 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 147.667-35 chr10 52081148 52081512 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 7 of 17) MIRb|SINE|MIR 232798 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 175.333-162 chr6 121158730 121159141 + 0.666667 NA intron (NR_104452, intron 27 of 35) intron (NR_104452, intron 27 of 35) 175545 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 268.667-15 chr14 52481410 52481933 + 0.666667 NA intron (NM_001160047, intron 14 of 20) intron (NM_001160047, intron 14 of 20) 70834 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 214.333-43 chr14 48760723 48761225 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 825406 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 114.667-22 chr1 237856475 237856807 + 0.666667 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -5534 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 146.333-184 chr21 37246685 37246971 + 0.666667 NA intron (NM_001331022, intron 1 of 6) AluJo|SINE|Alu 20506 NM_006052 10311 Hs.369488 NM_006052 ENSG00000157538 VPS26C DCRA|DSCR3|DSCRA VPS26 endosomal protein sorting factor C protein-coding 192.667-120 chr4 42019072 42019587 + 0.666667 NA intron (NM_006345, intron 3 of 17) intron (NM_006345, intron 3 of 17) 28799 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 174.667-57 chr15 34358988 34359339 + 0.666667 NA exon (NM_153613, exon 14 of 14) exon (NM_153613, exon 14 of 14) 8033 NM_153613 254531 Hs.352614 NM_153613 ENSG00000176454 LPCAT4 AGPAT7|AYTL3|LPAAT-eta|LPEAT2 lysophosphatidylcholine acyltransferase 4 protein-coding 243.333-45 chr19 29713647 29714161 + 0.666667 NA intron (NM_001256047, intron 1 of 2) intron (NM_001256047, intron 1 of 2) 1152 NM_001282929 83636 Hs.529094 NM_031448 ENSG00000131943 C19orf12 MPAN|NBIA3|NBIA4|SPG43 chromosome 19 open reading frame 12 protein-coding 154-21 chr11 14280881 14281225 + 0.666667 NA intron (NM_001177314, intron 5 of 5) intron (NM_001177314, intron 5 of 5) 77432 NM_001177315 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 123.667-70 chr17 48804313 48804614 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001366314, exon 3 of 14) 5' UTR (NM_001366314, exon 3 of 14) -10139 NM_173623 284076 Hs.91930 NM_173623 ENSG00000170703 TTLL6 TTL.6 tubulin tyrosine ligase like 6 protein-coding 197-47 chr18 13819987 13820407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3952 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 143-30 chr12 23996758 23997023 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) L1MB5|LINE|L1 -45858 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 224-11 chr10 65296392 65296827 + 0.666667 NA Intergenic LTR24|LTR|ERV1 -274816 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 146.667-267 chr5 124813416 124813692 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -68442 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 169.333-148 chr21 31052730 31053078 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -14428 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 127.333-53 chr14 100193028 100193252 + 0.666667 NA Intergenic CpG -33495 NM_206918 123099 Hs.159643 NM_206918 ENSG00000168350 DEGS2 C14orf66|DES2|FADS8 delta 4-desaturase, sphingolipid 2 protein-coding 160-11 chr1 221100693 221101061 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -220737 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 143-122 chr8 47739690 47739984 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1673 NM_005195 1052 Hs.440829 NM_005195 ENSG00000221869 CEBPD C/EBP-delta|CELF|CRP3|NF-IL6-beta CCAAT enhancer binding protein delta protein-coding 133.333-57 chr15 57117062 57117333 + 0.666667 NA intron (NM_207038, intron 5 of 19) AluJo|SINE|Alu -102233 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 138.333-65 chr14 66675936 66676179 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) L1PA17|LINE|L1 168650 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 160-13 chr10 7966399 7966768 + 0.666667 NA intron (NM_031923, intron 3 of 6) intron (NM_031923, intron 3 of 6) 85908 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 122.667-77 chr18 30389547 30389909 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90818 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 145.333-108 chr16 88782437 88782713 + 0.666667 NA intron (NM_001142864, intron 1 of 50) intron (NM_001142864, intron 1 of 50) 2645 NM_001142864 9780 Hs.377001 NM_001142864 ENSG00000103335 PIEZO1 DHS|FAM38A|LMPH3|LMPHM6|Mib piezo type mechanosensitive ion channel component 1 protein-coding 151-39 chr14 101751230 101751578 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -9169 NM_001352914 5527 Hs.368264 NM_002719 ENSG00000078304 PPP2R5C B56G|B56gamma|PR61G protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma protein-coding 200.667-68 chr2 12998711 12999232 + 0.666667 NA intron (NR_038434, intron 4 of 5) MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR 8042 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 188.667-40 chr13 75203910 75204199 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 36327 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 126.333-18 chr10 30439026 30439362 + 0.666667 NA exon (NM_001320961, exon 2 of 8) exon (NM_001320961, exon 2 of 8) 4548 NM_001320961 1326 Hs.432453 NM_005204 ENSG00000107968 MAP3K8 AURA2|COT|EST|ESTF|MEKK8|TPL2|Tpl-2|c-COT mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 protein-coding 114.667-118 chr19 56498207 56498523 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9490 NM_001321768 57573 Hs.230188 NM_020813 ENSG00000196263 ZNF471 ERP1|Z1971 zinc finger protein 471 protein-coding 175.667-141 chr8 40788201 40788631 + 0.666667 NA intron (NM_024645, intron 2 of 6) AluY|SINE|Alu 109410 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 176.667-103 chr3 81925384 81925795 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60553 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 189.667-71 chr2 77629428 77629848 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -107205 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 148.333-67 chr11 38627201 38627491 + 0.666667 NA intron (NR_120554, intron 3 of 4) MLT2A2|LTR|ERVL 19010 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 160.667-232 chr4 137884580 137884989 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -204230 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 119.667-134 chr4 84446296 84446600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51786 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 123.333-177 chr5 131703255 131703528 + 0.666667 NA intron (NM_133372, intron 10 of 17) L2a|LINE|L2 -68162 NM_001164390 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 255.333-53 chr2 68885961 68886449 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14808 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 159-2 chr1 22492331 22492655 + 0.666667 NA intron (NM_001330398, intron 3 of 15) intron (NM_001330398, intron 3 of 15) 40642 NM_014870 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 200-115 chr4 72827564 72828015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 241927 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 213-20 chr14 59278917 59279353 + 0.666667 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) L1ME1|LINE|L1 15694 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 231.667-41 chr21 22765476 22766007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -313543 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 113.667-90 chr2 11047001 11047269 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 85041 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 147-145 chr9 27931141 27931410 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -357409 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 143-115 chr7 43743239 43743523 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -13840 NM_001350924 55744 Hs.268887 NM_018224 ENSG00000106603 COA1 C7orf44|MITRAC15 cytochrome c oxidase assembly factor 1 homolog protein-coding 155.667-209 chr22 43434500 43434836 + 0.666667 NA intron (NM_001362786, intron 2 of 6) intron (NM_001362786, intron 2 of 6) 18116 NM_001362786 758 Hs.159538 NM_001044370 ENSG00000186732 MPPED1 239AB|C22orf1|FAM1A metallophosphoesterase domain containing 1 protein-coding 195.667-72 chr2 58183836 58184306 + 0.666667 NA intron (NR_156742, intron 3 of 9) intron (NR_156742, intron 3 of 9) 57309 NM_018062 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 203-66 chr3 66322994 66323492 + 0.666667 NA intron (NR_028475, intron 5 of 9) intron (NR_028475, intron 5 of 9) 102240 NM_001350992 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 132.667-21 chr10 51940642 51940951 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) intron (NM_001098512, intron 5 of 17) -241201 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 158.333-132 chr19 34661884 34662207 + 0.666667 NA intron (NR_027620, intron 1 of 3) AluSc|SINE|Alu 14986 NR_027620 643719 Hs.686754 NR_027620 SCGB1B2P SCGB4A1P secretoglobin family 1B member 2, pseudogene pseudo 122.667-108 chr21 45177195 45177455 + 0.666667 NA intron (NR_027674, intron 4 of 11) intron (NR_027674, intron 4 of 11) 24795 NM_001346687 104 Hs.474018 NM_001112 ENSG00000197381 ADARB1 ADAR2|DRABA2|DRADA2|RED1 adenosine deaminase RNA specific B1 protein-coding 177.667-83 chr20 37103710 37104069 + 0.666667 NA intron (NM_152503, intron 23 of 24) AluJb|SINE|Alu -7892 NM_002895 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 123.333-120 chr2 196517977 196518235 + 0.666667 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) intron (NM_001348768, intron 1 of 28) 74877 NM_020760 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 178-30 chr11 94468562 94469061 + 0.666667 NA intron (NM_001330347, intron 9 of 19) MER3|DNA|hAT-Charlie -2231 NR_031630 100302275 NR_031630 ENSG00000221230 MIR548L MIRN548L|hsa-mir-548l microRNA 548l ncRNA 147.333-290 chr7 25813388 25813746 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23448 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 148.667-326 chr5 167807193 167807553 + 0.666667 NA intron (NM_001080428, intron 1 of 24) intron (NM_001080428, intron 1 of 24) 52444 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 134.333-16 chr10 45525156 45525426 + 0.666667 NA intron (NM_001282866, intron 2 of 7) intron (NM_001282866, intron 2 of 7) 10080 NM_001282866 220972 Hs.499489 NM_145021 ENSG00000165406 MARCH8 CMIR|MARCH-VIII|MIR|RNF178|c-MIR membrane associated ring-CH-type finger 8 protein-coding 227.667-53 chr3 145935916 145936389 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 133033 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 155.333-263 chr4 62385404 62385749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -223811 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 143-111 chr7 9471342 9471732 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -162733 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 117-21 chr10 66251934 66252233 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) intron (NM_001127384, intron 13 of 17) -673953 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 213.333-45 chr12 67114867 67115252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18775 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 145.667-284 chr8 81443923 81444211 + 0.666667 NA intron (NM_002677, intron 3 of 3) intron (NM_002677, intron 3 of 3) 3372 NM_002677 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 139.333-170 chr4 103474734 103475041 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 49845 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 130-57 chr2 122103232 122103459 + 0.666667 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 347694 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 209.667-79 chr22 49844252 49844636 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -9400 NM_014838 9889 Hs.475208 NM_014838 ENSG00000100426 ZBED4 - zinc finger BED-type containing 4 protein-coding 177.667-65 chr18 11121731 11122130 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 1 of 51) intron (NM_022068, intron 1 of 51) 26832 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 178.333-143 chr5 107085994 107086438 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -75202 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 142-34 chr13 23593303 23593565 + 0.666667 NA exon (NM_001204458, exon 3 of 10) exon (NM_001204458, exon 3 of 10) 14074 NM_001354985 55504 Hs.149168 NM_018647 ENSG00000127863 TNFRSF19 TAJ|TAJ-alpha|TRADE|TROY TNF receptor superfamily member 19 protein-coding 189-61 chr3 42432310 42432697 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -21893 NM_001304386 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 117-150 chr8 130378038 130378250 + 0.666667 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) MIR|SINE|MIR 65516 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 114.333-78 chr16 7958952 7959180 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 626221 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 152.333-141 chr16 83628597 83628855 + 0.666667 NA intron (NM_001220489, intron 7 of 12) intron (NM_001220489, intron 7 of 12) 120380 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 112.333-225 chr6 40997420 40997743 + 0.666667 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) intron (NR_110873, intron 1 of 5) 25699 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 112-166 chr5 42711878 42712066 + 0.666667 NA intron (NM_001242403, intron 7 of 9) L3b|LINE|CR1 -44846 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 241.667-36 chr2 100972089 100972710 + 0.666667 NA TTS (NR_110213) TTS (NR_110213) 4762 NR_110213 101927142 Hs.656556 NR_110213 LOC101927142 - uncharacterized LOC101927142 ncRNA 169.667-131 chr3 82681924 82682331 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 695985 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 135.667-168 chr7 27605552 27605845 + 0.666667 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) intron (NM_152740, intron 4 of 7) -10276 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 169-95 chr7 16286603 16286994 + 0.666667 NA intron (NR_160656, intron 3 of 7) intron (NR_160656, intron 3 of 7) 76312 NR_038947 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 162-129 chr9 25079197 25079529 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -533466 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 161-5 chr10 56940972 56941365 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 363391 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 116.333-24 chr1 244130231 244130535 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 77178 NM_006352 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 155.333-208 chr21 29039604 29040034 + 0.666667 NA intron (NM_001032410, intron 10 of 18) intron (NM_001032410, intron 10 of 18) 15151 NM_006447 10600 Hs.99819 NM_006447 ENSG00000156256 USP16 UBP-M|UBPM ubiquitin specific peptidase 16 protein-coding 111.667-200 chr5 37315991 37316175 + 0.666667 NA intron (NM_001278312, intron 21 of 33) L1MB3|LINE|L1 55023 NM_001278312 9631 Hs.547696 NM_004298 ENSG00000113569 NUP155 ATFB15|N155 nucleoporin 155 protein-coding 124.667-130 chr22 39966502 39966733 + 0.666667 NA intron (NM_001291825, intron 4 of 6) intron (NM_001291825, intron 4 of 6) 19800 NM_001291825 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 124.333-36 chr12 28452104 28452462 + 0.666667 NA intron (NM_001352082, intron 11 of 13) intron (NM_001352082, intron 11 of 13) -261545 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 150-2 chr1 23995826 23996200 + 0.666667 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -15550 NR_034035 10772 Hs.3530 NM_006625 ENSG00000188529 SRSF10 FUSIP1|FUSIP2|NSSR|PPP1R149|SFRS13|SFRS13A|SRp38|SRrp40|TASR|TASR1|TASR2 serine and arginine rich splicing factor 10 protein-coding 130.667-162 chr5 29727584 29727957 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -152790 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 112-175 chr5 96439148 96439427 + 0.666667 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) HAL1|LINE|L1 -6039 NM_000439 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 141.333-170 chr4 38738535 38738895 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44275 NM_030956 81793 Hs.120551 NM_030956 ENSG00000174123 TLR10 CD290 toll like receptor 10 protein-coding 123-66 chr2 177688070 177688405 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 16 of 20) intron (NM_001077197, intron 16 of 20) 14915 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 151.667-307 chr6 42412909 42413247 + 0.666667 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 38973 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 117-19 chr10 52938970 52939261 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -167415 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 134.333-67 chr16 49535891 49536175 + 0.666667 NA intron (NM_001271620, intron 5 of 7) intron (NM_001271620, intron 5 of 7) -17448 NR_144553 1596 Hs.684517 NR_144553 ENSG00000260089 ADAM3B CYRN2 ADAM metallopeptidase domain 3B (pseudogene) pseudo 130.667-197 chr8 88997824 88998194 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -670526 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 181-12 chr12 4724188 4724577 + 0.666667 NA intron (NM_017417, intron 1 of 10) intron (NM_017417, intron 1 of 10) 3982 NM_017417 26290 Hs.511985 NM_017417 ENSG00000130035 GALNT8 GALNAC-T8 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 8 protein-coding 188-65 chr20 37226167 37226570 + 0.666667 NA intron (NM_001135771, intron 10 of 16) intron (NM_001135771, intron 10 of 16) 30540 NM_001184731 2691 Hs.37023 NM_021081 ENSG00000118702 GHRH GHRF|GRF|INN growth hormone releasing hormone protein-coding 202.333-8 chr1 55287073 55287518 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 61654 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 140.333-92 chr19 45864305 45864647 + 0.666667 NA exon (NM_004497, exon 1 of 2) exon (NM_004497, exon 1 of 2) 150 NM_004497 3171 Hs.36137 NM_004497 ENSG00000170608 FOXA3 FKHH3|HNF3G|TCF3G forkhead box A3 protein-coding 189.333-189 chr7 35816505 35817041 + 0.666667 NA intron (NM_001788, intron 1 of 12) L1MB7|LINE|L1 15554 NM_001363715 989 Hs.191346 NM_001788 ENSG00000122545 SEPTIN7 CDC10|CDC3|NBLA02942|SEPT7|SEPT7A septin 7 protein-coding 187.667-76 chr2 161247565 161247963 + 0.666667 NA non-coding (NR_110163, exon 3 of 3) non-coding (NR_110163, exon 3 of 3) 3025 NR_110163 100996579 Hs.660929 NR_110163 ENSG00000227403 LINC01806 - long intergenic non-protein coding RNA 1806 ncRNA 149.667-158 chr17 60786465 60786772 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 6 of 25) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 108767 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 165.667-112 chr21 16644784 16645130 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 54720 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 111.667-4 chr1 29215368 29215615 + 0.666667 NA intron (NM_001349715, intron 4 of 10) AluSx|SINE|Alu 15443 NM_001349717 51102 Hs.183646 NM_016011 ENSG00000116353 MECR CGI-63|DYTOABG|ETR1|FASN2B|NRBF1 mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase protein-coding 178.333-147 chr5 164562689 164563051 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 92591 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 113.667 chr1 15694589 15694795 + 0.666667 NA intron (NM_015164, intron 1 of 19) intron (NM_015164, intron 1 of 19) 10372 NM_015164 23207 Hs.646775 NM_015164 ENSG00000116786 PLEKHM2 SKIP pleckstrin homology and RUN domain containing M2 protein-coding 137.667-163 chr6 61829869 61830135 + 0.666667 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 255872 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 168-44 chr18 25128474 25128831 + 0.666667 NA intron (NM_001308225, intron 4 of 6) L1MC2|LINE|L1 -140673 NR_146903 105372030 NR_146903 LINC01894 - long intergenic non-protein coding RNA 1894 ncRNA 119.333-11 chr1 100267976 100268301 + 0.666667 NA intron (NM_001130841, intron 3 of 11) intron (NM_001130841, intron 3 of 11) -1964 NR_110434 100506007 Hs.192268 NR_110434 RTCA-AS1 - RTCA antisense RNA 1 ncRNA 133.667-135 chr6 131379134 131379494 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 128910 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 154.333-281 chr5 152842901 152843254 + 0.666667 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 129272 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 146.667-74 chr12 53205740 53206131 + 0.666667 NA intron (NM_000889, intron 1 of 15) intron (NM_000889, intron 1 of 15) 1316 NR_104181 3695 Hs.654470 NM_000889 ENSG00000139626 ITGB7 - integrin subunit beta 7 protein-coding 149.667-413 chr8 126991845 126992082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21191 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 144.667-243 chr5 86113048 86113455 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -169193 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 165-52 chr3 44400273 44400624 + 0.666667 NA exon (NM_001282913, exon 9 of 11) exon (NM_001282913, exon 9 of 11) 22489 NM_001351479 102724231 Hs.131918 NM_001351479 C3orf86 LINC00694 chromosome 3 open reading frame 86 protein-coding 127.667-101 chr20 32942853 32943097 + 0.666667 NA intron (NM_001143967, intron 22 of 26) L1ME4a|LINE|L1 61458 NM_080675 140732 Hs.375186 NM_080675 ENSG00000167098 SUN5 SPAG4L|SPGF16|TSARG4|dJ726C3.1 Sad1 and UNC84 domain containing 5 protein-coding 171.667-139 chr5 153976026 153976444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62675 NM_018691 10827 Hs.166551 NM_018691 ENSG00000055147 FAM114A2 133K02|C5orf3 family with sequence similarity 114 member A2 protein-coding 167.667-138 chr3 87948210 87948645 + 0.666667 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) intron (NM_001322210, intron 2 of 2) -34149 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 152.667-229 chr22 25790444 25790895 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 11 of 43) intron (NM_001318245, intron 11 of 43) 48481 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 125.667-143 chr5 17005075 17005301 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68900 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 214.333-6 chr1 109100167 109100767 + 0.666667 NA non-coding (NR_003023, exon 1 of 1) non-coding (NR_003023, exon 1 of 1) 274 NR_003023 677766 Hs.550815 NR_003023 ENSG00000278249 SCARNA2 HBII-382|mgU2-25/61 small Cajal body-specific RNA 2 ncRNA 120.333-16 chr1 190178822 190179065 + 0.666667 NA intron (NM_199051, intron 6 of 7) intron (NM_199051, intron 6 of 7) 297067 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 118.333-66 chr14 73947071 73947302 + 0.666667 NA intron (NM_152445, intron 1 of 8) AluSq|SINE|Alu -2748 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 111.667-212 chr5 155845380 155845624 + 0.666667 NA Intergenic 5S|rRNA|rRNA -481255 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 135.667-10 chr1 211524273 211524651 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31545 NM_001164688 343035 Hs.632495 NM_183059 ENSG00000198570 RD3 C1orf36|LCA12 retinal degeneration 3, GUCY2D regulator protein-coding 112.667-222 chr5 152056158 152056387 + 0.666667 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) intron (NR_109876, intron 1 of 2) 97374 NR_109876 101927115 Hs.549665 NR_109876 ENSG00000254226 LINC01933 CTB-12O2.1 long intergenic non-protein coding RNA 1933 ncRNA 153.333-162 chr17 45007155 45007585 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39067 NM_006688 10882 Hs.134012 NM_006688 ENSG00000131094 C1QL1 C1QRF|C1QTNF14|CRF|CTRP14 complement C1q like 1 protein-coding 120.667-54 chr14 65006885 65007094 + 0.666667 NA intron (NM_197957, intron 3 of 3) intron (NM_197957, intron 3 of 3) 20094 NM_002028 2342 Hs.325531 NM_002028 ENSG00000257365 FNTB FPTB farnesyltransferase, CAAX box, beta protein-coding 153-135 chr7 125769448 125769754 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -505310 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 112.333-197 chr4 182894453 182894702 + 0.666667 NA exon (NM_001351745, exon 5 of 7) exon (NM_001351745, exon 5 of 7) 22676 NM_001351744 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 112.667-228 chr6 50088248 50088480 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -38435 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 118.333-183 chr6 155619977 155620191 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 105240 NR_134597 105378068 Hs.131541 NR_134596 LOC105378068 - uncharacterized LOC105378068 ncRNA 128.333-139 chr4 56807228 56807478 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 14120 NR_073419 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 145.667-214 chr5 67680220 67680493 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33567 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 175-54 chr3 61754631 61755008 + 0.666667 NA intron (NM_002841, intron 2 of 29) intron (NM_002841, intron 2 of 29) 193248 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 169.333-250 chr7 86872875 86873325 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 92799 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 122.667-74 chr17 68867203 68867445 + 0.666667 NA TTS (NM_007168) TTS (NM_007168) 88068 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 157.667-302 chr7 42424745 42425157 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -187742 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 188.667-17 chr1 235380607 235381134 + 0.666667 NA intron (NM_001287802, intron 2 of 15) AluSp|SINE|Alu 13443 NM_001287801 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 146-42 chr17 39378208 39378571 + 0.666667 NA intron (NM_001370209, intron 1 of 13) AluJo|SINE|Alu 23237 NM_001184906 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 157.667-117 chr16 22640776 22641243 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 95311 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 195-8 chr1 167842297 167842659 + 0.666667 NA intron (NM_018417, intron 21 of 32) intron (NM_018417, intron 21 of 32) 71656 NM_001167749 55811 Hs.320892 NM_018417 ENSG00000143199 ADCY10 HCA2|HEL-S-7a|SAC|SACI|Sacy|hsAC adenylate cyclase 10 protein-coding 164-68 chr20 16950024 16950365 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 201841 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 162.333-147 chr22 25714108 25714421 + 0.666667 NA intron (NM_001362778, intron 16 of 19) intron (NM_001362778, intron 16 of 19) -27924 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 142.667-123 chr20 42793820 42794230 + 0.666667 NA intron (NM_133170, intron 2 of 31) intron (NM_133170, intron 2 of 31) 108542 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 134.333-164 chr8 16072463 16072816 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 113633 NM_001363744 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 180.333-136 chr8 80909686 80910191 + 0.666667 NA Intergenic MER48|LTR|ERV1 -35157 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 155.667-184 chr2 191515497 191515957 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -162345 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 152.333-52 chr10 81686463 81686768 + 0.666667 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 -188579 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 114-76 chr2 241777504 241777704 + 0.666667 NA intron (NM_022134, intron 1 of 3) intron (NM_022134, intron 1 of 3) 782 NM_022134 64090 Hs.632556 NM_022134 ENSG00000154252 GAL3ST2 GAL3ST-2|GP3ST galactose-3-O-sulfotransferase 2 protein-coding 195-5 chr1 84646876 84647334 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001166295, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001166295, exon 13 of 13) -12085 NR_027379 439927 Hs.407054 NM_001033660 ENSG00000180869 LINC01555 C1orf180 long intergenic non-protein coding RNA 1555 ncRNA 119.333-242 chrX 67078866 67079179 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -439724 NM_001199687 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 118-93 chr3 98770735 98771007 + 0.666667 NA intron (NM_001323367, intron 2 of 9) intron (NM_001323367, intron 2 of 9) 7564 NM_001323367 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 140.333-140 chr3 89000484 89000878 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106940 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 143.333-128 chr2 20024528 20024830 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -12011 NM_002381 4148 Hs.656199 NM_002381 ENSG00000132031 MATN3 DIPOA|EDM5|HOA|OADIP|OS2 matrilin 3 protein-coding 147.667-88 chr13 59528707 59529000 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -483865 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 166.333-88 chr17 18925192 18925617 + 0.666667 NA intron (NM_001243940, intron 9 of 9) intron (NM_001243940, intron 9 of 9) -25272 NM_001282417 125206 Hs.462418 NM_152351 ENSG00000154025 SLC5A10 SGLT-5|SGLT5 solute carrier family 5 member 10 protein-coding 196-189 chr8 134787957 134788445 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 12406 NR_029666 407030 NR_029666 ENSG00000207582 MIR30B MIRN30B|mir-30b microRNA 30b ncRNA 134.667-168 chr6 40013036 40013337 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -78724 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 183-80 chr4 69783342 69783714 + 0.666667 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -22908 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 125.333-193 chrX 88423301 88423612 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -323769 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 144-131 chr5 84336071 84336335 + 0.666667 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) L2c|LINE|L2 48664 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 231.333-92 chr5 115901549 115902150 + 0.666667 NA intron (NR_157085, intron 5 of 6) intron (NR_157085, intron 5 of 6) -54722 NR_157226 107986443 NR_157226 LINCADL LINC-ADAL lincRNA adipogenesis and lipogenesis associated ncRNA 194.667-105 chr4 45627605 45628030 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 496237 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 135.333-123 chr4 29511172 29511528 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 297058 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 126.333-90 chr2 68524334 68524557 + 0.666667 NA intron (NM_173545, intron 5 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie 56860 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 155.667-400 chrX 81673001 81673347 + 0.666667 NA Intergenic L1P5|LINE|L1 471072 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 135-122 chrX 52272647 52272988 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 63825 NR_107055 102466880 NR_107055 ENSG00000275335 MIR8088 hsa-mir-8088 microRNA 8088 ncRNA 116.667-207 chr8 125715775 125716045 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 235287 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 112-80 chr17 5257189 5257386 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -22427 NM_001271842 388325 Hs.462080 NM_207103 ENSG00000161929 SCIMP C17orf87|UNQ5783 SLP adaptor and CSK interacting membrane protein protein-coding 125-63 chr2 239090914 239091172 + 0.666667 NA intron (NM_006037, intron 17 of 26) intron (NM_006037, intron 17 of 26) -5117 NR_039643 100616493 NR_039643 ENSG00000264810 MIR4441 - microRNA 4441 ncRNA 136-82 chr5 46327141 46327415 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -630898 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 195.667-100 chr4 140452562 140453044 + 0.666667 NA intron (NM_001277353, intron 9 of 10) L1MEf|LINE|L1 -25142 NM_001130675 1047 Hs.86368 NM_004362 ENSG00000153132 CLGN - calmegin protein-coding 202.333-91 chr2 82494071 82494622 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -362457 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 118-39 chr14 66935637 66935838 + 0.666667 NA intron (NM_020806, intron 8 of 22) intron (NM_020806, intron 8 of 22) -253703 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 216.333-84 chr2 184133973 184134452 + 0.666667 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -244763 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 207.667-75 chr3 86977562 86977969 + 0.666667 NA intron (NM_001320494, intron 2 of 3) intron (NM_001320494, intron 2 of 3) 13384 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 153.333-214 chr2 141551575 141551987 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 579920 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 124.333-127 chr4 45302138 45302367 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -575618 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 155-114 chr6 38279522 38279945 + 0.666667 NA intron (NM_052893, intron 9 of 11) intron (NM_052893, intron 9 of 11) -201863 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-154 chr2 63487416 63487891 + 0.666667 NA intron (NR_148704, intron 3 of 18) intron (NR_148704, intron 3 of 18) -49646 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 144.333-167 chr3 54702163 54702449 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 11 of 37) L1PA15|LINE|L1 -62449 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 139.667-63 chr15 87579678 87579950 + 0.666667 NA TTS (NR_026869) TTS (NR_026869) 2885 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 118.333-129 chr3 39710896 39711103 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -97915 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 219.333-35 chr11 93447318 93447685 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 95890 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 160.333-110 chr15 49868170 49868587 + 0.666667 NA intron (NR_073597, intron 24 of 26) L1MEj|LINE|L1 245001 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 162.333-99 chr18 12986449 12986804 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_031216, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_031216, exon 9 of 9) -4736 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 124.667-136 chr3 105515982 105516248 + 0.666667 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 149206 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 147.667-68 chr12 24363556 24363902 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 140458 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 181-16 chr12 66432662 66433050 + 0.666667 NA intron (NM_001366722, intron 13 of 24) MER5A|DNA|hAT-Charlie 130311 NR_135081 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 159.667-222 chr3 182045969 182046240 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 93740 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 131-77 chr5 23416333 23416593 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -91146 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 259.333-65 chr22 28598556 28599147 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 81014 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 149.667-388 chr8 20181459 20181786 + 0.666667 NA intron (NM_003053, intron 1 of 15) intron (NM_003053, intron 1 of 15) 1514 NM_001142324 6570 Hs.158322 NM_003053 ENSG00000036565 SLC18A1 CGAT|VAT1|VMAT1 solute carrier family 18 member A1 protein-coding 132-72 chr20 51488238 51488524 + 0.666667 NA intron (NM_012340, intron 3 of 10) MER20|DNA|hAT-Charlie -35404 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 155.667-86 chr13 83133425 83133830 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 748766 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 119-24 chr10 111246422 111246728 + 0.666667 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 132284 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 145.667-199 chr4 157706468 157706768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 134128 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 118.333-61 chr14 30068336 30068566 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -140604 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 123.333-44 chr11 21797050 21797272 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -395924 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 115.667-176 chr5 31120482 31120764 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73063 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 146.333-164 chr2 189096982 189097394 + 0.666667 NA intron (NM_000393, intron 6 of 53) intron (NM_000393, intron 6 of 53) 35923 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 161-38 chr2 44702341 44702681 + 0.666667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) MIR|SINE|MIR 236377 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 134-27 chr14 59164514 59164891 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23965 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 206.333-69 chr18 261981 262410 + 0.666667 NA intron (NM_005131, intron 4 of 20) L2c|LINE|L2 5852 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 148.333-271 chr4 12179743 12180142 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43509 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 123.667-4 chr1 53301154 53301463 + 0.666667 NA intron (NM_004631, intron 2 of 18) intron (NM_004631, intron 2 of 18) 26762 NM_004631 7804 Hs.280387 NM_004631 ENSG00000157193 LRP8 APOER2|HSZ75190|LRP-8|MCI1 LDL receptor related protein 8 protein-coding 119.667-158 chr5 114016098 114016381 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -345831 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 176.667-29 chr10 59230813 59231127 + 0.666667 NA intron (NM_001143774, intron 1 of 4) MER4B|LTR|ERV1 53503 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 167-96 chr7 84478716 84479067 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53585 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 142.667-89 chr2 7097998 7098387 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20312 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 145.667-254 chr6 88933498 88933858 + 0.666667 NA intron (NM_001286428, intron 1 of 13) L1MB2|LINE|L1 29940 NM_001286428 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 179-55 chr2 191065646 191066036 + 0.666667 NA intron (NM_003151, intron 7 of 23) intron (NM_003151, intron 7 of 23) 44315 NR_136318 105373805 Hs.570280 NR_136318 ENSG00000231858 LOC105373805 - uncharacterized LOC105373805 ncRNA 124-17 chr1 241911842 241912096 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45798 NM_001290693 441925 Hs.731347 NM_001290693 ENSG00000196289 BECN2 BECN1L1|BECN1P1 beclin 2 protein-coding 147-102 chr4 86601578 86601851 + 0.666667 NA intron (NM_080685, intron 1 of 47) intron (NM_080685, intron 1 of 47) 7399 NM_006264 5783 Hs.436142 NM_006264 ENSG00000163629 PTPN13 FAP-1|PNP1|PTP-BAS|PTP-BL|PTP1E|PTPL1|PTPLE|hPTP1E protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13 protein-coding 230.333-89 chr5 4126031 4126675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 530521 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 195.333-231 chrX 105867234 105867652 + 0.666667 NA intron (NM_198465, intron 2 of 28) intron (NM_198465, intron 2 of 28) 44904 NM_198465 203447 Hs.209527 NM_198465 ENSG00000123572 NRK NESK Nik related kinase protein-coding 143-131 chr8 139478583 139478890 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 224387 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 164-113 chr8 66149470 66149924 + 0.666667 NA exon (NM_184086, exon 5 of 9) exon (NM_184086, exon 5 of 9) 22568 NM_033058 84675 Hs.85524 NM_033058 ENSG00000147573 TRIM55 MURF-2|RNF29|muRF2 tripartite motif containing 55 protein-coding 120.333-55 chr14 64394676 64394977 + 0.666667 NA intron (NM_005956, intron 1 of 27) intron (NM_005956, intron 1 of 27) 6473 NM_001364837 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 168.333-210 chr8 100843361 100843713 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 107034 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 186.333-83 chr2 166882964 166883424 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -5293 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 113.667-129 chr22 34810359 34810647 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 187413 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 240.333-61 chr22 35383398 35383872 + 0.666667 NA intron (NM_002133, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 2539 NM_002133 3162 Hs.517581 NM_002133 ENSG00000100292 HMOX1 HMOX1D|HO-1|HSP32|bK286B10 heme oxygenase 1 protein-coding 157-109 chr5 168757883 168758247 + 0.666667 NA intron (NM_003062, intron 16 of 35) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 10190 NR_029632 407001 NR_029632 ENSG00000207739 MIR218-2 MIRN218-2|mir-218-2 microRNA 218-2 ncRNA 112-171 chr5 68982782 68982982 + 0.666667 NA intron (NR_130778, intron 1 of 3) intron (NR_130778, intron 1 of 3) 47045 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 142-112 chr5 36832065 36832422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44451 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 173.667-65 chr19 32873558 32874032 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4028 NM_014270 11136 Hs.743345 NM_014270 ENSG00000021488 SLC7A9 BAT1|CSNU3 solute carrier family 7 member 9 protein-coding 177.667-37 chr12 29066705 29067123 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -82364 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 124.333-91 chr2 136709585 136709868 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55819 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 130-118 chr7 23560604 23560842 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 25804 NR_002711 1197 Hs.632635 NR_002711 CLK2P1 CLK2P CDC like kinase 2, pseudogene 1 pseudo 115.333-27 chr10 90145566 90145755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -188287 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 171-59 chr4 80258165 80258596 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8208 NM_004464 2250 Hs.37055 NM_004464 ENSG00000138675 FGF5 HBGF-5|Smag-82|TCMGLY fibroblast growth factor 5 protein-coding 142.667-80 chr17 52455988 52456345 + 0.666667 NA intron (NR_146898, intron 1 of 3) L1PREC2|LINE|L1 65644 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 112.667-143 chr2 223665752 223665955 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63492 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 184.667-17 chr10 60398738 60399137 + 0.666667 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) intron (NM_001204403, intron 2 of 43) -9062 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 118.333-130 chr3 41044340 41044668 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -155001 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 158-23 chr11 28857791 28858103 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -380399 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 142.333-32 chr10 124392998 124393284 + 0.666667 NA Intergenic LTR27B|LTR|ERV1 25782 NM_001322969 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 142.667-134 chr3 4815741 4816048 + 0.666667 NA intron (NM_001168272, intron 58 of 60) L1MC4|LINE|L1 -64304 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 208.667-7 chr1 112398135 112398579 + 0.666667 NA intron (NM_018704, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 2143 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 158.667-205 chr3 35616053 35616493 + 0.666667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -23252 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 140.667-196 chr6 54917036 54917370 + 0.666667 NA intron (NM_001010872, intron 2 of 4) intron (NM_001010872, intron 2 of 4) 70432 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 153-37 chr13 28834845 28835293 + 0.666667 NA intron (NM_001366651, intron 1 of 14) L1MB7|LINE|L1 14730 NM_001366651 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 112-152 chr4 56635832 56636111 + 0.666667 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 20551 NM_139211 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 163.667-81 chr16 84074583 84074858 + 0.666667 NA exon (NM_003791, exon 12 of 23) exon (NM_003791, exon 12 of 23) -32563 NM_001080442 146167 NM_001080442 ENSG00000166558 SLC38A8 FVH2 solute carrier family 38 member 8 protein-coding 160-55 chr2 10157213 10157567 + 0.666667 NA intron (NR_161344, intron 3 of 3) L1ME3A|LINE|L1 16008 NR_161344 348738 Hs.454981 NR_161344 ENSG00000171848 C2orf48 - chromosome 2 open reading frame 48 ncRNA 111.667-45 chr11 22279918 22280114 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_213599, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_213599, exon 22 of 22) -58365 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 204.667-22 chr11 26445255 26445781 + 0.666667 NA intron (NM_031418, intron 3 of 26) intron (NM_031418, intron 3 of 26) -28384 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 131-102 chr8 68181711 68181954 + 0.666667 NA intron (NM_024870, intron 35 of 39) L2c|LINE|L2 -148541 NM_001349479 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 211.333-65 chr14 78720912 78721535 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) intron (NR_073547, intron 8 of 20) 317504 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 145.333-210 chr4 36177454 36177734 + 0.666667 NA intron (NR_146894, intron 9 of 32) intron (NR_146894, intron 9 of 32) 66345 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 183.333-86 chr2 160960669 160961053 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -176094 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 135.333-81 chr2 28658664 28658985 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 77381 NR_145832 100505774 Hs.595909 NR_145832 ENSG00000226833 LOC100505774 - uncharacterized LOC100505774 ncRNA 150-155 chr9 15110778 15111114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 117619 NR_003920 389705 Hs.431257 NR_003920 LOC389705 - histone PARylation factor 1 pseudogene pseudo 131-90 chr7 27283339 27283596 + 0.666667 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -36238 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 123.667-130 chr3 186800011 186800301 + 0.666667 NA intron (NM_181573, intron 3 of 10) AluSz|SINE|Alu 6326 NM_002916 5984 Hs.732098 NM_002916 ENSG00000163918 RFC4 A1|RFC37 replication factor C subunit 4 protein-coding 119.333-192 chr6 126866647 126866843 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -251926 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 136.333-192 chr7 50705747 50706058 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001001550) promoter-TSS (NM_001001550) -601 NM_001001550 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 146.667-50 chr10 125708795 125709088 + 0.666667 NA non-coding (NR_033848, exon 5 of 5) non-coding (NR_033848, exon 5 of 5) 10552 NR_033847 399821 Hs.535286 NR_033847 ENSG00000224023 EDRF1-DT - EDRF1 divergent transcript ncRNA 142.333-233 chr8 50341030 50341326 + 0.666667 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) intron (NR_135797, intron 2 of 20) 177047 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 151-22 chr12 1190884 1191216 + 0.666667 NA intron (NM_001301248, intron 11 of 18) intron (NM_001301248, intron 11 of 18) 163302 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 373.333-5 chr12 40925677 40926304 + 0.666667 NA intron (NM_001256064, intron 6 of 15) L2a|LINE|L2 17633 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 112.667-146 chr20 19357149 19357406 + 0.666667 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -72681 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 210-144 chr8 67430657 67431245 + 0.666667 NA intron (NM_020361, intron 9 of 10) AluJr4|SINE|Alu 87117 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 151.667-54 chr10 115671622 115672056 + 0.666667 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) LTR103b_Mam|LTR|ERV1? 522950 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 150.667-83 chr12 20154186 20154436 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26410 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 113.667-19 chr1 241795569 241795831 + 0.666667 NA intron (NM_001367482, intron 26 of 27) L2c|LINE|L2 -52491 NM_001319224 9156 Hs.498248 NM_003686 ENSG00000174371 EXO1 HEX1|hExoI exonuclease 1 protein-coding 200-118 chr4 115494822 115495416 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -381499 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 156.667-16 chr1 80370562 80370882 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -165033 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 188.667-39 chr13 24705104 24705619 + 0.666667 NA intron (NM_001676, intron 14 of 22) intron (NM_001676, intron 14 of 22) 24950 NM_001185085 479 Hs.147111 NM_001676 ENSG00000075673 ATP12A ATP1AL1|HK ATPase H+/K+ transporting non-gastric alpha2 subunit protein-coding 137-111 chr9 10110753 10111153 + 0.666667 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) intron (NM_002839, intron 3 of 45) 311561 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 167-111 chr9 81045349 81045721 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 644000 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 116.333-32 chr10 64308792 64309083 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -516591 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 187.333-57 chr13 102352691 102353061 + 0.666667 NA intron (NM_001321941, intron 1 of 5) intron (NM_001321941, intron 1 of 5) -14654 NR_125912 100874081 Hs.569296 NR_125912 ENSG00000234445 FGF14-AS1 - FGF14 antisense RNA 1 ncRNA 139.667-58 chr15 25627019 25627308 + 0.666667 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -188107 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 117.667-68 chr17 7655834 7656053 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001303263, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001303263, exon 6 of 6) 5017 NM_001678 482 Hs.643540 NM_001678 ENSG00000129244 ATP1B2 AMOG ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 2 protein-coding 129.333-8 chr1 218808200 218808508 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) HAL1|LINE|L1 110157 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 116.333-58 chr13 77602904 77603156 + 0.666667 NA intron (NM_003843, intron 16 of 31) intron (NM_003843, intron 16 of 31) 3521 NR_126413 104355296 Hs.667682 NR_126412 ENSG00000224347 SCEL-AS1 - SCEL antisense RNA 1 ncRNA 134.333-34 chr11 123445424 123445793 + 0.666667 NA intron (NM_001367421, intron 2 of 20) AluSz|SINE|Alu 15339 NM_001354837 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 217.667-41 chr2 43689460 43689976 + 0.666667 NA intron (NM_172069, intron 3 of 29) intron (NM_172069, intron 3 of 29) -13289 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 127.667-90 chr2 137418463 137418713 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 14 of 27) L1MA4|LINE|L1 509344 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 144.667-117 chr18 12759512 12759777 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -10222 NR_110763 100996324 Hs.333275 NR_110763 LINC01882 - long intergenic non-protein coding RNA 1882 ncRNA 222.333-34 chr15 93491181 93491704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 285376 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 160.333-111 chr15 58461974 58462427 + 0.666667 NA intron (NR_120338, intron 2 of 2) L2c|LINE|L2 30209 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 131.333-166 chr7 83226182 83226384 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63399 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 129.333-100 chr2 132378443 132378687 + 0.666667 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 25898 NR_135203 339742 Hs.98178 NR_135203 FAM201B - family with sequence similarity 201 member B ncRNA 161.667-31 chr10 109802266 109802682 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 120772 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 133.667-59 chr17 77991468 77991770 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12618 NM_018996 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 125-86 chr5 38198286 38198562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49944 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 160.667-301 chr8 67114224 67114694 + 0.666667 NA intron (NM_001363131, intron 11 of 29) intron (NM_001363131, intron 11 of 29) 30611 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 136.667-125 chr4 35607301 35607562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 636508 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 173.333-115 chr3 13276178 13276619 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 143924 NM_024923 23225 Hs.475525 NM_024923 ENSG00000132182 NUP210 GP210|POM210 nucleoporin 210 protein-coding 209.333-156 chr3 115830518 115830935 + 0.666667 NA intron (NM_001318915, intron 7 of 8) intron (NM_001318915, intron 7 of 8) 74400 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 124-39 chr15 38632002 38632315 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -64440 NR_160786 221.667-18 chr12 315725 316142 + 0.666667 NA intron (NM_001042603, intron 19 of 27) L2a|LINE|L2 -53060 NM_001190997 6540 Hs.504398 NM_016615 ENSG00000010379 SLC6A13 GAT-2|GAT2|GAT3 solute carrier family 6 member 13 protein-coding 145.333-68 chr12 81408305 81408591 + 0.666667 NA intron (NM_001220478, intron 3 of 28) intron (NM_001220478, intron 3 of 28) -39034 NM_001220480 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 142-92 chr3 105228204 105228484 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -138369 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 154.667-238 chr3 52179516 52179899 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -18376 NM_001304443 211 Hs.476308 NM_000688 ENSG00000023330 ALAS1 ALAS|ALAS-H|ALAS3|ALASH|MIG4 5'-aminolevulinate synthase 1 protein-coding 251.333-10 chr10 36655368 36655815 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -470266 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 249.667-44 chr2 122749939 122750407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 323308 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 117.333-192 chr7 53231579 53231927 + 0.666667 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 196120 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 159.333-87 chr14 46607757 46608084 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43861 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 164.667-258 chr9 118401092 118401524 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -278363 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 187.667-89 chr3 41155833 41156262 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43458 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 113.667-46 chr12 119381159 119381416 + 0.666667 NA intron (NM_178499, intron 1 of 13) intron (NM_178499, intron 1 of 13) 46558 NM_178499 160777 Hs.98188 NM_178499 ENSG00000183273 CCDC60 - coiled-coil domain containing 60 protein-coding 219.667-97 chr9 32619813 32620380 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15573 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 136.667-133 chr4 124161555 124161870 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 387448 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 130-47 chr17 55574860 55575219 + 0.666667 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 147825 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 114-77 chr20 10805472 10805768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 52530 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 155.333-268 chr4 91139852 91140162 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 904976 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 159.333-185 chr20 40007159 40007542 + 0.666667 NA intron (NR_109936, intron 2 of 2) intron (NR_109936, intron 2 of 2) 2889 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 124.333-164 chr6 140633705 140633908 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50008 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 170-19 chr11 106376027 106376430 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 124821 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 112.333-100 chr18 2108189 2108522 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 463150 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 131-109 chr8 134221233 134221549 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 334895 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 112-140 chr3 100895751 100895994 + 0.666667 NA intron (NM_001349332, intron 4 of 35) intron (NM_001349332, intron 4 of 35) 97618 NM_001349330 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 128.667-138 chr5 7241020 7241381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28154 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 130.667-94 chr18 8587933 8588170 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -21394 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 211.333-88 chr17 59817882 59818417 + 0.666667 NA intron (NM_001329400, intron 8 of 9) intron (NM_001329400, intron 8 of 9) -23117 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 133.667-89 chr21 35245722 35246084 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -196605 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 135.333-144 chr5 74658492 74658774 + 0.666667 NA intron (NM_001292004, intron 1 of 13) MER77B|LTR|ERVL -17209 NM_003633 8507 Hs.104925 NM_003633 ENSG00000171617 ENC1 CCL28|ENC-1|KLHL35|KLHL37|NRPB|PIG10|TP53I10 ectodermal-neural cortex 1 protein-coding 133.333-163 chr6 75977840 75978214 + 0.666667 NA intron (NM_001563, intron 12 of 16) FRAM|SINE|Alu 94635 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 117.333-120 chr20 19190219 19190478 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -22294 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 131.667-187 chr7 95374698 95375081 + 0.666667 NA intron (NM_000940, intron 3 of 8) L2|LINE|L2 21486 NM_000940 5446 Hs.440967 NM_000940 ENSG00000105852 PON3 - paraoxonase 3 protein-coding 173.667-168 chr7 79158085 79158416 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) MER4B-int|LTR|ERV1 149262 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 141.667-35 chr10 92015492 92015768 + 0.666667 NA intron (NM_003972, intron 32 of 37) intron (NM_003972, intron 32 of 37) 91860 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 231.667-25 chr17 70618010 70618561 + 0.666667 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 448750 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 123-125 chr8 87665812 87666089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 208065 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 187.667-9 chr1 204529703 204530175 + 0.666667 NA intron (NM_001278519, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu 13533 NM_002393 4194 Hs.497492 NM_002393 ENSG00000198625 MDM4 HDMX|MDMX|MRP1 MDM4 regulator of p53 protein-coding 114-42 chr15 33604230 33604475 + 0.666667 NA intron (NM_001243996, intron 18 of 102) intron (NM_001243996, intron 18 of 102) 293385 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 134.333-15 chr10 33312578 33312909 + 0.666667 NA intron (NM_001244973, intron 2 of 16) intron (NM_001244973, intron 2 of 16) 21924 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 126.333-61 chr15 95876636 95876972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 251037 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 135.667-114 chr3 11201892 11202203 + 0.666667 NA intron (NM_001098212, intron 1 of 1) intron (NM_001098212, intron 1 of 1) -23934 NM_001098211 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 127-50 chr2 149227226 149227479 + 0.666667 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -102633 NM_001195685 130574 Hs.21929 NM_194317 ENSG00000187123 LYPD6 - LY6/PLAUR domain containing 6 protein-coding 143.333-287 chr8 104461370 104461691 + 0.666667 NA intron (NM_001385, intron 1 of 9) L1ME3G|LINE|L1 5525 NM_001385 1807 Hs.443161 NM_001385 ENSG00000147647 DPYS DHP|DHPase dihydropyrimidinase protein-coding 148-171 chr9 100340472 100340819 + 0.666667 NA intron (NM_001161584, intron 4 of 14) intron (NM_001161584, intron 4 of 14) 11926 NM_001161584 54881 Hs.494648 NM_017746 ENSG00000136891 TEX10 Ipi1|bA208F1.2 testis expressed 10 protein-coding 154.667-59 chr11 11940844 11941144 + 0.666667 NA intron (NM_001282659, intron 19 of 27) intron (NM_001282659, intron 19 of 27) 67645 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 115.333-227 chr8 137758912 137759171 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 324504 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 183-10 chr1 208952148 208952612 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20074 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 135.667-106 chr20 57485147 57485484 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 39552 NM_001269044 140690 Hs.131543 NM_080618 ENSG00000124092 CTCFL BORIS|CT27|CTCF-T|HMGB1L1|dJ579F20.2 CCCTC-binding factor like protein-coding 228.667-69 chr7 8362154 8362724 + 0.666667 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -71170 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 184-63 chr21 28739238 28739689 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145904 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 142-39 chr13 82793198 82793491 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 1089049 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 206.333-2 chr1 44025840 44026400 + 0.666667 NA intron (NM_001328630, intron 1 of 10) intron (NM_001328630, intron 1 of 10) 5003 NM_001328629 6536 Hs.442590 NM_006934 ENSG00000196517 SLC6A9 GCENSG|GLYT1 solute carrier family 6 member 9 protein-coding 220.333-5 chr1 77685178 77685682 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -2003 NM_001308237 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 166-42 chr14 65759243 65759582 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 288310 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 199.667-43 chr14 58733693 58734143 + 0.666667 NA Intergenic Charlie13a|DNA|hAT-Charlie -94370 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 202-135 chr4 95895305 95895753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55436 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 159-100 chr6 2334538 2334889 + 0.666667 NA intron (NR_046229, intron 4 of 6) L1MEd|LINE|L1 88960 NR_046229 100508120 Hs.188825 NR_046229 GMDS-DT GMDS-AS1 GMDS divergent transcript ncRNA 149.667-142 chr15 72262999 72263399 + 0.666667 NA intron (NR_136599, intron 8 of 22) L2|LINE|L2 9355 NR_136609 56965 Hs.270244 NM_020213 ENSG00000137817 PARP6 ARTD17|PARP-6-B1|PARP-6-C|pART17 poly(ADP-ribose) polymerase family member 6 protein-coding 130.667-172 chr5 128578220 128578494 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40112 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 112.667-115 chr2 29425473 29425779 + 0.666667 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) L1M4b|LINE|L1 49751 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 170-47 chr17 4501618 4501958 + 0.666667 NA intron (NM_001124758, intron 1 of 12) intron (NM_001124758, intron 1 of 12) 2907 NM_001124758 124976 Hs.22824 NM_001124758 ENSG00000183018 SPNS2 DFNB115|SLC62A2 sphingolipid transporter 2 protein-coding 139.667-121 chr3 104204773 104205034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -680787 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 155.667-356 chr8 90406820 90407141 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 185492 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 193-37 chr18 62736294 62736718 + 0.666667 NA intron (NM_194449, intron 1 of 16) intron (NM_194449, intron 1 of 16) 20965 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 219.333-130 chr4 120113971 120114435 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47355 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 152.667-400 chr9 128404170 128404619 + 0.666667 NA intron (NR_031672, intron 2 of 2).4 MIRb|SINE|MIR -11680 NR_029837 407003 NR_029837 ENSG00000284185 MIR219A2 MIR219-2|MIRN219-2|hsa-mir-219a-2|mir-219a-2 microRNA 219a-2 ncRNA 112.667-182 chr4 30310367 30310611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -409880 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 169-68 chr3 125294716 125295055 + 0.666667 NA intron (NM_001348436, intron 5 of 8) MIRc|SINE|MIR 62395 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 112.333-176 chr4 38678865 38679153 + 0.666667 NA intron (NM_016531, intron 1 of 5) intron (NM_016531, intron 1 of 5) -14381 NR_026804 79667 Hs.29725 NM_024614 ENSG00000231160 KLF3-AS1 - KLF3 antisense RNA 1 ncRNA 144.667-324 chr9 91207611 91207883 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88685 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 126-115 chr8 105355060 105355362 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 35668 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 269-21 chr2 19230046 19230657 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118078 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 114.333-36 chr10 124921670 124921920 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20328 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 119.333-20 chr1 225079052 225079259 + 0.666667 NA intron (NM_001367479, intron 17 of 85) intron (NM_001367479, intron 17 of 85) 149480 NM_001349912 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 162.333-210 chr5 171566332 171566796 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 146917 NM_003862 8817 Hs.87191 NM_003862 ENSG00000156427 FGF18 FGF-18|ZFGF5 fibroblast growth factor 18 protein-coding 175.333-15 chr10 39462333 39462707 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 765924 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 175.667-152 chr9 117906962 117907315 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 202735 NM_003266 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 130-49 chr18 6539729 6540003 + 0.666667 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 28450 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 149.333-142 chr17 55430795 55431080 + 0.666667 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 -9102 NM_012329 23531 Hs.463483 NM_012329 ENSG00000108960 MMD MMA|MMD1|PAQR11 monocyte to macrophage differentiation associated protein-coding 127.333-86 chr2 145638642 145638966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -948253 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 157-113 chr6 55552592 55552954 + 0.666667 NA intron (NR_109867, intron 1 of 3) intron (NR_109867, intron 1 of 3) 26441 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 142.667-172 chr5 4657802 4658168 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -115496 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 145.333-115 chr17 73453887 73454300 + 0.666667 NA intron (NM_001144952, intron 4 of 44) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -59590 NR_135635 101928251 Hs.434726 NR_135635 ENSG00000264985 LOC101928251 - uncharacterized LOC101928251 ncRNA 149.667-275 chr4 26261666 26261916 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57919 NM_005349 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 165.667-93 chr2 126544238 126544709 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -111462 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 193.667-13 chr1 162914278 162914814 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -45731 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 139.667-190 chr8 101385720 101386055 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL 16994 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 155.333-178 chr2 137740638 137741059 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 187084 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 196-95 chr2 213841804 213842237 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) 83953 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 169.667-180 chr6 48475573 48475960 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -407077 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 166.333-125 chr2 171065095 171065466 + 0.666667 NA intron (NM_012290, intron 3 of 20) intron (NM_012290, intron 3 of 20) 1693 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 212-76 chr19 8875426 8875892 + 0.666667 NA intron (NM_024690, intron 69 of 83) L1PB4|LINE|L1 33066 NM_145208 85509 Hs.133912 NM_145208 ENSG00000170948 MBD3L1 MBD3L methyl-CpG binding domain protein 3 like 1 protein-coding 187-80 chr7 42320881 42321357 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -83910 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 124.333-87 chr2 79484275 79484535 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16439 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 157-49 chr16 80578686 80579081 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -6075 NR_104666 101928276 Hs.149769 NR_104665 ENSG00000260737 LINC01227 - long intergenic non-protein coding RNA 1227 ncRNA 125.333-172 chr7 113359867 113360094 + 0.666667 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -241398 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 174-28 chr13 110172693 110173180 + 0.666667 NA intron (NM_001845, intron 40 of 51) intron (NM_001845, intron 40 of 51) 51234 NR_148221 105370361 Hs.134728 NR_148221 LOC105370361 - uncharacterized LOC105370361 ncRNA 248-14 chr11 84288947 84289517 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -15952 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 134.333-90 chr2 143015853 143016170 + 0.666667 NA intron (NM_001199241, intron 11 of 14) intron (NM_001199241, intron 11 of 14) -113408 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 115-17 chr1 195874600 195874807 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 214012 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 124-27 chr11 77476383 77476724 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -2490 NM_002576 5058 Hs.435714 NM_002576 ENSG00000149269 PAK1 IDDMSSD|PAKalpha p21 (RAC1) activated kinase 1 protein-coding 117.667-173 chr6 166994287 166994487 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 3525 NR_037504 100500857 NR_037504 ENSG00000265828 MIR3939 mir-3939 microRNA 3939 ncRNA 138-40 chr15 65478604 65478858 + 0.666667 NA intron (NR_135485, intron 11 of 20) intron (NR_135485, intron 11 of 20) 38543 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 116.333-212 chr8 128353685 128353932 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 203692 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 115.667-76 chr14 67969736 67969953 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 146252 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 195.333-216 chr8 114018511 114019002 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -581817 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 169.667-89 chr17 56430728 56431116 + 0.666667 NA intron (NM_001370326, intron 8 of 20) L2c|LINE|L2 -162777 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 242.333-45 chr2 47361735 47362395 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7083 NM_002354 4072 Hs.542050 NM_002354 ENSG00000119888 EPCAM DIAR5|EGP-2|EGP314|EGP40|ESA|HNPCC8|KS1/4|KSA|M4S1|MIC18|MK-1|TACSTD1|TROP1 epithelial cell adhesion molecule protein-coding 129.667-88 chr2 34077463 34077829 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) 10420 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 205.667-142 chr9 129136381 129136867 + 0.666667 NA intron (NM_178001, intron 8 of 10) intron (NM_178001, intron 8 of 10) 24936 NM_001193397 5524 Hs.400740 NM_021131 ENSG00000119383 PTPA PP2A|PPP2R4|PR53 protein phosphatase 2 phosphatase activator protein-coding 123-78 chr3 109009389 109009633 + 0.666667 NA intron (NM_014429, intron 17 of 27) L1M7|LINE|L1 -55632 NM_005459 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 205-63 chr3 182328049 182328569 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 158053 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 115.667-162 chr4 64328444 64328723 + 0.666667 NA intron (NM_001363796, intron 2 of 11) intron (NM_001363796, intron 2 of 11) 80867 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 185-8 chr11 64650193 64650686 + 0.666667 NA intron (NM_015080, intron 15 of 22) intron (NM_015080, intron 15 of 22) -6894 NM_138734 9379 Hs.372938 NM_015080 ENSG00000110076 NRXN2 - neurexin 2 protein-coding 137-37 chr17 81295991 81296341 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_138570) promoter-TSS (NM_138570) -859 NM_138570 124565 Hs.352240 NM_138570 ENSG00000157637 SLC38A10 PP1744 solute carrier family 38 member 10 protein-coding 167.667-224 chrX 65843783 65844148 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -174905 NR_029637 407008 NR_029637 ENSG00000284567 MIR223 MIRN223|miRNA223|mir-223 microRNA 223 ncRNA 115.333-185 chr6 41787439 41787673 + 0.666667 NA TTS (NM_013397) TTS (NM_013397) 113 NM_001134493 100188893 Hs.731633 NM_001134493 ENSG00000214736 TOMM6 OBTP|TOM6 translocase of outer mitochondrial membrane 6 protein-coding 148.667-371 chr8 63587712 63588079 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 122046 NR_125825 102724612 Hs.97639 NR_125825 ENSG00000253894 LOC102724612 - uncharacterized LOC102724612 ncRNA 178.667-122 chr4 102175228 102175615 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 148891 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 176-86 chr7 43796029 43796529 + 0.666667 NA intron (NM_001253823, intron 6 of 8) L1M4|LINE|L1 37599 NM_000712 644 Hs.488143 NM_000712 ENSG00000106605 BLVRA BLVR|BVR|BVRA biliverdin reductase A protein-coding 131.667-71 chr17 4206076 4206386 + 0.666667 NA intron (NR_047571, intron 6 of 23) intron (NR_047571, intron 6 of 23) 57616 NM_001257999 51479 Hs.696087 NM_016376 ENSG00000185722 ANKFY1 ANKHZN|BTBD23|ZFYVE14 ankyrin repeat and FYVE domain containing 1 protein-coding 187.333-209 chr9 31094170 31094606 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 287102 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 140.667-58 chr11 129077685 129078000 + 0.666667 NA intron (NM_001142685, intron 5 of 21) L1PB1|LINE|L1 -53654 NM_014715 9743 Hs.440379 NM_014715 ENSG00000134909 ARHGAP32 GC-GAP|GRIT|PX-RICS|RICS|p200RhoGAP|p250GAP Rho GTPase activating protein 32 protein-coding 169.333-126 chr2 122975123 122975550 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 98145 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 127.333-174 chr7 68040850 68041082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20713 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 150-11 chr10 26282918 26283292 + 0.666667 NA intron (NM_000818, intron 12 of 16) L3|LINE|CR1 66331 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 148-26 chr11 58138334 58138737 + 0.666667 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) intron (NM_001005212, intron 2 of 2) -19091 NM_001005211 219954 Hs.632122 NM_001005211 ENSG00000172377 OR9I1 OR11-228 olfactory receptor family 9 subfamily I member 1 protein-coding 144.333-128 chr2 79794275 79794614 + 0.666667 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) L1MA10|LINE|L1 72139 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 140-43 chr15 76572294 76572554 + 0.666667 NA intron (NR_148227, intron 23 of 32) intron (NR_148227, intron 23 of 32) -14223 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 150 chr1 14198690 14198979 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 221139 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 202.667-58 chr15 55174074 55174599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22605 NM_016304 51187 Hs.274772 NM_016304 ENSG00000137876 RSL24D1 C15orf15|HRP-L30-iso|L30|RLP24|RPL24|RPL24L|TVAS3 ribosomal L24 domain containing 1 protein-coding 152.667-208 chr2 194264105 194264413 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80010 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 134.667-122 chr20 51331936 51332253 + 0.666667 NA Intergenic (TTATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 120883 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 229-74 chr9 28069103 28069644 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -495507 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 252-96 chr7 5178542 5179115 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -11405 NM_001033518 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 119.333-146 chr22 24597344 24597673 + 0.666667 NA intron (NM_013430, intron 1 of 15) AluSz6|SINE|Alu -4435 NM_207644 388886 Hs.113314 NM_207644 ENSG00000178026 LRRC75B C22orf36|FAM211B leucine rich repeat containing 75B protein-coding 223.333-20 chr10 74970731 74971194 + 0.666667 NA intron (NM_001370144, intron 6 of 15) intron (NM_001370144, intron 6 of 15) -50771 NR_145812 109623471 NR_145812 SNORD172 - small nucleolar RNA, C/D box 172 snoRNA 184.333-96 chr22 41789921 41790313 + 0.666667 NA intron (NM_152513, intron 26 of 30) AluSz6|SINE|Alu -10505 NM_001304797 79879 Hs.474991 NM_024821 ENSG00000100147 CCDC134 - coiled-coil domain containing 134 protein-coding 142.667-246 chr9 108276510 108276899 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 579282 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 125.667-83 chr18 51403375 51403645 + 0.666667 NA intron (NR_040074, intron 1 of 2) MER106B|DNA|hAT-Charlie 11468 NR_040075 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 175.333-57 chr15 90984590 90985038 + 0.666667 NA exon (NM_003981, exon 2 of 15) exon (NM_003981, exon 2 of 15) 9721 NM_001267580 9055 Hs.366401 NM_003981 ENSG00000198901 PRC1 ASE1 protein regulator of cytokinesis 1 protein-coding 152.667-334 chr7 10732081 10732400 + 0.666667 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) 29564 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 140-83 chr5 19768598 19768868 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) L1M4|LINE|L1 117539 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 111.667-219 chr6 46111451 46111639 + 0.666667 NA intron (NM_001370650, intron 1 of 6) LTR49-int|LTR|ERV1 18274 NM_001370649 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 195.333-58 chr12 54435069 54435578 + 0.666667 NA intron (NR_120487, intron 3 of 3) intron (NR_120487, intron 3 of 3) 15538 NR_120488 102724050 Hs.670941 NR_120486 ENSG00000258137 LOC102724050 - uncharacterized LOC102724050 ncRNA 154.667-333 chr6 37722004 37722297 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24267 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 125.333-188 chr9 82828251 82828583 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 234725 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 175.667-6 chr1 150681945 150682318 + 0.666667 NA intron (NM_018178, intron 2 of 4) L1ME4a|LINE|L1 15023 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 146.333-239 chr4 110782836 110783165 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 77647 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 157.333-296 chr5 178179395 178179827 + 0.666667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 7760 NM_001358008 64396 Hs.591738 NM_022471 ENSG00000244234 GMCL2 GCL|GMCL1L|GMCL1P1 germ cell-less 2, spermatogenesis associated protein-coding 145.667-114 chr17 75666162 75666457 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001301839) promoter-TSS (NM_001301839) -807 NR_126037 29115 Hs.655088 NM_013260 ENSG00000161526 SAP30BP HCNGP|HTRG|HTRP SAP30 binding protein protein-coding 129.667-96 chr2 98873046 98873277 + 0.666667 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 63064 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 124.333-180 chr8 124038998 124039268 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 19 of 40) intron (NM_001039112, intron 19 of 40) 1649 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 160-40 chr14 53229397 53229737 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 76213 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 218.667-39 chr16 67416656 67417140 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_013304) promoter-TSS (NM_013304) -421 NM_001323627 29800 Hs.624541 NM_013304 ENSG00000159714 ZDHHC1 C16orf1|DHHC-1|HSU90653|ZNF377 zinc finger DHHC-type containing 1 protein-coding 121.333-151 chr5 121388504 121388857 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66130 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 117-68 chr18 4834382 4834601 + 0.666667 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie -246691 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 154-130 chr7 22358912 22359260 + 0.666667 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -1932 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 139.333-29 chr10 121075039 121075328 + 0.666667 NA Intergenic MER106A|DNA|hAT-Charlie 223821 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 166-10 chr1 150210389 150210815 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24076 NM_001136479 81611 Hs.656466 NM_030920 ENSG00000143401 ANP32E LANP-L|LANPL acidic nuclear phosphoprotein 32 family member E protein-coding 252.667-39 chr16 87072298 87072730 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 14730 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 157.333-20 chr1 114163480 114163863 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9802 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 118.333-219 chrX 155207182 155207455 + 0.666667 NA intron (NM_001303544, intron 1 of 6) intron (NM_001303544, intron 1 of 6) -8955 NM_001303543 7411 Hs.436803 NM_003372 ENSG00000155959 VBP1 HIBBJ46|PFD3|PFDN3|VBP-1 VHL binding protein 1 protein-coding 214-55 chr18 13782061 13782480 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -41879 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 152-152 chr8 58835808 58836112 + 0.666667 NA intron (NM_014729, intron 5 of 8) intron (NM_014729, intron 5 of 8) -176107 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 140.667-247 chr9 27755793 27756143 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -182102 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 118.333-14 chr1 114996000 114996179 + 0.666667 NA TTS (NR_104211) TTS (NR_104211) -33735 NM_000549 7252 Hs.406687 NM_000549 ENSG00000134200 TSHB TSH-B|TSH-BETA thyroid stimulating hormone subunit beta protein-coding 149-85 chr22 30665512 30665860 + 0.666667 NA intron (NM_001318371, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 2189 NM_152511 150290 Hs.517544 NM_152511 ENSG00000167065 DUSP18 DSP18|DUSP20|LMWDSP20 dual specificity phosphatase 18 protein-coding 117.333-71 chr15 97945195 97945396 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15408 NM_183376 91947 Hs.6093 NM_183376 ENSG00000140450 ARRDC4 - arrestin domain containing 4 protein-coding 172.667-140 chr6 148283862 148284226 + 0.666667 NA intron (NM_001346505, intron 1 of 19) intron (NM_001346505, intron 1 of 19) 11716 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 184-123 chr9 116083757 116084161 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69832 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 148-98 chr3 45094220 45094500 + 0.666667 NA intron (NM_022842, intron 5 of 8) AluSx1|SINE|Alu 52018 NM_022842 64866 Hs.476093 NM_022842 ENSG00000163814 CDCP1 CD318|SIMA135|TRASK CUB domain containing protein 1 protein-coding 140.333-223 chr7 136150771 136151039 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -173546 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 131-4 chr1 81974441 81974683 + 0.666667 NA intron (NM_001366002, intron 16 of 20) intron (NM_001366002, intron 16 of 20) 172109 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 122.333 chr1 10125274 10125579 + 0.666667 NA intron (NM_006048, intron 9 of 26) intron (NM_006048, intron 9 of 26) -85144 NM_001365951 23095 Hs.97858 NM_015074 ENSG00000054523 KIF1B CMT2|CMT2A|CMT2A1|HMSNII|KLP|NBLST1 kinesin family member 1B protein-coding 116.667-220 chrX 69040285 69040523 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 125049 NM_001032396 64219 Hs.522679 NM_022368 ENSG00000181191 PJA1 PRAJA1|RNF70 praja ring finger ubiquitin ligase 1 protein-coding 139.667-75 chr18 39386315 39386588 + 0.666667 NA intron (NR_024391, intron 3 of 3) MIRb|SINE|MIR 235724 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 115-4 chr1 85949782 85950013 + 0.666667 NA intron (NM_152890, intron 24 of 59) L2c|LINE|L2 206574 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 270-10 chr11 107106446 107107098 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -88296 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 144-105 chr3 49587922 49588190 + 0.666667 NA intron (NM_003458, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu 33579 NM_003458 8927 Hs.194684 NM_003458 ENSG00000164061 BSN ZNF231 bassoon presynaptic cytomatrix protein protein-coding 162.667-276 chr8 107633172 107633485 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -135410 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 120.667-177 chr9 32609627 32609901 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 25905 NM_153809 138474 Hs.591086 NM_153809 ENSG00000122728 TAF1L TAF(II)210|TAF2A2 TATA-box binding protein associated factor 1 like protein-coding 175-67 chr5 65005938 65006361 + 0.666667 NA intron (NM_005869, intron 13 of 13) intron (NM_005869, intron 13 of 13) 237219 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 139.333-227 chr9 68860364 68860694 + 0.666667 NA intron (NM_003558, intron 4 of 15) intron (NM_003558, intron 4 of 15) 80464 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 246.667-38 chr2 26005320 26005837 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23081 NM_002254 3797 Hs.21611 NM_002254 ENSG00000084731 KIF3C - kinesin family member 3C protein-coding 163-18 chr14 46681873 46682236 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -30273 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 203-17 chr11 8823781 8824174 + 0.666667 NA intron (NM_005418, intron 3 of 22) AluSc8|SINE|Alu -12642 NM_139157 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 127.667-53 chr15 59247048 59247254 + 0.666667 NA intron (NM_004998, intron 4 of 27) AluJr|SINE|Alu 40308 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 141.333-87 chr18 3069622 3069895 + 0.666667 NA intron (NM_019856, intron 36 of 36) intron (NM_019856, intron 36 of 36) -57811 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 181.667-70 chr2 100330907 100331401 + 0.666667 NA Intergenic Charlie21a|DNA|hAT-Charlie -8421 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 172.333-155 chr6 41186876 41187268 + 0.666667 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 14077 NM_024807 79865 Hs.164797 NM_024807 ENSG00000112195 TREML2 C6orf76|TLT-2|TLT2|dJ238O23.1 triggering receptor expressed on myeloid cells like 2 protein-coding 145-60 chr20 44357726 44357991 + 0.666667 NA intron (NM_175914, intron 1 of 9) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 2057 NM_001287183 3172 Hs.116462 NM_000457 ENSG00000101076 HNF4A FRTS4|HNF4|HNF4a7|HNF4a8|HNF4a9|HNF4alpha|MODY|MODY1|NR2A1|NR2A21|TCF|TCF14 hepatocyte nuclear factor 4 alpha protein-coding 145.667-232 chr5 116041145 116041540 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10124 NM_001195581 644100 Hs.98288 NM_001195581 ENSG00000268223 ARL14EPL - ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein like protein-coding 188.333-74 chr2 49225978 49226463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71693 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 203.667-6 chr1 187136576 187137012 + 0.666667 NA intron (NR_126347, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 43952 NR_126347 104169671 NR_126347 ENSG00000230426 LINC01036 - long intergenic non-protein coding RNA 1036 ncRNA 206.667-91 chr3 149840218 149840657 + 0.666667 NA intron (NM_007282, intron 2 of 10) intron (NM_007282, intron 2 of 10) 27749 NM_183383 11342 Hs.12333 NM_007282 ENSG00000082996 RNF13 EIEE73|RZF ring finger protein 13 protein-coding 157.333-266 chr4 90372346 90372710 + 0.666667 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) AluSx1|SINE|Alu 137497 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 173-99 chr8 115352020 115352417 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 315795 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 151-33 chr13 105685224 105685563 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21437 NR_120418 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 133-24 chr13 82167294 82167575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -940451 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 118-22 chr12 51749005 51749243 + 0.666667 NA intron (NM_001369788, intron 13 of 25) intron (NM_001369788, intron 13 of 25) 82793 NM_001013690 401720 Hs.648218 NM_001013690 ENSG00000261308 FIGNL2 - fidgetin like 2 protein-coding 121.333-44 chr12 66023567 66023842 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_106722) promoter-TSS (NR_106722) 22 NR_106722 102464827 NR_106722 ENSG00000276878 MIR6074 hsa-mir-6074 microRNA 6074 ncRNA 171-15 chr12 126544849 126545271 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -95733 NR_147498 283435 Hs.667334 NR_147498 LINC02825 - long intergenic non-protein coding RNA 2825 ncRNA 148-58 chr17 67918251 67918544 + 0.666667 NA intron (NM_182641, intron 11 of 27) intron (NM_182641, intron 11 of 27) 75209 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 167.333-253 chr8 66803659 66803947 + 0.666667 NA intron (NM_001204173, intron 5 of 18) AluJb|SINE|Alu 28598 NM_170709 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 131-44 chr18 54163630 54163883 + 0.666667 NA intron (NM_003927, intron 5 of 6) intron (NM_003927, intron 5 of 6) 58656 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 148-108 chr3 117951089 117951470 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -260354 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 135.667-70 chr16 76062997 76063237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -214284 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 118-25 chr12 75827946 75828287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 203660 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 113-170 chr5 81702476 81702761 + 0.666667 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) intron (NM_012446, intron 1 of 16) 48635 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 141-82 chr7 4706041 4706374 + 0.666667 NA intron (NM_001037165, intron 1 of 8) intron (NM_001037165, intron 1 of 8) 23912 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 127.667-79 chr2 49003091 49003416 + 0.666667 NA intron (NM_000145, intron 4 of 9) intron (NM_000145, intron 4 of 9) -56350 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 112.333-151 chr21 31918235 31918558 + 0.666667 NA intron (NM_014586, intron 1 of 10) intron (NM_014586, intron 1 of 10) 45376 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 181.333-65 chr18 65801824 65802312 + 0.666667 NA intron (NM_001362438, intron 2 of 11) intron (NM_001362438, intron 2 of 11) 51056 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 112.667-38 chr11 29275085 29275372 + 0.666667 NA Intergenic (CTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -319185 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 166-60 chr2 61252052 61252383 + 0.666667 NA intron (NM_014709, intron 48 of 79) MIRb|SINE|MIR 74799 NR_152216 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 119.667-165 chr6 54028585 54028795 + 0.666667 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) 9720 NM_001281746 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 120-59 chr19 36924913 36925119 + 0.666667 NA intron (NM_001204835, intron 3 of 6) intron (NM_001204835, intron 3 of 6) 8684 NM_001204835 374900 Hs.404220 NM_198539 ENSG00000198453 ZNF568 ZFP568 zinc finger protein 568 protein-coding 118.667-21 chr10 34877604 34877857 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 61962 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 157-64 chr2 86410698 86411148 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -30448 NM_018433 55818 Hs.557425 NM_018433 ENSG00000115548 KDM3A JHDM2A|JHMD2A|JMJD1|JMJD1A|TSGA lysine demethylase 3A protein-coding 147.667-355 chr8 76748592 76748871 + 0.666667 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) L2|LINE|L2 -65456 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 115.333-99 chr18 9225680 9225912 + 0.666667 NA intron (NM_001204056, intron 7 of 11) L1ME2z|LINE|L1 88233 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 164.667-154 chr4 23728494 23728917 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 152587 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 179-57 chr2 212805496 212806023 + 0.666667 NA intron (NR_131941, intron 1 of 4) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 10428 NR_131941 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 136.667-77 chr17 29862667 29863054 + 0.666667 NA intron (NM_001282129, intron 1 of 15) intron (NM_001282129, intron 1 of 15) -67043 NM_001145053 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 161.333-189 chr3 94207263 94207688 + 0.666667 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 144414 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 125-123 chr9 27964156 27964510 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) intron (NM_001354574, intron 5 of 5) -390467 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 217.667-35 chr17 61398945 61399425 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_005994) promoter-TSS (NM_005994) 421 NR_125749 103689912 Hs.410998 NR_125749 ENSG00000267280 TBX2-AS1 - TBX2 antisense RNA 1 ncRNA 126.333-24 chr11 22163098 22163360 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -29856 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 125-77 chr3 118963810 118964028 + 0.666667 NA intron (NM_001353325, intron 1 of 7) intron (NM_001353325, intron 1 of 7) 20843 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 113.333-174 chr3 62539797 62539994 + 0.666667 NA intron (NM_003716, intron 11 of 29) MIR|SINE|MIR -166345 NM_018008 55079 Hs.241523 NM_018008 ENSG00000153266 FEZF2 FEZ|FEZL|FKSG36|TOF|ZFP312|ZNF312 FEZ family zinc finger 2 protein-coding 209.333-239 chr8 92783465 92783940 + 0.666667 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) intron (NR_046114, intron 1 of 2) 2358 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 138-27 chr12 21667795 21668066 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10075 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 156.333-121 chr15 33798485 33798891 + 0.666667 NA intron (NM_001243996, intron 67 of 102) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -169809 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 123.333-128 chr20 43652473 43652658 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14454 NM_001278610 4605 Hs.179718 NM_002466 ENSG00000101057 MYBL2 B-MYB|BMYB MYB proto-oncogene like 2 protein-coding 118.333-81 chr16 60289699 60290018 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69935 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 125-44 chr16 68834830 68835067 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004360, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_004360, exon 16 of 16) -8583 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 112.333-210 chr5 90809625 90809910 + 0.666667 NA intron (NR_003149, intron 73 of 89) intron (NR_003149, intron 73 of 89) 250970 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 138.333-43 chr11 118802254 118802566 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11246 NM_004397 1656 Hs.408461 NM_004397 ENSG00000110367 DDX6 HLR2|P54|RCK DEAD-box helicase 6 protein-coding 141.333-233 chr8 30379052 30379370 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5290 NM_001008712 11030 Hs.334587 NM_006867 ENSG00000157110 RBPMS HERMES RNA binding protein, mRNA processing factor protein-coding 119-67 chr18 7389231 7389540 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 71621 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 217.667-43 chr2 62960276 62960803 + 0.666667 NA intron (NM_001354215, intron 15 of 24) L2b|LINE|L2 87172 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 130.333-212 chr8 121387398 121387729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -251783 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-153 chr20 19219478 19219784 + 0.666667 NA intron (NM_020689, intron 1 of 16) L1ME3G|LINE|L1 6989 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 143.333-77 chr14 28373857 28374187 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 391297 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 124.667-203 chr8 54815130 54815477 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 199207 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 181.333-152 chr6 69798351 69798792 + 0.666667 NA Intergenic LTR62|LTR|ERVL -1561 NM_018368 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 156.333-294 chr5 138912244 138912515 + 0.666667 NA intron (NM_001324009, intron 5 of 12) L2|LINE|L2 36979 NM_001324010 1495 Hs.445981 NM_001903 ENSG00000044115 CTNNA1 CAP102|MDPT2 catenin alpha 1 protein-coding 219.667-88 chr7 104837641 104838055 + 0.666667 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) intron (NM_199000, intron 2 of 2) -33756 NR_034141 645591 Hs.658835 NR_034141 ENSG00000226869 LHFPL3-AS1 - LHFPL3 antisense RNA 1 ncRNA 115.667-219 chr8 129871248 129871472 + 0.666667 NA intron (NM_001353307, intron 6 of 13) intron (NM_001353307, intron 6 of 13) 68451 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 120-22 chr11 80899061 80899341 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -136398 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 170.667-109 chr3 27310401 27310855 + 0.666667 NA intron (NM_152534, intron 10 of 38) intron (NM_152534, intron 10 of 38) 58755 NM_199347 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 150.667-408 chrX 100024525 100024862 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 385580 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 174.667-168 chr8 84569499 84569992 + 0.666667 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1PA15-16|LINE|L1 -136182 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 229.333-11 chr10 22710112 22710782 + 0.666667 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 3661 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 138.333-5 chr1 71962107 71962355 + 0.666667 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) CR1_Mam|LINE|CR1 -125219 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 170.333-200 chr7 41138828 41139177 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37398 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 126.333-142 chr5 98448578 98448915 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -287507 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 235 chr1 45172907 45173435 + 0.666667 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) intron (NM_020883, intron 1 of 13) 33434 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 116-63 chr17 79753670 79753988 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 22886 NM_178543 339221 Hs.114084 NM_178543 ENSG00000182156 ENPP7 ALK-SMase|E-NPP 7|NPP-7|NPP7 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7 protein-coding 261-51 chr6 112353096 112353617 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6026 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 172-37 chr13 28667182 28667528 + 0.666667 NA intron (NM_015932, intron 3 of 5) FAM|SINE|Alu 8225 NM_015932 51371 Hs.268742 NM_015932 ENSG00000132963 POMP C13orf12|HSPC014|PNAS-110|PRAAS2|UMP1 proteasome maturation protein protein-coding 234-51 chr4 30391516 30392016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -328603 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 151.333-291 chr3 174003122 174003539 + 0.666667 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) -82534 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 146.333-163 chr2 172991907 172992217 + 0.666667 NA intron (NM_001282901, intron 9 of 24) MIRb|SINE|MIR 63857 NM_001282901 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 165.667-221 chrX 42436015 42436347 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 341982 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 192-77 chr2 160190311 160190783 + 0.666667 NA intron (NM_001282390, intron 3 of 13) L2b|LINE|L2 9725 NM_000888 3694 Hs.470399 NM_000888 ENSG00000115221 ITGB6 AI1H integrin subunit beta 6 protein-coding 196.667-106 chr4 59411095 59411522 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 397735 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 115-26 chr10 28405081 28405286 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90630 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 153.667-174 chr2 39563095 39563451 + 0.666667 NA intron (NR_037875, intron 5 of 5) L1MA4A|LINE|L1 -102225 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 146 chr1 13913127 13913431 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 163864 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 326.333 chr1 35274128 35274829 + 0.666667 NA intron (NM_005095, intron 1 of 29) AluJr|SINE|Alu 5769 NM_001350139 9202 Hs.269211 NM_005095 ENSG00000146463 ZMYM4 CDIR|MYM|ZNF198L3|ZNF262 zinc finger MYM-type containing 4 protein-coding 166.333-186 chr5 76070602 76071047 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12559 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 127-103 chr9 71697589 71697827 + 0.666667 NA intron (NM_013390, intron 20 of 23) intron (NM_013390, intron 20 of 23) 70805 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 180-98 chr7 48353684 48354160 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 31 of 61) intron (NM_152701, intron 31 of 61) 182464 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 172.667-8 chr1 92570496 92570802 + 0.666667 NA intron (NM_001350198, intron 18 of 19) intron (NM_001350198, intron 18 of 19) -83724 NM_005263 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 112-91 chr18 9850250 9850529 + 0.666667 NA intron (NM_006868, intron 6 of 6) FLAM_C|SINE|Alu -35584 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 129-105 chr5 123643117 123643351 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 97817 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 179.333-9 chr1 105273142 105273537 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 345596 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 180.667-8 chr1 156157188 156157573 + 0.666667 NA intron (NM_001370567, intron 2 of 13) AluSx1|SINE|Alu 2832 NM_001370567 64218 Hs.408846 NM_022367 ENSG00000196189 SEMA4A CORD10|RP35|SEMAB|SEMB semaphorin 4A protein-coding 158.333-39 chr10 75486610 75487042 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) 55202 NM_001305581 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 177-59 chr4 108128228 108128682 + 0.666667 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) intron (NM_001130713, intron 3 of 10) 38342 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 157-21 chr10 65680420 65680833 + 0.666667 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) intron (NR_120647, intron 3 of 5) 109201 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 132-14 chr1 222279126 222279452 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 268815 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 220.667-59 chr21 26972307 26972840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5485 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 144.333-194 chr4 94871864 94872203 + 0.666667 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) intron (NM_001203, intron 1 of 12) 114078 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 128-92 chr5 77603120 77603400 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 35437 NM_032109 23440 Hs.202247 NM_032109 ENSG00000171540 OTP - orthopedia homeobox protein-coding 157.333-233 chr3 88818931 88819273 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -288519 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 146.667-260 chr5 88679145 88679433 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_152238) promoter-TSS (NR_152238) -841 NR_152238 645323 Hs.12827 NR_015436 ENSG00000245526 LINC00461 ECONEXIN|EyeLinc1|VISC long intergenic non-protein coding RNA 461 ncRNA 116.667-12 chr1 191205482 191205799 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 22858 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 214.333-71 chr2 15873377 15873848 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -46787 NR_125783 103752554 Hs.269571 NR_125783 ENSG00000223850 MYCNUT MYCNUN|lncUSMycN MYCN upstream transcript ncRNA 118.333-199 chr7 138552872 138553064 + 0.666667 NA intron (NM_003852, intron 8 of 18) intron (NM_003852, intron 8 of 18) 92709 NM_015905 8805 Hs.490287 NM_003852 ENSG00000122779 TRIM24 PTC6|RNF82|TF1A|TIF1|TIF1A|TIF1ALPHA|hTIF1 tripartite motif containing 24 protein-coding 123-70 chr20 53817174 53817475 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 58385 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 148.667-72 chr11 54752975 54753211 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 46261 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 276.667-45 chr22_KI270736v1_random 157164 157845 + 0.666667 NA NA (GAATG)n|Satellite|Satellite NA NA 205.667-97 chr3 108991295 108991608 + 0.666667 NA intron (NM_014429, intron 21 of 27) L2a|LINE|L2 -37572 NM_005459 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 133-92 chr8 58594656 58594962 + 0.666667 NA intron (NM_001144772, intron 22 of 30) intron (NM_001144772, intron 22 of 30) 41548 NM_005625 6386 Hs.200804 NM_005625 ENSG00000137575 SDCBP MDA-9|MDA9|ST1|SYCL|TACIP18 syndecan binding protein protein-coding 191.333-144 chr4 44998404 44998890 + 0.666667 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -272013 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 125.333-65 chr15 56037022 56037325 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -43561 NM_006154 4734 Hs.1565 NM_006154 ENSG00000069869 NEDD4 NEDD4-1|RPF1 NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 187.333-123 chr3 17463620 17463919 + 0.666667 NA intron (NM_014744, intron 3 of 21) intron (NM_014744, intron 3 of 21) 236251 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 193.333-59 chr15 26873374 26873912 + 0.666667 NA intron (NM_001165037, intron 3 of 10) intron (NM_001165037, intron 3 of 10) 6517 NM_001165037 2558 Hs.24969 NM_000810 ENSG00000186297 GABRA5 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit protein-coding 194.667-46 chr16 77721309 77721763 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001105663) promoter-TSS (NM_001105663) -956 NM_001243657 283927 Hs.282665 NM_001105663 ENSG00000140876 NUDT7 - nudix hydrolase 7 protein-coding 145.667-159 chr20 39456752 39457096 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -232176 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 122.667-31 chr11 111791180 111791448 + 0.666667 NA intron (NM_001352420, intron 14 of 15) intron (NM_001352420, intron 14 of 15) -24925 NM_001177563 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 114.333-129 chr20 8818564 8818877 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 32 of 32) intron (NM_182734, intron 32 of 32) -12465 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 318-34 chr21 24172344 24172888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 148761 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 113.333-273 chrX 97537051 97537245 + 0.666667 NA intron (NR_125391, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 27387 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 178.333-123 chr4 85466764 85467161 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8188 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 136.667-4 chr1 69695136 69695428 + 0.666667 NA intron (NM_001370785, intron 2 of 26) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR 125941 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 205.667-110 chr5 22920978 22921449 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -67869 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 127.333-12 chr1 168982859 168983125 + 0.666667 NA intron (NR_104091, intron 3 of 4) intron (NR_104091, intron 3 of 4) 104013 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 119-28 chr11 82064083 82064335 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) L1PA15|LINE|L1 -173373 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 114.667-23 chr1 246846819 246847015 + 0.666667 NA intron (NM_015446, intron 33 of 35) AluJb|SINE|Alu 57300 NR_015422 149134 Hs.720494 NM_207326 LINC01341 - long intergenic non-protein coding RNA 1341 ncRNA 189.667-28 chr11 96461301 96461654 + 0.666667 NA intron (NR_047481, intron 1 of 4) intron (NR_047481, intron 1 of 4) 45400 NR_047481 100874053 Hs.742044 NR_047481 JRKL-AS1 - JRKL antisense RNA 1 ncRNA 210.333-95 chr22 29764013 29764508 + 0.666667 NA intron (NM_019103, intron 1 of 6) intron (NM_019103, intron 1 of 6) 2720 NM_019103 55954 Hs.713647 NM_019103 ENSG00000100319 ZMAT5 SNRNP20|U11/U12-20K|ZC3H19 zinc finger matrin-type 5 protein-coding 203.333-54 chr12 45632527 45632952 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 95182 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 152.667-128 chr15 96542046 96542482 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 208499 NM_001145157 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 128.333-179 chr7 21926277 21926583 + 0.666667 NA intron (NM_001127371, intron 1 of 8) L1M4|LINE|L1 19469 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 142.333-249 chr9 11905769 11906115 + 0.666667 NA Intergenic FordPrefect_a|DNA|hAT-Tip100 -787443 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 150-127 chr6 146693053 146693463 + 0.666667 NA intron (NM_024694, intron 12 of 35) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 94286 NM_024694 79747 Hs.720870 NM_024694 ENSG00000118492 ADGB C6orf103|CAPN16 androglobin protein-coding 187.333-167 chr5 157235105 157235553 + 0.666667 NA intron (NM_005546, intron 8 of 16) intron (NM_005546, intron 8 of 16) -30794 NM_001037333 26999 Hs.519702 NM_014376 ENSG00000055163 CYFIP2 EIEE65|PIR121 cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 protein-coding 119.667-102 chr20 53623444 53623671 + 0.666667 NA intron (NR_134576, intron 2 of 2) intron (NR_134576, intron 2 of 2) 15203 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 122.333-49 chr13 52979031 52979375 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49610 NM_006418 10562 Hs.508113 NM_006418 ENSG00000102837 OLFM4 GC1|GW112|OLM4|OlfD|UNQ362|bA209J19.1|hGC-1|hOLfD olfactomedin 4 protein-coding 157-88 chr3 72092826 72093227 + 0.666667 NA intron (NR_104116, intron 2 of 6) L2c|LINE|L2 7429 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 153.333-20 chr1 145980082 145980473 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 15467 NM_001313972 10628 Hs.533977 NM_006472 ENSG00000265972 TXNIP ARRDC6|EST01027|HHCPA78|THIF|VDUP1 thioredoxin interacting protein protein-coding 147.667-293 chr5 117397865 117398172 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17494 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 164-80 chr4 11086589 11086918 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -282074 NR_030298 693157 NR_030298 ENSG00000207716 MIR572 MIRN572|hsa-mir-572 microRNA 572 ncRNA 111.667-104 chr17 55689092 55689406 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33615 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 171.667-86 chr2 114939670 114940032 + 0.666667 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -106303 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 182.333-71 chr19 41879555 41880008 + 0.666667 NA intron (NM_001783, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 2502 NM_021601 973 Hs.631567 NM_001783 ENSG00000105369 CD79A IGA|MB-1 CD79a molecule protein-coding 144.667-137 chr2 63569742 63570156 + 0.666667 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) intron (NR_148705, intron 1 of 16) 18528 NM_015910 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 128.333-145 chr4 171846523 171846882 + 0.666667 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) intron (NM_001034845, intron 2 of 12) -33095 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 155-70 chr2 132384652 132384966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31996 NM_001508 2863 Hs.432395 NM_001508 ENSG00000183840 GPR39 - G protein-coupled receptor 39 protein-coding 137-35 chr17 30796559 30796862 + 0.666667 NA intron (NM_015986, intron 3 of 7) intron (NM_015986, intron 3 of 7) 27982 NM_015986 51379 Hs.649372 NM_015986 ENSG00000176390 CRLF3 CREME-9|CREME9|CRLM9|CYTOR4|FRWS|p48.2 cytokine receptor like factor 3 protein-coding 135.667-82 chr2 16489482 16489755 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 176216 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 192.333-161 chr8 14067176 14067587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 437691 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 119.333-132 chr2 127747773 127748036 + 0.666667 NA intron (NM_001006623, intron 7 of 7) MER90a|LTR|ERV1 46407 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 190-56 chr18 7073273 7073641 + 0.666667 NA intron (NM_005559, intron 3 of 62) L1MB3|LINE|L1 44340 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 181-25 chr14 69601422 69601886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9942 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 112.333-263 chr8 105704686 105704930 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 355695 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 193.333-91 chr2 55873190 55873729 + 0.666667 NA intron (NM_001039349, intron 8 of 10) intron (NM_001039349, intron 8 of 10) 50323 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 173.333-11 chr1 97445264 97445560 + 0.666667 NA intron (NM_000110, intron 14 of 22) MER49|LTR|ERV1 349489 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 136.333-38 chr12 4028316 4028711 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -155065 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 217.333-66 chr2 134239776 134240275 + 0.666667 NA intron (NM_001371457, intron 1 of 16) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -14047 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 116-13 chr10 2572680 2572870 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71313 NR_136146 105376351 Hs.343482 NR_136146 LINC02645 - long intergenic non-protein coding RNA 2645 ncRNA 207.333-61 chr12 41383090 41383435 + 0.666667 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -54477 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 137-89 chr6 50322552 50322845 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -272769 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 159.667-168 chr2 63523563 63523885 + 0.666667 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) AluSp|SINE|Alu 64753 NM_015910 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 179-11 chr10 31608068 31608565 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208561 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 128-23 chr14 62040468 62040711 + 0.666667 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) L1MEc|LINE|L1 -76768 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 124.333-110 chr21 35419818 35420038 + 0.666667 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) (GATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 160836 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 190.667-105 chr5 128058193 128058528 + 0.666667 NA non-coding (NR_152799, exon 4 of 4) non-coding (NR_152799, exon 4 of 4) 24815 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 142-147 chr7 80457912 80458333 + 0.666667 NA TTS (NM_001102386) TTS (NM_001102386) 53942 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 120.667-136 chr5 5316245 5316574 + 0.666667 NA intron (NM_139056, intron 21 of 22) intron (NM_139056, intron 21 of 22) -106268 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 114-50 chr16 87442321 87442592 + 0.666667 NA intron (NM_015144, intron 2 of 12) L1MEf|LINE|L1 49398 NM_015144 23174 Hs.156231 NM_015144 ENSG00000140948 ZCCHC14 BDG-29|BDG29 zinc finger CCHC-type containing 14 protein-coding 121.667-146 chr4 101683930 101684132 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106576 NM_001127507 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 229.667-2 chr1 99707513 99708011 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001361041, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001361041, exon 17 of 17) 5191 NR_031666 100302152 NR_031666 ENSG00000221669 MIR548N MIRN548N|hsa-mir-548n microRNA 548n ncRNA 146.333-194 chr3 9866301 9866551 + 0.666667 NA TTS (NM_001199623) TTS (NM_001199623) 12386 NM_001199623 63924 Hs.567562 NM_022094 ENSG00000187288 CIDEC CIDE-3|CIDE3|FPLD5|FSP27 cell death inducing DFFA like effector c protein-coding 117.667-16 chr10 4691333 4691621 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13407 NR_024475 100216001 Hs.634869 NR_024475 ENSG00000231298 MANCR LINC00704 mitotically associated long non coding RNA ncRNA 115.667-210 chr8 72342898 72343158 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -91394 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 158.667-231 chr4 41500207 41500551 + 0.666667 NA intron (NM_001289122, intron 2 of 25) L1MC4|LINE|L1 -37778 NM_001330672 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 117-114 chr5 71859225 71859552 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140113 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 213.667-35 chr16 73780409 73780961 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 393880 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 139.333-88 chr17 29703759 29704164 + 0.666667 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) MIR|SINE|MIR 57471 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 154.333-162 chr2 113022916 113023225 + 0.666667 NA intron (NM_014438, intron 5 of 5) intron (NM_014438, intron 5 of 5) 17611 NM_014440 27179 Hs.278910 NM_014440 ENSG00000136694 IL36A FIL1|FIL1(EPSILON)|FIL1E|IL-1F6|IL1(EPSILON)|IL1F6 interleukin 36 alpha protein-coding 133.667-14 chr1 222347587 222347954 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 200334 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 202.333-148 chr5 113706398 113706965 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 192987 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 174-61 chr20 14160253 14160582 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1MA4A|LINE|L1 164901 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 143-60 chr19 45630836 45631259 + 0.666667 NA intron (NR_147901, intron 9 of 20) AluSx|SINE|Alu 8040 NR_029886 442902 NR_029886 ENSG00000284544 MIR330 MIRN330|hsa-mir-330|mir-330 microRNA 330 ncRNA 220.667-78 chr5 16643111 16643554 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -26274 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 144-76 chr2 98059000 98059275 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28030 NR_144298 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 117.667-108 chr20 52215452 52215714 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -23598 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 147.667-53 chr11 47425697 47426118 + 0.666667 NA exon (NM_002804, exon 2 of 12) exon (NM_002804, exon 2 of 12) 566 NM_002804 5702 Hs.250758 NM_002804 ENSG00000165916 PSMC3 TBP1 proteasome 26S subunit, ATPase 3 protein-coding 150.333-259 chr3 40532358 40532725 + 0.666667 NA exon (NM_198484, exon 5 of 5) exon (NM_198484, exon 5 of 5) 7581 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 162-128 chr8 131983872 131984234 + 0.666667 NA intron (NR_136616, intron 14 of 23) intron (NR_136616, intron 14 of 23) 67280 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 116-66 chr18 23439391 23439594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1523 NR_134875 85019 Hs.137562 NM_032933 ENSG00000134490 TMEM241 C18orf45|hVVT transmembrane protein 241 protein-coding 128.333-14 chr1 184436908 184437121 + 0.666667 NA intron (NM_030806, intron 1 of 5) intron (NM_030806, intron 1 of 5) 49985 NM_030806 81563 Hs.497159 NM_030806 ENSG00000116667 C1orf21 PIG13 chromosome 1 open reading frame 21 protein-coding 121-10 chr10 7979587 7979929 + 0.666667 NA intron (NM_031923, intron 4 of 6) intron (NM_031923, intron 4 of 6) 72733 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 127.667-158 chr7 7978199 7978437 + 0.666667 NA intron (NM_138426, intron 1 of 7) intron (NM_138426, intron 1 of 7) 9522 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 252.667-43 chr19 48825117 48825580 + 0.666667 NA intron (NM_016246, intron 5 of 8) AluJo|SINE|Alu 11143 NM_016246 51171 Hs.18788 NM_016246 ENSG00000087076 HSD17B14 DHRS10|SDR47C1|retSDR3 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 14 protein-coding 141.333-15 chr1 241631286 241631651 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001821, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_001821, exon 1 of 1) 4462 NM_001821 1122 Hs.654545 NM_001821 ENSG00000203668 CHML REP2 CHM like Rab escort protein protein-coding 169-40 chr19 28085556 28085889 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -291782 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 151.667-327 chr6 158341398 158341702 + 0.666667 NA intron (NM_020245, intron 1 of 13) L1MA4|LINE|L1 18568 NR_145798 109623462 NR_145798 SNORA116 - small nucleolar RNA, H/ACA box 116 snoRNA 184.333-21 chr11 92892152 92892616 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001367949, exon 28 of 28) 3' UTR (NM_001367949, exon 28 of 28) 23244 NR_135091 105369431 Hs.532389 NR_135091 LINC02746 - long intergenic non-protein coding RNA 2746 ncRNA 231-6 chr10 68012193 68012728 + 0.666667 NA intron (NM_001278185, intron 9 of 23) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -1577 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 134-65 chr3 20802659 20802981 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 460352 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 146.667-63 chr11 113889678 113889960 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -14247 NM_001301029 57646 Hs.503891 NM_020886 ENSG00000048028 USP28 - ubiquitin specific peptidase 28 protein-coding 173-81 chr5 131471194 131471527 + 0.666667 NA intron (NM_001164387, intron 17 of 28) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 163869 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 162.667-100 chr17 54333197 54333590 + 0.666667 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 510466 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 121-22 chr10 108392089 108392439 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -322971 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 208-75 chr2 30673566 30673994 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 133666 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 131-11 chr10 33665467 33665841 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107026 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 178.666-25 chr9 37720952 37721476 + 0.666667 NA intron (NM_001371225, intron 6 of 15) intron (NM_001371225, intron 6 of 15) -32589 NR_104612 158234 Hs.655614 NM_144964 ENSG00000165275 TRMT10B RG9MTD3|bA3J10.9 tRNA methyltransferase 10B protein-coding 180.333-77 chr3 52426274 52426733 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 15843 NM_016483 51533 Hs.372719 NM_016483 ENSG00000010318 PHF7 HSPC045|HSPC226|NYD-SP6 PHD finger protein 7 protein-coding 117.333-183 chr6 149060523 149060802 + 0.666667 NA intron (NM_005715, intron 7 of 7) intron (NM_005715, intron 7 of 7) -28001 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 191.333-207 chr8 114072591 114073037 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -635875 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 153.333-34 chr1 220146746 220147052 + 0.666667 NA intron (NM_018060, intron 22 of 22) AluSq2|SINE|Alu -28658 NR_029711 406969 NR_029711 ENSG00000207624 MIR194-1 MIRN194-1|mir-194-1 microRNA 194-1 ncRNA 117.333-155 chr4 98792386 98792636 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 133609 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 127-108 chr9 136475842 136476199 + 0.666667 NA exon (NM_001276418, exon 2 of 29) exon (NM_001276418, exon 2 of 29) -6990 NM_152571 158055 Hs.212613 NM_152571 C9orf163 - chromosome 9 open reading frame 163 protein-coding 291.333-9 chr10 97177067 97177572 + 0.666667 NA intron (NR_037909, intron 11 of 14) intron (NR_037909, intron 11 of 14) 8640 NM_003061 6585 Hs.632082 NM_003061 ENSG00000187122 SLIT1 MEGF4|SLIL1|SLIT-1|SLIT3 slit guidance ligand 1 protein-coding 112.333-232 chr6 74671716 74671957 + 0.666667 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 456946 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 144.667-260 chr6 44858590 44858884 + 0.666667 NA intron (NM_181356, intron 12 of 12) intron (NM_181356, intron 12 of 12) -306856 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 128.667-153 chr6 39723044 39723332 + 0.666667 NA intron (NM_001289020, intron 1 of 21) intron (NM_001289020, intron 1 of 21) 2220 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 145.333-266 chr6 141997594 141997878 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 91063 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 146.333-113 chr16 5760687 5761016 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 128384 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 128.667-52 chr14 33276530 33276807 + 0.666667 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) MIRb|SINE|MIR 337789 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 114.333-167 chr5 15347727 15347921 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -81264 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 200.333-71 chr2 83735378 83735846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 212798 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 135.333-70 chr18 2160526 2160827 + 0.666667 NA Intergenic MER4B-int|LTR|ERV1 410829 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 174.667-114 chr3 68924824 68925246 + 0.666667 NA intron (NM_001005527, intron 1 of 5) intron (NM_001005527, intron 1 of 5) 7512 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 130.667-108 chr2 54921987 54922211 + 0.666667 NA intron (NM_001039753, intron 25 of 40) L1MA9|LINE|L1 88173 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 154-42 chr12 71330733 71331037 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -108913 NM_003667 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 187.333-29 chr11 24905127 24905561 + 0.666667 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) AluSx|SINE|Alu 408291 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 168.667-31 chr11 24054700 24055109 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -442149 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 172.333-131 chr4 166991961 166992268 + 0.666667 NA intron (NM_001204355, intron 2 of 8) L1ME4b|LINE|L1 242312 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 213-4 chr1 87279933 87280407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48710 NM_006769 8543 Hs.436792 NM_006769 ENSG00000143013 LMO4 - LIM domain only 4 protein-coding 284.666-18 chr3 116174160 116174912 + 0.666667 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -185488 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 118.667-9 chr1 125044369 125044570 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 3525357 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 146.333-149 chr2 65984733 65985151 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 373386 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 193-30 chr16 77475182 77475690 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -40402 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 121.333-115 chr3 116714610 116714921 + 0.666667 NA intron (NR_015391, intron 3 of 3) L1MC1|LINE|L1 4977 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 221.333-37 chr14 44894153 44894774 + 0.666667 NA Intergenic AluYk4|SINE|Alu -2812 NM_001017923 122525 Hs.82098 NM_001017923 ENSG00000179476 C14orf28 DRIP-1|DRIP1|c14_5270 chromosome 14 open reading frame 28 protein-coding 193-38 chr19 6781273 6781578 + 0.666667 NA intron (NM_001258206, intron 1 of 25) L1ME4b|LINE|L1 8717 NM_001258206 7409 Hs.116237 NM_005428 ENSG00000141968 VAV1 VAV vav guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 158.333-88 chr14 66839731 66840113 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) intron (NM_001024218, intron 4 of 21) 332515 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 134.667-185 chr7 82065281 82065660 + 0.666667 NA intron (NM_000722, intron 8 of 38) intron (NM_000722, intron 8 of 38) 56293 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 125-80 chr4 52923507 52923869 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 61371 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 131.667-35 chr11 83974030 83974300 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 12 of 27) intron (NM_001142699, intron 12 of 27) -291740 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 200-54 chr14 54876734 54877184 + 0.666667 NA intron (NM_001024071, intron 1 of 5) L1MC5a|LINE|L1 1234 NR_036194 100422984 NR_036194 ENSG00000265432 MIR4308 - microRNA 4308 ncRNA 144.667-278 chr7 10766407 10766707 + 0.666667 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) 13387 NR_147499 79150 Hs.571301 NM_024304 ENSG00000283117 MGC4859 - uncharacterized LOC79150 ncRNA 157-133 chr8 119910063 119910405 + 0.666667 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 36512 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 188-95 chr6 63767120 63767510 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 40 of 43) L1PA16|LINE|L1 -39521 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 245.333-76 chr3 76949144 76949775 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -90640 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 118.333-176 chr6 48427793 48428124 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -359269 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 144.667-115 chr18 3910495 3910793 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 25291 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 139.667-124 chr3 155526174 155526432 + 0.666667 NA intron (NM_001349252, intron 10 of 24) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 40500 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 318-37 chr3 40943237 40943864 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -255955 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 113.333-156 chr21 41371763 41372058 + 0.666667 NA intron (NM_002463, intron 1 of 13) intron (NM_002463, intron 1 of 13) 9883 NM_002463 4600 Hs.926 NM_002463 ENSG00000183486 MX2 MXB MX dynamin like GTPase 2 protein-coding 214.667-39 chr13 63978433 63978918 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 97336 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 124.667-73 chr15 90413557 90413823 + 0.666667 NA intron (NM_003870, intron 2 of 37) MER84|LTR|ERV1 25448 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 121.667-129 chr3 101054500 101054815 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -61167 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 128-121 chr8 116110046 116110316 + 0.666667 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 214878 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 150-72 chr2 61370947 61371277 + 0.666667 NA intron (NM_014709, intron 8 of 79) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 46265 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 128.333-208 chrX 29785637 29785885 + 0.666667 NA intron (NM_014271, intron 6 of 10) L1ME2|LINE|L1 211483 NR_049877 100847047 NR_049877 ENSG00000264090 MIR4666B - microRNA 4666b ncRNA 112.333-178 chr4 55355487 55355671 + 0.666667 NA intron (NM_024592, intron 1 of 4) L3b|LINE|CR1 9337 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 111.667-94 chr15 100378370 100378546 + 0.666667 NA intron (NR_120374, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 5519 NR_120374 102723320 Hs.416099 NR_120374 CERS3-AS1 - CERS3 antisense RNA 1 ncRNA 148.333-152 chr16 48528957 48529243 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 81080 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 173.667-108 chr3 64870952 64871427 + 0.666667 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) intron (NR_038264, intron 4 of 5) -183189 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 111.667-192 chr4 162489335 162489635 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -325451 NM_001128428 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 188.667-43 chr14 47491933 47492352 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -148896 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 116-84 chr2 146898479 146898695 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 311530 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 148.667-383 chr8 114887032 114887338 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 780828 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 196-160 chr6 86564061 86564488 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -373254 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 122-46 chr18 41430679 41430909 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 89883 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 154.667-27 chr1 210378383 210378693 + 0.666667 NA intron (NM_001122834, intron 3 of 11) L1MA4|LINE|L1 49172 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 115.333-143 chr3 120030325 120030570 + 0.666667 NA intron (NM_002093, intron 1 of 11) L2b|LINE|L2 54201 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 112-77 chr15 97518869 97519048 + 0.666667 NA intron (NR_120324, intron 1 of 4) intron (NR_120324, intron 1 of 4) 2853 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 150.333-88 chr12 93962745 93963090 + 0.666667 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -19311 NR_135017 105369911 Hs.577495 NR_135017 ENSG00000257283 LOC105369911 - uncharacterized LOC105369911 ncRNA 122.667-59 chr15 73012972 73013192 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -39381 NM_002499 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 171-29 chr17 57957757 57958137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2535 NM_001271875 404093 Hs.46679 NM_001271875 ENSG00000180891 CUEDC1 - CUE domain containing 1 protein-coding 117-119 chr5 146994780 146995113 + 0.666667 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 61191 NM_181674 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 218.333-121 chr8 101337516 101338103 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31084 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 166-112 chr7 119148138 119148427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 759093 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 151.667-297 chr5 150390004 150390371 + 0.666667 NA intron (NM_001135244, intron 19 of 25) intron (NM_001135244, intron 19 of 25) 22569 NR_157074 972 Hs.436568 NM_004355 ENSG00000019582 CD74 DHLAG|HLADG|II|Ia-GAMMA|p33 CD74 molecule protein-coding 238.333-41 chr2 14156777 14157253 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 243943 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 164.333-200 chr5 110676057 110676399 + 0.666667 NA intron (NM_001039763, intron 1 of 13) L1MA9|LINE|L1 50443 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 115-120 chr4 79522884 79523148 + 0.666667 NA intron (NR_038826, intron 3 of 3) intron (NR_038826, intron 3 of 3) 30423 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 152.667-357 chr8 19368895 19369273 + 0.666667 NA intron (NR_156444, intron 7 of 8) L1MA4|LINE|L1 55108 NM_001174159 63898 Hs.303208 NM_022071 ENSG00000104611 SH2D4A PPP1R38|SH2A SH2 domain containing 4A protein-coding 191.667-93 chr4 70802679 70803162 + 0.666667 NA intron (NM_001037442, intron 15 of 17) intron (NM_001037442, intron 15 of 17) 36583 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 366.667-15 chr5 164618943 164619759 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 149072 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 241.333-74 chr4 74452277 74452876 + 0.666667 NA exon (NM_001657, exon 5 of 6) exon (NM_001657, exon 5 of 6) 7440 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 135-32 chr14 49020598 49020961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 565601 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 118.667-4 chr1 71437185 71437419 + 0.666667 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) L1MB8|LINE|L1 355978 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 170.333-194 chr7 7828509 7828899 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) -110097 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 188.333-3 chr1 52105070 52105470 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -36819 NM_007324 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 122.667-102 chr20 37022848 37023076 + 0.666667 NA intron (NM_002895, intron 16 of 21) intron (NM_002895, intron 16 of 21) -71119 NM_015474 25939 Hs.580681 NM_015474 ENSG00000101347 SAMHD1 CHBL2|DCIP|HDDC1|MOP-5|SBBI88|hSAMHD1 SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 protein-coding 192.667-185 chr9 93057559 93057882 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_145006) promoter-TSS (NM_145006) -968 NM_001287006 203328 Hs.88417 NM_145006 ENSG00000157303 SUSD3 - sushi domain containing 3 protein-coding 122.333-80 chr18 34626359 34626700 + 0.666667 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) Plat_L3|LINE|CR1 33194 NM_001128175 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 185.333-137 chr4 65394145 65394579 + 0.666667 NA intron (NM_001281767, intron 8 of 16) intron (NM_001281767, intron 8 of 16) 275126 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 149-124 chr6 28236568 28236871 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 11444 NM_001199480 7746 Hs.100921 NM_006299 ENSG00000137185 ZSCAN9 PRD51|ZNF193 zinc finger and SCAN domain containing 9 protein-coding 176-14 chr10 114329997 114330436 + 0.666667 NA intron (NM_001287824, intron 4 of 19) intron (NM_001287824, intron 4 of 19) 74286 NM_001001936 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 194.333-106 chr4 120653881 120654305 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 268773 NM_001300824 11107 Hs.666782 NM_018699 ENSG00000138738 PRDM5 BCS2|PFM2 PR/SET domain 5 protein-coding 199.667-83 chr20 7377085 7377604 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 5736 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 157.333-200 chr2 162443092 162443416 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 7 of 15) intron (NM_033272, intron 7 of 15) 98886 NM_001330271 25801 Hs.377894 NM_012198 ENSG00000115271 GCA GCL grancalcin protein-coding 152-123 chr5 11020701 11021021 + 0.666667 NA intron (NM_001288715, intron 16 of 20) intron (NM_001288715, intron 16 of 20) -259627 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 122.333-68 chr16 58707567 58707832 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002080, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_002080, exon 10 of 10) -22929 NR_161424 55238 Hs.10499 NM_018231 ENSG00000103042 SLC38A7 SNAT7 solute carrier family 38 member 7 protein-coding 139.667-204 chr9 32561599 32561984 + 0.666667 NA intron (NM_001199987, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 -9163 NM_001195622 10210 Hs.589962 NM_005802 ENSG00000197579 TOPORS LUN|P53BP3|RP31|TP53BPL TOP1 binding arginine/serine rich protein protein-coding 223.667-82 chr8 83786701 83787238 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 383211 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 179.333-200 chrX 50447256 50447677 + 0.666667 NA intron (NM_001013742, intron 1 of 27) intron (NM_001013742, intron 1 of 27) 23359 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 252.667-47 chr2 57387007 57387639 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -520328 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 150.333-317 chr5 9641786 9642138 + 0.666667 NA intron (NR_027112, intron 11 of 12) intron (NR_027112, intron 11 of 12) -11611 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 212.333-138 chr7 48525072 48525463 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 54 of 61) intron (NM_152701, intron 54 of 61) 353809 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 148.667-309 chr5 57280556 57280839 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 66623 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 138-68 chr20 34445326 34445715 + 0.666667 NA intron (NM_001257137, intron 12 of 25) intron (NM_001257137, intron 12 of 25) -20805 NR_030374 693229 NR_030374 ENSG00000207997 MIR644A MIR644|MIRN644|hsa-mir-644|hsa-mir-644a microRNA 644a ncRNA 147-114 chr5 116695874 116696167 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66189 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 135-123 chrX 100326192 100326450 + 0.666667 NA intron (NM_020766, intron 4 of 4) intron (NM_020766, intron 4 of 4) 83952 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 167.333-246 chr7 79049333 79049671 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 40514 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 169-65 chr3 104539102 104539385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -827470 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 123.667-14 chr1 110921550 110921835 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 42230 NM_018372 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 135-116 chr8 132763017 132763394 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2623 NM_144649 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 150-161 chr9 132911026 132911449 + 0.666667 NA intron (NM_000368, intron 10 of 22) intron (NM_000368, intron 10 of 22) 32339 NM_001316900 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 154.333-282 chr5 164398742 164399055 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 68504 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 122.667-210 chr9 78067234 78067457 + 0.666667 NA Intergenic MER4A1|LTR|ERV1 -35534 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 157-42 chr14 50443324 50443629 + 0.666667 NA intron (NM_198794, intron 20 of 31) intron (NM_198794, intron 20 of 31) -46178 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 149.667-179 chr19 52118627 52118899 + 0.666667 NA intron (NM_178523, intron 3 of 3) intron (NM_178523, intron 3 of 3) 21175 NM_178523 90317 Hs.645225 NM_178523 ENSG00000204611 ZNF616 - zinc finger protein 616 protein-coding 131.333-67 chr17 58942475 58942766 + 0.666667 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 164260 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 121.333-47 chr13 102675323 102675639 + 0.666667 NA intron (NM_001330588, intron 28 of 29) MIR|SINE|MIR 19040 NM_001010977 196541 Hs.508623 NM_001010977 ENSG00000139780 METTL21C C13orf39 methyltransferase like 21C protein-coding 147.333-95 chr13 114230639 114230902 + 0.666667 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 -4075 NM_003903 8881 Hs.374127 NM_003903 ENSG00000130177 CDC16 ANAPC6|APC6|CDC16Hs|CUT9 cell division cycle 16 protein-coding 131-79 chr5 105736346 105736600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 636999 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 191-80 chr9 29708125 29708613 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -494768 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 129-101 chr5 84615078 84615390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -230354 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 167-46 chr17 40675238 40675557 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -10220 NM_152349 125113 Hs.6920 NM_152349 ENSG00000213424 KRT222 KA21|KRT222P keratin 222 protein-coding 234-69 chr8 61150717 61151391 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136916 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 183.667-102 chr4 49062182 49062506 + 0.666667 NA TTS (NM_025087) TTS (NM_025087) 75702 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 111.667-228 chr6 134831758 134831950 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 118247 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 133.333-145 chr5 42940042 42940439 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53093 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 117.333-37 chr11 33548182 33548475 + 0.666667 NA intron (NM_012194, intron 4 of 20) AluSx1|SINE|Alu 152412 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 140.667-174 chr5 7731299 7731576 + 0.666667 NA intron (NM_020546, intron 14 of 24) AluSx1|SINE|Alu 119696 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 137.333-24 chr11 57330446 57330809 + 0.666667 NA intron (NM_003146, intron 10 of 16) intron (NM_003146, intron 10 of 16) 5265 NM_003146 6749 Hs.523680 NM_003146 ENSG00000149136 SSRP1 FACT|FACT80|T160 structure specific recognition protein 1 protein-coding 115.333-229 chr9 94855936 94856160 + 0.666667 NA intron (NM_032823, intron 5 of 14) intron (NM_032823, intron 5 of 14) 46086 NR_031755 100313780 NR_031755 ENSG00000252153 MIR2278 mir-2278 microRNA 2278 ncRNA 154.333-308 chr7 5635263 5635639 + 0.666667 NA intron (NM_207111, intron 15 of 16) intron (NM_207111, intron 15 of 16) 42635 NM_003088 6624 Hs.118400 NM_003088 ENSG00000075618 FSCN1 FAN1|HSN|SNL|p55 fascin actin-bundling protein 1 protein-coding 134.667-19 chr10 48864990 48865315 + 0.666667 NA intron (NM_020945, intron 39 of 61) L1MB8|LINE|L1 49083 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 146.333-312 chr7 91337454 91337823 + 0.666667 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? 73205 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 145.667-165 chr21 21145528 21145814 + 0.666667 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) -1491 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 128.667-60 chr15 27755439 27755668 + 0.666667 NA intron (NM_001300984, intron 22 of 22) intron (NM_001300984, intron 22 of 22) 343762 NM_001300984 4948 Hs.654411 NM_000275 ENSG00000104044 OCA2 BEY|BEY1|BEY2|BOCA|D15S12|EYCL|EYCL2|EYCL3|HCL3|P|PED|SHEP1 OCA2 melanosomal transmembrane protein protein-coding 173.667-195 chr9 134490603 134490952 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 84217 NM_001291921 6256 Hs.590886 NM_002957 ENSG00000186350 RXRA NR2B1 retinoid X receptor alpha protein-coding 152.333-188 chr2 126509911 126510216 + 0.666667 NA Intergenic MER4C|LTR|ERV1 -145872 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 114-181 chrX 74071252 74071454 + 0.666667 NA TTS (NR_024582) TTS (NR_024582) 127029 NR_024582 554203 Hs.648316 NR_024582 ENSG00000225470 JPX DCBALD06|ENOX|LINC00183|NCRNA00183 JPX transcript, XIST activator ncRNA 123.333-80 chr15 44655227 44655567 + 0.666667 NA intron (NM_025137, intron 4 of 39) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 8265 NM_001160227 80208 Hs.656271 NM_025137 ENSG00000104133 SPG11 ALS5|CMT2X|KIAA1840 SPG11 vesicle trafficking associated, spatacsin protein-coding 131-46 chr18 69576945 69577141 + 0.666667 NA intron (NM_152721, intron 2 of 7) intron (NM_152721, intron 2 of 7) 107112 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 151-16 chr10 75174535 75174851 + 0.666667 NA intron (NM_001174156, intron 4 of 5) AluSp|SINE|Alu -35461 NM_001184823 7417 Hs.355927 NM_003375 ENSG00000165637 VDAC2 POR voltage dependent anion channel 2 protein-coding 112.667-152 chr20 50941013 50941211 + 0.666667 NA exon (NM_001317034, exon 7 of 10) exon (NM_001317034, exon 7 of 10) -9675 NM_001282531 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 134.333-145 chr5 143009141 143009460 + 0.666667 NA intron (NR_146198, intron 11 of 22) (CAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -140390 NR_046680 100874239 Hs.570896 NR_046680 ENSG00000226272 ARHGAP26-AS1 - ARHGAP26 antisense RNA 1 ncRNA 113-107 chr2 81450712 81450979 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 16101 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 166-123 chr9 16620189 16620514 + 0.666667 NA intron (NM_001317940, intron 2 of 5) intron (NM_001317940, intron 2 of 5) -106463 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 206.667-143 chr8 134931514 134931910 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81777 NR_125427 101927845 Hs.559609 NR_125427 ENSG00000251218 LOC101927845 - uncharacterized LOC101927845 ncRNA 122.333-172 chr5 39233200 39233545 + 0.666667 NA intron (NM_001243093, intron 1 of 18) intron (NM_001243093, intron 1 of 18) -13809 NM_199335 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 206-83 chr2 100266997 100267438 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 55516 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 145.333-56 chr11 93956617 93957006 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64543 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 117.333-126 chr22 28147951 28148152 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -227439 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 123.333-53 chr11 114388190 114388454 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -8283 NR_120567 101928940 Hs.409846 NR_120567 ENSG00000256195 LOC101928940 - uncharacterized LOC101928940 ncRNA 143-44 chr14 99995039 99995345 + 0.666667 NA intron (NM_001330221, intron 1 of 13) L1MB2|LINE|L1 23770 NM_001330221 51466 Hs.125867 NM_016337 ENSG00000196405 EVL RNB6 Enah/Vasp-like protein-coding 140.667-132 chr20 56490230 56490618 + 0.666667 NA intron (NM_001283036, intron 5 of 8) intron (NM_001283036, intron 5 of 8) 21839 NM_016407 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 216.333-125 chr6 57180195 57180678 + 0.666667 NA intron (NM_004282, intron 1 of 2) L1MEd|LINE|L1 8110 NM_004282 9532 Hs.745046 NM_004282 ENSG00000112208 BAG2 BAG-2|dJ417I1.2 BCL2 associated athanogene 2 protein-coding 126-117 chr8 117261711 117261919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 126820 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 211-68 chr3 139003381 139003874 + 0.666667 NA TTS (NM_001134659) TTS (NM_001134659) 2641 NM_001134659 729627 Hs.121314 NM_001134659 ENSG00000206260 PRR23A - proline rich 23A protein-coding 149-155 chr9 71712659 71713025 + 0.666667 NA intron (NM_013390, intron 15 of 23) intron (NM_013390, intron 15 of 23) 55671 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 160-12 chr10 4596537 4596927 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -59424 NR_015425 338588 Hs.121365 NR_015425 LINC00705 - long intergenic non-protein coding RNA 705 ncRNA 163-89 chr9 3012782 3013189 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -168604 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 142-131 chr6 128903473 128903788 + 0.666667 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 20489 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 137-13 chr10 98132369 98132683 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -2098 NM_001256620 27291 Hs.419800 NM_014472 ENSG00000166024 R3HCC1L C10orf28|GIDRP86|GIDRP88|PSORT R3H domain and coiled-coil containing 1 like protein-coding 149.667-390 chr8 58362634 58363041 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -48427 NM_001330535 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 179-42 chr17 66051461 66051849 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 12 of 26) LTR86C|LTR|ERVL 140237 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 112.333-273 chr9 14957154 14957393 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -36054 NR_003920 389705 Hs.431257 NR_003920 LOC389705 - histone PARylation factor 1 pseudogene pseudo 112.333-53 chr12 56590502 56590813 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002898, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_002898, exon 14 of 14) 39669 NM_001300905 11176 Hs.314263 NM_013449 ENSG00000076108 BAZ2A TIP5|WALp3 bromodomain adjacent to zinc finger domain 2A protein-coding 156.667-226 chr3 96804959 96805220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9505 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 174-104 chr8 137450837 137451244 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37452 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 118-56 chr17 64520412 64520641 + 0.666667 NA intron (NM_138363, intron 6 of 19) AluSz|SINE|Alu 13549 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 135-90 chr5 149623554 149623868 + 0.666667 NA intron (NM_001001669, intron 9 of 12) intron (NM_001001669, intron 9 of 12) 42213 NM_001001669 389337 Hs.256206 NM_001001669 ENSG00000183111 ARHGEF37 - Rho guanine nucleotide exchange factor 37 protein-coding 156.333-144 chr17 29709281 29709595 + 0.666667 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) AluSz6|SINE|Alu 51994 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 173-8 chr10 55299075 55299416 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -299797 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 138.333-187 chr7 109517871 109518226 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 442165 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 282.333-52 chr6 80907308 80908052 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 801009 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 241.333-102 chr9 8287241 8287786 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 446433 NM_130392 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 146.667-216 chr3 85974462 85974773 + 0.666667 NA intron (NM_001256504, intron 9 of 10) intron (NM_001256504, intron 9 of 10) -146567 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 116.333-135 chr22 28734888 28735100 + 0.666667 NA intron (NM_001257387, intron 1 of 15) intron (NM_001257387, intron 1 of 15) 6826 NM_001005735 11200 Hs.291363 NM_007194 ENSG00000183765 CHEK2 CDS1|CHK2|HuCds1|LFS2|PP1425|RAD53|hCds1 checkpoint kinase 2 protein-coding 120.333-100 chr2 125462662 125462975 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 655167 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 137.333-207 chr9 108636974 108637246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 218876 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 183.667-29 chr11 13264734 13265146 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -11712 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 131.333-81 chr2 47476421 47476699 + 0.666667 NA exon (NM_001258281, exon 14 of 17) exon (NM_001258281, exon 14 of 17) -50977 NR_120602 644093 Hs.734158 NR_120602 ENSG00000235760 HCG2040054 - uncharacterized LOC644093 ncRNA 189-31 chr15 34280184 34280586 + 0.666667 NA intron (NM_001042496, intron 2 of 25) intron (NM_001042496, intron 2 of 25) 38435 NM_005135 9990 Hs.510939 NM_005135 ENSG00000140199 SLC12A6 ACCPN|KCC3|KCC3A|KCC3B solute carrier family 12 member 6 protein-coding 113-181 chr6 70163842 70164110 + 0.666667 NA intron (NM_001858, intron 36 of 50) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 119221 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 156-59 chr17 61872763 61873140 + 0.666667 NA intron (NM_001351695, intron 19 of 24) L1ME4a|LINE|L1 -9392 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 112-118 chr2 180046000 180046304 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38855 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 196-44 chr13 99073881 99074304 + 0.666667 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 12602 NM_015296 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 230.333-45 chr17 7500512 7501182 + 0.666667 NA exon (NM_000937, exon 11 of 30) exon (NM_000937, exon 11 of 30) 16481 NM_000937 5430 Hs.270017 NM_000937 POLR2A POLR2|POLRA|RPB1|RPBh1|RPO2|RPOL2|RpIILS|hRPB220|hsRPB1 RNA polymerase II subunit A protein-coding 156-74 chr2 111025938 111026332 + 0.666667 NA intron (NM_001371254, intron 15 of 18) L1ME1|LINE|L1 89453 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 112.333-58 chr12 65242456 65242680 + 0.666667 NA intron (NM_014319, intron 9 of 12) L2c|LINE|L2 -36115 NM_198080 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 165-5 chr1 186753999 186754323 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73507 NR_125801 103752588 Hs.441636 NR_125801 ENSG00000273129 PACERR PACER|PTGS2-AS1|PTGS2AS1 PTGS2 antisense NFKB1 complex-mediated expression regulator RNA ncRNA 150.333-10 chr1 93820044 93820401 + 0.666667 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) MER21C|LTR|ERVL -26610 NR_030621 100126348 NR_030621 ENSG00000211575 MIR760 MIRN760|hsa-mir-760|mir-760 microRNA 760 ncRNA 168.333-20 chr10 36054464 36054849 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 276354 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 126.333-6 chr1 95995889 95996159 + 0.666667 NA intron (NR_125991, intron 2 of 4) intron (NR_125991, intron 2 of 4) 3956 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 127.667-54 chr15 62670208 62670437 + 0.666667 NA intron (NM_015059, intron 6 of 55) intron (NM_015059, intron 6 of 55) 23011 NM_015059 83660 Hs.569438 NM_015059 ENSG00000171914 TLN2 ILWEQ talin 2 protein-coding 156.333-233 chr3 55071284 55071723 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 35 of 37) intron (NM_018398, intron 35 of 37) -104401 NM_001304389 57408 Hs.591668 NM_020678 ENSG00000144771 LRTM1 HT017 leucine rich repeats and transmembrane domains 1 protein-coding 151.333-221 chr2 127723317 127723661 + 0.666667 NA intron (NM_018383, intron 11 of 21) intron (NM_018383, intron 11 of 21) 21992 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 120.667-62 chr15 60034796 60035056 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30615 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 114.667-87 chr14 81508691 81508901 + 0.666667 NA intron (NM_005065, intron 3 of 20) intron (NM_005065, intron 3 of 20) 25057 NM_005065 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 201-94 chr5 102291128 102291499 + 0.666667 NA intron (NM_180991, intron 2 of 12) intron (NM_180991, intron 2 of 12) 4971 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 166.333-147 chr3 30227887 30228295 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -290777 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 191-32 chr2 82044900 82045186 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -578097 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 146.333-320 chr8 59244722 59245122 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 125712 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 149.667-400 chr8 90195888 90196171 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25459 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 136.667-174 chr8 90349001 90349281 + 0.666667 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) L1MC3|LINE|L1 127653 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 144-50 chr14 58347949 58348261 + 0.666667 NA intron (NM_002892, intron 15 of 23) intron (NM_002892, intron 15 of 23) -47825 NM_207377 387990 Hs.592307 NM_207377 ENSG00000196860 TOMM20L UNQ9438 translocase of outer mitochondrial membrane 20 like protein-coding 170.333-182 chr6 45690937 45691251 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 246503 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 222-84 chr7 4513602 4514124 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -168432 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 315.333-32 chr3 194272282 194273061 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22518 NR_125403 100505920 Hs.436654 NR_125403 ENSG00000225742 LINC02036 - long intergenic non-protein coding RNA 2036 ncRNA 206.333-39 chr12 98517822 98518149 + 0.666667 NA intron (NM_001032284, intron 1 of 5) AluSq10|SINE|Alu -1759 NR_027157 100128191 Hs.594042 NR_027157 ENSG00000257167 TMPO-AS1 - TMPO antisense RNA 1 ncRNA 225.333-82 chr2 175140104 175140631 + 0.666667 NA intron (NR_045773, intron 2 of 13) L1ME1|LINE|L1 27342 NR_030630 100126350 NR_030630 ENSG00000215973 MIR933 MIRN933|hsa-mir-933|mir-933 microRNA 933 ncRNA 167.333-43 chr10 61675299 61675723 + 0.666667 NA intron (NM_001366906, intron 2 of 7) intron (NM_001366906, intron 2 of 7) 12550 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 150.667-149 chr17 73658663 73659013 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -14393 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 186.333-98 chr3 41194797 41195194 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4510 NM_001098210 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 195.333-57 chr12 43146394 43146934 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -8651 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 162.667-62 chr12 69019361 69019796 + 0.666667 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -56338 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 120-151 chrX 151979822 151980111 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5290 NM_004961 2564 Hs.22785 NM_004961 ENSG00000102287 GABRE - gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit protein-coding 187.333-20 chr10 52295447 52295863 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_006258, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_006258, exon 18 of 18) 18473 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 133.333-84 chr2 148604190 148604550 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40381 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 141-26 chr14 41200950 41201298 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 246413 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 182.333-138 chr6 44915635 44916128 + 0.666667 NA intron (NM_001350324, intron 10 of 11) MER4B|LTR|ERV1 281889 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 139.667-101 chr20 1370721 1371000 + 0.666667 NA TTS (NM_054014) TTS (NM_054014) 22101 NR_106929 102465524 NR_106929 ENSG00000284436 MIR6869 hsa-mir-6869 microRNA 6869 ncRNA 163.667 chr1 38965639 38965963 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23971 NM_017821 54933 Hs.524626 NM_017821 ENSG00000158315 RHBDL2 RRP2 rhomboid like 2 protein-coding 182.333-53 chr15 48025803 48026198 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -94990 NM_205850 283652 Hs.710240 NM_205850 ENSG00000188467 SLC24A5 JSX|NCKX5|OCA6|SHEP4 solute carrier family 24 member 5 protein-coding 116-118 chr4 103245010 103245293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46808 NM_001286734 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 209.667-33 chr12 55121270 55121643 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8313 NM_001005243 441639 Hs.553827 NM_001005243 ENSG00000170605 OR9K2 OR12-2 olfactory receptor family 9 subfamily K member 2 protein-coding 152.333-335 chr6 65969123 65969441 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 181403 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 137.333-162 chr5 124014194 124014571 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 424138 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 135-2 chr1 29163711 29164027 + 0.666667 NA intron (NM_005626, intron 1 of 5) MIR3|SINE|MIR 18031 NM_005626 6429 Hs.469970 NM_005626 ENSG00000116350 SRSF4 SFRS4|SRP75 serine and arginine rich splicing factor 4 protein-coding 243.667-34 chr2 43053793 43054249 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -14478 NR_110585 102723854 Hs.570165 NR_110585 ENSG00000231826 LINC01819 - long intergenic non-protein coding RNA 1819 ncRNA 124-37 chr14 72963384 72963717 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 23406 NM_178441 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 143.333-224 chr5 57908591 57908931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9599 NR_109900 101928539 Hs.639385 NR_109900 ENSG00000249584 LINC02225 - long intergenic non-protein coding RNA 2225 ncRNA 178-53 chr17 39038618 39039031 + 0.666667 NA intron (NR_033753, intron 2 of 4) FLAM_C|SINE|Alu 8918 NR_033753 342666 Hs.129645 NM_198502 ENSG00000214553 LRRC37A11P LRRC37F leucine rich repeat containing 37 member A11, pseudogene pseudo 189-57 chr22 38023613 38024018 + 0.666667 NA intron (NM_001301130, intron 5 of 5) AluSx|SINE|Alu -33440 NM_001039584 9463 Hs.180871 NM_012407 ENSG00000100151 PICK1 PICK|PRKCABP protein interacting with PRKCA 1 protein-coding 127-5 chr1 43140584 43140923 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7151 NM_001101376 440585 Hs.657614 NM_001101376 ENSG00000186973 FAM183A - family with sequence similarity 183 member A protein-coding 119.333-14 chr1 172956833 172957130 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 93982 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 158-53 chr15 83083835 83084160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16662 NR_039740 100616404 NR_039740 ENSG00000263643 MIR4515 mir-4515 microRNA 4515 ncRNA 155.667-316 chr6 144609310 144609709 + 0.666667 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) L1MA7|LINE|L1 203854 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 133.333-152 chr5 130672623 130672983 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 492453 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 129.333-130 chr3 107726719 107726933 + 0.666667 NA intron (NM_001276286, intron 5 of 16) L2a|LINE|L2 151242 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 233-57 chr6 41944040 41944681 + 0.666667 NA intron (NM_001136017, intron 1 of 4) intron (NM_001136017, intron 1 of 4) -2512 NM_001760 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 177.667-46 chr14 56103682 56104110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14515 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 145-17 chr11 87299749 87300079 + 0.666667 NA intron (NR_033149, intron 6 of 13) intron (NR_033149, intron 6 of 13) 261980 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 128.667-37 chr11 104860043 104860324 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 38487 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 112.333-153 chr22 23123631 23123882 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002073, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_002073, exon 3 of 3) 18234 NM_014433 27156 Hs.526920 NM_014433 ENSG00000100218 RSPH14 RTDR1 radial spoke head 14 homolog protein-coding 197.333-55 chr12 108447042 108447477 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26430 NR_120483 102723562 Hs.455693 NR_120483 ENSG00000247213 LINC01498 - long intergenic non-protein coding RNA 1498 ncRNA 113-48 chr13 27958747 27958952 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5323 NR_135254 100132234 Hs.197435 NR_135254 ENSG00000260704 LINC00543 - long intergenic non-protein coding RNA 543 ncRNA 157.667-171 chr20 54759272 54759675 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 283880 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 194.667-39 chr14 57276667 57277219 + 0.666667 NA intron (NM_018229, intron 2 of 7) intron (NM_018229, intron 2 of 7) 7972 NM_018229 55745 Hs.597349 NM_018229 ENSG00000053770 AP5M1 C14orf108|MUDENG|Mu5|MuD adaptor related protein complex 5 subunit mu 1 protein-coding 148-165 chr9 4020788 4021166 + 0.666667 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) intron (NM_001042413, intron 4 of 10) 122331 NR_026663 84850 Hs.676113 NM_032764 ENSG00000237009 GLIS3-AS1 C9orf70 GLIS3 antisense RNA 1 ncRNA 172-110 chr8 129308837 129309347 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -67852 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 256-14 chr10 121186200 121186757 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 335116 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 122-91 chr5 21854441 21854672 + 0.666667 NA intron (NM_001317228, intron 4 of 11) intron (NM_001317228, intron 4 of 11) -29898 NR_132787 106635539 NR_132787 SNORA105A - small nucleolar RNA, H/ACA box 105A snoRNA 131-19 chr11 105104712 105104945 + 0.666667 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 -3397 NM_001007232 440068 Hs.732627 NM_001007232 ENSG00000255221 CARD17 INCA caspase recruitment domain family member 17 protein-coding 155.333-351 chr7 6522382 6522681 + 0.666667 NA intron (NM_001145118, intron 4 of 21) AluJb|SINE|Alu 28905 NM_001145118 392862 Hs.512174 NM_001145118 ENSG00000215045 GRID2IP DELPHILIN Grid2 interacting protein protein-coding 119.333-86 chr14 61997965 61998220 + 0.666667 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) MIR|SINE|MIR 70397 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 143.667-186 chr4 82163955 82164235 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 209896 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 145.667-270 chr7 80424020 80424296 + 0.666667 NA Intergenic MLT2C2|LTR|ERVL -49719 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 151.667-387 chr9 22749121 22749440 + 0.666667 NA intron (NR_038977, intron 4 of 5) AluSc|SINE|Alu 103080 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 123 chr1 27633487 27633737 + 0.666667 NA intron (NM_005248, intron 1 of 12) AluJr|SINE|Alu 1573 NM_005248 2268 Hs.1422 NM_005248 ENSG00000000938 FGR SRC2|c-fgr|c-src2|p55-Fgr|p55c-fgr|p58-Fgr|p58c-fgr FGR proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 117-70 chr18 8994960 8995262 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -107588 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 119.667-31 chr11 64567017 64567355 + 0.666667 NA intron (NM_001307985, intron 6 of 7) intron (NM_001307985, intron 6 of 7) 11245 NM_018484 55867 Hs.220844 NM_018484 ENSG00000168065 SLC22A11 OAT4|hOAT4 solute carrier family 22 member 11 protein-coding 130-5 chr1 154772709 154772933 + 0.666667 NA intron (NM_170782, intron 2 of 7) MER21C|LTR|ERVL 87055 NM_170782 3782 Hs.490765 NM_002249 ENSG00000143603 KCNN3 KCa2.3|SK3|SKCA3|hSK3 potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 protein-coding 112.333-143 chr2 213706857 213707028 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -51125 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 112.333-16 chr1 247757293 247757538 + 0.666667 NA TTS (NM_012353) TTS (NM_012353) 991 NM_012353 26188 Hs.381306 NM_012353 ENSG00000221888 OR1C1 HSTPCR27|OR1-42|OR1.5.10|ORL211|TPCR27 olfactory receptor family 1 subfamily C member 1 protein-coding 157-89 chr3 79895670 79895992 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127833 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 198.333-9 chr1 82751000 82751382 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -151992 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 127.333-118 chr3 127705809 127706021 + 0.666667 NA intron (NM_001256585, intron 5 of 6) L1M3|LINE|L1 32963 NM_172027 80325 Hs.107812 NM_032548 ENSG00000114626 ABTB1 BPOZ|BTB3|BTBD21|EF1ABP|PP2259 ankyrin repeat and BTB domain containing 1 protein-coding 156.333-80 chr12 65136409 65136795 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -15297 NM_007191 11197 Hs.284122 NM_007191 ENSG00000156076 WIF1 WIF-1 WNT inhibitory factor 1 protein-coding 118-63 chr19 37511312 37511577 + 0.666667 NA intron (NM_001013659, intron 2 of 7) AluSg|SINE|Alu -4357 NR_110723 101927720 Hs.18070 NR_110723 ENSG00000266916 ZNF793-AS1 - ZNF793 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 136.667-17 chr10 51184088 51184336 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 109725 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 125.333-76 chr18 4762614 4762941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -307470 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 202.333-77 chr17 81855483 81855923 + 0.666667 NA intron (NM_000918, intron 2 of 10) intron (NM_000918, intron 2 of 10) 4832 NM_000918 5034 Hs.464336 NM_000918 ENSG00000185624 P4HB CLCRP1|DSI|ERBA2L|GIT|P4Hbeta|PDI|PDIA1|PHDB|PO4DB|PO4HB|PROHB prolyl 4-hydroxylase subunit beta protein-coding 178.667-155 chr7 100683589 100683974 + 0.666667 NA intron (NM_022574, intron 16 of 23) intron (NM_022574, intron 16 of 23) 5667 NM_022574 64599 Hs.414396 NM_022574 ENSG00000146830 GIGYF1 GYF1|PERQ1 GRB10 interacting GYF protein 1 protein-coding 134-55 chr20 5756241 5756604 + 0.666667 NA intron (NM_152504, intron 1 of 2) L1M4|LINE|L1 6021 NM_001303479 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 134.333-72 chr17 51417493 51417695 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17833 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 150-156 chr9 28522745 28523065 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 196400 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 197.667-15 chr1 233313186 233313602 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14330 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 158-72 chr2 110849177 110849477 + 0.666667 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) intron (NM_001371254, intron 10 of 18) 116754 NM_001371254 117.333-161 chr4 165573093 165573363 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -111411 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 125-98 chr6 71061367 71061594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104420 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 160.667-102 chr15 48109367 48109783 + 0.666667 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy -11415 NM_205850 283652 Hs.710240 NM_205850 ENSG00000188467 SLC24A5 JSX|NCKX5|OCA6|SHEP4 solute carrier family 24 member 5 protein-coding 152.667-219 chr20 8494754 8495072 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) intron (NM_182734, intron 3 of 32) 246209 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 176-107 chr9 7390970 7391384 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 408601 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 155.333-154 chr19 48571969 48572270 + 0.666667 NA intron (NM_177973, intron 1 of 6) intron (NM_177973, intron 1 of 6) -3617 NM_004605 6820 Hs.369331 NM_004605 ENSG00000088002 SULT2B1 ARCI14|HSST2 sulfotransferase family 2B member 1 protein-coding 147.333-285 chr6 163203634 163203935 + 0.666667 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) intron (NM_001080379, intron 4 of 4) -11782 NR_122120 729658 Hs.728991 NR_122120 PACRG-AS3 - PACRG antisense RNA 3 ncRNA 116.333-111 chr2 33595771 33595972 + 0.666667 NA intron (NM_015475, intron 1 of 7) intron (NM_015475, intron 1 of 7) 3428 NM_015475 25940 Hs.468140 NM_015475 ENSG00000119812 FAM98A - family with sequence similarity 98 member A protein-coding 131.333-144 chr5 92070949 92071252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -687783 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 121.667-195 chr7 98828448 98828658 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 41461 NM_001134450 222865 Hs.270753 NM_152913 ENSG00000166448 TMEM130 - transmembrane protein 130 protein-coding 155-61 chr2 38582936 38583253 + 0.666667 NA intron (NM_138394, intron 4 of 12) intron (NM_138394, intron 4 of 12) 19834 NM_138394 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 120.333-26 chr10 114811935 114812139 + 0.666667 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL -9743 NM_020940 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 202.667-138 chr7 84658788 84659170 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 126503 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 229-36 chr20 8902751 8903199 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 71790 NR_004386 26767 NR_004386 ENSG00000201348 RNU105B 105B|E1-2 RNA, U105B small nucleolar snoRNA 187.333-16 chr1 238083174 238083574 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -192452 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 132.667-105 chr3 41477270 41477546 + 0.666667 NA intron (NR_136342, intron 30 of 34) intron (NR_136342, intron 30 of 34) 277903 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 147.333-71 chr11 98415164 98415453 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -605641 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 187.667-136 chr7 86762205 86762522 + 0.666667 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 118449 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 117.333-221 chr9 68629964 68630215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75151 NM_003558 8395 Hs.534371 NM_003558 ENSG00000107242 PIP5K1B MSS4|STM7 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase type 1 beta protein-coding 141.333-47 chr12 41692518 41692933 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71464 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 203.667-19 chr11 68408717 68409173 + 0.666667 NA intron (NM_002335, intron 9 of 22) AluJb|SINE|Alu -51807 NM_001352361 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 173-25 chr14 68260542 68261007 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) MER34|LTR|ERV1 368013 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 283.667-28 chr5 38216179 38216805 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42067 NM_152403 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 115.333-138 chr3 58049360 58049696 + 0.666667 NA intron (NM_001164318, intron 1 of 45) intron (NM_001164318, intron 1 of 45) 41106 NM_001164319 2317 Hs.476448 NM_001457 ENSG00000136068 FLNB ABP-278|ABP-280|AOI|FH1|FLN-B|FLN1L|LRS1|SCT|TABP|TAP filamin B protein-coding 166-41 chr14 47751197 47751595 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9708 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 163-49 chr20 7687840 7688192 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 252442 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 166-100 chr6 62322026 62322390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35981 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 143.333-152 chr2 234170060 234170357 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 119506 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 125-57 chr2 78891492 78891712 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -134100 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 114.333-26 chr10 55299960 55300221 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -298952 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 197.667-91 chr3 148310887 148311298 + 0.666667 NA intron (NR_146712, intron 2 of 4) intron (NR_146712, intron 2 of 4) 30201 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 179.333-138 chr4 73531174 73531548 + 0.666667 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 22558 NR_046377 728040 Hs.640574 NR_046377 ENSG00000250436 LINC02499 - long intergenic non-protein coding RNA 2499 ncRNA 178-13 chr1 203921576 203921915 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 59898 NM_001328637 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 112.667-245 chr7 25575124 25575423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 87867 NR_157826 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 153.333-328 chr5 36928192 36928633 + 0.666667 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) intron (NM_015384, intron 1 of 45) 51643 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 194.667-88 chr3 2873968 2874476 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 8 of 24) intron (NM_175607, intron 8 of 24) -17993 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 170-71 chr20 52540251 52540586 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -80420 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 169.667-30 chr11 23656910 23657368 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -237949 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 138-116 chr8 92777246 92777606 + 0.666667 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) L1MB8|LINE|L1 8634 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 131-57 chr20 62233893 62234240 + 0.666667 NA intron (NR_160555, intron 2 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -4455 NM_001278649 9885 Hs.473254 NM_014835 ENSG00000130703 OSBPL2 DFNA67|DNFA67|ORP-2|ORP2 oxysterol binding protein like 2 protein-coding 127-48 chr2 75271579 75271877 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -72208 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 150-102 chr4 59510580 59510970 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 497202 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 124-66 chr2 150050918 150051136 + 0.666667 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -191836 NR_145421 150596 Hs.470217 NM_153041 ENSG00000162947 LINC01931 - long intergenic non-protein coding RNA 1931 ncRNA 141.667-37 chr10 111172394 111172677 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 58244 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 148.667-354 chr7 67794808 67795103 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -225298 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 114-56 chr17 69304793 69305105 + 0.666667 NA intron (NM_018672, intron 5 of 37) intron (NM_018672, intron 5 of 37) 10684 NM_018672 23461 Hs.731824 NM_018672 ENSG00000154265 ABCA5 ABC13|EST90625|HTC3 ATP binding cassette subfamily A member 5 protein-coding 179.667-131 chr8 50465221 50465625 + 0.666667 NA intron (NR_135797, intron 8 of 20) L1MC3|LINE|L1 301292 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 178.667-103 chr3 86367998 86368417 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -113736 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 128.333-95 chr2 44490750 44490984 + 0.666667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 128920 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 194.667-77 chr2 166523488 166523983 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -36764 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 155 chr1 44254611 44254901 + 0.666667 NA intron (NM_001301698, intron 6 of 7) L2c|LINE|L2 -2197 NR_132966 106635545 NR_132966 SNORA110 - small nucleolar RNA, H/ACA box 110 snoRNA 129.333-42 chr12 11765200 11765522 + 0.666667 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) intron (NM_001987, intron 2 of 7) 115507 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 203.333-78 chr14 55583440 55583876 + 0.666667 NA intron (NM_004986, intron 1 of 41) L2a|LINE|L2 3451 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 155.333-324 chr6 35958151 35958474 + 0.666667 NA intron (NM_001193476, intron 16 of 19) AluSx|SINE|Alu -37132 NR_034069 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 155.333-124 chr16 19617045 19617350 + 0.666667 NA intron (NM_020314, intron 14 of 30) AluJr|SINE|Alu 61494 NR_158161 57020 Hs.654964 NM_020314 ENSG00000103544 VPS35L C16orf62 VPS35 endosomal protein sorting factor like protein-coding 119.667-73 chr17 56194581 56194870 + 0.666667 NA intron (NM_001365758, intron 2 of 20) L1MC1|LINE|L1 41250 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 183-35 chr14 32144474 32144904 + 0.666667 NA intron (NM_001030055, intron 3 of 6) AluSx1|SINE|Alu -57356 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 114-2 chr1 12291208 12291433 + 0.666667 NA intron (NM_015378, intron 23 of 69) intron (NM_015378, intron 23 of 69) 61290 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 182.333-172 chr9 137313389 137313769 + 0.666667 NA intron (NM_017820, intron 19 of 21) intron (NM_017820, intron 19 of 21) -11308 NM_001004354 441478 Hs.535075 NM_001004354 ENSG00000198435 NRARP - NOTCH regulated ankyrin repeat protein protein-coding 150.667-231 chr3 13077166 13077475 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3891 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 113.667-140 chr3 99755727 99756059 + 0.666667 NA intron (NM_001850, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -61969 NM_032359 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 112.667-98 chr17 70988002 70988175 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 214091 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 125.333-154 chr6 46631952 46632188 + 0.666667 NA intron (NM_016593, intron 5 of 11) MIR|SINE|MIR 20748 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 119-40 chr13 50707644 50707947 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -100060 NR_046551 100874074 Hs.734030 NR_046551 ENSG00000176124 DLEU7-AS1 - DLEU7 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-223 chr20 41518065 41518496 + 0.666667 NA intron (NM_032221, intron 3 of 36) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 100097 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 130-62 chr2 209464914 209465216 + 0.666667 NA intron (NM_001039538, intron 1 of 14) intron (NM_001039538, intron 1 of 14) 41018 NM_001363910 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 150.333-301 chr4 66163704 66164110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -112917 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 165.333-29 chr10 67201223 67201616 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 6 of 17) UCON1|Unknown|Unknown 189153 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 228-56 chr3 86729098 86729625 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 247418 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 159.667-22 chr1 150151054 150151372 + 0.666667 NA intron (NM_016274, intron 2 of 5) intron (NM_016274, intron 2 of 5) 627 NM_001304723 51177 Hs.438824 NM_016274 ENSG00000023902 PLEKHO1 CKIP-1|CKIP1|JBP|OC120 pleckstrin homology domain containing O1 protein-coding 128.333-44 chr12 3874729 3874982 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1407 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 114-4 chr1 37232175 37232384 + 0.666667 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 70716 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 243-70 chr8 93185026 93185717 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -18521 NR_161372 389676 Hs.386711 NR_161372 C8orf87 - chromosome 8 open reading frame 87 ncRNA 127.333-157 chr6 76155726 76155949 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -83159 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 146.333-203 chr3 43118551 43118939 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12666 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 112.667-197 chr4 104306088 104306316 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -184763 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 156-26 chr11 32441675 32442034 + 0.666667 NA intron (NR_120548, intron 1 of 4) intron (NR_120548, intron 1 of 4) 5815 NR_120546 51352 Hs.567499 NM_015855 ENSG00000183242 WT1-AS WIT-1|WIT1|WT1-AS1|WT1AS WT1 antisense RNA ncRNA 224-22 chr14 52273553 52274022 + 0.666667 NA intron (NM_001281469, intron 2 of 2) intron (NM_001281469, intron 2 of 2) 6089 NM_000953 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 116.333-15 chr1 160067955 160068274 + 0.666667 NA intron (NM_002241, intron 1 of 1) intron (NM_002241, intron 1 of 1) 2046 NM_002241 3766 Hs.408960 NM_002241 ENSG00000177807 KCNJ10 BIRK-10|KCNJ13-PEN|KIR1.2|KIR4.1|SESAME potassium voltage-gated channel subfamily J member 10 protein-coding 120-144 chr9 28402540 28402756 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) (CTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 316657 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 115-9 chr1 116292670 116292988 + 0.666667 NA Intergenic (ATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -80415 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 138.333-209 chr9 81108374 81108632 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 581032 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 129-95 chr4 170197347 170197562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29137 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 163.333-228 chr5 120298864 120299206 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -165243 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 148.333-269 chr4 7445679 7445959 + 0.666667 NA intron (NM_020777, intron 2 of 26) intron (NM_020777, intron 2 of 26) -10889 NM_001085382 768239 Hs.662523 NM_001085382 ENSG00000178597 PSAPL1 - prosaposin like 1 (gene/pseudogene) protein-coding 116.333-210 chr8 113966601 113966886 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -529804 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 114-134 chr6 50034071 50034255 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -12169 NM_001037497 245913 Hs.571093 NM_001037497 ENSG00000203970 DEFB110 DEFB-10|DEFB-11|DEFB111 defensin beta 110 protein-coding 229.667-72 chr6 149799670 149800075 + 0.666667 NA intron (NM_001360452, intron 6 of 7) HAL1|LINE|L1 50131 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 112.667-8 chr1 111251608 111251886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22011 NM_001025199 1117 Hs.514840 NM_004000 ENSG00000064886 CHI3L2 CHIL2|YKL-39|YKL39 chitinase 3 like 2 protein-coding 182.667-32 chr12 72401180 72401604 + 0.666667 NA intron (NM_013381, intron 3 of 18) MIR|SINE|MIR -127883 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 120-91 chr3 162040622 162040907 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 543956 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 158.333 chr1 4312263 4312576 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -99632 NR_027088 284661 Hs.278112 NR_027088 ENSG00000235054 LINC01777 - long intergenic non-protein coding RNA 1777 ncRNA 144.667-106 chr16 50162941 50163249 + 0.666667 NA intron (NM_001365324, intron 1 of 11) intron (NM_001365324, intron 1 of 11) 9614 NM_001365324 64282 Hs.514342 NM_022447 ENSG00000121274 TENT4B PAPD5|TRF4-2|TUT3 terminal nucleotidyltransferase 4B protein-coding 137.333-36 chr12 69409195 69409492 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 49600 NM_006530 8089 Hs.4029 NM_006530 ENSG00000127337 YEATS4 4930573H17Rik|B230215M10Rik|GAS41|NUBI-1|YAF9 YEATS domain containing 4 protein-coding 125.667-173 chr7 20560124 20560437 + 0.666667 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -55387 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 158-125 chr7 36510335 36510750 + 0.666667 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 89578 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 202.666 chr1 48184515 48185102 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -2380 NR_026749 391037 Hs.585393 NR_026749 SKINT1L BTN12|SKINT1|SKINTL|SKINTP Skint1 like (pseudogene) pseudo 133.333-153 chr5 132461493 132461871 + 0.666667 NA intron (NR_161242, intron 3 of 3) L1MB4|LINE|L1 29091 NR_149069 3659 Hs.436061 NM_002198 ENSG00000125347 IRF1 IRF-1|MAR interferon regulatory factor 1 protein-coding 115-94 chr2 162981125 162981436 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142513 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 121.667-25 chr10 65600961 65601281 + 0.666667 NA intron (NR_120647, intron 2 of 5) L1PA13|LINE|L1 29696 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 123.667-80 chr2 7893806 7894063 + 0.666667 NA intron (NR_110256, intron 3 of 5) MER39B|LTR|ERV1 5721 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 162-10 chr10 16444325 16444757 + 0.666667 NA intron (NM_001261837, intron 2 of 4) intron (NM_001261837, intron 2 of 4) 7598 NM_001261838 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 229-46 chr4 55034766 55035316 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90554 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 131.333-126 chr4 46886875 46887180 + 0.666667 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) intron (NM_130902, intron 1 of 2) 22218 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 195.667-93 chr3 107574830 107575272 + 0.666667 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) intron (NM_001276286, intron 2 of 16) 52089 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 115.667-194 chr6 103574981 103575259 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 1284426 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 125-75 chr3 114776705 114776939 + 0.666667 NA intron (NM_001164343, intron 4 of 11) intron (NM_001164343, intron 4 of 11) -17715 NM_001164344 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 137.667-15 chr1 213377960 213378308 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 326893 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 202.667-34 chr11 106103324 106103795 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -25821 NM_152433 143879 Hs.101949 NM_152433 ENSG00000182359 KBTBD3 BKLHD3 kelch repeat and BTB domain containing 3 protein-coding 141.667-222 chr8 74423120 74423385 + 0.666667 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 72849 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 113.333-95 chr16 69797302 69797543 + 0.666667 NA intron (NM_001270455, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 35090 NM_007014 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 115.667-102 chr18 2512071 2512287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 59326 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 188.667-68 chr2 14516708 14517140 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115793 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 118.667-90 chr18 26617218 26617508 + 0.666667 NA intron (NM_001258222, intron 1 of 4) intron (NM_001258222, intron 1 of 4) 22981 NM_198991 284252 Hs.526630 NM_198991 ENSG00000134504 KCTD1 C18orf5 potassium channel tetramerization domain containing 1 protein-coding 138.333-32 chr10 83629879 83630251 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 47024 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 136-57 chr20 18204185 18204478 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 59232 NR_028402 57325 Hs.488051 NM_020536 ENSG00000149474 KAT14 ATAC2|CRP2BP|CSRP2BP|PRO1194|dJ717M23.1 lysine acetyltransferase 14 protein-coding 131.667-5 chr1 57900245 57900531 + 0.666667 NA intron (NM_021080, intron 1 of 16) intron (NM_021080, intron 1 of 16) 39807 NR_104363 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 139.667-46 chr13 55143565 55143950 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -30697 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 142.333-36 chr11 11662835 11663100 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6245 NR_036184 100423026 NR_036184 ENSG00000266645 MIR4299 - microRNA 4299 ncRNA 134.667-99 chr2 69377459 69377849 + 0.666667 NA intron (NM_002056, intron 1 of 18) AluSx3|SINE|Alu 9573 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 120-23 chr11 85250147 85250387 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 4 of 27) intron (NM_001142699, intron 4 of 27) -326846 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 193.333-186 chr8 73472938 73473336 + 0.666667 NA intron (NM_001164383, intron 8 of 9) intron (NM_001164383, intron 8 of 9) 53063 NR_038406 100128126 Hs.679921 NR_038406 ENSG00000253302 STAU2-AS1 - STAU2 antisense RNA 1 ncRNA 146.667-57 chr11 67120851 67121275 + 0.666667 NA intron (NR_027473, intron 1 of 20) intron (NR_027473, intron 1 of 20) 1800 NM_012308 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 113-13 chr1 187786938 187787125 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 343403 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 173.333-160 chr5 86922730 86923059 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 176076 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 126-17 chr11 106075276 106075546 + 0.666667 NA intron (NM_152433, intron 1 of 2) intron (NM_152433, intron 1 of 2) 1936 NM_198439 143879 Hs.101949 NM_152433 ENSG00000182359 KBTBD3 BKLHD3 kelch repeat and BTB domain containing 3 protein-coding 191.333-179 chr6 125787304 125787652 + 0.666667 NA intron (NM_001199619, intron 2 of 16) intron (NM_001199619, intron 2 of 16) -3482 NM_001199621 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 157-118 chr6 150562229 150562580 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -37481 NM_001329804 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 125.333-19 chr10 24365497 24365726 + 0.666667 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) -83803 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 118-73 chr2 213991854 213992120 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 11 of 14) intron (NR_047660, intron 11 of 14) 233920 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 193.667-138 chr8 119643633 119644036 + 0.666667 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) L2b|LINE|L2 -4995 NM_001040092 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 190.333-60 chr18 8653230 8653586 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 43963 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 216-49 chr18 13743646 13744128 + 0.666667 NA intron (NM_003799, intron 8 of 11) intron (NM_003799, intron 8 of 11) 17214 NM_003799 8731 Hs.592347 NM_003799 ENSG00000101654 RNMT CMT1|CMT1c|MET|Met|RG7MT1|cm1p|hCMT1|hMet RNA guanine-7 methyltransferase protein-coding 115.667-62 chr12 124606158 124606370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38652 NM_001206654 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 115-11 chr1 158607335 158607624 + 0.666667 NA TTS (NM_001004478) TTS (NM_001004478) 1040 NM_001004478 128368 Hs.553590 NM_001004478 ENSG00000198967 OR10Z1 OR1-15 olfactory receptor family 10 subfamily Z member 1 protein-coding 134.333-187 chr9 93282182 93282477 + 0.666667 NA intron (NM_001282394, intron 19 of 29) L1MB1|LINE|L1 63974 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 230.667-83 chr8 18582070 18582601 + 0.666667 NA intron (NM_015310, intron 12 of 15) L2c|LINE|L2 191053 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 149.667-235 chr20 44699898 44700178 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -14806 NM_001323370 8839 Hs.592145 NM_003881 ENSG00000064205 CCN5 CT58|CTGF-L|WISP2 cellular communication network factor 5 protein-coding 130-137 chrX 64726741 64726989 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 249585 NM_018684 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 116.333-130 chr20 58720985 58721252 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 28318 NM_024663 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 167.333-233 chr6 123492967 123493341 + 0.666667 NA intron (NM_001256020, intron 8 of 8) intron (NM_001256020, intron 8 of 8) 53550 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 157.333-35 chr1 206880272 206880590 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 14622 NM_018724 50604 Hs.272373 NM_018724 ENSG00000162891 IL20 IL-20|IL10D|ZCYTO10 interleukin 20 protein-coding 139.333-196 chr6 165249544 165249811 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 59928 NM_144980 168090 Hs.144734 NM_144980 ENSG00000112539 C6orf118 bA85G2.1|dJ416F21.2 chromosome 6 open reading frame 118 protein-coding 119.667-67 chr17 26885334 26885543 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 203803 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 113.333-207 chr5 45149126 45149319 + 0.666667 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 340275 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 139-66 chr3 133013655 133013974 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -24474 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 155.667-6 chr1 23346240 23346533 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2102 NM_001102397 10236 Hs.373763 NM_005826 ENSG00000125944 HNRNPR HNRPR|hnRNP-R heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R protein-coding 171.333-47 chr14 50996447 50996789 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_052978, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_052978, exon 7 of 7) -52135 NM_002863 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 239-53 chr4 170365877 170366553 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 139624 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 177.667-133 chr8 76809183 76809681 + 0.666667 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -126157 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 138-61 chr2 186843929 186844185 + 0.666667 NA intron (NM_182521, intron 3 of 8) intron (NM_182521, intron 3 of 8) 5113 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 200.333-37 chr13 98982870 98983331 + 0.666667 NA intron (NM_015296, intron 1 of 55) intron (NM_015296, intron 1 of 55) -5036 NM_001130050 23348 Hs.596105 NM_015296 ENSG00000088387 DOCK9 ZIZ1|ZIZIMIN1 dedicator of cytokinesis 9 protein-coding 115.333-120 chr2 196276709 196276991 + 0.666667 NA intron (NM_020760, intron 15 of 28) intron (NM_020760, intron 15 of 28) 16826 NR_110226 101927482 Hs.191841 NR_110225 HECW2-AS1 - HECW2 antisense RNA 1 ncRNA 138.667-70 chr15 52574206 52574486 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -4900 NM_001306191 10776 Hs.512908 NM_006628 ENSG00000128989 ARPP19 ARPP-16|ARPP-19|ARPP16|ENSAL cAMP regulated phosphoprotein 19 protein-coding 165-57 chr3 148227936 148228328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52759 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 127-87 chr6 167290222 167290551 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001143947) promoter-TSS (NM_001143947) -929 NM_001143947 54346 Hs.567508 NM_018974 ENSG00000112494 UNC93A Unc-93A|dJ366N23.1|dJ366N23.2 unc-93 homolog A protein-coding 148.667-390 chr8 126792686 126793085 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -220269 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 148-93 chr20 63076635 63077021 + 0.666667 NA intron (NR_033370, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 -24464 NR_003244 768096 Hs.549606 NR_003244 HAR1A HAR1F|LINC00064|NCRNA00064 highly accelerated region 1A ncRNA 134.667-35 chr11 83500690 83500988 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 21 of 27) intron (NM_001142699, intron 21 of 27) 181586 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 121-9 chr1 217148860 217149127 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -11291 NM_001243510 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 135-61 chr3 24183806 24184061 + 0.666667 NA intron (NR_121667, intron 3 of 3) (TCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 32609 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 343.333-21 chr4 165840099 165840770 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32803 NM_001204760 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 162-7 chr1 215020373 215020696 + 0.666667 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) AluSx3|SINE|Alu 14992 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 170.333-32 chr10 72527365 72527711 + 0.666667 NA intron (NM_001363513, intron 5 of 12) AluJo|SINE|Alu -3552 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 112.667-162 chr22 20258106 20258277 + 0.666667 NA intron (NM_023004, intron 1 of 1) intron (NM_023004, intron 1 of 1) -8980 NR_031618 100302118 NR_031618 ENSG00000221039 MIR1286 MIRN1286|hsa-mir-1286|mir-1286 microRNA 1286 ncRNA 116.333-142 chr3 56238933 56239150 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) intron (NR_132749, intron 3 of 17) 229426 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 112.333-47 chr12 10410304 10410620 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_013431) promoter-TSS (NM_013431) -316 NM_001199805 100528032 Hs.387787 NM_001199805 KLRC4-KLRK1 - KLRC4-KLRK1 readthrough protein-coding 138.333-51 chr12 105352692 105353039 + 0.666667 NA intron (NM_001145199, intron 2 of 5) intron (NM_001145199, intron 2 of 5) 22174 NM_001145199 387882 Hs.368938 NM_207376 ENSG00000235162 C12orf75 AGD3|OCC-1|OCC1 chromosome 12 open reading frame 75 protein-coding 170.333-45 chr11 47423646 47424060 + 0.666667 NA intron (NM_002804, intron 6 of 11) MIRc|SINE|MIR 2620 NM_002804 5702 Hs.250758 NM_002804 ENSG00000165916 PSMC3 TBP1 proteasome 26S subunit, ATPase 3 protein-coding 112-195 chr8 31344885 31345114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -294753 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 179.333-104 chr2 157284510 157284876 + 0.666667 NA intron (NM_001329868, intron 3 of 10) intron (NM_001329868, intron 3 of 10) 26988 NM_014568 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 217.333-161 chr9 27919857 27920245 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -346185 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 152.333-178 chr2 57726669 57727082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -180776 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 150.667-280 chr4 135740407 135740748 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 147516 NR_103762 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 151-110 chr5 121185859 121186173 + 0.666667 NA Intergenic (TTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -136534 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 163-5 chr1 180676198 180676536 + 0.666667 NA intron (NR_137330, intron 1 of 12) intron (NR_137330, intron 1 of 12) 44345 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 120.667-113 chr3 32415219 32415538 + 0.666667 NA intron (NM_138410, intron 1 of 4) intron (NM_138410, intron 1 of 4) 23525 NM_138410 112616 Hs.440494 NM_138410 ENSG00000153551 CMTM7 CKLFSF7 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 7 protein-coding 126.667-113 chr3 144295856 144296145 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 322919 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 209.333-183 chr5 24920546 24921046 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -80213 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 222.333-45 chr2 77993118 77993642 + 0.666667 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -38354 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 115.333-7 chr1 82737738 82738032 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -165298 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 170.333-113 chr2 124814811 124815195 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 19 of 23) intron (NM_130773, intron 19 of 23) 789716 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 113-117 chr2 215634201 215634448 + 0.666667 NA intron (NR_037195, intron 5 of 9) L1PA15|LINE|L1 -83719 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 188.667-121 chr5 37142582 37142945 + 0.666667 NA intron (NM_023073, intron 42 of 51) L1MEd|LINE|L1 -106283 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 153.333-427 chr8 116521739 116522036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -130213 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 151.333-259 chr22 25750465 25750820 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 1 of 43) intron (NM_001318245, intron 1 of 43) 8454 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 114.667-258 chr9 28315921 28316205 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) MIR|SINE|MIR 403242 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 152-7 chr1 104980201 104980545 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 638562 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 128-93 chr5 82656228 82656497 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -183793 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 150.667-401 chr9 112300328 112300702 + 0.666667 NA intron (NM_001244896, intron 1 of 12) AluY|SINE|Alu 32511 NM_001244898 9991 Hs.269988 NM_005156 ENSG00000119314 PTBP3 ROD1 polypyrimidine tract binding protein 3 protein-coding 193.667-114 chr6 71876175 71876582 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10325 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 161.667-27 chr10 70254028 70254492 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_022146, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_022146, exon 4 of 4) -20831 NM_021129 5464 Hs.437403 NM_021129 ENSG00000180817 PPA1 HEL-S-66p|IOPPP|PP|PP1|SID6-8061 pyrophosphatase (inorganic) 1 protein-coding 159.333-81 chr13 79808937 79809385 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 4775 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 226.666-16 chr16 14081242 14081881 + 0.666667 NA intron (NM_001308142, intron 2 of 16) AluSq2|SINE|Alu 10242 NM_001365417 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 114-168 chr8 101419053 101419237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 50252 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 111.667-257 chr8 87771548 87771796 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 102343 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 133-87 chr7 50164332 50164601 + 0.666667 NA Intergenic (TTTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 68380 NM_001161834 100130988 Hs.99248 NM_001161834 ENSG00000164500 SPATA48 C7orf72 spermatogenesis associated 48 protein-coding 154.667-71 chr12 12930002 12930407 + 0.666667 NA intron (NR_149067, intron 1 of 2) MER91A|DNA|hAT-Tip100 2478 NR_149064 100506314 Hs.127718 NR_038920 ENSG00000247498 GPRC5D-AS1 - GPRC5D and HEBP1 antisense RNA 1 ncRNA 178-63 chr2 54841921 54842287 + 0.666667 NA intron (NM_001039753, intron 6 of 40) L1MC1|LINE|L1 117092 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 127.667-2 chr1 45033830 45034042 + 0.666667 NA intron (NM_020883, intron 11 of 13) AluY|SINE|Alu 21682 NR_158185 7389 Hs.78601 NM_000374 ENSG00000126088 UROD PCT|UPD uroporphyrinogen decarboxylase protein-coding 158.333-195 chr3 24357297 24357749 + 0.666667 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) L1ME4b|LINE|L1 -136564 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 153.333-312 chr4 148075491 148075889 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 293095 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 157-87 chr3 65928760 65929225 + 0.666667 NA intron (NR_145422, intron 1 of 2) intron (NR_145422, intron 1 of 2) 25566 NR_145422 151877 Hs.476636 NR_145422 ENSG00000272610 MAGI1-IT1 - MAGI1 intronic transcript 1 ncRNA 144-32 chr12 10178969 10179215 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_153022) promoter-TSS (NM_153022) 60 NM_153022 120939 Hs.226422 NM_153022 ENSG00000165685 TMEM52B C12orf59 transmembrane protein 52B protein-coding 121.667-33 chr10 101647925 101648179 + 0.666667 NA intron (NR_136613, intron 4 of 7) intron (NR_136613, intron 4 of 7) -46555 NR_036115 100423033 NR_036115 ENSG00000283558 MIR3158-2 mir-3158-2 microRNA 3158-2 ncRNA 177.333-72 chr17 29639949 29640475 + 0.666667 NA intron (NM_033389, intron 13 of 14) AluY|SINE|Alu -18789 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 296-23 chr18 2998155 2998959 + 0.666667 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) L2a|LINE|L2 13390 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 150.667-29 chr10 14709685 14709997 + 0.666667 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) L1MC2|LINE|L1 65056 NM_031453 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 125.333-89 chr2 39557057 39557277 + 0.666667 NA intron (NR_037875, intron 5 of 5) LTR67B|LTR|ERVL -108331 NM_001167959 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 151.667-172 chr2 151238384 151238688 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 23327 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 190.333-28 chr11 27951592 27951901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105069 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 187-78 chr7 22683667 22684110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18355 NR_122075 401312 Hs.583393 NR_122075 ENSG00000105889 LOC401312 - uncharacterized LOC401312 ncRNA 140-107 chr7 55344525 55344849 + 0.666667 NA Intergenic CpG -20761 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 114.667-199 chr5 5959948 5960133 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 377252 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 223.333-151 chr7 20327523 20328020 + 0.666667 NA TTS (NR_110119) TTS (NR_110119) -3129 NM_002214 3696 Hs.592171 NM_002214 ENSG00000105855 ITGB8 - integrin subunit beta 8 protein-coding 127-17 chr10 33535795 33536100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201042 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 249.667-45 chr2 125264597 125265097 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 853138 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 116.333-173 chr5 64919379 64919646 + 0.666667 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) L1PA16|LINE|L1 150582 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 140.667-166 chr4 88362801 88363181 + 0.666667 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -15748 NM_001165136 55008 Hs.529317 NM_017912 ENSG00000138642 HERC6 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6 protein-coding 148.667-167 chr18 23198583 23198906 + 0.666667 NA intron (NM_001256438, intron 3 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 42919 NM_138375 91768 Hs.11108 NM_138375 ENSG00000134508 CABLES1 CABL1|CABLES|HsT2563|IK3-1 Cdk5 and Abl enzyme substrate 1 protein-coding 166.333-178 chr5 18086635 18087037 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 279562 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 151.333-91 chr11 113870509 113870920 + 0.666667 NA intron (NM_020886, intron 1 of 24) intron (NM_020886, intron 1 of 24) 4858 NM_001346264 57646 Hs.503891 NM_020886 ENSG00000048028 USP28 - ubiquitin specific peptidase 28 protein-coding 116.667-41 chr12 116818024 116818315 + 0.666667 NA intron (NM_001109903, intron 7 of 11) AluJr|SINE|Alu 63272 NR_073189 8739 Hs.26605 NM_003806 ENSG00000135116 HRK DP5|HARAKIRI harakiri, BCL2 interacting protein protein-coding 114-112 chr5 12949950 12950162 + 0.666667 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) intron (NR_147005, intron 2 of 4) 82830 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 151.667-366 chr8 87738407 87738822 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 135401 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 116-60 chr17 59655249 59655538 + 0.666667 NA intron (NM_001288653, intron 5 of 31) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 35498 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 153-80 chr20 5266003 5266417 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 50522 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 150.667-298 chr5 43437924 43438231 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25686 NM_148672 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 112-83 chr17 49899374 49899615 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51477 NM_001077503 255061 Hs.652130 NM_170685 ENSG00000176358 TAC4 EK|HK-1|HK1|PPT-C tachykinin 4 protein-coding 150.333-375 chr7 9237381 9237679 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -396740 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 169-9 chr10 35658498 35658974 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17302 NM_031866 8325 Hs.302634 NM_031866 ENSG00000177283 FZD8 FZ-8|hFZ8 frizzled class receptor 8 protein-coding 138-127 chr9 26262218 26262562 + 0.666667 NA Intergenic LTR26|LTR|ERV1 195715 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 345-4 chr2 18800385 18801086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -211155 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 203.667-70 chr21 29690578 29690893 + 0.666667 NA intron (NM_001320618, intron 1 of 13) intron (NM_001320618, intron 1 of 13) -57440 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-293 chr5 66864760 66865091 + 0.666667 NA intron (NM_015183, intron 1 of 27) L2a|LINE|L2 36152 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 124-69 chr2 189093085 189093303 + 0.666667 NA intron (NM_000393, intron 6 of 53) intron (NM_000393, intron 6 of 53) 39917 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 210-33 chr14 28387621 28387971 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 377523 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 155-84 chr3 5275820 5276263 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -25786 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 128.667-71 chr16 76643470 76643741 + 0.666667 NA intron (NR_110934, intron 2 of 3) L1MC5|LINE|L1 8607 NR_110934 101928203 Hs.737035 NR_110934 ENSG00000250514 LINC02125 - long intergenic non-protein coding RNA 2125 ncRNA 126-69 chr3 34325561 34325820 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 527060 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 140.333-210 chr6 147152591 147152922 + 0.666667 NA intron (NR_034115, intron 3 of 10) L2c|LINE|L2 -6169 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 147.667-347 chr7 110254019 110254345 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -293969 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 152-129 chr5 88846994 88847288 + 0.666667 NA intron (NM_001131005, intron 2 of 10) (ATTTATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -19953 NM_001364341 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 156.333-325 chr7 745080 745396 + 0.666667 NA intron (NR_075098, intron 4 of 12) intron (NR_075098, intron 4 of 12) -17562 NM_001164759 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 154.333-77 chr13 112181671 112182090 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15453 NR_108094 101928698 Hs.528451 NR_108094 LINC01070 - long intergenic non-protein coding RNA 1070 ncRNA 222.667-36 chr17 65083354 65083855 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -17208 NR_110801 100507002 Hs.729924 NR_110801 LOC100507002 - uncharacterized LOC100507002 ncRNA 181.333-185 chr8 125161543 125162050 + 0.666667 NA intron (NR_146191, intron 5 of 8) AluSx|SINE|Alu 69936 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 164.667-123 chr20 137730 138143 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -4654 NM_030931 81623 Hs.124211 NM_030931 ENSG00000125788 DEFB126 C20orf8|DEFB-26|DEFB26|HBD26|bA530N10.1|hBD-26 defensin beta 126 protein-coding 118.667-151 chr4 93537610 93537876 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 12 of 14) L3|LINE|CR1 -291010 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 129.333-7 chr1 181688096 181688370 + 0.666667 NA intron (NM_001205293, intron 7 of 47) L1ME3E|LINE|L1 204716 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 152.333-17 chr1 104121428 104121823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48602 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 192.667-143 chr5 174043649 174043956 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -1904 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 115.333-131 chr22 34658907 34659148 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 338889 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 164-106 chr7 36284894 36285230 + 0.666667 NA intron (NM_030636, intron 5 of 7) intron (NM_030636, intron 5 of 7) 82178 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 200-82 chr2 77500638 77501111 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) L1ME3G|LINE|L1 21502 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 122.333-16 chr10 2507342 2507585 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6001 NR_136146 105376351 Hs.343482 NR_136146 LINC02645 - long intergenic non-protein coding RNA 2645 ncRNA 232.666-41 chr5 35271091 35271747 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40932 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 147-29 chr12 32893386 32893740 + 0.666667 NA intron (NM_001005242, intron 1 of 12) intron (NM_001005242, intron 1 of 12) 3283 NM_004572 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 128.667-58 chr14 72573949 72574234 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57271 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 222.667-7 chr1 218535624 218536203 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) AluY|SINE|Alu 25818 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 128-14 chr11 46261250 46261494 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -16290 NM_052854 90993 Hs.405961 NM_052854 ENSG00000157613 CREB3L1 OASIS|OI16 cAMP responsive element binding protein 3 like 1 protein-coding 159-62 chr2 108477850 108478171 + 0.666667 NA intron (NR_028063, intron 8 of 21) AluSz6|SINE|Alu 28804 NR_028063 9648 Hs.436505 NM_181453 ENSG00000135968 GCC2 GCC185|RANBP2L4|REN53 GRIP and coiled-coil domain containing 2 protein-coding 111.667-63 chr12 43100490 43100804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54668 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 117.667-206 chr9 31384530 31384769 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3159 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 120.667-2 chr1 27198225 27198453 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36293 NM_001276252 23038 Hs.469154 NM_015023 ENSG00000142784 WDTC1 ADP|DCAF9 WD and tetratricopeptide repeats 1 protein-coding 155-131 chr8 105214958 105215355 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -103282 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 174.667-123 chr4 47231547 47231937 + 0.666667 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 200175 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 233.333-66 chr2 117291736 117292365 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -522641 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 116.667-94 chr2 50838652 50838868 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -142498 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 186-64 chr3 96699766 96700123 + 0.666667 NA Intergenic LTR1A2|LTR|ERV1 -114650 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 256-83 chr5 167993683 167994112 + 0.666667 NA intron (NM_001080428, intron 3 of 24) intron (NM_001080428, intron 3 of 24) -171948 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 173-73 chr5 42490702 42491132 + 0.666667 NA intron (NM_001242401, intron 2 of 10) intron (NM_001242401, intron 2 of 10) -57126 NM_001242402 2690 Hs.125180 NM_000163 ENSG00000112964 GHR GHBP|GHIP growth hormone receptor protein-coding 125.667-200 chr9 108910201 108910537 + 0.666667 NA intron (NM_001330749, intron 10 of 34) intron (NM_001330749, intron 10 of 34) 23755 NM_003640 8518 Hs.494738 NM_003640 ENSG00000070061 ELP1 DYS|FD|IKAP|IKBKAP|IKI3|TOT1 elongator complex protein 1 protein-coding 190.333-64 chr19 56414757 56415159 + 0.666667 NA intron (NM_001159860, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 10626 NM_152478 147949 Hs.146854 NM_152478 ENSG00000198440 ZNF583 - zinc finger protein 583 protein-coding 243.667 chr1 112618054 112618627 + 0.666667 NA intron (NM_017744, intron 1 of 14) intron (NM_017744, intron 1 of 14) 801 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 231.333-29 chr12 24124125 24124677 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -88020 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 131-21 chr13 30951485 30951717 + 0.666667 NA intron (NM_001353391, intron 2 of 5) L1MC5|LINE|L1 18945 NM_001353390 122046 Hs.124463 NM_152325 ENSG00000175664 TEX26 C13orf26 testis expressed 26 protein-coding 152-54 chr14 50220838 50221220 + 0.666667 NA intron (NM_006939, intron 1 of 22) intron (NM_006939, intron 1 of 22) 10549 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 228.333-15 chr11 109853364 109853940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -239740 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 193-54 chr22 35508103 35508406 + 0.666667 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 -32240 NM_001366725 23551 Hs.474711 NM_014310 ENSG00000100302 RASD2 Rhes|TEM2 RASD family member 2 protein-coding 119.333-109 chr17 44166091 44166357 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4480 NM_080863 92591 Hs.534517 NM_080863 ENSG00000161664 ASB16 - ankyrin repeat and SOCS box containing 16 protein-coding 149.667-189 chr2 27366394 27366698 + 0.666667 NA intron (NM_015636, intron 11 of 12) AluJo|SINE|Alu 3506 NM_172195 8890 Hs.169474 NM_015636 ENSG00000115211 EIF2B4 EIF-2B|EIF2B|EIF2Bdelta eukaryotic translation initiation factor 2B subunit delta protein-coding 219.333-91 chr2 15201265 15201671 + 0.666667 NA intron (NR_052013, intron 47 of 50) intron (NR_052013, intron 47 of 50) 359866 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 126.667-7 chr1 90655048 90655334 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -2559 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 117-41 chr13 41623378 41623580 + 0.666667 NA intron (NM_015058, intron 37 of 44) intron (NM_015058, intron 37 of 44) -55084 NR_049803 100847026 NR_049803 ENSG00000284584 MIR5006 - microRNA 5006 ncRNA 127-59 chr3 52674151 52674391 + 0.666667 NA intron (NM_001366074, intron 5 of 30) AluSp|SINE|Alu 11328 NM_001350077 55193 Hs.189920 NM_018165 ENSG00000163939 PBRM1 BAF180|PB1 polybromo 1 protein-coding 141.667-6 chr1 92761110 92761396 + 0.666667 NA intron (NM_001308248, intron 1 of 18) intron (NM_001308248, intron 1 of 18) 23855 NM_001350197 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 136.667-159 chr6 139508057 139508399 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33632 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 116-96 chr21 27666200 27666398 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56080 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 149-11 chr1 178088393 178088742 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5426 NR_027982 100302401 Hs.736117 NR_027982 ENSG00000224687 RASAL2-AS1 - RASAL2 antisense RNA 1 ncRNA 156.667-29 chr1 195895850 195896162 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 192709 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 124-83 chr4 32379437 32379763 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 28562 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 149-144 chr8 84327117 84327434 + 0.666667 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) -88209 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 156.667-209 chr20 44485807 44486192 + 0.666667 NA intron (NM_001039199, intron 3 of 4) intron (NM_001039199, intron 3 of 4) 10125 NM_024331 79183 Hs.283869 NM_024331 ENSG00000124120 TTPAL C20orf121 alpha tocopherol transfer protein like protein-coding 174-21 chr12 39632443 39632853 + 0.666667 NA intron (NM_001031748, intron 1 of 12) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 6465 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 148-82 chr2 104922880 104923204 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -50447 NR_110374 102682016 Hs.638438 NR_110373 ENSG00000229743 LINC01159 linc-Brn1b long intergenic non-protein coding RNA 1159 ncRNA 113-216 chr9 117409890 117410222 + 0.666667 NA intron (NM_014010, intron 1 of 21) intron (NM_014010, intron 1 of 21) 5001 NM_001365069 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 147.667-162 chr2 16475750 16476045 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 189937 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 114.333-117 chr2 156918630 156918862 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -338959 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 139.667-107 chr20 58363719 58363989 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_020673, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_020673, exon 7 of 7) -25265 NM_004738 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 116.333-205 chr8 81218951 81219208 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61457 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 166-109 chr7 28979148 28979432 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_038965) promoter-TSS (NR_038965) -677 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 234.667-80 chr4 39154730 39155292 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27518 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 145-92 chr5 53167237 53167535 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 57544 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 147.667-173 chr2 64698323 64698618 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44557 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 142-45 chr14 75989217 75989498 + 0.666667 NA intron (NM_001102564, intron 2 of 8) intron (NM_001102564, intron 2 of 8) 3594 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 139.667-108 chr21 27752542 27752851 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30317 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 180.667-7 chr1 155537273 155537716 + 0.666667 NA intron (NM_018489, intron 1 of 27) MIRb|SINE|MIR -24548 NR_147963 645676 Hs.568693 NR_027023 ENSG00000235919 ASH1L-AS1 - ASH1L antisense RNA 1 ncRNA 205.333-196 chr6 10867329 10867720 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 14341 NM_004752 9247 Hs.227098 NM_004752 ENSG00000124827 GCM2 GCMB|HRPT4|hGCMb glial cells missing transcription factor 2 protein-coding 136.333-144 chr4 52180699 52181098 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 129594 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 206.667-3 chr1 72527314 72527759 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -244997 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 324.667-5 chr10 56911050 56911736 + 0.666667 NA Intergenic LTR13A|LTR|ERVK 393166 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 142.667-169 chr4 148966351 148966647 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24121 NR_134681 105377480 Hs.148699 NR_134681 ENSG00000249317 LOC105377480 - uncharacterized LOC105377480 ncRNA 117-104 chr4 65598509 65598811 + 0.666667 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) L2c|LINE|L2 70828 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 150.667-366 chr8 65555038 65555360 + 0.666667 NA intron (NR_033893, intron 1 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 7467 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 168.333-102 chr2 165800427 165800744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6338 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 174-68 chr3 180874934 180875365 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4971 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 145.667-129 chr2 37279744 37280030 + 0.666667 NA exon (NM_005813, exon 7 of 18) exon (NM_005813, exon 7 of 18) 37197 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 162.667-144 chr2 167581106 167581439 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -237400 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 260.667-27 chr15 78113807 78114318 + 0.666667 NA intron (NM_001271888, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 17383 NM_006383 10518 Hs.129867 NM_006383 ENSG00000136425 CIB2 DFNB48|KIP2|USH1J calcium and integrin binding family member 2 protein-coding 133.667-85 chr20 45066354 45066608 + 0.666667 NA intron (NM_001352385, intron 11 of 11) intron (NM_001352385, intron 11 of 11) 34646 NM_001322799 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 152.667-340 chr7 42790856 42791266 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -84614 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 111.667-180 chr4 26343986 26344194 + 0.666667 NA intron (NM_001363577, intron 1 of 10) AluSz6|SINE|Alu 22862 NM_001363577 3516 Hs.479396 NM_005349 ENSG00000168214 RBPJ AOS3|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region protein-coding 229-29 chr2 34683608 34683987 + 0.666667 NA intron (NR_126404, intron 1 of 2) intron (NR_126404, intron 1 of 2) 6240 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 123-20 chr10 108817171 108817403 + 0.666667 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -747994 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 148.667-38 chr10 32919793 32920086 + 0.666667 NA exon (NM_033668, exon 10 of 16) exon (NM_033668, exon 10 of 16) 15619 NM_033668 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 149-72 chr2 182130285 182130573 + 0.666667 NA non-coding (NR_048566, exon 6 of 6) non-coding (NR_048566, exon 6 of 6) 111634 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 122.667-63 chr16 19256682 19256920 + 0.666667 NA intron (NM_001308157, intron 7 of 7) AluJr|SINE|Alu -28930 NM_001256720 728276 Hs.632180 NM_001256720 ENSG00000261210 CLEC19A - C-type lectin domain containing 19A protein-coding 211.333-77 chr16 58154083 58154514 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24873 NR_136632 29105 Hs.532755 NM_013242 ENSG00000070761 CFAP20 BUG22|C16orf80|EVORF|GTL3|fSAP23 cilia and flagella associated protein 20 protein-coding 173.333-206 chr8 117532756 117533155 + 0.666667 NA intron (NM_080651, intron 3 of 3) intron (NM_080651, intron 3 of 3) 12242 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 182-22 chr12 93139765 93140139 + 0.666667 NA intron (NR_040096, intron 3 of 4) intron (NR_040096, intron 3 of 4) -34414 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 137-26 chr14 36164552 36164828 + 0.666667 NA intron (NR_073454, intron 2 of 2) intron (NR_073454, intron 2 of 2) 11961 NR_049735 100886964 Hs.742592 NR_049735 PTCSC3 - papillary thyroid carcinoma susceptibility candidate 3 ncRNA 169.333-110 chr19 48035068 48035515 + 0.666667 NA intron (NM_019855, intron 4 of 5) L1MA7|LINE|L1 8788 NM_019855 56344 Hs.117694 NM_016367 ENSG00000105507 CABP5 CABP3 calcium binding protein 5 protein-coding 149-69 chr2 101789989 101790390 + 0.666667 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 92482 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 172.333-91 chr2 182935666 182936073 + 0.666667 NA intron (NM_013436, intron 24 of 30) intron (NM_013436, intron 24 of 30) -69232 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 197.667 chr1 37259327 37259809 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 98005 NR_036217 100422898 NR_036217 ENSG00000264698 MIR4255 - microRNA 4255 ncRNA 131-40 chr17 79340925 79341308 + 0.666667 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 175032 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 140.333-243 chr8 143327888 143328160 + 0.666667 NA intron (NM_052963, intron 3 of 13) L1M4|LINE|L1 6856 NM_052963 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 154-67 chr16 54068670 54068998 + 0.666667 NA intron (NM_001363988, intron 9 of 9) intron (NM_001363988, intron 9 of 9) 29441 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 190.333-2 chr1 27486389 27486752 + 0.666667 NA intron (NM_006990, intron 1 of 8) intron (NM_006990, intron 1 of 8) 3597 NM_006990 10163 Hs.469244 NM_006990 ENSG00000158195 WASF2 IMD2|SCAR2|WASF4|WAVE2|dJ393P12.2 WASP family member 2 protein-coding 237.333-125 chr8 121750534 121751060 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109357 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 149.333-410 chr8 132145545 132145826 + 0.666667 NA intron (NM_001204824, intron 9 of 14) intron (NM_001204824, intron 9 of 14) -40420 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 122.667-148 chr5 17109412 17109754 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 46409 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 224-75 chr5 55361296 55361860 + 0.666667 NA intron (NM_015360, intron 15 of 26) AluSx1|SINE|Alu 53589 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 138.333-197 chr8 109075484 109075824 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -10974 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 222-37 chr18 7590295 7590816 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) L1ME4a|LINE|L1 23239 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 145.333-131 chr2 69711595 69711913 + 0.666667 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) intron (NM_001320698, intron 2 of 14) -30380 NM_001320702 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 154.667-179 chr2 84626954 84627262 + 0.666667 NA intron (NM_001370, intron 29 of 76) MER5A|DNA|hAT-Charlie 110653 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 138-33 chr13 100244109 100244410 + 0.666667 NA intron (NM_001352612, intron 8 of 21) intron (NM_001352612, intron 8 of 21) 155166 NR_148027 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 242-36 chr18 35896210 35896683 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 8480 NR_029616 406963 NR_029616 ENSG00000207797 MIR187 MIRN187|miR-187|miRNA187 microRNA 187 ncRNA 143.667-123 chr2 19640370 19640666 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -228336 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 113-7 chr1 110897407 110897630 + 0.666667 NA intron (NM_001040033, intron 7 of 8) intron (NM_001040033, intron 7 of 8) 24370 NM_000560 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 151.333-438 chr9 30369892 30370202 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 38407 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 166.667-9 chr1 91686128 91686472 + 0.666667 NA intron (NR_036634, intron 17 of 17) intron (NR_036634, intron 17 of 17) 185192 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 144.333-138 chr2 164314247 164314627 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 254058 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 142.333-264 chr9 108894255 108894545 + 0.666667 NA intron (NM_001330749, intron 23 of 34) intron (NM_001330749, intron 23 of 34) 32134 NM_006687 10881 Hs.123530 NM_006687 ENSG00000187003 ACTL7A - actin like 7A protein-coding 190.667-14 chr10 8924376 8924773 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 26585 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 145.333-150 chr2 184655666 184655982 + 0.666667 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) MER89-int|LTR|ERV1 57295 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 169-31 chr14 84677126 84677431 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -594654 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 148.333-409 chr9 27181981 27182272 + 0.666667 NA intron (NM_000459, intron 7 of 22) intron (NM_000459, intron 7 of 22) 72985 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 117-8 chr1 189441541 189441783 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 1034348 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 124.667-176 chr6 55985232 55985448 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 106322 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 158-49 chr15 62040984 62041343 + 0.666667 NA intron (NM_001018088, intron 3 of 81) intron (NM_001018088, intron 3 of 81) 19284 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 223.333-170 chr8 133137413 133137798 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35003 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 133.333-92 chr20 47624266 47624530 + 0.666667 NA intron (NM_181659, intron 4 of 22) MER1A|DNA|hAT-Charlie 122511 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 287.667-15 chr16 71275878 71276383 + 0.666667 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 13272 NM_001324378 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 143.667-276 chrX 97584825 97585108 + 0.666667 NA intron (NM_006729, intron 26 of 26) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -20431 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 155-107 chr5 51861664 51862074 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -146162 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 198-5 chr1 79866849 79867244 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -668709 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 112.667-283 chrX 40078446 40078686 + 0.666667 NA intron (NM_001123384, intron 1 of 13) intron (NM_001123384, intron 1 of 13) 18900 NM_001123385 54880 Hs.659681 NM_017745 ENSG00000183337 BCOR ANOP2|MAA2|MCOPS2 BCL6 corepressor protein-coding 146.667-98 chr14 43807579 43807897 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 699545 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 183.333-118 chr4 83028937 83029381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6024 NM_001330727 51138 Hs.190384 NM_016129 ENSG00000138663 COPS4 CSN4|SGN4 COP9 signalosome subunit 4 protein-coding 151.333-179 chr18 7141650 7141957 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -24006 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 159-99 chr5 147318363 147318819 + 0.666667 NA intron (NM_001112724, intron 4 of 12) AluJr|SINE|Alu 83565 NM_001112724 202374 Hs.585069 NM_145001 ENSG00000169302 STK32A YANK1 serine/threonine kinase 32A protein-coding 145.667-301 chr8 131847908 131848316 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -55981 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 121.333-42 chr12 42206884 42207119 + 0.666667 NA intron (NM_001320080, intron 2 of 4) L1MC4|LINE|L1 31367 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 148-173 chrX 63922981 63923257 + 0.666667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -137032 NR_031567 100302115 NR_031567 ENSG00000222532 MIR1468 MIRN1468|hsa-mir-1468|mir-1468 microRNA 1468 ncRNA 149.667-295 chr4 147802276 147802664 + 0.666667 NA intron (NM_024605, intron 1 of 22) intron (NM_024605, intron 1 of 22) 19875 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 148-129 chr5 51760489 51760811 + 0.666667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -247381 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 155.333-257 chr4 34456001 34456355 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -186431 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 193.333-92 chr2 80328452 80328866 + 0.666667 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) intron (NM_001282599, intron 1 of 11) 15280 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 184.667-66 chr2 219118645 219119038 + 0.666667 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) intron (NM_024782, intron 5 of 7) 42024 NM_024782 79840 Hs.225988 NM_024782 ENSG00000187736 NHEJ1 XLF non-homologous end joining factor 1 protein-coding 184.667-59 chr2 102962458 102962961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21720 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 210.667-6 chr1 85484591 85485076 + 0.666667 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) -19674 NM_012137 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 153-49 chr15 39538970 39539347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41921 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 146-77 chr22 27976936 27977225 + 0.666667 NA TTS (NM_001145418) TTS (NM_001145418) -56468 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 156.333-381 chr9 121886726 121887099 + 0.666667 NA intron (NM_001139442, intron 6 of 8) intron (NM_001139442, intron 6 of 8) 144127 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 126-98 chr6 34803296 34803559 + 0.666667 NA intron (NM_017754, intron 1 of 20) intron (NM_017754, intron 1 of 20) 11344 NM_017754 54887 Hs.700656 NM_017754 ENSG00000065060 UHRF1BP1 C6orf107|ICBP90|dJ349A12.1 UHRF1 binding protein 1 protein-coding 165.333-19 chr1 229387676 229388019 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -44800 NM_145257 126731 Hs.585011 NM_145257 ENSG00000154429 CCSAP C1orf96|CSAP centriole, cilia and spindle associated protein protein-coding 130.333-53 chr12 62431590 62431834 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -35114 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 197-92 chr5 56539621 56540065 + 0.666667 NA intron (NR_161255, intron 2 of 5) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -58074 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 186-5 chr1 113258226 113258671 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -52195 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 158.333-83 chr14 46631222 46631686 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 20327 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 194.333-27 chr11 11861819 11862286 + 0.666667 NA intron (NM_017944, intron 1 of 26) intron (NM_017944, intron 1 of 26) 20629 NM_017944 55031 Hs.577256 NM_017944 ENSG00000170242 USP47 TRFP ubiquitin specific peptidase 47 protein-coding 140.667-237 chr8 125886137 125886532 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 64863 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 175.333-50 chr14 82716657 82717164 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74278 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 177.667-146 chr9 84146328 84146711 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 83076 NR_110995 101927575 Hs.459826 NR_110995 ENSG00000227463 LOC101927575 - uncharacterized LOC101927575 ncRNA 147.667-367 chr8 114514368 114514721 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -1077605 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 145.333-278 chr7 80522938 80523300 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -11055 NM_001102386 346562 Hs.335049 NM_001102386 ENSG00000214415 GNAT3 GDCA G protein subunit alpha transducin 3 protein-coding 195.333-14 chr1 147644292 147644790 + 0.666667 NA non-coding (NR_136635, exon 10 of 10) non-coding (NR_136635, exon 10 of 10) 25983 NR_136635 51205 Hs.562154 NM_016361 ENSG00000162836 ACP6 ACPL1|LPAP|PACPL1 acid phosphatase 6, lysophosphatidic protein-coding 203-41 chr16 60403586 60404074 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44037 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 140-132 chrX 97116245 97116612 + 0.666667 NA intron (NM_007309, intron 21 of 26) intron (NM_007309, intron 21 of 26) 232520 NM_013347 29935 Hs.659349 NM_013347 ENSG00000204086 RPA4 HSU24186 replication protein A4 protein-coding 159.667-188 chr2 241209676 241210035 + 0.666667 NA intron (NM_001370694, intron 13 of 24) intron (NM_001370694, intron 13 of 24) 21178 NM_001001666 50636 Hs.163909 NM_001001666 ENSG00000146205 ANO7 D-TMPP|DTMPP|IPCA-5|IPCA5|NGEP|PCANAP5|PCANAP5L|TMEM16G anoctamin 7 protein-coding 194.667-42 chr14 79086130 79086560 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) MIR3|SINE|MIR -113637 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 153.667-192 chr2 100324029 100324339 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -1451 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 129-54 chr18 7139521 7139797 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21862 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 254.667-55 chr3 108987697 108988179 + 0.666667 NA intron (NM_014429, intron 21 of 27) intron (NM_014429, intron 21 of 27) -34059 NM_005459 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 171.333-151 chr5 93320045 93320405 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 251118 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 202.667-106 chr4 32113828 32114179 + 0.666667 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) intron (NR_125936, intron 1 of 2) -91581 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 145.333-147 chr2 147854198 147854632 + 0.666667 NA intron (NM_001278579, intron 2 of 11) intron (NM_001278579, intron 2 of 11) 9386 NM_001616 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 157.667-346 chr8 136805051 136805388 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 4 of 5) intron (NR_147196, intron 4 of 5) 274421 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 120.333-176 chr7 132294774 132295014 + 0.666667 NA intron (NM_020911, intron 4 of 31) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 34033 NR_134565 101928807 Hs.552131 NR_134565 LOC101928807 - uncharacterized LOC101928807 ncRNA 111.667-82 chr14 69366924 69367181 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 31247 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 119-113 chr4 105782501 105782811 + 0.666667 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) AluSx|SINE|Alu 44516 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 112.667-56 chr12 123540228 123540546 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3978 NR_037470 100500909 NR_037470 ENSG00000266655 MIR3908 - microRNA 3908 ncRNA 132.333-95 chr2 187930899 187931131 + 0.666667 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 356676 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 198-181 chr8 76834096 76834610 + 0.666667 NA intron (NM_024721, intron 5 of 10) L1MC1|LINE|L1 132497 NR_130460 100422921 NR_130460 ENSG00000266712 MIR3149 - microRNA 3149 ncRNA 153.667-233 chr22 20501384 20501707 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5750 NR_033825 84861 Hs.517419 NM_032775 ENSG00000099910 KLHL22 KELCHL kelch like family member 22 protein-coding 233.333-33 chr12 49140959 49141424 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9796 NM_006082 10376 Hs.524390 NM_006082 ENSG00000123416 TUBA1B K-ALPHA-1 tubulin alpha 1b protein-coding 116.667-135 chr3 125039762 125039965 + 0.666667 NA intron (NM_020733, intron 1 of 16) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16134 NM_020733 57493 Hs.477420 NM_020733 ENSG00000173706 HEG1 HEG|MST112|MSTP112 heart development protein with EGF like domains 1 protein-coding 142.667-117 chr2 222551509 222551864 + 0.666667 NA intron (NM_152386, intron 4 of 4) intron (NM_152386, intron 4 of 4) 104406 NR_130154 10056 Hs.471452 NM_005687 ENSG00000116120 FARSB FARSLB|FRSB|HSPC173|NEDBLLA|PheHB|PheRS|RILDBC phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta protein-coding 125-95 chr6 20305573 20305808 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -93221 NR_073465 154141 Hs.377830 NM_001080480 ENSG00000172197 MBOAT1 LPEAT1|LPLAT|LPLAT 1|LPSAT|OACT1|dJ434O11.1 membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 protein-coding 155-89 chr3 89804249 89804676 + 0.666667 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 696841 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 160-24 chr10 132389198 132389676 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7763 NM_001098637 170394 Hs.527751 NM_138499 ENSG00000171813 PWWP2B PWWP2|bA432J24.1|pp8607 PWWP domain containing 2B protein-coding 227-8 chr10 38022888 38023439 + 0.666667 NA intron (NR_136710, intron 4 of 4) AluSx4|SINE|Alu 12488 NM_006954 7581 Hs.435774 NM_006954 ENSG00000189180 ZNF33A KOX2|KOX31|KOX5|NF11A|ZNF11|ZNF11A|ZNF33|ZZAPK zinc finger protein 33A protein-coding 274-27 chr20 4547365 4547827 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -138860 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 124.667-53 chr13 32572547 32572772 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13793 NM_015032 23047 Hs.744901 NM_015032 ENSG00000083642 PDS5B APRIN|AS3|CG008 PDS5 cohesin associated factor B protein-coding 139-98 chr7 55919204 55919480 + 0.666667 NA intron (NM_182633, intron 4 of 6) MLT1G1-int|LTR|ERVL-MaLR 31886 NM_001366796 349075 Hs.660834 NM_182633 ENSG00000178665 ZNF713 - zinc finger protein 713 protein-coding 180-30 chr13 101551330 101551720 + 0.666667 NA intron (NM_001271756, intron 1 of 9) intron (NM_001271756, intron 1 of 9) 61573 NM_001271756 9358 Hs.696554 NM_004791 ENSG00000198542 ITGBL1 OSCP|TIED integrin subunit beta like 1 protein-coding 190-101 chr5 111112054 111112476 + 0.666667 NA intron (NM_139281, intron 15 of 22) intron (NM_139281, intron 15 of 22) 20093 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 116.333-141 chr3 54219638 54219819 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) intron (NM_018398, intron 2 of 37) 97176 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 165-17 chr12 41529625 41530050 + 0.666667 NA intron (NM_001164595, intron 5 of 9) intron (NM_001164595, intron 5 of 9) 92098 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 123-107 chr6 139303433 139303641 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -11539 NM_153235 167838 Hs.535820 NM_153235 ENSG00000164440 TXLNB C6orf198|LST001|MDP77|dJ522B19.2 taxilin beta protein-coding 248-23 chr14 55287728 55288322 + 0.666667 NA intron (NM_152231, intron 1 of 1) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 15871 NM_152231 55030 Hs.525348 NM_017943 ENSG00000178974 FBXO34 CGI-301|Fbx34 F-box protein 34 protein-coding 146.667-227 chr4 22298635 22298924 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40887 NR_037877 100505912 Hs.270471 NR_037877 LOC100505912 - uncharacterized LOC100505912 ncRNA 231-48 chr4 38519289 38519840 + 0.666667 NA intron (NR_110951, intron 1 of 7) intron (NR_110951, intron 1 of 7) 3616 NR_110951 101928776 Hs.586147 NR_110951 ENSG00000249534 LINC01258 - long intergenic non-protein coding RNA 1258 ncRNA 154.333-70 chr12 72367170 72367578 + 0.666667 NA intron (NM_013381, intron 2 of 18) intron (NM_013381, intron 2 of 18) -93865 NR_026836 283392 Hs.363603 NM_001025457 ENSG00000236333 TRHDE-AS1 - TRHDE antisense RNA 1 ncRNA 113-91 chr18 13652482 13652655 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_181481, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_181481, exon 6 of 6) 10810 NM_001276251 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 132.333-61 chr15 64886402 64886744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25329 NM_182703 348094 Hs.207157 NM_182703 ENSG00000166839 ANKDD1A - ankyrin repeat and death domain containing 1A protein-coding 112.667-50 chr12 40980140 40980349 + 0.666667 NA intron (NM_001843, intron 15 of 23) AluJb|SINE|Alu 71887 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 140.667-185 chr5 87418941 87419325 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -6100 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 174.333-159 chr9 83741480 83741759 + 0.666667 NA intron (NM_025211, intron 12 of 12) L1MC4|LINE|L1 33288 NR_135840 105376114 Hs.9589 NR_135839 ENSG00000254473 LOC105376114 - uncharacterized LOC105376114 ncRNA 118.667-130 chr3 1861790 1862102 + 0.666667 NA Intergenic MER5C|DNA|hAT-Charlie -236857 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 137.333-78 chr18 48588307 48588708 + 0.666667 NA intron (NM_001142397, intron 2 of 12).2 intron (NM_001142397, intron 2 of 12).2 49476 NM_001142397 9811 Hs.145230 NM_014772 ENSG00000134030 CTIF Gm672|KIAA0427 cap binding complex dependent translation initiation factor protein-coding 166.667-203 chr6 106956030 106956375 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 17837 NM_001291739 100133941 Hs.644105 NM_013230 ENSG00000272398 CD24 CD24A CD24 molecule protein-coding 223-41 chr3 27383552 27384069 + 0.666667 NA intron (NM_001258380, intron 22 of 23) intron (NM_001258380, intron 22 of 23) -14350 NM_152534 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 143.333-263 chr7 33461018 33461394 + 0.666667 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) L1MB5|LINE|L1 331642 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 125-56 chr2 71540924 71541134 + 0.666667 NA intron (NM_001130985, intron 17 of 54) intron (NM_001130985, intron 17 of 54) 74330 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 113.333-55 chr11 115068694 115068878 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -264791 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 215.667-27 chr12 27278555 27279030 + 0.666667 NA intron (NM_015000, intron 1 of 13) intron (NM_015000, intron 1 of 13) 34506 NM_015000 23012 Hs.184523 NM_015000 ENSG00000211455 STK38L NDR2 serine/threonine kinase 38 like protein-coding 162.667-96 chr16 61652974 61653306 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001796, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001796, exon 12 of 12) 383298 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 146.333-357 chrX 25812682 25813034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -325485 NM_173699 286514 Hs.350683 NM_173699 ENSG00000176774 MAGEB18 - MAGE family member B18 protein-coding 112-167 chr5 57726217 57726438 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75667 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 176-47 chr2 108987988 108988371 + 0.666667 NA intron (NM_022336, intron 1 of 11) intron (NM_022336, intron 1 of 11) 1041 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 119-128 chr6 71115554 71115737 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -158585 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 152.667-67 chr11 99858913 99859230 + 0.666667 NA intron (NM_001243270, intron 5 of 23) MIRb|SINE|MIR 302926 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 178-15 chr10 14256640 14257038 + 0.666667 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 74045 NR_134578 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 122.333-66 chr15 79654148 79654350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 221733 NM_015206 23251 Hs.301654 NM_015206 ENSG00000169330 MINAR1 KIAA1024|UBTOR membrane integral NOTCH2 associated receptor 1 protein-coding 119.333-37 chr10 74018723 74019054 + 0.666667 NA intron (NM_014000, intron 1 of 21) L1ME4b|LINE|L1 20772 NM_003373 7414 Hs.643896 NM_003373 ENSG00000035403 VCL CMD1W|CMH15|HEL114|MV|MVCL vinculin protein-coding 197.667-95 chr3 162998287 162998695 + 0.666667 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 304810 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 166-104 chr6 132253016 132253301 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 119180 NR_038981 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 154.667-366 chr7 46698847 46699289 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -1946 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 186.667-15 chr10 68483339 68483819 + 0.666667 NA exon (NM_001324312, exon 9 of 9) exon (NM_001324312, exon 9 of 9) -11458 NR_102264 1763 Hs.532446 NM_001080449 ENSG00000138346 DNA2 DNA2L|hDNA2 DNA replication helicase/nuclease 2 protein-coding 165-98 chr8 127308173 127308589 + 0.666667 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) intron (NR_117100, intron 5 of 5) 63744 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 159-55 chr2 56783579 56783952 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -597995 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 166-18 chr10 18154865 18155349 + 0.666667 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) L1ME3A|LINE|L1 14683 NM_201572 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 131-69 chr4 30580808 30581060 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -139435 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 177-78 chr8 125776616 125777009 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 174385 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 127.667-51 chr14 90069655 90070007 + 0.666667 NA intron (NM_022054, intron 1 of 1) MIRc|SINE|MIR 7837 NM_022054 56659 Hs.510191 NM_022054 ENSG00000152315 KCNK13 K2p13.1|THIK-1|THIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 13 protein-coding 267-19 chr12 132407407 132407980 + 0.666667 NA Intergenic CpG 77843 NR_120467 101928416 NR_120467 ENSG00000255916 LOC101928416 - uncharacterized LOC101928416 ncRNA 124.667-190 chr7 70573403 70573730 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 5 of 18) intron (NM_015570, intron 5 of 18) -558578 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 124.333-84 chr2 69698086 69698449 + 0.666667 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -43867 NM_001320702 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 154.667-258 chr3 161243363 161243677 + 0.666667 NA intron (NM_015938, intron 11 of 15) L1MC5a|LINE|L1 22230 NM_015938 51068 Hs.598836 NM_015938 ENSG00000169251 NMD3 CGI-07 NMD3 ribosome export adaptor protein-coding 169.667-106 chr2 55874767 55875130 + 0.666667 NA exon (NM_001039348, exon 9 of 12) exon (NM_001039348, exon 9 of 12) 48834 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 130.333-33 chr10 68414527 68414820 + 0.666667 NA non-coding (NR_102264, exon 22 of 22) non-coding (NR_102264, exon 22 of 22) -7379 NM_001042417 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 155.667-121 chr15 100956025 100956378 + 0.666667 NA intron (NM_024652, intron 2 of 33) L1MA9|LINE|L1 36844 NM_024652 79705 Hs.407918 NM_024652 ENSG00000154237 LRRK1 RIPK6|Roco1 leucine rich repeat kinase 1 protein-coding 111.667-42 chr10 118881331 118881567 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -126479 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 114-128 chr5 165191952 165192157 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 721775 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 149.333-63 chr10 94932456 94932783 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -6039 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 214-74 chr2 192207499 192207995 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12814 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 117-17 chr10 33668563 33668742 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 104028 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 131.667-18 chr10 12436679 12436979 + 0.666667 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) MER68B|LTR|ERVL 47847 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 137-74 chr4 112361373 112361722 + 0.666667 NA intron (NM_001102406, intron 2 of 15) L1PB1|LINE|L1 64178 NM_025144 80216 Hs.652825 NM_025144 ENSG00000073331 ALPK1 8430410J10Rik|LAK alpha kinase 1 protein-coding 118.667-150 chr4 85916644 85916906 + 0.666667 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) intron (NM_001287805, intron 1 of 7) -13241 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 168.667-180 chr5 118831938 118832293 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -142471 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 136.333-160 chr5 19610478 19610739 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 6 of 12) intron (NM_001349559, intron 6 of 12) 275664 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 182-28 chr14 58510701 58511179 + 0.666667 NA intron (NM_001329944, intron 28 of 31) L1ME1|LINE|L1 71259 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 146-119 chr6 156339576 156340008 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38958 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 122-73 chr3 86745734 86745984 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 245290 NM_016206 389136 Hs.606507 NM_016206 ENSG00000206538 VGLL3 VGL-3|VGL3 vestigial like family member 3 protein-coding 128-118 chr8 71588744 71589019 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40787 NM_001370336 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 223.667-75 chr7 2718255 2718736 + 0.666667 NA intron (NM_001321766, intron 6 of 6) CpG 30293 NM_001321766 155185 Hs.42221 NM_133463 ENSG00000174945 AMZ1 - archaelysin family metallopeptidase 1 protein-coding 144.333-112 chr19 29731498 29731750 + 0.666667 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -15835 NM_001256047 83636 Hs.529094 NM_031448 ENSG00000131943 C19orf12 MPAN|NBIA3|NBIA4|SPG43 chromosome 19 open reading frame 12 protein-coding 150.333-355 chr6 26608695 26609068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 11928 NM_013375 29777 Hs.254406 NM_013375 ENSG00000146109 ABT1 Esf2|hABT1 activator of basal transcription 1 protein-coding 154.667-315 chr5 71822931 71823247 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 103814 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 204.333-168 chr5 147338190 147338771 + 0.666667 NA intron (NM_001112724, intron 5 of 12) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 103454 NM_001112724 202374 Hs.585069 NM_145001 ENSG00000169302 STK32A YANK1 serine/threonine kinase 32A protein-coding 215.333-149 chr4 160150552 160151040 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -373012 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 115.667-23 chr10 35203950 35204181 + 0.666667 NA intron (NM_182717, intron 2 of 3) intron (NM_182717, intron 2 of 3) 8163 NM_001267570 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 114.333-72 chr14 51055828 51056120 + 0.666667 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 39730 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 127.333-194 chr8 119888745 119889067 + 0.666667 NA intron (NM_001283012, intron 1 of 6) intron (NM_001283012, intron 1 of 6) 15184 NM_022783 64798 Hs.112981 NM_022783 ENSG00000155792 DEPTOR DEP.6|DEPDC6 DEP domain containing MTOR interacting protein protein-coding 166.333-138 chr22 20471260 20471624 + 0.666667 NA exon (NM_032775, exon 3 of 7) exon (NM_032775, exon 3 of 7) 24353 NM_032775 84861 Hs.517419 NM_032775 ENSG00000099910 KLHL22 KELCHL kelch like family member 22 protein-coding 144.667-284 chr7 93563340 93563651 + 0.666667 NA intron (NM_001164737, intron 2 of 15) intron (NM_001164737, intron 2 of 15) -3685 NM_001164738 799 Hs.489127 NM_001742 ENSG00000004948 CALCR CRT|CT-R|CTR|CTR1 calcitonin receptor protein-coding 111.667-244 chr7 96895574 96895884 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109824 NM_005222 1750 Hs.249196 NM_005222 ENSG00000006377 DLX6 - distal-less homeobox 6 protein-coding 141.333-65 chr14 50912504 50912830 + 0.666667 NA intron (NM_002863, intron 13 of 19) intron (NM_002863, intron 13 of 19) 31816 NM_001163940 5836 Hs.282417 NM_002863 ENSG00000100504 PYGL GSD6 glycogen phosphorylase L protein-coding 117-105 chr4 80637390 80637597 + 0.666667 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) 301773 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 145-8 chr10 1714377 1714637 + 0.666667 NA intron (NM_018702, intron 1 of 9) intron (NM_018702, intron 1 of 9) 23018 NM_018702 105 Hs.586663 NM_018702 ENSG00000185736 ADARB2 ADAR3|RED2 adenosine deaminase RNA specific B2 (inactive) protein-coding 170.333-44 chr11 19942687 19943033 + 0.666667 NA intron (NM_182964, intron 8 of 37) AluJr|SINE|Alu -79696 NM_001111019 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 114-54 chr17 66840680 66840991 + 0.666667 NA intron (NM_145811, intron 1 of 5) intron (NM_145811, intron 1 of 5) 5718 NM_145811 27091 Hs.278907 NM_014404 ENSG00000075429 CACNG5 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5 protein-coding 143.667-246 chr8 56144101 56144333 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -30235 NM_005372 4342 Hs.533432 NM_005372 ENSG00000172680 MOS MSV MOS proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 252-113 chr8 142544017 142544758 + 0.666667 NA exon (NM_001702, exon 31 of 31) exon (NM_001702, exon 31 of 31) 70092 NM_015193 23237 Hs.40888 NM_015193 ENSG00000198576 ARC Arg3.1|hArc activity regulated cytoskeleton associated protein protein-coding 113.333-266 chr8 140527700 140528032 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_012154, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_012154, exon 19 of 19) 15870 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 142.333-108 chr19 27728342 27728621 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -64950 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 252.333-81 chr9 70548399 70548987 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 24 of 25) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie -134036 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 145.667-227 chr5 104261528 104261769 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -698859 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 199.667-126 chr7 18417581 18418075 + 0.666667 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) L1MEc|LINE|L1 -77882 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 135.333-140 chr5 50547500 50547752 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -106338 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 127.667-128 chr4 74411069 74411283 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33960 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 146.333-167 chr2 205551903 205552229 + 0.666667 NA intron (NM_205863, intron 20 of 21) intron (NM_205863, intron 20 of 21) -130434 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 111.667-243 chr7 90480551 90480837 + 0.666667 NA intron (NM_001365443, intron 2 of 6) L1MC5|LINE|L1 11055 NM_001365443 102723899 Hs.731917 NM_001365443 LOC102723899 - uncharacterized LOC102723899 protein-coding 221-13 chr10 108402473 108403009 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -333448 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 112-49 chr13 32726613 32726896 + 0.666667 NA intron (NM_015032, intron 19 of 34) L1MEf|LINE|L1 140302 NM_015032 23047 Hs.744901 NM_015032 ENSG00000083642 PDS5B APRIN|AS3|CG008 PDS5 cohesin associated factor B protein-coding 154.667-316 chr5 90637291 90637711 + 0.666667 NA intron (NR_003149, intron 10 of 89) intron (NR_003149, intron 10 of 89) 78704 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 131.667-145 chr4 65925467 65925788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -255132 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 157.667-223 chr4 145558463 145558837 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001003688, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001003688, exon 7 of 7) -41456 NR_126371 104326058 Hs.714527 NR_126371 ENSG00000250902 SMAD1-AS1 - SMAD1 antisense RNA 1 ncRNA 115-117 chr4 14688906 14689102 + 0.666667 NA intron (NR_126435, intron 3 of 6) intron (NR_126435, intron 3 of 6) 199165 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 115-152 chr8 84109761 84110074 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72870 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 173.333-13 chr1 118948494 118948882 + 0.666667 NA intron (NM_152380, intron 1 of 7) intron (NM_152380, intron 1 of 7) 39655 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 142.667-199 chr7 13691192 13691509 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 295164 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 114.667-47 chr11 42064636 42064824 + 0.666667 NA intron (NR_135065, intron 4 of 9) MER41C|LTR|ERV1 20728 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 123.333-15 chr1 161803361 161803654 + 0.666667 NA intron (NM_007348, intron 7 of 15) intron (NM_007348, intron 7 of 15) 37187 NM_007348 22926 Hs.492740 NM_007348 ENSG00000118217 ATF6 ACHM7|ATF6A activating transcription factor 6 protein-coding 143.667-173 chr3 172473813 172474099 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25500 NM_198407 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 205-33 chr14 82970981 82971316 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 328516 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 177.333-91 chr2 189222041 189222417 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -42468 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 115.333-155 chr4 63472725 63472904 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 936636 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 187.333-28 chr11 6387475 6387906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2784 NM_001365135 6609 Hs.498173 NM_000543 ENSG00000166311 SMPD1 ASM|ASMASE|NPD sphingomyelin phosphodiesterase 1 protein-coding 287-43 chrX 57307618 57308432 + 0.666667 NA intron (NR_148564, intron 2 of 11) L1PA16|LINE|L1 21171 NR_148564 158584 Hs.496205 NM_174912 ENSG00000165591 FAAH2 AMDD fatty acid amide hydrolase 2 protein-coding 172.667-76 chr2 17212773 17213260 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 305424 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 186-79 chr5 40738875 40739407 + 0.666667 NA intron (NM_012382, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 16820 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 130-115 chr6 168229982 168230307 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -3627 NR_134590 105378137 Hs.549668 NR_134590 ENSG00000237987 LOC105378137 - uncharacterized LOC105378137 ncRNA 166.667-118 chr2 150177836 150178311 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 78934 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 117.333-60 chr14 74719595 74719791 + 0.666667 NA intron (NM_015962, intron 4 of 7) AluJb|SINE|Alu 6549 NM_001318508 51077 Hs.579828 NM_015962 ENSG00000119616 FCF1 Bka|C14orf111|CGI-35|UTP24 FCF1 rRNA-processing protein protein-coding 176.333-152 chr7 17249763 17250086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48728 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 157.333-37 chr1 240176056 240176525 + 0.666667 NA intron (NM_020066, intron 2 of 17) LTR82A|LTR|ERVL 84407 NM_001305424 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 112-145 chr3 188387538 188387740 + 0.666667 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) AluSg|SINE|Alu 162234 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 129-50 chr18 628957 629288 + 0.666667 NA intron (NM_199167, intron 5 of 8) intron (NM_199167, intron 5 of 8) 12422 NM_199167 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 137-112 chr9 28886289 28886598 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 2512 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 113.333-149 chr20 11364776 11365084 + 0.666667 NA Intergenic (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -91547 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 148.667-59 chr10 107419085 107419380 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -254526 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 123.667-166 chr6 823261 823496 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -45120 NR_110853 101927691 Hs.552556 NR_110853 LOC101927691 - uncharacterized LOC101927691 ncRNA 154.667-241 chr3 94869794 94870186 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68273 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 140-25 chr11 96840259 96840593 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 332001 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 179.333-99 chr2 119616150 119616537 + 0.666667 NA intron (NR_073132, intron 15 of 24) L1MB7|LINE|L1 -62824 NM_001105198 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 132-34 chr13 45955976 45956229 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001330567, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_001330567, exon 19 of 19) 96644 NM_001076788 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 171.667-72 chr18 74867119 74867459 + 0.666667 NA intron (NM_017757, intron 3 of 7) intron (NM_017757, intron 3 of 7) 236326 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 154.333-99 chr14 98393881 98394322 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -317512 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 164-10 chr1 173893938 173894292 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001346115, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001346115, exon 4 of 4) 23212 NM_001365052 462 Hs.75599 NM_000488 ENSG00000117601 SERPINC1 AT3|AT3D|ATIII|ATIII-R2|ATIII-T1|ATIII-T2|THPH7 serpin family C member 1 protein-coding 123.667-143 chr4 73129947 73130174 + 0.666667 NA intron (NM_032217, intron 16 of 33) AluY|SINE|Alu -60301 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 116.667-106 chr2 198642567 198642876 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -267624 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 112.667-39 chr11 32394703 32394894 + 0.666667 NA intron (NR_160306, intron 7 of 9) intron (NR_160306, intron 7 of 9) 5602 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 179.333-130 chr3 128372751 128373211 + 0.666667 NA intron (NM_021937, intron 6 of 6) intron (NM_021937, intron 6 of 6) -90613 NR_037890 285224 Hs.683815 NR_037890 ENSG00000242049 DNAJB8-AS1 - DNAJB8 antisense RNA 1 ncRNA 120.333-84 chr18 61458802 61459011 + 0.666667 NA intron (NM_031891, intron 1 of 11) intron (NM_031891, intron 1 of 11) 125476 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 158-60 chr17 54064322 54064655 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 241561 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 151.333-420 chr8 85145794 85146185 + 0.666667 NA TTS (NM_001349638) TTS (NM_001349638) 31052 NR_134311 102723322 Hs.535913 NR_134311 ENSG00000260493 LOC102723322 - uncharacterized LOC102723322 ncRNA 115.667 chr1 14342150 14342366 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 77715 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 131-37 chr17 43482150 43482499 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1541 NR_136226 1659 Hs.463105 NM_004941 ENSG00000067596 DHX8 DDX8|Dhr2|HRH1|PRP22|PRPF22 DEAH-box helicase 8 protein-coding 137.333-169 chr6 25459611 25459932 + 0.666667 NA intron (NM_001173977, intron 8 of 36) intron (NM_001173977, intron 8 of 36) 180397 NM_001173977 55604 Hs.649550 NM_017640 ENSG00000079691 CARMIL1 CARMIL|CARMIL1a|LRRC16|LRRC16A|dJ501N12.1|dJ501N12.5 capping protein regulator and myosin 1 linker 1 protein-coding 157.667-23 chr10 25037634 25037939 + 0.666667 NA intron (NM_001270383, intron 2 of 5) intron (NM_001270383, intron 2 of 5) 21174 NM_024838 79896 Hs.645274 NM_024838 ENSG00000185875 THNSL1 TSH1 threonine synthase like 1 protein-coding 138.667-95 chr2 12246268 12246607 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 47307 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 167.667-181 chr6 44045435 44045900 + 0.666667 NA intron (NR_125864, intron 1 of 4) intron (NR_125864, intron 1 of 4) 28985 NR_125864 101929705 Hs.670378 NR_125864 ENSG00000237686 LOC101929705 - uncharacterized LOC101929705 ncRNA 183.333-12 chr1 222878220 222878594 + 0.666667 NA intron (NM_032890, intron 1 of 9) intron (NM_032890, intron 1 of 9) -50017 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 115-150 chr8 42316219 42316404 + 0.666667 NA exon (NM_001556, exon 10 of 22) exon (NM_001556, exon 10 of 22) -22183 NM_002690 5423 Hs.654484 NM_002690 ENSG00000070501 POLB - DNA polymerase beta protein-coding 132-65 chr2 193866572 193866896 + 0.666667 NA Intergenic (ATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -477535 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 160.667-109 chr15 71875659 71875982 + 0.666667 NA exon (NM_006901, exon 32 of 42) exon (NM_006901, exon 32 of 42) 65266 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 130.333-96 chr19 55217757 55218105 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -8430 NM_001161440 5794 Hs.179770 NM_002842 ENSG00000080031 PTPRH R-PTP-H|SAP1 protein tyrosine phosphatase receptor type H protein-coding 117.333-110 chr2 199331613 199331911 + 0.666667 NA intron (NM_001172509, intron 7 of 10) intron (NM_001172509, intron 7 of 10) 126177 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 155.333-159 chr2 51846783 51847079 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) intron (NR_135237, intron 6 of 10) -523717 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 166-74 chr22 24766342 24766711 + 0.666667 NA TTS (NR_001283) TTS (NR_001283) 2025 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 135-36 chr16 66235216 66235594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -131286 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 117-25 chr10 86518797 86519008 + 0.666667 NA intron (NM_001318328, intron 1 of 18) intron (NM_001318328, intron 1 of 18) 2882 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 225-24 chr14 63408358 63408851 + 0.666667 NA intron (NR_104104, intron 4 of 12) intron (NR_104104, intron 4 of 12) -89669 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 158.667-351 chr9 72142325 72142730 + 0.666667 NA intron (NM_001242507, intron 1 of 13) AluYc|SINE|Alu -6824 NM_001242505 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 159.667-247 chr5 5448958 5449423 + 0.666667 NA intron (NM_015325, intron 10 of 18) intron (NM_015325, intron 10 of 18) 26513 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 130.333-116 chr20 47881619 47881919 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -95153 NM_198596 55959 Hs.162016 NM_018837 ENSG00000196562 SULF2 HSULF-2 sulfatase 2 protein-coding 233.333-27 chr11 50238292 50238753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 59940 NR_003034 441601 Hs.144683 NR_003034 ENSG00000255042 LOC441601 - septin 7 pseudogene pseudo 244.666-21 chr18 79121997 79122686 + 0.666667 NA intron (NR_148360, intron 4 of 31) intron (NR_148360, intron 4 of 31) 52947 NM_001306085 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 268.666-3 chr10 14415025 14415760 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -21184 NR_031668 100302116 NR_031668 ENSG00000221371 MIR1265 MIRN1265|hsa-mir-1265 microRNA 1265 ncRNA 140.333-124 chr20 56770053 56770373 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 140907 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 200-120 chr4 161788585 161789099 + 0.666667 NA intron (NM_001128428, intron 4 of 14) AluJr4|SINE|Alu -233891 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 270.666-3 chr11 63851286 63852074 + 0.666667 NA intron (NM_001163296, intron 1 of 16) intron (NM_001163296, intron 1 of 16) 12570 NM_001163297 2011 Hs.567261 NM_004954 ENSG00000072518 MARK2 EMK-1|EMK1|PAR-1|Par-1b|Par1b microtubule affinity regulating kinase 2 protein-coding 136.333-134 chr3 160252283 160252646 + 0.666667 NA intron (NR_148401, intron 18 of 18) MER4A1_|LTR|ERV1 26828 NM_001168214 401097 Hs.729755 NM_001168214 ENSG00000180044 C3orf80 - chromosome 3 open reading frame 80 protein-coding 128.333-108 chr2 123759193 123759529 + 0.666667 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 265813 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 118.333-180 chr6 84265148 84265501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37681 NM_001286206 22832 Hs.485865 NM_014895 ENSG00000135315 CEP162 C6orf84|KIAA1009|QN1 centrosomal protein 162 protein-coding 144.333-46 chr12 10712452 10712795 + 0.666667 NA intron (NM_003651, intron 5 of 9) intron (NM_003651, intron 5 of 9) 10700 NM_003651 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 132-26 chr11 54958068 54958408 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 251406 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 117-40 chr12 131518730 131518999 + 0.666667 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 129257 NR_146868 105370085 Hs.739274 NR_146868 LINC02414 - long intergenic non-protein coding RNA 2414 ncRNA 138-99 chr6 73136579 73136898 + 0.666667 NA non-coding (NR_046621, exon 2 of 5) non-coding (NR_046621, exon 2 of 5) 6776 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 144.667-267 chr6 75580033 75580320 + 0.666667 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger -21333 NM_001304792 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 129.667 chr1 25522144 25522452 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21287 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 197.667-154 chr8 142106772 142107194 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69356 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 163.333-161 chr20 14471897 14472235 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) intron (NM_001351663, intron 3 of 17) -82318 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 133.333-64 chr17 63281615 63281957 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 8 of 25) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 158481 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 111.667-57 chr12 22597210 22597478 + 0.666667 NA intron (NR_135030, intron 2 of 3) intron (NR_135030, intron 2 of 3) 27702 NR_135031 105369691 Hs.556287 NR_135030 LOC105369691 - uncharacterized LOC105369691 ncRNA 113.667-221 chr9 3240814 3241096 + 0.666667 NA intron (NM_134428, intron 16 of 17) intron (NM_134428, intron 16 of 17) 59366 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 142.333-49 chr12 1380644 1380925 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 16 of 19) intron (NR_027948, intron 16 of 19) -119707 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 146-94 chr4 67502780 67503146 + 0.666667 NA intron (NR_155754, intron 12 of 18) L2a|LINE|L2 42540 NR_155754 1060 Hs.479867 NM_001812 ENSG00000145241 CENPC CENP-C|CENPC1|MIF2|hcp-4 centromere protein C protein-coding 186-66 chr3 112178551 112178937 + 0.666667 NA intron (NM_001320531, intron 22 of 27).2 L1MC5a|LINE|L1 45321 NR_157393 112806053 NR_157393 TBILA - TGF-beta induced lncRNA ncRNA 161-72 chr4 125961037 125961345 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 453932 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 111.667-136 chr2 116537859 116538072 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 1194150 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 136-8 chr10 28813686 28813960 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -17773 NR_038374 100507605 Hs.119207 NR_038374 ENSG00000235824 LINC00837 - long intergenic non-protein coding RNA 837 ncRNA 131.667-156 chr5 19562972 19563194 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 8 of 12) intron (NM_001349559, intron 8 of 12) 323189 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 133.333-6 chr1 101407657 101407936 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83959 NR_126402 104355286 Hs.568671 NR_126402 ENSG00000231671 LINC01307 - long intergenic non-protein coding RNA 1307 ncRNA 167.333-177 chr3 103458224 103458520 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65744 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 129.333-179 chr7 85195814 85196058 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74005 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 123.333-108 chr2 103073344 103073658 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -89072 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 172.667-166 chr9 81504343 81504755 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 184986 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 177-15 chr12 41810385 41810733 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 46370 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 134-118 chr9 131042452 131042804 + 0.666667 NA intron (NM_006059, intron 7 of 27) intron (NM_006059, intron 7 of 27) 33454 NM_006059 10319 Hs.201805 NM_006059 ENSG00000050555 LAMC3 OCCM laminin subunit gamma 3 protein-coding 142-65 chr2 143812184 143812501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -124725 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 201.333-82 chr13 43860939 43861277 + 0.666667 NA intron (NM_001350617, intron 2 of 4) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -18070 NM_001128303 144811 Hs.210586 NM_153218 ENSG00000179630 LACC1 C13orf31|FAMIN laccase domain containing 1 protein-coding 183-105 chrX 39176868 39177171 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 150343 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 183.666 chr1 71304697 71305238 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 223643 NR_046217 100852410 Hs.535534 NR_046217 ENSG00000229956 ZRANB2-AS2 - ZRANB2 antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 140.667-113 chr2 43378228 43378516 + 0.666667 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) L1MEi|LINE|L1 151161 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 125-50 chr18 2851800 2852032 + 0.666667 NA intron (NM_032048, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 4910 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 127.667-173 chr8 52781108 52781338 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66757 NM_001083617 9821 Hs.196102 NM_014781 ENSG00000023287 RB1CC1 ATG17|CC1|FIP200|PPP1R131 RB1 inducible coiled-coil 1 protein-coding 262-23 chr14 74395299 74395795 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30663 NM_001105579 646658 Hs.12400 NM_001105579 ENSG00000183379 SYNDIG1L CAPUCIN|DSPC1|IFITMD4|TMEM90A synapse differentiation inducing 1 like protein-coding 128.333-91 chr2 19997631 19997936 + 0.666667 NA intron (NM_002381, intron 5 of 7) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 7579 NR_110235 101928222 Hs.6985 NR_110235 LOC101928222 - uncharacterized LOC101928222 ncRNA 112.667-200 chr4 182037332 182037524 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 107087 NR_125905 90768 Hs.175465 NR_027107 TENM3-AS1 - TENM3 antisense RNA 1 ncRNA 141.667-19 chr1 217919774 217920092 + 0.666667 NA non-coding (NR_048550, exon 4 of 4) non-coding (NR_048550, exon 4 of 4) 27033 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 147.333-287 chr7 7515264 7515668 + 0.666667 NA intron (NM_001037763, intron 8 of 34) intron (NM_001037763, intron 8 of 34) 20407 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 169-71 chr3 137568379 137568737 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -195757 NM_004189 8403 Hs.248184 NM_004189 ENSG00000168875 SOX14 SOX28 SRY-box transcription factor 14 protein-coding 146.667-87 chr13 52686977 52687353 + 0.666667 NA intron (NM_001130912, intron 13 of 13) intron (NM_001130912, intron 13 of 13) 34329 NM_001130912 10910 Hs.281902 NM_006704 ENSG00000165416 SUGT1 SGT1 SGT1 homolog, MIS12 kinetochore complex assembly cochaperone protein-coding 194-104 chr4 146568951 146569446 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -47227 NM_001317817 84068 Hs.659209 NM_032128 ENSG00000120519 SLC10A7 C4orf13|P7|SSASKS solute carrier family 10 member 7 protein-coding 114-98 chr4 40390607 40390863 + 0.666667 NA Intergenic LTR41C|LTR|ERVL 55402 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 144-126 chr4 91015007 91015289 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) intron (NM_001145065, intron 9 of 10) 780117 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 126.667 chr1 6026608 6026847 + 0.666667 NA intron (NM_172130, intron 1 of 14) intron (NM_172130, intron 1 of 14) 394 NM_172130 8514 Hs.440497 NM_003636 ENSG00000069424 KCNAB2 AKR6A5|HKvbeta2|HKvbeta2.1|HKvbeta2.2|KCNA2B|KV-BETA-2 potassium voltage-gated channel subfamily A regulatory beta subunit 2 protein-coding 169-92 chr6 121763231 121763651 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 327795 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 175.333-120 chr3 89626820 89627257 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 519417 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 155.667-332 chr7 79212096 79212420 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L1ME3G|LINE|L1 203270 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 157.667-131 chr18 76279197 76279508 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69842 NR_146507 105372207 Hs.303880 NR_146507 LINC01893 - long intergenic non-protein coding RNA 1893 ncRNA 203.333-195 chr4 100923518 100923951 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -248621 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 178-23 chr11 26131315 26131703 + 0.666667 NA Intergenic Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger -57614 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 185.667-109 chr6 129073230 129073669 + 0.666667 NA intron (NM_000426, intron 3 of 64) L1MEg|LINE|L1 190308 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 132.667-7 chr1 152243562 152243785 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -19477 NM_001009931 388697 Hs.490162 NM_001009931 ENSG00000197915 HRNR FLG3|S100A16|S100a18 hornerin protein-coding 158.333-112 chr17 59031308 59031625 + 0.666667 NA intron (NR_148346, intron 18 of 23) intron (NR_148346, intron 18 of 23) 75414 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 155.667-84 chr13 71284998 71285310 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 270013 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 114-133 chr6 45945660 45945868 + 0.666667 NA intron (NM_001114086, intron 3 of 5) intron (NM_001114086, intron 3 of 5) -8167 NR_045672 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 261.667-40 chr2 179639101 179639568 + 0.666667 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) L1MA7|LINE|L1 20860 NM_001352812 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 148.333-167 chr18 7986887 7987179 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 380001 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 160-22 chr10 125457259 125457586 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -116949 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-104 chr15 87219879 87220206 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -231616 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 137.333-76 chr18 6222521 6222771 + 0.666667 NA intron (NM_001365769, intron 10 of 16) intron (NM_001365769, intron 10 of 16) -34098 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 132.333-166 chr7 68877912 68878282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 719527 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 152-137 chr6 142357437 142357845 + 0.666667 NA intron (NM_198569, intron 2 of 24) intron (NM_198569, intron 2 of 24) 55634 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 112.333-101 chr18 3187037 3187231 + 0.666667 NA intron (NM_019856, intron 5 of 36) intron (NM_019856, intron 5 of 36) 32834 NM_019856 8736 Hs.464469 NM_003803 ENSG00000101605 MYOM1 SKELEMIN myomesin 1 protein-coding 155.333-319 chr5 178601343 178601700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11128 NM_173465 91522 Hs.660026 NM_173465 ENSG00000050767 COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain protein-coding 119.667-20 chr10 21399327 21399534 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26480 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 216.333-70 chr2 28193885 28194363 + 0.666667 NA intron (NR_120504, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 12837 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 151.333-427 chr8 111943352 111943795 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 566934 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 228.333-61 chr3 28041721 28042278 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -199620 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 132.667-180 chr8 108624803 108625057 + 0.666667 NA intron (NR_136411, intron 2 of 3) intron (NR_136411, intron 2 of 3) 162664 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 150.667-363 chr8 28302649 28303064 + 0.666667 NA Intergenic Looper|DNA|PiggyBac -14412 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 175.667-112 chr4 184879440 184879954 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19764 NR_039977 100506229 Hs.378150 NR_039975 LINC01093 - long intergenic non-protein coding RNA 1093 ncRNA 131.333-49 chr14 25929027 25929301 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 624266 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 138.667-112 chr2 146928614 146928910 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 341705 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 193.667-77 chr21 16195478 16195908 + 0.666667 NA intron (NR_136543, intron 1 of 4) intron (NR_136543, intron 1 of 4) 1314 NR_027791 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 149.333-268 chr3 155588155 155588562 + 0.666667 NA intron (NM_001349252, intron 4 of 24) intron (NM_001349252, intron 4 of 24) 87985 NM_001130961 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 158-81 chr20 52662860 52663286 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42235 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 113.667-6 chr1 51108788 51109009 + 0.666667 NA intron (NM_001136508, intron 1 of 4) L1MA4|LINE|L1 6670 NM_001136508 284546 Hs.176177 NM_001136508 ENSG00000204006 C1orf185 - chromosome 1 open reading frame 185 protein-coding 179.667-51 chr14 83346621 83346914 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 704135 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 164.333-34 chr10 119210989 119211331 + 0.666667 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) intron (NM_005308, intron 1 of 15) 3589 NM_005308 2869 Hs.524625 NM_005308 ENSG00000198873 GRK5 FP2025|GPRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 protein-coding 140.333-8 chr1 72917847 72918144 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -388175 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 251-76 chr7 2073913 2074642 + 0.666667 NA intron (NM_001013837, intron 11 of 18) intron (NM_001013837, intron 11 of 18) 14775 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 179.667-141 chr8 87832399 87832866 + 0.666667 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 41383 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 129-9 chr1 197597395 197597637 + 0.666667 NA intron (NR_125340, intron 12 of 19) intron (NR_125340, intron 12 of 19) 177964 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 113.333-135 chr2 148037078 148037274 + 0.666667 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -15572 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 118.667-164 chr5 165102152 165102361 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 631977 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 135.667-18 chr10 67537015 67537276 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 4 of 17) intron (NM_001127384, intron 4 of 17) 128515 NM_001291133 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 184.667-21 chr11 29165054 29165459 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -429157 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 136.667-34 chr11 88271861 88272180 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 65716 NM_001114173 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 197-37 chr15 54567272 54567704 + 0.666667 NA intron (NM_001329919, intron 28 of 31) intron (NM_001329919, intron 28 of 31) -489259 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 134.333-155 chr6 148276246 148276490 + 0.666667 NA intron (NM_001346505, intron 1 of 19) intron (NM_001346505, intron 1 of 19) 4040 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 192.333-29 chr11 32292499 32292951 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 107675 NM_001367854 7490 Hs.591980 NM_000378 ENSG00000184937 WT1 AWT1|GUD|NPHS4|WAGR|WIT-2|WT33 WT1 transcription factor protein-coding 149.333-94 chr12 61746649 61746995 + 0.666667 NA intron (NM_178539, intron 4 of 4) intron (NM_178539, intron 4 of 4) 446017 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 116.667-131 chr3 87852278 87852585 + 0.666667 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) intron (NM_001322210, intron 2 of 2) 59725 NM_001322209 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 115.333-162 chr4 101512836 101513176 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 165229 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 159.667-239 chr4 106598562 106598921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 165117 NR_147150 105377355 Hs.253188 NR_147150 ENSG00000249613 LINC02173 - long intergenic non-protein coding RNA 2173 ncRNA 126.667-178 chr8 112643283 112643638 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_031745) promoter-TSS (NR_031745) -33 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 128-12 chr11 4438962 4439201 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -10214 NM_001005172 119774 Hs.553568 NM_001005172 ENSG00000181963 OR52K2 OR11-7 olfactory receptor family 52 subfamily K member 2 protein-coding 136.667-176 chr8 103637964 103638225 + 0.666667 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1MD3|LINE|L1 -136184 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 118-9 chr10 8724061 8724376 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129827 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 115.333-215 chr8 66813156 66813443 + 0.666667 NA intron (NM_001204173, intron 6 of 18) intron (NM_001204173, intron 6 of 18) 38094 NM_170709 23678 Hs.613417 NM_013257 ENSG00000104205 SGK3 CISK|SGK2|SGKL serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3 protein-coding 178.667-98 chr22 38340351 38340717 + 0.666667 NA intron (NM_001289912, intron 4 of 14) AluSx1|SINE|Alu -22450 NM_001894 1454 Hs.474833 NM_001894 ENSG00000213923 CSNK1E CKIe|CKIepsilon|HCKIE casein kinase 1 epsilon protein-coding 155.667-251 chr4 84448342 84448738 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49694 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 207-132 chr9 132721549 132722017 + 0.666667 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 51319 NM_012204 9329 Hs.22302 NM_012204 ENSG00000125484 GTF3C4 KAT12|TF3C-delta|TFIII90|TFIIIC290|TFIIIC90|TFIIICDELTA general transcription factor IIIC subunit 4 protein-coding 193.333-202 chrX 72204313 72204702 + 0.666667 NA TTS (NM_017669) TTS (NM_017669) 22750 NR_033187 5303 Hs.655623 NM_006223 ENSG00000102309 PIN4 EPVH|PAR14|PAR17 peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 protein-coding 120.667-121 chr3 185269250 185269460 + 0.666667 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -13586 NR_038322 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 124.667-23 chr10 28189224 28189504 + 0.666667 NA intron (NR_134518, intron 2 of 16) AluJb|SINE|Alu 92759 NM_173496 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 176.667-58 chr15 55494359 55494778 + 0.666667 NA intron (NM_001033560, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 4016 NR_037923 100533483 Hs.285051 NR_037923 ENSG00000261771 DNAAF4-CCPG1 DYX1C1-CCPG1 DNAAF4-CCPG1 readthrough (NMD candidate) ncRNA 152-5 chr1 96323621 96323952 + 0.666667 NA intron (NR_110693, intron 3 of 5) L1MA9|LINE|L1 50339 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 214.667-77 chr20 63107404 63107953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5359 NR_003245 768097 Hs.635159 NR_003245 ENSG00000231133 HAR1B HAR1R|LINC00065|NCRNA00065 highly accelerated region 1B ncRNA 156-12 chr1 167315852 167316132 + 0.666667 NA intron (NR_037163, intron 2 of 16) L1MD2|LINE|L1 -13078 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 129.667-68 chr16 5690957 5691191 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58607 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 188-118 chr8 140470469 140470918 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12114 NM_031466 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 165.333-146 chr20 50880400 50880840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29171 NM_001282532 23394 Hs.293736 NM_015339 ENSG00000101126 ADNP ADNP1|HVDAS|MRD28 activity dependent neuroprotector homeobox protein-coding 140.333-161 chr4 76725658 76726048 + 0.666667 NA intron (NM_020859, intron 3 of 10) intron (NM_020859, intron 3 of 10) 150302 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 128-65 chr22 25854018 25854332 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 21 of 43) intron (NM_001318245, intron 21 of 43) 111987 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 179.667-114 chr5 81673530 81673980 + 0.666667 NA intron (NM_012446, intron 1 of 16) L3|LINE|CR1 77498 NM_001256733 23635 Hs.102735 NM_012446 ENSG00000145687 SSBP2 HSPC116|SOSS-B2 single stranded DNA binding protein 2 protein-coding 113-194 chr7 51119361 51119564 + 0.666667 NA intron (NM_015198, intron 6 of 12) intron (NM_015198, intron 6 of 12) 197347 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 143.333-42 chr10 90600152 90600566 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59554 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 157.667-329 chr8 80513326 80513621 + 0.666667 NA intron (NM_001105539, intron 2 of 5) intron (NM_001105539, intron 2 of 5) 27247 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 242-32 chr17 66634953 66635525 + 0.666667 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -151833 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 148.333-55 chr10 116791675 116792070 + 0.666667 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) intron (NM_001330164, intron 2 of 12) 35696 NR_162126 113218494 NR_162126 MIR9851 - microRNA 9851 ncRNA 115.333-26 chr10 76149531 76149715 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) MamTip2|DNA|hAT-Tip100 366862 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 233.667-35 chr2 18239109 18239637 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 321280 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 179.667-75 chr2 37787466 37787873 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42042 NR_110011 101929559 Hs.468200 NR_110011 ENSG00000237803 LINC00211 NCRNA00211 long intergenic non-protein coding RNA 211 ncRNA 197.667-114 chr4 114907536 114907978 + 0.666667 NA intron (NM_022569, intron 6 of 13) L2c|LINE|L2 205863 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 225.667-64 chr5 119982153 119982646 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 352840 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 271-7 chr1 220964982 220965669 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85185 NR_046901 100873924 Hs.645593 NR_046901 ENSG00000257551 HLX-AS1 - HLX antisense RNA 1 ncRNA 130.333-34 chr10 72481999 72482248 + 0.666667 NA intron (NM_001195519, intron 1 of 6) intron (NM_001195519, intron 1 of 6) 41863 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 155.667-63 chr12 7040949 7041312 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19588 NM_201442 716 Hs.458355 NM_001734 ENSG00000182326 C1S EDSPD2 complement C1s protein-coding 134-22 chr12 69937753 69938043 + 0.666667 NA intron (NM_182530, intron 19 of 24) MIR|SINE|MIR 112671 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 145.333-170 chr22 28325492 28325859 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1ME1|LINE|L1 -134194 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 180.667-50 chr16 81815764 81816186 + 0.666667 NA intron (NM_002661, intron 2 of 32) AluSz|SINE|Alu 36684 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 148-156 chr8 72965686 72966119 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -42962 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 113-41 chr12 23814988 23815295 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 6 of 17) L3|LINE|CR1 134529 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 197.333-127 chr2 230958890 230959336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33871 NM_005683 9290 Hs.114545 NM_005683 ENSG00000135898 GPR55 LPIR1 G protein-coupled receptor 55 protein-coding 227-57 chr8 79926537 79927077 + 0.666667 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) -55070 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 153.333-413 chr8 89616100 89616546 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141388 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 208-138 chr5 93841345 93841698 + 0.666667 NA intron (NM_032042, intron 7 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger -99921 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 125-101 chr6 91574888 91575086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53327 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 173.333-183 chr7 34278794 34279130 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 373423 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 187.333-42 chr12 12242917 12243323 + 0.666667 NA intron (NM_002336, intron 2 of 22).2 intron (NM_002336, intron 2 of 22).2 23924 NM_002336 4040 Hs.584775 NM_002336 ENSG00000070018 LRP6 ADCAD2|STHAG7 LDL receptor related protein 6 protein-coding 116.667-199 chr8 86471218 86471475 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37340 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 179-48 chr18 72364818 72365196 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 179335 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 150-44 chr14 49527837 49528128 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 58398 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 168.667-95 chr2 26596263 26596690 + 0.666667 NA intron (NM_001029881, intron 3 of 6) AluSq2|SINE|Alu 33889 NM_001105519 339778 Hs.407083 NM_001105519 ENSG00000173557 C2orf70 - chromosome 2 open reading frame 70 protein-coding 173.333-173 chr6 64038843 64039196 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 33 of 43) AluSx1|SINE|Alu 232183 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 116.667-153 chr5 3746587 3746890 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 150906 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 116.667-104 chr2 141682676 141682885 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 448921 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 171-32 chr2 9772967 9773348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70285 NM_001318976 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 111.667-48 chr11 45166919 45167188 + 0.666667 NA intron (NM_001256695, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 19710 NM_001256696 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 178-57 chr18 12494627 12495159 + 0.666667 NA intron (NM_020148, intron 7 of 15) AluY|SINE|Alu 62119 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 129-118 chr6 152826300 152826516 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 75611 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 354-26 chr8 109804675 109805444 + 0.666667 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL -113268 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 182-37 chr17 4114402 4114780 + 0.666667 NA intron (NM_015113, intron 3 of 54) intron (NM_015113, intron 3 of 54) 28439 NM_015113 23140 Hs.277624 NM_015113 ENSG00000074755 ZZEF1 ZZZ4 zinc finger ZZ-type and EF-hand domain containing 1 protein-coding 212-152 chr8 87076097 87076663 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 209965 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 185.333-146 chr4 167662249 167662686 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -427877 NM_001204352 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 124.667-34 chr10 120065374 120065717 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 107032 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 129.333-32 chr11 21537270 21537545 + 0.666667 NA intron (NM_001288713, intron 17 of 20) L2a|LINE|L2 -655678 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 190.333-5 chr1 46645952 46646374 + 0.666667 NA intron (NM_022745, intron 6 of 8) L1ME3C|LINE|L1 19715 NM_001243728 64756 Hs.100874 NM_022745 ENSG00000123472 ATPAF1 ATP11|ATP11p ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 protein-coding 173.333-48 chr12 124765503 124765906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73967 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 131.333-115 chr3 83779895 83780202 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1089527 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 150.333-368 chr6 115577288 115577581 + 0.666667 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 66401 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 156.333-212 chr20 52742413 52742676 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121706 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 123.333-212 chr8 100572301 100572576 + 0.666667 NA TTS (NM_001363720) TTS (NM_001363720) -12679 NM_001270378 157567 Hs.530199 NM_198401 ENSG00000186106 ANKRD46 ANK-S|GENX-115279 ankyrin repeat domain 46 protein-coding 135.333-34 chr11 66082098 66082333 + 0.666667 NA intron (NM_018026, intron 1 of 23) AluJr|SINE|Alu 11943 NM_018026 55690 Hs.644326 NM_018026 ENSG00000175115 PACS1 MRD17|SHMS phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 protein-coding 159.333-69 chr12 52369635 52370054 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2363 NM_002283 3891 Hs.182507 NM_002283 ENSG00000135443 KRT85 ECTD4|HB5|Hb-5|K85|KRTHB5|hHb5 keratin 85 protein-coding 163.667-99 chr2 13549810 13550162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -542973 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 147-139 chr8 76772868 76773250 + 0.666667 NA intron (NM_024721, intron 3 of 10) intron (NM_024721, intron 3 of 10) -89784 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 197-80 chr4 35423192 35423610 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 820538 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 195.333-30 chr10 43354984 43355470 + 0.666667 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -16409 NM_173160 53828 Hs.130497 NM_173160 ENSG00000150201 FXYD4 CHIF FXYD domain containing ion transport regulator 4 protein-coding 178.333-85 chr2 155640313 155640605 + 0.666667 NA Intergenic AluYm1|SINE|Alu 614472 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 144-57 chr14 81501977 81502288 + 0.666667 NA intron (NM_005065, intron 6 of 20) intron (NM_005065, intron 6 of 20) 31721 NM_005065 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 181.667-92 chr3 30971102 30971463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76621 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 179.333-58 chr13 99194255 99194655 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 6300 NR_036532 100289373 Hs.225914 NR_036531 ENSG00000228889 UBAC2-AS1 - UBAC2 antisense RNA 1 ncRNA 123.333-144 chr3 42942817 42943093 + 0.666667 NA TTS (NM_001205272) TTS (NM_001205272) -6170 NR_122033 100506275 Hs.517918 NR_122033 ENSG00000206552 KRBOX1-AS1 - KRBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 116.333-126 chr2 173247861 173248115 + 0.666667 NA intron (NM_016653, intron 16 of 19) LTR35B|LTR|ERV1 34048 NR_033882 339751 Hs.570083 NR_033882 ENSG00000238133 MAP3K20-AS1 MLK7-AS1 MAP3K20 antisense RNA 1 ncRNA 139.667-56 chr14 65813156 65813487 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 342219 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 136.333-169 chr5 78395976 78396289 + 0.666667 NA intron (NR_110885, intron 2 of 7) L1MC1|LINE|L1 35515 NR_110885 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 117.667-140 chr4 98946208 98946447 + 0.666667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -15690 NM_001968 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 115.333-98 chr17 79361085 79361372 + 0.666667 NA intron (NM_001082575, intron 2 of 14) intron (NM_001082575, intron 2 of 14) 154920 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 207.333-228 chr5 135789951 135790386 + 0.666667 NA intron (NM_001349335, intron 3 of 10) SATR2|Satellite|Satellite 12907 NR_049867 100847082 NR_049867 ENSG00000265924 MIR5692C1 - microRNA 5692c-1 ncRNA 168-91 chr5 84253773 84254173 + 0.666667 NA intron (NM_005711, intron 2 of 10) intron (NM_005711, intron 2 of 10) 130894 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 133-59 chr3 23400325 23400633 + 0.666667 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 197152 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 202.333-50 chr12 99705155 99705596 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 8 of 25) HAL1|LINE|L1 57622 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 112.333-35 chr11 55390185 55390458 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR 22437 NM_001005275 81328 Hs.554529 NM_001005275 ENSG00000181958 OR4A15 OR11-118 olfactory receptor family 4 subfamily A member 15 protein-coding 133.333-15 chr1 185534230 185534472 + 0.666667 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 94137 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 209.333-36 chr11 77697143 77697621 + 0.666667 NA intron (NM_016578, intron 7 of 15) intron (NM_016578, intron 7 of 15) -59576 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 192-69 chr2 9946608 9947125 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -4827 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 157.333-372 chrX 68358184 68358548 + 0.666667 NA intron (NM_002547, intron 2 of 24) intron (NM_002547, intron 2 of 24) 75129 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 144.667-182 chr22 41600290 41600556 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_015704, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_015704, exon 6 of 6) -10583 NM_002676 5372 Hs.75835 NM_002676 ENSG00000100417 PMM1 PMM 1|PMMH-22|Sec53 phosphomannomutase 1 protein-coding 118.333-136 chr3 94310130 94310339 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 247173 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 173.333-184 chr7 47405500 47405906 + 0.666667 NA intron (NM_022748, intron 13 of 30) intron (NM_022748, intron 13 of 30) 59100 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 157.333-298 chr6 14117663 14117940 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_004233) promoter-TSS (NM_004233) 29 NM_004233 9308 Hs.595133 NM_004233 ENSG00000112149 CD83 BL11|HB15 CD83 molecule protein-coding 194.667-132 chr5 181223237 181223625 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_039781) promoter-TSS (NR_039781) 150 NR_045218 90933 Hs.441488 NM_033549 ENSG00000146063 TRIM41 RINCK tripartite motif containing 41 protein-coding 117.667-165 chr6 56225388 56225601 + 0.666667 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) intron (NM_001318752, intron 1 of 28) 22086 NR_134849 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 112-14 chr10 13452705 13452964 + 0.666667 NA intron (NM_001370075, intron 5 of 8) intron (NM_001370075, intron 5 of 8) 50142 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 197.667-60 chr19 10319916 10320342 + 0.666667 NA intron (NM_001366174, intron 10 of 13) intron (NM_001366174, intron 10 of 13) -4114 NM_001031734 112812 Hs.654865 NM_080665 ENSG00000267673 FDX2 FDX1L|MEOAL ferredoxin 2 protein-coding 179.333-79 chr17 43636866 43637236 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 24512 NM_013999 4222 Hs.438 NM_004527 ENSG00000005102 MEOX1 KFS2|MOX1 mesenchyme homeobox 1 protein-coding 116.667-114 chr21 42828923 42829170 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -49052 NR_135517 101928311 Hs.570404 NR_135517 ENSG00000283051 LINC01668 - long intergenic non-protein coding RNA 1668 ncRNA 146-9 chr10 47208201 47208555 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91819 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 214-79 chr20 35965226 35965836 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -3059 NM_080834 140894 Hs.732697 NM_080834 ENSG00000149646 CNBD2 C20orf152|CNMPD1 cyclic nucleotide binding domain containing 2 protein-coding 136.667-115 chr3 23422995 23423351 + 0.666667 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 219846 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 252.667-94 chr7 8108250 8108833 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 139745 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 218-91 chr5 60064674 60065258 + 0.666667 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) intron (NM_001349243, intron 2 of 16) -171240 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 196-75 chr18 2926220 2926763 + 0.666667 NA intron (NM_014646, intron 13 of 19) intron (NM_014646, intron 13 of 19) 20132 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 120.667-7 chr1 145795262 145795483 + 0.666667 NA intron (NM_014455, intron 1 of 8) LTR12_|LTR|ERV1 28723 NM_014455 27246 Hs.523550 NM_014455 ENSG00000265491 RNF115 BCA2|ZNF364 ring finger protein 115 protein-coding 164.667-250 chr8 137630237 137630660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -216860 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 144-164 chrX 31772451 31772721 + 0.666667 NA intron (NM_000109, intron 51 of 78) intron (NM_000109, intron 51 of 78) -264288 NM_004014 1756 Hs.495912 NM_000109 ENSG00000198947 DMD BMD|CMD3B|DXS142|DXS164|DXS206|DXS230|DXS239|DXS268|DXS269|DXS270|DXS272|MRX85 dystrophin protein-coding 112.667-3 chr1 63536105 63536330 + 0.666667 NA intron (NM_032437, intron 6 of 13) intron (NM_032437, intron 6 of 13) 12692 NM_032437 84455 Hs.652324 NM_032437 ENSG00000203965 EFCAB7 - EF-hand calcium binding domain 7 protein-coding 118.333-41 chr11 40324474 40324747 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 -31480 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 122.667-138 chr4 79655152 79655404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 162685 NR_038826 100506035 Hs.507664 NR_038826 ENSG00000250334 LINC00989 - long intergenic non-protein coding RNA 989 ncRNA 113.333-160 chr22 28728801 28729007 + 0.666667 NA intron (NM_001257387, intron 2 of 15) AluJb|SINE|Alu 12916 NM_001005735 11200 Hs.291363 NM_007194 ENSG00000183765 CHEK2 CDS1|CHK2|HuCds1|LFS2|PP1425|RAD53|hCds1 checkpoint kinase 2 protein-coding 126.667-116 chr3 191894224 191894466 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -344285 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 114.667-131 chr2 101146026 101146264 + 0.666667 NA intron (NM_001102426, intron 1 of 19) intron (NM_001102426, intron 1 of 19) 5302 NM_001330348 11138 Hs.442657 NM_007063 ENSG00000204634 TBC1D8 AD3|GRAMD8|HBLP1|TBC1D8A|VRP TBC1 domain family member 8 protein-coding 201.667-87 chr4 129060740 129061265 + 0.666667 NA intron (NM_001300898, intron 2 of 5) L1M2a|LINE|L1 32537 NM_001300897 132320 Hs.654690 NM_144643 ENSG00000151466 SCLT1 CAP-1A|CAP1A sodium channel and clathrin linker 1 protein-coding 122-53 chr2 123490184 123490385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -416803 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 176-15 chr10 120423808 120424193 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32954 NM_001318167 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 113-76 chr16 26525182 26525419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 500063 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 155.333-249 chr3 195324573 195324871 + 0.666667 NA intron (NM_012287, intron 9 of 22) AluSx|SINE|Alu -53563 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 158.667-294 chr6 135754050 135754477 + 0.666667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -97438 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 139.667-220 chrX 117691337 117691606 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282267 NM_033495 90293 Hs.348262 NM_033495 ENSG00000003096 KLHL13 BKLHD2 kelch like family member 13 protein-coding 150-19 chr10 99896416 99896848 + 0.666667 NA intron (NM_015221, intron 9 of 16) intron (NM_015221, intron 9 of 16) 17460 NM_001318327 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 126.333-108 chr20 59911880 59912094 + 0.666667 NA intron (NM_014258, intron 13 of 44) X7A_LINE|LINE|CR1 21650 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 116-42 chr14 67703003 67703196 + 0.666667 NA intron (NM_152443, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 1213 NM_152443 145226 Hs.415322 NM_152443 ENSG00000139988 RDH12 LCA13|RP53|SDR7C2 retinol dehydrogenase 12 protein-coding 202.667-72 chr17 74597104 74597555 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2511 NR_158152 101928343 Hs.93825 NR_158152 LOC101928343 - uncharacterized LOC101928343 ncRNA 130.333-52 chr12 48720166 48720400 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -3576 NM_001277842 904 Hs.92308 NM_001240 ENSG00000129315 CCNT1 CCNT|CYCT1|HIVE1 cyclin T1 protein-coding 121.333-188 chr8_KI270820v1_alt 13127 13385 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 9425 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 153.333-261 chr3 17728877 17729189 + 0.666667 NA intron (NM_001349076, intron 1 of 22) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11874 NM_014744 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 229.333-67 chr2 114176772 114177293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -197048 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 159.667-140 chr17 65811619 65811941 + 0.666667 NA intron (NR_126542, intron 1 of 5) intron (NR_126542, intron 1 of 5) 14671 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 150-81 chr2 183126858 183127218 + 0.666667 NA intron (NM_138285, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 2595 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 145.333-122 chr18 70694492 70694774 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43679 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 195.333-164 chr4 181884112 181884679 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -54422 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 132.667-138 chr5 54736995 54737231 + 0.666667 NA intron (NR_104658, intron 1 of 2) L1ME3Cz|LINE|L1 7145 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 151.667-82 chr12 40177083 40177517 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 21061 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 163.667-188 chr4 136339707 136340149 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -426248 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 151.667-104 chr14 20739745 20740048 + 0.666667 NA Intergenic LTR26B|LTR|ERV1 -5991 NM_006683 10876 Hs.304757 NM_006683 ENSG00000181562 EDDM3A EP3A|FAM12A|HE3-ALPHA|HE3A|HE3ALPHA|RAM1 epididymal protein 3A protein-coding 138.333-110 chr20 54381357 54381675 + 0.666667 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -94077 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 215.333-148 chr4 146878701 146879269 + 0.666667 NA intron (NR_133922, intron 6 of 13) intron (NR_133922, intron 6 of 13) 66879 NR_133922 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 140.667-180 chr5 26449054 26449386 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 589366 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 128.667-132 chr4 97648790 97649162 + 0.666667 NA intron (NM_174952, intron 10 of 10) intron (NM_174952, intron 10 of 10) 282050 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 147.667-247 chr3 197333400 197333748 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -34253 NM_001366203 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 168-105 chr7 54107039 54107381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -223487 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 153-121 chr6 122670097 122670447 + 0.666667 NA intron (NM_001270395, intron 1 of 4) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 17543 NM_001270395 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 137.667-187 chr8 105927018 105927316 + 0.666667 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 133336 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 111.667-113 chr18 5984352 5984587 + 0.666667 NA intron (NR_158609, intron 15 of 17) intron (NR_158609, intron 15 of 17) -88515 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 165-25 chr14 52954946 52955366 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4059 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 181.333-140 chr5 67633481 67633836 + 0.666667 NA intron (NR_147169, intron 2 of 2) intron (NR_147169, intron 2 of 2) 13131 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 140-27 chr12 7556834 7557190 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53194 NM_203416 9332 Hs.504641 NM_004244 ENSG00000177575 CD163 M130|MM130|SCARI1 CD163 molecule protein-coding 139.667-106 chr20 56174445 56174719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74150 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 189.333-126 chr3 13755683 13756057 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 105149 NR_027103 285375 Hs.319969 NR_027103 ENSG00000224514 LINC00620 - long intergenic non-protein coding RNA 620 ncRNA 161.667-272 chr9 91892134 91892415 + 0.666667 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 57954 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 233.333-114 chr5 150702792 150703333 + 0.666667 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 -2000 NM_018047 55696 Hs.713564 NM_018047 ENSG00000086589 RBM22 Cwc2|ZC3H16|fSAP47 RNA binding motif protein 22 protein-coding 137-71 chr4 64749537 64749789 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 254837 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 189.333-192 chr7 101027039 101027472 + 0.666667 NA intron (NM_001040105, intron 1 of 12) intron (NM_001040105, intron 1 of 12) 7174 NR_133665 140453 Hs.271819 NM_001004430 ENSG00000169876 MUC17 MUC-17|MUC-3|MUC3 mucin 17, cell surface associated protein-coding 128-129 chr9 91669044 91669330 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -32842 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 161-108 chr9 108884604 108885073 + 0.666667 NA intron (NM_001330749, intron 27 of 34) AluJr|SINE|Alu 22572 NM_006687 10881 Hs.123530 NM_006687 ENSG00000187003 ACTL7A - actin like 7A protein-coding 188-105 chr7 119399362 119399786 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 507801 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 179.333-73 chr16 35330042 35330414 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33188 NR_027080 283914 Hs.385772 NR_027079 ENSG00000259841 LINC01566 - long intergenic non-protein coding RNA 1566 ncRNA 201-79 chr3 139804750 139805200 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -126925 NM_001320511 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 123.667-15 chr1 119564672 119564908 + 0.666667 NA non-coding (NR_033781, exon 1 of 1) non-coding (NR_033781, exon 1 of 1) 910 NR_033781 128102 Hs.681806 NR_033781 HSD3BP4 - hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta, pseudogene 4 pseudo 155.667-4 chr1 19593719 19594046 + 0.666667 NA intron (NR_135054, intron 1 of 1) AluY|SINE|Alu 2950 NR_135054 105378614 Hs.430098 NR_135054 ENSG00000235185 LOC105378614 - uncharacterized LOC105378614 ncRNA 173.333-83 chr19 39967172 39967532 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3653 NM_153001 5704 Hs.211594 NM_006503 ENSG00000013275 PSMC4 MIP224|RPT3|S6|TBP-7|TBP7 proteasome 26S subunit, ATPase 4 protein-coding 133.333-139 chr4 170722588 170722859 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 21012 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 152.333-207 chr2 223910709 223910984 + 0.666667 NA intron (NM_020830, intron 3 of 11) L1MB7|LINE|L1 34489 NM_020830 57590 Hs.368359 NM_020830 ENSG00000085449 WDFY1 FENS-1|FENS1|WDF1|ZFYVE17 WD repeat and FYVE domain containing 1 protein-coding 185.667-66 chr2 32140271 32140730 + 0.666667 NA intron (NM_001363875, intron 11 of 15) AluSz6|SINE|Alu -25341 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 151-6 chr1 81152344 81152682 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -153679 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 145-13 chr10 91131463 91131756 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21471 NR_002779 119369 Hs.441287 NR_002779 NUDT9P1 C10orf98|bA56M3.1 nudix hydrolase 9 pseudogene 1 pseudo 114.667-115 chr18 63364970 63365243 + 0.666667 NA intron (NM_002035, intron 1 of 9) intron (NM_002035, intron 1 of 9) 2100 NM_002035 2531 Hs.74050 NM_002035 ENSG00000119537 KDSR DHSR|EKVP4|FVT1|SDR35C1 3-ketodihydrosphingosine reductase protein-coding 144.667-126 chr19 43832186 43832553 + 0.666667 NA intron (NM_001297752, intron 4 of 5) intron (NM_001297752, intron 4 of 5) 5048 NM_181845 284349 Hs.652513 NM_181845 ENSG00000167637 ZNF283 HZF19|HZF41 zinc finger protein 283 protein-coding 114.333-176 chr5 55673448 55673747 + 0.666667 NA intron (NM_001349385, intron 3 of 14) intron (NM_001349385, intron 3 of 14) 19456 NM_001258286 153129 Hs.742101 NM_173514 ENSG00000177058 SLC38A9 URLC11 solute carrier family 38 member 9 protein-coding 181.667-86 chr21 19385289 19385622 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 514300 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 153.667-220 chr20 31245995 31246357 + 0.666667 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -11488 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 147-69 chr2 75398627 75398971 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -125269 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 190.667-79 chr22 44644447 44644855 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -19232 NR_044991 414351 Hs.572878 NR_044991 LINC00229 C22orf10|NCRNA00229|dJ474I12.C22.2 long intergenic non-protein coding RNA 229 ncRNA 152.333-19 chr1 157024007 157024311 + 0.666667 NA intron (NM_014784, intron 1 of 39) L1MB7|LINE|L1 21583 NM_198236 9826 Hs.516954 NM_014784 ENSG00000132694 ARHGEF11 GTRAP48|PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 11 protein-coding 219-59 chr3 102057671 102058286 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105727 NR_135549 101929411 Hs.506540 NR_135549 LOC101929411 - uncharacterized LOC101929411 ncRNA 157.333-119 chr15 60487384 60487689 + 0.666667 NA TTS (NM_002943) TTS (NM_002943) 8358 NR_120341 101928784 Hs.655155 NR_120339 ENSG00000245534 RORA-AS1 - RORA antisense RNA 1 ncRNA 167.333-31 chr1 209745215 209745601 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2846 NR_134510 101930114 Hs.663934 NR_134509 ENSG00000227591 HSD11B1-AS1 - HSD11B1 antisense RNA 1 ncRNA 147.333-243 chr4 86855713 86856008 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6476 NM_197965 345274 Hs.452996 NM_197965 ENSG00000145283 SLC10A6 SOAT solute carrier family 10 member 6 protein-coding 148.333-83 chr12 10126388 10126710 + 0.666667 NA TTS (NM_197954) TTS (NM_197954) 3650 NM_197954 64581 Hs.143929 NM_022570 ENSG00000172243 CLEC7A BGR|CANDF4|CD369|CLECSF12|DECTIN1|SCARE2 C-type lectin domain containing 7A protein-coding 173.333-218 chr9 119148031 119148404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 221218 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 113.667-2 chr1 19340472 19340648 + 0.666667 NA intron (NM_001206541, intron 8 of 8) AluJr|SINE|Alu 28234 NM_001040125 54896 Hs.647620 NM_017765 ENSG00000040487 SLC66A1 LAAT-1|LAAT1|PQLC2 solute carrier family 66 member 1 protein-coding 159.333-303 chr7 28563737 28564080 + 0.666667 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) intron (NM_182899, intron 3 of 9) -122225 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 190.333-70 chr2 82519960 82520367 + 0.666667 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -336640 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 111.667-108 chr17 71997137 71997462 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 28680 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 155.667-82 chr13 64419960 64420363 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -344150 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 247.667-98 chr8 129577742 129578139 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) L1ME3A|LINE|L1 -2922 NR_130920 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 184.667-48 chr19 16146099 16146504 + 0.666667 NA intron (NR_163156, intron 1 of 4) intron (NR_163156, intron 1 of 4) 2616 NR_163156 84941 Hs.631617 NM_032855 ENSG00000196684 HSH2D ALX|HSH2 hematopoietic SH2 domain containing protein-coding 151.667-263 chr5 11298652 11299098 + 0.666667 NA intron (NM_001288715, intron 8 of 20) MIR|SINE|MIR 290042 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 174.667-167 chr8 76984822 76985297 + 0.666667 NA intron (NM_001172087, intron 2 of 2) intron (NM_001172087, intron 2 of 2) 15019 NM_000318 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 192.667-54 chr12 116681995 116682355 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55894 NM_024738 79794 Hs.120170 NM_024738 ENSG00000111412 C12orf49 - chromosome 12 open reading frame 49 protein-coding 128-22 chr14 40311588 40311865 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -642985 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 406.333-13 chr5 32101277 32102048 + 0.666667 NA intron (NM_178140, intron 24 of 24) intron (NM_178140, intron 24 of 24) 72657 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 114-19 chr11 114923352 114923532 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 244915 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 111.667-106 chr17 67053043 67053274 + 0.666667 NA intron (NM_000727, intron 1 of 3) intron (NM_000727, intron 1 of 3) 8604 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 171-67 chr5 108195043 108195379 + 0.666667 NA intron (NM_001163315, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 186887 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 130-43 chr16 76035969 76036232 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -241301 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 192.667-166 chr7 111190723 111191223 + 0.666667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 99846 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 155.667-344 chr8 43149688 43150096 + 0.666667 NA intron (NM_152419, intron 2 of 17) intron (NM_152419, intron 2 of 17) 9428 NM_152419 138050 Hs.600384 NM_152419 ENSG00000165102 HGSNAT HGNAT|MPS3C|RP73|TMEM76 heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase protein-coding 116.667-62 chr15 36611491 36611689 + 0.666667 NA intron (NM_001290232, intron 1 of 10) intron (NM_001290232, intron 1 of 10) 16713 NM_032499 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 139.667-85 chr2 58850112 58850358 + 0.666667 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 329482 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 200.333-39 chr14 27978693 27979130 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -305690 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 112.333-59 chr12 85828553 85828831 + 0.666667 NA intron (NM_005447, intron 1 of 1) intron (NM_005447, intron 1 of 1) 7717 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 118.667-177 chr7 34739930 34740230 + 0.666667 NA intron (NR_015356, intron 2 of 4) L1MB5|LINE|L1 18192 NR_033664 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 112.333-226 chr6 48803245 48803557 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 659852 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 191.667-76 chr20 14843395 14843845 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 85898 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 116.333-188 chr6 70028417 70028702 + 0.666667 NA intron (NM_001858, intron 12 of 50) LTR48|LTR|ERV1 162003 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 124.667-31 chr10 88220542 88220760 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 357026 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 218.333-92 chr4 24556762 24557114 + 0.666667 NA intron (NM_001358, intron 3 of 13) intron (NM_001358, intron 3 of 13) 27616 NM_001358 1665 Hs.696074 NM_001358 ENSG00000109606 DHX15 DBP1|DDX15|HRH2|PRP43|PRPF43|PrPp43p DEAH-box helicase 15 protein-coding 141.667-157 chr4 30553888 30554214 + 0.666667 NA Intergenic LTR80A|LTR|ERVL -166318 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 185.333-61 chr16 79758784 79759104 + 0.666667 NA intron (NR_104663, intron 2 of 5) intron (NR_104663, intron 2 of 5) -11527 NR_104660 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 228.667-53 chr21 21961432 21961856 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 136815 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 220.667-72 chr4 47941039 47941486 + 0.666667 NA intron (NM_000087, intron 9 of 10) L1MA4A|LINE|L1 -26595 NR_103795 152518 Hs.646325 NM_152995 ENSG00000170448 NFXL1 CDZFP|HOZFP|OZFP|URCC5 nuclear transcription factor, X-box binding like 1 protein-coding 130.667-192 chr8 56187759 56187993 + 0.666667 NA intron (NM_002655, intron 1 of 4) intron (NM_002655, intron 1 of 4) 23397 NM_001114634 5324 Hs.14968 NM_002655 ENSG00000181690 PLAG1 PSA|SGPA|ZNF912 PLAG1 zinc finger protein-coding 146.333-334 chr8 119281168 119281480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34467 NR_149113 105375726 Hs.666095 NR_149111 MAL2-AS1 - MAL2 antisense RNA 1 ncRNA 139.667-137 chr4 72059953 72060229 + 0.666667 NA intron (NM_053036, intron 1 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL 20959 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 202.333-35 chr11 73620663 73621216 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -22827 NM_001286051 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 129-45 chr17 2650721 2651006 + 0.666667 NA intron (NM_000430, intron 2 of 10) L1M|LINE|L1 42056 NR_106834 102465465 NR_106834 ENSG00000273606 MIR6776 hsa-mir-6776 microRNA 6776 ncRNA 193.333-56 chr14 60550154 60550557 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 41209 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 219-36 chr17 61051261 61051736 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 20 of 25) L1MD2|LINE|L1 316206 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 179.333-144 chr4 114959113 114959523 + 0.666667 NA intron (NM_022569, intron 4 of 13) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 154302 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 184-16 chr12 10269151 10269551 + 0.666667 NA intron (NM_001351060, intron 2 of 8) AluSx1|SINE|Alu 30390 NM_001351060 3824 Hs.562457 NM_002262 ENSG00000134539 KLRD1 CD94 killer cell lectin like receptor D1 protein-coding 155.333-335 chr6 95305410 95305716 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 271888 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 124.667-99 chr2 64668730 64669033 + 0.666667 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -14968 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 159.667-169 chr2 66157288 66157599 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 200885 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 243.667-71 chr7 69703435 69703898 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) intron (NM_015570, intron 1 of 18) 105191 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 124.667-60 chr14 68051305 68051625 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1ME4a|LINE|L1 227873 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 181-39 chr2 88154533 88154970 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -15544 NM_001244676 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 171-14 chr12 79301972 79302355 + 0.666667 NA intron (NM_001291901, intron 7 of 9) intron (NM_001291901, intron 7 of 9) -117094 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 121-82 chr20 16214478 16214836 + 0.666667 NA Intergenic MER131|DNA?|DNA? -228775 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 172-44 chr14 83435913 83436275 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 793462 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 162.667-12 chr1 194761931 194762264 + 0.666667 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL 1326618 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 212.667-119 chr6 20930910 20931376 + 0.666667 NA intron (NM_017774, intron 9 of 15) MIRb|SINE|MIR 396686 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 112.333-24 chr10 54675763 54676048 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) -67948 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 130.667-75 chr15 90475228 90475454 + 0.666667 NA intron (NM_003870, intron 23 of 37) AluSz|SINE|Alu -54582 NM_001042574 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 136.333-102 chr2 171226533 171226895 + 0.666667 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) intron (NM_001136554, intron 1 of 20) 4579 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 114-163 chr8 50630143 50630364 + 0.666667 NA intron (NR_135797, intron 15 of 20) intron (NR_135797, intron 15 of 20) 466122 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 219-35 chr17 56512659 56513282 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001365758, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001365758, exon 21 of 21) -80729 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 146.333-53 chr11 106204784 106205081 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -45087 NR_120552 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 208.333-130 chr6 97598943 97599503 + 0.666667 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) intron (NR_110757, intron 1 of 4) 293637 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 132.667-169 chr7 101532283 101532631 + 0.666667 NA intron (NM_133457, intron 3 of 12) intron (NM_133457, intron 3 of 12) 36549 NR_103748 100506527 Hs.535863 NR_103747 ENSG00000233123 LINC01007 - long intergenic non-protein coding RNA 1007 ncRNA 150.333-325 chr5 61429601 61429954 + 0.666667 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 97519 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 215.333-109 chr2 221654013 221654385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79997 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 126.333-67 chr17 59367934 59368259 + 0.666667 NA intron (NM_001005404, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 2013 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 119-108 chr3 121018104 121018399 + 0.666667 NA intron (NR_145517, intron 3 of 8) L1MCb|LINE|L1 -31389 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 174.667-99 chr2 225463828 225464312 + 0.666667 NA intron (NM_001371273, intron 3 of 7) intron (NM_001371273, intron 3 of 7) 63184 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 142.333-235 chr8 70495359 70495637 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 24364 NR_110653 101926892 Hs.367827 NR_110653 ENSG00000253967 LOC101926892 - uncharacterized LOC101926892 ncRNA 122.667-81 chr2 26133813 26134024 + 0.666667 NA intron (NM_016131, intron 5 of 5) AluSx|SINE|Alu -39170 NM_001168241 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 111.667-89 chr15 60596551 60596759 + 0.666667 NA intron (NM_134260, intron 1 of 11) intron (NM_134260, intron 1 of 11) -4129 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 117.333-100 chr2 67422305 67422540 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 25089 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 188-7 chr1 61968842 61969164 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 27 of 43) L1MB2|LINE|L1 -109783 NR_036058 100422902 NR_036058 ENSG00000263908 MIR3116-1 - microRNA 3116-1 ncRNA 130.333-149 chr4 73658623 73658865 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -38113 NM_201431 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 115.667-43 chr11 55570366 55570698 + 0.666667 NA Intergenic LTR10C|LTR|ERV1 -1596 NM_001004701 219428 Hs.553619 NM_001004701 ENSG00000279514 OR4C16 OR11-135 olfactory receptor family 4 subfamily C member 16 (gene/pseudogene) protein-coding 163.667-161 chr3 151181860 151182259 + 0.666667 NA intron (NM_053002, intron 10 of 42) intron (NM_053002, intron 10 of 42) 21157 NM_013308 29909 Hs.549152 NM_013308 ENSG00000174946 GPR171 H963 G protein-coupled receptor 171 protein-coding 134-10 chr1 210896504 210896875 + 0.666667 NA intron (NM_002238, intron 7 of 10) intron (NM_002238, intron 7 of 10) 236685 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 130-42 chr16 61311632 61311877 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -255988 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 175.333-185 chr8 71055071 71055570 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 301386 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 212.333-9 chr1 160447758 160448183 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 47406 NM_020335 57216 Hs.99477 NM_020335 ENSG00000162738 VANGL2 LPP1|LTAP|STB1|STBM|STBM1 VANGL planar cell polarity protein 2 protein-coding 224.333-129 chr9 23444575 23445098 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 227563 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 115-116 chr3 177042600 177042874 + 0.666667 NA intron (NM_001321194, intron 11 of 16) intron (NM_001321194, intron 11 of 16) 153741 NM_001321193 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 161.333-218 chr4 85874413 85874750 + 0.666667 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 46644 NM_001287805 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 187-61 chr4 122563855 122564291 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54910 NR_104126 100996941 Hs.439487 NR_104126 ENSG00000227145 IL21-AS1 - IL21 antisense RNA 1 ncRNA 185.333-7 chr1 78072136 78072550 + 0.666667 NA intron (NM_017655, intron 1 of 5) intron (NM_017655, intron 1 of 5) 26377 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 234.666-2 chr1 60981341 60981992 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -10890 NR_110617 100996570 Hs.46616 NR_110617 ENSG00000237928 NFIA-AS2 - NFIA antisense RNA 2 ncRNA 176-70 chr5 12629756 12630126 + 0.666667 NA intron (NR_033383, intron 2 of 3) L1ME3Cz|LINE|L1 -37918 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 215-69 chr6 21298344 21298784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 213328 NR_103790 100874531 Hs.112750 NR_103790 ENSG00000280989 LINC00581 linc-MBOAT1-4 long intergenic non-protein coding RNA 581 ncRNA 112.333-165 chr3 105478787 105479081 + 0.666667 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) intron (NM_001243280, intron 1 of 14) 112025 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 119.667-52 chr14 70922122 70922406 + 0.666667 NA intron (NM_014982, intron 1 of 35) intron (NM_014982, intron 1 of 35) 14805 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 126-102 chr6 79886061 79886344 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 61351 NM_022726 6785 Hs.101915 NM_022726 ENSG00000118402 ELOVL4 ADMD|CT118|ISQMR|SCA34|STGD2|STGD3 ELOVL fatty acid elongase 4 protein-coding 243.333-86 chr5 19471850 19472263 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001349563, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001349563, exon 14 of 14) 414216 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 208-8 chr1 150060275 150060739 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -6875 NM_001279353 11311 Hs.443750 NM_007259 ENSG00000136631 VPS45 H1|H1VPS45|SCN5|VPS45A|VPS45B|VPS54A|VSP45|VSP45A vacuolar protein sorting 45 homolog protein-coding 152.667-25 chr1 225986419 225986729 + 0.666667 NA intron (NM_152608, intron 6 of 6) intron (NM_152608, intron 6 of 6) 12769 NM_152608 163859 Hs.520192 NM_152608 ENSG00000143751 SDE2 C1orf55|dJ671D7.1 SDE2 telomere maintenance homolog protein-coding 154.667-13 chr1 90702447 90702865 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14646 NM_020063 343472 Hs.451956 NM_020063 ENSG00000143032 BARHL2 - BarH like homeobox 2 protein-coding 168-59 chr2 192464509 192464918 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -269780 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 179-37 chr16 74202153 74202543 + 0.666667 NA intron (NR_104657, intron 3 of 3) intron (NR_104657, intron 3 of 3) 13173 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 253.333-74 chr3 180160699 180161219 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -124022 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 140-53 chr18 69339490 69339765 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -61261 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 120.333-115 chr20 14430710 14430914 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -93145 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 147.333-5 chr1 39067229 39067562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16772 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 124.667-156 chr4 156929326 156929685 + 0.666667 NA intron (NR_036641, intron 1 of 6) intron (NR_036641, intron 1 of 6) 42294 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 122.667-176 chr7 47180341 47180555 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 284355 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 119.667-179 chr8 23068119 23068347 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_038873) promoter-TSS (NR_038873) 4 NR_038873 286059 Hs.306673 NR_038873 ENSG00000246130 LOC286059 - TNF receptor superfamily member 10d pseudogene pseudo 150.333-110 chr14 54973479 54973772 + 0.666667 NA intron (NM_007086, intron 16 of 25) intron (NM_007086, intron 16 of 25) 53474 NM_007086 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 205.333-42 chr10 106051693 106052246 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -88196 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 179.667-78 chr2 106823575 106823977 + 0.666667 NA intron (NM_001142352, intron 5 of 5) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 62252 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 138.667-92 chr19 46164869 46165173 + 0.666667 NA Intergenic HERVL32-int|LTR|ERVL 16783 NM_001135113 147920 Hs.99376 NM_001002915 ENSG00000204866 IGFL2 UNQ645|VPRI645 IGF like family member 2 protein-coding 216-81 chr3 101026888 101027271 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -33589 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 195-61 chr2 119513516 119513941 + 0.666667 NA intron (NM_002980, intron 1 of 12) intron (NM_002980, intron 1 of 12) 10724 NM_002980 6344 Hs.42091 NM_002980 ENSG00000080293 SCTR SR secretin receptor protein-coding 273.667-37 chr2 233931118 233931807 + 0.666667 NA intron (NM_024080, intron 3 of 25) intron (NM_024080, intron 3 of 25) 14089 NM_024080 79054 Hs.366053 NM_024080 ENSG00000144481 TRPM8 LTRPC6|LTrpC-6|TRPP8|trp-p8 transient receptor potential cation channel subfamily M member 8 protein-coding 137.667-128 chr3 124425076 124425339 + 0.666667 NA intron (NM_001024660, intron 15 of 59) L1MA5|LINE|L1 50875 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 153-125 chr7 24911285 24911710 + 0.666667 NA intron (NM_015550, intron 1 of 22) intron (NM_015550, intron 1 of 22) -18876 NM_145322 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 123.667-39 chr11 82562283 82562519 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -158488 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 150.333-69 chr11 112523095 112523499 + 0.666667 NA intron (NR_120559, intron 2 of 2) L3|LINE|CR1 32505 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 197-94 chr5 114473221 114473771 + 0.666667 NA intron (NM_021614, intron 5 of 7) intron (NM_021614, intron 5 of 7) 39985 NR_103458 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 163.333-178 chr3 3775337 3775766 + 0.666667 NA intron (NR_149025, intron 5 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -23880 NM_001324189 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 168-74 chr3 183358144 183358481 + 0.666667 NA intron (NM_015078, intron 3 of 29) AluSq2|SINE|Alu 69957 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 163.667-224 chr6 167352221 167352597 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 27323 NM_031949 83887 Hs.520554 NM_031949 ENSG00000120440 TTLL2 C6orf104|NYD-TSPG|dJ366N23.3 tubulin tyrosine ligase like 2 protein-coding 123-96 chr5 29349507 29349726 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 46360 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 161.667-59 chr12 122479217 122479541 + 0.666667 NA intron (NM_001350938, intron 8 of 10) intron (NM_001350938, intron 8 of 10) 21553 NM_017612 55596 Hs.37706 NM_017612 ENSG00000033030 ZCCHC8 - zinc finger CCHC-type containing 8 protein-coding 141.667-22 chr10 28088650 28089014 + 0.666667 NA intron (NR_134518, intron 11 of 16) intron (NR_134518, intron 11 of 16) -15454 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 186-105 chr9 109225580 109225981 + 0.666667 NA intron (NM_019114, intron 15 of 25) L2b|LINE|L2 -58489 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 135.333-29 chr10 110676003 110676350 + 0.666667 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 31840 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 136-108 chr9 8062103 8062491 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -262519 NM_001318058 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 236.667-2 chr1 24632369 24632780 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10728 NM_001366581 10250 Hs.18192 NM_005839 ENSG00000133226 SRRM1 160-KD|POP101|SRM160 serine and arginine repetitive matrix 1 protein-coding 130.667-31 chr10 75903213 75903456 + 0.666667 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 120573 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 148.333-379 chr8 53714202 53714593 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 128645 NM_213620 51606 Hs.491737 NM_015941 ENSG00000047249 ATP6V1H CGI-11|MSTP042|NBP1|SFD|SFDalpha|SFDbeta|VMA13 ATPase H+ transporting V1 subunit H protein-coding 116.667-138 chr3 173810074 173810317 + 0.666667 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) 110601 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 135.667-96 chr2 104440890 104441171 + 0.666667 NA intron (NR_015399, intron 1 of 3) intron (NR_015399, intron 1 of 3) 6683 NR_015399 150568 Hs.107284 NR_015399 ENSG00000235597 LINC01102 - long intergenic non-protein coding RNA 1102 ncRNA 151.333-422 chr8 86141055 86141421 + 0.666667 NA intron (NM_152565, intron 3 of 7) MER1A|DNA|hAT-Charlie 42328 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 211.667-73 chr20 57005476 57005880 + 0.666667 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -208018 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 136.333-118 chr22 25035230 25035496 + 0.666667 NA intron (NM_001145206, intron 2 of 10) L1ME1|LINE|L1 7389 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 120-97 chr4 130883326 130883677 + 0.666667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 507140 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 250-47 chr2 241429418 241430091 + 0.666667 NA intron (NM_014808, intron 8 of 26) intron (NM_014808, intron 8 of 26) -48151 NR_036083 100422942 NR_036083 ENSG00000263752 MIR3133 - microRNA 3133 ncRNA 132.667-188 chr8 132860562 132860878 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6238 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 216.333-57 chr16 81126179 81126716 + 0.666667 NA intron (NM_052892, intron 37 of 43) intron (NM_052892, intron 37 of 43) -30052 NR_033249 2653 Hs.546256 NM_004483 ENSG00000140905 GCSH GCE|NKH glycine cleavage system protein H protein-coding 227.666-16 chr2 169783126 169783771 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 -15423 NM_003142 6741 Hs.632535 NM_003142 ENSG00000138385 SSB LARP3|La|La/SSB small RNA binding exonuclease protection factor La protein-coding 151.667-382 chr9 10854653 10855044 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 241642 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 126.333-189 chr9 86735109 86735366 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 212269 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 156.667-282 chr5 122949020 122949341 + 0.666667 NA intron (NM_014035, intron 3 of 6) intron (NM_014035, intron 3 of 6) 87545 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 149.333-433 chr9 80114891 80115186 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 140015 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 209-74 chr22 49696474 49696918 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -39177 NM_001289922 348645 Hs.133159 NM_198851 ENSG00000188511 C22orf34 - chromosome 22 open reading frame 34 protein-coding 181-81 chr9 16582224 16582652 + 0.666667 NA intron (NM_001317939, intron 3 of 6) intron (NM_001317939, intron 3 of 6) -144376 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 212.333-3 chr1 26289225 26289644 + 0.666667 NA intron (NM_001077262, intron 4 of 10) intron (NM_001077262, intron 4 of 10) 9348 NM_031286 83442 Hs.109051 NM_031286 ENSG00000142669 SH3BGRL3 HEL-S-297|SH3BP-1|TIP-B1 SH3 domain binding glutamate rich protein like 3 protein-coding 143.333-157 chr20 51338335 51338647 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 114486 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 112.333-156 chr22 40897728 40898057 + 0.666667 NA intron (NM_022098, intron 4 of 9) L1MB4|LINE|L1 -35779 NM_145174 150353 Hs.585042 NM_145174 ENSG00000172404 DNAJB7 DJ5|HSC3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B7 protein-coding 149.667-409 chr8 119373400 119373687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42903 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 146.333-214 chr3 104173823 104174178 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -649884 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 124.667-20 chr1 241449122 241449438 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 70505 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 148-24 chr11 19517545 19517834 + 0.666667 NA intron (NR_033989, intron 3 of 3) intron (NR_033989, intron 3 of 3) 6389 NR_033989 399876 Hs.132600 NR_033989 ENSG00000254622 NAV2-AS4 - NAV2 antisense RNA 4 ncRNA 196.667-51 chr15 69631960 69632398 + 0.666667 NA intron (NR_126437, intron 3 of 5) intron (NR_126437, intron 3 of 5) 39979 NR_126437 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 118.667-74 chr15 59519493 59519847 + 0.666667 NA intron (NM_152450, intron 8 of 8) L1MA9|LINE|L1 81484 NM_152450 145773 Hs.531168 NM_152450 ENSG00000157470 FAM81A - family with sequence similarity 81 member A protein-coding 125.333-148 chr5 158696277 158696506 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_024007, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_024007, exon 16 of 16) -286618 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 160.667-118 chr16 83859804 83860201 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39113 NM_012213 23417 Hs.644610 NM_012213 ENSG00000103150 MLYCD MCD malonyl-CoA decarboxylase protein-coding 194-137 chr8 42198195 42198712 + 0.666667 NA intron (NM_001319189, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu 9112 NM_033011 5327 Hs.491582 NM_000930 ENSG00000104368 PLAT T-PA|TPA plasminogen activator, tissue type protein-coding 167.667-58 chr14 57089549 57089900 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 179181 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 139.333-43 chr11 108727310 108727636 + 0.666667 NA intron (NM_004398, intron 13 of 17) intron (NM_004398, intron 13 of 17) 62404 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 181-26 chr14 77554019 77554447 + 0.666667 NA intron (NM_004863, intron 8 of 11) intron (NM_004863, intron 8 of 11) -55417 NM_182509 145501 Hs.29742 NM_182509 ENSG00000100593 ISM2 TAIL1|THSD3 isthmin 2 protein-coding 143-112 chr7 25562172 25562479 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 100815 NR_157826 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 118.333-51 chr12 75393803 75394029 + 0.666667 NA intron (NM_001270396, intron 1 of 5) L1MB3|LINE|L1 2827 NM_001270396 144321 Hs.406728 NM_152436 ENSG00000180481 GLIPR1L2 - GLIPR1 like 2 protein-coding 153.333-321 chr5 12457384 12457816 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -117257 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 218.667-53 chr2 68634885 68635413 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8439 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 116.333-43 chr11 72996415 72996719 + 0.666667 NA intron (NM_014824, intron 5 of 19) intron (NM_014824, intron 5 of 19) 145751 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 112-98 chr18 75982376 75982623 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140499 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 113.667-78 chr16 66580191 66580361 + 0.666667 NA intron (NM_144673, intron 2 of 3) intron (NM_144673, intron 2 of 3) 813 NM_001199317 146225 Hs.195685 NM_144673 ENSG00000140932 CMTM2 CKLFSF2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 2 protein-coding 210.333-3 chr1 64090402 64090945 + 0.666667 NA intron (NM_005012, intron 4 of 8) intron (NM_005012, intron 4 of 8) 21532 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 189.667-24 chr11 30752645 30753160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166549 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 226.333-6 chr1 205218204 205218601 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6700 NM_015375 25778 Hs.6874 NM_015375 ENSG00000133059 DSTYK CAKUT1|DustyPK|HDCMD38P|RIP5|RIPK5|SPG23 dual serine/threonine and tyrosine protein kinase protein-coding 207-2 chr1 35638160 35638756 + 0.666667 NA intron (NM_001199779, intron 1 of 5) MIRc|SINE|MIR 3068 NM_002794 5690 Hs.471441 NM_002794 ENSG00000126067 PSMB2 HC7-I proteasome subunit beta 2 protein-coding 134.667-33 chr11 38656952 38657241 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 8238 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 150-67 chr18 41629886 41630165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109348 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 118.667-175 chr7 2032419 2032691 + 0.666667 NA intron (NM_001013837, intron 12 of 18) intron (NM_001013837, intron 12 of 18) 56497 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 112.333-96 chr17 58751594 58751830 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4142 NM_014906 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 228.667-25 chr15 50752457 50752917 + 0.666667 NA intron (NM_032802, intron 1 of 14) AluSx1|SINE|Alu 13019 NM_032802 84888 Hs.401537 NM_032802 ENSG00000138600 SPPL2A IMP3|PSL2 signal peptide peptidase like 2A protein-coding 115.333-125 chr20 8237648 8237940 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) -10910 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 175.333-70 chr18 12898918 12899334 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14791 NM_080423 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 117-92 chr22 37322609 37322925 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 32072 NR_110515 100506271 Hs.220558 NR_110515 ENSG00000237862 LOC100506271 - uncharacterized LOC100506271 ncRNA 177.667-45 chr14 49735591 49736064 + 0.666667 NA intron (NM_172193, intron 10 of 12) AluJr|SINE|Alu -32326 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 177.333-11 chr1 211317267 211317610 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9177 NM_004619 7188 Hs.523930 NM_004619 ENSG00000082512 TRAF5 MGC:39780|RNF84 TNF receptor associated factor 5 protein-coding 125.333-120 chr4 63392227 63392535 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 1017069 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 150-73 chr2 62738779 62739067 + 0.666667 NA intron (NM_001142615, intron 2 of 22) HAL1|LINE|L1 32026 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 167.333-130 chr2 105532795 105533149 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 77587 NR_038891 285000 Hs.737917 NR_038891 LOC285000 - uncharacterized LOC285000 ncRNA 117-158 chrX 148216482 148216779 + 0.666667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 235293 NM_152578 158521 Hs.128580 NM_152578 ENSG00000176988 FMR1NB CT37|NY-SAR-35|NYSAR35 FMR1 neighbor protein-coding 123.333-107 chr2 101748097 101748394 + 0.666667 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 50538 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 139-56 chr2 221578412 221578822 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4415 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 112.333-235 chr6 114829535 114829725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -766753 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 144-158 chr9 27698567 27698842 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -124838 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 118-127 chr8 2957777 2958033 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 62 of 69) intron (NM_033225, intron 62 of 69) -229454 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 123-131 chr9 2571399 2571705 + 0.666667 NA intron (NR_015375, intron 1 of 3) intron (NR_015375, intron 1 of 3) -50235 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 142-23 chr11 30732336 30732621 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -146125 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 155.333-166 chr2 98112533 98112864 + 0.666667 NA intron (NR_144297, intron 2 of 18) L1MEf|LINE|L1 25531 NR_144296 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 120.667-88 chr2 32387577 32387832 + 0.666667 NA intron (NM_016252, intron 3 of 73) intron (NM_016252, intron 3 of 73) 30676 NM_016252 57448 Hs.150107 NM_016252 ENSG00000115760 BIRC6 APOLLON|BRUCE baculoviral IAP repeat containing 6 protein-coding 155.667-399 chrX 64873360 64873819 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 102861 NM_018684 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 128.667-115 chr3 48184549 48184830 + 0.666667 NA exon (NM_001789, exon 3 of 15) exon (NM_001789, exon 3 of 15) 3728 NM_201567 993 Hs.437705 NM_001789 ENSG00000164045 CDC25A CDC25A2 cell division cycle 25A protein-coding 217-71 chr5 9315065 9315596 + 0.666667 NA intron (NM_003966, intron 5 of 22) L1MC4|LINE|L1 -196003 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 166.667-120 chr2 152651207 152651556 + 0.666667 NA TTS (NM_001365597) TTS (NM_001365597) 66080 NM_001365604 55660 Hs.643580 NM_017892 ENSG00000196504 PRPF40A FBP-11|FBP11|FLAF1|FNBP3|HIP-10|HIP10|HYPA|NY-REN-6|Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A protein-coding 176.333-182 chr9 107538112 107538514 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -48544 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 162-83 chr3 76788256 76788700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -251621 NM_001290039 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 181.333-115 chr4 44857296 44857665 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -130846 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 157.667-308 chr7 68387318 68387750 + 0.666667 NA Intergenic LTR66|LTR|ERVL 367281 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 141-13 chr11 48074326 48074608 + 0.666667 NA intron (NM_001098503, intron 1 of 8) intron (NM_001098503, intron 1 of 8) -22315 NR_036119 100423000 NR_036119 ENSG00000263693 MIR3161 - microRNA 3161 ncRNA 128.667-137 chr5 4951827 4952190 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -82351 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 159.333-94 chr14 65822573 65822980 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 351674 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 128-47 chr2 101849996 101850319 + 0.666667 NA intron (NM_145686, intron 12 of 30) intron (NM_145686, intron 12 of 30) -133308 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 219.667-5 chr1 201186964 201187346 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3669 NM_001367841 91156 Hs.519024 NM_178275 ENSG00000163395 IGFN1 EEF1A2BP1 immunoglobulin like and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 161.667-120 chr2 19283078 19283480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65150 NR_039914 100616307 NR_039914 ENSG00000266738 MIR4757 - microRNA 4757 ncRNA 113.333-22 chr10 44128091 44128329 + 0.666667 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -164540 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 244-79 chr4 47897620 47898217 + 0.666667 NA intron (NR_103795, intron 9 of 23) L1MC1|LINE|L1 -16309 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 112.667-136 chr2 188901742 188902028 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -72488 NM_000090 1281 Hs.443625 NM_000090 ENSG00000168542 COL3A1 EDS4A|EDSVASC|PMGEDSV collagen type III alpha 1 chain protein-coding 138.667-40 chr12 4174856 4175170 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -98749 NM_001759 894 Hs.376071 NM_001759 ENSG00000118971 CCND2 KIAK0002|MPPH3 cyclin D2 protein-coding 205.333-40 chr10 103627323 103627789 + 0.666667 NA intron (NM_001365079, intron 2 of 8) intron (NM_001365079, intron 2 of 8) 50659 NM_001365079 9644 Hs.678727 NM_014631 ENSG00000107957 SH3PXD2A FISH|SH3MD1|TKS5 SH3 and PX domains 2A protein-coding 126.333-193 chrX 84014281 84014655 + 0.666667 NA Intergenic PRIMA4-int|LTR|ERV1 153322 NM_021118 1538 Hs.444230 NM_021118 ENSG00000183035 CYLC1 CYCL1 cylicin 1 protein-coding 153.333-256 chr22 41963406 41963828 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -5821 NM_001363845 55964 Hs.120483 NM_019106 ENSG00000100167 SEPTIN3 SEP3|SEPT3|bK250D10.3 septin 3 protein-coding 187-44 chr20 39621931 39622333 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -382329 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 151.667-339 chr7 69492170 69492610 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 105234 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 150-98 chr3 78235421 78235785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -186640 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 164-119 chr8 128372307 128372711 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 192170 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 122.667-23 chr11 8432612 8432802 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001352398, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001352398, exon 13 of 13) 161269 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 120-120 chr6 20983608 20983885 + 0.666667 NA intron (NM_017774, intron 10 of 15) intron (NM_017774, intron 10 of 15) 449289 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 158.667-221 chr3 157940542 157940875 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 165455 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 177-23 chr14 50354615 50354995 + 0.666667 NA intron (NM_001282236, intron 3 of 8) intron (NM_001282236, intron 3 of 8) 42076 NM_001367065 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 193.667-44 chr14 72366450 72366953 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -150119 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 175.667-89 chr20 63515288 63515640 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -5277 NR_148427 79144 Hs.79625 NM_024299 ENSG00000125534 PPDPF C20orf149|dJ697K14.9|exdpf pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor protein-coding 149-20 chr10 86460638 86460913 + 0.666667 NA intron (NM_001318328, intron 10 of 18) AluSp|SINE|Alu 61009 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 115-3 chr1 75436889 75437080 + 0.666667 NA intron (NM_001320285, intron 2 of 25) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 174130 NM_001320287 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 131.333-50 chr14 43150646 43150946 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1356487 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 140.667-18 chr1 173079176 173079517 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -28383 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 162.667-154 chr20 17963344 17963673 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_003045) promoter-TSS (NR_003045) -562 NR_003045 692086 Hs.680747 NR_003045 ENSG00000212232 SNORD17 HBI-43 small nucleolar RNA, C/D box 17 snoRNA 154.667-46 chr10 68882495 68882841 + 0.666667 NA intron (NM_001130160, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu -18647 NM_024045 79009 Hs.522984 NM_024045 ENSG00000107625 DDX50 GU2|GUB|RH-II/GuB|mcdrh DExD-box helicase 50 protein-coding 166-26 chr10 111535515 111535775 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 421354 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 160.667-40 chr10 83737320 83737657 + 0.666667 NA Intergenic MER67A|LTR|ERV1 -60399 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 192-66 chr18 9430709 9431126 + 0.666667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -44596 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 177.667-48 chr14 68655471 68655871 + 0.666667 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) -26884 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 125.667-92 chr2 36485683 36485975 + 0.666667 NA intron (NM_016441, intron 7 of 16) intron (NM_016441, intron 7 of 16) 112339 NM_005102 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 129.333-70 chr15 65269802 65270126 + 0.666667 NA intron (NM_001316943, intron 2 of 5) MIR3|SINE|MIR 15627 NR_145768 109617003 NR_145768 ENSG00000206903 SNORA24B - small nucleolar RNA, H/ACA box 24B snoRNA 168.333-150 chr4 84281168 84281659 + 0.666667 NA intron (NR_125909, intron 4 of 8) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 17756 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 139.333-141 chr22 28525034 28525397 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluJb|SINE|Alu 65346 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 156.667-136 chr17 54887049 54887449 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13442 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 111.667-65 chr12 81325155 81325482 + 0.666667 NA intron (NM_001220474, intron 20 of 30) intron (NM_001220474, intron 20 of 30) 44051 NM_001220479 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 112.333-122 chr2 46900673 46900852 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15044 NM_001171509 90411 Hs.662152 NM_139279 ENSG00000180398 MCFD2 F5F8D|F5F8D2|LMAN1IP|SDNSF multiple coagulation factor deficiency 2 protein-coding 179-64 chr22 39820358 39820739 + 0.666667 NA intron (NM_152512, intron 5 of 6) intron (NM_152512, intron 5 of 6) 73212 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 142-85 chr3 49770320 49770597 + 0.666667 NA intron (NM_153273, intron 1 of 5) AluYk11|SINE|Alu 15736 NM_001242829 9807 Hs.386168 NM_153273 ENSG00000176095 IP6K1 IHPK1|PiUS inositol hexakisphosphate kinase 1 protein-coding 167.333-149 chr2 226242272 226242743 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 99713 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 136-43 chr17 53746058 53746411 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76693 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 149.667-187 chr2 25791073 25791363 + 0.666667 NA intron (NM_001369347, intron 1 of 9) AluSq2|SINE|Alu 3473 NM_001369347 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 122.667-156 chr5 109691627 109691868 + 0.666667 NA intron (NM_002372, intron 1 of 21) intron (NM_002372, intron 1 of 21) 2381 NM_002372 4124 Hs.432822 NM_002372 ENSG00000112893 MAN2A1 AMan II|GOLIM7|MANA2|MANII mannosidase alpha class 2A member 1 protein-coding 236-38 chr2 73028707 73029145 + 0.666667 NA intron (NR_138476, intron 3 of 14) MIRb|SINE|MIR 30246 NM_001330407 94097 Hs.368171 NM_144579 ENSG00000144040 SFXN5 BBG-TCC|SLC56A5 sideroflexin 5 protein-coding 154.667-287 chr4 141570438 141570796 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -65966 NM_000585 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 120-38 chr14 28920855 28921064 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -135172 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 151.333-38 chr1 241670193 241670521 + 0.666667 NA intron (NM_001367482, intron 2 of 27) intron (NM_001367482, intron 2 of 27) 18076 NM_001367482 128025 Hs.97527 NM_144625 ENSG00000162843 WDR64 - WD repeat domain 64 protein-coding 176-25 chr12 126709079 126709403 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -18923 NR_110035 100996671 Hs.121392 NR_110034 ENSG00000256732 LOC100996671 - uncharacterized LOC100996671 ncRNA 127.333-97 chr21 29033027 29033341 + 0.666667 NA intron (NM_001032410, intron 4 of 18) intron (NM_001032410, intron 4 of 18) 8516 NM_006447 10600 Hs.99819 NM_006447 ENSG00000156256 USP16 UBP-M|UBPM ubiquitin specific peptidase 16 protein-coding 122-57 chr2 180542753 180542958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -149249 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 166-58 chr2 30829422 30829830 + 0.666667 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -22180 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 144.667-51 chr12 30628928 30629220 + 0.666667 NA TTS (NM_001190995) TTS (NM_001190995) 48170 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 150.667-63 chr11 33348630 33348999 + 0.666667 NA exon (NM_005734, exon 13 of 17) exon (NM_005734, exon 13 of 17) -27294 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 145-69 chr3 48838971 48839270 + 0.666667 NA intron (NM_001321982, intron 1 of 11) AluSq2|SINE|Alu 8754 NM_001321982 5576 Hs.631923 NM_004157 ENSG00000114302 PRKAR2A PKR2|PRKAR2 protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit alpha protein-coding 160.667-3 chr1 48396236 48396635 + 0.666667 NA intron (NM_019073, intron 7 of 12) L1MB3|LINE|L1 75769 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 155-77 chr20 16800654 16800952 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie 52450 NM_020157 56914 Hs.41119 NM_020157 ENSG00000125879 OTOR FDP|MIAL1 otoraplin protein-coding 186.333-127 chr5 88150941 88151361 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 117694 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 148.667-376 chr8 81454028 81454340 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -6745 NM_001348381 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 126.667-12 chr1 210465445 210465788 + 0.666667 NA intron (NM_001122834, intron 8 of 11) FLAM_A|SINE|Alu 136250 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 281.333-9 chr11 76257958 76258467 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51710 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 191.333-169 chr6 1796165 1796663 + 0.666667 NA intron (NM_001253846, intron 7 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie 186499 NM_001453 2296 Hs.348883 NM_001453 ENSG00000054598 FOXC1 ARA|ASGD3|FKHL7|FREAC-3|FREAC3|IGDA|IHG1|IRID1|RIEG3 forkhead box C1 protein-coding 158.333-248 chr4 152673322 152673639 + 0.666667 NA intron (NM_152680, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu 6517 NM_152680 201799 Hs.518900 NM_152680 ENSG00000170006 TMEM154 - transmembrane protein 154 protein-coding 124-12 chr1 194504890 194505111 + 0.666667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 1200255 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 126.667-82 chr2 114329983 114330238 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -112531 NM_001321910 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 135-79 chr4 136048521 136048809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -134985 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 283-3 chr1 118529905 118530457 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -344953 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 126-83 chr4 64582147 64582336 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -172781 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 135-102 chr7 77820476 77820815 + 0.666667 NA intron (NM_001366088, intron 1 of 11) AluJr4|SINE|Alu -19483 NM_001366089 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 133.333-111 chr3 116186701 116187012 + 0.666667 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -173168 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 117.333-48 chr13 109651929 109652238 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76191 NR_103846 101409253 Hs.578072 NR_103846 ENSG00000234854 LINC00676 - long intergenic non-protein coding RNA 676 ncRNA 123.333-9 chr1 81720494 81720766 + 0.666667 NA intron (NM_001297704, intron 1 of 20) intron (NM_001297704, intron 1 of 20) 20860 NM_001297704 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 148.667-194 chr2 101535548 101535838 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -60581 NM_001145664 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 142.667-74 chr16 56349382 56349633 + 0.666667 NA intron (NM_020988, intron 6 of 8) intron (NM_020988, intron 6 of 8) 75482 NM_001323511 267 Hs.295137 NM_001144 ENSG00000159461 AMFR GP78|RNF45 autocrine motility factor receptor protein-coding 136.333-188 chr7 18969765 18970130 + 0.666667 NA intron (NM_001321868, intron 24 of 25) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 147689 NR_149001 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 149-46 chr15 20658461 20658844 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96303 NR_027411 729786 Hs.592025 NR_027411 ENSG00000181984 GOLGA8CP GOLGA8C golgin A8 family member C, pseudogene pseudo 204-40 chr11 83953354 83953791 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 14 of 27) MER1B|DNA|hAT-Charlie -271147 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 206-64 chr18 71845627 71846099 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -63637 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 113-153 chr4 48580684 48580898 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 22 of 63) intron (NM_015030, intron 22 of 63) 90539 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 117.333-11 chr1 118748858 118749067 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 239381 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 113.667-141 chr3 116701288 116701471 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8409 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 112-216 chrX 44193827 44194104 + 0.666667 NA intron (NM_025184, intron 11 of 14) intron (NM_025184, intron 11 of 14) 149707 NM_025184 80258 Hs.521953 NM_025184 ENSG00000183690 EFHC2 MRX74|dJ1158H2.1 EF-hand domain containing 2 protein-coding 229-51 chr5 24408372 24408906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 236339 NM_001317224 1008 Hs.92489 NM_006727 ENSG00000040731 CDH10 - cadherin 10 protein-coding 131-88 chr6 68108640 68108881 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53409 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 142-71 chr2 227395147 227395476 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -16005 NM_024795 79853 Hs.156652 NM_024795 ENSG00000168955 TM4SF20 PRO994|SLI5|TCCE518 transmembrane 4 L six family member 20 protein-coding 152.333-22 chr1 170253660 170254087 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30335 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 146-52 chr19 6814098 6814527 + 0.666667 NA intron (NM_001258206, intron 1 of 25) L1ME2z|LINE|L1 41604 NM_001258206 7409 Hs.116237 NM_005428 ENSG00000141968 VAV1 VAV vav guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 287.333-67 chr8 126533609 126534119 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24614 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 148-151 chr6 157795028 157795449 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -28008 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 253.333-80 chr4 129531995 129532437 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 239262 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 177-45 chr22 35681110 35681451 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 32834 NM_030641 80830 Hs.257352 NM_030641 ENSG00000221963 APOL6 APOL-VI|APOLVI apolipoprotein L6 protein-coding 186.333-123 chr5 55963147 55963679 + 0.666667 NA non-coding (NR_120480, exon 7 of 18) non-coding (NR_120480, exon 7 of 18) 31550 NM_001364276 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 156.333-249 chr3 141314906 141315347 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -9060 NM_001080412 253461 Hs.518301 NM_152535 ENSG00000177311 ZBTB38 CIBZ|PPP1R171|ZNF921 zinc finger and BTB domain containing 38 protein-coding 222.666-53 chr8 62402207 62402819 + 0.666667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 153659 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 159-102 chr6 66696546 66696878 + 0.666667 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 908833 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 156.667-5 chr1 43172959 43173358 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001159936) promoter-TSS (NM_001159936) -588 NM_001159936 10969 Hs.346868 NM_006824 ENSG00000117395 EBNA1BP2 EBP2|NOBP|P40 EBNA1 binding protein 2 protein-coding 153.333-352 chr6 34990897 34991200 + 0.666667 NA intron (NM_015245, intron 9 of 23) intron (NM_015245, intron 9 of 23) 101793 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 151-81 chr3 35499285 35499586 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -105412 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 193.667-129 chr7 118485614 118486165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 261185 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 124.333-11 chr1 167614352 167614586 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -15724 NM_001322923 92241 Hs.493867 NM_052862 ENSG00000198771 RCSD1 CAPZIP|MK2S4 RCSD domain containing 1 protein-coding 159.667-78 chr12 49462767 49463147 + 0.666667 NA intron (NM_001293285, intron 4 of 14) LTR1D|LTR|ERV1 73783 NR_033267 100335030 Hs.687044 NR_033267 LOC100335030 - FGFR1 oncogene partner 2 pseudogene pseudo 160.333-127 chr17 61130804 61131192 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) AluSx1|SINE|Alu 236706 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 127.333-73 chr19 50307004 50307342 + 0.666667 NA intron (NM_024729, intron 39 of 40) intron (NM_024729, intron 39 of 40) 22204 NM_004977 3748 Hs.467146 NM_004977 ENSG00000131398 KCNC3 KSHIIID|KV3.3|SCA13 potassium voltage-gated channel subfamily C member 3 protein-coding 228-9 chr10 22687668 22688136 + 0.666667 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) MER2|DNA|TcMar-Tigger 26206 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 147.667-9 chr1 103102934 103103238 + 0.666667 NA intron (NM_001854, intron 1 of 66) intron (NM_001854, intron 1 of 66) 5410 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 116-24 chr10 119324200 119324461 + 0.666667 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) MIR|SINE|MIR -53642 NR_039829 100616398 NR_039829 ENSG00000265719 MIR4681 - microRNA 4681 ncRNA 140-117 chr8 91591202 91591558 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 342061 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 122-69 chr22 31370343 31370643 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23734 NR_120386 54944 Hs.648259 NM_017834 LINC01521 - long intergenic non-protein coding RNA 1521 ncRNA 142.333-244 chr8 125040290 125040588 + 0.666667 NA intron (NM_014846, intron 23 of 28) intron (NM_014846, intron 23 of 28) 41934 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 141.333-237 chr8 87571165 87571537 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 302664 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 111.667-71 chr12 120334087 120334260 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6394 NM_000928 5319 Hs.992 NM_000928 ENSG00000170890 PLA2G1B PLA2|PLA2A|PPLA2 phospholipase A2 group IB protein-coding 145.667-72 chr14 45343414 45343705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90357 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 117-84 chr2 208919421 208919651 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 376894 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 113-192 chr7 27756387 27756633 + 0.666667 NA intron (NM_001362794, intron 2 of 16) MIR|SINE|MIR 16415 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 136.667-116 chr3 83369382 83369647 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 1383372 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 150.333-321 chr5 34777869 34778185 + 0.666667 NA intron (NM_015577, intron 3 of 17) L1MA4A|LINE|L1 -61137 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 214-23 chr11 13510764 13511242 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -14828 NM_001316352 5741 Hs.37045 NM_000315 ENSG00000152266 PTH PTH1 parathyroid hormone protein-coding 117.667-70 chr17 44978512 44978785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10345 NM_006688 10882 Hs.134012 NM_006688 ENSG00000131094 C1QL1 C1QRF|C1QTNF14|CRF|CTRP14 complement C1q like 1 protein-coding 167.333-263 chr8 114137603 114137945 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -700835 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 123.333-21 chr1 213086051 213086403 + 0.666667 NA intron (NM_001136138, intron 2 of 13) LTR41B|LTR|ERVL 34986 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 332-18 chr2 117061444 117062182 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -752878 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 177.333-170 chr8 86718159 86718491 + 0.666667 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) L1MA5A|LINE|L1 25350 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 137.333-68 chr17 63098003 63098393 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 3 of 25) L1PA5|LINE|L1 131963 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 175.333-166 chr6 168542136 168542601 + 0.666667 NA intron (NM_001166412, intron 4 of 12) intron (NM_001166412, intron 4 of 12) 101184 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 147-39 chr14 43544737 43545132 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 962349 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 119.667-19 chr10 17886021 17886252 + 0.666667 NA intron (NM_002438, intron 22 of 29) intron (NM_002438, intron 22 of 29) 41029 NR_030167 574445 NR_030167 ENSG00000207938 MIR511 MIR511-1|MIR511-2|MIRN511-1|MIRN511-2|hsa-mir-511|hsa-mir-511-2|mir-511 microRNA 511 ncRNA 150.333-103 chr14 39079103 39079399 + 0.666667 NA intron (NM_006364, intron 7 of 19) HAL1ME|LINE|L1 -23889 NR_146545 105370458 NR_146545 ENSG00000258651 SEC23A-AS1 - SEC23A antisense RNA 1 ncRNA 175.667-133 chr7 39928893 39929265 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 20340 NR_158201 112267983 Hs.587424 NR_158201 LOC112267983 - uncharacterized LOC112267983 ncRNA 117.667-73 chr18 834433 834775 + 0.666667 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -22362 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 151.333-199 chr2 34690402 34690696 + 0.666667 NA intron (NR_126404, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 12992 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 112-207 chr8 130455529 130455719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11950 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 153-128 chr7 54488169 54488535 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53973 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 119.667-161 chr6 4523050 4523300 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 34377 NR_149117 105374895 Hs.436882 NR_149117 LINC02533 - long intergenic non-protein coding RNA 2533 ncRNA 148.333-252 chr3 69294097 69294430 + 0.666667 NA intron (NM_015123, intron 4 of 22) intron (NM_015123, intron 4 of 22) 91825 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 174-43 chr17 32421251 32421663 + 0.666667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 -23053 NM_001270482 5717 Hs.443379 NM_002815 ENSG00000108671 PSMD11 Rpn6|S9|p44.5 proteasome 26S subunit, non-ATPase 11 protein-coding 134.667-115 chr20 31778397 31778758 + 0.666667 NA intron (NM_012112, intron 9 of 17) Tigger9a|DNA|TcMar-Tigger 39287 NM_012112 22974 Hs.244580 NM_012112 ENSG00000088325 TPX2 C20orf1|C20orf2|DIL-2|DIL2|FLS353|GD:C20orf1|HCA519|HCTP4|REPP86|p100 TPX2 microtubule nucleation factor protein-coding 144.333-256 chr8 12995441 12995731 + 0.666667 NA intron (NM_020844, intron 2 of 4) intron (NM_020844, intron 2 of 4) -16678 NM_001099677 57604 Hs.202521 NM_020844 ENSG00000250305 TRMT9B C8orf79|KIAA1456|TRM9L|hTRM9L tRNA methyltransferase 9B (putative) protein-coding 119.333-105 chr16 73275583 73275899 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1a_Art|DNA|TcMar-Tigger -111064 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 177-8 chr10 70393951 70394456 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9942 NM_004096 1979 Hs.621200 NM_004096 ENSG00000148730 EIF4EBP2 4EBP2|PHASII eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 protein-coding 139.667-142 chr4 111104588 111104958 + 0.666667 NA Intergenic Charlie17|DNA|hAT-Charlie -244126 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 164.333-151 chr3 24352248 24352524 + 0.666667 NA intron (NM_001354709, intron 1 of 10) intron (NM_001354709, intron 1 of 10) -141701 NR_046244 644990 Hs.631912 NR_046244 THRB-AS1 - THRB antisense RNA 1 ncRNA 149.333-115 chr14 65711620 65711909 + 0.666667 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 240662 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 206-194 chr9 86092480 86092803 + 0.666667 NA intron (NM_177937, intron 1 of 9) intron (NM_177937, intron 1 of 9) 6917 NM_016548 51280 Hs.494337 NM_016548 ENSG00000135052 GOLM1 C9orf155|GOLPH2|GP73|HEL46|PSEC0257|bA379P1.3 golgi membrane protein 1 protein-coding 148.333-28 chr1 192416248 192416600 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 99432 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 159-79 chr3 67961945 67962325 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -29457 NM_001252216 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 121.333-135 chr4 103534227 103534427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109285 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 201-89 chr5 36337405 36337777 + 0.666667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -35689 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 155.333-393 chr8 101791876 101792177 + 0.666667 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) -1057 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 164.667-241 chr8 117064016 117064410 + 0.666667 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) AluSq2|SINE|Alu -70782 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 159.333-288 chr6 74499944 74500325 + 0.666667 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) intron (NR_110856, intron 2 of 3) 430683 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 148.333-184 chr2 57081043 57081361 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -826449 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 267.333-73 chr5 27351437 27352104 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -120522 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 113-145 chr3 142937396 142937610 + 0.666667 NA intron (NR_038455, intron 3 of 4) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 10828 NR_038455 100507389 Hs.38715 NR_038455 ENSG00000243818 LOC100507389 - uncharacterized LOC100507389 ncRNA 147.667-337 chr7 65929208 65929575 + 0.666667 NA intron (NM_001284342, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 52822 NM_001284290 2990 Hs.255230 NM_000181 ENSG00000169919 GUSB BG|MPS7 glucuronidase beta protein-coding 112-113 chr2 155182057 155182317 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 483492 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 167.333-283 chrX 98871098 98871443 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -1306735 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-117 chr17 67873984 67874271 + 0.666667 NA intron (NM_182641, intron 3 of 27) L1MC4a|LINE|L1 48624 NM_004459 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 151.333-242 chr20 12766369 12766692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 170433 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 197-74 chr3 80465234 80465711 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -299425 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 231.333-95 chr5 132181789 132182256 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2854 NR_047470 100861518 Hs.519568 NR_047470 ENSG00000237714 P4HA2-AS1 - P4HA2 antisense RNA 1 ncRNA 161.333-292 chr8 127015633 127015966 + 0.666667 NA intron (NR_045262, intron 1 of 1) MIRb|SINE|MIR 2645 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 176-55 chr21 27360721 27361151 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -361443 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 111.667-147 chr2 217021343 217021541 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 150670 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 115-31 chr11 24005988 24006232 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -490943 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 148-147 chr6 125467650 125467943 + 0.666667 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -165829 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 171.667-7 chr1 77305592 77305952 + 0.666667 NA intron (NM_012093, intron 5 of 13) L1MA1|LINE|L1 22685 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 166.333-51 chr11 112962005 112962330 + 0.666667 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) CpG 747 NM_001076682 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 162-102 chr5 118617628 118617968 + 0.666667 NA intron (NR_104998, intron 4 of 4) intron (NR_104998, intron 4 of 4) 21610 NR_104998 102467225 Hs.582523 NR_104998 ENSG00000249128 LINC02215 - long intergenic non-protein coding RNA 2215 ncRNA 124.333-124 chr3 178397484 178397691 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -21614 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 207-52 chr17 53374695 53375250 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 389467 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 204-2 chr1 43700861 43701325 + 0.666667 NA intron (NR_033827, intron 4 of 4) AluSc|SINE|Alu 6248 NR_033827 100132774 Hs.655569 NR_033827 KDM4A-AS1 - KDM4A antisense RNA 1 ncRNA 168.333-63 chr15 67723280 67723646 + 0.666667 NA intron (NM_002757, intron 16 of 20) intron (NM_002757, intron 16 of 20) -102046 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 135.333-112 chr3 22388149 22388448 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 431159 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 132.667-145 chr5 127640667 127640924 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -8226 NM_001048252 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 215-12 chr11 82284572 82285109 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 3 of 7) MER70A|LTR|ERVL 119073 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 186.333-106 chr3 150415449 150415861 + 0.666667 NA intron (NM_001303264, intron 1 of 2) AluJr4|SINE|Alu 7357 NM_014779 9819 Hs.722470 NM_014779 ENSG00000196428 TSC22D2 TILZ4a|TILZ4b|TILZ4c TSC22 domain family member 2 protein-coding 161-109 chr9 126436127 126436444 + 0.666667 NA intron (NM_033446, intron 7 of 9) intron (NM_033446, intron 7 of 9) -25781 NR_045006 641373 Hs.742606 NR_045006 NRON NCRNA00194 non-coding repressor of NFAT ncRNA 205-21 chr11 117808235 117808664 + 0.666667 NA intron (NM_001367905, intron 1 of 6) intron (NM_001367905, intron 1 of 6) 9065 NM_001367905 57453 Hs.659513 NM_020693 ENSG00000177103 DSCAML1 DSCAM2 DS cell adhesion molecule like 1 protein-coding 119.333-229 chr9 931060 931377 + 0.666667 NA intron (NM_001363767, intron 4 of 4) L1MB7|LINE|L1 -45437 NM_021240 58524 Hs.189174 NM_021240 ENSG00000064218 DMRT3 DMRTA3 doublesex and mab-3 related transcription factor 3 protein-coding 213-12 chr11 126638261 126638607 + 0.666667 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) intron (NM_001301097, intron 1 of 15) -14344 NR_120532 101929427 Hs.600341 NR_120532 ENSG00000254607 LOC101929427 - uncharacterized LOC101929427 ncRNA 204.333-12 chr1 124979850 124980386 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 3461006 NR_003955 647121 Hs.697682 NR_003955 ENSG00000231752 EMBP1 - embigin pseudogene 1 pseudo 112-182 chr6 46430878 46431176 + 0.666667 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) intron (NM_001251973, intron 2 of 4) 60296 NM_001251974 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 195.333-9 chr1 63030947 63031519 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -18762 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 141-97 chr9 27728179 27728437 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -154442 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 121.667-150 chr4 167332496 167332746 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98031 NM_001204352 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 190-34 chr14 61031955 61032252 + 0.666667 NA intron (NR_033344, intron 6 of 16) intron (NR_033344, intron 6 of 16) -50413 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 156-72 chr2 85207141 85207434 + 0.666667 NA intron (NM_031283, intron 3 of 11) intron (NM_031283, intron 3 of 11) -6365 NR_136323 102724579 Hs.669216 NR_136323 LOC102724579 - uncharacterized LOC102724579 ncRNA 112.333-209 chr5 75580743 75580986 + 0.666667 NA intron (NM_016218, intron 6 of 14) intron (NM_016218, intron 6 of 14) -30612 NM_001276713 728780 Hs.370455 NM_001271529 ENSG00000189045 ANKDD1B - ankyrin repeat and death domain containing 1B protein-coding 119-146 chr8 133990001 133990280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 103644 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 196.333-146 chr5 127663950 127664342 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 11131 NM_001127385 613212 Hs.66194 NM_001048252 ENSG00000205279 CTXN3 KABE cortexin 3 protein-coding 147.667-371 chr8 125479194 125479486 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47131 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 145-101 chr6 3763235 3763541 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -11376 NM_183373 221749 Hs.484500 NM_183373 ENSG00000168994 PXDC1 C6orf145 PX domain containing 1 protein-coding 144.667-168 chr20 36246450 36246751 + 0.666667 NA intron (NM_015511, intron 3 of 3) intron (NM_015511, intron 3 of 3) 10122 NM_001271874 25980 Hs.11314 NM_015511 ENSG00000131043 AAR2 C20orf4|CGI-23 AAR2 splicing factor protein-coding 163-39 chr19 36810784 36811074 + 0.666667 NA intron (NR_040028, intron 2 of 3) MER20|DNA|hAT-Charlie 13366 NR_040028 284408 Hs.570010 NR_040027 ENSG00000267254 ZNF790-AS1 - ZNF790 antisense RNA 1 ncRNA 176-13 chr10 88414057 88414427 + 0.666667 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 169076 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 124.333-61 chr17 27126984 27127275 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37888 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 117.333-131 chr3 51023471 51023666 + 0.666667 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) AluSx|SINE|Alu 348488 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 149-51 chr16 35797043 35797368 + 0.666667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 50653 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 142.333-252 chr9 22586953 22587227 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -59110 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 172.667-52 chr14 46914865 46915255 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 10 of 16) intron (NM_001113498, intron 10 of 16) -263279 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 134-11 chr1 238356180 238356440 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 129707 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 164.667-96 chr18 21088159 21088541 + 0.666667 NA intron (NM_005406, intron 1 of 32) AluJo|SINE|Alu 23463 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 143-37 chr13 22238704 22239053 + 0.666667 NA intron (NR_103810, intron 1 of 1) intron (NR_103810, intron 1 of 1) 28593 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 126.667-19 chr10 84304363 84304726 + 0.666667 NA Intergenic MER34C_|LTR|ERV1 -24045 NM_018999 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 143-133 chr9 83179007 83179368 + 0.666667 NA Intergenic MER113A|DNA|hAT-Charlie 88081 NM_001244962 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 144.333-227 chr6 21822607 21823026 + 0.666667 NA intron (NR_015410, intron 4 of 11) MIRc|SINE|MIR 156403 NR_015410 401237 Hs.712707 NR_015410 CASC15 CANT|LINC00340|lnc-SOX4-1 cancer susceptibility 15 ncRNA 116-5 chr1 52317619 52317903 + 0.666667 NA intron (NM_007324, intron 12 of 17) L1ME1|LINE|L1 48444 NM_032449 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 149.667-41 chr1 216833337 216833734 + 0.666667 NA intron (NM_001243513, intron 1 of 7) intron (NM_001243513, intron 1 of 7) -28150 NM_001243514 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 141.333-128 chr2 226647324 226647640 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 11311 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 309-30 chr5 126312169 126312916 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27367 NR_105039 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 149.333-75 chr11 83553946 83554241 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 19 of 27) AluJo|SINE|Alu 128332 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 116.333-94 chr17 70609233 70609448 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 439805 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 205-20 chr11 61110246 61110571 + 0.666667 NA intron (NM_014207, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 7919 NM_014207 921 Hs.58685 NM_014207 ENSG00000110448 CD5 LEU1|T1 CD5 molecule protein-coding 201-6 chr1 88541789 88542277 + 0.666667 NA intron (NR_110682, intron 3 of 3) intron (NR_110682, intron 3 of 3) -142111 NM_001320707 5586 Hs.440833 NM_006256 ENSG00000065243 PKN2 PAK2|PRK2|PRKCL2|PRO2042|Pak-2|STK7 protein kinase N2 protein-coding 150.667-121 chr14 67670588 67670887 + 0.666667 NA intron (NM_006370, intron 1 of 5) AluSc|SINE|Alu 3895 NM_006370 10490 Hs.741177 NM_006370 ENSG00000100568 VTI1B VTI1|VTI1-LIKE|VTI1L|VTI2|v-SNARE|vti1-rp1 vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B protein-coding 236.333-82 chr6 148907505 148907898 + 0.666667 NA intron (NM_005715, intron 2 of 7) intron (NM_005715, intron 2 of 7) 56983 NR_038408 100128176 Hs.557541 NR_038408 UST-AS1 - UST antisense RNA 1 ncRNA 171.333-55 chr14 94841706 94842131 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 71276 NR_144432 108868751 NR_144432 GSC-DT DIGIT GSC divergent transcript ncRNA 174.333-106 chr4 96482426 96482730 + 0.666667 NA intron (NR_147149, intron 2 of 3) L1MA3|LINE|L1 171875 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 142-86 chr3 54763476 54763754 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 12 of 37) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -123758 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 164.333-201 chr5 117624253 117624599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105935 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 147.333-18 chr1 109732466 109732847 + 0.666667 NA Intergenic (TGTCCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8382 NR_024537 2947 Hs.2006 NM_000849 ENSG00000134202 GSTM3 GST5|GSTB|GSTM3-3|GTM3 glutathione S-transferase mu 3 protein-coding 139-107 chr8 116784359 116784705 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 18008 NM_032334 84294 Hs.86970 NM_032334 ENSG00000147679 UTP23 C8orf53 UTP23 small subunit processome component protein-coding 133.667-103 chr3 161926587 161926879 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 429925 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 175.667-28 chr12 704206 704614 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -40965 NM_016533 4815 Hs.655804 NM_016533 ENSG00000171840 NINJ2 - ninjurin 2 protein-coding 148.333-245 chr3 32157130 32157424 + 0.666667 NA intron (NM_015141, intron 5 of 7) AluYc|SINE|Alu 50766 NM_015141 23171 Hs.82432 NM_015141 ENSG00000152642 GPD1L GPD1-L glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like protein-coding 160.667-65 chr12 5244246 5244658 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1301 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 112-155 chr4 73408592 73408773 + 0.666667 NA exon (NM_000477, exon 4 of 15) exon (NM_000477, exon 4 of 15) 4395 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 125-120 chr8 138589420 138589654 + 0.666667 NA intron (NM_152888, intron 64 of 64) intron (NM_152888, intron 64 of 64) -91807 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 145.667-163 chr21 16900643 16900941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 310555 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 165-26 chr14 101213035 101213363 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 92343 NR_146490 101929422 NR_146490 ENSG00000259004 LINC02285 - long intergenic non-protein coding RNA 2285 ncRNA 148.667-279 chr4 63672668 63673037 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 736598 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 159.667-235 chr4 67012671 67013084 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 409123 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 126.667-185 chr9 107377964 107378192 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88507 NR_121581 101928720 Hs.125496 NR_121581 LINC01509 PRCAT37 long intergenic non-protein coding RNA 1509 ncRNA 199.667-108 chr5 14382357 14382788 + 0.666667 NA intron (NM_007118, intron 21 of 56) intron (NM_007118, intron 21 of 56) -81411 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 127-40 chr18 9766973 9767326 + 0.666667 NA intron (NM_006868, intron 1 of 6) intron (NM_006868, intron 1 of 6) 58848 NM_006868 11031 Hs.99528 NM_006868 ENSG00000168461 RAB31 Rab22B RAB31, member RAS oncogene family protein-coding 256-95 chrX 99098154 99098647 + 0.666667 NA Intergenic MER68-int|LTR|ERVL 1311873 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 140-105 chr7 34313936 34314303 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -344099 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 136.333-96 chr2 121877789 121878038 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 122262 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 152.667-32 chr10 26778196 26778633 + 0.666667 NA intron (NM_001012752, intron 2 of 9) L2c|LINE|L2 80713 NM_014317 23590 Hs.558468 NM_014317 ENSG00000148459 PDSS1 COQ1|COQ10D2|COQ1A|DPS|SPS|TPRT|TPT|TPT 1|hDPS1 decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 protein-coding 150-70 chr2 55523461 55523838 + 0.666667 NA intron (NM_001282761, intron 3 of 10) intron (NM_001282761, intron 3 of 10) 4054 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 152.333-386 chr8 117762462 117762743 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 158311 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 138-2 chr1 99294079 99294361 + 0.666667 NA intron (NM_014839, intron 2 of 6) intron (NM_014839, intron 2 of 6) 29928 NM_014839 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 149-159 chrX 80833504 80833799 + 0.666667 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -23774 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 122.667-89 chr2 69561619 69561842 + 0.666667 NA intron (NM_014911, intron 2 of 21) L1ME1|LINE|L1 -41559 NR_003705 100124535 Hs.693447 NR_003705 ENSG00000207016 SNORA36C - small nucleolar RNA, H/ACA box 36C snoRNA 250.333-7 chr10 55966838 55967411 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -339182 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 128.667-23 chr10 47231449 47231676 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68635 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 126.667-148 chr5 152397011 152397310 + 0.666667 NA intron (NM_020167, intron 2 of 3) intron (NM_020167, intron 2 of 3) 8119 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 137-36 chr17 79073045 79073300 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1765 NM_001042573 64772 Hs.29288 NM_022759 ENSG00000167280 ENGASE - endo-beta-N-acetylglucosaminidase protein-coding 113.333-119 chr2 33730351 33730622 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) intron (NR_126403, intron 1 of 5) -2269 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 114-124 chr5 131853836 131854048 + 0.666667 NA intron (NM_001303622, intron 10 of 12) L1MB3|LINE|L1 -56925 NM_001346114 96459 Hs.591273 NM_133372 ENSG00000217128 FNIP1 - folliculin interacting protein 1 protein-coding 122.333-107 chr2 174421684 174421891 + 0.666667 NA intron (NM_024583, intron 5 of 7) LTR16B2|LTR|ERVL 26057 NM_024583 79634 Hs.470679 NM_024583 ENSG00000144306 SCRN3 SES3 secernin 3 protein-coding 153.333-97 chr12 55653235 55653546 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 16498 NM_206899 121130 Hs.554551 NM_206899 ENSG00000175398 OR10P1 OR10P1P|OR10P2P|OR10P3P|OR12-7|OST701 olfactory receptor family 10 subfamily P member 1 protein-coding 199.333-89 chr15 87268069 87268535 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -279876 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 252-48 chr2 102505334 102505888 + 0.666667 NA intron (NM_001011552, intron 4 of 11) intron (NM_001011552, intron 4 of 11) 32385 NM_001011552 389015 Hs.447686 NM_001011552 ENSG00000180251 SLC9A4 NHE4 solute carrier family 9 member A4 protein-coding 128-30 chr17 2044520 2044712 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 2594 NM_080822 124641 Hs.513856 NM_080822 ENSG00000262664 OVCA2 - OVCA2 serine hydrolase domain containing protein-coding 114.333-90 chr18 1605042 1605288 + 0.666667 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -245536 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 134.333-177 chr8 111412075 111412434 + 0.666667 NA intron (NR_146282, intron 2 of 3) L1PA16|LINE|L1 35615 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 118-112 chr6 50863146 50863463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44433 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 147.667-306 chr6 35959322 35959644 + 0.666667 NA exon (NM_138718, exon 14 of 18) exon (NM_138718, exon 14 of 18) -38303 NR_034069 6732 Hs.443861 NM_003137 ENSG00000096063 SRPK1 SFRSK1 SRSF protein kinase 1 protein-coding 120.667-91 chr2 46074771 46075042 + 0.666667 NA intron (NM_005400, intron 10 of 14) intron (NM_005400, intron 10 of 14) -222501 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 153.667-388 chr8 108884611 108884984 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -97203 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 131.667-130 chr3 87616606 87616829 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -175989 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 216.333-119 chr6 25670354 25670857 + 0.666667 NA intron (NM_006998, intron 6 of 10) MIRb|SINE|MIR 18390 NM_006998 10590 Hs.116428 NM_006998 ENSG00000079689 SCGN CALBL|DJ501N12.8|SECRET|SEGN|setagin secretagogin, EF-hand calcium binding protein protein-coding 124.667-59 chr14 67890901 67891186 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 67451 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 112.333-25 chr10 69016471 69016653 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_015634, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_015634, exon 7 of 7) 27759 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 147.333-229 chr3 189483005 189483348 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -113570 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 131.667-59 chr14 83517773 83517970 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 875239 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 251-65 chr5 57675013 57675490 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24591 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 189.333-123 chr22 44435264 44435665 + 0.666667 NA Intergenic X7B_LINE|LINE|CR1 -7863 NR_109966 101927526 Hs.339290 NR_109966 ENSG00000232655 LINC01656 - long intergenic non-protein coding RNA 1656 ncRNA 141.333-93 chr18 61205783 61206171 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -127453 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 141.333-259 chr9 84324661 84324954 + 0.666667 NA intron (NM_022127, intron 2 of 18) intron (NM_022127, intron 2 of 18) 15951 NR_037638 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 164.333-116 chr2 68567133 68567459 + 0.666667 NA intron (NM_173545, intron 8 of 9) intron (NM_173545, intron 8 of 9) -76292 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 250.667-37 chr2 68878218 68878677 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7050 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 131-10 chr10 12469417 12469642 + 0.666667 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) intron (NM_001351032, intron 3 of 11) 80547 NM_001351032 57118 Hs.600547 NM_020397 ENSG00000183049 CAMK1D CKLiK|CaM-K1|CaMKID calcium/calmodulin dependent protein kinase ID protein-coding 131.333-94 chr2 137444723 137444973 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 14 of 27) L1MA4|LINE|L1 483084 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 123.333-233 chr9 80687251 80687545 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 712375 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 158-71 chr2 108952198 108952620 + 0.666667 NA intron (NM_022336, intron 1 of 11) intron (NM_022336, intron 1 of 11) 36811 NM_022336 10913 Hs.171971 NM_022336 ENSG00000135960 EDAR DL|ECTD10A|ECTD10B|ED1R|ED3|ED5|EDA-A1R|EDA1R|EDA3|HRM1 ectodysplasin A receptor protein-coding 147.667-250 chr4 34495545 34495933 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -225992 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 145-88 chr5 31172010 31172308 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -21527 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 116.333-41 chr11 34716949 34717197 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 84507 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 143.333-5 chr1 51443238 51443498 + 0.666667 NA intron (NM_001981, intron 11 of 24) intron (NM_001981, intron 11 of 24) -21273 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 113.333-7 chr1 70578477 70578653 + 0.666667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -127888 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 164-66 chr2 199393013 199393395 + 0.666667 NA intron (NM_001172509, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 64735 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 137.667-129 chr3 126395779 126396053 + 0.666667 NA intron (NM_182628, intron 1 of 16) intron (NM_182628, intron 1 of 16) 1007 NM_182628 348807 Hs.591305 NM_182628 ENSG00000163885 CFAP100 CCDC37|MIA1 cilia and flagella associated protein 100 protein-coding 179-80 chr5 112548707 112549080 + 0.666667 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -79543 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 157-52 chr17 61028756 61029149 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 17 of 25) intron (NM_001330413, intron 17 of 25) 338752 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 119.667-101 chr20 52140562 52140816 + 0.666667 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -35205 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 225-44 chr3 174476917 174477347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -382202 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 179.333-47 chr12 2218338 2218691 + 0.666667 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 4967 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 120.333-9 chr1 94229769 94230026 + 0.666667 NA intron (NM_001328665, intron 1 of 21) intron (NM_001328665, intron 1 of 21) 7687 NM_001328666 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 187.667-112 chr4 150294990 150295486 + 0.666667 NA intron (NM_001199282, intron 53 of 56) AluJo|SINE|Alu 216793 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 129-72 chr2 227415917 227416174 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36739 NM_024795 79853 Hs.156652 NM_024795 ENSG00000168955 TM4SF20 PRO994|SLI5|TCCE518 transmembrane 4 L six family member 20 protein-coding 137.333-148 chr5 11959995 11960381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55742 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 196-8 chr1 165042353 165042826 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -267948 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 171.667-64 chr16 66967351 66967712 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001185176) promoter-TSS (NM_001185176) 56 NM_001185176 23491 Hs.268700 NM_012122 ENSG00000172828 CES3 ES31 carboxylesterase 3 protein-coding 192.333-91 chr2 70411000 70411430 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 70425 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 179-33 chr15 67321057 67321406 + 0.666667 NA intron (NM_001322475, intron 3 of 17) intron (NM_001322475, intron 3 of 17) -66033 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 157.333-283 chr5 76843923 76844199 + 0.666667 NA Intergenic MER41A|LTR|ERV1 -5953 NM_130772 170591 Hs.482563 NM_130772 ENSG00000171643 S100Z Gm625|S100-zeta S100 calcium binding protein Z protein-coding 157-123 chr7 29972864 29973130 + 0.666667 NA intron (NM_001145514, intron 1 of 7) intron (NM_001145514, intron 1 of 7) 16804 NM_001145515 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 158-36 chr12 64134103 64134496 + 0.666667 NA intron (NM_001346201, intron 21 of 21) AluY|SINE|Alu 87997 NM_001300940 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 159.333-175 chr2 183951861 183952223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -426933 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 136-74 chr4 54996129 54996426 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 129318 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 124.333-162 chr6 127439691 127439912 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001012279, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001012279, exon 12 of 12) 19588 NM_014702 9729 Hs.319247 NM_014702 ENSG00000189367 KIAA0408 - KIAA0408 protein-coding 161-7 chr10 77045751 77046136 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 14 of 28) intron (NM_001271519, intron 14 of 28) -94888 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 192.333-5 chr1 103012209 103012756 + 0.666667 NA intron (NM_001854, intron 13 of 66) intron (NM_001854, intron 13 of 66) 96014 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 191.333-34 chr11 61057596 61058140 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36095 NM_001346456 921 Hs.58685 NM_014207 ENSG00000110448 CD5 LEU1|T1 CD5 molecule protein-coding 118.667-129 chr22 35328920 35329229 + 0.666667 NA intron (NR_156428, intron 6 of 13) AluSx|SINE|Alu -6566 NR_037471 100500826 NR_037471 ENSG00000266320 MIR3909 mir-3909 microRNA 3909 ncRNA 176.333 chr1 25923186 25923570 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16501 NM_203399 3925 Hs.209983 NM_005563 ENSG00000117632 STMN1 C1orf215|LAP18|Lag|OP18|PP17|PP19|PR22|SMN stathmin 1 protein-coding 154-77 chr2 18214349 18214740 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 335877 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 137.667-166 chr6 104172406 104172672 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 687007 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 201-34 chr14 41003477 41003898 + 0.666667 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 48976 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 147.333-137 chr17 31712553 31712841 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 137286 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 129-123 chr8 61622308 61622588 + 0.666667 NA intron (NM_004318, intron 13 of 24) intron (NM_004318, intron 13 of 24) 67363 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 115.333-14 chr1 167218651 167218886 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2117 NM_001365849 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 212 chr1 18736181 18736808 + 0.666667 NA TTS (NM_013945) TTS (NM_013945) 105648 NM_001135254 5081 Hs.113253 NM_002584 ENSG00000009709 PAX7 HUP1|PAX7B|RMS2 paired box 7 protein-coding 138.333-134 chr4 54063173 54063540 + 0.666667 NA intron (NM_012110, intron 1 of 5) intron (NM_012110, intron 1 of 5) 1249 NM_012110 26511 Hs.335393 NM_012110 ENSG00000109220 CHIC2 BTL cysteine rich hydrophobic domain 2 protein-coding 209.667-114 chr8 121973288 121973770 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -332089 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 140.333-82 chr17 54862681 54862940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37881 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 111.667-211 chr5 128145860 128146149 + 0.666667 NA intron (NM_001046, intron 10 of 26) intron (NM_001046, intron 10 of 26) 62238 NR_046207 6558 Hs.162585 NM_001046 ENSG00000064651 SLC12A2 BSC|BSC2|NKCC1|PPP1R141 solute carrier family 12 member 2 protein-coding 125.667-69 chr15 53199426 53199741 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83218 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 200.667-109 chr3 60205285 60205730 + 0.666667 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) -124598 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 151.667-400 chrX 47551795 47552142 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -9132 NM_001256197 369 Hs.446641 NM_001654 ENSG00000078061 ARAF A-RAF|ARAF1|PKS2|RAFA1 A-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 124.667-85 chr17 44555666 44555964 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1669 NM_001466 2535 Hs.142912 NM_001466 ENSG00000180340 FZD2 Fz2|OMOD2|fz-2|fzE2|hFz2 frizzled class receptor 2 protein-coding 168.333-216 chr8 132754769 132755219 + 0.666667 NA intron (NM_144649, intron 3 of 9) MIRc|SINE|MIR 5588 NM_001145153 137835 Hs.293842 NM_144649 ENSG00000165071 TMEM71 - transmembrane protein 71 protein-coding 272-31 chr3 106211494 106211950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -342321 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 159-40 chr15 101590405 101590841 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 23716 NR_147041 101927505 Hs.578394 NR_147041 LINC02348 - long intergenic non-protein coding RNA 2348 ncRNA 124.667-66 chr15 42994218 42994577 + 0.666667 NA intron (NM_174916, intron 33 of 46) FLAM_C|SINE|Alu -73619 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 141.667-225 chr8 86548907 86549277 + 0.666667 NA intron (NM_003909, intron 12 of 16) intron (NM_003909, intron 12 of 16) 34657 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 115-141 chr7 7730044 7730279 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -11554 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 211.333-48 chr12 122724593 122725017 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 6039 NM_032554 27198 Hs.610873 NM_032554 ENSG00000196917 HCAR1 FKSG80|GPR104|GPR81|HCA1|LACR1|TA-GPCR|TAGPCR hydroxycarboxylic acid receptor 1 protein-coding 115.333-220 chr8 110284754 110284959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -309085 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 112-95 chr18 65365800 65366079 + 0.666667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -384313 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 180.667-34 chr12 94959846 94960281 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 43634 NM_018838 55967 Hs.506374 NM_018838 ENSG00000184752 NDUFA12 B17.2|DAP13|MC1DN23 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A12 protein-coding 137.667-199 chrX 46123735 46124142 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 203736 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 150.667-283 chr4 143465037 143465340 + 0.666667 NA intron (NM_207123, intron 9 of 10) intron (NM_207123, intron 9 of 10) -48514 NM_003601 8467 Hs.558422 NM_003601 ENSG00000153147 SMARCA5 ISWI|SNF2H|WCRF135|hISWI|hSNF2H SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 protein-coding 143-14 chr10 14754485 14754885 + 0.666667 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 20212 NM_031453 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 117.333-193 chr7 70340049 70340392 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 741745 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 156.333-177 chr2 62171630 62171937 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -24332 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 184.667-73 chr22 37837538 37837966 + 0.666667 NA intron (NM_001349853, intron 3 of 7) AluSx3|SINE|Alu 6096 NM_001363839 129138 Hs.135259 NM_138797 ENSG00000100124 ANKRD54 LIAR ankyrin repeat domain 54 protein-coding 119.333-156 chr3 172965225 172965456 + 0.666667 NA intron (NM_031955, intron 5 of 10) intron (NM_031955, intron 5 of 10) 175895 NM_031955 83893 Hs.444236 NM_031955 ENSG00000144962 SPATA16 NYD-SP12|SPGF6 spermatogenesis associated 16 protein-coding 111.667-253 chr8 75534573 75534780 + 0.666667 NA intron (NM_001330561, intron 3 of 11) intron (NM_001330561, intron 3 of 11) -5292 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 118-26 chr12 88897925 88898139 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121660 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 121.333-41 chr12 39107563 39107790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -202085 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 115.667-56 chr12 30072157 30072495 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -287567 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 119.333-58 chr11 103625093 103625299 + 0.666667 NA Intergenic MER31A|LTR|ERV1 -224710 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 215-53 chr22 44043404 44043839 + 0.666667 NA intron (NM_001243386, intron 1 of 11) AluY|SINE|Alu 17317 NM_001243386 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 196.667-105 chr4 33669502 33669951 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 370167 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 124.333-112 chr22 30025274 30025549 + 0.666667 NA intron (NM_153050, intron 19 of 19) intron (NM_153050, intron 19 of 19) 18362 NR_106876 102466742 NR_106876 ENSG00000275818 MIR6818 hsa-mir-6818 microRNA 6818 ncRNA 126-116 chr8 106231058 106231292 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39003 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 136.333-108 chr2 214160900 214161245 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) L1PA10|LINE|L1 -249982 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 149-110 chr5 19231867 19232153 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 654262 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 257.667-43 chr2 123733920 123734357 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 291036 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 213-26 chr16 51535080 51535639 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -227160 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 164.333-159 chr3 103575142 103575472 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51191 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 201.667-57 chr2 126578248 126578701 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77461 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 145-55 chr2 155458312 155458568 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 759745 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 140.667-130 chr20 38155274 38155608 + 0.666667 NA intron (NM_001323317, intron 2 of 11) AluJr|SINE|Alu 9829 NM_001323318 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 138-10 chr1 235180571 235180829 + 0.666667 NA intron (NR_135074, intron 20 of 24) intron (NR_135074, intron 20 of 24) 9416 NR_039908 100616224 NR_039908 ENSG00000263439 MIR4753 mir-4753 microRNA 4753 ncRNA 247.667-44 chr2 5902339 5902919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30058 NR_026832 150622 Hs.560891 NR_026832 SILC1 LINC01105 sciatic injury induced lincRNA upregulator of SOX11 ncRNA 149.333-321 chr5 131098077 131098372 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 67032 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 155.333-394 chr8 103305650 103306067 + 0.666667 NA intron (NM_001317796, intron 2 of 5) intron (NM_001317796, intron 2 of 5) -3120 NR_145795 109623480 NR_145795 SNORD173 - small nucleolar RNA, C/D box 173 snoRNA 168-49 chr2 20246812 20247194 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -21570 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 292-12 chr14 27736009 27736744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63155 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 115.333-148 chr3 193411028 193411314 + 0.666667 NA intron (NM_032279, intron 27 of 29) intron (NM_032279, intron 27 of 29) -32418 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 205.333-161 chr3 159080748 159081142 + 0.666667 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) intron (NM_001197113, intron 1 of 10) 11626 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 117-145 chr8 109453485 109453815 + 0.666667 NA intron (NM_177531, intron 43 of 77) intron (NM_177531, intron 43 of 77) -86050 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 159-16 chr10 64941233 64941565 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16881 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 131.333-111 chr22_KI270736v1_random 166171 166456 + 0.666667 NA NA (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 147-16 chr10 96535223 96535534 + 0.666667 NA intron (NM_020123, intron 9 of 14) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -21452 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 121.333-167 chr7 48335809 48336013 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 28 of 61) intron (NM_152701, intron 28 of 61) 164453 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 132.667-36 chr12 15207253 15207497 + 0.666667 NA intron (NM_032918, intron 2 of 4) L3|LINE|CR1 14042 NM_001190726 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 163-32 chr16 78893579 78894055 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 706920 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 120.333-78 chr17 28829818 28830021 + 0.666667 NA intron (NM_001288635, intron 1 of 3) AluSc8|SINE|Alu 12871 NM_001288640 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 146.667-222 chr3 117939443 117939698 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -248645 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 158.333-320 chr8 100760451 100760776 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -38525 NM_002568 26986 Hs.387804 NM_002568 ENSG00000070756 PABPC1 PAB1|PABP|PABP1|PABPC2|PABPL1 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 protein-coding 151-10 chr10 4904074 4904396 + 0.666667 NA intron (NR_026743, intron 2 of 10) intron (NR_026743, intron 2 of 10) 12038 NR_026743 389932 Hs.631812 NR_026743 AKR1C6P TAKR aldo-keto reductase family 1 member C6, pseudogene pseudo 117.333-78 chr16 73154105 73154319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9765 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 117-22 chr10 76960375 76960584 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 20 of 28) AluJb|SINE|Alu 72435 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 165.333-48 chr11 84445012 84445449 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) L1ME3Cz|LINE|L1 -127891 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 155.667-255 chr4 107493108 107493485 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B5|LTR|ERVL 226938 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 157.333-256 chr4 56583126 56583503 + 0.666667 NA intron (NM_001256475, intron 5 of 8) L1MB7|LINE|L1 52708 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 148.333-416 chr9 116851014 116851312 + 0.666667 NA intron (NM_014010, intron 10 of 21) intron (NM_014010, intron 10 of 21) 163858 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 119.667-96 chr2 218616019 218616287 + 0.666667 NA intron (NM_032726, intron 3 of 15) intron (NM_032726, intron 3 of 15) 8254 NM_032726 84812 Hs.632528 NM_032726 ENSG00000115556 PLCD4 - phospholipase C delta 4 protein-coding 145.333-120 chr18 65165273 65165551 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -584840 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 132.667-56 chr14 73928176 73928495 + 0.666667 NA intron (NM_001242928, intron 12 of 12) L2c|LINE|L2 -21599 NM_182480 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 133.667-93 chr3 55075641 55075943 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102380 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 159-120 chr8 115357392 115357785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 310425 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 152.667 chr1 16257681 16257980 + 0.666667 NA intron (NM_018994, intron 4 of 9) AluSx1|SINE|Alu -20647 NM_030907 79363 Hs.546430 NM_030907 ENSG00000132881 CPLANE2 C1orf89|RSG1 ciliogenesis and planar polarity effector 2 protein-coding 115.333-193 chr6 146285849 146286116 + 0.666667 NA intron (NM_001278065, intron 3 of 9) intron (NM_001278065, intron 3 of 9) 256784 NM_001278067 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 154.667-22 chr1 169889571 169889891 + 0.666667 NA intron (NM_181093, intron 1 of 13) L1MA10|LINE|L1 4165 NM_020423 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 165-73 chr5 11516382 11516857 + 0.666667 NA intron (NM_001288715, intron 2 of 20) L1M4|LINE|L1 72298 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 269.667-49 chr7 40523284 40523810 + 0.666667 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 388571 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 133.333-71 chr2 4045569 4045853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71550 NR_136322 105373394 Hs.742693 NR_136322 LOC105373394 - uncharacterized LOC105373394 ncRNA 168-38 chr15 101344891 101345327 + 0.666667 NA intron (NM_002570, intron 13 of 21) intron (NM_002570, intron 13 of 21) 10672 NR_132373 105371027 NR_132373 ENSG00000259764 PCSK6-AS1 - PCSK6 antisense RNA 1 ncRNA 139.667-187 chr8 85116339 85116601 + 0.666667 NA intron (NM_033402, intron 6 of 18) AluJr|SINE|Alu 9232 NM_033402 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 189.333-167 chr6 46724224 46724672 + 0.666667 NA intron (NM_001168357, intron 1 of 11) intron (NM_001168357, intron 1 of 11) 10927 NM_005084 7941 Hs.584823 NM_005084 ENSG00000146070 PLA2G7 LDL-PLA2|LP-PLA2|PAFAD|PAFAH phospholipase A2 group VII protein-coding 152.333-372 chr8 62424427 62424780 + 0.666667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) L1MB1|LINE|L1 175749 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 219-6 chr1 192054038 192054513 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104187 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 146-38 chr15 78286723 78287011 + 0.666667 NA intron (NM_001303248, intron 6 of 8) L1MC2|LINE|L1 12742 NM_001303248 80349 Hs.513055 NM_025234 ENSG00000140395 WDR61 REC14|SKI8 WD repeat domain 61 protein-coding 221.667-81 chr8 68115801 68116314 + 0.666667 NA intron (NM_024870, intron 26 of 39) intron (NM_024870, intron 26 of 39) 164011 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 130-81 chr4 59016672 59016962 + 0.666667 NA intron (NR_133942, intron 1 of 1) L1M1|LINE|L1 3244 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 116.333-195 chr7 24196857 24197031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87246 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 127.667-192 chr9 11624459 11624790 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL 1011418 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 148.333-173 chr18 49804309 49804606 + 0.666667 NA intron (NM_006111, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 9076 NM_006111 10449 Hs.200136 NM_006111 ENSG00000167315 ACAA2 DSAEC acetyl-CoA acyltransferase 2 protein-coding 133-51 chr2 234910488 234910745 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41401 NM_014521 23677 Hs.516777 NM_014521 ENSG00000130147 SH3BP4 BOG25|TTP SH3 domain binding protein 4 protein-coding 148-32 chr12 21440324 21440622 + 0.666667 NA intron (NM_001350913, intron 2 of 10) intron (NM_001350913, intron 2 of 10) 2558 NM_001350912 79912 Hs.709545 NM_024854 ENSG00000121350 PYROXD1 MFM8 pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 protein-coding 174.333-49 chr17 73288442 73288898 + 0.666667 NA intron (NM_012121, intron 1 of 1) intron (NM_012121, intron 1 of 1) 23331 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 112.333-115 chr2 36644705 36645037 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -46703 NM_001042548 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 129.333-202 chr9 89787238 89787507 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 147589 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 138-92 chr5 68749103 68749451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 280650 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 147-97 chr3 153503956 153504375 + 0.666667 NA intron (NR_146713, intron 5 of 6) intron (NR_146713, intron 5 of 6) 19670 NR_160966 152118 Hs.58586 NR_160966 C3orf79 - chromosome 3 open reading frame 79 ncRNA 117.667-186 chr8 23169483 23169738 + 0.666667 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -5583 NM_003840 8793 Hs.213467 NM_003840 ENSG00000173530 TNFRSF10D CD264|DCR2|TRAIL-R4|TRAILR4|TRUNDD TNF receptor superfamily member 10d protein-coding 120-69 chr2 105997026 105997336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68507 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 257.667-52 chr22 19289445 19289978 + 0.666667 NA intron (NM_007098, intron 1 of 32) intron (NM_007098, intron 1 of 32) 2008 NM_001835 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 117.667-87 chr2 101664230 101664527 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -33325 NM_145686 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 186-15 chr10 53398700 53399090 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -627195 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 121.333-118 chr3 141548681 141548913 + 0.666667 NA intron (NM_006506, intron 5 of 23) L2|LINE|L2 61770 NM_001303245 5922 Hs.98445 NM_006506 ENSG00000155903 RASA2 GAP1M RAS p21 protein activator 2 protein-coding 125-43 chr16 54525734 54525949 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -155142 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 120.667-150 chr6 67618431 67618734 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -436769 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 125.667-76 chr16 81000570 81000797 + 0.666667 NA intron (NM_001351968, intron 1 of 4) L1PA16|LINE|L1 -3007 NM_001351973 56942 Hs.55028 NM_020188 ENSG00000103121 CMC2 2310061C15Rik|C16orf61|DC13 C-X9-C motif containing 2 protein-coding 116.667-7 chr1 79381419 79381622 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -374790 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 135-94 chr6 132400806 132401160 + 0.666667 NA intron (NM_015529, intron 1 of 11) CpG 492 NM_015529 26002 Hs.6909 NM_015529 ENSG00000079931 MOXD1 MOX|PRO5780|dJ248E1.1 monooxygenase DBH like 1 protein-coding 204.667-109 chr4 87044708 87045237 + 0.666667 NA intron (NM_001313960, intron 1 of 17) intron (NM_001313960, intron 1 of 17) 37971 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 148.333-102 chr12 81219155 81219489 + 0.666667 NA intron (NM_024560, intron 10 of 15) intron (NM_024560, intron 10 of 15) -59867 NR_120491 102724663 Hs.667264 NR_120491 ENSG00000257467 PPFIA2-AS1 - PPFIA2 antisense RNA 1 ncRNA 225.667-5 chr1 208474280 208474801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -230156 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 153.333-434 chr8 136415302 136415593 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -115351 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 167-73 chr3 189691740 189692226 + 0.666667 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) intron (NM_003722, intron 1 of 13) 60594 NM_001114978 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 113.667-168 chr5 26697395 26697617 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 341080 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 181.667-80 chr20 7788600 7788995 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 151661 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 111.667-210 chr5 118808824 118809014 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -165667 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 156.667-274 chr5 103235264 103235617 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23323 NM_033211 90355 Hs.482976 NM_033211 ENSG00000181751 C5orf30 - chromosome 5 open reading frame 30 protein-coding 146.667-357 chr9 96317162 96317458 + 0.666667 NA intron (NR_104627, intron 12 of 12) intron (NR_104627, intron 12 of 12) -15134 NM_000197 3293 Hs.477 NM_000197 ENSG00000130948 HSD17B3 EDH17B3|SDR12C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 3 protein-coding 156.667-61 chr11 38495791 38496169 + 0.666667 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 150376 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 198.333-126 chr3 84172191 84172641 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 697159 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 186.333-72 chr2 50617532 50617899 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 8 of 22) intron (NM_001330093, intron 8 of 22) 78547 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 141.667-16 chr1 205991248 205991617 + 0.666667 NA intron (NM_001164522, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 3007 NM_177403 338382 Hs.534612 NM_177403 ENSG00000276600 RAB7B RAB7 RAB7B, member RAS oncogene family protein-coding 206.333-41 chr12 116518580 116519111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14577 NR_027345 100287569 Hs.441601 NM_207436 ENSG00000196668 LINC00173 NCRNA00173 long intergenic non-protein coding RNA 173 ncRNA 112.333-253 chr7 111364042 111364273 + 0.666667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 198134 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 113.667-20 chr10 31494766 31495058 + 0.666667 NA intron (NM_001323678, intron 2 of 6) intron (NM_001323678, intron 2 of 6) -95157 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 151-55 chr2 63241588 63241966 + 0.666667 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) AluJr4|SINE|Alu -122235 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 153.333-409 chr8 82813017 82813419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98886 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 117-37 chr12 58414915 58415104 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -176693 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 176.333-64 chr17 16075478 16075928 + 0.666667 NA intron (NM_001190440, intron 25 of 44) intron (NM_001190440, intron 25 of 44) 75879 NM_017775 54902 Hs.462316 NM_017775 ENSG00000011295 TTC19 2010204O13Rik|MC3DN2 tetratricopeptide repeat domain 19 protein-coding 126.667-3 chr1 55268460 55268710 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 42944 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 146-26 chr13 64453838 64454211 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -378013 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 112.667-127 chr2 79480573 79480789 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 20163 NR_110289 101927987 Hs.574704 NR_110289 ENSG00000229385 LOC101927987 - uncharacterized LOC101927987 ncRNA 114.333-243 chrX 41963350 41963646 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39944 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 194-112 chr5 126097646 126098005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -81752 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 148.333-417 chr9 132319384 132319669 + 0.666667 NA intron (NM_001351527, intron 10 of 25) L2a|LINE|L2 35330 NM_001351527 23064 Hs.460317 NM_015046 ENSG00000107290 SETX ALS4|AOA2|SCAN2|SCAR1|Sen1|bA479K20.2 senataxin protein-coding 209.333-80 chr15 93885958 93886411 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 14415 NR_138083 283682 Hs.134687 NR_138083 LINC01579 - long intergenic non-protein coding RNA 1579 ncRNA 139.667-52 chr14 43486750 43487129 + 0.666667 NA Intergenic (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1020344 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 163-47 chr2 206841139 206841477 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58000 NR_036077 100422993 NR_036077 ENSG00000283469 MIR3130-1 MIR3130-3|mir-3130-1 microRNA 3130-1 ncRNA 136.333-221 chr9 113039806 113040166 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001282515, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001282515, exon 4 of 4) 16738 NM_001282515 7539 Hs.150406 NM_003408 ENSG00000136866 ZFP37 ZNF906|zfp-37 ZFP37 zinc finger protein protein-coding 117.333-180 chr6 116719002 116719318 + 0.666667 NA intron (NM_001366310, intron 8 of 8) HAL1|LINE|L1 37949 NM_001366308 3841 Hs.182971 NM_002269 ENSG00000196911 KPNA5 IPOA6|SRP6 karyopherin subunit alpha 5 protein-coding 134.333-142 chr5 106287969 106288293 + 0.666667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL 722883 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 191.333-110 chr2 68918229 68918692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 34433 NM_182536 200504 Hs.16757 NM_182536 ENSG00000183607 GKN2 BRICD1B|GDDR|PRO813|TFIZ1|VLTI465 gastrokine 2 protein-coding 174.667-66 chr16 51400131 51400521 + 0.666667 NA intron (NR_039672, intron 6 of 6) LTR43|LTR|ERV1 -249054 NM_002968 6299 Hs.135787 NM_002968 ENSG00000103449 SALL1 HEL-S-89|HSAL1|Sal-1|TBS|ZNF794 spalt like transcription factor 1 protein-coding 131.667-36 chr11 90723368 90723686 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 145675 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 159-25 chr11 61305396 61305721 + 0.666667 NA intron (NM_001923, intron 21 of 26) intron (NM_001923, intron 21 of 26) -10242 NM_152718 220001 Hs.60640 NM_152718 ENSG00000167992 VWCE URG11|VWC1 von Willebrand factor C and EGF domains protein-coding 124-23 chr10 123682588 123682834 + 0.666667 NA intron (NM_153442, intron 2 of 2) intron (NM_153442, intron 2 of 2) 16356 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 151.333-137 chr14 99341833 99342276 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69857 NM_138576 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 118.333-156 chr4 111853630 111853940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -291669 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 118.667-73 chr15 24926298 24926579 + 0.666667 NA intron (NM_001349456, intron 4 of 12) MER94|DNA|hAT-Blackjack -28455 NM_005678 8926 Hs.564847 NM_005678 ENSG00000273173 SNURF - SNRPN upstream reading frame protein-coding 134.667-17 chr10 36773079 36773390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -352623 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 125.333-171 chr7 104018390 104018598 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28836 NM_005045 5649 Hs.655654 NM_005045 ENSG00000189056 RELN ETL7|LIS2|PRO1598|RL reelin protein-coding 141.667-59 chr12 86664657 86665027 + 0.666667 NA intron (NM_001351285, intron 2 of 8) intron (NM_001351285, intron 2 of 8) 80307 NR_162123 113839519 NR_162123 MIR3059 - microRNA 3059 ncRNA 189-30 chr14 84424922 84425335 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -846804 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 167-104 chr8 96077967 96078276 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 82685 NM_001001557 392255 Hs.492277 NM_001001557 ENSG00000156466 GDF6 BMP-13|BMP13|CDMP2|KFM|KFS|KFS1|KFSL|SGM1|SYNS4 growth differentiation factor 6 protein-coding 122.333-177 chr5 146649051 146649414 + 0.666667 NA intron (NM_181678, intron 7 of 10) L2a|LINE|L2 -133119 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 171.667-104 chr22 35189440 35189938 + 0.666667 NA intron (NR_126356, intron 2 of 5) L1PREC2|LINE|L1 41367 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 175-16 chr11 108849937 108850339 + 0.666667 NA intron (NM_004398, intron 15 of 17) intron (NM_004398, intron 15 of 17) 185069 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 126-5 chr1 235880504 235880826 + 0.666667 NA intron (NR_102436, intron 1 of 3) intron (NR_102436, intron 1 of 3) 3043 NM_001301365 1130 Hs.532411 NM_000081 ENSG00000143669 LYST CHS|CHS1 lysosomal trafficking regulator protein-coding 172.667-121 chr5 40141459 40141783 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 89330 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 172.333-27 chr10 100469853 100470219 + 0.666667 NA intron (NM_003393, intron 1 of 5) intron (NM_003393, intron 1 of 5) 7027 NM_003393 7479 Hs.421281 NM_003393 ENSG00000075290 WNT8B - Wnt family member 8B protein-coding 124.667-65 chr15 38044861 38045087 + 0.666667 NA intron (NR_120330, intron 2 of 3) intron (NR_120330, intron 2 of 3) 4581 NR_120330 101928227 Hs.602381 NR_120330 ENSG00000259225 LINC02345 - long intergenic non-protein coding RNA 2345 ncRNA 171.333-9 chr1 114009668 114010020 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 30370 NM_001286352 56944 Hs.9315 NM_020190 ENSG00000116774 OLFML3 HNOEL-iso|OLF44 olfactomedin like 3 protein-coding 219-80 chr8 40556247 40556692 + 0.666667 NA intron (NM_024645, intron 6 of 6) L2b|LINE|L2 -213106 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 149.333-209 chr2 214810174 214810599 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001282548) promoter-TSS (NM_001282548) 157 NR_110292 101928103 Hs.665619 NR_110292 ENSG00000229267 SNHG31 - small nucleolar RNA host gene 31 ncRNA 133-6 chr10 62917494 62917812 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98486 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 152.667-268 chr4 36543022 36543454 + 0.666667 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR 98662 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 185-46 chr4 40841633 40842038 + 0.666667 NA intron (NM_001166051, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 15320 NM_001166051 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 133-23 chr12 68975624 68975964 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12554 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 193-49 chr2 172636081 172636456 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 80178 NM_001278549 5163 Hs.470633 NM_002610 ENSG00000152256 PDK1 - pyruvate dehydrogenase kinase 1 protein-coding 113.667-209 chr8 86616638 86616855 + 0.666667 NA intron (NM_019098, intron 13 of 17) intron (NM_019098, intron 13 of 17) 102311 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 117.667-182 chr7 81701251 81701563 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_000601, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_000601, exon 18 of 18) -10001 NR_126025 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 143.333-106 chr15 91879714 91880092 + 0.666667 NA intron (NR_135775, intron 1 of 10) intron (NR_135775, intron 1 of 10) 25599 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 150.333-123 chr15 27589172 27589458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -427996 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 121.667-215 chr9 1271513 1271861 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 220200 NM_001370532 10655 Hs.59506 NM_006557 ENSG00000173253 DMRT2 - doublesex and mab-3 related transcription factor 2 protein-coding 150-54 chr16 66488187 66488498 + 0.666667 NA intron (NM_001197224, intron 4 of 4) intron (NM_001197224, intron 4 of 4) -11940 NR_109960 101927726 Hs.739193 NR_109960 ENSG00000261656 BEAN1-AS1 CTD-2258A20.5 BEAN1 antisense RNA 1 ncRNA 124.333 chr1 2827742 2827981 + 0.666667 NA Intergenic G-rich|Low_complexity|Low_complexity -26993 NM_001242672 100287898 Hs.632363 NM_001242672 ENSG00000215912 TTC34 - tetratricopeptide repeat domain 34 protein-coding 149-106 chr4 186446877 186447175 + 0.666667 NA intron (NR_033901, intron 1 of 6) AluSp|SINE|Alu 54032 NR_033900 285441 Hs.481369 NR_033900 ENSG00000251165 F11-AS1 - F11 antisense RNA 1 ncRNA 114-61 chr18 8373112 8373302 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 22 of 30) intron (NM_002845, intron 22 of 30) -6173 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 117.667-62 chr16 46917460 46917723 + 0.666667 NA intron (NM_001142466, intron 7 of 11) intron (NM_001142466, intron 7 of 11) -31117 NR_145840 109623466 NR_145840 SNORD148 - small nucleolar RNA, C/D box 148 snoRNA 170.333-39 chr10 116845341 116845719 + 0.666667 NA intron (NM_001330164, intron 1 of 12) intron (NM_001330164, intron 1 of 12) -3969 NM_001242699 387712 Hs.693248 NM_001242699 ENSG00000188316 ENO4 C10orf134 enolase 4 protein-coding 155.333-340 chr6 133484226 133484628 + 0.666667 NA intron (NM_172103, intron 12 of 18) intron (NM_172103, intron 12 of 18) 242928 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 154-121 chr6 44325359 44325782 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -12223 NM_020745 57505 Hs.158381 NM_020745 ENSG00000124608 AARS2 AARSL|COXPD8|LKENP|MT-ALARS|MTALARS alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 113.333-190 chr4 57033323 57033642 + 0.666667 NA intron (NM_001553, intron 2 of 4) intron (NM_001553, intron 2 of 4) 54586 NM_000938 5431 Hs.602757 NM_000938 ENSG00000047315 POLR2B POL2RB|RPB2|hRPB140 RNA polymerase II subunit B protein-coding 137.333-84 chr19 46592781 46593058 + 0.666667 NA intron (NM_001370550, intron 1 of 2) MLT2A2|LTR|ERVL 7997 NM_001370550 100506012 Hs.671661 NM_001205281 ENSG00000230510 PPP5D1 - PPP5 tetratricopeptide repeat domain containing 1 protein-coding 161.667-222 chr6 42559421 42559874 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4375 NM_015255 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 159-95 chr5 65412663 65413039 + 0.666667 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie 69069 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 178.667-165 chr8 111021087 111021548 + 0.666667 NA intron (NR_125417, intron 1 of 5) intron (NR_125417, intron 1 of 5) 6116 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 148.333-118 chr14 45717851 45718237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2442 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 144 chr1 12449499 12449755 + 0.666667 NA intron (NM_015378, intron 65 of 69) intron (NM_015378, intron 65 of 69) -57619 NR_003022 677882 Hs.658450 NR_003022 ENSG00000266079 SNORA59B ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59B snoRNA 160-109 chr7 66319346 66319671 + 0.666667 NA intron (NM_003596, intron 3 of 5) intron (NM_003596, intron 3 of 5) 80900 NR_026873 285908 Hs.50755 NM_181722 ENSG00000179406 LINC00174 NCRNA00174 long intergenic non-protein coding RNA 174 ncRNA 178.667-161 chr8 87311435 87311826 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 8 of 10) L1PA16|LINE|L1 445215 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 132.333-50 chr14 43364263 43364520 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 1142892 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 123.333-192 chr7 39578784 39579128 + 0.666667 NA intron (NM_001282446, intron 2 of 2) intron (NM_001282446, intron 2 of 2) 12552 NM_001282446 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 218.667-77 chr4 74625718 74626198 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 168565 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 141.667-113 chr2 32118788 32119148 + 0.666667 NA intron (NM_001363875, intron 6 of 15) intron (NM_001363875, intron 6 of 15) -46873 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 146.333-350 chr9 68510596 68510896 + 0.666667 NA intron (NM_021965, intron 10 of 10) MER4D0|LTR|ERV1 30121 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 145.333-207 chr4 32167165 32167572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -144946 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 134.333-93 chr2 168328982 168329276 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -81534 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 190.333-69 chr2 58044125 58044535 + 0.666667 NA intron (NM_001288838, intron 3 of 15) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -2312 NM_001130482 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 112-58 chr14 52119611 52119921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50707 NM_007361 22795 Hs.369840 NM_007361 ENSG00000087303 NID2 NID-2 nidogen 2 protein-coding 112.667-268 chr8 118382941 118383118 + 0.666667 NA intron (NM_001349811, intron 3 of 4) intron (NM_001349811, intron 3 of 4) -237972 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 136 chr1 59789468 59789811 + 0.666667 NA TTS (NR_110627) TTS (NR_110627) 16844 NR_110627 101926944 Hs.720353 NR_110627 LOC101926944 - uncharacterized LOC101926944 ncRNA 121-48 chr14 77758587 77758828 + 0.666667 NA intron (NM_001318844, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 -2061 NR_161323 283579 Hs.375834 NM_174943 ENSG00000197734 C14orf178 - chromosome 14 open reading frame 178 ncRNA 120.667-118 chr3 145654443 145654774 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 414577 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 149-133 chr7 41803121 41803517 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -100229 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 171-73 chr7 67628089 67628575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 292356 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 115.333-212 chr8 53325135 53325429 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73585 NM_001282904 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 207.667-54 chr2 60889147 60889717 + 0.666667 NA intron (NM_002908, intron 1 of 10) intron (NM_002908, intron 1 of 10) 7858 NM_001291746 5966 Hs.631886 NM_002908 ENSG00000162924 REL C-Rel REL proto-oncogene, NF-kB subunit protein-coding 164.333-157 chr3 80452583 80453064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -312074 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 169.333-111 chr2 15589523 15590001 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2106 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 128.667-116 chr3 51795080 51795336 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -15971 NM_001368369 440956 Hs.444316 NM_001143833 ENSG00000214686 IQCF6 - IQ motif containing F6 protein-coding 151.667-152 chr18 30309551 30309843 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 10787 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 204.667-36 chr13 85802038 85802494 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2847 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 113.667-125 chr21 39145157 39145411 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 38167 NM_003720 8624 Hs.473838 NM_003720 ENSG00000183527 PSMG1 C21LRP|DSCR2|LRPC21|PAC-1|PAC1 proteasome assembly chaperone 1 protein-coding 172-27 chr11 83169882 83170208 + 0.666667 NA intron (NM_001346413, intron 8 of 15) intron (NM_001346413, intron 8 of 15) 12914 NM_001346414 51585 Hs.128959 NM_015885 ENSG00000165494 PCF11 - PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit protein-coding 116.667-6 chr1 52409007 52409291 + 0.666667 NA intron (NM_032864, intron 3 of 9) intron (NM_032864, intron 3 of 9) 4547 NM_032864 84950 Hs.5301 NM_032284 ENSG00000134748 PRPF38A PRP38A|Prp38 pre-mRNA processing factor 38A protein-coding 158-107 chr5 66977611 66977963 + 0.666667 NA intron (NM_001290226, intron 1 of 26) intron (NM_001290226, intron 1 of 26) 18714 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 127-51 chr2 182683891 182684175 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -32224 NR_073365 54431 Hs.516632 NM_018981 ENSG00000077232 DNAJC10 ERdj5|JPDI|MTHr|PDIA19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 protein-coding 124.667-19 chr1 211852854 211853187 + 0.666667 NA intron (NR_135820, intron 5 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 22059 NR_135820 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 170-125 chr9 30180560 30180913 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 227718 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 201-106 chr8 22000594 22000968 + 0.666667 NA intron (NM_015024, intron 24 of 27) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger -23353 NM_001286680 10361 Hs.131055 NM_182795 ENSG00000158806 NPM2 - nucleophosmin/nucleoplasmin 2 protein-coding 121.667-185 chr6 150201966 150202204 + 0.666667 NA intron (NM_030949, intron 1 of 3) intron (NM_030949, intron 1 of 3) 59041 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 196.333-25 chr12 30360689 30361142 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 316329 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 118.667-159 chr5 59706463 59706697 + 0.666667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -2877 NR_030308 693167 NR_030308 ENSG00000202601 MIR582 MIRN582|hsa-mir-582 microRNA 582 ncRNA 150.667-253 chr4 23345524 23345823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 535619 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 167.333-90 chr15 60147299 60147740 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 143208 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 119-141 chr8 82062670 82062981 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -220539 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 131.667-51 chr13 54952818 54953119 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -221486 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 173-50 chr2 221701934 221702365 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127947 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 145.667-133 chr2 67106611 67106938 + 0.666667 NA intron (NR_110564, intron 1 of 4) intron (NR_110564, intron 1 of 4) 20328 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 226-32 chr17 53618622 53619230 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -204001 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 125.667-61 chr14 57997357 57997632 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -131402 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 127.333-40 chr12 99258918 99259207 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 12 of 25) MIRb|SINE|MIR -103972 NM_001352189 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 174-17 chr11 92213405 92213798 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11433 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 150.333-380 chr7 37984531 37984840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 63366 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 146.667-108 chr14 73303775 73304109 + 0.666667 NA intron (NM_001005745, intron 5 of 10) intron (NM_001005745, intron 5 of 10) -57941 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 165.333-22 chr10 8715746 8716117 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -121540 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 134.333-183 chr8 133697551 133697842 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13630 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 126.333-187 chr9 34014471 34014795 + 0.666667 NA intron (NM_001370064, intron 2 of 27) AluSx1|SINE|Alu 34254 NM_001370067 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 231.667-35 chr2 213261692 213262193 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 22267 NR_161186 100130451 Hs.608433 NR_144752 SPAG16-DT - SPAG16 divergent transcript ncRNA 173.667-178 chr8 86877018 86877412 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 1 of 10) intron (NM_173538, intron 1 of 10) 10800 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 138.333-215 chrX 145796537 145796812 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -21155 NM_032539 84631 Hs.106688 NM_032539 ENSG00000185985 SLITRK2 CXorf1|CXorf2|SLITL1|TMEM257 SLIT and NTRK like family member 2 protein-coding 112.333-283 chrX 93720750 93721040 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 46689 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 149.667-394 chr8 81680631 81680912 + 0.666667 NA exon (NM_001144879, exon 3 of 8) exon (NM_001144879, exon 3 of 8) 5554 NM_005536 3612 Hs.656694 NM_005536 ENSG00000133731 IMPA1 IMP|IMPA|MRT59 inositol monophosphatase 1 protein-coding 185-61 chr6 126671938 126672442 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 187559 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 189.667-61 chr17 61804303 61804718 + 0.666667 NA intron (NM_032043, intron 7 of 19) AluSz6|SINE|Alu 59049 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 178-109 chr8 47341233 47341621 + 0.666667 NA intron (NR_104581, intron 5 of 16) intron (NR_104581, intron 5 of 16) 80489 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 139.333-65 chr13 88610545 88610795 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -16183 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 174-106 chr9 17720167 17720500 + 0.666667 NA intron (NM_003026, intron 1 of 8) MER57B2|LTR|ERV1 141267 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 208-159 chr7 42541845 42542219 + 0.666667 NA Intergenic AluYk3|SINE|Alu 164415 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 115.333-187 chr6 75109811 75110060 + 0.666667 NA intron (NM_080645, intron 36 of 50) intron (NM_080645, intron 36 of 50) 18847 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 137.333-115 chr21 31516466 31516781 + 0.666667 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) intron (NM_003253, intron 1 of 28) 42464 NM_003253 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 136.667-179 chr8 113051576 113051850 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) L2c|LINE|L2 325439 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 119.333-178 chr5 86957302 86957582 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 157512 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 239.333-64 chr20 54014616 54015328 + 0.666667 NA intron (NM_001366297, intron 4 of 8) intron (NM_001366297, intron 4 of 8) 44048 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 183.667-139 chr8 98981936 98982341 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31128 NM_017890 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 139.667-217 chr9 129906486 129906877 + 0.666667 NA intron (NM_001363755, intron 12 of 15) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 37076 NR_106914 102466750 NR_106914 ENSG00000276124 MIR6855 hsa-mir-6855 microRNA 6855 ncRNA 117-147 chr8 114259811 114260108 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -823020 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 144.333-215 chr5 83031200 83031546 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32964 NR_003139 677765 Hs.693283 NR_003139 ENSG00000238835 SCARNA18 SCARNA18A|U109 small Cajal body-specific RNA 18 ncRNA 162.333-25 chr10 23759346 23759817 + 0.666667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 64854 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 150.333-134 chr15 79799692 79800018 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 97142 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 197.333-110 chr2 63247372 63247818 + 0.666667 NA intron (NR_148705, intron 13 of 16) Tigger4|DNA|TcMar-Tigger -128053 NR_036635 100169989 Hs.606147 NR_036635 ENSG00000242412 DBIL5P2 ELP1P diazepam binding inhibitor-like 5 pseudogene 2 pseudo 136.333-4 chr1 64923365 64923673 + 0.666667 NA intron (NM_001321852, intron 1 of 24) intron (NM_001321852, intron 1 of 24) 43030 NM_001321857 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 153-143 chr8 72458761 72459039 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -78325 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 112-2 chr1 52683090 52683340 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 15132 NM_023077 65260 Hs.349905 NM_023077 ENSG00000162377 COA7 C1orf163|RESA1|SCAN3|SELRC1 cytochrome c oxidase assembly factor 7 (putative) protein-coding 113-199 chr8 61880857 61881192 + 0.666667 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -8815 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 122.667-4 chr1 45836224 45836409 + 0.666667 NA intron (NM_001324320, intron 3 of 29) L1MB5|LINE|L1 -28032 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 202.667-115 chr5 40426853 40427185 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -252896 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 145.333-319 chr9 72979290 72979711 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26447 NM_000689 216 Hs.76392 NM_000689 ENSG00000165092 ALDH1A1 ALDC|ALDH-E1|ALDH1|ALDH11|HEL-9|HEL-S-53e|HEL12|PUMB1|RALDH1 aldehyde dehydrogenase 1 family member A1 protein-coding 141.667-248 chr9 87127883 87128214 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20596 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 194.667-109 chr4 70782264 70782696 + 0.666667 NA intron (NM_001130709, intron 8 of 11) AluSc5|SINE|Alu 48070 NM_001345840 22902 Hs.740904 NM_014961 ENSG00000018189 RUFY3 RIPX|SINGAR1|ZFYVE30 RUN and FYVE domain containing 3 protein-coding 157.333-220 chr21 24528167 24528486 + 0.666667 NA intron (NR_135519, intron 1 of 2) intron (NR_135519, intron 1 of 2) 99586 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 159.667-294 chr7 23375155 23375526 + 0.666667 NA intron (NM_006547, intron 3 of 14) intron (NM_006547, intron 3 of 14) -21106 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 133.333-168 chr7 11104653 11105051 + 0.666667 NA non-coding (NR_033435, exon 16 of 16) non-coding (NR_033435, exon 16 of 16) 130980 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 148-28 chr11 103951475 103951866 + 0.666667 NA intron (NM_025208, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 -84970 NM_001001711 414301 Hs.591941 NM_001001711 ENSG00000170967 DDI1 - DNA damage inducible 1 homolog 1 protein-coding 224.333-82 chr3 108128909 108129384 + 0.666667 NA intron (NR_110028, intron 1 of 2) ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 3325 NR_110028 101929623 Hs.570653 NR_110028 ENSG00000271856 LINC01215 - long intergenic non-protein coding RNA 1215 ncRNA 121-71 chr2 113992586 113992855 + 0.666667 NA intron (NR_148508, intron 1 of 1) intron (NR_148508, intron 1 of 1) -12736 NR_034130 100499194 Hs.662336 NR_034130 LOC100499194 - uncharacterized LOC100499194 ncRNA 205.667-16 chr1 236485531 236485915 + 0.666667 NA TTS (NM_145861) TTS (NM_145861) -32491 NM_201545 3964 Hs.4082 NM_006499 ENSG00000116977 LGALS8 Gal-8|PCTA-1|PCTA1|Po66-CBP galectin 8 protein-coding 112-154 chr4 70968625 70968862 + 0.666667 NA intron (NM_173468, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu -24906 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 138.333-201 chr8 137109558 137109903 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 303858 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 151.667-312 chr6 66139086 66139421 + 0.666667 NA Intergenic LTR1D|LTR|ERV1 351374 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 176.667-160 chr9 136787595 136787946 + 0.666667 NA Intergenic HERVK-int|LTR|ERVK -3574 NM_032928 85014 Hs.356744 NM_032928 ENSG00000244187 TMEM141 - transmembrane protein 141 protein-coding 167.333-20 chr1 159032779 159033131 + 0.666667 NA intron (NM_005531, intron 7 of 10) intron (NM_005531, intron 7 of 10) 23048 NM_005531 3428 Hs.380250 NM_005531 ENSG00000163565 IFI16 IFNGIP1|PYHIN2 interferon gamma inducible protein 16 protein-coding 139.667-23 chr10 110914546 110914901 + 0.666667 NA intron (NM_001195304, intron 2 of 4) intron (NM_001195304, intron 2 of 4) 4213 NM_001195306 92482 Hs.232543 NM_001195304 ENSG00000214413 BBIP1 BBIP10|BBS18|NCRNA00081|bA348N5.3 BBSome interacting protein 1 protein-coding 172.333 chr1 15380158 15380629 + 0.666667 NA intron (NM_052929, intron 27 of 30) MER20|DNA|hAT-Charlie -29495 NM_024329 79180 Hs.465374 NM_024329 ENSG00000142634 EFHD2 SWS1 EF-hand domain family member D2 protein-coding 142.333-79 chr14 44763381 44763671 + 0.666667 NA non-coding (NR_146457, exon 5 of 5) non-coding (NR_146457, exon 5 of 5) 35600 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 122-19 chr10 131458565 131458767 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -146945 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 124.667-90 chr18 11430020 11430222 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -24357 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 166.667-176 chr5 23208691 23209054 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -298737 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 129-121 chr7 25627093 25627383 + 0.666667 NA intron (NR_157815, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR 35902 NR_157826 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 280-31 chr22 27097891 27098368 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37611 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 160.667-329 chr9 133017305 133017641 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -2957 NR_132980 106635683 NR_132980 SNORD141A - small nucleolar RNA, C/D box 141A snoRNA 125.667-140 chr4 134594237 134594600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 170550 NR_147155 105377434 Hs.738318 NR_147155 LINC02462 - long intergenic non-protein coding RNA 2462 ncRNA 211.667-101 chr6 106904983 106905410 + 0.666667 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 68843 NM_001291739 100133941 Hs.644105 NM_013230 ENSG00000272398 CD24 CD24A CD24 molecule protein-coding 255-52 chr3 2884946 2885511 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 9 of 24) intron (NM_175607, intron 9 of 24) -6987 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 157.667-286 chr6 123345147 123345520 + 0.666667 NA intron (NM_006073, intron 21 of 40) L1MC1|LINE|L1 -94271 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 136.333-32 chr11 57503366 57503675 + 0.666667 NA intron (NM_001198810, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu 11389 NM_001198810 8501 Hs.591952 NM_003627 ENSG00000149150 SLC43A1 LAT3|PB39|POV1|R00504 solute carrier family 43 member 1 protein-coding 123.667-111 chr22 26439580 26439872 + 0.666667 NA intron (NM_020437, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 10466 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 135.667-200 chr9 75533830 75534072 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -356693 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 115.333-117 chr2 171299182 171299516 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68056 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 142.333-57 chr12 29955824 29956178 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -171242 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 214.333-163 chr9 70482971 70483438 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68547 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 151.333-218 chr2 123663635 123664001 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 361356 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 205.667-13 chr1 202909607 202910076 + 0.666667 NA intron (NM_001303109, intron 5 of 9) LTR33|LTR|ERVL 17393 NM_021633 59349 Hs.706793 NM_021633 ENSG00000117153 KLHL12 C3IP1|DKIR kelch like family member 12 protein-coding 160-101 chr5 117336192 117336575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79129 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 170-54 chr18 67294068 67294412 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 212656 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 156.667-54 chr10 120289888 120290287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65136 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 139.667-193 chr8 106545385 106545781 + 0.666667 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) 97659 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 120.333-204 chr9 117936301 117936516 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 232005 NM_003266 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 158-89 chr3 100622716 100623111 + 0.666667 NA intron (NM_032787, intron 1 of 15) AluSx|SINE|Alu -12625 NM_001308362 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 179.333-181 chr8 9611071 9611379 + 0.666667 NA intron (NM_003747, intron 2 of 26) intron (NM_003747, intron 2 of 26) 55313 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 239.333-91 chr6 54164487 54164959 + 0.666667 NA intron (NM_001281746, intron 8 of 11) L1ME1|LINE|L1 53280 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 246.333-20 chr11 10716203 10716811 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22519 NM_130385 10335 Hs.501898 NM_130385 ENSG00000072952 MRVI1 IRAG|JAW1L murine retrovirus integration site 1 homolog protein-coding 130-134 chr9 79327278 79327492 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -181719 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 196.333-80 chr2 32905220 32905620 + 0.666667 NA intron (NR_027099, intron 10 of 10) intron (NR_027099, intron 10 of 10) -21707 NR_027097 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 147-106 chr5 21208262 21208594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -251052 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 159.333-289 chr6 89373289 89373582 + 0.666667 NA intron (NM_021244, intron 5 of 6) AluSx4|SINE|Alu -20713 NM_016021 51465 Hs.163776 NM_016021 ENSG00000198833 UBE2J1 CGI-76|HSPC153|HSPC205|HSU93243|NCUBE-1|NCUBE1|UBC6|UBC6E|Ubc6p ubiquitin conjugating enzyme E2 J1 protein-coding 147-6 chr1 106708429 106708723 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -109663 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 128.667-142 chr5 40718299 40718499 + 0.666667 NA intron (NM_012382, intron 4 of 4) AluSz6|SINE|Alu 37562 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 171.333-169 chr6 74812441 74812754 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 316185 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 224.333-83 chr3 136361587 136361956 + 0.666667 NA intron (NM_005862, intron 26 of 33) AluJo|SINE|Alu 111431 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 195.333-16 chr1 198186378 198186677 + 0.666667 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) intron (NM_133494, intron 1 of 9) 29529 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 140.333-32 chr10 78146559 78146827 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101932 NR_038985 100132987 Hs.55047 NR_038985 ENSG00000230417 LINC00856 - long intergenic non-protein coding RNA 856 ncRNA 123-40 chr14 72695896 72696172 + 0.666667 NA intron (NM_001280544, intron 6 of 9) intron (NM_001280544, intron 6 of 9) 179214 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 152.333-55 chr10 114209813 114210219 + 0.666667 NA intron (NM_198795, intron 11 of 25) intron (NM_198795, intron 11 of 25) -29238 NM_001272046 340706 Hs.197741 NM_198496 ENSG00000165816 VWA2 AMACO|CCSP-2|CCSP2|NET42 von Willebrand factor A domain containing 2 protein-coding 143.667-212 chr6 49176501 49176759 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 286623 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 210-138 chr7 40521153 40521628 + 0.666667 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 386414 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 116.333-60 chr13 107209581 107209923 + 0.666667 NA intron (NM_001080396, intron 2 of 2) intron (NM_001080396, intron 2 of 2) 111211 NR_145739 109616978 NR_145739 ENSG00000201847 SNORD31B - small nucleolar RNA, C/D box 31B snoRNA 128-27 chr16 23486815 23487146 + 0.666667 NA intron (NM_015044, intron 6 of 16) AluSc|SINE|Alu 23514 NM_015044 23062 Hs.460336 NM_015044 ENSG00000103365 GGA2 VEAR golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2 protein-coding 118-100 chr4 105999429 105999640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22944 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 122.667-211 chr9 87156270 87156533 + 0.666667 NA intron (NR_161226, intron 1 of 1) MLT2B2|LTR|ERVL 7757 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 112.667-169 chr3 70649723 70649996 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -337221 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 156-58 chr17 48164281 48164686 + 0.666667 NA intron (NM_003726, intron 10 of 12) intron (NM_003726, intron 10 of 12) -7972 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 137-102 chr8 83362686 83363076 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -40877 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 155.333-129 chr16 78001478 78001845 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -20887 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 133.667-7 chr1 114797916 114798202 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17374 NR_049742 80143 Hs.709277 NM_025073 ENSG00000052723 SIKE1 SIKE suppressor of IKBKE 1 protein-coding 158-45 chr14 69240453 69240852 + 0.666667 NA intron (NM_001193360, intron 9 of 9) intron (NM_001193360, intron 9 of 9) -19506 NM_020692 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 129.333-10 chr1 224375995 224376267 + 0.666667 NA non-coding (NR_102347, exon 4 of 4) non-coding (NR_102347, exon 4 of 4) 19252 NM_001277197 29097 Hs.445890 NM_014184 ENSG00000143771 CNIH4 CNIH-4|CNIH2|HSPC163 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4 protein-coding 164-111 chr7 85389200 85389543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31751 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 113.333-238 chr7 42254279 42254592 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17226 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 169-89 chr6 50913012 50913504 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 94387 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 182.333-91 chr2 189668904 189669311 + 0.666667 NA intron (NM_019048, intron 5 of 5) intron (NM_019048, intron 5 of 5) -6878 NM_144708 150709 Hs.60772 NM_144708 ENSG00000151687 ANKAR - ankyrin and armadillo repeat containing protein-coding 130.333-27 chr10 23480106 23480332 + 0.666667 NA Intergenic LTR84b|LTR|ERVL 40950 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 155.333-256 chr4 31667881 31668201 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 161497 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 121.667-196 chr8 8558637 8558928 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -143155 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 176.667-118 chr5 28918521 28918985 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8117 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 225.667-58 chr4 140937523 140938057 + 0.666667 NA intron (NM_020724, intron 4 of 6) L1ME4a|LINE|L1 -181405 NM_015130 23158 Hs.480819 NM_015130 ENSG00000109436 TBC1D9 GRAMD9|MDR1 TBC1 domain family member 9 protein-coding 203.667-63 chr2 241554608 241554988 + 0.666667 NA intron (NR_033346, intron 1 of 1) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -3947 NM_032515 666 Hs.293753 NM_032515 ENSG00000176720 BOK BCL2L9|BOKL BCL2 family apoptosis regulator BOK protein-coding 132.333-184 chr8 126288118 126288366 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37253 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 148.333-403 chr8 140412416 140412713 + 0.666667 NA intron (NM_001321646, intron 4 of 21) L1MC4|LINE|L1 45180 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 114.667-259 chr9 34807501 34807696 + 0.666667 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 30988 NR_024481 389715 Hs.713965 NM_001126494 FAM205BP C9orf144|C9orf144A|FAM205B transmembrane protein C9orf144B pseudogene pseudo 157-66 chr2 127670663 127670969 + 0.666667 NA intron (NM_001161404, intron 1 of 9) intron (NM_001161404, intron 1 of 9) 4714 NM_001161403 55679 Hs.469881 NM_017980 ENSG00000072163 LIMS2 LGMD2W|MDRCMTT|PINCH-2|PINCH2 LIM zinc finger domain containing 2 protein-coding 135.333-30 chr10 111842875 111843273 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 340691 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 157.333-103 chr14 33918883 33919201 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 32032 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 129-12 chr1 224893202 224893582 + 0.666667 NA Intergenic LTR7B|LTR|ERV1 -36262 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 120.667-137 chr5 30771261 30771515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -422298 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 150-131 chr7 37324730 37325167 + 0.666667 NA intron (NM_001206480, intron 2 of 21) intron (NM_001206480, intron 2 of 21) 28720 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 199-120 chr8 100149581 100150082 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_005034) promoter-TSS (NM_005034) -805 NM_005034 5440 Hs.351475 NM_005034 ENSG00000147669 POLR2K ABC10-alpha|RPABC4|RPB10alpha|RPB12|RPB7.0|hRPB7.0|hsRPB10a RNA polymerase II subunit K protein-coding 112.667-255 chr7 120372980 120373154 + 0.666667 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 99892 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 139.333-93 chr17 61700081 61700408 + 0.666667 NA intron (NM_032043, intron 17 of 19) L1MB7|LINE|L1 -109025 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 152.667-256 chr3 147559872 147560226 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 138722 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 154.333-197 chr22 25859412 25859801 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 21 of 43) L1M4a2|LINE|L1 117418 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 157.333-300 chr6 34416695 34417090 + 0.666667 NA TTS (NM_001014) TTS (NM_001014) 9177 NM_001203245 6204 Hs.406620 NM_001014 ENSG00000124614 RPS10 DBA9|S10 ribosomal protein S10 protein-coding 139.333-230 chr9 92358427 92358768 + 0.666667 NA intron (NM_001286969, intron 3 of 6) L1M4c|LINE|L1 32644 NM_001012267 401541 Hs.713775 NM_001012267 ENSG00000188312 CENPP CENP-P centromere protein P protein-coding 166.333-174 chr5 14062306 14062720 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -80829 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 149-71 chr2 159078510 159078890 + 0.666667 NA intron (NM_001350065, intron 4 of 27) intron (NM_001350065, intron 4 of 27) -108135 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 229.333-21 chr12 21665977 21666455 + 0.666667 NA Intergenic MER57A1|LTR|ERV1 -8361 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 146.667-111 chr15 34263798 34264117 + 0.666667 NA intron (NM_001042497, intron 1 of 23) L1MC5a|LINE|L1 38941 NM_001286420 51234 Hs.250905 NM_016454 ENSG00000128463 EMC4 PIG17|TMEM85 ER membrane protein complex subunit 4 protein-coding 143-40 chr14 51056370 51056671 + 0.666667 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 39184 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 113-179 chr6 66138178 66138374 + 0.666667 NA Intergenic HUERS-P1-int|LTR|ERV1 350397 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 155.667-200 chr21 25594211 25594521 + 0.666667 NA intron (NM_080794, intron 6 of 10) AluJo|SINE|Alu -11142 NR_024092 282566 Hs.384586 NR_024092 ENSG00000260583 LINC00515 C21orf71|PRED21 long intergenic non-protein coding RNA 515 ncRNA 125-21 chr10 122284031 122284283 + 0.666667 NA intron (NM_001318189, intron 4 of 15) intron (NM_001318189, intron 4 of 15) 12861 NM_001318189 118663 Hs.422466 NM_144587 ENSG00000138152 BTBD16 C10orf87 BTB domain containing 16 protein-coding 196.667-11 chr10 25451106 25451542 + 0.666667 NA intron (NM_020752, intron 4 of 10) L1ME3G|LINE|L1 -200388 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 160-62 chr2 121656143 121656586 + 0.666667 NA intron (NR_037857, intron 2 of 3) L1M4|LINE|L1 6375 NR_037856 254128 Hs.712685 NR_037856 ENSG00000236859 NIFK-AS1 - NIFK antisense RNA 1 ncRNA 120.667-179 chrX 54421033 54421319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19199 NM_001346789 90121 Hs.522662 NM_058163 ENSG00000158526 TSR2 DBA14|DT1P1A10|WGG1 TSR2 ribosome maturation factor protein-coding 136.667-141 chr5 33014030 33014340 + 0.666667 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 66742 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 159.333-306 chr7 34282680 34283015 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -375371 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 140.667-191 chr5 136662555 136662877 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -297240 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 121.667-86 chr19 58161516 58161784 + 0.666667 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie -10861 NM_024620 79673 Hs.458377 NM_024620 ENSG00000181894 ZNF329 - zinc finger protein 329 protein-coding 238-29 chr15 99477575 99478196 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87532 NM_001352617 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 142.667-219 chr8 76659937 76660354 + 0.666667 NA intron (NR_024360, intron 2 of 3) intron (NR_024360, intron 2 of 3) -21102 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 130.333-31 chr10 64974760 64975035 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50379 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 145.667-213 chr5 66542135 66542484 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -30705 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 131.667-96 chr2 97851045 97851324 + 0.666667 NA intron (NM_015348, intron 5 of 40) L2a|LINE|L2 116778 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 136-83 chr5 61552777 61553134 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84805 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 118.333-3 chr1 42208097 42208297 + 0.666667 NA intron (NM_001198850, intron 5 of 12) MIRb|SINE|MIR -43452 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 165.333-243 chr7 111170464 111170956 + 0.666667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 79583 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 137.667-19 chr1 234315145 234315513 + 0.666667 NA intron (NM_173508, intron 4 of 7) intron (NM_173508, intron 4 of 7) 8862 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 236-58 chr3 106761319 106761836 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 479061 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 126-20 chr12 23929848 23930119 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) 19687 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 152-82 chr2 36169383 36169781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 185988 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 157.667-140 chr2 36949186 36949523 + 0.666667 NA intron (NM_003162, intron 1 of 17) intron (NM_003162, intron 1 of 17) 17182 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 138-70 chr20 49251083 49251477 + 0.666667 NA intron (NM_021035, intron 13 of 13) AluSz|SINE|Alu 26777 NM_021035 57169 Hs.371794 NM_021035 ENSG00000124201 ZNFX1 - zinc finger NFX1-type containing 1 protein-coding 179.667-65 chr17 74396236 74396760 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 28992 NM_181790 350383 Hs.574368 NM_181790 ENSG00000257008 GPR142 GPRg1b|PGR2 G protein-coupled receptor 142 protein-coding 176.333-82 chr2 55568065 55568444 + 0.666667 NA exon (NM_001282850, exon 12 of 16) exon (NM_001282850, exon 12 of 16) 48659 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 207-118 chr8 81984537 81984859 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142412 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 157-131 chr8 71159213 71159562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 197319 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 188.333-42 chr12 122820251 122820664 + 0.666667 NA intron (NR_027918, intron 11 of 12) intron (NR_027918, intron 11 of 12) -14291 NM_001303099 9026 Hs.524815 NM_003959 ENSG00000130787 HIP1R HIP12|HIP3|ILWEQ huntingtin interacting protein 1 related protein-coding 130.333-111 chr2 204204450 204204698 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 267826 NM_012092 29851 Hs.56247 NM_012092 ENSG00000163600 ICOS AILIM|CD278|CVID1 inducible T cell costimulator protein-coding 189.333-183 chr7 18728891 18729280 + 0.666667 NA intron (NM_058176, intron 12 of 22) intron (NM_058176, intron 12 of 22) 219815 NM_001204147 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 114-40 chr14 73996743 73996953 + 0.666667 NA intron (NM_001330189, intron 3 of 16) AluJb|SINE|Alu 22440 NM_001321988 957 Hs.655070 NM_001249 ENSG00000187097 ENTPD5 CD39L4|NTPDase-5|PCPH ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (inactive) protein-coding 145-2 chr1 64327221 64327490 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 123732 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 119.667-168 chr6 62582371 62582574 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -296245 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 121.333-83 chr2 49049526 49049736 + 0.666667 NA intron (NM_000145, intron 2 of 9) intron (NM_000145, intron 2 of 9) -9972 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 163.667-7 chr1 163069764 163070080 + 0.666667 NA intron (NM_001102445, intron 2 of 5) intron (NM_001102445, intron 2 of 5) 668 NM_001113381 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 114.667-54 chr11 96278550 96278771 + 0.666667 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) L2c|LINE|L2 -62778 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 137.667-4 chr1 69745638 69745880 + 0.666667 NA intron (NM_001366839, intron 3 of 25) L1ME4a|LINE|L1 -173563 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 119-104 chr3 100139676 100139874 + 0.666667 NA intron (NM_001167924, intron 1 of 9) AluSq2|SINE|Alu 24845 NM_001167924 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 186.333-125 chr5 74503837 74504198 + 0.666667 NA intron (NR_126354, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 32959 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 246.667-107 chr9 87445595 87446104 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -51379 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 215.333-90 chr2 85624732 85625222 + 0.666667 NA intron (NR_046347, intron 4 of 12) AluSq2|SINE|Alu 8791 NM_001256725 10713 Hs.654745 NM_006590 ENSG00000168883 USP39 65K|CGI-21|HSPC332|SAD1|SNRNP65 ubiquitin specific peptidase 39 protein-coding 123-17 chr10 64586502 64586723 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -238916 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 130-74 chr3 7878682 7878982 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 137475 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 226.333-7 chr10 51503883 51504469 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 195419 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 157.667-305 chr7 49644646 49644934 + 0.666667 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -128848 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 116.667-87 chr18 63263292 63263573 + 0.666667 NA intron (NM_000633, intron 2 of 2) intron (NM_000633, intron 2 of 2) 55948 NM_000657 596 Hs.150749 NM_000633 ENSG00000171791 BCL2 Bcl-2|PPP1R50 BCL2 apoptosis regulator protein-coding 162.667-103 chr17 62705690 62706158 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_147886) promoter-TSS (NR_147886) -282 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 142.333-19 chr10 41914031 41914293 + 0.666667 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 453883 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 174-44 chr17 67623734 67624103 + 0.666667 NA intron (NM_181671, intron 5 of 9) intron (NM_181671, intron 5 of 9) -93915 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 262-8 chr10 63297093 63297619 + 0.666667 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) LTR2752|LTR|ERV1 -28113 NM_001318153 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 184.667-119 chr6 143119396 143119740 + 0.666667 NA intron (NM_001366344, intron 2 of 6) intron (NM_001366344, intron 2 of 6) -6571 NM_001366358 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 155.667-298 chr6 28226639 28226932 + 0.666667 NA intron (NM_006299, intron 1 of 3) FRAM|SINE|Alu 1510 NM_001199480 7746 Hs.100921 NM_006299 ENSG00000137185 ZSCAN9 PRD51|ZNF193 zinc finger and SCAN domain containing 9 protein-coding 216.333-105 chr4 28467199 28467746 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -352110 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 147-79 chr2 228878126 228878506 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -266921 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 253-28 chr17 28828639 28829119 + 0.666667 NA intron (NM_001288635, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 13911 NM_001288640 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 170-64 chr2 126499179 126499533 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -156579 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 169.667-56 chr14 38289990 38290331 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -34067 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 190-98 chr5 32264743 32265233 + 0.666667 NA intron (NM_001294344, intron 6 of 13) intron (NM_001294344, intron 6 of 13) 47951 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 153.333-443 chr9 80936188 80936552 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 753165 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 188-101 chr7 55423082 55423496 + 0.666667 NA intron (NM_018697, intron 6 of 8) intron (NM_018697, intron 6 of 8) 57841 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 132.333-69 chr17 9643528 9643780 + 0.666667 NA TTS (NM_145054) TTS (NM_145054) -1863 NM_153210 124739 Hs.709621 NM_153210 ENSG00000154914 USP43 - ubiquitin specific peptidase 43 protein-coding 120-64 chr2 53116318 53116544 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -413816 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 135-70 chr3 165178894 165179267 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 17304 NM_001318810 22865 Hs.101745 NM_014926 ENSG00000121871 SLITRK3 - SLIT and NTRK like family member 3 protein-coding 147.667-144 chr17 64168773 64169102 + 0.666667 NA intron (NM_018469, intron 7 of 11) AluY|SINE|Alu 22598 NR_002995 677842 Hs.405444 NR_002995 ENSG00000277887 SNORA50C ACA62|SNORA76|SNORA76C small nucleolar RNA, H/ACA box 50C snoRNA 150-95 chr3 49076808 49077107 + 0.666667 NA exon (NM_001320585, exon 2 of 10) exon (NM_001320585, exon 2 of 10) 16675 NM_001320581 54870 Hs.297389 NM_017730 ENSG00000198218 QRICH1 AB-DIP|VERBRAS glutamine rich 1 protein-coding 191-55 chr5 124374573 124375089 + 0.666667 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 63689 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 161.667-157 chr21 33959534 33959893 + 0.666667 NA intron (NR_134558, intron 2 of 2) L1MEf|LINE|L1 -16669 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 175-8 chr1 215678079 215678520 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 62 of 71) L2b|LINE|L2 110995 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 112-33 chr11 84775633 84775937 + 0.666667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) L1PA16|LINE|L1 -54843 NM_001351276 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 158.667-113 chr16 9833626 9834076 + 0.666667 NA intron (NM_001134408, intron 8 of 13) AluSx|SINE|Alu 348216 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 135-18 chr12 33423817 33424099 + 0.666667 NA intron (NM_198992, intron 2 of 6) intron (NM_198992, intron 2 of 6) 15861 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 164-38 chr15 57832721 57833048 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 126170 NM_015532 81488 Hs.437256 NM_015532 ENSG00000255529 POLR2M GCOM1|GRINL1A|Gdown|Gdown1 RNA polymerase II subunit M protein-coding 147.667-22 chr1 187621523 187621817 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 178042 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 154.667-271 chr4 47899713 47900018 + 0.666667 NA intron (NR_103795, intron 5 of 23) MER3|DNA|hAT-Charlie -14362 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 117-138 chr8 31315900 31316075 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -282631 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 125.333-78 chr18 48463524 48463770 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -51062 NM_001371287 216.333-25 chr10 126602789 126603234 + 0.666667 NA intron (NM_001350922, intron 2 of 8) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 67499 NR_146939 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 202-45 chr14 51089127 51089581 + 0.666667 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 6350 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 132.333-92 chr2 172307019 172307286 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -120184 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 149.667-31 chr1 157158992 157159294 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20552 NM_005240 2117 Hs.105636 NM_005240 ENSG00000117036 ETV3 METS|PE-1|PE1 ETS variant 3 protein-coding 164.667-238 chr8 110575423 110575700 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 451872 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 126.667-103 chr3 18450275 18450513 + 0.666667 NA intron (NR_125803, intron 1 of 6) MER11A|LTR|ERVK -4802 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 120-138 chr8 118567542 118567792 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) intron (NM_001101676, intron 2 of 4) -53334 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 152-51 chr13 83935222 83935542 + 0.666667 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -52908 NM_001281503 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 178-101 chr6 53239249 53239708 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37515 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 215.667-15 chr10 62899179 62899745 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80295 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 178.667-78 chr2 86360630 86361045 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22754 NM_001164730 65055 Hs.368884 NM_022912 ENSG00000068615 REEP1 C2orf23|HMN5B|SPG31|Yip2a receptor accessory protein 1 protein-coding 143.667-107 chr18 603668 604019 + 0.666667 NA intron (NM_014410, intron 1 of 8) L1MD2|LINE|L1 6845 NM_001289036 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 114-88 chr3 64619286 64619555 + 0.666667 NA intron (NM_001318781, intron 18 of 38) intron (NM_001318781, intron 18 of 38) 58074 NR_110151 101929335 Hs.476604 NR_110150 ENSG00000241158 ADAMTS9-AS1 - ADAMTS9 antisense RNA 1 ncRNA 128-115 chr8 39905180 39905465 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -8569 NM_002164 3620 Hs.840 NM_002164 ENSG00000131203 IDO1 IDO|IDO-1|INDO indoleamine 2,3-dioxygenase 1 protein-coding 136.667-36 chr11 113272450 113272782 + 0.666667 NA intron (NM_181351, intron 18 of 18) intron (NM_181351, intron 18 of 18) 1285 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 111.667-76 chr13 48454692 48454872 + 0.666667 NA intron (NM_000321, intron 18 of 26) L2a|LINE|L2 -10113 NM_005767 10161 Hs.123464 NM_005767 ENSG00000139679 LPAR6 ARWH1|HYPT8|LAH3|P2RY5|P2Y5 lysophosphatidic acid receptor 6 protein-coding 202.333-45 chr12 39693452 39693975 + 0.666667 NA intron (NM_001031748, intron 11 of 12) L1MC5a|LINE|L1 67530 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 122.667-162 chr6 44951899 44952141 + 0.666667 NA intron (NR_146635, intron 9 of 12) intron (NR_146635, intron 9 of 12) 245750 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 221-43 chr22 25933910 25934344 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 34 of 43) L1M5|LINE|L1 191939 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 152.333-338 chr6 135503287 135503617 + 0.666667 NA intron (NR_152842, intron 2 of 5) intron (NR_152842, intron 2 of 5) 5651 NR_026805 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 130-68 chr20 543976 544290 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001895) promoter-TSS (NM_001895) -343 NM_177560 1457 Hs.644056 NM_001895 ENSG00000101266 CSNK2A1 CK2A1|CKII|Cka1|Cka2|OCNDS casein kinase 2 alpha 1 protein-coding 208.667-104 chr4 167687557 167688012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -404753 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 119.667-4 chr1 41304279 41304503 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -57043 NM_001291281 100132074 Hs.559677 NM_001291281 FOXO6 - forkhead box O6 protein-coding 156.667-279 chr5 115547101 115547539 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -2545 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 149.667-380 chr7 110172144 110172443 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -212080 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 162-96 chr4 136826451 136826816 + 0.666667 NA intron (NR_149105, intron 3 of 3) intron (NR_149105, intron 3 of 3) -367123 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 157-3 chr1 30069579 30069944 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -32149 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 170-58 chr2 45548306 45548595 + 0.666667 NA intron (NM_018079, intron 12 of 20) L1M5|LINE|L1 62817 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 148-41 chr14 63180491 63180790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23803 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 133-17 chr11 114731864 114732117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53463 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 153.333-155 chr16 65171197 65171546 + 0.666667 NA intron (NR_110918, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 5202 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 133.333-78 chr2 63358064 63358297 + 0.666667 NA intron (NR_148704, intron 13 of 18) L1PA14|LINE|L1 79827 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 276-28 chr15 83167040 83167762 + 0.666667 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 40422 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 126.333-112 chr22 31965043 31965258 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5673 NR_149128 105372999 Hs.512525 NR_149128 LINC02558 - long intergenic non-protein coding RNA 2558 ncRNA 211.333-33 chr11 24575205 24575564 + 0.666667 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 78331 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 144.333-276 chr8 123790129 123790401 + 0.666667 NA intron (NM_144963, intron 15 of 23) intron (NM_144963, intron 15 of 23) 21826 NM_001317917 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 145-108 chr6 152065913 152066195 + 0.666667 NA intron (NM_001328100, intron 6 of 6) intron (NM_001328100, intron 6 of 6) 102233 NM_001347702 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 126-84 chr4 74990187 74990437 + 0.666667 NA intron (NM_015393, intron 1 of 3) intron (NM_015393, intron 1 of 3) -19950 NR_121617 100507388 Hs.570765 NR_121617 ENSG00000249717 LOC100507388 - uncharacterized LOC100507388 ncRNA 112.667-259 chr8 16212432 16212607 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19728 NM_138716 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 139.333-200 chr7 37438849 37439230 + 0.666667 NA intron (NM_001206480, intron 1 of 21) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 9913 NM_014800 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 131.667-178 chr7 1925883 1926154 + 0.666667 NA intron (NM_001013837, intron 17 of 18) L1MDa|LINE|L1 14553 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 127.333-68 chr17 81233819 81234109 + 0.666667 NA intron (NM_144679, intron 5 of 11) intron (NM_144679, intron 5 of 11) 5091 NM_001363764 146705 Hs.631761 NM_144679 ENSG00000167302 TEPSIN C17orf56|ENTHD2 TEPSIN adaptor related protein complex 4 accessory protein protein-coding 230.667-66 chr5 108764328 108764719 + 0.666667 NA intron (NR_146155, intron 1 of 19) AluSp|SINE|Alu 15575 NM_001308038 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 186 chr1 44558957 44559457 + 0.666667 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) 13714 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 251-51 chr4 48723078 48723490 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 1 of 63) AluJr|SINE|Alu 57015 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 194.667-33 chr12 44287637 44287974 + 0.666667 NA intron (NM_001286213, intron 4 of 6) intron (NM_001286213, intron 4 of 6) 451724 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 112.667-157 chr21 27613159 27613398 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -109101 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 154.667-117 chr14 84395743 84396056 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -876033 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 137-85 chr5 95008921 95009230 + 0.666667 NA intron (NM_001297777, intron 2 of 19) (GAGAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 72791 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 143.333-7 chr1 62925943 62926283 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 84812 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 210.333-42 chr14 26090380 26090827 + 0.666667 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 462827 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 158.667-196 chr22 34876484 34876899 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) LTR32|LTR|ERVL 121225 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 154.333-284 chr5 180783950 180784238 + 0.666667 NA TTS (NM_001364381) TTS (NM_001364381) 18712 NM_001364393 4245 Hs.519818 NM_002406 ENSG00000131446 MGAT1 GLCNAC-TI|GLCT1|GLYT1|GNT-1|GNT-I|GnTI|MGAT mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 144.667-6 chr1 76595847 76596120 + 0.666667 NA intron (NR_146056, intron 4 of 5) MER5B|DNA|hAT-Charlie 183284 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 151-31 chr13 47963943 47964263 + 0.666667 NA intron (NM_003850, intron 6 of 10) L1MD2|LINE|L1 -31481 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 113.667-187 chr6 77162141 77162455 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 301724 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 119.333-7 chr1 43521862 43522082 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -4065 NM_001329138 5792 Hs.272062 NM_002840 ENSG00000142949 PTPRF BNAH2|LAR protein tyrosine phosphatase receptor type F protein-coding 142.333-238 chr8 86470698 86470995 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 37840 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 150.333-424 chr8 135943848 135944158 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 486547 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 135-12 chr11 12225105 12225418 + 0.666667 NA intron (NR_144420, intron 13 of 27) MIRb|SINE|MIR 61578 NR_106739 102466906 NR_106739 ENSG00000275373 MIR6124 hsa-mir-6124 microRNA 6124 ncRNA 139-109 chr8 129093100 129093384 + 0.666667 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -127241 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 171.667-134 chr5 98944219 98944659 + 0.666667 NA intron (NR_151718, intron 1 of 3) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -14725 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 135.667-134 chr4 102986374 102986703 + 0.666667 NA intron (NR_047513, intron 3 of 10) L1MC1|LINE|L1 33167 NR_047513 150159 Hs.666728 NM_139173 ENSG00000164037 SLC9B1 NHA1|NHEDC1 solute carrier family 9 member B1 protein-coding 167.333-18 chr1 158595967 158596299 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10306 NM_001004478 128368 Hs.553590 NM_001004478 ENSG00000198967 OR10Z1 OR1-15 olfactory receptor family 10 subfamily Z member 1 protein-coding 139.333-153 chr3 111248442 111248779 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 176794 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 178.667-7 chr1 93042193 93042492 + 0.666667 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 -36893 NM_001164391 22823 Hs.31016 NM_007358 ENSG00000143033 MTF2 M96|PCL2|TDRD19A|dJ976O13.2 metal response element binding transcription factor 2 protein-coding 235.333-25 chr11 103297264 103297814 + 0.666667 NA intron (NM_001377, intron 75 of 88) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 188113 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 171-4 chr1 52970190 52970553 + 0.666667 NA intron (NM_001193600, intron 5 of 14) FAM|SINE|Alu 43095 NM_001193617 6342 Hs.476365 NM_002979 ENSG00000116171 SCP2 NLTP|NSL-TP|SCP-2|SCP-CHI|SCP-X|SCPX sterol carrier protein 2 protein-coding 148-111 chr4 39381320 39381542 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15069 NM_001363496 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 129.333-143 chr4 119812953 119813200 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -8561 NR_110660 101927007 Hs.143958 NR_110660 ENSG00000250772 LINC01365 - long intergenic non-protein coding RNA 1365 ncRNA 138.667-46 chr12 43298556 43298882 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 143404 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 147-77 chr2 206382259 206382629 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -61088 NM_003812 8745 Hs.370287 NM_003812 ENSG00000114948 ADAM23 MDC-3|MDC3 ADAM metallopeptidase domain 23 protein-coding 248.667-58 chr2 121637201 121637855 + 0.666667 NA intron (NM_015282, intron 1 of 38) L1MB4|LINE|L1 11934 NM_015282 23332 Hs.469840 NM_015282 ENSG00000074054 CLASP1 MAST1 cytoplasmic linker associated protein 1 protein-coding 116.333-80 chr16 57869754 57870099 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 59289 NM_001278081 388282 Hs.434720 NM_001278081 LOC388282 - uncharacterized LOC388282 protein-coding 193.667-19 chr10 66956749 66957277 + 0.666667 NA intron (NM_178011, intron 2 of 2) intron (NM_178011, intron 2 of 2) 30977 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 261.333-34 chr15 86777485 86778022 + 0.666667 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -155127 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 183-68 chr20 34238144 34238509 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -22039 NM_001672 434 Hs.659995 NM_001672 ENSG00000101440 ASIP AGSW|AGTI|AGTIL|ASP|SHEP9 agouti signaling protein protein-coding 122-14 chr10 36218959 36219215 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 440785 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 150.333-107 chr14 49199432 49199782 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 386773 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 134.333-144 chr5 131571398 131571699 + 0.666667 NA intron (NM_016340, intron 4 of 27) L1M4|LINE|L1 63681 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 115.667-68 chr14 30058293 30058562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -130580 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 182.667-83 chr20 6663059 6663519 + 0.666667 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 72847 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 146-96 chr4 67983531 67983810 + 0.666667 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 13769 NR_033737 644759 Hs.646883 NR_033737 ENSG00000229009 TMPRSS11GP - transmembrane serine protease 11G, pseudogene pseudo 134.667-7 chr1 117732375 117732712 + 0.666667 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 126495 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 160.667-83 chr14 28224106 28224442 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 541045 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 172-76 chr3 184410065 184410488 + 0.666667 NA intron (NR_161198, intron 1 of 2) FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 8739 NR_161199 105374250 Hs.129464 NR_161198 LINC02054 - long intergenic non-protein coding RNA 2054 ncRNA 130-7 chr1 222600326 222600579 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10493 NR_110614 100506161 Hs.553851 NR_110613 ENSG00000225265 TAF1A-AS1 - TAF1A antisense RNA 1 ncRNA 115.667-122 chr2 143159958 143160158 + 0.666667 NA intron (NM_018460, intron 2 of 13) intron (NM_018460, intron 2 of 13) 30639 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 193-62 chr3 182348856 182349419 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 137225 NR_040105 401103 Hs.591304 NR_040105 ENSG00000241098 LINC01994 - long intergenic non-protein coding RNA 1994 ncRNA 141.333-41 chr11 108396254 108396623 + 0.666667 NA intron (NM_001330368, intron 4 of 6) intron (NM_001330368, intron 4 of 6) 71091 NM_152587 160140 Hs.653180 NM_152587 ENSG00000166323 C11orf65 - chromosome 11 open reading frame 65 protein-coding 125.333-135 chr5 35635567 35635854 + 0.666667 NA intron (NM_144722, intron 2 of 9) MER75|DNA|PiggyBac 17847 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 112-13 chr10 5510759 5511042 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11330 NM_017422 51806 Hs.180142 NM_017422 ENSG00000178372 CALML5 CLSP calmodulin like 5 protein-coding 186.667-125 chr6 52383983 52384385 + 0.666667 NA intron (NM_133367, intron 1 of 1) intron (NM_133367, intron 1 of 1) 22033 NM_133367 85315 Hs.239388 NM_133367 ENSG00000170915 PAQR8 C6orf33|LMPB1|MPRB progestin and adipoQ receptor family member 8 protein-coding 146-129 chr7 74054521 74054813 + 0.666667 NA intron (NM_001278915, intron 18 of 32) intron (NM_001278915, intron 18 of 32) 26494 NM_001278916 2006 Hs.647061 NM_000501 ENSG00000049540 ELN ADCL1|SVAS|WBS|WS elastin protein-coding 185.333-170 chr6 147393179 147393577 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115312 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 237.333-77 chr3 51026541 51026921 + 0.666667 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) L1P4a|LINE|L1 351651 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 189-63 chr3 130342906 130343465 + 0.666667 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 -2331 NR_022012 256076 Hs.205403 NM_153264 ENSG00000172752 COL6A5 COL29A1|VWA4 collagen type VI alpha 5 chain protein-coding 136.667-163 chr7 7047615 7047897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19289 NR_037454 100500886 NR_037454 ENSG00000266287 MIR3683 - microRNA 3683 ncRNA 185-7 chr11 39983061 39983446 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 309877 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 123.667-75 chr18 13578167 13578472 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -32795 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 122.333-6 chr1 108096947 108097212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 95756 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 120-80 chr3 14484156 14484390 + 0.666667 NA intron (NR_103507, intron 13 of 13) intron (NR_103507, intron 13 of 13) 56069 NM_001080423 80852 Hs.517819 NM_001080423 ENSG00000144596 GRIP2 - glutamate receptor interacting protein 2 protein-coding 126-49 chr19 30865540 30865771 + 0.666667 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -301855 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 128-110 chr7 94039863 94040156 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -35654 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 219-62 chr3 123842585 123843180 + 0.666667 NA intron (NM_001321309, intron 2 of 32) L2c|LINE|L2 41450 NM_053025 4638 Hs.477375 NM_005965 ENSG00000065534 MYLK AAT7|KRP|MLCK|MLCK1|MLCK108|MLCK210|MSTP083|MYLK1|smMLCK myosin light chain kinase protein-coding 115-122 chr4 130391476 130391767 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15260 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 147-14 chr10 79077839 79078167 + 0.666667 NA intron (NM_020338, intron 1 of 24) intron (NM_020338, intron 1 of 24) 9037 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 172.667-3 chr1 44693818 44694133 + 0.666667 NA intron (NM_001145636, intron 2 of 11) L2a|LINE|L2 19261 NM_001145636 339541 Hs.173679 NM_001004307 ENSG00000198520 ARMH1 C1orf228|NCRNA00082|p40 armadillo like helical domain containing 1 protein-coding 118.333-102 chr2 51119770 51119971 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 2 of 10) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 87269 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 141.667-256 chrX 67636115 67636414 + 0.666667 NA intron (NM_001011645, intron 2 of 8) intron (NM_001011645, intron 2 of 8) 91641 NM_001348061 367 Hs.76704 NM_000044 ENSG00000169083 AR AIS|AR8|DHTR|HUMARA|HYSP1|KD|NR3C4|SBMA|SMAX1|TFM androgen receptor protein-coding 162.667-14 chr1 197332203 197332471 + 0.666667 NA intron (NM_001193640, intron 2 of 9) intron (NM_001193640, intron 2 of 9) 64085 NM_201253 23418 Hs.126135 NM_012076 ENSG00000134376 CRB1 LCA8|RP12 crumbs cell polarity complex component 1 protein-coding 113.667-152 chr3 187409688 187409891 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -37257 NR_146716 105374261 Hs.535726 NR_146716 LINC02041 - long intergenic non-protein coding RNA 2041 ncRNA 126.333-109 chr21 31353924 31354213 + 0.666667 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) AluSx1|SINE|Alu -9714 NM_001353687 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 116-157 chr8 118634464 118634649 + 0.666667 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) intron (NR_038210, intron 2 of 4) -12593 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 127-33 chr15 65205667 65205907 + 0.666667 NA intron (NM_003613, intron 4 of 8) intron (NM_003613, intron 4 of 8) 5686 NM_003613 8483 Hs.442180 NM_003613 ENSG00000138615 CILP CILP-1|HsT18872 cartilage intermediate layer protein protein-coding 138.333-183 chr7 48998142 48998419 + 0.666667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 73733 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 137-17 chr11 34522182 34522517 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8555 NM_001243080 2001 Hs.11713 NM_001422 ENSG00000135374 ELF5 ESE2 E74 like ETS transcription factor 5 protein-coding 111.667-139 chr2 148920774 148920942 + 0.666667 NA intron (NM_004522, intron 1 of 25) intron (NM_004522, intron 1 of 25) -27017 NR_111932 3800 Hs.435557 NM_004522 ENSG00000168280 KIF5C CDCBM2|KINN|NKHC|NKHC-2|NKHC2 kinesin family member 5C protein-coding 139.667-10 chr1 154896317 154896728 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -26241 NM_002249 3782 Hs.490765 NM_002249 ENSG00000143603 KCNN3 KCa2.3|SK3|SKCA3|hSK3 potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 protein-coding 121.333-80 chr2 41450098 41450406 + 0.666667 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -427303 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 116-88 chr2 185748139 185748341 + 0.666667 NA intron (NM_173651, intron 7 of 22) intron (NM_173651, intron 7 of 22) -7763 NR_110217 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 120-40 chr14 66486222 66486420 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_024338) promoter-TSS (NR_024338) -50 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 169.333-181 chr4 66866346 66866845 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 555405 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 155.333-49 chr11 8565943 8566366 + 0.666667 NA intron (NM_030906, intron 1 of 13) intron (NM_030906, intron 1 of 13) 27822 NM_001289061 65975 Hs.501833 NM_030906 ENSG00000130413 STK33 - serine/threonine kinase 33 protein-coding 129.667-13 chr1 165462746 165462991 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -17513 NM_001256570 6258 Hs.26550 NM_006917 ENSG00000143171 RXRG NR2B3|RXRC retinoid X receptor gamma protein-coding 159-22 chr11 47223455 47223779 + 0.666667 NA intron (NM_001300734, intron 3 of 5) AluY|SINE|Alu 8675 NM_000107 1643 Hs.700338 NM_000107 ENSG00000134574 DDB2 DDBB|UV-DDB2|XPE damage specific DNA binding protein 2 protein-coding 142.333-72 chr13 72445010 72445387 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282431 NM_001071775 440145 Hs.28465 NM_001071775 ENSG00000204899 MZT1 C13orf37|MOZART1 mitotic spindle organizing protein 1 protein-coding 223-6 chr10 51172901 51173308 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 98617 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 182.667-46 chr14 65245435 65245813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23277 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 139-111 chr8 139640006 139640289 + 0.666667 NA intron (NR_104210, intron 1 of 3) intron (NR_104210, intron 1 of 3) 62976 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 141.667-195 chr6 51692584 51692983 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 60 of 66) intron (NM_138694, intron 60 of 66) 70913 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 197 chr1 45264720 45265166 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -38967 NR_024270 400752 Hs.334348 NR_024270 ENSG00000281912 LINC01144 - long intergenic non-protein coding RNA 1144 ncRNA 201-63 chr2 148194763 148195064 + 0.666667 NA intron (NM_018328, intron 3 of 14) intron (NM_018328, intron 3 of 14) -173309 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 166.333-149 chr3 35223258 35223615 + 0.666667 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 170587 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 159.333-291 chr6 121129549 121129890 + 0.666667 NA intron (NR_104452, intron 29 of 35) intron (NR_104452, intron 29 of 35) 204761 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 129.667-45 chr13 22340546 22340816 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 130396 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 120.667-84 chr19 30224083 30224349 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -148168 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 157.667-160 chr2 209627528 209627849 + 0.666667 NA intron (NM_001039538, intron 4 of 14) L2c|LINE|L2 48009 NM_031845 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 169.667-205 chr8 74952577 74952925 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31754 NM_031461 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 218.667-45 chr2 12934323 12934804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72450 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 173.667-137 chr4 128920620 128920990 + 0.666667 NA intron (NM_144643, intron 18 of 20) L1PA15|LINE|L1 108961 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 192.667-92 chr2 184747146 184747625 + 0.666667 NA intron (NM_194250, intron 1 of 3) intron (NM_194250, intron 1 of 3) 148856 NM_194250 91752 Hs.159528 NM_194250 ENSG00000170396 ZNF804A C2orf10 zinc finger protein 804A protein-coding 117.667-184 chr8 3988692 3989043 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 5 of 69) intron (NM_033225, intron 5 of 69) 1006047 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 166.667-187 chr5 115777871 115778296 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 38574 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 230-73 chr8 81779479 81779956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47269 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 145.667-90 chr14 81133277 81133566 + 0.666667 NA intron (NM_000369, intron 8 of 9) intron (NM_000369, intron 8 of 9) 69413 NR_003021 677845 Hs.693251 NR_003021 ENSG00000221303 SNORA79 ACA65|SNORA79A small nucleolar RNA, H/ACA box 79 snoRNA 168.667-199 chr7 36365097 36365528 + 0.666667 NA intron (NM_001100425, intron 2 of 6) intron (NM_001100425, intron 2 of 6) 1928 NM_001199708 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 203.333-95 chr16 8304598 8305133 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 284973 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 173.333-215 chr9 78826561 78826866 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 318953 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 126-9 chr10 18263891 18264210 + 0.666667 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) intron (NM_000724, intron 1 of 12) 3328 NM_000724 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 161.667-109 chr17 77599351 77599692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 52580 NR_040050 100507351 Hs.514518 NR_040050 LOC100507351 - uncharacterized LOC100507351 ncRNA 152-124 chr5 29035131 29035498 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29930 NR_109948 101929645 Hs.531878 NR_109948 LOC101929645 - uncharacterized LOC101929645 ncRNA 206.333-110 chr3 45955703 45956285 + 0.666667 NA intron (NM_024513, intron 13 of 17) intron (NM_024513, intron 13 of 17) 12530 NM_006564 10663 Hs.34526 NM_006564 ENSG00000172215 CXCR6 BONZO|CD186|STRL33|TYMSTR C-X-C motif chemokine receptor 6 protein-coding 190-23 chr12 19791933 19792307 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -222565 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 182.333-114 chr4 53435207 53435626 + 0.666667 NA intron (NM_001134938, intron 10 of 14) intron (NM_001134938, intron 10 of 14) 57763 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 225.333-10 chr10 9801091 9801612 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -257371 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 172-99 chr6 137197956 137198445 + 0.666667 NA exon (NM_000416, exon 7 of 7) exon (NM_000416, exon 7 of 7) 20996 NM_001363527 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 219.333-90 chr2 12507170 12507612 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 4 of 5) intron (NR_110196, intron 4 of 5) -209481 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 155.333-316 chr5 174993335 174993723 + 0.666667 NA intron (NR_046113, intron 1 of 2) intron (NR_046113, intron 1 of 2) 2202 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 161-87 chr6 70162054 70162377 + 0.666667 NA intron (NM_001858, intron 35 of 50) intron (NM_001858, intron 35 of 50) 120982 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 142.333-50 chr12 3067767 3068029 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -9457 NM_001168320 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 231.667 chr1 44841916 44842419 + 0.666667 NA intron (NM_003738, intron 1 of 21) intron (NM_003738, intron 1 of 21) 777 NM_001166292 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 168.333-39 chr11 112185811 112186307 + 0.666667 NA intron (NM_031938, intron 2 of 11) intron (NM_031938, intron 2 of 11) 9693 NM_001256397 83875 Hs.728325 NM_031938 ENSG00000197580 BCO2 B-DIOX-II|BCDO2 beta-carotene oxygenase 2 protein-coding 153-67 chr18 52514895 52515206 + 0.666667 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) L1MD1|LINE|L1 174853 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 120.333-47 chr13 37492855 37493168 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8227 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 133.333-36 chr11 128498467 128498815 + 0.666667 NA intron (NM_001143820, intron 3 of 9) intron (NM_001143820, intron 3 of 9) 23669 NM_005238 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 293.667-44 chr3 121943450 121944182 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001145998, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001145998, exon 21 of 21) 49415 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 185.667-58 chr18 63706344 63706716 + 0.666667 NA intron (NM_001370475, intron 1 of 7) intron (NM_001370475, intron 1 of 7) 3570 NM_001291279 89778 Hs.350958 NM_080475 ENSG00000206072 SERPINB11 EPIPIN|SERPIN11 serpin family B member 11 (gene/pseudogene) protein-coding 154-98 chr3 167635833 167636225 + 0.666667 NA intron (NM_001348951, intron 2 of 18) L1PB1|LINE|L1 17913 NM_001366158 151790 Hs.213762 NM_178824 ENSG00000174776 WDR49 - WD repeat domain 49 protein-coding 197-26 chr12 10549533 10549928 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3649 NR_146456 101060038 NR_146455 LINC02446 - long intergenic non-protein coding RNA 2446 ncRNA 207.333-56 chr12 5876019 5876625 + 0.666667 NA intron (NM_001278596, intron 3 of 25) intron (NM_001278596, intron 3 of 25) 68937 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 114.667-24 chr10 1386967 1387240 + 0.666667 NA intron (NM_018702, intron 1 of 9) L1ME2|LINE|L1 -139527 NR_033387 642394 Hs.568831 NM_001098830 ENSG00000205696 ADARB2-AS1 C10orf109|NCRNA00168 ADARB2 antisense RNA 1 ncRNA 117.333-109 chr2 188629393 188629700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 160577 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 165-54 chr3 94894088 94894420 + 0.666667 NA Intergenic LTR24|LTR|ERV1 -44009 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 122.667-103 chr20 51530095 51530295 + 0.666667 NA intron (NM_001258292, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 12524 NM_001258297 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 143.333-138 chr2 88651766 88652052 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24080 NR_135540 101928403 Hs.434326 NR_135540 ENSG00000234028 EIF2AK3-DT - EIF2AK3 divergent transcript ncRNA 151.333-215 chr2 100207790 100208025 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_103730) promoter-TSS (NR_103730) -347 NR_103730 150577 Hs.434127 NM_001102655 ENSG00000232084 LINC01104 - long intergenic non-protein coding RNA 1104 ncRNA 205.667-54 chr16 22677951 22678381 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 132468 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 168.333-46 chr12 59424565 59424893 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -171300 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 112.667-273 chr8 133782485 133782687 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -5234 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 153.333-11 chr1 66423078 66423394 + 0.666667 NA Intergenic HERV9-int|LTR|ERV1 68701 NM_001297442 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 141.333-91 chr18 29793518 29793794 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner -505254 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 179-67 chr3 70862134 70862564 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 202575 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 204.667-2 chr1 25726910 25727240 + 0.666667 NA intron (NM_020379, intron 2 of 11) intron (NM_020379, intron 2 of 11) -73118 NM_206926 57190 Hs.323396 NM_020451 ENSG00000162430 SELENON CFTD|MDRS1|RSMD1|RSS|SELN|SEPN1 selenoprotein N protein-coding 194-19 chr11 98221447 98221871 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -799290 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 159.667-57 chr11 25987486 25987808 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -201476 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 153.667-60 chr11 13527133 13527491 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -31137 NM_001316352 5741 Hs.37045 NM_000315 ENSG00000152266 PTH PTH1 parathyroid hormone protein-coding 121-106 chr4 48548986 48549217 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 39 of 63) L2c|LINE|L2 58849 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 123-41 chr14 88361132 88361369 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24394 NM_001040428 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 113.333-30 chr10 65216128 65216317 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -291704 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 149.333-78 chr11 99017352 99017675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3436 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 114.667-177 chr3 109130351 109130667 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -6210 NR_161294 401081 Hs.280892 NM_001351622 ENSG00000241224 C3orf85 - chromosome 3 open reading frame 85 protein-coding 157-61 chr2 79134282 79134740 + 0.666667 NA TTS (NR_002714) TTS (NR_002714) 3916 NR_002714 5969 Hs.584797 NR_002714 REG1CP REG1P|REGL|RS regenerating family member 1 gamma, pseudogene pseudo 130.667-52 chr12 2699145 2699404 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -8117 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 144-33 chr12 12571940 12572207 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9210 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 195.333-84 chr14 88002284 88002839 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR2c|LTR|Gypsy -2574 NM_003608 8477 Hs.443243 NM_003608 ENSG00000140030 GPR65 TDAG8|hTDAG8 G protein-coupled receptor 65 protein-coding 153-6 chr1 189145170 189145452 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 1330699 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 142.333-266 chr9 126506917 126507185 + 0.666667 NA TTS (NM_033446) TTS (NM_033446) -96547 NR_045006 641373 Hs.742606 NR_045006 NRON NCRNA00194 non-coding repressor of NFAT ncRNA 151-57 chr2 84685483 84685780 + 0.666667 NA intron (NM_001370, intron 43 of 76) intron (NM_001370, intron 43 of 76) 169176 NM_001370 1768 Hs.249972 NM_001370 ENSG00000115423 DNAH6 DNHL1|Dnahc6|HL-2|HL2 dynein axonemal heavy chain 6 protein-coding 222-57 chr3 46782025 46782521 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -25418 NR_160552 100288960 NR_160552 PRSS43P PRSS43|TESSP3 serine protease 43, pseudogene pseudo 118.667-178 chr7 39120699 39120978 + 0.666667 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -107271 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 136.333-149 chr4 100548585 100548864 + 0.666667 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -30702 NM_001159694 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 250-39 chr2 65841438 65842071 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -409155 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 129-86 chr3 51066308 51066543 + 0.666667 NA intron (NM_004947, intron 6 of 52) HAL1|LINE|L1 -318866 NM_006010 7873 Hs.436446 NM_006010 ENSG00000145050 MANF ARMET|ARP mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor protein-coding 130.333-181 chr6 53069712 53069977 + 0.666667 NA intron (NM_033480, intron 1 of 12) L1MC5|LINE|L1 -1129 NM_012347 26268 Hs.216653 NM_012347 ENSG00000112146 FBXO9 FBX9|NY-REN-57|VCIA1|dJ341E18.2 F-box protein 9 protein-coding 140.667-16 chr1 119099420 119099715 + 0.666667 NA intron (NM_015836, intron 1 of 5) intron (NM_015836, intron 1 of 5) -40829 NR_125974 101929147 Hs.697821 NR_125974 ENSG00000231365 WARS2-AS1 - WARS2 antisense RNA 1 ncRNA 142.333-232 chr8 42890633 42890975 + 0.666667 NA intron (NM_030954, intron 1 of 6) intron (NM_030954, intron 1 of 6) 5471 NR_039679 100616115 NR_039679 ENSG00000284062 MIR4469 mir-4469 microRNA 4469 ncRNA 248.667-32 chr13 109167422 109167874 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_047700) promoter-TSS (NR_047700) -345 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 138.667-5 chr1 97791853 97792173 + 0.666667 NA intron (NM_000110, intron 3 of 22) intron (NM_000110, intron 3 of 22) -4908 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 154-4 chr1 99755503 99755831 + 0.666667 NA intron (NM_001361041, intron 1 of 16) MIR3|SINE|MIR 10126 NM_001013660 391059 Hs.454779 NM_001013660 ENSG00000156869 FRRS1 SDFR2|SDR2 ferric chelate reductase 1 protein-coding 118.667-62 chr13 65075075 65075426 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -790797 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 151.333-15 chr1 85131983 85132386 + 0.666667 NA intron (NM_001288563, intron 21 of 21) MIR|SINE|MIR -1610 NR_039619 100616481 NR_039619 ENSG00000266110 MIR4423 mir-4423 microRNA 4423 ncRNA 148.667-315 chr5 86806009 86806347 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 59360 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 153.333-257 chr22 45364967 45365400 + 0.666667 NA intron (NM_148674, intron 15 of 24) L2a|LINE|L2 46740 NM_001349913 55007 Hs.265018 NM_017911 ENSG00000100376 FAM118A C22orf8 family with sequence similarity 118 member A protein-coding 128.333-122 chr21 28173368 28173660 + 0.666667 NA intron (NR_126012, intron 3 of 5) intron (NR_126012, intron 3 of 5) 55153 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 171-34 chr2 59798648 59799089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 581160 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 128-99 chr6 122620753 122621019 + 0.666667 NA intron (NM_181795, intron 1 of 4) intron (NM_181795, intron 1 of 4) 10481 NM_181795 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 191.667-123 chr8 80607069 80607487 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 121052 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 174.667-72 chr18 10269364 10269851 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 144763 NR_110775 101927350 Hs.572523 NR_110775 ENSG00000260913 LINC01254 - long intergenic non-protein coding RNA 1254 ncRNA 150.333-247 chr22 24945724 24946123 + 0.666667 NA intron (NM_001001663, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 772 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 113.333-206 chr5 44717072 44717262 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91626 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 240.666-12 chr12 33587626 33588314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -148151 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 151.667-16 chr1 108906086 108906533 + 0.666667 NA intron (NM_013296, intron 10 of 14) FLAM_A|SINE|Alu 29324 NM_001321038 29899 Hs.584901 NM_013296 ENSG00000121957 GPSM2 CMCS|DFNB82|LGN|PINS G protein signaling modulator 2 protein-coding 156-127 chr6 134626060 134626345 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86197 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 155.667-214 chr3 25521579 25521998 + 0.666667 NA intron (NR_110892, intron 3 of 6) intron (NR_110892, intron 3 of 6) 63478 NM_001290217 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 152-48 chr13 28830207 28830611 + 0.666667 NA intron (NM_001366651, intron 1 of 14) L1MB7|LINE|L1 10070 NM_001366651 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 173.333-69 chr16 64268821 64269124 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 853091 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 150-65 chr17 81820021 81820349 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13106 NM_001288799 348262 Hs.514632 NM_207368 ENSG00000225663 MCRIP1 FAM195B|GRAN2|MCRIP MAPK regulated corepressor interacting protein 1 protein-coding 140.667-186 chr5 91795248 91795615 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -412114 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 151.333-173 chr17 40149901 40150248 + 0.666667 NA intron (NM_007359, intron 3 of 13) intron (NM_007359, intron 3 of 13) 9537 NM_007359 22794 Hs.743287 NM_007359 ENSG00000108349 CASC3 BTZ|MLN51 CASC3 exon junction complex subunit protein-coding 164-120 chr8 132557243 132557567 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 4074 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 122-116 chr7 111546531 111546809 + 0.666667 NA intron (NM_001350959, intron 2 of 7) intron (NM_001350959, intron 2 of 7) 15621 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 141.667-238 chr9 782111 782445 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -59419 NM_021951 1761 Hs.98586 NM_021951 ENSG00000137090 DMRT1 CT154|DMT1 doublesex and mab-3 related transcription factor 1 protein-coding 185.333-175 chr7 35505939 35506281 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 189025 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 133.333-141 chr5 24856112 24856403 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15674 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 180.333-46 chr17 57506463 57506885 + 0.666667 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 16923 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 124.667-58 chr14 62799910 62800235 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 9 of 10) intron (NM_139318, intron 9 of 10) 245386 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 123.667-53 chr14 50883885 50884151 + 0.666667 NA intron (NM_001206673, intron 5 of 12) L1ME4c|LINE|L1 11858 NM_181814 145447 Hs.271896 NM_181533 ENSG00000131969 ABHD12B BEM46L3|C14orf29|c14_5314 abhydrolase domain containing 12B protein-coding 145-86 chr4 187343592 187343943 + 0.666667 NA intron (NR_038931, intron 1 of 4) L1MEf|LINE|L1 -26881 NR_149103 105377602 Hs.582096 NR_149103 ENSG00000250042 LINC02514 - long intergenic non-protein coding RNA 2514 ncRNA 210.667-97 chr3 195364269 195364755 + 0.666667 NA intron (NM_012287, intron 4 of 22) AluSx|SINE|Alu 78508 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 170.333-86 chr16 56815478 56815864 + 0.666667 NA intron (NM_014669, intron 5 of 21) MIRb|SINE|MIR 32215 NM_001242796 9688 Hs.276878 NM_014669 ENSG00000102900 NUP93 NIC96 nucleoporin 93 protein-coding 153-100 chr4 55254388 55254720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91688 NM_024592 79644 Hs.39311 NM_024592 ENSG00000128039 SRD5A3 CDG1P|CDG1Q|KRIZI|SRD5A2L|SRD5A2L1 steroid 5 alpha-reductase 3 protein-coding 136.333-64 chr15 37511393 37511698 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -410234 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 166-22 chr10 53914988 53915334 + 0.666667 NA intron (NM_001354411, intron 26 of 34) intron (NM_001354411, intron 26 of 34) -571069 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 192-146 chr8 112614385 112614775 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 20 of 66) intron (NM_001363185, intron 20 of 66) -28913 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 173-80 chr5 129222774 129223212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 125305 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 291-40 chr5 123039797 123040447 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -3397 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 178.333-124 chr4 89861429 89861806 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17894 NM_001371403 138-58 chr2 116516366 116516616 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1172676 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 157.333-190 chr2 96692718 96693054 + 0.666667 NA intron (NM_001293083, intron 31 of 52) intron (NM_001293083, intron 31 of 52) 47190 NM_001142292 81562 Hs.655743 NM_030805 ENSG00000114988 LMAN2L MRT52|VIPL lectin, mannose binding 2 like protein-coding 180.333-141 chr8 121408388 121408749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -230778 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 249.667-37 chr17 63101878 63102455 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) AluJr|SINE|Alu 135931 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 240.667-67 chr5 61833673 61834220 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -98248 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 142.333-20 chr10 50231425 50231709 + 0.666667 NA intron (NM_001143974, intron 6 of 18) L2c|LINE|L2 17043 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 182.667-26 chr11 96102723 96103117 + 0.666667 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -178713 NM_016156 8898 Hs.181326 NM_016156 ENSG00000087053 MTMR2 CMT4B|CMT4B1 myotubularin related protein 2 protein-coding 125.667-193 chr8 130433418 130433619 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 1 of 29) intron (NM_001362925, intron 1 of 29) 10142 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 145.333-237 chr5 64073652 64073990 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -92022 NM_001113561 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 169-53 chr20 25559048 25559405 + 0.666667 NA intron (NM_025176, intron 1 of 23) intron (NM_025176, intron 1 of 23) 26305 NM_001318226 22981 Hs.631508 NM_025176 ENSG00000101004 NINL NLP ninein like protein-coding 160.333-79 chr12 99003588 99003910 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) intron (NM_152788, intron 17 of 25) -89610 NR_110095 101928937 Hs.555499 NR_110095 ENSG00000258039 LOC101928937 - uncharacterized LOC101928937 ncRNA 114.333-136 chr21 14181706 14181926 + 0.666667 NA exon (NM_001302998, exon 4 of 10) exon (NM_001302998, exon 4 of 10) 25133 NM_198996 149998 Hs.139907 NM_145317 ENSG00000188992 LIPI CT17|LPDL|PLA1C|PRED5|mPA-PLA1 beta lipase I protein-coding 144.667-53 chr12 34634552 34634814 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 612187 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 115.667-134 chr20 42371738 42372003 + 0.666667 NA intron (NM_133170, intron 9 of 31) intron (NM_133170, intron 9 of 31) -313613 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 136-67 chr3 127690102 127690387 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001256585, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001256585, exon 7 of 7) 17292 NM_172027 80325 Hs.107812 NM_032548 ENSG00000114626 ABTB1 BPOZ|BTB3|BTBD21|EF1ABP|PP2259 ankyrin repeat and BTB domain containing 1 protein-coding 115.667-133 chr20 37754397 37754593 + 0.666667 NA intron (NM_001281495, intron 5 of 16) intron (NM_001281495, intron 5 of 16) 60465 NM_030877 56259 Hs.472667 NM_030877 ENSG00000132792 CTNNBL1 C20orf33|NAP|P14L|PP8304|dJ633O20.1 catenin beta like 1 protein-coding 203.333-213 chr5 74762319 74762871 + 0.666667 NA intron (NR_104006, intron 2 of 19) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 4522 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 128-32 chr17 44520911 44521131 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -17615 NM_001304940 23131 Hs.463129 NM_001002909 ENSG00000186566 GPATCH8 GPATC8|KIAA0553 G-patch domain containing 8 protein-coding 229.333-104 chr5 152385254 152385805 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 19750 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 135.333-197 chr8 113730301 113730586 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -293504 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 181-80 chr8 126092438 126092836 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -141440 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 125-10 chr10 28976878 28977128 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 130595 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 166-70 chr2 222940931 222941273 + 0.666667 NA intron (NM_004457, intron 16 of 16) AluJr|SINE|Alu 80066 NM_001354159 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 210.333-176 chr9 4906538 4907124 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 56534 NR_029836 406894 NR_029836 ENSG00000199065 MIR101-2 MIRN101-2|mir-101-2 microRNA 101-2 ncRNA 135.333-38 chr11 111597337 111597633 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4964 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 114.667-175 chr3 98122061 98122277 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -10529 NM_001005338 26341 Hs.537383 NM_001005338 ENSG00000231192 OR5H1 HSHTPCRX14|HTPCRX14 olfactory receptor family 5 subfamily H member 1 protein-coding 158.667-185 chr20 7873742 7874068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66553 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 170-76 chr3 71574195 71574538 + 0.666667 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) intron (NR_146142, intron 2 of 19) 9362 NR_146143 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 172-52 chr19 49121977 49122355 + 0.666667 NA intron (NR_103842, intron 1 of 28) AluSp|SINE|Alu 2622 NM_003660 8541 Hs.413748 NM_003660 ENSG00000177380 PPFIA3 LPNA3 PTPRF interacting protein alpha 3 protein-coding 154.667-388 chr8 90169256 90169623 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -52049 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 137-109 chr8 133220764 133221158 + 0.666667 NA intron (NM_003882, intron 3 of 4) MIRc|SINE|MIR 29922 NM_001204870 8840 Hs.492974 NM_003882 ENSG00000104415 CCN4 WISP1|WISP1-OT1|WISP1-UT1|WISP1c|WISP1i|WISP1tc cellular communication network factor 4 protein-coding 151.333-110 chr13 41945861 41946164 + 0.666667 NA intron (NM_001009814, intron 2 of 25) L1M4|LINE|L1 15073 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 151-132 chr8 139582080 139582431 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 120868 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 156-141 chr8 100418258 100418623 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 35677 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 211.667-41 chr14 66790452 66790910 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) MER57-int|LTR|ERV1 283274 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 178.333-83 chr2 113803078 113803550 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46672 NM_001330317 80255 Hs.355655 NM_025181 ENSG00000115084 SLC35F5 - solute carrier family 35 member F5 protein-coding 147.333-148 chr18 2348899 2349187 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 222462 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 152-122 chr5 5575100 5575450 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 152598 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 120.333-144 chr4 106142860 106143099 + 0.666667 NA intron (NM_001290768, intron 24 of 26) intron (NM_001290768, intron 24 of 26) -120501 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 141.667-110 chr2 8645933 8646281 + 0.666667 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 35754 NR_110153 100506299 Hs.439031 NR_110153 ENSG00000235092 ID2-AS1 - ID2 antisense RNA 1 ncRNA 130.667-49 chr11 97068227 97068469 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 559923 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 128-83 chr4 92565579 92565780 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 261280 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 122.333-222 chr9 129827181 129827442 + 0.666667 NA TTS (NM_016520) TTS (NM_016520) -3175 NM_000113 1861 Hs.534312 NM_000113 ENSG00000136827 TOR1A DQ2|DYT1 torsin family 1 member A protein-coding 149.667-228 chr2 238364237 238364558 + 0.666667 NA intron (NM_001139490, intron 13 of 14) intron (NM_001139490, intron 13 of 14) 43853 NM_001139490 26146 Hs.631898 NM_015650 ENSG00000204104 TRAF3IP1 IFT54|MIP-T3|MIPT3|SLSN9 TRAF3 interacting protein 1 protein-coding 207.333-258 chr7 98454858 98455427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54052 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 184-52 chr2 108366148 108366556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11602 NM_001321770 27233 Hs.312644 NM_006588 ENSG00000198075 SULT1C4 SULT1C|SULT1C2 sulfotransferase family 1C member 4 protein-coding 199-52 chr2 108144805 108145224 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72827 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 113.333-98 chr17 14820074 14820279 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -194629 NR_135638 101928475 Hs.638944 NR_135638 ENSG00000232058 LOC101928475 - uncharacterized LOC101928475 ncRNA 127.667-131 chr4 166132956 166133181 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 259831 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 196.333-176 chr9 103191709 103192266 + 0.666667 NA intron (NR_121578, intron 7 of 9) L1MA9|LINE|L1 133046 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 111.667-234 chr7 28481017 28481348 + 0.666667 NA intron (NM_004904, intron 1 of 10) intron (NM_004904, intron 1 of 10) 45567 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 139.667-54 chr14 60677173 60677572 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -27895 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 191.333-195 chr7 112756526 112756960 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 33650 NM_001287497 64418 Hs.606345 NM_022484 ENSG00000146802 TMEM168 - transmembrane protein 168 protein-coding 132.333-130 chr5 34864317 34864607 + 0.666667 NA exon (NM_144725, exon 6 of 11) exon (NM_144725, exon 6 of 11) 25081 NM_001317949 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 124.333-25 chr11 44768549 44768855 + 0.666667 NA intron (NM_130783, intron 2 of 9) L1MC|LINE|L1 41740 NM_130783 90139 Hs.385634 NM_130783 ENSG00000157570 TSPAN18 TSPAN tetraspanin 18 protein-coding 122.333-18 chr10 17778216 17778529 + 0.666667 NA intron (NM_001098844, intron 3 of 3) intron (NM_001098844, intron 3 of 3) 26171 NM_001098844 653567 Hs.564139 NM_001013629 ENSG00000148483 TMEM236 FAM23A|FAM23B|bA162I21.2|bA16O1.2 transmembrane protein 236 protein-coding 143.667-274 chrX 10216232 10216559 + 0.666667 NA intron (NM_001830, intron 11 of 12) intron (NM_001830, intron 11 of 12) 59420 NM_001830 1183 Hs.495674 NM_001830 ENSG00000073464 CLCN4 CLC4|ClC-4|ClC-4A|MRX15|MRX49|MRXSRC chloride voltage-gated channel 4 protein-coding 209-77 chr3 37001803 37002426 + 0.666667 NA intron (NM_001167619, intron 3 of 17) AluSz|SINE|Alu 8764 NM_001354622 4292 Hs.195364 NM_000249 ENSG00000076242 MLH1 COCA2|FCC2|HNPCC|HNPCC2|hMLH1 mutL homolog 1 protein-coding 113-36 chr12 14901570 14901759 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15810 NM_001190839 4256 Hs.365706 NM_000900 ENSG00000111341 MGP GIG36|MGLAP|NTI matrix Gla protein protein-coding 149.333-147 chr17 65465855 65466142 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8457 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 151.667-101 chr13 112835741 112836092 + 0.666667 NA intron (NM_032189, intron 15 of 28) intron (NM_032189, intron 15 of 28) -81185 NR_046661 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 145.333-41 chr10 88726887 88727170 + 0.666667 NA intron (NM_001080518, intron 2 of 8) intron (NM_001080518, intron 2 of 8) 2484 NM_001080518 643414 Hs.632092 NM_001080518 ENSG00000204021 LIPK LIPL2|bA186O14.2 lipase family member K protein-coding 143.667-65 chr13 74632662 74633068 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 80022 NR_034025 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 243.667-60 chr5 29925637 29926150 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 45333 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 174.667-142 chr5 74467809 74468260 + 0.666667 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 68942 NR_126354 104310351 Hs.582291 NR_126354 ENSG00000248673 LINC01331 - long intergenic non-protein coding RNA 1331 ncRNA 116.333-143 chr3 82769199 82769398 + 0.666667 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 783156 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 118.667-35 chr10 94093040 94093343 + 0.666667 NA intron (NM_001165979, intron 1 of 31) intron (NM_001165979, intron 1 of 31) 4165 NM_001165979 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 179.333-35 chr11 38876213 38876518 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 227507 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 198.333-5 chr1 46720548 46720995 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -1657 NM_014774 9813 Hs.707688 NM_014774 ENSG00000159658 EFCAB14 KIAA0494 EF-hand calcium binding domain 14 protein-coding 133.667-31 chr12 2531600 2531872 + 0.666667 NA intron (NM_199460, intron 9 of 49).2 intron (NM_199460, intron 9 of 49).2 140484 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 201.667-25 chr12 90389587 90390110 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 96530 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 202-77 chr2 34627568 34628113 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49717 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 147-146 chr9 89844340 89844682 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -124905 NR_109791 101927847 Hs.584312 NR_109791 LOC101927847 - uncharacterized LOC101927847 ncRNA 150.667-299 chr5 52176186 52176496 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 168310 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 113.333-173 chr3 56667916 56668175 + 0.666667 NA intron (NM_001365638, intron 6 of 22) intron (NM_001365638, intron 6 of 22) -3999 NM_015224 23272 Hs.116877 NM_015224 ENSG00000163946 TASOR C3orf63|FAM208A|RAP140|TASOR1|se89-1 transcription activation suppressor protein-coding 185.333-63 chr17 32615930 32616303 + 0.666667 NA intron (NM_015194, intron 20 of 21) MLT1G-int|LTR|ERVL-MaLR 129123 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 141.333-147 chr3 7300039 7300381 + 0.666667 NA intron (NM_000844, intron 3 of 9) intron (NM_000844, intron 3 of 9) 235074 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 114.333-23 chr10 39380413 39380658 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 683939 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 140-48 chr16 75841683 75841956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115329 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 112.667-4 chr1 93397909 93398135 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -50096 NM_017737 54874 Hs.134060 NM_017737 ENSG00000137942 FNBP1L C1orf39|TOCA1 formin binding protein 1 like protein-coding 170.333-150 chr3 187574338 187574819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 95816 NM_001048 6750 Hs.12409 NM_001048 ENSG00000157005 SST SMST somatostatin protein-coding 152.667-324 chr6 53063590 53064035 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -1186 NM_033481 26268 Hs.216653 NM_012347 ENSG00000112146 FBXO9 FBX9|NY-REN-57|VCIA1|dJ341E18.2 F-box protein 9 protein-coding 183.667-88 chr22 34808613 34809038 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 189091 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 145.333-267 chr6 146551421 146551700 + 0.666667 NA intron (NM_006834, intron 2 of 2) intron (NM_006834, intron 2 of 2) 7727 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 194-14 chr11 6842592 6843168 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -2803 NM_178168 144124 Hs.447478 NM_178168 ENSG00000166363 OR10A5 JCG6|OR10A1|OR11-403 olfactory receptor family 10 subfamily A member 5 protein-coding 122-42 chr15 63193848 63194160 + 0.666667 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) intron (NM_016530, intron 1 of 7) 4398 NM_016530 51762 Hs.389733 NM_016530 ENSG00000166128 RAB8B - RAB8B, member RAS oncogene family protein-coding 225-61 chr8 72942927 72943492 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65655 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 189-11 chr10 112446661 112447143 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001303134) promoter-TSS (NM_001303134) 12 NM_022494 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 157.667-6 chr1 77595031 77595361 + 0.666667 NA intron (NM_001308237, intron 4 of 13) intron (NM_001308237, intron 4 of 13) 87462 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 180.667-54 chr18 4870913 4871250 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -210101 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 115.333-12 chr1 112563053 112563245 + 0.666667 NA intron (NM_017744, intron 11 of 14) intron (NM_017744, intron 11 of 14) 54184 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 160.333-296 chr9 22194043 22194422 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -184919 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 227.333-48 chr17 26883829 26884413 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 205120 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 180.667-61 chr2 50833078 50833468 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) L1ME1|LINE|L1 -137011 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 136-28 chr14 20516059 20516315 + 0.666667 NA Intergenic FordPrefect|DNA|hAT-Tip100 5715 NM_001012975 338879 Hs.451057 NM_001012975 ENSG00000182545 RNASE10 RAH1|RNASE9 ribonuclease A family member 10 (inactive) protein-coding 120-146 chr9 84927337 84927581 + 0.666667 NA intron (NM_001018064, intron 13 of 17) L2a|LINE|L2 221558 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 128.333-161 chr5 129100652 129100948 + 0.666667 NA intron (NM_016048, intron 1 of 4) intron (NM_016048, intron 1 of 4) 3112 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 136.333-69 chr15 90226192 90226478 + 0.666667 NA intron (NM_198925, intron 12 of 13) AluSx1|SINE|Alu 7606 NM_006384 10519 Hs.715556 NM_006384 ENSG00000185043 CIB1 CIB|CIBP|KIP1|PRKDCIP|SIP2-28 calcium and integrin binding 1 protein-coding 140.667-239 chr8 130004211 130004620 + 0.666667 NA intron (NM_001353245, intron 1 of 13) intron (NM_001353245, intron 1 of 13) 4038 NR_049826 100847051 NR_049826 ENSG00000264653 MIR5194 mir-5194 microRNA 5194 ncRNA 113.333-170 chr3 52202616 52202790 + 0.666667 NA exon (NM_000688, exon 4 of 12) exon (NM_000688, exon 4 of 12) 4543 NM_000688 211 Hs.476308 NM_000688 ENSG00000023330 ALAS1 ALAS|ALAS-H|ALAS3|ALASH|MIG4 5'-aminolevulinate synthase 1 protein-coding 127.667-139 chr5 40938589 40938819 + 0.666667 NA intron (NM_000587, intron 6 of 17) intron (NM_000587, intron 6 of 17) 29207 NM_000587 730 Hs.78065 NM_000587 ENSG00000112936 C7 - complement C7 protein-coding 238.667-90 chr8 105256847 105257440 + 0.666667 NA Intergenic THE1A|LTR|ERVL-MaLR -61295 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 209-107 chr6 166579925 166580390 + 0.666667 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) -35467 NM_001318938 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 231-47 chr4 37959417 37959956 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_006607) promoter-TSS (NM_006607) -712 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 156.333-26 chr1 203373424 203373781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22480 NM_002023 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 177.333-54 chr14 58832025 58832506 + 0.666667 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) intron (NR_110547, intron 1 of 5) 3977 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 154.667-229 chr22 46706427 46706737 + 0.666667 NA intron (NM_022766, intron 6 of 12) intron (NM_022766, intron 6 of 12) 31670 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 180.667-94 chr3 67220767 67221242 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4460 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 183.667-27 chr10 76752166 76752579 + 0.666667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -135672 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 135.667-25 chr11 33327103 33327365 + 0.666667 NA intron (NM_001278162, intron 2 of 15) L1MC4|LINE|L1 -48874 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 116.333-162 chr4 121041924 121042250 + 0.666667 NA intron (NM_024574, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 30448 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 159.667-121 chr16 17522351 17522739 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51585 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 196-78 chr18 66317577 66318010 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 286297 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 157-68 chr2 148347670 148348092 + 0.666667 NA intron (NM_018328, intron 5 of 14) ORSL|DNA|hAT-Tip100 -296870 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 141-17 chr12 7792266 7792639 + 0.666667 NA intron (NM_024865, intron 1 of 3) AluSp|SINE|Alu 3050 NM_024865 79923 Hs.635882 NM_024865 ENSG00000111704 NANOG - Nanog homeobox protein-coding 148.667-397 chr9 103144779 103145221 + 0.666667 NA intron (NR_121578, intron 8 of 9) AluYk2|SINE|Alu 149667 NM_001340 1539 Hs.3232 NM_001340 ENSG00000155833 CYLC2 - cylicin 2 protein-coding 152 chr1 39175321 39175761 + 0.666667 NA intron (NM_012090, intron 1 of 92) MamRep137|DNA|TcMar-Tigger 91374 NM_012090 23499 Hs.472475 NM_012090 ENSG00000127603 MACF1 ABP620|ACF7|LIS9|MACF|OFC4 microtubule actin crosslinking factor 1 protein-coding 114.667-3 chr1 66887526 66887837 + 0.666667 NA intron (NM_024763, intron 4 of 16) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 37175 NM_024763 79819 Hs.49421 NM_024763 ENSG00000152763 WDR78 DIC4 WD repeat domain 78 protein-coding 141.333-243 chr8 114054002 114054386 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -617255 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 143.667-152 chr22 29097498 29097879 + 0.666667 NA intron (NM_001039570, intron 2 of 8) intron (NM_001039570, intron 2 of 8) 24653 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 203.333-275 chr9 6592649 6593143 + 0.666667 NA exon (NM_000170, exon 10 of 25) exon (NM_000170, exon 10 of 25) 52796 NM_000170 2731 Hs.584238 NM_000170 ENSG00000178445 GLDC GCE|GCSP|HYGN1 glycine decarboxylase protein-coding 121.667-184 chr6 148380715 148380927 + 0.666667 NA intron (NM_001346506, intron 1 of 20) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie 37983 NM_015278 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 127.667-116 chr3 73949986 73950306 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140902 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 145.333-288 chr8 3685468 3685825 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 7 of 69) LOR1b|LTR|ERV1 -957195 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 153.667-4 chr1 44530135 44530438 + 0.666667 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR -15207 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 148-60 chr17 77077473 77077743 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11035 NR_027058 654434 Hs.720923 NR_027058 ENSG00000234912 SNHG20 C17orf86|LINC00338|NCRNA00338|SCARNA16HG small nucleolar RNA host gene 20 ncRNA 156.667-284 chr5 132381852 132382222 + 0.666667 NA intron (NM_003060, intron 2 of 9) MER20|DNA|hAT-Charlie -12121 NR_110997 553103 Hs.570908 NR_110997 ENSG00000233006 MIR3936HG SLC22A5-AS1 MIR3936 host gene ncRNA 172.667-2 chr1 33792613 33792980 + 0.666667 NA intron (NM_052896, intron 10 of 69) intron (NM_052896, intron 10 of 69) -67679 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 169.333-185 chr4 93155223 93155593 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 3 of 14) L2c|LINE|L2 -673345 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 129.667-102 chr2 145775061 145775301 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -811876 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 117.667-130 chr4 23142433 23142769 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 428512 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 149-83 chr21 28068170 28068401 + 0.666667 NA intron (NR_126010, intron 1 of 4) intron (NR_126010, intron 1 of 4) 19871 NR_126010 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 144-40 chr12 48387977 48388389 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36937 NM_001172682 121274 Hs.23492 NM_152320 ENSG00000167528 ZNF641 - zinc finger protein 641 protein-coding 118-62 chr19 28278496 28278683 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -328099 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 202.333-39 chr11 87712478 87712937 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 6704 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 120.333-194 chr8 122354258 122354585 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 214223 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 149-24 chr11 6373051 6373487 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -17205 NM_001365135 6609 Hs.498173 NM_000543 ENSG00000166311 SMPD1 ASM|ASMASE|NPD sphingomyelin phosphodiesterase 1 protein-coding 120-26 chr11 100140362 100140585 + 0.666667 NA intron (NM_001243270, intron 12 of 23) L2a|LINE|L2 -546815 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 127.667-195 chr9 76851845 76852087 + 0.666667 NA intron (NM_001308048, intron 2 of 17) intron (NM_001308048, intron 2 of 17) 54121 NM_001308047 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 195.333-4 chr1 45420794 45421220 + 0.666667 NA intron (NM_007170, intron 3 of 10) intron (NM_007170, intron 3 of 10) 70156 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 144.333-211 chr5 57656166 57656496 + 0.666667 NA intron (NR_104668, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 5671 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 118-97 chr4 86087587 86087796 + 0.666667 NA intron (NM_001318069, intron 9 of 13) intron (NM_001318069, intron 9 of 13) -32115 NR_110879 101929064 Hs.662221 NR_110879 ENSG00000250062 LOC101929064 - uncharacterized LOC101929064 ncRNA 146.667-93 chr14 22953951 22954243 + 0.666667 NA intron (NM_017815, intron 2 of 9) intron (NM_017815, intron 2 of 9) 2932 NR_039856 100616424 NR_039856 ENSG00000284118 MIR4707 mir-4707 microRNA 4707 ncRNA 222-21 chr12 106360883 106361355 + 0.666667 NA intron (NM_001160708, intron 1 of 27) L2|LINE|L2 3037 NM_001160708 55703 Hs.62696 NM_018082 ENSG00000013503 POLR3B C128|HLD8|INMAP|RPC2 RNA polymerase III subunit B protein-coding 223.667-84 chr8 88872817 88873362 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -545606 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 168-41 chr17 58671105 58671494 + 0.666667 NA intron (NM_031272, intron 1 of 31) intron (NM_031272, intron 1 of 31) 20756 NM_031272 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 160.667-113 chr16 68086201 68086578 + 0.666667 NA intron (NM_004555, intron 1 of 10) intron (NM_004555, intron 1 of 10) 1019 NM_173163 4775 Hs.436585 NM_004555 ENSG00000072736 NFATC3 NF-AT4c|NFAT4|NFATX nuclear factor of activated T cells 3 protein-coding 167-97 chr7 94455293 94455624 + 0.666667 NA Intergenic Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 -54351 NM_001363426 64921 Hs.260041 NM_022900 ENSG00000127995 CASD1 C7orf12|NBLA04196|SOAT CAS1 domain containing 1 protein-coding 112.333-212 chr5 108094812 108095075 + 0.666667 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 287155 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 194-60 chr18 41099050 41099474 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 421415 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 165.667-160 chr5 94273029 94273377 + 0.666667 NA intron (NM_001145678, intron 20 of 20) MIR|SINE|MIR -161504 NM_001163418 83989 Hs.600086 NM_032042 ENSG00000113391 FAM172A C5orf21|Toupee family with sequence similarity 172 member A protein-coding 117.333-223 chr9 131133348 131133652 + 0.666667 NA intron (NM_001318324, intron 7 of 35) AluJb|SINE|Alu 7914 NM_001318324 8021 Hs.654530 NM_005085 ENSG00000126883 NUP214 CAIN|CAN nucleoporin 214 protein-coding 217.667-64 chr4 32937411 32937807 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 586571 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 147.667-124 chr16 28139149 28139506 + 0.666667 NA intron (NM_001270940, intron 10 of 24) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 72638 NM_015171 23214 Hs.460468 NM_015171 ENSG00000169180 XPO6 EXP6|RANBP20 exportin 6 protein-coding 119.667-34 chr12 15910148 15910351 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1083 NM_001300779 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 112.667-208 chr5 26604442 26604640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 434045 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 187-30 chr2 28835472 28835890 + 0.666667 NA intron (NM_001008779, intron 4 of 4) intron (NM_001008779, intron 4 of 4) 19684 NM_001008779 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 115-153 chr8 98119997 98120231 + 0.666667 NA intron (NM_015029, intron 1 of 15) intron (NM_015029, intron 1 of 15) 2274 NM_015029 10940 Hs.252828 NM_015029 ENSG00000104356 POP1 ANXD2 POP1 homolog, ribonuclease P/MRP subunit protein-coding 129.667-80 chr17 67760873 67761252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20392 NR_003706 100124536 Hs.693446 NR_003706 ENSG00000200394 SNORA38B - small nucleolar RNA, H/ACA box 38B snoRNA 121.667-219 chr9 119265179 119265481 + 0.666667 NA intron (NM_014618, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu 104105 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 140.333 chr1 14268571 14268897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 151239 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 208-90 chr20 43109681 43110228 + 0.666667 NA intron (NM_133170, intron 1 of 31) L2a|LINE|L2 79952 NM_133170 11122 Hs.526879 NM_007050 ENSG00000196090 PTPRT RPTPrho protein tyrosine phosphatase receptor type T protein-coding 164-89 chr4 182601613 182602044 + 0.666667 NA intron (NM_001080477, intron 4 of 27) L3|LINE|CR1 315425 NM_001351744 1635 Hs.183850 NM_001921 ENSG00000129187 DCTD - dCMP deaminase protein-coding 149.667-162 chr17 74884452 74884743 + 0.666667 NA intron (NM_178128, intron 2 of 5) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 9036 NM_178128 283985 Hs.448845 NM_178128 ENSG00000172782 FADS6 FP18279 fatty acid desaturase 6 protein-coding 120.667-99 chr2 124028201 124028418 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) (GT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 3022 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 148-152 chr6 161976304 161976596 + 0.666667 NA intron (NM_013988, intron 2 of 8) intron (NM_013988, intron 2 of 8) 505473 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 170.333-181 chr6 36391732 36392238 + 0.666667 NA intron (NM_152990, intron 4 of 4) intron (NM_152990, intron 4 of 4) -4185 NM_001207041 51513 Hs.272398 NM_016135 ENSG00000010030 ETV7 TEL-2|TEL2|TELB ETS variant 7 protein-coding 156.333-333 chr7 29977000 29977435 + 0.666667 NA intron (NM_001145514, intron 1 of 7) intron (NM_001145514, intron 1 of 7) 12584 NM_001145515 9805 Hs.520740 NM_014766 ENSG00000136193 SCRN1 SES1 secernin 1 protein-coding 117.667-109 chr21 14403191 14403377 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -20138 NM_006948 6782 Hs.352341 NM_006948 ENSG00000155304 HSPA13 STCH heat shock protein family A (Hsp70) member 13 protein-coding 116.667-117 chr22 27068287 27068523 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -7887 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 170.667-5 chr1 48462799 48463258 + 0.666667 NA intron (NM_019073, intron 1 of 12) MLT2B2|LTR|ERVL 9176 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 136-59 chr22 26014255 26014627 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 42 of 43) L1ME3A|LINE|L1 -155021 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 210.333-123 chr4 162949455 162950050 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 143876 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 230.333-7 chr1 177652074 177652556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48209 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 130-79 chr4 39476781 39477075 + 0.666667 NA intron (NM_001278590, intron 9 of 9) intron (NM_001278590, intron 9 of 9) -3327 NR_026854 401127 Hs.383197 NR_026854 ENSG00000224097 LOC401127 - WD repeat domain 5 pseudogene pseudo 239.333-94 chr6 75609237 75609735 + 0.666667 NA intron (NM_001100409, intron 1 of 22) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 7606 NM_015571 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 129-64 chr2 162663114 162663466 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -105646 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 130.667-202 chr9 2012411 2012638 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2823 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 186-103 chr8 140155148 140155588 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) -54833 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 156.667-125 chr16 46383263 46383517 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 185707 NR_026556 124149 Hs.97414 NM_001004299 ANKRD26P1 - ankyrin repeat domain 26 pseudogene 1 pseudo 159.667-56 chr10 122412960 122413358 + 0.666667 NA intron (NM_001330178, intron 7 of 13) intron (NM_001330178, intron 7 of 13) -3806 NR_037506 100500866 NR_037506 ENSG00000265442 MIR3941 - microRNA 3941 ncRNA 210.333-125 chr5 19476413 19476913 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 12 of 12) intron (NM_001349559, intron 12 of 12) 409609 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 131.667-117 chr21 31017115 31017373 + 0.666667 NA Intergenic Charlie10a|DNA|hAT-Charlie 21232 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 203-77 chr5 22756624 22757206 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) AluSg7|SINE|Alu 96429 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 157.333-308 chr6 91250022 91250371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -271464 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 129.667-65 chr15 75925032 75925386 + 0.666667 NA intron (NM_012170, intron 5 of 5) intron (NM_012170, intron 5 of 5) 21331 NM_147188 26263 Hs.591115 NM_012170 ENSG00000167196 FBXO22 FBX22|FISTC1 F-box protein 22 protein-coding 158.667-283 chr6 37749167 37749514 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -51457 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 139.667-189 chr8 100199391 100199778 + 0.666667 NA intron (NM_003114, intron 10 of 18) AluSq2|SINE|Alu 41249 NM_003114 6674 Hs.591866 NM_003114 ENSG00000104450 SPAG1 CILD28|CT140|HEL-S-268|HSD-3.8|SP75|TPIS sperm associated antigen 1 protein-coding 146-101 chr4 121579464 121579747 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 117375 NM_001154 308 Hs.480653 NM_001154 ENSG00000164111 ANXA5 ANX5|ENX2|HEL-S-7|PP4|RPRGL3 annexin A5 protein-coding 192.667-174 chr8 114841749 114842178 + 0.666667 NA Intergenic MER81|DNA|hAT-Blackjack 826050 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 139.333-222 chr8 119051657 119051941 + 0.666667 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) intron (NM_001324095, intron 3 of 7) -15448 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 143.333-213 chr4 157242867 157243122 + 0.666667 NA intron (NM_001083620, intron 2 of 15) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 22266 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 141-77 chr6 104250473 104250858 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 608881 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 168-101 chr7 35249130 35249597 + 0.666667 NA intron (NM_001166220, intron 2 of 5) intron (NM_001166220, intron 2 of 5) 4737 NM_001166220 57057 Hs.404167 NM_020417 ENSG00000164532 TBX20 ASD4 T-box transcription factor 20 protein-coding 180.333-137 chr8 102396895 102397283 + 0.666667 NA intron (NM_001282873, intron 1 of 58) intron (NM_001282873, intron 1 of 58) 15600 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 129.333-185 chr8 14843414 14843732 + 0.666667 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 9937 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 272-44 chr5 149227204 149227902 + 0.666667 NA intron (NM_001370418, intron 7 of 18) MER5A|DNA|hAT-Charlie -44285 NM_001323063 134265 Hs.62930 NM_152406 ENSG00000157510 AFAP1L1 - actin filament associated protein 1 like 1 protein-coding 111.667-202 chr5 54638761 54638991 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64448 NR_104659 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 147.667-50 chr11 26425379 26425815 + 0.666667 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) intron (NM_031418, intron 1 of 26) -48305 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 211.667-59 chr2 75469725 75470127 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54142 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 177.333-182 chrX 29448519 29448935 + 0.666667 NA intron (NM_014271, intron 5 of 10) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -125551 NR_049877 100847047 NR_049877 ENSG00000264090 MIR4666B - microRNA 4666b ncRNA 183.667-81 chr2 189306510 189306937 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -126962 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 124-100 chr5 137441775 137442026 + 0.666667 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) intron (NM_004598, intron 2 of 10) 57426 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 132.667-113 chr3 159713866 159714189 + 0.666667 NA intron (NM_001197108, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 54585 NR_121669 100874433 Hs.601476 NR_121669 IQCJ-SCHIP1-AS1 uaz98 IQCJ-SCHIP1 readthrough antisense RNA 1 ncRNA 173-57 chr22 46625547 46625863 + 0.666667 NA intron (NM_015124, intron 1 of 18) intron (NM_015124, intron 1 of 18) 5319 NM_015124 23151 Hs.475150 NM_015124 ENSG00000075240 GRAMD4 DIP GRAM domain containing 4 protein-coding 191-67 chr7 98035138 98035562 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -45246 NM_006188 4951 Hs.510456 NM_006188 ENSG00000135175 OCM2 OCM|OM oncomodulin 2 protein-coding 150-12 chr10 31070250 31070539 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -38457 NM_182755 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 144.333-76 chr14 62795382 62795744 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 9 of 10) MER2|DNA|TcMar-Tigger 249895 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 200.667-165 chr9 34614692 34615123 + 0.666667 NA intron (NM_001281425, intron 3 of 5) intron (NM_001281425, intron 3 of 5) -2810 NM_148178 138716 Hs.15961 NM_148178 ENSG00000164967 RPP25L C9orf23|bA296L22.5 ribonuclease P/MRP subunit p25 like protein-coding 115.333-154 chr4 60570759 60571058 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -351711 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 116-90 chr2 190675081 190675358 + 0.666667 NA intron (NM_001321315, intron 3 of 5) intron (NM_001321315, intron 3 of 5) 16061 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 118-68 chr2 118930238 118930514 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -11793 NM_006770 8685 Hs.67726 NM_006770 ENSG00000019169 MARCO SCARA2|SR-A6 macrophage receptor with collagenous structure protein-coding 135-120 chr9 119792287 119792504 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142665 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 138-66 chr20 6916932 6917277 + 0.666667 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 149418 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 164-50 chr19 27796976 27797418 + 0.666667 NA intron (NR_110690, intron 1 of 1) intron (NR_110690, intron 1 of 1) -3257 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 135.333-202 chr9 76561898 76562206 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61419 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 112.333-103 chr18 11005079 11005254 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) intron (NM_022068, intron 2 of 51) 143596 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 169.333-96 chr17 18084919 18085296 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2841 NM_001388 1819 Hs.78582 NM_001388 ENSG00000108591 DRG2 - developmentally regulated GTP binding protein 2 protein-coding 121-51 chr16 20256909 20257132 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 70493 NM_001007240 2813 Hs.53985 NM_001502 ENSG00000169347 GP2 ZAP75 glycoprotein 2 protein-coding 139-49 chr2 84836561 84836926 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001307978, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001307978, exon 5 of 5) 44341 NM_001307978 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 147.667-228 chr3 64841280 64841578 + 0.666667 NA intron (NR_038264, intron 3 of 5) intron (NR_038264, intron 3 of 5) -153429 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 111.667-107 chr17 69215068 69215321 + 0.666667 NA intron (NM_080282, intron 9 of 39) intron (NM_080282, intron 9 of 39) 19818 NR_130736 100133319 NR_130736 ENSG00000278873 PRO1804 - uncharacterized LOC100133319 ncRNA 115-83 chr2 44170263 44170484 + 0.666667 NA intron (NM_177969, intron 1 of 4) intron (NM_177969, intron 1 of 4) 1498 NM_001033557 5495 Hs.416769 NM_002706 ENSG00000138032 PPM1B PP2C-beta|PP2C-beta-X|PP2CB|PP2CBETA|PPC2BETAX protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B protein-coding 263-66 chr7 81710764 81711389 + 0.666667 NA intron (NM_001010932, intron 12 of 17) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -19670 NR_126025 100128317 Hs.571267 NR_126025 ENSG00000233491 LOC100128317 - uncharacterized LOC100128317 ncRNA 170.333-15 chr1 212553072 212553482 + 0.666667 NA intron (NR_125985, intron 1 of 2) MER34|LTR|ERV1 7583 NR_125985 101929565 NR_125985 ENSG00000228067 LINC01740 - long intergenic non-protein coding RNA 1740 ncRNA 140-89 chr5 80824750 80825066 + 0.666667 NA intron (NM_002439, intron 20 of 23) intron (NM_002439, intron 20 of 23) -135455 NM_006909 5924 Hs.162129 NM_006909 ENSG00000113319 RASGRF2 GRF2|RAS-GRF2 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 2 protein-coding 178-6 chr1 88771328 88771848 + 0.666667 NA intron (NM_006256, intron 5 of 21) intron (NM_006256, intron 5 of 21) -86384 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 125.667-185 chr8 37988714 37989076 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -22296 NM_000025 155 Hs.2549 NM_000025 ENSG00000188778 ADRB3 BETA3AR adrenoceptor beta 3 protein-coding 182-2 chr1 25680243 25680603 + 0.666667 NA intron (NM_020379, intron 1 of 11) L1MB7|LINE|L1 62955 NM_001289010 57134 Hs.197043 NM_020379 ENSG00000117643 MAN1C1 HMIC|MAN1A3|MAN1C|pp6318 mannosidase alpha class 1C member 1 protein-coding 115.667-229 chr9 100580700 100581016 + 0.666667 NA intron (NM_001018116, intron 1 of 1) intron (NM_001018116, intron 1 of 1) 2779 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 116.667-198 chr8 85556061 85556299 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91265 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 156-101 chr4 77081109 77081482 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5306 NM_006835 10983 Hs.518827 NM_006835 ENSG00000118816 CCNI CCNI1|CYC1|CYI cyclin I protein-coding 159.667-217 chr3 106859617 106859912 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 380874 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 153-24 chr12 1133883 1134208 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 6 of 19) L1MEc|LINE|L1 106297 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 140.667-29 chr10 32620517 32620820 + 0.666667 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) intron (NM_001321115, intron 19 of 43) 174528 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 133.667-86 chr20 46940416 46940707 + 0.666667 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) intron (NM_172110, intron 1 of 13) 45718 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 132.333-51 chr14 44725253 44725590 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73705 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 145.333-238 chr5 79155008 79155345 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43367 NM_001713 635 Hs.80756 NM_001713 ENSG00000145692 BHMT BHMT1|HEL-S-61p betaine--homocysteine S-methyltransferase protein-coding 156.333-65 chr11 114320160 114320482 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 24508 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 143.667-56 chr12 52332555 52332840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11299 NM_002282 3889 Hs.720768 NM_002282 ENSG00000170523 KRT83 EKVP5|HB3|Hb-3|KRTHB3|MNLIX keratin 83 protein-coding 143.333-227 chr5 73017213 73017493 + 0.666667 NA intron (NM_001146032, intron 7 of 24) intron (NM_001146032, intron 7 of 24) 61312 NM_001146032 115548 Hs.165762 NM_138782 ENSG00000157107 FCHO2 - FCH domain only 2 protein-coding 183.667-49 chr15 60607836 60608198 + 0.666667 NA intron (NR_120342, intron 5 of 5) intron (NR_120342, intron 5 of 5) -15491 NM_134262 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 170.667-26 chr11 46036292 46036640 + 0.666667 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) L1M5|LINE|L1 84353 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 146.333-303 chr7 19702308 19702646 + 0.666667 NA intron (NM_001002926, intron 2 of 3) L1ME2|LINE|L1 2959 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 231-63 chr8 100020853 100021355 + 0.666667 NA intron (NM_015668, intron 14 of 27) intron (NM_015668, intron 14 of 27) 16522 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 112.333-17 chr10 7872868 7873169 + 0.666667 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) intron (NM_031923, intron 2 of 6) 54513 NM_031923 83860 Hs.527688 NM_031923 ENSG00000165632 TAF3 TAF140|TAFII-140|TAFII140 TATA-box binding protein associated factor 3 protein-coding 155.333-322 chr6 8635773 8636032 + 0.666667 NA intron (NR_038980, intron 3 of 4) intron (NR_038980, intron 3 of 4) -16307 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 194.667-146 chr7 78734543 78734951 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -274241 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 161-95 chr7 111238039 111238404 + 0.666667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 147094 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 131.667-24 chr10 66877969 66878205 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) -47949 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 132.667-161 chr7 33184799 33185173 + 0.666667 NA intron (NM_198428, intron 5 of 22) MER41B|LTR|ERV1 55422 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 141-81 chr7 2961095 2961420 + 0.666667 NA intron (NM_032415, intron 1 of 24) AluY|SINE|Alu 82610 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 187.667-148 chr9 7804735 7805100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5139 NM_001318058 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 170.333-144 chr3 111943681 111944133 + 0.666667 NA intron (NM_001134437, intron 8 of 17) L1ME2|LINE|L1 -35119 NR_073571 55347 Hs.477115 NM_018394 ENSG00000144827 ABHD10 - abhydrolase domain containing 10 protein-coding 149-82 chr21 19970573 19970959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71011 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 163-73 chr5 177058996 177059477 + 0.666667 NA intron (NR_131773, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR -27679 NM_001354984 2264 Hs.165950 NM_002011 ENSG00000160867 FGFR4 CD334|JTK2|TKF fibroblast growth factor receptor 4 protein-coding 129.333-15 chr10 41780649 41780927 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 587257 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 130.667-105 chr2 23817609 23817954 + 0.666667 NA intron (NR_125717, intron 17 of 28) intron (NR_125717, intron 17 of 28) 109342 NM_017552 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 148-134 chr5 87462830 87463141 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -49952 NM_001363539 902 Hs.292524 NM_001239 ENSG00000134480 CCNH CAK|CycH|p34|p37 cyclin H protein-coding 160.667-139 chr2 38611047 38611426 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8200 NM_001142650 92906 Hs.445497 NM_138394 ENSG00000143889 HNRNPLL HNRPLL|SRRF heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like protein-coding 273.333-37 chr2 173897554 173898281 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 65963 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 279.334-7 chr3 55759551 55760290 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) intron (NR_132749, intron 13 of 17) 92674 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 162-75 chr20 51145822 51146205 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -122906 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 238.667-12 chr10 77196050 77196503 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 3 of 28) intron (NM_001271519, intron 3 of 28) 55445 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 128-49 chr2 120392994 120393219 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 46970 NM_002193 3625 Hs.1735 NM_002193 ENSG00000163083 INHBB - inhibin subunit beta B protein-coding 142-43 chr14 50157719 50157993 + 0.666667 NA intron (NM_006939, intron 11 of 22) intron (NM_006939, intron 11 of 22) -41284 NM_024558 79609 Hs.558541 NM_024558 ENSG00000100483 VCPKMT C14orf138|METTL21D|VCP-KMT valosin containing protein lysine methyltransferase protein-coding 146.333-226 chr4 11024526 11024793 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -339891 NM_052964 116449 Hs.62772 NM_052964 ENSG00000109684 CLNK MIST cytokine dependent hematopoietic cell linker protein-coding 114-96 chr4 33310304 33310640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 729421 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 184-88 chr5 124355950 124356386 + 0.666667 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) intron (NR_125774, intron 4 of 5) 82352 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 170.333-88 chr16 76164484 76164925 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -112697 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 125.667-196 chr9 28320061 28320369 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) MIRc|SINE|MIR 399090 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 190.667-129 chr7 6411335 6411702 + 0.666667 NA intron (NM_001142936, intron 11 of 12) AluJb|SINE|Alu 36436 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 169.667-144 chr4 32091511 32091913 + 0.666667 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) L1MC2|LINE|L1 -69290 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 262.333-83 chr9 9486378 9486886 + 0.666667 NA intron (NM_002839, intron 8 of 45) intron (NM_002839, intron 8 of 45) -312760 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 171-26 chr16 66742297 66742790 + 0.666667 NA exon (NM_001323955, exon 3 of 12) exon (NM_001323955, exon 3 of 12) 9066 NM_006141 1783 Hs.369068 NM_006141 ENSG00000135720 DYNC1LI2 DNCLI2|LIC2 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 2 protein-coding 225.667-48 chr22 50320442 50321006 + 0.666667 NA intron (NM_001001794, intron 1 of 19) intron (NM_001001794, intron 1 of 19) 6288 NM_001001794 414918 Hs.530380 NM_001001794 ENSG00000205593 DENND6B AFI1B|FAM116B DENN domain containing 6B protein-coding 147.333-139 chr17 59663138 59663430 + 0.666667 NA intron (NM_001288653, intron 8 of 31) intron (NM_001288653, intron 8 of 31) 43389 NM_004859 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 196-20 chr10 48313729 48314314 + 0.666667 NA intron (NM_001323327, intron 2 of 12) L1ME4b|LINE|L1 7344 NM_001323320 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 207-110 chr7 90716647 90717210 + 0.666667 NA intron (NM_001287136, intron 1 of 13) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 7112 NM_001287136 5218 Hs.258576 NM_012395 ENSG00000058091 CDK14 PFTAIRE1|PFTK1 cyclin dependent kinase 14 protein-coding 121-31 chr12 30967815 30968062 + 0.666667 NA intron (NM_001370301, intron 2 of 6) intron (NM_001370301, intron 2 of 6) 41034 NM_001080509 441631 Hs.505141 NM_001080509 ENSG00000110900 TSPAN11 VSSW1971 tetraspanin 11 protein-coding 121.667-136 chr4 5913843 5914116 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9349 NR_039608 100616201 NR_039608 ENSG00000263631 MIR378D1 mir-378d-1 microRNA 378d-1 ncRNA 145.333-322 chr9 119116062 119116349 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 253230 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 143-70 chr2 109545645 109545928 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001321511, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001321511, exon 6 of 6) 67881 NM_001321513 151011 Hs.469615 NM_144710 ENSG00000186522 SEPTIN10 SEPT10 septin 10 protein-coding 177.667-91 chr3 119723091 119723477 + 0.666667 NA intron (NM_033364, intron 6 of 17) L1ME3Cz|LINE|L1 20262 NM_001320316 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 143-93 chr5 36105988 36106387 + 0.666667 NA intron (NM_001007527, intron 16 of 17) intron (NM_001007527, intron 16 of 17) -39305 NM_174914 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 116-107 chr3 69052064 69052276 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001363879, exon 1 of 17) 5' UTR (NM_001363879, exon 1 of 17) 163 NM_001363879 7110 Hs.267632 NM_007114 ENSG00000144747 TMF1 ARA160|TMF TATA element modulatory factor 1 protein-coding 117.667-48 chr14 30863757 30863965 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10674 NM_001135058 1690 Hs.21016 NM_004086 ENSG00000100473 COCH COCH-5B2|COCH5B2|DFNA9|DFNB110 cochlin protein-coding 142.333-155 chr3 50657899 50658174 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16891 NM_004947 1795 Hs.476284 NM_004947 ENSG00000088538 DOCK3 MOCA|NEDIDHA|PBP dedicator of cytokinesis 3 protein-coding 321.667-5 chr13 100762959 100763585 + 0.666667 NA intron (NR_047687, intron 2 of 7) intron (NR_047687, intron 2 of 7) 54947 NR_047687 100885778 Hs.602949 NR_047687 ENSG00000233009 NALCN-AS1 - NALCN antisense RNA 1 ncRNA 145-75 chr3 179019348 179019635 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_022470, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_022470, exon 6 of 6) 52318 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 133.667-101 chr3 138860715 138861053 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25956 NM_006219 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 194.333-101 chr4 89305464 89305904 + 0.666667 NA intron (NM_198281, intron 1 of 1) intron (NM_198281, intron 1 of 1) 2116 NM_198281 285513 Hs.100912 NM_198281 ENSG00000185477 GPRIN3 GRIN3 GPRIN family member 3 protein-coding 123-47 chr15 69150711 69150946 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -9769 NM_001324091 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 129-83 chr3 28424738 28425040 + 0.666667 NA intron (NM_001040432, intron 3 of 9) intron (NM_001040432, intron 3 of 9) 75740 NM_001324169 152098 Hs.510635 NM_001040432 ENSG00000206559 ZCWPW2 ZCW2 zinc finger CW-type and PWWP domain containing 2 protein-coding 217-65 chr4 29143230 29143878 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70738 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 111.667-256 chr8 84883577 84883862 + 0.666667 NA intron (NM_001354323, intron 7 of 7) intron (NM_001354323, intron 7 of 7) 177792 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 119.333-33 chr10 65649320 65649666 + 0.666667 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) L1MEf|LINE|L1 78068 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 127.333-46 chr14 38243508 38243827 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12426 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 166-128 chrX 79939504 79939828 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -75087 NM_001109879 50945 Hs.374253 NM_016954 ENSG00000122145 TBX22 ABERS|CLPA|CPX|TBXX|dJ795G23.1 T-box transcription factor 22 protein-coding 149.333-119 chr14 88874828 88875118 + 0.666667 NA intron (NM_001366535, intron 12 of 12) intron (NM_001366535, intron 12 of 12) 50322 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 193.667-58 chr19 27694969 27695365 + 0.666667 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -98264 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 115.667-19 chr10 27987861 27988171 + 0.666667 NA intron (NM_018076, intron 2 of 19) intron (NM_018076, intron 2 of 19) -5006 NM_001312689 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 180.667-47 chr15 94193234 94193656 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -85507 NR_120320 101927112 Hs.134687 NR_120320 ENSG00000259724 LINC01581 - long intergenic non-protein coding RNA 1581 ncRNA 142.667-125 chr20 58547311 58547640 + 0.666667 NA intron (NR_034147, intron 5 of 6) (GAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -32076 NM_001304787 164284 Hs.119286 NM_153360 ENSG00000198768 APCDD1L - APC down-regulated 1 like protein-coding 160.667-294 chr7 138296661 138297056 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -163401 NM_003852 8805 Hs.490287 NM_003852 ENSG00000122779 TRIM24 PTC6|RNF82|TF1A|TIF1|TIF1A|TIF1ALPHA|hTIF1 tripartite motif containing 24 protein-coding 149.667-348 chr6 67226904 67227230 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -828284 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 158.667-93 chr14 33870928 33871356 + 0.666667 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 79932 NM_001308103 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 138-37 chr14 59905193 59905479 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14377 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 202.667-96 chr22 44553917 44554364 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -15200 NR_028409 388910 Hs.332685 NM_001012986 ENSG00000187012 LINC00207 NCRNA00207 long intergenic non-protein coding RNA 207 ncRNA 137.667-37 chr11 80920156 80920426 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -157488 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 172.667-138 chr6 137909804 137910160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35818 NR_149097 105378020 Hs.520420 NR_149097 ENSG00000226004 LINC02528 - long intergenic non-protein coding RNA 2528 ncRNA 113.667-114 chr2 171680361 171680598 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6990 NM_001271786 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 160.667-16 chr1 114550624 114550953 + 0.666667 NA Intergenic LTR86B2|LTR|ERVL 30827 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 192.333-152 chr6 128850083 128850519 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32837 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 146-25 chr13 31974216 31974535 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 57264 NR_103839 100507099 Hs.536364 NR_103839 FRY-AS1 - FRY antisense RNA 1 ncRNA 152-85 chr2 67178586 67178980 + 0.666667 NA intron (NR_038844, intron 3 of 7) MIR|SINE|MIR -34625 NR_110568 101927661 Hs.580508 NR_110568 ENSG00000235885 LOC101927661 - uncharacterized LOC101927661 ncRNA 198.667-74 chr15 95201758 95202077 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 125183 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 113.667-144 chr3 133920845 133921170 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 8805 NR_161373 80111 Hs.287691 NM_025041 ENSG00000174640 C3orf36 - chromosome 3 open reading frame 36 ncRNA 139-4 chr1 95287348 95287699 + 0.666667 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 30740 NR_135588 100996630 Hs.662270 NR_135588 ENSG00000228504 LINC01760 - long intergenic non-protein coding RNA 1760 ncRNA 181.667-44 chr15 101200180 101200571 + 0.666667 NA intron (NM_014918, intron 2 of 2) MIRc|SINE|MIR 51673 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 121-101 chr4 7975226 7975499 + 0.666667 NA intron (NM_001130084, intron 19 of 19) L3|LINE|CR1 30019 NR_029511 407052 NR_029511 ENSG00000207807 MIR95 MIRN95|hsa-mir-95|miR-95 microRNA 95 ncRNA 117.667-141 chr4 103722159 103722465 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2327 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 183-71 chr20 49184866 49185274 + 0.666667 NA intron (NM_004602, intron 1 of 13) intron (NM_004602, intron 1 of 13) 3300 NM_001322932 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 162.333-57 chr12 75758269 75758609 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -246830 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 167.667-63 chr14 86369050 86369404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 434549 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 125.667-144 chr5 32344773 32344961 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -31928 NM_001294343 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 142.333-97 chr16 35441914 35442191 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38544 NR_026980 146481 Hs.316564 NR_026980 FRG2DP - FSHD region gene 2 family member D, pseudogene pseudo 148.333-50 chr10 67063334 67063630 + 0.666667 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) intron (NR_111909, intron 2 of 2) 51216 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 206.667-88 chr3 88626830 88627284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 288601 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 168-27 chr14 20492128 20492486 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18165 NM_001012975 338879 Hs.451057 NM_001012975 ENSG00000182545 RNASE10 RAH1|RNASE9 ribonuclease A family member 10 (inactive) protein-coding 212.667-132 chr8 54650167 54650713 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 34344 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 124.667-110 chr2 155174571 155174851 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 476016 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 114.333-209 chr7 105741169 105741351 + 0.666667 NA intron (NM_020725, intron 3 of 11) intron (NM_020725, intron 3 of 11) -62098 NM_138495 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 124.667-147 chr4 31656121 31656435 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 149734 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 215.667-121 chr8 91652743 91653228 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 364695 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 175.667-67 chr2 25668410 25668849 + 0.666667 NA intron (NM_033147, intron 1 of 19) L1MC2|LINE|L1 4948 NM_001351391 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 188-46 chr18 1674729 1675145 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -315308 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 123.333-27 chr10 11745829 11746093 + 0.666667 NA intron (NM_024693, intron 1 of 4) intron (NM_024693, intron 1 of 4) 3579 NM_024693 79746 Hs.22242 NM_024693 ENSG00000134463 ECHDC3 - enoyl-CoA hydratase domain containing 3 protein-coding 197.667-21 chr10 86286250 86286700 + 0.666667 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) intron (NM_017551, intron 2 of 15) -21687 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 158.333-328 chr8 121299308 121299655 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -339865 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 209.667-7 chr1 74273966 74274480 + 0.666667 NA intron (NM_015978, intron 5 of 24) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 38836 NM_015978 51086 Hs.480085 NM_015978 ENSG00000116783 TNNI3K CARK|CCDD TNNI3 interacting kinase protein-coding 129.333-43 chr12 14615228 14615501 + 0.666667 NA intron (NM_004963, intron 25 of 26) intron (NM_004963, intron 25 of 26) -47481 NM_024829 79887 Hs.131933 NM_024829 ENSG00000121316 PLBD1 - phospholipase B domain containing 1 protein-coding 116.667-85 chr18 9218115 9218430 + 0.666667 NA intron (NM_001204056, intron 6 of 11) intron (NM_001204056, intron 6 of 11) 80709 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 154-3 chr1 77892325 77892762 + 0.666667 NA intron (NM_001172309, intron 1 of 11) intron (NM_001172309, intron 1 of 11) -3004 NR_103535 374987 Hs.632414 NM_199343 ENSG00000235927 NEXN-AS1 C1orf118 NEXN antisense RNA 1 ncRNA 124.667-41 chr12 27615700 27615922 + 0.666667 NA intron (NM_001198915, intron 2 of 26) intron (NM_001198915, intron 2 of 26) -80636 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 150.333-270 chr3 103897720 103898140 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -373814 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 135-103 chr7 91836716 91837053 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 43818 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 195-75 chr3 132481621 132482068 + 0.666667 NA intron (NM_001329126, intron 27 of 56) intron (NM_001329126, intron 27 of 56) 64342 NM_015268 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 134.333-19 chr10 54888707 54888959 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) L1ME1|LINE|L1 -87542 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 123-91 chr4 183110506 183110779 + 0.666667 NA intron (NM_024949, intron 1 of 22) intron (NM_024949, intron 1 of 22) 11385 NM_024949 80014 Hs.333179 NM_024949 ENSG00000151718 WWC2 BOMB WW and C2 domain containing 2 protein-coding 159.667-3 chr1 27430930 27431261 + 0.666667 NA intron (NM_006990, intron 1 of 8) intron (NM_006990, intron 1 of 8) 38473 NM_005281 2827 Hs.66542 NM_005281 ENSG00000181773 GPR3 ACCA G protein-coupled receptor 3 protein-coding 120-147 chr9 99875348 99875620 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 31117 NR_038853 441461 Hs.163155 NR_038853 ENSG00000255145 STX17-AS1 - STX17 antisense RNA 1 ncRNA 120.667-180 chrX 65370037 65370378 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118528 NM_001010888 340554 Hs.21249 NM_001010888 ENSG00000102053 ZC3H12B CXorf32|MCPIP2 zinc finger CCCH-type containing 12B protein-coding 159.667-189 chr20 10560461 10560808 + 0.666667 NA intron (NM_001009608, intron 3 of 7) intron (NM_001009608, intron 3 of 7) 89061 NR_106930 102465525 NR_106930 ENSG00000273745 MIR6870 hsa-mir-6870 microRNA 6870 ncRNA 182.333-61 chr16 66580714 66581094 + 0.666667 NA intron (NM_144673, intron 2 of 3) intron (NM_144673, intron 2 of 3) 1441 NM_001199317 146225 Hs.195685 NM_144673 ENSG00000140932 CMTM2 CKLFSF2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 2 protein-coding 117.333-15 chr1 170157554 170157843 + 0.666667 NA intron (NM_001136107, intron 1 of 3) intron (NM_001136107, intron 1 of 3) -6236 NR_036064 100422839 NR_036064 ENSG00000283340 MIR3119-1 - microRNA 3119-1 ncRNA 128.667-67 chr15 86800333 86800584 + 0.666667 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -132422 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 135.333-24 chr10 81991962 81992217 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 114402 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 141.333-48 chr12 56646298 56646569 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001686) promoter-TSS (NM_001686) -449 NM_001686 506 Hs.406510 NM_001686 ENSG00000110955 ATP5F1B ATP5B|ATPMB|ATPSB|HEL-S-271 ATP synthase F1 subunit beta protein-coding 112.667-174 chr3 103044024 103044317 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 479946 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 114-131 chr6 23489815 23490049 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -636283 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 123.333-187 chr6 135126995 135127290 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -54166 NM_001161656 4602 Hs.606320 NM_005375 ENSG00000118513 MYB Cmyb|c-myb|c-myb_CDS|efg MYB proto-oncogene, transcription factor protein-coding 184.333-23 chr12 16099082 16099422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 178433 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 158.333-37 chr10 69160846 69161230 + 0.666667 NA intron (NM_001035260, intron 5 of 7) intron (NM_001035260, intron 5 of 7) -19196 NR_136626 6832 Hs.106469 NM_003171 ENSG00000156502 SUPV3L1 SUV3 Suv3 like RNA helicase protein-coding 157-108 chr5 154205637 154205954 + 0.666667 NA intron (NM_198321, intron 1 of 11) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 15062 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 129.667-183 chr9 28573813 28574132 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 145333 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 133.333-61 chr16 49824835 49825172 + 0.666667 NA intron (NM_001271620, intron 1 of 7) intron (NM_001271620, intron 1 of 7) -2265 NM_015069 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 135.667-121 chr3 103608047 103608299 + 0.666667 NA Intergenic L1M2b|LINE|L1 -84057 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 119.333-16 chr1 210581292 210581608 + 0.666667 NA intron (NM_001122834, intron 9 of 11) intron (NM_001122834, intron 9 of 11) 252084 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 116.333-66 chr14 64470829 64471138 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004857, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_004857, exon 2 of 2) 5484 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 170.667-154 chr7 26370595 26370934 + 0.666667 NA intron (NM_001318199, intron 5 of 6) intron (NM_001318199, intron 5 of 6) 5505 NR_136271 105375304 Hs.735352 NR_136270 ENSG00000225792 LOC105375304 - uncharacterized LOC105375304 ncRNA 160.333-42 chr10 51037131 51037490 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 1 of 17) AluJr|SINE|Alu 31242 NR_120678 102724719 NR_120678 ENSG00000223502 LOC102724719 - uncharacterized LOC102724719 ncRNA 181.667-22 chr11 87192715 87193141 + 0.666667 NA intron (NR_033149, intron 4 of 13) AluSz|SINE|Alu 154994 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 192-138 chr7 70386758 70387327 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) L2a|LINE|L2 -745102 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 138.333-143 chr5 35837645 35837926 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -19106 NR_120485 3575 Hs.591742 NM_002185 ENSG00000168685 IL7R CD127|CDW127|IL-7R-alpha|IL7RA|ILRA interleukin 7 receptor protein-coding 208-4 chr1 66222455 66222961 + 0.666667 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR -109400 NM_001037339 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 132.667-35 chr12 13528373 13528648 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -151765 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 116.333-83 chr16 77073665 77073979 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -117368 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 120.667-156 chr7 21612193 21612388 + 0.666667 NA intron (NM_001277115, intron 20 of 81) AluY|SINE|Alu 69251 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 129-97 chr5 43527817 43528151 + 0.666667 NA intron (NM_006451, intron 10 of 10) intron (NM_006451, intron 10 of 10) -12836 NM_198566 375444 Hs.661641 NM_198566 ENSG00000172244 C5orf34 - chromosome 5 open reading frame 34 protein-coding 122.667-106 chr20 61085104 61085460 + 0.666667 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 6218 NR_109919 100506470 Hs.125674 NR_109919 ENSG00000229606 LINC01718 - long intergenic non-protein coding RNA 1718 ncRNA 144-6 chr1 118339853 118340221 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -154809 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 163-48 chr2 220937138 220937509 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 634981 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 210.333-81 chr2 105515964 105516515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77726 NM_201557 2274 Hs.443687 NM_001450 ENSG00000115641 FHL2 AAG11|DRAL|FHL-2|SLIM-3|SLIM3 four and a half LIM domains 2 protein-coding 178-100 chr5 171716249 171716727 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -69384 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 155-92 chr3 96361779 96362145 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 1998 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 163.333-50 chr11 26260855 26261192 + 0.666667 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) 26984 NR_132968 105376599 Hs.125537 NR_132968 ENSG00000254819 ANO3-AS1 - ANO3 antisense RNA 1 ncRNA 148.667-332 chr6 51627782 51628082 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 65 of 66) L2a|LINE|L2 6062 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 138-106 chr7 18198392 18198688 + 0.666667 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) intron (NM_001321872, intron 2 of 11) -71231 NR_031635 100302140 NR_031635 ENSG00000221393 MIR1302-6 MIRN1302-6|hsa-mir-1302-6 microRNA 1302-6 ncRNA 255.667-62 chr4 41025078 41025598 + 0.666667 NA intron (NM_173075, intron 5 of 16) L1PA14|LINE|L1 -168146 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 134.667-186 chr7 83391470 83391840 + 0.666667 NA intron (NM_001178129, intron 14 of 16) intron (NM_001178129, intron 14 of 16) -228771 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 269-3 chr1 112185700 112186458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 195543 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 137-7 chr1 211331551 211331804 + 0.666667 NA intron (NM_001319207, intron 1 of 10) AluSq|SINE|Alu 4844 NM_001033910 7188 Hs.523930 NM_004619 ENSG00000082512 TRAF5 MGC:39780|RNF84 TNF receptor associated factor 5 protein-coding 222.333-92 chr8 78499584 78500098 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -16499 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 131.667-112 chr20 57549314 57549627 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11640 NM_002591 5105 Hs.1872 NM_002591 ENSG00000124253 PCK1 PCKDC|PEPCK-C|PEPCK1|PEPCKC phosphoenolpyruvate carboxykinase 1 protein-coding 120.333-201 chr9 86793102 86793373 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 154269 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 148-133 chr5 68154584 68154877 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35146 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 263-4 chr1 115531254 115532035 + 0.666667 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 -110326 NM_138959 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 219.667-3 chr1 150163739 150164174 + 0.666667 NA intron (NR_135098, intron 1 of 3) intron (NR_135098, intron 1 of 3) 3228 NR_135098 105371433 Hs.599366 NR_135098 LOC105371433 - uncharacterized LOC105371433 ncRNA 146.333-101 chr15 42808452 42808829 + 0.666667 NA intron (NM_173500, intron 9 of 14) AluJr|SINE|Alu -71512 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 268-48 chr5 164321275 164321829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145850 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 205.667-140 chr9 115229890 115230332 + 0.666667 NA intron (NR_163556, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 88293 NR_163556 50514 Hs.148841 NM_017418 ENSG00000173077 DEC1 CTS9 deleted in esophageal cancer 1 ncRNA 208.667-38 chr12 53573194 53573662 + 0.666667 NA intron (NR_073163, intron 2 of 12) MER2B|DNA|TcMar-Tigger 52562 NM_001366562 11016 Hs.12286 NM_006856 ENSG00000170653 ATF7 ATFA activating transcription factor 7 protein-coding 202.333-86 chr2 51622592 51622997 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 590193 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 187-74 chr6 120215978 120216478 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 201049 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 210.333-84 chr2 141542616 141543062 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) intron (NM_018557, intron 2 of 90) 588862 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 176.333-38 chr12 114745196 114745579 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61212 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 125.667-142 chr4 175732545 175732812 + 0.666667 NA intron (NM_201592, intron 1 of 6) intron (NM_201592, intron 1 of 6) 54998 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 138-39 chr14 96352197 96352476 + 0.666667 NA intron (NM_018036, intron 1 of 41) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 11005 NM_018036 55102 Hs.168241 NM_018036 ENSG00000066739 ATG2B C14orf103 autophagy related 2B protein-coding 174.333-104 chr4 85036950 85037318 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69650 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 137-93 chr6 149722135 149722417 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4020 NM_001270519 9113 Hs.549084 NM_004690 ENSG00000131023 LATS1 WARTS|wts large tumor suppressor kinase 1 protein-coding 132.333-119 chr4 42023376 42023768 + 0.666667 NA intron (NM_006345, intron 6 of 17) intron (NM_006345, intron 6 of 17) 33042 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 178.333-79 chr2 101735834 101736250 + 0.666667 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) intron (NM_145686, intron 2 of 30) 38335 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 135.333-171 chr7 34811086 34811454 + 0.666667 NA intron (NM_207172, intron 3 of 8) LTR1B|LTR|ERV1 23061 NR_015356 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 116.667-75 chr17 19832473 19832671 + 0.666667 NA intron (NM_014683, intron 10 of 26) L1M4a2|LINE|L1 35364 NM_001142610 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 143-94 chr5 52118721 52119103 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 110881 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 111.667-215 chr6 4902185 4902373 + 0.666667 NA intron (NM_001368126, intron 2 of 6) AluSp|SINE|Alu 12239 NM_001143971 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 119-124 chr5 99448859 99449195 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -84963 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 187.333-132 chr3 103773965 103774376 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -250054 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 169-103 chr8 124087377 124087753 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 33 of 40) L1MA3|LINE|L1 -46783 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 167-101 chr8 85346003 85346343 + 0.666667 NA intron (NM_001128830, intron 1 of 8) intron (NM_001128830, intron 1 of 8) -4459 NM_001164830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 240-10 chr10 81148329 81148762 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 498748 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 115-54 chr13 89307674 89307966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70930 NR_131229 105616982 Hs.564527 NR_131229 ENSG00000232225 LINC01047 - long intergenic non-protein coding RNA 1047 ncRNA 161-107 chr9 98923272 98923749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20397 NM_001855 1306 Hs.409034 NM_001855 ENSG00000204291 COL15A1 - collagen type XV alpha 1 chain protein-coding 137.333-208 chrX 28304521 28304756 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 191025 NR_106750 102465140 NR_106750 ENSG00000277569 MIR6134 hsa-mir-6134 microRNA 6134 ncRNA 132.667-8 chr1 154395999 154396308 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9040 NM_001206866 3570 Hs.135087 NM_000565 ENSG00000160712 IL6R CD126|IL-6R-1|IL-6RA|IL6Q|IL6RA|IL6RQ|gp80 interleukin 6 receptor protein-coding 150.667-73 chr11 87691724 87692028 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 27535 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 118-70 chr2 129677095 129677294 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 200297 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 129-104 chr5 102857735 102858036 + 0.666667 NA intron (NM_001364582, intron 1 of 24) intron (NM_001364582, intron 1 of 24) -7938 NR_033440 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 162.333-76 chr14 71000713 71001093 + 0.666667 NA intron (NM_014982, intron 8 of 35) MIR|SINE|MIR 93444 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 185.333-142 chr4 112460881 112461288 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -54295 NR_161159 105377372 NR_161159 LOC105377372 - uncharacterized LOC105377372 ncRNA 129-61 chr2 105798445 105798708 + 0.666667 NA intron (NM_003581, intron 1 of 4) intron (NM_003581, intron 1 of 4) -53271 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 127.333-50 chr14 62276470 62276823 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -136673 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 201.667-93 chr5 37537539 37537905 + 0.666667 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) intron (NM_001345998, intron 9 of 17) 158404 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 128.333 chr1 16308628 16308904 + 0.666667 NA intron (NM_018994, intron 2 of 9) AluSz|SINE|Alu 43714 NM_018994 54455 Hs.522384 NM_018994 ENSG00000037637 FBXO42 Fbx42|JFK F-box protein 42 protein-coding 170.667-167 chr8 120900223 120900706 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -88418 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 150.333-276 chr3 136452141 136452443 + 0.666667 NA intron (NM_005862, intron 13 of 33) AluY|SINE|Alu 201952 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 137-94 chr6 156902644 156903025 + 0.666667 NA intron (NM_020732, intron 4 of 19) intron (NM_020732, intron 4 of 19) -123103 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 204.667-71 chr2 40726814 40727256 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -214600 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 131.667-13 chr1 198094899 198095218 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61940 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 170-46 chr16 79849513 79849918 + 0.666667 NA Intergenic LTR103b_Mam|LTR|ERV1? 54466 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 120.333-117 chr20 32172797 32173061 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 17431 NR_002781 128854 Hs.647447 NR_002781 ENSG00000235217 TSPY26P TSPYL3|bA392M18.1 testis specific protein Y-linked 26, pseudogene pseudo 129.333-30 chr10 120233452 120233782 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121606 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 151.333-59 chr10 77121154 77121450 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 5 of 28) intron (NM_001271519, intron 5 of 28) -19529 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 146.333-62 chr12 30810932 30811265 + 0.666667 NA Intergenic (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 15417 NR_040245 100287314 Hs.355210 NR_040245 LINC00941 lncRNA-MUF long intergenic non-protein coding RNA 941 ncRNA 216-88 chr4 44175677 44176219 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 158886 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 120.667-35 chr12 1236849 1237114 + 0.666667 NA intron (NR_027946, intron 13 of 18) (TTTCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 209233 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 140.667-136 chr21 29649691 29649996 + 0.666667 NA intron (NM_000830, intron 6 of 16) intron (NM_000830, intron 6 of 16) 53803 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 129-65 chr2 171704916 171705241 + 0.666667 NA intron (NM_001271788, intron 3 of 15) intron (NM_001271788, intron 3 of 15) 17323 NM_001320884 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 162.667-292 chr9 28745211 28745491 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -26046 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 123.667-126 chr3 113756909 113757184 + 0.666667 NA intron (NM_001690, intron 1 of 14) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 10011 NM_001690 523 Hs.477155 NM_001690 ENSG00000114573 ATP6V1A ARCL2D|ATP6A1|ATP6V1A1|HO68|IECEE3|VA68|VPP2|Vma1 ATPase H+ transporting V1 subunit A protein-coding 157-114 chr6 70107070 70107522 + 0.666667 NA intron (NM_001858, intron 16 of 50) intron (NM_001858, intron 16 of 50) 175901 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 139-21 chr11 90567141 90567454 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 2 of 6) intron (NR_104190, intron 2 of 6) -11440 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 173.667-87 chr2 122755838 122756259 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 317433 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 169-86 chr5 154666533 154667020 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -16203 NM_001367714 23367 Hs.292078 NM_015315 ENSG00000155506 LARP1 LARP La ribonucleoprotein domain family member 1 protein-coding 131-110 chr9 36978929 36979250 + 0.666667 NA intron (NM_001280554, intron 4 of 8) intron (NM_001280554, intron 4 of 8) 55179 NM_001280548 5079 Hs.654464 NM_016734 ENSG00000196092 PAX5 ALL3|BSAP paired box 5 protein-coding 127-47 chr2 64445462 64445678 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8592 NM_014181 29094 Hs.372208 NM_014181 ENSG00000119862 LGALSL GRP|HSPC159 galectin like protein-coding 122.667 chr1 22095681 22095902 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001791, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001791, exon 6 of 6) 43082 NM_001039802 998 Hs.467637 NM_001791 ENSG00000070831 CDC42 CDC42Hs|G25K|TKS cell division cycle 42 protein-coding 156.667-36 chr1 246705205 246705607 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19003 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 154.667-303 chr5 22541337 22541690 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 311831 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 262-54 chr3 61329453 61329945 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78238 NR_148921 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 170.667-25 chr11 23964554 23964888 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -532332 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 147.333-36 chr10 28956371 28956743 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 110149 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 178.333-46 chr13 79035280 79035785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -195482 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 127.333-23 chr10 51199005 51199376 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) -100383 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 163.333-103 chr15 83839743 83840132 + 0.666667 NA intron (NM_207517, intron 7 of 29) L1MEg|LINE|L1 185814 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 152.667-300 chr5 102602843 102603155 + 0.666667 NA intron (NR_047462, intron 1 of 1) L1PREC2|LINE|L1 21631 NR_047462 100861468 Hs.519483 NR_047462 ENSG00000250958 LINC00492 - long intergenic non-protein coding RNA 492 ncRNA 175-64 chr4 109893445 109893707 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -19307 NM_001963 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 177.667-13 chr1 218128506 218128849 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 85172 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 159.667-221 chr3 172379631 172380005 + 0.666667 NA intron (NM_001135095, intron 24 of 25) intron (NM_001135095, intron 24 of 25) 68638 NM_004122 2693 Hs.130212 NM_004122 ENSG00000121853 GHSR GHDP growth hormone secretagogue receptor protein-coding 120.333-43 chr12 55393629 55393944 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6743 NM_001005518 403282 Hs.554553 NM_001005518 ENSG00000205328 OR6C65 - olfactory receptor family 6 subfamily C member 65 protein-coding 121-66 chr2 44325387 44325660 + 0.666667 NA intron (NM_006036, intron 10 of 13) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 34226 NM_001042386 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 186.667-51 chr17 2059080 2059592 + 0.666667 NA TTS (NM_001282326) TTS (NM_001282326) 3026 NM_001098202 3090 Hs.72956 NM_006497 ENSG00000177374 HIC1 ZBTB29|ZNF901|hic-1 HIC ZBTB transcriptional repressor 1 protein-coding 150.333-307 chr4 83744844 83745211 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 208919 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 144.333-137 chr2 146976493 146976826 + 0.666667 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL 389602 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 152.333-74 chr12 8455442 8455726 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001317999) promoter-TSS (NM_001317999) -378 NM_001317999 93978 Hs.591147 NM_001007033 ENSG00000205846 CLEC6A CLEC4N|CLECSF10|dectin-2 C-type lectin domain containing 6A protein-coding 170.333-189 chr6 144463336 144463652 + 0.666667 NA intron (NM_007124, intron 22 of 73) intron (NM_007124, intron 22 of 73) 57839 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 112-57 chr14 51277794 51278030 + 0.666667 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL 37665 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 164-17 chr10 89261021 89261339 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9141 NM_001288979 3988 Hs.643030 NM_000235 ENSG00000107798 LIPA CESD|LAL lipase A, lysosomal acid type protein-coding 167.333-100 chr16 52042616 52043072 + 0.666667 NA intron (NM_001242473, intron 2 of 5) L1MA9|LINE|L1 31091 NM_001242473 388276 Hs.534669 NM_001242473 C16orf97 - chromosome 16 open reading frame 97 protein-coding 132.333-185 chr8 138089665 138089945 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -6260 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 136.333-138 chr4 7953636 7953910 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13847 NM_001134647 60312 Hs.529369 NM_021638 ENSG00000196526 AFAP1 AFAP|AFAP-110|AFAP110 actin filament associated protein 1 protein-coding 147.667-78 chr12 79026740 79027022 + 0.666667 NA intron (NM_001291901, intron 2 of 9) L1M2|LINE|L1 -18811 NM_001135806 6857 Hs.310545 NM_005639 ENSG00000067715 SYT1 BAGOS|P65|SVP65|SYT synaptotagmin 1 protein-coding 118.333-201 chr8 22379267 22379571 + 0.666667 NA intron (NM_001135153, intron 1 of 8) intron (NM_001135153, intron 1 of 8) 11881 NM_001135153 23516 Hs.491232 NM_015359 ENSG00000104635 SLC39A14 HCIN|HMNDYT2|LZT-Hs4|NET34|ZIP14|cig19 solute carrier family 39 member 14 protein-coding 165-14 chr11 102204741 102205171 + 0.666667 NA intron (NM_001130145, intron 4 of 8) intron (NM_001130145, intron 4 of 8) 92508 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 124.667-33 chr10 113714116 113714386 + 0.666667 NA intron (NM_001267058, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 4906 NM_001267058 840 Hs.9216 NM_001227 ENSG00000165806 CASP7 CASP-7|CMH-1|ICE-LAP3|LICE2|MCH3 caspase 7 protein-coding 224.667-25 chr14 75346340 75346857 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 52194 NR_038421 731223 Hs.534624 NR_038421 LINC01220 - long intergenic non-protein coding RNA 1220 ncRNA 211.333-4 chr1 43872767 43873233 + 0.666667 NA intron (NR_073021, intron 6 of 9) L2a|LINE|L2 34378 NR_106727 102464830 NR_106727 ENSG00000283477 MIR6079 hsa-mir-6079 microRNA 6079 ncRNA 165-40 chr2 125534496 125534865 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 583305 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 153.333-36 chr1 245293992 245294295 + 0.666667 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 -59626 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 116.667-40 chr12 114604476 114604811 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 79532 NM_005996 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 118.333-197 chr7 104183880 104184153 + 0.666667 NA exon (NM_002553, exon 8 of 14) exon (NM_002553, exon 8 of 14) 23997 NM_002553 5001 Hs.432948 NM_002553 ENSG00000164815 ORC5 ORC5L|ORC5P|ORC5T|PPP1R117 origin recognition complex subunit 5 protein-coding 131-32 chr14 89988326 89988589 + 0.666667 NA intron (NM_001008744, intron 9 of 15) MER21B|LTR|ERVL 32530 NM_001330205 55775 Hs.209945 NM_018319 ENSG00000042088 TDP1 - tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 protein-coding 111.667-23 chr10 13457216 13457511 + 0.666667 NA intron (NM_001370075, intron 5 of 8) intron (NM_001370075, intron 5 of 8) 45613 NM_152751 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 170.333-226 chr9 23754504 23754963 + 0.666667 NA intron (NM_004432, intron 2 of 6) AluSx|SINE|Alu 66576 NM_001351465 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 218.333-68 chr2 61260220 61260827 + 0.666667 NA intron (NM_014709, intron 43 of 79) intron (NM_014709, intron 43 of 79) 83105 NR_152216 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 127.667-4 chr1 75029532 75029803 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -98767 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 174.667-161 chr7 51239287 51239617 + 0.666667 NA intron (NM_015198, intron 1 of 12) MER41B|LTR|ERV1 77357 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 277.333-47 chr2 117171741 117172325 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -642658 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 263-33 chr2 171208151 171208693 + 0.666667 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) intron (NM_001136554, intron 1 of 20) 22871 NM_001136554 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 165-41 chr2 127851382 127851716 + 0.666667 NA intron (NM_004805, intron 2 of 3) FLAM_C|SINE|Alu 6606 NM_004805 5433 Hs.715348 NM_004805 ENSG00000144231 POLR2D HSRBP4|HSRPB4|RBP4|RPB16 RNA polymerase II subunit D protein-coding 174-39 chr15 90787427 90787785 + 0.666667 NA intron (NM_001287246, intron 15 of 22) L1M6|LINE|L1 70260 NM_001287246 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 154.333-125 chr17 68863718 68864092 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 91487 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 117.667-105 chr2 206215060 206215254 + 0.666667 NA intron (NM_005279, intron 1 of 2) intron (NM_005279, intron 1 of 2) -1529 NM_001261455 2825 Hs.184907 NM_005279 ENSG00000183671 GPR1 - G protein-coupled receptor 1 protein-coding 120-134 chr8 55998321 55998552 + 0.666667 NA exon (NM_001111097, exon 11 of 13) exon (NM_001111097, exon 11 of 13) 75465 NR_002437 26795 NR_002437 ENSG00000238650 SNORD54 RNU54|U54 small nucleolar RNA, C/D box 54 snoRNA 144.333-18 chr1 217895387 217895667 + 0.666667 NA intron (NR_048550, intron 1 of 3) LTR78|LTR|ERV1 2627 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 163.667-55 chr14 25144559 25144899 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -94432 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 128.667-80 chr18 10908029 10908272 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 4 of 51) intron (NM_022068, intron 4 of 51) -148501 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 119.333-124 chr2 35920546 35920871 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 434862 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 155.667-110 chr15 45742015 45742331 + 0.666667 NA intron (NR_135680, intron 1 of 4) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 36978 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 129.333-175 chr7 54350463 54350712 + 0.666667 NA TTS (NR_120515) TTS (NR_120515) 19890 NR_120516 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 150.667-399 chr9 96586468 96586760 + 0.666667 NA intron (NR_147239, intron 1 of 14) AluJr|SINE|Alu -19638 NM_001351570 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 132.333-76 chr2 24311327 24311644 + 0.666667 NA intron (NM_001348182, intron 5 of 38) AluJr4|SINE|Alu 49051 NM_019595 50618 Hs.432562 NM_006277 ENSG00000198399 ITSN2 PRO2015|SH3D1B|SH3P18|SWA|SWAP intersectin 2 protein-coding 147-71 chr2 123737123 123737411 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 287907 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 141-49 chr22 26729872 26730235 + 0.666667 NA intron (NR_110543, intron 2 of 5) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 57210 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 169.333-82 chr14 62452298 62452552 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -312452 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 236.333-17 chr11 9691721 9692298 + 0.666667 NA intron (NM_015055, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 27932 NM_015055 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 142.333-102 chr17 60628195 60628616 + 0.666667 NA intron (NM_003620, intron 2 of 5) L1MC1|LINE|L1 28222 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 182.333-125 chr5 58394434 58394742 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65498 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 159.333-337 chr8 120531689 120531993 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL 86422 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 156-24 chr11 20089735 20090105 + 0.666667 NA intron (NM_182964, intron 26 of 37) intron (NM_182964, intron 26 of 37) -40617 NR_046672 100874014 Hs.557916 NR_046672 ENSG00000254453 NAV2-AS2 - NAV2 antisense RNA 2 ncRNA 209.333-121 chr2 125397912 125398368 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 719845 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 111.667-213 chr5 174009880 174010148 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 20844 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 141.333-14 chr1 234290530 234290853 + 0.666667 NA intron (NM_173508, intron 3 of 7) intron (NM_173508, intron 3 of 7) -15776 NR_039818 100616380 NR_039818 ENSG00000264377 MIR4671 - microRNA 4671 ncRNA 143-66 chr2 49500721 49501012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -346339 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 114.333-137 chr21 35600314 35600599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19692 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 147.667-163 chr2 22792123 22792448 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 255806 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 114.667-42 chr11 6352308 6352610 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -31958 NM_145040 112464 Hs.434044 NM_145040 ENSG00000170955 CAVIN3 HSRBC|PRKCDBP|SRBC|cavin-3 caveolae associated protein 3 protein-coding 130.667-17 chr1 215903071 215903447 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 38 of 71) L2-3_Crp|LINE|L2 -169206 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 146.333-193 chr3 4650707 4651085 + 0.666667 NA intron (NM_001168272, intron 10 of 60) L1MEc|LINE|L1 100694 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 189-55 chr21 32143809 32144296 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57757 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 168-14 chr10 126792277 126792546 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -112998 NM_001380 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 134-63 chr3 12552204 12552447 + 0.666667 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -4689 NM_001271707 23609 Hs.591666 NM_014160 ENSG00000075975 MKRN2 HSPC070|RNF62 makorin ring finger protein 2 protein-coding 130.333-18 chr1 194920628 194920980 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1167911 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 204.333-156 chr5 45278074 45278529 + 0.666667 NA intron (NM_021072, intron 6 of 7) intron (NM_021072, intron 6 of 7) 418079 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 279-9 chr13 102339878 102340336 + 0.666667 NA intron (NM_001321941, intron 1 of 5) intron (NM_001321941, intron 1 of 5) -22403 NM_001321935 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 122.667-122 chr3 116738222 116738530 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 28588 NR_015391 285194 Hs.120364 NR_015391 TUSC7 LINC00902|LSAMP-AS1|LSAMP-AS3|LSAMPAS3|NCRNA00295 tumor suppressor candidate 7 ncRNA 112.333-266 chr8 121701767 121702039 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -60463 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 119.333-39 chr10 86274958 86275263 + 0.666667 NA intron (NM_017551, intron 2 of 15) L1M4|LINE|L1 -10322 NR_029907 442911 NR_029907 ENSG00000199104 MIR346 MIRN346|hsa-mir-346|miR-346|miRNA346 microRNA 346 ncRNA 201.667-125 chr8 136710689 136711117 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 180105 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 178.667-54 chr15 58447891 58448357 + 0.666667 NA intron (NR_120338, intron 2 of 2) intron (NR_120338, intron 2 of 2) 16133 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 146.333-272 chr5 130944536 130944828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 220574 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 126.333-177 chr8 63036323 63036544 + 0.666667 NA intron (NM_003878, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 2373 NM_003878 8836 Hs.78619 NM_003878 ENSG00000137563 GGH GH gamma-glutamyl hydrolase protein-coding 128.667-5 chr1 74022505 74022817 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 175515 NM_001105659 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 172.333-99 chr22 25729521 25729837 + 0.666667 NA TTS (NM_005160) TTS (NM_005160) -12509 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 133.667-90 chr3 5547133 5547446 + 0.666667 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -297034 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 131-65 chr3 144943135 144943524 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 970248 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 194-3 chr1 204516440 204516857 + 0.666667 NA intron (NM_001278517, intron 1 of 7) CpG 242 NM_002393 4194 Hs.497492 NM_002393 ENSG00000198625 MDM4 HDMX|MDMX|MRP1 MDM4 regulator of p53 protein-coding 242.333-87 chr6 55473378 55473834 + 0.666667 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) L1ME3A|LINE|L1 105608 NR_109869 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 178-42 chr14 48929932 48930311 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 656259 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 119-53 chr15 58991864 58992182 + 0.666667 NA intron (NM_001270530, intron 1 of 13) L1MC5a|LINE|L1 3877 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 184.333-163 chr9 31003835 31004203 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 377471 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 176-110 chrX 84325667 84326038 + 0.666667 NA intron (NM_001177478, intron 9 of 9) intron (NM_001177478, intron 9 of 9) -100024 NR_031690 100302191 NR_031690 ENSG00000221494 MIR548I4 MIR548I-4|MIRN548I4|hsa-mir-548i-4 microRNA 548i-4 ncRNA 147-129 chr7 3740591 3740888 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) L1MA9|LINE|L1 -388946 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 201-3 chr1 59539688 59540268 + 0.666667 NA intron (NM_001278224, intron 1 of 9) L1ME3|LINE|L1 24348 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 213.666-2 chr1 25533107 25533705 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10179 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 137-6 chr1 119627172 119627443 + 0.666667 NA intron (NM_001080470, intron 1 of 2) intron (NM_001080470, intron 1 of 2) 20959 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 124.333-104 chr20 11844280 11844479 + 0.666667 NA intron (NR_110635, intron 1 of 1) intron (NR_110635, intron 1 of 1) 26336 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 133.667-126 chr5 180239601 180239989 + 0.666667 NA intron (NM_001364608, intron 11 of 12) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie -30584 NM_175062 255426 Hs.190559 NM_175062 ENSG00000146090 RASGEF1C - RasGEF domain family member 1C protein-coding 118.333-188 chr7 4656178 4656468 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25972 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 156.667-346 chr8 134112359 134112700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 226033 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 163.333-239 chr6 37306381 37306765 + 0.666667 NA intron (NR_130108, intron 8 of 12) intron (NR_130108, intron 8 of 12) -47410 NM_183078 9025 Hs.485278 NM_003958 ENSG00000112130 RNF8 hRNF8 ring finger protein 8 protein-coding 112.667-64 chr14 45337562 45337806 + 0.666667 NA Intergenic MER72B|LTR|ERV1 -84482 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 166.333-250 chrX 100557471 100557756 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -27323 NM_022144 64102 Hs.132957 NM_022144 ENSG00000000005 TNMD BRICD4|CHM1L|TEM tenomodulin protein-coding 134.667-211 chrX 98316429 98316798 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -752078 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 117-5 chr1 103052390 103052659 + 0.666667 NA intron (NM_001854, intron 4 of 66) intron (NM_001854, intron 4 of 66) 55972 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 197.333-231 chr8 80633086 80633469 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 147051 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 138-129 chr9 93646293 93646674 + 0.666667 NA intron (NM_005392, intron 4 of 21) intron (NM_005392, intron 4 of 21) 51642 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 121-15 chr10 62238286 62238529 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001282941, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001282941, exon 5 of 5) 30437 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 198.667-58 chr14 52543939 52544292 + 0.666667 NA intron (NM_001160047, intron 2 of 20) intron (NM_001160047, intron 2 of 20) 8390 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 182.667-145 chr6 46881392 46881769 + 0.666667 NA exon (NM_015234, exon 8 of 21) exon (NM_015234, exon 8 of 21) -21891 NR_110658 101926962 Hs.680113 NR_110658 LOC101926962 - uncharacterized LOC101926962 ncRNA 150.667-65 chr11 43898914 43899324 + 0.666667 NA non-coding (NR_026952, exon 1 of 1) non-coding (NR_026952, exon 1 of 1) 1816 NR_026952 729799 Hs.368920 NR_026952 ENSG00000213693 SEC14L1P1 - SEC14 like 1 pseudogene 1 pseudo 173.667-154 chr6 120668426 120668778 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 653423 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 214.667-104 chr7 6208079 6208509 + 0.666667 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) intron (NM_001367581, intron 1 of 13) -36157 NM_001367582 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 132.333-88 chr2 126327134 126327388 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -209276 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 154.333-332 chr8 29714546 29714853 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 33410 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 245-44 chr20 53360230 53360698 + 0.666667 NA intron (NM_173485, intron 2 of 2) L2b|LINE|L2 175181 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 114.667-76 chr14 35769828 35770054 + 0.666667 NA intron (NM_014990, intron 4 of 40) L1M4|LINE|L1 -7010 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 211.333-186 chr5 93559473 93559919 + 0.666667 NA intron (NR_109819, intron 2 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 11647 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 162-13 chr10 28099018 28099421 + 0.666667 NA intron (NR_134518, intron 10 of 16) intron (NR_134518, intron 10 of 16) -25841 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 177.666-12 chr2 217513752 217514274 + 0.666667 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) AluSg|SINE|Alu 231280 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 169.333-25 chr10 50219674 50220153 + 0.666667 NA intron (NM_001143974, intron 6 of 18) MER102a|DNA|hAT-Charlie 28697 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 264.667-53 chr3 69613972 69614443 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -125257 NM_001354605 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 137-100 chr7 69999961 70000351 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger 401681 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 173.667-80 chr2 73449025 73449452 + 0.666667 NA exon (NM_015120, exon 8 of 23) exon (NM_015120, exon 8 of 23) -7865 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 139.333-207 chr7 128334984 128335391 + 0.666667 NA intron (NM_018077, intron 8 of 18) intron (NM_018077, intron 8 of 18) 8721 NM_018077 55131 Hs.274263 NM_018077 ENSG00000106344 RBM28 ANES RNA binding motif protein 28 protein-coding 113.333-44 chr11 35562045 35562308 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31876 NM_001282675 25891 Hs.55044 NM_015430 ENSG00000149090 PAMR1 DKFZP586H2123|FP938|RAMP peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1 protein-coding 139.667-186 chr8 83991454 83991701 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -191210 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 175-21 chr14 51669545 51669881 + 0.666667 NA intron (NM_001267046, intron 1 of 13) L1ME1|LINE|L1 17803 NM_152330 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 166-24 chr10 77640534 77641015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2966 NM_001271521 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 176.666-11 chr16 13417418 13417943 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -502477 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 145.667-171 chr3 13178106 13178460 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -104854 NM_001134382 9922 Hs.475506 NM_014869 ENSG00000144711 IQSEC1 ARF-GEP100|ARFGEP100|BRAG2|GEP100 IQ motif and Sec7 domain 1 protein-coding 113-178 chr6 62368279 62368469 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -82147 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 224.666-12 chr17 53736397 53737027 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86215 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 118-84 chr22 39150821 39151061 + 0.666667 NA intron (NM_001346744, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 1739 NM_001346743 23492 Hs.356416 NM_175709 ENSG00000100307 CBX7 - chromobox 7 protein-coding 117.667-99 chr2 137366961 137367304 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 12 of 27) intron (NM_001316349, intron 12 of 27) 560800 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 126.333-129 chr4 18741089 18741403 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -719371 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 202-175 chr7 72297897 72298412 + 0.666667 NA intron (NM_001363460, intron 1 of 5) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 39237 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 148.333-217 chr2 229326429 229326819 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -55337 NM_017933 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 114.333-110 chr2 117732710 117732882 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -81895 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 142.667-141 chr3 131172848 131173177 + 0.666667 NA intron (NM_001353043, intron 14 of 17) MER41B|LTR|ERV1 145284 NM_001321223 79858 Hs.657336 NM_024800 ENSG00000114670 NEK11 - NIMA related kinase 11 protein-coding 185.333-73 chr18 13233238 13233647 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) intron (NM_181482, intron 1 of 5) -6101 NR_146617 147276 Hs.675872 NR_146617 ENSG00000279020 C18orf15 HsT3231 chromosome 18 open reading frame 15 (putative) ncRNA 168.333-136 chr3 197294326 197294716 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_039960) promoter-TSS (NR_039960) -573 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 147.667-134 chr17 30188355 30188795 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 47122 NM_001045 6532 Hs.29792 NM_001045 ENSG00000108576 SLC6A4 5-HTT|5-HTTLPR|5HTT|HTT|OCD1|SERT|SERT1|hSERT solute carrier family 6 member 4 protein-coding 135.333-134 chr4 174539167 174539533 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16452 NM_001145816 3248 Hs.596913 NM_000860 ENSG00000164120 HPGD 15-PGDH|PGDH|PGDH1|PHOAR1|SDR36C1 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase protein-coding 150.667-387 chr8 128482501 128482804 + 0.666667 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 82027 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 153.333-50 chr10 65614932 65615377 + 0.666667 NA intron (NR_120647, intron 2 of 5) LTR10E|LTR|ERV1 43729 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 215-35 chr2 83422968 83423485 + 0.666667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -99588 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 128-57 chr20 6739815 6740056 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3799 NR_146909 105372516 Hs.580741 NR_146909 LINC01713 - long intergenic non-protein coding RNA 1713 ncRNA 177-58 chr4 73469281 73469703 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -12253 NM_001133 173 Hs.168718 NM_001133 ENSG00000079557 AFM ALB2|ALBA|ALF afamin protein-coding 112-48 chr12 112038209 112038526 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_037430) promoter-TSS (NR_037430) -652 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 176.333-169 chr8 108634273 108634702 + 0.666667 NA intron (NR_136411, intron 2 of 3) intron (NR_136411, intron 2 of 3) 153107 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 144-37 chr12 26137299 26137593 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12409 NM_030762 79365 Hs.177841 NM_030762 ENSG00000123095 BHLHE41 BHLHB3|DEC2|SHARP1|hDEC2 basic helix-loop-helix family member e41 protein-coding 193-9 chr10 20108387 20108711 + 0.666667 NA intron (NM_032812, intron 4 of 13) intron (NM_032812, intron 4 of 13) 292117 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 173-68 chr5 5004559 5004900 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -29630 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 194-86 chr20 26287616 26288048 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -78599 NR_040095 284801 Hs.370699 NR_040095 ENSG00000227195 MIR663AHG - MIR663A host gene ncRNA 148.333-157 chr16 78448350 78448671 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) LTR73|LTR|ERV1 348856 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 177.667-12 chr1 218031029 218031355 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12313 NR_110794 101929631 Hs.407614 NR_110794 ENSG00000232100 LINC01653 - long intergenic non-protein coding RNA 1653 ncRNA 193.333-121 chr3 70836197 70836623 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 228514 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 178.667-76 chr2 55298927 55299265 + 0.666667 NA intron (NM_001254943, intron 29 of 33) AluSx1|SINE|Alu 16777 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 113.333-3 chr1 51939644 51939900 + 0.666667 NA intron (NM_002867, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu 50928 NM_002867 5865 Hs.123072 NM_002867 ENSG00000169213 RAB3B - RAB3B, member RAS oncogene family protein-coding 122-32 chr14 49741805 49742157 + 0.666667 NA intron (NM_172193, intron 11 of 12) intron (NM_172193, intron 11 of 12) -26172 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 181.667-140 chr8 11591035 11591486 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 14725 NR_040035 83655 Hs.742430 NR_040035 ENSG00000170983 LINC00208 C8orf14|NCRNA00208|VIR35 long intergenic non-protein coding RNA 208 ncRNA 127.667-8 chr1 162075296 162075623 + 0.666667 NA intron (NM_014697, intron 1 of 9) intron (NM_014697, intron 1 of 9) 5768 NM_014697 9722 Hs.731942 NM_014697 ENSG00000198929 NOS1AP 6330408P19Rik|CAPON nitric oxide synthase 1 adaptor protein protein-coding 119.333-127 chr2 71668677 71668884 + 0.666667 NA exon (NM_001130455, exon 48 of 55) exon (NM_001130455, exon 48 of 55) 202081 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 118.667-205 chrX 37961625 37961872 + 0.666667 NA Intergenic (TATAATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -29031 NM_012274 25763 Hs.122959 NM_012274 ENSG00000187516 HYPM CXorf27|HIP17 huntingtin interacting protein M protein-coding 116-105 chr3 48705928 48706178 + 0.666667 NA intron (NM_016291, intron 1 of 5) AluSq2|SINE|Alu 11168 NM_016291 51447 Hs.595983 NM_016291 ENSG00000068745 IP6K2 IHPK2|InsP6K2|PIUS inositol hexakisphosphate kinase 2 protein-coding 132-38 chr14 30022877 30023143 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -95163 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 113.667-222 chr9 3718734 3718959 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 50760 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 240.667-11 chr10 80823471 80823909 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 173893 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 119-105 chr3 116492197 116492389 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -46806 NM_001318915 4045 Hs.26409 NM_002338 ENSG00000185565 LSAMP IGLON3|LAMP limbic system associated membrane protein protein-coding 122.667-171 chr7 16593684 16593874 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 51975 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 126.667-15 chr10 69507787 69508085 + 0.666667 NA TTS (NR_147091) TTS (NR_147091) 56469 NR_147091 23555 Hs.499941 NM_012339 ENSG00000099282 TSPAN15 2700063A19Rik|NET-7|NET7|TM4SF15 tetraspanin 15 protein-coding 136.667-44 chr12 132772108 132772378 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_005895, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_005895, exon 24 of 24) -10411 NM_015114 23141 Hs.654628 NM_015114 ENSG00000176915 ANKLE2 KIAA0692|LEMD7|Lem4|MCPH16 ankyrin repeat and LEM domain containing 2 protein-coding 114.333-39 chr11 44325023 44325301 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15023 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 126-103 chr7 8449428 8449782 + 0.666667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 15996 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 134.333-56 chr15 54358791 54359048 + 0.666667 NA intron (NM_001329919, intron 16 of 31) L1M2|LINE|L1 346271 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 153.333-397 chr8 36531945 36532259 + 0.666667 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -252272 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 161-78 chr5 57421425 57421829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61184 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 191.333-115 chr2 132244158 132244560 + 0.666667 NA intron (NR_152415, intron 1 of 5) ALR/Alpha|Satellite|centr 12721 NR_031608 100313824 NR_031608 ENSG00000221288 MIR663B MIRN663B|mir-663b microRNA 663b ncRNA 222-101 chr8 138673290 138673890 + 0.666667 NA intron (NM_152888, intron 41 of 64) intron (NM_152888, intron 41 of 64) -175860 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 123.333-118 chr2 189628123 189628350 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -33163 NM_001353497 54529 Hs.101364 NM_019048 ENSG00000138381 ASNSD1 NBLA00058|NS3TP1 asparagine synthetase domain containing 1 protein-coding 282.667-39 chr5 152223202 152223706 + 0.666667 NA intron (NR_109876, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 181825 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 158.667-214 chr3 88209570 88209883 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 59767 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 178.333-45 chr13 50511971 50512358 + 0.666667 NA intron (NR_109974, intron 5 of 6) L2|LINE|L2 15285 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 129-56 chr18 41590157 41590438 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69620 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 223.333-87 chr2 206178086 206178733 + 0.666667 NA intron (NM_001098199, intron 2 of 2) intron (NM_001098199, intron 2 of 2) 16181 NR_002590 619569 Hs.742407 NR_002590 ENSG00000207406 SNORA41 ACA41|SNORA41A small nucleolar RNA, H/ACA box 41 snoRNA 142.667-22 chr10 67339328 67339634 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 63929 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 257.333-71 chr4 30462734 30463355 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -257325 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 150.667-167 chr2 16651017 16651450 + 0.666667 NA intron (NM_030797, intron 1 of 11) intron (NM_030797, intron 1 of 11) 14601 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 176.667-54 chr14 48671415 48671772 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -876579 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 117.667-33 chr12 10558392 10558621 + 0.666667 NA non-coding (NR_146455, exon 2 of 2) non-coding (NR_146455, exon 2 of 2) 5127 NR_146455 101060038 NR_146455 LINC02446 - long intergenic non-protein coding RNA 2446 ncRNA 128.667-176 chr8 53577993 53578250 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -54156 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 124-56 chr2 14303065 14303383 + 0.666667 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) L1MB8|LINE|L1 97734 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 120.667-135 chr4 185907383 185907654 + 0.666667 NA intron (NM_001270771, intron 1 of 23) intron (NM_001270771, intron 1 of 23) 48854 NM_001270771 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 114.667-220 chr6 36002195 36002386 + 0.666667 NA intron (NM_001193476, intron 3 of 19) intron (NM_001193476, intron 3 of 19) 22210 NM_138718 116369 Hs.435836 NM_052961 ENSG00000112053 SLC26A8 SPGF3|TAT1 solute carrier family 26 member 8 protein-coding 146.333-346 chr9 26889401 26889700 + 0.666667 NA intron (NM_024828, intron 1 of 5) L1MB7|LINE|L1 3252 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 123.667-93 chr2 101055018 101055316 + 0.666667 NA intron (NM_001102426, intron 3 of 19) AluSz6|SINE|Alu 52878 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 159-19 chr11 19858087 19858461 + 0.666667 NA intron (NM_182964, intron 3 of 37) L1MA9|LINE|L1 -98191 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 170.333-95 chr17 68039633 68040116 + 0.666667 NA intron (NM_001320611, intron 3 of 10) AluSp|SINE|Alu 3914 NM_001320611 3838 Hs.594238 NM_002266 ENSG00000182481 KPNA2 IPOA1|QIP2|RCH1|SRP1-alpha|SRP1alpha karyopherin subunit alpha 2 protein-coding 214.333-147 chr7 71122126 71122567 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9798 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 119.333-23 chr1 238713858 238714040 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -227932 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 133-94 chr8 105643735 105643999 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 324324 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 154.667-121 chr15 47124870 47125326 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -58991 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 213.333-64 chr15 23872964 23873508 + 0.666667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -101911 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 148.667-149 chr16 64367054 64367429 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 754822 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 140-109 chr7 89749544 89749838 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -369709 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 113.667-49 chr13 38721760 38722028 + 0.666667 NA intron (NM_207361, intron 2 of 23) intron (NM_207361, intron 2 of 23) 34817 NM_207361 341640 Hs.253994 NM_207361 ENSG00000150893 FREM2 CRYPTOP|FRASRS2 FRAS1 related extracellular matrix 2 protein-coding 112.667-246 chr7 42224704 42225003 + 0.666667 NA intron (NM_000168, intron 1 of 14) MIRc|SINE|MIR 12356 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 141.333-138 chr22 24893073 24893391 + 0.666667 NA intron (NM_001098498, intron 16 of 23) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 53463 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 189-78 chr5 180405806 180406235 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -52684 NM_005110 9945 Hs.696497 NM_005110 ENSG00000131459 GFPT2 GFAT|GFAT 2|GFAT2 glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 protein-coding 146.333-232 chr4 65206218 65206542 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201880 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 126.333-182 chr8 143446113 143446335 + 0.666667 NA intron (NM_015117, intron 9 of 11) L1M5|LINE|L1 -15492 NM_201589 389692 NM_201589 ENSG00000182759 MAFA INSDM|RIPE3b1|hMafA MAF bZIP transcription factor A protein-coding 112.333-257 chr8 59699652 59699856 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 580544 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 125.667-9 chr1 97996105 97996331 + 0.666667 NA intron (NR_046105, intron 3 of 4) intron (NR_046105, intron 3 of 4) 49133 NR_039604 100616452 NR_039604 ENSG00000284247 MIR2682 mir-2682 microRNA 2682 ncRNA 204.333-87 chr19 18071140 18071615 + 0.666667 NA intron (NM_153701, intron 9 of 9) intron (NM_153701, intron 9 of 9) 15557 NM_153701 3594 Hs.567294 NM_005535 ENSG00000096996 IL12RB1 CD212|IL-12R-BETA1|IL12RB|IMD30 interleukin 12 receptor subunit beta 1 protein-coding 173.333-76 chr17 69377186 69377559 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -37325 NM_002758 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 193.667-50 chr16 73084540 73084860 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -7649 NR_027756 283902 Hs.382776 NM_001101347 ENSG00000260880 HCCAT5 FJ222407|HTA hepatocellular carcinoma associated transcript 5 ncRNA 167.333-248 chr7 106747936 106748325 + 0.666667 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -86972 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 152.333-172 chr2 37075650 37075989 + 0.666667 NA intron (NM_019024, intron 4 of 35) intron (NM_019024, intron 4 of 35) 8553 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 193-33 chr17 72157460 72157945 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 36682 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 122.667-75 chr17 71878426 71878710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 147411 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 144.667 chr1 24769242 24769555 + 0.666667 NA intron (NM_013943, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 23951 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 149.667-125 chr14 75973997 75974377 + 0.666667 NA intron (NM_001329938, intron 1 of 4) intron (NM_001329938, intron 1 of 4) 7808 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 207.667-94 chr4 152618771 152619349 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_152680, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_152680, exon 7 of 7) 60937 NM_152680 201799 Hs.518900 NM_152680 ENSG00000170006 TMEM154 - transmembrane protein 154 protein-coding 121-14 chr10 61786143 61786419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115418 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 134.667-55 chr14 42494733 42494964 + 0.666667 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 887992 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 165-75 chr5 26393183 26393460 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 645265 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 213.667-33 chr14 71422881 71423463 + 0.666667 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) L1MB3|LINE|L1 -15767 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 187.333-13 chr1 210616157 210616664 + 0.666667 NA intron (NM_001122834, intron 10 of 11) intron (NM_001122834, intron 10 of 11) 287044 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 444.333-2 chr1 185558666 185559743 + 0.666667 NA intron (NR_110793, intron 3 of 3) intron (NR_110793, intron 3 of 3) 69284 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 244.333-10 chr10 50237898 50238441 + 0.666667 NA intron (NM_001143974, intron 3 of 18) MER63A|DNA|hAT-Blackjack 10441 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 117-32 chr11 45510682 45510949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 139418 NR_122071 399886 Hs.559970 NR_122071 ENSG00000255267 LINC02687 - long intergenic non-protein coding RNA 2687 ncRNA 113-209 chr8 119321914 119322149 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3140 NR_106755 102466162 NR_106755 ENSG00000276479 MIR548AZ hsa-mir-548az microRNA 548az ncRNA 131.667-137 chr3 124170084 124170343 + 0.666667 NA intron (NM_001024660, intron 1 of 59) intron (NM_001024660, intron 1 of 59) 37284 NR_049798 100847021 NR_049798 ENSG00000266383 MIR5002 - microRNA 5002 ncRNA 139-32 chr14 52702012 52702311 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -5039 NR_158967 5706 Hs.156171 NM_002806 ENSG00000100519 PSMC6 SUG2|p42 proteasome 26S subunit, ATPase 6 protein-coding 112.333-91 chr17 40399541 40399747 + 0.666667 NA intron (NM_001067, intron 24 of 34) intron (NM_001067, intron 24 of 34) 18252 NM_001067 7153 Hs.156346 NM_001067 ENSG00000131747 TOP2A TOP2|TP2A DNA topoisomerase II alpha protein-coding 146.667-347 chr8 141206692 141207039 + 0.666667 NA TTS (NM_001080431) TTS (NM_001080431) 21709 NM_001080431 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 121-102 chr4 21845882 21846229 + 0.666667 NA non-coding (NR_002813, exon 1 of 1) non-coding (NR_002813, exon 1 of 1) 7133 NR_002813 359822 Hs.354058 NR_002813 ENSG00000280650 KCNIP4-IT1 NCRNA00099|UM9(5)|UM9-5 KCNIP4 intronic transcript 1 ncRNA 124.667-199 chr8 10692856 10693143 + 0.666667 NA intron (NM_001040032, intron 2 of 3).2 L2a|LINE|L2 20371 NM_001040032 203076 Hs.371776 NM_001040032 ENSG00000171060 C8orf74 - chromosome 8 open reading frame 74 protein-coding 178-118 chr9 11335747 11336167 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 722751 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 126-111 chr8 78999521 78999846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 162154 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 317.333-13 chr15 60427888 60428485 + 0.666667 NA intron (NR_147171, intron 16 of 16) intron (NR_147171, intron 16 of 16) -30200 NM_004039 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 128-26 chr16 8646141 8646463 + 0.666667 NA non-coding (NR_134608, exon 10 of 10) non-coding (NR_134608, exon 10 of 10) 24604 NR_134608 79091 Hs.306380 NM_024109 ENSG00000067365 METTL22 C16orf68 methyltransferase like 22 protein-coding 148.333-56 chr10 125297893 125298192 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -137012 NM_001083914 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 191.667-31 chr11 115679920 115680412 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54596 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 134-59 chr22 28953365 28953746 + 0.666667 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) intron (NM_032173, intron 1 of 8) 36166 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 174.333-147 chr8 101144867 101145260 + 0.666667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 60610 NM_016096 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 115.333-157 chr4 78169299 78169498 + 0.666667 NA intron (NM_001166133, intron 2 of 41) MIRb|SINE|MIR 111828 NM_001166133 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 146-141 chr8 114876355 114876727 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 791472 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 141.667-135 chr21 22978544 22978835 + 0.666667 NA Intergenic LTR54|LTR|ERV1 -100595 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 149.667-393 chr8 80259778 80260085 + 0.666667 NA Intergenic LTR28B|LTR|ERV1 18542 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 139.333-130 chr2 237264189 237264510 + 0.666667 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 149815 NM_057165 1293 Hs.233240 NM_004369 ENSG00000163359 COL6A3 BTHLM1|DYT27|UCMD1 collagen type VI alpha 3 chain protein-coding 138-7 chr1 178165696 178165937 + 0.666667 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) MIR3|SINE|MIR 71712 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 130.667-161 chr5 26792705 26793056 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 245706 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 217.333-120 chr5 89590075 89590427 + 0.666667 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 426469 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 120-137 chr8 80525133 80525443 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_023929, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_023929, exon 7 of 7) 39062 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 112-4 chr1 56875085 56875272 + 0.666667 NA intron (NM_000562, intron 3 of 10) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 20408 NM_000562 731 Hs.93210 NM_000562 ENSG00000157131 C8A - complement C8 alpha chain protein-coding 132.333-131 chr5 39072363 39072671 + 0.666667 NA intron (NM_001285439, intron 2 of 38) intron (NM_001285439, intron 2 of 38) 1882 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 133.333-54 chr14 73146208 73146512 + 0.666667 NA intron (NM_000021, intron 1 of 11) AluJr|SINE|Alu 9853 NM_007318 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 118.667-183 chr7 109398430 109398696 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie -513976 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 214.667-68 chr2 137079786 137080327 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 3 of 27) AluSx|SINE|Alu 314511 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 116.667-134 chr3 104240034 104240297 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -716049 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 161.333-84 chr14 22520931 22521264 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 35965 NR_146543 105370400 NR_146543 ENSG00000259054 LINC02332 - long intergenic non-protein coding RNA 2332 ncRNA 121.667-179 chr6 84039401 84039693 + 0.666667 NA intron (NM_001346544, intron 1 of 3) intron (NM_001346544, intron 1 of 3) 5428 NM_001346544 112609 Hs.370055 NM_138409 ENSG00000135324 MRAP2 C6orf117|bA51G5.2 melanocortin 2 receptor accessory protein 2 protein-coding 123.333-17 chr1 186181588 186181802 + 0.666667 NA intron (NM_031935, intron 104 of 106) intron (NM_031935, intron 104 of 106) -114578 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 170.667-104 chr22 19556629 19557011 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10019 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 140.667-37 chr10 77330993 77331295 + 0.666667 NA intron (NM_001322838, intron 1 of 29) intron (NM_001322838, intron 1 of 29) 19617 NM_001322838 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 141-19 chr12 42226116 42226521 + 0.666667 NA intron (NR_135140, intron 2 of 6) intron (NR_135140, intron 2 of 6) 12050 NM_005748 10138 Hs.649195 NM_005748 ENSG00000015153 YAF2 - YY1 associated factor 2 protein-coding 227-63 chr9 121249854 121250359 + 0.666667 NA intron (NM_001353054, intron 7 of 25) intron (NM_001353054, intron 7 of 25) -18056 NM_001127666 2934 Hs.522373 NM_000177 ENSG00000148180 GSN ADF|AGEL gelsolin protein-coding 173-35 chr18 1442724 1443155 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -83310 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 146.667-190 chr2 238710468 238710761 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 137293 NR_157851 100287387 Hs.516864 NR_157851 LOC100287387 - uncharacterized LOC100287387 ncRNA 193-55 chr3 16692303 16692869 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87163 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 167-45 chr15 79087698 79088054 + 0.666667 NA intron (NM_001145648, intron 1 of 26) intron (NM_001145648, intron 1 of 26) 2904 NM_002891 5923 Hs.459035 NM_002891 ENSG00000058335 RASGRF1 CDC25|CDC25L|GNRP|GRF1|GRF55|H-GRF55|PP13187|ras-GRF1 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1 protein-coding 135.333-87 chr2 83244693 83245090 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -277923 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 137.333-52 chr15 42879393 42879719 + 0.666667 NA intron (NM_173500, intron 1 of 14) MER58A|DNA|hAT-Charlie 41222 NM_173500 146057 Hs.646511 NM_173500 ENSG00000128881 TTBK2 SCA11|TTBK tau tubulin kinase 2 protein-coding 187.667-15 chr10 68746374 68746732 + 0.666667 NA intron (NR_104262, intron 6 of 23) intron (NR_104262, intron 6 of 23) -8619 NR_003076 692211 NR_003076 ENSG00000283551 SNORD98 HBII-419 small nucleolar RNA, C/D box 98 snoRNA 127.333-81 chr2 68058327 68058703 + 0.666667 NA intron (NM_001190263, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 4489 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 145.667-13 chr1 82829157 82829446 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73882 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 297-3 chr1 84679422 84680230 + 0.666667 NA intron (NM_001166293, intron 1 of 13) MIR|SINE|MIR 10635 NM_001166294 117178 Hs.22587 NM_014021 ENSG00000117155 SSX2IP ADIP|hMsd1 SSX family member 2 interacting protein protein-coding 156-140 chr8 93610091 93610383 + 0.666667 NA intron (NR_033858, intron 5 of 10) MLT2B1|LTR|ERVL 90196 NR_033858 642924 Hs.434882 NR_033858 ENSG00000246662 LINC00535 - long intergenic non-protein coding RNA 535 ncRNA 146.333-91 chr14 58244311 58244595 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_152132) promoter-TSS (NM_152132) -352 NR_038123 5684 Hs.558799 NM_002788 ENSG00000100567 PSMA3 HC8|PSC3 proteasome subunit alpha 3 protein-coding 229.333-32 chr13 66000365 66000801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34154 NR_039692 100616302 NR_039692 ENSG00000263581 MIR548X2 - microRNA 548x-2 ncRNA 161.333-300 chr9 93344298 93344673 + 0.666667 NA intron (NM_001098808, intron 1 of 4) intron (NM_001098808, intron 1 of 4) 1818 NM_001368813 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 113.333-236 chr7 38837046 38837259 + 0.666667 NA intron (NM_014396, intron 4 of 28) MER77B|LTR|ERVL 72039 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 112.333-246 chr7 39616879 39617152 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6557 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 153.333-113 chr14 48063534 48063954 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -268730 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 157-82 chr22 28571801 28572184 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1ME3D|LINE|L1 107873 NM_001145418 23331 Hs.387856 NM_015281 ENSG00000100154 TTC28 TPRBK tetratricopeptide repeat domain 28 protein-coding 115-34 chr11 98939893 98940100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80953 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 249.667-5 chr1 198786516 198787100 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 72174 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 158-59 chr17 47346966 47347278 + 0.666667 NA intron (NM_001195192, intron 8 of 21) AluJo|SINE|Alu 23167 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 154-113 chr5 20131158 20131554 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -143156 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 112.333-260 chr8 80903183 80903364 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -28492 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 140.333-14 chr1 161904733 161905052 + 0.666667 NA intron (NM_007348, intron 14 of 15) intron (NM_007348, intron 14 of 15) 119573 NM_015441 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 190-15 chr10 66579311 66579689 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -346536 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 181-17 chr12 110061979 110062370 + 0.666667 NA intron (NR_148514, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu 5521 NM_207435 400073 Hs.44817 NM_207435 ENSG00000174456 C12orf76 - chromosome 12 open reading frame 76 protein-coding 149.333-55 chr10 69695819 69696110 + 0.666667 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie 65717 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 119.333-135 chr2 185397450 185397703 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -230504 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 169-102 chr8 123242437 123242775 + 0.666667 NA intron (NM_001204180, intron 2 of 5) intron (NM_001204180, intron 2 of 5) -1229 NM_032847 84933 Hs.707401 NM_032847 ENSG00000189376 C8orf76 - chromosome 8 open reading frame 76 protein-coding 128.667-92 chr2 99169895 99170226 + 0.666667 NA intron (NM_001320419, intron 4 of 5) intron (NM_001320419, intron 4 of 5) 10998 NM_001320419 129531 Hs.14222 NM_138798 ENSG00000158411 MITD1 - microtubule interacting and trafficking domain containing 1 protein-coding 211.333-193 chr5 118263078 118263630 + 0.666667 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) AluSx3|SINE|Alu -19220 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 149-80 chr20 55088759 55089147 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -334090 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 129.667-5 chr1 76623993 76624350 + 0.666667 NA intron (NR_146056, intron 4 of 5) intron (NR_146056, intron 4 of 5) 155096 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 151.667-280 chr5 85081556 85081991 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -696893 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 212.333-70 chr2 118398012 118398489 + 0.666667 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 204716 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 165.667-45 chr14 26231257 26231719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 321942 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 190.333-21 chr10 80339641 80340147 + 0.666667 NA intron (NM_001370157, intron 4 of 5) intron (NM_001370157, intron 4 of 5) -4851 NR_070308 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 134.667-154 chr5 19452061 19452435 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 434024 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 113-190 chr6 156579390 156579656 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -198332 NM_001346813 57492 Hs.291587 NM_017519 ENSG00000049618 ARID1B 6A3-5|BAF250B|BRIGHT|CSS1|DAN15|ELD/OSA1|MRD12|OSA2|P250R AT-rich interaction domain 1B protein-coding 145-91 chr5 52124687 52125099 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 116862 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 123.333-171 chr5 60650757 60650988 + 0.666667 NA intron (NM_001145208, intron 2 of 9) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 49294 NM_018369 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 153.667-55 chr10 126853526 126853961 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -51666 NM_001380 1793 Hs.159195 NM_001380 ENSG00000150760 DOCK1 DOCK180|ced5 dedicator of cytokinesis 1 protein-coding 163.333-71 chr12 121187620 121187943 + 0.666667 NA non-coding (NR_033952, exon 11 of 11) non-coding (NR_033952, exon 11 of 11) -22348 NM_001261398 5025 Hs.321709 NM_002560 ENSG00000135124 P2RX4 P2X4|P2X4R purinergic receptor P2X 4 protein-coding 169-3 chr1 147846691 147847077 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -55911 NM_005267 2703 Hs.632441 NM_005267 ENSG00000121634 GJA8 CAE|CAE1|CTRCT1|CX50|CZP1|MP70 gap junction protein alpha 8 protein-coding 145.333-58 chr11 110194700 110194989 + 0.666667 NA TTS (NM_001260492) TTS (NM_001260492) 101452 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 112.333-215 chr5 119738177 119738461 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 108760 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 225.667-30 chr16 46648051 46648520 + 0.666667 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -26906 NM_001324318 79801 Hs.123253 NM_024745 ENSG00000171241 SHCBP1 PAL SHC binding and spindle associated 1 protein-coding 114-45 chr15 59231091 59231348 + 0.666667 NA intron (NM_004998, intron 6 of 27) intron (NM_004998, intron 6 of 27) 24376 NM_033195 92483 Hs.307052 NM_033195 ENSG00000171989 LDHAL6B LDH6B|LDHAL6|LDHL lactate dehydrogenase A like 6B protein-coding 210.333-169 chr8 109984293 109984765 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -8758 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 127.333-65 chr17 60326832 60327067 + 0.666667 NA intron (NM_032582, intron 2 of 33) L1MA5|LINE|L1 65184 NM_032582 84669 Hs.132868 NM_032582 ENSG00000170832 USP32 NY-REN-60|USP10 ubiquitin specific peptidase 32 protein-coding 144.333-226 chr6 17307329 17307592 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24759 NM_153020 221662 Hs.519904 NM_153020 ENSG00000112183 RBM24 RNPC6|dJ259A10.1 RNA binding motif protein 24 protein-coding 126-57 chr2 133150570 133150783 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 5 of 17) L1ME3A|LINE|L1 -115519 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 172.667-66 chr17 58355727 58356157 + 0.666667 NA intron (NM_001305544, intron 9 of 9) intron (NM_001305544, intron 9 of 9) -3741 NM_003168 6827 Hs.439481 NM_003168 ENSG00000213246 SUPT4H1 SPT4|SPT4H|SUPT4H|Supt4a SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit protein-coding 128-6 chr1 196178123 196178472 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -89582 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 161-16 chr12 39402875 39403209 + 0.666667 NA intron (NM_001173464, intron 1 of 37) intron (NM_001173464, intron 1 of 37) 40078 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 182.667-67 chr18 65011475 65011821 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -738604 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 216-24 chr13 68442577 68443073 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 442500 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 157-30 chr12 41509705 41510086 + 0.666667 NA exon (NM_013377, exon 3 of 8) exon (NM_013377, exon 3 of 8) 72156 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 211.333-242 chr8 91996571 91997101 + 0.666667 NA intron (NM_004349, intron 5 of 10) intron (NM_004349, intron 5 of 10) 20844 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 158.667-280 chr5 174622191 174622546 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102214 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 136.333-128 chr3 98068512 98068835 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18500 NM_054106 81050 Hs.554715 NM_054106 ENSG00000196578 OR5AC2 HSA1 olfactory receptor family 5 subfamily AC member 2 protein-coding 282-51 chr9 3008054 3008654 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -164259 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 120.333-52 chr14 27469838 27470117 + 0.666667 NA intron (NR_148991, intron 2 of 2) intron (NR_148991, intron 2 of 2) -142611 NR_039992 100505967 Hs.668484 NR_039992 ENSG00000258548 LINC00645 - long intergenic non-protein coding RNA 645 ncRNA 140-18 chr10 39324549 39324796 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 628076 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 113-215 chr9 112060364 112060578 + 0.666667 NA intron (NM_022486, intron 13 of 16) AluSx1|SINE|Alu 114826 NM_001282643 64420 Hs.494827 NM_022486 ENSG00000106868 SUSD1 - sushi domain containing 1 protein-coding 127.667-26 chr11 12372576 12372926 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4820 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 133-32 chr16 10689379 10689648 + 0.666667 NA intron (NM_144674, intron 2 of 6) intron (NM_144674, intron 2 of 6) 5417 NM_144674 146279 Hs.143519 NM_144674 ENSG00000153060 TEKT5 CT149 tektin 5 protein-coding 151-56 chr2 68463138 68463549 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001024680, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001024680, exon 4 of 4) 3951 NR_133923 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 127-69 chr5 16059955 16060177 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 119725 NM_001102562 441061 Hs.662216 NM_001102562 ENSG00000183654 MARCH11 MARCH-XI|RNF226 membrane associated ring-CH-type finger 11 protein-coding 124.667-220 chrX 134110779 134111123 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 58501 NR_029852 574031 NR_029852 ENSG00000284499 MIR363 MIR-363|MIRN363|hsa-mir-363 microRNA 363 ncRNA 151-79 chr3 31120669 31121007 + 0.666667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 40949 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 135-95 chr6 134656875 134657259 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -117062 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 131.333-120 chr4 1917222 1917601 + 0.666667 NA intron (NM_133334, intron 3 of 8) intron (NM_133334, intron 3 of 8) 16785 NM_133334 7468 Hs.113876 NM_007331 ENSG00000109685 NSD2 KMT3F|KMT3G|MMSET|REIIBP|TRX5|WHS|WHSC1 nuclear receptor binding SET domain protein 2 protein-coding 215-58 chr3 158083947 158084487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21946 NM_006884 6474 Hs.55967 NM_003030 ENSG00000168779 SHOX2 OG12|OG12X|SHOT short stature homeobox 2 protein-coding 123.667-123 chr3 94051954 94052269 + 0.666667 NA intron (NR_135621, intron 8 of 8) intron (NR_135621, intron 8 of 8) 10805 NM_001195643 200895 Hs.718516 NM_176815 ENSG00000178700 DHFR2 DHFRL1|DHFRP4 dihydrofolate reductase 2 protein-coding 119-65 chr17 82555897 82556202 + 0.666667 NA intron (NM_004514, intron 1 of 8) L1ME3A|LINE|L1 36317 NM_004514 3607 Hs.591140 NM_004514 ENSG00000141568 FOXK2 ILF|ILF-1|ILF1|nGTBP forkhead box K2 protein-coding 175.667-125 chr6 61920060 61920423 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) MIR|SINE|MIR 346111 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 148.667-190 chr2 76436252 76436641 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -549519 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 174-85 chr6 119824473 119824815 + 0.666667 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) L1MEc|LINE|L1 -190535 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 122.333-71 chr17 20031820 20032029 + 0.666667 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) L1MB3|LINE|L1 22565 NM_001243439 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 127-76 chr5 154672235 154672458 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10633 NM_001367714 23367 Hs.292078 NM_015315 ENSG00000155506 LARP1 LARP La ribonucleoprotein domain family member 1 protein-coding 187-57 chr4 39344868 39345356 + 0.666667 NA intron (NM_001204747, intron 3 of 24) AluSz|SINE|Alu 21250 NM_001204747 5981 Hs.507475 NM_002913 ENSG00000035928 RFC1 A1|CANVAS|MHCBFB|PO-GA|RECC1|RFC|RFC140 replication factor C subunit 1 protein-coding 125.667-177 chr7 34709128 34709466 + 0.666667 NA intron (NM_001300934, intron 2 of 6) intron (NM_001300934, intron 2 of 6) 48975 NR_033664 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-200 chr2 142966972 142967409 + 0.666667 NA intron (NM_001199241, intron 9 of 14) intron (NM_001199241, intron 9 of 14) 89526 NM_003937 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 131.333-95 chr2 172885748 172886021 + 0.666667 NA intron (NM_001282899, intron 1 of 27) intron (NM_001282899, intron 1 of 27) 25846 NM_001282900 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 114-180 chrX 46860879 46861079 + 0.666667 NA intron (NM_006915, intron 3 of 4) intron (NM_006915, intron 3 of 4) 23936 NM_006915 6102 Hs.44766 NM_006915 ENSG00000102218 RP2 DELXp11.3|NM23-H10|NME10|TBCCD2|XRP2 RP2 activator of ARL3 GTPase protein-coding 198-186 chr8 120668284 120668741 + 0.666667 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) intron (NM_021021, intron 2 of 6) -92741 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 117.667-18 chr10 53471114 53471361 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -699537 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 140.333-35 chr10 130127977 130128257 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8258 NM_001199868 10539 Hs.42644 NM_006541 ENSG00000108010 GLRX3 GLRX4|GRX3|GRX4|PICOT|TXNL2|TXNL3 glutaredoxin 3 protein-coding 193.666-2 chr1 107349620 107350199 + 0.666667 NA intron (NM_001113226, intron 2 of 6) L1ME3E|LINE|L1 201840 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 165-53 chr3 56777563 56777916 + 0.666667 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) intron (NM_001128615, intron 4 of 12) -2022 NM_001128616 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 128.333-76 chr17 51550526 51550886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 115279 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 188.333-155 chr8 86500090 86500510 + 0.666667 NA intron (NM_001286719, intron 2 of 8) L1PA16|LINE|L1 8386 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 141-66 chr5 76102032 76102413 + 0.666667 NA intron (NM_014979, intron 1 of 12) L2b|LINE|L2 18839 NM_014979 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 146.333-306 chr7 41169067 41169299 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 67579 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 130.333-21 chr1 208997676 208998007 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 25387 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 192.333-41 chr12 18358215 18358691 + 0.666667 NA intron (NM_004570, intron 11 of 31) LSU-rRNA_Hsa|rRNA|rRNA 96913 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 164-101 chr6 163293224 163293566 + 0.666667 NA intron (NM_001080379, intron 4 of 4) intron (NM_001080379, intron 4 of 4) 31078 NR_028390 285796 Hs.668693 NR_028390 ENSG00000281692 PACRG-AS1 - PACRG antisense RNA 1 ncRNA 202.667-95 chr22 40159330 40159709 + 0.666667 NA intron (NM_001024843, intron 4 of 23) AluY|SINE|Alu -18406 NM_001162501 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 129-23 chr11 30025361 30025623 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8462 NM_002233 3739 Hs.592002 NM_002233 ENSG00000182255 KCNA4 HBK4|HK1|HPCN2|HUKII|KCNA4L|KCNA8|KV1.4|MCIDDS|PCN2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 4 protein-coding 153.333-429 chr8 118247029 118247456 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) L1MA7|LINE|L1 -135423 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 255.333-95 chr7 26219691 26220255 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18228 NM_016587 11335 Hs.381189 NM_007276 ENSG00000122565 CBX3 HECH|HP1-GAMMA|HP1Hs-gamma chromobox 3 protein-coding 114.333-62 chr13 37666722 37667002 + 0.666667 NA intron (NM_003306, intron 5 of 10) L2|LINE|L2 -68018 NM_001286666 10631 Hs.136348 NM_006475 ENSG00000133110 POSTN OSF-2|OSF2|PDLPOSTN|PN periostin protein-coding 156.333-165 chr19 53861776 53862204 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3638 NM_001290193 91663 Hs.380906 NM_138373 ENSG00000179820 MYADM SB135 myeloid associated differentiation marker protein-coding 177.333-75 chr18 63695551 63696002 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -6531 NM_080475 89778 Hs.350958 NM_080475 ENSG00000206072 SERPINB11 EPIPIN|SERPIN11 serpin family B member 11 (gene/pseudogene) protein-coding 114.667-108 chr17 63392648 63392856 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 16 of 25) L1MA5|LINE|L1 47515 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 117.333-68 chr15 62748687 62749033 + 0.666667 NA intron (NM_015059, intron 30 of 55) intron (NM_015059, intron 30 of 55) -75097 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 179.333-125 chr3 72349864 72350183 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96600 NM_012234 23429 Hs.7910 NM_012234 ENSG00000163602 RYBP AAP1|APAP-1|DEDAF|YEAF1 RING1 and YY1 binding protein protein-coding 167-57 chr2 56797590 56797931 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -611990 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 134-3 chr1 71822079 71822333 + 0.666667 NA intron (NR_046218, intron 1 of 2) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 14806 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 179-100 chr9 17083246 17083597 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51619 NM_001286984 54875 Hs.435381 NM_017738 ENSG00000044459 CNTLN C9orf101|C9orf39|bA340N12.1 centlein protein-coding 143-104 chr6 76526705 76527067 + 0.666667 NA intron (NR_149101, intron 2 of 2) intron (NR_149101, intron 2 of 2) 66737 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 171-22 chr15 60262947 60263355 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 134835 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 150-137 chr7 137886516 137886948 + 0.666667 NA intron (NM_001318246, intron 8 of 11) Tigger10|DNA|TcMar-Tigger -39868 NM_001321708 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 114-24 chr12 25667376 25667600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18910 NM_001352234 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 147.667-290 chr5 111012202 111012504 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -57727 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 202.333-64 chr15 64659621 64660085 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) AluSx|SINE|Alu 43428 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 144.333-209 chr5 45960282 45960676 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -264099 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 116.333-211 chr8 118667513 118667724 + 0.666667 NA intron (NR_038210, intron 2 of 4) intron (NR_038210, intron 2 of 4) -45655 NM_001363274 401474 Hs.359393 NM_207506 ENSG00000177570 SAMD12 - sterile alpha motif domain containing 12 protein-coding 133.667-107 chr4 32535817 32536183 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 184962 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 113.667-167 chr5 14319626 14319913 + 0.666667 NA intron (NM_007118, intron 9 of 56) intron (NM_007118, intron 9 of 56) -144214 NR_145815 109623458 NR_145815 SNORD170 - small nucleolar RNA, C/D box 170 snoRNA 119.667-27 chr11 43802858 43803054 + 0.666667 NA intron (NM_016142, intron 4 of 10) MIRc|SINE|MIR -77875 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 130.333-225 chrX 86556063 86556382 + 0.666667 NA intron (NM_001139515, intron 3 of 11) intron (NM_001139515, intron 3 of 11) 293254 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 130.667-42 chr11 9563299 9563590 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -10226 NM_003390 7465 Hs.249441 NM_003390 ENSG00000166483 WEE1 WEE1A|WEE1hu WEE1 G2 checkpoint kinase protein-coding 164.667-101 chr19 40608140 40608628 + 0.666667 NA intron (NM_003573, intron 11 of 32) intron (NM_003573, intron 11 of 32) 7015 NM_001042545 8425 Hs.466766 NM_003573 ENSG00000090006 LTBP4 ARCL1C|LTBP-4|LTBP4L|LTBP4S latent transforming growth factor beta binding protein 4 protein-coding 142-40 chr13 110970683 110971056 + 0.666667 NA intron (NR_126378, intron 1 of 1) L1MC5a|LINE|L1 4842 NR_126378 104355135 Hs.649708 NR_126378 LINC00431 - long intergenic non-protein coding RNA 431 ncRNA 126.333-141 chr5 34962575 34962870 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 33129 NM_194283 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 119-32 chr12 3001841 3002154 + 0.666667 NA intron (NM_201441, intron 3 of 11) AluSz|SINE|Alu 42062 NM_201443 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 153 chr1 40481277 40481690 + 0.666667 NA intron (NM_001320178, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 4193 NM_001320179 339559 Hs.434385 NM_198494 ENSG00000187815 ZFP69 ZFP69A|ZKSCAN23A|ZNF642|ZSCAN54A ZFP69 zinc finger protein protein-coding 138.333-87 chr2 31039429 31039695 + 0.666667 NA intron (NM_024572, intron 1 of 14) L3b|LINE|CR1 90078 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 304.333-33 chr7 46937212 46937759 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -240363 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 143-57 chr17 74575702 74576055 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -8535 NM_001324073 100130520 NM_001324073 ENSG00000284690 CD300H CD300Hs CD300H molecule (gene/pseudogene) protein-coding 117.333-2 chr1 46079634 46079841 + 0.666667 NA intron (NM_001328653, intron 1 of 8) AluSx|SINE|Alu 50936 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 135.667-37 chr12 53865981 53866295 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72693 NM_017410 3229 Hs.118608 NM_017410 ENSG00000123364 HOXC13 ECTD9|HOX3|HOX3G homeobox C13 protein-coding 167.333-132 chr2 109069683 109069994 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -59367 NM_001099289 344558 Hs.171244 NM_001099289 ENSG00000172985 SH3RF3 POSH2|SH3MD4 SH3 domain containing ring finger 3 protein-coding 248.333-73 chr4 111454246 111454813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -593882 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 163.667-63 chr14 73014291 73014734 + 0.666667 NA intron (NM_021260, intron 2 of 11) intron (NM_021260, intron 2 of 11) 12594 NM_021260 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 163.667-164 chr3 194317977 194318319 + 0.666667 NA Intergenic MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -5344 NR_024480 100131551 Hs.128066 NR_024480 ENSG00000214145 LINC00887 HEIRCC long intergenic non-protein coding RNA 887 ncRNA 130-14 chr10 77223082 77223393 + 0.666667 NA intron (NM_001322838, intron 3 of 29) AluSx3|SINE|Alu 82406 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 246-61 chr21 46570881 46571461 + 0.666667 NA TTS (NM_001353943) TTS (NM_001353943) 33911 NM_006272 6285 Hs.422181 NM_006272 ENSG00000160307 S100B NEF|S100|S100-B|S100beta S100 calcium binding protein B protein-coding 170-126 chr9 31831181 31831543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -449872 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 117-125 chr6 79633822 79634107 + 0.666667 NA intron (NM_031469, intron 1 of 3) intron (NM_031469, intron 1 of 3) 2635 NM_031469 83699 Hs.302772 NM_031469 ENSG00000198478 SH3BGRL2 - SH3 domain binding glutamate rich protein like 2 protein-coding 132.333-186 chr9 33110731 33110938 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001497, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001497, exon 6 of 6) 2142 NR_162131 113219452 NR_162131 MIR12117 - microRNA 12117 ncRNA 129.333-112 chr22 28465790 28466078 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 6065 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 136.667-15 chr10 4207502 4207789 + 0.666667 NA intron (NR_108040, intron 2 of 2) intron (NR_108040, intron 2 of 2) 36267 NR_108040 100652988 Hs.433011 NR_108040 LINC00702 - long intergenic non-protein coding RNA 702 ncRNA 133-15 chr11 12520173 12520417 + 0.666667 NA intron (NM_018222, intron 12 of 12) intron (NM_018222, intron 12 of 12) 142724 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 179-73 chr4 105994101 105994533 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28161 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 146-20 chr12 7586794 7587059 + 0.666667 NA Intergenic L1P4a|LINE|L1 78982 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 165-38 chr2 118291006 118291434 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104834 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 130-95 chr5 79186796 79187128 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -49169 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 150.333-115 chr14 62230365 62230658 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -90538 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 172.333-94 chr2 241292918 241293304 + 0.666667 NA intron (NM_005336, intron 1 of 27) intron (NM_005336, intron 1 of 27) -20225 NM_001243900 3069 Hs.471851 NM_005336 ENSG00000115677 HDLBP HBP|PRO2900|VGL high density lipoprotein binding protein protein-coding 141.333-46 chr12 40122620 40123017 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -16737 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 271.667-2 chr1 78428565 78429220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62082 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 165.667-197 chr8 101936670 101937020 + 0.666667 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) L3|LINE|CR1 -47587 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 133-35 chr18 3587058 3587354 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 7 of 11) AluSq2|SINE|Alu -6908 NR_024101 649446 Hs.19872 NM_001039796 DLGAP1-AS1 HsT914 DLGAP1 antisense RNA 1 ncRNA 166.667-219 chr7 79193685 79194011 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 184860 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 157.667-228 chr5 9951221 9951543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47558 NR_027112 285692 Hs.651487 NR_027112 ENSG00000249781 LINC02112 - long intergenic non-protein coding RNA 2112 ncRNA 128-64 chr21 28594417 28594691 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 55236 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 114-173 chr9 27980137 27980462 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR -406433 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 149-123 chr6 24776839 24777151 + 0.666667 NA intron (NM_001251991, intron 1 of 6) intron (NM_001251991, intron 1 of 6) 1582 NM_001251991 51053 Hs.234896 NM_015895 ENSG00000112312 GMNN Gem|MGORS6 geminin DNA replication inhibitor protein-coding 168.333-147 chr4 66100089 66100446 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -176557 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 151.333-310 chr4 90026580 90027013 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -100737 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 222-35 chr17 3805645 3806151 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001114118, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001114118, exon 13 of 13) -4710 NM_002208 3682 Hs.513867 NM_002208 ENSG00000083457 ITGAE CD103|HUMINAE integrin subunit alpha E protein-coding 132.667-103 chr3 25808549 25808780 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 18574 NM_017897 54995 Hs.55781 NM_017897 ENSG00000151093 OXSM CEM1|FASN2D|KASI|KS 3-oxoacyl-ACP synthase, mitochondrial protein-coding 161.333-146 chr2 97964285 97964630 + 0.666667 NA intron (NM_015348, intron 1 of 40) intron (NM_015348, intron 1 of 40) 31491 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 181.667-41 chr15 60429863 60430175 + 0.666667 NA intron (NR_147171, intron 15 of 16) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -32033 NM_004039 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 213-48 chr3 16566122 16566589 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 30037 NR_103843 100996597 Hs.599432 NR_103843 ENSG00000233570 LINC00690 - long intergenic non-protein coding RNA 690 ncRNA 160-61 chr2 121412899 121413219 + 0.666667 NA intron (NM_001207051, intron 22 of 37) AluJb|SINE|Alu -117821 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 214.333-131 chr6 160768543 160769179 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 66668 NM_000301 5340 Hs.143436 NM_000301 ENSG00000122194 PLG - plasminogen protein-coding 182.667-144 chr6 46859894 46860289 + 0.666667 NA intron (NM_001098518, intron 16 of 20) intron (NM_001098518, intron 16 of 20) -43380 NR_110658 101926962 Hs.680113 NR_110658 LOC101926962 - uncharacterized LOC101926962 ncRNA 200.333-128 chr5 125095266 125095679 + 0.666667 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 58641 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 128.333-153 chr5 63182258 63182558 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 603589 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 115.667-221 chr9 13221278 13221469 + 0.666667 NA exon (NM_001330637, exon 7 of 47) exon (NM_001330637, exon 7 of 47) 58191 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 113.333-176 chr3 74182084 74182278 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 338959 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 185-4 chr10 75734379 75734694 + 0.666667 NA intron (NR_132791, intron 1 of 2) intron (NR_132791, intron 1 of 2) 22081 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 113.333-178 chr3 86362181 86362473 + 0.666667 NA Intergenic 7SK|RNA|RNA -119616 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 239.667-12 chr11 82940505 82940951 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -38988 NM_001319214 5547 Hs.523936 NM_005040 ENSG00000137509 PRCP HUMPCP|PCP prolylcarboxypeptidase protein-coding 311-13 chr2 17467382 17468028 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 50735 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 211.666-6 chr10 112744152 112744776 + 0.666667 NA intron (NM_001365713, intron 8 of 8) AluJr|SINE|Alu -79032 NR_120684 103344931 Hs.458447 NR_120684 ENSG00000260917 LOC103344931 - uncharacterized LOC103344931 ncRNA 123.333-138 chr21 44010100 44010319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2100 NM_003274 7109 Hs.126221 NM_003274 ENSG00000160218 TRAPPC10 EHOC-1|EHOC1|GT334|TMEM1|TRS130|TRS30 trafficking protein particle complex 10 protein-coding 275.667-35 chr20 38096879 38097447 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 63417 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 213.333-151 chr4 122301610 122302090 + 0.666667 NA intron (NM_015312, intron 53 of 83) AluJo|SINE|Alu -77161 NM_139243 132612 Hs.518957 NM_139243 ENSG00000164113 ADAD1 Tenr adenosine deaminase domain containing 1 protein-coding 125-47 chr17 61745852 61746103 + 0.666667 NA intron (NM_032043, intron 14 of 19) intron (NM_032043, intron 14 of 19) 117582 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 136.667-105 chr20 47491171 47491416 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -10594 NM_001174088 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 192.333-166 chr8 74191173 74191710 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 129920 NM_001363050 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 116.333-13 chr1 111350640 111350891 + 0.666667 NA intron (NM_181643, intron 5 of 5) MIR|SINE|MIR 4143 NM_181643 128344 Hs.172510 NM_181643 ENSG00000173947 PIFO C1orf88|pitchfork primary cilia formation protein-coding 147.667-104 chr14 61204155 61204448 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 77037 NM_001017970 161291 Hs.146180 NM_001017970 ENSG00000182107 TMEM30B CDC50B transmembrane protein 30B protein-coding 194.333-149 chr8 18785580 18785931 + 0.666667 NA intron (NM_015310, intron 8 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 23112 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 160.333-50 chr10 110484122 110484443 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -13625 NM_004419 1847 Hs.2128 NM_004419 ENSG00000138166 DUSP5 DUSP|HVH3 dual specificity phosphatase 5 protein-coding 210.333-22 chr11 9011158 9011617 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -7386 NM_020645 56675 Hs.523467 NM_020645 ENSG00000175352 NRIP3 C11orf14|NY-SAR-105 nuclear receptor interacting protein 3 protein-coding 133.667-99 chr3 120339820 120340070 + 0.666667 NA intron (NM_001099678, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 9409 NM_001099678 116064 Hs.518084 NM_001099678 ENSG00000163428 LRRC58 - leucine rich repeat containing 58 protein-coding 114.667-239 chr7 49155132 49155452 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 230745 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 212-28 chr11 84230132 84230475 + 0.666667 NA intron (NM_001142700, intron 1 of 19) intron (NM_001142700, intron 1 of 19) 42977 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 142.333-82 chr14 58224703 58225128 + 0.666667 NA intron (NM_018477, intron 10 of 12) AluSp|SINE|Alu -19890 NR_038123 5684 Hs.558799 NM_002788 ENSG00000100567 PSMA3 HC8|PSC3 proteasome subunit alpha 3 protein-coding 154.333-254 chr4 170408445 170408748 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 182005 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 257.333-11 chr10 63488952 63489532 + 0.666667 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) AluSq|SINE|Alu -23265 NM_032776 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 227.333-102 chr5 36205566 36206158 + 0.666667 NA intron (NM_001085411, intron 8 of 11) L1PA6|LINE|L1 35529 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 176.667-24 chr10 6527762 6528130 + 0.666667 NA intron (NM_001323265, intron 1 of 17) MER4CL34|LTR|ERV1 52330 NM_001323266 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 149.333-179 chr2 65265472 65265781 + 0.666667 NA intron (NM_001005386, intron 9 of 9) intron (NM_001005386, intron 9 of 9) 37931 NM_005722 10097 Hs.643727 NM_005722 ENSG00000138071 ACTR2 ARP2 actin related protein 2 protein-coding 163.667-266 chr9 137028913 137029223 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001606) promoter-TSS (NM_001606) -146 NM_212533 20 Hs.421202 NM_001606 ENSG00000107331 ABCA2 ABC2 ATP binding cassette subfamily A member 2 protein-coding 192.333-98 chr2 177650927 177651447 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 20 of 20) intron (NM_001077197, intron 20 of 20) -22135 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 149.667-11 chr1 63330987 63331279 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4149 NR_106716 102464823 NR_106716 ENSG00000275836 MIR6068 hsa-mir-6068 microRNA 6068 ncRNA 120.667-11 chr1 197622645 197622962 + 0.666667 NA intron (NR_125340, intron 9 of 19) intron (NR_125340, intron 9 of 19) 152677 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 130.667-107 chr2 34866518 34866762 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 189083 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 117.333-19 chr1 216006068 216006360 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 32 of 71) intron (NM_206933, intron 32 of 71) -66251 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 140-50 chr18 1431882 1432159 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -72391 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 149-37 chr13 44541470 44541766 + 0.666667 NA intron (NM_183422, intron 1 of 2) intron (NM_183422, intron 1 of 2) -34278 NR_038381 641467 Hs.624196 NR_038381 ENSG00000278156 TSC22D1-AS1 - TSC22D1 antisense RNA 1 ncRNA 241.333-10 chr1 239358470 239358915 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -27876 NM_001347716 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 113.333-41 chr11 10464339 10464555 + 0.666667 NA intron (NM_001172431, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR 3316 NM_001172430 272 Hs.501890 NM_000480 ENSG00000133805 AMPD3 - adenosine monophosphate deaminase 3 protein-coding 120.667-41 chr12 75082822 75083039 + 0.666667 NA intron (NM_001260499, intron 2 of 3) intron (NM_001260499, intron 2 of 3) 126818 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 164.667-169 chr4 99614129 99614526 + 0.666667 NA intron (NM_001300785, intron 15 of 17) intron (NM_001300785, intron 15 of 17) 40352 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 117.333-138 chr3 126078199 126078481 + 0.666667 NA intron (NM_001008486, intron 1 of 10) intron (NM_001008486, intron 1 of 10) 5951 NM_017836 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 167.667-91 chr18 1512623 1513016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -153190 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 155.333-143 chr18 12589139 12589472 + 0.666667 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) intron (NM_020148, intron 2 of 15) 67427 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 142.333-166 chr4 5313152 5313485 + 0.666667 NA intron (NM_001306082, intron 4 of 12) L1MD|LINE|L1 -211251 NR_126519 10141 Hs.177972 NM_005750 ENSG00000082929 LINC01587 C4orf6|aC1 long intergenic non-protein coding RNA 1587 ncRNA 172.667-35 chr11 123522702 123523164 + 0.666667 NA intron (NM_001330396, intron 2 of 19) intron (NM_001330396, intron 2 of 19) -2693 NM_001286563 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 117-45 chr14 36722620 36722829 + 0.666667 NA intron (NM_001171170, intron 6 of 10) MER33|DNA|hAT-Charlie 65156 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 196-151 chr5 84869322 84869652 + 0.666667 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie -484607 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 113-6 chr1 108981444 108981647 + 0.666667 NA intron (NM_014969, intron 13 of 14) intron (NM_014969, intron 13 of 14) -18046 NM_001048210 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 122.667-213 chr9 119568098 119568376 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -198802 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 203.333-91 chr15 87814661 87815029 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 131423 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 136.667-79 chr17 60462338 60462648 + 0.666667 NA intron (NM_006380, intron 6 of 12) intron (NM_006380, intron 6 of 12) 40004 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 132-77 chr21 27682852 27683147 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39380 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 129.667-161 chr7 47202845 47203120 + 0.666667 NA Intergenic L1HS|LINE|L1 261821 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 234.667-14 chr11 8718430 8718987 + 0.666667 NA intron (NM_005418, intron 7 of 22) intron (NM_005418, intron 7 of 22) 33269 NR_002977 677826 Hs.745552 NR_002977 ENSG00000212607 SNORA3B ACA3-2|SNORA45|SNORA45B small nucleolar RNA, H/ACA box 3B snoRNA 236.333-93 chr8 118226695 118227127 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -115092 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 144.667-52 chr12 33585352 33585695 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -145704 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 247.333-43 chr2 75974686 75975278 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -264067 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 153.667-269 chr3 150165231 150165540 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 68942 NR_136187 105374313 Hs.151216 NR_136187 LOC105374313 - uncharacterized LOC105374313 ncRNA 174-79 chr5 41402550 41403032 + 0.666667 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) L1ME1|LINE|L1 107810 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 116.667-30 chr12 13894332 13894574 + 0.666667 NA intron (NM_000834, intron 1 of 12) L1ME4a|LINE|L1 85903 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 125.333-181 chr8 125321575 125321888 + 0.666667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) L1ME1|LINE|L1 -108627 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 182-82 chr4 97878055 97878477 + 0.666667 NA intron (NM_174952, intron 8 of 10) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 265210 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 185.667-126 chr8 77406656 77406988 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43875 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 137.333-193 chr8 80532749 80533099 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 46698 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 122-106 chr6 94848934 94849234 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 728367 NR_104136 101927288 Hs.616643 NR_047502 ENSG00000261366 MANEA-DT MANEA-AS1 MANEA divergent transcript ncRNA 205.667-92 chr3 16638945 16639347 + 0.666667 NA Intergenic BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack -33723 NM_001351 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 175.333-35 chr13 91694060 91694368 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 3 of 7) MIRb|SINE|MIR 295593 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 163-16 chr13 47706171 47706497 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 226288 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 175.333-148 chr5 148645057 148645424 + 0.666667 NA intron (NR_104445, intron 1 of 7) MER58B|DNA|hAT-Charlie -8179 NM_199453 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 167.667-36 chr11 45532725 45533173 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 132673 NM_003654 8534 Hs.104576 NM_003654 ENSG00000175264 CHST1 C6ST|GST-1|KS6ST|KSGal6ST|KSST carbohydrate sulfotransferase 1 protein-coding 119.333-236 chr9 75779197 75779530 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -111281 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 176.333-46 chr14 28763721 28764234 + 0.666667 NA intron (NR_125758, intron 1 of 6) intron (NR_125758, intron 1 of 6) 1342 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 143.667-120 chr19 52948220 52948546 + 0.666667 NA intron (NM_001202473, intron 3 of 3) AluSq2|SINE|Alu -5789 NR_037805 399669 Hs.745445 NM_203307 ENSG00000213801 ZNF321P ZNF321 zinc finger protein 321, pseudogene pseudo 141.667-46 chr11 56611762 56612033 + 0.666667 NA TTS (NM_001004740) TTS (NM_001004740) 1605 NM_001004740 390168 Hs.553751 NM_001004740 ENSG00000255012 OR5M1 OR11-208|OST050 olfactory receptor family 5 subfamily M member 1 protein-coding 164.667-223 chr7 47825170 47825571 + 0.666667 NA intron (NM_138295, intron 45 of 56) AluSq|SINE|Alu 30079 NR_161269 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 132-120 chr8 129690840 129691103 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10732 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 147.333-132 chr16 60175218 60175614 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 184377 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 174-109 chr9 92428422 92428904 + 0.666667 NA intron (NM_001286969, intron 4 of 6) intron (NM_001286969, intron 4 of 6) -4109 NM_005014 4958 Hs.94070 NM_005014 ENSG00000127083 OMD OSAD|SLRR2C osteomodulin protein-coding 119.667-47 chr14 62164207 62164549 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -24405 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 185.667-44 chr17 4261545 4261954 + 0.666667 NA intron (NR_047571, intron 1 of 23) intron (NR_047571, intron 1 of 23) 2098 NM_001257999 51479 Hs.696087 NM_016376 ENSG00000185722 ANKFY1 ANKHZN|BTBD23|ZFYVE14 ankyrin repeat and FYVE domain containing 1 protein-coding 114-49 chr15 79276209 79276488 + 0.666667 NA intron (NR_038997, intron 1 of 1) intron (NR_038997, intron 1 of 1) -6374 NM_001146341 390616 Hs.531231 NM_001146341 ENSG00000235711 ANKRD34C - ankyrin repeat domain 34C protein-coding 152-113 chr4 31153065 31153372 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17926 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 122.667-83 chr2 30343993 30344202 + 0.666667 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 -2549 NR_122048 285043 Hs.429119 NR_122048 LINC01936 - long intergenic non-protein coding RNA 1936 ncRNA 163.667-175 chr4 45850320 45850771 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 273509 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 116-156 chr8 113795632 113795824 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -358789 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 128.667-148 chr5 114110526 114110768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -251423 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 275.333-71 chr7 37067843 37068482 + 0.666667 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) intron (NM_001206480, intron 15 of 21) 70366 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 141.333-66 chr14 59743648 59743925 + 0.666667 NA intron (NM_021136, intron 2 of 8) L2b|LINE|L2 -96766 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 144-53 chr14 66817844 66818153 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) intron (NM_001024218, intron 3 of 21) 310591 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 177.667-124 chr7 7927524 7927974 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 41003 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 174.667-105 chr21 21655854 21656341 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81222 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 122-139 chrX 98927698 98927962 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1363295 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 180-109 chr8 86326162 86326503 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -16215 NM_007013 11059 Hs.655189 NM_007013 ENSG00000123124 WWP1 AIP5|Tiul1|hSDRP1 WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 185-53 chr4 126913296 126913703 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -719458 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 138-121 chr8 122429717 122430067 + 0.666667 NA intron (NR_131202, intron 2 of 3) L1PA16|LINE|L1 138752 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 126-127 chr9 136948200 136948407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3060 NM_000606 733 Hs.1285 NM_000606 ENSG00000176919 C8G C8C complement C8 gamma chain protein-coding 136.333 chr1 6739158 6739533 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 11818 NR_104621 100505887 Hs.250839 NR_104620 LINC01672 NMR long intergenic non-protein coding RNA 1672 ncRNA 144.333-203 chr5 1998966 1999216 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 111760 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 129-57 chr18 64887590 64887880 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -627680 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 215.667-97 chr5 50473525 50473998 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -32473 NM_198449 133418 Hs.561411 NM_198449 ENSG00000170571 EMB GP70 embigin protein-coding 146-123 chr7 11940353 11940639 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -108298 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 156.333-301 chr6 17222222 17222539 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -58981 NM_001143942 221662 Hs.519904 NM_153020 ENSG00000112183 RBM24 RNPC6|dJ259A10.1 RNA binding motif protein 24 protein-coding 208.667-100 chr4 57037129 57037551 + 0.666667 NA intron (NM_001553, intron 2 of 4) intron (NM_001553, intron 2 of 4) 58444 NM_000938 5431 Hs.602757 NM_000938 ENSG00000047315 POLR2B POL2RB|RPB2|hRPB140 RNA polymerase II subunit B protein-coding 168.333-6 chr1 68653976 68654331 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -157071 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 151.667-328 chr7 1042564 1042878 + 0.666667 NA intron (NM_001134395, intron 2 of 4) intron (NM_001134395, intron 2 of 4) -1825 NM_001303473 115330 Hs.585007 NM_138445 ENSG00000164849 GPR146 PGR8 G protein-coupled receptor 146 protein-coding 167.667-22 chr10 48434437 48434727 + 0.666667 NA intron (NM_001323331, intron 12 of 12) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 32970 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 130.333-136 chr3 113128682 113129022 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38879 NR_110823 101929717 Hs.638426 NR_110823 ENSG00000243795 LINC02044 - long intergenic non-protein coding RNA 2044 ncRNA 125-33 chr14 21056764 21057112 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_138331) promoter-TSS (NM_138331) -884 NM_138331 122665 Hs.553572 NM_138331 ENSG00000173431 RNASE8 RAE2 ribonuclease A family member 8 protein-coding 128.333-78 chr17 60735882 60736160 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 5 of 25) L1MC2|LINE|L1 58170 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 201.333-63 chr11 115576421 115576949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72270 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 112 chr1 42373001 42373328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7628 NM_173642 284716 Hs.420244 NM_173642 ENSG00000177181 RIMKLA FAM80A|NAAGS|NAAGS-II ribosomal modification protein rimK like family member A protein-coding 147.333-33 chr10 4635565 4635985 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20381 NR_015425 338588 Hs.121365 NR_015425 LINC00705 - long intergenic non-protein coding RNA 705 ncRNA 159.333-273 chr5 113430913 113431296 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) intron (NM_001085377, intron 1 of 18) 3885 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 124-4 chr1 65362686 65362916 + 0.666667 NA intron (NM_001256865, intron 2 of 19) intron (NM_001256865, intron 2 of 19) 53258 NM_001256864 9829 Hs.647643 NM_014787 ENSG00000116675 DNAJC6 DJC6|PARK19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 protein-coding 164.667-252 chr9 1729810 1730162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -285361 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 120-90 chr3 130556751 130556958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3480 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 145.667-181 chr3 109019805 109020102 + 0.666667 NA intron (NM_014429, intron 17 of 27) intron (NM_014429, intron 17 of 27) -66074 NM_005459 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 113-38 chr12 22574024 22574199 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29565 NM_001286177 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 145-4 chr1 109792320 109792613 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28543 NM_133181 79574 Hs.485352 NM_024526 ENSG00000198758 EPS8L3 EPS8R3 EPS8 like 3 protein-coding 207.666-17 chr14 74613158 74613743 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1213 NM_000428 4053 Hs.512776 NM_000428 ENSG00000119681 LTBP2 C14orf141|GLC3D|LTBP3|MSPKA|MSTP031|WMS3 latent transforming growth factor beta binding protein 2 protein-coding 271.333-5 chr10 57872008 57872474 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 395653 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 219-26 chr15 26615428 26615942 + 0.666667 NA intron (NR_103801, intron 6 of 6) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 13405 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 146.333-111 chr15 77093598 77093931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22655 NM_001168412 10099 Hs.744863 NM_005724 ENSG00000140391 TSPAN3 TM4-A|TM4SF8|TSPAN-3 tetraspanin 3 protein-coding 113.333-214 chr5 110493293 110493550 + 0.666667 NA intron (NM_001039763, intron 12 of 13) L1ME3E|LINE|L1 20494 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 160.667-172 chr20 1979815 1980152 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_024411, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_024411, exon 4 of 4) 12823 NM_001190892 5173 Hs.22584 NM_024411 ENSG00000101327 PDYN ADCA|PENKB|SCA23 prodynorphin protein-coding 157-57 chr19 32903231 32903551 + 0.666667 NA intron (NM_032816, intron 14 of 18) L1MEc|LINE|L1 -33624 NM_014270 11136 Hs.743345 NM_014270 ENSG00000021488 SLC7A9 BAT1|CSNU3 solute carrier family 7 member 9 protein-coding 248.667-6 chr1 184043072 184043665 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -5640 NM_001303420 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 113.667-151 chr3 185683034 185683338 + 0.666667 NA intron (NR_138486, intron 7 of 15) L1MB2|LINE|L1 -30066 NR_126326 646600 Hs.647949 NR_027317 ENSG00000163915 IGF2BP2-AS1 C3orf65 IGF2BP2 antisense RNA 1 ncRNA 162-135 chrX 99944562 99944883 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 465551 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 187-73 chr6 115821877 115822306 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -178256 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 125.333-31 chr10 115520139 115520339 + 0.666667 NA intron (NM_207303, intron 25 of 28) intron (NM_207303, intron 25 of 28) 426874 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 204-65 chr15 56899382 56899853 + 0.666667 NA intron (NR_015419, intron 2 of 3) AluJb|SINE|Alu -18473 NM_001322151 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 146.333-197 chr3 29677801 29678125 + 0.666667 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) intron (NM_001003792, intron 4 of 13) 256193 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 184-9 chr1 220353111 220353601 + 0.666667 NA Intergenic LTR1|LTR|ERV1 -80903 NM_012414 25782 Hs.654849 NM_012414 ENSG00000118873 RAB3GAP2 RAB3-GAP150|RAB3GAP150|SPG69|WARBM2|p150 RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2 protein-coding 169.667-76 chr15 59560843 59561334 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -50695 NM_004751 9245 Hs.194710 NM_004751 ENSG00000140297 GCNT3 C2/4GnT|C24GNT|C2GNT2|C2GNTM|GNTM glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type protein-coding 135.667-67 chr15 99673990 99674395 + 0.666667 NA intron (NM_001365201, intron 5 of 11) (TATAGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 41214 NM_001130928 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 136.667-50 chr13 94468732 94469008 + 0.666667 NA exon (NM_001922, exon 2 of 8) exon (NM_001922, exon 2 of 8) 10812 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 113.667-193 chr7 4337268 4337515 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -202554 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 169.333-261 chr8 18562791 18563083 + 0.666667 NA intron (NM_015310, intron 14 of 15) AluSz|SINE|Alu 171655 NM_000015 10 Hs.2 NM_000015 ENSG00000156006 NAT2 AAC2|NAT-2|PNAT N-acetyltransferase 2 protein-coding 187-63 chr4 168593691 168594112 + 0.666667 NA intron (NM_001166108, intron 2 of 21) intron (NM_001166108, intron 2 of 21) -37677 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 153-70 chr2 13299298 13299720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -292496 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 136.667-24 chr10 103892942 103893334 + 0.666667 NA intron (NM_024928, intron 7 of 9) intron (NM_024928, intron 7 of 9) 25046 NM_024928 79991 Hs.62314 NM_024928 ENSG00000107960 STN1 AAF-44|AAF44|OBFC1|RPA-32|bA541N10.2 STN1 subunit of CST complex protein-coding 123.333-160 chr4 57459999 57460345 + 0.666667 NA intron (NR_125907, intron 4 of 5) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 34300 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 140.667-201 chr6 105766201 105766566 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -319953 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 133-45 chr2 123710952 123711340 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 314028 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 173-62 chr4 32499271 32499647 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 148421 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 211-7 chr1 228762550 228763142 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 27367 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 121.667-51 chr12 112141995 112142306 + 0.666667 NA exon (NM_001143906, exon 6 of 12) exon (NM_001143906, exon 6 of 12) 16590 NM_006700 10906 Hs.5148 NM_006700 ENSG00000135148 TRAFD1 FLN29 TRAF-type zinc finger domain containing 1 protein-coding 128.333-120 chr20 34063227 34063547 + 0.666667 NA intron (NM_007367, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR 14268 NR_039911 100616434 NR_039911 ENSG00000264616 MIR4755 mir-4755 microRNA 4755 ncRNA 116.333-75 chr15 92638742 92638918 + 0.666667 NA intron (NM_207446, intron 1 of 2) intron (NM_207446, intron 1 of 2) 16945 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 140.667-125 chr2 126845392 126845665 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -53362 NM_001322244 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 112.333-184 chr4 64072011 64072220 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 337335 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 271.667-17 chr11 103225914 103226569 + 0.666667 NA intron (NM_001377, intron 59 of 88) L1PB1|LINE|L1 116815 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 288-19 chr14 87965816 87966458 + 0.666667 NA intron (NM_000153, intron 8 of 16) MIR|SINE|MIR 27045 NM_000153 2581 Hs.513439 NM_000153 ENSG00000054983 GALC - galactosylceramidase protein-coding 123.667-61 chr14 83175883 83176138 + 0.666667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 533378 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 145.667-257 chr6 119791424 119791772 + 0.666667 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) -223581 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 222-18 chr11 88561792 88562227 + 0.666667 NA intron (NM_001143831, intron 7 of 8) intron (NM_001143831, intron 7 of 8) 57433 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-184 chr7 95314825 95315047 + 0.666667 NA intron (NM_000446, intron 4 of 8) intron (NM_000446, intron 4 of 8) 9596 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 121.333-51 chr14 47103007 47103291 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 5 of 16) intron (NM_001113498, intron 5 of 16) 240097 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 179-7 chr1 177125082 177125480 + 0.666667 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) intron (NM_207108, intron 1 of 21) 39431 NM_001364856 460 Hs.495897 NM_004319 ENSG00000152092 ASTN1 ASTN astrotactin 1 protein-coding 124.333-4 chr1 47981113 47981320 + 0.666667 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) AluSz6|SINE|Alu 16169 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 212-151 chr8 50184002 50184526 + 0.666667 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) AluSx1|SINE|Alu 20133 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 166.333-137 chr21 28285537 28285957 + 0.666667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -57080 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 114.667-143 chr2 171051334 171051622 + 0.666667 NA intron (NM_001136555, intron 6 of 18) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 15495 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 198.667-42 chr11 133606962 133607451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74705 NM_001012393 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 173.333-18 chr1 198860442 198860892 + 0.666667 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) intron (NR_040073, intron 2 of 2) -1514 NR_029626 406995 NR_029626 ENSG00000207759 MIR181A1 MIR213|MIRN181A1|MIRN213|hsa-mir-181a-1|mir-181a-1|mir-213 microRNA 181a-1 ncRNA 152.333-190 chr2 133630291 133630597 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -61981 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 152-27 chr10 118027159 118027479 + 0.666667 NA intron (NM_014904, intron 3 of 4) MIR|SINE|MIR -19502 NR_026940 255082 Hs.89387 NM_178816 ENSG00000177640 CASC2 C10orf5 cancer susceptibility 2 ncRNA 118.333-133 chr3 47927801 47928090 + 0.666667 NA intron (NM_002375, intron 4 of 18) intron (NM_002375, intron 4 of 18) 78390 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 132.333-145 chr6 7178095 7178490 + 0.666667 NA intron (NM_001003699, intron 2 of 12) intron (NM_001003699, intron 2 of 12) 70331 NM_001003698 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 160.333-273 chr8 36816005 36816313 + 0.666667 NA intron (NM_001031836, intron 9 of 26) intron (NM_001031836, intron 9 of 26) 31785 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 126.667-175 chr8 86256127 86256467 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25916 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 221-22 chr15 27389962 27390497 + 0.666667 NA intron (NM_001270873, intron 5 of 5) intron (NM_001270873, intron 5 of 5) -228910 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 125.333-75 chr18 1375483 1375800 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16012 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 152-119 chr4 157393374 157393781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 172849 NM_000826 2891 Hs.32763 NM_000826 ENSG00000120251 GRIA2 GLUR2|GLURB|GluA2|GluR-K2|HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 protein-coding 136.667-41 chr12 99985389 99985646 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001352185) promoter-TSS (NM_001352185) -863 NM_001352185 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 126.667-6 chr1 82433559 82433909 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -469449 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 199-12 chr10 85769115 85769563 + 0.666667 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) intron (NM_017551, intron 8 of 15) 191608 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 152-153 chr8 82294507 82294817 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -452376 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 153-13 chr10 51389378 51389660 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 89946 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 122.333-180 chr5 173159006 173159295 + 0.666667 NA intron (NM_013979, intron 5 of 6) AluSx|SINE|Alu 14619 NM_013980 662 Hs.145726 NM_001205 ENSG00000113734 BNIP1 NIP1|SEC20|TRG-8 BCL2 interacting protein 1 protein-coding 144-70 chr2 19824340 19824716 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -44326 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 163.333-219 chr5 55222604 55222923 + 0.666667 NA intron (NM_001190787, intron 4 of 6) intron (NM_001190787, intron 4 of 6) 4552 NM_001190787 345643 Hs.394578 NM_001190787 ENSG00000234602 MCIDAS IDAS|MCI|MCIN multiciliate differentiation and DNA synthesis associated cell cycle protein protein-coding 135.667-120 chr3 95400843 95401134 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282205 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 114-52 chr17 65849437 65849670 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) intron (NM_001353129, intron 21 of 26) -23010 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 128-124 chr9 32491043 32491366 + 0.666667 NA intron (NM_014314, intron 5 of 17) intron (NM_014314, intron 5 of 17) 34992 NM_014314 23586 Hs.190622 NM_014314 ENSG00000107201 DDX58 RIG-I|RIG1|RIGI|RLR-1|SGMRT2 DExD/H-box helicase 58 protein-coding 154-115 chr5 98574115 98574443 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -194353 NM_001366510 285704 Hs.526902 NM_173670 ENSG00000174136 RGMB DRAGON repulsive guidance molecule BMP co-receptor b protein-coding 134.333-60 chr15 66883401 66883693 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72968 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 173.667 chr1 19436605 19437110 + 0.666667 NA intron (NM_001206540, intron 1 of 9) intron (NM_001206540, intron 1 of 9) 47438 NM_001282162 832 Hs.432760 NM_004930 ENSG00000077549 CAPZB CAPB|CAPPB|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit beta protein-coding 153.667-240 chr22 40471846 40472275 + 0.666667 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) L1M4|LINE|L1 -8620 NM_001282660 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 218.333-53 chr17 64227505 64228003 + 0.666667 NA intron (NM_018469, intron 1 of 11) MIRb|SINE|MIR 2980 NM_001288733 55852 Hs.175414 NM_018469 ENSG00000136478 TEX2 HT008|TMEM96 testis expressed 2 protein-coding 235-53 chr8 136723404 136724020 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 192914 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 144-10 chr1 225830153 225830452 + 0.666667 NA intron (NM_001136018, intron 2 of 8) intron (NM_001136018, intron 2 of 8) 4948 NM_000120 2052 Hs.89649 NM_000120 ENSG00000143819 EPHX1 EPHX|EPOX|HYL1|MEH epoxide hydrolase 1 protein-coding 240-37 chr17 66726467 66726874 + 0.666667 NA intron (NM_002737, intron 8 of 16) intron (NM_002737, intron 8 of 16) -60402 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 165.667-108 chr20 50504916 50505293 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5217 NM_001278618 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 191.333-50 chr12 130601453 130601946 + 0.666667 NA intron (NM_001351226, intron 2 of 21) intron (NM_001351226, intron 2 of 21) 26757 NM_015347 23504 Hs.657441 NM_015347 ENSG00000060709 RIMBP2 PPP1R133|RBP2|RIM-BP2 RIMS binding protein 2 protein-coding 125.667-189 chr8 99895676 99895924 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2093 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 121.333-102 chr20 54098198 54098493 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -27580 NM_001316361 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 113.333-243 chr7 62766770 62767054 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 537144 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 204.333-53 chr14 58782309 58782644 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45812 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 146.667-283 chr6 102883282 102883631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1484471 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 177.333-105 chr3 31283198 31283699 + 0.666667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -121661 NR_130459 100423038 NR_130459 ENSG00000265376 MIR466 hsa-mir-466 microRNA 466 ncRNA 209.667-37 chr12 109189706 109190209 + 0.666667 NA intron (NM_001093, intron 13 of 52) AluSq2|SINE|Alu 73370 NM_001093 32 Hs.234898 NM_001093 ENSG00000076555 ACACB ACC2|ACCB|HACC275 acetyl-CoA carboxylase beta protein-coding 135-48 chr2 151469423 151469675 + 0.666667 NA intron (NM_001177665, intron 31 of 33) intron (NM_001177665, intron 31 of 33) 59647 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 125.667-162 chr6 27449405 27449762 + 0.666667 NA intron (NR_144688, intron 5 of 8) AluJr|SINE|Alu 23315 NM_001318892 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 159-41 chr16 12021123 12021388 + 0.666667 NA intron (NM_032167, intron 3 of 20) AluSx3|SINE|Alu 44521 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 116.333-98 chr18 6491614 6491800 + 0.666667 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -19709 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 199.333-166 chr20 56611647 56612038 + 0.666667 NA Intergenic (ATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17464 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 162-18 chr10 105062720 105063058 + 0.666667 NA intron (NM_014978, intron 5 of 26) intron (NM_014978, intron 5 of 26) -396673 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 123.667-141 chr4 61884821 61885154 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 276778 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 195.333-19 chr1 204775197 204775644 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -53232 NM_001005389 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 127-44 chr2 56364562 56364907 + 0.666667 NA intron (NM_001348515, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 -178964 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 205-95 chr8 40631866 40632212 + 0.666667 NA intron (NM_001135731, intron 4 of 5) intron (NM_001135731, intron 4 of 5) 265787 NM_001135731 79698 Hs.591850 NM_024645 ENSG00000165061 ZMAT4 - zinc finger matrin-type 4 protein-coding 176-64 chr4 40626011 40626385 + 0.666667 NA intron (NM_001371114, intron 1 of 5) intron (NM_001371114, intron 1 of 5) 3666 NM_001098634 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 162-62 chr2 55853158 55853475 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 70466 NM_001039349 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 123-6 chr1 87140888 87141101 + 0.666667 NA intron (NR_026989, intron 2 of 2) intron (NR_026989, intron 2 of 2) 9068 NR_026985 339524 Hs.306423 NM_207357 ENSG00000267272 LINC01140 - long intergenic non-protein coding RNA 1140 ncRNA 176.333-104 chr22 25684541 25684940 + 0.666667 NA intron (NM_001362778, intron 8 of 19) intron (NM_001362778, intron 8 of 19) -57448 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 167-70 chr3 18504965 18505374 + 0.666667 NA intron (NR_125803, intron 4 of 6) intron (NR_125803, intron 4 of 6) -59577 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 120-125 chr6 114296187 114296394 + 0.666667 NA intron (NR_125845, intron 9 of 9) intron (NR_125845, intron 9 of 9) -233413 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 118.333-211 chr8 134406185 134406472 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -191743 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 149-52 chr16 46976527 46976845 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3012 NM_005880 10294 Hs.368078 NM_005880 ENSG00000069345 DNAJA2 CPR3|DJ3|DJA2|DNAJ|DNJ3|HIRIP4|PRO3015|RDJ2 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A2 protein-coding 155.333-279 chr4 169403955 169404298 + 0.666667 NA intron (NM_001199400, intron 29 of 32) intron (NM_001199400, intron 29 of 32) -133170 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 156-77 chr2 219970586 219970879 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64167 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 156.333-153 chr18 13445953 13446385 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR -13778 NR_049822 100847080 NR_049822 ENSG00000266146 MIR5190 - microRNA 5190 ncRNA 184.667-13 chr1 242029866 242030273 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -30971 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 313.333-49 chr8 141934922 141935672 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -148984 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 141.333-195 chr5 89275968 89276265 + 0.666667 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) intron (NR_136219, intron 7 of 9) -372011 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 139.667-37 chr12 41497421 41497794 + 0.666667 NA intron (NM_013377, intron 1 of 7) intron (NM_013377, intron 1 of 7) 59868 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 132.333-105 chr20 63855551 63855800 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5538 NM_080622 140701 Hs.266774 NM_080622 ENSG00000183260 ABHD16B C20orf135|dJ591C20.1 abhydrolase domain containing 16B protein-coding 138.667-183 chr6 120336514 120336913 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 321534 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 170-41 chr16 4274766 4275132 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1926 NM_003223 7023 Hs.513305 NM_003223 ENSG00000090447 TFAP4 AP-4|bHLHc41 transcription factor AP-4 protein-coding 174.667-160 chr7 44927613 44927969 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42261 NM_033224 5814 Hs.349150 NM_033224 ENSG00000146676 PURB PURBETA purine rich element binding protein B protein-coding 112-178 chr5 146992457 146992651 + 0.666667 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) L1MDa|LINE|L1 63583 NM_181674 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 113-195 chr7 67719728 67720012 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -300383 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 119.333-19 chr1 224211791 224212082 + 0.666667 NA intron (NR_110669, intron 1 of 1) intron (NR_110669, intron 1 of 1) 1343 NR_110669 101927143 Hs.638720 NR_110669 ENSG00000232628 LOC101927143 - uncharacterized LOC101927143 ncRNA 119.333-171 chr5 38180025 38180369 + 0.666667 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) 31717 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 169.667-86 chr17 10548027 10548465 + 0.666667 NA intron (NM_001100112, intron 2 of 39) MIRc|SINE|MIR 1377 NM_001100112 4620 Hs.667534 NM_017534 ENSG00000125414 MYH2 IBM3|MYH2A|MYHSA2|MYHas8|MYPOP|MyHC-2A|MyHC-IIa myosin heavy chain 2 protein-coding 237-39 chr2 44246601 44247111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28624 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 121.333-4 chr1 45290885 45291166 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12885 NR_024270 400752 Hs.334348 NR_024270 ENSG00000281912 LINC01144 - long intergenic non-protein coding RNA 1144 ncRNA 127-53 chr20 52194655 52194896 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2790 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 140-60 chr2 76542263 76542636 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -443516 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 165-61 chr3 195291642 195292047 + 0.666667 NA intron (NM_012287, intron 19 of 22) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -20685 NM_152531 152002 Hs.478741 NM_152531 ENSG00000173950 XXYLT1 C3orf21 xyloside xylosyltransferase 1 protein-coding 158.333-274 chr6 54219778 54220116 + 0.666667 NA intron (NM_138569, intron 10 of 12) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -88494 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 166.667-214 chr7 29874890 29875338 + 0.666667 NA intron (NM_001080529, intron 2 of 8) intron (NM_001080529, intron 2 of 8) 68560 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 120.667-13 chr1 228503779 228503990 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8404 NM_001287262 100129094 Hs.730208 NM_001287262 BTNL10 BTN4|BUTR1 butyrophilin like 10 protein-coding 214-26 chr11 110339098 110339455 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15838 NR_135100 105369486 Hs.611557 NR_135100 LINC02732 - long intergenic non-protein coding RNA 2732 ncRNA 337-9 chr14 59042352 59043189 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -145897 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 167.333-128 chr2 101184079 101184384 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 32571 NR_135594 100506286 Hs.679790 NR_135594 ENSG00000272902 TBC1D8-AS1 - TBC1 domain family member 8 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-420 chr8 110492501 110492780 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -516869 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 118-53 chr17 61876856 61877193 + 0.666667 NA intron (NM_001351695, intron 18 of 24) HAL1|LINE|L1 -13465 NM_032043 83990 Hs.128903 NM_032043 ENSG00000136492 BRIP1 BACH1|FANCJ|OF BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 protein-coding 121.667-74 chr17 71385189 71385503 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -183167 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 121.667-210 chr8 124574679 124574937 + 0.666667 NA intron (NM_001363294, intron 6 of 13) intron (NM_001363294, intron 6 of 13) 35685 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 133.667-91 chr3 16788781 16789073 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -96028 NM_001144382 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 146.333-263 chr5 100554500 100554829 + 0.666667 NA intron (NM_198507, intron 1 of 2) intron (NM_198507, intron 1 of 2) 19290 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 111.667-185 chr4 86245543 86245866 + 0.666667 NA intron (NM_001363657, intron 2 of 13) intron (NM_001363657, intron 2 of 13) 108940 NM_001318067 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 162-49 chr16 21568262 21568558 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28811 NM_001288660 51108 Hs.279583 NM_016025 ENSG00000197006 METTL9 CGI-81|DREV|DREV1|PAP1 methyltransferase like 9 protein-coding 182.667-70 chr19 52679942 52680439 + 0.666667 NA intron (NM_001348019, intron 1 of 6) AluSp|SINE|Alu 10391 NM_001277945 55769 Hs.467210 NM_018300 ENSG00000167766 ZNF83 HPF1|ZNF816B zinc finger protein 83 protein-coding 131.667-105 chr2 179172090 179172483 + 0.666667 NA intron (NM_178123, intron 4 of 17) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 92546 NM_178123 91404 Hs.30977 NM_178123 ENSG00000187231 SESTD1 SOLO SEC14 and spectrin domain containing 1 protein-coding 154.667-43 chr10 58724251 58724529 + 0.666667 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9375 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 231.333-107 chr7 7396507 7397055 + 0.666667 NA intron (NM_001037763, intron 27 of 34) intron (NM_001037763, intron 27 of 34) 139092 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 126.667-162 chr7 5362368 5362575 + 0.666667 NA intron (NM_001080495, intron 12 of 29) MIR3|SINE|MIR 61075 NM_001080495 84629 Hs.520638 NM_001013722 ENSG00000182095 TNRC18 CAGL79|TNRC18A trinucleotide repeat containing 18 protein-coding 158-66 chr18 35651009 35651273 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3428 NM_020474 2589 Hs.514806 NM_020474 ENSG00000141429 GALNT1 GALNAC-T1 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 159-36 chr14 52550980 52551308 + 0.666667 NA intron (NM_001160047, intron 1 of 20) intron (NM_001160047, intron 1 of 20) 1361 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 115.667-98 chr17 43764213 43764400 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -5515 NM_025237 50964 Hs.349204 NM_025237 ENSG00000167941 SOST CDD|DAND6|SOST1|VBCH sclerostin protein-coding 144.667-286 chr7 106107451 106107866 + 0.666667 NA intron (NM_182715, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 4654 NM_182715 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 121.667-45 chr12 5779563 5779769 + 0.666667 NA intron (NM_001278596, intron 10 of 25) L1MC4|LINE|L1 165593 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 149.667-180 chr2 8562841 8563156 + 0.666667 NA non-coding (NR_110257, exon 6 of 6) non-coding (NR_110257, exon 6 of 6) 20794 NR_110257 101929567 Hs.634706 NR_110257 ENSG00000236008 LINC01814 - long intergenic non-protein coding RNA 1814 ncRNA 188-48 chr18 22576103 22576577 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -158425 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 130.667-93 chr18 8292866 8293141 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 17 of 30) intron (NM_002845, intron 17 of 30) 74031 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 145.667-238 chr5 158889478 158889887 + 0.666667 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) MIR3|SINE|MIR 208274 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 162.667-67 chr13 22549890 22550295 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 339807 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 119.667-197 chrX 87584820 87585144 + 0.666667 NA intron (NM_057162, intron 1 of 10) L1MA1|LINE|L1 67180 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 121.333-178 chr8 88847406 88847741 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -520090 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 153.333-339 chr5 102759654 102760016 + 0.666667 NA intron (NR_157231, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 4530 NM_001364591 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 172.333-150 chr6 12938629 12939009 + 0.666667 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) L1ME1|LINE|L1 -18537 NM_001322311 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 173.333-89 chr2 28785364 28785697 + 0.666667 NA intron (NM_206876, intron 6 of 8) AluJb|SINE|Alu -25304 NM_001142634 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 181.333-30 chr11 132669911 132670445 + 0.666667 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) intron (NM_001319104, intron 1 of 6) 273459 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 241-5 chr10 71659244 71659941 + 0.666667 NA intron (NM_022124, intron 13 of 67) MER112|DNA|hAT-Charlie 60186 NM_001164375 414152 Hs.568788 NM_001164375 ENSG00000214688 C10orf105 - chromosome 10 open reading frame 105 protein-coding 209.333-195 chr5 129053872 129054359 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40634 NM_016048 51015 Hs.483296 NM_016048 ENSG00000066583 ISOC1 CGI-111 isochorismatase domain containing 1 protein-coding 164-122 chr8 144428085 144428433 + 0.666667 NA TTS (NM_013432) TTS (NM_013432) 289 NM_016208 51160 Hs.418175 NM_016208 ENSG00000160948 VPS28 - VPS28 subunit of ESCRT-I protein-coding 179.667-138 chr8 85627721 85628120 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 27756 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 156.333-86 chr12 109010737 109011119 + 0.666667 NA intron (NM_018711, intron 1 of 15) AluSz|SINE|Alu 10140 NM_018711 55530 Hs.4221 NM_018711 ENSG00000166111 SVOP - SV2 related protein protein-coding 190.333-144 chr8 71328290 71328612 + 0.666667 NA intron (NM_001370336, intron 5 of 17) L2c|LINE|L2 28255 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 146-33 chr14 86038927 86039268 + 0.666667 NA intron (NR_110155, intron 1 of 3) MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR 104419 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 113-3 chr1 93283836 93284028 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 61879 NR_034089 100131564 Hs.732666 NR_034089 CCDC18-AS1 - CCDC18 antisense RNA 1 ncRNA 156.667-87 chr12 116970299 116970708 + 0.666667 NA intron (NM_153348, intron 5 of 10) intron (NM_153348, intron 5 of 10) 16834 NR_103809 100506551 Hs.657861 NR_103809 ENSG00000257279 LOC100506551 - uncharacterized LOC100506551 ncRNA 131.333-172 chr8 36101500 36101729 + 0.666667 NA Intergenic MER90a|LTR|ERV1 -391294 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 118.333-196 chr7 86541689 86541906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102112 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 153.667-285 chr4 48139859 48140165 + 0.666667 NA intron (NM_003215, intron 15 of 17) intron (NM_003215, intron 15 of 17) -5762 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 166.333-9 chr1 87926242 87926653 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -554792 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 114.333-116 chr2 148627182 148627425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17448 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 212.333 chr1 15755065 15755553 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1329 NM_001350151 54751 Hs.530101 NM_017556 ENSG00000162458 FBLIM1 CAL|FBLP-1|FBLP1 filamin binding LIM protein 1 protein-coding 167-30 chr12 27577787 27578069 + 0.666667 NA intron (NM_003622, intron 1 of 29) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 53722 NM_001198916 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 178.667-81 chr2 121421977 121422333 + 0.666667 NA intron (NM_015282, intron 22 of 38) intron (NM_015282, intron 22 of 38) -108725 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 127-88 chr7 23744526 23744887 + 0.666667 NA intron (NM_031414, intron 8 of 23) L1M2|LINE|L1 34487 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 115.667-154 chr3 193938187 193938443 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55923 NR_027764 100128023 Hs.730112 NR_027764 DPPA2P3 - developmental pluripotency associated 2 pseudogene 3 pseudo 134.667-16 chr10 31317159 31317492 + 0.666667 NA non-coding (NR_148977, exon 1 of 1) non-coding (NR_148977, exon 1 of 1) -1092 NM_001323638 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 185-73 chr8 9483618 9484074 + 0.666667 NA Intergenic MER54A|LTR|ERVL -72066 NM_003747 8658 Hs.370267 NM_003747 ENSG00000173273 TNKS ARTD5|PARP-5a|PARP5A|PARPL|TIN1|TINF1|TNKS1|pART5 tankyrase protein-coding 170.667-29 chr11 130185808 130186146 + 0.666667 NA intron (NM_021978, intron 1 of 18) AluSx|SINE|Alu 26195 NM_021978 6768 Hs.504315 NM_021978 ENSG00000149418 ST14 ARCI11|HAI|MT-SP1|MTSP1|PRSS14|SNC19|TADG15|TMPRSS14 suppression of tumorigenicity 14 protein-coding 242-30 chr17 7967561 7968193 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -34793 NM_000180 3000 Hs.592109 NM_000180 ENSG00000132518 GUCY2D CACD1|CORD5|CORD6|CYGD|GUC1A4|GUC2D|LCA|LCA1|RCD2|RETGC-1|ROS-GC1|ROSGC|retGC guanylate cyclase 2D, retinal protein-coding 153.667-360 chr7 51205291 51205650 + 0.666667 NA intron (NM_015198, intron 2 of 12) L1MA9|LINE|L1 111339 NM_001346441 23242 Hs.99141 NM_015198 ENSG00000106078 COBL - cordon-bleu WH2 repeat protein protein-coding 144.333-4 chr1 35785869 35786155 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -16034 NM_022111 63967 Hs.175613 NM_022111 ENSG00000092853 CLSPN - claspin protein-coding 239.667-30 chr17 72708986 72709536 + 0.666667 NA intron (NM_001352692, intron 7 of 9) intron (NM_001352692, intron 7 of 9) -68789 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 164.667-176 chr4 176884089 176884409 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8547 NR_149104 105377556 NR_149104 ENSG00000250263 LINC02509 - long intergenic non-protein coding RNA 2509 ncRNA 164.333-107 chr19 46219930 46220300 + 0.666667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 -9627 NM_198541 374918 Hs.546554 NM_198541 ENSG00000188293 IGFL1 APRG644|UNQ644 IGF like family member 1 protein-coding 152-69 chr17 29063925 29064367 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 11463 NM_004740 9220 Hs.462590 NM_004740 ENSG00000221995 TIAF1 MAJN|SPR210 TGFB1-induced anti-apoptotic factor 1 protein-coding 169.667-143 chr4 16739215 16739575 + 0.666667 NA intron (NM_001304435, intron 2 of 7) AluSz|SINE|Alu 159250 NM_001130834 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 129.667-101 chr2 128881213 128881443 + 0.666667 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 16728 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 165.667-101 chr2 241547314 241547773 + 0.666667 NA intron (NR_033346, intron 1 of 1) HAL1|LINE|L1 -11202 NM_032515 666 Hs.293753 NM_032515 ENSG00000176720 BOK BCL2L9|BOKL BCL2 family apoptosis regulator BOK protein-coding 155.667-64 chr12 12348343 12348625 + 0.666667 NA intron (NM_001363613, intron 1 of 4) L1MC2|LINE|L1 1758 NM_001363613 54682 Hs.591145 NM_018050 ENSG00000111261 MANSC1 9130403P13Rik|LOH12CR3 MANSC domain containing 1 protein-coding 151.333-26 chr1 162049094 162049419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20435 NM_001164757 9722 Hs.731942 NM_014697 ENSG00000198929 NOS1AP 6330408P19Rik|CAPON nitric oxide synthase 1 adaptor protein protein-coding 113.667-111 chr2 162812224 162812466 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) 26422 NM_173162 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 141.333-19 chr10 28461009 28461294 + 0.666667 NA intron (NR_134496, intron 1 of 2) L1MD|LINE|L1 34662 NR_134496 105376468 Hs.522525 NR_134496 ENSG00000237128 LINC02652 - long intergenic non-protein coding RNA 2652 ncRNA 201.333-264 chr7 66791647 66792045 + 0.666667 NA intron (NM_001367725, intron 6 of 10) AluSx3|SINE|Alu 35964 NM_001287061 27342 Hs.530053 NM_014504 ENSG00000154710 RABGEF1 RABEX5|RAP1|rabex-5 RAB guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 158.333-175 chr20 47591526 47591961 + 0.666667 NA intron (NM_181659, intron 2 of 22) L1MC4|LINE|L1 89856 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 181.667-15 chr10 91833165 91833581 + 0.666667 NA intron (NM_025235, intron 11 of 26) L1ME2z|LINE|L1 34947 NM_025235 80351 Hs.329327 NM_025235 ENSG00000107854 TNKS2 ARTD6|PARP-5b|PARP-5c|PARP5B|PARP5C|TANK2|TNKL|pART6 tankyrase 2 protein-coding 196-196 chr9 99867464 99867856 + 0.666667 NA TTS (NM_173200) TTS (NM_173200) 38941 NR_038853 441461 Hs.163155 NR_038853 ENSG00000255145 STX17-AS1 - STX17 antisense RNA 1 ncRNA 189.666-15 chr16 8102150 8102707 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 487410 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 115.333-86 chr16 10193352 10193651 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -10593 NM_000833 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 194.667-66 chr2 94983314 94983788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36209 NR_037597 442028 Hs.611545 NR_037597 ENSG00000259848 LOC442028 - uncharacterized LOC442028 ncRNA 226.667-21 chr10 82601666 82602202 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) AluJr|SINE|Alu -369014 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 176.667-18 chr1 208481890 208482352 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -237737 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 157-20 chr10 65383208 65383572 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -188035 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 145-93 chr5 54143060 54143409 + 0.666667 NA intron (NM_019087, intron 3 of 4) L1M5|LINE|L1 167339 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 166.333-170 chr5 4693353 4693693 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79958 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 175.333-72 chr18 57757533 57757985 + 0.666667 NA intron (NM_005603, intron 1 of 27) L1MC4|LINE|L1 45556 NM_005603 5205 Hs.216623 NM_005603 ENSG00000081923 ATP8B1 ATPIC|BRIC|FIC1|ICP1|PFIC|PFIC1 ATPase phospholipid transporting 8B1 protein-coding 132-23 chr10 114835553 114835865 + 0.666667 NA intron (NM_001135051, intron 4 of 16) intron (NM_001135051, intron 4 of 16) 13929 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 166.667-192 chr5 177427777 177428246 + 0.666667 NA intron (NM_001004106, intron 1 of 15) intron (NM_001004106, intron 1 of 15) 1325 NM_002082 2870 Hs.235116 NM_002082 ENSG00000198055 GRK6 GPRK6 G protein-coupled receptor kinase 6 protein-coding 139-116 chr9 121725824 121726223 + 0.666667 NA intron (NM_032552, intron 3 of 16) MER21B|LTR|ERVL -16762 NM_138709 153090 Hs.522378 NM_032552 ENSG00000136848 DAB2IP AF9Q34|AIP-1|AIP1|DIP1/2 DAB2 interacting protein protein-coding 126.667-136 chr5 36097528 36097887 + 0.666667 NA TTS (NM_001007527) TTS (NM_001007527) -30825 NM_174914 167127 Hs.348941 NM_174914 ENSG00000168671 UGT3A2 - UDP glycosyltransferase family 3 member A2 protein-coding 148-34 chr12 65125836 65126179 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4702 NM_007191 11197 Hs.284122 NM_007191 ENSG00000156076 WIF1 WIF-1 WNT inhibitory factor 1 protein-coding 125.667-14 chr1 177553243 177553602 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -147102 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 153.667-114 chr13 114322166 114322554 + 0.666667 NA intron (NM_001164144, intron 2 of 2) intron (NM_001164144, intron 2 of 2) 7857 NM_001164144 283489 Hs.7542 NM_032436 ENSG00000198824 CHAMP1 C13orf8|CAMP|CHAMP|MRD40|ZNF828 chromosome alignment maintaining phosphoprotein 1 protein-coding 142.667-52 chr14 42162483 42162852 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 555811 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 115.333-100 chr18 11291529 11291855 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -142930 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 156-52 chr15 58975479 58975892 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11978 NM_001270528 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 186.333-60 chr17 59336400 59336807 + 0.666667 NA intron (NM_001005404, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 4948 NM_001005404 388403 Hs.463613 NM_001005404 ENSG00000175155 YPEL2 FKSG4 yippee like 2 protein-coding 190.667-158 chr9 83599954 83600374 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22885 NM_001256915 414328 Hs.530261 NM_001001551 ENSG00000148057 IDNK C9orf103|bA522I20.2|hGntK IDNK gluconokinase protein-coding 136.333-194 chr7 78107479 78107839 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 19 of 20) L1MA3|LINE|L1 -239583 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 145-82 chr4 129326984 129327347 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 231013 NM_001099783 132321 Hs.567679 NM_173487 ENSG00000151470 C4orf33 - chromosome 4 open reading frame 33 protein-coding 203.667-69 chr21 8993923 8994360 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6524 NR_162105 113218501 NR_162105 MIR10396A - microRNA 10396a ncRNA 114.333-9 chr1 147485597 147485926 + 0.666667 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 32114 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 192.667-11 chr1 177771526 177771953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71215 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 163-2 chr1 51235254 51235591 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_147076) promoter-TSS (NR_147076) -326 NR_147076 105378716 NR_147076 ENSG00000203356 LINC01562 - long intergenic non-protein coding RNA 1562 ncRNA 164-110 chr7 71802930 71803223 + 0.666667 NA intron (NM_001363460, intron 5 of 5) intron (NM_001363460, intron 5 of 5) -495306 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 164-45 chr17 47178589 47178927 + 0.666667 NA intron (NM_001256, intron 2 of 18) MIRb|SINE|MIR 10537 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 176.333-113 chr3 125285287 125285697 + 0.666667 NA intron (NM_001348434, intron 4 of 7) intron (NM_001348434, intron 4 of 7) 71788 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 131.333-100 chr20 19486009 19486264 + 0.666667 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) intron (NM_020689, intron 2 of 16) -201540 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 193.667-119 chr6 153665164 153665600 + 0.666667 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -345114 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 152-13 chr1 224177553 224177860 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR2c|LTR|Gypsy -5534 NM_003676 8560 Hs.299878 NM_003676 ENSG00000143753 DEGS1 DEGS|DEGS-1|DES1|Des-1|FADS7|HLD18|MIG15|MLD delta 4-desaturase, sphingolipid 1 protein-coding 120.667-122 chr3 197590420 197590645 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17209 NM_203315 622 Hs.274539 NM_004051 ENSG00000161267 BDH1 BDH|SDR9C1 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 1 protein-coding 238.333-29 chr15 79099253 79099731 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8712 NM_001145648 5923 Hs.459035 NM_002891 ENSG00000058335 RASGRF1 CDC25|CDC25L|GNRP|GRF1|GRF55|H-GRF55|PP13187|ras-GRF1 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1 protein-coding 123-109 chr6 146738471 146738774 + 0.666667 NA intron (NM_024694, intron 23 of 35) AluY|SINE|Alu 65202 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 114.667-231 chr6 147662439 147662627 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 153843 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 119.667-196 chrX 73742762 73742959 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -49345 NR_003255 9383 Hs.529901 NR_003255 ENSG00000270641 TSIX LINC00013|NCRNA00013|XIST-AS|XIST-AS1|XISTAS TSIX transcript, XIST antisense RNA ncRNA 180-2 chr1 39652729 39653267 + 0.666667 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 -13355 NM_014571 26508 Hs.472566 NM_014571 ENSG00000163909 HEYL HESR3|HEY3|HRT3|bHLHb33 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif like protein-coding 118.333-165 chr5 53868520 53868814 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -48985 NR_147167 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 135-52 chr2 196700839 196701103 + 0.666667 NA intron (NR_034036, intron 3 of 3) intron (NR_034036, intron 3 of 3) 12041 NR_034036 100130452 Hs.591625 NR_034036 LOC100130452 - uncharacterized LOC100130452 ncRNA 146-22 chr12 58503735 58504082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87794 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 114.667-169 chr3 9254349 9254538 + 0.666667 NA intron (NR_146969, intron 1 of 2) L1MB5|LINE|L1 4687 NR_146969 101927440 NR_146969 ENSG00000235830 SRGAP3-AS4 - SRGAP3 antisense RNA 4 ncRNA 181.333-155 chr6 129312237 129312623 + 0.666667 NA intron (NM_000426, intron 22 of 64) L2c|LINE|L2 397747 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 119-140 chr8 66337324 66337527 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 91552 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 135.667-56 chr14 83560472 83560738 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 917973 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 155.667-98 chr14 62973222 62973675 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 6 of 10) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 72010 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 208.333-99 chr4 2035292 2035860 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -6417 NM_001168243 401115 Hs.446474 NM_001141936 ENSG00000243449 C4orf48 CHR4_55 chromosome 4 open reading frame 48 protein-coding 117.333-96 chr2 29527470 29527676 + 0.666667 NA intron (NM_004304, intron 4 of 28) AluJr|SINE|Alu -52196 NR_136317 105374389 Hs.196534 NR_136317 LOC105374389 - uncharacterized LOC105374389 ncRNA 241.333-96 chr7 66916929 66917578 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -3972 NM_017994 55069 Hs.488478 NM_017994 ENSG00000106609 TMEM248 C7orf42 transmembrane protein 248 protein-coding 183-58 chr2 88296280 88296704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 123353 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 145.667-241 chr5 172120743 172121106 + 0.666667 NA intron (NM_005990, intron 3 of 18) MIRb|SINE|MIR 67300 NM_005990 6793 Hs.744005 NM_005990 ENSG00000072786 STK10 LOK|PRO2729 serine/threonine kinase 10 protein-coding 159-10 chr1 145912423 145912866 + 0.666667 NA intron (NM_001184795, intron 3 of 3) intron (NM_001184795, intron 3 of 3) -2455 NM_001303041 8515 Hs.158237 NM_003637 ENSG00000143127 ITGA10 PRO827 integrin subunit alpha 10 protein-coding 164.667-206 chr6 125252665 125253070 + 0.666667 NA intron (NM_001318903, intron 5 of 7) intron (NM_001318903, intron 5 of 7) 49100 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 173.667-93 chr2 173642637 173642961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 287927 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 269.667-34 chr22 38166121 38166748 + 0.666667 NA intron (NM_001349869, intron 2 of 16) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 15396 NM_001004426 8398 Hs.170479 NM_003560 ENSG00000184381 PLA2G6 CaI-PLA2|GVI|INAD1|IPLA2-VIA|NBIA2|NBIA2A|NBIA2B|PARK14|PLA2|PNPLA9|iPLA2|iPLA2beta phospholipase A2 group VI protein-coding 113.333-115 chr19 40765454 40765726 + 0.666667 NA TTS (NM_004596) TTS (NM_004596) -9570 NM_001202553 8190 Hs.646364 NM_006533 ENSG00000261857 MIA CD-RAP MIA SH3 domain containing protein-coding 162.333-65 chr14 21245887 21246370 + 0.666667 NA intron (NM_001077442, intron 1 of 7) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 23351 NM_031314 3183 Hs.508848 NM_004500 ENSG00000092199 HNRNPC C1|C2|HNRNP|HNRPC|SNRPC heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (C1/C2) protein-coding 184.333-45 chr14 70653613 70653975 + 0.666667 NA intron (NM_015351, intron 1 of 2) intron (NM_015351, intron 1 of 2) 11878 NM_015351 23508 Hs.79170 NM_015351 ENSG00000133985 TTC9 TTC9A tetratricopeptide repeat domain 9 protein-coding 113-46 chr12 115745199 115745457 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 403326 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 129.333-141 chr4 76762778 76763049 + 0.666667 NA intron (NM_020859, intron 9 of 10) L2b|LINE|L2 135231 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 151.667-379 chr8 131809135 131809423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -94814 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 143.333-94 chr14 81553065 81553385 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -19364 NM_001244984 6400 Hs.181300 NM_005065 ENSG00000071537 SEL1L Hrd3|PRO1063|SEL1-LIKE|SEL1L1 SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase protein-coding 155.667-5 chr1 20760905 20761248 + 0.666667 NA intron (NM_016287, intron 8 of 12) AluSx|SINE|Alu 25612 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 129-6 chr1 168891667 168891989 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 104887 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 134-85 chr5 33148212 33148515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -81372 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 170.333-40 chr10 119593129 119593594 + 0.666667 NA intron (NM_001323964, intron 1 of 12) intron (NM_001323964, intron 1 of 12) 3668 NM_001033925 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 120-139 chr8 127059615 127059901 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -20116 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 113-100 chr2 39443268 39443566 + 0.666667 NA intron (NR_037875, intron 1 of 5) MamTip3|DNA|hAT-Tip100 6001 NR_037875 728730 Hs.655344 NR_037875 ENSG00000231312 MAP4K3-DT - MAP4K3 divergent transcript ncRNA 140.667-175 chr5 13101248 13101523 + 0.666667 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -68499 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 129.333-58 chr13 82218564 82218846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -991722 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 113-114 chr2 190633588 190633899 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15152 NM_001321313 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 139-18 chr10 107416876 107417175 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -252319 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 130.333-86 chr16 83766152 83766445 + 0.666667 NA intron (NM_001220489, intron 10 of 12) intron (NM_001220489, intron 10 of 12) 37678 NR_120308 102724163 NR_120308 ENSG00000260228 LOC102724163 - uncharacterized LOC102724163 ncRNA 142.667-111 chr2 183162653 183162936 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38351 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 171-72 chr7 3485064 3485409 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MA4|LINE|L1 183984 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 113-132 chr3 12129042 12129375 + 0.666667 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) intron (NM_133625, intron 1 of 12) 29704 NM_003256 7079 Hs.591665 NM_003256 ENSG00000157150 TIMP4 TIMP-4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 protein-coding 144-79 chr2 203270157 203270495 + 0.666667 NA intron (NM_177538, intron 5 of 12) intron (NM_177538, intron 5 of 12) 31885 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 112-64 chr14 71177873 71178042 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -142519 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 129-90 chr4 30739587 30739808 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 19328 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 214-44 chr16 51071632 51072146 + 0.666667 NA intron (NR_039672, intron 2 of 6) intron (NR_039672, intron 2 of 6) 54131 NR_110913 101927334 Hs.555184 NR_110913 ENSG00000261637 LINC02127 - long intergenic non-protein coding RNA 2127 ncRNA 120.333-179 chr8 51362629 51362870 + 0.666667 NA intron (NM_144651, intron 19 of 22) MER57A-int|LTR|ERV1 446696 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 174.333-57 chr2 33960202 33960620 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -106815 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 193.667-149 chrX 56237758 56238180 + 0.666667 NA intron (NM_001324099, intron 1 of 3) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 4811 NR_136704 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 166.667-204 chr6 121089175 121089621 + 0.666667 NA intron (NR_104452, intron 35 of 35) intron (NR_104452, intron 35 of 35) 245082 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 116.667-184 chr7 13341704 13341937 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 644694 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 111.667-115 chr18 21868268 21868515 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_020774, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_020774, exon 21 of 21) -36985 NR_110369 102723167 Hs.658808 NR_110369 ENSG00000265142 MIR133A1HG MIR1-2HG MIR133A1 host gene ncRNA 190.667-56 chr17 61293445 61293895 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 74034 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 151-83 chr3 49053373 49053681 + 0.666667 NA intron (NM_017730, intron 4 of 10) L2|LINE|L2 -24129 NM_000884 3615 Hs.654400 NM_000884 ENSG00000178035 IMPDH2 IMPD2|IMPDH-II inosine monophosphate dehydrogenase 2 protein-coding 179.333-101 chr2 137226547 137226874 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 461165 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 136.333-23 chr10 69628347 69628704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1722 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 199.667 chr1 19573178 19573659 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 23414 NR_135054 105378614 Hs.430098 NR_135054 ENSG00000235185 LOC105378614 - uncharacterized LOC105378614 ncRNA 155-63 chr2 54982758 54983139 + 0.666667 NA intron (NM_020532, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR 27324 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 255-30 chr14 48897693 48898143 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 688462 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 142.667-126 chr20 62506129 62506404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30271 NM_080473 140628 Hs.352250 NM_080473 ENSG00000130700 GATA5 CHTD5|GATAS|bB379O24.1 GATA binding protein 5 protein-coding 140-86 chr5 52031856 52032206 + 0.666667 NA intron (NR_147166, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 24000 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 144.667-90 chr15 26853675 26853976 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -13237 NM_000810 2558 Hs.24969 NM_000810 ENSG00000186297 GABRA5 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit protein-coding 198-15 chr10 44607233 44607542 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -222290 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 202.667-64 chr16 75667332 75667785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19785 NM_018975 54386 Hs.301419 NM_018975 ENSG00000166848 TERF2IP DRIP5|RAP1 TERF2 interacting protein protein-coding 179-72 chr4 92892706 92893034 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 588471 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 153-17 chr11 50605203 50605620 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 196264 NR_024504 646813 Hs.684179 NR_024504 LOC646813 - DExH-box helicase 9 pseudogene pseudo 113.333-217 chr5 145971054 145971361 + 0.666667 NA intron (NM_152550, intron 2 of 9) intron (NM_152550, intron 2 of 9) 34629 NM_152550 153769 Hs.443728 NM_152550 ENSG00000156463 SH3RF2 HEPP1|POSHER|PPP1R39|RNF158 SH3 domain containing ring finger 2 protein-coding 209.667-51 chr15 86132608 86133054 + 0.666667 NA intron (NM_152336, intron 1 of 24) intron (NM_152336, intron 1 of 24) -16114 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 159.333-89 chr14 50264088 50264531 + 0.666667 NA intron (NM_024884, intron 9 of 9) AluSp|SINE|Alu -32731 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 274-12 chr12 122074774 122075324 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -3707 NM_014938 22877 Hs.437153 NM_014938 ENSG00000175727 MLXIP MIR|MONDOA|bHLHe36 MLX interacting protein protein-coding 169.333-156 chr3 29222735 29223181 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57981 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 118-114 chr6 114737673 114738008 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -674963 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 152.667-292 chr5 60243254 60243577 + 0.666667 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) L1MA3|LINE|L1 129248 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 207.333-26 chr10 16036157 16036745 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -175918 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 172.667-39 chr12 32954892 32955256 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -58228 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 140.667-146 chr3 70533637 70533908 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -221134 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 114.333-74 chr14 68122294 68122548 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1ME4b|LINE|L1 298829 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 154.667-296 chr5 12101751 12102086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -197472 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 143.333-286 chr8 101916289 101916628 + 0.666667 NA intron (NM_001040624, intron 3 of 7) L1PA16|LINE|L1 -67974 NR_126152 104054148 Hs.683917 NR_126152 LOC104054148 - uncharacterized LOC104054148 ncRNA 169.667-200 chr8 3855355 3855751 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 5 of 69) intron (NM_033225, intron 5 of 69) -1127102 NR_125426 101927815 Hs.571467 NR_125423 ENSG00000254319 LOC101927815 - uncharacterized LOC101927815 ncRNA 192-127 chr6 142042814 142043368 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 45708 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 138.667-190 chr7 54248305 54248575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -82257 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 202-57 chr15 98772823 98773328 + 0.666667 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) -11351 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 209.667-75 chr20 48370350 48370720 + 0.666667 NA non-coding (NR_026958, exon 5 of 5) non-coding (NR_026958, exon 5 of 5) 10624 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 136-71 chr4 3410243 3410546 + 0.666667 NA intron (NM_002926, intron 4 of 16) intron (NM_002926, intron 4 of 16) -31574 NM_001297439 3083 Hs.104 NM_001528 ENSG00000109758 HGFAC HGFA HGF activator protein-coding 149-102 chr4 79215805 79216095 + 0.666667 NA intron (NR_038342, intron 4 of 5) (TAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 110111 NM_032693 84779 Hs.676048 NM_032693 ENSG00000156269 NAA11 ARD1B|ARD2|hARD2 N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit protein-coding 146.333-13 chr1 89770209 89770612 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50622 NM_001134479 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 148.333-106 chr12 118185665 118185939 + 0.666667 NA intron (NM_001346490, intron 15 of 21) L2c|LINE|L2 4733 NM_001346495 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 157.667-328 chr8 78768669 78768987 + 0.666667 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L1PA3|LINE|L1 36635 NM_000880 3574 Hs.591873 NM_000880 ENSG00000104432 IL7 IL-7 interleukin 7 protein-coding 112.333-111 chr2 15173286 15173470 + 0.666667 NA intron (NR_052013, intron 50 of 50) intron (NR_052013, intron 50 of 50) 387956 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 114-48 chr15 78316061 78316341 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16592 NM_001303247 80349 Hs.513055 NM_025234 ENSG00000140395 WDR61 REC14|SKI8 WD repeat domain 61 protein-coding 133.667-5 chr1 103104112 103104425 + 0.666667 NA intron (NM_001854, intron 1 of 66) intron (NM_001854, intron 1 of 66) 4228 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 148.333-125 chr14 64950612 64950979 + 0.666667 NA intron (NM_001330182, intron 5 of 7) intron (NM_001330182, intron 5 of 7) -8050 NR_046320 2877 Hs.2704 NM_002083 ENSG00000176153 GPX2 GI-GPx|GPRP|GPRP-2|GPx-2|GPx-GI|GSHPX-GI|GSHPx-2 glutathione peroxidase 2 protein-coding 169.667-209 chr8 123327723 123328085 + 0.666667 NA intron (NM_014109, intron 25 of 27) MIRb|SINE|MIR -20130 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 143.667-213 chr6 50283052 50283327 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -233260 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 178-8 chr1 108993442 108993819 + 0.666667 NA intron (NM_014969, intron 8 of 14) HAL1|LINE|L1 -30131 NM_001048210 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 170.667-79 chr2 39041910 39042274 + 0.666667 NA intron (NM_005633, intron 6 of 22) L1MEi|LINE|L1 78371 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 159.333-177 chr2 202248698 202249074 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10289 NM_001371392 154-68 chr16 67363456 67363896 + 0.666667 NA exon (NM_001161575, exon 3 of 11) exon (NM_001161575, exon 3 of 11) 16321 NM_001161575 55282 Hs.125139 NM_018296 ENSG00000159708 LRRC36 RORBP70|XLHSRF2 leucine rich repeat containing 36 protein-coding 157.333-27 chr1 169827996 169828344 + 0.666667 NA intron (NR_159440, intron 13 of 24) L2a|LINE|L2 33130 NR_159440 55732 Hs.443551 NM_018186 ENSG00000000460 C1orf112 - chromosome 1 open reading frame 112 protein-coding 126.667-144 chr5 111154928 111155179 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 62881 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 141.333-174 chr4 76019162 76019453 + 0.666667 NA intron (NM_001130017, intron 1 of 9) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 4190 NM_001565 3627 Hs.632586 NM_001565 ENSG00000169245 CXCL10 C7|IFI10|INP10|IP-10|SCYB10|crg-2|gIP-10|mob-1 C-X-C motif chemokine ligand 10 protein-coding 122-17 chr10 98769931 98770180 + 0.666667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 154513 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 202.333-159 chr7 7126223 7126772 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -29711 NR_034022 100131257 Hs.551110 NR_034022 LOC100131257 - zinc finger protein 655 pseudogene pseudo 153.667-355 chr7 28516336 28516712 + 0.666667 NA intron (NM_182899, intron 3 of 9) intron (NM_182899, intron 3 of 9) 80909 NM_004904 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 214.333-68 chr19 9162832 9163437 + 0.666667 NA non-coding (NR_102435, exon 7 of 7) non-coding (NR_102435, exon 7 of 7) -22460 NM_175883 162998 Hs.531755 NM_175883 ENSG00000188000 OR7D2 HTPCRH03|OR19-10|OR19-4 olfactory receptor family 7 subfamily D member 2 protein-coding 164.333-248 chr9 33073502 33073902 + 0.666667 NA exon (NM_018225, exon 2 of 12) exon (NM_018225, exon 2 of 12) 2972 NM_018225 55234 Hs.655351 NM_018225 ENSG00000122692 SMU1 BWD|SMU-1|fSAP57 SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor protein-coding 134-106 chr8 64398608 64398871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19590 NR_029669 406908 NR_029669 ENSG00000207816 MIR124-2 MIRN124-2|MIRN124A2|mir-124-2 microRNA 124-2 ncRNA 134.333-50 chr14 61073743 61073994 + 0.666667 NA intron (NR_033344, intron 15 of 16) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -92178 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 166-90 chr4 86520789 86521199 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 21558 NR_039657 100616463 NR_039657 ENSG00000266515 MIR4452 - microRNA 4452 ncRNA 155-121 chr7 101905282 101905592 + 0.666667 NA intron (NM_181552, intron 1 of 23) intron (NM_181552, intron 1 of 23) 87811 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 157-132 chr8 110035561 110035973 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59996 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 111.667-277 chrX 81809123 81809353 + 0.666667 NA Intergenic HERV30-int|LTR|ERV1 607136 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 116.667-46 chr13 50572589 50572813 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -45252 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 115-123 chr5 23225174 23225354 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -282345 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 158.667-306 chr7 78989106 78989442 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -19714 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 229-61 chr7 10028901 10029348 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 394854 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 122.667-136 chr4 60711726 60711963 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -210775 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 156-8 chr1 69794166 69794545 + 0.666667 NA intron (NM_001370785, intron 4 of 26) intron (NM_001370785, intron 4 of 26) -124967 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 157-37 chr13 49748607 49748931 + 0.666667 NA intron (NM_002267, intron 1 of 16) intron (NM_002267, intron 1 of 16) 43913 NM_002267 3839 Hs.527919 NM_002267 ENSG00000102753 KPNA3 IPOA4|SRP1|SRP1gamma|SRP4|hSRP1 karyopherin subunit alpha 3 protein-coding 136-40 chr16 25907280 25907647 + 0.666667 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) intron (NM_006040, intron 1 of 1) -117774 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 151-37 chr14 57971888 57972178 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -105941 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 169.333-63 chr13 22450106 22450608 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 240072 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 179.333-195 chr9 24266693 24267105 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 278777 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 136-54 chr2 192004326 192004594 + 0.666667 NA intron (NM_001305134, intron 5 of 9) intron (NM_001305134, intron 5 of 9) -157372 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 240-13 chr11 99698247 99698634 + 0.666667 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) intron (NM_175566, intron 1 of 21) 142295 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 168.667-98 chr2 33756576 33756979 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) AluSx4|SINE|Alu -28560 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 182.333-95 chr20 3152820 3153330 + 0.666667 NA intron (NM_021826, intron 1 of 1) intron (NM_021826, intron 1 of 1) 6790 NM_021826 60493 Hs.741168 NM_021826 ENSG00000215251 FASTKD5 dJ1187M17.5 FAST kinase domains 5 protein-coding 147-85 chr21 27150144 27150581 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -183274 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 175.667-47 chr15 60438952 60439458 + 0.666667 NA intron (NM_024611, intron 12 of 15) Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger 39937 NM_024611 79664 Hs.200943 NM_024611 ENSG00000128915 ICE2 BRCC1|NARG2 interactor of little elongation complex ELL subunit 2 protein-coding 140-6 chr1 76200621 76200950 + 0.666667 NA intron (NM_001349108, intron 1 of 3) intron (NM_001349108, intron 1 of 3) 126039 NM_001349110 256435 Hs.337040 NM_152996 ENSG00000184005 ST6GALNAC3 PRO7177|SIAT7C|ST6GALNACIII|STY ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 protein-coding 119.333-185 chr6 5490995 5491229 + 0.666667 NA intron (NM_006567, intron 4 of 6) L1ME1|LINE|L1 -33037 NR_125846 101927972 Hs.668417 NR_125846 ENSG00000269985 LOC101927972 - uncharacterized LOC101927972 ncRNA 128-105 chr7 29093905 29094178 + 0.666667 NA intron (NM_001371256, intron 9 of 16) intron (NM_001371256, intron 9 of 16) -30992 NR_120523 101928168 Hs.666750 NR_120523 ENSG00000285412 LOC101928168 - uncharacterized LOC101928168 ncRNA 192.333-144 chr5 174832518 174833041 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81045 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 207.333-195 chr4 33496332 33496778 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 543338 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 111.667-129 chr2 50443593 50443767 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -95924 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 116.333-97 chr18 4496254 4496493 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41066 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 152.333-388 chr8 121002340 121002633 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -190440 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 247-22 chr14 64654209 64654811 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49914 NM_001308147 26030 Hs.509637 NM_015549 ENSG00000126822 PLEKHG3 ARHGEF43|KIAA0599 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G3 protein-coding 155.667-181 chr2 180434581 180434974 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -257327 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 115.667-53 chr12 12544744 12545027 + 0.666667 NA intron (NM_030640, intron 1 of 6).2 L1ME3A|LINE|L1 17978 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 144.333-180 chr3 182056822 182057101 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 104597 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 142-48 chr15 62364170 62364452 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 21282 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 144-20 chr10 104769619 104769862 + 0.666667 NA intron (NM_014978, intron 1 of 26) intron (NM_014978, intron 1 of 26) -103524 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 120.667-171 chr8 32041645 32041890 + 0.666667 NA intron (NR_104156, intron 3 of 3) L1ME1|LINE|L1 15549 NR_104156 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 122.333-25 chr10 109480820 109481120 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 442276 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 112-214 chr9 86833728 86833896 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 113694 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 165.333-197 chr4 159482128 159482542 + 0.666667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity 214526 NM_014247 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 205.667-71 chr2 77286250 77286600 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 235951 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 122-75 chr3 98677846 98678210 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -54208 NM_001271147 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 171.667-30 chr11 75155250 75155607 + 0.666667 NA intron (NM_001145212, intron 1 of 10) intron (NM_001145212, intron 1 of 10) 4321 NM_001145212 11309 Hs.7884 NM_007256 ENSG00000137491 SLCO2B1 OATP-B|OATP2B1|OATPB|SLC21A9 solute carrier organic anion transporter family member 2B1 protein-coding 144.667-87 chr14 68378857 68379265 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 249726 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 127.333-7 chr1 85364867 85365117 + 0.666667 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) intron (NM_001134445, intron 2 of 6) 39514 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 184.333-41 chr14 60767669 60768104 + 0.666667 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) AluSc5|SINE|Alu 33125 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 149.333-71 chr11 24354769 24355137 + 0.666667 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 -142100 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 113-43 chr12 61456074 61456385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 736610 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 128.667-43 chr12 40822782 40823141 + 0.666667 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) L1PA16|LINE|L1 -4977 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 112.667-95 chr17 55664092 55664275 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58681 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 179.667-24 chr10 106002626 106002948 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -137378 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 183.667-56 chr15 91432438 91432862 + 0.666667 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -30689 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 125.667-25 chr10 65222711 65222985 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -298330 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 181 chr1 104390248 104390679 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 317440 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 165.333-235 chr6 163856881 163857356 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -185634 NR_134620 102724152 Hs.738183 NR_134620 LOC102724152 - uncharacterized LOC102724152 ncRNA 154.667-382 chr8 78030474 78030774 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -485716 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 205-52 chr2 234692554 234692976 + 0.666667 NA intron (NR_132376, intron 1 of 2) intron (NR_132376, intron 1 of 2) 10097 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 117-103 chr4 61416406 61416656 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) Charlie10|DNA|hAT-Charlie 214359 NM_001371342 202-31 chr12 9641371 9641773 + 0.666667 NA intron (NR_046448, intron 1 of 4) MER61-int|LTR|ERV1 -1296 NR_046449 374443 Hs.569124 NR_002814 ENSG00000256594 LOC374443 - C-type lectin domain family 2 member D pseudogene pseudo 120.333-196 chr8 132125395 132125643 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004519, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_004519, exon 15 of 15) -20254 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 187-89 chr8 95912178 95912651 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 35934 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 233.333-80 chr22 26675433 26675986 + 0.666667 NA non-coding (NR_003491, exon 5 of 5) non-coding (NR_003491, exon 5 of 5) 2866 NR_110543 102724827 Hs.642767 NR_110543 MIATNB - MIAT neighbor ncRNA 206.333-165 chr8 99106946 99107441 + 0.666667 NA intron (NR_047582, intron 6 of 8) intron (NR_047582, intron 6 of 8) 93927 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 139.667-103 chr20 41104992 41105226 + 0.666667 NA intron (NM_003286, intron 13 of 20) L1ME3C|LINE|L1 -32434 NM_002660 5335 Hs.268177 NM_002660 ENSG00000124181 PLCG1 NCKAP3|PLC-II|PLC1|PLC148|PLCgamma1 phospholipase C gamma 1 protein-coding 120.333-175 chr7 117697109 117697349 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132553 NR_149084 111082987 Hs.583149 NR_149084 ENSG00000232661 CFTR-AS1 BGas CFTR antisense RNA 1 ncRNA 148.667-328 chr6 35145400 35145680 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4130 NM_001261821 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 150-158 chr9 76141558 76141859 + 0.666667 NA intron (NM_006200, intron 10 of 20) L1ME1|LINE|L1 251035 NR_120409 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 117.333-114 chr2 216870471 216870670 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_130782) promoter-TSS (NR_130782) -202 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 153.333-171 chr18 39972906 39973306 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93180 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 167.333-165 chr22 38502027 38502452 + 0.666667 NA intron (NM_006386, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 4072 NM_001098504 10521 Hs.528305 NM_006386 ENSG00000100201 DDX17 P72|RH70 DEAD-box helicase 17 protein-coding 177-61 chr5 20685107 20685480 + 0.666667 NA intron (NR_149120, intron 3 of 11) intron (NR_149120, intron 3 of 11) -69758 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 187.667-44 chr14 64786177 64786604 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_107009) promoter-TSS (NR_107009) -704 NR_107009 102465841 NR_107009 ENSG00000284269 MIR7855 hsa-mir-7855 microRNA 7855 ncRNA 199-7 chr10 25136316 25136796 + 0.666667 NA intron (NR_120649, intron 6 of 7) L2a|LINE|L2 23498 NR_120649 101929025 Hs.553324 NR_120649 ENSG00000231422 LINC01516 - long intergenic non-protein coding RNA 1516 ncRNA 204.333-107 chr2 178815659 178816057 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -8435 NM_133432 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 143-22 chr11 16024156 16024458 + 0.666667 NA intron (NM_033326, intron 12 of 15) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -54686 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 116.333-103 chr19 46958513 46958731 + 0.666667 NA intron (NM_004491, intron 3 of 6) L1M7|LINE|L1 -61215 NM_002517 4861 Hs.79564 NM_002517 ENSG00000130751 NPAS1 MOP5|PASD5|bHLHe11 neuronal PAS domain protein 1 protein-coding 144.333-231 chr6 57243997 57244378 + 0.666667 NA Intergenic MER101B|LTR|ERV1 19159 NR_109774 100506188 Hs.485640 NR_109774 LOC100506188 - uncharacterized LOC100506188 ncRNA 166-110 chr7 71021460 71021936 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -110446 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 125.333-109 chr22 29861614 29861984 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21370 NM_153050 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 126-11 chr10 47168045 47168272 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -132039 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 127-95 chr8 104731946 104732295 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143096 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 112.333-146 chr20 24717812 24718030 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -231348 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 128-43 chr2 51831618 51831863 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) MIR|SINE|MIR -538908 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 177.333-73 chr17 67420403 67420885 + 0.666667 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) AluSz6|SINE|Alu 43363 NM_012417 26207 Hs.591185 NM_012417 ENSG00000154217 PITPNC1 M-RDGB-beta|MRDGBbeta|RDGB-BETA|RDGBB|RDGBB1 phosphatidylinositol transfer protein cytoplasmic 1 protein-coding 145.667-122 chr18 63960547 63960934 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001123366, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001123366, exon 4 of 4) -9289 NM_001276490 5271 Hs.368077 NM_002640 ENSG00000166401 SERPINB8 C18orf53|CAP2|PI-8|PI8|PSS5 serpin family B member 8 protein-coding 144.333-200 chr4 167985100 167985498 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -107238 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 118.667-136 chr3 70692794 70693007 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 372024 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 184.667-103 chr5 111617177 111617633 + 0.666667 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR -104808 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 113.333-129 chr2 80507701 80507980 + 0.666667 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) intron (NM_001282599, intron 3 of 11) 194461 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 161.333-204 chr3 197264400 197264753 + 0.666667 NA intron (NM_001366216, intron 4 of 23) AluSq2|SINE|Alu 29372 NR_039960 100616216 NR_039960 ENSG00000265850 MIR4797 - microRNA 4797 ncRNA 163.333-204 chr4 84740176 84740476 + 0.666667 NA exon (NM_014991, exon 39 of 68) exon (NM_014991, exon 39 of 68) 157199 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 259.666-6 chr10 48370806 48371524 + 0.666667 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) intron (NM_001323302, intron 3 of 13) -30447 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 140.333-249 chr9 109111350 109111657 + 0.666667 NA intron (NM_032012, intron 1 of 17) intron (NM_032012, intron 1 of 17) 8444 NM_032012 23731 Hs.308074 NM_032012 ENSG00000106771 TMEM245 C9orf5|CG-2|CG2 transmembrane protein 245 protein-coding 125.333-82 chr19 34910099 34910327 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4898 NR_146451 100652911 Hs.292009 NR_146451 ENSG00000269037 LINC01838 - long intergenic non-protein coding RNA 1838 ncRNA 223.333-141 chr6 41123248 41123751 + 0.666667 NA intron (NR_026938, intron 15 of 22) intron (NR_026938, intron 15 of 22) 22465 NR_026938 221442 Hs.374076 NM_001010871 ENSG00000161912 ADCY10P1 - ADCY10 pseudogene 1 pseudo 118-12 chr10 122845260 122845450 + 0.666667 NA intron (NM_022034, intron 1 of 8) AluSg|SINE|Alu 502 NM_022034 50624 Hs.647182 NM_022034 ENSG00000138161 CUZD1 ERG-1|ERG1|ITMAP1|UO-44 CUB and zona pellucida like domains 1 protein-coding 145.333-134 chr2 73315770 73316064 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -22369 NM_001965 1961 Hs.3052 NM_001965 ENSG00000135625 EGR4 AT133|NGFI-C|NGFIC|PAT133 early growth response 4 protein-coding 209-100 chr6 65987951 65988550 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 200371 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 112-47 chr12 75816125 75816348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 215540 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 147.667-171 chr2 63309574 63309922 + 0.666667 NA intron (NR_148704, intron 14 of 18) L1M4|LINE|L1 128259 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 158.667-192 chr21 29359186 29359615 + 0.666667 NA intron (NR_027655, intron 6 of 7) intron (NR_027655, intron 6 of 7) -13101 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 176-102 chr8 109325461 109325944 + 0.666667 NA intron (NM_032869, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 4231 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 113.667-203 chr7 97047639 97047809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22893 NM_005221 1749 Hs.99348 NM_005221 ENSG00000105880 DLX5 SHFM1D distal-less homeobox 5 protein-coding 128.333-81 chr17 72498503 72498886 + 0.666667 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) intron (NR_036488, intron 1 of 3) 94110 NR_152515 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 152-97 chr21 30311406 30311853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8686 NM_203405 388818 Hs.28704 NM_203405 ENSG00000197683 KRTAP26-1 - keratin associated protein 26-1 protein-coding 131.667-90 chr2 49856574 49856813 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 117510 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 127.333-66 chr17 63717286 63717516 + 0.666667 NA intron (NM_153335, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu 17063 NR_046273 729683 Hs.534931 NR_046273 LOC729683 - uncharacterized LOC729683 ncRNA 177.333-132 chr5 61112343 61112717 + 0.666667 NA intron (NM_174889, intron 3 of 3) L1MA3|LINE|L1 -49786 NR_109908 101928630 Hs.575209 NR_109908 SMIM15-AS1 CTC-436P18.1 SMIM15 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-198 chr8 127825351 127825682 + 0.666667 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 29554 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 116-71 chr2 27475134 27475455 + 0.666667 NA intron (NM_015662, intron 14 of 47) L1MEd|LINE|L1 14449 NM_015662 26160 Hs.127401 NM_015662 ENSG00000138002 IFT172 BBS20|NPHP17|RP71|SLB|SRTD10|osm-1|wim intraflagellar transport 172 protein-coding 161-77 chr5 53130046 53130367 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20364 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 177.333-76 chr18 64849467 64849808 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -589582 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 172.333-73 chr18 50061549 50061929 + 0.666667 NA intron (NM_001080467, intron 1 of 39) MER5B|DNA|hAT-Charlie 64824 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 144-137 chr5 147437958 147438243 + 0.666667 NA intron (NM_001197294, intron 1 of 13) intron (NM_001197294, intron 1 of 13) 15592 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 200-27 chr10 109004001 109004395 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 919048 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 260.333-68 chr7 108304210 108304673 + 0.666667 NA intron (NM_001371126, intron 3 of 32) intron (NM_001371126, intron 3 of 32) 24085 NM_001371178 147-10 chr10 13545493 13545868 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16666 NM_001369863 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 175.667-50 chr15 95038734 95039225 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 183616 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 122.333-74 chr17 58802312 58802647 + 0.666667 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) L1M3|LINE|L1 46610 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 111.667-31 chr10 55694091 55694388 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66297 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 143.667-273 chrUn_KI270519v1 84006 84351 + 0.666667 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 112.333-150 chr21 27004402 27004592 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37409 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 167-9 chr10 34618530 34618914 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) intron (NM_001184789, intron 2 of 22) 196574 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 196.667-73 chr2 59336526 59336960 + 0.666667 NA Intergenic MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 119035 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 122.667-100 chr2 206882883 206883197 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56478 NM_173077 130749 Hs.684103 NM_173077 ENSG00000144410 CPO - carboxypeptidase O protein-coding 132.667-117 chr4 8089078 8089356 + 0.666667 NA intron (NM_001130084, intron 3 of 19) intron (NM_001130084, intron 3 of 19) -17229 NM_001286688 84448 Hs.233404 NM_032432 ENSG00000163995 ABLIM2 - actin binding LIM protein family member 2 protein-coding 115.333-81 chr15 38912832 38913143 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 216389 NR_160786 145-22 chr12 79426994 79427338 + 0.666667 NA intron (NM_001291901, intron 8 of 9) intron (NM_001291901, intron 8 of 9) 7909 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 114.667-138 chr2 126734900 126735231 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 78907 NM_002101 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 127-52 chr20 38984558 38984850 + 0.666667 NA intron (NM_021931, intron 4 of 21) L1M6|LINE|L1 22360 NM_021931 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 193-22 chr14 62297035 62297413 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -157251 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 177.667-31 chr11 114760507 114760930 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 82191 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 209.333-173 chr4 88032505 88032850 + 0.666667 NA intron (NR_156488, intron 2 of 13) intron (NR_156488, intron 2 of 13) 25042 NR_156488 5311 Hs.181272 NM_000297 ENSG00000118762 PKD2 APKD2|PC2|PKD4|Pc-2|TRPP2 polycystin 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 138-88 chr5 2833232 2833580 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81275 NM_178569 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 167.667-220 chr9 128363117 128363592 + 0.666667 NA intron (NR_031672, intron 2 of 2).4 AluSp|SINE|Alu -7965 NM_001135947 81605 Hs.495229 NM_030914 ENSG00000167118 URM1 C9orf74 ubiquitin related modifier 1 protein-coding 126.667-150 chr6 15938336 15938671 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -190583 NM_013262 29116 Hs.484738 NM_013262 ENSG00000007944 MYLIP IDOL|MIR myosin regulatory light chain interacting protein protein-coding 229.333-96 chr5 33609857 33610399 + 0.666667 NA intron (NM_001324512, intron 14 of 21) AluSp|SINE|Alu 169352 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 149-154 chr9 71423962 71424245 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 22868 NM_001366141 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 142-83 chr3 37893061 37893357 + 0.666667 NA intron (NM_001008392, intron 1 of 7) intron (NM_001008392, intron 1 of 7) 31329 NM_001008392 10217 Hs.475963 NM_005808 ENSG00000144677 CTDSPL C3orf8|HYA22|PSR1|RBSP3|SCP3 CTD small phosphatase like protein-coding 151-127 chr8 103092164 103092472 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -28714 NR_145429 379034 Hs.591862 NR_145429 LINC01181 - long intergenic non-protein coding RNA 1181 ncRNA 250-25 chr13 95541956 95542695 + 0.666667 NA intron (NM_182848, intron 1 of 4) intron (NM_182848, intron 1 of 4) -8415 NR_046533 100874194 Hs.569229 NR_046533 ENSG00000223392 CLDN10-AS1 - CLDN10 antisense RNA 1 ncRNA 195.333-102 chr19 32357977 32358397 + 0.666667 NA intron (NM_001136156, intron 4 of 6) intron (NM_001136156, intron 4 of 6) 12577 NM_014910 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 147.667-295 chr5 140386016 140386308 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -15652 NM_001197030 54882 Hs.594084 NM_017747 ENSG00000131503 ANKHD1 MASK|MASK1|PP2500|VBARP ankyrin repeat and KH domain containing 1 protein-coding 150.333-383 chr7 55011104 55011390 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -7770 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 229.667-9 chr10 9982902 9983453 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -75545 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 168.333-110 chr2 232678447 232678800 + 0.666667 NA intron (NM_025202, intron 3 of 3) AluSp|SINE|Alu -18708 NM_001103147 26058 Hs.565319 NM_015575 ENSG00000204120 GIGYF2 GYF2|PARK11|PERQ2|PERQ3|TNRC15 GRB10 interacting GYF protein 2 protein-coding 152.667-239 chr3 32780186 32780536 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37636 NM_001039111 131405 Hs.113170 NM_001039111 ENSG00000206557 TRIM71 LIN-41|LIN41 tripartite motif containing 71 protein-coding 120.667-94 chr2 50456893 50457221 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -109301 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 187.667-74 chr2 134703081 134703378 + 0.666667 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) HAL1|LINE|L1 15771 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 170.333-179 chr5 159808598 159808937 + 0.666667 NA intron (NR_109891, intron 2 of 2) L1MEf|LINE|L1 62617 NR_109891 101927766 Hs.638568 NR_109891 ENSG00000253311 LINC01847 - long intergenic non-protein coding RNA 1847 ncRNA 190-48 chr17 32604369 32604715 + 0.666667 NA intron (NM_001303279, intron 21 of 21) intron (NM_001303279, intron 21 of 21) 117549 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 149-114 chr5 51781237 51781665 + 0.666667 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -226580 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 112.333-167 chr3 119040774 119041057 + 0.666667 NA intron (NM_152538, intron 3 of 8) L1M5|LINE|L1 -6069 NM_001015887 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 133.333-129 chr4 70948768 70949091 + 0.666667 NA intron (NM_173468, intron 1 of 5) intron (NM_173468, intron 1 of 5) -44720 NM_000788 1633 Hs.709 NM_000788 ENSG00000156136 DCK - deoxycytidine kinase protein-coding 166.667-174 chr4 179434147 179434615 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -1526445 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 137.333-165 chr5 169282262 169282554 + 0.666667 NA intron (NM_003062, intron 1 of 35) MIR1_Amn|SINE|MIR -18714 NR_030311 693170 NR_030311 ENSG00000207619 MIR585 MIRN585|hsa-mir-585|mir-585 microRNA 585 ncRNA 116-68 chr19 36396223 36396556 + 0.666667 NA intron (NM_001321917, intron 4 of 4) AluYk2|SINE|Alu -17188 NM_020917 57677 Hs.35524 NM_020917 ENSG00000142065 ZFP14 ZNF531 ZFP14 zinc finger protein protein-coding 162.667-246 chr6 106681248 106681623 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14050 NR_149100 105377926 Hs.635821 NR_149100 ENSG00000229654 LINC02526 - long intergenic non-protein coding RNA 2526 ncRNA 155.667-169 chr2 103500307 103500614 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -516031 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 125.333-115 chr3 127478564 127478764 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 59116 NR_125397 101927149 Hs.407798 NR_125397 ENSG00000239921 LINC01471 - long intergenic non-protein coding RNA 1471 ncRNA 201.333-134 chr18 65054512 65055081 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -695456 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 129.333-54 chr12 91001836 91002174 + 0.666667 NA intron (NM_004950, intron 2 of 6) AluSc|SINE|Alu 2967 NM_004950 1833 Hs.435680 NM_004950 ENSG00000083782 EPYC DSPG3|PGLB|Pg-Lb|SLRR3B epiphycan protein-coding 113-200 chr8 66293634 66293826 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 101616 NR_039979 100505659 Hs.529729 NR_039979 ENSG00000253138 LINC00967 - long intergenic non-protein coding RNA 967 ncRNA 131.667-48 chr12 118025995 118026329 + 0.666667 NA intron (NM_001346815, intron 8 of 11) intron (NM_001346815, intron 8 of 11) 9459 NM_007370 5985 Hs.731908 NM_007370 ENSG00000111445 RFC5 RFC36 replication factor C subunit 5 protein-coding 148-142 chr6 12784071 12784494 + 0.666667 NA intron (NM_001322308, intron 3 of 13) (ACATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 65583 NM_001322310 221692 Hs.436996 NM_030948 ENSG00000112137 PHACTR1 EIEE70|RPEL|RPEL1|dJ257A7.2 phosphatase and actin regulator 1 protein-coding 197.333-250 chrX 44922273 44922796 + 0.666667 NA intron (NR_111960, intron 2 of 27) AluSx1|SINE|Alu 49359 NM_001291416 7403 Hs.522616 NM_021140 ENSG00000147050 KDM6A KABUK2|UTX|bA386N14.2 lysine demethylase 6A protein-coding 201-27 chr12 1288257 1288652 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 14 of 19) intron (NR_027948, intron 14 of 19) -212037 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 158.667-360 chrX 80253545 80253966 + 0.666667 NA intron (NR_110646, intron 5 of 5) L1MEc|LINE|L1 81563 NR_110646 101060146 Hs.546064 NR_110646 ENSG00000278530 CHMP1B2P - charged multivesicular body protein 1B2, pseudogene pseudo 143.333-226 chr5 72362887 72363163 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001284403, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001284403, exon 7 of 7) 42652 NM_001284403 79810 Hs.126906 NM_024754 ENSG00000049883 PTCD2 - pentatricopeptide repeat domain 2 protein-coding 262-30 chr17 30832944 30833495 + 0.666667 NA intron (NM_024857, intron 1 of 22) intron (NM_024857, intron 1 of 22) 1253 NM_024857 79915 Hs.528902 NM_024857 ENSG00000176208 ATAD5 C17orf41|ELG1|FRAG1 ATPase family AAA domain containing 5 protein-coding 117-127 chr7 2993593 2993851 + 0.666667 NA intron (NM_001324281, intron 1 of 25) intron (NM_001324281, intron 1 of 25) 50145 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 166-12 chr1 159312353 159312685 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 2140 NM_001004467 441911 Hs.553833 NM_001004467 ENSG00000196266 OR10J3 OR1-25|OR10J3P olfactory receptor family 10 subfamily J member 3 protein-coding 126-107 chr7 44920705 44920922 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -35283 NM_033224 5814 Hs.349150 NM_033224 ENSG00000146676 PURB PURBETA purine rich element binding protein B protein-coding 119.333-111 chr17 56446938 56447172 + 0.666667 NA intron (NM_001370326, intron 10 of 20) AluSz|SINE|Alu -146644 NM_005450 9241 Hs.248201 NM_005450 ENSG00000183691 NOG SYM1|SYNS1|SYNS1A noggin protein-coding 126-91 chr5 44075679 44075993 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -312896 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 112-123 chr20 39688736 39689038 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -315574 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 134-58 chr22 26374680 26374924 + 0.666667 NA intron (NM_001184773, intron 14 of 16) intron (NM_001184773, intron 14 of 16) -54458 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 114-20 chr11 116232508 116232813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -406762 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 153-23 chr11 127735252 127735543 + 0.666667 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 464327 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 191.667-37 chr12 21046740 21047183 + 0.666667 NA intron (NM_001009562, intron 6 of 12) intron (NM_001009562, intron 6 of 12) 31265 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 127-55 chr22 42404896 42405103 + 0.666667 NA intron (NM_001318323, intron 2 of 4) intron (NM_001318323, intron 2 of 4) 27360 NM_001318323 150372 Hs.436677 NM_145912 ENSG00000235568 NFAM1 CNAIP NFAT activating protein with ITAM motif 1 protein-coding 146.333-36 chr10 106640431 106640780 + 0.666667 NA intron (NM_001206569, intron 18 of 25) intron (NM_001206569, intron 18 of 25) 500440 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 218.333-50 chr17 53907477 53908064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 84843 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 191.667-75 chr2 233783482 233783890 + 0.666667 NA intron (NM_001367507, intron 3 of 41) AluSz|SINE|Alu 7962 NM_001367507 339766 Hs.361778 NM_001287395 ENSG00000185038 MROH2A HEATR7B1 maestro heat like repeat family member 2A protein-coding 219.667-12 chr10 120083974 120084325 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 125636 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 118.667-30 chr10 73838363 73838667 + 0.666667 NA intron (NR_160046, intron 12 of 19) MIRb|SINE|MIR -26695 NR_160744 8509 Hs.654758 NM_003635 ENSG00000166507 NDST2 HSST2|N-HSST 2|NST2 N-deacetylase and N-sulfotransferase 2 protein-coding 132.667-25 chr10 84574252 84574547 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 149230 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 179.333-89 chr2 16919279 16919650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -253630 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 171.333-102 chr2 232862258 232862620 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6575 NM_001346122 389084 Hs.657509 NM_206895 ENSG00000182600 SNORC ASCL830|C2orf82|UNQ830 secondary ossification center associated regulator of chondrocyte maturation protein-coding 215.333-22 chr10 24439925 24440395 + 0.666667 NA intron (NM_019590, intron 5 of 20) intron (NM_019590, intron 5 of 20) -9254 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 132.333-175 chr8 34899695 34900004 + 0.666667 NA Intergenic LTR9|LTR|ERV1 115928 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 212.667-36 chr14 45359622 45360113 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -106665 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 167-72 chr3 119939334 119939699 + 0.666667 NA intron (NM_002093, intron 3 of 11) intron (NM_002093, intron 3 of 11) 145132 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 126.667-177 chr8 105005518 105005891 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -312734 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 180.667-13 chr10 43760937 43761416 + 0.666667 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 17649 NR_134484 102724264 Hs.140667 NR_134483 ENSG00000234973 LINC02658 - long intergenic non-protein coding RNA 2658 ncRNA 149-92 chr3 94722086 94722338 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -216051 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 135.333-27 chr10 102003714 102004057 + 0.666667 NA intron (NM_024541, intron 14 of 25) intron (NM_024541, intron 14 of 25) 52288 NM_024541 79591 Hs.16004 NM_024541 ENSG00000120029 ARMH3 C10orf76 armadillo like helical domain containing 3 protein-coding 115.333-5 chr1 73595208 73595539 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79306 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 150.667-162 chr18 80155255 80155596 + 0.666667 NA intron (NR_028340, intron 1 of 2) intron (NR_028340, intron 1 of 2) 7501 NR_028339 100130522 Hs.352602 NM_001145731 ENSG00000267270 PARD6G-AS1 - PARD6G antisense RNA 1 ncRNA 123.333-191 chr7 34125471 34125728 + 0.666667 NA intron (NM_133468, intron 14 of 15) intron (NM_133468, intron 14 of 15) 220060 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 158.333-209 chr3 114305092 114305462 + 0.666667 NA intron (NM_173799, intron 3 of 3) intron (NM_173799, intron 3 of 3) 11249 NM_173799 201633 Hs.421750 NM_173799 ENSG00000181847 TIGIT VSIG9|VSTM3|WUCAM T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains protein-coding 253.667-7 chr1 182975519 182975991 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -22589 NM_001345928 81626 Hs.497034 NM_030933 ENSG00000157060 SHCBP1L C1orf14|GE36 SHC binding and spindle associated 1 like protein-coding 198.333-207 chrX 39338859 39339289 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -11712 NR_038968 286442 Hs.638478 NR_038968 ENSG00000235304 LINC01281 - long intergenic non-protein coding RNA 1281 ncRNA 171.667-32 chr11 81106833 81107206 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -344216 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 115.667-51 chr12 9620823 9621016 + 0.666667 NA intron (NR_046450, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 3635 NR_046450 374443 Hs.569124 NR_002814 ENSG00000256594 LOC374443 - C-type lectin domain family 2 member D pseudogene pseudo 202-39 chr13 68756829 68757337 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 128242 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 189.333-122 chr22 44372381 44372916 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59697 NM_001099294 85352 Hs.6829 NM_001099294 ENSG00000138944 SHISAL1 KIAA1644 shisa like 1 protein-coding 225-13 chr12 19473112 19473630 + 0.666667 NA intron (NM_001114176, intron 3 of 8) intron (NM_001114176, intron 3 of 8) 32772 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 137.667-111 chr20 40286862 40287111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282525 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 198.667-133 chr3 195844474 195844907 + 0.666667 NA intron (NR_134939, intron 1 of 1) AluSx3|SINE|Alu 9538 NR_134940 101929697 Hs.551750 NR_134939 LINC01983 - long intergenic non-protein coding RNA 1983 ncRNA 191.333-45 chr12 66695270 66695681 + 0.666667 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) intron (NM_001366724, intron 1 of 23) -16399 NM_021150 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 135-84 chr5 28415133 28415400 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -127601 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 154-88 chr3 43159456 43159889 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53593 NM_032806 84892 Hs.745002 NM_032806 ENSG00000144647 POMGNT2 AGO61|C3orf39|GTDC2|MDDGA8|MDDGC8 protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) protein-coding 188-67 chr21 30035411 30035873 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -95590 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 136.667-180 chr8 116075811 116076178 + 0.666667 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) L2|LINE|L2 249065 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 112.667-185 chr4 40201780 40202079 + 0.666667 NA intron (NM_001278362, intron 2 of 3) L1ME4c|LINE|L1 4898 NM_004310 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 118-52 chr17 60530563 60530880 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -4479 NM_006380 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 212.333-125 chr6 36789898 36790456 + 0.666667 NA intron (NM_020939, intron 8 of 20) MIR|SINE|MIR -32768 NM_001314018 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 130.667-79 chr16 50104778 50105017 + 0.666667 NA intron (NR_138092, intron 15 of 15) intron (NR_138092, intron 15 of 15) 38927 NR_138093 55027 Hs.733027 NM_017939 ENSG00000155393 HEATR3 SYO1 HEAT repeat containing 3 protein-coding 238-71 chr4 166124717 166125234 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 251738 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 187.333-5 chr1 59746780 59747253 + 0.666667 NA intron (NM_001350790, intron 15 of 16) MIR|SINE|MIR -13720 NR_039861 100616409 NR_039861 ENSG00000266150 MIR4711 - microRNA 4711 ncRNA 165.667-215 chr9 90606144 90606468 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -23560 NR_034157 340515 Hs.522284 NM_001105317 LINC01501 - long intergenic non-protein coding RNA 1501 ncRNA 159-44 chr16 77200600 77201058 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001286639, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001286639, exon 5 of 5) 1421 NM_001348924 100130958 Hs.734779 NM_001129979 ENSG00000205078 SYCE1L MRP2 synaptonemal complex central element protein 1 like protein-coding 137.333-113 chr20 55716110 55716444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -289080 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 165.333-140 chr20 28790866 28791202 + 0.666667 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -188369 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 214.667-72 chr2 174002930 174003354 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -22138 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 145.333-9 chr1 109084134 109084505 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6445 NM_001322248 56900 Hs.82933 NM_020141 ENSG00000215717 TMEM167B AD-020|C1orf119 transmembrane protein 167B protein-coding 121-128 chr7 2046684 2046946 + 0.666667 NA intron (NM_001013837, intron 12 of 18) intron (NM_001013837, intron 12 of 18) 42237 NR_145797 109623488 NR_145797 SNORA114 - small nucleolar RNA, H/ACA box 114 snoRNA 118.667-44 chr11 73118971 73119277 + 0.666667 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) AluJb|SINE|Alu 23194 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 215.333-71 chr17 54647886 54648333 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -252582 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 131-34 chr15 98828221 98828486 + 0.666667 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) 43927 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 123.333-149 chr3 148510388 148510724 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -187315 NM_009585 185 Hs.477887 NM_000685 ENSG00000144891 AGTR1 AG2S|AGTR1B|AT1|AT1AR|AT1B|AT1BR|AT1R|AT2R1|HAT1R angiotensin II receptor type 1 protein-coding 113.667-185 chr6 62568598 62568796 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -282470 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 138.667-97 chr2 15949099 15949362 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6797 NR_161163 10408 Hs.651453 NR_110230 ENSG00000233718 MYCNOS MYCN-AS1|N-CYM|NCYM|NYCM MYCN opposite strand ncRNA 148.333-187 chr2 71517805 71518132 + 0.666667 NA intron (NM_001130985, intron 10 of 54) intron (NM_001130985, intron 10 of 54) 51269 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 130.667-123 chr2 203886220 203886574 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18626 NM_001037631 1493 Hs.247824 NM_005214 ENSG00000163599 CTLA4 ALPS5|CD|CD152|CELIAC3|CTLA-4|GRD4|GSE|IDDM12 cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4 protein-coding 181.333-136 chr5 59578998 59579360 + 0.666667 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) L2c|LINE|L2 7319 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 183.667-152 chr9 37475938 37476350 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -9791 NM_001282766 64425 Hs.591087 NM_022490 ENSG00000137054 POLR1E PAF53|PRAF1 RNA polymerase I subunit E protein-coding 137-60 chr3 26559067 26559456 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -63545 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 149.333-327 chr5 173945937 173946236 + 0.666667 NA intron (NM_001308192, intron 4 of 8) intron (NM_001308192, intron 4 of 8) -43084 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 119-88 chr20 11357200 11357502 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -83968 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 113.333-230 chr6 127579831 127580054 + 0.666667 NA intron (NM_001010905, intron 2 of 5) intron (NM_001010905, intron 2 of 5) 2768 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 123.667-46 chr12 84759932 84760154 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 152756 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 128.667-24 chr10 61126741 61127000 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 110595 NR_108052 100507058 Hs.145227 NR_108052 ENSG00000227244 LINC00845 - long intergenic non-protein coding RNA 845 ncRNA 242.333-76 chr4 73575370 73575791 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001270392, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001270392, exon 10 of 10) 44856 NM_001270391 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 214.667-58 chr19 32964346 32964799 + 0.666667 NA intron (NM_032816, intron 2 of 18) L1ME1|LINE|L1 7386 NM_032816 84902 Hs.599703 NM_032816 ENSG00000121289 CEP89 CCDC123|CEP123 centrosomal protein 89 protein-coding 130.667-198 chr8 99817912 99818285 + 0.666667 NA intron (NM_017890, intron 45 of 61) intron (NM_017890, intron 45 of 61) 75609 NM_004374 1345 Hs.351875 NM_004374 ENSG00000164919 COX6C - cytochrome c oxidase subunit 6C protein-coding 178.333-76 chr2 75514956 75515449 + 0.666667 NA intron (NM_032181, intron 3 of 3) intron (NM_032181, intron 3 of 3) -8866 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 115.667-121 chr2 135652345 135652525 + 0.666667 NA intron (NM_001282798, intron 17 of 25) AluJo|SINE|Alu -12962 NR_029672 406915 NR_029672 ENSG00000207654 MIR128-1 MIR128A|MIRN128-1|MIRN128A|mir-128-1 microRNA 128-1 ncRNA 139 chr1 1577404 1577758 + 0.666667 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -2718 NM_014188 29101 Hs.30026 NM_014188 ENSG00000160075 SSU72 HSPC182|PNAS-120 SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase protein-coding 118-8 chr1 220727673 220727874 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20549 NM_001317338 54996 Hs.369042 NM_017898 ENSG00000117791 MARC2 MOSC2 mitochondrial amidoxime reducing component 2 protein-coding 183-67 chr20 11910510 11910982 + 0.666667 NA intron (NM_001282550, intron 1 of 4) intron (NM_001282550, intron 1 of 4) -7119 NM_001282551 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 194.333-121 chr5 98300557 98300994 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -139536 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 154.667-38 chr10 31720114 31720545 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 188597 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 119.667-33 chr12 13116224 13116545 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12717 NM_001367364 83445 Hs.240053 NM_031289 ENSG00000111305 GSG1 - germ cell associated 1 protein-coding 116.333-194 chr7 11422244 11422567 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 15 of 26) intron (NM_015204, intron 15 of 26) 409793 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 286-60 chr8 6838661 6839223 + 0.666667 NA intron (NR_045217, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 3388 NR_045217 100652791 Hs.369771 NR_045217 ENSG00000245857 GS1-24F4.2 - uncharacterized LOC100652791 ncRNA 115-76 chr17 64442716 64442940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6287 NM_001291317 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 126.667-129 chr4 152860772 152861092 + 0.666667 NA intron (NM_001025595, intron 2 of 8) intron (NM_001025595, intron 2 of 8) -75391 NM_001371116 111.667-66 chr12 87554331 87554595 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -214349 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 113.667-157 chr4 55407954 55408130 + 0.666667 NA intron (NR_073070, intron 2 of 6) intron (NR_073070, intron 2 of 6) 12085 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 202.667-13 chr10 10163445 10163908 + 0.666667 NA Intergenic MER31B|LTR|ERV1 104954 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 239-26 chr17 15274557 15275103 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -9504 NM_001330143 5376 Hs.372031 NM_000304 ENSG00000109099 PMP22 CIDP|CMT1A|CMT1E|DSS|GAS-3|GAS3|HMSNIA|HNPP|Sp110 peripheral myelin protein 22 protein-coding 145.667-290 chr8 101410958 101411249 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42210 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 130.667-54 chr12 50368192 50368452 + 0.666667 NA intron (NM_001145475, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 28287 NM_001145475 121006 Hs.133187 NM_001145475 ENSG00000185958 FAM186A - family with sequence similarity 186 member A protein-coding 152.667-249 chr3 96936003 96936307 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 2 of 17) intron (NM_001080448, intron 2 of 17) 121561 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 167.333-150 chr20 6108397 6108767 + 0.666667 NA intron (NM_017671, intron 5 of 14) AluSx|SINE|Alu 14962 NM_017671 55612 Hs.472054 NM_017671 ENSG00000101311 FERMT1 C20orf42|DTGCU2|KIND1|UNC112A|URP1 fermitin family member 1 protein-coding 122.667-98 chr2 184373678 184373886 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -5193 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 170.333-156 chr4 52919956 52920310 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 6 of 8) intron (NM_152540, intron 6 of 8) 57816 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 116.333-139 chr3 19765066 19765240 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 169064 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 122-105 chr6 73100582 73100928 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 5 of 13) L1MA3|LINE|L1 42759 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 227.333-55 chr18 45311795 45312246 + 0.666667 NA intron (NM_001371319, intron 4 of 23) intron (NM_001371319, intron 4 of 23) 99025 NM_001242692 8170 Hs.710927 NM_007163 ENSG00000132874 SLC14A2 HUT2|UT-A2|UT2|UTA|UTR|hUT-A6 solute carrier family 14 member 2 protein-coding 153-113 chr5 68800011 68800424 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 229710 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 141.333-120 chr2 170863508 170863896 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 46815 NM_000817 2571 Hs.420036 NM_000817 ENSG00000128683 GAD1 CPSQ1|GAD|SCP glutamate decarboxylase 1 protein-coding 170.333-99 chr18 21522579 21522935 + 0.666667 NA exon (NM_001142966, exon 33 of 33) exon (NM_001142966, exon 33 of 33) 77947 NM_052911 114799 Hs.464733 NM_052911 ENSG00000141446 ESCO1 A930014I12Rik|CTF|ECO1|EFO1|ESO1 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 protein-coding 112.667-217 chr5 106647757 106648034 + 0.666667 NA Intergenic MER97d|DNA|hAT-Tip100 363119 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 152.667-333 chr6 166435672 166436028 + 0.666667 NA intron (NM_001006932, intron 15 of 21) intron (NM_001006932, intron 15 of 21) 29533 NR_046793 100874353 Hs.675698 NR_046793 ENSG00000232082 RPS6KA2-IT1 - RPS6KA2 intronic transcript 1 ncRNA 128.333-10 chr1 159524512 159524734 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 11384 NM_001004469 127385 Hs.553587 NM_001004469 ENSG00000184155 OR10J5 OR1-28 olfactory receptor family 10 subfamily J member 5 protein-coding 125-31 chr13 76608961 76609255 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 277297 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 192-19 chr10 29419103 29419527 + 0.666667 NA intron (NR_110927, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 9072 NR_110928 102724316 Hs.499209 NR_003930 ENSG00000224597 SVIL-AS1 - SVIL antisense RNA 1 ncRNA 118.333-126 chr3 10768919 10769110 + 0.666667 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -4805 NR_027102 285370 Hs.157613 NR_027102 ENSG00000226567 LINC00606 - long intergenic non-protein coding RNA 606 ncRNA 118-139 chr9 76561412 76561613 + 0.666667 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 60879 NM_001097636 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 148.667-44 chr10 52836126 52836433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64579 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 115.667-209 chr8 64166947 64167214 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 201478 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 149-74 chr20 5253290 5253575 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 63300 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 113.333-11 chr1 118592326 118592562 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 395899 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 112.333-205 chr5 64779560 64779731 + 0.666667 NA intron (NM_001297645, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 10715 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 188.333-87 chr20 41060220 41060681 + 0.666667 NA intron (NM_003286, intron 2 of 20) L1ME2|LINE|L1 31628 NM_003286 7150 Hs.472737 NM_003286 ENSG00000198900 TOP1 TOPI DNA topoisomerase I protein-coding 130.333-175 chr5 148863145 148863471 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36715 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 149.333-295 chr4 163514887 163515266 + 0.666667 NA intron (NM_018352, intron 4 of 6) L2b|LINE|L2 20386 NM_018352 55319 Hs.267446 NM_018352 ENSG00000198498 TMA16 C4orf43 translation machinery associated 16 homolog protein-coding 132.333-78 chr2 38276983 38277208 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 99435 NM_001330459 64225 Hs.594950 NM_022374 ENSG00000119787 ATL2 ARL3IP2|ARL6IP2|aip-2|atlastin2 atlastin GTPase 2 protein-coding 115-100 chr20 44184690 44184975 + 0.666667 NA intron (NM_175913, intron 1 of 1) L2c|LINE|L2 2356 NM_175913 57158 Hs.441737 NM_020433 ENSG00000149596 JPH2 CMH17|JP-2|JP2 junctophilin 2 protein-coding 278-52 chr6 87525538 87526329 + 0.666667 NA intron (NR_146748, intron 10 of 19) L1MA7|LINE|L1 52959 NM_006416 10559 Hs.423163 NM_006416 ENSG00000164414 SLC35A1 CDG2F|CMPST|CST|hCST solute carrier family 35 member A1 protein-coding 146.333-119 chr16 69697841 69698205 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_006599, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_006599, exon 14 of 14) 10652 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 123.333-143 chr3 42457801 42458006 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31396 NM_001251882 7433 Hs.348500 NM_004624 ENSG00000114812 VIPR1 HVR1|II|PACAP-R-2|PACAP-R2|RDC1|V1RG|VAPC1|VIP-R-1|VIPR|VIRG|VPAC1|VPAC1R|VPCAP1R vasoactive intestinal peptide receptor 1 protein-coding 135.667-186 chr8 105608621 105608925 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 4 of 7) L2|LINE|L2 289230 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 144.667-7 chr1 77149573 77149857 + 0.666667 NA intron (NM_005482, intron 9 of 10) L1MA4|LINE|L1 69715 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 135.667-8 chr1 177888456 177888794 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81297 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 202.333-190 chrX 102632575 102633059 + 0.666667 NA intron (NR_146584, intron 4 of 18) intron (NR_146584, intron 4 of 18) -18549 NM_001099411 9737 Hs.729265 NM_014710 ENSG00000198932 GPRASP1 GASP|GASP-1|GASP1 G protein-coupled receptor associated sorting protein 1 protein-coding 139-77 chr4 102558639 102558904 + 0.666667 NA intron (NM_003998, intron 5 of 23) AluJo|SINE|Alu -56285 NR_136202 105377621 Hs.15833 NR_136202 LOC105377621 - uncharacterized LOC105377621 ncRNA 118.667-135 chr3 69241365 69241680 + 0.666667 NA intron (NM_015123, intron 7 of 22) intron (NM_015123, intron 7 of 22) -118927 NM_198271 56203 Hs.350621 NM_198271 ENSG00000163380 LMOD3 NEM10 leiomodin 3 protein-coding 198.333-148 chr4 100595658 100596119 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -77866 NM_001159694 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 133-29 chr14 70370371 70370584 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_018373, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_018373, exon 4 of 4) -10794 NM_016468 51241 Hs.709581 NM_016468 ENSG00000133983 COX16 C14orf112|HSPC203|hCOX16 cytochrome c oxidase assembly factor COX16 protein-coding 154-75 chr2 10619065 10619372 + 0.666667 NA intron (NR_048552, intron 12 of 19) AluJo|SINE|Alu 70757 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 160.333-23 chr1 164648896 164649251 + 0.666667 NA intron (NM_001204963, intron 2 of 8) intron (NM_001204963, intron 2 of 8) 89351 NM_001353130 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 180.333-101 chr5 163958204 163958580 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 452773 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 148.333-277 chr4 41744083 41744506 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_003924, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_003924, exon 3 of 3) 4676 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 115.333-201 chr7 53805922 53806206 + 0.666667 NA intron (NR_038371, intron 1 of 5) MER21C|LTR|ERVL 5867 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 119.667-113 chr3 49740948 49741171 + 0.666667 NA intron (NM_001006115, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu -17085 NM_013334 29925 Hs.567488 NM_013334 ENSG00000173540 GMPPB LGMDR19|MDDGA14|MDDGB14|MDDGC14 GDP-mannose pyrophosphorylase B protein-coding 125-110 chr8 51890104 51890442 + 0.666667 NA intron (NM_001363193, intron 1 of 5) intron (NM_001363193, intron 1 of 5) 8763 NM_001286783 115294 Hs.671268 NM_052937 ENSG00000168300 PCMTD1 - protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 protein-coding 157.667-362 chr9 130770495 130770960 + 0.666667 NA intron (NM_007313, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 56846 NM_007313 25 Hs.431048 NM_005157 ENSG00000097007 ABL1 ABL|CHDSKM|JTK7|bcr/abl|c-ABL|c-ABL1|p150|v-abl ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 183.667-155 chrX 99060146 99060544 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1349928 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 113.333-180 chr3 106020205 106020397 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -150900 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 182.333-87 chr2 105942405 105942765 + 0.666667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 90738 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 196.667-68 chr2 16520427 16520730 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145256 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 181.667-148 chr8 101495234 101495705 + 0.666667 NA intron (NM_001330593, intron 1 of 15) intron (NM_001330593, intron 1 of 15) 3030 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 147-36 chr13 56520051 56520428 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -620679 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 118.333-65 chr14 57785060 57785375 + 0.666667 NA intron (NR_159373, intron 1 of 10) intron (NR_159373, intron 1 of 10) 79782 NM_001352013 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 152.667-278 chr4 81458097 81458433 + 0.666667 NA intron (NM_152545, intron 2 of 13) intron (NM_152545, intron 2 of 13) 13642 NM_001300735 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 162-115 chr7 130734845 130735317 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1048 NM_138693 136259 Hs.125240 NM_138693 ENSG00000266265 KLF14 BTEB5 Kruppel like factor 14 protein-coding 126.333-116 chr3 56072508 56072769 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 7 of 17) intron (NR_132749, intron 7 of 17) -220044 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 140 chr1 11543419 11543745 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 64427 NM_020780 57540 Hs.202355 NM_020780 ENSG00000204624 DISP3 PTCHD2 dispatched RND transporter family member 3 protein-coding 128.333-199 chr8 134494022 134494253 + 0.666667 NA intron (NM_001174158, intron 13 of 13) intron (NM_001174158, intron 13 of 13) -103934 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 128.667-149 chr5 123989181 123989409 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 443878 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 323.334-5 chr14 73727287 73728166 + 0.666667 NA intron (NM_001367710, intron 4 of 12) MIRb|SINE|MIR -13342 NM_006029 9240 Hs.194709 NM_006029 ENSG00000176903 PNMA1 MA1 PNMA family member 1 protein-coding 112.333-95 chr17 58215092 58215398 + 0.666667 NA intron (NM_001321269, intron 4 of 16) intron (NM_001321269, intron 4 of 16) 4010 NM_001330397 54903 Hs.408843 NM_017777 ENSG00000011143 MKS1 BBS13|JBTS28|MES|MKS|POC12 MKS transition zone complex subunit 1 protein-coding 152.667-217 chr2 234620203 234620527 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -62303 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 139-29 chr13 41755001 41755393 + 0.666667 NA intron (NM_001009814, intron 21 of 25) L1MA3|LINE|L1 -186802 NR_049803 100847026 NR_049803 ENSG00000284584 MIR5006 - microRNA 5006 ncRNA 121.333-179 chr8 106233241 106233550 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -36783 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 193-6 chr1 147144679 147145080 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 27591 NR_103871 5565 Hs.50732 NM_005399 ENSG00000131791 PRKAB2 - protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 2 protein-coding 120-143 chr9 28345661 28345910 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 4 of 5) intron (NM_001354574, intron 4 of 5) 373520 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 158.333-93 chr14 78975982 78976404 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 13 of 20) intron (NR_073547, intron 13 of 20) -223789 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 117-34 chr11 127831340 127831590 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -377301 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 154.667-276 chr4 78883785 78884162 + 0.666667 NA intron (NM_198892, intron 14 of 15) AluJr|SINE|Alu 55465 NM_001350106 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 161.667-86 chr15 34699235 34699669 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -43688 NR_146869 105370762 Hs.569462 NR_146869 ENSG00000261304 LINC02252 - long intergenic non-protein coding RNA 2252 ncRNA 180.333-37 chr15 33791574 33791959 + 0.666667 NA intron (NM_001243996, intron 67 of 102) L2a|LINE|L2 -176731 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 201.667-66 chr20 58356743 58357164 + 0.666667 NA intron (NM_020673, intron 6 of 6) L1ME3A|LINE|L1 -32166 NM_004738 9217 Hs.182625 NM_004738 ENSG00000124164 VAPB ALS8|VAMP-B|VAP-B VAMP associated protein B and C protein-coding 114.333-97 chr2 21233004 21233290 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109161 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 191.667-34 chr12 649230 649749 + 0.666667 NA intron (NM_016533, intron 1 of 3) intron (NM_016533, intron 1 of 3) -5853 NR_160428 4815 Hs.655804 NM_016533 ENSG00000171840 NINJ2 - ninjurin 2 protein-coding 126-19 chr12 6563170 6563444 + 0.666667 NA intron (NM_001033714, intron 8 of 15) intron (NM_001033714, intron 8 of 15) 4984 NM_001258310 4839 Hs.534334 NM_006170 ENSG00000111641 NOP2 NOL1|NOP120|NSUN1|p120 NOP2 nucleolar protein protein-coding 157-56 chr19 3462762 3463109 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_205843, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_205843, exon 11 of 11) 17590 NM_001136503 284422 Hs.130714 NM_001136503 ENSG00000095932 SMIM24 C19orf77|HSPC323|MARDI small integral membrane protein 24 protein-coding 149.667-74 chr11 45899468 45899787 + 0.666667 NA intron (NM_005456, intron 2 of 11) intron (NM_005456, intron 2 of 11) 7644 NM_001080446 143678 NM_001080446 ENSG00000234776 C11orf94 - chromosome 11 open reading frame 94 protein-coding 133.667-113 chr4 89142418 89142675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29729 NM_145715 166815 Hs.58924 NM_145715 ENSG00000180346 TIGD2 HEL106 tigger transposable element derived 2 protein-coding 117.333-70 chr15 67607439 67607744 + 0.666667 NA intron (NM_001206804, intron 8 of 21) intron (NM_001206804, intron 8 of 21) 58497 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 164.667-56 chr12 61742216 61742510 + 0.666667 NA intron (NM_178539, intron 4 of 4) intron (NM_178539, intron 4 of 4) 450476 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 194.667-3 chr1 31995286 31995725 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -18363 NM_001271878 10657 Hs.445893 NM_006559 ENSG00000121774 KHDRBS1 Sam68|p62|p68 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 1 protein-coding 145.333-261 chr6 125625548 125625931 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -48614 NR_038906 643623 Hs.520367 NR_038906 ENSG00000224506 LINC02523 - long intergenic non-protein coding RNA 2523 ncRNA 115.667-224 chr9 71116426 71116643 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 5087 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 166.333-208 chr7 15449134 15449480 + 0.666667 NA intron (NM_001004320, intron 3 of 12) intron (NM_001004320, intron 3 of 12) 112708 NM_001004320 392636 Hs.670634 NM_001004320 ENSG00000187546 AGMO TMEM195 alkylglycerol monooxygenase protein-coding 147-126 chr6 115790081 115790431 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -146421 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 150-31 chr12 41716563 41716879 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47468 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 161.333-290 chr8 124703241 124703610 + 0.666667 NA intron (NM_001282971, intron 2 of 14) AluSq2|SINE|Alu 25048 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 152-56 chr14 60506863 60507300 + 0.666667 NA Intergenic CpG -2065 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 169.333-201 chr5 33026412 33026767 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 79146 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 162.667-117 chr19 32881770 32882165 + 0.666667 NA exon (NM_032816, exon 18 of 19) exon (NM_032816, exon 18 of 19) -12200 NM_014270 11136 Hs.743345 NM_014270 ENSG00000021488 SLC7A9 BAT1|CSNU3 solute carrier family 7 member 9 protein-coding 155-31 chr14 60901917 60902219 + 0.666667 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 79011 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 146-32 chr14 80281749 80282170 + 0.666667 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) intron (NR_038355, intron 2 of 8) -50902 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 145.667-237 chr5 158461644 158462011 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52054 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 174.667-106 chr21 24005034 24005418 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 316151 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 126.333-105 chr20 16031797 16032029 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 15 of 17) intron (NM_001351663, intron 15 of 17) -46031 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 128.667-68 chr16 5829408 5829705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -189468 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 178.333-167 chr7 117521359 117521858 + 0.666667 NA intron (NM_000492, intron 3 of 26) intron (NM_000492, intron 3 of 26) 41645 NM_000492 1080 Hs.489786 NM_000492 ENSG00000001626 CFTR ABC35|ABCC7|CF|CFTR/MRP|MRP7|TNR-CFTR|dJ760C5.1 CF transmembrane conductance regulator protein-coding 124.667-3 chr1 42624523 42624787 + 0.666667 NA intron (NM_001080850, intron 11 of 16) AluJr|SINE|Alu -33768 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 129-131 chr8 113371296 113371497 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) intron (NM_001363185, intron 1 of 66) 5756 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 170.333-140 chr3 98261468 98261796 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2612 NM_001005479 79295 Hs.554712 NM_001005479 ENSG00000230301 OR5H6 OR3-11 olfactory receptor family 5 subfamily H member 6 (gene/pseudogene) protein-coding 150.667-184 chr2 106303228 106303579 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -66342 NR_157576 402096 NR_157576 LOC402096 - anaphase promoting complex subunit 1 pseudogene pseudo 136-53 chr2 134797947 134798252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40517 NM_001307983 130013 Hs.655728 NM_138326 ENSG00000153086 ACMSD - aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase protein-coding 137.333-8 chr1 114625916 114626179 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_198459, exon 2 of 18) 5' UTR (NM_198459, exon 2 of 18) 44002 NM_001256404 163259 Hs.654928 NM_198459 ENSG00000175984 DENND2C dJ1156J9.1 DENN domain containing 2C protein-coding 163.667-43 chr12 7983049 7983447 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -47061 NM_006931 6515 Hs.419240 NM_006931 ENSG00000059804 SLC2A3 GLUT3 solute carrier family 2 member 3 protein-coding 127-91 chr7 146413167 146413442 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -360967 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 305-10 chr2 14797505 14798215 + 0.666667 NA Intergenic LTR28C|LTR|ERV1 165143 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 132.667-181 chr8 117377590 117377863 + 0.666667 NA Intergenic AluYc|SINE|Alu -142987 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 158-99 chr4 168137564 168137882 + 0.666667 NA intron (NM_007193, intron 2 of 11) L1PB4|LINE|L1 45186 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 152-117 chr4 71960672 71960970 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70983 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 165-89 chr7 54522294 54522731 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -19813 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 116.333-214 chr8 134343479 134343742 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -254461 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 183.333-137 chr5 150612979 150613332 + 0.666667 NA intron (NM_001166208, intron 1 of 2) intron (NM_001166208, intron 1 of 2) -4489 NM_001166209 11346 Hs.435228 NM_007286 ENSG00000171992 SYNPO - synaptopodin protein-coding 124.667-118 chr20 2886956 2887199 + 0.666667 NA intron (NM_080840, intron 1 of 22) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 13581 NM_080840 5786 Hs.269577 NM_002836 ENSG00000132670 PTPRA HEPTP|HLPR|HPTPA|HPTPalpha|LRP|PTPA|PTPRL2|R-PTP-alpha|RPTPA protein tyrosine phosphatase receptor type A protein-coding 173.333-192 chr7 131919763 131920177 + 0.666667 NA intron (NR_110836, intron 1 of 5) intron (NR_110836, intron 1 of 5) 9750 NR_110836 101928782 Hs.571369 NR_110836 ENSG00000224865 LOC101928782 - uncharacterized LOC101928782 ncRNA 169.333-205 chr5 55398329 55398700 + 0.666667 NA intron (NM_015360, intron 20 of 26) intron (NM_015360, intron 20 of 26) 90525 NM_015360 23517 Hs.274531 NM_015360 ENSG00000039123 MTREX Dob1|KIAA0052|Mtr4|SKIV2L2|fSAP118 Mtr4 exosome RNA helicase protein-coding 162.333-170 chr3 144240763 144241193 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 267897 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 129-26 chr12 31499678 31499991 + 0.666667 NA intron (NM_001366890, intron 1 of 8) intron (NM_001366890, intron 1 of 8) -90089 NR_046909 100874249 Hs.627628 NR_046909 ENSG00000255867 DENND5B-AS1 - DENND5B antisense RNA 1 ncRNA 130-32 chr14 24988896 24989246 + 0.666667 NA intron (NM_001351940, intron 1 of 6) MER102c|DNA|hAT-Charlie 59929 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 156.333-338 chr7 46084181 46084593 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -163115 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 149.667-372 chr7 64390760 64391073 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42777 NR_029404 649395 Hs.728871 NR_029404 YWHAEP1 - tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein epsilon pseudogene 1 pseudo 191.333-66 chr14 74916883 74917300 + 0.666667 NA intron (NM_001370253, intron 4 of 10) intron (NM_001370253, intron 4 of 10) 5351 NM_031464 83694 Hs.414481 NM_031464 ENSG00000198208 RPS6KL1 RSKL2 ribosomal protein S6 kinase like 1 protein-coding 126.667-55 chr15 57572517 57572803 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -19244 NR_104370 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 128 chr1 67726726 67726995 + 0.666667 NA intron (NM_018841, intron 2 of 3) intron (NM_018841, intron 2 of 3) 41659 NM_001199741 1647 Hs.80409 NM_001924 ENSG00000116717 GADD45A DDIT1|GADD45 growth arrest and DNA damage inducible alpha protein-coding 113.333-220 chr5 174146356 174146684 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 100814 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 142-10 chr1 191653976 191654258 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -425619 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 120.333-73 chr16 87530424 87530652 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 36351 NR_110943 101928737 Hs.579009 NR_110943 ENSG00000260750 LOC101928737 - uncharacterized LOC101928737 ncRNA 120.333-155 chr5 75715674 75715883 + 0.666667 NA intron (NM_001099271, intron 1 of 11) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie -1654 NR_149046 441087 NM_001013716 LOC441087 - uncharacterized LOC441087 ncRNA 113-96 chr2 3258532 3258722 + 0.666667 NA intron (NM_003310, intron 3 of 8) intron (NM_003310, intron 3 of 8) 119191 NM_003310 7260 Hs.502770 NM_003310 ENSG00000032389 EIPR1 EIPR-1|TSSC1 EARP complex and GARP complex interacting protein 1 protein-coding 119.667-72 chr17 53091974 53092252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106608 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 140.667 chr1 32259663 32260024 + 0.666667 NA intron (NM_005356, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 8578 NM_001330468 3932 Hs.470627 NM_005356 ENSG00000182866 LCK IMD22|LSK|YT16|p56lck|pp58lck LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 195.333-172 chr5 28500238 28500673 + 0.666667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -212790 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 116-31 chr12 27671781 27672080 + 0.666667 NA intron (NM_003622, intron 14 of 29) AluSz6|SINE|Alu -24517 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 175.667-61 chr18 71502380 71502866 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76333 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 149-140 chr8 67324197 67324492 + 0.666667 NA intron (NM_006421, intron 1 of 38) L2c|LINE|L2 19437 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 185.667-134 chr8 124095503 124095984 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 35 of 40) MER94|DNA|hAT-Blackjack -54961 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 159-9 chr1 145743183 145743558 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014455, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_014455, exon 9 of 9) 23871 NR_103845 11126 Hs.488237 NM_007053 ENSG00000117281 CD160 BY55|NK1|NK28 CD160 molecule protein-coding 154-105 chr4 81329214 81329530 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114150 NM_001363401 5593 Hs.232044 NM_006259 ENSG00000138669 PRKG2 PKG2|PRKGR2|cGK2|cGKII protein kinase cGMP-dependent 2 protein-coding 149.667-57 chr10 66312407 66312746 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) AluSc|SINE|Alu -613460 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 179-20 chr12 9206408 9206850 + 0.666667 NA intron (NM_002864, intron 1 of 35) intron (NM_002864, intron 1 of 35) 1766 NM_002864 5858 Hs.707491 NM_002864 ENSG00000126838 PZP CPAMD6 PZP alpha-2-macroglobulin like protein-coding 164-49 chr17 82705846 82706247 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -7348 NM_006822 10966 Hs.484068 NM_006822 ENSG00000141542 RAB40B RAR|SEC4L RAB40B, member RAS oncogene family protein-coding 154.667-31 chr1 235426407 235426783 + 0.666667 NA intron (NM_001287801, intron 5 of 17).2 intron (NM_001287801, intron 5 of 17).2 59168 NM_001287801 6905 Hs.744998 NM_003193 ENSG00000284770 TBCE HRD|KCS|KCS1|PEAMO|pac2 tubulin folding cofactor E protein-coding 132-98 chr5 37641969 37642272 + 0.666667 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 192702 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 239-20 chr15 85308180 85308742 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 68110 NM_001310153 100133220 Hs.454625 NM_001310153 GOLGA6L3 - golgin A6 family like 3 protein-coding 115.667-70 chr14 33323633 33323863 + 0.666667 NA intron (NM_173159, intron 3 of 11) intron (NM_173159, intron 3 of 11) 384869 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 131.667-164 chr5 78636827 78637166 + 0.666667 NA intron (NM_005779, intron 1 of 4) intron (NM_005779, intron 1 of 4) 11776 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 202.667-52 chr14 60396756 60397137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73750 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 198.333-65 chr15 48027523 48027989 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93234 NM_205850 283652 Hs.710240 NM_205850 ENSG00000188467 SLC24A5 JSX|NCKX5|OCA6|SHEP4 solute carrier family 24 member 5 protein-coding 116.333-178 chr5 93373073 93373414 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 198100 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 136-47 chr19 28901823 28902194 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -63123 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 114.333-201 chr6 162573175 162573371 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) intron (NM_004562, intron 1 of 11) -153859 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 132-114 chr8 62778360 62778678 + 0.666667 NA intron (NM_001304533, intron 4 of 6) L1MA3|LINE|L1 -199342 NR_027378 643763 Hs.491856 NM_001039769 ENSG00000274956 NKAIN3-IT1 UG0898H09 NKAIN3 intronic transcript ncRNA 181.666-11 chr15 77061645 77062180 + 0.666667 NA intron (NM_198902, intron 1 of 5) L3|LINE|CR1 9197 NM_198902 10099 Hs.744863 NM_005724 ENSG00000140391 TSPAN3 TM4-A|TM4SF8|TSPAN-3 tetraspanin 3 protein-coding 212.333-68 chr2 55660373 55660964 + 0.666667 NA intron (NM_033109, intron 14 of 27) MIR3|SINE|MIR 33176 NM_033109 87178 Hs.388733 NM_033109 ENSG00000138035 PNPT1 COXPD13|DFNB70|OLD35|PNPASE|old-35 polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 protein-coding 217.333-2 chr1 43633321 43633929 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16524 NM_014663 9682 Hs.155983 NM_014663 ENSG00000066135 KDM4A JHDM3A|JMJD2|JMJD2A|TDRD14A lysine demethylase 4A protein-coding 209-117 chr8 21992130 21992681 + 0.666667 NA intron (NM_015024, intron 19 of 27) L1MB2|LINE|L1 -31729 NM_001286680 10361 Hs.131055 NM_182795 ENSG00000158806 NPM2 - nucleophosmin/nucleoplasmin 2 protein-coding 144.667-280 chr7 36650408 36650684 + 0.666667 NA intron (NM_001177507, intron 3 of 19) intron (NM_001177507, intron 3 of 19) -50426 NR_046764 100874264 Hs.690994 NR_046764 ENSG00000230539 AOAH-IT1 - AOAH intronic transcript 1 ncRNA 190.667-58 chr18 75600941 75601474 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 111196 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 208-27 chr11 33933513 33933901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41631 NM_005574 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 155.333-321 chr6 5465902 5466214 + 0.666667 NA intron (NM_006567, intron 4 of 6) intron (NM_006567, intron 4 of 6) -7983 NR_125846 101927972 Hs.668417 NR_125846 ENSG00000269985 LOC101927972 - uncharacterized LOC101927972 ncRNA 160-38 chr14 22215511 22215843 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 217076 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 149.333-79 chr11 103413312 103413615 + 0.666667 NA intron (NM_001377, intron 84 of 88) intron (NM_001377, intron 84 of 88) 304037 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 154.333-96 chr14 68192724 68193039 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 369289 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 125.667-32 chr11 26415526 26415863 + 0.666667 NA intron (NM_031418, intron 1 of 26) intron (NM_031418, intron 1 of 26) -58208 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 176.333-128 chr5 12748235 12748615 + 0.666667 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) intron (NR_033383, intron 3 of 3) 80566 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 137.667-46 chr12 119472091 119472369 + 0.666667 NA intron (NM_178499, intron 3 of 13) intron (NM_178499, intron 3 of 13) -121544 NM_001136534 387890 Hs.530965 NM_001136534 ENSG00000224982 TMEM233 DSPB2|IFITMD2 transmembrane protein 233 protein-coding 151-101 chr5 19010746 19011069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 875365 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 126-38 chr16 60883763 60884055 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 171857 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 171.667-4 chr1 50656526 50656887 + 0.666667 NA intron (NM_007051, intron 7 of 18) AluSz6|SINE|Alu -233263 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 134.667-109 chr2 197409035 197409274 + 0.666667 NA intron (NM_012433, intron 7 of 24) AluSp|SINE|Alu 25939 NM_001308824 23451 Hs.632554 NM_012433 ENSG00000115524 SF3B1 Hsh155|MDS|PRP10|PRPF10|SAP155|SF3b155 splicing factor 3b subunit 1 protein-coding 154.667-169 chr2 46723652 46724016 + 0.666667 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) L1MEf|LINE|L1 24539 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 151.667-302 chr5 165524934 165525232 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1054804 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 144-34 chr12 13832449 13832741 + 0.666667 NA intron (NM_000834, intron 2 of 12) L1ME4a|LINE|L1 147761 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 119.333-210 chr8 67559385 67559673 + 0.666667 NA intron (NM_020361, intron 2 of 10) intron (NM_020361, intron 2 of 10) 186831 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 131.667-57 chr14 67266210 67266486 + 0.666667 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) AluSx1|SINE|Alu 24913 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 128.333-194 chr8 89187022 89187246 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 570577 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 146.667-244 chr5 6831501 6831763 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3711 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 129-42 chr16 9623212 9623452 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -167827 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 157.333-206 chr2 207708912 207709217 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -2476 NM_001142300 151195 Hs.471234 NM_152523 ENSG00000163249 CCNYL1 - cyclin Y like 1 protein-coding 205.333-208 chr6 150967875 150968342 + 0.666667 NA intron (NM_001350486, intron 19 of 27) L2a|LINE|L2 -38900 NM_001350490 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 278.667-19 chr17 55034464 55035127 + 0.666667 NA intron (NM_178509, intron 10 of 17) L1ME3A|LINE|L1 -66010 NM_001321518 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 146.667-28 chr10 27581431 27581727 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 77275 NM_021252 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 155-27 chr13 20342039 20342353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91650 NR_039721 100616304 NR_039721 ENSG00000263978 MIR4499 - microRNA 4499 ncRNA 133-67 chr4 41697616 41697923 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001330792, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001330792, exon 25 of 25) 51201 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 187.667-92 chr3 94575543 94575942 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -362521 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 113-42 chr12 49926312 49926515 + 0.666667 NA TTS (NR_110048) TTS (NR_110048) 14460 NR_110048 101927292 Hs.129345 NR_110048 ENSG00000257771 LINC02395 - long intergenic non-protein coding RNA 2395 ncRNA 227.667-80 chr9 28706788 28707367 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) 12228 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 208.333-83 chr2 221704632 221704977 + 0.666667 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -130602 NM_001304536 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 135.333-117 chr3 99546314 99546591 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -92142 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 113.333-212 chr5 95726292 95726611 + 0.666667 NA intron (NM_001349303, intron 1 of 8) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -4885 NM_014899 22836 Hs.445030 NM_014899 ENSG00000164292 RHOBTB3 - Rho related BTB domain containing 3 protein-coding 128.667-152 chr6 37997484 37997717 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 2 of 5) intron (NM_021943, intron 2 of 5) 177873 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 127.667-154 chr6 142953370 142953594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8306 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 168.667-110 chr2 148048356 148048718 + 0.666667 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) L2c|LINE|L2 -26933 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 113.333-191 chr4 57085818 57086023 + 0.666667 NA intron (NM_001553, intron 1 of 4) HAL1M8|LINE|L1 -23842 NR_034081 255130 Hs.691061 NR_034081 ENSG00000245067 IGFBP7-AS1 - IGFBP7 antisense RNA 1 ncRNA 154-127 chr6 138847010 138847306 + 0.666667 NA intron (NM_001077706, intron 8 of 21) AluSx|SINE|Alu 51047 NM_001195037 345930 Hs.660603 NM_001077706 ENSG00000203734 ECT2L ARHGEF32|C6orf91|FBXO49|LFDH|dJ509I19.2|dJ509I19.3|dJ509I19.5 epithelial cell transforming 2 like protein-coding 160-67 chr20 52447876 52448207 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -172797 NR_110038 101927700 Hs.434465 NR_110038 ENSG00000234948 LINC01524 - long intergenic non-protein coding RNA 1524 ncRNA 263.333-20 chr14 40441362 40441976 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -513042 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 128.333-143 chr4 102648474 102648698 + 0.666667 NA intron (NM_005908, intron 13 of 16) L1MB7|LINE|L1 112382 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 112-75 chr15 90601709 90601980 + 0.666667 NA intron (NM_001042574, intron 3 of 14) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -58390 NR_120371 101929765 Hs.615348 NR_120371 ENSG00000245479 LINC01585 - long intergenic non-protein coding RNA 1585 ncRNA 118-29 chr13 84717257 84717570 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66241 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 123.333-84 chr16 3609449 3609672 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_032444, exon 2 of 15) 5' UTR (NM_032444, exon 2 of 15) 2046 NM_032444 84464 Hs.143681 NM_032444 ENSG00000188827 SLX4 BTBD12|FANCP|MUS312 SLX4 structure-specific endonuclease subunit protein-coding 119.333-170 chr5 36844853 36845131 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 31702 NR_046262 646719 Hs.355684 NR_046262 ENSG00000285967 NIPBL-DT NIPBL-AS|NIPBL-AS1 NIPBL divergent transcript ncRNA 153.333-301 chr4 66641735 66642189 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 365138 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 156.333-166 chr2 52883 53308 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6590 NM_001077710 642273 Hs.8379 NM_001077710 ENSG00000184731 FAM110C - family with sequence similarity 110 member C protein-coding 123-34 chr12 21719234 21719581 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55299 NM_004982 3764 Hs.102308 NM_004982 ENSG00000121361 KCNJ8 KIR6.1|uKATP-1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 8 protein-coding 151.667-181 chr2 215840624 215840917 + 0.666667 NA intron (NR_037195, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 2766 NR_037195 646324 Hs.655713 NR_037195 ENSG00000235770 LINC00607 - long intergenic non-protein coding RNA 607 ncRNA 211-36 chr14 67779061 67779536 + 0.666667 NA intron (NM_015346, intron 23 of 41) AluSx1|SINE|Alu 37292 NM_015346 23503 Hs.98041 NM_015346 ENSG00000072121 ZFYVE26 FYVE-CENT|SPG15 zinc finger FYVE-type containing 26 protein-coding 192-15 chr1 229840500 229840921 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 45108 NR_146476 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 143.333-58 chr12 7704240 7704554 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7036 NM_199286 359787 Hs.131358 NM_199286 ENSG00000187569 DPPA3 Pgc7|STELLA developmental pluripotency associated 3 protein-coding 116.667-73 chr16 87724257 87724547 + 0.666667 NA intron (NM_001184856, intron 6 of 10) L1ME2z|LINE|L1 41584 NM_001184856 54758 Hs.123450 NM_017566 ENSG00000104731 KLHDC4 - kelch domain containing 4 protein-coding 131.667-127 chr3 39979940 39980280 + 0.666667 NA intron (NM_001284424, intron 2 of 15) LTR16A1|LTR|ERVL -119901 NM_001284426 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 114-13 chr10 88178893 88179081 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 315362 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 158.333-243 chr4 116108121 116108440 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -191445 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 148-45 chr15 47112923 47113268 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -70994 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 210-53 chr18 29123130 29123472 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -946171 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 123.333-110 chr2 112045760 112046093 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -9343 NM_032824 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 124.333-187 chr9 75081742 75082038 + 0.666667 NA intron (NM_001330679, intron 2 of 9) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 6265 NM_001330678 54981 Hs.494186 NM_017881 ENSG00000106733 NMRK1 C9orf95|NRK1|bA235O14.2 nicotinamide riboside kinase 1 protein-coding 122.333-204 chr8 97518712 97519062 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72390 NR_125390 101927066 Hs.732112 NR_125390 LOC101927066 - uncharacterized LOC101927066 ncRNA 188.333-102 chr3 181394180 181394598 + 0.666667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) L1MA9|LINE|L1 48097 NR_125407 102724604 Hs.570524 NR_125407 ENSG00000241231 LOC102724604 - uncharacterized LOC102724604 ncRNA 117.667-117 chr3 60500369 60500578 + 0.666667 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) intron (NM_001320900, intron 6 of 9) 117397 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 126.333-39 chr12 132824774 132825144 + 0.666667 NA intron (NM_001172557, intron 1 of 15) intron (NM_001172557, intron 1 of 15) 3430 NM_005895 2802 Hs.507333 NM_005895 ENSG00000090615 GOLGA3 GCP170|MEA-2 golgin A3 protein-coding 197.333-129 chr20 24000947 24001348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12368 NM_178311 92086 Hs.355394 NM_080920 ENSG00000149435 GGTLC1 GGTL6|GGTLA3|GGTLA4|dJ831C21.1|dJ831C21.2 gamma-glutamyltransferase light chain 1 protein-coding 147.667-390 chr9 32236797 32237057 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -147676 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 155.667-315 chr6 143170108 143170467 + 0.666667 NA intron (NM_001366354, intron 3 of 4) L1M2|LINE|L1 5505 NM_001366361 51390 Hs.567501 NM_016108 ENSG00000146416 AIG1 AIG-1|dJ95L4.1 androgen induced 1 protein-coding 111.667-110 chr17 82472160 82472345 + 0.666667 NA intron (NM_001038618, intron 4 of 10) AluSx1|SINE|Alu 13511 NM_001083608 26502 Hs.256526 NM_012336 ENSG00000141562 NARF IOP2 nuclear prelamin A recognition factor protein-coding 182.667-31 chr12 66747076 66747521 + 0.666667 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) intron (NM_001366724, intron 1 of 23) 56971 NM_001366724 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 250-71 chr6 46052252 46052889 + 0.666667 NA intron (NM_001370649, intron 1 of 5) HAL1ME|LINE|L1 27778 NM_001114086 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 191.333-183 chr6 158097567 158098117 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001178088, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001178088, exon 26 of 26) 70420 NR_073096 84947 Hs.154706 NM_032861 ENSG00000122335 SERAC1 - serine active site containing 1 protein-coding 166.333-66 chr14 47702514 47702962 + 0.666667 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -27784 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 153-66 chr18 28664084 28664407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -487115 NM_001792 1000 Hs.464829 NM_001792 ENSG00000170558 CDH2 CD325|CDHN|CDw325|NCAD cadherin 2 protein-coding 170-66 chr2 155294655 155295056 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 596160 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 114.333-198 chr6 139588880 139589207 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114447 NR_033919 645434 Hs.666240 NR_033919 ENSG00000238099 LINC01625 - long intergenic non-protein coding RNA 1625 ncRNA 144-9 chr1 220744026 220744320 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4149 NM_001317338 54996 Hs.369042 NM_017898 ENSG00000117791 MARC2 MOSC2 mitochondrial amidoxime reducing component 2 protein-coding 145.333-124 chr18 73066941 73067264 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 197396 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 133-81 chr6 988965 989200 + 0.666667 NA intron (NR_027116, intron 2 of 3) L1MB7|LINE|L1 112250 NR_027116 285768 Hs.209463 NR_027115 LINC01622 - long intergenic non-protein coding RNA 1622 ncRNA 113.333-56 chr11 120447965 120448162 + 0.666667 NA intron (NM_015313, intron 19 of 40) intron (NM_015313, intron 19 of 40) 62736 NM_001301084 23365 Hs.24598 NM_015313 ENSG00000196914 ARHGEF12 LARG|PRO2792 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 protein-coding 161-15 chr12 20245543 20245928 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117834 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 115.667-135 chr20 55196961 55197244 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -225941 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 142-46 chr15 25899876 25900300 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -2272 NR_040082 100128714 Hs.587854 NR_040082 ENSG00000206187 LINC02346 - long intergenic non-protein coding RNA 2346 ncRNA 130-111 chr6 80306309 80306612 + 0.666667 NA intron (NR_134945, intron 10 of 10) L2c|LINE|L2 199789 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 144-98 chr22 50536579 50536853 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4137 NM_001014440 440836 Hs.531314 NM_001014440 ENSG00000177989 ODF3B ODF3L3 outer dense fiber of sperm tails 3B protein-coding 129-32 chr13 32406985 32407207 + 0.666667 NA intron (NR_148477, intron 2 of 3) intron (NR_148477, intron 2 of 3) 21034 NR_148476 90634 Hs.732118 NM_052818 ENSG00000139597 N4BP2L1 CG018 NEDD4 binding protein 2 like 1 protein-coding 178-91 chr5 63354815 63355197 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 607286 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 169-67 chr3 118954601 118955082 + 0.666667 NA intron (NM_001353325, intron 1 of 7) intron (NM_001353325, intron 1 of 7) 11765 NR_046230 100506765 Hs.660823 NR_046230 ENSG00000239877 IGSF11-AS1 - IGSF11 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-209 chrX 50854006 50854203 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -40060 NR_027121 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 222-25 chr14 48130407 48130795 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -335587 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 117.333-67 chr15 51018643 51018847 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -18743 NR_146310 109729174 NR_146310 ENSG00000259240 MIR4713HG - MIR4713 host gene ncRNA 113.667-192 chr7 998584 998791 + 0.666667 NA intron (NR_146966, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 15506 NM_017781 54905 Hs.272795 NM_017781 ENSG00000073067 CYP2W1 - cytochrome P450 family 2 subfamily W member 1 protein-coding 141-8 chr10 68998065 68998340 + 0.666667 NA intron (NM_015634, intron 1 of 6) AluSx3|SINE|Alu 9399 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 135.333-108 chr22 36143912 36144124 + 0.666667 NA intron (NM_145639, intron 3 of 3) intron (NM_145639, intron 3 of 3) 16737 NM_030644 80833 Hs.474737 NM_014349 ENSG00000128284 APOL3 APOLIII|CG121|CG12_1|apoL-III apolipoprotein L3 protein-coding 142-22 chr10 123010457 123010725 + 0.666667 NA intron (NM_001609, intron 1 of 10) MIR|SINE|MIR 1585 NM_001330174 36 Hs.81934 NM_001609 ENSG00000196177 ACADSB 2-MEBCAD|ACAD7|SBCAD acyl-CoA dehydrogenase short/branched chain protein-coding 124.667-11 chr1 153328341 153328708 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -17806 NM_052891 114771 Hs.348266 NM_052891 ENSG00000159527 PGLYRP3 PGLYRPIalpha|PGRP-Ialpha|PGRPIA peptidoglycan recognition protein 3 protein-coding 142.333-39 chr11 28526718 28527064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49343 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 157.667-35 chr10 75883603 75883954 + 0.666667 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 101017 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 212-138 chr6 63848175 63848759 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 36 of 43) L1PA8|LINE|L1 41631 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 239-16 chr12 60405855 60406421 + 0.666667 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL 716768 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 147.667-148 chr18 1675595 1675925 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -316131 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 145.333-312 chr9 4241014 4241354 + 0.666667 NA intron (NM_001042413, intron 2 of 10) intron (NM_001042413, intron 2 of 10) 58884 NM_001042413 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 163-82 chr7 130469976 130470435 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -15970 NM_001253901 4232 Hs.270978 NM_002402 ENSG00000106484 MEST PEG1 mesoderm specific transcript protein-coding 173.333-159 chr5 66908520 66908973 + 0.666667 NA intron (NM_001164664, intron 4 of 28) intron (NM_001164664, intron 4 of 28) -50327 NM_001290226 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 162.333-216 chr6 66590922 66591328 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 803246 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 144-77 chr2 100238111 100238404 + 0.666667 NA intron (NR_103730, intron 1 of 2) intron (NR_103730, intron 1 of 2) 30003 NR_103730 150577 Hs.434127 NM_001102655 ENSG00000232084 LINC01104 - long intergenic non-protein coding RNA 1104 ncRNA 290-39 chr4 127967853 127968451 + 0.666667 NA intron (NM_001366044, intron 2 of 11) AluYc3|SINE|Alu -2189 NM_152778 256471 Hs.480701 NM_152778 ENSG00000164073 MFSD8 CCMD|CLN7 major facilitator superfamily domain containing 8 protein-coding 151.667-107 chr14 40462151 40462507 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -492382 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 200.333-105 chr4 92349096 92349611 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 44954 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 221.333-109 chr5 9340659 9340991 + 0.666667 NA intron (NM_003966, intron 3 of 22) intron (NM_003966, intron 3 of 22) -170508 NR_109935 101929338 Hs.675861 NR_109935 ENSG00000251370 SEMA5A-AS1 CTD-2201E9.1 SEMA5A antisense RNA 1 ncRNA 159-33 chr13 44048982 44049348 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 26830 NR_026955 121838 Hs.201441 NR_026955 LINC00284 NCRNA00284 long intergenic non-protein coding RNA 284 ncRNA 140-34 chr14 24502852 24503234 + 0.666667 NA TTS (NR_110032) TTS (NR_110032) 5222 NM_001836 1215 Hs.135626 NM_001836 ENSG00000092009 CMA1 CYH|MCT1|chymase chymase 1 protein-coding 136-69 chr3 188792072 188792432 + 0.666667 NA intron (NM_001167672, intron 7 of 9) intron (NM_001167672, intron 7 of 9) 103471 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 114.333-113 chr2 127822098 127822274 + 0.666667 NA Intergenic HUERS-P3-int|LTR|ERV1 -10999 NM_001006622 55339 Hs.554831 NM_018383 ENSG00000136709 WDR33 NET14|WDC146 WD repeat domain 33 protein-coding 173.333-60 chr15 26262577 26263063 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 147007 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 121.667-143 chr4 84331322 84331685 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -32334 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 174.333-75 chr20 50321786 50322166 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_109950) promoter-TSS (NR_109950) -634 NR_109950 101927586 Hs.637665 NR_109950 ENSG00000233077 LINC01271 - long intergenic non-protein coding RNA 1271 ncRNA 146.333-171 chr2 216710981 216711331 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15607 NM_000599 3488 Hs.607212 NM_000599 ENSG00000115461 IGFBP5 IBP5 insulin like growth factor binding protein 5 protein-coding 113.333-88 chr15 88972065 88972261 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58784 NM_005928 4240 Hs.3745 NM_005928 ENSG00000140545 MFGE8 BA46|EDIL1|HMFG|HsT19888|MFG-E8|MFGM|OAcGD3S|SED1|SPAG10|hP47 milk fat globule-EGF factor 8 protein protein-coding 258-57 chr5 12916575 12917246 + 0.666667 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) HERVL-int|LTR|ERVL 115976 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 121.667-44 chr11 134161193 134161451 + 0.666667 NA intron (NM_015261, intron 28 of 34) intron (NM_015261, intron 28 of 34) -9959 NR_145790 109623486 NR_145790 SNORD153 - small nucleolar RNA, C/D box 153 snoRNA 187.667-31 chr13 83257663 83258037 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 624543 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 261.333-36 chr16 9852789 9853292 + 0.666667 NA intron (NM_001134408, intron 4 of 13) L2c|LINE|L2 329027 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 123.667-177 chr8 69586638 69586873 + 0.666667 NA intron (NR_156414, intron 6 of 20) intron (NR_156414, intron 6 of 20) -6145 NR_132437 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 148-52 chr16 54592618 54592908 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -222064 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 166.333-70 chr14 62474913 62475278 + 0.666667 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -335122 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 114-79 chr20 46363033 46363332 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001281460, exon 2 of 11) 5' UTR (NM_001281460, exon 2 of 11) 1243 NM_001281459 51006 Hs.593344 NM_015945 ENSG00000080189 SLC35C2 BA394O2.1|C20orf5|CGI-15|OVCOV1 solute carrier family 35 member C2 protein-coding 171.667-145 chr6 80017478 80017970 + 0.666667 NA intron (NM_003318, intron 10 of 21) L1ME3|LINE|L1 13075 NM_003318 7272 Hs.169840 NM_003318 ENSG00000112742 TTK CT96|ESK|MPH1|MPS1|MPS1L1|PYT TTK protein kinase protein-coding 259-32 chr22 26484612 26485107 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001349905) promoter-TSS (NM_001349905) 982 NM_001013694 402055 Hs.709914 NM_001013694 ENSG00000100104 SRRD HC/HCC|SRR1L SRR1 domain containing protein-coding 122.667-217 chrX 126345477 126345799 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -179349 NM_001013628 340578 Hs.181867 NM_001013628 ENSG00000198354 DCAF12L2 WDR40C DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 2 protein-coding 178-88 chr5 20093678 20094046 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) intron (NM_001291956, intron 2 of 14) -105662 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 184.667-113 chr6 15777461 15777852 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114598 NM_001271669 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 249.333-105 chr9 28254527 28255169 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) L1PA13|LINE|L1 464457 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 154-71 chr18 5836690 5837034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3833 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 131.667-128 chr3 56261334 56261634 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 3 of 17) intron (NR_132749, intron 3 of 17) 206983 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 159.667-125 chr16 71264205 71264555 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25022 NM_001324378 55783 Hs.72782 NM_018348 ENSG00000180917 CMTR2 AFT|FTSJD1|HMTr2|MTr2 cap methyltransferase 2 protein-coding 155.667-61 chr11 121263712 121264021 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -28905 NM_006918 6309 Hs.287749 NM_006918 ENSG00000109929 SC5D ERG3|S5DES|SC5DL sterol-C5-desaturase protein-coding 140.333-198 chr6 10213255 10213545 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -191102 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 152-16 chr1 237626211 237626508 + 0.666667 NA intron (NM_001035, intron 40 of 104) Kanga11a|DNA|TcMar-Tc2 155240 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 132.333-62 chr16 28813173 28813541 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -9691 NM_017492 11273 Hs.460499 NM_007245 ENSG00000168488 ATXN2L A2D|A2LG|A2LP|A2RP ataxin 2 like protein-coding 118.333-155 chr4 110099627 110099968 + 0.666667 NA intron (NM_001130721, intron 3 of 4) intron (NM_001130721, intron 3 of 4) 98818 NM_001130721 79071 Hs.412939 NM_024090 ENSG00000170522 ELOVL6 FACE|FAE|LCE ELOVL fatty acid elongase 6 protein-coding 170.333-170 chr5 9060924 9061263 + 0.666667 NA intron (NM_003966, intron 18 of 22) intron (NM_003966, intron 18 of 22) -7198 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 187.333-69 chr15 33713301 33713766 + 0.666667 NA intron (NM_001243996, intron 43 of 102) intron (NM_001243996, intron 43 of 102) -254964 NM_012125 1133 Hs.584747 NM_012125 ENSG00000184984 CHRM5 HM5 cholinergic receptor muscarinic 5 protein-coding 146.667-228 chr4 33530748 33531103 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 508968 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 151-91 chr4 40170229 40170496 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -20718 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 158.667-288 chr6 82594055 82594382 + 0.666667 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 229974 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 166-96 chr5 106463769 106464152 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 547054 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 235-33 chr2 75571681 75572209 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2226 NM_032181 84141 Hs.302346 NM_032181 ENSG00000115363 EVA1A FAM176A|TMEM166 eva-1 homolog A, regulator of programmed cell death protein-coding 115.333-121 chr2 204932800 204933042 + 0.666667 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 387446 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 113.667-75 chr16 50828156 50828391 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 21601 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 139.667-192 chr8 106299594 106299854 + 0.666667 NA intron (NM_018002, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 29546 NM_018002 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 200-65 chr16 21154228 21154701 + 0.666667 NA intron (NM_017539, intron 1 of 61) intron (NM_017539, intron 1 of 61) -3618 NM_001347886 55567 Hs.526500 NM_017539 ENSG00000158486 DNAH3 DNAHC3-B|DNAHC3B|HDHC8|HEL-36|HSADHC3 dynein axonemal heavy chain 3 protein-coding 146.667-351 chr9 31839036 31839392 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -457724 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 207.333-103 chr15 80937823 80938154 + 0.666667 NA intron (NM_001293304, intron 25 of 29) intron (NM_001293304, intron 25 of 29) 51831 NM_015154 23184 Hs.578450 NM_015154 ENSG00000117899 MESD BOCA|MESDC2 mesoderm development LRP chaperone protein-coding 170-88 chr4 44382034 44382379 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) L1MA5|LINE|L1 66603 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 112.333-152 chr22 20215310 20215604 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 9125 NR_026919 150197 Hs.635544 NM_152508 ENSG00000236499 LINC00896 - long intergenic non-protein coding RNA 896 ncRNA 138.667-10 chr1 211891749 211892112 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60969 NR_135820 102723727 Hs.147656 NR_135818 ENSG00000229258 LPGAT1-AS1 - LPGAT1 antisense RNA 1 ncRNA 158-40 chr13 111365521 111365897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 45067 NM_152324 121793 Hs.210677 NM_152324 ENSG00000153495 TEX29 C13orf16|bA474D23.1 testis expressed 29 protein-coding 203.667-48 chr2 23300086 23300550 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84861 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 125-111 chr8 89504976 89505244 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 252601 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 199.667-144 chr8 126846204 126846621 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -166742 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 128.333-36 chr11 37271404 37271713 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -667043 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 204.667-79 chr2 216737068 216737612 + 0.666667 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -41791 NM_000599 3488 Hs.607212 NM_000599 ENSG00000115461 IGFBP5 IBP5 insulin like growth factor binding protein 5 protein-coding 257.667-21 chr14 67613702 67614269 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -5935 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 127.667-10 chr1 189770487 189770825 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 705354 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 113.333-19 chr1 212889896 212890232 + 0.666667 NA intron (NM_014053, intron 8 of 9) intron (NM_014053, intron 8 of 9) 31789 NM_014053 28982 Hs.7055 NM_014053 ENSG00000162769 FLVCR1 AXPC1|FLVCR|MFSD7B|PCA|PCARP|SLC49A1 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 protein-coding 124.333-17 chr10 19458909 19459221 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 29 of 39) intron (NM_001142308, intron 29 of 39) 269485 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 269-42 chr5 41837678 41838339 + 0.666667 NA intron (NM_001364301, intron 7 of 16) intron (NM_001364301, intron 7 of 16) 5649 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 112.667-15 chr1 171730677 171730992 + 0.666667 NA intron (NM_001185127, intron 2 of 7) intron (NM_001185127, intron 2 of 7) 11231 NM_001185127 8674 Hs.6651 NM_003762 ENSG00000117533 VAMP4 VAMP-4|VAMP24 vesicle associated membrane protein 4 protein-coding 116.667-172 chr6 19955247 19955529 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 118018 NM_001546 3400 Hs.519601 NM_001546 ENSG00000172201 ID4 IDB4|bHLHb27 inhibitor of DNA binding 4, HLH protein protein-coding 150.667-221 chr21 28921233 28921634 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -36060 NR_047510 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 129.667-24 chr10 39349647 39349973 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 653214 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 151.333-150 chr15 63489476 63489856 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14845 NM_001256702 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 136.333-142 chr4 37658836 37659085 + 0.666667 NA intron (NM_001085400, intron 1 of 6) intron (NM_001085400, intron 1 of 6) 27416 NM_001085400 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 144-83 chr20 13730569 13730862 + 0.666667 NA intron (NM_001276380, intron 10 of 13) intron (NM_001276380, intron 10 of 13) 54171 NM_016649 51575 Hs.369284 NM_016649 ENSG00000089048 ESF1 ABTAP|C20orf6|HDCMC28P|bA526K24.1 ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog protein-coding 112.667-225 chr6 9196256 9196587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 544212 NR_004855 728655 Hs.214343 NR_004855 HULC HCCAT1|LINC00078|NCRNA00078 hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA ncRNA 146.333-304 chr7 32425155 32425438 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) intron (NM_001322059, intron 1 of 17) 2928 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 154-63 chr15 89218983 89219424 + 0.666667 NA intron (NM_000326, intron 2 of 8) MER5A|DNA|hAT-Charlie 2376 NM_000326 6017 Hs.1933 NM_000326 ENSG00000140522 RLBP1 CRALBP retinaldehyde binding protein 1 protein-coding 117.333-73 chr16 20098626 20098858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24964 NM_001318483 124274 Hs.446875 NM_001002911 ENSG00000180269 GPR139 GPRg1|PGR3 G protein-coupled receptor 139 protein-coding 237.667-69 chr5 153829786 153830343 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 68923 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 135-50 chr2 173914704 173915008 + 0.666667 NA intron (NM_003111, intron 5 of 6) (AATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 49024 NM_001017371 6670 Hs.531587 NM_003111 ENSG00000172845 SP3 SPR2 Sp3 transcription factor protein-coding 116.667-101 chr2 113085252 113085575 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 13095 NM_032556 84639 Hs.306974 NM_032556 ENSG00000136697 IL1F10 FIL1-theta|FKSG75|IL-1HY2|IL-38|IL1-theta|IL1HY2 interleukin 1 family member 10 protein-coding 154.667-286 chr4 124528810 124529205 + 0.666667 NA intron (NR_110838, intron 5 of 8) L1MEd|LINE|L1 29427 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 112.333-12 chr1 207015394 207015648 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 17235 NM_023938 79098 Hs.32417 NM_023938 ENSG00000182795 C1orf116 SARG chromosome 1 open reading frame 116 protein-coding 118.333-99 chr2 39881418 39881680 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36085 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 148-100 chr3 73969330 73969703 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 160272 NR_146637 105377165 NR_146637 LINC02005 - long intergenic non-protein coding RNA 2005 ncRNA 126.333-37 chr12 74960808 74961039 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 248825 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 178-74 chr20 53850293 53850638 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 25244 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 159-63 chr2 122262355 122262681 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 506867 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 117.333-185 chr7 11441394 11441715 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 13 of 26) intron (NM_015204, intron 13 of 26) 390644 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 118.333-181 chr6 132679946 132680140 + 0.666667 NA TTS (NM_004666) TTS (NM_004666) 34012 NM_004666 8876 Hs.12114 NM_004666 ENSG00000112299 VNN1 HDLCQ8|Tiff66 vanin 1 protein-coding 130.667-71 chr15 38033983 38034269 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -6267 NR_120330 101928227 Hs.602381 NR_120330 ENSG00000259225 LINC02345 - long intergenic non-protein coding RNA 2345 ncRNA 156-89 chr3 86507471 86507881 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 25733 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 130.333-128 chr3 32445046 32445422 + 0.666667 NA intron (NM_181472, intron 2 of 3) L1MB8|LINE|L1 53381 NM_138410 112616 Hs.440494 NM_138410 ENSG00000153551 CMTM7 CKLFSF7 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 7 protein-coding 176-19 chr11 41761968 41762379 + 0.666667 NA intron (NR_120584, intron 2 of 5) L2|LINE|L2 47605 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 121-87 chr22 27437276 27437505 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 126739 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 164.667-37 chr11 64597584 64598060 + 0.666667 NA intron (NM_144585, intron 4 of 9) intron (NM_144585, intron 4 of 9) 6602 NM_144585 116085 Hs.174424 NM_144585 ENSG00000197891 SLC22A12 OAT4L|RST|URAT1 solute carrier family 22 member 12 protein-coding 159.667-162 chr2 27785512 27785923 + 0.666667 NA intron (NM_022128, intron 7 of 7) AluSg7|SINE|Alu 13998 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 214-5 chr1 87309670 87310176 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -18957 NM_006769 8543 Hs.436792 NM_006769 ENSG00000143013 LMO4 - LIM domain only 4 protein-coding 164.667-61 chr13 34590607 34590952 + 0.666667 NA intron (NR_047036, intron 1 of 2) L2a|LINE|L2 49906 NR_047036 100874179 Hs.569253 NR_047036 ENSG00000225179 LINC00457 - long intergenic non-protein coding RNA 457 ncRNA 217-78 chr6 41147015 41147483 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7100 NM_001271808 340205 Hs.117331 NM_178174 ENSG00000161911 TREML1 GLTL1825|PRO3438|TLT-1|TLT1|dJ238O23.3 triggering receptor expressed on myeloid cells like 1 protein-coding 119-14 chr10 12116328 12116618 + 0.666667 NA intron (NM_018706, intron 13 of 16) AluSx|SINE|Alu -13168 NM_001142628 55176 Hs.112955 NM_018144 ENSG00000065665 SEC61A2 - SEC61 translocon alpha 2 subunit protein-coding 144-29 chr11 111679066 111679420 + 0.666667 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) intron (NM_015191, intron 3 of 14) 76794 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 127.667-24 chr10 127051659 127051889 + 0.666667 NA intron (NM_001290223, intron 21 of 51) AluJb|SINE|Alu 144817 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 120.667-124 chr4 43678398 43678666 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -185989 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 169-46 chr2 76931207 76931562 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) -54581 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 216-2 chr1 100414629 100415120 + 0.666667 NA intron (NM_001319212, intron 4 of 13) intron (NM_001319212, intron 4 of 13) 62368 NM_003672 8556 Hs.127411 NM_003672 ENSG00000079335 CDC14A DFNB105|DFNB32|DFNB35|cdc14|hCDC14 cell division cycle 14A protein-coding 187.333-4 chr1 51226682 51227079 + 0.666667 NA intron (NR_147076, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 8216 NR_147076 105378716 NR_147076 ENSG00000203356 LINC01562 - long intergenic non-protein coding RNA 1562 ncRNA 140.333-103 chr2 81580950 81581333 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114195 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 196.333-149 chr5 161211405 161211823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -272988 NR_151858 285629 Hs.554279 NR_027111 ENSG00000253417 LINC02159 - long intergenic non-protein coding RNA 2159 ncRNA 112.333-48 chr12 11679820 11680061 + 0.666667 NA intron (NM_001987, intron 1 of 7) intron (NM_001987, intron 1 of 7) 30086 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 189.333-65 chr16 23361070 23361601 + 0.666667 NA intron (NM_000336, intron 4 of 12) AluJb|SINE|Alu 59033 NM_000336 6338 Hs.414614 NM_000336 ENSG00000168447 SCNN1B BESC1|ENaCb|ENaCbeta|LIDLS1|SCNEB sodium channel epithelial 1 beta subunit protein-coding 167.667-120 chr20 49798055 49798360 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14506 NM_001260491 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 151.667-83 chr12 40321286 40321690 + 0.666667 NA intron (NM_198578, intron 35 of 50) intron (NM_198578, intron 35 of 50) -71906 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 128.667-49 chr13 54749391 54749726 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -424896 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 202-26 chr11 17834809 17835258 + 0.666667 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) intron (NR_104040, intron 11 of 11) 99085 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 121.667-61 chr14 87731864 87732187 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76731 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 129.667-107 chr2 215773242 215773540 + 0.666667 NA intron (NR_037195, intron 1 of 9) intron (NR_037195, intron 1 of 9) 55348 NR_132383 105373869 Hs.152812 NR_132383 LINC01614 LCAL4 long intergenic non-protein coding RNA 1614 ncRNA 182-80 chr4 65951729 65952231 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -281485 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 143.333-29 chr10 30146216 30146506 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -30867 NM_001350022 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 137-81 chr5 61406188 61406508 + 0.666667 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 74090 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 185.666-16 chr5 36716433 36716971 + 0.666667 NA Intergenic MER91C|DNA|hAT-Tip100 110096 NM_004172 6507 Hs.481918 NM_004172 ENSG00000079215 SLC1A3 EA6|EAAT1|GLAST|GLAST1 solute carrier family 1 member 3 protein-coding 214.333-104 chr3 191698165 191698653 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 237246 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 130.667-24 chr10 42554053 42554300 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -1306 NR_026777 100129482 Hs.278064 NR_026777 ENSG00000234420 ZNF37BP KOX21|ZNF37B zinc finger protein 37B, pseudogene pseudo 115-137 chr6 74059089 74059290 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -10262 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 125.333-174 chr8 63687260 63687626 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -81987 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 173-14 chr11 36570203 36570617 + 0.666667 NA intron (NM_000448, intron 1 of 1) intron (NM_000448, intron 1 of 1) 2397 NM_000448 5896 Hs.73958 NM_000448 ENSG00000166349 RAG1 RAG-1|RNF74 recombination activating 1 protein-coding 163.333-139 chr2 27576167 27576460 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_032266) promoter-TSS (NM_032266) -209 NM_032266 84226 Hs.131021 NM_032266 ENSG00000221843 C2orf16 - chromosome 2 open reading frame 16 protein-coding 173-100 chr8 143291050 143291441 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_030895) promoter-TSS (NM_030895) -172 NM_030895 79943 Hs.512740 NM_030895 ENSG00000185730 ZNF696 - zinc finger protein 696 protein-coding 208.333-5 chr1 96176131 96176606 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 184300 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 154.333-10 chr1 97437542 97437983 + 0.666667 NA intron (NM_000110, intron 14 of 22) L1ME1|LINE|L1 341839 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 116.667-48 chr13 104575811 104576046 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -889939 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 178.333-117 chr3 196469514 196469839 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_152617, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_152617, exon 6 of 6) 34092 NM_152617 165918 Hs.250648 NM_152617 ENSG00000163961 RNF168 hRNF168 ring finger protein 168 protein-coding 149-132 chr7 31744898 31745205 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57836 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 128.333-99 chr2 56390233 56390517 + 0.666667 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -204605 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 193-91 chr8 82434577 82435001 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -477315 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 126.667-180 chr8 134731836 134732075 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -18924 NM_001289394 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 165-2 chr1 37546692 37547083 + 0.666667 NA intron (NM_024700, intron 2 of 3) L2-3_Crp|LINE|L2 7406 NM_024700 79753 Hs.47232 NM_024700 ENSG00000163877 SNIP1 PML1|PMRED Smad nuclear interacting protein 1 protein-coding 129-110 chr6 52621244 52621568 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -42995 NR_024405 730101 Hs.7921 NR_024403 ENSG00000216775 LOC730101 - uncharacterized LOC730101 ncRNA 160.667-332 chrX 94249368 94249755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 575355 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 141-72 chr5 148653161 148653471 + 0.666667 NA intron (NR_104445, intron 1 of 7) intron (NR_104445, intron 1 of 7) 1211 NM_000870 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 112-32 chr11 82507730 82508007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103955 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 153.667-366 chr7 135388721 135389034 + 0.666667 NA exon (NM_001008225, exon 11 of 11) exon (NM_001008225, exon 11 of 11) 121225 NM_013316 4850 Hs.490224 NM_013316 ENSG00000080802 CNOT4 CLONE243|NOT4|NOT4H CCR4-NOT transcription complex subunit 4 protein-coding 147.333-177 chr2 172033533 172033832 + 0.666667 NA intron (NM_001322279, intron 1 of 9) L1MC5|LINE|L1 33729 NR_136273 254042 Hs.298250 NM_199227 ENSG00000172878 METAP1D MAP 1D|MAP1D|MetAP 1D|Metap1l methionyl aminopeptidase type 1D, mitochondrial protein-coding 190.333-133 chr6 121461484 121461930 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 26061 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 125-37 chr14 96550793 96551064 + 0.666667 NA intron (NM_001363662, intron 16 of 20) MIRb|SINE|MIR 48063 NM_001293628 10914 Hs.253726 NM_032632 ENSG00000090060 PAPOLA PAP|PAP-alpha poly(A) polymerase alpha protein-coding 122.333-37 chr11 104659004 104659262 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -49831 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 222.333-13 chr10 69694029 69694499 + 0.666667 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 64017 NM_145306 219738 Hs.522992 NM_145306 ENSG00000171224 FAM241B C10orf35 family with sequence similarity 241 member B protein-coding 152-34 chr11 98779015 98779302 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -241791 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 160-112 chr7 131482911 131483315 + 0.666667 NA intron (NM_001321316, intron 17 of 17) intron (NM_001321316, intron 17 of 17) 73515 NM_005397 5420 Hs.744213 NM_005397 ENSG00000128567 PODXL Gp200|PC|PCLP|PCLP-1 podocalyxin like protein-coding 225.667-22 chr13 61155703 61156115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43971 NR_036128 100422973 NR_036128 ENSG00000266663 MIR3169 - microRNA 3169 ncRNA 164-104 chr7 30654391 30654724 + 0.666667 NA intron (NM_001202481, intron 13 of 13) intron (NM_001202481, intron 13 of 13) 27899 NM_001883 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 111.667-218 chr6 45475871 45476178 + 0.666667 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 53749 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 189.667-58 chr16 51727914 51728410 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -34357 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 249.333-90 chr7 4726779 4727290 + 0.666667 NA intron (NM_001037165, intron 1 of 8) AluJr|SINE|Alu 44739 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 183-92 chr6 40643909 40644351 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -56766 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 220.333-119 chr7 4304089 4304586 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -169500 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 119-16 chr10 41883429 41883634 + 0.666667 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 484514 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 190.333-101 chr3 196754534 196754826 + 0.666667 NA intron (NM_002577, intron 1 of 14) L1M6|LINE|L1 14823 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 128.333-192 chr8 82354938 82355155 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -512760 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 155-3 chr1 68749771 68750159 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -252883 NM_001114120 55635 Hs.445098 NM_017779 ENSG00000024526 DEPDC1 DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35 DEP domain containing 1 protein-coding 188.667-7 chr1 75485851 75486344 + 0.666667 NA intron (NM_001320285, intron 2 of 25) (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 125017 NM_001320287 204962 Hs.654821 NM_152697 ENSG00000137968 SLC44A5 CTL5 solute carrier family 44 member 5 protein-coding 115.333-146 chr3 142462143 142462416 + 0.666667 NA intron (NM_001354579, intron 40 of 45) intron (NM_001354579, intron 40 of 45) -14217 NM_001282859 54464 Hs.435103 NM_019001 ENSG00000114127 XRN1 SEP1 5'-3' exoribonuclease 1 protein-coding 160.333-220 chr4 99964860 99965180 + 0.666667 NA intron (NR_125923, intron 1 of 3) L1MC5a|LINE|L1 14526 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 177.333-181 chr9 118240428 118240732 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -439091 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 182.333-146 chr7 67808952 67809342 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -211106 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 257-14 chr14 45024813 45025322 + 0.666667 NA intron (NR_131765, intron 7 of 19) L2a|LINE|L2 -59049 NM_017922 55015 Hs.274337 NM_017922 ENSG00000185246 PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 protein-coding 144-146 chr7 37198982 37199260 + 0.666667 NA intron (NM_001206480, intron 13 of 21) intron (NM_001206480, intron 13 of 21) 154547 NM_001206482 9844 Hs.434989 NM_014800 ENSG00000155849 ELMO1 CED-12|CED12|ELMO-1 engulfment and cell motility 1 protein-coding 168-3 chr1 108607196 108607534 + 0.666667 NA intron (NM_001010883, intron 3 of 10) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 47265 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 114.667-173 chr3 78391816 78391997 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -342943 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 142-31 chr12 124991402 124991680 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -2104 NM_080626 140707 Hs.596464 NM_080626 ENSG00000184992 BRI3BP BNAS1|HCCR-1|HCCR-2|HCCRBP-1|HCCRBP-3|KG19 BRI3 binding protein protein-coding 216.333-53 chr15 99260315 99260656 + 0.666667 NA TTS (NR_073383) TTS (NR_073383) 2960 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 141.667-196 chr6 51929161 51929450 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 37 of 66) intron (NM_138694, intron 37 of 66) 158308 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 136-104 chr8 110429627 110429987 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -454036 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 141.333-152 chr3 88008762 88009014 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 26312 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 148.667-356 chr7 72036139 72036535 + 0.666667 NA intron (NM_001363460, intron 3 of 5) L1M4c|LINE|L1 301054 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 132-94 chr4 159073662 159074026 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -30207 NM_001351724 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 153-129 chr7 73463302 73463602 + 0.666667 NA intron (NM_001370402, intron 11 of 18) AluJr|SINE|Alu 29674 NM_003508 8326 Hs.647029 NM_003508 ENSG00000188763 FZD9 CD349|FZD3 frizzled class receptor 9 protein-coding 160-50 chr18 10100705 10101025 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 186849 NM_003574 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 112.333-224 chr6 502869 503059 + 0.666667 NA intron (NM_018303, intron 23 of 27) intron (NM_018303, intron 23 of 27) 111212 NM_001195286 3662 Hs.401013 NM_002460 ENSG00000137265 IRF4 LSIRF|MUM1|NF-EM5|SHEP8 interferon regulatory factor 4 protein-coding 189.333-113 chr20 54694393 54694815 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 219011 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 140.667-67 chr13 42129139 42129410 + 0.666667 NA intron (NM_178009, intron 2 of 29) intron (NM_178009, intron 2 of 29) -8768 NR_123715 160851 Hs.630380 NM_152910 ENSG00000102780 DGKH DGKeta diacylglycerol kinase eta protein-coding 136-88 chr5 156462468 156462749 + 0.666667 NA intron (NM_001128209, intron 2 of 7) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 135444 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 157.333-131 chr16 9102014 9102341 + 0.666667 NA intron (NM_014117, intron 2 of 3) intron (NM_014117, intron 2 of 3) 10533 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 162.333-251 chr8 78517456 78517777 + 0.666667 NA intron (NM_181839, intron 1 of 2) intron (NM_181839, intron 1 of 2) 1276 NM_181839 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 115.333-175 chr5 78960555 78960729 + 0.666667 NA intron (NM_198709, intron 4 of 7) AluSg|SINE|Alu 24668 NM_000046 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 132.333-16 chr10 29801871 29802246 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -65122 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 162-8 chr1 223864859 223865211 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -19063 NM_005426 7159 Hs.523968 NM_005426 ENSG00000143514 TP53BP2 53BP2|ASPP2|BBP|P53BP2|PPP1R13A tumor protein p53 binding protein 2 protein-coding 198-63 chr15 86055655 86056098 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23744 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 124-54 chr19 42461221 42461489 + 0.666667 NA intron (NR_073179, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu -18409 NR_133910 284340 Hs.445586 NM_198477 ENSG00000189377 CXCL17 DMC|Dcip1|UNQ473|VCC-1|VCC1 C-X-C motif chemokine ligand 17 protein-coding 213.667-42 chr19 15978339 15978790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29556 NM_001004465 126541 Hs.553579 NM_001004465 ENSG00000176231 OR10H4 OR19-28 olfactory receptor family 10 subfamily H member 4 protein-coding 164-125 chr9 23841985 23842424 + 0.666667 NA intron (NM_001351456, intron 2 of 8) intron (NM_001351456, intron 2 of 8) 8397 NM_001351462 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 135-93 chr6 102052402 102052693 + 0.666667 NA intron (NM_001166247, intron 14 of 16) intron (NM_001166247, intron 14 of 16) 653562 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 141-75 chr6 71032036 71032367 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75141 NM_080742 135152 Hs.713609 NM_080742 ENSG00000112309 B3GAT2 GLCATS beta-1,3-glucuronyltransferase 2 protein-coding 140.333-71 chr15 64525548 64525951 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) L1MB7|LINE|L1 26329 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 113-161 chr4 130162342 130162622 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -213879 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 126.667-181 chr8 144887360 144887593 + 0.666667 NA intron (NM_001363100, intron 4 of 5) intron (NM_001363100, intron 4 of 5) 12829 NM_001363103 58500 Hs.532277 NM_021061 ENSG00000196150 ZNF250 ZFP647|ZNF647 zinc finger protein 250 protein-coding 153-95 chr3 98826216 98826640 + 0.666667 NA intron (NM_080927, intron 3 of 15) L2b|LINE|L2 63121 NM_001323367 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 184-119 chr8 136327610 136327905 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -203041 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 128-9 chr10 78959061 78959388 + 0.666667 NA intron (NR_024429, intron 6 of 7) MER5B|DNA|hAT-Charlie 108224 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 155-120 chr7 97368466 97368785 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 252032 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 155-46 chr16 73419429 73419753 + 0.666667 NA intron (NR_038234, intron 1 of 2) intron (NR_038234, intron 1 of 2) 32786 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 129-22 chr11 27575666 27575903 + 0.666667 NA intron (NR_033315, intron 2 of 6) intron (NR_033315, intron 2 of 6) 58843 NR_102708 101410541 Hs.471439 NR_102708 ENSG00000254934 LINC00678 - long intergenic non-protein coding RNA 678 ncRNA 117-118 chr5 128760437 128760614 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -204602 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 220-117 chr8 37686062 37686687 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -9408 NM_025069 80139 Hs.288042 NM_025069 ENSG00000183779 ZNF703 NLZ1|ZEPPO1|ZNF503L|ZPO1 zinc finger protein 703 protein-coding 120-60 chr2 3961035 3961236 + 0.666667 NA intron (NR_037881, intron 1 of 2) AluY|SINE|Alu 12897 NR_037881 100505964 Hs.190267 NR_037881 ENSG00000237401 LINC01304 - long intergenic non-protein coding RNA 1304 ncRNA 116-112 chr3 135389143 135389336 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -576489 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 137-34 chr16 60854838 60855123 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 200786 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 117-11 chr1 214661270 214661594 + 0.666667 NA intron (NM_016343, intron 19 of 19) intron (NM_016343, intron 19 of 19) 58237 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 179.667-149 chr8 139516758 139517141 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 186174 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 123.667-186 chr8 125895400 125895636 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55679 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 112.333-110 chr2 13518354 13518603 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -511465 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 111.667-198 chr5 33246852 33247144 + 0.666667 NA intron (NR_147008, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 17263 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 154-19 chr10 93912962 93913300 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19153 NR_144336 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 156.333-311 chr6 66520612 66520935 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 732894 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 150-142 chr8 69040459 69040748 + 0.666667 NA intron (NR_039986, intron 2 of 4) intron (NR_039986, intron 2 of 4) 63587 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 126.333-146 chr6 16235039 16235399 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -3368 NM_006877 2766 Hs.484741 NM_006877 ENSG00000137198 GMPR GMPR 1|GMPR1 guanosine monophosphate reductase protein-coding 185.667-38 chr15 69235368 69235759 + 0.666667 NA intron (NM_001324092, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR -63349 NM_017705 54852 Hs.591096 NM_017705 ENSG00000137819 PAQR5 MPRG progestin and adipoQ receptor family member 5 protein-coding 167-21 chr11 32165645 32166049 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21935 NR_132770 106635521 NR_132770 SNORA88 - small nucleolar RNA, H/ACA box 88 snoRNA 135.333-9 chr1 104601502 104601853 + 0.666667 NA Intergenic HERVH-int|LTR|ERV1 528654 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 184.667-14 chr1 245049301 245049828 + 0.666667 NA intron (NM_032328, intron 3 of 7) intron (NM_032328, intron 3 of 7) -78695 NR_111907 101928068 Hs.134857 NR_111907 LOC101928068 - uncharacterized LOC101928068 ncRNA 154.333-80 chr14 37009689 37010061 + 0.666667 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -57484 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 155.667-77 chr12 123700621 123700942 + 0.666667 NA intron (NM_001143850, intron 14 of 17) AluJr4|SINE|Alu -11572 NM_012463 23545 Hs.25786 NM_012463 ENSG00000185344 ATP6V0A2 A2|ARCL|ARCL2A|ATP6A2|ATP6N1D|J6B7|RTF|STV1|TJ6|TJ6M|TJ6S|VPH1|WSS ATPase H+ transporting V0 subunit a2 protein-coding 147.333-114 chr14 79917477 79917828 + 0.666667 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -293767 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 208-102 chr3 47228645 47229207 + 0.666667 NA intron (NM_001134878, intron 21 of 21) intron (NM_001134878, intron 21 of 21) 21683 NR_145712 109617025 NR_145712 SNORD13J - small nucleolar RNA, C/D box 13J snoRNA 123.667-140 chr4 56173162 56173379 + 0.666667 NA intron (NM_020722, intron 1 of 10) intron (NM_020722, intron 1 of 10) 3075 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 126.333-33 chr12 9277195 9277449 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6335 NR_024374 642846 Hs.447869 NR_024374 LOC642846 - DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 11-like ncRNA 125.333-106 chr20 54488020 54488367 + 0.666667 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) intron (NM_018431, intron 1 of 7) 12600 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 157-2 chr1 20568293 20568598 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 15872 NM_207334 163933 Hs.429179 NM_207334 ENSG00000183114 FAM43B - family with sequence similarity 43 member B protein-coding 138-9 chr1 203461702 203461953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13979 NM_201348 5549 Hs.632481 NM_002725 ENSG00000188783 PRELP MST161|MSTP161|SLRR2A proline and arginine rich end leucine rich repeat protein protein-coding 116.333-168 chr5 28649735 28649945 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -277030 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 156.667-297 chr6 47526550 47526988 + 0.666667 NA intron (NM_012120, intron 2 of 17) intron (NM_012120, intron 2 of 17) 48980 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 128.333-142 chr4 77771010 77771374 + 0.666667 NA intron (NM_001365006, intron 4 of 11) AluSp|SINE|Alu 47872 NM_001365007 246175 Hs.592519 NM_144571 ENSG00000138767 CNOT6L CCR4b CCR4-NOT transcription complex subunit 6 like protein-coding 132.667-178 chr8 84177975 84178327 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4636 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 184.667-91 chr4 60783473 60783823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -138971 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 172-59 chr2 160298143 160298504 + 0.666667 NA intron (NM_002897, intron 6 of 13) L2c|LINE|L2 -26428 NR_103775 100505984 Hs.729532 NR_103775 ENSG00000285373 LINC02478 - long intergenic non-protein coding RNA 2478 ncRNA 122-11 chr10 11482349 11482682 + 0.666667 NA intron (NM_014688, intron 13 of 14) intron (NM_014688, intron 13 of 14) 49765 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 159-84 chr3 175702127 175702449 + 0.666667 NA intron (NM_207015, intron 11 of 13) intron (NM_207015, intron 11 of 13) 74045 NR_046714 100874245 Hs.614827 NR_046714 NAALADL2-AS1 - NAALADL2 antisense RNA 1 ncRNA 275.333-9 chr10 114705227 114705710 + 0.666667 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) -20465 NM_001322882 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 132-112 chr7 105306134 105306376 + 0.666667 NA intron (NM_001350746, intron 2 of 14) MamTip1|DNA|hAT-Tip100 -7476 NM_001278273 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 182.333-59 chr15 97156902 97157357 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 364682 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 153-36 chr12 131717568 131717987 + 0.666667 NA intron (NM_004592, intron 3 of 17) AluSx1|SINE|Alu 6687 NM_004592 6433 Hs.308171 NM_004592 ENSG00000061936 SFSWAP SFRS8|SWAP splicing factor SWAP protein-coding 174.667-63 chr15 88773277 88773655 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29970 NM_001369268 176 Hs.2159 NM_001135 ENSG00000157766 ACAN AGC1|AGCAN|CSPG1|CSPGCP|MSK16|SEDK|SSOAOD aggrecan protein-coding 188.667-145 chr8 13931412 13931810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 301921 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 156.333-305 chr6 39066904 39067276 + 0.666667 NA intron (NR_136563, intron 5 of 13) L1ME3C|LINE|L1 -7224 NR_162114 113218508 NR_162114 MIR9983 - microRNA 9983 ncRNA 148.667-288 chr4 87878079 87878432 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43552 NM_001291183 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 196.333-128 chr4 43078745 43079180 + 0.666667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 185696 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 113.333-35 chr10 101365830 101366061 + 0.666667 NA intron (NM_003939, intron 1 of 13) intron (NM_003939, intron 1 of 13) 11780 NM_033637 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 122-97 chr5 115269780 115270041 + 0.666667 NA intron (NM_001040440, intron 7 of 9) intron (NM_001040440, intron 7 of 9) -7033 NM_005023 5229 Hs.254006 NM_005023 ENSG00000164219 PGGT1B BGGI|GGTI protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta protein-coding 173.333-144 chr4 47893746 47894110 + 0.666667 NA intron (NR_103795, intron 11 of 23) intron (NR_103795, intron 11 of 23) -20299 NR_125879 101927157 Hs.134190 NR_125879 LOC101927157 - uncharacterized LOC101927157 ncRNA 116.667-156 chr5 19125524 19125745 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 760638 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 173.333-177 chr6 156351669 156352024 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -26904 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 207-77 chr3 18158280 18158799 + 0.666667 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) intron (NR_161333, intron 4 of 4) 195987 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 158.667-70 chr12 8587080 8587385 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 25627 NM_001330343 57379 Hs.149342 NM_020661 ENSG00000111732 AICDA AID|ARP2|CDA2|HEL-S-284|HIGM2 activation induced cytidine deaminase protein-coding 180.333-73 chr3 28066995 28067475 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -174384 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 143.333-212 chr4 115407460 115407736 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -293978 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 123.667-47 chr13 58439771 58440020 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -206778 NR_132367 106144531 Hs.736640 NR_132367 ENSG00000232954 LINC00374 - long intergenic non-protein coding RNA 374 ncRNA 165.667-168 chr5 171561946 171562336 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 142494 NM_003862 8817 Hs.87191 NM_003862 ENSG00000156427 FGF18 FGF-18|ZFGF5 fibroblast growth factor 18 protein-coding 199.667-16 chr10 68042361 68042761 + 0.666667 NA intron (NM_001278186, intron 3 of 22) AluJb|SINE|Alu -31678 NR_131184 100009667 NR_131184 POU5F1P5 Oct4-pg5 POU class 5 homeobox 1 pseudogene 5 pseudo 126.333-7 chr1 98776871 98777110 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 115269 NM_001364903 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 129.667-166 chr8 34555859 34556077 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -227953 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 344-19 chr18 53438784 53439675 + 0.666667 NA intron (NM_005215, intron 22 of 28) intron (NM_005215, intron 22 of 28) -129218 NR_110798 102724651 Hs.123442 NR_110798 ENSG00000263438 LINC01919 - long intergenic non-protein coding RNA 1919 ncRNA 122.333-132 chr3 88604 88875 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76988 NR_110824 102723448 Hs.543290 NR_110824 LINC01986 - long intergenic non-protein coding RNA 1986 ncRNA 119.333-190 chr6 93221247 93221433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 198219 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 185.333-156 chr5 85787737 85788135 + 0.666667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -494508 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 176.333-149 chr6 127053300 127053667 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -65188 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 162-17 chr10 91102547 91102864 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 50375 NR_002779 119369 Hs.441287 NR_002779 NUDT9P1 C10orf98|bA56M3.1 nudix hydrolase 9 pseudogene 1 pseudo 133-3 chr1 93192571 93192837 + 0.666667 NA intron (NM_001306076, intron 5 of 28) AluJr|SINE|Alu 11988 NM_001306076 343099 Hs.482873 NM_206886 ENSG00000122483 CCDC18 NY-SAR-41 coiled-coil domain containing 18 protein-coding 138-46 chr17 61188090 61188369 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 179475 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 167-55 chr2 27780218 27780586 + 0.666667 NA TTS (NM_004891) TTS (NM_004891) 8683 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 151-103 chr5 27440609 27440959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31508 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 138.667-94 chr2 11717711 11718074 + 0.666667 NA intron (NM_001261428, intron 2 of 21) MIR|SINE|MIR -6423 NM_001261427 23175 Hs.467740 NM_145693 ENSG00000134324 LPIN1 PAP1 lipin 1 protein-coding 150-37 chr13 74270033 74270331 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 38738 NR_144451 100507612 Hs.447508 NR_144451 ENSG00000235532 LINC00402 - long intergenic non-protein coding RNA 402 ncRNA 124.667-193 chr7 105085401 105085663 + 0.666667 NA intron (NM_182931, intron 13 of 26) AluSq|SINE|Alu 71327 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 238-94 chr7 19547619 19548065 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 157594 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 113-50 chr13 66285649 66285966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 67557 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 152-98 chr21 45217072 45217515 + 0.666667 NA intron (NR_027674, intron 9 of 11) L1MEc|LINE|L1 -17047 NR_135279 114042 Hs.375832 NR_135279 ENSG00000182586 LINC00334 C21orf89|NCRNA00334 long intergenic non-protein coding RNA 334 ncRNA 115-132 chr6 41253189 41253479 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3957 NR_002794 221438 Hs.639392 NR_002794 TREML5P TLT5|TREML2P|TREML2P1 triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene pseudo 112.333-83 chr16 26472118 26472444 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 447044 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 155-45 chr16 25898298 25898728 + 0.666667 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) MER113|DNA|hAT-Charlie -126724 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 145-26 chr13 37697564 37697842 + 0.666667 NA intron (NM_001135958, intron 2 of 9) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -98859 NM_001286666 10631 Hs.136348 NM_006475 ENSG00000133110 POSTN OSF-2|OSF2|PDLPOSTN|PN periostin protein-coding 201-114 chr8 137060835 137061300 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 352521 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 187.333-128 chr3 78706268 78706805 + 0.666667 NA intron (NM_001145845, intron 6 of 28) FLAM_C|SINE|Alu 312923 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 277.333-37 chr17 67917499 67918033 + 0.666667 NA intron (NM_182641, intron 11 of 27) AluSq2|SINE|Alu 75840 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 157.333-14 chr1 100487243 100487558 + 0.666667 NA intron (NM_001319212, intron 10 of 13) AluSz|SINE|Alu -50739 NM_022049 54112 Hs.170053 NM_022049 ENSG00000181656 GPR88 COCPMR|STRG G protein-coupled receptor 88 protein-coding 261 chr1 27413161 27413858 + 0.666667 NA intron (NM_006990, intron 6 of 8) intron (NM_006990, intron 6 of 8) 20887 NM_005281 2827 Hs.66542 NM_005281 ENSG00000181773 GPR3 ACCA G protein-coupled receptor 3 protein-coding 233.666-30 chr8 53859833 53860519 + 0.666667 NA intron (NM_001286674, intron 1 of 2) intron (NM_001286674, intron 1 of 2) 8381 NM_170587 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 145.333-275 chr7 73480473 73480768 + 0.666667 NA intron (NM_001370402, intron 6 of 18) intron (NM_001370402, intron 6 of 18) 41673 NM_001370402 9031 Hs.743372 NM_023005 ENSG00000009954 BAZ1B WBSCR10|WBSCR9|WSTF bromodomain adjacent to zinc finger domain 1B protein-coding 115.333-176 chr5 139242414 139242622 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -31234 NR_036536 724102 Hs.268939 NR_003141 SNHG4 NCRNA00059|U19H small nucleolar RNA host gene 4 ncRNA 121-103 chr4 31395213 31395545 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111165 NR_149121 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 123.667-30 chr10 31356270 31356554 + 0.666667 NA intron (NM_001323658, intron 2 of 8) intron (NM_001323658, intron 2 of 8) 34752 NM_001323673 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 275.667-8 chr10 57738532 57739017 + 0.666667 NA Intergenic MER57E1|LTR|ERV1 -434215 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 178.333-156 chr6 138104722 138105053 + 0.666667 NA intron (NM_022121, intron 1 of 2) intron (NM_022121, intron 1 of 2) 2532 NM_022121 64065 Hs.201446 NM_022121 ENSG00000112378 PERP KCP1|KRTCAP1|PIGPC1|THW|dJ496H19.1 p53 apoptosis effector related to PMP22 protein-coding 159.667-60 chr11 35287312 35287684 + 0.666667 NA intron (NM_001252652, intron 8 of 11) intron (NM_001252652, intron 8 of 11) 124548 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 120.333-68 chr15 94958874 94959094 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 103621 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 186.667-141 chr7 88247475 88247885 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -20687 NM_001256892 6717 Hs.489040 NM_003130 ENSG00000075142 SRI CP-22|CP22|SCN|V19 sorcin protein-coding 113-45 chr12 89830560 89830840 + 0.666667 NA Intergenic (TGATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -116993 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 142-20 chr10 103367489 103367871 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_006951) promoter-TSS (NM_006951) -296 NM_139052 6877 Hs.96103 NM_006951 ENSG00000148835 TAF5 TAF(II)100|TAF2D|TAFII-100|TAFII100 TATA-box binding protein associated factor 5 protein-coding 188-73 chr3 143172300 143172604 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 52681 NM_004267 9435 Hs.8786 NM_004267 ENSG00000175040 CHST2 C6ST|GST-2|GST2|Gn6ST-1|HEL-S-75|glcNAc6ST-1 carbohydrate sulfotransferase 2 protein-coding 145.333-44 chr10 101813075 101813401 + 0.666667 NA intron (NM_012215, intron 2 of 15) intron (NM_012215, intron 2 of 15) 5206 NM_012215 10724 Hs.500842 NM_012215 ENSG00000198408 OGA MEA5|MGEA5|NCOAT O-GlcNAcase protein-coding 154.667-269 chr4 42199995 42200456 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -47570 NM_207406 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 121.667-204 chr8 104764028 104764244 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -175112 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 155.667-114 chr15 64074130 64074586 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001289108, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001289108, exon 3 of 3) 19480 NM_032231 84191 Hs.439548 NM_032231 ENSG00000166797 CIAO2A CIA2A|FAM96A cytosolic iron-sulfur assembly component 2A protein-coding 171-23 chr15 90500677 90501040 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_003870, exon 38 of 38) 3' UTR (NM_003870, exon 38 of 38) -29065 NM_001042574 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 138.667-161 chr5 44120414 44120676 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -268187 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 246.667-39 chr2 44603228 44603702 + 0.666667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 241518 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 140-57 chr2 37071960 37072341 + 0.666667 NA exon (NM_019024, exon 6 of 36) exon (NM_019024, exon 6 of 36) 12222 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 143-132 chr9 28162527 28162865 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 556609 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 111.667-271 chr9 73935032 73935339 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -436346 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 116.667-21 chr11 59177379 59177624 + 0.666667 NA intron (NM_015177, intron 1 of 8) intron (NM_015177, intron 1 of 8) 5369 NM_015177 23220 Hs.523696 NM_015177 ENSG00000110042 DTX4 RNF155 deltex E3 ubiquitin ligase 4 protein-coding 196.667-42 chr14 43731252 43731699 + 0.666667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 775808 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 164-42 chr16 76064219 76064565 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -213009 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 125.333-40 chr11 132984784 132985134 + 0.666667 NA intron (NM_001012393, intron 1 of 7) intron (NM_001012393, intron 1 of 7) -41191 NM_001319105 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 124.333-115 chr3 64712197 64712523 + 0.666667 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) intron (NR_038264, intron 1 of 5) -24360 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 132-51 chr17 64407896 64408159 + 0.666667 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -17167 NM_000442 5175 Hs.376675 NM_000442 ENSG00000261371 PECAM1 CD31|CD31/EndoCAM|GPIIA'|PECA1|PECAM-1|endoCAM platelet and endothelial cell adhesion molecule 1 protein-coding 149-158 chrX 50448135 50448469 + 0.666667 NA intron (NM_001013742, intron 1 of 27) intron (NM_001013742, intron 1 of 27) 22523 NM_001013742 139189 Hs.38132 NM_001013742 ENSG00000274588 DGKK - diacylglycerol kinase kappa protein-coding 257.667-82 chr8 108134947 108135625 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -51666 NM_178565 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 139.667-92 chr2 141764943 141765285 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 2 of 90) (CAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 366587 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 144.667-239 chr5 76906193 76906520 + 0.666667 NA intron (NM_130772, intron 4 of 4) L1MA9|LINE|L1 -46689 NM_001882 1393 Hs.115617 NM_001882 ENSG00000145708 CRHBP CRF-BP|CRFBP corticotropin releasing hormone binding protein protein-coding 169.667-191 chr7 5647835 5648122 + 0.666667 NA intron (NM_207111, intron 14 of 16) L2|LINE|L2 32483 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 173.667-111 chr3 74748438 74748809 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -227483 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 148.667-408 chrX 76763326 76763612 + 0.666667 NA intron (NR_110400, intron 1 of 3) L1MA4A|LINE|L1 155891 NR_029909 494333 NR_029909 ENSG00000283242 MIR384 MIRN384|hsa-mir-384 microRNA 384 ncRNA 189-54 chr20 57842201 57842586 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -130857 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 120.333-64 chr15 86516024 86516265 + 0.666667 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) MER4A1_|LTR|ERV1 -199176 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 125.333-83 chr19 44338175 44338483 + 0.666667 NA intron (NM_001348284, intron 1 of 2) L1MC4|LINE|L1 18351 NM_001083335 7771 Hs.48589 NM_013380 ENSG00000062370 ZNF112 ZFP112|ZNF228 zinc finger protein 112 protein-coding 150-75 chr2 70104024 70104300 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 16685 NM_006196 5093 Hs.2853 NM_006196 ENSG00000169564 PCBP1 HEL-S-85|HNRPE1|HNRPX|hnRNP-E1|hnRNP-X poly(rC) binding protein 1 protein-coding 179.333-29 chr10 97133559 97134009 + 0.666667 NA intron (NM_003061, intron 4 of 36) intron (NM_003061, intron 4 of 36) 31028 NR_038330 100505540 Hs.568878 NR_038330 ENSG00000234855 SLIT1-AS1 - SLIT1 antisense RNA 1 ncRNA 130-120 chr7 41799469 41799745 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -96517 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 162.333-20 chr1 242775703 242776058 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -251183 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 125.667-38 chr11 103787838 103788109 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61933 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 176-26 chr13 41777359 41777725 + 0.666667 NA intron (NM_001009814, intron 20 of 25) L2a|LINE|L2 183543 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 188.667-41 chr13 105972145 105972557 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 265521 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 145-43 chr18 69650196 69650555 + 0.666667 NA intron (NM_152721, intron 3 of 7) intron (NM_152721, intron 3 of 7) 180444 NR_134579 105372179 Hs.666269 NR_134579 ENSG00000264845 LOC105372179 - uncharacterized LOC105372179 ncRNA 172-114 chrX 16674528 16674965 + 0.666667 NA intron (NM_019857, intron 10 of 18) AluY|SINE|Alu 24588 NM_004057 795 Hs.639 NM_004057 ENSG00000169906 S100G CABP|CABP1|CABP9K|CALB3 S100 calcium binding protein G protein-coding 119-139 chr8 10654245 10654589 + 0.666667 NA intron (NM_178857, intron 1 of 3) intron (NM_178857, intron 1 of 3) 726 NM_178857 94137 Hs.33538 NM_178857 ENSG00000183638 RP1L1 DCDC4B RP1 like 1 protein-coding 155.333-209 chr21 42315865 42316298 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_003226) promoter-TSS (NM_003226) -485 NM_003226 7033 Hs.82961 NM_003226 ENSG00000160180 TFF3 ITF|P1B|TFI trefoil factor 3 protein-coding 115-70 chr16 12864907 12865210 + 0.666667 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -36540 NM_001145204 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 115.333-107 chr2 19044581 19044828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17733 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 127.667-133 chr5 2078561 2078796 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 191347 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 211.667-36 chr12 111451859 111452235 + 0.666667 NA TTS (NM_002973) TTS (NM_002973) 17185 NM_001291424 10019 Hs.506784 NM_005475 ENSG00000111252 SH2B3 IDDM20|LNK SH2B adaptor protein 3 protein-coding 137.333-91 chr2 39841607 39841876 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62465 NM_001321468 80745 Hs.468254 NM_025264 ENSG00000138050 THUMPD2 C2orf8 THUMP domain containing 2 protein-coding 190.333-132 chr6 111158165 111158720 + 0.666667 NA intron (NM_018593, intron 1 of 5) MER1B|DNA|hAT-Charlie 44608 NR_145796 109623478 NR_145796 SNORD166 - small nucleolar RNA, C/D box 166 snoRNA 170.667-108 chr22 47426268 47426559 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60698 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 152.667-139 chr17 51737445 51737863 + 0.666667 NA intron (NM_001082533, intron 5 of 9) MIRc|SINE|MIR 302227 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 190.667-134 chr7 19675949 19676301 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 29311 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 125.667-17 chr1 246501911 246502182 + 0.666667 NA intron (NM_001167740, intron 1 of 11) intron (NM_001167740, intron 1 of 11) 5233 NM_001167740 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 146.667-328 chr8 70954462 70954786 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 285285 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 171-44 chr20 44684034 44684431 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -12493 NR_034104 79015 Hs.671450 NM_024049 ENSG00000283440 LINC01260 - long intergenic non-protein coding RNA 1260 ncRNA 147.333-70 chr11 89422464 89422763 + 0.666667 NA intron (NM_001143837, intron 10 of 20) intron (NM_001143837, intron 10 of 20) 68147 NM_001291929 50507 Hs.371036 NM_016931 ENSG00000086991 NOX4 KOX|KOX-1|RENOX NADPH oxidase 4 protein-coding 140.667-53 chr11 83792914 83793267 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) L1MC5a|LINE|L1 -110665 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 113-109 chr2 99111244 99111581 + 0.666667 NA intron (NM_001349012, intron 2 of 18) intron (NM_001349012, intron 2 of 18) 29768 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 112-74 chr15 82829469 82829798 + 0.666667 NA intron (NM_001080435, intron 8 of 9) intron (NM_001080435, intron 8 of 9) 20005 NM_001080435 123720 Hs.377360 NM_001080435 ENSG00000156232 WHAMM WHAMM1|WHDC1 WASP homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules protein-coding 238.333-4 chr1 202820257 202820768 + 0.666667 NA intron (NR_038135, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 255 NR_038135 641515 Hs.23459 NR_038135 ENSG00000184774 MGAT4EP - MGAT4 family member E, pseudogene pseudo 156.333-159 chr19 7441284 7441628 + 0.666667 NA intron (NM_001130955, intron 1 of 19) AluSx1|SINE|Alu 1768 NM_001130955 23370 Hs.465761 NM_015318 ENSG00000104880 ARHGEF18 P114-RhoGEF|RP78|SA-RhoGEF|p114RhoGEF Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18 protein-coding 221.667-68 chr5 146178000 146178593 + 0.666667 NA intron (NM_016460, intron 1 of 30) intron (NM_016460, intron 1 of 30) 4354 NM_020117 51520 Hs.432674 NM_016460 ENSG00000133706 LARS HSPC192|ILFS1|LARS1|LEURS|LEUS|LFIS|LRS|PIG44|RNTLS|hr025Cl leucyl-tRNA synthetase protein-coding 214.667-13 chr10 31940219 31940668 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11567 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 221.667-40 chr2 39231332 39231847 + 0.666667 NA intron (NR_144521, intron 1 of 10) intron (NR_144521, intron 1 of 10) -2001 NR_144520 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 199.666-34 chr3 42419177 42419745 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8851 NM_001304386 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 117-153 chr9 29816022 29816304 + 0.666667 NA Intergenic L1M2c|LINE|L1 592291 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 215.333-201 chr8 113244925 113245394 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) L1MB8|LINE|L1 131993 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 126.333-152 chr6 67195096 67195360 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -860123 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 143.333-186 chr3 87912283 87912610 + 0.666667 NA intron (NM_001322210, intron 2 of 2) L1PA13|LINE|L1 -70130 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 169.333-242 chr7 43711578 43712057 + 0.666667 NA intron (NM_001371314, intron 1 of 7) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 17706 NM_001371317 212.333-12 chr1 221584971 221585505 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 151662 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 113.667-153 chr4 18786474 18786650 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -764687 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 177.667-56 chr15 96190321 96190701 + 0.666667 NA intron (NR_125738, intron 3 of 4) intron (NR_125738, intron 3 of 4) -62670 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 113-180 chr6 68060303 68060630 + 0.666667 NA TTS (NR_125869) TTS (NR_125869) 5115 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 153-116 chr6 41254410 41254843 + 0.666667 NA Intergenic LTR75|LTR|ERVL 5249 NR_002794 221438 Hs.639392 NR_002794 TREML5P TLT5|TREML2P|TREML2P1 triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene pseudo 125.667-132 chr4 54814842 54815129 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 157057 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 152.667-37 chr10 44334588 44335013 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42050 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 164.667-161 chr4 52736962 52737428 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 14230 NM_001242690 100288413 Hs.363087 NM_024534 ENSG00000226887 ERVMER34-1 HEMO|envMER34 endogenous retrovirus group MER34 member 1, envelope protein-coding 122.333-28 chr11 1176782 1177014 + 0.666667 NA intron (NM_001304359, intron 21 of 48) intron (NM_001304359, intron 21 of 48) 18945 NM_001304359 4586 Hs.534332 NM_017511 ENSG00000215182 MUC5AC MUC5|TBM|leB|mucin mucin 5AC, oligomeric mucus/gel-forming protein-coding 131.333-86 chr2 70950363 70950708 + 0.666667 NA intron (NM_001692, intron 2 of 13) L1M5|LINE|L1 -1924 NR_110273 101927750 Hs.676120 NR_110273 ENSG00000239322 ATP6V1B1-AS1 - ATP6V1B1 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-113 chr14 61484485 61484884 + 0.666667 NA intron (NM_006255, intron 9 of 13) L2c|LINE|L2 85510 NR_110417 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 145.333-220 chr4 98291415 98291764 + 0.666667 NA intron (NM_001100427, intron 1 of 14) LTR79|LTR|ERVL 30205 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 142.333-154 chr3 43821652 43822068 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -130266 NM_001346468 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 147.333-249 chr4 163368238 163368524 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24279 NM_001317091 4889 Hs.519058 NM_006174 ENSG00000164129 NPY5R NPY5-R|NPYR5|NPYY5-R neuropeptide Y receptor Y5 protein-coding 157-40 chr13 105411480 105411864 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -54195 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 182-76 chr4 47481266 47481682 + 0.666667 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? -3801 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 143.667-96 chr17 7453730 7454091 + 0.666667 NA intron (NM_000747, intron 7 of 10) AluJb|SINE|Alu 8849 NM_000747 1140 Hs.330386 NM_000747 ENSG00000170175 CHRNB1 ACHRB|CHRNB|CMS1D|CMS2A|CMS2C|SCCMS cholinergic receptor nicotinic beta 1 subunit protein-coding 147-4 chr1 75994881 75995168 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16300 NR_125939 101927342 Hs.216363 NR_125939 LOC101927342 - uncharacterized LOC101927342 ncRNA 141-80 chr6 149780026 149780335 + 0.666667 NA intron (NM_001252050, intron 3 of 6) AluJb|SINE|Alu 30439 NM_001360456 5110 Hs.279257 NM_005389 ENSG00000120265 PCMT1 PIMT protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase protein-coding 209-111 chr7 41305619 41306081 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 204246 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 191-40 chr3 36390926 36391223 + 0.666667 NA intron (NM_001292049, intron 1 of 8) intron (NM_001292049, intron 1 of 8) 10587 NM_003149 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 149-2 chr1 90757813 90758079 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -40644 NM_020063 343472 Hs.451956 NM_020063 ENSG00000143032 BARHL2 - BarH like homeobox 2 protein-coding 136-3 chr1 161959520 161959843 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_007348, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_007348, exon 16 of 16) 64784 NM_015441 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 118.333-30 chr10 34737891 34738082 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 77310 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 198.333-87 chr18 65002353 65002789 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -742516 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 217-5 chr1 113672627 113673081 + 0.666667 NA intron (NM_001142782, intron 18 of 20) intron (NM_001142782, intron 18 of 20) 86301 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 142.333-90 chr15 77667627 77668039 + 0.666667 NA non-coding (NR_120361, exon 3 of 3) non-coding (NR_120361, exon 3 of 3) 7782 NR_120361 101929478 Hs.569510 NR_120361 ENSG00000259281 LINGO1-AS2 - LINGO1 antisense RNA 2 ncRNA 156-64 chr19 39990236 39990549 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -6668 NM_178544 339327 Hs.125008 NM_178544 ENSG00000187187 ZNF546 ZNF49 zinc finger protein 546 protein-coding 168.333-144 chr4 39452131 39452438 + 0.666667 NA TTS (NM_175737) TTS (NM_175737) 6664 NM_000661 6133 Hs.412370 NM_000661 ENSG00000163682 RPL9 L9|NPC-A-16 ribosomal protein L9 protein-coding 115.333-70 chr14 61926686 61926996 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001367663) promoter-TSS (NM_001367663) -854 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 205-98 chr8 79074120 79074577 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 236819 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 118-6 chr1 190875783 190876014 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 251008 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 203.667-17 chr11 13696524 13697021 + 0.666667 NA intron (NM_032228, intron 2 of 11) intron (NM_032228, intron 2 of 11) 28104 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 138.667-135 chr3 120866181 120866554 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -30010 NR_135570 101926983 Hs.553055 NR_135570 ENSG00000243593 LINC02049 - long intergenic non-protein coding RNA 2049 ncRNA 160-5 chr1 96264929 96265302 + 0.666667 NA intron (NR_110693, intron 5 of 5) L1MD|LINE|L1 109010 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 206.666-6 chr1 86448558 86449155 + 0.666667 NA intron (NM_006536, intron 11 of 13) intron (NM_006536, intron 11 of 13) -20071 NM_001285 1179 Hs.194659 NM_001285 ENSG00000016490 CLCA1 CACC|CACC1|CLCRG1|CaCC-1|GOB5|hCLCA1|hCaCC-1 chloride channel accessory 1 protein-coding 129-35 chr14 76604267 76604638 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -157016 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 113.667-67 chr15 68891042 68891332 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -39313 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 178.667-99 chr3 48826696 48827084 + 0.666667 NA intron (NM_001321982, intron 1 of 11) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 20984 NM_001321982 5576 Hs.631923 NM_004157 ENSG00000114302 PRKAR2A PKR2|PRKAR2 protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit alpha protein-coding 290-31 chr3 10283006 10283799 + 0.666667 NA intron (NR_024145, intron 2 of 5) intron (NR_024145, intron 2 of 5) -1017 NR_026829 84657 Hs.302131 NM_001039102 ENSG00000231177 LINC00852 C3orf42|GHRL-AS2|GHRLOS2|NAG73 long intergenic non-protein coding RNA 852 ncRNA 112-131 chr22 28509656 28509925 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1PA11|LINE|L1 49921 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 124.667-68 chr15 50741987 50742308 + 0.666667 NA intron (NM_032802, intron 5 of 14) AluSq2|SINE|Alu 23559 NM_032802 84888 Hs.401537 NM_032802 ENSG00000138600 SPPL2A IMP3|PSL2 signal peptide peptidase like 2A protein-coding 133.333-98 chr22 27244482 27244693 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19908 NM_001350812 105372978 NM_001350812 LINC01638 - long intergenic non-protein coding RNA 1638 protein-coding 115-35 chr11 132411318 132411531 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 127122 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 170.667-66 chr17 77944087 77944375 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60006 NM_018996 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 155.333-133 chr17 8330212 8330641 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -9414 NM_153007 146852 Hs.186045 NM_153007 ENSG00000184650 ODF4 CT134|CT136|OPPO1 outer dense fiber of sperm tails 4 protein-coding 150.333-437 chr9 86725098 86725384 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 222265 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 184-53 chr2 134942677 134943097 + 0.666667 NA intron (NM_001241, intron 5 of 9) intron (NM_001241, intron 5 of 9) 24065 NR_135468 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 138.667-20 chr10 76876619 76877033 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001014797, exon 29 of 29) 3' UTR (NM_001014797, exon 29 of 29) -11218 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 201.667-7 chr10 54907084 54907596 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) intron (NM_001354404, intron 3 of 34) -106049 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 151-93 chr4 82842650 82843002 + 0.666667 NA intron (NM_016211, intron 19 of 24) intron (NM_016211, intron 19 of 24) -43969 NM_024906 79966 Hs.379191 NM_024906 ENSG00000145284 SCD5 ACOD4|FADS4|HSCD5|SCD2|SCD4 stearoyl-CoA desaturase 5 protein-coding 149.333-373 chr7 86445665 86446016 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -198069 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 157.333-81 chr12 37888877 37889310 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -427681 NM_001308340 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 147.333-57 chr11 3880678 3881088 + 0.666667 NA intron (NM_001277962, intron 1 of 12) intron (NM_001277962, intron 1 of 12) 24821 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 290-55 chr8 120052854 120053370 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -71990 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 169-108 chr9 69492302 69492658 + 0.666667 NA intron (NM_001163, intron 2 of 12) intron (NM_001163, intron 2 of 12) 163155 NM_004816 9413 Hs.118003 NM_004816 ENSG00000135063 FAM189A2 C9orf61|X123 family with sequence similarity 189 member A2 protein-coding 134.667-191 chr8 22968647 22968956 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -18450 NM_001160036 23221 Hs.372688 NM_015178 ENSG00000008853 RHOBTB2 DBC2|EIEE64 Rho related BTB domain containing 2 protein-coding 170.333-118 chr2 172016666 172017029 + 0.666667 NA intron (NM_001322279, intron 1 of 9) L2b|LINE|L2 16894 NR_136273 254042 Hs.298250 NM_199227 ENSG00000172878 METAP1D MAP 1D|MAP1D|MetAP 1D|Metap1l methionyl aminopeptidase type 1D, mitochondrial protein-coding 170.333-115 chr2 159741226 159741594 + 0.666667 NA intron (NM_001282807, intron 1 of 8) intron (NM_001282807, intron 1 of 8) 7446 NM_001282807 64844 Hs.529272 NM_022826 ENSG00000136536 MARCH7 AXO|AXOT|MARCH-VII|RNF177 membrane associated ring-CH-type finger 7 protein-coding 194.667-96 chr3 96782604 96782982 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31801 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 193.333-37 chr11 90614386 90614813 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) intron (NR_104190, intron 3 of 6) -58742 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 164.667-117 chr2 123850767 123851114 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 174234 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 166-72 chr20 52290697 52291042 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98884 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 200.667-89 chr2 202910652 202911075 + 0.666667 NA intron (NM_018256, intron 1 of 12) intron (NM_018256, intron 1 of 12) -1355 NM_001282911 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 194-29 chr12 120040704 120041133 + 0.666667 NA intron (NR_147894, intron 3 of 8) AluSz6|SINE|Alu 51074 NR_147892 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 141-74 chr6 67419697 67420013 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -635496 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 141.667-217 chr8 13567484 13567819 + 0.666667 NA exon (NM_001007090, exon 1 of 1) exon (NM_001007090, exon 1 of 1) 782 NM_001007090 157773 Hs.104941 NM_001007090 ENSG00000164743 C8orf48 - chromosome 8 open reading frame 48 protein-coding 112.667-167 chr3 44706351 44706545 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6195 NM_001134440 91392 Hs.224843 NM_033210 ENSG00000196653 ZNF502 - zinc finger protein 502 protein-coding 190-103 chr5 145716496 145716919 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 118635 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 114-183 chrX 118114879 118115159 + 0.666667 NA intron (NM_001168301, intron 1 of 7) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 1846 NM_001168302 90293 Hs.348262 NM_033495 ENSG00000003096 KLHL13 BKLHD2 kelch like family member 13 protein-coding 228.667-33 chr17 70616012 70616577 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 446759 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 112.667-96 chr17 56171290 56171526 + 0.666667 NA intron (NM_153228, intron 1 of 16) intron (NM_153228, intron 1 of 16) 17933 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 149-54 chr16 53641031 53641380 + 0.666667 NA intron (NM_001127897, intron 18 of 24) intron (NM_001127897, intron 18 of 24) 62654 NM_015272 23322 Hs.298382 NM_015272 ENSG00000103494 RPGRIP1L CORS3|FTM|JBTS7|MKS5|NPHP8|PPP1R134 RPGRIP1 like protein-coding 168-73 chr3 178715029 178715358 + 0.666667 NA intron (NM_001278911, intron 1 of 4) intron (NM_001278911, intron 1 of 4) 145212 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 112.667-206 chr5 23024190 23024471 + 0.666667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -170986 NM_001364105 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 181-48 chr3 31629167 31629615 + 0.666667 NA exon (NM_178862, exon 14 of 16) exon (NM_178862, exon 14 of 16) -74822 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 177.667-70 chr2 64484311 64484698 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1849 NR_147011 105374774 NR_147011 ENSG00000223863 LINC01805 - long intergenic non-protein coding RNA 1805 ncRNA 114.333-159 chr4 80598907 80599237 + 0.666667 NA intron (NM_152770, intron 3 of 5) intron (NM_152770, intron 3 of 5) 263352 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 158-39 chr13 52418684 52418972 + 0.666667 NA intron (NM_001282168, intron 10 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie -12656 NM_018676 55901 Hs.325667 NM_018676 ENSG00000136114 THSD1 TMTSP|UNQ3010 thrombospondin type 1 domain containing 1 protein-coding 166.667-23 chr10 32118867 32119284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62650 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 123.333-59 chr12 63875544 63875849 + 0.666667 NA intron (NM_001346201, intron 1 of 21) intron (NM_001346201, intron 1 of 21) 30996 NM_020762 57522 Hs.210751 NM_020762 ENSG00000196935 SRGAP1 ARHGAP13|NMTC2 SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 protein-coding 114-159 chr8 15552811 15553096 + 0.666667 NA intron (NM_001356429, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 12690 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 118.667-108 chr2 146379509 146379783 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -207411 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 149.333-411 chr8 132304218 132304555 + 0.666667 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 142876 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 171.333-92 chr2 159979532 159979883 + 0.666667 NA intron (NM_001007267, intron 14 of 26) intron (NM_001007267, intron 14 of 26) -74951 NM_002349 4065 Hs.153563 NM_002349 ENSG00000054219 LY75 CD205|CLEC13B|DEC-205|GP200-MR6|LY-75 lymphocyte antigen 75 protein-coding 153.667-299 chr4 108098859 108099181 + 0.666667 NA intron (NM_001130713, intron 3 of 10) MER33|DNA|hAT-Charlie 67777 NM_001166119 51176 Hs.743478 NM_016269 ENSG00000138795 LEF1 LEF-1|TCF10|TCF1ALPHA|TCF7L3 lymphoid enhancer binding factor 1 protein-coding 177.333-126 chr4 148441893 148442383 + 0.666667 NA intron (NM_001354819, intron 1 of 7) CpG 276 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 119.333-68 chr12 33754649 33754914 + 0.666667 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -267715 NM_032834 84920 Hs.102971 NM_032834 ENSG00000139133 ALG10 ALG10A|DIE2|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase protein-coding 180.667-60 chr2 20244492 20244939 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19282 NM_001006946 6382 Hs.224607 NM_002997 ENSG00000115884 SDC1 CD138|SDC|SYND1|syndecan syndecan 1 protein-coding 173-88 chr7 40565113 40565480 + 0.666667 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 414643 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 130-45 chr16 82020183 82020511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8877 NM_145168 93517 Hs.87779 NM_145168 ENSG00000184860 SDR42E1 HSPC105 short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 protein-coding 143.667-194 chr4 175014610 175015035 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96464 NM_001278127 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 144.667-144 chr2 101314312 101314660 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 5036 NR_049881 100847007 NR_049881 ENSG00000264857 MIR5696 - microRNA 5696 ncRNA 142-61 chr18 7990889 7991166 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 376007 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 138.333-52 chr13 21065455 21065750 + 0.666667 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -4016 NM_014572 26524 Hs.78960 NM_014572 ENSG00000150457 LATS2 KPM large tumor suppressor kinase 2 protein-coding 180.667-4 chr1 107256339 107256779 + 0.666667 NA intron (NM_001113226, intron 1 of 6) intron (NM_001113226, intron 1 of 6) 108490 NM_001113226 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 123.333-168 chr5 14972153 14972433 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -100515 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 203.667-74 chr3 7887099 7887625 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 128945 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 155.333-93 chr13 58195742 58196145 + 0.666667 NA intron (NR_120416, intron 1 of 2) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 30116 NR_120416 101926897 Hs.640215 NR_120416 ENSG00000277448 LINC02338 - long intergenic non-protein coding RNA 2338 ncRNA 303.333-63 chr5 127366690 127367261 + 0.666667 NA intron (NM_001308121, intron 4 of 13) intron (NM_001308121, intron 4 of 13) 76179 NM_001256545 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 147-89 chr3 7663736 7664021 + 0.666667 NA intron (NM_000844, intron 8 of 9) MIRc|SINE|MIR -128594 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 136.333-190 chr7 42308103 42308356 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -71020 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 148.333-169 chr18 11535731 11536046 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 45840 NR_110778 101927433 Hs.331210 NR_110778 ENSG00000267252 LINC01255 - long intergenic non-protein coding RNA 1255 ncRNA 116.333-101 chr18 61703103 61703351 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -44949 NR_103449 100996669 Hs.586981 NR_103449 LINC01544 - long intergenic non-protein coding RNA 1544 ncRNA 127.667-125 chr4 53000839 53001180 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 138692 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 112-138 chr3 51622193 51622414 + 0.666667 NA intron (NM_001322253, intron 4 of 23) intron (NM_001322253, intron 4 of 23) -48872 NM_001243727 51368 Hs.517864 NM_015926 ENSG00000164081 TEX264 ZSIG11 testis expressed 264, ER-phagy receptor protein-coding 144.333-264 chr8 73205385 73205712 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53954 NM_001243237 100130301 Hs.202296 NM_001243237 ENSG00000274443 C8orf89 - chromosome 8 open reading frame 89 protein-coding 215.667-79 chr3 5209103 5209620 + 0.666667 NA intron (NM_014674, intron 8 of 11) intron (NM_014674, intron 8 of 11) 21654 NM_014674 9695 Hs.224616 NM_014674 ENSG00000134109 EDEM1 EDEM ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1 protein-coding 152.667-7 chr1 73250393 73250694 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55627 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 153.667-202 chr2 151230032 151230399 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31648 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 116-85 chr2 148513480 148513726 + 0.666667 NA TTS (NM_018328) TTS (NM_018328) -131148 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 134.333-178 chr8 112863694 112864053 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 8 of 66) intron (NM_001363185, intron 8 of 66) 220380 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 176.667-37 chr11 95486002 95486423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -253737 NM_001271594 143686 Hs.120633 NM_144665 ENSG00000149212 SESN3 SEST3 sestrin 3 protein-coding 161.333-130 chr18 56478845 56479175 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 159582 NR_024546 9352 Hs.114412 NM_004786 ENSG00000091164 TXNL1 HEL-S-114|TRP32|TXL-1|TXNL|Txl thioredoxin like 1 protein-coding 171.667-185 chr9 109173326 109173731 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_019114, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_019114, exon 26 of 26) -6237 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 260-45 chr2 227218708 227219476 + 0.666667 NA intron (NM_000091, intron 1 of 51) AluSx|SINE|Alu 54527 NM_000091 1285 Hs.570065 NM_000091 ENSG00000169031 COL4A3 ATS2|ATS3 collagen type IV alpha 3 chain protein-coding 126.333-176 chr8 32614919 32615265 + 0.666667 NA intron (NM_001322201, intron 3 of 8) intron (NM_001322201, intron 3 of 8) 19266 NM_001322201 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 150-123 chr6 55421851 55422244 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 94578 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 157-106 chr5 118966251 118966605 + 0.666667 NA intron (NM_173666, intron 1 of 5) intron (NM_173666, intron 1 of 5) -8158 NR_036263 100422872 NR_036263 ENSG00000283429 MIR1244-3 - microRNA 1244-3 ncRNA 224.667-14 chr11 62116602 62117141 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -7140 NM_001040694 3619 Hs.142179 NM_020238 ENSG00000149503 INCENP - inner centromere protein protein-coding 193-43 chr2 44440505 44440820 + 0.666667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) MER3|DNA|hAT-Charlie 78715 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 167.667-158 chr4 108694371 108694739 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43956 NM_021227 58505 Hs.445803 NM_021227 ENSG00000198856 OSTC DC2 oligosaccharyltransferase complex non-catalytic subunit protein-coding 144-142 chr7 4366863 4367177 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -232183 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 112.333-148 chr21 19973425 19973601 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73758 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 119.667-43 chr13 67822072 67822326 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 449812 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 152.667-354 chr8 11239446 11239798 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -37789 NM_173683 286046 Hs.657083 NM_173683 ENSG00000171044 XKR6 C8orf21|C8orf5|C8orf7|XRG6 XK related 6 protein-coding 116.333-50 chr12 21307624 21307895 + 0.666667 NA intron (NM_021094, intron 3 of 13) LTR84b|LTR|ERVL 27158 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 145-112 chr7 82833016 82833308 + 0.666667 NA intron (NM_033026, intron 16 of 24) intron (NM_033026, intron 16 of 24) 329722 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 168.667-83 chr18 9059658 9060042 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42849 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 205.667-11 chr1 178878710 178879194 + 0.666667 NA exon (NM_001286247, exon 10 of 19) exon (NM_001286247, exon 10 of 19) -7875 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 113.333-271 chr9 88545710 88545932 + 0.666667 NA intron (NM_145283, intron 1 of 2) AluSq2|SINE|Alu 10643 NM_145283 158046 Hs.734507 NM_145283 ENSG00000130045 NXNL2 C9orf121|RDCVF2|RdCVF2L nucleoredoxin like 2 protein-coding 176.333-67 chr17 69935420 69935838 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26078 NR_110874 102723487 Hs.451409 NR_110874 ENSG00000237560 LINC01497 - long intergenic non-protein coding RNA 1497 ncRNA 121.333-139 chr4 153217916 153218144 + 0.666667 NA intron (NM_001302693, intron 1 of 2) L1ME4a|LINE|L1 13587 NM_015271 23321 Hs.435711 NM_015271 ENSG00000109654 TRIM2 CMT2R|RNF86 tripartite motif containing 2 protein-coding 282-50 chr8 121771088 121771659 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -129933 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 113.667-116 chr2 176437588 176437836 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 163340 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 186.667-80 chr2 222186962 222187303 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -111015 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 136.333-115 chr21 28726241 28726596 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie 158949 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 124.333-74 chr18 66774886 66775190 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -170948 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 119.667-175 chr7 55050125 55050335 + 0.666667 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) L1MB3|LINE|L1 31198 NM_201283 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 290.333-30 chr3 140505178 140505881 + 0.666667 NA TTS (NR_108084) TTS (NR_108084) 3260 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 187-69 chr6 37400809 37401213 + 0.666667 NA Intergenic MER2B|DNA|TcMar-Tigger -32210 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 140-72 chr3 23005715 23006022 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 196710 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 184.667-110 chr5 171886381 171886804 + 0.666667 NA intron (NM_012300, intron 6 of 12) (AATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 100720 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 116.667-191 chr7 91749592 91749895 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 130959 NM_001301134 7978 Hs.532216 NM_006980 ENSG00000127989 MTERF1 MTERF mitochondrial transcription termination factor 1 protein-coding 185.667-139 chr8 138301691 138302226 + 0.666667 NA intron (NM_015912, intron 3 of 19) intron (NM_015912, intron 3 of 19) 195303 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 160.667-315 chr8 126920712 126921065 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -92266 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 158-58 chr17 2438447 2438847 + 0.666667 NA intron (NM_024086, intron 7 of 9) AluSx|SINE|Alu -23211 NR_028335 284009 Hs.632244 NM_001025459 LOC284009 - uncharacterized LOC284009 ncRNA 197-101 chr6 109776691 109777123 + 0.666667 NA intron (NM_014845, intron 15 of 22) intron (NM_014845, intron 15 of 22) 85686 NM_014845 9896 Hs.529959 NM_014845 ENSG00000112367 FIG4 ALS11|BTOP|CMT4J|KIAA0274|SAC3|YVS|dJ249I4.1 FIG4 phosphoinositide 5-phosphatase protein-coding 174.333-16 chr10 68524767 68525141 + 0.666667 NA intron (NM_001324314, intron 1 of 9) AluSz6|SINE|Alu 2569 NM_001324314 8034 Hs.180408 NM_152707 ENSG00000122912 SLC25A16 D10S105E|GDA|GDC|HGT.1|ML7|hML7 solute carrier family 25 member 16 protein-coding 125.333-6 chr1 78831579 78831884 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 174999 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 129-62 chr2 151966131 151966405 + 0.666667 NA intron (NM_000726, intron 2 of 13) AluSq2|SINE|Alu 5784 NM_001330118 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 127.333-201 chrX 73410738 73411086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36342 NM_005193 1046 Hs.553488 NM_005193 ENSG00000131264 CDX4 - caudal type homeobox 4 protein-coding 271.667-51 chr4 85329816 85330397 + 0.666667 NA Intergenic LTR84a|LTR|ERVL -145044 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 128.333-146 chr4 175758331 175758638 + 0.666667 NA intron (NM_201592, intron 1 of 6) MIRc|SINE|MIR 29192 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 130.667-55 chr12 53552883 53553198 + 0.666667 NA intron (NR_073163, intron 2 of 12) intron (NR_073163, intron 2 of 12) 39056 NR_046221 100652999 Hs.633602 NR_046221 ENSG00000257550 LOC100652999 - uncharacterized LOC100652999 ncRNA 234.667-16 chr11 47750858 47751344 + 0.666667 NA intron (NM_001318339, intron 5 of 16) intron (NM_001318339, intron 5 of 16) 16240 NM_001318339 23360 Hs.6834 NM_015308 ENSG00000109920 FNBP4 FBP30 formin binding protein 4 protein-coding 112.667-103 chr18 79110434 79110667 + 0.666667 NA intron (NR_148360, intron 3 of 31) intron (NR_148360, intron 3 of 31) 41156 NM_001306085 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 134.667-130 chr3 16354011 16354279 + 0.666667 NA intron (NM_015150, intron 7 of 9) L2c|LINE|L2 88933 NM_138381 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 231.333-30 chr12 27874479 27875040 + 0.666667 NA Intergenic SVA_D|Retroposon|SVA 94526 NM_020782 57542 Hs.505104 NM_020782 ENSG00000087448 KLHL42 Ctb9|KLHDC5 kelch like family member 42 protein-coding 146.333-85 chr14 45768945 45769248 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53494 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 115.667-214 chr8 94885444 94885724 + 0.666667 NA intron (NM_057749, intron 7 of 11) intron (NM_057749, intron 7 of 11) 9670 NM_057749 9134 Hs.521693 NM_004702 ENSG00000175305 CCNE2 CYCE2 cyclin E2 protein-coding 149.667-106 chr13 90630602 90630901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 137463 NR_120414 101927224 Hs.385801 NR_120414 LINC01049 - long intergenic non-protein coding RNA 1049 ncRNA 132.333-46 chr13 93164237 93164528 + 0.666667 NA Intergenic MamGyp-int|LTR|Gypsy -62425 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 127-57 chr3 19912099 19912454 + 0.666667 NA intron (NM_001330688, intron 7 of 14) L1M1|LINE|L1 21941 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 126-58 chr2 138656660 138656976 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 123572 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 127-26 chr11 14058318 14058552 + 0.666667 NA intron (NM_006108, intron 3 of 15) intron (NM_006108, intron 3 of 15) 95712 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 118.667-199 chr8 138283851 138284159 + 0.666667 NA intron (NM_015912, intron 3 of 19) L1MC1|LINE|L1 -200460 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 134-77 chr4 44394179 44394548 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) intron (NM_198353, intron 1 of 1) 54446 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 215.667-40 chr15 38250580 38251115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1989 NM_152594 161742 Hs.525781 NM_152594 ENSG00000166068 SPRED1 LGSS|NFLS|PPP1R147|hSpred1|spred-1 sprouty related EVH1 domain containing 1 protein-coding 168.667-23 chr10 64049520 64049883 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -527811 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 150-30 chr12 25178060 25178343 + 0.666667 NA intron (NR_147909, intron 1 of 14) L1MB3|LINE|L1 16959 NM_001204101 55259 Hs.407771 NM_018272 ENSG00000118307 CASC1 LAS1|PPP1R54 cancer susceptibility 1 protein-coding 170.667-145 chr6 74968227 74968574 + 0.666667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 160382 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 134-91 chr6 153577959 153578235 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -432399 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 146.333-156 chr2 125336457 125336800 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 781357 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 118.667-123 chr21 26881148 26881420 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -35875 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 237-17 chr10 109497504 109497984 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 425502 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 140-119 chr8 108184286 108184676 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64236 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 113.333-186 chr3 188328816 188329043 + 0.666667 NA intron (NM_005578, intron 2 of 10) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 103524 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 139-96 chr7 42247232 42247574 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10194 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 135-33 chr14 82341492 82341789 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -300992 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 141.333-82 chr17 70723643 70724015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 478350 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 174.333-145 chr8 74190703 74191072 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 130474 NM_001363050 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 128.333-124 chr22 48264333 48264634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9881 NR_036172 100422916 NR_036172 ENSG00000266508 MIR3201 - microRNA 3201 ncRNA 260.333-33 chr2 198517494 198518065 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -142682 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 159-71 chr20 42346535 42346872 + 0.666667 NA intron (NM_133170, intron 11 of 31) intron (NM_133170, intron 11 of 31) -338780 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 116.333-179 chr5 106713278 106713478 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 297636 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 149.333-384 chr8 31017748 31018052 + 0.666667 NA intron (NM_001323312, intron 2 of 2) intron (NM_001323312, intron 2 of 2) 14901 NM_013357 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 167-34 chr13 93159900 93160376 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66669 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 145.667-205 chr5 18643844 18644275 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 836785 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 120.333-49 chr13 68916587 68916932 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31434 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 121.333-186 chr8 135134462 135134712 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -99544 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 159.667-98 chr14 52514877 52515275 + 0.666667 NA intron (NM_001160047, intron 7 of 20) intron (NM_001160047, intron 7 of 20) 37429 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 181-62 chr5 162674232 162674573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 606760 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 176.667-42 chr12 12901389 12901687 + 0.666667 NA intron (NM_003979, intron 1 of 3) intron (NM_003979, intron 1 of 3) 10516 NM_003979 9052 Hs.631733 NM_003979 ENSG00000013588 GPRC5A GPCR5A|PEIG-1|RAI3|RAIG1|TIG1 G protein-coupled receptor class C group 5 member A protein-coding 115-131 chr6 35044563 35044787 + 0.666667 NA intron (NM_015245, intron 11 of 23) intron (NM_015245, intron 11 of 23) 96664 NM_001366324 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 166-82 chr3 178921950 178922330 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61735 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 199.667-13 chr10 55714931 55715372 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -87209 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 116.333-93 chr17 67672708 67672947 + 0.666667 NA intron (NM_181671, intron 7 of 9) intron (NM_181671, intron 7 of 9) -45006 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 125.667-199 chr9 103343738 103344020 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18846 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 270.333-30 chr2 133651885 133652613 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -83786 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 176.667-88 chr2 220092775 220093152 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -186398 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 278.667-37 chr4 39032524 39032999 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_024943) promoter-TSS (NM_024943) -352 NM_001303228 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 151.333-130 chr14 65544138 65544445 + 0.666667 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) MIR|SINE|MIR 73189 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 127-66 chr4 39965145 39965432 + 0.666667 NA intron (NM_001100399, intron 2 of 32) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 12623 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 196-65 chr16 69537469 69537893 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28187 NR_031719 100302119 NR_031719 ENSG00000223109 MIR1538 MIRN1538|hsa-mir-1538 microRNA 1538 ncRNA 126-120 chr8 140434995 140435339 + 0.666667 NA exon (NM_031466, exon 4 of 23) exon (NM_031466, exon 4 of 23) 22577 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 131.333-10 chr1 118560014 118560256 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -374907 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 126 chr1 9978066 9978357 + 0.666667 NA intron (NM_001297778, intron 3 of 4) AluSx|SINE|Alu 10830 NR_049882 100847055 NR_049882 ENSG00000265521 MIR5697 - microRNA 5697 ncRNA 146-93 chr4 2934730 2935041 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001120) promoter-TSS (NM_001120) -26 NM_001363679 10227 Hs.632581 NM_001120 ENSG00000109736 MFSD10 TETRAN|TETTRAN major facilitator superfamily domain containing 10 protein-coding 113.667-100 chr2 58475653 58475823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45015 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 180.333-98 chr5 123863834 123864217 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 318608 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 168.667-126 chr21 25903222 25903665 + 0.666667 NA intron (NM_001204301, intron 14 of 16) intron (NM_001204301, intron 14 of 16) -167789 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 121.667-70 chr17 53203412 53203721 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 218061 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 129.333-191 chr8 125125196 125125397 + 0.666667 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) L1MB8|LINE|L1 33436 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 211.333-139 chr22 26238481 26238916 + 0.666667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 69224 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 217-30 chr17 55743831 55744398 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -6937 NM_001330377 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 179-60 chr20 47303767 47304213 + 0.666667 NA intron (NM_001281774, intron 4 of 23) intron (NM_001281774, intron 4 of 23) -14512 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 159.333-56 chr11 9504028 9504380 + 0.666667 NA intron (NM_001282656, intron 11 of 15) AluSg|SINE|Alu 43192 NM_003442 7702 Hs.523471 NM_003442 ENSG00000166478 ZNF143 SBF|STAF|pHZ-1 zinc finger protein 143 protein-coding 155-22 chr11 78332160 78332527 + 0.666667 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) intron (NM_080491, intron 1 of 9) 9537 NM_012296 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 143.333-230 chr5 109073275 109073576 + 0.666667 NA intron (NR_146155, intron 16 of 19) intron (NR_146155, intron 16 of 19) 148819 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 172.333-13 chr10 28897935 28898371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51745 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 148.333-319 chr5 91019875 91020291 + 0.666667 NA intron (NR_003149, intron 85 of 89) intron (NR_003149, intron 85 of 89) 294319 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 158-17 chr10 112075679 112076123 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107864 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 146.333-55 chr11 114040739 114041017 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18833 NM_001354750 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 209-48 chr15 54893511 54893992 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -162996 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 204-123 chr21 30973308 30973726 + 0.666667 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 64959 NM_001099219 728299 Hs.580875 NM_001099219 ENSG00000206102 KRTAP19-8 - keratin associated protein 19-8 protein-coding 127.667-104 chr20 59911415 59911715 + 0.666667 NA intron (NM_014258, intron 14 of 44) intron (NM_014258, intron 14 of 44) 22072 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 140.667-5 chr1 62176367 62176618 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -18357 NM_001164835 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 120-65 chr2 54885536 54885824 + 0.666667 NA intron (NM_001039753, intron 16 of 40) AluYk3|SINE|Alu 124592 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 154.333-52 chr11 19261649 19261975 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20157 NM_001256372 79733 Hs.523526 NM_024680 ENSG00000129173 E2F8 E2F-8 E2F transcription factor 8 protein-coding 167-17 chr10 116830818 116831191 + 0.666667 NA intron (NM_001330164, intron 2 of 12) Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -3436 NR_162126 113218494 NR_162126 MIR9851 - microRNA 9851 ncRNA 152.667-184 chr2 83018434 83018750 + 0.666667 NA Intergenic MLT1-int|LTR|ERVL-MaLR 161789 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 237.333-13 chr1 245233411 245233925 + 0.666667 NA intron (NR_151721, intron 1 of 4) intron (NR_151721, intron 1 of 4) 849 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 175-48 chr22 22317004 22317361 + 0.666667 NA intron (NR_027293, intron 8 of 10) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 19084 NR_027293 96610 Hs.449601 NM_080926 BMS1P20 IGL|IGLV|IGLV1 BMS1 pseudogene 20 pseudo 156.667-289 chr5 152906008 152906301 + 0.666667 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) intron (NR_109877, intron 2 of 4) 66195 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 164.667-129 chr21 21779103 21779507 + 0.666667 NA intron (NR_109958, intron 2 of 4) L1MA2|LINE|L1 32320 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 142-156 chr8 121243757 121244067 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -395434 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 178.667-65 chr17 80131614 80132086 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 15278 NM_014740 9775 Hs.389649 NM_014740 ENSG00000141543 EIF4A3 DDX48|Fal1|MUK34|NMP265|NUK34|RCPS|eIF-4A-III|eIF4A-III|eIF4AIII eukaryotic translation initiation factor 4A3 protein-coding 117.667-41 chr12 79706032 79706291 + 0.666667 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie -15064 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 126.667-81 chr2 112340822 112341057 + 0.666667 NA TTS (NM_198581) TTS (NM_198581) 65342 NM_198581 376940 Hs.190477 NM_198581 ENSG00000188177 ZC3H6 ZC3HDC6 zinc finger CCCH-type containing 6 protein-coding 155.667-295 chr5 168300615 168300921 + 0.666667 NA intron (NM_001161661, intron 1 of 22) intron (NM_001161661, intron 1 of 22) 9123 NM_001161661 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 184.333-54 chr16 60911958 60912382 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 143596 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 117-151 chr8 135475757 135476094 + 0.666667 NA intron (NM_006558, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 18469 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 132-11 chr1 179896270 179896549 + 0.666667 NA intron (NM_001267578, intron 3 of 9) AluYk11|SINE|Alu 14367 NM_001267578 26092 Hs.496459 NM_015602 ENSG00000143337 TOR1AIP1 LAP1|LAP1B|LGMD2Y torsin 1A interacting protein 1 protein-coding 150.667-164 chr19 20146005 20146367 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21028 NM_052852 90649 Hs.590991 NM_052852 ENSG00000256229 ZNF486 KRBO2 zinc finger protein 486 protein-coding 139-47 chr2 25936144 25936412 + 0.666667 NA intron (NM_002254, intron 5 of 7) AluJr4|SINE|Alu 46219 NM_002254 3797 Hs.21611 NM_002254 ENSG00000084731 KIF3C - kinesin family member 3C protein-coding 117.667-20 chr10 118172247 118172464 + 0.666667 NA intron (NR_026940, intron 3 of 3) MER20|DNA|hAT-Charlie -125414 NM_014904 22841 Hs.173656 NM_014904 ENSG00000107560 RAB11FIP2 Rab11-FIP2|nRip11 RAB11 family interacting protein 2 protein-coding 128.333-116 chr2 234029525 234029822 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -21029 NM_006944 6694 Hs.444488 NM_006944 ENSG00000072080 SPP2 SPP-24|SPP24 secreted phosphoprotein 2 protein-coding 144-87 chr20 47079961 47080242 + 0.666667 NA intron (NM_172110, intron 7 of 13) L1ME1|LINE|L1 -86866 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 120.667-51 chr14 51830117 51830383 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -30362 NM_001243773 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 120-31 chr12 78088610 78088818 + 0.666667 NA intron (NM_001024383, intron 12 of 39) intron (NM_001024383, intron 12 of 39) 257820 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 217-20 chr14 46323029 46323576 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) MER58A|DNA|hAT-Charlie -148057 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 165.667-143 chr4 70599146 70599531 + 0.666667 NA intron (NM_016519, intron 4 of 12) AluSc|SINE|Alu 7082 NM_016519 258 Hs.272396 NM_016519 ENSG00000178522 AMBN AI1F ameloblastin protein-coding 129.333-129 chr3 102598974 102599247 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 164095 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 124.333-176 chr8 89071517 89071833 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 686036 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 146.333-359 chrX 42142479 42142772 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219071 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 118-16 chr11 115063177 115063394 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -270292 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 147.667-269 chr5 4389392 4389712 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -383929 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 133.333-206 chrX 94133754 94134027 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR 459684 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 124.667-2 chr1 12741744 12742115 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -4271 NM_152290 93190 Hs.98095 NM_152290 ENSG00000157330 C1orf158 - chromosome 1 open reading frame 158 protein-coding 193.667-133 chr8 81484731 81485176 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -1720 NM_001442 2167 Hs.391561 NM_001442 ENSG00000170323 FABP4 A-FABP|AFABP|ALBP|HEL-S-104|aP2 fatty acid binding protein 4 protein-coding 132-107 chr6 100917507 100917782 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36272 NM_022091 10973 Hs.486031 NM_006828 ENSG00000112249 ASCC3 ASC1p200|HELIC1|RNAH activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 protein-coding 112-82 chr17 49530762 49531001 + 0.666667 NA intron (NR_103773, intron 1 of 2) L1MC1|LINE|L1 20064 NR_106751 102465141 NR_106751 ENSG00000277478 MIR6165 hsa-mir-6165 microRNA 6165 ncRNA 171-20 chr14 58451095 58451571 + 0.666667 NA intron (NM_001329944, intron 8 of 31) AluJb|SINE|Alu 11652 NM_001244193 9786 Hs.232532 NM_014749 ENSG00000100578 KIAA0586 JBTS23|SRTD14|Talpid3 KIAA0586 protein-coding 223.667-44 chr21 39204568 39205002 + 0.666667 NA intron (NM_018963, intron 37 of 41) MER1B|DNA|hAT-Charlie -21271 NR_049728 8624 Hs.473838 NM_003720 ENSG00000183527 PSMG1 C21LRP|DSCR2|LRPC21|PAC-1|PAC1 proteasome assembly chaperone 1 protein-coding 150.667-81 chr12 4744147 4744520 + 0.666667 NA intron (NM_017417, intron 3 of 10) intron (NM_017417, intron 3 of 10) 23933 NM_017417 26290 Hs.511985 NM_017417 ENSG00000130035 GALNT8 GALNAC-T8 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 8 protein-coding 119-75 chr2 47625173 47625440 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -54975 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 218.667-104 chr7 129630883 129631384 + 0.666667 NA intron (NM_001040110, intron 1 of 10) intron (NM_001040110, intron 1 of 10) 1055 NM_001040110 4899 Hs.654363 NM_005011 ENSG00000106459 NRF1 ALPHA-PAL nuclear respiratory factor 1 protein-coding 114.333-173 chr5 41628875 41629066 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118369 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 194.667-35 chr13 47303518 47303821 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -406593 NM_001165947 3356 Hs.72630 NM_000621 ENSG00000102468 HTR2A 5-HT2A|HTR2 5-hydroxytryptamine receptor 2A protein-coding 125-61 chr2 162696409 162696638 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) HAL1M8|LINE|L1 -72413 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 118.333-124 chr21 29458761 29459058 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37138 NR_146594 54147 Hs.124532 NR_146594 ENSG00000234293 BACH1-IT3 C21orf8|NCRNA00097 BACH1 intronic transcript 3 ncRNA 113.667-17 chr1 208580356 208580650 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -148185 NR_146914 105372893 Hs.568720 NR_146914 ENSG00000232812 LINC01717 - long intergenic non-protein coding RNA 1717 ncRNA 159.667-178 chr2 146248545 146248882 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -338344 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 150.667-187 chr2 119387652 119387932 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20117 NM_001079863 1622 Hs.78888 NM_020548 ENSG00000155368 DBI ACBD1|ACBP|CCK-RP|EP diazepam binding inhibitor, acyl-CoA binding protein protein-coding 138.333-39 chr11 59189285 59189565 + 0.666667 NA intron (NM_015177, intron 4 of 8) MIRc|SINE|MIR 17293 NM_015177 23220 Hs.523696 NM_015177 ENSG00000110042 DTX4 RNF155 deltex E3 ubiquitin ligase 4 protein-coding 127-80 chr6 43210743 43210981 + 0.666667 NA intron (NM_015089, intron 26 of 40) intron (NM_015089, intron 26 of 40) 18619 NM_006443 10591 Hs.109752 NM_006443 ENSG00000112667 DNPH1 C6orf108|RCL|dJ330M21.3 2'-deoxynucleoside 5'-phosphate N-hydrolase 1 protein-coding 171-61 chr4 137208012 137208437 + 0.666667 NA intron (NR_149105, intron 1 of 3) intron (NR_149105, intron 1 of 3) 4575 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 194.333-123 chr5 113188610 113189191 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 106038 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 192.667-101 chr20 61339343 61339770 + 0.666667 NA intron (NM_001794, intron 2 of 15) intron (NM_001794, intron 2 of 15) 87295 NM_001794 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 163.667-123 chr2 174128100 174128547 + 0.666667 NA intron (NM_001011708, intron 4 of 9) AluJr|SINE|Alu 103043 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 191.667-5 chr1 80327809 80328230 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -207736 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 136.333-177 chr5 180409978 180410339 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -56822 NM_005110 9945 Hs.696497 NM_005110 ENSG00000131459 GFPT2 GFAT|GFAT 2|GFAT2 glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 protein-coding 186.333-128 chr5 92364612 92365027 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -981502 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 187-48 chr22 26203095 26203508 + 0.666667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) L2c|LINE|L2 33827 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 171.333-163 chr6 62366329 62366683 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -80279 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 142.667-101 chr2 117250317 117250599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -564233 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 132-108 chr6 158849915 158850289 + 0.666667 NA intron (NR_028496, intron 2 of 2) intron (NR_028496, intron 2 of 2) 7530 NR_028496 202459 Hs.487035 NM_145303 ENSG00000243775 OSTCP1 DC2L|OSTCL oligosaccharyltransferase complex subunit pseudogene 1 pseudo 185-22 chr15 80739800 80740285 + 0.666667 NA intron (NM_021214, intron 1 of 2) intron (NM_021214, intron 1 of 2) -39328 NM_001293304 57214 Hs.459088 NM_018689 ENSG00000103888 CEMIP CCSP1|HYBID|KIAA1199|TMEM2L cell migration inducing hyaluronidase 1 protein-coding 173.333-194 chr8 8289167 8289575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60801 NR_024363 286042 Hs.656318 NR_024361 ENSG00000173295 FAM86B3P - family with sequence similarity 86, member A pseudogene pseudo 169.333-11 chr1 180648065 180648429 + 0.666667 NA intron (NR_137330, intron 1 of 12) intron (NR_137330, intron 1 of 12) 16225 NR_137330 9213 Hs.227656 NM_004736 ENSG00000143324 XPR1 IBGC6|SLC53A1|SYG1|X3 xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 protein-coding 219.667-90 chr7 125503415 125503923 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -239378 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 193.667-132 chr8 60092888 60093244 + 0.666667 NA Intergenic CR1_Mam|LINE|CR1 188334 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 193.333-165 chr7 19250518 19250972 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -105324 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 194-138 chr8 47894629 47895057 + 0.666667 NA intron (NM_001081640, intron 30 of 84) AluJr|SINE|Alu 65293 NM_001081640 5591 Hs.491682 NM_006904 ENSG00000253729 PRKDC DNA-PKC|DNA-PKcs|DNAPK|DNAPKc|DNPK1|HYRC|HYRC1|IMD26|XRCC7|p350 protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit protein-coding 113.667-94 chr2 21974334 21974614 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -263822 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 157.333-195 chr2 132937780 132938133 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 8 of 17) intron (NM_207481, intron 8 of 17) 22399 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 168.333-98 chr2 106025874 106026232 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39635 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 119.667-137 chr4 147371211 147371418 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -26597 NR_031662 100313938 NR_031662 ENSG00000221369 MIR548G MIRN548G|hsa-mir-548g microRNA 548g ncRNA 113.667-212 chr8 118108794 118109052 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 2896 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 186.333-33 chr11 88515592 88516011 + 0.666667 NA intron (NR_049724, intron 4 of 5) intron (NR_049724, intron 4 of 5) 11225 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 151-74 chr20 59074516 59074810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31817 NR_037930 100533975 Hs.656865 NR_037929 SLMO2-ATP5E - SLMO2-ATP5E readthrough ncRNA 113.333-46 chr11 67617795 67618111 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -2289 NR_033791 390213 Hs.523838 NR_033791 DOC2GP - double C2 domain gamma, pseudogene pseudo 114-65 chr18 68930381 68930620 + 0.666667 NA intron (NM_001093729, intron 8 of 9) intron (NM_001093729, intron 8 of 9) 132420 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 147-74 chr2 159966180 159966469 + 0.666667 NA intron (NM_001007267, intron 20 of 26) L1MB2|LINE|L1 -61568 NM_002349 4065 Hs.153563 NM_002349 ENSG00000054219 LY75 CD205|CLEC13B|DEC-205|GP200-MR6|LY-75 lymphocyte antigen 75 protein-coding 273-24 chr3 19416523 19417165 + 0.666667 NA intron (NM_144633, intron 7 of 15) intron (NM_144633, intron 7 of 15) -101913 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 132-87 chr4 30570026 30570375 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -150169 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 177-65 chr5 88215482 88215859 + 0.666667 NA intron (NM_001349407, intron 5 of 14) intron (NM_001349407, intron 5 of 14) 53175 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 179.667-148 chr8 135810073 135810531 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 352846 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 139.333-182 chr5 65714217 65714474 + 0.666667 NA intron (NM_019072, intron 2 of 10) L2a|LINE|L2 7764 NM_019072 54557 Hs.482301 NM_019072 ENSG00000197860 SGTB SGT2 small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing beta protein-coding 129.667-74 chr16 69844178 69844470 + 0.666667 NA intron (NM_001270453, intron 3 of 20) intron (NM_001270453, intron 3 of 20) 5587 NM_001270453 11060 Hs.408458 NM_007014 ENSG00000198373 WWP2 AIP2|WWp2-like WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 204.667-52 chr16 23135982 23136519 + 0.666667 NA intron (NM_020718, intron 1 of 15) L1M4|LINE|L1 13020 NM_020718 57478 Hs.183817 NM_020718 ENSG00000103404 USP31 - ubiquitin specific peptidase 31 protein-coding 254-56 chr4 62876017 62876693 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -714590 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 159-80 chr3 88900112 88900426 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -207352 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 124-25 chr11 36000325 36000683 + 0.666667 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 -9594 NR_039769 100616311 NR_039769 ENSG00000263389 MIR3973 - microRNA 3973 ncRNA 150-132 chr7 83642386 83642687 + 0.666667 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) -1105 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 150-55 chr16 71508246 71508636 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2a|DNA|hAT-Charlie -5370 NR_135171 105371335 Hs.564879 NR_135171 ENSG00000260520 LOC105371335 - uncharacterized LOC105371335 ncRNA 164-12 chr10 44762574 44762949 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -148555 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 200-177 chr9 32407278 32407751 + 0.666667 NA intron (NM_001278352, intron 4 of 21) intron (NM_001278352, intron 4 of 21) 22871 NM_001362840 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 139.333-100 chr18 31143244 31143638 + 0.666667 NA intron (NM_024421, intron 8 of 15) intron (NM_024421, intron 8 of 15) 19415 NM_024421 1823 Hs.567260 NM_004948 ENSG00000134765 DSC1 CDHF1|DG2/DG3 desmocollin 1 protein-coding 133.333-101 chr22 46922808 46923102 + 0.666667 NA intron (NR_104292, intron 10 of 13) L1PREC2|LINE|L1 -6913 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 187-23 chr15 58730664 58731133 + 0.666667 NA intron (NM_001320570, intron 1 of 14) Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR 18809 NM_001110 102 Hs.172028 NM_001110 ENSG00000137845 ADAM10 AD10|AD18|CD156c|CDw156|HsT18717|MADM|RAK|kuz ADAM metallopeptidase domain 10 protein-coding 195.667-29 chr12 28167939 28168362 + 0.666667 NA Intergenic MSTA1|LTR|ERVL-MaLR -22306 NM_001352084 55297 Hs.653125 NM_018318 ENSG00000123106 CCDC91 HSD8|p56 coiled-coil domain containing 91 protein-coding 216.333-123 chr6 55089523 55090036 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -16681 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 182-57 chr2 203539761 203540167 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4663 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 170-6 chr1 238932496 238932916 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -446689 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 233.667-33 chr18 11578425 11578884 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -30904 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 119-117 chr4 181262571 181262882 + 0.666667 NA intron (NR_149139, intron 1 of 1) intron (NR_149139, intron 1 of 1) 2303 NR_149139 101928679 Hs.149643 NR_149139 LINC02500 - long intergenic non-protein coding RNA 2500 ncRNA 130.667-39 chr10 110791588 110791821 + 0.666667 NA intron (NM_001134363, intron 5 of 13) intron (NM_001134363, intron 5 of 13) 79200 NR_026932 282997 Hs.599931 NR_026932 PDCD4-AS1 - PDCD4 antisense RNA 1 ncRNA 139.333-63 chr13 75308208 75308467 + 0.666667 NA intron (NM_001286658, intron 13 of 19) intron (NM_001286658, intron 13 of 19) 67749 NR_132375 106144536 Hs.591226 NR_132375 LINC01078 - long intergenic non-protein coding RNA 1078 ncRNA 142.667-63 chr15 48708697 48708967 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -63044 NM_000138 2200 Hs.591133 NM_000138 ENSG00000166147 FBN1 ACMICD|ECTOL1|FBN|GPHYSD2|MASS|MFLS|MFS1|OCTD|SGS|SSKS|WMS|WMS2 fibrillin 1 protein-coding 115-56 chr14 29626387 29626649 + 0.666667 NA exon (NM_002742, exon 12 of 18) exon (NM_002742, exon 12 of 18) 300578 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 134-8 chr1 176138209 176138450 + 0.666667 NA intron (NM_022457, intron 6 of 19) intron (NM_022457, intron 6 of 19) 68915 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 114.667-197 chr4 88093898 88094221 + 0.666667 NA intron (NM_001257386, intron 15 of 15) intron (NM_001257386, intron 15 of 15) 64580 NM_004827 9429 Hs.480218 NM_004827 ENSG00000118777 ABCG2 ABC15|ABCP|BCRP|BCRP1|BMDP|CD338|CDw338|EST157481|GOUT1|MRX|MXR|MXR-1|MXR1|UAQTL1 ATP binding cassette subfamily G member 2 (Junior blood group) protein-coding 271-13 chr12 124665099 124665655 + 0.666667 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -97765 NM_001206654 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 156.667-324 chr7 111151561 111152004 + 0.666667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) AluSx|SINE|Alu 60655 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 131.333-139 chr5 13594163 13594428 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 350185 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 116.667-35 chr12 50009427 50009641 + 0.666667 NA intron (NM_001320005, intron 1 of 15) L2a|LINE|L2 15960 NM_001319999 29127 Hs.505469 NM_013277 ENSG00000161800 RACGAP1 CYK4|HsCYK-4|ID-GAP|MgcRacGAP Rac GTPase activating protein 1 protein-coding 150-92 chr3 41486324 41486630 + 0.666667 NA intron (NR_136342, intron 30 of 34) MER89|LTR|ERV1 286972 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 176-63 chr4 39636227 39636588 + 0.666667 NA intron (NM_001317896, intron 1 of 5) intron (NM_001317896, intron 1 of 5) 2458 NM_001317896 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 185-51 chr4 99953717 99954124 + 0.666667 NA intron (NR_125923, intron 1 of 3) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE 3426 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 140-14 chr1 223313259 223313541 + 0.666667 NA intron (NM_017982, intron 2 of 8) MER77B|LTR|ERVL 50776 NM_001037175 55061 Hs.497841 NM_017982 ENSG00000143502 SUSD4 PRO222 sushi domain containing 4 protein-coding 115.333-47 chr12 57684949 57685250 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -8856 NM_001261422 10956 Hs.527861 NM_006812 ENSG00000135506 OS9 ERLEC2|OS-9 OS9 endoplasmic reticulum lectin protein-coding 143.667-214 chr6 51781250 51781527 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 53 of 66) intron (NM_138694, intron 53 of 66) 159518 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 151.667-137 chr16 55519751 55520172 + 0.666667 NA intron (NM_017839, intron 1 of 13) L1ME2|LINE|L1 10889 NM_017839 54947 Hs.460857 NM_017839 ENSG00000087253 LPCAT2 AGPAT11|AYTL1|LysoPAFAT lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 protein-coding 165.333-127 chr2 79254314 79254742 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -94775 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 134-73 chr4 19049327 19049584 + 0.666667 NA Intergenic (GGCTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1027580 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 196.333-104 chr3 55919711 55920183 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 12 of 17) intron (NR_132749, intron 12 of 17) -67353 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 181.333-54 chr16 61517905 61518301 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -462337 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 119.333-41 chr10 98957245 98957458 + 0.666667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) LTR47A2|LTR|ERVL -32783 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 125-49 chr17 82430271 82430603 + 0.666667 NA intron (NM_173620, intron 4 of 11) AluSx|SINE|Alu -11851 NR_033265 79701 Hs.187505 NM_024648 ENSG00000181396 OGFOD3 C17orf101 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 3 protein-coding 123.333-36 chr10 72292153 72292519 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18412 NM_019058 54541 Hs.744875 NM_019058 ENSG00000168209 DDIT4 Dig2|REDD-1|REDD1 DNA damage inducible transcript 4 protein-coding 147.667-343 chr7 106279444 106279746 + 0.666667 NA intron (NM_005746, intron 1 of 10) intron (NM_005746, intron 1 of 10) 5388 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 199.333-190 chr3 170115719 170116149 + 0.666667 NA intron (NM_024947, intron 10 of 14) intron (NM_024947, intron 10 of 14) 65799 NM_001308116 80012 Hs.529592 NM_024947 ENSG00000173889 PHC3 EDR3|HPH3 polyhomeotic homolog 3 protein-coding 200-89 chr2 165979899 165980373 + 0.666667 NA intron (NR_110598, intron 1 of 3) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 22718 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 180-115 chr8 121321265 121321729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -317849 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 175.667-11 chr1 192566905 192567272 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8685 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 193.333-199 chr9 107339146 107339608 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 54608 NM_001244713 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 121-78 chr2 204695934 204696132 + 0.666667 NA intron (NM_205863, intron 2 of 21) intron (NM_205863, intron 2 of 21) 150558 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 153.333-227 chr2 223255360 223255654 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 203577 NM_080671 23704 Hs.348522 NM_080671 ENSG00000152049 KCNE4 MIRP3 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 4 protein-coding 127.333-60 chr16 64474617 64474846 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 647332 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 114.667-127 chr2 59716482 59716776 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 498921 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 119.667-38 chr12 56065948 56066260 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -13921 NM_001982 2065 Hs.118681 NM_001982 ENSG00000065361 ERBB3 ErbB-3|FERLK|HER3|LCCS2|MDA-BF-1|c-erbB-3|c-erbB3|erbB3-S|p180-ErbB3|p45-sErbB3|p85-sErbB3 erb-b2 receptor tyrosine kinase 3 protein-coding 140.333-213 chr7 20478686 20479075 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136787 NM_001163941 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 219.333-65 chr16 10672915 10673368 + 0.666667 NA intron (NM_144674, intron 5 of 6) intron (NM_144674, intron 5 of 6) 21789 NM_144674 146279 Hs.143519 NM_144674 ENSG00000153060 TEKT5 CT149 tektin 5 protein-coding 201.333-111 chr14 97584064 97584440 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 102406 NR_033943 100129345 Hs.23632 NR_033943 ENSG00000197176 LINC02291 - long intergenic non-protein coding RNA 2291 ncRNA 129-89 chr3 149821178 149821524 + 0.666667 NA intron (NM_007282, intron 2 of 10) L1MB5|LINE|L1 8663 NM_183383 11342 Hs.12333 NM_007282 ENSG00000082996 RNF13 EIEE73|RZF ring finger protein 13 protein-coding 132.333-96 chr2 198643542 198643891 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -268619 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 208.667-23 chr10 83506509 83506944 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 170363 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 233-17 chr12 47126499 47126990 + 0.666667 NA intron (NM_001281429, intron 2 of 2) L1ME1|LINE|L1 -46785 NM_001370299 347902 Hs.121520 NM_181847 ENSG00000139211 AMIGO2 ALI1|AMIGO-2|DEGA adhesion molecule with Ig like domain 2 protein-coding 123.667-66 chr15 89480353 89480582 + 0.666667 NA intron (NM_001321041, intron 3 of 10) intron (NM_001321041, intron 3 of 10) 16116 NR_110261 51458 Hs.459284 NM_016321 ENSG00000140519 RHCG C15orf6|PDRC2|RHGK|SLC42A3 Rh family C glycoprotein protein-coding 222.667-79 chr6 54106272 54106760 + 0.666667 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 -4927 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 173-43 chr2 23015998 23016460 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -368950 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 205-24 chr12 76870060 76870613 + 0.666667 NA intron (NM_001300965, intron 1 of 5) intron (NM_001300965, intron 1 of 5) 8683 NM_001321 1466 Hs.530904 NM_001321 ENSG00000175183 CSRP2 CRP2|LMO5|SmLIM cysteine and glycine rich protein 2 protein-coding 191.667-137 chrX 58199046 58199511 + 0.666667 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -288645 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 142-143 chr7 38988282 38988701 + 0.666667 NA intron (NR_138047, intron 4 of 6) intron (NR_138047, intron 4 of 6) 10582 NM_001370959 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 113-39 chr12 22791093 22791358 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 166054 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 149.667-259 chr3 89546538 89546876 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 439086 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 151.333-111 chr13 55007240 55007562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -167053 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 141.667-190 chr6 23184854 23185142 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -467074 NR_134614 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 185.333-180 chr7 105150105 105150483 + 0.666667 NA intron (NM_182692, intron 7 of 15) AluSz6|SINE|Alu 118783 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 138-104 chr7 471962 472344 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47691 NM_002607 5154 Hs.535898 NM_002607 ENSG00000197461 PDGFA PDGF-A|PDGF1 platelet derived growth factor subunit A protein-coding 163.333-276 chr8 20640670 20641047 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25932 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 114.667-224 chr6 70140666 70140857 + 0.666667 NA intron (NM_001858, intron 19 of 50) intron (NM_001858, intron 19 of 50) 142436 NM_078485 1297 Hs.590892 NM_001851 ENSG00000112280 COL9A1 DJ149L1.1.2|EDM6|MED|STL4 collagen type IX alpha 1 chain protein-coding 119.333-215 chr8 89091701 89091928 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 665897 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 145.333-247 chr5 156879671 156879991 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 29536 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 115.333-136 chr3 26525374 26525697 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -97271 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 148.667-93 chr12 33374824 33375250 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_198992, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_198992, exon 7 of 7) 64782 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 113-93 chr19 34329727 34330041 + 0.666667 NA intron (NM_014686, intron 6 of 13) AluJb|SINE|Alu -34856 NM_001184722 2821 Hs.466471 NM_000175 ENSG00000105220 GPI AMF|GNPI|NLK|PGI|PHI|SA-36|SA36 glucose-6-phosphate isomerase protein-coding 128.667-203 chrX 89071026 89071309 + 0.666667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 323942 NM_001184771 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 216.333-81 chr2 120019140 120019684 + 0.666667 NA intron (NM_001330307, intron 2 of 16) intron (NM_001330307, intron 2 of 16) 6335 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 182-5 chr1 94984336 94984800 + 0.666667 NA intron (NM_144988, intron 3 of 3) intron (NM_144988, intron 3 of 3) 56540 NR_033998 729970 Hs.297988 NR_033998 ENSG00000235501 LOC729970 - hCG2028352-like ncRNA 221.333-29 chr11 131502374 131502871 + 0.666667 NA intron (NM_001352003, intron 1 of 8) intron (NM_001352003, intron 1 of 8) 38245 NR_110140 101929653 Hs.559159 NR_110140 ENSG00000237654 LOC101929653 - uncharacterized LOC101929653 ncRNA 134.667-62 chr14 66446475 66446722 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39773 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 190.333-145 chr8 87836421 87836909 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 37350 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 120.333-167 chr7 28969314 28969653 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -10484 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 166.667-82 chr16 85023590 85024083 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3915 NM_014732 9764 Hs.301658 NM_014732 ENSG00000135709 KIAA0513 - KIAA0513 protein-coding 187-43 chr20 8235747 8236103 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) -12779 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 140-10 chr1 156132314 156132673 + 0.666667 NA intron (NM_005572, intron 2 of 9) AluSx1|SINE|Alu 6323 NM_001257374 4000 Hs.594444 NM_005572 ENSG00000160789 LMNA CDCD1|CDDC|CMD1A|CMT2B1|EMD2|FPL|FPLD|FPLD2|HGPS|IDC|LDP1|LFP|LGMD1B|LMN1|LMNC|LMNL1|MADA|PRO1 lamin A/C protein-coding 139-14 chr10 65238705 65239109 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -314389 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 188-114 chr8 98950172 98950581 + 0.666667 NA intron (NM_001142462, intron 2 of 3) intron (NM_001142462, intron 2 of 3) 5934 NM_001142462 116039 Hs.253247 NM_053001 ENSG00000164920 OSR2 - odd-skipped related transciption factor 2 protein-coding 159.667-302 chr7 50622188 50622649 + 0.666667 NA intron (NM_001350816, intron 7 of 17) intron (NM_001350816, intron 7 of 17) -57013 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 128.667-32 chr11 26792823 26793098 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70900 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 199.333-70 chr14 45010569 45011052 + 0.666667 NA intron (NM_001308120, intron 6 of 19) intron (NM_001308120, intron 6 of 19) 48620 NM_001308120 23116 Hs.371078 NM_015091 ENSG00000198718 TOGARAM1 FAM179B|KIAA0423 TOG array regulator of axonemal microtubules 1 protein-coding 128.667-187 chr8 120573859 120574090 + 0.666667 NA intron (NM_021021, intron 4 of 6) L1MA10|LINE|L1 128555 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 221.333-74 chr2 195597039 195597433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59722 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 184.667-50 chr2 22780235 22780710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 243993 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 114.333-86 chr17 48226273 48226554 + 0.666667 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -67934 NR_131240 105371807 Hs.661105 NR_131239 ENSG00000235300 THRA1/BTR - uncharacterized LOC105371807 ncRNA 192.667-95 chr2 214962798 214963135 + 0.666667 NA non-coding (NR_110292, exon 4 of 4) non-coding (NR_110292, exon 4 of 4) 69120 NM_015657 26154 Hs.134585 NM_015657 ENSG00000144452 ABCA12 ARCI4A|ARCI4B|ICR2B|LI2 ATP binding cassette subfamily A member 12 protein-coding 148-63 chr18 12956915 12957210 + 0.666667 NA intron (NM_031216, intron 3 of 8) AluY|SINE|Alu 9051 NM_001013437 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 117-16 chr10 20131051 20131304 + 0.666667 NA intron (NM_032812, intron 4 of 13) L1MA9|LINE|L1 314745 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 147-9 chr10 5196959 5197277 + 0.666667 NA intron (NM_001818, intron 1 of 8) intron (NM_001818, intron 1 of 8) 281 NM_001818 1109 Hs.567245 NM_001818 ENSG00000198610 AKR1C4 3-alpha-HSD|C11|CDR|CHDR|DD-4|DD4|HAKRA aldo-keto reductase family 1 member C4 protein-coding 170-123 chr9 16487792 16488199 + 0.666667 NA intron (NM_001317939, intron 4 of 6) intron (NM_001317939, intron 4 of 6) -211682 NM_001364979 100129385 Hs.586441 NM_001271829 ENSG00000205549 C9orf92 Em:AL513424.1 chromosome 9 open reading frame 92 protein-coding 114-83 chr22 25718572 25718771 + 0.666667 NA intron (NM_001362778, intron 18 of 19) intron (NM_001362778, intron 18 of 19) -23517 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 122.333-174 chr5 62546715 62546954 + 0.666667 NA intron (NM_016338, intron 24 of 29) intron (NM_016338, intron 24 of 29) -31901 NR_073584 101180901 Hs.482269 NR_073584 ENSG00000086200 IPO11-LRRC70 - IPO11-LRRC70 readthrough ncRNA 226.666-28 chr4 87360118 87360753 + 0.666667 NA intron (NM_016245, intron 4 of 6) L1M5|LINE|L1 30753 NM_016245 51170 Hs.594923 NM_016245 ENSG00000198189 HSD17B11 17-BETA-HSD11|17-BETA-HSDXI|17BHSD11|DHRS8|PAN1B|RETSDR2|SDR16C2 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 11 protein-coding 144-148 chr8 67477997 67478336 + 0.666667 NA intron (NR_136224, intron 4 of 4) MER21B|LTR|ERVL 134332 NR_136223 102724708 Hs.636330 NR_136223 LOC102724708 - uncharacterized LOC102724708 ncRNA 152.333-127 chr15 77493105 77493414 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -32336 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 127.667-64 chr17 67538023 67538353 + 0.666667 NA intron (NM_181671, intron 2 of 9) L1ME3Cz|LINE|L1 -66603 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 132-15 chr1 230283352 230283624 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 142844 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 124-41 chr15 66669140 66669497 + 0.666667 NA intron (NR_110372, intron 3 of 4) AluSx3|SINE|Alu -32918 NM_005585 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 162.333-168 chr3 118547989 118548291 + 0.666667 NA intron (NR_135547, intron 3 of 3) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -93628 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 178.667-23 chr10 62026654 62027086 + 0.666667 NA intron (NM_032199, intron 4 of 9) intron (NM_032199, intron 4 of 9) -22487 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 134.667-8 chr1 165690610 165690840 + 0.666667 NA intron (NM_001365774, intron 2 of 10) L1PA6|LINE|L1 7837 NM_001365774 223 Hs.2533 NM_000696 ENSG00000143149 ALDH9A1 ALDH4|ALDH7|ALDH9|E3|TMABADH aldehyde dehydrogenase 9 family member A1 protein-coding 354.667-14 chr3 41288879 41289641 + 0.666667 NA intron (NR_136342, intron 33 of 34) intron (NR_136342, intron 33 of 34) 89755 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 155.333-334 chr6 76240434 76240744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -167911 NM_001282368 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 140.333-128 chr21 28535590 28535862 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -3592 NR_026553 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 146.333-122 chr17 54790126 54790492 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -110382 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 173.333-58 chr14 88451564 88451889 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 66069 NM_018418 55812 Hs.525518 NM_018418 ENSG00000042317 SPATA7 HEL-S-296|HSD-3.1|HSD3|LCA3 spermatogenesis associated 7 protein-coding 245.333-57 chr18 3021865 3022390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10180 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 162.333-86 chr15 78177043 78177479 + 0.666667 NA intron (NM_015162, intron 11 of 13) L1M5|LINE|L1 27899 NM_005530 3419 Hs.591110 NM_005530 ENSG00000166411 IDH3A - isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 alpha protein-coding 128-4 chr1 157855559 157855863 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -13903 NM_001347698 922 Hs.134035 NM_005894 ENSG00000073754 CD5L AIM|API6|CT-2|PRO229|SP-ALPHA|Spalpha|hAIM CD5 molecule like protein-coding 153.333-160 chr17 34178412 34178701 + 0.666667 NA intron (NR_110748, intron 4 of 5) MIR|SINE|MIR 5076 NR_110748 101927239 Hs.603592 NR_110748 ENSG00000261156 LINC01989 - long intergenic non-protein coding RNA 1989 ncRNA 120.333-145 chr4 144401222 144401511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 244653 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 180-53 chr2 112842058 112842449 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5474 NM_000576 3553 Hs.126256 NM_000576 ENSG00000125538 IL1B IL-1|IL1-BETA|IL1F2 interleukin 1 beta protein-coding 121-63 chr19 29193832 29194077 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 19197 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 151-82 chr3 37259880 37260186 + 0.666667 NA intron (NM_002078, intron 2 of 23) intron (NM_002078, intron 2 of 23) -15838 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 124.333-184 chr8 143244807 143245053 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2009 NM_173832 286128 Hs.668016 NM_173832 ENSG00000181638 ZFP41 ZNF753|zfp-41 ZFP41 zinc finger protein protein-coding 152.667-2 chr1 21067573 21067967 + 0.666667 NA intron (NM_003760, intron 1 of 31) intron (NM_003760, intron 1 of 31) 43613 NM_003760 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 207.333-196 chr4 47595144 47595521 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001278585, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001278585, exon 20 of 20) -57337 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 112-39 chr12 2021801 2021996 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -17363 NR_135060 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 167.333-276 chr9 110667442 110667793 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1174 NM_001166280 4593 Hs.521653 NM_005592 ENSG00000030304 MUSK CMS9|FADS|FADS1 muscle associated receptor tyrosine kinase protein-coding 114.667-26 chr10 25150828 25151063 + 0.666667 NA intron (NR_120649, intron 6 of 7) L1MA4|LINE|L1 -24056 NM_020752 57512 Hs.499108 NM_020752 ENSG00000151025 GPR158 - G protein-coupled receptor 158 protein-coding 155.333-78 chr12 48299245 48299542 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29587 NM_181788 341567 Hs.155833 NM_181788 ENSG00000187166 H1FNT H1.7|H1T2 H1 histone family member N, testis specific protein-coding 190.667-97 chr5 20310150 20310560 + 0.666667 NA intron (NR_146519, intron 1 of 1) intron (NR_146519, intron 1 of 1) 4804 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 131-8 chr1 235746635 235746979 + 0.666667 NA intron (NM_000081, intron 28 of 52) intron (NM_000081, intron 28 of 52) -96053 NM_001098721 2786 Hs.159711 NM_004485 ENSG00000168243 GNG4 - G protein subunit gamma 4 protein-coding 229.666-27 chr5 139093334 139094005 + 0.666667 NA intron (NM_022464, intron 3 of 9) X7C_LINE|LINE|CR1 104699 NM_022464 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 148.667-171 chr2 5249595 5249912 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 441365 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 136.667-134 chr4 168415371 168415605 + 0.666667 NA exon (NM_001291510, exon 22 of 30) exon (NM_001291510, exon 22 of 30) 65004 NM_001345927 91351 Hs.535011 NM_001012967 ENSG00000181381 DDX60L - DExD/H-box 60 like protein-coding 187.333-83 chr17 71176528 71177006 + 0.666667 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) intron (NR_104152, intron 2 of 3) 25412 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 135-38 chr17 63391422 63391671 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 16 of 25) intron (NM_025185, intron 16 of 25) 48721 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 198.667-40 chr11 106410513 106410949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 159324 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 201-23 chr10 119513994 119514441 + 0.666667 NA intron (NM_001005339, intron 4 of 4) AluSz|SINE|Alu 22316 NM_002925 6001 Hs.501200 NM_002925 ENSG00000148908 RGS10 - regulator of G protein signaling 10 protein-coding 165.667-194 chr8 33402150 33402560 + 0.666667 NA intron (NM_032664, intron 3 of 4) intron (NM_032664, intron 3 of 4) 70791 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 120.667-14 chr10 4786465 4786698 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39596 NM_001271021 83592 Hs.657944 NM_031436 ENSG00000165568 AKR1E2 AKR1CL2|AKRDC1|LoopADR|TAKR|hTSP|htAKR aldo-keto reductase family 1 member E2 protein-coding 167.667-177 chr5 158542388 158542768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132805 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 193-50 chr2 186640959 186641377 + 0.666667 NA intron (NM_001145000, intron 9 of 27) intron (NM_001145000, intron 9 of 27) 40963 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 113-169 chr5 72586372 72586638 + 0.666667 NA intron (NR_105007, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 29428 NR_105008 102503427 Hs.429280 NR_105008 LOC102503427 - uncharacterized LOC102503427 ncRNA 164.667-112 chr2 88673080 88673424 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -18421 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 115-98 chr2 215560107 215560309 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106501 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 147.333-194 chr20 59144759 59145159 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46061 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 143.333-56 chr11 132373525 132373938 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 89429 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 148.333-77 chr11 124483963 124484388 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43090 NM_012378 26493 Hs.351822 NM_012378 ENSG00000197125 OR8B8 TPCR85 olfactory receptor family 8 subfamily B member 8 protein-coding 255.667-85 chr9 28198220 28198808 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) 520791 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 242.333-13 chr10 75154794 75155288 + 0.666667 NA intron (NM_001174156, intron 2 of 5) AluJr4|SINE|Alu 43385 NM_144660 142891 Hs.744986 NM_144660 ENSG00000156671 SAMD8 HEL-177|SMSr sterile alpha motif domain containing 8 protein-coding 191.333-164 chr5 119974168 119974664 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 344857 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 220.667-17 chr10 125508937 125509310 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65248 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 136-73 chr4 49110633 49110882 + 0.666667 NA Intergenic (CATTC)n|Satellite|Satellite 124115 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 192.333-94 chr2 106981565 106982134 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -94740 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 136.333-171 chr5 95893792 95894098 + 0.666667 NA intron (NM_012081, intron 9 of 11) intron (NM_012081, intron 9 of 11) 41713 NR_026936 202299 Hs.8373 NM_175616 ENSG00000236882 LINC01554 C5orf27|FIS long intergenic non-protein coding RNA 1554 ncRNA 170-44 chr16 65779687 65780075 + 0.666667 NA Intergenic (TATTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -203581 NR_027755 283867 Hs.444774 NM_001101346 ENSG00000261742 LINC00922 - long intergenic non-protein coding RNA 922 ncRNA 147.333-13 chr1 70420284 70420641 + 0.666667 NA intron (NM_001902, intron 3 of 11) MER1B|DNA|hAT-Charlie 9194 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 151.333-297 chr4 30616956 30617319 + 0.666667 NA Intergenic MSTA1|LTR|ERVL-MaLR -103232 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 114.667-65 chr12 102693800 102694104 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 130447 NR_033855 283432 Hs.382110 NR_033855 ENSG00000258169 LINC00485 - long intergenic non-protein coding RNA 485 ncRNA 136.667-29 chr11 37297147 37297432 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -641312 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 163-44 chr2 80605845 80606181 + 0.666667 NA intron (NM_001164883, intron 16 of 16) intron (NM_001164883, intron 16 of 16) 292634 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 192-116 chr5 113408309 113408669 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) intron (NM_001085377, intron 1 of 18) 26500 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 125.333-183 chr9 26051359 26051616 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15188 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 124.667-184 chr7 18999853 19000065 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001321877, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_001321877, exon 25 of 25) 117677 NR_149001 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 161.667-107 chr17 69388457 69388814 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -26062 NM_002758 5608 Hs.49329 NM_002758 ENSG00000108984 MAP2K6 MAPKK6|MEK6|MKK6|PRKMK6|SAPKK-3|SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 protein-coding 270-11 chr12 14112883 14113412 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132791 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 175-11 chr10 75702640 75703152 + 0.666667 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) -9559 NR_132791 105378367 Hs.464836 NR_132791 LOC105378367 - uncharacterized LOC105378367 ncRNA 133.667-10 chr1 180242935 180243288 + 0.666667 NA intron (NM_033343, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 12847 NM_033343 89884 Hs.658487 NM_033343 ENSG00000121454 LHX4 CPHD4 LIM homeobox 4 protein-coding 194.667-102 chr3 179881552 179881905 + 0.666667 NA intron (NM_001349401, intron 1 of 11) intron (NM_001349401, intron 1 of 11) -16466 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 244.333-92 chr6 169476666 169477303 + 0.666667 NA intron (NR_146875, intron 19 of 20) L1M5|LINE|L1 -222870 NM_003247 7058 Hs.371147 NM_003247 ENSG00000186340 THBS2 TSP2 thrombospondin 2 protein-coding 183.333-147 chr6 165578487 165578942 + 0.666667 NA intron (NM_006661, intron 1 of 22) intron (NM_006661, intron 1 of 22) 83386 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 113.333-158 chr22 20789531 20789806 + 0.666667 NA intron (NM_058004, intron 19 of 54) MIR|SINE|MIR 15555 NM_000185 3053 Hs.474270 NM_000185 ENSG00000099937 SERPIND1 D22S673|HC2|HCF2|HCII|HLS2|LS2|THPH10 serpin family D member 1 protein-coding 180.333-131 chr8 61601671 61602116 + 0.666667 NA intron (NM_004318, intron 14 of 24) L1M2|LINE|L1 87918 NM_001164752 444 Hs.332422 NM_004318 ENSG00000198363 ASPH AAH|BAH|CASQ2BP1|FDLAB|HAAH|JCTN|junctin aspartate beta-hydroxylase protein-coding 186.667-26 chr11 94479426 94479899 + 0.666667 NA intron (NM_001330347, intron 5 of 19) intron (NM_001330347, intron 5 of 19) -13082 NR_031630 100302275 NR_031630 ENSG00000221230 MIR548L MIRN548L|hsa-mir-548l microRNA 548l ncRNA 114.667-263 chrX 46865982 46866303 + 0.666667 NA intron (NM_006915, intron 3 of 4) L1MC3|LINE|L1 29099 NM_006915 6102 Hs.44766 NM_006915 ENSG00000102218 RP2 DELXp11.3|NM23-H10|NME10|TBCCD2|XRP2 RP2 activator of ARL3 GTPase protein-coding 119-89 chr20 19868478 19868764 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -17900 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 121.667-17 chr1 234090533 234090715 + 0.666667 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) LTR31|LTR|ERV1 -123587 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 154.667-239 chr3 72123428 72123738 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23128 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 187.667-122 chr5 120208068 120208504 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -255992 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 113-208 chr8 118911757 118912085 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 39964 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 137.667-83 chr18 68431277 68431572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 283684 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 114.667-151 chr20 5982214 5982552 + 0.666667 NA intron (NM_182802, intron 13 of 18) intron (NM_182802, intron 13 of 18) 23438 NR_110101 101929225 Hs.635771 NR_110101 ENSG00000278719 MCM8-AS1 - MCM8 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-15 chr1 196235757 196236110 + 0.666667 NA intron (NM_001287820, intron 26 of 26) intron (NM_001287820, intron 26 of 26) -147218 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 171.667-18 chr10 31255722 31256089 + 0.666667 NA intron (NR_134478, intron 1 of 2) L1ME3Cz|LINE|L1 -62512 NM_001323638 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 173.333-193 chr7 133845841 133846260 + 0.666667 NA intron (NM_021807, intron 11 of 17) intron (NM_021807, intron 11 of 17) -21162 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 155-98 chr3 169126328 169126683 + 0.666667 NA intron (NM_001163999, intron 4 of 14) intron (NM_001163999, intron 4 of 14) 19018 NM_001366472 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 179.667-111 chr5 28944084 28944436 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 17390 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 119-8 chr1 183979128 183979457 + 0.666667 NA intron (NM_001303421, intron 1 of 11) L1M3|LINE|L1 58436 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 131.333-12 chr1 167120159 167120416 + 0.666667 NA intron (NM_001080426, intron 5 of 5) MIRb|SINE|MIR 26212 NM_001080426 92235 Hs.632462 NM_001080426 ENSG00000198842 DUSP27 - dual specificity phosphatase 27, atypical protein-coding 130.333-209 chr8 105523252 105523528 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 3 of 7) intron (NM_001362837, intron 3 of 7) 203847 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 148.333-202 chr2 170425631 170426040 + 0.666667 NA intron (NM_001083615, intron 22 of 33) MIRb|SINE|MIR -74892 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 162-6 chr1 212172498 212172765 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 62105 NR_125982 101929541 Hs.632493 NR_125982 ENSG00000226251 LINC02608 - long intergenic non-protein coding RNA 2608 ncRNA 143-41 chr14 60978325 60978692 + 0.666667 NA intron (NM_020810, intron 2 of 4) intron (NM_020810, intron 2 of 4) 2571 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 147.333-280 chr6 117929620 117929937 + 0.666667 NA intron (NM_001029858, intron 1 of 7) MLT2C1|LTR|ERVL 22514 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 189.333-48 chr13 113510052 113510455 + 0.666667 NA exon (NM_017905, exon 7 of 13) exon (NM_017905, exon 7 of 13) 19232 NM_017905 55002 Hs.317593 NM_017905 ENSG00000150403 TMCO3 C13orf11 transmembrane and coiled-coil domains 3 protein-coding 140.333-91 chr19 43468888 43469187 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3429 NM_014400 27076 Hs.631594 NM_014400 ENSG00000124466 LYPD3 C4.4A LY6/PLAUR domain containing 3 protein-coding 159.333-34 chr10 8723574 8723971 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129381 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 124.667-168 chr5 78563167 78563486 + 0.666667 NA intron (NM_005779, intron 3 of 4) intron (NM_005779, intron 3 of 4) 85446 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 113-87 chr17 74724891 74725154 + 0.666667 NA intron (NM_175738, intron 1 of 8) MER115|DNA|hAT-Tip100 -11538 NM_001330471 326624 Hs.351413 NM_175738 ENSG00000172794 RAB37 - RAB37, member RAS oncogene family protein-coding 264.667-70 chr6 42591894 42592517 + 0.666667 NA exon (NM_001184801, exon 3 of 12) exon (NM_001184801, exon 3 of 12) 28176 NM_001184801 23304 Hs.529925 NM_015255 ENSG00000024048 UBR2 C6orf133|bA49A4.1|dJ242G1.1|dJ392M17.3 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 protein-coding 148.667-84 chr11 126047560 126047853 + 0.666667 NA intron (NM_016952, intron 1 of 19) MIR|SINE|MIR 15586 NM_016952 50937 Hs.38034 NM_016952 ENSG00000064309 CDON CDO|CDON1|HPE11|ORCAM cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 154.667-36 chr10 19059575 19060030 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 1 of 39) intron (NM_001142308, intron 1 of 39) 11001 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 146.333-104 chr15 52994432 52994809 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -121745 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 143-107 chr6 132864072 132864397 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47015 NR_002436 594839 Hs.671378 NR_002436 ENSG00000200534 SNORA33 ACA33 small nucleolar RNA, H/ACA box 33 snoRNA 133-39 chr2 19683822 19684059 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -184914 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 111.667-276 chrX 46200789 46201109 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 126725 NR_110388 101927574 Hs.350952 NR_110388 ENSG00000236751 LINC01186 ZNF674-1 long intergenic non-protein coding RNA 1186 ncRNA 128-37 chr17 77090255 77090472 + 0.666667 NA TTS (NR_003013) TTS (NR_003013) 946 NR_106997 102466864 NR_106997 ENSG00000284250 MIR6516 hsa-mir-6516 microRNA 6516 ncRNA 158.333-244 chr4 125663402 125663763 + 0.666667 NA Intergenic MER4A|LTR|ERV1 156323 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 136-79 chr4 114502969 114503224 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -95306 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 122-127 chr8 133782010 133782253 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -4779 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 153.333-46 chr10 52662433 52662803 + 0.666667 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 92786 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 206.667 chr1 6848937 6849480 + 0.666667 NA intron (NM_001349608, intron 2 of 21) intron (NM_001349608, intron 2 of 21) 63754 NR_146204 23261 Hs.397705 NM_015215 ENSG00000171735 CAMTA1 CANPMR calmodulin binding transcription activator 1 protein-coding 145-107 chr6 148384278 148384682 + 0.666667 NA intron (NM_001346506, intron 1 of 20) intron (NM_001346506, intron 1 of 20) 41642 NM_015278 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 115.667-45 chr11 109266253 109266563 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -155782 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 263-51 chr5 35714720 35715327 + 0.666667 NA intron (NM_024867, intron 20 of 36) AluJb|SINE|Alu 97160 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 151.333-340 chr5 65994172 65994510 + 0.666667 NA intron (NM_001253697, intron 3 of 25) intron (NM_001253697, intron 3 of 25) -48768 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 257.333-89 chr6 141882140 141882634 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 206412 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 161-53 chr22 28007406 28007821 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 14 of 22) intron (NM_001145418, intron 14 of 22) -87001 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 113-51 chr13 67075229 67075450 + 0.666667 NA intron (NM_001318372, intron 2 of 4) intron (NM_001318372, intron 2 of 4) 84453 NR_046637 100874087 Hs.606903 NR_046637 ENSG00000233840 PCDH9-AS4 - PCDH9 antisense RNA 4 ncRNA 139.667-218 chrX 98548638 98548953 + 0.666667 NA Intergenic MER34A1|LTR|ERV1 -984260 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 113.667-169 chr5 52698957 52699134 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88871 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 119-136 chr7 46770888 46771188 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73916 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 134.333-162 chr7 95273230 95273457 + 0.666667 NA intron (NM_001166160, intron 14 of 19) intron (NM_001166160, intron 14 of 19) 51189 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 193.667-148 chrX 50711779 50712234 + 0.666667 NA intron (NR_027121, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 102038 NM_020717 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 143.333-115 chr17 67048409 67048813 + 0.666667 NA intron (NM_000727, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 4057 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 131-113 chrX 84578121 84578457 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -75836 NM_001177479 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 154-54 chr14 71040365 71040697 + 0.666667 NA intron (NM_014982, intron 19 of 35) L1MEc|LINE|L1 133072 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 152.333-318 chr5 147734865 147735208 + 0.666667 NA intron (NM_001270934, intron 1 of 20) intron (NM_001270934, intron 1 of 20) 47692 NM_001282282 9832 Hs.740461 NM_014790 ENSG00000176049 JAKMIP2 JAMIP2|NECC1 janus kinase and microtubule interacting protein 2 protein-coding 184.333-6 chr1 182341306 182341683 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -27433 NR_104175 400799 Hs.634884 NR_104175 ENSG00000228918 LINC01344 GS1-122H1.2 long intergenic non-protein coding RNA 1344 ncRNA 203.667-81 chr3 169014909 169015385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113202 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 169-106 chr9 26876071 26876512 + 0.666667 NA intron (NM_001167575, intron 4 of 5) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 16511 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 139-41 chr17 81609889 81610241 + 0.666667 NA intron (NM_001369698, intron 5 of 16) intron (NM_001369698, intron 5 of 16) 27047 NM_017921 55666 Hs.464333 NM_017921 ENSG00000182446 NPLOC4 NPL4 NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor protein-coding 152-63 chr15 64569868 64570174 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) FLAM_C|SINE|Alu 70601 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 176.667-49 chr13 21283839 21284211 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001365454, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001365454, exon 5 of 5) 14066 NM_001365454 101928764 NM_001365454 LOC101928764 - coiled-coil domain-containing protein 144B protein-coding 219.666-39 chr6 37545472 37546096 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9638 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 301.333-19 chr15 68613695 68614329 + 0.666667 NA intron (NM_006091, intron 1 of 11) Charlie20a|DNA|hAT-Charlie -2528 NM_001190456 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 135.333-49 chr14 50179237 50179530 + 0.666667 NA intron (NM_006939, intron 7 of 22) AluJo|SINE|Alu 52195 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 158.333-349 chrX 50030033 50030414 + 0.666667 NA intron (NM_001127899, intron 3 of 14) L1M5|LINE|L1 15625 NR_030226 574504 NR_030226 ENSG00000272080 MIR502 MIRN502|hsa-mir-502|mir-502 microRNA 502 ncRNA 113-58 chr14 62891844 62892090 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 7 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 153491 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 113.333-233 chr6 138724689 138724980 + 0.666667 NA TTS (NR_161203) TTS (NR_161203) 33166 NR_033896 441172 Hs.92290 NR_033896 FLJ46906 - uncharacterized LOC441172 ncRNA 168.667-167 chr4 171055952 171056278 + 0.666667 NA intron (NR_038838, intron 3 of 4) MER101-int|LTR|ERV1 15513 NR_038838 100506122 Hs.434205 NR_038838 ENSG00000248872 LINC02431 - long intergenic non-protein coding RNA 2431 ncRNA 166-120 chr8 127650881 127651216 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 82919 NR_117102 100270680 Hs.333720 NR_117101 ENSG00000249375 CASC11 CARLO7|CARLo-7|LINC00990|TCONS_00014535 cancer susceptibility 11 ncRNA 190.333-153 chr9 135306751 135307198 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -36275 NM_173520 157927 Hs.559511 NM_173520 C9orf62 - chromosome 9 open reading frame 62 protein-coding 144.333-82 chr14 86517169 86517545 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -388421 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 154.667-322 chr5 137729771 137730190 + 0.666667 NA intron (NM_017415, intron 1 of 14) intron (NM_017415, intron 1 of 14) 6109 NM_017415 26249 Hs.655084 NM_017415 ENSG00000146021 KLHL3 PHA2D kelch like family member 3 protein-coding 235.333-14 chr10 103147415 103147980 + 0.666667 NA intron (NM_001351187, intron 3 of 21) intron (NM_001351187, intron 3 of 21) 6124 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 158-32 chr12 26493310 26493581 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 39 of 56) intron (NM_002223, intron 39 of 56) 297872 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 129.667-157 chr7 10147245 10147472 + 0.666667 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 513088 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 149.333-92 chr12 50036457 50036759 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -11051 NM_001320007 29127 Hs.505469 NM_013277 ENSG00000161800 RACGAP1 CYK4|HsCYK-4|ID-GAP|MgcRacGAP Rac GTPase activating protein 1 protein-coding 161.667-34 chr11 12670151 12670497 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -4097 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 126.333-60 chr15 64658515 64658809 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 44619 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 129-48 chr17 74676311 74676547 + 0.666667 NA intron (NM_175738, intron 1 of 8) intron (NM_175738, intron 1 of 8) 5298 NM_175738 326624 Hs.351413 NM_175738 ENSG00000172794 RAB37 - RAB37, member RAS oncogene family protein-coding 157.333-194 chr2 116402931 116403225 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 1059263 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 115-12 chr1 159886468 159886761 + 0.666667 NA exon (NM_012337, exon 6 of 12) exon (NM_012337, exon 6 of 12) 13465 NR_130464 100422852 NR_130464 ENSG00000266458 MIR4259 - microRNA 4259 ncRNA 150.667-327 chr6 36732444 36732720 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001257357, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001257357, exon 14 of 14) 24818 NM_001314020 57699 Hs.372129 NM_020939 ENSG00000124772 CPNE5 COPN5|CPN5 copine 5 protein-coding 136-22 chr12 131483612 131483915 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 136293 NR_103736 338797 Hs.592007 NM_001025466 LINC02370 - long intergenic non-protein coding RNA 2370 ncRNA 176-97 chr8 60595108 60595560 + 0.666667 NA intron (NM_002865, intron 6 of 7) intron (NM_002865, intron 6 of 7) 78347 NM_002865 5862 Hs.369017 NM_002865 ENSG00000104388 RAB2A LHX|RAB2 RAB2A, member RAS oncogene family protein-coding 156-99 chr4 65310221 65310530 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -305875 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 113.667-176 chr5 126610127 126610350 + 0.666667 NA intron (NM_032177, intron 3 of 4) intron (NM_032177, intron 3 of 4) 9291 NM_032177 51808 Hs.555731 NM_032177 ENSG00000164902 PHAX RNUXA phosphorylated adaptor for RNA export protein-coding 171.333-147 chr5 36352073 36352431 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50350 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 124-94 chr5 64146138 64146426 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -19561 NM_001113561 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 139.333-208 chr8 8256143 8256424 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 27713 NR_024363 286042 Hs.656318 NR_024361 ENSG00000173295 FAM86B3P - family with sequence similarity 86, member A pseudogene pseudo 114-146 chr7 32486004 32486317 + 0.666667 NA non-coding (NR_024466, exon 5 of 5) non-coding (NR_024466, exon 5 of 5) 4220 NR_024466 23658 Hs.424908 NM_012322 ENSG00000106355 LSM5 YER146W LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated protein-coding 114.333-104 chr2 69668995 69669313 + 0.666667 NA intron (NM_001320698, intron 2 of 14) AluSx|SINE|Alu 25346 NM_001320698 307 Hs.422986 NM_001153 ENSG00000196975 ANXA4 ANX4|HEL-S-274|P32.5|PAP-II|PIG28|PP4-X|ZAP36 annexin A4 protein-coding 123.333-93 chr17 73250749 73251045 + 0.666667 NA intron (NM_001129885, intron 5 of 5) intron (NM_001129885, intron 5 of 5) 10983 NM_001129885 642843 Hs.534707 NM_001129885 ENSG00000187959 CPSF4L - cleavage and polyadenylation specific factor 4 like protein-coding 134.667-177 chr6 154027976 154028324 + 0.666667 NA intron (NM_001145280, intron 1 of 3) L1M1|LINE|L1 -10952 NM_001285523 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 118-99 chr4 94761146 94761351 + 0.666667 NA intron (NM_001203, intron 1 of 12) intron (NM_001203, intron 1 of 12) 3293 NM_001203 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 244-55 chr2 76543731 76544163 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -442018 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 116.333-68 chr14 68784099 68784331 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9699 NM_001244698 677 Hs.85155 NM_004926 ENSG00000185650 ZFP36L1 BRF1|Berg36|ERF-1|ERF1|RNF162B|TIS11B|cMG1 ZFP36 ring finger protein like 1 protein-coding 115.333-139 chr3 70304004 70304208 + 0.666667 NA intron (NM_001364676, intron 2 of 4) L2b|LINE|L2 8532 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 146.333-254 chr5 44768626 44769034 + 0.666667 NA intron (NR_109865, intron 1 of 2) intron (NR_109865, intron 1 of 2) 39963 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 184.333-48 chr15 57360189 57360587 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -16117 NM_001252335 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 131.667-120 chr22 24360382 24360717 + 0.666667 NA intron (NM_015330, intron 11 of 16) intron (NM_015330, intron 11 of 16) 18441 NM_001254733 23384 Hs.474384 NM_015330 ENSG00000100014 SPECC1L CYTSA|GBBB2|OBLFC1|TBHS sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 like protein-coding 114.667-28 chr10 35320719 35321009 + 0.666667 NA intron (NM_181698, intron 3 of 11) AluJo|SINE|Alu -15645 NM_001282854 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 177.333-40 chr12 64280098 64280431 + 0.666667 NA intron (NM_001099676, intron 6 of 10) intron (NM_001099676, intron 6 of 10) -57968 NM_001300941 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 217.333-136 chr7 33116349 33116742 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -7141 NM_203288 6100 Hs.326805 NM_203288 ENSG00000164610 RP9 PAP-1|PAP1 RP9 pre-mRNA splicing factor protein-coding 158.667-173 chr2 191752844 191753247 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39795 NR_157850 729254 NR_157850 LOC729254 - hCG2045843 ncRNA 147.667-62 chr11 112848894 112849315 + 0.666667 NA Intergenic (CCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -112316 NM_001242607 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 190.333-152 chr9 115685499 115685938 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 58521 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 238-43 chr2 20037807 20038304 + 0.666667 NA intron (NM_014713, intron 2 of 6) intron (NM_014713, intron 2 of 6) 13573 NM_014713 9741 Hs.467807 NM_014713 ENSG00000068697 LAPTM4A HUMORF13|LAPTM4|MBNT|Mtrp lysosomal protein transmembrane 4 alpha protein-coding 134.333-123 chr4 35622898 35623149 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 620916 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 170.333-28 chr10 31461015 31461512 + 0.666667 NA intron (NM_001323678, intron 2 of 6) intron (NM_001323678, intron 2 of 6) -61508 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 123.667-195 chr9 37289522 37289733 + 0.666667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) L2a|LINE|L2 -133069 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 119.333-56 chr11 90252703 90253040 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) L1M3e|LINE|L1 1639 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 143.667-137 chr2 232815949 232816212 + 0.666667 NA intron (NM_015575, intron 21 of 30) intron (NM_015575, intron 21 of 30) -39515 NM_001172416 3769 Hs.467338 NM_002242 ENSG00000115474 KCNJ13 KIR1.4|KIR7.1|LCA16|SVD potassium voltage-gated channel subfamily J member 13 protein-coding 155.333-188 chr2 190173333 190173781 + 0.666667 NA intron (NM_001042521, intron 2 of 2) intron (NM_001042521, intron 2 of 2) -7306 NM_001042519 84281 Hs.389311 NM_032321 ENSG00000187699 C2orf88 smAKAP chromosome 2 open reading frame 88 protein-coding 203-115 chr9 75825918 75826373 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64499 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 117.333-95 chr2 18133253 18133555 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 254737 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 197.333-36 chr11 79874571 79875020 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -433765 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 117-29 chr11 20056535 20056771 + 0.666667 NA intron (NM_001244963, intron 21 of 39) intron (NM_001244963, intron 21 of 39) -7350 NR_046672 100874014 Hs.557916 NR_046672 ENSG00000254453 NAV2-AS2 - NAV2 antisense RNA 2 ncRNA 178-84 chr4 72312588 72312921 + 0.666667 NA intron (NM_014243, intron 12 of 21) intron (NM_014243, intron 12 of 21) 256467 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 167.667-70 chr16 19863523 19863870 + 0.666667 NA intron (NM_016235, intron 2 of 3) AluSz|SINE|Alu 21152 NM_016235 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 134-114 chr9 38287573 38287877 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104977 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 122-125 chr8 127991278 127991497 + 0.666667 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) AluY|SINE|Alu -17511 NR_031611 100302170 NR_031611 ENSG00000283200 MIR1206 MIRN1206|hsa-mir-1206 microRNA 1206 ncRNA 145.667-303 chr8 135060109 135060399 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -173877 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 163-33 chr17 2716338 2716673 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 4196 NR_136412 105371592 Hs.731739 NR_136412 ENSG00000262050 LOC105371592 - uncharacterized LOC105371592 ncRNA 111.667-75 chr13 42716690 42716906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64752 NM_182508 144809 Hs.16970 NM_182508 ENSG00000179813 FAM216B C13orf30 family with sequence similarity 216 member B protein-coding 213.667-16 chr10 63702259 63702824 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -180651 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 116-109 chr3 98636091 98636285 + 0.666667 NA Intergenic LTR45C|LTR|ERV1 -42577 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 114.333-244 chrX 88709345 88709516 + 0.666667 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -37795 NM_033048 53336 Hs.458292 NM_033048 ENSG00000147183 CPXCR1 CT77 CPX chromosome region candidate 1 protein-coding 145-129 chr9 97538285 97538713 + 0.666667 NA intron (NM_001166116, intron 2 of 9) intron (NM_001166116, intron 2 of 9) 36833 NM_003275 7111 Hs.404289 NM_003275 ENSG00000136842 TMOD1 D9S57E|ETMOD|TMOD tropomodulin 1 protein-coding 151.333-141 chr15 23845968 23846373 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -128977 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 136.667-111 chr22 35324514 35324784 + 0.666667 NA intron (NR_156428, intron 5 of 13) AluSz|SINE|Alu -10991 NR_037471 100500826 NR_037471 ENSG00000266320 MIR3909 mir-3909 microRNA 3909 ncRNA 128.667-158 chr6 63370133 63370359 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50263 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 181.333-121 chr4 61174417 61174931 + 0.666667 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 -26556 NM_001371343 120-47 chr17 56732890 56733128 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 100911 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 181.333-188 chr9 27179277 27179635 + 0.666667 NA intron (NM_001290077, intron 6 of 21) L1MEb|LINE|L1 70315 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 158-114 chr5 155664658 155665001 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 651074 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 169.667-5 chr1 77244710 77245187 + 0.666667 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 -25518 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 152.667-82 chr12 46131262 46131581 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 135095 NM_001278389 81539 Hs.533770 NM_030674 ENSG00000111371 SLC38A1 ATA1|NAT2|SAT1|SNAT1 solute carrier family 38 member 1 protein-coding 145-73 chr3 106638543 106638858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 601938 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 142.667-43 chr13 39969872 39970109 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -211819 NR_046870 100874127 Hs.578028 NR_046870 ENSG00000230710 LINC00332 NCRNA00332 long intergenic non-protein coding RNA 332 ncRNA 148.333-153 chr16 54676668 54676952 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 171423 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 148.333-422 chrX 124204397 124204674 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -128125 NM_001355534 100132015 NM_001355534 ENSG00000282419 TEX13D - TEX13 family member D protein-coding 232-89 chr8 115983671 115984109 + 0.666667 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) AluSx1|SINE|Alu -314915 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 178-85 chr4 78560623 78561028 + 0.666667 NA intron (NM_005139, intron 2 of 12) MER21C|LTR|ERVL 9055 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 210-13 chr1 202317081 202317528 + 0.666667 NA intron (NM_001017403, intron 17 of 17) intron (NM_001017403, intron 17 of 17) 24632 NM_014176 29089 Hs.5199 NM_014176 ENSG00000077152 UBE2T FANCT|HSPC150|PIG50 ubiquitin conjugating enzyme E2 T protein-coding 159.333-220 chr3 136415429 136415823 + 0.666667 NA intron (NM_005862, intron 21 of 33) AluSx1|SINE|Alu 165286 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 140.667-243 chr8 143413199 143413446 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4357 NR_126358 104326051 Hs.202140 NR_126358 ENSG00000254338 MAFA-AS1 TCONS_00014882 MAFA antisense RNA 1 ncRNA 149-15 chr10 24690060 24690417 + 0.666667 NA intron (NM_001367447, intron 2 of 24) L1ME4a|LINE|L1 32510 NM_001367454 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 120-11 chr10 33423403 33423674 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88633 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 184-15 chr11 108066903 108067381 + 0.666667 NA intron (NM_003478, intron 7 of 18) MIRb|SINE|MIR -54425 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 141.667-100 chr17 80520687 80520944 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24023 NM_001163034 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 137-43 chr2 37368972 37369250 + 0.666667 NA intron (NM_012413, intron 4 of 6) intron (NM_012413, intron 4 of 6) 24481 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 217.333-58 chr18 13013829 13014456 + 0.666667 NA intron (NM_032142, intron 5 of 44) intron (NM_032142, intron 5 of 44) 22780 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 181.333-79 chr2 138548723 138549093 + 0.666667 NA intron (NM_001001664, intron 1 of 10) L3|LINE|CR1 47138 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 136.333-137 chr4 7831203 7831593 + 0.666667 NA intron (NM_198595, intron 6 of 16) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 40910 NM_001371090 173.667-165 chr7 49481628 49482022 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -291813 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 202.667-39 chr12 45833425 45833819 + 0.666667 NA intron (NM_152641, intron 6 of 20) L1ME3A|LINE|L1 103913 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 154-124 chr6 81868541 81868941 + 0.666667 NA intron (NR_149135, intron 3 of 3) intron (NR_149135, intron 3 of 3) -54549 NR_126363 101928770 Hs.586239 NR_126363 ENSG00000224995 LINC01526 Lnc-FAM46A-1 long intergenic non-protein coding RNA 1526 ncRNA 117.333-141 chr3 187296338 187296628 + 0.666667 NA non-coding (NR_135551, exon 2 of 2) non-coding (NR_135551, exon 2 of 2) -4461 NM_139125 5648 Hs.89983 NM_001879 ENSG00000127241 MASP1 3MC1|CRARF|CRARF1|MAP1|MASP|MASP3|MAp44|PRSS5|RaRF mannan binding lectin serine peptidase 1 protein-coding 229-42 chr3 155557941 155558448 + 0.666667 NA intron (NM_001349252, intron 8 of 24) intron (NM_001349252, intron 8 of 24) 72391 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 229.667-4 chr1 116268502 116268991 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104498 NM_000701 476 Hs.371889 NM_000701 ENSG00000163399 ATP1A1 CMT2DD|HOMGSMR2 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1 protein-coding 172.333-139 chr5 68444692 68445079 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 152308 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 137.333-48 chr14 69306660 69306992 + 0.666667 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) L1ME4c|LINE|L1 46668 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 177-10 chr11 28490236 28490557 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12848 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 212.333-31 chr12 28490582 28490975 + 0.666667 NA intron (NM_001352082, intron 13 of 13) intron (NM_001352082, intron 13 of 13) -300040 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 124.667-219 chrX 73317240 73317465 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -102501 NM_021963 4674 Hs.66180 NM_021963 ENSG00000186462 NAP1L2 BPX nucleosome assembly protein 1 like 2 protein-coding 137-12 chr10 86489924 86490283 + 0.666667 NA intron (NM_001318328, intron 4 of 18) AluSz|SINE|Alu 31681 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 189.667-138 chr8 58958610 58959012 + 0.666667 NA intron (NM_014729, intron 2 of 8) intron (NM_014729, intron 2 of 8) 160336 NM_014729 9760 Hs.491805 NM_014729 ENSG00000198846 TOX TOX1 thymocyte selection associated high mobility group box protein-coding 194.333-69 chr2 76660288 76660742 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -325450 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 130.333-150 chr4 74043762 74044047 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5215 NM_002090 2921 Hs.89690 NM_002090 ENSG00000163734 CXCL3 CINC-2b|GRO3|GROg|MIP-2b|MIP2B|SCYB3 C-X-C motif chemokine ligand 3 protein-coding 116.667-95 chr2 56879103 56879316 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -693439 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 113.667-210 chr8 109277644 109277901 + 0.666667 NA intron (NM_032869, intron 6 of 9) intron (NM_032869, intron 6 of 9) 52161 NM_001128211 84955 Hs.380291 NM_032869 ENSG00000120526 NUDCD1 CML66|OVA66 NudC domain containing 1 protein-coding 275.667-37 chr22 26344381 26344945 + 0.666667 NA intron (NM_001184776, intron 10 of 14) intron (NM_001184776, intron 10 of 14) -84597 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 153.667-372 chr8 37078262 37078535 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 294024 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 201.667-131 chr9 94067455 94067983 + 0.666667 NA intron (NM_177995, intron 2 of 9) AluSz6|SINE|Alu -16710 NM_152422 138639 Hs.437943 NM_152422 ENSG00000158079 PTPDC1 PTP9Q22 protein tyrosine phosphatase domain containing 1 protein-coding 208-38 chr12 114878713 114879147 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -194755 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 204.667-41 chr14 59168437 59168912 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -19993 NM_001270520 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 126.333-55 chr15 34869434 34869802 + 0.666667 NA intron (NM_014691, intron 31 of 34) intron (NM_014691, intron 31 of 34) -74069 NM_005159 70 Hs.118127 NM_005159 ENSG00000159251 ACTC1 ACTC|ASD5|CMD1R|CMH11|LVNC4 actin alpha cardiac muscle 1 protein-coding 255.667-80 chr7 127232631 127233196 + 0.666667 NA intron (NR_163850, intron 1 of 9) AluSg|SINE|Alu 10602 NR_028041 2918 Hs.449625 NM_000845 ENSG00000179603 GRM8 GLUR8|GPRC1H|MGLUR8|mGlu8 glutamate metabotropic receptor 8 protein-coding 138-98 chr6 57203964 57204308 + 0.666667 NA intron (NM_001278667, intron 3 of 6) intron (NM_001278667, intron 3 of 6) 17325 NM_001278668 51715 Hs.555016 NM_016277 ENSG00000112210 RAB23 HSPC137 RAB23, member RAS oncogene family protein-coding 142.333-162 chr3 90013086 90013410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 905627 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 149.667-95 chr12 67204707 67204986 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64512 NM_018448 55832 Hs.546407 NM_018448 ENSG00000111530 CAND1 TIP120|TIP120A cullin associated and neddylation dissociated 1 protein-coding 162-40 chr14 53650661 53650996 + 0.666667 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR 297656 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 130-106 chr6 33651290 33651578 + 0.666667 NA intron (NM_002224, intron 2 of 57) intron (NM_002224, intron 2 of 57) -17689 NR_134628 101929188 Hs.658327 NR_134628 LOC101929188 - uncharacterized LOC101929188 ncRNA 119.333-120 chr2 14188656 14188966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 212147 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 128.333-131 chr3 110059734 110059997 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 457037 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 155.667-326 chr7 29292568 29292878 + 0.666667 NA intron (NM_001293072, intron 1 of 12) intron (NM_001293072, intron 1 of 12) -83753 NR_120522 102724484 Hs.638665 NR_120522 LOC102724484 - uncharacterized LOC102724484 ncRNA 125-13 chr10 39148997 39149222 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 452513 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 186.667-34 chr14 21987397 21987809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -316586 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 149.667-5 chr1 30593655 30593940 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -124975 NR_034182 100129196 Hs.659751 NR_034182 ENSG00000186056 MATN1-AS1 - MATN1 antisense RNA 1 ncRNA 134-35 chr16 54581688 54582021 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -211155 NR_134923 100996345 Hs.112680 NR_134922 ENSG00000261803 LINC02140 - long intergenic non-protein coding RNA 2140 ncRNA 162.667-58 chr12 64293354 64293768 + 0.666667 NA intron (NM_001099676, intron 4 of 10) MIR|SINE|MIR -71265 NM_001300941 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 128.333-107 chr2 122282588 122282814 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 527050 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 172-70 chr22 25957539 25957904 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 39 of 43) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -211741 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 199-31 chr15 79335867 79336368 + 0.666667 NA intron (NM_001330376, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 25005 NM_001301203 23423 Hs.71608 NM_007364 ENSG00000166557 TMED3 C15orf22|P24B|p24g4|p24gamma4|p26 transmembrane p24 trafficking protein 3 protein-coding 224-98 chr7 38111682 38112320 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66244 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 146-134 chr8 42453330 42453629 + 0.666667 NA intron (NM_006749, intron 5 of 10) intron (NM_006749, intron 5 of 10) 47752 NM_001257180 6575 Hs.653173 NM_006749 ENSG00000168575 SLC20A2 GLVR-2|GLVR2|IBGC1|IBGC3|MLVAR|PIT-2|PIT2|RAM1|Ram-1 solute carrier family 20 member 2 protein-coding 140.333-23 chr10 5984255 5984632 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -5702 NM_001351095 3601 Hs.445124 NM_002189 ENSG00000134470 IL15RA CD215 interleukin 15 receptor subunit alpha protein-coding 151.667-98 chr13 96081425 96081804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9225 NM_153456 266722 Hs.171001 NM_153456 ENSG00000185352 HS6ST3 HS6ST-3 heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 3 protein-coding 124.333-181 chr8 129412862 129413108 + 0.666667 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) intron (NR_130920, intron 1 of 3) 71157 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 165-15 chr12 22867320 22867790 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 242384 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 150-93 chr3 44383260 44383560 + 0.666667 NA intron (NM_001282915, intron 5 of 10) L1MB3|LINE|L1 39527 NM_001351479 102724231 Hs.131918 NM_001351479 C3orf86 LINC00694 chromosome 3 open reading frame 86 protein-coding 132.667-61 chr16 6197950 6198324 + 0.666667 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) intron (NM_018723, intron 1 of 15) 178434 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 124.667 chr1 9936824 9937047 + 0.666667 NA intron (NM_001316974, intron 2 of 7) AluSc8|SINE|Alu -5988 NM_001297778 64802 Hs.633762 NM_022787 ENSG00000173614 NMNAT1 LCA9|NMNAT|PNAT1 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 protein-coding 189.667-12 chr1 223644242 223644566 + 0.666667 NA intron (NM_001143962, intron 2 of 20) intron (NM_001143962, intron 2 of 20) 21297 NM_001143962 388743 Hs.291487 NM_001143962 ENSG00000203697 CAPN8 nCL-2 calpain 8 protein-coding 136-92 chr6 46631178 46631457 + 0.666667 NA intron (NM_016593, intron 5 of 11) MIR|SINE|MIR 21501 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 151.667-155 chr18 49040768 49041201 + 0.666667 NA TTS (NM_017653) TTS (NM_017653) 8784 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 115-95 chr2 176519921 176520180 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 81002 NR_031648 100302142 NR_031648 ENSG00000283203 MIR1246 MIRN1246|hsa-mir-1246 microRNA 1246 ncRNA 189.667-75 chr2 117895737 117896040 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 62157 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 148.333-236 chr21 34756387 34756720 + 0.666667 NA intron (NR_038885, intron 1 of 2) intron (NR_038885, intron 1 of 2) 10728 NR_038886 100506385 Hs.120179 NR_038885 ENSG00000234380 LINC01426 lincRNA-uc002yug.2 long intergenic non-protein coding RNA 1426 ncRNA 112.333-52 chr12 46884169 46884378 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -58276 NM_001143824 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 198.667-66 chr14 92481168 92481586 + 0.666667 NA intron (NM_153647, intron 13 of 17) L1MB7|LINE|L1 -32404 NM_024832 79890 Hs.326822 NM_024832 ENSG00000100599 RIN3 - Ras and Rab interactor 3 protein-coding 184-105 chr7 89339590 89339961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -544038 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 138.333-99 chr2 158973529 158973808 + 0.666667 NA intron (NM_001350065, intron 1 of 27) intron (NM_001350065, intron 1 of 27) 5028 NR_146421 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 112-41 chr12 12910220 12910467 + 0.666667 NA intron (NM_003979, intron 2 of 3) intron (NM_003979, intron 2 of 3) -5486 NR_030345 693199 NR_030345 ENSG00000283759 MIR614 MIRN614|hsa-mir-614 microRNA 614 ncRNA 123.333-39 chr10 81602360 81602600 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -272714 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 198-93 chr2 78776644 78777150 + 0.666667 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 231366 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 113-183 chr6 73804176 73804445 + 0.666667 NA intron (NM_001159588, intron 23 of 31) intron (NM_001159588, intron 23 of 31) 108107 NM_133493 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 245.667-15 chr13 113411082 113411641 + 0.666667 NA intron (NM_001304433, intron 1 of 1) intron (NM_001304433, intron 1 of 1) 3032 NM_001304433 101928841 Hs.646609 NM_001003399 LOC101928841 - collagen alpha-1(II) chain-like protein-coding 165.333-144 chr20 47199292 47199698 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 32528 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 157.667-96 chr13 108182172 108182491 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 32451 NM_002312 3981 Hs.166091 NM_002312 ENSG00000174405 LIG4 LIG4S DNA ligase 4 protein-coding 150.333-319 chr5 19362073 19362490 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 523991 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 132.333-158 chr6 150683662 150683921 + 0.666667 NA exon (NM_001329798, exon 1 of 16) exon (NM_001329798, exon 1 of 16) 144 NM_001329798 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 162.667-183 chr3 169238918 169239289 + 0.666667 NA intron (NM_001205194, intron 1 of 15) intron (NM_001205194, intron 1 of 15) -91632 NM_001164000 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 121.667-139 chr4 62177793 62178005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16134 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 129.333-115 chr3 18012712 18013036 + 0.666667 NA intron (NR_161333, intron 1 of 4) (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 50322 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 137.667-193 chr9 101396407 101396633 + 0.666667 NA intron (NM_019051, intron 1 of 1) L1MA6|LINE|L1 2098 NM_019051 54534 Hs.288224 NM_019051 ENSG00000136897 MRPL50 MRP-L50 mitochondrial ribosomal protein L50 protein-coding 170-106 chr6 41062834 41063193 + 0.666667 NA intron (NM_006789, intron 2 of 2) intron (NM_006789, intron 2 of 2) 8827 NM_001329696 221443 Hs.227457 NM_145063 ENSG00000124596 OARD1 C6orf130|TARG1|dJ34B21.3 O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 protein-coding 173.667-192 chr9 83733256 83733610 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 25102 NR_135840 105376114 Hs.9589 NR_135839 ENSG00000254473 LOC105376114 - uncharacterized LOC105376114 ncRNA 134.333-181 chr8 127067567 127067855 + 0.666667 NA Intergenic MER92B|LTR|ERV1 -12163 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 162-20 chr10 109405229 109405638 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 517813 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 122-43 chr15 94480918 94481278 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001159643, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001159643, exon 20 of 20) 125168 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 166.667-135 chr20 61460821 61461160 + 0.666667 NA intron (NM_001794, intron 2 of 15) intron (NM_001794, intron 2 of 15) -38431 NM_001252338 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 187-46 chr20 51952913 51953360 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90223 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 166.667-29 chr10 110595038 110595365 + 0.666667 NA intron (NM_005445, intron 18 of 28) AluSp|SINE|Alu 27510 NM_005445 9126 Hs.24485 NM_005445 ENSG00000108055 SMC3 BAM|BMH|CDLS3|CSPG6|HCAP|SMC3L1 structural maintenance of chromosomes 3 protein-coding 309.333-53 chr5 23843417 23844150 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -107565 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 114-6 chr1 113858407 113858615 + 0.666667 NA exon (NM_001193431, exon 4 of 21) exon (NM_001193431, exon 4 of 21) 1876 NR_037864 100287722 Hs.664669 NR_037864 ENSG00000226167 AP4B1-AS1 - AP4B1 antisense RNA 1 ncRNA 148.333-228 chr20 49364737 49365111 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004975, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_004975, exon 2 of 2) 84241 NR_003030 692057 NR_003030 ENSG00000212304 SNORD12 HBII-99|MIR1259|MIRN1259 small nucleolar RNA, C/D box 12 snoRNA 120.333-164 chr6 96610508 96610781 + 0.666667 NA exon (NM_001322466, exon 5 of 6) exon (NM_001322466, exon 5 of 6) 47519 NM_001322467 9457 Hs.632608 NM_020482 ENSG00000112214 FHL5 1700027G07Rik|ACT|FHL-5|dJ393D12.2 four and a half LIM domains 5 protein-coding 196-12 chr1 226466926 226467377 + 0.666667 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -59058 NM_001618 142 Hs.177766 NM_001618 ENSG00000143799 PARP1 ADPRT|ADPRT 1|ADPRT1|ARTD1|PARP|PARP-1|PPOL|pADPRT-1 poly(ADP-ribose) polymerase 1 protein-coding 134.333-54 chr14 80324730 80325085 + 0.666667 NA intron (NR_038355, intron 2 of 8) intron (NR_038355, intron 2 of 8) -93850 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 130-40 chr15 61753121 61753450 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 23367 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 117.333-146 chr4 43381051 43381243 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 111396 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 136.333-205 chr8 77439422 77439791 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -11091 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 156.333-248 chr3 136539453 136539813 + 0.666667 NA intron (NM_005862, intron 6 of 33) intron (NM_005862, intron 6 of 33) 212745 NM_005862 10274 Hs.412586 NM_005862 ENSG00000118007 STAG1 MRD47|SA1|SCC3A stromal antigen 1 protein-coding 136.333-163 chr5 31800584 31800824 + 0.666667 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) MER77|LTR|ERVL 135455 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 116.333-150 chr3 189975741 189975952 + 0.666667 NA intron (NM_018192, intron 8 of 14) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 145051 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 122-123 chr8 121851742 121852061 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -210461 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 194-80 chr2 144963336 144963783 + 0.666667 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) intron (NR_033870, intron 3 of 4) 295592 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 150.333-308 chr4 97302802 97303217 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -63917 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-352 chr6 25121554 25121972 + 0.666667 NA intron (NR_027626, intron 2 of 6) intron (NR_027626, intron 2 of 6) 16060 NR_002174 8418 Hs.484918 NR_002174 ENSG00000168405 CMAHP CMAH|CSAH cytidine monophospho-N-acetylneuraminic acid hydroxylase, pseudogene pseudo 143-59 chr19 7128418 7128721 + 0.666667 NA intron (NM_001079817, intron 14 of 20) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 58866 NM_001044388 79230 Hs.591380 NM_024341 ENSG00000130544 ZNF557 - zinc finger protein 557 protein-coding 123-88 chr4 73468272 73468497 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -13361 NM_001133 173 Hs.168718 NM_001133 ENSG00000079557 AFM ALB2|ALBA|ALF afamin protein-coding 122.667-3 chr1 44175690 44175907 + 0.666667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 -34167 NM_001358438 105378952 NM_001358438 ENSG00000283039 KLF18 - Kruppel like factor 18 protein-coding 129.333-118 chr3 25269821 25270137 + 0.666667 NA intron (NM_001290216, intron 4 of 10) L1MB3|LINE|L1 -70823 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 113.667-9 chr1 88749778 88749963 + 0.666667 NA intron (NM_006256, intron 2 of 21) intron (NM_006256, intron 2 of 21) -64666 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 203.667-24 chr12 41241662 41242111 + 0.666667 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) MLT2F|LTR|ERVL 53566 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 153.333-242 chr20 46163332 46163771 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 45237 NR_126502 958 Hs.472860 NM_001250 ENSG00000101017 CD40 Bp50|CDW40|TNFRSF5|p50 CD40 molecule protein-coding 130-90 chr5 33563352 33563608 + 0.666667 NA intron (NM_001324512, intron 17 of 21) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 122704 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 174-7 chr10 31432017 31432303 + 0.666667 NA intron (NM_001323646, intron 4 of 11) MER3|DNA|hAT-Charlie -32405 NM_001368169 100505502 Hs.730227 NM_001368169 LOC100505502 - putative UPF0607 protein FLJ37424 protein-coding 117.667-64 chr16 54691190 54691389 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 156944 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 118 chr1 77968116 77968317 + 0.666667 NA intron (NM_003902, intron 2 of 19) intron (NM_003902, intron 2 of 19) 10856 NR_130152 8880 Hs.567380 NM_003902 ENSG00000162613 FUBP1 FBP|FUBP|hDH V far upstream element binding protein 1 protein-coding 192-30 chr11 26049216 26049628 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -139701 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 179.667-153 chr9 118214273 118214771 + 0.666667 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie -465149 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 131-17 chr10 110647323 110647668 + 0.666667 NA intron (NM_001134363, intron 1 of 13) intron (NM_001134363, intron 1 of 13) 3159 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 148.667-57 chr10 95747381 95747808 + 0.666667 NA intron (NM_001098175, intron 1 of 9) intron (NM_001098175, intron 1 of 9) -8058 NM_001164181 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 195.333-140 chr3 23740739 23741132 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -65020 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 128-55 chr2 232767788 232768118 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001172417, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001172417, exon 3 of 3) 8612 NM_002242 3769 Hs.467338 NM_002242 ENSG00000115474 KCNJ13 KIR1.4|KIR7.1|LCA16|SVD potassium voltage-gated channel subfamily J member 13 protein-coding 190.666-20 chr14 75763191 75763754 + 0.666667 NA intron (NM_015072, intron 18 of 31) intron (NM_015072, intron 18 of 31) 102226 NM_015072 23093 Hs.709609 NM_015072 ENSG00000119685 TTLL5 CORD19|KIAA0998|STAMP tubulin tyrosine ligase like 5 protein-coding 195.667-144 chr8 100242279 100242671 + 0.666667 NA TTS (NM_172218) TTS (NM_172218) 59718 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 190.667-100 chr5 52303731 52304134 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 295901 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 121.333-59 chr15 26449016 26449231 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 179967 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 203.333-145 chr2 167622107 167622563 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -196337 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 261-61 chr9 102471767 102472396 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47556 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 138.667-208 chr8 109193238 109193475 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106728 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 128.667-3 chr1 46525810 46526091 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 9565 NM_001357063 105378696 NM_001357063 ENSG00000282881 TMEM275 - transmembrane protein 275 protein-coding 162.333 chr1 19465030 19465342 + 0.666667 NA intron (NM_001206541, intron 1 of 8) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 19109 NM_001282162 832 Hs.432760 NM_004930 ENSG00000077549 CAPZB CAPB|CAPPB|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit beta protein-coding 148.667-398 chr9 107828968 107829255 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -339342 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 165.333-189 chr4 74023714 74024083 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14791 NM_002090 2921 Hs.89690 NM_002090 ENSG00000163734 CXCL3 CINC-2b|GRO3|GROg|MIP-2b|MIP2B|SCYB3 C-X-C motif chemokine ligand 3 protein-coding 126-109 chr8 30164398 30164708 + 0.666667 NA intron (NM_006571, intron 2 of 6) MIRb|SINE|MIR 8184 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 165-51 chr3 33252141 33252621 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -24644 NM_001349323 25827 Hs.475872 NM_012157 ENSG00000153558 FBXL2 FBL2|FBL3 F-box and leucine rich repeat protein 2 protein-coding 116.667-132 chr3 99978128 99978425 + 0.666667 NA intron (NM_001042459, intron 1 of 4) L1MA5|LINE|L1 -13878 NR_037486 100500859 NR_037486 ENSG00000264897 MIR3921 - microRNA 3921 ncRNA 190.333-155 chrX 64224063 64224492 + 0.666667 NA TTS (NM_130388) TTS (NM_130388) 6330 NM_130388 142689 Hs.56281 NM_130388 ENSG00000198881 ASB12 - ankyrin repeat and SOCS box containing 12 protein-coding 145.667-39 chr10 108061660 108062012 + 0.666667 NA intron (NR_125760, intron 1 of 4) intron (NR_125760, intron 1 of 4) 7457 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 121-6 chr1 108562847 108563091 + 0.666667 NA intron (NM_001010883, intron 1 of 10) intron (NM_001010883, intron 1 of 10) 2869 NM_001010883 284611 Hs.200230 NM_001010883 ENSG00000162636 FAM102B SYM-3B family with sequence similarity 102 member B protein-coding 116.333-183 chr5 162908269 162908534 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -529170 NR_157056 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 147-78 chr2 226517046 226517440 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141550 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 113.667-80 chr17 48378945 48379196 + 0.666667 NA intron (NM_001075099, intron 2 of 12) intron (NM_001075099, intron 2 of 12) 51144 NM_003726 8631 Hs.316931 NM_003726 ENSG00000141293 SKAP1 HEL-S-81p|SCAP1|SKAP55 src kinase associated phosphoprotein 1 protein-coding 215.667-56 chr2 15364973 15365466 + 0.666667 NA intron (NR_052013, intron 32 of 50) intron (NR_052013, intron 32 of 50) 196115 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 112-188 chr7 14539320 14539506 + 0.666667 NA intron (NM_001350717, intron 19 of 24) intron (NM_001350717, intron 19 of 24) 302037 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 166.333-72 chr14 63629004 63629443 + 0.666667 NA intron (NM_080666, intron 1 of 2) intron (NM_080666, intron 1 of 2) 12648 NM_080666 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 128.333-137 chr4 53985111 53985366 + 0.666667 NA TTS (NR_027153) TTS (NR_027153) 2044 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 153-134 chr7 99949942 99950394 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -20548 NM_181538 349149 Hs.647524 NM_181538 ENSG00000176402 GJC3 CX29|CX30.2|CX31.3|GJE1 gap junction protein gamma 3 protein-coding 174-82 chr5 144586053 144586543 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 380907 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 191-25 chr18 53911107 53911476 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 311121 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 112.333-276 chr9 36833056 36833296 + 0.666667 NA TTS (NR_104000) TTS (NR_104000) -9577 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 152-32 chr11 47834206 47834496 + 0.666667 NA intron (NM_015231, intron 7 of 35) intron (NM_015231, intron 7 of 35) 13999 NR_134636 23279 Hs.643526 NM_015231 ENSG00000030066 NUP160 NPHS19 nucleoporin 160 protein-coding 120.667-142 chr5 95526330 95526648 + 0.666667 NA intron (NM_014639, intron 13 of 42) AluSz|SINE|Alu 28516 NM_014639 9652 Hs.482868 NM_014639 ENSG00000198677 TTC37 KIAA0372|Ski3|THES tetratricopeptide repeat domain 37 protein-coding 112.333-259 chr8 60186002 60186284 + 0.666667 NA non-coding (NR_135821, exon 10 of 10) non-coding (NR_135821, exon 10 of 10) 95257 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 155.667-21 chr1 159182982 159183300 + 0.666667 NA intron (NM_001127173, intron 1 of 8) intron (NM_001127173, intron 1 of 8) 11526 NM_001127173 57863 Hs.365689 NM_021189 ENSG00000162706 CADM3 BIgR|IGSF4B|NECL1|Necl-1|TSLL1|synCAM3 cell adhesion molecule 3 protein-coding 173.333-49 chr13 36325927 36326370 + 0.666667 NA intron (NM_015087, intron 5 of 8) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 20246 NM_015087 23111 Hs.440414 NM_015087 ENSG00000133104 SPART SPG20|TAHCCP1 spartin protein-coding 128.333-196 chr8 118302427 118302782 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -190785 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 153.667-157 chr17 74019994 74020374 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -183494 NM_001035258 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 197-44 chr17 52299156 52299475 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91207 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 116-37 chr14 54504415 54504723 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5337 NM_006568 10668 Hs.59106 NM_006568 ENSG00000100532 CGRRF1 CGR19|RNF197 cell growth regulator with ring finger domain 1 protein-coding 150.667-254 chr4 30210468 30210915 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -509678 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 174.667-52 chr14 61960754 61961105 + 0.666667 NA intron (NM_001367663, intron 1 of 7) L1PA15|LINE|L1 33234 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 193.667-95 chr4 107596494 107596887 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 123544 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 154-151 chr9 69742439 69742730 + 0.666667 NA intron (NR_159517, intron 1 of 5) L1M5|LINE|L1 17427 NR_159517 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 170.667-18 chr10 50413460 50413821 + 0.666667 NA intron (NM_147156, intron 6 of 10) MER20|DNA|hAT-Charlie -165030 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 269.333-19 chr14 24864230 24864983 + 0.666667 NA intron (NM_001351943, intron 3 of 6) intron (NM_001351943, intron 3 of 6) 184394 NM_001304477 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 122.333-53 chr14 25375840 25376064 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -325655 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 122.333-184 chr6 64524019 64524279 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) 717313 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 143.333-108 chr16 2067027 2067358 + 0.666667 NA intron (NM_021055, intron 16 of 40) AluJr|SINE|Alu 18990 NM_001318832 7249 Hs.90303 NM_000548 ENSG00000103197 TSC2 LAM|PPP1R160|TSC4 TSC complex subunit 2 protein-coding 138.667-140 chr3 152278528 152278812 + 0.666667 NA intron (NM_001314057, intron 1 of 11) intron (NM_001314057, intron 1 of 11) -9044 NR_027037 401093 Hs.725347 NR_027037 ENSG00000229619 MBNL1-AS1 - MBNL1 antisense RNA 1 ncRNA 182.333-27 chr11 73570786 73571177 + 0.666667 NA intron (NM_001286051, intron 1 of 5) intron (NM_001286051, intron 1 of 5) 27131 NM_015159 23201 Hs.475334 NM_015159 ENSG00000054965 FAM168A KIAA0280|TCRP1 family with sequence similarity 168 member A protein-coding 164.333-84 chr16 69701695 69702018 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_006599, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_006599, exon 14 of 14) 6819 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 301-23 chr2 225629901 225630617 + 0.666667 NA intron (NM_001371273, intron 6 of 7) intron (NM_001371273, intron 6 of 7) 229373 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 223-72 chrX 152380776 152381244 + 0.666667 NA intron (NM_000808, intron 1 of 9) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR 11289 NR_029521 406897 NR_029521 ENSG00000207957 MIR105-1 MIRN105-1|mir-105-1 microRNA 105-1 ncRNA 220.667-67 chr3 179595076 179595640 + 0.666667 NA intron (NM_020409, intron 4 of 6) intron (NM_020409, intron 4 of 6) 9280 NM_020409 57129 Hs.283734 NM_020409 ENSG00000136522 MRPL47 CGI-204|L47mt|MRP-L47|NCM1 mitochondrial ribosomal protein L47 protein-coding 116.333-61 chr13 111211332 111211612 + 0.666667 NA intron (NM_001330597, intron 4 of 18) intron (NM_001330597, intron 4 of 18) 8412 NM_001320853 8874 Hs.508738 NM_003899 ENSG00000102606 ARHGEF7 BETA-PIX|COOL-1|COOL1|Nbla10314|P50|P50BP|P85|P85COOL1|P85SPR|PAK3|PIXB Rho guanine nucleotide exchange factor 7 protein-coding 140-66 chr2 174078329 174078689 + 0.666667 NA intron (NM_001011708, intron 9 of 9) intron (NM_001011708, intron 9 of 9) 53229 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 148.333-264 chr3 168462842 168463085 + 0.666667 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) L1M4c|LINE|L1 -88891 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 149-87 chr22 33532384 33532686 + 0.666667 NA intron (NM_133642, intron 6 of 14) MIRb|SINE|MIR -95866 NR_039921 100616295 NR_039921 ENSG00000266012 MIR4764 - microRNA 4764 ncRNA 120.333-142 chr4 75571828 75572084 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 15890 NR_046429 152816 Hs.24510 NM_178497 ENSG00000174792 ODAPH AI2A4|C4orf26 odontogenesis associated phosphoprotein protein-coding 229.333-120 chr8 117084914 117085512 + 0.666667 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR -49782 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 206.667-78 chr21 37075433 37075933 + 0.666667 NA intron (NM_001353936, intron 1 of 36) intron (NM_001353936, intron 1 of 36) 2429 NM_001353937 7267 Hs.368214 NM_003316 ENSG00000182670 TTC3 DCRR1|RNF105|TPRDIII tetratricopeptide repeat domain 3 protein-coding 139-8 chr1 217911546 217911810 + 0.666667 NA intron (NR_048550, intron 1 of 3) intron (NR_048550, intron 1 of 3) 18778 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 145.333-214 chr4 48225839 48226171 + 0.666667 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) intron (NM_003215, intron 2 of 17) 43833 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 172.667-108 chr4 64518053 64518383 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -108758 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 138.667-61 chr14 63710586 63710934 + 0.666667 NA intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 intron (NM_030791, intron 1 of 2).2 17305 NM_030791 81537 Hs.24678 NM_030791 ENSG00000126821 SGPP1 SPP-1|SPPase1 sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 protein-coding 122 chr1 34965394 34965700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13159 NR_037869 653160 Hs.533986 NR_037869 ENSG00000241014 LOC653160 - uncharacterized LOC653160 ncRNA 159-31 chr12 98168576 98168897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -173288 NR_036189 100422924 NR_036189 ENSG00000263890 MIR4303 - microRNA 4303 ncRNA 112-68 chr15 63510843 63511094 + 0.666667 NA intron (NM_001256702, intron 1 of 13) intron (NM_001256702, intron 1 of 13) 6375 NR_046342 9960 Hs.458499 NM_006537 ENSG00000140455 USP3 SIH003|UBP ubiquitin specific peptidase 3 protein-coding 137.333-141 chr4 130477996 130478304 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 101789 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 219.667-11 chr10 119582838 119583194 + 0.666667 NA intron (NM_001323970, intron 3 of 12) intron (NM_001323970, intron 3 of 12) 14013 NM_001033925 7073 Hs.501203 NM_003252 ENSG00000151923 TIAL1 TCBP|TIAR TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 protein-coding 216.667-21 chr11 79765479 79765952 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -324685 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 119.333-5 chr1 42274125 42274331 + 0.666667 NA intron (NM_001198850, intron 3 of 12) intron (NM_001198850, intron 3 of 12) 60727 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 120-150 chrX 81077646 81077848 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 124166 NM_030763 79366 Hs.282204 NM_030763 ENSG00000198157 HMGN5 NBP-45|NSBP1 high mobility group nucleosome binding domain 5 protein-coding 233.333-119 chr7 26220958 26221629 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 19548 NM_016587 11335 Hs.381189 NM_007276 ENSG00000122565 CBX3 HECH|HP1-GAMMA|HP1Hs-gamma chromobox 3 protein-coding 141-18 chr12 26686181 26686599 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 11 of 56) intron (NM_002223, intron 11 of 56) 146804 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 125-6 chr1 152438680 152438993 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -24573 NM_016190 49860 Hs.242057 NM_016190 ENSG00000143536 CRNN C1orf10|DRC1|PDRC1|SEP53 cornulin protein-coding 117.667-162 chr6 41480800 41480996 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -21546 NR_120347 103106903 Hs.563396 NR_120347 ENSG00000226917 LINC01276 - long intergenic non-protein coding RNA 1276 ncRNA 138-13 chr10 29719997 29720218 + 0.666667 NA intron (NM_001323599, intron 1 of 38) AluJo|SINE|Alu 15694 NM_003174 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 121.667-55 chr14 46437271 46437495 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L1MEd|LINE|L1 -33976 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 165-59 chr3 174633117 174633478 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -226037 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 170.333-190 chr6 144611962 144612317 + 0.666667 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) L1MA7|LINE|L1 206484 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 150.667-156 chr18 4962339 4962641 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -118692 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 113.333-21 chr1 238492771 238493055 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6896 NR_015407 339535 Hs.532047 NR_015407 ENSG00000215808 LINC01139 LINK-A|LINKA long intergenic non-protein coding RNA 1139 ncRNA 155.333-84 chr12 116304973 116305379 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27990 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 122.667-170 chr7 11106030 11106294 + 0.666667 NA non-coding (NR_033435, exon 16 of 16) non-coding (NR_033435, exon 16 of 16) 132290 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 232.666-52 chr9 104424662 104425328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79268 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 202.667-75 chr18 71321130 71321650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 257566 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 140.667-137 chr21 31743414 31743756 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11467 NM_001145445 57466 Hs.17255 NM_020706 ENSG00000156304 SCAF4 SFRS15|SRA4 SR-related CTD associated factor 4 protein-coding 145.333-40 chr10 73492643 73492922 + 0.666667 NA intron (NM_001289969, intron 1 of 12) intron (NM_001289969, intron 1 of 12) -2970 NR_132103 101929145 Hs.434502 NR_132103 ENSG00000221817 PPP3CB-AS1 USP54-AS1 PPP3CB antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 118.667-66 chr14 49382316 49382597 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 203924 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 167-108 chr8 138771791 138772099 + 0.666667 NA intron (NM_152888, intron 16 of 64) intron (NM_152888, intron 16 of 64) 142096 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 175.667-30 chr12 72968293 72968674 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190707 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 158.667-359 chrX 45731793 45732106 + 0.666667 NA TTS (NR_102268) TTS (NR_102268) 861 NR_102268 392452 Hs.745266 NR_102268 LOC392452 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 168 chr1 24644347 24644698 + 0.666667 NA intron (NM_001366597, intron 1 of 17) intron (NM_001366597, intron 1 of 17) 943 NM_001366596 10250 Hs.18192 NM_005839 ENSG00000133226 SRRM1 160-KD|POP101|SRM160 serine and arginine repetitive matrix 1 protein-coding 117.333-219 chr9 29558915 29559180 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -345446 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 157.333-85 chr12 51710305 51710700 + 0.666667 NA intron (NM_001369788, intron 11 of 25) AluJr|SINE|Alu 119266 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 120.667-147 chr5 174667740 174668095 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56665 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 180.333-81 chr3 110678901 110679371 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 390823 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 118.667-54 chr12 33043440 33043760 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -146754 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 145-46 chr2 31542007 31542290 + 0.666667 NA intron (NM_000348, intron 1 of 4) L1M1|LINE|L1 38790 NM_000348 6716 Hs.458345 NM_000348 ENSG00000277893 SRD5A2 - steroid 5 alpha-reductase 2 protein-coding 165.333-89 chr15 95298392 95298666 + 0.666667 NA intron (NR_034095, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 28571 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 155.667-105 chr14 82435924 82436256 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -206542 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 149.667-126 chr14 79226515 79226927 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) 26739 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 112.667-193 chr4 72834942 72835168 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 234661 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 205-57 chr22 41918527 41918854 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3595 NM_001207020 440829 Hs.526704 NM_001207020 ENSG00000234965 SHISA8 C22orf17|Orf26 shisa family member 8 protein-coding 199.333-193 chr4 3080244 3080718 + 0.666667 NA intron (NM_002111, intron 1 of 66) L1M4|LINE|L1 5800 NM_002111 3064 Hs.518450 NM_002111 ENSG00000197386 HTT HD|IT15|LOMARS huntingtin protein-coding 112-160 chr4 169699016 169699254 + 0.666667 NA intron (NM_173872, intron 9 of 13) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 39073 NM_001243374 1182 Hs.481186 NM_001829 ENSG00000109572 CLCN3 CLC3|ClC-3 chloride voltage-gated channel 3 protein-coding 202.667-77 chr2 26166309 26166763 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6552 NM_001168241 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 131-16 chr10 105149355 105149632 + 0.666667 NA intron (NM_014978, intron 9 of 26) intron (NM_014978, intron 9 of 26) -483277 NR_104028 100505890 Hs.348526 NR_104028 ENSG00000226387 SORCS3-AS1 - SORCS3 antisense RNA 1 ncRNA 127.333-178 chr7 97273291 97273613 + 0.666667 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL 156859 NM_020186 57001 Hs.592269 NM_020186 ENSG00000196636 SDHAF3 ACN9|DC11|LYRM10|Sdh7 succinate dehydrogenase complex assembly factor 3 protein-coding 152.333-108 chr14 63899169 63899483 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) AluSx1|SINE|Alu 46322 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 127.333-189 chr8 81179475 81179812 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -67575 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 136-55 chr2 202772250 202772509 + 0.666667 NA TTS (NM_138468) TTS (NM_138468) 56855 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 117-43 chr13 100592730 100593015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4080 NM_001195087 87769 Hs.350868 NM_033110 ENSG00000134864 GGACT A2LD1 gamma-glutamylamine cyclotransferase protein-coding 158-43 chr14 54538073 54538457 + 0.666667 NA exon (NM_006568, exon 6 of 6) exon (NM_006568, exon 6 of 6) 28359 NM_006568 10668 Hs.59106 NM_006568 ENSG00000100532 CGRRF1 CGR19|RNF197 cell growth regulator with ring finger domain 1 protein-coding 178.667-83 chr2 128976738 128977169 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 112353 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 113.667-61 chr14 62978994 62979284 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 6 of 10) intron (NM_139318, intron 6 of 10) 66319 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 178-10 chr1 179266216 179266575 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -27319 NM_001252512 6646 Hs.445588 NM_003101 ENSG00000057252 SOAT1 ACACT|ACAT|ACAT-1|ACAT1|SOAT|STAT sterol O-acyltransferase 1 protein-coding 154-107 chr4 100535626 100535931 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -17756 NM_001159694 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 171.667-87 chr2 135121466 135121804 + 0.666667 NA intron (NM_001172435, intron 8 of 24) intron (NM_001172435, intron 8 of 24) -14993 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 161.333-287 chr8 99273535 99273938 + 0.666667 NA intron (NM_017890, intron 17 of 61) AluSx|SINE|Alu 260470 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 146-103 chr4 132837584 132837872 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 246639 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 153.667-61 chr11 16951773 16952112 + 0.666667 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) intron (NM_001329630, intron 3 of 26) -25920 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 153.667-204 chr2 166018392 166018823 + 0.666667 NA intron (NR_110598, intron 2 of 3) intron (NR_110598, intron 2 of 3) 61189 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 141.667-172 chr5 21632368 21632691 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 173049 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 114.667-237 chr7 30672107 30672421 + 0.666667 NA intron (NM_001202481, intron 4 of 13) intron (NM_001202481, intron 4 of 13) 10192 NM_001883 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 132.667-86 chr2 86181539 86181882 + 0.666667 NA intron (NM_006839, intron 1 of 14) intron (NM_006839, intron 1 of 14) 11398 NR_039939 100616159 NR_039939 ENSG00000265420 MIR4779 - microRNA 4779 ncRNA 118.667-147 chr4 33739566 33739867 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 300177 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 140-44 chr15 84649599 84649859 + 0.666667 NA intron (NM_032856, intron 3 of 7) AluSx|SINE|Alu 4517 NR_130944 84942 Hs.745027 NM_032856 ENSG00000177082 WDR73 GAMOS|GAMOS1|HSPC264 WD repeat domain 73 protein-coding 127.667-74 chr2 13071152 13071523 + 0.666667 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 -64324 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 138-55 chr2 33869071 33869471 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 2 of 5) LOR1a|LTR|ERV1 -141054 NR_003143 151325 Hs.528847 NM_207329 ENSG00000239649 MYADML - myeloid associated differentiation marker like (pseudogene) pseudo 143-48 chr16 11836875 11837162 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_015659, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_015659, exon 9 of 9) -8186 NR_131222 400500 Hs.24611 NR_024049 ENSG00000262117 BCAR4 - breast cancer anti-estrogen resistance 4 ncRNA 131.333-63 chr16 86634582 86634811 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 56187 NM_005250 2300 Hs.533830 NM_005250 ENSG00000176678 FOXL1 FKH6|FKHL11|FREAC7 forkhead box L1 protein-coding 138.667-12 chr1 224706981 224707245 + 0.666667 NA intron (NR_136287, intron 3 of 4) AluSz|SINE|Alu 90796 NM_152495 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 174.667-137 chr5 15002841 15003209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -131247 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 170.333-58 chr12 93590554 93590918 + 0.666667 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 18061 NM_001270471 8835 Hs.485572 NM_003877 ENSG00000120833 SOCS2 CIS2|Cish2|SOCS-2|SSI-2|SSI2|STATI2 suppressor of cytokine signaling 2 protein-coding 219.333-31 chr11 12863230 12863868 + 0.666667 NA intron (NM_021961, intron 4 of 12) intron (NM_021961, intron 4 of 12) 125999 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 277-22 chr17 65124046 65124745 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12943 NM_001165933 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 111.667-10 chr1 62373372 62373641 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -54072 NM_181712 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 159.667-24 chr1 162731622 162732046 + 0.666667 NA intron (NM_006182, intron 3 of 17) MIRb|SINE|MIR -58868 NM_016371 51478 Hs.492925 NM_016371 ENSG00000132196 HSD17B7 PRAP|SDR37C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 7 protein-coding 146-90 chr3 120570601 120571006 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -25533 NM_004547 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 150.667-266 chr4 67482714 67483022 + 0.666667 NA intron (NR_155754, intron 17 of 18) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -60868 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 274.667-31 chr20 6905612 6906097 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 138168 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 186.333-174 chr9 70414366 70414652 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001206, exon 1 of 2) 5' UTR (NM_001206, exon 1 of 2) 148 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 124.333-173 chr8 74858705 74859038 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 34337 NM_001324403 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 124.667-116 chr2 210018036 210018285 + 0.666667 NA exon (NM_001278289, exon 6 of 7) exon (NM_001278289, exon 6 of 7) -11762 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 153.333-380 chr7 33738130 33738469 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -166616 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 153.333-6 chr1 51948975 51949323 + 0.666667 NA intron (NM_002867, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 41551 NM_002867 5865 Hs.123072 NM_002867 ENSG00000169213 RAB3B - RAB3B, member RAS oncogene family protein-coding 147.667-313 chr6 51335993 51336261 + 0.666667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -285743 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 163-81 chr7 71877125 71877469 + 0.666667 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) L1MC|LINE|L1 460094 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 141.333-100 chr2 30053132 30053489 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -93697 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 183.333-171 chr9 33350441 33350862 + 0.666667 NA intron (NM_002504, intron 15 of 23) intron (NM_002504, intron 15 of 23) 51917 NM_001170 364 Hs.455323 NM_001170 ENSG00000165269 AQP7 AQP7L|AQPap|GLYCQTL aquaporin 7 protein-coding 162.667-253 chr7 30700359 30700754 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001202475) promoter-TSS (NM_001202475) -453 NM_001202475 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 130-83 chr4 109993448 109993798 + 0.666667 NA intron (NM_001357021, intron 16 of 19) intron (NM_001357021, intron 16 of 19) 80740 NM_001178131 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 201.333-180 chr3 28245261 28245703 + 0.666667 NA intron (NM_001331187, intron 1 of 3) intron (NM_001331187, intron 1 of 3) 3863 NM_182523 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 179.333-70 chr15 78845729 78846228 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -26803 NM_206839 10933 Hs.374503 NM_006791 ENSG00000185787 MORF4L1 Eaf3|FWP006|HsT17725|MEAF3|MORFRG15|MRG15|S863-6 mortality factor 4 like 1 protein-coding 161.667-243 chr7 107405982 107406404 + 0.666667 NA intron (NM_181733, intron 7 of 20) intron (NM_181733, intron 7 of 20) -63864 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 137-51 chr2 187205941 187206254 + 0.666667 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL 242155 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 142-25 chr12 40754182 40754485 + 0.666667 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) MER2|DNA|TcMar-Tigger 61891 NM_001256063 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 133-70 chr4 100983070 100983290 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 257692 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 124.333-142 chr5 40075825 40076088 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23665 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 114.333-166 chr5 12758187 12758468 + 0.666667 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) MER58A|DNA|hAT-Charlie 90468 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 331.333-7 chr1 117390924 117391716 + 0.666667 NA intron (NM_006699, intron 1 of 12) L1MD|LINE|L1 23871 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 131.667-200 chr8 116499678 116499905 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -152309 NR_136278 105375713 NR_136278 LOC105375713 - uncharacterized LOC105375713 ncRNA 118.667-86 chr17 61993765 61994110 + 0.666667 NA intron (NM_005121, intron 10 of 29) AluSp|SINE|Alu -65955 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 161-50 chr20 32262469 32262839 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14997 NM_004798 9371 Hs.369670 NM_004798 ENSG00000101350 KIF3B FLA8|HH0048|KLP-11 kinesin family member 3B protein-coding 155.333-52 chr11 43555861 43556248 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3602 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 134-83 chr5 19796752 19797112 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) L1MDa|LINE|L1 89340 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 151.333-278 chr3 57045972 57046276 + 0.666667 NA intron (NM_001128615, intron 1 of 12) intron (NM_001128615, intron 1 of 12) -14540 NM_181727 353324 Hs.129794 NM_181727 ENSG00000186451 SPATA12 SRG5 spermatogenesis associated 12 protein-coding 122.667-183 chr7 122596861 122597116 + 0.666667 NA intron (NM_001167940, intron 6 of 29) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 102129 NM_139175 168433 Hs.126730 NM_139175 ENSG00000188050 RNF133 - ring finger protein 133 protein-coding 183.333-50 chr14 84061621 84062024 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1210110 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 195.667-102 chr4 159320426 159320927 + 0.666667 NA intron (NM_001351727, intron 3 of 24) intron (NM_001351727, intron 3 of 24) 52867 NM_014247 9693 Hs.744884 NM_014247 ENSG00000109756 RAPGEF2 CNrasGEF|NRAPGEP|PDZ-GEF1|PDZGEF1|RA-GEF|RA-GEF-1|RAGEF|Rap-GEP|nRap GEP Rap guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 174.667-22 chr10 30640348 30640739 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10790 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 165.333-122 chr2 45394641 45395059 + 0.666667 NA intron (NM_018079, intron 19 of 20) intron (NM_018079, intron 19 of 20) -139909 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 121.333-15 chr1 227848306 227848566 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 32719 NM_183062 339501 Hs.97604 NM_183062 ENSG00000185888 PRSS38 MPN2 serine protease 38 protein-coding 156 chr1 28487421 28487719 + 0.666667 NA intron (NM_023923, intron 8 of 12) intron (NM_023923, intron 8 of 12) -18373 NR_002909 8420 Hs.469723 NR_002909 ENSG00000242125 SNHG3 NCRNA00014|RNU17C|RNU17D|U17HG|U17HG-A|U17HG-AB small nucleolar RNA host gene 3 ncRNA 152-67 chr16 57424432 57424759 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 19828 NM_002987 6361 Hs.546294 NM_002987 ENSG00000102970 CCL17 A-152E5.3|ABCD-2|SCYA17|TARC C-C motif chemokine ligand 17 protein-coding 115-107 chr22 44877237 44877420 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 124770 NM_001198726 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 129-115 chr6 136435684 136435985 + 0.666667 NA intron (NM_001198617, intron 1 of 15) intron (NM_001198617, intron 1 of 15) 31041 NM_001198615 9053 Hs.486548 NM_003980 ENSG00000135525 MAP7 E-MAP-115|EMAP115 microtubule associated protein 7 protein-coding 129.333-95 chr2 81970199 81970469 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -503388 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 152.333-278 chr4 98374330 98374683 + 0.666667 NA intron (NM_001100430, intron 4 of 12) L1MEf|LINE|L1 113122 NM_001100429 5910 Hs.132858 NM_021159 ENSG00000138698 RAP1GDS1 GDS1|SmgGDS Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 protein-coding 172.667-63 chr16 17832615 17833005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -361850 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 160-131 chrX 22267250 22267626 + 0.666667 NA intron (NR_073010, intron 5 of 11) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -5475 NM_152577 158506 Hs.132485 NM_152577 ENSG00000175809 CBLL2 CT138|HAKAIL|ZNF645 Cbl proto-oncogene like 2 protein-coding 115-156 chr8 126481900 126482088 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76484 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 138-81 chr3 196072291 196072619 + 0.666667 NA intron (NM_001313966, intron 2 of 16) intron (NM_001313966, intron 2 of 16) 9635 NM_003234 7037 Hs.529618 NM_003234 ENSG00000072274 TFRC CD71|IMD46|T9|TFR|TFR1|TR|TRFR|p90 transferrin receptor protein-coding 153-92 chr3 26593412 26593771 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -29215 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 129-129 chr8 103206659 103206878 + 0.666667 NA intron (NM_001364874, intron 2 of 3) LTR16A1|LTR|ERVL -34628 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 115.333-96 chr17 65873595 65873876 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 20 of 26) L3|LINE|CR1 -47192 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 155-113 chr5 130529251 130529626 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 624973 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 166.667-221 chr7 96099088 96099526 + 0.666667 NA TTS (NM_001278421) TTS (NM_001278421) 120449 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 194-145 chr8 102787943 102788404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18649 NR_149020 401472 NR_149020 GASAL1 GASL1 growth arrest associated lncRNA 1 ncRNA 118.333-93 chr19 43536018 43536308 + 0.666667 NA TTS (NM_174945) TTS (NM_174945) 2975 NM_174945 284346 Hs.213534 NM_174945 ENSG00000176472 ZNF575 - zinc finger protein 575 protein-coding 116.333-160 chr4 105787481 105787745 + 0.666667 NA intron (NM_001370181, intron 5 of 11) intron (NM_001370181, intron 5 of 11) 39559 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 147-35 chr13 46622866 46623195 + 0.666667 NA intron (NM_001164213, intron 1 of 18) intron (NM_001164213, intron 1 of 18) 69860 NM_001164211 23143 Hs.507971 NM_015116 ENSG00000136141 LRCH1 CHDC1|NP81 leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1 protein-coding 232.333-41 chr2 53919072 53919540 + 0.666667 NA intron (NM_014614, intron 19 of 46) intron (NM_014614, intron 19 of 46) 51687 NM_014614 23198 Hs.413801 NM_014614 ENSG00000068878 PSME4 PA200 proteasome activator subunit 4 protein-coding 213-11 chr10 128939903 128940509 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27373 NR_148990 728327 Hs.454452 NR_148990 ENSG00000224190 LINC02667 - long intergenic non-protein coding RNA 2667 ncRNA 113.667-38 chr12 27338440 27338621 + 0.666667 NA intron (NM_001248003, intron 1 of 14) intron (NM_001248003, intron 1 of 14) 5694 NM_001248002 56938 Hs.445447 NM_020183 ENSG00000029153 ARNTL2 BMAL2|CLIF|MOP9|PASD9|bHLHe6 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like 2 protein-coding 119.333-117 chr18 41243168 41243490 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 277348 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 192.333-83 chr2 21844490 21844939 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -134062 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 169-87 chr6 37048079 37048409 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42589 NM_173558 221472 Hs.509664 NM_173558 ENSG00000146192 FGD2 ZFYVE4 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 protein-coding 164.333-24 chr10 33742517 33742856 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29994 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 125-79 chr4 4416506 4416722 + 0.666667 NA intron (NM_014392, intron 4 of 4) intron (NM_014392, intron 4 of 4) 29651 NM_014392 27065 Hs.518595 NM_014392 ENSG00000168824 NSG1 D4S234|D4S234E|NEEP21|P21 neuronal vesicle trafficking associated 1 protein-coding 160.667-318 chr8 140658394 140658854 + 0.666667 NA non-coding (NR_148038, exon 33 of 33) non-coding (NR_148038, exon 33 of 33) -22991 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 139-97 chr7 51933922 51934180 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -540795 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 134.333-83 chr2 18186803 18187169 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 308319 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 127.667-84 chr2 77997459 77997682 + 0.666667 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) MADE1|DNA|TcMar-Mariner -42544 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 188.333-134 chr6 131797363 131797814 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5416 NR_039610 100616455 NR_039610 ENSG00000266807 MIR548H5 - microRNA 548h-5 ncRNA 203-49 chr2 43730414 43730757 + 0.666667 NA intron (NM_172069, intron 18 of 29) AluSz|SINE|Alu -43454 NM_001193464 51626 Hs.371597 NM_015522 ENSG00000138036 DYNC2LI1 CGI-60|D2LIC|LIC3 dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 protein-coding 139-48 chr2 49333539 49333834 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -179159 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 169.333-102 chr17 76433793 76434204 + 0.666667 NA intron (NM_022066, intron 1 of 17) intron (NM_022066, intron 1 of 17) 19154 NM_022066 63893 Hs.16130 NM_022066 ENSG00000175931 UBE2O E2-230K ubiquitin conjugating enzyme E2 O protein-coding 119.333-93 chr14 99643244 99643501 + 0.666667 NA intron (NM_001329411, intron 2 of 8) L1MCa|LINE|L1 -1738 NM_001127258 84439 Hs.131714 NM_032425 ENSG00000182218 HHIPL1 KIAA1822|UNQ9245 HHIP like 1 protein-coding 122-101 chr5 130980606 130980836 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 184535 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 172-12 chr1 176624179 176624660 + 0.666667 NA intron (NM_021936, intron 3 of 4) intron (NM_021936, intron 3 of 4) 161244 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 133-2 chr1 51456210 51456447 + 0.666667 NA intron (NM_001981, intron 8 of 24) intron (NM_001981, intron 8 of 24) -34233 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 204.667-84 chr20 34765847 34766217 + 0.666667 NA intron (NM_001242539, intron 3 of 11) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 16372 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 116-25 chr11 12220699 12220887 + 0.666667 NA intron (NR_144420, intron 9 of 27) intron (NR_144420, intron 9 of 27) 57110 NR_106739 102466906 NR_106739 ENSG00000275373 MIR6124 hsa-mir-6124 microRNA 6124 ncRNA 228.333-16 chr11 134409669 134410209 + 0.666667 NA intron (NM_054025, intron 1 of 5) intron (NM_054025, intron 1 of 5) 1979 NM_018644 27087 Hs.381050 NM_018644 ENSG00000109956 B3GAT1 CD57|GLCATP|GLCUATP|HNK1|LEU7|NK-1|NK1 beta-1,3-glucuronyltransferase 1 protein-coding 121-2 chr1 45388539 45388859 + 0.666667 NA intron (NM_007170, intron 3 of 10) MSTC|LTR|ERVL-MaLR -48229 NM_001293192 4595 Hs.271353 NM_012222 ENSG00000132781 MUTYH MYH mutY DNA glycosylase protein-coding 111.667-8 chr1 53252781 53253087 + 0.666667 NA intron (NM_004631, intron 16 of 18) L1ME3G|LINE|L1 14324 NR_038953 100507564 Hs.592502 NR_038953 ENSG00000226754 LOC100507564 - uncharacterized LOC100507564 ncRNA 146-127 chr7 44170757 44171055 + 0.666667 NA intron (NM_001354800, intron 1 of 10) intron (NM_001354800, intron 1 of 10) -11624 NM_033508 2645 Hs.1270 NM_000162 ENSG00000106633 GCK FGQTL3|GK|GLK|HHF3|HK4|HKIV|HXKP|LGLK|MODY2 glucokinase protein-coding 133.667-124 chr5 112013746 112014133 + 0.666667 NA intron (NR_046678, intron 3 of 3) intron (NR_046678, intron 3 of 3) -37007 NM_001142474 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 170.667-164 chr8 81555490 81555922 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24316 NM_001105281 646486 Hs.586370 NM_001105281 ENSG00000197416 FABP12 - fatty acid binding protein 12 protein-coding 146-34 chr15 25836974 25837262 + 0.666667 NA intron (NM_024490, intron 1 of 20) L1MA9|LINE|L1 11707 NR_039865 100616474 NR_039865 ENSG00000266517 MIR4715 - microRNA 4715 ncRNA 211-101 chr9 103909515 103910018 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -89943 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 156-102 chr4 87050078 87050461 + 0.666667 NA intron (NM_005935, intron 3 of 19) intron (NM_005935, intron 3 of 19) 43268 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 141-16 chr12 4773048 4773316 + 0.666667 NA TTS (NM_017417) TTS (NM_017417) -35994 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 150.333-248 chr22 25541871 25542187 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -22646 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 138.667-69 chr15 46082457 46082853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 377460 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 112.667-282 chr9 104385434 104385720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 115348 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 114-64 chr18 54591637 54591854 + 0.666667 NA intron (NM_001307955, intron 2 of 2) intron (NM_001307955, intron 2 of 2) 586 NM_173629 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 163.667-115 chr2 119962144 119962470 + 0.666667 NA intron (NM_002830, intron 23 of 26) AluSq2|SINE|Alu -50770 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 157.333-129 chr16 3635881 3636185 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -16906 NM_005223 1773 Hs.629638 NM_005223 ENSG00000213918 DNASE1 DNL1|DRNI deoxyribonuclease 1 protein-coding 142-134 chr6 138292583 138292889 + 0.666667 NA intron (NM_020340, intron 19 of 33) MIRc|SINE|MIR -74246 NM_021635 59351 Hs.302016 NM_021635 ENSG00000254440 PBOV1 UC28|UROC28|dJ171N11.2 prostate and breast cancer overexpressed 1 protein-coding 117.667-72 chr17 78379643 78379910 + 0.666667 NA intron (NR_111989, intron 1 of 8) AluSq2|SINE|Alu 1127 NR_110601 9489 Hs.654671 NM_024419 ENSG00000087157 PGS1 - phosphatidylglycerophosphate synthase 1 protein-coding 141.333-258 chr9 76745740 76746126 + 0.666667 NA intron (NM_001308048, intron 6 of 17) intron (NM_001308048, intron 6 of 17) -18503 NR_015342 50652 Hs.663766 NR_015342 ENSG00000225937 PCA3 DD3|NCRNA00019|PCAT3|PRUNE2-AS1 prostate cancer associated 3 ncRNA 132-84 chr3 104061933 104062195 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -537948 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 115.667-27 chr10 57724640 57724842 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -420182 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 203.667-116 chr7 136993839 136994388 + 0.666667 NA intron (NM_001006630, intron 3 of 3) intron (NM_001006630, intron 3 of 3) 90946 NR_030165 574443 NR_030165 ENSG00000207597 MIR490 MIRN490|hsa-mir-490|miR-490 microRNA 490 ncRNA 187.333-104 chr2 122814854 122815361 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 258374 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 177-62 chr5 29016647 29017087 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -48377 NR_109948 101929645 Hs.531878 NR_109948 LOC101929645 - uncharacterized LOC101929645 ncRNA 197.333-164 chr4 36089377 36089713 + 0.666667 NA intron (NR_146894, intron 28 of 32) L1ME2|LINE|L1 154394 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 149.667-137 chr15 42200528 42200967 + 0.666667 NA intron (NM_015289, intron 1 of 24) L1MB8|LINE|L1 -1081 NR_030357 693212 NR_030357 ENSG00000207712 MIR627 MIRN627|hsa-mir-627|mir-627 microRNA 627 ncRNA 111.667-229 chr6 137327758 137327998 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -108448 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 124.667-101 chr2 72236766 72236998 + 0.666667 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -89020 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 115.667-9 chr1 151670846 151671182 + 0.666667 NA intron (NM_030918, intron 7 of 11) L1M1|LINE|L1 45789 NM_001291106 11189 Hs.26047 NM_007185 ENSG00000159409 CELF3 BRUNOL1|CAGH4|ERDA4|ETR-1|TNRC4 CUGBP Elav-like family member 3 protein-coding 195.667-69 chr2 36622463 36623012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24569 NM_001042548 9637 Hs.258563 NM_005102 ENSG00000171055 FEZ2 HUM3CL fasciculation and elongation protein zeta 2 protein-coding 113.333-27 chr10 60661969 60662288 + 0.666667 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) 71400 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 180.333-130 chr8 58459471 58459918 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40469 NM_000780 1581 Hs.1644 NM_000780 ENSG00000167910 CYP7A1 CP7A|CYP7|CYPVII cytochrome P450 family 7 subfamily A member 1 protein-coding 140.667-142 chr3 23712325 23712614 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93486 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 159.333-18 chr1 172935993 172936343 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 114795 NM_005092 8995 Hs.248197 NM_005092 ENSG00000120337 TNFSF18 AITRL|GITRL|TL6|TNLG2A|hGITRL TNF superfamily member 18 protein-coding 116.333-197 chr7 48130341 48130651 + 0.666667 NA Intergenic LTR24|LTR|ERV1 -40962 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 132.333-29 chr11 29451442 29451721 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142832 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 145.667-283 chr8 78486524 78486829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29664 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 182.333-171 chr9 106299482 106299880 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -301247 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 184-108 chr8 110278322 110278722 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -302751 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 118.333-115 chr2 149471320 149471537 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001195685, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001195685, exon 5 of 5) -115930 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 163.333-35 chr10 63248978 63249349 + 0.666667 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) AluSx1|SINE|Alu 20060 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 191.667-65 chr19 29062914 29063352 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60578 NR_040036 100505835 Hs.176539 NR_040036 ENSG00000267014 LINC01532 - long intergenic non-protein coding RNA 1532 ncRNA 132.667-114 chr3 170709765 170710053 + 0.666667 NA intron (NR_135556, intron 3 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -123834 NM_020949 57709 Hs.596660 NM_020949 ENSG00000013293 SLC7A14 PPP1R142 solute carrier family 7 member 14 protein-coding 148.333-244 chr3 26648372 26648715 + 0.666667 NA intron (NM_001317810, intron 2 of 2) intron (NM_001317810, intron 2 of 2) 23876 NM_001317810 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 146.333-352 chr9 72538613 72538992 + 0.666667 NA intron (NM_138691, intron 1 of 23) MER4D0|LTR|ERV1 17001 NM_138691 117531 Hs.670211 NM_138691 ENSG00000165091 TMC1 DFNA36|DFNB11|DFNB7 transmembrane channel like 1 protein-coding 118-23 chr12 54236067 54236387 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001127321, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001127321, exon 5 of 5) -4751 NR_039851 100616400 NR_039851 ENSG00000283803 MIR3198-2 mir-3198-2 microRNA 3198-2 ncRNA 133-4 chr1 205126738 205127131 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4956 NM_001193272 5929 Hs.519230 NM_005057 ENSG00000117222 RBBP5 RBQ3|SWD1 RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit protein-coding 148.667-161 chr17 69621569 69621944 + 0.666667 NA intron (NR_109972, intron 2 of 4) L1MA4A|LINE|L1 27769 NR_109971 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 220.333-89 chr3 48977233 48977821 + 0.666667 NA intron (NM_001349216, intron 12 of 16) AluSx3|SINE|Alu -12381 NM_177938 54681 Hs.654944 NM_017732 ENSG00000178467 P4HTM EGLN4|HIFPH4|P4H-TM|PH-4|PH4|PHD4 prolyl 4-hydroxylase, transmembrane protein-coding 197-40 chr16 2775396 2775760 + 0.666667 NA intron (NM_207013, intron 2 of 4) intron (NM_207013, intron 2 of 4) 1702 NM_007108 6923 Hs.172772 NM_007108 ENSG00000103363 ELOB SIII|TCEB2 elongin B protein-coding 289.333-11 chr11 28683390 28684165 + 0.666667 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 -206229 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 118.333-60 chr13 105653538 105653852 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53135 NR_120418 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 144-22 chr10 114026682 114026967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17042 NM_000684 153 Hs.99913 NM_000684 ENSG00000043591 ADRB1 ADRB1R|B1AR|BETA1AR|RHR adrenoceptor beta 1 protein-coding 121.667-134 chr3 178905585 178905834 + 0.666667 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -45304 NR_126560 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 186-93 chr7 11620984 11621436 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 2 of 26) intron (NM_015204, intron 2 of 26) 210988 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 153.667-187 chr2 81971019 81971333 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -504230 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 118.667-43 chr11 71245869 71246119 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21198 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 192-42 chr12 14079347 14079909 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -99272 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 149.667-239 chr21 23635646 23636038 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -251007 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 186.333-26 chr11 12930515 12930852 + 0.666667 NA intron (NM_021961, intron 12 of 12) MER5B|DNA|hAT-Charlie 58865 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 120.333-15 chr1 177072987 177073309 + 0.666667 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) intron (NM_207108, intron 1 of 21) -43703 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 113.667-11 chr1 114490713 114490904 + 0.666667 NA intron (NM_015906, intron 1 of 19) HY1|scRNA|scRNA 20395 NM_033020 51592 Hs.26837 NM_015906 ENSG00000197323 TRIM33 ECTO|PTC7|RFG7|TF1G|TIF1G|TIF1GAMMA|TIFGAMMA tripartite motif containing 33 protein-coding 160-19 chr10 82911975 82912362 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 6 of 10) L1MCa|LINE|L1 -679248 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 160.667-214 chr3 189970897 189971289 + 0.666667 NA intron (NM_018192, intron 12 of 14) intron (NM_018192, intron 12 of 14) 141171 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 192.333-95 chr2 127281899 127282273 + 0.666667 NA intron (NM_001303418, intron 8 of 14) L1ME3|LINE|L1 12058 NM_001303416 2071 Hs.469872 NM_000122 ENSG00000163161 ERCC3 BTF2|GTF2H|RAD25|TFIIH|TTD2|XPB ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit protein-coding 190-118 chr7 105068879 105069347 + 0.666667 NA intron (NM_182931, intron 6 of 26) L1MD1|LINE|L1 54908 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 149.333-19 chr1 113223469 113223776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17369 NR_038846 643441 Hs.124895 NR_038846 LOC643441 - uncharacterized LOC643441 ncRNA 152-109 chr3 189927353 189927792 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 97650 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 179.667-136 chr8 83075672 83076051 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 163757 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 113.333-76 chr14 65321790 65322042 + 0.666667 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL 13267 NR_039857 100616176 NR_039857 ENSG00000266740 MIR4708 mir-4708 microRNA 4708 ncRNA 169.667-18 chr10 44606480 44606827 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -221556 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 116.667-58 chr14 71261430 71261615 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -58954 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 114-114 chr5 32442202 32442379 + 0.666667 NA intron (NM_016107, intron 2 of 19) intron (NM_016107, intron 2 of 19) 2450 NR_144318 51663 Hs.435231 NM_016107 ENSG00000056097 ZFR SPG71|ZFR1 zinc finger RNA binding protein protein-coding 123.667 chr1 23615437 23615750 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11741 NM_001348075 259283 Hs.523369 NM_001348075 MDS2 - myelodysplastic syndrome 2 translocation associated protein-coding 131.333-46 chr12 88360730 88361015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 218565 NM_001366579 160418 Hs.331268 NM_181783 ENSG00000139324 TMTC3 LIS8|SMILE transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 3 protein-coding 224.667-21 chr14 31513698 31514108 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -25864 NM_001197184 2856 Hs.727479 NM_001197184 ENSG00000214943 GPR33 - G protein-coupled receptor 33 (gene/pseudogene) protein-coding 165-29 chr17 35210825 35211256 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -16647 NM_152462 146861 Hs.514814 NM_152462 ENSG00000164729 SLC35G3 AMAC1|TMEM21A solute carrier family 35 member G3 protein-coding 203-119 chr9 107467526 107468115 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1235 NR_121581 101928720 Hs.125496 NR_121581 LINC01509 PRCAT37 long intergenic non-protein coding RNA 1509 ncRNA 132.667-10 chr1 166479868 166480184 + 0.666667 NA intron (NR_146890, intron 1 of 2) intron (NR_146890, intron 1 of 2) 10013 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 192.666-18 chr12 102615548 102616104 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -135263 NM_000618 3479 Hs.160562 NM_000618 ENSG00000017427 IGF1 IGF|IGF-I|IGFI|MGF insulin like growth factor 1 protein-coding 128.667-136 chr4 146434972 146435175 + 0.666667 NA intron (NM_001317816, intron 4 of 10) L2b|LINE|L2 26490 NR_107003 102465837 NR_107003 ENSG00000278438 MIR7849 hsa-mir-7849 microRNA 7849 ncRNA 139.333-169 chr4 103325910 103326248 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98963 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 116.333-122 chr2 134700364 134700640 + 0.666667 NA intron (NM_030923, intron 2 of 7) intron (NM_030923, intron 2 of 7) 18498 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 150.333-366 chr6 108837034 108837323 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11238 NM_001286609 84071 Hs.645481 NM_032131 ENSG00000118690 ARMC2 SPGF38|bA787I22.1 armadillo repeat containing 2 protein-coding 195.667-156 chrUn_GL000216v2 12227 12653 + 0.666667 NA NA (CATTC)n|Satellite|Satellite NA NA 209.333-148 chr3 25183219 25183680 + 0.666667 NA intron (NM_001290216, intron 4 of 10) intron (NM_001290216, intron 4 of 10) -157353 NM_001290300 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 159.667-100 chr14 67266902 67267370 + 0.666667 NA intron (NM_001256550, intron 1 of 14) intron (NM_001256550, intron 1 of 14) 25701 NM_001256550 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 113.333-256 chr8 79769170 79769345 + 0.666667 NA TTS (NR_110954) TTS (NR_110954) 1115 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 234.333-80 chr7 100818577 100819117 + 0.666667 NA intron (NM_004444, intron 6 of 16) AluSg|SINE|Alu -8022 NM_001363494 56996 Hs.521087 NM_020246 ENSG00000146828 SLC12A9 CCC6|CIP1|WO3.3|hCCC6 solute carrier family 12 member 9 protein-coding 226-89 chr7 107748354 107749007 + 0.666667 NA intron (NR_024199, intron 1 of 6) Charlie24|DNA|hAT-Charlie -4099 NR_144537 101927974 Hs.432792 NR_144536 ENSG00000241764 LOC101927974 - uncharacterized LOC101927974 ncRNA 119-59 chr16 57204282 57204493 + 0.666667 NA intron (NM_001305163, intron 1 of 14) intron (NM_001305163, intron 1 of 14) 18058 NM_001305163 89970 Hs.460885 NM_133368 ENSG00000159579 RSPRY1 SEMDFA ring finger and SPRY domain containing 1 protein-coding 199-121 chr8 102809706 102810132 + 0.666667 NA non-coding (NR_149020, exon 2 of 2) non-coding (NR_149020, exon 2 of 2) 3097 NR_149020 401472 NR_149020 GASAL1 GASL1 growth arrest associated lncRNA 1 ncRNA 118-120 chr7 28802365 28802560 + 0.666667 NA intron (NM_001011666, intron 3 of 6) intron (NM_001011666, intron 3 of 6) 116329 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 149.333-164 chr2 5105621 5106018 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -449597 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 119.333-237 chr9 82267003 82267332 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 278395 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 229.667-67 chr5 28176733 28177191 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 110703 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 225.667-45 chr22 24738082 24738600 + 0.666667 NA intron (NM_001008496, intron 12 of 20) L1M1|LINE|L1 -26160 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 121.667-112 chr20 44201622 44201855 + 0.666667 NA intron (NM_016470, intron 3 of 3) L1MEd|LINE|L1 9033 NM_016470 51526 Hs.75798 NM_016470 ENSG00000132823 OSER1 C20orf111|HSPC207|Osr1|Perit1|dJ1183I21.1 oxidative stress responsive serine rich 1 protein-coding 155.333-196 chr20 10780137 10780485 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27221 NR_110611 101929395 Hs.244862 NR_110611 LINC01752 - long intergenic non-protein coding RNA 1752 ncRNA 132-80 chr3 18508367 18508638 + 0.666667 NA intron (NR_125803, intron 4 of 6) L2a|LINE|L2 -62910 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 131.667-135 chr3 118278978 118279201 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -362679 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 158-143 chr8 128370183 128370522 + 0.666667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 194327 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 148.333-292 chr4 111542135 111542427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -603173 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 116.667-140 chr4 6015184 6015427 + 0.666667 NA intron (NM_001364689, intron 1 of 11) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 3241 NM_001364689 389197 Hs.479065 NM_207405 ENSG00000181215 C4orf50 - chromosome 4 open reading frame 50 protein-coding 150.333-62 chr11 60389337 60389622 + 0.666667 NA exon (NM_206940, exon 4 of 6) exon (NM_206940, exon 4 of 6) -6535 NM_001261827 84689 Hs.709736 NM_032597 ENSG00000166928 MS4A14 MS4A16|NYD-SP21 membrane spanning 4-domains A14 protein-coding 169.333-146 chr21 24099623 24100001 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 221565 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 197.667-53 chr17 75013237 75013749 + 0.666667 NA intron (NM_001545, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 823 NM_001303265 3396 Hs.407955 NM_001545 ENSG00000167862 MRPL58 DS-1|DS1|ICT1|MRP-L58 mitochondrial ribosomal protein L58 protein-coding 127-42 chr2 19150822 19151123 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -124001 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 195.667-51 chr15 69680402 69680858 + 0.666667 NA intron (NR_126438, intron 3 of 3) intron (NR_126438, intron 3 of 3) 88430 NR_126437 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 134.333-47 chr14 35526916 35527252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7080 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 133.333-122 chr4 29650763 29651123 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 436651 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 185.667-77 chr2 174926965 174927369 + 0.666667 NA intron (NM_001025201, intron 4 of 12) MER4A|LTR|ERV1 78086 NM_001822 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 198.667-154 chr5 147143594 147144110 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -62332 NM_001271900 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 153.333-406 chr8 77954234 77954587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 503713 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 151-95 chr4 109164460 109164762 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 138047 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 142.333-17 chr10 19219389 19219666 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 18 of 39) AluJo|SINE|Alu 170726 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 114.667-218 chr5 131301728 131301929 + 0.666667 NA intron (NM_001038702, intron 1 of 4) intron (NM_001038702, intron 1 of 4) 37819 NM_001038702 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 222.667-48 chr21 26755080 26755460 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90139 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 166.667-193 chr6 24982207 24982598 + 0.666667 NA intron (NM_001286446, intron 1 of 13) intron (NM_001286446, intron 1 of 13) -46442 NM_001286445 9750 Hs.559459 NM_014722 ENSG00000111913 RIPOR2 C6orf32|DFNB104|DIFF40|DIFF48|FAM65B|MYONAP|PL48 RHO family interacting cell polarization regulator 2 protein-coding 167.333-171 chr3 43674426 43674874 + 0.666667 NA intron (NM_001346469, intron 1 of 11) LTR16A|LTR|ERVL -16220 NM_001365650 51099 Hs.19385 NM_016006 ENSG00000011198 ABHD5 CGI58|IECN2|NCIE2 abhydrolase domain containing 5 protein-coding 213-52 chr3 67784484 67784964 + 0.666667 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) MIRb|SINE|MIR 130027 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 178-115 chr8 136630386 136630781 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) LTR16E2|LTR|ERVL 99785 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 145-80 chr4 70665965 70666251 + 0.666667 NA intron (NM_144646, intron 1 of 3) intron (NM_144646, intron 1 of 3) 400 NM_144646 3512 Hs.643431 NM_144646 ENSG00000132465 JCHAIN IGCJ|IGJ|JCH joining chain of multimeric IgA and IgM protein-coding 198.667-35 chr11 42747685 42748210 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -494257 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 158.667-206 chr3 42179552 42179836 + 0.666667 NA intron (NM_001349247, intron 3 of 16) intron (NM_001349247, intron 3 of 16) 19501 NM_014965 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 140.333-118 chr20 4366698 4366993 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -117558 NM_000678 146 Hs.557 NM_000678 ENSG00000171873 ADRA1D ADRA1|ADRA1A|ADRA1R|ALPHA1|DAR|dJ779E11.2 adrenoceptor alpha 1D protein-coding 152-42 chr12 24536055 24536427 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 26250 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 177.333-7 chr1 69986389 69986699 + 0.666667 NA intron (NM_001370785, intron 10 of 26) intron (NM_001370785, intron 10 of 26) 67222 NR_023916 5301 Hs.654711 NR_023916 ENSG00000229359 PIN1P1 PIN1L peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 pseudogene 1 pseudo 138-109 chr7 54216002 54216328 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -114532 NR_120515 102723605 Hs.154626 NR_120515 ENSG00000231427 LINC01445 - long intergenic non-protein coding RNA 1445 ncRNA 138-79 chr3 111150748 111151072 + 0.666667 NA intron (NM_001243288, intron 7 of 8) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 79094 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 122.667-40 chr12 99793291 99793617 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 4 of 25) L1MA2|LINE|L1 145701 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 183-32 chr13 88854483 88854851 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 227814 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 123.333-69 chr13 86724753 86724963 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -187062 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 142.333-242 chr8 113471185 113471561 + 0.666667 NA Intergenic HERV4_I-int|LTR|ERV1 -34434 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 116-45 chr14 92038726 92039068 + 0.666667 NA intron (NM_004239, intron 1 of 20) intron (NM_004239, intron 1 of 20) 1162 NM_004239 9321 Hs.632339 NM_004239 ENSG00000100815 TRIP11 ACG1A|CEV14|GMAP-210|GMAP210|ODCD|TRIP-11|TRIP230 thyroid hormone receptor interactor 11 protein-coding 128.667-94 chr2 128009587 128009809 + 0.666667 NA intron (NM_001330303, intron 7 of 19) L2a|LINE|L2 17597 NM_001145928 79595 Hs.32995 NM_024545 ENSG00000136715 SAP130 - Sin3A associated protein 130 protein-coding 129.333-85 chr19 29719969 29720234 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4312 NM_001256047 83636 Hs.529094 NM_031448 ENSG00000131943 C19orf12 MPAN|NBIA3|NBIA4|SPG43 chromosome 19 open reading frame 12 protein-coding 163.667-108 chr2 58208510 58208870 + 0.666667 NA intron (NR_156742, intron 1 of 9) L2|LINE|L2 32690 NM_018062 55120 Hs.631890 NM_018062 ENSG00000115392 FANCL FAAP43|PHF9|POG FA complementation group L protein-coding 136.667-175 chr8 100644013 100644229 + 0.666667 NA intron (NM_152628, intron 2 of 13) intron (NM_152628, intron 2 of 13) 5544 NM_152628 169166 Hs.567758 NM_152628 ENSG00000174226 SNX31 - sorting nexin 31 protein-coding 120-115 chr5 122915714 122915981 + 0.666667 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) intron (NM_014035, intron 1 of 6) 70234 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 146-120 chr7 3762779 3763066 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -366763 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 168.667-68 chr15 63371378 63371839 + 0.666667 NA intron (NR_135511, intron 2 of 9) intron (NR_135511, intron 2 of 9) 10238 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 182.333-115 chr4 78559111 78559411 + 0.666667 NA intron (NM_005139, intron 2 of 12) AluJb|SINE|Alu 7491 NM_005139 306 Hs.480042 NM_005139 ENSG00000138772 ANXA3 ANX3 annexin A3 protein-coding 129-82 chr3 21385461 21385760 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -20116 NR_002311 391518 Hs.543226 NR_002311 VENTXP7 HPX42|VENTX1 VENT homeobox pseudogene 7 pseudo 229.667-11 chr10 28109141 28109593 + 0.666667 NA intron (NR_134518, intron 10 of 16) intron (NR_134518, intron 10 of 16) -35989 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 158-26 chr11 72479152 72479473 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44628 NM_001258394 81570 Hs.523877 NM_030813 ENSG00000162129 CLPB ANKCLB|HSP78|MEGCANN|MGCA7|SKD3 ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin protein-coding 123.333-54 chr11 132707916 132708263 + 0.666667 NA intron (NM_001319104, intron 1 of 6) L3|LINE|CR1 235548 NM_002545 4978 Hs.4817 NM_002545 ENSG00000183715 OPCML IGLON1|OBCAM|OPCM opioid binding protein/cell adhesion molecule like protein-coding 179-2 chr1 63259755 63260079 + 0.666667 NA intron (NR_038252, intron 3 of 11) MIR|SINE|MIR 57340 NR_038252 199899 Hs.116210 NR_038252 ENSG00000224209 LINC00466 - long intergenic non-protein coding RNA 466 ncRNA 161-58 chr3 80540357 80540691 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -224373 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 125.333-194 chrX 105111867 105112178 + 0.666667 NA intron (NM_017416, intron 2 of 10) intron (NM_017416, intron 2 of 10) 108671 NM_001291277 56157 Hs.567543 NM_031274 ENSG00000268629 TEX13A - testis expressed 13A protein-coding 148.667-85 chr12 861006 861311 + 0.666667 NA exon (NM_014823, exon 7 of 26) exon (NM_014823, exon 7 of 26) 71918 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 128.667-47 chr12 59415109 59415357 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -180796 NM_001270622 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 142.667-209 chr7 91164652 91164941 + 0.666667 NA intron (NM_012395, intron 13 of 13) intron (NM_012395, intron 13 of 13) -99637 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 149.333-220 chr21 24537683 24538075 + 0.666667 NA intron (NR_135519, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 109139 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 112.333-233 chr6 90972533 90972733 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -385561 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 147-15 chr10 85807600 85807976 + 0.666667 NA intron (NM_017551, intron 8 of 15) L1MEh|LINE|L1 230057 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 134.667-209 chrX 86905076 86905431 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -612549 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 225-57 chr6 166557635 166558007 + 0.666667 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) MERX|DNA|TcMar-Tigger -13131 NM_001318938 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 118.667-202 chr9 77449311 77449592 + 0.666667 NA intron (NR_121184, intron 1 of 4) intron (NR_121184, intron 1 of 4) 1802 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 164-128 chrX 86862639 86862935 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 599819 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 231-21 chr18 1141821 1142322 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -214078 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 126.667-132 chr5 6856756 6857043 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28978 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 132-47 chr16 59140762 59141114 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -406622 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 126.333-59 chr15 63849014 63849319 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy -15218 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 184.667-106 chr5 126219144 126219546 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 39768 NR_105042 102546228 Hs.582529 NR_105042 ENSG00000248107 LINC02039 - long intergenic non-protein coding RNA 2039 ncRNA 133.667-131 chr6 103595106 103595396 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 1264295 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 116-26 chr11 13949306 13949579 + 0.666667 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL -13281 NM_006108 10418 Hs.643864 NM_006108 ENSG00000262655 SPON1 VSGP/F-spondin|f-spondin spondin 1 protein-coding 111.667-134 chr2 95235099 95235345 + 0.666667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -39227 NM_001165978 150696 Hs.437376 NM_144707 ENSG00000155066 PROM2 PROML2 prominin 2 protein-coding 138.667-101 chr2 46737668 46737994 + 0.666667 NA intron (NM_144949, intron 1 of 1) intron (NM_144949, intron 1 of 1) 38536 NM_144949 9655 Hs.468426 NM_014011 ENSG00000171150 SOCS5 CIS6|CISH6|Cish5|SOCS-5 suppressor of cytokine signaling 5 protein-coding 118.333-75 chr15 75724628 75724833 + 0.666667 NA intron (NM_175881, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 689 NM_175881 161753 Hs.144348 NM_175881 ENSG00000182950 ODF3L1 - outer dense fiber of sperm tails 3 like 1 protein-coding 169.667-136 chr3 123012436 123012796 + 0.666667 NA intron (NR_046079, intron 1 of 22) intron (NR_046079, intron 1 of 22) 15147 NM_001031702 54437 Hs.210870 NM_018987 ENSG00000082684 SEMA5B SEMAG|SemG semaphorin 5B protein-coding 184.667-61 chr2 117966711 117967188 + 0.666667 NA intron (NM_019044, intron 11 of 23) intron (NM_019044, intron 11 of 23) 47121 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 137.333-188 chr8 26993111 26993368 + 0.666667 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie 55724 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 121.667-81 chr18 12328476 12328764 + 0.666667 NA TTS (NM_006796) TTS (NM_006796) 20379 NM_001303529 84617 Hs.193491 NM_032525 ENSG00000176014 TUBB6 FPVEPD|HsT1601|TUBB-5 tubulin beta 6 class V protein-coding 165.667-187 chr7 52035079 52035503 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -642035 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 181-46 chr21 21682429 21682834 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 54688 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 130-112 chr6 112897997 112898230 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 535334 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 156.333-341 chr7 77629786 77630063 + 0.666667 NA intron (NM_001131009, intron 12 of 16) AluJo|SINE|Alu 66341 NR_134253 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 132.333-3 chr1 60783189 60783455 + 0.666667 NA intron (NR_110628, intron 1 of 5) MER89-int|LTR|ERV1 42262 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 126.333-132 chr4 62663397 62663667 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -501767 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 117.333-82 chr17 71894930 71895148 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 130940 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 165.333-222 chr6 53834339 53834709 + 0.666667 NA intron (NM_018214, intron 1 of 13) intron (NM_018214, intron 1 of 13) 39519 NM_018214 55227 Hs.606493 NM_018214 ENSG00000137269 LRRC1 LANO|dJ523E19.1 leucine rich repeat containing 1 protein-coding 137.667-120 chr3 39067786 39068163 + 0.666667 NA intron (NM_001346225, intron 6 of 19) intron (NM_001346225, intron 6 of 19) 15682 NM_001346228 57599 Hs.109778 NM_020839 ENSG00000114742 WDR48 P80|SPG60|UAF1 WD repeat domain 48 protein-coding 114.333-141 chr22_KI270878v1_alt 157651 157968 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -24870 NR_110539 388882 Hs.542766 NR_110539 ENSG00000178248 FAM230I LINC01658 family with sequence similarity 230 member I ncRNA 116.333-31 chr10 56271473 56271801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 89622 NM_007057 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 161.667-70 chr14 31245281 31245616 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -37655 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 210.333-86 chr2 175347635 175348152 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166183 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 202-108 chr3 26138832 26139225 + 0.666667 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 -265333 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 140.667-120 chr2 86007022 86007332 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 98709 NM_015425 25885 Hs.531818 NM_015425 ENSG00000068654 POLR1A A190|AFDCIN|RPA1|RPA194|RPO1-4|RPO14 RNA polymerase I subunit A protein-coding 228-44 chr2 69255807 69256301 + 0.666667 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 131173 NM_002056 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 153.667-385 chr8 100629869 100630189 + 0.666667 NA intron (NM_152628, intron 4 of 13) intron (NM_152628, intron 4 of 13) -11624 NM_001363720 169166 Hs.567758 NM_152628 ENSG00000174226 SNX31 - sorting nexin 31 protein-coding 278-68 chr8 105230441 105231003 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87716 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 194-23 chr11 127116048 127116586 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49315 NR_120578 101929473 Hs.737523 NR_120578 ENSG00000255087 LOC101929473 - uncharacterized LOC101929473 ncRNA 112.333-188 chr4 76771261 76771595 + 0.666667 NA intron (NM_020859, intron 10 of 10) intron (NM_020859, intron 10 of 10) 126716 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 137.333-190 chr8 56241607 56241874 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29951 NM_001011671 79145 Hs.436913 NM_024300 ENSG00000170791 CHCHD7 COX23 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 7 protein-coding 114.667-148 chr2 239902181 239902480 + 0.666667 NA intron (NR_136158, intron 9 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 40764 NR_039949 100616417 NR_039949 ENSG00000264279 MIR4786 mir-4786 microRNA 4786 ncRNA 147-47 chr15 59165705 59166024 + 0.666667 NA intron (NM_004998, intron 22 of 27) intron (NM_004998, intron 22 of 27) 5398 NR_031750 100313886 NR_031750 ENSG00000253030 MIR2116 mir-2116 microRNA 2116 ncRNA 119.667-14 chr1 174769185 174769413 + 0.666667 NA intron (NM_001366451, intron 3 of 12) LTR8A|LTR|ERV1 -30439 NM_001366456 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 151.667-334 chr7 35623047 35623347 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 71938 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 204.667-21 chr11 22413653 22414115 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 75503 NM_020346 57084 Hs.242821 NM_020346 ENSG00000091664 SLC17A6 DNPI|VGLUT2 solute carrier family 17 member 6 protein-coding 141-85 chr7 31660602 31660927 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -26253 NM_001145123 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 130-26 chr12 51703189 51703511 + 0.666667 NA intron (NM_001369788, intron 9 of 25) AluJb|SINE|Alu 112114 NM_001177984 6334 Hs.436550 NM_014191 ENSG00000196876 SCN8A BFIS5|CERIII|CIAT|EIEE13|MED|MYOCL2|NaCh6|Nav1.6|PN4 sodium voltage-gated channel alpha subunit 8 protein-coding 144-30 chr12 3172318 3172637 + 0.666667 NA intron (NM_006675, intron 2 of 8) intron (NM_006675, intron 2 of 8) 95098 NM_006675 10867 Hs.504517 NM_006675 ENSG00000011105 TSPAN9 NET-5|NET5|PP1057 tetraspanin 9 protein-coding 165.333-142 chr20 46879757 46880106 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14693 NM_172110 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 199.667-124 chr7 5670943 5671376 + 0.666667 NA intron (NR_046834, intron 1 of 2) intron (NR_046834, intron 1 of 2) 9302 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 115.667-50 chr12 3923005 3923188 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49648 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 208.667-110 chr5 88756890 88757293 + 0.666667 NA intron (NM_001364332, intron 3 of 9) MER45A|DNA|hAT-Tip100 28420 NM_001364356 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 143.333-96 chr15 36666357 36666734 + 0.666667 NA intron (NM_001321757, intron 6 of 12) intron (NM_001321757, intron 6 of 12) 71668 NM_032499 84529 Hs.48348 NM_032499 ENSG00000186073 C15orf41 HH114 chromosome 15 open reading frame 41 protein-coding 189.333-33 chr10 122844351 122844727 + 0.666667 NA intron (NM_022034, intron 1 of 8) intron (NM_022034, intron 1 of 8) 1318 NM_022034 50624 Hs.647182 NM_022034 ENSG00000138161 CUZD1 ERG-1|ERG1|ITMAP1|UO-44 CUB and zona pellucida like domains 1 protein-coding 127.667-37 chr12 60610053 60610294 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 920803 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 145.333-197 chr3 114438767 114439047 + 0.666667 NA intron (NM_001348805, intron 7 of 10) intron (NM_001348805, intron 7 of 10) -14686 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 122-2 chr1 39309433 39309699 + 0.666667 NA intron (NM_012090, intron 22 of 92) intron (NM_012090, intron 22 of 92) -99507 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 120.333-92 chr2 41601374 41601582 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -276077 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 146-31 chr14 73497221 73497515 + 0.666667 NA intron (NM_001220484, intron 14 of 17) MIRb|SINE|MIR 6435 NM_024644 79697 Hs.509916 NM_024644 ENSG00000170468 RIOX1 C14orf169|JMJD9|MAPJD|NO66|ROX|URLC2|hsNO66 ribosomal oxygenase 1 protein-coding 147.333-199 chr22 19658811 19659107 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55544 NM_002688 5413 Hs.728762 NM_002688 ENSG00000184702 SEPTIN5 CDCREL|CDCREL-1|CDCREL1|H5|HCDCREL-1|PNUTL1|SEPT5 septin 5 protein-coding 236-29 chr16 59234430 59234926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -500362 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 128-24 chr15 85473208 85473440 + 0.666667 NA intron (NM_007200, intron 1 of 36) intron (NM_007200, intron 1 of 36) 92721 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 198-74 chr17 59834895 59835444 + 0.666667 NA intron (NM_001329395, intron 11 of 12) AluSg|SINE|Alu -6097 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 150.333-40 chr10 72902473 72902757 + 0.666667 NA intron (NR_130125, intron 3 of 7) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 8876 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 241.333-40 chr14 96303958 96304500 + 0.666667 NA intron (NM_018036, intron 32 of 41) MER5A|DNA|hAT-Charlie 48019 NM_000710 623 Hs.525572 NM_000710 ENSG00000100739 BDKRB1 B1BKR|B1R|BDKRB2|BKB1R|BKR1|BRADYB1 bradykinin receptor B1 protein-coding 168.667-233 chr9 38249340 38249766 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -143149 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 116.333-163 chr4 147014725 147014915 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68934 NM_031956 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 130.667-146 chr3 114719792 114720024 + 0.666667 NA intron (NM_001348801, intron 4 of 11) intron (NM_001348801, intron 4 of 11) 23617 NR_039959 100616166 NR_039959 ENSG00000264623 MIR4796 mir-4796 microRNA 4796 ncRNA 195.667-36 chr12 131724533 131724974 + 0.666667 NA intron (NM_004592, intron 4 of 17) intron (NM_004592, intron 4 of 17) 13663 NM_004592 6433 Hs.308171 NM_004592 ENSG00000061936 SFSWAP SFRS8|SWAP splicing factor SWAP protein-coding 132-21 chr10 76040694 76041000 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 3 of 6) intron (NM_001305581, intron 3 of 6) 258086 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 144.333-104 chr18 39640031 39640322 + 0.666667 NA intron (NR_024391, intron 2 of 3) intron (NR_024391, intron 2 of 3) -18001 NR_030628 100126323 NR_030628 ENSG00000283615 MIR924 MIRN924|hsa-mir-924 microRNA 924 ncRNA 156.667-19 chr1 106896010 106896348 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 77940 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 142.333-47 chr11 110008235 110008569 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84990 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 121.333-193 chr9 115492152 115492444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 251941 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 114.667-170 chr3 28964176 28964392 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 316655 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 159-76 chr22 34780297 34780621 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) L1ME1|LINE|L1 217457 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 141-101 chrX 42350787 42351151 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 427194 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 138-113 chr7 151485256 151485534 + 0.666667 NA intron (NM_005614, intron 2 of 7) intron (NM_005614, intron 2 of 7) 34500 NM_005614 6009 Hs.283521 NM_005614 ENSG00000106615 RHEB RHEB2 Ras homolog, mTORC1 binding protein-coding 168-42 chr17 73927745 73928099 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -99385 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 126.333-52 chr14 64137066 64137324 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 78 of 114) intron (NM_015180, intron 78 of 114) -42070 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 191.333-14 chr1 203844313 203844739 + 0.666667 NA intron (NM_014827, intron 14 of 19) intron (NM_014827, intron 14 of 19) -17073 NR_130746 6635 Hs.334612 NM_003094 ENSG00000182004 SNRPE HYPT11|SME|Sm-E|snRNP-E small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E protein-coding 294.333-30 chr3 179114632 179115173 + 0.666667 NA intron (NR_125401, intron 2 of 2) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 33071 NR_125401 101928739 Hs.434553 NR_125401 ENSG00000229102 LOC101928739 - uncharacterized LOC101928739 ncRNA 123.333-130 chr20 52844986 52845300 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127215 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 169.667-158 chr4 136583619 136583943 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -609975 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 148.667-24 chr1 206463123 206463412 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001170637, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_001170637, exon 22 of 22) -7209 NM_001193321 9641 Hs.321045 NM_014002 ENSG00000263528 IKBKE IKK-E|IKK-i|IKKE|IKKI inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit epsilon protein-coding 140.333-38 chr11 74010099 74010415 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1020 NM_022803 7352 Hs.101337 NM_003356 ENSG00000175564 UCP3 SLC25A9 uncoupling protein 3 protein-coding 118-88 chr3 29618175 29618424 + 0.666667 NA intron (NM_001003792, intron 4 of 13) AluSx1|SINE|Alu 315857 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 131.333-90 chr2 85286257 85286504 + 0.666667 NA intron (NM_031283, intron 4 of 11) AluSx|SINE|Alu 41609 NM_001368096 10618 Hs.593382 NM_006464 ENSG00000152291 TGOLN2 TGN38|TGN46|TGN48|TGN51|TTGN2 trans-golgi network protein 2 protein-coding 144.667-176 chr21 29292499 29292821 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6262 NM_001186 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 122-10 chr1 210953529 210953879 + 0.666667 NA intron (NM_002238, intron 6 of 10) L2c|LINE|L2 179670 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 140-64 chr2 130864873 130865203 + 0.666667 NA intron (NM_001367493, intron 1 of 13) intron (NM_001367493, intron 1 of 13) 28124 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 151.333-415 chr8 78315339 78315673 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -200834 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 260.333-24 chr17 78469507 78470064 + 0.666667 NA intron (NM_173628, intron 54 of 80) L1MB3|LINE|L1 -15125 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 128.667-89 chr2 68487738 68488021 + 0.666667 NA intron (NM_173545, intron 1 of 9) intron (NM_173545, intron 1 of 9) 20294 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 114-58 chr18 7284934 7285208 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53967 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 150.667-273 chr4 93542894 93543236 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 12 of 14) intron (NM_001286838, intron 12 of 14) -285688 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 119.333 chr1 15152984 15153190 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_027136) promoter-TSS (NR_027136) 521 NM_001136216 55092 Hs.465305 NM_018022 ENSG00000171729 TMEM51 C1orf72 transmembrane protein 51 protein-coding 152.667-215 chr2 228550232 228550637 + 0.666667 NA intron (NR_151716, intron 1 of 3) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 60961 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 159.667-204 chr22 29347618 29347958 + 0.666667 NA intron (NM_001166019, intron 11 of 20) L1ME4b|LINE|L1 -14530 NR_003686 100113380 NR_003686 ENSG00000239127 SNORD125 - small nucleolar RNA, C/D box 125 snoRNA 141.667-26 chr10 51533196 51533443 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 166276 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 114.667-162 chr21 32014172 32014466 + 0.666667 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner 71976 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 144.667-163 chr2 218666045 218666428 + 0.666667 NA intron (NM_022453, intron 5 of 9) intron (NM_022453, intron 5 of 9) 5766 NM_022453 64320 Hs.471403 NM_022453 ENSG00000163481 RNF25 AO7 ring finger protein 25 protein-coding 112.333-187 chr4 76079558 76079820 + 0.666667 NA intron (NM_001130017, intron 2 of 9) L2|LINE|L2 4994 NM_001179 419 Hs.24976 NM_001179 ENSG00000156219 ART3 ARTC3 ADP-ribosyltransferase 3 protein-coding 118-135 chr9 29051201 29051507 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) L1MC1|LINE|L1 160945 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 201-69 chr22 16849124 16849479 + 0.666667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 21827 NR_003607 27437 Hs.143955 NR_003607 ENSG00000229027 HSFY1P1 CECR8|HSFYL1|HSFYP1|NCRNA00016 HSFY1 pseudogene 1 pseudo 114.333-179 chr5 91252035 91252211 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62279 NR_103548 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 226.333-70 chr22 21978451 21979050 + 0.666667 NA intron (NM_001349847, intron 1 of 18) L2b|LINE|L2 4037 NR_146277 8940 Hs.436401 NM_003935 ENSG00000100038 TOP3B TOP3B1 DNA topoisomerase III beta protein-coding 150.333-361 chr6 70019082 70019409 + 0.666667 NA intron (NM_001858, intron 11 of 50) MIRb|SINE|MIR 152689 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 214.667-103 chr6 11716986 11717459 + 0.666667 NA intron (NM_032744, intron 5 of 5) intron (NM_032744, intron 5 of 5) 61825 NM_001143948 84830 Hs.126409 NM_032744 ENSG00000111863 ADTRP AIG1L|C6orf105|dJ413H6.1 androgen dependent TFPI regulating protein protein-coding 151.333-286 chr3 113324829 113325115 + 0.666667 NA intron (NM_001164496, intron 28 of 34) L1MD|LINE|L1 -79026 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 194-147 chr8 114962478 114962957 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 705296 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 120-95 chr4 61300230 61300421 + 0.666667 NA intron (NM_001371342, intron 1 of 20) intron (NM_001371342, intron 1 of 20) 98153 NM_001371342 149.333-400 chr8 95262106 95262487 + 0.666667 NA intron (NM_001363260, intron 2 of 4) intron (NM_001363260, intron 2 of 4) -6540 NR_038205 100616530 Hs.554328 NR_038201 ENSG00000253773 C8orf37-AS1 - C8orf37 antisense RNA 1 ncRNA 111.667-273 chr9 104802142 104802327 + 0.666667 NA intron (NM_005502, intron 33 of 49) intron (NM_005502, intron 33 of 49) 38105 NR_130760 55335 Hs.429294 NM_018376 ENSG00000165028 NIPSNAP3B FP944|NIPSNAP3|SNAP1 nipsnap homolog 3B protein-coding 154.667-335 chr6 44963201 44963506 + 0.666667 NA intron (NM_181356, intron 8 of 12) AluSz|SINE|Alu 234417 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 112-135 chr3 34850691 34850870 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 543243 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 127.333-131 chr4 84031820 84032106 + 0.666667 NA intron (NR_125909, intron 7 of 8) intron (NR_125909, intron 7 of 8) 267206 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 132.333-170 chr7 86825049 86825275 + 0.666667 NA intron (NM_001363522, intron 3 of 4) L1PA15|LINE|L1 140737 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 137.333-98 chr2 64874100 64874432 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10635 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 130.333-199 chr7 94145245 94145507 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -141021 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 289.333-54 chr5 166401583 166402316 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 524421 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 198.333-8 chr1 63966138 63966573 + 0.666667 NA intron (NM_005012, intron 1 of 8) intron (NM_005012, intron 1 of 8) 145850 NR_110666 101927034 Hs.680824 NR_110665 ENSG00000223949 ROR1-AS1 - ROR1 antisense RNA 1 ncRNA 123.333-13 chr1 111101592 111101852 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 -37661 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 151.667-147 chr17 62698248 62698681 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7742 NR_147886 105371855 Hs.446268 NR_147886 ENSG00000265702 LOC105371855 - uncharacterized LOC105371855 ncRNA 209.667-67 chr2 111140475 111140848 + 0.666667 NA intron (NM_138625, intron 3 of 4) intron (NM_138625, intron 3 of 4) 19747 NM_138626 10018 Hs.469658 NM_006538 ENSG00000153094 BCL2L11 BAM|BIM|BOD BCL2 like 11 protein-coding 152.333-368 chr8 34304111 34304421 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -479655 NR_125746 103689844 Hs.590682 NR_125746 ENSG00000254344 LINC01288 TCONS_00014671 long intergenic non-protein coding RNA 1288 ncRNA 111.667-260 chr8 104418131 104418458 + 0.666667 NA intron (NM_001385, intron 7 of 9) intron (NM_001385, intron 7 of 9) 48761 NM_001385 1807 Hs.443161 NM_001385 ENSG00000147647 DPYS DHP|DHPase dihydropyrimidinase protein-coding 166.333-155 chr3 65990312 65990660 + 0.666667 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -35928 NR_145422 151877 Hs.476636 NR_145422 ENSG00000272610 MAGI1-IT1 - MAGI1 intronic transcript 1 ncRNA 246-105 chr8 112364033 112364547 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 34 of 66) intron (NM_001363185, intron 34 of 66) -279203 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 158.667-336 chr8 136612366 136612727 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 81748 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 119.333-226 chr8 137573780 137574105 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -160354 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 116-20 chr10 57894621 57894837 + 0.666667 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 373165 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 143-26 chr11 112814259 112814535 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -147023 NM_001242607 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 148.667-375 chr8 80271393 80271686 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 30150 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 130-13 chr10 44545380 44545656 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -160421 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 139.333-204 chr7 106407292 106407662 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -122494 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 182.667-27 chr11 102062308 102062829 + 0.666667 NA intron (NM_001195005, intron 3 of 3) MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 15130 NM_001363505 85016 Hs.98328 NM_032930 ENSG00000137691 CFAP300 C11orf70|CILD38 cilia and flagella associated protein 300 protein-coding 151.333-7 chr1 53991464 53991764 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26572 NM_001010978 388633 Hs.439583 NM_001010978 ENSG00000203985 LDLRAD1 - low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 protein-coding 120.667-12 chr1 218508434 218508750 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 2 of 6) THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -1503 NR_146760 440714 Hs.146774 NR_146760 ENSG00000228208 C1orf143 - chromosome 1 open reading frame 143 (putative) ncRNA 125.667-160 chr5 171758032 171758244 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -27734 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 231-45 chr3 194388647 194389084 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 10401 NM_004488 2814 Hs.73734 NM_004488 ENSG00000178732 GP5 CD42d|GPV glycoprotein V platelet protein-coding 114-22 chr12 2979891 2980100 + 0.666667 NA intron (NM_201443, intron 1 of 10) intron (NM_201443, intron 1 of 10) 20060 NM_201443 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 138.667-87 chr18 41693285 41693573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -172752 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 150-113 chr5 39588741 39589112 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 68495 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 168.667-151 chr3 167680282 167680642 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -22539 NM_001348951 151790 Hs.213762 NM_178824 ENSG00000174776 WDR49 - WD repeat domain 49 protein-coding 126.667-16 chr10 72911638 72911878 + 0.666667 NA exon (NM_152635, exon 5 of 9) exon (NM_152635, exon 5 of 9) 18019 NR_130125 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 202.667-59 chr15 70267777 70268342 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -170142 NM_001282980 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 154.333-85 chr14 46217854 46218209 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) intron (NR_102702, intron 3 of 3) 153872 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 119.333-72 chr12 62525538 62525800 + 0.666667 NA intron (NM_001278469, intron 10 of 35) intron (NM_001278469, intron 10 of 35) 58843 NM_001278471 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 115-58 chr14 52789769 52789955 + 0.666667 NA intron (NM_198066, intron 1 of 5) intron (NM_198066, intron 1 of 5) 1745 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 130.333-9 chr1 90980331 90980600 + 0.666667 NA intron (NM_201269, intron 2 of 5) intron (NM_201269, intron 2 of 5) 41043 NM_016620 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 224.333-30 chr12 73441210 73441734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282282 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 158-127 chr7 39560064 39560413 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6166 NM_020192 57002 Hs.72168 NM_020192 ENSG00000241127 YAE1 C7orf36|CIAB2|GK003|YAE1D1 YAE1 maturation factor of ABCE1 protein-coding 116.333-120 chr2 104815003 104815226 + 0.666667 NA intron (NR_037883, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 36362 NR_037883 100506421 Hs.437281 NR_037883 ENSG00000233639 PANTR1 LINC01158|linc-Brn1a|linc-POU3F3 POU3F3 adjacent non-coding transcript 1 ncRNA 227-22 chr15 86008387 86008811 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71021 NM_152336 123624 Hs.31795 NM_152336 ENSG00000273540 AGBL1 CCP4|FECD8 ATP/GTP binding protein like 1 protein-coding 229-58 chr6 38466027 38466602 + 0.666667 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) AluSq2|SINE|Alu -15282 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 241-54 chr7 77916318 77916755 + 0.666667 NA intron (NM_001366085, intron 7 of 10) AluJo|SINE|Alu 76406 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 121.667-6 chr1 52774652 52774931 + 0.666667 NA intron (NM_024646, intron 3 of 13) intron (NM_024646, intron 3 of 13) 48338 NM_024646 79699 Hs.476280 NM_024646 ENSG00000162378 ZYG11B ZYG11 zyg-11 family member B, cell cycle regulator protein-coding 160.333-14 chr1 61260698 61261029 + 0.666667 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) AluY|SINE|Alu -7345 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 208.333-117 chr5 87112932 87113469 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1754 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 152-22 chr10 54474487 54474845 + 0.666667 NA intron (NM_001142773, intron 2 of 31) intron (NM_001142773, intron 2 of 31) -11564 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 111.667-80 chr14 47711164 47711333 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -36294 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 167-4 chr1 105718728 105719076 + 0.666667 NA Intergenic L1P1|LINE|L1 -99967 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 113-203 chr8 80525859 80526061 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_023929, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_023929, exon 7 of 7) 39734 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 151.667-77 chr12 1355889 1356178 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 15 of 19) AluJb|SINE|Alu -144458 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 112.667-160 chr21 31188429 31188685 + 0.666667 NA intron (NM_001353686, intron 13 of 27) intron (NM_001353686, intron 13 of 27) -27617 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 250.667-49 chr3 63797817 63798411 + 0.666667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -21185 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 112-197 chr8 59416058 59416356 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 296997 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 139.333-180 chr5 34946092 34946483 + 0.666667 NA intron (NM_001012339, intron 9 of 11) intron (NM_001012339, intron 9 of 11) 16694 NM_194283 134218 Hs.131887 NM_194283 ENSG00000168724 DNAJC21 BMFS3|DNAJA5|GS3|JJJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C21 protein-coding 155-100 chr4 81925887 81926290 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 447903 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 141-67 chr5 79702434 79702702 + 0.666667 NA intron (NM_153610, intron 1 of 12) L1MB7|LINE|L1 12732 NM_153610 202333 Hs.482625 NM_153610 ENSG00000164309 CMYA5 C5orf10|SPRYD2|TRIM76 cardiomyopathy associated 5 protein-coding 226.333-39 chr16 87591996 87592633 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9521 NR_073379 57338 Hs.592068 NM_020655 ENSG00000154118 JPH3 CAGL237|HDL2|JP-3|JP3|TNRC22 junctophilin 3 protein-coding 188-33 chr14 47756552 47757022 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4317 NR_037503 100500919 NR_037503 ENSG00000263945 MIR548Y - microRNA 548y ncRNA 163.667-42 chr11 113070774 113071237 + 0.666667 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -107545 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 233-28 chr15 65601655 65602182 + 0.666667 NA intron (NR_045901, intron 2 of 10) intron (NR_045901, intron 2 of 10) 9213 NR_045106 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 148-135 chr5 113566686 113567029 + 0.666667 NA intron (NM_001345975, intron 20 of 28) intron (NM_001345975, intron 20 of 28) 53163 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 182-118 chr9 68513930 68514336 + 0.666667 NA intron (NM_021965, intron 10 of 10) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 26734 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 121-114 chr5 75170999 75171357 + 0.666667 NA intron (NM_001164443, intron 10 of 24) L1MEf|LINE|L1 65700 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 197-115 chr8 102772458 102772896 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -34145 NR_149020 401472 NR_149020 GASAL1 GASL1 growth arrest associated lncRNA 1 ncRNA 146.333-141 chr2 33378441 33378846 + 0.666667 NA intron (NM_206943, intron 31 of 33) intron (NM_206943, intron 31 of 33) -39873 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 157.667-15 chr1 171739877 171740201 + 0.666667 NA intron (NM_001185127, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 2026 NM_001185127 8674 Hs.6651 NM_003762 ENSG00000117533 VAMP4 VAMP-4|VAMP24 vesicle associated membrane protein 4 protein-coding 151.667-108 chr14 42510808 42511155 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 904125 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 135.667-103 chr2 232209310 232209566 + 0.666667 NA intron (NR_046477, intron 8 of 18) intron (NR_046477, intron 8 of 18) 36785 NR_030288 693147 NR_030288 ENSG00000207626 MIR562 MIRN562|hsa-mir-562 microRNA 562 ncRNA 135.667-69 chr16 73310050 73310285 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -76638 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 120-44 chr15 91584740 91585008 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR 121535 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 116-123 chr5 44049804 44050090 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -338785 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 158-122 chr6 120144263 120144623 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 129264 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 137.333-73 chr17 82760083 82760347 + 0.666667 NA intron (NM_005993, intron 2 of 38) intron (NM_005993, intron 2 of 38) 8150 NM_005993 6904 Hs.464391 NM_005993 ENSG00000141556 TBCD PEBAT|SSD-1|tfcD tubulin folding cofactor D protein-coding 124.667-188 chr7 37840943 37841168 + 0.666667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -7542 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 113.333-43 chr11 27503321 27503638 + 0.666667 NA intron (NM_018362, intron 1 of 4) intron (NM_018362, intron 1 of 4) 3290 NM_018362 55327 Hs.91393 NM_018362 ENSG00000148943 LIN7C LIN-7-C|LIN-7C|MALS-3|MALS3|VELI3 lin-7 homolog C, crumbs cell polarity complex component protein-coding 117.667-142 chr4 105395232 105395467 + 0.666667 NA intron (NM_176869, intron 9 of 11) intron (NM_176869, intron 9 of 11) -42468 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 136.333-18 chr10 28097331 28097642 + 0.666667 NA intron (NR_134518, intron 10 of 16) intron (NR_134518, intron 10 of 16) -24108 NR_132973 106635548 NR_132973 SNORD130 - small nucleolar RNA, C/D box 130 snoRNA 146-132 chr7 135780900 135781193 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -32233 NM_205855 389558 Hs.55200 NM_205855 ENSG00000189320 FAM180A UNQ1940 family with sequence similarity 180 member A protein-coding 173-15 chr11 41403021 41403511 + 0.666667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 56370 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 114.667-30 chr10 39076623 39076823 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 380127 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 190.333-93 chr3 120133082 120133472 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -38830 NM_001146156 2932 Hs.445733 NM_002093 ENSG00000082701 GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta protein-coding 205-61 chr3 132792761 132793107 + 0.666667 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) intron (NR_002811, intron 3 of 10) -70475 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 113-138 chr3 68462368 68462555 + 0.666667 NA intron (NM_001252216, intron 3 of 4) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -38176 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 154-18 chr10 75169254 75169711 + 0.666667 NA intron (NM_001174156, intron 4 of 5) AluSg4|SINE|Alu -40672 NM_001184823 7417 Hs.355927 NM_003375 ENSG00000165637 VDAC2 POR voltage dependent anion channel 2 protein-coding 176.667-36 chr11 44597663 44598014 + 0.666667 NA intron (NM_001024844, intron 3 of 8) intron (NM_001024844, intron 3 of 8) 32175 NM_002231 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 130.667-118 chr2 166789239 166789518 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -99109 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 143.333-252 chr6 141400603 141400930 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 688033 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 215.667-25 chr12 4575732 4576216 + 0.666667 NA intron (NM_001371301, intron 2 of 14) L1MC2|LINE|L1 13766 NM_001371301 116.667-181 chr6 153379532 153379742 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -248355 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 180-119 chr9 24730188 24730667 + 0.666667 NA Intergenic LTR28B|LTR|ERV1 -184530 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 114.333-66 chr13 109420599 109420774 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19990 NR_126361 104326054 Hs.569298 NR_126361 ENSG00000229792 LINC00399 TCONS_00021596 long intergenic non-protein coding RNA 399 ncRNA 168.333-94 chr2 65418287 65418718 + 0.666667 NA intron (NM_181784, intron 1 of 5) intron (NM_181784, intron 1 of 5) 14097 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 162-124 chr8 117709656 117710044 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 189137 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 146.333-305 chr7 40383421 40383815 + 0.666667 NA intron (NM_024728, intron 9 of 14) L2c|LINE|L2 248642 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 169.667-91 chr17 62040108 62040579 + 0.666667 NA intron (NM_005121, intron 3 of 29) intron (NM_005121, intron 3 of 29) 24935 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 127.667-178 chr8 101780212 101780425 + 0.666667 NA intron (NM_001040628, intron 4 of 7) intron (NM_001040628, intron 4 of 7) 10651 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 113.667-56 chr14 26531841 26532051 + 0.666667 NA intron (NM_001366393, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 21484 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 126-85 chr4 96280984 96281219 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29602 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 141.333-185 chr5 17149739 17150062 + 0.666667 NA intron (NR_027253, intron 2 of 2) intron (NR_027253, intron 2 of 2) 6092 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 180-82 chr5 180780175 180780558 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22440 NM_001364393 4245 Hs.519818 NM_002406 ENSG00000131446 MGAT1 GLCNAC-TI|GLCT1|GLYT1|GNT-1|GNT-I|GnTI|MGAT mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 147-59 chr18 22996780 22997081 + 0.666667 NA intron (NM_002894, intron 13 of 18) AluJr|SINE|Alu 63054 NM_203291 5932 Hs.546282 NM_002894 ENSG00000101773 RBBP8 COM1|CTIP|JWDS|RIM|SAE2|SCKL2 RB binding protein 8, endonuclease protein-coding 171.333-112 chr3 21487688 21488055 + 0.666667 NA intron (NM_024697, intron 4 of 7) MIR|SINE|MIR -54918 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 326.333-9 chr16 9658916 9659601 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -203753 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 152.333-196 chr2 165980789 165981081 + 0.666667 NA intron (NR_110598, intron 1 of 3) intron (NR_110598, intron 1 of 3) 23517 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 180.333-145 chr8 129859808 129860194 + 0.666667 NA intron (NM_001353282, intron 4 of 10) intron (NM_001353282, intron 4 of 10) -73377 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 134.333-57 chr15 60532811 60533053 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) intron (NM_134261, intron 2 of 10) 53754 NR_120341 101928784 Hs.655155 NR_120339 ENSG00000245534 RORA-AS1 - RORA antisense RNA 1 ncRNA 146-66 chr2 204441995 204442290 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103333 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 115-96 chr2 192986996 192987321 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 237313 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 126.667-122 chr4 59248364 59248630 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 234924 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 173.666-8 chr2 162291866 162292383 + 0.666667 NA intron (NM_022168, intron 4 of 15) L2a|LINE|L2 26560 NM_022168 64135 Hs.163173 NM_022168 ENSG00000115267 IFIH1 AGS7|Hlcd|IDDM19|MDA-5|MDA5|RLR-2|SGMRT1 interferon induced with helicase C domain 1 protein-coding 192.667-60 chr14 86225532 86225969 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 291072 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 143-109 chr7 4293684 4294037 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -159023 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 159.333-63 chr12 501812 502174 + 0.666667 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) intron (NM_173593, intron 1 of 19) 42054 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 156-32 chr12 3987437 3987872 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -114206 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 152-154 chr8 90125977 90126319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43269 NM_004929 793 Hs.65425 NM_004929 ENSG00000104327 CALB1 CALB|D-28K calbindin 1 protein-coding 204-83 chr18 6321361 6321826 + 0.666667 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) L1PB3|LINE|L1 37437 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 130.333-179 chr6 46732718 46732919 + 0.666667 NA intron (NM_001168357, intron 1 of 11) intron (NM_001168357, intron 1 of 11) 2557 NM_005084 7941 Hs.584823 NM_005084 ENSG00000146070 PLA2G7 LDL-PLA2|LP-PLA2|PAFAD|PAFAH phospholipase A2 group VII protein-coding 192.667-9 chr1 161259700 161260229 + 0.666667 NA intron (NM_001102566, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 1219 NM_001102566 654790 Hs.433150 NM_001102566 ENSG00000248485 PCP4L1 IQM1 Purkinje cell protein 4 like 1 protein-coding 193.333-81 chr18 67841634 67842152 + 0.666667 NA intron (NR_033921, intron 3 of 4) intron (NR_033921, intron 3 of 4) -27071 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 122.667-35 chr12 14645486 14645691 + 0.666667 NA intron (NM_004963, intron 15 of 26) intron (NM_004963, intron 15 of 26) 51011 NM_004963 2984 Hs.524278 NM_004963 ENSG00000070019 GUCY2C DIAR6|GC-C|GUC2C|MECIL|MUCIL|STAR guanylate cyclase 2C protein-coding 115.333-17 chr1 194354750 194354998 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1050129 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 125.667-181 chr7 125968214 125968523 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -704077 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 223.667-69 chr5 51339268 51339673 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43862 NR_046243 642366 Hs.544139 NR_046243 LOC642366 - uncharacterized LOC642366 ncRNA 135.333-58 chr15 82732214 82732473 + 0.666667 NA intron (NR_036446, intron 2 of 2) intron (NR_036446, intron 2 of 2) 7437 NR_036446 283693 Hs.560399 NR_036446 ACTG1P17 - actin gamma 1 pseudogene 17 pseudo 246.667-90 chr8 17619364 17619911 + 0.666667 NA intron (NM_006207, intron 3 of 6) intron (NM_006207, intron 3 of 6) 43204 NM_006207 5157 Hs.458573 NM_006207 ENSG00000104213 PDGFRL PDGRL|PRLTS platelet derived growth factor receptor like protein-coding 140.667-33 chr10 44227145 44227440 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -65458 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 198.667-17 chr10 11532166 11532672 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001080491) promoter-TSS (NM_001080491) -139 NM_001080491 9712 Hs.498661 NM_014688 ENSG00000148429 USP6NL RNTRE|TRE2NL|USP6NL-IT1 USP6 N-terminal like protein-coding 149-141 chr8 72353616 72353969 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102158 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 117.333-168 chr5 71675378 71675674 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -43749 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 199-119 chr8 92119631 92119987 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -16424 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 133.667-74 chr2 64161768 64162139 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -17533 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 154-17 chr10 64537077 64537385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -288297 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 112.667-234 chr6 117915427 117915686 + 0.666667 NA intron (NM_001029858, intron 1 of 7) intron (NM_001029858, intron 1 of 7) 8292 NM_001029858 222553 Hs.654841 NM_001029858 ENSG00000196376 SLC35F1 C6orf169|dJ230I3.1 solute carrier family 35 member F1 protein-coding 143 chr1 13706646 13706926 + 0.666667 NA intron (NM_012231, intron 1 of 9) intron (NM_012231, intron 1 of 9) 1931 NM_012231 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 184.333-50 chr15 61728044 61728398 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1697 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 152.333-275 chr4 82550912 82551313 + 0.666667 NA intron (NM_001353454, intron 1 of 7) intron (NM_001353454, intron 1 of 7) 10876 NM_001353455 441027 Hs.507676 NM_001080506 ENSG00000249242 TMEM150C TTN3 transmembrane protein 150C protein-coding 155.667-68 chr12 25788510 25788954 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 85347 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 161.333-106 chr16 24216761 24217155 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002738, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_002738, exon 17 of 17) 13842 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 224-64 chr4 18003065 18003640 + 0.666667 NA intron (NR_158566, intron 1 of 5) L2|LINE|L2 18403 NR_136669 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 121-61 chr18 63676314 63676598 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -14563 NM_006919 6317 Hs.227948 NM_006919 ENSG00000057149 SERPINB3 HsT1196|SCC|SCCA-1|SCCA-PD|SCCA1|SSCA1|T4-A serpin family B member 3 protein-coding 128-103 chr7 16712083 16712368 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -41530 NM_014399 27075 Hs.364544 NM_014399 ENSG00000106537 TSPAN13 NET-6|NET6|TM4SF13 tetraspanin 13 protein-coding 115-80 chr18 2515276 2515490 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 56122 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 185.667-11 chr10 57410228 57410620 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -105865 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 151-68 chr20 3653197 3653490 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2-int|LTR|ERVL-MaLR 10056 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 161.333-191 chr3 97746607 97747087 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 16 of 17) intron (NM_001080448, intron 16 of 17) -17674 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 124.333-27 chr11 81374015 81374378 + 0.666667 NA Intergenic (CTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 516640 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 253-36 chr2 67723032 67723747 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 102173 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 145-31 chr14 65174927 65175211 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47278 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 185.667-59 chr19 24334649 24335047 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -171401 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 112.667-101 chr18 22785988 22786183 + 0.666667 NA intron (NR_110782, intron 1 of 1) intron (NR_110782, intron 1 of 1) 752 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 123.333-229 chr9 29833486 29833726 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 574848 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 176.333-10 chr1 90079517 90079813 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 84555 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 114.333-131 chr20 23281973 23282165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68722 NM_013248 29107 Hs.516933 NM_013248 ENSG00000132661 NXT1 MTR2|P15 nuclear transport factor 2 like export factor 1 protein-coding 173.667-112 chr3 80833573 80833945 + 0.666667 NA Intergenic MER4D0|LTR|ERV1 63055 NR_147145 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 152.667-89 chr12 98978794 98979117 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) AluY|SINE|Alu -83664 NM_001352211 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 115.333-147 chr3 152313350 152313629 + 0.666667 NA intron (NM_207296, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 14084 NM_207295 4154 Hs.201858 NM_021038 ENSG00000152601 MBNL1 EXP|MBNL muscleblind like splicing regulator 1 protein-coding 115-30 chr10 89034006 89034185 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29241 NR_039826 100616128 NR_039826 ENSG00000283664 MIR4679-1 - microRNA 4679-1 ncRNA 183.667-132 chr7 32595508 32595921 + 0.666667 NA intron (NR_036680, intron 12 of 16) AluSx|SINE|Alu 100225 NM_015060 23080 Hs.128056 NM_015060 ENSG00000105778 AVL9 KIAA0241 AVL9 cell migration associated protein-coding 112-94 chr18 54720510 54720752 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -107846 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 130.667-74 chr15 81825364 81825690 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 220491 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 137-57 chr21 26756575 26756849 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 88697 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 129.333-29 chr10 120191043 120191397 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 164003 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 162-44 chr14 69912531 69912891 + 0.666667 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 33295 NM_001034852 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 134.667-183 chr7 41330967 41331220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 229489 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 160.333-55 chr11 13588409 13588677 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -80125 NM_032228 84188 Hs.501991 NM_032228 ENSG00000197601 FAR1 MLSTD2|PFCRD|SDR10E1 fatty acyl-CoA reductase 1 protein-coding 111.667-178 chr4 11535697 11535983 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106946 NM_005114 9957 Hs.507348 NM_005114 ENSG00000002587 HS3ST1 3OST|3OST1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 1 protein-coding 139.667-196 chr8 129724268 129724572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44181 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 198.333-171 chr5 158177219 158177716 + 0.666667 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie 232306 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 147.333-233 chr4 40660086 40660498 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -29698 NM_001371114 144.667-330 chrX 99784340 99784625 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 625791 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 162-79 chr22 32632686 32633109 + 0.666667 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) 157660 NM_001257990 25793 Hs.5912 NM_012179 ENSG00000100225 FBXO7 FBX|FBX07|FBX7|PARK15|PKPS F-box protein 7 protein-coding 117-66 chr17 81371797 81372037 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 13208 NM_001347841 100130370 Hs.646594 NM_001272086 LOC100130370 - uncharacterized LOC100130370 protein-coding 111.667-224 chr6 75216491 75216776 + 0.666667 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -10580 NM_080645 1303 Hs.101302 NM_004370 ENSG00000111799 COL12A1 BA209D8.1|BTHLM2|COL12A1L|DJ234P15.1|EDSMYP|UCMD2 collagen type XII alpha 1 chain protein-coding 166-113 chr7 128194549 128194861 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13167 NR_029596 406917 NR_029596 ENSG00000207705 MIR129-1 MIR-129b|MIRN129-1|mir-129-1 microRNA 129-1 ncRNA 172.333-47 chr14 49236507 49236959 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 349647 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 117.667-209 chr9 134869273 134869522 + 0.666667 NA intron (NR_103451, intron 1 of 1) intron (NR_103451, intron 1 of 1) 3221 NR_103451 101448202 Hs.679677 NR_103451 LOC101448202 - uncharacterized LOC101448202 ncRNA 167-92 chr7 11763771 11764269 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 68178 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 134.333-91 chr2 165095846 165096224 + 0.666667 NA intron (NM_006922, intron 24 of 27) intron (NM_006922, intron 24 of 27) 108015 NM_006922 6328 Hs.435274 NM_006922 ENSG00000153253 SCN3A EIEE62|FFEVF4|NAC3|Nav1.3 sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 protein-coding 177-49 chr3 36167207 36167663 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -213052 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 136-7 chr10 17413317 17413658 + 0.666667 NA intron (NM_001004470, intron 2 of 7) intron (NM_001004470, intron 2 of 7) 26551 NR_034129 100128098 Hs.530588 NR_034129 ENSG00000204832 ST8SIA6-AS1 - ST8SIA6 antisense RNA 1 ncRNA 174-3 chr1 95978955 95979330 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -12926 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 139.667-207 chr9 72126239 72126510 + 0.666667 NA intron (NM_001242507, intron 1 of 13) L2b|LINE|L2 11779 NM_001242507 9615 Hs.494163 NM_004293 ENSG00000119125 GDA CYPIN|GAH|GUANASE|NEDASIN guanine deaminase protein-coding 143.333-85 chr14 56698278 56698516 + 0.666667 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 107270 NM_172337 5015 Hs.288655 NM_021728 ENSG00000165588 OTX2 CPHD6|MCOPS5 orthodenticle homeobox 2 protein-coding 149.667-358 chr6 129980418 129980779 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -37771 NM_032438 84456 Hs.658051 NM_032438 ENSG00000198945 L3MBTL3 MBT-1|MBT1 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 3 protein-coding 111.667-252 chr8 63863710 63864003 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) L1MD1|LINE|L1 94426 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 149.333-237 chr3 34542530 34542840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 744055 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 161.667-209 chr5 124521032 124521391 + 0.666667 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -82691 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 114.667-186 chr4 15914365 15914557 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24279 NM_005130 9982 Hs.1690 NM_005130 ENSG00000137440 FGFBP1 FGF-BP|FGF-BP1|FGFBP|FGFBP-1|HBP17 fibroblast growth factor binding protein 1 protein-coding 142-56 chr17 44693940 44694358 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -4352 NM_001099225 124808 Hs.579115 NM_144609 ENSG00000180329 CCDC43 - coiled-coil domain containing 43 protein-coding 168.333-182 chr6 122106538 122106920 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -292822 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 154-106 chr4 87434696 87435080 + 0.666667 NA intron (NM_024047, intron 1 of 7) AluSq2|SINE|Alu 12291 NM_198038 53343 Hs.149500 NM_024047 ENSG00000170502 NUDT9 NUDT10 nudix hydrolase 9 protein-coding 121.667-30 chr10 74425142 74425419 + 0.666667 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) L1MEd|LINE|L1 104044 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 113.333-252 chr8 28377979 28378151 + 0.666667 NA intron (NM_018660, intron 1 of 9) intron (NM_018660, intron 1 of 9) 8395 NM_018660 55893 Hs.435535 NM_018660 ENSG00000186918 ZNF395 HDBP-2|HDBP2|HDRF-2|PBF|PRF-1|PRF1|Si-1-8-14 zinc finger protein 395 protein-coding 166 chr1 8693375 8693706 + 0.666667 NA intron (NM_001042681, intron 1 of 22) L1MC2|LINE|L1 124100 NM_012102 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 152.333-302 chr5 74727296 74727599 + 0.666667 NA intron (NR_104006, intron 16 of 19) intron (NR_104006, intron 16 of 19) 39670 NM_001281302 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 217.667-65 chr4 42523950 42524397 + 0.666667 NA intron (NM_001105529, intron 20 of 35) intron (NM_001105529, intron 20 of 35) 126685 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 134-56 chr20 57556656 57556922 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4321 NM_002591 5105 Hs.1872 NM_002591 ENSG00000124253 PCK1 PCKDC|PEPCK-C|PEPCK1|PEPCKC phosphoenolpyruvate carboxykinase 1 protein-coding 135.667-2 chr1 26738207 26738575 + 0.666667 NA intron (NM_139135, intron 4 of 19) intron (NM_139135, intron 4 of 19) 42376 NM_006015 8289 Hs.468972 NM_006015 ENSG00000117713 ARID1A B120|BAF250|BAF250a|BM029|C1orf4|CSS2|ELD|MRD14|OSA1|P270|SMARCF1|hELD|hOSA1 AT-rich interaction domain 1A protein-coding 139.667-65 chr16 80742524 80742852 + 0.666667 NA intron (NM_152342, intron 1 of 6) (ATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 61910 NM_152342 124359 Hs.60257 NM_152342 ENSG00000166446 CDYL2 PCCP1 chromodomain Y like 2 protein-coding 121-116 chr5 108022856 108023066 + 0.666667 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) -352024 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 126.333-192 chrX 74693530 74693804 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -79043 NM_016120 51132 Hs.653288 NM_016120 ENSG00000131263 RLIM MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS ring finger protein, LIM domain interacting protein-coding 134.333-173 chr8 80727506 80727775 + 0.666667 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) intron (NM_001033723, intron 2 of 8) 146828 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 192-147 chr8 113852656 113853127 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -415952 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 141-23 chr14 24700412 24700801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66416 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 155.333-396 chr8 112349392 112349693 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 36 of 66) intron (NM_001363185, intron 36 of 66) -293951 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 134-39 chr17 60416314 60416619 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6023 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 193.333-182 chr8 23284643 23285150 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3196 NM_001301650 203069 Hs.458644 NM_001136108 ENSG00000104679 R3HCC1 - R3H domain and coiled-coil containing 1 protein-coding 135.333-54 chr14 61423863 61424159 + 0.666667 NA intron (NM_006255, intron 2 of 13) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 102568 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 126-124 chr9 94602782 94603117 + 0.666667 NA TTS (NM_001127628) TTS (NM_001127628) -9125 NM_003837 8789 Hs.61255 NM_003837 ENSG00000130957 FBP2 - fructose-bisphosphatase 2 protein-coding 130.667-47 chr11 40321459 40321744 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -28471 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 142.333-98 chr16 52224228 52224634 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -34133 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 165-3 chr1 92452236 92452645 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 31514 NM_001127215 2672 Hs.73172 NM_005263 ENSG00000162676 GFI1 GFI-1|GFI1A|SCN2|ZNF163 growth factor independent 1 transcriptional repressor protein-coding 119.333-34 chr10 68306434 68306737 + 0.666667 NA intron (NM_001033083, intron 2 of 8) intron (NM_001033083, intron 2 of 8) -25108 NM_001322445 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 143.667-70 chr14 46577302 46577582 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 74339 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 200.333-110 chr4 178287066 178287614 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -379404 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 210.333-133 chr5 53153162 53153700 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 43589 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 138.667-67 chr14 102058774 102059062 + 0.666667 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 28126 NM_005348 3320 Hs.525600 NM_005348 ENSG00000080824 HSP90AA1 EL52|HEL-S-65p|HSP86|HSP89A|HSP90A|HSP90N|HSPC1|HSPCA|HSPCAL1|HSPCAL4|HSPN|Hsp103|Hsp89|Hsp90|LAP-2|LAP2 heat shock protein 90 alpha family class A member 1 protein-coding 236-71 chr5 85955729 85956153 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -326503 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 197-48 chr18 24175849 24176358 + 0.666667 NA intron (NM_001242508, intron 9 of 15) L1ME1|LINE|L1 36619 NM_138644 26256 Hs.511983 NM_012189 ENSG00000154040 CABYR CABYRa|CABYRc|CABYRc/d|CABYRe|CBP86|CT88|FSP-2|FSP2 calcium binding tyrosine phosphorylation regulated protein-coding 127.333-123 chr3 180948173 180948441 + 0.666667 NA intron (NM_005087, intron 4 of 16) intron (NM_005087, intron 4 of 16) 35636 NM_001363882 8087 Hs.478407 NM_005087 ENSG00000114416 FXR1 FXR1P FMR1 autosomal homolog 1 protein-coding 120.333-97 chr2 63459080 63459389 + 0.666667 NA intron (NR_148704, intron 7 of 18) L1MA4A|LINE|L1 -21227 NR_122106 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 164-47 chr17 73184721 73185059 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -8165 NM_018714 9382 Hs.103555 NM_018714 ENSG00000166685 COG1 CDG2G|LDLB component of oligomeric golgi complex 1 protein-coding 185.333-33 chr11 97416746 97417114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 908505 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 152.333-244 chr3 118191071 118191467 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -450499 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 144.667-183 chr22_KI270733v1_random 150524 150819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19790 NR_162111 113218488 NR_162111 MIR10396B - microRNA 10396b ncRNA 169-34 chr16 53934810 53935145 + 0.666667 NA intron (NM_001363894, intron 9 of 9) intron (NM_001363894, intron 9 of 9) -104416 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 245.333-104 chr7 6263180 6263715 + 0.666667 NA intron (NM_001367581, intron 1 of 13) L1ME3Cz|LINE|L1 9177 NM_001367580 9265 Hs.487479 NM_004227 ENSG00000008256 CYTH3 ARNO3|GRP1|PSCD3|cytohesin-3 cytohesin 3 protein-coding 128.667-29 chr10 109911428 109911639 + 0.666667 NA intron (NM_001324132, intron 1 of 19) intron (NM_001324132, intron 1 of 19) 11713 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 132-45 chr15 80639313 80639642 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -55833 NM_021214 58489 Hs.459072 NM_021214 ENSG00000136379 ABHD17C FAM108C1 abhydrolase domain containing 17C protein-coding 145-10 chr10 44753646 44754031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -157478 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 112-194 chr8 25722487 25722818 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 263419 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 215.333-165 chr5 104824830 104825370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -274374 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 116.667-162 chr5 108113015 108113207 + 0.666667 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 268987 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 115-85 chr2 47592606 47592815 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -22379 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 134.333-21 chr10 75667513 75667756 + 0.666667 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) 20125 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 180-42 chr17 34144638 34145101 + 0.666667 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 11937 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 184.333-151 chr8 85191589 85192112 + 0.666667 NA intron (NM_001083589, intron 1 of 7) intron (NM_001083589, intron 1 of 7) 4185 NM_001083589 1875 Hs.445758 NM_001951 ENSG00000133740 E2F5 E2F-5 E2F transcription factor 5 protein-coding 141.667-105 chr18 77712404 77712784 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 281133 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 169.333-57 chr12 84777256 84777609 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 135367 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 259.333-85 chr6 70735611 70736367 + 0.666667 NA intron (NM_001044305, intron 2 of 10) intron (NM_001044305, intron 2 of 10) 67459 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 153.333-144 chr15 66340723 66341075 + 0.666667 NA intron (NM_001289986, intron 6 of 6) intron (NM_001289986, intron 6 of 6) 6443 NR_004388 692149 NR_004388 ENSG00000252712 SCARNA14 U100 small Cajal body-specific RNA 14 ncRNA 167.333-103 chr16 77481666 77482141 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46869 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 198-97 chr2 128496527 128497040 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR2c|LTR|Gypsy -177915 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 122.333-31 chr11 33882482 33882679 + 0.666667 NA intron (NM_005574, intron 1 of 5) intron (NM_005574, intron 1 of 5) 9496 NM_005574 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 245-5 chr1 188043541 188044124 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 600204 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 121.667-170 chr5 134601896 134602084 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_016103, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_016103, exon 7 of 7) 30838 NM_001033503 51128 Hs.432984 NM_016103 ENSG00000152700 SAR1B ANDD|CMRD|GTBPB|SARA2 secretion associated Ras related GTPase 1B protein-coding 119-50 chr14 73414306 73414555 + 0.666667 NA intron (NM_001005743, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 44150 NM_003744 8650 Hs.525443 NM_003744 ENSG00000133961 NUMB C14orf41|S171|c14_5527 NUMB endocytic adaptor protein protein-coding 112.667-49 chr12 32154557 32154765 + 0.666667 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) intron (NR_148725, intron 1 of 9) 47814 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 149-101 chr4 65803564 65803972 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -133273 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 213.333-42 chr12 52627847 52628463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9596 NM_175068 319101 Hs.55410 NM_175068 ENSG00000186049 KRT73 IRT6IRS3|K6IRS3|KRT6IRS3 keratin 73 protein-coding 140.667-200 chr6 103199119 103199379 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1660297 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 133-46 chr2 162798850 162799120 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) 30049 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 142-49 chr15 87169478 87169747 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -181186 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 127-104 chr9 80880737 80880997 + 0.666667 NA Intergenic (ATTTAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 808668 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 129-102 chr5 90495197 90495514 + 0.666667 NA intron (NM_001370351, intron 3 of 7) intron (NM_001370351, intron 3 of 7) 20491 NM_001370352 10622 Hs.282387 NM_006467 ENSG00000113356 POLR3G RPC32|RPC7 RNA polymerase III subunit G protein-coding 141.333-223 chr7 50484600 50484863 + 0.666667 NA intron (NM_001242888, intron 7 of 12) intron (NM_001242888, intron 7 of 12) -34325 NM_001287495 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 113-21 chr10 67155609 67155853 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) 143465 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 156-76 chr2 200167677 200167959 + 0.666667 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -138061 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 121.333-18 chr10 12023234 12023566 + 0.666667 NA intron (NM_080599, intron 3 of 21) AluSc|SINE|Alu 19409 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 149-36 chr12 132260253 132260685 + 0.666667 NA intron (NM_001122636, intron 4 of 10) intron (NM_001122636, intron 4 of 10) -14922 NR_024563 100130238 Hs.536338 NR_024563 LOC100130238 - uncharacterized LOC100130238 ncRNA 190-63 chr2 71677313 71677813 + 0.666667 NA intron (NM_001130985, intron 51 of 54) intron (NM_001130985, intron 51 of 54) 210864 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 184-8 chr1 193181207 193181623 + 0.666667 NA exon (NM_003783, exon 2 of 2) exon (NM_003783, exon 2 of 2) 5198 NM_003783 8707 Hs.518834 NM_003783 ENSG00000162630 B3GALT2 BETA3GALT2|GLCT2|beta3Gal-T2 beta-1,3-galactosyltransferase 2 protein-coding 211.333-148 chr3 9672294 9672790 + 0.666667 NA intron (NM_001077525, intron 6 of 18) intron (NM_001077525, intron 6 of 18) 23037 NM_001077526 64419 Hs.475382 NM_022485 ENSG00000163719 MTMR14 C3orf29 myotubularin related protein 14 protein-coding 157.333-123 chr15 66720315 66720627 + 0.666667 NA intron (NR_027654, intron 4 of 4) intron (NR_027654, intron 4 of 4) 18235 NR_027654 4091 Hs.153863 NM_005585 ENSG00000137834 SMAD6 AOVD2|HsT17432|MADH6|MADH7 SMAD family member 6 protein-coding 112-198 chr8 76820298 76820599 + 0.666667 NA intron (NM_024721, intron 4 of 10) intron (NM_024721, intron 4 of 10) -137173 NR_024360 100192378 Hs.596420 NR_024360 ENSG00000253661 ZFHX4-AS1 - ZFHX4 antisense RNA 1 ncRNA 117.333-107 chr2 180769923 180770238 + 0.666667 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 77976 NR_104323 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 194.333-45 chr14 83334553 83334872 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 692080 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 199.333-221 chr5 37120345 37120659 + 0.666667 NA intron (NM_023073, intron 48 of 51) FAM|SINE|Alu -128544 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 191.333-197 chr8 25703884 25704271 + 0.666667 NA Intergenic (ACCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 244844 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 127.333-33 chr11 116393300 116393522 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -246011 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 169.667-40 chr12 30459842 30460254 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 217196 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 218.667-70 chr3 171441809 171442395 + 0.666667 NA intron (NM_001161563, intron 1 of 31) intron (NM_001161563, intron 1 of 31) 18303 NM_001161566 23043 Hs.34024 NM_015028 ENSG00000154310 TNIK MRT54 TRAF2 and NCK interacting kinase protein-coding 169-54 chr20 34512766 34513110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3446 NR_104032 83658 Hs.593920 NM_014183 ENSG00000125971 DYNLRB1 BITH|BLP|DNCL2A|DNLC2A|ROBLD1 dynein light chain roadblock-type 1 protein-coding 214.667-30 chr12 20104140 20104575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23544 NR_146523 105369684 NR_146523 LINC02468 - long intergenic non-protein coding RNA 2468 ncRNA 172-98 chr6 125409134 125409529 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -107364 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 157-24 chr10 123777605 123778008 + 0.666667 NA intron (NM_198148, intron 7 of 13) intron (NM_198148, intron 7 of 13) 111451 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 169.667-198 chr7 107553780 107554188 + 0.666667 NA intron (NM_181733, intron 3 of 20) MIR|SINE|MIR -9973 NR_073004 11062 Hs.97627 NM_181581 ENSG00000105865 DUS4L DUS4|PP35 dihydrouridine synthase 4 like protein-coding 120.667-164 chr7 86943501 86943692 + 0.666667 NA intron (NM_001291991, intron 2 of 20) intron (NM_001291991, intron 2 of 20) 22303 NM_152748 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 121-76 chr2 164575034 164575269 + 0.666667 NA intron (NM_004490, intron 2 of 13) L1M7|LINE|L1 -6656 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 148-72 chr2 24515271 24515583 + 0.666667 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) AluJb|SINE|Alu 23550 NM_001362954 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 215.333-169 chr5 164840153 164840718 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 370156 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 116.667-152 chr4 154989317 154989557 + 0.666667 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 207932 NM_001277173 166863 Hs.133095 NM_144979 ENSG00000151962 RBM46 CT68 RNA binding motif protein 46 protein-coding 116-38 chr14 54715765 54716079 + 0.666667 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) intron (NM_001161576, intron 2 of 10) -38911 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 201.667-121 chr8 112796254 112796670 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) MIR|SINE|MIR 152969 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 119.333-197 chr6 162774088 162774308 + 0.666667 NA intron (NM_001080379, intron 1 of 4) intron (NM_001080379, intron 1 of 4) 46228 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 187.333 chr1 43059723 43060022 + 0.666667 NA Intergenic (TCAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -88032 NM_001101376 440585 Hs.657614 NM_001101376 ENSG00000186973 FAM183A - family with sequence similarity 183 member A protein-coding 227.333-97 chr5 12767574 12768121 + 0.666667 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) intron (NR_033383, intron 3 of 3) 99988 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 147.333-255 chr5 23583908 23584191 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76394 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 153.333-314 chr4 151662380 151662756 + 0.666667 NA exon (NM_001348694, exon 13 of 13) exon (NM_001348694, exon 13 of 13) 98439 NM_004564 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 137.667-25 chr10 54488187 54488423 + 0.666667 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) LTR37-int|LTR|ERV1 2075 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 114.333-63 chr13 75056167 75056444 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 184076 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 112.333-97 chr17 62956643 62956883 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -9472 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 121.333-33 chr11 97887159 97887501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1133619 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 140-30 chr12 114343228 114343511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62775 NM_181486 6910 Hs.381715 NM_000192 ENSG00000089225 TBX5 HOS T-box transcription factor 5 protein-coding 111.667-17 chr1 188903100 188903309 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1459576 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 182.667-21 chr10 121889503 121889870 + 0.666667 NA intron (NM_001001976, intron 7 of 11) AluJr|SINE|Alu 38345 NM_007041 11101 Hs.632080 NM_007041 ENSG00000107669 ATE1 - arginyltransferase 1 protein-coding 112.667-141 chr2 208515859 208516140 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -26643 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 198.333-154 chr5 12248531 12248974 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -326105 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 113.333-171 chr3 55010647 55010842 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 34 of 37) intron (NM_018398, intron 34 of 37) -43642 NM_001304389 57408 Hs.591668 NM_020678 ENSG00000144771 LRTM1 HT017 leucine rich repeats and transmembrane domains 1 protein-coding 267.667-36 chr21 28357535 28358230 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129215 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 210.667-48 chr15 66549142 66549615 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001287822, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_001287822, exon 18 of 18) 16119 NM_207338 197021 Hs.680983 NM_207338 ENSG00000188501 LCTL KLG|KLPH lactase like protein-coding 132.333-154 chr6 116510367 116510669 + 0.666667 NA intron (NM_001139444, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu -1121 NM_153711 254228 Hs.105081 NM_153711 ENSG00000178033 CALHM5 C6orf188|FAM26E|dJ493F7.3 calcium homeostasis modulator family member 5 protein-coding 321.667-14 chr4 141462098 141462764 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -129814 NR_121625 100507639 Hs.535010 NR_121625 LINC02432 - long intergenic non-protein coding RNA 2432 ncRNA 123-65 chr2 124320398 124320660 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) LTR16E1|LTR|ERVL 295242 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 136.667-109 chr22 23183910 23184149 + 0.666667 NA intron (NM_004327, intron 1 of 22) intron (NM_004327, intron 1 of 22) 3520 NM_021574 613 Hs.517461 NM_004327 ENSG00000186716 BCR ALL|BCR1|CML|D22S11|D22S662|PHL BCR activator of RhoGEF and GTPase protein-coding 141-70 chr5 133456291 133456592 + 0.666667 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -28735 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 202.333-67 chr15 89364489 89364982 + 0.666667 NA intron (NR_133002, intron 1 of 5) intron (NR_133002, intron 1 of 5) 2214 NR_133002 254559 Hs.136313 NR_015411 ENSG00000255571 MIR9-3HG LINC00925 MIR9-3 host gene ncRNA 146.333-308 chr7 64909423 64909852 + 0.666667 NA intron (NM_021148, intron 1 of 3) L1PA11|LINE|L1 6395 NR_003099 10793 Hs.520889 NM_021148 ENSG00000198039 ZNF273 HZF9 zinc finger protein 273 protein-coding 119.333-12 chr1 119238164 119238487 + 0.666667 NA intron (NR_125975, intron 4 of 6) L1ME4b|LINE|L1 -89927 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 119.667-177 chr7 96891416 96891619 + 0.666667 NA Intergenic LTR32|LTR|ERVL -114036 NM_005222 1750 Hs.249196 NM_005222 ENSG00000006377 DLX6 - distal-less homeobox 6 protein-coding 197-3 chr1 75838055 75838465 + 0.666667 NA intron (NM_002440, intron 7 of 19) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 41378 NM_002440 4438 Hs.216639 NM_002440 ENSG00000057468 MSH4 - mutS homolog 4 protein-coding 112-79 chr16 73999277 73999543 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 216111 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 145-115 chr8 53606222 53606573 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -82432 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 112.333-145 chr20 13105065 13105365 + 0.666667 NA intron (NM_001349945, intron 7 of 12) intron (NM_001349945, intron 7 of 12) 96243 NM_001349945 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 177-82 chr9 82153605 82154015 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 165038 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 148-5 chr1 69217598 69217893 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 161847 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 192-132 chr7 27478314 27478746 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -137444 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 251.333 chr1 40282137 40282646 + 0.666667 NA intron (NM_005857, intron 7 of 9) intron (NM_005857, intron 7 of 9) 24155 NM_005857 10269 Hs.132642 NM_005857 ENSG00000084073 ZMPSTE24 FACE-1|FACE1|HGPS|PRO1|STE24|Ste24p zinc metallopeptidase STE24 protein-coding 135.333-40 chr12 7408874 7409258 + 0.666667 NA intron (NM_001297650, intron 4 of 19) intron (NM_001297650, intron 4 of 19) 35119 NM_174941 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 173.667-149 chr6 41091464 41091887 + 0.666667 NA exon (NM_002505, exon 7 of 10) exon (NM_002505, exon 7 of 10) 6112 NM_001329684 221443 Hs.227457 NM_145063 ENSG00000124596 OARD1 C6orf130|TARG1|dJ34B21.3 O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 protein-coding 135-112 chr8 116245975 116246282 + 0.666667 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) L1MC1|LINE|L1 78931 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 121.667-172 chr5 162161395 162161608 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 93859 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 131.667-188 chr7 113068313 113068622 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 17871 NM_001146266 54329 Hs.152009 NM_018970 ENSG00000164604 GPR85 SREB|SREB2 G protein-coupled receptor 85 protein-coding 162.667-197 chr4 70334914 70335233 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_033122) promoter-TSS (NM_033122) 92 NM_033122 85438 Hs.120316 NM_033122 ENSG00000145309 CABS1 C4orf35|CLPH|NYD-SP26 calcium binding protein, spermatid associated 1 protein-coding 146.667-84 chr12 106721447 106721842 + 0.666667 NA intron (NM_001206691, intron 13 of 17) intron (NM_001206691, intron 13 of 17) 36915 NM_032491 5992 Hs.388827 NM_002920 ENSG00000111783 RFX4 NYD-SP10 regulatory factor X4 protein-coding 120.667-129 chr4 80245378 80245588 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21105 NM_004464 2250 Hs.37055 NM_004464 ENSG00000138675 FGF5 HBGF-5|Smag-82|TCMGLY fibroblast growth factor 5 protein-coding 176.333-177 chr9 27566149 27566608 + 0.666667 NA intron (NM_001256054, intron 2 of 10) intron (NM_001256054, intron 2 of 10) 7103 NM_018325 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 132-2 chr1 40958171 40958399 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -21411 NM_001905 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 120.333-173 chr7 83503503 83503716 + 0.666667 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 137822 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 163.333-299 chrX 13742153 13742511 + 0.666667 NA intron (NM_001330210, intron 6 of 23) L1MC3|LINE|L1 7584 NM_003611 8481 Hs.6483 NM_003611 ENSG00000046651 OFD1 71-7A|CXorf5|JBTS10|RP23|SGBS2 OFD1 centriole and centriolar satellite protein protein-coding 113-118 chr2 219479435 219479700 + 0.666667 NA intron (NM_005876, intron 23 of 40) MER91B|DNA|hAT-Tip100 -16788 NM_001286811 100996693 Hs.21639 NM_001286811 ENSG00000286095 SPEGNB - SPEG neighbor protein-coding 167-24 chr11 78790733 78791080 + 0.666667 NA intron (NM_001098816, intron 15 of 33) intron (NM_001098816, intron 15 of 33) -216042 NM_001243251 79731 Hs.503389 NM_024678 ENSG00000137513 NARS2 DFNB94|SLM5|asnRS asparaginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 142.333-180 chr4 66484693 66485075 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 208060 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 139-44 chr19 14655359 14655620 + 0.666667 NA intron (NM_032571, intron 5 of 15) AluJo|SINE|Alu 19355 NM_032571 84658 Hs.658712 NM_032571 ENSG00000131355 ADGRE3 EMR3 adhesion G protein-coupled receptor E3 protein-coding 317.667-31 chr4 39087450 39088127 + 0.666667 NA intron (NM_199039, intron 4 of 9) intron (NM_199039, intron 4 of 9) 25556 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 131.667-95 chr2 76470205 76470534 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -515596 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 209-88 chr5 33267071 33267517 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 37559 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 236-35 chr2 20282758 20283340 + 0.666667 NA exon (NM_001352918, exon 12 of 21) exon (NM_001352918, exon 12 of 21) 44337 NM_001282791 23369 Hs.467824 NM_015317 ENSG00000055917 PUM2 PUMH2|PUML2 pumilio RNA binding family member 2 protein-coding 143.333-215 chr4 189283044 189283367 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -376401 NR_121679 101928971 Hs.519164 NR_121679 ENSG00000250739 LINC01262 TCONS_l2_00021807 long intergenic non-protein coding RNA 1262 ncRNA 190.333-41 chr13 35169818 35170277 + 0.666667 NA intron (NM_015678, intron 25 of 57) intron (NM_015678, intron 25 of 57) 227760 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 147-65 chr2 63661278 63661621 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 72298 NM_001199112 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 116.667-174 chr6 45484336 45484603 + 0.666667 NA intron (NM_001015051, intron 5 of 7) intron (NM_001015051, intron 5 of 7) 62194 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 129.333-19 chr10 67333142 67333426 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) intron (NM_001127384, intron 5 of 17) 70126 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 117-63 chr17 73936569 73936777 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -108136 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 163-6 chr1 189296286 189296760 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 1179487 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 113.667-132 chr3 2860275 2860562 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 7 of 24) intron (NM_175607, intron 7 of 24) -31797 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 140.333-5 chr1 58047569 58047878 + 0.666667 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) intron (NM_001353980, intron 1 of 5) 187142 NR_104363 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 190.333-122 chr5 100965340 100965772 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -62274 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 123-16 chr10 63444256 63444480 + 0.666667 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) AluSz|SINE|Alu 13793 NR_134312 105378330 Hs.602852 NR_134312 LOC105378330 - uncharacterized LOC105378330 ncRNA 148.333-15 chr1 90622599 90623034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34934 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 141.667-160 chr4 45206352 45206730 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -479907 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 156.333-304 chr6 38979517 38979751 + 0.666667 NA intron (NM_001371, intron 84 of 91) intron (NM_001371, intron 84 of 91) -26527 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 122-24 chr12 1762617 1762954 + 0.666667 NA intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 intron (NM_024551, intron 2 of 7).2 -57482 NM_001163925 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 120.667-66 chr15 91473497 91473857 + 0.666667 NA intron (NR_110106, intron 2 of 3) AluY|SINE|Alu 10338 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 197.333-252 chrX 80499500 80500017 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 79311 NM_152630 169966 Hs.367959 NM_152630 ENSG00000174016 TENT5D CT1.26|CT112|FAM46D terminal nucleotidyltransferase 5D protein-coding 160.333-139 chr2 35096046 35096519 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -375123 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 112.667-201 chr5 6271291 6271571 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65861 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 182.667-155 chr7 133867907 133868277 + 0.666667 NA intron (NM_021807, intron 11 of 17) intron (NM_021807, intron 11 of 17) -43204 NR_120513 101928861 Hs.675747 NR_120513 LOC101928861 - uncharacterized LOC101928861 ncRNA 197-28 chr12 48512731 48513165 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -12684 NM_001005203 341568 Hs.524373 NM_001005203 ENSG00000284723 OR8S1 - olfactory receptor family 8 subfamily S member 1 protein-coding 266-34 chr2 11178802 11179289 + 0.666667 NA TTS (NM_001282711) TTS (NM_001282711) 23578 NM_001282711 130814 Hs.274415 NM_152391 ENSG00000162976 SLC66A3 C2orf22|PQLC3 solute carrier family 66 member 3 protein-coding 149.667-101 chr13 28801279 28801569 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -18915 NM_001366650 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 229.333-39 chr14 82103015 82103669 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -360204 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 201.667-59 chr2 209947424 209947804 + 0.666667 NA intron (NM_032504, intron 46 of 63) intron (NM_032504, intron 46 of 63) -54951 NM_001318927 6120 Hs.282260 NM_006916 ENSG00000197713 RPE RPE2-1 ribulose-5-phosphate-3-epimerase protein-coding 118.333-175 chr6 47810585 47810919 + 0.666667 NA intron (NR_033806, intron 5 of 6) intron (NR_033806, intron 5 of 6) 23684 NR_033806 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 142.667-250 chr9 124619231 124619576 + 0.666667 NA intron (NM_033334, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu -39033 NR_038975 100379345 Hs.660412 NR_038975 ENSG00000224020 MIR181A2HG - MIR181A2 host gene ncRNA 226.667-29 chr12 4790049 4790523 + 0.666667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -18890 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 112.333-106 chr19 15668399 15668580 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -4598 NM_023944 66002 Hs.131459 NM_023944 ENSG00000186204 CYP4F12 CYPIVF12|F22329_1 cytochrome P450 family 4 subfamily F member 12 protein-coding 195.667-82 chr22 20432905 20433316 + 0.666667 NA intron (NM_182895, intron 1 of 10) intron (NM_182895, intron 1 of 10) 4715 NM_153334 91179 Hs.474251 NM_153334 ENSG00000244486 SCARF2 NSR1|SREC-II|SREC2|SRECRP-1|VDEGS scavenger receptor class F member 2 protein-coding 207.333-209 chr4 145448082 145448417 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -33057 NM_001354812 4086 Hs.604588 NM_005900 ENSG00000170365 SMAD1 BSP-1|BSP1|JV4-1|JV41|MADH1|MADR1 SMAD family member 1 protein-coding 133-57 chr22 29443954 29444273 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1984 NR_002727 10740 Hs.167750 NR_002727 RFPL1S NCRNA00006|RFPL1-AS|RFPL1-AS1|RFPL1AS RFPL1 antisense RNA 1 ncRNA 203.667-71 chr21 31341449 31341923 + 0.666667 NA intron (NM_001353690, intron 1 of 27) intron (NM_001353690, intron 1 of 27) 2668 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 147.667-5 chr1 70407995 70408372 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3035 NM_001190463 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 173.667-166 chr7 54540391 54540815 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1722 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 119.667-185 chr8 122210715 122210929 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 357822 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 133-77 chr5 78992047 78992440 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6285 NM_198709 411 Hs.149103 NM_000046 ENSG00000113273 ARSB ASB|G4S|MPS6 arylsulfatase B protein-coding 270.667-42 chr5 111614557 111615077 + 0.666667 NA intron (NR_040093, intron 1 of 6) L1PA16|LINE|L1 -102220 NM_001308061 134429 Hs.93842 NM_139164 ENSG00000164211 STARD4 - StAR related lipid transfer domain containing 4 protein-coding 147-30 chr12 51405939 51406221 + 0.666667 NA intron (NM_001258401, intron 1 of 24) intron (NM_001258401, intron 1 of 24) -14674 NM_007210 11226 Hs.505575 NM_007210 ENSG00000139629 GALNT6 GALNAC-T6|GalNAcT6 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6 protein-coding 133.333-29 chr10 95179290 95179597 + 0.666667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -14757 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 182.667-36 chr13 89209575 89209931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25538 NR_047025 100874172 Hs.569291 NR_047025 LINC00440 - long intergenic non-protein coding RNA 440 ncRNA 125-87 chr5 55152016 55152286 + 0.666667 NA intron (NM_001145734, intron 2 of 10) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -8020 NM_001008397 493869 Hs.289044 NM_001008397 ENSG00000164294 GPX8 EPLA847|GPx-8|GSHPx-8|UNQ847 glutathione peroxidase 8 (putative) protein-coding 118.333-120 chr20 33306907 33307208 + 0.666667 NA intron (NM_033197, intron 15 of 15) MIR3|SINE|MIR 23843 NM_033197 92747 Hs.65551 NM_033197 ENSG00000125999 BPIFB1 C20orf114|LPLUNC1 BPI fold containing family B member 1 protein-coding 149.333-103 chr13 84938455 84938768 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 154957 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 168.667-160 chr4 60018652 60019100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -903743 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 130.333-205 chr8 80183503 80183809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12092 NM_001025253 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 127.333-17 chr1 209631146 209631372 + 0.666667 NA intron (NM_001017402, intron 7 of 21) intron (NM_001017402, intron 7 of 21) -7749 NR_036213 100422894 NR_036213 ENSG00000283876 MIR4260 - microRNA 4260 ncRNA 201.666-11 chr12 92485293 92485863 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18899 NR_144532 100507616 Hs.339918 NR_144532 LINC02397 - long intergenic non-protein coding RNA 2397 ncRNA 138.333-29 chr10 63299038 63299406 + 0.666667 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) AluSz6|SINE|Alu -29979 NM_001318153 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 220-112 chr7 54990645 54991154 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28118 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 164.667-143 chr3 23575880 23576214 + 0.666667 NA intron (NM_001370225, intron 5 of 5) HAL1ME|LINE|L1 -229908 NM_003341 7324 Hs.164853 NM_003341 ENSG00000170142 UBE2E1 UBCH6 ubiquitin conjugating enzyme E2 E1 protein-coding 122-99 chr5 120175706 120176004 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -288423 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 118.667-104 chr2 122283928 122284204 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 528415 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 127.333-87 chr2 166318482 166318800 + 0.666667 NA intron (NM_001365536, intron 1 of 26) intron (NM_001365536, intron 1 of 26) 57303 NM_001365536 6335 Hs.439145 NM_002977 ENSG00000169432 SCN9A ETHA|FEB3B|GEFSP7|HSAN2D|NE-NA|NENA|Nav1.7|PN1|SFNP sodium voltage-gated channel alpha subunit 9 protein-coding 151.333-176 chr17 59853424 59853784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12338 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 112-51 chr13 47562563 47562764 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 369959 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 121.333-130 chr4 44173014 44173307 + 0.666667 NA TTS (NM_198353) TTS (NM_198353) 156098 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 183-20 chr11 79945314 79945845 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -504549 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 209.333-41 chr11 134553277 134553876 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 117094 NR_033852 283177 Hs.504390 NR_033852 LOC283177 - uncharacterized LOC283177 ncRNA 139.667-134 chr4 46598659 46598989 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -208696 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 182.667-7 chr1 114551066 114551505 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30330 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 114.333-175 chr5 54221328 54221653 + 0.666667 NA intron (NM_019087, intron 1 of 4) (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 89083 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 193.333-152 chr5 103608063 103608400 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -45442 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 157.667-323 chr8 71212585 71212911 + 0.666667 NA intron (NM_001370336, intron 16 of 17) intron (NM_001370336, intron 16 of 17) 143958 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 192.667-77 chr17 64522642 64523192 + 0.666667 NA intron (NM_138363, intron 8 of 19) intron (NM_138363, intron 8 of 19) 15940 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 184.667-25 chr12 120795099 120795622 + 0.666667 NA intron (NM_139015, intron 2 of 10) L1MEc|LINE|L1 69534 NM_000017 35 Hs.507076 NM_000017 ENSG00000122971 ACADS ACAD3|SCAD acyl-CoA dehydrogenase short chain protein-coding 119.333-199 chr7 23584213 23584441 + 0.666667 NA TTS (NR_002711) TTS (NR_002711) 2200 NR_002711 1197 Hs.632635 NR_002711 CLK2P1 CLK2P CDC like kinase 2, pseudogene 1 pseudo 182.667-141 chr5 174176494 174176879 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 130980 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 154.333-110 chr16 5438508 5438847 + 0.666667 NA Intergenic LTR53B|LTR|ERVL 177573 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 170.667-6 chr1 60902221 60902673 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 68329 NR_110618 100996570 Hs.46616 NR_110617 ENSG00000237928 NFIA-AS2 - NFIA antisense RNA 2 ncRNA 197.667-99 chr3 182141745 182142195 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 189606 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 142.333-173 chr4 46385994 46386292 + 0.666667 NA exon (NM_001330690, exon 3 of 11) exon (NM_001330690, exon 3 of 11) 3236 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 137-54 chr2 224876652 224876857 + 0.666667 NA intron (NM_001290263, intron 7 of 55) L2a|LINE|L2 70295 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 219.333-171 chr7 77900046 77900584 + 0.666667 NA intron (NM_001127357, intron 3 of 17) intron (NM_001127357, intron 3 of 17) 60185 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 149.667-401 chr8 97862988 97863284 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -5928 NM_001317748 4147 Hs.189445 NM_002380 ENSG00000132561 MATN2 - matrilin 2 protein-coding 153.667-7 chr1 54986878 54987227 + 0.666667 NA intron (NM_182532, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 6424 NM_182532 199964 Hs.663950 NM_182532 ENSG00000143001 TMEM61 - transmembrane protein 61 protein-coding 111.667-268 chr9 26825764 26826064 + 0.666667 NA Intergenic HAL1M8|LINE|L1 66888 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 113-53 chr13 97366335 97366563 + 0.666667 NA intron (NM_001306070, intron 7 of 7) intron (NM_001306070, intron 7 of 7) -67720 NM_021033 5911 Hs.508480 NM_021033 ENSG00000125249 RAP2A K-REV|KREV|RAP2|RbBP-30 RAP2A, member of RAS oncogene family protein-coding 182.667-38 chr13 97534450 97534816 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 100464 NM_021033 5911 Hs.508480 NM_021033 ENSG00000125249 RAP2A K-REV|KREV|RAP2|RbBP-30 RAP2A, member of RAS oncogene family protein-coding 128.667-164 chr7 29815062 29815337 + 0.666667 NA intron (NM_001080529, intron 1 of 8) L1M1|LINE|L1 8645 NM_001080529 644150 Hs.380698 NM_001080529 ENSG00000122574 WIPF3 CR16 WAS/WASL interacting protein family member 3 protein-coding 167-49 chr18 71018871 71019210 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -368086 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 186.333-145 chr6 141637587 141637995 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 451008 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 182-120 chr9 131694769 131695201 + 0.666667 NA intron (NM_001304275, intron 1 of 23) L1PA4|LINE|L1 14857 NM_198679 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 152.333-136 chr16 65070441 65070857 + 0.666667 NA intron (NM_001330576, intron 1 of 11) intron (NM_001330576, intron 1 of 11) 51414 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 226.333-32 chr14 72371878 72372312 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) intron (NM_001370288, intron 3 of 16) -144725 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 300-28 chr19 50707110 50707705 + 0.666667 NA intron (NM_016148, intron 8 of 23) intron (NM_016148, intron 8 of 23) 12395 NM_016148 50944 Hs.274255 NM_016148 ENSG00000161681 SHANK1 SPANK-1|SSTRIP|synamon SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1 protein-coding 114-39 chr14 70036677 70036997 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 43380 NM_001130417 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 122-5 chr1 46203365 46203687 + 0.666667 NA exon (NM_001013615, exon 1 of 2) exon (NM_001013615, exon 1 of 2) 192 NM_001013615 541468 Hs.568642 NM_001013615 ENSG00000171357 LURAP1 C1orf190|LRAP35a|LRP35A leucine rich adaptor protein 1 protein-coding 160.333-13 chr1 60655308 60655634 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -32786 NR_146508 105378763 Hs.551175 NR_146508 ENSG00000226476 LINC01748 - long intergenic non-protein coding RNA 1748 ncRNA 159.333-299 chr7 3151053 3151367 + 0.666667 NA intron (NR_126024, intron 2 of 3) intron (NR_126024, intron 2 of 3) 7363 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 119.333-79 chr13 69966728 69967009 + 0.666667 NA intron (NM_001286725, intron 1 of 9) L1PB4|LINE|L1 -140345 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 138-36 chr14 51380686 51381071 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16257 NR_146549 105370496 Hs.578228 NR_146549 ENSG00000258808 LINC02310 - long intergenic non-protein coding RNA 2310 ncRNA 138.333-9 chr1 171953990 171954256 + 0.666667 NA intron (NM_001278252, intron 2 of 14) L3|LINE|CR1 89931 NR_046845 100874284 NR_046845 ENSG00000233540 DNM3-IT1 - DNM3 intronic transcript 1 ncRNA 148.333-315 chr5 64062797 64063198 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -100705 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 113.667-25 chr10 92846288 92846518 + 0.666667 NA intron (NM_001319194, intron 2 of 22) FRAM|SINE|Alu -2052 NM_001319200 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 243.333-26 chr13 66163576 66164127 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54399 NR_039853 100616205 NR_039853 ENSG00000263561 MIR4704 - microRNA 4704 ncRNA 142-54 chr17 28952113 28952375 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_020889) promoter-TSS (NM_020889) -726 NM_020889 57649 Hs.444173 NM_020889 ENSG00000109118 PHF12 PF1 PHD finger protein 12 protein-coding 188.333-72 chr2 44352208 44352668 + 0.666667 NA intron (NM_001171617, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu 7311 NM_001042386 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 113.667-181 chr5 167572797 167573118 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001368146) promoter-TSS (NM_001368146) -702 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 147.333-64 chr11 37408158 37408444 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -530300 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 166.333-63 chr14 20495099 20495443 + 0.666667 NA Intergenic MER41D|LTR|ERV1 -15201 NM_001012975 338879 Hs.451057 NM_001012975 ENSG00000182545 RNASE10 RAH1|RNASE9 ribonuclease A family member 10 (inactive) protein-coding 128.333-102 chr2 73302995 73303230 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -9564 NM_001965 1961 Hs.3052 NM_001965 ENSG00000135625 EGR4 AT133|NGFI-C|NGFIC|PAT133 early growth response 4 protein-coding 149.667-122 chr14 65670870 65671152 + 0.666667 NA intron (NR_038167, intron 7 of 8) intron (NR_038167, intron 7 of 8) 199909 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 205-47 chr2 28279056 28279506 + 0.666667 NA intron (NM_199193, intron 11 of 13) intron (NM_199193, intron 11 of 13) 31178 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 114.667-185 chr3 190743659 190743938 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 118896 NM_001146686 647309 Hs.518490 NM_001146686 ENSG00000205835 GMNC GEMC1 geminin coiled-coil domain containing protein-coding 169-35 chr16 73158096 73158589 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13895 NM_207385 388289 Hs.371893 NM_207385 C16orf47 - chromosome 16 open reading frame 47 protein-coding 112.667-220 chr5 120633879 120634087 + 0.666667 NA intron (NM_001308088, intron 3 of 3) L1PB1|LINE|L1 102519 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 128.667-141 chr5 27128176 27128502 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -89753 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 128.333-159 chr5 124011699 124012024 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 426659 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 206-96 chr21 22643081 22643605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -435941 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 149.333-224 chr22 28498904 28499213 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluJb|SINE|Alu 39189 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 184-83 chr5 43799309 43799728 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -196288 NR_073113 100652772 Hs.482043 NR_073113 NNT-AS1 - NNT antisense RNA 1 ncRNA 217-18 chr14 35914244 35914697 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 88132 NM_032352 84312 Hs.525299 NM_032352 ENSG00000100916 BRMS1L BRMS1 BRMS1 like transcriptional repressor protein-coding 121.667-147 chr4 121816407 121816770 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001237, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001237, exon 8 of 8) 7295 NM_001237 890 Hs.58974 NM_001237 ENSG00000145386 CCNA2 CCN1|CCNA cyclin A2 protein-coding 120-42 chr15 57178609 57178804 + 0.666667 NA intron (NM_001322154, intron 6 of 20) intron (NM_001322154, intron 6 of 20) -40724 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 164-60 chr2 122619483 122619823 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 453828 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 133.333-39 chr12 39298645 39299034 + 0.666667 NA intron (NM_001173464, intron 37 of 37) intron (NM_001173464, intron 37 of 37) 144281 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 238.666-45 chr9 108378727 108379385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 476930 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 147-123 chr6 90863424 90863750 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -276515 NM_145331 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 145.333-213 chr4 45712847 45713175 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 411043 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 141-93 chr8 100324101 100324335 + 0.666667 NA intron (NM_001280539, intron 1 of 10) intron (NM_001280539, intron 1 of 10) 11986 NM_001280539 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 165.333-84 chr15 57412622 57413106 + 0.666667 NA intron (NM_032866, intron 1 of 18) AluSg|SINE|Alu 36359 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 192-113 chr5 83745240 83745653 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -24591 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 129.333-24 chr10 90031386 90031608 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -74124 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 112.667-163 chr22 26356318 26356624 + 0.666667 NA intron (NM_001184777, intron 12 of 14) AluSx|SINE|Alu -72789 NM_020437 57168 Hs.567547 NM_020437 ENSG00000128203 ASPHD2 - aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 protein-coding 171.667-117 chr4 29104163 29104527 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 107561 NR_146499 102723764 NR_146499 LINC02364 - long intergenic non-protein coding RNA 2364 ncRNA 197.333-25 chr10 98323448 98323867 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55463 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 150.667-229 chr22 42445826 42446103 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7978 NM_001371362 117.667-55 chr15 64813131 64813350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12407 NM_001286497 80119 Hs.112160 NM_025049 ENSG00000140451 PIF1 C15orf20|PIF PIF1 5'-to-3' DNA helicase protein-coding 244.667-103 chrX 94177404 94177890 + 0.666667 NA Intergenic MER8|DNA|TcMar-Tigger 503441 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 124.333-122 chr3 141580671 141580961 + 0.666667 NA intron (NM_006506, intron 16 of 23) intron (NM_006506, intron 16 of 23) -82383 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 111.667-140 chr2 164102069 164102296 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -366174 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 124-55 chr2 12216849 12217106 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 17847 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 136-99 chr8 29415656 29416001 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -65144 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 144.333-212 chr5 66724458 66724792 + 0.666667 NA intron (NM_001290228, intron 1 of 4) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -104148 NM_015183 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 121.333-90 chr2 140832892 140833194 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 31 of 90) MER6|DNA|TcMar-Tigger -246358 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 117.667-89 chr2 108862075 108862387 + 0.666667 NA intron (NM_001351557, intron 11 of 12) intron (NM_001351557, intron 11 of 12) 75460 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 125.667-127 chr3 191283731 191283959 + 0.666667 NA intron (NM_198152, intron 4 of 8) intron (NM_198152, intron 4 of 8) -45549 NM_174908 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 130.333-65 chr14 55358635 55358991 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 53045 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 160-30 chr11 118018331 118018765 + 0.666667 NA intron (NM_001354434, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 32154 NR_026691 3587 Hs.504035 NM_001558 ENSG00000110324 IL10RA CD210|CD210a|CDW210A|HIL-10R|IL-10R1|IL10R interleukin 10 receptor subunit alpha protein-coding 140-42 chr15 76288968 76289384 + 0.666667 NA intron (NM_000126, intron 4 of 11) AluJr4|SINE|Alu 22293 NM_001127716 2108 Hs.39925 NM_000126 ENSG00000140374 ETFA EMA|GA2|MADD electron transfer flavoprotein subunit alpha protein-coding 157.333-86 chr12 52937445 52937827 + 0.666667 NA intron (NM_001256293, intron 1 of 8) AluSz6|SINE|Alu -11167 NM_001256282 3856 Hs.533782 NM_002273 ENSG00000170421 KRT8 CARD2|CK-8|CK8|CYK8|K2C8|K8|KO keratin 8 protein-coding 132.333-49 chr14 20337990 20338262 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4814 NM_182852 57820 Hs.107003 NM_021178 ENSG00000100814 CCNB1IP1 C14orf18|HEI10 cyclin B1 interacting protein 1 protein-coding 195-116 chr9 100191174 100191735 + 0.666667 NA intron (NR_134606, intron 3 of 16) L1PB3|LINE|L1 92211 NM_014425 27130 Hs.558477 NM_014425 ENSG00000119509 INVS INV|NPH2|NPHP2 inversin protein-coding 132.667-124 chr4 40972487 40972774 + 0.666667 NA intron (NM_004307, intron 6 of 17) L2b|LINE|L2 -115438 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 156.667-25 chr1 157688938 157689320 + 0.666667 NA intron (NM_052939, intron 10 of 14) L1MEc|LINE|L1 11640 NM_001320333 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 112.333-70 chr14 48038955 48039211 + 0.666667 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL -244069 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 132.667-131 chr4 97077497 97077853 + 0.666667 NA Intergenic LTR86C|LTR|ERVL -289251 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 147.667-391 chr9 36346467 36346790 + 0.666667 NA intron (NM_194328, intron 9 of 11) intron (NM_194328, intron 9 of 11) 53641 NM_022781 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 184.333-100 chr3 26766012 26766412 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71655 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 162.333-158 chr3 29579286 29579635 + 0.666667 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) intron (NM_001003792, intron 3 of 13) 298148 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 121-135 chr8 70478635 70478907 + 0.666667 NA intron (NR_110653, intron 2 of 3) MER58A|DNA|hAT-Charlie 7637 NR_110653 101926892 Hs.367827 NR_110653 ENSG00000253967 LOC101926892 - uncharacterized LOC101926892 ncRNA 141.667-204 chr7 11460880 11461233 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 10 of 26) intron (NM_015204, intron 10 of 26) 371142 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 211.666-25 chr20 6145557 6146151 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -22310 NM_017671 55612 Hs.472054 NM_017671 ENSG00000101311 FERMT1 C20orf42|DTGCU2|KIND1|UNC112A|URP1 fermitin family member 1 protein-coding 197.333-197 chr6 39855026 39855511 + 0.666667 NA intron (NM_015345, intron 1 of 24) intron (NM_015345, intron 1 of 24) 42112 NR_125831 100505635 Hs.668513 NR_125831 ENSG00000235033 LOC100505635 - uncharacterized LOC100505635 ncRNA 170.333-77 chr14 79494284 79494617 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 215070 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 115.667-14 chr1 232188064 232188276 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 262336 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 165.667-23 chr10 123969664 123970002 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -78026 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 159.667-292 chr7 7811513 7811799 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) -93049 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 182.333-162 chr8 126798740 126799247 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -214161 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 178.667-22 chr10 58554345 58554691 + 0.666667 NA intron (NM_001080512, intron 1 of 20) intron (NM_001080512, intron 1 of 20) 41646 NM_001080512 80114 Hs.100261 NM_001080512 ENSG00000122870 BICC1 BICC|CYSRD BicC family RNA binding protein 1 protein-coding 131.333-37 chr11 68448480 68448786 + 0.666667 NA intron (NM_002335, intron 22 of 22) MIRc|SINE|MIR -12119 NM_001352361 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 144.667-77 chr14 29471144 29471458 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 455795 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 152.667-77 chr12 23158171 23158573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17264 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 197.333-3 chr1 57593711 57594170 + 0.666667 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) -169019 NM_001353983 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 180.333-154 chrX 52301153 52301659 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35236 NR_107055 102466880 NR_107055 ENSG00000275335 MIR8088 hsa-mir-8088 microRNA 8088 ncRNA 188.667-118 chr4 101817922 101818232 + 0.666667 NA intron (NM_001083907, intron 1 of 16) ERVL-E-int|LTR|ERVL 4235 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 194-61 chr18 47368090 47368512 + 0.666667 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -12195 NR_039753 100616264 NR_039753 ENSG00000266582 MIR4527 - microRNA 4527 ncRNA 119.667-22 chr10 95709091 95709354 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -2542 NM_001098175 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 152-40 chr12 19462449 19462798 + 0.666667 NA exon (NM_153207, exon 2 of 8) exon (NM_153207, exon 2 of 8) 22024 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 119-20 chr10 80404949 80405274 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2718 NM_001243779 84293 Hs.500333 NM_032333 ENSG00000122378 PRXL2A Adrx|C10orf58|FAM213A|PAMM peroxiredoxin like 2A protein-coding 220-126 chr9 70665293 70665686 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 9 of 25) intron (NM_001366143, intron 9 of 25) 144595 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 135.333-83 chr2 43905924 43906322 + 0.666667 NA intron (NM_133259, intron 30 of 37) intron (NM_133259, intron 30 of 37) 67152 NM_001357321 64241 Hs.413931 NM_022437 ENSG00000143921 ABCG8 GBD4|STSL ATP binding cassette subfamily G member 8 protein-coding 160-132 chrX 85340991 85341447 + 0.666667 NA intron (NM_001307940, intron 6 of 15) HAL1|LINE|L1 38446 NM_024921 79983 Hs.267038 NM_024921 ENSG00000124429 POF1B POF|POF2B POF1B actin binding protein protein-coding 201.333-271 chr7 124253686 124254179 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 98164 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 139.333-80 chr15 61393816 61394138 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -164675 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 301.667-19 chr18 6289570 6290244 + 0.666667 NA intron (NM_001365769, intron 4 of 16) MER101-int|LTR|ERV1 33163 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 126.667-4 chr1 61243156 61243474 + 0.666667 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) 10203 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 195.666-12 chr12 861737 862300 + 0.666667 NA intron (NM_001184985, intron 7 of 27) intron (NM_001184985, intron 7 of 27) 71058 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 119.333-2 chr1 19733641 19733931 + 0.666667 NA intron (NM_001349112, intron 12 of 14) intron (NM_001349112, intron 12 of 14) 65563 NM_001349115 255104 Hs.466729 NM_181719 ENSG00000162542 TMCO4 - transmembrane and coiled-coil domains 4 protein-coding 114.667-153 chr20 37280869 37281175 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -8633 NM_001369742 63905 Hs.6126 NM_022077 ENSG00000101363 MANBAL - mannosidase beta like protein-coding 114.333-14 chr1 157976584 157976838 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16562 NM_001286349 55243 Hs.272234 NM_018240 ENSG00000183853 KIRREL1 KIRREL|NEPH1 kirre like nephrin family adhesion molecule 1 protein-coding 187-36 chr2 133541422 133541934 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 2 of 17) intron (NM_207481, intron 2 of 17) 26785 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 174.333-10 chr1 233959823 233960154 + 0.666667 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) intron (NM_173508, intron 2 of 7) 55312 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 152-155 chr8 105834632 105834969 + 0.666667 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) intron (NR_125796, intron 2 of 7) 225703 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 124.667-166 chr5 58210018 58210321 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87828 NR_104669 101928569 Hs.319708 NR_104669 LINC02101 - long intergenic non-protein coding RNA 2101 ncRNA 204.333-5 chr1 59854556 59854871 + 0.666667 NA intron (NM_015888, intron 12 of 21) L1MB7|LINE|L1 39764 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 189-50 chr2 225311291 225311584 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -88273 NM_001371273 148.333-130 chr14 75016095 75016383 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001040108, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001040108, exon 13 of 13) 13318 NM_014239 8892 Hs.409137 NM_014239 ENSG00000119718 EIF2B2 EIF-2Bbeta|EIF2B eukaryotic translation initiation factor 2B subunit beta protein-coding 114-11 chr10 68124277 68124598 + 0.666667 NA intron (NR_045663, intron 2 of 17) intron (NR_045663, intron 2 of 17) 14949 NR_045663 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 118.667-94 chr2 49217712 49217906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63282 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 134-104 chr8 20384574 20384836 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -80742 NM_021020 11178 Hs.521432 NM_021020 ENSG00000061337 LZTS1 F37|FEZ1 leucine zipper tumor suppressor 1 protein-coding 199-18 chr11 102651399 102651842 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 -26288 NM_004771 9313 Hs.591946 NM_004771 ENSG00000137674 MMP20 AI2A2|MMP-20 matrix metallopeptidase 20 protein-coding 138.333-117 chr22 45859988 45860236 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 99588 NR_039919 100616253 NR_039919 ENSG00000264160 MIR4762 - microRNA 4762 ncRNA 127.667-19 chr10 77759238 77759575 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -121598 NM_001271521 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 159.333-351 chr9 36405152 36405558 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -4157 NM_194330 152006 Hs.333503 NM_022781 ENSG00000137075 RNF38 - ring finger protein 38 protein-coding 130.667-82 chr16 78929454 78929790 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 671115 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 148.333-98 chr12 66216155 66216490 + 0.666667 NA intron (NM_007199, intron 5 of 11) intron (NM_007199, intron 5 of 11) 27108 NM_001142523 11213 Hs.369265 NM_007199 ENSG00000090376 IRAK3 ASRT5|IRAKM interleukin 1 receptor associated kinase 3 protein-coding 174-2 chr1 39696613 39697126 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -5384 NM_001282397 51440 Hs.743975 NM_016257 ENSG00000116983 HPCAL4 HLP4 hippocalcin like 4 protein-coding 152.667-366 chr8 69504448 69504877 + 0.666667 NA intron (NR_156414, intron 2 of 20) intron (NR_156414, intron 2 of 20) 11815 NM_001128206 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 202.667-30 chr11 59678727 59679077 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -9865 NM_152716 219988 Hs.591960 NM_152716 ENSG00000166889 PATL1 Pat1b|hPat1b PAT1 homolog 1, processing body mRNA decay factor protein-coding 139-62 chr3 98674000 98674268 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -58102 NM_001271147 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 113.333-94 chr16 68196883 68197153 + 0.666667 NA intron (NM_173165, intron 9 of 9) AluSp|SINE|Alu 36481 NR_106831 102466194 NR_106831 ENSG00000284259 MIR6773 hsa-mir-6773 microRNA 6773 ncRNA 167.667-174 chr5 146936598 146936921 + 0.666667 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) L2c|LINE|L2 -17253 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 112.667-158 chr21 30033801 30034075 + 0.666667 NA Intergenic LTR27C|LTR|ERV1 -93886 NM_001320630 2897 Hs.664641 NM_000830 ENSG00000171189 GRIK1 EAA3|EEA3|GLR5|GLUR5|GluK1|gluR-5 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 protein-coding 126.333-130 chr4 21264367 21264598 + 0.666667 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 39424 NM_147183 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 114.333-115 chr2 139445500 139445687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 548269 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 228-53 chr22 38270528 38271098 + 0.666667 NA intron (NM_001195072, intron 1 of 9) intron (NM_001195072, intron 1 of 9) 1851 NM_001195071 25829 Hs.182626 NM_012264 ENSG00000198792 TMEM184B C22orf5|FM08|HS5O6A|HSPC256 transmembrane protein 184B protein-coding 115.667-112 chr2 43406496 43406813 + 0.666667 NA intron (NM_001083953, intron 28 of 37) intron (NM_001083953, intron 28 of 37) 179443 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 190.333-27 chr11 23044581 23045073 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -184353 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 172-95 chr6 40996584 40997063 + 0.666667 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 26457 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 161.333-294 chr8 132992218 132992640 + 0.666667 NA intron (NM_003235, intron 35 of 47) MADE1|DNA|TcMar-Mariner 54152 NR_107002 102466865 NR_107002 ENSG00000276961 MIR7848 hsa-mir-7848 microRNA 7848 ncRNA 124-114 chr8 91488039 91488314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 238857 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 159.667-43 chr10 53873964 53874362 + 0.666667 NA intron (NM_001354411, intron 27 of 34) intron (NM_001354411, intron 27 of 34) -612067 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 121.333-23 chr10 68196005 68196206 + 0.666667 NA intron (NR_045663, intron 13 of 17) intron (NR_045663, intron 13 of 17) 36008 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 143-127 chr8 124155256 124155549 + 0.666667 NA intron (NR_103547, intron 1 of 4) L1MEg|LINE|L1 16120 NR_103547 157376 Hs.662360 NM_182525 ENSG00000253868 FER1L6-AS2 C8orf78 FER1L6 antisense RNA 2 ncRNA 117-83 chr2 201274457 201274677 + 0.666667 NA intron (NM_033358, intron 6 of 7) AluSx1|SINE|Alu 14031 NM_033356 841 Hs.599762 NM_001228 ENSG00000064012 CASP8 ALPS2B|CAP4|Casp-8|FLICE|MACH|MCH5 caspase 8 protein-coding 208.667-13 chr1 213158125 213158604 + 0.666667 NA intron (NM_001136138, intron 5 of 13) intron (NM_001136138, intron 5 of 13) 107123 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 197.667-116 chr4 184117581 184118006 + 0.666667 NA exon (NM_153343, exon 4 of 8) exon (NM_153343, exon 4 of 8) 100080 NM_153343 133121 Hs.297814 NM_153343 ENSG00000164303 ENPP6 NPP6 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 protein-coding 132.333-193 chr9 109531827 109532074 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20405 NR_037493 100500898 NR_037493 ENSG00000263861 MIR3927 - microRNA 3927 ncRNA 344.666-14 chr17 66279716 66280578 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22466 NM_002737 5578 Hs.531704 NM_002737 ENSG00000154229 PRKCA AAG6|PKC-alpha|PKCA|PKCI+/-|PKCalpha|PRKACA protein kinase C alpha protein-coding 150.667-214 chr20 36061069 36061340 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -10244 NR_027451 647979 Hs.743232 NR_027451 ENSG00000260032 NORAD LINC00657 non-coding RNA activated by DNA damage ncRNA 127.667-100 chr2 214879802 214880043 + 0.666667 NA intron (NR_110292, intron 2 of 3) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 32975 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 150.667-368 chr8 71374135 71374556 + 0.666667 NA intron (NM_001370336, intron 2 of 17) L1MA9|LINE|L1 -12276 NM_000503 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 186.333-70 chr2 37036245 37036645 + 0.666667 NA intron (NM_019024, intron 21 of 35) L2c|LINE|L2 47927 NM_019024 54497 Hs.744084 NM_019024 ENSG00000008869 HEATR5B - HEAT repeat containing 5B protein-coding 121.333-169 chr7 51518578 51518797 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -125431 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 138.333-198 chr8 123222893 123223156 + 0.666667 NA intron (NM_032847, intron 5 of 5) intron (NM_032847, intron 5 of 5) -7161 NR_039808 100616260 NR_039808 ENSG00000266324 MIR4663 - microRNA 4663 ncRNA 208.667-119 chr6 77712400 77712807 + 0.666667 NA intron (NM_001282136, intron 2 of 4) intron (NM_001282136, intron 2 of 4) 59564 NM_001322247 101928601 Hs.544538 NM_001282136 ENSG00000269964 MEI4 - meiotic double-stranded break formation protein 4 protein-coding 180.667-82 chr20 43915749 43916039 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001098796) promoter-TSS (NM_001098796) -236 NM_001098796 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 190-54 chr18 2794755 2795186 + 0.666667 NA intron (NM_015295, intron 45 of 47) intron (NM_015295, intron 45 of 47) -52036 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 131.667-124 chr3 24841549 24841860 + 0.666667 NA intron (NM_001290216, intron 1 of 10) intron (NM_001290216, intron 1 of 10) 12381 NM_001290216 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 118-125 chr7 86707006 86707204 + 0.666667 NA intron (NM_001363522, intron 1 of 4) intron (NM_001363522, intron 1 of 4) 63191 NM_000840 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 178.333-53 chr14 100746430 100746802 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 19724 NM_001317172 8788 Hs.116631 NM_003836 ENSG00000185559 DLK1 DLK|DLK-1|Delta1|FA1|PREF1|Pref-1|ZOG|pG2 delta like non-canonical Notch ligand 1 protein-coding 167.333-186 chr4 35045232 35045587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -775662 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 114.333-133 chr20 38334571 38334872 + 0.666667 NA intron (NM_001725, intron 13 of 14) MIRb|SINE|MIR -11761 NM_004139 3929 Hs.154078 NM_004139 ENSG00000129988 LBP BPIFD2 lipopolysaccharide binding protein protein-coding 259.667-84 chr8 70294304 70294892 + 0.666667 NA intron (NM_001321711, intron 2 of 21) intron (NM_001321711, intron 2 of 21) 108792 NM_001321713 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 171.333-198 chr8 119851139 119851517 + 0.666667 NA intron (NM_024094, intron 2 of 8) intron (NM_024094, intron 2 of 8) 4566 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 111.667-56 chr12 15120102 15120435 + 0.666667 NA intron (NM_001190726, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 -31655 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 149.667-134 chr15 35658357 35658797 + 0.666667 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) intron (NR_038251, intron 1 of 2) 112382 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 178.667-163 chr8 107441990 107442374 + 0.666667 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) 55736 NM_001199859 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 139.667-84 chr2 56477805 56478135 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -292200 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 123.667-95 chr2 125583023 125583233 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 534857 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 210.333-41 chr13 91536408 91536816 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 2 of 7) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 137991 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 172.667-28 chr11 12965029 12965373 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 24347 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 137.667-17 chr1 219490200 219490469 + 0.666667 NA intron (NR_135822, intron 1 of 3) intron (NR_135822, intron 1 of 3) 66990 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 130.333-82 chr15 97636307 97636640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75775 NR_110756 101927310 Hs.560324 NR_110756 ENSG00000259582 LOC101927310 - uncharacterized LOC101927310 ncRNA 130-107 chr6 34730739 34731055 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26197 NR_029472 6631 Hs.1063 NM_003093 ENSG00000124562 SNRPC U1C|Yhc1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C protein-coding 113.667-91 chr2 12600368 12600660 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -116358 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 112.667-230 chr6 63335505 63335702 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -15620 NM_016571 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 142.667-12 chr1 214175453 214175835 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105515 NM_020197 56950 Hs.66170 NM_020197 ENSG00000143499 SMYD2 HSKM-B|KMT3C|ZMYND14 SET and MYND domain containing 2 protein-coding 148.667-65 chr11 19593530 19593819 + 0.666667 NA intron (NM_001111018, intron 1 of 37) L1MD2|LINE|L1 18364 NR_039706 100616118 NR_039706 ENSG00000265210 MIR4486 - microRNA 4486 ncRNA 148.667-216 chr2 217177577 217177876 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -105007 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 165-65 chr4 47487793 47488133 + 0.666667 NA intron (NM_020453, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu 2688 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 242.333-11 chr10 31163281 31163813 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -24336 NR_134478 101929352 Hs.209289 NR_134478 LINC02664 - long intergenic non-protein coding RNA 2664 ncRNA 206.667-136 chr8 43719603 43719982 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 427350 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 194.333-5 chr1 58309083 58309577 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58783 NM_001353980 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 128.667-139 chr5 25416128 25416468 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 225345 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 135.333-20 chr10 42778683 42778937 + 0.666667 NA Intergenic AluYa5|SINE|Alu -3985 NM_014753 9790 Hs.10848 NM_014753 ENSG00000165733 BMS1 ACC|BMS1L BMS1 ribosome biogenesis factor protein-coding 227.333-43 chr16 13163954 13164464 + 0.666667 NA intron (NM_001145204, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 262611 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 193-81 chr6 13250857 13251278 + 0.666667 NA intron (NM_001322308, intron 9 of 13) intron (NM_001322308, intron 9 of 13) 32375 NR_134859 100130357 Hs.484678 NM_001242698 LOC100130357 - uncharacterized LOC100130357 ncRNA 153.667-270 chr3 155799716 155799995 + 0.666667 NA intron (NM_173657, intron 3 of 5) L1MA3|LINE|L1 6423 NM_001308229 285315 Hs.350846 NM_173657 ENSG00000174928 C3orf33 AC3-33 chromosome 3 open reading frame 33 protein-coding 123-30 chr11 100444540 100444749 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -242644 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 159-69 chr2 231599238 231599547 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6528 NM_152614 165100 Hs.98104 NM_152614 ENSG00000177673 TEX44 C2orf57 testis expressed 44 protein-coding 133-82 chr6 7060937 7061178 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46686 NM_001168344 6239 Hs.298248 NM_002955 ENSG00000124782 RREB1 FINB|HNT|LZ321|RREB-1|Zep-1 ras responsive element binding protein 1 protein-coding 135-45 chr2 98235478 98235807 + 0.666667 NA intron (NR_144297, intron 17 of 18) AluSx1|SINE|Alu 86109 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 137.667-53 chr14 47238278 47238580 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 2 of 16) intron (NM_001113498, intron 2 of 16) 104817 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 182.333-121 chr5 25029913 25030404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 160498 NR_147006 105374694 NR_147006 ENSG00000251273 LINC02228 - long intergenic non-protein coding RNA 2228 ncRNA 138.333-92 chr2 88843188 88843453 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30950 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 132.333-47 chr13 94441787 94442042 + 0.666667 NA intron (NM_001129889, intron 9 of 9) L1MB3|LINE|L1 37768 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 188.667-56 chr17 48207857 48208261 + 0.666667 NA intron (NM_001075099, intron 4 of 12) intron (NM_001075099, intron 4 of 12) -51548 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 146.333-48 chr11 65304627 65304906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10100 NM_006779 10435 Hs.343380 NM_006779 ENSG00000149798 CDC42EP2 BORG1|CEP2 CDC42 effector protein 2 protein-coding 140-55 chr2 28111377 28111689 + 0.666667 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) intron (NM_199193, intron 7 of 13) 95428 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 133.333-86 chr2 164378147 164378483 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 190180 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 120.667-81 chr18 9052146 9052441 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50406 NM_021074 4729 Hs.464572 NM_021074 ENSG00000178127 NDUFV2 CI-24k|MC1DN7 NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V2 protein-coding 121.667-127 chr3 80887353 80887716 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -106334 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 137.667-121 chr3 43514123 43514380 + 0.666667 NA intron (NM_001346464, intron 12 of 13) L1MEc|LINE|L1 107675 NM_001346466 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 126-93 chr5 72246477 72246719 + 0.666667 NA intron (NM_001286748, intron 4 of 11) intron (NM_001286748, intron 4 of 11) 66811 NM_001324255 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 182.333-10 chr1 196984055 196984483 + 0.666667 NA intron (NM_030787, intron 3 of 9) intron (NM_030787, intron 3 of 9) 6732 NM_030787 81494 Hs.282594 NM_030787 ENSG00000134389 CFHR5 CFHL5|CFHR5D|FHR-5|FHR5 complement factor H related 5 protein-coding 115.333-67 chr14 54229623 54229837 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -167138 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 202.333 chr1 8447418 8447981 + 0.666667 NA intron (NM_001042681, intron 11 of 22) intron (NM_001042681, intron 11 of 22) 23054 NR_125999 102724552 Hs.568612 NR_125999 RERE-AS1 - RERE antisense RNA 1 ncRNA 184.333-112 chr4 52614937 52615385 + 0.666667 NA intron (NM_001286768, intron 5 of 9) L1MEf|LINE|L1 41378 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 177.667-131 chr8 56115178 56115647 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1430 NM_005372 4342 Hs.533432 NM_005372 ENSG00000172680 MOS MSV MOS proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 185-6 chr10 89890719 89891132 + 0.666667 NA intron (NR_149079, intron 1 of 1) LTR33A_|LTR|ERVL 2791 NR_149079 105378425 Hs.559891 NR_149079 ENSG00000280560 LINC01374 TCONS_00018278 long intergenic non-protein coding RNA 1374 ncRNA 155.667-335 chr7 86001993 86002446 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 581097 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 171.667 chr1 21362064 21362415 + 0.666667 NA Intergenic Charlie29a|DNA|hAT-Charlie -16735 NM_001113348 1889 Hs.195080 NM_001397 ENSG00000117298 ECE1 ECE endothelin converting enzyme 1 protein-coding 112-111 chr2 133917960 133918205 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201853 NM_001371457 179-47 chr18 51170775 51171069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26759 NM_016626 51320 Hs.465144 NM_016626 ENSG00000176624 MEX3C BM-013|MEX-3C|RKHD2|RNF194 mex-3 RNA binding family member C protein-coding 118-17 chr11 117348376 117348632 + 0.666667 NA intron (NM_001271933, intron 3 of 31) intron (NM_001271933, intron 3 of 31) 20650 NM_014956 22897 Hs.504009 NM_014956 ENSG00000110274 CEP164 NPHP15 centrosomal protein 164 protein-coding 118.667-149 chr4 54991727 54991964 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 133750 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 132.667-182 chr8 118224673 118225023 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -113029 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 116.667-202 chr8 98798232 98798553 + 0.666667 NA intron (NM_001256312, intron 3 of 12) intron (NM_001256312, intron 3 of 12) 27279 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 178.333-51 chr14 62029495 62029824 + 0.666667 NA intron (NM_001367661, intron 4 of 8) intron (NM_001367661, intron 4 of 8) -87698 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 111.667-230 chr6 143504728 143504987 + 0.666667 NA intron (NM_032020, intron 2 of 6) intron (NM_032020, intron 2 of 6) 6863 NM_032020 2519 Hs.17680 NM_032020 ENSG00000001036 FUCA2 dJ20N2.5 alpha-L-fucosidase 2 protein-coding 131.667-28 chr10 119960644 119960965 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 2291 NR_039830 100616322 NR_039830 ENSG00000265370 MIR4682 - microRNA 4682 ncRNA 154-25 chr11 41935572 41935895 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 149725 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 193.333-201 chrX 10634527 10634847 + 0.666667 NA intron (NM_033290, intron 1 of 9) intron (NM_033290, intron 1 of 9) -14102 NM_000381 4281 Hs.27695 NM_000381 ENSG00000101871 MID1 BBBG1|FXY|GBBB1|MIDIN|OGS1|OS|OSX|RNF59|TRIM18|XPRF|ZNFXY midline 1 protein-coding 162.667-18 chr1 232543306 232543625 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -27857 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 115.333-127 chr21 32318718 32319057 + 0.666667 NA intron (NM_014825, intron 36 of 38) intron (NM_014825, intron 36 of 38) 27074 NM_178817 56246 Hs.584940 NM_178817 ENSG00000170262 MRAP B27|C21orf61|FALP|FGD2|GCCD2 melanocortin 2 receptor accessory protein protein-coding 222.333-2 chr1 54930087 54930585 + 0.666667 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -43141 NM_014762 1718 Hs.498727 NM_014762 ENSG00000116133 DHCR24 DCE|Nbla03646|SELADIN1|seladin-1 24-dehydrocholesterol reductase protein-coding 135-63 chr3 68025562 68025831 + 0.666667 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 21449 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 160-85 chr4 59417309 59417766 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 403964 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 128.667-78 chr18 1666799 1667091 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -307316 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 119.667-131 chr4 54496044 54496254 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 110982 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 239.667-53 chr4 85468809 85469254 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6119 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 139-93 chr6 155413040 155413450 + 0.666667 NA intron (NM_015718, intron 10 of 13) L2a|LINE|L2 42594 NM_015718 50508 Hs.247776 NM_015718 ENSG00000074771 NOX3 GP91-3|MOX-2 NADPH oxidase 3 protein-coding 273-11 chr11 129504106 129504906 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 112763 NR_120582 101929557 Hs.385785 NR_120582 ENSG00000281097 LINC01395 - long intergenic non-protein coding RNA 1395 ncRNA 114.667-114 chr18 57282339 57282659 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70058 NM_015879 51046 Hs.23172 NM_015879 ENSG00000177511 ST8SIA3 SIAT8C|ST8SiaIII ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3 protein-coding 150.667-165 chr19 50281820 50282117 + 0.666667 NA intron (NM_024729, intron 31 of 40) intron (NM_024729, intron 31 of 40) 47409 NM_004977 3748 Hs.467146 NM_004977 ENSG00000131398 KCNC3 KSHIIID|KV3.3|SCA13 potassium voltage-gated channel subfamily C member 3 protein-coding 169-100 chr8 84819915 84820345 + 0.666667 NA intron (NM_001287244, intron 3 of 7) intron (NM_001287244, intron 3 of 7) 114203 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 125.333-161 chr6 122515044 122515406 + 0.666667 NA intron (NM_001270393, intron 3 of 7) intron (NM_001270393, intron 3 of 7) 43308 NM_001270394 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 178-112 chr8 124214144 124214615 + 0.666667 NA intron (NR_125420, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu 33019 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 116.333-128 chr20 32013066 32013266 + 0.666667 NA intron (NM_080625, intron 1 of 8) AluJo|SINE|Alu 2728 NM_080625 140706 Hs.382151 NM_080625 ENSG00000101331 CCM2L C20orf160|dJ310O13.5 CCM2 like scaffold protein protein-coding 123.333-141 chr22 19861292 19861530 + 0.666667 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 -6537 NM_024627 79680 Hs.105642 NM_024627 ENSG00000215012 RTL10 BOP|C22orf29 retrotransposon Gag like 10 protein-coding 146.667-269 chr5 150789647 150789986 + 0.666667 NA intron (NM_032947, intron 1 of 1) MamTip1|DNA|hAT-Tip100 11870 NM_032947 85027 Hs.29444 NM_032947 ENSG00000256235 SMIM3 C5orf62|MST150|NID67 small integral membrane protein 3 protein-coding 146.667-123 chr16 62469856 62470105 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -433542 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 191.667-120 chr8 38009148 38009566 + 0.666667 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 -21177 NM_004095 1978 Hs.411641 NM_004095 ENSG00000187840 EIF4EBP1 4E-BP1|4EBP1|BP-1|PHAS-I eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 1 protein-coding 171.667-85 chr2 112630223 112630666 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13736 NR_033871 400999 Hs.585221 NR_033871 FLJ42351 - uncharacterized LOC400999 ncRNA 123-37 chr12 104253387 104253684 + 0.666667 NA intron (NM_001093771, intron 2 of 16) intron (NM_001093771, intron 2 of 16) -33497 NM_182742 7296 Hs.654922 NM_003330 ENSG00000198431 TXNRD1 GRIM-12|TR|TR1|TRXR1|TXNR thioredoxin reductase 1 protein-coding 193.333-157 chr6 18447679 18448030 + 0.666667 NA intron (NM_182757, intron 4 of 7) L2a|LINE|L2 60504 NM_182757 255488 Hs.148741 NM_182757 ENSG00000137393 RNF144B IBRDC2|PIR2|bA528A10.3|p53RFP ring finger protein 144B protein-coding 156.333-186 chr2 111949658 111950074 + 0.666667 NA intron (NM_006343, intron 4 of 18) L1ME2|LINE|L1 51259 NM_006343 10461 Hs.306178 NM_006343 ENSG00000153208 MERTK MER|RP38|Tyro12|c-Eyk|c-mer MER proto-oncogene, tyrosine kinase protein-coding 160-117 chr8 66414041 66414358 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 14778 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 147.667-101 chr14 56560929 56561315 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18676 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 205.333-139 chr20 35941232 35941542 + 0.666667 NA intron (NM_016436, intron 17 of 17) intron (NM_016436, intron 17 of 17) 13239 NM_033630 51282 Hs.584909 NM_016558 ENSG00000171222 SCAND1 RAZ1|SDP1 SCAN domain containing 1 protein-coding 143-105 chr6 105991809 105992213 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -94325 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 130-31 chr12 122987797 122988037 + 0.666667 NA intron (NM_020845, intron 19 of 24) intron (NM_020845, intron 19 of 24) 7857 NM_001278380 51329 Hs.103561 NM_016638 ENSG00000182196 ARL6IP4 SFRS20|SR-25|SRp25|SRrp37 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4 protein-coding 159.667-172 chr2 78294787 78295106 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4215 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 281.667-28 chr2 174886881 174887321 + 0.666667 NA intron (NM_001025201, intron 6 of 12) intron (NM_001025201, intron 6 of 12) -39483 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 151-71 chr20 50053756 50054127 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -12312 NR_051976 100887755 Hs.195705 NR_051976 TRERNA1 LINC00651|treRNA translation regulatory long non-coding RNA 1 ncRNA 181-67 chr6 159039203 159039557 + 0.666667 NA intron (NM_138810, intron 7 of 7) intron (NM_138810, intron 7 of 7) 2973 NM_001278733 117289 Hs.529984 NM_054114 ENSG00000164691 TAGAP ARHGAP47|FKSG15|IDDM21|TAGAP1 T cell activation RhoGTPase activating protein protein-coding 336.333-3 chr1 228500562 228501466 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 11274 NM_001287262 100129094 Hs.730208 NM_001287262 BTNL10 BTN4|BUTR1 butyrophilin like 10 protein-coding 142-84 chr3 48001600 48001992 + 0.666667 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) AluSz|SINE|Alu 87052 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 152.667-38 chr10 44711026 44711363 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -200122 NM_001345926 643236 Hs.292788 NM_001123376 ENSG00000187783 TMEM72 C10orf127|KSP37 transmembrane protein 72 protein-coding 286-23 chr2 45330595 45331149 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -75931 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 115.333-171 chr5 35232127 35232364 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1758 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 252.333-51 chr4 156537985 156538583 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 433515 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 122.667-72 chr17 63755268 63755528 + 0.666667 NA intron (NM_020198, intron 8 of 12) AluSx|SINE|Alu -13412 NM_001003788 92335 Hs.514402 NM_153335 ENSG00000266173 STRADA LYK5|NY-BR-96|PMSE|STRAD|STRAD alpha|Stlk STE20 related adaptor alpha protein-coding 197-43 chr16 74965698 74966000 + 0.666667 NA intron (NM_001324172, intron 1 of 13) intron (NM_001324172, intron 1 of 13) 19274 NM_030581 79726 Hs.280951 NM_030581 ENSG00000103091 WDR59 CDW12|FP977|p90-120 WD repeat domain 59 protein-coding 170.333-12 chr1 147830013 147830419 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -56854 NM_005266 2702 Hs.447968 NM_005266 ENSG00000265107 GJA5 ATFB11|CX40 gap junction protein alpha 5 protein-coding 186.667-98 chr4 30352296 30352695 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -367874 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 210.333-16 chr10 67918018 67918586 + 0.666667 NA TTS (NM_001314049) TTS (NM_001314049) 26900 NM_001314049 23411 Hs.369779 NM_012238 ENSG00000096717 SIRT1 SIR2|SIR2L1|SIR2alpha sirtuin 1 protein-coding 165.333-183 chr4 45571107 45571540 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A-int|LTR|ERVL-MaLR 552731 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 273.667-47 chr6 48425783 48426303 + 0.666667 NA Intergenic (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -357354 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 120-122 chr6 68507883 68508187 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 126289 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 142-164 chr9 69731032 69731366 + 0.666667 NA intron (NM_001099666, intron 5 of 7) G-rich|Low_complexity|Low_complexity 28812 NR_159517 375743 Hs.744192 NM_001099666 ENSG00000188647 PTAR1 - protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 protein-coding 177.333-156 chr7 95065164 95065649 + 0.666667 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 155508 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 123-55 chr17 54291151 54291417 + 0.666667 NA Intergenic HERV9-int|LTR|ERV1 468357 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 148-31 chr12 19012937 19013229 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -116650 NM_001256470 54477 Hs.188614 NM_019012 ENSG00000052126 PLEKHA5 PEPP-2|PEPP2 pleckstrin homology domain containing A5 protein-coding 131-96 chr8 23759091 23759310 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -52602 NM_001136271 137814 Hs.532654 NM_001136271 ENSG00000180053 NKX2-6 CSX2|CTHM|NKX2F|NKX4-2 NK2 homeobox 6 protein-coding 144.333-55 chr13 21487137 21487475 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -27936 NM_001286638 253832 Hs.564611 NM_153251 ENSG00000180776 ZDHHC20 4933421L13Rik|DHHC-20|DHHC20 zinc finger DHHC-type containing 20 protein-coding 122-13 chr10 33699748 33700078 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 72767 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 166-71 chr20 6828090 6828438 + 0.666667 NA Intergenic Eulor9B|DNA|DNA 60578 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 152.333-151 chr17 62880725 62881085 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -63310 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 122.333-21 chr10 68408558 68408815 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1392 NM_001042417 55680 Hs.653144 NM_017987 ENSG00000204130 RUFY2 RABIP4R|ZFYVE13 RUN and FYVE domain containing 2 protein-coding 146-28 chr14 54673405 54673811 + 0.666667 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) intron (NM_015589, intron 1 of 11) -81225 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 186.333-122 chr5 38359806 38360212 + 0.666667 NA intron (NM_152403, intron 5 of 21) intron (NM_152403, intron 5 of 21) 43462 NR_102750 100506475 Hs.662304 NR_102749 ENSG00000248572 EGFLAM-AS2 - EGFLAM antisense RNA 2 ncRNA 154.333-120 chr17 58185530 58185890 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7016 NM_000502 8288 Hs.279259 NM_000502 ENSG00000121053 EPX EPO|EPP|EPX-PEN|EPXD eosinophil peroxidase protein-coding 137-38 chr18 1748734 1749035 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -389255 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 148-141 chr6 8095626 8096034 + 0.666667 NA intron (NR_037618, intron 2 of 6) intron (NR_037618, intron 2 of 6) 6718 NM_001135650 9521 Hs.602353 NM_004280 ENSG00000124802 EEF1E1 AIMP3|P18 eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon 1 protein-coding 132-49 chr16 75697429 75697661 + 0.666667 NA intron (NM_001351309, intron 1 of 3) intron (NM_001351309, intron 1 of 3) 3916 NM_001351307 100033411 NM_001351307 ENSG00000282757 DUXB - double homeobox B protein-coding 132.667-195 chrX 42953954 42954254 + 0.666667 NA Intergenic MER34-int|LTR|ERV1 -175941 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 170-96 chr5 89298057 89298399 + 0.666667 NA intron (NR_136219, intron 7 of 9) intron (NR_136219, intron 7 of 9) -394123 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 113.333-99 chr17 30002237 30002429 + 0.666667 NA intron (NR_026738, intron 7 of 15) L1MD2|LINE|L1 60699 NM_198529 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 249.667-53 chr20 51829137 51829600 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -26847 NM_020436 57167 Hs.517113 NM_020436 ENSG00000101115 SALL4 DRRS|HSAL4|ZNF797 spalt like transcription factor 4 protein-coding 232-24 chr12 120248702 120249226 + 0.666667 NA intron (NM_002859, intron 1 of 10) AluSx1|SINE|Alu 1199 NM_025157 5829 Hs.446336 NM_002859 ENSG00000089159 PXN - paxillin protein-coding 157-12 chr1 220023648 220023959 + 0.666667 NA intron (NM_004446, intron 8 of 31) intron (NM_004446, intron 8 of 31) 22702 NM_004446 2058 Hs.497788 NM_004446 ENSG00000136628 EPRS EARS|GLUPRORS|HLD15|PARS|PIG32|QARS|QPRS glutamyl-prolyl-tRNA synthetase protein-coding 114-164 chr8 52976389 52976711 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 36642 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 141.667-75 chr14 63419789 63420060 + 0.666667 NA intron (NR_104104, intron 3 of 12) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 88314 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 160.333-69 chr11 117643963 117644304 + 0.666667 NA intron (NM_020693, intron 3 of 32) intron (NM_020693, intron 3 of 32) 153083 NM_001367904 57453 Hs.659513 NM_020693 ENSG00000177103 DSCAML1 DSCAM2 DS cell adhesion molecule like 1 protein-coding 116-144 chr7 31915640 31915890 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) 154642 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 148-65 chr18 26956935 26957368 + 0.666667 NA intron (NM_031422, intron 4 of 5) intron (NM_031422, intron 4 of 5) -91348 NM_001317387 361 Hs.315369 NM_001650 ENSG00000171885 AQP4 MIWC|WCH4 aquaporin 4 protein-coding 161.667-51 chr12 26940954 26941292 + 0.666667 NA intron (NM_015633, intron 1 of 6) intron (NM_015633, intron 1 of 6) 2653 NM_015633 26127 Hs.591162 NM_015633 ENSG00000111790 FGFR1OP2 HSPC123-like|WIT3.0 FGFR1 oncogene partner 2 protein-coding 136.333-42 chr12 23411747 23412052 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 172687 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 123-85 chr4 28461961 28462182 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -357511 NR_036237 100422937 NR_036237 ENSG00000283275 MIR4275 - microRNA 4275 ncRNA 254.333-75 chr7 1167238 1167954 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 6811 NR_110070 101927021 Hs.529566 NR_110065 LOC101927021 - uncharacterized LOC101927021 ncRNA 201.667-34 chr14 78994877 78995372 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -204858 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 202-22 chr10 89388766 89389105 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3611 NM_001270930 3434 Hs.20315 NM_001548 ENSG00000185745 IFIT1 C56|G10P1|IFI-56|IFI-56K|IFI56|IFIT-1|IFNAI1|ISG56|P56|RNM561 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1 protein-coding 140-90 chr5 81477380 81477657 + 0.666667 NA intron (NM_001256733, intron 5 of 15) L1MC4|LINE|L1 -83384 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 207-45 chr15 66459498 66460077 + 0.666667 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) intron (NM_002755, intron 5 of 10) 37247 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 138.667-143 chr4 11458618 11458886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29858 NM_005114 9957 Hs.507348 NM_005114 ENSG00000002587 HS3ST1 3OST|3OST1 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 1 protein-coding 149.667-121 chr14 62706956 62707292 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_172375, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_172375, exon 10 of 10) 338334 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 155-117 chr7 26342488 26342803 + 0.666667 NA intron (NM_001318199, intron 1 of 6) intron (NM_001318199, intron 1 of 6) -18239 NM_001199837 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 162.333-271 chr9 38059363 38059699 + 0.666667 NA intron (NM_003028, intron 1 of 5) intron (NM_003028, intron 1 of 5) 9696 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 115.667-66 chr13 92542191 92542413 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) L1MA5|LINE|L1 52139 NR_049840 100847092 NR_049840 ENSG00000263741 MIR548AS - microRNA 548as ncRNA 184.333-117 chr4 158839466 158839831 + 0.666667 NA intron (NM_001346043, intron 7 of 15) AluJo|SINE|Alu 33809 NM_001366843 57600 Hs.652441 NM_020840 ENSG00000052795 FNIP2 FNIPL|MAPO1 folliculin interacting protein 2 protein-coding 215.333-209 chr9 80264718 80265352 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 290012 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 196.333-113 chr3 109489561 109489931 + 0.666667 NA intron (NR_109841, intron 4 of 4) intron (NR_109841, intron 4 of 4) 79756 NR_109842 401082 Hs.477089 NM_001145553 ENSG00000228980 LINC01205 - long intergenic non-protein coding RNA 1205 ncRNA 153-124 chr7 18833320 18833627 + 0.666667 NA intron (NM_058176, intron 18 of 22) intron (NM_058176, intron 18 of 22) 284163 NR_149001 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 142.333-158 chr3 59706425 59706802 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -48116 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 115-133 chr6 42272207 42272478 + 0.666667 NA intron (NM_001297573, intron 4 of 17) intron (NM_001297573, intron 4 of 17) -54481 NM_018141 55173 Hs.380887 NM_018141 ENSG00000048544 MRPS10 MRP-S10|PNAS-122 mitochondrial ribosomal protein S10 protein-coding 190.333-15 chr10 22014547 22015041 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -11064 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 134.667-128 chr22 34775273 34775520 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 222520 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 122.333-225 chrX 70402811 70403066 + 0.666667 NA intron (NM_012310, intron 23 of 30) intron (NM_012310, intron 23 of 30) -20093 NM_001171191 54857 Hs.438712 NM_017711 ENSG00000130055 GDPD2 GDE3|OBDPF glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 2 protein-coding 147-22 chr11 44134066 44134354 + 0.666667 NA intron (NM_207122, intron 7 of 13) intron (NM_207122, intron 7 of 13) 38013 NM_000401 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 122-136 chrX 16707170 16707397 + 0.666667 NA intron (NM_019857, intron 1 of 18) intron (NM_019857, intron 1 of 18) 4934 NM_001144002 56474 Hs.227049 NM_019857 ENSG00000047230 CTPS2 - CTP synthase 2 protein-coding 167-64 chr20 13051780 13052186 + 0.666667 NA intron (NM_001349945, intron 3 of 12) L1PBa|LINE|L1 43011 NM_001349945 55304 Hs.425023 NM_018327 ENSG00000172296 SPTLC3 C20orf38|LCB 3|LCB2B|LCB3|SPT 3|SPT3|SPTLC2L|dJ718P11|dJ718P11.1|hLCB2b serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 protein-coding 158.667-226 chr3 189532324 189532631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64269 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 162.667-291 chr9 27780182 27780572 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -206511 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 184.333-118 chr5 5622048 5622446 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 199570 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 152-8 chr1 117972738 117973111 + 0.666667 NA intron (NM_206996, intron 44 of 48) intron (NM_206996, intron 44 of 48) 43185 NM_006784 10885 Hs.310809 NM_006784 ENSG00000065183 WDR3 DIP2|UTP12 WD repeat domain 3 protein-coding 219.333-186 chr8 126308682 126309334 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16487 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 148-164 chr9 3165654 3166024 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -15750 NR_121585 101929247 Hs.547178 NR_121585 LINC01231 - long intergenic non-protein coding RNA 1231 ncRNA 179.333-128 chr3 105978132 105978519 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -108924 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 197.667-54 chr17 78009005 78009523 + 0.666667 NA intron (NM_018996, intron 2 of 20) intron (NM_018996, intron 2 of 20) 5027 NM_001142640 57690 Hs.406810 NM_018996 ENSG00000078687 TNRC6C - trinucleotide repeat containing adaptor 6C protein-coding 133.333-143 chr5 30637642 30638028 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -555851 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 143-86 chr4 32464208 32464591 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113361 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 160-121 chr8 100238354 100238718 + 0.666667 NA intron (NM_003114, intron 16 of 18) intron (NM_003114, intron 16 of 18) 63657 NM_001353837 25897 Hs.292882 NM_015435 ENSG00000034677 RNF19A RNF19 ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 153.333-446 chr9 129071920 129072329 + 0.666667 NA TTS (NR_138425) TTS (NR_138425) -8987 NR_072983 57171 Hs.21701 NM_020438 ENSG00000167130 DOLPP1 LSFR2 dolichyldiphosphatase 1 protein-coding 139.333-71 chr14 51961592 51961907 + 0.666667 NA intron (NM_001243773, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 -27797 NM_016039 51637 Hs.534457 NM_016039 ENSG00000087302 RTRAF C14orf166|CGI-99|CGI99|CLE|CLE7|LCRP369|RLLM1|hCLE|hCLE1 RNA transcription, translation and transport factor protein-coding 193.333-147 chr5 15689704 15690246 + 0.666667 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) MER20|DNA|hAT-Charlie -74973 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 114.667-40 chr10 121577433 121577626 + 0.666667 NA intron (NM_001320658, intron 2 of 17) intron (NM_001320658, intron 2 of 17) 16438 NM_001144913 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 129.333-152 chr5 63756773 63757062 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 205375 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 193.333-43 chr12 43049790 43050259 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105291 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 118.333-139 chr3 104244970 104245251 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -720994 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 176-83 chr6 94192271 94192611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 474138 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 249-24 chr14 60218706 60219381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26707 NM_177952 5494 Hs.130036 NM_021003 ENSG00000100614 PPM1A PP2C-ALPHA|PP2CA|PP2Calpha protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1A protein-coding 128-16 chr11 110727850 110728152 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -14812 NM_001258416 57569 Hs.6136 NM_020809 ENSG00000137727 ARHGAP20 RARHOGAP Rho GTPase activating protein 20 protein-coding 124.333-114 chr3 61059611 61059977 + 0.666667 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 191658 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 199-9 chr10 28950035 28950621 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 103920 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 133.667-158 chr8 131050148 131050429 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9379 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 262-69 chr6 148176820 148177572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -95132 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 208.667-150 chr8 124452873 124453321 + 0.666667 NA TTS (NM_017956) TTS (NM_017956) 2277 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 139.333-50 chr12 14062178 14062498 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -81982 NM_000834 2904 Hs.504844 NM_000834 ENSG00000273079 GRIN2B EIEE27|GluN2B|MRD6|NMDAR2B|NR2B|NR3|hNR3 glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B protein-coding 130.333-148 chr4 67935508 67935738 + 0.666667 NA intron (NM_001114387, intron 3 of 9) L2b|LINE|L2 27870 NM_001114387 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 168.667-9 chr1 119937617 119938109 + 0.666667 NA exon (NM_024408, exon 20 of 34) exon (NM_024408, exon 20 of 34) -41348 NM_021794 11085 Hs.283011 NM_021794 ENSG00000134249 ADAM30 svph4 ADAM metallopeptidase domain 30 protein-coding 194.333-116 chr5 31538071 31538529 + 0.666667 NA exon (NM_018356, exon 4 of 9) exon (NM_018356, exon 4 of 9) 5999 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 152.333-242 chr3 110879653 110880029 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 190118 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-22 chr10 21360389 21360708 + 0.666667 NA intron (NR_155751, intron 3 of 4) intron (NR_155751, intron 3 of 4) 12402 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 132.333 chr1 19056213 19056463 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -99662 NM_001136265 126917 Hs.466625 NM_001136265 ENSG00000169991 IFFO2 - intermediate filament family orphan 2 protein-coding 181.667-24 chr11 105415085 105415502 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -194780 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 154-139 chr8 79579161 79579460 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -31807 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 236-62 chr4 46127472 46128021 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3692 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 178-22 chr11 17587713 17588141 + 0.666667 NA intron (NM_001277269, intron 23 of 54) intron (NM_001277269, intron 23 of 54) 40554 NM_001277269 340990 Hs.688380 NM_198497 ENSG00000188162 OTOG DFNB18B|MLEMP|OTGN otogelin protein-coding 163.667-203 chr5 110264244 110264639 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 249474 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 118-54 chr17 62300803 62301051 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -25272 NR_027486 440452 Hs.448884 NR_027486 ENSG00000188755 TBC1D3P2 - TBC1 domain family member 3 pseudogene 2 pseudo 125-46 chr17 20130698 20131029 + 0.666667 NA intron (NM_001033553, intron 3 of 14) L1MD|LINE|L1 -25209 NM_001033555 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 112.333-26 chr10 74323091 74323422 + 0.666667 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) Charlie2a|DNA|hAT-Charlie 146493 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 113.667-170 chr5 61794041 61794313 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58479 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 140-15 chr10 13820057 13820400 + 0.666667 NA intron (NM_001318336, intron 2 of 23) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -112661 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 265.333-6 chr1 190424448 190424964 + 0.666667 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 51304 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 156.333-171 chr2 26923483 26923825 + 0.666667 NA intron (NM_020134, intron 2 of 12) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -46983 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 121.333-30 chr11 47100662 47100900 + 0.666667 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) AluSz6|SINE|Alu 76098 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 199-96 chr6 93951233 93951690 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 233158 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 183.667-5 chr1 81700473 81700996 + 0.666667 NA intron (NM_001297704, intron 1 of 20) intron (NM_001297704, intron 1 of 20) 964 NM_001297704 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 121-105 chr4 40228912 40229267 + 0.666667 NA intron (NM_001278360, intron 2 of 3) intron (NM_001278360, intron 2 of 3) 32058 NM_004310 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 183-15 chr10 81095669 81096164 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 446119 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 165.333-218 chr6 7465819 7466167 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -75678 NM_001008844 1832 Hs.519873 NM_004415 ENSG00000096696 DSP DCWHKTA|DP desmoplakin protein-coding 183.333-160 chr8 101346233 101346717 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -22418 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 138.333-41 chr11 75663543 75663878 + 0.666667 NA intron (NM_207577, intron 1 of 2) intron (NM_207577, intron 1 of 2) 4724 NM_033063 4135 Hs.585540 NM_033063 ENSG00000171533 MAP6 MAP6-N|MTAP6|N-STOP|STOP microtubule associated protein 6 protein-coding 146-148 chr9 101862929 101863256 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -124512 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 173.333-47 chr12 120421981 120422406 + 0.666667 NA Intergenic AluSq4|SINE|Alu -15920 NM_004373 1337 Hs.369624 NM_004373 ENSG00000111775 COX6A1 CMTRID|COX6A|COX6AL cytochrome c oxidase subunit 6A1 protein-coding 148-44 chr14 80193555 80193913 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -17685 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 113-15 chr10 20770520 20770747 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 126969 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 113.667-105 chr2 71504131 71504321 + 0.666667 NA intron (NM_001130985, intron 4 of 54) intron (NM_001130985, intron 4 of 54) 37527 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 115.667-138 chr21 35997149 35997415 + 0.666667 NA intron (NR_110418, intron 1 of 5) intron (NR_110418, intron 1 of 5) 7385 NR_110418 101928269 Hs.589909 NR_110418 LOC101928269 - uncharacterized LOC101928269 ncRNA 116-34 chr12 65765426 65765660 + 0.666667 NA intron (NR_026825, intron 1 of 1) intron (NR_026825, intron 1 of 1) -58917 NM_001330190 8091 Hs.505924 NM_003483 ENSG00000149948 HMGA2 BABL|HMGI-C|HMGIC|LIPO|STQTL9 high mobility group AT-hook 2 protein-coding 140-116 chr8 88804705 88805014 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -477376 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 125-39 chr15 84698117 84698406 + 0.666667 NA intron (NM_014300, intron 1 of 5) intron (NM_014300, intron 1 of 5) 17878 NM_014300 23478 Hs.9534 NM_014300 ENSG00000140612 SEC11A 1810012E07Rik|SEC11L1|SPC18|SPCS4A|sid2895 SEC11 homolog A, signal peptidase complex subunit protein-coding 200.333-121 chr5 81908084 81908622 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63670 NM_031482 83734 Hs.713698 NM_031482 ENSG00000152348 ATG10 APG10|APG10L|pp12616 autophagy related 10 protein-coding 117.667-138 chr4 88743710 88744028 + 0.666667 NA intron (NM_001015045, intron 13 of 17) intron (NM_001015045, intron 13 of 17) 34080 NR_002806 285512 Hs.744957 NR_002806 ENSG00000248019 FAM13A-AS1 FAM13A1OS|FAM13AOS|NCRNA00039 FAM13A antisense RNA 1 ncRNA 111.667-120 chr19 12178471 12178658 + 0.666667 NA intron (NM_001348014, intron 2 of 4) intron (NM_001348014, intron 2 of 4) 15468 NM_003437 7695 Hs.479874 NM_003437 ENSG00000196646 ZNF136 pHZ-20 zinc finger protein 136 protein-coding 172.667-77 chr2 28127037 28127334 + 0.666667 NA intron (NM_199193, intron 7 of 13) L1PA3|LINE|L1 79776 NR_120504 100505736 Hs.659540 NR_120504 LOC100505736 - uncharacterized LOC100505736 ncRNA 116.333-114 chr2 40115730 40115952 + 0.666667 NA intron (NM_001351483, intron 8 of 8) intron (NM_001351483, intron 8 of 8) 198207 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 147-49 chr15 90942715 90943102 + 0.666667 NA intron (NM_001323621, intron 7 of 19) intron (NM_001323621, intron 7 of 19) 7623 NM_018671 55898 Hs.389461 NM_017979 ENSG00000140553 UNC45A GC-UNC45|GCUNC-45|GCUNC45|IRO039700|SMAP-1|SMAP1|UNC-45A unc-45 myosin chaperone A protein-coding 113.667-85 chr18 6225119 6225330 + 0.666667 NA intron (NM_001365769, intron 10 of 16) L1MCc|LINE|L1 -31520 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 142.667-203 chr7 38581217 38581537 + 0.666667 NA intron (NM_001635, intron 1 of 20) L2a|LINE|L2 49996 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 138.667-220 chr9 127862954 127863272 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 6382 NR_039819 100616429 NR_039819 ENSG00000263979 MIR4672 - microRNA 4672 ncRNA 127.667-106 chr21 18432347 18432540 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -28658 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 195.667-135 chr7 109856688 109857176 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 103281 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 166.333-16 chr1 209222214 209222561 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -103069 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 215-65 chr5 38314669 38315170 + 0.666667 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -23933 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 141.333-8 chr1 97636722 97637094 + 0.666667 NA intron (NM_000110, intron 8 of 22) LTR85a|LTR|Gypsy? -160013 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 117.333-188 chr7 23120691 23121000 + 0.666667 NA intron (NR_033329, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 14184 NM_018846 55975 Hs.654817 NM_018846 ENSG00000122550 KLHL7 CISS3|KLHL6|SBBI26 kelch like family member 7 protein-coding 138.667-221 chrX 41859478 41859827 + 0.666667 NA intron (NM_003688, intron 1 of 26) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 63382 NM_003688 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 150.333-152 chr16 87740455 87740847 + 0.666667 NA intron (NM_001351938, intron 4 of 10) intron (NM_001351938, intron 4 of 10) 25335 NM_001184856 54758 Hs.123450 NM_017566 ENSG00000104731 KLHDC4 - kelch domain containing 4 protein-coding 216.333-42 chr13 72809773 72810112 + 0.666667 NA intron (NR_146206, intron 5 of 16) intron (NR_146206, intron 5 of 16) 27809 NR_146206 10464 Hs.441926 NM_006346 ENSG00000083535 PIBF1 C13orf24|CEP90|JBTS33|PIBF progesterone immunomodulatory binding factor 1 protein-coding 205.667-112 chr5 81479129 81479566 + 0.666667 NA intron (NM_001256733, intron 5 of 15) AluSx1|SINE|Alu -85213 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 262.667-39 chr2 116585269 116585866 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1229124 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 193.333-11 chr1 189680016 189680445 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 795780 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 143-120 chr7 104881486 104881751 + 0.666667 NA intron (NM_199000, intron 2 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 45027 NR_027374 723809 Hs.124316 NR_027374 ENSG00000225329 LHFPL3-AS2 - LHFPL3 antisense RNA 2 ncRNA 154.333-370 chr9 84333555 84333870 + 0.666667 NA intron (NM_022127, intron 2 of 18) L1ME3B|LINE|L1 7046 NR_037638 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 170.667-94 chr20 1105507 1105864 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7544 NM_178578 9491 Hs.471917 NM_006814 ENSG00000125818 PSMF1 PI31 proteasome inhibitor subunit 1 protein-coding 220.666-70 chr8 81928645 81929288 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -86680 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 149.333-214 chr20 32043725 32044110 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -8325 NM_002110 3055 Hs.655210 NM_002110 ENSG00000101336 HCK JTK9|p59Hck|p61Hck HCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase protein-coding 129-41 chr16 5346982 5347298 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -249320 NM_001289029 196483 Hs.406461 NM_201400 ENSG00000118894 EEF2KMT EFM3|FAM86A|SB153|eEF2-KMT eukaryotic elongation factor 2 lysine methyltransferase protein-coding 167.333-225 chr6 48067007 48067361 + 0.666667 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) intron (NM_207499, intron 1 of 2) 1505 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 234.333-55 chr4 109090523 109090932 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 211931 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 134.333-75 chr17 64083829 64084047 + 0.666667 NA intron (NM_001433, intron 2 of 21) intron (NM_001433, intron 2 of 21) 46206 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 185.667-20 chr12 8958585 8958976 + 0.666667 NA intron (NR_137427, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 8736 NM_001329103 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 128-77 chr4 31274483 31274705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 103450 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 141.667-205 chr7 19345474 19345823 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -200227 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 116.667-185 chr7 33765155 33765430 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -139623 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 113.667-186 chr6 69430720 69431003 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 365605 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 152-55 chr14 56240709 56240987 + 0.666667 NA intron (NM_021255, intron 2 of 5) intron (NM_021255, intron 2 of 5) 122437 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 164.333-100 chr18 13703753 13704120 + 0.666667 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) MER57-int|LTR|ERV1 22622 NM_152352 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 146.333-34 chr10 102758250 102758585 + 0.666667 NA intron (NM_001083913, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 14469 NM_001083913 54838 Hs.500897 NM_017787 ENSG00000166272 WBP1L C10orf26|OPA1L|OPAL1 WW domain binding protein 1 like protein-coding 135.667 chr1 14223554 14223853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 196270 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 113.333-177 chr3 76321019 76321323 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -535622 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 210.667-108 chr5 77788304 77788797 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12189 NM_004607 6902 Hs.291212 NM_004607 ENSG00000171530 TBCA - tubulin folding cofactor A protein-coding 227.333-47 chr16 83946540 83947005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6468 NM_182981 29948 Hs.128055 NM_013370 ENSG00000140961 OSGIN1 BDGI|OKL38 oxidative stress induced growth inhibitor 1 protein-coding 139.333-94 chr17 70086643 70087020 + 0.666667 NA intron (NM_001270422, intron 1 of 5) intron (NM_001270422, intron 1 of 5) 11606 NM_001270422 3773 Hs.463985 NM_018658 ENSG00000153822 KCNJ16 BIR9|KIR5.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 16 protein-coding 123.333-188 chr6 162155871 162156107 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) intron (NM_004562, intron 4 of 11) -571143 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 150.667-297 chr5 43380861 43381158 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001301875, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001301875, exon 3 of 3) 16128 NM_001301875 56477 Hs.656904 NM_019846 ENSG00000151882 CCL28 CCK1|MEC|SCYA28 C-C motif chemokine ligand 28 protein-coding 275.667-7 chr10 14145468 14146080 + 0.666667 NA intron (NR_134578, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 71490 NR_120638 101928453 Hs.650212 NR_120638 LOC101928453 - uncharacterized LOC101928453 ncRNA 155-102 chr4 95884315 95884630 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 44379 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 146.667-132 chr17 30258542 30258805 + 0.666667 NA intron (NM_000386, intron 11 of 11) intron (NM_000386, intron 11 of 11) -22976 NM_001045 6532 Hs.29792 NM_001045 ENSG00000108576 SLC6A4 5-HTT|5-HTTLPR|5HTT|HTT|OCD1|SERT|SERT1|hSERT solute carrier family 6 member 4 protein-coding 168.667-172 chr5 55954644 55955122 + 0.666667 NA non-coding (NR_120480, exon 12 of 18) non-coding (NR_120480, exon 12 of 18) 40080 NM_001364276 3572 Hs.532082 NM_002184 ENSG00000134352 IL6ST CD130|CDW130|GP130|IL-6RB interleukin 6 signal transducer protein-coding 135.667-191 chr8 135118192 135118538 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115766 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 149.333-49 chr10 61259817 61260118 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -192672 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 148.667-158 chr17 61937164 61937491 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -9345 NM_001330417 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 152.667-351 chr7 119234887 119235187 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 672338 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 166.333-150 chr3 37967582 37967898 + 0.666667 NA intron (NM_001008392, intron 4 of 7) intron (NM_001008392, intron 4 of 7) -1664 NR_029499 407015 NR_029499 ENSG00000199075 MIR26A1 MIR26A|MIRN26A1|mir-26a-1 microRNA 26a-1 ncRNA 161.333-96 chr14 87433852 87434138 + 0.666667 NA Intergenic MER110|LTR|ERV1 221299 NR_146551 105370611 Hs.691123 NR_146551 ENSG00000258770 LINC02330 - long intergenic non-protein coding RNA 2330 ncRNA 117.667-201 chr8 134619357 134619689 + 0.666667 NA intron (NM_020863, intron 3 of 15) L2a|LINE|L2 21452 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 149-125 chr6 34588363 34588675 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_024294, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_024294, exon 5 of 5) -32186 NM_001252294 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 152-11 chr1 197732619 197732933 + 0.666667 NA intron (NR_125340, intron 2 of 19) intron (NR_125340, intron 2 of 19) 42704 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 167-106 chr8 133679322 133679610 + 0.666667 NA intron (NR_134462, intron 1 of 2) intron (NR_134462, intron 1 of 2) 4600 NR_134462 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 148-153 chr6 162837293 162837724 + 0.666667 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) intron (NM_001080379, intron 2 of 4) 109538 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 178.333-58 chr15 93006578 93006870 + 0.666667 NA intron (NM_001271, intron 34 of 38) MIR|SINE|MIR 66432 NM_001166286 56963 Hs.271277 NM_020211 ENSG00000182175 RGMA RGM repulsive guidance molecule BMP co-receptor a protein-coding 315.333-38 chr5 68073526 68074143 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -116042 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 135.667-9 chr1 196476720 196476956 + 0.666667 NA intron (NM_001287820, intron 5 of 26) intron (NM_001287820, intron 5 of 26) 105643 NR_039888 100616363 NR_039888 ENSG00000265986 MIR4735 - microRNA 4735 ncRNA 167.333-147 chr2 205989378 205989873 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96549 NM_017759 54891 Hs.445036 NM_017759 ENSG00000114933 INO80D - INO80 complex subunit D protein-coding 129.667-98 chr2 113724484 113724721 + 0.666667 NA intron (NM_001330315, intron 13 of 16) intron (NM_001330315, intron 13 of 16) -3234 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 187.333-30 chr11 34364248 34364652 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6440 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 134-102 chr8 4162239 4162586 + 0.666667 NA intron (NM_033225, intron 3 of 69) intron (NM_033225, intron 3 of 69) 832502 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 238-37 chr18 6093352 6093959 + 0.666667 NA intron (NM_001365769, intron 14 of 16) intron (NM_001365769, intron 14 of 16) -163089 NR_110765 101927150 NR_110765 L3MBTL4-AS1 - L3MBTL4 antisense RNA 1 ncRNA 115.667-143 chr3 16053981 16054233 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -120573 NM_001319051 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 149.667-327 chr5 102313008 102313314 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -16877 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 121-117 chr5 123832322 123832507 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 286997 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 208.667-42 chr12 129999971 130000389 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42162 NR_024457 100190940 Hs.625993 NR_024457 ENSG00000214039 LINC02418 - long intergenic non-protein coding RNA 2418 ncRNA 120.667-63 chr15 71706481 71706697 + 0.666667 NA intron (NM_001286429, intron 2 of 11) intron (NM_001286429, intron 2 of 11) -15050 NR_120346 101929173 Hs.680593 NR_120346 THSD4-AS2 - THSD4 antisense RNA 2 ncRNA 145.667-203 chr5 7970348 7970613 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 101332 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 130.667-50 chr11 97507411 97507653 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 999107 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 123.333-148 chr3 139698755 139699086 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -20870 NM_001320511 349565 Hs.208673 NM_178177 ENSG00000163864 NMNAT3 FKSG76|PNAT-3|PNAT3 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 protein-coding 170-31 chr13 92894643 92895005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -150517 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 143-95 chr5 62847146 62847425 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 268466 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 112.333-149 chr21 23925640 23925868 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 395623 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 191.667-69 chr2 121157774 121158150 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 127240 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 276.667-52 chr3 187282908 187283376 + 0.666667 NA intron (NR_033519, intron 1 of 9) intron (NR_033519, intron 1 of 9) -8130 NR_135551 101929130 NR_135551 ENSG00000283175 LOC101929130 - uncharacterized LOC101929130 ncRNA 154.333-157 chr2 98036275 98036684 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40531 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 243.666-34 chr7 29510740 29511449 + 0.666667 NA intron (NM_001293081, intron 6 of 6) intron (NM_001293081, intron 6 of 6) 27278 NM_001293081 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 167-58 chr2 72866260 72866593 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -20982 NM_003124 6697 Hs.301540 NM_003124 ENSG00000116096 SPR SDR38C1 sepiapterin reductase protein-coding 194.333-120 chr5 96630134 96630630 + 0.666667 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) L2c|LINE|L2 -31655 NM_001042442 831 Hs.436186 NM_001750 ENSG00000153113 CAST BS-17|PLACK calpastatin protein-coding 165.667-189 chr7 98697415 98697819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 80332 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 114-113 chr5 29952443 29952679 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F1-int|LTR|ERVL-MaLR 72001 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 140.333-86 chr18 424613 424969 + 0.666667 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) L2b|LINE|L2 75910 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 135.333-183 chr7 92822188 92822512 + 0.666667 NA intron (NM_001259, intron 2 of 7) intron (NM_001259, intron 2 of 7) 11609 NM_001259 1021 Hs.119882 NM_001259 ENSG00000105810 CDK6 MCPH12|PLSTIRE cyclin dependent kinase 6 protein-coding 115-158 chr9 19393178 19393435 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -13070 NM_001010 6194 Hs.408073 NM_001010 ENSG00000137154 RPS6 S6 ribosomal protein S6 protein-coding 132-126 chrX 5783442 5783772 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -442751 NR_136577 105373156 Hs.21107 NR_136577 LOC105373156 - uncharacterized LOC105373156 ncRNA 156.333-84 chr12 87135669 87136048 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -194881 NR_135020 105369879 Hs.552351 NR_135020 LOC105369879 - uncharacterized LOC105369879 ncRNA 139-22 chr11 109733626 109734001 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 311623 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 177.333-12 chr1 214812730 214813207 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -192574 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 152-134 chr6 75730318 75730691 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -18735 NM_001368137 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 141.333-163 chr3 172211963 172212287 + 0.666667 NA intron (NM_001135095, intron 3 of 25) intron (NM_001135095, intron 3 of 25) 171594 NM_001135095 64778 Hs.744888 NM_022763 ENSG00000075420 FNDC3B FAD104|PRO4979|YVTM2421 fibronectin type III domain containing 3B protein-coding 176.333-95 chr2 192798595 192799110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49007 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 128.333-53 chr13 111653447 111653752 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 57590 NR_135814 105370369 NR_135814 ENSG00000215881 LINC02337 - long intergenic non-protein coding RNA 2337 ncRNA 120-43 chr15 63742934 63743194 + 0.666667 NA intron (NM_003922, intron 12 of 77) L1MB7|LINE|L1 90884 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 220-36 chr14 99079900 99080496 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 191999 NM_022898 64919 Hs.709690 NM_022898 ENSG00000127152 BCL11B ATL1|ATL1-alpha|ATL1-beta|ATL1-delta|ATL1-gamma|CTIP-2|CTIP2|IDDFSTA|IMD49|RIT1|ZNF856B|hRIT1-alpha BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11B protein-coding 112.667-63 chr14 39516238 39516537 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -83887 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 160.667-22 chr1 211625331 211625672 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14307 NR_131925 105748977 Hs.553186 NR_131925 LINC01693 - long intergenic non-protein coding RNA 1693 ncRNA 157.667-353 chr9 36133510 36133829 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2867 NR_104637 152007 Hs.493819 NM_022343 ENSG00000122694 GLIPR2 C9orf19|GAPR-1|GAPR1 GLI pathogenesis related 2 protein-coding 143.333-190 chr3 117353222 117353544 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 337542 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 167.333-133 chr2 110943140 110943494 + 0.666667 NA intron (NM_001142807, intron 12 of 17) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 172271 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 158.667-109 chr15 74914587 74914927 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7863 NR_135848 57184 Hs.367690 NM_020447 ENSG00000178761 FAM219B C15orf17 family with sequence similarity 219 member B protein-coding 141.667-38 chr10 111862027 111862359 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 321572 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 245.333-103 chr6 164478725 164479145 + 0.666667 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 343128 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 125.667-98 chr2 74425942 74426161 + 0.666667 NA TTS (NM_001320823) TTS (NM_001320823) 4321 NM_001320823 84058 Hs.643480 NM_032118 ENSG00000005448 WDR54 - WD repeat domain 54 protein-coding 122.667-142 chr4 137817389 137817744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -271448 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 168-20 chr12 27926890 27927370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42846 NM_198964 5744 Hs.591159 NM_002820 ENSG00000087494 PTHLH BDE2|HHM|PLP|PTHR|PTHRP parathyroid hormone like hormone protein-coding 225.667-81 chr8 142014363 142014904 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -161706 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 184.333-33 chr14 42920143 42920543 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 1313487 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 161-56 chr22 46467206 46467655 + 0.666667 NA intron (NM_014246, intron 1 of 34) intron (NM_014246, intron 1 of 34) 70190 NM_014246 9620 Hs.252387 NM_014246 ENSG00000075275 CELSR1 ADGRC1|CDHF9|FMI2|HFMI2|ME2 cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 protein-coding 168-122 chr9 82798718 82799097 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 264235 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 150.333-75 chr12 16837945 16838361 + 0.666667 NA Intergenic MER21-int|LTR|ERVL -150594 NR_036619 728622 Hs.741380 NR_036619 SKP1P2 SKP1B|p19B S-phase kinase associated protein 1 pseudogene 2 pseudo 194.333-92 chr4 35275084 35275595 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 968600 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 150-90 chr3 19962285 19962571 + 0.666667 NA intron (NM_001292048, intron 2 of 5) AluSg|SINE|Alu 15331 NM_004162 5868 Hs.475663 NM_004162 ENSG00000144566 RAB5A RAB5 RAB5A, member RAS oncogene family protein-coding 170.667-140 chr5 171652473 171652775 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -133248 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 155-20 chr11 28081231 28081547 + 0.666667 NA intron (NM_031217, intron 9 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 24574 NR_030341 693195 NR_030341 ENSG00000207874 MIR610 MIRN610|hsa-mir-610 microRNA 610 ncRNA 160.333-90 chr13 92180089 92180407 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) 171959 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 153.333-260 chr3 14678271 14678672 + 0.666667 NA intron (NM_001184957, intron 1 of 16) L2c|LINE|L2 3330 NM_032137 84077 Hs.661452 NM_032137 ENSG00000131379 C3orf20 - chromosome 3 open reading frame 20 protein-coding 238.667-71 chr5 105594588 105595087 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 495363 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 147.333-179 chr2 198407185 198407471 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32231 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 135.667-6 chr1 108171313 108171578 + 0.666667 NA intron (NM_013386, intron 3 of 9).2 intron (NM_013386, intron 3 of 9).2 21390 NM_213651 29957 Hs.656870 NM_013386 ENSG00000085491 SLC25A24 APC1|SCAMC-1|SCAMC1 solute carrier family 25 member 24 protein-coding 114.333-125 chr2 221390830 221391045 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 181367 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 154.667-93 chr13 60523716 60524092 + 0.666667 NA intron (NM_030794, intron 10 of 13) intron (NM_030794, intron 10 of 13) 126684 NM_001146070 81550 Hs.525061 NM_030794 ENSG00000083544 TDRD3 - tudor domain containing 3 protein-coding 122.667-68 chr16 85218522 85218858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10894 NR_162142 113219463 NR_162142 MIR12128 - microRNA 12128 ncRNA 207.333-186 chr3 121108862 121109341 + 0.666667 NA intron (NR_145517, intron 5 of 8) L1PA10|LINE|L1 59461 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 130-98 chr5 107248030 107248384 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -237193 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 254-14 chr11 39510310 39510800 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 782575 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 114-73 chr2 143985253 143985546 + 0.666667 NA intron (NM_001354353, intron 7 of 9) L1M7|LINE|L1 48332 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 173.333-125 chr3 98385676 98386153 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -4752 NM_001005516 403277 Hs.554709 NM_001005516 ENSG00000206536 OR5K3 - olfactory receptor family 5 subfamily K member 3 protein-coding 130-3 chr1 51450521 51450861 + 0.666667 NA intron (NM_001981, intron 8 of 24) L1ME4b|LINE|L1 -28596 NM_001159969 2060 Hs.83722 NM_001981 ENSG00000085832 EPS15 AF-1P|AF1P|MLLT5 epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 protein-coding 144.333-188 chr4 37526825 37527121 + 0.666667 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -57260 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 208-84 chr2 177106736 177107189 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 105449 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 166-77 chr3 8161449 8161803 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -145319 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 213.333-168 chr5 133369992 133370474 + 0.666667 NA intron (NM_015082, intron 4 of 15) intron (NM_015082, intron 4 of 15) 57473 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 162-39 chr14 52755146 52755496 + 0.666667 NA intron (NM_001130701, intron 5 of 11) AluSx|SINE|Alu 25155 NM_145251 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 177.333-16 chr10 25267040 25267483 + 0.666667 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -90985 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 148-46 chr15 60193447 60193738 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 189281 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 144.667-20 chr1 188343211 188343626 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 899790 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 191.667-19 chr10 110609407 110609842 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34712 NM_001134363 282996 Hs.116630 NM_001134363 ENSG00000203867 RBM20 - RNA binding motif protein 20 protein-coding 130-87 chr4 153431039 153431339 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -35157 NM_015196 23240 Hs.732450 NM_015196 ENSG00000121210 TMEM131L KIAA0922 transmembrane 131 like protein-coding 214.667-44 chr15 37571201 37571556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -363229 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 115.667-18 chr10 22137962 22138233 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 71886 NM_001199938 340900 Hs.450519 NM_001199938 ENSG00000223601 EBLN1 EBLN-1 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 1 protein-coding 215.667 chr1 66089163 66089650 + 0.666667 NA intron (NM_001037340, intron 1 of 14) L3|LINE|CR1 -38688 NR_123718 101927139 Hs.127908 NR_123718 ENSG00000227466 LOC101927139 - uncharacterized LOC101927139 ncRNA 151-94 chr4 90322321 90322691 + 0.666667 NA intron (NM_207491, intron 3 of 7) L1MA3|LINE|L1 87475 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 148.667-358 chr7 80847242 80847551 + 0.666667 NA intron (NM_006379, intron 2 of 17) MER5C|DNA|hAT-Charlie 71655 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 124-121 chr9 118408570 118408800 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -270986 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 156.333-346 chr7 113311734 113312075 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -193322 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 122.333-171 chr5 28290880 28291186 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3368 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 112.667-33 chr10 124925868 124926091 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -16144 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 140.333-227 chr8 17658309 17658643 + 0.666667 NA intron (NR_156437, intron 7 of 13) intron (NR_156437, intron 7 of 13) 18025 NM_001330470 57509 Hs.7946 NM_020749 ENSG00000129422 MTUS1 ATBP|ATIP|ATIP3|ICIS|MP44|MTSG1 microtubule associated scaffold protein 1 protein-coding 145.667-292 chr8 112166717 112166993 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -476638 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 144-49 chr14 52742880 52743197 + 0.666667 NA intron (NM_001130701, intron 2 of 11) AluSq2|SINE|Alu 12872 NM_145251 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 175-68 chr5 71910306 71910680 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 191218 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 136-29 chr14 43446205 43446557 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 1060902 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 164.333-203 chr5 146114246 146114601 + 0.666667 NA intron (NM_016460, intron 30 of 30) intron (NM_016460, intron 30 of 30) -8846 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 147.333-143 chr17 62919815 62920228 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -24194 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 169.666-5 chr3 107155522 107156029 + 0.666667 NA intron (NR_028303, intron 1 of 3) L1PA8|LINE|L1 84863 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 164.667-242 chr8 117867917 117868394 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) MER91A|DNA|hAT-Tip100 52758 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 159.667-159 chr2 20034214 20034532 + 0.666667 NA exon (NM_014713, exon 6 of 7) exon (NM_014713, exon 6 of 7) 17255 NM_014713 9741 Hs.467807 NM_014713 ENSG00000068697 LAPTM4A HUMORF13|LAPTM4|MBNT|Mtrp lysosomal protein transmembrane 4 alpha protein-coding 140.667-50 chr11 46939534 46939791 + 0.666667 NA intron (NM_001278222, intron 1 of 7) (ATAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 2901 NM_024113 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 146.333-291 chr6 120509739 120510154 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 494767 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 171.333-115 chr3 35039999 35040351 + 0.666667 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 353848 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 194.667-62 chr2 40331234 40331641 + 0.666667 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 98867 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 236.666-21 chr17 75781038 75781717 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1598 NM_005324 3021 Hs.180877 NM_005324 ENSG00000132475 H3F3B H3.3B H3 histone family member 3B protein-coding 159.333-345 chr9 2481012 2481442 + 0.666667 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -140560 NM_003383 7436 Hs.370422 NM_003383 ENSG00000147852 VLDLR CAMRQ1|CARMQ1|CHRMQ1|VLDL-R|VLDLRCH very low density lipoprotein receptor protein-coding 146.667-33 chr10 48528551 48528979 + 0.666667 NA intron (NR_144642, intron 3 of 9) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -17176 NR_146782 100689073 Hs.667964 NR_146782 ARHGAP22-IT1 - ARHGAP22 intronic transcript 1 ncRNA 144.333-197 chr4 121075454 121075732 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3058 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 125.333-169 chr7 83438830 83439158 + 0.666667 NA intron (NM_001178129, intron 4 of 16) intron (NM_001178129, intron 4 of 16) 202437 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 176.667-121 chr5 42153252 42153667 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21886 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 159.667-198 chr21 20017997 20018468 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -118477 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 164.667-45 chr12 4335888 4336232 + 0.666667 NA intron (NM_020375, intron 2 of 5) L1MC4a|LINE|L1 14847 NM_020375 57103 Hs.504545 NM_020375 ENSG00000078237 TIGAR C12orf5|FR2BP TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase protein-coding 156.667-119 chr15 69448402 69448719 + 0.666667 NA TTS (NM_001281301) TTS (NM_001281301) -4258 NM_001003 6176 Hs.356502 NM_001003 ENSG00000137818 RPLP1 LP1|P1|RPP1 ribosomal protein lateral stalk subunit P1 protein-coding 221-14 chr11 98315688 98316285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -704963 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 149.333-17 chr1 111090503 111090885 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -48689 NM_001007794 10390 Hs.363572 NM_006090 ENSG00000134255 CEPT1 - choline/ethanolamine phosphotransferase 1 protein-coding 137.667-12 chr1 171574494 171574741 + 0.666667 NA intron (NM_015172, intron 24 of 33) intron (NM_015172, intron 24 of 33) -45146 NM_001368164 110806290 NM_001368164 MYOCOS - myocilin opposite strand protein-coding 213-90 chrX 8020425 8020910 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -92928 NM_001142389 8228 Hs.264 NM_004650 ENSG00000006757 PNPLA4 DXS1283E|GS2|iPLA2eta patatin like phospholipase domain containing 4 protein-coding 171-53 chr3 53621846 53622224 + 0.666667 NA intron (NM_001128840, intron 3 of 47) L1PA13|LINE|L1 127424 NM_001128839 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 117-130 chr7 34618181 34618492 + 0.666667 NA intron (NR_033664, intron 2 of 4) L1MB3|LINE|L1 -39882 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 135.333-55 chr14 72303759 72304080 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) LTR53B|LTR|ERVL -212901 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 168.667-139 chr3 58404238 58404713 + 0.666667 NA intron (NM_017771, intron 13 of 17) MER20|DNA|hAT-Charlie 29357 NM_000925 5162 Hs.161357 NM_000925 ENSG00000168291 PDHB PDHBD|PDHE1-B|PDHE1B|PHE1B pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit protein-coding 116.667-15 chr10 67785123 67785380 + 0.666667 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie 52928 NM_201262 56521 Hs.260720 NM_021800 ENSG00000108176 DNAJC12 HPANBH4|JDP1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C12 protein-coding 139.667-202 chr9 24631876 24632205 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -86143 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 205.666-53 chr7 111255595 111256198 + 0.666667 NA intron (NM_032549, intron 3 of 5) intron (NM_032549, intron 3 of 5) 164769 NM_001099658 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 121-118 chr5 124379145 124379349 + 0.666667 NA intron (NR_125774, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 59273 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 233.333-35 chr12 75556997 75557452 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45615 NM_007043 11103 Hs.645517 NM_007043 ENSG00000111615 KRR1 HRB2|RIP-1 KRR1 small subunit processome component homolog protein-coding 199-30 chr15 72009223 72009778 + 0.666667 NA intron (NM_006901, intron 7 of 41) AluJb|SINE|Alu -104758 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 120.333-154 chr5 65214474 65214788 + 0.666667 NA intron (NR_135689, intron 21 of 25) intron (NR_135689, intron 21 of 25) 267289 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 147-128 chr6 163085583 163086012 + 0.666667 NA intron (NM_001080379, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 -31636 NR_110871 101929239 Hs.571035 NR_110871 ENSG00000225437 PACRG-AS2 - PACRG antisense RNA 2 ncRNA 181.667-28 chr12 55837522 55838023 + 0.666667 NA intron (NM_002429, intron 7 of 8) intron (NM_002429, intron 7 of 8) 5164 NM_002429 4327 Hs.591033 NM_002429 ENSG00000123342 MMP19 CODA|MMP18|RASI-1 matrix metallopeptidase 19 protein-coding 124.333-185 chr9 25978935 25979147 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -87634 NM_001004352 100506422 Hs.533221 NM_001004352 LOC100506422 - putative deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like protein FLJ16323 protein-coding 183-38 chr14 59272922 59273257 + 0.666667 NA intron (NM_001270520, intron 2 of 24) intron (NM_001270520, intron 2 of 24) 9648 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 141.667-187 chr5 153609119 153609495 + 0.666667 NA intron (NM_001258020, intron 3 of 16) L1ME3|LINE|L1 117135 NM_001258021 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 128.333-135 chr3 178115368 178115654 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 298646 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 121-62 chr18 73028166 73028427 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 159256 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 152.333-319 chr5 153000313 153000610 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -28112 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 160-105 chr6 37242746 37243051 + 0.666667 NA intron (NM_145316, intron 1 of 3) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 14701 NM_145316 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 127.333-179 chr7 128182317 128182549 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -25439 NR_029596 406917 NR_029596 ENSG00000207705 MIR129-1 MIR-129b|MIRN129-1|mir-129-1 microRNA 129-1 ncRNA 127.667-121 chr3 194976590 194976850 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117868 NR_104188 100874528 Hs.581659 NR_104188 ENSG00000233303 XXYLT1-AS1 - XXYLT1 antisense RNA 1 ncRNA 113.333-17 chr1 195832824 195833054 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 255776 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 114.333-218 chr8 62302276 62302452 + 0.666667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 53510 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 135-108 chr8 65929798 65930122 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85018 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 137.333-100 chr2 110648950 110649189 + 0.666667 NA intron (NM_001278616, intron 18 of 23) intron (NM_001278616, intron 18 of 23) 9180 NR_132975 106635550 NR_132975 SNORD132 - small nucleolar RNA, C/D box 132 snoRNA 142.667-29 chr11 34006606 34006940 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -44958 NM_005898 4076 Hs.471818 NM_005898 ENSG00000135387 CAPRIN1 GPIAP1|GPIP137|GRIP137|M11S1|RNG105|p137GPI cell cycle associated protein 1 protein-coding 130.667-8 chr1 80165699 80165964 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -369924 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 150.667-46 chr10 74490879 74491182 + 0.666667 NA intron (NM_001369124, intron 6 of 9) intron (NM_001369124, intron 6 of 9) 38294 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 196.333-167 chr8 132852727 132853160 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -14015 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 126.667-151 chr6 37879809 37880042 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) intron (NM_021943, intron 1 of 5) 60198 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 146.333-338 chr8 126063356 126063672 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -112317 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 123.333-115 chr2 153027288 153027618 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 308816 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 155.333-226 chr3 45427273 45427586 + 0.666667 NA intron (NM_001368263, intron 5 of 20) intron (NM_001368263, intron 5 of 20) 38853 NM_001368263 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 125.333-122 chr4 67013786 67014000 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 408107 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 141-58 chr4 38215682 38216015 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 95894 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 132-50 chr17 29630127 29630456 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001282129, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001282129, exon 16 of 16) -8868 NM_032854 84940 Hs.143046 NM_032854 ENSG00000167549 CORO6 - coronin 6 protein-coding 155-64 chr2 58490462 58490913 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -30066 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 189.667-129 chr6 154875197 154875741 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22109 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 237.333-22 chr11 97748869 97749336 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 1240677 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 161-25 chr14 100618346 100618729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38731 NR_024096 283601 Hs.379802 NM_001007560 ENSG00000196273 LINC00523 C14orf70 long intergenic non-protein coding RNA 523 ncRNA 152-130 chr5 134371137 134371452 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_003337) promoter-TSS (NM_003337) -247 NM_001349363 51265 Hs.719926 NM_016508 ENSG00000006837 CDKL3 NKIAMRE cyclin dependent kinase like 3 protein-coding 163.667-144 chr22 20490593 20490929 + 0.666667 NA intron (NR_033825, intron 1 of 5) MER1B|DNA|hAT-Charlie 5034 NM_032775 84861 Hs.517419 NM_032775 ENSG00000099910 KLHL22 KELCHL kelch like family member 22 protein-coding 257-77 chr8 130744130 130744661 + 0.666667 NA Intergenic (CAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 296514 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 114.333-197 chr6 113520378 113520570 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -87027 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 145.667-149 chr2 151159006 151159294 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 102713 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 143-5 chr1 47734922 47735208 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 262320 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 232-26 chr14 49290476 49290943 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 295671 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 156.333-288 chr5 97922544 97923002 + 0.666667 NA non-coding (NR_146299, exon 3 of 3) non-coding (NR_146299, exon 3 of 3) 82015 NR_146299 109729164 NR_146299 LINC02234 - long intergenic non-protein coding RNA 2234 ncRNA 117-134 chr7 78789299 78789496 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -219591 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 166-119 chr8 119859692 119860071 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3987 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 218.333-117 chr7 96667786 96668346 + 0.666667 NA intron (NR_163952, intron 2 of 6) intron (NR_163952, intron 2 of 6) -3728 NR_038948 7979 Hs.489201 NM_006304 ENSG00000127922 SEM1 C7orf76|DSS1|ECD|SHFD1|SHFM1|SHSF1|Shfdg1 SEM1 26S proteasome complex subunit protein-coding 154-70 chr17 63206848 63207132 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) L1ME3E|LINE|L1 233277 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 112.333-220 chr5 156292975 156293186 + 0.666667 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -33677 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 117.667-30 chr11 85736378 85736656 + 0.666667 NA exon (NM_001162951, exon 5 of 18) exon (NM_001162951, exon 5 of 18) -17167 NM_001162952 54843 Hs.369520 NM_032379 ENSG00000137501 SYTL2 CHR11SYT|EXO4|PPP1R151|SGA72M|SLP2|SLP2A synaptotagmin like 2 protein-coding 221.333-43 chr16 11693600 11693994 + 0.666667 NA intron (NM_001324022, intron 6 of 10) intron (NM_001324022, intron 6 of 10) 25342 NM_003498 8303 Hs.618526 NM_003498 ENSG00000184602 SNN - stannin protein-coding 156.333-287 chr5 85427519 85427961 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -854704 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 193-16 chr11 40878111 40878593 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) Charlie3|DNA|hAT-Charlie 581284 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 121.667-162 chr5 51412978 51413228 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29655 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 116-122 chr5 31943523 31943739 + 0.666667 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) intron (NM_178140, intron 2 of 24) -7472 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 207-107 chr6 153376768 153377220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -245712 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 198 chr1 4290572 4290888 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -121321 NR_027088 284661 Hs.278112 NR_027088 ENSG00000235054 LINC01777 - long intergenic non-protein coding RNA 1777 ncRNA 139.333-197 chr7 10645705 10646066 + 0.666667 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) -56791 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 210.667-36 chr13 69415221 69415701 + 0.666667 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 193115 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 134-68 chr3 89590556 89590942 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 483128 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 141-38 chr18 36278416 36278721 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -19145 NM_025135 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 180.667-144 chr8 92124398 92124849 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21238 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 159.667-252 chr5 23671752 23672129 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 164285 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 119.333-85 chr14 61819749 61819953 + 0.666667 NA intron (NM_001367656, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 7148 NM_001367657 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 160-126 chr8 135188767 135189194 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45151 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 161-67 chr4 61857171 61857634 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) intron (NM_001371343, intron 9 of 23) 304363 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 197.667-40 chr14 61398133 61398649 + 0.666667 NA intron (NM_006255, intron 2 of 13) intron (NM_006255, intron 2 of 13) 76948 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 138.667-42 chr12 15154034 15154393 + 0.666667 NA intron (NR_046559, intron 1 of 2) intron (NR_046559, intron 1 of 2) 2290 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 148.333-389 chr8 100063709 100064011 + 0.666667 NA exon (NM_001286693, exon 6 of 26) exon (NM_001286693, exon 6 of 26) 41766 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 132.667-81 chr2 55235885 55236170 + 0.666667 NA TTS (NM_001321002) TTS (NM_001321002) 1863 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 130.333-152 chr4 83764410 83764743 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 228468 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 157-99 chr4 181901079 181901485 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71309 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 169.333-246 chr7 68475195 68475648 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 455168 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 169.333-60 chr12 102028950 102029246 + 0.666667 NA intron (NM_016053, intron 5 of 6) intron (NM_016053, intron 5 of 6) 32893 NM_016053 51019 Hs.405692 NM_016053 ENSG00000120860 WASHC3 CCDC53|CGI-116 WASH complex subunit 3 protein-coding 112-127 chr21 25840738 25840940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105185 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 131.333-74 chr19 43527795 43528138 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001320867) promoter-TSS (NM_001320867) -765 NM_001320869 23474 Hs.7486 NM_014297 ENSG00000105755 ETHE1 HSCO|YF13H12 ETHE1 persulfide dioxygenase protein-coding 189-35 chr17 4032737 4033147 + 0.666667 NA exon (NM_015113, exon 41 of 55) exon (NM_015113, exon 41 of 55) 55839 NR_146884 105371496 Hs.579239 NR_146884 LINC01975 - long intergenic non-protein coding RNA 1975 ncRNA 226-56 chr21 40925319 40925811 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78407 NR_073202 1826 Hs.160418 NM_001389 ENSG00000171587 DSCAM CHD2|CHD2-42|CHD2-52 DS cell adhesion molecule protein-coding 115.333-156 chr4 75467182 75467420 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 41995 NR_103725 25898 Hs.48297 NM_015436 ENSG00000163743 RCHY1 ARNIP|CHIMP|PIRH2|PRO1996|RNF199|ZCHY|ZNF363 ring finger and CHY zinc finger domain containing 1 protein-coding 147-112 chr5 90291509 90291738 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1552 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 147.333-208 chr22 49820892 49821173 + 0.666667 NA intron (NM_001349942, intron 1 of 12) intron (NM_001349942, intron 1 of 12) 3299 NR_146335 23774 Hs.127950 NM_014577 ENSG00000100425 BRD1 BRL|BRPF1|BRPF2 bromodomain containing 1 protein-coding 146-71 chr20 54040324 54040612 + 0.666667 NA intron (NM_001366297, intron 3 of 8) intron (NM_001366297, intron 3 of 8) 18552 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 173.667-22 chr10 84978627 84979032 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 220076 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 169.333-91 chr16 48299228 48299556 + 0.666667 NA intron (NM_031490, intron 9 of 14) AluSz6|SINE|Alu -51853 NM_001370497 85320 Hs.652267 NM_032583 ENSG00000121270 ABCC11 EWWD|MRP8|WW ATP binding cassette subfamily C member 11 protein-coding 212.333-84 chr20 39148089 39148424 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 76492 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 114.333-13 chr1 156417380 156417619 + 0.666667 NA intron (NM_006365, intron 2 of 6) intron (NM_006365, intron 2 of 6) 2930 NR_029691 407046 NR_029691 ENSG00000207933 MIR9-1 MIRN9-1|hsa-mir-9-1|miRNA9-1|mir-9-1 microRNA 9-1 ncRNA 113.333-248 chr7 124481861 124482038 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129853 NR_110180 101928211 Hs.131334 NR_110180 LOC101928211 - uncharacterized LOC101928211 ncRNA 111.667-175 chr3 155722347 155722561 + 0.666667 NA intron (NM_001349252, intron 1 of 24) AluSp|SINE|Alu -18190 NM_014996 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 126-112 chr8 84105973 84106313 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76644 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 136-20 chr12 59067887 59068188 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -147499 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 120.667-55 chr14 69862814 69863117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16451 NM_022137 64093 Hs.497349 NM_022137 ENSG00000198732 SMOC1 OAS SPARC related modular calcium binding 1 protein-coding 119.333-53 chr11 79262581 79262907 + 0.666667 NA intron (NM_001098816, intron 2 of 33) MIRb|SINE|MIR 139365 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 144-51 chr14 64412212 64412495 + 0.666667 NA intron (NM_005956, intron 3 of 27) intron (NM_005956, intron 3 of 27) 24000 NM_001364837 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 165.667-115 chr21 32707993 32708326 + 0.666667 NA intron (NM_203446, intron 2 of 32) intron (NM_203446, intron 2 of 32) 19762 NM_001160306 8867 Hs.473632 NM_003895 ENSG00000159082 SYNJ1 EIEE53|INPP5G|PARK20 synaptojanin 1 protein-coding 144.333-39 chr11 86288192 86288440 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 9983 NR_106813 102465452 NR_106813 ENSG00000283744 MIR6755 hsa-mir-6755 microRNA 6755 ncRNA 271-16 chr14 54741371 54741825 + 0.666667 NA intron (NM_015589, intron 3 of 11) intron (NM_015589, intron 3 of 11) -13235 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 151.667-273 chr5 40152811 40153165 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 100697 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 115.333-56 chr13 35400527 35400851 + 0.666667 NA intron (NM_015678, intron 38 of 57) intron (NM_015678, intron 38 of 57) 76000 NM_005584 4081 Hs.584776 NM_005584 ENSG00000180660 MAB21L1 CAGR1|Nbla00126 mab-21 like 1 protein-coding 126-95 chr5 130155553 130155901 + 0.666667 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) intron (NM_175856, intron 2 of 2) 251262 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 162.667-27 chr10 50558936 50559359 + 0.666667 NA intron (NM_147156, intron 2 of 10) intron (NM_147156, intron 2 of 10) 64809 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 180-57 chr2 196844663 196844966 + 0.666667 NA intron (NM_001321099, intron 24 of 27) A-rich|Low_complexity|Low_complexity -34538 NM_213608 401027 Hs.245666 NM_213608 ENSG00000187944 C2orf66 IIDS6411|UNQ6411 chromosome 2 open reading frame 66 protein-coding 135-29 chr14 34765736 34766028 + 0.666667 NA intron (NM_013448, intron 21 of 26) intron (NM_013448, intron 21 of 26) -51059 NR_028130 1073 Hs.180141 NM_021914 ENSG00000165410 CFL2 NEM7 cofilin 2 protein-coding 121.333-5 chr1 54840615 54840855 + 0.666667 NA intron (NM_001110533, intron 9 of 9) L1ME1|LINE|L1 34672 NM_001110533 163747 Hs.376018 NM_152607 ENSG00000162398 LEXM C1orf177|LEM lymphocyte expansion molecule protein-coding 143.333-206 chr4 74051275 74051628 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 3948 NR_026769 10895 Hs.3134 NM_006692 ENSG00000248848 PPBPP2 PPBPL2|SPBPBP pro-platelet basic protein pseudogene 2 pseudo 173.667-188 chr9 23081746 23082116 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 435731 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 154-22 chr11 33889138 33889424 + 0.666667 NA intron (NM_005574, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 2795 NM_005574 4005 Hs.34560 NM_005574 ENSG00000135363 LMO2 LMO-2|RBTN2|RBTNL1|RHOM2|TTG2 LIM domain only 2 protein-coding 178.333-71 chr19 53326010 53326407 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -7511 NM_001321524 91664 Hs.720672 NM_138374 ENSG00000213799 ZNF845 - zinc finger protein 845 protein-coding 157.333-67 chr11 80415235 80415588 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 347392 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 114.333-187 chr5 160327104 160327375 + 0.666667 NA intron (NR_131769, intron 1 of 7) MIR|SINE|MIR 12353 NR_131769 79616 Hs.14070 NM_024565 ENSG00000135083 CCNJL - cyclin J like protein-coding 131.333-177 chr8 81409595 81409891 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 37696 NM_002677 5375 Hs.571512 NM_002677 ENSG00000147588 PMP2 CMT1G|FABP8|M-FABP|MP2|P2 peripheral myelin protein 2 protein-coding 167.667-20 chr10 24420954 24421307 + 0.666667 NA intron (NM_019590, intron 3 of 20) AluSx|SINE|Alu -28284 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 123.667-149 chr4 176526418 176526611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 206548 NM_021928 60559 Hs.42194 NM_021928 ENSG00000129128 SPCS3 PRO3567|SPC22/23|SPC3|YLR066W signal peptidase complex subunit 3 protein-coding 182.667-96 chr3 82254872 82255269 + 0.666667 NA intron (NR_147146, intron 3 of 8) L1ME1|LINE|L1 268928 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 114.667-203 chr5 38227894 38228108 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30558 NM_152403 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 115-89 chr2 75907534 75907733 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -196718 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 159-113 chr7 97508223 97508541 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -223704 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 133.667-49 chr14 44942690 44943046 + 0.666667 NA intron (NM_017658, intron 2 of 4) L2c|LINE|L2 18617 NM_001308112 54813 Hs.550906 NM_017658 ENSG00000179454 KLHL28 BTBD5 kelch like family member 28 protein-coding 162.667-223 chr5 90327756 90328179 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -37896 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 165-9 chr10 32234635 32234940 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1a_Art|DNA|TcMar-Tigger 112371 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 151.667-91 chr12 94734987 94735347 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -84610 NM_020698 57458 Hs.370410 NM_020698 ENSG00000057704 TMCC3 - transmembrane and coiled-coil domain family 3 protein-coding 145.333-233 chr5 40216796 40217079 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 164646 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 116.333-99 chr18 22829623 22829924 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42936 NR_110782 101927571 Hs.335020 NR_110782 ENSG00000266850 LOC101927571 - uncharacterized LOC101927571 ncRNA 195.667-97 chr4 77900961 77901343 + 0.666667 NA intron (NM_020236, intron 6 of 8) L1M4a2|LINE|L1 38322 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 152-46 chr12 126171438 126171730 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75592 NR_110053 101927464 Hs.443932 NR_110053 ENSG00000284848 LINC02359 - long intergenic non-protein coding RNA 2359 ncRNA 117-52 chr16 29016458 29016788 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 31571 NM_001014988 27040 Hs.632179 NM_014387 ENSG00000213658 LAT IMD52|LAT1|pp36 linker for activation of T cells protein-coding 115.333-216 chr8 72156825 72157117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -81387 NM_007332 8989 Hs.716816 NM_007332 ENSG00000104321 TRPA1 ANKTM1|FEPS|FEPS1 transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 protein-coding 141.333-153 chr3 89710110 89710385 + 0.666667 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 602626 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 158-83 chr22 18124726 18125082 + 0.666667 NA intron (NM_001193414, intron 3 of 4) MIR3|SINE|MIR 14095 NM_018943 51807 Hs.137400 NM_018943 ENSG00000183785 TUBA8 CDCBM8|TUBAL2 tubulin alpha 8 protein-coding 166-73 chr21 21890455 21890909 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 143697 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 122.667-32 chr11 115392606 115392945 + 0.666667 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) L1MC5a|LINE|L1 -3981 NR_135102 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 207.333-97 chr15 42721663 42722102 + 0.666667 NA TTS (NM_020759) TTS (NM_020759) 15246 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 162-4 chr1 104756308 104756567 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 683414 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 121.667-125 chr3 63193666 63193933 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84509 NM_001130003 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 181-70 chr7 51665497 51665979 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -272482 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 137-52 chr2 193763681 193764056 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -580401 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 128-130 chrX 80368676 80368955 + 0.666667 NA intron (NM_001170574, intron 3 of 4) Charlie23a|DNA|hAT-Charlie 33311 NM_001170574 169966 Hs.367959 NM_152630 ENSG00000174016 TENT5D CT1.26|CT112|FAM46D terminal nucleotidyltransferase 5D protein-coding 156-104 chr4 97004104 97004413 + 0.666667 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -362668 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-78 chr13 102560374 102560760 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -36419 NM_003291 7174 Hs.432424 NM_003291 ENSG00000134900 TPP2 TPP-2|TPP-II|TPPII tripeptidyl peptidase 2 protein-coding 187.333-212 chr9 73296660 73297071 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145000 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 157.667-84 chr12 89067342 89067673 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -47815 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 163.333-2 chr1 11988757 11989203 + 0.666667 NA intron (NM_014874, intron 2 of 18) AluSx|SINE|Alu 8799 NM_001127660 9927 Hs.376681 NM_014874 ENSG00000116688 MFN2 CMT2A|CMT2A2|CMT2A2A|CMT2A2B|CPRP1|HMSN6A|HSG|MARF mitofusin 2 protein-coding 151.667-71 chr11 98952752 98953147 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -68000 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 135.667-128 chr4 39230435 39230694 + 0.666667 NA intron (NM_025132, intron 17 of 36) MIRb|SINE|MIR 48035 NM_025132 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 155-106 chr5 15666383 15666744 + 0.666667 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) L3|LINE|CR1 -51561 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 150-16 chr10 71205566 71205938 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6818 NM_170744 219699 Hs.522997 NM_170744 ENSG00000107731 UNC5B UNC5H2|p53RDL1 unc-5 netrin receptor B protein-coding 173-40 chr18 64222799 64223247 + 0.666667 NA intron (NR_033983, intron 2 of 2) L1M5|LINE|L1 37032 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 217-4 chr1 102787129 102787611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 321126 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 303-39 chr4 114483049 114483724 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115016 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 146-128 chr7 50820682 50820984 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -27380 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 119-7 chr1 183177263 183177577 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8844 NM_018891 3918 Hs.591484 NM_005562 ENSG00000058085 LAMC2 B2T|BM600|CSF|EBR2|EBR2A|LAMB2T|LAMNB2 laminin subunit gamma 2 protein-coding 147.667-13 chr1 150787520 150787852 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20574 NM_000396 1513 Hs.632466 NM_000396 ENSG00000143387 CTSK CTS02|CTSO|CTSO1|CTSO2|PKND|PYCD cathepsin K protein-coding 240.333-90 chr8 28326719 28327285 + 0.666667 NA intron (NM_006228, intron 1 of 3) intron (NM_006228, intron 1 of 3) 9734 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 137-108 chr8 129550631 129550887 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 24259 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 132-5 chr1 98459378 98459615 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -202225 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 141.333-31 chr11 21793930 21794199 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -399021 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 132.667 chr1 33918236 33918528 + 0.666667 NA intron (NM_052896, intron 4 of 69) intron (NM_052896, intron 4 of 69) 49426 NR_038372 402779 Hs.666207 NR_038372 ENSG00000231163 CSMD2-AS1 - CSMD2 antisense RNA 1 ncRNA 187.333-65 chr14 75393692 75394223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33767 NM_001135047 122953 Hs.196482 NM_130469 ENSG00000140044 JDP2 JUNDM2 Jun dimerization protein 2 protein-coding 128-3 chr1 112575374 112575674 + 0.666667 NA intron (NM_017744, intron 11 of 14) MER44B|DNA|TcMar-Tigger 43617 NM_001308264 54879 Hs.201921 NM_017744 ENSG00000007341 ST7L FAM4B|ST7R|STLR suppression of tumorigenicity 7 like protein-coding 157.667-198 chr3 134668350 134668656 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17481 NM_001366277 339855 Hs.146730 NM_178554 ENSG00000174611 KY MFM7 kyphoscoliosis peptidase protein-coding 112-163 chr5 19963969 19964267 + 0.666667 NA intron (NM_001349562, intron 2 of 13) intron (NM_001349562, intron 2 of 13) 24082 NM_001349560 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 207-70 chr20 2997322 2997722 + 0.666667 NA intron (NM_080841, intron 8 of 22) L3|LINE|CR1 -46100 NM_178332 2797 Hs.129715 NM_001501 ENSG00000125787 GNRH2 GnRH-II|LH-RHII gonadotropin releasing hormone 2 protein-coding 113-133 chr3 12132795 12133107 + 0.666667 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) CR1_Mam|LINE|CR1 25961 NM_003256 7079 Hs.591665 NM_003256 ENSG00000157150 TIMP4 TIMP-4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 protein-coding 114-46 chr15 69156728 69156921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3773 NM_001324091 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 165.333-50 chr11 101355226 101355643 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 164471 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 211.333-191 chr5 116808998 116809562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47071 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 157.333-148 chr17 41645946 41646390 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -5969 NR_033415 284116 Hs.725790 NR_033415 ENSG00000214514 KRT42P - keratin 42 pseudogene pseudo 115-87 chr2 64604642 64604868 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2557 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 146.333-302 chr7 18408386 18408672 + 0.666667 NA intron (NM_001321896, intron 1 of 12) intron (NM_001321896, intron 1 of 12) -87181 NM_001204146 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 132-42 chr14 45657752 45658128 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 57662 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 220.333-68 chr2 204539836 204540329 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5393 NM_057177 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 130.333-25 chr10 10200881 10201105 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 142271 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 151.667-345 chr7 107636876 107637145 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -23818 NM_000441 5172 Hs.571246 NM_000441 ENSG00000091137 SLC26A4 DFNB4|EVA|PDS|TDH2B solute carrier family 26 member 4 protein-coding 153-127 chr7 49261682 49261972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 337280 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 170-80 chr3 121325567 121325945 + 0.666667 NA intron (NM_001348343, intron 21 of 27) MIRc|SINE|MIR 220232 NM_199420 10721 Hs.241517 NM_199420 ENSG00000051341 POLQ PRO0327 DNA polymerase theta protein-coding 156.333-25 chr1 200192798 200193117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 150132 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 133.667-78 chr2 130958101 130958336 + 0.666667 NA intron (NM_001367493, intron 4 of 13) L1M4b|LINE|L1 121304 NM_015320 50649 Hs.469935 NM_015320 ENSG00000136002 ARHGEF4 ASEF|ASEF1|GEF4|SMIM39|STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 116-99 chr22 28122910 28123210 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -202448 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 179.667-118 chr6 49442520 49442959 + 0.666667 NA intron (NM_000255, intron 9 of 12) L2a|LINE|L2 20514 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 137.667-61 chr14 84457970 84458228 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -813833 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 112.667-170 chr3 82624472 82624698 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 638443 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 127.333-18 chr1 209714186 209714428 + 0.666667 NA intron (NM_181755, intron 5 of 6) Kanga1d|DNA|TcMar-Tc2 9461 NM_005525 3290 Hs.195040 NM_005525 ENSG00000117594 HSD11B1 11-DH|11-beta-HSD1|CORTRD2|HDL|HSD11|HSD11B|HSD11L|SDR26C1 hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 1 protein-coding 150-23 chr11 17199228 17199526 + 0.666667 NA intron (NM_002645, intron 1 of 32) L1MB4|LINE|L1 8609 NM_002645 5286 Hs.175343 NM_002645 ENSG00000011405 PIK3C2A CPK|OCSKD|PI3-K-C2(ALPHA)|PI3-K-C2A|PI3K-C2-alpha|PI3K-C2alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha protein-coding 204.333-63 chr15 67903519 67903938 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -63683 NR_004394 26827 NR_004394 ENSG00000206625 RNU6-1 RNU6|RNU6A|U6|U6-1 RNA, U6 small nuclear 1 snRNA 160-42 chr14 59845633 59846062 + 0.666667 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 24929 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 123.667-55 chr14 54588344 54588576 + 0.666667 NA intron (NM_015589, intron 1 of 11) L1PB1|LINE|L1 20848 NM_015589 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 167.667-57 chr14 54047237 54047552 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90503 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 150-116 chr5 98358294 98358610 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -197213 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 200.333-6 chr1 239985629 239986162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21629 NR_036695 645884 Hs.613280 NR_036695 RPS7P5 RPS7_2_183 ribosomal protein S7 pseudogene 5 pseudo 114-122 chr5 106954603 106954868 + 0.666667 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) intron (NR_104671, intron 2 of 3) 56279 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 144.333-154 chr21 21442081 21442427 + 0.666667 NA intron (NM_001352592, intron 13 of 18) L2a|LINE|L2 295065 NR_038872 378828 Hs.551009 NR_038872 ENSG00000238265 LINC00317 C21orf117|NCRNA00317|PRED89 long intergenic non-protein coding RNA 317 ncRNA 162.667-76 chr14 27885329 27885655 + 0.666667 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -212271 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 115.333-184 chr6 39359003 39359308 + 0.666667 NA intron (NM_001289020, intron 17 of 21) MIR3|SINE|MIR -36187 NM_001363784 83795 Hs.287765 NM_032115 ENSG00000095981 KCNK16 K2p16.1|TALK-1|TALK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 16 protein-coding 139.333-66 chr13 100199432 100199806 + 0.666667 NA intron (NR_148031, intron 6 of 22) L1MC5|LINE|L1 110526 NR_148027 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 243.667-66 chr6 39288134 39288652 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 26026 NM_001135111 89822 Hs.162282 NM_031460 ENSG00000124780 KCNK17 K2p17.1|TALK-2|TALK2|TASK-4|TASK4 potassium two pore domain channel subfamily K member 17 protein-coding 145-12 chr10 80468017 80468399 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001351272) promoter-TSS (NM_001351272) -55 NM_001351271 81619 Hs.308615 NM_030927 ENSG00000108219 TSPAN14 DC-TM4F2|TM4SF14|tspan-14 tetraspanin 14 protein-coding 174-87 chr6 143967000 143967368 + 0.666667 NA intron (NM_001289039, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR -1706 NM_001317158 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 147.333-11 chr1 58564446 58564811 + 0.666667 NA Intergenic LTR9|LTR|ERV1 12624 NM_002353 4070 Hs.23582 NM_002353 ENSG00000184292 TACSTD2 EGP-1|EGP1|GA733-1|GA7331|GP50|M1S1|TROP2 tumor associated calcium signal transducer 2 protein-coding 179.333-81 chr18 197964 198373 + 0.666667 NA intron (NM_001037334, intron 8 of 14) intron (NM_001037334, intron 8 of 14) 39611 NM_005151 9097 Hs.464416 NM_005151 ENSG00000101557 USP14 TGT ubiquitin specific peptidase 14 protein-coding 117.333-14 chr1 165776055 165776351 + 0.666667 NA TTS (NR_125374) TTS (NR_125374) 7274 NR_125374 100147773 Hs.633824 NR_125374 TMCO1-AS1 - TMCO1 antisense RNA 1 ncRNA 136-48 chr2 47735237 47735624 + 0.666667 NA Intergenic Tigger5|DNA|TcMar-Tigger -47652 NM_000179 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 131.333-112 chr3 5518972 5519332 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -268897 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 142-142 chr7 37131929 37132260 + 0.666667 NA intron (NM_001206480, intron 14 of 21) intron (NM_001206480, intron 14 of 21) 134298 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 224.333-11 chr1 237274567 237275008 + 0.666667 NA intron (NM_001035, intron 2 of 104) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -196332 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 190-108 chr6 43885305 43885806 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5473 NR_024478 100132354 Hs.376232 NR_024478 LINC01512 HI-LNC77 long intergenic non-protein coding RNA 1512 ncRNA 121.667-104 chr2 219913151 219913478 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6749 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 153-58 chr16 73441871 73442311 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55286 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 118-5 chr1 176618246 176618591 + 0.666667 NA intron (NM_021936, intron 3 of 4) intron (NM_021936, intron 3 of 4) 155243 NM_020318 60676 Hs.187284 NM_020318 ENSG00000116183 PAPPA2 PAPP-A2|PAPP-E|PAPPE|PLAC3 pappalysin 2 protein-coding 171.667-136 chr5 112754764 112755138 + 0.666667 NA exon (NM_001354896, exon 2 of 17) exon (NM_001354896, exon 2 of 17) 17066 NM_001354896 324 Hs.158932 NM_000038 ENSG00000134982 APC BTPS2|DP2|DP2.5|DP3|GS|PPP1R46 APC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 223-28 chr18 36991826 36992321 + 0.666667 NA intron (NR_136303, intron 6 of 13) L1M5|LINE|L1 -68259 NR_134585 105372069 Hs.666765 NR_134585 ENSG00000267039 LOC105372069 - uncharacterized LOC105372069 ncRNA 130.333-90 chr17 66845183 66845426 + 0.666667 NA intron (NM_145811, intron 1 of 5) L1PA8|LINE|L1 10187 NM_145811 27091 Hs.278907 NM_014404 ENSG00000075429 CACNG5 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5 protein-coding 129.333-66 chr14 70095110 70095377 + 0.666667 NA intron (NM_033262, intron 2 of 7) intron (NM_033262, intron 2 of 7) -15026 NM_182936 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 132.333-74 chr19 33482233 33482511 + 0.666667 NA intron (NM_001166056, intron 6 of 12) L1MB7|LINE|L1 39419 NM_000285 5184 Hs.36473 NM_000285 ENSG00000124299 PEPD PROLIDASE peptidase D protein-coding 174.667-148 chr5 157517321 157517811 + 0.666667 NA intron (NM_033274, intron 7 of 22) L2c|LINE|L2 -57466 NR_136204 102724404 Hs.570889 NR_136204 LOC102724404 - uncharacterized LOC102724404 ncRNA 174.667-128 chr4 75910141 75910514 + 0.666667 NA TTS (NM_001042402) TTS (NM_001042402) -7875 NM_006239 5470 Hs.290873 NM_006239 ENSG00000156194 PPEF2 PPP7CB protein phosphatase with EF-hand domain 2 protein-coding 138.333-130 chr4 35326840 35327110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 916964 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 143.333-43 chr10 95444312 95444648 + 0.666667 NA intron (NM_001290295, intron 2 of 24) L1ME4c|LINE|L1 -3300 NM_001290297 10580 Hs.38621 NM_006434 ENSG00000095637 SORBS1 CAP|FLAF2|R85FL|SH3D5|SH3P12|SORB1 sorbin and SH3 domain containing 1 protein-coding 129.333-151 chr5 45296509 45296789 + 0.666667 NA intron (NM_021072, intron 6 of 7) L1MC|LINE|L1 399731 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 175-22 chr14 53587621 53588062 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 360643 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 142-113 chr5 40616553 40616801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63238 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 152.667-171 chr2 35981491 35981843 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 373903 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 145.667-174 chr3 42495994 42496277 + 0.666667 NA intron (NM_001251882, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu -6477 NM_001251883 7433 Hs.348500 NM_004624 ENSG00000114812 VIPR1 HVR1|II|PACAP-R-2|PACAP-R2|RDC1|V1RG|VAPC1|VIP-R-1|VIPR|VIRG|VPAC1|VPAC1R|VPCAP1R vasoactive intestinal peptide receptor 1 protein-coding 157.667-150 chr2 126474718 126475054 + 0.666667 NA Intergenic (ATAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -181049 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 171.667-151 chr7 4545524 4545857 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -136605 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 150-154 chr9 10376756 10377055 + 0.666667 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) L1MA2|LINE|L1 236097 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 193-15 chr11 36544089 36544610 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -23664 NM_000448 5896 Hs.73958 NM_000448 ENSG00000166349 RAG1 RAG-1|RNF74 recombination activating 1 protein-coding 148.333-192 chr2 101142910 101143200 + 0.666667 NA intron (NM_001102426, intron 1 of 19) AluSg|SINE|Alu 8392 NM_001330348 11138 Hs.442657 NM_007063 ENSG00000204634 TBC1D8 AD3|GRAMD8|HBLP1|TBC1D8A|VRP TBC1 domain family member 8 protein-coding 151.333-367 chr6 114192989 114193291 + 0.666667 NA intron (NR_125845, intron 8 of 9) intron (NR_125845, intron 8 of 9) -130263 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 113.667-72 chr16 19860558 19860756 + 0.666667 NA intron (NM_016235, intron 3 of 3) intron (NM_016235, intron 3 of 3) 24191 NM_016235 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 132.667-91 chr2 117995745 117996037 + 0.666667 NA intron (NM_019044, intron 5 of 23) MIR|SINE|MIR 18179 NM_019044 54520 Hs.107845 NM_019044 ENSG00000125633 CCDC93 - coiled-coil domain containing 93 protein-coding 112.667-179 chr3 179299085 179299386 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -23796 NM_001303425 51193 Hs.632578 NM_016331 ENSG00000121864 ZNF639 ANC-2H01|ANC_2H01|ZASC1 zinc finger protein 639 protein-coding 168-104 chr7 53100169 53100519 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 64711 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 182.333-148 chr7 113545150 113545576 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 373646 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 117.333-130 chr3 35149360 35149603 + 0.666667 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) L1MC5a|LINE|L1 244542 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 116.667-218 chr9 128086499 128086703 + 0.666667 NA intron (NM_001006641, intron 1 of 9) AluSp|SINE|Alu -4863 NM_001006642 114789 Hs.5476 NM_052901 ENSG00000148339 SLC25A25 MCSC|PCSCL|SCAMC-2 solute carrier family 25 member 25 protein-coding 113-167 chr5 52445246 52445519 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -342534 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 145-41 chr17 50198859 50199142 + 0.666667 NA intron (NM_000088, intron 5 of 50) L1MC4|LINE|L1 2639 NM_000088 1277 Hs.172928 NM_000088 ENSG00000108821 COL1A1 EDSARTH1|EDSC|OI1|OI2|OI3|OI4 collagen type I alpha 1 chain protein-coding 125.333-178 chr8 100019003 100019332 + 0.666667 NA intron (NM_015668, intron 14 of 27) intron (NM_015668, intron 14 of 27) 14585 NR_145741 109616982 NR_145741 ENSG00000212414 SNORD77B - small nucleolar RNA, C/D box 77B snoRNA 111.667-81 chr14 57489962 57490282 + 0.666667 NA intron (NM_001283060, intron 2 of 5) intron (NM_001283060, intron 2 of 5) 3735 NM_001283056 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 177.667-4 chr1 44773216 44773711 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2077 NM_001012 6202 Hs.512675 NM_001012 ENSG00000142937 RPS8 S8 ribosomal protein S8 protein-coding 146.333-8 chr1 74974619 74974927 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -153661 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 141.333-222 chr7 43031575 43031869 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -80925 NM_015052 23072 Hs.164453 NM_015052 ENSG00000002746 HECW1 NEDL1 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 187.333-210 chr9 31659583 31660070 + 0.666667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -278336 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 156.333-374 chr9 9232586 9232960 + 0.666667 NA intron (NM_002839, intron 9 of 45) MER39|LTR|ERV1 374755 NR_121599 101929407 Hs.649971 NR_121599 PTPRD-AS1 - PTPRD antisense RNA 1 ncRNA 132.333-66 chr16 69571351 69571652 + 0.666667 NA intron (NM_138714, intron 2 of 15) MIR|SINE|MIR 5535 NM_138713 10725 Hs.371987 NM_006599 ENSG00000102908 NFAT5 NF-AT5|NFATL1|NFATZ|OREBP|TONEBP nuclear factor of activated T cells 5 protein-coding 231-7 chr10 74198147 74198703 + 0.666667 NA intron (NM_001369124, intron 1 of 9) intron (NM_001369124, intron 1 of 9) 21662 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 204.667-128 chr5 123218122 123218684 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -128087 NR_146771 105379152 Hs.537420 NR_146771 LOC105379152 - uncharacterized LOC105379152 ncRNA 225-54 chr6 27126973 27127593 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5513 NM_021058 8970 Hs.591807 NM_021058 ENSG00000124635 HIST1H2BJ H2B/r|H2BFR|H2BJ histone cluster 1 H2B family member j protein-coding 137.667-114 chr21 26971664 26971951 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4719 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 181.667-46 chr16 71385866 71386147 + 0.666667 NA intron (NM_001740, intron 10 of 10) L1MB2|LINE|L1 27283 NM_001740 794 Hs.106857 NM_001740 ENSG00000172137 CALB2 CAB29|CAL2|CR calbindin 2 protein-coding 141.333-40 chr11 97205613 97205931 + 0.666667 NA Intergenic MER44C|DNA|TcMar-Tigger 697347 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 185.333-185 chr8 80723783 80724073 + 0.666667 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) intron (NM_001033723, intron 2 of 8) 150540 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 113-33 chr12 4668248 4668476 + 0.666667 NA intron (NM_005002, intron 6 of 10) intron (NM_005002, intron 6 of 10) 19248 NM_005002 4704 Hs.75227 NM_005002 ENSG00000139180 NDUFA9 CC6|CI-39k|CI39k|COQ11|MC1DN26|NDUFS2L|SDR22E1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 protein-coding 151-118 chr6 87189713 87190051 + 0.666667 NA intron (NM_015021, intron 1 of 7) L1MC3|LINE|L1 34317 NM_015021 23036 Hs.444800 NM_015021 ENSG00000188994 ZNF292 Nbla00365|ZFP292|ZN-16|Zn-15|bA393I2.3 zinc finger protein 292 protein-coding 175-20 chr12 61053683 61054066 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR 1138965 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 175-5 chr1 154883297 154883747 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -13241 NM_002249 3782 Hs.490765 NM_002249 ENSG00000143603 KCNN3 KCa2.3|SK3|SKCA3|hSK3 potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 protein-coding 148-33 chr12 62139503 62139828 + 0.666667 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 53174 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 121.667-121 chr3 11134128 11134355 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -2997 NM_001098213 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 115.667-211 chr8 81978340 81978584 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -136176 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 117.667-56 chr15 65874820 65875106 + 0.666667 NA intron (NM_004663, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 5472 NM_004663 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 112-202 chr8 91264833 91265125 + 0.666667 NA intron (NM_134266, intron 2 of 18) L1MA6|LINE|L1 15660 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 142-98 chr4 5280971 5281299 + 0.666667 NA intron (NM_001306082, intron 4 of 12) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 229655 NM_001306082 55351 Hs.133062 NM_018401 ENSG00000152953 STK32B HSA250839|STK32|STKG6|YANK2 serine/threonine kinase 32B protein-coding 151.667-377 chr8 124711085 124711362 + 0.666667 NA intron (NM_001282971, intron 1 of 14) intron (NM_001282971, intron 1 of 14) 17250 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 151.333-338 chr5 60166644 60166980 + 0.666667 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) L1MA8|LINE|L1 205851 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 115.667-94 chr16 80463305 80463561 + 0.666667 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -77301 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 141.667-58 chr12 74331243 74331515 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -38748 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 176.667-89 chr20 34181884 34182224 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -69811 NM_003908 8894 Hs.429180 NM_003908 ENSG00000125977 EIF2S2 EIF2|EIF2B|EIF2beta|PPP1R67|eIF-2-beta eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta protein-coding 251.333-84 chr5 14098235 14098972 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -44739 NR_134469 7204 Hs.130031 NM_007118 ENSG00000038382 TRIO ARHGEF23|MEBAS|MRD44|tgat trio Rho guanine nucleotide exchange factor protein-coding 242.667-69 chr3 58866315 58866960 + 0.666667 NA exon (NM_001351531, exon 10 of 16) exon (NM_001351531, exon 10 of 16) 42166 NR_110820 101929238 Hs.683953 NR_110820 ENSG00000242428 C3orf67-AS1 - C3orf67 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-309 chr5 83255697 83255980 + 0.666667 NA intron (NM_001318012, intron 6 of 7) LTR82A|LTR|ERVL 178291 NM_001318012 7518 Hs.567359 NM_003401 ENSG00000152422 XRCC4 SSMED X-ray repair cross complementing 4 protein-coding 126-92 chr5 65975939 65976185 + 0.666667 NA intron (NM_001253697, intron 1 of 25) intron (NM_001253697, intron 1 of 25) -30489 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 244.333-26 chr11 80780236 80780671 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -17650 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 124-101 chr5 174799457 174799707 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47848 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 115-37 chr12 13534063 13534357 + 0.666667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -157465 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 194.667-76 chr2 166174511 166174959 + 0.666667 NA intron (NR_110260, intron 3 of 11) intron (NR_110260, intron 3 of 11) -25574 NM_001353949 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 137.667-49 chr13 48782034 48782338 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 128257 NM_001308469 57105 Hs.253706 NM_020377 ENSG00000152207 CYSLTR2 CYSLT2|CYSLT2R|GPCR21|HG57|HPN321|KPG_011|PSEC0146|hGPCR21 cysteinyl leukotriene receptor 2 protein-coding 116-83 chr2 145133478 145133760 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 465652 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 138.667-31 chr10 125035857 125036206 + 0.666667 NA intron (NM_001290214, intron 3 of 10) intron (NM_001290214, intron 3 of 10) -3161 NR_036178 100423041 NR_036178 ENSG00000264572 MIR4296 - microRNA 4296 ncRNA 165-49 chr21 9736893 9737223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74869 NR_135513 105379514 Hs.543309 NR_135513 LOC105379514 - uncharacterized LOC105379514 ncRNA 228.333-36 chr17 64491012 64491425 + 0.666667 NA intron (NM_007215, intron 3 of 7) FAM|SINE|Alu 5836 NM_007215 11232 Hs.437009 NM_007215 ENSG00000256525 POLG2 HP55|MTPOLB|PEOA4|POLB|POLG-BETA|POLGB DNA polymerase gamma 2, accessory subunit protein-coding 112.333-244 chr7 34192036 34192217 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 286587 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 136.667-10 chr1 169765757 169766114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28754 NM_001320201 92342 Hs.33922 NM_033418 ENSG00000171806 METTL18 AsTP2|C1orf156|HPM1 methyltransferase like 18 protein-coding 203.667-42 chr18 2691139 2691481 + 0.666667 NA intron (NM_015295, intron 7 of 47) intron (NM_015295, intron 7 of 47) 35423 NM_015295 23347 Hs.8118 NM_015295 ENSG00000101596 SMCHD1 BAMS|FSHD2 structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 protein-coding 112.667-187 chr4 53078410 53078713 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 216244 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 171.333-176 chr7 21329591 21330067 + 0.666667 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -98254 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 116-94 chr20 62377385 62377669 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9576 NM_001024 6227 Hs.190968 NM_001024 ENSG00000171858 RPS21 HLDF|S21 ribosomal protein S21 protein-coding 209.333-216 chr7 34048160 34048497 + 0.666667 NA intron (NM_133468, intron 8 of 15) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 142789 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 131.667-84 chr2 5372261 5372496 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 318740 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 168.667-179 chr5 105698578 105698974 + 0.666667 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 599302 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 119-119 chr5 41219050 41219398 + 0.666667 NA intron (NM_001115131, intron 1 of 17) intron (NM_001115131, intron 1 of 17) -5692 NM_000065 729 Hs.481992 NM_000065 ENSG00000039537 C6 - complement C6 protein-coding 112.333-49 chr12 15757701 15757934 + 0.666667 NA intron (NM_004447, intron 1 of 20) MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR 31571 NM_004447 2059 Hs.591160 NM_004447 ENSG00000151491 EPS8 DFNB102 epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 protein-coding 150.333-297 chr4 41764433 41764781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15637 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 112.667-209 chr5 27615005 27615336 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 142878 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 112-12 chr10 4868670 4868979 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 42617 NM_001040177 83592 Hs.657944 NM_031436 ENSG00000165568 AKR1E2 AKR1CL2|AKRDC1|LoopADR|TAKR|hTSP|htAKR aldo-keto reductase family 1 member E2 protein-coding 178-26 chr11 74241115 74241461 + 0.666667 NA intron (NM_016147, intron 9 of 13) L1MB8|LINE|L1 69999 NM_001271593 51400 Hs.503251 NM_016147 ENSG00000214517 PPME1 ABDH19|PME-1 protein phosphatase methylesterase 1 protein-coding 191.667-63 chr19 13557207 13557673 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -50961 NM_001174080 773 Hs.501632 NM_000068 ENSG00000141837 CACNA1A APCA|BI|CACNL1A4|CAV2.1|EA2|EIEE42|FHM|HPCA|MHP|MHP1|SCA6 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A protein-coding 120.667-18 chr10 43638929 43639240 + 0.666667 NA intron (NR_038867, intron 1 of 4) L1M5|LINE|L1 -4788 NR_047557 414197 Hs.605832 NR_047557 ENSG00000226245 ZNF32-AS1 ZNF32OS1|bA402L1.8 ZNF32 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-198 chr8 117830361 117830685 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 3 of 10) intron (NM_000127, intron 3 of 10) 90390 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 140.667-222 chr7 158579743 158580150 + 0.666667 NA intron (NM_130843, intron 1 of 21) intron (NM_130843, intron 1 of 21) 7877 NM_130843 5799 Hs.490789 NM_002847 ENSG00000155093 PTPRN2 IA-2beta|IAR|ICAAR|PTPRP|R-PTP-N2 protein tyrosine phosphatase receptor type N2 protein-coding 188.667-69 chr2 19439152 19439570 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80738 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 200.667-170 chr9 120225553 120225985 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 19281 NR_029604 406939 NR_029604 ENSG00000207814 MIR147A MIR147|MIRN147|hsa-mir-147a microRNA 147a ncRNA 128-86 chr4 116210610 116210857 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -88992 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 161.667-52 chr12 28823514 28823840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -325601 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 158-140 chr8 108598576 108598935 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 155131 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 131-103 chr8 72719132 72719393 + 0.666667 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) -12783 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 188-53 chr2 45521675 45522141 + 0.666667 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) AluJb|SINE|Alu 89359 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 136.667-22 chr10 89026506 89026812 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33684 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 185.333-198 chr9 31874502 31874999 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -493260 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 121.333-142 chr4 180986443 180986713 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 172571 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 113-128 chr21 28141914 28142202 + 0.666667 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) AluSg4|SINE|Alu 51655 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 143.667-161 chr3 96069076 96069384 + 0.666667 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -290734 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 118-7 chr1 210156737 210157027 + 0.666667 NA intron (NM_153262, intron 7 of 7) AluSq2|SINE|Alu -75914 NM_019605 56256 Hs.600545 NM_019605 ENSG00000082497 SERTAD4 DJ667H12.2 SERTA domain containing 4 protein-coding 112-180 chr6 37850973 37851277 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 31398 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 151-28 chr12 60788253 60788671 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 1099092 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 120-82 chr3 20215728 20216008 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -29635 NM_001199255 151648 Hs.105153 NM_138484 ENSG00000129810 SGO1 CAID|NY-BR-85|SGO|SGOL1 shugoshin 1 protein-coding 147.333-153 chr18 46612350 46612707 + 0.666667 NA intron (NM_144612, intron 5 of 39) L1ME3Cz|LINE|L1 44505 NM_144612 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 155.667-225 chr3 88233172 88233637 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 83445 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 157-7 chr1 85393346 85393794 + 0.666667 NA intron (NM_001134445, intron 2 of 6) MER34C_|LTR|ERV1 10936 NM_001330655 23576 Hs.713411 NM_012137 ENSG00000153904 DDAH1 DDAH|DDAH-1|DDAHI|HEL-S-16 dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 protein-coding 132.667-176 chr8 66063687 66063935 + 0.666667 NA intron (NR_146171, intron 4 of 6) intron (NR_146171, intron 4 of 6) 42258 NR_146171 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 119.333-128 chr2 101478828 101479090 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3847 NM_001145664 731220 Hs.662488 NM_207403 ENSG00000196460 RFX8 - RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain protein-coding 131-95 chr7 98720842 98721097 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 103684 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 153-99 chr4 43777830 43778212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -238840 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 164-21 chr10 113731500 113731842 + 0.666667 NA TTS (NM_033339) TTS (NM_033339) -20011 NM_001193435 79949 Hs.228320 NM_024889 ENSG00000148735 PLEKHS1 C10orf81|HEL185 pleckstrin homology domain containing S1 protein-coding 133-63 chr3 133162994 133163247 + 0.666667 NA intron (NM_001282865, intron 1 of 3) intron (NM_001282865, intron 1 of 3) 38299 NM_001282865 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 128.333-82 chr18 3351096 3351421 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_146506) promoter-TSS (NR_146506) -699 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 137-22 chr12 26874942 26875266 + 0.666667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -41910 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 122.667-11 chr1 218924073 218924366 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -5708 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 155-33 chr14 76193477 76193779 + 0.666667 NA intron (NM_001322028, intron 8 of 9) L1ME3A|LINE|L1 39274 NM_017972 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 131-106 chr8 121633397 121633779 + 0.666667 NA intron (NM_005328, intron 1 of 3) intron (NM_005328, intron 1 of 3) -5758 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 165-68 chr4 80469591 80470016 + 0.666667 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) L4_B_Mam|LINE|RTE-X 134083 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 143.667-197 chr5 18162027 18162280 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 354879 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 140.333-52 chr12 105693640 105693972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10397 NR_110108 101929110 Hs.145944 NR_110108 ENSG00000257859 CASC18 - cancer susceptibility 18 ncRNA 138-17 chr10 55989938 55990259 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -362156 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 172.333-11 chr10 24342024 24342453 + 0.666667 NA intron (NM_019590, intron 2 of 20) intron (NM_019590, intron 2 of 20) 66553 NR_030334 693188 NR_030334 ENSG00000207930 MIR603 MIRN603|hsa-mir-603 microRNA 603 ncRNA 122.333-85 chr19 44605539 44605831 + 0.666667 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL -7878 NM_001205280 147710 Hs.512509 NM_001205280 ENSG00000216588 IGSF23 - immunoglobulin superfamily member 23 protein-coding 179-29 chr14 55562936 55563386 + 0.666667 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 16931 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 138.333-21 chr10 25064596 25064987 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2512 NM_001270383 219670 Hs.534486 NM_145010 ENSG00000151023 ENKUR C10orf63|CFAP106 enkurin, TRPC channel interacting protein protein-coding 159.667-329 chr8 121448655 121448985 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190526 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 139.667-26 chr11 16518986 16519390 + 0.666667 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) intron (NM_001367872, intron 3 of 16) -42800 NM_033326 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 250.333-39 chr21 36569233 36569966 + 0.666667 NA intron (NM_001146077, intron 1 of 2) L1MC5a|LINE|L1 6970 NM_001146077 23562 Hs.660278 NM_012130 ENSG00000159261 CLDN14 DFNB29 claudin 14 protein-coding 160.333-48 chr10 89163079 89163414 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44071 NM_003956 9023 Hs.47357 NM_003956 ENSG00000138135 CH25H C25H cholesterol 25-hydroxylase protein-coding 120.667-59 chr15 58492781 58493022 + 0.666667 NA intron (NR_120338, intron 2 of 2) intron (NR_120338, intron 2 of 2) 5834 NR_120338 101928694 Hs.655781 NR_120338 ENSG00000259293 LIPC-AS1 - LIPC antisense RNA 1 ncRNA 135-42 chr2 24542489 24542825 + 0.666667 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) intron (NM_001362952, intron 1 of 23) -41820 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 114.667-15 chr1 208280452 208280776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36230 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 121-64 chr2 14124059 14124297 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 276780 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 187-31 chr2 34485165 34485575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -192187 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 221-73 chr9 135063287 135063712 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -12006 NM_006334 10439 Hs.522484 NM_006334 ENSG00000130558 OLFM1 AMY|NOE1|NOELIN1|OlfA olfactomedin 1 protein-coding 152-18 chr10 27617858 27618240 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113745 NM_021252 22931 Hs.406799 NM_021252 ENSG00000099246 RAB18 RAB18LI1|WARBM3 RAB18, member RAS oncogene family protein-coding 170.333-24 chr10 15209752 15210141 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41253 NM_004808 9397 Hs.60339 NM_004808 ENSG00000152465 NMT2 - N-myristoyltransferase 2 protein-coding 173.333-204 chr8 108116456 108116803 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33009 NM_178565 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 132.333-25 chr10 110236435 110236735 + 0.666667 NA intron (NM_001008541, intron 2 of 4) AluJb|SINE|Alu 10589 NM_005962 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 206.667-144 chr8 136099419 136099812 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -431183 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 171-45 chr20 45065238 45065590 + 0.666667 NA intron (NM_001352385, intron 11 of 11) L1PA15|LINE|L1 35713 NM_001322799 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 123-98 chr5 75946839 75947152 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136388 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 161-55 chr22 33132749 33133064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24377 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 175.667 chr1 13727459 13727838 + 0.666667 NA intron (NM_012231, intron 2 of 9) intron (NM_012231, intron 2 of 9) -21767 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 165-34 chr19 32063521 32063836 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37816 NR_110673 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 209-52 chr18 72242341 72242736 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 301804 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 115.333-137 chr3 37645891 37646095 + 0.666667 NA intron (NM_002207, intron 16 of 27) intron (NM_002207, intron 16 of 27) 193852 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 125.667-37 chr11 103729356 103729650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -120403 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 119.333-240 chr9 117672360 117672649 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23898 NR_109806 101928797 Hs.382317 NR_109806 ENSG00000233569 LOC101928797 - uncharacterized LOC101928797 ncRNA 112.667-21 chr1 218957204 218957404 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) L1MEf|LINE|L1 -38793 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 159.667-326 chr8 110321015 110321395 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -345434 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 124.333-34 chr12 15642044 15642256 + 0.666667 NA intron (NM_004447, intron 15 of 20) intron (NM_004447, intron 15 of 20) 95539 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 170.667-65 chr17 75016396 75016800 + 0.666667 NA intron (NM_001545, intron 1 of 5) intron (NM_001545, intron 1 of 5) 3928 NM_001303265 3396 Hs.407955 NM_001545 ENSG00000167862 MRPL58 DS-1|DS1|ICT1|MRP-L58 mitochondrial ribosomal protein L58 protein-coding 159.667-130 chr17 10491551 10491859 + 0.666667 NA TTS (NM_005963) TTS (NM_005963) -22146 NM_017533 4622 Hs.711141 NM_017533 ENSG00000264424 MYH4 MYH2B|MyHC-2B|MyHC-IIb myosin heavy chain 4 protein-coding 164.667-142 chr3 15091783 15092109 + 0.666667 NA intron (NM_001302378, intron 3 of 12) intron (NM_001302378, intron 3 of 12) 7202 NM_001302378 64145 Hs.475565 NM_022340 ENSG00000131381 RBSN Rabenosyn-5|ZFYVE20 rabenosyn, RAB effector protein-coding 116-152 chr8 69528548 69528886 + 0.666667 NA intron (NR_156414, intron 2 of 20) intron (NR_156414, intron 2 of 20) 35870 NM_001128206 23213 Hs.409602 NM_015170 ENSG00000137573 SULF1 SULF-1 sulfatase 1 protein-coding 124.667-75 chr15 92656440 92656724 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_207446) promoter-TSS (NM_207446) -807 NM_207446 400451 Hs.27373 NM_207446 ENSG00000185442 FAM174B - family with sequence similarity 174 member B protein-coding 160.333-201 chr3 194047271 194047594 + 0.666667 NA intron (NR_136179, intron 1 of 2) intron (NR_136179, intron 1 of 2) 22097 NR_136181 285389 Hs.157102 NR_136179 ENSG00000230102 LINC02028 - long intergenic non-protein coding RNA 2028 ncRNA 188.333-33 chr12 27006979 27007428 + 0.666667 NA intron (NM_016551, intron 1 of 11) intron (NM_016551, intron 1 of 11) 7181 NM_016551 51768 Hs.438641 NM_016551 ENSG00000064115 TM7SF3 - transmembrane 7 superfamily member 3 protein-coding 179-16 chr11 31226750 31227225 + 0.666667 NA intron (NM_001367979, intron 9 of 38) L1MEc|LINE|L1 142752 NM_181807 341019 Hs.127405 NM_020869 ENSG00000170959 DCDC1 DCDC5 doublecortin domain containing 1 protein-coding 217-36 chr18 10434936 10435405 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19465 NM_153000 147495 Hs.293274 NM_153000 ENSG00000154856 APCDD1 B7323|DRAPC1|FP7019|HHS|HTS|HYPT1 APC down-regulated 1 protein-coding 160.667-76 chr12 96017901 96018242 + 0.666667 NA intron (NR_132659, intron 8 of 18) intron (NR_132659, intron 8 of 18) 17516 NM_000895 4048 Hs.524648 NM_000895 ENSG00000111144 LTA4H - leukotriene A4 hydrolase protein-coding 113-108 chr2 83513641 83513844 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -9072 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 145.667-309 chr9 75078127 75078536 + 0.666667 NA exon (NM_001330678, exon 3 of 10) exon (NM_001330678, exon 3 of 10) 9824 NM_001330678 54981 Hs.494186 NM_017881 ENSG00000106733 NMRK1 C9orf95|NRK1|bA235O14.2 nicotinamide riboside kinase 1 protein-coding 151.667-141 chr17 12940942 12941242 + 0.666667 NA exon (NM_001321168, exon 7 of 20) exon (NM_001321168, exon 7 of 20) -23750 NR_039747 100616494 NR_039747 ENSG00000265503 MIR1269B - microRNA 1269b ncRNA 119.333-74 chr12 78531759 78532077 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -172172 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 116.667-59 chr14 82059224 82059465 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -316206 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 176.667-39 chr12 2735132 2735534 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44176 NR_045725 100652846 Hs.683896 NR_045725 ENSG00000246627 CACNA1C-AS1 - CACNA1C antisense RNA 1 ncRNA 214.333-100 chr3 122708709 122709030 + 0.666667 NA intron (NM_017554, intron 9 of 16) L1MEf|LINE|L1 28030 NM_017554 54625 Hs.518203 NM_017554 ENSG00000173193 PARP14 ARTD8|BAL2|PARP-14|pART8 poly(ADP-ribose) polymerase family member 14 protein-coding 119.667-65 chr16 68954857 68955166 + 0.666667 NA intron (NM_024562, intron 14 of 17) intron (NM_024562, intron 14 of 17) 111480 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 134.667-27 chr10 88949587 88949898 + 0.666667 NA intron (NM_001320855, intron 1 of 8) intron (NM_001320855, intron 1 of 8) 3031 NM_001613 59 Hs.500483 NM_001613 ENSG00000107796 ACTA2 ACTSA actin alpha 2, smooth muscle protein-coding 122.333-219 chr9 105783152 105783360 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 88715 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 180.333-123 chr8 15468155 15468569 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71725 NM_178234 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 113.667-190 chr6 127642900 127643112 + 0.666667 NA Intergenic LTR19B|LTR|ERV1 65832 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 144.333-182 chr4 25714066 25714396 + 0.666667 NA Intergenic Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 57767 NM_001177999 10568 Hs.479372 NM_006424 ENSG00000157765 SLC34A2 NAPI-3B|NAPI-IIb|NPTIIb solute carrier family 34 member 2 protein-coding 192-11 chr1 180052609 180053100 + 0.666667 NA intron (NM_014810, intron 22 of 37) intron (NM_014810, intron 22 of 37) 98044 NM_014810 9857 Hs.413045 NM_014810 ENSG00000135837 CEP350 CAP350|GM133 centrosomal protein 350 protein-coding 115-108 chr3 27226285 27226596 + 0.666667 NA intron (NM_199347, intron 24 of 24) intron (NM_199347, intron 24 of 24) -9917 NM_001031741 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 132.333-68 chr16 86367369 86367620 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21815 NR_024406 732275 Hs.558087 NR_024406 ENSG00000168367 LINC00917 - long intergenic non-protein coding RNA 917 ncRNA 198.333-150 chr4 125121583 125122000 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -194621 NM_024582 79633 Hs.563205 NM_024582 ENSG00000196159 FAT4 CDHF14|CDHR11|FAT-J|FATJ|HKLLS2|NBLA00548|VMLDS2 FAT atypical cadherin 4 protein-coding 152.333-253 chr3 155811655 155811983 + 0.666667 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -5532 NM_173657 285315 Hs.350846 NM_173657 ENSG00000174928 C3orf33 AC3-33 chromosome 3 open reading frame 33 protein-coding 122-48 chr2 47206662 47206949 + 0.666667 NA intron (NR_110208, intron 3 of 4) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -29869 NM_001305625 805 Hs.468442 NM_001743 ENSG00000143933 CALM2 CALM|CALML2|CAM1|CAM3|CAMC|CAMII|CAMIII|LQT15|PHKD|PHKD2|caM calmodulin 2 protein-coding 154-6 chr1 155794604 155794934 + 0.666667 NA intron (NM_032292, intron 12 of 20) L2c|LINE|L2 -10937 NR_132767 106633816 NR_132767 SCARNA26B - small Cajal body-specific RNA 26B ncRNA 143-88 chr4 48689445 48689725 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 2 of 63) L2a|LINE|L2 90714 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 116-146 chr7 48766350 48766604 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -158070 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 264.333-23 chr15 57301411 57301974 + 0.666667 NA intron (NR_024433, intron 1 of 2) intron (NR_024433, intron 1 of 2) 1327 NR_024433 283663 Hs.181297 NR_024433 ENSG00000247982 LINC00926 - long intergenic non-protein coding RNA 926 ncRNA 218.667-32 chr14 89522152 89522514 + 0.666667 NA intron (NM_001085471, intron 1 of 6) L1ME1|LINE|L1 -53883 NR_024620 29018 Hs.673124 NM_014099 ENSG00000259073 FOXN3-AS2 PRO1768 FOXN3 antisense RNA 2 ncRNA 198-43 chr13 88958254 88958821 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -276754 NR_047025 100874172 Hs.569291 NR_047025 LINC00440 - long intergenic non-protein coding RNA 440 ncRNA 184.667-76 chr3 6238485 6238943 + 0.666667 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 566735 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 172-80 chr4 48192620 48192978 + 0.666667 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) intron (NM_003215, intron 2 of 17) -58549 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 144-21 chr10 105854239 105854639 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34106 NR_120625 101927549 Hs.556885 NR_120625 LINC02627 - long intergenic non-protein coding RNA 2627 ncRNA 209.667-40 chr12 128038089 128038636 + 0.666667 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 -11196 NR_131985 105370070 NR_131985 ENSG00000256643 LINC02441 CRAT8 long intergenic non-protein coding RNA 2441 ncRNA 151-21 chr11 71557332 71557638 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8078 NM_001012710 387273 Hs.661887 NM_001012710 ENSG00000204572 KRTAP5-10 KRTAP5.10 keratin associated protein 5-10 protein-coding 193.333-146 chr5 8666689 8667145 + 0.666667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -172815 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 116-98 chr22 26530114 26530353 + 0.666667 NA intron (NM_003595, intron 5 of 6) FLAM_A|SINE|Alu 17701 NR_144529 100507599 Hs.405877 NR_144529 LOC100507599 - uncharacterized LOC100507599 ncRNA 119-90 chr20 21954170 21954386 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -99812 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 120-112 chr5 79106878 79107110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4815 NM_001713 635 Hs.80756 NM_001713 ENSG00000145692 BHMT BHMT1|HEL-S-61p betaine--homocysteine S-methyltransferase protein-coding 133.333-198 chr9 80400524 80400829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 425653 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 125.333-133 chr5 23313136 23313438 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -194322 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 219.333-148 chr5 157974935 157975410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -116027 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 138.333-6 chr1 110009530 110009780 + 0.666667 NA intron (NM_001242673, intron 2 of 16) intron (NM_001242673, intron 2 of 16) 5707 NM_001242676 10768 Hs.743973 NM_006621 ENSG00000168710 AHCYL1 DCAL|IRBIT|PPP1R78|PRO0233|XPVKONA adenosylhomocysteinase like 1 protein-coding 123.333-129 chr20 43975032 43975391 + 0.666667 NA intron (NM_001098797, intron 2 of 8) intron (NM_001098797, intron 2 of 8) 29315 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 204-17 chr1 168050355 168050802 + 0.666667 NA intron (NM_001017977, intron 14 of 18) intron (NM_001017977, intron 14 of 18) 51918 NR_031702 100313835 NR_031702 ENSG00000221545 MIR1255B2 MIR1255B-2|MIRN1255B2|hsa-mir-1255b-2 microRNA 1255b-2 ncRNA 123.333-209 chr8 84090056 84090306 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -92606 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 168.667-75 chr16 50073100 50073436 + 0.666667 NA intron (NR_138092, intron 5 of 15) intron (NR_138092, intron 5 of 15) 7298 NR_138093 55027 Hs.733027 NM_017939 ENSG00000155393 HEATR3 SYO1 HEAT repeat containing 3 protein-coding 111.667-179 chr4 11763948 11764122 + 0.666667 NA intron (NR_146995, intron 1 of 3) L1MA10|LINE|L1 5433 NR_146995 105374484 Hs.581972 NR_146995 ENSG00000248300 LINC02360 - long intergenic non-protein coding RNA 2360 ncRNA 161.667-11 chr1 100980453 100980802 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001144884, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001144884, exon 12 of 12) 45157 NM_001077395 51611 Hs.440776 NM_015958 ENSG00000117543 DPH5 AD-018|CGI-30|HSPC143|NPD015 diphthamide biosynthesis 5 protein-coding 167.667-14 chr1 215806407 215806742 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 49 of 71) intron (NM_206933, intron 49 of 71) 239270 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 123-5 chr1 81931340 81931565 + 0.666667 NA intron (NM_001366002, intron 4 of 20) intron (NM_001366002, intron 4 of 20) 128999 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 260-91 chrX 101203215 101203838 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16418 NM_001939 1821 Hs.159291 NM_001939 ENSG00000102385 DRP2 DRP-2 dystrophin related protein 2 protein-coding 136.333-198 chr7 132943123 132943465 + 0.666667 NA intron (NM_001317177, intron 4 of 8) intron (NM_001317177, intron 4 of 8) 91621 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 126.667-94 chr20 39011963 39012272 + 0.666667 NA intron (NM_021931, intron 13 of 21) AluSz|SINE|Alu 49773 NM_021931 60625 Hs.444520 NM_021931 ENSG00000101452 DHX35 C20orf15|DDX35|KAIA0875 DEAH-box helicase 35 protein-coding 134.667-68 chr15 45471576 45471862 + 0.666667 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 38669 NR_030599 100126311 NR_030599 ENSG00000284386 MIR147B MIRN147B|mir-147b microRNA 147b ncRNA 158.333-15 chr1 161737645 161738068 + 0.666667 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -11930 NM_007240 11266 Hs.416216 NM_007240 ENSG00000081721 DUSP12 DUSP1|YVH1 dual specificity phosphatase 12 protein-coding 154-64 chr15 98976262 98976553 + 0.666667 NA intron (NM_001167902, intron 2 of 4) intron (NM_001167902, intron 2 of 4) 29249 NM_001102612 145814 Hs.592021 NM_001102612 ENSG00000183571 PGPEP1L - pyroglutamyl-peptidase I like protein-coding 169.667-201 chr8 31267927 31268283 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -234749 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 208.333-109 chr4 85891001 85891393 + 0.666667 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) intron (NM_001287805, intron 1 of 7) -38819 NM_031305 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 114-158 chr8 13590420 13590707 + 0.666667 NA intron (NM_001348082, intron 1 of 16) intron (NM_001348082, intron 1 of 16) 14057 NM_001348082 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 166.333-92 chr17 72764743 72765175 + 0.666667 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) LTR8A|LTR|ERV1 -124487 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 112-36 chr11 114444786 114445052 + 0.666667 NA intron (NM_015523, intron 4 of 6) intron (NM_015523, intron 4 of 6) 5452 NM_015523 25996 Hs.677190 NM_015523 ENSG00000076043 REXO2 CGI-114|REX2|RFN|SFN RNA exonuclease 2 protein-coding 126.667-32 chr12 22590636 22590843 + 0.666667 NA intron (NR_135030, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu 34307 NR_135031 105369691 Hs.556287 NR_135030 LOC105369691 - uncharacterized LOC105369691 ncRNA 136-102 chr8 72451618 72452014 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85409 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 137.333-156 chr5 65362946 65363233 + 0.666667 NA intron (NR_135689, intron 7 of 25) Tigger14a|DNA|TcMar-Tigger 118831 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 145-125 chr9 29413720 29414139 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -200328 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 121-13 chr10 43359022 43359283 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12484 NM_173160 53828 Hs.130497 NM_173160 ENSG00000150201 FXYD4 CHIF FXYD domain containing ion transport regulator 4 protein-coding 130-125 chr8 17270903 17271153 + 0.666667 NA intron (NM_001363167, intron 4 of 11) MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR 24070 NM_001363172 137492 Hs.343873 NM_152415 ENSG00000155975 VPS37A HCRP1|PQBP2|SPG53 VPS37A subunit of ESCRT-I protein-coding 143.333-27 chr10 21448019 21448347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48458 NR_031736 100302129 NR_031736 ENSG00000222071 MIR1915 MIRN1915|hsa-mir-1915 microRNA 1915 ncRNA 117.333-225 chrX 70427218 70427429 + 0.666667 NA exon (NM_017711, exon 10 of 16) exon (NM_017711, exon 10 of 16) 4292 NM_001171193 54857 Hs.438712 NM_017711 ENSG00000130055 GDPD2 GDE3|OBDPF glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 2 protein-coding 140.667-119 chr2 70083056 70083325 + 0.666667 NA intron (NR_033872, intron 3 of 10) intron (NR_033872, intron 3 of 10) 3825 NR_033872 400960 Hs.683864 NR_033872 ENSG00000179818 PCBP1-AS1 - PCBP1 antisense RNA 1 ncRNA 131-50 chr2 64583146 64583358 + 0.666667 NA intron (NM_203437, intron 8 of 9) intron (NM_203437, intron 8 of 9) -24060 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 120-89 chr3 108703017 108703283 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 54133 NM_032579 84666 Hs.307047 NM_032579 ENSG00000163515 RETNLB FIZZ1|FIZZ2|HXCP2|RELM-beta|RELMb|RELMbeta|XCP2 resistin like beta protein-coding 147.667-61 chr11 106610733 106611089 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 359504 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 139.667-32 chr12 1036397 1036733 + 0.666667 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) AluSq2|SINE|Alu 8817 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 112-179 chr6 8358739 8358975 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 76688 NM_001370478 51000 Hs.285847 NM_015948 ENSG00000124786 SLC35B3 C6orf196|CGI-19|PAPST2 solute carrier family 35 member B3 protein-coding 130-24 chr12 2955264 2955555 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -3988 NM_201441 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 113.333-87 chr15 85617385 85617629 + 0.666667 NA intron (NM_007200, intron 8 of 36) AluSc|SINE|Alu -2443 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 115-53 chr13 82645071 82645373 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 1237171 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 153.333-192 chr2 40395035 40395396 + 0.666667 NA intron (NM_001351483, intron 2 of 8) intron (NM_001351483, intron 2 of 8) 35089 NM_001112800 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 264-11 chr10 61443629 61444215 + 0.666667 NA intron (NR_134508, intron 1 of 6) intron (NR_134508, intron 1 of 6) -8717 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 242.333-50 chr2 133047023 133047410 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 131659 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 203-62 chr22 25973022 25973486 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 39 of 43) intron (NM_001318245, intron 39 of 43) -196208 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 158-16 chr10 106873840 106874128 + 0.666667 NA intron (NM_001206569, intron 2 of 25) MIRc|SINE|MIR 290722 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 114.333-190 chr6 24561937 24562115 + 0.666667 NA intron (NM_001350410, intron 17 of 21) AluJb|SINE|Alu 21201 NM_001252328 9856 Hs.26441 NM_014809 ENSG00000137261 KIAA0319 AAVR|DYLX2|DYX2|NMIG KIAA0319 protein-coding 116.667-8 chr1 108743310 108743508 + 0.666667 NA TTS (NM_001144937) TTS (NM_001144937) -3265 NM_007269 6814 Hs.530436 NM_007269 ENSG00000116266 STXBP3 MUNC18-3|MUNC18C|PSP|UNC-18C syntaxin binding protein 3 protein-coding 145.333-95 chr14 95219766 95220156 + 0.666667 NA intron (NM_024734, intron 4 of 12) L1MB8|LINE|L1 -61951 NM_001291628 23405 Hs.87889 NM_030621 ENSG00000100697 DICER1 DCR1|Dicer|Dicer1e|GLOW|HERNA|K12H4.8-LIKE|MNG1|RMSE2 dicer 1, ribonuclease III protein-coding 117.333-53 chr14 51248333 51248575 + 0.666667 NA intron (NM_030755, intron 4 of 7) intron (NM_030755, intron 4 of 7) 8207 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 152.333-31 chr1 232063501 232063813 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 137823 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 135.667-192 chr8 135763451 135763853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 306196 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 149.333-226 chr22 34857731 34858029 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 140036 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 132.333-4 chr1 62793702 62793973 + 0.666667 NA intron (NM_032852, intron 1 of 10) intron (NM_032852, intron 1 of 10) 9705 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 165.333-204 chr5 39153636 39153981 + 0.666667 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) AluJo|SINE|Alu 65755 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 187.667-6 chr1 147880073 147880539 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -22489 NM_005267 2703 Hs.632441 NM_005267 ENSG00000121634 GJA8 CAE|CAE1|CTRCT1|CX50|CZP1|MP70 gap junction protein alpha 8 protein-coding 140-100 chr6 143456467 143456814 + 0.666667 NA intron (NM_003630, intron 1 of 11) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 5835 NM_003630 8504 Hs.7277 NM_003630 ENSG00000034693 PEX3 PBD10A|PBD10B|TRG18 peroxisomal biogenesis factor 3 protein-coding 124.333-44 chr14 32249683 32249953 + 0.666667 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -46549 NR_125730 103625684 NR_125730 ENSG00000207357 RNU6-2 U6-2 RNA, U6 small nuclear 2 snRNA 126-61 chr20 7531531 7531875 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 160095 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 116.667-190 chr7 62865330 62865621 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 438581 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 200.333-16 chr10 120599736 120600180 + 0.666667 NA non-coding (NR_103717, exon 1 of 1) non-coding (NR_103717, exon 1 of 1) 2009 NR_103717 404216 Hs.196578 NM_001012711 ENSG00000177234 LINC01561 C10orf85 long intergenic non-protein coding RNA 1561 ncRNA 219.667-71 chr5 27521762 27522277 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49727 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 197.667-147 chr8 68176176 68176636 + 0.666667 NA intron (NM_024870, intron 35 of 39) intron (NM_024870, intron 35 of 39) -153967 NM_001349479 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 149.667-265 chr3 126631255 126631598 + 0.666667 NA intron (NM_001173513, intron 8 of 14) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 23698 NM_001173513 114112 Hs.477475 NM_052883 ENSG00000197763 TXNRD3 TGR|TR2|TR2IT1|TRXR3|TXNRD3IT1|TXNRD3NB|TXNRD3NT1 thioredoxin reductase 3 protein-coding 159-4 chr1 43716666 43717045 + 0.666667 NA intron (NR_125986, intron 3 of 3) intron (NR_125986, intron 3 of 3) 9319 NM_174971 6487 Hs.597915 NM_006279 ENSG00000126091 ST3GAL3 EIEE15|MRT12|SIAT6|ST3GALII|ST3Gal III|ST3GalIII|ST3N ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 3 protein-coding 115.667-114 chr2 83597560 83597897 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 74914 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 227.667-52 chr3 142729045 142729596 + 0.666667 NA intron (NM_001251845, intron 1 of 12) intron (NM_001251845, intron 1 of 12) 4896 NM_003304 7220 Hs.250687 NM_003304 ENSG00000144935 TRPC1 HTRP-1|TRP1 transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 protein-coding 146.333-173 chr2 229498194 229498501 + 0.666667 NA intron (NM_139072, intron 6 of 12) L1M2|LINE|L1 216208 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 144.667-17 chr1 169164835 169165120 + 0.666667 NA intron (NR_104229, intron 12 of 12) intron (NR_104229, intron 12 of 12) 58287 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 213.667-38 chr17 47349366 47349699 + 0.666667 NA intron (NM_152347, intron 9 of 24) intron (NM_152347, intron 9 of 24) 25577 NM_152347 124989 Hs.463303 NM_152347 ENSG00000178852 EFCAB13 C17orf57 EF-hand calcium binding domain 13 protein-coding 180-18 chr11 91705651 91706000 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -519209 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 123-2 chr1 38957362 38957558 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -15630 NM_017821 54933 Hs.524626 NM_017821 ENSG00000158315 RHBDL2 RRP2 rhomboid like 2 protein-coding 128.667-42 chr12 30581532 30581828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 95564 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 133.333-160 chr6 28350513 28350886 + 0.666667 NA intron (NM_001242894, intron 2 of 6) intron (NM_001242894, intron 2 of 6) 752 NM_001242895 80317 Hs.380930 NM_024493 ENSG00000189298 ZKSCAN3 ZF47|ZFP306|ZNF306|ZNF309|ZSCAN13|ZSCAN35|Zfp47|dJ874C20.1|dJ874C20.1.|zfp-47 zinc finger with KRAB and SCAN domains 3 protein-coding 184.333-157 chr8 126359216 126359634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33930 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 122.667-82 chr2 28259882 28260233 + 0.666667 NA intron (NM_199193, intron 11 of 13) AluSc8|SINE|Alu 50402 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 160.333-281 chr8 90755616 90755956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35989 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 115.667-39 chr11 14843421 14843606 + 0.666667 NA intron (NM_000922, intron 11 of 15) intron (NM_000922, intron 11 of 15) 48692 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 152.667-330 chr6 116313420 116313831 + 0.666667 NA intron (NR_136524, intron 1 of 4) intron (NR_136524, intron 1 of 4) -33508 NM_003309 7259 Hs.458358 NM_003309 ENSG00000189241 TSPYL1 TSPYL TSPY like 1 protein-coding 162.333-80 chr14 77365426 77365763 + 0.666667 NA intron (NM_001346133, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 8315 NM_001346134 283578 Hs.26403 NM_213601 ENSG00000100580 TMED8 FAM15B transmembrane p24 trafficking protein family member 8 protein-coding 113.667-211 chr8 115821959 115822164 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -153086 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 152.667-164 chr2 7936759 7937167 + 0.666667 NA intron (NR_015405, intron 2 of 2) intron (NR_015405, intron 2 of 2) -37308 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 125.333-141 chr5 68190427 68190674 + 0.666667 NA intron (NR_105003, intron 1 of 2) AluSq2|SINE|Alu 674 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 120.667-70 chr17 14472828 14473033 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 169190 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 126-126 chr9 113347393 113347718 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1986 NM_001317943 54836 Hs.614517 NM_017688 ENSG00000119411 BSPRY - B-box and SPRY domain containing protein-coding 174.667-74 chr18 43626334 43626843 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -349098 NM_020783 6860 Hs.8059 NM_020783 ENSG00000132872 SYT4 HsT1192 synaptotagmin 4 protein-coding 167.333-59 chr12 10129445 10129773 + 0.666667 NA intron (NR_125336, intron 1 of 6) AluSx|SINE|Alu 590 NM_197954 64581 Hs.143929 NM_022570 ENSG00000172243 CLEC7A BGR|CANDF4|CD369|CLECSF12|DECTIN1|SCARE2 C-type lectin domain containing 7A protein-coding 154.333-268 chr5 83959527 83959964 + 0.666667 NA intron (NM_001278642, intron 9 of 9) intron (NM_001278642, intron 9 of 9) -238890 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 143.667-166 chr3 122340519 122340915 + 0.666667 NA intron (NM_005213, intron 2 of 2) intron (NM_005213, intron 2 of 2) 15469 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 227.333-23 chr11 13250921 13251378 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25503 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 212.667-91 chr3 85892814 85893273 + 0.666667 NA intron (NM_001256502, intron 5 of 10) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -64993 NR_046752 100874037 Hs.570566 NR_046752 ENSG00000241648 CADM2-AS2 - CADM2 antisense RNA 2 ncRNA 260.667-73 chr5 45593856 45594333 + 0.666667 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) MER135|DNA|DNA 102286 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 199.667-61 chr17 77395483 77395945 + 0.666667 NA intron (NM_001113494, intron 1 of 10) intron (NM_001113494, intron 1 of 10) 1340 NR_036200 100422851 NR_036200 ENSG00000264060 MIR4316 - microRNA 4316 ncRNA 201.333-174 chr21 25637727 25638176 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1307 NR_072999 58494 Hs.517227 NM_021219 ENSG00000154721 JAM2 C21orf43|CD322|JAM-B|JAMB|PRO245|VE-JAM|VEJAM junctional adhesion molecule 2 protein-coding 179-45 chr18 10974506 10974844 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) intron (NM_022068, intron 3 of 51) 174087 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 149.667-317 chr5 62762667 62763048 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 184038 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 173-47 chr2 42663918 42664358 + 0.666667 NA intron (NM_001330444, intron 8 of 15) intron (NM_001330444, intron 8 of 15) 95506 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 153-21 chr11 76452618 76453056 + 0.666667 NA intron (NM_001300942, intron 3 of 21) intron (NM_001300942, intron 3 of 21) 7812 NM_020193 56946 Hs.352588 NM_020193 ENSG00000158636 EMSY C11orf30|GL002 EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting protein-coding 135-78 chr4 104396977 104397246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93854 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 168-109 chr7 127062243 127062597 + 0.666667 NA intron (NM_001371085, intron 3 of 10) intron (NM_001371085, intron 3 of 10) -4236 NR_030323 693177 NR_030323 ENSG00000207692 MIR592 MIRN592|hsa-mir-592|mir-592 microRNA 592 ncRNA 211.667-26 chr11 12798416 12798909 + 0.666667 NA intron (NM_021961, intron 3 of 12) intron (NM_021961, intron 3 of 12) 124241 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 159.333-164 chr2 112031864 112032184 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23245 NM_032824 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 215.333-65 chr15 96279710 96280205 + 0.666667 NA intron (NR_102743, intron 5 of 7) intron (NR_102743, intron 5 of 7) -46089 NM_001145155 7026 Hs.347991 NM_021005 ENSG00000185551 NR2F2 ARP-1|ARP1|CHTD4|COUPTF2|COUPTFB|COUPTFII|NF-E3|SVP40|TFCOUP2 nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 protein-coding 121.667-144 chr4 97230857 97231107 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -135944 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 169-96 chr7 24023990 24024430 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -259980 NM_000905 4852 Hs.1832 NM_000905 ENSG00000122585 NPY PYY4 neuropeptide Y protein-coding 234.333-50 chr3 56814840 56815440 + 0.666667 NA intron (NM_001128615, intron 4 of 12) AluJo|SINE|Alu -13191 NM_019555 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 197-83 chr4 85086474 85086913 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 119209 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 231.667-59 chr8 96952048 96952581 + 0.666667 NA non-coding (NR_125390, exon 3 of 3) non-coding (NR_125390, exon 3 of 3) 307072 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 129-78 chr22 27836386 27836713 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34793 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 228-12 chr10 73031091 73031570 + 0.666667 NA intron (NM_001017962, intron 9 of 14) AluJr|SINE|Alu 65644 NM_001142595 5033 Hs.500047 NM_000917 ENSG00000122884 P4HA1 P4HA prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1 protein-coding 207-76 chr3 10477642 10478251 + 0.666667 NA intron (NM_001353564, intron 2 of 20) L1MB3|LINE|L1 27638 NM_001363862 491 Hs.268942 NM_001683 ENSG00000157087 ATP2B2 PMCA2|PMCA2a|PMCA2i ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2 protein-coding 149.667-102 chr13 30799340 30799670 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3701 NR_047012 100874158 Hs.577982 NR_047012 ENSG00000237879 LINC00398 - long intergenic non-protein coding RNA 398 ncRNA 177-33 chr18 13950210 13950682 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -34739 NM_001291911 4158 Hs.248144 NM_000529 ENSG00000185231 MC2R ACTHR melanocortin 2 receptor protein-coding 122-92 chr5 23196629 23196841 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -310874 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 170-92 chr4 124410554 124410914 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 147700 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 124.333-66 chr18 1258428 1258675 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 101078 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 111.667-183 chr4 69844144 69844368 + 0.666667 NA exon (NM_005420, exon 7 of 8) exon (NM_005420, exon 7 of 8) 15889 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 120.667-32 chr11 126595527 126595742 + 0.666667 NA intron (NM_001301097, intron 1 of 15) MIRc|SINE|MIR -57144 NR_120532 101929427 Hs.600341 NR_120532 ENSG00000254607 LOC101929427 - uncharacterized LOC101929427 ncRNA 184.333-139 chr7 53952272 53952745 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140577 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 124.333-117 chr3 68869296 68869519 + 0.666667 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) L1MA4|LINE|L1 63140 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 156.667-24 chr1 156789246 156789561 + 0.666667 NA intron (NM_005973, intron 3 of 6) intron (NM_005973, intron 3 of 6) 21868 NM_005973 5546 Hs.516948 NM_005973 ENSG00000143294 PRCC RCCP1|TPRC proline rich mitotic checkpoint control factor protein-coding 131.333-183 chr8 121589665 121589979 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -49524 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 145-96 chr5 108555534 108555867 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 172561 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 179.667-104 chr4 113851662 113852062 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -89935 NM_172114 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 133-36 chr18 30944015 30944261 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 98604 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 157.667-281 chr6 63528308 63528779 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -43469 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 117-35 chr12 5515552 5515813 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 21550 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 120-129 chr7 46380183 46380460 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 316801 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 142.667-229 chr8 123318203 123318462 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -29702 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 157-74 chr2 209278268 209278584 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -145621 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 149.667-92 chr12 45804737 45805105 + 0.666667 NA intron (NM_152641, intron 3 of 20) L1ME3D|LINE|L1 75212 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 225.333-141 chrX 3241570 3242011 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -30030 NR_038428 100129464 Hs.187816 NR_038428 ENSG00000228459 LINC01546 CXorf28 long intergenic non-protein coding RNA 1546 ncRNA 125.667-102 chr2 125872771 125873059 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 245070 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 111.667-123 chr2 10503912 10504222 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 54339 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 120-96 chr4 80813496 80813688 + 0.666667 NA intron (NM_001206997, intron 4 of 6) intron (NM_001206997, intron 4 of 6) -217116 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 149-12 chr1 191561278 191561661 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -332971 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 201.667-96 chr5 102402365 102402888 + 0.666667 NA intron (NM_173488, intron 9 of 13) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 96375 NM_001289002 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 196.667-134 chr6 100486684 100487182 + 0.666667 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -23258 NM_005068 6492 Hs.520293 NM_005068 ENSG00000112246 SIM1 bHLHe14 SIM bHLH transcription factor 1 protein-coding 127.667-105 chr21 18329706 18330048 + 0.666667 NA intron (NM_002772, intron 14 of 24) L2|LINE|L2 73908 NM_002772 5651 Hs.149473 NM_002772 ENSG00000154646 TMPRSS15 ENTK|PRSS7 transmembrane serine protease 15 protein-coding 153.333-76 chr11 118065983 118066282 + 0.666667 NA intron (NM_001354434, intron 1 of 5) L2c|LINE|L2 -10880 NM_001173551 56649 Hs.161985 NM_019894 ENSG00000137648 TMPRSS4 CAPH2|MT-SP2|TMPRSS3 transmembrane serine protease 4 protein-coding 121.667-152 chr5 4516663 4516989 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -256655 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 154.333-175 chr2 202672792 202673094 + 0.666667 NA intron (NM_173511, intron 1 of 7) AluJr|SINE|Alu 37974 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 221.333-133 chr7 48449987 48450467 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 42 of 61) intron (NM_152701, intron 42 of 61) 278769 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 117-97 chr3 186031301 186031568 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71491 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 114.667-192 chr4 56843661 56843907 + 0.666667 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -21915 NM_021114 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 129.333-165 chr5 175205196 175205433 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -209583 NR_046113 441116 Hs.533036 NM_001004348 ENSG00000204754 LINC01951 - long intergenic non-protein coding RNA 1951 ncRNA 153-91 chr3 17353092 17353404 + 0.666667 NA intron (NM_014744, intron 13 of 21) intron (NM_014744, intron 13 of 21) 346772 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 112.667-236 chr6 142864460 142864668 + 0.666667 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 80612 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 196-195 chr9 35708718 35709060 + 0.666667 NA intron (NM_006289, intron 33 of 56) intron (NM_006289, intron 33 of 56) 1852 NR_106911 102465513 NR_106911 ENSG00000284195 MIR6852 hsa-mir-6852 microRNA 6852 ncRNA 222-98 chr8 102314044 102314552 + 0.666667 NA intron (NM_001282873, intron 15 of 58) intron (NM_001282873, intron 15 of 58) 74847 NR_125415 101927221 Hs.492445 NR_125415 ENSG00000246263 UBR5-AS1 - UBR5 antisense RNA 1 ncRNA 178.667-153 chr7 66850597 66851032 + 0.666667 NA intron (NR_135738, intron 2 of 6) intron (NR_135738, intron 2 of 6) 3364 NR_135738 101929580 Hs.571342 NR_135738 GTF2IP23 - general transcription factor IIi pseudogene 23 pseudo 149-33 chr12 80405144 80405450 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38938 NM_001145026 374462 Hs.539284 NM_001145026 ENSG00000139304 PTPRQ DFNA73|DFNB84|DFNB84A|PTPGMC1|R-PTP-Q protein tyrosine phosphatase receptor type Q protein-coding 198-142 chr4 123939087 123939669 + 0.666667 NA Intergenic MADE2|DNA|TcMar-Mariner 165114 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 143.667-18 chr10 30177968 30178364 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -33686 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 184.667-49 chr2 20852586 20852996 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29661 NM_001282719 60526 Hs.187823 NM_021925 ENSG00000118961 LDAH C2orf43|hLDAH lipid droplet associated hydrolase protein-coding 166-106 chr7 4838834 4839302 + 0.666667 NA intron (NM_018059, intron 2 of 14) intron (NM_018059, intron 2 of 14) -1618 NR_145804 109623455 NR_145804 SNORD165 - small nucleolar RNA, C/D box 165 snoRNA 290.333-21 chr2 64650360 64651040 + 0.666667 NA intron (NM_014755, intron 1 of 1) intron (NM_014755, intron 1 of 1) 3213 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 120.333-96 chr2 61338447 61338682 + 0.666667 NA intron (NM_014709, intron 18 of 79) intron (NM_014709, intron 18 of 79) 78813 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 206.667-51 chr17 69187759 69188246 + 0.666667 NA intron (NM_080282, intron 19 of 39) intron (NM_080282, intron 19 of 39) -46107 NM_080284 23460 Hs.709514 NM_080284 ENSG00000154262 ABCA6 EST155051 ATP binding cassette subfamily A member 6 protein-coding 221-30 chr18 11295136 11295794 + 0.666667 NA Intergenic ERV24B_Prim-int|LTR|ERV1 -146703 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 132.333-93 chr2 182812815 182813086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53687 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 173-93 chr8 40007210 40007605 + 0.666667 NA intron (NM_194294, intron 9 of 10) intron (NM_194294, intron 9 of 10) 72452 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 118.667-163 chr5 159055545 159055754 + 0.666667 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 42307 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 159.667-250 chr5 16723421 16723752 + 0.666667 NA intron (NM_012334, intron 19 of 40) L1MC3|LINE|L1 -106528 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 173-55 chr20 59946240 59946649 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_022106, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_022106, exon 4 of 4) 6055 NM_001190827 63939 Hs.54973 NM_022106 ENSG00000196227 FAM217B C20orf177|dJ551D2.5 family with sequence similarity 217 member B protein-coding 115.333-2 chr1 40466007 40466310 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11132 NM_001320178 339559 Hs.434385 NM_198494 ENSG00000187815 ZFP69 ZFP69A|ZKSCAN23A|ZNF642|ZSCAN54A ZFP69 zinc finger protein protein-coding 255.667-29 chr15 97811289 97811834 + 0.666667 NA intron (NR_024172, intron 1 of 2) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 62868 NR_024172 91948 Hs.130423 NR_024172 ENSG00000251209 LINC00923 - long intergenic non-protein coding RNA 923 ncRNA 184.667-139 chr9 4696963 4697347 + 0.666667 NA exon (NM_017913, exon 4 of 7) exon (NM_017913, exon 4 of 7) 17586 NM_017913 55664 Hs.666439 NM_017913 ENSG00000106993 CDC37L1 CDC37B|HARC cell division cycle 37 like 1 protein-coding 170.667 chr1 4680852 4681273 + 0.666667 NA intron (NM_018836, intron 1 of 5) intron (NM_018836, intron 1 of 5) 26453 NM_001042478 55966 Hs.12473 NM_018836 ENSG00000196581 AJAP1 MOT8|SHREW-1|SHREW1 adherens junctions associated protein 1 protein-coding 207.666-55 chr6 53273743 53274339 + 0.666667 NA intron (NM_001301856, intron 5 of 7) MIR3|SINE|MIR -2952 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 137-2 chr1 16325090 16325457 + 0.666667 NA intron (NM_018994, intron 1 of 9) intron (NM_018994, intron 1 of 9) 27207 NM_018994 54455 Hs.522384 NM_018994 ENSG00000037637 FBXO42 Fbx42|JFK F-box protein 42 protein-coding 150-7 chr1 181519832 181520179 + 0.666667 NA intron (NM_001205293, intron 3 of 47) MIRc|SINE|MIR 36488 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 161-45 chr2 158627164 158627622 + 0.666667 NA intron (NM_001005476, intron 7 of 20) intron (NM_001005476, intron 7 of 20) 107609 NR_135242 100129029 Hs.630724 NR_135242 ENSG00000204380 PKP4-AS1 - PKP4 antisense RNA 1 ncRNA 156-150 chrX 93724356 93724641 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie 50292 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 111.667-11 chr1 64959408 64959586 + 0.666667 NA intron (NM_001321853, intron 2 of 26) intron (NM_001321853, intron 2 of 26) 7052 NM_001321857 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 145.667-263 chr7 7179995 7180285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2475 NM_020156 56913 Hs.239666 NM_020156 ENSG00000106392 C1GALT1 C1GALT|T-synthase core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 protein-coding 113.667-83 chr17 65252744 65252961 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 115482 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 138.333-25 chr10 44197585 44197922 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -94997 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 117-121 chr5 155228335 155228567 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 214696 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 120.333-130 chr3 97299510 97299752 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) intron (NM_001080448, intron 5 of 17) -139976 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 127.333-89 chr20 5729361 5729678 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20868 NM_001303478 149840 Hs.529340 NM_152504 ENSG00000171984 SHLD1 C20orf196|RINN3 shieldin complex subunit 1 protein-coding 143.667-106 chr17 77196187 77196476 + 0.666667 NA intron (NM_001143999, intron 8 of 16) intron (NM_001143999, intron 8 of 16) 11118 NM_001144001 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 156.333-318 chr6 140021413 140021868 + 0.666667 NA intron (NR_121623, intron 1 of 1) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -30379 NR_121624 103352541 Hs.582647 NR_121624 LOC103352541 - uncharacterized LOC103352541 ncRNA 124.667-202 chr8 49950681 49950898 + 0.666667 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) 39382 NR_135796 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 131.333-58 chr16 2809400 2809649 + 0.666667 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -7713 NM_006799 10942 Hs.72026 NM_006799 ENSG00000007038 PRSS21 ESP-1|ESP1|TEST1|TESTISIN serine protease 21 protein-coding 144.333-16 chr1 194166176 194166443 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 861564 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 155-82 chr21 28572404 28572746 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33257 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 145.667-304 chr8 140952669 140952950 + 0.666667 NA intron (NM_001352719, intron 1 of 32) intron (NM_001352719, intron 1 of 32) 48195 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 165-47 chr20 24390185 24390649 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78782 NM_001323606 79953 Hs.124638 NM_024893 ENSG00000101463 SYNDIG1 C20orf39|DSPC2|IFITMD5|TMEM90B synapse differentiation inducing 1 protein-coding 186-21 chr11 77284897 77285319 + 0.666667 NA exon (NM_182833, exon 3 of 17) exon (NM_182833, exon 3 of 17) 16558 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 122.333-8 chr1 113454768 113455062 + 0.666667 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 64400 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 176.333-112 chr3 122346040 122346414 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 20979 NM_005213 1475 Hs.518198 NM_005213 ENSG00000121552 CSTA AREI|PSS4|STF1|STFA cystatin A protein-coding 152.333-213 chr21 26247786 26248110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76820 NM_001136131 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 158-29 chr12 745032 745417 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -7355 NM_018979 65125 Hs.744906 NM_014823 ENSG00000060237 WNK1 HSAN2|HSN2|KDP|PPP1R167|PRKWNK1|PSK|p65 WNK lysine deficient protein kinase 1 protein-coding 141.667-64 chr13 43472343 43472759 + 0.666667 NA intron (NM_001347968, intron 3 of 17) intron (NM_001347968, intron 3 of 17) 23699 NR_120399 100874130 Hs.738887 NR_120399 ENOX1-AS2 - ENOX1 antisense RNA 2 ncRNA 166-91 chr4 90828888 90829234 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 8 of 10) intron (NM_001145065, intron 8 of 10) 594030 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 125.333-33 chr11 12888377 12888647 + 0.666667 NA intron (NM_021961, intron 9 of 12) AluSq2|SINE|Alu 101036 NR_038904 100506305 Hs.153408 NR_038904 ENSG00000251381 LINC00958 BLACAT2 long intergenic non-protein coding RNA 958 ncRNA 123.333-181 chr6 5416358 5416611 + 0.666667 NA intron (NM_006567, intron 3 of 6) L1ME1|LINE|L1 41591 NR_125847 101927972 Hs.668417 NR_125846 ENSG00000269985 LOC101927972 - uncharacterized LOC101927972 ncRNA 142.667-159 chr4 82095682 82095932 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 278184 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 181.333-72 chr2 2643318 2643794 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -312281 NM_015025 23040 Hs.434418 NM_015025 ENSG00000186487 MYT1L MRD39|NZF1|ZC2H2C2|ZC2HC4B|myT1-L myelin transcription factor 1 like protein-coding 167-83 chr5 59739206 59739510 + 0.666667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) AluSz|SINE|Alu 29490 NM_001364601 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 158.333-356 chrX 152121572 152121912 + 0.666667 NA intron (NM_001204811, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 -3803 NM_021049 4104 Hs.18048 NM_021049 MAGEA5 CT1.5|MAGE5|MAGEA4 MAGE family member A5 protein-coding 165-81 chr5 139299144 139299637 + 0.666667 NA intron (NM_001194956, intron 1 of 13) intron (NM_001194956, intron 1 of 13) 5640 NM_001194956 9782 Hs.268939 NM_018834 ENSG00000015479 MATR3 ALS21|MPD2|VCPDM matrin 3 protein-coding 155-65 chr2 58613543 58613878 + 0.666667 NA intron (NR_033873, intron 1 of 13) intron (NR_033873, intron 1 of 13) 92957 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 210-155 chr9 86212838 86213330 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42949 NM_001276368 389766 Hs.632073 NM_001010907 ENSG00000187753 C9orf153 bA507D14.1 chromosome 9 open reading frame 153 protein-coding 235.333-67 chr3 2659726 2660418 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 4 of 24) intron (NM_175607, intron 4 of 24) -232143 NM_001206956 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 117.667-148 chr5 19108406 19108589 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 777775 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 118.333-52 chr12 90251685 90251956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41498 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 144.333-280 chr8 139618201 139618523 + 0.666667 NA exon (NM_001282534, exon 2 of 2) exon (NM_001282534, exon 2 of 2) 84761 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 145.667-175 chr3 46934284 46934669 + 0.666667 NA intron (NM_144716, intron 3 of 7) MIR3|SINE|MIR 42025 NR_102269 151903 Hs.631918 NM_144716 ENSG00000160799 CCDC12 - coiled-coil domain containing 12 protein-coding 114.333-34 chr10 94489998 94490176 + 0.666667 NA intron (NM_015188, intron 3 of 12) AluSq2|SINE|Alu -55680 NM_001289067 3070 Hs.463677 NM_018063 ENSG00000119969 HELLS ICF4|LSH|Nbla10143|PASG|SMARCA6 helicase, lymphoid specific protein-coding 148.667-240 chr3 1521435 1521784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 428585 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 119-134 chr6 162577679 162577993 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) AluJr|SINE|Alu -149296 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 192-28 chr11 13829757 13830303 + 0.666667 NA intron (NR_149108, intron 3 of 3) MER11C|LTR|ERVK 40586 NR_149109 105376561 Hs.512244 NR_149109 ENSG00000254930 LINC02545 - long intergenic non-protein coding RNA 2545 ncRNA 155.667-30 chr1 215034486 215034817 + 0.666667 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) L1ME2|LINE|L1 29109 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 146.667-34 chr10 51964061 51964488 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -264679 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 153.667-77 chr11 113109677 113109957 + 0.666667 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -146357 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 148.667-96 chr12 76994896 76995189 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 70527 NM_203394 144455 Hs.416375 NM_203394 ENSG00000165891 E2F7 - E2F transcription factor 7 protein-coding 167-51 chr19 29497371 29497810 + 0.666667 NA intron (NR_040029, intron 1 of 9) intron (NR_040029, intron 1 of 9) 28162 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 148.333-419 chrX 20663081 20663376 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -396319 NM_004586 6197 Hs.445387 NM_004586 ENSG00000177189 RPS6KA3 CLS|HU-3|ISPK-1|MAPKAPK1B|MRX19|RSK|RSK2|S6K-alpha3|p90-RSK2|pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase A3 protein-coding 151-90 chr4 12558659 12559044 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3d|DNA|TcMar-Tigger 335400 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 138-34 chr14 37021963 37022248 + 0.666667 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) intron (NM_001171170, intron 1 of 10) -69714 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 140-124 chr8 138892008 138892276 + 0.666667 NA intron (NM_152888, intron 1 of 64) L1MC|LINE|L1 21899 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 157-137 chr9 78958521 78958966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 186923 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 177.667-17 chr10 44549444 44549813 + 0.666667 NA Intergenic MER51A|LTR|ERV1 -164531 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 186.667-137 chr7 53408704 53409193 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 373315 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 157-26 chr11 32590336 32590774 + 0.666667 NA intron (NM_006360, intron 5 of 10) intron (NM_006360, intron 5 of 10) 6724 NM_006360 10480 Hs.502244 NM_006360 ENSG00000149100 EIF3M B5|GA17|PCID1|TANGO7|hfl-B5 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M protein-coding 166.667-231 chr8 82329498 82329876 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -487401 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 111.667-157 chr20 39529452 39529743 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -304849 NR_027124 339568 Hs.434319 NR_027124 ENSG00000230324 LINC01734 - long intergenic non-protein coding RNA 1734 ncRNA 144.333-270 chr8 112451747 112452055 + 0.666667 NA intron (NM_052900, intron 31 of 68) intron (NM_052900, intron 31 of 68) -191592 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 177.333-66 chr16 53243267 53243626 + 0.666667 NA intron (NM_001352157, intron 12 of 37) AluSp|SINE|Alu 34995 NM_001352158 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 148.333-297 chr4 173554749 173555047 + 0.666667 NA intron (NR_136195, intron 3 of 4) L1ME4b|LINE|L1 24440 NR_003679 79804 Hs.61435 NR_003679 ENSG00000237125 HAND2-AS1 DEIN|NBLA00301|UPH HAND2 antisense RNA 1 ncRNA 178.333-18 chr10 60027968 60028493 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_020987, exon 44 of 44) 3' UTR (NM_020987, exon 44 of 44) -67317 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 124.333-76 chr19 28665364 28665661 + 0.666667 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) L1MA5|LINE|L1 58824 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 183.333-104 chr3 57109455 57109869 + 0.666667 NA intron (NM_001318864, intron 5 of 13) intron (NM_001318864, intron 5 of 13) -30394 NM_001128615 50650 Hs.476402 NM_019555 ENSG00000163947 ARHGEF3 GEF3|STA3|XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 119.667-84 chr2 98552053 98552319 + 0.666667 NA intron (NM_001134224, intron 14 of 25) intron (NM_001134224, intron 14 of 25) 56326 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 205.667-68 chr2 67515593 67516069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 118498 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 139-72 chr4 46995261 46995658 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1878 NM_001204266 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 112.667-110 chr2 10577789 10578078 + 0.666667 NA intron (NR_048552, intron 18 of 19) intron (NR_048552, intron 18 of 19) 112042 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 125-54 chr2 41714812 41715148 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -162575 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 116-116 chr4 37795626 37795897 + 0.666667 NA Intergenic LTR56|LTR|ERV1 -30925 NM_018290 55276 Hs.23363 NM_018290 ENSG00000169299 PGM2 MSTP006 phosphoglucomutase 2 protein-coding 144.667-220 chr4 101503959 101504232 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 156318 NR_033874 90024 Hs.534513 NR_033874 ENSG00000254531 FLJ20021 - uncharacterized LOC90024 ncRNA 174.333-102 chr4 77910888 77911379 + 0.666667 NA intron (NM_020236, intron 7 of 8) MIRb|SINE|MIR 48303 NM_020236 65008 Hs.532019 NM_020236 ENSG00000169288 MRPL1 BM022|L1MT|MRP-L1 mitochondrial ribosomal protein L1 protein-coding 154.333-5 chr1 73422899 73423187 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 116873 NR_110676 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 259-29 chr2 219081564 219082120 + 0.666667 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) intron (NM_024782, intron 5 of 7) -20921 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 112.667-140 chr2 205213260 205213518 + 0.666667 NA intron (NM_205863, intron 15 of 21) L2c|LINE|L2 -469111 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 125.667-186 chr8 81317483 81317787 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37099 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 154-7 chr1 209814380 209814739 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -8384 NM_001206696 3664 Hs.591415 NM_006147 ENSG00000117595 IRF6 LPS|OFC6|PIT|PPS|PPS1|VWS|VWS1 interferon regulatory factor 6 protein-coding 144.667-69 chr13 44284018 44284290 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87954 NR_107046 102465876 NR_107046 ENSG00000276319 MIR8079 hsa-mir-8079 microRNA 8079 ncRNA 165.667-47 chr14 40981417 40981840 + 0.666667 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 26917 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 142-119 chr5 122077995 122078294 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001317073) promoter-TSS (NM_001317073) 115 NM_002317 4015 Hs.102267 NM_002317 ENSG00000113083 LOX AAT10 lysyl oxidase protein-coding 127-11 chr1 239941926 239942254 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -42218 NR_046582 100873984 Hs.199475 NR_046582 ENSG00000234601 CHRM3-AS1 - CHRM3 antisense RNA 1 ncRNA 121.333-116 chr3 117511617 117511869 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 179182 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 141.333-96 chr18 77355965 77356231 + 0.666667 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL 106250 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 148.333-126 chr14 65483911 65484209 + 0.666667 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) L1MEc|LINE|L1 12958 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 115.333-189 chr6 100141246 100141461 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -147115 NM_032503 84539 Hs.591342 NM_032503 ENSG00000152034 MCHR2 GPR145|GPRv17|MCH-2R|MCH-R2|MCH2|MCH2R|MCHR-2|SLT melanin concentrating hormone receptor 2 protein-coding 117-24 chr10 80737920 80738244 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88285 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 126-64 chr21 22733185 22733495 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -345944 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 164-39 chr15 67479250 67479583 + 0.666667 NA intron (NR_147832, intron 15 of 17) intron (NR_147832, intron 15 of 17) 41557 NR_040055 100506686 Hs.656245 NR_040051 ENSG00000259673 IQCH-AS1 - IQCH antisense RNA 1 ncRNA 125.333-90 chr2 45386930 45387284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132166 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 120-56 chr18 67641554 67641756 + 0.666667 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) L1PA7|LINE|L1 -124935 NM_032160 92126 Hs.124673 NM_032160 ENSG00000171451 DSEL C18orf4|DE-epi2 dermatan sulfate epimerase like protein-coding 142.333-25 chr10 65603564 65603976 + 0.666667 NA intron (NR_120647, intron 2 of 5) intron (NR_120647, intron 2 of 5) 32345 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 208.667-41 chr12 115925001 115925480 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 223414 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 258.667-77 chr5 108469574 108470037 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -87707 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 232.333-79 chr7 3177538 3178075 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -19233 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 260-41 chr2 191341243 191341782 + 0.666667 NA exon (NM_001330238, exon 5 of 30) exon (NM_001330238, exon 5 of 30) 96108 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 142.333-76 chr14 39133754 39134176 + 0.666667 NA intron (NM_003616, intron 9 of 9) AluJr|SINE|Alu 19681 NM_001009182 8487 Hs.652307 NM_003616 ENSG00000092208 GEMIN2 SIP1|SIP1-delta gem nuclear organelle associated protein 2 protein-coding 147.667-199 chr20 6448748 6449053 + 0.666667 NA intron (NR_109953, intron 2 of 3) intron (NR_109953, intron 2 of 3) 22168 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 158.333-64 chr12 43764412 43764752 + 0.666667 NA intron (NM_001351339, intron 2 of 13) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 5638 NM_001351340 51135 Hs.138499 NM_016123 ENSG00000198001 IRAK4 IPD1|IRAK-4|NY-REN-64|REN64 interleukin 1 receptor associated kinase 4 protein-coding 242-40 chr2 56934091 56934795 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -748673 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 139-51 chr2 116715540 116715901 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -1098971 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 149-5 chr1 112791285 112791539 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 59231 NR_103746 100996702 Hs.632431 NR_103746 ENSG00000215866 LINC01356 - long intergenic non-protein coding RNA 1356 ncRNA 133-55 chr20 41262653 41262943 + 0.666667 NA intron (NM_015035, intron 2 of 3) intron (NM_015035, intron 2 of 3) 37322 NM_015035 23051 Hs.380133 NM_015035 ENSG00000174306 ZHX3 TIX1 zinc fingers and homeoboxes 3 protein-coding 120.333-95 chr2 56987257 56987526 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -801621 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 119.333-228 chr8 138528251 138528540 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30665 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 171-71 chr6 76949302 76949693 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -355874 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 145.667-100 chr15 84795691 84796100 + 0.666667 NA intron (NM_014630, intron 5 of 10) intron (NM_014630, intron 5 of 10) -20785 NM_020778 57538 Hs.459183 NM_020778 ENSG00000136383 ALPK3 CMH27|MAK|MIDORI alpha kinase 3 protein-coding 124-107 chr7 26526296 26526662 + 0.666667 NA intron (NR_148500, intron 5 of 5) intron (NR_148500, intron 5 of 5) 12346 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 146.667-241 chr4 138136062 138136386 + 0.666667 NA intron (NR_038380, intron 3 of 6) intron (NR_038380, intron 3 of 6) -5539 NR_037866 641365 Hs.435630 NR_037866 ENSG00000248307 LINC00616 - long intergenic non-protein coding RNA 616 ncRNA 132.333-122 chr4 95389997 95390247 + 0.666667 NA intron (NM_003728, intron 1 of 15) intron (NM_003728, intron 1 of 15) 158851 NM_003728 8633 Hs.388565 NM_003728 ENSG00000182168 UNC5C UNC5H3 unc-5 netrin receptor C protein-coding 217.666-32 chr4 107453065 107453682 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 266861 NM_005443 9061 Hs.368610 NM_005443 ENSG00000138801 PAPSS1 ATPSK1|PAPSS|SK1 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1 protein-coding 191-27 chr19 29537083 29537489 + 0.666667 NA intron (NM_001146339, intron 4 of 4) intron (NM_001146339, intron 4 of 4) 10702 NM_001146339 342865 Hs.451618 NM_001146339 ENSG00000187135 VSTM2B - V-set and transmembrane domain containing 2B protein-coding 160.333-294 chr9 12900980 12901354 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 71466 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 194.333-86 chr3 48913676 48914167 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -4921 NM_001317334 10425 Hs.633601 NM_006321 ENSG00000177479 ARIH2 ARI2|TRIAD1 ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 114.667-57 chr11 108203287 108203481 + 0.666667 NA intron (NM_001321307, intron 1 of 17) MER52-int|LTR|ERV1 19254 NM_002519 4863 Hs.171061 NM_002519 ENSG00000149308 NPAT E14|E14/NPAT|p220 nuclear protein, coactivator of histone transcription protein-coding 150-6 chr1 155813288 155813603 + 0.666667 NA intron (NM_032292, intron 10 of 20) AluJb|SINE|Alu -29613 NR_132767 106633816 NR_132767 SCARNA26B - small Cajal body-specific RNA 26B ncRNA 234.667-22 chr12 16659540 16660059 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -51585 NM_001243609 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 156-23 chr11 14459777 14460108 + 0.666667 NA intron (NM_016451, intron 20 of 21) intron (NM_016451, intron 20 of 21) 39916 NM_016451 1315 Hs.339278 NM_016451 ENSG00000129083 COPB1 COPB coatomer protein complex subunit beta 1 protein-coding 120.667-5 chr1 45123181 45123440 + 0.666667 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) L1MD1|LINE|L1 83295 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 117-69 chr18 7797166 7797514 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 2 of 30) intron (NM_002845, intron 2 of 30) 230024 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 121-112 chr5 56440663 56440864 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 41006 NR_104664 102467147 Hs.650177 NR_104664 ENSG00000248727 LINC01948 - long intergenic non-protein coding RNA 1948 ncRNA 223.667-52 chr3 149615341 149615883 + 0.666667 NA intron (NM_001348362, intron 5 of 9) MIRb|SINE|MIR 42413 NM_015472 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 160.333-170 chr20 58110912 58111218 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39837 NM_178456 128602 Hs.43977 NM_178456 ENSG00000124237 C20orf85 LLC1|bA196N14.1 chromosome 20 open reading frame 85 protein-coding 147-118 chr6 12461883 12462216 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 123355 NR_149140 101928309 Hs.639414 NR_149140 ENSG00000234015 LINC02530 - long intergenic non-protein coding RNA 2530 ncRNA 125.333-12 chr1 154812832 154813059 + 0.666667 NA intron (NM_170782, intron 2 of 7) intron (NM_170782, intron 2 of 7) 46931 NM_170782 3782 Hs.490765 NM_002249 ENSG00000143603 KCNN3 KCa2.3|SK3|SKCA3|hSK3 potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 protein-coding 170.667-181 chrX 74429465 74429863 + 0.666667 NA intron (NM_006517, intron 1 of 5) intron (NM_006517, intron 1 of 5) 8171 NM_006517 6567 Hs.75317 NM_006517 ENSG00000147100 SLC16A2 AHDS|DXS128|DXS128E|MCT 7|MCT 8|MCT7|MCT8|MRX22|XPCT solute carrier family 16 member 2 protein-coding 218.667-56 chr2 142785970 142786462 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -91448 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 238.333-45 chr2 61293029 61293559 + 0.666667 NA intron (NM_014709, intron 33 of 79) intron (NM_014709, intron 33 of 79) 115876 NR_152216 130872 Hs.655602 NM_152392 ENSG00000173209 AHSA2P AHA1|AHSA2|Hch1 activator of HSP90 ATPase homolog 2, pseudogene pseudo 145.333-302 chr8 93960963 93961359 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44214 NM_001161779 54704 Hs.22265 NM_018444 ENSG00000164951 PDP1 PDH|PDP|PDPC|PPM2A|PPM2C pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 protein-coding 243-74 chr8 141063043 141063461 + 0.666667 NA Intergenic Ricksha_b|DNA|MULE-MuDR -61173 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 148-118 chr4 72988360 72988590 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 81241 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 156.667-133 chr17 48074679 48075012 + 0.666667 NA intron (NM_006807, intron 4 of 4) intron (NM_006807, intron 4 of 4) 26341 NM_006807 10951 Hs.77254 NM_006807 ENSG00000108468 CBX1 CBX|HP1-BETA|HP1Hs-beta|HP1Hsbeta|M31|MOD1|p25beta chromobox 1 protein-coding 177.667-71 chr2 98839893 98840316 + 0.666667 NA intron (NM_207362, intron 2 of 9) L1MEg|LINE|L1 -68206 NR_126337 101927070 Hs.469395 NR_126337 LINC02611 - long intergenic non-protein coding RNA 2611 ncRNA 213.666-17 chr15 75185118 75185731 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -16458 NM_015492 56905 Hs.17936 NM_015492 ENSG00000167173 C15orf39 - chromosome 15 open reading frame 39 protein-coding 162.667-138 chr2 121411741 121412072 + 0.666667 NA intron (NM_001207051, intron 22 of 37) intron (NM_001207051, intron 22 of 37) -118974 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 192-44 chr12 61267760 61268145 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 924887 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 132.667-45 chr12 127660988 127661319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5565 NR_134995 105370068 Hs.524845 NR_134995 LOC105370068 - uncharacterized LOC105370068 ncRNA 129.333-20 chr10 75616933 75617315 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) -30385 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 221.667-51 chr3 66491882 66492393 + 0.666667 NA intron (NM_015541, intron 1 of 18) intron (NM_015541, intron 1 of 18) 8284 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 188-80 chr4 48129816 48130270 + 0.666667 NA intron (NM_003328, intron 1 of 14) intron (NM_003328, intron 1 of 14) 4207 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 130.667-200 chr8 123752282 123752592 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL -15044 NM_001003954 312 Hs.181107 NM_004306 ENSG00000104537 ANXA13 ANX13|ISA annexin A13 protein-coding 124.667-22 chr10 26313425 26313696 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96786 NM_001134366 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 127.667-180 chr8 106036860 106037098 + 0.666667 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 23524 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 143-77 chr2 200280802 200281086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24935 NM_015535 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 204.667-53 chr16 53900043 53900511 + 0.666667 NA intron (NM_001363903, intron 7 of 7) intron (NM_001363903, intron 7 of 7) -139116 NR_103838 100505692 Hs.664629 NR_103838 FTO-IT1 - FTO intronic transcript 1 ncRNA 118-10 chr10 44285681 44285917 + 0.666667 NA Intergenic LTR23|LTR|ERV1 -6951 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 169.667-156 chr4 114820792 114821113 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 164193 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 187.333-93 chr2 47330590 47331048 + 0.666667 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu -4496 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 145.333-143 chr2 135871113 135871445 + 0.666667 NA intron (NM_005915, intron 2 of 16) intron (NM_005915, intron 2 of 16) 5164 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 115.333-234 chrX 143686566 143686828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33971 NM_001009615 494119 NM_001009615 ENSG00000268988 SPANXN2 CT11.7|SPANX-N2 SPANX family member N2 protein-coding 261.333-58 chr20 22281079 22281798 + 0.666667 NA intron (NR_110615, intron 3 of 3) L1ME3Cz|LINE|L1 1363 NR_110615 101929663 Hs.143562 NR_110615 ENSG00000225321 LINC01427 - long intergenic non-protein coding RNA 1427 ncRNA 279.333-26 chr13 45677926 45678495 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22974 NR_125786 103752581 NR_125786 LINC01055 - long intergenic non-protein coding RNA 1055 ncRNA 170.333-90 chr17 39772467 39772803 + 0.666667 NA intron (NM_001257413, intron 3 of 3) intron (NM_001257413, intron 3 of 3) 5590 NM_001284516 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 144-91 chr21 14404666 14405008 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21691 NM_006948 6782 Hs.352341 NM_006948 ENSG00000155304 HSPA13 STCH heat shock protein family A (Hsp70) member 13 protein-coding 116.333-5 chr1 42120793 42121058 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32485 NM_007102 2981 Hs.32966 NM_007102 ENSG00000044012 GUCA2B GCAP-II|UGN guanylate cyclase activator 2B protein-coding 159-24 chr11 59192511 59192825 + 0.666667 NA intron (NM_015177, intron 6 of 8) intron (NM_015177, intron 6 of 8) 20259 NM_001039396 219972 Hs.744920 NM_001039396 ENSG00000197629 MPEG1 MPG1|MPS1|Mpg-1|P-2 macrophage expressed 1 protein-coding 116.333-206 chr8 83106777 83107019 + 0.666667 NA Intergenic LTR28|LTR|ERV1 194794 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 137.333-167 chr6 19642592 19642969 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 161979 NR_134649 100506885 Hs.346489 NR_134649 ENSG00000228412 LOC100506885 - uncharacterized LOC100506885 ncRNA 145.667-47 chr11 43704706 43705102 + 0.666667 NA intron (NM_016142, intron 1 of 10) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 24166 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 127.667-122 chr4 30652771 30653016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -67476 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 146-97 chr4 112099614 112099907 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45694 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 149-39 chr13 91387133 91387578 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11266 NM_004466 2262 Hs.655675 NM_004466 ENSG00000179399 GPC5 - glypican 5 protein-coding 144.333-117 chr2 18197538 18197893 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 319048 NM_002252 3790 Hs.414489 NM_002252 ENSG00000170745 KCNS3 KV9.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3 protein-coding 237-75 chr8 112512809 112513272 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 26 of 66) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -130453 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 196.667-125 chr5 123362631 123363076 + 0.666667 NA intron (NM_153223, intron 19 of 20) intron (NM_153223, intron 19 of 20) 60739 NM_001166226 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 120.667-161 chr7 74161443 74161762 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12754 NM_022170 7458 Hs.520943 NM_022170 ENSG00000106682 EIF4H WBSCR1|WSCR1|eIF-4H eukaryotic translation initiation factor 4H protein-coding 179.666 chr1 82691072 82691598 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -211848 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 175-29 chr15 89075128 89075390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13197 NM_152924 11057 Hs.122337 NM_007011 ENSG00000140526 ABHD2 HS1-2|LABH2|PHPS1-2 abhydrolase domain containing 2 protein-coding 113.333-168 chr3 34808187 34808388 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 585736 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 166.333-221 chr8 66933679 66934008 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -8302 NR_152598 641638 Hs.372680 NR_002599 ENSG00000245910 SNHG6 HBII-276HG|NCRNA00058|U87HG small nucleolar RNA host gene 6 ncRNA 229.333-22 chr12 23436438 23436840 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 147947 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 127.667-41 chr14 42862603 42862916 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 1255903 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 201.333-247 chr6 131607424 131607819 + 0.666667 NA intron (NM_015979, intron 13 of 30) intron (NM_015979, intron 13 of 30) 20621 NM_001270521 9439 Hs.29679 NM_004830 ENSG00000112282 MED23 ARC130|CRSP130|CRSP133|CRSP3|DRIP130|MRT18|SUR-2|SUR2 mediator complex subunit 23 protein-coding 161-71 chr4 108195964 108196345 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 24034 NR_029373 641518 Hs.535760 NR_029373 ENSG00000232021 LEF1-AS1 LEF1NAT LEF1 antisense RNA 1 ncRNA 151-52 chr2 8420407 8420778 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -92173 NR_152741 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 124.667-157 chr4 162137805 162138073 + 0.666667 NA intron (NM_001128428, intron 1 of 14) intron (NM_001128428, intron 1 of 14) 26061 NM_020116 56884 Hs.32452 NM_020116 ENSG00000168843 FSTL5 - follistatin like 5 protein-coding 144-118 chr3 168413506 168413791 + 0.666667 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) AluSx|SINE|Alu -138206 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 139.667-49 chr13 94108279 94108526 + 0.666667 NA intron (NM_005708, intron 4 of 8) L1PB1|LINE|L1 79589 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 242-19 chr11 90667227 90667727 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) intron (NR_104190, intron 3 of 6) -111620 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 118-24 chr12 55755529 55755786 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_005811, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_005811, exon 3 of 3) 12535 NM_005811 10220 Hs.600883 NM_005811 ENSG00000135414 GDF11 BMP-11|BMP11 growth differentiation factor 11 protein-coding 237.333-112 chr7 71366707 71367376 + 0.666667 NA intron (NM_022479, intron 2 of 10) intron (NM_022479, intron 2 of 10) -59271 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 185.667-87 chr3 49414861 49415192 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_022171, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_022171, exon 3 of 3) 2820 NM_022171 6988 Hs.517962 NM_022171 ENSG00000145022 TCTA - T cell leukemia translocation altered protein-coding 193.667-11 chr1 114813078 114813501 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -32604 NR_049742 80143 Hs.709277 NM_025073 ENSG00000052723 SIKE1 SIKE suppressor of IKBKE 1 protein-coding 119.667-50 chr14 66138067 66138248 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -348214 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 229-27 chr16 77578117 77578615 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -143332 NM_001326358 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 172-26 chr11 40854741 40855233 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 1 of 4) intron (NM_020929, intron 1 of 4) -561857 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 114.333-152 chr3 161311229 161311476 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 60731 NM_001040100 165679 Hs.369104 NM_145035 ENSG00000196542 SPTSSB ADMP|C3orf57|SSSPTB serine palmitoyltransferase small subunit B protein-coding 156.333-384 chrX 51791146 51791555 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -11726 NM_001005332 9500 Hs.5258 NM_006986 ENSG00000179222 MAGED1 DLXIN-1|NRAGE MAGE family member D1 protein-coding 218-33 chr16 20669609 20670204 + 0.666667 NA exon (NM_052956, exon 5 of 13) exon (NM_052956, exon 5 of 13) 21350 NM_052956 116285 Hs.306812 NM_052956 ENSG00000166743 ACSM1 BUCS1|MACS1 acyl-CoA synthetase medium chain family member 1 protein-coding 156-5 chr1 55752909 55753315 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 191851 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 155.333-407 chr8 143485273 143485588 + 0.666667 NA intron (NM_015117, intron 4 of 11) L1ME3|LINE|L1 20818 NR_145785 109623485 NR_145785 SNORD149 - small nucleolar RNA, C/D box 149 snoRNA 134.333-176 chr8 105646442 105646692 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) HAL1|LINE|L1 327024 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 294.667-23 chr2 158184666 158185270 + 0.666667 NA intron (NM_138803, intron 11 of 13) intron (NM_138803, intron 11 of 13) 18318 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 193.666-3 chr10 11971001 11971574 + 0.666667 NA intron (NM_080599, intron 9 of 21) AluSp|SINE|Alu 71522 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 160.333-65 chr11 106732073 106732380 + 0.666667 NA intron (NM_000855, intron 6 of 7) L1PREC2|LINE|L1 286250 NM_001256424 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 111.667-64 chr12 57480012 57480216 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_032496) promoter-TSS (NM_032496) -248 NM_032496 64333 Hs.437126 NM_032496 ENSG00000123329 ARHGAP9 10C|RGL1 Rho GTPase activating protein 9 protein-coding 198.667-13 chr1 208388704 208389146 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -144541 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 133.333-185 chr8 107990274 107990582 + 0.666667 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) L1PA13|LINE|L1 91511 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 215-63 chr4 118864206 118864796 + 0.666667 NA intron (NM_001286754, intron 1 of 4) L1MA2|LINE|L1 13820 NM_001286754 171024 Hs.655519 NM_133477 ENSG00000172403 SYNPO2 - synaptopodin 2 protein-coding 132.333-152 chr6 68728413 68728800 + 0.666667 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 93324 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 183.333-101 chr21 46270440 46270832 + 0.666667 NA intron (NM_003906, intron 8 of 27) intron (NM_003906, intron 8 of 27) 14975 NM_003906 8888 Hs.389037 NM_003906 ENSG00000160294 MCM3AP GANP|MAP80|PNRIID|SAC3 minichromosome maintenance complex component 3 associated protein protein-coding 130.667-171 chr5 113483051 113483388 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) L1MB7|LINE|L1 5234 NM_001085377 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 123.333-72 chr13 109871388 109871612 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -84917 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 156-146 chr9 37595700 37596108 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3265 NM_001134484 401505 Hs.130774 NM_001001790 ENSG00000175768 TOMM5 C9orf105|Tom5|bA613M10.3 translocase of outer mitochondrial membrane 5 protein-coding 120.667-3 chr1 39888977 39889246 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -5600 NR_132403 54802 Hs.356554 NM_017646 ENSG00000043514 TRIT1 COXPD35|GRO1|IPPT|IPT|IPTase|MOD5|hGRO1 tRNA isopentenyltransferase 1 protein-coding 118.667-72 chr15 24022958 24023167 + 0.666667 NA intron (NR_126392, intron 4 of 5) MER83A-int|LTR|ERV1 47915 NR_126392 105370731 Hs.532639 NR_126392 PWRN4 LINC01084 Prader-Willi region non-protein coding RNA 4 ncRNA 148.333-165 chr18 810422 810710 + 0.666667 NA intron (NM_005433, intron 1 of 11) intron (NM_005433, intron 1 of 11) 1676 NM_005433 7525 Hs.194148 NM_005433 ENSG00000176105 YES1 HsT441|P61-YES|Yes|c-yes YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase protein-coding 157.667-76 chr12 45511478 45511794 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 216285 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 142.333-89 chr15 37671439 37671764 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -263006 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 145.667-249 chr6 69996021 69996292 + 0.666667 NA intron (NM_001858, intron 11 of 50) intron (NM_001858, intron 11 of 50) 129600 NM_001858 1310 Hs.444842 NM_001858 ENSG00000082293 COL19A1 COL9A1L|D6S228E collagen type XIX alpha 1 chain protein-coding 195-92 chr6 69492806 69493126 + 0.666667 NA Intergenic MER4C|LTR|ERV1 303500 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 133-16 chr11 29065704 29066071 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -528526 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 143.667-138 chr2 237726307 237726697 + 0.666667 NA intron (NM_001137550, intron 7 of 23) intron (NM_001137550, intron 7 of 23) 34297 NM_001137552 9208 Hs.471779 NM_004735 ENSG00000124831 LRRFIP1 FLAP-1|FLAP1|FLIIAP1|GCF-2|GCF2|HUFI-1|TRIP LRR binding FLII interacting protein 1 protein-coding 204.333-146 chr4 155997842 155998187 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44148 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 168.333-175 chr6 45430129 45430476 + 0.666667 NA intron (NM_001015051, intron 3 of 7) intron (NM_001015051, intron 3 of 7) 8027 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 113-65 chr15 56526940 56527132 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61899 NM_018365 55329 Hs.444483 NM_018365 ENSG00000138587 MNS1 SPATA40 meiosis specific nuclear structural 1 protein-coding 164.333-67 chr14 50299646 50300126 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_039726) promoter-TSS (NR_039726) 60 NR_039726 100616261 NR_039726 ENSG00000264712 MIR4504 - microRNA 4504 ncRNA 113.667-173 chr5 116668413 116668617 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93692 NM_001300780 57556 Hs.156967 NM_020681 ENSG00000092421 SEMA6A HT018|SEMA|SEMA6A1|SEMAQ|VIA semaphorin 6A protein-coding 198.333-56 chr14 50840902 50841335 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -9997 NM_020921 51199 Hs.310429 NM_016350 ENSG00000100503 NIN SCKL7 ninein protein-coding 119.333-30 chr10 36306968 36307226 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 528795 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 116.667-221 chrX 78032896 78033231 + 0.666667 NA intron (NM_001282224, intron 15 of 21) intron (NM_001282224, intron 15 of 21) -63425 NM_001029891 441531 Hs.632822 NM_001029891 ENSG00000226784 PGAM4 PGAM-B|PGAM1|PGAM3|dJ1000K24.1 phosphoglycerate mutase family member 4 protein-coding 167.667-208 chr8 120086602 120087053 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38275 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 216.667-65 chr21 27044167 27044600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77295 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 113.333-155 chr20 58968095 58968317 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13050 NM_198976 51497 Hs.517148 NM_016397 ENSG00000101158 NELFCD HSPC130|NELF-C|NELF-D|TH1|TH1L negative elongation factor complex member C/D protein-coding 198.333-116 chr21 34590261 34590783 + 0.666667 NA intron (NM_004414, intron 1 of 3) intron (NM_004414, intron 1 of 3) 23321 NM_001285389 1827 Hs.282326 NM_004414 ENSG00000159200 RCAN1 ADAPT78|CSP1|DSC1|DSCR1|MCIP1|RCN1 regulator of calcineurin 1 protein-coding 156-124 chr6 119321074 119321460 + 0.666667 NA intron (NM_005907, intron 2 of 12) intron (NM_005907, intron 2 of 12) 28494 NM_005907 4121 Hs.102788 NM_005907 ENSG00000111885 MAN1A1 HUMM3|HUMM9|MAN9 mannosidase alpha class 1A member 1 protein-coding 116.667-208 chr8 127262712 127262888 + 0.666667 NA intron (NR_117099, intron 1 of 3) AluSg|SINE|Alu 18163 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 113-90 chr18 10791778 10792023 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 13 of 51) intron (NM_022068, intron 13 of 51) -32251 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 114.667-25 chr10 5751442 5751759 + 0.666667 NA intron (NM_017782, intron 15 of 20) L1MC4|LINE|L1 61834 NM_001494 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 141-4 chr1 109332843 109333110 + 0.666667 NA intron (NM_001205228, intron 11 of 19) AluSc|SINE|Alu -25965 NM_001265613 343263 Hs.443402 NM_001010985 ENSG00000221986 MYBPHL - myosin binding protein H like protein-coding 147-58 chr18 21030376 21030790 + 0.666667 NA intron (NM_005406, intron 9 of 32) intron (NM_005406, intron 9 of 32) 81230 NM_005406 6093 Hs.306307 NM_005406 ENSG00000067900 ROCK1 P160ROCK|ROCK-I Rho associated coiled-coil containing protein kinase 1 protein-coding 136.333-11 chr1 199976817 199977075 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50764 NM_003822 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 138-103 chr6 155022026 155022438 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68057 NM_012454 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 202.667-150 chr8 127862125 127862570 + 0.666667 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 66385 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 150-101 chr4 54688439 54688845 + 0.666667 NA intron (NM_000222, intron 1 of 20) intron (NM_000222, intron 1 of 20) 30714 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 151.667-371 chr8 99046483 99046790 + 0.666667 NA intron (NM_017890, intron 3 of 61) L1PB1|LINE|L1 33370 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 225-60 chr8 63880342 63880892 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 111187 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 149-57 chr17 83141400 83141698 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 60403 NM_001363853 284207 Hs.378821 NM_001004431 ENSG00000176845 METRNL - meteorin like, glial cell differentiation regulator protein-coding 191-31 chr2 79289404 79289951 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -129924 NM_138937 5068 Hs.567312 NM_002580 ENSG00000172016 REG3A HIP|HIP/PAP|INGAP|PAP|PAP-H|PAP1|PBCGF|REG-III|REG3 regenerating family member 3 alpha protein-coding 144.667-313 chr8 131410609 131410981 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -369886 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 173.667-182 chr8 125025126 125025496 + 0.666667 NA intron (NM_014846, intron 28 of 28) L1ME4a|LINE|L1 26806 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 152.333-53 chr10 89595535 89595880 + 0.666667 NA intron (NM_148977, intron 3 of 6) AluSx|SINE|Alu -2880 NR_029524 406901 NR_029524 ENSG00000198997 MIR107 MIRN107|miR-107 microRNA 107 ncRNA 194.333-52 chr17 6624579 6625120 + 0.666667 NA exon (NM_014804, exon 4 of 19) exon (NM_014804, exon 4 of 19) 15862 NM_001351225 9851 Hs.28070 NM_014804 ENSG00000198920 KIAA0753 MNR|OFIP KIAA0753 protein-coding 191.667-35 chr12 8024421 8024834 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8089 NM_018416 55810 Hs.120844 NM_018416 ENSG00000065970 FOXJ2 FHX forkhead box J2 protein-coding 183.333-52 chr15 54673818 54674198 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -382739 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 168.667-158 chr4 32611131 32611497 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 260276 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 173.333-23 chr10 25572738 25573116 + 0.666667 NA intron (NM_020752, intron 7 of 10) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -78785 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 128-45 chr2 78704578 78704865 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 159190 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 137.667-118 chr3 30037387 30037734 + 0.666667 NA Intergenic (TTTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -103404 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 151-119 chr6 102504531 102504857 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 1105709 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 251-60 chr5 27005536 27006056 + 0.666667 NA intron (NM_016279, intron 1 of 11) L1PA14|LINE|L1 32790 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 147.333-328 chr9 419554 419885 + 0.666667 NA intron (NM_001193536, intron 29 of 46) intron (NM_001193536, intron 29 of 46) -50572 NM_001256876 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 148.333-353 chr7 7751517 7751868 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) intron (NM_001302350, intron 3 of 4) -33085 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 112-100 chr19 50644406 50644642 + 0.666667 NA Intergenic (TGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -4643 NM_001160329 84258 Hs.515554 NM_032298 ENSG00000213023 SYT3 SytIII synaptotagmin 3 protein-coding 123.667-43 chr12 13363945 13364206 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H2-int|LTR|ERVL-MaLR 12670 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 141.333-202 chr6 2173669 2174013 + 0.666667 NA intron (NM_001500, intron 1 of 10) intron (NM_001500, intron 1 of 10) 2150 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 189.667-40 chr14 40686806 40687314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -267651 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 125.333-43 chr12 9485919 9486163 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25619 NR_153413 408186 NR_153413 OVOS - alpha-2-macroglobulin like 1 pseudogene pseudo 141-47 chr2 138828783 138829059 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48531 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 129.333-144 chr4 167061350 167061714 + 0.666667 NA intron (NM_001204354, intron 2 of 9) intron (NM_001204354, intron 2 of 9) 172894 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 165.667-37 chr12 40316949 40317332 + 0.666667 NA intron (NM_198578, intron 33 of 50) intron (NM_198578, intron 33 of 50) -76254 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 173.333-176 chr6 152278758 152279093 + 0.666667 NA intron (NM_182961, intron 97 of 145) AluJo|SINE|Alu -93547 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 183.667-118 chr5 77764705 77765168 + 0.666667 NA intron (NM_004607, intron 1 of 3) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 11403 NM_001297738 6902 Hs.291212 NM_004607 ENSG00000171530 TBCA - tubulin folding cofactor A protein-coding 141.333-169 chr4 30660585 30660992 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59581 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 239.333-96 chr6 137101979 137102433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57026 NM_014432 53832 Hs.445868 NM_014432 ENSG00000016402 IL20RA CRF2-8|IL-20R-alpha|IL-20R1|IL-20RA interleukin 20 receptor subunit alpha protein-coding 203-72 chr4 59888827 59889300 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 875490 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 114.667-55 chr11 99570570 99570771 + 0.666667 NA intron (NM_175566, intron 1 of 21) L2a|LINE|L2 14525 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 209.667-35 chr12 91031425 91031938 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26673 NM_007035 11081 Hs.125750 NM_007035 ENSG00000139330 KERA CNA2|KTN|SLRR2B keratocan protein-coding 122.667-92 chr2 98185186 98185399 + 0.666667 NA intron (NR_144297, intron 10 of 18) L2a|LINE|L2 35759 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 223-8 chr10 78982548 78982999 + 0.666667 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 84675 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 182-43 chr2 42866186 42866718 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73869 NM_012205 23498 Hs.368805 NM_012205 ENSG00000162882 HAAO 3-HAO|HAO|VCRL1|h3HAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase protein-coding 209-101 chr6 81232321 81232929 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 520056 NM_017633 55603 Hs.10784 NM_017633 ENSG00000112773 TENT5A C6orf37|FAM46A|OI18|XTP11 terminal nucleotidyltransferase 5A protein-coding 121-86 chr21 42124767 42124976 + 0.666667 NA intron (NM_001004416, intron 17 of 22) MIRb|SINE|MIR -16337 NR_027243 150147 Hs.558646 NM_152507 ENSG00000184385 UMODL1-AS1 C21orf128 UMODL1 antisense RNA 1 ncRNA 258.333-56 chr7 2438262 2438750 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_018641, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_018641, exon 2 of 2) 34895 NM_018641 55501 Hs.288853 NM_018641 ENSG00000136213 CHST12 C4S-2|C4ST-2|C4ST2 carbohydrate sulfotransferase 12 protein-coding 135.667-141 chr5 40618031 40618311 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -61744 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 166-40 chr14 46738954 46739313 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -87352 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 199-116 chr8 87517573 87518057 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 356200 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 170.667-134 chr5 73579029 73579419 + 0.666667 NA intron (NM_001284431, intron 10 of 11) intron (NM_001284431, intron 10 of 11) 13481 NM_032175 84135 Hs.406703 NM_032175 ENSG00000164338 UTP15 NET21 UTP15 small subunit processome component protein-coding 172.333-53 chr14 67973035 67973439 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 149645 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 169.333-160 chr3 68865258 68865616 + 0.666667 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 67110 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 170-17 chr11 93591736 93592050 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48502 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 169-5 chr1 186179936 186180431 + 0.666667 NA intron (NM_031935, intron 104 of 106) intron (NM_031935, intron 104 of 106) -116090 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 131.667-104 chr2 179136274 179136595 + 0.666667 NA intron (NM_178123, intron 9 of 17) intron (NM_178123, intron 9 of 17) -86297 NM_173648 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 135-11 chr11 11978580 11978935 + 0.666667 NA intron (NM_015881, intron 4 of 7) MIR|SINE|MIR 29882 NM_001018057 27122 Hs.292156 NM_013253 ENSG00000050165 DKK3 REIC|RIG dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 protein-coding 183.333-77 chr19 6976053 6976365 + 0.666667 NA intron (NR_024075, intron 7 of 15) L2a|LINE|L2 14637 NR_024075 326342 Hs.688043 NM_001080498 ENSG00000268758 ADGRE4P EMR4|EMR4P|FIRE|GPR127|PGR16 adhesion G protein-coupled receptor E4, pseudogene pseudo 139-35 chr14 70632166 70632550 + 0.666667 NA intron (NR_110071, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 8940 NR_110071 101928075 Hs.737532 NR_110071 ENSG00000245466 LOC101928075 - uncharacterized LOC101928075 ncRNA 215-81 chr8 105702561 105703018 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 5 of 7) intron (NM_001362837, intron 5 of 7) 357714 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 134.667-208 chr9 82993633 82993972 + 0.666667 NA intron (NM_152573, intron 14 of 16) MIR3|SINE|MIR 69340 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 192.333-68 chr17 29426254 29426776 + 0.666667 NA intron (NM_025142, intron 1 of 17) intron (NM_025142, intron 1 of 17) 35590 NM_020791 57551 Hs.597434 NM_020791 ENSG00000160551 TAOK1 KFC-B|MAP3K16|MARKK|PSK-2|PSK2|TAO1|hKFC-B|hTAOK1 TAO kinase 1 protein-coding 118-79 chr20 37215042 37215284 + 0.666667 NA intron (NM_001135771, intron 8 of 16) L1MC4a|LINE|L1 -35615 NM_213632 140699 Hs.349125 NM_152503 ENSG00000101353 MROH8 C20orf131|C20orf132 maestro heat like repeat family member 8 protein-coding 149.667-43 chr1 235765973 235766341 + 0.666667 NA exon (NM_001301365, exon 21 of 53) exon (NM_001301365, exon 21 of 53) 86903 NR_031718 100302139 NR_031718 ENSG00000222831 MIR1537 MIRN1537|hsa-mir-1537|mir-1537 microRNA 1537 ncRNA 142.667-153 chr4 42518913 42519241 + 0.666667 NA intron (NM_001105529, intron 21 of 35) intron (NM_001105529, intron 21 of 35) 121589 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 160.667-100 chr15 26070173 26070502 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45476 NR_038851 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 150.333-323 chr5 44743042 44743350 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 65597 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 145-37 chr15 96877408 96877700 + 0.666667 NA Intergenic LTR7|LTR|ERV1 94119 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 166.333-139 chr22 24828028 24828371 + 0.666667 NA intron (NM_001098498, intron 2 of 23) intron (NM_001098498, intron 2 of 23) 21978 NM_133454 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 151-23 chr12 13032053 13032456 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -12127 NM_020853 57613 Hs.132660 NM_020853 ENSG00000084444 FAM234B KIAA1467 family with sequence similarity 234 member B protein-coding 204.333-182 chr7 729515 729976 + 0.666667 NA exon (NM_017802, exon 2 of 13) exon (NM_017802, exon 2 of 13) -2069 NM_001164759 5575 Hs.520851 NM_002735 ENSG00000188191 PRKAR1B PRKAR1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta protein-coding 124.667-80 chr16 73333106 73333379 + 0.666667 NA Intergenic (TAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -53563 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 181-28 chr15 48830541 48830932 + 0.666667 NA intron (NM_203349, intron 11 of 11) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -19667 NM_001194998 22995 Hs.443005 NM_014985 ENSG00000103995 CEP152 MCPH4|MCPH9|SCKL5 centrosomal protein 152 protein-coding 158 chr1 67962677 67962991 + 0.666667 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) intron (NR_040077, intron 1 of 9) 88797 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 152.333-81 chr12 30267239 30267546 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 409852 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 136-109 chr9 12102265 12102669 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -590918 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 191.333-28 chr10 76471818 76472225 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1MB8|LINE|L1 -416023 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 166-9 chr1 115119607 115120044 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -30322 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 173-77 chr5 86426712 86427156 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 144490 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 157.333-216 chr20 50776710 50777009 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -18035 NM_198799 55653 Hs.381178 NM_017843 ENSG00000124243 BCAS4 CNOL breast carcinoma amplified sequence 4 protein-coding 160.667-35 chr10 55819420 55819767 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -191651 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 185.667-85 chr22 25493996 25494414 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38559 NR_106875 102466198 NR_106875 ENSG00000277872 MIR6817 hsa-mir-6817 microRNA 6817 ncRNA 284.333-36 chr4 98694034 98694623 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 35426 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 261.333-4 chr1 68079799 68080411 + 0.666667 NA intron (NR_040077, intron 3 of 9) MER6C|DNA|TcMar-Tigger -28474 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 126-27 chr13 54383461 54383830 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71597 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 176.667-128 chr6 64966868 64967259 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 14 of 43) intron (NM_001292009, intron 14 of 43) -334355 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 145.333-57 chr11 104249993 104250280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85989 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 200.666-109 chr7 5663182 5663767 + 0.666667 NA intron (NR_046834, intron 2 of 2) AluY|SINE|Alu 16987 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 120-12 chr10 35080095 35080430 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_037405) promoter-TSS (NR_037405) -582 NR_037405 100500890 NR_037405 ENSG00000266228 MIR3611 - microRNA 3611 ncRNA 195.333-116 chr2 106796537 106796946 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 89287 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 141.667-76 chr14 66967243 66967589 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) L2a|LINE|L2 -222024 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 120.667-123 chr4 19637413 19637644 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -614377 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 153-77 chr2 151394156 151394463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14938 NR_110248 101929319 Hs.639241 NR_110248 LOC101929319 - uncharacterized LOC101929319 ncRNA 164.333-215 chr6 134996305 134996633 + 0.666667 NA intron (NM_006620, intron 7 of 17) intron (NM_006620, intron 7 of 17) -17037 NR_037435 100500880 NR_037435 ENSG00000283409 MIR3662 mir-3662 microRNA 3662 ncRNA 289.333-13 chr11 126018219 126018788 + 0.666667 NA intron (NM_016952, intron 4 of 19) intron (NM_016952, intron 4 of 19) 44789 NM_016952 50937 Hs.38034 NM_016952 ENSG00000064309 CDON CDO|CDON1|HPE11|ORCAM cell adhesion associated, oncogene regulated protein-coding 147-7 chr1 176828189 176828546 + 0.666667 NA intron (NM_020318, intron 21 of 22) intron (NM_020318, intron 21 of 22) 201078 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 145.333-89 chr14 72409086 72409364 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) MER57E1|LTR|ERV1 -107595 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 235-31 chr2 46300573 46301004 + 0.666667 NA intron (NM_001430, intron 1 of 15) intron (NM_001430, intron 1 of 15) 3381 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 112.667-253 chr7 93979081 93979406 + 0.666667 NA intron (NR_133909, intron 3 of 4) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 25112 NM_005868 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 188.667-3 chr1 63000404 63000826 + 0.666667 NA non-coding (NR_146607, exon 2 of 2) non-coding (NR_146607, exon 2 of 2) 10310 NR_146607 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 177-26 chr14 75967799 75968119 + 0.666667 NA intron (NM_001329938, intron 3 of 4) intron (NM_001329938, intron 3 of 4) 14036 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 162.667-185 chr3 185878335 185878766 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -53508 NM_006548 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 147.333-254 chr5 22805157 22805473 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 48029 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 151.667-144 chr17 59711880 59712308 + 0.666667 NA intron (NM_001329394, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 4440 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 135.333-105 chr22 20880461 20880715 + 0.666667 NA intron (NM_004782, intron 2 of 4) intron (NM_004782, intron 2 of 4) 21581 NM_004782 9342 Hs.108002 NM_004782 ENSG00000099940 SNAP29 CEDNIK|SNAP-29 synaptosome associated protein 29 protein-coding 208.667-145 chr8 101702492 101702888 + 0.666667 NA intron (NM_001040624, intron 6 of 7) intron (NM_001040624, intron 6 of 7) 88279 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 131.333-22 chr10 18833020 18833273 + 0.666667 NA Intergenic (TTTAAGAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 173715 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 186.333-157 chr8 18810108 18810524 + 0.666667 NA intron (NM_015310, intron 4 of 15) intron (NM_015310, intron 4 of 15) -1449 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 157.333-26 chr1 166238729 166239137 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -72178 NR_135199 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 140-97 chr6 91239664 91240000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -281828 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 114.667-249 chr8 129231996 129232299 + 0.666667 NA intron (NR_033916, intron 1 of 2) L1ME3|LINE|L1 9093 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 155.667-18 chr1 116117930 116118319 + 0.666667 NA intron (NM_152367, intron 2 of 6) AluSc|SINE|Alu 6369 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 180.667-72 chr2 173069638 173070111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5972 NM_133646 51776 Hs.444451 NM_016653 ENSG00000091436 MAP3K20 AZK|CNM6|MLK7|MLT|MLTK|MLTKalpha|MLTKbeta|MRK|SFMMP|ZAK|mlklak|pk mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20 protein-coding 129.667-39 chr12 41778528 41778867 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 14508 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 150-157 chr9 69246849 69247154 + 0.666667 NA intron (NM_001369873, intron 18 of 20) intron (NM_001369873, intron 18 of 20) 41846 NM_001369875 9414 Hs.50382 NM_004817 ENSG00000119139 TJP2 C9DUPq21.11|DFNA51|DUP9q21.11|PFIC4|X104|ZO2 tight junction protein 2 protein-coding 156.667-58 chr11 30410179 30410626 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001584, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001584, exon 6 of 6) 87298 NM_152316 120534 Hs.502208 NM_152316 ENSG00000152219 ARL14EP ARF7EP|C11orf46|dJ299F11.1 ADP ribosylation factor like GTPase 14 effector protein protein-coding 157.667-158 chr2 201068874 201069256 + 0.666667 NA intron (NM_001321626, intron 1 of 12) intron (NM_001321626, intron 1 of 12) 2606 NM_001321618 285172 Hs.24701 NM_173822 ENSG00000155744 FAM126B HYCC2 family with sequence similarity 126 member B protein-coding 164-51 chr19 42467743 42468170 + 0.666667 NA intron (NR_073179, intron 1 of 1) AluSg4|SINE|Alu -25010 NR_133910 284340 Hs.445586 NM_198477 ENSG00000189377 CXCL17 DMC|Dcip1|UNQ473|VCC-1|VCC1 C-X-C motif chemokine ligand 17 protein-coding 141.667-111 chr2 26309139 26309546 + 0.666667 NA TTS (NM_001145168) TTS (NM_001145168) 9707 NM_001145168 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 118.333-64 chr14 52741811 52742049 + 0.666667 NA intron (NM_001130701, intron 2 of 11) L1MEd|LINE|L1 11764 NM_145251 6815 Hs.364980 NM_145251 ENSG00000198252 STYX - serine/threonine/tyrosine interacting protein protein-coding 156.667-361 chr9 107268731 107269138 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -14345 NM_002874 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 204.333-14 chr1 180986767 180987251 + 0.666667 NA intron (NM_005819, intron 6 of 7) L2a|LINE|L2 -32122 NR_145481 103344928 Hs.665319 NR_145481 ENSG00000232586 KIAA1614-AS1 - KIAA1614 antisense RNA 1 ncRNA 132.667-191 chr9 91432480 91432875 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8051 NM_001290000 4783 Hs.79334 NM_005384 ENSG00000165030 NFIL3 E4BP4|IL3BP1|NF-IL3A|NFIL3A nuclear factor, interleukin 3 regulated protein-coding 112.333-42 chr11 91644194 91644435 + 0.666667 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -580720 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 173-36 chr18 2132445 2132927 + 0.666667 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 438819 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 148.333-410 chr9 37309324 37309657 + 0.666667 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) L2|LINE|L2 -113206 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 137-27 chr14 48475219 48475480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -680335 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 127.333-51 chr14 71354236 71354587 + 0.666667 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) AluSx1|SINE|Alu 33935 NM_001354289 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 153.333-180 chr19 53676002 53676311 + 0.666667 NA TTS (NR_030183) TTS (NR_030183) 445 NR_030183 574461 NR_030183 ENSG00000207599 MIR520E MIRN520E microRNA 520e ncRNA 117.333-32 chr11 8313554 8313752 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44866 NM_001270428 4004 Hs.654426 NM_002315 ENSG00000166407 LMO1 RBTN1|RHOM1|TTG1 LIM domain only 1 protein-coding 233.667-4 chr1 167920433 167920956 + 0.666667 NA intron (NM_001143674, intron 3 of 5) intron (NM_001143674, intron 3 of 5) -6560 NM_018417 55811 Hs.320892 NM_018417 ENSG00000143199 ADCY10 HCA2|HEL-S-7a|SAC|SACI|Sacy|hsAC adenylate cyclase 10 protein-coding 238.667-21 chr13 84012743 84013342 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -127560 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 127-8 chr1 162518562 162518845 + 0.666667 NA intron (NM_175866, intron 7 of 7) intron (NM_175866, intron 7 of 7) 20885 NM_175866 127933 Hs.127310 NM_144624 ENSG00000152332 UHMK1 KIS|KIST|P-CIP2 U2AF homology motif kinase 1 protein-coding 144.333-26 chr10 74701112 74701425 + 0.666667 NA intron (NM_001369124, intron 9 of 9) L1MC4a|LINE|L1 -123987 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 136.333-153 chr4 126574620 126574877 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1058209 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 114.667-111 chr18 7518338 7518629 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48833 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 234.667-68 chr3 66801944 66802488 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -63880 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 169.667-104 chr2 46656933 46657252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 39877 NM_014171 9419 Hs.133998 NM_014171 ENSG00000119878 CRIPT HSPC139|SSMDF CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain protein-coding 166-85 chr4 53742636 53742991 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 46912 NR_125918 100506444 Hs.636176 NR_125918 ENSG00000249341 LOC100506444 - uncharacterized LOC100506444 ncRNA 121.333-11 chr1 181450950 181451162 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -32461 NM_001205293 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 118-117 chr7 2464508 2464780 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 11739 NM_001291784 402635 NM_001291784 GRIFIN - galectin-related inter-fiber protein protein-coding 163-22 chr14 73782416 73782757 + 0.666667 NA intron (NM_001043318, intron 1 of 11) AluJo|SINE|Alu 4622 NM_001043318 91748 Hs.594157 NM_194278 ENSG00000156030 ELMSAN1 C14orf117|C14orf43|LSR68|MIDEAS|c14_5541 ELM2 and Myb/SANT domain containing 1 protein-coding 126.333-82 chr2 27029306 27029573 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -3526 NM_017727 54867 Hs.533934 NM_017727 ENSG00000119777 TMEM214 - transmembrane protein 214 protein-coding 133.667-87 chr20 58879729 58880022 + 0.666667 NA intron (NR_126334, intron 3 of 4) intron (NR_126334, intron 3 of 4) -8538 NR_132273 2778 Hs.125898 NM_000516 ENSG00000087460 GNAS AHO|C20orf45|GNAS1|GPSA|GSA|GSP|NESP|PITA3|POH|SCG6|SgVI GNAS complex locus protein-coding 139.333-178 chr5 27525977 27526365 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53879 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 150-18 chr10 98242795 98243122 + 0.666667 NA intron (NM_001256620, intron 8 of 8) intron (NM_001256620, intron 8 of 8) 25236 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 126.667-58 chr15 67742480 67742784 + 0.666667 NA intron (NM_001206804, intron 17 of 21) intron (NM_001206804, intron 17 of 21) -82877 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 176.333-92 chr2 140732517 140732893 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 35 of 90) intron (NM_018557, intron 35 of 90) -146020 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 142.667-44 chr13 46013651 46014011 + 0.666667 NA intron (NM_001330566, intron 6 of 19) intron (NM_001330566, intron 6 of 19) 38915 NM_001076788 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 116.333-158 chr4 79933383 79933616 + 0.666667 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 106028 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 153.333-127 chr14 72780165 72780469 + 0.666667 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 112332 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 113.667-89 chr19 39291020 39291308 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5243 NM_172140 282618 Hs.406745 NM_172140 ENSG00000182393 IFNL1 IL-29|IL29 interferon lambda 1 protein-coding 141-56 chr3 164685831 164686246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145442 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 141-42 chr2 50845265 50845676 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) L2a|LINE|L2 -149208 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 112.333-182 chr4 59536547 59536795 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 523098 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 174.333-100 chr4 32208099 32208474 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142752 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 146.667-62 chr11 109094791 109095032 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -327279 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 159.667-166 chr2 45515432 45515746 + 0.666667 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) MIRb|SINE|MIR 95678 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 163.333-13 chr1 98545560 98545903 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X -115990 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 180.667-5 chr1 114220323 114220698 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -66641 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 121.333-89 chr2 103260938 103261121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -276600 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 178-37 chr12 41899127 41899504 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 135126 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 113.333-223 chr6 19571234 19571418 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121505 NR_134615 105374960 Hs.519913 NR_134615 LOC105374960 - uncharacterized LOC105374960 ncRNA 158.333-136 chr2 21766485 21766801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55991 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 134-64 chr3 17009934 17010327 + 0.666667 NA exon (NM_001144382, exon 2 of 6).2 exon (NM_001144382, exon 2 of 6).2 76934 NR_037465 100500913 NR_037465 ENSG00000283885 MIR3714 - microRNA 3714 ncRNA 141.667-82 chr15 57598601 57598878 + 0.666667 NA intron (NM_001018100, intron 1 of 12) intron (NM_001018100, intron 1 of 12) 6835 NM_001018090 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 164.333-134 chr2 203291749 203292163 + 0.666667 NA intron (NM_177538, intron 10 of 12) L1PA4|LINE|L1 -36283 NM_001282932 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 121-50 chr15 81520163 81520367 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -146052 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 156-107 chr4 143261488 143261810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75227 NM_207123 2549 Hs.80720 NM_002039 ENSG00000109458 GAB1 DFNB26 GRB2 associated binding protein 1 protein-coding 137.667-185 chr8 76185147 76185465 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -221348 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 113-31 chr11 132229569 132229817 + 0.666667 NA intron (NM_016522, intron 3 of 6) intron (NM_016522, intron 3 of 6) -54609 NR_046820 100874281 NR_046820 NTM-IT NTM-IT3 NTM intronic transcript ncRNA 140-49 chr16 78232244 78232557 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) Tigger20a|DNA|TcMar-Tigger 132746 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 141.667-106 chr19 45322725 45323002 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001824) promoter-TSS (NM_001824) 12 NM_001824 1158 Hs.334347 NM_001824 ENSG00000104879 CKM CKMM|CPK-M|M-CK creatine kinase, M-type protein-coding 121.667-157 chr5 22516465 22516762 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) AluJb|SINE|Alu -302763 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 153-46 chr14 52378263 52378571 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 64105 NM_000956 5732 Hs.2090 NM_000956 ENSG00000125384 PTGER2 EP2 prostaglandin E receptor 2 protein-coding 156-92 chr3 129996497 129996925 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21991 NM_007117 7200 Hs.182231 NM_007117 ENSG00000170893 TRH Pro-TRH|TRF thyrotropin releasing hormone protein-coding 208.667-142 chr8 78923054 78923597 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 85796 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 166.333-162 chr3 185092203 185092629 + 0.666667 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) intron (NM_001025266, intron 1 of 1) 60644 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 115.333-25 chr10 60936030 60936319 + 0.666667 NA intron (NM_001350908, intron 2 of 11) MER63C|DNA|hAT-Blackjack 8011 NM_001350910 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 166-54 chr17 67071732 67072046 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014877, exon 33 of 33) 3' UTR (NM_014877, exon 33 of 33) 27335 NM_000727 786 Hs.147989 NM_000727 ENSG00000108878 CACNG1 CACNLG calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 protein-coding 115.333-149 chr4 4742030 4742326 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19582 NR_125892 101928279 Hs.586152 NR_125892 LOC101928279 - uncharacterized LOC101928279 ncRNA 183.667-147 chr9 7779986 7780487 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 19542 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 131.333-44 chr12 41206259 41206540 + 0.666667 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) L1ME3A|LINE|L1 18079 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 116-64 chr18 4523672 4523967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68512 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 146.333-230 chr4 62904284 62904712 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -742733 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 148.667-290 chr4 99350123 99350455 + 0.666667 NA intron (NR_133005, intron 1 of 8) L1PB2|LINE|L1 2457 NR_133005 126 Hs.654537 NM_000669 ENSG00000248144 ADH1C ADH3 alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide protein-coding 132-125 chr9 103635292 103635681 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -310453 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 187.333-75 chr15 75826326 75826640 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -16964 NM_001284382 92912 Hs.23033 NM_173469 ENSG00000140367 UBE2Q2 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 protein-coding 114.667-32 chr10 53875131 53875335 + 0.666667 NA intron (NM_001354411, intron 27 of 34) L1MEg|LINE|L1 -610997 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 152.333-315 chr5 134223947 134224398 + 0.666667 NA intron (NM_002715, intron 1 of 6) intron (NM_002715, intron 1 of 6) 1382 NM_001355019 5515 Hs.105818 NM_002715 ENSG00000113575 PPP2CA NEDLBA|PP2Ac|PP2CA|PP2Calpha|RP-C protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha protein-coding 144-12 chr10 24425227 24425633 + 0.666667 NA intron (NM_019590, intron 3 of 20) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -23984 NM_001282769 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 149.667-226 chr2 208702174 208702594 + 0.666667 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 159742 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 143.333-147 chr2 162761114 162761392 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) -7683 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 228.333-28 chr14 54233545 54233994 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -163099 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 160.333-229 chr5 30257629 30257974 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 377241 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 122.667-177 chr7 77501255 77501456 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35940 NM_002835 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 157.333-261 chr4 75596194 75596592 + 0.666667 NA intron (NM_003948, intron 9 of 11) intron (NM_003948, intron 9 of 11) 34135 NM_001330724 8999 Hs.591698 NM_003948 ENSG00000138769 CDKL2 KKIAMRE|P56 cyclin dependent kinase like 2 protein-coding 130.333-39 chr10 114449060 114449306 + 0.666667 NA intron (NM_001322891, intron 8 of 15) intron (NM_001322891, intron 8 of 15) -44405 NM_001351074 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 151-8 chr1 208296835 208297162 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -52614 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 139.333-10 chr1 150889794 150890157 + 0.666667 NA intron (NR_148929, intron 1 of 1) L2|LINE|L2 2722 NR_148929 100996521 Hs.208452 NR_148929 CTXND2 - cortexin domain containing 2 ncRNA 139.333-150 chr3 81220318 81220729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 226655 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 171-30 chr18 46599201 46599522 + 0.666667 NA intron (NM_144612, intron 8 of 39) L1ME3E|LINE|L1 -40049 NM_001145472 125336 Hs.345877 NM_144612 ENSG00000167210 LOXHD1 DFNB77|LH2D1 lipoxygenase homology domains 1 protein-coding 192-18 chr10 23896574 23896999 + 0.666667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 202059 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 155-133 chr9 86863096 86863421 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 84248 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 141-37 chr18 34129101 34129413 + 0.666667 NA intron (NM_001353237, intron 2 of 10) intron (NM_001353237, intron 2 of 10) -80645 NM_001353236 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 151-89 chr3 181883104 181883401 + 0.666667 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -69112 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 112-164 chr5 28690241 28690451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -236524 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 153.667-337 chr6 62217086 62217410 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 1 of 13) intron (NR_146874, intron 1 of 13) 68977 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 149.667-56 chr10 65617906 65618201 + 0.666667 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) L1PA3|LINE|L1 46628 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 218.667-6 chr1 153276173 153276665 + 0.666667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 16732 NM_000427 4014 Hs.251680 NM_000427 ENSG00000203782 LOR - loricrin protein-coding 167.333-220 chr5 164454202 164454684 + 0.666667 NA intron (NR_105064, intron 2 of 3) intron (NR_105064, intron 2 of 3) 12959 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 130.333-141 chr3 170884835 170885157 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -14801 NR_135259 200916 Hs.380933 NM_001099645 ENSG00000163584 RPL22L1 - ribosomal protein L22 like 1 protein-coding 168.333 chr1 38838942 38839366 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001271851, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001271851, exon 7 of 7) 20618 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 137.667-43 chr12 33528106 33528501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88484 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 113.667-117 chr2 185228579 185228762 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61598 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 146.667-316 chr7 92401421 92401716 + 0.666667 NA TTS (NM_019004) TTS (NM_019004) 35746 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 116-131 chr5 145831550 145831850 + 0.666667 NA intron (NM_138492, intron 1 of 7) intron (NM_138492, intron 1 of 7) 3642 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 151-32 chr13 92766385 92766824 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) intron (NM_004466, intron 7 of 7) -44990 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 111.667-159 chr21 14182074 14182273 + 0.666667 NA intron (NM_198996, intron 3 of 9) intron (NM_198996, intron 3 of 9) 24776 NM_198996 149998 Hs.139907 NM_145317 ENSG00000188992 LIPI CT17|LPDL|PLA1C|PRED5|mPA-PLA1 beta lipase I protein-coding 112.333-139 chr2 178156536 178156736 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -37845 NM_001201482 114880 Hs.318775 NM_032523 ENSG00000079156 OSBPL6 ORP6 oxysterol binding protein like 6 protein-coding 177-20 chr13 101053599 101053969 + 0.666667 NA TTS (NM_052867) TTS (NM_052867) -109420 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 112.333-120 chr2 42546633 42546958 + 0.666667 NA intron (NM_001282755, intron 2 of 17) intron (NM_001282755, intron 2 of 17) -21250 NM_001282756 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 182.667-101 chr3 119448600 119448990 + 0.666667 NA intron (NM_018266, intron 4 of 8) MIRb|SINE|MIR 14820 NM_018266 55254 Hs.594171 NM_018266 ENSG00000176142 TMEM39A - transmembrane protein 39A protein-coding 192.667-167 chr7 113195452 113195864 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -77076 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 122.333-32 chr11 47583326 47583565 + 0.666667 NA intron (NM_004551, intron 6 of 6) intron (NM_004551, intron 6 of 6) -3206 NM_001367967 399888 Hs.502529 NM_001164379 ENSG00000196666 FAM180B - family with sequence similarity 180 member B protein-coding 131.333-19 chr10 7764085 7764382 + 0.666667 NA intron (NM_012311, intron 9 of 12) intron (NM_012311, intron 9 of 12) 23760 NR_045609 22944 Hs.397918 NM_012311 ENSG00000151657 KIN BTCD|KIN17|Rts2 Kin17 DNA and RNA binding protein protein-coding 144.667-44 chr11 71365695 71365964 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57525 NR_038862 399923 Hs.128191 NM_001001680 ENSG00000172900 FLJ42102 - uncharacterized LOC399923 ncRNA 203-31 chr14 67672328 67672712 + 0.666667 NA intron (NM_006370, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 2112 NM_006370 10490 Hs.741177 NM_006370 ENSG00000100568 VTI1B VTI1|VTI1-LIKE|VTI1L|VTI2|v-SNARE|vti1-rp1 vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B protein-coding 136-111 chr9 23335821 23336058 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 336460 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 152.667-271 chr4 42706302 42706648 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49370 NM_001105529 10396 Hs.435052 NM_006095 ENSG00000124406 ATP8A1 ATPASEII|ATPIA|ATPP2 ATPase phospholipid transporting 8A1 protein-coding 177.333-30 chr11 132008041 132008388 + 0.666667 NA intron (NR_147849, intron 2 of 6) intron (NR_147849, intron 2 of 6) 97396 NR_147854 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 147.667-305 chr6 28037484 28037768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35690 NM_001355425 442179 NM_001355425 OR1F12 OR1F12P|OR1F12Q|OR6-12|hs6M1-35P olfactory receptor family 1 subfamily F member 12 protein-coding 176.667-156 chr9 37237020 37237287 + 0.666667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) intron (NM_001289120, intron 2 of 8) 116555 NM_001289120 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 172-72 chr3 107750822 107751184 + 0.666667 NA intron (NM_001276286, intron 9 of 16) MER5A|DNA|hAT-Charlie 127065 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 121.667-193 chr7 76226039 76226378 + 0.666667 NA intron (NM_001110199, intron 1 of 14) intron (NM_001110199, intron 1 of 14) 24312 NM_001291831 222183 Hs.511025 NM_001039212 ENSG00000177679 SRRM3 - serine/arginine repetitive matrix 3 protein-coding 125.333-112 chr3 65815206 65815514 + 0.666667 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) intron (NM_001365904, intron 1 of 24) -78456 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 129-81 chr3 18119223 18119508 + 0.666667 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) intron (NR_161333, intron 4 of 4) 156813 NR_161333 339862 Hs.652981 NR_046199 LOC339862 - uncharacterized LOC339862 ncRNA 112.333-7 chr1 99878525 99878785 + 0.666667 NA intron (NM_000028, intron 12 of 33) intron (NM_000028, intron 12 of 33) 27680 NM_000646 178 Hs.904 NM_000028 ENSG00000162688 AGL GDE amylo-alpha-1, 6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase protein-coding 118-40 chr14 69382827 69383027 + 0.666667 NA intron (NM_004450, intron 3 of 3) intron (NM_004450, intron 3 of 3) 15372 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 167.333-75 chr14 43196939 43197240 + 0.666667 NA Intergenic Cheshire|DNA|hAT-Charlie 1310194 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 148.333 chr1 12386057 12386351 + 0.666667 NA exon (NM_018156, exon 59 of 69) exon (NM_018156, exon 59 of 69) -121042 NR_003022 677882 Hs.658450 NR_003022 ENSG00000266079 SNORA59B ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59B snoRNA 176.333-125 chr4 111638868 111639346 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -506347 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 133-86 chr7 38946196 38946441 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31591 NM_007252 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 126-31 chr14 51024219 51024557 + 0.666667 NA intron (NM_015163, intron 2 of 9) intron (NM_015163, intron 2 of 9) 71316 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 158.333-159 chr2 136392266 136392706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -274331 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 125.333-34 chr11 17096809 17097037 + 0.666667 NA intron (NM_001321380, intron 26 of 31) intron (NM_001321380, intron 26 of 31) -19256 NM_001017 6207 Hs.446588 NM_001017 ENSG00000110700 RPS13 S13 ribosomal protein S13 protein-coding 114-140 chr6 125188663 125188912 + 0.666667 NA intron (NR_149043, intron 2 of 3) intron (NR_149043, intron 2 of 3) 9030 NR_149043 100126584 Hs.640031 NR_149043 LOC100126584 - uncharacterized LOC100126584 ncRNA 140.667-80 chr14 65032357 65032643 + 0.666667 NA intron (NM_002028, intron 6 of 11) intron (NM_002028, intron 6 of 11) -12188 NR_039855 100616490 NR_039855 ENSG00000266531 MIR4706 mir-4706 microRNA 4706 ncRNA 160-57 chr2 19671845 19672293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -196785 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 162.667-40 chr10 129986214 129986553 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -22109 NM_001005463 253738 Hs.591374 NM_001005463 ENSG00000108001 EBF3 COE3|EBF-3|HADDS|O/E-2|OE-2 EBF transcription factor 3 protein-coding 165.333-82 chr14 102936865 102937199 + 0.666667 NA intron (NM_006035, intron 36 of 36) FLAM_C|SINE|Alu 14376 NM_030943 81693 Hs.534494 NM_030943 ENSG00000166126 AMN PRO1028|amnionless amnion associated transmembrane protein protein-coding 119.667-28 chr11 45093259 45093529 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001359633) promoter-TSS (NM_001359633) -619 NM_001359633 56981 Hs.178715 NM_001256695 ENSG00000019485 PRDM11 PFM8 PR/SET domain 11 protein-coding 121.667-34 chr10 110324241 110324455 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -19428 NM_005871 10285 Hs.632093 NM_005871 ENSG00000119953 SMNDC1 SMNR|SPF30|TDRD16C survival motor neuron domain containing 1 protein-coding 216-77 chr22 43747267 43747879 + 0.666667 NA intron (NM_198856, intron 4 of 29) intron (NM_198856, intron 4 of 29) 64732 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 139.333-26 chr10 114667005 114667393 + 0.666667 NA intron (NM_001322886, intron 1 of 20) intron (NM_001322886, intron 1 of 20) -8924 NM_002313 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 161-44 chr2 120053422 120053745 + 0.666667 NA intron (NM_001330307, intron 3 of 16) L1MB7|LINE|L1 40506 NM_020909 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 179-88 chr6 146395834 146396201 + 0.666667 NA intron (NM_001278065, intron 7 of 9) intron (NM_001278065, intron 7 of 9) -147816 NM_006834 10981 Hs.287714 NM_006834 ENSG00000118508 RAB32 - RAB32, member RAS oncogene family protein-coding 262.333 chr1 26466338 26466828 + 0.666667 NA intron (NR_125952, intron 1 of 3) intron (NR_125952, intron 1 of 3) 954 NR_125952 101928324 Hs.663256 NR_125952 LOC101928324 - uncharacterized LOC101928324 ncRNA 175.333-64 chr17 57752550 57752904 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7428 NM_001282544 101927581 Hs.540784 NM_001282544 ENSG00000166329 CCDC182 - coiled-coil domain containing 182 protein-coding 160.667-162 chr2 155528224 155528585 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 726527 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 178.333-138 chr5 61271845 61272288 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7137 NR_146624 105378992 Hs.621682 NR_146624 ENSG00000249279 LINC02057 - long intergenic non-protein coding RNA 2057 ncRNA 195-7 chr1 150854978 150855373 + 0.666667 NA intron (NM_001350225, intron 2 of 21) L1ME4a|LINE|L1 21424 NM_001350224 405 Hs.632446 NM_001668 ENSG00000143437 ARNT HIF-1-beta|HIF-1beta|HIF1-beta|HIF1B|HIF1BETA|TANGO|bHLHe2 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein-coding 115.667-93 chr16 65285260 65285441 + 0.666667 NA non-coding (NR_027755, exon 9 of 9) non-coding (NR_027755, exon 9 of 9) -108777 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 121.333-45 chr12 75174620 75174825 + 0.666667 NA intron (NM_001260499, intron 2 of 3) intron (NM_001260499, intron 2 of 3) 35026 NM_139136 3747 Hs.27214 NM_139136 ENSG00000166006 KCNC2 KV3.2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 2 protein-coding 171.667-10 chr1 163068580 163068991 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_005613) promoter-TSS (NM_005613) 179 NM_001102445 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 174.333-60 chr2 50365717 50366132 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -18168 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 114.667-78 chr14 47078649 47078866 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 6 of 16) intron (NM_001113498, intron 6 of 16) 264489 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 273.666-16 chr2 178626631 178627363 + 0.666667 NA intron (NM_001256850, intron 190 of 312) intron (NM_001256850, intron 190 of 312) 103806 NR_038271 100506866 Hs.710694 NR_038271 ENSG00000237298 TTN-AS1 - TTN antisense RNA 1 ncRNA 136.333-50 chr14 19883521 19883903 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7444 NM_001005501 390431 Hs.551345 NM_001005501 ENSG00000165762 OR4K2 OR14-15 olfactory receptor family 4 subfamily K member 2 protein-coding 152.333-245 chr3 120698495 120698802 + 0.666667 NA intron (NM_173825, intron 4 of 7) intron (NM_173825, intron 4 of 7) -16409 NM_000187 3081 Hs.368254 NM_000187 ENSG00000113924 HGD AKU|HGO homogentisate 1,2-dioxygenase protein-coding 137.333-203 chr8 135144233 135144463 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -89783 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 177-18 chr13 76391958 76392315 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -457004 NR_047491 100861545 Hs.638962 NR_047491 ENSG00000261206 LINC00561 - long intergenic non-protein coding RNA 561 ncRNA 171-19 chr14 48730758 48731102 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 855450 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 196-152 chr5 111126177 111126612 + 0.666667 NA intron (NM_139281, intron 22 of 22) intron (NM_139281, intron 22 of 22) 34222 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 135-34 chr15 23561836 23562124 + 0.666667 NA TTS (NR_039731) TTS (NR_039731) 151 NR_039731 100616275 NR_039731 ENSG00000265673 MIR4508 mir-4508 microRNA 4508 ncRNA 135.333-50 chr14 52524756 52525134 + 0.666667 NA intron (NM_020784, intron 6 of 20) AluSq2|SINE|Alu 27560 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 163.333-6 chr1 59678381 59678722 + 0.666667 NA intron (NM_001350790, intron 15 of 16) intron (NM_001350790, intron 15 of 16) 54745 NR_039861 100616409 NR_039861 ENSG00000266150 MIR4711 - microRNA 4711 ncRNA 125-70 chr3 3986579 3986874 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -185851 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 125-96 chr6 39791083 39791453 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1108 NM_001201427 23500 Hs.357128 NM_015345 ENSG00000146122 DAAM2 dJ90A20A.1 dishevelled associated activator of morphogenesis 2 protein-coding 124.333-183 chr8 130738880 130739167 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -295349 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 131.333-40 chr12 2931419 2931668 + 0.666667 NA intron (NM_003324, intron 6 of 10) intron (NM_003324, intron 6 of 10) -27854 NM_201441 7004 Hs.94865 NM_003213 ENSG00000197905 TEAD4 EFTR-2|RTEF1|TCF13L1|TEF-3|TEF3|TEFR-1|hRTEF-1B TEA domain transcription factor 4 protein-coding 154.667-376 chr7 149402686 149403000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58219 NM_015694 27153 Hs.38512 NM_015694 ENSG00000196453 ZNF777 - zinc finger protein 777 protein-coding 235.333-29 chr12 60595265 60595807 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 906166 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 145.667-135 chr2 70227005 70227292 + 0.666667 NA intron (NM_001351517, intron 7 of 14) intron (NM_001351517, intron 7 of 14) 21480 NM_001351516 7072 Hs.413123 NM_022037 ENSG00000116001 TIA1 TIA-1|WDM TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein protein-coding 118-130 chr8 58457532 58457749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42523 NM_000780 1581 Hs.1644 NM_000780 ENSG00000167910 CYP7A1 CP7A|CYP7|CYPVII cytochrome P450 family 7 subfamily A member 1 protein-coding 154.333-4 chr1 50631508 50631858 + 0.666667 NA intron (NM_007051, intron 8 of 18) Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -208240 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 165.333-108 chr17 72006737 72007122 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 19050 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 115.667-41 chr11 42009490 42009814 + 0.666667 NA intron (NR_135065, intron 8 of 9) intron (NR_135065, intron 8 of 9) 75806 NR_135065 101928591 Hs.149771 NR_135065 LINC02745 - long intergenic non-protein coding RNA 2745 ncRNA 220.667-91 chr6 37217914 37218466 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001162900, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001162900, exon 2 of 2) 39409 NM_145316 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 116.667-194 chr7 102850828 102851095 + 0.666667 NA TTS (NR_146986) TTS (NR_146986) -62039 NM_001031692 10234 Hs.567412 NM_005824 ENSG00000128606 LRRC17 P37NB leucine rich repeat containing 17 protein-coding 150.333-42 chr10 83940953 83941273 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -198396 NM_014394 27069 Hs.352656 NM_014394 ENSG00000165678 GHITM DERP2|HSPC282|MICS1|My021|PTD010|TMBIM5 growth hormone inducible transmembrane protein protein-coding 157-16 chr10 15898574 15899018 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -38263 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 160.333-248 chr6 68447199 68447658 + 0.666667 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -117529 NR_125854 101928280 Hs.544560 NR_125854 ENSG00000226497 LINC02549 - long intergenic non-protein coding RNA 2549 ncRNA 113.333-188 chr4 23176990 23177208 + 0.666667 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 463010 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 130.667-149 chr3 154326203 154326505 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -1857 NM_001114397 170506 Hs.446270 NM_020865 ENSG00000174953 DHX36 DDX36|G4R1|MLEL1|RHAU DEAH-box helicase 36 protein-coding 152.667-403 chrX 70275018 70275307 + 0.666667 NA intron (NM_004312, intron 5 of 16) L1ME3C|LINE|L1 6828 NM_004312 407 Hs.308 NM_004312 ENSG00000120500 ARR3 ARRX|MYP26|cArr arrestin 3 protein-coding 247-52 chr3 82521972 82522527 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 536107 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 139.667-168 chr7 7262450 7262819 + 0.666667 NA intron (NR_108073, intron 2 of 3) intron (NR_108073, intron 2 of 3) 7480 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 141-21 chr12 72910437 72910810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -248567 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 123.333-100 chr2 5478995 5479273 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 211984 NR_110580 102723818 Hs.128107 NR_110580 LINC01248 - long intergenic non-protein coding RNA 1248 ncRNA 130.667-22 chr10 28550488 28550813 + 0.666667 NA intron (NM_100486, intron 3 of 12) intron (NM_100486, intron 3 of 12) 17532 NM_016628 51322 Hs.743224 NM_016628 ENSG00000095787 WAC BM-016|DESSH|PRO1741|Wwp4 WW domain containing adaptor with coiled-coil protein-coding 176.333-187 chrX 38591325 38591743 + 0.666667 NA intron (NM_004615, intron 1 of 7) L1MEc|LINE|L1 30056 NM_004615 7102 Hs.441664 NM_004615 ENSG00000156298 TSPAN7 A15|CCG-B7|CD231|DXS1692E|MRX58|MXS1|TALLA-1|TM4SF2|TM4SF2b tetraspanin 7 protein-coding 189-74 chr5 55209875 55210416 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 17170 NM_001190787 345643 Hs.394578 NM_001190787 ENSG00000234602 MCIDAS IDAS|MCI|MCIN multiciliate differentiation and DNA synthesis associated cell cycle protein protein-coding 113.667-29 chr11 16350722 16350920 + 0.666667 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) L2a|LINE|L2 5725 NM_001367873 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 147-80 chr20 1478760 1479048 + 0.666667 NA intron (NM_001134836, intron 2 of 4) intron (NM_001134836, intron 2 of 4) -11212 NM_018839 55968 Hs.12865 NM_016143 ENSG00000088833 NSFL1C P47|UBX1|UBXD10|UBXN2C|dJ776F14.1 NSFL1 cofactor protein-coding 167.333-231 chr6 76804848 76805158 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -211380 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 113-24 chr10 101308658 101308851 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45204 NR_120621 101927419 Hs.638503 NR_120621 ENSG00000229649 LINC02681 - long intergenic non-protein coding RNA 2681 ncRNA 117-132 chr7 52980125 52980336 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -55403 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 203.333-167 chr3 16143588 16143996 + 0.666667 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack -30888 NM_001319051 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 205.667-77 chr2 181215046 181215502 + 0.666667 NA intron (NR_130784, intron 1 of 4) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 90378 NR_039637 100616213 NR_039637 ENSG00000266705 MIR4437 mir-4437 microRNA 4437 ncRNA 203-120 chrX 95541073 95541436 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -478028 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 117-20 chr10 55429149 55429456 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1MEc|LINE|L1 -169740 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 135-107 chr8 64595388 64595714 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004820, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_004820, exon 6 of 6) -13659 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 124.333-54 chr14 97843429 97843655 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80711 NR_146447 100132612 Hs.587781 NR_146447 ENSG00000258869 LINC02312 - long intergenic non-protein coding RNA 2312 ncRNA 158-133 chr7 113491286 113491587 + 0.666667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -372854 NM_001352687 401397 Hs.117929 NM_001352687 ENSG00000214194 SMIM30 LINC00998 small integral membrane protein 30 protein-coding 187.333-149 chr5 7025174 7025606 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -197469 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 192.333-119 chr3 197862971 197863454 + 0.666667 NA intron (NM_001365718, intron 15 of 19) intron (NM_001365718, intron 15 of 19) 71958 NM_001365718 84859 Hs.518414 NM_032773 ENSG00000186001 LRCH3 - leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3 protein-coding 115.667-175 chr5 29373232 29373439 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 22641 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 207.333-99 chr15 62001356 62001869 + 0.666667 NA intron (NM_001018088, intron 15 of 81) L1PA3|LINE|L1 58835 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 225-56 chr6 62807343 62807897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 512357 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 161-32 chr16 83450715 83451035 + 0.666667 NA intron (NM_001220489, intron 5 of 12) AluY|SINE|Alu -57471 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 193.667-6 chr1 52831314 52831619 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -11294 NM_001004339 440590 Hs.658458 NM_001004339 ENSG00000203995 ZYG11A ZYG11 zyg-11 family member A, cell cycle regulator protein-coding 167.333-226 chr6 49718409 49718804 + 0.666667 NA Intergenic PABL_A-int|LTR|ERV1 -5016 NM_001261822 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 276-17 chr14 31846623 31847138 + 0.666667 NA intron (NM_001201573, intron 7 of 8) AluY|SINE|Alu -97973 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 112-159 chr4 142429983 142430186 + 0.666667 NA intron (NM_001331040, intron 4 of 25) intron (NM_001331040, intron 4 of 25) 416451 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 160-129 chr9 68463527 68463996 + 0.666667 NA intron (NM_021965, intron 6 of 10) Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger 77106 NM_153237 169693 Hs.663056 NM_153237 ENSG00000181778 TMEM252 C9orf71 transmembrane protein 252 protein-coding 345.333-29 chr3 191020007 191020723 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 142435 NR_024343 100170222 Hs.717310 NR_024343 SNAR-I snaR-3 small NF90 (ILF3) associated RNA I snRNA 145.667-41 chr10 114447266 114447632 + 0.666667 NA intron (NM_001352440, intron 14 of 20) intron (NM_001352440, intron 14 of 20) -42671 NM_001351074 84632 Hs.501106 NM_032550 ENSG00000169129 AFAP1L2 CTB-1144G6.4|KIAA1914|XB130 actin filament associated protein 1 like 2 protein-coding 148.667-318 chr5 101855880 101856172 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 440258 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 153.333-132 chr15 27263409 27263838 + 0.666667 NA intron (NM_001270873, intron 3 of 5) intron (NM_001270873, intron 3 of 5) -102304 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 142-95 chr3 194605089 194605439 + 0.666667 NA intron (NM_001011655, intron 8 of 9) intron (NM_001011655, intron 8 of 9) 20996 NR_047574 100507297 Hs.586059 NR_047573 TMEM44-AS1 - TMEM44 antisense RNA 1 ncRNA 136.667-51 chr14 21857492 21857809 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -186633 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 180.333-96 chr5 39430034 39430437 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5002 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 162.667-220 chr5 76893121 76893467 + 0.666667 NA intron (NM_130772, intron 4 of 4) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 43280 NM_130772 170591 Hs.482563 NM_130772 ENSG00000171643 S100Z Gm625|S100-zeta S100 calcium binding protein Z protein-coding 133.667-149 chr8 79814371 79814675 + 0.666667 NA intron (NR_110954, intron 3 of 5) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 46381 NR_125410 101927067 Hs.144030 NR_125410 ENSG00000272138 LINC01607 - long intergenic non-protein coding RNA 1607 ncRNA 187-75 chr6 140238110 140238624 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33115 NR_037441 100500879 NR_037441 ENSG00000263514 MIR3668 - microRNA 3668 ncRNA 157.333-316 chr7 7728278 7728748 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 3 of 4) AluSg|SINE|Alu -9906 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 112.333-242 chr7 31405552 31405725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64912 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 145.333-196 chr3 108873142 108873523 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 50546 NM_001317747 50852 Hs.138701 NM_016388 ENSG00000163519 TRAT1 HSPC062|TCRIM|TRIM|pp29/30 T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 protein-coding 152-14 chr1 224620196 224620497 + 0.666667 NA intron (NM_152495, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 4029 NM_152495 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 155.333-364 chr7 47050220 47050491 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -353233 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 225-35 chr2 68480563 68481040 + 0.666667 NA intron (NM_173545, intron 1 of 9) L1M2c|LINE|L1 13216 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 154.333-42 chr10 90736792 90737092 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121097 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 129.333-107 chr20 50019023 50019279 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 22478 NR_051976 100887755 Hs.195705 NR_051976 TRERNA1 LINC00651|treRNA translation regulatory long non-coding RNA 1 ncRNA 123.667-178 chr8 72214096 72214369 + 0.666667 NA non-coding (NR_033867, exon 14 of 20) non-coding (NR_033867, exon 14 of 20) 37402 NR_033867 392232 Hs.454043 NR_033867 LOC392232 - transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene pseudo 214.667-69 chr2 139038475 139038950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141388 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 119.333-63 chr12 869735 869928 + 0.666667 NA intron (NM_001184985, intron 9 of 27) intron (NM_001184985, intron 9 of 27) 63245 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 148-37 chr12 129397676 129398032 + 0.666667 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) intron (NM_133448, intron 3 of 8) 189253 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 134-117 chr9 128071908 128072129 + 0.666667 NA intron (NM_001006641, intron 1 of 9) intron (NM_001006641, intron 1 of 9) 3818 NM_001006641 114789 Hs.5476 NM_052901 ENSG00000148339 SLC25A25 MCSC|PCSCL|SCAMC-2 solute carrier family 25 member 25 protein-coding 207.333-138 chr2 124862057 124862537 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 19 of 23) intron (NM_130773, intron 19 of 23) 837010 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 111.667-119 chr18 77330468 77330749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 80760 NM_001480 2587 Hs.272191 NM_001480 ENSG00000166573 GALR1 GALNR|GALNR1 galanin receptor 1 protein-coding 169.333-16 chr1 216939451 216939920 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001243513) promoter-TSS (NM_001243513) -12 NM_001243512 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 214.667-109 chr7 87840581 87841080 + 0.666667 NA intron (NM_018843, intron 10 of 11) intron (NM_018843, intron 10 of 11) 35530 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 131.667-186 chr7 88641389 88641741 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118135 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 126.333-159 chr6 149235220 149235508 + 0.666667 NA intron (NM_001292035, intron 2 of 6) L3|LINE|CR1 17438 NM_001292035 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 146.333-212 chr3 98013545 98013867 + 0.666667 NA intron (NM_001105580, intron 4 of 9) intron (NM_001105580, intron 4 of 9) 21598 NR_047685 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 160-71 chr22 22079716 22080038 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35943 NR_135291 649179 Hs.553939 NR_135291 ENSG00000197549 PRAMENP PRAMEF24P|PRAMEL PRAME N-terminal like, pseudogene pseudo 169.667-193 chr7 33898622 33898929 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -6140 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 210.333-49 chr15 65423504 65423973 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_020962) promoter-TSS (NM_020962) -791 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 134.333-150 chr6 39001432 39001755 + 0.666667 NA intron (NM_001371, intron 87 of 91) L2c|LINE|L2 -47188 NM_002062 2740 Hs.351883 NM_002062 ENSG00000112164 GLP1R GLP-1|GLP-1-R|GLP-1R glucagon like peptide 1 receptor protein-coding 119-73 chr2 22776931 22777180 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 240576 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 235-36 chr20 54951912 54952574 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -470800 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 161.333-186 chr3 87206361 87206815 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19689 NR_039958 100616161 NR_039958 ENSG00000264119 MIR4795 - microRNA 4795 ncRNA 120.333-29 chr10 133599330 133599596 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27332 NM_001080998 441581 Hs.690471 NM_001080998 ENSG00000225899 FRG2B - FSHD region gene 2 family member B protein-coding 144-112 chr3 98638652 98639034 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -45232 NM_000097 1371 Hs.476982 NM_000097 ENSG00000080819 CPOX COX|CPO|CPX|HCP coproporphyrinogen oxidase protein-coding 115.333-133 chr22 39725999 39726180 + 0.666667 NA Intergenic UCON43|Unknown|Unknown 155336 NM_001003406 8911 Hs.125116 NM_021096 ENSG00000100346 CACNA1I Cav3.3|ca(v)3.3 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 I protein-coding 135.333-192 chr8 86787145 86787492 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -43643 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 113-28 chr11 88125166 88125450 + 0.666667 NA intron (NM_022337, intron 2 of 2) intron (NM_022337, intron 2 of 2) 50135 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 117.333-121 chr20 19861809 19861990 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24622 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 123.667-136 chr4 39444739 39444946 + 0.666667 NA intron (NM_175737, intron 3 of 4) intron (NM_175737, intron 3 of 4) 14106 NM_000661 6133 Hs.412370 NM_000661 ENSG00000163682 RPL9 L9|NPC-A-16 ribosomal protein L9 protein-coding 118.667-133 chr3 54689681 54689929 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 11 of 37) L2a|LINE|L2 -49948 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 164-59 chr2 113898639 113898979 + 0.666667 NA intron (NM_001277140, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR -7817 NR_110174 101060091 Hs.741753 NR_110174 ACTR3-AS1 - ACTR3 antisense RNA 1 ncRNA 154.333-260 chr5 39382073 39382491 + 0.666667 NA intron (NM_001343, intron 10 of 14) intron (NM_001343, intron 10 of 14) -17787 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 207.666-16 chr14 31877510 31878119 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -67039 NR_146544 105370439 NR_146544 ENSG00000258474 LINC02313 - long intergenic non-protein coding RNA 2313 ncRNA 121.333-26 chr10 91687621 91687923 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54701 NM_005398 5507 Hs.303090 NM_005398 ENSG00000119938 PPP1R3C PPP1R5|PTG protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C protein-coding 149.667-291 chr4 72712399 72712744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143350 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 212.667-19 chr11 26579274 26579689 + 0.666667 NA intron (NM_031418, intron 14 of 26) intron (NM_031418, intron 14 of 26) -7218 NM_145650 143662 Hs.407152 NM_145650 ENSG00000169550 MUC15 MUC-15|PAS3|PASIII mucin 15, cell surface associated protein-coding 118.333-78 chr16 5994363 5994634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24526 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 114.333-57 chr12 69001960 69002250 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -38865 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 249-73 chr9 33085887 33086260 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -9399 NM_018225 55234 Hs.655351 NM_018225 ENSG00000122692 SMU1 BWD|SMU-1|fSAP57 SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor protein-coding 123.333-74 chr14 29041394 29041721 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -255770 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 150.333-111 chr14 55137861 55138276 + 0.666667 NA exon (NM_002306, exon 3 of 6) exon (NM_002306, exon 3 of 6) 1085 NR_003225 3958 Hs.531081 NM_002306 ENSG00000131981 LGALS3 CBP35|GAL3|GALBP|GALIG|L31|LGALS2|MAC2 galectin 3 protein-coding 137.333-63 chr16 72518704 72518956 + 0.666667 NA intron (NR_159371, intron 3 of 5) intron (NR_159371, intron 3 of 5) 146140 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 156.333-220 chr22 28160411 28160725 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -239956 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 122.333-86 chr2 22714086 22714314 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 177721 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 114.333-238 chr9 36578253 36578456 + 0.666667 NA intron (NM_001256693, intron 1 of 15) intron (NM_001256693, intron 1 of 15) 5459 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 130.667-56 chr12 53776898 53777211 + 0.666667 NA Intergenic (TGTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -20020 NR_104332 102216268 Hs.742074 NR_104332 ENSG00000260492 CISTR CISTR-ACT|CISTRACT|re52431 chondrogenesis-associated transcript ncRNA 191-41 chr3 89023257 89023672 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84157 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 138.333-79 chr17 66740581 66740935 + 0.666667 NA intron (NM_002737, intron 11 of 16) intron (NM_002737, intron 11 of 16) -46314 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 148.667-109 chr14 21692019 21692313 + 0.666667 NA Intergenic PRIMAX-int|LTR|ERV1 -21149 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 160.667-33 chr10 49193754 49194167 + 0.666667 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -5569 NM_001288742 170371 Hs.385493 NM_001010863 ENSG00000204161 TMEM273 C10orf128 transmembrane protein 273 protein-coding 144-19 chr10 90303059 90303383 + 0.666667 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 237584 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 251.333-4 chr1 215524193 215524731 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42842 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 151-12 chr10 34258708 34259129 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 20 of 22) AluJo|SINE|Alu -486238 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 117.333-184 chr6 165504755 165505066 + 0.666667 NA intron (NM_006661, intron 3 of 22) intron (NM_006661, intron 3 of 22) 157190 NM_001130690 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 156.667-57 chr11 29915523 29915941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66661 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 111.667-99 chr17 19823525 19823806 + 0.666667 NA intron (NM_014683, intron 12 of 26) MIRb|SINE|MIR 44271 NM_001142610 9706 Hs.168762 NM_014683 ENSG00000083290 ULK2 ATG1B|Unc51.2 unc-51 like autophagy activating kinase 2 protein-coding 114-36 chr14 60659103 60659386 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9767 NM_005982 6495 Hs.633506 NM_005982 ENSG00000126778 SIX1 BOS3|DFNA23|TIP39 SIX homeobox 1 protein-coding 195.333-190 chr6 37011813 37012205 + 0.666667 NA intron (NM_173558, intron 4 of 15) intron (NM_173558, intron 4 of 15) 6354 NM_173558 221472 Hs.509664 NM_173558 ENSG00000146192 FGD2 ZFYVE4 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 protein-coding 114.333-48 chr11 125803556 125803809 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 15555 NM_001129883 100169851 Hs.131278 NM_001129883 ENSG00000236027 PATE3 HEL-127|PATE-DJ prostate and testis expressed 3 protein-coding 177-74 chr8 31110751 31111140 + 0.666667 NA intron (NM_000553, intron 18 of 34) intron (NM_000553, intron 18 of 34) -77589 NM_001015508 29942 Hs.373778 NM_013357 ENSG00000172733 PURG PURG-A|PURG-B|PURGA|PURGB purine rich element binding protein G protein-coding 146-53 chr19 28796679 28796988 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69139 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 116.667-168 chr5 144554421 144554692 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 349165 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 147-34 chr12 130258797 130259083 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -78947 NM_001190971 9271 Hs.405659 NM_004764 ENSG00000125207 PIWIL1 CT80.1|HIWI|MIWI|PIWI piwi like RNA-mediated gene silencing 1 protein-coding 268.667-20 chr17 39244983 39245516 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19304 NM_001351360 342667 Hs.145068 NM_198993 ENSG00000141750 STAC2 24b2|24b2/STAC2 SH3 and cysteine rich domain 2 protein-coding 175.333-83 chr2 48213301 48213814 + 0.666667 NA Intergenic Tigger5b|DNA|TcMar-Tigger -101125 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 181.333-24 chr11 60998121 60998602 + 0.666667 NA intron (NM_001254751, intron 1 of 10) intron (NM_001254751, intron 1 of 10) 26681 NM_006725 923 Hs.744366 NM_006725 ENSG00000013725 CD6 TP120 CD6 molecule protein-coding 241.333-49 chr19 56008188 56008675 + 0.666667 NA intron (NM_153447, intron 2 of 14) L2b|LINE|L2 8705 NM_153447 126206 Hs.356872 NM_153447 ENSG00000171487 NLRP5 CLR19.8|MATER|NALP5|PAN11|PYPAF8 NLR family pyrin domain containing 5 protein-coding 189.667-134 chr7 78635326 78635798 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) 288320 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 146.667-348 chr9 17919312 17919695 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 340437 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 142.667-226 chr8 119158533 119158851 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49671 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 210-117 chr5 38707989 38708532 + 0.666667 NA intron (NR_109951, intron 3 of 3) intron (NR_109951, intron 3 of 3) 12013 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 141.333-164 chr3 175282114 175282444 + 0.666667 NA intron (NM_207015, intron 4 of 13) intron (NM_207015, intron 4 of 13) -11183 NR_046713 100874244 Hs.581176 NR_046713 NAALADL2-AS2 - NAALADL2 antisense RNA 2 ncRNA 122.333-151 chr4 21449915 21450212 + 0.666667 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) 14695 NR_107018 102465859 NR_107018 ENSG00000283281 MIR7978 hsa-mir-7978 microRNA 7978 ncRNA 205-92 chr7 158170077 158170635 + 0.666667 NA intron (NM_130843, intron 5 of 21) intron (NM_130843, intron 5 of 21) 315771 NR_038966 100506585 Hs.661265 NR_038966 LOC100506585 - uncharacterized LOC100506585 ncRNA 119.333-184 chr5 169442912 169443140 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140747 NM_017785 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 184.667-111 chr6 2263201 2263567 + 0.666667 NA intron (NR_046229, intron 2 of 6) L1MC1|LINE|L1 17631 NR_046229 100508120 Hs.188825 NR_046229 GMDS-DT GMDS-AS1 GMDS divergent transcript ncRNA 169.667-3 chr1 55320943 55321353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 95507 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 178.667-74 chr2 33713506 33713884 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) MER4E|LTR|ERV1 6809 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 152.333-58 chr10 126383748 126384189 + 0.666667 NA intron (NM_001288974, intron 1 of 18) intron (NM_001288974, intron 1 of 18) 4509 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 122-39 chr15 38456370 38456699 + 0.666667 NA intron (NM_173611, intron 1 of 7) L2b|LINE|L2 2407 NM_173611 283742 Hs.6799 NM_173611 ENSG00000171262 FAM98B - family with sequence similarity 98 member B protein-coding 119.333-153 chr3 103985160 103985452 + 0.666667 NA Intergenic LTR81AB|LTR|Gypsy -461190 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 163.667-113 chr2 108156071 108156372 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61620 NR_131251 102724774 Hs.626744 NR_131251 ENSG00000225328 LINC01594 TCONS_l2_00015893 long intergenic non-protein coding RNA 1594 ncRNA 173.667-70 chr2 41586691 41587062 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -290679 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 145.667-110 chr17 48789655 48790029 + 0.666667 NA intron (NM_001130918, intron 10 of 15) AluSx|SINE|Alu 4482 NM_173623 284076 Hs.91930 NM_173623 ENSG00000170703 TTLL6 TTL.6 tubulin tyrosine ligase like 6 protein-coding 138.333-31 chr10 83170318 83170632 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 506614 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 172-40 chr13 112888914 112889291 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 79536 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 291-10 chr12 2057814 2058628 + 0.666667 NA intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 4936 NM_199460 775 Hs.118262 NM_000719 ENSG00000151067 CACNA1C CACH2|CACN2|CACNL1A1|CCHL1A1|CaV1.2|LQT8|TS|TS. LQT8 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C protein-coding 157-63 chr2 83192071 83192497 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -330530 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 163-79 chr7 8724424 8724874 + 0.666667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 291040 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 177-79 chr8 130472802 130473126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29290 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 154.333-310 chr7 8041200 8041534 + 0.666667 NA intron (NM_138426, intron 3 of 7) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 72571 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 229-26 chr16 66408440 66408981 + 0.666667 NA non-coding (NR_046242, exon 1 of 2) non-coding (NR_046242, exon 1 of 2) 186 NR_046242 100505865 Hs.314372 NR_046242 LINC00920 - long intergenic non-protein coding RNA 920 ncRNA 124.333-188 chr9 107011155 107011457 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_021224, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_021224, exon 13 of 13) 91682 NR_126029 340512 Hs.432529 NR_126029 ENSG00000230782 LOC340512 - uncharacterized LOC340512 ncRNA 140.333-16 chr1 169075018 169075280 + 0.666667 NA intron (NR_104091, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 11856 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 177.667-55 chr15 69870709 69871125 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35683 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 126-10 chr10 38502513 38502828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74524 NR_024497 399744 Hs.497951 NM_001013665 LINC00999 - long intergenic non-protein coding RNA 999 ncRNA 206.667-114 chr5 84193605 84194067 + 0.666667 NA intron (NM_001278642, intron 2 of 9) intron (NM_001278642, intron 2 of 9) 191031 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 169.333-9 chr1 168212211 168212552 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -13623 NM_199344 375035 Hs.645435 NM_199344 ENSG00000213064 SFT2D2 UNQ512|dJ747L4.C1.2 SFT2 domain containing 2 protein-coding 160.333-49 chr10 108005260 108005710 + 0.666667 NA intron (NR_125760, intron 4 of 4) intron (NR_125760, intron 4 of 4) 63808 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 175.667-81 chr2 195489027 195489408 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -167741 NM_001127257 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 112.333-89 chr17 34259113 34259314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3928 NM_002982 6347 Hs.303649 NM_002982 ENSG00000108691 CCL2 GDCF-2|HC11|HSMCR30|MCAF|MCP-1|MCP1|SCYA2|SMC-CF C-C motif chemokine ligand 2 protein-coding 121.667-43 chr11 115901488 115901696 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -141392 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 133-21 chr12 29382787 29383023 + 0.666667 NA Intergenic HERV9NC-int|LTR|ERV1 -1733 NM_016570 51290 Hs.339453 NM_016570 ENSG00000087502 ERGIC2 CDA14|Erv41|PTX1|cd002 ERGIC and golgi 2 protein-coding 143.667-272 chr9 131689880 131690235 + 0.666667 NA intron (NM_001304275, intron 1 of 23) MER65-int|LTR|ERV1 19785 NM_198679 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 113.333-199 chr4 145896066 145896351 + 0.666667 NA intron (NM_178835, intron 2 of 14) intron (NM_178835, intron 2 of 14) 42615 NM_178835 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 131-25 chr14 29154844 29155193 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -369231 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 170-48 chr17 66641662 66642102 + 0.666667 NA intron (NM_002737, intron 4 of 16) intron (NM_002737, intron 4 of 16) -145190 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 114.333-177 chr5 68620044 68620270 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 327580 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 144.333-246 chr7 50548302 50548608 + 0.666667 NA intron (NM_001082971, intron 1 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 12616 NM_001242890 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 157.333-124 chr15 68047328 68047790 + 0.666667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -6620 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 197.667-7 chr1 97892266 97892671 + 0.666667 NA intron (NM_000110, intron 1 of 22) intron (NM_000110, intron 1 of 22) 28591 NM_000110 1806 Hs.335034 NM_000110 ENSG00000188641 DPYD DHP|DHPDHASE|DPD dihydropyrimidine dehydrogenase protein-coding 237.333-36 chr15 81336344 81336975 + 0.666667 NA intron (NM_001080532, intron 19 of 21) intron (NM_001080532, intron 19 of 21) 12326 NR_120365 101929655 Hs.696654 NR_120365 TMC3-AS1 - TMC3 antisense RNA 1 ncRNA 145-77 chr3 189988811 189989111 + 0.666667 NA exon (NM_001134418, exon 4 of 15) exon (NM_001134418, exon 4 of 15) 131936 NM_018192 55214 Hs.374191 NM_018192 ENSG00000090530 P3H2 LEPREL1|MCVD|MLAT4 prolyl 3-hydroxylase 2 protein-coding 190.667-138 chr7 38093104 38093529 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -84929 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 171.667-114 chr3 184396437 184396793 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -4922 NR_161198 105374250 Hs.129464 NR_161198 LINC02054 - long intergenic non-protein coding RNA 2054 ncRNA 150.333-15 chr1 119820257 119820604 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -8970 NM_001159352 83998 Hs.660883 NM_032044 ENSG00000134193 REG4 GISP|REG-IV|RELP regenerating family member 4 protein-coding 169.333-199 chr5 28530494 28530908 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -243036 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 179-95 chr7 68443086 68443523 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 423051 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 142.333-150 chr22 33934904 33935301 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -12214 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 127.333-39 chr12 62049143 62049449 + 0.666667 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) MamTip3|DNA|hAT-Tip100 143543 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 209-66 chr20 3597398 3597877 + 0.666667 NA intron (NM_001207047, intron 21 of 24) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 65762 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 183.667 chr1 15892300 15892684 + 0.666667 NA intron (NM_015001, intron 3 of 14) intron (NM_015001, intron 3 of 14) -44345 NR_024279 729614 Hs.119298 NR_024279 ENSG00000179743 FLJ37453 - uncharacterized LOC729614 ncRNA 157.333-295 chr5 155813768 155814163 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -512792 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 131-35 chr16 71256204 71256451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25605 NM_001270974 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 129-51 chr18 998900 999221 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71067 NR_146724 388456 Hs.407666 NR_146724 ENSG00000259837 LINC01904 - long intergenic non-protein coding RNA 1904 ncRNA 124.333-172 chr8 19318810 19319136 + 0.666667 NA intron (NM_001363111, intron 1 of 8) (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 4997 NM_001174159 63898 Hs.303208 NM_022071 ENSG00000104611 SH2D4A PPP1R38|SH2A SH2 domain containing 4A protein-coding 160.333-155 chr2 185386714 185386985 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219777 NR_136319 105373782 Hs.128285 NR_136319 LOC105373782 - uncharacterized LOC105373782 ncRNA 135.333-33 chr11 19339814 19340205 + 0.666667 NA Intergenic Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -10715 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 143-39 chr14 51044706 51045089 + 0.666667 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 50807 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 189.667-41 chr14 41924578 41925059 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 317962 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 134.333-82 chr2 17461411 17461714 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 56878 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 137.667-55 chr14 49219423 49219724 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 366807 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 114.333-130 chr20 15974894 15975211 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 13 of 17) L1ME4a|LINE|L1 10830 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 141-28 chr14 71954639 71954933 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) L1MCa|LINE|L1 21259 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 143.667-169 chr3 142131680 142132084 + 0.666667 NA intron (NM_001178139, intron 1 of 12) AluSx|SINE|Alu 17662 NM_001178138 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 176-42 chr17 78484201 78484577 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_102401) promoter-TSS (NR_102401) -521 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 238.667-81 chr6 108879560 108880150 + 0.666667 NA intron (NM_001286609, intron 4 of 16) MIRc|SINE|MIR 31433 NM_032131 84071 Hs.645481 NM_032131 ENSG00000118690 ARMC2 SPGF38|bA787I22.1 armadillo repeat containing 2 protein-coding 206-174 chr7 137597478 137598000 + 0.666667 NA intron (NM_001321710, intron 12 of 32) intron (NM_001321710, intron 12 of 32) 248593 NM_001321709 9162 Hs.242947 NM_004717 ENSG00000157680 DGKI DGK-IOTA diacylglycerol kinase iota protein-coding 149-98 chr4 37016866 37017152 + 0.666667 NA intron (NR_134669, intron 1 of 1) intron (NR_134669, intron 1 of 1) 15230 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 142-58 chr17 71146236 71146635 + 0.666667 NA intron (NR_104152, intron 2 of 3) intron (NR_104152, intron 2 of 3) 55744 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 127-83 chr6 53527839 53528115 + 0.666667 NA intron (NM_001498, intron 1 of 15) intron (NM_001498, intron 1 of 15) 17124 NM_001498 2729 Hs.654465 NM_001498 ENSG00000001084 GCLC GCL|GCS|GLCL|GLCLC glutamate-cysteine ligase catalytic subunit protein-coding 125.667-57 chr14 45103209 45103438 + 0.666667 NA intron (NM_017922, intron 5 of 13) intron (NM_017922, intron 5 of 13) -7552 NR_003691 100113389 Hs.712501 NR_003691 ENSG00000239043 SNORD127 - small nucleolar RNA, C/D box 127 snoRNA 136.667-93 chr2 113715892 113716292 + 0.666667 NA intron (NM_001330316, intron 14 of 14) intron (NM_001330316, intron 14 of 14) 5276 NR_039943 100616208 NR_039943 ENSG00000265429 MIR4782 - microRNA 4782 ncRNA 132.333-176 chr8 51517374 51517661 + 0.666667 NA intron (NM_144651, intron 4 of 22) intron (NM_144651, intron 4 of 22) 291928 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 119-102 chr3 84974313 84974614 + 0.666667 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) 15474 NM_001167675 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 115-59 chr14 55566740 55566981 + 0.666667 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu 13232 NR_027123 100129075 Hs.633724 NR_027123 ENSG00000186615 KTN1-AS1 C14orf33|MYCLo-3 KTN1 antisense RNA 1 ncRNA 188.667-150 chr8 102394816 102395217 + 0.666667 NA intron (NM_001282873, intron 1 of 58) L2c|LINE|L2 17673 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 170.667-137 chr5 91318644 91318952 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -4396 NR_103549 100505994 Hs.628363 NR_103548 ENSG00000248323 LUCAT1 SCAL1|SCAT5 lung cancer associated transcript 1 ncRNA 176.333-84 chr2 64613577 64613963 + 0.666667 NA intron (NR_034023, intron 3 of 3) MER5B|DNA|hAT-Charlie 6458 NR_034023 339807 Hs.434736 NR_034023 ENSG00000233694 LINC02579 - long intergenic non-protein coding RNA 2579 ncRNA 132.667-166 chr7 83112422 83112731 + 0.666667 NA intron (NM_033026, intron 3 of 24) intron (NM_033026, intron 3 of 24) 50308 NM_033026 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 186.667-130 chr6 95746538 95746950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 169209 NM_024641 79694 Hs.734632 NM_024641 ENSG00000172469 MANEA ENDO|hEndo mannosidase endo-alpha protein-coding 139-2 chr1 12292569 12292873 + 0.666667 NA intron (NM_015378, intron 23 of 69) AluSx3|SINE|Alu 62691 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 125-115 chr8 112477558 112477798 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 29 of 66) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -165815 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 124.667-141 chr3 139855103 139855325 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -79971 NM_022131 64084 Hs.158529 NM_022131 ENSG00000158258 CLSTN2 ALC-GAMMA|CDHR13|CS2|CSTN2|alcagamma calsyntenin 2 protein-coding 191.333-96 chr18 8156752 8157203 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 14 of 30) intron (NM_002845, intron 14 of 30) 210057 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 146.667-230 chr4 46108867 46109185 + 0.666667 NA intron (NM_173536, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 15028 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 146.667-189 chr2 219105666 219105952 + 0.666667 NA intron (NM_024782, intron 5 of 7) L2c|LINE|L2 -44888 NM_002181 3549 Hs.654504 NM_002181 ENSG00000163501 IHH BDA1|HHG2 Indian hedgehog signaling molecule protein-coding 196-108 chr22 31493691 31494223 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -2182 NM_001258325 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 117.667-128 chr4 5875110 5875286 + 0.666667 NA intron (NM_001014809, intron 1 of 13) intron (NM_001014809, intron 1 of 13) 12615 NM_001288662 1400 Hs.135270 NM_001313 ENSG00000072832 CRMP1 CRMP-1|DPYSL1|DRP-1|DRP1|ULIP-3 collapsin response mediator protein 1 protein-coding 122.667-119 chr3 98515304 98515617 + 0.666667 NA TTS (NM_001040182) TTS (NM_001040182) 7442 NM_001040181 56650 Hs.531371 NM_019895 ENSG00000080822 CLDND1 C3orf4|GENX-3745|Z38 claudin domain containing 1 protein-coding 181-37 chr2 49647426 49647832 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 326574 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 117.333-33 chr11 12576576 12576812 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -97727 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 384.667-4 chr18 44347163 44347815 + 0.666667 NA intron (NR_110792, intron 2 of 4) L1MA3|LINE|L1 184208 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 140-118 chr8 107562087 107562423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64337 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 157-19 chr10 63531547 63531988 + 0.666667 NA intron (NM_001001330, intron 1 of 7) intron (NM_001001330, intron 1 of 7) -9877 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 179.333-155 chr5 97362568 97362838 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -141993 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 184-41 chr17 31137970 31138396 + 0.666667 NA intron (NM_001042492, intron 1 of 57) (TTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 43206 NM_001128147 4763 Hs.113577 NM_000267 ENSG00000196712 NF1 NFNS|VRNF|WSS neurofibromin 1 protein-coding 152.667-111 chr14 63570565 63570849 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -27312 NM_001354926 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 112.667-243 chr7 19551587 19551883 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 153701 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 126-14 chr10 109181594 109181822 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 741538 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 117-140 chr8 50911681 50911993 + 0.666667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 747706 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 198.667-96 chr2 21813456 21813911 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103031 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 113.667-7 chr1 62029001 62029190 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 29 of 43) L1MB3|LINE|L1 -49691 NR_036058 100422902 NR_036058 ENSG00000263908 MIR3116-1 - microRNA 3116-1 ncRNA 198.333-64 chr14 74102239 74102755 + 0.666667 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) Tigger12c|DNA|TcMar-Tigger 17544 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 113-63 chr14 97629417 97629677 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 57111 NR_033943 100129345 Hs.23632 NR_033943 ENSG00000197176 LINC02291 - long intergenic non-protein coding RNA 2291 ncRNA 142.667-217 chr8 35100585 35100859 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -134753 NM_080872 137970 Hs.238889 NM_080872 ENSG00000156687 UNC5D PRO34692|Unc5h4 unc-5 netrin receptor D protein-coding 139-81 chr5 39842872 39843161 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -209275 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 159.667-181 chr2 170278909 170279237 + 0.666667 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) L1MA4A|LINE|L1 71870 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 155.333-88 chr13 28916912 28917236 + 0.666667 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) L1MA3|LINE|L1 96735 NM_001366651 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 190.667-50 chr16 8530332 8530750 + 0.666667 NA intron (NR_110736, intron 3 of 3) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 59297 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 123.667-82 chr2 28826077 28826338 + 0.666667 NA intron (NM_001008779, intron 3 of 4) AluSx|SINE|Alu 10210 NM_001008779 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 145.667-21 chr1 200876108 200876520 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 3333 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 198.333-41 chr12 9681175 9681520 + 0.666667 NA intron (NM_001197318, intron 2 of 3) intron (NM_001197318, intron 2 of 3) 11634 NM_001197319 29121 Hs.268326 NM_013269 ENSG00000069493 CLEC2D CLAX|LLT1|OCIL C-type lectin domain family 2 member D protein-coding 122-84 chr4 38904827 38905043 + 0.666667 NA intron (NM_001330764, intron 3 of 13) intron (NM_001330764, intron 3 of 13) 36903 NR_030300 693159 NR_030300 ENSG00000207944 MIR574 MIR574-3p|MIRN574|hsa-mir-574|mir-574 microRNA 574 ncRNA 118.333-36 chr10 100747003 100747243 + 0.666667 NA intron (NM_003988, intron 1 of 10) intron (NM_003988, intron 1 of 10) 1412 NM_003987 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 155-85 chr3 18849842 18850221 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -298479 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 206-93 chr2 192420105 192420574 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -225406 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 145.333-49 chr10 113045455 113045775 + 0.666667 NA TTS (NR_132769) TTS (NR_132769) 260 NR_132769 106635520 NR_132769 SNORA87 - small nucleolar RNA, H/ACA box 87 snoRNA 225.667-71 chr7 40077088 40077489 + 0.666667 NA intron (NM_003718, intron 9 of 13) intron (NM_003718, intron 9 of 13) 57334 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 197.333-122 chr2 157347776 157348182 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -20267 NM_001009959 57471 Hs.443894 NM_020711 ENSG00000136541 ERMN JN|KIAA1189 ermin protein-coding 277-49 chr7 134310461 134311176 + 0.666667 NA intron (NM_032826, intron 1 of 9) AluY|SINE|Alu 6112 NM_032826 84912 Hs.490181 NM_032826 ENSG00000205060 SLC35B4 YEA|YEA4 solute carrier family 35 member B4 protein-coding 114.667-176 chr3 104721251 104721480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -645348 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 133.333-175 chr7 83825610 83825956 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -176644 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 122-82 chr4 15539142 15539347 + 0.666667 NA intron (NM_001080522, intron 17 of 37) MER5A|DNA|hAT-Charlie 69362 NM_001164720 57545 Hs.590928 NM_020785 ENSG00000048342 CC2D2A JBTS9|MKS6 coiled-coil and C2 domain containing 2A protein-coding 235-40 chr4 10514862 10515230 + 0.666667 NA intron (NM_052964, intron 15 of 18) AluSx|SINE|Alu -57620 NM_053042 85460 Hs.455089 NM_053042 ENSG00000178163 ZNF518B - zinc finger protein 518B protein-coding 210-124 chr5 136265481 136266022 + 0.666667 NA intron (NM_020389, intron 5 of 11) intron (NM_020389, intron 5 of 11) 36105 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 123.333-97 chr18 71728108 71728355 + 0.666667 NA Intergenic LTR43|LTR|ERV1 53995 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 113.333-9 chr1 111825730 111825926 + 0.666667 NA intron (NM_172198, intron 2 of 6) intron (NM_172198, intron 2 of 6) 31077 NR_046783 100874295 Hs.738190 NR_046783 ENSG00000232558 KCND3-IT1 - KCND3 intronic transcript 1 ncRNA 247-8 chr10 55963356 55963889 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -335680 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 242.333-71 chr3 100380850 100381306 + 0.666667 NA intron (NM_014820, intron 5 of 11) intron (NM_014820, intron 5 of 11) 20011 NM_014820 9868 Hs.227253 NM_014820 ENSG00000154174 TOMM70 TOMM70A|Tom70 translocase of outer mitochondrial membrane 70 protein-coding 175-12 chr11 48145793 48146159 + 0.666667 NA intron (NM_002843, intron 14 of 24) AluJr4|SINE|Alu 49194 NR_036119 100423000 NR_036119 ENSG00000263693 MIR3161 - microRNA 3161 ncRNA 162.667-205 chr4 160965478 160965904 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -1057042 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 267.667-31 chr2 138095243 138095860 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6333 NR_135526 105373635 NR_135526 ENSG00000224231 LINC01832 - long intergenic non-protein coding RNA 1832 ncRNA 126.333-21 chr10 66358312 66358669 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) L1MB8|LINE|L1 -567546 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 202-151 chr5 111372455 111372917 + 0.666667 NA intron (NM_001323376, intron 2 of 8) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -139540 NR_040093 100505678 Hs.745061 NR_040093 ENSG00000246859 STARD4-AS1 - STARD4 antisense RNA 1 ncRNA 152-2 chr1 40599741 40600042 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 65791 NM_014747 9783 Hs.654808 NM_014747 ENSG00000117016 RIMS3 NIM3|RIM 3|RIM3 regulating synaptic membrane exocytosis 3 protein-coding 223-35 chr2 118090200 118090582 + 0.666667 NA intron (NM_001321332, intron 1 of 5) intron (NM_001321332, intron 1 of 5) 1841 NM_001321332 51141 Hs.7089 NM_016133 ENSG00000125629 INSIG2 INSIG-2 insulin induced gene 2 protein-coding 160.667-324 chr9 26918618 26918933 + 0.666667 NA intron (NM_001031689, intron 9 of 13) intron (NM_001031689, intron 9 of 13) -25947 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 140.333-186 chr5 88509245 88509523 + 0.666667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -70294 NR_105021 102546226 Hs.535810 NR_105021 ENSG00000250156 LINC02060 - long intergenic non-protein coding RNA 2060 ncRNA 119.333-200 chr7 52700408 52700608 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -335125 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 112.667-51 chr12 52650182 52650438 + 0.666667 NA intron (NM_000423, intron 2 of 8) intron (NM_000423, intron 2 of 8) 1901 NM_000423 3849 Hs.707 NM_000423 ENSG00000172867 KRT2 CK-2e|K2e|KRT2A|KRT2E|KRTE keratin 2 protein-coding 176-74 chr5 82624840 82625217 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -215127 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 119.333-83 chr14 59933666 59933884 + 0.666667 NA intron (NR_075071, intron 6 of 32) L2c|LINE|L2 14062 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 172.333-156 chr6 46729015 46729327 + 0.666667 NA intron (NM_001168357, intron 1 of 11) intron (NM_001168357, intron 1 of 11) 6204 NM_005084 7941 Hs.584823 NM_005084 ENSG00000146070 PLA2G7 LDL-PLA2|LP-PLA2|PAFAD|PAFAH phospholipase A2 group VII protein-coding 146-137 chr8 84337463 84337878 + 0.666667 NA intron (NM_001354320, intron 2 of 9) intron (NM_001354320, intron 2 of 9) -77814 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 135.333-92 chr2 171811187 171811559 + 0.666667 NA intron (NR_047549, intron 10 of 16) intron (NR_047549, intron 10 of 16) 82871 NM_003705 8604 Hs.470608 NM_003705 ENSG00000115840 SLC25A12 AGC1|ARALAR|EIEE39 solute carrier family 25 member 12 protein-coding 111.667-85 chr15 44492671 44492908 + 0.666667 NA intron (NM_016396, intron 5 of 12) intron (NM_016396, intron 5 of 12) 44111 NR_034171 645212 Hs.594287 NR_034170 EIF3J-DT EIF3J-AS1 EIF3J divergent transcript ncRNA 144.333-255 chr7 158095639 158096061 + 0.666667 NA intron (NM_130843, intron 9 of 21) AluJr|SINE|Alu 241265 NR_038966 100506585 Hs.661265 NR_038966 LOC100506585 - uncharacterized LOC100506585 ncRNA 164.333-183 chr4 147805945 147806271 + 0.666667 NA intron (NM_024605, intron 1 of 22) intron (NM_024605, intron 1 of 22) 23513 NR_039962 100616246 NR_039962 ENSG00000264274 MIR4799 - microRNA 4799 ncRNA 242.333-15 chr10 84991766 84992393 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 206826 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 168.667-77 chr16 83282712 83283068 + 0.666667 NA intron (NM_001220489, intron 4 of 12) intron (NM_001220489, intron 4 of 12) -225456 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 237.333-8 chr1 212064349 212064902 + 0.666667 NA intron (NM_001286229, intron 5 of 12) L1MC1|LINE|L1 -12574 NR_026911 100131205 Hs.126774 NR_026911 ENSG00000220749 RPL21P28 RPL21_8_160 ribosomal protein L21 pseudogene 28 pseudo 153.667-133 chr15 56644513 56644845 + 0.666667 NA intron (NM_001002843, intron 18 of 20) intron (NM_001002843, intron 18 of 20) 89407 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 129.667-75 chr17 12140770 12141006 + 0.666667 NA intron (NM_001281435, intron 11 of 11) intron (NM_001281435, intron 11 of 11) 58989 NR_030613 100126313 NR_030613 ENSG00000266297 MIR744 MIRN744|hsa-mir-744|mir-744 microRNA 744 ncRNA 120-149 chr9 129451706 129451946 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36834 NR_038955 100506190 Hs.529860 NR_038955 LINC00963 MetaLnc9 long intergenic non-protein coding RNA 963 ncRNA 143-102 chr6 35357724 35357993 + 0.666667 NA intron (NM_001171819, intron 2 of 6) intron (NM_001171819, intron 2 of 6) 15300 NM_006238 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 138.333-20 chr10 17001960 17002229 + 0.666667 NA intron (NM_001081, intron 28 of 66) intron (NM_001081, intron 28 of 66) 127723 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 115-71 chr16 80451622 80451826 + 0.666667 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -89010 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 207.667-44 chr17 55619530 55619937 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 103131 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 119.667-163 chr6 37607743 37607996 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -52447 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 134-5 chr1 90518973 90519212 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -138658 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 151-4 chr1 58566241 58566662 + 0.666667 NA Intergenic LTR29|LTR|ERV1 10801 NM_002353 4070 Hs.23582 NM_002353 ENSG00000184292 TACSTD2 EGP-1|EGP1|GA733-1|GA7331|GP50|M1S1|TROP2 tumor associated calcium signal transducer 2 protein-coding 158.667-22 chr1 179022842 179023191 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2788 NM_001324310 9917 Hs.5737 NM_014864 ENSG00000116199 FAM20B gxk1 FAM20B glycosaminoglycan xylosylkinase protein-coding 114.667-89 chr15 49192607 49192849 + 0.666667 NA intron (NM_002044, intron 1 of 9) L1MC4|LINE|L1 22481 NM_001289030 2585 Hs.122006 NM_002044 ENSG00000156958 GALK2 GK2 galactokinase 2 protein-coding 207.333-279 chr9 33303153 33303662 + 0.666667 NA intron (NM_002504, intron 4 of 23) intron (NM_002504, intron 4 of 23) 12891 NM_002504 4799 Hs.413074 NM_002504 ENSG00000086102 NFX1 NFX2|TEG-42|Tex42 nuclear transcription factor, X-box binding 1 protein-coding 135-96 chr7 2767421 2767691 + 0.666667 NA intron (NM_007353, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 -4416 NM_001282440 2768 Hs.487341 NM_007353 ENSG00000146535 GNA12 NNX3|RMP|gep G protein subunit alpha 12 protein-coding 117.667-202 chr8 137395818 137396062 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 17648 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 148.667-117 chr14 56468963 56469255 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -45222 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 337.667-11 chr17 74090698 74091388 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -112635 NM_001035258 6169 Hs.380953 NM_000999 ENSG00000172809 RPL38 L38 ribosomal protein L38 protein-coding 164.333-180 chr4 102064048 102064390 + 0.666667 NA intron (NM_017935, intron 13 of 16) intron (NM_017935, intron 13 of 16) 250377 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 174.333-128 chr6 5990935 5991272 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12941 NM_001278711 51299 Hs.103291 NM_016588 ENSG00000124785 NRN1 NRN|dJ380B8.2 neuritin 1 protein-coding 229.667-19 chr12 22049511 22050016 + 0.666667 NA intron (NR_135117, intron 1 of 6) AluSg|SINE|Alu 3545 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 116.667-165 chr5 129696496 129696727 + 0.666667 NA intron (NM_133638, intron 19 of 22) MER4D1|LTR|ERV1 -51483 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 119-27 chr11 48831796 48832148 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -199628 NM_001206626 283116 Hs.448644 NM_001206626 ENSG00000182053 TRIM49B - tripartite motif containing 49B protein-coding 122.333-100 chr2 104737844 104738134 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19730 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 137.667-26 chr10 66356528 66356793 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) L1MD|LINE|L1 -569376 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 150.667-224 chr21 43910742 43911129 + 0.666667 NA intron (NM_001369881, intron 2 of 9) L1ME4a|LINE|L1 -5853 NM_001369880 56894 Hs.248785 NM_020132 ENSG00000160216 AGPAT3 1-AGPAT 3|LPAAT-GAMMA1|LPAAT3 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3 protein-coding 112.333-51 chr12 33577261 33577523 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -137573 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 134-45 chr19 51109954 51110259 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1697 NM_145232 90353 Hs.148425 NM_145232 ENSG00000142544 CTU1 ATPBD3|NCS6 cytosolic thiouridylase subunit 1 protein-coding 219.333-13 chr1 190756530 190757075 + 0.666667 NA intron (NR_033922, intron 2 of 4) MLT2A2|LTR|ERVL 131912 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 230-27 chr16 72566308 72566801 + 0.666667 NA intron (NR_159370, intron 2 of 5) intron (NR_159370, intron 2 of 5) 98416 NR_159371 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 226.333-66 chr2 182957821 182958337 + 0.666667 NA intron (NM_013436, intron 18 of 30) intron (NM_013436, intron 18 of 30) 80378 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 158.667-170 chr2 169316660 169316970 + 0.666667 NA intron (NM_004525, intron 3 of 78) L2c|LINE|L2 45719 NM_004525 4036 Hs.657729 NM_004525 ENSG00000081479 LRP2 DBS|GP330|LRP-2 LDL receptor related protein 2 protein-coding 141.667-24 chr10 35026564 35026904 + 0.666667 NA intron (NM_003591, intron 16 of 20) intron (NM_003591, intron 16 of 20) 47549 NM_001324376 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 158-62 chr17 60444505 60444809 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001282476, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_001282476, exon 12 of 12) 22168 NM_181707 124773 Hs.129312 NM_181707 ENSG00000141371 C17orf64 - chromosome 17 open reading frame 64 protein-coding 151.667-341 chr7 97692247 97692613 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -39656 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 115-47 chr12 69461994 69462249 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8267 NM_001042555 10818 Hs.593446 NM_006654 ENSG00000166225 FRS2 FRS1A|FRS2A|FRS2alpha|SNT|SNT-1|SNT1 fibroblast growth factor receptor substrate 2 protein-coding 116-62 chr17 77124477 77124665 + 0.666667 NA intron (NM_001204410, intron 2 of 17) intron (NM_001204410, intron 2 of 17) -16398 NM_001039573 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 181.333-150 chr6 43400250 43400613 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27110 NM_001198934 89845 Hs.55879 NM_033450 ENSG00000124574 ABCC10 EST182763|MRP7|SIMRP7 ATP binding cassette subfamily C member 10 protein-coding 171.333-108 chr22 29783758 29784133 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16576 NM_013387 29796 Hs.284292 NM_013387 ENSG00000184076 UQCR10 HSPC051|HSPC119|HSPC151|QCR9|UCCR7.2|UCRC ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit X protein-coding 124-95 chr5 73555367 73555630 + 0.666667 NA exon (NM_023039, exon 5 of 9) exon (NM_023039, exon 5 of 9) 10141 NM_023039 57763 Hs.239154 NM_023039 ENSG00000164331 ANKRA2 ANKRA ankyrin repeat family A member 2 protein-coding 112.667-233 chr6 83520137 83520317 + 0.666667 NA intron (NM_153362, intron 1 of 1) intron (NM_153362, intron 1 of 1) 7693 NM_001170423 167681 Hs.98381 NM_153362 ENSG00000146250 PRSS35 C6orf158|dJ223E3.1 serine protease 35 protein-coding 214.333-64 chr17 63163323 63163858 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 197355 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 146.667-138 chr17 63815181 63815436 + 0.666667 NA intron (NM_203499, intron 15 of 17) intron (NM_203499, intron 15 of 17) -12123 NM_002805 5705 Hs.79387 NM_002805 ENSG00000087191 PSMC5 S8|SUG-1|SUG1|TBP10|TRIP1|p45|p45/SUG proteasome 26S subunit, ATPase 5 protein-coding 189.333-186 chr7 27370751 27371136 + 0.666667 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -123714 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 165.667-125 chr3 96839703 96840104 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 1 of 17) L2c|LINE|L2 25309 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 132.333-110 chr3 47103557 47103841 + 0.666667 NA intron (NR_146158, intron 6 of 21) intron (NR_146158, intron 6 of 21) 60278 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 142.333-258 chr9 34852206 34852523 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -13778 NR_024481 389715 Hs.713965 NM_001126494 FAM205BP C9orf144|C9orf144A|FAM205B transmembrane protein C9orf144B pseudogene pseudo 141.667-159 chr4 42803457 42803781 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -89647 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 215.667-114 chr7 39696649 39697233 + 0.666667 NA intron (NM_005402, intron 4 of 4) intron (NM_005402, intron 4 of 4) -36627 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 132-16 chr10 33463056 33463370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -128308 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 148-132 chr5 64868731 64869000 + 0.666667 NA intron (NM_005869, intron 10 of 13) intron (NM_005869, intron 10 of 13) 99935 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 253.667-35 chr2 191471818 191472209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -206059 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 112-97 chr18 71821880 71822085 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -39756 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 211.333-125 chr2 162054682 162055097 + 0.666667 NA intron (NM_001935, intron 2 of 25) MIRb|SINE|MIR 19326 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 191.333-47 chr12 94713184 94713656 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62863 NM_020698 57458 Hs.370410 NM_020698 ENSG00000057704 TMCC3 - transmembrane and coiled-coil domain family 3 protein-coding 142.333-4 chr1 60888299 60888597 + 0.666667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -62864 NR_110628 101926964 Hs.650459 NR_110628 ENSG00000231252 LOC101926964 - uncharacterized LOC101926964 ncRNA 166.333-90 chr17 49826680 49827013 + 0.666667 NA intron (NM_007067, intron 14 of 14) intron (NM_007067, intron 14 of 14) -19064 NM_001242791 729220 Hs.434138 NM_001242791 FLJ45513 - uncharacterized LOC729220 protein-coding 209.333-232 chr8 75354229 75354771 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -53149 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 193.333-4 chr1 81402204 81402629 + 0.666667 NA intron (NM_001366003, intron 2 of 27) intron (NM_001366003, intron 2 of 27) 96021 NM_001366008 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 119.333-66 chr12 10384728 10385083 + 0.666667 NA intron (NR_120430, intron 3 of 3) L1MA5|LINE|L1 5136 NM_007360 22914 Hs.387787 NM_007360 ENSG00000213809 KLRK1 CD314|D12S2489E|KLR|NKG2-D|NKG2D killer cell lectin like receptor K1 protein-coding 123.333-190 chr7 18223038 18223344 + 0.666667 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) L1ME4a|LINE|L1 -66901 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 290.667-32 chr4 67824299 67825001 + 0.666667 NA intron (NM_004262, intron 9 of 9) intron (NM_004262, intron 9 of 9) 59352 NM_004262 9407 Hs.132195 NM_004262 ENSG00000153802 TMPRSS11D HAT transmembrane serine protease 11D protein-coding 157-119 chr7 5192362 5192764 + 0.666667 NA intron (NM_016003, intron 1 of 11) intron (NM_016003, intron 1 of 11) 2330 NM_001278299 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 158-149 chrX 73735628 73736075 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -56354 NR_003255 9383 Hs.529901 NR_003255 ENSG00000270641 TSIX LINC00013|NCRNA00013|XIST-AS|XIST-AS1|XISTAS TSIX transcript, XIST antisense RNA ncRNA 191-38 chr20 43845044 43845467 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49463 NR_134577 105372626 Hs.130555 NR_134577 ENSG00000233277 LINC01728 - long intergenic non-protein coding RNA 1728 ncRNA 133-44 chr2 118478513 118478810 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 124305 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 114-101 chr4 63352024 63352306 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1057285 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 213.333-139 chr3 169669327 169669936 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -5919 NM_001366473 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 194.666-69 chr8 8717892 8718451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16234 NM_194284 137075 Hs.183617 NM_194284 ENSG00000253958 CLDN23 CLDNL|hCG1646163 claudin 23 protein-coding 136-45 chr18 2082790 2083057 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 488582 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 124.333-161 chr6 125331343 125331568 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -29488 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 163.333-210 chr5 5089445 5089747 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11285 NR_134266 105374631 Hs.570964 NR_134266 ENSG00000250529 LINC02121 - long intergenic non-protein coding RNA 2121 ncRNA 118-78 chr20 36595093 36595331 + 0.666667 NA intron (NM_001199535, intron 2 of 4) intron (NM_001199535, intron 2 of 4) -10567 NM_199483 55969 Hs.584985 NM_018840 ENSG00000101084 RAB5IF C20orf24|PNAS-11|RIP5 RAB5 interacting factor protein-coding 135.667-76 chr17 61612111 61612353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21013 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 160.667-237 chr5 11977976 11978402 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -73743 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 196.333-98 chr20 35041852 35042400 + 0.666667 NA intron (NM_199368, intron 7 of 18) intron (NM_199368, intron 7 of 18) 50681 NM_015638 26133 Hs.168073 NM_015638 ENSG00000100991 TRPC4AP C20orf188|PPP1R158|TRRP4AP|TRUSS transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein protein-coding 122-110 chr7 1914564 1914778 + 0.666667 NA intron (NM_001013837, intron 17 of 18) AluJr|SINE|Alu 25900 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 147-17 chr10 99069226 99069537 + 0.666667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) -144813 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 168.667-193 chr6 166619994 166620470 + 0.666667 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) intron (NM_001006932, intron 2 of 21) 7019 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 177.667-111 chr5 96070230 96070660 + 0.666667 NA intron (NR_130776, intron 1 of 4) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -8693 NR_030309 693168 NR_030309 ENSG00000207578 MIR583 MIRN583|hsa-mir-583 microRNA 583 ncRNA 162.667-82 chr14 76683342 76683802 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -77896 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 170-14 chr10 118424123 118424507 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 67207 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 123-27 chr11 38363256 38363502 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282977 NR_120554 103312105 Hs.641711 NR_120554 ENSG00000255175 LINC02759 - long intergenic non-protein coding RNA 2759 ncRNA 192.333-82 chr19 31469701 31470153 + 0.666667 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -118262 NM_001278578 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 211-84 chr5 156019653 156020081 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -306890 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 159.667-187 chr2 235311510 235311835 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -182371 NM_014914 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 157.667-354 chr9 68813282 68813623 + 0.666667 NA intron (NM_003558, intron 2 of 15) intron (NM_003558, intron 2 of 15) 33387 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 121-40 chr14 34147560 34147844 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -196628 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 141.333-3 chr1 50754960 50755332 + 0.666667 NA intron (NM_007051, intron 4 of 18) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 205121 NM_007051 11124 Hs.530402 NM_007051 ENSG00000185104 FAF1 CGI-03|HFAF1s|UBXD12|UBXN3A|hFAF1 Fas associated factor 1 protein-coding 188.333-36 chr12 59100559 59100934 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -180208 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 206 chr1 8823029 8823571 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5660 NM_001042681 473 Hs.463041 NM_012102 ENSG00000142599 RERE ARG|ARP|ATN1L|DNB1|NEDBEH arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein-coding 141.667-253 chr9 119700341 119700632 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -234574 NR_132393 106146149 Hs.638938 NR_132393 ENSG00000261432 LINC01613 n341773 long intergenic non-protein coding RNA 1613 ncRNA 169.667-50 chr13 33821570 33821978 + 0.666667 NA intron (NM_002915, intron 2 of 8) intron (NM_002915, intron 2 of 8) 3625 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 140.667-213 chr7 35655551 35655778 + 0.666667 NA intron (NM_022373, intron 5 of 8) L1MA4A|LINE|L1 39471 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 201.667-116 chr8 47055394 47055825 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -133698 NR_037168 100287846 Hs.21550 NR_037168 LOC100287846 - uncharacterized LOC100287846 ncRNA 152.333-3 chr1 25200400 25200686 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 31959 NM_207170 25949 Hs.20013 NM_015484 ENSG00000117614 SYF2 CBPIN|NTC31|P29|fSAP29 SYF2 pre-mRNA splicing factor protein-coding 129-44 chr16 48975073 48975426 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 306589 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 220.333-33 chr12 15220159 15220506 + 0.666667 NA intron (NM_032918, intron 1 of 4) intron (NM_032918, intron 1 of 4) 1085 NM_001190726 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 147.667-153 chr18 56903008 56903313 + 0.666667 NA intron (NM_015285, intron 21 of 27) intron (NM_015285, intron 21 of 27) 168959 NR_152602 100885779 Hs.565136 NR_048536 ENSG00000258609 LINC-ROR ROR|lincRNA-RoR|lincRNA-ST8SIA3 long intergenic non-protein coding RNA, regulator of reprogramming ncRNA 184-49 chr2 58900712 58901112 + 0.666667 NA intron (NR_033873, intron 3 of 13) intron (NR_033873, intron 3 of 13) -316796 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 248-25 chr15 61159169 61159650 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 69893 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 153.667-154 chr17 53321630 53322042 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 336331 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 228.667-75 chr7 82599393 82599949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -155715 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 148.333-51 chr10 76359845 76360149 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) AluSp|SINE|Alu -528047 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 154-149 chr8 140929398 140929711 + 0.666667 NA intron (NM_001352699, intron 1 of 35) MIRb|SINE|MIR 71450 NM_001352710 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 172.333-25 chr10 95680269 95680677 + 0.666667 NA exon (NM_001143973, exon 9 of 10) exon (NM_001143973, exon 9 of 10) 13454 NM_015631 26123 Hs.438991 NM_015631 ENSG00000119977 TCTN3 C10orf61|JBTS18|OFD4|TECT3 tectonic family member 3 protein-coding 229-22 chr15 97476023 97476479 + 0.666667 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) L1ME2|LINE|L1 45560 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 138-93 chr5 91730360 91730612 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -347169 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 246.666-11 chr13 28789013 28789678 + 0.666667 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -30994 NM_001366650 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 199.667-32 chr11 114213198 114213747 + 0.666667 NA intron (NM_006006, intron 4 of 6) intron (NM_006006, intron 4 of 6) -82341 NM_006169 4837 Hs.503911 NM_006169 ENSG00000166741 NNMT - nicotinamide N-methyltransferase protein-coding 191-82 chr9 93034785 93035133 + 0.666667 NA intron (NM_001369952, intron 16 of 16) intron (NM_001369952, intron 16 of 16) -20015 NR_121565 101927954 Hs.673794 NR_121565 LOC101927954 - uncharacterized LOC101927954 ncRNA 114.333-100 chr2 48928667 48928957 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -130791 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 260.667-24 chr15 64769526 64769983 + 0.666667 NA intron (NR_138350, intron 1 of 7) MER97a|DNA|hAT-Tip100 4989 NR_138363 348093 Hs.436518 NM_194272 ENSG00000166831 RBPMS2 - RNA binding protein, mRNA processing factor 2 protein-coding 123.333-125 chr20 3249754 3249956 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001009984, exon 37 of 37) 3' UTR (NM_001009984, exon 37 of 37) -10665 NM_001363745 83959 Hs.105607 NM_032034 ENSG00000088836 SLC4A11 BTR1|CDPD1|CHED|CHED2|NABC1|dJ794I6.2 solute carrier family 4 member 11 protein-coding 141-84 chr7 29049415 29049699 + 0.666667 NA intron (NM_001371256, intron 15 of 16) L1PA17|LINE|L1 69590 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 177.333-92 chr2 222765150 222765635 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 93734 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 121.333-177 chr8 86042841 86043160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26668 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 183-101 chr9 79054074 79054565 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91347 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 150-15 chr10 65732543 65732797 + 0.666667 NA intron (NR_120647, intron 4 of 5) intron (NR_120647, intron 4 of 5) 161245 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 159.333-21 chr1 178576315 178576623 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33673 NR_033186 400798 Hs.668085 NM_207467 ENSG00000213057 C1orf220 - chromosome 1 open reading frame 220 (putative) ncRNA 347.667-16 chr5 45226813 45227671 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 418295 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 132-109 chr6 169584766 169585074 + 0.666667 NA intron (NM_182552, intron 23 of 25) L1MA9|LINE|L1 117109 NM_182552 253769 Hs.131903 NM_182552 ENSG00000184465 WDR27 - WD repeat domain 27 protein-coding 325.667-4 chr12 70255678 70256396 + 0.666667 NA intron (NM_001199303, intron 1 of 15) intron (NM_001199303, intron 1 of 15) 12323 NM_001199303 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 126-15 chr10 125090906 125091132 + 0.666667 NA intron (NM_001321013, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR -58149 NR_036178 100423041 NR_036178 ENSG00000264572 MIR4296 - microRNA 4296 ncRNA 197.667-14 chr1 217961697 217962121 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 69009 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 159-101 chr6 52414235 52414556 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -5947 NM_018100 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 135-14 chr11 30619972 30620342 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -33804 NM_001145399 744 Hs.289795 NM_001584 ENSG00000066382 MPPED2 239FB|C11orf8 metallophosphoesterase domain containing 2 protein-coding 112.667-104 chr19 41905411 41905601 + 0.666667 NA intron (NM_198977, intron 23 of 27) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 21063 NM_199002 9138 Hs.631550 NM_004706 ENSG00000076928 ARHGEF1 GEF1|IMD62|LBCL2|LSC|P115-RHOGEF|SUB1.5 Rho guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 148.667-320 chr5 110973590 110973883 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -96344 NR_045089 85480 Hs.389874 NM_033035 ENSG00000145777 TSLP - thymic stromal lymphopoietin protein-coding 119-68 chr18 7637791 7638010 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 70584 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 120.667-49 chr14 25271719 25272021 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -221573 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 115-126 chr5 39644997 39645205 + 0.666667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 124670 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 149.333-10 chr1 61778665 61779064 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 7 of 43) AluSg|SINE|Alu 36384 NM_176877 10207 Hs.478125 NM_005799 ENSG00000132849 PATJ Cipp|INADL|InaD-like|hINADL PATJ crumbs cell polarity complex component protein-coding 125-16 chr10 76022023 76022245 + 0.666667 NA intron (NR_131178, intron 3 of 7) intron (NR_131178, intron 3 of 7) 239373 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 126.333-13 chr1 224998090 224998460 + 0.666667 NA intron (NM_001349911, intron 8 of 10) L1MDa|LINE|L1 68600 NM_001349912 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 118-108 chr5 147524010 147524325 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -14099 NM_001197294 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 190.667-119 chr6 105893319 105893767 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -192793 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 194.667-93 chr3 82000755 82001248 + 0.666667 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 14859 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 177-11 chr11 68531638 68532054 + 0.666667 NA intron (NM_001352348, intron 3 of 24) MIR3|SINE|MIR 71094 NM_001164164 55291 Hs.503022 NM_018312 ENSG00000110075 PPP6R3 C11orf23|PP6R3|SAP190|SAPL|SAPLa|SAPS3 protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 protein-coding 149.667-319 chr5 75229157 75229544 + 0.666667 NA intron (NM_001164443, intron 2 of 24) intron (NM_001164443, intron 2 of 24) 7528 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 138.333-48 chr12 62317253 62317553 + 0.666667 NA intron (NR_147080, intron 4 of 19) MIRb|SINE|MIR 56999 NM_001351163 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 155.333-377 chr8 27787143 27787451 + 0.666667 NA intron (NM_001017420, intron 5 of 10) intron (NM_001017420, intron 5 of 10) 12743 NM_001017420 157570 Hs.99480 NM_001017420 ENSG00000171320 ESCO2 2410004I17Rik|EFO2|EFO2p|RBS|hEFO2 establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 protein-coding 170.667-39 chr13 45283156 45283646 + 0.666667 NA intron (NM_004128, intron 7 of 7) intron (NM_004128, intron 7 of 7) 53046 NR_145985 109616966 NR_145726 ENSG00000253051 SNORA31B - small nucleolar RNA, H/ACA box 31B snoRNA 146.667-45 chr10 98877160 98877577 + 0.666667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 47200 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 165-56 chr3 114693992 114694343 + 0.666667 NA intron (NM_001348805, intron 5 of 10) intron (NM_001348805, intron 5 of 10) 49358 NR_039959 100616166 NR_039959 ENSG00000264623 MIR4796 mir-4796 microRNA 4796 ncRNA 161.333-240 chr5 166552560 166553022 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 373579 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 113.333-251 chr8 19840880 19841099 + 0.666667 NA intron (NR_148458, intron 13 of 18) intron (NR_148458, intron 13 of 18) 23573 NM_018142 55174 Hs.512627 NM_018142 ENSG00000104613 INTS10 C8orf35|INT10 integrator complex subunit 10 protein-coding 113.667-130 chr22 41680650 41680859 + 0.666667 NA intron (NM_001003796, intron 1 of 2) AluSx3|SINE|Alu 8113 NM_001003796 4809 Hs.182255 NM_005008 ENSG00000100138 SNU13 15.5K|FA-1|FA1|NHP2L1|NHPX|OTK27|SNRNP15-5|SPAG12|SSFA1 small nuclear ribonucleoprotein 13 protein-coding 172.667-26 chr11 9727957 9728330 + 0.666667 NA exon (NM_001297714, exon 4 of 11) exon (NM_001297714, exon 4 of 11) -30150 NR_036485 283104 Hs.632156 NR_036485 ENSG00000246273 SBF2-AS1 - SBF2 antisense RNA 1 ncRNA 123.333-103 chr2 68964924 68965200 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -9511 NM_019617 56287 Hs.69319 NM_019617 ENSG00000169605 GKN1 AMP18|BRICD1|CA11|FOV|foveolin gastrokine 1 protein-coding 183.667-44 chr14 53054423 53054824 + 0.666667 NA exon (NM_001160147, exon 12 of 13) exon (NM_001160147, exon 12 of 13) 98700 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 168.333-12 chr1 205369262 205369702 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -3770 NR_038425 284576 Hs.585440 NR_038425 ENSG00000226235 LEMD1-AS1 - LEMD1 antisense RNA 1 ncRNA 144-41 chr12 53929168 53929573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9461 NM_017410 3229 Hs.118608 NM_017410 ENSG00000123364 HOXC13 ECTD9|HOX3|HOX3G homeobox C13 protein-coding 192.333-148 chr6 71204050 71204576 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -84498 NM_024576 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 205.667-123 chr7 11458911 11459323 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 11 of 26) intron (NM_015204, intron 11 of 26) 373081 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 133-48 chr2 203140086 203140365 + 0.666667 NA intron (NM_001114132, intron 30 of 54) AluSp|SINE|Alu -98216 NM_177538 57404 Hs.446065 NM_020674 ENSG00000119004 CYP20A1 CYP-M cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 protein-coding 188-123 chrX 152509089 152509496 + 0.666667 NA Intergenic L2-3_Crp|LINE|L2 -57977 NM_000808 2556 Hs.123024 NM_000808 ENSG00000011677 GABRA3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha3 subunit protein-coding 149.333-13 chr1 82375250 82375650 + 0.666667 NA Intergenic (TCTGTGTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -527733 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 224.333-52 chr16 73941624 73942159 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 273630 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 124.667-126 chr20 50554837 50555066 + 0.666667 NA intron (NM_001278618, intron 1 of 8) L1MEc|LINE|L1 -30835 NR_030375 693230 NR_030375 ENSG00000208018 MIR645 MIRN645|hsa-mir-645 microRNA 645 ncRNA 136.333-202 chr8 68148685 68148945 + 0.666667 NA intron (NM_024870, intron 34 of 39) intron (NM_024870, intron 34 of 39) -181558 NM_001349479 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 113.667-175 chr5 122196444 122196740 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36416 NM_001195535 100505841 Hs.733368 NM_001195535 LOC100505841 - zinc finger protein 474-like protein-coding 126-41 chr16 77407201 77407413 + 0.666667 NA intron (NM_199355, intron 3 of 22) L1ME3A|LINE|L1 27727 NM_199355 170692 Hs.188746 NM_139054 ENSG00000140873 ADAMTS18 ADAMTS21|KNO2|MMCAT ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 protein-coding 207-50 chr17 17868946 17869285 + 0.666667 NA intron (NM_001288787, intron 7 of 13) intron (NM_001288787, intron 7 of 13) -32104 NM_004176 6720 Hs.592123 NM_004176 ENSG00000072310 SREBF1 SREBP1|bHLHd1 sterol regulatory element binding transcription factor 1 protein-coding 134-57 chr22 26135326 26135679 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -33960 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 118.667-55 chr12 39499710 39500021 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -56745 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 116-114 chr3 198032873 198033072 + 0.666667 NA intron (NR_026786, intron 15 of 16) HAL1|LINE|L1 6495 NR_046669 100873947 Hs.637166 NR_046669 ENSG00000232832 LMLN-AS1 - LMLN antisense RNA 1 ncRNA 132.667-47 chr14 30514695 30514935 + 0.666667 NA intron (NR_151720, intron 3 of 3) AluSz6|SINE|Alu -44308 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 137.333-185 chr7 99412981 99413240 + 0.666667 NA intron (NM_001370410, intron 3 of 5) intron (NM_001370410, intron 3 of 5) 3938 NR_162133 113219453 NR_162133 MIR12119 - microRNA 12119 ncRNA 173-78 chr5 105173276 105173697 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 74012 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 198.333-155 chr5 21152757 21153071 + 0.666667 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -306566 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 161.667-151 chr2 227903912 227904204 + 0.666667 NA intron (NM_178821, intron 7 of 12) intron (NM_178821, intron 7 of 12) 32427 NM_178821 164781 Hs.424594 NM_178821 ENSG00000123977 DAW1 ODA16|WDR69 dynein assembly factor with WD repeats 1 protein-coding 136-70 chr3 194390251 194390587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8847 NM_004488 2814 Hs.73734 NM_004488 ENSG00000178732 GP5 CD42d|GPV glycoprotein V platelet protein-coding 269-43 chr5 149854832 149855409 + 0.666667 NA TTS (NM_133263) TTS (NM_133263) 77857 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 192-48 chr12 130225860 130226397 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 63669 NM_007197 11211 Hs.31664 NM_007197 ENSG00000111432 FZD10 CD350|FZ-10|Fz10|FzE7|hFz10 frizzled class receptor 10 protein-coding 174-38 chr15 76461961 76462354 + 0.666667 NA intron (NR_148227, intron 25 of 32) L1MC4a|LINE|L1 -124490 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 165.333-56 chr12 43496689 43497033 + 0.666667 NA intron (NM_025003, intron 4 of 38) intron (NM_025003, intron 4 of 38) 55342 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 115.333-101 chr18 30902442 30902722 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140160 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 127-3 chr1 33944373 33944637 + 0.666667 NA intron (NM_052896, intron 3 of 69) intron (NM_052896, intron 3 of 69) 75549 NR_038372 402779 Hs.666207 NR_038372 ENSG00000231163 CSMD2-AS1 - CSMD2 antisense RNA 1 ncRNA 114-102 chr4 64901626 64901919 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 102728 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 123.333-217 chr8 114816630 114816939 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 851229 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 112.667-65 chr14 52863113 52863409 + 0.666667 NA intron (NM_001134999, intron 12 of 15) intron (NM_001134999, intron 12 of 15) -71654 NM_198066 64841 Hs.478025 NM_198066 ENSG00000100522 GNPNAT1 GNA1|GNPNAT|Gpnat1 glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 protein-coding 202.333-79 chr18 48601026 48601628 + 0.666667 NA intron (NM_001142397, intron 2 of 12).2 L4_B_Mam|LINE|RTE-X 62296 NM_001142397 9811 Hs.145230 NM_014772 ENSG00000134030 CTIF Gm672|KIAA0427 cap binding complex dependent translation initiation factor protein-coding 197.333-46 chr12 12080760 12081347 + 0.666667 NA intron (NM_001370269, intron 4 of 7) AluJb|SINE|Alu 9585 NM_138722 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 121.333-106 chr22 28919143 28919466 + 0.666667 NA intron (NM_032173, intron 1 of 8) intron (NM_032173, intron 1 of 8) 1915 NM_032173 84133 Hs.604200 NM_032173 ENSG00000183579 ZNRF3 BK747E2.3|RNF203 zinc and ring finger 3 protein-coding 164.333-158 chr3 90490170 90490525 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1382726 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 267-41 chr2 144258542 144259151 + 0.666667 NA intron (NM_001354354, intron 1 of 12) intron (NM_001354354, intron 1 of 12) -10147 NR_148872 79712 Hs.44780 NM_024659 ENSG00000121964 GTDC1 Hmat-Xa|mat-Xa glycosyltransferase like domain containing 1 protein-coding 159.667-332 chr8 132099115 132099495 + 0.666667 NA intron (NM_001145095, intron 3 of 15) intron (NM_001145095, intron 3 of 15) 5960 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 143.333-34 chr10 51779776 51780067 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) -80326 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 117.667-166 chr6 70378340 70378521 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15772 NR_125857 101928353 NR_125857 EVADR - uncharacterized LOC101928353 ncRNA 149-145 chr8 84831338 84831682 + 0.666667 NA intron (NM_001287244, intron 3 of 7) intron (NM_001287244, intron 3 of 7) 125583 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 188.667-58 chr17 50825559 50826011 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8799 NM_001330341 124857 Hs.211475 NM_175575 ENSG00000173714 WFIKKN2 GASP-1|WFDC20B|WFIKKNRP|hGASP-1 WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 protein-coding 116-32 chr12 61548819 61549010 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 643925 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 218-81 chr4 74994235 74994799 + 0.666667 NA intron (NM_015393, intron 1 of 3) intron (NM_015393, intron 1 of 3) -24155 NR_121617 100507388 Hs.570765 NR_121617 ENSG00000249717 LOC100507388 - uncharacterized LOC100507388 ncRNA 197.667-141 chr7 80946588 80947080 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24445 NM_001350120 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 170-4 chr1 183501839 183502196 + 0.666667 NA intron (NM_001350220, intron 2 of 24) intron (NM_001350220, intron 2 of 24) 29518 NM_201569 9887 Hs.591463 NM_014837 ENSG00000116698 SMG7 C1orf16|EST1C|SGA56M SMG7 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 184-99 chr6 156001433 156001792 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 54815 NR_031606 100302259 NR_031606 ENSG00000221456 MIR1202 MIRN1202|hsa-mir-1202 microRNA 1202 ncRNA 154-72 chr18 40886660 40886951 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 633872 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 153.333-115 chr14 49749336 49749648 + 0.666667 NA intron (NM_172193, intron 12 of 12) AluSx3|SINE|Alu -18661 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 122.333-59 chr14 57938084 57938398 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72149 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 131.667-191 chr8 57613938 57614205 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -132078 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 143.333-251 chr6 139209426 139209726 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 74496 NM_016217 51696 Hs.197644 NM_016217 ENSG00000112406 HECA HDC|HDCL|HHDC|dJ225E12.1 hdc homolog, cell cycle regulator protein-coding 128-90 chr5 22337871 22338168 + 0.666667 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) L1MA2|LINE|L1 -124169 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 115-32 chr11 61048142 61048409 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45688 NM_001346456 921 Hs.58685 NM_014207 ENSG00000110448 CD5 LEU1|T1 CD5 molecule protein-coding 167.667-108 chr2 123046405 123046856 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 26851 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 186.667-38 chr14 63391612 63392051 + 0.666667 NA exon (NM_001282180, exon 10 of 14) exon (NM_001282180, exon 10 of 14) -72896 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 134.333-169 chr8 54033104 54033368 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10788 NM_201437 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 157.333-252 chr4 25380827 25381139 + 0.666667 NA intron (NM_013367, intron 3 of 28) intron (NM_013367, intron 3 of 28) 3720 NM_001286756 29945 Hs.152173 NM_013367 ENSG00000053900 ANAPC4 APC4 anaphase promoting complex subunit 4 protein-coding 122.333-104 chr2 160124382 160124610 + 0.666667 NA intron (NM_001282390, intron 10 of 13) intron (NM_001282390, intron 10 of 13) -61881 NM_001007267 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 161-59 chr3 85176221 85176575 + 0.666667 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -114134 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 134.333-179 chr8 116940668 116940885 + 0.666667 NA intron (NM_001025357, intron 1 of 1) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 2569 NM_001025357 441376 Hs.437551 NM_001025357 ENSG00000205002 AARD C8orf85 alanine and arginine rich domain containing protein protein-coding 130.667-184 chr7 31493555 31493927 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20330 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 294.667-48 chr6 138223570 138224223 + 0.666667 NA intron (NM_020340, intron 4 of 33) L2b|LINE|L2 -5406 NM_021635 59351 Hs.302016 NM_021635 ENSG00000254440 PBOV1 UC28|UROC28|dJ171N11.2 prostate and breast cancer overexpressed 1 protein-coding 246-20 chr12 24421425 24421897 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 140830 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 153-141 chr8 64463337 64463757 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 84398 NR_029669 406908 NR_029669 ENSG00000207816 MIR124-2 MIRN124-2|MIRN124A2|mir-124-2 microRNA 124-2 ncRNA 114.667-11 chr1 162681346 162681581 + 0.666667 NA intron (NM_006182, intron 2 of 17) intron (NM_006182, intron 2 of 17) 48999 NM_001014796 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 126.667-49 chr14 53170078 53170423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16896 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 117.667-197 chr8 109650839 109651090 + 0.666667 NA TTS (NR_161375) TTS (NR_161375) -2061 NM_001099748 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 149-89 chr3 39541361 39541721 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL 39475 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 172.667-151 chr7 66197668 66198005 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7498 NM_003596 8460 Hs.421194 NM_003596 ENSG00000169902 TPST1 TANGO13A tyrosylprotein sulfotransferase 1 protein-coding 152.667-30 chr10 17042771 17043079 + 0.666667 NA intron (NM_001081, intron 26 of 66) intron (NM_001081, intron 26 of 66) 86892 NM_001081 8029 Hs.166206 NM_001081 ENSG00000107611 CUBN IFCR|MGA1|gp280 cubilin protein-coding 119.333-244 chrX 93239871 93240140 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -415102 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 139.333-46 chr12 3732053 3732463 + 0.666667 NA intron (NM_001144958, intron 2 of 19) L2c|LINE|L2 20851 NM_032680 84766 Hs.504534 NM_032680 ENSG00000130038 CRACR2A EFCAB4B calcium release activated channel regulator 2A protein-coding 190.667-66 chr2 103612374 103612824 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -628170 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 169-11 chr10 88141103 88141468 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 277660 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 117.667-9 chr1 190234731 190234914 + 0.666667 NA intron (NM_199051, intron 4 of 7) intron (NM_199051, intron 4 of 7) 241188 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 256.333-90 chr9 126787804 126788294 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -16957 NM_001135776 23099 Hs.355581 NM_014007 ENSG00000169155 ZBTB43 ZBTB22B|ZNF-X|ZNF297B zinc finger and BTB domain containing 43 protein-coding 120-101 chr5 12496208 12496553 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -78477 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 162-99 chr5 24106341 24106630 + 0.666667 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) MER4D1|LTR|ERV1 155137 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 157.333-169 chr2 19106498 19106818 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79687 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 117-139 chr8 37027788 37028022 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 243531 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 122.667-158 chr5 128739177 128739454 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -201070 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 188.333-9 chr1 164338512 164338979 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -220615 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 219-11 chr10 66933313 66933939 + 0.666667 NA intron (NM_178011, intron 2 of 2) intron (NM_178011, intron 2 of 2) 7590 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 143.333-45 chr10 126366277 126366542 + 0.666667 NA intron (NM_001288974, intron 1 of 18) L1MEg|LINE|L1 22068 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 166-76 chr3 5325274 5325686 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -75225 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 139.333-16 chr1 232136449 232136752 + 0.666667 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL 210766 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 236-16 chr11 115815865 115816440 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55952 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 163.667-177 chr4 48196124 48196522 + 0.666667 NA intron (NM_003215, intron 2 of 17) MIR|SINE|MIR -62073 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 151.667-245 chr4 30853034 30853391 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) MIRc|SINE|MIR 132843 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 113-29 chr11 94700086 94700296 + 0.666667 NA intron (NR_135096, intron 1 of 6) MER41D|LTR|ERV1 40164 NR_135094 105369438 Hs.568921 NR_135093 ENSG00000255929 LOC105369438 - uncharacterized LOC105369438 ncRNA 171.667-96 chr20 23107436 23107817 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21302 NM_012072 22918 Hs.97199 NM_012072 ENSG00000125810 CD93 C1QR1|C1qR(P)|C1qRP|CDw93|ECSM3|MXRA4|dJ737E23.1 CD93 molecule protein-coding 143.333-238 chr6 15136758 15137110 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -109135 NM_004973 3720 Hs.269059 NM_004973 ENSG00000008083 JARID2 JMJ jumonji and AT-rich interaction domain containing 2 protein-coding 164-126 chr9 36191338 36191746 + 0.666667 NA intron (NM_001311204, intron 1 of 4) intron (NM_001311204, intron 1 of 4) 621 NM_001184760 1211 Hs.522114 NM_001833 ENSG00000122705 CLTA LCA clathrin light chain A protein-coding 182.667-99 chr3 105209914 105210338 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -156587 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 154.333-188 chr20 57479303 57479704 + 0.666667 NA Intergenic (AATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 45364 NM_001269044 140690 Hs.131543 NM_080618 ENSG00000124092 CTCFL BORIS|CT27|CTCF-T|HMGB1L1|dJ579F20.2 CCCTC-binding factor like protein-coding 114-125 chr5 146077713 146078041 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 27700 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 198.667-68 chr15 39450196 39450634 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL -130664 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 172-57 chr2 115042066 115042434 + 0.666667 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) MIRb|SINE|MIR -22323 NM_001178037 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 119.667-180 chr8 64041340 64041535 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 272007 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 232.333-27 chr15 86509377 86509921 + 0.666667 NA intron (NM_152336, intron 18 of 24) intron (NM_152336, intron 18 of 24) -192681 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 190.667-16 chr10 52274118 52274524 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 12 of 17) L1PB1|LINE|L1 39807 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 124-2 chr1 44570451 44570696 + 0.666667 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 25080 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 253-60 chr6 49741003 49741597 + 0.666667 NA intron (NM_001368123, intron 1 of 7) intron (NM_001368123, intron 1 of 7) 3088 NM_001368123 10321 Hs.404466 NM_006061 ENSG00000096006 CRISP3 Aeg2|CRISP-3|CRS3|SGP28|dJ442L6.3 cysteine rich secretory protein 3 protein-coding 194-36 chr14 51232598 51232932 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -7482 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 157.333-360 chr9 74049906 74050215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -321471 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 156.667-310 chr7 7709483 7709874 + 0.666667 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) intron (NM_002947, intron 2 of 7) 8929 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 131-23 chr13 94323356 94323712 + 0.666667 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) L1PB4|LINE|L1 -135543 NR_046535 100873972 Hs.670344 NR_046535 ENSG00000236520 GPC6-AS1 - GPC6 antisense RNA 1 ncRNA 215.333-191 chr7 125114774 125115263 + 0.666667 NA intron (NR_125719, intron 5 of 7) AluJb|SINE|Alu -69551 NR_110188 101928283 Hs.566650 NR_110188 ENSG00000224897 LOC101928283 - uncharacterized LOC101928283 ncRNA 118.667-82 chr16 76893564 76893861 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 24776 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 199.333-85 chr15 26604012 26604514 + 0.666667 NA intron (NM_001191320, intron 2 of 6) L1MA2|LINE|L1 24827 NM_001191321 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 234.667-115 chr9 28645149 28645693 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 73884 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 206.333-105 chr22 24559862 24560296 + 0.666667 NA intron (NR_103819, intron 2 of 2) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 4080 NM_004175 6634 Hs.356549 NM_004175 ENSG00000100028 SNRPD3 SMD3|Sm-D3 small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide protein-coding 112.333-79 chr14 100036406 100036660 + 0.666667 NA intron (NM_001330221, intron 1 of 13) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -28889 NM_016337 51466 Hs.125867 NM_016337 ENSG00000196405 EVL RNB6 Enah/Vasp-like protein-coding 169.667-27 chr11 16597649 16597960 + 0.666667 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) L3b|LINE|CR1 -121416 NM_033326 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 146-99 chr4 118729823 118730212 + 0.666667 NA intron (NM_014822, intron 21 of 22) intron (NM_014822, intron 21 of 22) 44625 NM_020961 57721 Hs.596872 NM_020961 ENSG00000145388 METTL14 hMETTL14 methyltransferase like 14 protein-coding 146-61 chr2 104191763 104192074 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 216414 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 193-53 chr21 28964934 28965343 + 0.666667 NA intron (NM_001320766, intron 10 of 28) L1MB2|LINE|L1 27739 NM_015565 26046 Hs.288773 NM_015565 ENSG00000198862 LTN1 C21orf10|C21orf98|RNF160|ZNF294 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 150.667-199 chr2 196311473 196311864 + 0.666667 NA intron (NM_020760, intron 10 of 28) AluSx|SINE|Alu 50509 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 190-51 chr17 58207038 58207415 + 0.666667 NA intron (NM_001321269, intron 14 of 16) intron (NM_001321269, intron 14 of 16) 12029 NM_001330397 54903 Hs.408843 NM_017777 ENSG00000011143 MKS1 BBS13|JBTS28|MES|MKS|POC12 MKS transition zone complex subunit 1 protein-coding 120-136 chr8 68129074 68129339 + 0.666667 NA intron (NM_024870, intron 31 of 39) intron (NM_024870, intron 31 of 39) 177160 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 138-38 chr14 64127580 64127977 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 73 of 114) L1MC5|LINE|L1 -32653 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 143.667-208 chr6 14494298 14494583 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -208986 NR_108096 102216342 Hs.563409 NR_108096 ENSG00000226673 LINC01108 LncRNA-ES1 long intergenic non-protein coding RNA 1108 ncRNA 119-110 chr4 36571572 36571843 + 0.666667 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) L1MB2|LINE|L1 70193 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 144.333-144 chr2 214270492 214270900 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) L2a|LINE|L2 -140358 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 210.667-11 chr1 244847965 244848487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5991 NR_132782 106635532 NR_132782 SNORA100 - small nucleolar RNA, H/ACA box 100 snoRNA 120-71 chr2 152199008 152199339 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -23410 NM_005843 10254 Hs.17200 NM_005843 ENSG00000115145 STAM2 Hbp|STAM2A|STAM2B signal transducing adaptor molecule 2 protein-coding 186.333 chr1 17558954 17559324 + 0.666667 NA intron (NR_137287, intron 1 of 29) MIR|SINE|MIR 19441 NR_137288 55160 Hs.443460 NM_018125 ENSG00000074964 ARHGEF10L GrinchGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like protein-coding 130.667-5 chr1 53624083 53624338 + 0.666667 NA intron (NM_001367484, intron 2 of 10) L1M5|LINE|L1 109994 NM_147193 148979 Hs.306691 NM_147193 ENSG00000174332 GLIS1 - GLIS family zinc finger 1 protein-coding 275.667-65 chr8 101291684 101292196 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76953 NR_002182 83955 Hs.567608 NM_032031 ENSG00000228224 NACA4P FKSG17|NACAP1 NACA family member 4, pseudogene pseudo 227-38 chr4 32314548 32315091 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -36219 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 150.667-7 chr1 53170565 53170874 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26105 NM_001330589 1376 Hs.713535 NM_000098 ENSG00000157184 CPT2 CPT1|CPTASE|IIAE4 carnitine palmitoyltransferase 2 protein-coding 112-72 chr15 79148610 79148850 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -57950 NM_001145648 5923 Hs.459035 NM_002891 ENSG00000058335 RASGRF1 CDC25|CDC25L|GNRP|GRF1|GRF55|H-GRF55|PP13187|ras-GRF1 Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1 protein-coding 139-28 chr12 62269408 62269726 + 0.666667 NA intron (NR_147080, intron 1 of 19) AluJr4|SINE|Alu 9163 NM_001351163 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 117.333-77 chr16 70732364 70732598 + 0.666667 NA intron (NM_001351157, intron 12 of 17) intron (NM_001351157, intron 12 of 17) -22614 NR_034083 100130894 Hs.678899 NR_034083 ENSG00000214353 VAC14-AS1 - VAC14 antisense RNA 1 ncRNA 144.333-269 chr8 104105276 104105703 + 0.666667 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) intron (NM_001348498, intron 19 of 24) -117846 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 113-119 chr2 241312976 241313215 + 0.666667 NA intron (NM_005336, intron 1 of 27) L2c|LINE|L2 -2092 NM_001349315 4735 Hs.721234 NM_004404 ENSG00000168385 SEPTIN2 DIFF6|NEDD-5|NEDD5|Pnutl3|SEPT2|hNedd5 septin 2 protein-coding 129.667-12 chr1 162756304 162756585 + 0.666667 NA intron (NM_006182, intron 7 of 17) intron (NM_006182, intron 7 of 17) -34258 NM_016371 51478 Hs.492925 NM_016371 ENSG00000132196 HSD17B7 PRAP|SDR37C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 7 protein-coding 126.667-139 chr5 64763379 64763605 + 0.666667 NA intron (NM_173829, intron 1 of 4) AluSc8|SINE|Alu 5199 NM_173829 285672 Hs.69504 NM_173829 ENSG00000153006 SREK1IP1 P18SRP|SFRS12IP1 SREK1 interacting protein 1 protein-coding 189.333-110 chr20 39774610 39775109 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -229602 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 118.667-122 chr20 49356639 49356948 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76110 NR_003030 692057 NR_003030 ENSG00000212304 SNORD12 HBII-99|MIR1259|MIRN1259 small nucleolar RNA, C/D box 12 snoRNA 158.333-225 chr3 197359281 197359566 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -60102 NM_001366203 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 121.333-176 chr8 80629091 80629301 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001367783, exon 9 of 9) 142970 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 132-111 chr7 77407894 77408154 + 0.666667 NA intron (NR_146937, intron 1 of 31) L1ME3A|LINE|L1 -7174 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 177.333 chr1 19496552 19496942 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11208 NM_004930 832 Hs.432760 NM_004930 ENSG00000077549 CAPZB CAPB|CAPPB|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit beta protein-coding 168-22 chr12 69821038 69821392 + 0.666667 NA non-coding (NR_103520, exon 9 of 9) non-coding (NR_103520, exon 9 of 9) -4012 NM_182530 196446 Hs.253773 NM_182530 ENSG00000166268 MYRFL C12orf15|C12orf28|bcm1377 myelin regulatory factor like protein-coding 120-7 chr1 209337998 209338301 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12693 NR_135085 105372897 Hs.116154 NR_135085 ENSG00000227940 LINC01696 - long intergenic non-protein coding RNA 1696 ncRNA 118.667-39 chr10 124634615 124634908 + 0.666667 NA intron (NM_014661, intron 4 of 4) L1MB7|LINE|L1 -69267 NR_120630 101927944 Hs.437448 NR_120630 FAM53B-AS1 - FAM53B antisense RNA 1 ncRNA 140-75 chr3 193624761 193625174 + 0.666667 NA intron (NR_046634, intron 1 of 2) intron (NR_046634, intron 1 of 2) 2365 NR_046634 100873941 Hs.679364 NR_046634 ENSG00000224855 OPA1-AS1 - OPA1 antisense RNA 1 ncRNA 230.333-66 chr2 164027790 164028357 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -292065 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 166-88 chr4 63443067 63443396 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 966219 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 150.333-212 chr2 145849844 145850208 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -737031 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 131-13 chr10 50862680 50863023 + 0.666667 NA intron (NM_001370131, intron 1 of 11) intron (NM_001370131, intron 1 of 11) 22776 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 202.667-62 chr16 57214925 57215402 + 0.666667 NA intron (NM_001305164, intron 6 of 14) L2c|LINE|L2 28834 NM_001305163 89970 Hs.460885 NM_133368 ENSG00000159579 RSPRY1 SEMDFA ring finger and SPRY domain containing 1 protein-coding 156-42 chr14 34477245 34477538 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -15151 NM_138288 171546 Hs.740577 NM_138288 ENSG00000165389 SPTSSA C14orf147|SSSPTA serine palmitoyltransferase small subunit A protein-coding 118.333-182 chr6 134039973 134040217 + 0.666667 NA intron (NM_145176, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 12529 NM_145176 154091 Hs.486508 NM_145176 ENSG00000146411 SLC2A12 GLUT12|GLUT8 solute carrier family 2 member 12 protein-coding 114-70 chr2 70286661 70286960 + 0.666667 NA intron (NM_001317166, intron 3 of 3) intron (NM_001317166, intron 3 of 3) 6414 NM_001317167 6637 Hs.465167 NM_003096 ENSG00000143977 SNRPG SMG|Sm-G small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G protein-coding 123-81 chr3 154871198 154871481 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -152785 NM_001354642 4311 Hs.307734 NM_000902 ENSG00000196549 MME CALLA|CD10|CMT2T|NEP|SCA43|SFE membrane metalloendopeptidase protein-coding 150.667-240 chr3 50674046 50674333 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_039950) promoter-TSS (NR_039950) -738 NM_004947 1795 Hs.476284 NM_004947 ENSG00000088538 DOCK3 MOCA|NEDIDHA|PBP dedicator of cytokinesis 3 protein-coding 136.333-154 chr4 127100769 127101029 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -532058 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 112.667-165 chr3 16894513 16894824 + 0.666667 NA intron (NM_001144382, intron 1 of 5).2 L1M5|LINE|L1 9713 NM_001144382 23228 Hs.202010 NM_015184 ENSG00000154822 PLCL2 PLCE2 phospholipase C like 2 protein-coding 162.333-183 chr4 63010170 63010495 + 0.666667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -848567 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 112.333-94 chr17 56870467 56870738 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14311 NR_027025 246754 Hs.720736 NR_027025 MTVR2 - mouse mammary tumor virus receptor homolog 2 pseudo 176.333-150 chr6 136130593 136131084 + 0.666667 NA intron (NM_018945, intron 3 of 12) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -58011 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 116-95 chr21 17600195 17600408 + 0.666667 NA intron (NM_006806, intron 3 of 4) intron (NM_006806, intron 3 of 4) -11385 NR_149073 110806272 Hs.607138 NR_149073 ENSG00000280594 BTG3-AS1 ASBEL BTG3 antisense RNA 1 ncRNA 205-77 chr6 13540863 13541367 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -33414 NM_031244 23408 Hs.567431 NM_012241 ENSG00000124523 SIRT5 SIR2L5 sirtuin 5 protein-coding 163.333-267 chr7 105817609 105817957 + 0.666667 NA intron (NM_152749, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 58802 NM_020725 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 192-119 chr5 168447189 168447500 + 0.666667 NA intron (NM_001161661, intron 17 of 22) MER58B|DNA|hAT-Charlie -39127 NM_002887 5917 Hs.654907 NM_002887 ENSG00000113643 RARS ArgRS|DALRD1|HLD9 arginyl-tRNA synthetase protein-coding 115.333-174 chr5 69111634 69111882 + 0.666667 NA intron (NM_022902, intron 5 of 15) intron (NM_022902, intron 5 of 15) 17744 NM_022902 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 130.333-61 chr13 84672725 84673070 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -110757 NR_132852 106635542 NR_132852 SNORA107 - small nucleolar RNA, H/ACA box 107 snoRNA 181-5 chr10 37208297 37208688 + 0.666667 NA intron (NM_052997, intron 31 of 35) L1PA15-16|LINE|L1 82635 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 148.667-173 chr2 16479030 16479326 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 186656 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 157.333-278 chr5 38560787 38561250 + 0.666667 NA intron (NR_103554, intron 1 of 8) intron (NR_103554, intron 1 of 8) -3457 NR_037423 100500824 NR_037423 ENSG00000265304 MIR3650 - microRNA 3650 ncRNA 111.667-93 chr15 93550328 93550658 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -306067 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 121-99 chr3 114611981 114612218 + 0.666667 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) 12107 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 153.333-340 chr5 113869808 113870174 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 356297 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 175.333-117 chr3 36927138 36927616 + 0.666667 NA intron (NM_001329998, intron 1 of 23) MER83|LTR|ERV1 17677 NM_014831 9881 Hs.170999 NM_014831 ENSG00000168016 TRANK1 LBA1 tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 protein-coding 170.667-125 chr4 85213245 85213615 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 245946 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 134.667-106 chr2 174084171 174084454 + 0.666667 NA intron (NM_001011708, intron 6 of 9) intron (NM_001011708, intron 6 of 9) 59032 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 179.667-81 chr2 191552806 191553172 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -125083 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 160-76 chr3 68786527 68786983 + 0.666667 NA intron (NM_001005527, intron 3 of 5) MIRc|SINE|MIR 145792 NM_182522 151647 Hs.187873 NM_182522 ENSG00000163377 TAFA4 FAM19A4|TAFA-4 TAFA chemokine like family member 4 protein-coding 186-69 chr4 30828759 30829173 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) MER121|DNA|hAT? 108597 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 114.667-112 chr18 10886716 10887000 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 4 of 51) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -127209 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 115.333-178 chr5 167684973 167685157 + 0.666667 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) -69864 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 246.333-26 chr13 88066768 88067324 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75821 NR_131919 105370306 Hs.560133 NR_131919 ENSG00000231019 LINC00373 - long intergenic non-protein coding RNA 373 ncRNA 144-114 chr3 144401462 144401731 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 428515 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 256.666-14 chr14 96299005 96299714 + 0.666667 NA intron (NM_018036, intron 34 of 41) L2c|LINE|L2 43149 NM_000710 623 Hs.525572 NM_000710 ENSG00000100739 BDKRB1 B1BKR|B1R|BDKRB2|BKB1R|BKR1|BRADYB1 bradykinin receptor B1 protein-coding 146-89 chr3 108516962 108517311 + 0.666667 NA intron (NM_014981, intron 1 of 41) intron (NM_014981, intron 1 of 41) 12186 NM_014981 22989 Hs.731060 NM_014981 ENSG00000144821 MYH15 - myosin heavy chain 15 protein-coding 136-85 chr5 81548465 81548733 + 0.666667 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) intron (NM_012446, intron 4 of 16) -154465 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 146.667-302 chr7 36747203 36747491 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22798 NM_001177507 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 125-8 chr1 173658879 173659207 + 0.666667 NA intron (NM_198493, intron 2 of 5) intron (NM_198493, intron 2 of 5) 10808 NM_198493 339416 Hs.130054 NM_198493 ENSG00000183831 ANKRD45 CT117 ankyrin repeat domain 45 protein-coding 142.667-13 chr1 215887697 215888025 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 41 of 71) intron (NM_206933, intron 41 of 71) -184604 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 112.333-105 chr18 71779965 71780181 + 0.666667 NA intron (NR_126324, intron 1 of 4) intron (NR_126324, intron 1 of 4) 2153 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 217.667-66 chr4 56263164 56263693 + 0.666667 NA intron (NM_020722, intron 2 of 10) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 93233 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 151-63 chr2 126923941 126924239 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 25200 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 115.333-198 chr7 44135420 44135729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5758 NM_021223 58498 Hs.75636 NM_021223 ENSG00000106631 MYL7 MYL2A|MYLC2A myosin light chain 7 protein-coding 118.333-148 chr4 36827261 36827520 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -174389 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 223-17 chr14 51547963 51548557 + 0.666667 NA intron (NR_047477, intron 2 of 3) intron (NR_047477, intron 2 of 3) 51692 NR_051990 100874185 Hs.578226 NR_047477 ENSG00000258537 FRMD6-AS2 - FRMD6 antisense RNA 2 ncRNA 173-6 chr10 32921271 32921769 + 0.666667 NA intron (NM_002211, intron 9 of 15) intron (NM_002211, intron 9 of 15) 14038 NM_033668 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 131-71 chr4 99864653 99864874 + 0.666667 NA intron (NM_001306151, intron 7 of 9) intron (NM_001306151, intron 7 of 9) 29664 NM_021970 8649 Hs.433332 NM_021970 ENSG00000109270 LAMTOR3 MAP2K1IP1|MAPBP|MAPKSP1|MP1|PRO0633|Ragulator3 late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 protein-coding 115.333-194 chr6 160652627 160652868 + 0.666667 NA intron (NM_005577, intron 1 of 38) L1MCc|LINE|L1 11512 NM_005577 4018 Hs.520120 NM_005577 ENSG00000198670 LPA AK38|APOA|LP lipoprotein(a) protein-coding 147.667-36 chr10 53193561 53193968 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -422064 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 114.667-187 chr4 23651770 23651995 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 229410 NM_001330753 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 161.667-269 chr9 71082580 71083041 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 38811 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 113.333-101 chr17 65189656 65189890 + 0.666667 NA intron (NM_003835, intron 10 of 18) intron (NM_003835, intron 10 of 18) 52403 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 160.667-326 chr9 34960217 34960534 + 0.666667 NA intron (NM_015297, intron 1 of 7) intron (NM_015297, intron 1 of 7) 2090 NM_001347983 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 127.333-70 chr18 57666130 57666447 + 0.666667 NA intron (NM_005603, intron 20 of 27) intron (NM_005603, intron 20 of 27) 35957 NM_001242804 100505549 Hs.660645 NM_001242804 LOC100505549 - uncharacterized LOC100505549 protein-coding 152.333-355 chr7 66364289 66364594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35967 NR_026873 285908 Hs.50755 NM_181722 ENSG00000179406 LINC00174 NCRNA00174 long intergenic non-protein coding RNA 174 ncRNA 121.333-166 chr7 41983514 41983743 + 0.666667 NA intron (NM_000168, intron 10 of 14) intron (NM_000168, intron 10 of 14) 253581 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 159.333-235 chr4 44727052 44727391 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_138335) promoter-TSS (NM_138335) -587 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 166.333-197 chr6 40617413 40617852 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -30268 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 155-124 chr8 35876324 35876680 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166182 NR_125819 101929550 Hs.583803 NR_125819 LOC101929550 - uncharacterized LOC101929550 ncRNA 244.333-75 chr3 185524222 185524761 + 0.666667 NA intron (NM_139248, intron 4 of 9) AluSx3|SINE|Alu -25456 NM_080652 90407 Hs.677570 NM_080652 ENSG00000163900 TMEM41A 2900010K02Rik transmembrane protein 41A protein-coding 120-32 chr12 79732481 79732681 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -41484 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 111.667-102 chr17 47798532 47798754 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23151 NM_145798 114881 Hs.463320 NM_017731 ENSG00000006025 OSBPL7 ORP7 oxysterol binding protein like 7 protein-coding 141.667-62 chr12 120231785 120232100 + 0.666667 NA intron (NM_002859, intron 1 of 10) intron (NM_002859, intron 1 of 10) 18221 NM_025157 5829 Hs.446336 NM_002859 ENSG00000089159 PXN - paxillin protein-coding 247-6 chr1 212045319 212045757 + 0.666667 NA intron (NM_001286229, intron 2 of 12) L2b|LINE|L2 6513 NR_026911 100131205 Hs.126774 NR_026911 ENSG00000220749 RPL21P28 RPL21_8_160 ribosomal protein L21 pseudogene 28 pseudo 134.333-141 chr5 100645206 100645423 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 109940 NM_198507 345757 Hs.356108 NM_198507 ENSG00000174132 FAM174A HGS_RE408|NS5ATP6|TMEM157|UNQ1912 family with sequence similarity 174 member A protein-coding 161-83 chr5 133668406 133668742 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56033 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 206.333-43 chr13 21171958 21172363 + 0.666667 NA intron (NM_145061, intron 3 of 8) intron (NM_145061, intron 3 of 8) 4392 NM_001166017 221150 Hs.88523 NM_145061 ENSG00000165480 SKA3 C13orf3|RAMA1 spindle and kinetochore associated complex subunit 3 protein-coding 131-29 chr14 67852981 67853227 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 4 of 10) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 29512 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 152.667-47 chr10 73892783 73893232 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18094 NM_001319191 5328 Hs.77274 NM_002658 ENSG00000122861 PLAU ATF|BDPLT5|QPD|UPA|URK|u-PA plasminogen activator, urokinase protein-coding 237-66 chr6 120371016 120371526 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 356092 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 119.667-133 chr4 83632021 83632306 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 96055 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 162-104 chr5 144771214 144771533 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 565982 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 118.667-101 chr2 100371348 100371560 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 46214 NM_004854 9486 Hs.516370 NM_004854 ENSG00000115526 CHST10 HNK-1ST|HNK1ST carbohydrate sulfotransferase 10 protein-coding 170.333-193 chr7 853236 853720 + 0.666667 NA exon (NM_001367665, exon 11 of 19) exon (NM_001367665, exon 11 of 19) 12104 NM_001367708 23353 Hs.438072 NM_025154 ENSG00000164828 SUN1 UNC84A Sad1 and UNC84 domain containing 1 protein-coding 115.667-222 chr9 21069022 21069302 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8780 NM_002176 3456 Hs.93177 NM_002176 ENSG00000171855 IFNB1 IFB|IFF|IFN-beta|IFNB interferon beta 1 protein-coding 130-54 chr2 85606378 85606704 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001013649, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001013649, exon 4 of 4) 3680 NR_046347 10713 Hs.654745 NM_006590 ENSG00000168883 USP39 65K|CGI-21|HSPC332|SAD1|SNRNP65 ubiquitin specific peptidase 39 protein-coding 144.333-53 chr12 97399929 97400183 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62720 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 145.667-74 chr14 48333624 48333910 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -538753 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 113.333-12 chr1 143271546 143271753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 150943 NR_027354 645166 Hs.744183 NR_027354 LSP1P5 - LSP1 pseudogene 5 pseudo 155.333-246 chr3 184942117 184942559 + 0.666667 NA intron (NM_001009921, intron 35 of 46) intron (NM_001009921, intron 35 of 46) 129831 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 171.333-86 chr2 111116768 111117127 + 0.666667 NA intron (NM_001142807, intron 17 of 17) intron (NM_001142807, intron 17 of 17) -1359 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 167.667-104 chr2 80460651 80461011 + 0.666667 NA intron (NM_001282599, intron 3 of 11) MER5A|DNA|hAT-Charlie 147452 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 135.667-72 chr17 29053049 29053438 + 0.666667 NA intron (NM_016518, intron 3 of 7) intron (NM_016518, intron 3 of 7) 10102 NM_016518 51268 Hs.462585 NM_016518 ENSG00000179761 PIPOX LPIPOX pipecolic acid and sarcosine oxidase protein-coding 160.667-273 chr7 24883080 24883531 + 0.666667 NA intron (NR_104111, intron 1 of 21) intron (NR_104111, intron 1 of 21) 9316 NM_145320 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 114.333-4 chr1 78371742 78372009 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -119099 NM_000959 5737 Hs.654365 NM_000959 ENSG00000122420 PTGFR FP prostaglandin F receptor protein-coding 203.667-57 chr2 100994869 100995360 + 0.666667 NA intron (NM_002518, intron 20 of 20) intron (NM_002518, intron 20 of 20) -7115 NM_001098577 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 155.333-40 chr10 98299106 98299544 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -31131 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 135-97 chr7 17634194 17634525 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -75450 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 165-37 chr2 77206160 77206518 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 220374 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 152-80 chr2 3801769 3802030 + 0.666667 NA intron (NM_001287444, intron 10 of 10) intron (NM_001287444, intron 10 of 10) 95057 NM_001365580 728597 Hs.304233 NM_001287444 ENSG00000214866 DCDC2C - doublecortin domain containing 2C protein-coding 242.667-7 chr1 74576123 74576531 + 0.666667 NA intron (NM_001002912, intron 13 of 14) intron (NM_001002912, intron 13 of 14) -1103 NR_121671 101927320 Hs.662589 NR_121670 ENSG00000234497 ERICH3-AS1 - ERICH3 antisense RNA 1 ncRNA 173.667-56 chr16 88723386 88723884 + 0.666667 NA intron (NM_001142864, intron 31 of 50) intron (NM_001142864, intron 31 of 50) -7298 NR_039873 100616167 NR_039873 ENSG00000284585 MIR4722 - microRNA 4722 ncRNA 112.667-216 chr5 105836831 105837086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 737484 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 129.333-5 chr1 116811276 116811631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57023 NM_001328609 914 Hs.523500 NM_001767 ENSG00000116824 CD2 LFA-2|SRBC|T11 CD2 molecule protein-coding 207.333-126 chr18 69377864 69378251 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22831 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 118.667-8 chr1 114742813 114743109 + 0.666667 NA intron (NM_001130523, intron 2 of 19) intron (NM_001130523, intron 2 of 19) 15023 NM_001130523 7812 Hs.69855 NM_007158 ENSG00000009307 CSDE1 D1S155E|UNR cold shock domain containing E1 protein-coding 157-135 chr8 135799471 135799772 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 342165 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 142.333-96 chr16 27688147 27688484 + 0.666667 NA intron (NM_015202, intron 8 of 27) AluSx1|SINE|Alu 30714 NR_147898 100128079 Hs.610277 NR_147898 LOC100128079 - uncharacterized LOC100128079 ncRNA 152.667-155 chr18 79317480 79317775 + 0.666667 NA intron (NR_148360, intron 16 of 31) L1MEg|LINE|L1 -78303 NM_006162 4772 Hs.534074 NM_006162 ENSG00000131196 NFATC1 NF-ATC|NF-ATc1.2|NFAT2|NFATc nuclear factor of activated T cells 1 protein-coding 117.333-171 chr5 95424581 95424812 + 0.666667 NA intron (NM_152548, intron 5 of 9) L1M7|LINE|L1 33330 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 155-97 chr3 133527431 133527704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36421 NR_135277 85003 Hs.659202 NR_135276 ENSG00000249993 BFSP2-AS1 - BFSP2 antisense RNA 1 ncRNA 183-93 chr6 50589243 50589645 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -124100 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 143-32 chr12 48770278 48770635 + 0.666667 NA intron (NM_015270, intron 20 of 21) MIRb|SINE|MIR 1581 NR_039850 100616262 NR_039850 ENSG00000264201 MIR4701 - microRNA 4701 ncRNA 151.333-148 chr15 62839053 62839465 + 0.666667 NA intron (NM_015059, intron 55 of 55) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 15302 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 155.667-92 chr14 52582440 52582848 + 0.666667 NA intron (NM_001353361, intron 1 of 7) AluSx|SINE|Alu 29808 NR_148417 283554 Hs.416214 NM_001099652 ENSG00000180998 GPR137C TM7SF1L2 G protein-coupled receptor 137C protein-coding 192.667-184 chr9 34265207 34265695 + 0.666667 NA intron (NM_194313, intron 8 of 12) AluJr|SINE|Alu 63817 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 116.333-57 chr13 73610113 73610313 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 45969 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 113.667-92 chr2 15708371 15708560 + 0.666667 NA intron (NR_110201, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR 17683 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 144.667-160 chr2 192946174 192946520 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 196502 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 114-59 chr18 7348975 7349261 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 111888 NM_001364581 112577592 NM_001364581 LOC112577592 - uncharacterized LOC112577592 protein-coding 165.333-102 chr17 30074823 30075141 + 0.666667 NA TTS (NM_001145053) TTS (NM_001145053) -41825 NM_001261467 84081 Hs.462663 NM_032141 ENSG00000126653 NSRP1 CCDC55|HSPC095|NSrp70 nuclear speckle splicing regulatory protein 1 protein-coding 341-4 chr10 92807272 92807952 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -19219 NM_001013848 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 137-50 chr2 177761818 177762045 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 11 of 20) intron (NM_001077197, intron 11 of 20) 88609 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 189.333-136 chr3 140765454 140765992 + 0.666667 NA Intergenic (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 87659 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 138.667-104 chr2 59309591 59309875 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 92025 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 140.333-157 chr4 43579573 43579983 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87235 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 183.333-122 chr4_GL000008v2_random 3263 3643 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 174718 NR_046228 100874392 Hs.648245 NR_046228 ANKRD20A12P - ankyrin repeat domain 20 family member A12, pseudogene pseudo 159-29 chr12 52004774 52005231 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1944 NM_181711 160622 Hs.407202 NM_181711 ENSG00000161835 GRASP TAMALIN general receptor for phosphoinositides 1 associated scaffold protein protein-coding 142-75 chr20 48372786 48373097 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13030 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 168-39 chr16 67694134 67694465 + 0.666667 NA intron (NM_001243650, intron 1 of 1) intron (NM_001243650, intron 1 of 1) 25017 NR_027398 81577 Hs.307084 NM_030819 ENSG00000141098 GFOD2 - glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2 protein-coding 158-30 chr12 1103766 1104180 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 3 of 19) intron (NR_027948, intron 3 of 19) 76225 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 112.667-145 chr20 3621823 3622041 + 0.666667 NA intron (NM_001323332, intron 24 of 25) L2a|LINE|L2 41467 NM_022139 64096 Hs.302025 NM_022139 ENSG00000125861 GFRA4 - GDNF family receptor alpha 4 protein-coding 129.667-181 chr8 133906808 133907048 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20432 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 132-33 chr13 42154896 42155126 + 0.666667 NA intron (NR_123715, intron 3 of 31) intron (NR_123715, intron 3 of 31) 16953 NM_001297429 160851 Hs.630380 NM_152910 ENSG00000102780 DGKH DGKeta diacylglycerol kinase eta protein-coding 150.333-105 chr14 45865664 45865967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -150213 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 114-148 chr7 84529480 84529704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2884 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 117.333-213 chr8 129011979 129012293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46135 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 127.667-73 chr2 13049628 13049846 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -42724 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 134.333-128 chr4 86307571 86307813 + 0.666667 NA intron (NM_001363657, intron 2 of 13) intron (NM_001363657, intron 2 of 13) 46952 NM_001318067 5602 Hs.13438 NM_002753 ENSG00000109339 MAPK10 JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK mitogen-activated protein kinase 10 protein-coding 125-41 chr15 101438190 101438529 + 0.666667 NA intron (NM_138325, intron 2 of 13) intron (NM_138325, intron 2 of 13) 51348 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 143.333-261 chr7 33365146 33365572 + 0.666667 NA intron (NM_198428, intron 16 of 22) L1M2a|LINE|L1 235795 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 114.333-242 chrX 10512473 10512722 + 0.666667 NA intron (NM_001193281, intron 2 of 2) intron (NM_001193281, intron 2 of 2) 55006 NM_001193279 4281 Hs.27695 NM_000381 ENSG00000101871 MID1 BBBG1|FXY|GBBB1|MIDIN|OGS1|OS|OSX|RNF59|TRIM18|XPRF|ZNFXY midline 1 protein-coding 159.667-144 chr18 2955767 2956238 + 0.666667 NA intron (NM_014646, intron 2 of 19) L1MC4a|LINE|L1 -9379 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 121-16 chr10 64842289 64842606 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16919 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 119.333-186 chr6 38919230 38919414 + 0.666667 NA intron (NM_001371, intron 69 of 91) intron (NM_001371, intron 69 of 91) 33785 NR_038401 100131047 Hs.670957 NR_038401 LOC100131047 - uncharacterized LOC100131047 ncRNA 118.667-100 chr2 88465017 88465253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12442 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 188.333-119 chr5 43215617 43216078 + 0.666667 NA intron (NR_072980, intron 1 of 3) intron (NR_072980, intron 1 of 3) 22995 NR_072980 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 182-66 chr3 39459652 39460006 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7851 NR_103506 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 152.333-239 chr3 97312276 97312707 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 5 of 17) Tigger4a|DNA|TcMar-Tigger -127116 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 261.333-15 chr10 77594040 77594801 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 1 of 28) intron (NM_001271519, intron 1 of 28) 43388 NM_001271522 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 117.667-163 chr6 54830939 54831146 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15729 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 207.333-135 chr2 101311995 101312487 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 2791 NR_049881 100847007 NR_049881 ENSG00000264857 MIR5696 - microRNA 5696 ncRNA 130-131 chr8 107259391 107259620 + 0.666667 NA intron (NM_001199859, intron 8 of 8) intron (NM_001199859, intron 8 of 8) 77010 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 164.333-249 chr9 38426726 38427185 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2501 NM_001007563 347252 Hs.349705 NM_001007563 ENSG00000137142 IGFBPL1 IGFBP-RP4|IGFBPRP4|bA113O24.1 insulin like growth factor binding protein like 1 protein-coding 166.667-181 chr5 63075997 63076444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 497401 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 192.333-116 chr3 141655107 141655616 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -7838 NR_136190 646730 Hs.570677 NR_136190 LINC02618 - long intergenic non-protein coding RNA 2618 ncRNA 121.667-5 chr1 50570759 50570982 + 0.666667 NA intron (NM_007051, intron 12 of 18) intron (NM_007051, intron 12 of 18) -147427 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 134.333-46 chr14 29801871 29802191 + 0.666667 NA intron (NM_001330069, intron 1 of 18) L2b|LINE|L2 125065 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 132.333-24 chr10 110082678 110083068 + 0.666667 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) intron (NM_001121, intron 1 of 13) -74492 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-211 chr2 216528988 216529344 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30322 NM_000998 6168 Hs.433701 NM_000998 ENSG00000197756 RPL37A L37A ribosomal protein L37a protein-coding 245.667-63 chr6 112759439 112759885 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 412332 NM_001013734 442247 Hs.448264 NM_001013734 ENSG00000251258 RFPL4B RNF211 ret finger protein like 4B protein-coding 190-89 chr4 55456330 55456630 + 0.666667 NA intron (NM_004898, intron 11 of 22) AluSx1|SINE|Alu 60523 NM_018475 55858 Hs.479766 NM_018475 ENSG00000134851 TMEM165 CDG2K|FT27|GDT1|TMPT27|TPARL transmembrane protein 165 protein-coding 136.667-186 chr9 29196737 29196992 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 15435 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 138-78 chr3 102981291 102981561 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 542690 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 132.667-151 chr6 62744818 62745125 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -458744 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 145.333-301 chr8 92529068 92529448 + 0.666667 NA Intergenic Ricksha_0|DNA|MULE-MuDR 126236 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 120.667-16 chr10 15491323 15491512 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -120128 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 122.667-180 chr7 106394204 106394497 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109367 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 148-49 chr15 92479992 92480291 + 0.666667 NA intron (NR_161371, intron 2 of 2) MIRb|SINE|MIR 8464 NR_161370 145858 Hs.367879 NM_153040 C15orf32 - chromosome 15 open reading frame 32 ncRNA 208.333-105 chr4 53912929 53913241 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 74197 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 180.333 chr1 24784642 24784978 + 0.666667 NA intron (NM_013943, intron 1 of 5) AluY|SINE|Alu 39363 NM_013943 25932 Hs.440544 NM_013943 ENSG00000169504 CLIC4 CLIC4L|H1|MTCLIC|huH1|p64H1 chloride intracellular channel 4 protein-coding 179.333-120 chr3 2150441 2150921 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 2 of 24) intron (NM_175607, intron 2 of 24) -6440 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 246.333-65 chr3 181677112 181677762 + 0.666667 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) intron (NR_075090, intron 2 of 2) -34488 NM_003106 6657 Hs.518438 NM_003106 ENSG00000181449 SOX2 ANOP3|MCOPS3 SRY-box transcription factor 2 protein-coding 157.667-13 chr1 150692612 150693036 + 0.666667 NA intron (NM_018178, intron 2 of 4) intron (NM_018178, intron 2 of 4) 4330 NM_018178 55204 Hs.203699 NM_018178 ENSG00000143457 GOLPH3L GPP34R golgi phosphoprotein 3 like protein-coding 250-84 chr8 57577339 57577790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -168585 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 200-12 chr1 200121228 200121768 + 0.666667 NA intron (NM_205860, intron 7 of 7) intron (NM_205860, intron 7 of 7) 78673 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 112-121 chr20 24741050 24741369 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -208060 NM_003650 8530 Hs.143212 NM_003650 ENSG00000077984 CST7 CMAP cystatin F protein-coding 143.333-290 chr8 110375667 110375975 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -400050 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 177.667-152 chr9 118138508 118138847 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 434274 NM_003266 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 119.333-155 chr3 158130770 158131097 + 0.666667 NA intron (NM_001271834, intron 3 of 8) L1MD|LINE|L1 20844 NM_001271838 51319 Hs.591283 NM_016625 ENSG00000174891 RSRC1 BM-011|MRT70|SFRS21|SRrp53 arginine and serine rich coiled-coil 1 protein-coding 153.667-304 chr5 3784638 3784962 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 188968 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 131.333-178 chr8 83964689 83965031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -217927 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 160.333-168 chr20 52140032 52140395 + 0.666667 NA intron (NM_199427, intron 5 of 8) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -34729 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 146.667-291 chr6 147915679 147915952 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -356513 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 201.333-179 chr3 23324317 23324733 + 0.666667 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 121198 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 160.333-208 chr4 42116720 42117018 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001159547, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001159547, exon 6 of 6) 35786 NM_001159547 389206 Hs.120591 NM_207406 ENSG00000188848 BEND4 CCDC4 BEN domain containing 4 protein-coding 123.333-89 chr17 49301512 49301746 + 0.666667 NA intron (NM_014897, intron 5 of 5) intron (NM_014897, intron 5 of 5) -13175 NR_106745 102465137 NR_106745 ENSG00000273500 MIR6129 hsa-mir-6129 microRNA 6129 ncRNA 179.667-77 chr2 96953008 96953384 + 0.666667 NA intron (NM_001122646, intron 6 of 16) intron (NM_001122646, intron 6 of 16) 33384 NM_001122646 51252 Hs.107922 NM_016490 ENSG00000168754 FAM178B - family with sequence similarity 178 member B protein-coding 208.667-72 chr2 112192597 112192921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54374 NM_001128165 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 155.333-87 chr13 20784239 20784541 + 0.666667 NA intron (NM_022459, intron 22 of 22) intron (NM_022459, intron 22 of 22) -10429 NM_001318939 221143 Hs.26674 NM_174928 ENSG00000150456 EEF1AKMT1 ESP13|N6AMT2 EEF1A lysine methyltransferase 1 protein-coding 127.333-76 chr2 58437566 58437799 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -83071 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 113.667-135 chr3 48051066 48051243 + 0.666667 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) AluSx|SINE|Alu 37694 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 143-118 chr7 49082722 49082988 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B-int|LTR|ERVL-MaLR 158308 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 190.333-120 chr5 74777444 74777982 + 0.666667 NA non-coding (NR_073403, exon 7 of 7) non-coding (NR_073403, exon 7 of 7) -10342 NM_170681 84340 Hs.277154 NM_032380 ENSG00000164347 GFM2 EF-G2mt|EFG2|MRRF2|MST027|MSTP027|RRF|RRF2|RRF2mt|hEFG2|mEF-G 2 G elongation factor mitochondrial 2 protein-coding 139-115 chr9 97744095 97744398 + 0.666667 NA intron (NR_147055, intron 5 of 10) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -46837 NR_149091 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 150.333-171 chr18 11405892 11406199 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48433 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 191.333-146 chr4 59701361 59701865 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 688040 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 134-4 chr1 75748468 75748825 + 0.666667 NA intron (NM_001286042, intron 7 of 10) L1ME1|LINE|L1 -3633 NR_130749 1744 Hs.525459 NR_130749 DLSTP1 DLSTP dihydrolipoamide S-succinyltransferase pseudogene 1 pseudo 136-12 chr11 34665132 34665398 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32699 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 135-24 chr13 37369511 37369867 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 115095 NR_125762 103695431 Hs.550637 NR_125762 ENSG00000230390 LINC01048 - long intergenic non-protein coding RNA 1048 ncRNA 156.333-50 chr10 117289439 117289732 + 0.666667 NA intron (NM_173791, intron 4 of 4) intron (NM_173791, intron 4 of 4) 48471 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 135.333-122 chr4 16007403 16007769 + 0.666667 NA intron (NM_001371408, intron 11 of 24) intron (NM_001371408, intron 11 of 24) -44411 NM_031950 83888 Hs.98785 NM_031950 ENSG00000137441 FGFBP2 HBP17RP|KSP37 fibroblast growth factor binding protein 2 protein-coding 207.333-140 chr2 158371590 158372195 + 0.666667 NA intron (NM_138803, intron 1 of 13) intron (NM_138803, intron 1 of 13) 84861 NM_001301685 130940 Hs.668597 NM_138803 ENSG00000153237 CCDC148 - coiled-coil domain containing 148 protein-coding 134-32 chr15 78816924 78817321 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -5658 NM_014272 11173 Hs.16441 NM_014272 ENSG00000136378 ADAMTS7 ADAM-TS 7|ADAM-TS7|ADAMTS-7 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 7 protein-coding 185-82 chr9 36301589 36302117 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -24797 NM_001190388 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 130.333-167 chr5 53092310 53092547 + 0.666667 NA non-coding (NR_073107, exon 29 of 29) non-coding (NR_073107, exon 29 of 29) 17329 NM_004531 4338 Hs.163645 NM_004531 ENSG00000164172 MOCS2 MCBPE|MOCO1|MOCODB|MPTS molybdenum cofactor synthesis 2 protein-coding 257-79 chrX 71504610 71505127 + 0.666667 NA intron (NR_104396, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 12418 NR_104396 6872 Hs.158560 NM_004606 ENSG00000147133 TAF1 BA2R|CCG1|CCGS|DYT3|DYT3/TAF1|KAT4|MRXS33|N-TAF1|NSCL2|OF|P250|TAF(II)250|TAF2A|TAFII-250|TAFII250|XDP TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 161.667-14 chr1 164459115 164459443 + 0.666667 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -100081 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 146.667-289 chr6 142408258 142408691 + 0.666667 NA intron (NM_198569, intron 16 of 24) intron (NM_198569, intron 16 of 24) 106467 NM_198569 57211 Hs.743302 NM_020455 ENSG00000112414 ADGRG6 APG1|DREG|GPR126|LCCS9|PR126|PS1TP2|VIGR adhesion G protein-coupled receptor G6 protein-coding 125.667-34 chr11 73928212 73928488 + 0.666667 NA TTS (NM_001267806) TTS (NM_001267806) -21969 NM_153614 374407 Hs.567888 NM_153614 ENSG00000187726 DNAJB13 CILD34|RSPH16A|TSARG5|TSARG6 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B13 protein-coding 114.667-73 chr13 69153664 69153953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68538 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 151.667-274 chr5 43545130 43545429 + 0.666667 NA intron (NM_006451, intron 3 of 10) HAL1|LINE|L1 11798 NM_006451 10605 Hs.482038 NM_006451 ENSG00000172239 PAIP1 - poly(A) binding protein interacting protein 1 protein-coding 201-120 chrX 19035133 19035447 + 0.666667 NA intron (NM_001184833, intron 6 of 27) L1ME4a|LINE|L1 -51176 NM_000292 5256 Hs.54941 NM_000292 ENSG00000044446 PHKA2 GSD9A|PHK|PYK|PYKL|XLG|XLG2 phosphorylase kinase regulatory subunit alpha 2 protein-coding 155.667-223 chr3 86632343 86632687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 150572 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 168.333-225 chr9 127458076 127458540 + 0.666667 NA intron (NM_001190723, intron 6 of 24) AluYb8|SINE|Alu 6053 NM_001005374 90678 Hs.495188 NM_138361 ENSG00000148356 LRSAM1 CMT2P|RIFLE|TAL leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1 protein-coding 130.333-79 chr15 88534091 88534328 + 0.666667 NA intron (NM_001144074, intron 1 of 4) LTR106_Mam|LTR|LTR 12166 NM_001321596 55070 Hs.655064 NM_017996 ENSG00000140543 DET1 - DET1 partner of COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 114.667-84 chr14 71612210 71612386 + 0.666667 NA intron (NM_001354286, intron 6 of 24) L1ME4c|LINE|L1 26000 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 168-58 chr2 170589236 170589590 + 0.666667 NA intron (NM_001083615, intron 31 of 33) Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 125154 NR_027433 440925 Hs.668461 NM_001013712 ENSG00000222033 LINC01124 - long intergenic non-protein coding RNA 1124 ncRNA 157.667-275 chr6 37685975 37686343 + 0.666667 NA intron (NM_153487, intron 1 of 16) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 11724 NM_153487 266727 Hs.437993 NM_153487 ENSG00000112139 MDGA1 GPIM|MAMDC3 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 protein-coding 136.667-144 chr5 79634700 79635015 + 0.666667 NA intron (NM_001349553, intron 6 of 16) FLAM_A|SINE|Alu 22416 NM_001297745 167153 Hs.418198 NM_173797 ENSG00000164329 TENT2 APD4|GLD2|PAPD4|TUT2 terminal nucleotidyltransferase 2 protein-coding 188.666-30 chr5 57495257 57495807 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12721 NM_001017992 345651 Hs.482167 NM_001017992 ENSG00000169067 ACTBL2 ACT actin beta like 2 protein-coding 121.667-177 chr6 44502993 44503331 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48719 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 115-24 chr10 18171296 18171521 + 0.666667 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) intron (NM_201593, intron 2 of 13) 30984 NM_201572 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 163.667-267 chrX 38586433 38586783 + 0.666667 NA intron (NM_004615, intron 1 of 7) intron (NM_004615, intron 1 of 7) 25130 NM_004615 7102 Hs.441664 NM_004615 ENSG00000156298 TSPAN7 A15|CCG-B7|CD231|DXS1692E|MRX58|MXS1|TALLA-1|TM4SF2|TM4SF2b tetraspanin 7 protein-coding 115.667-157 chr4 20907247 20907516 + 0.666667 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) MIRc|SINE|MIR -24671 NM_025221 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 121.667-72 chr17 63818227 63818443 + 0.666667 NA exon (NM_007372, exon 19 of 19) exon (NM_007372, exon 19 of 19) -9096 NM_002805 5705 Hs.79387 NM_002805 ENSG00000087191 PSMC5 S8|SUG-1|SUG1|TBP10|TRIP1|p45|p45/SUG proteasome 26S subunit, ATPase 5 protein-coding 141.667-254 chr9 133370731 133371025 + 0.666667 NA intron (NM_001280791, intron 1 of 5) intron (NM_001280791, intron 1 of 5) 5182 NM_001280789 6836 Hs.512465 NM_033161 ENSG00000148248 SURF4 ERV29 surfeit 4 protein-coding 165-62 chr4 31189003 31189455 + 0.666667 NA intron (NR_125935, intron 2 of 4) intron (NR_125935, intron 2 of 4) 18085 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 189.667-124 chr6 24020931 24021399 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105050 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 146.667-65 chr11 114774007 114774343 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 95648 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 124.667-63 chr14 80897895 80898146 + 0.666667 NA intron (NM_152446, intron 7 of 24) AluJb|SINE|Alu 43718 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 159.333-226 chr3 188743492 188743939 + 0.666667 NA intron (NM_001167672, intron 6 of 9) L3|LINE|CR1 54934 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 165.333-210 chr5 108604112 108604496 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 123957 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 150-46 chr14 59366992 59367434 + 0.666667 NA intron (NM_001270520, intron 23 of 24) AluSx|SINE|Alu 98167 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 127-61 chr3 164381786 164382002 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -210338 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 181.333-187 chr9 11111337 11111815 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 498370 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 158.333-9 chr1 72631627 72631950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -349249 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 152.333-323 chr6 13534654 13534982 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39711 NM_031244 23408 Hs.567431 NM_012241 ENSG00000124523 SIRT5 SIR2L5 sirtuin 5 protein-coding 223-25 chr17 620385 620868 + 0.666667 NA intron (NM_001366254, intron 12 of 19).2 intron (NM_001366254, intron 12 of 19).2 94213 NM_001128159 55275 Hs.461819 NM_018289 ENSG00000141252 VPS53 HCCS1|PCH2E|hVps53L|pp13624 VPS53 subunit of GARP complex protein-coding 118.667-20 chr10 33623548 33623775 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 149019 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 210.333-159 chr7 46776387 46776863 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79503 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 121-96 chr3 100517337 100517640 + 0.666667 NA intron (NM_018004, intron 1 of 5) intron (NM_018004, intron 1 of 5) 24869 NM_018004 55076 Hs.658956 NM_018004 ENSG00000181458 TMEM45A DERP7|DNAPTP4 transmembrane protein 45A protein-coding 201.333-187 chr3 71571458 71571953 + 0.666667 NA intron (NR_146142, intron 2 of 19) intron (NR_146142, intron 2 of 19) 12023 NR_146143 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 158.667-133 chr18 12987614 12988075 + 0.666667 NA TTS (NM_001013437) TTS (NM_001013437) -3518 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 150.333-24 chr1 179697533 179697832 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -30094 NM_001329714 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 117-75 chr2 34837014 34837360 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 159630 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 240-40 chr19 49994932 49995644 + 0.666667 NA intron (NM_016440, intron 7 of 14) intron (NM_016440, intron 7 of 14) 25624 NR_145574 400709 Hs.568076 NM_001348364 SIGLEC16 SIGLECP16|Siglec-P16 sialic acid binding Ig like lectin 16 (gene/pseudogene) protein-coding 383.667-6 chr8 89318951 89319619 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 438426 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 140.667-258 chrX 87093474 87093766 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -424182 NM_019117 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 150.667-244 chr3 111571720 111572029 + 0.666667 NA intron (NM_001318889, intron 3 of 7) LTR43B|LTR|ERV1 23472 NM_024508 79413 Hs.136912 NM_024508 ENSG00000177494 ZBED2 - zinc finger BED-type containing 2 protein-coding 142.667-49 chr13 113919299 113919723 + 0.666667 NA exon (NM_001278674, exon 6 of 8) exon (NM_001278674, exon 6 of 8) 9480 NR_047495 100861555 Hs.353773 NR_047495 ENSG00000260910 LINC00565 - long intergenic non-protein coding RNA 565 ncRNA 195.333-78 chr14 57958546 57958965 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -92663 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 214.667-70 chr2 159207552 159208025 + 0.666667 NA intron (NM_001350065, intron 20 of 27) MIR|SINE|MIR 20953 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 112.333-55 chr12 60890146 60890424 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1200915 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 249 chr1 87982044 87982751 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -610742 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 169.667-9 chr1 164340957 164341292 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -218236 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 111.667-274 chrX 19704138 19704429 + 0.666667 NA intron (NM_001024666, intron 3 of 16) intron (NM_001024666, intron 3 of 16) -33284 NM_001184960 30011 Hs.726365 NM_031892 ENSG00000147010 SH3KBP1 AGMX2|CD2BP3|CIN85|GIG10|HSB-1|HSB1|IMD61|MIG18 SH3 domain containing kinase binding protein 1 protein-coding 156.333-139 chr16 81569705 81570123 + 0.666667 NA intron (NM_030629, intron 1 of 20) MIRb|SINE|MIR 36012 NR_107008 102465840 NR_107008 ENSG00000277255 MIR7854 hsa-mir-7854 microRNA 7854 ncRNA 207-80 chr3 111262223 111262533 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 190562 NM_015480 25945 Hs.293917 NM_015480 ENSG00000177707 NECTIN3 CD113|CDW113|NECTIN-3|PPR3|PRR3|PVRL3|PVRR3 nectin cell adhesion molecule 3 protein-coding 192-2 chr1 45914901 45915408 + 0.666667 NA intron (NM_001324320, intron 4 of 29) AluJo|SINE|Alu 50806 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 119.667-68 chr17 31218362 31218575 + 0.666667 NA intron (NM_001042492, intron 13 of 57) L1MB8|LINE|L1 78771 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 149.333-86 chr12 29559609 29559895 + 0.666667 NA intron (NM_001367875, intron 11 of 19) intron (NM_001367875, intron 11 of 19) -60059 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 132.667-168 chr7 95790066 95790383 + 0.666667 NA intron (NM_004411, intron 1 of 16) MER81|DNA|hAT-Blackjack 17718 NM_001135556 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 133-96 chr9 85606272 85606546 + 0.666667 NA intron (NM_015239, intron 17 of 25) L1MA4A|LINE|L1 135620 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 211.667-24 chr10 127583128 127583581 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 34005 NM_001030013 594857 Hs.643423 NM_001030013 ENSG00000214285 NPS - neuropeptide S protein-coding 231.333-18 chr10 62052111 62052629 + 0.666667 NA intron (NM_001244638, intron 2 of 6) intron (NM_001244638, intron 2 of 6) 3013 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 182.667-13 chr1 199039398 199039811 + 0.666667 NA intron (NR_126351, intron 1 of 2) intron (NR_126351, intron 1 of 2) -20640 NR_110525 102800316 Hs.568480 NR_110525 LINC01222 TCONS_00000112 long intergenic non-protein coding RNA 1222 ncRNA 158.333-325 chr8 118271100 118271425 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) THE1C|LTR|ERVL-MaLR -159443 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 150-147 chr8 124011399 124011773 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 14 of 40) AluJb|SINE|Alu 29196 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 134.333-122 chr3 197312433 197312688 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -13239 NM_001366203 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 113-35 chr12 12686107 12686358 + 0.666667 NA intron (NM_006143, intron 2 of 3) intron (NM_006143, intron 2 of 3) 9951 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 112.667-251 chr7 89639758 89639940 + 0.666667 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL -479551 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 247.667-70 chr3 191282968 191283455 + 0.666667 NA intron (NM_198152, intron 4 of 8) L2c|LINE|L2 -46183 NM_174908 152137 Hs.478682 NM_174908 ENSG00000152492 CCDC50 C3orf6|DFNA44|YMER coiled-coil domain containing 50 protein-coding 194.333-96 chr4 52958849 52959278 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) MIR|SINE|MIR 96746 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 161-29 chr15 69180498 69180851 + 0.666667 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 20039 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 254.667-14 chr11 107347595 107348049 + 0.666667 NA intron (NM_152434, intron 14 of 17) intron (NM_152434, intron 14 of 17) 110024 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 118.667-188 chr8 61184028 61184337 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103788 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 134-61 chr22 39998418 39998714 + 0.666667 NA intron (NM_138435, intron 1 of 4) intron (NM_138435, intron 1 of 4) 3612 NM_138435 113828 Hs.26192 NM_138435 ENSG00000133477 FAM83F - family with sequence similarity 83 member F protein-coding 217-35 chr18 9417818 9418319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57445 NM_006788 10928 Hs.528993 NM_006788 ENSG00000017797 RALBP1 RIP1|RLIP1|RLIP76 ralA binding protein 1 protein-coding 159.667-220 chr3 162459332 162459770 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 843750 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 156-129 chr6 153837257 153837639 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -173048 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 147.333-85 chr12 69217950 69218181 + 0.666667 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -21504 NM_001300947 11052 Hs.369606 NM_007007 ENSG00000111605 CPSF6 CFIM|CFIM68|CFIM72|HPBRII-4|HPBRII-7 cleavage and polyadenylation specific factor 6 protein-coding 138.667-76 chr15 95146746 95147082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 180186 NR_034095 400456 Hs.536404 NR_034095 ENSG00000248441 LINC01197 - long intergenic non-protein coding RNA 1197 ncRNA 116.667-86 chr18 45150435 45150674 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17409 NM_001371319 161-64 chr3 197052472 197052921 + 0.666667 NA intron (NM_001366216, intron 22 of 23) L1MC5|LINE|L1 -22879 NM_033316 4241 Hs.184727 NM_005929 ENSG00000163975 MELTF CD228|MAP97|MFI2|MTF1|MTf melanotransferrin protein-coding 239.667-77 chr8 126107134 126107625 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -156182 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 149-122 chr6 9757048 9757348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -647304 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 221.667-86 chr9 27542472 27542977 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12910 NM_024761 79817 Hs.369022 NM_024761 ENSG00000120162 MOB3B C9orf35|MOB1D|MOBKL2B MOB kinase activator 3B protein-coding 183.667-89 chr22 44562675 44563065 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -6470 NR_028409 388910 Hs.332685 NM_001012986 ENSG00000187012 LINC00207 NCRNA00207 long intergenic non-protein coding RNA 207 ncRNA 151.333-364 chr6 85746724 85747047 + 0.666667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -68152 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 182-6 chr1 106170935 106171251 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142840 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 136-33 chr14 55024273 55024531 + 0.666667 NA intron (NM_001008396, intron 1 of 24) L2c|LINE|L2 2697 NM_007086 11169 Hs.385998 NM_007086 ENSG00000198554 WDHD1 AND-1|AND1|CHTF4|CTF4 WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 protein-coding 159-35 chr14 45701308 45701636 + 0.666667 NA Intergenic MER58B|DNA|hAT-Charlie 14130 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 128-89 chr5 11699371 11699636 + 0.666667 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) -110437 NM_001364128 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 172-58 chr2 157388682 157389064 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -8364 NR_034169 728066 Hs.470311 NR_034169 FAM133DP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 159-82 chr3 116551123 116551551 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -1136 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 113.333-164 chr3 1357995 1358193 + 0.666667 NA intron (NM_001289080, intron 12 of 22) L1ME2z|LINE|L1 265070 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 185.333-17 chr10 23889897 23890219 + 0.666667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) L1ME2|LINE|L1 195331 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 151-125 chr8 30107535 30107836 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_015344, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_015344, exon 4 of 4) 12277 NM_001128208 23484 Hs.146585 NM_015344 ENSG00000104660 LEPROTL1 HSPC112|Vps55|my047 leptin receptor overlapping transcript like 1 protein-coding 267-49 chr3 150717398 150717952 + 0.666667 NA intron (NR_121674, intron 3 of 3) AluY|SINE|Alu 13700 NR_121674 101928085 Hs.561114 NR_121674 ENSG00000240137 ERICH6-AS1 - ERICH6 antisense RNA 1 ncRNA 168-4 chr1 112405180 112405677 + 0.666667 NA intron (NM_018704, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 9214 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 130.333-189 chr7 33428389 33428676 + 0.666667 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) intron (NM_001348037, intron 18 of 20) 298968 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 125.667-94 chr2 52276797 52277017 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) MER39|LTR|ERV1 -93741 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 195.667-14 chr10 116349992 116350298 + 0.666667 NA intron (NM_198515, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 25697 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 162-58 chr18 73864101 73864544 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 283512 NM_152676 201456 Hs.664011 NM_152676 ENSG00000141665 FBXO15 FBX15 F-box protein 15 protein-coding 294-31 chr2 43681057 43681607 + 0.666667 NA intron (NM_172069, intron 3 of 29) intron (NM_172069, intron 3 of 29) -4903 NM_001101330 728819 NM_001101330 ENSG00000223658 C1GALT1C1L - C1GALT1 specific chaperone 1 like protein-coding 172-21 chr10 116386836 116387252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40803 NM_001011709 119548 Hs.276724 NM_001011709 ENSG00000203837 PNLIPRP3 - pancreatic lipase related protein 3 protein-coding 187.333-49 chr12 116604684 116605086 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 45504 NM_001085481 643246 Hs.356061 NM_001085481 ENSG00000258102 MAP1LC3B2 ATG8G microtubule associated protein 1 light chain 3 beta 2 protein-coding 139.333-57 chr12 90069020 90069315 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121474 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 157.667-248 chr5 72229684 72230018 + 0.666667 NA intron (NM_015084, intron 7 of 10) intron (NM_015084, intron 7 of 10) 50064 NM_001324255 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 179-15 chr10 123919206 123919666 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -27629 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 130-71 chr22 21579090 21579339 + 0.666667 NA intron (NR_046082, intron 1 of 3) AluSq2|SINE|Alu 11500 NR_046082 7332 Hs.108104 NM_003347 ENSG00000185651 UBE2L3 E2-F1|L-UBC|UBCH7|UbcM4 ubiquitin conjugating enzyme E2 L3 protein-coding 145-36 chr15 58658477 58658775 + 0.666667 NA intron (NM_001320570, intron 5 of 14) L1MA2|LINE|L1 34981 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 217.333-72 chr2 180214387 180214891 + 0.666667 NA Intergenic MER47B|DNA|TcMar-Tigger -207342 NM_020943 57703 Hs.311363 NM_020943 ENSG00000163510 CWC22 EIF4GL|NCM|fSAPb CWC22 spliceosome associated protein homolog protein-coding 165.667-188 chr7 80783482 80783820 + 0.666667 NA intron (NM_006379, intron 12 of 17) intron (NM_006379, intron 12 of 17) 135400 NM_006379 10512 Hs.269109 NM_006379 ENSG00000075223 SEMA3C SEMAE|SemE semaphorin 3C protein-coding 144.333-251 chr7 105082241 105082544 + 0.666667 NA intron (NM_182931, intron 13 of 26) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 68187 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 136.333-67 chr15 59846645 59846898 + 0.666667 NA Intergenic UCON132b|DNA|hAT-Tip100 -157451 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 112-181 chr6 40291781 40292089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64071 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 187.333-137 chr4 37962200 37962556 + 0.666667 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) intron (NM_001253912, intron 2 of 20) 1980 NM_006607 10744 Hs.668806 NM_006607 ENSG00000250254 PTTG2 - pituitary tumor-transforming 2 protein-coding 145-25 chr13 34934927 34935250 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7199 NM_015678 26960 Hs.491172 NM_015678 ENSG00000172915 NBEA BCL8B|LYST2 neurobeachin protein-coding 203.667-4 chr1 173912984 173913417 + 0.666667 NA intron (NM_001365052, intron 3 of 7) intron (NM_001365052, intron 3 of 7) 4127 NM_001365052 462 Hs.75599 NM_000488 ENSG00000117601 SERPINC1 AT3|AT3D|ATIII|ATIII-R2|ATIII-T1|ATIII-T2|THPH7 serpin family C member 1 protein-coding 178-107 chr7 99168908 99169318 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -25005 NM_181349 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 157-79 chr20 37828085 37828473 + 0.666667 NA intron (NM_001281495, intron 12 of 16) intron (NM_001281495, intron 12 of 16) -74848 NM_080607 128434 Hs.517029 NM_080607 ENSG00000132821 VSTM2L C20orf102|dJ1118M15.2 V-set and transmembrane domain containing 2 like protein-coding 153-101 chr4 61187912 61188343 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13103 NM_001371343 118.333-134 chr3 77272586 77272831 + 0.666667 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 174696 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 169-63 chr3 38646531 38647036 + 0.666667 NA intron (NM_198056, intron 1 of 27) intron (NM_198056, intron 1 of 27) 2889 NM_001099405 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 235-18 chr14 41400396 41400838 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -206239 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 210-142 chr8 28975665 28976179 + 0.666667 NA intron (NR_136757, intron 3 of 9) intron (NR_136757, intron 3 of 9) 84608 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 127-110 chrX 13129331 13129664 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -84877 NM_174901 171484 Hs.667546 NM_174901 ENSG00000187268 FAM9C TEX39C family with sequence similarity 9 member C protein-coding 149.333-442 chrX 78927747 78928043 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17437 NM_198333 27334 Hs.296433 NM_014499 ENSG00000078589 P2RY10 LYPSR2|P2Y10 P2Y receptor family member 10 protein-coding 114.333-186 chr5 154721003 154721321 + 0.666667 NA intron (NM_001367717, intron 1 of 18) AluJb|SINE|Alu 8319 NM_015315 23367 Hs.292078 NM_015315 ENSG00000155506 LARP1 LARP La ribonucleoprotein domain family member 1 protein-coding 114.333-45 chr11 79069194 79069399 + 0.666667 NA intron (NM_001098816, intron 5 of 33) MIRb|SINE|MIR 332813 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 131.667-29 chr10 122495267 122495507 + 0.666667 NA intron (NM_002775, intron 3 of 8) intron (NM_002775, intron 3 of 8) 33834 NM_002775 5654 Hs.501280 NM_002775 ENSG00000166033 HTRA1 ARMD7|CADASIL2|CARASIL|HtrA|L56|ORF480|PRSS11 HtrA serine peptidase 1 protein-coding 157-34 chr12 75395322 75395642 + 0.666667 NA intron (NM_001270396, intron 1 of 5) L1MB3|LINE|L1 4393 NM_001270396 144321 Hs.406728 NM_152436 ENSG00000180481 GLIPR1L2 - GLIPR1 like 2 protein-coding 132.667-58 chr15 57441825 57442069 + 0.666667 NA intron (NM_032866, intron 3 of 18) intron (NM_032866, intron 3 of 18) 65442 NM_032866 84952 Hs.148989 NM_032866 ENSG00000128849 CGNL1 JACOP|PCING cingulin like 1 protein-coding 228.333-87 chr7 26946044 26946594 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -81729 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 124.667-212 chr8 144945395 144945630 + 0.666667 NA intron (NM_006958, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 5368 NM_006958 7564 Hs.493225 NM_006958 ENSG00000170631 ZNF16 HZF1|KOX9 zinc finger protein 16 protein-coding 164.333-57 chr12 44771454 44771934 + 0.666667 NA intron (NM_006159, intron 10 of 20) intron (NM_006159, intron 10 of 20) 103967 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 117.667-90 chr2 112147575 112147813 + 0.666667 NA intron (NM_001128165, intron 1 of 6) HAL1|LINE|L1 9309 NM_001128165 129804 Hs.437696 NM_153214 ENSG00000144152 FBLN7 TM14 fibulin 7 protein-coding 193.667-127 chr7 79035882 79036197 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) 27051 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 177.667-153 chr9 127337843 127338227 + 0.666667 NA intron (NR_104591, intron 11 of 26) intron (NR_104591, intron 11 of 26) -59103 NM_001271711 29988 Hs.179522 NM_014580 ENSG00000136856 SLC2A8 GLUT8|GLUTX1 solute carrier family 2 member 8 protein-coding 275.333-17 chr12 86454058 86454642 + 0.666667 NA intron (NM_013244, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu -197051 NM_001351287 25834 Hs.589093 NM_013244 ENSG00000182050 MGAT4C GNTIVH|HGNT-IV-H MGAT4 family member C protein-coding 120-140 chr8 128267202 128267409 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 117189 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 144-60 chr16 64024688 64025076 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1097181 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 173-92 chr8 26726445 26726859 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 139003 NM_033304 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 168.667-108 chr2 126986612 126986934 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E-int|LTR|ERVL-MaLR 87883 NR_136239 101929926 Hs.98984 NM_001322244 ENSG00000237524 TEX51 - testis expressed 51 protein-coding 122-51 chr2 89818497 89818803 + 0.666667 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -180743 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 111.667-151 chr20 7457602 7457872 + 0.666667 NA Intergenic MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 86129 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 115.333-30 chr11 9305594 9305821 + 0.666667 NA intron (NR_028491, intron 1 of 7) intron (NR_028491, intron 1 of 7) 8886 NM_001165030 440026 Hs.594563 NM_015012 ENSG00000166471 TMEM41B - transmembrane protein 41B protein-coding 131.333-167 chr7 93668731 93669036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48045 NR_039796 100616206 NR_039796 ENSG00000265423 MIR4652 - microRNA 4652 ncRNA 241-23 chr15 69191734 69192125 + 0.666667 NA intron (NM_001324093, intron 2 of 5) L1MEc|LINE|L1 31294 NM_001324093 26035 Hs.183006 NM_015554 ENSG00000138604 GLCE HSEPI glucuronic acid epimerase protein-coding 183-11 chr10 19242754 19243064 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 18 of 39) L1MA6|LINE|L1 194108 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 143-116 chr7 45220867 45221164 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 63224 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 114 chr1 10492164 10492448 + 0.666667 NA intron (NM_004565, intron 1 of 8) intron (NM_004565, intron 1 of 8) 17356 NM_004565 5195 Hs.149983 NM_004565 ENSG00000142655 PEX14 NAPP2|PBD13A|Pex14p|dJ734G22.2 peroxisomal biogenesis factor 14 protein-coding 140.667-129 chr20 12600685 12600976 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 336133 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 173.333-128 chr3 105377169 105377619 + 0.666667 NA intron (NM_001243280, intron 1 of 14) L1ME4b|LINE|L1 10485 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 247-55 chr3 114615731 114616317 + 0.666667 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) intron (NM_001348803, intron 6 of 13) 8182 NM_001164347 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 149-99 chr4 37914475 37914832 + 0.666667 NA intron (NM_001253912, intron 2 of 20) L2a|LINE|L2 23569 NM_001253912 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 151-102 chr5 21589369 21589675 + 0.666667 NA TTS (NR_027026) TTS (NR_027026) 130042 NR_027026 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 232-68 chr5 51135273 51135943 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -165421 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 141.333-116 chr2 126278509 126278884 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -160711 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 174-62 chr20 54026420 54026833 + 0.666667 NA intron (NM_001366297, intron 4 of 8) intron (NM_001366297, intron 4 of 8) 32394 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 117.667-179 chr7 48025660 48025868 + 0.666667 NA intron (NM_001284350, intron 2 of 10) intron (NM_001284350, intron 2 of 10) 3343 NM_001284350 256979 Hs.406741 NM_152782 ENSG00000164744 SUN3 SUNC1 Sad1 and UNC84 domain containing 3 protein-coding 147.667-47 chr10 112887089 112887425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62990 NM_001367943 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 141.333-81 chr17 69104962 69105299 + 0.666667 NA intron (NM_080284, intron 20 of 38) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -5498 NR_039750 100616316 NR_039750 ENSG00000283385 MIR4524A MIR4524|hsa-mir-4524a|mir-4524a microRNA 4524a ncRNA 168.333-24 chr10 80737471 80737806 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 87841 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 114.333-215 chr8 49466764 49466997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 45300 NR_134294 100507464 Hs.245745 NR_134294 ENSG00000253380 LOC100507464 - uncharacterized LOC100507464 ncRNA 151.667-231 chr3 132264884 132265325 + 0.666667 NA Intergenic MamRep38|DNA|hAT -52303 NM_001099 55 Hs.433060 NM_001099 ENSG00000014257 ACPP 5'-NT|ACP-3|ACP3 acid phosphatase, prostate protein-coding 165.333-98 chr17 15190442 15190830 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61060 NR_039884 100616125 NR_039884 ENSG00000265110 MIR4731 - microRNA 4731 ncRNA 233-49 chr3 108188280 108188770 + 0.666667 NA intron (NM_018010, intron 6 of 10) intron (NM_018010, intron 6 of 10) 33899 NM_018010 55081 Hs.412196 NM_018010 ENSG00000114446 IFT57 ESRRBL1|HIPPI|MHS4R2|OFD18 intraflagellar transport 57 protein-coding 112.333-189 chr4 84907088 84907389 + 0.666667 NA intron (NM_014991, intron 2 of 67) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -58378 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 166-117 chr8 103434046 103434507 + 0.666667 NA intron (NM_015420, intron 7 of 10) MIR3|SINE|MIR 18890 NM_015420 25879 Hs.532265 NM_015420 ENSG00000164934 DCAF13 GM83|HSPC064|Sof1|WDSOF1 DDB1 and CUL4 associated factor 13 protein-coding 203.333-255 chr8 54251889 54252351 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78566 NR_004385 26766 NR_004385 ENSG00000199212 RNU105C E1-5|E1-6 RNA, U105C small nucleolar snoRNA 135-72 chr3 195580724 195581047 + 0.666667 NA intron (NM_001647, intron 1 of 4) intron (NM_001647, intron 1 of 4) 3055 NM_001647 347 Hs.522555 NM_001647 ENSG00000189058 APOD - apolipoprotein D protein-coding 119.667-9 chr1 96736677 96736879 + 0.666667 NA intron (NM_001300990, intron 2 of 12) AluJo|SINE|Alu 14140 NR_125356 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 184-109 chr8 117058611 117059011 + 0.666667 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) MER58B|DNA|hAT-Charlie -76184 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 163.333-20 chr1 183256584 183256953 + 0.666667 NA intron (NM_170706, intron 10 of 10) L1MA9|LINE|L1 48106 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 164.667-253 chr9 5031340 5031683 + 0.666667 NA intron (NM_004972, intron 4 of 24) L1M5|LINE|L1 -10182 NM_001322204 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 215.667-92 chr4 94733114 94733589 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 24182 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 116.667-171 chr6 18013169 18013495 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -25697 NM_022113 63971 Hs.94499 NM_022113 ENSG00000137177 KIF13A RBKIN|bA500C11.2 kinesin family member 13A protein-coding 167.333-152 chr20 15947524 15947870 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 12 of 17) L2b|LINE|L2 -24383 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 185.333-55 chr15 84627823 84628168 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -3465 NR_003654 54581 Hs.658114 NM_022050 SCAND2P SCAND2 SCAN domain containing 2 pseudogene pseudo 132.667-66 chr17 16176217 16176496 + 0.666667 NA intron (NM_001190440, intron 2 of 44) AluSx|SINE|Alu 18283 NM_001190438 9611 Hs.462323 NM_006311 ENSG00000141027 NCOR1 N-CoR|N-CoR1|PPP1R109|TRAC1|hN-CoR nuclear receptor corepressor 1 protein-coding 145.667-69 chr13 54784497 54784785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -389813 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 240.333-23 chr11 70179080 70179580 + 0.666667 NA intron (NM_018043, intron 22 of 25) intron (NM_018043, intron 22 of 25) -23833 NM_003824 8772 Hs.86131 NM_003824 ENSG00000168040 FADD GIG3|MORT1 Fas associated via death domain protein-coding 119.667-109 chr3 8845547 8845902 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76110 NM_001354653 5021 Hs.2820 NM_000916 ENSG00000180914 OXTR OT-R oxytocin receptor protein-coding 182.333-152 chr8 66837580 66837971 + 0.666667 NA intron (NM_001204173, intron 12 of 18) AluJb|SINE|Alu -32996 NM_173518 157777 Hs.437006 NM_173518 ENSG00000178460 MCMDC2 C8orf45 minichromosome maintenance domain containing 2 protein-coding 166-67 chr2 171064524 171064870 + 0.666667 NA intron (NM_012290, intron 3 of 20) intron (NM_012290, intron 3 of 20) 2276 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 236.333-30 chr14 104790710 104791263 + 0.666667 NA intron (NM_001014431, intron 2 of 13) MIRb|SINE|MIR 2615 NM_005163 207 Hs.525622 NM_005163 ENSG00000142208 AKT1 AKT|CWS6|PKB|PKB-ALPHA|PRKBA|RAC|RAC-ALPHA AKT serine/threonine kinase 1 protein-coding 122.667-121 chr3 105699108 105699404 + 0.666667 NA intron (NR_135809, intron 13 of 18) intron (NR_135809, intron 13 of 18) 168335 NM_001321813 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 153.333-31 chr1 202026673 202026953 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 16226 NM_001114309 1999 Hs.603657 NM_004433 ENSG00000163435 ELF3 EPR-1|ERT|ESE-1|ESX E74 like ETS transcription factor 3 protein-coding 134.667-21 chr10 59020191 59020412 + 0.666667 NA Intergenic (AAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 20783 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 126.333-43 chr14 23803697 23803982 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -149931 NM_001282991 10901 Hs.528385 NM_021004 ENSG00000157326 DHRS4 CR|NRDR|PHCR|PSCD|SCAD-SRL|SDR-SRL|SDR25C1|SDR25C2 dehydrogenase/reductase 4 protein-coding 115-162 chrX 53801957 53802296 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -115407 NM_031407 10075 Hs.136905 NM_031407 ENSG00000086758 HUWE1 ARF-BP1|HECTH9|HSPC272|Ib772|LASU1|MRXST|MULE|URE-B1|UREB1 HECT, UBA and WWE domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 125.667-157 chr5 116179826 116180122 + 0.666667 NA intron (NM_001308080, intron 5 of 6) intron (NM_001308080, intron 5 of 6) -75769 NR_162144 113219464 NR_162144 MIR12130 - microRNA 12130 ncRNA 136.667-19 chr10 53273985 53274346 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -502465 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 146.333-207 chr3 84426567 84426880 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 442852 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 153-75 chr2 81330080 81330414 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 136699 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 114.333-53 chr12 30276365 30276606 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 400759 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 140-69 chr21 14666873 14667272 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23965 NM_001256579 388813 Hs.334177 NM_001256579 LOC388813 - uncharacterized protein ENSP00000383407-like protein-coding 201.667-43 chr16 5409070 5409514 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 206958 NR_110902 101926950 Hs.613285 NR_110902 ENSG00000260338 LINC01570 - long intergenic non-protein coding RNA 1570 ncRNA 243-22 chr2 11534200 11534789 + 0.666667 NA intron (NM_014668, intron 1 of 32) intron (NM_014668, intron 1 of 32) 449 NM_014668 9687 Hs.467733 NM_014668 ENSG00000196208 GREB1 - growth regulating estrogen receptor binding 1 protein-coding 236.666-33 chr21 23223042 23223737 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 144105 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 160.667-23 chr1 212307195 212307534 + 0.666667 NA intron (NM_001199756, intron 1 of 12) L1MB8|LINE|L1 5506 NM_001199756 5525 Hs.744012 NM_006243 ENSG00000066027 PPP2R5A B56A|B56alpha|PR61A protein phosphatase 2 regulatory subunit B'alpha protein-coding 172.333-101 chr22 31529115 31529500 + 0.666667 NA intron (NM_001258325, intron 3 of 30) AluSz6|SINE|Alu 32771 NM_014775 9814 Hs.62209 NM_014775 ENSG00000198089 SFI1 PISD|PPP1R139|hSfi1p SFI1 centrin binding protein protein-coding 227-6 chr1 225746950 225747582 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -30547 NM_001130440 6726 Hs.511425 NM_003133 ENSG00000143742 SRP9 ALURBP signal recognition particle 9 protein-coding 173.333-165 chr5 158294861 158295226 + 0.666667 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie 114730 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 124.667-25 chr10 32310013 32310280 + 0.666667 NA intron (NM_001282391, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu 37012 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 111.667-279 chrX 94438041 94438239 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 625086 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 124.333-59 chr16 17378652 17378874 + 0.666667 NA intron (NM_022166, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 92197 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 126.667-78 chr2 71948178 71948506 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 199520 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 256-46 chr2 131108284 131108945 + 0.666667 NA intron (NM_001309448, intron 1 of 6) MER30|DNA|hAT-Charlie 3767 NM_001267066 55041 Hs.469944 NM_017958 ENSG00000115762 PLEKHB2 EVT2 pleckstrin homology domain containing B2 protein-coding 124.333-80 chr2 39299649 39299998 + 0.666667 NA intron (NM_001270425, intron 14 of 32) intron (NM_001270425, intron 14 of 32) -55840 NR_144521 344387 Hs.403201 NM_001009565 ENSG00000205111 CDKL4 - cyclin dependent kinase like 4 protein-coding 233.333-64 chr2 98150087 98150439 + 0.666667 NA intron (NM_001345864, intron 1 of 21) intron (NM_001345864, intron 1 of 21) 730 NM_001345864 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 140.333-63 chr14 58836687 58836974 + 0.666667 NA intron (NR_110547, intron 1 of 5) intron (NR_110547, intron 1 of 5) 8542 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 195-21 chr10 98315490 98316073 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47587 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 145.333-138 chr2 105315621 105315915 + 0.666667 NA intron (NR_137328, intron 1 of 12) L1ME2|LINE|L1 13888 NR_137328 9392 Hs.446350 NM_004257 ENSG00000135966 TGFBRAP1 TRAP-1|TRAP1|VPS3 transforming growth factor beta receptor associated protein 1 protein-coding 152-127 chr5 46253047 46253423 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -556855 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 230.333-14 chr10 60359430 60360109 + 0.666667 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) AluJo|SINE|Alu 30106 NM_001320874 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 140-3 chr1 50402551 50402801 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 20767 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 145.667-8 chr1 68972793 68973117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -82943 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 145-130 chr9 98623770 98624140 + 0.666667 NA intron (NM_005458, intron 1 of 18) MIR|SINE|MIR 84980 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 176.667-68 chr18 7989511 7989858 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 377350 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 113.667-202 chr7 96163958 96164165 + 0.666667 NA intron (NM_001160210, intron 13 of 17) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 55695 NR_030322 693176 NR_030322 ENSG00000208025 MIR591 MIRN591|hsa-mir-591 microRNA 591 ncRNA 150-141 chr8 42669750 42670128 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -27427 NM_000749 1142 Hs.654576 NM_000749 ENSG00000147432 CHRNB3 - cholinergic receptor nicotinic beta 3 subunit protein-coding 128-117 chr8 69294489 69294705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 153647 NR_110433 100505739 Hs.127115 NR_110433 LINC01603 - long intergenic non-protein coding RNA 1603 ncRNA 168.333-19 chr10 31312998 31313384 + 0.666667 NA intron (NR_148979, intron 1 of 2) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -5226 NM_001323638 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 220.667-28 chr14 63645676 63646266 + 0.666667 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -4100 NM_001008726 112840 Hs.655666 NM_080666 ENSG00000140006 WDR89 C14orf150|MSTP050 WD repeat domain 89 protein-coding 175.667-94 chr3 19325471 19325855 + 0.666667 NA intron (NM_144633, intron 3 of 15) L1PA13|LINE|L1 -10732 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 217.667-84 chr7 108997225 108997694 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -112872 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 124-11 chr1 177245136 177245459 + 0.666667 NA intron (NM_021165, intron 2 of 7) L3|LINE|CR1 74339 NM_021165 57795 Hs.495918 NM_021165 ENSG00000198797 BRINP2 DBCCR1L2|FAM5B BMP/retinoic acid inducible neural specific 2 protein-coding 149-35 chr12 110881894 110882278 + 0.666667 NA intron (NM_152591, intron 7 of 11) MER68|LTR|ERVL 35099 NM_001286244 160762 Hs.437141 NM_152591 ENSG00000173093 CCDC63 ODA5 coiled-coil domain containing 63 protein-coding 229.333-86 chr4 75181728 75182378 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -97345 NR_149051 105377283 Hs.103159 NR_149051 LINC02562 - long intergenic non-protein coding RNA 2562 ncRNA 162-114 chr7 82770802 82771215 + 0.666667 NA intron (NM_033026, intron 22 of 24) intron (NM_033026, intron 22 of 24) -327052 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 123-49 chr16 13317194 13317407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 415702 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 222.667-73 chr5 37714964 37715321 + 0.666667 NA intron (NM_001345998, intron 13 of 17) intron (NM_001345998, intron 13 of 17) 119680 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 152-115 chr4 38311851 38312284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54847 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 150.333-187 chr2 30523747 30524054 + 0.666667 NA intron (NM_001304445, intron 3 of 7) intron (NM_001304445, intron 3 of 7) 76654 NM_001304445 253558 Hs.468048 NM_182551 ENSG00000172954 LCLAT1 1AGPAT8|AGPAT8|ALCAT1|HSRG1849|LYCAT|UNQ1849 lysocardiolipin acyltransferase 1 protein-coding 176.333-36 chr12 69030357 69030841 + 0.666667 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -67359 NM_001874 1368 Hs.654387 NM_001874 ENSG00000135678 CPM - carboxypeptidase M protein-coding 145-64 chr22 25827874 25828160 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 14 of 43) intron (NM_001318245, intron 14 of 43) 85829 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 158.333-82 chr14 46246261 46246575 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 182259 NR_102702 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 154.333-3 chr1 42969435 42969718 + 0.666667 NA intron (NR_033967, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 10527 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-97 chr3 96296699 96297223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63003 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 132.667-51 chr14 56931604 56931901 + 0.666667 NA TTS (NR_029385) TTS (NR_029385) 118594 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 138-30 chr12 121791898 121792192 + 0.666667 NA intron (NM_019034, intron 2 of 4) intron (NM_019034, intron 2 of 4) 1643 NM_019034 54509 Hs.707579 NM_019034 ENSG00000139725 RHOF ARHF|RIF ras homolog family member F, filopodia associated protein-coding 166.333-36 chr10 99777842 99778320 + 0.666667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -4559 NM_000392 1244 Hs.368243 NM_000392 ENSG00000023839 ABCC2 ABC30|CMOAT|DJS|MRP2|cMRP ATP binding cassette subfamily C member 2 protein-coding 120.667-160 chr7 47370025 47370326 + 0.666667 NA intron (NM_022748, intron 16 of 30) AluSx3|SINE|Alu 94628 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 168.667-191 chr6 155465451 155465799 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9786 NM_015718 50508 Hs.247776 NM_015718 ENSG00000074771 NOX3 GP91-3|MOX-2 NADPH oxidase 3 protein-coding 114.333-8 chr1 110609075 110609303 + 0.666667 NA intron (NM_001204269, intron 1 of 4) intron (NM_001204269, intron 1 of 4) -2831 NM_004974 3737 Hs.248139 NM_004974 ENSG00000177301 KCNA2 EIEE32|HBK5|HK4|HUKIV|KV1.2|MK2|NGK1|RBK2 potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 protein-coding 181.333-106 chr3 177121036 177121431 + 0.666667 NA intron (NM_001321194, intron 1 of 16) L1MC4|LINE|L1 75245 NM_001321193 79718 Hs.714201 NM_024665 ENSG00000177565 TBL1XR1 C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1 transducin beta like 1 X-linked receptor 1 protein-coding 157.667-119 chr16 80388484 80388792 + 0.666667 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) MER53|DNA|hAT -152096 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 127.667-135 chr5 10340174 10340446 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13385 NM_005885 10299 Hs.432862 NM_005885 ENSG00000145495 MARCH6 DOA10|MARCH-VI|RNF176|TEB4 membrane associated ring-CH-type finger 6 protein-coding 213.333-175 chr5 181186918 181187380 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4759 NR_108031 102577426 Hs.277359 NR_108031 ENSG00000248473 LINC01962 - long intergenic non-protein coding RNA 1962 ncRNA 186-43 chr18 54902568 54903076 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_025214, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_025214, exon 12 of 12) 55226 NM_001143829 80323 Hs.120790 NM_025214 ENSG00000166510 CCDC68 SE57-1 coiled-coil domain containing 68 protein-coding 157.333-177 chr2 47281262 47281624 + 0.666667 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) L1M4|LINE|L1 -53872 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 138.333-53 chr13 30713221 30713481 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001204406) promoter-TSS (NM_001204406) -127 NM_001204406 241 Hs.507658 NM_001629 ENSG00000132965 ALOX5AP FLAP arachidonate 5-lipoxygenase activating protein protein-coding 159.667-173 chr2 78382179 78382603 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91660 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 158.333-335 chr8 145000820 145001183 + 0.666667 NA intron (NR_023392, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 -1810 NR_026974 286103 Hs.359978 NM_001039382 ENSG00000255559 ZNF252P-AS1 C8orf77 ZNF252P antisense RNA 1 ncRNA 162.667-93 chr16 2826646 2827026 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3336 NM_145252 124220 Hs.105887 NM_145252 ENSG00000162078 ZG16B EECP|HRPE773|JCLN2|PAUF|PRO1567 zymogen granule protein 16B protein-coding 148-74 chr2 37915451 37915739 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9692 NM_001322212 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 211.333-34 chr11 40003708 40004166 + 0.666667 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 289193 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 143.667-74 chr14 65498335 65498675 + 0.666667 NA intron (NM_004480, intron 2 of 9) intron (NM_004480, intron 2 of 9) 27403 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 119.333-161 chr4 88331144 88331406 + 0.666667 NA non-coding (NR_134236, exon 5 of 5) non-coding (NR_134236, exon 5 of 5) 46345 NR_134237 105369192 Hs.733660 NR_134236 ENSG00000246375 PPM1K-DT - PPM1K divergent transcript ncRNA 214.667-12 chr10 31101040 31101517 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69341 NM_182755 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 208.666-47 chr16 64597681 64598299 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 524073 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 152-140 chr7 1662683 1663063 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25246 NM_001128636 392617 Hs.42896 NM_001128636 ENSG00000225968 ELFN1 PPP1R28 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 122.667-160 chr6 35323290 35323559 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -19134 NM_001171818 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 151.333-281 chr3 73169296 73169671 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107824 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 148.333-63 chr11 21883255 21883548 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -309684 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 180.333-104 chr6 27143419 27143834 + 0.666667 NA intron (NM_080593, intron 1 of 1) intron (NM_080593, intron 1 of 1) 3232 NM_001312653 85236 Hs.437275 NM_080593 ENSG00000197903 HIST1H2BK H2B/S|H2BFAiii|H2BFT|H2BK histone cluster 1 H2B family member k protein-coding 131-49 chr2 61404470 61404771 + 0.666667 NA intron (NM_014709, intron 3 of 79) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 12757 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 165-78 chr5 51511459 51511784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 128173 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 149.333-249 chr3 96498462 96498759 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 138646 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 126.667-40 chr12 104293175 104293466 + 0.666667 NA intron (NM_001261446, intron 2 of 13) intron (NM_001261446, intron 2 of 13) 6288 NM_001261446 7296 Hs.654922 NM_003330 ENSG00000198431 TXNRD1 GRIM-12|TR|TR1|TRXR1|TXNR thioredoxin reductase 1 protein-coding 134-92 chr6 166815679 166816013 + 0.666667 NA intron (NM_001318936, intron 2 of 22) intron (NM_001318936, intron 2 of 22) 46679 NM_001006932 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 203.667-36 chr16 59678961 59679410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76006 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 122.667-147 chr5 14971470 14971734 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -99824 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 141-30 chr15 64266534 64266913 + 0.666667 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) L1MA6|LINE|L1 89450 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 125.667-109 chr20 35124957 35125236 + 0.666667 NA intron (NM_001145025, intron 7 of 9) L2a|LINE|L2 22240 NM_018217 55741 Hs.720177 NM_018217 ENSG00000088298 EDEM2 C20orf31|C20orf49|bA4204.1 ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 2 protein-coding 256-82 chr5 134355951 134356379 + 0.666667 NA intron (NM_001113575, intron 3 of 12) MER1A|DNA|hAT-Charlie 10909 NM_016508 51265 Hs.719926 NM_016508 ENSG00000006837 CDKL3 NKIAMRE cyclin dependent kinase like 3 protein-coding 178.333-139 chr5 68832276 68832661 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 197459 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 176-57 chr3 58569979 58570426 + 0.666667 NA intron (NM_001282714, intron 2 of 4) intron (NM_001282714, intron 2 of 4) 7189 NM_001076778 11170 Hs.506357 NM_007177 ENSG00000168309 FAM107A DRR1|TU3A family with sequence similarity 107 member A protein-coding 211-51 chr2 119333344 119333954 + 0.666667 NA intron (NM_001322330, intron 2 of 5) MER58B|DNA|hAT-Charlie 33093 NM_001322329 130355 Hs.99488 NM_001017927 ENSG00000186132 C2orf76 AIM29 chromosome 2 open reading frame 76 protein-coding 112.333-262 chr8 92855010 92855215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69052 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 165-6 chr1 200527648 200527978 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91025 NM_001305792 9928 Hs.3104 NM_014875 ENSG00000118193 KIF14 MCPH20|MKS12 kinesin family member 14 protein-coding 165-10 chr10 66135153 66135525 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L1MC4|LINE|L1 563914 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 115.667-126 chr2 192120189 192120382 + 0.666667 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) LTR51|LTR|ERV1 74648 NM_016192 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 116-154 chr8 89627314 89627551 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 130279 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 149.333-53 chr10 68675266 68675681 + 0.666667 NA intron (NM_030625, intron 8 of 11) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -45766 NM_018237 55749 Hs.49853 NM_018237 ENSG00000060339 CCAR1 - cell division cycle and apoptosis regulator 1 protein-coding 186.333-91 chr20 54923813 54924260 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 448443 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 112.667-204 chr5 12549342 12549578 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -25397 NR_033383 404663 Hs.552273 NR_033383 LINC01194 CT49|TAG long intergenic non-protein coding RNA 1194 ncRNA 183.666-15 chr3 5482062 5482606 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -232079 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 122.667-18 chr10 100695636 100695833 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -39662 NM_001304569 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 112.667-99 chr17 72086350 72086525 + 0.666667 NA intron (NR_103738, intron 2 of 6) intron (NR_103738, intron 2 of 6) 14104 NR_110827 101928205 Hs.620808 NR_110827 ENSG00000226101 LINC02097 - long intergenic non-protein coding RNA 2097 ncRNA 123.333-185 chr6 66222879 66223101 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 435111 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 114.333-189 chr5 167986277 167986603 + 0.666667 NA intron (NM_001368145, intron 3 of 26) intron (NM_001368145, intron 3 of 26) -179405 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 145-47 chr2 72477090 72477394 + 0.666667 NA intron (NM_001321730, intron 16 of 21) L2a|LINE|L2 -329380 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 149.333-66 chr10 116030236 116030657 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 164343 NR_145811 109623470 NR_145811 SNORD158 - small nucleolar RNA, C/D box 158 snoRNA 113-81 chr16 79490664 79490987 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109912 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 133.333-107 chr3 66946802 66947121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51346 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 172-92 chr5 113166272 113166664 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 3 of 18) intron (NM_001085377, intron 3 of 18) 128470 NM_002387 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 154.667-164 chr2 34131019 34131382 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) ERV24_Prim-int|LTR|ERV1 63974 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 175.667-144 chr8 82923175 82923644 + 0.666667 NA intron (NR_134295, intron 2 of 3) L2a|LINE|L2 11305 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 140-37 chr14 58805492 58805889 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22598 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 130.667-3 chr1 45898821 45899126 + 0.666667 NA intron (NM_001324320, intron 4 of 29) MER21-int|LTR|ERVL 34625 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 118-27 chr12 113938995 113939304 + 0.666667 NA intron (NM_001146698, intron 15 of 24) AluJr|SINE|Alu 27176 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 236-83 chr7 39197584 39198070 + 0.666667 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) 131307 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 152.333-233 chr3 60231360 60231649 + 0.666667 NA intron (NM_001320900, intron 6 of 9) L1ME3A|LINE|L1 -150595 NM_001320901 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 115-103 chr21 16291167 16291367 + 0.666667 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -6499 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 187-92 chr9 71839061 71839437 + 0.666667 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -70736 NM_001349784 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 230.666-2 chr1 72103114 72103780 + 0.666667 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) LTR78|LTR|ERV1 179092 NM_173808 257194 Hs.146542 NM_173808 ENSG00000172260 NEGR1 DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra neuronal growth regulator 1 protein-coding 139.333-2 chr1 47829255 47829551 + 0.666667 NA intron (NM_001194986, intron 2 of 6) intron (NM_001194986, intron 2 of 6) 167982 NM_001194986 388630 Hs.61504 NM_001194986 ENSG00000269113 TRABD2B TIKI2 TraB domain containing 2B protein-coding 159-59 chr2 77719764 77720237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -195934 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 116.667-107 chr2 233019560 233019762 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -6405 NM_019850 25791 Hs.97316 NM_019850 ENSG00000066248 NGEF ARHGEF27|EPHEXIN neuronal guanine nucleotide exchange factor protein-coding 148.667-311 chr5 78334821 78335110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25576 NR_105014 728769 Hs.586193 NR_105014 ENSG00000245556 SCAMP1-AS1 - SCAMP1 antisense RNA 1 ncRNA 203.667-108 chr6 129697410 129697828 + 0.666667 NA intron (NM_033515, intron 1 of 14) intron (NM_033515, intron 1 of 14) 12558 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 225.333-79 chr2 68781813 68782480 + 0.666667 NA intron (NM_001007231, intron 2 of 10) intron (NM_001007231, intron 2 of 10) 7236 NM_014882 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 111.667-220 chr6 52285499 52285766 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001366371) promoter-TSS (NM_001366371) -890 NM_001366370 4172 Hs.179565 NM_002388 ENSG00000112118 MCM3 HCC5|P1-MCM3|P1.h|RLFB minichromosome maintenance complex component 3 protein-coding 131.333-152 chr6 27161754 27162077 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 14289 NR_036096 100422934 NR_036096 ENSG00000265565 MIR3143 mir-3143 microRNA 3143 ncRNA 149-63 chr19 45448055 45448491 + 0.666667 NA intron (NM_001369412, intron 1 of 9) MIR3|SINE|MIR 2493 NM_001369414 2067 Hs.435981 NM_001983 ENSG00000012061 ERCC1 COFS4|RAD10|UV20 ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit protein-coding 148.667-209 chr2 199192870 199193191 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 264909 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 171.667-133 chr5 76275571 76275965 + 0.666667 NA intron (NM_014979, intron 4 of 12) intron (NM_014979, intron 4 of 12) -127517 NM_006633 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 218-121 chrX 71555348 71555697 + 0.666667 NA intron (NM_181672, intron 7 of 21) AluJb|SINE|Alu 22418 NM_181672 8473 Hs.405410 NM_003605 ENSG00000147162 OGT HINCUT-1|HRNT1|MRX106|O-GLCNAC|OGT1 O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase protein-coding 160.667-41 chr10 85135024 85135333 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 63727 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 188.333-39 chr12 75931486 75931991 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 100038 NM_007350 22822 Hs.602085 NM_007350 ENSG00000139289 PHLDA1 DT1P1B11|PHRIP|TDAG51 pleckstrin homology like domain family A member 1 protein-coding 152-114 chr4 34220248 34220548 + 0.666667 NA intron (NR_147184, intron 2 of 3) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 49349 NR_147184 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 325.333-27 chr3 119841457 119842204 + 0.666667 NA intron (NM_001354596, intron 9 of 9) intron (NM_001354596, intron 9 of 9) 59120 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 154-58 chr15 63220937 63221347 + 0.666667 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) intron (NM_016530, intron 1 of 7) 31536 NM_016530 51762 Hs.389733 NM_016530 ENSG00000166128 RAB8B - RAB8B, member RAS oncogene family protein-coding 117-65 chr17 81357786 81358003 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27231 NM_001347841 100130370 Hs.646594 NM_001272086 LOC100130370 - uncharacterized LOC100130370 protein-coding 118-81 chr21 24982199 24982509 + 0.666667 NA intron (NR_046198, intron 2 of 3) intron (NR_046198, intron 2 of 3) 141804 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 185.667-49 chr17 78971004 78971418 + 0.666667 NA TTS (NM_005567) TTS (NM_005567) 8712 NM_005567 3959 Hs.514535 NM_005567 ENSG00000108679 LGALS3BP 90K|BTBD17B|CyCAP|M2BP|MAC-2-BP|TANGO10B|gp90 galectin 3 binding protein protein-coding 124.667-37 chr11 121404591 121404836 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -47601 NM_003105 6653 Hs.368592 NM_003105 ENSG00000137642 SORL1 C11orf32|LR11|LRP9|SORLA|SorLA-1|gp250 sortilin related receptor 1 protein-coding 155-52 chr17 61323880 61324266 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L2c|LINE|L2 43631 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 184-58 chr20 5660880 5661317 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -50092 NM_019593 56261 Hs.636359 NM_019593 ENSG00000125772 GPCPD1 EDI3|GDE5|GDPD6|PREI4 glycerophosphocholine phosphodiesterase 1 protein-coding 144.333-290 chrX 25349776 25350112 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -333979 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 171.333-27 chr11 79539107 79539489 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -98268 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 153.333-179 chr19 52763802 52764162 + 0.666667 NA TTS (NM_198457) TTS (NM_198457) 22809 NM_001321867 162966 Hs.696848 NM_198457 ENSG00000189190 ZNF600 KR-ZNF1 zinc finger protein 600 protein-coding 115.333-55 chr13 28477522 28477809 + 0.666667 NA intron (NM_002019, intron 1 of 29) intron (NM_002019, intron 1 of 29) 17463 NM_001159920 2321 Hs.594454 NM_002019 ENSG00000102755 FLT1 FLT|FLT-1|VEGFR-1|VEGFR1 fms related tyrosine kinase 1 protein-coding 116-46 chr14 96943515 96943721 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_104113) promoter-TSS (NR_104113) 39 NR_104113 145249 Hs.592323 NR_104113 ENSG00000225163 LINC00618 C14orf63 long intergenic non-protein coding RNA 618 ncRNA 130-128 chr8 78407494 78407748 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -108719 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 127.667-72 chr19 45936619 45936862 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002516, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_002516, exon 4 of 4) -21962 NM_001029861 339345 Hs.434218 NM_001029861 ENSG00000188425 NANOS2 NOS2|ZC2HC12B nanos C2HC-type zinc finger 2 protein-coding 125.667-118 chr3 16578072 16578386 + 0.666667 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu 26561 NM_001190811 1618 Hs.131179 NM_001351 ENSG00000092345 DAZL DAZH|DAZL1|DAZLA|SPGYLA deleted in azoospermia like protein-coding 180-122 chr9 117517580 117517952 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102709 NM_014010 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 116-106 chr3 63884869 63885068 + 0.666667 NA intron (NM_000333, intron 1 of 12) L1MC3|LINE|L1 -13431 NM_001177387 6314 Hs.476595 NM_000333 ENSG00000163635 ATXN7 ADCAII|OPCA3|SCA7|SGF73 ataxin 7 protein-coding 162.667-86 chr15 49976709 49977042 + 0.666667 NA intron (NR_073597, intron 12 of 26) intron (NR_073597, intron 12 of 26) 136504 NR_073598 79895 Hs.511311 NM_024837 ENSG00000104043 ATP8B4 ATPIM ATPase phospholipid transporting 8B4 (putative) protein-coding 138.667-58 chr14 46479461 46479749 + 0.666667 NA intron (NR_102700, intron 1 of 1) intron (NR_102700, intron 1 of 1) 8246 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 142.667-11 chr1 211567626 211567983 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 11357 NM_021194 7779 Hs.519469 NM_021194 ENSG00000170385 SLC30A1 ZNT1|ZRC1 solute carrier family 30 member 1 protein-coding 221.666-34 chr20 52909506 52910144 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -62533 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 319.333-35 chr8 116089291 116089828 + 0.666667 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) intron (NR_046215, intron 7 of 13) 235500 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 128.333-200 chr8 140600194 140600424 + 0.666667 NA intron (NM_001164623, intron 1 of 17) intron (NM_001164623, intron 1 of 17) 35324 NM_001164623 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 116.333-54 chr12 98482127 98482365 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 21609 NR_038383 643770 Hs.129589 NR_038383 ENSG00000245017 LINC02453 - long intergenic non-protein coding RNA 2453 ncRNA 117.667-88 chr2 104153136 104153451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 255039 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 142.333-193 chr5 28518907 28519246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -231411 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 113-32 chr12 477654 477962 + 0.666667 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) intron (NM_173593, intron 1 of 19) 17869 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 206.667-16 chr10 63328911 63329372 + 0.666667 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) AluJb|SINE|Alu 43907 NR_031566 100302150 NR_031566 ENSG00000221063 MIR1296 MIRN1296|hsa-mir-1296|mir-1296 microRNA 1296 ncRNA 152-126 chr5 39876207 39876526 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -175925 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 178.333-30 chr12 1450963 1451440 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 19 of 19) L1MCc|LINE|L1 -49290 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 253.666-21 chr5 38226717 38227461 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31470 NM_152403 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 150.333-332 chr5 82930972 82931356 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71328 NR_105016 102546175 NR_105016 ENSG00000281327 LINC01338 - long intergenic non-protein coding RNA 1338 ncRNA 121.667-142 chr4 76394730 76394945 + 0.666667 NA intron (NM_001042784, intron 3 of 23) intron (NM_001042784, intron 3 of 23) 12468 NM_001042784 339965 Hs.529680 NM_178555 ENSG00000163749 CCDC158 - coiled-coil domain containing 158 protein-coding 173-19 chr12 39351883 39352243 + 0.666667 NA intron (NM_001173464, intron 10 of 37) L1MB3|LINE|L1 91057 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 182-88 chr5 119886345 119886883 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 257055 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 121-55 chr17 28815572 28815929 + 0.666667 NA intron (NM_001288635, intron 1 of 3) AluSg|SINE|Alu -3279 NM_001288634 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 198.667-178 chr8 54927174 54927706 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -174588 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 164.333-218 chr6 151016340 151016718 + 0.666667 NA intron (NM_001350486, intron 24 of 27) AluSg7|SINE|Alu 9521 NM_001350490 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 126-114 chr8 87169352 87169702 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MA2|LINE|L1 303112 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 114.333-140 chr22 21022584 21022878 + 0.666667 NA exon (NM_001159554, exon 4 of 12) exon (NM_001159554, exon 4 of 12) 7571 NM_001349876 9127 Hs.113275 NM_005446 ENSG00000099957 P2RX6 P2RXL1|P2X6|P2XM purinergic receptor P2X 6 protein-coding 139.667-125 chr3 155560367 155560723 + 0.666667 NA intron (NM_001349252, intron 8 of 24) intron (NM_001349252, intron 8 of 24) 74742 NR_146955 100874036 Hs.128933 NR_146955 ENSG00000242925 PLCH1-AS2 - PLCH1 antisense RNA 2 ncRNA 163.333-194 chr4 31337810 31338122 + 0.666667 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 166822 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 175.333-46 chr14 66649314 66649676 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) Charlie3|DNA|hAT-Charlie 142088 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 188-66 chr20 54557968 54558376 + 0.666667 NA intron (NM_018431, intron 2 of 7) intron (NM_018431, intron 2 of 7) 82579 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 135.333-146 chr5 107628160 107628430 + 0.666667 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 42642 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 116.333-65 chr14 60547270 60547495 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 38236 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 144-44 chr13 25369152 25369430 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2683 NM_016529 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 236.333-7 chr1 85796196 85796819 + 0.666667 NA intron (NM_152890, intron 47 of 59) intron (NM_152890, intron 47 of 59) -88074 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 148.667-202 chr2 151662739 151663026 + 0.666667 NA intron (NM_001271208, intron 45 of 182) intron (NM_001271208, intron 45 of 182) 71594 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 311.667-15 chr3 67390136 67390858 + 0.666667 NA intron (NM_003848, intron 10 of 10) intron (NM_003848, intron 10 of 10) 165033 NR_036234 100422941 NR_036234 ENSG00000283298 MIR4272 - microRNA 4272 ncRNA 149.333-354 chr6 152166463 152166901 + 0.666667 NA intron (NM_182961, intron 130 of 145) intron (NM_182961, intron 130 of 145) 1605 NM_001347702 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 119.667-6 chr1 52739957 52740282 + 0.666667 NA intron (NM_024646, intron 1 of 13) intron (NM_024646, intron 1 of 13) 13666 NM_024646 79699 Hs.476280 NM_024646 ENSG00000162378 ZYG11B ZYG11 zyg-11 family member B, cell cycle regulator protein-coding 233.667-17 chr13 53798212 53798626 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17000 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 145-53 chr2 106015997 106016397 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -49491 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 159.667-36 chr1 221733792 221734126 + 0.666667 NA intron (NR_111940, intron 1 of 2) intron (NR_111940, intron 1 of 2) 2941 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 183.667-18 chr1 237355538 237355918 + 0.666667 NA intron (NM_001035, intron 3 of 104) intron (NM_001035, intron 3 of 104) -115391 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 135 chr1 23031421 23031699 + 0.666667 NA intron (NM_015013, intron 2 of 18) intron (NM_015013, intron 2 of 18) 12092 NM_015013 23028 Hs.591518 NM_015013 ENSG00000004487 KDM1A AOF2|BHC110|CPRF|KDM1|LSD1 lysine demethylase 1A protein-coding 112-71 chr15 73768006 73768251 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_120353) promoter-TSS (NR_120353) 42 NR_120353 101929221 NR_120352 INSYN1-AS1 C15orf59-AS1 INSYN1 antisense RNA 1 ncRNA 152.333-273 chr4 68124293 68124645 + 0.666667 NA intron (NM_207407, intron 1 of 9) AluSx3|SINE|Alu 5400 NM_207407 389208 Hs.677557 NM_207407 ENSG00000198092 TMPRSS11F - transmembrane serine protease 11F protein-coding 141.333-158 chr3 116279692 116280023 + 0.666667 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -80167 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 134-33 chr16 7772663 7773034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 440003 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 170-105 chr6 39137712 39138171 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -22755 NM_001304793 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 140.667-6 chr1 68451727 68452042 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -1930 NM_000329 6121 Hs.2133 NM_000329 ENSG00000116745 RPE65 BCO3|LCA2|RP20|mRPE65|p63|rd12|sRPE65 retinoid isomerohydrolase RPE65 protein-coding 134.667-145 chr4 95871895 95872210 + 0.666667 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 31959 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 114-117 chr5 55885104 55885438 + 0.666667 NA intron (NM_001297572, intron 5 of 10) L3|LINE|CR1 31949 NM_001242639 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 202.333-106 chr3 16118094 16118398 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -56434 NM_001319051 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 143.333-44 chr10 113360131 113360392 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190570 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 202.666-92 chr5 52705197 52705785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -82425 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 176-48 chr2 115178082 115178370 + 0.666667 NA intron (NM_001321906, intron 2 of 26) L2b|LINE|L2 16071 NM_001321909 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 183-96 chr7 18947887 18948279 + 0.666667 NA intron (NM_058176, intron 22 of 22) L1M5|LINE|L1 169553 NR_149001 7291 Hs.66744 NM_000474 ENSG00000122691 TWIST1 ACS3|BPES2|BPES3|CRS|CRS1|CSO|SCS|SWCOS|TWIST|bHLHa38 twist family bHLH transcription factor 1 protein-coding 230-19 chr13 50290559 50291241 + 0.666667 NA intron (NR_109974, intron 2 of 6) LTR33A|LTR|ERVL 118882 NR_002183 145165 Hs.511834 NM_153290 ST13P4 FAM10A4|FAM10A4P ST13, Hsp70 interacting protein pseudogene 4 pseudo 155.667-9 chr1 54996878 54997185 + 0.666667 NA Intergenic CpG -1902 NM_057176 7809 Hs.151291 NM_057176 ENSG00000162399 BSND BART|DFNB73 barttin CLCNK type accessory beta subunit protein-coding 231.333-21 chr10 119109069 119109570 + 0.666667 NA intron (NM_207009, intron 2 of 8) intron (NM_207009, intron 2 of 8) 5206 NM_001303113 404636 Hs.434241 NM_207009 ENSG00000119979 DENND10 FAM45A DENN domain containing 10 protein-coding 207.667-67 chr20 56453966 56454517 + 0.666667 NA intron (NM_001164116, intron 6 of 6) intron (NM_001164116, intron 6 of 6) -14344 NM_001283035 51507 Hs.517134 NM_016407 ENSG00000022277 RTF2 C20orf43|CDAO5|HSPC164|RTFDC1|SHUJUN-3 replication termination factor 2 protein-coding 203.333-244 chr7 40090090 40090668 + 0.666667 NA intron (NM_031267, intron 12 of 13) AluSz|SINE|Alu 44243 NM_138701 136647 Hs.654989 NM_138701 ENSG00000168303 MPLKIP ABHS|C7orf11|ORF20|TTD4 M-phase specific PLK1 interacting protein protein-coding 113.333-237 chr7 39621195 39621376 + 0.666667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB -2287 NM_005402 5898 Hs.6906 NM_005402 ENSG00000006451 RALA RAL RAS like proto-oncogene A protein-coding 120-9 chr10 19327819 19328019 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 23 of 39) intron (NM_001142308, intron 23 of 39) 279118 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 118.667-70 chr14 81687223 81687561 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55746 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 112.667-84 chr16 60111217 60111446 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 248462 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 154.667-95 chr13 69690936 69691304 + 0.666667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 -416093 NR_002717 6315 Hs.676453 NR_002717 ATXN8OS KLHL1AS|NCRNA00003|SCA8 ATXN8 opposite strand lncRNA ncRNA 120-79 chr22 34864594 34864907 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 133166 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 142-133 chr6 136152638 136152914 + 0.666667 NA intron (NM_018945, intron 6 of 12) intron (NM_018945, intron 6 of 12) -79949 NR_149042 644135 Hs.126980 NR_149042 ENSG00000237596 LOC644135 - uncharacterized LOC644135 ncRNA 149.667-392 chr8 79951569 79952001 + 0.666667 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 78474 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 175.667-39 chr14 67512226 67512593 + 0.666667 NA intron (NM_001348549, intron 1 of 3) intron (NM_001348549, intron 1 of 3) 2806 NM_001348544 161145 Hs.509707 NM_182526 ENSG00000198133 TMEM229B C14orf83 transmembrane protein 229B protein-coding 120.333-60 chr15 65582467 65582809 + 0.666667 NA intron (NR_045106, intron 10 of 11) L1MB5|LINE|L1 28493 NR_045106 81556 Hs.6686 NM_030800 ENSG00000138614 INTS14 C15orf44|VWA9 integrator complex subunit 14 protein-coding 151.667-265 chr5 16274765 16275079 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 94681 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 267-17 chr12 45724448 45724922 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3236 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 121-123 chr6 55283749 55284013 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43588 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 135.667-161 chr6 136746991 136747222 + 0.666667 NA intron (NM_005923, intron 1 of 29) AluJr|SINE|Alu -36941 NR_134635 101928429 Hs.672896 NR_134635 LOC101928429 - uncharacterized LOC101928429 ncRNA 122-30 chr13 95540611 95540944 + 0.666667 NA intron (NM_182848, intron 1 of 4) intron (NM_182848, intron 1 of 4) -6867 NR_046533 100874194 Hs.569229 NR_046533 ENSG00000223392 CLDN10-AS1 - CLDN10 antisense RNA 1 ncRNA 121.667-141 chr4 69802966 69803286 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42506 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 229-4 chr1 203648519 203649052 + 0.666667 NA intron (NM_001365784, intron 1 of 20) intron (NM_001365784, intron 1 of 20) 20848 NM_001365784 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 127.667-12 chr1 242626766 242627015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102193 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 440.666-7 chr2 106782410 106783516 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 103065 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 148-86 chr2 163103109 163103539 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -264557 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 127.333-2 chr1 54644537 54644767 + 0.666667 NA intron (NM_001291332, intron 1 of 21) L1MDa|LINE|L1 2866 NM_001039464 374977 Hs.412482 NM_198547 ENSG00000184313 MROH7 C1orf175|HEATR8 maestro heat like repeat family member 7 protein-coding 112.667-183 chr4 30351653 30351862 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -368612 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 127.667-118 chr3 100845559 100845782 + 0.666667 NA intron (NM_001349330, intron 18 of 61) intron (NM_001349330, intron 18 of 61) 136128 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 114.333-240 chr9 74865455 74865776 + 0.666667 NA intron (NM_017662, intron 1 of 38) intron (NM_017662, intron 1 of 38) 21732 NM_001177311 140803 Hs.272225 NM_017662 ENSG00000119121 TRPM6 CHAK2|HMGX|HOMG|HOMG1|HSH transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 protein-coding 129-38 chr15 64282848 64283115 + 0.666667 NA intron (NM_001329607, intron 2 of 11) L1MB7|LINE|L1 73192 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 171.667-73 chr19 16694796 16695108 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -24895 NM_001290355 284434 Hs.406014 NM_001007525 ENSG00000188039 NWD1 - NACHT and WD repeat domain containing 1 protein-coding 176-75 chr5 88218369 88218737 + 0.666667 NA intron (NM_001349407, intron 5 of 14) AluJb|SINE|Alu 50292 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 172.333-15 chr10 34502464 34502832 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 3 of 22) intron (NM_001184789, intron 3 of 22) 312648 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 152.333-204 chr2 215472231 215472551 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18684 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 148-25 chr11 24813159 24813494 + 0.666667 NA intron (NM_001252010, intron 5 of 9) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 316273 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 114.667-31 chr10 51177634 51177864 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 103262 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 142.667-208 chr7 89481800 89482099 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -637451 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 137.667-146 chr4 132843260 132843671 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 252376 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 124.667-94 chr18 78136143 78136358 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -142523 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 143.333-60 chr12 10005162 10005435 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -5329 NM_001129998 387837 Hs.127937 NM_205852 ENSG00000256660 CLEC12B UNQ5782 C-type lectin domain family 12 member B protein-coding 140-77 chr4 60103524 60103782 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -818966 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 141.333-168 chr4 30493422 30493745 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -226786 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 145.333-173 chr22 50074752 50075065 + 0.666667 NA intron (NM_015166, intron 7 of 11) MER66B|LTR|ERV1 10444 NM_139202 23209 Hs.517729 NM_015166 ENSG00000100427 MLC1 LVM|MLC|VL modulator of VRAC current 1 protein-coding 119.667-66 chr16 76973839 76974106 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 105036 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 152-104 chr3 27899451 27899823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65501 NR_132438 100996624 Hs.275746 NR_132438 ENSG00000229243 LINC01981 - long intergenic non-protein coding RNA 1981 ncRNA 129-135 chr9 119432424 119432797 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -63175 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 130.333-101 chr2 60650748 60651007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -97223 NM_018014 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 139-55 chr2 210028899 210029284 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_110291) promoter-TSS (NR_110291) -831 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 112-132 chr3 22102774 22103063 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145779 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 118-110 chr6 39930005 39930207 + 0.666667 NA intron (NM_001358530, intron 1 of 10) intron (NM_001358530, intron 1 of 10) -2390 NM_005943 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 200.667-48 chr15 53058303 53058753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57837 NR_147181 105370822 Hs.527821 NR_147181 ENSG00000259237 LINC02490 - long intergenic non-protein coding RNA 2490 ncRNA 141-9 chr10 89982886 89983280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25710 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 130.667-45 chr11 33761082 33761340 + 0.666667 NA intron (NM_012175, intron 3 of 10) L1ME3A|LINE|L1 13309 NM_033406 26273 Hs.406787 NM_012175 ENSG00000110429 FBXO3 FBA|FBX3 F-box protein 3 protein-coding 181.667-101 chr3 157576173 157576561 + 0.666667 NA intron (NM_001130002, intron 4 of 4) intron (NM_001130002, intron 4 of 4) 33023 NM_001099777 152078 Hs.259046 NM_001099777 ENSG00000174899 SLC66A1L C3orf55|PQLC2L|SLC66A2L solute carrier family 66 member 1 like protein-coding 166-17 chr1 246756104 246756470 + 0.666667 NA intron (NM_016002, intron 5 of 11) L1ME3B|LINE|L1 31878 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 143.667-32 chr10 120372695 120373083 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -17666 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 185.667-31 chr14 49785576 49785994 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014315, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_014315, exon 13 of 13) 17632 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 151.333-44 chr10 27793455 27793762 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47789 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 283-8 chr12 5943829 5944303 + 0.666667 NA intron (NM_001278597, intron 1 of 25) intron (NM_001278597, intron 1 of 25) 1193 NM_001278596 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 114-162 chr8 46613791 46614054 + 0.666667 NA intron (NR_146077, intron 3 of 8) L1PA7|LINE|L1 3721 NR_146077 389652 NR_146077 ENSG00000248498 ASNSP1 ASNSL1 asparagine synthetase pseudogene 1 pseudo 127.667-9 chr1 189065905 189066249 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 1409933 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 144.667-326 chrUn_KI270442v1 358134 358437 + 0.666667 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 156.667-40 chr10 36104828 36105181 + 0.666667 NA Intergenic LTR80A|LTR|ERVL 326702 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 135.333-142 chr5 56859955 56860196 + 0.666667 NA intron (NM_005921, intron 3 of 19) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 44526 NM_005921 4214 Hs.653654 NM_005921 ENSG00000095015 MAP3K1 MAPKKK1|MEKK|MEKK 1|MEKK1|SRXY6 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1 protein-coding 126-90 chr5 32620310 32620559 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 34877 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 196-50 chr14 70759526 70760076 + 0.666667 NA intron (NM_033141, intron 3 of 12) AluJr|SINE|Alu 23651 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 188.333-162 chr8 143175340 143175684 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -14858 NM_001130478 4062 Hs.159590 NM_002347 ENSG00000176956 LY6H NMLY6 lymphocyte antigen 6 family member H protein-coding 166-15 chr1 190874714 190875183 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 250058 NR_033922 440704 NR_033922 ENSG00000231175 LINC01720 - long intergenic non-protein coding RNA 1720 ncRNA 210.333-124 chr5 4947971 4948512 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86118 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 158.333-348 chrX 49950024 49950351 + 0.666667 NA intron (NM_001127899, intron 3 of 14) intron (NM_001127899, intron 3 of 14) 27591 NM_001127898 1184 Hs.166486 NM_000084 ENSG00000171365 CLCN5 CLC5|CLCK2|ClC-5|DENTS|NPHL1|NPHL2|XLRH|XRN|hCIC-K2 chloride voltage-gated channel 5 protein-coding 149.667-252 chr22 45370124 45370409 + 0.666667 NA intron (NM_148674, intron 14 of 24) intron (NM_148674, intron 14 of 24) 43333 NM_148674 27127 Hs.334176 NM_148674 ENSG00000077935 SMC1B SMC1BETA|SMC1L2 structural maintenance of chromosomes 1B protein-coding 144.667-45 chr11 90622681 90623079 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) L1PA13|LINE|L1 -67023 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 146-30 chr14 71232075 71232491 + 0.666667 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 -88193 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 146.333-52 chr11 101400850 101401262 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 118849 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 148-22 chr10 126202978 126203262 + 0.666667 NA intron (NM_001288974, intron 3 of 18) intron (NM_001288974, intron 3 of 18) 185357 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 139.333-116 chr2 126243834 126244097 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -125980 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 167-107 chr8 137471240 137471589 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57826 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 131-112 chr9 136338445 136338820 + 0.666667 NA exon (NM_001145638, exon 7 of 14) exon (NM_001145638, exon 7 of 14) 11093 NM_001145638 26086 Hs.239370 NM_015597 ENSG00000160360 GPSM1 AGS3 G protein signaling modulator 1 protein-coding 164.333-245 chr9 19050375 19050716 + 0.666667 NA exon (NM_006570, exon 1 of 1) exon (NM_006570, exon 1 of 1) 1118 NM_006570 10670 Hs.743260 NM_006570 ENSG00000155876 RRAGA FIP-1|FIP1|RAGA Ras related GTP binding A protein-coding 143.333-98 chr15 45880417 45880753 + 0.666667 NA intron (NR_135680, intron 2 of 4) intron (NR_135680, intron 2 of 4) 175390 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 132.667-170 chr7 106878369 106878737 + 0.666667 NA intron (NM_001282426, intron 5 of 10) L1ME1|LINE|L1 13074 NM_002649 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 164.667-50 chr12 32407505 32407920 + 0.666667 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) intron (NM_001370298, intron 1 of 16) 8154 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 141.333 chr1 25490556 25490902 + 0.666667 NA intron (NM_018202, intron 9 of 10) L1ME4a|LINE|L1 -52856 NM_015627 26119 Hs.590911 NM_015627 ENSG00000157978 LDLRAP1 ARH|ARH1|ARH2|FHCB1|FHCB2 low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 protein-coding 142-100 chr4 43985897 43986162 + 0.666667 NA Intergenic MLT2C1|LTR|ERVL -30832 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 166-34 chr12 47034282 47034740 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45092 NM_001281429 91523 Hs.560100 NM_138371 ENSG00000179715 PCED1B FAM113B PC-esterase domain containing 1B protein-coding 147.667-277 chr5 19790378 19790700 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 3 of 12) L2c|LINE|L2 95733 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 189.667-20 chr10 67072137 67072500 + 0.666667 NA intron (NR_111909, intron 2 of 2) L1MEg|LINE|L1 60052 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 126-73 chr3 111680931 111681216 + 0.666667 NA intron (NM_001185106, intron 1 of 4) intron (NM_001185106, intron 1 of 4) -3640 NR_046733 100874115 Hs.626740 NR_046733 PLCXD2-AS1 - PLCXD2 antisense RNA 1 ncRNA 138.667-32 chr11 61736821 61737146 + 0.666667 NA intron (NM_006133, intron 13 of 19) L2c|LINE|L2 -15653 NM_001127392 745 Hs.473109 NM_013279 ENSG00000124920 MYRF 11orf9|C11orf9|CUGS|MMERV|MRF|Ndt80|pqn-47 myelin regulatory factor protein-coding 220-119 chr8 83648146 83648593 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 244611 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 142-4 chr1 77364683 77365037 + 0.666667 NA intron (NM_012093, intron 6 of 13) L1MA5A|LINE|L1 81773 NM_012093 26289 Hs.559718 NM_012093 ENSG00000154027 AK5 AK6 adenylate kinase 5 protein-coding 156-132 chr7 32391473 32391804 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L1MC4a|LINE|L1 36586 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 318.667-12 chr14 61045846 61046400 + 0.666667 NA exon (NM_001172702, exon 12 of 17) exon (NM_001172702, exon 12 of 17) -64433 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 140.333-70 chr14 85522289 85522564 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7599 NR_144387 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 163.333-49 chr11 15165948 15166400 + 0.666667 NA intron (NM_001042536, intron 2 of 12) intron (NM_001042536, intron 2 of 12) 17072 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 180.667-91 chr3 22860003 22860511 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 342321 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 169.333-278 chr8 129129400 129129834 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 111623 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 158.333-74 chr13 46665051 46665288 + 0.666667 NA intron (NM_001164213, intron 2 of 18) intron (NM_001164213, intron 2 of 18) 111999 NM_001164211 23143 Hs.507971 NM_015116 ENSG00000136141 LRCH1 CHDC1|NP81 leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1 protein-coding 153-155 chr9 106319306 106319633 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -281459 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 145.667-141 chr2 105869852 105870191 + 0.666667 NA intron (NM_001004722, intron 3 of 3) intron (NM_001004722, intron 3 of 3) 18174 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 113-103 chr2 55236486 55236666 + 0.666667 NA TTS (NM_001321002) TTS (NM_001321002) 2412 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 112.333-34 chr11 33440616 33440868 + 0.666667 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) L1MEd|LINE|L1 64634 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 266.333-47 chr5 81067174 81067676 + 0.666667 NA intron (NM_006909, intron 2 of 26) intron (NM_006909, intron 2 of 26) -106518 NR_105015 102524628 Hs.737159 NR_105015 ENSG00000251450 RASGRF2-AS1 - RASGRF2 antisense RNA 1 ncRNA 336.667-7 chr10 59045658 59046388 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 46505 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 234-31 chr18 30834006 30834514 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 208482 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 124-38 chr14 82147486 82147824 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -404517 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 145-71 chr3 69850508 69850779 + 0.666667 NA intron (NM_001354608, intron 2 of 10) intron (NM_001354608, intron 2 of 10) -15581 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 164.333-80 chr15 82850549 82850927 + 0.666667 NA intron (NM_004839, intron 8 of 8) MIR1_Amn|SINE|MIR 41110 NM_001080435 123720 Hs.377360 NM_001080435 ENSG00000156232 WHAMM WHAMM1|WHDC1 WASP homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules protein-coding 116-137 chr6 111032700 111032994 + 0.666667 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 14707 NR_002932 442245 Hs.551627 NR_002932 GSTM2P1 - glutathione S-transferase mu 2 pseudogene 1 pseudo 187.667-55 chr17 3144290 3144677 + 0.666667 NA intron (NR_147912, intron 3 of 3) L1MDa|LINE|L1 -16932 NM_003555 8390 Hs.248183 NM_003555 ENSG00000183024 OR1G1 OR17-130|OR17-209|OR1G2 olfactory receptor family 1 subfamily G member 1 protein-coding 215-16 chr13 82313218 82313706 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -1086479 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 114.333-51 chr12 22472983 22473259 + 0.666667 NA intron (NM_001286176, intron 16 of 26) intron (NM_001286176, intron 16 of 26) 71076 NM_001286174 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 166.667-215 chr7 31724500 31724910 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37490 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 195.333-195 chr6 153125413 153125973 + 0.666667 NA intron (NM_012419, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 5589 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 115.667-48 chr11 114785518 114785796 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107130 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 135.667-60 chr15 63107989 63108391 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13671 NM_001288585 114294 Hs.410388 NM_032857 ENSG00000103642 LACTB G24|MRPL56 lactamase beta protein-coding 127-35 chr15 69021904 69022235 + 0.666667 NA intron (NM_024505, intron 1 of 15) intron (NM_024505, intron 1 of 15) 7374 NM_024505 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 112.333-274 chr9 24980384 24980687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -434638 NM_001365008 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 126-39 chr16 69460523 69460878 + 0.666667 NA intron (NM_030579, intron 4 of 4) L1ME3B|LINE|L1 36105 NM_030579 80777 Hs.461131 NM_030579 ENSG00000103018 CYB5B CYB5-M|CYPB5M|OMB5 cytochrome b5 type B protein-coding 114-87 chr3 57797695 57797990 + 0.666667 NA intron (NM_001304420, intron 1 of 21) intron (NM_001304420, intron 1 of 21) 40586 NM_001304421 7871 Hs.476432 NM_007159 ENSG00000163681 SLMAP SLAP sarcolemma associated protein protein-coding 117.333-208 chr8 95624462 95624691 + 0.666667 NA intron (NR_038205, intron 2 of 2) intron (NR_038205, intron 2 of 2) 323772 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 189-3 chr1 104148608 104149028 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 75795 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 128.667-151 chr5 133489143 133489394 + 0.666667 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) intron (NM_015082, intron 3 of 15) -61562 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 167-26 chr11 96280017 96280358 + 0.666667 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -61251 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 132.667-146 chr5 133722683 133722993 + 0.666667 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -110297 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 119-116 chr4 168649278 168649513 + 0.666667 NA intron (NM_001166109, intron 1 of 18) intron (NM_001166109, intron 1 of 18) 17817 NM_001166109 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 150.667-314 chr5 116920101 116920387 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -158035 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 168.333-44 chr12 9658561 9658916 + 0.666667 NA TTS (NR_046450) TTS (NR_046450) 10691 NR_046444 374443 Hs.569124 NR_002814 ENSG00000256594 LOC374443 - C-type lectin domain family 2 member D pseudogene pseudo 182.667-3 chr1 81446434 81446846 + 0.666667 NA intron (NM_001366008, intron 2 of 26) intron (NM_001366008, intron 2 of 26) 111062 NR_125943 101927434 Hs.130394 NR_125943 ENSG00000234953 LOC101927434 - uncharacterized LOC101927434 ncRNA 132.667-27 chr10 102372733 102373040 + 0.666667 NA intron (NM_001199378, intron 29 of 39) L1MD2|LINE|L1 -21224 NM_001288724 4791 Hs.73090 NM_002502 ENSG00000077150 NFKB2 CVID10|H2TF1|LYT-10|LYT10|NF-kB2|p100|p49/p100|p52 nuclear factor kappa B subunit 2 protein-coding 117.667-14 chr1 221202423 221202681 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 133744 NR_024236 400804 Hs.722626 NR_024236 ENSG00000234754 C1orf140 - uncharacterized LOC400804 ncRNA 197.667-137 chr6 141674261 141674796 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 414271 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 218-37 chr17 51807734 51808333 + 0.666667 NA intron (NM_001082533, intron 4 of 9) intron (NM_001082533, intron 4 of 9) 350681 NM_020178 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 141-45 chr2 83493978 83494302 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 -28674 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 149-23 chr10 100892044 100892357 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -20763 NM_001243770 55719 Hs.447458 NM_018121 ENSG00000119906 SLF2 C10orf6|FAM178A SMC5-SMC6 complex localization factor 2 protein-coding 208.667-154 chrX 148978481 148978958 + 0.666667 NA intron (NM_001170628, intron 15 of 17) intron (NM_001170628, intron 15 of 17) 259628 NM_001170628 2334 Hs.496911 NM_002025 ENSG00000155966 AFF2 FMR2|FMR2P|FRAXE|MRX2|OX19 AF4/FMR2 family member 2 protein-coding 209.333-4 chr1 52148095 52148627 + 0.666667 NA intron (NM_007324, intron 1 of 17) AluSq2|SINE|Alu 6267 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 175.333-3 chr1 53108575 53109054 + 0.666667 NA intron (NM_001287596, intron 3 of 3) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 33824 NM_001287597 6512 Hs.104637 NM_006671 ENSG00000162383 SLC1A7 AAAT|EAAT5 solute carrier family 1 member 7 protein-coding 131.667-198 chr8 107917818 107918065 + 0.666667 NA intron (NM_001282863, intron 4 of 4) MER41-int|LTR|ERV1 163998 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 201-28 chr12 20472270 20472571 + 0.666667 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -99444 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 196.667-133 chr6 85923220 85923703 + 0.666667 NA Intergenic LTR41|LTR|ERVL -244728 NR_003038 387066 Hs.292457 NR_003038 ENSG00000203875 SNHG5 C6orf160|LINC00044|NCRNA00044|U50HG small nucleolar RNA host gene 5 ncRNA 178.333-175 chr8 131269671 131270058 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -228955 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 117-39 chr12 124826478 124826659 + 0.666667 NA intron (NR_160424, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 13103 NM_001367982 949 Hs.731377 NM_005505 ENSG00000073060 SCARB1 CD36L1|CLA-1|CLA1|HDLQTL6|SR-BI|SRB1 scavenger receptor class B member 1 protein-coding 132.333-118 chr4 33493425 33493747 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 546307 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 135.667-189 chr8 124805859 124806261 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15925 NR_039806 100616221 NR_039806 ENSG00000283609 MIR4662A - microRNA 4662a ncRNA 131.333-105 chr20 58680793 58681113 + 0.666667 NA intron (NR_037945, intron 8 of 22) intron (NR_037945, intron 8 of 22) -8178 NM_001204873 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 226.667-5 chr1 103842077 103842594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 92494 NM_001008218 277 Hs.599274 NM_001008218 ENSG00000174876 AMY1B AMY1 amylase alpha 1B (salivary) protein-coding 134.333-115 chr3 47908222 47908559 + 0.666667 NA intron (NM_002375, intron 8 of 18) intron (NM_002375, intron 8 of 18) 58835 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 167-10 chr10 48426318 48426645 + 0.666667 NA non-coding (NR_136585, exon 9 of 12) non-coding (NR_136585, exon 9 of 12) 24869 NM_001278548 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 159-97 chr5 73847785 73848108 + 0.666667 NA intron (NM_001177693, intron 12 of 35) intron (NM_001177693, intron 12 of 35) 34400 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 189.333-129 chr3 106459698 106460181 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -590538 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 151.333-154 chr15 89740161 89740444 + 0.666667 NA intron (NM_001284395, intron 16 of 16) intron (NM_001284395, intron 16 of 16) 11007 NM_018670 55897 Hs.447531 NM_018670 ENSG00000166823 MESP1 bHLHc5 mesoderm posterior bHLH transcription factor 1 protein-coding 143.333-78 chr14 29197863 29198187 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -412238 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 204.333-11 chr1 111342168 111342660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4146 NM_001300831 128344 Hs.172510 NM_181643 ENSG00000173947 PIFO C1orf88|pitchfork primary cilia formation protein-coding 157.333-222 chr22 34761417 34761726 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 236345 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 169.667-149 chr4 48105705 48106063 + 0.666667 NA intron (NM_003328, intron 5 of 14) intron (NM_003328, intron 5 of 14) 28366 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 178.667-164 chr8 108859636 108859983 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72215 NM_153015 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 126-6 chr10 7440676 7440973 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29338 NM_001029880 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 122-115 chr7 108299303 108299571 + 0.666667 NA intron (NM_001371126, intron 3 of 32) intron (NM_001371126, intron 3 of 32) 29089 NM_001371178 113-30 chr11 106282280 106282566 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31016 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 140.667-205 chr6 160586858 160587148 + 0.666667 NA intron (NM_005577, intron 24 of 38) intron (NM_005577, intron 24 of 38) -75879 NR_028093 80350 Hs.654503 NM_024492 ENSG00000213071 LPAL2 APOA2|APOAL|APOARGC|apo(a)rg-C lipoprotein(a) like 2, pseudogene pseudo 114.667-242 chr8 60869973 60870154 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 97685 NR_034003 100130298 Hs.636194 NR_034003 LOC100130298 - hCG1816373-like ncRNA 149.667-42 chr1 221581112 221581427 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 155631 NR_111939 11221 Hs.497822 NM_007207 ENSG00000143507 DUSP10 MKP-5|MKP5 dual specificity phosphatase 10 protein-coding 169.333-124 chr2 112657669 112658081 + 0.666667 NA intron (NM_005415, intron 6 of 10) intron (NM_005415, intron 6 of 10) 11936 NM_005415 6574 Hs.187946 NM_005415 ENSG00000144136 SLC20A1 GLVR1|Glvr-1|PIT1|PiT-1 solute carrier family 20 member 1 protein-coding 219.333-176 chr7 108208812 108209172 + 0.666667 NA intron (NM_001371137, intron 9 of 25) L1MD3|LINE|L1 34393 NM_001371181 114.667-180 chr3 120501347 120501537 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -50450 NM_007085 11167 Hs.269512 NM_007085 ENSG00000163430 FSTL1 FRP|FSL1|MIR198|OCC-1|OCC1|tsc36 follistatin like 1 protein-coding 125-104 chr6 139417685 139417991 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -43190 NM_006079 10370 Hs.82071 NM_006079 ENSG00000164442 CITED2 ASD8|MRG-1|MRG1|P35SRJ|VSD2 Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2 protein-coding 156-97 chr4 31102919 31103235 + 0.666667 NA intron (NM_001173523, intron 2 of 2) intron (NM_001173523, intron 2 of 2) -68067 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 146.667-206 chr22 22875817 22876153 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -10282 NR_049835 100847006 NR_049835 ENSG00000264824 MIR5571 - microRNA 5571 ncRNA 128-59 chr20 18626877 18627123 + 0.666667 NA intron (NM_080820, intron 3 of 5) intron (NM_080820, intron 3 of 5) 38946 NM_080820 92675 Hs.659442 NM_080820 ENSG00000125821 DTD1 C20orf88|DTD|DUE-B|DUEB|HARS2|pqn-68 D-aminoacyl-tRNA deacylase 1 protein-coding 116.667-91 chr2 25992058 25992241 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9652 NM_002254 3797 Hs.21611 NM_002254 ENSG00000084731 KIF3C - kinesin family member 3C protein-coding 116-74 chr2 53799376 53799599 + 0.666667 NA intron (NM_015701, intron 6 of 13) L2c|LINE|L2 12443 NM_015701 27248 Hs.438336 NM_015701 ENSG00000068912 ERLEC1 C2orf30|CIM|CL24936|CL25084|HEL117|XTP3-B|XTP3TPB endoplasmic reticulum lectin 1 protein-coding 116-76 chr2 62124949 62125259 + 0.666667 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) intron (NM_001321781, intron 2 of 2) -71011 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 151-38 chr14 73632369 73632803 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -12400 NM_001201366 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 115.333-232 chrX 83556565 83556840 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 48412 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 254.333-50 chr21 30288024 30288737 + 0.666667 NA TTS (NM_001128598) TTS (NM_001128598) 1134 NM_001128598 100131902 Hs.580882 NM_001128598 ENSG00000232263 KRTAP25-1 KAP25.1 keratin associated protein 25-1 protein-coding 223.333-71 chr2 71262001 71262507 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -35151 NM_020459 400961 Hs.416735 NM_020459 ENSG00000124374 PAIP2B - poly(A) binding protein interacting protein 2B protein-coding 117.333-39 chr11 93905949 93906140 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -55426 NM_001144871 387804 Hs.512252 NM_001144871 ENSG00000214376 VSTM5 C11orf90 V-set and transmembrane domain containing 5 protein-coding 112-96 chr18 68924186 68924513 + 0.666667 NA intron (NM_001093729, intron 8 of 9) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 126269 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 138.333-212 chr9 102163444 102163821 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -356005 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 111.667-3 chr1 28701624 28701811 + 0.666667 NA intron (NM_001319674, intron 6 of 9) AluJr|SINE|Alu 32933 NM_006582 10691 Hs.632373 NM_006582 ENSG00000162419 GMEB1 P96PIF|PIF96 glucocorticoid modulatory element binding protein 1 protein-coding 139.333-158 chr3 189406079 189406321 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -165606 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 124.667-175 chr6 52594269 52594575 + 0.666667 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 17124 NR_103447 401264 Hs.544586 NR_103446 ENSG00000225791 TRAM2-AS1 - TRAM2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 125-92 chr5 132873040 132873320 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_052971) promoter-TSS (NM_052971) -488 NM_052971 116842 Hs.337588 NM_052971 ENSG00000164406 LEAP2 LEAP-2 liver enriched antimicrobial peptide 2 protein-coding 189.667-30 chr12 1220752 1221058 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 12 of 19) L2a|LINE|L2 193157 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 139.333-36 chr11 65631461 65631725 + 0.666667 NA intron (NM_032223, intron 27 of 34) AluSx1|SINE|Alu -4717 NR_039839 100616292 NR_039839 ENSG00000266041 MIR4690 - microRNA 4690 ncRNA 115.667-137 chr21 14915085 14915348 + 0.666667 NA intron (NR_146322, intron 1 of 3) intron (NR_146322, intron 1 of 3) 3452 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 158.667-233 chr4 43142885 43143218 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 249785 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 138-95 chr5 146345189 146345524 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 6517 NM_002700 5459 Hs.553499 NM_002700 ENSG00000091010 POU4F3 BRN3C|DFNA15|DFNA42|DFNA52 POU class 4 homeobox 3 protein-coding 207.667-14 chr11 8805410 8805848 + 0.666667 NA intron (NR_120590, intron 4 of 4) intron (NR_120590, intron 4 of 4) 5045 NM_213618 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 146-151 chrX 41098963 41099300 + 0.666667 NA intron (NM_001039591, intron 1 of 44) AluJb|SINE|Alu 13686 NM_001039590 8239 Hs.77578 NM_004652 ENSG00000124486 USP9X DFFRX|FAF|FAM|MRX99|MRXS99F ubiquitin specific peptidase 9 X-linked protein-coding 220.333-21 chr10 125434668 125435044 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -139515 NR_023362 100169752 Hs.652647 NR_023362 ENSG00000237675 TEX36-AS1 - TEX36 antisense RNA 1 ncRNA 129-27 chr12 45244749 45245106 + 0.666667 NA intron (NM_001025356, intron 1 of 19) intron (NM_001025356, intron 1 of 19) 28832 NM_001142679 196527 Hs.505339 NM_001025356 ENSG00000177119 ANO6 BDPLT7|SCTS|TMEM16F anoctamin 6 protein-coding 140.333-123 chr20 46939326 46939658 + 0.666667 NA intron (NM_172110, intron 1 of 13) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 44649 NM_005244 2139 Hs.472877 NM_005244 ENSG00000064655 EYA2 EAB1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 protein-coding 153.667-328 chr5 144815781 144816092 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 610545 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 113.333-213 chr5 98930890 98931194 + 0.666667 NA TTS (NR_036530) TTS (NR_036530) -1328 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 190.667-35 chr13 109859827 109860305 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73483 NM_003749 8660 Hs.442344 NM_003749 ENSG00000185950 IRS2 IRS-2 insulin receptor substrate 2 protein-coding 135.333-149 chr5 123057433 123057765 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -20874 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 140.667-65 chr12 112127909 112128199 + 0.666667 NA intron (NM_001143906, intron 1 of 11) AluSx1|SINE|Alu 2494 NM_006700 10906 Hs.5148 NM_006700 ENSG00000135148 TRAFD1 FLN29 TRAF-type zinc finger domain containing 1 protein-coding 195-107 chr8 100600824 100601263 + 0.666667 NA intron (NM_152628, intron 8 of 13) L1ME4a|LINE|L1 17362 NM_001363720 169166 Hs.567758 NM_152628 ENSG00000174226 SNX31 - sorting nexin 31 protein-coding 152.333-70 chr11 112851780 112852124 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -109468 NM_001242607 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 140.667-212 chr7 27561088 27561422 + 0.666667 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) intron (NM_152740, intron 4 of 7) -54719 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 132.667-107 chr3 63165942 63166247 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 63406 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 152-99 chr22 19831712 19832010 + 0.666667 NA intron (NM_053004, intron 2 of 7) L1MC5a|LINE|L1 23013 NM_053004 54584 Hs.105642 NM_053004 ENSG00000185838 GNB1L DGCRK3|FKSG1|GY2|WDR14|WDVCF G protein subunit beta 1 like protein-coding 140-125 chr8 139277116 139277398 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -363216 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 166.667-119 chr2 151740830 151741167 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -6511 NM_001164507 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 144.667-245 chr5 111234823 111235235 + 0.666667 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) intron (NM_001744, intron 1 of 10) 10645 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 146.667-248 chr5 12777699 12777937 + 0.666667 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) AluSq2|SINE|Alu 109959 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 145-38 chr16 10891755 10892132 + 0.666667 NA intron (NR_104444, intron 1 of 17) intron (NR_104444, intron 1 of 17) 14741 NM_001286403 4261 Hs.592051 NM_000246 ENSG00000179583 CIITA C2TA|CIITAIV|MHC2TA|NLRA class II major histocompatibility complex transactivator protein-coding 292.333-11 chr11 111538510 111538977 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1537 NM_001318799 143903 Hs.503831 NM_178834 ENSG00000204381 LAYN - layilin protein-coding 118.667-50 chr12 10004640 10004828 + 0.666667 NA Intergenic LTR1B|LTR|ERV1 -5434 NM_001099431 51266 Hs.409794 NM_016509 ENSG00000165682 CLEC1B 1810061I13Rik|CLEC2|CLEC2B|PRO1384|QDED721 C-type lectin domain family 1 member B protein-coding 227-26 chr2 107110494 107110947 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -223611 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 113-85 chr17 50334968 50335271 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11007 NM_022167 64132 Hs.463416 NM_022167 ENSG00000015532 XYLT2 PXYLT2|SOS|XT-II|XT2|xylT-II xylosyltransferase 2 protein-coding 170.333-132 chr22 33088898 33089347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19407 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 177.333-52 chr14 51244861 51245246 + 0.666667 NA intron (NM_030755, intron 2 of 7) intron (NM_030755, intron 2 of 7) 4806 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 150-149 chr8 125189253 125189590 + 0.666667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) LTR10E|LTR|ERV1 97561 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 167.667-17 chr1 228688278 228688678 + 0.666667 NA intron (NR_037962, intron 1 of 2) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -42320 NR_023368 100169757 NR_023368 ENSG00000200624 RNA5S6 RN5S6 RNA, 5S ribosomal 6 rRNA 344-39 chr7 39934086 39934864 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14944 NR_158201 112267983 Hs.587424 NR_158201 LOC112267983 - uncharacterized LOC112267983 ncRNA 118-129 chr8 41778508 41778793 + 0.666667 NA intron (NM_001142446, intron 1 of 42) intron (NM_001142446, intron 1 of 42) 18972 NM_020476 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 119.667-135 chr4 103465704 103466031 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 40825 NR_125925 101929448 Hs.570839 NR_125925 ENSG00000248740 LINC02428 - long intergenic non-protein coding RNA 2428 ncRNA 150.333-8 chr1 83893715 83894058 + 0.666667 NA intron (NM_001350215, intron 17 of 19) intron (NM_001350215, intron 17 of 19) -32890 NR_119375 101927587 Hs.621230 NR_119375 ENSG00000233008 LINC01725 - long intergenic non-protein coding RNA 1725 ncRNA 113.667-145 chr3 134353087 134353390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14624 NR_106885 102466744 NR_106885 ENSG00000277723 MIR6827 hsa-mir-6827 microRNA 6827 ncRNA 123.667-151 chr5 28413967 28414266 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -126451 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 202.333-120 chr4 30146057 30146422 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -574130 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 173-22 chr14 47684421 47684818 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9665 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 111.667-88 chr15 58374808 58375024 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57075 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 114.333-139 chr22 19212064 19212390 + 0.666667 NA intron (NM_007098, intron 19 of 32) L1MD2|LINE|L1 -33364 NR_046298 6576 Hs.111024 NM_005984 ENSG00000100075 SLC25A1 CMS23|CTP|D2L2AD|SEA|SLC20A3 solute carrier family 25 member 1 protein-coding 146-149 chr9 102005468 102005752 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -267030 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 130.667-120 chr2 196473637 196473931 + 0.666667 NA intron (NM_001348768, intron 1 of 28) intron (NM_001348768, intron 1 of 28) -111607 NM_001304840 57520 Hs.633212 NM_020760 ENSG00000138411 HECW2 NDHSAL|NEDL2 HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 186.667-117 chr5 83304923 83305328 + 0.666667 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) L1MC2|LINE|L1 -166549 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 182.667-5 chr1 82230546 82230982 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 428311 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 126-63 chr20 58303674 58303901 + 0.666667 NA intron (NR_003505, intron 2 of 16) MER58A|DNA|hAT-Charlie 5652 NR_003505 55370 Hs.473179 NM_018498 PPP4R1L C20orf192|PPP4R1P1|PRO1085 protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 like (pseudogene) pseudo 207-126 chr9 91310139 91310639 + 0.666667 NA intron (NM_001306190, intron 3 of 8) intron (NM_001306190, intron 3 of 8) 51535 NM_001698 549 Hs.175905 NM_001698 ENSG00000148090 AUH - AU RNA binding methylglutaconyl-CoA hydratase protein-coding 180-92 chr6 129534539 129534904 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1|DNA|hAT-Tip100 175456 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 135.667-156 chr6 49082703 49082954 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 380425 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 233-53 chr4 87887059 87887636 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 52644 NM_001291183 56955 Hs.676357 NM_020203 ENSG00000152595 MEPE OF45 matrix extracellular phosphoglycoprotein protein-coding 185-84 chrX 102138671 102139079 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001367790, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001367790, exon 4 of 4) 3606 NM_001006938 158931 Hs.447815 NM_001006938 ENSG00000204071 TCEAL6 Tceal3|WEX2 transcription elongation factor A like 6 protein-coding 129-16 chr10 57159810 57160180 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 144564 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 143.333-200 chr4 44023764 44024068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6854 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 134.333-175 chr8 105307458 105307823 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -10798 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 143.667-252 chr8 99347890 99348217 + 0.666667 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) intron (NM_017890, intron 19 of 61) 188677 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 158.333-183 chr22 20477237 20477605 + 0.666667 NA intron (NM_032775, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu 18374 NM_032775 84861 Hs.517419 NM_032775 ENSG00000099910 KLHL22 KELCHL kelch like family member 22 protein-coding 113.667-216 chr8 130271100 130271387 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) intron (NM_001362925, intron 3 of 29) 25290 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 186-84 chr5 113825421 113825903 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 311968 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 223-23 chr16 35988322 35988812 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 242015 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 182.667-126 chr5 5605153 5605544 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 182671 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 262.333-37 chr17 68822008 68822647 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 133065 NM_007168 10351 Hs.58351 NM_007168 ENSG00000141338 ABCA8 - ATP binding cassette subfamily A member 8 protein-coding 148.333-275 chr4 36892782 36893192 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -108792 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 137.667-134 chr4 2145191 2145491 + 0.666667 NA intron (NM_181808, intron 16 of 25) L1ME3D|LINE|L1 86014 NM_178557 339983 Hs.318529 NM_178557 ENSG00000185818 NAT8L CML3|NACED|NAT8-LIKE N-acetyltransferase 8 like protein-coding 124-14 chr1 205057885 205058191 + 0.666667 NA exon (NM_005076, exon 3 of 23) exon (NM_005076, exon 3 of 23) 14826 NM_005076 6900 Hs.519220 NM_005076 ENSG00000184144 CNTN2 AXT|FAME5|TAG-1|TAX|TAX1 contactin 2 protein-coding 156-136 chr7 129997654 129998029 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -44881 NM_182697 7328 Hs.643548 NM_003344 ENSG00000186591 UBE2H E2-20K|GID3|UBC8|UBCH|UBCH2 ubiquitin conjugating enzyme E2 H protein-coding 186-107 chrX 66659386 66659796 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -20293 NM_001199687 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 152.333-391 chr8 129927417 129927865 + 0.666667 NA intron (NM_001353256, intron 2 of 13) HAL1b|LINE|L1 12170 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 122.667-167 chr6 109696395 109696694 + 0.666667 NA intron (NM_014845, intron 1 of 22) L1MA5|LINE|L1 5323 NM_014845 9896 Hs.529959 NM_014845 ENSG00000112367 FIG4 ALS11|BTOP|CMT4J|KIAA0274|SAC3|YVS|dJ249I4.1 FIG4 phosphoinositide 5-phosphatase protein-coding 173.333-161 chr5 91458325 91458612 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -75151 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 131.667 chr1 12240957 12241193 + 0.666667 NA intron (NM_015378, intron 2 of 69) AluJo|SINE|Alu 11045 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 119-145 chr8 123929733 123929940 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 1 of 40) intron (NM_001039112, intron 1 of 40) 77849 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 151.333-204 chr2 50325319 50325742 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) MIRc|SINE|MIR 22224 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 127.333-57 chr15 67532797 67533067 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9771 NM_145160 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 118.667-60 chr12 126486549 126486856 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -37375 NR_147498 283435 Hs.667334 NR_147498 LINC02825 - long intergenic non-protein coding RNA 2825 ncRNA 220-5 chr1 162126955 162127595 + 0.666667 NA intron (NM_014697, intron 1 of 9) intron (NM_014697, intron 1 of 9) -29832 NR_039798 100616386 NR_039798 ENSG00000266144 MIR4654 mir-4654 microRNA 4654 ncRNA 158.333-237 chr4 101961593 101961924 + 0.666667 NA intron (NM_017935, intron 7 of 16) intron (NM_017935, intron 7 of 16) 147916 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 162-22 chr11 8908178 8908516 + 0.666667 NA intron (NM_005418, intron 1 of 22) intron (NM_005418, intron 1 of 22) 2604 NM_005418 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 157.333-297 chr6 11604271 11604633 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66703 NM_001100829 100113407 Hs.146317 NM_001100829 ENSG00000205269 TMEM170B - transmembrane protein 170B protein-coding 220.333-122 chr7 49430171 49430618 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -343244 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 172.667-30 chr11 22476717 22477131 + 0.666667 NA intron (NR_120583, intron 2 of 3) intron (NR_120583, intron 2 of 3) 15095 NR_120583 102723378 Hs.374255 NR_120583 ENSG00000255323 LINC01495 - long intergenic non-protein coding RNA 1495 ncRNA 157.333-89 chr12 78385994 78386336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26419 NR_135021 105369860 Hs.156898 NR_135021 ENSG00000258220 LINC02424 - long intergenic non-protein coding RNA 2424 ncRNA 123.667-184 chr8 102385594 102385806 + 0.666667 NA intron (NM_001282873, intron 1 of 58) FAM|SINE|Alu 26989 NM_001282873 51366 Hs.492445 NM_015902 ENSG00000104517 UBR5 DD5|EDD|EDD1|HYD ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 protein-coding 165-39 chr2 122442320 122442652 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 630995 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 136.667-27 chr10 121693385 121693718 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -95093 NM_022970 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 146.333-142 chr2 37498613 37499043 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 154198 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 210-74 chr2 162827948 162828436 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) intron (NM_033272, intron 2 of 15) 10575 NM_173162 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 116.333-100 chr18 41402877 41403181 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 117648 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 140.333-226 chr8 16956664 16957042 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 45492 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 144-104 chr3 39946359 39946673 + 0.666667 NA intron (NM_001284424, intron 2 of 15) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 136856 NM_001284425 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 137.333-159 chr5 105017361 105017763 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -81912 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 207.333-58 chr12 12745216 12745548 + 0.666667 NA intron (NM_001130415, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu -19267 NR_030344 693198 NR_030344 ENSG00000207983 MIR613 MIRN613|hsa-mir-613 microRNA 613 ncRNA 174.333-83 chr22 44950647 44951156 + 0.666667 NA intron (NM_001284296, intron 2 of 13) Charlie3|DNA|hAT-Charlie 52718 NR_147506 101927551 Hs.683911 NR_147506 ENSG00000230922 LOC101927551 - uncharacterized LOC101927551 ncRNA 179-46 chr18 13120409 13120889 + 0.666667 NA intron (NM_032142, intron 44 of 44) intron (NM_032142, intron 44 of 44) -98111 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 180-10 chr10 25915383 25915779 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18129 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 324.666-14 chr4 43869783 43870666 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -146637 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 158.667-166 chr2 133267836 133268200 + 0.666667 NA intron (NR_110294, intron 2 of 4) intron (NR_110294, intron 2 of 4) 1823 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 174-73 chr4 161993821 161994176 + 0.666667 NA intron (NM_001128428, intron 3 of 14) L1PA14|LINE|L1 -28735 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 179.667-52 chr14 92116284 92116685 + 0.666667 NA intron (NM_004545, intron 2 of 2) AluSz|SINE|Alu 5222 NM_004545 4707 Hs.183435 NM_004545 ENSG00000183648 NDUFB1 CI-MNLL|CI-SGDH|MNLL NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B1 protein-coding 115.667-161 chr4 59648439 59648618 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 634955 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 167.333-243 chr7 43660456 43660870 + 0.666667 NA intron (NM_001371308, intron 1 of 7) intron (NM_001371308, intron 1 of 7) 68860 NM_001371317 128.333-86 chr18 25756617 25756879 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 333865 NM_001007559 6760 Hs.129261 NM_005637 ENSG00000141380 SS18 SSXT|SYT SS18 subunit of BAF chromatin remodeling complex protein-coding 111.667-164 chr22 40216274 40216521 + 0.666667 NA intron (NM_015088, intron 1 of 20) L2b|LINE|L2 38472 NM_015088 23112 Hs.372082 NM_015088 ENSG00000100354 TNRC6B - trinucleotide repeat containing adaptor 6B protein-coding 119.667-71 chr17 52264990 52265210 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -105083 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 114.333-171 chr5 32530747 32531053 + 0.666667 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -54657 NM_006713 10923 Hs.229641 NM_006713 ENSG00000113387 SUB1 P15|PC4|p14 SUB1 regulator of transcription protein-coding 118-126 chr7 136531573 136531844 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -336944 NM_001006630 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 215.333-110 chr2 240382611 240382983 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52866 NM_002081 2817 Hs.328232 NM_002081 ENSG00000063660 GPC1 glypican glypican 1 protein-coding 153.333-447 chr9 133658892 133659212 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_000787, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_000787, exon 12 of 12) -1644 NR_102735 138948 Hs.223858 NR_002783 ENSG00000225756 DBH-AS1 NCRNA00118 DBH antisense RNA 1 ncRNA 224.666-40 chr9 24429116 24429769 + 0.666667 NA Intergenic LTR33C|LTR|ERVL 116234 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 152.667-345 chr7 85173052 85173458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51324 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 118.333-208 chr8 121225327 121225563 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -413399 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 185.667-106 chr5 141634792 141635172 + 0.666667 NA intron (NR_149167, intron 2 of 12) intron (NR_149167, intron 2 of 12) 1867 NR_149167 8841 Hs.519632 NM_003883 ENSG00000171720 HDAC3 HD3|KDAC3|RPD3|RPD3-2 histone deacetylase 3 protein-coding 117.667-101 chr2 154810728 154811025 + 0.666667 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) intron (NM_002239, intron 2 of 2) 112181 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 115.667-29 chr10 89839882 89840101 + 0.666667 NA non-coding (NR_038382, exon 4 of 4) non-coding (NR_038382, exon 4 of 4) 10498 NR_038382 643529 Hs.618956 NR_038382 ENSG00000232229 LINC00865 - long intergenic non-protein coding RNA 865 ncRNA 191-59 chr6 46331831 46332128 + 0.666667 NA intron (NR_125838, intron 2 of 3) L1MC5|LINE|L1 -6087 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 157.667-38 chr10 90852675 90853034 + 0.666667 NA intron (NM_019860, intron 1 of 2) L1ME2|LINE|L1 5185 NM_000872 3363 Hs.73739 NM_000872 ENSG00000148680 HTR7 5-HT7 5-hydroxytryptamine receptor 7 protein-coding 156.333-120 chr14 92420196 92420658 + 0.666667 NA intron (NM_153647, intron 3 of 17) AluSx4|SINE|Alu -93354 NM_024832 79890 Hs.326822 NM_024832 ENSG00000100599 RIN3 - Ras and Rab interactor 3 protein-coding 136.667-128 chr4 69151226 69151629 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -30673 NR_136191 105377267 Hs.654304 NR_136191 ENSG00000250696 LOC105377267 - uncharacterized LOC105377267 ncRNA 151.333-430 chr8 123555362 123555713 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -14331 NM_001242463 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 140.667-30 chr10 35099853 35100218 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -9421 NM_001198777 8453 Hs.82919 NM_003591 ENSG00000108094 CUL2 - cullin 2 protein-coding 150-76 chr2 99173150 99173446 + 0.666667 NA intron (NM_001320419, intron 2 of 5) intron (NM_001320419, intron 2 of 5) 7760 NM_001320419 129531 Hs.14222 NM_138798 ENSG00000158411 MITD1 - microtubule interacting and trafficking domain containing 1 protein-coding 150-42 chr14 36778348 36778713 + 0.666667 NA intron (NM_001171170, intron 3 of 10) intron (NM_001171170, intron 3 of 10) 120962 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 143-34 chr12 61364371 61364663 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 828322 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 149.667-103 chr13 42682500 42682858 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -98871 NM_182508 144809 Hs.16970 NM_182508 ENSG00000179813 FAM216B C13orf30 family with sequence similarity 216 member B protein-coding 197-6 chr1 156021960 156022268 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1163 NM_003145 6746 Hs.74564 NM_003145 ENSG00000163479 SSR2 HSD25|TLAP|TRAP-BETA|TRAPB signal sequence receptor subunit 2 protein-coding 258.333-42 chr3 7307827 7308410 + 0.666667 NA intron (NM_000844, intron 4 of 9) intron (NM_000844, intron 4 of 9) 227166 NR_046606 100873937 Hs.570608 NR_046606 ENSG00000236202 GRM7-AS1 - GRM7 antisense RNA 1 ncRNA 169.667-175 chr5 167882853 167883287 + 0.666667 NA intron (NM_001368145, intron 2 of 26) intron (NM_001368145, intron 2 of 26) 128141 NM_001080428 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 132.667-54 chr14 68078912 68079175 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 255451 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 144-155 chr9 10324929 10325349 + 0.666667 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 287863 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 177.667-30 chr11 87184599 87184973 + 0.666667 NA intron (NR_033149, intron 4 of 13) intron (NR_033149, intron 4 of 13) 146852 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 135.667-201 chr9 132622395 132622648 + 0.666667 NA intron (NM_001322341, intron 18 of 20) intron (NM_001322341, intron 18 of 20) 39915 NM_020064 56751 Hs.283809 NM_020064 ENSG00000125492 BARHL1 - BarH like homeobox 1 protein-coding 123.667-36 chr11 3127254 3127470 + 0.666667 NA intron (NM_020896, intron 2 of 21) intron (NM_020896, intron 2 of 21) 37948 NM_020896 114879 Hs.436166 NM_020896 ENSG00000021762 OSBPL5 OBPH1|ORP5 oxysterol binding protein like 5 protein-coding 129-70 chr2 215450977 215451175 + 0.666667 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -2631 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 146.333 chr1 13785487 13785773 + 0.666667 NA intron (NM_012231, intron 8 of 9) intron (NM_012231, intron 8 of 9) 36215 NM_001007257 7799 Hs.371823 NM_012231 ENSG00000116731 PRDM2 HUMHOXY1|KMT8|KMT8A|MTB-ZF|RIZ|RIZ1|RIZ2 PR/SET domain 2 protein-coding 139.667-197 chr8 131449437 131449718 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -408668 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 157-75 chr2 210724207 210724626 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106845 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 116.333-186 chr6 48746461 48746705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -677894 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 123.333-210 chr8 84160208 84160414 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -22476 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 124-81 chr3 178824356 178824691 + 0.666667 NA intron (NM_181361, intron 2 of 4) AluY|SINE|Alu 35882 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 147.667-387 chr9 6586184 6586482 + 0.666667 NA intron (NM_000170, intron 15 of 24) MER5A|DNA|hAT-Charlie 59359 NM_000170 2731 Hs.584238 NM_000170 ENSG00000178445 GLDC GCE|GCSP|HYGN1 glycine decarboxylase protein-coding 132-63 chr2 121300333 121300582 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -15255 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 169.333-144 chr21 16313154 16313489 + 0.666667 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -28553 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 119.333-212 chr8 75344446 75344670 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63091 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 142.333-139 chr20 18799273 18799608 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -4856 NR_026883 29075 Hs.584899 NM_014162 LINC00652 HSPC072 long intergenic non-protein coding RNA 652 ncRNA 185.333-92 chr2 85809492 85809894 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5437 NR_038888 284950 Hs.570227 NR_038888 LOC284950 - uncharacterized LOC284950 ncRNA 149-28 chr12 22679833 22680191 + 0.666667 NA intron (NM_018638, intron 6 of 7) intron (NM_018638, intron 6 of 7) 54841 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 118.333-122 chr20 51510593 51510845 + 0.666667 NA intron (NM_012340, intron 3 of 10) AluJo|SINE|Alu 32000 NM_001258297 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 115.667-37 chr11 12326021 12326324 + 0.666667 NA intron (NM_032867, intron 5 of 8) intron (NM_032867, intron 5 of 8) 39272 NM_032867 84953 Hs.60371 NM_032867 ENSG00000133816 MICALCL Ebitein1 MICAL C-terminal like protein-coding 178.667-5 chr1 64779582 64780015 + 0.666667 NA intron (NM_001366165, intron 3 of 11) L3|LINE|CR1 34723 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 119.333-98 chr15 77522936 77523123 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2566 NR_135692 101929457 Hs.637111 NR_135692 ENSG00000259362 LOC101929457 - uncharacterized LOC101929457 ncRNA 130-38 chr14 71962379 71962624 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 1 of 16) intron (NM_001370288, intron 1 of 16) 28974 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 165.333-95 chr16 73577812 73578126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 191164 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 145.667-187 chr3 194664606 194664921 + 0.666667 NA intron (NM_018385, intron 5 of 13) AluSp|SINE|Alu 7428 NM_018385 55341 Hs.744061 NM_018385 ENSG00000041802 LSG1 - large 60S subunit nuclear export GTPase 1 protein-coding 137.333-176 chr7 28265681 28265964 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -33499 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 137.667-3 chr1 57191867 57192130 + 0.666667 NA intron (NM_001353980, intron 5 of 5) intron (NM_001353980, intron 5 of 5) -225858 NM_001278543 732 Hs.391835 NM_000066 ENSG00000021852 C8B C82 complement C8 beta chain protein-coding 140.333-101 chr2 55022061 55022434 + 0.666667 NA intron (NM_153828, intron 1 of 6) intron (NM_153828, intron 1 of 6) -11975 NM_007008 57142 Hs.637850 NM_007008 ENSG00000115310 RTN4 ASY|NI220/250|NOGO|NSP|NSP-CL|Nbla00271|Nbla10545|RTN-X|RTN4-A|RTN4-B1|RTN4-B2|RTN4-C reticulon 4 protein-coding 184-26 chr14 52626248 52626658 + 0.666667 NA intron (NR_148417, intron 4 of 7) L1ME2z|LINE|L1 69105 NM_014584 30001 Hs.525339 NM_014584 ENSG00000197930 ERO1A ERO1-L|ERO1-L-alpha|ERO1-alpha|ERO1L|ERO1LA|Ero1alpha endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha protein-coding 170-70 chr20 48379944 48380283 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20202 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 172.667-152 chr7 70801458 70801955 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -330438 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 137-69 chr4 37296485 37296738 + 0.666667 NA intron (NM_001144990, intron 1 of 6) L1PB3|LINE|L1 51868 NM_001144990 57495 Hs.4280 NM_001144990 ENSG00000174145 NWD2 KIAA1239 NACHT and WD repeat domain containing 2 protein-coding 256-19 chr12 12483468 12484062 + 0.666667 NA intron (NM_030640, intron 5 of 6).2 intron (NM_030640, intron 5 of 6).2 79098 NM_030640 80824 Hs.536535 NM_030640 ENSG00000111266 DUSP16 MKP-7|MKP7 dual specificity phosphatase 16 protein-coding 118.333-179 chr6 76828627 76828923 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -235152 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 123.333-142 chr3 24502334 24502661 + 0.666667 NA Intergenic (TTTAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6789 NM_001354708 7068 Hs.187861 NM_000461 ENSG00000151090 THRB C-ERBA-2|C-ERBA-BETA|ERBA2|GRTH|NR1A2|PRTH|THR1|THRB1|THRB2 thyroid hormone receptor beta protein-coding 208-10 chr1 162767358 162767846 + 0.666667 NA intron (NM_006182, intron 11 of 17) intron (NM_006182, intron 11 of 17) -23100 NM_016371 51478 Hs.492925 NM_016371 ENSG00000132196 HSD17B7 PRAP|SDR37C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 7 protein-coding 112-76 chr15 93690927 93691170 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -165512 NR_120321 101927153 Hs.371900 NR_120321 LINC02207 - long intergenic non-protein coding RNA 2207 ncRNA 152-103 chr3 4685681 4685964 + 0.666667 NA intron (NM_001168272, intron 29 of 60) intron (NM_001168272, intron 29 of 60) 65768 NR_004428 100126791 Hs.663059 NR_004428 ENSG00000235947 EGOT EGO|NCRNA00190 eosinophil granule ontogeny transcript ncRNA 119-98 chr3 51857434 51857662 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4067 NM_203424 389123 Hs.412294 NM_203424 ENSG00000184345 IQCF2 - IQ motif containing F2 protein-coding 118-4 chr1 110715638 110715980 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40869 NM_002232 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 118.333-58 chr13 80229363 80229620 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 110168 NM_001318538 10253 Hs.18676 NM_005842 ENSG00000136158 SPRY2 IGAN3|hSPRY2 sprouty RTK signaling antagonist 2 protein-coding 113.333-80 chr14 86434150 86434372 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -471517 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 274.333-4 chr1 231521027 231521830 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7225 NR_028393 100303453 Hs.13318 NR_028393 ENSG00000270106 TSNAX-DISC1 - TSNAX-DISC1 readthrough (NMD candidate) ncRNA 136.333-28 chr10 120466435 120466748 + 0.666667 NA intron (NR_134516, intron 2 of 4) intron (NR_134516, intron 2 of 4) 9637 NM_001318169 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 122.667-189 chr8 50961259 50961483 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 797240 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 146-41 chr16 59490853 59491244 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 264143 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 129.333-148 chr5 24213515 24213819 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 262319 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 139-12 chr10 52216384 52216711 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) intron (NM_001098512, intron 9 of 17) 97581 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 131.667-44 chr12 53507844 53508118 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001320296) promoter-TSS (NM_001320296) -497 NM_003717 8620 Hs.733076 NM_003717 ENSG00000139574 NPFF FMRFAL neuropeptide FF-amide peptide precursor protein-coding 166.667-108 chr2 48882193 48882443 + 0.666667 NA Intergenic LTR40A1|LTR|ERVL -126594 NM_000233 3973 Hs.468490 NM_000233 ENSG00000138039 LHCGR HHG|LCGR|LGR2|LH/CG-R|LH/CGR|LHR|LHRHR|LSH-R|ULG5 luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor protein-coding 122-117 chr8 67035730 67036078 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -7350 NM_001364911 286187 Hs.583933 NM_001013626 ENSG00000178125 PPP1R42 LRRC67|TLLR|TLRR|dtr protein phosphatase 1 regulatory subunit 42 protein-coding 183-40 chr14 69821074 69821567 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 9560 NR_149012 100506358 NR_149012 LOC100506358 - uncharacterized LOC100506358 ncRNA 154.333-353 chr8 124420306 124420655 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30340 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 138.333-10 chr1 173389784 173390188 + 0.666667 NA intron (NR_037845, intron 2 of 2) L1MEd|LINE|L1 71376 NR_125960 101928673 Hs.674889 NR_125960 ENSG00000203739 LOC101928673 - uncharacterized LOC101928673 ncRNA 160-59 chr2 43950753 43951086 + 0.666667 NA intron (NM_133259, intron 14 of 37) AluSx|SINE|Alu 45070 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 210.333-122 chr4 141059865 141060260 + 0.666667 NA intron (NM_020724, intron 1 of 6) intron (NM_020724, intron 1 of 6) 73407 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 155.667-216 chr3 46058705 46059015 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -31377 NM_005283 2829 Hs.128375 NM_005283 ENSG00000173578 XCR1 CCXCR1|GPR5 X-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 268.667-55 chr5 80710494 80710970 + 0.666667 NA intron (NM_002439, intron 8 of 23) intron (NM_002439, intron 8 of 23) -55749 NM_000791 1719 Hs.592364 NM_000791 ENSG00000228716 DHFR DHFRP1|DYR dihydrofolate reductase protein-coding 121.333-159 chr6 71628809 71629025 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 207890 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 160.667-297 chr8 28226288 28226594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90827 NM_006228 5368 Hs.88218 NM_006228 ENSG00000168081 PNOC N/OFQ|NOP|OFQ|PPNOC|ppN/OFQ prepronociceptin protein-coding 265.333-19 chr12 45567257 45567865 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 160360 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 183-6 chr1 118670266 118670682 + 0.666667 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie 317869 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 189-91 chr8 85382875 85383271 + 0.666667 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL -4960 NM_001128830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 127.333-107 chr3 55025984 55026232 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 35 of 37) L1ME3A|LINE|L1 -59006 NM_001304389 57408 Hs.591668 NM_020678 ENSG00000144771 LRTM1 HT017 leucine rich repeats and transmembrane domains 1 protein-coding 231.333-73 chr3 112718358 112718744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18538 NR_162092 113218483 NR_162092 MIR9900 - microRNA 9900 ncRNA 136.333-179 chr6 42204582 42204871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9770 NM_002098 2979 Hs.446529 NM_002098 ENSG00000112599 GUCA1B GCAP 2|GCAP2|GUCA2|RP48 guanylate cyclase activator 1B protein-coding 134.333-180 chr8 120909121 120909448 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -97238 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 283.667-29 chr5 43078802 43079361 + 0.666667 NA intron (NR_102752, intron 2 of 2) LTR23|LTR|ERV1 -11642 NR_104651 648987 Hs.649468 NR_034085 ENSG00000177738 LOC648987 - uncharacterized LOC648987 ncRNA 113.333-57 chr12 1903062 1903312 + 0.666667 NA intron (NM_172364, intron 6 of 37).2 L1MA3|LINE|L1 15465 NM_172364 93589 Hs.13768 NM_172364 ENSG00000151062 CACNA2D4 RCD4 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 4 protein-coding 121.667-40 chr11 58057314 58057630 + 0.666667 NA intron (NM_001005212, intron 2 of 2) intron (NM_001005212, intron 2 of 2) 26519 NM_001005186 219952 Hs.690432 NM_001005186 ENSG00000279051 OR6Q1 OR11-226 olfactory receptor family 6 subfamily Q member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 177.667-68 chr2 20634717 20635210 + 0.666667 NA intron (NM_022460, intron 4 of 6) intron (NM_022460, intron 4 of 6) 16135 NM_022460 64342 Hs.531785 NM_022460 ENSG00000118960 HS1BP3 ETM2|HS1-BP3 HCLS1 binding protein 3 protein-coding 171.667-9 chr1 114782225 114782620 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1737 NR_049742 80143 Hs.709277 NM_025073 ENSG00000052723 SIKE1 SIKE suppressor of IKBKE 1 protein-coding 125.667-101 chr2 110738520 110738801 + 0.666667 NA intron (NM_001371254, intron 1 of 18) L1MEh|LINE|L1 6087 NM_001371254 205-45 chr19 27714933 27715270 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -78330 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 224.333-99 chr5 78489449 78490102 + 0.666667 NA intron (NM_005779, intron 4 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie 129158 NR_110885 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 153-59 chr16 75628909 75629346 + 0.666667 NA intron (NM_001130089, intron 13 of 14) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? -5846 NM_001324452 23536 Hs.729312 NM_012091 ENSG00000065457 ADAT1 HADAT1 adenosine deaminase tRNA specific 1 protein-coding 176.667-61 chr15 83034399 83034840 + 0.666667 NA intron (NM_001011885, intron 4 of 6) AluSz6|SINE|Alu -22980 NM_001160115 123207 Hs.352541 NM_144597 ENSG00000169609 C15orf40 - chromosome 15 open reading frame 40 protein-coding 115.667-65 chr13 68750817 68751004 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 134415 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 158.333-143 chr2 54178159 54178499 + 0.666667 NA intron (NM_138448, intron 3 of 3) intron (NM_138448, intron 3 of 3) 55046 NM_001320588 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 112.333-213 chr5 108353173 108353388 + 0.666667 NA intron (NM_001163315, intron 3 of 8) L1MC1|LINE|L1 28818 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 214.333-149 chr7 125575575 125575904 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -311448 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 156.333-219 chr22 27688076 27688533 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 113452 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 142-165 chr9 75709730 75710000 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -180779 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 120.667-130 chr4 98909548 98909753 + 0.666667 NA intron (NM_001968, intron 1 of 6) intron (NM_001968, intron 1 of 6) 19483 NM_001130678 1977 Hs.13211 NM_001968 ENSG00000151247 EIF4E AUTS19|CBP|EIF4E1|EIF4EL1|EIF4F|eIF-4E eukaryotic translation initiation factor 4E protein-coding 137.333-13 chr1 246097614 246097867 + 0.666667 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) intron (NM_022743, intron 5 of 11) 319672 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 129.667-139 chr5 67532377 67532713 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 114244 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 113.667-128 chr22 27111175 27111397 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50768 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 120-93 chr4 30353708 30354019 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -366506 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 161-110 chrX 82157066 82157462 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 955162 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 125.333-142 chr5 69083853 69084154 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -10011 NM_024055 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 112.333-116 chr2 37398510 37398683 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 53966 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 166.667-61 chr14 26374511 26374936 + 0.666667 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 178707 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 149-130 chr6 133239114 133239402 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2099 NM_004100 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 139.667-21 chr10 66405420 66405816 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) intron (NM_001127384, intron 11 of 17) -520418 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 312-11 chr11 29532991 29533732 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61052 NR_149107 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 130-63 chr2 212443371 212443578 + 0.666667 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) HERVL-int|LTR|ERVL -17114 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 121.667-80 chr18 3340149 3340421 + 0.666667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 10274 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 149-103 chr4 89918151 89918524 + 0.666667 NA intron (NM_001371403, intron 4 of 8) intron (NM_001371403, intron 4 of 8) 23483 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 116.333-86 chr17 35567040 35567350 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_135479) promoter-TSS (NR_135479) -919 NR_135479 105371743 NR_135479 SNHG30 LINC02001 small nucleolar RNA host gene 30 ncRNA 161-80 chr5 60040205 60040680 + 0.666667 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -146716 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 167-50 chr18 76748681 76749059 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 58841 NR_122073 400661 Hs.514963 NR_122073 ENSG00000276397 LINC01879 - long intergenic non-protein coding RNA 1879 ncRNA 114.333-20 chr1 245919671 245919973 + 0.666667 NA intron (NM_022743, intron 7 of 11) intron (NM_022743, intron 7 of 11) 497590 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 117-122 chr6 37503741 37504005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3475 NR_126057 100505530 Hs.582978 NM_001039791 LINC02520 - long intergenic non-protein coding RNA 2520 ncRNA 158.333-29 chr10 23416830 23417167 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -22271 NM_001145373 220213 Hs.499042 NM_001145373 ENSG00000165312 OTUD1 DUBA7|OTDC1 OTU deubiquitinase 1 protein-coding 167 chr1 14566655 14567008 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -31854 NM_001370230 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 118.667-19 chr10 24012933 24013258 + 0.666667 NA intron (NM_001098500, intron 2 of 18) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -195696 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 285.667-5 chr10 63414297 63414862 + 0.666667 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) intron (NM_001322258, intron 1 of 24) -15996 NR_134312 105378330 Hs.602852 NR_134312 LOC105378330 - uncharacterized LOC105378330 ncRNA 165-35 chr19 48783978 48784282 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 26899 NM_001164773 587 Hs.512670 NM_001190 ENSG00000105552 BCAT2 BCAM|BCATM|BCT2|PP18 branched chain amino acid transaminase 2 protein-coding 225-62 chr8 86671869 86672435 + 0.666667 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) AluSx|SINE|Alu 71523 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 322.667-27 chr6 39566220 39566916 + 0.666667 NA intron (NM_001289020, intron 10 of 21) intron (NM_001289020, intron 10 of 21) -135178 NM_001351566 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 226.667-72 chr5 40711611 40712121 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_012382, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_012382, exon 5 of 5) 31951 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 137-101 chr8 56485985 56486306 + 0.666667 NA intron (NR_125813, intron 1 of 3) L1MDa|LINE|L1 -39504 NM_001135690 5179 Hs.339831 NM_006211 ENSG00000181195 PENK PE|PENK-A proenkephalin protein-coding 154-83 chr2 189151263 189151664 + 0.666667 NA intron (NM_000393, intron 1 of 53) intron (NM_000393, intron 1 of 53) -18352 NR_036076 100422908 NR_036076 ENSG00000264725 MIR3129 mir-3129 microRNA 3129 ncRNA 122.667-196 chr8 104666733 104667074 + 0.666667 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 -77879 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 113-97 chr2 15518537 15518739 + 0.666667 NA intron (NR_052013, intron 9 of 50) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 42696 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 150.333-403 chr8 77016830 77017261 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16001 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 187.667-71 chr2 99584722 99585185 + 0.666667 NA intron (NM_001025108, intron 15 of 23) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -94936 NR_135652 51455 Hs.443077 NM_016316 ENSG00000135945 REV1 AIBP80|REV1L REV1 DNA directed polymerase protein-coding 142-162 chr9 2262001 2262350 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 103719 NM_001289400 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 246.667-61 chr3 182065735 182066323 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113665 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 119-100 chr3 72097453 72097798 + 0.666667 NA intron (NR_104116, intron 2 of 6) LTR81A|LTR|Gypsy 2830 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 160.333-222 chr4 110344858 110345270 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -131091 NM_001977 2028 Hs.435765 NM_001977 ENSG00000138792 ENPEP APA|CD249|gp160 glutamyl aminopeptidase protein-coding 162-106 chr6 83984035 83984365 + 0.666667 NA Intergenic MER57-int|LTR|ERV1 -49572 NM_138409 112609 Hs.370055 NM_138409 ENSG00000135324 MRAP2 C6orf117|bA51G5.2 melanocortin 2 receptor accessory protein 2 protein-coding 168.667-59 chr14 46304692 46305052 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L1MC5a|LINE|L1 -166487 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 147.667-185 chr2 121537294 121537631 + 0.666667 NA intron (NM_015282, intron 2 of 38) L1ME3B|LINE|L1 6582 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 113.667-174 chr5 118293922 118294132 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 11453 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 122.333-212 chr8 126675173 126675492 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -116854 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 157-44 chr14 60497574 60498039 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -11340 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 167.333-222 chr6 36295656 36296013 + 0.666667 NA intron (NM_173676, intron 5 of 7) intron (NM_173676, intron 5 of 7) 25374 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 159.333-65 chr12 21684492 21684795 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -26788 NM_002300 3945 Hs.446149 NM_002300 ENSG00000111716 LDHB HEL-S-281|LDH-B|LDH-H|LDHBD|TRG-5 lactate dehydrogenase B protein-coding 152.333-46 chr10 58432752 58433147 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47539 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 146.667-250 chr5 16180820 16181177 + 0.666667 NA intron (NR_149044, intron 1 of 1) intron (NR_149044, intron 1 of 1) 757 NR_149044 401176 Hs.369777 NR_149044 LOC401176 - uncharacterized LOC401176 ncRNA 117-120 chr5 148684779 148685008 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30366 NR_104445 3360 Hs.483773 NM_000870 ENSG00000164270 HTR4 5-HT4|5-HT4R 5-hydroxytryptamine receptor 4 protein-coding 164.667-175 chr4 174925499 174925828 + 0.666667 NA intron (NM_001130703, intron 2 of 3) intron (NM_001130703, intron 2 of 3) 7305 NM_001278127 11086 Hs.126838 NM_014269 ENSG00000168594 ADAM29 CT73|svph1 ADAM metallopeptidase domain 29 protein-coding 138-83 chr4 78998574 78998840 + 0.666667 NA intron (NR_038342, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 26959 NR_038342 100505875 Hs.480055 NR_038342 LINC01088 - long intergenic non-protein coding RNA 1088 ncRNA 166.667-66 chr14 60976268 60976719 + 0.666667 NA intron (NM_020810, intron 3 of 4) intron (NM_020810, intron 3 of 4) 4586 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 145.667-127 chr2 25562379 25562724 + 0.666667 NA intron (NM_001320937, intron 8 of 8) L1MB7|LINE|L1 87671 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 133.333-136 chr4 110608431 110608740 + 0.666667 NA intron (NR_147204, intron 1 of 3) intron (NR_147204, intron 1 of 3) 6873 NR_147204 110231149 Hs.436030 NR_147203 ENSG00000250103 PANCR - PITX2 adjacent non-coding RNA ncRNA 126-66 chr22 25545902 25546225 + 0.666667 NA Intergenic MLT2E|LTR|ERVL -18612 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 143-99 chr5 153669322 153669629 + 0.666667 NA intron (NM_000827, intron 5 of 15) intron (NM_000827, intron 5 of 15) 177303 NM_001258021 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 182-47 chr2 83332350 83332735 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190272 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 125.333-175 chr8 80603683 80603913 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 117572 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 182-104 chr7 85484201 85484531 + 0.666667 NA intron (NR_134240, intron 3 of 3) intron (NR_134240, intron 3 of 3) 63244 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 185-77 chr8 106698249 106698654 + 0.666667 NA intron (NM_181354, intron 5 of 13) L1MEc|LINE|L1 -27656 NM_001198534 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 167.333-170 chr3 29825483 29825817 + 0.666667 NA intron (NM_001003792, intron 6 of 13) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 108506 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-329 chr5 33110340 33110639 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -119246 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 162.333-174 chr3 189964781 189965119 + 0.666667 NA intron (NM_018192, intron 13 of 14) intron (NM_018192, intron 13 of 14) 135028 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 113.333-117 chr2 28310008 28310202 + 0.666667 NA non-coding (NR_137439, exon 12 of 14) non-coding (NR_137439, exon 12 of 14) 354 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 328.667-13 chr5 52490702 52491356 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -296887 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 163.333-89 chr14 62847134 62847600 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 8 of 10) intron (NM_139318, intron 8 of 10) 198091 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 201.333-112 chr14 102849182 102849632 + 0.666667 NA intron (NM_145725, intron 2 of 11) intron (NM_145725, intron 2 of 11) 71928 NM_145725 7187 Hs.510528 NM_003300 ENSG00000131323 TRAF3 CAP-1|CAP1|CD40bp|CRAF1|IIAE5|LAP1|RNF118 TNF receptor associated factor 3 protein-coding 222.667-47 chr20 50338485 50339036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17418 NR_109950 101927586 Hs.637665 NR_109950 ENSG00000233077 LINC01271 - long intergenic non-protein coding RNA 1271 ncRNA 135-9 chr10 63504277 63504631 + 0.666667 NA intron (NM_001322258, intron 1 of 24) L2a|LINE|L2 -16947 NM_001001330 221035 Hs.499833 NM_001001330 ENSG00000165476 REEP3 C10orf74|Yip2b receptor accessory protein 3 protein-coding 291.333-64 chr8 20475516 20476055 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 139141 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 114.667-201 chr5 20536699 20536876 + 0.666667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 38926 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 192-105 chr4 126517124 126517475 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 1010040 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 161-101 chr8 118568187 118568649 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 -52583 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 125.667-86 chr18 74777716 74778020 + 0.666667 NA intron (NM_001146190, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 146905 NM_001146189 55628 Hs.536490 NM_017757 ENSG00000215421 ZNF407 - zinc finger protein 407 protein-coding 120-39 chr14 29608581 29608780 + 0.666667 NA intron (NM_001330069, intron 14 of 18) intron (NM_001330069, intron 14 of 18) 318416 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 147.333-232 chr4 36741032 36741375 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -99303 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 115.667-36 chr11 9508392 9508737 + 0.666667 NA intron (NM_001282656, intron 11 of 15) intron (NM_001282656, intron 11 of 15) 47552 NM_003442 7702 Hs.523471 NM_003442 ENSG00000166478 ZNF143 SBF|STAF|pHZ-1 zinc finger protein 143 protein-coding 120.667-95 chr2 52622154 52622406 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 80335 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 149.333-140 chr17 44815346 44815689 + 0.666667 NA intron (NM_001080383, intron 1 of 2) L1ME4c|LINE|L1 14770 NM_005497 10052 Hs.712052 NM_005497 ENSG00000182963 GJC1 CX45|GJA7 gap junction protein gamma 1 protein-coding 128.667-53 chr14 43395816 43396089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1111331 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 211-83 chr5 133043319 133043795 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8456 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 216.333-56 chr16 80021826 80022332 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 226830 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 195.333-191 chr6 56130443 56130860 + 0.666667 NA intron (NM_030820, intron 12 of 29) HAL1b|LINE|L1 -38989 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 150.333-430 chr9 15570483 15570879 + 0.666667 NA intron (NM_001355547, intron 1 of 24) HAL1|LINE|L1 6703 NM_001355547 203238 Hs.17267 NM_173550 ENSG00000164989 CCDC171 C9orf93|bA536D16.1|bA778P13.1 coiled-coil domain containing 171 protein-coding 115.333-132 chr22 36483896 36484082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2349 NM_012473 25828 Hs.211929 NM_012473 ENSG00000100348 TXN2 COXPD29|MT-TRX|MTRX|TRX2|TXN thioredoxin 2 protein-coding 145.333-146 chr2 142229891 142230230 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a2|LINE|L1 -98359 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 125.333-179 chr8 121397485 121397828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -241690 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 114.667-146 chr2 234488693 234488904 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8251 NM_005737 10123 Hs.111554 NM_005737 ENSG00000188042 ARL4C ARL7|LAK ADP ribosylation factor like GTPase 4C protein-coding 181-3 chr10 5770845 5771324 + 0.666667 NA intron (NM_001494, intron 7 of 10) intron (NM_001494, intron 7 of 10) 42350 NM_001494 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 132.667-97 chr2 217488044 217488303 + 0.666667 NA intron (NR_026597, intron 2 of 12) L1MEf|LINE|L1 205440 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 190-13 chr10 49812825 49813223 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -50645 NM_001347826 55753 Hs.17860 NM_018245 ENSG00000197444 OGDHL - oxoglutarate dehydrogenase like protein-coding 115.333-57 chr13 43566391 43566684 + 0.666667 NA intron (NM_001347965, intron 1 of 15) intron (NM_001347965, intron 1 of 15) 62940 NM_001127615 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 154-97 chr3 152660654 152661080 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -174264 NM_002563 5028 Hs.79881 NM_002563 ENSG00000169860 P2RY1 P2Y1|SARCC purinergic receptor P2Y1 protein-coding 120-41 chr14 77891515 77891794 + 0.666667 NA intron (NR_158988, intron 5 of 10) intron (NR_158988, intron 5 of 10) 91545 NR_158987 57143 Hs.413208 NM_020421 ENSG00000063761 ADCK1 - aarF domain containing kinase 1 protein-coding 206-15 chr1 229898443 229898884 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4755 NR_146475 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 154.333-82 chr14 42905123 42905425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1298418 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 115-102 chr20 63482989 63483225 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10452 NM_172106 3785 Hs.161851 NM_004518 ENSG00000075043 KCNQ2 BFNC|EBN|EBN1|ENB1|HNSPC|KCNA11|KV7.2 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 2 protein-coding 166.667-172 chr4 122813591 122813888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12969 NM_002006 2247 Hs.284244 NM_002006 ENSG00000138685 FGF2 BFGF|FGF-2|FGFB|HBGF-2 fibroblast growth factor 2 protein-coding 196.667-49 chr15 35640512 35640853 + 0.666667 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) L1PA13|LINE|L1 94487 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 152-26 chr10 112010198 112010605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 173364 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 123.667-174 chr7 95044743 95045036 + 0.666667 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 134991 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 210.667-96 chr3 181279639 181280152 + 0.666667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) intron (NR_075091, intron 3 of 7) 48158 NR_104084 101954275 NR_104084 ENSG00000201654 RNU6-7 U6-7 RNA, U6 small nuclear 7 snRNA 160.667-231 chr4 121298909 121299252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71597 NM_001244764 79931 Hs.208206 NM_024873 ENSG00000050730 TNIP3 ABIN-3|LIND TNFAIP3 interacting protein 3 protein-coding 166-79 chr3 129829327 129829665 + 0.666667 NA intron (NM_001349263, intron 4 of 7) intron (NM_001349263, intron 4 of 7) -34884 NM_001349273 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 185.333-8 chr1 79011237 79011761 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4769 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 192.333-134 chr4 171273846 171274253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 87865 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 112.667-226 chr6 15635049 15635292 + 0.666667 NA intron (NR_036448, intron 5 of 9) AluSx|SINE|Alu 27858 NR_036448 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 130-103 chr5 154973655 154973998 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 32753 NM_001014990 29093 Hs.483924 NM_014180 ENSG00000082515 MRPL22 HSPC158|L22mt|MRP-L22|MRP-L25|RPML25 mitochondrial ribosomal protein L22 protein-coding 163.667-114 chr2 112927576 112928059 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 12624 NM_173205 27178 Hs.166371 NM_014439 ENSG00000125571 IL37 FIL1|FIL1(ZETA)|FIL1Z|IL-1F7|IL-1H|IL-1H4|IL-1RP1|IL-37|IL1F7|IL1H4|IL1RP1 interleukin 37 protein-coding 117.333-34 chr11 16910214 16910432 + 0.666667 NA intron (NM_001329630, intron 3 of 26) MIRb|SINE|MIR 15699 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 169-37 chr17 35701300 35701655 + 0.666667 NA intron (NM_001030006, intron 18 of 21) intron (NM_001030006, intron 18 of 21) -30162 NM_033315 91608 Hs.744994 NM_033315 ENSG00000270885 RASL10B RRP17|VTS58635 RAS like family 10 member B protein-coding 115.333-111 chr2 74422480 74422684 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001316766) promoter-TSS (NM_001316766) 852 NM_001320823 84058 Hs.643480 NM_032118 ENSG00000005448 WDR54 - WD repeat domain 54 protein-coding 168.333-88 chr2 12781417 12781727 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44205 NR_036072 100422986 NR_036072 ENSG00000264370 MIR3125 mir-3125 microRNA 3125 ncRNA 146-68 chr2 224212950 224213293 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -173802 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 233.667-78 chr8 133870121 133870643 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16114 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 127-90 chr7 140691153 140691426 + 0.666667 NA intron (NM_052853, intron 7 of 7) intron (NM_052853, intron 7 of 7) -5419 NM_004546 4708 Hs.655788 NM_004546 ENSG00000090266 NDUFB2 AGGG|CI-AGGG NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2 protein-coding 238-48 chr2 106091475 106092184 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 26141 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 141.667-143 chr3 47962926 47963273 + 0.666667 NA intron (NM_002375, intron 3 of 18) intron (NM_002375, intron 3 of 18) 113544 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 120-99 chr4 154383545 154383757 + 0.666667 NA intron (NM_001358235, intron 1 of 19) intron (NM_001358235, intron 1 of 19) 108148 NM_001142552 54798 Hs.655664 NM_017639 ENSG00000197410 DCHS2 CDH27|CDHJ|CDHR7|PCDH23|PCDHJ dachsous cadherin-related 2 protein-coding 171.333-91 chr2 157698285 157698637 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -69597 NM_001111032 130399 Hs.562901 NM_145259 ENSG00000123612 ACVR1C ACVRLK7|ALK7 activin A receptor type 1C protein-coding 126-33 chr14 76149273 76149623 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -2437 NM_001322031 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 138-23 chr11 116418854 116419103 + 0.666667 NA Intergenic Charlie19a|DNA|hAT-Charlie -220444 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 265.667-37 chr2 103274926 103275571 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -290819 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 189.333-170 chr6 62027690 62028205 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) MER21C|LTR|ERVL 258278 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 139.667-219 chrX 103298818 103299167 + 0.666667 NA Intergenic MER66-int|LTR|ERV1 11963 NM_001168399 84707 Hs.398989 NM_032621 ENSG00000133134 BEX2 BEX1|DJ79P11.1 brain expressed X-linked 2 protein-coding 150-62 chr17 75024749 75025021 + 0.666667 NA Intergenic HERVK14-int|LTR|ERVK -7682 NR_110835 23510 Hs.514468 NM_015353 ENSG00000180901 KCTD2 - potassium channel tetramerization domain containing 2 protein-coding 192.667-142 chr5 155635946 155636384 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 622410 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 149.667-54 chr10 60787515 60787953 + 0.666667 NA TTS (NM_001170406) TTS (NM_001170406) 9256 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 113-37 chr12 15303084 15303298 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -19317 NM_002848 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 145-87 chr5 20113764 20114191 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) LTR103b_Mam|LTR|ERV1? -125777 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 119.667-83 chr2 80069781 80070128 + 0.666667 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) ERVL-int|LTR|ERVL -203371 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 153.667-95 chr12 81683805 81684253 + 0.666667 NA intron (NM_003625, intron 3 of 32) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 74478 NM_001220476 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 125-62 chr2 207523483 207523793 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -6324 NR_135473 1385 Hs.516646 NM_004379 ENSG00000118260 CREB1 CREB|CREB-1 cAMP responsive element binding protein 1 protein-coding 241.667-51 chr3 11345396 11345877 + 0.666667 NA intron (NM_001349237, intron 11 of 17) L1M5|LINE|L1 73239 NM_001349237 10533 Hs.38032 NM_006395 ENSG00000197548 ATG7 APG7-LIKE|APG7L|GSA7 autophagy related 7 protein-coding 130-17 chr10 94645461 94645668 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38165 NM_001128925 1562 Hs.511872 NM_000772 ENSG00000108242 CYP2C18 CPCI|CYP2C|CYP2C17|P450-6B/29C|P450IIC17 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 18 protein-coding 190.667-41 chr14 50369143 50369497 + 0.666667 NA intron (NM_001282236, intron 2 of 8) Charlie8|DNA|hAT-Charlie 27561 NM_001367065 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 156-16 chr1 208479214 208479671 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -235058 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 120.333-126 chr3 37101760 37101951 + 0.666667 NA intron (NM_017724, intron 4 of 13) intron (NM_017724, intron 4 of 13) 72727 NM_006309 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 169.333-192 chr4 164126753 164127121 + 0.666667 NA intron (NM_001166373, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 70774 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 114-176 chr9 111331497 111331789 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -1419 NM_205859 26248 Hs.381312 NM_205859 ENSG00000171133 OR2K2 HSHTPCRH06|HTPCRH06|OR2AN1P|OR2AR1P olfactory receptor family 2 subfamily K member 2 protein-coding 222-2 chr1 45853284 45853799 + 0.666667 NA intron (NM_001324320, intron 3 of 29) AluSz|SINE|Alu -10807 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 149-27 chr11 115385669 115385961 + 0.666667 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -10941 NR_135102 105369507 Hs.664155 NR_135102 ENSG00000256315 LOC105369507 - uncharacterized LOC105369507 ncRNA 123.667-92 chr2 89833902 89834176 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -196132 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 121.333-120 chr3 148962550 148962787 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28740 NM_004130 2992 Hs.477892 NM_004130 ENSG00000163754 GYG1 GSD15|GYG glycogenin 1 protein-coding 198.667-29 chr10 109099465 109099904 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 823562 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 130.333-113 chr2 233009161 233009539 + 0.666667 NA intron (NM_019850, intron 1 of 14) L1MA4|LINE|L1 -3264 NR_136325 101928881 Hs.570311 NR_136325 ENSG00000222001 LOC101928881 - uncharacterized LOC101928881 ncRNA 172.333-50 chr14 59262144 59262575 + 0.666667 NA intron (NM_001270520, intron 1 of 24) intron (NM_001270520, intron 1 of 24) -1082 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 153-102 chr4 63032572 63032954 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -870998 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 162.333-28 chr10 55590224 55590542 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) L1PA3|LINE|L1 -8659 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 173.667-126 chr3 192533392 192533731 + 0.666667 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 18539 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 181-36 chr2 42022559 42022887 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25298 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 168-54 chr2 107606130 107606611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76951 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 122-56 chr2 172400318 172400632 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26861 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 126.667-118 chr4 32066650 32066929 + 0.666667 NA intron (NR_125936, intron 1 of 2) L1MEg|LINE|L1 -44367 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 169.667-194 chr7 34308575 34308941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -349460 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 242.667-53 chr2 85863722 85864263 + 0.666667 NA intron (NM_001354233, intron 1 of 7) AluSg|SINE|Alu 3678 NM_001042437 8869 Hs.415117 NM_003896 ENSG00000115525 ST3GAL5 SATI|SIAT9|SIATGM3S|SPDRS|ST3Gal V|ST3GalV ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5 protein-coding 149.667-55 chr10 62462989 62463287 + 0.666667 NA intron (NM_199451, intron 4 of 7) intron (NM_199451, intron 4 of 7) -57310 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 173.333-187 chr7 50625486 50625985 + 0.666667 NA intron (NM_001350816, intron 7 of 17) intron (NM_001350816, intron 7 of 17) -60330 NM_001082971 1644 Hs.359698 NM_000790 ENSG00000132437 DDC AADC dopa decarboxylase protein-coding 171-70 chr6 49880335 49880759 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -3451 NM_001205220 167 Hs.109620 NM_001131 ENSG00000124812 CRISP1 AEGL1|ARP|CRISP-1|HEL-S-57|HSCRISP1D|HSCRISP1G|HUMARP cysteine rich secretory protein 1 protein-coding 178.333-130 chr4 169292134 169292667 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -21444 NM_020870 57630 Hs.301804 NM_020870 ENSG00000154447 SH3RF1 POSH|RNF142|SH3MD2 SH3 domain containing ring finger 1 protein-coding 147.667-179 chr2 99034915 99035185 + 0.666667 NA intron (NM_001349013, intron 13 of 16) intron (NM_001349013, intron 13 of 16) -98825 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 114.333-205 chr7 32253009 32253227 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L2b|LINE|L2 46210 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 157-121 chr7 13213864 13214185 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 526391 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 153.667-168 chr19 32941536 32941874 + 0.666667 NA intron (NM_032816, intron 5 of 18) intron (NM_032816, intron 5 of 18) 30253 NM_032816 84902 Hs.599703 NM_032816 ENSG00000121289 CEP89 CCDC123|CEP123 centrosomal protein 89 protein-coding 183-47 chr16 77189783 77190220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1189 NM_014940 22879 Hs.513743 NM_014940 ENSG00000103111 MON1B HSRG1|SAND2|SRG1 MON1 homolog B, secretory trafficking associated protein-coding 138-53 chr19 48918174 48918438 + 0.666667 NA intron (NM_006184, intron 7 of 12) intron (NM_006184, intron 7 of 12) 585 NR_046633 100874085 Hs.569933 NR_046633 ENSG00000235191 NUCB1-AS1 - NUCB1 antisense RNA 1 ncRNA 139.667-72 chr18 3901337 3901601 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 16116 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 144.333-98 chr17 68568514 68568794 + 0.666667 NA intron (NM_017565, intron 1 of 10) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -10227 NR_027751 54757 Hs.268874 NM_017565 ENSG00000108950 FAM20A AI1G|AIGFS|FP2747 FAM20A golgi associated secretory pathway pseudokinase protein-coding 148-48 chr15 91186544 91186807 + 0.666667 NA intron (NM_001323040, intron 2 of 12) L1PB4|LINE|L1 84879 NM_001323040 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 184.333-155 chr8 119655902 119656199 + 0.666667 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) intron (NM_001330600, intron 1 of 25) -17211 NM_001040092 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 152-96 chr21 29683816 29684198 + 0.666667 NA intron (NM_001320621, intron 1 of 13) L2a|LINE|L2 -64168 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 115.667-22 chr10 35125887 35126196 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001352467) promoter-TSS (NM_001352467) -800 NM_001881 1390 Hs.200250 NM_001881 ENSG00000095794 CREM CREM-2|ICER|hCREM-2 cAMP responsive element modulator protein-coding 121-145 chr9 83482418 83482777 + 0.666667 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) intron (NM_174938, intron 1 of 13) -14855 NM_001244960 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 141.667-230 chr8 117395292 117395553 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -125291 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 260-33 chr2 13249193 13249822 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -242494 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 157-8 chr1 97840805 97841131 + 0.666667 NA intron (NM_000110, intron 2 of 22) intron (NM_000110, intron 2 of 22) 44047 NR_046591 100873933 Hs.568669 NR_046591 ENSG00000235777 DPYD-AS2 - DPYD antisense RNA 2 ncRNA 207.667-127 chrX 11079404 11079896 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -31682 NM_005333 3052 Hs.211571 NM_005333 ENSG00000004961 HCCS CCHL|LSDMCA1|MCOPS7|MLS holocytochrome c synthase protein-coding 204-207 chr9 71114338 71114695 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 7105 NM_001366147 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 206.667-137 chr8 73586472 73586865 + 0.666667 NA intron (NM_001164384, intron 9 of 10) HAL1|LINE|L1 160172 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 189.667-46 chr14 80390714 80391120 + 0.666667 NA intron (NR_038355, intron 5 of 8) intron (NR_038355, intron 5 of 8) -159860 NM_000793 1734 Hs.202354 NM_000793 ENSG00000211448 DIO2 5DII|D2|DIOII|SelY|TXDI2 iodothyronine deiodinase 2 protein-coding 127.667-164 chr7 74489746 74489979 + 0.666667 NA intron (NM_016328, intron 1 of 26) intron (NM_016328, intron 1 of 26) 35956 NM_001199207 9569 Hs.647056 NM_005685 ENSG00000006704 GTF2IRD1 BEN|CREAM1|GTF3|MUSTRD1|RBAP2|WBS|WBSCR11|WBSCR12|hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1 protein-coding 132-57 chr19 16916223 16916617 + 0.666667 NA intron (NM_015692, intron 27 of 41) AluSx1|SINE|Alu -19473 NR_147452 27151 Hs.631644 NM_015692 ENSG00000160111 CPAMD8 ASGD8|K-CAP|VIP C3 and PZP like alpha-2-macroglobulin domain containing 8 protein-coding 208-96 chr21 33015492 33016104 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -10137 NM_005806 10215 Hs.176977 NM_005806 ENSG00000205927 OLIG2 BHLHB1|OLIGO2|PRKCBP2|RACK17|bHLHe19 oligodendrocyte transcription factor 2 protein-coding 112.333-60 chr12 91899777 91900088 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 241781 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 227.333-72 chr20 9933071 9933520 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53038 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 117.667-178 chr7 47151881 47152099 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 312813 NR_145813 109623468 NR_145813 SNORD151 - small nucleolar RNA, C/D box 151 snoRNA 149.667-398 chr8 86775021 86775311 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31491 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 157.333-136 chr16 63357575 63357957 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1321328 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 174.667-12 chr1 169091793 169092164 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -4973 NR_104091 101978719 Hs.517849 NR_104091 ENSG00000203601 LINC00970 - long intergenic non-protein coding RNA 970 ncRNA 112-136 chr3 38039960 38040265 + 0.666667 NA intron (NM_007335, intron 1 of 36) intron (NM_007335, intron 1 of 36) 904 NM_007335 9940 Hs.714499 NM_007335 ENSG00000008226 DLEC1 CFAP81|DLC-1|DLC1|F56 DLEC1 cilia and flagella associated protein protein-coding 143.333 chr1 16003869 16004147 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_178840) promoter-TSS (NM_178840) -228 NM_178840 149563 Hs.29190 NM_178840 ENSG00000183888 SRARP C1orf64|ERRF steroid receptor associated and regulated protein protein-coding 129.333-168 chr6 39682981 39683297 + 0.666667 NA intron (NM_001289020, intron 3 of 21) L2a|LINE|L2 42269 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 214.667-53 chr17 59737214 59737628 + 0.666667 NA intron (NM_001329400, intron 3 of 9) intron (NM_001329400, intron 3 of 9) 29767 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 143-81 chr3 53262613 53263011 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -6698 NM_001135055 7086 Hs.89643 NM_001064 ENSG00000163931 TKT HEL-S-48|HEL107|SDDHD|TK|TKT1 transketolase protein-coding 119.333-62 chr11 123339823 123340133 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -18444 NM_001367419 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 180.333-71 chr3 15523147 15523522 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -1628 NM_005677 8292 Hs.146735 NM_005677 ENSG00000206561 COLQ CMS5|EAD collagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesterase protein-coding 116.667-55 chr14 57227298 57227489 + 0.666667 NA intron (NM_006544, intron 12 of 17) L1ME3C|LINE|L1 41512 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 167-102 chr8 91885201 91885562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 132299 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 175-37 chr19 32338615 32339065 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -6770 NM_001136156 22847 Hs.205392 NM_014910 ENSG00000168813 ZNF507 - zinc finger protein 507 protein-coding 127.667-124 chr4 42434482 42434723 + 0.666667 NA intron (NM_001105529, intron 32 of 35) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 37114 NM_001080505 152573 Hs.370904 NM_001080505 ENSG00000178343 SHISA3 hShisa3 shisa family member 3 protein-coding 123.333-169 chr5 36418916 36419169 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117140 NM_001323279 202151 Hs.199777 NM_145000 ENSG00000164188 RANBP3L - RAN binding protein 3 like protein-coding 186-23 chr12 89205226 89205564 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 147106 NM_001946 1848 Hs.298654 NM_001946 ENSG00000139318 DUSP6 HH19|MKP3|PYST1 dual specificity phosphatase 6 protein-coding 192.333-3 chr1 61276659 61277198 + 0.666667 NA intron (NM_001134673, intron 2 of 10) intron (NM_001134673, intron 2 of 10) -23410 NR_104180 645030 Hs.632410 NR_104180 ENSG00000237853 NFIA-AS1 - NFIA antisense RNA 1 ncRNA 144-69 chr19 33709277 33709572 + 0.666667 NA intron (NM_001127895, intron 3 of 4) L1MB7|LINE|L1 24896 NM_022467 64377 Hs.165724 NM_022467 ENSG00000124302 CHST8 GALNAC4ST1|GalNAc4ST|PSS3 carbohydrate sulfotransferase 8 protein-coding 173.667-186 chr8 141326554 141326910 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13817 NR_024441 731779 Hs.586414 NR_024441 ENSG00000253595 LINC01300 - long intergenic non-protein coding RNA 1300 ncRNA 164.667-139 chr22 49333388 49333829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 209858 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 115-20 chr1 241159573 241159864 + 0.666667 NA intron (NM_001282778, intron 2 of 16) intron (NM_001282778, intron 2 of 16) 27446 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 183.667-28 chr10 107665670 107666069 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 403424 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 131.333-97 chr20 11695315 11695646 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 175235 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 167-38 chr14 47392183 47392547 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -49119 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 137-15 chr11 22683961 22684229 + 0.666667 NA intron (NM_005256, intron 1 of 6) intron (NM_005256, intron 1 of 6) 9321 NM_005256 2620 Hs.711297 NM_005256 ENSG00000148935 GAS2 GAS-2 growth arrest specific 2 protein-coding 122.667-193 chr8 102675768 102676062 + 0.666667 NA intron (NR_160672, intron 3 of 4) intron (NR_160672, intron 3 of 4) 19667 NR_160672 101927245 NR_160672 LOC101927245 - uncharacterized LOC101927245 ncRNA 151.333-247 chr20 38128860 38129160 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001323316, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001323316, exon 14 of 14) 36260 NM_001323318 7052 Hs.517033 NM_004613 ENSG00000198959 TGM2 TG(C)|TGC transglutaminase 2 protein-coding 189.667-49 chr15 62593609 62593919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51417 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 130.667-27 chr10 61949706 61949976 + 0.666667 NA intron (NM_032199, intron 3 of 9) intron (NM_032199, intron 3 of 9) 48142 NM_032199 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 157.667-344 chr8 134651609 134651989 + 0.666667 NA intron (NM_020863, intron 2 of 15) L1MEg|LINE|L1 44756 NM_001174158 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 186.667-21 chr10 113550721 113551127 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001177660) promoter-TSS (NM_001177660) 93 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 140-130 chr9 102500721 102501027 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18763 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 146.667-53 chr11 16535417 16535781 + 0.666667 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) AluJb|SINE|Alu -59211 NM_033326 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 124.667-191 chr7 82308771 82309017 + 0.666667 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) LTR49-int|LTR|ERV1 134883 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 213.333-178 chr6 34322416 34323028 + 0.666667 NA intron (NM_001202470, intron 6 of 8) L1MC5a|LINE|L1 69947 NM_006703 11165 Hs.188882 NM_006703 ENSG00000272325 NUDT3 DIPP|DIPP-1|DIPP1 nudix hydrolase 3 protein-coding 114.333-146 chr3 97723956 97724223 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 15 of 17) intron (NM_001080448, intron 15 of 17) -40432 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 166-59 chr2 33337970 33338364 + 0.666667 NA intron (NM_001166264, intron 20 of 28) intron (NM_001166264, intron 20 of 28) -80349 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 140.333-29 chr10 72371837 72372214 + 0.666667 NA intron (NM_001195519, intron 6 of 6) AluJb|SINE|Alu -17106 NM_001002762 54788 Hs.500013 NM_017626 ENSG00000148719 DNAJB12 DJ10 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B12 protein-coding 117.667-49 chr14 56609317 56609610 + 0.666667 NA intron (NM_017799, intron 6 of 15) intron (NM_017799, intron 6 of 15) 29665 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 166-46 chr15 93160699 93161030 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45202 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 207.333-104 chr15 92521696 92522012 + 0.666667 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 50177 NR_161370 145858 Hs.367879 NM_153040 C15orf32 - chromosome 15 open reading frame 32 ncRNA 259-21 chr17 47148213 47148692 + 0.666667 NA intron (NM_001256, intron 9 of 18) L1MEc|LINE|L1 40843 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 143.667-177 chr4 44286631 44286906 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) L2|LINE|L2 162041 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 148-130 chr5 55004615 55004903 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19166 NM_001135604 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 134.667-31 chr10 132621824 132622065 + 0.666667 NA intron (NM_005539, intron 2 of 15) L1MC|LINE|L1 -59331 NM_001321042 3632 Hs.523360 NM_005539 ENSG00000068383 INPP5A 5PTASE inositol polyphosphate-5-phosphatase A protein-coding 125.667-146 chr5 38130909 38131134 + 0.666667 NA intron (NR_147009, intron 2 of 2) intron (NR_147009, intron 2 of 2) -17459 NR_134272 101929745 Hs.374715 NR_134272 ENSG00000248461 LINC02119 - long intergenic non-protein coding RNA 2119 ncRNA 144-138 chr5 169590996 169591280 + 0.666667 NA exon (NM_001329642, exon 4 of 12) exon (NM_001329642, exon 4 of 12) 7058 NM_001329641 54908 Hs.368710 NM_017785 ENSG00000040275 SPDL1 CCDC99 spindle apparatus coiled-coil protein 1 protein-coding 116.333-81 chr16 71184656 71184942 + 0.666667 NA intron (NM_017558, intron 3 of 19) intron (NM_017558, intron 3 of 19) 45923 NM_001198542 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 163-83 chr7 141024961 141025319 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -10188 NM_053035 51650 Hs.416207 NM_016071 ENSG00000090263 MRPS33 CGI-139|MRP-S33|PTD003|S33mt mitochondrial ribosomal protein S33 protein-coding 149.333-70 chr11 8057877 8058204 + 0.666667 NA intron (NM_003320, intron 2 of 12) AluJb|SINE|Alu -1998 NR_120538 101927917 Hs.680586 NR_120537 ENSG00000248332 TUB-AS1 - TUB antisense RNA 1 ncRNA 196-165 chr7 8907302 8907737 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 473910 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 122-94 chr5 53584374 53584572 + 0.666667 NA intron (NR_134475, intron 2 of 5) AluSq2|SINE|Alu 23834 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 123.667-69 chr16 80524803 80525021 + 0.666667 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) intron (NR_120307, intron 2 of 5) -15822 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 172.333-116 chr3 121912941 121913337 + 0.666667 NA intron (NM_021082, intron 5 of 21) intron (NM_021082, intron 5 of 21) 18738 NM_021082 6565 Hs.518089 NM_021082 ENSG00000163406 SLC15A2 PEPT2 solute carrier family 15 member 2 protein-coding 147.333-157 chr19 46284638 46285042 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12202 NM_152795 64344 Hs.420830 NM_022462 ENSG00000124440 HIF3A HIF-3A|HIF3-alpha-1|IPAS|MOP7|PASD7|bHLHe17 hypoxia inducible factor 3 subunit alpha protein-coding 115-29 chr10 72835772 72836001 + 0.666667 NA intron (NM_138357, intron 2 of 7) intron (NM_138357, intron 2 of 7) -57853 NM_152635 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 131-18 chr11 77742552 77742829 + 0.666667 NA intron (NM_016578, intron 3 of 15) L1MA8|LINE|L1 78144 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 134.333-99 chr20 3067930 3068310 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR -3500 NM_000915 5020 Hs.113216 NM_000915 ENSG00000101405 OXT OT|OT-NPI|OXT-NPI oxytocin/neurophysin I prepropeptide protein-coding 252-93 chr6 68603253 68603733 + 0.666667 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR 30831 NR_125872 101928307 Hs.535825 NR_125872 ENSG00000230910 LOC101928307 - uncharacterized LOC101928307 ncRNA 115.667-150 chr3 150590461 150590727 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -12727 NM_016275 51714 Hs.369052 NM_016275 ENSG00000198843 SELENOT SELT selenoprotein T protein-coding 174.667-79 chr2 42618001 42618364 + 0.666667 NA intron (NM_001330443, intron 4 of 16) AluJr|SINE|Alu 49550 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 112-19 chr10 60041848 60042164 + 0.666667 NA intron (NM_001204403, intron 43 of 43) intron (NM_001204403, intron 43 of 43) -81093 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 119-30 chr11 102736588 102736931 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -11805 NM_002424 4317 Hs.161839 NM_002424 ENSG00000118113 MMP8 CLG1|HNC|MMP-8|PMNL-CL matrix metallopeptidase 8 protein-coding 165.333-176 chr3 117460804 117461213 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 229917 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 319-16 chr20 13356272 13357034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -116966 NR_040043 100505536 Hs.665253 NR_040043 ISM1-AS1 - ISM1 antisense RNA 1 ncRNA 159.333-341 chr8 134185754 134186202 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 299482 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 224.667-28 chr15 83333515 83334079 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49133 NM_001717 646 Hs.459153 NM_001717 ENSG00000169594 BNC1 BNC|BSN1|HsT19447 basonuclin 1 protein-coding 150.667-177 chr2 72260729 72261027 + 0.666667 NA intron (NR_135773, intron 19 of 21) intron (NR_135773, intron 19 of 21) -113016 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 220-66 chr2 143922907 143923425 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -13901 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 169-58 chr21 31567998 31568368 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 8950 NM_001321023 150051 Hs.708976 NM_001321023 LOC150051 - uncharacterized LOC150051 protein-coding 123.667-89 chr2 59766508 59766836 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 548964 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 117-55 chr16 71373528 71373817 + 0.666667 NA intron (NM_001740, intron 2 of 10) MIRc|SINE|MIR 14949 NM_001740 794 Hs.106857 NM_001740 ENSG00000172137 CALB2 CAB29|CAL2|CR calbindin 2 protein-coding 124.333-101 chr2 225971464 225971804 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -171160 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 165.333-2 chr1 24008416 24008775 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28132 NR_034035 10772 Hs.3530 NM_006625 ENSG00000188529 SRSF10 FUSIP1|FUSIP2|NSSR|PPP1R149|SFRS13|SFRS13A|SRp38|SRrp40|TASR|TASR1|TASR2 serine and arginine rich splicing factor 10 protein-coding 115.667-115 chr2 83649110 83649440 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 126461 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 246.667-75 chr5 158653757 158654280 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -244245 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 164.333-168 chr4 25177065 25177390 + 0.666667 NA intron (NR_037934, intron 1 of 1) intron (NR_037934, intron 1 of 1) 16555 NR_037934 285540 Hs.732278 NR_037934 SEPSECS-AS1 - SEPSECS antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 240.667-54 chr3 19342242 19342833 + 0.666667 NA intron (NM_144633, intron 3 of 15) intron (NM_144633, intron 3 of 15) -27606 NR_039954 100616291 NR_039954 ENSG00000271898 MIR4791 mir-4791 microRNA 4791 ncRNA 215.333-53 chr13 99994391 99994942 + 0.666667 NA TTS (NR_047483) TTS (NR_047483) 3243 NR_047483 100861542 Hs.508571 NR_047483 ENSG00000260738 LINC00554 lncZic2 long intergenic non-protein coding RNA 554 ncRNA 119.667-35 chr12 23867685 23867987 + 0.666667 NA intron (NM_001330785, intron 2 of 14) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 81834 NM_001330785 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 284-51 chr6 34540792 34541344 + 0.666667 NA exon (NM_001252294, exon 3 of 5) exon (NM_001252294, exon 3 of 5) 15261 NM_012391 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 182.667-93 chr3 48289672 48290199 + 0.666667 NA TTS (NR_134638) TTS (NR_134638) 1743 NR_134638 101060195 Hs.670746 NR_134638 FCF1P2 - FCF1 pseudogene 2 pseudo 113-74 chr15 101258030 101258222 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -6078 NM_014918 22856 Hs.110488 NM_014918 ENSG00000131873 CHSY1 CHSY|CSS1|ChSy-1|TPBS chondroitin sulfate synthase 1 protein-coding 125.333-134 chr5 28534994 28535330 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -247497 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 157-112 chr6 50867450 50867861 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48784 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 121-37 chr13 47414849 47415078 + 0.666667 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy 517659 NR_047492 100861549 Hs.660978 NR_047492 ENSG00000260388 LINC00562 - long intergenic non-protein coding RNA 562 ncRNA 134.333-153 chr6 122494222 122494582 + 0.666667 NA intron (NM_001270393, intron 3 of 7) intron (NM_001270393, intron 3 of 7) 22485 NM_001270394 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 203.667-139 chr9 137286068 137286604 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8610 NM_017723 54863 Hs.495541 NM_017723 ENSG00000198113 TOR4A C9orf167 torsin family 4 member A protein-coding 113.333-189 chr4 35112154 35112475 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -842567 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 180.667-108 chr5 4611294 4611720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -161974 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 173.667-40 chr12 105231481 105231879 + 0.666667 NA intron (NM_001251904, intron 1 of 20) intron (NM_001251904, intron 1 of 20) 1725 NM_001251905 55198 Hs.506603 NM_018171 ENSG00000136044 APPL2 DIP13B adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 2 protein-coding 194-4 chr1 204553305 204553834 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001278519, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001278519, exon 5 of 5) 37163 NM_002393 4194 Hs.497492 NM_002393 ENSG00000198625 MDM4 HDMX|MDMX|MRP1 MDM4 regulator of p53 protein-coding 155.667-324 chr7 27053140 27053531 + 0.666667 NA Intergenic MER61A|LTR|ERV1 42665 NM_153620 3198 Hs.67397 NM_005522 ENSG00000105991 HOXA1 BSAS|HOX1|HOX1F homeobox A1 protein-coding 142.667-110 chr2 173380686 173380957 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25949 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 153.667-98 chr12 93156991 93157349 + 0.666667 NA intron (NR_040096, intron 3 of 4) intron (NR_040096, intron 3 of 4) -17196 NR_120492 102724933 Hs.663947 NR_120492 ENSG00000258171 LINC02412 - long intergenic non-protein coding RNA 2412 ncRNA 222-51 chr2 235631299 235631823 + 0.666667 NA intron (NM_001037131, intron 1 of 17) intron (NM_001037131, intron 1 of 17) -113640 NR_146582 27321 NR_146582 TNRC17 CAGL234 trinucleotide repeat containing 17 ncRNA 222-85 chr7 4956213 4956840 + 0.666667 NA intron (NR_072989, intron 1 of 8) intron (NR_072989, intron 1 of 8) 2661 NR_072989 221938 Hs.558694 NM_198403 ENSG00000136297 MMD2 PAQR10 monocyte to macrophage differentiation associated 2 protein-coding 175.667-75 chr2 133274985 133275462 + 0.666667 NA intron (NR_110294, intron 4 of 4) L1ME3Cz|LINE|L1 9028 NR_110294 101928161 Hs.661917 NR_110294 ENSG00000226953 NCKAP5-AS2 - NCKAP5 antisense RNA 2 ncRNA 263-69 chr9 34426448 34427096 + 0.666667 NA intron (NM_001184942, intron 1 of 5) intron (NM_001184942, intron 1 of 5) -28962 NM_032596 84688 Hs.50334 NM_032596 ENSG00000164972 C9orf24 CBE1|NYD-SP22|SMRP1|bA573M23.4 chromosome 9 open reading frame 24 protein-coding 273.333-2 chr1 91233518 91234179 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 170989 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 192.333-155 chr7 26938357 26938931 + 0.666667 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie -74054 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 153-55 chr15 101685777 101686064 + 0.666667 NA exon (NM_152334, exon 11 of 19) exon (NM_152334, exon 11 of 19) -33529 NM_025141 80213 Hs.288912 NM_025141 ENSG00000184277 TM2D3 BLP2 TM2 domain containing 3 protein-coding 139.333-103 chr18 73230146 73230394 + 0.666667 NA intron (NR_034133, intron 2 of 5) intron (NR_034133, intron 2 of 5) 34228 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 141.667-255 chrX 29916333 29916707 + 0.666667 NA intron (NM_014271, intron 6 of 10) intron (NM_014271, intron 6 of 10) -299043 NM_002364 4113 Hs.113824 NM_002364 ENSG00000099399 MAGEB2 CT3.2|DAM6|MAGE-XP-2 MAGE family member B2 protein-coding 147.667-157 chr18 80234420 80234663 + 0.666667 NA intron (NM_032510, intron 1 of 2) intron (NM_032510, intron 1 of 2) 12973 NM_032510 84552 Hs.654920 NM_032510 ENSG00000178184 PARD6G PAR-6G|PAR6gamma par-6 family cell polarity regulator gamma protein-coding 136-13 chr11 39640810 39641204 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 652123 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 176-44 chr2 16733642 16734013 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -67993 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 183.333-128 chr5 83970683 83970988 + 0.666667 NA intron (NM_001278642, intron 8 of 9) L1M6|LINE|L1 -249980 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 166.333-136 chr21 15680778 15681233 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48929 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 219.666 chr1 35636528 35637157 + 0.666667 NA intron (NM_001199779, intron 1 of 5) MER2|DNA|TcMar-Tigger 4684 NM_002794 5690 Hs.471441 NM_002794 ENSG00000126067 PSMB2 HC7-I proteasome subunit beta 2 protein-coding 209-32 chr12 97826718 97827154 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -70419 NR_077240 643711 Hs.585557 NR_077240 ENSG00000257501 LOC643711 - platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 pseudogene pseudo 122.333-121 chr20 9203399 9203747 + 0.666667 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) MIRb|SINE|MIR -13817 NM_182797 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 113.333-89 chr15 91769702 91769924 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -83895 NM_013272 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 311-11 chr17 70956809 70957428 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 245061 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 146-136 chr8 83955080 83955419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -227538 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 113 chr1 4010190 4010474 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61352 NR_147024 105376672 Hs.435087 NR_147024 ENSG00000226374 LINC01345 - long intergenic non-protein coding RNA 1345 ncRNA 112-137 chr3 39364816 39365013 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -18456 NM_001354798 54977 Hs.369615 NM_017875 ENSG00000144659 SLC25A38 SIDBA2 solute carrier family 25 member 38 protein-coding 184.667-5 chr1 113662706 113663106 + 0.666667 NA intron (NM_001142782, intron 16 of 20) L1MB7|LINE|L1 96249 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 224.667-33 chr17 78498856 78499373 + 0.666667 NA non-coding (NR_102401, exon 6 of 6) non-coding (NR_102401, exon 6 of 6) 14204 NR_102401 100996295 Hs.615304 NR_102401 DNAH17-AS1 - DNAH17 antisense RNA 1 ncRNA 173-32 chr16 74708661 74709041 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -7989 NM_001142497 197259 Hs.119878 NM_152649 ENSG00000168404 MLKL hMLKL mixed lineage kinase domain like pseudokinase protein-coding 124.667-106 chr2 126134687 126134905 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -16811 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 114.333-207 chr7 37838420 37838674 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -10050 NM_016616 51314 Hs.723454 NM_016616 ENSG00000086288 NME8 CILD6|HEL-S-99|NM23-H8|SPTRX2|TXNDC3|sptrx-2 NME/NM23 family member 8 protein-coding 137.333-105 chr2 171153555 171153827 + 0.666667 NA intron (NM_001136554, intron 1 of 20) intron (NM_001136554, intron 1 of 20) 7202 NM_012290 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 190.333-61 chr18 78346565 78346970 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -353040 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 196.667-12 chr10 27828163 27828581 + 0.666667 NA intron (NM_018076, intron 19 of 19) intron (NM_018076, intron 19 of 19) -82553 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 116-128 chr5 113476218 113476548 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 1 of 18) L1MB8|LINE|L1 12070 NM_001085377 4163 Hs.593171 NM_002387 ENSG00000171444 MCC MCC1 MCC regulator of WNT signaling pathway protein-coding 129.667-79 chr17 61013798 61014046 + 0.666667 NA intron (NM_001353144, intron 16 of 25) intron (NM_001353144, intron 16 of 25) 336071 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 212.667-80 chr2 209807257 209807769 + 0.666667 NA intron (NM_032504, intron 7 of 63) AluY|SINE|Alu 35520 NM_032504 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 226.667-38 chr16 5795052 5795563 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 162840 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 153.333-145 chr15 66533166 66533537 + 0.666667 NA intron (NM_001287823, intron 13 of 17) intron (NM_001287823, intron 13 of 17) 28025 NM_001287823 55055 Hs.21331 NM_017975 ENSG00000174442 ZWILCH KNTC1AP|hZwilch zwilch kinetochore protein protein-coding 161.667-223 chr6 52976431 52976710 + 0.666667 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 18714 NM_001512 2941 Hs.485557 NM_001512 ENSG00000170899 GSTA4 GSTA4-4|GTA4 glutathione S-transferase alpha 4 protein-coding 200.667-149 chr7 116271664 116272115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14775 NR_130923 102724434 Hs.667624 NR_130921 ENSG00000237870 LOC102724434 - uncharacterized LOC102724434 ncRNA 197.667-148 chr8 78513650 78514208 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -2411 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 169.333-161 chr3 77208066 77208537 + 0.666667 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) intron (NM_001290039, intron 2 of 26) 110289 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 178-97 chr5 156222385 156222665 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104232 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 145-127 chr9 83506872 83507143 + 0.666667 NA intron (NM_174938, intron 1 of 13) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 31394 NM_001244959 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 173.667-153 chr6 102162846 102163356 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 764116 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 138-72 chr3 8511528 8511878 + 0.666667 NA intron (NM_001278233, intron 1 of 4) intron (NM_001278233, intron 1 of 4) 9880 NM_001278235 29995 Hs.475353 NM_014583 ENSG00000071282 LMCD1 - LIM and cysteine rich domains 1 protein-coding 204-78 chr17 20059705 20060081 + 0.666667 NA intron (NM_001243439, intron 1 of 14) intron (NM_001243439, intron 1 of 14) -27129 NM_152904 92521 Hs.431045 NM_152904 ENSG00000128487 SPECC1 CYTSB|HCMOGT-1|HCMOGT1|NSP sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 protein-coding 113.333-118 chr2 33361899 33362092 + 0.666667 NA intron (NM_206943, intron 28 of 33) intron (NM_206943, intron 28 of 33) -56521 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 227.667-60 chr5 62150226 62150674 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -155712 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 152.333-59 chr10 127152002 127152301 + 0.666667 NA intron (NM_001039762, intron 5 of 5) intron (NM_001039762, intron 5 of 5) 44440 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 122-133 chr9 132557823 132558037 + 0.666667 NA intron (NM_207417, intron 6 of 6) intron (NM_207417, intron 6 of 6) -24676 NM_020064 56751 Hs.283809 NM_020064 ENSG00000125492 BARHL1 - BarH like homeobox 1 protein-coding 147-37 chr13 70571502 70571835 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -443473 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 149-91 chr3 89189748 89190172 + 0.666667 NA intron (NM_182644, intron 2 of 6) LTR91|LTR|ERVL 82339 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 203.333-211 chr5 72781959 72782358 + 0.666667 NA Intergenic MSTC-int|LTR|ERVL-MaLR -34433 NM_002270 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 169.667-151 chr4 64306232 64306511 + 0.666667 NA intron (NM_001363796, intron 6 of 11) LTR25-int|LTR|ERV1 103079 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 112.667-61 chr13 85654549 85654823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 144733 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 151-66 chr2 174829621 174829961 + 0.666667 NA intron (NM_001025201, intron 7 of 12) intron (NM_001025201, intron 7 of 12) 17827 NM_001206602 1123 Hs.380138 NM_001822 ENSG00000128656 CHN1 ARHGAP2|CHN|DURS2|NC|RHOGAP2 chimerin 1 protein-coding 124.333-177 chr8 89354124 89354413 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 403443 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 193.333-144 chr4 129539048 129539474 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 232217 NR_110753 101927282 Hs.407480 NR_110753 ENSG00000246876 LINC02466 - long intergenic non-protein coding RNA 2466 ncRNA 205.667-81 chr2 205132576 205132981 + 0.666667 NA intron (NM_152526, intron 10 of 21) MIR|SINE|MIR -549722 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 155-42 chr15 96208123 96208418 + 0.666667 NA intron (NR_125738, intron 2 of 4) AluSz6|SINE|Alu -80429 NR_158193 105369212 NR_158193 LOC105369212 - uncharacterized LOC105369212 ncRNA 157.333-373 chrX 94185853 94186295 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 511868 NM_001171110 286499 Hs.110069 NM_173698 ENSG00000179083 FAM133A CT115 family with sequence similarity 133 member A protein-coding 149.333-381 chr7 146225525 146225812 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -548603 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 127.667-30 chr11 93705732 93706026 + 0.666667 NA intron (NM_033395, intron 17 of 29) HAL1|LINE|L1 -15635 NR_002569 619383 Hs.660668 NR_002569 ENSG00000254911 SCARNA9 Z32|mgU2-19/30 small Cajal body-specific RNA 9 ncRNA 116.667-37 chr12 65985689 65985971 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 37896 NR_106722 102464827 NR_106722 ENSG00000276878 MIR6074 hsa-mir-6074 microRNA 6074 ncRNA 138-8 chr1 180307287 180307604 + 0.666667 NA intron (NM_032360, intron 7 of 7) L1MA2|LINE|L1 -32764 NR_037642 100527964 Hs.496545 NR_037642 ENSG00000230124 LHX4-AS1 - LHX4 antisense RNA 1 ncRNA 181.333-198 chrX 138463415 138463796 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 204188 NR_030229 574507 NR_030229 ENSG00000207800 MIR504 MIRN504|hsa-mir-504|mir-504 microRNA 504 ncRNA 137.667-77 chr17 74473293 74473665 + 0.666667 NA intron (NM_001330457, intron 1 of 4) intron (NM_001330457, intron 1 of 4) 6845 NM_001330457 11314 Hs.9688 NM_007261 ENSG00000167851 CD300A CLM-8|CMRF-35-H9|CMRF-35H|CMRF35-H|CMRF35-H9|CMRF35H|CMRF35H9|IGSF12|IRC1|IRC1/IRC2|IRC2|IRp60 CD300a molecule protein-coding 169.333-130 chr2 174137684 174138037 + 0.666667 NA intron (NM_001011708, intron 4 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 110672 NM_001011708 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 207-106 chr6 137434823 137435337 + 0.666667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 59314 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 219.333-150 chr6 15885989 15886463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -223168 NM_001271669 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 129.333-98 chr2 122471831 122472095 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 601518 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 114.667-119 chr2 7795267 7795582 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 104231 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 144.333-56 chr13 38753248 38753529 + 0.666667 NA intron (NM_207361, intron 2 of 23) intron (NM_207361, intron 2 of 23) 66311 NM_207361 341640 Hs.253994 NM_207361 ENSG00000150893 FREM2 CRYPTOP|FRASRS2 FRAS1 related extracellular matrix 2 protein-coding 190.333-136 chr7 44888068 44888533 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -2770 NM_033224 5814 Hs.349150 NM_033224 ENSG00000146676 PURB PURBETA purine rich element binding protein B protein-coding 185.333-59 chr16 10359026 10359412 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -26842 NR_045815 80063 Hs.513343 NM_024997 ENSG00000166669 ATF7IP2 MCAF2 activating transcription factor 7 interacting protein 2 protein-coding 117.333-38 chr11 40292296 40292514 + 0.666667 NA non-coding (NR_047673, exon 1 of 3) non-coding (NR_047673, exon 1 of 3) 725 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 145.667-124 chr19 45448915 45449349 + 0.666667 NA intron (NM_001369412, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 1634 NM_001369414 2067 Hs.435981 NM_001983 ENSG00000012061 ERCC1 COFS4|RAD10|UV20 ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit protein-coding 158.667-341 chr9 29031359 29031652 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu -142550 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 151.333-300 chr4 39156071 39156456 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -26266 NM_001317924 57728 Hs.438482 NM_025132 ENSG00000157796 WDR19 ATD5|CED4|DYF-2|IFT144|NPHP13|ORF26|Oseg6|PWDMP|SRTD5 WD repeat domain 19 protein-coding 154-10 chr1 233155810 233156120 + 0.666667 NA intron (NM_014801, intron 19 of 33) intron (NM_014801, intron 19 of 33) 139760 NM_001328607 80003 Hs.370605 NM_014801 ENSG00000135749 PCNX2 PCNXL2 pecanex 2 protein-coding 241-63 chr9 33869999 33870485 + 0.666667 NA intron (NM_017811, intron 1 of 4) AluSx|SINE|Alu 53082 NM_017811 54926 Hs.643648 NM_017811 ENSG00000107341 UBE2R2 CDC34B|E2-CDC34B|UBC3B ubiquitin conjugating enzyme E2 R2 protein-coding 120.333-191 chr8 95856166 95856384 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 92073 NR_036611 100500773 Hs.741582 NR_036611 LOC100500773 - serine and arginine rich splicing factor 3 pseudogene pseudo 148.667-232 chr22 26211345 26211643 + 0.666667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 42020 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 151.333-88 chr11 104957331 104957612 + 0.666667 NA intron (NM_033306, intron 1 of 9) AluJr4|SINE|Alu 11103 NM_033306 837 Hs.138378 NM_001225 ENSG00000196954 CASP4 ICE(rel)II|ICEREL-II|ICH-2|Mih1|Mih1/TX|TX caspase 4 protein-coding 145-51 chr2 103998323 103998614 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 409864 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 159-74 chr21 31185918 31186309 + 0.666667 NA intron (NM_001353686, intron 14 of 27) intron (NM_001353686, intron 14 of 27) -25173 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 139.333-55 chr12 62397747 62398020 + 0.666667 NA intron (NR_147080, intron 18 of 19) L1ME3Cz|LINE|L1 -68943 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 267-44 chr20 6486278 6486756 + 0.666667 NA intron (NR_109953, intron 3 of 3) intron (NR_109953, intron 3 of 3) 59785 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 180-13 chr10 59979916 59980340 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -19215 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 153.667-264 chr3 119895779 119896077 + 0.666667 NA intron (NM_002093, intron 7 of 11) AluJb|SINE|Alu 113218 NM_022002 8856 Hs.7303 NM_003889 ENSG00000144852 NR1I2 BXR|ONR1|PAR|PAR1|PAR2|PARq|PRR|PXR|SAR|SXR nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 protein-coding 114-104 chr4 78386393 78386592 + 0.666667 NA intron (NM_001166133, intron 28 of 41) intron (NM_001166133, intron 28 of 41) 97507 NR_145782 109623453 NR_145782 SNORD161 - small nucleolar RNA, C/D box 161 snoRNA 113.667-183 chr6 37570154 37570426 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14868 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 147.667-324 chr6 153069043 153069335 + 0.666667 NA intron (NM_012419, intron 1 of 4) L1MA2|LINE|L1 62093 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 239.667-15 chr12 41136005 41136572 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52032 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 120-116 chr5 123588010 123588320 + 0.666667 NA intron (NM_001044723, intron 6 of 12) intron (NM_001044723, intron 6 of 12) 42748 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 136-81 chr5 4515545 4515936 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -257741 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 121-26 chr11 64501924 64502174 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 52992 NR_073177 100996455 Hs.634142 NR_073177 ENSG00000181908 LINC02724 - long intergenic non-protein coding RNA 2724 ncRNA 240.333-14 chr10 72622113 72622692 + 0.666667 NA intron (NM_006077, intron 1 of 11) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 3677 NM_001195518 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 229.333-92 chr4 180702819 180703449 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 456015 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 197.667-102 chr3 189726425 189726817 + 0.666667 NA intron (NM_003722, intron 1 of 13) intron (NM_003722, intron 1 of 13) -63038 NM_001329146 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 185.667-9 chr1 248152060 248152374 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 7069 NM_001004690 127059 Hs.553580 NM_001004690 ENSG00000162727 OR2M5 OR2M5P olfactory receptor family 2 subfamily M member 5 protein-coding 163.333-230 chr5 146753723 146754041 + 0.666667 NA intron (NM_001271899, intron 2 of 9) intron (NM_001271899, intron 2 of 9) 124903 NM_001271948 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 140.333-149 chr3 126645223 126645536 + 0.666667 NA intron (NM_001173513, intron 3 of 14) intron (NM_001173513, intron 3 of 14) 9745 NM_001173513 114112 Hs.477475 NM_052883 ENSG00000197763 TXNRD3 TGR|TR2|TR2IT1|TRXR3|TXNRD3IT1|TXNRD3NB|TXNRD3NT1 thioredoxin reductase 3 protein-coding 198-126 chr3 117937513 117938033 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -246848 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 114.667-128 chr2 72803991 72804181 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) intron (NR_135774, intron 1 of 19) 21947 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 129.333-45 chr12 18804908 18805284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66977 NM_033328 93661 Hs.131288 NM_033328 ENSG00000177938 CAPZA3 CAPPA3|Gsg3|HEL-S-86 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 3 protein-coding 215.333-96 chr2 138664616 138664981 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 115592 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 173-56 chr21 30543113 30543565 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -1475 NM_181612 337973 Hs.553695 NM_181612 ENSG00000186925 KRTAP19-6 KAP19.6 keratin associated protein 19-6 protein-coding 131.333-185 chr8 128285976 128286280 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 136012 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 142.333-202 chr5 120814420 120814700 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 283096 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 145.667-183 chr3 115547167 115547471 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76191 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 177-5 chr10 37337636 37337973 + 0.666667 NA intron (NR_104061, intron 3 of 4) intron (NR_104061, intron 3 of 4) 28618 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 122.667-27 chr11 67187077 67187349 + 0.666667 NA intron (NR_027473, intron 5 of 20) L1M4c|LINE|L1 -52801 NM_001256405 22992 Hs.124147 NM_012308 ENSG00000173120 KDM2A CXXC8|FBL11|FBL7|FBXL11|JHDM1A|LILINA lysine demethylase 2A protein-coding 166.333-211 chr7 44558674 44559006 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 15698 NM_019082 54606 Hs.654762 NM_019082 ENSG00000136271 DDX56 DDX21|DDX26|NOH61 DEAD-box helicase 56 protein-coding 154.667-232 chr3 4496621 4496990 + 0.666667 NA intron (NM_001168272, intron 2 of 60) intron (NM_001168272, intron 2 of 60) 3457 NM_001099952 3708 Hs.567295 NM_002222 ENSG00000150995 ITPR1 ACV|CLA4|INSP3R1|IP3R|IP3R1|PPP1R94|SCA15|SCA16|SCA29 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 protein-coding 112.333-9 chr1 174398223 174398419 + 0.666667 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) intron (NM_001366446, intron 13 of 25) -49643 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 154.667-16 chr1 115168731 115169167 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79446 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 144.667-228 chr5 2994279 2994647 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76609 NR_136207 105374620 Hs.742780 NR_136207 LOC105374620 - uncharacterized LOC105374620 ncRNA 159.333-160 chr2 81691209 81691659 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -224488 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 141.333-250 chr9 14121668 14121950 + 0.666667 NA intron (NR_161383, intron 6 of 7) intron (NR_161383, intron 6 of 7) 58993 NM_001282787 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 297-45 chr8 137201979 137202767 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 211215 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 120.333-151 chr5 41727100 41727420 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 116397 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 212-105 chr3 68239434 68239889 + 0.666667 NA intron (NM_001252216, intron 2 of 4) intron (NM_001252216, intron 2 of 4) 235414 NM_213609 407738 Hs.655061 NM_213609 ENSG00000183662 TAFA1 FAM19A1|TAFA-1 TAFA chemokine like family member 1 protein-coding 153-87 chr22 35108846 35109145 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 42837 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 138.667-88 chr18 46806544 46806872 + 0.666667 NA non-coding (NR_148702, exon 13 of 13) non-coding (NR_148702, exon 13 of 13) -49655 NM_001307987 29906 Hs.465025 NM_013305 ENSG00000101638 ST8SIA5 SIAT8-E|SIAT8E|ST8SiaV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 protein-coding 148.333-90 chr12 30655339 30655642 + 0.666667 NA intron (NM_006390, intron 17 of 24) L1MA7|LINE|L1 21754 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 165.333-133 chr2 152116129 152116584 + 0.666667 NA TTS (NM_005843) TTS (NM_005843) -17189 NM_000726 785 Hs.120725 NM_000726 ENSG00000182389 CACNB4 CAB4|CACNLB4|EA5|EIG9|EJM|EJM4|EJM6 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 protein-coding 128.333-173 chr6 73508062 73508378 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_012123, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_012123, exon 12 of 12) 10218 NR_132981 106635684 NR_132981 SNORD141B - small nucleolar RNA, C/D box 141B snoRNA 140-40 chr15 60632261 60632524 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 2 of 10) AluY|SINE|Alu -4862 NM_134260 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 167.667-49 chr12 94862533 94862910 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 28267 NR_036685 160313 Hs.527883 NR_036685 ENSG00000216306 KRT19P2 KRT19P5 keratin 19 pseudogene 2 pseudo 153-158 chrX 80650219 80650553 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 159491 NM_153252 254065 Hs.147027 NM_153252 ENSG00000165288 BRWD3 BRODL|MRX93 bromodomain and WD repeat domain containing 3 protein-coding 115.333-150 chr4 38139510 38139813 + 0.666667 NA TTS (NM_001253915) TTS (NM_001253915) 19707 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 112.333-183 chr4 61113195 61113400 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30359 NR_147148 105377249 Hs.575120 NR_147148 ENSG00000240152 LINC02271 - long intergenic non-protein coding RNA 2271 ncRNA 144.333-143 chr2 209988720 209989002 + 0.666667 NA intron (NM_032504, intron 60 of 63) intron (NM_032504, intron 60 of 63) -13704 NM_001318927 6120 Hs.282260 NM_006916 ENSG00000197713 RPE RPE2-1 ribulose-5-phosphate-3-epimerase protein-coding 155.333-384 chr8 71749001 71749305 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93970 NR_033652 100132891 Hs.137674 NR_033651 ENSG00000235531 MSC-AS1 - MSC antisense RNA 1 ncRNA 203-114 chr9 72823380 72823802 + 0.666667 NA intron (NM_138691, intron 20 of 23) intron (NM_138691, intron 20 of 23) 50518 NR_121181 101927258 Hs.586433 NR_121120 ENSG00000236849 LINC01474 - long intergenic non-protein coding RNA 1474 ncRNA 148.667-341 chr6 163495592 163495903 + 0.666667 NA intron (NM_206853, intron 3 of 6) L1MC4|LINE|L1 81029 NM_206854 9444 Hs.510324 NM_006775 ENSG00000112531 QKI Hqk|QK|QK1|QK3|hqkI QKI, KH domain containing RNA binding protein-coding 151-88 chr3 140787596 140787905 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109686 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 138.333-155 chr5 107570161 107570520 + 0.666667 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 100597 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 118.667-71 chr14 102063763 102064027 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23149 NM_005348 3320 Hs.525600 NM_005348 ENSG00000080824 HSP90AA1 EL52|HEL-S-65p|HSP86|HSP89A|HSP90A|HSP90N|HSPC1|HSPCA|HSPCAL1|HSPCAL4|HSPN|Hsp103|Hsp89|Hsp90|LAP-2|LAP2 heat shock protein 90 alpha family class A member 1 protein-coding 143.667-144 chr21 19578144 19578418 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 321474 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 146.333-30 chr10 64158857 64159206 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -637141 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 111.667-127 chr2 22832103 22832353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 295749 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 235-8 chr10 36373630 36374156 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 595591 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 283.333-19 chr14 71592159 71592627 + 0.666667 NA intron (NM_001354286, intron 6 of 24) intron (NM_001354286, intron 6 of 24) 6095 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 171.333-181 chr7 41098682 41099031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2748 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 204.667 chr1 14685976 14686398 + 0.666667 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) AluSc|SINE|Alu 87470 NM_015209 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 158.667-356 chr9 101979299 101979725 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -240932 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 124-28 chr11 99138284 99138624 + 0.666667 NA intron (NM_001243270, intron 1 of 23) intron (NM_001243270, intron 1 of 23) 117505 NM_001243270 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 123.333-55 chr12 4458780 4459102 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -13327 NM_020996 2251 Hs.166015 NM_020996 ENSG00000111241 FGF6 HBGF-6|HST2 fibroblast growth factor 6 protein-coding 197-69 chr3 25905766 25906339 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -32357 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 143.667-150 chr22 28279390 28279673 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) AluSg|SINE|Alu -180338 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 119-52 chr15 35200838 35201132 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -36341 NR_003144 723972 Hs.631698 NR_003144 ENSG00000259516 ANP32AP1 - acidic nuclear phosphoprotein 32 family member A pseudogene 1 pseudo 112.667-176 chr3 105039650 105039847 + 0.666667 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 -326965 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 173-26 chr14 75577102 75577589 + 0.666667 NA intron (NR_110552, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR -1275 NM_017791 55640 Hs.509966 NM_017791 ENSG00000119686 FLVCR2 C14orf58|CCT|EPV|FLVCRL14q|MFSD7C|PVHH|SLC49A2 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor family member 2 protein-coding 147.667-275 chr5 13013048 13013364 + 0.666667 NA intron (NR_147005, intron 2 of 4) L1PA13|LINE|L1 19680 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 137.667-9 chr1 108697266 108697676 + 0.666667 NA intron (NM_001349765, intron 4 of 5) intron (NM_001349765, intron 4 of 5) 5161 NM_001349759 55119 Hs.342307 NM_018061 ENSG00000134186 PRPF38B NET1 pre-mRNA processing factor 38B protein-coding 148-29 chr11 111580286 111580539 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22037 NM_015191 23235 Hs.269128 NM_015191 ENSG00000170145 SIK2 LOH11CR1I|QIK|SIK-2|SNF1LK2 salt inducible kinase 2 protein-coding 143.667-83 chr15 54390141 54390520 + 0.666667 NA intron (NM_001329919, intron 16 of 31) intron (NM_001329919, intron 16 of 31) 377682 NM_001080534 440279 Hs.657273 NM_001080534 ENSG00000137766 UNC13C - unc-13 homolog C protein-coding 169.333-214 chr5 153722917 153723265 + 0.666667 NA intron (NM_000827, intron 11 of 15) intron (NM_000827, intron 11 of 15) 175896 NR_146729 105378238 Hs.590229 NR_146729 ENSG00000251183 LINC01861 - long intergenic non-protein coding RNA 1861 ncRNA 240.333-83 chr7 27247925 27248630 + 0.666667 NA TTS (NM_001304519) TTS (NM_001304519) -1048 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 144-45 chr13 26817612 26817894 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -56967 NM_005288 2835 Hs.123034 NM_005288 ENSG00000132975 GPR12 GPCR12|GPCR21|PPP1R84 G protein-coupled receptor 12 protein-coding 119.667-115 chr3 62782717 62782952 + 0.666667 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) AluSx1|SINE|Alu 92582 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 220.333-17 chr10 91359065 91359626 + 0.666667 NA intron (NR_024467, intron 3 of 4) intron (NR_024467, intron 3 of 4) -49890 NM_001348365 143279 Hs.596096 NM_173497 ENSG00000165338 HECTD2 - HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 127.333-151 chr5 163500046 163500274 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -2904 NM_182796 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 189.667-37 chr13 41833886 41834289 + 0.666667 NA intron (NM_001009814, intron 12 of 25) intron (NM_001009814, intron 12 of 25) 126998 NM_001009814 23078 Hs.368282 NM_015058 ENSG00000102763 VWA8 KIAA0564|P7BP2 von Willebrand factor A domain containing 8 protein-coding 166.333-207 chr6 159145206 159145482 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -24056 NM_032532 84624 Hs.520525 NM_032532 ENSG00000164694 FNDC1 AGS8|FNDC2|MEL4B3|bA243O10.1|dJ322A24.1 fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 141.667-218 chr8 25330801 25331101 + 0.666667 NA intron (NM_024940, intron 18 of 51) AluJb|SINE|Alu -14451 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 216.667-95 chr6 45027805 45028389 + 0.666667 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) HAL1|LINE|L1 169673 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 113.333-140 chr2 212554197 212554375 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15484 NM_005235 2066 Hs.390729 NM_005235 ENSG00000178568 ERBB4 ALS19|HER4|p180erbB4 erb-b2 receptor tyrosine kinase 4 protein-coding 140.667-187 chr5 101561911 101562201 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -658774 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 127.333-59 chr16 17914921 17915284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 417560 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 119.333-149 chr3 30600650 30600906 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -5724 NM_001024847 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 190-79 chr3 55762296 55762815 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 13 of 17) intron (NR_132749, intron 13 of 17) 90039 NR_037502 100500875 NR_037502 ENSG00000264013 MIR3938 - microRNA 3938 ncRNA 205.667-72 chr2 77885647 77886134 + 0.666667 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -30044 NR_110286 101927926 Hs.149042 NR_110286 ENSG00000233605 LINC01851 - long intergenic non-protein coding RNA 1851 ncRNA 126.667-123 chr4 63531458 63531775 + 0.666667 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 877834 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 115.333-202 chr7 70766143 70766363 + 0.666667 NA exon (NM_001127231, exon 9 of 18) exon (NM_001127231, exon 9 of 18) -365891 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 216-12 chr10 100145507 100145981 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40285 NM_001100626 10613 Hs.150087 NM_006459 ENSG00000107566 ERLIN1 C10orf69|Erlin-1|KE04|KEO4|SPFH1|SPG62 ER lipid raft associated 1 protein-coding 157-47 chr16 7012101 7012443 + 0.666667 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) MIRb|SINE|MIR 238463 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 148.333-113 chr14 21139780 21140103 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 16122 NM_001004731 390445 Hs.553768 NM_001004731 ENSG00000169327 OR5AU1 OR14-38 olfactory receptor family 5 subfamily AU member 1 protein-coding 171-57 chr3 198026013 198026446 + 0.666667 NA intron (NR_026786, intron 15 of 16) AluJb|SINE|Alu 13238 NR_046669 100873947 Hs.637166 NR_046669 ENSG00000232832 LMLN-AS1 - LMLN antisense RNA 1 ncRNA 139.333-138 chr21 31230025 31230368 + 0.666667 NA intron (NM_001353686, intron 6 of 27) intron (NM_001353686, intron 6 of 27) -69256 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 139.333-82 chr16 7922965 7923230 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 590252 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 169.333-6 chr1 113113845 113114196 + 0.666667 NA intron (NM_014813, intron 14 of 17) intron (NM_014813, intron 14 of 17) 40822 NM_001312686 9860 Hs.448972 NM_014813 ENSG00000198799 LRIG2 LIG-2|LIG2|UFS2 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 protein-coding 328.333-21 chr2 81396272 81397034 + 0.666667 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 70293 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 154.667-329 chr5 155194024 155194446 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 180480 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 155.667-375 chr8 141736750 141737016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49430 NR_031636 100302147 NR_031636 ENSG00000221768 MIR1302-7 MIRN1302-7|hsa-mir-1302-7 microRNA 1302-7 ncRNA 114.333-162 chr4 99286864 99287091 + 0.666667 NA exon (NM_000667, exon 3 of 9) exon (NM_000667, exon 3 of 9) 4008 NM_000667 124 Hs.654433 NM_000667 ENSG00000187758 ADH1A ADH1 alcohol dehydrogenase 1A (class I), alpha polypeptide protein-coding 112-105 chr2 70303311 70303511 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -1344 NM_001329755 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 131-91 chr7 45350372 45350646 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 192718 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 119.667-146 chr5 29760381 29760601 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -120069 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 169.667-29 chr11 21792921 21793260 + 0.666667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -399995 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 112-204 chr8 125304981 125305303 + 0.666667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -125216 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 112.333-281 chr9 114321598 114321802 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -1323 NM_000607 5004 Hs.522356 NM_000607 ENSG00000229314 ORM1 AGP-A|AGP1|HEL-S-153w|ORM orosomucoid 1 protein-coding 123.333-182 chr6 5853119 5853323 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 150823 NM_001278711 51299 Hs.103291 NM_016588 ENSG00000124785 NRN1 NRN|dJ380B8.2 neuritin 1 protein-coding 113-59 chr14 67002026 67002281 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 8 of 21) MER105|DNA|hAT-Charlie -187287 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 181.667-144 chr8 68954481 68954874 + 0.666667 NA intron (NR_039986, intron 2 of 4) MER61A|LTR|ERV1 149513 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 147-23 chr11 59935334 59935620 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7402 NR_130719 255649 Hs.722773 NR_130719 OOSP1 - oocyte secreted protein 1 pseudo 179.333-131 chr3 131377996 131378320 + 0.666667 NA intron (NR_038976, intron 1 of 3) L1MC3|LINE|L1 3317 NR_038976 339874 Hs.718930 NR_038976 ENSG00000250608 LOC339874 - uncharacterized LOC339874 ncRNA 129-136 chrX 43419475 43419841 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -235249 NM_001270458 4128 Hs.183109 NM_000240 ENSG00000189221 MAOA BRNRS|MAO-A monoamine oxidase A protein-coding 196-166 chr7 16998492 16998882 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -116704 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 114-171 chr8 125922267 125922532 + 0.666667 NA TTS (NR_038447) TTS (NR_038447) 28798 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 146.667-234 chr4 66129333 66129701 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -147307 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 164.333-176 chr4 73899493 73899862 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 30284 NR_046035 2919 Hs.789 NM_001511 ENSG00000163739 CXCL1 FSP|GRO1|GROa|MGSA|MGSA-a|NAP-3|SCYB1 C-X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 130-86 chr4 150949280 150949524 + 0.666667 NA intron (NM_001367550, intron 2 of 56) L1MD1|LINE|L1 65865 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 166.333-109 chr2 49263762 49264156 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109432 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 158.667-183 chr2 229687307 229687638 + 0.666667 NA intron (NM_139072, intron 1 of 12) AluSx1|SINE|Alu 27083 NM_139072 92737 Hs.234074 NM_139072 ENSG00000187957 DNER UNQ26|bet delta/notch like EGF repeat containing protein-coding 122.667-64 chr16 68691189 68691535 + 0.666667 NA intron (NM_001793, intron 12 of 15) intron (NM_001793, intron 12 of 15) -45930 NM_004360 999 Hs.461086 NM_004360 ENSG00000039068 CDH1 Arc-1|BCDS1|CD324|CDHE|ECAD|LCAM|UVO cadherin 1 protein-coding 204.333-121 chr3 37607390 37607733 + 0.666667 NA intron (NM_002207, intron 15 of 27) intron (NM_002207, intron 15 of 27) 155420 NM_002207 3680 Hs.113157 NM_002207 ENSG00000144668 ITGA9 ALPHA-RLC|ITGA4L|RLC integrin subunit alpha 9 protein-coding 153-60 chr17 44550723 44551100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6573 NM_001466 2535 Hs.142912 NM_001466 ENSG00000180340 FZD2 Fz2|OMOD2|fz-2|fzE2|hFz2 frizzled class receptor 2 protein-coding 186.667-114 chr5 23440510 23440953 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -66878 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 166.667-8 chr1 80985202 80985627 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -320778 NM_001366003 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 217.333-132 chr6 138942896 138943469 + 0.666667 NA intron (NM_031922, intron 7 of 19) intron (NM_031922, intron 7 of 19) 45079 NM_001286612 85021 Hs.334603 NM_031922 ENSG00000135597 REPS1 NBIA7|RALBP1 RALBP1 associated Eps domain containing 1 protein-coding 115.333-34 chr11 41073723 41074057 + 0.666667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 385746 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 148.667-393 chr8 137150013 137150342 + 0.666667 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL 263411 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 144.667-88 chr14 73974805 73975219 + 0.666667 NA intron (NM_001249, intron 10 of 15) intron (NM_001249, intron 10 of 15) 24710 NM_182476 51004 Hs.131555 NM_182476 ENSG00000119723 COQ6 CGI-10|CGI10|COQ10D6 coenzyme Q6, monooxygenase protein-coding 121-120 chr5 134478049 134478243 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -28406 NR_105045 101927934 Hs.535775 NR_105045 ENSG00000251169 LINC01843 - long intergenic non-protein coding RNA 1843 ncRNA 130-91 chr5 39167912 39168224 + 0.666667 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) intron (NM_001243093, intron 2 of 18) 51495 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 170-12 chr10 92872058 92872349 + 0.666667 NA intron (NM_001319195, intron 1 of 21) L1M1|LINE|L1 23683 NM_019053 54536 Hs.655657 NM_019053 ENSG00000138190 EXOC6 EXOC6A|SEC15|SEC15L|SEC15L1|SEC15L3|Sec15p exocyst complex component 6 protein-coding 200-143 chr6 89631734 89632164 + 0.666667 NA TTS (NM_020466) TTS (NM_020466) 6548 NR_028495 57226 Hs.177275 NM_020466 ENSG00000083099 LYRM2 DJ122O8.2 LYR motif containing 2 protein-coding 163-29 chr16 5959606 5959944 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -59249 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 162.667-74 chr13 93293848 93294236 + 0.666667 NA intron (NM_005708, intron 1 of 8) L2c|LINE|L2 67235 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 131.667-163 chr5 67420131 67420451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -223492 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 144.667-166 chr20 17584943 17585264 + 0.666667 NA intron (NM_006870, intron 1 of 3) L1ME4a|LINE|L1 15028 NM_006870 11034 Hs.304192 NM_006870 ENSG00000125868 DSTN ACTDP|ADF|HEL32|bA462D18.2 destrin, actin depolymerizing factor protein-coding 152-64 chr15 69710568 69710873 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 118520 NR_126437 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 143.333-37 chr10 65670406 65670686 + 0.666667 NA intron (NR_120647, intron 3 of 5) intron (NR_120647, intron 3 of 5) 99121 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 189-32 chr15 59040150 59040461 + 0.666667 NA intron (NM_001270529, intron 2 of 13) AluJr|SINE|Alu 52159 NM_001270530 54778 Hs.404423 NM_017610 ENSG00000157450 RNF111 ARK|hRNF111 ring finger protein 111 protein-coding 174.667-155 chr7 10115023 10115419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 480951 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 152.333-256 chr3 189555955 189556273 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -40632 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 221.333-63 chr2 63351258 63351819 + 0.666667 NA intron (NR_148704, intron 13 of 18) L1PA16|LINE|L1 86469 NM_001042692 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 125-53 chr19 27992469 27992777 + 0.666667 NA intron (NR_146733, intron 3 of 6) intron (NR_146733, intron 3 of 6) -198683 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 140.333-119 chr20 14380525 14380879 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1MB4|LINE|L1 -43035 NM_013281 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 135.667-78 chr18 63439410 63439779 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17118 NM_004869 9525 Hs.126550 NM_004869 ENSG00000119541 VPS4B MIG1|SKD1|SKD1B|VPS4-2 vacuolar protein sorting 4 homolog B protein-coding 123.333-172 chr5 64138441 64138757 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -27244 NM_001113561 285671 Hs.657843 NM_178532 ENSG00000164197 RNF180 RINES ring finger protein 180 protein-coding 177.333-88 chr2 171449833 171450265 + 0.666667 NA intron (NM_001164821, intron 5 of 11) intron (NM_001164821, intron 5 of 11) -15246 NM_024770 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 143.333-148 chr2 165721842 165722113 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72270 NM_004482 2591 Hs.170986 NM_004482 ENSG00000115339 GALNT3 GalNAc-T3|HFTC|HFTC1|HHS polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 protein-coding 141-10 chr10 114274194 114274463 + 0.666667 NA intron (NM_001272046, intron 6 of 13) L2a|LINE|L2 34714 NM_001320804 340706 Hs.197741 NM_198496 ENSG00000165816 VWA2 AMACO|CCSP-2|CCSP2|NET42 von Willebrand factor A domain containing 2 protein-coding 142-8 chr1 155348505 155348868 + 0.666667 NA intron (NM_018489, intron 19 of 27) AluSx1|SINE|Alu -2241 NR_030282 693140 NR_030282 ENSG00000283701 MIR555 MIRN555|hsa-mir-555 microRNA 555 ncRNA 112-153 chr4 60845984 60846212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -76521 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 130.333-198 chr7 82797499 82797832 + 0.666667 NA intron (NM_033026, intron 22 of 24) intron (NM_033026, intron 22 of 24) -353709 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 112.667-252 chr7 92670043 92670296 + 0.666667 NA intron (NM_001259, intron 5 of 7) MIRc|SINE|MIR -79779 NR_109929 257415 Hs.18564 NM_152789 ENSG00000234545 FAM133B - family with sequence similarity 133 member B protein-coding 178.333-97 chr22 46932922 46933398 + 0.666667 NA intron (NR_104292, intron 10 of 13) intron (NR_104292, intron 10 of 13) -17118 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 198-105 chr20 4593212 4593660 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -93020 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 124-75 chr3 23015282 23015565 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 187155 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 154.333-330 chr7 85479155 85479452 + 0.666667 NA intron (NR_134240, intron 3 of 3) intron (NR_134240, intron 3 of 3) 58181 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 137-44 chr2 50299302 50299622 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) 48292 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 113.333-157 chr21 43625959 43626205 + 0.666667 NA intron (NM_007031, intron 6 of 8) intron (NM_007031, intron 6 of 8) -16093 NR_106718 102464825 NR_106718 ENSG00000278433 MIR6070 hsa-mir-6070 microRNA 6070 ncRNA 158-139 chr8 104196534 104196837 + 0.666667 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) MER101-int|LTR|ERV1 -26650 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 151.333-446 chr9 105350523 105350929 + 0.666667 NA intron (NM_001330731, intron 5 of 15) MIRb|SINE|MIR -97308 NM_001287191 83856 Hs.136901 NM_031919 ENSG00000106701 FSD1L CCDC10|CSDUFD1|FSD1CL|FSD1NL|MIR1 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like protein-coding 147.667-232 chr3 96599574 96599960 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -214827 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 133.333-8 chr1 114567404 114567722 + 0.666667 NA TTS (NM_005872) TTS (NM_005872) 14052 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 206.667-70 chr2 191107469 191107913 + 0.666667 NA intron (NM_003151, intron 3 of 23) intron (NM_003151, intron 3 of 23) 43303 NM_003151 6775 Hs.80642 NM_003151 ENSG00000138378 STAT4 SLEB11 signal transducer and activator of transcription 4 protein-coding 168.667-53 chr13 51601775 51602161 + 0.666667 NA intron (NM_052950, intron 1 of 11) intron (NM_052950, intron 1 of 11) 17506 NM_052950 115825 Hs.46506 NM_052950 ENSG00000139668 WDFY2 PROF|WDF2|ZFYVE22 WD repeat and FYVE domain containing 2 protein-coding 133.333-83 chr2 146763594 146763823 + 0.666667 NA Intergenic HAL1b|LINE|L1 176651 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 121.333-75 chr18 75143161 75143348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62259 NM_001306093 284273 Hs.465433 NM_175907 ENSG00000180011 ZADH2 PRG-3 zinc binding alcohol dehydrogenase domain containing 2 protein-coding 133.333-159 chr5_GL383530v1_alt 51652 51928 + 0.666667 NA NA Intergenic NA NA 188.667-129 chr6 38578528 38579004 + 0.666667 NA intron (NM_052893, intron 6 of 11) intron (NM_052893, intron 6 of 11) 17301 NM_001172418 114781 Hs.603858 NM_052893 ENSG00000183826 BTBD9 dJ322I12.1 BTB domain containing 9 protein-coding 134.333-188 chr9 94481282 94481662 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73573 NR_121569 101928099 Hs.674409 NR_121566 PCAT7 PCAN-R2 prostate cancer associated transcript 7 ncRNA 165.333-40 chr11 18131704 18132198 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001370464) promoter-TSS (NM_001370464) -620 NM_001370464 117195 Hs.380177 NM_054031 ENSG00000179826 MRGPRX3 GPCR|MRGX3|SNSR1|SNSR2 MAS related GPR family member X3 protein-coding 189-5 chr1 192491703 192492099 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -83872 NM_002922 5996 Hs.75256 NM_002922 ENSG00000090104 RGS1 1R20|BL34|HEL-S-87|IER1|IR20 regulator of G protein signaling 1 protein-coding 190.667-122 chr6 131310270 131310584 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 60023 NM_138633 9465 Hs.486483 NM_004842 ENSG00000118507 AKAP7 AKAP15|AKAP18 A-kinase anchoring protein 7 protein-coding 111.667-54 chr12 2017484 2017721 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13067 NR_135060 196513 Hs.130934 NM_152640 ENSG00000151065 DCP1B DCP1 decapping mRNA 1B protein-coding 149.333-338 chr6 73703353 73703688 + 0.666667 NA intron (NM_001159588, intron 2 of 31) MIR3|SINE|MIR 7317 NM_133493 135228 Hs.399891 NM_133493 ENSG00000156535 CD109 CPAMD7|p180|r150 CD109 molecule protein-coding 125-55 chr2 50084560 50084831 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 19 of 22) LTR12C|LTR|ERV1 -110492 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 147.333-166 chr2 44229299 44229582 + 0.666667 NA intron (NM_177968, intron 5 of 5) L1MC5a|LINE|L1 -46040 NM_000341 6519 Hs.112916 NM_000341 ENSG00000138079 SLC3A1 ATR1|CSNU1|D2H|NBAT|RBAT solute carrier family 3 member 1 protein-coding 118.333-194 chr7 79528679 79528961 + 0.666667 NA Intergenic LTR52|LTR|ERVL 74860 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 122.667-87 chr2 50885081 50885345 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) intron (NM_001330093, intron 4 of 22) 146919 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 153.333-347 chr5 148428125 148428466 + 0.666667 NA intron (NM_205836, intron 15 of 21) intron (NM_205836, intron 15 of 21) 44337 NM_205836 81545 Hs.483772 NM_030793 ENSG00000145868 FBXO38 Fbx38|HMN2D|MOKA|SP329 F-box protein 38 protein-coding 199-110 chr8 27853729 27854179 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16137 NM_018492 55872 Hs.104741 NM_018492 ENSG00000168078 PBK CT84|HEL164|Nori-3|SPK|TOPK PDZ binding kinase protein-coding 183.667-98 chr4 20131725 20132169 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -119958 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 147-46 chr15 44564710 44565144 + 0.666667 NA intron (NM_025137, intron 38 of 39) FLAM_A|SINE|Alu 27780 NM_003758 8669 Hs.404056 NM_003758 ENSG00000104131 EIF3J EIF3S1|eIF3-alpha|eIF3-p35 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J protein-coding 183.333-167 chr8 133139839 133140238 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37436 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 114-179 chr9 137293097 137293315 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9065 NM_001004354 441478 Hs.535075 NM_001004354 ENSG00000198435 NRARP - NOTCH regulated ankyrin repeat protein protein-coding 163-67 chr5 99085625 99086072 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -156134 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 233.333-31 chr12 23189281 23189886 + 0.666667 NA intron (NR_120471, intron 3 of 4) intron (NR_120471, intron 3 of 4) 13947 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 129.333-126 chr3 96038042 96038303 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -321792 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 129-113 chr6 126037756 126038136 + 0.666667 NA intron (NM_001031712, intron 12 of 12) intron (NM_001031712, intron 12 of 12) 51406 NR_146803 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 120-103 chr5 24985948 24986212 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -145497 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 158-56 chr16 9220824 9221212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 129374 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 120-85 chr3 41237030 41237278 + 0.666667 NA intron (NM_001904, intron 13 of 14) intron (NM_001904, intron 13 of 14) 37649 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 138.667-119 chr20 49394488 49394769 + 0.666667 NA intron (NM_004975, intron 1 of 1) intron (NM_004975, intron 1 of 1) 88040 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 167-62 chr2 201646036 201646373 + 0.666667 NA intron (NM_033066, intron 21 of 21) (ATATAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2701 NM_001044385 65062 Hs.12319 NM_152388 ENSG00000155755 TMEM237 ALS2CR4|JBTS14 transmembrane protein 237 protein-coding 157-96 chr4 91221605 91221886 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L2b|LINE|L2 986714 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 207.667-129 chrX 86886187 86886700 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 623475 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 154.667-421 chrX 86288238 86288611 + 0.666667 NA intron (NM_001139515, intron 1 of 11) L1MA1|LINE|L1 25456 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 118.667-16 chr10 11037215 11037540 + 0.666667 NA intron (NM_001326345, intron 1 of 13) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 18621 NM_001326345 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 227-18 chr13 54235128 54235571 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 76699 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 172.667-49 chr13 31976218 31976696 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 55182 NR_103839 100507099 Hs.536364 NR_103839 FRY-AS1 - FRY antisense RNA 1 ncRNA 115.333-60 chr13 103389461 103389735 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35602 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 136.333-82 chr18 12811798 12812131 + 0.666667 NA intron (NM_080423, intron 7 of 8) intron (NM_080423, intron 7 of 8) 28998 NM_001308287 5771 Hs.654527 NM_002828 ENSG00000175354 PTPN2 PTN2|PTPT|TC-PTP|TCELLPTP|TCPTP protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 protein-coding 122.333-51 chr13 87821082 87821438 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10740 NR_104059 101930749 Hs.539610 NR_104059 ENSG00000223404 LINC00397 - long intergenic non-protein coding RNA 397 ncRNA 132-79 chr21 39781917 39782308 + 0.666667 NA intron (NM_001080444, intron 5 of 8) L1MC4a|LINE|L1 36705 NM_001080444 150084 Hs.422120 NM_001080444 ENSG00000183067 IGSF5 GSF5|JAM4 immunoglobulin superfamily member 5 protein-coding 189.667-66 chr2 17771383 17771859 + 0.666667 NA intron (NM_182625, intron 7 of 13) intron (NM_182625, intron 7 of 13) 17483 NM_001130009 348654 Hs.467793 NM_182625 ENSG00000178295 GEN1 Gen GEN1 Holliday junction 5' flap endonuclease protein-coding 206.333-27 chr11 77634755 77635127 + 0.666667 NA intron (NM_001293, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 2853 NM_001311201 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 144.667-171 chr20 47042076 47042342 + 0.666667 NA intron (NM_172110, intron 5 of 13) MIR|SINE|MIR -124758 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 165-33 chr19 11494079 11494395 + 0.666667 NA intron (NM_138783, intron 3 of 8) AluSz|SINE|Alu 1385 NR_107014 102465856 NR_107014 ENSG00000274713 MIR7974 hsa-mir-7974 microRNA 7974 ncRNA 167-11 chr10 52680158 52680592 + 0.666667 NA intron (NR_155748, intron 1 of 2) intron (NR_155748, intron 1 of 2) 75029 NR_155748 105378305 Hs.257871 NR_155748 LOC105378305 - uncharacterized LOC105378305 ncRNA 169.333-285 chr9 32570219 32570556 + 0.666667 NA intron (NM_001199987, intron 1 of 2) intron (NM_001199987, intron 1 of 2) 2772 NM_002493 4712 Hs.493668 NM_002493 ENSG00000165264 NDUFB6 B17|CI NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B6 protein-coding 205.667-52 chr15 63182720 63183179 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -6657 NM_016530 51762 Hs.389733 NM_016530 ENSG00000166128 RAB8B - RAB8B, member RAS oncogene family protein-coding 117.667-174 chr7 26040130 26040456 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR1b|LTR|Gypsy -90307 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 163.333-39 chr10 80329914 80330207 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14685 NR_070308 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 177-85 chrX 109784454 109784790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51230 NM_022977 2182 Hs.268785 NM_004458 ENSG00000068366 ACSL4 ACS4|FACL4|LACS4|MRX63|MRX68 acyl-CoA synthetase long chain family member 4 protein-coding 145-21 chr12 23753288 23753571 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 7 of 17) intron (NM_152989, intron 7 of 17) -168843 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 174.667-47 chr14 45429529 45429969 + 0.666667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -176547 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 163.333-192 chr3 190253891 190254328 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 68337 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 219-2 chr1 18159151 18159580 + 0.666667 NA intron (NM_032880, intron 1 of 9) intron (NM_032880, intron 1 of 9) 51567 NM_032880 84966 Hs.212511 NM_032880 ENSG00000117154 IGSF21 - immunoglobin superfamily member 21 protein-coding 195.667-123 chr6 115554418 115554948 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 89152 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 120-52 chr18 7953887 7954170 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 6 of 30) intron (NM_002845, intron 6 of 30) 386712 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 118.667-89 chr18 15165225 15165466 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 160574 NR_027417 644669 Hs.579474 NR_027417 ENSG00000215512 LOC644669 - ankyrin repeat domain 30B pseudogene pseudo 147.333-25 chr1 209596976 209597359 + 0.666667 NA intron (NM_020439, intron 2 of 12) MER91B|DNA|hAT-Tip100 13453 NM_020439 57172 Hs.199068 NM_020439 ENSG00000008118 CAMK1G CLICK3|CLICKIII|VWS1|dJ272L16.1 calcium/calmodulin dependent protein kinase IG protein-coding 158.667-353 chr9 83575731 83576021 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -37475 NM_174938 257019 Hs.127535 NM_174938 ENSG00000172159 FRMD3 4.1O|EPB41L4O|EPB41LO|P410 FERM domain containing 3 protein-coding 135.667-124 chr3 153929316 153929645 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166954 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 173.333-79 chr18 52750924 52751352 + 0.666667 NA intron (NM_005215, intron 1 of 28) Plat_L3|LINE|CR1 410941 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 193.333-68 chr15 101435792 101436186 + 0.666667 NA intron (NM_138325, intron 2 of 13) intron (NM_138325, intron 2 of 13) 53718 NM_138322 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 192.667-88 chr2 64096777 64097218 + 0.666667 NA intron (NM_020651, intron 4 of 6) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger 47423 NM_020651 57162 Hs.7886 NM_020651 ENSG00000197329 PELI1 - pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 190.667-57 chr18 5817495 5817936 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -22980 NR_039772 100616244 NR_039772 ENSG00000272380 MIR3976 - microRNA 3976 ncRNA 148.667-92 chr12 28861993 28862311 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -287126 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 144-39 chr12 48007563 48007852 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3231 NM_033150 1280 Hs.408182 NM_001844 ENSG00000139219 COL2A1 ANFH|AOM|COL11A3|SEDC|STL1 collagen type II alpha 1 chain protein-coding 142-139 chr7 17309901 17310177 + 0.666667 NA exon (NM_001621, exon 2 of 11) exon (NM_001621, exon 2 of 11) 11387 NM_001621 196 Hs.171189 NM_001621 ENSG00000106546 AHR RP85|bHLHe76 aryl hydrocarbon receptor protein-coding 120.667-87 chr2 28515394 28515646 + 0.666667 NA intron (NM_001170585, intron 1 of 56) intron (NM_001170585, intron 1 of 56) 19449 NM_001170585 151056 Hs.444933 NM_153021 ENSG00000163803 PLB1 PLB|PLB/LIP phospholipase B1 protein-coding 187.667-64 chr2 3137252 3137597 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11398 NR_110228 101927554 Hs.638446 NR_110228 ENSG00000234423 LINC01250 - long intergenic non-protein coding RNA 1250 ncRNA 115.667-64 chr13 42239109 42239452 + 0.666667 NA non-coding (NR_123714, exon 28 of 28) non-coding (NR_123714, exon 28 of 28) -32872 NM_016248 11215 Hs.105105 NM_016248 ENSG00000023516 AKAP11 AKAP-11|AKAP220|PPP1R44|PRKA11 A-kinase anchoring protein 11 protein-coding 208.333-25 chr12 32410224 32410680 + 0.666667 NA intron (NM_001370298, intron 1 of 16) AluJb|SINE|Alu 10894 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 128-63 chr21 25604020 25604265 + 0.666667 NA intron (NM_080794, intron 2 of 10) AluSx|SINE|Alu 3347 NM_080794 54148 Hs.420696 NM_017446 ENSG00000154719 MRPL39 C21orf92|L39mt|MRP-L5|MRPL5|MSTP003|PRED22|PRED66|RPML5 mitochondrial ribosomal protein L39 protein-coding 197.667-49 chr17 56043783 56044214 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -109477 NM_001365758 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 121.667-218 chr9 109214890 109215160 + 0.666667 NA intron (NM_019114, intron 16 of 25) intron (NM_019114, intron 16 of 25) -47734 NM_014334 23732 Hs.347537 NM_014334 ENSG00000260230 FRRS1L C9orf4|CG-6|CG6|EIEE37 ferric chelate reductase 1 like protein-coding 215.333-181 chr7 16785154 16785573 + 0.666667 NA TTS (NM_014399) TTS (NM_014399) 19636 NM_006408 10551 Hs.530009 NM_006408 ENSG00000106541 AGR2 AG-2|AG2|GOB-4|HAG-2|HEL-S-116|HPC8|PDIA17|XAG-2 anterior gradient 2, protein disulphide isomerase family member protein-coding 119.333-163 chr4 96069302 96069501 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 229308 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 126.667-92 chr20 2428305 2428679 + 0.666667 NA intron (NM_198994, intron 10 of 12) MER5A|DNA|hAT-Charlie 34555 NR_003684 100113378 NR_003684 SNORD119 - small nucleolar RNA, C/D box 119 snoRNA 121.667-155 chr5 15070062 15070343 + 0.666667 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 196358 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 129.667-57 chr14 63275285 63275604 + 0.666667 NA intron (NM_020663, intron 2 of 4) intron (NM_020663, intron 2 of 4) 43491 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 151-135 chr9 89702355 89702657 + 0.666667 NA intron (NR_024280, intron 5 of 5) intron (NR_024280, intron 5 of 5) 62723 NR_024280 100129066 Hs.125947 NR_024280 ENSG00000237372 UNQ6494 - uncharacterized LOC100129066 ncRNA 114.333-191 chr6 40823113 40823314 + 0.666667 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 200067 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 149.667-25 chr1 111461780 111462127 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001688, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001688, exon 7 of 7) -12031 NM_174896 128346 Hs.288010 NM_174896 ENSG00000143110 C1orf162 - chromosome 1 open reading frame 162 protein-coding 122-22 chr11 109684872 109685165 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie 262828 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 111.667-68 chr12 112754119 112754318 + 0.666667 NA intron (NM_001347952, intron 1 of 21) MIRb|SINE|MIR -37320 NM_001347953 22895 Hs.21239 NM_014954 ENSG00000089169 RPH3A - rabphilin 3A protein-coding 125.333-2 chr1 42305981 42306207 + 0.666667 NA intron (NM_001198850, intron 2 of 12) intron (NM_001198850, intron 2 of 12) 28861 NM_001198851 22887 Hs.26023 NM_014947 ENSG00000198815 FOXJ3 - forkhead box J3 protein-coding 187.333-89 chr2 23759602 23760060 + 0.666667 NA intron (NR_125717, intron 25 of 28) intron (NR_125717, intron 25 of 28) 167292 NM_017552 54454 Hs.467862 NM_017552 ENSG00000119778 ATAD2B - ATPase family AAA domain containing 2B protein-coding 143-54 chr16 87088961 87089297 + 0.666667 NA Intergenic MER4D|LTR|ERV1 31345 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 122.333-13 chr1 170079416 170079779 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -4859 NM_001204514 22920 Hs.433442 NM_014970 ENSG00000075945 KIFAP3 FLA3|KAP-1|KAP-3|KAP3|SMAP|Smg-GDS|dJ190I16.1 kinesin associated protein 3 protein-coding 195-90 chr6 42748604 42749058 + 0.666667 NA intron (NM_001318819, intron 1 of 13) intron (NM_001318819, intron 1 of 13) 1844 NM_001318819 23506 Hs.658033 NM_015349 ENSG00000112624 BICRAL GLTSCR1L|KIAA0240 BRD4 interacting chromatin remodeling complex associated protein like protein-coding 190-60 chr2 40048974 40049273 + 0.666667 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 131489 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 120.667-144 chr5 107462346 107462701 + 0.666667 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 208414 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 134.333-49 chr14 59342583 59342832 + 0.666667 NA intron (NM_001270520, intron 16 of 24) intron (NM_001270520, intron 16 of 24) 79266 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 115.667-228 chr9 99437839 99438111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62718 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 112.667-258 chr7 141324609 141324826 + 0.666667 NA intron (NM_001195278, intron 2 of 3) intron (NM_001195278, intron 2 of 3) -226693 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 197-91 chr5 53924484 53924981 + 0.666667 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) 26867 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 178.333-88 chr2 187220972 187221410 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 227061 NM_001271751 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 149-113 chr5 30987554 30987844 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -205987 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 177-76 chr8 83254569 83255064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -148942 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 150.333-391 chr7 120804034 120804427 + 0.666667 NA intron (NM_012338, intron 7 of 7) intron (NM_012338, intron 7 of 7) 53914 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 152-53 chr14 46960860 46961163 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 8 of 16) L1MEd|LINE|L1 -309230 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 123.333-176 chr5 130146140 130146480 + 0.666667 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) L1MA6|LINE|L1 241845 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 129.667-60 chr14 68024610 68024876 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1PA16|LINE|L1 201151 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 117-129 chr7 15648634 15648837 + 0.666667 NA intron (NM_005924, intron 1 of 2) intron (NM_005924, intron 1 of 2) -19212 NR_134258 105375166 Hs.658822 NR_134258 ENSG00000237070 LOC105375166 - uncharacterized LOC105375166 ncRNA 145.667-125 chr2 10476733 10477146 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27211 NR_110597 101929715 Hs.634550 NR_110597 ODC1-DT lncRNA-MIF ODC1 divergent transcript ncRNA 127-36 chr15 99290959 99291238 + 0.666667 NA intron (NM_001321677, intron 5 of 8) intron (NM_001321677, intron 5 of 8) 33573 NR_073383 7190 Hs.656611 NR_073383 ENSG00000259706 HSP90B2P GRP94P1|GRP94b|HSP|HSPCP2|TRA1P1|TRAP1 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene pseudo 149-32 chr12 64325527 64325863 + 0.666667 NA intron (NM_001170633, intron 3 of 12) intron (NM_001170633, intron 3 of 12) 65063 NM_001170633 115749 Hs.535190 NM_001099676 ENSG00000185306 C12orf56 - chromosome 12 open reading frame 56 protein-coding 128-127 chr9 37397132 37397420 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -25420 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 147.667-34 chr10 39074592 39074857 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 378128 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 127.333-67 chr17 65773012 65773310 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) intron (NM_001353129, intron 21 of 26) 53290 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 175.333-110 chr22 32262005 32262404 + 0.666667 NA intron (NR_149072, intron 2 of 3) L1MA2|LINE|L1 -6857 NM_014227 6527 Hs.130101 NM_014227 ENSG00000100191 SLC5A4 DJ90G24.4|SAAT1|SGLT3 solute carrier family 5 member 4 protein-coding 154-153 chr9 134399954 134400302 + 0.666667 NA intron (NM_001291920, intron 1 of 9) intron (NM_001291920, intron 1 of 9) -6432 NM_001291921 6256 Hs.590886 NM_002957 ENSG00000186350 RXRA NR2B1 retinoid X receptor alpha protein-coding 147-25 chr11 131864709 131865148 + 0.666667 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) intron (NM_001352006, intron 2 of 9) -44996 NM_001352009 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 127-75 chr5 150107673 150107938 + 0.666667 NA intron (NM_005211, intron 1 of 21) MIRb|SINE|MIR 5567 NM_005211 1436 Hs.586219 NM_005211 ENSG00000182578 CSF1R C-FMS|CD115|CSF-1R|CSFR|FIM2|FMS|HDLS|M-CSF-R colony stimulating factor 1 receptor protein-coding 135-98 chr7 25787357 25787625 + 0.666667 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) 2628 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 182.333-73 chr2 7788043 7788520 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 111374 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 152.667-16 chr1 152572598 152573025 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6031 NM_178435 353145 Hs.490208 NM_178435 ENSG00000185966 LCE3E LEP17 late cornified envelope 3E protein-coding 167-3 chr1 73757072 73757517 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 82615 NR_146300 109729166 Hs.563902 NR_146300 LINC02238 - long intergenic non-protein coding RNA 2238 ncRNA 192.333-157 chr7 36405009 36405324 + 0.666667 NA intron (NM_001284302, intron 3 of 22) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -14809 NM_001100425 23366 Hs.6224 NM_015314 ENSG00000164542 KIAA0895 - KIAA0895 protein-coding 153-7 chr1 215666241 215666566 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 64 of 71) intron (NM_206933, intron 64 of 71) 99099 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 156.333-369 chr8 128534212 128534672 + 0.666667 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 30237 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 167-89 chr6 64116782 64117217 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) L1M2a|LINE|L1 310163 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 199.333-13 chr1 77204897 77205346 + 0.666667 NA intron (NM_005482, intron 3 of 10) intron (NM_005482, intron 3 of 10) 14309 NM_005482 10026 Hs.178305 NM_005482 ENSG00000142892 PIGK GPI8 phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K protein-coding 155-50 chr17 40401562 40401991 + 0.666667 NA intron (NM_001067, intron 20 of 34) L2a|LINE|L2 16120 NM_001067 7153 Hs.156346 NM_001067 ENSG00000131747 TOP2A TOP2|TP2A DNA topoisomerase II alpha protein-coding 203.667-76 chr3 30237398 30237852 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -281243 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 130.667-135 chr21 28710215 28710429 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 171004 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 165-46 chr20 14747187 14747563 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 182143 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 187-35 chr2 129378690 129379088 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104998 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 116.333-157 chr4 79667269 79667600 + 0.666667 NA Intergenic MER96B|DNA|hAT-Tip100 -160037 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 127.333-188 chr8 71929206 71929406 + 0.666667 NA intron (NR_033651, intron 1 of 2) L1PA7|LINE|L1 -84810 NM_005098 9242 Hs.442619 NM_005098 ENSG00000178860 MSC ABF-1|ABF1|MYOR|bHLHa22 musculin protein-coding 154.667-125 chr15 61001935 61002360 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 227155 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 134-49 chr2 59437217 59437549 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 219675 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 141.333-32 chr11 24297504 24297770 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -199416 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 175.667-151 chr9 96760771 96761076 + 0.666667 NA intron (NM_001314060, intron 4 of 4) intron (NM_001314060, intron 4 of 4) 17164 NM_001314059 22869 Hs.75264 NM_014930 ENSG00000081386 ZNF510 - zinc finger protein 510 protein-coding 142.333-184 chr4 83437970 83438278 + 0.666667 NA intron (NM_001297757, intron 7 of 16) intron (NM_001297757, intron 7 of 16) 17699 NM_133636 113510 Hs.480101 NM_133636 ENSG00000163312 HELQ HEL308 helicase, POLQ like protein-coding 158.333-72 chr12 130057646 130057920 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -13552 NR_146538 105370078 NR_146538 LINC02419 - long intergenic non-protein coding RNA 2419 ncRNA 213.667-27 chr12 13649108 13649564 + 0.666667 NA intron (NM_000834, intron 4 of 12) intron (NM_000834, intron 4 of 12) -272591 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 129.333-122 chr3 39158301 39158526 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3772 NM_001320560 64651 Hs.370950 NM_033027 ENSG00000144655 CSRNP1 AXUD1|CSRNP-1|FAM130B|TAIP-3|URAX1 cysteine and serine rich nuclear protein 1 protein-coding 164.667-246 chr8 124019514 124019865 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 16 of 40) L2b|LINE|L2 21093 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 162.333-218 chr6 72716031 72716403 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 85722 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 135-41 chr19 27809183 27809505 + 0.666667 NA intron (NR_146736, intron 2 of 2) AluSq2|SINE|Alu -15404 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 118.333-7 chr1 92769461 92769666 + 0.666667 NA intron (NM_001308248, intron 1 of 18) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 15545 NM_001350197 7813 Hs.594434 NM_005665 ENSG00000067208 EVI5 EVI-5|NB4S ecotropic viral integration site 5 protein-coding 177.667-93 chr3 184565243 184565669 + 0.666667 NA intron (NM_004443, intron 1 of 15) intron (NM_004443, intron 1 of 15) 3671 NM_004443 2049 Hs.2913 NM_004443 ENSG00000182580 EPHB3 EK2|ETK2|HEK2|TYRO6 EPH receptor B3 protein-coding 143-58 chr18 77794022 77794312 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 199560 NR_104127 101927715 Hs.385670 NR_104127 LINC01029 - long intergenic non-protein coding RNA 1029 ncRNA 138.667-122 chr21 10674836 10675195 + 0.666667 NA Intergenic (TTCCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 153501 NM_199260 7179 Hs.122986 NM_199259 ENSG00000274391 TPTE CT44|PTEN2 transmembrane phosphatase with tensin homology protein-coding 368.333 chr1 34392644 34393425 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 216127 NM_001134734 84970 Hs.194610 NM_032884 ENSG00000142698 C1orf94 - chromosome 1 open reading frame 94 protein-coding 152.667-172 chr2 38819478 38819736 + 0.666667 NA intron (NM_001329963, intron 17 of 23) intron (NM_001329963, intron 17 of 23) 41397 NM_024775 79833 Hs.143818 NM_024775 ENSG00000152147 GEMIN6 - gem nuclear organelle associated protein 6 protein-coding 149.333-106 chr14 28927386 28927684 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -141748 NR_135255 105370424 Hs.375809 NR_135255 ENSG00000257056 LINC02282 - long intergenic non-protein coding RNA 2282 ncRNA 134.667-135 chr3 81046493 81046876 + 0.666667 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 52816 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 115-105 chr21 45956576 45956815 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -16275 NR_109931 101928796 Hs.130919 NR_109931 LOC101928796 - uncharacterized LOC101928796 ncRNA 172.333-180 chr8 89839720 89840144 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61936 NM_004337 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 164-63 chr2 139526000 139526451 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 628901 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 169.333-198 chr5 16516777 16517221 + 0.666667 NA intron (NM_001034850, intron 3 of 8) intron (NM_001034850, intron 3 of 8) -8001 NM_019000 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 172.333-169 chr7 106132031 106132351 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -19615 NM_006754 6856 Hs.80919 NM_006754 ENSG00000008282 SYPL1 H-SP1|SYPL synaptophysin like 1 protein-coding 123.667-98 chr2 177822204 177822565 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 7 of 20) L1ME3A|LINE|L1 66372 NM_001077196 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 118.333-42 chr11 41821861 41822179 + 0.666667 NA intron (NR_120584, intron 3 of 5) intron (NR_120584, intron 3 of 5) 107452 NR_120584 102723644 Hs.564283 NR_120584 ENSG00000255171 LINC01499 - long intergenic non-protein coding RNA 1499 ncRNA 147.333-291 chr7 27920095 27920404 + 0.666667 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) 180154 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 126.667-67 chr18 9250821 9251031 + 0.666667 NA intron (NM_001204056, intron 7 of 11) L2|LINE|L2 -83847 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 194-11 chr10 117276625 117277043 + 0.666667 NA TTS (NM_173791) TTS (NM_173791) 35720 NM_003054 6571 Hs.596992 NM_003054 ENSG00000165646 SLC18A2 PKDYS2|SVAT|SVMT|VAT2|VMAT2 solute carrier family 18 member A2 protein-coding 117.667-7 chr1 145833658 145834005 + 0.666667 NA intron (NM_006468, intron 7 of 14) intron (NM_006468, intron 7 of 14) 9386 NM_001303456 10623 Hs.515768 NM_006468 ENSG00000186141 POLR3C RPC3|RPC62 RNA polymerase III subunit C protein-coding 114.667-49 chr11 46066231 46066442 + 0.666667 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) (TATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 54483 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 124-26 chr11 69531337 69531684 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 45949 NR_120544 101928292 Hs.736219 NR_120542 LINC01488 BRCAT8 long intergenic non-protein coding RNA 1488 ncRNA 159.333-301 chr7 7285755 7286125 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 30786 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 145.667-70 chr14 43134339 43134746 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 1372741 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 131.333-171 chr7 116703351 116703717 + 0.666667 NA intron (NM_000245, intron 2 of 20) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 31338 NM_000245 4233 Hs.132966 NM_000245 ENSG00000105976 MET AUTS9|DFNB97|HGFR|RCCP2|c-Met MET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 121.667-164 chr5 72884978 72885220 + 0.666667 NA intron (NM_001364293, intron 11 of 24) MIRb|SINE|MIR 6508 NR_039968 100616152 NR_039968 ENSG00000263593 MIR4804 - microRNA 4804 ncRNA 281-22 chr20 3315842 3316518 + 0.666667 NA intron (NM_001009984, intron 18 of 36) intron (NM_001009984, intron 18 of 36) -76990 NM_001363745 83959 Hs.105607 NM_032034 ENSG00000088836 SLC4A11 BTR1|CDPD1|CHED|CHED2|NABC1|dJ794I6.2 solute carrier family 4 member 11 protein-coding 115.667-11 chr1 171243877 171244155 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -4455 NM_001282694 2326 Hs.1424 NM_002021 ENSG00000010932 FMO1 - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 1 protein-coding 139-94 chr7 14270385 14270648 + 0.666667 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -279091 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 394.667-8 chr6 153515011 153515891 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -384169 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 228.333-50 chr2 105799638 105800260 + 0.666667 NA intron (NM_003581, intron 1 of 4) intron (NM_003581, intron 1 of 4) -51898 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 161.667-202 chr5 60357637 60357932 + 0.666667 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) 14879 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 189.333-14 chr1 96270291 96270713 + 0.666667 NA intron (NR_110693, intron 5 of 5) L1PA13|LINE|L1 103623 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 112.667-156 chr21 27307473 27307753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -340525 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 147.667-200 chr20 18482368 18482808 + 0.666667 NA intron (NR_104209, intron 9 of 9) MIRb|SINE|MIR 11973 NR_036160 100422875 NR_036160 ENSG00000265137 MIR3192 mir-3192 microRNA 3192 ncRNA 139-61 chr3 74399817 74400226 + 0.666667 NA intron (NM_020872, intron 4 of 21) L2c|LINE|L2 121119 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 117.333-47 chr13 73190268 73190574 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 131416 NM_001730 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 172-101 chr6 162392030 162392430 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 2 of 11) intron (NM_004562, intron 2 of 11) -334902 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 111.667-216 chr6 25462099 25462354 + 0.666667 NA intron (NM_001173977, intron 8 of 36) L1ME3B|LINE|L1 182852 NM_001173977 55604 Hs.649550 NM_017640 ENSG00000079691 CARMIL1 CARMIL|CARMIL1a|LRRC16|LRRC16A|dJ501N12.1|dJ501N12.5 capping protein regulator and myosin 1 linker 1 protein-coding 159-123 chr9 77574025 77574307 + 0.666667 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) intron (NM_004297, intron 1 of 6) 74156 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 159.667-103 chr14 81722937 81723349 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 19995 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 214.667-46 chr15 58446074 58446596 + 0.666667 NA intron (NR_120338, intron 2 of 2) AluSz6|SINE|Alu 14344 NM_000236 3990 Hs.654472 NM_000236 ENSG00000166035 LIPC HDLCQ12|HL|HTGL|LIPH lipase C, hepatic type protein-coding 126.333-110 chr22 18730516 18730727 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -3293 NR_136561 642643 NR_136561 ENSG00000182824 FAM230E LINC01662 family with sequence similarity 230 member E ncRNA 155-37 chr15 48601095 48601411 + 0.666667 NA intron (NM_000138, intron 4 of 65) intron (NM_000138, intron 4 of 65) 44535 NM_000138 2200 Hs.591133 NM_000138 ENSG00000166147 FBN1 ACMICD|ECTOL1|FBN|GPHYSD2|MASS|MFLS|MFS1|OCTD|SGS|SSKS|WMS|WMS2 fibrillin 1 protein-coding 116.333-123 chr2 143287197 143287394 + 0.666667 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 157876 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 112.333-80 chr15 41269747 41269982 + 0.666667 NA intron (NM_007236, intron 4 of 6) intron (NM_007236, intron 4 of 6) -14126 NR_152822 729082 Hs.380164 NR_026757 ENSG00000247556 OIP5-AS1 cyrano|linc-OIP5 OIP5 antisense RNA 1 ncRNA 157-48 chr16 71427001 71427314 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_146574) promoter-TSS (NR_146574) -693 NR_146574 105371333 Hs.578738 NR_146574 ENSG00000261348 LINC02136 - long intergenic non-protein coding RNA 2136 ncRNA 147.333-187 chr20 32857188 32857500 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1579 NM_001143967 388795 NM_001143967 ENSG00000215529 EFCAB8 - EF-hand calcium binding domain 8 protein-coding 185.667-74 chr2 150877415 150877819 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 248720 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 149-14 chr10 18526587 18526934 + 0.666667 NA intron (NM_201593, intron 9 of 13) L2c|LINE|L2 124827 NM_001351118 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 208.667-149 chr8 121396365 121396860 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -242734 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 115.333-182 chr5 179827859 179828104 + 0.666667 NA intron (NM_003900, intron 5 of 7).2 intron (NM_003900, intron 5 of 7).2 7076 NM_003900 8878 Hs.587290 NM_003900 ENSG00000161011 SQSTM1 A170|DMRV|FTDALS3|NADGP|OSIL|PDB3|ZIP3|p60|p62|p62B sequestosome 1 protein-coding 127.333-27 chr10 89522646 89522920 + 0.666667 NA intron (NM_213606, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 12811 NM_213606 387700 Hs.530338 NM_213606 ENSG00000152779 SLC16A12 CJMG|CRT2|CTRCT47|MCT12 solute carrier family 16 member 12 protein-coding 146.667-18 chr1 166170882 166171175 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4273 NR_135199 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 273-35 chr6 44422504 44422944 + 0.666667 NA exon (NM_001253, exon 10 of 16) exon (NM_001253, exon 10 of 16) -12917 NR_039785 100616352 NR_039785 ENSG00000266619 MIR4642 - microRNA 4642 ncRNA 148-11 chr1 178475605 178476022 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_170692, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_170692, exon 18 of 18) -37296 NM_032126 84066 Hs.534501 NM_032126 ENSG00000240021 TEX35 C1orf49|TSC24 testis expressed 35 protein-coding 131.667-12 chr1 190444716 190445075 + 0.666667 NA intron (NM_199051, intron 2 of 7) intron (NM_199051, intron 2 of 7) 31115 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 133-97 chrX 97287551 97287902 + 0.666667 NA intron (NM_007309, intron 23 of 26) (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 276809 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-122 chr15 58916581 58916907 + 0.666667 NA intron (NM_024755, intron 3 of 20) intron (NM_024755, intron 3 of 20) 16935 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 134-80 chr4 61539740 61540018 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 4 of 23) L1PA17|LINE|L1 337707 NM_001371342 142.667-5 chr1 77654859 77655210 + 0.666667 NA intron (NM_001308237, intron 1 of 13) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 27624 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 170-83 chr3 144698855 144699205 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 725949 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 180.333-60 chr2 209847766 209848215 + 0.666667 NA intron (NM_032504, intron 21 of 63) intron (NM_032504, intron 21 of 63) 75997 NM_032504 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 147-110 chr5 62723856 62724186 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145202 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 245.333-94 chr5 10451090 10451507 + 0.666667 NA intron (NM_001201466, intron 4 of 5) intron (NM_001201466, intron 4 of 5) 9419 NM_031916 83853 Hs.381089 NM_031916 ENSG00000145491 ROPN1L ASP|RSPH11 rhophilin associated tail protein 1 like protein-coding 157.333-365 chr9 105733794 105734193 + 0.666667 NA intron (NM_018112, intron 4 of 5) L1M2a|LINE|L1 39452 NM_018112 55151 Hs.411925 NM_018112 ENSG00000095209 TMEM38B C9orf87|D4Ertd89e|OI14|TRIC-B|TRICB|bA219P18.1 transmembrane protein 38B protein-coding 203-82 chr5 92427530 92427941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1044418 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 121.667-113 chr20 48338387 48338643 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -21396 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 121.667-98 chr2 171526521 171526864 + 0.666667 NA intron (NM_001127383, intron 1 of 2) intron (NM_001127383, intron 1 of 2) 4218 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 120.333-25 chr10 106516886 106517140 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 376848 NR_134330 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 117-60 chr17 58154735 58155006 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_012374) promoter-TSS (NM_012374) -284 NM_012374 26689 Hs.531188 NM_012374 ENSG00000141194 OR4D1 OR17-23|OR4D3|OR4D4P|TPCR16 olfactory receptor family 4 subfamily D member 1 protein-coding 141.333-155 chr3 103769408 103769659 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -245417 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 117-137 chr8 27067020 27067271 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -18182 NR_031680 100313884 NR_031680 ENSG00000221616 MIR548H4 MIR548H-4|MIRN548H4|hsa-mir-548h-4 microRNA 548h-4 ncRNA 145-15 chr11 11564674 11564958 + 0.666667 NA intron (NM_001363464, intron 1 of 9) MER3|DNA|hAT-Charlie 57189 NM_001363464 374378 Hs.655152 NM_198516 ENSG00000110328 GALNT18 GALNACT18|GALNT15|GALNTL4|GalNAc-T15|GalNAc-T18 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18 protein-coding 128-19 chr12 58636811 58637143 + 0.666667 NA intron (NR_120452, intron 1 of 7) L1MA7|LINE|L1 45275 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 210.333-142 chr6 26632210 26632673 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27305 NM_024639 79692 Hs.126280 NM_024639 ENSG00000181315 ZNF322 HCG12|ZNF322A|ZNF388|ZNF489 zinc finger protein 322 protein-coding 140.333-191 chr5 145170993 145171280 + 0.666667 NA Intergenic LTR89|LTR|ERVL? 664206 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 141.333-64 chr14 29705576 29705974 + 0.666667 NA intron (NM_001330069, intron 2 of 18) L1MB7|LINE|L1 221321 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 227.667-56 chr4 102744776 102745226 + 0.666667 NA intron (NM_005908, intron 1 of 16) HERVL-int|LTR|ERVL 15967 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 207-27 chr13 29572184 29572652 + 0.666667 NA intron (NM_003045, intron 1 of 12) intron (NM_003045, intron 1 of 12) 23270 NM_003045 6541 Hs.14846 NM_003045 ENSG00000139514 SLC7A1 ATRC1|CAT-1|ERR|HCAT1|REC1L solute carrier family 7 member 1 protein-coding 151.667-74 chr11 124515358 124515723 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28114 NM_001005195 219858 Hs.553634 NM_001005195 ENSG00000170953 OR8B12 OR11-317 olfactory receptor family 8 subfamily B member 12 protein-coding 149.333-227 chr22 45617914 45618229 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -12424 NR_131244 100506737 Hs.517692 NR_131244 ENSG00000238120 LINC01589 TCONS_00029353 long intergenic non-protein coding RNA 1589 ncRNA 126.667-184 chr9 92591440 92591755 + 0.666667 NA intron (NM_001286969, intron 4 of 6) intron (NM_001286969, intron 4 of 6) -8660 NM_001286971 401541 Hs.713775 NM_001012267 ENSG00000188312 CENPP CENP-P centromere protein P protein-coding 132-75 chr21 17348007 17348378 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -90698 NR_037585 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 174.333-134 chr6 135895602 135895985 + 0.666667 NA intron (NM_018945, intron 1 of 12) intron (NM_018945, intron 1 of 12) 44092 NM_018945 27115 Hs.744230 NM_018945 ENSG00000171408 PDE7B bA472E5.1 phosphodiesterase 7B protein-coding 116-57 chr16 50782363 50782537 + 0.666667 NA exon (NM_001042412, exon 10 of 18) exon (NM_001042412, exon 10 of 18) -24222 NR_146573 105371252 NR_146573 ENSG00000261703 LINC02168 - long intergenic non-protein coding RNA 2168 ncRNA 234-32 chr18 70253326 70253937 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35414 NM_004232 9306 Hs.44439 NM_004232 ENSG00000170677 SOCS6 CIS-4|CIS4|HSPC060|SOCS-4|SOCS-6|SOCS4|SSI4|STAI4|STATI4 suppressor of cytokine signaling 6 protein-coding 155.667-393 chr9 118765546 118765927 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 86065 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 141.333-209 chr6 51822673 51822980 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 52 of 66) intron (NM_138694, intron 52 of 66) 200956 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 169.333-194 chr5 969582 969930 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27584 NR_104614 100506688 Hs.532063 NM_001242737 ENSG00000215246 LOC100506688 - uncharacterized LOC100506688 ncRNA 149-66 chr2 42603198 42603594 + 0.666667 NA intron (NM_001330443, intron 3 of 16) intron (NM_001330443, intron 3 of 16) 34764 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 175.667-135 chr7 103470271 103470743 + 0.666667 NA intron (NR_110141, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu -24300 NM_206885 375611 Hs.585146 NM_198999 ENSG00000170615 SLC26A5 DFNB61|PRES solute carrier family 26 member 5 protein-coding 151-109 chr5 78477161 78477462 + 0.666667 NA non-coding (NR_110885, exon 8 of 8) non-coding (NR_110885, exon 8 of 8) 116694 NR_110885 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 140.667-71 chr14 22053414 22053823 + 0.666667 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 379135 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 113.667-217 chr8 131400364 131400605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -359575 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 125.333-187 chr9 76167678 76167912 + 0.666667 NA intron (NR_120409, intron 11 of 19) MamRep605|LTR?|LTR? 226631 NM_018339 55312 Hs.37558 NM_018339 ENSG00000135002 RFK RIFK riboflavin kinase protein-coding 129.667-59 chr14 66239594 66239820 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -246664 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 127.667-184 chr8 123219548 123219799 + 0.666667 NA TTS (NM_032847) TTS (NM_032847) -3810 NR_039808 100616260 NR_039808 ENSG00000266324 MIR4663 - microRNA 4663 ncRNA 206.333-177 chrX 68080038 68080642 + 0.666667 NA intron (NM_002547, intron 19 of 24) intron (NM_002547, intron 19 of 24) 353155 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 141-94 chr8 117325828 117326078 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 190958 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 133.667-108 chr4 35780066 35780412 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 463700 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 134.333-68 chr16 55142816 55143107 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -181598 NM_024335 79190 Hs.369907 NM_024335 ENSG00000159387 IRX6 IRX-3|IRX7|IRXB3 iroquois homeobox 6 protein-coding 137.667-152 chr5 101966363 101966729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 329738 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 138.667-54 chr13 64812336 64812634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -736474 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 142-163 chr9 38330394 38330794 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62108 NM_000692 219 Hs.436219 NM_000692 ENSG00000137124 ALDH1B1 ALDH5|ALDHX aldehyde dehydrogenase 1 family member B1 protein-coding 140-108 chr7 78042491 78042878 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 20 of 20) MIR|SINE|MIR 202554 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 173-34 chr17 67946406 67946756 + 0.666667 NA intron (NM_182641, intron 21 of 27) intron (NM_182641, intron 21 of 27) 47025 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 111.667-111 chr18 621774 622015 + 0.666667 NA intron (NM_199167, intron 3 of 8) intron (NM_199167, intron 3 of 8) 5194 NM_199167 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 161-35 chr17 61273019 61273412 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) AluJb|SINE|Alu 94489 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 149.333-299 chr5 8363797 8364072 + 0.666667 NA intron (NR_039984, intron 3 of 5) intron (NR_039984, intron 3 of 5) 93630 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 119-18 chr10 72517022 72517295 + 0.666667 NA intron (NM_006077, intron 5 of 11) intron (NM_006077, intron 5 of 11) 6828 NM_001195519 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 130.333-4 chr1 31116644 31116890 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -51050 NM_001020658 9698 Hs.281707 NM_014676 ENSG00000134644 PUM1 HSPUM|PUMH|PUMH1|PUML1|SCA47 pumilio RNA binding family member 1 protein-coding 258.666-47 chr8 117770584 117771331 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 149956 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 121.667-158 chr5 37830347 37830686 + 0.666667 NA intron (NM_001278098, intron 1 of 2) intron (NM_001278098, intron 1 of 2) 4306 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 177.667-52 chr15 33114392 33114770 + 0.666667 NA intron (NM_001277313, intron 4 of 20) intron (NM_001277313, intron 4 of 20) -46407 NM_001103184 342184 Hs.657649 NM_198500 ENSG00000248905 FMN1 FMN|LD formin 1 protein-coding 191-13 chr12 10093216 10093701 + 0.666667 NA intron (NM_001297750, intron 1 of 6) intron (NM_001297750, intron 1 of 6) 5527 NM_001297750 51267 Hs.29549 NM_016511 ENSG00000150048 CLEC1A CLEC-1|CLEC1 C-type lectin domain family 1 member A protein-coding 202-80 chr2 57369173 57369660 + 0.666667 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 -538235 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 134.333-147 chr6 9614779 9615054 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -789586 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 188.333-105 chr4 42921001 42921417 + 0.666667 NA intron (NM_001080476, intron 1 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 27943 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 116-129 chr5 139641819 139642055 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5362 NM_001317201 51523 Hs.189119 NM_016463 ENSG00000171604 CXXC5 CF5|HSPC195|RINF|WID CXXC finger protein 5 protein-coding 119.333-50 chr11 57498231 57498469 + 0.666667 NA intron (NM_001198810, intron 5 of 14) AluSz|SINE|Alu 16559 NM_001198810 8501 Hs.591952 NM_003627 ENSG00000149150 SLC43A1 LAT3|PB39|POV1|R00504 solute carrier family 43 member 1 protein-coding 127-41 chr18 43136462 43136798 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20938 NM_001272077 6014 Hs.464985 NM_002930 ENSG00000152214 RIT2 RIBA|RIN|ROC2 Ras like without CAAX 2 protein-coding 192.333-129 chr4 93480815 93481273 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 10 of 14) ERVL-E-int|LTR|ERVL -347709 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 189.333-213 chr8 137467747 137468185 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54378 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 170.333-165 chr4 166853959 166854408 + 0.666667 NA intron (NM_001040159, intron 6 of 10) intron (NM_001040159, intron 6 of 10) 380243 NM_001204353 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 159-67 chr2 187468550 187468911 + 0.666667 NA intron (NM_006287, intron 6 of 7) intron (NM_006287, intron 6 of 7) -20478 NM_001369435 10203 Hs.470882 NM_005795 ENSG00000064989 CALCRL CGRPR|CRLR calcitonin receptor like receptor protein-coding 142-106 chr4 87092950 87093346 + 0.666667 NA intron (NM_005935, intron 6 of 19) intron (NM_005935, intron 6 of 19) 86147 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 166-7 chr1 90121997 90122334 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 127055 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 122-23 chr11 131828473 131828765 + 0.666667 NA intron (NM_001352006, intron 2 of 9) (CAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -81305 NM_001352009 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 115-18 chr1 200833120 200833339 + 0.666667 NA intron (NM_001297707, intron 7 of 17) intron (NM_001297707, intron 7 of 17) -39752 NM_005298 2848 Hs.534316 NM_005298 ENSG00000170128 GPR25 - G protein-coupled receptor 25 protein-coding 212.667-108 chr5 102152964 102153434 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 143085 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 211-26 chr13 28074480 28075001 + 0.666667 NA intron (NM_004119, intron 1 of 23) AluJb|SINE|Alu 25836 NR_130706 2322 Hs.507590 NM_004119 ENSG00000122025 FLT3 CD135|FLK-2|FLK2|STK1 fms related tyrosine kinase 3 protein-coding 164.333-213 chr6 84731806 84732230 + 0.666667 NA TTS (NM_001080508) TTS (NM_001080508) 32580 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 127.333-185 chr8 39996097 39996295 + 0.666667 NA intron (NM_194294, intron 8 of 10) LTR13|LTR|ERVK 61241 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 138.667-111 chr2 140097320 140097573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 489239 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 139-100 chr7 148087685 148087934 + 0.666667 NA intron (NM_014141, intron 14 of 22) intron (NM_014141, intron 14 of 22) 416130 NR_133930 105375556 Hs.667432 NR_133929 ENSG00000230190 LOC105375556 - uncharacterized LOC105375556 ncRNA 193.333-72 chr16 85530529 85530856 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -80717 NM_001134473 23199 Hs.461647 NM_014615 ENSG00000131149 GSE1 CRHSP24|KIAA0182 Gse1 coiled-coil protein protein-coding 165-43 chr2 172900175 172900539 + 0.666667 NA intron (NM_001282899, intron 1 of 27) AluJr4|SINE|Alu -27848 NM_001282901 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 143.667-181 chr4 69730792 69731061 + 0.666667 NA intron (NM_014465, intron 6 of 7) intron (NM_014465, intron 6 of 7) 29694 NM_014465 27284 Hs.129742 NM_014465 ENSG00000173597 SULT1B1 ST1B1|ST1B2|SULT1B2 sulfotransferase family 1B member 1 protein-coding 127-4 chr1 42398377 42398603 + 0.666667 NA intron (NM_173642, intron 1 of 4) L1ME4a|LINE|L1 17698 NM_173642 284716 Hs.420244 NM_173642 ENSG00000177181 RIMKLA FAM80A|NAAGS|NAAGS-II ribosomal modification protein rimK like family member A protein-coding 174-46 chr19 37821184 37821545 + 0.666667 NA intron (NR_040013, intron 3 of 4) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 3953 NR_040013 644554 Hs.683930 NR_040013 LOC644554 - uncharacterized LOC644554 ncRNA 129.667-108 chr2 221117446 221117804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 454679 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 118.667-77 chr15 99599081 99599414 + 0.666667 NA intron (NM_001319206, intron 2 of 11) intron (NM_001319206, intron 2 of 11) 32764 NM_001352616 4205 Hs.268675 NM_005587 ENSG00000068305 MEF2A ADCAD1|RSRFC4|RSRFC9|mef2 myocyte enhancer factor 2A protein-coding 124.667-10 chr1 107857943 107858221 + 0.666667 NA intron (NM_006113, intron 2 of 26) intron (NM_006113, intron 2 of 26) -39141 NR_107006 102465839 NR_107006 ENSG00000275455 MIR7852 hsa-mir-7852 microRNA 7852 ncRNA 119.333-205 chr7 158531281 158531528 + 0.666667 NA intron (NM_130843, intron 1 of 21) intron (NM_130843, intron 1 of 21) 1409 NR_030325 693180 NR_030325 ENSG00000207637 MIR595 MIRN595|hsa-mir-595 microRNA 595 ncRNA 133.667-48 chr14 42596395 42596737 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 989710 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 179.333-11 chr1 187321921 187322302 + 0.666667 NA intron (NR_126347, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 -121517 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 132.333-190 chr9 104089799 104090190 + 0.666667 NA intron (NR_121580, intron 1 of 2) intron (NR_121580, intron 1 of 2) 2480 NR_121580 101928550 Hs.144722 NR_121580 ENSG00000270332 SMC2-AS1 - SMC2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 113.667-233 chrUn_KI270438v1 108615 108820 + 0.666667 NA NA (GGAATGGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat NA NA 167-41 chr15 50295761 50296214 + 0.666667 NA intron (NM_016654, intron 6 of 8) intron (NM_016654, intron 6 of 8) -30261 NM_002112 3067 Hs.1481 NM_002112 ENSG00000140287 HDC - histidine decarboxylase protein-coding 129.667-154 chr6 124029627 124029987 + 0.666667 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) MER1A|DNA|hAT-Charlie 225942 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 120-15 chr10 97918634 97918948 + 0.666667 NA intron (NM_001206528, intron 4 of 14) AluSz|SINE|Alu -42894 NR_162124 113839520 NR_162124 MIR3085 - microRNA 3085 ncRNA 244-8 chr1 109666099 109666667 + 0.666667 NA TTS (NM_147148) TTS (NM_147148) -1639 NM_001142368 2946 Hs.279837 NM_000848 ENSG00000213366 GSTM2 GST4|GSTM|GSTM2-2|GTHMUS glutathione S-transferase mu 2 protein-coding 170-55 chr19 34906955 34907368 + 0.666667 NA intron (NR_146451, intron 1 of 1) AluSc|SINE|Alu 1846 NR_146451 100652911 Hs.292009 NR_146451 ENSG00000269037 LINC01838 - long intergenic non-protein coding RNA 1838 ncRNA 191.667-136 chrX 36410224 36410666 + 0.666667 NA intron (NR_110412, intron 5 of 7) L1M1|LINE|L1 29847 NR_110412 101928627 Hs.590831 NR_110412 ENSG00000226484 LOC101928627 - uncharacterized LOC101928627 ncRNA 235.333-116 chr7 112542419 112542970 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 61703 NM_182597 286006 Hs.396189 NM_182597 ENSG00000181016 LSMEM1 C7orf53 leucine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 192-8 chr1 110482137 110482557 + 0.666667 NA intron (NR_003599, intron 1 of 8) L2c|LINE|L2 1581 NR_003599 643160 Hs.532720 NR_003599 ENSG00000240194 CYMP - chymosin pseudogene pseudo 137-16 chr11 28803590 28803902 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -326198 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 186-67 chr3 123438718 123439230 + 0.666667 NA intron (NM_183357, intron 1 of 20) AluJr|SINE|Alu 9571 NM_183357 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 140-120 chr8 109969696 109969974 + 0.666667 NA intron (NM_014379, intron 3 of 3) AluSg|SINE|Alu 5936 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 123-60 chr18 36422573 36422772 + 0.666667 NA intron (NM_001281740, intron 3 of 28) intron (NM_001281740, intron 3 of 28) 124959 NM_001281739 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 174-72 chr4 105822198 105822551 + 0.666667 NA intron (NR_125927, intron 2 of 3) intron (NR_125927, intron 2 of 3) 4798 NR_125927 101929529 Hs.603751 NR_125927 ENSG00000251175 LOC101929529 - uncharacterized LOC101929529 ncRNA 148-161 chr8 126911393 126911686 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101615 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 119.667-94 chr2 205359690 205359982 + 0.666667 NA intron (NM_205863, intron 18 of 21) L1ME5|LINE|L1 -322664 NM_201264 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 122.667-216 chrX 66885449 66885769 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -246311 NM_001199687 60401 Hs.302017 NM_021783 ENSG00000131080 EDA2R EDA-A2R|EDAA2R|TNFRSF27|XEDAR ectodysplasin A2 receptor protein-coding 146.333-189 chr22 34115282 34115684 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -192595 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 158.333-63 chr12 39269448 39269857 + 0.666667 NA Intergenic Charlie8|DNA|hAT-Charlie 173468 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 126-8 chr10 14390692 14391026 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7582 NR_036181 100422843 NR_036181 ENSG00000266321 MIR4293 - microRNA 4293 ncRNA 210.667-118 chr7 25720764 25721162 + 0.666667 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) intron (NR_157808, intron 1 of 4) 30069 NR_157815 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 133-78 chr5 98859611 98859989 + 0.666667 NA intron (NM_001364113, intron 34 of 36) L1MC4a|LINE|L1 66734 NM_001270 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 148.667-413 chrX 154998300 154998675 + 0.666667 NA intron (NM_000132, intron 2 of 25) LTR78B|LTR|ERV1 24236 NM_000132 2157 Hs.632836 NM_000132 ENSG00000185010 F8 AHF|DXS1253E|F8B|F8C|FVIII|HEMA coagulation factor VIII protein-coding 183.667-74 chr2 81407717 81408038 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 59069 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 229-32 chr2 171395627 171396152 + 0.666667 NA intron (NM_024770, intron 1 of 9) L1MEc|LINE|L1 38101 NM_001321155 79828 Hs.135146 NM_024770 ENSG00000123600 METTL8 TIP methyltransferase like 8 protein-coding 169.333-176 chr4 47694513 47694889 + 0.666667 NA intron (NM_006587, intron 5 of 21) L2b|LINE|L2 42032 NR_107020 102467004 NR_107020 ENSG00000277388 MIR8053 hsa-mir-8053 microRNA 8053 ncRNA 183.333-75 chr18 30818490 30818887 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 224054 NM_001941 1825 Hs.41690 NM_001941 ENSG00000134762 DSC3 CDHF3|DSC|DSC1|DSC2|DSC4|HT-CP desmocollin 3 protein-coding 173-101 chr9 21114261 21114611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27465 NM_002177 3467 Hs.73010 NM_002177 ENSG00000177047 IFNW1 - interferon omega 1 protein-coding 170.667-63 chr17 60661634 60661920 + 0.666667 NA intron (NM_003620, intron 5 of 5) intron (NM_003620, intron 5 of 5) -16074 NM_001099432 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 218-11 chr10 73555091 73555587 + 0.666667 NA intron (NR_146997, intron 4 of 21) intron (NR_146997, intron 4 of 21) -1999 NR_135250 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 160-27 chr11 90860864 90861197 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 6 of 6) L1ME1|LINE|L1 8172 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 152.333-13 chr1 75902487 75902898 + 0.666667 NA intron (NM_002440, intron 19 of 19) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 29712 NM_080868 127247 Hs.125423 NM_080868 ENSG00000154007 ASB17 Asb-17 ankyrin repeat and SOCS box containing 17 protein-coding 114-123 chr5 120027228 120027487 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 397798 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 157.333-46 chr10 54785325 54785666 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) 15736 NM_001142763 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 118.667-128 chr22 35191935 35192256 + 0.666667 NA intron (NR_126356, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 38961 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 146.333-195 chr3 27777462 27777895 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -19910 NR_146630 105377007 NR_146630 LINC01980 - long intergenic non-protein coding RNA 1980 ncRNA 187.667-4 chr1 78063763 78064135 + 0.666667 NA intron (NM_017655, intron 1 of 5) intron (NM_017655, intron 1 of 5) 17983 NM_017655 54810 Hs.603818 NM_017655 ENSG00000137960 GIPC2 SEMCAP-2|SEMCAP2 GIPC PDZ domain containing family member 2 protein-coding 225.333-46 chr14 54703781 54704349 + 0.666667 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) intron (NM_001161576, intron 2 of 10) -50768 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 152.333-354 chr7 64934815 64935212 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 31771 NR_003099 10793 Hs.520889 NM_021148 ENSG00000198039 ZNF273 HZF9 zinc finger protein 273 protein-coding 202.333-57 chr14 59438818 59439308 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26317 NM_022571 64582 Hs.647573 NM_022571 ENSG00000181619 GPR135 HUMNPIIY20 G protein-coupled receptor 135 protein-coding 169-83 chr5 63231876 63232226 + 0.666667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 653232 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 161.667-94 chr16 28134764 28135103 + 0.666667 NA intron (NM_001270940, intron 11 of 24) intron (NM_001270940, intron 11 of 24) -71219 NM_001323901 146395 Hs.91910 NM_144675 ENSG00000169181 GSG1L PRO19651 GSG1 like protein-coding 193 chr1 9048023 9048390 + 0.666667 NA intron (NM_003039, intron 3 of 11) L1M5|LINE|L1 21429 NM_001328620 6518 Hs.530003 NM_003039 ENSG00000142583 SLC2A5 GLUT-5|GLUT5 solute carrier family 2 member 5 protein-coding 165.667-170 chr5 175764365 175764769 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -31966 NM_006650 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 158.667-41 chr10 62803747 62804195 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_032804) promoter-TSS (NM_032804) -749 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 223.333-90 chr20 34787575 34788126 + 0.666667 NA intron (NM_001318240, intron 3 of 15) MER66B|LTR|ERV1 -5446 NM_001242539 23054 Hs.368971 NM_014071 ENSG00000198646 NCOA6 AIB3|ASC2|NRC|PRIP|RAP250|TRBP nuclear receptor coactivator 6 protein-coding 148.667-181 chr2 50895248 50895549 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) MIR3|SINE|MIR 136734 NM_001330081 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 120.667-78 chr18 3084175 3084443 + 0.666667 NA intron (NM_019856, intron 30 of 36) intron (NM_019856, intron 30 of 36) -72362 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 134-20 chr11 112134132 112134444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29806 NM_001243211 3606 Hs.83077 NM_001562 ENSG00000150782 IL18 IGIF|IL-18|IL-1g|IL1F4 interleukin 18 protein-coding 161-99 chr8 89034996 89035326 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -707678 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 215.333-50 chr13 82612849 82613354 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1269292 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 215-6 chr10 28963705 28964189 + 0.666667 NA Intergenic MER70A|LTR|ERVL 117539 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 153-2 chr1 44138444 44138801 + 0.666667 NA intron (NM_001358438, intron 1 of 1) intron (NM_001358438, intron 1 of 1) 3009 NM_001358438 105378952 NM_001358438 ENSG00000283039 KLF18 - Kruppel like factor 18 protein-coding 204.333-105 chr2 160364664 160365272 + 0.666667 NA intron (NM_002897, intron 2 of 13) L3|LINE|CR1 42914 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 118.667-142 chr3 147513188 147513393 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91963 NR_121655 440982 Hs.535724 NR_121655 LOC440982 - uncharacterized LOC440982 ncRNA 168-119 chr9 30205853 30206196 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 202430 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 190-113 chr7 33691033 33691465 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -213666 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 141.333-178 chr4 88435701 88435976 + 0.666667 NA exon (NM_017912, exon 18 of 23) exon (NM_017912, exon 18 of 23) -21281 NM_016323 51191 Hs.26663 NM_016323 ENSG00000138646 HERC5 CEB1|CEBP1 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5 protein-coding 139.333-129 chr2 236745095 236745408 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 175426 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 165.667-76 chr17 81164870 81165251 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001354639) promoter-TSS (NM_001354639) -447 NM_001354639 388428 Hs.591202 NM_207389 ENSG00000225180 PVALEF AATK-AS1 parvalbumin like EF-hand containing protein-coding 138.333-60 chr14 54264605 54264951 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132090 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 144-94 chr21 30056932 30057211 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 109734 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 187.333-116 chr20 32504648 32505068 + 0.666667 NA intron (NM_001256798, intron 4 of 10) AluSc|SINE|Alu -5101 NR_110619 101929698 Hs.638392 NR_110619 ENSG00000277301 LOC101929698 - uncharacterized LOC101929698 ncRNA 119.333-158 chr3 191561032 191561304 + 0.666667 NA intron (NR_120606, intron 4 of 6) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 100005 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 186.667-41 chr14 74125771 74126173 + 0.666667 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) L1PA4|LINE|L1 41019 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 203-90 chr5 176382332 176382853 + 0.666667 NA TTS (NM_173664) TTS (NM_173664) 6006 NM_001291308 51491 Hs.696283 NM_016391 ENSG00000048162 NOP16 HSPC111|HSPC185 NOP16 nucleolar protein protein-coding 131.333-13 chr1 167388115 167388476 + 0.666667 NA intron (NM_001198783, intron 8 of 15) L1ME4c|LINE|L1 59225 NM_001198783 5451 Hs.283402 NM_002697 ENSG00000143190 POU2F1 OCT1|OTF1|oct-1B POU class 2 homeobox 1 protein-coding 225.333-104 chr4 107262839 107263291 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -226752 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 141.667-226 chr8 87777049 87777342 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96820 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 155-69 chr2 125153205 125153564 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 964601 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 113-40 chr12 22947144 22947317 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -228406 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 132-53 chr18 1887191 1887474 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -527703 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 149.333-89 chr12 42643342 42643704 + 0.666667 NA intron (NR_110042, intron 2 of 5) AluSx|SINE|Alu 2975 NR_110042 101927058 Hs.434238 NR_110042 ENSG00000257510 LINC02402 - long intergenic non-protein coding RNA 2402 ncRNA 194.333-19 chr10 39035623 39036054 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 339242 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 154 chr1 32632976 32633414 + 0.666667 NA intron (NR_158774, intron 3 of 6) intron (NR_158774, intron 3 of 6) 17355 NM_001366278 339487 Hs.655921 NM_178547 ENSG00000176261 ZBTB8OS ARCH|ARCH2 zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand protein-coding 117.333-173 chr5 102211490 102211816 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 84631 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 114.667-206 chr5 55831935 55832130 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19325 NM_001297572 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 149.333-288 chr4 101914584 101914921 + 0.666667 NA intron (NM_017935, intron 6 of 16) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 100910 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 152-4 chr1 96239145 96239549 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 134778 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 215.667-81 chr3 27775410 27775921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21923 NR_146630 105377007 NR_146630 LINC01980 - long intergenic non-protein coding RNA 1980 ncRNA 205-3 chr1 37905073 37905498 + 0.666667 NA intron (NR_158630, intron 7 of 24) AluSx|SINE|Alu 26454 NM_001350227 3633 Hs.449942 NM_005540 ENSG00000204084 INPP5B 5PTase inositol polyphosphate-5-phosphatase B protein-coding 169-57 chr21 15998595 15999037 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71672 NR_136541 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 170-62 chr2 104278727 104279124 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 129407 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 153-65 chr18 2760931 2761303 + 0.666667 NA intron (NM_015295, intron 35 of 47) L1PA17|LINE|L1 -85889 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 140.667-117 chr2 55350437 55350851 + 0.666667 NA intron (NM_001254943, intron 8 of 33) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 68325 NR_027258 344405 Hs.445292 NM_001080459 ENSG00000162997 PRORSD1P NCRNA00117|PRDXDD1P|Prdxdd1|Ybakd1 prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1, pseudogene pseudo 185-78 chr8 126933240 126933621 + 0.666667 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -79724 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 121.667-49 chr12 94134003 94134325 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14413 NM_005761 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 157.333-60 chr10 111216299 111216704 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 102210 NR_159949 113633881 NR_159949 HEAT2 lnc-ADRA2A-1:1 HEart disease Associated Transcript 2 ncRNA 164-14 chr10 51713869 51714207 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) AluY|SINE|Alu -14443 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 168.333-132 chr3 144752012 144752365 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 779107 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 179-98 chr8 116034025 116034409 + 0.666667 NA intron (NR_046215, intron 7 of 13) L1MC3|LINE|L1 290842 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 125.667-30 chr11 4897281 4897488 + 0.666667 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -9986 NM_001004749 119687 Hs.553560 NM_001004749 ENSG00000176895 OR51A7 OR11-27 olfactory receptor family 51 subfamily A member 7 protein-coding 145-16 chr11 20753124 20753549 + 0.666667 NA intron (NM_201551, intron 2 of 18) L3|LINE|CR1 83750 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 179.333-4 chr1 50483641 50483996 + 0.666667 NA intron (NM_007051, intron 17 of 18) L2a|LINE|L2 -60375 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 113-116 chr2 209112414 209112748 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -311466 NM_001039538 4133 Hs.368281 NM_002374 ENSG00000078018 MAP2 MAP-2|MAP2A|MAP2B|MAP2C microtubule associated protein 2 protein-coding 201-21 chr10 100405091 100405520 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 31729 NR_026762 90271 Hs.628088 NR_026762 ENSG00000235823 OLMALINC C10orf75|HI-LNC80|LINC00263|NCRNA00263|OLMALINCAS oligodendrocyte maturation-associated long intergenic non-coding RNA ncRNA 137 chr1 14206196 14206518 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 213616 NR_149058 105376762 Hs.568591 NR_149058 KAZN-AS1 - KAZN antisense RNA 1 ncRNA 147-119 chr6 52486995 52487420 + 0.666667 NA intron (NR_033327, intron 8 of 9) MER58A|DNA|hAT-Charlie 66199 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 148-66 chr18 75943457 75943811 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -179364 NR_040034 339298 Hs.151215 NR_040034 ENSG00000263547 LOC339298 - uncharacterized LOC339298 ncRNA 144-81 chr2 218699949 218700254 + 0.666667 NA intron (NM_001369423, intron 26 of 26) AluSp|SINE|Alu -10734 NM_014640 9654 Hs.471405 NM_014640 ENSG00000135912 TTLL4 - tubulin tyrosine ligase like 4 protein-coding 136-14 chr12 847252 847513 + 0.666667 NA intron (NM_001184985, intron 4 of 27) intron (NM_001184985, intron 4 of 27) 85694 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 126.333-188 chr9 79966010 79966311 + 0.666667 NA intron (NR_121213, intron 1 of 2) ORSL-2b|DNA|hAT-Tip100 -8863 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 187.333-97 chr2 63849487 63849894 + 0.666667 NA intron (NM_006759, intron 1 of 9) intron (NM_006759, intron 1 of 9) 7810 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 153.667-33 chr10 2344758 2345155 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -29882 NR_038884 399708 Hs.521270 NR_038884 LINC00701 - long intergenic non-protein coding RNA 701 ncRNA 151.667-197 chr21 32675694 32676007 + 0.666667 NA intron (NM_001160306, intron 12 of 27) intron (NM_001160306, intron 12 of 27) 52071 NM_001160306 8867 Hs.473632 NM_003895 ENSG00000159082 SYNJ1 EIEE53|INPP5G|PARK20 synaptojanin 1 protein-coding 141.667-60 chr12 98890047 98890355 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) intron (NM_152788, intron 17 of 25) 4573 NM_001352220 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 121.333-113 chr3 106282169 106282526 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -412946 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 180.667-113 chr5 83300060 83300475 + 0.666667 NA intron (NM_022550, intron 7 of 7) intron (NM_022550, intron 7 of 7) -171407 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 148.667-254 chr3 81075876 81076192 + 0.666667 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) intron (NR_132411, intron 1 of 1) 82166 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 118.333-71 chr15 36964166 36964380 + 0.666667 NA intron (NM_172316, intron 8 of 12) L2a|LINE|L2 8628 NR_107030 102466875 NR_107030 ENSG00000277202 MIR8063 hsa-mir-8063 microRNA 8063 ncRNA 144-89 chr20 53952187 53952456 + 0.666667 NA intron (NM_001366297, intron 8 of 8) L2b|LINE|L2 -76612 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 160.667-328 chr9 111191636 111192085 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL 79354 NR_106989 102465800 NR_106989 ENSG00000274263 MIR7702 hsa-mir-7702 microRNA 7702 ncRNA 115.333-52 chr12 106317971 106318170 + 0.666667 NA intron (NM_152772, intron 3 of 9) intron (NM_152772, intron 3 of 9) 15337 NM_152772 255394 Hs.696047 NM_152772 ENSG00000166046 TCP11L2 - t-complex 11 like 2 protein-coding 119-6 chr1 115984597 115984913 + 0.666667 NA intron (NM_018420, intron 1 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -7479 NR_125970 101928977 Hs.627914 NR_125970 LOC101928977 - uncharacterized LOC101928977 ncRNA 167.333-145 chr2 188853939 188854298 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63995 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 113.333-136 chr2 166578904 166579098 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -92030 NM_002976 6332 Hs.596087 NM_002976 ENSG00000136546 SCN7A NaG|Nav2.1|Nav2.2|SCN6A sodium voltage-gated channel alpha subunit 7 protein-coding 212.667-4 chr1 79760078 79760612 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -753615 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 201.667-94 chr5 62928915 62929345 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 350311 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 281.333-60 chr7 31734203 31734829 + 0.666667 NA Intergenic MER119|DNA|hAT-Charlie 47301 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 128-108 chr7 47938538 47938755 + 0.666667 NA intron (NM_138295, intron 3 of 56) intron (NM_138295, intron 3 of 56) 9845 NM_138295 168507 Hs.195979 NM_138295 ENSG00000158683 PKD1L1 HTX8|PRO19563 polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting protein-coding 159-124 chr9 130924051 130924350 + 0.666667 NA intron (NM_001145106, intron 4 of 7) intron (NM_001145106, intron 4 of 7) 14868 NM_001145106 84929 Hs.133205 NM_032843 ENSG00000130720 FIBCD1 - fibrinogen C domain containing 1 protein-coding 136.333-76 chr17 685320 685646 + 0.666667 NA intron (NM_001366254, intron 4 of 19).2 MER47A|DNA|TcMar-Tigger 29356 NM_001128159 55275 Hs.461819 NM_018289 ENSG00000141252 VPS53 HCCS1|PCH2E|hVps53L|pp13624 VPS53 subunit of GARP complex protein-coding 141-99 chr9 84456645 84456963 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88077 NM_022127 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 238.333-44 chr2 48988225 48988850 + 0.666667 NA intron (NM_181446, intron 5 of 8) intron (NM_181446, intron 5 of 8) -71066 NR_107011 102465854 NR_107011 ENSG00000212036 MIR548BA hsa-mir-548ba microRNA 548ba ncRNA 178.667-47 chr14 36289233 36289729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31156 NM_016586 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 156.667-326 chr7 150402822 150403160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2761 NR_027237 728743 Hs.650365 NM_001080852 LOC728743 - zinc finger protein pseudogene pseudo 150-78 chr2 142568867 142569282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -308590 NM_001199241 8942 Hs.470126 NM_003937 ENSG00000115919 KYNU KYNUU|VCRL2 kynureninase protein-coding 279.666-4 chr10 51633508 51634339 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 65672 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 122-132 chr9 77029276 77029632 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 9799 NM_001013735 442425 Hs.553843 NM_001013735 ENSG00000204612 FOXB2 bA159H20.4 forkhead box B2 protein-coding 172.667-71 chr19 46125930 46126274 + 0.666667 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 -1414 NM_207393 388555 Hs.365496 NM_207393 ENSG00000188624 IGFL3 UNQ483 IGF like family member 3 protein-coding 183.667-65 chr18 59726787 59727227 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -29584 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 126-60 chr2 179645456 179645802 + 0.666667 NA intron (NR_148056, intron 3 of 9) intron (NR_148056, intron 3 of 9) 14565 NM_001352812 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 183.333-141 chr6 45250617 45251129 + 0.666667 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) AluJo|SINE|Alu -53103 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 137.667-137 chr4 36518913 36519170 + 0.666667 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) intron (NR_149124, intron 3 of 4) -92613 NR_031701 100313806 NR_031701 ENSG00000283207 MIR1255B1 MIR1255B-1|MIRN1255B1 microRNA 1255b-1 ncRNA 120.333-4 chr1 67003664 67003873 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_015139, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_015139, exon 12 of 12) 50380 NM_015139 23169 Hs.213642 NM_015139 ENSG00000116704 SLC35D1 SHNKND|UGTREL7 solute carrier family 35 member D1 protein-coding 183.667-60 chr16 79970762 79971118 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 175691 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 194-139 chr8 53761785 53762251 + 0.666667 NA intron (NM_213620, intron 11 of 13) intron (NM_213620, intron 11 of 13) 81024 NM_213620 51606 Hs.491737 NM_015941 ENSG00000047249 ATP6V1H CGI-11|MSTP042|NBP1|SFD|SFDalpha|SFDbeta|VMA13 ATPase H+ transporting V1 subunit H protein-coding 115-36 chr12 8668283 8668527 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5579 NM_001297711 8076 Hs.512842 NM_003480 ENSG00000197614 MFAP5 AAT9|MAGP-2|MAGP2|MFAP-5|MP25 microfibril associated protein 5 protein-coding 124-29 chr11 111284688 111284991 + 0.666667 NA intron (NM_198498, intron 4 of 4) intron (NM_198498, intron 4 of 4) -13707 NM_001271458 120376 Hs.31409 NM_001136105 ENSG00000214290 COLCA2 C11orf93|CASC13|LOH11CR1G colorectal cancer associated 2 protein-coding 213-50 chr3 47099009 47099646 + 0.666667 NA intron (NR_146158, intron 8 of 21) intron (NR_146158, intron 8 of 21) 64650 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 155-80 chr20 63390562 63390861 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -29315 NM_000744 1137 Hs.10734 NM_000744 ENSG00000101204 CHRNA4 BFNC|EBN|EBN1|NACHR|NACHRA4|NACRA4 cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit protein-coding 160.333-290 chr8 132150579 132150896 + 0.666667 NA intron (NM_001204824, intron 9 of 14) MER61-int|LTR|ERV1 -45472 NM_001145095 10086 Hs.285026 NM_005712 ENSG00000132297 HHLA1 PLA2L HERV-H LTR-associating 1 protein-coding 125.333-94 chr2 77989161 77989388 + 0.666667 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) intron (NR_110288, intron 1 of 3) -34248 NR_024342 100170221 Hs.717311 NR_024342 SNAR-H snaR-2 small NF90 (ILF3) associated RNA H snRNA 138.333-159 chr5 132563090 132563411 + 0.666667 NA intron (NM_005732, intron 2 of 24) L2a|LINE|L2 6273 NM_005732 10111 Hs.633509 NM_005732 ENSG00000113522 RAD50 NBSLD|RAD502|hRad50 RAD50 double strand break repair protein protein-coding 120-117 chr5 124732215 124732519 + 0.666667 NA intron (NM_020747, intron 1 of 8) intron (NM_020747, intron 1 of 8) 12745 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 140-22 chr10 88183638 88183902 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 320145 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 146-95 chr4 67729256 67729643 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 26637 NM_001012763 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 127.667-94 chr2 165391903 165392120 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001371247, exon 27 of 27) 3' UTR (NM_001371247, exon 27 of 27) -77687 NM_001172173 80034 Hs.470479 NM_024969 ENSG00000178662 CSRNP3 FAM130A2|PPP1R73|TAIP-2|TAIP2 cysteine and serine rich nuclear protein 3 protein-coding 124.333-63 chr17 53473802 53474051 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -349001 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 123.333-49 chr11 80491741 80492105 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 270880 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 239.667-65 chr7 12380950 12381550 + 0.666667 NA intron (NM_001135924, intron 4 of 28) intron (NM_001135924, intron 4 of 28) 22615 NM_001135924 221806 Hs.669526 NM_001135924 ENSG00000146530 VWDE - von Willebrand factor D and EGF domains protein-coding 144.333-47 chr12 15339989 15340300 + 0.666667 NA intron (NM_030667, intron 1 of 26) MIRb|SINE|MIR 17636 NM_030667 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 114-137 chr6 56561487 56561724 + 0.666667 NA intron (NM_001144770, intron 48 of 94) intron (NM_001144770, intron 48 of 94) 81284 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 179-35 chr16 8338668 8339008 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 251000 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 145-67 chr3 30701440 30701780 + 0.666667 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger 95009 NM_003242 7048 Hs.82028 NM_003242 ENSG00000163513 TGFBR2 AAT3|FAA3|LDS1B|LDS2|LDS2B|MFS2|RIIC|TAAD2|TBR-ii|TBRII|TGFR-2|TGFbeta-RII transforming growth factor beta receptor 2 protein-coding 124.667-159 chr4 188944289 188944561 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 167768 NR_149102 105377610 NR_149102 ENSG00000251619 LINC02508 - long intergenic non-protein coding RNA 2508 ncRNA 114-109 chr4 100475421 100475634 + 0.666667 NA intron (NM_001159694, intron 2 of 10) intron (NM_001159694, intron 2 of 10) 42495 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 220.333-113 chr5 67560248 67560755 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 86288 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 161.333-115 chr17 52599541 52599945 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 209221 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 196-104 chr21 34019744 34020221 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43600 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 116.667-217 chr9 90037178 90037411 + 0.666667 NA intron (NR_038882, intron 1 of 3) intron (NR_038882, intron 1 of 3) 4205 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 121.667-189 chr7 31795039 31795340 + 0.666667 NA intron (NM_001322057, intron 17 of 17) intron (NM_001322057, intron 17 of 17) 107974 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 113.333-211 chr5 86810600 86810875 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 63919 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 164-75 chr3 47743377 47743767 + 0.666667 NA intron (NM_003074, intron 3 of 27) AluSx1|SINE|Alu 38321 NM_003074 6599 Hs.476179 NM_003074 ENSG00000173473 SMARCC1 BAF155|CRACC1|Rsc8|SRG3|SWI3 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 1 protein-coding 163.667-37 chr11 47060936 47061286 + 0.666667 NA intron (NM_001003677, intron 3 of 8) (CCTCTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 115768 NM_032389 84364 Hs.436204 NM_032389 ENSG00000149182 ARFGAP2 IRZ|NBLA10535|ZFP289|ZNF289 ADP ribosylation factor GTPase activating protein 2 protein-coding 233-64 chr8 120652898 120653456 + 0.666667 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -108076 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 145.333-31 chr10 48317546 48317779 + 0.666667 NA intron (NM_001323327, intron 2 of 12) L2|LINE|L2 10985 NM_001323320 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 114.333-161 chr4 91003747 91004000 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) L1PBa1|LINE|L1 768842 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 160.667-290 chr7 93923451 93923870 + 0.666667 NA intron (NM_004126, intron 1 of 1) intron (NM_004126, intron 1 of 1) 1925 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 171.667-45 chr14 42026085 42026521 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 419447 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 120.333-182 chr8 66575414 66575666 + 0.666667 NA intron (NM_001294282, intron 10 of 14) AluJb|SINE|Alu 37678 NM_001294282 4603 Hs.445898 NM_001080416 ENSG00000185697 MYBL1 A-MYB|AMYB MYB proto-oncogene like 1 protein-coding 112.333-104 chr18 11591913 11592104 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17550 NM_001282300 646000 NM_001282300 ENSG00000236396 SLC35G4 AMAC1L1|SLC35G4P solute carrier family 35 member G4 protein-coding 119-85 chr2 237216148 237216373 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 130371 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 203.667-51 chr2 72549662 72550144 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) L2c|LINE|L2 276130 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 171.667-168 chr8 120421039 120421392 + 0.666667 NA intron (NM_014078, intron 4 of 6) intron (NM_014078, intron 4 of 6) 23935 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 125.667-33 chr11 36950301 36950524 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -352133 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 239.333-7 chr1 154633601 154634257 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 -5932 NM_001365045 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 218.333-102 chr5 150041483 150042057 + 0.666667 NA intron (NM_014983, intron 14 of 19) intron (NM_014983, intron 14 of 19) 41031 NM_014983 22993 Hs.719189 NM_014983 ENSG00000113716 HMGXB3 HMGX3|SMF HMG-box containing 3 protein-coding 113-164 chr5 13223927 13224124 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -191139 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 112.667-159 chr21 30310909 30311236 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9243 NM_203405 388818 Hs.28704 NM_203405 ENSG00000197683 KRTAP26-1 - keratin associated protein 26-1 protein-coding 248.333-34 chr16 21563802 21564397 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33122 NM_001288660 51108 Hs.279583 NM_016025 ENSG00000197006 METTL9 CGI-81|DREV|DREV1|PAP1 methyltransferase like 9 protein-coding 111.667-36 chr10 74662661 74662955 + 0.666667 NA intron (NM_001369124, intron 8 of 9) L2a|LINE|L2 -133484 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 145-128 chr9 93090832 93091109 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5247 NR_134468 84270 Hs.434213 NM_032310 ENSG00000165233 CARD19 BinCARD|C9orf89 caspase recruitment domain family member 19 protein-coding 166.667-132 chr20 36114569 36114913 + 0.666667 NA intron (NM_001258329, intron 2 of 22) intron (NM_001258329, intron 2 of 22) 22031 NM_001258329 2036 Hs.437422 NM_012156 ENSG00000088367 EPB41L1 4.1N|MRD11 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 1 protein-coding 113.333-122 chr2 43347381 43347564 + 0.666667 NA intron (NM_001083953, intron 29 of 37) intron (NM_001083953, intron 29 of 37) 120261 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 141.667-40 chr10 118464933 118465354 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 108035 NR_108045 100506126 Hs.69494 NR_108045 ENSG00000232139 LINC00867 - long intergenic non-protein coding RNA 867 ncRNA 156-142 chr8 115736024 115736345 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -67209 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 156.333-323 chr6 159884698 159885005 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -6137 NM_002377 4142 Hs.99900 NM_002377 ENSG00000130368 MAS1 MAS|MGRA MAS1 proto-oncogene, G protein-coupled receptor protein-coding 146.333-233 chr4 67818258 67818552 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -62319 NM_000406 2798 Hs.407587 NM_000406 ENSG00000109163 GNRHR GNRHR1|GRHR|HH7|LHRHR|LRHR gonadotropin releasing hormone receptor protein-coding 127-68 chr5 8380719 8381083 + 0.666667 NA intron (NR_039984, intron 3 of 5) intron (NR_039984, intron 3 of 5) 76663 NR_039984 729506 Hs.566412 NR_039984 ENSG00000245729 LINC02226 - long intergenic non-protein coding RNA 2226 ncRNA 138.333-70 chr15 58855714 58855991 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001040453, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001040453, exon 9 of 9) 77827 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 199-55 chr2 158997012 158997475 + 0.666667 NA intron (NM_001350065, intron 1 of 27) L1MC3|LINE|L1 28603 NR_146421 85461 Hs.61590 NM_033394 ENSG00000115183 TANC1 ROLSB|TANC tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 protein-coding 151.667-361 chr8 64979048 64979454 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -180514 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 112.333-179 chr4 55478811 55479125 + 0.666667 NA intron (NM_004898, intron 5 of 22) intron (NM_004898, intron 5 of 22) 66964 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 146.333-348 chr9 34963636 34963997 + 0.666667 NA intron (NM_015297, intron 1 of 7) intron (NM_015297, intron 1 of 7) 5531 NM_001347983 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 140.333-59 chr14 35697867 35698222 + 0.666667 NA intron (NM_014990, intron 16 of 40) intron (NM_014990, intron 16 of 40) 64887 NR_135620 107399303 Hs.742611 NR_135620 SNORA101B ZL4 small nucleolar RNA, H/ACA box 101B snoRNA 112-215 chr9 115078720 115078908 + 0.666667 NA intron (NM_002160, intron 6 of 27) intron (NM_002160, intron 6 of 27) 39343 NM_002160 3371 Hs.143250 NM_002160 ENSG00000041982 TNC 150-225|DFNA56|GMEM|GP|HXB|JI|TN|TN-C tenascin C protein-coding 113.333-133 chr2 129446018 129446327 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -172281 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 151.667-271 chr5 37757924 37758269 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 76726 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 147.667-126 chr16 71190752 71191051 + 0.666667 NA intron (NM_001198543, intron 1 of 18) L1MC5a|LINE|L1 39821 NM_001198542 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 219.333-93 chr2 64965300 64965856 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -22901 NM_001348407 6509 Hs.654352 NM_003038 ENSG00000115902 SLC1A4 ASCT1|SATT|SPATCCM solute carrier family 1 member 4 protein-coding 146.667-345 chr8 137915551 137915839 + 0.666667 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) intron (NR_161374, intron 2 of 7) 167850 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 149-90 chr3 51988843 51989128 + 0.666667 NA exon (NM_001198895, exon 15 of 15) exon (NM_001198895, exon 15 of 15) 5450 NM_001198898 95 Hs.334707 NM_000666 ENSG00000243989 ACY1 ACY-1|ACY1D|HEL-S-5 aminoacylase 1 protein-coding 334-16 chr17 80910211 80911006 + 0.666667 NA intron (NM_020761, intron 21 of 33) intron (NM_020761, intron 21 of 33) 60605 NR_148968 400627 Hs.591201 NR_148968 ENSG00000261924 LOC400627 - uncharacterized LOC400627 ncRNA 117-42 chr13 62119731 62119993 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90314 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 155.667-129 chr17 32813024 32813399 + 0.666667 NA intron (NM_015194, intron 1 of 21) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 63913 NM_015194 4642 Hs.602063 NM_015194 ENSG00000176658 MYO1D PPP1R108|myr4 myosin ID protein-coding 161.333-28 chr10 33262760 33263076 + 0.666667 NA intron (NM_001244973, intron 4 of 16) L2a|LINE|L2 71749 NM_003873 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 170.667-107 chr22 46720201 46720674 + 0.666667 NA intron (NM_022766, intron 2 of 12) AluSq|SINE|Alu 17815 NM_022766 64781 Hs.200668 NM_022766 ENSG00000100422 CERK LK4|dA59H18.2|dA59H18.3|hCERK ceramide kinase protein-coding 155.667-80 chr13 34083976 34084277 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -263917 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 118-80 chr21 16163798 16164010 + 0.666667 NA intron (NR_111005, intron 1 of 6) intron (NR_111005, intron 1 of 6) -17494 NR_136552 388815 Hs.473394 NR_027790 MIR99AHG C21orf34|C21orf35|LINC00478|MONC mir-99a-let-7c cluster host gene ncRNA 116.667-19 chr11 23228125 23228329 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 190963 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 131.667-134 chr3 111738139 111738358 + 0.666667 NA intron (NM_001185106, intron 4 of 4) intron (NM_001185106, intron 4 of 4) 5752 NM_001134437 90102 Hs.603252 NM_145753 ENSG00000144824 PHLDB2 LL5b|LL5beta pleckstrin homology like domain family B member 2 protein-coding 258.667-48 chr2 133739093 133739542 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -170854 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 163-80 chr7 27963751 27964105 + 0.666667 NA intron (NM_175061, intron 2 of 4) intron (NM_175061, intron 2 of 4) -216529 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 147-143 chr8 136476376 136476719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54251 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 190.667-10 chr1 112287950 112288325 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -108077 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 206-45 chr12 118849588 118850139 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16327 NR_134997 105370016 Hs.550627 NR_134997 ENSG00000255814 LINC02439 - long intergenic non-protein coding RNA 2439 ncRNA 120-77 chr20 58626152 58626436 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8478 NR_125359 79160 Hs.280135 NR_125359 ENSG00000268941 LINC01711 - long intergenic non-protein coding RNA 1711 ncRNA 163.333-7 chr1 65261135 65261499 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3377 NM_001256865 9829 Hs.647643 NM_014787 ENSG00000116675 DNAJC6 DJC6|PARK19 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 protein-coding 168.333-15 chr1 237779199 237779679 + 0.666667 NA intron (NM_001035, intron 88 of 104) intron (NM_001035, intron 88 of 104) -82736 NR_027247 100130331 Hs.661736 NR_027247 ENSG00000237250 LOC100130331 - POTE ankyrin domain family, member F pseudogene pseudo 129.333-14 chr10 18186033 18186271 + 0.666667 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) AluSp|SINE|Alu 45728 NM_201572 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 217-26 chr17 20909611 20910008 + 0.666667 NA intron (NR_160710, intron 3 of 4) intron (NR_160710, intron 3 of 4) -11219 NR_160711 440416 Hs.661076 NR_104185 ENSG00000233098 CCDC144NL-AS1 - CCDC144NL antisense RNA 1 ncRNA 124.667-70 chr15 62776279 62776583 + 0.666667 NA intron (NM_015059, intron 39 of 55) intron (NM_015059, intron 39 of 55) -47526 NR_029709 406965 NR_029709 ENSG00000211137 MIR190A MIR190|MIRN190|hsa-mir-190a|miR-190|mir-190a microRNA 190a ncRNA 123.667-152 chr5 34859076 34859407 + 0.666667 NA intron (NM_001317949, intron 4 of 10) intron (NM_001317949, intron 4 of 10) 19860 NM_001317949 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 150.333-195 chr2 67127266 67127618 + 0.666667 NA intron (NR_038844, intron 6 of 7) L1ME4a|LINE|L1 40996 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 138.333-24 chr10 30532996 30533362 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 96574 NM_183058 119180 Hs.522610 NM_183058 ENSG00000151033 LYZL2 LYZD2 lysozyme like 2 protein-coding 113-185 chr6 129402325 129402548 + 0.666667 NA exon (NM_001079823, exon 39 of 64) exon (NM_001079823, exon 39 of 64) 307741 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 113.333-228 chr6 116785501 116785703 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -19883 NM_001085480 221303 Hs.126712 NM_001085480 ENSG00000183807 FAM162B C6orf189|bA86F4.2 family with sequence similarity 162 member B protein-coding 133.667-2 chr1 24289765 24290052 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29449 NM_001195010 57822 Hs.657920 NM_021180 ENSG00000158055 GRHL3 SOM|TFCP2L4|VWS2 grainyhead like transcription factor 3 protein-coding 202.667-156 chr9 83750813 83751136 + 0.666667 NA intron (NM_025211, intron 9 of 12) AluSc8|SINE|Alu 42643 NR_135840 105376114 Hs.9589 NR_135839 ENSG00000254473 LOC105376114 - uncharacterized LOC105376114 ncRNA 132-91 chr4 78061239 78061488 + 0.666667 NA intron (NM_001166133, intron 1 of 41) intron (NM_001166133, intron 1 of 41) 3793 NM_001166133 80144 Hs.369448 NM_020875 ENSG00000138759 FRAS1 FRASRS1 Fraser extracellular matrix complex subunit 1 protein-coding 160-36 chr12 94769411 94769716 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -64835 NR_030171 574449 NR_030171 ENSG00000283998 MIR492 MIRN492|hsa-mir-492 microRNA 492 ncRNA 186.667-59 chr2 8299438 8299746 + 0.666667 NA intron (NR_152741, intron 4 of 9) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 28827 NR_034135 339789 Hs.565619 NR_034135 ENSG00000236790 LINC00299 C2orf46|NCRNA00299 long intergenic non-protein coding RNA 299 ncRNA 214.333-58 chr16 86171912 86172344 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -24053 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 154-102 chr4 30774449 30774808 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 54259 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 189.667-97 chr3 94603150 94603613 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -334882 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 146.333-22 chr10 29065819 29066107 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 219555 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 148-110 chr4 19408664 19408952 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -843097 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 113.667-12 chr1 115676719 115676904 + 0.666667 NA intron (NM_001172411, intron 4 of 7) intron (NM_001172411, intron 4 of 7) 34182 NM_001172412 81839 Hs.515130 NM_138959 ENSG00000173218 VANGL1 KITENIN|LPP2|STB2|STBM2 VANGL planar cell polarity protein 1 protein-coding 120.667-29 chr11 58492148 58492451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15806 NM_001005218 219968 Hs.553647 NM_001005218 ENSG00000198283 OR5B21 - olfactory receptor family 5 subfamily B member 21 protein-coding 157-92 chr3 179868082 179868510 + 0.666667 NA intron (NR_146167, intron 6 of 13) MIRb|SINE|MIR -29898 NR_110059 101928790 Hs.667247 NR_110059 ENSG00000244302 PEX5L-AS2 - PEX5L antisense RNA 2 ncRNA 165.667 chr1 11903100 11903452 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4878 NR_002754 26829 NR_002754 ENSG00000199347 RNU5E-1 RNU5E|U5E RNA, U5E small nuclear 1 snRNA 200.667-74 chr2 64692781 64693212 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -39083 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 176-23 chr12 12449297 12449720 + 0.666667 NA intron (NM_001300742, intron 3 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 3 of 3).2 92430 NM_001330356 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 159.333-88 chr14 47633022 47633388 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) L2a|LINE|L2 41749 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 133.333-73 chr2 30785270 30785589 + 0.666667 NA intron (NM_144575, intron 2 of 22) intron (NM_144575, intron 2 of 22) 22017 NM_144575 92291 Hs.660911 NM_144575 ENSG00000162949 CAPN13 - calpain 13 protein-coding 130.667-63 chr14 46319394 46319657 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) MLT2B1|LTR|ERVL -151834 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 178-78 chr3 64957448 64957830 + 0.666667 NA intron (NR_038264, intron 4 of 5) intron (NR_038264, intron 4 of 5) -269639 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 197-57 chr2 47804374 47804798 + 0.666667 NA intron (NM_001281493, intron 4 of 8) MER5B|DNA|hAT-Charlie 20631 NM_001281494 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 220.667-36 chr16 69659903 69660416 + 0.666667 NA intron (NM_173215, intron 7 of 13) intron (NM_173215, intron 7 of 13) 48516 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 123.667-20 chr1 175720421 175720652 + 0.666667 NA intron (NM_003285, intron 1 of 22) intron (NM_003285, intron 1 of 22) 23059 NM_003285 7143 Hs.659864 NM_003285 ENSG00000116147 TNR TN-R tenascin R protein-coding 211.333-123 chr2 140613799 140614277 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 41 of 90) MER67B|LTR|ERV1 -27353 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 121-121 chr5 175348613 175348846 + 0.666667 NA Intergenic LTR85c|LTR|Gypsy? 95453 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 128.333-13 chr1 183086811 183087157 + 0.666667 NA intron (NM_002293, intron 1 of 27) MIR3|SINE|MIR 54286 NR_149048 110841583 Hs.604063 NR_149048 ENSG00000224468 LAMC1-AS1 lnc-LAMC2-1:1 LAMC1 antisense RNA 1 ncRNA 144.333-241 chr7 3322179 3322474 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) L1MB5|LINE|L1 21074 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 178-99 chr5 168324097 168324489 + 0.666667 NA intron (NM_001161661, intron 1 of 22) AluSg|SINE|Alu 32648 NM_001161661 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 125.667-91 chr2 28764656 28764949 + 0.666667 NA intron (NM_206876, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu 12972 NM_002709 5500 Hs.702907 NM_002709 ENSG00000213639 PPP1CB HEL-S-80p|NSLH2|PP-1B|PP1B|PP1beta|PPP1CD protein phosphatase 1 catalytic subunit beta protein-coding 137-30 chr15 47915099 47915410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69018 NR_120336 101928442 Hs.242804 NR_120336 ENSG00000259572 LINC01491 - long intergenic non-protein coding RNA 1491 ncRNA 199.333-246 chr6 108460739 108461103 + 0.666667 NA intron (NR_136553, intron 4 of 8) AluY|SINE|Alu -98904 NM_201559 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 166.667-113 chr2 75314876 75315200 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -115518 NM_001058 6869 Hs.633301 NM_001058 ENSG00000115353 TACR1 NK1R|NKIR|SPR|TAC1R tachykinin receptor 1 protein-coding 131.667-75 chr17 66175265 66175613 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 3 of 26) intron (NM_001353129, intron 3 of 26) 16453 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 147.667-285 chr5 72446039 72446347 + 0.666667 NA intron (NM_152625, intron 4 of 4) MIRc|SINE|MIR 61217 NM_152625 167465 Hs.224794 NM_152625 ENSG00000178175 ZNF366 DC-SCRIPT|DCSCRIPT zinc finger protein 366 protein-coding 160-88 chr4 111531008 111531418 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -614241 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 150.333-261 chr3 49646305 49646608 + 0.666667 NA intron (NM_003458, intron 3 of 11) intron (NM_003458, intron 3 of 11) -27895 NM_001640 327 Hs.517969 NM_001640 ENSG00000164062 APEH AARE|ACPH|APH|D3F15S2|D3S48E|DNF15S2|OPH acylaminoacyl-peptide hydrolase protein-coding 208.666-53 chr18 11331875 11332466 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -122308 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 136.333-130 chr3 117365628 117365989 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 325117 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 157.667-58 chr11 81775342 81775804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 115263 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 154.667-398 chr8 125043176 125043503 + 0.666667 NA intron (NM_014846, intron 23 of 28) intron (NM_014846, intron 23 of 28) 44834 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 231.667-24 chr17 52775737 52776207 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86149 NR_146899 105371831 Hs.97791 NR_146899 ENSG00000226364 LINC02089 - long intergenic non-protein coding RNA 2089 ncRNA 148.667-108 chr13 112604297 112604617 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -16272 NM_001286279 10426 Hs.224152 NM_006322 ENSG00000126216 TUBGCP3 104p|ALP6|GCP3|Grip104|SPBC98|Spc98|Spc98p tubulin gamma complex associated protein 3 protein-coding 173.333-91 chr2 50403781 50404195 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 17 of 22) intron (NM_001330093, intron 17 of 22) -56232 NM_138735 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 135.667-75 chr17 59958993 59959368 + 0.666667 NA intron (NM_016125, intron 4 of 8) L2|LINE|L2 5560 NM_016125 51136 Hs.531701 NM_016125 ENSG00000189050 RNFT1 PTD016 ring finger protein, transmembrane 1 protein-coding 139.667-19 chr10 61306646 61307030 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -145801 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 205-16 chr10 76923506 76923999 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 23 of 28) AluJb|SINE|Alu 35708 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 175.333-141 chr5 54375238 54375580 + 0.666667 NA intron (NR_126379, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 54465 NR_126379 104355136 Hs.559024 NR_126379 ENSG00000249069 LINC01033 - long intergenic non-protein coding RNA 1033 ncRNA 112.333-223 chr5 174696607 174696893 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -27832 NM_001363626 4488 Hs.89404 NM_002449 ENSG00000120149 MSX2 CRS2|FPP|HOX8|MSH|PFM|PFM1 msh homeobox 2 protein-coding 113.667-225 chr9 36737354 36737676 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 86084 NR_039686 100616289 NR_039686 ENSG00000266255 MIR4475 - microRNA 4475 ncRNA 212-4 chr1 35385769 35386286 + 0.666667 NA intron (NM_005095, intron 10 of 29) intron (NM_005095, intron 10 of 29) -19950 NR_046659 100861513 Hs.585397 NR_046659 ENSG00000227409 ZMYM4-AS1 - ZMYM4 antisense RNA 1 ncRNA 222.667-39 chr2 22591030 22591574 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 54823 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 140.333-139 chr3 86528460 86528819 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 46696 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 130-116 chr7 11558666 11558905 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 4 of 26) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 273413 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 121.333-101 chr20 49747004 49747234 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -33241 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 129-99 chr5 72117759 72118057 + 0.666667 NA intron (NM_005909, intron 2 of 6) intron (NM_005909, intron 2 of 6) 10433 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 150.333-160 chr17 66029178 66029517 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 13 of 26) intron (NM_001353129, intron 13 of 26) 162545 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 168.333-116 chr20 33780086 33780401 + 0.666667 NA intron (NR_104259, intron 10 of 13) L2a|LINE|L2 30856 NR_110623 101929746 Hs.504633 NR_110623 ENSG00000230753 ZNF341-AS1 - ZNF341 antisense RNA 1 ncRNA 147.333-21 chr1 153031071 153031338 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_003125) promoter-TSS (NM_003125) 1 NM_003125 6699 Hs.1076 NM_003125 ENSG00000169469 SPRR1B CORNIFIN|GADD33|SPR-IB|SPRR1 small proline rich protein 1B protein-coding 222.333-66 chr3 184876586 184877104 + 0.666667 NA intron (NM_001009921, intron 20 of 46) L2b|LINE|L2 64338 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 167.333-232 chr6 108210303 108210636 + 0.666667 NA TTS (NM_001300928) TTS (NM_001300928) 42446 NM_001286102 7101 Hs.157688 NM_003269 ENSG00000112333 NR2E1 TLL|TLX|XTLL nuclear receptor subfamily 2 group E member 1 protein-coding 167.333-156 chr20 54390725 54391166 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84648 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 149.333-126 chr15 90513427 90513786 + 0.666667 NA Intergenic LTR22B|LTR|ERVK -16317 NM_001042574 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 123-124 chr8 80897982 80898192 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -23306 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 168-120 chr9 69875463 69875807 + 0.666667 NA intron (NM_001308084, intron 4 of 4) intron (NM_001308084, intron 4 of 4) 54818 NM_001308084 138255 Hs.444459 NM_001010940 ENSG00000204711 C9orf135 - chromosome 9 open reading frame 135 protein-coding 131.667-152 chr4 167775546 167775853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -316838 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 116.333-164 chr4 162052532 162052735 + 0.666667 NA intron (NM_020116, intron 2 of 15) intron (NM_020116, intron 2 of 15) 29900 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 133.333-37 chr12 31648026 31648299 + 0.666667 NA intron (NM_001135864, intron 1 of 3) L1MB7|LINE|L1 1002 NM_001135864 254013 Hs.740628 NM_173802 ENSG00000139160 ETFBKMT C12orf72|ETFB-KMT|METTL20 electron transfer flavoprotein subunit beta lysine methyltransferase protein-coding 162.333-261 chr8 123097825 123098288 + 0.666667 NA intron (NM_001363149, intron 6 of 21) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 24807 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 143.667-122 chr2 17024836 17025116 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -359142 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 201.333-166 chr2 229892537 229893059 + 0.666667 NA intron (NM_001348335, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 28881 NM_001348334 9320 Hs.572642 NM_004238 ENSG00000153827 TRIP12 MRD49|TRIP-12|ULF thyroid hormone receptor interactor 12 protein-coding 202-27 chr11 17898667 17899165 + 0.666667 NA intron (NR_104041, intron 8 of 9) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 114131 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 166.333-224 chr8 75140184 75140624 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 138077 NR_103850 101805492 Hs.571424 NR_103848 CASC9 ESCCAL-1|ESSCAL1|LINC00981|linc-JPH1 cancer susceptibility 9 ncRNA 136.333-139 chr4 19166388 19166692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1085365 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 144-75 chr2 73154899 73155178 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -42090 NM_015470 26056 Hs.24557 NM_015470 ENSG00000135631 RAB11FIP5 GAF1|RIP11|pp75 RAB11 family interacting protein 5 protein-coding 158.333-125 chr18 22119200 22119587 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 49575 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 147.667-69 chr12 38919020 38919430 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13634 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 163-72 chr5 166982448 166982924 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56316 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 124 chr1 10849353 10849640 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -52850 NM_017766 54897 Hs.439894 NM_017766 ENSG00000130940 CASZ1 CAS11|CST|SRG|ZNF693|dJ734G22.1 castor zinc finger 1 protein-coding 122-72 chr3 44932789 44933005 + 0.666667 NA intron (NR_146162, intron 5 of 6) intron (NR_146162, intron 5 of 6) 43277 NR_146162 51304 Hs.61430 NM_016598 ENSG00000163812 ZDHHC3 DHHC-3|DHHC3|GODZ|ZNF373 zinc finger DHHC-type containing 3 protein-coding 150.333-135 chr15 81378293 81378592 + 0.666667 NA intron (NR_120365, intron 5 of 6) intron (NR_120365, intron 5 of 6) -4229 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 132.333-82 chr2 57766938 57767247 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140559 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 195-57 chr2 24459864 24460331 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31157 NM_003743 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 148-15 chr1 237336363 237336691 + 0.666667 NA intron (NM_001035, intron 3 of 104) intron (NM_001035, intron 3 of 104) -134592 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 132.333-41 chr12 39091819 39092099 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -186368 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 201.667-83 chr4 35631942 35632399 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 611769 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 166-107 chr7 5060840 5061189 + 0.666667 NA intron (NM_001204513, intron 4 of 5) intron (NM_001204513, intron 4 of 5) -11046 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 113-160 chr4 121859479 121859703 + 0.666667 NA intron (NM_176824, intron 4 of 18) MIR|SINE|MIR 10883 NM_176824 55212 Hs.591694 NM_018190 ENSG00000138686 BBS7 BBS2L1 Bardet-Biedl syndrome 7 protein-coding 260.667-29 chr16 49786070 49786594 + 0.666667 NA intron (NM_001271620, intron 2 of 7) intron (NM_001271620, intron 2 of 7) 36406 NM_015069 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 156-112 chr5 38291714 38292032 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_046219) promoter-TSS (NR_046219) -887 NR_046219 100852408 Hs.570954 NR_046219 ENSG00000248730 EGFLAM-AS4 - EGFLAM antisense RNA 4 ncRNA 160-29 chr11 115280207 115280535 + 0.666667 NA intron (NM_001098517, intron 1 of 8) intron (NM_001098517, intron 1 of 8) -53206 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 144.667-11 chr1 102636317 102636598 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 472039 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 117-90 chr21 17874975 17875313 + 0.666667 NA intron (NR_024354, intron 1 of 2) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 10464 NR_024354 54075 Hs.404306 NR_024354 CHODL-AS1 C21orf39|NCRNA00157 CHODL antisense RNA 1 ncRNA 150.667-191 chr2 152995392 152995700 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 276909 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 196-133 chr4 52239764 52240199 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 188677 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 203.333-53 chr12 40842420 40842795 + 0.666667 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) 14669 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 122.333-168 chr5 15604099 15604335 + 0.666667 NA intron (NR_109945, intron 2 of 2) intron (NR_109945, intron 2 of 2) 10785 NR_109945 101929472 Hs.662664 NR_109945 CTD-2350J17.1 - uncharacterized LOC101929472 ncRNA 124.333-159 chr6 74931688 74932020 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 196928 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 147.667-197 chr20 2366143 2366527 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -14566 NM_198994 343641 Hs.452039 NM_198994 ENSG00000166948 TGM6 SCA35|TG6|TGM3L|TGY|dJ734P14.3 transglutaminase 6 protein-coding 129.333-203 chr9 115568631 115568958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 175445 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 113-11 chr1 174723976 174724164 + 0.666667 NA intron (NM_001366451, intron 2 of 12) intron (NM_001366451, intron 2 of 12) 23075 NM_001366453 9910 Hs.585378 NM_014857 ENSG00000152061 RABGAP1L HHL|TBC1D18 RAB GTPase activating protein 1 like protein-coding 192.667-19 chr1 241043107 241043604 + 0.666667 NA intron (NM_001350116, intron 3 of 16) L1M6|LINE|L1 -88917 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 161.667-261 chr8 119797981 119798331 + 0.666667 NA intron (NM_003184, intron 6 of 25) intron (NM_003184, intron 6 of 25) 34685 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 219.333-111 chr22 24959057 24959543 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12605 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 126.667-63 chr16 48580772 48581095 + 0.666667 NA intron (NM_153029, intron 1 of 6) MER2|DNA|TcMar-Tigger 29247 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 119.667-59 chr15 90777342 90777623 + 0.666667 NA intron (NM_001287246, intron 13 of 22) intron (NM_001287246, intron 13 of 22) 60136 NM_001287246 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 141.667-63 chr12 125408687 125409108 + 0.666667 NA intron (NM_052907, intron 2 of 8) L1ME3A|LINE|L1 82281 NM_052907 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 117.667-204 chr9 11264270 11264543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 651200 NR_110696 101929428 Hs.434446 NR_110696 ENSG00000226717 PTPRD-AS2 - PTPRD antisense RNA 2 (head to head) ncRNA 163.667-187 chr4 114120774 114121137 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -141308 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 249.667-95 chr7 127549952 127550541 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35350 NM_024523 79571 Hs.521168 NM_024523 ENSG00000179562 GCC1 GCC1P|GCC88 GRIP and coiled-coil domain containing 1 protein-coding 123.667-102 chr2 236827306 236827665 + 0.666667 NA Intergenic MER112|DNA|hAT-Charlie 228682 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 188.333-47 chr14 71967237 71967668 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 33925 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 136.333-77 chr17 14554766 14555031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 251158 NR_026880 84815 Hs.597458 NM_032729 ENSG00000266709 MGC12916 - uncharacterized protein MGC12916 ncRNA 154-50 chr14 29938348 29938800 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10727 NM_001330069 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 182.333-158 chr8 101612385 101612895 + 0.666667 NA intron (NM_024915, intron 8 of 15) intron (NM_024915, intron 8 of 15) 120201 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 125.667-84 chr18 55922617 55922838 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2528 NR_110755 101927273 Hs.434335 NR_110755 ENSG00000260930 LINC01416 - long intergenic non-protein coding RNA 1416 ncRNA 119-39 chr12 124657312 124657524 + 0.666667 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -89806 NM_001206654 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 113.333-124 chr2 50165045 50165303 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) intron (NM_001330093, intron 18 of 22) 182580 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 131.667-26 chr10 83171106 83171360 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 505856 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 122-80 chr3 145717445 145717661 + 0.666667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 351632 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 211.333-210 chr6 131969462 131970072 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18395 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 131-54 chr2 177717606 177717858 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 13 of 20) MamGypsy2-LTR|LTR|Gypsy 44410 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 243-29 chr2 76161312 76161772 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -450627 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 122-134 chr9 135423208 135423513 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48889 NR_038969 100506599 Hs.561897 NR_038969 ENSG00000225361 PPP1R26-AS1 - PPP1R26 antisense RNA 1 ncRNA 215-87 chrX 45287242 45287724 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86607 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 122-113 chr7 41184733 41185005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83265 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 169.667-49 chr13 29396719 29397135 + 0.666667 NA intron (NM_001033602, intron 6 of 13) intron (NM_001033602, intron 6 of 13) -31733 NM_015233 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 124-112 chr7 105333711 105333992 + 0.666667 NA intron (NM_001350746, intron 2 of 14) intron (NM_001350746, intron 2 of 14) -35072 NM_001278273 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 115-99 chr20 34542208 34542467 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4507 NM_181509 84557 Hs.632273 NM_032514 ENSG00000101460 MAP1LC3A ATG8E|LC3|LC3A|MAP1ALC3|MAP1BLC3 microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha protein-coding 113.333-96 chr16 71659719 71659953 + 0.666667 NA intron (NM_001289003, intron 12 of 17) intron (NM_001289003, intron 12 of 17) 33652 NM_052858 91862 Hs.513706 NM_052858 ENSG00000140832 MARVELD3 MARVD3|MRVLDC3 MARVEL domain containing 3 protein-coding 173.333-221 chrX 71598342 71598763 + 0.666667 NA intron (NM_052957, intron 7 of 12) intron (NM_052957, intron 7 of 12) 19959 NM_001504 2833 Hs.198252 NM_001504 ENSG00000186810 CXCR3 CD182|CD183|CKR-L2|CMKAR3|GPR9|IP10-R|Mig-R|MigR C-X-C motif chemokine receptor 3 protein-coding 288.667-38 chr9 99296281 99296864 + 0.666667 NA Intergenic CpG 74290 NM_006808 10952 Hs.191887 NM_006808 ENSG00000106803 SEC61B - SEC61 translocon beta subunit protein-coding 223.333-3 chr1 38674925 38675426 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 184597 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 177.333-147 chr6 163406368 163406749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7392 NR_037593 100526820 Hs.644159 NR_037593 ENSG00000270419 CAHM LINC00468 colon adenocarcinoma hypermethylated ncRNA 245.333-27 chr12 25183006 25183730 + 0.666667 NA intron (NR_147909, intron 1 of 14) L1PA17|LINE|L1 11792 NM_001204101 55259 Hs.407771 NM_018272 ENSG00000118307 CASC1 LAS1|PPP1R54 cancer susceptibility 1 protein-coding 136.667-52 chr14 22264199 22264439 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 168434 NR_148363 105370401 Hs.435144 NR_148361 LOC105370401 - uncharacterized LOC105370401 ncRNA 146.333-18 chr1 215445951 215446326 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -121166 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 113-136 chr3 45983379 45983670 + 0.666667 NA intron (NM_024513, intron 2 of 17) intron (NM_024513, intron 2 of 17) 12300 NM_024513 79443 Hs.200227 NM_024513 ENSG00000163820 FYCO1 CATC2|CTRCT18|RUFY3|ZFYVE7 FYVE and coiled-coil domain containing 1 protein-coding 115-109 chr3 39007860 39008090 + 0.666667 NA intron (NM_001349253, intron 2 of 29) MER21C|LTR|ERVL 43969 NM_001349253 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 123.333-151 chr3 178503016 178503268 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33294 NM_181361 10242 Hs.478368 NM_005832 ENSG00000197584 KCNMB2 - potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 2 protein-coding 119.667-15 chr1 206001125 206001373 + 0.666667 NA intron (NM_001164522, intron 1 of 5) intron (NM_001164522, intron 1 of 5) 2146 NM_001164522 338382 Hs.534612 NM_177403 ENSG00000276600 RAB7B RAB7 RAB7B, member RAS oncogene family protein-coding 128-33 chr17 59089112 59089454 + 0.666667 NA intron (NR_148346, intron 3 of 23) intron (NR_148346, intron 3 of 23) 17597 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 134.333-156 chr7 9160046 9160301 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -474097 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 151.333-185 chr19 32495554 32495876 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -85475 NM_004708 9141 Hs.443831 NM_004708 ENSG00000105185 PDCD5 TFAR19 programmed cell death 5 protein-coding 180.333-8 chr1 186673042 186673444 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_000963, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_000963, exon 10 of 10) 7180 NM_000963 5743 Hs.196384 NM_000963 ENSG00000073756 PTGS2 COX-2|COX2|GRIPGHS|PGG/HS|PGHS-2|PHS-2|hCox-2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 protein-coding 112.667-229 chr6 57066587 57066766 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19929 NM_001286276 57691 Hs.709521 NM_020931 ENSG00000168116 KIAA1586 - KIAA1586 protein-coding 132.667-141 chr5 100859358 100859676 + 0.666667 NA intron (NM_005668, intron 3 of 4) intron (NM_005668, intron 3 of 4) -42952 NR_031686 100302288 NR_031686 ENSG00000221263 MIR548P MIRN548P|hsa-mir-548p microRNA 548p ncRNA 151.667-202 chr22 28545425 28545739 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) AluJr|SINE|Alu 85713 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 188.667-111 chr4 48039091 48039405 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_207330, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_207330, exon 6 of 6) 22476 NM_207330 152519 Hs.134190 NM_207330 ENSG00000163293 NIPAL1 NPAL1 NIPA like domain containing 1 protein-coding 155.333-404 chr8 127964739 127965183 + 0.666667 NA intron (NR_003367, intron 3 of 8) intron (NR_003367, intron 3 of 8) 4328 NR_031610 100302161 NR_031610 ENSG00000221771 MIR1205 MIRN1205|hsa-mir-1205 microRNA 1205 ncRNA 155-71 chr2 139359434 139359796 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 462291 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 190.666-62 chrUn_KI270442v1 144476 145030 + 0.666667 NA NA ALR/Alpha|Satellite|centr NA NA 211-65 chr3 97788743 97789231 + 0.666667 NA intron (NR_136602, intron 6 of 7) intron (NR_136602, intron 6 of 7) 24229 NR_136595 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 206-48 chr13 44467299 44467892 + 0.666667 NA intron (NM_183422, intron 1 of 2) L1PB3|LINE|L1 6706 NM_001243798 8848 Hs.436383 NM_006022 ENSG00000102804 TSC22D1 Ptg-2|TGFB1I4|TSC22 TSC22 domain family member 1 protein-coding 151.667-125 chr15 63643862 63644166 + 0.666667 NA intron (NM_003922, intron 57 of 77) intron (NM_003922, intron 57 of 77) -43187 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 201.333-309 chrX 120472340 120472792 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3217 NM_001122606 3920 Hs.496684 NM_002294 ENSG00000005893 LAMP2 CD107b|LAMP-2|LAMPB|LGP-96|LGP110 lysosomal associated membrane protein 2 protein-coding 144.667-327 chrX 42826164 42826572 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -48205 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 135.667-131 chr4 84949429 84949727 + 0.666667 NA intron (NM_014991, intron 1 of 67) intron (NM_014991, intron 1 of 67) -16038 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 163.667-72 chr16 2154397 2154834 + 0.666667 NA TTS (NR_132114) TTS (NR_132114) 490 NR_002736 26788 NR_002736 ENSG00000206630 SNORD60 RNU60|U60 small nucleolar RNA, C/D box 60 snoRNA 112.333-71 chr14 48093206 48093435 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -298306 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 159.333-340 chr8 123536777 123537085 + 0.666667 NA intron (NM_058229, intron 1 of 8) intron (NM_058229, intron 1 of 8) 4275 NM_058229 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 179-102 chr9 102097990 102098291 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -359560 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 187-60 chr4 115530666 115531145 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -417285 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 202.667-73 chr18 1986993 1987359 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 584329 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 124.333-68 chr18 3485128 3485346 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18987 NR_110429 100505592 Hs.635114 NR_110428 ENSG00000266835 GAPLINC LINC01540 gastric adenocarcinoma associated, positive CD44 regulator, long intergenic non-coding RNA ncRNA 125.333-146 chr5 119477061 119477333 + 0.666667 NA intron (NM_001199291, intron 7 of 24) intron (NM_001199291, intron 7 of 24) 24700 NM_001292028 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 194-71 chr2 39129509 39129999 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL -9291 NM_005633 6654 Hs.709893 NM_005633 ENSG00000115904 SOS1 GF1|GGF1|GINGF|HGF|NS4|SOS-1 SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 143-10 chr1 118663895 118664135 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 324328 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 137.333-121 chr3 60779338 60779731 + 0.666667 NA intron (NR_148921, intron 4 of 4) MER61-int|LTR|ERV1 -161664 NR_128708 103504735 NR_128708 ENSG00000281426 MIR548BB MI0029321|hsa-mir-548bb microRNA 548bb ncRNA 166-94 chr5 18616717 18617105 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 809637 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 124-67 chr2 162268799 162269031 + 0.666667 NA intron (NM_022168, intron 13 of 15) intron (NM_022168, intron 13 of 15) -25470 NM_001291807 2191 Hs.654370 NM_004460 ENSG00000078098 FAP DPPIV|FAPA|FAPalpha|SIMP fibroblast activation protein alpha protein-coding 163-38 chr19 31254073 31254552 + 0.666667 NA intron (NR_138036, intron 1 of 4) intron (NR_138036, intron 1 of 4) 86802 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 128-114 chr8 37860715 37861092 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_025151, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_025151, exon 5 of 5) -11042 NM_018310 55290 Hs.709301 NM_018310 ENSG00000104221 BRF2 BRFU|TFIIIB50 BRF2 RNA polymerase III transcription initiation factor subunit protein-coding 192.667-125 chr4 69860101 69860521 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_005420) promoter-TSS (NM_005420) -166 NM_005420 6783 Hs.479898 NM_005420 ENSG00000109193 SULT1E1 EST|EST-1|ST1E1|STE sulfotransferase family 1E member 1 protein-coding 124.333-51 chr14 58585781 58586054 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48151 NR_046093 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 172-85 chr4 102748838 102749254 + 0.666667 NA intron (NM_005908, intron 1 of 16) intron (NM_005908, intron 1 of 16) 11922 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 198-157 chr5 113990651 113991110 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -371190 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 184.666-5 chr10 15335965 15336512 + 0.666667 NA intron (NM_001010924, intron 1 of 7) intron (NM_001010924, intron 1 of 7) 35051 NM_001010924 221061 Hs.66762 NM_001010924 ENSG00000148468 FAM171A1 APCN|C10orf38 family with sequence similarity 171 member A1 protein-coding 202-105 chr22 35269613 35270049 + 0.666667 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) AluJr|SINE|Alu 12338 NM_001003681 10042 Hs.588815 NM_005487 ENSG00000100281 HMGXB4 HMG2L1|HMGBCG|THC211630 HMG-box containing 4 protein-coding 187.333-141 chr4 82518073 82518533 + 0.666667 NA intron (NM_001353454, intron 1 of 7) AluSx1|SINE|Alu 43685 NM_001353455 441027 Hs.507676 NM_001080506 ENSG00000249242 TMEM150C TTN3 transmembrane protein 150C protein-coding 143-29 chr12 9274929 9275235 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -8575 NR_024374 642846 Hs.447869 NR_024374 LOC642846 - DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 11-like ncRNA 134.667-86 chr18 472423 472675 + 0.666667 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) AluJr|SINE|Alu 28152 NM_130386 81035 Hs.464422 NM_030781 ENSG00000158270 COLEC12 CLP1|NSR2|SCARA4|SRCL collectin subfamily member 12 protein-coding 147.667-327 chr7 1132914 1133234 + 0.666667 NA intron (NM_001134396, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 5173 NM_001318252 84310 Hs.653258 NM_032350 ENSG00000146540 C7orf50 YCR016W chromosome 7 open reading frame 50 protein-coding 126.667-25 chr11 31385891 31386230 + 0.666667 NA intron (NM_181706, intron 2 of 4) L1MA3|LINE|L1 16200 NM_181706 120526 Hs.187269 NM_181706 ENSG00000170946 DNAJC24 DPH4|JJJ3|ZCSL3 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C24 protein-coding 121.333-8 chr1 80557243 80557458 + 0.666667 NA intron (NR_125940, intron 2 of 3) intron (NR_125940, intron 2 of 3) 21595 NR_125940 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 137.667-20 chr1 243935311 243935703 + 0.666667 NA intron (NR_033883, intron 1 of 11) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 18105 NR_033883 339529 Hs.209374 NR_033883 ENSG00000226828 LINC02774 - long intergenic non-protein coding RNA 2774 ncRNA 112.667-241 chr7 6114320 6114546 + 0.666667 NA intron (NM_032172, intron 2 of 17) L1MC5|LINE|L1 9484 NM_032172 84132 Hs.31856 NM_032172 ENSG00000106346 USP42 - ubiquitin specific peptidase 42 protein-coding 186.333-21 chr10 85381436 85381892 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie 51108 NR_120669 101929646 Hs.116129 NR_120669 LINC02647 - long intergenic non-protein coding RNA 2647 ncRNA 174.667-170 chr8 86125921 86126237 + 0.666667 NA intron (NM_152565, intron 2 of 7) AluSz6|SINE|Alu 27169 NM_152565 245972 Hs.436360 NM_152565 ENSG00000147614 ATP6V0D2 ATP6D2|VMA6 ATPase H+ transporting V0 subunit d2 protein-coding 202-104 chr21 19542226 19542714 + 0.666667 NA Intergenic LTR24C|LTR|ERV1 357285 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 145-63 chr22 25510542 25510825 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53992 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 144.667-289 chr7 120617110 120617425 + 0.666667 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 240877 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 142.667-14 chr1 220251453 220251822 + 0.666667 NA intron (NM_012414, intron 1 of 34) L1ME4b|LINE|L1 16078 NR_001587 6791 Hs.654849 NR_001587 AURKAP1 AURKAPS1|AurAps1|STK6P aurora kinase A pseudogene 1 pseudo 134.667-39 chr11 106133089 106133346 + 0.666667 NA Intergenic (ATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -1101 NR_135099 105369473 Hs.524010 NR_135099 ENSG00000254580 LINC02719 - long intergenic non-protein coding RNA 2719 ncRNA 152.667-113 chr14 64315840 64316150 + 0.666667 NA intron (NM_001291712, intron 2 of 13) L1MDa|LINE|L1 -21585 NM_001437 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 150.667-28 chr10 9475588 9475884 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -180143 NR_120635 101928272 Hs.650697 NR_120635 LOC101928272 - uncharacterized LOC101928272 ncRNA 119.667-145 chr5 29298379 29298580 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 97497 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 191.333-116 chr2 171580115 171580416 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57791 NM_001127383 79901 Hs.221941 NM_024843 ENSG00000071967 CYBRD1 CYB561A2|DCYTB|FRRS3 cytochrome b reductase 1 protein-coding 163.667-167 chr4 8499060 8499486 + 0.666667 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 58476 NM_001350233 152992 Hs.566191 NM_024950 ENSG00000155275 TRMT44 C4orf23|METTL19|TRM44 tRNA methyltransferase 44 homolog protein-coding 158-65 chr18 4144596 4144881 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) -119864 NR_036489 284215 Hs.647594 NR_036489 ENSG00000261520 DLGAP1-AS5 - DLGAP1 antisense RNA 5 ncRNA 126.667-2 chr1 51753351 51753630 + 0.666667 NA intron (NM_001350209, intron 9 of 23) L1MD|LINE|L1 23640 NM_148907 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 112-206 chr8 129864448 129864668 + 0.666667 NA intron (NM_001353307, intron 6 of 13) intron (NM_001353307, intron 6 of 13) 75253 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 131.667-146 chr4 71931877 71932128 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -99802 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 127.667-203 chrX 43845302 43845677 + 0.666667 NA intron (NM_000898, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 36961 NM_000898 4129 Hs.654473 NM_000898 ENSG00000069535 MAOB - monoamine oxidase B protein-coding 124-49 chr18 11700954 11701282 + 0.666667 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) intron (NM_182978, intron 1 of 11) 11854 NM_182978 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 147.667-388 chr9 26960463 26960755 + 0.666667 NA intron (NM_001099224, intron 1 of 13) intron (NM_001099224, intron 1 of 13) 4197 NM_025103 80173 Hs.145402 NM_025103 ENSG00000096872 IFT74 BBS20|CCDC2|CMG-1|CMG1 intraflagellar transport 74 protein-coding 116.333-87 chr17 56177975 56178271 + 0.666667 NA intron (NM_153228, intron 1 of 16) intron (NM_153228, intron 1 of 16) 24648 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 112.667-52 chr12 61608822 61609101 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 583878 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 137-86 chr5 101884445 101884774 + 0.666667 NA Intergenic Helitron3Na_Mam|RC|Helitron 411675 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 137-21 chr12 19938628 19939025 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75859 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 194-142 chr8 85124014 85124454 + 0.666667 NA intron (NM_033402, intron 7 of 18) MamRep605|LTR?|LTR? 16996 NM_033402 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 145.667-152 chr2 232361299 232361530 + 0.666667 NA Intergenic LTR45B|LTR|ERV1 -17337 NM_001632 250 Hs.284255 NM_001632 ENSG00000163283 ALPP ALP|ALPI|IAP|PALP|PLAP|PLAP-1 alkaline phosphatase, placental protein-coding 139.333-171 chr4 110953869 110954232 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93403 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 123-48 chr15 69544667 69544963 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16905 NR_026979 145837 Hs.410126 NR_026979 DRAIC - downregulated RNA in cancer, inhibitor of cell invasion and migration ncRNA 131.667-179 chr7 21473572 21473869 + 0.666667 NA intron (NM_003112, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 2662 NR_031594 100302122 NR_031594 ENSG00000221783 MIR1183 MIRN1183|hsa-mir-1183 microRNA 1183 ncRNA 125-112 chr8 91058717 91059022 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 11320 NR_110438 100506365 Hs.153412 NR_110438 ENSG00000253738 OTUD6B-AS1 GS1-251I9.4 OTUD6B antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 114-132 chr6 39098150 39098391 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 16916 NM_018322 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 221.333-58 chr2 41613180 41613687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -264122 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 206.333-117 chr4 36152691 36153176 + 0.666667 NA intron (NR_146894, intron 15 of 32) intron (NR_146894, intron 15 of 32) 91006 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 115.667-167 chr4 114441810 114442007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -156494 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 164-69 chr20 21437985 21438316 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL -40624 NM_033176 644524 NM_033176 ENSG00000125816 NKX2-4 NKX2.4|NKX2D NK2 homeobox 4 protein-coding 119-71 chr2 14274740 14274962 + 0.666667 NA intron (NR_103814, intron 2 of 3) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 126107 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 116.333-127 chr20 22003624 22003833 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50362 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 248.667-10 chr10 37291974 37292445 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16977 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 177.667-19 chr10 59093680 59094102 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 82573 NR_131782 105682749 Hs.592518 NR_131782 CCEPR CCHE1|lncRNA-CCHE1 cervical carcinoma expressed PCNA regulatory lncRNA ncRNA 251-31 chr18 8787791 8788454 + 0.666667 NA intron (NM_015210, intron 7 of 16) intron (NM_015210, intron 7 of 16) 70741 NM_015210 23255 Hs.707920 NM_015210 ENSG00000168502 MTCL1 CCDC165|KIAA0802|SOGA2 microtubule crosslinking factor 1 protein-coding 146-3 chr1 48627212 48627637 + 0.666667 NA intron (NM_001323575, intron 9 of 12) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 149467 NM_024603 79656 Hs.475348 NM_024603 ENSG00000162373 BEND5 C1orf165 BEN domain containing 5 protein-coding 221.667-79 chr7 149548910 149549346 + 0.666667 NA non-coding (NR_027788, exon 8 of 8) non-coding (NR_027788, exon 8 of 8) -51319 NM_001363517 155061 Hs.24643 NM_152557 ENSG00000181220 ZNF746 PARIS zinc finger protein 746 protein-coding 192.333-22 chr10 94067981 94068373 + 0.666667 NA intron (NM_001288989, intron 2 of 32) L2a|LINE|L2 -20849 NM_001165979 51196 Hs.655033 NM_016341 ENSG00000138193 PLCE1 NPHS3|PLCE|PPLC phospholipase C epsilon 1 protein-coding 256-49 chr2 168160802 168161390 + 0.666667 NA intron (NM_013233, intron 5 of 17) intron (NM_013233, intron 5 of 17) 86499 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 119-62 chr16 84710968 84711156 + 0.666667 NA intron (NM_001272075, intron 2 of 14) intron (NM_001272075, intron 2 of 14) 11062 NM_005153 9100 Hs.136778 NM_005153 ENSG00000103194 USP10 UBPO ubiquitin specific peptidase 10 protein-coding 121.667-182 chr6 124650796 124651016 + 0.666667 NA intron (NM_001300738, intron 4 of 7) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR -311639 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 122.667-20 chr10 109760220 109760413 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 162930 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 234-65 chr7 32397450 32398096 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) AluSx3|SINE|Alu 30451 NM_001322059 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 146-13 chr10 95332478 95332889 + 0.666667 NA intron (NM_001034956, intron 24 of 27) AluSz|SINE|Alu -41680 NM_020992 9124 Hs.368525 NM_020992 ENSG00000107438 PDLIM1 CLIM1|CLP-36|CLP36|HEL-S-112|hCLIM1 PDZ and LIM domain 1 protein-coding 171.667-142 chr6 61766678 61767044 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 6 of 13) L1M1|LINE|L1 192731 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 182.333-88 chr2 117666593 117666913 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -147938 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 150.333-346 chr5 158323487 158323779 + 0.666667 NA non-coding (NR_109888, exon 7 of 7) non-coding (NR_109888, exon 7 of 7) 86140 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 150.333-421 chr8 130921325 130921614 + 0.666667 NA intron (NM_001115, intron 5 of 17) AluSp|SINE|Alu 119440 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 174-63 chr3 5469617 5469972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219539 NR_039953 100616334 NR_039953 ENSG00000265180 MIR4790 - microRNA 4790 ncRNA 125-109 chr8 13690089 13690307 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60508 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 243.667-55 chr4 66698450 66698927 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 421864 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 212-49 chr13 94774658 94775265 + 0.666667 NA intron (NR_110754, intron 2 of 4) intron (NR_110754, intron 2 of 4) 14020 NR_110754 101927284 Hs.551673 NR_110754 LOC101927284 - uncharacterized LOC101927284 ncRNA 111.667-148 chr2 222912953 222913135 + 0.666667 NA intron (NM_004457, intron 4 of 16) intron (NM_004457, intron 4 of 16) 52008 NM_001354159 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 114.333-220 chr8 77124402 77124713 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -123513 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 212-139 chr6 84021237 84021725 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -12291 NM_138409 112609 Hs.370055 NM_138409 ENSG00000135324 MRAP2 C6orf117|bA51G5.2 melanocortin 2 receptor accessory protein 2 protein-coding 147.667-334 chr7 51426810 51427220 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -33759 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 159-5 chr1 62075797 62076092 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 31 of 43) intron (NM_001350145, intron 31 of 43) -2842 NR_036058 100422902 NR_036058 ENSG00000263908 MIR3116-1 - microRNA 3116-1 ncRNA 120-107 chr5 57034413 57034695 + 0.666667 NA Intergenic (AAGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -82424 NM_001297598 166968 Hs.657594 NM_152622 ENSG00000155545 MIER3 - MIER family member 3 protein-coding 142.333-147 chr21 25321189 25321613 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 110300 NR_024027 54072 Hs.234016 NM_058184 ENSG00000185433 LINC00158 C21orf42|NCRNA00158 long intergenic non-protein coding RNA 158 ncRNA 178.333-112 chr3 132770982 132771494 + 0.666667 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) L1ME1|LINE|L1 -48779 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 125.333-165 chr7 38007537 38007767 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 86333 NM_001242948 54749 Hs.563491 NM_017549 ENSG00000086289 EPDR1 EPDR|MERP-1|MERP1|UCC1 ependymin related 1 protein-coding 223.333-51 chr17 47179912 47180422 + 0.666667 NA intron (NM_001256, intron 2 of 18) intron (NM_001256, intron 2 of 18) 9128 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 186.333-17 chr10 63765954 63766306 + 0.666667 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 -244240 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 176-61 chr3 135908827 135909160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56735 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 121-33 chr12 39486594 39486887 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43620 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 170.667-35 chr12 122098248 122098645 + 0.666667 NA intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 intron (NM_014938, intron 1 of 16).2 19690 NM_014938 22877 Hs.437153 NM_014938 ENSG00000175727 MLXIP MIR|MONDOA|bHLHe36 MLX interacting protein protein-coding 155.667-378 chr9 12490120 12490413 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -203119 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 136.333-146 chr4 92847874 92848162 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) MER63B|DNA|hAT-Blackjack 543619 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 153-63 chr17 62887671 62887978 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -56391 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 129-49 chr17 76711683 76711919 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001008529) promoter-TSS (NM_001008529) -836 NM_198530 439921 Hs.250723 NM_198530 ENSG00000182534 MXRA7 - matrix remodeling associated 7 protein-coding 128.667-79 chr18 2202094 2202345 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 369286 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 142.333-156 chr3 55692179 55692506 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 15 of 17) intron (NR_132749, intron 15 of 17) -32873 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 169.333-247 chr7 77577962 77578329 + 0.666667 NA intron (NM_001131009, intron 2 of 16) intron (NM_001131009, intron 2 of 16) 40102 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 164.333-240 chr8 129296477 129296810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55403 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 113-73 chr15 94224081 94224374 + 0.666667 NA Intergenic AluSg7|SINE|Alu -73974 NM_001159643 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 120.333-110 chr2 191459605 191459803 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 214300 NM_001161819 4430 Hs.439620 NM_012223 ENSG00000128641 MYO1B MMI-alpha|MMIa|MYH-1c|myr1 myosin IB protein-coding 194.333-108 chr4 168906433 168906863 + 0.666667 NA intron (NM_001367567, intron 5 of 11) AluJr|SINE|Alu 74553 NM_001367570 23022 Hs.151220 NM_016081 ENSG00000129116 PALLD CGI-151|CGI151|MYN|PNCA1|SIH002 palladin, cytoskeletal associated protein protein-coding 146-70 chr20 46104408 46104694 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -13763 NM_001322422 958 Hs.472860 NM_001250 ENSG00000101017 CD40 Bp50|CDW40|TNFRSF5|p50 CD40 molecule protein-coding 160-32 chr12 57227126 57227537 + 0.666667 NA TTS (NM_007224) TTS (NM_007224) -2380 NR_029417 6472 Hs.741179 NM_005412 ENSG00000182199 SHMT2 GLYA|HEL-S-51e|SHMT serine hydroxymethyltransferase 2 protein-coding 144.333-91 chr17 13204923 13205224 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 101687 NR_146885 105371541 NR_146885 ENSG00000234634 LINC02093 - long intergenic non-protein coding RNA 2093 ncRNA 153-111 chr5 34504031 34504390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -152118 NM_015577 26064 Hs.431400 NM_015577 ENSG00000039560 RAI14 NORPEG|RAI13 retinoic acid induced 14 protein-coding 158-98 chr4 158926420 158926740 + 0.666667 NA intron (NM_152543, intron 3 of 4) L1MB7|LINE|L1 108649 NM_152543 152940 Hs.415576 NM_152543 ENSG00000164123 C4orf45 - chromosome 4 open reading frame 45 protein-coding 113-151 chr4 39099593 39099788 + 0.666667 NA intron (NM_199039, intron 5 of 9) L2a|LINE|L2 37458 NM_199039 51088 Hs.272251 NM_015990 ENSG00000109790 KLHL5 - kelch like family member 5 protein-coding 188-31 chr12 118012898 118013310 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -3557 NM_001346815 5985 Hs.731908 NM_007370 ENSG00000111445 RFC5 RFC36 replication factor C subunit 5 protein-coding 159.333-145 chr2 32976464 32976889 + 0.666667 NA intron (NM_206943, intron 2 of 33) L1PA14|LINE|L1 29723 NM_206943 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 123.667-16 chr1 147604904 147605117 + 0.666667 NA intron (NM_004326, intron 2 of 9) intron (NM_004326, intron 2 of 9) 63509 NM_004326 607 Hs.415209 NM_004326 ENSG00000116128 BCL9 LGS BCL9 transcription coactivator protein-coding 218.333-69 chr2 83189883 83190360 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -332693 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 131.333-25 chr10 54709821 54710169 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 91236 NM_001142763 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 111.667-205 chr5 66200821 66201118 + 0.666667 NA Intergenic MER57B2|LTR|ERV1 8477 NR_146488 101928741 Hs.676049 NR_146488 LINC02065 - long intergenic non-protein coding RNA 2065 ncRNA 221-45 chr3 66621608 66622117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 116474 NR_135533 105377143 Hs.553944 NR_135533 LOC105377143 - uncharacterized LOC105377143 ncRNA 115.333-122 chr2 211641174 211641378 + 0.666667 NA intron (NM_001042599, intron 16 of 26) intron (NM_001042599, intron 16 of 26) 785084 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 149-138 chr7 129116904 129117329 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9155 NR_002144 407835 Hs.592273 NR_002144 LOC407835 - mitogen-activated protein kinase kinase 2 pseudogene pseudo 168.667-156 chr4 24648556 24649029 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -64238 NM_001358 1665 Hs.696074 NM_001358 ENSG00000109606 DHX15 DBP1|DDX15|HRH2|PRP43|PRPF43|PrPp43p DEAH-box helicase 15 protein-coding 236-19 chr14 22565061 22565624 + 0.666667 NA intron (NM_001344, intron 2 of 2) intron (NM_001344, intron 2 of 2) -8280 NR_146543 105370400 NR_146543 ENSG00000259054 LINC02332 - long intergenic non-protein coding RNA 2332 ncRNA 128.333-96 chr2 49173974 49174234 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19577 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 162-84 chr3 125161250 125161605 + 0.666667 NA intron (NM_001195483, intron 4 of 12) intron (NM_001195483, intron 4 of 12) -9875 NR_049815 100847039 NR_049815 ENSG00000264986 MIR5092 - microRNA 5092 ncRNA 159.667-233 chr4 60714349 60714677 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208106 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 207.333-68 chr12 106504303 106504850 + 0.666667 NA intron (NM_001160708, intron 27 of 27) MIR3|SINE|MIR -78331 NM_213594 5992 Hs.388827 NM_002920 ENSG00000111783 RFX4 NYD-SP10 regulatory factor X4 protein-coding 228-62 chr4 79926252 79926751 + 0.666667 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 99030 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 113.667-120 chr2 236605886 236606158 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 36197 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 113-110 chr2 107104254 107104503 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -217269 NM_001142352 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 140.667-21 chr1 186839141 186839481 + 0.666667 NA intron (NM_024420, intron 1 of 17) intron (NM_024420, intron 1 of 17) 10362 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 144-31 chr12 8606122 8606472 + 0.666667 NA intron (NM_001330343, intron 2 of 4) intron (NM_001330343, intron 2 of 4) 6562 NM_001330343 57379 Hs.149342 NM_020661 ENSG00000111732 AICDA AID|ARP2|CDA2|HEL-S-284|HIGM2 activation induced cytidine deaminase protein-coding 145.333-84 chr14 53656303 53656703 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 291981 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 150.333-400 chr8 70748547 70748799 + 0.666667 NA Intergenic MER52D|LTR|ERV1 79334 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 163.667-149 chr3 29186374 29186783 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 94361 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 184-84 chr5 52655306 52655785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132371 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 154.667-248 chr3 112575498 112575865 + 0.666667 NA intron (NM_001348908, intron 3 of 4) intron (NM_001348908, intron 3 of 4) 13636 NM_017945 55032 Hs.237480 NM_017945 ENSG00000138459 SLC35A5 - solute carrier family 35 member A5 protein-coding 308-13 chr12 28235166 28235775 + 0.666667 NA intron (NM_001352082, intron 2 of 13) intron (NM_001352082, intron 2 of 13) -44732 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 116.667-24 chr11 88409713 88410047 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -72144 NM_001814 1075 Hs.128065 NM_001814 ENSG00000109861 CTSC CPPI|DPP-I|DPP1|DPPI|HMS|JP|JPD|PALS|PDON1|PLS cathepsin C protein-coding 200.333-21 chr11 84335177 84335769 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -18134 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 177.333-180 chr9 80540778 80541172 + 0.666667 NA Intergenic Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 565952 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 119.667-5 chr1 52454498 52454823 + 0.666667 NA intron (NM_001009881, intron 20 of 29) L1MC1|LINE|L1 50058 NM_032864 84950 Hs.5301 NM_032284 ENSG00000134748 PRPF38A PRP38A|Prp38 pre-mRNA processing factor 38A protein-coding 212.333-47 chr14 69946373 69946852 + 0.666667 NA intron (NM_001034852, intron 1 of 11) intron (NM_001034852, intron 1 of 11) -31521 NR_145786 109623479 NR_145786 SNORD169 - small nucleolar RNA, C/D box 169 snoRNA 113-140 chr3 97876957 97877129 + 0.666667 NA exon (NM_153605, exon 4 of 22) exon (NM_153605, exon 4 of 22) 55032 NM_153605 131544 Hs.733378 NM_153605 ENSG00000080200 CRYBG3 DKFZp667G2110|vlAKAP crystallin beta-gamma domain containing 3 protein-coding 196.333-107 chr3 72040143 72040521 + 0.666667 NA intron (NR_104116, intron 6 of 6) intron (NR_104116, intron 6 of 6) 60123 NR_104116 285286 Hs.559386 NR_104116 ENSG00000241163 LINC00877 - long intergenic non-protein coding RNA 877 ncRNA 149-120 chr5 145802595 145802892 + 0.666667 NA intron (NM_205846, intron 4 of 6) intron (NM_205846, intron 4 of 6) 32599 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 174.333-50 chr17 80462080 80462443 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14346 NM_002522 4884 Hs.514556 NM_002522 ENSG00000171246 NPTX1 NP1 neuronal pentraxin 1 protein-coding 199-5 chr1 203352439 203352930 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -1562 NM_002023 2331 Hs.519168 NM_002023 ENSG00000122176 FMOD FM|SLRR2E fibromodulin protein-coding 135.333-32 chr11 13501329 13501594 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5286 NM_001316352 5741 Hs.37045 NM_000315 ENSG00000152266 PTH PTH1 parathyroid hormone protein-coding 112-219 chrX 131867078 131867258 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -36525 NR_026975 286467 Hs.720385 NR_026975 ENSG00000213468 FIRRE LINC01200 firre intergenic repeating RNA element ncRNA 138.333-35 chr10 116894856 116895118 + 0.666667 NA intron (NM_018330, intron 14 of 14) intron (NM_018330, intron 14 of 14) -45265 NM_001330164 259217 Hs.648448 NM_025015 ENSG00000165868 HSPA12A - heat shock protein family A (Hsp70) member 12A protein-coding 122-15 chr10 80338880 80339155 + 0.666667 NA intron (NM_001370156, intron 6 of 7) intron (NM_001370156, intron 6 of 7) -5728 NR_070308 84332 Hs.741500 NM_032372 ENSG00000133665 DYDC2 - DPY30 domain containing 2 protein-coding 117.333-160 chr4 149141197 149141515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12939 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 261-31 chr19 40110371 40110907 + 0.666667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -19696 NM_001142579 284323 Hs.115140 NM_001010880 ENSG00000197782 ZNF780A ZNF780 zinc finger protein 780A protein-coding 154.667-299 chr5 18569195 18569559 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 762103 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 148.333-381 chr8 83000811 83001164 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 88883 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 122.667-39 chr12 63152093 63152296 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_000706, exon 1 of 2) 5' UTR (NM_000706, exon 1 of 2) 616 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 164.667-40 chr11 94944914 94945233 + 0.666667 NA Intergenic L4_A_Mam|LINE|RTE-X 28483 NM_016403 51503 Hs.503597 NM_016403 ENSG00000150316 CWC15 AD002|C11orf5|Cwf15|HSPC148|ORF5 CWC15 spliceosome associated protein homolog protein-coding 135.333-6 chr1 64854308 64854581 + 0.666667 NA intron (NM_002227, intron 11 of 24) MIR3|SINE|MIR 109369 NM_018211 55225 Hs.591443 NM_018211 ENSG00000162437 RAVER2 - ribonucleoprotein, PTB binding 2 protein-coding 147.333-135 chr16 69688759 69689083 + 0.666667 NA intron (NM_173215, intron 11 of 13) intron (NM_173215, intron 11 of 13) 19754 NR_145753 109617018 NR_145753 SNORD13H - small nucleolar RNA, C/D box 13H snoRNA 154.667-263 chr3 188033377 188033704 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -57133 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 155.667-276 chr5 64752548 64752987 + 0.666667 NA intron (NM_173829, intron 2 of 4) intron (NM_173829, intron 2 of 4) 15924 NM_173829 285672 Hs.69504 NM_173829 ENSG00000153006 SREK1IP1 P18SRP|SFRS12IP1 SREK1 interacting protein 1 protein-coding 113-71 chr15 66465076 66465337 + 0.666667 NA intron (NM_002755, intron 5 of 10) LTR2|LTR|ERV1 31828 NR_039737 100616149 NR_039737 ENSG00000266589 MIR4512 - microRNA 4512 ncRNA 189.333-6 chr1 62517765 62518264 + 0.666667 NA intron (NM_001367561, intron 31 of 49) L1ME3C|LINE|L1 -79506 NM_014495 27329 Hs.209153 NM_014495 ENSG00000132855 ANGPTL3 ANG-5|ANGPT5|ANL3|FHBL2 angiopoietin like 3 protein-coding 224-19 chr13 33877801 33878329 + 0.666667 NA intron (NM_181558, intron 8 of 8) MIRb|SINE|MIR 59916 NM_002915 5983 Hs.115474 NM_002915 ENSG00000133119 RFC3 RFC38 replication factor C subunit 3 protein-coding 138.667-66 chr14 98079254 98079541 + 0.666667 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner -101273 NR_152750 388011 Hs.651477 NR_015430 ENSG00000246223 LINC01550 C14orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1550 ncRNA 188.333-81 chr2 182968206 182968647 + 0.666667 NA intron (NM_013436, intron 15 of 30) LTR40c|LTR|ERVL 70031 NM_205842 10787 Hs.603732 NM_013436 ENSG00000061676 NCKAP1 HEM2|NAP1|NAP125|p125Nap1 NCK associated protein 1 protein-coding 112.667-172 chr3 89691183 89691391 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 583666 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 177.333-175 chr8 137171853 137172217 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 241553 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 155.333-328 chr6 46588407 46588706 + 0.666667 NA intron (NM_016593, intron 8 of 11) intron (NM_016593, intron 8 of 11) 64262 NM_016593 51302 Hs.387367 NM_016593 ENSG00000146233 CYP39A1 - cytochrome P450 family 39 subfamily A member 1 protein-coding 133 chr1 10989240 10989599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7382 NM_001170754 148345 Hs.127026 NM_173507 ENSG00000175262 C1orf127 - chromosome 1 open reading frame 127 protein-coding 136-91 chr6 28239755 28240004 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 12390 NM_019110 387032 Hs.44720 NM_019110 ENSG00000187626 ZKSCAN4 P1P373C6|ZNF307|ZNF427|ZSCAN36 zinc finger with KRAB and SCAN domains 4 protein-coding 130.667-23 chr10 41912683 41912924 + 0.666667 NA Intergenic (AATGG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 455242 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 132-10 chr1 166596776 166597047 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -7005 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 156.667-247 chr4 91961490 91961875 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 315620 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 158.333-4 chr1 39909202 39909534 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -7451 NM_001033082 4610 Hs.437922 NM_005376 ENSG00000116990 MYCL L-Myc|LMYC|MYCL1|bHLHe38 MYCL proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 257-64 chr7 4507572 4508152 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -174433 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 143-73 chr2 140922208 140922620 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 21 of 90) intron (NM_018557, intron 21 of 90) -335729 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 154-23 chr11 37733944 37734284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -204487 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 190.333-140 chr8 53541387 53541824 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17640 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 182.667-76 chr2 57811221 57811620 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -96231 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 154.333-127 chr17 79917149 79917482 + 0.666667 NA non-coding (NR_110850, exon 5 of 6) non-coding (NR_110850, exon 5 of 6) -2042 NR_110851 101928738 Hs.399280 NR_110851 ENSG00000262188 LINC01978 - long intergenic non-protein coding RNA 1978 ncRNA 268.333-14 chr13 32148389 32148960 + 0.666667 NA intron (NM_023037, intron 13 of 60) MIRc|SINE|MIR 116900 NM_023037 10129 Hs.507669 NM_023037 ENSG00000073910 FRY 13CDNA73|214K23.2|C13orf14|CG003|bA207N4.2|bA37E23.1 FRY microtubule binding protein protein-coding 190-52 chr17 62920279 62920671 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -23740 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 231.667-38 chr20 21270226 21270604 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -32916 NM_012255 22803 Hs.255932 NM_012255 ENSG00000088930 XRN2 - 5'-3' exoribonuclease 2 protein-coding 114.333-31 chr10 81806035 81806370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68992 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 179.667-92 chr3 48993751 48994225 + 0.666667 NA intron (NM_177939, intron 2 of 8) intron (NM_177939, intron 2 of 8) 3747 NM_177939 54681 Hs.654944 NM_017732 ENSG00000178467 P4HTM EGLN4|HIFPH4|P4H-TM|PH-4|PH4|PHD4 prolyl 4-hydroxylase, transmembrane protein-coding 224-114 chr9 71730068 71730617 + 0.666667 NA intron (NM_001349784, intron 8 of 23) intron (NM_001349784, intron 8 of 23) 38171 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 165.333-158 chr3 22477844 22478163 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 520864 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 116.667-63 chr15 63382243 63382442 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001293642) promoter-TSS (NM_001293642) -232 NM_206925 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 152-17 chr1 241487497 241487804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32135 NM_000143 2271 Hs.592490 NM_000143 ENSG00000091483 FH FMRD|HLRCC|HsFH|LRCC|MCL|MCUL1 fumarate hydratase protein-coding 166.333-2 chr1 38787133 38787627 + 0.666667 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL 72392 NM_022157 64121 Hs.532461 NM_022157 ENSG00000116954 RRAGC GTR2|RAGC|TIB929 Ras related GTP binding C protein-coding 113.333-108 chr18 29608144 29608369 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -690654 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 115.667-189 chr6 40458414 40458637 + 0.666667 NA intron (NM_020737, intron 1 of 2) intron (NM_020737, intron 1 of 2) 80188 NR_160958 732253 Hs.180197 NM_001359094 TDRG1 LINC00532|lincRNA-NR_024015 testis development related 1 ncRNA 176.333-96 chr20 8048448 8048948 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -28937 NM_021156 56255 Hs.169358 NM_021156 ENSG00000125827 TMX4 DJ971N18.2|PDIA14|TXNDC13 thioredoxin related transmembrane protein 4 protein-coding 126.333-45 chr14 42980801 42981099 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1374094 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 138.333-193 chr8 69197327 69197593 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -93270 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 138.667-197 chr8 15664762 15665008 + 0.666667 NA intron (NM_001356429, intron 5 of 10) intron (NM_001356429, intron 5 of 10) 124622 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 180.667-90 chr3 3755819 3756208 + 0.666667 NA intron (NR_149025, intron 5 of 5) intron (NR_149025, intron 5 of 5) -43418 NM_001324189 57633 Hs.163244 NM_020873 ENSG00000175928 LRRN1 FIGLER3|NLRR-1 leucine rich repeat neuronal 1 protein-coding 184.333-99 chr3 22296949 22297256 + 0.666667 NA Intergenic MER115|DNA|hAT-Tip100 339963 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 132.667-88 chr2 95368656 95369049 + 0.666667 NA intron (NM_001034914, intron 1 of 7) intron (NM_001034914, intron 1 of 7) 22194 NM_001034914 30818 Hs.437376 NM_013434 ENSG00000115041 KCNIP3 CSEN|DREAM|KCHIP3 potassium voltage-gated channel interacting protein 3 protein-coding 115-127 chr5 56668136 56668446 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62035 NR_161255 101928448 Hs.208052 NM_001287053 ENSG00000225940 C5orf67 - chromosome 5 open reading frame 67 ncRNA 179.667-50 chr14 79238865 79239250 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 39075 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 146.333-50 chr11 81706284 81706506 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 184441 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 121-36 chr12 120630841 120631073 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9662 NM_001033677 9478 Hs.458482 NM_004276 ENSG00000157782 CABP1 CALBRAIN|HCALB_BR calcium binding protein 1 protein-coding 195-51 chr17 70802693 70803235 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 399215 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 125-89 chr5 84495386 84495688 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -110657 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 165-23 chr14 33982051 33982400 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31151 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 168.333-184 chr6 137369388 137369734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 124833 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 154.667-310 chr5 44889275 44889595 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 80488 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 127-63 chr3 197175098 197175317 + 0.666667 NA intron (NM_001290983, intron 5 of 25) intron (NM_001290983, intron 5 of 25) 8665 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 141.667-96 chr17 58575598 58575894 + 0.666667 NA intron (NM_031272, intron 21 of 31) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -31418 NM_001368772 5414 Hs.287518 NM_004574 ENSG00000108387 SEPTIN4 ARTS|BRADEION|C17orf47|CE5B3|H5|MART|PNUTL2|SEP4|SEPT4|hCDCREL-2|hucep-7 septin 4 protein-coding 153.333-104 chr13 28765799 28766092 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -46932 NM_181785 283537 Hs.117167 NM_181785 ENSG00000139508 SLC46A3 FKSG16 solute carrier family 46 member 3 protein-coding 138.667-212 chr9 3615187 3615531 + 0.666667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -52727 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 182.667-125 chr4 135982860 135983245 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69372 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 189-4 chr1 178748385 178748816 + 0.666667 NA intron (NM_152663, intron 1 of 19) AluSx1|SINE|Alu 23356 NM_152663 55103 Hs.632485 NM_018037 ENSG00000116191 RALGPS2 dJ595C2.1 Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2 protein-coding 182-17 chr10 71834046 71834437 + 0.666667 NA intron (NM_001042465, intron 2 of 14) MIRc|SINE|MIR 17010 NM_001042466 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 175.333-156 chr6 55881791 55882310 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6460 NM_001329756 653 Hs.296648 NM_021073 ENSG00000112175 BMP5 - bone morphogenetic protein 5 protein-coding 175.333-134 chr4 62593907 62594208 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -432292 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-217 chr20 46370456 46370721 + 0.666667 NA intron (NM_133171, intron 19 of 21) intron (NM_133171, intron 19 of 21) -6130 NM_001281458 51006 Hs.593344 NM_015945 ENSG00000080189 SLC35C2 BA394O2.1|C20orf5|CGI-15|OVCOV1 solute carrier family 35 member C2 protein-coding 234.333-44 chr2 200892717 200893174 + 0.666667 NA intron (NM_001369445, intron 2 of 6) intron (NM_001369445, intron 2 of 6) 1027 NM_001142356 60491 Hs.145284 NM_021824 ENSG00000196290 NIF3L1 ALS2CR1|CALS-7|MDS015 NGG1 interacting factor 3 like 1 protein-coding 125.667-145 chr5 35703163 35703388 + 0.666667 NA intron (NM_024867, intron 16 of 36) intron (NM_024867, intron 16 of 36) 85412 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 197.667-80 chr22 24932239 24932647 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14252 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 166.333-195 chr6 36536927 36537270 + 0.666667 NA intron (NM_007271, intron 2 of 13) L1ME2z|LINE|L1 10381 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 148.333-318 chr5 88327955 88328273 + 0.666667 NA intron (NR_105019, intron 6 of 7) intron (NR_105019, intron 6 of 7) 59098 NR_105019 100505894 Hs.559426 NR_039993 ENSG00000247828 TMEM161B-AS1 linc-POLR3G-8 TMEM161B antisense RNA 1 ncRNA 136.667-57 chr14 57659841 57660101 + 0.666667 NA intron (NM_001352014, intron 1 of 9) intron (NM_001352014, intron 1 of 9) -166114 NM_001283058 55195 Hs.659706 NM_018168 ENSG00000100557 CCDC198 C14orf105 coiled-coil domain containing 198 protein-coding 126.667-43 chr13 43238527 43238740 + 0.666667 NA intron (NM_001347966, intron 15 of 17) intron (NM_001347966, intron 15 of 17) 125468 NR_047013 100874159 Hs.633241 NR_047013 LINC00400 - long intergenic non-protein coding RNA 400 ncRNA 139-20 chr11 78391847 78392247 + 0.666667 NA intron (NM_080491, intron 1 of 9) AluSx3|SINE|Alu 25773 NM_080491 9846 Hs.429434 NM_012296 ENSG00000033327 GAB2 - GRB2 associated binding protein 2 protein-coding 127.667-209 chrX 113250078 113250434 + 0.666667 NA intron (NR_110399, intron 3 of 3) L1MA1|LINE|L1 207529 NR_110399 101928437 Hs.640112 NR_110399 LOC101928437 - uncharacterized LOC101928437 ncRNA 150.667-258 chr4 46498461 46498784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -108494 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 151.667-237 chr3 169116276 169116688 + 0.666667 NA exon (NM_001164000, exon 7 of 15) exon (NM_001164000, exon 7 of 15) 29041 NM_001366472 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 191.667-90 chr4 86837 87258 + 0.666667 NA exon (NM_182524, exon 4 of 4) exon (NM_182524, exon 4 of 4) 33726 NM_182524 152687 Hs.709469 NM_182524 ENSG00000272602 ZNF595 - zinc finger protein 595 protein-coding 112.667-244 chr7 25112474 25112705 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 12772 NM_018947 54205 Hs.437060 NM_018947 ENSG00000172115 CYCS CYC|HCS|THC4 cytochrome c, somatic protein-coding 120.667-153 chr6 146040213 146040523 + 0.666667 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) L1M1|LINE|L1 11170 NM_001278067 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 208-42 chr13 55391660 55392087 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 217419 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 135.667-118 chr3 72652932 72653331 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 11118 NR_135531 105377162 Hs.123457 NR_135531 LOC105377162 - uncharacterized LOC105377162 ncRNA 128.667-159 chr6 68077614 68077849 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 22380 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 251.667-20 chr13 26166598 26167088 + 0.666667 NA intron (NM_183045, intron 5 of 5) AluSz|SINE|Alu 54914 NM_183044 6049 Hs.136885 NM_005977 ENSG00000127870 RNF6 - ring finger protein 6 protein-coding 202.667-140 chr7 106651809 106652377 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9065 NM_175884 168455 Hs.29692 NM_175884 ENSG00000253276 CCDC71L C7orf74 coiled-coil domain containing 71 like protein-coding 142-141 chr7 25635929 25636203 + 0.666667 NA intron (NR_157815, intron 3 of 4) intron (NR_157815, intron 3 of 4) 27074 NR_157826 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 198.333-86 chr18 12296827 12297210 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner -10651 NM_001303524 84617 Hs.193491 NM_032525 ENSG00000176014 TUBB6 FPVEPD|HsT1601|TUBB-5 tubulin beta 6 class V protein-coding 172.667-164 chr9 27685685 27686069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -112011 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 125-28 chr12 49726177 49726398 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -15270 NM_003217 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 146.667-277 chr6 56028944 56029238 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62571 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 144.333-248 chr7 69936600 69936958 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 338304 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 129.667-86 chr2 4746978 4747347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90940 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 199.667-54 chr15 85326789 85327141 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53631 NR_106993 102465803 NR_106993 ENSG00000284160 MIR7706 hsa-mir-7706 microRNA 7706 ncRNA 140.667-254 chr9 113125137 113125507 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12426 NR_024366 286333 Hs.99052 NR_024366 ENSG00000231528 FAM225A C9orf109|LINC00256A|NCRNA00256A family with sequence similarity 225 member A ncRNA 126.667-22 chr10 126196729 126197079 + 0.666667 NA intron (NM_001288974, intron 3 of 18) intron (NM_001288974, intron 3 of 18) 191573 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 178.667-35 chr12 31656197 31656664 + 0.666667 NA intron (NM_001135864, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 -2773 NM_173802 254013 Hs.740628 NM_173802 ENSG00000139160 ETFBKMT C12orf72|ETFB-KMT|METTL20 electron transfer flavoprotein subunit beta lysine methyltransferase protein-coding 158.667-56 chr11 37252413 37252717 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -654286 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 194-157 chrX 29446660 29447020 + 0.666667 NA intron (NM_014271, intron 5 of 10) MER63D|DNA|hAT-Blackjack -127438 NR_049877 100847047 NR_049877 ENSG00000264090 MIR4666B - microRNA 4666b ncRNA 150-109 chr4 181678732 181679030 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 151092 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 124.333-144 chr5 64956181 64956455 + 0.666667 NA intron (NM_005869, intron 11 of 13) intron (NM_005869, intron 11 of 13) 187388 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 165-28 chr17 18849908 18850340 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6175 NM_001243942 5636 Hs.632236 NM_002767 ENSG00000141127 PRPSAP2 PAP41 phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 2 protein-coding 151-124 chr8 27922788 27923085 + 0.666667 NA intron (NM_173833, intron 3 of 8) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -36820 NR_036249 100422828 NR_036249 ENSG00000265847 MIR4287 - microRNA 4287 ncRNA 131-89 chr6 162106083 162106376 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 4 of 11) HAL1ME|LINE|L1 -620903 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 165-11 chr10 72725786 72726188 + 0.666667 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) intron (NR_073062, intron 3 of 9) 4958 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 121 chr1 29161017 29161229 + 0.666667 NA intron (NM_005626, intron 1 of 5) intron (NM_005626, intron 1 of 5) 20777 NM_005626 6429 Hs.469970 NM_005626 ENSG00000116350 SRSF4 SFRS4|SRP75 serine and arginine rich splicing factor 4 protein-coding 178.667-71 chr19 44604214 44604511 + 0.666667 NA Intergenic LTR9A1|LTR|ERV1 -9201 NM_001205280 147710 Hs.512509 NM_001205280 ENSG00000216588 IGSF23 - immunoglobulin superfamily member 23 protein-coding 120.333-206 chrX 122948513 122948849 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -235562 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 111.667-25 chr10 26870050 26870332 + 0.666667 NA Intergenic LTR81A|LTR|Gypsy -9104 NM_001178116 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 157-90 chr3 130461309 130461631 + 0.666667 NA intron (NM_001278298, intron 37 of 40) MIRb|SINE|MIR -98864 NM_001102608 131873 Hs.591282 NM_001102608 ENSG00000206384 COL6A6 - collagen type VI alpha 6 chain protein-coding 192-21 chr10 74725961 74726464 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -99043 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 204-117 chr20 54182375 54182965 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8684 NM_001128915 1591 Hs.89663 NM_000782 ENSG00000019186 CYP24A1 CP24|CYP24|HCAI|HCINF1|P450-CC24 cytochrome P450 family 24 subfamily A member 1 protein-coding 112-18 chr10 55459894 55460187 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -139002 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 130.667-212 chrX 116999104 116999367 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -181375 NR_145523 100126447 Hs.695847 NR_145523 LOC100126447 - uncharacterized LOC100126447 ncRNA 121.667-216 chr9 3743474 3743735 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75518 NR_121586 101929302 Hs.122828 NR_121586 ENSG00000232104 RFX3-AS1 CVAT7 RFX3 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-76 chr11 104711443 104711853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102346 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 210-15 chr10 8987691 8988302 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90007 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 153.667-140 chr15 95627443 95627882 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 194569 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 191.333-36 chr11 87210103 87210504 + 0.666667 NA intron (NR_033149, intron 4 of 13) L1P4a|LINE|L1 172369 NM_022918 65084 Hs.188591 NM_022918 ENSG00000166575 TMEM135 PMP52 transmembrane protein 135 protein-coding 139.333-75 chr14 71695279 71695581 + 0.666667 NA intron (NM_001354286, intron 14 of 24) intron (NM_001354286, intron 14 of 24) 109132 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 220.333-70 chr20 6909410 6909876 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 141957 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 177-55 chr4 39390780 39391234 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15923 NM_175737 152831 Hs.90756 NM_175737 ENSG00000134962 KLB BKL klotho beta protein-coding 156-57 chr16 83649926 83650232 + 0.666667 NA intron (NM_001220489, intron 7 of 12) intron (NM_001220489, intron 7 of 12) 141733 NR_036147 100422853 NR_036147 ENSG00000263785 MIR3182 mir-3182 microRNA 3182 ncRNA 147.333-200 chr22 21701596 21701929 + 0.666667 NA intron (NM_013313, intron 4 of 4) intron (NM_013313, intron 4 of 4) 34032 NR_130910 29799 Hs.517436 NM_013313 ENSG00000100027 YPEL1 FKSG3 yippee like 1 protein-coding 117.667-183 chr7 110608011 110608354 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -482824 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 243-13 chr10 72111589 72112089 + 0.666667 NA intron (NM_001369103, intron 8 of 9) AluY|SINE|Alu -22807 NM_014767 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 197-105 chr6 158501366 158501801 + 0.666667 NA intron (NM_001007466, intron 12 of 12) intron (NM_001007466, intron 12 of 12) -34853 NM_020823 57583 Hs.99145 NM_020823 ENSG00000146433 TMEM181 GPR178|KIAA1423 transmembrane protein 181 protein-coding 143.333-24 chr10 18430999 18431324 + 0.666667 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) AluJr4|SINE|Alu 30586 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 155.333-348 chr6 153685394 153685697 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -324951 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 126-105 chr7 34709834 34710158 + 0.666667 NA intron (NM_001300934, intron 2 of 6) intron (NM_001300934, intron 2 of 6) 48276 NR_033664 404744 Hs.487951 NM_207283 ENSG00000197085 NPSR1-AS1 AAA1 NPSR1 antisense RNA 1 ncRNA 206-155 chr6 63568329 63568898 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -3399 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 189-29 chr14 69292887 69293412 + 0.666667 NA intron (NM_020692, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR 32991 NM_001168368 57452 Hs.21035 NM_020692 ENSG00000100626 GALNT16 GALNACT16|GALNTL1|GalNAc-T16 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 protein-coding 211.667-48 chr18 7319203 7319667 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88331 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 152.667-364 chr8 65959312 65959599 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR -55523 NM_001349432 85479 Hs.491885 NM_033105 ENSG00000147570 DNAJC5B CSP-beta DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5 beta protein-coding 190.667-135 chr7 27800957 27801408 + 0.666667 NA intron (NM_001362795, intron 13 of 14) intron (NM_001362795, intron 13 of 14) 61087 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 112.667-131 chr2 121116171 121116348 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 168943 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 174.667-16 chr1 222637393 222637818 + 0.666667 NA intron (NM_198551, intron 6 of 27) L1MC5|LINE|L1 -6698 NM_001324065 375056 Hs.118474 NM_198551 ENSG00000154305 MIA3 ARNT|D320|TANGO|TANGO1|UNQ6077 MIA SH3 domain ER export factor 3 protein-coding 208.667-76 chr2 226289161 226289614 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 146593 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 200-107 chr3 130780563 130781004 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -33954 NM_014602 30849 Hs.149032 NM_014602 ENSG00000196455 PIK3R4 VPS15|p150 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4 protein-coding 138.667-185 chr6 134188142 134188499 + 0.666667 NA intron (NM_001143676, intron 3 of 13) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -10459 NM_001143677 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 173-86 chr6 122533636 122534008 + 0.666667 NA intron (NM_001270393, intron 3 of 7) intron (NM_001270393, intron 3 of 7) 61905 NM_001270394 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 123.333-8 chr1 76468265 76468594 + 0.666667 NA intron (NM_001349109, intron 3 of 3) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 310838 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 123-62 chr19 48505543 48505798 + 0.666667 NA intron (NM_001080434, intron 6 of 15) AluSq2|SINE|Alu 7519 NM_001080434 114783 Hs.207426 NM_001080434 ENSG00000142235 LMTK3 LMR3|PPP1R101|TYKLM3 lemur tyrosine kinase 3 protein-coding 127.667-140 chr5 51585889 51586265 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 202629 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 154-116 chr5 119389722 119390155 + 0.666667 NA intron (NM_014350, intron 1 of 1) intron (NM_014350, intron 1 of 1) 33919 NM_014350 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 137-14 chr11 8321722 8321972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53060 NM_001270428 4004 Hs.654426 NM_002315 ENSG00000166407 LMO1 RBTN1|RHOM1|TTG1 LIM domain only 1 protein-coding 145.667-46 chr11 37047127 37047410 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -448989 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 296.333-31 chr4 5843333 5843777 + 0.666667 NA intron (NM_001014809, intron 6 of 13) intron (NM_001014809, intron 6 of 13) 44258 NM_001288662 1400 Hs.135270 NM_001313 ENSG00000072832 CRMP1 CRMP-1|DPYSL1|DRP-1|DRP1|ULIP-3 collapsin response mediator protein 1 protein-coding 131.667-206 chr8 131342074 131342304 + 0.666667 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -301280 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 161-36 chr17 62923578 62923940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20456 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 145.667-253 chr6 78500107 78500393 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 39059 NR_162115 113218491 NR_162115 MIR10524 - microRNA 10524 ncRNA 112-114 chr2 155696776 155697054 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 558016 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 185-69 chr7 91558771 91559292 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 294598 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 117.667-112 chr22 36249609 36249856 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -3339 NM_145343 8542 Hs.114309 NM_003661 ENSG00000100342 APOL1 APO-L|APOL|APOL-I|FSGS4 apolipoprotein L1 protein-coding 114.333-71 chr14 45910771 45911057 + 0.666667 NA Intergenic LTR1F2|LTR|ERV1 -153245 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 127-106 chr9 114689232 114689487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7270 NR_144867 100505478 Hs.200101 NM_001199233 ENSG00000230601 TEX48 - testis expressed 48 protein-coding 146.333-238 chr4 99008858 99009139 + 0.666667 NA intron (NM_015143, intron 1 of 10) L1MB2|LINE|L1 11611 NR_037455 100500867 NR_037455 ENSG00000265213 MIR3684 - microRNA 3684 ncRNA 145-23 chr12 120890901 120891238 + 0.666667 NA intron (NM_139015, intron 1 of 10) intron (NM_139015, intron 1 of 10) 13289 NM_139015 121665 Hs.507087 NM_139015 ENSG00000157837 SPPL3 IMP2|MDHV1887|PRO4332|PSH1|PSL4 signal peptide peptidase like 3 protein-coding 167-78 chr4 110693379 110693751 + 0.666667 NA Intergenic L1HS|LINE|L1 -51442 NM_153427 5308 Hs.643588 NM_000325 ENSG00000164093 PITX2 ARP1|ASGD4|Brx1|IDG2|IGDS|IGDS2|IHG2|IRID2|Otlx2|PTX2|RGS|RIEG|RIEG1|RS paired like homeodomain 2 protein-coding 140.667-143 chr3 27355553 27355935 + 0.666667 NA intron (NM_152534, intron 2 of 38) L2a|LINE|L2 13639 NM_199347 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 189.333-124 chr22 48967233 48967557 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 100625 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 127.667-205 chrX 65533250 65533591 + 0.666667 NA intron (NM_001170650, intron 1 of 11) intron (NM_001170650, intron 1 of 11) 1386 NM_001170649 81887 Hs.522675 NM_031206 ENSG00000001497 LAS1L Las1-like|WTS|dJ475B7.2 LAS1 like, ribosome biogenesis factor protein-coding 154.333-338 chr8 72961614 72962012 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -47051 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 128-53 chr2 178866077 178866366 + 0.666667 NA intron (NM_173648, intron 16 of 23) intron (NM_173648, intron 16 of 23) -58798 NM_133432 7273 Hs.134602 NM_003319 ENSG00000155657 TTN CMD1G|CMH9|CMPD4|EOMFC|HMERF|LGMD2J|LGMDR10|MYLK5|SALMY|TMD titin protein-coding 135-67 chr3 83838305 83838544 + 0.666667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 1031151 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 149-143 chr8 76515605 76515899 + 0.666667 NA intron (NR_105006, intron 4 of 5) L1PA17|LINE|L1 109098 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 154-20 chr11 8865350 8865712 + 0.666667 NA intron (NM_005418, intron 2 of 22) intron (NM_005418, intron 2 of 22) 45420 NM_005418 6764 Hs.117715 NM_005418 ENSG00000166444 ST5 DENND2B|HTS1|p126 suppression of tumorigenicity 5 protein-coding 123.667-173 chr7 93386701 93387069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 95970 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 179-49 chr19 6036696 6037164 + 0.666667 NA intron (NM_000635, intron 5 of 17) L1ME1|LINE|L1 58527 NR_046376 100128568 Hs.624525 NR_046376 ENSG00000266983 LOC100128568 - uncharacterized LOC100128568 ncRNA 124-109 chr7 53626995 53627217 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 184825 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 119-125 chr6 34932996 34933332 + 0.666667 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) L1MC|LINE|L1 43909 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 177.333-95 chr20 11641409 11641781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 229120 NR_110635 728450 Hs.560990 NR_110635 ENSG00000228422 LINC00687 C20orf61|dJ1012F16.1 long intergenic non-protein coding RNA 687 ncRNA 168-86 chr4 103987541 103987894 + 0.666667 NA Intergenic MLT-int|LTR|ERVL-MaLR -267732 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 158-2 chr1 79813321 79813645 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -722272 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 199-85 chr5 62114970 62115400 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190977 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 126.667-39 chr12 66597325 66597528 + 0.666667 NA intron (NM_001366724, intron 1 of 23) intron (NM_001366724, intron 1 of 23) 81650 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 149.333-436 chr9 96175656 96176091 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59462 NR_132344 158434 Hs.381771 NM_001256408 ENSG00000275465 LOC158434 - uncharacterized LOC158434 ncRNA 203.667-120 chr8 80334984 80335479 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 93842 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 150-25 chr11 43473747 43474042 + 0.666667 NA intron (NM_018259, intron 21 of 23) AluSz|SINE|Alu -85762 NR_031577 100313777 NR_031577 ENSG00000211568 MIR670 hsa-mir-670 microRNA 670 ncRNA 137.667-68 chr16 13674126 13674368 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -245910 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 164.333-104 chr18 71401803 71402118 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 176996 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 115-115 chr3 87619881 87620082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -172725 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 206.333-143 chr6 116250426 116250964 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_021648, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_021648, exon 1 of 1) 3380 NM_021648 23270 Hs.284141 NM_021648 ENSG00000187189 TSPYL4 dJ486I3.2 TSPY like 4 protein-coding 147-116 chr5 142794561 142794941 + 0.666667 NA intron (NM_001349547, intron 1 of 21) intron (NM_001349547, intron 1 of 21) 23524 NM_001349547 23092 Hs.654668 NM_015071 ENSG00000145819 ARHGAP26 GRAF|GRAF1|OPHN1L|OPHN1L1 Rho GTPase activating protein 26 protein-coding 186.667-94 chr3 105523407 105523831 + 0.666667 NA intron (NM_001243280, intron 2 of 14) intron (NM_001243280, intron 2 of 14) 156710 NM_001627 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 207.333-175 chr3 16346193 16346714 + 0.666667 NA intron (NM_015150, intron 7 of 9) intron (NM_015150, intron 7 of 9) 81241 NM_138381 92106 Hs.655449 NM_138381 ENSG00000154814 OXNAD1 - oxidoreductase NAD binding domain containing 1 protein-coding 118.667-109 chr2 157924530 157924863 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48366 NM_001111067 90 Hs.470316 NM_001105 ENSG00000115170 ACVR1 ACTRI|ACVR1A|ACVRLK2|ALK2|FOP|SKR1|TSRI activin A receptor type 1 protein-coding 155.333-101 chr14 45444455 45444716 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -191383 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 116.667-88 chr2 9029361 9029582 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -25787 NM_001321267 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 175.333-171 chr7 45925830 45926202 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -4744 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 130-136 chrX 46877005 46877248 + 0.666667 NA intron (NM_006915, intron 3 of 4) intron (NM_006915, intron 3 of 4) 22578 NR_046101 724087 Hs.679235 NR_046101 ENSG00000204904 LINC01545 CXorf31 long intergenic non-protein coding RNA 1545 ncRNA 148.667-22 chr1 187507772 187508110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64313 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 158.667-347 chr9 35497015 35497339 + 0.666667 NA intron (NM_001330740, intron 1 of 10) intron (NM_001330740, intron 1 of 10) 7066 NM_001330740 9853 Hs.493796 NM_014806 ENSG00000198853 RUSC2 Iporin|MRT61 RUN and SH3 domain containing 2 protein-coding 205-66 chr4 80224249 80224712 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 26977 NM_001099403 56978 Hs.373642 NM_020226 ENSG00000152784 PRDM8 EPM10|KMT8D|PFM5 PR/SET domain 8 protein-coding 190.667-69 chr2 127412315 127412724 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5901 NM_000312 5624 Hs.224698 NM_000312 ENSG00000115718 PROC APC|PC|PROC1|THPH3|THPH4 protein C, inactivator of coagulation factors Va and VIIIa protein-coding 158.333-22 chr1 190000312 190000717 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 475496 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 115-97 chr2 199316436 199316766 + 0.666667 NA intron (NM_001172509, intron 9 of 10) intron (NM_001172509, intron 9 of 10) 141338 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 155.333-309 chr5 132316318 132316699 + 0.666667 NA intron (NM_003059, intron 3 of 9) intron (NM_003059, intron 3 of 9) 22114 NM_003059 6583 Hs.310591 NM_003059 ENSG00000197208 SLC22A4 DFNB60|OCTN1 solute carrier family 22 member 4 protein-coding 113.333-222 chr6 4927720 4927966 + 0.666667 NA intron (NM_001368126, intron 2 of 6) intron (NM_001368126, intron 2 of 6) 37803 NM_001143971 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 115.333-179 chr5 172162596 172162808 + 0.666667 NA intron (NM_005990, intron 1 of 18) intron (NM_005990, intron 1 of 18) 25522 NM_005990 6793 Hs.744005 NM_005990 ENSG00000072786 STK10 LOK|PRO2729 serine/threonine kinase 10 protein-coding 131.333-140 chr5 42713223 42713572 + 0.666667 NA intron (NM_001242403, intron 7 of 9) intron (NM_001242403, intron 7 of 9) -43421 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 216-100 chr5 117684116 117684463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46072 NR_104997 102467224 Hs.134230 NR_104997 LINC02147 - long intergenic non-protein coding RNA 2147 ncRNA 164.667-106 chr2 61160996 61161371 + 0.666667 NA intron (NM_001367071, intron 2 of 4) L1MB3|LINE|L1 -1005 NM_001143959 339804 Hs.140617 NM_001143959 ENSG00000237651 C2orf74 - chromosome 2 open reading frame 74 protein-coding 147.333-14 chr1 85973428 85973734 + 0.666667 NA intron (NM_152890, intron 20 of 59) intron (NM_152890, intron 20 of 59) 182890 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 152-132 chr5 168320218 168320508 + 0.666667 NA intron (NM_001161661, intron 1 of 22) intron (NM_001161661, intron 1 of 22) 28718 NM_001161661 23286 Hs.484047 NM_015238 ENSG00000113645 WWC1 HBEBP3|HBEBP36|KIBRA|MEMRYQTL|PPP1R168 WW and C2 domain containing 1 protein-coding 146-87 chr3 98767414 98767719 + 0.666667 NA intron (NM_001323368, intron 1 of 9) intron (NM_001323368, intron 1 of 9) 4259 NM_001323367 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 156.333-296 chr5 148789202 148789559 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -37213 NM_000024 154 Hs.2551 NM_000024 ENSG00000169252 ADRB2 ADRB2R|ADRBR|B2AR|BAR|BETA2AR adrenoceptor beta 2 protein-coding 162.667-250 chr6 166729624 166730108 + 0.666667 NA intron (NM_001006932, intron 2 of 21) MER101-int|LTR|ERV1 -102615 NM_021135 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 136.667-135 chr4 171842494 171842730 + 0.666667 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -29005 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 168.333-138 chr4 19552715 19553040 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -699028 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 119.667-55 chr15 68108718 68109024 + 0.666667 NA intron (NM_016166, intron 2 of 13) L2a|LINE|L2 54295 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 169.333-266 chr8 76489814 76490226 + 0.666667 NA intron (NR_105006, intron 3 of 5) intron (NR_105006, intron 3 of 5) 83366 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 116.667-69 chr16 19032524 19032780 + 0.666667 NA intron (NM_001324268, intron 6 of 14) AluSg|SINE|Alu 34831 NR_119382 102723385 Hs.569608 NR_119379 ENSG00000261465 LOC102723385 - uncharacterized LOC102723385 ncRNA 152-43 chr12 57291767 57292148 + 0.666667 NA intron (NM_001351215, intron 9 of 22) intron (NM_001351215, intron 9 of 22) -40770 NR_104422 246329 Hs.417595 NM_145064 ENSG00000185482 STAC3 MYPBB|NAM SH3 and cysteine rich domain 3 protein-coding 174.667-45 chr14 31446388 31446751 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_080664, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_080664, exon 3 of 3) 10937 NM_080664 112487 Hs.116014 NM_080664 ENSG00000129480 DTD2 ATD|C14orf126 D-aminoacyl-tRNA deacylase 2 protein-coding 127.333-138 chr5 40073144 40073499 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21030 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 122.333-208 chr8 117381021 117381353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -139526 NM_001363182 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 118-109 chr5 174108700 174109006 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_015980, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_015980, exon 5 of 5) 63147 NM_015980 51617 Hs.559412 NM_015980 ENSG00000170091 NSG2 CALY3|HMP19 neuronal vesicle trafficking associated 2 protein-coding 121.667-69 chr17 27288985 27289246 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 4881 NR_039748 100616277 NR_039748 ENSG00000263583 MIR4522 - microRNA 4522 ncRNA 150.333-340 chr5 120984213 120984515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -338186 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 119.333-52 chr11 69617995 69618330 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -22943 NM_053056 595 Hs.523852 NM_053056 ENSG00000110092 CCND1 BCL1|D11S287E|PRAD1|U21B31 cyclin D1 protein-coding 144-78 chr2 119926191 119926475 + 0.666667 NA intron (NM_002830, intron 12 of 26) intron (NM_002830, intron 12 of 26) -86744 NR_138472 57669 Hs.369232 NM_020909 ENSG00000115109 EPB41L5 BE37|YMO1|YRT erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 protein-coding 121.333-16 chr1 233653833 233654086 + 0.666667 NA intron (NM_002245, intron 1 of 2) MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR 29807 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 212.667-113 chr5 140074771 140075316 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -31744 NM_004883 9542 Hs.408515 NM_004883 ENSG00000158458 NRG2 DON1|HRG2|NTAK neuregulin 2 protein-coding 130-20 chr10 106987246 106987551 + 0.666667 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) L1MEf|LINE|L1 177308 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 135.333-8 chr1 87238814 87239092 + 0.666667 NA intron (NM_001290053, intron 2 of 3) Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 26284 NM_001290053 101927844 Hs.694591 NM_001290053 LINC02801 - long intergenic non-protein coding RNA 2801 protein-coding 145.333-248 chr5 157129058 157129368 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 13562 NM_001100816 9443 Hs.279902 NM_004270 ENSG00000155868 MED7 ARC34|CRSP33|CRSP9 mediator complex subunit 7 protein-coding 126-122 chr9 77319455 77319699 + 0.666667 NA exon (NM_015186, exon 42 of 69) exon (NM_015186, exon 42 of 69) -128072 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 145.333-306 chr8 121786198 121786613 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -144965 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 131-86 chr6 33952460 33952827 + 0.666667 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 47408 NR_031681 100302123 NR_031681 ENSG00000221697 MIR1275 MIRN1275|hsa-mir-1275|mir-1275 microRNA 1275 ncRNA 147.333-151 chr18 21278818 21279130 + 0.666667 NA intron (NM_001142966, intron 1 of 32) intron (NM_001142966, intron 1 of 32) 36732 NM_001142966 80000 Hs.149020 NM_024935 ENSG00000141449 GREB1L C18orf6|KIAA1772|RHDA3 GREB1 like retinoic acid receptor coactivator protein-coding 121-42 chr14 43051081 43051320 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1444344 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 113.333-125 chr2 50843549 50843820 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 4 of 22) MER110A|LTR|ERV1 -147422 NR_130470 103504737 NR_130470 ENSG00000216191 MIR8485 hsa-mir-8485 microRNA 8485 ncRNA 172.333-95 chr20 22868124 22868597 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -167060 NM_001052 6754 Hs.673846 NM_001052 ENSG00000132671 SSTR4 SS-4-R|SS4-R|SS4R somatostatin receptor 4 protein-coding 180.333-78 chr3 69615676 69616020 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -123616 NM_001354605 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 133.333-59 chr15 63379297 63379610 + 0.666667 NA intron (NR_135511, intron 1 of 9) intron (NR_135511, intron 1 of 9) 2393 NM_001218 771 Hs.210995 NM_001218 ENSG00000074410 CA12 CA-XII|CAXII|HsT18816|T18816 carbonic anhydrase 12 protein-coding 151.667-154 chr18 47298752 47299058 + 0.666667 NA intron (NR_147192, intron 1 of 2) L2b|LINE|L2 13181 NR_147192 110175910 Hs.639112 NR_147192 ENSG00000267761 MIR4527HG - MIR4527 host gene ncRNA 177.667-28 chr11 20335254 20335655 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28231 NM_006410 10553 Hs.90753 NM_006410 ENSG00000109854 HTATIP2 CC3|SDR44U1|TIP30 HIV-1 Tat interactive protein 2 protein-coding 114.667-261 chr9 69598691 69598978 + 0.666667 NA intron (NM_001163, intron 1 of 12) intron (NM_001163, intron 1 of 12) 73537 NM_001163 320 Hs.171939 NM_001163 ENSG00000107282 APBA1 D9S411E|LIN10|MINT1|X11|X11A|X11ALPHA amyloid beta precursor protein binding family A member 1 protein-coding 208.667-20 chr10 58908022 58908524 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91245 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 162-25 chr11 92629281 92629736 + 0.666667 NA intron (NM_001008781, intron 2 of 24) AluJr4|SINE|Alu 277412 NM_001008781 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 152.333-411 chrX 9127671 9127963 + 0.666667 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -93690 NM_205849 171483 Hs.733351 NM_173696 ENSG00000177138 FAM9B TEX39B family with sequence similarity 9 member B protein-coding 156.333-149 chr17 78877270 78877608 + 0.666667 NA intron (NM_003255, intron 1 of 4) AluSz|SINE|Alu 25762 NM_001243540 100653515 Hs.734636 NM_001243540 ENSG00000178404 CEP295NL DDC8|KIAA1731NL CEP295 N-terminal like protein-coding 174.333-84 chr3 8022825 8023279 + 0.666667 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -6745 NR_110131 101927394 Hs.517767 NR_110131 ENSG00000227110 LOC101927394 - uncharacterized LOC101927394 ncRNA 119.333-222 chr8 126087133 126087346 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136042 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 145.333-125 chr19 10907702 10907980 + 0.666667 NA intron (NM_001370089, intron 2 of 14) intron (NM_001370089, intron 2 of 14) 20798 NM_001321439 78992 Hs.164026 NM_024029 ENSG00000130733 YIPF2 FinGER2 Yip1 domain family member 2 protein-coding 135.333-167 chr7 8378584 8378959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54838 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 127.667-134 chr5 5158612 5158866 + 0.666667 NA intron (NM_139056, intron 3 of 22) intron (NM_139056, intron 3 of 22) 18409 NR_136935 170690 Hs.661915 NM_139056 ENSG00000145536 ADAMTS16 ADAMTS16s ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 16 protein-coding 116.667-5 chr1 52274805 52275105 + 0.666667 NA intron (NM_007324, intron 7 of 17) intron (NM_007324, intron 7 of 17) 91250 NM_032449 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 137-70 chr4 44365544 44365947 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) L1ME3G|LINE|L1 83064 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 171.333-15 chr1 210977999 210978437 + 0.666667 NA intron (NM_002238, intron 6 of 10) AluY|SINE|Alu 155156 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 182-29 chr14 63318986 63319494 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_145171) promoter-TSS (NM_145171) -305 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 175.667-23 chr11 21400585 21401076 + 0.666667 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) 731244 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 156.667-246 chr4 76597069 76597429 + 0.666667 NA intron (NM_020859, intron 2 of 10) intron (NM_020859, intron 2 of 10) 21698 NR_039655 100616254 NR_039655 ENSG00000283682 MIR548AH - microRNA 548ah ncRNA 217.333-96 chr3 108651715 108652211 + 0.666667 NA intron (NM_014648, intron 18 of 32) intron (NM_014648, intron 18 of 32) 62241 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 199.333-209 chr4 116061809 116062308 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -237667 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 209-58 chr2 68671441 68671924 + 0.666667 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 28094 NM_138964 10887 Hs.683430 NM_138964 ENSG00000169618 PROKR1 GPR73|GPR73a|PK-R1|PKR1|ZAQ prokineticin receptor 1 protein-coding 154.667-114 chr14 68249610 68249926 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 379019 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 207-102 chr6 48252001 48252516 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -183569 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 182-86 chr5 35289041 35289431 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -58749 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 180.667-98 chr3 94580661 94581041 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -357412 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 115.667-203 chr7 129072527 129072792 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 17436 NR_002187 286016 Hs.369665 NR_002187 ENSG00000230359 TPI1P2 - triosephosphate isomerase 1 pseudogene 2 pseudo 115.667-21 chr10 31313774 31314031 + 0.666667 NA intron (NR_148979, intron 1 of 2) intron (NR_148979, intron 1 of 2) -4515 NM_001323638 6935 Hs.124503 NM_030751 ENSG00000148516 ZEB1 AREB6|BZP|DELTAEF1|FECD6|NIL2A|PPCD3|TCF8|ZFHEP|ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 protein-coding 193.333-108 chr2 201815601 201816023 + 0.666667 NA intron (NM_001366386, intron 4 of 13) intron (NM_001366386, intron 4 of 13) 9233 NM_001261436 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 112-109 chr2 116809680 116809885 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1004909 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 135.667-171 chr7 43267198 43267477 + 0.666667 NA intron (NM_001287059, intron 2 of 27) intron (NM_001287059, intron 2 of 27) 116442 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 120.667-86 chr2 26077311 26077548 + 0.666667 NA intron (NM_016131, intron 1 of 5) intron (NM_016131, intron 1 of 5) 43345 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 215.333-147 chr4 102648776 102649369 + 0.666667 NA intron (NM_005908, intron 13 of 16) L1ME3|LINE|L1 111896 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 163.333-146 chr2 83756450 83756790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 233806 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 211.333-252 chr9 29859612 29860028 + 0.666667 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 548634 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 220.667-95 chr7 8403219 8403688 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -30156 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 212-112 chr3 196812150 196812691 + 0.666667 NA intron (NM_002577, intron 9 of 14) intron (NM_002577, intron 9 of 14) -55436 NM_001308045 205564 Hs.240770 NM_152699 ENSG00000119231 SENP5 - SUMO specific peptidase 5 protein-coding 147.333-50 chr10 99984634 99984925 + 0.666667 NA intron (NM_015221, intron 1 of 16) AluJb|SINE|Alu 25168 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 150.333-96 chr13 85232170 85232593 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84324 NR_126383 104355140 NR_126383 ENSG00000226370 LINC00375 - long intergenic non-protein coding RNA 375 ncRNA 222.667-10 chr10 103492945 103493457 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_004210) promoter-TSS (NM_004210) -504 NM_004210 9148 Hs.594708 NM_004210 ENSG00000107954 NEURL1 NEUR1|NEURL|RNF67|bA416N2.1|neu|neu-1 neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 174.333-12 chr10 16699009 16699352 + 0.666667 NA intron (NM_152724, intron 6 of 7) intron (NM_152724, intron 6 of 7) 118244 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 208.667-62 chr19 28568994 28569387 + 0.666667 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) intron (NR_110759, intron 5 of 9) -37498 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 114.667-133 chr2 104231074 104231288 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 177151 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 115-159 chr9 105648363 105648688 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -13932 NM_005421 6887 Hs.247978 NM_005421 ENSG00000186051 TAL2 - TAL bHLH transcription factor 2 protein-coding 117.667-37 chr12 39479719 39479924 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -36701 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 167.333-51 chr11 26652731 26653065 + 0.666667 NA intron (NM_031418, intron 24 of 26) L2a|LINE|L2 69162 NM_178498 159963 Hs.148907 NM_178498 ENSG00000148942 SLC5A12 SMCT2 solute carrier family 5 member 12 protein-coding 152-12 chr1 217034380 217034752 + 0.666667 NA intron (NM_001243509, intron 1 of 8) intron (NM_001243509, intron 1 of 8) 42426 NM_001243509 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 122.667-28 chr11 72321968 72322231 + 0.666667 NA intron (NM_030813, intron 7 of 16) intron (NM_030813, intron 7 of 16) -77923 NM_005169 401 Hs.731115 NM_005169 ENSG00000165462 PHOX2A ARIX|CFEOM2|FEOM2|NCAM2|PMX2A paired like homeobox 2A protein-coding 121-11 chr10 20651987 20652209 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 100128 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 115.667-158 chr4 31602451 31602730 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96046 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 133.333-192 chr8 131930661 131930904 + 0.666667 NA intron (NM_001323557, intron 1 of 22) intron (NM_001323557, intron 1 of 22) 14009 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 116.333-95 chr17 74939890 74940082 + 0.666667 NA intron (NM_001272005, intron 1 of 6) AluJo|SINE|Alu 4088 NM_001272005 347741 Hs.454407 NM_178233 ENSG00000182938 OTOP3 - otopetrin 3 protein-coding 113.333-71 chr14 42598756 42598988 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 992016 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 164-54 chr2 23054709 23055159 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -330245 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 186-76 chr4 120399320 120399855 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -332739 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 112.333-199 chr5 8933750 8934069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 94177 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 143.333-278 chr7 144979333 144979734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143480 NM_001350887 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 122-8 chr1 85993492 85993713 + 0.666667 NA intron (NM_152890, intron 19 of 59) L1MA10|LINE|L1 162869 NR_146344 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 179.667-67 chr17 81542245 81542594 + 0.666667 NA intron (NR_033338, intron 7 of 8) intron (NR_033338, intron 7 of 8) 9934 NR_033338 80233 Hs.313905 NM_025161 ENSG00000185504 FAAP100 C17orf70 FA core complex associated protein 100 protein-coding 154.667-151 chr18 27322689 27322997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19813 NR_134589 105372038 Hs.722107 NR_134589 ENSG00000264151 LOC105372038 - uncharacterized LOC105372038 ncRNA 122.333-178 chr5 154228993 154229276 + 0.666667 NA intron (NM_198321, intron 1 of 11) intron (NM_198321, intron 1 of 11) 38401 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 116.667-52 chr14 47949178 47949453 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -154301 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 162.333-120 chr2 129005558 129005898 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141128 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 123-29 chr11 97840400 97840612 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -1180443 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 136.333-103 chr2 182037736 182037980 + 0.666667 NA intron (NM_001261425, intron 2 of 5) L3|LINE|CR1 52005 NM_001261425 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 148.333-131 chr14 78598924 78599276 + 0.666667 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 195381 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 170-10 chr10 70867208 70867620 + 0.666667 NA intron (NM_003901, intron 7 of 14) AluSx1|SINE|Alu 20467 NM_001289797 5092 Hs.3192 NM_000281 ENSG00000166228 PCBD1 DCOH|PCBD|PCD|PHS pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1 protein-coding 175.667-121 chr5 135262157 135262533 + 0.666667 NA intron (NR_161235, intron 3 of 5) L1ME2|LINE|L1 -14168 NR_037895 340073 Hs.434422 NR_037895 ENSG00000249647 C5orf66-AS2 - C5orf66 antisense RNA 2 ncRNA 130.333-182 chr6 71911471 71911792 + 0.666667 NA intron (NM_001350412, intron 1 of 2) intron (NM_001350412, intron 1 of 2) 24928 NM_001350411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 139.333-143 chr3 8360295 8360573 + 0.666667 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) intron (NR_033378, intron 3 of 3) 141224 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 120.333-138 chr4 37650047 37650346 + 0.666667 NA intron (NM_001085400, intron 1 of 6) L2a|LINE|L2 36180 NM_001085400 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 191.667-59 chr17 58404057 58404579 + 0.666667 NA intron (NM_001305544, intron 2 of 9) MIR3|SINE|MIR -1597 NM_001305545 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 154.333-147 chr2 41929712 41930016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3859 NR_110263 101929723 Hs.369330 NR_110262 ENSG00000234362 LINC01914 - long intergenic non-protein coding RNA 1914 ncRNA 114.333-180 chr5 110058393 110058566 + 0.666667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 175297 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 187.667-48 chr14 70445780 70446222 + 0.666667 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 -6173 NM_003813 8747 Hs.178748 NM_003813 ENSG00000139985 ADAM21 ADAM 21|ADAM31 ADAM metallopeptidase domain 21 protein-coding 205.333-214 chr7 12735231 12735669 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47817 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 144-133 chr5 103009695 103010115 + 0.666667 NA intron (NM_001364590, intron 22 of 25) intron (NM_001364590, intron 22 of 25) 110233 NM_001317954 54826 Hs.24088 NM_017676 ENSG00000145723 GIN1 GIN-1|TGIN1|ZH2C2 gypsy retrotransposon integrase 1 protein-coding 119-12 chr10 8808679 8808872 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -89214 NR_131944 105755953 Hs.564146 NR_131944 ENSG00000234752 LINC02676 - long intergenic non-protein coding RNA 2676 ncRNA 154.667-402 chr8 134691278 134691578 + 0.666667 NA intron (NM_001289394, intron 1 of 16) intron (NM_001289394, intron 1 of 16) 5127 NM_001174158 57623 Hs.446172 NM_020863 ENSG00000066827 ZFAT AITD3|ZFAT1|ZNF406 zinc finger and AT-hook domain containing protein-coding 161-47 chr2 177429754 177430231 + 0.666667 NA intron (NM_003659, intron 2 of 19) L1PA10|LINE|L1 37219 NM_003659 8540 Hs.516543 NM_003659 ENSG00000018510 AGPS ADAP-S|ADAS|ADHAPS|ADPS|ALDHPSY|RCDP3 alkylglycerone phosphate synthase protein-coding 117.333-113 chr2 214853212 214853494 + 0.666667 NA intron (NR_110292, intron 2 of 3) intron (NR_110292, intron 2 of 3) 6406 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 175.667-132 chr7 28602855 28603232 + 0.666667 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) L1MD2|LINE|L1 -83090 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 150-114 chr5 72250325 72250592 + 0.666667 NA intron (NM_001286748, intron 4 of 11) intron (NM_001286748, intron 4 of 11) 69782 NM_001286751 23107 Hs.482491 NM_015084 ENSG00000113048 MRPS27 MRP-S27|S27mt mitochondrial ribosomal protein S27 protein-coding 208.667-39 chr12 79488700 79489168 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 69677 NR_031700 100302136 NR_031700 ENSG00000221788 MIR1252 MIRN1252|hsa-mir-1252 microRNA 1252 ncRNA 190-74 chr21 24506889 24507351 + 0.666667 NA intron (NR_135519, intron 1 of 2) L1PA13|LINE|L1 78380 NR_135520 105372751 Hs.652040 NR_135519 ENSG00000237484 LINC01684 lnc-JAM2-6 long intergenic non-protein coding RNA 1684 ncRNA 140.667-214 chr7 52739833 52740193 + 0.666667 NA Intergenic Looper|DNA|PiggyBac -295620 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 185.667-69 chr2 88079607 88079972 + 0.666667 NA intron (NM_001330364, intron 1 of 8) AluSg|SINE|Alu 2810 NR_039940 100616447 NR_039940 ENSG00000265003 MIR4780 - microRNA 4780 ncRNA 255.333-109 chr8 84041939 84042624 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140506 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 151-97 chr4 124579812 124580202 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21573 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 197.333-213 chr7 54891804 54892365 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -126933 NM_005228 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 143.667-175 chr3 191577503 191577877 + 0.666667 NA intron (NR_120606, intron 6 of 6) intron (NR_120606, intron 6 of 6) 116527 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 217-29 chr17 47107459 47107911 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu 81610 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 140-76 chr3 194615123 194615411 + 0.666667 NA intron (NM_001011655, intron 7 of 9) AluSx|SINE|Alu 18152 NM_138399 93109 Hs.478729 NM_138399 ENSG00000145014 TMEM44 - transmembrane protein 44 protein-coding 242.667-58 chr2 226540996 226541547 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 117522 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 280.333-42 chr7 128379492 128380070 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6901 NR_148338 107986845 Hs.592261 NR_148338 LOC107986845 - uncharacterized LOC107986845 ncRNA 139-117 chrX 74416136 74416526 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5162 NM_006517 6567 Hs.75317 NM_006517 ENSG00000147100 SLC16A2 AHDS|DXS128|DXS128E|MCT 7|MCT 8|MCT7|MCT8|MRX22|XPCT solute carrier family 16 member 2 protein-coding 138.333-103 chr2 190662794 190663078 + 0.666667 NA intron (NM_001321314, intron 1 of 6) intron (NM_001321314, intron 1 of 6) 3778 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 123.333-78 chr14 56373564 56373863 + 0.666667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -140618 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 177.333-23 chr10 124361589 124361925 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 57166 NM_001322969 4942 Hs.523332 NM_000274 ENSG00000065154 OAT GACR|HOGA|OATASE|OKT ornithine aminotransferase protein-coding 192-52 chr14 60930503 60930969 + 0.666667 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) L2c|LINE|L2 50343 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 119.333-204 chr7 137327334 137327609 + 0.666667 NA intron (NM_001321387, intron 1 of 4) intron (NM_001321387, intron 1 of 4) 16262 NM_002825 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 116.667-127 chr3 35098321 35098512 + 0.666667 NA intron (NR_110817, intron 2 of 3) intron (NR_110817, intron 2 of 3) 295607 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 136.333-168 chr5 66021336 66021731 + 0.666667 NA intron (NM_001253697, intron 8 of 25) intron (NM_001253697, intron 8 of 25) -75960 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 164.667-109 chr2 69430189 69430479 + 0.666667 NA intron (NM_001002755, intron 2 of 7) AluJb|SINE|Alu 7101 NR_045631 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 142.333-197 chr5 61767165 61767512 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31640 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 237-77 chr8 118810404 118810882 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141242 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 150.667-265 chr4 63843126 63843520 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 566127 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 117-124 chr6 52582339 52582646 + 0.666667 NA intron (NR_103447, intron 3 of 3) intron (NR_103447, intron 3 of 3) 5194 NR_103447 401264 Hs.544586 NR_103446 ENSG00000225791 TRAM2-AS1 - TRAM2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 196-132 chr4 42062260 42062744 + 0.666667 NA intron (NM_006345, intron 10 of 17) intron (NM_006345, intron 10 of 17) 71972 NM_006345 10463 Hs.479634 NM_006345 ENSG00000014824 SLC30A9 BILAPES|C4orf1|GAC63|HUEL|ZNT9 solute carrier family 30 member 9 protein-coding 130.333-160 chr5 3975624 3975945 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 379952 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 128-15 chr11 75928322 75928683 + 0.666667 NA intron (NM_003369, intron 6 of 14) FLAM_C|SINE|Alu 113292 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 230.333-47 chr17 45105617 45106242 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_021079, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_021079, exon 12 of 12) 8504 NR_106842 102465470 NR_106842 ENSG00000277249 MIR6784 hsa-mir-6784 microRNA 6784 ncRNA 127-43 chr2 42449088 42449464 + 0.666667 NA intron (NM_172344, intron 1 of 1) MER58B|DNA|hAT-Charlie 44706 NM_133329 170850 Hs.352633 NM_133329 ENSG00000171126 KCNG3 KV10.1|KV6.3 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 3 protein-coding 115.667-225 chr9 77406858 77407185 + 0.666667 NA intron (NM_001018037, intron 69 of 70) intron (NM_001018037, intron 69 of 70) -40628 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 114.667-236 chr7 30060829 30061010 + 0.666667 NA exon (NM_032639, exon 10 of 13) exon (NM_032639, exon 10 of 13) 15834 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 142.667-211 chr7 94274362 94274745 + 0.666667 NA Intergenic L4_C_Mam|LINE|RTE-X 117639 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 146.667-225 chr3 189833675 189833946 + 0.666667 NA intron (NM_003722, intron 4 of 13) intron (NM_003722, intron 4 of 13) 3888 NR_030642 100126340 NR_030642 ENSG00000216058 MIR944 MIRN944|hsa-mir-944|mir-944 microRNA 944 ncRNA 131-41 chr18 3251646 3251957 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001303049) promoter-TSS (NM_001303049) -412 NM_001303049 10627 Hs.190086 NM_006471 ENSG00000101608 MYL12A HEL-S-24|MLC-2B|MLCB|MRCL3|MRLC3|MYL2B myosin light chain 12A protein-coding 125-105 chr7 79457028 79457345 + 0.666667 NA intron (NR_038344, intron 2 of 4) LTR16A2|LTR|ERVL 3226 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 149.667-38 chr1 201769538 201769886 + 0.666667 NA intron (NM_001167738, intron 1 of 26) intron (NM_001167738, intron 1 of 26) 29812 NM_001167738 89796 Hs.585374 NM_020443 ENSG00000134369 NAV1 POMFIL3|STEERIN1|UNC53H1 neuron navigator 1 protein-coding 137.333-35 chr12 46749000 46749334 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 76830 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 116.667-39 chr12 111649178 111649420 + 0.666667 NA intron (NM_006768, intron 11 of 11) AluJb|SINE|Alu 36657 NM_006768 8315 Hs.530940 NM_006768 ENSG00000089234 BRAP BRAP2|IMP|RNF52 BRCA1 associated protein protein-coding 195-19 chr10 74200586 74201088 + 0.666667 NA exon (NM_006721, exon 2 of 11) exon (NM_006721, exon 2 of 11) 24074 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 189.667-81 chr2 217075974 217076364 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 205397 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 162-68 chr2 154741477 154741828 + 0.666667 NA intron (NM_002239, intron 2 of 2) intron (NM_002239, intron 2 of 2) 42957 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 208.667-5 chr1 84047611 84048078 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -30131 NM_002731 5567 Hs.487325 NM_002731 ENSG00000142875 PRKACB PKA C-beta|PKACB protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta protein-coding 190.333-32 chr11 90649008 90649419 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 3 of 6) L1PA11|LINE|L1 -93356 NR_039711 100616186 NR_039711 ENSG00000266703 MIR4490 - microRNA 4490 ncRNA 159.333-213 chr3 100312770 100313163 + 0.666667 NA intron (NM_001199198, intron 15 of 18) AluY|SINE|Alu -21791 NM_020202 56954 Hs.439152 NM_020202 ENSG00000114021 NIT2 HEL-S-8a nitrilase family member 2 protein-coding 113.333-66 chr12 131517711 131518006 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 130263 NR_146868 105370085 Hs.739274 NR_146868 LINC02414 - long intergenic non-protein coding RNA 2414 ncRNA 159-96 chr5 67674998 67675290 + 0.666667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -28355 NR_147169 105379006 NR_147169 ENSG00000249736 LINC02242 - long intergenic non-protein coding RNA 2242 ncRNA 116.667-71 chr16 74793580 74793866 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18903 NM_024306 79152 Hs.461329 NM_024306 ENSG00000103089 FA2H FAAH|FAH1|FAXDC1|SCS7|SPG35 fatty acid 2-hydroxylase protein-coding 145.667-316 chrX 58246642 58246919 + 0.666667 NA Intergenic HSAT4|Satellite|centr -336147 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 155-2 chr1 51352091 51352384 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -7121 NM_001144832 22996 Hs.112949 NM_001080494 ENSG00000085831 TTC39A C1orf34|DEME-6 tetratricopeptide repeat domain 39A protein-coding 267-5 chr1 231216355 231216861 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001004342, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_001004342, exon 10 of 10) 24567 NM_001300830 128061 Hs.743464 NM_152379 ENSG00000143633 C1orf131 - chromosome 1 open reading frame 131 protein-coding 135.333-65 chr17 51524741 51525017 + 0.666667 NA Intergenic MER67D|LTR|ERV1 89452 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 136.333-56 chr14 73466204 73466456 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2688 NR_135251 101928143 Hs.654609 NR_135251 ENSG00000284930 LOC101928143 - uncharacterized LOC101928143 ncRNA 140.333-145 chr3 120986123 120986407 + 0.666667 NA intron (NR_145517, intron 3 of 8) L1M2|LINE|L1 -63375 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 153.333-150 chr16 4197583 4197905 + 0.666667 NA intron (NM_001098814, intron 4 of 5) intron (NM_001098814, intron 4 of 5) 44336 NM_001323667 6345 Hs.10041 NM_001098814 ENSG00000185739 SRL SAR sarcalumenin protein-coding 172-33 chr12 41647362 41647631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -116693 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 122.667-169 chr7 6705327 6705541 + 0.666667 NA intron (NM_006956, intron 1 of 5) intron (NM_006956, intron 1 of 5) 1513 NM_006956 7559 Hs.431471 NM_006956 ENSG00000164631 ZNF12 GIOT-3|HZF11|KOX3|ZNF325 zinc finger protein 12 protein-coding 113.667-77 chr16 64464515 64464776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 657418 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 116.333-204 chr8 74286720 74287017 + 0.666667 NA intron (NM_020647, intron 2 of 5) intron (NM_020647, intron 2 of 5) 34493 NM_001363050 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 148.667-55 chr10 91555834 91556139 + 0.666667 NA intron (NR_024467, intron 1 of 4) MER20|DNA|hAT-Charlie 55474 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 172-17 chr1 219622410 219622818 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -9469 NM_001355457 643136 Hs.647764 NM_001085394 ENSG00000215817 ZC3H11B ZC3HDC11B zinc finger CCCH-type containing 11B protein-coding 143.333-11 chr1 108684591 108684884 + 0.666667 NA Intergenic Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -7573 NM_001349766 55119 Hs.342307 NM_018061 ENSG00000134186 PRPF38B NET1 pre-mRNA processing factor 38B protein-coding 156.667-339 chr8 95132182 95132456 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -1466 NM_024613 79666 Hs.29724 NM_024613 ENSG00000175895 PLEKHF2 EAPF|PHAFIN2|ZFYVE18 pleckstrin homology and FYVE domain containing 2 protein-coding 158.333-100 chr15 68152650 68153019 + 0.666667 NA intron (NM_016166, intron 6 of 13) intron (NM_016166, intron 6 of 13) 53276 NR_104583 91860 Hs.709550 NM_033429 ENSG00000129007 CALML4 NY-BR-20 calmodulin like 4 protein-coding 161.667-63 chr13 50468875 50469349 + 0.666667 NA intron (NR_109974, intron 4 of 6) L2b|LINE|L2 58337 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 182-19 chr11 39335285 39335750 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 686659 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 169.333-76 chr14 53881975 53882335 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66329 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 117.333-133 chr3 89786518 89786850 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 679063 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 131.333-123 chr4 32386227 32386482 + 0.666667 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner 35316 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 257.667-62 chr4 127906977 127907412 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 25950 NM_001190801 10733 Hs.172052 NM_014264 ENSG00000142731 PLK4 MCCRP2|SAK|STK18 polo like kinase 4 protein-coding 185.333-27 chr11 35722629 35723111 + 0.666667 NA intron (NM_017583, intron 2 of 4) intron (NM_017583, intron 2 of 4) 60095 NM_017583 54765 Hs.192103 NM_017583 ENSG00000166326 TRIM44 AN3|DIPB|HSA249128|MC7 tripartite motif containing 44 protein-coding 127.333-28 chr10 89918828 89919143 + 0.666667 NA intron (NR_110655, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu 30851 NR_149079 105378425 Hs.559891 NR_149079 ENSG00000280560 LINC01374 TCONS_00018278 long intergenic non-protein coding RNA 1374 ncRNA 150.333-137 chr15 87062289 87062575 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 -74006 NR_135683 102724452 Hs.128062 NR_135683 ENSG00000259620 LOC102724452 - uncharacterized LOC102724452 ncRNA 135.333-159 chr6 77456900 77457137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7004 NM_000863 3351 Hs.123016 NM_000863 ENSG00000135312 HTR1B 5-HT-1B|5-HT-1D-beta|5-HT1B|5-HT1DB|HTR1D2|HTR1DB|S12 5-hydroxytryptamine receptor 1B protein-coding 121-19 chr10 83658396 83658739 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18522 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 226-81 chr6 107923912 107924385 + 0.666667 NA intron (NM_007214, intron 3 of 20) AluY|SINE|Alu 34060 NM_007214 11231 Hs.26904 NM_007214 ENSG00000025796 SEC63 DNAJC23|ERdj2|PCLD2|PRO2507|SEC63L SEC63 homolog, protein translocation regulator protein-coding 255-90 chr9 136300335 136300956 + 0.666667 NA intron (NR_111982, intron 2 of 9) AluSx1|SINE|Alu 3449 NR_111982 399693 Hs.530383 NM_001291516 ENSG00000260220 CCDC187 - coiled-coil domain containing 187 protein-coding 157.667-59 chr11 98029936 98030267 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -990848 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 156.333-178 chr2 68008832 68009141 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 54018 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 123-72 chr22 39973155 39973441 + 0.666667 NA TTS (NM_001291825) TTS (NM_001291825) -21656 NM_138435 113828 Hs.26192 NM_138435 ENSG00000133477 FAM83F - family with sequence similarity 83 member F protein-coding 149.667-172 chr18 50623622 50624050 + 0.666667 NA intron (NM_001292039, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 63749 NM_002747 5596 Hs.433728 NM_002747 ENSG00000141639 MAPK4 ERK-4|ERK4|PRKM4|p63-MAPK|p63MAPK mitogen-activated protein kinase 4 protein-coding 120.333-127 chr3 44642332 44642574 + 0.666667 NA non-coding (NR_147692, exon 8 of 8) non-coding (NR_147692, exon 8 of 8) -6279 NM_003420 7584 Hs.288658 NM_003420 ENSG00000169981 ZNF35 HF.10|HF10|Zfp105 zinc finger protein 35 protein-coding 190.667-40 chr14 47453748 47454068 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -110662 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 112.333-82 chr15 87926103 87926279 + 0.666667 NA intron (NM_001320135, intron 15 of 15) intron (NM_001320135, intron 15 of 15) 20077 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 145-97 chr5 119308715 119309056 + 0.666667 NA intron (NM_001077654, intron 1 of 1) intron (NM_001077654, intron 1 of 1) -24290 NM_001286814 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 232.667-79 chr9 90163225 90163707 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -121967 NR_038882 286370 Hs.407589 NR_038882 ENSG00000227555 MIR4290HG - MIR4290 host gene ncRNA 161-106 chr9 36029372 36029701 + 0.666667 NA Intergenic Charlie15b|DNA|hAT-Charlie -7377 NM_001316348 8434 Hs.388918 NM_021111 ENSG00000122707 RECK ST15 reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs protein-coding 327.667-22 chr4 38612690 38613447 + 0.666667 NA non-coding (NR_026804, exon 8 of 8) non-coding (NR_026804, exon 8 of 8) 49065 NR_146991 105374411 NR_146991 LINC02278 - long intergenic non-protein coding RNA 2278 ncRNA 166.333-228 chr8 83734432 83734846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 330881 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 127.667-120 chr3 115000754 115001058 + 0.666667 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) intron (NM_015642, intron 1 of 9) 70508 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 218-64 chr2 232822330 232822850 + 0.666667 NA intron (NM_015575, intron 23 of 30) AluSg|SINE|Alu -46025 NM_001172416 3769 Hs.467338 NM_002242 ENSG00000115474 KCNJ13 KIR1.4|KIR7.1|LCA16|SVD potassium voltage-gated channel subfamily J member 13 protein-coding 212.667-45 chr15 63135778 63136135 + 0.666667 NA intron (NM_032857, intron 5 of 5) intron (NM_032857, intron 5 of 5) 14095 NM_171846 114294 Hs.410388 NM_032857 ENSG00000103642 LACTB G24|MRPL56 lactamase beta protein-coding 121.333-125 chr4 20324676 20324926 + 0.666667 NA intron (NM_001289135, intron 4 of 35) L1MA10|LINE|L1 -67388 NR_037876 100505893 Hs.665305 NR_037876 ENSG00000248228 SLIT2-IT1 - SLIT2 intronic transcript 1 ncRNA 112.333-6 chr1 65539888 65540162 + 0.666667 NA intron (NM_001198687, intron 1 of 18) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 14336 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 152.333-47 chr10 59812883 59813201 + 0.666667 NA intron (NM_005436, intron 4 of 8) intron (NM_005436, intron 4 of 8) -59587 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 187-40 chr2 223660499 223660923 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -58350 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 198.667-122 chr20 58695426 58695780 + 0.666667 NA intron (NM_024663, intron 3 of 11) intron (NM_024663, intron 3 of 11) 2803 NM_024663 79716 Hs.654868 NM_024663 ENSG00000215440 NPEPL1 bA261P9.2 aminopeptidase like 1 protein-coding 160.333-68 chr11 116407875 116408170 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -231400 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 158-33 chr12 39371295 39371614 + 0.666667 NA intron (NM_001173464, intron 1 of 37) intron (NM_001173464, intron 1 of 37) 71666 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 117.333-189 chr7 29132093 29132437 + 0.666667 NA intron (NM_001371261, intron 2 of 13) L2a|LINE|L2 7232 NR_120523 101928168 Hs.666750 NR_120523 ENSG00000285412 LOC101928168 - uncharacterized LOC101928168 ncRNA 146.333-51 chr11 83037433 83037772 + 0.666667 NA intron (NM_014488, intron 1 of 5) L2b|LINE|L2 -3328 NM_001286059 27314 Hs.40758 NM_014488 ENSG00000137502 RAB30 - RAB30, member RAS oncogene family protein-coding 130-8 chr1 232723740 232724122 + 0.666667 NA Intergenic LTR16B2|LTR|ERVL 5860 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA 143-87 chr4 45694399 45694660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 429525 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 317.666-11 chr7 49846032 49846896 + 0.666667 NA intron (NR_136188, intron 2 of 3) L2b|LINE|L2 71131 NR_136188 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 154.667-187 chr2 132427190 132427524 + 0.666667 NA intron (NM_001508, intron 1 of 1) AluY|SINE|Alu -6354 NR_162099 113218485 NR_162099 MIR9986 - microRNA 9986 ncRNA 185.667-104 chr5 131700431 131700932 + 0.666667 NA intron (NM_133372, intron 10 of 17) intron (NM_133372, intron 10 of 17) -65452 NM_001164390 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 121.333-50 chr14 37544873 37545230 + 0.666667 NA intron (NM_138731, intron 13 of 13) intron (NM_138731, intron 13 of 13) 50198 NM_004496 3169 Hs.163484 NM_004496 ENSG00000129514 FOXA1 HNF3A|TCF3A forkhead box A1 protein-coding 142-17 chr10 62162593 62162886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106105 NM_001282941 219790 Hs.58559 NM_145307 ENSG00000182010 RTKN2 PLEKHK1|bA531F24.1 rhotekin 2 protein-coding 150-26 chr11 77354298 77354724 + 0.666667 NA intron (NM_001128620, intron 7 of 15) MIRc|SINE|MIR -52845 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 164.667-196 chr5 138676058 138676403 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 77079 NR_134245 105379194 Hs.445981 NR_134244 ENSG00000253404 LOC105379194 - uncharacterized LOC105379194 ncRNA 236.333-76 chr5 24969624 24970181 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129319 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 164.333-53 chr12 25317603 25317989 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66867 NM_001369786 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 168-76 chr4 23294607 23294916 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 580672 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 124.667-13 chr1 166255437 166255739 + 0.666667 NA Intergenic L1M2a|LINE|L1 -88833 NR_135199 149297 Hs.22930 NM_001017961 ENSG00000188859 FAM78B - family with sequence similarity 78 member B protein-coding 152.333-404 chr9 95809050 95809463 + 0.666667 NA non-coding (NR_023390, exon 3 of 3) non-coding (NR_023390, exon 3 of 3) -66435 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 257.333-106 chr8 133312251 133312723 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15183 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 201.667-50 chr2 7415090 7415517 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -5958 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 157.333-267 chr4 90470944 90471311 + 0.666667 NA intron (NM_207491, intron 5 of 7) intron (NM_207491, intron 5 of 7) 236096 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 122.667-96 chr2 175577923 175578130 + 0.666667 NA Intergenic Charlie18a|DNA|hAT-Charlie -396316 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 134-29 chr14 78545186 78545435 + 0.666667 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 141591 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 221.666-9 chr10 83371343 83371992 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 305422 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 128.333-193 chr8 88513008 88513382 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -185712 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 190-67 chr2 162084253 162084768 + 0.666667 NA Intergenic MER34D|LTR|ERV1 9653 NR_147697 100131604 NR_147697 LOC100131604 - uncharacterized LOC100131604 ncRNA 160-37 chr12 122608785 122609170 + 0.666667 NA intron (NM_014708, intron 51 of 63) AluJb|SINE|Alu 81728 NM_014708 9735 Hs.300559 NM_014708 ENSG00000184445 KNTC1 ROD kinetochore associated 1 protein-coding 145.667-34 chr10 63628406 63628690 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106658 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 122.333-27 chr10 126595763 126596087 + 0.666667 NA intron (NM_001350922, intron 2 of 8) L1MC3|LINE|L1 -74432 NM_001004298 118611 Hs.587663 NM_001004298 ENSG00000154493 C10orf90 FATS|bA422P15.2 chromosome 10 open reading frame 90 protein-coding 231-19 chr17 59808317 59808833 + 0.666667 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) intron (NM_001329400, intron 5 of 9) -32691 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 143-103 chr6 54957100 54957385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 110471 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 121-81 chr2 240179138 240179463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38642 NM_148961 150677 Hs.148586 NM_148961 ENSG00000178602 OTOS OTOSP otospiralin protein-coding 156-106 chr4 126731034 126731495 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -901693 NM_015693 27152 Hs.391481 NM_015693 ENSG00000164066 INTU CPLANE4|INT|OFD17|PDZD6|PDZK6|SRTD20 inturned planar cell polarity protein protein-coding 170.333-185 chr6 68046532 68046897 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -8637 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 121.333-161 chr6 83661344 83661624 + 0.666667 NA intron (NM_001242792, intron 5 of 28) intron (NM_001242792, intron 5 of 28) 47075 NM_001363677 9892 Hs.368046 NM_014841 ENSG00000065609 SNAP91 AP180|CALM synaptosome associated protein 91 protein-coding 126.333-126 chr3 196138434 196138712 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4063 NR_034088 401109 Hs.280133 NM_001001699 ENSG00000224652 LINC00885 - long intergenic non-protein coding RNA 885 ncRNA 128.333-3 chr1 50541154 50541373 + 0.666667 NA intron (NM_007051, intron 13 of 18) intron (NM_007051, intron 13 of 18) -117820 NM_032110 63950 Hs.334481 NM_032110 ENSG00000142700 DMRTA2 - DMRT like family A2 protein-coding 219.333-127 chr4 76485989 76486346 + 0.666667 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) intron (NM_020859, intron 1 of 10) 50938 NM_020859 57619 Hs.683808 NM_020859 ENSG00000138771 SHROOM3 APXL3|MSTP013|SHRM|ShrmL shroom family member 3 protein-coding 138.667-225 chrX 155274108 155274448 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -9787 NM_171998 116442 Hs.632832 NM_171998 ENSG00000155961 RAB39B BGMR|MRX72|WSMN|WSN RAB39B, member RAS oncogene family protein-coding 125.667-138 chr4 122203742 122204097 + 0.666667 NA intron (NM_015312, intron 13 of 83) intron (NM_015312, intron 13 of 83) 33316 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 146.667-344 chr8 136901734 136902165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 371151 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 193.333-82 chr19 16714256 16714631 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -5404 NM_001290355 284434 Hs.406014 NM_001007525 ENSG00000188039 NWD1 - NACHT and WD repeat domain containing 1 protein-coding 112.333-73 chr14 51076344 51076542 + 0.666667 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) intron (NM_015163, intron 1 of 9) 19261 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 210.333-162 chr7 93368298 93368747 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 114333 NR_030388 724023 NR_030388 ENSG00000208014 MIR653 MIRN653|hsa-mir-653|mir-653 microRNA 653 ncRNA 155.667-345 chr8 56065185 56065516 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 8551 NR_002437 26795 NR_002437 ENSG00000238650 SNORD54 RNU54|U54 small nucleolar RNA, C/D box 54 snoRNA 168.667-117 chr2 225242574 225243004 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -156921 NM_001371273 112-16 chr10 45040672 45040863 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 39844 NM_006963 7570 Hs.462693 NM_006963 ENSG00000165512 ZNF22 HKR-T1|KOX15|ZNF422|Zfp422 zinc finger protein 22 protein-coding 157.333-264 chr4 77499673 77499973 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11930 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 116.333-136 chr22 42384159 42384400 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001371362, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001371362, exon 8 of 8) -15071 NR_120595 102723775 Hs.335413 NR_120595 ENSG00000229891 LINC01315 C22orf32-1|lnc-C22orf32-1 long intergenic non-protein coding RNA 1315 ncRNA 138.333-80 chr17 76321721 76322004 + 0.666667 NA intron (NM_001366236, intron 7 of 9) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -14182 NR_130649 84074 Hs.252739 NM_032134 ENSG00000129646 QRICH2 SPGF35 glutamine rich 2 protein-coding 119.667-178 chr7 105864002 105864253 + 0.666667 NA intron (NM_152749, intron 2 of 3) MER5A|DNA|hAT-Charlie 12458 NM_020725 222255 Hs.745056 NM_020725 ENSG00000146776 ATXN7L1 ATXN7L4 ataxin 7 like 1 protein-coding 119.333-173 chr5 44688031 44688241 + 0.666667 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 120657 NR_109863 100506674 Hs.575213 NR_109862 MRPS30-DT BRCAT54 MRPS30 divergent transcript ncRNA 117-149 chr8 123183977 123184286 + 0.666667 NA intron (NM_001288587, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 1466 NM_001321630 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 115.333-199 chr7 50448670 50448905 + 0.666667 NA intron (NM_001346562, intron 1 of 3) intron (NM_001346562, intron 1 of 3) 1563 NM_001042762 63979 Hs.137516 NM_022116 ENSG00000132436 FIGNL1 - fidgetin like 1 protein-coding 155.667-195 chr20 39763076 39763385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -241231 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 114-126 chr5 149477341 149477528 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 46788 NR_029686 406937 NR_029686 ENSG00000276365 MIR145 MIRN145|miR-145|miRNA145 microRNA 145 ncRNA 175.333-152 chr6 23686362 23686846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -439611 NM_080723 140767 Hs.726270 NM_080723 ENSG00000152954 NRSN1 VMP|p24 neurensin 1 protein-coding 154.333-58 chr11 44083485 44083792 + 0.666667 NA intron (NM_032592, intron 14 of 14) intron (NM_032592, intron 14 of 14) -11911 NM_207122 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 196.667-65 chr18 70412912 70413285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28507 NR_110764 101060542 Hs.586967 NR_110764 ENSG00000266278 LINC01910 - long intergenic non-protein coding RNA 1910 ncRNA 212-78 chr2 13046880 13047341 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -40097 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 111.667-201 chr5 50926404 50926725 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 43623 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 115.667-28 chr10 79588022 79588303 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22777 NM_001164647 653509 Hs.535295 NM_005411 ENSG00000122852 SFTPA1 COLEC4|PSAP|PSP-A|PSPA|SFTP1|SFTPA1B|SP-A|SP-A1|SPA|SPA1 surfactant protein A1 protein-coding 114.667-43 chr11 10810194 10810384 + 0.666667 NA intron (NR_120540, intron 2 of 2) intron (NR_120540, intron 2 of 2) 992 NR_120540 101928053 Hs.637773 NR_120540 ENSG00000246308 LOC101928053 - uncharacterized LOC101928053 ncRNA 175.667-64 chr2 15638262 15638543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 46534 NM_004939 1653 Hs.440599 NM_004939 ENSG00000079785 DDX1 DBP-RB|UKVH5d DEAD-box helicase 1 protein-coding 124.667-103 chr2 103615257 103615460 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -630929 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 213.667-11 chr10 13674542 13674956 + 0.666667 NA intron (NM_001318336, intron 15 of 23) intron (NM_001318336, intron 15 of 23) 32818 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 161.667-102 chr17 32199444 32199767 + 0.666667 NA intron (NM_001033566, intron 13 of 19) intron (NM_001033566, intron 13 of 19) -48034 NR_002222 503640 Hs.631752 NR_002222 ARGFXP2 - arginine-fifty homeobox pseudogene 2 pseudo 146-69 chr20 9028052 9028350 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -40853 NM_001172646 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 135.667-15 chr10 50497656 50497915 + 0.666667 NA intron (NM_147156, intron 3 of 10) AluSq2|SINE|Alu 126171 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 134-40 chr17 63804613 63804814 + 0.666667 NA intron (NM_203499, intron 6 of 17) AluSz6|SINE|Alu -22718 NM_002805 5705 Hs.79387 NM_002805 ENSG00000087191 PSMC5 S8|SUG-1|SUG1|TBP10|TRIP1|p45|p45/SUG proteasome 26S subunit, ATPase 5 protein-coding 128-120 chr8 104103034 104103353 + 0.666667 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) L1MB7|LINE|L1 -120142 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 113.667-227 chr9 81254269 81254473 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 435164 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 119-133 chr6 156803116 156803309 + 0.666667 NA intron (NM_020732, intron 1 of 19) intron (NM_020732, intron 1 of 19) -23481 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 115.667-226 chr9 87123417 87123595 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25138 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 212.333-135 chr7 21539632 21540060 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -3193 NM_001277115 8701 Hs.520245 NM_001277115 ENSG00000105877 DNAH11 CILD7|DNAHBL|DNAHC11|DNHBL|DPL11 dynein axonemal heavy chain 11 protein-coding 131.667-159 chr5 50898100 50898432 + 0.666667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 71921 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 112.667-232 chr6 75616386 75616555 + 0.666667 NA intron (NM_001100409, intron 1 of 22) AluSg|SINE|Alu 14590 NM_015571 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 123.333-200 chr7 77227826 77228071 + 0.666667 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) intron (NM_020879, intron 2 of 18) -28129 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 152-92 chr2 218948605 218949047 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -10840 NM_003936 8941 Hs.158460 NM_003936 ENSG00000171450 CDK5R2 NCK5AI|P39|p39nck5ai cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 2 protein-coding 209-87 chr5 27246602 27247117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208273 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 115.667-145 chr3 31727816 31728083 + 0.666667 NA intron (NM_001174060, intron 5 of 10) intron (NM_001174060, intron 5 of 10) 23736 NR_049771 100874206 Hs.662428 NR_049771 ENSG00000232490 OSBPL10-AS1 - OSBPL10 antisense RNA 1 ncRNA 145.333-48 chr10 111769123 111769453 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 414477 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 114.333-35 chr10 102707572 102707829 + 0.666667 NA intron (NM_004311, intron 1 of 5) intron (NM_004311, intron 1 of 5) 6697 NM_004311 403 Hs.182215 NM_004311 ENSG00000138175 ARL3 ARFL3|JBTS35|RP83 ADP ribosylation factor like GTPase 3 protein-coding 151-87 chr3 120508240 120508674 + 0.666667 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 -57465 NM_007085 11167 Hs.269512 NM_007085 ENSG00000163430 FSTL1 FRP|FSL1|MIR198|OCC-1|OCC1|tsc36 follistatin like 1 protein-coding 245.333-99 chr6 36208555 36209189 + 0.666667 NA intron (NM_015695, intron 4 of 12) Charlie17a|DNA|hAT-Charlie 12128 NM_015695 27154 Hs.520096 NM_015695 ENSG00000096070 BRPF3 - bromodomain and PHD finger containing 3 protein-coding 115-55 chr13 113333019 113333232 + 0.666667 NA intron (NM_024719, intron 5 of 7) intron (NM_024719, intron 5 of 7) -18548 NR_120385 100874068 Hs.661837 NR_046541 GRTP1-AS1 - GRTP1 antisense RNA 1 ncRNA 139.667-105 chr20 47531516 47531796 + 0.666667 NA intron (NM_181659, intron 1 of 22) intron (NM_181659, intron 1 of 22) 29769 NM_006534 8202 Hs.592142 NM_006534 ENSG00000124151 NCOA3 ACTR|AIB-1|AIB1|CAGH16|CTG26|KAT13B|RAC3|SRC-3|SRC3|TNRC14|TNRC16|TRAM-1|bHLHe42|pCIP nuclear receptor coactivator 3 protein-coding 113.667-119 chr2 196975146 196975412 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -48572 NM_001321099 80055 Hs.229988 NM_024989 ENSG00000197121 PGAP1 Bst1|ISPD3024|MRT42|SPG67 post-GPI attachment to proteins 1 protein-coding 195.667-23 chr12 919450 920001 + 0.666667 NA intron (NM_001297421, intron 5 of 9) AluSz6|SINE|Alu 13351 NM_001297420 5893 Hs.410355 NM_134422 ENSG00000002016 RAD52 - RAD52 homolog, DNA repair protein protein-coding 116.333-112 chr2 34605988 34606281 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -71423 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 149.667-211 chr2 119538459 119538692 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -5857 NR_073133 200373 Hs.496753 NM_001029996 ENSG00000163075 CFAP221 FAP221|PCDP1 cilia and flagella associated protein 221 protein-coding 181.666-5 chr12 26763240 26763775 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 2 of 56) L1ME3D|LINE|L1 69687 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 146-140 chr8 114689061 114689337 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 978814 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 159-46 chr16 86171506 86171837 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24510 NR_103859 100506542 Hs.111902 NR_103859 ENSG00000269186 LINC01082 TCONS_00024492 long intergenic non-protein coding RNA 1082 ncRNA 203-50 chr2 43960721 43961200 + 0.666667 NA intron (NM_133259, intron 12 of 37) intron (NM_133259, intron 12 of 37) 35029 NM_133259 10128 Hs.368084 NM_133259 ENSG00000138095 LRPPRC CLONE-23970|GP130|LRP130|LSFC leucine rich pentatricopeptide repeat containing protein-coding 155-105 chr4 151684373 151684665 + 0.666667 NA intron (NM_001363341, intron 10 of 11) intron (NM_001363341, intron 10 of 11) 76488 NM_004564 5188 Hs.119316 NM_004564 ENSG00000059691 GATB HSPC199|PET112|PET112L glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B protein-coding 155.333-25 chr10 61449149 61449530 + 0.666667 NA intron (NR_134508, intron 1 of 6) intron (NR_134508, intron 1 of 6) -3300 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 190.667-114 chr6 73088216 73088626 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 5 of 13) intron (NM_001160132, intron 5 of 13) 55093 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 118.333-212 chr8 136669403 136669666 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 138736 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 169.333-276 chr8 126165413 126165744 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -159917 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 184.667-20 chr10 119255611 119255993 + 0.666667 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) intron (NM_005308, intron 1 of 15) 48231 NM_005308 2869 Hs.524625 NM_005308 ENSG00000198873 GRK5 FP2025|GPRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 protein-coding 274-51 chr5 164561228 164561966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91318 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 146.667-313 chr7 83427441 83427870 + 0.666667 NA intron (NM_001178129, intron 4 of 16) intron (NM_001178129, intron 4 of 16) 213776 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 179-99 chr8 118298866 118299361 + 0.666667 NA intron (NM_001101676, intron 4 of 4) intron (NM_001101676, intron 4 of 4) -187294 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 167-20 chr11 11702366 11702783 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -45852 NR_036184 100423026 NR_036184 ENSG00000266645 MIR4299 - microRNA 4299 ncRNA 112.333-200 chr5 28357674 28357850 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70097 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 120.333-72 chr16 78448708 78448941 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) LTR73|LTR|ERV1 349170 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 113-4 chr1 94307078 94307356 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -59471 NM_001328664 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 242.333-47 chr2 85380194 85380850 + 0.666667 NA intron (NR_138131, intron 11 of 14) AluSx1|SINE|Alu 25753 NR_138131 84173 Hs.269990 NM_032213 ENSG00000115459 ELMOD3 DFNB88|LST3|RBED1|RBM29 ELMO domain containing 3 protein-coding 152.333-131 chr16 35762393 35762797 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 16043 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 112-90 chr18 652204 652403 + 0.666667 NA intron (NM_001012716, intron 1 of 1) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -5350 NM_001354867 7298 Hs.369762 NM_001071 ENSG00000176890 TYMS HST422|TMS|TS thymidylate synthetase protein-coding 130-129 chr8 84760304 84760643 + 0.666667 NA intron (NM_001287244, intron 1 of 7) BLACKJACK|DNA|hAT-Blackjack 54546 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 157.333-145 chr17 28803564 28803858 + 0.666667 NA intron (NM_001288635, intron 1 of 3) AluSg7|SINE|Alu 8760 NM_001288634 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 122-16 chr10 90630800 90630992 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -90091 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 141.667-128 chr20 19727424 19727778 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -158920 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 148.333-92 chr12 40675134 40675469 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17138 NM_001843 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 152-139 chr6 145679616 145679991 + 0.666667 NA intron (NM_001368129, intron 2 of 4) HAL1|LINE|L1 7074 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 137-98 chr7 34278146 34278403 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 372735 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 198.667-90 chr18 59785058 59785510 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -87861 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 142.333-67 chr13 43929421 43929719 + 0.666667 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 49666 NM_153218 144811 Hs.210586 NM_153218 ENSG00000179630 LACC1 C13orf31|FAMIN laccase domain containing 1 protein-coding 163-30 chr16 9900516 9900957 + 0.666667 NA intron (NM_001134408, intron 3 of 13) intron (NM_001134408, intron 3 of 13) 281331 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 223.667-83 chr8 85047864 85048381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59116 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 167.667-151 chr4 56832658 56833111 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -11015 NM_021114 6691 Hs.98243 NM_021114 ENSG00000128040 SPINK2 HUSI-II|SPGF29 serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 protein-coding 278-6 chr11 71260594 71261194 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -36098 NM_012309 22941 Hs.268726 NM_012309 ENSG00000162105 SHANK2 AUTS17|CORTBP1|CTTNBP1|ProSAP1|SHANK|SPANK-3 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 2 protein-coding 119-137 chr7 77564938 77565162 + 0.666667 NA intron (NM_001131009, intron 1 of 16) AluSc5|SINE|Alu 27007 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 161.333-288 chr8 102222876 102223198 + 0.666667 NA intron (NM_001172477, intron 5 of 8) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 15794 NM_001172477 50484 Hs.512592 NM_015713 ENSG00000048392 RRM2B MTDPS8A|MTDPS8B|P53R2 ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B protein-coding 129.667-184 chr9 34174050 34174325 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4818 NM_001171201 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 150.333-159 chr17 57558612 57559014 + 0.666667 NA intron (NM_001322250, intron 7 of 13) AluSq2|SINE|Alu -35216 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 202-139 chr4 175862990 175863397 + 0.666667 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) L1ME1|LINE|L1 -50079 NM_201591 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 193.333-130 chr3 182030008 182030462 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 77871 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 148-172 chrX 47550324 47550683 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10597 NM_001256197 369 Hs.446641 NM_001654 ENSG00000078061 ARAF A-RAF|ARAF1|PKS2|RAFA1 A-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 129.667-67 chr15 98771795 98772037 + 0.666667 NA intron (NM_000875, intron 2 of 20) intron (NM_000875, intron 2 of 20) -12510 NR_039864 100616432 NR_039864 ENSG00000264480 MIR4714 - microRNA 4714 ncRNA 162.667-202 chr4 105363723 105364104 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11032 NR_126420 104384744 Hs.624109 NR_126420 TET2-AS1 - TET2 antisense RNA 1 ncRNA 183.667-127 chr6 118613967 118614342 + 0.666667 NA intron (NM_001042475, intron 2 of 12) L1MD1|LINE|L1 37437 NM_001042475 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 141-20 chr12 42940419 42940741 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -214735 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 140.667-10 chr1 86375339 86375684 + 0.666667 NA intron (NM_001007022, intron 8 of 17) intron (NM_001007022, intron 8 of 17) -17824 NR_107010 102465842 NR_107010 ENSG00000278281 MIR7856 hsa-mir-7856 microRNA 7856 ncRNA 112.333-160 chr3 56456907 56457133 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 1 of 17) intron (NR_132749, intron 1 of 17) 11447 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 181.333-165 chr7 101305569 101306053 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2496 NR_110115 101927746 NR_110115 LOC101927746 - uncharacterized LOC101927746 ncRNA 148-168 chr9 82971619 82972049 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91308 NM_152573 158158 Hs.129136 NM_152573 ENSG00000165105 RASEF RAB45 RAS and EF-hand domain containing protein-coding 167.333-117 chr18 9371091 9371566 + 0.666667 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) AluSg|SINE|Alu 36555 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 181.333-162 chr7 47813564 47813982 + 0.666667 NA intron (NR_161269, intron 2 of 3) intron (NR_161269, intron 2 of 3) 18482 NR_161269 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 121-29 chr12 3611724 3611938 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -119012 NR_126055 100129223 Hs.586788 NR_126055 THCAT155 - thyroid cancer-associated transcript 155 ncRNA 214.667-75 chr20 53825994 53826515 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 49455 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 119.333-231 chr9 14236222 14236412 + 0.666667 NA intron (NR_161383, intron 1 of 7) intron (NR_161383, intron 1 of 7) -55513 NR_161385 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 190-116 chr7 85299342 85299715 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -121594 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 126.333-169 chr7 96491939 96492288 + 0.666667 NA intron (NR_163951, intron 3 of 4) L1MB3|LINE|L1 11410 NR_163949 151.333-237 chr2 225569077 225569383 + 0.666667 NA intron (NM_001371273, intron 4 of 7) LTR48B|LTR|ERV1 168344 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 115.333-207 chr8 5044250 5044473 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -49447 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 161.333-188 chr3 93731734 93732147 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 242141 NM_001314077 5627 Hs.64016 NM_000313 ENSG00000184500 PROS1 PROS|PS21|PS22|PS23|PS24|PS25|PSA|THPH5|THPH6 protein S protein-coding 119.333-35 chr10 71027575 71027845 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 88657 NR_134313 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 204-69 chr15 82112772 82113309 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24446 NR_120367 101929690 Hs.176109 NR_120367 ENSG00000259518 LINC01583 - long intergenic non-protein coding RNA 1583 ncRNA 130.667-35 chr10 83524979 83525337 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 151931 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 123.333-153 chr3 194409537 194409840 + 0.666667 NA intron (NM_024524, intron 31 of 31) intron (NM_024524, intron 31 of 31) -10422 NM_004488 2814 Hs.73734 NM_004488 ENSG00000178732 GP5 CD42d|GPV glycoprotein V platelet protein-coding 120-135 chr8 58474980 58475187 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 25080 NM_000780 1581 Hs.1644 NM_000780 ENSG00000167910 CYP7A1 CP7A|CYP7|CYPVII cytochrome P450 family 7 subfamily A member 1 protein-coding 149.333-9 chr1 53211287 53211569 + 0.666667 NA intron (NM_000098, intron 4 of 4) intron (NM_000098, intron 4 of 4) 9206 NM_017887 54987 Hs.525391 NM_017887 ENSG00000162384 CZIB C1orf123 CXXC motif containing zinc binding protein protein-coding 184.667-125 chr7 87402990 87403442 + 0.666667 NA exon (NM_018850, exon 26 of 27) exon (NM_018850, exon 26 of 27) 57552 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 168.333-145 chr4 43775055 43775424 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -241622 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 176.667-96 chr3 8531771 8532242 + 0.666667 NA intron (NM_001278233, intron 1 of 4) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 30183 NM_001278235 29995 Hs.475353 NM_014583 ENSG00000071282 LMCD1 - LIM and cysteine rich domains 1 protein-coding 137-104 chr8 98512312 98512615 + 0.666667 NA intron (NM_006281, intron 10 of 10) intron (NM_006281, intron 10 of 10) 85505 NM_020697 3788 Hs.388045 NM_020697 ENSG00000156486 KCNS2 KV9.2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 2 protein-coding 292-51 chr7 107214211 107214764 + 0.666667 NA intron (NM_181733, intron 18 of 20) L1MA7|LINE|L1 45484 NM_012257 26959 Hs.162032 NM_012257 ENSG00000105856 HBP1 - HMG-box transcription factor 1 protein-coding 143-45 chr15 66948677 66948964 + 0.666667 NA intron (NR_135687, intron 1 of 2) MSTD-int|LTR|ERVL-MaLR 7695 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 114.667-8 chr1 117404147 117404364 + 0.666667 NA intron (NM_006699, intron 2 of 12) L1M4|LINE|L1 36806 NM_006699 10905 Hs.435938 NM_006699 ENSG00000198162 MAN1A2 MAN1B mannosidase alpha class 1A member 2 protein-coding 113.667-110 chr2 155101371 155101590 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 402785 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 203-42 chr16 81126897 81127335 + 0.666667 NA intron (NM_052892, intron 37 of 43) LTR40c|LTR|ERVL -30721 NR_033249 2653 Hs.546256 NM_004483 ENSG00000140905 GCSH GCE|NKH glycine cleavage system protein H protein-coding 111.667-121 chr19 13264534 13264714 + 0.666667 NA intron (NM_023035, intron 24 of 46) L2c|LINE|L2 114213 NM_004907 9592 Hs.501629 NM_004907 ENSG00000160888 IER2 ETR101 immediate early response 2 protein-coding 122.667-29 chr11 83086775 83087048 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14845 NR_038903 100506233 Hs.503429 NR_038903 ENSG00000246067 RAB30-DT RAB30-AS1 RAB30 divergent transcript ncRNA 173-83 chr6 57186329 57186630 + 0.666667 NA TTS (NM_016277) TTS (NM_016277) 14153 NM_004282 9532 Hs.745046 NM_004282 ENSG00000112208 BAG2 BAG-2|dJ417I1.2 BCL2 associated athanogene 2 protein-coding 131-20 chr12 54994236 54994560 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -9636 NR_147063 9840 Hs.33187 NM_014796 ENSG00000135426 TESPA1 HSPC257|ITPRID3|KIAA0748 thymocyte expressed, positive selection associated 1 protein-coding 196.666-105 chr8 89578155 89578729 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 179269 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 145.667-244 chr6 64590000 64590382 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 26 of 43) intron (NM_001292009, intron 26 of 43) -711227 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 187-84 chr7 140347192 140347623 + 0.666667 NA intron (NM_001287498, intron 10 of 13) intron (NM_001287498, intron 10 of 13) 51123 NR_156491 84255 Hs.446021 NM_032295 ENSG00000157800 SLC37A3 - solute carrier family 37 member 3 protein-coding 188.667-113 chr4 61594109 61594518 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) L1M1|LINE|L1 392141 NM_001371342 197-98 chr6 36713901 36714346 + 0.666667 NA intron (NM_001257357, intron 3 of 13) intron (NM_001257357, intron 3 of 13) 16297 NM_001257357 401258 Hs.485258 NM_207498 ENSG00000255587 RAB44 RASD3|RASL13|dJ431A14.3 RAB44, member RAS oncogene family protein-coding 145.333-162 chr20 55213512 55213810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -209382 NR_110629 102723578 Hs.446269 NR_110629 ENSG00000235166 LINC01440 - long intergenic non-protein coding RNA 1440 ncRNA 168.667-72 chr15 95026157 95026576 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 171003 NR_077061 440311 Hs.745156 NR_077061 ENSG00000277654 LOC440311 - NOP53 ribosome biogenesis factor pseudogene pseudo 175.333-159 chr6 75736772 75737195 + 0.666667 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu -12256 NM_001368137 4646 Hs.149387 NM_004999 ENSG00000196586 MYO6 DFNA22|DFNB37 myosin VI protein-coding 151.667-296 chr5 149397270 149397639 + 0.666667 NA intron (NM_001317987, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 6748 NM_001317987 27190 Hs.156979 NM_014443 ENSG00000127743 IL17B IL-17B|IL-20|NIRF|ZCYTO7 interleukin 17B protein-coding 160-66 chr20 48875903 48876237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45641 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 133.333-2 chr1 52540708 52540940 + 0.666667 NA intron (NM_001009881, intron 1 of 29) Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 12266 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 191-34 chr2 196775059 196775483 + 0.666667 NA intron (NM_012086, intron 12 of 17) intron (NM_012086, intron 12 of 17) 24412 NM_001206774 9330 Hs.470996 NM_012086 ENSG00000119041 GTF3C3 TFIIIC102|TFIIICgamma|TFiiiC2-102 general transcription factor IIIC subunit 3 protein-coding 145.667-224 chr5 95567491 95567853 + 0.666667 NA intron (NM_198150, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR 12571 NM_198150 153642 Hs.585051 NM_198150 ENSG00000164291 ARSK TSULF arylsulfatase family member K protein-coding 150.667-235 chr3 36174893 36175223 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -205429 NM_001292049 6769 Hs.56045 NM_003149 ENSG00000144681 STAC STAC1 SH3 and cysteine rich domain protein-coding 140.333-22 chr1 207997447 207997834 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86515 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 117.667-80 chr2 56448191 56448469 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -262560 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 160.667-278 chr7 38931204 38931535 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22169 NM_080631 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 156.667-275 chr5 105183550 105183900 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 84251 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 127.667-136 chr5 16320297 16320587 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 120660 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 118.667-13 chr1 184175586 184175854 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 123990 NR_125335 116461 Hs.548197 NM_052965 ENSG00000198860 TSEN15 C1orf19|PCH2F|sen15 tRNA splicing endonuclease subunit 15 protein-coding 128-126 chr9 36646924 36647156 + 0.666667 NA intron (NM_001256691, intron 9 of 15) intron (NM_001256691, intron 9 of 15) 74145 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 130-55 chr2 100763977 100764323 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55989 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 149-16 chr10 27865469 27865821 + 0.666667 NA intron (NM_001290021, intron 10 of 13) L2b|LINE|L2 116226 NM_001290021 55130 Hs.127530 NM_018076 ENSG00000169126 ARMC4 CILD23 armadillo repeat containing 4 protein-coding 136-68 chr3 150915191 150915532 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -9922 NM_001351281 646951 Hs.380222 NM_001351281 MINDY4B C3orf76|FAM188B2 MINDY family member 4B protein-coding 169.667-28 chr11 20834945 20835446 + 0.666667 NA intron (NM_001288714, intron 3 of 18) intron (NM_001288714, intron 3 of 18) 165609 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 155.667-374 chr8 135867412 135867721 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 410110 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 176.333-184 chr9 130570376 130570709 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 8952 NR_027440 100272217 Hs.601255 NR_027440 LOC100272217 - uncharacterized LOC100272217 ncRNA 123.667-18 chr1 162432118 162432370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20108 NM_053282 117157 Hs.350581 NM_053282 ENSG00000198574 SH2D1B EAT2 SH2 domain containing 1B protein-coding 160.333-275 chr8 66440487 66440805 + 0.666667 NA intron (NM_144650, intron 2 of 13) intron (NM_144650, intron 2 of 13) 8142 NM_144650 137872 Hs.720023 NM_144650 ENSG00000147576 ADHFE1 ADH8|HMFT2263|HOT alcohol dehydrogenase iron containing 1 protein-coding 146.333-27 chr10 54147079 54147363 + 0.666667 NA intron (NM_001354411, intron 15 of 34) intron (NM_001354411, intron 15 of 34) -339009 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 116.333-26 chr10 17666840 17667174 + 0.666667 NA intron (NM_001324287, intron 2 of 11) MIR|SINE|MIR 22856 NM_001324287 8027 Hs.335391 NM_003473 ENSG00000136738 STAM STAM-1|STAM1 signal transducing adaptor molecule protein-coding 141.667-227 chr8 89485756 89486130 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 271768 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 121-100 chr3 128388742 128388967 + 0.666667 NA intron (NM_021937, intron 6 of 6) intron (NM_021937, intron 6 of 6) -74740 NR_037890 285224 Hs.683815 NR_037890 ENSG00000242049 DNAJB8-AS1 - DNAJB8 antisense RNA 1 ncRNA 115-74 chr17 54386380 54386703 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -514150 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 149-60 chr18 13579293 13579611 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) intron (NM_181482, intron 4 of 5) -31662 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 114-43 chr15 46268093 46268397 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 563050 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 185-31 chr18 10732998 10733285 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 32 of 51) intron (NM_022068, intron 32 of 51) 26508 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 207-28 chr13 74780972 74781470 + 0.666667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 228378 NR_034025 338864 Hs.97408 NR_034024 ENSG00000236678 LINC00347 - long intergenic non-protein coding RNA 347 ncRNA 139.333-117 chr2 133636693 133636949 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -68358 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 133.667-167 chrX 86743357 86743605 + 0.666667 NA intron (NM_001139515, intron 7 of 11) intron (NM_001139515, intron 7 of 11) 480513 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 131.333-180 chr8 115190985 115191363 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 476839 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 136.333-195 chr7 79787593 79787952 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 333812 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 192.667-50 chr12 50658698 50659082 + 0.666667 NA intron (NM_173602, intron 3 of 37) AluSg|SINE|Alu -105211 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 145.333-92 chr14 75830684 75830977 + 0.666667 NA intron (NM_015072, intron 28 of 31) intron (NM_015072, intron 28 of 31) 151165 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 251.667 chr1 35281266 35281792 + 0.666667 NA intron (NM_005095, intron 1 of 29) L1MA7|LINE|L1 12820 NM_001350139 9202 Hs.269211 NM_005095 ENSG00000146463 ZMYM4 CDIR|MYM|ZNF198L3|ZNF262 zinc finger MYM-type containing 4 protein-coding 201.333-60 chr11 111294152 111294690 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001302646, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001302646, exon 2 of 2) -4125 NM_001271458 120376 Hs.31409 NM_001136105 ENSG00000214290 COLCA2 C11orf93|CASC13|LOH11CR1G colorectal cancer associated 2 protein-coding 155.667-267 chr5 22728658 22728963 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 124534 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 156.667-26 chr1 159158940 159159271 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -12510 NM_001346510 57863 Hs.365689 NM_021189 ENSG00000162706 CADM3 BIgR|IGSF4B|NECL1|Necl-1|TSLL1|synCAM3 cell adhesion molecule 3 protein-coding 148.667-350 chr7 41158438 41158722 + 0.666667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 56976 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 139.333-214 chr8 81219996 81220281 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -60398 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 121.667-9 chr1 63101287 63101572 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -88958 NR_146606 105378769 Hs.435002 NR_146605 ENSG00000229537 LINC01739 - long intergenic non-protein coding RNA 1739 ncRNA 166-86 chr4 57291346 57291810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -134294 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 123-87 chr4 67349431 67349706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72432 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 144-140 chr6 72516464 72516781 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -105221 NM_001160130 56479 Hs.445324 NM_019842 ENSG00000185760 KCNQ5 Kv7.5|MRD46 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 5 protein-coding 206.333-106 chr22 25693952 25694433 + 0.666667 NA intron (NM_001362778, intron 11 of 19) MIRc|SINE|MIR -47996 NM_001318245 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 198.667-190 chr8 137478954 137479372 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65575 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 148-96 chr22 25018152 25018492 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9652 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 150.333-373 chr6 161777471 161777796 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) intron (NM_004562, intron 7 of 11) 306656 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 163-58 chr4 54187885 54188237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41232 NM_006206 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 155-16 chr10 83172932 83173245 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 504001 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 160.333-207 chr4 41046438 41046750 + 0.666667 NA intron (NM_001330658, intron 3 of 15) intron (NM_001330658, intron 3 of 15) 167948 NM_001166050 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 117.667-106 chr2 222267479 222267783 + 0.666667 NA intron (NM_181457, intron 4 of 7) intron (NM_181457, intron 4 of 7) -30516 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 153-48 chr15 35575843 35576295 + 0.666667 NA intron (NR_038251, intron 1 of 2) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 29874 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 112-158 chr4 123934112 123934312 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 159948 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 119-129 chr6 86713273 86713542 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -224121 NM_000865 3354 Hs.1611 NM_000865 ENSG00000168830 HTR1E 5-HT1E 5-hydroxytryptamine receptor 1E protein-coding 156.667-191 chr2 155441394 155441787 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 742895 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 115-140 chr7 4503668 4503901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -178511 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 147.667-65 chr12 15564899 15565319 + 0.666667 NA intron (NM_030671, intron 5 of 13) intron (NM_030671, intron 5 of 13) 18498 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 143.333-57 chr12 3964263 3964546 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90956 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 146.667-2 chr1 39681724 39682016 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001282396, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001282396, exon 5 of 5) 9563 NM_016257 51440 Hs.743975 NM_016257 ENSG00000116983 HPCAL4 HLP4 hippocalcin like 4 protein-coding 128-13 chr11 5466407 5466784 + 0.666667 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) intron (NM_001005567, intron 1 of 4) 13187 NM_001004754 390064 Hs.553733 NM_001004754 ENSG00000187918 OR51I2 OR11-38 olfactory receptor family 51 subfamily I member 2 protein-coding 174.667-77 chr2 8048269 8048625 + 0.666667 NA intron (NR_034135, intron 8 of 8) intron (NR_034135, intron 8 of 8) -71633 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 121-7 chr1 112332170 112332521 + 0.666667 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR -63869 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 216-126 chrX 103369760 103370163 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -6362 NM_206915 27018 Hs.448588 NM_014380 ENSG00000166681 BEX3 Bex|DXS6984E|HGR74|NADE|NGFRAP1 brain expressed X-linked 3 protein-coding 146.333-287 chr6 63114726 63114988 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 205120 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 143.667-133 chr2 123176858 123177180 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103538 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 131.333-72 chr19 5903798 5904014 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001017921) promoter-TSS (NM_001017921) -116 NM_175614 126328 Hs.406062 NM_175614 ENSG00000174886 NDUFA11 B14.7|CI-B14.7|MC1DN14 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A11 protein-coding 255.333-70 chr3 48196085 48196538 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_039645) promoter-TSS (NR_039645) -253 NR_039645 100616407 NR_039645 ENSG00000265483 MIR4443 mir-4443 microRNA 4443 ncRNA 123.333-137 chr21 35973243 35973485 + 0.666667 NA intron (NR_110418, intron 4 of 5) intron (NR_110418, intron 4 of 5) 31303 NR_110418 101928269 Hs.589909 NR_110418 LOC101928269 - uncharacterized LOC101928269 ncRNA 142.333-69 chr13 55368200 55368548 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 193920 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 199-11 chr10 58157644 58158066 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 110039 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 189-47 chr2 176963385 176963836 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 248801 NR_157853 105373759 NR_157853 LOC105373759 - uncharacterized LOC105373759 ncRNA 145.333-216 chr4 66178495 66178904 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -98125 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 188-9 chr1 119661936 119662296 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13850 NM_001080470 90874 Hs.381105 NM_001080470 ENSG00000143067 ZNF697 - zinc finger protein 697 protein-coding 142.333-68 chr13 53939928 53940243 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 124666 NR_047488 100861552 Hs.224691 NR_047488 ENSG00000261517 LINC00558 - long intergenic non-protein coding RNA 558 ncRNA 127.333-192 chr8 117259213 117259508 + 0.666667 NA Intergenic MER5C1|DNA|hAT-Charlie 124365 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 141.667-36 chr10 102344372 102344645 + 0.666667 NA intron (NM_001199378, intron 4 of 39) AluY|SINE|Alu -49602 NM_001288724 4791 Hs.73090 NM_002502 ENSG00000077150 NFKB2 CVID10|H2TF1|LYT-10|LYT10|NF-kB2|p100|p49/p100|p52 nuclear factor kappa B subunit 2 protein-coding 141.667-201 chr7 3477809 3478120 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 1 of 44) intron (NM_152744, intron 1 of 44) 176712 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 145-103 chr6 50573802 50574085 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -139601 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 243.333-66 chr22 19746421 19746963 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10011 NM_005992 6899 Hs.173984 NM_005992 ENSG00000184058 TBX1 CAFS|CATCH22|CTHM|DGCR|DGS|DORV|TBX1C|TGA|VCF|VCFS T-box transcription factor 1 protein-coding 161.333-105 chr16 13294861 13295177 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 393421 NM_001145205 729993 Hs.130661 NM_001145204 ENSG00000237515 SHISA9 CKAMP44 shisa family member 9 protein-coding 184.667-141 chr9 26912237 26912688 + 0.666667 NA intron (NM_001321546, intron 10 of 12) L2c|LINE|L2 -19634 NM_001167575 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 196-51 chr14 72308961 72309435 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) -207622 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 145.333-305 chr8 121187946 121188240 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -376047 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 156-22 chr10 76467646 76467937 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -420253 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 119.333-31 chr10 47303596 47303867 + 0.666667 NA intron (NM_004962, intron 1 of 2) intron (NM_004962, intron 1 of 2) 3534 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 144.333-261 chr8 64556722 64557085 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 20360 NR_015374 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 191.667-95 chr4 83209585 83210124 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74941 NM_001358921 27235 Hs.144304 NM_015697 ENSG00000173085 COQ2 CL640|COQ10D1|MSA1|PHB:PPT coenzyme Q2, polyprenyltransferase protein-coding 129.667-100 chr2 115869794 115870139 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 526151 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 155-11 chr10 19666494 19666891 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 36 of 39) L2|LINE|L2 61858 NR_120646 101928834 Hs.676482 NR_120646 ENSG00000233968 LOC101928834 - uncharacterized LOC101928834 ncRNA 128.667-40 chr12 21818937 21819202 + 0.666667 NA intron (NM_005691, intron 29 of 37) intron (NM_005691, intron 29 of 37) -44363 NM_004982 3764 Hs.102308 NM_004982 ENSG00000121361 KCNJ8 KIR6.1|uKATP-1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 8 protein-coding 131-108 chr8 134035599 134035848 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 149227 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 120.667-47 chr13 106961126 106961420 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 307393 NR_047026 100874173 Hs.569297 NR_047026 ENSG00000230156 LINC00443 - long intergenic non-protein coding RNA 443 ncRNA 154.667-240 chr3 77605685 77606047 + 0.666667 NA intron (NM_001290039, intron 21 of 26) MIRc|SINE|MIR 443097 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 208-83 chr2 160581310 160581788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87742 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 134.333-23 chr10 82839221 82839472 + 0.666667 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -606426 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 127-2 chr1 14998050 14998404 + 0.666667 NA intron (NM_001370231, intron 3 of 8) intron (NM_001370231, intron 3 of 8) 52308 NM_001017999 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 118.333-22 chr1 189268635 189268917 + 0.666667 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 1207234 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 135.333-18 chr10 21344158 21344468 + 0.666667 NA intron (NR_155751, intron 4 of 4) AluJo|SINE|Alu 28637 NR_155751 105376444 Hs.638243 NR_155751 LINC02643 - long intergenic non-protein coding RNA 2643 ncRNA 157-71 chr2 157156015 157156358 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101519 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 130-104 chr5 178857035 178857266 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2803 NM_058230 117608 Hs.724051 NM_058230 ENSG00000178338 ZNF354B KID2 zinc finger protein 354B protein-coding 188.333-171 chr9 118873485 118874031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 194087 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 187.333-107 chr2 127731327 127731882 + 0.666667 NA intron (NM_018383, intron 7 of 21) L1ME4b|LINE|L1 30107 NM_032740 84826 Hs.345849 NM_032740 ENSG00000173349 SFT2D3 - SFT2 domain containing 3 protein-coding 146.667-150 chr2 19416084 19416368 + 0.666667 NA Intergenic (TTCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -57603 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 149-8 chr1 152184232 152184529 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25152 NM_001122965 126638 Hs.376144 NM_152364 ENSG00000215853 RPTN - repetin protein-coding 161-75 chr4 170372968 170373444 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 146615 NR_125889 101928223 Hs.254617 NR_125889 LINC01612 - long intergenic non-protein coding RNA 1612 ncRNA 116.667-186 chr7 35389008 35389216 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75257 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 119.333-80 chr13 84095384 84095706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45057 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 176-90 chr7 98174193 98174565 + 0.666667 NA intron (NM_014916, intron 7 of 13) intron (NM_014916, intron 7 of 13) -37875 NM_177455 168620 Hs.511979 NM_177455 ENSG00000180535 BHLHA15 BHLHB8|MIST1 basic helix-loop-helix family member a15 protein-coding 226.333-53 chr18 66696795 66697293 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -92954 NM_021153 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 143.667-187 chr4 113706539 113706889 + 0.666667 NA intron (NM_001321585, intron 2 of 19) intron (NM_001321585, intron 2 of 19) 55024 NM_001321592 817 Hs.144114 NM_001221 ENSG00000145349 CAMK2D CAMKD calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta protein-coding 145.667-79 chr14 61663792 61664112 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31561 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 170-43 chr16 25863118 25863488 + 0.666667 NA intron (NM_006040, intron 1 of 1) AluSc|SINE|Alu -161934 NR_036146 100422923 NR_036146 ENSG00000265005 MIR548W - microRNA 548w ncRNA 184-112 chr8 120958729 120959073 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -146855 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 205-35 chr15 61524602 61525066 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -205084 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 173-74 chr5 56293782 56294158 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60640 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 137-20 chr12 4953627 4954014 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43915 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 251.667-99 chr8 127300140 127300733 + 0.666667 NA intron (NR_117100, intron 5 of 5) intron (NR_117100, intron 5 of 5) 55799 NR_117099 103021164 Hs.571531 NR_117099 CASC21 CARLO2|CARLo-2|LINC01244 cancer susceptibility 21 ncRNA 141.333-171 chr4 48587172 48587481 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 18 of 63) (TTAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 97074 NM_175619 326340 Hs.276457 NM_175619 ENSG00000182223 ZAR1 Z3CXXC6 zygote arrest 1 protein-coding 179-32 chr15 65404646 65405113 + 0.666667 NA intron (NM_020962, intron 3 of 19) AluJb|SINE|Alu 18068 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 265-56 chr5 15901095 15901846 + 0.666667 NA intron (NM_001278317, intron 2 of 3) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -33712 NR_030616 100126347 NR_030616 ENSG00000216077 MIR887 MIRN887|hsa-mir-887 microRNA 887 ncRNA 215-21 chr14 102395112 102395650 + 0.666667 NA intron (NM_014844, intron 2 of 19) intron (NM_014844, intron 2 of 19) 32440 NM_001172631 9895 Hs.195667 NM_014844 ENSG00000196663 TECPR2 KIAA0329|SPG49 tectonin beta-propeller repeat containing 2 protein-coding 155.667-104 chr14 71268765 71269086 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -51551 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 148-89 chr2 184304018 184304307 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74813 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 148-140 chr6 5677228 5677596 + 0.666667 NA intron (NR_110842, intron 2 of 3) intron (NR_110842, intron 2 of 3) 17860 NR_110842 101927950 Hs.571136 NR_110842 ENSG00000270174 LOC101927950 - uncharacterized LOC101927950 ncRNA 163.333-270 chr7 121520509 121520913 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -124343 NM_001040020 10447 Hs.434053 NM_014888 ENSG00000196937 FAM3C GS3786|ILEI family with sequence similarity 3 member C protein-coding 116-102 chr3 9053448 9053714 + 0.666667 NA intron (NM_014850, intron 8 of 21) intron (NM_014850, intron 8 of 21) -90109 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 116.333-166 chr5 19033185 19033483 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 852938 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 135-74 chr4 30324539 30324850 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -395675 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 195-73 chr3 110996674 110997198 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 73023 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 191.667-41 chr12 76221168 76221712 + 0.666667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -38443 NR_146531 105369848 NR_146531 LNCOG LINC02407|lncRNA-OG lncRNA osteogenesis associated ncRNA 116.333-25 chr10 9698725 9698989 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -359865 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 130.667-173 chr5 144936363 144936739 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 731160 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 258.667-22 chr11 72609383 72610016 + 0.666667 NA intron (NM_001143839, intron 1 of 29) intron (NM_001143839, intron 1 of 29) 5431 NR_029603 406931 NR_029603 ENSG00000272036 MIR139 MIR139-3p|MIRN139|mir-139 microRNA 139 ncRNA 115.667-132 chr20 12602020 12602350 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 334778 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 116.333-208 chr8 106020627 106020936 + 0.666667 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 39722 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 132-99 chr5 41455897 41456181 + 0.666667 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) MIRc|SINE|MIR 54562 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 142.667-179 chr5 90703356 90703650 + 0.666667 NA intron (NR_003149, intron 34 of 89) intron (NR_003149, intron 34 of 89) 144706 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 129.333-81 chr18 6566732 6566983 + 0.666667 NA intron (NR_120518, intron 2 of 5) intron (NR_120518, intron 2 of 5) 55441 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 114.667-51 chr11 74433666 74433854 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 33795 NM_005472 10008 Hs.523899 NM_005472 ENSG00000175538 KCNE3 BRGDA6|HOKPP|HYPP|MiRP2 potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 3 protein-coding 155.333-99 chr13 100155688 100156075 + 0.666667 NA intron (NR_148031, intron 5 of 22) intron (NR_148031, intron 5 of 22) 66788 NR_148027 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 158-68 chr2 45381867 45382177 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127081 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 118.333-127 chr3 15537500 15537764 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -15926 NM_005677 8292 Hs.146735 NM_005677 ENSG00000206561 COLQ CMS5|EAD collagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesterase protein-coding 173.666-2 chr10 96326346 96326860 + 0.666667 NA intron (NM_004088, intron 6 of 10) L3|LINE|CR1 22169 NM_001017520 1791 Hs.534206 NM_004088 ENSG00000107447 DNTT TDT DNA nucleotidylexotransferase protein-coding 120-83 chr3 22656038 22656280 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 546419 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 253.333-27 chr14 72800932 72801559 + 0.666667 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) intron (NM_001280542, intron 1 of 10) 91404 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 237.333-124 chr8 121695440 121695999 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54279 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 131-30 chr14 85649978 85650311 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_013231, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_013231, exon 2 of 2) 116795 NM_001346143 23768 Hs.533710 NM_013231 ENSG00000185070 FLRT2 - fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 protein-coding 202-109 chr3 42006148 42006698 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44320 NM_001322500 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 159-103 chr6 120601766 120602092 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 586750 NR_036098 100422951 NR_036098 ENSG00000265725 MIR3144 mir-3144 microRNA 3144 ncRNA 119.333-78 chr13 23205193 23205542 + 0.666667 NA intron (NM_000231, intron 2 of 7) intron (NM_000231, intron 2 of 7) 24446 NM_000231 6445 Hs.37167 NM_000231 ENSG00000102683 SGCG 35DAG|A4|DAGA4|DMDA|DMDA1|LGMD2C|LGMDR5|MAM|SCARMD2|SCG3|gamma-SG sarcoglycan gamma protein-coding 128.333-158 chr5 106938028 106938262 + 0.666667 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) intron (NR_104671, intron 2 of 3) 72869 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 155.333-327 chr6 46238329 46238666 + 0.666667 NA intron (NM_001251973, intron 4 of 4) intron (NM_001251973, intron 4 of 4) -37827 NR_125838 101926915 Hs.575377 NR_125838 LOC101926915 - uncharacterized LOC101926915 ncRNA 157.333-121 chr15 62346573 62346949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3732 NR_106733 102464834 NR_106733 ENSG00000275451 MIR6085 hsa-mir-6085 microRNA 6085 ncRNA 142.333-263 chr9 98568285 98568703 + 0.666667 NA intron (NM_005458, intron 2 of 18) intron (NM_005458, intron 2 of 18) 140441 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 113.333-72 chr14 49341790 49341983 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 244494 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 114.667-241 chr8 38437063 38437293 + 0.666667 NA intron (NM_015850, intron 2 of 17) intron (NM_015850, intron 2 of 17) 30546 NM_001174066 2260 Hs.264887 NM_015850 ENSG00000077782 FGFR1 BFGFR|CD331|CEK|ECCL|FGFBR|FGFR-1|FLG|FLT-2|FLT2|HBGFR|HH2|HRTFDS|KAL2|N-SAM|OGD|bFGF-R-1 fibroblast growth factor receptor 1 protein-coding 124.667-143 chr3 174805739 174805964 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53483 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 127.333-184 chr8 36296769 36297065 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -487457 NM_001031836 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 141.667-78 chr14 73631853 73632126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12997 NM_001201366 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 190.667-11 chr1 117707306 117707824 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 101517 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 129.667-145 chr6 6253541 6253889 + 0.666667 NA intron (NM_000129, intron 4 of 14) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 66976 NM_000129 2162 Hs.335513 NM_000129 ENSG00000124491 F13A1 F13A coagulation factor XIII A chain protein-coding 199.667-33 chr12 82042597 82042957 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 89058 NR_110089 101928449 Hs.737488 NR_110089 ENSG00000257747 LINC02426 - long intergenic non-protein coding RNA 2426 ncRNA 202.667-56 chr14 101690283 101690740 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39926 NR_026774 145200 Hs.150840 NR_026774 ENSG00000258512 LINC00239 C14orf72|NCRNA00239 long intergenic non-protein coding RNA 239 ncRNA 151.667-277 chr5 58487866 58488313 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -3346 NM_001304431 202309 Hs.547697 NM_152687 ENSG00000175857 GAPT C5orf29 GRB2 binding adaptor protein, transmembrane protein-coding 169-22 chr13 40390631 40391066 + 0.666667 NA intron (NR_024506, intron 5 of 5) intron (NR_024506, intron 5 of 5) 90158 NR_024505 646982 Hs.287664 NR_024505 ENSG00000215483 LINC00598 lncFOXO1 long intergenic non-protein coding RNA 598 ncRNA 117.667-77 chr19 5626435 5626682 + 0.666667 NA intron (NM_001320571, intron 2 of 18) intron (NM_001320571, intron 2 of 18) 3475 NM_002967 6294 Hs.728802 NM_002967 ENSG00000160633 SAFB HAP|HET|SAB-B1|SAF-B|SAF-B1|SAFB1 scaffold attachment factor B protein-coding 169.333-252 chr7 88296511 88296872 + 0.666667 NA intron (NM_001205315, intron 1 of 5) intron (NM_001205315, intron 1 of 5) 10203 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 236-27 chr15 70906045 70906592 + 0.666667 NA intron (NM_017691, intron 5 of 15) AluSc|SINE|Alu 13875 NM_001199017 54839 Hs.12692 NM_017691 ENSG00000137821 LRRC49 PGs4 leucine rich repeat containing 49 protein-coding 169.333-75 chr14 51722155 51722508 + 0.666667 NA intron (NM_001042481, intron 13 of 14) intron (NM_001042481, intron 13 of 14) 5048 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 144.333-258 chr8 50238159 50238443 + 0.666667 NA intron (NR_135797, intron 2 of 20) L1PREC2|LINE|L1 74170 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 250-38 chr2 46625709 46626159 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014171, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_014171, exon 5 of 5) 8719 NM_014171 9419 Hs.133998 NM_014171 ENSG00000119878 CRIPT HSPC139|SSMDF CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain protein-coding 227-47 chr5 90907839 90908253 + 0.666667 NA intron (NR_003149, intron 83 of 89) AluSx|SINE|Alu 349249 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 144-160 chr9 85668316 85668602 + 0.666667 NA intron (NM_015239, intron 8 of 25) FRAM|SINE|Alu 73570 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 153.667-137 chr15 78877576 78878016 + 0.666667 NA intron (NM_001265604, intron 1 of 11) intron (NM_001265604, intron 1 of 11) 4807 NM_001265605 10933 Hs.374503 NM_006791 ENSG00000185787 MORF4L1 Eaf3|FWP006|HsT17725|MEAF3|MORFRG15|MRG15|S863-6 mortality factor 4 like 1 protein-coding 166-99 chr6 37301847 37302162 + 0.666667 NA intron (NR_130108, intron 8 of 12) intron (NR_130108, intron 8 of 12) -43849 NR_104442 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 151.333-447 chr9 105542310 105542751 + 0.666667 NA intron (NM_001287191, intron 13 of 13) AluJr|SINE|Alu -15600 NM_006731 2218 Hs.55777 NM_006731 ENSG00000106692 FKTN CMD1X|FCMD|LGMD2M|LGMDR13|MDDGA4|MDDGB4|MDDGC4 fukutin protein-coding 232.333-61 chr4 73341959 73342447 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62084 NM_000477 213 Hs.418167 NM_000477 ENSG00000163631 ALB HSA|PRO0883|PRO0903|PRO1341 albumin protein-coding 122.667-175 chr7 41344138 41344439 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 242684 NR_110832 101928773 Hs.382363 NR_110832 ENSG00000224017 LINC01449 - long intergenic non-protein coding RNA 1449 ncRNA 147.333-211 chr3 49521377 49521659 + 0.666667 NA intron (NM_001177640, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu 32848 NR_038866 100132677 Hs.435651 NR_038866 ENSG00000226913 BSN-DT BSN-AS2 BSN divergent transcript ncRNA 182-84 chr4 137055161 137055568 + 0.666667 NA intron (NR_149105, intron 2 of 3) intron (NR_149105, intron 2 of 3) -138392 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 314.667-33 chr6 38083347 38084001 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 4 of 5) intron (NM_021943, intron 4 of 5) 263947 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 166-13 chr1 163911119 163911456 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -488096 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 240-9 chr10 5241021 5241459 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR1|DNA|TcMar-Mariner 29996 NR_149060 110806285 NR_149060 ENSG00000224034 LINC02561 - long intergenic non-protein coding RNA 2561 ncRNA 154.667-33 chr10 12516541 12516863 + 0.666667 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) L1ME1|LINE|L1 -62051 NR_039700 100616151 NR_039700 ENSG00000263584 MIR4480 - microRNA 4480 ncRNA 152.667-96 chr13 56090611 56090904 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 916303 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 124.667-69 chr15 57189810 57190093 + 0.666667 NA intron (NM_001322154, intron 6 of 20) L1MB5|LINE|L1 -29479 NM_001306220 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 150.333-13 chr1 112474189 112474485 + 0.666667 NA intron (NM_001291880, intron 1 of 4) AluSc8|SINE|Alu 7796 NM_001291880 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 261.667-11 chr12 47532924 47533433 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 118170 NR_149087 111082992 Hs.380659 NR_149087 LINC02156 - long intergenic non-protein coding RNA 2156 ncRNA 161.333-217 chr4 84158642 84159065 + 0.666667 NA intron (NR_125909, intron 5 of 8) intron (NR_125909, intron 5 of 8) 140316 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 177-31 chr17 42939493 42939917 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24749 NM_001261434 80755 Hs.317403 NM_001261434 ENSG00000266967 AARSD1 - alanyl-tRNA synthetase domain containing 1 protein-coding 174.333-162 chrX 76977488 76977858 + 0.666667 NA intron (NR_110403, intron 1 of 3) intron (NR_110403, intron 1 of 3) 27828 NR_029905 442899 NR_029905 ENSG00000207995 MIR325 MIRN325|hsa-mir-325 microRNA 325 ncRNA 113.667-36 chr12 2753633 2753928 + 0.666667 NA intron (NR_146317, intron 3 of 3) intron (NR_146317, intron 3 of 3) -41190 NM_002014 2288 Hs.524183 NM_002014 ENSG00000004478 FKBP4 FKBP51|FKBP52|FKBP59|HBI|Hsp56|PPIase|p52 FKBP prolyl isomerase 4 protein-coding 169.667-42 chr12 45812498 45812861 + 0.666667 NA intron (NM_152641, intron 4 of 20) L3|LINE|CR1 82970 NM_001347839 196528 Hs.317304 NM_152641 ENSG00000189079 ARID2 BAF200|CSS6|p200 AT-rich interaction domain 2 protein-coding 114.333-65 chr13 95974935 95975175 + 0.666667 NA intron (NM_020121, intron 10 of 38) AluSz|SINE|Alu 78346 NM_020121 55757 Hs.193226 NM_020121 ENSG00000102595 UGGT2 HUGT2|UGCGL2|UGT2 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 2 protein-coding 113-10 chr1 155318707 155318896 + 0.666667 NA intron (NM_001135822, intron 6 of 9) intron (NM_001135822, intron 6 of 9) -2093 NM_001105203 23623 Hs.226499 NM_014328 ENSG00000160753 RUSC1 NESCA RUN and SH3 domain containing 1 protein-coding 114-175 chr9 98839258 98839487 + 0.666667 NA intron (NM_024642, intron 6 of 9) intron (NM_024642, intron 6 of 9) 31702 NM_024642 79695 Hs.47099 NM_024642 ENSG00000119514 GALNT12 CRCS1|GalNAc-T12 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 protein-coding 163.667-193 chr5 18514659 18515104 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 707607 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 126.333-137 chr4 184465596 184465955 + 0.666667 NA intron (NM_002199, intron 1 of 8) L1ME4a|LINE|L1 8775 NM_002199 3660 Hs.654566 NM_002199 ENSG00000168310 IRF2 IRF-2 interferon regulatory factor 2 protein-coding 118.333-214 chr9 27163232 27163518 + 0.666667 NA intron (NM_001290077, intron 2 of 21) L2b|LINE|L2 54234 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 164.667-90 chr17 57369763 57370170 + 0.666667 NA intron (NM_001322250, intron 5 of 13) intron (NM_001322250, intron 5 of 13) 112947 NM_170721 124540 Hs.658922 NM_138962 ENSG00000153944 MSI2 MSI2H musashi RNA binding protein 2 protein-coding 113.333-92 chr16 27323015 27323205 + 0.666667 NA intron (NM_001257997, intron 1 of 9) intron (NM_001257997, intron 1 of 9) 9136 NM_001257997 3566 Hs.513457 NM_000418 ENSG00000077238 IL4R CD124|IL-4RA|IL4RA interleukin 4 receptor protein-coding 163.333-193 chr4 27311046 27311391 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 93739 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 126.333-25 chr11 25782022 25782299 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -406963 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 145.667-71 chr14 44493390 44493697 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13740 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 114.667-222 chr6 50299694 50299948 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -249892 NM_001369057 245915 Hs.571092 NM_001037498 ENSG00000180872 DEFB112 DEFB-12 defensin beta 112 protein-coding 112-120 chr2 207427321 207427561 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -102521 NR_135473 1385 Hs.516646 NM_004379 ENSG00000118260 CREB1 CREB|CREB-1 cAMP responsive element binding protein 1 protein-coding 133.667-163 chr9 73673422 73673685 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 521688 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 143.333-36 chr10 60825729 60826120 + 0.666667 NA Intergenic LTR8B|LTR|ERV1 47446 NM_001786 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 136.333-59 chr14 88726408 88726703 + 0.666667 NA exon (NM_183387, exon 8 of 43) exon (NM_183387, exon 8 of 43) 66398 NM_183387 161436 Hs.325846 NM_183387 ENSG00000165521 EML5 EMAP-2|EMAP-5 EMAP like 5 protein-coding 117.333-200 chr7 140896905 140897197 + 0.666667 NA intron (NR_148928, intron 1 of 17) L1ME3Cz|LINE|L1 27878 NM_004333 673 Hs.324250 NM_004333 ENSG00000157764 BRAF B-RAF1|B-raf|BRAF1|NS7|RAFB1 B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 271.667-45 chr3 48663194 48663800 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001407) promoter-TSS (NM_001407) -271 NR_111921 102724368 Hs.663571 NR_111921 ENSG00000228350 LINC02585 CELSR3-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 2585 ncRNA 138-42 chr16 56084760 56084997 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 106216 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 163.333-293 chr9 18629973 18630445 + 0.666667 NA intron (NM_052866, intron 5 of 12) L1MEc|LINE|L1 56903 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 123-59 chr18 33994523 33994758 + 0.666667 NA intron (NM_001353232, intron 6 of 9) L1MB8|LINE|L1 53972 NM_001198549 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 135.333-43 chr12 39086226 39086623 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -180833 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 145.667-7 chr1 64365507 64365866 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104443 NM_020925 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 181-43 chr2 216164612 216165044 + 0.666667 NA intron (NM_021141, intron 16 of 20) intron (NM_021141, intron 16 of 20) -52061 NR_037701 150967 Hs.56876 NM_001199924 ENSG00000260804 LINC01963 PKI55 long intergenic non-protein coding RNA 1963 ncRNA 118.667-115 chr2 210099955 210100291 + 0.666667 NA intron (NM_001307976, intron 4 of 13) MER1B|DNA|hAT-Charlie 70201 NR_110291 101928020 Hs.635556 NR_110291 LOC101928020 - uncharacterized LOC101928020 ncRNA 148.333-412 chr9 77351134 77351441 + 0.666667 NA intron (NM_001018038, intron 52 of 68) intron (NM_001018038, intron 52 of 68) -96362 NR_121184 101927422 Hs.434324 NR_121184 ENSG00000231373 GNA14-AS1 - GNA14 antisense RNA 1 ncRNA 189-88 chr8 53557348 53557718 + 0.666667 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -33568 NR_149032 100507516 Hs.597483 NR_149032 LOC100507516 - uncharacterized LOC100507516 ncRNA 121.667-29 chr10 73221992 73222260 + 0.666667 NA intron (NM_173348, intron 7 of 13) L1MEc|LINE|L1 25129 NM_015190 23234 Hs.408577 NM_015190 ENSG00000213551 DNAJC9 HDJC9|JDD1|SB73 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C9 protein-coding 183-22 chr11 109704415 109704720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282377 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 235.333-64 chr22 35295934 35296395 + 0.666667 NA TTS (NR_027780) TTS (NR_027780) -3111 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 194-105 chr4 167987459 167988013 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104801 NM_007193 11199 Hs.188401 NM_007193 ENSG00000109511 ANXA10 ANX14 annexin A10 protein-coding 143.333-244 chr6 73280194 73280516 + 0.666667 NA intron (NR_027005, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu -17159 NM_030568 80759 Hs.433062 NM_030568 ENSG00000135314 KHDC1 C6orf147|C6orf148|Em:AC019205.8|KHDC1L|NDG1|bA257K9.4 KH domain containing 1 protein-coding 211.667-51 chr18 13682487 13682843 + 0.666667 NA intron (NM_152352, intron 1 of 3) AluSz6|SINE|Alu 40907 NM_001276251 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 143-64 chr2 33959671 33959978 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) -107402 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 149-65 chr2 29044510 29044805 + 0.666667 NA intron (NM_001321538, intron 17 of 18) intron (NM_001321538, intron 17 of 18) 29866 NM_001029883 388939 Hs.354243 NM_001029883 ENSG00000179270 PCARE C2orf71|RP54 photoreceptor cilium actin regulator protein-coding 114.667-251 chr8 131336062 131336377 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -295310 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 205.667-88 chr22 39079690 39080092 + 0.666667 NA intron (NM_001349436, intron 2 of 7) AluSq2|SINE|Alu 2616 NM_001349438 60489 Hs.660143 NM_021822 ENSG00000239713 APOBEC3G A3G|ARCD|ARP-9|ARP9|CEM-15|CEM15|MDS019|bK150C2.7|dJ494G10.1 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G protein-coding 132-71 chr20 45360054 45360333 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1756 NM_001197129 90196 Hs.655055 NM_033542 ENSG00000204070 SYS1 C20orf169|dJ453C12.4|dJ453C12.4.1 SYS1 golgi trafficking protein protein-coding 143.667-118 chr19 29723164 29723551 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7568 NM_001256047 83636 Hs.529094 NM_031448 ENSG00000131943 C19orf12 MPAN|NBIA3|NBIA4|SPG43 chromosome 19 open reading frame 12 protein-coding 119.667-152 chr5 59805464 59805699 + 0.666667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) -36733 NM_001364603 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 152.667-153 chr18 71437326 71437705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141441 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 174.667-141 chr5 56229779 56230233 + 0.666667 NA intron (NM_024669, intron 2 of 11) MER5B|DNA|hAT-Charlie 3324 NM_024669 79722 Hs.436214 NM_024669 ENSG00000164512 ANKRD55 - ankyrin repeat domain 55 protein-coding 270.333-20 chr13 113387863 113388392 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -23979 NM_001286732 79774 Hs.745043 NM_024719 ENSG00000139835 GRTP1 TBC1D6 growth hormone regulated TBC protein 1 protein-coding 142-33 chr13 23176576 23176939 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -4164 NM_000231 6445 Hs.37167 NM_000231 ENSG00000102683 SGCG 35DAG|A4|DAGA4|DMDA|DMDA1|LGMD2C|LGMDR5|MAM|SCARMD2|SCG3|gamma-SG sarcoglycan gamma protein-coding 115.333-230 chr9 99797493 99797773 + 0.666667 NA intron (NR_109802, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR 22256 NR_109802 101928438 Hs.637767 NR_109802 ENSG00000237461 LOC101928438 - uncharacterized LOC101928438 ncRNA 131.333-193 chr9 75615815 75616067 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -274703 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 205-60 chr3 97946032 97946476 + 0.666667 NA intron (NM_001042533, intron 8 of 9) intron (NM_001042533, intron 8 of 9) 26177 NM_153182 84864 Hs.570562 NM_032778 ENSG00000170854 RIOX2 JMJD10|MDIG|MINA|MINA53|NO52|ROX ribosomal oxygenase 2 protein-coding 117-107 chr4 128574440 128574663 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 146535 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 130.667-132 chr20 49992052 49992434 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 9263 NM_005985 6615 Hs.48029 NM_005985 ENSG00000124216 SNAI1 SLUGH2|SNA|SNAH|SNAIL|SNAIL1|dJ710H13.1 snail family transcriptional repressor 1 protein-coding 159.667-346 chrX 74283795 74284162 + 0.666667 NA intron (NR_028379, intron 1 of 6) AluSc5|SINE|Alu 3231 NR_030258 664614 NR_030258 ENSG00000207820 MIR545 MIRN545|hsa-mir-545|mir-545 microRNA 545 ncRNA 192-117 chr5 119405954 119406448 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -46296 NM_001292027 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 146.667-12 chr1 89008325 89008623 + 0.666667 NA TTS (NM_001319181) TTS (NM_001319181) 14392 NM_001319181 2635 Hs.720167 NM_018284 ENSG00000117226 GBP3 - guanylate binding protein 3 protein-coding 117.333-115 chr2 219335237 219335416 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2149 NM_001007089 389075 Hs.290551 NM_001007089 ENSG00000182698 RESP18 - regulated endocrine specific protein 18 protein-coding 115-104 chr21 26581627 26581821 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8438 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 261-6 chr1 245936254 245936722 + 0.666667 NA intron (NM_022743, intron 5 of 11) Charlie21a|DNA|hAT-Charlie 480924 NM_022743 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 144.333-85 chr15 75980815 75981155 + 0.666667 NA intron (NM_138573, intron 3 of 5) L1MD|LINE|L1 31439 NM_138573 145957 Hs.732438 NM_138573 ENSG00000169752 NRG4 HRG4 neuregulin 4 protein-coding 142.333-55 chr12 19904696 19905065 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109805 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 115.667-191 chr6 52945626 52945897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36063 NM_001363542 2940 Hs.102484 NM_000847 ENSG00000174156 GSTA3 GSTA3-3|GTA3 glutathione S-transferase alpha 3 protein-coding 128.667-88 chr2 61145318 61145662 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_036496) promoter-TSS (NR_036496) 374 NM_001367069 339804 Hs.140617 NM_001143959 ENSG00000237651 C2orf74 - chromosome 2 open reading frame 74 protein-coding 212-109 chr3 136853703 136854157 + 0.666667 NA intron (NR_110177, intron 1 of 2) intron (NR_110177, intron 1 of 2) 8133 NR_110176 101927597 Hs.559587 NR_110175 NCK1-DT NCK1-AS1|SLC35G2-AS1 NCK1 divergent transcript ncRNA 173.667-78 chr2 72144650 72145014 + 0.666667 NA intron (NM_019885, intron 1 of 5) CpG 3030 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 130-109 chr6 54026005 54026283 + 0.666667 NA intron (NM_001281746, intron 1 of 11) intron (NM_001281746, intron 1 of 11) 7174 NM_001281746 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 118.667-18 chr10 15956740 15957087 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -96380 NM_001318330 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 112-93 chr18 37161523 37161787 + 0.666667 NA intron (NR_136303, intron 9 of 13) intron (NR_136303, intron 9 of 13) -112805 NR_134588 105372068 Hs.569903 NR_134588 ENSG00000267202 LOC105372068 - uncharacterized LOC105372068 ncRNA 158.667-12 chr1 85184248 85184573 + 0.666667 NA intron (NM_032184, intron 2 of 6) L1ME4a|LINE|L1 16606 NM_032184 84144 Hs.533853 NM_032184 ENSG00000097096 SYDE2 - synapse defective Rho GTPase homolog 2 protein-coding 167.333-12 chr1 96197782 96198249 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 176110 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 194.333-21 chr10 62697904 62698402 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106567 NM_032804 84890 Hs.99821 NM_032804 ENSG00000181915 ADO C10orf22 2-aminoethanethiol dioxygenase protein-coding 189.667-122 chr6 10239574 10240117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -164657 NR_145448 109729173 NR_145448 ENSG00000285278 TFAP2A-AS2 HIPSTR TFAP2A antisense RNA 2 ncRNA 178.333-11 chr1 188422684 188423007 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 979217 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 158-110 chr5 107439386 107439723 + 0.666667 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 231383 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 150-59 chr17 53373588 53373859 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 388218 NM_001243552 100506650 Hs.146556 NM_001243552 C17orf112 - chromosome 17 open reading frame 112 protein-coding 119.667-126 chr3 162848183 162848459 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 454980 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 113.333-145 chr2 237111604 237111833 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 25829 NM_006710 10920 Hs.531713 NM_006710 ENSG00000198612 COPS8 COP9|CSN8|SGN8 COP9 signalosome subunit 8 protein-coding 128.667-69 chr16 19819599 19819883 + 0.666667 NA intron (NR_130968, intron 7 of 8) AluY|SINE|Alu 65107 NM_016235 51704 Hs.148685 NM_016235 ENSG00000167191 GPRC5B RAIG-2|RAIG2 G protein-coupled receptor class C group 5 member B protein-coding 220.333-31 chr12 515225 515847 + 0.666667 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) MIR|SINE|MIR 55597 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 115.667-215 chr8 121311842 121312028 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -327411 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 197.333-161 chr3 194680356 194680828 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -5291 NM_153690 131583 Hs.435080 NM_153690 ENSG00000185112 FAM43A - family with sequence similarity 43 member A protein-coding 147.667-395 chrX 22395458 22395855 + 0.666667 NA intron (NR_073010, intron 4 of 11) intron (NR_073010, intron 4 of 11) 122743 NM_152577 158506 Hs.132485 NM_152577 ENSG00000175809 CBLL2 CT138|HAKAIL|ZNF645 Cbl proto-oncogene like 2 protein-coding 142.667-79 chr17 32136986 32137281 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5321 NM_001288755 55288 Hs.655325 NM_018307 ENSG00000126858 RHOT1 ARHT1|MIRO-1|MIRO1 ras homolog family member T1 protein-coding 212.667-58 chr18 2108669 2109193 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 462574 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 180.667-75 chr2 216915672 216916066 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 45097 NR_130782 101928327 Hs.350698 NR_130782 ENSG00000223874 LINC01921 - long intergenic non-protein coding RNA 1921 ncRNA 125-14 chr10 61328321 61328573 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -124192 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 138.333-149 chr5 72124430 72124711 + 0.666667 NA intron (NM_005909, intron 2 of 6) intron (NM_005909, intron 2 of 6) 17095 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 121-74 chr2 134451707 134452006 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002410, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_002410, exon 16 of 16) 197784 NM_002410 4249 Hs.4988 NM_002410 ENSG00000152127 MGAT5 GNT-V|GNT-VA|MGAT5A alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 122-119 chr8 95594994 95595343 + 0.666667 NA intron (NR_038207, intron 2 of 2) intron (NR_038207, intron 2 of 2) -325967 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 149-84 chr21 31285844 31286193 + 0.666667 NA intron (NM_001353686, intron 2 of 27) intron (NM_001353686, intron 2 of 27) 58336 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 127-109 chr9 137471115 137471433 + 0.666667 NA intron (NM_001098537, intron 25 of 34) L1MEg|LINE|L1 -11940 NM_001130970 26012 Hs.455336 NM_015537 ENSG00000165802 NSMF HH9|NELF NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor protein-coding 145-45 chr2 28924447 28924729 + 0.666667 NA intron (NM_015131, intron 7 of 17) L2|LINE|L2 -2479 NR_002741 26796 NR_002741 ENSG00000265145 SNORD53 RNU53|SNORD53A|U53 small nucleolar RNA, C/D box 53 snoRNA 151-50 chr19 30374152 30374486 + 0.666667 NA intron (NM_014717, intron 1 of 4) (TATTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1935 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 196.667-137 chr6 148114906 148115364 + 0.666667 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -157193 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 112.667-212 chr5 52147966 52148282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140093 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 148-30 chr11 122060277 122060611 + 0.666667 NA intron (NR_137178, intron 3 of 4) L1MEc|LINE|L1 39400 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 118.667-111 chr2 162845577 162845918 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -6980 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 125.667-51 chr13 23592494 23592795 + 0.666667 NA intron (NM_001354985, intron 2 of 8) intron (NM_001354985, intron 2 of 8) 13284 NM_001354985 55504 Hs.149168 NM_018647 ENSG00000127863 TNFRSF19 TAJ|TAJ-alpha|TRADE|TROY TNF receptor superfamily member 19 protein-coding 178-103 chr6 141471537 141471999 + 0.666667 NA Intergenic MER61-int|LTR|ERV1 617031 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 130-108 chr6 36446447 36446685 + 0.666667 NA intron (NR_104481, intron 1 of 3) AluJo|SINE|Alu 3566 NM_173562 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 247.667-57 chr20 8315718 8316363 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) 67336 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 160-56 chr2 17403833 17404256 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 114396 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 208.666-108 chr8 79051861 79052461 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 214632 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 161-57 chr3 739406 739764 + 0.666667 NA intron (NR_110118, intron 1 of 3) L1M4c|LINE|L1 147480 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 337-22 chr5 106288531 106289246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 722126 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 129.333-116 chr3 21478114 21478410 + 0.666667 NA intron (NM_024697, intron 4 of 7) intron (NM_024697, intron 4 of 7) -64527 NR_046731 100874216 Hs.661720 NR_046731 ENSG00000225542 ZNF385D-AS1 - ZNF385D antisense RNA 1 ncRNA 185.667-144 chr9 26589063 26589442 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 303550 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 147.667-45 chr10 110102351 110102645 + 0.666667 NA intron (NM_001320591, intron 3 of 15) AluJo|SINE|Alu -94117 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 190.667-45 chr14 96530351 96530712 + 0.666667 NA intron (NM_001363662, intron 6 of 20) AluJr|SINE|Alu 27666 NM_001293628 10914 Hs.253726 NM_032632 ENSG00000090060 PAPOLA PAP|PAP-alpha poly(A) polymerase alpha protein-coding 119.667-128 chr3 181557077 181557323 + 0.666667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) AluSx|SINE|Alu -53134 NR_004053 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 166.333-163 chr3 187014270 187014620 + 0.666667 NA intron (NM_173216, intron 2 of 7) intron (NM_173216, intron 2 of 7) -7410 NM_003032 6480 Hs.207459 NM_003032 ENSG00000073849 ST6GAL1 SIAT1|ST6GalI|ST6N ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 130.667-11 chr1 152912455 152912688 + 0.666667 NA TTS (NM_005547) TTS (NM_005547) 4026 NM_005547 3713 Hs.516439 NM_005547 ENSG00000163207 IVL - involucrin protein-coding 173.333-127 chr3 104720710 104721023 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -645847 NM_001243283 214 Hs.591293 NM_001627 ENSG00000170017 ALCAM CD166|MEMD activated leukocyte cell adhesion molecule protein-coding 194.667-37 chr14 31033822 31034240 + 0.666667 NA intron (NM_001254728, intron 1 of 5) intron (NM_001254728, intron 1 of 5) 7388 NM_001254728 11154 Hs.293411 NM_007077 ENSG00000100478 AP4S1 AP47B|CLA20|CLAPS4|CPSQ6|SPG52 adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1 protein-coding 132-100 chr5 45013307 45013624 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 204518 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 112-99 chr19 45638497 45638725 + 0.666667 NA TTS (NR_029886) TTS (NR_029886) 476 NR_029886 442902 NR_029886 ENSG00000284544 MIR330 MIRN330|hsa-mir-330|mir-330 microRNA 330 ncRNA 113.333-227 chr6 98157712 98157889 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 133269 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 120.333-35 chr11 40598950 40599238 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 -305964 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 143.667-111 chr18 6879035 6879379 + 0.666667 NA intron (NM_001010000, intron 9 of 16) intron (NM_001010000, intron 9 of 16) 44722 NM_001010000 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 169-55 chr20 41122744 41123184 + 0.666667 NA intron (NM_003286, intron 20 of 20) MIR|SINE|MIR -14579 NM_002660 5335 Hs.268177 NM_002660 ENSG00000124181 PLCG1 NCKAP3|PLC-II|PLC1|PLC148|PLCgamma1 phospholipase C gamma 1 protein-coding 148.667-236 chr22 39793306 39793644 + 0.666667 NA intron (NM_152512, intron 5 of 6) L1M2|LINE|L1 100285 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 169-30 chr14 80839173 80839574 + 0.666667 NA intron (NM_152446, intron 10 of 24) intron (NM_152446, intron 10 of 24) 102365 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 168.333-108 chr2 220655146 220655636 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -748826 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 170.667-158 chr7 77633537 77634002 + 0.666667 NA intron (NM_001131009, intron 13 of 16) AluSq2|SINE|Alu 62496 NR_134253 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 151.333-20 chr1 113677339 113677648 + 0.666667 NA intron (NM_001142782, intron 19 of 20) MIRb|SINE|MIR 81662 NM_006608 10745 Hs.655824 NM_006608 ENSG00000116793 PHTF1 PHTF putative homeodomain transcription factor 1 protein-coding 144.667-99 chr15 73372834 73373162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4040 NM_005477 10021 Hs.86941 NM_005477 ENSG00000138622 HCN4 SSS2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4 protein-coding 208.667-47 chr14 62989120 62989488 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 4 of 10) intron (NM_139318, intron 4 of 10) 56154 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 124.333-42 chr13 75602846 75603214 + 0.666667 NA intron (NM_006002, intron 7 of 8) AluJr|SINE|Alu -17404 NM_005358 4008 Hs.207631 NM_005358 ENSG00000136153 LMO7 FBX20|FBXO20|LMO7b|LOMP LIM domain 7 protein-coding 199.667-134 chr8 19830435 19830901 + 0.666667 NA intron (NR_148458, intron 10 of 18) intron (NR_148458, intron 10 of 18) 13252 NM_018142 55174 Hs.512627 NM_018142 ENSG00000104613 INTS10 C8orf35|INT10 integrator complex subunit 10 protein-coding 115.667-192 chr6 54242279 54242541 + 0.666667 NA intron (NM_138569, intron 11 of 12) intron (NM_138569, intron 11 of 12) -66031 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 204-160 chr5 39436844 39437314 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -11846 NM_001244871 1601 Hs.696631 NM_001343 ENSG00000153071 DAB2 DOC-2|DOC2 DAB adaptor protein 2 protein-coding 120.667-154 chr6 154536284 154536587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25750 NM_001368117 154043 Hs.16064 NM_173515 ENSG00000153721 CNKSR3 CNK3|CNK3/IPCEF1|MAGI1 CNKSR family member 3 protein-coding 149.333-3 chr1 30183122 30183399 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -145648 NR_110790 101929406 Hs.639413 NR_110790 ENSG00000233399 LINC01648 - long intergenic non-protein coding RNA 1648 ncRNA 114-130 chr6 18294019 18294225 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -29592 NM_001134709 7913 Hs.484813 NM_003472 ENSG00000124795 DEK D6S231E DEK proto-oncogene protein-coding 129-11 chr1 213847868 213848099 + 0.666667 NA intron (NR_037850, intron 4 of 5) (CA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -76766 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 114.667-124 chr2 31927347 31927571 + 0.666667 NA intron (NM_001137602, intron 2 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 83205 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 157.667-283 chr6 69727061 69727526 + 0.666667 NA intron (NM_001367272, intron 7 of 15) L1MA2|LINE|L1 69173 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 129.333-6 chr1 156282713 156282993 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001323614) promoter-TSS (NM_001323614) -28 NM_015327 23381 Hs.516837 NM_015327 ENSG00000198952 SMG5 EST1B|LPTS-RP1|LPTSRP1|SMG-5 SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor protein-coding 182-46 chr2 54503514 54504025 + 0.666667 NA intron (NM_003128, intron 1 of 35) intron (NM_003128, intron 1 of 35) -25453 NR_002229 56969 Hs.657366 NM_020217 RPL23AP32 RPL23A_9_220 ribosomal protein L23a pseudogene 32 pseudo 200.333-151 chr8 70897569 70897981 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 228436 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 116-17 chr10 43520795 43521060 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47532 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 123-36 chr12 61538531 61538810 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 654169 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 299.333-3 chr1 183030226 183031003 + 0.666667 NA intron (NM_002293, intron 1 of 27) (ATATGTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 7194 NM_002293 3915 Hs.609663 NM_002293 ENSG00000135862 LAMC1 LAMB2 laminin subunit gamma 1 protein-coding 183.667-134 chr7 109737712 109738187 + 0.666667 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 222264 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 208-72 chr2 16002131 16002653 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -48035 NR_126559 104797537 Hs.435748 NR_126559 ENSG00000236289 GACAT3 LINC01458|lncRNA-AC130710 gastric cancer associated transcript 3 ncRNA 119-111 chr4 75745991 75746266 + 0.666667 NA intron (NM_003715, intron 1 of 23) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 21606 NM_001290049 8615 Hs.744877 NM_003715 ENSG00000138768 USO1 P115|TAP|VDP USO1 vesicle transport factor protein-coding 134.667-18 chr10 44199556 44199762 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93091 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 142.333-254 chr9 28931286 28931558 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -42467 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 162.333-11 chr1 103972246 103972635 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -100583 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 182.333-107 chr3 88372011 88372426 + 0.666667 NA intron (NM_001368167, intron 2 of 2) L1M4a1|LINE|L1 33762 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 123-80 chr3 138959488 138959788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12421 NM_001040061 401089 Hs.591303 NM_001040061 ENSG00000206262 FOXL2NB C3orf72 FOXL2 neighbor protein-coding 139.667-169 chr7 23169994 23170264 + 0.666667 NA intron (NM_001031710, intron 9 of 10) AluSq2|SINE|Alu -11919 NM_001370444 11097 Hs.408241 NM_007342 ENSG00000136243 NUP42 CG1|NLP-1|NLP_1|NUPL2|hCG1 nucleoporin 42 protein-coding 199.667-22 chr10 117528675 117529075 + 0.666667 NA intron (NR_002791, intron 2 of 3) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger -13570 NM_001165924 2018 Hs.202095 NM_004098 ENSG00000170370 EMX2 - empty spiracles homeobox 2 protein-coding 128.667-25 chr10 62836511 62836730 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -17453 NM_001136178 1959 Hs.1395 NM_000399 ENSG00000122877 EGR2 AT591|CHN1|CMT1D|CMT4E|KROX20 early growth response 2 protein-coding 143.667-159 chr3 54521811 54522149 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 5 of 37) L1MB8|LINE|L1 117877 NR_027122 790952 Hs.720658 NR_027122 ENSG00000265992 ESRG HESRG embryonic stem cell related ncRNA 134-109 chr8 95309864 95310212 + 0.666667 NA intron (NR_038208, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR -40837 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 120-74 chr2 175937852 175938053 + 0.666667 NA intron (NR_130941, intron 12 of 14) MER5B|DNA|hAT-Charlie 64315 NM_001305011 80856 Hs.209561 NM_030650 ENSG00000144320 LNPK KIAA1715|LNP|LNP1|NEDEHCC|Ul|ulnaless lunapark, ER junction formation factor protein-coding 112-117 chr2 178728939 178729251 + 0.666667 NA exon (NM_001267550, exon 65 of 363) exon (NM_001267550, exon 65 of 363) -47831 NR_120594 101927055 Hs.570275 NR_120594 ENSG00000237298 LOC101927055 - uncharacterized LOC101927055 ncRNA 231.333-58 chr2 73564533 73565098 + 0.666667 NA intron (NM_015120, intron 15 of 22) L1MEd|LINE|L1 77607 NM_003960 9027 Hs.14637 NM_003960 ENSG00000144035 NAT8 ATase2|CCNAT|CML1|GLA|Hcml1|TSC501|TSC510 N-acetyltransferase 8 (putative) protein-coding 140.333-25 chr10 20547447 20547840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4327 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 168.333-134 chr3 150490043 150490480 + 0.666667 NA Intergenic MER72|LTR|ERV1 56235 NM_014445 27230 Hs.518326 NM_014445 ENSG00000120742 SERP1 RAMP4 stress associated endoplasmic reticulum protein 1 protein-coding 170.667-56 chr15 62556204 62556558 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 88800 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 118.333-6 chr1 87607943 87608248 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -236440 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 336.667-9 chr14 52547248 52547899 + 0.666667 NA intron (NM_001160047, intron 1 of 20) MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 4932 NM_020784 57544 Hs.532609 NM_020784 ENSG00000087301 TXNDC16 ERp90|KIAA1344 thioredoxin domain containing 16 protein-coding 140-33 chr13 78568526 78568866 + 0.666667 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) -27426 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 123.333-203 chr7 99706640 99706928 + 0.666667 NA intron (NM_000765, intron 12 of 12) intron (NM_000765, intron 12 of 12) -26788 NR_033807 1577 Hs.571258 NM_000777 ENSG00000106258 CYP3A5 CP35|CYPIIIA5|P450PCN3|PCN3 cytochrome P450 family 3 subfamily A member 5 protein-coding 135.667-110 chr22 35125640 35125936 + 0.666667 NA intron (NR_126356, intron 4 of 5) intron (NR_126356, intron 4 of 5) 59630 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 279.333-49 chr21 15457713 15458282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -271937 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 134-108 chr8 91266962 91267271 + 0.666667 NA intron (NM_134266, intron 2 of 18) L1MA6|LINE|L1 17797 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 155-56 chr18 53591857 53592193 + 0.666667 NA intron (NR_110798, intron 4 of 5) L1P1|LINE|L1 -10966 NR_110800 101928167 Hs.382012 NR_110800 ENSG00000260433 LINC01917 - long intergenic non-protein coding RNA 1917 ncRNA 114-57 chr18 4392982 4393207 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 1 of 11) L2a|LINE|L2 62172 NM_001242761 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 185.333-5 chr1 74643808 74644259 + 0.666667 NA intron (NM_001002912, intron 3 of 14) intron (NM_001002912, intron 3 of 14) 29759 NM_001002912 127254 Hs.531182 NM_001002912 ENSG00000178965 ERICH3 C1orf173 glutamate rich 3 protein-coding 174.667-87 chr2 79915777 79916061 + 0.666667 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) intron (NM_001282598, intron 7 of 17) -49336 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 138.667-16 chr10 63940677 63940945 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -418921 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 218.333-71 chr2 105121584 105122197 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18946 NR_110227 101927492 Hs.469537 NR_110227 ENSG00000231851 UTAT33 - uncharacterized LOC101927492 ncRNA 122-58 chr2 212781615 212781871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13588 NR_131942 102725079 Hs.176124 NR_131941 ENSG00000234308 LINC01878 - long intergenic non-protein coding RNA 1878 ncRNA 183.333-139 chr6 35674685 35675067 + 0.666667 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) -10087 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 138.667-201 chr8 60429383 60429745 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -15746 NR_103854 100505532 Hs.720321 NR_103854 LINC01301 - long intergenic non-protein coding RNA 1301 ncRNA 118.333-20 chr1 165886217 165886546 + 0.666667 NA intron (NM_001363568, intron 2 of 7) AluJb|SINE|Alu -21540 NR_037431 100500832 NR_037431 ENSG00000283936 MIR3658 - microRNA 3658 ncRNA 143.333-289 chr8 106647345 106647619 + 0.666667 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -10326 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 207.667-32 chr14 73314981 73315457 + 0.666667 NA intron (NM_001005745, intron 5 of 10) intron (NM_001005745, intron 5 of 10) -69218 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 155.667-34 chr10 29831728 29832052 + 0.666667 NA Intergenic MER77B|LTR|ERVL -94954 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 152-6 chr1 102667220 102667515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 441129 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 140.667-223 chr8 13865458 13865730 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 235904 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 273-38 chr6 157689773 157690506 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -133107 NM_016224 51429 Hs.191213 NM_016224 ENSG00000130340 SNX9 SDP1|SH3PX1|SH3PXD3A|WISP sorting nexin 9 protein-coding 144-48 chr14 44471071 44471355 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 36070 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 121.667-180 chr6 103317141 103317366 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR 1542293 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 141.667-83 chr15 58716760 58717026 + 0.666667 NA intron (NM_001320570, intron 2 of 14) intron (NM_001320570, intron 2 of 14) -23286 NR_073415 664618 Hs.670224 NR_002927 HSP90AB4P HSP90Bd heat shock protein 90 alpha family class B member 4, pseudogene pseudo 136-6 chr10 16743151 16743518 + 0.666667 NA intron (NM_152724, intron 6 of 7) MIRc|SINE|MIR 74090 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 120-27 chr12 24494921 24495101 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 1 of 17) intron (NM_152989, intron 1 of 17) 67480 NM_001261414 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 141.667-107 chr19 47797113 47797391 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 6352 NM_198479 284355 Hs.629812 NM_198479 ENSG00000178928 TPRX1 TPRX tetrapeptide repeat homeobox 1 protein-coding 137-66 chr3 167648163 167648503 + 0.666667 NA intron (NM_001348951, intron 2 of 18) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 5609 NM_001366158 151790 Hs.213762 NM_178824 ENSG00000174776 WDR49 - WD repeat domain 49 protein-coding 205.333-12 chr1 59606503 59607063 + 0.666667 NA intron (NM_001350794, intron 8 of 14) MER95|LTR|ERV1 91153 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 128.333-190 chr8 30796204 30796527 + 0.666667 NA intron (NM_001009552, intron 3 of 6) intron (NM_001009552, intron 3 of 6) 16453 NM_001009552 5516 Hs.491440 NM_004156 ENSG00000104695 PPP2CB PP2Abeta|PP2CB protein phosphatase 2 catalytic subunit beta protein-coding 139.667-184 chr8 63902551 63902829 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 133260 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 131.667-122 chr22 30242797 30243074 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002309, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_002309, exon 3 of 3) -3275 NR_148946 91370 Hs.658999 NM_052856 ENSG00000268812 LOC91370 - uncharacterized LOC91370 ncRNA 115-138 chr6 96065634 96065950 + 0.666667 NA intron (NM_006581, intron 1 of 2) intron (NM_006581, intron 1 of 2) 49818 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 189.333-154 chr5 45308465 45308866 + 0.666667 NA intron (NM_021072, intron 5 of 7) intron (NM_021072, intron 5 of 7) 387715 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 153.333-309 chr4 102654171 102654546 + 0.666667 NA intron (NM_005908, intron 12 of 16) L1MA8|LINE|L1 106610 NM_005908 4126 Hs.480415 NM_005908 ENSG00000109323 MANBA MANB1 mannosidase beta protein-coding 177.667-60 chr17 3488939 3489316 + 0.666667 NA intron (NM_001128085, intron 4 of 6) intron (NM_001128085, intron 4 of 6) 13130 NM_000049 443 Hs.171142 NM_000049 ENSG00000108381 ASPA ACY2|ASP aspartoacylase protein-coding 125-17 chr10 104475311 104475576 + 0.666667 NA non-coding (NR_120624, exon 3 of 3) non-coding (NR_120624, exon 3 of 3) 4832 NR_120624 101927523 Hs.407539 NR_120624 ENSG00000225768 LINC02620 - long intergenic non-protein coding RNA 2620 ncRNA 121.333-34 chr11 104553876 104554082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55323 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 141-83 chr7 16870399 16870674 + 0.666667 NA intron (NM_176813, intron 3 of 7) L1M4|LINE|L1 11447 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 173.333-55 chr14 40018243 40018680 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -585961 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 192.667-46 chr12 17744816 17745313 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71765 NR_039770 100616279 NR_039770 ENSG00000283665 MIR3974 - microRNA 3974 ncRNA 196-197 chr9 101771188 101771689 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32858 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 210.333-153 chr7 6629044 6629661 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -7966 NM_001278559 100131017 Hs.112668 NM_001278559 ENSG00000205903 ZNF316 MZF-3 zinc finger protein 316 protein-coding 167.667-197 chr7 78161279 78161649 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 14 of 20) intron (NM_001301128, intron 14 of 20) -185778 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 194.667-71 chr2 127921932 127922252 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -36152 NM_001199140 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 142-29 chr12 53698773 53699044 + 0.666667 NA Intergenic (ATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -22578 NM_001369755 517 Hs.524464 NM_005176 ENSG00000135390 ATP5MC2 ATP5A|ATP5G2 ATP synthase membrane subunit c locus 2 protein-coding 116.667-105 chr2 144893023 144893237 + 0.666667 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) intron (NR_033870, intron 2 of 4) 225163 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 140-45 chr15 99956791 99957073 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 149909 NR_135737 400464 Hs.187134 NM_001013670 ENSG00000259363 LOC400464 - ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene pseudo 152-20 chr10 48345843 48346217 + 0.666667 NA intron (NM_001323302, intron 3 of 13) L1MD2|LINE|L1 39353 NM_001323320 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 115.333-74 chr14 70396989 70397222 + 0.666667 NA intron (NM_001202549, intron 1 of 4) L1MB4|LINE|L1 19985 NM_001202549 100529257 Hs.443661 NM_001202547 ENSG00000258644 SYNJ2BP-COX16 - SYNJ2BP-COX16 readthrough protein-coding 159-51 chr2 23476551 23476922 + 0.666667 NA intron (NM_052920, intron 2 of 13) L1ME4a|LINE|L1 91557 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 137.667-39 chr11 111684304 111684558 + 0.666667 NA intron (NM_015191, intron 3 of 14) intron (NM_015191, intron 3 of 14) 81958 NM_181699 5519 Hs.269128 NM_002716 ENSG00000137713 PPP2R1B PP2A-Abeta|PR65B protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta protein-coding 147-72 chr2 133075270 133075705 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) L1MEf|LINE|L1 159930 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 120-18 chr10 122773187 122773424 + 0.666667 NA intron (NR_003570, intron 10 of 27) L1MA7|LINE|L1 16611 NR_003570 375940 Hs.650695 NM_198577 ENSG00000176584 DMBT1P1 - deleted in malignant brain tumors 1 pseudogene 1 pseudo 140.333-98 chr2 22437957 22438182 + 0.666667 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -98410 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 119.333-13 chr1 170156458 170156724 + 0.666667 NA intron (NM_001136107, intron 1 of 3) intron (NM_001136107, intron 1 of 3) -5129 NR_036064 100422839 NR_036064 ENSG00000283340 MIR3119-1 - microRNA 3119-1 ncRNA 216-113 chr7 11142595 11143115 + 0.666667 NA intron (NR_033436, intron 16 of 16) intron (NR_033436, intron 16 of 16) 168983 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 155.333-343 chr6 136716818 136717159 + 0.666667 NA intron (NM_005923, intron 2 of 29) AluSz|SINE|Alu -67059 NR_134635 101928429 Hs.672896 NR_134635 LOC101928429 - uncharacterized LOC101928429 ncRNA 127.333-141 chr5 108600331 108600539 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 127826 NR_046368 100652853 Hs.133009 NR_046368 ENSG00000272523 LINC01023 HP07349 long intergenic non-protein coding RNA 1023 ncRNA 136-65 chr3 90144771 90145033 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1037281 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 154-108 chr4 100723079 100723520 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -48186 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 151-85 chr3 83473414 83473711 + 0.666667 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 1396013 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 158.667-45 chr10 86475378 86475816 + 0.666667 NA intron (NM_001318328, intron 4 of 18) intron (NM_001318328, intron 4 of 18) 46187 NM_001318328 23063 Hs.203099 NM_015045 ENSG00000062650 WAPL FOE|KIAA0261|WAPAL WAPL cohesin release factor protein-coding 176.667-32 chr10 122940325 122940700 + 0.666667 NA intron (NM_024942, intron 4 of 5) L1MB1|LINE|L1 13715 NM_024942 80007 Hs.501286 NM_024942 ENSG00000119965 C10orf88 - chromosome 10 open reading frame 88 protein-coding 116.333-102 chr19 36518793 36519006 + 0.666667 NA intron (NM_001012756, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 9372 NM_001166036 339324 Hs.18103 NM_001012756 ENSG00000254004 ZNF260 OZRF1|PEX1|ZFP260 zinc finger protein 260 protein-coding 120.333-69 chr16 53600837 53601031 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001308334, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_001308334, exon 26 of 26) -97630 NM_001012398 64400 Hs.380897 NM_022476 ENSG00000166971 AKTIP FT1|FTS AKT interacting protein protein-coding 223.333-43 chr15 65341656 65342078 + 0.666667 NA intron (NM_004884, intron 2 of 13) AluSz6|SINE|Alu 36135 NM_004884 9543 Hs.128292 NM_004884 ENSG00000174498 IGDCC3 HsT18880|PUNC immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3 protein-coding 163.333-100 chr15 64652002 64652324 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) AluSz|SINE|Alu 51118 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 133.333-201 chr9 115739448 115739696 + 0.666667 NA TTS (NR_109805) TTS (NR_109805) 4667 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 143.667-164 chr3 113438280 113438572 + 0.666667 NA intron (NM_001164496, intron 1 of 34) MIR|SINE|MIR 3067 NM_001164496 55779 Hs.584936 NM_018338 ENSG00000206530 CFAP44 SPGF20|WDR52 cilia and flagella associated protein 44 protein-coding 175.667-27 chr11 59587130 59587543 + 0.666667 NA intron (NM_002556, intron 9 of 13) AluSx1|SINE|Alu 7822 NR_036120 100422880 NR_036120 ENSG00000264559 MIR3162 mir-3162 microRNA 3162 ncRNA 134-48 chr2 44329674 44329904 + 0.666667 NA intron (NM_001042386, intron 7 of 12) intron (NM_001042386, intron 7 of 12) 29960 NM_001042386 9581 Hs.444349 NM_006036 ENSG00000138078 PREPL CMS22 prolyl endopeptidase like protein-coding 152.667-148 chr18 12943763 12944054 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4076 NM_031216 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 168-100 chr7 18116569 18116993 + 0.666667 NA intron (NM_001204144, intron 1 of 12) intron (NM_001204144, intron 1 of 12) 10528 NR_031635 100302140 NR_031635 ENSG00000221393 MIR1302-6 MIRN1302-6|hsa-mir-1302-6 microRNA 1302-6 ncRNA 351.333-17 chr2 184365573 184366477 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12950 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 228.333-107 chr9 29917074 29917621 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 491107 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 159-28 chr12 2175470 2175943 + 0.666667 NA intron (NM_199460, intron 3 of 49).2 L1MC5a|LINE|L1 47775 NR_046578 100874234 Hs.372570 NR_046578 ENSG00000256025 CACNA1C-AS4 - CACNA1C antisense RNA 4 ncRNA 113.667-69 chr15 69118940 69119246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38243 NR_026949 283673 Hs.177927 NM_173610 ENSG00000212766 EWSAT1 LINC00277|NCRNA00277|TMEM84 Ewing sarcoma associated transcript 1 ncRNA 148.333-281 chr4 53284136 53284434 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 3 of 8) intron (NM_152540, intron 3 of 8) 81776 NM_152540 152579 Hs.302287 NM_152540 ENSG00000184178 SCFD2 STXBP1L1 sec1 family domain containing 2 protein-coding 162.667-54 chr12 29533801 29534247 + 0.666667 NA intron (NM_001367875, intron 13 of 19) intron (NM_001367875, intron 13 of 19) -34331 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 112.333-172 chr3 171002221 171002474 + 0.666667 NA intron (NM_001278658, intron 7 of 9) intron (NM_001278658, intron 7 of 9) 24373 NM_001278658 6514 Hs.167584 NM_000340 ENSG00000163581 SLC2A2 GLUT2 solute carrier family 2 member 2 protein-coding 137.667-96 chr2 128351931 128352198 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -33196 NM_004807 9394 Hs.512841 NM_004807 ENSG00000136720 HS6ST1 HH15|HS6ST heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 protein-coding 143.667-157 chr3 50023272 50023545 + 0.666667 NA intron (NM_001349194, intron 3 of 17) AluSq|SINE|Alu -65511 NR_036627 10181 Hs.439480 NM_005778 ENSG00000003756 RBM5 G15|H37|LUCA-15|LUCA15|RMB5 RNA binding motif protein 5 protein-coding 175-38 chr19 50807095 50807557 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -2473 NM_001290155 84798 Hs.256301 NM_032712 ENSG00000167747 C19orf48 - chromosome 19 open reading frame 48 protein-coding 135-21 chr12 103881830 103882071 + 0.666667 NA intron (NR_027249, intron 9 of 15) intron (NR_027249, intron 9 of 15) -40716 NM_001031701 51559 Hs.48428 NM_016575 ENSG00000111696 NT5DC3 TU12B1-TY|TU12B1TY 5'-nucleotidase domain containing 3 protein-coding 129.667-7 chr1 94155653 94155962 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -34659 NM_000350 24 Hs.416707 NM_000350 ENSG00000198691 ABCA4 ABC10|ABCR|ARMD2|CORD3|FFM|RMP|RP19|STGD|STGD1 ATP binding cassette subfamily A member 4 protein-coding 216.667-26 chr12 1620280 1620868 + 0.666667 NA intron (NM_030775, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 3518 NM_030775 81029 Hs.306051 NM_030775 ENSG00000111186 WNT5B - Wnt family member 5B protein-coding 145.333-27 chr1 244886403 244886709 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -22013 NM_031844 3192 Hs.106212 NM_004501 ENSG00000153187 HNRNPU EIEE54|GRIP120|HNRNPU-AS1|HNRPU|SAF-A|SAFA|U21.1|hnRNP U|pp120 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U protein-coding 115-61 chr14 64515193 64515392 + 0.666667 NA intron (NR_110550, intron 3 of 3) intron (NR_110550, intron 3 of 3) -10079 NM_001304507 7597 Hs.654571 NM_006977 ENSG00000089775 ZBTB25 C14orf51|KUP|ZNF46 zinc finger and BTB domain containing 25 protein-coding 127.333-54 chr15 55116463 55116815 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 59892 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 168.667-204 chr7 70818352 70818712 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -313612 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 339-14 chr5 107060784 107061369 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50062 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 139.667-99 chr2 189738984 189739373 + 0.666667 NA intron (NM_144708, intron 19 of 22) L2b|LINE|L2 -23602 NR_102429 101409258 Hs.738558 NR_102429 OSGEPL1-AS1 - OSGEPL1 antisense RNA 1 ncRNA 145.667-2 chr1 44577080 44577438 + 0.666667 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) intron (NM_001319957, intron 1 of 13) 31766 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 130.333-103 chr2 71514846 71515103 + 0.666667 NA intron (NM_001130985, intron 7 of 54) intron (NM_001130985, intron 7 of 54) 48275 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 165.333-249 chr8 97617548 97617880 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -26470 NM_178812 92140 Hs.377155 NM_178812 ENSG00000147649 MTDH 3D3|AEG-1|AEG1|LYRIC|LYRIC/3D3 metadherin protein-coding 142.333-210 chr6 4678719 4679075 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -27241 NM_001368125 9425 Hs.269092 NM_004824 ENSG00000153046 CDYL CDYL1 chromodomain Y like protein-coding 144.333-179 chr3 181544538 181544922 + 0.666667 NA intron (NR_075091, intron 3 of 7) MIR|SINE|MIR -65604 NR_004053 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 130-67 chr2 234987630 234987879 + 0.666667 NA intron (NM_001371305, intron 1 of 5) intron (NM_001371305, intron 1 of 5) 6380 NM_001371305 117-67 chr18 1614130 1614380 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -254626 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 154.667-177 chr2 81046769 81047158 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 419983 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 130.333-30 chr10 58635068 58635409 + 0.666667 NA intron (NM_001080512, intron 2 of 20) MER103C|DNA|hAT-Charlie -79777 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 177-63 chr5 30372225 30372710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 491907 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 190-112 chr7 5741437 5741937 + 0.666667 NA exon (NM_207111, exon 4 of 17) exon (NM_207111, exon 4 of 17) -29777 NR_106934 102466203 NR_106934 ENSG00000283419 MIR6874 hsa-mir-6874 microRNA 6874 ncRNA 168.667-27 chr10 122924192 122924545 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 13758 NM_001029888 118670 Hs.369829 NM_001029888 ENSG00000203795 FAM24A - family with sequence similarity 24 member A protein-coding 183.333-72 chr17 73106779 73107286 + 0.666667 NA Intergenic ORSL-2b|DNA|hAT-Tip100 -14344 NM_001159770 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 177.333-43 chr12 115489947 115490400 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 658481 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 138.333-91 chr2 67400481 67400766 + 0.666667 NA intron (NM_019002, intron 3 of 5) intron (NM_019002, intron 3 of 5) 3290 NM_019002 54465 Hs.353022 NM_019002 ENSG00000143971 ETAA1 ETAA16 ETAA1 activator of ATR kinase protein-coding 130.667-174 chr5 147166067 147166388 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 68632 NR_147190 105378217 Hs.162649 NR_147190 STK32A-AS1 - STK32A antisense RNA 1 ncRNA 123.333-204 chr8 15739735 15740072 + 0.666667 NA intron (NM_001356429, intron 7 of 10) MIRb|SINE|MIR 199640 NM_006765 7991 Hs.426324 NM_006765 ENSG00000104723 TUSC3 D8S1992|M33|MRT22|MRT7|MagT2|N33|OST3A|SLC58A2 tumor suppressor candidate 3 protein-coding 149-67 chr2 75631959 75632371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14618 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 169.667-146 chr4 38289180 38289658 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -77495 NR_149123 105374410 NR_149123 ENSG00000248227 LINC02513 - long intergenic non-protein coding RNA 2513 ncRNA 111.667-246 chr7 112489808 112490058 + 0.666667 NA exon (NM_001134468, exon 4 of 4) exon (NM_001134468, exon 4 of 4) 8942 NM_182597 286006 Hs.396189 NM_182597 ENSG00000181016 LSMEM1 C7orf53 leucine rich single-pass membrane protein 1 protein-coding 170-124 chr9 27159227 27159661 + 0.666667 NA intron (NM_001290077, intron 2 of 21) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 50303 NM_001290078 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 114.667-132 chr2 101714997 101715321 + 0.666667 NA intron (NM_145686, intron 2 of 30) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 17452 NM_001242560 9448 Hs.701013 NM_004834 ENSG00000071054 MAP4K4 FLH21957|HEL-S-31|HGK|MEKKK4|NIK mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 protein-coding 125-119 chr8 126427019 126427280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 101654 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 168.333-217 chr8 135940018 135940372 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 482739 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 126.333-51 chr14 62089969 62090308 + 0.666667 NA intron (NM_001367661, intron 8 of 8) intron (NM_001367661, intron 8 of 8) -27219 NR_015358 646113 Hs.445241 NM_001039785 LINC00643 - long intergenic non-protein coding RNA 643 ncRNA 114.667-234 chr7 17409759 17410015 + 0.666667 NA intron (NR_110015, intron 1 of 2) L1ME3E|LINE|L1 34970 NR_110014 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 142-151 chr7 113636032 113636353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282817 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 113.667-71 chr16 4939110 4939325 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2069 NM_002705 5493 Hs.192233 NM_002705 ENSG00000118898 PPL - periplakin protein-coding 146.667-154 chr2 37489761 37490091 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145296 NM_012413 25797 Hs.79033 NM_012413 ENSG00000115828 QPCT GCT|QC|sQC glutaminyl-peptide cyclotransferase protein-coding 131.667-113 chr20 62314450 62314800 + 0.666667 NA exon (NM_005560, exon 61 of 80) exon (NM_005560, exon 61 of 80) 11628 NM_007002 11047 Hs.90107 NM_007002 ENSG00000130706 ADRM1 ARM-1|ARM1|GP110 adhesion regulating molecule 1 protein-coding 116.667-70 chr16 24395678 24395986 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140279 NM_006539 10368 Hs.7235 NM_006539 ENSG00000006116 CACNG3 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 3 protein-coding 147-38 chr13 113525126 113525561 + 0.666667 NA intron (NR_146222, intron 8 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 34322 NM_017905 55002 Hs.317593 NM_017905 ENSG00000150403 TMCO3 C13orf11 transmembrane and coiled-coil domains 3 protein-coding 190.333-112 chr5 22386117 22386513 + 0.666667 NA intron (NM_001364104, intron 2 of 13) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -172465 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 149-21 chr10 95738702 95739008 + 0.666667 NA intron (NM_001098175, intron 1 of 9) intron (NM_001098175, intron 1 of 9) -16797 NM_001164181 953 Hs.576612 NM_001776 ENSG00000138185 ENTPD1 ATPDase|CD39|NTPDase-1|SPG64 ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 protein-coding 189-95 chrX 15181427 15181789 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88475 NM_024087 140462 Hs.19404 NM_024087 ENSG00000102048 ASB9 - ankyrin repeat and SOCS box containing 9 protein-coding 163.333-33 chr10 56825710 56826190 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -464677 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 164-43 chr17 28704563 28704895 + 0.666667 NA exon (NM_152465, exon 2 of 4) exon (NM_152465, exon 2 of 4) 5375 NM_001366303 147011 Hs.207471 NM_152465 ENSG00000167525 PROCA1 - protein interacting with cyclin A1 protein-coding 140.333-41 chr11 84851466 84851823 + 0.666667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) 71777 NM_001364 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 153.667-169 chr19 51190129 51190440 + 0.666667 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -8318 NR_110732 101928517 Hs.707693 NR_110732 ENSG00000269072 LOC101928517 - uncharacterized LOC101928517 ncRNA 143.333-304 chr9 74255323 74255618 + 0.666667 NA Intergenic LTR54B|LTR|ERV1 -116061 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 149.667-423 chr9 79251873 79252236 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106388 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 149-116 chr5 108499988 108500267 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -118029 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 164.667-178 chr5 10658464 10658804 + 0.666667 NA TTS (NM_001164440) TTS (NM_001164440) 94564 NM_001164440 651746 Hs.26039 NM_001164440 ENSG00000164236 ANKRD33B - ankyrin repeat domain 33B protein-coding 124.667-111 chr2 155802302 155802569 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 452496 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 159.333-50 chr10 87905552 87906015 + 0.666667 NA intron (NM_001304718, intron 2 of 8) intron (NM_001304718, intron 2 of 8) 42158 NM_000314 5728 Hs.500466 NM_000314 ENSG00000171862 PTEN 10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1 phosphatase and tensin homolog protein-coding 188-14 chr1 206764498 206765047 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR -6001 NM_153758 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 141.667-229 chr8 117219213 117219476 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 84349 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 114.667-198 chr4 91282581 91282835 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 994594 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 154.333-285 chr6 3983104 3983465 + 0.666667 NA Intergenic MARNA|DNA|TcMar-Mariner -38016 NR_146785 8899 Hs.159014 NM_003913 ENSG00000112739 PRPF4B PR4H|PRP4|PRP4H|PRP4K|dJ1013A10.1 pre-mRNA processing factor 4B protein-coding 164.667-87 chr16 84539138 84539574 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34697 NM_020947 57707 Hs.288274 NM_020947 ENSG00000140950 MEAK7 KIAA1609|TLDC1|mEAK-7 MTOR associated protein, eak-7 homolog protein-coding 127.667-111 chr22 44739957 44740163 + 0.666667 NA intron (NM_181334, intron 4 of 14) intron (NM_181334, intron 4 of 14) -12498 NM_001017526 23779 Hs.102336 NM_181335 ENSG00000241484 ARHGAP8 BPGAP1|PP610 Rho GTPase activating protein 8 protein-coding 127.333-168 chr7 39019086 39019450 + 0.666667 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) HAL1ME|LINE|L1 -5701 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 142-19 chr10 102368247 102368566 + 0.666667 NA exon (NM_004193, exon 22 of 40) exon (NM_004193, exon 22 of 40) -25704 NM_001288724 4791 Hs.73090 NM_002502 ENSG00000077150 NFKB2 CVID10|H2TF1|LYT-10|LYT10|NF-kB2|p100|p49/p100|p52 nuclear factor kappa B subunit 2 protein-coding 155.667-219 chr3 64370875 64371193 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102861 NM_001370528 166336 Hs.148105 NM_198859 ENSG00000163637 PRICKLE2 EPM5 prickle planar cell polarity protein 2 protein-coding 114.667-61 chr12 32715390 32715681 + 0.666667 NA intron (NM_001330380, intron 7 of 18) AluSz|SINE|Alu 36234 NM_012062 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 232.667-68 chr6 121759526 121760087 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 324160 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 114.667-213 chr5 95672580 95672764 + 0.666667 NA intron (NR_125330, intron 2 of 7) intron (NR_125330, intron 2 of 7) 10319 NM_031952 83890 Hs.50499 NM_031952 ENSG00000145757 SPATA9 NYD-SP16 spermatogenesis associated 9 protein-coding 213-67 chr5 14765588 14765932 + 0.666667 NA intron (NM_054027, intron 2 of 11) intron (NM_054027, intron 2 of 11) 53066 NR_046285 100130744 Hs.660550 NR_046285 LOC100130744 - uncharacterized LOC100130744 ncRNA 171-28 chr17 44963304 44963587 + 0.666667 NA intron (NM_006688, intron 1 of 1) AluSx1|SINE|Alu 4858 NM_006688 10882 Hs.134012 NM_006688 ENSG00000131094 C1QL1 C1QRF|C1QTNF14|CRF|CTRP14 complement C1q like 1 protein-coding 129.333-136 chr4 34468287 34468526 + 0.666667 NA Intergenic (TTTTACT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -198659 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 241-7 chr11 36209398 36210047 + 0.666667 NA intron (NM_001304264, intron 4 of 5) intron (NM_001304264, intron 4 of 5) 79702 NM_001307932 29099 Hs.99443 NM_014186 ENSG00000110442 COMMD9 C11orf55|HSPC166|LINC00610 COMM domain containing 9 protein-coding 154-33 chr12 4809065 4809472 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_002235) promoter-TSS (NM_002235) 92 NM_002235 3742 Hs.306190 NM_002235 ENSG00000130035 KCNA6 HBK2|KV1.6|PPP1R96 potassium voltage-gated channel subfamily A member 6 protein-coding 196.667-74 chr2 67793801 67794201 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31561 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 202.667-16 chr10 17553023 17553430 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64148 NM_014241 9200 Hs.114062 NM_014241 ENSG00000165996 HACD1 CAP|PTPLA 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 protein-coding 228.667-47 chr2 191857114 191857540 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10239 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 128.667-179 chr8 65201822 65202067 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -21604 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 222.333-71 chr5 18877370 18877882 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 1008646 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 118.667-53 chr12 32648315 32648667 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -30709 NM_012063 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 172.667-115 chr4 100062171 100062543 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 111863 NR_125923 256880 Hs.448554 NR_002799 ENSG00000245322 LOC256880 - uncharacterized LOC256880 ncRNA 149.667-381 chr7 111612960 111613357 + 0.666667 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -50641 NM_001350959 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 115.333-6 chr1 82602721 82602972 + 0.666667 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL -300337 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 167.333-72 chr13 75114853 75115207 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 125351 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 156-98 chr4 47167121 47167465 + 0.666667 NA intron (NM_000812, intron 4 of 8) intron (NM_000812, intron 4 of 8) 135726 NM_000812 2560 Hs.27283 NM_000812 ENSG00000163288 GABRB1 EIEE45 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta1 subunit protein-coding 123.667-29 chr10 17246797 17247029 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -16928 NR_108061 100507347 Hs.740502 NR_108060 ENSG00000229124 VIM-AS1 - VIM antisense RNA 1 ncRNA 209.667-115 chr8 127155645 127156066 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 41772 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 140.667-168 chr4 91576673 91577078 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L1MA10|LINE|L1 700427 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 126.333-85 chr2 34431144 34431389 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -246291 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 134.667-188 chr7 93818112 93818369 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 72513 NM_001271004 7980 Hs.438231 NM_006528 ENSG00000105825 TFPI2 PP5|REF1|TFPI-2 tissue factor pathway inhibitor 2 protein-coding 126.667-167 chr7 52669494 52669691 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -366041 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 121-59 chr18 9401699 9402048 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_020648, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_020648, exon 5 of 5) 67100 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 218-14 chr10 120176443 120176914 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 178545 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 160.333-3 chr1 19359988 19360350 + 0.666667 NA intron (NM_001206540, intron 4 of 9) intron (NM_001206540, intron 4 of 9) 47843 NM_001040125 54896 Hs.647620 NM_017765 ENSG00000040487 SLC66A1 LAAT-1|LAAT1|PQLC2 solute carrier family 66 member 1 protein-coding 190-106 chr5 167401126 167401653 + 0.666667 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -172270 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 117.667-119 chr3 82497264 82497505 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E|LTR|ERVL-MaLR 511242 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 132.333-103 chr20 21631777 21632093 + 0.666667 NA intron (NR_109878, intron 1 of 4) L1MC4|LINE|L1 61911 NR_109880 101929625 Hs.542413 NR_109880 LINC01727 - long intergenic non-protein coding RNA 1727 ncRNA 183.667-68 chr2 8985663 8985976 + 0.666667 NA intron (NR_135603, intron 1 of 13) L2|LINE|L2 17865 NM_001321265 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 159-47 chr17 44030754 44031137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7794 NM_001304813 84336 Hs.514211 NM_032376 ENSG00000091947 TMEM101 - transmembrane protein 101 protein-coding 124.333-160 chr6 97845685 97845904 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -178737 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 241.333-80 chr5 18256842 18257288 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 449791 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 143.667-102 chr17 70804612 70804959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 397394 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 167.333-228 chr6 55241754 55242176 + 0.666667 NA intron (NM_001526, intron 2 of 7) AluSx1|SINE|Alu -85504 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 134-36 chr17 32937803 32938132 + 0.666667 NA intron (NM_001301746, intron 7 of 8) intron (NM_001301746, intron 7 of 8) 9814 NM_015544 26022 Hs.3447 NM_015544 ENSG00000006042 TMEM98 TADA1 transmembrane protein 98 protein-coding 146.667-9 chr1 70477618 70477881 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 66481 NM_001902 1491 Hs.19904 NM_001902 ENSG00000116761 CTH - cystathionine gamma-lyase protein-coding 157.667-269 chr5 167629322 167629692 + 0.666667 NA intron (NM_001368145, intron 1 of 26) intron (NM_001368145, intron 1 of 26) 55848 NM_001368145 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 153-10 chr10 29965787 29966098 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 93644 NM_020848 57608 Hs.533953 NM_020848 ENSG00000165757 JCAD KIAA1462 junctional cadherin 5 associated protein-coding 201-53 chr2 74822128 74822640 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -10271 NM_000189 3099 Hs.406266 NM_000189 ENSG00000159399 HK2 HKII|HXK2 hexokinase 2 protein-coding 112.333-39 chr11 79705999 79706249 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -265094 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 204.333-165 chr5 84994927 84995499 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -610333 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 157.333-55 chr10 101500090 101500537 + 0.666667 NA intron (NM_001256856, intron 3 of 13) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 87944 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 141.333-254 chr9 30510612 30510904 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102304 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 115.667-207 chr8 47767963 47768306 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -29970 NM_005195 1052 Hs.440829 NM_005195 ENSG00000221869 CEBPD C/EBP-delta|CELF|CRP3|NF-IL6-beta CCAAT enhancer binding protein delta protein-coding 167.667-102 chr2 55360805 55361303 + 0.666667 NA intron (NM_001254943, intron 7 of 33) AluSx|SINE|Alu 58802 NM_001135597 55704 Hs.292925 NM_018084 ENSG00000115355 CCDC88A APE|GIRDIN|GIV|GRDN|HkRP1|KIAA1212|PEHO|PEHOL coiled-coil domain containing 88A protein-coding 173.667-82 chr2 107538722 107539081 + 0.666667 NA intron (NR_146968, intron 2 of 2) intron (NR_146968, intron 2 of 2) 9482 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 174.333-158 chr9 79622597 79623107 + 0.666667 NA intron (NM_001351563, intron 5 of 17) intron (NM_001351563, intron 5 of 17) 49675 NM_001351563 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 124-70 chr20 28781939 28782144 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -179376 NR_132315 100289097 Hs.529357 NR_132315 ENSG00000282826 FRG1CP - FSHD region gene 1 family member C, pseudogene pseudo 244-46 chr17 68423991 68424710 + 0.666667 NA TTS (NR_030365) TTS (NR_030365) 198 NR_030365 693220 NR_030365 ENSG00000207561 MIR635 MIRN635|hsa-mir-635 microRNA 635 ncRNA 149.333-404 chr8 115062340 115062632 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 605527 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 179.667-16 chr10 7750293 7750705 + 0.666667 NA TTS (NR_045609) TTS (NR_045609) 37494 NR_045609 22944 Hs.397918 NM_012311 ENSG00000151657 KIN BTCD|KIN17|Rts2 Kin17 DNA and RNA binding protein protein-coding 123.333-73 chr14 20643100 20643363 + 0.666667 NA Intergenic LTR19B|LTR|ERV1 -1540 NM_001001968 341799 Hs.513132 NM_001001968 ENSG00000181803 OR6S1 OR14-37|OR6S1Q olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 protein-coding 157-91 chr3 142148450 142148855 + 0.666667 NA intron (NM_001178139, intron 1 of 12) intron (NM_001178139, intron 1 of 12) 892 NM_001178138 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 126.333-179 chr8 94878605 94878952 + 0.666667 NA intron (NR_073445, intron 27 of 27) L2|LINE|L2 16476 NM_057749 9134 Hs.521693 NM_004702 ENSG00000175305 CCNE2 CYCE2 cyclin E2 protein-coding 123-23 chr11 23505030 23505354 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -86002 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 175-52 chr3 47094608 47095047 + 0.666667 NA intron (NR_146158, intron 9 of 21) intron (NR_146158, intron 9 of 21) 69150 NM_014159 29072 Hs.517941 NM_012271 ENSG00000181555 SETD2 HBP231|HIF-1|HIP-1|HSPC069|HYPB|KMT3A|LLS|SET2|p231HBP SET domain containing 2, histone lysine methyltransferase protein-coding 154-146 chr8 126085047 126085408 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -134030 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 133.667-68 chr2 14001564 14001839 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 399257 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 136.333-211 chr8 129755032 129755296 + 0.666667 NA intron (NM_031415, intron 6 of 13) L1MA2|LINE|L1 31460 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 130.333-7 chr1 57339735 57340103 + 0.666667 NA intron (NM_001353980, intron 4 of 5) intron (NM_001353980, intron 4 of 5) 83193 NM_001365793 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 201-24 chr10 122717650 122718055 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18006 NM_001010912 399814 Hs.363649 NM_001010912 ENSG00000183559 C10orf120 bA318C4.1 chromosome 10 open reading frame 120 protein-coding 133.333-120 chr3 181628693 181628993 + 0.666667 NA intron (NR_075090, intron 2 of 2) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 18509 NR_075089 347689 Hs.654932 NR_004053 SOX2-OT NCRNA00043|SOX2OT SOX2 overlapping transcript ncRNA 167.333-237 chr6 143026734 143027232 + 0.666667 NA intron (NR_038987, intron 1 of 2) intron (NR_038987, intron 1 of 2) 10599 NR_038987 100507489 Hs.486645 NR_038987 LINC01277 - long intergenic non-protein coding RNA 1277 ncRNA 156.333-326 chr7 3133278 3133586 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 25141 NR_126024 100129603 Hs.652997 NR_126024 LOC100129603 - uncharacterized LOC100129603 ncRNA 152.333-220 chr22 28565947 28566378 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 106293 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 163.333-296 chr9 74099283 74099601 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -272089 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 167.667-196 chr7 47684380 47684734 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 29313 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 160-16 chr10 57262501 57262926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 41846 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 151-13 chr10 36700570 36700915 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -425115 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 161.667-3 chr1 55369826 55370211 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 144377 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 151-69 chr20 6337527 6337963 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -88987 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 152.333-145 chr17 43904713 43905151 + 0.666667 NA intron (NM_001278370, intron 1 of 12) AluJb|SINE|Alu 2604 NM_001278373 4355 Hs.514208 NM_005374 ENSG00000108852 MPP2 DLG2 membrane palmitoylated protein 2 protein-coding 138.333-11 chr1 206806234 206806482 + 0.666667 NA intron (NM_153758, intron 2 of 6) intron (NM_153758, intron 2 of 6) -22519 NM_013371 29949 Hs.661017 NM_013371 ENSG00000142224 IL19 IL-10C|MDA1|NG.1|ZMDA1 interleukin 19 protein-coding 136.667-81 chr17 76868968 76869222 + 0.666667 NA exon (NM_001199172, exon 1 of 17) exon (NM_001199172, exon 1 of 17) 691 NM_001199172 146664 Hs.144531 NM_144677 ENSG00000167889 MGAT5B GnT-IX|GnT-VB alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B protein-coding 204.333-210 chr9 128607631 128608089 + 0.666667 NA exon (NM_001130438, exon 33 of 57) exon (NM_001130438, exon 33 of 57) 48990 NM_052844 89891 Hs.495240 NM_052844 ENSG00000119333 WDR34 DIC5|FAP133|SRTD11|bA216B9.3 WD repeat domain 34 protein-coding 176.333-37 chr12 99911271 99911587 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 1 of 25) intron (NM_152788, intron 1 of 25) 73225 NM_001352186 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 152.667-105 chr14 54129695 54129991 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -172952 NM_001347912 652 Hs.68879 NM_001202 ENSG00000125378 BMP4 BMP2B|BMP2B1|MCOPS6|OFC11|ZYME bone morphogenetic protein 4 protein-coding 124.667-38 chr11 121938894 121939126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 160834 NR_029671 406911 NR_029671 ENSG00000207971 MIR125B1 MIRN125B1|mir-125b-1 microRNA 125b-1 ncRNA 188.667-94 chr21 46258102 46258467 + 0.666667 NA intron (NM_003906, intron 16 of 27) intron (NM_003906, intron 16 of 27) 27327 NM_003906 8888 Hs.389037 NM_003906 ENSG00000160294 MCM3AP GANP|MAP80|PNRIID|SAC3 minichromosome maintenance complex component 3 associated protein protein-coding 118.333-5 chr1 78605470 78605673 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14877 NM_006820 10964 Hs.744918 NM_006820 ENSG00000137959 IFI44L C1orf29|GS3686 interferon induced protein 44 like protein-coding 186.667-44 chr15 83202053 83202496 + 0.666667 NA intron (NM_016073, intron 1 of 5) intron (NM_016073, intron 1 of 5) 5549 NM_016073 50810 Hs.513954 NM_016073 ENSG00000166503 HDGFL3 CGI-142|HDGF-2|HDGF2|HDGFRP3|HRP-3 HDGF like 3 protein-coding 151-44 chr16 82224415 82224724 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B2|LTR|ERVL -54345 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 151-84 chr3 66200690 66200986 + 0.666667 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) intron (NM_173471, intron 1 of 10) -19904 NR_028475 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 172.333-96 chr20 59558883 59559236 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18450 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 124-74 chr22 24679068 24679347 + 0.666667 NA Intergenic REP522|Satellite|telo -20060 NR_024593 646074 Hs.531306 NM_001025230 POM121L10P - POM121 transmembrane nucleoporin like 10, pseudogene pseudo 172-10 chr1 167028452 167028942 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 39417 NM_032858 84944 Hs.651245 NM_032858 ENSG00000143194 MAEL CT128|SPATA35 maelstrom spermatogenic transposon silencer protein-coding 142.333-223 chr6 154122693 154123028 + 0.666667 NA non-coding (NR_104348, exon 5 of 5) non-coding (NR_104348, exon 5 of 5) 33098 NM_001285528 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 116.667-143 chr4 32598341 32598655 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 247460 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 177.333-133 chr5 102889385 102889749 + 0.666667 NA intron (NR_033440, intron 2 of 23) LTR33|LTR|ERVL 23744 NM_000919 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 261.333 chr1 23692776 23693413 + 0.666667 NA intron (NM_001199802, intron 2 of 5) intron (NM_001199802, intron 2 of 5) 1288 NM_000975 6135 Hs.719951 NM_000975 ENSG00000142676 RPL11 DBA7|GIG34|L11|uL5 ribosomal protein L11 protein-coding 133.333-99 chr22 30753308 30753609 + 0.666667 NA intron (NM_030758, intron 2 of 13) intron (NM_030758, intron 2 of 13) -10795 NM_001282740 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 151.333-348 chr5 114270088 114270392 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91830 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 119.333-150 chr3 66889309 66889513 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -108896 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 142.333-45 chr11 101585645 101585923 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1777 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 115-114 chr3 74429620 74429862 + 0.666667 NA intron (NM_020872, intron 3 of 21) L1MD2|LINE|L1 91399 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 113-120 chr2 241330914 241331137 + 0.666667 NA intron (NM_001349302, intron 3 of 12) AluSx1|SINE|Alu 14860 NM_001321033 4735 Hs.721234 NM_004404 ENSG00000168385 SEPTIN2 DIFF6|NEDD-5|NEDD5|Pnutl3|SEPT2|hNedd5 septin 2 protein-coding 254-50 chr3 25401324 25401902 + 0.666667 NA intron (NM_001290300, intron 1 of 7) L1MEg|LINE|L1 -16686 NR_134933 105376997 Hs.536687 NR_134933 RARB-AS1 - RARB antisense RNA 1 ncRNA 148-154 chr7 74113411 74113790 + 0.666667 NA intron (NM_001204426, intron 11 of 14) AluSz6|SINE|Alu 20383 NM_001204426 3984 Hs.647035 NM_002314 ENSG00000106683 LIMK1 LIMK|LIMK-1 LIM domain kinase 1 protein-coding 146.667-24 chr1 198815372 198815661 + 0.666667 NA intron (NR_040073, intron 2 of 2) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 43466 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 112-70 chr15 69790115 69790359 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44997 NR_026764 414926 Hs.569502 NR_026764 ENSG00000245750 LINC00593 C15orf50 long intergenic non-protein coding RNA 593 ncRNA 121.333-97 chr2 218605393 218605650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2378 NM_032726 84812 Hs.632528 NM_032726 ENSG00000115556 PLCD4 - phospholipase C delta 4 protein-coding 131-38 chr17 58625318 58625541 + 0.666667 NA intron (NM_031272, intron 3 of 31) AluSq2|SINE|Alu 66626 NM_031272 56155 Hs.390221 NM_031272 ENSG00000121101 TEX14 CT113|SPGF23 testis expressed 14, intercellular bridge forming factor protein-coding 118.667-95 chr2 53975510 53975723 + 0.666667 NA intron (NM_001320587, intron 2 of 5) AluSc8|SINE|Alu 4503 NM_001320586 98 Hs.516173 NM_138448 ENSG00000170634 ACYP2 ACYM|ACYP acylphosphatase 2 protein-coding 114.667-157 chr20 54301670 54301867 + 0.666667 NA Intergenic (ATAGAC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 93681 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 168.667-218 chr8 80063391 80063779 + 0.666667 NA intron (NR_105034, intron 1 of 4) AluSx1|SINE|Alu 17245 NM_001025252 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 322-15 chr14 84454316 84454966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -817291 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 112-203 chr8 110531353 110531612 + 0.666667 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 495951 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 171.333-82 chr2 71865403 71865817 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282252 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 146.333-103 chr15 50374174 50374577 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14046 NR_039862 100616396 NR_039862 ENSG00000284284 MIR4712 - microRNA 4712 ncRNA 145-98 chr5 141138657 141138932 + 0.666667 NA TTS (NM_015669) TTS (NM_015669) 3588 NM_015669 26167 Hs.119693 NM_015669 ENSG00000113209 PCDHB5 PCDH-BETA5 protocadherin beta 5 protein-coding 187.667-130 chr6 125304216 125304734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2508 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 165.667-207 chr9 22816853 22817281 + 0.666667 NA intron (NR_038977, intron 4 of 5) MLT1A1-int|LTR|ERVL-MaLR 170867 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 158.667-153 chr2 41169074 41169450 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -656827 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 125.667-55 chr14 40250328 40250601 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -704247 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 123.667-179 chr8 77312157 77312388 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -138425 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 151.333-42 chr10 20928478 20928851 + 0.666667 NA intron (NM_001173484, intron 4 of 6) L2|LINE|L2 -31062 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 140.667-156 chr3 192769518 192769926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42181 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 135.667-125 chr3 192135303 192135597 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103180 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-162 chr20 19159225 19159635 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -53212 NM_020689 57419 Hs.654790 NM_020689 ENSG00000185052 SLC24A3 NCKX3 solute carrier family 24 member 3 protein-coding 153-25 chr12 4962330 4962692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 52606 NM_000217 3736 Hs.416139 NM_000217 ENSG00000111262 KCNA1 AEMK|EA1|HBK1|HUK1|KV1.1|MBK1|MK1|RBK1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 1 protein-coding 131.667-109 chr20 53154963 53155290 + 0.666667 NA intron (NM_173485, intron 1 of 2) intron (NM_173485, intron 1 of 2) -30157 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 145.333-137 chr2 102047293 102047605 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -22941 NM_001320978 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 153.333-111 chr14 46623000 46623440 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 28561 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 121.667-75 chr17 72614386 72614702 + 0.666667 NA intron (NR_033876, intron 3 of 4) L2c|LINE|L2 -21740 NR_137280 100499467 Hs.157726 NR_036488 ENSG00000227036 LINC00673 ERRLR01|HI-LNC75|HILNC75|LUCAIR1|SLNCR|SLNCR1 long intergenic non-protein coding RNA 673 ncRNA 128.333-112 chr2 189516447 189516801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64187 NM_014585 30061 Hs.643005 NM_014585 ENSG00000138449 SLC40A1 FPN1|HFE4|IREG1|MST079|MSTP079|MTP1|SLC11A3 solute carrier family 40 member 1 protein-coding 143.333-302 chr9 27279616 27280039 + 0.666667 NA intron (NR_026679, intron 3 of 16) intron (NR_026679, intron 3 of 16) 2966 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 130.667-89 chr17 75389943 75390297 + 0.666667 NA intron (NM_002086, intron 2 of 5) intron (NM_002086, intron 2 of 5) 15558 NM_002086 2885 Hs.444356 NM_002086 ENSG00000177885 GRB2 ASH|EGFRBP-GRB2|Grb3-3|MST084|MSTP084|NCKAP2 growth factor receptor bound protein 2 protein-coding 117-6 chr1 113555232 113555426 + 0.666667 NA intron (NM_001142782, intron 2 of 20) L1MEc|LINE|L1 164814 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 167.333-168 chr3 17584109 17584511 + 0.666667 NA intron (NM_001349089, intron 1 of 20) L1MB5|LINE|L1 115710 NM_001134381 9779 Hs.475629 NM_014744 ENSG00000131374 TBC1D5 - TBC1 domain family member 5 protein-coding 133.667-57 chr16 34590240 34590514 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208897 NR_158158 102724928 Hs.692710 NR_158158 CCNYL3 - cyclin Y like 3 (pseudogene) pseudo 167.333-6 chr1 53121281 53121667 + 0.666667 NA intron (NR_109858, intron 2 of 10) L3|LINE|CR1 21164 NM_001287597 6512 Hs.104637 NM_006671 ENSG00000162383 SLC1A7 AAAT|EAAT5 solute carrier family 1 member 7 protein-coding 120.333-177 chr7 133406732 133406936 + 0.666667 NA intron (NM_021807, intron 7 of 17) (AATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 115953 NR_106749 102465139 NR_106749 ENSG00000276137 MIR6133 hsa-mir-6133 microRNA 6133 ncRNA 152-25 chr10 100052901 100053208 + 0.666667 NA intron (NM_001308, intron 7 of 8) intron (NM_001308, intron 7 of 8) 28815 NM_001308 1369 Hs.2246 NM_001308 ENSG00000120054 CPN1 CPN|SCPN carboxypeptidase N subunit 1 protein-coding 113.667-159 chr4 79948862 79949147 + 0.666667 NA intron (NM_001286781, intron 16 of 16) intron (NM_001286781, intron 16 of 16) 121533 NR_026555 118425 Hs.104215 NR_026555 ENSG00000251321 PCAT4 GDEP|PCA4|PCAN1 prostate cancer associated transcript 4 ncRNA 149.667-23 chr1 103921038 103921463 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -151773 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 117.333-84 chr18 5377891 5378081 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -80933 NM_001243704 7541 Hs.592340 NM_003409 ENSG00000198081 ZBTB14 ZF5|ZFP-161|ZFP-5|ZFP161|ZNF478 zinc finger and BTB domain containing 14 protein-coding 122.333-221 chr9 128756716 128756928 + 0.666667 NA intron (NM_006336, intron 1 of 15) L1MB7|LINE|L1 15105 NM_006336 10444 Hs.147950 NM_006336 ENSG00000160445 ZER1 C9orf60|ZYG|ZYG11BL zyg-11 related cell cycle regulator protein-coding 145.333-96 chr15 33413831 33414134 + 0.666667 NA intron (NM_001243996, intron 1 of 102) intron (NM_001243996, intron 1 of 102) 103015 NM_001243996 6263 Hs.709373 NM_001036 ENSG00000198838 RYR3 RYR-3 ryanodine receptor 3 protein-coding 164.333-76 chr15 64642944 64643289 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) intron (NM_015042, intron 2 of 8) 60165 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 151-72 chr20 53659028 53659329 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 50824 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 234.333-57 chr5 25351531 25352015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 160820 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 133-14 chr11 11062189 11062434 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 204094 NR_034137 729013 Hs.726427 NR_034137 ENSG00000247271 ZBED5-AS1 - ZBED5 antisense RNA 1 ncRNA 200.333-25 chr11 123363657 123364128 + 0.666667 NA intron (NM_001367419, intron 1 of 20) intron (NM_001367419, intron 1 of 20) 5356 NM_001367421 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 175.333-47 chr14 72858952 72859433 + 0.666667 NA intron (NM_001280542, intron 1 of 10) L1MC5|LINE|L1 33457 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 169-7 chr1 246816739 246817205 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 27355 NR_015422 149134 Hs.720494 NM_207326 LINC01341 - long intergenic non-protein coding RNA 1341 ncRNA 128-101 chr7 7498958 7499179 + 0.666667 NA intron (NM_001037763, intron 11 of 34) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 36805 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 128-28 chr16 24929583 24929959 + 0.666667 NA intron (NM_001006634, intron 19 of 19) intron (NM_001006634, intron 19 of 19) 83540 NM_052944 115584 Hs.164118 NM_052944 ENSG00000158865 SLC5A11 KST1|RKST1|SGLT6|SMIT2 solute carrier family 5 member 11 protein-coding 136.333-166 chr5 54096662 54097021 + 0.666667 NA intron (NM_019087, intron 4 of 4) intron (NM_019087, intron 4 of 4) -145242 NR_030307 693166 NR_030307 ENSG00000207627 MIR581 MIRN581|hsa-mir-581 microRNA 581 ncRNA 172.667-113 chr4 94093819 94094283 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113505 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 156-61 chr18 3877783 3878147 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_038895) promoter-TSS (NR_038895) -215 NR_038895 201477 Hs.627208 NR_038895 ENSG00000263724 DLGAP1-AS3 - DLGAP1 antisense RNA 3 ncRNA 114-144 chr7 4675503 4675678 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -6705 NM_001037165 221937 Hs.487393 NM_001037165 ENSG00000164916 FOXK1 FOXK1L forkhead box K1 protein-coding 143.333-265 chr7 42853418 42853812 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58228 NM_001363436 79020 Hs.698120 NM_024054 ENSG00000136197 C7orf25 - chromosome 7 open reading frame 25 protein-coding 199.333-264 chr7 108351211 108351707 + 0.666667 NA intron (NM_001371131, intron 2 of 33) intron (NM_001371131, intron 2 of 33) -22933 NM_001371177 269.333-64 chr3 124477490 124478169 + 0.666667 NA intron (NM_001024660, intron 27 of 59) intron (NM_001024660, intron 27 of 59) 103497 NR_106731 102464832 NR_106731 ENSG00000276656 MIR6083 hsa-mir-6083 microRNA 6083 ncRNA 118.333-54 chr13 30119566 30119832 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10824 NR_046998 100874146 Hs.574116 NR_046998 ENSG00000224511 LINC00365 - long intergenic non-protein coding RNA 365 ncRNA 114.667-90 chr15 56737523 56737747 + 0.666667 NA Intergenic MER34A|LTR|ERV1 -3549 NM_001002843 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 129.667-94 chr2 74300498 74300725 + 0.666667 NA intron (NM_133478, intron 7 of 30) L2c|LINE|L2 14414 NM_021196 57835 Hs.594099 NM_021196 ENSG00000188687 SLC4A5 NBC4|NBCe2 solute carrier family 4 member 5 protein-coding 120.333-198 chr8 135240142 135240338 + 0.666667 NA intron (NR_120396, intron 1 of 4) intron (NR_120396, intron 1 of 4) 6109 NR_120395 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 197-38 chr15 68493476 68493883 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24694 NM_001324014 10391 Hs.551213 NM_006091 ENSG00000103647 CORO2B CLIPINC coronin 2B protein-coding 263-34 chr20 7882443 7883014 + 0.666667 NA TTS (NM_017545) TTS (NM_017545) 57730 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 122.667-67 chr16 79957913 79958140 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 162777 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 146.333-295 chr6 152269584 152270002 + 0.666667 NA intron (NM_182961, intron 98 of 145) intron (NM_182961, intron 98 of 145) -84415 NM_001347701 23345 Hs.12967 NM_015293 ENSG00000131018 SYNE1 8B|ARCA1|C6orf98|CPG2|EDMD4|KASH1|MYNE1|Nesp1|SCAR8|dJ45H2.2 spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1 protein-coding 130.333-140 chr3 153698231 153698473 + 0.666667 NA intron (NR_146713, intron 2 of 6) HAL1b|LINE|L1 64174 NR_146713 105374165 Hs.637991 NR_146713 LINC02006 - long intergenic non-protein coding RNA 2006 ncRNA 111.667-84 chr15 40421849 40422128 + 0.666667 NA TTS (NM_002225) TTS (NM_002225) 16191 NR_148925 3712 Hs.513646 NM_002225 ENSG00000128928 IVD ACAD2 isovaleryl-CoA dehydrogenase protein-coding 142-55 chr17 41835276 41835567 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001329595) promoter-TSS (NM_001329595) -264 NM_001329595 317719 Hs.127510 NM_152467 ENSG00000161594 KLHL10 SPGF11 kelch like family member 10 protein-coding 116.667-149 chr4 87153094 87153269 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 67087 NM_001292003 57563 Hs.106601 NM_020803 ENSG00000145332 KLHL8 - kelch like family member 8 protein-coding 173-49 chr2 53419656 53420146 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -347882 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 137.667-21 chr10 5741259 5741571 + 0.666667 NA intron (NM_017782, intron 13 of 20) intron (NM_017782, intron 13 of 20) 56577 NM_017782 54906 Hs.610717 NM_017782 ENSG00000108021 TASOR2 C10orf18|FAM208B|bA318E3.2 transcription activation suppressor family member 2 protein-coding 235-25 chr15 64861555 64862182 + 0.666667 NA intron (NM_001195059, intron 4 of 4) intron (NM_001195059, intron 4 of 4) 19953 NM_025201 80301 Hs.709337 NM_025201 ENSG00000241839 PLEKHO2 PLEKHQ1|PP1628|pp9099 pleckstrin homology domain containing O2 protein-coding 267-8 chr10 69495905 69496505 + 0.666667 NA intron (NM_001351263, intron 2 of 5) intron (NM_001351263, intron 2 of 5) 44738 NR_147091 23555 Hs.499941 NM_012339 ENSG00000099282 TSPAN15 2700063A19Rik|NET-7|NET7|TM4SF15 tetraspanin 15 protein-coding 113.667-178 chr5 153008683 153008885 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36435 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 207.667-72 chr22 43765118 43765678 + 0.666667 NA intron (NM_198856, intron 2 of 29) intron (NM_198856, intron 2 of 29) 46907 NM_022785 64800 Hs.658996 NM_022785 ENSG00000186976 EFCAB6 DJBP|HSCBCIP1|dJ185D5.1 EF-hand calcium binding domain 6 protein-coding 173-33 chr17 26838810 26839183 + 0.666667 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 250245 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 182.667-6 chr1 102304396 102304796 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -307362 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 113.333-192 chr4 61417211 61417462 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 2 of 23) AluJb|SINE|Alu 215164 NM_001371342 155.667-141 chr18 51586870 51587168 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 194977 NR_040075 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 143.667-238 chr7 118419674 118419953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 195109 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 166.667-60 chr13 93013316 93013793 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31787 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 214.333-9 chr1 163743393 163743852 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -320431 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 159-89 chr4 48229173 48229484 + 0.666667 NA intron (NM_003215, intron 1 of 17) intron (NM_003215, intron 1 of 17) 40510 NM_003215 7006 Hs.479670 NM_003215 ENSG00000135605 TEC PSCTK4 tec protein tyrosine kinase protein-coding 152-31 chr11 42264007 42264368 + 0.666667 NA Intergenic MER89|LTR|ERV1 -10497 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 193.333-83 chr2 14173515 14173950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 227226 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 188-39 chr17 40611432 40611968 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 36118 NM_003079 6605 Hs.743978 NM_003079 ENSG00000073584 SMARCE1 BAF57|CSS5 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 protein-coding 209-28 chr12 9604341 9604846 + 0.666667 NA intron (NM_002258, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 3323 NM_002258 3820 Hs.169824 NM_002258 ENSG00000111796 KLRB1 CD161|CLEC5B|NKR|NKR-P1|NKR-P1A|NKRP1A|hNKR-P1A killer cell lectin like receptor B1 protein-coding 222.667-67 chr4 105943259 105943766 + 0.666667 NA intron (NM_001184692, intron 8 of 10) intron (NM_001184692, intron 8 of 10) 48041 NM_001184690 255743 Hs.518921 NM_198278 ENSG00000168743 NPNT EGFL6L|POEM nephronectin protein-coding 155.667-254 chr4 103087745 103088061 + 0.666667 NA intron (NM_020139, intron 5 of 9) intron (NM_020139, intron 5 of 9) -10584 NM_001300754 133308 Hs.546482 NM_178833 ENSG00000164038 SLC9B2 NHA2|NHE10|NHEDC2 solute carrier family 9 member B2 protein-coding 138-85 chr4 102067989 102068270 + 0.666667 NA intron (NM_017935, intron 13 of 16) L1ME1|LINE|L1 254287 NM_001083907 55024 Hs.480400 NM_017935 ENSG00000153064 BANK1 BANK B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 protein-coding 151-24 chr12 16414962 16415258 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61693 NM_145764 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 165.333-179 chr3 166115730 166116105 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -278494 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 113.667-139 chr3 90321425 90321725 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1213954 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 126.333-111 chr22 23018899 23019114 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -51513 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 143.333-70 chr12 87768700 87768994 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_149056) promoter-TSS (NR_149056) 35 NR_149056 110806294 Hs.615803 NR_149056 LINC02258 - long intergenic non-protein coding RNA 2258 ncRNA 177.667-141 chr8 140059855 140060231 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) L1M4a1|LINE|L1 40492 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 156-38 chr12 66257923 66258309 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 7034 NR_106757 102465249 NR_106757 ENSG00000284011 MIR6502 hsa-mir-6502 microRNA 6502 ncRNA 130.333-92 chr17 70599937 70600213 + 0.666667 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie 430540 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 114-12 chr10 73243782 73243995 + 0.666667 NA exon (NM_015190, exon 4 of 5) exon (NM_015190, exon 4 of 5) 3367 NM_015190 23234 Hs.408577 NM_015190 ENSG00000213551 DNAJC9 HDJC9|JDD1|SB73 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C9 protein-coding 150.333-151 chr16 86295082 86295423 + 0.666667 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR 8821 NR_038438 146513 Hs.434338 NR_038438 ENSG00000268532 LINC02135 - long intergenic non-protein coding RNA 2135 ncRNA 152.333-98 chr13 101952133 101952485 + 0.666667 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) intron (NM_175929, intron 1 of 4) 15437 NR_039603 100616110 NR_039603 ENSG00000265164 MIR2681 - microRNA 2681 ncRNA 122.667-212 chr9 108516588 108516911 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 339237 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 181.667-82 chr20 49788492 49788881 + 0.666667 NA Intergenic OldhAT1|DNA|hAT-Ac -24027 NM_001260491 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 123.333-22 chr1 218249979 218250247 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35180 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 190.667-70 chr2 178126520 178127029 + 0.666667 NA intron (NM_001365579, intron 9 of 9) intron (NM_001365579, intron 9 of 9) 14337 NM_152945 129831 Hs.377257 NM_152945 ENSG00000155636 RBM45 DRB1|RB-1 RNA binding motif protein 45 protein-coding 149.667-199 chr2 71965788 71966085 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 181926 NM_019885 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 131.333-7 chr1 99108418 99108671 + 0.666667 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -103683 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 149-26 chr11 115185232 115185640 + 0.666667 NA intron (NM_001098517, intron 7 of 8) intron (NM_001098517, intron 7 of 8) -148141 NR_135108 105369509 Hs.736064 NR_135108 LOC105369509 - uncharacterized LOC105369509 ncRNA 218-45 chr2 40944239 40944712 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -432040 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 180-94 chr7 7852976 7853465 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) L1MB8|LINE|L1 115532 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 114-129 chr5 173040668 173040840 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -15598 NM_001168394 153222 Hs.484195 NM_153607 ENSG00000164463 CREBRF C5orf41|LRF CREB3 regulatory factor protein-coding 117.333-24 chr10 64164878 64165119 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -643108 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 243-10 chr10 19325790 19326270 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 22 of 39) intron (NM_001142308, intron 22 of 39) 277229 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 212.333-53 chr17 44553526 44554022 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -3710 NM_001466 2535 Hs.142912 NM_001466 ENSG00000180340 FZD2 Fz2|OMOD2|fz-2|fzE2|hFz2 frizzled class receptor 2 protein-coding 153-119 chr6 52672779 52673149 + 0.666667 NA intron (NM_014051, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 1851 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 149.333-146 chr17 63164980 63165271 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) AluJr|SINE|Alu 198890 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 143.667-262 chr8 134841469 134841748 + 0.666667 NA intron (NR_126028, intron 1 of 2) MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 3539 NR_126028 552853 Hs.575612 NR_126028 ENSG00000253433 NCRNA00250 C8orf24 non-protein coding RNA 250 ncRNA 135-58 chr22 21555731 21556107 + 0.666667 NA intron (NM_001256355, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu -4458 NM_001128633 150221 Hs.447643 NM_001128633 ENSG00000183246 RIMBP3C RIM-BP3.3|RIMBP3.3 RIMS binding protein 3C protein-coding 146.667-96 chr14 38404797 38405114 + 0.666667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -148862 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 174.667-92 chr2 139161988 139162339 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 264839 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 194.333-135 chr6 155220795 155221102 + 0.666667 NA intron (NM_001010927, intron 1 of 12) L1PA7|LINE|L1 3982 NM_001010927 26230 Hs.586279 NM_012454 ENSG00000146426 TIAM2 STEF|TIAM-2 T cell lymphoma invasion and metastasis 2 protein-coding 116.333-148 chr3 138772192 138772487 + 0.666667 NA intron (NM_006219, intron 2 of 23) intron (NM_006219, intron 2 of 23) 62589 NM_006219 5291 Hs.239818 NM_006219 ENSG00000051382 PIK3CB P110BETA|PI3K|PI3KBETA|PIK3C1 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta protein-coding 139.333-184 chr5 98383341 98383622 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -222242 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 125.333-42 chr12 7635721 7635945 + 0.666667 NA Intergenic MER4E|LTR|ERV1 30075 NM_005889 339 Hs.560 NM_001644 ENSG00000111701 APOBEC1 APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 protein-coding 152.333-150 chr17 61660731 61661153 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69723 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 120.667-166 chr7 95538295 95538587 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_016116, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_016116, exon 5 of 5) 52498 NM_016116 51666 Hs.602765 NM_016116 ENSG00000005981 ASB4 ASB-4 ankyrin repeat and SOCS box containing 4 protein-coding 202-14 chr1 222934659 222935211 + 0.666667 NA intron (NM_001369594, intron 1 of 7) intron (NM_001369594, intron 1 of 7) 6511 NM_001369594 84976 Hs.528817 NM_032890 ENSG00000154309 DISP1 DISPA dispatched RND transporter family member 1 protein-coding 167-110 chr9 75671286 75671733 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219135 NM_001190482 5125 Hs.368542 NM_006200 ENSG00000099139 PCSK5 PC5|PC6|PC6A|SPC6 proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 protein-coding 150.333-263 chr3 63746577 63746980 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72521 NM_001355236 132200 Hs.506386 NM_001355236 ENSG00000163632 C3orf49 - chromosome 3 open reading frame 49 protein-coding 196.667-18 chr10 83117220 83117711 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 559624 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 160.333-67 chr11 113090822 113091147 + 0.666667 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) L2a|LINE|L2 -127524 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 145-109 chr7 24471651 24471999 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -101627 NM_016447 51678 Hs.533355 NM_016447 ENSG00000105926 MPP6 PALS2|VAM-1|VAM1|p55T membrane palmitoylated protein 6 protein-coding 186.667-39 chr14 64422811 64423335 + 0.666667 NA intron (NM_005956, intron 8 of 27) intron (NM_005956, intron 8 of 27) 34720 NM_001364837 4522 Hs.652308 NM_005956 ENSG00000100714 MTHFD1 CIMAH|MTHFC|MTHFD methylenetetrahydrofolate dehydrogenase, cyclohydrolase and formyltetrahydrofolate synthetase 1 protein-coding 120.667-126 chr4 60795615 60795903 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -126860 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 166.333-166 chr4 83780831 83781286 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 244950 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 215-2 chr1 60056536 60056898 + 0.666667 NA intron (NM_152377, intron 2 of 11) intron (NM_152377, intron 2 of 11) 17053 NM_152377 127795 Hs.47385 NM_152377 ENSG00000162598 C1orf87 CREF chromosome 1 open reading frame 87 protein-coding 166.333-191 chr5 131668436 131668790 + 0.666667 NA intron (NM_133372, intron 15 of 17) AluSx1|SINE|Alu -33384 NM_001164390 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 146.333-208 chr3 87451196 87451480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -174754 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 197.333-98 chr18 74561944 74562389 + 0.666667 NA intron (NM_032649, intron 5 of 11) intron (NM_032649, intron 5 of 11) 27666 NM_032649 84735 Hs.400613 NM_032649 ENSG00000150656 CNDP1 CN1|CPGL2|HsT2308 carnosine dipeptidase 1 protein-coding 129-124 chr8 77355827 77356066 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -94751 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 124.333-137 chr4 171370538 171370746 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 184458 NR_106730 102466953 NR_106730 ENSG00000278502 MIR6082 hsa-mir-6082 microRNA 6082 ncRNA 299-34 chr6 53230168 53230786 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46516 NR_049866 100847075 NR_049866 ENSG00000264056 MIR5685 - microRNA 5685 ncRNA 249.333-6 chr1 100030323 100030817 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_012243, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_012243, exon 8 of 8) -7525 NM_033055 64645 Hs.124156 NM_033055 ENSG00000156875 MFSD14A HIAT1 major facilitator superfamily domain containing 14A protein-coding 123.667-103 chr20 21005117 21005339 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 101130 NR_147212 105372556 Hs.371339 NR_147212 ENSG00000225127 LINC00237 NCRNA00237 long intergenic non-protein coding RNA 237 ncRNA 144-55 chr14 72223103 72223388 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) intron (NM_001370288, intron 2 of 16) 289718 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 170-52 chr18 41310692 41311113 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 209775 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 301-58 chr8 85855007 85855680 + 0.666667 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger -27401 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 160-60 chr2 88665693 88665993 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25830 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 163.333-152 chr2 143149181 143149513 + 0.666667 NA intron (NM_018460, intron 1 of 13) intron (NM_018460, intron 1 of 13) 19928 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 264.667-58 chr4 30853828 30854382 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 133736 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 185.667-68 chr2 77232439 77232962 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 246735 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 201-29 chr12 39418759 39419326 + 0.666667 NA intron (NM_001173464, intron 1 of 37) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 24078 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 176-67 chr4 106087179 106087531 + 0.666667 NA intron (NM_001290768, intron 26 of 26) L1PA8A|LINE|L1 -64877 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 252-91 chr6 46211070 46211511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40280 NM_021572 59084 Hs.35198 NM_021572 ENSG00000112796 ENPP5 NPP-5|NPP5 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 5 protein-coding 122.667-185 chr8 8952557 8952846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50196 NM_001354636 90459 Hs.20000 NM_153332 ENSG00000104626 ERI1 3'HEXO|HEXO|THEX1 exoribonuclease 1 protein-coding 195.333-224 chr9 266843 267282 + 0.666667 NA intron (NM_203447, intron 1 of 47) intron (NM_203447, intron 1 of 47) -5984 NM_001190458 81704 Hs.132599 NM_203447 ENSG00000107099 DOCK8 HEL-205|MRD2|ZIR8 dedicator of cytokinesis 8 protein-coding 145.667-116 chr18 4043611 4043903 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 81404 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 151-36 chr14 56378885 56379313 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -135232 NR_135241 101927690 Hs.385477 NR_135241 ENSG00000258803 LOC101927690 - uncharacterized LOC101927690 ncRNA 150.667-146 chr17 65443533 65443883 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13833 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 216.667-46 chr17 75693291 75693808 + 0.666667 NA intron (NR_126037, intron 4 of 8) intron (NR_126037, intron 4 of 8) 26211 NM_013260 29115 Hs.655088 NM_013260 ENSG00000161526 SAP30BP HCNGP|HTRG|HTRP SAP30 binding protein protein-coding 125.667-158 chr5 120649987 120650211 + 0.666667 NA intron (NM_001308088, intron 3 of 3) AluSc|SINE|Alu 118635 NM_001308088 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 120.333-3 chr1 65803118 65803344 + 0.666667 NA intron (NM_002600, intron 1 of 16) MIRc|SINE|MIR 10336 NM_002600 5142 Hs.198072 NM_002600 ENSG00000184588 PDE4B DPDE4|PDEIVB phosphodiesterase 4B protein-coding 205.667-17 chr10 11149373 11149762 + 0.666667 NA intron (NM_001326334, intron 2 of 13) intron (NM_001326334, intron 2 of 13) -15314 NM_001326346 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 202-180 chr8 20780213 20780593 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -165477 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 120-128 chr7 22905975 22906291 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49520 NR_003075 692210 NR_003075 ENSG00000221740 SNORD93 HBII-336 small nucleolar RNA, C/D box 93 snoRNA 198-139 chr4 93447954 93448397 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 9 of 14) L1MC4|LINE|L1 -380578 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 113.333-134 chr2 130296083 130296341 + 0.666667 NA Intergenic MER83|LTR|ERV1 45896 NM_001321119 84317 Hs.104203 NM_032357 ENSG00000136710 CCDC115 CDG2O|ccp1 coiled-coil domain containing 115 protein-coding 147.667-259 chr4 83151288 83151665 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36747 NM_001130715 51316 Hs.546392 NM_016619 ENSG00000145287 PLAC8 C15|DGIC|PNAS-144|onzin placenta associated 8 protein-coding 215-85 chr9 104837090 104837518 + 0.666667 NA intron (NM_005502, intron 10 of 49) intron (NM_005502, intron 10 of 49) 73175 NR_130760 55335 Hs.429294 NM_018376 ENSG00000165028 NIPSNAP3B FP944|NIPSNAP3|SNAP1 nipsnap homolog 3B protein-coding 141.667-221 chr8 53886551 53886802 + 0.666667 NA intron (NR_104579, intron 1 of 3) intron (NR_104579, intron 1 of 3) 5804 NR_104578 8601 Hs.368733 NM_003702 ENSG00000147509 RGS20 RGSZ1|ZGAP1|g(z)GAP|gz-GAP regulator of G protein signaling 20 protein-coding 132-68 chr2 237697206 237697512 + 0.666667 NA intron (NM_001137551, intron 1 of 11) intron (NM_001137551, intron 1 of 11) 5154 NM_001137552 9208 Hs.471779 NM_004735 ENSG00000124831 LRRFIP1 FLAP-1|FLAP1|FLIIAP1|GCF-2|GCF2|HUFI-1|TRIP LRR binding FLII interacting protein 1 protein-coding 135-65 chr3 77123684 77123960 + 0.666667 NA intron (NM_001290039, intron 2 of 26) (ATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 25810 NM_001128929 6092 Hs.13305 NM_002942 ENSG00000185008 ROBO2 SAX3 roundabout guidance receptor 2 protein-coding 226.333-91 chr4 98054199 98054745 + 0.666667 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) intron (NM_174952, intron 5 of 10) 89004 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 114-89 chr3 73278010 73278274 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 155853 NM_001303142 23024 Hs.660347 NM_015009 ENSG00000121440 PDZRN3 LNX3|SEMACAP3|SEMCAP3 PDZ domain containing ring finger 3 protein-coding 117.667-203 chr8 142054744 142054970 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -121482 NR_039682 100616268 NR_039682 ENSG00000265247 MIR4472-1 - microRNA 4472-1 ncRNA 116.667-36 chr12 50355498 50355780 + 0.666667 NA exon (NM_001145475, exon 4 of 8) exon (NM_001145475, exon 4 of 8) 40970 NM_001145475 121006 Hs.133187 NM_001145475 ENSG00000185958 FAM186A - family with sequence similarity 186 member A protein-coding 125.667-164 chr6 46748381 46748570 + 0.666667 NA intron (NM_001162435, intron 1 of 4) intron (NM_001162435, intron 1 of 4) 1558 NM_001162435 100287718 Hs.736491 NM_001162435 ENSG00000230062 ANKRD66 - ankyrin repeat domain 66 protein-coding 276.667-41 chr2 194745647 194746292 + 0.666667 NA intron (NR_110223, intron 3 of 3) intron (NR_110223, intron 3 of 3) 15374 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 188.333-38 chr12 63533140 63533484 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 135181 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 131.667-180 chr7 26326245 26326572 + 0.666667 NA intron (NM_001318199, intron 1 of 6) intron (NM_001318199, intron 1 of 6) 33377 NM_001318199 29887 Hs.741316 NM_013322 ENSG00000086300 SNX10 OPTB8 sorting nexin 10 protein-coding 198.667-52 chr12 108200647 108201095 + 0.666667 NA intron (NM_001304447, intron 3 of 9) intron (NM_001304447, intron 3 of 9) 69085 NM_001304447 9671 Hs.143591 NM_014653 ENSG00000075035 WSCD2 - WSC domain containing 2 protein-coding 173.667-46 chr14 64068097 64068450 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 51 of 114) L1ME1|LINE|L1 26852 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 136.333-111 chr20 17901630 17901883 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 61190 NR_003045 692086 Hs.680747 NR_003045 ENSG00000212232 SNORD17 HBI-43 small nucleolar RNA, C/D box 17 snoRNA 193.667-87 chr3 103664296 103664591 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140327 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 125.667-105 chr2 137965652 137965895 + 0.666667 NA intron (NM_001024075, intron 1 of 2) intron (NM_001024075, intron 1 of 2) 1300 NM_006895 3176 Hs.42151 NM_006895 ENSG00000150540 HNMT HMT|HNMT-S1|HNMT-S2|MRT51 histamine N-methyltransferase protein-coding 121-18 chr10 77188115 77188333 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 3 of 28) intron (NM_001271519, intron 3 of 28) 47393 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 133.333-179 chr8 65011980 65012362 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 168169 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 216-55 chr2 36042941 36043316 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 312442 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 129.333-172 chr6 126434739 126434992 + 0.666667 NA intron (NR_104462, intron 3 of 3) Plat_L3|LINE|CR1 -49766 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 124.333-55 chr15 41653857 41654086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6441 NM_001080541 23269 Hs.187569 NM_001080541 ENSG00000174197 MGA MAD5|MXD5 MAX dimerization protein MGA protein-coding 185.667-118 chr7 95225731 95226159 + 0.666667 NA intron (NM_001166160, intron 7 of 19) intron (NM_001166160, intron 7 of 19) 98587 NM_000446 5444 Hs.370995 NM_000446 ENSG00000005421 PON1 ESA|MVCD5|PON paraoxonase 1 protein-coding 195-85 chr5 66438202 66438613 + 0.666667 NA Intergenic MER6|DNA|TcMar-Tigger 73197 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 192-74 chr2 118291499 118291896 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105311 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 175-46 chr2 209757313 209757796 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -14278 NM_182587 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 117.667-210 chrX 14662963 14663260 + 0.666667 NA intron (NM_002063, intron 7 of 8) L1M4|LINE|L1 133575 NM_001118886 2742 Hs.2700 NM_002063 ENSG00000101958 GLRA2 GLR glycine receptor alpha 2 protein-coding 187.667-83 chr20 57170482 57170835 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001719, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001719, exon 7 of 7) -43038 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 189.333-94 chr2 69473115 69473412 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014911, exon 22 of 22) 3' UTR (NM_014911, exon 22 of 22) -35635 NM_001002756 27247 Hs.430439 NM_015700 ENSG00000169599 NFU1 CGI-33|HIRIP|HIRIP5|MMDS1|NIFUC|Nfu|NifU NFU1 iron-sulfur cluster scaffold protein-coding 168-52 chr2 68276150 68276515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23800 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 250.667-84 chr8 132495039 132495668 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14258 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 157.667-26 chr10 30264927 30265274 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 53248 NR_120653 101929279 Hs.559153 NR_120653 LOC101929279 - uncharacterized LOC101929279 ncRNA 192.667-117 chr4 30602266 30602777 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117848 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 113.333-58 chr12 10690568 10690829 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -16646 NM_018423 55359 Hs.24979 NM_018423 ENSG00000060140 STYK1 NOK|SuRTK106 serine/threonine/tyrosine kinase 1 protein-coding 179.333-38 chr11 57904155 57904660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -119474 NM_001005212 219956 Hs.689841 NM_001005212 ENSG00000186509 OR9Q1 - olfactory receptor family 9 subfamily Q member 1 protein-coding 157.333-38 chr1 246492450 246492760 + 0.666667 NA intron (NM_001167740, intron 1 of 11) intron (NM_001167740, intron 1 of 11) 14674 NM_001167740 64754 Hs.567571 NM_022743 ENSG00000185420 SMYD3 KMT3E|ZMYND1|ZNFN3A1|bA74P14.1 SET and MYND domain containing 3 protein-coding 130.667-104 chr2 15504514 15504836 + 0.666667 NA intron (NR_052013, intron 10 of 50) intron (NR_052013, intron 10 of 50) 56659 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 142-80 chr3 21675714 21676097 + 0.666667 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) intron (NM_024697, intron 1 of 7) 75305 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 158.667-55 chr11 20457129 20457540 + 0.666667 NA intron (NM_005788, intron 11 of 15) intron (NM_005788, intron 11 of 15) 69618 NM_005788 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 136-105 chr8 127391466 127391781 + 0.666667 NA intron (NR_117099, intron 3 of 3) intron (NR_117099, intron 3 of 3) -8776 NR_109834 101805488 Hs.745578 NR_109834 ENSG00000280997 CCAT2 LINC00873|NCCP1 colon cancer associated transcript 2 ncRNA 159.333-260 chr5 30942573 30943012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -250894 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 143-21 chr10 133543007 133543375 + 0.666667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 15828 NM_000773 1571 Hs.12907 NM_000773 ENSG00000130649 CYP2E1 CPE1|CYP2E|P450-J|P450C2E cytochrome P450 family 2 subfamily E member 1 protein-coding 123.333-121 chr2 201866803 201867008 + 0.666667 NA intron (NM_001366386, intron 10 of 13) intron (NM_001366386, intron 10 of 13) 60326 NM_001261436 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 178.333-38 chr12 71492853 71493235 + 0.666667 NA intron (NR_110596, intron 1 of 19) intron (NR_110596, intron 1 of 19) 53246 NM_001277226 8549 Hs.658889 NM_003667 ENSG00000139292 LGR5 FEX|GPR49|GPR67|GRP49|HG38 leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 protein-coding 112.667-271 chr8 129121096 129121267 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 120059 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 154.333-13 chr1 102968397 102968687 + 0.666667 NA intron (NM_001854, intron 37 of 66) intron (NM_001854, intron 37 of 66) 139954 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 122-59 chr2 214329648 214329867 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -81297 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 143.333-178 chr3 46652766 46653131 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 40423 NM_001195442 100132146 Hs.679623 NM_001195442 ENSG00000283473 FAM240A - family with sequence similarity 240 member A protein-coding 129.667-165 chr8 25093494 25093844 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91020 NM_001322810 80005 Hs.195403 NM_024940 ENSG00000147459 DOCK5 - dedicator of cytokinesis 5 protein-coding 126.333-11 chr1 188997896 188998228 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1477948 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 203.667-82 chr3 196486712 196487194 + 0.666667 NA intron (NM_152617, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu 16815 NM_152617 165918 Hs.250648 NM_152617 ENSG00000163961 RNF168 hRNF168 ring finger protein 168 protein-coding 193-93 chr8 131158731 131159107 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -118010 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 203.667-126 chr8 117938805 117939317 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -18148 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 120.333-105 chr2 169906677 169907008 + 0.666667 NA intron (NM_172070, intron 10 of 38) intron (NM_172070, intron 10 of 38) 79334 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 172.333-60 chr16 4036696 4037107 + 0.666667 NA intron (NM_001116, intron 2 of 10) L1MA4A|LINE|L1 79541 NM_001116 115 Hs.391860 NM_001116 ENSG00000162104 ADCY9 AC9|ACIX adenylate cyclase 9 protein-coding 156.333-382 chr9 130083468 130083777 + 0.666667 NA intron (NM_020960, intron 6 of 17) intron (NM_020960, intron 6 of 17) 29716 NM_020960 57720 Hs.512461 NM_020960 ENSG00000148358 GPR107 GCDRP|LUSTR1|bA138E2.2 G protein-coupled receptor 107 protein-coding 119.333-57 chr11 103427837 103428174 + 0.666667 NA intron (NM_001377, intron 84 of 88) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 318579 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 197-2 chr1 56901927 56902388 + 0.666667 NA intron (NM_000562, intron 7 of 10) L3|LINE|CR1 47387 NM_000562 731 Hs.93210 NM_000562 ENSG00000157131 C8A - complement C8 alpha chain protein-coding 207-97 chr5 55606080 55606612 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -71268 NR_103485 8611 Hs.696231 NM_003711 ENSG00000067113 PLPP1 LLP1a|LPP1|PAP-2a|PAP2|PPAP2A phospholipid phosphatase 1 protein-coding 184.667-60 chr2 111013755 111014149 + 0.666667 NA intron (NM_001371254, intron 15 of 18) L1ME2|LINE|L1 101636 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 112.667-71 chr14 84094528 84094769 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -1177284 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 173.333-201 chr8 83157586 83157990 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 245684 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 117-82 chr2 177646193 177646414 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 20 of 20) intron (NM_001077197, intron 20 of 20) -27019 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 133.333-154 chr5 133071317 133071597 + 0.666667 NA intron (NM_002154, intron 4 of 18) intron (NM_002154, intron 4 of 18) 19444 NM_002154 3308 Hs.90093 NM_002154 ENSG00000170606 HSPA4 APG-2|HEL-S-5a|HS24/P52|HSPH2|RY|hsp70|hsp70RY heat shock protein family A (Hsp70) member 4 protein-coding 115-44 chr12 58197858 58198040 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 110057 NR_135022 105369785 Hs.539353 NR_135022 ENSG00000257541 LINC02403 - long intergenic non-protein coding RNA 2403 ncRNA 153-73 chr2 57882413 57882718 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25086 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 169-14 chr11 101810903 101811252 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -103933 NM_001363543 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 114.333-160 chr4 83620220 83620455 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 84229 NM_032717 84803 Hs.99196 NM_032717 ENSG00000138678 GPAT3 AGPAT 10|AGPAT10|AGPAT8|AGPAT9|HMFN0839|LPAAT-theta|MAG1 glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 protein-coding 143.333-66 chr12 54064964 54065240 + 0.666667 NA intron (NR_026655, intron 1 of 1) Charlie1|DNA|hAT-Charlie 6848 NR_026655 440101 Hs.350378 NR_026655 ENSG00000248265 FLJ12825 - uncharacterized LOC440101 ncRNA 214.667-132 chrX 82735195 82735675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -772855 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 126.333-168 chr7 83846867 83847203 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -197896 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 150.333-316 chr5 2374065 2374347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62005 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 155-21 chr11 61848970 61849269 + 0.666667 NA intron (NM_001281502, intron 5 of 11) AluSg|SINE|Alu 20819 NM_004265 9415 Hs.502745 NM_004265 ENSG00000134824 FADS2 D6D|DES6|FADSD6|LLCDL2|SLL0262|TU13 fatty acid desaturase 2 protein-coding 142.667-196 chr6 154236121 154236494 + 0.666667 NA intron (NM_015553, intron 5 of 11) L1MB3|LINE|L1 93774 NM_001130699 26034 Hs.146100 NM_015553 ENSG00000074706 IPCEF1 PIP3-E interaction protein for cytohesin exchange factors 1 protein-coding 241.333-21 chr10 85342827 85343268 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 89725 NR_120669 101929646 Hs.116129 NR_120669 LINC02647 - long intergenic non-protein coding RNA 2647 ncRNA 195.333-199 chr7 35755218 35755792 + 0.666667 NA intron (NR_120512, intron 4 of 4) intron (NR_120512, intron 4 of 4) 39068 NR_108083 100506725 Hs.304253 NR_108082 ENSG00000227544 LOC100506725 - uncharacterized LOC100506725 ncRNA 127.667-63 chr17 64123963 64124201 + 0.666667 NA intron (NM_001433, intron 1 of 21) L1MB8|LINE|L1 6062 NM_001433 2081 Hs.133982 NM_001433 ENSG00000178607 ERN1 IRE1|IRE1P|IRE1a|hIRE1p endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 protein-coding 209-5 chr1 192402623 192403081 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 85860 NM_001039152 431704 Hs.558673 NM_001039152 ENSG00000253148 RGS21 - regulator of G protein signaling 21 protein-coding 118-76 chr2 238988236 238988467 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62082 NR_034162 401039 Hs.516791 NM_001001698 ENSG00000227744 LINC01940 - long intergenic non-protein coding RNA 1940 ncRNA 161.333-236 chr5 131000607 131001064 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 164421 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 151.667-86 chr12 57634104 57634396 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -1011 NM_001276469 2583 Hs.159481 NM_001478 ENSG00000135454 B4GALNT1 GALGT|GALNACT|GalNAc-T|SPG26 beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1 protein-coding 126.333-12 chr1 205832009 205832228 + 0.666667 NA intron (NM_152491, intron 11 of 12) intron (NM_152491, intron 11 of 12) 18014 NR_135186 148811 Hs.177744 NM_152491 ENSG00000162877 PM20D1 Cps1 peptidase M20 domain containing 1 protein-coding 112.667-91 chr17 7442009 7442303 + 0.666667 NA intron (NM_001303460, intron 3 of 4).2 intron (NM_001303460, intron 3 of 4).2 1388 NM_001303460 2256 Hs.655193 NM_004112 ENSG00000161958 FGF11 FGF-11|FHF-3|FHF3 fibroblast growth factor 11 protein-coding 115.667-153 chr3 186576902 186577169 + 0.666667 NA intron (NM_016306, intron 3 of 9) intron (NM_016306, intron 3 of 9) 6359 NM_016306 51726 Hs.317192 NM_016306 ENSG00000090520 DNAJB11 ABBP-2|ABBP2|DJ9|Dj-9|EDJ|ERdj3|ERj3|ERj3p|PKD6|PRO1080|UNQ537 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B11 protein-coding 189.667-19 chr10 60937476 60937765 + 0.666667 NA intron (NM_001242359, intron 2 of 11) intron (NM_001242359, intron 2 of 11) 6565 NM_001350910 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 223-47 chr4 90637426 90637884 + 0.666667 NA intron (NM_207491, intron 6 of 7) MLT1F-int|LTR|ERVL-MaLR 402624 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 167.667-125 chr20 58326051 58326460 + 0.666667 NA intron (NM_020673, intron 2 of 6) L1ME2|LINE|L1 16540 NM_020673 57403 Hs.529044 NM_020673 ENSG00000124209 RAB22A - RAB22A, member RAS oncogene family protein-coding 151-120 chr7 23602914 23603269 + 0.666667 NA intron (NM_138771, intron 2 of 3) intron (NM_138771, intron 2 of 3) 5709 NM_138771 90693 Hs.232296 NM_138771 ENSG00000169193 CCDC126 - coiled-coil domain containing 126 protein-coding 113-23 chr10 75599355 75599659 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 2 of 6) intron (NM_001305581, intron 2 of 6) 47049 NR_030337 693191 NR_030337 ENSG00000207583 MIR606 MIRN606|hsa-mir-606 microRNA 606 ncRNA 121-80 chr2 231073658 231073977 + 0.666667 NA intron (NM_001191037, intron 7 of 23) L1M5|LINE|L1 16950 NM_002807 5707 Hs.3887 NM_002807 ENSG00000173692 PSMD1 P112|Rpn2|S1 proteasome 26S subunit, non-ATPase 1 protein-coding 178.333-166 chr7 94763832 94764237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107664 NM_001184962 23089 Hs.147492 NM_015068 ENSG00000242265 PEG10 EDR|HB-1|MEF3L|Mar2|Mart2|RGAG3|RTL2|SIRH1 paternally expressed 10 protein-coding 177.333-57 chr14 69489611 69489900 + 0.666667 NA intron (NM_001161498, intron 1 of 12) intron (NM_001161498, intron 1 of 12) 5027 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 123.333-33 chr10 61591382 61591651 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71413 NM_001366907 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 132.333-164 chr7 52016277 52016612 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -623188 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 113-17 chr10 45472322 45472573 + 0.666667 NA intron (NM_001282866, intron 3 of 7) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -19326 NR_120674 102724323 Hs.559151 NR_120674 ENSG00000231964 LOC102724323 - uncharacterized LOC102724323 ncRNA 126-62 chr20 54075741 54076017 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5114 NM_001316361 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 159.667-137 chr17 62383670 62384021 + 0.666667 NA intron (NM_001144933, intron 4 of 11) intron (NM_001144933, intron 4 of 11) 3292 NM_173503 146779 Hs.152670 NM_173503 ENSG00000172421 EFCAB3 - EF-hand calcium binding domain 3 protein-coding 169.667-23 chr10 82655458 82655813 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) L1ME3G|LINE|L1 -422715 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 162.333-233 chr7 24840638 24841090 + 0.666667 NA intron (NR_104111, intron 12 of 21) intron (NR_104111, intron 12 of 21) 51757 NM_145320 26031 Hs.520259 NM_015550 ENSG00000070882 OSBPL3 ORP-3|ORP3|OSBP3 oxysterol binding protein like 3 protein-coding 144.667-26 chr10 44195922 44196344 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -96617 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 179.333-15 chr1 216038567 216038962 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 32 of 71) intron (NM_206933, intron 32 of 71) -33701 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 244-41 chr17 33217787 33218272 + 0.666667 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) 74959 NM_183377 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 153.333-293 chr4 37748574 37748876 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62349 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 190.666-48 chr7 27796880 27797433 + 0.666667 NA intron (NM_001362794, intron 12 of 16) AluY|SINE|Alu 57061 NM_006024 8887 Hs.34576 NM_006024 ENSG00000106052 TAX1BP1 CALCOCO3|T6BP|TXBP151 Tax1 binding protein 1 protein-coding 141.667-101 chr18 6468727 6469059 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -42523 NR_120518 100130480 Hs.646267 NM_001243517 ENSG00000265944 LINC01387 C18orf64 long intergenic non-protein coding RNA 1387 ncRNA 199.667-84 chr20 45053160 45053576 + 0.666667 NA intron (NM_001352385, intron 11 of 11) intron (NM_001352385, intron 11 of 11) 47759 NM_001322799 3787 Hs.117780 NM_002251 ENSG00000124134 KCNS1 Kv9.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1 protein-coding 117.333-58 chr14 71822168 71822462 + 0.666667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 -109856 NM_001370270 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 125.333-143 chr5 90730667 90730890 + 0.666667 NA intron (NR_003149, intron 50 of 89) intron (NR_003149, intron 50 of 89) 171981 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 157-124 chr7 53565078 53565431 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 246677 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 172.333-32 chr11 78169604 78169968 + 0.666667 NA intron (NR_102281, intron 2 of 2) AluSc|SINE|Alu 18840 NM_001029859 283219 Hs.528439 NM_001029859 ENSG00000188997 KCTD21 KCASH2 potassium channel tetramerization domain containing 21 protein-coding 126.667-11 chr1 196049830 196050062 + 0.666667 NA intron (NR_146895, intron 3 of 3) intron (NR_146895, intron 3 of 3) 38769 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 116-59 chr17 34139175 34139501 + 0.666667 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) L1MC5a|LINE|L1 17468 NM_001094 40 Hs.368417 NM_001094 ENSG00000108684 ASIC2 ACCN|ACCN1|ASIC2a|BNC1|BNaC1|MDEG|hBNaC1 acid sensing ion channel subunit 2 protein-coding 180.667-78 chr20 14544208 14544642 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 4 of 17) MIRb|SINE|MIR -9959 NR_104193 140848 Hs.570367 NR_104193 ENSG00000227927 MACROD2-IT1 C20orf68|NCRNA00227|bA467D7.4 MACROD2 intronic transcript 1 ncRNA 118.333-207 chr8 114533704 114533995 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -1096910 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 147-28 chr12 32546031 32546377 + 0.666667 NA intron (NM_001304480, intron 1 of 16) intron (NM_001304480, intron 1 of 16) 11911 NM_001304480 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 186-86 chr5 137026234 137026775 + 0.666667 NA intron (NM_004598, intron 6 of 10) MLT2D|LTR|ERVL -101693 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 257-17 chr14 65561251 65561775 + 0.666667 NA non-coding (NR_038167, exon 3 of 9) non-coding (NR_038167, exon 3 of 9) 90411 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 144-166 chrX 118373281 118373564 + 0.666667 NA intron (NM_001184966, intron 1 of 17) Tigger15a|DNA|TcMar-Tigger -12972 NR_031685 100302214 NR_031685 ENSG00000221463 MIR1277 MIRN1277|hsa-mir-1277 microRNA 1277 ncRNA 172-23 chr11 21770472 21770962 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -422368 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 165-72 chr4 181590351 181590781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 239407 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 134.667-151 chr4 128936188 128936458 + 0.666667 NA intron (NM_144643, intron 18 of 20) intron (NM_144643, intron 18 of 20) 124479 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 121-131 chr7 19893194 19893542 + 0.666667 NA Intergenic L1M3a|LINE|L1 -119751 NM_001366627 256130 Hs.487670 NM_152774 ENSG00000173452 TMEM196 - transmembrane protein 196 protein-coding 125.333-37 chr11 39160839 39161068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 512095 NR_120553 101928536 Hs.144776 NR_120553 ENSG00000254562 LINC01493 - long intergenic non-protein coding RNA 1493 ncRNA 157-117 chr6 127096004 127096450 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D|LTR|ERVL -22444 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 115.667-85 chr15 77006803 77006994 + 0.666667 NA intron (NR_135552, intron 1 of 11) L1MB4|LINE|L1 11772 NM_003978 9051 Hs.129758 NM_003978 ENSG00000140368 PSTPIP1 CD2BP1|CD2BP1L|CD2BP1S|H-PIP|PAPAS|PSTPIP proline-serine-threonine phosphatase interacting protein 1 protein-coding 142-96 chr3 194767252 194767491 + 0.666667 NA intron (NR_146990, intron 2 of 2) L3|LINE|CR1 1338 NR_146990 105374293 NR_146990 ENSG00000230401 LINC01972 - long intergenic non-protein coding RNA 1972 ncRNA 115-84 chr2 45230731 45231044 + 0.666667 NA intron (NR_033831, intron 1 of 5) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 24054 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 138-97 chr6 35597661 35597973 + 0.666667 NA intron (NM_001145775, intron 6 of 11) intron (NM_001145775, intron 6 of 11) 66972 NR_049873 100847048 NR_049873 ENSG00000265527 MIR5690 - microRNA 5690 ncRNA 157.333-88 chr12 68056062 68056450 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 66811 NR_104125 100885789 Hs.439832 NR_104124 ENSG00000255733 IFNG-AS1 GS1-410F4.2|NEST|Tmevpg1 IFNG antisense RNA 1 ncRNA 205-9 chr1 208922291 208922756 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -49931 NR_146915 105372894 Hs.98665 NR_146915 ENSG00000236950 LINC01774 - long intergenic non-protein coding RNA 1774 ncRNA 128.333-40 chr11 102366880 102367184 + 0.666667 NA intron (NM_001256163, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 19658 NM_001256163 329 Hs.696238 NM_001166 ENSG00000110330 BIRC2 API1|HIAP2|Hiap-2|MIHB|RNF48|c-IAP1|cIAP1 baculoviral IAP repeat containing 2 protein-coding 158-141 chr8 112734134 112734458 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 90803 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 138-126 chr9 24091895 24092150 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -241421 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 154.667-293 chr5 4309320 4309768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -463937 NR_104619 101929153 Hs.385526 NR_104619 ENSG00000249521 LINC02114 - long intergenic non-protein coding RNA 2114 ncRNA 156.667-199 chr2 222685048 222685375 + 0.666667 NA intron (NM_058165, intron 1 of 5) intron (NM_058165, intron 1 of 5) 13553 NM_058165 116255 Hs.344090 NM_058165 ENSG00000124003 MOGAT1 DGAT2L|DGAT2L1|MGAT1 monoacylglycerol O-acyltransferase 1 protein-coding 149.333-356 chr7 2500263 2500553 + 0.666667 NA Intergenic (CCGGCCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -12121 NM_001166355 3955 Hs.159142 NM_002304 ENSG00000106003 LFNG SCDO3 LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 161.667-256 chr8 107249972 107250272 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001146, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001146, exon 9 of 9) 86393 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 213.333-194 chr7 65323250 65323737 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -50306 NM_001287532 168374 Hs.9521 NM_007139 ENSG00000146757 ZNF92 HEL-203|HPF12|HTF12|TF12 zinc finger protein 92 protein-coding 182.333-94 chr20 1759258 1759602 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 20316 NR_037142 100289473 Hs.641525 NR_037142 ENSG00000232528 LOC100289473 - cytoskeleton associated protein 2-like pseudogene pseudo 170-103 chr6 25598206 25598564 + 0.666667 NA intron (NM_001173977, intron 32 of 36) AluJb|SINE|Alu -53830 NM_006998 10590 Hs.116428 NM_006998 ENSG00000079689 SCGN CALBL|DJ501N12.8|SECRET|SEGN|setagin secretagogin, EF-hand calcium binding protein protein-coding 163-40 chr2 29770006 29770448 + 0.666667 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) HAL1|LINE|L1 151359 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 181.333-28 chr11 104252700 104253130 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88768 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 231-60 chr8 64393827 64394297 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 14913 NR_029669 406908 NR_029669 ENSG00000207816 MIR124-2 MIRN124-2|MIRN124A2|mir-124-2 microRNA 124-2 ncRNA 145-95 chr5 69043653 69043931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13865 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 120-36 chr13 86703285 86703583 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -208486 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 154.333-303 chr6 115799545 115799983 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -155929 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 193.666-50 chr8 144494851 144495407 + 0.666667 NA intron (NM_001329444, intron 2 of 11) intron (NM_001329444, intron 2 of 11) -9011 NM_005309 2875 Hs.103502 NM_005309 ENSG00000167701 GPT AAT1|ALT1|GPT1 glutamic--pyruvic transaminase protein-coding 129-73 chr20 8138973 8139251 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 1 of 32) AluSz6|SINE|Alu 6846 NM_182734 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 133.667-62 chr18 10989488 10989808 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) L1ME5|LINE|L1 159114 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 235.333-31 chr13 94545771 94546276 + 0.666667 NA intron (NM_001322186, intron 1 of 9) MER67B|LTR|ERV1 3383 NM_001322185 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 140.667-48 chr11 36592586 36592881 + 0.666667 NA exon (NM_001243786, exon 3 of 3) exon (NM_001243786, exon 3 of 3) -1760 NM_001276725 119710 Hs.159376 NM_138787 ENSG00000166352 C11orf74 HEPIS|NWC chromosome 11 open reading frame 74 protein-coding 128.333-172 chr6 71188743 71189111 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -99884 NM_024576 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 170.667-73 chr2 24915750 24916183 + 0.666667 NA intron (NM_001320613, intron 2 of 21) Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger 4271 NM_004036 109 Hs.467898 NM_004036 ENSG00000138031 ADCY3 AC-III|AC3|BMIQ19 adenylate cyclase 3 protein-coding 155.333-36 chr10 83535260 83535580 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 141669 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 171-65 chr5 59453536 59453933 + 0.666667 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -96764 NM_001197219 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 120.667-172 chr8 98675244 98675447 + 0.666667 NA intron (NM_001256313, intron 4 of 8) intron (NM_001256313, intron 4 of 8) 150326 NM_001256313 6788 Hs.492333 NM_006281 ENSG00000104375 STK3 KRS1|MST2 serine/threonine kinase 3 protein-coding 184.333-76 chr2 117908733 117909124 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75197 NR_158150 107985939 NR_158150 LOC107985939 - uncharacterized LOC107985939 ncRNA 131.667-194 chr8 84573564 84573930 + 0.666667 NA intron (NM_001354308, intron 3 of 9) L1MEf|LINE|L1 -132180 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 250-100 chrX 95970320 95970750 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 367367 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 115-149 chr7 110904676 110905011 + 0.666667 NA intron (NM_032549, intron 4 of 5) intron (NM_032549, intron 4 of 5) -186163 NM_001099660 54674 Hs.3781 NM_018334 ENSG00000173114 LRRN3 FIGLER5|NLRR-3|NLRR3 leucine rich repeat neuronal 3 protein-coding 197.667-64 chr2 42647271 42647623 + 0.666667 NA intron (NM_001330443, intron 6 of 16) AluSz6|SINE|Alu 78815 NM_001330442 57504 Hs.435413 NM_020744 ENSG00000057935 MTA3 - metastasis associated 1 family member 3 protein-coding 119.333-61 chr11 122489482 122489704 + 0.666667 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie -66722 NR_137179 399959 Hs.44098 NR_024430 ENSG00000255248 MIR100HG AGD1|linc-NeD125|lncRNA-N2 mir-100-let-7a-2-mir-125b-1 cluster host gene ncRNA 111.667-226 chr6 126693041 126693277 + 0.666667 NA Intergenic LTR79|LTR|ERVL 208528 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 223-27 chr17 73581939 73582509 + 0.666667 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) intron (NM_001144952, intron 1 of 44) 62221 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 129.667-148 chr6 63606664 63606905 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29018 NM_001370350 23469 Hs.348921 NM_015153 ENSG00000118482 PHF3 - PHD finger protein 3 protein-coding 120.667-98 chr2 102704058 102704338 + 0.666667 NA intron (NM_003048, intron 9 of 11) FRAM|SINE|Alu 32690 NR_136174 84804 Hs.590898 NM_032718 ENSG00000135953 MFSD9 - major facilitator superfamily domain containing 9 protein-coding 126-36 chr15 99756607 99756848 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23283 NM_001284422 145748 Hs.562568 NM_152449 ENSG00000183060 LYSMD4 - LysM domain containing 4 protein-coding 146-11 chr10 77656227 77656517 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -18564 NM_001271521 3778 Hs.144795 NM_002247 ENSG00000156113 KCNMA1 BKTM|CADEDS|KCa1.1|MaxiK|PNKD3|SAKCA|SLO|SLO-ALPHA|SLO1|bA205K10.1|hSlo|mSLO1 potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1 protein-coding 184-33 chr16 5009056 5009543 + 0.666667 NA intron (NM_014692, intron 14 of 15) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -24403 NR_038913 100507589 Hs.729936 NR_038913 NAGPA-AS1 - NAGPA antisense RNA 1 ncRNA 193.667-85 chr3 72642972 72643391 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 21068 NR_135531 105377162 Hs.123457 NR_135531 LOC105377162 - uncharacterized LOC105377162 ncRNA 158.333-200 chr3 46722398 46722704 + 0.666667 NA intron (NR_147121, intron 3 of 3) AluJo|SINE|Alu -4682 NM_013270 29122 Hs.120365 NM_013270 ENSG00000283706 PRSS50 CT20|TSP50 serine protease 50 protein-coding 179.333-177 chr7 89728737 89729065 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -390499 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 156-133 chr7 84843895 84844304 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 277832 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 194.333-59 chr19 30045447 30045961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 103465 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 124-117 chr9 28509199 28509399 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) intron (NM_152570, intron 2 of 6) 210006 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 155-76 chr2 233101904 233102275 + 0.666667 NA intron (NM_001017915, intron 2 of 26).2 MIRb|SINE|MIR 41747 NM_001017915 3635 Hs.262886 NM_005541 ENSG00000168918 INPP5D SHIP|SHIP-1|SHIP1|SIP-145|hp51CN|p150Ship inositol polyphosphate-5-phosphatase D protein-coding 289.333-69 chrX 103388243 103388832 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 11499 NM_014380 27018 Hs.448588 NM_014380 ENSG00000166681 BEX3 Bex|DXS6984E|HGR74|NADE|NGFRAP1 brain expressed X-linked 3 protein-coding 149.667-30 chr1 156160177 156160611 + 0.666667 NA intron (NM_001370567, intron 5 of 13) intron (NM_001370567, intron 5 of 13) 5846 NM_001370567 64218 Hs.408846 NM_022367 ENSG00000196189 SEMA4A CORD10|RP35|SEMAB|SEMB semaphorin 4A protein-coding 157.667-105 chr14 88029652 88029990 + 0.666667 NA intron (NR_046094, intron 2 of 3) ERVL-E-int|LTR|ERVL -3509 NR_110121 101928791 Hs.641889 NR_110121 ENSG00000258826 LINC01147 - long intergenic non-protein coding RNA 1147 ncRNA 143.667-158 chr3 53437067 53437385 + 0.666667 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -57385 NM_001128840 776 Hs.476358 NM_000720 ENSG00000157388 CACNA1D CACH3|CACN4|CACNL1A2|CCHL1A2|Cav1.3|PASNA|SANDD calcium voltage-gated channel subunit alpha1 D protein-coding 151.333-385 chr7 39115851 39116303 + 0.666667 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) intron (NM_001370959, intron 2 of 9) -102510 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 123-32 chr11 110228323 110228608 + 0.666667 NA TTS (NM_001260494) TTS (NM_001260494) 68247 NM_001260494 5962 Hs.263671 NM_002906 ENSG00000137710 RDX DFNB24 radixin protein-coding 188.667-31 chr12 15117085 15117483 + 0.666667 NA intron (NM_001190726, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR -34639 NR_046559 100873980 Hs.569154 NR_046559 ENSG00000255660 RERG-AS1 - RERG antisense RNA 1 ncRNA 197.333-241 chr8 122865794 122866227 + 0.666667 NA intron (NM_014943, intron 2 of 3) MIRc|SINE|MIR 84355 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 111.667-258 chr8 92211235 92211534 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -107999 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 177.667-18 chr10 56484467 56484976 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -123448 NM_032997 11130 Hs.591363 NM_007057 ENSG00000122952 ZWINT HZwint-1|KNTC2AP|SIP30|ZWINT1 ZW10 interacting kinetochore protein protein-coding 173.333-163 chr5 115806571 115807003 + 0.666667 NA intron (NM_001323565, intron 4 of 5) HAL1|LINE|L1 9870 NR_136621 1036 Hs.442378 NM_001801 ENSG00000129596 CDO1 CDO-I cysteine dioxygenase type 1 protein-coding 112.667-223 chr5 164006511 164006747 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 460773 NR_105064 101927835 Hs.735171 NR_105064 ENSG00000253236 LINC02143 - long intergenic non-protein coding RNA 2143 ncRNA 134.667-159 chr5 72086867 72087125 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20479 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 150.667-390 chr8 137585453 137585896 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -172086 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 158.333-58 chr11 114850124 114850438 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 171754 NM_182495 120406 Hs.446760 NM_182495 ENSG00000204361 NXPE2 FAM55B neurexophilin and PC-esterase domain family member 2 protein-coding 174-75 chr5 5281873 5282250 + 0.666667 NA intron (NM_139056, intron 18 of 22) intron (NM_139056, intron 18 of 22) -140616 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 142.333-93 chr15 97498381 97498654 + 0.666667 NA intron (NR_120324, intron 2 of 4) ERVL-E-int|LTR|ERVL 23294 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 153-54 chr15 83923062 83923396 + 0.666667 NA intron (NM_207517, intron 16 of 29) MIRc|SINE|MIR -156958 NR_036652 648809 Hs.585157 NR_036652 EFL1P1 EFTUD1P1|FAM42B|HsT19321 elongation factor like GTPase 1 pseudogene 1 pseudo 209.667-5 chr1 53242885 53243452 + 0.666667 NA TTS (NR_038953) TTS (NR_038953) 4558 NR_038953 100507564 Hs.592502 NR_038953 ENSG00000226754 LOC100507564 - uncharacterized LOC100507564 ncRNA 147.667-329 chr7 10548094 10548418 + 0.666667 NA intron (NR_147499, intron 2 of 2) intron (NR_147499, intron 2 of 2) -154420 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 206-184 chr8 115946194 115946657 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -277450 NM_001330599 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 155.333-111 chr14 69752803 69753148 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14167 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 162.333-92 chr16 85084299 85084766 + 0.666667 NA intron (NM_001286565, intron 10 of 12) AluSq2|SINE|Alu 21320 NM_001286565 9764 Hs.301658 NM_014732 ENSG00000135709 KIAA0513 - KIAA0513 protein-coding 177.333-164 chr8 58228478 58228943 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43391 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 126.333-136 chr4 177166277 177166622 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -143425 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 186.333-140 chr6 79937400 79937854 + 0.666667 NA intron (NM_022726, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 9926 NM_022726 6785 Hs.101915 NM_022726 ENSG00000118402 ELOVL4 ADMD|CT118|ISQMR|SCA34|STGD2|STGD3 ELOVL fatty acid elongase 4 protein-coding 114-127 chr5 165058736 165058966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 588572 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 156-134 chr7 87804117 87804508 + 0.666667 NA intron (NM_001134406, intron 8 of 9) intron (NM_001134406, intron 8 of 9) 72048 NM_018843 55972 Hs.208414 NM_018843 ENSG00000075303 SLC25A40 MCFP solute carrier family 25 member 40 protein-coding 216.333-130 chr7 4011448 4011958 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 15 of 44) intron (NM_152744, intron 15 of 44) -117982 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 153.667-90 chr12 38375458 38375832 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 58871 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 172.667-144 chr7 22367197 22367607 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -10248 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 133.667-13 chr1 207927475 207927817 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16521 NM_001773 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 123.667-109 chr21 21928687 21929005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 169613 NR_109959 101927843 Hs.652879 NR_109959 ENSG00000233215 LINC01687 - long intergenic non-protein coding RNA 1687 ncRNA 125.667-80 chr18 4489642 4489864 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34446 NM_004746 9229 Hs.594640 NM_004746 ENSG00000170579 DLGAP1 DAP-1|DAP-1-ALPHA|DAP-1-BETA|DAP1|DLGAP1A|DLGAP1B|GKAP|SAPAP1 DLG associated protein 1 protein-coding 148.333-25 chr1 150838169 150838479 + 0.666667 NA intron (NM_001286036, intron 6 of 21) intron (NM_001286036, intron 6 of 21) -30064 NM_000396 1513 Hs.632466 NM_000396 ENSG00000143387 CTSK CTS02|CTSO|CTSO1|CTSO2|PKND|PYCD cathepsin K protein-coding 145.667-189 chr4 23268141 23268429 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 554196 NR_102357 57733 Hs.653107 NM_020973 ENSG00000249948 GBA3 CBG|CBGL1|GLUC|KLRP glucosylceramidase beta 3 (gene/pseudogene) protein-coding 227.667-79 chr8 123206105 123206605 + 0.666667 NA intron (NM_001288587, intron 2 of 3) intron (NM_001288587, intron 2 of 3) -3612 NR_024479 100131726 Hs.660862 NR_024479 ENSG00000204949 FAM83A-AS1 HCCC11|HCCC11_v1|HCCC11_v2 FAM83A antisense RNA 1 ncRNA 213.667-13 chr10 37451352 37451850 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 142415 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 158.667-4 chr1 42067885 42068255 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -32136 NR_038261 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 140.667-51 chr11 74962176 74962450 + 0.666667 NA intron (NM_014752, intron 1 of 4) MER68B|LTR|ERVL 13047 NM_014752 9789 Hs.282700 NM_014752 ENSG00000118363 SPCS2 - signal peptidase complex subunit 2 protein-coding 155-5 chr1 104343186 104343497 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 270318 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 113.667-76 chr16 55457799 55458062 + 0.666667 NA intron (NR_147198, intron 1 of 6) intron (NR_147198, intron 1 of 6) 4367 NR_147198 107984884 Hs.666473 NR_147198 MMP2-AS1 - MMP2 antisense RNA 1 ncRNA 122.333-209 chr8 119421446 119421803 + 0.666667 NA intron (NM_002514, intron 4 of 4) intron (NM_002514, intron 4 of 4) 5178 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 117-89 chr20 43701857 43702101 + 0.666667 NA intron (NM_001278610, intron 6 of 12) AluSx|SINE|Alu 25023 NM_001008901 149699 Hs.447626 NM_176791 ENSG00000124196 GTSF1L C20orf65|FAM112A|dJ1028D15.4 gametocyte specific factor 1 like protein-coding 169.667-163 chr5 23814893 23815228 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136288 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 119.333-180 chr5 94818102 94818321 + 0.666667 NA intron (NM_001002796, intron 17 of 22) intron (NM_001002796, intron 17 of 22) 199542 NM_032290 84250 Hs.657315 NM_032290 ENSG00000133302 SLF1 ANKRD32|BRCTD1|BRCTx SMC5-SMC6 complex localization factor 1 protein-coding 184-86 chr5 75378830 75379228 + 0.666667 NA intron (NM_031361, intron 16 of 16) AluJr|SINE|Alu 41809 NM_000859 3156 Hs.628096 NM_000859 ENSG00000113161 HMGCR LDLCQ3 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase protein-coding 113-156 chr4 63587229 63587455 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 822108 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 222.333-31 chr14 76927042 76927554 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32340 NR_133913 105370578 Hs.574184 NR_133913 ENSG00000258602 LINC01629 linc-KIAA1737-2 long intergenic non-protein coding RNA 1629 ncRNA 144.333-266 chr8 79584241 79584542 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -26726 NM_007029 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 116.667-11 chr1 172626076 172626266 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32837 NM_001302746 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 138.667-192 chr7 84829848 84830189 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 291913 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 177-75 chr8 43635014 43635469 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 342799 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 239.333-19 chr11 90364107 90364541 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) LTR50|LTR|ERVL 113092 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 155.333-227 chr3 46403329 46403643 + 0.666667 NA intron (NR_125406, intron 1 of 3) LTR41C|LTR|ERVL 3573 NR_125406 102724297 Hs.622021 NR_125406 LOC102724297 - uncharacterized LOC102724297 ncRNA 154.333-152 chr2 70557566 70557853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3883 NM_001099691 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 142.667-55 chr14 65809767 65810054 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 338808 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 171.667-79 chr2 37211604 37212044 + 0.666667 NA intron (NM_005760, intron 12 of 15) intron (NM_005760, intron 12 of 15) 15328 NM_001322375 100505876 Hs.666958 NM_001322373 ENSG00000218739 CEBPZOS CEBPZ-AS1 CEBPZ opposite strand protein-coding 186-75 chr4 89668086 89668495 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -168111 NR_045481 644248 Hs.553954 NR_045481 ENSG00000247775 SNCA-AS1 - SNCA antisense RNA 1 ncRNA 202-112 chr3 63095524 63095954 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6949 NR_027104 285401 Hs.211125 NR_027104 ENSG00000244342 LINC00698 - long intergenic non-protein coding RNA 698 ncRNA 156.333-321 chr6 148544765 148545053 + 0.666667 NA intron (NM_001346506, intron 19 of 20) intron (NM_001346506, intron 19 of 20) 35758 NM_001346509 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 198.667-168 chr7 3763953 3764360 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 4 of 44) intron (NM_152744, intron 4 of 44) -365529 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 180.667-27 chr12 19979397 19979829 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -35072 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 144-134 chr5 121134408 121134665 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -188014 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 135-64 chr3 68614229 68614479 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 113717 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 164-67 chr2 214741377 214741662 + 0.666667 NA intron (NM_001282549, intron 3 of 4) intron (NM_001282549, intron 3 of 4) 68164 NM_001282545 580 Hs.591642 NM_000465 ENSG00000138376 BARD1 - BRCA1 associated RING domain 1 protein-coding 125.333-184 chr9 26696837 26697157 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 195805 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 157-67 chr2 140507304 140507629 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 52 of 90) Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 79219 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 194.667-2 chr1 20921619 20921919 + 0.666667 NA intron (NM_003760, intron 9 of 31) intron (NM_003760, intron 9 of 31) 66663 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 116-2 chr1 41464033 41464377 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20478 NM_001302269 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 217.333-40 chr13 38951066 38951559 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 39519 NM_145286 161003 Hs.327794 NM_145286 ENSG00000133115 STOML3 Epb7.2l|SRO stomatin like 3 protein-coding 166-56 chr18 49247280 49247727 + 0.666667 NA intron (NM_001353214, intron 13 of 17) intron (NM_001353214, intron 13 of 17) -197735 NR_039898 100616420 NR_039898 ENSG00000263849 MIR4744 - microRNA 4744 ncRNA 234.667-55 chr2 136506359 136506831 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -258950 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 114.333-5 chr1 78654960 78655151 + 0.666667 NA non-coding (NR_135640, exon 3 of 6) non-coding (NR_135640, exon 3 of 6) 5224 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 188.667-100 chr3 22683393 22683812 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 518976 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 179.666-2 chr11 44228245 44228776 + 0.666667 NA intron (NM_207122, intron 10 of 13) intron (NM_207122, intron 10 of 13) 81629 NM_021926 60529 Hs.436055 NM_021926 ENSG00000052850 ALX4 CRS5|FND2 ALX homeobox 4 protein-coding 180-106 chr8 30546411 30546682 + 0.666667 NA intron (NM_001008710, intron 6 of 8) intron (NM_001008710, intron 6 of 8) -92034 NM_001206847 100507341 Hs.659493 NM_001206847 ENSG00000253457 SMIM18 - small integral membrane protein 18 protein-coding 172.667-86 chr2 138358332 138358829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143190 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 145.333-136 chr2 76267622 76267922 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -556857 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 160.333-150 chr2 135518697 135518977 + 0.666667 NA intron (NM_032143, intron 1 of 20) intron (NM_032143, intron 1 of 20) 11748 NM_001286568 84083 Hs.658422 NM_032143 ENSG00000121988 ZRANB3 4933425L19Rik|AH2 zinc finger RANBP2-type containing 3 protein-coding 135-91 chr6 39146430 39146675 + 0.666667 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL -31366 NM_001304793 55776 Hs.58382 NM_018322 ENSG00000112167 SAYSD1 C6orf64 SAYSVFN motif domain containing 1 protein-coding 149-68 chr2 79746503 79746859 + 0.666667 NA intron (NM_001282598, intron 3 of 17) L2b|LINE|L2 -97322 NR_036231 100422888 NR_036231 ENSG00000266436 MIR4264 - microRNA 4264 ncRNA 171-75 chr8 82203968 82204471 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -361933 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 163.667-10 chr1 214656581 214656923 + 0.666667 NA intron (NM_016343, intron 17 of 19) intron (NM_016343, intron 17 of 19) 53557 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 185.333-130 chr4 32999973 33000370 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 649133 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 132.667-96 chr2 151005818 151006205 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 255852 NM_198557 375287 Hs.302442 NM_198557 ENSG00000184898 RBM43 C2orf38 RNA binding motif protein 43 protein-coding 186.333-110 chr4 30749234 30749522 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 29009 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 114.667-130 chr2 100031475 100031737 + 0.666667 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) L1MC3|LINE|L1 73977 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 162.667-28 chr10 59961010 59961340 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_024340) promoter-TSS (NR_024340) -262 NR_024340 283025 Hs.522955 NM_001017982 ENSG00000235931 LINC01553 C10orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1553 ncRNA 144.667-216 chr4 55514100 55514522 + 0.666667 NA intron (NM_004898, intron 1 of 22) L1MC1|LINE|L1 31621 NM_001267843 9575 Hs.436975 NM_004898 ENSG00000134852 CLOCK KAT13D|bHLHe8 clock circadian regulator protein-coding 165-66 chr4 65529249 65529593 + 0.666667 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 140067 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 125.333-69 chr16 47806568 47806886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51854 NR_110650 101927132 Hs.589404 NR_110650 ENSG00000261231 LINC02133 - long intergenic non-protein coding RNA 2133 ncRNA 122-85 chr4 61626327 61626571 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 5 of 23) intron (NM_001371343, intron 5 of 23) 424277 NM_001371342 165.667-25 chr11 7694978 7695342 + 0.666667 NA exon (NM_198185, exon 12 of 15) exon (NM_198185, exon 12 of 15) 11317 NM_001367963 341277 Hs.532475 NM_198185 ENSG00000183378 OVCH2 OVTN ovochymase 2 (gene/pseudogene) protein-coding 139.333-149 chr3 80541180 80541543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -223536 NR_147143 105377175 Hs.180696 NR_147143 ENSG00000242781 LINC02050 - long intergenic non-protein coding RNA 2050 ncRNA 134.333-48 chr14 51461225 51461484 + 0.666667 NA intron (NR_051990, intron 2 of 2) LTR84b|LTR|ERVL -27774 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 129.667-106 chr2 205103884 205104219 + 0.666667 NA intron (NM_205863, intron 4 of 21) intron (NM_205863, intron 4 of 21) 558576 NM_152526 117583 Hs.657382 NM_057177 ENSG00000116117 PARD3B ALS2CR19|PAR3B|PAR3L|PAR3beta par-3 family cell polarity regulator beta protein-coding 112-139 chr3 98807160 98807461 + 0.666667 NA intron (NM_080927, intron 13 of 15) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 44003 NM_001323367 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 112.333-221 chr5 159199160 159199421 + 0.666667 NA intron (NM_001199383, intron 2 of 10) intron (NM_001199383, intron 2 of 10) 8358 NM_001199382 153830 Hs.349306 NM_144726 ENSG00000145860 RNF145 - ring finger protein 145 protein-coding 195.333-167 chr5 10941285 10941753 + 0.666667 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -180285 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 225.667-56 chr4 33176750 33177339 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 826006 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 114-27 chr12 95564400 95564600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13024 NM_032147 84101 Hs.646421 NM_032147 ENSG00000136014 USP44 - ubiquitin specific peptidase 44 protein-coding 122.667-186 chr8 21509389 21509658 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 211284 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 215.333-46 chr12 90993937 90994526 + 0.666667 NA intron (NM_004950, intron 2 of 6) intron (NM_004950, intron 2 of 6) 10741 NM_004950 1833 Hs.435680 NM_004950 ENSG00000083782 EPYC DSPG3|PGLB|Pg-Lb|SLRR3B epiphycan protein-coding 119-138 chr7 87775380 87775661 + 0.666667 NA intron (NM_138290, intron 8 of 11) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -62197 NM_001348944 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 151.333-309 chr4 78847865 78848174 + 0.666667 NA intron (NM_017593, intron 6 of 13) intron (NM_017593, intron 6 of 13) 71641 NM_198892 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 344.667-2 chr14 65877284 65878059 + 0.666667 NA Intergenic LTR37-int|LTR|ERV1 406569 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 152.333-247 chr3 128895534 128895839 + 0.666667 NA intron (NM_014049, intron 4 of 17) intron (NM_014049, intron 4 of 17) 16066 NM_014049 28976 Hs.567482 NM_014049 ENSG00000177646 ACAD9 MC1DN20|NPD002 acyl-CoA dehydrogenase family member 9 protein-coding 160-87 chr4 104371834 104372233 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118932 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 118.333-95 chr2 29171099 29171377 + 0.666667 NA intron (NM_001287528, intron 14 of 14) L1MC|LINE|L1 52662 NM_001353765 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 146.667-285 chr6 129631411 129631702 + 0.666667 NA intron (NM_033515, intron 4 of 14) intron (NM_033515, intron 4 of 14) 78621 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 168-82 chr4 84305727 84306186 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -6787 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 129.667-151 chr6 97464830 97465197 + 0.666667 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) intron (NR_110757, intron 1 of 4) 159427 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 136.667-139 chr5 18212228 18212433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 405056 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 115.667-15 chr10 5795268 5795520 + 0.666667 NA intron (NM_001494, intron 3 of 10) AluJb|SINE|Alu 18040 NM_001494 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 183.333-11 chr1 195915033 195915459 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 173469 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 161.667-115 chr19 39561280 39561651 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -21304 NM_153232 163126 Hs.18949 NM_153232 ENSG00000176396 EID2 CRI2|EID-2 EP300 interacting inhibitor of differentiation 2 protein-coding 181.667-84 chr21 15140581 15140873 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75727 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 122.333-140 chr3 118643446 118643667 + 0.666667 NA intron (NR_135573, intron 1 of 1) intron (NR_135573, intron 1 of 1) 1788 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 123-45 chr15 64628808 64629057 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) intron (NM_015042, intron 2 of 8) 74349 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 157-134 chr8 131798739 131799052 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -105198 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 115.667-230 chr9 117470086 117470425 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -55198 NM_014010 23245 Hs.601562 NM_014010 ENSG00000148219 ASTN2 bA67K19.1 astrotactin 2 protein-coding 122.667-118 chr3 84454064 84454334 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 415376 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 169-20 chr12 65413800 65414175 + 0.666667 NA intron (NM_001031679, intron 5 of 6) L2a|LINE|L2 135000 NM_001193461 253827 Hs.339024 NM_198080 ENSG00000174099 MSRB3 DFNB74 methionine sulfoxide reductase B3 protein-coding 180.667-88 chr22 17141500 17141881 + 0.666667 NA intron (NM_017829, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR 17587 NM_033070 27440 Hs.26890 NM_017829 ENSG00000069998 HDHD5 CECR5 haloacid dehalogenase like hydrolase domain containing 5 protein-coding 139.333-127 chr2 220118968 220119338 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -212588 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 129-53 chr18 4095168 4095509 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 2 of 11) intron (NM_001242761, intron 2 of 11) 132985 NR_102696 101410534 Hs.141055 NR_102696 ENSG00000263878 DLGAP1-AS4 - DLGAP1 antisense RNA 4 ncRNA 119-123 chr5 99154482 99154754 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -224904 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 148-127 chr5 38613023 38613353 + 0.666667 NA intron (NR_103554, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR -17783 NM_002310 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 154.667-373 chr7 111560594 111560962 + 0.666667 NA intron (NM_001350959, intron 2 of 7) intron (NM_001350959, intron 2 of 7) 1513 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 150.667-268 chr4 72195588 72195930 + 0.666667 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger 156627 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 138.333-76 chr17 5597151 5597514 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -12823 NM_001033053 22861 Hs.652273 NM_014922 ENSG00000091592 NLRP1 AIADK|CARD7|CIDED|CLR17.1|DEFCAP|DEFCAP-L/S|MSPC|NAC|NALP1|PP1044|SLEV1|VAMAS1 NLR family pyrin domain containing 1 protein-coding 114.667-253 chr8 135895346 135895612 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 438023 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 154.333-362 chr8 137906382 137906694 + 0.666667 NA intron (NR_161374, intron 2 of 7) L1MA4|LINE|L1 177007 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 128.333-201 chr9 30490482 30490755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -82164 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 121-30 chr12 29565564 29565841 + 0.666667 NA intron (NM_001367875, intron 11 of 19) AluSq|SINE|Alu -66009 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 196.667-140 chr7 28078066 28078498 + 0.666667 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) MIRc|SINE|MIR -102175 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 147.667-248 chr4 14814736 14815106 + 0.666667 NA intron (NR_126435, intron 2 of 6) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 73248 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 143-53 chr16 61501091 61501365 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -445462 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 177.667-145 chr9 71299746 71300118 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) 147039 NM_001366141 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 143-7 chr1 82784934 82785361 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -118036 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 120-33 chr12 81678624 81678854 + 0.666667 NA intron (NM_003625, intron 3 of 32) intron (NM_003625, intron 3 of 32) 79768 NM_001220476 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 150.333-77 chr12 23678572 23678869 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 9 of 17) MIR|SINE|MIR -94134 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 179-90 chr7 3066861 3067324 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23225 NM_032415 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 118.667-87 chr17 78725333 78725536 + 0.666667 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) intron (NM_004762, intron 1 of 12) -1684 NM_001292018 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 197-20 chr10 82598255 82598595 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -365505 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 266-38 chr2 40797057 40797575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -284881 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 227-39 chr4 45508767 45509164 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 615089 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 138.333-56 chr13 94572333 94572636 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -23078 NM_001322184 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 113.667-146 chr3 145769956 145770167 + 0.666667 NA Intergenic Tigger12|DNA|TcMar-Tigger 299124 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 156.667-212 chr20 59188845 59189200 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -1998 NM_178457 128611 Hs.473204 NM_178457 ENSG00000124203 ZNF831 C20orf174 zinc finger protein 831 protein-coding 140-59 chr2 61414008 61414288 + 0.666667 NA intron (NM_014709, intron 2 of 79) AluSx|SINE|Alu 3229 NR_003707 100124537 Hs.675825 NR_003707 ENSG00000206937 SNORA70B - small nucleolar RNA, H/ACA box 70B snoRNA 148.333-197 chr2 123169959 123170251 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -96624 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 192.667-178 chr8 127509115 127509532 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27184 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 178.333-36 chr12 55552878 55553362 + 0.666667 NA TTS (NM_001005494) TTS (NM_001005494) 1893 NM_001005494 341418 Hs.495021 NM_001005494 ENSG00000179626 OR6C4 OR12-10 olfactory receptor family 6 subfamily C member 4 protein-coding 151 chr1 8652023 8652288 + 0.666667 NA intron (NM_001042681, intron 2 of 22) intron (NM_001042681, intron 2 of 22) -157242 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 245.667-79 chr9 31917505 31918083 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -466809 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 215.667-11 chr10 18921901 18922467 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -126617 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 178.667-15 chr1 240655966 240656361 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44008 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 252-64 chr3 126061656 126062308 + 0.666667 NA intron (NM_001164475, intron 1 of 9) LTR53-int|LTR|ERVL -5207 NM_001008487 54946 Hs.573007 NM_017836 ENSG00000114544 SLC41A3 SLC41A1-L2 solute carrier family 41 member 3 protein-coding 168.667-215 chr8 54780925 54781402 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 165067 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 129-24 chr11 124677303 124677655 + 0.666667 NA intron (NM_017425, intron 2 of 4) L1MC5|LINE|L1 -1176 NM_001199922 54414 Hs.10056 NM_018978 ENSG00000110013 SIAE AIS6|CSE-C|CSEC|LSE|YSG2 sialic acid acetylesterase protein-coding 213-45 chr20 8370101 8370583 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) 121638 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 168-2 chr1 101182035 101182370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54326 NR_104626 101928370 Hs.534209 NR_104626 LOC101928370 - uncharacterized LOC101928370 ncRNA 154-55 chr14 78461404 78461800 + 0.666667 NA intron (NM_004796, intron 1 of 16) intron (NM_004796, intron 1 of 16) 57883 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 139-104 chr8 101566028 101566308 + 0.666667 NA intron (NM_024915, intron 4 of 15) intron (NM_024915, intron 4 of 15) 73729 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 159.667-160 chr2 22868192 22868511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 331872 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 127-82 chr6 49968698 49969061 + 0.666667 NA intron (NM_001037729, intron 1 of 1) intron (NM_001037729, intron 1 of 1) 746 NM_001037729 245927 Hs.582789 NM_001037729 ENSG00000214642 DEFB113 DEFB-13 defensin beta 113 protein-coding 164.667-52 chr12 45654187 45654641 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73507 NR_028408 400027 Hs.597122 NR_028408 LINC00938 - long intergenic non-protein coding RNA 938 ncRNA 213-73 chr6 71757945 71758434 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -128514 NM_001350413 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 116-142 chr7 11197810 11198020 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 224043 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 198.333-182 chr7 33373648 33374165 + 0.666667 NA intron (NM_198428, intron 17 of 22) intron (NM_198428, intron 17 of 22) 244342 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 124.333-49 chr14 55910619 55910921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114096 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 203.333-37 chr10 96363801 96364255 + 0.666667 NA TTS (NM_012465) TTS (NM_012465) -4663 NM_001284321 93377 Hs.12449 NM_033207 ENSG00000197430 OPALIN HTMP10|TMEM10|TMP10 oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein protein-coding 143-8 chr1 94286006 94286277 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -38395 NM_001328664 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 114.333-56 chr12 65063744 65064043 + 0.666667 NA intron (NM_007191, intron 6 of 9) AluJo|SINE|Alu 57412 NM_007191 11197 Hs.284122 NM_007191 ENSG00000156076 WIF1 WIF-1 WNT inhibitory factor 1 protein-coding 167.667-39 chr11 86381846 86382213 + 0.666667 NA intron (NM_001156474, intron 1 of 14) L2b|LINE|L2 7142 NM_001156474 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 120-94 chr4 48966276 48966593 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19841 NM_025087 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 179-12 chr10 36263562 36264036 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 485497 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 133.667-30 chr11 116361848 116362135 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -277431 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 209.333-222 chr7 81338638 81339068 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 222966 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 147-70 chr2 119657915 119658238 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -21091 NM_001105198 80775 Hs.439991 NM_030577 ENSG00000144120 TMEM177 - transmembrane protein 177 protein-coding 131.667-80 chr18 33915808 33916093 + 0.666667 NA intron (NM_001198548, intron 7 of 8) MIRb|SINE|MIR 132662 NM_001198549 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 126.333-107 chr20 47204782 47205051 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37949 NR_037410 100500814 NR_037410 ENSG00000264901 MIR3616 mir-3616 microRNA 3616 ncRNA 217-38 chr18 24094540 24095037 + 0.666667 NA intron (NM_001135993, intron 6 of 13) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -18539 NM_001292030 125488 Hs.128576 NM_153211 ENSG00000168234 TTC39C C18orf17|HsT2697 tetratricopeptide repeat domain 39C protein-coding 144.333-205 chr5 15432814 15433097 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -67225 NM_012304 23194 Hs.433057 NM_012304 ENSG00000183580 FBXL7 FBL6|FBL7 F-box and leucine rich repeat protein 7 protein-coding 155-116 chr7 14243683 14243994 + 0.666667 NA intron (NM_001350717, intron 22 of 24) intron (NM_001350717, intron 22 of 24) -252413 NM_001163148 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 178-102 chr6 97133523 97134018 + 0.666667 NA intron (NR_136579, intron 7 of 7) intron (NR_136579, intron 7 of 7) 123694 NM_001323261 114792 Hs.45056 NM_052904 ENSG00000186231 KLHL32 BKLHD5|KIAA1900|UG0030H05|dJ21F7.1 kelch like family member 32 protein-coding 165.333-248 chr8 87592445 87592847 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 281369 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 132.667-122 chr4 36581179 36581500 + 0.666667 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) L1MC3|LINE|L1 60561 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 144-64 chr18 12975476 12975755 + 0.666667 NA intron (NM_031216, intron 5 of 8) intron (NM_031216, intron 5 of 8) -15747 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 118-90 chr3 38584817 38585070 + 0.666667 NA intron (NM_198056, intron 16 of 27) (TGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 64729 NM_001099405 6331 Hs.517898 NM_000335 ENSG00000183873 SCN5A CDCD2|CMD1E|CMPD2|HB1|HB2|HBBD|HH1|ICCD|IVF|LQT3|Nav1.5|PFHB1|SSS1|VF1 sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 protein-coding 136.667-72 chr16 3096247 3096601 + 0.666667 NA intron (NM_001365272, intron 1 of 4) intron (NM_001365272, intron 1 of 4) 2870 NM_001365273 84891 Hs.334515 NM_032805 ENSG00000130182 ZSCAN10 ZFP206|ZNF206 zinc finger and SCAN domain containing 10 protein-coding 159-15 chr10 55916030 55916337 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -288241 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 192-83 chr20 35924962 35925380 + 0.666667 NA intron (NM_016436, intron 13 of 17) L1M5|LINE|L1 29455 NM_033630 51282 Hs.584909 NM_016558 ENSG00000171222 SCAND1 RAZ1|SDP1 SCAN domain containing 1 protein-coding 125.333-58 chr14 57406870 57407097 + 0.666667 NA intron (NM_001011713, intron 4 of 4) AluJb|SINE|Alu 16397 NM_001011713 122830 Hs.165465 NM_001011713 ENSG00000139977 NAA30 C14orf35|MAK3|Mak3p|NAT12|NAT12P N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit protein-coding 199.333-276 chr8 96785659 96786253 + 0.666667 NA intron (NM_016134, intron 2 of 7) intron (NM_016134, intron 2 of 7) 140714 NM_016134 10404 Hs.156178 NM_016134 ENSG00000104324 CPQ LDP|PGCP carboxypeptidase Q protein-coding 152.667-156 chr19 4586402 4586682 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26858 NM_032108 10501 Hs.465642 NM_020241 ENSG00000167680 SEMA6B SEM-SEMA-Y|SEMA-VIB|SEMAN|semaZ semaphorin 6B protein-coding 153.333-401 chr8 52878936 52879245 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -60818 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 113-2 chr1 10221846 10222167 + 0.666667 NA intron (NM_001365952, intron 1 of 48) intron (NM_001365952, intron 1 of 48) -8758 NM_001365953 23095 Hs.97858 NM_015074 ENSG00000054523 KIF1B CMT2|CMT2A|CMT2A1|HMSNII|KLP|NBLST1 kinesin family member 1B protein-coding 315.667-5 chr11 76664542 76665223 + 0.666667 NA intron (NM_001370190, intron 1 of 1) intron (NM_001370190, intron 1 of 1) 5056 NM_001370188 2615 Hs.151641 NM_005512 ENSG00000137507 LRRC32 D11S833E|GARP leucine rich repeat containing 32 protein-coding 196.667-38 chr12 65891211 65891625 + 0.666667 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) MamSINE1|SINE|tRNA-RTE -9093 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 115-88 chr2 73453341 73453604 + 0.666667 NA exon (NM_015120, exon 8 of 23) exon (NM_015120, exon 8 of 23) -3631 NR_046762 100874291 Hs.668279 NR_046762 ENSG00000230002 ALMS1-IT1 - ALMS1 intronic transcript 1 ncRNA 148.333-21 chr1 114299245 114299551 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -145529 NM_001366226 148281 Hs.370963 NM_205848 ENSG00000134207 SYT6 sytVI synaptotagmin 6 protein-coding 112-196 chr8 48785287 48785557 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -50111 NR_157026 79645 Hs.23245 NM_024593 ENSG00000034239 EFCAB1 - EF-hand calcium binding domain 1 protein-coding 112.333-45 chr11 113860042 113860325 + 0.666667 NA intron (NM_020886, intron 1 of 24) intron (NM_020886, intron 1 of 24) 15389 NM_001346264 57646 Hs.503891 NM_020886 ENSG00000048028 USP28 - ubiquitin specific peptidase 28 protein-coding 134-82 chr4 160525632 160525877 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -747970 NR_146278 109729132 NR_146278 ENSG00000250488 LINC02233 - long intergenic non-protein coding RNA 2233 ncRNA 122-93 chr5 38261498 38261710 + 0.666667 NA intron (NM_152403, intron 1 of 21) intron (NM_152403, intron 1 of 21) 3045 NM_001205301 133584 Hs.20103 NM_152403 ENSG00000164318 EGFLAM AGRINL|AGRNL|PIKA EGF like, fibronectin type III and laminin G domains protein-coding 155-75 chr2 222881364 222881724 + 0.666667 NA intron (NM_001354159, intron 1 of 14) AluSq2|SINE|Alu 20508 NM_001354159 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 158.667-57 chr11 41129538 41129851 + 0.666667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 329942 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 112-61 chr14 53623652 53623967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 324675 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 154.667-237 chr3 50069936 50070246 + 0.666667 NA intron (NM_001349194, intron 15 of 17) AluSg|SINE|Alu -18828 NR_036627 10181 Hs.439480 NM_005778 ENSG00000003756 RBM5 G15|H37|LUCA-15|LUCA15|RMB5 RNA binding motif protein 5 protein-coding 148.667-146 chr16 14128492 14128802 + 0.666667 NA intron (NM_001365418, intron 3 of 5) L1ME4b|LINE|L1 57328 NM_001365417 57496 Hs.49143 NM_014048 ENSG00000186260 MRTFB MKL2|MRTF-B|NPD001 myocardin related transcription factor B protein-coding 136.667-13 chr1 216974183 216974502 + 0.666667 NA intron (NM_001134285, intron 1 of 8) L1MA4|LINE|L1 -34669 NM_001243512 2104 Hs.444225 NM_001438 ENSG00000196482 ESRRG ERR-gamma|ERR3|ERRg|ERRgamma|NR3B3 estrogen related receptor gamma protein-coding 156.333-71 chr12 19465507 19465821 + 0.666667 NA intron (NM_001114176, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 25065 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 197.333-253 chrX 83322556 83323001 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -185512 NM_000307 5456 Hs.2229 NM_000307 ENSG00000196767 POU3F4 BRAIN-4|BRN-4|BRN4|DFN3|DFNX2|OCT-9|OTF-9|OTF9 POU class 3 homeobox 4 protein-coding 142-108 chr4 99627825 99628132 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 26701 NM_001354435 285556 Hs.480371 NM_001354435 ENSG00000248713 C4orf54 FOPV chromosome 4 open reading frame 54 protein-coding 180-80 chr5 61449522 61450008 + 0.666667 NA intron (NM_020928, intron 1 of 13) intron (NM_020928, intron 1 of 13) 117507 NM_020928 57688 Hs.744939 NM_020928 ENSG00000130449 ZSWIM6 AFND|NEDMAGA zinc finger SWIM-type containing 6 protein-coding 183-39 chr14 66520714 66521053 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) L1PREC2|LINE|L1 13476 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 144.333-199 chr4 146430153 146430437 + 0.666667 NA intron (NM_001317816, intron 4 of 10) intron (NM_001317816, intron 4 of 10) 21712 NR_107003 102465837 NR_107003 ENSG00000278438 MIR7849 hsa-mir-7849 microRNA 7849 ncRNA 113-61 chr14 68646116 68646375 + 0.666667 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) L1ME4a|LINE|L1 -17458 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 161.667-42 chr11 68803798 68804240 + 0.666667 NA exon (NM_001876, exon 5 of 19) exon (NM_001876, exon 5 of 19) 37897 NM_001876 1374 Hs.503043 NM_001876 ENSG00000110090 CPT1A CPT1|CPT1-L|L-CPT1 carnitine palmitoyltransferase 1A protein-coding 181.333-195 chrX 25072813 25073200 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57041 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 146.333-29 chr10 60929171 60929473 + 0.666667 NA intron (NM_001350908, intron 2 of 11) intron (NM_001350908, intron 2 of 11) 14863 NM_001350910 9886 Hs.737374 NM_014836 ENSG00000072422 RHOBTB1 - Rho related BTB domain containing 1 protein-coding 190.333-129 chr6 52314614 52315045 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30087 NM_001366370 4172 Hs.179565 NM_002388 ENSG00000112118 MCM3 HCC5|P1-MCM3|P1.h|RLFB minichromosome maintenance complex component 3 protein-coding 115-139 chr6 135303432 135303646 + 0.666667 NA intron (NM_017651, intron 25 of 27) MIRc|SINE|MIR 64379 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 154.667-47 chr10 72147143 72147534 + 0.666667 NA intron (NM_001369099, intron 6 of 8) AluSx|SINE|Alu -58306 NM_014767 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 128.667-156 chr6 49701520 49701777 + 0.666667 NA intron (NM_001261822, intron 3 of 8) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11895 NM_001142408 7180 Hs.2042 NM_003296 ENSG00000124490 CRISP2 CRISP-2|CT36|GAPDL5|TPX1|TSP1 cysteine rich secretory protein 2 protein-coding 167.667-88 chr17 69567133 69567542 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26650 NR_109972 101928122 Hs.579342 NR_109971 ENSG00000227517 LINC01483 - long intergenic non-protein coding RNA 1483 ncRNA 154.667-345 chr6 106425615 106425908 + 0.666667 NA intron (NM_001371242, intron 1 of 21) AluSq2|SINE|Alu 31487 NR_134603 105377924 Hs.741855 NR_134603 ENSG00000282408 LOC105377924 - uncharacterized LOC105377924 ncRNA 161.333-54 chr11 116802674 116802999 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -10416 NM_052968 116519 Hs.283923 NM_052968 ENSG00000110243 APOA5 APOAV|RAP3 apolipoprotein A5 protein-coding 207.667-23 chr12 41632211 41632733 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -131717 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 150.667-71 chr11 81113081 81113522 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -350498 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 153-84 chr21 26948229 26948539 + 0.666667 NA intron (NM_007038, intron 2 of 7) intron (NM_007038, intron 2 of 7) -5577 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 147.667-161 chr2 15031295 15031602 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 398731 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 133.667-79 chr2 157411633 157411928 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR -31271 NR_034169 728066 Hs.470311 NR_034169 FAM133DP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 114-51 chr17 55640297 55640568 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 82432 NM_018286 55273 Hs.173233 NM_018286 ENSG00000166292 TMEM100 - transmembrane protein 100 protein-coding 136.667-110 chr22 28443101 28443489 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) -16574 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 150-64 chr17 78264924 78265303 + 0.666667 NA intron (NR_073178, intron 5 of 6) FRAM|SINE|Alu 13379 NR_073178 100996291 Hs.744493 NR_073178 ENSG00000204277 LINC01993 - long intergenic non-protein coding RNA 1993 ncRNA 276.667-72 chrX 54339174 54339774 + 0.666667 NA intron (NM_001002838, intron 1 of 22) L1MB8|LINE|L1 18531 NM_020922 65267 Hs.92423 NM_020922 ENSG00000196632 WNK3 PRKWNK3 WNK lysine deficient protein kinase 3 protein-coding 149.667-51 chr10 53768484 53768800 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -717588 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 125.667-54 chr14 36562768 36563032 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 19714 NM_014360 26257 Hs.234763 NM_014360 ENSG00000136327 NKX2-8 NKX2.8|NKX2H|Nkx2-9 NK2 homeobox 8 protein-coding 172.333-187 chr8 113680464 113680784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -243685 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 154.333-242 chr4 55787674 55788023 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -32155 NM_001351574 644145 Hs.570825 NM_001351574 ENSG00000250821 EXOC1L - exocyst complex component 1 like protein-coding 119.667-23 chr10 121380355 121380571 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 150851 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 151-67 chr2 183702720 183703160 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 578497 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 167.667-114 chr2 224766499 224766825 + 0.666667 NA intron (NM_001290263, intron 55 of 55) intron (NM_001290263, intron 55 of 55) 180387 NM_001290263 55619 Hs.46578 NM_014689 ENSG00000135905 DOCK10 DRIP2|Nbla10300|ZIZ3 dedicator of cytokinesis 10 protein-coding 181.667-97 chr3 138635143 138635537 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3C|LINE|L1 26291 NM_018147 55179 Hs.173438 NM_018147 ENSG00000158234 FAIM FAIM1 Fas apoptotic inhibitory molecule protein-coding 227.333-18 chr10 42475332 42475795 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_026827) promoter-TSS (NR_026827) 72 NR_026827 84856 Hs.55977 NM_032770 ENSG00000185904 LINC00839 - long intergenic non-protein coding RNA 839 ncRNA 126-82 chr4 59387720 59388001 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 374287 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 247.333-26 chr14 55066067 55066584 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_144578, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_144578, exon 4 of 4) 14678 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 161.667-9 chr1 90518053 90518379 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -139534 NR_145742 109616984 NR_145742 ENSG00000199666 SNORD3G - small nucleolar RNA, C/D box 3G snoRNA 161.667-259 chr8 112708707 112709107 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) MER89|LTR|ERV1 65414 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 111.667-122 chr19 35339779 35340058 + 0.666667 NA intron (NM_001278417, intron 5 of 12) intron (NM_001278417, intron 5 of 12) -5595 NR_049828 100847070 NR_049828 ENSG00000284034 MIR5196 mir-5196 microRNA 5196 ncRNA 125-19 chr10 121565553 121565791 + 0.666667 NA exon (NM_000141, exon 3 of 18) exon (NM_000141, exon 3 of 18) 28295 NM_001144913 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 124.333-98 chr2 177849045 177849398 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 6 of 20) intron (NM_001077197, intron 6 of 20) 39535 NM_001077196 50940 Hs.570273 NM_016953 ENSG00000128655 PDE11A PPNAD2 phosphodiesterase 11A protein-coding 114-68 chr2 41664336 41664631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -213072 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 132-60 chr2 67839292 67839648 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13908 NR_110271 101927701 Hs.348697 NR_110271 ENSG00000237013 LINC01812 - long intergenic non-protein coding RNA 1812 ncRNA 158.333-103 chr15 90908288 90908603 + 0.666667 NA intron (NR_135502, intron 8 of 22) L3|LINE|CR1 4255 NR_135504 4122 Hs.116459 NM_006122 ENSG00000196547 MAN2A2 MANA2X mannosidase alpha class 2A member 2 protein-coding 157.667-202 chr3 169708570 169709026 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -45086 NM_001366473 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 141.333-73 chr16 2491371 2491670 + 0.666667 NA intron (NM_020705, intron 1 of 6) AluJb|SINE|Alu 16393 NM_020705 57465 Hs.353087 NM_020705 ENSG00000162065 TBC1D24 DFNA65|DFNB86|DOORS|EIEE16|FIME|TLDC6 TBC1 domain family member 24 protein-coding 168.333-146 chr4 59262526 59262907 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 249143 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 188-90 chr5 93800117 93800477 + 0.666667 NA intron (NM_032042, intron 8 of 10) intron (NM_032042, intron 8 of 10) -58697 NM_153216 134187 Hs.678995 NM_153216 ENSG00000248483 POU5F2 SPRM-1 POU domain class 5, transcription factor 2 protein-coding 117.667-129 chr4 16786682 16787013 + 0.666667 NA intron (NM_001304435, intron 1 of 7) intron (NM_001304435, intron 1 of 7) 111798 NM_001130834 9079 Hs.714330 NM_001290 ENSG00000169744 LDB2 CLIM1|LDB-2|LDB1 LIM domain binding 2 protein-coding 113.667-180 chr5 162081177 162081449 + 0.666667 NA intron (NM_198904, intron 1 of 9) intron (NM_198904, intron 1 of 9) 13671 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 120.333-103 chr2 153934871 153935113 + 0.666667 NA intron (NM_052917, intron 2 of 12) HERVL40-int|LTR|ERVL -9402 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 170.667-143 chr6 49418902 49419194 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44205 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 135-118 chr9 25699025 25699263 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20286 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 140.333-165 chr4 84963702 84963992 + 0.666667 NA intron (NM_014991, intron 1 of 67) MIR|SINE|MIR -1769 NR_152775 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 120.667-26 chr11 5640179 5640504 + 0.666667 NA intron (NM_001003819, intron 10 of 13) L1M4|LINE|L1 8086 NM_130390 53840 Hs.729048 NM_021616 ENSG00000258659 TRIM34 IFP1|RNF21 tripartite motif containing 34 protein-coding 214.333-18 chr10 45809699 45810280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7335 NM_001351234 643479 Hs.522900 NM_001351234 FAM25E FAM25D family with sequence similarity 25 member E protein-coding 148-83 chr2 125457035 125457348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 660794 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 234.666-47 chr7 77840373 77841018 + 0.666667 NA intron (NM_001366085, intron 2 of 10) intron (NM_001366085, intron 2 of 10) 565 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 168-18 chr12 23984610 23985037 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -33791 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 116.333-52 chr12 26508238 26508578 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 312835 NM_005086 8082 Hs.183428 NM_005086 ENSG00000123096 SSPN DAGA5|KRAG|NSPN|SPN1|SPN2 sarcospan protein-coding 190-99 chr5 45533304 45533723 + 0.666667 NA intron (NM_021072, intron 2 of 7) intron (NM_021072, intron 2 of 7) 162867 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 132.333-32 chr11 58991729 58992104 + 0.666667 NA intron (NR_033853, intron 4 of 5) intron (NR_033853, intron 4 of 5) 48667 NM_001220496 92292 Hs.38085 NM_080661 ENSG00000166840 GLYATL1 GATF-C|GNAT glycine-N-acyltransferase like 1 protein-coding 184-20 chr12 49751018 49751423 + 0.666667 NA intron (NM_001098576, intron 1 of 9) L1MC4|LINE|L1 9411 NM_001098576 7009 Hs.743965 NM_003217 ENSG00000139644 TMBIM6 BAXI1|BI-1|TEGT transmembrane BAX inhibitor motif containing 6 protein-coding 204-102 chr2 163965869 163966330 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -230091 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 143.667-264 chr9 27526357 27526746 + 0.666667 NA TTS (NM_020124) TTS (NM_020124) 2237 NM_020124 56832 Hs.591083 NM_020124 ENSG00000147896 IFNK IFNT1|INFE1 interferon kappa protein-coding 113.667-26 chr10 102052197 102052391 + 0.666667 NA intron (NM_024541, intron 1 of 25) AluJo|SINE|Alu 3879 NM_024541 79591 Hs.16004 NM_024541 ENSG00000120029 ARMH3 C10orf76 armadillo like helical domain containing 3 protein-coding 129.667-52 chr14 24599656 24599877 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 9919 NM_033423 2999 Hs.348264 NM_033423 ENSG00000100450 GZMH CCP-X|CGL-2|CSP-C|CTLA1|CTSGL2 granzyme H protein-coding 152.333-20 chr1 160197723 160198068 + 0.666667 NA intron (NM_001231, intron 7 of 10) AluY|SINE|Alu 7320 NM_001231 844 Hs.632476 NM_001231 ENSG00000143318 CASQ1 CASQ|PDIB1|VMCQA calsequestrin 1 protein-coding 113.333-4 chr1 52376489 52376675 + 0.666667 NA intron (NM_001190818, intron 14 of 16) intron (NM_001190818, intron 14 of 16) -10377 NM_001330585 200014 Hs.591451 NM_032449 ENSG00000154222 CC2D1B - coiled-coil and C2 domain containing 1B protein-coding 122.333-202 chr8 86828376 86828710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37872 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 163-11 chr11 24612186 24612622 + 0.666667 NA intron (NM_001252008, intron 1 of 11) intron (NM_001252008, intron 1 of 11) 115351 NM_001009909 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 141-63 chr4 173667682 173667959 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 137362 NR_003679 79804 Hs.61435 NR_003679 ENSG00000237125 HAND2-AS1 DEIN|NBLA00301|UPH HAND2 antisense RNA 1 ncRNA 170.667-12 chr1 215731870 215732228 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 60 of 71) intron (NM_206933, intron 60 of 71) 164745 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 136.333-161 chr5 20145499 20145835 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) MLT2C2|LTR|ERVL -157467 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 152.333-162 chr18 72580123 72580476 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35957 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 152.667-402 chrX 65823913 65824217 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 156411 NM_002444 4478 Hs.87752 NM_002444 ENSG00000147065 MSN HEL70|IMD50 moesin protein-coding 113.667-103 chr2 68440640 68440829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26560 NR_133923 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 154.667-243 chr3 101074505 101074815 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -81170 NM_001349331 25890 Hs.477015 NM_015429 ENSG00000154175 ABI3BP NESHBP|TARSH ABI family member 3 binding protein protein-coding 150.333-59 chr11 35973975 35974271 + 0.666667 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) L1MC4a|LINE|L1 30061 NM_174902 143458 Hs.745134 NM_174902 ENSG00000179241 LDLRAD3 LRAD3 low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 protein-coding 192.333-181 chrX 49119982 49120400 + 0.666667 NA intron (NM_015698, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 3544 NM_015698 27238 Hs.503666 NM_015698 ENSG00000068394 GPKOW GPATC5|GPATCH5|Spp2|T54 G-patch domain and KOW motifs protein-coding 176.333-119 chr4 59595958 59596353 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 582582 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 179.667-109 chr5 7640590 7640971 + 0.666667 NA intron (NM_020546, intron 4 of 24) intron (NM_020546, intron 4 of 24) 210353 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 130.333-117 chr21 19538425 19538749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 361168 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 112-59 chr14 53144550 53144767 + 0.666667 NA intron (NM_030637, intron 1 of 11) intron (NM_030637, intron 1 of 11) 8665 NM_001160148 80821 Hs.125525 NM_030637 ENSG00000100523 DDHD1 PA-PLA1|PAPLA1|SPG28 DDHD domain containing 1 protein-coding 231.333-127 chr9 104566608 104566994 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2367 NM_001004483 138802 Hs.553599 NM_001004483 ENSG00000186943 OR13C8 OR37H|OR9-10 olfactory receptor family 13 subfamily C member 8 protein-coding 169-81 chr5 35402231 35402657 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -171957 NM_000949 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 189.333-112 chr20 49224623 49225145 + 0.666667 NA intron (NM_017895, intron 4 of 20) MIR|SINE|MIR 5589 NM_001348187 55661 Hs.65234 NM_017895 ENSG00000124228 DDX27 DRS1|Drs1p|HSPC259|PP3241|RHLP|dJ686N3.1 DEAD-box helicase 27 protein-coding 136-72 chr4 31850428 31850762 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -146784 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 114-15 chr11 79162620 79162921 + 0.666667 NA intron (NM_001098816, intron 3 of 33) intron (NM_001098816, intron 3 of 33) 239339 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 142.667-233 chr8 128449870 128450202 + 0.666667 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 114643 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 130.667-28 chr10 64658994 64659233 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -166415 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 145.333-4 chr1 90180158 90180457 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 185197 NM_181781 284695 Hs.306221 NM_181781 ENSG00000162664 ZNF326 ZAN75|ZIRD|Zfp326|dJ871E2.1 zinc finger protein 326 protein-coding 146.667-70 chr12 38867676 38867966 + 0.666667 NA intron (NM_153634, intron 3 of 19) intron (NM_153634, intron 3 of 19) 37770 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 188-86 chr5 12125428 12125873 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -221204 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 117-33 chr11 112945507 112945765 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15784 NM_001242607 4684 Hs.503878 NM_000615 ENSG00000149294 NCAM1 CD56|MSK39|NCAM neural cell adhesion molecule 1 protein-coding 158.333-299 chr7 44571608 44571939 + 0.666667 NA intron (NM_019082, intron 5 of 13) intron (NM_019082, intron 5 of 13) 2765 NM_019082 54606 Hs.654762 NM_019082 ENSG00000136271 DDX56 DDX21|DDX26|NOH61 DEAD-box helicase 56 protein-coding 149.333-158 chr18 48147282 48147568 + 0.666667 NA intron (NM_001371291, intron 4 of 6) MER92-int|LTR|ERV1 -10277 NM_001039360 201501 Hs.515388 NM_001039360 ENSG00000184828 ZBTB7C APM-1|APM1|ZBTB36|ZNF857C zinc finger and BTB domain containing 7C protein-coding 125.667-35 chr11 85032737 85032974 + 0.666667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) UCON8|DNA|DNA -109434 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 179-101 chr9 82159639 82160026 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 171060 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 128.667-91 chr2 81290150 81290493 + 0.666667 NA Intergenic L1M3c|LINE|L1 176625 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 229.333-100 chr5 78208988 78209434 + 0.666667 NA intron (NM_003664, intron 7 of 26) MER4B|LTR|ERV1 85487 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 126-86 chr4 137289404 137289618 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -76712 NR_149105 105377441 Hs.668386 NR_149105 LINC02511 - long intergenic non-protein coding RNA 2511 ncRNA 182.667-80 chr2 113199568 113199905 + 0.666667 NA intron (NM_012455, intron 16 of 16) MIRb|SINE|MIR 25765 NM_012455 23550 Hs.516306 NM_012455 ENSG00000125637 PSD4 EFA6B|TIC pleckstrin and Sec7 domain containing 4 protein-coding 206.667-65 chr2 136369685 136370182 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -251778 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 145.667-33 chr10 48203176 48203408 + 0.666667 NA intron (NM_001018071, intron 14 of 28) Charlie17|DNA|hAT-Charlie -28149 NM_001042512 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 146.333-365 chrX 137895904 137896288 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 329969 NM_003413 7547 Hs.111227 NM_003413 ENSG00000156925 ZIC3 HTX|HTX1|VACTERLX|ZNF203 Zic family member 3 protein-coding 156.333-217 chr22 25186420 25186716 + 0.666667 NA intron (NM_001145206, intron 9 of 10) AluJr|SINE|Alu -13290 NM_004076 1417 Hs.533022 NM_004076 ENSG00000100053 CRYBB3 CATCN2|CRYB3|CTRCT22 crystallin beta B3 protein-coding 129.333-190 chr8 123230071 123230362 + 0.666667 NA intron (NM_001204180, intron 5 of 5) intron (NM_001204180, intron 5 of 5) 11161 NM_032847 84933 Hs.707401 NM_032847 ENSG00000189376 C8orf76 - chromosome 8 open reading frame 76 protein-coding 156.333-348 chr7 133147563 133147951 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -39246 NR_133931 105375512 Hs.521205 NR_133931 LOC105375512 - uncharacterized LOC105375512 ncRNA 118-18 chr12 9369372 9369634 + 0.666667 NA non-coding (NR_120479, exon 1 of 4) non-coding (NR_120479, exon 1 of 4) 2039 NR_120479 101930452 Hs.734183 NR_120479 ENSG00000260423 LINC02367 - long intergenic non-protein coding RNA 2367 ncRNA 152.333-184 chr2 82237533 82237872 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -619101 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 245.333-9 chr1 191387369 191387906 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -159139 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 154.333-194 chr21 30642173 30642544 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001128077) promoter-TSS (NM_001128077) -506 NM_001128077 337985 Hs.580878 NM_001128077 ENSG00000206104 KRTAP20-3 KAP19D|KAP20.3|KRTAP19P4 keratin associated protein 20-3 protein-coding 137.333-146 chr5 7755537 7755838 + 0.666667 NA intron (NM_020546, intron 15 of 24) MIR|SINE|MIR 95446 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 117.333-150 chr4 46870509 46870763 + 0.666667 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) L1PA14|LINE|L1 38609 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 154.667-408 chr9 31178581 31178980 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 202710 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 114.333-230 chr8 120073015 120073311 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51939 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 113.667-88 chr19 10440872 10441096 + 0.666667 NA intron (NM_001111309, intron 1 of 14) AluSz|SINE|Alu 8549 NM_001111309 5141 Hs.89901 NM_006202 ENSG00000065989 PDE4A DPDE2|PDE4|PDE46 phosphodiesterase 4A protein-coding 223-16 chr13 92052076 92052640 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 6 of 7) LTR12|LTR|ERV1 299849 NR_120382 100873970 Hs.567269 NR_120382 GPC5-AS2 - GPC5 antisense RNA 2 ncRNA 112.667-242 chr7 17553053 17553340 + 0.666667 NA intron (NR_110013, intron 1 of 3) L1ME1|LINE|L1 5713 NR_110013 101927630 Hs.583400 NR_110013 ENSG00000236039 LOC101927630 - uncharacterized LOC101927630 ncRNA 174.333-107 chr4 106330548 106330862 + 0.666667 NA intron (NM_001142416, intron 4 of 6) L2c|LINE|L2 -13911 NM_001163436 93627 Hs.151498 NM_033115 ENSG00000145348 TBCK HSPC302|IHPRF3|TBCKL TBC1 domain containing kinase protein-coding 206.667-56 chr19 28209509 28209965 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -396951 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 167.667-38 chr11 81341023 81341358 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 549646 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 166.667-247 chrX 14120761 14121100 + 0.666667 NA Intergenic LTR40a|LTR|ERVL -91038 NM_017856 54960 Hs.592237 NM_017856 ENSG00000046647 GEMIN8 FAM51A1 gem nuclear organelle associated protein 8 protein-coding 132-96 chr5 27166557 27166832 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -128108 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 232.667-49 chr3 49640203 49640773 + 0.666667 NA intron (NM_003458, intron 2 of 11) AluSz|SINE|Alu -33863 NM_001640 327 Hs.517969 NM_001640 ENSG00000164062 APEH AARE|ACPH|APH|D3F15S2|D3S48E|DNF15S2|OPH acylaminoacyl-peptide hydrolase protein-coding 227.667-57 chr5 13108020 13108398 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75323 NR_147005 105374658 NR_147005 LINC02220 - long intergenic non-protein coding RNA 2220 ncRNA 149.333-328 chr5 174000760 174001126 + 0.666667 NA intron (NM_001144954, intron 3 of 4) intron (NM_001144954, intron 3 of 4) 11773 NM_001144954 133491 Hs.131469 NM_001144954 ENSG00000185056 C5orf47 - chromosome 5 open reading frame 47 protein-coding 168.667-220 chr8 91017278 91017733 + 0.666667 NA intron (NM_018710, intron 4 of 6) intron (NM_018710, intron 4 of 6) 23354 NM_018710 55529 Hs.202517 NM_018710 ENSG00000155099 PIP4P2 TMEM55A phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 4-phosphatase 2 protein-coding 153.667-203 chr2 163718777 163719076 + 0.666667 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 17082 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 139-99 chr7 132950376 132950700 + 0.666667 NA intron (NM_001317177, intron 4 of 8) intron (NM_001317177, intron 4 of 8) 84377 NR_037427 100500804 NR_037427 ENSG00000284135 MIR3654 - microRNA 3654 ncRNA 128.667-90 chr2 78803769 78804102 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -221767 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 156.333-229 chr3 37412284 37412584 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001302831, exon 2 of 5) 5' UTR (NM_001302831, exon 2 of 5) 1296 NM_001302832 339883 Hs.475945 NM_178339 ENSG00000198590 C3orf35 APRG1 chromosome 3 open reading frame 35 protein-coding 145 chr1 42229337 42229729 + 0.666667 NA intron (NM_001198850, intron 4 of 12) intron (NM_001198850, intron 4 of 12) -64788 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 156.667-285 chr5 134611586 134612009 + 0.666667 NA intron (NM_001033503, intron 5 of 7) intron (NM_001033503, intron 5 of 7) 21031 NM_001033503 51128 Hs.432984 NM_016103 ENSG00000152700 SAR1B ANDD|CMRD|GTBPB|SARA2 secretion associated Ras related GTPase 1B protein-coding 145.667-120 chr18 11045401 11045699 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 103212 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 150.667-226 chr22 22996002 22996402 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -74317 NM_002073 2781 Hs.584760 NM_002073 ENSG00000128266 GNAZ gz-alpha G protein subunit alpha z protein-coding 113.667-55 chr13 112936791 112936962 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 31762 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 165.667-193 chr8 10956799 10957166 + 0.666667 NA intron (NM_173683, intron 1 of 2) AluSx|SINE|Alu 78320 NR_030328 693183 NR_030328 ENSG00000207600 MIR598 MIRN598|hsa-mir-598|mir-598 microRNA 598 ncRNA 112.333-214 chr5 112151194 112151376 + 0.666667 NA intron (NM_001347887, intron 22 of 23) L1MEd|LINE|L1 -9241 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 121.333-117 chr3 141026692 141027007 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -24498 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 213-36 chr19 24346714 24347255 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -183537 NR_003603 100101266 Hs.149312 NR_003603 ENSG00000268442 HAVCR1P1 - hepatitis A virus cellular receptor 1 pseudogene 1 pseudo 287.666-9 chr5 29780691 29781441 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -99494 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 112-65 chr14 89262546 89262754 + 0.666667 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 154583 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 152.667-140 chr17 61164814 61165116 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) intron (NM_001330413, intron 23 of 25) 202739 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 112.333-69 chr14 47142690 47142906 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 4 of 16) intron (NM_001113498, intron 4 of 16) 200448 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 126.667-157 chr6 123478699 123478994 + 0.666667 NA intron (NM_001256020, intron 8 of 8) L2c|LINE|L2 39242 NR_110844 101927990 Hs.660877 NR_110844 TRDN-AS1 HRAT13 TRDN antisense RNA 1 ncRNA 120-63 chr2 45552853 45553106 + 0.666667 NA intron (NM_018079, intron 11 of 20) intron (NM_018079, intron 11 of 20) 58288 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 177-6 chr10 57526407 57526840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -222064 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 120-37 chr13 112735640 112735897 + 0.666667 NA intron (NM_032189, intron 1 of 28) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 18963 NR_109811 100874205 Hs.658692 NR_046661 ENSG00000232684 ATP11A-AS1 - ATP11A antisense RNA 1 ncRNA 151.667-194 chr21 25892282 25892651 + 0.666667 NA intron (NM_001136131, intron 14 of 15) intron (NM_001136131, intron 14 of 15) -156812 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 143.333-112 chr16 89393139 89393550 + 0.666667 NA intron (NR_045839, intron 2 of 9) AluSz|SINE|Alu -37574 NR_110932 101927817 Hs.667942 NR_110931 LOC101927817 - uncharacterized LOC101927817 ncRNA 160.667-18 chr1 153953616 153953944 + 0.666667 NA intron (NM_181715, intron 4 of 13) intron (NM_181715, intron 4 of 13) 4832 NM_181715 200186 Hs.406392 NM_181715 ENSG00000160741 CRTC2 TORC-2|TORC2 CREB regulated transcription coactivator 2 protein-coding 115.667-54 chr12 23410734 23410930 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 173754 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 183.333-54 chr15 61999033 61999473 + 0.666667 NA intron (NM_001018088, intron 16 of 81) AluSx|SINE|Alu 61194 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 117-38 chr12 122942500 122942800 + 0.666667 NA intron (NM_019624, intron 6 of 10) AluSz|SINE|Alu 23813 NM_001243013 23457 Hs.511951 NM_019624 ENSG00000150967 ABCB9 EST122234|TAPL ATP binding cassette subfamily B member 9 protein-coding 166-62 chr2 69022431 69022745 + 0.666667 NA intron (NM_032208, intron 1 of 17) intron (NM_032208, intron 1 of 17) 9444 NM_018153 84168 Hs.165859 NM_018153 ENSG00000169604 ANTXR1 ATR|GAPO|TEM8 ANTXR cell adhesion molecule 1 protein-coding 112.667-213 chr5 53607798 53608009 + 0.666667 NA intron (NR_134474, intron 3 of 5) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 47264 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 138.667-141 chr3 186231148 186231413 + 0.666667 NA intron (NM_001346, intron 20 of 24) L3b|LINE|CR1 -122191 NM_004454 2119 Hs.43697 NM_004454 ENSG00000244405 ETV5 ERM ETS variant 5 protein-coding 111.667-149 chr2 237935364 237935659 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31434 NM_001278308 140739 Hs.471785 NM_080678 ENSG00000184182 UBE2F NCE2 ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) protein-coding 161-37 chr2 34307080 34307447 + 0.666667 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 240037 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 160.333-86 chr13 48018560 48018971 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -17439 NM_003850 8803 Hs.743361 NM_003850 ENSG00000136143 SUCLA2 A-BETA|A-SCS|MTDPS5|SCS-betaA succinate-CoA ligase ADP-forming beta subunit protein-coding 131.667-89 chr2 46575501 46575838 + 0.666667 NA intron (NR_104182, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 4569 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 136.333-81 chr18 7168053 7168319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50389 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 217.667-8 chr1 188775395 188775851 + 0.666667 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 1331995 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 186.333-85 chr2 190283310 190283810 + 0.666667 NA intron (NM_198047, intron 6 of 12) LTR10F|LTR|ERV1 36266 NM_198047 26275 Hs.656685 NM_014362 ENSG00000198130 HIBCH HIBYLCOAH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase protein-coding 140-54 chr2 12595747 12596087 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -120955 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 121.667-111 chr20 35195119 35195473 + 0.666667 NA intron (NM_001355008, intron 4 of 14) L1MEf|LINE|L1 23224 NM_006404 10544 Hs.647450 NM_006404 ENSG00000101000 PROCR CCCA|CCD41|EPCR protein C receptor protein-coding 130.333-176 chr5 171713533 171713823 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -72194 NM_001289970 644994 Hs.591740 NM_001289970 ENSG00000185662 SMIM23 C5orf50 small integral membrane protein 23 protein-coding 116-91 chr2 191591527 191591729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86444 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 145-132 chrX 45854023 45854435 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2739 NR_125365 401585 Hs.633348 NR_125365 ENSG00000231566 LINC02595 - long intergenic non-protein coding RNA 2595 ncRNA 132-64 chr2 132009225 132009514 + 0.666667 NA intron (NR_146485, intron 2 of 6) (CTTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 28531 NR_146484 101928067 NR_146484 LINC01945 - long intergenic non-protein coding RNA 1945 ncRNA 212-119 chr4 90431006 90431465 + 0.666667 NA intron (NM_207491, intron 4 of 7) intron (NM_207491, intron 4 of 7) 196204 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 160.667-234 chr4 172847764 172848092 + 0.666667 NA intron (NM_001034845, intron 7 of 12) L2|LINE|L2 -121050 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 120-29 chr12 39495279 39495554 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52296 NM_001173465 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 117-54 chr16 65248885 65249064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72401 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 117.333-16 chr1 178474069 178474326 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_170692, exon 18 of 18) 3' UTR (NM_170692, exon 18 of 18) -38912 NM_032126 84066 Hs.534501 NM_032126 ENSG00000240021 TEX35 C1orf49|TSC24 testis expressed 35 protein-coding 130-50 chr18 7304473 7304738 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 73501 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 124.333-152 chr5 151605581 151605802 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -36747 NM_001447 2196 Hs.591255 NM_001447 ENSG00000086570 FAT2 CDHF8|CDHR9|HFAT2|MEGF1|SCA45 FAT atypical cadherin 2 protein-coding 117.667-161 chr6 36484654 36484854 + 0.666667 NA exon (NM_173562, exon 7 of 8) exon (NM_173562, exon 7 of 8) 41754 NM_173562 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 120.333-116 chr20 19889567 19889787 + 0.666667 NA intron (NM_001242581, intron 2 of 11) intron (NM_001242581, intron 2 of 11) 111 NM_018993 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 125.667-178 chr7 89400000 89400219 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -604372 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 126-76 chr3 149984195 149984427 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001079809) promoter-TSS (NM_001079809) -945 NM_001079809 653659 Hs.652908 NM_001079809 TMEM183B C1ORF37DUP|C1orf37-DUP transmembrane protein 183B protein-coding 155.333-137 chr17 57631196 57631576 + 0.666667 NA intron (NM_001322250, intron 10 of 13) intron (NM_001322250, intron 10 of 13) -22974 NR_110807 101927539 Hs.680439 NR_110807 ENSG00000263499 LOC101927539 - uncharacterized LOC101927539 ncRNA 150.667-62 chr11 27252037 27252469 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -32140 NR_125767 103695435 Hs.196133 NR_125766 ENSG00000254560 BBOX1-AS1 - BBOX1 antisense RNA 1 ncRNA 152.333-41 chr10 43791930 43792307 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1701 NR_002726 10151 Hs.632956 NR_002726 HNRNPA3P1 D10S102|FBRNP|HNRPA3|HNRPA3P1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 1 pseudo 170.667-20 chr10 88951668 88951999 + 0.666667 NA intron (NM_001320855, intron 1 of 8) intron (NM_001320855, intron 1 of 8) 940 NM_001613 59 Hs.500483 NM_001613 ENSG00000107796 ACTA2 ACTSA actin alpha 2, smooth muscle protein-coding 210-75 chr2 174149064 174149492 + 0.666667 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) L2|LINE|L2 99254 NM_001011708 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 244.666-9 chr10 72088841 72089541 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001244950) promoter-TSS (NM_001244950) -159 NM_014767 9806 Hs.523009 NM_014767 ENSG00000107742 SPOCK2 testican-2 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 protein-coding 166.333-190 chr5 114904678 114905019 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -131435 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 164.333-36 chr10 120856027 120856453 + 0.666667 NA intron (NM_018117, intron 2 of 28) L1MEf|LINE|L1 4878 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 166.333-237 chr9 28468542 28468851 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) L1M4c|LINE|L1 250609 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 115.667-103 chr18 3273187 3273417 + 0.666667 NA intron (NM_001144944, intron 2 of 3) intron (NM_001144944, intron 2 of 3) 10583 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 150.333-116 chr14 66906166 66906606 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) L1MA4|LINE|L1 -283054 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 133.333-164 chr6 110483697 110483932 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -7201 NM_033125 85413 Hs.520319 NM_033125 ENSG00000004809 SLC22A16 CT2|FLIPT2|HEL-S-18|OAT6|OCT6|OKB1|dJ261K5.1 solute carrier family 22 member 16 protein-coding 123-119 chr8 20495393 20495604 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 119428 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 121.667-148 chr4 128514998 128515228 + 0.666667 NA intron (NR_125882, intron 7 of 8) L1MEd|LINE|L1 87097 NR_125882 100507487 Hs.549644 NR_125882 ENSG00000251432 LINC02615 - long intergenic non-protein coding RNA 2615 ncRNA 113.667-127 chr22 26135849 26136155 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33460 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 114.333-37 chr11 19328786 19329074 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21794 NM_001111018 89797 Hs.64341 NM_145117 ENSG00000166833 NAV2 HELAD1|POMFIL2|RAINB1|STEERIN2|UNC53H2 neuron navigator 2 protein-coding 146-92 chr3 195435144 195435468 + 0.666667 NA intron (NM_012287, intron 1 of 22) AluSg|SINE|Alu 7714 NM_012287 23527 Hs.593373 NM_012287 ENSG00000114331 ACAP2 CENTB2|CNT-B2 ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 protein-coding 187-50 chr3 78142347 78142901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93661 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 113-101 chr2 40729346 40729546 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -217011 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 127-18 chr10 53474509 53474734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -702921 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 177.667-66 chr18 42059365 42059738 + 0.666667 NA intron (NM_001308020, intron 21 of 23) intron (NM_001308020, intron 21 of 23) 104317 NM_001308020 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 289-21 chr4 88022728 88023455 + 0.666667 NA intron (NR_156488, intron 2 of 13) (AAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 15456 NR_156488 5311 Hs.181272 NM_000297 ENSG00000118762 PKD2 APKD2|PC2|PKD4|Pc-2|TRPP2 polycystin 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 112-23 chr10 118617657 118617978 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22169 NM_004248 2834 Hs.248119 NM_004248 ENSG00000119973 PRLHR GPR10|GR3|PrRPR prolactin releasing hormone receptor protein-coding 212.333-106 chr4 85751411 85751924 + 0.666667 NA intron (NM_001025616, intron 3 of 9) intron (NM_001025616, intron 3 of 9) -27131 NM_001042669 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 137.333-131 chr4 37553444 37553808 + 0.666667 NA intron (NM_001104629, intron 1 of 3) MER104|DNA|TcMar-Tc2 -30607 NM_018302 55286 Hs.107527 NM_018302 ENSG00000154274 C4orf19 - chromosome 4 open reading frame 19 protein-coding 137.333-59 chr16 47451900 47452194 + 0.666667 NA intron (NM_030790, intron 4 of 17) intron (NM_030790, intron 4 of 17) 9016 NM_030790 81533 Hs.42217 NM_030790 ENSG00000129636 ITFG1 2310047C21Rik|CDA08|LNKN-1|TIP integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 protein-coding 162.333-154 chr22 49556542 49556879 + 0.666667 NA intron (NR_110523, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 -13244 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 147.333-125 chr15 80602883 80603316 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21996 NR_049837 100847042 NR_049837 ENSG00000284059 MIR5572 - microRNA 5572 ncRNA 127.333-71 chr18 73541483 73541860 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 216730 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 120.333 chr1 17122944 17123151 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3596 NM_007365 11240 Hs.33455 NM_007365 ENSG00000117115 PADI2 PAD-H19|PAD2|PDI2 peptidyl arginine deiminase 2 protein-coding 153-118 chr6 51248167 51248472 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -373551 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 151-113 chr5 165842849 165843155 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 1083368 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 149.667-176 chr19 30126058 30126354 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 183967 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 122.333-117 chr2 235406160 235406451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87738 NM_014914 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 121-94 chr3 84286123 84286444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 583292 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 146.333-191 chr22 44038837 44039210 + 0.666667 NA intron (NM_001243386, intron 1 of 11) L1ME2z|LINE|L1 12719 NM_001243386 29780 Hs.475074 NM_013327 ENSG00000188677 PARVB CGI-56 parvin beta protein-coding 124.667-50 chr12 103396696 103396953 + 0.666667 NA intron (NR_103526, intron 3 of 10) L2|LINE|L2 99144 NM_198521 374470 Hs.534649 NM_198521 ENSG00000179088 C12orf42 - chromosome 12 open reading frame 42 protein-coding 123-64 chr2 120348744 120349031 + 0.666667 NA intron (NM_002193, intron 1 of 1) intron (NM_002193, intron 1 of 1) 2751 NM_002193 3625 Hs.1735 NM_002193 ENSG00000163083 INHBB - inhibin subunit beta B protein-coding 136.667-129 chr4 72764484 72764843 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -195442 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 162.333-87 chr16 23264686 23265049 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -37435 NM_000336 6338 Hs.414614 NM_000336 ENSG00000168447 SCNN1B BESC1|ENaCb|ENaCbeta|LIDLS1|SCNEB sodium channel epithelial 1 beta subunit protein-coding 143.333-295 chr8 130117232 130117519 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 21 of 29) MIR|SINE|MIR -32607 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 131-80 chr5 109925411 109925628 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42337 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 158.667-69 chr11 125976258 125976670 + 0.666667 NA intron (NM_016952, intron 18 of 19) intron (NM_016952, intron 18 of 19) 30408 NM_001365077 338667 Hs.730137 NM_001365077 VSIG10L2 - V-set and immunoglobulin domain containing 10 like 2 protein-coding 115-121 chr4 93645510 93645754 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -183121 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 228.333-38 chr17 72443859 72444384 + 0.666667 NA intron (NR_036488, intron 1 of 3) AluSg|SINE|Alu 101310 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 253.667-4 chr1 95221564 95222056 + 0.666667 NA non-coding (NR_125948, exon 2 of 5) non-coding (NR_125948, exon 2 of 5) 12172 NR_125949 101928118 Hs.656443 NR_125948 ENSG00000226026 LOC101928118 - uncharacterized LOC101928118 ncRNA 144.667-314 chr8 133398305 133398720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101208 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 126.667-66 chr17 73606628 73606887 + 0.666667 NA intron (NM_001144952, intron 1 of 44) intron (NM_001144952, intron 1 of 44) 37688 NM_001144952 54549 Hs.435719 NM_019064 ENSG00000069188 SDK2 - sidekick cell adhesion molecule 2 protein-coding 183-78 chr4 8143883 8144261 + 0.666667 NA intron (NM_001130084, intron 1 of 19) intron (NM_001130084, intron 1 of 19) 14741 NM_001130088 84448 Hs.233404 NM_032432 ENSG00000163995 ABLIM2 - actin binding LIM protein family member 2 protein-coding 113-94 chr19 37442349 37442566 + 0.666667 NA intron (NM_152484, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 24987 NM_152484 148266 Hs.511848 NM_152484 ENSG00000196437 ZNF569 ZAP1|ZNF zinc finger protein 569 protein-coding 153-14 chr10 72743837 72744281 + 0.666667 NA intron (NR_073062, intron 3 of 9) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 23030 NR_039823 100616286 NR_039823 ENSG00000266719 MIR4676 - microRNA 4676 ncRNA 116.667-212 chr8 137176202 137176529 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 237223 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 150-61 chr17 65606039 65606368 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -44555 NM_001363813 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 117.667-181 chr7 80346406 80346657 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27908 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 147-104 chr5 9022093 9022414 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 31642 NR_039779 100616326 NR_039779 ENSG00000266415 MIR4636 mir-4636 microRNA 4636 ncRNA 141-25 chr14 38245155 38245464 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 10784 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 148-131 chr5 63851191 63851485 + 0.666667 NA Intergenic LTR41B|LTR|ERVL 110954 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 147.667-368 chr8 115012113 115012460 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 655727 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 130-23 chr11 65850388 65850741 + 0.666667 NA intron (NM_152760, intron 5 of 12) intron (NM_152760, intron 5 of 12) 7616 NM_005507 1072 Hs.170622 NM_005507 ENSG00000172757 CFL1 CFL|HEL-S-15|cofilin cofilin 1 protein-coding 169.667-8 chr1 154308028 154308502 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -12828 NM_080429 89872 Hs.259048 NM_080429 ENSG00000143595 AQP10 AQPA_HUMAN aquaporin 10 protein-coding 207.667-69 chr21 28093988 28094506 + 0.666667 NA intron (NR_126011, intron 1 of 2) intron (NR_126011, intron 1 of 2) 3844 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 213-43 chr2 169805813 169806236 + 0.666667 NA intron (NM_003142, intron 4 of 11) AluJb|SINE|Alu 6722 NM_001294145 6741 Hs.632535 NM_003142 ENSG00000138385 SSB LARP3|La|La/SSB small RNA binding exonuclease protection factor La protein-coding 123-8 chr1 105297648 105297997 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 321113 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 193.666-17 chr15 41077458 41078015 + 0.666667 NA intron (NM_017553, intron 9 of 35) AluJb|SINE|Alu 38510 NR_104038 54617 Hs.292949 NM_017553 ENSG00000128908 INO80 INO80A|INOC1 INO80 complex ATPase subunit protein-coding 112-189 chr7 25817101 25817306 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27084 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 167.667-77 chr16 89502597 89503005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5587 NM_001363850 6687 Hs.185597 NM_003119 ENSG00000197912 SPG7 CAR|CMAR|PGN|SPG5C SPG7 matrix AAA peptidase subunit, paraplegin protein-coding 153.667-87 chr12 25567730 25568084 + 0.666667 NA intron (NM_001352234, intron 1 of 8) MSTB-int|LTR|ERVL-MaLR -14624 NM_001145729 160492 Hs.44647 NM_152590 ENSG00000152936 LMNTD1 IFLTD1|LMNARS1|PAS1C1 lamin tail domain containing 1 protein-coding 149.333-144 chr17 58119713 58120119 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35238 NM_012374 26689 Hs.531188 NM_012374 ENSG00000141194 OR4D1 OR17-23|OR4D3|OR4D4P|TPCR16 olfactory receptor family 4 subfamily D member 1 protein-coding 206-89 chr2 141014108 141014549 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 13 of 90) intron (NM_018557, intron 13 of 90) -427643 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 189-79 chr6 46288281 46288652 + 0.666667 NA intron (NR_125838, intron 1 of 3) intron (NR_125838, intron 1 of 3) 12142 NR_125838 101926915 Hs.575377 NR_125838 LOC101926915 - uncharacterized LOC101926915 ncRNA 157.667-61 chr11 103640432 103640714 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -209333 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 142.333-31 chr10 121393562 121393895 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 137586 NM_001320654 2263 Hs.533683 NM_000141 ENSG00000066468 FGFR2 BBDS|BEK|BFR-1|CD332|CEK3|CFD1|ECT1|JWS|K-SAM|KGFR|TK14|TK25 fibroblast growth factor receptor 2 protein-coding 162-50 chr16 70465156 70465634 + 0.666667 NA intron (NM_145059, intron 4 of 23) AluJb|SINE|Alu 10800 NM_145059 197258 Hs.7907 NM_145059 ENSG00000157353 FCSK 1110046B12Rik|CDGF2|FUK fucose kinase protein-coding 143.333-281 chr8 32400953 32401347 + 0.666667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) L1PA15|LINE|L1 -39596 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 128.333-64 chr15 63901680 63901978 + 0.666667 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -26445 NR_120344 101928988 Hs.673214 NR_120344 ENSG00000259351 LOC101928988 - uncharacterized LOC101928988 ncRNA 221.333-77 chr2 231158830 231159362 + 0.666667 NA intron (NM_001191037, intron 19 of 23) intron (NM_001191037, intron 19 of 23) -34054 NM_001320758 3357 Hs.421649 NM_000867 ENSG00000135914 HTR2B 5-HT(2B)|5-HT-2B|5-HT2B 5-hydroxytryptamine receptor 2B protein-coding 236-57 chr3 103369337 103369835 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 154530 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 129.333-11 chr1 229423908 229424271 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10007 NM_001100 58 Hs.1288 NM_001100 ENSG00000143632 ACTA1 ACTA|ASMA|CFTD|CFTD1|CFTDM|MPFD|NEM1|NEM2|NEM3|SHPM actin alpha 1, skeletal muscle protein-coding 129.333-46 chr12 20058434 20058672 + 0.666667 NA intron (NR_040098, intron 2 of 2) intron (NR_040098, intron 2 of 2) 43868 NR_040098 100506393 Hs.658356 NR_040098 ENSG00000256287 LINC02398 - long intergenic non-protein coding RNA 2398 ncRNA 147.667-300 chr6 1915841 1916280 + 0.666667 NA intron (NM_001253846, intron 7 of 10) intron (NM_001253846, intron 7 of 10) 259931 NM_001253846 2762 Hs.144496 NM_001500 ENSG00000112699 GMDS GMD|SDR3E1 GDP-mannose 4,6-dehydratase protein-coding 173-69 chr5 5655939 5656317 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 233451 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 139.333-3 chr1 56362567 56362828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52266 NR_147163 105378744 Hs.183974 NR_147163 ENSG00000223956 LINC01767 - long intergenic non-protein coding RNA 1767 ncRNA 117.667-35 chr12 30634799 30635038 + 0.666667 NA intron (NM_006390, intron 22 of 24) L1MA7|LINE|L1 42326 NM_001190995 10526 Hs.505136 NM_006390 ENSG00000133704 IPO8 RANBP8 importin 8 protein-coding 225.333-17 chr10 73212086 73212604 + 0.666667 NA intron (NM_173348, intron 7 of 13) AluSq2|SINE|Alu 34910 NM_015190 23234 Hs.408577 NM_015190 ENSG00000213551 DNAJC9 HDJC9|JDD1|SB73 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C9 protein-coding 159-27 chr11 86349049 86349392 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -25516 NM_021827 60494 Hs.144913 NM_021827 ENSG00000149201 CCDC81 - coiled-coil domain containing 81 protein-coding 129.333-147 chr5 22500752 22501058 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 2 of 14) intron (NM_004061, intron 2 of 14) -287055 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 122.333-207 chr8 115118768 115119036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 549111 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 181.333-11 chr10 31096006 31096522 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64327 NM_182755 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 119.667-77 chr18 34013549 34013905 + 0.666667 NA intron (NM_001353232, intron 6 of 9) intron (NM_001353232, intron 6 of 9) 34885 NM_001198549 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 152.333-26 chr1 181304469 181304774 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 68233 NR_046249 100287948 Hs.742594 NR_046249 ENSG00000179452 LINC01699 GM140 long intergenic non-protein coding RNA 1699 ncRNA 150-36 chr13 48030143 48030511 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -7240 NM_001304745 55270 Hs.144407 NM_018283 ENSG00000136159 NUDT15 MTH2|NUDT15D nudix hydrolase 15 protein-coding 169-70 chr3 133387204 133387639 + 0.666667 NA intron (NM_023943, intron 4 of 5) intron (NM_023943, intron 4 of 5) -12635 NM_003571 8419 Hs.659862 NM_003571 ENSG00000170819 BFSP2 CP47|CP49|CTRCT12|LIFL-L|PHAKOSIN beaded filament structural protein 2 protein-coding 138.333-2 chr1 25966087 25966329 + 0.666667 NA intron (NM_000437, intron 10 of 10) L1PB4|LINE|L1 31855 NM_000437 5051 Hs.477083 NM_000437 ENSG00000158006 PAFAH2 HSD-PLA2 platelet activating factor acetylhydrolase 2 protein-coding 170.667-130 chr5 26170209 26170656 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 868154 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 147.667-72 chr12 48292232 48292521 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36604 NM_181788 341567 Hs.155833 NM_181788 ENSG00000187166 H1FNT H1.7|H1T2 H1 histone family member N, testis specific protein-coding 185.333-66 chr17 67495474 67495898 + 0.666667 NA intron (NM_181671, intron 1 of 9) L1PREC2|LINE|L1 -24101 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 117.333 chr1 12346896 12347148 + 0.666667 NA intron (NM_015378, intron 44 of 69) intron (NM_015378, intron 44 of 69) 116992 NM_018156 55187 Hs.439381 NM_015378 ENSG00000048707 VPS13D SCAR4 vacuolar protein sorting 13 homolog D protein-coding 243-73 chr8 131935089 131935661 + 0.666667 NA intron (NM_001323557, intron 1 of 22) L2c|LINE|L2 18602 NM_001323557 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 142.333-21 chr10 51092844 51093239 + 0.666667 NA intron (NM_006258, intron 1 of 17) intron (NM_006258, intron 1 of 17) 18554 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 151.667-164 chr2 65859761 65860209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -427386 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 144.333-40 chr11 87448248 87448653 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 270961 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 195-54 chr18 35699199 35699693 + 0.666667 NA intron (NM_020474, intron 8 of 10) intron (NM_020474, intron 8 of 10) 44877 NM_020474 2589 Hs.514806 NM_020474 ENSG00000141429 GALNT1 GALNAC-T1 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1 protein-coding 125.667-182 chr8 23293137 23293484 + 0.666667 NA exon (NM_001136108, exon 6 of 8) exon (NM_001136108, exon 6 of 8) 5202 NM_001136108 203069 Hs.458644 NM_001136108 ENSG00000104679 R3HCC1 - R3H domain and coiled-coil containing 1 protein-coding 112.333-142 chr2 207566985 207567192 + 0.666667 NA intron (NM_001371426, intron 4 of 8) intron (NM_001371426, intron 4 of 8) 7966 NM_001371428 131-114 chrX 96679462 96679690 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5087 NM_007309 1730 Hs.226483 NM_006729 ENSG00000147202 DIAPH2 DIA|DIA2|DRF2|POF|POF2|POF2A diaphanous related formin 2 protein-coding 119.333-43 chr10 113266689 113266976 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 137561 NM_001349870 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 171.333-2 chr1 13542234 13542693 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -28460 NM_001010847 126755 Hs.657356 NM_001010847 ENSG00000162494 LRRC38 - leucine rich repeat containing 38 protein-coding 155.333-306 chr5 120188245 120188556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -275878 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 196-58 chr15 90421368 90421807 + 0.666667 NA intron (NM_003870, intron 2 of 37) intron (NM_003870, intron 2 of 37) 33345 NM_003870 8826 Hs.430551 NM_003870 ENSG00000140575 IQGAP1 HUMORFA01|SAR1|p195 IQ motif containing GTPase activating protein 1 protein-coding 130.667-211 chrX 65123647 65123956 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -89060 NM_001178032 55906 Hs.28249 NM_018684 ENSG00000126970 ZC4H2 HCA127|KIAA1166|MRXS4|WRWF|WWS zinc finger C4H2-type containing protein-coding 245.667-5 chr10 57086012 57086539 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 218284 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 141.333-79 chr17 61549364 61549755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 41660 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 114.667-189 chr4 37720547 37720885 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -34340 NM_001085399 768211 Hs.283378 NM_001085399 ENSG00000181826 RELL1 - RELT like 1 protein-coding 142.667-3 chr1 62407892 62408153 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -28282 NM_001017415 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 120.667-117 chr3 133708977 133709201 + 0.666667 NA intron (NM_001354703, intron 4 of 22) LTR67B|LTR|ERVL -37304 NM_001063 7018 Hs.518267 NM_001063 ENSG00000091513 TF HEL-S-71p|PRO1557|PRO2086|TFQTL1 transferrin protein-coding 165.667-116 chr22 34705436 34705776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 292310 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 120.667-34 chr11 129503196 129503458 + 0.666667 NA Intergenic LTR67B|LTR|ERVL 113942 NR_120582 101929557 Hs.385785 NR_120582 ENSG00000281097 LINC01395 - long intergenic non-protein coding RNA 1395 ncRNA 189.333-73 chr17 59810536 59810906 + 0.666667 NA intron (NM_001329400, intron 6 of 9) intron (NM_001329400, intron 6 of 9) -30545 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 116.333-169 chr5 36913122 36913342 + 0.666667 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) L1MC4|LINE|L1 36463 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 170.333-23 chr10 3623724 3624027 + 0.666667 NA intron (NR_131187, intron 1 of 1) intron (NR_131187, intron 1 of 1) -121037 NR_155745 101927880 NR_155743 LINC02669 - long intergenic non-protein coding RNA 2669 ncRNA 116-93 chr20 47297811 47298124 + 0.666667 NA TTS (NM_001281769) TTS (NM_001281769) -20535 NR_024594 100131496 Hs.662547 NR_024594 ENSG00000267882 LOC100131496 - uncharacterized LOC100131496 ncRNA 137.667-66 chr15 60208411 60208669 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 189446 NM_001136015 302 Hs.511605 NM_004039 ENSG00000182718 ANXA2 ANX2|ANX2L4|CAL1H|HEL-S-270|LIP2|LPC2|LPC2D|P36|PAP-IV annexin A2 protein-coding 112-56 chr14 33706616 33706909 + 0.666667 NA intron (NM_001165893, intron 5 of 10) MIR|SINE|MIR -2175 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 187.667-151 chr9 100511541 100511962 + 0.666667 NA intron (NM_001198812, intron 3 of 9) intron (NM_001198812, intron 3 of 9) 38602 NM_003692 8577 Hs.598100 NM_003692 ENSG00000241697 TMEFF1 C9orf2|CT120.1|H7365|TR-1 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 1 protein-coding 167.667-15 chr1 220514580 220514951 + 0.666667 NA Intergenic Charlie10|DNA|hAT-Charlie -13371 NM_001286128 4139 Hs.497806 NM_018650 ENSG00000116141 MARK1 MARK|Par-1c|Par1c microtubule affinity regulating kinase 1 protein-coding 166.333-116 chr2 70338965 70339296 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37063 NM_001329755 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 184-42 chr17 34952167 34952557 + 0.666667 NA intron (NM_006584, intron 4 of 13) MIR3|SINE|MIR 9098 NM_001193529 10693 Hs.73072 NM_006584 ENSG00000132141 CCT6B CCT-zeta-2|CCTZ-2|Cctz2|TCP-1-zeta-2|TSA303 chaperonin containing TCP1 subunit 6B protein-coding 230.333-52 chr19 18549695 18550157 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -6353 NM_012181 23770 Hs.173464 NM_012181 ENSG00000105701 FKBP8 FKBP38|FKBPr38 FKBP prolyl isomerase 8 protein-coding 255.667-88 chr9 99845671 99846090 + 0.666667 NA intron (NM_006981, intron 6 of 7) intron (NM_006981, intron 6 of 7) 23995 NM_006981 8013 Hs.279522 NM_006981 ENSG00000119508 NR4A3 CHN|CSMF|MINOR|NOR1|TEC nuclear receptor subfamily 4 group A member 3 protein-coding 144.333-218 chr5 104767513 104767783 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -331826 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 318.333-8 chr12 39656535 39657151 + 0.666667 NA intron (NM_001031748, intron 7 of 12) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 30660 NM_001031748 283461 Hs.648205 NM_001031748 ENSG00000180116 C12orf40 HEL-206|HEL-S-94 chromosome 12 open reading frame 40 protein-coding 253.333-78 chr4 85547831 85548431 + 0.666667 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) L1MC4|LINE|L1 72981 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 174.333-97 chr4 12422569 12423068 + 0.666667 NA Intergenic MER4-int|LTR|ERV1 199367 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 136.333-125 chr3 34291356 34291667 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 492881 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 198-28 chr11 59736150 59736714 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -12380 NR_045005 81343 Hs.741974 NR_045005 ENSG00000255538 OR10V2P - olfactory receptor family 10 subfamily V member 2 pseudogene pseudo 113-175 chr5 146501713 146501888 + 0.666667 NA intron (NM_006706, intron 16 of 21) intron (NM_006706, intron 16 of 21) 14313 NM_194251 134391 Hs.483732 NM_194251 ENSG00000173250 GPR151 GALR4|GALRL|GPCR|GPCR-2037|PGR7 G protein-coupled receptor 151 protein-coding 179-87 chr6 82407026 82407478 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43008 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 131.667-153 chr5 3579877 3580164 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -15812 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 116.667-213 chr8 144848129 144848331 + 0.666667 NA TTS (NM_001330623) TTS (NM_001330623) 4818 NM_001081004 28991 Hs.493218 NM_014066 ENSG00000170619 COMMD5 HCARG|HT002 COMM domain containing 5 protein-coding 119.333-224 chr8 131512775 131513004 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -391204 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 173.333-137 chr3 185093873 185094266 + 0.666667 NA intron (NM_001025266, intron 1 of 1) MER2|DNA|TcMar-Tigger 58991 NM_001025266 285382 Hs.245793 NM_001025266 ENSG00000187068 C3orf70 - chromosome 3 open reading frame 70 protein-coding 219.667 chr1 43157957 43158363 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10256 NM_001101376 440585 Hs.657614 NM_001101376 ENSG00000186973 FAM183A - family with sequence similarity 183 member A protein-coding 219-40 chr18 3380951 3381326 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -30579 NR_146506 105371964 Hs.105326 NR_146506 ENSG00000259256 LINC01895 - long intergenic non-protein coding RNA 1895 ncRNA 149.333-212 chr2 240377169 240377491 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58333 NM_002081 2817 Hs.328232 NM_002081 ENSG00000063660 GPC1 glypican glypican 1 protein-coding 195-47 chr16 84628706 84629263 + 0.666667 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -10906 NM_021149 23406 Hs.289092 NM_021149 ENSG00000103187 COTL1 CLP coactosin like F-actin binding protein 1 protein-coding 202.333-76 chr17 64436426 64436928 + 0.666667 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -12438 NM_001291317 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 173-87 chr7 25600183 25600568 + 0.666667 NA intron (NR_157815, intron 3 of 4) intron (NR_157815, intron 3 of 4) 62765 NR_157826 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 153.333-342 chr5 128437614 128437971 + 0.666667 NA intron (NM_001999, intron 7 of 64) (TAGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 100453 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 137-63 chr3 110133332 110133620 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 530648 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 176-41 chr17 49616146 49616664 + 0.666667 NA intron (NM_001007230, intron 7 of 11) intron (NM_001007230, intron 7 of 11) 10184 NM_001370732 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 247.333-86 chr8 104464233 104464643 + 0.666667 NA intron (NM_001385, intron 1 of 9) intron (NM_001385, intron 1 of 9) 2617 NM_001385 1807 Hs.443161 NM_001385 ENSG00000147647 DPYS DHP|DHPase dihydropyrimidinase protein-coding 113.667-10 chr1 95346684 95346872 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5329 NR_146486 101928169 NR_146486 LINC01650 - long intergenic non-protein coding RNA 1650 ncRNA 166.667-76 chr15 66918110 66918452 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 38234 NR_135687 102723481 Hs.512978 NR_135687 ENSG00000259289 LINC02206 - long intergenic non-protein coding RNA 2206 ncRNA 197-93 chr5 73981807 73982343 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 168529 NM_001244364 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 138.333-129 chr4 31514016 31514299 + 0.666667 NA intron (NR_149121, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 7613 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 113-159 chr4 84749371 84749563 + 0.666667 NA intron (NM_014991, intron 36 of 67) MER6B|DNA|TcMar-Tigger 166340 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 167.667-40 chr11 94018035 94018458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3108 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 180-24 chr12 1742576 1742910 + 0.666667 NA intron (NM_024551, intron 1 of 7).2 MER2|DNA|TcMar-Tigger 51673 NM_024551 79602 Hs.371642 NM_024551 ENSG00000006831 ADIPOR2 ACDCR2|PAQR2 adiponectin receptor 2 protein-coding 167.333-118 chr18 11740586 11740974 + 0.666667 NA intron (NM_182978, intron 1 of 11) intron (NM_182978, intron 1 of 11) -10692 NM_001261443 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 314.333-3 chr10 19934300 19935160 + 0.666667 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 118298 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 148-76 chr2 52156583 52156901 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -213906 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 153.333-14 chr1 104527048 104527355 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 454178 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 112.667-263 chr8 70908738 70909010 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 239535 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 144.333-158 chr3 524374 524657 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -67590 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 142.333-78 chr14 40614678 40615041 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -339852 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 142-24 chr12 31730686 31731040 + 0.666667 NA Intergenic MER65D|LTR|ERV1 -1689 NR_103522 196394 Hs.585084 NM_001113402 ENSG00000151743 AMN1 - antagonist of mitotic exit network 1 homolog protein-coding 112.667-79 chr15 101529392 101529716 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39570 NM_138319 5046 Hs.498494 NM_002570 ENSG00000140479 PCSK6 PACE4|SPC4 proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 protein-coding 121.333-31 chr11 58476210 58476567 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 31717 NM_001005218 219968 Hs.553647 NM_001005218 ENSG00000198283 OR5B21 - olfactory receptor family 5 subfamily B member 21 protein-coding 240-28 chr15 60498887 60499438 + 0.666667 NA intron (NM_134260, intron 11 of 11) intron (NM_134260, intron 11 of 11) 19984 NR_120341 101928784 Hs.655155 NR_120339 ENSG00000245534 RORA-AS1 - RORA antisense RNA 1 ncRNA 161-22 chr14 48387008 48387334 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -592157 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 202-115 chr3 72990690 72991093 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -5852 NM_001318026 151987 Hs.431092 NM_174907 ENSG00000163605 PPP4R2 PP4R2 protein phosphatase 4 regulatory subunit 2 protein-coding 148.333-397 chr8 124559532 124559887 + 0.666667 NA intron (NM_001363298, intron 10 of 13) L2a|LINE|L2 20586 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 139.333-37 chr11 76375414 76375735 + 0.666667 NA intron (NM_004705, intron 1 of 4) intron (NM_004705, intron 1 of 4) 5391 NR_130898 5612 Hs.503315 NM_004705 ENSG00000137492 THAP12 DAP4|P52rIPK|PRKRIR|THAP0 THAP domain containing 12 protein-coding 158-128 chr7 50348277 50348582 + 0.666667 NA intron (NM_001291840, intron 2 of 2) intron (NM_001291840, intron 2 of 2) 29381 NM_001291841 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 178.333-15 chr10 26822254 26822558 + 0.666667 NA intron (NM_001012752, intron 2 of 9) L1ME1|LINE|L1 38681 NM_001348031 10006 Hs.508148 NM_005470 ENSG00000136754 ABI1 ABI-1|ABLBP4|E3B1|NAP1BP|SSH3BP|SSH3BP1 abl interactor 1 protein-coding 189.333-103 chr2 168946742 168947242 + 0.666667 NA intron (NM_003742, intron 19 of 27) intron (NM_003742, intron 19 of 27) 45701 NM_001081686 57818 Hs.283963 NM_021176 ENSG00000152254 G6PC2 IGRP glucose-6-phosphatase catalytic subunit 2 protein-coding 135.667-91 chr2 74393598 74393881 + 0.666667 NA non-coding (NR_158172, exon 4 of 4) non-coding (NR_158172, exon 4 of 4) -1652 NR_033935 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 181.333-143 chr5 98933409 98933744 + 0.666667 NA intron (NR_151718, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 -3862 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 126.333-139 chr5 17719726 17720064 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64257 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 143.667-88 chr16 11091442 11091721 + 0.666667 NA intron (NM_015226, intron 18 of 22) MIR|SINE|MIR 147017 NM_015226 23274 Hs.35490 NM_015226 ENSG00000038532 CLEC16A Gop-1|KIAA0350 C-type lectin domain containing 16A protein-coding 115.667-106 chr18 47988421 47988673 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -57401 NM_001135937 4087 Hs.12253 NM_005901 ENSG00000175387 SMAD2 JV18|JV18-1|MADH2|MADR2|hMAD-2|hSMAD2 SMAD family member 2 protein-coding 124-119 chr9 34507301 34507669 + 0.666667 NA intron (NM_001281428, intron 13 of 19) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 15505 NM_198573 375704 Hs.522085 NM_198573 ENSG00000168913 ENHO C9orf165|UNQ470 energy homeostasis associated protein-coding 111.667-41 chr10 115164289 115164479 + 0.666667 NA intron (NM_001276282, intron 6 of 7) L1MA4|LINE|L1 71019 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 190.667-154 chr8 127471330 127471752 + 0.666667 NA intron (NR_024393, intron 4 of 4) intron (NR_024393, intron 4 of 4) 10598 NR_024393 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 162-5 chr1 164956772 164957115 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -182302 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 126-51 chr2 23194847 23195190 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 -190161 NM_052920 114818 Hs.130593 NM_025067 ENSG00000119771 KLHL29 KBTBD9 kelch like family member 29 protein-coding 182-121 chrX 69058476 69058877 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 106777 NM_001032396 64219 Hs.522679 NM_022368 ENSG00000181191 PJA1 PRAJA1|RNF70 praja ring finger ubiquitin ligase 1 protein-coding 133-41 chr2 42103984 42104238 + 0.666667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 56090 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 117.333-87 chr18 32325112 32325316 + 0.666667 NA intron (NM_001242409, intron 2 of 5) AluSg|SINE|Alu 135175 NM_001308171 4225 Hs.194777 NM_005925 ENSG00000141434 MEP1B - meprin A subunit beta protein-coding 148.333-239 chr22 28298326 28298658 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 3 of 22) AluJb|SINE|Alu -161377 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 175-58 chr4 32152209 32152575 + 0.666667 NA intron (NR_125936, intron 2 of 2) intron (NR_125936, intron 2 of 2) -129970 NR_134682 105377651 Hs.581935 NR_134682 LOC105377651 - uncharacterized LOC105377651 ncRNA 137.333-5 chr1 73227914 73228137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78145 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 157-38 chr13 62084593 62084888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55192 NR_046995 100874143 Hs.552684 NR_046995 ENSG00000229578 LINC00358 - long intergenic non-protein coding RNA 358 ncRNA 120.333-22 chr10 83740959 83741186 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR -63983 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 217-28 chr17 43459880 43460296 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 15282 NR_031751 100313779 NR_031751 ENSG00000284344 MIR2117 - microRNA 2117 ncRNA 140.333-42 chr11 95141427 95141793 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8929 NR_110303 101929295 Hs.735838 NR_110303 ENSG00000245552 LOC101929295 - uncharacterized LOC101929295 ncRNA 148.667-13 chr1 106613541 106613836 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -204551 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 157.667-44 chr11 449801 450269 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001329544).2 promoter-TSS (NM_001329544).2 -244 NR_138046 81490 Hs.12851 NM_030783 ENSG00000174915 PTDSS2 PSS2 phosphatidylserine synthase 2 protein-coding 138.667-90 chr19 14100679 14100979 + 0.666667 NA exon (NM_002730, exon 5 of 10) exon (NM_002730, exon 5 of 10) 7561 NM_001304349 5566 Hs.631630 NM_002730 ENSG00000072062 PRKACA PKACA|PPNAD4 protein kinase cAMP-activated catalytic subunit alpha protein-coding 170-7 chr1 244705981 244706469 + 0.666667 NA non-coding (NR_123735, exon 5 of 5) non-coding (NR_123735, exon 5 of 5) 53099 NM_016076 51029 Hs.498317 NM_016076 ENSG00000121644 DESI2 C1orf121|CGI-146|DESI|DESI1|DeSI-2|FAM152A|PNAS-4|PPPDE1 desumoylating isopeptidase 2 protein-coding 117.333-59 chr14 73660234 73660514 + 0.666667 NA intron (NM_001201366, intron 4 of 8) intron (NM_001201366, intron 4 of 8) 15388 NM_031427 83544 Hs.271270 NM_031427 ENSG00000119661 DNAL1 C14orf168|CILD16|LC1 dynein axonemal light chain 1 protein-coding 144-61 chr17 29413907 29414294 + 0.666667 NA intron (NM_025142, intron 1 of 17) AluY|SINE|Alu 23175 NM_020791 57551 Hs.597434 NM_020791 ENSG00000160551 TAOK1 KFC-B|MAP3K16|MARKK|PSK-2|PSK2|TAO1|hKFC-B|hTAOK1 TAO kinase 1 protein-coding 200-117 chr4 100365661 100365987 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 29423 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 228-82 chr7 92406769 92407212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30324 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 111.667-67 chr12 92768242 92768561 + 0.666667 NA intron (NM_001004330, intron 10 of 11) intron (NM_001004330, intron 10 of 11) 31912 NM_001004330 440107 Hs.591013 NM_001004330 ENSG00000187510 PLEKHG7 - pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G7 protein-coding 170.333-138 chr3 86701806 86702146 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 220033 NR_135563 101927494 Hs.385622 NR_135563 ENSG00000241328 LINC02070 - long intergenic non-protein coding RNA 2070 ncRNA 152-83 chr2 61736565 61736897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 117329 NM_032180 84140 Hs.440466 NM_032180 ENSG00000170264 FAM161A RP28 FAM161 centrosomal protein A protein-coding 144.333-148 chr20 54012522 54012774 + 0.666667 NA intron (NM_001366297, intron 4 of 8) intron (NM_001366297, intron 4 of 8) 46372 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 131.333-92 chr2 102025298 102025652 + 0.666667 NA TTS (NM_001261419) TTS (NM_001261419) 26514 NR_048564 7850 Hs.25333 NM_004633 ENSG00000115590 IL1R2 CD121b|CDw121b|IL-1R-2|IL-1RT-2|IL-1RT2|IL1R2c|IL1RB interleukin 1 receptor type 2 protein-coding 155-110 chr5 72789568 72789959 + 0.666667 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy -26828 NM_002270 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 180-65 chr3 39771181 39771667 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37490 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 161.333-297 chr9 31679427 31679763 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -298105 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 123-101 chr5 124798122 124798338 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53118 NM_020747 57507 Hs.266616 NM_020747 ENSG00000168916 ZNF608 NY-REN-36 zinc finger protein 608 protein-coding 218.667-29 chr13 48686252 48686708 + 0.666667 NA intron (NM_001308471, intron 1 of 1) MER90a|LTR|ERV1 32551 NM_001308469 57105 Hs.253706 NM_020377 ENSG00000152207 CYSLTR2 CYSLT2|CYSLT2R|GPCR21|HG57|HPN321|KPG_011|PSEC0146|hGPCR21 cysteinyl leukotriene receptor 2 protein-coding 195-11 chr10 8041577 8042018 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10694 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 117.667-4 chr1 102802806 102803087 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 305550 NM_080629 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 239-47 chr4 72027176 72027755 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 -4339 NM_004885 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 151.333-28 chr1 170440162 170440543 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -91770 NM_001146039 92344 Hs.183702 NM_152281 ENSG00000120370 GORAB GO|NTKLBP1|SCYL1BP1 golgin, RAB6 interacting protein-coding 299-17 chr14_GL000225v1_random 25925 26556 + 0.666667 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 155.667-292 chr5 117026576 117026927 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -264542 NR_104678 102467223 Hs.570916 NR_104678 LINC02214 - long intergenic non-protein coding RNA 2214 ncRNA 199.667-21 chr10 111750131 111750564 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 433418 NM_001244949 57678 Hs.42586 NM_020918 ENSG00000119927 GPAM GPAT|GPAT1 glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial protein-coding 247.666-21 chr3 103722063 103722783 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -198307 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 253-6 chr1 119284088 119284675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43871 NR_146623 105378934 NR_146623 ENSG00000232650 LINC01780 - long intergenic non-protein coding RNA 1780 ncRNA 148.667-250 chr3 55671223 55671666 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 16 of 17) intron (NR_132749, intron 16 of 17) -11975 NR_024615 711 Hs.667161 NR_024615 ENSG00000281708 ERC2-IT1 C1orf1|C3orf51|Po42 ERC2 intronic transcript 1 ncRNA 200-126 chr5 40364895 40365395 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL 312854 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 178.333-145 chr5 114712289 114712658 + 0.666667 NA intron (NR_130785, intron 1 of 12) intron (NR_130785, intron 1 of 12) 60940 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 233-47 chr3 94742885 94743415 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -195113 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 214-109 chr5 96436951 96437520 + 0.666667 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) intron (NR_130776, intron 4 of 4) -3987 NM_000439 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 123-122 chr8 59372033 59372274 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 252943 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 178-111 chr8 92754990 92755382 + 0.666667 NA intron (NR_046114, intron 1 of 2) intron (NR_046114, intron 1 of 2) 30874 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 128.333-197 chr8 119041816 119042136 + 0.666667 NA intron (NM_001324095, intron 3 of 7) intron (NM_001324095, intron 3 of 7) -25271 NM_006438 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 204.333-24 chr10 51151034 51151492 + 0.666667 NA intron (NM_006258, intron 1 of 17) intron (NM_006258, intron 1 of 17) 76776 NM_006258 5592 Hs.407535 NM_006258 ENSG00000185532 PRKG1 AAT8|PKG|PKG1|PRKG1B|PRKGR1B|cGK|cGK 1|cGK1|cGKI|cGKI-BETA|cGKI-alpha protein kinase cGMP-dependent 1 protein-coding 127.667-169 chr7 112682492 112682698 + 0.666667 NA intron (NR_110158, intron 5 of 7) AluSz6|SINE|Alu 60214 NR_110158 101928012 Hs.521131 NR_110158 ENSG00000223646 LOC101928012 - uncharacterized LOC101928012 ncRNA 196-193 chr9 23258463 23258897 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 413719 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 160.333-256 chr6 156856283 156856624 + 0.666667 NA intron (NM_017519, intron 2 of 18) MIR|SINE|MIR -76722 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 161.667-110 chr17 78361356 78361839 + 0.666667 NA intron (NR_110846, intron 1 of 2) intron (NR_110846, intron 1 of 2) 595 NR_110846 101928674 Hs.637297 NR_110845 ENSG00000266970 LOC101928674 - uncharacterized LOC101928674 ncRNA 117-135 chr7 92978872 92979090 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 138998 NM_017654 54809 Hs.65641 NM_017654 ENSG00000205413 SAMD9 C7orf5|DRIF1|MIRAGE|NFTC|OEF1|OEF2 sterile alpha motif domain containing 9 protein-coding 111.667-172 chr3 125493451 125493654 + 0.666667 NA intron (NM_003794, intron 5 of 13) AluY|SINE|Alu 26650 NM_003794 8723 Hs.507243 NM_003794 ENSG00000114520 SNX4 ATG24B sorting nexin 4 protein-coding 115.333-16 chr1 189147503 189147696 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1328411 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 150.667-316 chr5 147437073 147437357 + 0.666667 NA intron (NM_001197294, intron 1 of 13) intron (NM_001197294, intron 1 of 13) 16477 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 199-106 chr7 81852608 81853054 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -82784 NM_001010934 3082 Hs.396530 NM_000601 ENSG00000019991 HGF DFNB39|F-TCF|HGFB|HPTA|SF hepatocyte growth factor protein-coding 156.333-62 chr11 104625464 104625800 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16330 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 112.667-35 chr11 9568256 9568471 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5307 NM_003390 7465 Hs.249441 NM_003390 ENSG00000166483 WEE1 WEE1A|WEE1hu WEE1 G2 checkpoint kinase protein-coding 268-55 chr7 117405707 117406230 + 0.666667 NA intron (NM_001301821, intron 4 of 12) LTR32|LTR|ERVL 21525 NM_001301821 136991 Hs.352412 NM_130768 ENSG00000154438 ASZ1 ALP1|ANKL1|C7orf7|CT1.19|GASZ|Orf3 ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain containing 1 protein-coding 132.333-67 chr16 80273427 80273757 + 0.666667 NA intron (NR_120307, intron 2 of 5) MIR|SINE|MIR -267142 NM_001305017 83657 Hs.98849 NM_130897 ENSG00000168589 DYNLRB2 DNCL2B|DNLC2B|ROBLD2 dynein light chain roadblock-type 2 protein-coding 135.333-17 chr1 229288987 229289387 + 0.666667 NA intron (NR_073545, intron 3 of 7) intron (NR_073545, intron 3 of 7) -15195 NM_006542 10638 Hs.296169 NM_006542 ENSG00000213029 SPHAR - S-phase response (cyclin related) protein-coding 177-64 chr5 34905421 34905824 + 0.666667 NA non-coding (NR_026591, exon 5 of 5) non-coding (NR_026591, exon 5 of 5) 9882 NM_002853 5810 Hs.38114 NM_002853 ENSG00000113456 RAD1 HRAD1|REC1 RAD1 checkpoint DNA exonuclease protein-coding 164.333-86 chr16 76805285 76805626 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -63481 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 151.667-310 chr6 63185387 63185708 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 134430 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 153.667-394 chr8 122140346 122140655 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 428144 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 115.333-195 chr6 165694812 165695036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32644 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 258.667-96 chr8 89969616 89970187 + 0.666667 NA intron (NM_001024688, intron 8 of 16) AluSx|SINE|Alu 14770 NM_002485 4683 Hs.492208 NM_002485 ENSG00000104320 NBN AT-V1|AT-V2|ATV|NBS|NBS1|P95 nibrin protein-coding 179.333-63 chr14 51886742 51887205 + 0.666667 NA intron (NM_001243773, intron 2 of 3) intron (NM_001243773, intron 2 of 3) 26361 NM_053064 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 136.333-181 chr6 97284892 97285180 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -1820 NM_001350599 253714 Hs.444292 NM_198468 ENSG00000146263 MMS22L C6orf167|dJ39B17.2 MMS22 like, DNA repair protein protein-coding 220.333-107 chr4 115809698 115810201 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -489776 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 113.333-179 chr3 89785144 89785420 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 677661 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 142-57 chr17 46925246 46925580 + 0.666667 NA intron (NM_001363851, intron 1 of 5) L2a|LINE|L2 2253 NR_148349 9570 Hs.463278 NM_004287 ENSG00000108433 GOSR2 Bos1|EPM6|GS27 golgi SNAP receptor complex member 2 protein-coding 154.333-348 chr8 112754446 112754752 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 11 of 66) LTR33B|LTR|ERVL 111106 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 149-4 chr1 112634939 112635339 + 0.666667 NA intron (NM_006135, intron 1 of 9) intron (NM_006135, intron 1 of 9) 15307 NM_006135 829 Hs.744974 NM_006135 ENSG00000116489 CAPZA1 CAPPA1|CAPZ|CAZ1 capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 1 protein-coding 131-62 chr3 55524286 55524555 + 0.666667 NA intron (NM_015576, intron 16 of 16) intron (NM_015576, intron 16 of 16) -36778 NM_003392 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 132-39 chr14 31131477 31131837 + 0.666667 NA intron (NM_015382, intron 24 of 42) intron (NM_015382, intron 24 of 42) 76136 NM_015382 25831 Hs.708017 NM_015382 ENSG00000092148 HECTD1 EULIR HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 116-18 chr10 49363437 49363637 + 0.666667 NA TTS (NM_001276451) TTS (NM_001276451) 32552 NM_001276451 644168 Hs.534530 NM_001080520 ENSG00000165606 DRGX DRG11|PRRXL1 dorsal root ganglia homeobox protein-coding 156-147 chr9 92973533 92973982 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_033086) promoter-TSS (NM_033086) -679 NM_033086 89846 Hs.411081 NM_033086 ENSG00000127084 FGD3 ZFYVE5 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3 protein-coding 170-50 chr17 74619474 74619924 + 0.666667 NA intron (NM_181449, intron 1 of 3) intron (NM_181449, intron 1 of 3) 4039 NM_181449 342510 Hs.158954 NM_181449 ENSG00000186407 CD300E CD300LE|CLM-2|CLM2|CMRF35-A5|IREM-2|IREM2|PIgR-2|PIgR2 CD300e molecule protein-coding 183-29 chr12 112474893 112475314 + 0.666667 NA intron (NM_001330437, intron 7 of 15) intron (NM_001330437, intron 7 of 15) 56156 NM_080601 5781 Hs.506852 NM_002834 ENSG00000179295 PTPN11 BPTP3|CFC|JMML|METCDS|NS1|PTP-1D|PTP2C|SH-PTP2|SH-PTP3|SHP2 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11 protein-coding 146.667-261 chr5 88696374 88696670 + 0.666667 NA intron (NR_146284, intron 1 of 3) L1MC5|LINE|L1 -5481 NR_152232 645323 Hs.12827 NR_015436 ENSG00000245526 LINC00461 ECONEXIN|EyeLinc1|VISC long intergenic non-protein coding RNA 461 ncRNA 142.333-30 chr10 120171417 120171783 + 0.666667 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 183623 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 178.667-50 chr14 63871391 63871766 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 1 of 114) intron (NM_015180, intron 1 of 114) 18574 NM_015180 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 209.333-23 chr10 81928517 81928997 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 51070 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 199.333-268 chr8 15155718 15156056 + 0.666667 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) AluSx3|SINE|Alu 82544 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 151.333-93 chr12 5313451 5313821 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -70485 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 203.333-134 chr2 72705972 72706383 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) intron (NR_135774, intron 6 of 19) 119856 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 153.667-41 chr10 43116867 43117227 + 0.666667 NA intron (NM_020630, intron 12 of 18) intron (NM_020630, intron 12 of 18) 12315 NM_001355216 5979 Hs.350321 NM_000323 ENSG00000165731 RET CDHF12|CDHR16|HSCR1|MEN2A|MEN2B|MTC1|PTC|RET-ELE1 ret proto-oncogene protein-coding 113.333-267 chr8 144186305 144186601 + 0.666667 NA intron (NM_001099281, intron 6 of 11) intron (NM_001099281, intron 6 of 11) 37808 NM_001288814 727957 Hs.443139 NM_032450 ENSG00000179832 MROH1 HEATR7A maestro heat like repeat family member 1 protein-coding 132-4 chr1 85847921 85848220 + 0.666667 NA intron (NM_152890, intron 38 of 59) (TATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -139637 NM_017953 54680 Hs.5111 NM_017953 ENSG00000117174 ZNHIT6 BCD1|C1orf181|NY-BR-75 zinc finger HIT-type containing 6 protein-coding 188.667-125 chr5 65475485 65475884 + 0.666667 NA intron (NR_135689, intron 1 of 25) L2c|LINE|L2 6236 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 174.333-157 chr9 16780657 16781165 + 0.666667 NA intron (NM_017637, intron 1 of 6) intron (NM_017637, intron 1 of 6) 54097 NR_151723 111216284 Hs.609218 NR_151723 ENSG00000234779 BNC2-AS1 - BNC2 antisense RNA 1 ncRNA 125.667-188 chr8 85055975 85056280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51111 NM_001349638 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 162.667-297 chr9 126435153 126435563 + 0.666667 NA intron (NM_033446, intron 7 of 9) intron (NM_033446, intron 7 of 9) -24854 NR_045006 641373 Hs.742606 NR_045006 NRON NCRNA00194 non-coding repressor of NFAT ncRNA 153-159 chrX 85638878 85639218 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -196732 NR_031710 100302171 NR_031710 ENSG00000283435 MIR1321 MIRN1321|hsa-mir-1321 microRNA 1321 ncRNA 143.333-198 chr4 41682572 41682944 + 0.666667 NA intron (NM_001330786, intron 18 of 22) AluSx|SINE|Alu 66212 NM_003924 8929 Hs.87202 NM_003924 ENSG00000109132 PHOX2B CCHS|NBLST2|NBPhox|PMX2B paired like homeobox 2B protein-coding 147.667-340 chr7 80070636 80071047 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63990 NM_002069 2770 Hs.134587 NM_002069 ENSG00000127955 GNAI1 Gi G protein subunit alpha i1 protein-coding 157-29 chr11 104505702 104506082 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 103410 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 155.333-118 chr15 61292618 61292937 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -63475 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 117-157 chrX 102770771 102771102 + 0.666667 NA intron (NR_038988, intron 2 of 7) L1MA5|LINE|L1 1783 NR_146590 100287765 Hs.556850 NR_038988 LINC00630 - long intergenic non-protein coding RNA 630 ncRNA 131-63 chr3 75024547 75024893 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -189756 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 124-32 chr12 21614435 21614687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9714 NM_021957 2998 Hs.82614 NM_021957 ENSG00000111713 GYS2 - glycogen synthase 2 protein-coding 156.667-75 chr12 7459237 7459665 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -15266 NM_001297650 283316 Hs.631727 NM_174941 ENSG00000177675 CD163L1 CD163B|M160|SCARI2|WC1 CD163 molecule like 1 protein-coding 121.667-11 chr1 85267642 85267858 + 0.666667 NA exon (NM_003921, exon 3 of 3) exon (NM_003921, exon 3 of 3) -8088 NM_198077 148423 Hs.26226 NM_198077 ENSG00000162642 C1orf52 gm117 chromosome 1 open reading frame 52 protein-coding 142.667-210 chr7 93935625 93936008 + 0.666667 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL 14081 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 146.667-99 chr14 48117939 48118229 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -323070 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 196.667-139 chr7 21793756 21794156 + 0.666667 NA intron (NM_001277115, intron 61 of 81) L1M3f|LINE|L1 151943 NM_018719 55536 Hs.744069 NM_018719 ENSG00000164649 CDCA7L JPO2|R1|RAM2 cell division cycle associated 7 like protein-coding 119-127 chr6 52137807 52138148 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6372 NR_029713 406989 NR_029713 ENSG00000207604 MIR206 MIRN206|miRNA206|mir-206 microRNA 206 ncRNA 193.667-72 chr20 18600015 18600480 + 0.666667 NA intron (NM_080820, intron 3 of 5) L1MC1|LINE|L1 12193 NM_080820 92675 Hs.659442 NM_080820 ENSG00000125821 DTD1 C20orf88|DTD|DUE-B|DUEB|HARS2|pqn-68 D-aminoacyl-tRNA deacylase 1 protein-coding 161-102 chr8 118873221 118873527 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 78511 NM_002546 4982 Hs.81791 NM_002546 ENSG00000164761 TNFRSF11B OCIF|OPG|PDB5|TR1 TNF receptor superfamily member 11b protein-coding 117.333-151 chr4 59087053 59087334 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73620 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 152-15 chr1 227317067 227317509 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001366010, exon 1 of 35) 5' UTR (NM_001366010, exon 1 of 35) 1204 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 120-73 chr2 174358340 174358538 + 0.666667 NA intron (NM_004882, intron 7 of 9) AluSz|SINE|Alu 23485 NM_001145250 100131390 NM_001145250 ENSG00000217236 SP9 ZNF990 Sp9 transcription factor protein-coding 161-10 chr10 123924520 123924942 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -32924 NM_198148 119587 Hs.656887 NM_198148 ENSG00000121898 CPXM2 CPX2|UNQ676 carboxypeptidase X, M14 family member 2 protein-coding 241-40 chr4 39617136 39617843 + 0.666667 NA intron (NM_001317896, intron 1 of 5) intron (NM_001317896, intron 1 of 5) 9632 NM_001317897 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 151.667-52 chr10 81958049 81958481 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 80578 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 131.667-43 chr12 52698873 52699147 + 0.666667 NA intron (NM_175078, intron 1 of 8) intron (NM_175078, intron 1 of 8) 4514 NM_175078 374454 Hs.334989 NM_175078 ENSG00000189182 KRT77 K1B|KRT1B keratin 77 protein-coding 113.333-105 chr18 7287111 7287393 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 56148 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 261-48 chr6 44615894 44616609 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64370 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 186.333-154 chr7 107068974 107069371 + 0.666667 NA intron (NM_002736, intron 1 of 10) AluSx1|SINE|Alu 24467 NM_002736 5577 Hs.433068 NM_002736 ENSG00000005249 PRKAR2B PRKAR2|RII-BETA protein kinase cAMP-dependent type II regulatory subunit beta protein-coding 122.333-77 chr18 6356486 6356773 + 0.666667 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 2401 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 112.667-10 chr1 152725606 152725854 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6208 NM_001024679 100129271 Hs.601077 NM_001024679 ENSG00000198854 C1orf68 LEP7|XP32 chromosome 1 open reading frame 68 protein-coding 126.333-53 chr14 65600825 65601104 + 0.666667 NA intron (NM_178156, intron 2 of 9) intron (NM_178156, intron 2 of 9) 129862 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 148.667-112 chr14 36850119 36850498 + 0.666667 NA intron (NM_001171170, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR 102083 NR_039725 100616280 NR_039725 ENSG00000266327 MIR4503 - microRNA 4503 ncRNA 125.667-159 chr5 128330904 128331184 + 0.666667 NA intron (NM_001999, intron 32 of 64) intron (NM_001999, intron 32 of 64) 207201 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 134.667-136 chr3 85587747 85587988 + 0.666667 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) AluJb|SINE|Alu 82808 NM_001256505 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 143-129 chr8 126785901 126786242 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -227083 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 204-193 chr8 83253033 83253531 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -150476 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 140.667-217 chr7 83269158 83269499 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -106444 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 145.667-197 chr4 124722691 124723012 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -10119 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 118.667-132 chr3 50962360 50962642 + 0.666667 NA intron (NM_004947, intron 5 of 52) OldhAT1|DNA|hAT-Ac 287421 NR_039950 100616138 NR_039950 ENSG00000272543 MIR4787 mir-4787 microRNA 4787 ncRNA 134.667-50 chr13 53345571 53345852 + 0.666667 NA Intergenic LTR53-int|LTR|ERVL -193811 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 124.333-163 chr6 137422471 137422721 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 71798 NM_175747 167826 Hs.195398 NM_175747 ENSG00000177468 OLIG3 Bhlhb7|bHLHe20 oligodendrocyte transcription factor 3 protein-coding 132-56 chr18 68587960 68588332 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 126962 NM_001350516 54495 Hs.440534 NM_019022 ENSG00000166479 TMX3 PDIA13|TXNDC10 thioredoxin related transmembrane protein 3 protein-coding 118.333-17 chr1 118439048 118439257 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -253924 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 206-78 chr2 48542218 48542721 + 0.666667 NA intron (NM_001198595, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 12300 NM_001198595 11037 Hs.44385 NM_006873 ENSG00000243244 STON1 SALF|SBLF|STN1|STNB1 stonin 1 protein-coding 128.667-171 chr7 113946668 113946947 + 0.666667 NA Intergenic L1PBb|LINE|L1 -27798 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 185.667-86 chr22 26494986 26495398 + 0.666667 NA TTS (NM_001013694) TTS (NM_001013694) 11315 NM_001013694 402055 Hs.709914 NM_001013694 ENSG00000100104 SRRD HC/HCC|SRR1L SRR1 domain containing protein-coding 212-40 chr12 64457326 64457903 + 0.666667 NA intron (NM_013254, intron 2 of 20) intron (NM_013254, intron 2 of 20) 5494 NM_013254 29110 Hs.505874 NM_013254 ENSG00000183735 TBK1 FTDALS4|IIAE8|NAK|T2K TANK binding kinase 1 protein-coding 185-21 chr15 60056469 60056877 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 52362 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 192.333-20 chr10 89849292 89849709 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -4406 NR_149080 105378425 Hs.559891 NR_149079 ENSG00000280560 LINC01374 TCONS_00018278 long intergenic non-protein coding RNA 1374 ncRNA 122.667-117 chr3 83570180 83570466 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1299252 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 171.333-193 chr8 67723289 67723675 + 0.666667 NA intron (NM_020361, intron 1 of 10) L1ME3Cz|LINE|L1 22878 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 114.667-60 chr12 31669038 31669295 + 0.666667 NA TTS (NM_001135864) TTS (NM_001135864) 9478 NM_001135863 254013 Hs.740628 NM_173802 ENSG00000139160 ETFBKMT C12orf72|ETFB-KMT|METTL20 electron transfer flavoprotein subunit beta lysine methyltransferase protein-coding 153-151 chr9 12360028 12360404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -333169 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 119-13 chr10 12016811 12017045 + 0.666667 NA intron (NM_080599, intron 3 of 21) AluSx1|SINE|Alu 25881 NM_015542 26019 Hs.370689 NM_015542 ENSG00000151461 UPF2 HUPF2|RENT2|smg-3 UPF2 regulator of nonsense mediated mRNA decay protein-coding 146.333-94 chr14 67972274 67972540 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) intron (NM_133509, intron 7 of 10) 148815 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 316-44 chr6 47968856 47969589 + 0.666667 NA intron (NM_207499, intron 2 of 2) intron (NM_207499, intron 2 of 2) 99467 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 155.667-66 chr12 23968521 23968861 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) MSTD|LTR|ERVL-MaLR -17659 NM_001261415 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 169.667-171 chr5 99269928 99270257 + 0.666667 NA Intergenic L1M3d|LINE|L1 -263898 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 151.333-153 chr15 81927677 81928009 + 0.666667 NA Intergenic AluYf1|SINE|Alu 118175 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 190.667-163 chrX 78417239 78417643 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -89750 NM_001282186 10800 Hs.733809 NM_006639 ENSG00000173198 CYSLTR1 CYSLT1|CYSLT1R|CYSLTR|HMTMF81 cysteinyl leukotriene receptor 1 protein-coding 183.667-130 chr6 130799128 130799503 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -28090 NM_001195597 100507203 Hs.388715 NM_001195597 ENSG00000256162 SMLR1 - small leucine rich protein 1 protein-coding 114.667-58 chr11 129785416 129785719 + 0.666667 NA Intergenic LTR25-int|LTR|ERV1 -30214 NM_001331210 120224 Hs.504301 NM_138788 ENSG00000151715 TMEM45B - transmembrane protein 45B protein-coding 168.333-185 chr6 145224298 145224748 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 462354 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 119-86 chr20 2681581 2681775 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -11102 NR_138537 57593 Hs.471955 NM_020833 ENSG00000088881 EBF4 COE4|O/E-4 EBF family member 4 protein-coding 156.667-145 chr18 2961782 2962189 + 0.666667 NA intron (NM_014646, intron 1 of 19) intron (NM_014646, intron 1 of 19) -15362 NR_026659 727896 Hs.673126 NR_026659 LOC727896 - cysteine and histidine rich domain containing 1 pseudogene pseudo 152.333-114 chr14 71341492 71341807 + 0.666667 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) L1PA16|LINE|L1 21173 NM_001354289 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 142-11 chr1 213263310 213263572 + 0.666667 NA intron (NM_001136138, intron 13 of 13) intron (NM_001136138, intron 13 of 13) 212200 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 112.333-258 chr8 59752342 59752600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 528929 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 164.333-120 chr2 121392732 121393064 + 0.666667 NA intron (NM_015282, intron 29 of 38) intron (NM_015282, intron 29 of 38) -107696 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 126.333-138 chr5 3967002 3967327 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 371332 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 126-97 chr5 176741237 176741527 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1823 NR_108030 102577424 Hs.349025 NR_108030 ENSG00000248859 LINC01574 HI-LNC12 long intergenic non-protein coding RNA 1574 ncRNA 115-62 chr14 81216277 81216562 + 0.666667 NA exon (NM_201595, exon 2 of 9) exon (NM_201595, exon 2 of 9) 4540 NM_015859 2957 Hs.592334 NM_015859 ENSG00000165417 GTF2A1 TF2A1|TFIIA|TFIIA-42|TFIIAL general transcription factor IIA subunit 1 protein-coding 181.667-134 chr7 15032089 15032554 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57463 NM_001350707 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 262.333-11 chr10 33548279 33548867 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -213668 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 240.667-33 chr17 4711108 4711677 + 0.666667 NA intron (NR_047516, intron 1 of 13) intron (NR_047516, intron 1 of 13) 760 NM_199004 409 Hs.435811 NM_004313 ENSG00000141480 ARRB2 ARB2|ARR2|BARR2 arrestin beta 2 protein-coding 161.333-121 chr17 77328609 77328939 + 0.666667 NA intron (NM_006640, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 9259 NM_006640 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 122.333-98 chr2 103629431 103629695 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -645134 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 151.333-440 chr9 71554105 71554434 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -107298 NM_001366144 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 115.333-183 chr6 24591437 24591683 + 0.666667 NA intron (NM_001350410, intron 4 of 21) AluJo|SINE|Alu -8333 NM_001252328 9856 Hs.26441 NM_014809 ENSG00000137261 KIAA0319 AAVR|DYLX2|DYX2|NMIG KIAA0319 protein-coding 189.333-182 chr7 16880854 16881228 + 0.666667 NA intron (NM_176813, intron 1 of 7) Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 942 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 118.667-14 chr1 215784029 215784335 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 52 of 71) intron (NM_206933, intron 52 of 71) 216878 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 123.333-86 chr16 19510296 19510573 + 0.666667 NA intron (NR_136689, intron 3 of 5) intron (NR_136689, intron 3 of 5) 11664 NM_016641 51573 Hs.512607 NM_016641 ENSG00000006007 GDE1 363E6.2|MIR16 glycerophosphodiester phosphodiesterase 1 protein-coding 170.667-92 chr2 224535828 224536328 + 0.666667 NA intron (NM_001257197, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 33877 NM_001257198 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 141-59 chr4 45547094 45547367 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 576824 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 148-123 chr4 182294823 182295107 + 0.666667 NA intron (NM_001080477, intron 1 of 27) intron (NM_001080477, intron 1 of 27) 51563 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 112.667-231 chr6 73607338 73607526 + 0.666667 NA intron (NM_012434, intron 9 of 10) AluSq2|SINE|Alu 46560 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 206.667-68 chr2 181955729 181956170 + 0.666667 NA intron (NR_048567, intron 1 of 4) L1PA7|LINE|L1 1708 NR_048567 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 179-19 chr12 4517303 4517833 + 0.666667 NA intron (NR_144379, intron 7 of 12) intron (NR_144379, intron 7 of 12) 20901 NM_020374 57102 Hs.302977 NM_020374 ENSG00000047621 C12orf4 - chromosome 12 open reading frame 4 protein-coding 221-68 chr8 59424314 59424705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 305299 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 112-199 chr8 78868427 78868687 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 31028 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 114.333-184 chr5 148147700 148147931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20731 NM_001001325 408187 Hs.553815 NM_001001325 ENSG00000196800 SPINK14 SPINK5L2 serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (putative) protein-coding 185.667-149 chr9 122446841 122447131 + 0.666667 NA Intergenic LTR19B|LTR|ERV1 30940 NM_001004451 347168 Hs.632692 NM_001004451 ENSG00000136834 OR1J1 OR9-18|hg32 olfactory receptor family 1 subfamily J member 1 protein-coding 164.333-105 chr19 18190043 18190387 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -3003 NM_032683 84769 Hs.515254 NM_032683 ENSG00000254858 MPV17L2 FKSG24 MPV17 mitochondrial inner membrane protein like 2 protein-coding 121-79 chr2 211409308 211409651 + 0.666667 NA intron (NM_005235, intron 25 of 27) intron (NM_005235, intron 25 of 27) 791908 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 111.667-14 chr1 94282900 94283160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35284 NM_001328664 9411 Hs.483238 NM_004815 ENSG00000137962 ARHGAP29 PARG1 Rho GTPase activating protein 29 protein-coding 124-88 chr4 57841420 57841670 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 415673 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 125.667-203 chr9 118165559 118165797 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 461275 NM_003266 7099 Hs.174312 NM_003266 ENSG00000136869 TLR4 ARMD10|CD284|TLR-4|TOLL toll like receptor 4 protein-coding 149.333-139 chr17 43985360 43985659 + 0.666667 NA intron (NM_004160, intron 1 of 6) intron (NM_004160, intron 1 of 6) 18960 NM_004160 5697 Hs.169249 NM_004160 ENSG00000131096 PYY PYY-I|PYY1 peptide YY protein-coding 125-30 chr13 71330169 71330445 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 315166 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 138.667-188 chr7 4154039 4154350 + 0.666667 NA intron (NM_001079653, intron 4 of 19) intron (NM_001079653, intron 4 of 19) -19357 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 159.333-278 chr6 45893945 45894385 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 43432 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 191.667-48 chr14 45837074 45837503 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -121686 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 172.667-157 chr8 72861965 72862409 + 0.666667 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) 130142 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 137.333-107 chr2 238342406 238342773 + 0.666667 NA intron (NM_015650, intron 8 of 16) intron (NM_015650, intron 8 of 16) 22045 NM_001139490 26146 Hs.631898 NM_015650 ENSG00000204104 TRAF3IP1 IFT54|MIP-T3|MIPT3|SLSN9 TRAF3 interacting protein 1 protein-coding 156-103 chr4 96877876 96878273 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -488852 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-89 chr12 63138814 63139119 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 13844 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 226.333-11 chr10 110143631 110144189 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63695 NM_130439 4601 Hs.602078 NM_005962 ENSG00000119950 MXI1 MAD2|MXD2|MXI|bHLHc11 MAX interactor 1, dimerization protein protein-coding 154.667-94 chr13 62190023 62190421 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -22060 NR_125787 103752583 Hs.578048 NR_125787 LINC01075 - long intergenic non-protein coding RNA 1075 ncRNA 168.333-79 chr18 8103026 8103336 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 11 of 30) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 263853 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 165.333-66 chr12 118321822 118322186 + 0.666667 NA intron (NM_001346490, intron 1 of 21) L1M5|LINE|L1 37701 NM_001346489 51347 Hs.644420 NM_016281 ENSG00000135090 TAOK3 DPK|JIK|MAP3K18|hKFC-A TAO kinase 3 protein-coding 149.667-272 chr3 189440313 189440611 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -156284 NM_001329964 8626 Hs.137569 NM_003722 ENSG00000073282 TP63 AIS|B(p51A)|B(p51B)|EEC3|KET|LMS|NBP|OFC8|RHS|SHFM4|TP53CP|TP53L|TP73L|p40|p51|p53CP|p63|p73H|p73L tumor protein p63 protein-coding 160.667 chr1 6410877 6411268 + 0.666667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL 8847 NM_019089 54626 Hs.118727 NM_019089 ENSG00000069812 HES2 bHLHb40 hes family bHLH transcription factor 2 protein-coding 121.667-21 chr10 41764096 41764310 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 603842 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 113.333-70 chr14 41479635 41479908 + 0.666667 NA Intergenic LTR40b|LTR|ERVL -127085 NR_144389 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 176-34 chr14 68333438 68333806 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 295165 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 133-8 chr10 76773598 76773861 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -114315 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 230.333-76 chr3 59566081 59566624 + 0.666667 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 92145 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 207-56 chr17 82832217 82832573 + 0.666667 NA exon (NM_024702, exon 2 of 3) exon (NM_024702, exon 2 of 3) 7627 NM_024702 79755 Hs.464391 NM_024702 ENSG00000141579 ZNF750 ZFP750 zinc finger protein 750 protein-coding 168-56 chr2 124590028 124590391 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 11 of 23) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 564922 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 192-80 chr2 211303410 211303958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 686113 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 184.667-109 chr5 170914938 170915336 + 0.666667 NA intron (NM_022897, intron 8 of 27) intron (NM_022897, intron 8 of 27) 53119 NM_022897 64901 Hs.410810 NM_022897 ENSG00000204764 RANBP17 - RAN binding protein 17 protein-coding 139-42 chr18 9913663 9913928 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_003574) promoter-TSS (NM_003574) -221 NM_194434 9218 Hs.165195 NM_003574 ENSG00000101558 VAPA VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33 VAMP associated protein A protein-coding 201.333-160 chr2 214324397 214324732 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 14 of 14) intron (NR_047660, intron 14 of 14) -86490 NM_001345929 402117 Hs.534834 NM_001080500 ENSG00000174453 VWC2L - von Willebrand factor C domain containing 2 like protein-coding 256.333-50 chr21 44454117 44454568 + 0.666667 NA intron (NR_047476, intron 2 of 3) L1ME1|LINE|L1 942 NR_047476 100861510 Hs.505254 NR_047476 ENSG00000229356 LRRC3-DT LRRC3-AS1 LRRC3 divergent transcript ncRNA 137-90 chr6 61952943 61953278 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 4 of 13) intron (NR_146874, intron 4 of 13) 333115 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 114.667-207 chr5 56770439 56770627 + 0.666667 NA TTS (NM_001365184) TTS (NM_001365184) 2338 NM_001365184 105378979 NM_001365184 LOC105378979 - growth/differentiation factor 3 protein-coding 121-23 chr11 7086569 7086858 + 0.666667 NA Intergenic LTR39|LTR|ERV1 -2285 NM_014469 27288 Hs.121605 NM_014469 ENSG00000170748 RBMXL2 HNRNPG-T|HNRNPGT|HNRPGT RBMX like 2 protein-coding 131-70 chr4 62703054 62703336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -541430 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 118.333-11 chr1 94831712 94831979 + 0.666667 NA intron (NM_001258340, intron 5 of 14) intron (NM_001258340, intron 5 of 14) 7352 NM_001350223 126969 Hs.483423 NM_152369 ENSG00000143036 SLC44A3 CTL3 solute carrier family 44 member 3 protein-coding 173-23 chr14 60548535 60548938 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 39590 NM_007374 4990 Hs.194756 NM_007374 ENSG00000184302 SIX6 MCOPCT2|ODRMD|OPTX2|Six9 SIX homeobox 6 protein-coding 148-138 chr5 149970990 149971417 + 0.666667 NA intron (NM_000112, intron 1 of 2) intron (NM_000112, intron 1 of 2) 10466 NM_000112 1836 Hs.302738 NM_000112 ENSG00000155850 SLC26A2 D5S1708|DTD|DTDST|EDM4|MST153|MSTP157 solute carrier family 26 member 2 protein-coding 130.667-196 chr8 88465938 88466280 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -138626 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 144-95 chr21 32923520 32923806 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -35225 NR_135522 102724502 Hs.130572 NR_135522 ENSG00000228961 LINC01690 - long intergenic non-protein coding RNA 1690 ncRNA 172.667-168 chr9 86175993 86176269 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48591 NR_110996 101927623 Hs.575644 NR_110996 LOC101927623 - uncharacterized LOC101927623 ncRNA 123.667-171 chr7 70932668 70933001 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -199310 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 168-81 chr4 51852794 51853118 + 0.666667 NA intron (NM_001287757, intron 2 of 11) intron (NM_001287757, intron 2 of 11) 9377 NM_001287755 23142 Hs.605388 NM_015115 ENSG00000109184 DCUN1D4 - defective in cullin neddylation 1 domain containing 4 protein-coding 123-58 chr18 32617147 32617356 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 105588 NR_003558 441818 Hs.549773 NR_003558 ENSG00000260389 WBP11P1 HsT3017 WW domain binding protein 11 pseudogene 1 pseudo 137.667-108 chr20 33011296 33011638 + 0.666667 NA intron (NM_025227, intron 3 of 15) intron (NM_025227, intron 3 of 15) 3763 NM_025227 80341 Hs.257045 NM_025227 ENSG00000078898 BPIFB2 BPIL1|C20orf184|LPLUNC2|RYSR|dJ726C3.2 BPI fold containing family B member 2 protein-coding 280-26 chr2 112952531 112953252 + 0.666667 NA Intergenic MER41G|LTR|ERV1 -25115 NM_019618 56300 Hs.211238 NM_019618 ENSG00000136688 IL36G IL-1F9|IL-1H1|IL-1RP2|IL1E|IL1F9|IL1H1|IL1RP2 interleukin 36 gamma protein-coding 268-26 chr18 11436642 11437290 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -17512 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 122.333-144 chr3 163216884 163217117 + 0.666667 NA intron (NR_033945, intron 2 of 6) L1MA3|LINE|L1 86301 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 267.333-37 chr16 65978537 65979208 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -387819 NM_001795 1003 Hs.76206 NM_001795 ENSG00000179776 CDH5 7B4|CD144 cadherin 5 protein-coding 186.333-6 chr1 103443898 103444368 + 0.666667 NA intron (NM_001347930, intron 1 of 4) L1MC3|LINE|L1 81378 NM_001347929 101928436 Hs.558999 NM_001286997 LOC101928436 - uncharacterized LOC101928436 protein-coding 117-106 chr4 91043916 91044124 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) L1MEi|LINE|L1 808989 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 165.667-67 chr16 61963679 61964170 + 0.666667 NA intron (NM_001796, intron 2 of 11) intron (NM_001796, intron 2 of 11) 72514 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 154-29 chr11 81721140 81721455 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 169539 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 187.333-130 chr3 89389197 89389578 + 0.666667 NA intron (NM_182644, intron 5 of 6) intron (NM_182644, intron 5 of 6) 281766 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 231.667-31 chr2 72774292 72774833 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 1 of 19) L1MD2|LINE|L1 51471 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 130-53 chr2 47689157 47689430 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -93789 NM_000179 2956 Hs.445052 NM_000179 ENSG00000116062 MSH6 GTBP|GTMBP|HNPCC5|HSAP|p160 mutS homolog 6 protein-coding 114.667-129 chr2 98107537 98107774 + 0.666667 NA intron (NR_144297, intron 2 of 18) L1MDa|LINE|L1 20488 NR_144296 200403 Hs.269977 NM_144992 ENSG00000168658 VWA3B SCAR22 von Willebrand factor A domain containing 3B protein-coding 130-4 chr1 78002558 78002857 + 0.666667 NA intron (NM_001317100, intron 2 of 3) intron (NM_001317100, intron 2 of 3) -2121 NM_001317103 11080 Hs.13852 NM_007034 ENSG00000162616 DNAJB4 DNAJW|DjB4|HLJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B4 protein-coding 113.667-32 chr11 91930490 91930680 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -294449 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 127.667-45 chr14 50728350 50728583 + 0.666667 NA intron (NM_182944, intron 29 of 29) intron (NM_182944, intron 29 of 29) -60160 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 118-15 chr11 93211249 93211565 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -13416 NM_152313 120103 Hs.148766 NM_152313 ENSG00000180773 SLC36A4 PAT4 solute carrier family 36 member 4 protein-coding 116.667-49 chr14 23545120 23545369 + 0.666667 NA intron (NM_033400, intron 1 of 9) intron (NM_033400, intron 1 of 9) 6521 NM_033400 85446 Hs.508937 NM_033400 ENSG00000136367 ZFHX2 MARSIS|ZFH-5|ZFH5|ZNF409 zinc finger homeobox 2 protein-coding 162.333-275 chr9 87381313 87381765 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115689 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 121.333-52 chr14 63239637 63239878 + 0.666667 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 35314 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 133.333-156 chr5 159014378 159014704 + 0.666667 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) MIRc|SINE|MIR 83415 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 131-9 chr1 241731806 241732172 + 0.666667 NA intron (NM_001367482, intron 10 of 27) intron (NM_001367482, intron 10 of 27) 79708 NM_001367482 128025 Hs.97527 NM_144625 ENSG00000162843 WDR64 - WD repeat domain 64 protein-coding 221-34 chr2 35943226 35943831 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 412042 NR_037631 100288911 Hs.432924 NR_037631 CRIM1-DT - CRIM1 divergent transcript ncRNA 187.333-84 chr18 10712359 10712774 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 36 of 51) intron (NM_022068, intron 36 of 51) 47083 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 127-19 chr10 58329321 58329545 + 0.666667 NA non-coding (NR_158219, exon 1 of 1) non-coding (NR_158219, exon 1 of 1) 246 NR_158219 112268068 Hs.586671 NR_158219 LOC112268068 - uncharacterized LOC112268068 ncRNA 133-26 chr14 47340385 47340776 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) 2666 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 132-76 chr21 21766180 21766465 + 0.666667 NA intron (NR_109958, intron 2 of 4) L3b|LINE|CR1 19337 NR_109958 101927821 Hs.334181 NR_109958 ENSG00000233997 LINC01425 - long intergenic non-protein coding RNA 1425 ncRNA 185.333-48 chr14 66812748 66813168 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) intron (NM_001024218, intron 3 of 21) 305551 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 131-85 chr6 6540917 6541195 + 0.666667 NA intron (NR_026970, intron 3 of 7) L1MEg|LINE|L1 -47664 NM_004271 9450 Hs.653138 NM_004271 ENSG00000112799 LY86 MD-1|MD1|MMD-1|dJ80N2.1 lymphocyte antigen 86 protein-coding 113.333-82 chr15 26668331 26668550 + 0.666667 NA intron (NM_001278631, intron 3 of 9) intron (NM_001278631, intron 3 of 9) -39350 NR_103801 2562 Hs.302352 NM_000814 ENSG00000166206 GABRB3 ECA5|EIEE43 gamma-aminobutyric acid type A receptor beta3 subunit protein-coding 210.333-138 chr5 110710408 110710860 + 0.666667 NA intron (NM_001039763, intron 1 of 13) L1MA2|LINE|L1 16037 NM_001039763 642987 Hs.729154 NM_001039763 ENSG00000186952 TMEM232 - transmembrane protein 232 protein-coding 153-26 chr12 7854344 7854744 + 0.666667 NA intron (NM_001286237, intron 1 of 9) AluSp|SINE|Alu 18371 NM_001286234 144195 Hs.655169 NM_153449 ENSG00000173262 SLC2A14 GLUT14|SLC2A3P3 solute carrier family 2 member 14 protein-coding 271.667-39 chr2 44517227 44517768 + 0.666667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 155550 NM_024766 79823 Hs.468349 NM_024766 ENSG00000143919 CAMKMT C2orf34|CLNMT|CaM KMT|Cam|KMT calmodulin-lysine N-methyltransferase protein-coding 123-116 chr7 71494227 71494561 + 0.666667 NA intron (NM_022479, intron 5 of 10) AluJo|SINE|Alu -186624 NR_037477 100500836 NR_037477 ENSG00000265878 MIR3914-1 - microRNA 3914-1 ncRNA 253.667-49 chr4 48095373 48096018 + 0.666667 NA intron (NM_003328, intron 6 of 14) intron (NM_003328, intron 6 of 14) 38555 NM_003328 7294 Hs.479669 NM_003328 ENSG00000074966 TXK BTKL|PSCTK5|PTK4|RLK|TKL TXK tyrosine kinase protein-coding 209.667-20 chr10 60735175 60735640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1879 NM_001204403 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 150-41 chr14 35500723 35501066 + 0.666667 NA Intergenic (AAATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -33270 NM_032594 84684 Hs.62813 NM_032594 ENSG00000168348 INSM2 IA-6|IA6|mlt1 INSM transcriptional repressor 2 protein-coding 119.333-32 chr10 55954201 55954410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -326363 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 122.667-149 chr5 17420508 17420833 + 0.666667 NA intron (NR_134274, intron 1 of 1) intron (NR_134274, intron 1 of 1) -16067 NR_134273 101929544 Hs.23725 NR_134273 ENSG00000248455 LINC02217 - long intergenic non-protein coding RNA 2217 ncRNA 129.667-15 chr1 181590455 181590719 + 0.666667 NA intron (NM_001205293, intron 6 of 47) Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger 107070 NM_000721 777 Hs.437444 NM_000721 ENSG00000198216 CACNA1E BII|CACH6|CACNL1A6|Cav2.3|EIEE69|gm139 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E protein-coding 112-144 chr3 184536875 184537049 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 19956 NR_046593 100874079 Hs.574899 NR_046593 ENSG00000230215 LINC01840 EIF2B5-AS1 long intergenic non-protein coding RNA 1840 ncRNA 124-53 chr19 35971559 35971760 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23529 NM_001042631 644096 Hs.356460 NM_001042631 ENSG00000205138 SDHAF1 LYRM8 succinate dehydrogenase complex assembly factor 1 protein-coding 176.667-99 chr3 48388340 48388754 + 0.666667 NA intron (NM_207102, intron 10 of 10) L1MA7|LINE|L1 16328 NM_001159929 285231 Hs.288793 NM_207102 ENSG00000164049 FBXW12 FBW12|FBXO12|FBXO35 F-box and WD repeat domain containing 12 protein-coding 143-47 chr15 80499203 80499501 + 0.666667 NA intron (NM_014862, intron 5 of 18) MIR|SINE|MIR 63592 NR_120363 101929586 Hs.569426 NR_120363 ENSG00000259175 LOC101929586 - uncharacterized LOC101929586 ncRNA 225.333-12 chr10 25853282 25853956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 80091 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 134-89 chr5 159072413 159072658 + 0.666667 NA intron (NM_182708, intron 5 of 14) intron (NM_182708, intron 5 of 14) 25421 NM_001364158 1879 Hs.573143 NM_024007 ENSG00000164330 EBF1 COE1|EBF|O/E-1|OLF1 EBF transcription factor 1 protein-coding 112.667-249 chr7 70714497 70714716 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 6 of 18) L1MC5a|LINE|L1 -417538 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 163.667-178 chr4 48738935 48739238 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 1 of 63) L1MC1|LINE|L1 41213 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 271.333-57 chr5 17159044 17159712 + 0.666667 NA intron (NR_027253, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu -3386 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 140.667-8 chr1 76823053 76823386 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -43952 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 194.333-82 chr20 53788943 53789378 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 86549 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 147-21 chr11 21512255 21512574 + 0.666667 NA intron (NM_201551, intron 15 of 18) intron (NM_201551, intron 15 of 18) -680671 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 340.667-16 chr5 14038385 14039178 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -94301 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 119.667-195 chrX 50833854 50834137 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -19951 NR_027121 57477 Hs.420541 NM_020717 ENSG00000158352 SHROOM4 SHAP|shrm4 shroom family member 4 protein-coding 116.333-199 chr7 78164729 78165056 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 14 of 20) intron (NM_001301128, intron 14 of 20) -182350 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 125.667-81 chr18 8110396 8110745 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 11 of 30) intron (NM_002845, intron 11 of 30) 256464 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 147.333-329 chr9 22214153 22214571 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -205049 NM_078487 1030 Hs.72901 NM_004936 ENSG00000147883 CDKN2B CDK4I|INK4B|MTS2|P15|TP15|p15INK4b cyclin dependent kinase inhibitor 2B protein-coding 130.667-68 chr14 63192583 63192882 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11711 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 170-128 chrX 63820441 63820896 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -34581 NR_031567 100302115 NR_031567 ENSG00000222532 MIR1468 MIRN1468|hsa-mir-1468|mir-1468 microRNA 1468 ncRNA 180.667-25 chr12 5009756 5010158 + 0.666667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -33922 NM_002234 3741 Hs.150208 NM_002234 ENSG00000130037 KCNA5 ATFB7|HCK1|HK2|HPCN1|KV1.5|PCN1 potassium voltage-gated channel subfamily A member 5 protein-coding 129.333-162 chr5 145117726 145118018 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 717470 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 139-10 chr10 22812005 22812347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -97598 NM_005028 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 211.667-113 chr8 127455206 127455690 + 0.666667 NA intron (NR_024393, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 26691 NR_024393 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 136.333-165 chr5 39189351 39189635 + 0.666667 NA intron (NM_001243093, intron 2 of 18) intron (NM_001243093, intron 2 of 18) 30070 NM_001465 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 201.333-66 chr12 3370229 3370792 + 0.666667 NA intron (NR_146865, intron 2 of 2) AluJo|SINE|Alu 2402 NR_146865 101930162 Hs.351489 NR_146865 LINC02417 - long intergenic non-protein coding RNA 2417 ncRNA 114-29 chr13 22531041 22531341 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 320906 NR_103810 100506622 Hs.255773 NR_103810 ENSG00000276476 LINC00540 - long intergenic non-protein coding RNA 540 ncRNA 134.667-9 chr1 183311925 183312159 + 0.666667 NA intron (NM_015039, intron 1 of 10) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -7168 NM_170706 23057 Hs.497123 NM_015039 ENSG00000157064 NMNAT2 C1orf15|PNAT2 nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 protein-coding 237.333-118 chr8 87515875 87516484 + 0.666667 NA Intergenic MER50B|LTR|ERV1 357836 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 166.333-124 chr2 154049434 154049779 + 0.666667 NA intron (NM_052917, intron 3 of 12) intron (NM_052917, intron 3 of 12) 105212 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 112.667-87 chr16 80060893 80061162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 265778 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 175.667-101 chr3 128473720 128474084 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6654 NM_153330 165721 Hs.518241 NM_153330 ENSG00000179407 DNAJB8 CT156|DJ6 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B8 protein-coding 147-83 chr20 37972536 37972853 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60762 NM_014657 9675 Hs.655481 NM_014657 ENSG00000101407 TTI1 KIAA0406|smg-10 TELO2 interacting protein 1 protein-coding 153-117 chr6 44840733 44841180 + 0.666667 NA intron (NM_181356, intron 12 of 12) intron (NM_181356, intron 12 of 12) -289075 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 127.333-90 chr20 10006841 10007069 + 0.666667 NA non-coding (NR_109861, exon 2 of 2) non-coding (NR_109861, exon 2 of 2) 20622 NR_109861 101929371 Hs.619265 NR_109861 PARAL1 - PPARG activating RBM14 associated lncRNA 1 ncRNA 155.667-343 chr8 37011127 37011473 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 226926 NR_134267 157855 Hs.13861 NM_001031836 ENSG00000215262 KCNU1 KCNMC1|KCa5|KCa5.1|Kcnma3|Slo3 potassium calcium-activated channel subfamily U member 1 protein-coding 187.333-139 chr4 73450808 73451299 + 0.666667 NA intron (NM_001354717, intron 11 of 14) (TAACTCA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 14832 NM_001134 174 Hs.518808 NM_001134 ENSG00000081051 AFP AFPD|FETA|HPAFP alpha fetoprotein protein-coding 149.667-186 chr2 21278826 21279135 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 154994 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 146-133 chr8 27317547 27317899 + 0.666667 NA intron (NM_173174, intron 3 of 35) MER102b|DNA|hAT-Charlie -4679 NM_004103 2185 Hs.491322 NM_004103 ENSG00000120899 PTK2B CADTK|CAKB|FADK2|FAK2|PKB|PTK|PYK2|RAFTK protein tyrosine kinase 2 beta protein-coding 195.333-43 chr11 14835663 14836164 + 0.666667 NA intron (NM_000922, intron 11 of 15) AluJr|SINE|Alu 56292 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 144.667-282 chr7 48969438 48969797 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 45070 NM_152627 168448 Hs.567757 NM_152627 ENSG00000218305 CDC14C CDC14B2|CDC14Bretro cell division cycle 14C protein-coding 158.333-355 chrX 110047489 110047936 + 0.666667 NA intron (NM_001353850, intron 2 of 7) Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger -7617 NR_030381 724022 NR_030381 ENSG00000208013 MIR652 MIRN652|hsa-mir-652 microRNA 652 ncRNA 115.333-130 chr22 32855229 32855457 + 0.666667 NA intron (NM_000362, intron 2 of 4) intron (NM_000362, intron 2 of 4) 54527 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 126-48 chr18 51453488 51453801 + 0.666667 NA intron (NR_040074, intron 1 of 2) L1MD2|LINE|L1 61602 NR_040075 100287225 Hs.448920 NR_040074 ENSG00000227115 LINC01630 - long intergenic non-protein coding RNA 1630 ncRNA 160.667-187 chr3 6041302 6041711 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 763943 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 192.667-8 chr1 118851285 118851747 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 136827 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 193-51 chr2 229471047 229471497 + 0.666667 NA intron (NM_139072, intron 7 of 12) intron (NM_139072, intron 7 of 12) -199985 NM_017933 55022 Hs.745038 NM_017933 ENSG00000153823 PID1 HMFN2073|NYGGF4|P-CLI1|PCLI1 phosphotyrosine interaction domain containing 1 protein-coding 113-68 chr15 61443563 61443810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -214384 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 116-70 chr2 26717134 26717452 + 0.666667 NA intron (NM_002246, intron 1 of 1) intron (NM_002246, intron 1 of 1) 24571 NM_002246 3777 Hs.24040 NM_002246 ENSG00000171303 KCNK3 K2p3.1|OAT1|PPH4|TASK|TASK-1|TBAK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 3 protein-coding 146.333-2 chr1 16607069 16607358 + 0.666667 NA intron (NM_017940, intron 2 of 28) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 6392 NM_017940 55672 Hs.467587 NM_017940 ENSG00000219481 NBPF1 AB13|AB14|AB23|AD2|NBG|NBPF NBPF member 1 protein-coding 190.333-16 chr10 29893754 29894238 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -157060 NM_001323599 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 117.667-17 chr10 34939840 34940171 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 124237 NR_108043 100505601 Hs.549790 NR_108043 ENSG00000226386 PARD3-AS1 - PARD3 antisense RNA 1 ncRNA 174-70 chr4 35224298 35224660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -954732 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 209.333-32 chr11 35288335 35288670 + 0.666667 NA intron (NM_001252652, intron 8 of 11) intron (NM_001252652, intron 8 of 11) 125552 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 201-14 chr1 215013762 215014183 + 0.666667 NA intron (NM_001017424, intron 1 of 6) L1MC|LINE|L1 8430 NM_001017424 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 206-66 chr2 9639392 9639893 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8645 NM_006826 10971 Hs.74405 NM_006826 ENSG00000134308 YWHAQ 14-3-3|1C5|HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein theta protein-coding 197.667-71 chr2 185597075 185597462 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 141451 NR_110216 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 130-12 chr10 37366712 37366974 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 57657 NR_104061 101929520 Hs.144151 NR_104061 ENSG00000235687 LINC00993 - long intergenic non-protein coding RNA 993 ncRNA 209-31 chr12 44214907 44215469 + 0.666667 NA intron (NM_001286213, intron 4 of 6) intron (NM_001286213, intron 4 of 6) 379107 NM_032256 84216 Hs.444668 NM_032256 ENSG00000139173 TMEM117 - transmembrane protein 117 protein-coding 208-67 chr19 28619118 28619468 + 0.666667 NA intron (NR_110759, intron 5 of 9) MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 12605 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 159.667-267 chr5 114398444 114398860 + 0.666667 NA intron (NM_001278204, intron 2 of 6) L1PA15|LINE|L1 -34859 NM_170775 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 135.667-71 chr16 86523804 86524046 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13398 NM_001451 2294 Hs.155591 NM_001451 ENSG00000103241 FOXF1 ACDMPV|FKHL5|FREAC1 forkhead box F1 protein-coding 118.333-31 chr10 53489665 53489934 + 0.666667 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -718099 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 136-35 chr14 69097776 69098016 + 0.666667 NA intron (NM_003861, intron 5 of 8) L2a|LINE|L2 54703 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 242-45 chr2 168129838 168130287 + 0.666667 NA intron (NM_013233, intron 8 of 17) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 117533 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 160.667-293 chr7 136258338 136258810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -281215 NM_145808 136319 Hs.602015 NM_145808 ENSG00000105887 MTPN GCDP|V-1 myotrophin protein-coding 132.333-174 chr8 31608250 31608594 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31330 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 134.333-78 chr18 65066934 65067245 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -683163 NM_033646 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 163.333-86 chr14 59961417 59961763 + 0.666667 NA intron (NR_075071, intron 10 of 32) intron (NR_075071, intron 10 of 32) 41877 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 201-115 chr9 22707883 22708235 + 0.666667 NA intron (NR_038977, intron 3 of 5) HAL1M8|LINE|L1 61859 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 157.667-145 chr2 82588555 82588871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -268090 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 164.333-250 chr9 79270389 79270765 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -124911 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 210-162 chrX 154366354 154366973 + 0.666667 NA intron (NM_001110556, intron 6 of 47) intron (NM_001110556, intron 6 of 47) 7971 NM_001110556 2316 Hs.195464 NM_001456 ENSG00000196924 FLNA ABP-280|ABPX|CSBS|CVD1|FGS2|FLN|FLN-A|FLN1|FMD|MNS|NHBP|OPD|OPD1|OPD2|XLVD|XMVD filamin A protein-coding 124-110 chr7 62747380 62747733 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 556500 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 131-39 chr17 71842626 71842868 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 183232 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 115.667-17 chr10 18651437 18651765 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001351117) promoter-TSS (NM_001351117) -14 NM_182543 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 146.333-175 chr20 344298 344730 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -2212 NR_136649 80023 Hs.416024 NM_024958 ENSG00000125841 NRSN2 C20orf98|dJ1103G7.6 neurensin 2 protein-coding 141-86 chr7 45155284 45155542 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -2378 NM_005856 10268 Hs.25691 NM_005856 ENSG00000122679 RAMP3 - receptor activity modifying protein 3 protein-coding 138-11 chr10 20009015 20009353 + 0.666667 NA intron (NM_001282736, intron 2 of 12) intron (NM_001282736, intron 2 of 12) 192752 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 153-71 chr2 33716343 33716794 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu 9682 NR_126403 104355287 Hs.636582 NR_126403 ENSG00000228262 LINC01317 - long intergenic non-protein coding RNA 1317 ncRNA 270-40 chr3 108930892 108931460 + 0.666667 NA intron (NM_001363884, intron 1 of 3) intron (NM_001363884, intron 1 of 3) 22670 NM_001363884 9626 Hs.233363 NM_005459 ENSG00000138472 GUCA1C GCAP3 guanylate cyclase activator 1C protein-coding 137.333-69 chr17 64620595 64620857 + 0.666667 NA intron (NM_022739, intron 1 of 18) L2a|LINE|L2 41581 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 174.667-179 chr9 81893875 81894307 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19346 NR_026851 347127 Hs.215235 NM_198509 ENSG00000240632 SPATA31D5P FAM75D5|FAM75D5P SPATA31 subfamily D member 5, pseudogene pseudo 207.333-23 chr1 234104487 234105102 + 0.666667 NA intron (NM_173508, intron 2 of 7) MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR -109417 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 130-64 chr2 220047267 220047510 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140823 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 114.333-106 chr2 77021535 77021749 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR 35677 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 129.667-170 chr8 78066000 78066299 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -450191 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 112.667-117 chr2 34924131 34924411 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 246714 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 173.333-188 chr7 53996479 53996840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -184728 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 196.667-132 chr6 65159096 65159522 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) intron (NM_001292009, intron 12 of 43) -142109 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 131-33 chr15 73123373 73123620 + 0.666667 NA intron (NM_002499, intron 3 of 28) intron (NM_002499, intron 3 of 28) 71012 NM_001172623 4756 Hs.388613 NM_002499 ENSG00000067141 NEO1 IGDCC2|NGN|NTN1R2 neogenin 1 protein-coding 177.666-33 chr9 76869389 76869912 + 0.666667 NA intron (NM_001308048, intron 1 of 17) intron (NM_001308048, intron 1 of 17) 36437 NM_001308047 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 234.667-108 chr8 25698833 25699377 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 239872 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 222.333-70 chr5 3800385 3800838 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 204779 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 128.667-177 chr8 56977253 56977599 + 0.666667 NA intron (NM_017813, intron 3 of 4) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 16441 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 137-107 chr8 125306754 125307132 + 0.666667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) MIR|SINE|MIR -123415 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 126.667-111 chr3 126143591 126143912 + 0.666667 NA intron (NR_072979, intron 9 of 20) AluJo|SINE|Alu -36314 NR_046383 100862662 Hs.633362 NR_046383 ENSG00000246022 ALDH1L1-AS2 - ALDH1L1 antisense RNA 2 ncRNA 160.667-55 chr11 36762608 36762933 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -164491 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 215.667-108 chr6 135588658 135589148 + 0.666667 NA intron (NR_152845, intron 2 of 4) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 91102 NR_026805 100131814 Hs.734007 NR_026805 ENSG00000231028 LINC00271 C6orf217|NCRNA00271 long intergenic non-protein coding RNA 271 ncRNA 129.667-123 chr3 108637552 108637795 + 0.666667 NA intron (NM_014648, intron 12 of 32) intron (NM_014648, intron 12 of 32) 47951 NM_014648 9666 Hs.409210 NM_014648 ENSG00000198919 DZIP3 PPP1R66|UURF2|hRUL138 DAZ interacting zinc finger protein 3 protein-coding 145.333-274 chr7 61916035 61916330 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1387874 NR_003952 643955 Hs.583308 NR_003952 ENSG00000185037 ZNF733P ZNF733 zinc finger protein 733, pseudogene pseudo 183-86 chr5 111282744 111283262 + 0.666667 NA intron (NM_001744, intron 1 of 10) MER47B|DNA|TcMar-Tigger 58619 NM_001323376 814 Hs.438801 NM_001744 ENSG00000152495 CAMK4 CaMK IV|CaMK-GR|CaMKIV|caMK calcium/calmodulin dependent protein kinase IV protein-coding 139.333-28 chr10 118716428 118716767 + 0.666667 NA intron (NM_153810, intron 3 of 8) intron (NM_153810, intron 3 of 8) 38373 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 207.667-59 chr2 170301990 170302367 + 0.666667 NA intron (NM_001083615, intron 7 of 33) intron (NM_001083615, intron 7 of 33) 48765 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 121.667-83 chr18 33931391 33931606 + 0.666667 NA intron (NM_001198548, intron 7 of 8) AluJo|SINE|Alu 117114 NM_001198549 8715 Hs.514795 NM_003787 ENSG00000101746 NOL4 CT125|HRIHFB2255|NOLP nucleolar protein 4 protein-coding 118.333-169 chr5 122946036 122946241 + 0.666667 NA non-coding (NR_146145, exon 3 of 8) non-coding (NR_146145, exon 3 of 8) 90587 NM_000943 5480 Hs.110364 NM_000943 ENSG00000168938 PPIC CYPC peptidylprolyl isomerase C protein-coding 280.666-24 chr5 81571336 81572096 + 0.666667 NA intron (NM_012446, intron 4 of 16) intron (NM_012446, intron 4 of 16) -177582 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 153.667-48 chr10 71531889 71532198 + 0.666667 NA intron (NM_052836, intron 6 of 12) intron (NM_052836, intron 6 of 12) -20123 NR_120672 102723377 Hs.568789 NR_120672 ENSG00000223817 CDH23-AS1 C10orf106|NCRNA00223|bA327E2.3 CDH23 antisense RNA 1 ncRNA 122.667-127 chr3 155630431 155630734 + 0.666667 NA intron (NM_001349252, intron 2 of 24) intron (NM_001349252, intron 2 of 24) 45761 NM_001130961 23007 Hs.567423 NM_014996 ENSG00000114805 PLCH1 PLCL3 phospholipase C eta 1 protein-coding 149.333-438 chr9 116488243 116488553 + 0.666667 NA intron (NM_014010, intron 18 of 21) MIR3|SINE|MIR -15885 NR_033973 100128505 Hs.675821 NR_033973 ENSG00000229105 ASTN2-AS1 - ASTN2 antisense RNA 1 ncRNA 124-102 chr6 27509816 27510029 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -36804 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 234-48 chr22 46874951 46875565 + 0.666667 NA intron (NM_001284305, intron 4 of 12) L1ME2|LINE|L1 40784 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 171.333-44 chr14 46840764 46841129 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_182830, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_182830, exon 17 of 17) -189165 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 128.333-80 chr17 72104382 72104684 + 0.666667 NA intron (NR_103738, intron 2 of 6) intron (NR_103738, intron 2 of 6) 11483 NR_103738 400618 Hs.657374 NR_103737 ENSG00000234899 SOX9-AS1 - SOX9 antisense RNA 1 ncRNA 154-12 chr1 242212363 242212731 + 0.666667 NA intron (NM_001320272, intron 6 of 10) intron (NM_001320272, intron 6 of 10) -213449 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 140.667-177 chr5 18989807 18990078 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 896330 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 128.333-141 chr4 74559265 74559504 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 114248 NM_001657 374 Hs.270833 NM_001657 ENSG00000109321 AREG AR|AREGB|CRDGF|SDGF amphiregulin protein-coding 133.333-26 chr10 76853137 76853430 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -34761 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 142-154 chr8 80726097 80726375 + 0.666667 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) intron (NM_001033723, intron 2 of 8) 148232 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 163.667-143 chr21 31939575 31939936 + 0.666667 NA intron (NM_014586, intron 2 of 10) intron (NM_014586, intron 2 of 10) 66735 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 116.667-144 chr4 38070151 38070440 + 0.666667 NA intron (NM_001253912, intron 14 of 20) intron (NM_001253912, intron 14 of 20) -39886 NM_001253913 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 158-47 chr14 85950828 85951142 + 0.666667 NA intron (NR_110155, intron 1 of 3) L1ME3A|LINE|L1 16307 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 183.667-13 chr1 173799606 173800024 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001127181, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001127181, exon 7 of 7) 24317 NM_001171182 91687 Hs.531856 NM_033319 ENSG00000120334 CENPL C1orf155|CENP-L|dJ383J4.3 centromere protein L protein-coding 132.333-172 chr8 13103971 13104298 + 0.666667 NA intron (NM_001348084, intron 2 of 12).2 intron (NM_001348084, intron 2 of 12).2 12110 NM_001164271 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 157-129 chr8 55257029 55257355 + 0.666667 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 155164 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 112.333-121 chr2 43622343 43622646 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14766 NM_172069 130271 Hs.164162 NM_172069 ENSG00000152527 PLEKHH2 PLEKHH1L pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H2 protein-coding 129.333-149 chr5 28063590 28063923 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 223909 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 136.667-91 chr2 54701511 54701725 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -23394 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 230.333-63 chr2 70400865 70401451 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 80482 NR_046798 100874273 Hs.682157 NR_046798 ENSG00000224606 TGFA-IT1 - TGFA intronic transcript 1 ncRNA 238-50 chr2 122355495 122355925 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 600059 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 139.333-12 chr1 174917676 174917995 + 0.666667 NA intron (NM_001366451, intron 5 of 12) AluSx1|SINE|Alu 36426 NR_121196 101928696 Hs.666680 NR_121196 ENSG00000229531 LOC101928696 - uncharacterized LOC101928696 ncRNA 153.333-153 chr16 52162962 52163330 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 77865 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 132.667-163 chr7 46722464 46722847 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -25533 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 151.667-401 chrX 49894155 49894482 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie 14834 NM_001145073 389856 Hs.143587 NM_001145073 ENSG00000273820 USP27X MRX105|USP22L|USP27 ubiquitin specific peptidase 27 X-linked protein-coding 187 chr1 74371950 74372338 + 0.666667 NA intron (NM_015978, intron 17 of 24) LTR23|LTR|ERV1 111296 NM_001364665 105378803 NM_001364665 ENSG00000162621 LRRC53 - leucine rich repeat containing 53 protein-coding 221.667-26 chr14 32357712 32358213 + 0.666667 NA intron (NM_004274, intron 1 of 13) intron (NM_004274, intron 1 of 13) 28664 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 254.667 chr1 40061729 40062392 + 0.666667 NA intron (NM_001350484, intron 5 of 13) intron (NM_001350484, intron 5 of 13) 21209 NM_001350481 10487 Hs.370581 NM_006367 ENSG00000131236 CAP1 CAP|CAP1-PEN cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 1 protein-coding 113-207 chr8 117043697 117044012 + 0.666667 NA intron (NM_001172815, intron 2 of 10) intron (NM_001172815, intron 2 of 10) -91141 NM_173851 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 116.333-67 chr14 68349695 68349969 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 8 of 10) intron (NM_133509, intron 8 of 10) 278955 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 120.667-92 chr2 46168672 46168893 + 0.666667 NA intron (NM_005400, intron 14 of 14) intron (NM_005400, intron 14 of 14) -128625 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 141.667-15 chr1 196321844 196322253 + 0.666667 NA intron (NR_146057, intron 18 of 26) intron (NR_146057, intron 18 of 26) -233333 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 329-4 chr1 179736666 179737534 + 0.666667 NA intron (NM_001329716, intron 1 of 6) L1MA10|LINE|L1 -4909 NR_138086 148753 Hs.400696 NM_173509 ENSG00000143340 FAM163A C1orf76|NDSP family with sequence similarity 163 member A protein-coding 118-136 chr9 29743528 29743830 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -530078 NM_001354574 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 126-7 chr10 12604648 12604859 + 0.666667 NA intron (NM_001351032, intron 4 of 11) intron (NM_001351032, intron 4 of 11) 26000 NR_039700 100616151 NR_039700 ENSG00000263584 MIR4480 - microRNA 4480 ncRNA 114-35 chr14 59703551 59703737 + 0.666667 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) L2a|LINE|L2 -56624 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 188-91 chr5 113975550 113975930 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -386330 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 145-120 chr8 81861700 81862002 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19565 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 161.667-57 chr12 88801529 88801942 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 217957 NR_038385 728084 Hs.132563 NR_038385 ENSG00000246363 LINC02458 - long intergenic non-protein coding RNA 2458 ncRNA 186-95 chr7 23353015 23353564 + 0.666667 NA intron (NM_006547, intron 5 of 14) intron (NM_006547, intron 5 of 14) -43157 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 183-46 chr16 75000581 75000980 + 0.666667 NA intron (NM_032268, intron 1 of 4) intron (NM_032268, intron 1 of 4) 1756 NM_032268 84937 Hs.427284 NM_032268 ENSG00000186187 ZNRF1 NIN283 zinc and ring finger 1 protein-coding 269.333-78 chr7 34422369 34423002 + 0.666667 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 -235533 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 118-36 chr14 55199693 55199976 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8249 NM_001146015 9787 Hs.77695 NM_014750 ENSG00000126787 DLGAP5 DLG7|HURP DLG associated protein 5 protein-coding 142.667-33 chr11 81842815 81843235 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 47811 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 121.667-167 chr5 97497583 97497907 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6951 NR_105028 102546227 Hs.582516 NR_105028 ENSG00000250331 LINC01340 - long intergenic non-protein coding RNA 1340 ncRNA 182.333-5 chr1 62177237 62177738 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -17362 NM_001164835 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 141-64 chr5 5113337 5113603 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 26584 NR_109915 101929176 Hs.208717 NR_109915 CTD-2297D10.2 - uncharacterized LOC101929176 ncRNA 112-208 chr8 130651608 130651814 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -208037 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 112.667-257 chr7 137315951 137316179 + 0.666667 NA intron (NM_001321387, intron 1 of 4) Charlie15a|DNA|hAT-Charlie 27668 NM_002825 5764 Hs.371249 NM_002825 ENSG00000105894 PTN HARP|HB-GAM|HBBM|HBGF-8|HBGF8|HBNF|HBNF-1|NEGF1|OSF-1 pleiotrophin protein-coding 168.667-40 chr12 20658515 20658910 + 0.666667 NA intron (NM_000921, intron 15 of 15) MER67D|LTR|ERV1 -36643 NM_001145946 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 155.333-95 chr13 70845768 70846082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -169216 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 199 chr1 71510313 71510808 + 0.666667 NA intron (NM_173808, intron 6 of 6) LTR71A|LTR|ERV1 326452 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 137.667-117 chr3 22554135 22554414 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 597135 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 150.667-290 chr5 25438338 25438788 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 247610 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 122.333-133 chr3 15848945 15849302 + 0.666667 NA intron (NM_001349279, intron 1 of 28) L1MB7|LINE|L1 10691 NM_001349279 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 114.667-110 chr17 80636148 80636414 + 0.666667 NA intron (NM_020761, intron 2 of 33) intron (NM_020761, intron 2 of 33) 91443 NM_020761 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 180-44 chr17 67920225 67920612 + 0.666667 NA intron (NM_182641, intron 13 of 27) L2b|LINE|L2 73188 NM_181656 284018 Hs.90790 NM_181655 ENSG00000186665 C17orf58 - chromosome 17 open reading frame 58 protein-coding 139.333-14 chr1 194363300 194363637 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1058723 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 170-120 chr8 103216181 103216675 + 0.666667 NA intron (NM_001364874, intron 3 of 3) intron (NM_001364874, intron 3 of 3) -44288 NR_109954 100499183 Hs.654812 NR_034092 ENSG00000247081 BAALC-AS1 FZD6-DT|lncFZD6 BAALC antisense RNA 1 ncRNA 198.667-147 chr5 41972292 41972711 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 47220 NM_012176 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 127-49 chr2 106768769 106769037 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 117125 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 198.333-55 chr14 34622639 34623084 + 0.666667 NA intron (NM_001366519, intron 2 of 12) MIR|SINE|MIR 7287 NR_159357 58533 Hs.276523 NM_021249 ENSG00000129515 SNX6 MSTP010|TFAF2 sorting nexin 6 protein-coding 125-121 chr8 142784412 142784701 + 0.666667 NA TTS (NM_003695) TTS (NM_003695) 1983 NM_003695 8581 Hs.415762 NM_003695 ENSG00000167656 LY6D E48|Ly-6D lymphocyte antigen 6 family member D protein-coding 149.667-231 chr20 12703405 12703751 + 0.666667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 233385 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 156.667-44 chr10 61694511 61694951 + 0.666667 NA intron (NM_173554, intron 4 of 6) L1MEg|LINE|L1 31770 NM_173554 219621 Hs.673160 NM_173554 ENSG00000183346 CABCOCO1 C10orf107 ciliary associated calcium binding coiled-coil 1 protein-coding 138.333-28 chr10 58438583 58438919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53341 NM_003201 7019 Hs.594250 NM_003201 ENSG00000108064 TFAM MTDPS15|MTTF1|MTTFA|TCF6|TCF6L1|TCF6L2|TCF6L3 transcription factor A, mitochondrial protein-coding 248-20 chr14 21808482 21809145 + 0.666667 NA Intergenic MER84|LTR|ERV1 -137796 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 112.333-56 chr12 60898369 60898578 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 1209103 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 122.333-29 chr11 17485597 17485823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8865 NM_001351295 6833 Hs.54470 NM_000352 ENSG00000006071 ABCC8 ABC36|HHF1|HI|HRINS|MRP8|PHHI|SUR|SUR1|SUR1delta2|TNDM2 ATP binding cassette subfamily C member 8 protein-coding 124.667-144 chr3 185177235 185177551 + 0.666667 NA non-coding (NR_038990, exon 2 of 7) non-coding (NR_038990, exon 2 of 7) 14492 NR_038990 339926 Hs.567848 NR_038990 ENSG00000223358 EHHADH-AS1 - EHHADH antisense RNA 1 ncRNA 137-73 chr4 97159208 97159505 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -207570 NR_102713 101410545 Hs.628520 NR_102713 ENSG00000251620 STPG2-AS1 - STPG2 antisense RNA 1 ncRNA 347.333-29 chr8 85114186 85114751 + 0.666667 NA intron (NM_001349637, intron 4 of 18) intron (NM_001349637, intron 4 of 18) 7230 NM_033402 85444 Hs.193115 NM_033402 ENSG00000133739 LRRCC1 CLERC|CLERK|SAP2|VFL1 leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 protein-coding 177-32 chr18 3890074 3890593 + 0.666667 NA intron (NM_001242761, intron 3 of 11) intron (NM_001242761, intron 3 of 11) 4980 NR_106776 102465430 NR_106776 ENSG00000275518 MIR6718 hsa-mir-6718 microRNA 6718 ncRNA 124.333-83 chr2 63538257 63538619 + 0.666667 NA intron (NR_148705, intron 1 of 16) intron (NR_148705, intron 1 of 16) 50039 NM_015910 51057 Hs.414952 NM_015910 ENSG00000143951 WDPCP BBS15|C2orf86|CHDTHP|CPLANE5|FRITZ|FRTZ WD repeat containing planar cell polarity effector protein-coding 221.333-73 chr2 194323061 194323538 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20970 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 144.667-317 chr9 12106199 12106494 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -587039 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 225-40 chr2 213127181 213127720 + 0.666667 NA intron (NM_001371277, intron 3 of 6) intron (NM_001371277, intron 3 of 6) 22987 NM_001371275 154.667-145 chr17 76896190 76896459 + 0.666667 NA intron (NM_144677, intron 3 of 16) intron (NM_144677, intron 3 of 16) 23677 NM_198955 146664 Hs.144531 NM_144677 ENSG00000167889 MGAT5B GnT-IX|GnT-VB alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B protein-coding 122.667-73 chr17 65625690 65625952 + 0.666667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -64173 NM_001363813 8313 Hs.156527 NM_004655 ENSG00000168646 AXIN2 AXIL|ODCRCS axin 2 protein-coding 140-80 chr4 100361074 100361404 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 34008 NR_135619 107399301 NR_135619 SNORA101A - small nucleolar RNA, H/ACA box 101A snoRNA 215.667-54 chr19 34044602 34045038 + 0.666667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -127684 NM_015578 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 156.333-72 chr12 20747757 20748192 + 0.666667 NA intron (NM_017435, intron 13 of 14) L1MC4|LINE|L1 52509 NM_017435 53919 Hs.47261 NM_017435 ENSG00000139155 SLCO1C1 OATP-F|OATP1|OATP14|OATP1C1|OATPF|OATPRP5|SLC21A14 solute carrier organic anion transporter family member 1C1 protein-coding 159.333-49 chr10 82064516 82064844 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 168240 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 148-57 chr17 59108469 59108849 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1779 NM_001353082 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 118-91 chr3 58127586 58127872 + 0.666667 NA intron (NM_001164318, intron 24 of 45) intron (NM_001164318, intron 24 of 45) 42906 NR_135534 105377105 Hs.613914 NR_135534 ENSG00000244161 FLNB-AS1 - FLNB antisense RNA 1 ncRNA 186-3 chr1 66982726 66983179 + 0.666667 NA intron (NM_001077700, intron 13 of 13) intron (NM_001077700, intron 13 of 13) 52696 NM_001077701 57708 Hs.605432 NM_020948 ENSG00000198160 MIER1 ER1|MI-ER1 MIER1 transcriptional regulator protein-coding 142.333-101 chr17 40378588 40378874 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13994 NM_152219 125111 Hs.444663 NM_152219 ENSG00000183153 GJD3 CX31.9|Cx30.2|GJA11|GJC1 gap junction protein delta 3 protein-coding 144.333-272 chr8 119810063 119810449 + 0.666667 NA intron (NM_003184, intron 3 of 25) L1ME1|LINE|L1 22585 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 149-76 chr20 21446011 21446425 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -48692 NM_033176 644524 NM_033176 ENSG00000125816 NKX2-4 NKX2.4|NKX2D NK2 homeobox 4 protein-coding 114.667-243 chr8 66411121 66411411 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 17711 NR_040434 100505676 Hs.121613 NM_001242759 ENSG00000246145 RRS1-AS1 - RRS1 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 154.333-159 chr2 98951535 98951901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15493 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 121-35 chr12 61761914 61762149 + 0.666667 NA intron (NM_178539, intron 2 of 4) MSTA|LTR|ERVL-MaLR 430808 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 126.333-156 chr6 122591678 122592002 + 0.666667 NA intron (NM_181794, intron 3 of 6) AluJb|SINE|Alu -18392 NM_032471 5570 Hs.741340 NM_032471 ENSG00000135549 PKIB PRKACN2 cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta protein-coding 157.333-184 chr2 69199693 69200150 + 0.666667 NA intron (NM_032208, intron 17 of 17) intron (NM_032208, intron 17 of 17) 96239 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 115-91 chr2 120418603 120418835 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 47630 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 146.667-152 chr2 28933926 28934212 + 0.666667 NA intron (NM_015131, intron 11 of 17) L1ME1|LINE|L1 6086 NR_145755 109617012 NR_145755 ENSG00000265706 SNORD53B - small nucleolar RNA, C/D box 53B snoRNA 150.667-195 chr2 182021800 182022102 + 0.666667 NA intron (NM_001261425, intron 2 of 5) intron (NM_001261425, intron 2 of 5) 36098 NM_001261425 151242 Hs.10941 NM_001080545 ENSG00000150722 PPP1R1C IPP5 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1C protein-coding 164.333-220 chr6 160153741 160154086 + 0.666667 NA intron (NM_153187, intron 8 of 9) intron (NM_153187, intron 8 of 9) 32082 NM_153187 6580 Hs.117367 NM_003057 ENSG00000175003 SLC22A1 HOCT1|OCT1|oct1_cds solute carrier family 22 member 1 protein-coding 161-2 chr1 117762768 117763094 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 156883 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 137.333-18 chr10 55940253 55940635 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -312502 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 115.667-90 chr16 48554496 48554729 + 0.666667 NA intron (NM_153029, intron 2 of 6) intron (NM_153029, intron 2 of 6) 55568 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 116-29 chr11 104719517 104719740 + 0.666667 NA Intergenic Tigger9b|DNA|TcMar-Tigger -110326 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 152.667-213 chr2 222184687 222184998 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -113305 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 153.667-219 chr20 11514067 11514499 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -240900 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 155-99 chr4 30507215 30507530 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -212997 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 337.334 chr14 59966059 59966744 + 0.666667 NA intron (NR_075071, intron 10 of 32) intron (NR_075071, intron 10 of 32) 46688 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 149.667-89 chr12 25847848 25848184 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26063 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 148.333-309 chr5 37946203 37946519 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2130 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 188.333-144 chr7 68636293 68636692 + 0.666667 NA Intergenic Charlie17b|DNA|hAT-Charlie 616239 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 162-21 chr10 118723319 118723737 + 0.666667 NA intron (NM_153810, intron 3 of 8) L1MEg|LINE|L1 31442 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 145-48 chr2 81545216 81545486 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78405 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 159.333-354 chr9 86808843 86809150 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 138510 NM_002048 2619 Hs.65029 NM_002048 ENSG00000180447 GAS1 - growth arrest specific 1 protein-coding 245.667-72 chr8 83976728 83977301 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -205773 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 112.667-68 chr14 66815191 66815506 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 3 of 21) L1PA13|LINE|L1 307941 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 154-96 chr3 147873112 147873425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -204891 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 118.667-201 chr9 24501795 24501988 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43785 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 168-92 chr5 108461969 108462428 + 0.666667 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -80100 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 151.333-344 chr5 89443174 89443597 + 0.666667 NA intron (NR_136221, intron 5 of 6) intron (NR_136221, intron 5 of 6) -539280 NM_001131005 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 180.667-109 chr5 25440161 25440590 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 249422 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 147.333-304 chr7 115870323 115870607 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 97848 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 230.333-49 chr18 7341238 7341835 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 110432 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 116-136 chr6 92872943 92873199 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 546488 NM_001288629 2045 Hs.73962 NM_004440 ENSG00000135333 EPHA7 EHK-3|EHK3|EK11|HEK11 EPH receptor A7 protein-coding 156-48 chr14 70918054 70918518 + 0.666667 NA intron (NM_014982, intron 1 of 35) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 10827 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 148.333-171 chr18 13793918 13794322 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30029 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 189.667-8 chr1 186276150 186276590 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -19903 NM_005807 10216 Hs.647723 NM_005807 ENSG00000116690 PRG4 CACP|HAPO|JCAP|MSF|SZP proteoglycan 4 protein-coding 144.667-281 chr7 46217739 46218109 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -296652 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 119.333-217 chr8 101735219 101735564 + 0.666667 NA intron (NM_001040625, intron 4 of 6) intron (NM_001040625, intron 4 of 6) 55578 NM_032041 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 119-78 chr2 117321652 117321956 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -492887 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 114-38 chr14 67855623 67855959 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 4 of 10) intron (NM_133509, intron 4 of 10) 32199 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 130.333 chr1 8516531 8516773 + 0.666667 NA intron (NM_001042681, intron 7 of 22) MIRb|SINE|MIR -21739 NR_132752 106632271 NR_132752 SNORD128 ZL43 small nucleolar RNA, C/D box 128 snoRNA 125.667-43 chr11 127316314 127316618 + 0.666667 NA intron (NR_120580, intron 1 of 2) L1MEf|LINE|L1 45396 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 179.667-90 chr3 30561601 30561987 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42926 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 122-131 chr9 37290628 37290830 + 0.666667 NA intron (NM_001289120, intron 2 of 8) Looper|DNA|PiggyBac -131967 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 188.333-143 chr7 52831410 52831940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -203958 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 206-76 chr2 47943433 47943758 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37802 NM_001190274 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 123.333-11 chr1 91790072 91790268 + 0.666667 NA intron (NR_036634, intron 4 of 17) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 95981 NM_001195683 7049 Hs.482390 NM_003243 ENSG00000069702 TGFBR3 BGCAN|betaglycan transforming growth factor beta receptor 3 protein-coding 163-62 chr4 183273828 183274164 + 0.666667 NA intron (NM_024949, intron 16 of 22) L1MB8|LINE|L1 -33362 NR_126473 101928734 Hs.570713 NR_126473 ENSG00000251128 WWC2-AS1 - WWC2 antisense RNA 1 ncRNA 161.333-4 chr1 77725171 77725502 + 0.666667 NA intron (NM_015017, intron 12 of 24) L1ME1|LINE|L1 34516 NM_201626 23032 Hs.480597 NM_015017 ENSG00000077254 USP33 VDU1 ubiquitin specific peptidase 33 protein-coding 228.667-31 chr17 62637753 62638171 + 0.666667 NA intron (NM_006039, intron 1 of 29) AluJo|SINE|Alu 10292 NM_006039 9902 Hs.7835 NM_006039 ENSG00000011028 MRC2 CD280|CLEC13E|ENDO180|UPARAP mannose receptor C type 2 protein-coding 160.667-212 chr3 183985002 183985322 + 0.666667 NA intron (NR_135125, intron 6 of 6) intron (NR_135125, intron 6 of 6) -21176 NR_046570 100873982 Hs.570696 NR_046570 ENSG00000223882 ABCC5-AS1 - ABCC5 antisense RNA 1 ncRNA 193.667-107 chr6 15645522 15645993 + 0.666667 NA intron (NM_001271669, intron 1 of 7) L1PA17|LINE|L1 17271 NR_036448 84062 Hs.571148 NM_032122 ENSG00000047579 DTNBP1 BLOC1S8|DBND|HPS7|My031|SDY dystrobrevin binding protein 1 protein-coding 170-23 chr11 128162831 128163323 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45689 NR_146647 105369564 Hs.591937 NR_146647 ENSG00000272575 LINC02098 - long intergenic non-protein coding RNA 2098 ncRNA 152-58 chr14 73289070 73289523 + 0.666667 NA intron (NM_001005743, intron 8 of 12) intron (NM_001005743, intron 8 of 12) -43295 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 183.333-66 chr17 62406781 62407284 + 0.666667 NA exon (NM_173503, exon 8 of 10) exon (NM_173503, exon 8 of 10) -16853 NM_181725 339175 Hs.381204 NM_181725 ENSG00000087995 METTL2A METTL2 methyltransferase like 2A protein-coding 143.333-266 chr7 46619059 46619466 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 77860 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 117.333-224 chrX 40127624 40127909 + 0.666667 NA intron (NM_001123384, intron 1 of 13) AluJr|SINE|Alu -29808 NM_017745 54880 Hs.659681 NM_017745 ENSG00000183337 BCOR ANOP2|MAA2|MCOPS2 BCL6 corepressor protein-coding 175.667-66 chr2 25098026 25098403 + 0.666667 NA intron (NM_014971, intron 3 of 22) intron (NM_014971, intron 3 of 22) 55751 NM_001319099 22979 Hs.4892 NM_014971 ENSG00000084710 EFR3B KIAA0953 EFR3 homolog B protein-coding 155-115 chr6 159830851 159831263 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30781 NM_001271862 154197 Hs.349077 NM_173516 ENSG00000146453 PNLDC1 HsPNLDC1 PARN like, ribonuclease domain containing 1 protein-coding 116-9 chr1 118715865 118716169 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 272326 NM_001330677 6913 Hs.146196 NM_152380 ENSG00000092607 TBX15 TBX14 T-box transcription factor 15 protein-coding 138.333-128 chr4 27842377 27842741 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 625080 NR_125921 101929199 Hs.570815 NR_125921 ENSG00000249699 LINC02261 - long intergenic non-protein coding RNA 2261 ncRNA 130.667-136 chr21 32063426 32063726 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22719 NR_038033 100551499 Hs.224449 NR_038033 LINC00159 C21orf44|NCRNA00159 long intergenic non-protein coding RNA 159 ncRNA 194.667-49 chr17 49724102 49724525 + 0.666667 NA intron (NM_030802, intron 2 of 7) intron (NM_030802, intron 2 of 7) -16349 NM_005827 10237 Hs.154073 NM_005827 ENSG00000121073 SLC35B1 UGTREL1 solute carrier family 35 member B1 protein-coding 113.667-74 chr16 35658348 35658635 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -88061 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 158.333-67 chr12 58841874 58842185 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -60313 NR_120452 101927653 Hs.130744 NR_120452 ENSG00000257259 LINC02388 - long intergenic non-protein coding RNA 2388 ncRNA 201-16 chr10 55186635 55187062 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -385557 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 275.667-41 chr4 29809196 29809861 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 595236 NR_146996 105374561 Hs.582013 NR_146996 ENSG00000248338 LINC02472 - long intergenic non-protein coding RNA 2472 ncRNA 148-162 chr8 131905694 131905987 + 0.666667 NA intron (NM_001323555, intron 1 of 22) intron (NM_001323555, intron 1 of 22) 1747 NR_136615 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 112.667-26 chr10 33756473 33756714 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 16087 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 248.666-27 chr3 82048342 82048924 + 0.666667 NA intron (NR_147146, intron 1 of 8) intron (NR_147146, intron 1 of 8) 62491 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 192.667-7 chr1 117269058 117269460 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26207 NR_126408 104355292 Hs.576446 NR_126408 ENSG00000235202 LINC01525 lnc-MAN1A2-1 long intergenic non-protein coding RNA 1525 ncRNA 160-74 chr22 38404983 38405342 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -6236 NR_002821 400927 Hs.720223 NR_002821 TPTEP2 Z98749.2 TPTE pseudogene 2 pseudo 116.667-187 chr7 40580922 40581167 + 0.666667 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 398895 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 178-69 chr2 205828654 205828975 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 146313 NM_018534 8828 Hs.471200 NM_003872 ENSG00000118257 NRP2 NP2|NPN2|PRO2714|VEGF165R2 neuropilin 2 protein-coding 129.333-67 chr15 24823696 24823954 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_022808, exon 1 of 12) 5' UTR (NM_022808, exon 1 of 12) 217 NR_146177 104472715 Hs.555970 NR_146177 SNHG14 115HG|IC-SNURF-SNRPN|LNCAT|NCRNA00214|U-UBE3A-ATS|UBE3A-AS|UBE3A-AS1|UBE3A-ATS|UBE3AATS small nucleolar RNA host gene 14 ncRNA 157.667-22 chr10 13304553 13304872 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -4582 NM_001323083 5264 Hs.498732 NM_006214 ENSG00000107537 PHYH LN1|LNAP1|PAHX|PHYH1|RD phytanoyl-CoA 2-hydroxylase protein-coding 111.667-266 chr9 4992914 4993194 + 0.666667 NA intron (NM_004972, intron 2 of 24) MLT1G3-int|LTR|ERVL-MaLR 7809 NM_004972 3717 Hs.656213 NM_004972 ENSG00000096968 JAK2 JTK10|THCYT3 Janus kinase 2 protein-coding 121.667-174 chr5 175229746 175229972 + 0.666667 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack 214323 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 185.333-201 chr9 134742332 134742741 + 0.666667 NA intron (NM_001278074, intron 11 of 65) MIR3|SINE|MIR -89693 NR_138049 414316 Hs.571561 NR_138049 ENSG00000204011 COL5A1-AS1 C9orf104|bA54A22.4 COL5A1 antisense RNA 1 ncRNA 196-72 chr17 75905154 75905590 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_032478) promoter-TSS (NM_032478) -272 NM_032478 64978 Hs.442609 NM_032478 ENSG00000204316 MRPL38 HSPC262|L38MT|MRP-L3|MRP-L38|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L38 protein-coding 194-59 chr18 9861803 9862122 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_006868, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_006868, exon 7 of 7) -24011 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 118.333-110 chr2 102713246 102713558 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23486 NR_136174 84804 Hs.590898 NM_032718 ENSG00000135953 MFSD9 - major facilitator superfamily domain containing 9 protein-coding 138-14 chr10 33059434 33059656 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57262 NR_160030 101929447 NR_160030 IATPR TCONS_00018476|linc-ITGB1 ITGB1 adjacent tumor promoting lncRNA ncRNA 116-41 chr14 65919897 65920084 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 448888 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 143.667-9 chr1 73219975 73220191 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86087 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 156.333-282 chr5 53769843 53770173 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 49674 NR_147168 105378966 Hs.570949 NR_147167 LINC02105 - long intergenic non-protein coding RNA 2105 ncRNA 145-27 chr13 65788819 65789134 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77071 NR_132362 105370242 Hs.578051 NR_132362 LINC01052 - long intergenic non-protein coding RNA 1052 ncRNA 121.333-128 chr4 39522684 39522945 + 0.666667 NA intron (NM_003359, intron 1 of 11) AluSc|SINE|Alu 4625 NM_001184701 7358 Hs.572518 NM_003359 ENSG00000109814 UGDH GDH|UDP-GlcDH|UDPGDH|UGD UDP-glucose 6-dehydrogenase protein-coding 127.333-58 chr15 90705279 90705617 + 0.666667 NA intron (NR_120372, intron 2 of 3) L1MEc|LINE|L1 11692 NR_120372 101926895 Hs.564760 NR_120372 ENSG00000259736 CRTC3-AS1 - CRTC3 antisense RNA 1 ncRNA 149.667-236 chr20 48094172 48094456 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -104197 NR_110027 101927457 Hs.445823 NR_110027 LINC01522 - long intergenic non-protein coding RNA 1522 ncRNA 155.667-266 chr5 17013309 17013614 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -77173 NM_012334 4651 Hs.481720 NM_012334 ENSG00000145555 MYO10 - myosin X protein-coding 127-23 chr10 121168248 121168487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 317005 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 145.333-32 chr10 58040421 58040689 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 227339 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 118-46 chr15 59091010 59091237 + 0.666667 NA exon (NM_001330331, exon 12 of 14) exon (NM_001330331, exon 12 of 14) -14023 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 161-40 chr2 58308916 58309273 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33217 NR_147010 105374744 Hs.447687 NR_147010 ENSG00000225226 LINC01795 - long intergenic non-protein coding RNA 1795 ncRNA 112-213 chr9 83714600 83714919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6428 NR_135840 105376114 Hs.9589 NR_135839 ENSG00000254473 LOC105376114 - uncharacterized LOC105376114 ncRNA 116-159 chr8 125058776 125059119 + 0.666667 NA intron (NM_014846, intron 14 of 28) intron (NM_014846, intron 14 of 28) 32845 NM_014846 9897 Hs.270043 NM_014846 ENSG00000164961 WASHC5 KIAA0196|RTSC|RTSC1|SPG8 WASH complex subunit 5 protein-coding 151-2 chr1 43355874 43356184 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2952 NM_001255 991 Hs.524947 NM_001255 ENSG00000117399 CDC20 CDC20A|bA276H19.3|p55CDC cell division cycle 20 protein-coding 131.667-174 chr6 69272469 69272710 + 0.666667 NA intron (NM_001704, intron 20 of 31) intron (NM_001704, intron 20 of 31) 523877 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 155.333-2 chr1 22352109 22352433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 86032 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 124.667-129 chr22 26873485 26873733 + 0.666667 NA intron (NR_146604, intron 3 of 5) L1ME3Cz|LINE|L1 13398 NR_146604 110091768 Hs.639900 NR_146604 LOC110091768 - uncharacterized LOC110091768 ncRNA 192.666-58 chr7 31361206 31361757 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -20755 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 115.333-37 chr11 101565073 101565293 + 0.666667 NA intron (NM_004621, intron 1 of 12) L1M3|LINE|L1 18824 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 273.667-42 chr5 16694276 16694959 + 0.666667 NA intron (NM_012334, intron 26 of 40) intron (NM_012334, intron 26 of 40) -77559 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 156.667-196 chr2 176766027 176766377 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 128448 NR_110599 102724224 Hs.663125 NR_110599 ENSG00000224577 LINC01117 - long intergenic non-protein coding RNA 1117 ncRNA 112-212 chr9 78324852 78325024 + 0.666667 NA intron (NM_021154, intron 7 of 7) intron (NM_021154, intron 7 of 7) 27813 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 194.667-128 chr5 139156514 139156986 + 0.666667 NA intron (NM_022464, intron 1 of 9) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 41618 NM_022464 64374 Hs.483521 NM_022464 ENSG00000120725 SIL1 BAP|MSS|ULG5 SIL1 nucleotide exchange factor protein-coding 224-79 chr5 76498686 76499073 + 0.666667 NA intron (NM_006633, intron 2 of 35) intron (NM_006633, intron 2 of 35) -48530 NM_001285460 10788 Hs.291030 NM_006633 ENSG00000145703 IQGAP2 - IQ motif containing GTPase activating protein 2 protein-coding 163.667-104 chr2 44697070 44697521 + 0.666667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) HAL1|LINE|L1 241593 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 150-136 chr7 118760842 118761203 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 536318 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 113.667-73 chr16 25186213 25186424 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -30629 NM_001169 343 Hs.176658 NM_001169 ENSG00000103375 AQP8 AQP-8 aquaporin 8 protein-coding 152.333-360 chr7 95619156 95619507 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22815 NM_002612 5166 Hs.8364 NM_002612 ENSG00000004799 PDK4 - pyruvate dehydrogenase kinase 4 protein-coding 179-103 chrX 142355885 142356305 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -150805 NM_016249 51438 Hs.123536 NM_016249 ENSG00000046774 MAGEC2 CT10|HCA587|MAGEE1 MAGE family member C2 protein-coding 126-121 chr9 413027 413322 + 0.666667 NA intron (NM_001193536, intron 27 of 46) L1MB7|LINE|L1 -57117 NM_001256876 23189 Hs.306764 NM_015158 ENSG00000107104 KANK1 ANKRD15|CPSQ2|KANK KN motif and ankyrin repeat domains 1 protein-coding 121.667-91 chr2 70291209 70291497 + 0.666667 NA intron (NM_001317169, intron 1 of 4) intron (NM_001317169, intron 1 of 4) 1871 NM_001317167 6637 Hs.465167 NM_003096 ENSG00000143977 SNRPG SMG|Sm-G small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G protein-coding 121.333-174 chr8 69075978 69076193 + 0.666667 NA intron (NR_039986, intron 1 of 4) intron (NR_039986, intron 1 of 4) 28105 NR_039986 100505718 Hs.122386 NR_039986 ENSG00000253658 LINC01592 - long intergenic non-protein coding RNA 1592 ncRNA 174-100 chr8 129889497 129889858 + 0.666667 NA intron (NM_001353307, intron 4 of 13) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 50134 NM_016623 51571 Hs.126941 NM_016623 ENSG00000153310 FAM49B BM-009|L1 family with sequence similarity 49 member B protein-coding 147.667-308 chr6 46317820 46318194 + 0.666667 NA intron (NR_125838, intron 2 of 3) intron (NR_125838, intron 2 of 3) 7885 NM_005822 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 187.667-128 chr6 73179893 73180371 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 11 of 13) intron (NM_001160132, intron 11 of 13) -36618 NR_046621 100873997 Hs.741819 NR_046621 ENSG00000229154 KCNQ5-AS1 - KCNQ5 antisense RNA 1 ncRNA 205-6 chr1 91629964 91630315 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 129031 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 175.333-90 chr2 78810542 78810982 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -214940 NM_198448 130120 Hs.447084 NM_198448 ENSG00000143954 REG3G LPPM429|PAP IB|PAP-1B|PAP1B|PAPIB|REG III|REG-III|UNQ429 regenerating family member 3 gamma protein-coding 157-136 chr9 29930207 29930582 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 478060 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 119-93 chr22 27288214 27288526 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22281 NR_134581 100507657 Hs.537371 NR_134581 ENSG00000226741 LINC02554 - long intergenic non-protein coding RNA 2554 ncRNA 148.333-321 chr5 105324995 105325274 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 225660 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 237-73 chr8 105006254 105006669 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -311977 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 155-43 chr15 99231739 99232139 + 0.666667 NA intron (NM_001288616, intron 2 of 11) AluSp|SINE|Alu 17642 NM_001288615 64927 Hs.513195 NM_022905 ENSG00000103852 TTC23 HCC-8 tetratricopeptide repeat domain 23 protein-coding 256.667-54 chr22 24040494 24041014 + 0.666667 NA intron (NM_012295, intron 4 of 36) intron (NM_012295, intron 4 of 36) 29384 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 117.667-46 chr14 28104868 28105097 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -431761 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 119.667-136 chr4 111177633 111177897 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -317118 NR_030643 100126354 NR_030643 ENSG00000215961 MIR297 MIRN297|hsa-mir-297 microRNA 297 ncRNA 137-95 chr7 11705178 11705438 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 1 of 26) intron (NM_015204, intron 1 of 26) 126890 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 157-45 chr14 71055337 71055716 + 0.666667 NA exon (NM_001308160, exon 23 of 34) exon (NM_001308160, exon 23 of 34) 148067 NM_001308160 22990 Hs.446559 NM_014982 ENSG00000100731 PCNX1 PCNX|PCNXL1|pecanex pecanex 1 protein-coding 115.333-115 chr2 141138247 141138487 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 7 of 90) L1ME2z|LINE|L1 -551682 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 205.333-229 chr7 123814666 123815010 + 0.666667 NA non-coding (NR_002731, exon 1 of 2) non-coding (NR_002731, exon 1 of 2) 699 NR_002731 26062 Hs.381305 NR_002731 HYAL6P HYAL6|HYALP1 hyaluronidase 6, pseudogene pseudo 115.333-159 chr4 84516479 84516700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18355 NM_006168 4825 Hs.546270 NM_006168 ENSG00000163623 NKX6-1 NKX6.1|NKX6A NK6 homeobox 1 protein-coding 164.333-130 chr2 188649188 188649469 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 140795 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 141.667-112 chr2 27436417 27436704 + 0.666667 NA intron (NM_001321361, intron 8 of 18) intron (NM_001321361, intron 8 of 18) -5806 NM_001168364 200634 Hs.59509 NM_173853 ENSG00000157992 KRTCAP3 KCP3 keratinocyte associated protein 3 protein-coding 132.333-87 chr2 124206809 124207105 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 1 of 23) intron (NM_130773, intron 1 of 23) 181670 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 164.667-26 chr10 71980570 71980899 + 0.666667 NA intron (NM_004273, intron 1 of 2) intron (NM_004273, intron 1 of 2) 16339 NM_004273 9469 Hs.158304 NM_004273 ENSG00000122863 CHST3 C6ST|C6ST1|HSD carbohydrate sulfotransferase 3 protein-coding 140-9 chr1 117211346 117211592 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001253850) promoter-TSS (NM_001253850) -509 NM_001253850 79679 Hs.546434 NM_024626 ENSG00000134258 VTCN1 B7-H4|B7H4|B7S1|B7X|B7h.5|PRO1291|VCTN1 V-set domain containing T cell activation inhibitor 1 protein-coding 145.667-193 chr4 56586024 56586406 + 0.666667 NA intron (NM_001256475, intron 6 of 8) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 55609 NM_001256475 100506564 Hs.573073 NM_001256475 ENSG00000249693 THEGL - theg spermatid protein like protein-coding 186.333-95 chr3 8276766 8277288 + 0.666667 NA intron (NR_033378, intron 3 of 3) MIR|SINE|MIR 224631 NR_033378 100288428 Hs.651576 NR_033378 ENSG00000227110 LMCD1-AS1 - LMCD1 antisense RNA 1 ncRNA 191-84 chrX 55240601 55241035 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 20472 NM_001013435 90737 Hs.668491 NM_130467 ENSG00000158639 PAGE5 CT16|CT16.1|CT16.2|GAGEE1|PAGE-5 PAGE family member 5 protein-coding 132.333-90 chr2 148661562 148661891 + 0.666667 NA intron (NM_015630, intron 1 of 13) intron (NM_015630, intron 1 of 13) 16975 NM_015630 26122 Hs.23270 NM_015630 ENSG00000135999 EPC2 EPC-LIKE enhancer of polycomb homolog 2 protein-coding 112.667-202 chr5 7055910 7056097 + 0.666667 NA Intergenic HERVH-int|LTR|ERV1 213351 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 141.667-239 chr9 1858992 1859312 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -156195 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 121-136 chr8 73698204 73698469 + 0.666667 NA intron (NM_001164385, intron 1 of 9) L1MA2|LINE|L1 48504 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 157-17 chr10 31083699 31084015 + 0.666667 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -51920 NM_182755 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 186.333-57 chr15 92425039 92425520 + 0.666667 NA intron (NM_001330416, intron 1 of 4) intron (NM_001330416, intron 1 of 4) 31392 NM_001330416 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 145.333-79 chr14 43911405 43911790 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 595686 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 154-86 chr22 24030833 24031116 + 0.666667 NA intron (NM_001199281, intron 1 of 36) intron (NM_001199281, intron 1 of 36) 19604 NM_001199281 23523 Hs.517478 NM_012295 ENSG00000099991 CABIN1 CAIN|KB-318B8.7|PPP3IN calcineurin binding protein 1 protein-coding 153-96 chr3 110032159 110032493 + 0.666667 NA Intergenic MLT2D|LTR|ERVL 429498 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 123-106 chr6 123849533 123849845 + 0.666667 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) LTR16C|LTR|ERVL 45824 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 126.333-161 chr6 162747452 162747808 + 0.666667 NA intron (NM_001080379, intron 1 of 4) intron (NM_001080379, intron 1 of 4) 19660 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 139-11 chr10 50305229 50305508 + 0.666667 NA TTS (NM_147156) TTS (NM_147156) -56758 NM_019893 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 210.667-64 chr2 31128589 31129075 + 0.666667 NA intron (NM_001329096, intron 1 of 16) intron (NM_001329096, intron 1 of 16) 808 NM_001253827 79623 Hs.468058 NM_024572 ENSG00000158089 GALNT14 GALNT15|GalNac-T10|GalNac-T14 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 protein-coding 118.667-12 chr1 179783355 179783594 + 0.666667 NA intron (NM_001329719, intron 1 of 4) intron (NM_001329719, intron 1 of 4) -20450 NR_162130 113219451 NR_162130 MIR12116 - microRNA 12116 ncRNA 144.667-93 chr15 41202912 41203340 + 0.666667 NA intron (NM_152596, intron 5 of 9) intron (NM_152596, intron 5 of 9) 27631 NM_152596 161829 Hs.307999 NM_152596 ENSG00000178997 EXD1 EXDL1 exonuclease 3'-5' domain containing 1 protein-coding 145.333-127 chr19 30135574 30135982 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 193539 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 144.333-7 chr1 46089640 46089979 + 0.666667 NA intron (NM_001303427, intron 1 of 9) HAL1|LINE|L1 40864 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 158.667-338 chr8 139111065 139111384 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -197183 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 144.667-300 chr8 108038334 108038758 + 0.666667 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 43393 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 148-80 chr2 64232446 64232838 + 0.666667 NA intron (NR_120420, intron 2 of 4) intron (NR_120420, intron 2 of 4) 4241 NR_120420 100507006 Hs.442789 NR_120420 LOC100507006 - uncharacterized LOC100507006 ncRNA 111.667-153 chr20 9414908 9415099 + 0.666667 NA intron (NM_000933, intron 21 of 35) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -99355 NM_001199897 24141 Hs.22920 NM_012261 ENSG00000125869 LAMP5 BAD-LAMP|BADLAMP|C20orf103|LAMP-5|UNC-46 lysosomal associated membrane protein family member 5 protein-coding 114.667-195 chr4 71375797 71376054 + 0.666667 NA intron (NM_003759, intron 3 of 22) intron (NM_003759, intron 3 of 22) 36872 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 264.333-73 chr7 105215008 105215569 + 0.666667 NA intron (NM_182692, intron 2 of 15) L1MB8|LINE|L1 53789 NM_001350745 6733 Hs.285197 NM_182691 ENSG00000135250 SRPK2 SFRSK2 SRSF protein kinase 2 protein-coding 130-10 chr10 32257021 32257274 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90011 NM_001272004 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 213.667-9 chr1 215356273 215356757 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -210789 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 225-31 chr18 13357388 13357875 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) L1MC5|LINE|L1 69903 NR_040031 100288122 Hs.646264 NR_040031 ENSG00000267690 LDLRAD4-AS1 - LDLRAD4 antisense RNA 1 ncRNA 148.333-110 chr13 92919722 92920135 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -125413 NR_126360 104326053 Hs.578064 NR_126360 LINC00363 TCONS_00021586 long intergenic non-protein coding RNA 363 ncRNA 184.333-11 chr10 20707288 20707684 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 155516 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 131-87 chr6 64286745 64287001 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 30 of 43) intron (NM_001292009, intron 30 of 43) 480037 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 120-25 chr11 96944748 96944952 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 436425 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 152-71 chr17 59169302 59169671 + 0.666667 NA intron (NM_018304, intron 1 of 9) intron (NM_018304, intron 1 of 9) 13740 NM_018304 55771 Hs.631750 NM_018304 ENSG00000068489 PRR11 - proline rich 11 protein-coding 145.333-90 chr14 73314442 73314876 + 0.666667 NA intron (NM_001005745, intron 5 of 10) intron (NM_001005745, intron 5 of 10) -68658 NR_135248 101928123 Hs.660593 NR_135248 LOC101928123 - uncharacterized LOC101928123 ncRNA 136.667-47 chr13 70218518 70218866 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -110199 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 117.667-149 chr5 25609720 25609984 + 0.666667 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 418899 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 118.333-29 chr10 32022853 32023081 + 0.666667 NA exon (NM_004521, exon 16 of 26) exon (NM_004521, exon 16 of 26) 33458 NM_004521 3799 Hs.327736 NM_004521 ENSG00000170759 KIF5B HEL-S-61|KINH|KNS|KNS1|UKHC kinesin family member 5B protein-coding 113.667-21 chr10 44167321 44167583 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -125298 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 236.667-50 chr3 44574895 44575462 + 0.666667 NA intron (NM_001288592, intron 5 of 5) AluJb|SINE|Alu -9786 NM_001351733 110354863 Hs.157035 NM_001351732 ZNF660-ZNF197 - ZNF660-ZNF197 readthrough protein-coding 150.667-58 chr11 4500947 4501379 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 12284 NM_001005171 390036 Hs.553726 NM_001005171 ENSG00000196778 OR52K1 OR11-8 olfactory receptor family 52 subfamily K member 1 protein-coding 122-52 chr2 119526802 119527050 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2474 NM_002980 6344 Hs.42091 NM_002980 ENSG00000080293 SCTR SR secretin receptor protein-coding 140.667-165 chr4 69441146 69441515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54575 NM_001297615 7363 Hs.285887 NM_021139 ENSG00000156096 UGT2B4 HLUG25|UDPGT2B4|UDPGTH1|UDPGTh-1|UGT2B11 UDP glucuronosyltransferase family 2 member B4 protein-coding 147-127 chr6 155381404 155381683 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -67059 NR_146725 51106 Hs.279908 NM_016020 ENSG00000029639 TFB1M CGI-75|CGI75|mtTFB|mtTFB1 transcription factor B1, mitochondrial protein-coding 112.667-203 chr5 10209057 10209260 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 40730 NM_199133 134145 Hs.481569 NM_199133 ENSG00000150756 ATPSCKMT FAM173B|JS-2|hFAM173B ATP synthase c subunit lysine N-methyltransferase protein-coding 167.333-182 chr3 166589188 166589574 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -309302 NR_135545 105374194 NR_135545 LOC105374194 inv3q26.1 uncharacterized LOC105374194 ncRNA 115.667-105 chr18 23819032 23819371 + 0.666667 NA intron (NM_001127717, intron 18 of 73) intron (NM_001127717, intron 18 of 73) -53819 NM_001127718 3909 Hs.436367 NM_000227 ENSG00000053747 LAMA3 BM600|E170|LAMNA|LOCS laminin subunit alpha 3 protein-coding 122.667-159 chr6 34541469 34541669 + 0.666667 NA intron (NM_012391, intron 2 of 5) intron (NM_012391, intron 2 of 5) 14760 NM_012391 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 114.333-118 chr2 172252788 172253014 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 149895 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 129-109 chr6 37428204 37428505 + 0.666667 NA Intergenic MER65A|LTR|ERV1 -4867 NM_015050 23070 Hs.520102 NM_015050 ENSG00000137200 CMTR1 FTSJD2|KIAA0082|MTr1|hMTr1 cap methyltransferase 1 protein-coding 212-161 chrX 69764298 69764724 + 0.666667 NA intron (NM_001005613, intron 2 of 2) AluSx1|SINE|Alu 148398 NM_001005612 1896 Hs.105407 NM_001399 ENSG00000158813 EDA ECTD1|ED1|ED1-A1|ED1-A2|EDA-A1|EDA-A2|EDA1|EDA2|HED|HED1|ODT1|STHAGX1|TNLG7C|XHED|XLHED ectodysplasin A protein-coding 142.333-71 chr13 59570595 59570903 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -441969 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 177.667-81 chr2 216480087 216480476 + 0.666667 NA intron (NM_001127207, intron 17 of 17) intron (NM_001127207, intron 17 of 17) -18563 NM_000998 6168 Hs.433701 NM_000998 ENSG00000197756 RPL37A L37A ribosomal protein L37a protein-coding 193-42 chr2 31766031 31766469 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37730 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 155.333-242 chr3 164875969 164876306 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44657 NR_126405 104355289 Hs.574909 NR_126405 ENSG00000241767 LINC01324 - long intergenic non-protein coding RNA 1324 ncRNA 137.667-165 chr6 101981761 101982044 + 0.666667 NA intron (NM_001166247, intron 13 of 16) intron (NM_001166247, intron 13 of 16) 582917 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 148.333-352 chr7 5463950 5464307 + 0.666667 NA intron (NM_001363441, intron 4 of 4) AluSx3|SINE|Alu 31789 NR_030318 693174 NR_030318 ENSG00000207973 MIR589 MIRN589|hsa-mir-589|mir-589 microRNA 589 ncRNA 121.667-105 chr2 220617455 220617727 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -711026 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 154-39 chr12 41367363 41367754 + 0.666667 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -70181 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 155-140 chrX 138606272 138606621 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 61347 NR_030229 574507 NR_030229 ENSG00000207800 MIR504 MIRN504|hsa-mir-504|mir-504 microRNA 504 ncRNA 139.667-44 chr12 91794722 91795118 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 346793 NR_046159 256021 Hs.651357 NM_001256373 ENSG00000257242 LINC01619 C12orf79 long intergenic non-protein coding RNA 1619 ncRNA 111.667-174 chr3 149241050 149241321 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19356 NM_000096 1356 Hs.558314 NM_000096 ENSG00000047457 CP CP-2 ceruloplasmin protein-coding 126-30 chr14 47824984 47825246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30101 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 215.333-194 chr8 67995172 67995673 + 0.666667 NA intron (NM_024870, intron 1 of 39) intron (NM_024870, intron 1 of 39) 43376 NM_025170 80243 Hs.169943 NM_024870 ENSG00000046889 PREX2 DEP.2|DEPDC2|P-REX2|PPP1R129 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 protein-coding 122.333-124 chr20 31883996 31884350 + 0.666667 NA intron (NR_148010, intron 3 of 14) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 4356 NR_160276 164395 Hs.712915 NM_001008409 ENSG00000131044 TTLL9 C20orf125 tubulin tyrosine ligase like 9 protein-coding 149.667-292 chr4 73842077 73842447 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 5584 NM_002993 6372 Hs.164021 NM_002993 ENSG00000124875 CXCL6 CKA-3|GCP-2|GCP2|SCYB6 C-X-C motif chemokine ligand 6 protein-coding 113.667-35 chr11 117719678 117719854 + 0.666667 NA intron (NM_020693, intron 3 of 32) MIR|SINE|MIR 77450 NM_001367904 57453 Hs.659513 NM_020693 ENSG00000177103 DSCAML1 DSCAM2 DS cell adhesion molecule like 1 protein-coding 128.333-70 chr16 9836091 9836375 + 0.666667 NA intron (NM_001134408, intron 7 of 13) intron (NM_001134408, intron 7 of 13) 345834 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 153-146 chr8 87070616 87070931 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) intron (NM_173538, intron 4 of 10) 204358 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 114-28 chr12 103940321 103940526 + 0.666667 NA intron (NM_003299, intron 8 of 17) Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 9998 NR_037425 100500842 NR_037425 ENSG00000284503 MIR3652 - microRNA 3652 ncRNA 161.333-254 chr6 163526865 163527179 + 0.666667 NA intron (NM_206853, intron 3 of 6) intron (NM_206853, intron 3 of 6) 112304 NM_206854 9444 Hs.510324 NM_006775 ENSG00000112531 QKI Hqk|QK|QK1|QK3|hqkI QKI, KH domain containing RNA binding protein-coding 150-89 chr3 18738815 18739162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -293396 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 115-135 chr6 53165254 53165595 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 -16583 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 147.667-222 chr3 27796668 27797074 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_146630) promoter-TSS (NR_146630) -717 NR_146630 105377007 NR_146630 LINC01980 - long intergenic non-protein coding RNA 1980 ncRNA 174.333-93 chr3 143216359 143216727 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96772 NM_004267 9435 Hs.8786 NM_004267 ENSG00000175040 CHST2 C6ST|GST-2|GST2|Gn6ST-1|HEL-S-75|glcNAc6ST-1 carbohydrate sulfotransferase 2 protein-coding 115.667-30 chr10 90439009 90439235 + 0.666667 NA intron (NR_110657, intron 3 of 6) MIRc|SINE|MIR 101683 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 114.667-5 chr1 79548169 79548483 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -541596 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 145.667-143 chr2 121097847 121098222 + 0.666667 NA Intergenic MER41D|LTR|ERV1 187168 NM_014553 29842 Hs.156471 NM_014553 ENSG00000115112 TFCP2L1 CRTR1|LBP-9|LBP9 transcription factor CP2 like 1 protein-coding 154.667-257 chr3 159147829 159148286 + 0.666667 NA intron (NM_001197113, intron 1 of 10) MER5A|DNA|hAT-Charlie 78738 NM_001042706 654502 Hs.570685 NM_001042705 ENSG00000214216 IQCJ - IQ motif containing J protein-coding 160.667-208 chr3 168962816 168963159 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 61042 NR_109989 100507661 Hs.65918 NR_109989 ENSG00000242268 LINC02082 - long intergenic non-protein coding RNA 2082 ncRNA 212.333-98 chr3 115318217 115318561 + 0.666667 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -171101 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 225-48 chr4 149931583 149931998 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -115947 NM_001363507 285423 Hs.591689 NM_001363507 ENSG00000234828 IQCM - IQ motif containing M protein-coding 185.667-10 chr10 41884793 41885128 + 0.666667 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 483085 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 120.667-38 chr12 41399866 41400095 + 0.666667 NA intron (NM_001164595, intron 3 of 9) intron (NM_001164595, intron 3 of 9) -37759 NM_013377 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 140.667-147 chr3 81090067 81090375 + 0.666667 NA intron (NR_132411, intron 1 of 1) intron (NR_132411, intron 1 of 1) 96353 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 144.667-5 chr1 63516842 63517221 + 0.666667 NA intron (NM_001206739, intron 1 of 9) intron (NM_001206739, intron 1 of 9) 6242 NM_001347145 23421 Hs.166539 NM_014288 ENSG00000142856 ITGB3BP CENP-R|CENPR|HSU37139|NRIF3|TAP20 integrin subunit beta 3 binding protein protein-coding 236.667-12 chr10 102558252 102558785 + 0.666667 NA intron (NM_001178133, intron 3 of 10) intron (NM_001178133, intron 3 of 10) 54546 NM_001178133 51684 Hs.404089 NM_016169 ENSG00000107882 SUFU JBTS32|PRO1280|SUFUH|SUFUXL SUFU negative regulator of hedgehog signaling protein-coding 183-24 chr12 18294499 18294898 + 0.666667 NA intron (NM_001288774, intron 5 of 32) intron (NM_001288774, intron 5 of 32) 33158 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 287-31 chr6 124288063 124288572 + 0.666667 NA intron (NM_001040214, intron 2 of 6) intron (NM_001040214, intron 2 of 6) 5312 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 171.667-48 chr14 54494369 54494808 + 0.666667 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -5608 NM_004124 2764 Hs.151413 NM_004124 ENSG00000197045 GMFB GMF glia maturation factor beta protein-coding 119.333-125 chr2 55936193 55936385 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -12507 NM_001039348 2202 Hs.76224 NM_004105 ENSG00000115380 EFEMP1 DHRD|DRAD|FBLN3|FBNL|FIBL-3|MLVT|MTLV|S1-5 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 protein-coding 188.333-83 chr2 224280318 224280687 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 121492 NM_024785 79843 Hs.147585 NM_024785 ENSG00000124019 FAM124B - family with sequence similarity 124 member B protein-coding 166.333-176 chr5 16651040 16651383 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34153 NM_001034850 54463 Hs.481704 NM_019000 ENSG00000154153 RETREG1 FAM134B|JK-1|JK1 reticulophagy regulator 1 protein-coding 188.667-98 chr22 41463198 41463711 + 0.666667 NA intron (NM_032758, intron 3 of 3) AluSx3|SINE|Alu 5238 NM_032758 84844 Hs.474980 NM_032758 ENSG00000100410 PHF5A INI|Rds3|SAP14b|SF3B7|SF3b14b|bK223H9.2 PHD finger protein 5A protein-coding 139-37 chr15 66427713 66428093 + 0.666667 NA intron (NM_002755, intron 1 of 10) AluSg|SINE|Alu 41030 NM_002755 5604 Hs.145442 NM_002755 ENSG00000169032 MAP2K1 CFC3|MAPKK1|MEK1|MKK1|PRKMK1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 protein-coding 177.667-149 chr9 91935626 91935981 + 0.666667 NA intron (NM_001318204, intron 1 of 7) intron (NM_001318204, intron 1 of 7) 14425 NM_004560 4920 Hs.98255 NM_004560 ENSG00000169071 ROR2 BDB|BDB1|NTRKR2 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2 protein-coding 131.333-162 chr6 166054027 166054291 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -43561 NR_147704 729681 Hs.520550 NR_147704 LOC729681 - uncharacterized LOC729681 ncRNA 233-62 chr8 113644984 113645341 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208223 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 112.333-109 chr2 6752517 6752813 + 0.666667 NA intron (NR_038369, intron 1 of 5) intron (NR_038369, intron 1 of 5) 17646 NR_038369 400941 Hs.446195 NM_001001695 ENSG00000205837 LINC00487 - long intergenic non-protein coding RNA 487 ncRNA 170.333-135 chr3 28146213 28146577 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -95224 NM_001331185 152100 Hs.444724 NM_182523 ENSG00000187118 CMC1 C3orf68 C-X9-C motif containing 1 protein-coding 184 chr1 34940191 34940536 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -10713 NM_001080418 58512 Hs.436393 NM_001080418 ENSG00000116544 DLGAP3 DAP3|SAPAP3 DLG associated protein 3 protein-coding 208.667-121 chr6 125253276 125253828 + 0.666667 NA intron (NM_001318903, intron 5 of 7) intron (NM_001318903, intron 5 of 7) 48415 NM_016063 51020 Hs.32826 NM_016063 ENSG00000111906 HDDC2 C6orf74|CGI-130|NS5ATP2|dJ167O5.2 HD domain containing 2 protein-coding 124.333-129 chr4 63003216 63003430 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -841558 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 191.333-140 chr4 24241684 24242168 + 0.666667 NA intron (NR_148982, intron 1 of 13) Tigger19a|DNA|TcMar-Tigger 230979 NM_001354826 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 121-38 chr13 50566563 50566830 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -39247 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 151-20 chr11 22080966 22081255 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111975 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 124.333-40 chr12 103091521 103091748 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60208 NR_126333 101929058 Hs.171310 NR_126333 ENSG00000257860 LOC101929058 - uncharacterized LOC101929058 ncRNA 182.333-42 chr14 58742070 58742422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86042 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 194-114 chr5 134100658 134101000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13852 NM_001346425 6932 Hs.573153 NM_003202 ENSG00000081059 TCF7 TCF-1 transcription factor 7 protein-coding 163.667-25 chr10 66485007 66485439 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) L1MA9|LINE|L1 -440813 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 113-146 chr3 184577254 184577578 + 0.666667 NA exon (NM_004443, exon 6 of 16) exon (NM_004443, exon 6 of 16) 15631 NM_004443 2049 Hs.2913 NM_004443 ENSG00000182580 EPHB3 EK2|ETK2|HEK2|TYRO6 EPH receptor B3 protein-coding 178.333-22 chr10 90496749 90497203 + 0.666667 NA intron (NR_110657, intron 2 of 6) LTR52|LTR|ERVL 43829 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 123-100 chr5 124406637 124406965 + 0.666667 NA intron (NR_125774, intron 3 of 5) intron (NR_125774, intron 3 of 5) 31719 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 130.667-206 chr9 32374192 32374519 + 0.666667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -10248 NM_001278352 48 Hs.567229 NM_002197 ENSG00000122729 ACO1 ACONS|HEL60|IREB1|IREBP|IREBP1|IRP1 aconitase 1 protein-coding 136-37 chr15 80098823 80099140 + 0.666667 NA intron (NM_001242916, intron 2 of 6) intron (NM_001242916, intron 2 of 6) 565 NM_001242919 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 188.666-35 chr7 47990346 47990893 + 0.666667 NA intron (NM_001030019, intron 8 of 9) LTR5_Hs|LTR|ERVK -11004 NM_004507 3364 Hs.152983 NM_004507 ENSG00000136273 HUS1 hHUS1 HUS1 checkpoint clamp component protein-coding 155.667-357 chr8 95604108 95604544 + 0.666667 NA intron (NR_038207, intron 2 of 2) intron (NR_038207, intron 2 of 2) -335125 NM_177965 157657 Hs.548157 NM_177965 ENSG00000156172 C8orf37 BBS21|CORD16|RP64|smalltalk chromosome 8 open reading frame 37 protein-coding 127-107 chr9 128654346 128654572 + 0.666667 NA intron (NM_052844, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 2391 NM_052844 89891 Hs.495240 NM_052844 ENSG00000119333 WDR34 DIC5|FAP133|SRTD11|bA216B9.3 WD repeat domain 34 protein-coding 112.333-136 chr2 147280877 147281063 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -563547 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 173.333-219 chr9 136700048 136700486 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -12305 NM_152421 138311 Hs.741305 NM_152421 ENSG00000165716 DIPK1B C9orf136|FAM69B|pp6977 divergent protein kinase domain 1B protein-coding 128.333-93 chr2 37314860 37315204 + 0.666667 NA intron (NM_005813, intron 1 of 17) intron (NM_005813, intron 1 of 17) 2052 NM_005813 23683 Hs.660757 NM_005813 ENSG00000115825 PRKD3 EPK2|PKC-NU|PKD3|PRKCN|nPKC-NU protein kinase D3 protein-coding 159.667-312 chr8 27689395 27689729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12115 NR_037417 100500858 NR_037417 ENSG00000284351 MIR3622A mir-3622a microRNA 3622a ncRNA 160.333-143 chr2 73591281 73591606 + 0.666667 NA intron (NM_015120, intron 16 of 22) intron (NM_015120, intron 16 of 22) 50979 NM_003960 9027 Hs.14637 NM_003960 ENSG00000144035 NAT8 ATase2|CCNAT|CML1|GLA|Hcml1|TSC501|TSC510 N-acetyltransferase 8 (putative) protein-coding 156.333-285 chr5 76649422 76649829 + 0.666667 NA intron (NM_006633, intron 17 of 35) THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -26222 NM_001256566 2151 Hs.42502 NM_004101 ENSG00000164220 F2RL2 PAR-3|PAR3 coagulation factor II thrombin receptor like 2 protein-coding 198-9 chr1 195487270 195487730 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 601215 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 148-73 chr2 24612568 24612848 + 0.666667 NA intron (NM_001362950, intron 3 of 23) L1PA15-16|LINE|L1 28231 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 133.667-4 chr1 76804981 76805248 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -25847 NR_149059 110806286 NR_149059 ENSG00000237552 LINC02567 - long intergenic non-protein coding RNA 2567 ncRNA 145.333-112 chr17 41563745 41564083 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 8145 NM_000226 3857 Hs.654569 NM_000226 ENSG00000171403 KRT9 CK-9|EPPK|K9 keratin 9 protein-coding 116-16 chr10 33985726 33985941 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -213153 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 231-23 chr18 7772894 7773505 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) intron (NM_002845, intron 1 of 30) 205883 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 147-18 chr10 108160312 108160646 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -91186 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 150.333-199 chr2 101148299 101148617 + 0.666667 NA intron (NM_001102426, intron 1 of 19) L2a|LINE|L2 2989 NM_001330348 11138 Hs.442657 NM_007063 ENSG00000204634 TBC1D8 AD3|GRAMD8|HBLP1|TBC1D8A|VRP TBC1 domain family member 8 protein-coding 197.333-211 chr7 40776610 40777044 + 0.666667 NA intron (NM_024728, intron 14 of 14) MER117|DNA|hAT-Charlie 203112 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 221.666-46 chr5 99159520 99160139 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -230115 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 142.667-129 chr22 24443271 24443501 + 0.666667 NA intron (NR_028484, intron 3 of 6) AluSx3|SINE|Alu 11267 NM_001278497 135 Hs.197029 NM_000675 ENSG00000128271 ADORA2A A2aR|ADORA2|RDC8 adenosine A2a receptor protein-coding 124-50 chr18 49389763 49390101 + 0.666667 NA intron (NM_001353210, intron 3 of 16) intron (NM_001353210, intron 3 of 16) 70713 NM_001353211 54808 Hs.162996 NM_017653 ENSG00000141627 DYM DMC|SMC dymeclin protein-coding 179.333-172 chr7 75643747 75644238 + 0.666667 NA intron (NM_005338, intron 1 of 30) AluSx1|SINE|Alu 94949 NM_001243198 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 138-62 chr2 209983961 209984288 + 0.666667 NA intron (NM_182587, intron 59 of 62) intron (NM_182587, intron 59 of 62) -18441 NM_001318927 6120 Hs.282260 NM_006916 ENSG00000197713 RPE RPE2-1 ribulose-5-phosphate-3-epimerase protein-coding 140.667-234 chr8 123996021 123996304 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 12 of 40) L1M1|LINE|L1 44620 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 114.667-145 chr2 211573713 211573995 + 0.666667 NA intron (NM_001042599, intron 19 of 26) intron (NM_001042599, intron 19 of 26) 852506 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 150.667-140 chr16 60696651 60696991 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -337028 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 118-44 chr14 89908127 89908411 + 0.666667 NA intron (NM_001284269, intron 5 of 5) MIR|SINE|MIR 46267 NM_001284269 90141 Hs.123232 NM_145231 ENSG00000140025 EFCAB11 C14orf143 EF-hand calcium binding domain 11 protein-coding 114-115 chr5 39803329 39803631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -248811 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 192.667-35 chr10 113563077 113563621 + 0.666667 NA intron (NM_004132, intron 1 of 12) intron (NM_004132, intron 1 of 12) 10296 NM_004132 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 141.333-141 chr22 31980400 31980673 + 0.666667 NA intron (NR_149128, intron 2 of 4) MIRb|SINE|MIR 9713 NR_149128 105372999 Hs.512525 NR_149128 LINC02558 - long intergenic non-protein coding RNA 2558 ncRNA 231.333-108 chr7 35441713 35442343 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 128173 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 114.667-69 chr13 51371256 51371527 + 0.666667 NA intron (NM_001306091, intron 17 of 19) L2b|LINE|L2 -22752 NR_049878 100847003 NR_049878 ENSG00000266072 MIR5693 - microRNA 5693 ncRNA 150.333-425 chr8 135945311 135945606 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 488002 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 154.333-117 chr17 32328515 32328864 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_022344, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_022344, exon 10 of 10) 13484 NM_022344 64149 Hs.655257 NM_022344 ENSG00000108666 C17orf75 NJMU-R1|SRI2 chromosome 17 open reading frame 75 protein-coding 200.667-131 chr5 155294403 155294865 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 280879 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 174-58 chr2 188597199 188597540 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 192754 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 141-60 chr4 54937818 54938110 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 187631 NM_002253 3791 Hs.479756 NM_002253 ENSG00000128052 KDR CD309|FLK1|VEGFR|VEGFR2 kinase insert domain receptor protein-coding 118.667-91 chr18 44110891 44111105 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 420699 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 150.667-115 chr14 45624002 45624289 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 91457 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 157.667-236 chr5 26911905 26912219 + 0.666667 NA intron (NM_016279, intron 3 of 11) intron (NM_016279, intron 3 of 11) 126524 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 317.667-36 chr6 33737183 33737762 + 0.666667 NA intron (NM_054111, intron 1 of 5) intron (NM_054111, intron 1 of 5) 9433 NM_054111 117283 Hs.17253 NM_054111 ENSG00000161896 IP6K3 IHPK3|INSP6K3 inositol hexakisphosphate kinase 3 protein-coding 157.333-248 chr3 185988375 185988687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28588 NR_151491 344887 Hs.128803 NR_033752 ENSG00000171658 NMRAL2P NMRAL1P1 NmrA like redox sensor 2, pseudogene pseudo 148.667-410 chrX 84201053 84201390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13022 NM_014496 27330 Hs.234478 NM_014496 ENSG00000072133 RPS6KA6 PP90RSK4|RSK-4|RSK4|S6K-alpha-6|p90RSK6 ribosomal protein S6 kinase A6 protein-coding 131.667-168 chr5 157124741 157125078 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15865 NM_032782 84868 Hs.710500 NM_032782 ENSG00000135077 HAVCR2 CD366|HAVcr-2|KIM-3|SPTCL|TIM3|TIMD-3|TIMD3|Tim-3 hepatitis A virus cellular receptor 2 protein-coding 240.333-99 chr9 30994186 30994632 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 387081 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 131-2 chr1 33794374 33794611 + 0.666667 NA intron (NM_052896, intron 10 of 69) L2c|LINE|L2 -65983 NM_145205 127540 Hs.568628 NM_145205 ENSG00000176256 HMGB4 dJ1007G16.5 high mobility group box 4 protein-coding 237.333-43 chr17 58791446 58791864 + 0.666667 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 35786 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 117.333-56 chr14 59293319 59293651 + 0.666667 NA intron (NM_001270520, intron 3 of 24) intron (NM_001270520, intron 3 of 24) 30044 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 131.667-196 chr8 103058152 103058515 + 0.666667 NA intron (NM_001695, intron 8 of 12) intron (NM_001695, intron 8 of 12) 37250 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 128-41 chr2 38086973 38087269 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10940 NM_000104 1545 Hs.154654 NM_000104 ENSG00000138061 CYP1B1 ASGD6|CP1B|CYPIB1|GLC3A|P4501B1 cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 protein-coding 145.333-34 chr10 59853828 59854155 + 0.666667 NA intron (NM_005436, intron 1 of 8) intron (NM_005436, intron 1 of 8) 52565 NM_005436 8030 Hs.591360 NM_005436 ENSG00000108091 CCDC6 D10S170|H4|PTC|TPC|TST1 coiled-coil domain containing 6 protein-coding 214.333-36 chr13 23264392 23264845 + 0.666667 NA intron (NM_000231, intron 4 of 7) L1PA14|LINE|L1 83697 NM_000231 6445 Hs.37167 NM_000231 ENSG00000102683 SGCG 35DAG|A4|DAGA4|DMDA|DMDA1|LGMD2C|LGMDR5|MAM|SCARMD2|SCG3|gamma-SG sarcoglycan gamma protein-coding 129.333-199 chr9 35762304 35762574 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -8163 NM_001044264 692094 Hs.571601 NM_001044264 ENSG00000215183 MSMP PSMP microseminoprotein, prostate associated protein-coding 187.667-129 chr6 75279994 75280499 + 0.666667 NA intron (NM_018247, intron 1 of 6) intron (NM_018247, intron 1 of 6) 4546 NM_018247 55754 Hs.108530 NM_018247 ENSG00000112697 TMEM30A C6orf67|CDC50A transmembrane protein 30A protein-coding 117.667-97 chr2 133650030 133650263 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -81683 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 119.333-84 chr14 61069990 61070284 + 0.666667 NA intron (NR_033344, intron 15 of 16) L1MB1|LINE|L1 -88447 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 139.333-181 chr5 63912456 63912752 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 49688 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 147-88 chr22 50691749 50692093 + 0.666667 NA intron (NM_033517, intron 9 of 21).2 L1MB5|LINE|L1 17279 NM_033517 85358 Hs.149035 NM_033517 ENSG00000251322 SHANK3 DEL22q13.3|PROSAP2|PSAP2|SCZD15|SPANK-2 SH3 and multiple ankyrin repeat domains 3 protein-coding 206-126 chr4 58612355 58612687 + 0.666667 NA Intergenic MER45A|DNA|hAT-Tip100 -76193 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 193.667-29 chr11 127599046 127599516 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 328211 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 161.333-157 chr2 146238333 146238688 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -348547 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 248-9 chr10 57581856 57582348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -277543 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 126.667-183 chr9 84699447 84699667 + 0.666667 NA intron (NM_001369550, intron 1 of 11) L4_A_Mam|LINE|RTE-X -2048 NM_001369551 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 132.333-177 chr8 56341715 56342039 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21101 NM_001318050 195814 Hs.170673 NM_138969 ENSG00000170786 SDR16C5 EPHD-2|RDH#2|RDH-E2|RDHE2|retSDR2 short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 5 protein-coding 151.667-262 chr5 3552735 3553074 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -16810 NR_033898 285577 Hs.582442 NR_033898 ENSG00000248118 LINC01019 - long intergenic non-protein coding RNA 1019 ncRNA 128.333-134 chr3 175310348 175310565 + 0.666667 NA intron (NM_207015, intron 4 of 13) intron (NM_207015, intron 4 of 13) -39360 NR_046713 100874244 Hs.581176 NR_046713 NAALADL2-AS2 - NAALADL2 antisense RNA 2 ncRNA 147.667-33 chr10 32740078 32740427 + 0.666667 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) L1MCa|LINE|L1 161220 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 182.333-129 chr5 64986478 64986876 + 0.666667 NA intron (NM_005869, intron 13 of 13) L1ME4a|LINE|L1 217747 NM_001364478 10283 Hs.371372 NM_005869 ENSG00000153015 CWC27 NY-CO-10|RPSKA|SDCCAG-10|SDCCAG10 CWC27 spliceosome associated cyclophilin protein-coding 159.333-93 chr14 65088895 65089210 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_045122) promoter-TSS (NR_045122) -866 NR_045122 100506321 Hs.711267 NR_045122 ENSG00000259118 LOC100506321 - uncharacterized LOC100506321 ncRNA 139.333-212 chr8 60319969 60320210 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -38689 NM_001321837 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 240.667-62 chr4 72525901 72526470 + 0.666667 NA intron (NM_014243, intron 3 of 21) intron (NM_014243, intron 3 of 21) 43036 NM_014243 9508 Hs.590919 NM_014243 ENSG00000156140 ADAMTS3 ADAMTS-4|HKLLS3 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 3 protein-coding 204.333-31 chr11 15823052 15823522 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 146334 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 115.333-167 chr5 21009581 21009896 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -394203 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 173.333-213 chr9 71620111 71620515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 148200 NM_001135820 23670 Hs.494146 NM_013390 ENSG00000135048 CEMIP2 TMEM2 cell migration inducing hyaluronidase 2 protein-coding 209.333-214 chr7 6474028 6474472 + 0.666667 NA exon (NM_006854, exon 2 of 5) exon (NM_006854, exon 2 of 5) 9902 NM_001100603 11014 Hs.654552 NM_006854 ENSG00000136240 KDELR2 ELP-1|ERD2.2 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 protein-coding 170-81 chr3 132651532 132651921 + 0.666667 NA intron (NM_032169, intron 1 of 19) THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR -2720 NM_198329 79876 Hs.170737 NM_024818 ENSG00000081307 UBA5 EIEE44|SCAR24|THIFP1|UBE1DC1 ubiquitin like modifier activating enzyme 5 protein-coding 221-17 chr12 97838583 97839220 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -82384 NR_077240 643711 Hs.585557 NR_077240 ENSG00000257501 LOC643711 - platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 pseudogene pseudo 201-100 chr7 16038586 16039153 + 0.666667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -171617 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 177.667-120 chr6 130572328 130572805 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 135449 NM_052913 114801 Hs.591341 NM_052913 ENSG00000164484 TMEM200A KIAA1913|TTMA|TTMC transmembrane protein 200A protein-coding 167-5 chr1 112958083 112958413 + 0.666667 NA intron (NR_103743, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 1833 NR_103744 100506392 Hs.418285 NR_103743 ENSG00000226419 SLC16A1-AS1 - SLC16A1 antisense RNA 1 ncRNA 167.333-63 chr12 28367814 28368206 + 0.666667 NA intron (NM_001330367, intron 7 of 11) MLT2D|LTR|ERVL -177272 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 124.333-82 chr2 57806805 57807159 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -100669 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 125.333-66 chr15 58789740 58790089 + 0.666667 NA intron (NM_001040450, intron 2 of 8) AluSp|SINE|Alu 18612 NM_001040453 54629 Hs.591122 NM_019092 ENSG00000128923 MINDY2 FAM63B MINDY lysine 48 deubiquitinase 2 protein-coding 116.333-71 chr14 85434115 85434348 + 0.666667 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL 40316 NR_102738 100996280 Hs.135735 NR_102737 ENSG00000259107 LINC00911 - long intergenic non-protein coding RNA 911 ncRNA 155-67 chr2 100076125 100076510 + 0.666667 NA intron (NM_001025108, intron 2 of 23) intron (NM_001025108, intron 2 of 23) 29266 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 128.667-95 chr2 150366847 150367173 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -110003 NR_146972 105373683 NR_146972 ENSG00000231420 LINC01817 - long intergenic non-protein coding RNA 1817 ncRNA 112.667-54 chr12 113224819 113225072 + 0.666667 NA intron (NM_017901, intron 1 of 27) AluSz|SINE|Alu 3481 NM_001143819 53373 Hs.524763 NM_017901 ENSG00000186815 TPCN1 TPC1 two pore segment channel 1 protein-coding 115.333-23 chr10 57156360 57156587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 148086 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 167.667-119 chr20 49068420 49068728 + 0.666667 NA intron (NM_001362762, intron 6 of 24) AluY|SINE|Alu 22262 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 141.667-7 chr1 97048842 97049209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46898 NR_046590 100873932 Hs.682651 NR_046590 ENSG00000232878 DPYD-AS1 - DPYD antisense RNA 1 ncRNA 124.333-62 chr17 52304970 52305197 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -85439 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 122.333-205 chr8 102614869 102615103 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 38978 NR_103760 7071 Hs.435001 NM_005655 ENSG00000155090 KLF10 EGR-alpha|EGRA|TIEG|TIEG1 Kruppel like factor 10 protein-coding 116-138 chr6 116121854 116122049 + 0.666667 NA exon (NM_000493, exon 3 of 3) exon (NM_000493, exon 3 of 3) 4181 NM_000493 1300 Hs.520339 NM_000493 ENSG00000123500 COL10A1 - collagen type X alpha 1 chain protein-coding 142.667-174 chr5 12792529 12792955 + 0.666667 NA intron (NR_033383, intron 3 of 3) intron (NR_033383, intron 3 of 3) 124883 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 138-115 chr8 89148976 89149245 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu 608601 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 161.333-110 chr17 3632480 3632908 + 0.666667 NA intron (NM_013276, intron 1 of 6) intron (NM_013276, intron 1 of 6) 3556 NM_013276 23729 Hs.579217 NM_013276 ENSG00000197417 SHPK CARKL|SHK sedoheptulokinase protein-coding 129.667-180 chr8 132613406 132613731 + 0.666667 NA intron (NR_135908, intron 4 of 7) L1MB5|LINE|L1 -52089 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 224.667-63 chr5 23375049 23375634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132268 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 157-25 chr11 22764770 22765079 + 0.666667 NA intron (NR_147085, intron 9 of 10) intron (NR_147085, intron 9 of 10) 64455 NR_135213 258010 Hs.349096 NM_148893 ENSG00000198168 SVIP - small VCP interacting protein protein-coding 138-114 chr8 14083323 14083591 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 453767 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 116.333-59 chr13 92861995 92862214 + 0.666667 NA intron (NM_004466, intron 7 of 7) MIRb|SINE|MIR -140490 NR_046520 100873969 Hs.577863 NR_046520 ENSG00000235984 GPC5-AS1 - GPC5 antisense RNA 1 ncRNA 124.333-134 chr4 102292839 102293127 + 0.666667 NA intron (NM_022154, intron 5 of 7) MIRb|SINE|MIR 31329 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 202-187 chr8 123834998 123835423 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -16777 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 158.333-48 chr11 14542763 14543232 + 0.666667 NA intron (NM_148976, intron 2 of 10) AluSx1|SINE|Alu -22552 NM_002786 5682 Hs.102798 NM_002786 ENSG00000129084 PSMA1 HC2|HEL-S-275|NU|PROS30 proteasome subunit alpha 1 protein-coding 152.333-6 chr1 41759992 41760374 + 0.666667 NA intron (NM_024503, intron 1 of 8) FAM|SINE|Alu 158739 NM_024503 59269 Hs.403972 NM_024503 ENSG00000127124 HIVEP3 KBP-1|KBP1|KRC|SHN3|Schnurri-3|ZAS3|ZNF40C human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 protein-coding 114.333-122 chr2 191482747 191482973 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -195212 NM_001254736 64859 Hs.591610 NM_022837 ENSG00000173559 NABP1 OBFC2A|SOSS-B2|SSB2 nucleic acid binding protein 1 protein-coding 158.667-19 chr1 151970814 151971117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22894 NM_002966 6281 Hs.143873 NM_002966 ENSG00000197747 S100A10 42C|ANX2L|ANX2LG|CAL1L|CLP11|Ca[1]|GP11|P11|p10 S100 calcium binding protein A10 protein-coding 145-111 chr7 82175828 82176137 + 0.666667 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 166805 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 156.667-321 chr7 51935715 51936004 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -542603 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 114.333-236 chr9 7380564 7380761 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 419116 NM_033428 90871 Hs.7517 NM_033428 ENSG00000137038 DMAC1 C9orf123|TMEM261 distal membrane arm assembly complex 1 protein-coding 193.333-163 chr6 162835120 162835691 + 0.666667 NA intron (NM_001080379, intron 2 of 4) intron (NM_001080379, intron 2 of 4) 107435 NM_001080379 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 120.333-13 chr1 169181697 169181985 + 0.666667 NA intron (NM_197972, intron 10 of 11) L2|LINE|L2 75151 NM_001677 481 Hs.291196 NM_001677 ENSG00000143153 ATP1B1 ATP1B ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 1 protein-coding 116.667-128 chr3 42606346 42606565 + 0.666667 NA intron (NM_001349126, intron 2 of 18) intron (NM_001349126, intron 2 of 18) -5377 NM_001201572 9117 Hs.445892 NM_004206 ENSG00000093183 SEC22C SEC22L3 SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein protein-coding 123-35 chr12 46008464 46008699 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -18007 NM_004719 9169 Hs.210367 NM_004719 ENSG00000139218 SCAF11 CASP11|SFRS2IP|SIP1|SRRP129|SRSF2IP SR-related CTD associated factor 11 protein-coding 121.333-82 chr2 46584552 46584763 + 0.666667 NA TTS (NM_012249) TTS (NM_012249) -4419 NR_104182 100506142 Hs.658541 NR_104182 ENSG00000250116 LOC100506142 - uncharacterized LOC100506142 ncRNA 287-27 chr5 129110264 129110778 + 0.666667 NA intron (NM_016048, intron 4 of 4) intron (NM_016048, intron 4 of 4) 12833 NR_039776 100616175 NR_039776 ENSG00000264563 MIR4633 - microRNA 4633 ncRNA 212-80 chr2 20520557 20521029 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -19269 NR_157978 107985856 NR_157978 LOC107985856 - uncharacterized LOC107985856 ncRNA 157-120 chr7 12828035 12828486 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 140627 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 183.333-7 chr1 111438500 111438862 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10575 NM_024102 79084 Hs.204773 NM_024102 ENSG00000116455 WDR77 HKMT1069|MEP-50|MEP50|Nbla10071|p44|p44/Mep50 WD repeat domain 77 protein-coding 155-39 chr15 76638206 76638517 + 0.666667 NA intron (NR_148227, intron 21 of 32) L1MB8|LINE|L1 51714 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 119.667-111 chr3 33606490 33606707 + 0.666667 NA exon (NM_001207044, exon 10 of 33) exon (NM_001207044, exon 10 of 33) 53081 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 266-21 chr14 49948454 49949114 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -17615 NR_106724 102464828 NR_106724 ENSG00000278038 MIR6076 hsa-mir-6076 microRNA 6076 ncRNA 268 chr1 39910052 39910526 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -8372 NM_001033082 4610 Hs.437922 NM_005376 ENSG00000116990 MYCL L-Myc|LMYC|MYCL1|bHLHe38 MYCL proto-oncogene, bHLH transcription factor protein-coding 112.667-77 chr15 68379516 68379687 + 0.666667 NA intron (NM_001004439, intron 2 of 29) intron (NM_001004439, intron 2 of 29) 52562 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 112.333-64 chr13 87075632 87075825 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 163808 NR_132371 106144533 Hs.525107 NR_132371 LINC00430 - long intergenic non-protein coding RNA 430 ncRNA 164.333-139 chr20 36663653 36663994 + 0.666667 NA intron (NM_032013, intron 12 of 15) AluSx|SINE|Alu -17627 NM_032214 84174 Hs.713578 NM_032214 ENSG00000101082 SLA2 C20orf156|MARS|SLAP-2|SLAP2 Src like adaptor 2 protein-coding 161-49 chr20 12830918 12831324 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 105842 NR_109872 102606466 Hs.602196 NR_109872 LOC102606466 - uncharacterized LOC102606466 ncRNA 155.333-238 chr3 138649278 138649591 + 0.666667 NA Intergenic L1M2b|LINE|L1 40385 NM_018147 55179 Hs.173438 NM_018147 ENSG00000158234 FAIM FAIM1 Fas apoptotic inhibitory molecule protein-coding 124.333-168 chr7 10616841 10617136 + 0.666667 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) L1MA9|LINE|L1 -85688 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 159.333-118 chr16 76042934 76043263 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -234303 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 158-21 chr11 14770242 14770607 + 0.666667 NA intron (NM_000922, intron 1 of 15) L3|LINE|CR1 121781 NM_024514 120227 Hs.371427 NM_024514 ENSG00000186104 CYP2R1 - cytochrome P450 family 2 subfamily R member 1 protein-coding 116-12 chr1 240238266 240238562 + 0.666667 NA intron (NM_020066, intron 6 of 17) intron (NM_020066, intron 6 of 17) 146531 NM_001305424 56776 Hs.24889 NM_020066 ENSG00000155816 FMN2 - formin 2 protein-coding 118.333-191 chr7 40255208 40255481 + 0.666667 NA intron (NM_001193312, intron 7 of 12) intron (NM_001193312, intron 7 of 12) 120368 NM_024728 79783 Hs.586313 NM_024728 ENSG00000175600 SUGCT C7orf10|DERP13|GA3|ORF19 succinyl-CoA:glutarate-CoA transferase protein-coding 223 chr1 53458617 53459082 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_033067) promoter-TSS (NM_033067) -550 NM_033067 63948 Hs.131654 NM_033067 ENSG00000143006 DMRTB1 - DMRT like family B with proline rich C-terminal 1 protein-coding 140-35 chr14 28219603 28220014 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 545511 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 196.667-77 chr2 134098301 134098741 + 0.666667 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -21414 NM_001371457 111.667-272 chr9 91761103 91761390 + 0.666667 NA intron (NM_001318204, intron 2 of 7) MER1A|DNA|hAT-Charlie -124901 NR_037489 100500902 NR_037489 ENSG00000283351 MIR3910-2 mir-3910-2 microRNA 3910-2 ncRNA 116.667-99 chr2 85513597 85513841 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 25167 NR_038942 100630918 Hs.66049 NR_038942 PARTICL PARTICLE promoter of MAT2A antisense radiation-induced circulating long non-coding RNA ncRNA 143.667-145 chr21 20079769 20080038 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 178782 NR_151724 111216285 Hs.561034 NR_151724 LINC02573 - long intergenic non-protein coding RNA 2573 ncRNA 170-30 chr13 89419313 89419719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 80993 NR_131228 105370308 Hs.599406 NR_131228 ENSG00000226037 LINC01040 TCONS_00021682 long intergenic non-protein coding RNA 1040 ncRNA 155-72 chr2 163587281 163587608 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 148564 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 173.667-33 chr12 14963025 14963437 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1630 NM_001321420 397 Hs.504877 NM_001175 ENSG00000111348 ARHGDIB D4|GDIA2|GDID4|LYGDI|Ly-GDI|RAP1GN1|RhoGDI2 Rho GDP dissociation inhibitor beta protein-coding 184.667-58 chr2 89829173 89829556 + 0.666667 NA Intergenic (ATTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -191457 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 144.667-254 chr6 13430201 13430600 + 0.666667 NA intron (NM_018988, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu -22263 NM_001242630 54438 Hs.484686 NM_018988 ENSG00000145990 GFOD1 ADG-90|C6orf114 glucose-fructose oxidoreductase domain containing 1 protein-coding 151.667-167 chr2 112464216 112464507 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -17795 NM_153712 150465 Hs.358997 NM_153712 ENSG00000114999 TTL - tubulin tyrosine ligase protein-coding 141.667-88 chr16 27097732 27098072 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30975 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 209-96 chr5 147059625 147059954 + 0.666667 NA intron (NM_181677, intron 2 of 10) intron (NM_181677, intron 2 of 10) -3652 NM_181676 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 135.333-193 chr8 91621898 91622219 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 372739 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 137.667-11 chr1 119512409 119512765 + 0.666667 NA intron (NM_001328615, intron 3 of 3) intron (NM_001328615, intron 3 of 3) 5377 NM_000862 3283 Hs.364941 NM_000862 ENSG00000203857 HSD3B1 3BETAHSD|HSD3B|HSDB3|HSDB3A|SDR11E1 hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 protein-coding 154.333-331 chr7 116785684 116785998 + 0.666667 NA intron (NM_000245, intron 19 of 20) intron (NM_000245, intron 19 of 20) -76746 NM_006136 830 Hs.446123 NM_006136 ENSG00000198898 CAPZA2 CAPPA2|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 2 protein-coding 142.667-200 chr7 19362077 19362375 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -216805 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 118-64 chr2 683021 683285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5747 NM_001352680 129787 Hs.6729 NM_152834 ENSG00000151353 TMEM18 lncND transmembrane protein 18 protein-coding 139.667-29 chr11 101829183 101829577 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85630 NM_001363543 57562 Hs.156352 NM_020802 ENSG00000110318 CEP126 KIAA1377 centrosomal protein 126 protein-coding 151-126 chr8 51847822 51848133 + 0.666667 NA intron (NM_001286783, intron 1 of 5) AluJo|SINE|Alu -38532 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 115.333-104 chr18 74338438 74338630 + 0.666667 NA intron (NM_001174123, intron 7 of 13) intron (NM_001174123, intron 7 of 13) 22695 NM_001174123 644041 Hs.465414 NM_001174123 ENSG00000206043 C18orf63 DKFZP781G0119 chromosome 18 open reading frame 63 protein-coding 113.667-160 chr4 81781235 81781551 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -309486 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 180-62 chr20 45830215 45830659 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -3125 NM_003279 7125 Hs.182421 NM_003279 ENSG00000101470 TNNC2 - troponin C2, fast skeletal type protein-coding 178.333-131 chr4 176603045 176603422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 189689 NM_005429 7424 Hs.435215 NM_005429 ENSG00000150630 VEGFC Flt4-L|LMPH1D|LMPHM4|VRP vascular endothelial growth factor C protein-coding 128.333-38 chr11 67459056 67459279 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001300896, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001300896, exon 7 of 7) 3813 NM_145200 57010 Hs.143036 NM_145200 ENSG00000175544 CABP4 CRSD|CSNB2B calcium binding protein 4 protein-coding 113-152 chr4 46133925 46134218 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -10017 NM_173536 2565 Hs.375051 NM_173536 ENSG00000163285 GABRG1 - gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma1 subunit protein-coding 180.667-28 chr12 27649297 27649689 + 0.666667 NA intron (NM_003622, intron 6 of 29) intron (NM_003622, intron 6 of 29) -46954 NM_001029874 387849 Hs.269836 NM_001029874 ENSG00000174236 REP15 RAB15EP RAB15 effector protein protein-coding 114.667-181 chr3 127650095 127650327 + 0.666667 NA intron (NM_015720, intron 2 of 7) Plat_L3|LINE|CR1 21026 NM_015720 50512 Hs.591290 NM_015720 ENSG00000114631 PODXL2 EG|PODLX2 podocalyxin like 2 protein-coding 157-15 chr10 14507812 14508171 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24723 NM_001320741 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 131.667-101 chr2 161980319 161980666 + 0.666667 NA intron (NM_001354451, intron 25 of 25) AluSz|SINE|Alu 93723 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 145.333-258 chr6 64915438 64915836 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 15 of 43) intron (NM_001292009, intron 15 of 43) -385781 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 120-46 chr16 52762056 52762268 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -155187 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 127-39 chr17 72793635 72793919 + 0.666667 NA intron (NM_001352692, intron 6 of 9) intron (NM_001352692, intron 6 of 9) -153305 NR_033876 400619 Hs.447555 NR_033876 ENSG00000227036 LINC00511 LCAL5|onco-lncRNA-12 long intergenic non-protein coding RNA 511 ncRNA 134.667-121 chr20 51262529 51262843 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 190291 NR_036162 100422889 NR_036162 ENSG00000266761 MIR3194 mir-3194 microRNA 3194 ncRNA 167.333-16 chr1 154660216 154660597 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32409 NM_001365045 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 126-70 chr3 59573476 59573697 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 84911 NR_149028 339902 Hs.132446 NR_149028 LOC339902 - hCG1813818 ncRNA 137.333-95 chr2 51628782 51629038 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 596309 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 158-142 chr8 126028581 126028969 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -77578 NR_038446 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 175-51 chr3 28774265 28774640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 199174 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 128-82 chr4 84588737 84589072 + 0.666667 NA intron (NM_001263, intron 1 of 12) LTR8A|LTR|ERV1 5777 NM_001263 1040 Hs.654899 NM_001263 ENSG00000163624 CDS1 CDS 1 CDP-diacylglycerol synthase 1 protein-coding 162-16 chr10 79382674 79383104 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_153367, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_153367, exon 4 of 4) 35420 NM_005729 10105 Hs.381072 NM_005729 ENSG00000108179 PPIF CYP3|CyP-M|Cyp-D|CypD peptidylprolyl isomerase F protein-coding 169-21 chr12 113242027 113242419 + 0.666667 NA intron (NM_001351346, intron 3 of 28) intron (NM_001351346, intron 3 of 28) -2038 NM_001301214 53373 Hs.524763 NM_017901 ENSG00000186815 TPCN1 TPC1 two pore segment channel 1 protein-coding 146-118 chr6 90224503 90224865 + 0.666667 NA intron (NM_001170794, intron 1 of 6) Charlie15b|DNA|hAT-Charlie 72159 NM_021813 60468 Hs.269764 NM_021813 ENSG00000112182 BACH2 BTBD25|IMD60 BTB domain and CNC homolog 2 protein-coding 191.333-165 chr5 122812618 122813041 + 0.666667 NA intron (NM_003100, intron 7 of 14) intron (NM_003100, intron 7 of 14) -32620 NR_146145 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 153.333-139 chr15 58921255 58921695 + 0.666667 NA intron (NR_135043, intron 1 of 18) intron (NR_135043, intron 1 of 18) 12204 NM_001013843 79811 Hs.512932 NM_017968 ENSG00000137776 SLTM Met SAFB like transcription modulator protein-coding 135-117 chr9 24164403 24164690 + 0.666667 NA Intergenic (TATG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -313945 NM_001351460 1993 Hs.166109 NM_004432 ENSG00000107105 ELAVL2 HEL-N1|HELN1|HUB ELAV like RNA binding protein 2 protein-coding 154.333-181 chr2 236182930 236183327 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -14742 NM_001301687 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 152.667-262 chr3 194278731 194279155 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -28790 NR_125403 100505920 Hs.436654 NR_125403 ENSG00000225742 LINC02036 - long intergenic non-protein coding RNA 2036 ncRNA 162.333-118 chr2 111976893 111977231 + 0.666667 NA intron (NM_006343, intron 7 of 18) L1MEc|LINE|L1 -78207 NM_032824 84910 Hs.656298 NM_032824 ENSG00000153214 TMEM87B - transmembrane protein 87B protein-coding 124.667-206 chr8 101609376 101609727 + 0.666667 NA intron (NM_024915, intron 8 of 15) L1ME3G|LINE|L1 117112 NM_001330593 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 133.667-65 chr18 69083885 69084222 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 285973 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 171.333-155 chr5 106765431 106765799 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 245399 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 154.667-113 chr14 66521150 66521523 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 13929 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 153.667-287 chr4 48836614 48836906 + 0.666667 NA intron (NM_001079839, intron 3 of 8) intron (NM_001079839, intron 3 of 8) 5454 NM_001168254 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 186.667-72 chr2 110993078 110993584 + 0.666667 NA intron (NM_001371254, intron 14 of 18) L1ME2z|LINE|L1 122257 NR_122074 400997 Hs.652337 NR_122074 ENSG00000204581 ACOXL-AS1 - ACOXL antisense RNA 1 ncRNA 128-109 chr7 53180389 53180678 + 0.666667 NA Intergenic (AAAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 144900 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 160-106 chr6 121520446 121520782 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 84968 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 128-58 chr20 7722242 7722526 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 218074 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 140-111 chr7 98097905 98098177 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -8821 NM_014916 22853 Hs.444179 NM_014916 ENSG00000164715 LMTK2 AATYK2|BREK|KPI-2|KPI2|LMR2|PPP1R100|cprk|hBREK lemur tyrosine kinase 2 protein-coding 216-54 chr2 10881466 10881934 + 0.666667 NA intron (NR_110575, intron 1 of 1) L1ME1|LINE|L1 3433 NR_110575 101929733 Hs.736697 NR_110575 ENSG00000271952 LINC01954 - long intergenic non-protein coding RNA 1954 ncRNA 284-30 chr22 35300190 35300784 + 0.666667 NA intron (NR_156428, intron 1 of 13) intron (NR_156428, intron 1 of 13) 593 NR_024194 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 113.667-188 chr6 84792616 84792931 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -28175 NM_001080508 9096 Hs.251830 NM_001080508 ENSG00000112837 TBX18 CAKUT2 T-box transcription factor 18 protein-coding 125-69 chr22 47452838 47453153 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 34116 NR_109967 101927722 Hs.589927 NR_109967 ENSG00000218357 LINC01644 LL22NC03-75H12.2 long intergenic non-protein coding RNA 1644 ncRNA 117.667-134 chr4 60969769 60970048 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47289 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 146.667-355 chr9 78098698 78099058 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -67067 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 166.333-68 chr14 49683707 49684043 + 0.666667 NA intron (NM_001348385, intron 1 of 18) intron (NM_001348385, intron 1 of 18) 4339 NM_001197331 5427 Hs.162777 NM_002692 ENSG00000100479 POLE2 DPE2 DNA polymerase epsilon 2, accessory subunit protein-coding 219.667-70 chr5 15223613 15223954 + 0.666667 NA intron (NR_109944, intron 2 of 2) intron (NR_109944, intron 2 of 2) 42777 NR_109944 101929454 Hs.453273 NR_109944 LINC02149 - long intergenic non-protein coding RNA 2149 ncRNA 138.333-202 chr8 138573401 138573678 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -75809 NM_001362965 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 159.667-123 chr16 53431450 53431923 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2785 NM_001323608 5934 Hs.513609 NM_005611 ENSG00000103479 RBL2 P130|Rb2 RB transcriptional corepressor like 2 protein-coding 115.333-116 chr2 163800450 163800630 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64532 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 335.333-30 chr21 29302477 29303372 + 0.666667 NA intron (NM_206866, intron 1 of 4) intron (NM_206866, intron 1 of 4) -2280 NR_027655 571 Hs.154276 NM_001186 ENSG00000156273 BACH1 BACH-1|BTBD24 BTB domain and CNC homolog 1 protein-coding 143-28 chr11 129885761 129886030 + 0.666667 NA intron (NM_001143835, intron 5 of 26) intron (NM_001143835, intron 5 of 26) 7114 NM_006165 4798 Hs.530539 NM_006165 ENSG00000170322 NFRKB INO80G nuclear factor related to kappaB binding protein protein-coding 175-34 chr17 65724282 65724657 + 0.666667 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) intron (NR_126542, intron 2 of 5) 101982 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 115.667-155 chr4 3442542 3442851 + 0.666667 NA intron (NM_001528, intron 1 of 13) intron (NM_001528, intron 1 of 13) 728 NM_001528 3083 Hs.104 NM_001528 ENSG00000109758 HGFAC HGFA HGF activator protein-coding 127-16 chr10 21438608 21438925 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 57875 NR_031736 100302129 NR_031736 ENSG00000222071 MIR1915 MIRN1915|hsa-mir-1915 microRNA 1915 ncRNA 111.667-37 chr10 79085683 79085900 + 0.666667 NA intron (NM_020338, intron 1 of 24) intron (NM_020338, intron 1 of 24) 16825 NM_020338 57178 Hs.193118 NM_020338 ENSG00000108175 ZMIZ1 MIZ|RAI17|TRAFIP10|ZIMP10 zinc finger MIZ-type containing 1 protein-coding 114.667-216 chr5 123785524 123785764 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 240227 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 148-137 chr5 143170002 143170385 + 0.666667 NA intron (NM_001349547, intron 20 of 21) intron (NM_001349547, intron 20 of 21) -22307 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 212.333-13 chr10 4771999 4772492 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53932 NM_001271021 83592 Hs.657944 NM_031436 ENSG00000165568 AKR1E2 AKR1CL2|AKRDC1|LoopADR|TAKR|hTSP|htAKR aldo-keto reductase family 1 member E2 protein-coding 204-146 chr4 40006950 40007368 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -29203 NM_001100400 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 150.667-68 chr11 59426737 59427155 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -3993 NM_001001954 219981 Hs.553648 NM_001001954 ENSG00000172324 OR5A2 - olfactory receptor family 5 subfamily A member 2 protein-coding 198.667-123 chr21 24009341 24009802 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 311806 NR_109963 101927869 Hs.555591 NR_109963 ENSG00000224832 LINC01689 - long intergenic non-protein coding RNA 1689 ncRNA 128.333-164 chr5 152530608 152530917 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -125483 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 165.333-161 chr3 26777373 26777658 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 82958 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 131.667-2 chr1 16119177 16119554 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36704 NM_004431 1969 Hs.171596 NM_004431 ENSG00000142627 EPHA2 ARCC2|CTPA|CTPP1|CTRCT6|ECK EPH receptor A2 protein-coding 179-51 chr2 15471596 15471989 + 0.666667 NA intron (NR_052013, intron 16 of 50) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 89542 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 133-28 chr14 68464799 68465043 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 9 of 10) intron (NM_133509, intron 9 of 10) 163866 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 169.333-101 chr17 66199838 66200218 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -7895 NM_001353128 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 143.667-196 chr5 12113227 12113495 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208915 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 187-22 chr14 74758931 74759315 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -4193 NM_019589 56252 Hs.531111 NM_019589 ENSG00000119596 YLPM1 C14orf170|PPP1R169|ZAP113|ZAP3 YLP motif containing 1 protein-coding 149.333-267 chr3 151827210 151827620 + 0.666667 NA intron (NM_001086, intron 4 of 4) intron (NM_001086, intron 4 of 4) 13299 NM_001086 13 Hs.506908 NM_001086 ENSG00000114771 AADAC CES5A1|DAC arylacetamide deacetylase protein-coding 193-13 chr11 7339469 7340017 + 0.666667 NA intron (NM_175733, intron 3 of 6) L1PREC2|LINE|L1 87839 NM_175733 143425 Hs.177193 NM_175733 ENSG00000170743 SYT9 - synaptotagmin 9 protein-coding 212.333-95 chr3 104370841 104371373 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -846991 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 168.333-75 chr17 82460345 82460640 + 0.666667 NA intron (NM_001083608, intron 2 of 9) AluY|SINE|Alu 1751 NM_001083608 26502 Hs.256526 NM_012336 ENSG00000141562 NARF IOP2 nuclear prelamin A recognition factor protein-coding 243.333-47 chr2 12166927 12167486 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) -31924 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 155-51 chr17 41694686 41695007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5961 NM_005801 10209 Hs.150580 NM_005801 ENSG00000173812 EIF1 A121|EIF-1|EIF1A|ISO1|SUI1 eukaryotic translation initiation factor 1 protein-coding 123.333-234 chr9 103289536 103289896 + 0.666667 NA intron (NR_121578, intron 3 of 9) intron (NR_121578, intron 3 of 9) 35317 NR_121578 101928496 Hs.410860 NR_121578 ENSG00000225564 LINC01492 - long intergenic non-protein coding RNA 1492 ncRNA 169.333-108 chr19 3761796 3762220 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_004886) promoter-TSS (NM_004886) -316 NM_004886 9546 Hs.25527 NM_004886 ENSG00000011132 APBA3 MGC:15815|X11L2|mint3 amyloid beta precursor protein binding family A member 3 protein-coding 134-97 chr7 40567838 40568093 + 0.666667 NA intron (NM_001193312, intron 11 of 12) intron (NM_001193312, intron 11 of 12) 411974 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 116-127 chr5 102944713 102945011 + 0.666667 NA intron (NR_157231, intron 8 of 14) intron (NR_157231, intron 8 of 14) 79039 NM_000919 5066 Hs.369430 NM_000919 ENSG00000145730 PAM PAL|PHM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase protein-coding 208.333-26 chr12 40871828 40872322 + 0.666667 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) -36282 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 154.667-393 chr8 106016744 106017053 + 0.666667 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) L1MEc|LINE|L1 43605 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 263-27 chr17 66618478 66619125 + 0.666667 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) intron (NM_002737, intron 3 of 16) -168271 NR_030364 693219 NR_030364 ENSG00000207943 MIR634 MIRN634|hsa-mir-634 microRNA 634 ncRNA 119.333-206 chr8 24698834 24699160 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -150379 NR_125808 101929294 Hs.637673 NR_125808 LOC101929294 - uncharacterized LOC101929294 ncRNA 115-81 chr2 7486523 7486715 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 65358 NR_038432 100506274 Hs.177930 NR_038432 ENSG00000229727 LOC100506274 - uncharacterized LOC100506274 ncRNA 152.667-237 chr3 13367659 13367970 + 0.666667 NA intron (NM_024923, intron 13 of 39) L1ME3A|LINE|L1 52508 NM_024923 23225 Hs.475525 NM_024923 ENSG00000132182 NUP210 GP210|POM210 nucleoporin 210 protein-coding 143-2 chr1 31935007 31935402 + 0.666667 NA intron (NM_001369859, intron 1 of 6) intron (NM_001369859, intron 1 of 6) 2614 NM_001369860 8073 Hs.470477 NM_003479 ENSG00000184007 PTP4A2 HH13|HH7-2|HU-PP-1|OV-1|PRL-2|PRL2|PTP4A|PTPCAAX2|ptp-IV1a|ptp-IV1b protein tyrosine phosphatase 4A2 protein-coding 115-93 chr2 135155009 135155245 + 0.666667 NA intron (NM_001172435, intron 19 of 24) L1MC4|LINE|L1 18499 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 162.333-63 chr13 104456537 104456856 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1009171 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 197.333-13 chr1 205397040 205397623 + 0.666667 NA intron (NR_037583, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR 24079 NR_038425 284576 Hs.585440 NR_038425 ENSG00000226235 LEMD1-AS1 - LEMD1 antisense RNA 1 ncRNA 163.333-80 chr14 25273563 25273919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -223444 NM_001351942 29091 Hs.508958 NM_014178 ENSG00000168952 STXBP6 HSPC156|amisyn syntaxin binding protein 6 protein-coding 142.333-60 chr12 48573482 48573794 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -3592 NM_002289 3906 Hs.72938 NM_002289 ENSG00000167531 LALBA LYZG lactalbumin alpha protein-coding 133.333-134 chr4 104102824 104103126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -382990 NM_001059 6870 Hs.942 NM_001059 ENSG00000169836 TACR3 HH11|NK-3R|NK3|NK3R|NKR|TAC3R|TAC3RL tachykinin receptor 3 protein-coding 154-132 chr7 50293514 50293823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10396 NM_001291839 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 153-4 chr1 63529924 63530264 + 0.666667 NA intron (NM_032437, intron 2 of 13) intron (NM_032437, intron 2 of 13) 6569 NM_032437 84455 Hs.652324 NM_032437 ENSG00000203965 EFCAB7 - EF-hand calcium binding domain 7 protein-coding 115.333-161 chr4 95866923 95867139 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 26938 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 152.333-152 chr17 62928786 62929071 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -15287 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 250-32 chr17 76726872 76727556 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001081461) promoter-TSS (NM_001081461) 384 NM_001302705 124512 Hs.74655 NM_001080510 ENSG00000181038 METTL23 C17orf95|MRT44 methyltransferase like 23 protein-coding 143.667-250 chr8 77441536 77441958 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -8950 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 114.333-75 chr14 69701288 69701525 + 0.666667 NA intron (NM_014734, intron 2 of 5) intron (NM_014734, intron 2 of 5) -65736 NM_006925 6430 Hs.632326 NM_006925 ENSG00000100650 SRSF5 HRS|SFRS5|SRP40 serine and arginine rich splicing factor 5 protein-coding 166.333-85 chr16 4629845 4630241 + 0.666667 NA intron (NM_001142290, intron 1 of 16) AluSx|SINE|Alu 5217 NM_015246 23295 Hs.526494 NM_015246 ENSG00000102858 MGRN1 RNF156 mahogunin ring finger 1 protein-coding 196.667-17 chr10 72965144 72965553 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -10542 NM_001318124 84647 Hs.333175 NM_032562 ENSG00000138308 PLA2G12B FKSG71|GXIIB|GXIIIsPLA2|PLA2G13|sPLA2-GXIIB phospholipase A2 group XIIB protein-coding 120.333-90 chr2 18444491 18444802 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 116007 NM_020905 57665 Hs.120319 NM_020905 ENSG00000240857 RDH14 PAN2|SDR7C4 retinol dehydrogenase 14 protein-coding 115.333-69 chr14 60301431 60301721 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21620 NR_146481 101927729 NR_146481 ENSG00000258556 LINC02322 - long intergenic non-protein coding RNA 2322 ncRNA 137.333-87 chr2 19140775 19141058 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -113945 NR_135287 400945 Hs.502854 NR_135287 ENSG00000236204 LINC01376 - long intergenic non-protein coding RNA 1376 ncRNA 144.333-190 chr4 74737381 74737693 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 56986 NM_001729 685 Hs.591704 NM_001729 ENSG00000174808 BTC - betacellulin protein-coding 198.333-63 chr14 71699746 71700046 + 0.666667 NA intron (NM_001354286, intron 15 of 24) L3|LINE|CR1 113598 NM_001284246 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 225.667-63 chr5 116394276 116394826 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19981 NR_104675 101927190 Hs.639849 NR_104675 LOC101927190 - uncharacterized LOC101927190 ncRNA 122-37 chr14 87062096 87062352 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 156446 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 115-41 chr12 32510259 32510463 + 0.666667 NA intron (NM_001370297, intron 1 of 14) L1ME4a|LINE|L1 8198 NM_001370297 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 164.333-210 chr6 36215296 36215616 + 0.666667 NA intron (NM_015695, intron 8 of 12) intron (NM_015695, intron 8 of 12) 18712 NM_015695 27154 Hs.520096 NM_015695 ENSG00000096070 BRPF3 - bromodomain and PHD finger containing 3 protein-coding 121.333-14 chr1 218955696 218955986 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) L1MEf|LINE|L1 -37330 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 137-113 chr9 77587082 77587403 + 0.666667 NA intron (NM_004297, intron 1 of 6) L1MB5|LINE|L1 61080 NM_004297 9630 Hs.657795 NM_004297 ENSG00000156049 GNA14 - G protein subunit alpha 14 protein-coding 241.667-15 chr11 65326542 65327018 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7072 NM_001330308 5977 Hs.13495 NM_006268 ENSG00000133884 DPF2 CSS7|REQ|UBID4|ubi-d4 double PHD fingers 2 protein-coding 141.667-199 chr6 134014327 134014683 + 0.666667 NA intron (NM_145176, intron 2 of 4) intron (NM_145176, intron 2 of 4) 38119 NM_145176 154091 Hs.486508 NM_145176 ENSG00000146411 SLC2A12 GLUT12|GLUT8 solute carrier family 2 member 12 protein-coding 205-39 chr16 53750317 53750866 + 0.666667 NA intron (NM_001363897, intron 1 of 7) MER58C|DNA|hAT-Charlie 46435 NM_001080432 79068 Hs.528833 NM_001080432 ENSG00000140718 FTO ALKBH9|BMIQ14|GDFD FTO alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase protein-coding 195.333-12 chr1 81898484 81898972 + 0.666667 NA intron (NM_001366002, intron 3 of 20) intron (NM_001366002, intron 3 of 20) 96275 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 147-142 chr8 129235319 129235607 + 0.666667 NA intron (NR_033916, intron 1 of 2) MamRep564|Unknown|Unknown 5777 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 114-120 chr5 84908091 84908419 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -523375 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 143.667-253 chr8 99389226 99389503 + 0.666667 NA intron (NM_017890, intron 20 of 61) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 147366 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 208-131 chr5 7068811 7069197 + 0.666667 NA Intergenic MER51B|LTR|ERV1 200350 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 119.333-176 chr5 83595667 83595977 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -33508 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 158.667-242 chr4 65399584 65400019 + 0.666667 NA intron (NM_001281767, intron 8 of 16) intron (NM_001281767, intron 8 of 16) 269687 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 221.667-32 chr15 25562218 25562674 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -123390 NM_000462 7337 Hs.598862 NM_000462 ENSG00000114062 UBE3A ANCR|AS|E6-AP|EPVE6AP|HPVE6A ubiquitin protein ligase E3A protein-coding 212.333-42 chr14 50433906 50434390 + 0.666667 NA intron (NM_198794, intron 27 of 31) intron (NM_198794, intron 27 of 31) -36850 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 260.333-59 chr7 850337 850935 + 0.666667 NA intron (NM_001367704, intron 7 of 19) intron (NM_001367704, intron 7 of 19) 9262 NM_001367708 23353 Hs.438072 NM_025154 ENSG00000164828 SUN1 UNC84A Sad1 and UNC84 domain containing 1 protein-coding 113-139 chr3 88158174 88158431 + 0.666667 NA TTS (NM_173824) TTS (NM_173824) 8343 NM_173824 285237 Hs.476944 NM_173824 ENSG00000179021 C3orf38 - chromosome 3 open reading frame 38 protein-coding 144-52 chr14 64945557 64945978 + 0.666667 NA TTS (NM_198686) TTS (NM_198686) -3022 NR_046320 2877 Hs.2704 NM_002083 ENSG00000176153 GPX2 GI-GPx|GPRP|GPRP-2|GPx-2|GPx-GI|GSHPX-GI|GSHPx-2 glutathione peroxidase 2 protein-coding 220.667-89 chr6 6572031 6572477 + 0.666667 NA intron (NR_026970, intron 1 of 7) L1MB4|LINE|L1 -16466 NM_004271 9450 Hs.653138 NM_004271 ENSG00000112799 LY86 MD-1|MD1|MMD-1|dJ80N2.1 lymphocyte antigen 86 protein-coding 141.667-155 chr4 8453169 8453493 + 0.666667 NA intron (NM_152544, intron 5 of 10) intron (NM_152544, intron 5 of 10) 12534 NM_001350233 152992 Hs.566191 NM_024950 ENSG00000155275 TRMT44 C4orf23|METTL19|TRM44 tRNA methyltransferase 44 homolog protein-coding 192-47 chr12 126416698 126417058 + 0.666667 NA intron (NR_147498, intron 2 of 3) AluSx1|SINE|Alu -9268 NR_146291 105370059 NR_146291 LINC02350 - long intergenic non-protein coding RNA 2350 ncRNA 130.333-12 chr1 112169513 112169875 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 179158 NR_145438 643355 Hs.279714 NR_145438 ENSG00000231437 LINC01750 - long intergenic non-protein coding RNA 1750 ncRNA 148.667-347 chr7 22949786 22950205 + 0.666667 NA intron (NM_001363467, intron 10 of 11) intron (NM_001363467, intron 10 of 11) 64135 NM_001363466 84668 Hs.85603 NM_032581 ENSG00000122591 FAM126A DRCTNNB1A|HCC|HLD5|HYCC1 family with sequence similarity 126 member A protein-coding 132.667-20 chr10 51758744 51758949 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) L1PA8|LINE|L1 -59251 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 154.333-309 chr7 5999915 6000298 + 0.666667 NA intron (NM_001322007, intron 4 of 13) AluJb|SINE|Alu 8943 NM_001322008 5395 Hs.632637 NM_000535 ENSG00000122512 PMS2 HNPCC4|MLH4|PMS2CL|PMSL2 PMS1 homolog 2, mismatch repair system component protein-coding 158.667-276 chr5 112232657 112233011 + 0.666667 NA intron (NR_110559, intron 1 of 3) MIRc|SINE|MIR 4551 NR_110559 101927023 Hs.571002 NR_110559 ENSG00000251076 LOC101927023 - uncharacterized LOC101927023 ncRNA 282.333-32 chr20 51990152 51990868 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 114974 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 141.667-73 chr14 55778251 55778564 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 12162 NR_004844 645683 Hs.663461 NR_004844 ENSG00000177350 RPL13AP3 RPL13A_11_1370 ribosomal protein L13a pseudogene 3 pseudo 139-64 chr3 117853142 117853414 + 0.666667 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -162353 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 196.333-110 chr3 89755724 89756196 + 0.666667 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 648339 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 160.667-277 chr7 38506441 38506769 + 0.666667 NA intron (NM_001635, intron 2 of 20) intron (NM_001635, intron 2 of 20) 124768 NM_001635 273 Hs.592182 NM_001635 ENSG00000078053 AMPH AMPH1 amphiphysin protein-coding 188.333-17 chr10 18684278 18684792 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25104 NM_178815 221079 Hs.25362 NM_178815 ENSG00000165997 ARL5B ARL8 ADP ribosylation factor like GTPase 5B protein-coding 199-107 chr7 82233413 82233841 + 0.666667 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 210150 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 112.333-128 chr2 83296014 83296246 + 0.666667 NA Intergenic L1MEb|LINE|L1 -226684 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 114.667-123 chr2 28348481 28348660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38111 NR_038319 100505716 Hs.679092 NR_038319 ENSG00000223522 LOC100505716 - uncharacterized LOC100505716 ncRNA 180.667-67 chr2 116375040 116375433 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 1031421 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 154.667-126 chr15 64945458 64945816 + 0.666667 NA intron (NM_182703, intron 12 of 14) AluSc8|SINE|Alu 33735 NM_182703 348094 Hs.207157 NM_182703 ENSG00000166839 ANKDD1A - ankyrin repeat and death domain containing 1A protein-coding 163-75 chr6 36434649 36435022 + 0.666667 NA intron (NM_152990, intron 2 of 4) MamRep1151|LTR?|LTR? -7932 NM_001286580 222658 Hs.188757 NM_173562 ENSG00000112078 KCTD20 C6orf69|dJ108K11.3 potassium channel tetramerization domain containing 20 protein-coding 129.667-32 chr11 65694618 65694860 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -17513 NM_182709 10524 Hs.397010 NM_006388 ENSG00000172977 KAT5 ESA1|HTATIP|HTATIP1|PLIP|TIP|TIP60|ZC2HC5|cPLA2 lysine acetyltransferase 5 protein-coding 135-80 chr4 143089851 143090133 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 94869 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 129-10 chr1 207376300 207376533 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54738 NM_001114752 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 129.333 chr1 30981218 30981444 + 0.666667 NA exon (NM_014676, exon 8 of 22) exon (NM_014676, exon 8 of 22) -13094 NR_003066 692200 NR_003066 SNORD103C HBII-251|SNORD85 small nucleolar RNA, C/D box 103C snoRNA 162-15 chr10 75336731 75337077 + 0.666667 NA intron (NR_038226, intron 2 of 3) MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 40521 NR_038225 253264 Hs.662111 NR_038223 ENSG00000226051 ZNF503-AS1 - ZNF503 antisense RNA 1 ncRNA 146-45 chr17 58414119 58414412 + 0.666667 NA intron (NM_001305544, intron 2 of 9) intron (NM_001305544, intron 2 of 9) 3269 NM_001305544 54894 Hs.584916 NM_017763 ENSG00000108375 RNF43 RNF124|SSPCS|URCC ring finger protein 43 protein-coding 119-54 chr15 63581712 63581911 + 0.666667 NA intron (NM_001256702, intron 10 of 13) AluJb|SINE|Alu -15576 NM_203373 283807 Hs.631163 NM_203373 ENSG00000197361 FBXL22 Fbl22 F-box and leucine rich repeat protein 22 protein-coding 150.667-255 chr4 30465420 30465692 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -254813 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 112.667-120 chr2 40769286 40769511 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -256963 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 137.667-174 chr7 30400630 30400912 + 0.666667 NA intron (NR_108081, intron 1 of 2) L1MD2|LINE|L1 9886 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 150.667-205 chr2 224061144 224061588 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22047 NM_001136528 5270 Hs.38449 NM_006216 ENSG00000135919 SERPINE2 GDN|GDNPF|PI-7|PI7|PN-1|PN1|PNI serpin family E member 2 protein-coding 207.333-31 chr10 62025947 62026542 + 0.666667 NA intron (NM_032199, intron 4 of 9) intron (NM_032199, intron 4 of 9) -23113 NM_001244638 84159 Hs.535297 NM_032199 ENSG00000150347 ARID5B DESRT|MRF-2|MRF2 AT-rich interaction domain 5B protein-coding 184.333-132 chr6 117440813 117441272 + 0.666667 NA Intergenic MER57D|LTR|ERV1 -15187 NM_002944 6098 Hs.1041 NM_002944 ENSG00000047936 ROS1 MCF3|ROS|c-ros-1 ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase protein-coding 148.333-265 chr3 171823704 171823991 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13364 NM_002662 5337 Hs.382865 NM_002662 ENSG00000075651 PLD1 CVDD phospholipase D1 protein-coding 158-18 chr11 5405308 5405754 + 0.666667 NA intron (NM_001005567, intron 1 of 4) intron (NM_001005567, intron 1 of 4) 3134 NM_001348224 79470 NM_001348224 OR51J1 HOR5'Beta8|OR51J1P|OR51J2 olfactory receptor family 51 subfamily J member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 201-80 chr3 185220095 185220530 + 0.666667 NA intron (NM_001966, intron 4 of 6) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 32960 NR_106712 100847054 NR_106712 ENSG00000264614 MIR5588 - microRNA 5588 ncRNA 216-68 chr20 48832707 48833195 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4952 NM_020820 57580 Hs.153310 NM_020820 ENSG00000124126 PREX1 P-REX1 phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 protein-coding 159-75 chr22 27875509 27875834 + 0.666667 NA intron (NM_001284278, intron 7 of 11) intron (NM_001284278, intron 7 of 11) 43543 NM_001284278 23760 Hs.705323 NM_012399 ENSG00000180957 PITPNB PI-TP-beta|PtdInsTP|VIB1B phosphatidylinositol transfer protein beta protein-coding 120.333-184 chr8 75039027 75039266 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 38991 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 125.667-135 chr4 101218407 101218653 + 0.666667 NA intron (NM_001130691, intron 1 of 12) intron (NM_001130691, intron 1 of 12) 22342 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 112-10 chr1 191478378 191478624 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -250003 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 139.667-13 chr1 169863946 169864218 + 0.666667 NA intron (NM_181093, intron 9 of 13) intron (NM_181093, intron 9 of 13) 29814 NM_020423 57147 Hs.435560 NM_020423 ENSG00000000457 SCYL3 PACE-1|PACE1 SCY1 like pseudokinase 3 protein-coding 160.667-133 chr18 50039008 50039427 + 0.666667 NA intron (NM_001080467, intron 3 of 39) intron (NM_001080467, intron 3 of 39) 87346 NR_036204 100422865 NR_036204 ENSG00000283343 MIR4320 - microRNA 4320 ncRNA 154-62 chr15 85494770 85495086 + 0.666667 NA intron (NM_007200, intron 2 of 36) intron (NM_007200, intron 2 of 36) 114325 NM_007200 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 171-52 chr3 29964269 29964663 + 0.666667 NA intron (NM_001003792, intron 11 of 13) intron (NM_001003792, intron 11 of 13) -30310 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 145.667-230 chr5 108063360 108063642 + 0.666667 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) intron (NM_001163315, intron 6 of 8) 318597 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 201.667-64 chr20 39620787 39621113 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -383511 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 191.667-54 chr16 64371368 64371760 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 750499 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 129.667-137 chr5 27478158 27478429 + 0.666667 NA intron (NR_038848, intron 3 of 4) L1MEf|LINE|L1 6001 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 159.333-148 chr2 39713931 39714242 + 0.666667 NA intron (NM_152390, intron 3 of 3) intron (NM_152390, intron 3 of 3) 48169 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 164.667-119 chr2 185491616 185491951 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 246936 NR_110216 101927196 Hs.244783 NR_110214 ENSG00000226747 FSIP2-AS2 - FSIP2 antisense RNA 2 ncRNA 147-130 chr7 8994825 8995126 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 561366 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 119.667-51 chr14 67637167 67637397 + 0.666667 NA intron (NM_001172, intron 2 of 7) AluSz|SINE|Alu 17362 NM_001172 384 Hs.226007 NM_001172 ENSG00000081181 ARG2 - arginase 2 protein-coding 147-86 chr21 28694310 28694590 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 155132 NR_026552 118421 Hs.438549 NR_026552 ENSG00000226935 LINC00161 C21orf100|Linc-USP16|NCRNA00161 long intergenic non-protein coding RNA 161 ncRNA 176-46 chr2 99852498 99852842 + 0.666667 NA intron (NM_001025108, intron 6 of 23) L2c|LINE|L2 252913 NM_001025108 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 140.667-91 chr16 53084297 53084581 + 0.666667 NA intron (NM_025134, intron 1 of 38) intron (NM_025134, intron 1 of 38) 29448 NM_025134 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 189.667-16 chr10 9169884 9170315 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -105514 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 132.667-76 chr19 41455894 41456268 + 0.666667 NA non-coding (NR_136334, exon 3 of 3) non-coding (NR_136334, exon 3 of 3) 12925 NM_001130514 100170765 Hs.649452 NM_001130514 ENSG00000204978 ERICH4 C19orf69 glutamate rich 4 protein-coding 133.667-140 chr7 69873259 69873537 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) intron (NM_015570, intron 1 of 18) 274923 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 172.333-88 chr2 166115212 166115593 + 0.666667 NA intron (NR_110260, intron 2 of 11) intron (NR_110260, intron 2 of 11) 12618 NM_006920 6323 Hs.22654 NM_006920 ENSG00000144285 SCN1A EIEE6|FEB3|FEB3A|FHM3|GEFSP2|HBSCI|NAC1|Nav1.1|SCN1|SMEI sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 protein-coding 155-15 chr10 68766477 68766885 + 0.666667 NA intron (NR_104262, intron 16 of 23) AluSp|SINE|Alu 11509 NR_003076 692211 NR_003076 ENSG00000283551 SNORD98 HBII-419 small nucleolar RNA, C/D box 98 snoRNA 169.333-80 chr14 61650160 61650588 + 0.666667 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) L1MC3|LINE|L1 -45139 NM_181054 3091 Hs.597216 NM_001530 ENSG00000100644 HIF1A HIF-1-alpha|HIF-1A|HIF-1alpha|HIF1|HIF1-ALPHA|MOP1|PASD8|bHLHe78 hypoxia inducible factor 1 subunit alpha protein-coding 178.333-99 chr3 34638888 34639222 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 754968 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 132.333-33 chr11 68192171 68192560 + 0.666667 NA intron (NR_161380, intron 1 of 10) intron (NR_161380, intron 1 of 10) 20931 NM_001369433 51111 Hs.632120 NM_016028 ENSG00000110066 KMT5B CGI-85|CGI85|MRD51|SUV420H1 lysine methyltransferase 5B protein-coding 126.333-9 chr1 168522975 168523199 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 20910 NM_003175 6846 Hs.458346 NM_003175 ENSG00000143185 XCL2 SCM-1b|SCM1B|SCYC2 X-C motif chemokine ligand 2 protein-coding 159-85 chr3 177817077 177817546 + 0.666667 NA intron (NR_110826, intron 1 of 2) MER5C|DNA|hAT-Charlie 446 NR_110826 102724550 Hs.570526 NR_110826 ENSG00000231574 LINC02015 KCCAT211 long intergenic non-protein coding RNA 2015 ncRNA 117-30 chr11 23373879 23374205 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 45148 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 165.667-43 chr13 108965977 108966417 + 0.666667 NA intron (NM_015011, intron 20 of 34) intron (NM_015011, intron 20 of 34) 201106 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 120-130 chr7 48496879 48497188 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 48 of 61) L1MDa|LINE|L1 325575 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 115-33 chr11 74854665 74854852 + 0.666667 NA intron (NM_001270381, intron 9 of 15) AluSg4|SINE|Alu 94333 NM_001270380 143570 Hs.370145 NM_182969 ENSG00000166435 XRRA1 - X-ray radiation resistance associated 1 protein-coding 159-65 chr2 156478919 156479369 + 0.666667 NA intron (NM_000408, intron 2 of 16) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 42765 NM_000408 2820 Hs.512382 NM_000408 ENSG00000115159 GPD2 GDH2|GPDM|mGPDH glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2 protein-coding 119.667-58 chr15 90735660 90735876 + 0.666667 NA intron (NM_001287246, intron 2 of 22) intron (NM_001287246, intron 2 of 22) 18422 NM_001287246 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 178-61 chr2 46235304 46235682 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61914 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 119.667-186 chr9 6878420 6878604 + 0.666667 NA intron (NR_148680, intron 5 of 21) intron (NR_148680, intron 5 of 21) 121162 NM_001353998 23081 Hs.709425 NM_015061 ENSG00000107077 KDM4C GASC1|JHDM3C|JMJD2C|TDRD14C lysine demethylase 4C protein-coding 168-17 chr11 109522992 109523449 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu 101030 NM_207645 399947 Hs.172982 NM_207645 ENSG00000185742 C11orf87 LOH11CR1A|NEURIM1 chromosome 11 open reading frame 87 protein-coding 203.333-143 chr2 151330156 151330582 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -27223 NM_007115 7130 Hs.437322 NM_007115 ENSG00000123610 TNFAIP6 TSG-6|TSG6 TNF alpha induced protein 6 protein-coding 176.667-9 chr1 89975072 89975446 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19707 NR_002830 492303 Hs.550796 NR_002830 GEMIN8P4 - gem nuclear organelle associated protein 8 pseudogene 4 pseudo 123-86 chr4 65581377 65581561 + 0.666667 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) MIR3|SINE|MIR 88019 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 138.333-18 chr10 9221689 9221929 + 0.666667 NA intron (NR_120635, intron 4 of 4) MIRb|SINE|MIR -53804 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 128-21 chr14 24174419 24174738 + 0.666667 NA intron (NM_001048205, intron 5 of 18) intron (NM_001048205, intron 5 of 18) 2498 NM_001048205 9985 Hs.419259 NM_005132 ENSG00000100918 REC8 HR21spB|REC8L1|Rec8p REC8 meiotic recombination protein protein-coding 122.333-218 chr9 78270839 78271140 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001330691, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_001330691, exon 17 of 17) -26136 NM_058179 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 129.333-177 chr7 77456606 77456959 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -40433 NR_146937 54103 Hs.186649 NM_017439 ENSG00000186088 GSAP PION gamma-secretase activating protein protein-coding 113.333-151 chr20 21942078 21942374 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111864 NR_038394 100270679 Hs.385748 NR_038394 ENSG00000234435 LINC01432 - long intergenic non-protein coding RNA 1432 ncRNA 174.667-147 chr5 130876185 130876638 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 288845 NM_005340 3094 Hs.483305 NM_005340 ENSG00000169567 HINT1 HINT|NMAN|PKCI-1|PRKCNH1 histidine triad nucleotide binding protein 1 protein-coding 119.333-81 chr14 45445678 45445911 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -192592 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 120.667-58 chr15 43863218 43863552 + 0.666667 NA intron (NM_024908, intron 12 of 12) L1MA8|LINE|L1 14786 NR_003571 728758 Hs.658099 NR_003571 PIN4P1 - peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 4 pseudogene 1 pseudo 116.333-90 chr17 60593502 60593704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6580 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 145-68 chr3 45504605 45504969 + 0.666667 NA intron (NM_001368263, intron 14 of 20) intron (NM_001368263, intron 14 of 20) 4758 NR_048543 100885795 Hs.641094 NR_048543 LARS2-AS1 - LARS2 antisense RNA 1 ncRNA 153.333-220 chr2 169468753 169469071 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10582 NM_152384 129880 Hs.233398 NM_152384 ENSG00000163093 BBS5 - Bardet-Biedl syndrome 5 protein-coding 164.333-216 chr6 139965835 139966271 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10266 NR_121622 100507477 Hs.179213 NR_121622 ENSG00000236013 LOC100507477 - uncharacterized LOC100507477 ncRNA 164-41 chr16 55030794 55031256 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 99826 NM_001252197 10265 Hs.435730 NM_005853 ENSG00000176842 IRX5 HMMS|IRX-2a|IRXB2 iroquois homeobox 5 protein-coding 158.333-142 chr2 50002497 50002857 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) -28474 NM_001320156 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 114.667-209 chr5 65755778 65755954 + 0.666667 NA intron (NM_020726, intron 1 of 12) L2c|LINE|L2 33661 NM_020726 57486 Hs.247460 NM_020726 ENSG00000123213 NLN AGTBP|EP24.16|MEP|MOP neurolysin protein-coding 196.333-93 chr2 179802825 179803278 + 0.666667 NA intron (NR_148056, intron 1 of 9) MIR|SINE|MIR -56541 NM_001352817 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 124.333-141 chr5 36937305 36937607 + 0.666667 NA intron (NM_015384, intron 1 of 45) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 60687 NM_015384 25836 Hs.481927 NM_015384 ENSG00000164190 NIPBL CDLS|CDLS1|IDN3|IDN3-B|Scc2 NIPBL cohesin loading factor protein-coding 112-191 chr7 114827501 114827799 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -94504 NM_199072 29969 Hs.741413 NM_199072 ENSG00000135272 MDFIC HIC|MDFIC1 MyoD family inhibitor domain containing protein-coding 152.667-100 chr14 35789474 35789928 + 0.666667 NA intron (NM_014990, intron 1 of 40) MER1B|DNA|hAT-Charlie 19594 NM_001346249 253959 Hs.113150 NM_014990 ENSG00000174373 RALGAPA1 GARNL1|GRIPE|RalGAPalpha1|TULIP1|p240 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1 protein-coding 248.667-65 chr2 186859068 186859601 + 0.666667 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR -10164 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 114.667-95 chr15 67269420 67269601 + 0.666667 NA intron (NM_001031715, intron 3 of 20) L1MA4|LINE|L1 -14312 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 153.667-284 chr4 40572848 40573113 + 0.666667 NA intron (NM_001371114, intron 1 of 5) AluSx1|SINE|Alu 56884 NM_001098634 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 142.667-94 chr2 55520274 55520619 + 0.666667 NA exon (NM_001282761, exon 2 of 11) exon (NM_001282761, exon 2 of 11) 851 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 157-4 chr1 62405438 62405741 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -30715 NM_001017415 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 145-119 chr8 81819524 81819781 + 0.666667 NA intron (NM_001348189, intron 6 of 9) intron (NM_001348189, intron 6 of 9) 22533 NR_145472 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 168.667-144 chr3 100765157 100765508 + 0.666667 NA intron (NM_001349332, intron 31 of 35) intron (NM_001349332, intron 31 of 35) 55790 NM_001195478 10342 Hs.518123 NM_006070 ENSG00000114354 TFG HMSNP|SPG57|TF6|TRKT3 trafficking from ER to golgi regulator protein-coding 132-35 chr13 74305411 74305657 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74090 NR_144451 100507612 Hs.447508 NR_144451 ENSG00000235532 LINC00402 - long intergenic non-protein coding RNA 402 ncRNA 186.333-2 chr1 20748304 20748792 + 0.666667 NA intron (NM_016287, intron 10 of 12) AluY|SINE|Alu -15845 NM_001103160 400745 Hs.591522 NM_001103160 ENSG00000189410 SH2D5 - SH2 domain containing 5 protein-coding 111.667-173 chr3 148002808 148003090 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75210 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 116.667-139 chr3 189398667 189398874 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -158176 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 119-103 chr3 98739586 98739857 + 0.666667 NA intron (NM_001323366, intron 1 of 11) intron (NM_001323366, intron 1 of 11) 6265 NM_001323365 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 149-38 chr13 73462762 73463061 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101333 NR_047009 100874155 Hs.672679 NR_047009 LINC00392 - long intergenic non-protein coding RNA 392 ncRNA 166.667-83 chr16 86498222 86498545 + 0.666667 NA intron (NR_036444, intron 1 of 3) CpG 10477 NR_036444 400550 Hs.448825 NR_033925 ENSG00000268388 FENDRR FOXF1-AS1|FOXF1AS1|TCONS_00024240|lincFOXF1|onco-lncRNA-21 FOXF1 adjacent non-coding developmental regulatory RNA ncRNA 213.666-32 chr4 70463310 70463924 + 0.666667 NA intron (NM_001145006, intron 1 of 3) intron (NM_001145006, intron 1 of 3) -8341 NM_001145007 4589 Hs.631946 NM_152291 ENSG00000171195 MUC7 MG2 mucin 7, secreted protein-coding 251.667-104 chrX 73294949 73295546 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -80396 NM_021963 4674 Hs.66180 NM_021963 ENSG00000186462 NAP1L2 BPX nucleosome assembly protein 1 like 2 protein-coding 121.333-195 chrX 58220331 58220662 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -309863 NM_007156 7789 Hs.550094 NM_007156 ENSG00000198205 ZXDA ZNF896 zinc finger X-linked duplicated A protein-coding 169-19 chr12 50422764 50423146 + 0.666667 NA intron (NM_001352316, intron 2 of 15) AluSx1|SINE|Alu 21548 NM_001352314 113251 Hs.26613 NM_052879 ENSG00000161813 LARP4 PP13296 La ribonucleoprotein domain family member 4 protein-coding 139.333-216 chr8 85373960 85374368 + 0.666667 NA intron (NM_001738, intron 1 of 8) Arthur1|DNA|hAT-Tip100 3949 NM_001291967 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 122.333-163 chr4 138269922 138270199 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27711 NM_014331 23657 Hs.390594 NM_014331 ENSG00000151012 SLC7A11 CCBR1|xCT solute carrier family 7 member 11 protein-coding 115.333-180 chr5 174742649 174742986 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8917 NR_039777 100616202 NR_039777 ENSG00000266890 MIR4634 - microRNA 4634 ncRNA 218-63 chr2 224491724 224492212 + 0.666667 NA intron (NM_001257197, intron 12 of 14) L1M5|LINE|L1 77987 NM_001257198 8452 Hs.372286 NM_003590 ENSG00000036257 CUL3 CUL-3|PHA2E cullin 3 protein-coding 131.333-75 chr2 4667763 4668111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11715 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 146.667-82 chr12 90319909 90320226 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26749 NR_135018 105369893 Hs.577777 NR_135018 LINC02392 - long intergenic non-protein coding RNA 2392 ncRNA 166.333-59 chr12 124158232 124158652 + 0.666667 NA intron (NM_001347902, intron 3 of 4) intron (NM_001347902, intron 3 of 4) -130722 NM_181709 144347 Hs.432901 NM_181709 ENSG00000178882 RFLNA CFM2|FAM101A refilin A protein-coding 149-44 chr14 70216534 70216936 + 0.666667 NA intron (NR_135825, intron 2 of 3) L1M5|LINE|L1 -27665 NM_033262 6547 Hs.337696 NM_033262 ENSG00000100678 SLC8A3 NCX3 solute carrier family 8 member A3 protein-coding 144-74 chr2 49858878 49859270 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 115129 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 158-46 chr14 71420305 71420717 + 0.666667 NA intron (NM_015556, intron 4 of 26) intron (NM_015556, intron 4 of 26) -18428 NM_001284247 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 208-113 chr4 6409479 6409959 + 0.666667 NA intron (NM_001206994, intron 2 of 9) MIR3|SINE|MIR 11399 NM_001206996 5522 Hs.479069 NM_020416 ENSG00000074211 PPP2R2C B55-GAMMA|B55gamma|IMYPNO|IMYPNO1|PR52|PR55G protein phosphatase 2 regulatory subunit Bgamma protein-coding 146.333-69 chr12 127803597 127803903 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie -77867 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 149.667-9 chr1 42585119 42585516 + 0.666667 NA intron (NM_001080850, intron 9 of 16) AluJo|SINE|Alu 52297 NM_001080850 728621 Hs.729640 NM_001080850 ENSG00000186409 CCDC30 PFD6L|PFDN6L coiled-coil domain containing 30 protein-coding 194.667-6 chr1 62343615 62343966 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24356 NM_181712 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 122.667-201 chr8 134470569 134470780 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127397 NR_002438 594840 Hs.626298 NR_002438 ENSG00000248492 ZFAT-AS1 NCRNA00070|SAS-ZFAT|ZFAT-AS|ZFATAS ZFAT antisense RNA 1 ncRNA 129.333-111 chr22 25573881 25574186 + 0.666667 NA intron (NM_001362778, intron 1 of 19) intron (NM_001362778, intron 1 of 19) 9358 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 309.667-8 chr15 44482895 44483531 + 0.666667 NA intron (NM_016396, intron 2 of 12) AluSg|SINE|Alu 53687 NR_034171 645212 Hs.594287 NR_034170 EIF3J-DT EIF3J-AS1 EIF3J divergent transcript ncRNA 126.333-63 chr16 72165049 72165262 + 0.666667 NA intron (NM_031293, intron 2 of 20) intron (NM_031293, intron 2 of 20) 7000 NM_031293 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 164-107 chr7 36707195 36707588 + 0.666667 NA intron (NM_001637, intron 1 of 20) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 17103 NM_001637 313 Hs.488007 NM_001637 ENSG00000136250 AOAH - acyloxyacyl hydrolase protein-coding 119-60 chr16 57922216 57922544 + 0.666667 NA intron (NM_001297, intron 18 of 32) intron (NM_001297, intron 18 of 32) 48748 NM_001297 1258 Hs.147062 NM_001297 ENSG00000070729 CNGB1 CNCG2|CNCG3L|CNCG4|CNG4|CNGB1B|GAR1|GARP|GARP2|RCNC2|RCNCb|RCNCbeta|RP45 cyclic nucleotide gated channel beta 1 protein-coding 154-148 chr8 126816822 126817162 + 0.666667 NA Intergenic LTR16E1|LTR|ERVL -196162 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 141.333-122 chr2 189278162 189278485 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98562 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 185.333-196 chr9 4080727 4081233 + 0.666667 NA intron (NM_001042413, intron 4 of 10) intron (NM_001042413, intron 4 of 10) 71203 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 154.667-61 chr11 34493622 34493937 + 0.666667 NA intron (NM_001422, intron 2 of 6) intron (NM_001422, intron 2 of 6) 17945 NM_198381 2001 Hs.11713 NM_001422 ENSG00000135374 ELF5 ESE2 E74 like ETS transcription factor 5 protein-coding 120.667-79 chr18 4859522 4859833 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -221505 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 149.667-282 chr4 46291831 46292172 + 0.666667 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) HERVL-int|LTR|ERVL 97378 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 123-14 chr10 16934811 16935082 + 0.666667 NA intron (NM_001081, intron 39 of 66) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -117492 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 152.667-390 chr8 133307677 133307976 + 0.666667 NA Intergenic MER65-int|LTR|ERV1 -10522 NM_006096 10397 Hs.372914 NM_006096 ENSG00000104419 NDRG1 CAP43|CMT4D|DRG-1|DRG1|GC4|HMSNL|NDR1|NMSL|PROXY1|RIT42|RTP|TARG1|TDD5 N-myc downstream regulated 1 protein-coding 139-57 chr2 223570423 223570700 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 31800 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 143-36 chr13 20554785 20555146 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12192 NM_001353578 8100 Hs.187376 NM_006531 ENSG00000032742 IFT88 D13S1056E|DAF19|TG737|TTC10|hTg737 intraflagellar transport 88 protein-coding 172.333-120 chr4 33305290 33305641 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 734428 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 155-101 chr4 91111949 91112247 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) intron (NM_001145065, intron 10 of 10) 877067 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 134.333-11 chr1 215307501 215307749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 224888 NM_001017425 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 175.333-194 chr8 132484392 132484859 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -3530 NM_004519 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 117.333-176 chr5 138112076 138112293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27244 NM_003551 8382 Hs.730856 NM_003551 ENSG00000112981 NME5 NM23-H5|NM23H5|RSPH23 NME/NM23 family member 5 protein-coding 172.667-51 chr14 42095179 42095518 + 0.666667 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 488492 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 125-114 chr8 108286982 108287321 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38434 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 148.333-320 chr5 93676553 93676929 + 0.666667 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) intron (NM_032042, intron 10 of 10) -55953 NR_031754 100313887 NR_031754 ENSG00000284336 MIR2277 mir-2277 microRNA 2277 ncRNA 170.667-19 chr10 78398823 78399168 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 131653 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 123.333-139 chr22 19305781 19306123 + 0.666667 NA Intergenic PRIMAX-int|LTR|ERV1 -14233 NM_007098 8218 Hs.368266 NM_001835 ENSG00000070371 CLTCL1 CHC22|CLH22|CLTCL|CLTD clathrin heavy chain like 1 protein-coding 127.667-165 chr7 84420593 84420879 + 0.666667 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -111740 NR_110079 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 163.667-245 chr8 42224477 42224953 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -17150 NM_001319189 5327 Hs.491582 NM_000930 ENSG00000104368 PLAT T-PA|TPA plasminogen activator, tissue type protein-coding 130-133 chr9 35167827 35168089 + 0.666667 NA intron (NM_006377, intron 1 of 38) AluJr|SINE|Alu 5949 NM_001330653 10497 Hs.493791 NM_006377 ENSG00000198722 UNC13B MUNC13|UNC13|Unc13h2 unc-13 homolog B protein-coding 188.667-124 chr5 53613082 53613514 + 0.666667 NA intron (NR_134474, intron 3 of 5) intron (NR_134474, intron 3 of 5) 52659 NR_134475 4724 Hs.528222 NM_002495 ENSG00000164258 NDUFS4 AQDQ|CI-18|CI-18 kDa|CI-AQDQ|MC1DN1 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S4 protein-coding 117.333-86 chr18 12567479 12567666 + 0.666667 NA intron (NM_020148, intron 2 of 15) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 89160 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 207-10 chr10 22438983 22439463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1294 NR_036533 100499489 Hs.7444 NR_036533 LOC100499489 - uncharacterized LOC100499489 ncRNA 114.667-214 chr5 107585427 107585693 + 0.666667 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 85377 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 171.667-141 chr5 176907412 176907776 + 0.666667 NA intron (NM_016290, intron 12 of 14) intron (NM_016290, intron 12 of 14) -8248 NM_002115 3101 Hs.411695 NM_002115 ENSG00000160883 HK3 HKIII|HXK3 hexokinase 3 protein-coding 111.667-239 chr7 49475923 49476131 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -297611 NM_198570 375567 Hs.629302 NM_198570 ENSG00000188730 VWC2 PSST739|UNQ739 von Willebrand factor C domain containing 2 protein-coding 188.667-103 chr3 110934246 110934660 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 135506 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 115.667-13 chr1 222016261 222016563 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37892 NR_149057 105372950 Hs.185118 NR_149057 ENSG00000238042 LINC02257 - long intergenic non-protein coding RNA 2257 ncRNA 232-58 chr22 29563616 29564005 + 0.666667 NA intron (NM_001202502, intron 4 of 9) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -10053 NM_001002877 8563 Hs.75361 NM_003678 ENSG00000100296 THOC5 C22orf19|Fmip|PK1.3|fSAP79 THO complex 5 protein-coding 135.667-59 chr15 61063218 61063587 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 165900 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 137.667-178 chr7 82697622 82697884 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -253797 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 134.333-22 chr10 81151960 81152238 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 502302 NR_155749 105378386 Hs.531456 NR_155749 LINC02655 - long intergenic non-protein coding RNA 2655 ncRNA 141.667-74 chr14 63233745 63234016 + 0.666667 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) L2b|LINE|L2 29437 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 125.333-170 chr7 95771346 95771631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1018 NM_001278422 1780 Hs.440364 NM_004411 ENSG00000158560 DYNC1I1 DNCI1|DNCIC1 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 protein-coding 133.667-129 chr6 75156897 75157127 + 0.666667 NA intron (NM_004370, intron 14 of 65) intron (NM_004370, intron 14 of 65) -28230 NR_145788 109623475 NR_145788 SNORD156 - small nucleolar RNA, C/D box 156 snoRNA 131-26 chr14 51066350 51066586 + 0.666667 NA intron (NM_015163, intron 1 of 9) L2a|LINE|L2 29236 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 320.667-9 chr11 115728982 115729671 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5436 NR_135066 101928985 Hs.398155 NR_135066 LOC101928985 - uncharacterized LOC101928985 ncRNA 151.667-61 chr11 36001020 36001462 + 0.666667 NA intron (NM_001304264, intron 1 of 5) L1PA4|LINE|L1 -8857 NR_039769 100616311 NR_039769 ENSG00000263389 MIR3973 - microRNA 3973 ncRNA 112.667-25 chr10 20635812 20636054 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83963 NR_039822 100616383 NR_039822 ENSG00000265372 MIR4675 - microRNA 4675 ncRNA 114.667-44 chr11 23702463 23702716 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -283399 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 157.667-126 chr18 13094924 13095262 + 0.666667 NA intron (NM_032142, intron 34 of 44) AluJr|SINE|Alu 103731 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 174-97 chr8 79689783 79690155 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76506 NM_001282851 23462 Hs.234434 NM_012258 ENSG00000164683 HEY1 BHLHb31|CHF2|HERP2|HESR1|HRT-1|NERP2|OAF1|hHRT1 hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1 protein-coding 131.667-74 chr17 44860052 44860310 + 0.666667 NA intron (NM_001142605, intron 16 of 26) intron (NM_001142605, intron 16 of 26) 12298 NR_073504 51751 Hs.151787 NM_016438 ENSG00000131097 HIGD1B CLST11240|CLST11240-15 HIG1 hypoxia inducible domain family member 1B protein-coding 208-179 chr9 19213427 19213997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16981 NM_017925 55667 Hs.249591 NM_017925 ENSG00000137145 DENND4C C9orf55|C9orf55B|RAB10GEF|bA513M16.3 DENN domain containing 4C protein-coding 199-111 chr8 33474083 33474476 + 0.666667 NA Intergenic MER96|DNA|hAT-Tip100 -1133 NM_032664 84750 Hs.458713 NM_032664 ENSG00000172728 FUT10 FUCTX fucosyltransferase 10 protein-coding 112.333-133 chr2 124739319 124739508 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) intron (NM_130773, intron 13 of 23) 714126 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 165.333-52 chr11 107523183 107523551 + 0.666667 NA intron (NM_138775, intron 9 of 11) L1MA8|LINE|L1 42368 NM_001301010 91801 Hs.503763 NM_138775 ENSG00000137760 ALKBH8 ABH8|TRM9|TRMT9|TRMT9A alkB homolog 8, tRNA methyltransferase protein-coding 199-33 chr16 80117466 80117905 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 322436 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 134.333-64 chr15 83531988 83532229 + 0.666667 NA intron (NM_001324186, intron 2 of 9) L2c|LINE|L2 41494 NM_001324187 6457 Hs.270055 NM_003027 ENSG00000140600 SH3GL3 CNSA3|EEN-B2|HsT19371|SH3D2C|SH3P13 SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3 protein-coding 111.667-47 chr11 22932580 22932788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72210 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 124.333-99 chr2 182399578 182399845 + 0.666667 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) L1ME4b|LINE|L1 27337 NM_001258313 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 117.667-40 chr12 76776641 76776852 + 0.666667 NA intron (NM_015336, intron 1 of 16) MER3|DNA|hAT-Charlie 12488 NM_001359626 23390 Hs.4014 NM_015336 ENSG00000186908 ZDHHC17 DHHC-17|HIP14|HIP3|HSPC294|HYPH zinc finger DHHC-type containing 17 protein-coding 145.667-255 chr6 102711029 102711412 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1312235 NM_001166247 2898 Hs.98262 NM_021956 ENSG00000164418 GRIK2 EAA4|GLR6|GLUK6|GLUR6|GluK2|MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 protein-coding 178-96 chr5 115928039 115928429 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28337 NR_157226 107986443 NR_157226 LINCADL LINC-ADAL lincRNA adipogenesis and lipogenesis associated ncRNA 111.667-49 chr11 68374758 68374975 + 0.666667 NA intron (NM_002335, intron 5 of 22) intron (NM_002335, intron 5 of 22) 62275 NM_001291902 4041 Hs.6347 NM_002335 ENSG00000162337 LRP5 BMND1|EVR1|EVR4|HBM|LR3|LRP-5|LRP-7|LRP7|OPPG|OPS|OPTA1|PCLD4|VBCH2 LDL receptor related protein 5 protein-coding 203-97 chr6 130277299 130277766 + 0.666667 NA intron (NM_001258275, intron 2 of 13) L2b|LINE|L2 -54581 NM_001017373 154075 Hs.440508 NM_152552 ENSG00000164483 SAMD3 - sterile alpha motif domain containing 3 protein-coding 112.667-13 chr1 160413980 160414189 + 0.666667 NA intron (NM_020335, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 13520 NM_020335 57216 Hs.99477 NM_020335 ENSG00000162738 VANGL2 LPP1|LTAP|STB1|STBM|STBM1 VANGL planar cell polarity protein 2 protein-coding 254.667-60 chr4 56097311 56097967 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -72556 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 137.333-111 chr20 40088514 40088865 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 84228 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 111.667-275 chrX 22570009 22570293 + 0.666667 NA intron (NR_073010, intron 4 of 11) L1MCa|LINE|L1 297238 NM_152577 158506 Hs.132485 NM_152577 ENSG00000175809 CBLL2 CT138|HAKAIL|ZNF645 Cbl proto-oncogene like 2 protein-coding 111.667-214 chr5 178168288 178168470 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -14419 NM_001034833 55651 Hs.744074 NM_017838 ENSG00000145912 NHP2 DKCB2|NHP2P|NOLA2 NHP2 ribonucleoprotein protein-coding 170.333-3 chr1 41076591 41076882 + 0.666667 NA intron (NM_001172222, intron 4 of 10) L2a|LINE|L2 -54981 NM_001168247 200172 Hs.194609 NM_144990 ENSG00000171790 SLFNL1 - schlafen like 1 protein-coding 158.333-226 chr4 36096385 36096756 + 0.666667 NA intron (NR_146894, intron 27 of 32) intron (NR_146894, intron 27 of 32) 147369 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 177.333-20 chr10 99495838 99496196 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35160 NR_120618 101927324 Hs.642588 NR_120618 ENSG00000257582 LINC01475 - long intergenic non-protein coding RNA 1475 ncRNA 148.667-344 chr7 7829818 7830219 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) L2|LINE|L2 -111411 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 150.333-370 chr6 134445777 134446053 + 0.666667 NA intron (NR_038218, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 7525 NR_038219 154092 Hs.223718 NR_038216 LINC01010 - long intergenic non-protein coding RNA 1010 ncRNA 159.333-247 chr4 178523873 178524252 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -616126 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 203.333-50 chr12 20476216 20476778 + 0.666667 NA intron (NM_000921, intron 1 of 15) intron (NM_000921, intron 1 of 15) -95367 NM_001244683 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 140.333-33 chr10 99583325 99583600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36977 NM_031212 81894 Hs.403790 NM_031212 ENSG00000155287 SLC25A28 MFRN2|MRS3/4|MRS4L|NPD016 solute carrier family 25 member 28 protein-coding 158.667-14 chr1 96311978 96312397 + 0.666667 NA intron (NR_110693, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 61938 NR_110693 101928241 Hs.514137 NR_110693 ENSG00000231987 LINC01787 - long intergenic non-protein coding RNA 1787 ncRNA 203.667-88 chr4 65086647 65087016 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -82331 NR_033976 401134 Hs.165899 NR_033976 ENSG00000250125 LINC02232 - long intergenic non-protein coding RNA 2232 ncRNA 150.667-204 chr2 222385444 222385805 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -38364 NM_001320834 130367 Hs.210043 NM_152386 ENSG00000163082 SGPP2 SPP2|SPPase2 sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 protein-coding 121-3 chr1 52552469 52552724 + 0.666667 NA intron (NM_001009881, intron 1 of 29) CpG 494 NM_015269 23318 Hs.655407 NM_015269 ENSG00000134744 TUT4 PAPD3|TENT3A|ZCCHC11 terminal uridylyl transferase 4 protein-coding 148.333-257 chr3 112850269 112850562 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -4465 NM_001199215 344807 Hs.531814 NM_001008784 ENSG00000206531 CD200R1L CD200R2|CD200RLa CD200 receptor 1 like protein-coding 141.333-114 chr2 114862175 114862444 + 0.666667 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -28761 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 111.667-30 chr10 54679259 54679579 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) -71462 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 112.333-163 chr3 79865801 79866002 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -97903 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 137-83 chr5 88900196 88900603 + 0.666667 NA intron (NR_136221, intron 1 of 6) intron (NR_136221, intron 1 of 6) 3706 NM_001193347 4208 Hs.649965 NM_002397 ENSG00000081189 MEF2C C5DELq14.3|DEL5q14.3 myocyte enhancer factor 2C protein-coding 186.667-50 chr16 79583724 79584224 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16763 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 202.333-169 chr8 63959361 63959855 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 190178 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 137-42 chr2 20604810 20605086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12400 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 123.333-202 chr7 88102181 88102408 + 0.666667 NA intron (NM_001324421, intron 4 of 28) MER5A|DNA|hAT-Charlie -114366 NR_120517 102723885 Hs.489040 NR_120517 LOC102723885 - uncharacterized LOC102723885 ncRNA 131.333-98 chr20 14239301 14239660 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1PA15|LINE|L1 98132 NM_198391 23767 Hs.41296 NM_013281 ENSG00000125848 FLRT3 HH21 fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 protein-coding 164.333-236 chr8 73640126 73640463 + 0.666667 NA intron (NM_001164383, intron 1 of 9) intron (NM_001164383, intron 1 of 9) 106546 NM_001164380 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 190.333-77 chr2 156345937 156346454 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4075 NR_147695 440918 Hs.641142 NR_147695 FLJ46875 - uncharacterized LOC440918 ncRNA 163-10 chr10 93882656 93883119 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -11091 NR_144337 159371 Hs.632085 NM_153226 ENSG00000176273 SLC35G1 C10orf60|POST|TMEM20 solute carrier family 35 member G1 protein-coding 113.333 chr1 44070646 44070911 + 0.666667 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 -39316 NM_001024845 6536 Hs.442590 NM_006934 ENSG00000196517 SLC6A9 GCENSG|GLYT1 solute carrier family 6 member 9 protein-coding 114-90 chr3 103184107 103184352 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 339887 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 128.333-182 chr7 86031562 86031873 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 610595 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 124.667-154 chr4 120390898 120391191 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -324196 NM_002358 4085 Hs.591697 NM_002358 ENSG00000164109 MAD2L1 HSMAD2|MAD2 mitotic arrest deficient 2 like 1 protein-coding 122.667-85 chr2 40430527 40430805 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001112800) promoter-TSS (NM_001112800) -362 NM_001252624 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 129-107 chr5 173486846 173487204 + 0.666667 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -92609 NR_027108 285593 Hs.409730 NR_027108 ENSG00000253955 LOC285593 - uncharacterized LOC285593 ncRNA 228-55 chr3 60024699 60025174 + 0.666667 NA intron (NM_001320901, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 55973 NR_135491 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 226.667-17 chr10 20824269 20824801 + 0.666667 NA intron (NM_006393, intron 18 of 27) intron (NM_006393, intron 18 of 27) 73067 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 169.667-34 chr11 75838452 75838793 + 0.666667 NA intron (NM_003369, intron 1 of 14) AluJr|SINE|Alu 23412 NM_003369 7405 Hs.202470 NM_003369 ENSG00000198382 UVRAG DHTX|VPS38|p63 UV radiation resistance associated protein-coding 143.333-144 chr2 140487331 140487664 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 58 of 90) intron (NM_018557, intron 58 of 90) 99188 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 183.667-58 chr15 98967873 98968356 + 0.666667 NA TTS (NM_001102612) TTS (NM_001102612) 37542 NM_001102612 145814 Hs.592021 NM_001102612 ENSG00000183571 PGPEP1L - pyroglutamyl-peptidase I like protein-coding 137.667-78 chr17 82364279 82364561 + 0.666667 NA TTS (NM_207459) TTS (NM_207459) 5173 NM_207459 400629 Hs.231897 NM_207459 ENSG00000182459 TEX19 - testis expressed 19 protein-coding 155.333-218 chr22 35287766 35288080 + 0.666667 NA intron (NM_001003681, intron 8 of 10) AluSp|SINE|Alu -11352 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 143-78 chr20 46767307 46767679 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57844 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 196.667-117 chr5 7012426 7012970 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -184777 NR_036242 100422999 NR_036242 ENSG00000283420 MIR4278 - microRNA 4278 ncRNA 156.333-118 chr14 86626446 86626827 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -279142 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 136.667-162 chr7 3265987 3266241 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35138 NM_152744 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 168-64 chr3 53889109 53889468 + 0.666667 NA intron (NM_021237, intron 1 of 4) L1MB3|LINE|L1 2571 NM_021237 58515 Hs.58471 NM_021237 ENSG00000113811 SELENOK HSPC030|HSPC297|SELK selenoprotein K protein-coding 112-124 chr20 40684539 40684741 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4596 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 164-27 chr12 32279160 32279531 + 0.666667 NA intron (NR_148725, intron 2 of 9) L1MB8|LINE|L1 -120213 NM_001370298 121512 Hs.117835 NM_139241 ENSG00000139132 FGD4 CMT4H|FRABP|ZFYVE6 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 protein-coding 162.333-59 chr12 124533914 124534239 + 0.666667 NA intron (NM_001077261, intron 2 of 47) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 33536 NM_006312 9612 Hs.137510 NM_006312 ENSG00000196498 NCOR2 CTG26|N-CoR2|SMAP270|SMRT|SMRTE|SMRTE-tau|TNRC14|TRAC|TRAC-1|TRAC1 nuclear receptor corepressor 2 protein-coding 221.333-111 chr5 25477209 25477679 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 286491 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 112.667-45 chr12 9020120 9020446 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 30658 NR_137428 10219 Hs.558446 NM_005810 ENSG00000139187 KLRG1 2F1|CLEC15A|MAFA|MAFA-2F1|MAFA-L|MAFA-LIKE killer cell lectin like receptor G1 protein-coding 113-72 chr15 72000856 72001099 + 0.666667 NA intron (NM_006901, intron 8 of 41) L1ME3Cz|LINE|L1 -113281 NM_001166340 123228 Hs.513002 NM_145204 ENSG00000166192 SENP8 DEN1|NEDP1|PRSC2 SUMO peptidase family member, NEDD8 specific protein-coding 161.333-175 chr21 35237805 35238136 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -188672 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 189-16 chr11 39621008 39621427 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 671913 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 121.667-95 chr2 154444901 154445166 + 0.666667 NA intron (NM_052917, intron 12 of 12) intron (NM_052917, intron 12 of 12) 12405 NR_161181 100144595 Hs.683952 NR_161181 LOC100144595 - uncharacterized LOC100144595 ncRNA 148-18 chr10 62598918 62599212 + 0.666667 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) L1ME1|LINE|L1 78617 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 160.333-305 chrX 41432224 41432544 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1b|DNA|hAT-Charlie -15076 NM_022567 60506 Hs.302019 NM_022567 ENSG00000188937 NYX CLRP|CSNB1|CSNB1A|CSNB4|NBM1 nyctalopin protein-coding 201.667-28 chr12 123592663 123593136 + 0.666667 NA intron (NM_006815, intron 3 of 3) AluSx|SINE|Alu 8347 NM_006815 10959 Hs.733403 NM_006815 ENSG00000086598 TMED2 P24A|RNP24|p24|p24b1|p24beta1 transmembrane p24 trafficking protein 2 protein-coding 139.667-206 chr9 38105437 38105814 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -36398 NM_003028 6461 Hs.521482 NM_003028 ENSG00000107338 SHB bA3J10.2 SH2 domain containing adaptor protein B protein-coding 197.333-72 chr14 75155775 75156216 + 0.666667 NA intron (NM_006827, intron 1 of 4) MIRb|SINE|MIR 20617 NM_006827 10972 Hs.74137 NM_006827 ENSG00000170348 TMED10 P24(DELTA)|S31I125|S31III125|TMP21|Tmp-21-I|p23|p24d1 transmembrane p24 trafficking protein 10 protein-coding 160.667-303 chr8 81780473 81780790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48183 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 161.667-248 chr8 81265588 81266036 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -14724 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 144.333-22 chr10 34548198 34548510 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 2 of 22) AluSz6|SINE|Alu 266942 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 155.667-188 chr2 207048110 207048427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61805 NR_036227 100423036 NR_036227 ENSG00000253008 MIR2355 mir-2355 microRNA 2355 ncRNA 114.333-3 chr1 67436179 67436502 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -5938 NM_015640 26135 Hs.530412 NM_015640 ENSG00000142864 SERBP1 CGI-55|CHD3IP|HABP4L|PAI-RBP1|PAIRBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 protein-coding 154-24 chr11 40998523 40998981 + 0.666667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) intron (NM_001258419, intron 1 of 6) 460884 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 134-100 chr7 55651014 55651348 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 36851 NR_027340 360132 Hs.446691 NM_182827 ENSG00000176826 FKBP9P1 FKBP9L FKBP prolyl isomerase 9 pseudogene 1 pseudo 194.667-100 chr3 121679302 121679736 + 0.666667 NA intron (NM_001256486, intron 15 of 21) L1MDa|LINE|L1 -18616 NM_001292041 3059 Hs.14601 NM_005335 ENSG00000180353 HCLS1 CTTNL|HS1|lckBP1|p75 hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 protein-coding 162-65 chr2 102908178 102908509 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12621 NR_135562 105373518 Hs.738351 NR_135562 ENSG00000277527 LINC01796 - long intergenic non-protein coding RNA 1796 ncRNA 274-19 chr16 51724300 51724927 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -37906 NR_110916 101927364 Hs.133120 NR_110916 ENSG00000260057 LINC01571 - long intergenic non-protein coding RNA 1571 ncRNA 156.667-163 chr19 31601452 31601781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9335 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 161-26 chr15 60118200 60118493 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 114035 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 114.667-221 chr6 47200133 47200463 + 0.666667 NA Intergenic L1PA17|LINE|L1 109607 NM_014452 27242 Hs.443577 NM_014452 ENSG00000146072 TNFRSF21 BM-018|CD358|DR6 TNF receptor superfamily member 21 protein-coding 147.667-264 chr4 150291833 150292129 + 0.666667 NA intron (NM_001199282, intron 53 of 56) L1PA2|LINE|L1 213536 NM_001040261 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 128.333-18 chr1 240706788 240707034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -94756 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 164-86 chr4 61948024 61948292 + 0.666667 NA exon (NM_001322402, exon 17 of 26) exon (NM_001322402, exon 17 of 26) 213607 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 209.333-50 chr12 94290264 94290734 + 0.666667 NA intron (NM_005761, intron 23 of 30) intron (NM_005761, intron 23 of 30) 27978 NR_037687 10154 Hs.584845 NM_005761 ENSG00000136040 PLXNC1 CD232|PLXN-C1|VESPR plexin C1 protein-coding 116.667-96 chr2 69941659 69941858 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002357, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_002357, exon 6 of 6) 20507 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 129.333-102 chr2 214884161 214884525 + 0.666667 NA intron (NR_110292, intron 2 of 3) intron (NR_110292, intron 2 of 3) 37396 NR_145773 109617008 NR_145773 ENSG00000207274 SNORA70I - small nucleolar RNA, H/ACA box 70I snoRNA 159-68 chr2 189910720 189911037 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 126428 NM_001321048 5378 Hs.111749 NM_000534 ENSG00000064933 PMS1 HNPCC3|MLH2|PMSL1|hPMS1 PMS1 homolog 1, mismatch repair system component protein-coding 214-57 chr18 40723180 40723738 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 657173 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 129.333-2 chr1 46682950 46683178 + 0.666667 NA intron (NR_038827, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 9028 NR_038828 100130197 Hs.568643 NR_038827 ENSG00000228237 EFCAB14-AS1 KIAA0494-AS1 EFCAB14 antisense RNA 1 ncRNA 165.667-66 chr16 13963835 13964212 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 43866 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 139.333-194 chr6 122389016 122389407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10340 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 191.333-161 chr5 108009359 108009783 + 0.666667 NA intron (NM_001163315, intron 7 of 8) intron (NM_001163315, intron 7 of 8) -338634 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 143.667-80 chr14 76103618 76103968 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -48092 NM_001322031 55668 Hs.410231 NM_017926 ENSG00000089916 GPATCH2L C14orf118 G-patch domain containing 2 like protein-coding 132-8 chr1 119226195 119226441 + 0.666667 NA intron (NR_125975, intron 4 of 6) MIR3|SINE|MIR -85646 NM_015836 10352 Hs.523506 NM_015836 ENSG00000116874 WARS2 NEMMLAS|TrpRS|mtTrpRS tryptophanyl tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 144.667-72 chr13 79948363 79948780 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62506 NR_104138 101515984 Hs.569290 NR_104138 LINC01080 TCONS_00021856 long intergenic non-protein coding RNA 1080 ncRNA 148.667-259 chr3 123233760 123234067 + 0.666667 NA intron (NM_012430, intron 4 of 6) L1MB7|LINE|L1 31970 NM_012430 26984 Hs.477361 NM_012430 ENSG00000121542 SEC22A SEC22L2 SEC22 homolog A, vesicle trafficking protein protein-coding 118.667-67 chr14 71476864 71477096 + 0.666667 NA intron (NM_001284247, intron 1 of 23) AluSz|SINE|Alu -10881 NR_027046 145474 Hs.658241 NR_027046 LOC145474 - uncharacterized LOC145474 ncRNA 157.667-249 chr5 72750375 72750708 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -66050 NM_002270 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 115.667-199 chr7 37086628 37086946 + 0.666667 NA intron (NM_001206480, intron 15 of 21) intron (NM_001206480, intron 15 of 21) 88991 NR_104120 100861514 Hs.627775 NR_104120 ENSG00000224101 ELMO1-AS1 - ELMO1 antisense RNA 1 ncRNA 200.667-93 chr20 1531529 1532029 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 25926 NM_178460 128646 Hs.729560 NM_178460 ENSG00000125900 SIRPD PTPNS1L2|dJ576H24.4 signal regulatory protein delta protein-coding 142.333-239 chr8 101062055 101062420 + 0.666667 NA intron (NR_033962, intron 2 of 2) intron (NR_033962, intron 2 of 2) 10183 NR_033962 441374 Hs.652045 NR_033962 ENSG00000248599 FLJ42969 - uncharacterized LOC441374 ncRNA 220-122 chr8 110671220 110671647 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 356000 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 213.333-129 chr3 69438725 69439143 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -52846 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 121.333-91 chr2 148044305 148044633 + 0.666667 NA intron (NM_018328, intron 2 of 14) intron (NM_018328, intron 2 of 14) -22865 NM_181742 5000 Hs.558364 NM_002552 ENSG00000115947 ORC4 ORC4L|ORC4P origin recognition complex subunit 4 protein-coding 126.667-14 chr10 47049334 47049547 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 137718 NM_001352524 26095 Hs.440733 NM_015605 ENSG00000204179 PTPN20 CT126|PTPN20A|PTPN20B|bA142I17.1|bA42B19.1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 protein-coding 151.333-448 chr9 107664954 107665334 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -175375 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 158.667-236 chr4 48728877 48729201 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 1 of 63) L1PA7|LINE|L1 51260 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 196-157 chr6 54547313 54547698 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 239064 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 225.333-38 chr12 128206117 128206706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60992 NM_001136103 92293 Hs.49599 NM_001136103 ENSG00000181234 TMEM132C PPP1R152 transmembrane protein 132C protein-coding 120-113 chr5 115340136 115340402 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -43615 NM_001040440 153733 Hs.436121 NM_152549 ENSG00000164221 CCDC112 MBC1 coiled-coil domain containing 112 protein-coding 126-129 chrX 153238375 153238706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 59256 NM_004988 4100 Hs.72879 NM_004988 ENSG00000198681 MAGEA1 CT1.1|MAGE1 MAGE family member A1 protein-coding 168-97 chr6 146003379 146003780 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -24128 NM_001278065 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 182-79 chr4 62991894 62992216 + 0.666667 NA Intergenic Charlie5|DNA|hAT-Charlie -830290 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-50 chr11 43888876 43889175 + 0.666667 NA intron (NM_139178, intron 5 of 9) AluSq2|SINE|Alu 8194 NM_139178 221120 Hs.720708 NM_139178 ENSG00000166199 ALKBH3 ABH3|DEPC-1|DEPC1|PCA1|hABH3 alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase protein-coding 175.333-181 chr8 25496319 25496773 + 0.666667 NA intron (NM_001317906, intron 12 of 13) L1MA9|LINE|L1 37313 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 150.333-206 chr2 121868678 121869097 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113236 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 142-93 chr3 123456975 123457299 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8592 NM_183357 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 130-92 chr5 40206930 40207204 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 154776 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 166-93 chr4 161896078 161896529 + 0.666667 NA intron (NM_001128428, intron 4 of 14) intron (NM_001128428, intron 4 of 14) -126430 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 141.667-240 chr9 14201679 14201891 + 0.666667 NA intron (NR_161383, intron 1 of 7) intron (NR_161383, intron 1 of 7) -20981 NR_161385 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 144-92 chr21 29585363 29585645 + 0.666667 NA intron (NM_000830, intron 12 of 16) LTR101_Mam|LTR|ERVL -10536 NR_033368 100379661 Hs.659368 NR_033368 ENSG00000156273 GRIK1-AS2 C21orf41|NCRNA00258 GRIK1 antisense RNA 2 ncRNA 160.667-135 chr19 28886147 28886553 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78781 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 187-29 chr18 6679914 6680322 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -49598 NM_001366230 79822 Hs.183114 NM_030672 ENSG00000088756 ARHGAP28 - Rho GTPase activating protein 28 protein-coding 129-2 chr1 63644977 63645348 + 0.666667 NA intron (NM_001172818, intron 7 of 10) intron (NM_001172818, intron 7 of 10) 21946 NM_001172818 5236 Hs.1869 NM_002633 ENSG00000079739 PGM1 CDG1T|GSD14 phosphoglucomutase 1 protein-coding 137.667-150 chr5 84904156 84904421 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -519408 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 165-13 chr11 31840472 31840758 + 0.666667 NA intron (NR_033971, intron 1 of 2) intron (NR_033971, intron 1 of 2) 14048 NR_117094 103157000 NR_117094 ENSG00000281880 PAUPAR - PAX6 upstream antisense RNA ncRNA 196-5 chr1 62874368 62874748 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90426 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 125.333-108 chr21 26607910 26608247 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34792 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 134.667-49 chr12 114786126 114786451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102113 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 155-111 chr5 119242046 119242373 + 0.666667 NA intron (NM_001290321, intron 42 of 43) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -26550 NM_001286815 25816 Hs.618488 NM_014350 ENSG00000145779 TNFAIP8 GG2-1|MDC-3.13|NDED|SCC-S2|SCCS2 TNF alpha induced protein 8 protein-coding 135.333-153 chr5 173540444 173540800 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -39012 NR_027108 285593 Hs.409730 NR_027108 ENSG00000253955 LOC285593 - uncharacterized LOC285593 ncRNA 154.333-192 chr21 26944235 26944624 + 0.666667 NA intron (NM_007038, intron 2 of 7) intron (NM_007038, intron 2 of 7) -9532 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 131.333-14 chr1 178103513 178103822 + 0.666667 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) L1ME4b|LINE|L1 9563 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 129-17 chr10 67678175 67678403 + 0.666667 NA intron (NM_013266, intron 1 of 17) intron (NM_013266, intron 1 of 17) -12604 NM_001127384 29119 Hs.21375 NM_013266 ENSG00000183230 CTNNA3 ARVD13|VR22 catenin alpha 3 protein-coding 174.333-80 chr22 35282777 35283174 + 0.666667 NA intron (NM_001003681, intron 5 of 10) intron (NM_001003681, intron 5 of 10) -16300 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 147.333-279 chr6 116898903 116899267 + 0.666667 NA intron (NM_173560, intron 6 of 18) L1M5|LINE|L1 21843 NM_173560 222546 Hs.352276 NM_173560 ENSG00000185002 RFX6 MTCHRS|MTFS|RFXDC1|dJ955L16.1 regulatory factor X6 protein-coding 125.333-191 chr9 130293529 130293773 + 0.666667 NA intron (NM_001291815, intron 4 of 97) intron (NM_001291815, intron 4 of 97) 27891 NM_001291815 256158 Hs.32194 NM_144655 ENSG00000148357 HMCN2 - hemicentin 2 protein-coding 121-126 chr6 119683912 119684258 + 0.666667 NA intron (NR_134600, intron 2 of 3) intron (NR_134600, intron 2 of 3) 134277 NR_134600 105377975 Hs.671597 NR_134600 LOC105377975 - uncharacterized LOC105377975 ncRNA 157.667-102 chr14 72376274 72376569 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 3 of 16) L1MA5A|LINE|L1 -140399 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 235.667-51 chr5 166788736 166789119 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie 137443 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 113.333-249 chr7 132639811 132640023 + 0.666667 NA intron (NM_181775, intron 2 of 4) MIR3|SINE|MIR 8771 NM_181775 91584 Hs.511454 NM_020911 ENSG00000221866 PLXNA4 FAYV2820|PLEXA4|PLXNA4A|PLXNA4B|PRO34003 plexin A4 protein-coding 128.667-85 chr2 30208563 30208926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21310 NR_145719 109616960 NR_145719 ENSG00000207187 SNORA10B - small nucleolar RNA, H/ACA box 10B snoRNA 112-37 chr11 125694190 125694411 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13453 NM_020108 56 Hs.169222 NM_001612 ENSG00000134940 ACRV1 D11S4365|SP-10|SPACA2 acrosomal vesicle protein 1 protein-coding 121-43 chr14 50682883 50683104 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -14687 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 146-23 chr12 68524231 68524567 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72915 NR_120458 100507195 Hs.450772 NR_120458 ENSG00000251301 LINC02384 - long intergenic non-protein coding RNA 2384 ncRNA 120-98 chr4 147108468 147108822 + 0.666667 NA Intergenic MER20B|DNA|hAT-Charlie -162759 NM_031956 83894 Hs.378893 NM_031956 ENSG00000137473 TTC29 NYD-SP14|TBPP2A tetratricopeptide repeat domain 29 protein-coding 115.667-156 chr4 14887679 14887875 + 0.666667 NA intron (NR_126435, intron 1 of 6) MER45A|DNA|hAT-Tip100 392 NR_126435 201853 Hs.551051 NR_126435 ENSG00000248360 LINC00504 - long intergenic non-protein coding RNA 504 ncRNA 370.334-4 chr3 15251316 15252234 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014296, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_014296, exon 21 of 21) -2409 NR_046084 100505696 Hs.745026 NR_046084 ENSG00000224660 SH3BP5-AS1 - SH3BP5 antisense RNA 1 ncRNA 150-66 chr18 12042965 12043300 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -50711 NM_001277333 342850 Hs.448906 NM_001277333 ENSG00000181626 ANKRD62 DKFZp779B1634 ankyrin repeat domain 62 protein-coding 161-20 chr14 22962242 22962568 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -5263 NM_001166269 54930 Hs.442782 NM_017815 ENSG00000092036 HAUS4 C14orf94 HAUS augmin like complex subunit 4 protein-coding 162.333-191 chr5 13949148 13949480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4834 NM_001369 1767 Hs.212360 NM_001369 ENSG00000039139 DNAH5 CILD3|DNAHC5|HL1|KTGNR|PCD dynein axonemal heavy chain 5 protein-coding 157.667-2 chr1 45942749 45943126 + 0.666667 NA intron (NM_001324321, intron 3 of 28) MER34A|LTR|ERV1 78589 NM_001324321 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 189.667-121 chr5 149898820 149899197 + 0.666667 NA intron (NM_000440, intron 9 of 21) AluJb|SINE|Alu 33969 NR_110534 644762 Hs.730366 NR_110534 LOC644762 - mitochondrial fission factor pseudogene pseudo 147.333-99 chr14 51821188 51821556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39240 NM_001243773 54331 Hs.187772 NM_053064 ENSG00000186469 GNG2 - G protein subunit gamma 2 protein-coding 186.667-96 chr3 175017133 175017568 + 0.666667 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) intron (NM_207015, intron 1 of 13) 97892 NR_046390 100862679 Hs.148810 NR_046390 ENSG00000230292 NAALADL2-AS3 - NAALADL2 antisense RNA 3 ncRNA 124-73 chr21 25849447 25849741 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -113940 NM_001320266 522 Hs.246310 NM_001685 ENSG00000154723 ATP5PF ATP5|ATP5A|ATP5J|ATPM|CF6|F6 ATP synthase peripheral stalk subunit F6 protein-coding 164.667-7 chr1 83182140 83182388 + 0.666667 NA Intergenic L1PA2|LINE|L1 -196056 NR_110633 101927498 NR_110632 ENSG00000236268 LINC01361 - long intergenic non-protein coding RNA 1361 ncRNA 146.333-362 chrX 84278874 84279157 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -53187 NR_031690 100302191 NR_031690 ENSG00000221494 MIR548I4 MIR548I-4|MIRN548I4|hsa-mir-548i-4 microRNA 548i-4 ncRNA 157-78 chr20 15625329 15625751 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 8 of 17) intron (NM_001351663, intron 8 of 17) 297774 NR_130925 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 146.667-199 chr20 49707282 49707571 + 0.666667 NA intron (NM_004776, intron 1 of 8) intron (NM_004776, intron 1 of 8) 6452 NM_004776 9334 Hs.370487 NM_004776 ENSG00000158470 B4GALT5 B4Gal-T5|BETA4-GALT-IV|beta4Gal-T5|beta4GalT-V|gt-V beta-1,4-galactosyltransferase 5 protein-coding 135.667-112 chr3 2135929 2136329 + 0.666667 NA intron (NR_046555, intron 1 of 2) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 8112 NR_046555 100873976 Hs.611138 NR_046555 ENSG00000227588 CNTN4-AS2 - CNTN4 antisense RNA 2 ncRNA 134.667-48 chr12 84408975 84409266 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 503679 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 286.333-24 chr20 38617636 38618273 + 0.666667 NA intron (NM_001164431, intron 1 of 14) MIRb|SINE|MIR 16145 NM_001164431 343578 NM_001164431 ENSG00000124143 ARHGAP40 C20orf95|dJ1100H13.4 Rho GTPase activating protein 40 protein-coding 112-3 chr1 56767152 56767383 + 0.666667 NA intron (NM_001004303, intron 5 of 19) intron (NM_001004303, intron 5 of 19) 52137 NM_001004303 199920 Hs.437655 NM_001004303 ENSG00000187889 FYB2 ARAP|C1orf168 FYN binding protein 2 protein-coding 147.667-48 chr10 113878185 113878479 + 0.666667 NA intron (NM_198514, intron 3 of 10) intron (NM_198514, intron 3 of 10) 23671 NM_198514 374354 Hs.369924 NM_198514 ENSG00000196865 NHLRC2 FINCA NHL repeat containing 2 protein-coding 180.333-94 chr4 148178428 148178816 + 0.666667 NA intron (NM_000901, intron 4 of 8) intron (NM_000901, intron 4 of 8) 263792 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 187.667-105 chr4 46279011 46279440 + 0.666667 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) intron (NM_001114175, intron 7 of 8) 110154 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 120.667-37 chr12 39597924 39598224 + 0.666667 NA intron (NM_005164, intron 6 of 9) intron (NM_005164, intron 6 of 9) 21729 NM_005164 225 Hs.117852 NM_005164 ENSG00000173208 ABCD2 ABC39|ALDL1|ALDR|ALDRP|hALDR ATP binding cassette subfamily D member 2 protein-coding 144.667-197 chr3 106035147 106035539 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -165942 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 137-46 chr2 72522940 72523197 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) intron (NR_135774, intron 8 of 19) 302965 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 234.667-93 chr5 96484676 96485223 + 0.666667 NA intron (NR_130776, intron 4 of 4) intron (NR_130776, intron 4 of 4) -51701 NM_000439 5122 Hs.78977 NM_000439 ENSG00000175426 PCSK1 BMIQ12|NEC1|PC1|PC3|SPC3 proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 protein-coding 120.333-88 chr2 8857384 8857685 + 0.666667 NA non-coding (NR_135601, exon 11 of 11) non-coding (NR_135601, exon 11 of 11) -19921 NM_001348741 57498 Hs.9873 NM_020738 ENSG00000134313 KIDINS220 ARMS|SINO kinase D interacting substrate 220 protein-coding 157.333-128 chr15 95674387 95674686 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 241443 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 121-70 chr2 107501011 107501220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28304 NR_146968 105373537 NR_146968 ENSG00000224568 LINC01886 - long intergenic non-protein coding RNA 1886 ncRNA 123.667-38 chr11 48252804 48253014 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 7805 NM_001004727 119764 Hs.553565 NM_001004727 ENSG00000172208 OR4X2 OR11-105 olfactory receptor family 4 subfamily X member 2 (gene/pseudogene) protein-coding 216-62 chr2 121498628 121499143 + 0.666667 NA intron (NM_015282, intron 8 of 38) L1MB7|LINE|L1 -31995 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 150.667-403 chr9 131915418 131915848 + 0.666667 NA intron (NM_004269, intron 4 of 7) intron (NM_004269, intron 4 of 7) 164234 NM_001253882 9442 Hs.374262 NM_004269 ENSG00000160563 MED27 CRAP34|CRSP34|CRSP8|MED3|TRAP37 mediator complex subunit 27 protein-coding 113-173 chr5 110033303 110033527 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 150233 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 153.333-49 chr10 64095140 64095539 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -573449 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 192.333-176 chr9 36637900 36638277 + 0.666667 NA intron (NM_001256691, intron 8 of 15) intron (NM_001256691, intron 8 of 15) 65193 NM_014791 9833 Hs.184339 NM_014791 ENSG00000165304 MELK HPK38 maternal embryonic leucine zipper kinase protein-coding 196.666-102 chr7 112579209 112579795 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -38563 NR_110160 100996249 Hs.561749 NR_110159 LOC100996249 - uncharacterized LOC100996249 ncRNA 173-103 chrX 62612048 62612418 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 739099 NM_001012968 139886 Hs.612782 NM_001012968 ENSG00000186767 SPIN4 TDRD28 spindlin family member 4 protein-coding 125.667-167 chr6 85446404 85446743 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -3011 NM_001204813 4907 Hs.153952 NM_002526 ENSG00000135318 NT5E CALJA|CD73|E5NT|NT|NT5|NTE|eN|eNT 5'-nucleotidase ecto protein-coding 115-161 chr9 129053856 129054095 + 0.666667 NA intron (NR_138421, intron 7 of 16) AluJo|SINE|Alu 17041 NM_032809 84895 Hs.632693 NM_032809 ENSG00000148343 MIGA2 C9orf54|FAM73B mitoguardin 2 protein-coding 120-121 chr6 36620406 36620636 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 1991 NR_037491 100500885 NR_037491 ENSG00000263894 MIR3925 - microRNA 3925 ncRNA 147-98 chr3 185792816 185793097 + 0.666667 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) -25052 NR_049838 100847078 NR_049838 ENSG00000265470 MIR548AQ - microRNA 548aq ncRNA 128.667-181 chr8 71297171 71297380 + 0.666667 NA intron (NM_001370336, intron 10 of 17) intron (NM_001370336, intron 10 of 17) 59431 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 180.667-138 chr7 93924174 93924643 + 0.666667 NA intron (NM_004126, intron 1 of 1) intron (NM_004126, intron 1 of 1) 2673 NM_004126 2791 Hs.83381 NM_004126 ENSG00000127920 GNG11 GNGT11 G protein subunit gamma 11 protein-coding 167-86 chr5 79330846 79331339 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 94961 NM_152405 133746 Hs.482605 NM_152405 ENSG00000152409 JMY WHAMM2|WHDC1L3 junction mediating and regulatory protein, p53 cofactor protein-coding 137.333-62 chr16 71257722 71257982 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -27130 NM_001270974 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 198.333-170 chr5 155345675 155346104 + 0.666667 NA Intergenic (ATATCT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 332134 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 174.667-182 chrX 43791318 43791739 + 0.666667 NA intron (NM_000898, intron 8 of 14) AluSc8|SINE|Alu 90922 NM_000898 4129 Hs.654473 NM_000898 ENSG00000069535 MAOB - monoamine oxidase B protein-coding 135-92 chr6 56328575 56328865 + 0.666667 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) intron (NM_001318752, intron 1 of 28) 65408 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 118.333-166 chr5 57253759 57253967 + 0.666667 NA intron (NM_001203246, intron 9 of 10) AluJb|SINE|Alu 39789 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 144.667-16 chr1 150573599 150573997 + 0.666667 NA TTS (NM_182763) TTS (NM_182763) 754 NR_104133 574406 Hs.516243 NM_001025493 ENSG00000203804 ADAMTSL4-AS1 C1orf138 ADAMTSL4 antisense RNA 1 ncRNA 117-81 chr2 129928100 129928304 + 0.666667 NA intron (NR_026740, intron 1 of 2) intron (NR_026740, intron 1 of 2) 5025 NR_110285 101927924 Hs.570248 NR_110285 ENSG00000237574 LINC01856 - long intergenic non-protein coding RNA 1856 ncRNA 146-105 chr5 17674004 17674357 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -18542 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 166.667-213 chr7 25860960 25861299 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71010 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 170.667-144 chr6 54597197 54597562 + 0.666667 NA Intergenic MER44B|DNA|TcMar-Tigger -249392 NM_001010872 222584 Hs.152423 NM_001010872 ENSG00000168143 FAM83B C6orf143 family with sequence similarity 83 member B protein-coding 167-48 chr17 67882258 67882632 + 0.666667 NA intron (NM_004459, intron 5 of 29) L1MC5a|LINE|L1 56942 NM_004459 2186 Hs.444200 NM_004459 ENSG00000171634 BPTF FAC1|FALZ|NEDDFL|NURF301 bromodomain PHD finger transcription factor protein-coding 123.667-196 chr9 89043987 89044334 + 0.666667 NA intron (NM_016848, intron 9 of 11) intron (NM_016848, intron 9 of 11) 52692 NM_005226 1903 Hs.585118 NM_005226 ENSG00000213694 S1PR3 EDG-3|EDG3|LPB3|S1P3 sphingosine-1-phosphate receptor 3 protein-coding 167.333-123 chr2 22197957 22198341 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -338330 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 260-86 chr8 126733918 126734326 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -175644 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 118.333-125 chr3 1224943 1225253 + 0.666667 NA intron (NM_001289080, intron 3 of 22) intron (NM_001289080, intron 3 of 22) 132074 NM_001289081 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 147-96 chr3 151868184 151868564 + 0.666667 NA intron (NR_110203, intron 1 of 2) AluJo|SINE|Alu -5269 NM_033050 56670 Hs.133181 NM_033050 ENSG00000198829 SUCNR1 GPR91 succinate receptor 1 protein-coding 149.333-425 chr9 31274080 31274381 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 107260 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 139.333-106 chr2 25679585 25679821 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -6029 NM_001256304 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 207-3 chr1 56066295 56066753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121437 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 146.333-300 chr7 6426532 6426843 + 0.666667 NA intron (NM_001142936, intron 4 of 12) L1MC4|LINE|L1 21267 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 195-89 chr5 110787641 110788125 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 48876 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 126.333-56 chr15 45713940 45714224 + 0.666667 NA intron (NR_135680, intron 1 of 4) intron (NR_135680, intron 1 of 4) 8887 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 114-166 chr8 65773410 65773723 + 0.666667 NA intron (NM_001242318, intron 3 of 12) intron (NM_001242318, intron 3 of 12) 15491 NM_002603 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 118.333-116 chr2 163980364 163980708 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -244528 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 121.667-159 chr5 38742783 38743012 + 0.666667 NA intron (NR_109951, intron 3 of 3) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -22624 NR_104631 101926904 Hs.634191 NR_104631 ENSG00000249740 LINC01265 - long intergenic non-protein coding RNA 1265 ncRNA 117.667-27 chr11 46531771 46532012 + 0.666667 NA intron (NM_001267782, intron 8 of 19) AluSx1|SINE|Alu 55553 NR_160027 55626 Hs.654644 NM_017749 ENSG00000110497 AMBRA1 DCAF3|WDR94 autophagy and beclin 1 regulator 1 protein-coding 141-95 chr8 143344523 143344917 + 0.666667 NA intron (NM_001258447, intron 1 of 13) intron (NM_001258447, intron 1 of 13) -9840 NM_052963 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 119.667-176 chr7 94055247 94055550 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51043 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 114.667-2 chr1 63647581 63647790 + 0.666667 NA intron (NM_001172818, intron 7 of 10) L1M5|LINE|L1 24469 NM_001172818 5236 Hs.1869 NM_002633 ENSG00000079739 PGM1 CDG1T|GSD14 phosphoglucomutase 1 protein-coding 217.333-26 chr10 76898733 76899355 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 26 of 28) intron (NM_001271519, intron 26 of 28) 11000 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 141.333-22 chr10 43616102 43616458 + 0.666667 NA intron (NM_145312, intron 4 of 4) intron (NM_145312, intron 4 of 4) 9842 NM_145312 220992 Hs.147440 NM_145312 ENSG00000198298 ZNF485 - zinc finger protein 485 protein-coding 212.333-28 chr12 12397761 12398235 + 0.666667 NA intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 intron (NM_001300742, intron 2 of 3).2 40920 NM_001330356 118426 Hs.504805 NM_058169 ENSG00000165714 BORCS5 LOH12CR1|LOH1CR12 BLOC-1 related complex subunit 5 protein-coding 155.667-180 chr2 171651050 171651476 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -36206 NM_001271786 1781 Hs.546250 NM_001378 ENSG00000077380 DYNC1I2 DIC74|DNCI2|IC2 dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 protein-coding 182-38 chr17 42874308 42874821 + 0.666667 NA TTS (NR_027254) TTS (NR_027254) 7419 NR_002773 90586 Hs.367781 NR_002773 ENSG00000260105 AOC4P AOC4|UPAT amine oxidase copper containing 4, pseudogene pseudo 136.667-9 chr1 166980382 166980703 + 0.666667 NA intron (NM_001286378, intron 1 of 12) intron (NM_001286378, intron 1 of 12) 4960 NM_001286378 84944 Hs.651245 NM_032858 ENSG00000143194 MAEL CT128|SPATA35 maelstrom spermatogenic transposon silencer protein-coding 197-33 chr14 50820407 50820809 + 0.666667 NA intron (NM_016350, intron 3 of 28) intron (NM_016350, intron 3 of 28) -1189 NR_135258 105370489 Hs.569387 NR_135258 ENSG00000258843 LOC105370489 - uncharacterized LOC105370489 ncRNA 218.333-127 chrX 22327670 22328192 + 0.666667 NA intron (NR_073010, intron 5 of 11) MER20|DNA|hAT-Charlie 55018 NM_152577 158506 Hs.132485 NM_152577 ENSG00000175809 CBLL2 CT138|HAKAIL|ZNF645 Cbl proto-oncogene like 2 protein-coding 259.333-20 chr12 10702356 10702821 + 0.666667 NA intron (NM_001145426, intron 6 of 8) intron (NM_001145426, intron 6 of 8) 20735 NM_003651 8531 Hs.221889 NM_003651 ENSG00000060138 YBX3 CSDA|CSDA1|DBPA|ZONAB Y-box binding protein 3 protein-coding 160.667-228 chr4 83947946 83948255 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 351069 NR_125909 101928978 Hs.647977 NR_125909 ENSG00000250546 LOC101928978 - uncharacterized LOC101928978 ncRNA 128.333-27 chr10 50822038 50822268 + 0.666667 NA intron (NM_001370131, intron 6 of 11) intron (NM_001370131, intron 6 of 11) 63474 NM_001370130 29974 Hs.282795 NM_014576 ENSG00000148584 A1CF ACF|ACF64|ACF65|APOBEC1CF|ASP APOBEC1 complementation factor protein-coding 138.667-64 chr14 79046966 79047225 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -152887 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 115-144 chr7 51669114 51669292 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -275947 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 138.667-51 chr12 102466158 102466398 + 0.666667 NA intron (NM_000618, intron 2 of 3) intron (NM_000618, intron 2 of 3) 12272 NM_001111284 3479 Hs.160562 NM_000618 ENSG00000017427 IGF1 IGF|IGF-I|IGFI|MGF insulin like growth factor 1 protein-coding 155-66 chr2 63693974 63694287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 104979 NM_001199112 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 115.667-33 chr10 106127720 106127999 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12306 NR_134329 105378470 Hs.142910 NR_134329 ENSG00000229775 LINC02624 - long intergenic non-protein coding RNA 2624 ncRNA 125.333 chr1 25995400 25995627 + 0.666667 NA intron (NM_000437, intron 1 of 10) intron (NM_000437, intron 1 of 10) 2550 NM_000437 5051 Hs.477083 NM_000437 ENSG00000158006 PAFAH2 HSD-PLA2 platelet activating factor acetylhydrolase 2 protein-coding 133-93 chr8 61171007 61171391 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -116771 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 124-76 chr3 83179733 83179959 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 1193704 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 181-69 chr7 26139866 26140258 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -12136 NM_004289 9603 Hs.404741 NM_004289 ENSG00000050344 NFE2L3 NRF3 nuclear factor, erythroid 2 like 3 protein-coding 194.333-89 chr3 113563635 113564034 + 0.666667 NA intron (NM_001322297, intron 1 of 24) L1MC5a|LINE|L1 -31042 NR_039648 100616476 NR_039648 ENSG00000265253 MIR4446 mir-4446 microRNA 4446 ncRNA 169-15 chr11 112684656 112685063 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -129057 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 168.333-18 chr10 11746427 11746846 + 0.666667 NA intron (NM_024693, intron 1 of 4) L1MA2|LINE|L1 4254 NM_024693 79746 Hs.22242 NM_024693 ENSG00000134463 ECHDC3 - enoyl-CoA hydratase domain containing 3 protein-coding 164.667-217 chr7 19215663 19216143 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -70482 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 198.333-162 chr5 66414004 66414595 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 97305 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 183.333-16 chr10 112932648 112933147 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -17350 NM_001367943 6934 Hs.593995 NM_030756 ENSG00000148737 TCF7L2 TCF-4|TCF4 transcription factor 7 like 2 protein-coding 204.333-149 chr4 176192670 176193109 + 0.666667 NA intron (NM_144644, intron 3 of 5) intron (NM_144644, intron 3 of 5) 2696 NM_144644 132851 Hs.481235 NM_144644 ENSG00000150628 SPATA4 SPEF1B|TSARG2 spermatogenesis associated 4 protein-coding 177.667-130 chr7 158663994 158664437 + 0.666667 NA exon (NM_001281933, exon 15 of 28) exon (NM_001281933, exon 15 of 28) 40589 NM_001281932 54892 Hs.18616 NM_017760 ENSG00000146918 NCAPG2 3KS|CAP-G2|CAPG2|LUZP5|MTB|hCAP-G2 non-SMC condensin II complex subunit G2 protein-coding 156.667-301 chr6 91320992 91321320 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -200504 NR_039786 100616174 NR_039786 ENSG00000263734 MIR4643 - microRNA 4643 ncRNA 113.333-260 chr8 123668493 123668697 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -14794 NM_001081675 340359 Hs.450252 NM_001081675 ENSG00000175946 KLHL38 C8ORFK36 kelch like family member 38 protein-coding 113.667-182 chr5 179140481 179140714 + 0.666667 NA intron (NM_014244, intron 10 of 21) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 80224 NM_014594 30832 Hs.272328 NM_014594 ENSG00000177932 ZNF354C KID3 zinc finger protein 354C protein-coding 185-65 chr7 35392124 35392521 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 78467 NR_038864 401324 Hs.377034 NR_038864 LOC401324 - uncharacterized LOC401324 ncRNA 157.333-335 chr8 81909462 81909826 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -67358 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 212.667-85 chr22 25881598 25882031 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 25 of 43) intron (NM_001318245, intron 25 of 43) 139626 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 290.333-27 chr3 51593381 51594043 + 0.666667 NA intron (NM_001322253, intron 4 of 23) intron (NM_001322253, intron 4 of 23) 52123 NM_001322257 23132 Hs.105399 NM_015106 ENSG00000164080 RAD54L2 ARIP4|HSPC325|SRISNF2L RAD54 like 2 protein-coding 122-118 chr8 91268604 91268954 + 0.666667 NA intron (NM_134266, intron 2 of 18) L1MA6|LINE|L1 19460 NM_134266 115111 Hs.354013 NM_052832 ENSG00000147606 SLC26A7 SUT2 solute carrier family 26 member 7 protein-coding 122.333-149 chr3 193172088 193172384 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -68986 NM_001366112 57110 Hs.36761 NM_020386 ENSG00000127252 PLAAT1 A-C1|H-REV107|HRASLS|HRASLS1|HRSL1|HSD28|PLA/AT1|PLAAT-1 phospholipase A and acyltransferase 1 protein-coding 165.667-134 chr3 195510069 195510482 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33050 NM_001291504 5504 Hs.535731 NM_006241 ENSG00000184203 PPP1R2 IPP-2|IPP2|PPP1R2A protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 protein-coding 135-40 chr18 5255356 5255729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 17442 NR_015389 339290 Hs.643553 NR_015389 ENSG00000263753 LINC00667 - long intergenic non-protein coding RNA 667 ncRNA 144.667-19 chr1 185507828 185508116 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 120516 NR_110793 101929093 Hs.535227 NR_110793 ENSG00000228309 LINC01350 GS1-204I12.1 long intergenic non-protein coding RNA 1350 ncRNA 168.333-80 chr18 10524212 10524603 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -1620 NM_003826 8774 Hs.464622 NM_003826 ENSG00000134265 NAPG GAMMASNAP NSF attachment protein gamma protein-coding 149.667-293 chr4 76481383 76481728 + 0.666667 NA intron (NM_020859, intron 1 of 10) L1PA7|LINE|L1 46326 NM_020859 57619 Hs.683808 NM_020859 ENSG00000138771 SHROOM3 APXL3|MSTP013|SHRM|ShrmL shroom family member 3 protein-coding 210-56 chr18 64329594 64329998 + 0.666667 NA intron (NR_033881, intron 5 of 9) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -69741 NR_033983 400654 Hs.434235 NR_033983 ENSG00000266952 LINC01538 - long intergenic non-protein coding RNA 1538 ncRNA 127.667-93 chr2 164345180 164345485 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 223163 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 129.667-129 chr4 103186668 103186999 + 0.666667 NA intron (NM_001813, intron 8 of 48) L2a|LINE|L2 11510 NM_001813 1062 Hs.75573 NM_001813 ENSG00000138778 CENPE CENP-E|KIF10|MCPH13|PPP1R61 centromere protein E protein-coding 152-9 chr1 188841988 188842350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1398541 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 163.333-149 chr2 109623131 109623487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8945 NM_023016 65124 Hs.355455 NM_023016 ENSG00000198142 SOWAHC ANKRD57|C2orf26 sosondowah ankyrin repeat domain family member C protein-coding 123-9 chr1 109007323 109007596 + 0.666667 NA intron (NM_014969, intron 5 of 14) intron (NM_014969, intron 5 of 14) 34769 NM_014969 22911 Hs.570055 NM_014969 ENSG00000085433 WDR47 - WD repeat domain 47 protein-coding 167.667-173 chr5 133648543 133648877 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -36169 NM_015082 23105 Hs.483390 NM_015082 ENSG00000053108 FSTL4 - follistatin like 4 protein-coding 136.667-122 chr3 137786188 137786484 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 14425 NR_109987 100507274 Hs.360349 NR_109987 ENSG00000239513 LINC01210 - long intergenic non-protein coding RNA 1210 ncRNA 171.333-124 chr3 118456834 118457198 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -184752 NR_135573 101926968 Hs.518185 NR_135573 LOC101926968 - uncharacterized LOC101926968 ncRNA 164.667-16 chr1 244502793 244503151 + 0.666667 NA intron (NM_001130957, intron 7 of 21) LTR16E2|LTR|ERVL 41601 NM_001242340 257044 Hs.459534 NM_173807 ENSG00000179397 CATSPERE C10orf101|C1orf101 catsper channel auxiliary subunit epsilon protein-coding 148-20 chr10 89631547 89631920 + 0.666667 NA intron (NM_148977, intron 1 of 6) intron (NM_148977, intron 1 of 6) 12183 NM_148978 53354 Hs.163555 NM_138316 ENSG00000152782 PANK1 PANK pantothenate kinase 1 protein-coding 371-6 chr14 44536492 44537379 + 0.666667 NA intron (NR_135257, intron 2 of 2) intron (NR_135257, intron 2 of 2) 29526 NR_135257 105370473 Hs.180134 NR_135257 ENSG00000258747 LOC105370473 - uncharacterized LOC105370473 ncRNA 157-28 chr11 81404925 81405246 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 485751 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 125-124 chr9 31718437 31718771 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -337114 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 115-154 chr8 113300299 113300557 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 2 of 66) L1PA16|LINE|L1 76724 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 123-68 chr20 45374199 45374532 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001099791, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001099791, exon 4 of 4) 3960 NM_014477 27296 Hs.710271 NM_014477 ENSG00000124251 TP53TG5 C20orf10|CLG01 TP53 target 5 protein-coding 208.333-126 chr6 51836851 51837167 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 50 of 66) intron (NM_138694, intron 50 of 66) 215139 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 157.667-128 chr18 23082953 23083315 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -51430 NM_001256438 91768 Hs.11108 NM_138375 ENSG00000134508 CABLES1 CABL1|CABLES|HsT2563|IK3-1 Cdk5 and Abl enzyme substrate 1 protein-coding 112.667-250 chr7 80760903 80761132 + 0.666667 NA intron (NM_006379, intron 14 of 17) intron (NM_006379, intron 14 of 17) 114364 NM_001289908 948 Hs.120949 NM_000072 ENSG00000135218 CD36 BDPLT10|CHDS7|FAT|GP3B|GP4|GPIV|PASIV|SCARB3 CD36 molecule protein-coding 147-44 chr14 75599027 75599316 + 0.666667 NA intron (NM_017791, intron 1 of 9) L1MB3|LINE|L1 -6369 NM_001195283 55640 Hs.509966 NM_017791 ENSG00000119686 FLVCR2 C14orf58|CCT|EPV|FLVCRL14q|MFSD7C|PVHH|SLC49A2 feline leukemia virus subgroup C cellular receptor family member 2 protein-coding 124-52 chr19 31723014 31723321 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 130886 NM_001205273 100507527 Hs.432564 NM_001205273 THEG5 - testis highly expressed protein 5 protein-coding 156.333-67 chr12 472792 473238 + 0.666667 NA intron (NM_173593, intron 1 of 19) AluJo|SINE|Alu 13076 NM_173593 283358 Hs.504416 NM_173593 ENSG00000139044 B4GALNT3 - beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 3 protein-coding 175.333-34 chr13 73006590 73007002 + 0.666667 NA intron (NR_146206, intron 16 of 16) intron (NR_146206, intron 16 of 16) -48180 NM_001286818 688 Hs.508234 NM_001730 ENSG00000102554 KLF5 BTEB2|CKLF|IKLF Kruppel like factor 5 protein-coding 136.333-113 chr20 59549323 59549634 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -28031 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 165.667-7 chr1 188341157 188341624 + 0.666667 NA Intergenic MLT2A1|LTR|ERVL 897762 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 147.667-363 chr8 92280125 92280506 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -176930 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 176.667-10 chr1 99771122 99771433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4642 NM_001361041 391059 Hs.454779 NM_001013660 ENSG00000156869 FRRS1 SDFR2|SDR2 ferric chelate reductase 1 protein-coding 134.667-190 chr7 125664447 125664835 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -400350 NR_110183 101928254 Hs.571236 NR_110182 ENSG00000219445 LOC101928254 - uncharacterized LOC101928254 ncRNA 147.667-219 chr22 36507704 36508131 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001102371) promoter-TSS (NM_001102371) -877 NM_001102371 80020 Hs.387601 NM_024955 ENSG00000100350 FOXRED2 ERFAD FAD dependent oxidoreductase domain containing 2 protein-coding 155.333-201 chr20 49813013 49813314 + 0.666667 NA intron (NR_048539, intron 1 of 13) intron (NR_048539, intron 1 of 13) 335 NR_048539 23315 Hs.444202 NM_015266 ENSG00000197818 SLC9A8 NHE-8|NHE8 solute carrier family 9 member A8 protein-coding 196.333-65 chr17 65251972 65252393 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 114812 NM_003835 8787 Hs.664380 NM_003835 ENSG00000108370 RGS9 PERRS|RGS9L regulator of G protein signaling 9 protein-coding 118.333-123 chr21 23610750 23610950 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -226015 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 130-93 chr5 45027901 45028190 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 219098 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 144-128 chr4 137409926 137410223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 122420 NM_019035 54510 Hs.591691 NM_019035 ENSG00000189184 PCDH18 PCDH68L protocadherin 18 protein-coding 230.333-37 chr14 46495657 46496287 + 0.666667 NA intron (NR_102699, intron 2 of 2) intron (NR_102699, intron 2 of 2) 24613 NR_102700 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 152-148 chr7 84679461 84679762 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 147135 NR_110080 101927378 Hs.539042 NR_110079 ENSG00000235139 LOC101927378 - uncharacterized LOC101927378 ncRNA 172.333-12 chr10 25917474 25917886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16030 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 121.667-120 chr3 2528399 2528694 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 3 of 24) intron (NM_175607, intron 3 of 24) 289717 NM_001206955 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 113.333-78 chr14 79093421 79093740 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -106402 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 132-116 chr8 85507031 85507329 + 0.666667 NA Intergenic LTR8A|LTR|ERV1 -42265 NR_121630 100996348 Hs.606624 NR_121630 ENSG00000253549 CA3-AS1 - CA3 antisense RNA 1 ncRNA 112.667-116 chr2 29912536 29912745 + 0.666667 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) L1MEf|LINE|L1 8946 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 159.667-15 chr1 87116152 87116622 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13378 NR_026989 339524 Hs.306423 NM_207357 ENSG00000267272 LINC01140 - long intergenic non-protein coding RNA 1140 ncRNA 124-48 chr16 64443705 64443907 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 678257 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 152.333-171 chr2 34703725 34704017 + 0.666667 NA intron (NR_126404, intron 1 of 2) intron (NR_126404, intron 1 of 2) 26314 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 117.333-8 chr1 89180835 89181121 + 0.666667 NA TTS (NM_052941) TTS (NM_052941) -4975 NM_207398 388646 Hs.591450 NM_207398 ENSG00000213512 GBP7 GBP4L guanylate binding protein 7 protein-coding 170-91 chr4 52944096 52944588 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 82025 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 163.333-283 chr8 97757212 97757679 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -18343 NM_018407 55353 Hs.492314 NM_018407 ENSG00000104341 LAPTM4B LAPTM4beta|LC27 lysosomal protein transmembrane 4 beta protein-coding 189.333-5 chr1 59565922 59566388 + 0.666667 NA intron (NM_001350794, intron 8 of 14) intron (NM_001350794, intron 8 of 14) 50525 NM_001278224 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 185.667-75 chr2 152952740 152953176 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 234321 NR_146430 151188 Hs.643580 NM_152522 ENSG00000177917 ARL6IP6 AIP-6|AIP6|PFAAP1 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 6 protein-coding 162.333-121 chr2 135868918 135869370 + 0.666667 NA intron (NM_005915, intron 3 of 16) AluSc|SINE|Alu 7299 NM_005915 4175 Hs.444118 NM_005915 ENSG00000076003 MCM6 MCG40308|Mis5|P105MCM minichromosome maintenance complex component 6 protein-coding 142.333-237 chr8 85886915 85887255 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59143 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 123.333-101 chr2 10756072 10756425 + 0.666667 NA intron (NM_001039362, intron 4 of 13) AluSx|SINE|Alu 34618 NM_144583 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 196-66 chr17 8936956 8937435 + 0.666667 NA intron (NM_001142633, intron 1 of 18) L1MC2|LINE|L1 -24678 NM_014308 23533 Hs.278901 NM_014308 ENSG00000141506 PIK3R5 F730038I15Rik|FOAP-2|P101-PI3K|p101 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 5 protein-coding 140-133 chrX 132777871 132778248 + 0.666667 NA intron (NM_001077188, intron 3 of 5) intron (NM_001077188, intron 3 of 5) 110417 NR_046691 100874102 Hs.619341 NR_046691 ENSG00000235849 HS6ST2-AS1 - HS6ST2 antisense RNA 1 ncRNA 134.667-91 chr19 37458356 37458706 + 0.666667 NA intron (NM_001330482, intron 2 of 4) intron (NM_001330482, intron 2 of 4) 8913 NM_152484 148266 Hs.511848 NM_152484 ENSG00000196437 ZNF569 ZAP1|ZNF zinc finger protein 569 protein-coding 225-25 chr14 102306997 102307520 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -2094 NM_001353830 5891 Hs.36859 NM_014226 ENSG00000080823 MOK RAGE|RAGE-1|RAGE1|STK30 MOK protein kinase protein-coding 151.667-190 chr20 31370907 31371326 + 0.666667 NA intron (NM_054112, intron 1 of 1) L2a|LINE|L2 2515 NM_054112 117285 Hs.274124 NM_054112 ENSG00000131068 DEFB118 C20orf63|DEFB-18|ESC42|ESP13.6 defensin beta 118 protein-coding 118.667-138 chr3 101191332 101191587 + 0.666667 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL 129116 NM_016247 50939 Hs.209249 NM_016247 ENSG00000081148 IMPG2 IPM200|RP56|SPACRCAN|VMD5 interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 protein-coding 208.333-128 chr6 76938198 76938821 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -344886 NR_149101 105377860 Hs.544542 NR_149101 ENSG00000236635 LINC02540 - long intergenic non-protein coding RNA 2540 ncRNA 151.333-407 chr8 40582905 40583253 + 0.666667 NA intron (NM_001135731, intron 4 of 5) LTR78|LTR|ERV1 -239716 NR_156738 112543493 NR_156738 SIRLNT lncRNA-PRLB SIRT1 regulating lncRNA tumor promoter ncRNA 121.333-126 chr4 31693790 31694087 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 187394 NR_149122 105374565 Hs.112715 NR_149121 LINC02501 - long intergenic non-protein coding RNA 2501 ncRNA 111.667-19 chr1 196313430 196313683 + 0.666667 NA intron (NM_001287820, intron 19 of 26) intron (NM_001287820, intron 19 of 26) -224841 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 149-10 chr1 159219319 159219673 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14621 NM_001122951 2532 Hs.153381 NM_002036 ENSG00000213088 ACKR1 CCBP1|CD234|DARC|DARC/ACKR1|Dfy|FY|GPD|GpFy|WBCQ1 atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group) protein-coding 147-2 chr1 55509920 55510225 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 284431 NR_039618 100616272 NR_039618 ENSG00000265822 MIR4422 mir-4422 microRNA 4422 ncRNA 157.333-224 chr3 12056417 12056817 + 0.666667 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) intron (NM_133625, intron 1 of 12) 52226 NM_133625 6854 Hs.445503 NM_003178 ENSG00000157152 SYN2 SYNII synapsin II protein-coding 136-41 chr16 82371896 82372150 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -201799 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 185.333-124 chr3 111424235 111424581 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -117789 NR_134917 10225 Hs.142023 NM_005816 ENSG00000153283 CD96 TACTILE CD96 molecule protein-coding 171.333-152 chr5 93638535 93638895 + 0.666667 NA intron (NM_032042, intron 10 of 10) AluSp|SINE|Alu -17927 NR_031754 100313887 NR_031754 ENSG00000284336 MIR2277 mir-2277 microRNA 2277 ncRNA 188.667-138 chr7 52833665 52834170 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201716 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 157.667-364 chrX 121830004 121830337 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 459198 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 170.333-71 chr14 47886993 47887356 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -92160 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 123-115 chr7 33401845 33402090 + 0.666667 NA intron (NM_001348037, intron 18 of 20) MER4D1|LTR|ERV1 272403 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 118.667-181 chr7 100950501 100950700 + 0.666667 NA intron (NM_005960, intron 1 of 11) intron (NM_005960, intron 1 of 11) 1066 NM_005960 4584 Hs.703577 NM_005960 ENSG00000169894 MUC3A MUC-3A|MUC3 mucin 3A, cell surface associated protein-coding 139.667-152 chr5 90008802 90009092 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 7773 NR_037433 100500825 NR_037433 ENSG00000264342 MIR3660 mir-3660 microRNA 3660 ncRNA 142.667-251 chrX 46720102 46720450 + 0.666667 NA intron (NM_001257291, intron 1 of 16) intron (NM_001257291, intron 1 of 16) 38842 NM_032591 84679 Hs.91389 NM_032591 ENSG00000065923 SLC9A7 MRX108|NHE-7|NHE7|SLC9A6 solute carrier family 9 member A7 protein-coding 133.333-124 chr4 30789762 30790134 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 69579 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 154.333-251 chr4 117396247 117396590 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31980 NR_125757 103689918 Hs.582062 NR_125757 LINC01378 - long intergenic non-protein coding RNA 1378 ncRNA 225.333-73 chr18 63407656 63408037 + 0.666667 NA intron (NM_004869, intron 3 of 10) intron (NM_004869, intron 3 of 10) 14630 NM_004869 9525 Hs.126550 NM_004869 ENSG00000119541 VPS4B MIG1|SKD1|SKD1B|VPS4-2 vacuolar protein sorting 4 homolog B protein-coding 147-141 chr8 104131103 104131481 + 0.666667 NA intron (NM_001348498, intron 19 of 24) intron (NM_001348498, intron 19 of 24) -92043 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 144-90 chr20 55855926 55856204 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 149454 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 284.333-20 chr18 71017916 71018619 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -367313 NR_160904 220158 Hs.448217 NM_178506 GTSCR1 - Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1 ncRNA 132.333-79 chr2 38867899 38868235 + 0.666667 NA intron (NM_001329963, intron 2 of 23) intron (NM_001329963, intron 2 of 23) 7867 NM_198963 90957 Hs.468226 NM_198963 ENSG00000163214 DHX57 DDX57 DExH-box helicase 57 protein-coding 169.333-120 chr2 88055840 88056346 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_016618) promoter-TSS (NM_016618) -310 NM_016618 51315 Hs.469254 NM_016618 ENSG00000172086 KRCC1 CHBP2 lysine rich coiled-coil 1 protein-coding 157-105 chr5 118103105 118103457 + 0.666667 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -179293 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 116-44 chr14 89406537 89406849 + 0.666667 NA intron (NM_001085471, intron 2 of 6) intron (NM_001085471, intron 2 of 6) 10540 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 147-113 chr5 106823855 106824169 + 0.666667 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 187002 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 119.667-78 chr2 31369347 31369636 + 0.666667 NA intron (NM_000379, intron 18 of 35) intron (NM_000379, intron 18 of 35) 45251 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 133.333-125 chr4 40365425 40365812 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30285 NM_017581 55584 Hs.272278 NM_017581 ENSG00000174343 CHRNA9 HSA243342|NACHRA9 cholinergic receptor nicotinic alpha 9 subunit protein-coding 140.667-227 chr8 75425924 75426163 + 0.666667 NA intron (NM_001330561, intron 1 of 11) intron (NM_001330561, intron 1 of 11) 18394 NM_001330561 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 113.667-44 chr12 101259494 101259715 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -20501 NM_014503 27340 Hs.295732 NM_014503 ENSG00000120800 UTP20 1A6/DRIM|DRIM UTP20 small subunit processome component protein-coding 138.333-150 chr5 78693233 78693578 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -44633 NM_005779 10184 Hs.79299 NM_005779 ENSG00000145685 LHFPL2 - LHFPL tetraspan subfamily member 2 protein-coding 152.333-159 chr18 22524224 22524573 + 0.666667 NA Intergenic BC200|scRNA|scRNA -106483 NM_172241 64693 Hs.406709 NM_022663 ENSG00000212710 CTAGE1 CT21.1|CT21.2|CTAGE|CTAGE-1|CTAGE-2 cutaneous T cell lymphoma-associated antigen 1 protein-coding 116-135 chr6 68020837 68021124 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34371 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 207.333-261 chr8 14488422 14488988 + 0.666667 NA intron (NM_001322881, intron 2 of 6) MER67D|LTR|ERV1 364805 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 182.667-52 chr15 70140328 70140779 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42636 NM_001282980 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 138-26 chr12 20292307 20292560 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -76812 NM_000921 5139 Hs.386791 NM_000921 ENSG00000172572 PDE3A CGI-PDE|CGI-PDE A|CGI-PDE-A|HTNB phosphodiesterase 3A protein-coding 126-78 chr3 186346109 186346449 + 0.666667 NA intron (NM_001346, intron 1 of 24) L1M6|LINE|L1 15955 NM_001080744 1608 Hs.683449 NM_001346 ENSG00000058866 DGKG DAGK3|DGK-GAMMA diacylglycerol kinase gamma protein-coding 147.667-7 chr1 89392480 89392840 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15019 NR_003133 400759 Hs.661968 NR_003133 ENSG00000225492 GBP1P1 - guanylate binding protein 1 pseudogene 1 pseudo 111.667-145 chr2 201712891 201713113 + 0.666667 NA intron (NM_020919, intron 25 of 33) L1MD2|LINE|L1 -14358 NM_033066 58538 Hs.63085 NM_033066 ENSG00000082126 MPP4 ALS2CR5|DLG6 membrane palmitoylated protein 4 protein-coding 167.333-212 chr5 98371235 98371570 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -210163 NR_146477 105379098 Hs.566306 NR_146477 LINC01846 - long intergenic non-protein coding RNA 1846 ncRNA 162.333-212 chr6 24317835 24318192 + 0.666667 NA intron (NM_016356, intron 2 of 9) L1MC4a|LINE|L1 -38890 NM_181337 353219 Hs.697888 NM_181337 ENSG00000146049 KAAG1 RU2AS kidney associated antigen 1 protein-coding 239.333-41 chr17 59520116 59520695 + 0.666667 NA intron (NR_110813, intron 1 of 2) L1MB3|LINE|L1 6452 NR_110813 101927728 Hs.569720 NR_110813 ENSG00000265313 LINC01476 - long intergenic non-protein coding RNA 1476 ncRNA 155-138 chrX 85472135 85472511 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -92658 NM_001307940 79983 Hs.267038 NM_024921 ENSG00000124429 POF1B POF|POF2B POF1B actin binding protein protein-coding 120-21 chr11 75267823 75268015 + 0.666667 NA intron (NM_004041, intron 14 of 15) intron (NM_004041, intron 14 of 15) 27145 NM_001195528 100507050 Hs.577323 NM_001195528 ENSG00000261594 TPBGL - trophoblast glycoprotein like protein-coding 132-123 chr9 37306803 37307137 + 0.666667 NA intron (NR_110317, intron 4 of 7) AluSx1|SINE|Alu -115726 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 190.333-72 chr2 103613566 103613971 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -629339 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 118.667-197 chr8 121955055 121955394 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -313784 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 160-64 chr20 33905802 33906123 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -87949 NM_016732 22913 Hs.136947 NM_007367 ENSG00000125970 RALY HNRPCL2|P542 RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein-coding 137.667-140 chr4 72977323 72977621 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 92244 NM_173827 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 182-3 chr1 68912927 68913322 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -142774 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 170-20 chr11 110080002 110080429 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -13177 NM_033390 85463 Hs.376289 NM_033390 ENSG00000149289 ZC3H12C MCPIP3 zinc finger CCCH-type containing 12C protein-coding 149-40 chr14 26030832 26031242 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 522393 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 158.333-319 chr8 79075114 79075582 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 237819 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 128.333-5 chr1 100866464 100866719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28251 NM_001033025 2135 Hs.357637 NM_001439 ENSG00000162694 EXTL2 EXTR2 exostosin like glycosyltransferase 2 protein-coding 143.667-117 chr18 70308044 70308411 + 0.666667 NA intron (NM_004232, intron 1 of 1) L1M4|LINE|L1 19182 NM_004232 9306 Hs.44439 NM_004232 ENSG00000170677 SOCS6 CIS-4|CIS4|HSPC060|SOCS-4|SOCS-6|SOCS4|SSI4|STAI4|STATI4 suppressor of cytokine signaling 6 protein-coding 188.667-2 chr1 46575486 46575784 + 0.666667 NA intron (NM_198973, intron 5 of 11) intron (NM_198973, intron 5 of 11) -23978 NM_001322255 148930 Hs.350764 NM_182516 ENSG00000162456 KNCN Kino|L5 kinocilin protein-coding 158-24 chr11 55720994 55721389 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -52247 NM_001001967 390142 Hs.553743 NM_001001967 ENSG00000279761 OR5D13 - olfactory receptor family 5 subfamily D member 13 (gene/pseudogene) protein-coding 140.333-113 chr2 190916790 190917181 + 0.666667 NA intron (NM_014905, intron 7 of 17) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 36164 NM_014905 2744 Hs.116448 NM_014905 ENSG00000115419 GLS AAD20|CASGID|EIEE71|GAC|GAM|GDPAG|GLS1|KGA glutaminase protein-coding 163.667-74 chr16 12543118 12543451 + 0.666667 NA intron (NM_032167, intron 20 of 20) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -177037 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 157-126 chr8 21975581 21976027 + 0.666667 NA intron (NM_015024, intron 6 of 27) intron (NM_015024, intron 6 of 27) -48330 NM_001286680 10361 Hs.131055 NM_182795 ENSG00000158806 NPM2 - nucleophosmin/nucleoplasmin 2 protein-coding 122-61 chr20 19616937 19617178 + 0.666667 NA intron (NM_020689, intron 6 of 16) intron (NM_020689, intron 6 of 16) -269464 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 143-4 chr1 40926377 40926664 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53176 NM_001905 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 132.333-178 chr8 76157715 76158078 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -248758 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 121.333-107 chr22 32851727 32851950 + 0.666667 NA intron (NM_000362, intron 2 of 4) intron (NM_000362, intron 2 of 4) 51022 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 164.667-188 chr5 64750445 64750834 + 0.666667 NA intron (NM_173829, intron 2 of 4) L2|LINE|L2 18052 NM_173829 285672 Hs.69504 NM_173829 ENSG00000153006 SREK1IP1 P18SRP|SFRS12IP1 SREK1 interacting protein 1 protein-coding 112.333-84 chr16 62787566 62787746 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -751218 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 175.667-12 chr1 207880881 207881310 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001025109, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001025109, exon 8 of 8) 30030 NM_001025109 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 143-114 chr7 38469280 38469701 + 0.666667 NA intron (NM_001635, intron 7 of 20) intron (NM_001635, intron 7 of 20) 127913 NR_040085 100506776 Hs.173034 NR_040085 ENSG00000281103 TRG-AS1 TCRGV T cell receptor gamma locus antisense RNA 1 ncRNA 150.667-53 chr10 117763282 117763588 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -218367 NR_002791 196047 Hs.312592 NR_002791 ENSG00000229847 EMX2OS EMX2-AS1|NCRNA00045 EMX2 opposite strand/antisense RNA ncRNA 166.333-94 chr18 1630811 1631154 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 -271353 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 196.333-143 chr5 82274954 82275479 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001025, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001025, exon 4 of 4) 3138 NM_001025 6228 Hs.527193 NM_001025 ENSG00000186468 RPS23 BTDD|MABAS|MCINS|PAMAS|S23|uS12 ribosomal protein S23 protein-coding 131.333-99 chr20 17719317 17719572 + 0.666667 NA intron (NM_001014977, intron 1 of 2) MIR3|SINE|MIR 19496 NM_178477 140836 Hs.115366 NM_178477 ENSG00000125888 BANF2 BAF-L|BAF2|BAFL|C20orf179 barrier to autointegration factor 2 protein-coding 159.667-300 chr7 49946165 49946537 + 0.666667 NA intron (NM_001159878, intron 7 of 7) L1M1|LINE|L1 146895 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 146-16 chr11 70077657 70078083 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_018043) promoter-TSS (NM_018043) -670 NM_018043 55107 Hs.503074 NM_018043 ENSG00000131620 ANO1 DOG1|ORAOV2|TAOS2|TMEM16A anoctamin 1 protein-coding 205.667-35 chr12 76275356 76275801 + 0.666667 NA intron (NR_146531, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 15695 NR_146531 105369848 NR_146531 LNCOG LINC02407|lncRNA-OG lncRNA osteogenesis associated ncRNA 180.667-148 chr8 113773582 113773972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -336838 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 205.667-73 chr2 106058046 106058356 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7487 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 137.667-27 chr10 68941984 68942359 + 0.666667 NA intron (NM_024045, intron 13 of 14) intron (NM_024045, intron 13 of 14) -13999 NM_004728 9188 Hs.223141 NM_004728 ENSG00000165732 DDX21 GUA|GURDB|RH-II/GU|RH-II/GuA DExD-box helicase 21 protein-coding 127-37 chr17 21207593 21207889 + 0.666667 NA intron (NM_003876, intron 1 of 1) AluSq10|SINE|Alu 6854 NR_024547 8834 Hs.592945 NM_003876 ENSG00000178307 TMEM11 C17orf35|PM1|PMI transmembrane protein 11 protein-coding 195-63 chr2 156285412 156285854 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30702 NR_110250 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 138.333-23 chr10 27767974 27768250 + 0.666667 NA TTS (NR_121652) TTS (NR_121652) -22293 NM_173576 283078 Hs.128193 NM_173576 ENSG00000150051 MKX C10orf48|IFRX|IRXL1 mohawk homeobox protein-coding 213.333-213 chr8 126441809 126442364 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 116392 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 160-123 chr8 112857254 112857668 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 9 of 66) intron (NM_001363185, intron 9 of 66) 213968 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 150.667-220 chr21 28747881 28748253 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 137300 NM_013240 29104 Hs.163846 NM_013240 ENSG00000156239 N6AMT1 C21orf127|HEMK2|MTQ2|N6AMT|PRED28|m.HsaHemK2P N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 protein-coding 159.333-6 chr1 47282426 47282845 + 0.666667 NA intron (NM_001282938, intron 12 of 18) intron (NM_001282938, intron 12 of 18) 31512 NM_003035 6491 Hs.525198 NM_003035 ENSG00000123473 STIL MCPH7|SIL STIL centriolar assembly protein protein-coding 131.333-145 chr5 122854619 122854844 + 0.666667 NA intron (NM_014035, intron 1 of 6) L1MC5|LINE|L1 9118 NM_014035 28966 Hs.483200 NM_014035 ENSG00000064652 SNX24 PRO1284|SBBI31 sorting nexin 24 protein-coding 236.666-10 chr13 50415056 50415697 + 0.666667 NA intron (NR_109974, intron 3 of 6) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 112073 NR_125753 103689915 Hs.722230 NR_125753 ENSG00000186047 DLEU1-AS1 LINC01308 DLEU1 antisense RNA 1 ncRNA 140.333-208 chr6 121602485 121602762 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 166977 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 187.667-135 chr7 77997685 77998010 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1|LTR|ERVL-MaLR 157717 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 133.667-81 chr2 174274465 174274760 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26080 NM_001328688 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 118-123 chr7 42564563 42564765 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 141783 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 175.667-48 chr15 61037916 61038286 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 191201 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 213.667-81 chr6 44198805 44199335 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -17856 NM_001315494 101929726 Hs.438979 NM_001315494 ENSG00000262179 MYMX MINION|hMINION myomixer, myoblast fusion factor protein-coding 199.667-113 chr5 65250445 65250808 + 0.666667 NA intron (NR_135689, intron 15 of 25) intron (NR_135689, intron 15 of 25) 231294 NM_197941 11174 Hs.482291 NM_197941 ENSG00000049192 ADAMTS6 ADAM-TS 6|ADAM-TS6|ADAMTS-6 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 6 protein-coding 203.667-77 chr3 48082855 48083231 + 0.666667 NA intron (NM_002375, intron 1 of 18) L1MD3|LINE|L1 5805 NM_001134364 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 172.667-119 chr5 2801693 2802145 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49788 NM_178569 153571 Hs.148486 NM_178569 ENSG00000186493 C5orf38 CEI|IRX2NB chromosome 5 open reading frame 38 protein-coding 118.333-109 chr2 101857139 101857475 + 0.666667 NA intron (NM_145686, intron 13 of 30) intron (NM_145686, intron 13 of 30) -126158 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 155.667-231 chr3 140728267 140728562 + 0.666667 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 50350 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 149.333-149 chr17 70765207 70765526 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 436813 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 186.667-81 chr20 6952782 6953294 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 185352 NM_001200 650 Hs.73853 NM_001200 ENSG00000125845 BMP2 BDA2|BMP2A|SSFSC bone morphogenetic protein 2 protein-coding 128.667-162 chr6 132031005 132031307 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -79784 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 192.333-107 chr21 26907951 26908374 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45799 NR_039916 100616243 NR_039916 ENSG00000266133 MIR4759 - microRNA 4759 ncRNA 182-11 chr1 156304143 156304527 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -4698 NM_001004319 391104 Hs.532378 NM_001004319 ENSG00000189030 VHLL VHLP|VLP VHL like protein-coding 131.667-116 chr21 26577600 26577905 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4466 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 198-39 chr12 116221082 116221584 + 0.666667 NA intron (NM_015335, intron 2 of 30) AluJb|SINE|Alu 55853 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 119.333-114 chr18 12499328 12499580 + 0.666667 NA intron (NM_020148, intron 6 of 15) L1M4|LINE|L1 66680 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 149 chr1 61672742 61673086 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 18672 NR_073400 414927 Hs.123471 NR_073400 MGC34796 - sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) pseudogene pseudo 264.667-33 chr15 93510550 93511019 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 304718 NM_001365393 105370980 NM_001365393 LOC105370980 - putative uncharacterized protein UNQ9370/PRO34162 protein-coding 153.667-295 chr4 80430143 80430455 + 0.666667 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) L2-3_Crp|LINE|L2 94579 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 113.333-34 chr10 95901845 95902073 + 0.666667 NA intron (NR_038444, intron 2 of 5) intron (NR_038444, intron 2 of 5) -6006 NM_001349008 387707 Hs.652240 NM_001001732 ENSG00000188649 CC2D2B C10orf130|C10orf131 coiled-coil and C2 domain containing 2B protein-coding 184-32 chr15 71478075 71478460 + 0.666667 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -68969 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 185.333-181 chr8 38168642 38169040 + 0.666667 NA intron (NR_045492, intron 2 of 2) intron (NR_045492, intron 2 of 2) 7652 NM_014462 27257 Hs.425311 NM_014462 ENSG00000175324 LSM1 CASM|YJL124C LSM1 homolog, mRNA degradation associated protein-coding 158.667-246 chr4 102792247 102792586 + 0.666667 NA intron (NR_125932, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 15379 NR_125932 102723704 Hs.638374 NR_125932 LOC102723704 - uncharacterized LOC102723704 ncRNA 123.333-211 chr8 95006911 95007212 + 0.666667 NA intron (NM_001354522, intron 3 of 11) intron (NM_001354522, intron 3 of 11) -17914 NM_001354530 137682 Hs.435500 NM_152416 ENSG00000156170 NDUFAF6 C8orf38|MC1DN17 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6 protein-coding 186-65 chr3 98225017 98225432 + 0.666667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -39020 NM_001005479 79295 Hs.554712 NM_001005479 ENSG00000230301 OR5H6 OR3-11 olfactory receptor family 5 subfamily H member 6 (gene/pseudogene) protein-coding 122-50 chr2 62131327 62131554 + 0.666667 NA intron (NM_001321781, intron 2 of 2) intron (NM_001321781, intron 2 of 2) -64675 NM_006577 10678 Hs.173203 NM_006577 ENSG00000170340 B3GNT2 3-Gn-T1|3-Gn-T2|B3GN-T2|B3GNT|B3GNT-2|B3GNT1|BETA3GNT|BGNT2|BGnT-2|beta-1|beta3Gn-T1|beta3Gn-T2 UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 protein-coding 113.333-103 chr17 73821714 73822021 + 0.666667 NA intron (NR_027146, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 6670 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 145-89 chr5 38982157 38982444 + 0.666667 NA intron (NM_001285439, intron 7 of 38) L1M4|LINE|L1 92099 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 181.667-63 chr2 26612041 26612402 + 0.666667 NA intron (NM_001029881, intron 3 of 6) intron (NM_001029881, intron 3 of 6) 29145 NM_001029881 130106 Hs.591579 NM_001029881 ENSG00000157884 CIB4 KIP4 calcium and integrin binding family member 4 protein-coding 113.333-172 chr3 55173357 55173537 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -4725 NR_147142 105377096 Hs.640507 NR_147142 ENSG00000243572 LINC02017 - long intergenic non-protein coding RNA 2017 ncRNA 165.667-82 chr19 56703710 56704188 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -32192 NM_001005850 90485 Hs.458438 NM_001005850 ENSG00000127903 ZNF835 BC37295_3 zinc finger protein 835 protein-coding 221.333-19 chr10 101471548 101472128 + 0.666667 NA intron (NM_003939, intron 2 of 13) L1ME2|LINE|L1 116419 NM_001174084 27343 Hs.523230 NM_013274 ENSG00000166169 POLL BETAN|POLKAPPA DNA polymerase lambda protein-coding 143.333-18 chr1 234244245 234244613 + 0.666667 NA intron (NM_173508, intron 3 of 7) intron (NM_173508, intron 3 of 7) 30218 NM_001300845 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 196-153 chr5 123438060 123438501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14688 NM_153223 153241 Hs.483209 NM_153223 ENSG00000168944 CEP120 CCDC100|JBTS31|SRTD13 centrosomal protein 120 protein-coding 133-90 chr8 31885595 31885914 + 0.666667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -139982 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 115.667-206 chr8 41940591 41940869 + 0.666667 NA intron (NM_006766, intron 15 of 16) intron (NM_006766, intron 15 of 16) -43989 NM_001142446 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 141.333-186 chr5 35129152 35129497 + 0.666667 NA intron (NM_000949, intron 1 of 9) intron (NM_000949, intron 1 of 9) -11202 NM_001204316 5618 Hs.368587 NM_000949 ENSG00000113494 PRLR HPRL|MFAB|RI-PRLR|hPRLrI prolactin receptor protein-coding 140.333-188 chr5 123087532 123087829 + 0.666667 NA non-coding (NR_146771, exon 2 of 2) non-coding (NR_146771, exon 2 of 2) -1561 NM_001136239 93166 Hs.135118 NM_001136239 ENSG00000061455 PRDM6 KMT8C|PDA3|PRISM PR/SET domain 6 protein-coding 226.333-84 chr4 1748329 1748844 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27065 NM_006342 10460 Hs.104019 NM_006342 ENSG00000013810 TACC3 ERIC-1|ERIC1 transforming acidic coiled-coil containing protein 3 protein-coding 164.667-144 chr3 28957348 28957693 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 323419 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 183-25 chr12 29758366 29758779 + 0.666667 NA intron (NM_001367875, intron 3 of 19) intron (NM_001367875, intron 3 of 19) 25370 NM_001367875 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 175-9 chr10 28802555 28802890 + 0.666667 NA intron (NR_120652, intron 2 of 3) AluJo|SINE|Alu -6672 NR_038374 100507605 Hs.119207 NR_038374 ENSG00000235824 LINC00837 - long intergenic non-protein coding RNA 837 ncRNA 189.333-139 chr3 188066563 188067006 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87114 NM_001167672 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 165-45 chr2 231499492 231499969 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 14609 NR_024079 151477 Hs.375211 NM_173513 ENSG00000181798 LINC00471 C2orf52 long intergenic non-protein coding RNA 471 ncRNA 151-116 chr6 79098792 79099208 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20746 NM_017934 55023 Hs.511817 NM_017934 ENSG00000146247 PHIP BRWD2|DCAF14|DIDOD|WDR11|ndrp pleckstrin homology domain interacting protein protein-coding 135.333-95 chr2 186019842 186020238 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 66277 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 165.333-206 chr5 63494200 63494581 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 467902 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 113.667-142 chr3 121128945 121129216 + 0.666667 NA intron (NR_145517, intron 7 of 8) ERVL-E-int|LTR|ERVL 79440 NR_049861 100847043 NR_049861 ENSG00000264477 MIR5682 - microRNA 5682 ncRNA 114.667-246 chr8 100956448 100956713 + 0.666667 NA Intergenic LTR12E|LTR|ERV1 -3198 NM_003406 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 121.667-173 chr5 167525588 167525798 + 0.666667 NA intron (NM_001122679, intron 3 of 29) intron (NM_001122679, intron 3 of 29) -47966 NM_001368146 57451 Hs.631957 NM_001080428 ENSG00000145934 TENM2 ODZ2|TEN-M2|TNM2|ten-2 teneurin transmembrane protein 2 protein-coding 167.667-176 chr5 154324946 154325277 + 0.666667 NA intron (NM_198321, intron 3 of 11) L1MC5a|LINE|L1 -21995 NR_031626 100302181 NR_031626 ENSG00000221430 MIR1294 MIRN1294|hsa-mir-1294|mir-1294 microRNA 1294 ncRNA 178.333-135 chr5 20085739 20086149 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -97744 NM_001349561 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 178-71 chr2 240584620 240585069 + 0.666667 NA non-coding (NR_103792, exon 1 of 1) non-coding (NR_103792, exon 1 of 1) 1472 NR_103792 101752400 Hs.585987 NR_103792 ENSG00000260942 CAPN10-DT CAPN10-AS1|locus959 CAPN10 divergent transcript ncRNA 191.667-13 chr10 35226714 35227128 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -20104 NM_181698 219771 Hs.14745 NM_145012 ENSG00000108100 CCNY C10orf9|CBCP1|CCNX|CFP1 cyclin Y protein-coding 146-12 chr10 78775130 78775419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 292174 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 140.333-138 chr3 45878826 45879082 + 0.666667 NA intron (NM_001276379, intron 2 of 9) L1MC1|LINE|L1 -7550 NM_001256369 10803 Hs.225946 NM_006641 ENSG00000173585 CCR9 CC-CKR-9|CDw199|GPR-9-6|GPR28 C-C motif chemokine receptor 9 protein-coding 193.333-22 chr10 44402905 44403415 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18063 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 161.667-247 chr8 65615358 65615752 + 0.666667 NA intron (NM_018120, intron 3 of 6) AluSx1|SINE|Alu 18622 NM_018120 55156 Hs.269542 NM_018120 ENSG00000104442 ARMC1 Arcp armadillo repeat containing 1 protein-coding 167-80 chr4 140952447 140952846 + 0.666667 NA intron (NM_020724, intron 2 of 6) intron (NM_020724, intron 2 of 6) 180823 NM_020724 57484 Hs.659104 NM_020724 ENSG00000170153 RNF150 - ring finger protein 150 protein-coding 128-98 chr5 173364360 173364691 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 17070 NR_107023 102465862 NR_107023 ENSG00000274994 MIR8056 hsa-mir-8056 microRNA 8056 ncRNA 127.667-22 chr10 113489541 113489855 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -61133 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 116-23 chr10 108279610 108279870 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -210447 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 146.667-339 chr8 119798687 119798936 + 0.666667 NA intron (NM_003184, intron 6 of 25) intron (NM_003184, intron 6 of 25) 34030 NM_003184 6873 Hs.122752 NM_003184 ENSG00000064313 TAF2 CIF150|MRT40|TAF2B|TAFII150 TATA-box binding protein associated factor 2 protein-coding 150-74 chr2 69825397 69825722 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001320702, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001320702, exon 13 of 13) -4101 NM_178439 64395 Hs.293971 NM_178439 ENSG00000087338 GMCL1 BTBD13|GCL|GCL1|SPATA29 germ cell-less 1, spermatogenesis associated protein-coding 153.333-128 chr14 72981112 72981414 + 0.666667 NA intron (NM_178441, intron 2 of 8) MER5B|DNA|hAT-Charlie 5693 NM_178441 53349 Hs.335106 NM_021260 ENSG00000165861 ZFYVE1 DFCP1|PPP1R172|SR3|TAFF1|ZNFN2A1 zinc finger FYVE-type containing 1 protein-coding 186.667-126 chr6 71540540 71540971 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 119728 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 148.333-141 chr15 67356652 67356962 + 0.666667 NA intron (NM_001031715, intron 6 of 20) intron (NM_001031715, intron 6 of 20) -101609 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 179.333-110 chr20 3909356 3909727 + 0.666667 NA TTS (NM_001324192) TTS (NM_001324192) -7953 NR_029519 406896 NR_029519 ENSG00000199024 MIR103A2 MIR103-2|MIRN103-2|mir-103a-2 microRNA 103a-2 ncRNA 132.333-168 chr7 78937888 78938156 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -70966 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 127-78 chr6 35203798 35204092 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10011 NM_152753 222663 Hs.12923 NM_152753 ENSG00000146197 SCUBE3 CEGF3 signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3 protein-coding 162.667-288 chr8 139864413 139864749 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 21 of 22) MIRb|SINE|MIR -161458 NM_001282534 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 134.667-137 chr3 87997511 87997832 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15095 NM_000866 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 132.333-45 chr13 71435429 71435678 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 420412 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 299.667-7 chr14 37394854 37395414 + 0.666667 NA intron (NM_138731, intron 11 of 13) L1PB1|LINE|L1 197197 NM_138731 145282 Hs.660396 NM_138731 ENSG00000151338 MIPOL1 CCDC193 mirror-image polydactyly 1 protein-coding 167.333-29 chr1 193949499 193949888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 644948 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 121-84 chr20 41963626 41963820 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -345346 NM_032221 84181 Hs.740645 NM_032221 ENSG00000124177 CHD6 CHD-6|CHD5|RIGB chromodomain helicase DNA binding protein 6 protein-coding 170.333-224 chr8 128486144 128486502 + 0.666667 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) MIRc|SINE|MIR 78356 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 125.333-157 chr6 73037368 73037591 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 2 of 13) L1MD2|LINE|L1 -69726 NR_036244 100423005 NR_036244 ENSG00000266180 MIR4282 - microRNA 4282 ncRNA 205-94 chr8 31800264 31800783 + 0.666667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) 160771 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 256.333-24 chr12 73416646 73417215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 257740 NR_110130 101928137 Hs.694666 NR_110130 ENSG00000258123 LINC02444 - long intergenic non-protein coding RNA 2444 ncRNA 153.667-28 chr1 211714413 211714643 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38766 NR_148994 91548 Hs.367839 NR_148994 LOC91548 - uncharacterized LOC91548 ncRNA 171.667-182 chr9 98846818 98847147 + 0.666667 NA intron (NM_024642, intron 9 of 9) intron (NM_024642, intron 9 of 9) 39312 NM_024642 79695 Hs.47099 NM_024642 ENSG00000119514 GALNT12 CRCS1|GalNAc-T12 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 protein-coding 278-58 chr7 73582595 73583275 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -4356 NM_001362661 26608 Hs.647044 NM_012453 ENSG00000106638 TBL2 WBSCR13|WS-betaTRP transducin beta like 2 protein-coding 120.333-59 chr15 63956863 63957156 + 0.666667 NA intron (NM_014326, intron 4 of 11) L1MA3|LINE|L1 28735 NR_120344 101928988 Hs.673214 NR_120344 ENSG00000259351 LOC101928988 - uncharacterized LOC101928988 ncRNA 165.333-217 chr5 165503496 165503839 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1033388 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 113-143 chr3 131588224 131588470 + 0.666667 NA intron (NM_130808, intron 7 of 15) intron (NM_130808, intron 7 of 15) -85376 NM_007208 11222 Hs.205163 NM_007208 ENSG00000114686 MRPL3 COXPD9|MRL3|RPML3 mitochondrial ribosomal protein L3 protein-coding 143-119 chr7 50285770 50286122 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18118 NM_001291839 10320 Hs.435949 NM_006060 ENSG00000185811 IKZF1 CVID13|Hs.54452|IK1|IKAROS|LYF1|LyF-1|PPP1R92|PRO0758|ZNFN1A1 IKAROS family zinc finger 1 protein-coding 119.333-136 chr2 199444190 199444461 + 0.666667 NA intron (NM_001172509, intron 2 of 10) intron (NM_001172509, intron 2 of 10) 13614 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 128-76 chr4 15880047 15880295 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58569 NM_005130 9982 Hs.1690 NM_005130 ENSG00000137440 FGFBP1 FGF-BP|FGF-BP1|FGFBP|FGFBP-1|HBP17 fibroblast growth factor binding protein 1 protein-coding 186.667-46 chr16 26784344 26784859 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -282326 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 111.667-255 chr8 83421259 83421469 + 0.666667 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL 17606 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 152.667-371 chr8 76509417 76509725 + 0.666667 NA intron (NR_105006, intron 3 of 5) L1MEg|LINE|L1 102917 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 144-5 chr1 96590018 96590368 + 0.666667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -131412 NM_001300988 58155 Hs.596061 NM_021190 ENSG00000117569 PTBP2 PTBLP|brPTB|nPTB polypyrimidine tract binding protein 2 protein-coding 130.333-62 chr13 88892313 88892600 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 265603 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 132.333-129 chr5 30003716 30004005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 123300 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 113.667-48 chr12 129978186 129978520 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 63989 NR_024457 100190940 Hs.625993 NR_024457 ENSG00000214039 LINC02418 - long intergenic non-protein coding RNA 2418 ncRNA 142-158 chr8 128107511 128107855 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -42433 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 123.667-160 chr5 88045822 88046089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 222890 NM_001289007 153396 Hs.379972 NM_153354 ENSG00000164180 TMEM161B FLB3342|PRO1313 transmembrane protein 161B protein-coding 161.667-21 chr1 214775391 214775818 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 172409 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 135.667-73 chr17 29948951 29949248 + 0.666667 NA intron (NR_026738, intron 3 of 15) intron (NR_026738, intron 3 of 15) 7465 NM_198529 374786 Hs.662411 NM_198529 ENSG00000176927 EFCAB5 - EF-hand calcium binding domain 5 protein-coding 130.333-218 chr9 29043366 29043703 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) -154579 NR_030618 100126316 NR_030618 ENSG00000215939 MIR873 MIRN873|hsa-mir-873|mir-873 microRNA 873 ncRNA 144-62 chr17 40412010 40412434 + 0.666667 NA intron (NM_001067, intron 7 of 34) intron (NM_001067, intron 7 of 34) 5674 NM_001067 7153 Hs.156346 NM_001067 ENSG00000131747 TOP2A TOP2|TP2A DNA topoisomerase II alpha protein-coding 132.333-98 chr2 219805411 219805715 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 99326 NR_146975 105373889 Hs.570066 NR_146975 ENSG00000228909 LINC01803 - long intergenic non-protein coding RNA 1803 ncRNA 139-5 chr1 112305646 112306034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90374 NM_018704 55917 Hs.744100 NM_018704 ENSG00000143079 CTTNBP2NL - CTTNBP2 N-terminal like protein-coding 170.333-128 chr20 57139671 57140091 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73815 NR_110631 102723590 Hs.667674 NR_110631 BMP7-AS1 - BMP7 antisense RNA 1 ncRNA 190-82 chr3 120561615 120561976 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34541 NM_004547 4710 Hs.304613 NM_004547 ENSG00000065518 NDUFB4 B15|CI-B15 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 protein-coding 152-10 chr1 192718985 192719290 + 0.666667 NA Intergenic MER75|DNA|PiggyBac 2809 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 114.667-211 chr5 82686461 82686725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -153562 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 221.333-72 chr2 194214648 194215266 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -129312 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 135-89 chr5 129777575 129777926 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 29656 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 140.667-199 chr6 98693629 98693935 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 137918 NR_148381 105447646 Hs.211213 NR_148381 PNKY - long intergenic non-protein coding RNA PNKY ncRNA 156.333-78 chr12 50634444 50634769 + 0.666667 NA intron (NM_173602, intron 2 of 37) L2a|LINE|L2 -129495 NM_005171 466 Hs.648565 NM_005171 ENSG00000123268 ATF1 EWS-ATF1|FUS/ATF-1|TREB36 activating transcription factor 1 protein-coding 154-76 chr2 10736328 10736733 + 0.666667 NA intron (NM_001039362, intron 3 of 13) L1M5|LINE|L1 14900 NM_144583 245973 Hs.580464 NM_144583 ENSG00000143882 ATP6V1C2 ATP6C2|VMA5 ATPase H+ transporting V1 subunit C2 protein-coding 230.667-41 chr2 108885996 108886579 + 0.666667 NA TTS (NR_147236) TTS (NR_147236) 99516 NM_144978 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 150-129 chr7 20648341 20648784 + 0.666667 NA intron (NM_001163942, intron 2 of 5) Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger 1232 NM_178559 340273 Hs.404102 NM_178559 ENSG00000004846 ABCB5 ABCB5alpha|ABCB5beta|EST422562 ATP binding cassette subfamily B member 5 protein-coding 166-125 chr9 96662049 96662424 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-B4-int|LTR|ERVL -6919 NM_153698 195827 Hs.44640 NM_153698 ENSG00000158122 PRXL2C AAED1|C9orf21 peroxiredoxin like 2C protein-coding 148-42 chr14 74097322 74097718 + 0.666667 NA intron (NM_001024674, intron 3 of 5) AluSz6|SINE|Alu 12567 NM_001024674 91750 Hs.612866 NM_001024674 ENSG00000205659 LIN52 C14orf46|c14_5549 lin-52 DREAM MuvB core complex component protein-coding 204.333-150 chr4 185647115 185647707 + 0.666667 NA intron (NM_001145672, intron 9 of 20) AluJr|SINE|Alu 9335 NM_001145675 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 203.667-101 chr5 147420051 147420505 + 0.666667 NA intron (NM_001197294, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR 33414 NM_001387 1809 Hs.519659 NM_001387 ENSG00000113657 DPYSL3 CRMP-4|CRMP4|DRP-3|DRP3|LCRMP|ULIP|ULIP-1 dihydropyrimidinase like 3 protein-coding 115.333-141 chr3 81353942 81354124 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 360165 NR_132411 728290 Hs.563132 NR_132411 ENSG00000243694 LINC02027 - long intergenic non-protein coding RNA 2027 ncRNA 132.333-58 chr15 39516783 39516997 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -64189 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 165.667-175 chr6 45022498 45022839 + 0.666667 NA intron (NM_001350327, intron 2 of 9) intron (NM_001350327, intron 2 of 9) 175102 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 225.333-4 chr1 62862123 62862521 + 0.666667 NA intron (NM_178221, intron 10 of 10) intron (NM_178221, intron 10 of 10) 78190 NM_032852 84938 Hs.7353 NM_032852 ENSG00000125703 ATG4C APG4-C|APG4C|AUTL1|AUTL3 autophagy related 4C cysteine peptidase protein-coding 243-18 chr14 99596975 99597517 + 0.666667 NA intron (NM_001144995, intron 1 of 5) intron (NM_001144995, intron 1 of 5) 6961 NM_001144995 317762 Hs.709288 NM_001144995 ENSG00000205476 CCDC85C - coiled-coil domain containing 85C protein-coding 123.667-21 chr1 176109243 176109468 + 0.666667 NA intron (NM_022457, intron 9 of 19) intron (NM_022457, intron 9 of 19) 97889 NM_001286644 64326 Hs.523744 NM_022457 ENSG00000143207 COP1 RFWD2|RNF200 COP1 E3 ubiquitin ligase protein-coding 131.667-177 chr6 168311880 168312157 + 0.666667 NA intron (NM_001286351, intron 1 of 5) intron (NM_001286351, intron 1 of 5) 7759 NM_214462 168002 Hs.673059 NM_214462 ENSG00000164488 DACT2 C6orf116|DAPPER2|DPR2|bA503C24.7 dishevelled binding antagonist of beta catenin 2 protein-coding 122-83 chr4 31782413 31782748 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -214799 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 129.333-17 chr10 44134408 44134751 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -158171 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 113-19 chr10 63104090 63104350 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -29027 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 148.667-151 chr16 85142759 85143097 + 0.666667 NA intron (NR_033984, intron 1 of 2) intron (NR_033984, intron 1 of 2) 5778 NR_033984 400548 Hs.592054 NR_033984 ENSG00000278214 LINC02139 - long intergenic non-protein coding RNA 2139 ncRNA 132.333-107 chr21 33961535 33961891 + 0.666667 NA intron (NR_134558, intron 2 of 2) (TAGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -14669 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 177.667-76 chr2 149532393 149532777 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -54773 NR_110240 101929231 Hs.5324 NR_110240 ENSG00000231969 LOC101929231 - uncharacterized LOC101929231 ncRNA 112-183 chr6 46494004 46494223 + 0.666667 NA intron (NR_125837, intron 1 of 2) L1MC1|LINE|L1 -2046 NM_001251973 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 182.333-54 chr15 56730618 56731004 + 0.666667 NA intron (NM_001002843, intron 1 of 20) intron (NM_001002843, intron 1 of 20) 3275 NM_001002844 54816 Hs.511477 NM_017661 ENSG00000137871 ZNF280D SUHW4|ZNF634 zinc finger protein 280D protein-coding 113-187 chr6 142904245 142904472 + 0.666667 NA intron (NM_006734, intron 1 of 9) intron (NM_006734, intron 1 of 9) 40818 NM_006734 3097 Hs.510172 NM_006734 ENSG00000010818 HIVEP2 HIV-EP2|MBP-2|MIBP1|MRD43|SHN2|ZAS2|ZNF40B human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 protein-coding 112.333-248 chr7 54816726 54816971 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 57535 NR_110040 100996654 Hs.127991 NR_110040 LOC100996654 - uncharacterized LOC100996654 ncRNA 142.667-84 chr18 62221874 62222168 + 0.666667 NA intron (NR_144409, intron 5 of 31) intron (NR_144409, intron 5 of 31) 34766 NR_144406 57614 Hs.465323 NM_020854 ENSG00000134444 RELCH HsT3308|HsT885|KIAA1468 RAB11 binding and LisH domain, coiled-coil and HEAT repeat containing protein-coding 214.667-7 chr1 224487220 224487741 + 0.666667 NA intron (NM_001322302, intron 2 of 6) intron (NM_001322302, intron 2 of 6) 52631 NR_136297 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 202.333-152 chr6 45898852 45899359 + 0.666667 NA non-coding (NR_045672, exon 3 of 3) non-coding (NR_045672, exon 3 of 3) 38492 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 186.333-28 chr11 63949003 63949464 + 0.666667 NA intron (NM_024771, intron 3 of 7) MIR|SINE|MIR 9902 NM_001300800 79829 Hs.523753 NM_024771 ENSG00000110583 NAA40 NAT11|NatD|PATT1|hNatD N(alpha)-acetyltransferase 40, NatD catalytic subunit protein-coding 112-31 chr11 77090413 77090679 + 0.666667 NA intron (NM_004055, intron 2 of 12) MIRb|SINE|MIR -12294 NM_006189 4975 Hs.673853 NM_006189 ENSG00000254550 OMP - olfactory marker protein protein-coding 145.667-49 chr11 73432595 73432881 + 0.666667 NA intron (NM_001286051, intron 2 of 5) AluSc5|SINE|Alu 56070 NM_032871 84957 Hs.533720 NM_032871 ENSG00000054967 RELT AI3C|TNFRSF19L|TRLT RELT TNF receptor protein-coding 170-117 chr8 72433701 72434095 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103327 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 161.667-156 chr20 46741510 46741794 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL 32003 NM_030777 81031 Hs.305971 NM_030777 ENSG00000197496 SLC2A10 ATORS|ATS|GLUT10 solute carrier family 2 member 10 protein-coding 192.333-160 chr7 96560693 96561109 + 0.666667 NA intron (NR_163950, intron 3 of 6) intron (NR_163950, intron 3 of 6) -57378 NR_163948 154-81 chr2 181177692 181178006 + 0.666667 NA intron (NR_130784, intron 1 of 4) intron (NR_130784, intron 1 of 4) 54012 NR_130784 101927156 Hs.580074 NR_130784 LINC01934 - long intergenic non-protein coding RNA 1934 ncRNA 128.333-206 chr9 104551622 104551997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14996 NM_001001961 138803 Hs.553600 NM_001001961 ENSG00000204246 OR13C3 OR37G|OR9-8 olfactory receptor family 13 subfamily C member 3 protein-coding 204.667-145 chr8 57371581 57372042 + 0.666667 NA Intergenic MER50-int|LTR|ERV1 28024 NR_125818 101929488 Hs.407557 NR_125818 ENSG00000253871 LOC101929488 - uncharacterized LOC101929488 ncRNA 189.333-96 chr2 106097144 106097520 + 0.666667 NA intron (NM_025076, intron 13 of 14) intron (NM_025076, intron 13 of 14) 31644 NM_032411 84417 Hs.43125 NM_032411 ENSG00000119147 ECRG4 C2orf40 ECRG4 augurin precursor protein-coding 207.333-168 chr21 29402581 29402933 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 30256 NR_046564 100874322 Hs.326404 NR_046564 BACH1-IT2 - BACH1 intronic transcript 2 ncRNA 143.667-99 chr17 64434848 64435196 + 0.666667 NA Intergenic HERV35I-int|LTR|ERV1 -14093 NM_001291317 284021 Hs.631749 NM_001085423 ENSG00000271605 MILR1 Allergin-1|C17orf60|MCA-32|MCA32 mast cell immunoglobulin like receptor 1 protein-coding 169-110 chr9 119460123 119460480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90866 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 219.333-50 chr14 50262827 50263348 + 0.666667 NA intron (NM_024884, intron 9 of 9) intron (NM_024884, intron 9 of 9) -31509 NM_006939 6655 Hs.291533 NM_006939 ENSG00000100485 SOS2 NS9|SOS-2 SOS Ras/Rho guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 218.666-50 chr22 36191905 36192557 + 0.666667 NA intron (NM_145660, intron 4 of 4) AluY|SINE|Alu 12602 NM_145660 80832 Hs.115099 NM_030643 ENSG00000100336 APOL4 APOL-IV|APOLIV apolipoprotein L4 protein-coding 132-105 chr6 52956778 52957105 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38343 NM_001512 2941 Hs.485557 NM_001512 ENSG00000170899 GSTA4 GSTA4-4|GTA4 glutathione S-transferase alpha 4 protein-coding 150.333-124 chr15 36738896 36739223 + 0.666667 NA intron (NM_032499, intron 11 of 11) intron (NM_032499, intron 11 of 11) 79447 NR_027320 161635 Hs.659822 NR_027320 CSNK1A1P1 CSNK1A1P casein kinase 1 alpha 1 pseudogene 1 pseudo 228.667-62 chr5 23608152 23608680 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 100761 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 162-81 chr3 37247230 37247567 + 0.666667 NA intron (NM_001172713, intron 1 of 22) intron (NM_001172713, intron 1 of 22) -3203 NR_149029 152048 Hs.596176 NM_152532 ENSG00000270194 LOC152048 - uncharacterized FLJ31715 ncRNA 183.667-103 chr4 62286419 62286926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -124907 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 160.667-78 chr12 129443655 129443966 + 0.666667 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 235209 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 167.333-252 chr8 43001666 43002109 + 0.666667 NA intron (NM_032410, intron 16 of 21) intron (NM_032410, intron 16 of 21) -54412 NR_033698 2339 Hs.370312 NM_002027 ENSG00000168522 FNTA FPTA|PGGT1A|PTAR2 farnesyltransferase, CAAX box, alpha protein-coding 130.333-157 chr4 139456455 139456793 + 0.666667 NA intron (NM_031296, intron 1 of 1) intron (NM_031296, intron 1 of 1) 2503 NM_031296 83452 Hs.591679 NM_031296 ENSG00000172007 RAB33B SMC2 RAB33B, member RAS oncogene family protein-coding 139.667-148 chr5 24018872 24019242 + 0.666667 NA intron (NR_131245, intron 4 of 4) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 67709 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 222-56 chr3 41950012 41950432 + 0.666667 NA intron (NR_136342, intron 2 of 34) AluJb|SINE|Alu 11881 NM_001322501 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 146-147 chr9 28748974 28749387 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 2 of 5) intron (NM_001354574, intron 2 of 5) -29875 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 121.667-107 chr20 1692853 1693098 + 0.666667 NA Intergenic Tigger6a|DNA|TcMar-Tigger -35196 NM_080816 55423 Hs.590883 NM_018556 ENSG00000089012 SIRPG CD172g|SIRP-B2|SIRPB2|SIRPgamma|bA77C3.1 signal regulatory protein gamma protein-coding 177.667-126 chr7 30919155 30919579 + 0.666667 NA intron (NM_198098, intron 1 of 3) L2c|LINE|L2 7514 NM_001329872 358 Hs.76152 NM_000385 ENSG00000240583 AQP1 AQP-CHIP|CHIP28|CO aquaporin 1 (Colton blood group) protein-coding 117-15 chr10 16356213 16356502 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -80586 NM_001001484 9317 Hs.444321 NM_030664 ENSG00000165983 PTER HPHRP|RPR-1 phosphotriesterase related protein-coding 176-51 chr2 182545529 182545856 + 0.666667 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger -22847 NM_001003683 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 112.667-80 chr16 47949989 47950280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15555 NR_146502 105371238 Hs.743032 NR_146502 LINC02134 - long intergenic non-protein coding RNA 2134 ncRNA 112.667-53 chr12 62933330 62933588 + 0.666667 NA intron (NM_020700, intron 1 of 9) intron (NM_020700, intron 1 of 9) 1691 NM_020700 57460 Hs.435479 NM_020700 ENSG00000111110 PPM1H ARHCL1|NERPP-2C|URCC2 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1H protein-coding 208.667-22 chr10 68293293 68293706 + 0.666667 NA intron (NM_001033083, intron 4 of 8) intron (NM_001033083, intron 4 of 8) -38194 NM_001322445 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 182.667-158 chr8 68390516 68390905 + 0.666667 NA intron (NR_146187, intron 1 of 13) MIRc|SINE|MIR -59219 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 140.667-215 chr7 53490752 53491024 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 321043 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 169.667-15 chr10 14572347 14572687 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001320737) promoter-TSS (NM_001320737) -142 NM_001320735 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 143.667-29 chr10 91618619 91618938 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -7318 NR_024467 100188947 Hs.535293 NR_024467 HECTD2-AS1 - HECTD2 antisense RNA 1 ncRNA 125-4 chr1 82316570 82316816 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger 514240 NM_001366007 23266 Hs.24212 NM_012302 ENSG00000117114 ADGRL2 CIRL2|CL2|LEC1|LPHH1|LPHN2 adhesion G protein-coupled receptor L2 protein-coding 149.667-71 chr11 26470475 26470768 + 0.666667 NA intron (NM_031418, intron 4 of 26) L1ME4a|LINE|L1 -3281 NM_001313727 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 121.667-140 chr4 62538454 62538728 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -376826 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 182-49 chr2 108782338 108782779 + 0.666667 NA exon (NM_006267, exon 28 of 29) exon (NM_006267, exon 28 of 29) -4192 NM_001351544 165055 Hs.362702 NM_144978 ENSG00000163006 CCDC138 - coiled-coil domain containing 138 protein-coding 228.333-100 chr8 119431196 119431834 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15069 NM_002514 4856 Hs.235935 NM_002514 ENSG00000136999 CCN3 IBP-9|IGFBP-9|IGFBP9|NOV|NOVh cellular communication network factor 3 protein-coding 147-81 chr20 7828297 7828591 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 112014 NM_017545 54363 Hs.193640 NM_017545 ENSG00000101323 HAO1 GOX|GOX1|HAOX1 hydroxyacid oxidase 1 protein-coding 257-70 chr8 83983002 83983550 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -199511 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 128.333-59 chr14 64159411 64159694 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 87 of 114) intron (NM_015180, intron 87 of 114) -54592 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 146.333-294 chr6 143613010 143613316 + 0.666667 NA intron (NM_014721, intron 1 of 12) AluYi6_4d|SINE|Alu 4983 NM_014721 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 186-98 chr8 125500586 125500958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 68563 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 138.333-26 chr10 47156559 47156824 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143506 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 114-85 chr3 34397690 34397966 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 599198 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 209-33 chr12 115054336 115054805 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -370395 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 176-45 chr2 38040208 38040683 + 0.666667 NA intron (NM_144713, intron 10 of 10) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -4104 NR_102712 101410544 Hs.591566 NR_102712 RMDN2-AS1 - RMDN2 antisense RNA 1 ncRNA 124.667-108 chr2 144069319 144069687 + 0.666667 NA intron (NM_001354355, intron 7 of 13) intron (NM_001354355, intron 7 of 13) 132436 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 196.666-47 chr2 57202472 57203051 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -704890 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 133-12 chr10 120326200 120326437 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 28905 NM_000982 6144 Hs.381123 NM_000982 ENSG00000122026 RPL21 HYPT12|L21 ribosomal protein L21 protein-coding 114.667-147 chr2 235281470 235281777 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -212420 NM_014914 116987 Hs.435039 NM_014914 ENSG00000157985 AGAP1 AGAP-1|CENTG2|GGAP1|cnt-g2 ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 112.667-90 chr16 88681834 88682046 + 0.666667 NA intron (NM_178310, intron 1 of 2) intron (NM_178310, intron 1 of 2) 4567 NM_178310 333929 Hs.673548 NM_178310 ENSG00000185669 SNAI3 SMUC|SNAIL3|ZNF293|Zfp293 snail family transcriptional repressor 3 protein-coding 131.333-85 chr2 63985628 63985859 + 0.666667 NA intron (NM_001005739, intron 1 of 22) intron (NM_001005739, intron 1 of 22) 33685 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 193.667-80 chr22 25941344 25941813 + 0.666667 NA intron (NM_001318245, intron 34 of 43) intron (NM_001318245, intron 34 of 43) 199390 NM_032608 84700 Hs.417959 NM_032608 ENSG00000133454 MYO18B KFS4 myosin XVIIIB protein-coding 131-6 chr1 95451509 95451730 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -23118 NR_033966 440594 Hs.514123 NR_033966 ENSG00000233907 LINC01761 - long intergenic non-protein coding RNA 1761 ncRNA 132.667-26 chr10 99026831 99027152 + 0.666667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) L1MA1|LINE|L1 -102423 NR_106762 102465253 NR_106762 ENSG00000274056 MIR6507 hsa-mir-6507 microRNA 6507 ncRNA 117.667-196 chr8 108726611 108726854 + 0.666667 NA intron (NR_136411, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 60862 NR_136411 157753 Hs.99439 NM_153015 ENSG00000164841 TMEM74 NET36 transmembrane protein 74 protein-coding 177-27 chr14 88976784 88977148 + 0.666667 NA Intergenic LTR37B|LTR|ERV1 152315 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 115.667-223 chr9 69049284 69049571 + 0.666667 NA intron (NM_000144, intron 2 of 4) intron (NM_000144, intron 2 of 4) 13675 NM_000144 2395 Hs.20685 NM_000144 ENSG00000165060 FXN CyaY|FA|FARR|FRDA|X25 frataxin protein-coding 196-201 chrX 57028265 57028706 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -32944 NM_001010862 169981 Hs.522672 NM_001010862 ENSG00000204271 SPIN3 SPIN-3|TDRD27|bA445O16.1 spindlin family member 3 protein-coding 115.667-10 chr1 154608526 154608701 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_015840) promoter-TSS (NM_015840) 184 NM_001365048 103 Hs.12341 NM_001111 ENSG00000160710 ADAR ADAR1|AGS6|DRADA|DSH|DSRAD|G1P1|IFI-4|IFI4|K88DSRBP|P136 adenosine deaminase RNA specific protein-coding 119.333-201 chr7 77731257 77731496 + 0.666667 NA intron (NM_198467, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -34031 NR_038361 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 245-76 chr8 121030365 121030862 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -218567 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 128.333-34 chr11 25933058 25933347 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -255921 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 120.667-36 chr12 10594504 10594708 + 0.666667 NA intron (NR_028045, intron 4 of 6) L1MA10|LINE|L1 5229 NR_028045 10748 Hs.159297 NM_006611 KLRA1P KLRA1|KLRAP1|LY49L|Ly-49L|Ly49 killer cell lectin like receptor A1, pseudogene pseudo 199.333-219 chr5 30669923 30670451 + 0.666667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -523499 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 155-41 chr15 88599858 88600171 + 0.666667 NA intron (NR_120370, intron 2 of 2) intron (NR_120370, intron 2 of 2) 4589 NR_120369 101929743 Hs.558810 NR_120369 ENSG00000249487 LINC01586 - long intergenic non-protein coding RNA 1586 ncRNA 149.667-379 chr7 109145238 109145656 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -260860 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 180-104 chr7 87363354 87363841 + 0.666667 NA intron (NM_021151, intron 6 of 17) L2a|LINE|L2 17933 NM_001243745 54677 Hs.125039 NM_021151 ENSG00000005469 CROT COT carnitine O-octanoyltransferase protein-coding 132-83 chr3 99649874 99650144 + 0.666667 NA intron (NM_020351, intron 1 of 3) intron (NM_020351, intron 1 of 3) 11415 NM_001850 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 228-16 chr11 61970857 61971510 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3549 NM_002032 2495 Hs.524910 NM_002032 ENSG00000167996 FTH1 FHC|FTH|FTHL6|HFE5|PIG15|PLIF ferritin heavy chain 1 protein-coding 157.333-15 chr1 102203972 102204350 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -206927 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 139.333-68 chr14 20318987 20319382 + 0.666667 NA intron (NM_182852, intron 4 of 7) intron (NM_182852, intron 4 of 7) 4142 NR_145735 109616976 Hs.742613 NR_145735 ENSG00000222489 SNORA79B - small nucleolar RNA, H/ACA box 79B snoRNA 202.666-117 chr7 41778738 41779315 + 0.666667 NA non-coding (NR_027118, exon 4 of 4) non-coding (NR_027118, exon 4 of 4) -75936 NM_002192 3624 Hs.28792 NM_002192 ENSG00000122641 INHBA EDF|FRP inhibin subunit beta A protein-coding 145-39 chr16 26667946 26668329 + 0.666667 NA Intergenic LTR38|LTR|ERV1 -398790 NM_001145545 162083 Hs.120831 NM_182831 C16orf82 TNT chromosome 16 open reading frame 82 protein-coding 189.666-28 chr3 50309655 50310207 + 0.666667 NA intron (NM_153281, intron 1 of 5) MER4-int|LTR|ERV1 2450 NM_153281 3373 Hs.75619 NM_033159 ENSG00000114378 HYAL1 HYAL-1|LUCA1|MPS9|NAT6 hyaluronidase 1 protein-coding 112-53 chr13 76587094 76587284 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 299216 NM_138444 115207 Hs.644125 NM_138444 ENSG00000178695 KCTD12 C13orf2|PFET1|PFETIN potassium channel tetramerization domain containing 12 protein-coding 151.333-368 chr6 118367917 118368286 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -133272 NR_002730 23629 Hs.648050 NR_002730 BRD7P3 BP75 bromodomain containing 7 pseudogene 3 pseudo 201.667-124 chr8 125581778 125582230 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 149795 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 111.667-69 chr12 116324323 116324579 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47265 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 195.667-96 chr4 58785206 58785686 + 0.666667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -198836 NR_133941 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 133.667-110 chr4 58700936 58701215 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -164747 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 153.667-376 chr8 68268700 68269070 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -61488 NM_001349479 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 190.667-39 chr14 42538610 42539117 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 932007 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 174-50 chr2 52920863 52921257 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -218445 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 143.667-258 chr8 130132265 130132541 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 16 of 29) intron (NM_001362925, intron 16 of 29) -47635 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 121.667-202 chr8 79627766 79628011 + 0.666667 NA intron (NM_007029, intron 1 of 4) L1MA8|LINE|L1 16771 NM_001199214 11075 Hs.521651 NM_007029 ENSG00000104435 STMN2 SCG10|SCGN10 stathmin 2 protein-coding 158.333-228 chr4 54181715 54182054 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47409 NM_006206 5156 Hs.74615 NM_006206 ENSG00000134853 PDGFRA CD140A|PDGFR-2|PDGFR2 platelet derived growth factor receptor alpha protein-coding 119.333-187 chr6 41798941 41799123 + 0.666667 NA intron (NM_001286554, intron 4 of 5) MIRb|SINE|MIR 11589 NM_001134493 100188893 Hs.731633 NM_001134493 ENSG00000214736 TOMM6 OBTP|TOM6 translocase of outer mitochondrial membrane 6 protein-coding 132-110 chr7 5771633 5771859 + 0.666667 NA intron (NM_207111, intron 1 of 16) AluJb|SINE|Alu 9917 NM_207111 54476 Hs.487458 NM_019011 ENSG00000011275 RNF216 CAHH|TRIAD3|U7I1|UBCE7IP1|ZIN ring finger protein 216 protein-coding 157.333-288 chr5 110872938 110873285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 134104 NR_138151 91137 Hs.75639 NM_138773 ENSG00000164209 SLC25A46 HMSN6B solute carrier family 25 member 46 protein-coding 275.667-44 chr5 20200815 20201324 + 0.666667 NA intron (NM_001291956, intron 2 of 14) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -104482 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 118-31 chr14 22897811 22898047 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001352766, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001352766, exon 16 of 16) 14707 NM_173527 161253 Hs.444911 NM_173527 ENSG00000139890 REM2 - RRAD and GEM like GTPase 2 protein-coding 152.667-168 chr2 29778430 29778742 + 0.666667 NA intron (NM_004304, intron 1 of 28) intron (NM_004304, intron 1 of 28) 143000 NM_004304 238 Hs.654469 NM_004304 ENSG00000171094 ALK CD246|NBLST3 ALK receptor tyrosine kinase protein-coding 125.333-176 chr8 92266497 92266817 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -163272 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 183.667-36 chr12 41901799 41902203 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 137812 NR_135041 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 129-133 chr8 140660542 140660906 + 0.666667 NA intron (NM_001352724, intron 33 of 33) intron (NM_001352724, intron 33 of 33) -25091 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 219.333-128 chr4 102145701 102146079 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 178422 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 137-92 chr6 113296179 113296442 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 137137 NR_149098 105377957 Hs.25088 NR_149098 ENSG00000232316 LINC02518 - long intergenic non-protein coding RNA 2518 ncRNA 165.667-21 chr10 101436278 101436644 + 0.666667 NA intron (NM_001256856, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu 82296 NM_033637 8945 Hs.643802 NM_003939 ENSG00000166167 BTRC BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 117-113 chr5 42108479 42108733 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 66739 NR_104635 101926960 Hs.365692 NR_104635 LOC101926960 - uncharacterized LOC101926960 ncRNA 116.667-150 chr4 89846023 89846198 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7806 NM_001146055 6622 Hs.21374 NM_000345 ENSG00000145335 SNCA NACP|PARK1|PARK4|PD1 synuclein alpha protein-coding 157-50 chr17 50518834 50519199 + 0.666667 NA exon (NM_032133, exon 6 of 19) exon (NM_032133, exon 6 of 19) 10577 NR_158785 84073 Hs.398196 NM_032133 ENSG00000136449 MYCBPAP AMAP-1|AMAP1 MYCBP associated protein protein-coding 148.333-193 chr2 110712904 110713197 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19523 NM_001365487 55289 Hs.253320 NM_018308 ENSG00000153093 ACOXL - acyl-CoA oxidase like protein-coding 133.333-137 chr4 136671152 136671399 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -522481 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 179.333-85 chr18 13224734 13225119 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 1 of 5) AluSz6|SINE|Alu 6166 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 153.333-442 chr9 34744882 34745183 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15544 NM_001141917 259308 Hs.522093 NM_001141917 ENSG00000205108 FAM205A C9orf144B family with sequence similarity 205 member A protein-coding 196.667-169 chr8 142908257 142908722 + 0.666667 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL 9354 NM_000498 1585 Hs.632054 NM_000498 ENSG00000179142 CYP11B2 ALDOS|CPN2|CYP11B|CYP11BL|CYPXIB2|P-450C18|P450C18|P450aldo cytochrome P450 family 11 subfamily B member 2 protein-coding 115.333-119 chr2 187104779 187104967 + 0.666667 NA Intergenic Tigger19b|DNA|TcMar-Tigger -255703 NM_182521 151112 Hs.375054 NM_182521 ENSG00000163012 ZSWIM2 MEX|ZZZ2 zinc finger SWIM-type containing 2 protein-coding 291.666-3 chr11 85365587 85366399 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) L1PA7|LINE|L1 261277 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 185.667-124 chr8 17091242 17091775 + 0.666667 NA intron (NM_001349810, intron 8 of 14) intron (NM_001349810, intron 8 of 14) 64270 NM_001349810 286097 Hs.403594 NM_181723 ENSG00000155970 MICU3 EFHA2 mitochondrial calcium uptake family member 3 protein-coding 204.333-123 chr3 82992876 82993450 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 1007021 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 179-70 chr4 56739463 56739807 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57929 NM_001145460 84525 Hs.619396 NM_032495 ENSG00000171476 HOPX CAMEO|HOD|HOP|LAGY|NECC1|OB1|SMAP31|TOTO HOP homeobox protein-coding 134-23 chr13 32474056 32474404 + 0.666667 NA intron (NM_001320836, intron 6 of 9) L1MC5a|LINE|L1 24262 NR_051980 100462953 Hs.687692 NR_051980 MICOS10P1 CG012|MINOS1P1|N4BP2L2-IT|N4BP2L2-IT1|N4BP2L2IT1 MICOS10 pseudogene 1 pseudo 236.667-89 chr8 85259776 85260325 + 0.666667 NA intron (NM_198584, intron 3 of 6) intron (NM_198584, intron 3 of 6) 14592 NM_198584 377677 Hs.127189 NM_198584 ENSG00000185015 CA13 CAXIII carbonic anhydrase 13 protein-coding 319-30 chr8 16622845 16623800 + 0.666667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 379023 NM_019851 26281 Hs.199905 NM_019851 ENSG00000078579 FGF20 FGF-20|RHDA2 fibroblast growth factor 20 protein-coding 168-72 chr3 148286403 148286861 + 0.666667 NA intron (NR_146712, intron 1 of 4) AluY|SINE|Alu 5741 NR_146712 105374149 Hs.274837 NR_146712 LINC02046 - long intergenic non-protein coding RNA 2046 ncRNA 129-7 chr1 196975130 196975371 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -2287 NM_030787 81494 Hs.282594 NM_030787 ENSG00000134389 CFHR5 CFHL5|CFHR5D|FHR-5|FHR5 complement factor H related 5 protein-coding 160-8 chr1 164831372 164831719 + 0.666667 NA intron (NM_001353131, intron 7 of 7) AluY|SINE|Alu -56904 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 159-106 chr6 146140812 146141131 + 0.666667 NA intron (NM_001278065, intron 2 of 9) L1MA3|LINE|L1 111773 NM_001278067 2911 Hs.32945 NM_000838 ENSG00000152822 GRM1 GPRC1A|MGLU1|MGLUR1|PPP1R85|SCA44|SCAR13 glutamate metabotropic receptor 1 protein-coding 193.666-10 chr12 23208655 23209215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33299 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 154.333-232 chr3 196794180 196794595 + 0.666667 NA intron (NM_002577, intron 2 of 14) L1M3f|LINE|L1 54530 NM_002577 5062 Hs.518530 NM_002577 ENSG00000180370 PAK2 PAK65|PAKgamma p21 (RAC1) activated kinase 2 protein-coding 111.667-58 chr12 24743948 24744191 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 158153 NM_001178094 586 Hs.438993 NM_005504 ENSG00000060982 BCAT1 BCATC|BCT1|ECA39|MECA39|PNAS121|PP18 branched chain amino acid transaminase 1 protein-coding 177-35 chr2 21892231 21892605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -181766 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 278.333-25 chr19 36033925 36034645 + 0.666667 NA TTS (NM_152658) TTS (NM_152658) -1412 NM_015526 25999 Hs.466539 NM_015526 ENSG00000105270 CLIP3 CLIPR-59|CLIPR59|RSNL1 CAP-Gly domain containing linker protein 3 protein-coding 142.667-242 chr9 71189120 71189357 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 1 of 25) intron (NM_001366143, intron 1 of 25) -67617 NM_001366148 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 160.333-145 chr2 82221840 82222149 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -634809 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 140.333-28 chr10 60203661 60203970 + 0.666667 NA intron (NM_001204403, intron 12 of 43) intron (NM_001204403, intron 12 of 43) -62799 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 148.667-211 chr2 203429062 203429370 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001282925, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001282925, exon 11 of 11) 62332 NM_001282927 10152 Hs.471156 NM_005759 ENSG00000138443 ABI2 ABI-2|ABI2B|AIP-1|AIP1|AblBP3|SSH3BP2|argBP1|argBPIA|argBPIB abl interactor 2 protein-coding 111.667-225 chr6 88687764 88687962 + 0.666667 NA intron (NM_001286428, intron 11 of 13) L1MC4a|LINE|L1 -148494 NR_110867 101928936 Hs.533080 NR_110867 LOC101928936 - uncharacterized LOC101928936 ncRNA 169-98 chr7 108808200 108808600 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 76187 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 210.333-93 chr20 61645049 61645491 + 0.666667 NA intron (NM_001252339, intron 1 of 14) MIR|SINE|MIR 45509 NM_001252339 1002 Hs.473231 NM_001794 ENSG00000179242 CDH4 CAD4|R-CAD|RCAD cadherin 4 protein-coding 173-24 chr14 61796169 61796569 + 0.666667 NA TTS (NM_003082) TTS (NM_003082) -15793 NM_001367650 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 177.333-163 chr8 28894935 28895279 + 0.666667 NA intron (NM_024567, intron 2 of 10) intron (NM_024567, intron 2 of 10) 3793 NM_001324382 79618 Hs.563560 NM_024567 ENSG00000147421 HMBOX1 HNF1LA|HOT1|PBHNF homeobox containing 1 protein-coding 139-113 chr9 9966291 9966596 + 0.666667 NA intron (NM_002839, intron 4 of 45) intron (NM_002839, intron 4 of 45) 167051 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 124-7 chr1 97897885 97898151 + 0.666667 NA intron (NM_000110, intron 1 of 22) L1MEc|LINE|L1 23041 NM_000110 1806 Hs.335034 NM_000110 ENSG00000188641 DPYD DHP|DHPDHASE|DPD dihydropyrimidine dehydrogenase protein-coding 112.667-164 chr22 29678544 29678797 + 0.666667 NA intron (NR_156186, intron 15 of 16) intron (NR_156186, intron 15 of 16) -41333 NM_182527 164633 Hs.643608 NM_182527 ENSG00000100314 CABP7 CALN2 calcium binding protein 7 protein-coding 111.667-168 chr3 95737482 95737744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54420 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 161-62 chr3 144996536 144996940 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 1023657 NM_001134470 205428 Hs.288954 NM_173552 ENSG00000181744 DIPK2A C3orf58|DIA1|GoPro49|HASF divergent protein kinase domain 2A protein-coding 176.667-44 chr12 14360479 14360930 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4928 NM_018179 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 200.667-133 chr6 34964331 34964780 + 0.666667 NA intron (NM_015245, intron 1 of 23) L1ME3G|LINE|L1 75300 NM_015245 23294 Hs.656492 NM_015245 ENSG00000064999 ANKS1A ANKS1 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A protein-coding 136.667-54 chr14 44926691 44927008 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001308112, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001308112, exon 5 of 5) -14932 NR_110050 101927418 Hs.144809 NR_110050 ENSG00000258949 LOC101927418 - uncharacterized LOC101927418 ncRNA 113.667-138 chr3 79331141 79331429 + 0.666667 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -80442 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 142-161 chr8 144761179 144761433 + 0.666667 NA Intergenic MER66D|LTR|ERV1 -5775 NM_138367 90987 Hs.534516 NM_138367 ENSG00000198169 ZNF251 - zinc finger protein 251 protein-coding 243-7 chr1 153177942 153178363 + 0.666667 NA intron (NR_110685, intron 2 of 2) L1ME2|LINE|L1 3634 NR_110685 101928009 Hs.385720 NR_110685 ENSG00000229699 LOC101928009 - uncharacterized LOC101928009 ncRNA 159.667-190 chr20 13957594 13957951 + 0.666667 NA intron (NM_001363752, intron 1 of 16) AluJb|SINE|Alu 32842 NR_073206 80343 Hs.590879 NM_025229 ENSG00000101251 SEL1L2 C20orf50|sel-1L2 SEL1L2 adaptor subunit of ERAD E3 ligase protein-coding 181.667-136 chr7 28978517 28978915 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -1251 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 157-140 chr9 111409412 111409735 + 0.666667 NA intron (NM_001363756, intron 22 of 48) AluSq2|SINE|Alu 73989 NM_001364930 23392 Hs.368255 NM_001080398 ENSG00000136813 ECPAS ECM29|KIAA0368 Ecm29 proteasome adaptor and scaffold protein-coding 140-87 chr5 67038775 67039156 + 0.666667 NA intron (NM_001297651, intron 1 of 25) intron (NM_001297651, intron 1 of 25) 34310 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 127-27 chr12 49699641 49700013 + 0.666667 NA intron (NM_001367835, intron 1 of 26) L1ME4a|LINE|L1 7578 NM_175736 91010 Hs.179838 NM_175736 ENSG00000161791 FMNL3 FHOD3|FRL2|WBP-3|WBP3 formin like 3 protein-coding 139.333-165 chr4 59252944 59253354 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 239576 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 204-58 chr14 60989082 60989608 + 0.666667 NA intron (NR_033344, intron 3 of 16) L2a|LINE|L2 -7655 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 159-98 chr5 112565900 112566237 + 0.666667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -62368 NR_104672 102467214 Hs.124613 NR_104672 LINC02200 - long intergenic non-protein coding RNA 2200 ncRNA 135-51 chr2 183560366 183560644 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 436062 NM_138285 129401 Hs.180591 NM_138285 ENSG00000163002 NUP35 MP-44|MP44|NP44|NUP53 nucleoporin 35 protein-coding 157.333-211 chr20 8364776 8365119 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 2 of 32) intron (NM_182734, intron 2 of 32) 116243 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 216-5 chr1 164978921 164979480 + 0.666667 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -204559 NR_038072 100505795 Hs.661039 NR_038072 ENSG00000233693 LOC100505795 - uncharacterized LOC100505795 ncRNA 222.333-75 chr5 107752506 107753160 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -81896 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 140.333-218 chr7 68785208 68785609 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 765155 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 124.333-139 chr5 16431610 16431831 + 0.666667 NA intron (NR_104625, intron 4 of 8) intron (NR_104625, intron 4 of 8) 9382 NR_104625 101929505 Hs.639360 NR_104625 ENSG00000248150 LINC02150 - long intergenic non-protein coding RNA 2150 ncRNA 143.333-277 chr7 115861500 115861780 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106673 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 115-23 chr10 13321554 13321850 + 0.666667 NA intron (NM_001195604, intron 7 of 7) intron (NM_001195604, intron 7 of 7) -21572 NM_001323083 5264 Hs.498732 NM_006214 ENSG00000107537 PHYH LN1|LNAP1|PAHX|PHYH1|RD phytanoyl-CoA 2-hydroxylase protein-coding 113.667-231 chr9 121522365 121522672 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -22491 NR_045211 2681 Hs.97469 NR_003191 ENSG00000204136 GGTA1P GGTA|GGTA1|GLYT2|a1/3GTP glycoprotein alpha-galactosyltransferase 1, pseudogene pseudo 137.333-201 chr8 125332848 125333120 + 0.666667 NA intron (NM_001349486, intron 5 of 7) intron (NM_001349486, intron 5 of 7) -97374 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 147.667-214 chr22 23352924 23353254 + 0.666667 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL 26473 NR_149133 102724679 Hs.517462 NR_149133 ENSG00000236611 LINC02556 - long intergenic non-protein coding RNA 2556 ncRNA 132-92 chr4 92369556 92369888 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 65323 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 118.667-17 chr10 14019012 14019326 + 0.666667 NA intron (NM_018027, intron 2 of 24) HAL1|LINE|L1 -10619 NM_001318336 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 162.667-107 chr17 78906552 78906843 + 0.666667 NA intron (NM_003255, intron 1 of 4) AluSz6|SINE|Alu -3496 NM_001243541 100653515 Hs.734636 NM_001243540 ENSG00000178404 CEP295NL DDC8|KIAA1731NL CEP295 N-terminal like protein-coding 175-82 chr9 22867923 22868435 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 221979 NR_038977 441389 NR_038977 ENSG00000234840 LINC01239 - long intergenic non-protein coding RNA 1239 ncRNA 173.667-141 chr5 35680871 35681354 + 0.666667 NA intron (NM_024867, intron 10 of 36) intron (NM_024867, intron 10 of 36) 63249 NM_144722 79925 Hs.298863 NM_024867 ENSG00000152582 SPEF2 CT122|KPL2 sperm flagellar 2 protein-coding 126.667-186 chr9 119556443 119556667 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -187120 NM_014618 1620 Hs.532316 NM_014618 ENSG00000078725 BRINP1 DBC1|DBCCR1|FAM5A BMP/retinoic acid inducible neural specific 1 protein-coding 130-84 chr4 114766844 114767130 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 110228 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 165-90 chr7 66015426 66015771 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33385 NM_001293105 2990 Hs.255230 NM_000181 ENSG00000169919 GUSB BG|MPS7 glucuronidase beta protein-coding 117.667-151 chr5 33978031 33978382 + 0.666667 NA intron (NM_001012509, intron 2 of 5) MER4D|LTR|ERV1 6487 NM_016180 51151 Hs.278962 NM_016180 ENSG00000164175 SLC45A2 1A1|AIM1|MATP|OCA4|SHEP5 solute carrier family 45 member 2 protein-coding 164.667-168 chr4 95747379 95747714 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -92547 NM_005390 5161 Hs.131361 NM_005390 ENSG00000163114 PDHA2 PDHAL pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 subunit protein-coding 137.333-178 chr7 46271614 46271867 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -350468 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 201.667-68 chr21 27641356 27641681 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -80861 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 140-21 chr10 78579836 78580085 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 312618 NR_073447 414243 Hs.55047 NR_073447 ENSG00000230417 LINC00595 C10orf101 long intergenic non-protein coding RNA 595 ncRNA 157.333-333 chr8 77178255 77178567 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -177367 NM_001172087 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 113.333-48 chr11 74405436 74405761 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 6361 NR_039710 100616215 NR_039710 ENSG00000264402 MIR548AL - microRNA 548al ncRNA 151.333-276 chr3 46370558 46370971 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_000579, exon 2 of 3) 5' UTR (NM_000579, exon 2 of 3) 622 NM_000579 1234 Hs.450802 NM_000579 ENSG00000160791 CCR5 CC-CKR-5|CCCKR5|CCR-5|CD195|CKR-5|CKR5|CMKBR5|IDDM22 C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene) protein-coding 147.667-297 chr5 159624130 159624503 + 0.666667 NA Intergenic MER51B|LTR|ERV1 -158040 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 154.333-364 chr8 140665302 140665607 + 0.666667 NA intron (NR_148037, intron 33 of 34) intron (NR_148037, intron 33 of 34) -29821 NM_012154 27161 Hs.660189 NM_012154 ENSG00000123908 AGO2 CASC7|EIF2C2|LINC00980|PPD|Q10 argonaute RISC catalytic component 2 protein-coding 136.333-80 chr17 75106166 75106382 + 0.666667 NA TTS (NM_001369668) TTS (NM_001369668) -3695 NM_001304272 79637 Hs.413047 NM_024585 ENSG00000125449 ARMC7 - armadillo repeat containing 7 protein-coding 152.667-180 chr2 62818522 62818921 + 0.666667 NA intron (NM_001142615, intron 5 of 22) L1ME3D|LINE|L1 111824 NM_001354217 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 149-19 chr10 58322246 58322553 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 7280 NR_158219 112268068 Hs.586671 NR_158219 LOC112268068 - uncharacterized LOC112268068 ncRNA 161.667-26 chr10 48298196 48298637 + 0.666667 NA Intergenic MER45R|DNA|hAT-Tip100 -8223 NM_001278547 5599 Hs.138211 NM_002750 ENSG00000107643 MAPK8 JNK|JNK-46|JNK1|JNK1A2|JNK21B1/2|PRKM8|SAPK1|SAPK1c mitogen-activated protein kinase 8 protein-coding 180-8 chr1 177663057 177663459 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -37266 NR_110722 101928778 Hs.573792 NR_110722 ENSG00000236720 LINC01741 - long intergenic non-protein coding RNA 1741 ncRNA 124.667-140 chr3 127304822 127305041 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16885 NM_001362810 100419008 NM_001362810 PRR20G - proline rich 20G protein-coding 144-97 chr22 41434752 41435030 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_016272, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_016272, exon 2 of 2) 11910 NM_016272 10766 Hs.474978 NM_016272 ENSG00000183864 TOB2 APRO5|TOB4|TOBL|TROB2 transducer of ERBB2, 2 protein-coding 127.667-92 chr2 155654156 155654454 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 600626 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 151.333-229 chr2 181409286 181409599 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -47450 NM_001316312 3676 Hs.72981 NM_000885 ENSG00000115232 ITGA4 CD49D|IA4 integrin subunit alpha 4 protein-coding 139.333-111 chr2 116043235 116043625 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 699615 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 144.667-210 chr4 25151447 25151783 + 0.666667 NA intron (NM_016955, intron 6 of 10) intron (NM_016955, intron 6 of 10) 8834 NM_016955 51091 Hs.253305 NM_016955 ENSG00000109618 SEPSECS LP|PCH2D|SLA|SLA/LP Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase protein-coding 142.667-17 chr10 29320857 29321250 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31983 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 184.667-134 chr8 81742332 81742856 + 0.666667 NA intron (NM_152284, intron 1 of 4) intron (NM_152284, intron 1 of 4) 10146 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 158.667-272 chr5 77716332 77716635 + 0.666667 NA intron (NM_004607, intron 1 of 3) intron (NM_004607, intron 1 of 3) 59856 NM_001297738 6902 Hs.291212 NM_004607 ENSG00000171530 TBCA - tubulin folding cofactor A protein-coding 205.333-241 chr8 79113386 79113854 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -218568 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 133.667-21 chr10 74310915 74311142 + 0.666667 NA intron (NM_001369124, intron 3 of 9) intron (NM_001369124, intron 3 of 9) 134265 NM_001369124 132 Hs.656586 NM_001123 ENSG00000156110 ADK AK adenosine kinase protein-coding 172.333-55 chr14 81766513 81766980 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23608 NR_146498 102724294 NR_146498 ENSG00000258718 LINC02311 - long intergenic non-protein coding RNA 2311 ncRNA 133.667-29 chr11 98287846 98288161 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -732946 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 114.667-232 chr6 154858529 154858854 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5331 NR_036100 100422821 NR_036100 ENSG00000264814 MIR1273C - microRNA 1273c ncRNA 120-48 chr17 56837196 56837377 + 0.666667 NA intron (NM_003647, intron 2 of 11) MER5A|DNA|hAT-Charlie 3135 NM_003647 8526 Hs.239514 NM_003647 ENSG00000153933 DGKE AHUS7|DAGK5|DAGK6|DGK|NPHS7 diacylglycerol kinase epsilon protein-coding 114.667-72 chr13 68205332 68205636 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 679841 NR_038878 338862 NR_038878 ENSG00000281778 LINC00550 - long intergenic non-protein coding RNA 550 ncRNA 166-45 chr15 64320532 64320917 + 0.666667 NA intron (NM_001329606, intron 1 of 11) MER102b|DNA|hAT-Charlie 35449 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 114.333-11 chr1 154223797 154224059 + 0.666667 NA intron (NM_001287816, intron 1 of 26) intron (NM_001287816, intron 1 of 26) 2973 NM_014847 9898 Hs.490551 NM_014847 ENSG00000143569 UBAP2L NICE-4|NICE4 ubiquitin associated protein 2 like protein-coding 163-70 chr5 144781765 144782106 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 576544 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 175-62 chr4 96740322 96740681 + 0.666667 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) L1MEc|LINE|L1 429798 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 112.333-271 chr8 140554529 140554721 + 0.666667 NA intron (NM_001164623, intron 10 of 17) intron (NM_001164623, intron 10 of 17) 42629 NR_040712 54108 Hs.279704 NM_017444 ENSG00000104472 CHRAC1 CHARC1|CHARC15|CHRAC-1|CHRAC-15|CHRAC15|YCL1 chromatin accessibility complex subunit 1 protein-coding 167-29 chr12 27461926 27462293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4701 NM_001145010 341346 Hs.282121 NM_001145010 ENSG00000165935 SMCO2 C12orf70 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 2 protein-coding 167-69 chr22 28459132 28459607 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_106713) promoter-TSS (NR_106713) -500 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 114-84 chr3 33099789 33100005 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2667 NM_001317040 2720 Hs.443031 NM_000404 ENSG00000170266 GLB1 EBP|ELNR1|MPS4B galactosidase beta 1 protein-coding 163.667-147 chr22 43380251 43380591 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -19910 NR_146918 105373054 NR_146918 ENSG00000236117 LINC01639 - long intergenic non-protein coding RNA 1639 ncRNA 111.667-20 chr1 198794224 198794503 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64619 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 194.667-48 chr17 49246486 49246920 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -1540 NR_034161 124871 Hs.446890 NM_001007529 ENSG00000177369 FLJ40194 - uncharacterized FLJ40194 ncRNA 160-48 chr16 87080985 87081336 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 23376 NR_126008 440390 Hs.513789 NR_126008 ENSG00000232190 LINC02181 - long intergenic non-protein coding RNA 2181 ncRNA 123.333-221 chr8 130346444 130346729 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) MIRb|SINE|MIR -50053 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 113.667-236 chrX 110597274 110597476 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 77063 NR_002718 6998 Hs.592361 NR_002718 ENSG00000225366 TDGF1P3 CR-3|CRIPTO|CRIPTO-3|CRIPTO3|TDGF1|TDGF2|TDGF3 teratocarcinoma-derived growth factor 1 pseudogene 3 pseudo 162.333-45 chr11 115900237 115900575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140206 NR_034148 283143 Hs.130499 NR_034148 LINC00900 - long intergenic non-protein coding RNA 900 ncRNA 157.333-97 chr13 38821801 38822210 + 0.666667 NA non-coding (NR_146963, exon 2 of 2) non-coding (NR_146963, exon 2 of 2) 5586 NR_146963 100874073 Hs.253994 NR_146963 FREM2-AS1 - FREM2 antisense RNA 1 ncRNA 113-9 chr1 153160036 153160206 + 0.666667 NA Intergenic L1MA10|LINE|L1 -9231 NM_001014291 6706 Hs.490253 NM_001014291 ENSG00000159516 SPRR2G - small proline rich protein 2G protein-coding 250.667-17 chr14 44043413 44043906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 463624 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 171-46 chr21 16625831 16626151 + 0.666667 NA intron (NR_136541, intron 7 of 9) intron (NR_136541, intron 7 of 9) 35754 NR_029694 406912 NR_029694 ENSG00000207863 MIR125B2 MIRN125B2|mir-125b-2 microRNA 125b-2 ncRNA 170.333-136 chr3 48132319 48132656 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -43639 NM_002375 4134 Hs.517949 NM_002375 ENSG00000047849 MAP4 - microtubule associated protein 4 protein-coding 169-51 chr2 211109801 211110252 + 0.666667 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu 492455 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 178.667-137 chr5 145366489 145366896 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 468650 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 135-105 chr8 53691501 53691755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 151414 NM_213620 51606 Hs.491737 NM_015941 ENSG00000047249 ATP6V1H CGI-11|MSTP042|NBP1|SFD|SFDalpha|SFDbeta|VMA13 ATPase H+ transporting V1 subunit H protein-coding 127.333-149 chr5 156706772 156707096 + 0.666667 NA intron (NM_001128209, intron 6 of 7) intron (NM_001128209, intron 6 of 7) -143361 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 202-59 chr16 64188393 64188799 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 933467 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 115.333-164 chr4 170868285 170868466 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -124640 NR_134683 100506107 Hs.380602 NR_134683 ENSG00000250968 LINC02382 - long intergenic non-protein coding RNA 2382 ncRNA 127.333-202 chrX 155397230 155397446 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -14140 NR_036259 100422985 NR_036259 ENSG00000221190 MIR1184-2 - microRNA 1184-2 ncRNA 182.667-104 chr3 151020246 151020640 + 0.666667 NA intron (NR_024066, intron 1 of 5) L1MEj|LINE|L1 -47444 NM_001195794 7401 Hs.745448 NM_052995 ENSG00000163646 CLRN1 RP61|USH3|USH3A clarin 1 protein-coding 199.333-91 chr16 73642647 73643076 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 256056 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 152.667-227 chr22 24734134 24734558 + 0.666667 NA intron (NM_001008496, intron 13 of 20) L1PB1|LINE|L1 -30155 NR_001283 7152 Hs.381281 NR_001283 TOP1P2 - DNA topoisomerase I pseudogene 2 pseudo 148.333-60 chr11 16599998 16600284 + 0.666667 NA intron (NM_001367872, intron 3 of 16) intron (NM_001367872, intron 3 of 16) -123753 NM_033326 55553 Hs.368226 NM_017508 ENSG00000110693 SOX6 HSSOX6|SOXD SRY-box transcription factor 6 protein-coding 156.667-161 chr18 73052310 73052623 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 183426 NR_134647 100505797 Hs.145111 NR_134647 ENSG00000263958 LOC100505797 - myosin heavy chain IB-like ncRNA 218.333-39 chr14 64286753 64287274 + 0.666667 NA intron (NR_073496, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu -3938 NM_001271877 2100 Hs.660607 NM_001437 ENSG00000140009 ESR2 ER-BETA|ESR-BETA|ESRB|ESTRB|Erb|NR3A2|ODG8 estrogen receptor 2 protein-coding 142.333-250 chr9 18781117 18781454 + 0.666667 NA intron (NM_001040272, intron 19 of 28) intron (NM_001040272, intron 19 of 28) 207979 NR_036107 100422869 NR_036107 ENSG00000264638 MIR3152 - microRNA 3152 ncRNA 182-12 chr1 178822671 178823213 + 0.666667 NA intron (NM_152663, intron 7 of 19) AluJr|SINE|Alu 48135 NM_004673 9068 Hs.591474 NM_004673 ENSG00000116194 ANGPTL1 ANG3|ANGPT3|ARP1|AngY|UNQ162|dJ595C2.2 angiopoietin like 1 protein-coding 119.333-189 chr6 73287099 73287289 + 0.666667 NA intron (NR_027005, intron 3 of 4) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 22965 NM_001251874 80759 Hs.433062 NM_030568 ENSG00000135314 KHDC1 C6orf147|C6orf148|Em:AC019205.8|KHDC1L|NDG1|bA257K9.4 KH domain containing 1 protein-coding 150.667-192 chr2 170472160 170472422 + 0.666667 NA intron (NM_001083615, intron 25 of 33) L2b|LINE|L2 -121348 NR_110576 101929753 Hs.534101 NR_110576 MYO3B-AS1 - MYO3B antisense RNA 1 ncRNA 172.333-146 chr5 143293858 143294241 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001204265, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001204265, exon 7 of 7) 101549 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 281-4 chr10 103973876 103974422 + 0.666667 NA intron (NM_001304743, intron 1 of 17) HAL1|LINE|L1 7009 NM_001304743 9748 Hs.591922 NM_014720 ENSG00000065613 SLK LOSK|STK2|bA16H23.1|se20-9 STE20 like kinase protein-coding 153.667-320 chr5 97202147 97202527 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19090 NM_001159749 55781 Hs.27021 NM_018343 ENSG00000058729 RIOK2 RIO2 RIO kinase 2 protein-coding 209.667-26 chr11 77816046 77816512 + 0.666667 NA intron (NM_016578, intron 1 of 15) intron (NM_016578, intron 1 of 15) 4555 NM_016578 51773 Hs.420229 NM_016578 ENSG00000048649 RSF1 HBXAP|RSF-1|XAP8|p325 remodeling and spacing factor 1 protein-coding 196.667-19 chr10 91767728 91768239 + 0.666667 NA Intergenic MLT2F|LTR|ERVL 30213 NR_108070 100507633 Hs.291528 NR_108070 ENSG00000228701 TNKS2-AS1 - TNKS2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 138-41 chr16 11292766 11293092 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11599 NM_002761 5619 Hs.2909 NM_002761 ENSG00000175646 PRM1 CT94.1|P1 protamine 1 protein-coding 153-90 chr3 15574639 15575042 + 0.666667 NA intron (NR_104315, intron 8 of 14) intron (NR_104315, intron 8 of 14) -26512 NM_001281723 686 Hs.444197 NM_001281723 ENSG00000169814 BTD - biotinidase protein-coding 153.333-345 chr5 140357249 140357550 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2795 NM_001258428 83697 Hs.550313 NM_031467 ENSG00000113073 SLC4A9 AE4 solute carrier family 4 member 9 protein-coding 168.667-206 chr7 87046869 87047254 + 0.666667 NA intron (NM_001142749, intron 1 of 21) L1MA2|LINE|L1 -6827 NM_001291990 222223 Hs.208093 NM_152748 ENSG00000164659 KIAA1324L EIG121L KIAA1324 like protein-coding 220.333-111 chr5 37947582 37948158 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_134262) promoter-TSS (NR_134262) -621 NR_134262 105374729 Hs.150642 NR_134262 ENSG00000251518 LINC02110 - long intergenic non-protein coding RNA 2110 ncRNA 141.667-61 chr12 112028118 112028471 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_024953, exon 24 of 24) 3' UTR (NM_024953, exon 24 of 24) 9421 NR_037430 100500889 NR_037430 ENSG00000266370 MIR3657 - microRNA 3657 ncRNA 144.667-141 chr2 77635791 77636056 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -113490 NR_146416 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 119.667-139 chr4 158947361 158947664 + 0.666667 NA intron (NM_152543, intron 3 of 4) intron (NM_152543, intron 3 of 4) 87717 NM_152543 152940 Hs.415576 NM_152543 ENSG00000164123 C4orf45 - chromosome 4 open reading frame 45 protein-coding 127.333-15 chr1 200070395 200070713 + 0.666667 NA intron (NM_205860, intron 5 of 7) AluJb|SINE|Alu 27729 NM_001276464 2494 Hs.33446 NM_003822 ENSG00000116833 NR5A2 B1F|B1F2|CPF|FTF|FTZ-F1|FTZ-F1beta|LRH-1|LRH1|hB1F-2 nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 protein-coding 129.667-2 chr1 36042599 36042890 + 0.666667 NA intron (NM_177422, intron 14 of 16) intron (NM_177422, intron 14 of 16) -41350 NM_014466 27285 Hs.127111 NM_014466 ENSG00000092850 TEKT2 TEKTB1|TEKTIN-T|h-tektin-t tektin 2 protein-coding 204.333-192 chr7 118374285 118374794 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 149835 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 179.667-147 chr8 133764927 133765422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12178 NR_125422 101927798 Hs.615036 NR_125422 ENSG00000253165 LOC101927798 - uncharacterized LOC101927798 ncRNA 113.333-113 chr19 28250322 28250524 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H2|LTR|ERVL-MaLR -356265 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 179.333-42 chr11 101724484 101724858 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -140664 NM_004621 7225 Hs.159003 NM_004621 ENSG00000137672 TRPC6 FSGS2|TRP6 transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 protein-coding 130.667-2 chr1 40076732 40076968 + 0.666667 NA exon (NM_000310, exon 8 of 9) exon (NM_000310, exon 8 of 9) 20402 NM_001363695 5538 Hs.3873 NM_000310 ENSG00000131238 PPT1 CLN1|INCL|PPT palmitoyl-protein thioesterase 1 protein-coding 123.667-164 chr5 119942128 119942352 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 312681 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 218-112 chr8 83311897 83312335 + 0.666667 NA Intergenic MER52A|LTR|ERV1 -91642 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 171-60 chr4 82108142 82108558 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 265641 NM_031370 3184 Hs.480073 NM_002138 ENSG00000138668 HNRNPD AUF1|AUF1A|HNRPD|P37|hnRNPD0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D protein-coding 111.667-206 chr5 72570815 72571034 + 0.666667 NA intron (NR_105008, intron 2 of 3) intron (NR_105008, intron 2 of 3) 13847 NR_105008 102503427 Hs.429280 NR_105008 LOC102503427 - uncharacterized LOC102503427 ncRNA 141.333-240 chr8 89827067 89827374 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 69404 NM_003821 8767 Hs.103755 NM_003821 ENSG00000104312 RIPK2 CARD3|CARDIAK|CCK|GIG30|RICK|RIP2 receptor interacting serine/threonine kinase 2 protein-coding 111.667-91 chr15 71944612 71944816 + 0.666667 NA intron (NM_006901, intron 15 of 41) L1ME1|LINE|L1 134160 NM_016346 10002 Hs.187354 NM_014249 ENSG00000278570 NR2E3 ESCS|PNR|RNR|RP37|rd7 nuclear receptor subfamily 2 group E member 3 protein-coding 113.333-59 chr12 20879084 20879363 + 0.666667 NA intron (NM_019844, intron 10 of 15) AluYc3|SINE|Alu 56675 NM_001349920 28234 Hs.504966 NM_019844 ENSG00000111700 SLCO1B3 HBLRR|LST-2|LST-3TM13|LST3|OATP-8|OATP1B3|OATP8|SLC21A8 solute carrier organic anion transporter family member 1B3 protein-coding 224-34 chr18 364513 365036 + 0.666667 NA intron (NM_130386, intron 2 of 9) intron (NM_130386, intron 2 of 9) -96727 NM_005131 9984 Hs.712543 NM_005131 ENSG00000079134 THOC1 HPR1|P84|P84N5 THO complex 1 protein-coding 140-79 chr4 90959435 90959756 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) MIR|SINE|MIR 724564 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 114.333-135 chr20 51871894 51872113 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9090 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 267-54 chr5 125732636 125733352 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 239733 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 172.333-14 chr10 29242763 29243102 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -46138 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 162-113 chr7 77550502 77550859 + 0.666667 NA intron (NM_001131009, intron 1 of 16) HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 12637 NM_001131009 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 169-16 chr12 5243401 5243734 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_120476) promoter-TSS (NR_120476) -416 NR_120477 101929584 Hs.436529 NR_120476 ENSG00000256115 LINC02443 - long intergenic non-protein coding RNA 2443 ncRNA 203.667-40 chr17 59606000 59606313 + 0.666667 NA intron (NM_024612, intron 17 of 17) AluSp|SINE|Alu -13533 NM_001288653 1213 Hs.491351 NM_004859 ENSG00000141367 CLTC CHC|CHC17|CLH-17|CLTCL2|Hc|MRD56 clathrin heavy chain protein-coding 182.667-135 chr5 113086627 113087152 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 8 of 18) MER5A|DNA|hAT-Charlie 110091 NR_038352 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 182.333-155 chr8 78968737 78969081 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 131380 NR_157588 112935892 NR_157588 LINC02605 - long intergenic non-protein coding RNA 2605 ncRNA 124.667-155 chr4 148120229 148120436 + 0.666667 NA intron (NR_148974, intron 4 of 6) intron (NR_148974, intron 4 of 6) 322082 NM_000901 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 164-3 chr1 39396519 39396916 + 0.666667 NA intron (NM_012090, intron 52 of 92) intron (NM_012090, intron 52 of 92) -12356 NM_015038 643314 Hs.658760 NM_015038 ENSG00000127603 KIAA0754 - KIAA0754 protein-coding 164.333-4 chr1 113430617 113430947 + 0.666667 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 40267 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 209-115 chr7 82677663 82678080 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -233915 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 169.667-162 chr5 17934686 17935109 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 127623 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 149.333-216 chr20 45525034 45525315 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9552 NM_006652 10816 Hs.370724 NM_006652 ENSG00000101446 SPINT3 HKIB9 serine peptidase inhibitor, Kunitz type 3 protein-coding 172.667-11 chr1 153450036 153450350 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 10458 NM_002963 6278 Hs.112408 NM_002963 ENSG00000143556 S100A7 PSOR1|S100A7c S100 calcium binding protein A7 protein-coding 158.333-332 chr8 132576050 132576362 + 0.666667 NA intron (NR_135913, intron 10 of 10) intron (NR_135913, intron 10 of 10) -14727 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 192-111 chr5 40255801 40256320 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 203769 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 198-27 chr11 11177313 11177757 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 175715 NM_001256686 283106 Hs.654675 NM_001256686 ENSG00000254598 CSNK2A3 CSNK2A1P casein kinase 2 alpha 3 protein-coding 129.333-135 chr4 13822445 13822803 + 0.666667 NA intron (NR_121681, intron 2 of 3) intron (NR_121681, intron 2 of 3) 167445 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 151.333-106 chr12 65942171 65942497 + 0.666667 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -60009 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 243.333-114 chr8 75586316 75586985 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 46682 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 126.667-83 chr2 117512036 117512367 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -302490 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 188.667-27 chr11 79767280 79767753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -326486 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 115.667-118 chr2 116396586 116396841 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1052898 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 138.333-213 chrX 3576893 3577196 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44793 NR_145722 109616969 NR_145722 ENSG00000212214 SNORA48B - small nucleolar RNA, H/ACA box 48B snoRNA 126.667-73 chr19 58155976 58156173 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -5285 NM_024620 79673 Hs.458377 NM_024620 ENSG00000181894 ZNF329 - zinc finger protein 329 protein-coding 184.333-78 chr2 145651556 145652048 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -935255 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 113.667-147 chr3 150021130 150021436 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -37917 NM_001079809 653659 Hs.652908 NM_001079809 TMEM183B C1ORF37DUP|C1orf37-DUP transmembrane protein 183B protein-coding 125.333-111 chr3 47889637 47889906 + 0.666667 NA intron (NM_002375, intron 8 of 18) intron (NM_002375, intron 8 of 18) 40216 NR_031595 100302232 NR_031595 ENSG00000221585 MIR1226 MIRN1226|hsa-mir-1226|mir-1226 microRNA 1226 ncRNA 194.667-118 chr5 24899564 24900036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59217 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 202.333-2 chr1 27846562 27846988 + 0.666667 NA intron (NM_138558, intron 5 of 6) MIRb|SINE|MIR 12374 NR_002997 677774 Hs.689694 NR_002997 ENSG00000252947 SCARNA1 ACA35 small Cajal body-specific RNA 1 ncRNA 148.667-348 chr7 26682022 26682320 + 0.666667 NA intron (NM_003930, intron 11 of 12) intron (NM_003930, intron 11 of 12) 44300 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 186.667-68 chr2 78452333 78452838 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -92946 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 113.667-106 chr2 76113209 76113493 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -402436 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 229.333-91 chr4 175544057 175544551 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 243372 NM_001261448 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 168-111 chr8 30825842 30826275 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -13240 NM_001009552 5516 Hs.491440 NM_004156 ENSG00000104695 PPP2CB PP2Abeta|PP2CB protein phosphatase 2 catalytic subunit beta protein-coding 145.333-64 chr12 29368426 29368726 + 0.666667 NA intron (NM_016570, intron 3 of 13) intron (NM_016570, intron 3 of 13) 12596 NM_016570 51290 Hs.339453 NM_016570 ENSG00000087502 ERGIC2 CDA14|Erv41|PTX1|cd002 ERGIC and golgi 2 protein-coding 192-35 chr11 82052686 82053034 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) L1MA1|LINE|L1 -162024 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 279.667-44 chr8 75821384 75822016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 281732 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 163.667-238 chr7 83888635 83889036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -239696 NM_012431 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 129.333-164 chr5 160318585 160318963 + 0.666667 NA intron (NR_131769, intron 1 of 7) MER45B|DNA|hAT-Tip100 -6210 NM_024565 79616 Hs.14070 NM_024565 ENSG00000135083 CCNJL - cyclin J like protein-coding 114.667-191 chr4 56327044 56327332 + 0.666667 NA intron (NM_020722, intron 10 of 10) intron (NM_020722, intron 10 of 10) 60303 NM_001323890 132949 Hs.104347 NM_181806 ENSG00000157426 AASDH ACSF4|LYS2|NRPS1098|NRPS998 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase protein-coding 113-218 chrX 95748614 95748800 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 589195 NR_003539 643486 Hs.590806 NR_003539 ENSG00000271209 BRDTP1 - bromodomain testis associated pseudogene 1 pseudo 287.667-30 chr5 39561477 39561975 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 41295 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 139.333-152 chr3 95497736 95498009 + 0.666667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 185321 NR_077228 100287639 Hs.591320 NR_077228 ENSG00000244681 MTHFD2P1 - methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 pseudo 116-78 chr2 98941822 98942147 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -5759 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 114-31 chr13 94625373 94625648 + 0.666667 NA intron (NM_180989, intron 7 of 8) L1ME4b|LINE|L1 23653 NM_180989 160897 Hs.439363 NM_180989 ENSG00000152749 GPR180 ITR G protein-coupled receptor 180 protein-coding 134-90 chr6 65759882 65760274 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -27801 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 143.667-103 chr17 71034223 71034532 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 167802 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 116.667-23 chr11 84003374 84003691 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 11 of 27) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 269748 NM_001142700 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 153.333-419 chr8 108296984 108297436 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48493 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 149.667-10 chr1 51684561 51684862 + 0.666667 NA intron (NM_148906, intron 2 of 22) AluSz|SINE|Alu -45139 NM_148905 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 142-150 chr7 101651158 101651504 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -22035 NM_138403 93408 Hs.247831 NM_138403 ENSG00000106436 MYL10 MYLC2PL|PLRLC myosin light chain 10 protein-coding 121.333-140 chr4 163942503 163942718 + 0.666667 NA intron (NM_001166373, intron 2 of 7) intron (NM_001166373, intron 2 of 7) 255101 NM_012403 23520 Hs.661161 NM_012403 ANP32C PP32R1 acidic nuclear phosphoprotein 32 family member C protein-coding 122.667-153 chr5 51042646 51042911 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72591 NR_104653 100287592 Hs.519298 NR_104653 ENSG00000251573 LINC02106 - long intergenic non-protein coding RNA 2106 ncRNA 142.667-97 chr2 65848016 65848335 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -415576 NM_181784 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 141.333-172 chr4 54745270 54745581 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 87497 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 234-19 chr13 64533295 64533820 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -457546 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 112.333-114 chr2 24090771 24090964 + 0.666667 NA intron (NR_111929, intron 2 of 5) AluJb|SINE|Alu -5652 NM_147184 9540 Hs.50649 NM_004881 ENSG00000115129 TP53I3 PIG3 tumor protein p53 inducible protein 3 protein-coding 143.333-241 chr6 63857900 63858327 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 36 of 43) intron (NM_001292009, intron 36 of 43) 51277 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 156.333-302 chr6 34605686 34606025 + 0.666667 NA intron (NM_022758, intron 3 of 3) intron (NM_022758, intron 3 of 3) -49522 NM_001252294 25803 Hs.485158 NM_012391 ENSG00000124664 SPDEF PDEF|bA375E1.3 SAM pointed domain containing ETS transcription factor protein-coding 178-33 chr12 9645901 9646275 + 0.666667 NA TTS (NR_157802) TTS (NR_157802) -1831 NR_046451 374443 Hs.569124 NR_002814 ENSG00000256594 LOC374443 - C-type lectin domain family 2 member D pseudogene pseudo 128.333-130 chr3 100568191 100568522 + 0.666667 NA intron (NM_001363876, intron 5 of 6) L1MB5|LINE|L1 -41245 NM_032787 84873 Hs.334511 NM_032787 ENSG00000144820 ADGRG7 GPR128 adhesion G protein-coupled receptor G7 protein-coding 128-80 chr4 66692534 66692870 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 415878 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 157-6 chr1 77599369 77599677 + 0.666667 NA intron (NM_001308237, intron 4 of 13) intron (NM_001308237, intron 4 of 13) 83135 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 133.667-76 chr2 122284414 122284668 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 528890 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 153.667-99 chr12 114706954 114707347 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -22975 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 185-56 chr5 39570777 39571173 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 50544 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 125.667-19 chr10 31990141 31990414 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61401 NM_001270697 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 189.667-73 chr2 101985858 101986280 + 0.666667 NA TTS (NR_103791) TTS (NR_103791) 2604 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 172.333-49 chr14 55610713 55611078 + 0.666667 NA intron (NR_073129, intron 2 of 45) intron (NR_073129, intron 2 of 45) 30688 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 124.333-2 chr1 15748982 15749293 + 0.666667 NA intron (NR_149050, intron 1 of 1) intron (NR_149050, intron 1 of 1) 753 NR_149050 110806303 Hs.615589 NR_149050 ENSG00000224459 SLC25A34-AS1 - SLC25A34 and TMEM82 antisense RNA 1 ncRNA 117.667-180 chr7 79248292 79248632 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L1MA3|LINE|L1 -204495 NR_038346 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 163.667-134 chr20 49314415 49314754 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 33901 NR_003030 692057 NR_003030 ENSG00000212304 SNORD12 HBII-99|MIR1259|MIRN1259 small nucleolar RNA, C/D box 12 snoRNA 122.667-95 chr2 163725282 163725558 + 0.666667 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 10588 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 135.667-117 chr3 64742019 64742338 + 0.666667 NA intron (NR_038264, intron 1 of 5) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -54178 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 144-156 chr9 14604367 14604635 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -72424 NM_001369462 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 119.667-194 chr9 133517745 133517967 + 0.666667 NA intron (NM_001080483, intron 3 of 4) intron (NM_001080483, intron 3 of 4) 7103 NM_001080483 389827 NM_001080483 ENSG00000187616 MYMK MYOMAKER|TMEM226|TMEM8C myomaker, myoblast fusion factor protein-coding 156.333-32 chr10 28374157 28374487 + 0.666667 NA Intergenic (ACCCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -71258 NR_134518 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 139-68 chr3 169612366 169612693 + 0.666667 NA intron (NM_001366473, intron 1 of 15) MER121|DNA|hAT? 51183 NM_001205194 2122 Hs.656395 NM_004991 ENSG00000085276 MECOM AML1-EVI-1|EVI1|KMT8E|MDS1|MDS1-EVI1|PRDM3|RUSAT2 MDS1 and EVI1 complex locus protein-coding 174-34 chr14 84005570 84006002 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -1266146 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 120-75 chr2 236618988 236619199 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49268 NM_020311 57007 Hs.471751 NM_020311 ENSG00000144476 ACKR3 CMKOR1|CXC-R7|CXCR-7|CXCR7|GPR159|RDC-1|RDC1 atypical chemokine receptor 3 protein-coding 160.667-255 chr5 168654196 168654502 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52578 NR_130737 101927969 Hs.661903 NR_130737 LOC101927969 - uncharacterized LOC101927969 ncRNA 124.667-15 chr1 173753892 173754223 + 0.666667 NA intron (NM_014458, intron 5 of 11) intron (NM_014458, intron 5 of 11) 39076 NM_014458 27252 Hs.495035 NM_014458 ENSG00000076321 KLHL20 KHLHX|KLEIP|KLHLX kelch like family member 20 protein-coding 126.333-23 chr11 15267547 15267775 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 118559 NM_001278313 387755 Hs.591997 NM_001031853 ENSG00000188487 INSC - INSC spindle orientation adaptor protein protein-coding 236-26 chr15 64500565 64500992 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 1358 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 162-61 chr2 54820102 54820409 + 0.666667 NA intron (NM_001039753, intron 3 of 40) intron (NM_001039753, intron 3 of 40) 95243 NM_001039753 400954 Hs.656692 NM_001039753 ENSG00000214595 EML6 - EMAP like 6 protein-coding 187.667-50 chr14 89168909 89169436 + 0.666667 NA intron (NM_001085471, intron 6 of 6) AluJb|SINE|Alu 248061 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 113.333-18 chr1 212572948 212573253 + 0.666667 NA intron (NM_001030287, intron 1 of 3) L1ME2z|LINE|L1 7766 NM_001030287 467 Hs.460 NM_001674 ENSG00000162772 ATF3 - activating transcription factor 3 protein-coding 345.333-34 chr5 153475772 153476527 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -14375 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 119.333-113 chr17 80666262 80666570 + 0.666667 NA intron (NM_020761, intron 3 of 33) intron (NM_020761, intron 3 of 33) 121578 NM_020761 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 225.333-25 chr11 37763254 37763893 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -175028 NR_135110 105376633 Hs.135690 NR_135110 ENSG00000254516 LINC02760 - long intergenic non-protein coding RNA 2760 ncRNA 112-143 chr3 168381733 168381957 + 0.666667 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) L1MA2|LINE|L1 132323 NR_021485 93556 Hs.478158 NR_021485 EGFEM1P C3orf50|NCRNA00259 EGF like and EMI domain containing 1, pseudogene pseudo 133.333-103 chr3 13973352 13973689 + 0.666667 NA intron (NR_002223, intron 1 of 2) L1PBa|LINE|L1 36213 NR_002223 348825 Hs.529180 NR_002223 ENSG00000180438 TPRXL TPRX3P tetrapeptide repeat homeobox like pseudo 195.667-62 chr17 67539877 67540321 + 0.666667 NA intron (NM_181671, intron 2 of 9) (ATTTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -68514 NR_030385 693131 NR_030385 ENSG00000263690 MIR548D2 MIRN548D2 microRNA 548d-2 ncRNA 143-121 chr8 18617075 18617407 + 0.666667 NA intron (NM_015310, intron 11 of 15) intron (NM_015310, intron 11 of 15) 191626 NM_206909 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 156.667-65 chr11 82035834 82036134 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) intron (NR_120571, intron 5 of 7) -145148 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 269.333-21 chr14 55945783 55946206 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -149320 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 154-59 chr15 69639156 69639615 + 0.666667 NA intron (NR_126437, intron 3 of 5) L1MD1|LINE|L1 47185 NR_126437 104472713 Hs.430824 NR_126437 ENSG00000245750 PCAT29 - prostate cancer associated transcript 29 ncRNA 173.667-180 chr8 117704923 117705407 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 184452 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 158.667-330 chr8 121612479 121612837 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_005328, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_005328, exon 4 of 4) -26688 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 217.333-78 chr2 236382878 236383346 + 0.666667 NA intron (NR_073043, intron 11 of 19) L1M3e|LINE|L1 -118767 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 121-85 chr21 30697510 30697817 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21114 NM_001164435 100288323 Hs.580877 NM_001164435 ENSG00000231068 KRTAP21-3 - keratin associated protein 21-3 protein-coding 131.333-24 chr10 32579108 32579475 + 0.666667 NA intron (NM_001321115, intron 17 of 43) intron (NM_001321115, intron 17 of 43) 133151 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 121.667-178 chr6 46454819 46455039 + 0.666667 NA intron (NM_001251973, intron 2 of 4) intron (NM_001251973, intron 2 of 4) 36394 NM_001251974 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 140.333-169 chr4 111683003 111683255 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -462325 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 132.333-147 chr6 27522707 27523013 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49742 NM_007149 7738 Hs.158174 NM_007149 ENSG00000096654 ZNF184 kr-ZNF3 zinc finger protein 184 protein-coding 150.333-106 chr14 46057915 46058280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6062 NR_102701 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 127.333-139 chr5 45918754 45919016 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -222505 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 112.333-32 chr10_GL383545v1_alt 36127 36438 + 0.666667 NA intron (NR_138082, intron 1 of 1) intron (NR_138082, intron 1 of 1) 33264 NR_138082 101060171 Hs.568842 NR_138082 ARMC4P1 - armadillo repeat containing 4 pseudogene 1 pseudo 145-19 chr11 103175430 103175797 + 0.666667 NA intron (NM_001377, intron 36 of 88) intron (NM_001377, intron 36 of 88) 66187 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 206-182 chr8 113081810 113082302 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 5 of 66) L1MA5|LINE|L1 295096 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 203-34 chr14 83291485 83291944 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 649082 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 115-43 chr12 46784327 46784547 + 0.666667 NA intron (NM_018018, intron 7 of 16) intron (NM_018018, intron 7 of 16) 41560 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 139-7 chr1 217893829 217894081 + 0.666667 NA intron (NR_048550, intron 1 of 3) LTR78|LTR|ERV1 1055 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 145-7 chr1 211175043 211175379 + 0.666667 NA Intergenic LTR28C|LTR|ERV1 -41063 NM_172362 3756 Hs.553187 NM_002238 ENSG00000143473 KCNH1 EAG|EAG1|Kv10.1|TMBTS|ZLS1|h-eag|hEAG1 potassium voltage-gated channel subfamily H member 1 protein-coding 120.333-23 chr10 85919920 85920171 + 0.666667 NA intron (NM_017551, intron 4 of 15) intron (NM_017551, intron 4 of 15) 342314 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 127.667-185 chr8 127000695 127000926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12344 NR_045262 100750225 Hs.571530 NR_045262 ENSG00000253438 PCAT1 PCA1|PCAT-1 prostate cancer associated transcript 1 ncRNA 160-18 chr10 76403273 76403614 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) intron (NM_001305581, intron 6 of 6) -484601 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 184.333-111 chr4 43708807 43709210 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -216465 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 192-94 chr3 53988852 53989265 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -97199 NM_021237 58515 Hs.58471 NM_021237 ENSG00000113811 SELENOK HSPC030|HSPC297|SELK selenoprotein K protein-coding 199-115 chr8 83456528 83456982 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 52997 NR_122034 103352670 Hs.399852 NR_122034 ENSG00000253898 LINC01419 LVCAT7|TCONS_00014497 long intergenic non-protein coding RNA 1419 ncRNA 123-28 chr11 42357883 42358123 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104313 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 186.333-120 chr5 21757542 21758024 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 13 of 14) L2|LINE|L2 -126671 NR_132787 106635539 NR_132787 SNORA105A - small nucleolar RNA, H/ACA box 105A snoRNA 154-93 chr3 99121007 99121423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219520 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 134.667-20 chr10 55054035 55054395 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) L1PA12|LINE|L1 -252924 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 119.667-130 chr4 31335939 31336258 + 0.666667 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 164954 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 148.333-10 chr1 70238055 70238337 + 0.666667 NA intron (NM_001190987, intron 7 of 12) intron (NM_001190987, intron 7 of 12) 16816 NR_146810 9295 Hs.479693 NM_004768 ENSG00000116754 SRSF11 NET2|SFRS11|dJ677H15.2|p54 serine and arginine rich splicing factor 11 protein-coding 163-19 chr14 50702378 50702737 + 0.666667 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 -34251 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 169.333-38 chr11 64493193 64493660 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 44369 NR_073177 100996455 Hs.634142 NR_073177 ENSG00000181908 LINC02724 - long intergenic non-protein coding RNA 2724 ncRNA 157.667-62 chr11 108101600 108101926 + 0.666667 NA intron (NM_003478, intron 18 of 18) intron (NM_003478, intron 18 of 18) -19804 NM_000019 38 Hs.232375 NM_000019 ENSG00000075239 ACAT1 ACAT|MAT|T2|THIL acetyl-CoA acetyltransferase 1 protein-coding 112-35 chr11 107600669 107600999 + 0.666667 NA intron (NM_001308018, intron 1 of 12) intron (NM_001308018, intron 1 of 12) 9687 NM_018712 55531 Hs.495779 NM_018712 ENSG00000110675 ELMOD1 - ELMO domain containing 1 protein-coding 155-60 chr2 38187615 38187931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 56668 NR_027252 285154 Hs.353894 NM_173652 ENSG00000232973 CYP1B1-AS1 C2orf58 CYP1B1 antisense RNA 1 ncRNA 125-29 chr12 66988765 66989114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107345 NR_120490 102724421 Hs.135774 NR_120490 ENSG00000257083 LOC102724421 - uncharacterized LOC102724421 ncRNA 131-12 chr10 48785785 48786063 + 0.666667 NA intron (NM_020945, intron 19 of 61) L1MD2|LINE|L1 100461 NM_020945 57705 Hs.287379 NM_020945 ENSG00000128815 WDFY4 C10orf64 WDFY family member 4 protein-coding 155.667-128 chr17 28262719 28263089 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 15460 NR_002181 23614 Hs.744962 NR_002181 ENSG00000265060 PPY2P PPY2 pancreatic polypeptide 2, pseudogene pseudo 159.667-155 chr19 7417935 7418262 + 0.666667 NA intron (NM_015318, intron 1 of 20) L2|LINE|L2 -21590 NM_001130955 23370 Hs.465761 NM_015318 ENSG00000104880 ARHGEF18 P114-RhoGEF|RP78|SA-RhoGEF|p114RhoGEF Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18 protein-coding 154.333-287 chr6 35017417 35017694 + 0.666667 NA exon (NM_015245, exon 11 of 24) exon (NM_015245, exon 11 of 24) 123784 NM_001366324 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 136.333-19 chr10 49284983 49285302 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 13751 NR_108038 100506769 Hs.562293 NR_108038 C10orf71-AS1 - C10orf71 antisense RNA 1 ncRNA 201.667-4 chr1 242206142 242206611 + 0.666667 NA intron (NM_001320272, intron 6 of 10) intron (NM_001320272, intron 6 of 10) -207278 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 114.667-102 chr16 74116045 74116301 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 99348 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 124-45 chr16 11793596 11793821 + 0.666667 NA intron (NM_014153, intron 1 of 22) intron (NM_014153, intron 1 of 22) 3550 NM_014153 29066 Hs.371856 NM_014153 ENSG00000122299 ZC3H7A HSPC055|ZC3H7|ZC3HDC7 zinc finger CCCH-type containing 7A protein-coding 142.333-269 chrX 95380193 95380546 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -317143 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 138.667-49 chr12 80268096 80268444 + 0.666667 NA intron (NM_001368062, intron 27 of 62) MIR|SINE|MIR 58817 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 148.667-321 chr5 120117847 120118155 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -346277 NM_016644 51334 Hs.157461 NM_016644 ENSG00000184838 PRR16 DSC54|LARGEN proline rich 16 protein-coding 196.667-152 chr8 27478381 27478874 + 0.666667 NA intron (NM_001347707, intron 1 of 7) intron (NM_001347707, intron 1 of 7) 634 NM_000742 1135 Hs.57718 NM_000742 ENSG00000120903 CHRNA2 - cholinergic receptor nicotinic alpha 2 subunit protein-coding 216-108 chr6 110342620 110343152 + 0.666667 NA intron (NM_001123364, intron 1 of 4) L1MB7|LINE|L1 -12828 NM_001354595 728464 Hs.634429 NM_001123364 ENSG00000053328 METTL24 C6orf186 methyltransferase like 24 protein-coding 156.333-123 chr15 39484494 39484941 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -96362 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 396-14 chr6 609657 610620 + 0.666667 NA non-coding (NR_073064, exon 9 of 30) non-coding (NR_073064, exon 9 of 30) 46826 NM_148959 135458 Hs.669039 NM_148959 ENSG00000188996 HUS1B - HUS1 checkpoint clamp component B protein-coding 151-42 chr15 98079668 98079974 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 8932 NR_120325 101927332 NR_120325 LINC01582 - long intergenic non-protein coding RNA 1582 ncRNA 180-47 chr18 66024468 66024848 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 273646 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 123-46 chr15 65713392 65713638 + 0.666667 NA intron (NM_005848, intron 14 of 31) L1MC4|LINE|L1 5817 NR_039736 100616379 NR_039736 ENSG00000264737 MIR4511 mir-4511 microRNA 4511 ncRNA 138-100 chr6 90219389 90219662 + 0.666667 NA intron (NM_001170794, intron 1 of 6) intron (NM_001170794, intron 1 of 6) 77318 NM_021813 60468 Hs.269764 NM_021813 ENSG00000112182 BACH2 BTBD25|IMD60 BTB domain and CNC homolog 2 protein-coding 128-95 chr5 111784759 111785013 + 0.666667 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -26668 NM_001142476 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 153-144 chr8 80426834 80427257 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58548 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 137.333-196 chr8 89903714 89904026 + 0.666667 NA intron (NM_001126111, intron 1 of 5) Charlie4a|DNA|hAT-Charlie 1300 NM_001126111 734 Hs.436445 NM_004337 ENSG00000164823 OSGIN2 C8orf1|hT41 oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 protein-coding 148.667-197 chr2 122627948 122628342 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR 445336 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 166.667-243 chr9 17490141 17490478 + 0.666667 NA intron (NM_001365029, intron 25 of 25) intron (NM_001365029, intron 25 of 25) -88757 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 193.333-80 chr18 63820208 63820631 + 0.666667 NA Intergenic MER96|DNA|hAT-Tip100 42642 NM_001261830 8710 Hs.138202 NM_003784 ENSG00000166396 SERPINB7 MEGSIN|PPKN|TP55 serpin family B member 7 protein-coding 161.333-7 chr1 89885602 89885933 + 0.666667 NA intron (NM_001134479, intron 2 of 2) intron (NM_001134479, intron 2 of 2) 63828 NM_018103 55144 Hs.482087 NM_018103 ENSG00000171492 LRRC8D LRRC5 leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D protein-coding 114.333-227 chr8 107158986 107159314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 177365 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 122-68 chr22 28446631 28446866 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MSTB|LTR|ERVL-MaLR -13121 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 123.333-140 chr22 19589687 19589872 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -22940 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 149.333-408 chr8 129664540 129664944 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 15497 NR_130917 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 135-62 chr3 26365554 26365906 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -257076 NM_052953 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 115.667-159 chr4 32561196 32561407 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 210263 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 197.333-92 chr18 12647895 12648244 + 0.666667 NA intron (NM_020148, intron 1 of 15) L1MC3|LINE|L1 8663 NM_001128627 56907 Hs.515283 NM_020148 ENSG00000134278 SPIRE1 Spir-1 spire type actin nucleation factor 1 protein-coding 151.667-398 chr9 133745949 133746312 + 0.666667 NA Intergenic AluSx4|SINE|Alu -6175 NM_007101 1757 Hs.198003 NM_007101 ENSG00000123453 SARDH BPR-2|DMGDHL1|SAR|SARD|SDH sarcosine dehydrogenase protein-coding 175.667-19 chr10 107752706 107753098 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 316391 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 121.333-105 chr21 27472236 27472459 + 0.666667 NA Intergenic LTR16E2|LTR|ERVL -250032 NR_024357 54088 Hs.570434 NR_024357 ENSG00000225298 LINC00113 C21orf23|NCRNA00113 long intergenic non-protein coding RNA 113 ncRNA 115.333-82 chr15 60123068 60123402 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 118924 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 188-47 chr18 6778771 6779198 + 0.666667 NA intron (NM_001366230, intron 1 of 17) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy -49122 NR_134645 101927168 Hs.242240 NR_134645 LOC101927168 - uncharacterized LOC101927168 ncRNA 239.667-45 chr3 116873356 116873913 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23267 NR_039649 100616485 NR_039649 ENSG00000265433 MIR4447 - microRNA 4447 ncRNA 144.333-219 chr5 134987294 134987573 + 0.666667 NA intron (NM_178019, intron 2 of 7) L1MB4|LINE|L1 19526 NM_178019 347732 Hs.631804 NM_178019 ENSG00000152705 CATSPER3 CACRC cation channel sperm associated 3 protein-coding 136-4 chr1 196662225 196662531 + 0.666667 NA intron (NM_001014975, intron 1 of 9) L1MEg|LINE|L1 10500 NM_000186 3075 Hs.363396 NM_000186 ENSG00000000971 CFH AHUS1|AMBP1|ARMD4|ARMS1|CFHL3|FH|FHL1|HF|HF1|HF2|HUS complement factor H protein-coding 117.667-92 chr2 116419681 116419995 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1076023 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 112.333-169 chr3 132638053 132638260 + 0.666667 NA intron (NM_032169, intron 5 of 19) MIRb|SINE|MIR -16290 NM_198329 79876 Hs.170737 NM_024818 ENSG00000081307 UBA5 EIEE44|SCAR24|THIFP1|UBE1DC1 ubiquitin like modifier activating enzyme 5 protein-coding 152.667-382 chr8 116204139 116204448 + 0.666667 NA intron (NR_046215, intron 4 of 13) intron (NR_046215, intron 4 of 13) 120766 NR_046215 100859921 Hs.552281 NR_046215 ENSG00000249917 LINC00536 - long intergenic non-protein coding RNA 536 ncRNA 155-74 chr2 212211245 212211585 + 0.666667 NA intron (NM_001042599, intron 1 of 26) intron (NM_001042599, intron 1 of 26) 214945 NR_031643 100313771 NR_031643 ENSG00000221782 MIR548F2 MIR548F-2|MIRN548F2|hsa-mir-548f-2 microRNA 548f-2 ncRNA 163.333-298 chr9 132604336 132604738 + 0.666667 NA intron (NR_136309, intron 18 of 18) X7A_LINE|LINE|CR1 21931 NM_020064 56751 Hs.283809 NM_020064 ENSG00000125492 BARHL1 - BarH like homeobox 1 protein-coding 189.666-12 chr15 60096506 60097073 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 92478 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 158.667-156 chr2 69223483 69223903 + 0.666667 NA intron (NM_032208, intron 17 of 17) intron (NM_032208, intron 17 of 17) 120011 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 141.333-71 chr15 73266826 73267242 + 0.666667 NA intron (NM_002499, intron 16 of 28) AluY|SINE|Alu -32876 NR_162148 113219462 NR_162148 MIR12135 - microRNA 12135 ncRNA 160-14 chr10 18301461 18301794 + 0.666667 NA intron (NM_000724, intron 1 of 12) intron (NM_000724, intron 1 of 12) -39082 NM_201590 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 128-48 chr2 116772673 116772997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1041856 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 135.667-165 chr6 161999106 161999446 + 0.666667 NA intron (NM_013988, intron 2 of 8) intron (NM_013988, intron 2 of 8) 528299 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 211.667-71 chr2 187977402 187977956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 310012 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 137-58 chr21 46330772 46331019 + 0.666667 NA intron (NM_001315529, intron 2 of 46) intron (NM_001315529, intron 2 of 46) 6228 NM_001315529 5116 Hs.474069 NM_006031 ENSG00000160299 PCNT KEN|MOPD2|PCN|PCNT2|PCNTB|PCTN2|SCKL4 pericentrin protein-coding 215.333-197 chr8 87889131 87889755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15428 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 111.667-95 chr16 25646250 25646449 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45610 NM_006040 9951 Hs.655275 NM_006040 ENSG00000182601 HS3ST4 3-OST-4|30ST4|3OST4|h3-OST-4 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 4 protein-coding 149.333-8 chr1 45482006 45482294 + 0.666667 NA intron (NM_007170, intron 1 of 10) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 9013 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 118.333-25 chr10 14577831 14578088 + 0.666667 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) intron (NM_001282695, intron 2 of 5) -5584 NM_001320735 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 186.333-90 chr20 46017216 46017625 + 0.666667 NA TTS (NM_004994) TTS (NM_004994) -4266 NM_001134771 57468 Hs.21413 NM_020708 ENSG00000124140 SLC12A5 EIEE34|EIG14|KCC2|hKCC2 solute carrier family 12 member 5 protein-coding 142.667-78 chr17 15312165 15312589 + 0.666667 NA exon (NM_031898, exon 7 of 9) exon (NM_031898, exon 7 of 9) 29220 NM_031898 64518 Hs.414648 NM_031898 ENSG00000125409 TEKT3 - tektin 3 protein-coding 130-6 chr1 215906180 215906564 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 38 of 71) MIRb|SINE|MIR -166093 NR_125993 102723833 Hs.232072 NR_125992 ENSG00000233620 LOC102723833 - uncharacterized LOC102723833 ncRNA 116-67 chr19 29524154 29524363 + 0.666667 NA intron (NR_040029, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 1494 NR_040029 284395 Hs.631601 NR_040029 ENSG00000264515 LOC284395 - uncharacterized LOC284395 ncRNA 159.667-286 chr6 153249162 153249571 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118084 NM_012419 26575 Hs.166313 NM_012419 ENSG00000091844 RGS17 RGS-17|RGSZ2|hRGS17 regulator of G protein signaling 17 protein-coding 111.667-60 chr12 30229445 30229631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -444779 NM_175861 83857 Hs.401954 NM_031920 ENSG00000133687 TMTC1 ARG99|OLF|TMTC1A transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 1 protein-coding 151.667-338 chr7 68907671 68907994 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 689792 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 179.333-48 chr12 11774647 11775020 + 0.666667 NA intron (NM_001987, intron 2 of 7) intron (NM_001987, intron 2 of 7) 124979 NM_001987 2120 Hs.504765 NM_001987 ENSG00000139083 ETV6 TEL|TEL/ABL|THC5 ETS variant 6 protein-coding 171.333-70 chr19 30270892 30271257 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101310 NM_014717 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 118-116 chr6 144598606 144598847 + 0.666667 NA intron (NM_007124, intron 50 of 73) MER4D1|LTR|ERV1 193071 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 135.333-139 chr5 45777568 45777818 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -81313 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 225-16 chr12 89654133 89654714 + 0.666667 NA intron (NM_001001323, intron 2 of 21) intron (NM_001001323, intron 2 of 21) 54415 NM_001366525 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 218.667-79 chr4 181739304 181739790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90426 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 130.667-178 chr6 38744758 38745083 + 0.666667 NA intron (NM_001371, intron 7 of 91) L1ME3G|LINE|L1 29609 NM_001206927 1769 Hs.520106 NM_001371 ENSG00000124721 DNAH8 ATPase|hdhc9 dynein axonemal heavy chain 8 protein-coding 144.667-174 chr20 59873843 59874219 + 0.666667 NA exon (NM_014258, exon 35 of 45) exon (NM_014258, exon 35 of 45) 59606 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 123.333-41 chr10 100639163 100639427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -96101 NM_001304569 5076 Hs.155644 NM_000278 ENSG00000075891 PAX2 FSGS7|PAPRS paired box 2 protein-coding 112-125 chr20 45710250 45710465 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -5177 NR_037411 100500897 NR_037411 ENSG00000266071 MIR3617 - microRNA 3617 ncRNA 202-185 chr8 117774426 117774730 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 146335 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 142.667-4 chr1 70985181 70985451 + 0.666667 NA intron (NM_198719, intron 2 of 3) intron (NM_198719, intron 2 of 3) -61190 NR_038420 100132618 Hs.720513 NR_038420 ZRANB2-AS1 - ZRANB2 antisense RNA 1 ncRNA 143-72 chr2 118375930 118376233 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -189695 NR_144530 100506797 Hs.116176 NR_144530 ENSG00000226856 THORLNC THOR testis associated oncogenic lncRNA ncRNA 161.333-98 chr15 58122034 58122442 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3E|LINE|L1 -15931 NM_001320636 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 196.333-34 chr13 42504050 42504623 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -58400 NM_033012 8600 Hs.333791 NM_003701 ENSG00000120659 TNFSF11 CD254|ODF|OPGL|OPTB2|RANKL|TNLG6B|TRANCE|hRANKL2|sOdf TNF superfamily member 11 protein-coding 188.667-12 chr1 109105752 109106225 + 0.666667 NA TTS (NM_001366201) TTS (NM_001366201) 5795 NR_003023 677766 Hs.550815 NR_003023 ENSG00000278249 SCARNA2 HBII-382|mgU2-25/61 small Cajal body-specific RNA 2 ncRNA 125-51 chr18 8685097 8685370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22388 NR_120598 100287082 Hs.439434 NR_120598 ENSG00000265962 GACAT2 MTCL1-AS1|MTCL1AS1 gastric cancer associated transcript 2 ncRNA 169.667-83 chr16 12838998 12839459 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -35341 NM_018340 55313 Hs.460002 NM_018340 ENSG00000103381 CPPED1 CSTP1 calcineurin like phosphoesterase domain containing 1 protein-coding 179.333-90 chr2 17463448 17463942 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54745 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 189.667 chr1 22394544 22394952 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -57103 NM_001083621 9923 Hs.418966 NM_014870 ENSG00000184677 ZBTB40 ZNF923 zinc finger and BTB domain containing 40 protein-coding 125.667-123 chr3 109442055 109442389 + 0.666667 NA intron (NR_109841, intron 2 of 4) L1M1|LINE|L1 32232 NR_109842 401082 Hs.477089 NM_001145553 ENSG00000228980 LINC01205 - long intergenic non-protein coding RNA 1205 ncRNA 172-97 chr6 91932799 91933166 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -242554 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 182-32 chr14 96814518 96814931 + 0.666667 NA intron (NM_003384, intron 1 of 12) L1ME4b|LINE|L1 17342 NM_003384 7443 Hs.422662 NM_003384 ENSG00000100749 VRK1 PCH1|PCH1A VRK serine/threonine kinase 1 protein-coding 169.333-271 chr8 123385035 123385411 + 0.666667 NA intron (NM_014109, intron 1 of 27) intron (NM_014109, intron 1 of 27) 11224 NM_014109 29028 Hs.370834 NM_014109 ENSG00000156802 ATAD2 ANCCA|CT137|PRO2000 ATPase family AAA domain containing 2 protein-coding 146-79 chr22 30812560 30812846 + 0.666667 NA intron (NM_001282740, intron 1 of 12) L1ME3G|LINE|L1 -9813 NM_001282741 23762 Hs.517546 NM_030758 ENSG00000184792 OSBP2 HLM|ORP-4|ORP4|OSBPL1|OSBPL4 oxysterol binding protein 2 protein-coding 152.333-363 chr8 5227485 5227775 + 0.666667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -232716 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 132-41 chr14 45328185 45328541 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75161 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 154.667-289 chr4 151424302 151424603 + 0.666667 NA intron (NM_001348694, intron 1 of 12) intron (NM_001348694, intron 1 of 12) 15276 NM_001109977 729830 Hs.633810 NM_001109977 ENSG00000164142 FAM160A1 - family with sequence similarity 160 member A1 protein-coding 157.333-304 chr6 54283893 54284220 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -24385 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 112.667-274 chr8 136311100 136311411 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219543 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 140-63 chr2 100353390 100353712 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30818 NM_198461 164832 Hs.21380 NM_198461 ENSG00000170500 LONRF2 RNF192 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 protein-coding 121.667-108 chr20 2912735 2912986 + 0.666667 NA intron (NM_080840, intron 1 of 22) intron (NM_080840, intron 1 of 22) -10347 NM_080841 5786 Hs.269577 NM_002836 ENSG00000132670 PTPRA HEPTP|HLPR|HPTPA|HPTPalpha|LRP|PTPA|PTPRL2|R-PTP-alpha|RPTPA protein tyrosine phosphatase receptor type A protein-coding 133.333-109 chr3 88128784 88129036 + 0.666667 NA exon (NM_001350134, exon 5 of 9) exon (NM_001350134, exon 5 of 9) 20956 NM_001195308 8545 Hs.444818 NM_003663 ENSG00000163320 CGGBP1 CGGBP|p20-CGGBP CGG triplet repeat binding protein 1 protein-coding 156.333-126 chr15 70211885 70212201 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114126 NM_001282980 7090 Hs.287362 NM_005078 ENSG00000140332 TLE3 ESG|ESG3|GRG3|HsT18976 TLE family member 3, transcriptional corepressor protein-coding 153.333-195 chr2 57615727 57616121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -291727 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 156-139 chr8 62028145 62028501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 138484 NR_149085 111082988 Hs.521600 NR_149085 ENSG00000254120 LINC02155 - long intergenic non-protein coding RNA 2155 ncRNA 191-48 chr5 58338141 58338557 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121737 NM_006622 10769 Hs.398157 NM_006622 ENSG00000145632 PLK2 SNK|hPlk2|hSNK polo like kinase 2 protein-coding 186.667-48 chr16 71881195 71881624 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001318239) promoter-TSS (NM_001318239) -933 NM_001318239 55565 Hs.744055 NM_017530 ENSG00000102984 ZNF821 - zinc finger protein 821 protein-coding 151-49 chr19 634136 634488 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_005035) promoter-TSS (NM_005035) -775 NM_005035 5442 Hs.254113 NM_005035 ENSG00000099821 POLRMT APOLMT|MTRNAP|MTRPOL|h-mtRPOL RNA polymerase mitochondrial protein-coding 206-101 chr22 33169528 33170125 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 61297 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 135-37 chr17 48549218 48549582 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001330323, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001330323, exon 5 of 5) -4369 NM_002145 3212 Hs.514289 NM_002145 ENSG00000173917 HOXB2 HOX2|HOX2H|Hox-2.8|K8 homeobox B2 protein-coding 115.667-204 chr8 30180517 30180717 + 0.666667 NA exon (NM_006571, exon 6 of 7) exon (NM_006571, exon 6 of 7) 24248 NM_006571 10671 Hs.158427 NM_006571 ENSG00000104671 DCTN6 WS-3|WS3|p27 dynactin subunit 6 protein-coding 112.333-99 chr17 74644418 74644589 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -20765 NM_181449 342510 Hs.158954 NM_181449 ENSG00000186407 CD300E CD300LE|CLM-2|CLM2|CMRF35-A5|IREM-2|IREM2|PIgR-2|PIgR2 CD300e molecule protein-coding 150-58 chr17 43448049 43448400 + 0.666667 NA intron (NR_146952, intron 1 of 1) L1MD|LINE|L1 3418 NR_031751 100313779 NR_031751 ENSG00000284344 MIR2117 - microRNA 2117 ncRNA 200.333-36 chr13 66833413 66833877 + 0.666667 NA intron (NR_046527, intron 1 of 5) intron (NR_046527, intron 1 of 5) 8476 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 154.667-419 chrX 66212299 66212683 + 0.666667 NA intron (NM_001367241, intron 15 of 18) L1MA4A|LINE|L1 44741 NM_001367234 9843 Hs.31720 NM_014799 ENSG00000089472 HEPH CPL hephaestin protein-coding 138.333-57 chr14 43761530 43761847 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 745595 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 148.667-325 chr5 163527229 163527508 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 21749 NM_013283 27430 Hs.54642 NM_013283 ENSG00000038274 MAT2B MAT-II|MATIIbeta|Nbla02999|SDR23E1|TGR methionine adenosyltransferase 2B protein-coding 125-2 chr1 44663753 44664101 + 0.666667 NA intron (NM_001300748, intron 1 of 2) AluJb|SINE|Alu 7129 NR_145816 109623472 NR_145816 SNORD145 - small nucleolar RNA, C/D box 145 snoRNA 211-4 chr1 91580234 91580679 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 79348 NM_001134420 8317 Hs.533573 NM_003503 ENSG00000097046 CDC7 CDC7L1|HsCDC7|Hsk1|huCDC7 cell division cycle 7 protein-coding 174-23 chr12 106378631 106379110 + 0.666667 NA intron (NM_001160708, intron 8 of 27) intron (NM_001160708, intron 8 of 27) 20788 NM_001160708 55703 Hs.62696 NM_018082 ENSG00000013503 POLR3B C128|HLD8|INMAP|RPC2 RNA polymerase III subunit B protein-coding 209.667-24 chr10 103167016 103167330 + 0.666667 NA intron (NM_001351187, intron 3 of 21) AluSx1|SINE|Alu 9884 NM_001351189 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 183.333-99 chr21 28138735 28139250 + 0.666667 NA intron (NR_126012, intron 5 of 5) MLT1D-int|LTR|ERVL-MaLR 48589 NR_126011 284825 Hs.651529 NR_126010 ENSG00000232079 LINC01697 - long intergenic non-protein coding RNA 1697 ncRNA 118.667-57 chr12 76527479 76527802 + 0.666667 NA intron (NM_001003712, intron 1 of 22) intron (NM_001003712, intron 1 of 22) 32131 NM_001319652 114882 Hs.430849 NM_020841 ENSG00000091039 OSBPL8 MST120|MSTP120|ORP8|OSBP10 oxysterol binding protein like 8 protein-coding 190.333-66 chr2 18787326 18787842 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -198004 NM_001199104 100526794 Hs.744358 NM_001199103 ENSG00000250741 NT5C1B-RDH14 AIRP|NT5C1B|cN-IB|cN1B NT5C1B-RDH14 readthrough protein-coding 126.667-158 chr6 127075602 127075858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42941 NM_032784 84870 Hs.135254 NM_032784 ENSG00000146374 RSPO3 CRISTIN1|PWTSR|THSD2 R-spondin 3 protein-coding 138.667-223 chrX 56379397 56379734 + 0.666667 NA Intergenic SVA_C|Retroposon|SVA 146407 NR_136704 11279 Hs.646614 NM_007250 ENSG00000102349 KLF8 BKLF3|ZNF741 Kruppel like factor 8 protein-coding 205.333-85 chr15 85555449 85555863 + 0.666667 NA intron (NM_007200, intron 5 of 36) intron (NM_007200, intron 5 of 36) -64294 NM_001270546 11214 Hs.459211 NM_006738 ENSG00000170776 AKAP13 AKAP-13|AKAP-Lbc|ARHGEF13|BRX|HA-3|Ht31|LBC|PRKA13|PROTO-LB|PROTO-LBC|c-lbc|p47 A-kinase anchoring protein 13 protein-coding 148.333-346 chr6 128783018 128783304 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -99977 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 159.333-165 chr2 126068561 126068969 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49220 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 176.667-158 chr9 83699000 83699271 + 0.666667 NA intron (NM_013438, intron 1 of 10) L1MB3|LINE|L1 -8700 NR_135839 105376114 Hs.9589 NR_135839 ENSG00000254473 LOC105376114 - uncharacterized LOC105376114 ncRNA 163-66 chr5 92485744 92486082 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1085430 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 146-72 chr20 54338438 54338732 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 130498 NM_002623 5203 Hs.91161 NM_002623 ENSG00000101132 PFDN4 C1|PFD4 prefoldin subunit 4 protein-coding 147-100 chr4 54421086 54421322 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 88312 NR_147160 105377656 Hs.157697 NR_147160 LINC02283 - long intergenic non-protein coding RNA 2283 ncRNA 115.667-184 chr5 172299818 172300082 + 0.666667 NA Intergenic MER34B-int|LTR|ERV1 14353 NR_130933 100288254 Hs.531911 NM_001007542 LOC100288254 - uncharacterized LOC100288254 ncRNA 135-7 chr1 212417665 212417891 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2877 NM_001198862 55248 Hs.445386 NM_018252 ENSG00000065600 PACC1 C1orf75|PAC|TMEM206 proton activated chloride channel 1 protein-coding 114.667-139 chr2 136742510 136742807 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22887 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 187.333-47 chr12 65903342 65903797 + 0.666667 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -21244 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 162.667-268 chr8 82692017 82692413 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -219889 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 227-54 chr7 28872143 28872552 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 85983 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 157.333-34 chr1 191501094 191501433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -272765 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 121.333-155 chr6 39725145 39725396 + 0.666667 NA exon (NM_145027, exon 1 of 23) exon (NM_145027, exon 1 of 23) 138 NM_001289020 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 125.667-36 chr11 87633310 87633567 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 85973 NR_135090 105369423 Hs.125442 NR_135090 ENSG00000255183 LINC02711 - long intergenic non-protein coding RNA 2711 ncRNA 162.333-222 chr6 96998471 96998845 + 0.666667 NA intron (NM_001286251, intron 3 of 8) intron (NM_001286251, intron 3 of 8) -11418 NR_136579 114792 Hs.45056 NM_052904 ENSG00000186231 KLHL32 BKLHD5|KIAA1900|UG0030H05|dJ21F7.1 kelch like family member 32 protein-coding 150.333-196 chr2 72355612 72355924 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 17 of 19) intron (NR_135774, intron 17 of 19) -207906 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 128.667-39 chr12 7513232 7513486 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -9541 NM_203416 9332 Hs.504641 NM_004244 ENSG00000177575 CD163 M130|MM130|SCARI1 CD163 molecule protein-coding 149.333-293 chr4 132758136 132758467 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 167212 NR_126401 104355285 Hs.123483 NR_126401 ENSG00000251398 LINC01256 TCONS_l2_00021715 long intergenic non-protein coding RNA 1256 ncRNA 167-109 chr9 35567827 35568203 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4137 NM_001287238 730112 Hs.98959 NM_001099951 ENSG00000215187 FAM166B - family with sequence similarity 166 member B protein-coding 118.333-104 chr2 69393905 69394104 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -6750 NM_001244710 2673 Hs.580300 NM_002056 ENSG00000198380 GFPT1 CMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1 protein-coding 139.333-219 chr8 113480108 113480376 + 0.666667 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -43303 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 199.333-191 chr3 171274387 171274816 + 0.666667 NA intron (NM_001161563, intron 2 of 31) intron (NM_001161563, intron 2 of 31) -167842 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 177.333-87 chr2 123792813 123793284 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 232126 NR_147976 107985820 Hs.637705 NR_147976 LOC107985820 - uncharacterized LOC107985820 ncRNA 163-65 chr5 61780594 61780917 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 -45057 NR_105000 100506526 Hs.662277 NR_105000 C5orf64-AS1 - C5orf64 antisense RNA 1 ncRNA 154.667-396 chr8 112461914 112462360 + 0.666667 NA intron (NM_052900, intron 31 of 68) MIR3|SINE|MIR -181356 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 135-17 chr12 18255677 18256022 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR -5691 NM_001288774 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 112.333-36 chr11 55792495 55792778 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2920 NM_001004735 219436 Hs.553622 NM_001004735 ENSG00000186113 OR5D14 OR11-141|OR11-150 olfactory receptor family 5 subfamily D member 14 protein-coding 189.667-60 chr16 78969761 78970181 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) L1MB8|LINE|L1 630766 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 159.667-231 chr4 58563170 58563600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27057 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 188.667-34 chr12 52653954 52654471 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2001 NM_000423 3849 Hs.707 NM_000423 ENSG00000172867 KRT2 CK-2e|K2e|KRT2A|KRT2E|KRTE keratin 2 protein-coding 287.667-29 chr4 80075820 80076508 + 0.666667 NA Intergenic LTR106_Mam|LTR|LTR -2692 NM_001286780 118429 Hs.162963 NM_058172 ENSG00000163297 ANTXR2 CMG-2|CMG2|HFS|ISH|JHF ANTXR cell adhesion molecule 2 protein-coding 188.333-129 chr6 62992871 62993288 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 326898 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 267.667-61 chr6 71630180 71630783 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 209454 NR_121615 102724000 Hs.145785 NR_121615 LINC01626 - long intergenic non-protein coding RNA 1626 ncRNA 146-81 chr3 31419106 31419393 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -113676 NM_178862 201595 Hs.475812 NM_178862 ENSG00000163527 STT3B CDG1X|SIMP|STT3-B STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B protein-coding 215.333-47 chr12 117750092 117750559 + 0.666667 NA intron (NM_173598, intron 4 of 19) intron (NM_173598, intron 4 of 19) 218665 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 114.667-171 chr3 37088771 37089016 + 0.666667 NA intron (NM_017724, intron 6 of 13) L1ME3G|LINE|L1 85689 NM_006309 9209 Hs.740522 NM_006309 ENSG00000093167 LRRFIP2 HUFI-2 LRR binding FLII interacting protein 2 protein-coding 181.667-6 chr1 157726137 157726532 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25565 NR_135215 115352 Hs.292449 NM_052939 ENSG00000160856 FCRL3 CD307c|FCRH3|IFGP3|IRTA3|SPAP2 Fc receptor like 3 protein-coding 203.667-35 chr16 48552872 48553291 + 0.666667 NA intron (NM_153029, intron 3 of 6) intron (NM_153029, intron 3 of 6) 57099 NM_153029 9683 Hs.511839 NM_153029 ENSG00000102921 N4BP1 - NEDD4 binding protein 1 protein-coding 206.333-118 chr4 44426739 44427246 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) L1MD|LINE|L1 21817 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 175-47 chr2 219521454 219521857 + 0.666667 NA intron (NM_018674, intron 1 of 9) intron (NM_018674, intron 1 of 9) 7485 NM_018674 55515 Hs.87469 NM_018674 ENSG00000072182 ASIC4 ACCN4|BNAC4 acid sensing ion channel subunit family member 4 protein-coding 147.667-147 chr17 75960723 75961009 + 0.666667 NA intron (NM_004035, intron 2 of 13) AluSx|SINE|Alu 18300 NM_001185039 51 Hs.464137 NM_004035 ENSG00000161533 ACOX1 ACOX|PALMCOX|SCOX acyl-CoA oxidase 1 protein-coding 121.333-85 chr2 63675757 63675949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 86702 NM_001199112 4190 Hs.526521 NM_005917 ENSG00000014641 MDH1 HEL-S-32|MDH-s|MDHA|MGC:1375|MOR2 malate dehydrogenase 1 protein-coding 236.667-86 chr8 29527951 29528427 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -177505 NM_001394 1846 Hs.417962 NM_001394 ENSG00000120875 DUSP4 HVH2|MKP-2|MKP2|TYP dual specificity phosphatase 4 protein-coding 177.333-169 chr8 85940868 85941371 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 -113177 NR_003594 100288527 Hs.535056 NR_003594 REXO1L2P - REXO1 like 2, pseudogene pseudo 215.333-123 chr3 28660119 28660663 + 0.666667 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 85113 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 138.667-148 chr4 46984754 46985099 + 0.666667 NA intron (NM_001204267, intron 2 of 7) L1ME3F|LINE|L1 8655 NM_001204267 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 159.667-182 chr2 193092628 193093042 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 342990 NR_152587 64002 Hs.546994 NR_002769 ENSG00000227418 PCGEM1 LINC00071|NCRNA00071|PCAT9 PCGEM1 prostate-specific transcript ncRNA 132.333-132 chr5 42973420 42973722 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 19762 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 136-38 chr15 94486082 94486417 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 130319 NM_001159644 55784 Hs.33368 NM_018349 ENSG00000140563 MCTP2 - multiple C2 and transmembrane domain containing 2 protein-coding 114-32 chr14 33037947 33038155 + 0.666667 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) intron (NM_001165893, intron 1 of 10) 99172 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 170-25 chr12 15504485 15504849 + 0.666667 NA intron (NM_030667, intron 6 of 26) intron (NM_030667, intron 6 of 26) -41944 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 292.667-38 chr6 94094682 94095253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 376664 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 219.333-180 chr8 65480472 65480865 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81998 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 209-121 chr8 99370482 99370961 + 0.666667 NA intron (NM_017890, intron 19 of 61) AluSz|SINE|Alu 166009 NR_030329 693184 NR_030329 ENSG00000207804 MIR599 MIRN599|hsa-mir-599 microRNA 599 ncRNA 125.667-111 chr20 57731844 57732063 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -20417 NM_199171 56937 Hs.517155 NM_020182 ENSG00000124225 PMEPA1 STAG1|TMEPAI prostate transmembrane protein, androgen induced 1 protein-coding 144.667-271 chr6 143595242 143595533 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12793 NM_001100166 9749 Hs.102471 NM_014721 ENSG00000112419 PHACTR2 C6orf56 phosphatase and actin regulator 2 protein-coding 123-92 chr5 6385214 6385414 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6767 NM_032286 84246 Hs.13885 NM_032286 ENSG00000133398 MED10 L6|NUT2|TRG20 mediator complex subunit 10 protein-coding 112.333-177 chr4 48027519 48027691 + 0.666667 NA intron (NM_207330, intron 2 of 5) intron (NM_207330, intron 2 of 5) 10833 NM_207330 152519 Hs.134190 NM_207330 ENSG00000163293 NIPAL1 NPAL1 NIPA like domain containing 1 protein-coding 116-28 chr11 98658377 98658578 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -362472 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 161.667-213 chr5 146989696 146990036 + 0.666667 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) L1MA6|LINE|L1 66271 NM_181674 5521 Hs.627618 NM_181674 ENSG00000156475 PPP2R2B B55BETA|PP2AB55BETA|PP2ABBETA|PP2APR55B|PP2APR55BETA|PR2AB55BETA|PR2ABBETA|PR2APR55BETA|PR52B|PR55-BETA|PR55BETA|SCA12 protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta protein-coding 166.333-57 chr12 66276414 66276748 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25499 NR_106757 102465249 NR_106757 ENSG00000284011 MIR6502 hsa-mir-6502 microRNA 6502 ncRNA 114.333-195 chr6 71332547 71332797 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43861 NM_001324266 79627 Hs.648434 NM_024576 ENSG00000119900 OGFRL1 dJ331H24.1 opioid growth factor receptor like 1 protein-coding 156-39 chr12 68455364 68455681 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4038 NR_120458 100507195 Hs.450772 NR_120458 ENSG00000251301 LINC02384 - long intergenic non-protein coding RNA 2384 ncRNA 165-16 chr12 39259104 39259567 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 183785 NM_017641 55605 Hs.374201 NM_017641 ENSG00000139116 KIF21A CFEOM1|FEOM1|FEOM3A kinesin family member 21A protein-coding 176.333-114 chr3 185808937 185809403 + 0.666667 NA intron (NR_138486, intron 2 of 15) intron (NR_138486, intron 2 of 15) 11961 NM_001291873 10644 Hs.35354 NM_006548 ENSG00000073792 IGF2BP2 IMP-2|IMP2|VICKZ2 insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2 protein-coding 112.667-58 chr13 52837353 52837531 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 11198 NM_002590 5100 Hs.19492 NM_002590 ENSG00000136099 PCDH8 ARCADLIN|PAPC protocadherin 8 protein-coding 119.333-27 chr10 25297806 25298066 + 0.666667 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) MIRb|SINE|MIR -121660 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 190.333-157 chrX 101902805 101903206 + 0.666667 NA intron (NM_001282401, intron 2 of 8) intron (NM_001282401, intron 2 of 8) 29022 NM_001282401 84460 Hs.496512 NM_001011657 ENSG00000166432 ZMAT1 - zinc finger matrin-type 1 protein-coding 138-15 chr10 35729084 35729376 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -49072 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 174.666-16 chr4 88367115 88367634 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11365 NM_001165136 55008 Hs.529317 NM_017912 ENSG00000138642 HERC6 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6 protein-coding 115.667-213 chr8 90863126 90863409 + 0.666667 NA intron (NM_022351, intron 3 of 12) intron (NM_022351, intron 3 of 12) 71492 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 115.333-233 chrX 116392329 116392575 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -44154 NM_007231 11254 Hs.522109 NM_007231 ENSG00000268104 SLC6A14 BMIQ11 solute carrier family 6 member 14 protein-coding 115-25 chr10 23969928 23970140 + 0.666667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) THE1B|LTR|ERVL-MaLR -238757 NM_001282768 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 250.666-33 chr5 174425100 174425784 + 0.666667 NA intron (NR_125806, intron 1 of 5) intron (NR_125806, intron 1 of 5) 89088 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 113.333-262 chr8 128112542 128112737 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37477 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 169-47 chr2 88691284 88691714 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_144563) promoter-TSS (NM_144563) -174 NM_144563 22934 Hs.469264 NM_144563 ENSG00000153574 RPIA RPI|RPIAD ribose 5-phosphate isomerase A protein-coding 116.333-40 chr11 17840923 17841191 + 0.666667 NA intron (NR_104040, intron 11 of 11) intron (NR_104040, intron 11 of 11) 105109 NM_004976 3746 Hs.552896 NM_004976 ENSG00000129159 KCNC1 EPM7|KV3.1|KV4|NGK2 potassium voltage-gated channel subfamily C member 1 protein-coding 163-13 chr12 20969057 20969360 + 0.666667 NA intron (NM_001371097, intron 13 of 15) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -46488 NM_001009562 338821 Hs.729117 NM_001009562 ENSG00000205754 SLCO1B7 LST-3|LST-3TM12|LST3|SLC21A21 solute carrier organic anion transporter family member 1B7 (putative) protein-coding 122.667-54 chr14 79214563 79214841 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) L1M6|LINE|L1 14720 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 135.667-77 chr17 72126174 72126401 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_000346, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_000346, exon 3 of 3) 5267 NM_000346 6662 Hs.647409 NM_000346 ENSG00000125398 SOX9 CMD1|CMPD1|SRA1|SRXX2|SRXY10 SRY-box transcription factor 9 protein-coding 147-62 chr2 27826972 27827265 + 0.666667 NA intron (NM_022128, intron 7 of 7) intron (NM_022128, intron 7 of 7) 55399 NM_004891 9553 Hs.515879 NM_004891 ENSG00000243147 MRPL33 C2orf1|L33mt|MRP-L33|RPL33L mitochondrial ribosomal protein L33 protein-coding 227.333-111 chr7 2006918 2007456 + 0.666667 NA intron (NM_001013837, intron 13 of 18) intron (NM_001013837, intron 13 of 18) -66616 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 252-79 chr5 68362303 68362979 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 70064 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 114-23 chr12 12100817 12101102 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -10993 NR_036052 100302285 NR_036052 ENSG00000284378 MIR1244-1 MIR1244|MIRN1244|hsa-mir-1244|hsa-mir-1244-1 microRNA 1244-1 ncRNA 180.667-41 chr14 38291825 38292149 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35894 NM_175060 161198 Hs.525307 NM_175060 ENSG00000176435 CLEC14A C14orf27|CEG1|EGFR-5 C-type lectin domain containing 14A protein-coding 206-121 chr4 23998928 23999393 + 0.666667 NA intron (NM_001330752, intron 2 of 13) intron (NM_001330752, intron 2 of 13) -109113 NM_013261 10891 Hs.527078 NM_013261 ENSG00000109819 PPARGC1A LEM6|PGC-1(alpha)|PGC-1alpha|PGC-1v|PGC1|PGC1A|PPARGC1 PPARG coactivator 1 alpha protein-coding 126-75 chr3 119948579 119948905 + 0.666667 NA intron (NM_002093, intron 2 of 11) AluSq2|SINE|Alu 135906 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 161.667-246 chr8 59225702 59226185 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 106733 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 130.667-140 chr3 39030822 39031069 + 0.666667 NA intron (NM_001349253, intron 2 of 29) intron (NM_001349253, intron 2 of 29) 20999 NM_001349253 11280 Hs.591657 NM_014139 ENSG00000168356 SCN11A FEPS3|HSAN7|NAV1.9|NaN|PN5|SCN12A|SNS-2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 11 protein-coding 152.333-66 chr11 86231060 86231435 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13137 NM_001330334 8726 Hs.503510 NM_003797 ENSG00000074266 EED COGIS|HEED|WAIT1 embryonic ectoderm development protein-coding 151.333-392 chr7 78678544 78678871 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -330281 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 160-113 chr7 139930797 139931153 + 0.666667 NA intron (NM_001314028, intron 4 of 12) intron (NM_001314028, intron 4 of 12) 101711 NM_001061 6916 Hs.520757 NM_001061 ENSG00000059377 TBXAS1 BDPLT14|CYP5|CYP5A1|GHOSAL|THAS|TS|TXAS|TXS thromboxane A synthase 1 protein-coding 170-45 chr16 79185298 79185652 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 7 of 7) intron (NM_001291997, intron 7 of 7) 415262 NM_001031804 4094 Hs.134859 NM_005360 ENSG00000178573 MAF AYGRP|CCA4|CTRCT21|c-MAF MAF bZIP transcription factor protein-coding 290.667-9 chr11 90387015 90387733 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 1 of 6) AluY|SINE|Alu 136142 NR_104190 101929222 Hs.616763 NR_104190 ENSG00000261645 DISC1FP1 Boymaw DISC1 fusion partner 1 ncRNA 169.333-22 chr10 36529103 36529443 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -596584 NM_052997 91074 Hs.373787 NM_052997 ENSG00000148513 ANKRD30A NY-BR-1 ankyrin repeat domain 30A protein-coding 150.333-192 chr2 57458629 57458968 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -448853 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 129.667-64 chr15 73816378 73816614 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48282 NR_120352 101929221 NR_120352 INSYN1-AS1 C15orf59-AS1 INSYN1 antisense RNA 1 ncRNA 129.667-50 chr13 96181473 96181793 + 0.666667 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) 90794 NM_153456 266722 Hs.171001 NM_153456 ENSG00000185352 HS6ST3 HS6ST-3 heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 3 protein-coding 156-100 chr4 68289612 68289912 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -44068 NM_182502 132724 Hs.407122 NM_182502 ENSG00000185873 TMPRSS11B - transmembrane serine protease 11B protein-coding 190-30 chr14 47654618 47655126 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) HERV16-int|LTR|ERVL 20082 NM_001113498 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 155.667-44 chr10 114856856 114857173 + 0.666667 NA intron (NM_001135051, intron 14 of 16) FAM|SINE|Alu 35234 NM_001135051 57700 Hs.192619 NM_020940 ENSG00000151553 FAM160B1 KIAA1600|bA106M7.3 family with sequence similarity 160 member B1 protein-coding 158-4 chr1 90894230 90894582 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42647 NR_146610 105378854 Hs.606283 NR_146610 LINC01763 - long intergenic non-protein coding RNA 1763 ncRNA 133.333-108 chr3 74550354 74550647 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -29360 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 157.667-325 chr8 76265446 76265835 + 0.666667 NA Intergenic U2|snRNA|snRNA -141014 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 126-59 chr2 176275093 176275430 + 0.666667 NA intron (NM_001006635, intron 2 of 10) AluSq2|SINE|Alu 5819 NM_001319097 10651 Hs.470728 NM_006554 ENSG00000128654 MTX2 - metaxin 2 protein-coding 156-120 chr5 166548943 166549335 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 377231 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 175.333-86 chr2 57574554 57574872 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -332938 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 122.667-128 chr3 163902806 163903067 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 268620 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 125.667-195 chr8 137394536 137394909 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 18866 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 142-126 chr6 61833487 61833758 + 0.666667 NA intron (NM_001350622, intron 6 of 9) intron (NM_001350622, intron 6 of 9) 259492 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 113.333-91 chr16 17809877 17810206 + 0.666667 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 -339081 NM_022166 64131 Hs.22907 NM_022166 ENSG00000103489 XYLT1 DBQD2|PXYLT1|XT-I|XT1|XTI|XYLTI|xylT-I xylosyltransferase 1 protein-coding 122-36 chr14 75138521 75138791 + 0.666667 NA intron (NM_006827, intron 3 of 4) intron (NM_006827, intron 3 of 4) -11608 NM_001329237 91754 Hs.7200 NM_033116 ENSG00000119638 NEK9 APUG|LCCS10|NC|NERCC|NERCC1 NIMA related kinase 9 protein-coding 242.667-12 chr1 233458827 233459259 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 131319 NM_032435 84451 Hs.547779 NM_032435 ENSG00000143674 MAP3K21 MLK4|dJ862P8.3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 21 protein-coding 127-62 chr3 194223086 194223445 + 0.666667 NA intron (NR_125403, intron 1 of 2) intron (NR_125403, intron 1 of 2) -16958 NR_125404 100505920 Hs.436654 NR_125403 ENSG00000225742 LINC02036 - long intergenic non-protein coding RNA 2036 ncRNA 162.333-40 chr11 43765032 43765395 + 0.666667 NA intron (NM_016142, intron 3 of 10) L1MEc|LINE|L1 84475 NM_016142 51144 Hs.132513 NM_016142 ENSG00000149084 HSD17B12 KAR|SDR12C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 12 protein-coding 187.667-34 chr14 24658040 24658429 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24044 NM_001346011 3002 Hs.1051 NM_004131 ENSG00000100453 GZMB C11|CCPI|CGL-1|CGL1|CSP-B|CSPB|CTLA1|CTSGL1|HLP|SECT granzyme B protein-coding 133.667-61 chr18 597128 597469 + 0.666667 NA intron (NM_014410, intron 1 of 8) intron (NM_014410, intron 1 of 8) 300 NM_001289036 27098 Hs.732341 NM_014410 ENSG00000079101 CLUL1 RA337M clusterin like 1 protein-coding 120.333-56 chr14 67349956 67350170 + 0.666667 NA intron (NM_015994, intron 3 of 8) MIRc|SINE|MIR 9741 NM_015994 51382 Hs.272630 NM_015994 ENSG00000100554 ATP6V1D ATP6M|VATD|VMA8 ATPase H+ transporting V1 subunit D protein-coding 224-41 chr2 3618353 3618713 + 0.666667 NA intron (NM_001255988, intron 2 of 4) L1MA9|LINE|L1 12481 NM_001255988 78989 Hs.32603 NM_024027 ENSG00000118004 COLEC11 3MC2|CL-K1-I|CL-K1-II|CL-K1-IIa|CL-K1-IIb|CLK1 collectin subfamily member 11 protein-coding 123.333-235 chr9 128028538 128028754 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 38674 NM_197956 203245 Hs.373606 NM_197956 ENSG00000171169 NAIF1 C9orf90|bA379C10.2 nuclear apoptosis inducing factor 1 protein-coding 121.667-109 chr20 9149979 9150323 + 0.666667 NA intron (NM_001172646, intron 1 of 37) intron (NM_001172646, intron 1 of 37) -67239 NM_182797 5332 Hs.472101 NM_000933 ENSG00000101333 PLCB4 ARCND2|PI-PLC phospholipase C beta 4 protein-coding 204.333-124 chr3 85185919 85186238 + 0.666667 NA intron (NM_001167674, intron 1 of 9) intron (NM_001167674, intron 1 of 9) -123814 NR_132777 106635529 NR_132777 SNORA95 - small nucleolar RNA, H/ACA box 95 snoRNA 124.333-43 chr13 87306299 87306531 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 312325 NR_039722 100616182 NR_039722 ENSG00000266052 MIR4500 - microRNA 4500 ncRNA 198.333-23 chr10 33498504 33499011 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -163852 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 165.667-165 chr5 149537017 149537376 + 0.666667 NA intron (NM_001271742, intron 1 of 9) AluSx1|SINE|Alu 13169 NM_001271742 1452 Hs.529862 NM_001892 ENSG00000113712 CSNK1A1 CK1|CK1a|CKIa|HEL-S-77p|HLCDGP1|PRO2975 casein kinase 1 alpha 1 protein-coding 184-65 chr22 47395387 47395793 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 50019 NR_144462 339685 Hs.434351 NR_038922 ENSG00000224715 LOC339685 - uncharacterized LOC339685 ncRNA 140.333-100 chr2 54269964 54270232 + 0.666667 NA intron (NM_001320589, intron 4 of 4) intron (NM_001320589, intron 4 of 4) -13869 NM_001003937 388951 Hs.620508 NM_001003937 ENSG00000178021 TSPYL6 - TSPY like 6 protein-coding 138.667-102 chr2 52399458 52399845 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 10 of 10) L1MEc|LINE|L1 29003 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 187.667-90 chr3 46083465 46083861 + 0.666667 NA Intergenic LTR39-int|LTR|ERV1 -56180 NM_005283 2829 Hs.128375 NM_005283 ENSG00000173578 XCR1 CCXCR1|GPR5 X-C motif chemokine receptor 1 protein-coding 153.333-445 chr9 94674458 94674866 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -34413 NM_001127628 2203 Hs.494496 NM_000507 ENSG00000165140 FBP1 FBP fructose-bisphosphatase 1 protein-coding 119.333-142 chr21 15517859 15518175 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -211917 NM_001283041 29761 Hs.743994 NM_013396 ENSG00000155313 USP25 USP21 ubiquitin specific peptidase 25 protein-coding 114.667-46 chr11 40381537 40381730 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -88503 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 161-24 chr14 83773457 83773867 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1131030 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 112-128 chr21 42498129 42498300 + 0.666667 NA TTS (NR_135518) TTS (NR_135518) -1408 NM_018964 54020 Hs.547009 NM_018964 ENSG00000160190 SLC37A1 G3PP solute carrier family 37 member 1 protein-coding 187-13 chr10 87101911 87102386 + 0.666667 NA intron (NM_001330112, intron 2 of 9) L1MB7|LINE|L1 6942 NM_019054 54537 Hs.500419 NM_019054 ENSG00000122376 SHLD2 FAM35A|FAM35A1|RINN2|bA163M19.1 shieldin complex subunit 2 protein-coding 144-132 chr5 96991335 96991761 + 0.666667 NA intron (NM_005575, intron 4 of 17) L1PB1|LINE|L1 33115 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 128.667-51 chr13 90810347 90810547 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 116150 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 240-63 chr3 173930568 173931083 + 0.666667 NA intron (NM_001365928, intron 4 of 6) intron (NM_001365928, intron 4 of 6) -10029 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 139.333-61 chr13 38459083 38459460 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -108453 NR_046999 100874147 Hs.555371 NR_046999 LINC00366 - long intergenic non-protein coding RNA 366 ncRNA 135-111 chr8 101174923 101175247 + 0.666667 NA Intergenic HSMAR2|DNA|TcMar-Mariner 30588 NM_016096 51123 Hs.374485 NM_016096 ENSG00000120963 ZNF706 HSPC038|PNAS-106|PNAS-113 zinc finger protein 706 protein-coding 152.667-383 chr8 117550908 117551313 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 30397 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 119.333-220 chr8 123321045 123321255 + 0.666667 NA exon (NM_014109, exon 28 of 28) exon (NM_014109, exon 28 of 28) -26884 NR_037516 100500863 NR_037516 ENSG00000207704 MIR548AA1 - microRNA 548aa-1 ncRNA 147.333-115 chr14 80934385 80934666 + 0.666667 NA intron (NM_152446, intron 2 of 24) MIRb|SINE|MIR 7213 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 170.667-57 chr15 62636316 62636805 + 0.666667 NA TTS (NR_026897) TTS (NR_026897) 8621 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 167.667-44 chr12 41049891 41050244 + 0.666667 NA intron (NM_001843, intron 23 of 23) AluSx|SINE|Alu -138253 NM_001164595 29951 Hs.380044 NM_013377 ENSG00000165966 PDZRN4 LNX4|SAMCAP3L PDZ domain containing ring finger 4 protein-coding 150-43 chr14 47118027 47118332 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 5 of 16) intron (NM_001113498, intron 5 of 16) 225067 NM_182830 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 178-105 chr7 2589883 2590401 + 0.666667 NA intron (NM_001287501, intron 12 of 19) intron (NM_001287501, intron 12 of 19) 31163 NM_001287502 23288 Hs.520627 NM_152558 ENSG00000106012 IQCE 1700028P05Rik|PAPA7 IQ motif containing E protein-coding 124.667-125 chr20 50494442 50494766 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15717 NM_001278618 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 163.667-56 chr14 26233443 26233846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 319786 NM_001366398 4857 Hs.31588 NM_002515 ENSG00000139910 NOVA1 Nova-1 NOVA alternative splicing regulator 1 protein-coding 124-65 chr2 105953180 105953401 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 101443 NM_001004720 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 142.667-95 chr2 56613234 56613573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -427633 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 218.333-94 chr4 59412307 59412807 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 398984 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 171.333-57 chr15 37934808 37935166 + 0.666667 NA intron (NM_001330255, intron 1 of 11) intron (NM_001330255, intron 1 of 11) 345 NM_001370736 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 150.667-67 chr11 47229492 47229844 + 0.666667 NA intron (NM_001300734, intron 3 of 5) L1MC4|LINE|L1 14726 NM_000107 1643 Hs.700338 NM_000107 ENSG00000134574 DDB2 DDBB|UV-DDB2|XPE damage specific DNA binding protein 2 protein-coding 162.667-191 chr4 35120250 35120675 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -850715 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 138.333-162 chr6 43328743 43329012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20051 NM_001366068 401262 Hs.653165 NM_206922 ENSG00000146215 CRIP3 CRP-3|TLP|TLP-A|h6LIMo cysteine rich protein 3 protein-coding 190.667-48 chr15 71454363 71454793 + 0.666667 NA intron (NM_024817, intron 6 of 16) intron (NM_024817, intron 6 of 16) -92658 NM_001286429 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 144.667-114 chr18 867382 867695 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -37333 NM_001099733 116 Hs.531719 NM_001117 ENSG00000141433 ADCYAP1 PACAP adenylate cyclase activating polypeptide 1 protein-coding 144.667-291 chr8 48377699 48377965 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -173735 NR_105002 101929268 Hs.683934 NR_105002 ENSG00000253608 LOC101929268 - uncharacterized LOC101929268 ncRNA 187-59 chr4 88876432 88876934 + 0.666667 NA intron (NM_014883, intron 6 of 23) AluY|SINE|Alu -53322 NM_001265579 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 170-2 chr1 79326645 79327140 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -320162 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 195.333-87 chr15 40419097 40419562 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002225, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_002225, exon 12 of 12) 13532 NR_148925 3712 Hs.513646 NM_002225 ENSG00000128928 IVD ACAD2 isovaleryl-CoA dehydrogenase protein-coding 188.667-22 chr10 118762130 118762570 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -7380 NM_153810 143384 Hs.420024 NM_153810 ENSG00000151893 CACUL1 C10orf46|CAC1 CDK2 associated cullin domain 1 protein-coding 148.333-35 chr10 8371724 8372019 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -103566 NR_108058 100507143 Hs.258979 NR_108058 ENSG00000232170 LINC00708 GS1-756B1.2 long intergenic non-protein coding RNA 708 ncRNA 265.667-62 chr5 180725490 180726015 + 0.666667 NA Intergenic L1M7|LINE|L1 14306 NM_001001657 134083 Hs.554719 NM_001001657 ENSG00000174339 OR2Y1 OR5-2 olfactory receptor family 2 subfamily Y member 1 protein-coding 113-168 chr5 67120396 67120696 + 0.666667 NA intron (NM_001297651, intron 10 of 25) intron (NM_001297651, intron 10 of 25) 76253 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 145-28 chr13 112631041 112631324 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -15862 NM_207440 400165 Hs.591213 NM_207440 ATP11AUN C13orf35|SMABLO1 ATP11A upstream neighbor protein-coding 156-21 chr10 72644743 72645027 + 0.666667 NA Intergenic MER51-int|LTR|ERV1 -18694 NM_001363513 10367 Hs.524367 NM_006077 ENSG00000107745 MICU1 CALC|CBARA1|EFHA3|MPXPS|ara CALC mitochondrial calcium uptake 1 protein-coding 164.667-80 chr15 60091972 60092369 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 87859 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 183.333-132 chr5 104556790 104557287 + 0.666667 NA Intergenic THE1D-int|LTR|ERVL-MaLR -542436 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 135-3 chr1 52178324 52178589 + 0.666667 NA intron (NM_007324, intron 1 of 17) AluSg4|SINE|Alu 36362 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 207.667-85 chr4 36988055 36988487 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -13508 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 175-14 chr11 88181161 88181549 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4853 NR_036124 100423040 NR_036124 ENSG00000266581 MIR3166 - microRNA 3166 ncRNA 153-53 chr15 80074766 80075130 + 0.666667 NA intron (NM_001242915, intron 1 of 5) intron (NM_001242915, intron 1 of 5) 2387 NM_001242915 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 271-32 chr22 17696380 17697002 + 0.666667 NA intron (NM_001270727, intron 4 of 4) MIRc|SINE|MIR -9967 NM_001270733 23786 Hs.631672 NM_015367 ENSG00000099968 BCL2L13 BCL-RAMBO|Bcl2-L-13|MIL1 BCL2 like 13 protein-coding 137-61 chr3 54169796 54170172 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) AluSx1|SINE|Alu 47432 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 148.667-119 chr14 60864689 60865041 + 0.666667 NA intron (NM_002431, intron 6 of 7) intron (NM_002431, intron 6 of 7) 116214 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 136.333-121 chr3 12101366 12101623 + 0.666667 NA intron (NM_133625, intron 1 of 12) L1MB7|LINE|L1 57418 NM_003256 7079 Hs.591665 NM_003256 ENSG00000157150 TIMP4 TIMP-4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 protein-coding 155.667-321 chr7 11501703 11502091 + 0.666667 NA intron (NM_015204, intron 6 of 26) L1PA14|LINE|L1 330301 NM_015204 221981 Hs.120855 NM_015204 ENSG00000005108 THSD7A - thrombospondin type 1 domain containing 7A protein-coding 193-96 chr9 130055642 130055977 + 0.666667 NA intron (NM_020960, intron 1 of 17) AluSx|SINE|Alu 1903 NM_020960 57720 Hs.512461 NM_020960 ENSG00000148358 GPR107 GCDRP|LUSTR1|bA138E2.2 G protein-coupled receptor 107 protein-coding 145.667-123 chr19 29138586 29138875 + 0.666667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 74421 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 254.667-26 chr15 72206630 72207205 + 0.666667 NA intron (NM_182470, intron 7 of 10) intron (NM_182470, intron 7 of 10) -9130 NM_001012642 196996 Hs.596332 NM_001012642 ENSG00000175318 GRAMD2A GRAMD2 GRAM domain containing 2A protein-coding 183.333-29 chr12 43040263 43040661 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114853 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 127.667-42 chr14 45882752 45882982 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -167265 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 161 chr1 42225603 42225934 + 0.666667 NA intron (NM_001198850, intron 5 of 12) intron (NM_001198850, intron 5 of 12) -61023 NM_033553 2980 Hs.778 NM_033553 ENSG00000197273 GUCA2A GCAP-I|GUCA2|STARA guanylate cyclase activator 2A protein-coding 147.333-281 chr6 124876389 124876808 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -85947 NM_001286398 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 140.333-154 chr3 189248935 189249208 + 0.666667 NA intron (NM_198485, intron 4 of 5) intron (NM_198485, intron 4 of 5) -8477 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 167.667-21 chr10 25854571 25854871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 78989 NR_120650 101929073 Hs.409816 NR_120650 ENSG00000226304 LOC101929073 - uncharacterized LOC101929073 ncRNA 143-76 chr2 189635742 189636065 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25496 NM_001353497 54529 Hs.101364 NM_019048 ENSG00000138381 ASNSD1 NBLA00058|NS3TP1 asparagine synthetase domain containing 1 protein-coding 124.333-35 chr12 26828796 26829000 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 1 of 56) intron (NM_002223, intron 1 of 56) 4296 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 193.333-15 chr1 224470203 224470649 + 0.666667 NA intron (NM_001322302, intron 2 of 6) AluJr4|SINE|Alu 35577 NR_136297 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 144.333-106 chr18 59619267 59619542 + 0.666667 NA intron (NM_133459, intron 2 of 10) FRAM|SINE|Alu 78019 NM_133459 147372 Hs.34333 NM_133459 ENSG00000183287 CCBE1 HKLLS1 collagen and calcium binding EGF domains 1 protein-coding 137-9 chr10 58281249 58281609 + 0.666667 NA intron (NM_018464, intron 2 of 2) intron (NM_018464, intron 2 of 2) 12267 NM_018464 55847 Hs.370102 NM_018464 ENSG00000122873 CISD1 C10orf70|MDS029|ZCD1|mitoNEET CDGSH iron sulfur domain 1 protein-coding 131.667-20 chr10 32632724 32633097 + 0.666667 NA intron (NM_001321115, intron 19 of 43) L1M4|LINE|L1 186770 NM_001321115 79741 Hs.585464 NM_024688 ENSG00000216937 CCDC7 BIOT2|BioT2-A|BioT2-B|BioT2-C|C10orf68 coiled-coil domain containing 7 protein-coding 114.667-104 chr17 19562362 19562697 + 0.666667 NA intron (NM_018242, intron 12 of 16) AluSx|SINE|Alu 4969 NR_003022 677882 Hs.658450 NR_003022 ENSG00000266079 SNORA59B ACA59 small nucleolar RNA, H/ACA box 59B snoRNA 188-8 chr1 78303193 78303550 + 0.666667 NA intron (NR_027310, intron 3 of 5) intron (NR_027310, intron 3 of 5) 73772 NR_027310 149047 Hs.352665 NM_144700 ENSG00000237413 MGC27382 - uncharacterized MGC27382 ncRNA 145-105 chr6 128800265 128800550 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -82731 NM_001079823 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 181-78 chr8 108463251 108463640 + 0.666667 NA intron (NM_001329494, intron 5 of 7) intron (NM_001329494, intron 5 of 7) 19821 NM_014673 9694 Hs.654351 NM_014673 ENSG00000104412 EMC2 KIAA0103|TTC35 ER membrane protein complex subunit 2 protein-coding 119.333-38 chr10 82402420 82402689 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -169634 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 114.333-99 chr2 47417779 47417964 + 0.666667 NA intron (NM_000251, intron 6 of 15) AluSz6|SINE|Alu 14804 NM_001258281 4436 Hs.597656 NM_000251 ENSG00000095002 MSH2 COCA1|FCC1|HNPCC|HNPCC1|LCFS2|hMSH2 mutS homolog 2 protein-coding 168.667-94 chr2 22723180 22723513 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-int|LTR|ERVL 186867 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 185.333-123 chr3 109455383 109455893 + 0.666667 NA intron (NR_109841, intron 2 of 4) intron (NR_109841, intron 2 of 4) 45648 NR_109842 401082 Hs.477089 NM_001145553 ENSG00000228980 LINC01205 - long intergenic non-protein coding RNA 1205 ncRNA 128-25 chr15 101795668 101795901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9936 NM_001005326 390648 Hs.553399 NM_001005326 ENSG00000184140 OR4F6 OR15-15|OR4F12 olfactory receptor family 4 subfamily F member 6 protein-coding 210-147 chr8 104156547 104157069 + 0.666667 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) intron (NM_001348498, intron 20 of 24) -66527 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 112-209 chr8 130677412 130677725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -233894 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 197-54 chr2 29104757 29105168 + 0.666667 NA intron (NM_001287528, intron 1 of 14) intron (NM_001287528, intron 1 of 14) 7286 NM_001287528 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 181.667-48 chr17 6682535 6682950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25023 NR_045985 100652883 Hs.549540 NR_045985 ALOX15P1 ALOX15P arachidonate 15-lipoxygenase pseudogene 1 pseudo 136.667-18 chr10 51957882 51958201 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) intron (NM_001098512, intron 5 of 17) -258446 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 178-12 chr1 202743319 202743754 + 0.666667 NA intron (NM_001314042, intron 17 of 27) intron (NM_001314042, intron 17 of 27) -33082 NM_177402 127833 Hs.25422 NM_177402 ENSG00000143858 SYT2 CMS7|MYSPC|SytII synaptotagmin 2 protein-coding 191.667-14 chr10 43031676 43032083 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 34316 NR_049836 100847014 NR_049836 ENSG00000263795 MIR5100 - microRNA 5100 ncRNA 112.667-284 chrX 41182162 41182401 + 0.666667 NA intron (NM_001039591, intron 21 of 44) AluJb|SINE|Alu -93458 NR_135616 105373185 Hs.546119 NR_135616 ENSG00000223714 LINC02601 - long intergenic non-protein coding RNA 2601 ncRNA 124.667-182 chr7 5179353 5179634 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -10740 NM_001033518 26100 Hs.122363 NM_015610 ENSG00000157954 WIPI2 ATG18B|Atg21|CGI-50|IDDSSA|WIPI-2 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 protein-coding 208.666-26 chr12 14369937 14370532 + 0.666667 NA intron (NM_001286515, intron 1 of 12) AluSp|SINE|Alu 4552 NM_001286514 55729 Hs.504856 NM_018179 ENSG00000171681 ATF7IP AM|ATF-IP|MCAF|MCAF1|p621 activating transcription factor 7 interacting protein protein-coding 122-88 chr4 87497482 87497838 + 0.666667 NA intron (NM_001291976, intron 2 of 11) intron (NM_001291976, intron 2 of 11) 31843 NM_001128310 8404 Hs.62886 NM_004684 ENSG00000152583 SPARCL1 MAST 9|MAST9|PIG33|SC1 SPARC like 1 protein-coding 183.667-34 chr11 108844501 108845024 + 0.666667 NA intron (NM_004398, intron 15 of 17) intron (NM_004398, intron 15 of 17) 179693 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 149.333-110 chr14 53700994 53701305 + 0.666667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL 247335 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 116.333-177 chr5 87195463 87195678 + 0.666667 NA intron (NR_105018, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 43631 NR_130914 55338 Hs.677194 NM_018382 LINC01949 - long intergenic non-protein coding RNA 1949 ncRNA 118.667-22 chr10 36345564 36345900 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 567430 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 152-24 chr10 77040024 77040442 + 0.666667 NA intron (NM_001271519, intron 14 of 28) L1ME4b|LINE|L1 -100598 NR_120654 101929310 Hs.666457 NR_120654 ENSG00000225497 KCNMA1-AS2 - KCNMA1 antisense RNA 2 ncRNA 117.667-159 chr5 159162067 159162275 + 0.666667 NA intron (NM_001199383, intron 9 of 10) intron (NM_001199383, intron 9 of 10) 45477 NM_001199382 153830 Hs.349306 NM_144726 ENSG00000145860 RNF145 - ring finger protein 145 protein-coding 174-66 chr3 110017272 110017611 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 414613 NR_039647 100616129 NR_039647 ENSG00000265956 MIR4445 - microRNA 4445 ncRNA 135.667-183 chr8 87203899 87204158 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) MLT1J1-int|LTR|ERVL-MaLR 337613 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 245.667-40 chr22 21671836 21672413 + 0.666667 NA intron (NM_148175, intron 4 of 20) L1ME4a|LINE|L1 6112 NM_148175 23759 Hs.438587 NM_014337 ENSG00000100023 PPIL2 CYC4|CYP60|Cyp-60|UBOX7|hCyP-60 peptidylprolyl isomerase like 2 protein-coding 149.667-45 chr10 16694088 16694388 + 0.666667 NA intron (NM_152724, intron 7 of 7) intron (NM_152724, intron 7 of 7) 123186 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 154-61 chr15 76352830 76353189 + 0.666667 NA intron (NR_148227, intron 31 of 32) intron (NR_148227, intron 31 of 32) 16236 NM_145805 64843 Hs.444677 NM_145805 ENSG00000159556 ISL2 - ISL LIM homeobox 2 protein-coding 152.333-342 chr6 152836962 152837330 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 86349 NM_003381 7432 Hs.53973 NM_003381 ENSG00000146469 VIP PHM27 vasoactive intestinal peptide protein-coding 147.333-155 chr19 30523013 30523245 + 0.666667 NA intron (NM_014717, intron 2 of 4) intron (NM_014717, intron 2 of 4) 150745 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 111.667-144 chr2 197134503 197134773 + 0.666667 NA intron (NM_153697, intron 4 of 9) L2c|LINE|L2 -63353 NR_135584 101927596 NR_135584 ENSG00000231621 LOC101927596 - uncharacterized LOC101927596 ncRNA 146.333-97 chr14 70762495 70762886 + 0.666667 NA intron (NM_033141, intron 2 of 12) L1MB5|LINE|L1 20762 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 208.667-125 chr7 31575060 31575440 + 0.666667 NA intron (NM_194300, intron 6 of 12) intron (NM_194300, intron 6 of 12) 22248 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 189-58 chr22 41967659 41968062 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -1578 NM_001363845 55964 Hs.120483 NM_019106 ENSG00000100167 SEPTIN3 SEP3|SEPT3|bK250D10.3 septin 3 protein-coding 143-126 chr8 106534329 106534609 + 0.666667 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) 86545 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 127.333-154 chr6 56069310 56069580 + 0.666667 NA intron (NM_030820, intron 21 of 29) intron (NM_030820, intron 21 of 29) 22217 NM_001318753 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 141.667-211 chr7 77729589 77729855 + 0.666667 NA intron (NM_198467, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu -32377 NR_038361 100505854 Hs.72451 NR_038361 ENSG00000214293 APTR RSBN1L-AS1 Alu-mediated CDKN1A/p21 transcriptional regulator ncRNA 125.667-26 chr10 66359840 66360099 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 12 of 17) AluSx3|SINE|Alu -566067 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 152.667-169 chr2 32285647 32285952 + 0.666667 NA intron (NM_032312, intron 1 of 5) AluSg4|SINE|Alu 7895 NM_032312 84272 Hs.468099 NM_032312 ENSG00000119820 YIPF4 FinGER4|Nbla11189 Yip1 domain family member 4 protein-coding 115-7 chr1 110906437 110906612 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 33376 NM_000560 963 Hs.443057 NM_000560 ENSG00000143119 CD53 MOX44|TSPAN25 CD53 molecule protein-coding 127-85 chr6 71923183 71923450 + 0.666667 NA intron (NM_001350412, intron 1 of 2) intron (NM_001350412, intron 1 of 2) 36613 NM_001350411 22999 Hs.485729 NM_014989 ENSG00000079841 RIMS1 CORD7|RAB3IP2|RIM|RIM1 regulating synaptic membrane exocytosis 1 protein-coding 255.667-9 chr10 93277709 93278284 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 204103 NM_000783 1592 Hs.150595 NM_000783 ENSG00000095596 CYP26A1 CP26|CYP26|P450RAI|P450RAI1 cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1 protein-coding 180-56 chr2 190753848 190754233 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 94882 NM_001321315 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 143-52 chr16 22354806 22355092 + 0.666667 NA intron (NM_001802, intron 2 of 4).2 L1MC5a|LINE|L1 19670 NM_001802 1039 Hs.513430 NM_001802 ENSG00000140743 CDR2 CDR62|Yo cerebellar degeneration related protein 2 protein-coding 208.333-161 chr9 111505104 111505572 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -19841 NM_133464 158399 Hs.584864 NM_133464 ENSG00000173258 ZNF483 ZKSCAN16|ZSCAN48 zinc finger protein 483 protein-coding 144.667-302 chr8 112003838 112004239 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 627399 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 114.667-67 chr12 121553341 121553563 + 0.666667 NA intron (NM_001005366, intron 4 of 22) intron (NM_001005366, intron 4 of 22) 26794 NM_001005366 84678 Hs.524800 NM_032590 ENSG00000089094 KDM2B CXXC2|FBXL10|Fbl10|JHDM1B|PCCX2 lysine demethylase 2B protein-coding 174-60 chr20 2392641 2393014 + 0.666667 NA intron (NM_198994, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 11926 NM_001254734 343641 Hs.452039 NM_198994 ENSG00000166948 TGM6 SCA35|TG6|TGM3L|TGY|dJ734P14.3 transglutaminase 6 protein-coding 176.333-28 chr11 41276768 41277159 + 0.666667 NA intron (NM_001258419, intron 1 of 6) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 182673 NM_020929 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 146.333-229 chr4 56066973 56067328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103045 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 113-142 chr3 116843993 116844194 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 6274 NR_039649 100616485 NR_039649 ENSG00000265433 MIR4447 - microRNA 4447 ncRNA 138.667-137 chr3 129765822 129766086 + 0.666667 NA intron (NM_001349271, intron 2 of 4) intron (NM_001349271, intron 2 of 4) 28658 NM_001349273 23023 Hs.477547 NM_015008 ENSG00000172765 TMCC1 - transmembrane and coiled-coil domain family 1 protein-coding 118.333-43 chr11 45921028 45921294 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001300722) promoter-TSS (NM_001300722) -460 NM_152312 120071 Hs.86543 NM_152312 ENSG00000165905 LARGE2 GYLTL1B|PP5656 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 2 protein-coding 114.667-196 chr4 73275779 73276019 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -17101 NM_198889 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 187.667-91 chr3 61402843 61403258 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -151589 NR_148921 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 112.667-109 chr2 7991603 7991784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14879 NR_015405 339788 Hs.46864 NR_015405 ENSG00000235665 LINC00298 - long intergenic non-protein coding RNA 298 ncRNA 206-27 chr10 126192974 126193422 + 0.666667 NA intron (NM_001288974, intron 3 of 18) AluSc8|SINE|Alu 195279 NM_001288973 8038 Hs.594351 NM_003474 ENSG00000148848 ADAM12 ADAM12-OT1|CAR10|MCMP|MCMPMltna|MLTN|MLTNA ADAM metallopeptidase domain 12 protein-coding 140.333-104 chr2 81988393 81988672 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -521586 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 135.667-155 chr6 38484261 38484657 + 0.666667 NA intron (NM_001172418, intron 5 of 10) L3b|LINE|CR1 2863 NR_144472 101929425 Hs.665280 NR_144472 ENSG00000226533 BTBD9-AS1 - BTBD9 antisense RNA 1 ncRNA 144.667-73 chr13 83491403 83491778 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 390803 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 116.333-219 chr9 93426086 93426358 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 25386 NR_136237 158293 Hs.350364 NM_198841 ENSG00000188938 FAM120AOS C9orf10OS family with sequence similarity 120A opposite strand protein-coding 189-90 chr8 79167898 79168297 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -164091 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 124.667-104 chr2 119856124 119856331 + 0.666667 NA intron (NM_002830, intron 2 of 26) HUERS-P3-int|LTR|ERV1 96305 NM_002830 5775 Hs.469809 NM_002830 ENSG00000088179 PTPN4 MEG|PTPMEG|PTPMEG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 protein-coding 151.667-76 chr12 1284652 1284974 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 14 of 19) AluJo|SINE|Alu -215678 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 176.667-31 chr10 90485212 90485605 + 0.666667 NA intron (NR_110657, intron 2 of 6) L1PBa|LINE|L1 55397 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 178.333-42 chr12 98538107 98538481 + 0.666667 NA intron (NM_001032284, intron 4 of 5) intron (NM_001032284, intron 4 of 5) -22068 NR_027157 100128191 Hs.594042 NR_027157 ENSG00000257167 TMPO-AS1 - TMPO antisense RNA 1 ncRNA 169-97 chr7 98634326 98634772 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 17264 NM_002523 4885 Hs.3281 NM_002523 ENSG00000106236 NPTX2 NARP|NP-II|NP2 neuronal pentraxin 2 protein-coding 117.333-122 chr20 40198894 40199096 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 194534 NR_109937 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 119-56 chr15 74351146 74351357 + 0.666667 NA intron (NM_000781, intron 1 of 8) MER51-int|LTR|ERV1 -10301 NR_045207 729739 Hs.742028 NR_045207 ENSG00000260266 PPIAP46 - peptidylprolyl isomerase A pseudogene 46 pseudo 168.667-115 chr2 218595946 218596276 + 0.666667 NA non-coding (NR_073390, exon 7 of 7) non-coding (NR_073390, exon 7 of 7) -11788 NM_032726 84812 Hs.632528 NM_032726 ENSG00000115556 PLCD4 - phospholipase C delta 4 protein-coding 195.667-127 chr7 13723857 13724292 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 262440 NM_001163150 2115 Hs.22634 NM_004956 ENSG00000006468 ETV1 ER81 ETS variant 1 protein-coding 114.667-93 chr15 64650497 64650827 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 2 of 8) intron (NM_015042, intron 2 of 8) 52619 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 144-73 chr2 41283530 41283804 + 0.666667 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 -593888 NR_033996 388942 Hs.631883 NR_033996 ENSG00000214691 LINC01913 - long intergenic non-protein coding RNA 1913 ncRNA 226.333-65 chr2 135199102 135199663 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_032143, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_032143, exon 21 of 21) 62754 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 144-68 chr19 29965756 29966036 + 0.666667 NA intron (NR_045557, intron 1 of 9) intron (NR_045557, intron 1 of 9) 23657 NM_003796 8725 Hs.466391 NM_003796 ENSG00000105176 URI1 C19orf2|NNX3|PPP1R19|RMP|URI URI1 prefoldin like chaperone protein-coding 204-211 chrX 73749320 73749771 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -42660 NR_003255 9383 Hs.529901 NR_003255 ENSG00000270641 TSIX LINC00013|NCRNA00013|XIST-AS|XIST-AS1|XISTAS TSIX transcript, XIST antisense RNA ncRNA 138.667-48 chr12 79692230 79692573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1304 NM_001354733 5074 Hs.643130 NM_002583 ENSG00000177425 PAWR PAR4|Par-4 pro-apoptotic WT1 regulator protein-coding 154.333-343 chr8 105329670 105329956 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 1 of 7) intron (NM_001362837, intron 1 of 7) 10270 NM_001362837 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 222-34 chr16 68758956 68759337 + 0.666667 NA intron (NM_001317185, intron 2 of 15) AluJo|SINE|Alu 21854 NM_001317185 999 Hs.461086 NM_004360 ENSG00000039068 CDH1 Arc-1|BCDS1|CD324|CDHE|ECAD|LCAM|UVO cadherin 1 protein-coding 146.667-112 chr15 42521561 42521881 + 0.666667 NA intron (NM_130798, intron 5 of 6) intron (NM_130798, intron 5 of 6) 26087 NM_003825 8773 Hs.511149 NM_003825 ENSG00000092531 SNAP23 HsT17016|SNAP-23|SNAP23A|SNAP23B synaptosome associated protein 23 protein-coding 142.667-108 chr2 164333347 164333707 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 234968 NM_001303422 2888 Hs.411881 NM_004490 ENSG00000115290 GRB14 - growth factor receptor bound protein 14 protein-coding 185.333-75 chr18 52119862 52120341 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -220096 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 139.667-211 chr9 87294897 87295170 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 146389 NR_161226 401535 Hs.657740 NR_161226 C9orf170 - chromosome 9 open reading frame 170 ncRNA 125.667-75 chr16 64894099 64894409 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 227809 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 139.667-199 chr8 136627480 136627813 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 96848 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 169.667-188 chr6 126047368 126047718 + 0.666667 NA intron (NR_146803, intron 15 of 16) LTR1F|LTR|ERV1 61003 NR_146803 60487 Hs.404186 NM_021820 ENSG00000066651 TRMT11 C6orf75|MDS024|TRM11|TRMT11-1 tRNA methyltransferase 11 homolog protein-coding 169-13 chr11 77676446 77676937 + 0.666667 NA intron (NM_016578, intron 13 of 15) intron (NM_016578, intron 13 of 15) -38885 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 227.667-71 chr7 7535475 7536057 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001037763, exon 1 of 35) 5' UTR (NM_001037763, exon 1 of 35) 107 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 119.667-48 chr14 63028963 63029204 + 0.666667 NA intron (NM_139318, intron 1 of 10) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 16375 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 112.667-199 chr4 156391570 156391844 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -437841 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 135.667-159 chr6 98022475 98022725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1931 NR_031579 100302164 NR_031579 ENSG00000238367 MIR2113 hsa-mir-2113 microRNA 2113 ncRNA 160.333-169 chr20 57323057 57323501 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1688 NR_036219 100422883 NR_036219 ENSG00000266666 MIR4325 - microRNA 4325 ncRNA 184.333-73 chr2 45416739 45417142 + 0.666667 NA intron (NM_018079, intron 18 of 20) AluSx|SINE|Alu -161999 NR_033831 400952 Hs.468368 NR_033831 ENSG00000205054 LINC01121 UNQ6975 long intergenic non-protein coding RNA 1121 ncRNA 176.667-64 chr17 34510176 34510589 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 68987 NR_160787 400591 Hs.514090 NM_207454 C17orf102 - chromosome 17 open reading frame 102 ncRNA 146-24 chr12 99781466 99781763 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 5 of 25) intron (NM_152788, intron 5 of 25) 133861 NM_153364 196472 Hs.591011 NM_153364 ENSG00000180219 FAM71C - family with sequence similarity 71 member C protein-coding 211-24 chr12 56372751 56373224 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -10130 NM_001638 319 Hs.534302 NM_001638 ENSG00000175336 APOF Apo-F|LTIP apolipoprotein F protein-coding 147.667-344 chr7 106880040 106880314 + 0.666667 NA intron (NM_001282426, intron 6 of 10) intron (NM_001282426, intron 6 of 10) 14698 NM_002649 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 116-54 chr15 73729988 73730317 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 21323 NM_001039614 388135 Hs.40794 NM_001039614 ENSG00000205363 INSYN1 C15orf59 inhibitory synaptic factor 1 protein-coding 119.333-148 chr22 37443909 37444197 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -16574 NM_052906 114794 Hs.344170 NM_052906 ENSG00000166897 ELFN2 LRRC62|PPP1R29 extracellular leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 114.667-56 chr11 107032971 107033180 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14599 NM_000855 2977 Hs.24321 NM_000855 ENSG00000152402 GUCY1A2 GC-SA2|GUC1A2 guanylate cyclase 1 soluble subunit alpha 2 protein-coding 167.333-124 chr2 37025165 37025539 + 0.666667 NA intron (NM_019024, intron 24 of 35) L1M6|LINE|L1 -58816 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 124.667-91 chr18 30218155 30218485 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -80590 NR_031684 100302131 NR_031684 ENSG00000283218 MIR302F MIRN302F|hsa-mir-302f microRNA 302f ncRNA 121.333-37 chr12 16106387 16106732 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 171126 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 129.333-88 chr2 32234882 32235131 + 0.666667 NA intron (NM_001199138, intron 8 of 8) intron (NM_001199138, intron 8 of 8) 29880 NM_001199138 58484 Hs.574741 NM_021209 ENSG00000091106 NLRC4 AIFEC|CARD12|CLAN|CLAN1|CLANA|CLANB|CLANC|CLAND|CLR2.1|FCAS4|IPAF NLR family CARD domain containing 4 protein-coding 154.333-313 chr7 11241750 11242048 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 268027 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 123.333-50 chr11 98561099 98561441 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -459679 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 180-97 chr7 30780437 30780819 + 0.666667 NA intron (NR_037598, intron 4 of 19) intron (NR_037598, intron 4 of 19) 9211 NM_032222 84182 Hs.660192 NM_032222 ENSG00000106125 MINDY4 AQP-1|AQP1|C7orf67|CHIP28|FAM188B MINDY lysine 48 deubiquitinase 4 protein-coding 165.667-96 chr2 160218522 160218905 + 0.666667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie -18400 NM_001282354 3694 Hs.470399 NM_000888 ENSG00000115221 ITGB6 AI1H integrin subunit beta 6 protein-coding 166.667-160 chr4 36751820 36752159 + 0.666667 NA Intergenic MADE1|DNA|TcMar-Mariner -110089 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 136.667-183 chr8 140184343 140184652 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) AluSx|SINE|Alu -83962 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 115-129 chr5 146174790 146175096 + 0.666667 NA intron (NM_001317965, intron 1 of 30) AluSz6|SINE|Alu 7707 NM_020117 51520 Hs.432674 NM_016460 ENSG00000133706 LARS HSPC192|ILFS1|LARS1|LEURS|LEUS|LFIS|LRS|PIG44|RNTLS|hr025Cl leucyl-tRNA synthetase protein-coding 197-46 chr18 12153874 12154240 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -46722 NR_049896 497259 Hs.451609 NR_049896 C18orf61 - uncharacterized LOC497259 ncRNA 171.667-43 chr13 43934667 43934996 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54927 NM_153218 144811 Hs.210586 NM_153218 ENSG00000179630 LACC1 C13orf31|FAMIN laccase domain containing 1 protein-coding 171.666-2 chr12 48929931 48930441 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -4639 NM_001143782 51303 Hs.655103 NM_016594 ENSG00000134285 FKBP11 FKBP19 FKBP prolyl isomerase 11 protein-coding 158-70 chr2 77294393 77294732 + 0.666667 NA intron (NR_146416, intron 1 of 1) intron (NR_146416, intron 1 of 1) 227814 NM_001282928 80059 Hs.285782 NM_024993 ENSG00000176204 LRRTM4 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 protein-coding 138-94 chr5 137980306 137980607 + 0.666667 NA intron (NM_001101801, intron 9 of 21) AluJb|SINE|Alu -52318 NR_037900 100130172 Hs.616629 NR_037900 LOC100130172 - uncharacterized LOC100130172 ncRNA 119.333-3 chr1 36055979 36056264 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_024852, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_024852, exon 19 of 19) -27973 NM_014466 27285 Hs.127111 NM_014466 ENSG00000092850 TEKT2 TEKTB1|TEKTIN-T|h-tektin-t tektin 2 protein-coding 120.333-183 chr8 70224028 70224232 + 0.666667 NA intron (NM_001321711, intron 2 of 21) L2a|LINE|L2 -152878 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 158.667-337 chr8 137371292 137371585 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 42150 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 113.333-197 chr4 108539466 108539646 + 0.666667 NA non-coding (NR_026968, exon 4 of 4) non-coding (NR_026968, exon 4 of 4) -17677 NR_134679 101929621 Hs.679455 NR_134679 LOC101929621 - uncharacterized LOC101929621 ncRNA 114.667-167 chr22 34846696 34846944 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 3 of 4) intron (NR_138042, intron 3 of 4) 151096 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 129-79 chr22 30501410 30501724 + 0.666667 NA intron (NM_001161368, intron 2 of 11) L1MC3|LINE|L1 4128 NM_174977 284904 Hs.517541 NM_174977 ENSG00000133488 SEC14L4 TAP3 SEC14 like lipid binding 4 protein-coding 155.667-308 chr6 75656397 75656782 + 0.666667 NA intron (NM_001100409, intron 6 of 22) intron (NM_001100409, intron 6 of 22) 54709 NM_015571 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 152.333-88 chr12 114987538 114987876 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -303532 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 159-34 chr13 104925633 104925959 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -540071 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 182-95 chr6 139732187 139732708 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38626 NR_038399 100132735 Hs.62646 NR_038399 ENSG00000231426 FILNC1 - FOXO induced long non-coding RNA 1 ncRNA 153.667-71 chr11 72264169 72264523 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -20170 NM_005169 401 Hs.731115 NM_005169 ENSG00000165462 PHOX2A ARIX|CFEOM2|FEOM2|NCAM2|PMX2A paired like homeobox 2A protein-coding 171-35 chr2 78557764 78558073 + 0.666667 NA intron (NR_136311, intron 2 of 2) L1MEg|LINE|L1 12387 NR_136312 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 117-73 chr19 33156748 33156946 + 0.666667 NA intron (NR_135565, intron 7 of 11) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 24733 NR_135565 126248 Hs.211046 NM_173479 ENSG00000166359 WDR88 PQWD WD repeat domain 88 protein-coding 214.667-79 chr3 35469810 35470215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75989 NR_110817 101928135 Hs.550715 NR_110817 LOC101928135 - uncharacterized LOC101928135 ncRNA 181.333-119 chr4 58718524 58718838 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -182353 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 121-45 chr14 54178938 54179239 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -217780 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 116.333-8 chr1 51181136 51181342 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 53857 NR_147076 105378716 NR_147076 ENSG00000203356 LINC01562 - long intergenic non-protein coding RNA 1562 ncRNA 131.667-72 chr17 28838711 28838987 + 0.666667 NA intron (NM_001288636, intron 1 of 5) AluSx|SINE|Alu 3941 NM_001288640 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 143.667-25 chr10 65516012 65516404 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -55217 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 146.667-360 chrX 24885162 24885567 + 0.666667 NA intron (NM_016937, intron 34 of 36) intron (NM_016937, intron 34 of 36) 130601 NM_139058 170302 Hs.300304 NM_139058 ENSG00000004848 ARX CT121|EIEE1|ISSX|MRX29|MRX32|MRX33|MRX36|MRX38|MRX43|MRX54|MRX76|MRX87|MRXS1|PRTS aristaless related homeobox protein-coding 131-107 chr8 132814796 132815138 + 0.666667 NA intron (NM_001277196, intron 9 of 19) intron (NM_001277196, intron 9 of 19) 39579 NM_016018 51105 Hs.304362 NM_016018 ENSG00000129292 PHF20L1 CGI-72|TDRD20B|URLC1 PHD finger protein 20 like 1 protein-coding 123.667-28 chr10 698265 698553 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -8741 NM_014974 22982 Hs.432397 NM_014974 ENSG00000151240 DIP2C KIAA0934 disco interacting protein 2 homolog C protein-coding 165-91 chr7 79040546 79041003 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 31786 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 115.667-227 chr9 94184464 94184699 + 0.666667 NA intron (NR_160773, intron 2 of 2) intron (NR_160773, intron 2 of 2) 5747 NR_029481 406886 NR_029481 ENSG00000199133 MIRLET7D LET7D|MIRNLET7D|hsa-let-7d|let-7d microRNA let-7d ncRNA 130-110 chr6 54117539 54117780 + 0.666667 NA intron (NM_001281747, intron 1 of 13) L1MA8|LINE|L1 6216 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 181.333-27 chr11 76132933 76133354 + 0.666667 NA intron (NM_003369, intron 14 of 14) MIR|SINE|MIR 73359 NM_004626 7481 Hs.108219 NM_004626 ENSG00000085741 WNT11 HWNT11 Wnt family member 11 protein-coding 144-122 chr4 55591175 55591483 + 0.666667 NA intron (NM_152401, intron 1 of 5) intron (NM_152401, intron 1 of 5) 916 NM_152401 132954 Hs.223712 NM_152401 ENSG00000163440 PDCL2 GCPHLP phosducin like 2 protein-coding 138.667-106 chr2 73904984 73905348 + 0.666667 NA intron (NM_001615, intron 3 of 8) intron (NM_001615, intron 3 of 8) 12158 NM_001615 72 Hs.516105 NM_001615 ENSG00000163017 ACTG2 ACT|ACTA3|ACTE|ACTL3|ACTSG|VSCM actin gamma 2, smooth muscle protein-coding 245.333-30 chr12 59132893 59133500 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -212658 NM_153377 121227 Hs.253736 NM_153377 ENSG00000139263 LRIG3 LIG3 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3 protein-coding 219-18 chr11 123552581 123553182 + 0.666667 NA intron (NM_020716, intron 1 of 19) intron (NM_020716, intron 1 of 19) -7381 NM_001286564 57476 Hs.144725 NM_020716 ENSG00000023171 GRAMD1B LINC01059 GRAM domain containing 1B protein-coding 146.333-107 chr15 62984376 62984683 + 0.666667 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -58218 NM_001018004 7168 Hs.133892 NM_000366 ENSG00000140416 TPM1 C15orf13|CMD1Y|CMH3|HEL-S-265|HTM-alpha|LVNC9|TMSA tropomyosin 1 protein-coding 150.667-94 chr12 110844258 110844558 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -2579 NM_001286243 160762 Hs.437141 NM_152591 ENSG00000173093 CCDC63 ODA5 coiled-coil domain containing 63 protein-coding 168-124 chr9 135190755 135191088 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9312 NR_046107 401557 Hs.640138 NR_046107 LOC401557 - uncharacterized LOC401557 ncRNA 151.667-175 chr2 160895572 160896023 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -241158 NM_133484 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 157.333-229 chr3 74950493 74950926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -263767 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 300-8 chr10 52009356 52009932 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 5 of 17) L1PA14|LINE|L1 304484 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-116 chr15 42741751 42742191 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_173500, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_173500, exon 15 of 15) -4843 NM_138477 146059 Hs.599232 NM_138477 ENSG00000140326 CDAN1 CDA1|CDAI|CDAN1A|DLT|PRO1295 codanin 1 protein-coding 190-132 chr9 96538063 96538464 + 0.666667 NA intron (NR_147239, intron 7 of 14) intron (NR_147239, intron 7 of 14) 28568 NM_001351569 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 165-97 chr8 103123679 103124066 + 0.666667 NA intron (NR_145429, intron 1 of 5) L1ME4b|LINE|L1 2840 NR_145429 379034 Hs.591862 NR_145429 LINC01181 - long intergenic non-protein coding RNA 1181 ncRNA 157-33 chr12 64917242 64917598 + 0.666667 NA intron (NR_033988, intron 2 of 2) MER85|DNA|PiggyBac 33646 NR_033988 400046 Hs.591032 NR_033988 ENSG00000255693 LINC02389 - long intergenic non-protein coding RNA 2389 ncRNA 144.333-60 chr13 75037656 75037971 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 202568 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 156-137 chr8 25297102 25297447 + 0.666667 NA intron (NM_024940, intron 7 of 51) AluSx1|SINE|Alu -48128 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 125.667-169 chr6 127615867 127616237 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 38878 NM_001010905 352999 Hs.226268 NM_001010905 ENSG00000184530 C6orf58 LEG1 chromosome 6 open reading frame 58 protein-coding 138.333-102 chr2 184103001 184103331 + 0.666667 NA Intergenic MamTip3|DNA|hAT-Tip100 -275809 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 166.333-17 chr1 220808756 220809216 + 0.666667 NA intron (NM_022746, intron 6 of 6) intron (NM_022746, intron 6 of 6) -15285 NR_157260 106481171 NR_157260 RNU6ATAC35P - RNA, U6atac small nuclear 35, pseudogene pseudo 211-10 chr10 49486735 49487349 + 0.666667 NA intron (NM_001346440, intron 8 of 20) intron (NM_001346440, intron 8 of 20) 37239 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 247.333-73 chr6 165751286 165751940 + 0.666667 NA Intergenic MER66C|LTR|ERV1 -89333 NM_006661 10846 Hs.348762 NM_006661 ENSG00000112541 PDE10A ADSD2|HSPDE10A|IOLOD|LINC00473|PDE10A19 phosphodiesterase 10A protein-coding 232.333-78 chr6 123846325 123846938 + 0.666667 NA intron (NM_001040214, intron 1 of 6) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 42766 NM_001040214 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 114-53 chr17 66049802 66050068 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 12 of 26) L1MEh|LINE|L1 141957 NM_001302891 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 123-118 chr7 108683389 108683605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113623 NM_012328 4189 Hs.732494 NM_012328 ENSG00000128590 DNAJB9 ERdj4|MDG-1|MDG1|MST049|MSTP049 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9 protein-coding 147.333-104 chr14 59716847 59717257 + 0.666667 NA intron (NM_021136, intron 3 of 8) intron (NM_021136, intron 3 of 8) -70032 NR_049851 100847088 NR_049851 ENSG00000263629 MIR5586 - microRNA 5586 ncRNA 218.667-96 chr6 167867741 167868171 + 0.666667 NA intron (NM_001207008, intron 2 of 31) intron (NM_001207008, intron 2 of 31) 40321 NM_001291964 4301 Hs.614974 NM_005936 ENSG00000130396 AFDN AF6|MLL-AF6|MLLT4|l-afadin afadin, adherens junction formation factor protein-coding 180.667-69 chr2 142069419 142069825 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 1 of 90) intron (NM_018557, intron 1 of 90) 62079 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 141-48 chr2 201499126 201499544 + 0.666667 NA intron (NM_001168216, intron 11 of 12) L2|LINE|L2 47595 NM_018571 55437 Hs.652338 NM_018571 ENSG00000082146 STRADB ALS2CR2|CALS-21|ILPIP|ILPIPA|PAPK|PRO1038 STE20 related adaptor beta protein-coding 138.667-117 chr20 17397441 17397797 + 0.666667 NA intron (NM_002594, intron 5 of 11) AluSg7|SINE|Alu 133760 NM_001195 631 Hs.129702 NM_001195 ENSG00000125864 BFSP1 CP115|CP94|CTRCT33|LIFL-H beaded filament structural protein 1 protein-coding 217.333-110 chr4 114728522 114729113 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72058 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 141.333-149 chr3 44391598 44391842 + 0.666667 NA intron (NM_001282915, intron 5 of 10) intron (NM_001282915, intron 5 of 10) 31217 NM_001351479 102724231 Hs.131918 NM_001351479 C3orf86 LINC00694 chromosome 3 open reading frame 86 protein-coding 153.333-91 chr12 40899910 40900231 + 0.666667 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) MIRb|SINE|MIR -8287 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 114-30 chr13 62916988 62917221 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -109745 NR_120403 100874176 Hs.402083 NR_047029 LINC00448 - long intergenic non-protein coding RNA 448 ncRNA 175-57 chr3 187722572 187722905 + 0.666667 NA intron (NM_001706, intron 9 of 9) intron (NM_001706, intron 9 of 9) 12169 NM_001134738 604 Hs.478588 NM_001706 ENSG00000113916 BCL6 BCL5|BCL6A|LAZ3|ZBTB27|ZNF51 BCL6 transcription repressor protein-coding 150-85 chr20 59335160 59335461 + 0.666667 NA Intergenic MamRep434|DNA|TcMar-Tigger 34699 NM_207033 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 117.333-154 chr4 72182452 72182796 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 143492 NM_001144756 10886 Hs.99231 NM_004885 ENSG00000056291 NPFFR2 GPR74|HLWAR77|NPFF2|NPGPR neuropeptide FF receptor 2 protein-coding 155.333-231 chr3 73040115 73040432 + 0.666667 NA intron (NM_001318025, intron 2 of 7) intron (NM_001318025, intron 2 of 7) -21386 NM_018029 55096 Hs.658858 NM_018029 ENSG00000255423 EBLN2 EBLN-2 endogenous Bornavirus like nucleoprotein 2 protein-coding 136.333-45 chr13 29939064 29939360 + 0.666667 NA intron (NR_033889, intron 3 of 4) intron (NR_033889, intron 3 of 4) 2681 NR_033889 440131 Hs.132371 NM_001010918 LINC00544 - long intergenic non-protein coding RNA 544 ncRNA 155-34 chr14 101257915 101258231 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 137217 NR_146490 101929422 NR_146490 ENSG00000259004 LINC02285 - long intergenic non-protein coding RNA 2285 ncRNA 144-80 chr2 208440291 208440704 + 0.666667 NA intron (NM_005048, intron 4 of 12) intron (NM_005048, intron 4 of 12) 33667 NM_005048 5746 Hs.570296 NM_005048 ENSG00000144407 PTH2R PTHR2 parathyroid hormone 2 receptor protein-coding 122.667-124 chr3 135476593 135476881 + 0.666667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -488991 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 158-20 chr11 14397945 14398392 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -33662 NM_001177314 22800 Hs.502004 NM_012250 ENSG00000133818 RRAS2 TC21 RAS related 2 protein-coding 197.333-85 chr17 55233529 55233947 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31222 NM_002126 3131 Hs.196952 NM_002126 ENSG00000108924 HLF - HLF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 157.333-219 chr21 19308278 19308631 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -548642 NR_109925 101927797 Hs.551743 NR_109925 MIR548XHG - MIR548X host gene ncRNA 162-118 chr8 42193899 42194301 + 0.666667 NA intron (NM_001319189, intron 1 of 11) AluJb|SINE|Alu 13465 NM_033011 5327 Hs.491582 NM_000930 ENSG00000104368 PLAT T-PA|TPA plasminogen activator, tissue type protein-coding 112.667-151 chr20 50485648 50485847 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -24574 NM_001278618 5770 Hs.417549 NM_002827 ENSG00000196396 PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 protein-coding 152.333-407 chr9 116169774 116170088 + 0.666667 NA intron (NM_002581, intron 1 of 21) intron (NM_002581, intron 1 of 21) 16140 NM_002581 5069 Hs.643599 NM_002581 ENSG00000182752 PAPPA ASBABP2|DIPLA1|IGFBP-4ase|PAPA|PAPP-A|PAPPA1 pappalysin 1 protein-coding 155-103 chr4 96091037 96091377 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -219496 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 126.667-99 chr22 33006674 33006966 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_133633) promoter-TSS (NM_133633) 1 NM_133633 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 219.667-46 chr20 50573881 50574436 + 0.666667 NA intron (NM_002827, intron 4 of 9) MamRTE1|LINE|RTE-BovB -11628 NR_030375 693230 NR_030375 ENSG00000208018 MIR645 MIRN645|hsa-mir-645 microRNA 645 ncRNA 156-121 chr6 44526914 44527205 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 24822 NR_134609 105375075 Hs.123393 NR_134609 LOC105375075 - uncharacterized LOC105375075 ncRNA 145-121 chr8 82236845 82237122 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -394697 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 165-21 chr14 23312389 23312801 + 0.666667 NA TTS (NM_004050) TTS (NM_004050) 5735 NM_001199839 599 Hs.410026 NM_004050 ENSG00000129473 BCL2L2 BCL-W|BCL2-L-2|BCLW|PPP1R51 BCL2 like 2 protein-coding 114.333-28 chr10 68097885 68098080 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8025 NR_045662 84665 Hs.55205 NM_032578 ENSG00000138347 MYPN CMD1DD|CMH22|MYOP|NEM11|RCM4 myopalladin protein-coding 116-72 chr2 32002503 32002714 + 0.666667 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) MIRb|SINE|MIR 8056 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 124-34 chr13 75627259 75627625 + 0.666667 NA intron (NM_005358, intron 2 of 29) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 7008 NM_005358 4008 Hs.207631 NM_005358 ENSG00000136153 LMO7 FBX20|FBXO20|LMO7b|LOMP LIM domain 7 protein-coding 129.667-36 chr11 118937435 118937749 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -18706 NM_006760 7379 Hs.379613 NM_006760 ENSG00000110375 UPK2 UP2|UPII uroplakin 2 protein-coding 124.333-30 chr11 93470405 93470717 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 72830 NM_020179 56935 Hs.438064 NM_020179 ENSG00000166002 SMCO4 C11orf75|FN5 single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 protein-coding 160.667-193 chr3 42815766 42816114 + 0.666667 NA intron (NM_001296, intron 1 of 2) MIR|SINE|MIR 6495 NM_001296 1238 Hs.146346 NM_001296 ENSG00000144648 ACKR2 CCBP2|CCR10|CCR9|CMKBR9|D6|hD6 atypical chemokine receptor 2 protein-coding 143.667-234 chr7 55563426 55563834 + 0.666667 NA intron (NM_001321244, intron 1 of 5) Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger 8238 NM_001321250 81552 Hs.488307 NM_030796 ENSG00000154978 VOPP1 ECOP|GASP|WBP1L2 VOPP1 WW domain binding protein protein-coding 200.667-27 chr11 8120852 8121306 + 0.666667 NA intron (NM_001135109, intron 1 of 1) intron (NM_001135109, intron 1 of 1) 39717 NM_177972 7275 Hs.568986 NM_003320 ENSG00000166402 TUB RDOB|rd5 TUB bipartite transcription factor protein-coding 173.667-129 chr4 30350270 30350630 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -369919 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 137.333-151 chr5 41923112 41923414 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -1989 NM_001297437 26272 Hs.165575 NM_012176 ENSG00000151876 FBXO4 FBX4 F-box protein 4 protein-coding 127.667-102 chr20 43581342 43581562 + 0.666667 NA intron (NM_170693, intron 12 of 12) L1ME4a|LINE|L1 -9485 NM_001303458 51098 Hs.444332 NM_016004 ENSG00000101052 IFT52 C20orf9|CGI-53|NGD2|NGD5 intraflagellar transport 52 protein-coding 167.667-221 chrX 18091824 18092268 + 0.666667 NA intron (NR_133641, intron 1 of 4) intron (NR_133641, intron 1 of 4) 12598 NR_133641 105373144 NR_133641 ENSG00000225882 LINC01456 - long intergenic non-protein coding RNA 1456 ncRNA 157.667-348 chr8 144388202 144388459 + 0.666667 NA intron (NM_174922, intron 3 of 14) AluSg|SINE|Alu 5900 NR_030635 100126351 NR_030635 ENSG00000284310 MIR939 MIRN939|hsa-mir-939|mir-939 microRNA 939 ncRNA 117-109 chr4 174188991 174189329 + 0.666667 NA intron (NR_125896, intron 1 of 4) HERVL40-int|LTR|ERVL 31238 NR_125896 101928509 Hs.147719 NR_125896 ENSG00000248174 LINC02268 - long intergenic non-protein coding RNA 2268 ncRNA 235.667-60 chr8 59767055 59767458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 514144 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 162-67 chr2 135037194 135037472 + 0.666667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -12655 NM_001018047 80122 Hs.659395 NM_025052 ENSG00000176601 MAP3K19 RCK|YSK4 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 protein-coding 146-98 chr4 116226284 116226607 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73280 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 195.667-85 chr22 27996531 27996925 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 16 of 22) intron (NM_001145418, intron 16 of 22) -76116 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 123.667-67 chr16 6022778 6023128 + 0.666667 NA intron (NM_018723, intron 1 of 15) L1MB1|LINE|L1 3250 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 160.667-156 chr2 137120901 137121229 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 5 of 27) intron (NM_001316349, intron 5 of 27) 355520 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 117-94 chr3 55508941 55509139 + 0.666667 NA non-coding (NR_132749, exon 18 of 18) non-coding (NR_132749, exon 18 of 18) -21398 NM_003392 7474 Hs.643085 NM_003392 ENSG00000114251 WNT5A hWNT5A Wnt family member 5A protein-coding 150-87 chr22 37318174 37318537 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35847 NM_001318024 27128 Hs.170944 NM_013385 ENSG00000100055 CYTH4 CYT4|DJ63G5.1|PSCD4|cytohesin-4 cytohesin 4 protein-coding 171-25 chr16 57025441 57025773 + 0.666667 NA exon (NM_032206, exon 5 of 48) exon (NM_032206, exon 5 of 48) 8533 NM_032206 84166 Hs.528836 NM_032206 ENSG00000140853 NLRC5 CLR16.1|NOD27|NOD4 NLR family CARD domain containing 5 protein-coding 129.333-28 chr10 116345030 116345318 + 0.666667 NA intron (NM_198515, intron 5 of 8) L1ME2|LINE|L1 20726 NM_198515 374355 Hs.233407 NM_198515 ENSG00000182645 CCDC172 C10orf96 coiled-coil domain containing 172 protein-coding 183.333-109 chr3 193526120 193526658 + 0.666667 NA intron (NM_032279, intron 1 of 29) L1PA8|LINE|L1 -26824 NR_121666 101929198 Hs.450092 NR_046726 ATP13A4-AS1 - ATP13A4 antisense RNA 1 ncRNA 117.333-202 chr8 15053988 15054188 + 0.666667 NA intron (NM_139167, intron 1 of 7) intron (NM_139167, intron 1 of 7) 184343 NM_139167 137868 Hs.545526 NM_139167 ENSG00000185053 SGCZ ZSG1 sarcoglycan zeta protein-coding 153.333-355 chr6 47777471 47777833 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4387 NM_181744 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 316.333-24 chr5 95005837 95006477 + 0.666667 NA intron (NM_001297777, intron 2 of 19) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 75709 NM_001002796 79772 Hs.591248 NM_024717 ENSG00000175471 MCTP1 - multiple C2 and transmembrane domain containing 1 protein-coding 128.333-25 chr10 31778920 31779145 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 129894 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 142.667-147 chr3 166114521 166114831 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -277253 NM_000055 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 224.667-35 chr19 42535886 42536315 + 0.666667 NA intron (NR_073180, intron 2 of 2) L1M1|LINE|L1 -7619 NM_001184815 634 Hs.512682 NM_001712 ENSG00000079385 CEACAM1 BGP|BGP1|BGPI carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 1 protein-coding 211.666-10 chr11 129765722 129766349 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -49746 NM_001331210 120224 Hs.504301 NM_138788 ENSG00000151715 TMEM45B - transmembrane protein 45B protein-coding 151.333-421 chr8 85335688 85336060 + 0.666667 NA intron (NM_001291968, intron 2 of 5) intron (NM_001291968, intron 2 of 5) 5840 NM_001164830 759 Hs.23118 NM_001738 ENSG00000133742 CA1 CA-I|CAB|Car1|HEL-S-11 carbonic anhydrase 1 protein-coding 161-76 chr5 25001783 25002152 + 0.666667 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -161384 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 226.333-37 chr15 87893400 87894011 + 0.666667 NA intron (NM_001012338, intron 17 of 19) intron (NM_001012338, intron 17 of 19) 52563 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 164.333-70 chr14 98429090 98429562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -282287 NR_161368 283598 Hs.448754 NM_182560 ENSG00000176605 C14orf177 - chromosome 14 open reading frame 177 ncRNA 126-13 chr10 83806201 83806529 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129276 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 122.333-188 chr6 126447616 126447904 + 0.666667 NA intron (NR_104462, intron 3 of 3) intron (NR_104462, intron 3 of 3) -36871 NR_030316 693173 NR_030316 ENSG00000207632 MIR588 MIRN588|hsa-mir-588 microRNA 588 ncRNA 174.667-95 chr2 165983061 165983424 + 0.666667 NA intron (NR_110598, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 25824 NR_110598 102724058 Hs.570269 NR_110598 ENSG00000236107 LOC102724058 - uncharacterized LOC102724058 ncRNA 130.667-137 chr22 31269592 31269861 + 0.666667 NA intron (NM_001031801, intron 10 of 14) AluSz|SINE|Alu 21342 NM_001031801 3985 Hs.474596 NM_005569 ENSG00000182541 LIMK2 - LIM domain kinase 2 protein-coding 151.667-124 chr15 62038253 62038552 + 0.666667 NA intron (NM_001018088, intron 3 of 81) AluJb|SINE|Alu 22045 NM_017684 54832 Hs.511668 NM_017684 ENSG00000129003 VPS13C PARK23 vacuolar protein sorting 13 homolog C protein-coding 181.333-142 chr5 90244056 90244493 + 0.666667 NA intron (NR_120601, intron 3 of 5) L1PA5|LINE|L1 45797 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 142.333-227 chr7 79447697 79447976 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) intron (NM_001301128, intron 1 of 20) -5121 NR_038346 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 128.333-167 chr5 169782987 169783230 + 0.666667 NA intron (NR_156756, intron 25 of 52) intron (NR_156756, intron 25 of 52) 145833 NM_004946 1794 Hs.586174 NM_004946 ENSG00000134516 DOCK2 IMD40 dedicator of cytokinesis 2 protein-coding 122-47 chr19 37661723 37661978 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5589 NM_001320668 22835 Hs.668737 NM_014898 ENSG00000120784 ZFP30 ZNF745 ZFP30 zinc finger protein protein-coding 130.667-9 chr1 93356394 93356701 + 0.666667 NA intron (NM_001938, intron 2 of 2) intron (NM_001938, intron 2 of 2) 10640 NM_001938 1810 Hs.348418 NM_001938 ENSG00000117505 DR1 NC2|NC2-BETA|NC2B|NCB2 down-regulator of transcription 1 protein-coding 115.333-49 chr12 62426660 62426997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39998 NM_015026 23041 Hs.389378 NM_015026 ENSG00000061987 MON2 - MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking protein-coding 124.667-45 chr12 44961304 44961592 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -47520 NM_001145110 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 169-2 chr1 116467336 116467664 + 0.666667 NA intron (NR_125973, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 11326 NR_125973 101929023 Hs.668091 NR_125972 ENSG00000233154 LINC01762 - long intergenic non-protein coding RNA 1762 ncRNA 123.667-3 chr1 43029791 43030072 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 70882 NR_033967 440584 Hs.260928 NR_033967 ENSG00000227533 SLC2A1-AS1 - SLC2A1 antisense RNA 1 ncRNA 137.667-69 chr16 22650747 22651115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 105233 NR_003676 653786 Hs.564945 NR_003676 ENSG00000257838 OTOAP1 - OTOA pseudogene 1 pseudo 182-26 chr13 66624236 66624705 + 0.666667 NA intron (NM_001318373, intron 3 of 3) intron (NM_001318373, intron 3 of 3) -200699 NR_046527 100874064 Hs.569284 NR_046527 ENSG00000228842 PCDH9-AS2 - PCDH9 antisense RNA 2 ncRNA 198-196 chr9 91061192 91061684 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13694 NR_033912 100129316 Hs.458154 NR_033912 LOC100129316 - uncharacterized LOC100129316 ncRNA 162.333-123 chr2 146324551 146324909 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -262327 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 180.333-45 chr17 54946245 54946624 + 0.666667 NA intron (NM_001321176, intron 12 of 16) L1MD2|LINE|L1 22220 NR_135677 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 113-158 chr4 73194795 73195105 + 0.666667 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) L1ME1|LINE|L1 28107 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 115.667-123 chr2 153873171 153873460 + 0.666667 NA intron (NM_052917, intron 1 of 12) CpG 1393 NM_052917 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 184.667-122 chr7 52298027 52298514 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -737363 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 123.333-238 chrX 94938644 94938950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 124429 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 166-39 chr14 45315737 45316080 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -62706 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 144-115 chr3 148833450 148833715 + 0.666667 NA intron (NM_001871, intron 2 of 10) intron (NM_001871, intron 2 of 10) 5771 NM_001871 1360 Hs.477891 NM_001871 ENSG00000153002 CPB1 CPB|PASP|PCPB carboxypeptidase B1 protein-coding 112.667-16 chr1 171807542 171807711 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25966 NM_014955 51603 Hs.494705 NM_014955 ENSG00000010165 EEF1AKNMT 5630401D24Rik|CGI-01|DFNB26|DFNB26M|KIAA0859|METTL13|feat eEF1A lysine and N-terminal methyltransferase protein-coding 122.333-106 chr2 173432647 173432924 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 77913 NM_031942 83879 Hs.470654 NM_031942 ENSG00000144354 CDCA7 ICF3|JPO1 cell division cycle associated 7 protein-coding 151.667-352 chr8 31933728 31934053 + 0.666667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -91846 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 114.333-123 chr2 213751966 213752193 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) HAL1ME|LINE|L1 -5988 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 173-96 chr8 92322397 92322776 + 0.666667 NA Intergenic MER21B|LTR|ERVL -219201 NM_175634 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 116-124 chr5 76622375 76622607 + 0.666667 NA intron (NM_001256566, intron 1 of 1) intron (NM_001256566, intron 1 of 1) 912 NM_004101 2151 Hs.42502 NM_004101 ENSG00000164220 F2RL2 PAR-3|PAR3 coagulation factor II thrombin receptor like 2 protein-coding 118.667-117 chr20 3817752 3817984 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2656 NM_001204446 55317 Hs.104806 NM_018347 ENSG00000125843 AP5S1 C20orf29 adaptor related protein complex 5 subunit sigma 1 protein-coding 167.333-74 chr14 29633229 29633694 + 0.666667 NA intron (NM_001330069, intron 9 of 18) intron (NM_001330069, intron 9 of 18) 293635 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 144-163 chr9 131449983 131450303 + 0.666667 NA intron (NM_013318, intron 8 of 30) L1ME2z|LINE|L1 20053 NM_013318 84726 Hs.743955 NM_013318 ENSG00000130723 PRRC2B BAT2L|BAT2L1|KIAA0515|LQFBS-1 proline rich coiled-coil 2B protein-coding 208.333-155 chr8 129408309 129408726 + 0.666667 NA intron (NR_130920, intron 1 of 3) L1PB4|LINE|L1 75625 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 114.333-121 chr2 187545157 187545476 + 0.666667 NA intron (NM_001329239, intron 1 of 9) intron (NM_001329239, intron 1 of 9) 9119 NM_001329240 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 259-41 chr5 28916110 28916533 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10549 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 129-67 chr2 195757987 195758258 + 0.666667 NA intron (NM_018897, intron 61 of 64) HAL1|LINE|L1 100896 NM_020342 57181 Hs.650158 NM_020342 ENSG00000196950 SLC39A10 LZT-Hs2 solute carrier family 39 member 10 protein-coding 159-92 chr4 141790432 141790759 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 154012 NM_172175 3600 Hs.168132 NM_000585 ENSG00000164136 IL15 IL-15 interleukin 15 protein-coding 182.667-150 chr7 5682947 5683327 + 0.666667 NA intron (NM_207111, intron 13 of 16) (CAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -2676 NR_046834 100874342 Hs.665728 NR_046834 ENSG00000237738 RNF216-IT1 - RNF216 intronic transcript 1 ncRNA 162-123 chr8 115180416 115180832 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 487389 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 144.667-59 chr12 47151345 47151622 + 0.666667 NA intron (NM_001281429, intron 2 of 2) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -36329 NR_039847 100616486 NR_039847 ENSG00000263838 MIR4698 - microRNA 4698 ncRNA 199.667-68 chr2 7151470 7151963 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73836 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 142.333-228 chr7 89849645 89849926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -269615 NR_003551 442523 Hs.406964 NR_003551 ENSG00000235436 DPY19L2P4 - DPY19L2 pseudogene 4 pseudo 149.667-104 chr13 59452808 59453103 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -559763 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 128.667-167 chr7 66623827 66624084 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -4926 NM_153033 154881 Hs.546627 NM_153033 ENSG00000243335 KCTD7 CLN14|EPM3 potassium channel tetramerization domain containing 7 protein-coding 201.667-62 chr20 5016294 5016636 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -6152 NM_203327 9962 Hs.516866 NM_005116 ENSG00000089057 SLC23A2 NBTL1|SLC23A1|SVCT2|YSPL2 solute carrier family 23 member 2 protein-coding 156-115 chr5 91798240 91798548 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -415077 NM_001329672 57561 Hs.24684 NM_020801 ENSG00000113369 ARRDC3 TLIMP arrestin domain containing 3 protein-coding 206.667-141 chr8 129088667 129088991 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -122828 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 113-177 chr6 45779254 45779470 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 158235 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 140.333-144 chr3 112930315 112930563 + 0.666667 NA intron (NM_138806, intron 3 of 7) intron (NM_138806, intron 3 of 7) 44664 NM_170780 131450 Hs.309158 NM_138806 ENSG00000163606 CD200R1 CD200R|HCRTR2|MOX2R|OX2R CD200 receptor 1 protein-coding 160.333-77 chr12 56523536 56523868 + 0.666667 NA intron (NM_002898, intron 1 of 13) AluSz|SINE|Alu 1882 NM_002898 5939 Hs.505729 NM_002898 ENSG00000076067 RBMS2 SCR3 RNA binding motif single stranded interacting protein 2 protein-coding 162-9 chr10 12914297 12914643 + 0.666667 NA intron (NM_001282658, intron 6 of 6) AluSz6|SINE|Alu 87243 NM_031455 83643 Hs.498720 NM_031455 ENSG00000151468 CCDC3 - coiled-coil domain containing 3 protein-coding 196.333-148 chr5 156253461 156253871 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73091 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 193.667-3 chr1 34824922 34825319 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 32121 NM_002060 2701 Hs.296310 NM_002060 ENSG00000187513 GJA4 CX37 gap junction protein alpha 4 protein-coding 150.333-286 chr3 194515502 194515800 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 28511 NR_033929 401106 Hs.407087 NR_033929 LINC00884 - long intergenic non-protein coding RNA 884 ncRNA 122.667-46 chr14 56079351 56079621 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38925 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 123.667-156 chr5 44973148 44973366 + 0.666667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 164310 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 153.667-301 chr4 115789028 115789351 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -510536 NR_031737 100302290 NR_031737 ENSG00000284253 MIR1973 hsa-mir-1973|mir-1973 microRNA 1973 ncRNA 213.333-107 chr2 186254658 186255098 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -168561 NR_110218 101927217 Hs.130011 NR_110218 ENSG00000237877 LINC01473 - long intergenic non-protein coding RNA 1473 ncRNA 133-31 chr15 83671646 83671930 + 0.666667 NA intron (NM_207517, intron 2 of 29) LTR85a|LTR|Gypsy? 17665 NM_001301110 57188 Hs.459162 NM_207517 ENSG00000156218 ADAMTSL3 ADAMTSL-3 ADAMTS like 3 protein-coding 115-2 chr1 65605622 65605800 + 0.666667 NA intron (NM_001003679, intron 11 of 19) intron (NM_001003679, intron 11 of 19) 80022 NM_001198689 3953 Hs.23581 NM_002303 ENSG00000116678 LEPR CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR leptin receptor protein-coding 127-56 chr3 9820120 9820348 + 0.666667 NA intron (NM_001366051, intron 6 of 12) intron (NM_001366051, intron 6 of 12) 9972 NR_037162 26140 Hs.726435 NM_015644 ENSG00000214021 TTLL3 HOTTL tubulin tyrosine ligase like 3 protein-coding 150.333-363 chr6 87649156 87649446 + 0.666667 NA intron (NM_181837, intron 13 of 19) L1M5|LINE|L1 52932 NM_018064 55122 Hs.485915 NM_018064 ENSG00000135334 AKIRIN2 C6orf166|FBI1|dJ486L4.2 akirin 2 protein-coding 133-27 chr14 63365387 63365772 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -46644 NM_145171 122876 Hs.375028 NM_145171 ENSG00000179600 GPHB5 B5|GPB5|ZLUT1 glycoprotein hormone subunit beta 5 protein-coding 148-158 chr8 92832005 92832318 + 0.666667 NA Intergenic (ACTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -46101 NR_046114 441369 Hs.521683 NR_046114 ENSG00000248858 FLJ46284 - uncharacterized LOC441369 ncRNA 121.667-220 chrX 42256086 42256400 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -332689 NM_001367721 8573 Hs.495984 NM_003688 ENSG00000147044 CASK CAGH39|CAMGUK|CMG|FGS4|LIN2|MICPCH|MRXSNA|TNRC8|hCASK calcium/calmodulin dependent serine protein kinase protein-coding 263.333-14 chr12 5602918 5603413 + 0.666667 NA intron (NM_001278596, intron 20 of 25) HAL1|LINE|L1 109033 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 249.333-22 chr11 125908794 125909401 + 0.666667 NA intron (NM_013264, intron 6 of 11) MIR3|SINE|MIR 4589 NM_013264 29118 Hs.420263 NM_013264 ENSG00000109832 DDX25 GRTH DEAD-box helicase 25 protein-coding 113.333-74 chr14 61899119 61899310 + 0.666667 NA intron (NM_001367661, intron 2 of 8) MIRb|SINE|MIR -28481 NM_001367663 83851 Hs.404139 NM_031914 ENSG00000139973 SYT16 CHR14SYT|SYT14L|Strep14|syt14r synaptotagmin 16 protein-coding 163.667-153 chr3 63615802 63616186 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_144642, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_144642, exon 5 of 5) -36681 NM_001080537 132203 Hs.130704 NM_001080537 ENSG00000188817 SNTN S100A1L|S100AL|sentan sentan, cilia apical structure protein protein-coding 158-3 chr1 87873276 87873598 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -501782 NR_038324 100505768 Hs.125247 NR_038324 ENSG00000227290 LINC01364 - long intergenic non-protein coding RNA 1364 ncRNA 125.333-32 chr10 117487315 117487616 + 0.666667 NA non-coding (NR_002791, exon 4 of 4) non-coding (NR_002791, exon 4 of 4) -54980 NM_001165924 2018 Hs.202095 NM_004098 ENSG00000170370 EMX2 - empty spiracles homeobox 2 protein-coding 149-64 chr2 8620460 8620755 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -36815 NR_110257 101929567 Hs.634706 NR_110257 ENSG00000236008 LINC01814 - long intergenic non-protein coding RNA 1814 ncRNA 119.667-25 chr11 21923987 21924291 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -268946 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 158-136 chr8 43787995 43788294 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 495702 NM_001002920 340441 Hs.531579 NM_001002920 ENSG00000188877 POTEA A26A1|CT104.3|POTE-8|POTE8 POTE ankyrin domain family member A protein-coding 128-75 chr4 15051191 15051424 + 0.666667 NA intron (NM_001177383, intron 5 of 10) intron (NM_001177383, intron 5 of 10) 48826 NM_182646 132864 Hs.656937 NM_182485 ENSG00000137449 CPEB2 CPE-BP2|CPEB-2|hCPEB-2 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2 protein-coding 125-84 chr5 27617964 27618274 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145827 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 163.667-93 chr18 22110243 22110683 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 58505 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 208.667-133 chr7 107459875 107460342 + 0.666667 NA intron (NM_181733, intron 6 of 20) L1MEf|LINE|L1 -9949 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 135-26 chr13 60017915 60018183 + 0.666667 NA intron (NM_001258369, intron 5 of 26) intron (NM_001258369, intron 5 of 26) 4746 NR_109839 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 154-135 chr7 101501233 101501653 + 0.666667 NA intron (NM_133457, intron 3 of 12) intron (NM_133457, intron 3 of 12) 67563 NR_103748 100506527 Hs.535863 NR_103747 ENSG00000233123 LINC01007 - long intergenic non-protein coding RNA 1007 ncRNA 155.667-135 chr18 2091348 2091660 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 480001 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 173-3 chr1 183970538 183970899 + 0.666667 NA intron (NM_015101, intron 4 of 11) MIRc|SINE|MIR 67010 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 154.667-54 chr10 112485861 112486292 + 0.666667 NA intron (NM_001365712, intron 3 of 8) intron (NM_001365712, intron 3 of 8) -38473 NM_001351082 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 252-114 chr9 10090018 10090449 + 0.666667 NA intron (NM_002839, intron 3 of 45) intron (NM_002839, intron 3 of 45) 290841 NR_135135 105375972 Hs.738242 NR_135135 ENSG00000230920 LOC105375972 - uncharacterized LOC105375972 ncRNA 190-91 chr4 60703948 60704301 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -218495 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 123.667-83 chr2 34535084 34535350 + 0.666667 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL -142340 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 136-27 chr13 113568823 113569131 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -15711 NR_026580 7027 Hs.79353 NM_007111 ENSG00000198176 TFDP1 DILC|DP1|DRTF1|Dp-1 transcription factor Dp-1 protein-coding 239.667-9 chr10 109466987 109467602 + 0.666667 NA Intergenic MER61D|LTR|ERV1 455952 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 218.667-87 chr6 37821264 37821658 + 0.666667 NA intron (NM_021943, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 1734 NM_021943 60685 Hs.36959 NM_021943 ENSG00000156639 ZFAND3 TEX27 zinc finger AN1-type containing 3 protein-coding 123.333-222 chr8 131829412 131829642 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -74566 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 175.667-79 chr2 156239617 156240128 + 0.666667 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) intron (NR_110250, intron 1 of 3) 15059 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 204.333-68 chr16 58837385 58837855 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -103304 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 141.667-146 chr3 110449764 110450086 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 620034 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 112.333-61 chr12 92462122 92462400 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -4418 NR_144532 100507616 Hs.339918 NR_144532 LINC02397 - long intergenic non-protein coding RNA 2397 ncRNA 153.333-264 chr3 21747842 21748215 + 0.666667 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) intron (NM_024697, intron 1 of 7) 3182 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 187.667-56 chr17 60628759 60629132 + 0.666667 NA intron (NM_003620, intron 2 of 5) intron (NM_003620, intron 2 of 5) 28762 NM_003620 8493 Hs.286073 NM_003620 ENSG00000170836 PPM1D IDDGIP|PP2C-DELTA|WIP1 protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1D protein-coding 189.667-145 chr8 121755734 121756278 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -114566 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 118.333-91 chr18 71156654 71156855 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 422202 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 152.333-312 chr5 115003992 115004392 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 165716 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 196.333-132 chr4 100255229 100255802 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -65047 NM_145244 115265 Hs.480378 NM_145244 ENSG00000145358 DDIT4L REDD2|Rtp801L DNA damage inducible transcript 4 like protein-coding 189-7 chr10 19989181 19989701 + 0.666667 NA intron (NM_032812, intron 1 of 13) intron (NM_032812, intron 1 of 13) 173009 NM_001282736 84898 Hs.99472 NM_032812 ENSG00000120594 PLXDC2 TEM7R plexin domain containing 2 protein-coding 171.333-173 chr6 145559370 145559655 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 127365 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 229.667-54 chr3 764393 764887 + 0.666667 NA intron (NR_110118, intron 2 of 3) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 172535 NR_110118 101927215 Hs.650700 NR_110118 ENSG00000224957 LINC01266 - long intergenic non-protein coding RNA 1266 ncRNA 172.667-156 chr8 58438830 58439242 + 0.666667 NA intron (NR_156456, intron 6 of 8) MSTB|LTR|ERVL-MaLR 27675 NM_001077619 137886 Hs.155572 NM_001077619 ENSG00000215114 UBXN2B p37 UBX domain protein 2B protein-coding 129.333-178 chr7 77859147 77859478 + 0.666667 NA intron (NM_001366089, intron 2 of 18) intron (NM_001366089, intron 2 of 18) 19182 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 149.667-245 chr22 25624996 25625296 + 0.666667 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) LTR13|LTR|ERVK 60471 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 150.667-230 chr3 885607 886041 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -207200 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 153.667-135 chr15 63223873 63224178 + 0.666667 NA intron (NM_016530, intron 1 of 7) MIRc|SINE|MIR 34419 NM_016530 51762 Hs.389733 NM_016530 ENSG00000166128 RAB8B - RAB8B, member RAS oncogene family protein-coding 142-120 chr5 134788686 134789020 + 0.666667 NA intron (NM_001300860, intron 12 of 22) AluYc|SINE|Alu 30074 NM_014829 9879 Hs.406549 NM_014829 ENSG00000145833 DDX46 PRPF5|Prp5 DEAD-box helicase 46 protein-coding 130.333-214 chr8 127144786 127145048 + 0.666667 NA Intergenic LOR1-int|LTR|ERV1 52710 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 115-118 chr4 66787444 66787686 + 0.666667 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 510741 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 182.333-8 chr1 113547813 113548138 + 0.666667 NA intron (NM_001142782, intron 1 of 20) intron (NM_001142782, intron 1 of 20) 157460 NM_001142782 260425 Hs.486189 NM_020965 ENSG00000081026 MAGI3 MAGI-3|dJ730K3.2 membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 protein-coding 117-61 chr17 61120154 61120365 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 23 of 25) L1MC4|LINE|L1 247445 NR_136397 101927855 Hs.662123 NR_136397 ENSG00000267131 LOC101927855 - uncharacterized LOC101927855 ncRNA 111.667-196 chr5 30998254 30998467 + 0.666667 NA Intergenic MER34|LTR|ERV1 -195326 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 181-42 chr2 213811019 213811401 + 0.666667 NA intron (NR_047660, intron 9 of 14) intron (NR_047660, intron 9 of 14) 53143 NR_039640 100616375 NR_039640 ENSG00000265734 MIR4438 - microRNA 4438 ncRNA 203.667-72 chr22 40369504 40369956 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_015705) promoter-TSS (NM_015705) -864 NM_001350046 27352 Hs.474914 NM_015705 ENSG00000100359 SGSM3 CIP85|MAP|RABGAP5|RUSC3|RUTBC3|RabGAP-5|rabGAPLP small G protein signaling modulator 3 protein-coding 121-53 chr16 62246609 62246959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -210346 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 276.666-7 chr11 20936320 20937088 + 0.666667 NA intron (NM_201551, intron 9 of 18) L2a|LINE|L2 267118 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 136.333-206 chr8 82807454 82807753 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -104501 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 154-91 chr3 90093021 90093314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 985546 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 158.333-117 chr17 70593266 70593594 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 423895 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 208.667-56 chr17 71333581 71334042 + 0.666667 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -131632 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 200-37 chr11 116516605 116516937 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -122651 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 300.667-38 chr7 35560573 35561133 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 134282 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 185-71 chr7 101022998 101023321 + 0.666667 NA intron (NM_001040105, intron 1 of 12) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 3078 NR_133665 140453 Hs.271819 NM_001004430 ENSG00000169876 MUC17 MUC-17|MUC-3|MUC3 mucin 17, cell surface associated protein-coding 216.667-90 chr5 162232253 162232797 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 164883 NM_198904 2566 Hs.7195 NM_000816 ENSG00000113327 GABRG2 CAE2|ECA2|EIEE74|FEB8|GEFSP3 gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit protein-coding 139.667-96 chr2 175378458 175378849 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -196943 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 157.667-313 chr7 116146038 116146466 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64287 NM_015641 26136 Hs.592286 NM_015641 ENSG00000135269 TES TESS|TESS-2 testin LIM domain protein protein-coding 186.667-118 chr5 123691908 123692268 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 146671 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 160-28 chr11 112978602 112978983 + 0.666667 NA intron (NM_181351, intron 1 of 18) intron (NM_181351, intron 1 of 18) -15332 NR_120563 101928847 Hs.711235 NR_120563 ENSG00000247416 LOC101928847 - uncharacterized LOC101928847 ncRNA 167.333-257 chr8 87181160 87181513 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1MA10|LINE|L1 314921 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 210.667-138 chrX 43554876 43555259 + 0.666667 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -99840 NM_001270458 4128 Hs.183109 NM_000240 ENSG00000189221 MAOA BRNRS|MAO-A monoamine oxidase A protein-coding 217-70 chr5 5418883 5419532 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3470 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 114.667-194 chr4 61829875 61830173 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) AluJb|SINE|Alu 331741 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 134-28 chr14 76695954 76696249 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -65367 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 117.667-24 chr11 33606289 33606608 + 0.666667 NA intron (NM_012194, intron 13 of 20) intron (NM_012194, intron 13 of 20) 94292 NM_001166692 100131378 Hs.709466 NM_001166692 ENSG00000205177 C11orf91 - chromosome 11 open reading frame 91 protein-coding 119.667-10 chr1 108673709 108673923 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -12290 NM_144584 113802 Hs.7962 NM_144584 ENSG00000162639 HENMT1 C1orf59|HEN1 HEN methyltransferase 1 protein-coding 223.666-16 chr15 82897718 82898370 + 0.666667 NA intron (NM_004839, intron 1 of 8) MIRc|SINE|MIR 54676 NM_004839 9455 Hs.578443 NM_004839 ENSG00000103942 HOMER2 ACPD|CPD|DFNA68|HOMER-2|VESL-2 homer scaffold protein 2 protein-coding 120.667-132 chr4 147236063 147236321 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 108525 NR_031662 100313938 NR_031662 ENSG00000221369 MIR548G MIRN548G|hsa-mir-548g microRNA 548g ncRNA 214.333-108 chr4 144372756 144373233 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -232276 NM_001308190 2993 Hs.434973 NM_002099 ENSG00000170180 GYPA CD235a|GPA|GPErik|GPSAT|HGpMiV|HGpMiXI|HGpSta(C)|MN|MNS|PAS-2 glycophorin A (MNS blood group) protein-coding 157.667-179 chr22 17688070 17688438 + 0.666667 NA intron (NR_073069, intron 3 of 4) AluJb|SINE|Alu -18404 NM_001270733 23786 Hs.631672 NM_015367 ENSG00000099968 BCL2L13 BCL-RAMBO|Bcl2-L-13|MIL1 BCL2 like 13 protein-coding 122.333-181 chr5 174286426 174286634 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -49824 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 138.667-210 chr8 124436718 124437049 + 0.666667 NA Intergenic MamGypLTR1d|LTR|Gypsy -13937 NM_017956 55039 Hs.9925 NM_017956 ENSG00000183665 TRMT12 TRM12|TYW2 tRNA methyltransferase 12 homolog protein-coding 116-43 chr14 67875901 67876090 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 5 of 10) intron (NM_133509, intron 5 of 10) 52403 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 209.333-235 chr8 90874395 90874887 + 0.666667 NA intron (NM_022351, intron 4 of 12) intron (NM_022351, intron 4 of 12) 82866 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 276.667-68 chr8 123970560 123971101 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 6 of 40) intron (NM_001039112, intron 6 of 40) 69952 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 129.667-159 chr7 25773447 25773736 + 0.666667 NA intron (NR_157808, intron 1 of 4) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 2608 NR_157811 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 131.333-175 chr8 65328827 65329049 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -148598 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 164-121 chr8 137496680 137497004 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -83254 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 278.667-14 chr14 39392712 39393398 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 39445 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 184.333-58 chr17 61545063 61545456 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 45960 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 126-34 chr15 48365558 48365804 + 0.666667 NA Intergenic (ATAATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 33484 NM_001948 1854 Hs.527980 NM_001948 ENSG00000128951 DUT dUTPase deoxyuridine triphosphatase protein-coding 143.667-227 chr7 11262463 11262776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 288747 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 318-57 chr8 120294883 120295564 + 0.666667 NA intron (NM_021110, intron 34 of 47) intron (NM_021110, intron 34 of 47) 149927 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 155-81 chr21 17426616 17426927 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -12119 NR_037585 100505929 Hs.46707 NM_001005521 ENSG00000232560 LINC01549 C21orf37 long intergenic non-protein coding RNA 1549 ncRNA 174.333-89 chr3 89244935 89245363 + 0.666667 NA intron (NM_182644, intron 3 of 6) intron (NM_182644, intron 3 of 6) 137528 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 118.333-215 chr9 27262365 27262685 + 0.666667 NA intron (NR_026679, intron 12 of 16) MIRb|SINE|MIR 20268 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 211-48 chr2 20587967 20588443 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 4343 NR_046836 100874343 Hs.591546 NR_046836 ENSG00000231948 HS1BP3-IT1 - HS1BP3 intronic transcript 1 ncRNA 193.333-65 chr15 92017982 92018546 + 0.666667 NA intron (NR_135775, intron 2 of 10) MIR3|SINE|MIR 163960 NR_135775 28232 Hs.311187 NM_013272 ENSG00000176463 SLCO3A1 OATP-D|OATP-RP3|OATP3A1|OATPD|OATPRP3|SLC21A11 solute carrier organic anion transporter family member 3A1 protein-coding 112.667-67 chr14 56081284 56081465 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37037 NM_021255 57161 Hs.657926 NM_021255 ENSG00000139946 PELI2 - pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 protein-coding 146-50 chr18 44268995 44269413 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 262493 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 143.667-54 chr12 16033221 16033453 + 0.666667 NA intron (NM_015954, intron 7 of 8) intron (NM_015954, intron 7 of 8) 122005 NM_015954 51071 Hs.39429 NM_015954 ENSG00000023697 DERA CGI-26|DEOC deoxyribose-phosphate aldolase protein-coding 137.667-41 chr12 2657797 2658200 + 0.666667 NA intron (NM_199460, intron 36 of 49).2 L1ME3C|LINE|L1 14222 NR_046579 100874235 Hs.667644 NR_046579 ENSG00000256271 CACNA1C-AS2 - CACNA1C antisense RNA 2 ncRNA 142.667-7 chr1 88689439 88689662 + 0.666667 NA intron (NM_001320708, intron 1 of 20) AluSx|SINE|Alu -4346 NR_110682 101927891 Hs.637231 NR_110682 ENSG00000237505 PKN2-AS1 - PKN2 antisense RNA 1 ncRNA 146.333-339 chr8 126231222 126231531 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -94119 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 148.667-364 chr7 123778260 123778557 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 12303 NR_104080 101954271 NR_104080 ENSG00000207507 RNU6-9 U6-9 RNA, U6 small nuclear 9 snRNA 129-103 chr5 99900954 99901217 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 367095 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 138.333-196 chr8 91939697 91939969 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 77847 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 181.667-91 chr3 30240942 30241402 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -277696 NR_147054 101928015 Hs.581534 NR_147054 LINC01985 - long intergenic non-protein coding RNA 1985 ncRNA 118.667-15 chr1 229219389 229219616 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -44701 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 153-120 chr6 105916482 105916788 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -169701 NM_001198 639 Hs.436023 NM_001198 ENSG00000057657 PRDM1 BLIMP1|PRDI-BF1 PR/SET domain 1 protein-coding 163.667-9 chr1 213236492 213236836 + 0.666667 NA intron (NM_001136138, intron 9 of 13) L2c|LINE|L2 185423 NM_012424 26750 Hs.591416 NM_012424 ENSG00000136643 RPS6KC1 RPK118|RSKL1|S6K-delta-1|S6PKh1|humS6PKh1 ribosomal protein S6 kinase C1 protein-coding 163-57 chr3 119935896 119936280 + 0.666667 NA intron (NM_002093, intron 3 of 11) L1M4|LINE|L1 148560 NR_162125 113839522 NR_162125 MIR6529 - microRNA 6529 ncRNA 117-10 chr1 208478515 208478710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -234228 NM_025179 5362 Hs.497626 NM_025179 ENSG00000076356 PLXNA2 OCT|PLXN2 plexin A2 protein-coding 125.333-36 chr11 36731939 36732285 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa|LINE|L1 -133833 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 122.333-63 chr15 52328441 52328661 + 0.666667 NA intron (NM_001142495, intron 33 of 39) L2a|LINE|L2 -32747 NM_018728 55930 Hs.487036 NM_018728 ENSG00000128833 MYO5C - myosin VC protein-coding 133-62 chr3 118011148 118011452 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -320375 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 263.667-73 chr7 39996557 39997012 + 0.666667 NA intron (NM_003718, intron 2 of 13) AluSx1|SINE|Alu 46424 NM_031267 8621 Hs.233552 NM_003718 ENSG00000065883 CDK13 CDC2L|CDC2L5|CHDFIDD|CHED|hCDK13 cyclin dependent kinase 13 protein-coding 120-72 chr2 172463153 172463434 + 0.666667 NA TTS (NR_157573) TTS (NR_157573) 2729 NR_157573 101929947 Hs.710861 NR_157573 ITGA6-AS1 - ITGA6 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-72 chr12 23287444 23287753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 111962 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 141.667-29 chr10 62539020 62539376 + 0.666667 NA intron (NM_199452, intron 1 of 6) L1MA7|LINE|L1 18750 NM_199452 22891 Hs.22653 NM_014951 ENSG00000138311 ZNF365 Su48|UAN|ZNF365D zinc finger protein 365 protein-coding 148.333-234 chr21 26623176 26623573 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -50088 NR_135472 116159 Hs.37445 NM_052954 ENSG00000166265 CYYR1 C21orf95 cysteine and tyrosine rich 1 protein-coding 126-45 chr18 7296504 7296731 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 65513 NM_001105581 339291 Hs.647588 NM_001105581 ENSG00000206422 LRRC30 - leucine rich repeat containing 30 protein-coding 152.333-205 chr2 218317283 218317700 + 0.666667 NA intron (NM_015488, intron 2 of 9) intron (NM_015488, intron 2 of 9) -5688 NM_022572 25953 Hs.98475 NM_015488 ENSG00000127838 PNKD BRP17|DYT8|FKSG19|FPD1|KIPP1184|MR-1|MR-1S|MR1|PDC|PKND1|PNKD1|TAHCCP2 PNKD metallo-beta-lactamase domain containing protein-coding 112.667-72 chr15 37289616 37289951 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0-int|LTR|ERVL-MaLR -188472 NM_001220482 4212 Hs.510989 NM_002399 ENSG00000134138 MEIS2 CPCMR|HsT18361|MRG1 Meis homeobox 2 protein-coding 150-77 chr2 101040413 101040690 + 0.666667 NA intron (NM_001102426, intron 5 of 19) AluSx|SINE|Alu 38262 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 158-119 chr6 68974152 68974597 + 0.666667 NA intron (NM_001704, intron 8 of 31) intron (NM_001704, intron 8 of 31) 339092 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 116-92 chr2 228919307 228919499 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -308008 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 135-44 chr2 67027293 67027547 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -59026 NR_110564 102800447 Hs.144196 NR_110564 LINC01828 - long intergenic non-protein coding RNA 1828 ncRNA 147-111 chr5 84260072 84260363 + 0.666667 NA intron (NM_001278642, intron 1 of 9) intron (NM_001278642, intron 1 of 9) 124650 NM_001278642 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 199-83 chr5 60187517 60187928 + 0.666667 NA intron (NM_001364599, intron 1 of 16) intron (NM_001364599, intron 1 of 16) 184941 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 217-37 chr18 22153698 22154301 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger 14969 NR_102763 100128893 Hs.514745 NR_102763 ENSG00000266010 GATA6-AS1 BM742401|locus5689 GATA6 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 155.333-161 chr2 58722026 58722451 + 0.666667 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 201485 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 117.333-75 chr16 59079970 59080212 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -345775 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 169.333-259 chr7 120484476 120484887 + 0.666667 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 211506 NM_012281 3751 Hs.654739 NM_012281 ENSG00000184408 KCND2 KV4.2|RK5 potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 protein-coding 111.667-126 chr2 22344138 22344327 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -192247 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 124.333-88 chr2 107740565 107740814 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13423 NR_126369 104326057 Hs.585967 NR_126369 ENSG00000232991 GACAT1 LINC00876 gastric cancer associated transcript 1 ncRNA 112-115 chr2 162974733 162975043 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136121 NM_033272 90134 Hs.657413 NM_033272 ENSG00000184611 KCNH7 ERG3|HERG3|Kv11.3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 protein-coding 170.333-169 chr5 3410498 3410858 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -42138 NR_147000 105374624 Hs.518991 NR_147000 ENSG00000249830 LINC02162 - long intergenic non-protein coding RNA 2162 ncRNA 177-12 chr11 79478922 79479305 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38083 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 260.667-38 chr19 28232852 28233341 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -373592 NR_135636 102724908 NR_135636 ENSG00000266976 LOC102724908 - uncharacterized LOC102724908 ncRNA 207.333-50 chr11 77679823 77680340 + 0.666667 NA intron (NM_016578, intron 11 of 15) MER3|DNA|hAT-Charlie -42275 NM_001311199 1207 Hs.430733 NM_001293 ENSG00000074201 CLNS1A CLCI|CLNS1B|ICln chloride nucleotide-sensitive channel 1A protein-coding 131-104 chr8 76623026 76623362 + 0.666667 NA intron (NR_024360, intron 2 of 3) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -58053 NM_024721 79776 Hs.458973 NM_024721 ENSG00000091656 ZFHX4 ZFH4|ZHF4 zinc finger homeobox 4 protein-coding 115.667-59 chr12 71930466 71930699 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8263 NM_173353 121278 Hs.736576 NM_173353 ENSG00000139287 TPH2 ADHD7|NTPH tryptophan hydroxylase 2 protein-coding 212.667-136 chr8 105051017 105051498 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -267181 NM_001362836 23414 Hs.431009 NM_012082 ENSG00000169946 ZFPM2 DIH3|FOG2|SRXY9|ZC2HC11B|ZNF89B|hFOG-2 zinc finger protein, FOG family member 2 protein-coding 153.333-18 chr1 114591853 114592196 + 0.666667 NA intron (NM_001256404, intron 18 of 20) AluSz|SINE|Alu -10409 NM_005872 10286 Hs.22960 NM_005872 ENSG00000116752 BCAS2 DAM1|SPF27|Snt309 BCAS2 pre-mRNA processing factor protein-coding 140.667-170 chr4 137616055 137616377 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 70485 NR_146553 105377443 Hs.135587 NR_146553 ENSG00000251632 LINC02172 - long intergenic non-protein coding RNA 2172 ncRNA 152-75 chr18 2652461 2652765 + 0.666667 NA non-coding (NR_033754, exon 2 of 2) non-coding (NR_033754, exon 2 of 2) 2782 NR_033754 645158 Hs.712861 NR_033754 ENSG00000266405 CBX3P2 - chromobox 3 pseudogene 2 pseudo 126.667-10 chr1 111675357 111675679 + 0.666667 NA intron (NM_001370217, intron 1 of 7) L2c|LINE|L2 10724 NM_001370217 5906 Hs.190334 NM_002884 ENSG00000116473 RAP1A C21KG|G-22K|KREV-1|KREV1|RAP1|SMGP21 RAP1A, member of RAS oncogene family protein-coding 133.667-12 chr1 200946824 200947209 + 0.666667 NA intron (NR_147176, intron 4 of 15) L1MEd|LINE|L1 18072 NR_147176 647215 Hs.576504 NR_147176 ENSG00000233217 MROH3P C1orf81 maestro heat like repeat family member 3, pseudogene pseudo 236.667-76 chr6 136802812 136803194 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -10526 NM_005923 4217 Hs.186486 NM_005923 ENSG00000197442 MAP3K5 ASK1|MAPKKK5|MEKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 protein-coding 116.667-155 chr5 15025537 15025785 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -153883 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 151.333-359 chr6 62288920 62289282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2874 NR_146872 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 119-72 chr2 21839508 21839686 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -128945 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 113.667-195 chr7 21208819 21209104 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -219122 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 157.333-8 chr1 59249411 59249717 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -47249 NM_001350798 55277 Hs.444301 NM_018291 ENSG00000172456 FGGY - FGGY carbohydrate kinase domain containing protein-coding 130.333-142 chr3 194099851 194100212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29061 NR_136180 285389 Hs.157102 NR_136179 ENSG00000230102 LINC02028 - long intergenic non-protein coding RNA 2028 ncRNA 146.667-179 chr2 164125279 164125560 + 0.666667 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack -389411 NM_001321825 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 160-23 chr10 127052631 127052933 + 0.666667 NA exon (NM_001380, exon 22 of 52) exon (NM_001380, exon 22 of 52) 143809 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 134.333-193 chrX 155218746 155219092 + 0.666667 NA intron (NM_001303545, intron 1 of 5) intron (NM_001303545, intron 1 of 5) 2459 NM_003372 7411 Hs.436803 NM_003372 ENSG00000155959 VBP1 HIBBJ46|PFD3|PFDN3|VBP-1 VHL binding protein 1 protein-coding 150-120 chr5 172240014 172240312 + 0.666667 NA intron (NM_152277, intron 1 of 2) intron (NM_152277, intron 1 of 2) 43601 NM_152277 92181 Hs.131570 NM_152277 ENSG00000168246 UBTD2 DCUBP ubiquitin domain containing 2 protein-coding 117.667-107 chr2 225941633 225941934 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201011 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 151-26 chr12 43160016 43160443 + 0.666667 NA intron (NR_146866, intron 2 of 3) intron (NR_146866, intron 2 of 3) 4914 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 192.667-70 chr16 70360579 70361054 + 0.666667 NA intron (NM_001320525, intron 5 of 12) AluJb|SINE|Alu 13913 NM_018332 55308 Hs.656037 NM_018332 ENSG00000168872 DDX19A DDX19-DDX19L|DDX19L DEAD-box helicase 19A protein-coding 168.333-69 chr16 73812037 73812394 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 403306 NR_104657 101928035 Hs.39557 NR_104657 ENSG00000261404 LOC101928035 - uncharacterized LOC101928035 ncRNA 188-29 chr12 4060284 4060686 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -187037 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 277.333-9 chr10 25285367 25285980 + 0.666667 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) MLT2B3|LTR|ERVL -109397 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 130-18 chr10 94860149 94860448 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -78360 NM_000771 1559 Hs.282624 NM_000771 ENSG00000138109 CYP2C9 CPC9|CYP2C|CYP2C10|CYPIIC9|P450IIC9 cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 protein-coding 209.333-87 chr17 17905632 17906035 + 0.666667 NA intron (NM_001288787, intron 2 of 13) L2a|LINE|L2 66567 NM_001350333 146691 Hs.462379 NM_144678 ENSG00000175662 TOM1L2 - target of myb1 like 2 membrane trafficking protein protein-coding 159.333-32 chr1 237379956 237380363 + 0.666667 NA intron (NM_001035, intron 8 of 104) intron (NM_001035, intron 8 of 104) -90960 NR_039626 100616141 NR_039626 ENSG00000266262 MIR4428 - microRNA 4428 ncRNA 153.667-143 chr16 845095 845402 + 0.666667 NA Intergenic MER63A|DNA|hAT-Blackjack 39805 NM_001013638 388199 Hs.528461 NM_001013638 PRR25 gs64 proline rich 25 protein-coding 157-18 chr10 63291493 63291814 + 0.666667 NA intron (NM_001322258, intron 2 of 24) FAM|SINE|Alu -22410 NM_001318153 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 132.667-159 chr7 17452866 17453121 + 0.666667 NA intron (NR_110015, intron 2 of 2) intron (NR_110015, intron 2 of 2) 78076 NR_110014 102659288 Hs.559488 NR_110014 KCCAT333 - renal clear cell carcinoma-associated transcript 333 ncRNA 124-62 chr2 98022955 98023173 + 0.666667 NA Intergenic MER57F|LTR|ERV1 -27116 NM_015348 23505 Hs.469376 NM_015348 ENSG00000075568 TMEM131 CC28|PRO1048|RW1|YR-23 transmembrane protein 131 protein-coding 206-23 chr10 114474692 114475157 + 0.666667 NA intron (NM_001352440, intron 8 of 20) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 51989 NM_001322898 3983 Hs.438236 NM_002313 ENSG00000099204 ABLIM1 ABLIM|LIMAB1|LIMATIN|abLIM-1 actin binding LIM protein 1 protein-coding 122.333-7 chr1 113081240 113081593 + 0.666667 NA intron (NM_014813, intron 1 of 17) (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat 8218 NM_001312686 9860 Hs.448972 NM_014813 ENSG00000198799 LRIG2 LIG-2|LIG2|UFS2 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 protein-coding 187-90 chr8 104225621 104226033 + 0.666667 NA intron (NM_001282882, intron 1 of 5) intron (NM_001282882, intron 1 of 5) 2492 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 122.667-215 chrX 42866568 42866912 + 0.666667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -88577 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 318.667-3 chr10 85152976 85153627 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 45604 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 118.333-174 chr5 175343017 175343360 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 100994 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 117-148 chr8 118001863 118002200 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) Charlie7|DNA|hAT-Charlie -81118 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 120.333-136 chr3 184893147 184893471 + 0.666667 NA non-coding (NR_146113, exon 22 of 49) non-coding (NR_146113, exon 22 of 49) 80802 NM_001349295 23355 Hs.269263 NM_015303 ENSG00000156931 VPS8 KIAA0804 VPS8 subunit of CORVET complex protein-coding 129-117 chr6 149020741 149021060 + 0.666667 NA intron (NM_005715, intron 6 of 7) intron (NM_005715, intron 6 of 7) 11761 NR_134599 105378047 Hs.659484 NR_134599 LOC105378047 - uncharacterized LOC105378047 ncRNA 194.333-111 chr5 9591512 9591846 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 38672 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 147.667-194 chr2 203000892 203001188 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13839 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 149.667-318 chr5 68172357 68172735 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17330 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 174.667-17 chr1 225401433 225401800 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_002296, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_002296, exon 14 of 14) 26422 NM_002296 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 295.666-17 chr9 84936931 84937780 + 0.666667 NA intron (NM_001018064, intron 14 of 17) intron (NM_001018064, intron 14 of 17) 231454 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 144-161 chr9 86603081 86603418 + 0.666667 NA Intergenic MER50|LTR|ERV1 -248839 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 131-84 chr5 166331999 166332278 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 594232 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 155.333-374 chr7 144064490 144064949 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9501 NM_001004488 392138 Hs.553787 NM_001004488 ENSG00000221933 OR2A25 OR2A24P|OR2A25P|OR2A27 olfactory receptor family 2 subfamily A member 25 protein-coding 160.333-133 chr18 45652215 45652656 + 0.666667 NA intron (NM_007163, intron 10 of 19) intron (NM_007163, intron 10 of 19) 36959 NM_007163 8170 Hs.710927 NM_007163 ENSG00000132874 SLC14A2 HUT2|UT-A2|UT2|UTA|UTR|hUT-A6 solute carrier family 14 member 2 protein-coding 146.333-166 chr2 197402531 197402836 + 0.666667 NA exon (NM_012433, exon 14 of 25) exon (NM_012433, exon 14 of 25) 32410 NM_001308824 23451 Hs.632554 NM_012433 ENSG00000115524 SF3B1 Hsh155|MDS|PRP10|PRPF10|SAP155|SF3b155 splicing factor 3b subunit 1 protein-coding 112.667-132 chr2 134944068 134944388 + 0.666667 NA intron (NM_001241, intron 5 of 9) intron (NM_001241, intron 5 of 9) 25406 NR_135468 905 Hs.744115 NM_001241 ENSG00000082258 CCNT2 CYCT2 cyclin T2 protein-coding 115.333-15 chr1 183953094 183953312 + 0.666667 NA intron (NM_015101, intron 7 of 11) intron (NM_015101, intron 7 of 11) 84525 NM_001303421 23127 Hs.387995 NM_015101 ENSG00000198756 COLGALT2 C1orf17|ColGalT 2|GLT25D2 collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 protein-coding 141-14 chr11 82750842 82751166 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17140 NM_175885 220382 Hs.448218 NM_175885 ENSG00000182103 FAM181B - family with sequence similarity 181 member B protein-coding 251.333-33 chr14 49259211 49259744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 326903 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 146.667-258 chr5 62073565 62073898 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -232431 NM_004520 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 139-90 chr6 109442063 109442361 + 0.666667 NA exon (NM_003080, exon 5 of 10) exon (NM_003080, exon 5 of 10) -1041 NM_001286360 285755 Hs.32234 NM_173672 ENSG00000185250 PPIL6 PPIase|RSPH12|bA425D10.6|dJ919F19.1 peptidylprolyl isomerase like 6 protein-coding 218.667-102 chr7 103304549 103305062 + 0.666667 NA intron (NM_004279, intron 6 of 12) AluSx3|SINE|Alu 7370 NM_004279 9512 Hs.184211 NM_004279 ENSG00000105819 PMPCB Beta-MPP|MPP11|MPPB|MPPP52|P-52 peptidase, mitochondrial processing beta subunit protein-coding 125.667-27 chr10 70759028 70759258 + 0.666667 NA intron (NM_080722, intron 21 of 21) intron (NM_080722, intron 21 of 21) 23430 NR_134534 219793 Hs.386698 NM_152710 ENSG00000166220 TBATA C10orf27|SPATIAL thymus, brain and testes associated protein-coding 149.333-269 chr3 180836038 180836325 + 0.666667 NA intron (NR_109986, intron 2 of 13) L1PA12|LINE|L1 33997 NR_109986 101928882 Hs.734668 NR_109986 ENSG00000285336 LOC101928882 - uncharacterized LOC101928882 ncRNA 127.333-43 chr13 100140631 100140933 + 0.666667 NA intron (NR_148031, intron 4 of 22) L1MD2|LINE|L1 51689 NR_148027 5095 Hs.80741 NM_000282 ENSG00000175198 PCCA - propionyl-CoA carboxylase subunit alpha protein-coding 160-54 chr19 35281971 35282284 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_021175) promoter-TSS (NM_021175) -401 NM_021175 57817 Hs.8821 NM_021175 ENSG00000105697 HAMP HEPC|HFE2B|LEAP1|PLTR hepcidin antimicrobial peptide protein-coding 193.666-19 chr16 78362454 78363032 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) MIRb|SINE|MIR 263089 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 149.667-439 chrX 112417105 112417400 + 0.666667 NA intron (NM_001004308, intron 2 of 2) intron (NM_001004308, intron 2 of 2) 262686 NM_178175 340596 Hs.297420 NM_178175 ENSG00000182508 LHFPL1 - LHFPL tetraspan subfamily member 1 protein-coding 149.333-308 chr5 75156682 75156990 + 0.666667 NA intron (NM_001164443, intron 11 of 24) MLT1F1|LTR|ERVL-MaLR 80042 NM_001164443 256006 Hs.482533 NM_001164443 ENSG00000145700 ANKRD31 - ankyrin repeat domain 31 protein-coding 153.667-191 chr2 88749585 88749879 + 0.666667 NA intron (NM_144563, intron 8 of 8) L2b|LINE|L2 -16170 NR_015424 645784 Hs.105323 NR_015424 ENSG00000230006 ANKRD36BP2 - ankyrin repeat domain 36B pseudogene 2 pseudo 150.333-197 chr2 73626939 73627383 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 15261 NM_003960 9027 Hs.14637 NM_003960 ENSG00000144035 NAT8 ATase2|CCNAT|CML1|GLA|Hcml1|TSC501|TSC510 N-acetyltransferase 8 (putative) protein-coding 160.333-259 chr7 8015226 8015669 + 0.666667 NA intron (NM_138426, intron 2 of 7) intron (NM_138426, intron 2 of 7) 46651 NM_138426 113263 Hs.131673 NM_138426 ENSG00000106415 GLCCI1 FAM117C|GCTR|GIG18|TSSN1 glucocorticoid induced 1 protein-coding 172.333-166 chr7 86626147 86626642 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -17515 NM_001363522 2913 Hs.590575 NM_000840 ENSG00000198822 GRM3 GLUR3|GPRC1C|MGLUR3|mGlu3 glutamate metabotropic receptor 3 protein-coding 176.667-12 chr1 161903420 161903877 + 0.666667 NA intron (NM_007348, intron 14 of 15) MIR|SINE|MIR 120817 NM_015441 25903 Hs.507515 NM_015441 ENSG00000162745 OLFML2B - olfactomedin like 2B protein-coding 161.333-11 chr1 190038136 190038557 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 437664 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 176.333-110 chr3 60998223 60998701 + 0.666667 NA intron (NR_148922, intron 3 of 3) intron (NR_148922, intron 3 of 3) 252990 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 115.333-124 chr2 230588443 230588639 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 111988 NR_040038 151475 Hs.528154 NR_040038 ENSG00000226125 LINC01907 - long intergenic non-protein coding RNA 1907 ncRNA 187.667-150 chr9 81080920 81081325 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 608413 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 156-108 chr4 175891298 175891596 + 0.666667 NA intron (NR_048571, intron 1 of 5) MER90a|LTR|ERV1 -78333 NM_201591 2823 Hs.75819 NM_005277 ENSG00000150625 GPM6A GPM6|M6A glycoprotein M6A protein-coding 127-34 chr15 65855237 65855608 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -14069 NM_001206836 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 192.667-168 chr7 120616302 120616826 + 0.666667 NA intron (NM_012281, intron 1 of 5) intron (NM_012281, intron 1 of 5) 241580 NM_012338 23554 Hs.16529 NM_012338 ENSG00000106025 TSPAN12 EVR5|NET-2|NET2|TM4SF12 tetraspanin 12 protein-coding 149-31 chr12 53876408 53876715 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -62270 NM_017410 3229 Hs.118608 NM_017410 ENSG00000123364 HOXC13 ECTD9|HOX3|HOX3G homeobox C13 protein-coding 177-46 chr22 40661654 40662048 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL -17327 NM_005297 2847 Hs.248122 NM_005297 ENSG00000128285 MCHR1 GPR24|MCH-1R|MCH1R|SLC-1|SLC1 melanin concentrating hormone receptor 1 protein-coding 137.667-45 chr12 95281969 95282233 + 0.666667 NA intron (NR_147922, intron 8 of 12) intron (NR_147922, intron 8 of 12) -26319 NR_029895 442903 NR_029895 ENSG00000199172 MIR331 MIRN331|hsa-mir-331|mir-331 microRNA 331 ncRNA 255.333-45 chr17 58822437 58823033 + 0.666667 NA intron (NM_014906, intron 1 of 6) intron (NM_014906, intron 1 of 6) 66866 NR_048561 22843 Hs.245044 NM_014906 ENSG00000175175 PPM1E CaMKP-N|POPX1|PP2CH|caMKN protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1E protein-coding 291.667-14 chr15 65505018 65505488 + 0.666667 NA intron (NR_135485, intron 3 of 20) AluY|SINE|Alu 12021 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 139.667-149 chr5 37226788 37227084 + 0.666667 NA exon (NM_023073, exon 12 of 52) exon (NM_023073, exon 12 of 52) -22110 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 127.667-179 chr8 104006007 104006254 + 0.666667 NA intron (NM_001348500, intron 15 of 20) intron (NM_001348500, intron 15 of 20) 186910 NM_001348507 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 127.333-153 chr6 52458453 52458661 + 0.666667 NA intron (NR_033327, intron 4 of 9) L1PA16|LINE|L1 37549 NM_001172420 114327 Hs.403171 NM_018100 ENSG00000096093 EFHC1 EJM1|dJ304B14.2 EF-hand domain containing 1 protein-coding 114.667-121 chr2 13302718 13303004 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -295848 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 133.667-23 chr10 109288963 109289206 + 0.666667 NA Intergenic MER45C|DNA|hAT-Tip100 634162 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 207.667-70 chr21 45900965 45901342 + 0.666667 NA intron (NR_145493, intron 6 of 12) intron (NR_145493, intron 6 of 12) 51192 NM_020528 54039 Hs.474049 NM_020528 ENSG00000183570 PCBP3 ALPHA-CP3|PCBP3-OT1|PCBP3OT poly(rC) binding protein 3 protein-coding 123-7 chr1 101927710 101927947 + 0.666667 NA intron (NM_058170, intron 1 of 5) intron (NM_058170, intron 1 of 5) 55816 NR_033424 94236 Hs.606193 NR_033424 DNAJA1P5 HEJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A1 pseudogene 5 pseudo 193-3 chr1 29646371 29646809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -296476 NR_110758 101928460 Hs.434659 NR_110758 ENSG00000230523 LINC01756 - long intergenic non-protein coding RNA 1756 ncRNA 159.333-274 chr5 130282882 130283209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 378580 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 161.667-72 chr14 50399304 50399713 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -2210 NM_001367064 8814 Hs.280881 NM_004196 ENSG00000100490 CDKL1 KKIALRE|P42 cyclin dependent kinase like 1 protein-coding 179-93 chr7 28337547 28337946 + 0.666667 NA intron (NM_182899, intron 1 of 9) L1MA3|LINE|L1 38425 NM_182899 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 196.667-2 chr1 62224904 62225312 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 30259 NM_019079 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 141.333-67 chr14 64171060 64171426 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 94 of 114) intron (NM_015180, intron 94 of 114) -42901 NM_182913 23224 Hs.745014 NM_015180 ENSG00000054654 SYNE2 EDMD5|KASH2|NUA|NUANCE|Nesp2|Nesprin-2|SYNE-2|TROPH spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 protein-coding 156.333-388 chrX 80451829 80452206 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31570 NM_152630 169966 Hs.367959 NM_152630 ENSG00000174016 TENT5D CT1.26|CT112|FAM46D terminal nucleotidyltransferase 5D protein-coding 185.333-103 chr2 211332993 211333497 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 715674 NR_002763 29034 Hs.658398 NR_002763 ENSG00000280837 CPS1-IT1 CPS1-IT|CPS1IT|CPS1IT1|PRO0132 CPS1 intronic transcript 1 ncRNA 160.333-262 chr7 32237227 32237568 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 1 of 17) L1ME1|LINE|L1 61931 NM_001191058 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 173.667-135 chr4 88615551 88616023 + 0.666667 NA intron (NM_001318505, intron 3 of 8) intron (NM_001318505, intron 3 of 8) 23307 NM_014606 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 114-81 chr21 29833971 29834254 + 0.666667 NA intron (NM_000830, intron 1 of 16) intron (NM_000830, intron 1 of 16) 85937 NR_027021 642976 Hs.473554 NR_027021 GRIK1-AS1 C21orf9|GRIK1-AS|GRIK1AS|NCRNA00110 GRIK1 antisense RNA 1 ncRNA 238.333-26 chr15 61797627 61798181 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 67986 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 191.333-101 chr2 13727928 13728477 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 672756 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 140.333-137 chr3 41837136 41837543 + 0.666667 NA intron (NR_136342, intron 16 of 34) L1ME1|LINE|L1 124764 NM_001322501 54986 Hs.656192 NM_017886 ENSG00000168038 ULK4 FAM7C1|REC01035 unc-51 like kinase 4 protein-coding 119.333-133 chr2 160014493 160014766 + 0.666667 NA intron (NM_001007267, intron 9 of 26) intron (NM_001007267, intron 9 of 26) 47986 NM_001195641 22925 Hs.410477 NM_007366 ENSG00000153246 PLA2R1 CLEC13C|PLA2-R|PLA2G1R|PLA2IR|PLA2R phospholipase A2 receptor 1 protein-coding 158.667-50 chr10 110078455 110078870 + 0.666667 NA intron (NM_001121, intron 1 of 13) intron (NM_001121, intron 1 of 13) -70281 NR_038943 100505933 Hs.604103 NR_038943 ADD3-AS1 - ADD3 antisense RNA 1 ncRNA 142.667-232 chr8 125357430 125357745 + 0.666667 NA intron (NM_001349486, intron 6 of 7) intron (NM_001349486, intron 6 of 7) -72771 NM_025195 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 126-23 chr12 74104355 74104725 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 188091 NR_038300 100507377 Hs.455715 NR_038300 ENSG00000251138 LOC100507377 - uncharacterized LOC100507377 ncRNA 119.667-57 chr15 86257163 86257368 + 0.666667 NA intron (NM_152336, intron 8 of 24) intron (NM_152336, intron 8 of 24) 59703 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 167-98 chr8 77827537 77827873 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 377008 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 149.667-389 chr8 25964546 25964954 + 0.666667 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) intron (NM_022659, intron 6 of 15) 80663 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 139.667-104 chr20 43625261 43625572 + 0.666667 NA intron (NM_001323578, intron 10 of 13) AluSq2|SINE|Alu 34479 NM_001323580 51098 Hs.444332 NM_016004 ENSG00000101052 IFT52 C20orf9|CGI-53|NGD2|NGD5 intraflagellar transport 52 protein-coding 162.667-109 chr18 6932675 6933142 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 -3039 NR_034100 400643 Hs.253920 NM_001103383 ENSG00000265933 LINC00668 - long intergenic non-protein coding RNA 668 ncRNA 159-48 chr18 41918441 41918766 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -36631 NM_002647 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 124.667-55 chr14 40510527 40510858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -444019 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 146.333-157 chr2 140297525 140297861 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 84 of 90) L2|LINE|L2 288992 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 139.667-89 chr2 108236067 108236382 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -3744 NM_001008743 442038 NM_001008743 ENSG00000196228 SULT1C3 ST1C3 sulfotransferase family 1C member 3 protein-coding 120.333-178 chr8 37568726 37568940 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -47447 NR_121621 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 123-123 chr8 68247448 68247729 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 -82785 NM_001349479 116328 Hs.491941 NM_052958 ENSG00000165084 C8orf34 VEST-1|VEST1 chromosome 8 open reading frame 34 protein-coding 122-38 chr15 25011912 25012268 + 0.666667 NA intron (NR_146177, intron 20 of 147) intron (NR_146177, intron 20 of 147) -19783 NR_146168 100506965 Hs.592473 NR_146168 PWAR6 HBT8|PAR-6 Prader Willi/Angelman region RNA 6 ncRNA 181.333-50 chr15 61125397 61125929 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 103639 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 180.333-128 chr8 50087541 50087920 + 0.666667 NA intron (NR_135798, intron 1 of 15) intron (NR_135798, intron 1 of 15) -76401 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 162.667-244 chr6 81990626 81991020 + 0.666667 NA intron (NR_149135, intron 3 of 3) L2b|LINE|L2 -52402 NR_149134 102724168 Hs.485841 NR_149134 LINC02542 - long intergenic non-protein coding RNA 2542 ncRNA 119.333-44 chr10 125849157 125849499 + 0.666667 NA intron (NM_018180, intron 6 of 10) intron (NM_018180, intron 6 of 10) 25782 NM_078469 56647 Hs.370292 NM_016567 ENSG00000107949 BCCIP TOK-1|TOK1 BRCA2 and CDKN1A interacting protein protein-coding 176-21 chr11 107794145 107794526 + 0.666667 NA intron (NM_017515, intron 7 of 7) AluSx4|SINE|Alu 64452 NM_017515 54733 Hs.524014 NM_017515 ENSG00000110660 SLC35F2 HSNOV1 solute carrier family 35 member F2 protein-coding 130-65 chr2 224998954 224999273 + 0.666667 NA intron (NM_014689, intron 1 of 55) AluSz|SINE|Alu 11427 NR_039641 100616207 NR_039641 ENSG00000263828 MIR4439 - microRNA 4439 ncRNA 136.333-15 chr1 240388923 240389168 + 0.666667 NA intron (NM_020066, intron 14 of 17) intron (NM_020066, intron 14 of 17) 223110 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 131.667-209 chr9 2858892 2859191 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14946 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 141-15 chr11 118243234 118243525 + 0.666667 NA intron (NR_104405, intron 1 of 4) L2|LINE|L2 8986 NM_001286152 196264 Hs.15396 NM_198275 ENSG00000160588 MPZL3 - myelin protein zero like 3 protein-coding 142.333-116 chr2 37169690 37169960 + 0.666667 NA intron (NM_001367551, intron 6 of 6) intron (NM_001367551, intron 6 of 6) -12778 NM_002759 5610 Hs.131431 NM_002759 ENSG00000055332 EIF2AK2 EIF2AK1|PKR|PPP1R83|PRKR eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 protein-coding 183.667-91 chr3 81983306 81983799 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2590 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 157-101 chr5 14595704 14596084 + 0.666667 NA intron (NM_019018, intron 1 of 7) intron (NM_019018, intron 1 of 7) 14102 NM_019018 54491 Hs.155085 NM_019018 ENSG00000145569 OTULINL FAM105A|NET20 OTU deubiquitinase with linear linkage specificity like protein-coding 156.667-130 chr16 78041653 78042016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19286 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 142.667-62 chr15 26226095 26226436 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 110452 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 149.667-105 chr13 59737913 59738215 + 0.666667 NA intron (NM_001258366, intron 26 of 26) AluSx1|SINE|Alu -274654 NR_109838 100874195 Hs.664101 NR_046539 ENSG00000227528 DIAPH3-AS1 - DIAPH3 antisense RNA 1 ncRNA 205.667-131 chr8 112117060 112117431 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -526248 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 154.667-309 chr5 41622313 41622773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111942 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 254.333-27 chr17 19940668 19941170 + 0.666667 NA exon (NM_001330152, exon 7 of 14) exon (NM_001330152, exon 7 of 14) 36909 NM_007202 11216 Hs.642676 NM_007202 ENSG00000108599 AKAP10 AKAP-10|D-AKAP-2|D-AKAP2|PRKA10 A-kinase anchoring protein 10 protein-coding 126.667-101 chr22 50309880 50310179 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001001794, exon 20 of 20) 3' UTR (NM_001001794, exon 20 of 20) -2383 NM_012401 23654 Hs.3989 NM_012401 ENSG00000196576 PLXNB2 MM1|Nbla00445|PLEXB2|dJ402G11.3 plexin B2 protein-coding 144.333-24 chr10 61437462 61437834 + 0.666667 NA intron (NR_134508, intron 1 of 6) AluSz|SINE|Alu -14991 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-188 chr8 81765690 81765944 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 33369 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 152-105 chr3 39540025 39540315 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 38104 NM_001278323 4336 Hs.121333 NM_182935 ENSG00000168314 MOBP - myelin associated oligodendrocyte basic protein protein-coding 116.667-133 chr3 103665109 103665306 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -141091 NR_039611 100616336 NR_039611 ENSG00000265328 MIR548AB - microRNA 548ab ncRNA 117-117 chr5 107275152 107275398 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -264261 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 273-4 chr1 114871766 114872513 + 0.666667 NA intron (NM_001282542, intron 8 of 30) FLAM_C|SINE|Alu 17276 NR_104211 6847 Hs.112743 NM_003176 ENSG00000198765 SYCP1 CT8|HOM-TES-14|SCP-1|SCP1 synaptonemal complex protein 1 protein-coding 150-9 chr1 204728036 204728338 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -42449 NM_006338 10446 Hs.26312 NM_006338 ENSG00000170382 LRRN2 FIGLER7|GAC1|LRANK1|LRRN5 leucine rich repeat neuronal 2 protein-coding 137.333-172 chr6 63578643 63578952 + 0.666667 NA intron (NM_003463, intron 3 of 5) intron (NM_003463, intron 3 of 5) 6785 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 154.333-111 chr16 5899248 5899628 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -119586 NM_018723 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 154-15 chr10 54572641 54572969 + 0.666667 NA intron (NR_134503, intron 2 of 5) intron (NR_134503, intron 2 of 5) 35152 NR_031642 100302192 NR_031642 ENSG00000221594 MIR548F1 MIR548F-1|MIRN548F1|hsa-mir-548f-1 microRNA 548f-1 ncRNA 145.667-68 chr12 96413772 96414164 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -13529 NM_002595 5128 Hs.506415 NM_002595 ENSG00000059758 CDK17 PCTAIRE2|PCTK2 cyclin dependent kinase 17 protein-coding 228.333-8 chr10 55982502 55982990 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -354804 NM_001354404 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 276-12 chr11 92202745 92203283 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22020 NM_001367949 120114 Hs.98523 NM_001008781 ENSG00000165323 FAT3 CDHF15|CDHR10|hFat3 FAT atypical cadherin 3 protein-coding 171.333-22 chr10 90356250 90356621 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 184370 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 173.667-133 chr4 53013461 53013896 + 0.666667 NA intron (NM_152540, intron 5 of 8) intron (NM_152540, intron 5 of 8) 151361 NM_023940 65997 Hs.8035 NM_023940 ENSG00000128045 RASL11B - RAS like family 11 member B protein-coding 146.667-233 chr4 57379043 57379330 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46686 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 208.667-58 chr18 5994766 5995334 + 0.666667 NA intron (NR_158609, intron 15 of 17) intron (NR_158609, intron 15 of 17) -99096 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 152.667-246 chr3 89488028 89488422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 380604 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 161.333-206 chr4 12362815 12363290 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 139601 NR_125910 101929019 Hs.434234 NR_125910 ENSG00000251210 LINC02270 - long intergenic non-protein coding RNA 2270 ncRNA 151.333-37 chr1 241360925 241361371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3918 NM_001350115 6000 Hs.655739 NM_002924 ENSG00000182901 RGS7 - regulator of G protein signaling 7 protein-coding 154-128 chr6 150959138 150959509 + 0.666667 NA intron (NM_001350486, intron 17 of 27) intron (NM_001350486, intron 17 of 27) -47685 NM_001350490 25902 Hs.591343 NM_015440 ENSG00000120254 MTHFD1L FTHFSDC1|MTC1THFS|dJ292B18.2 methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1 like protein-coding 288-52 chr7 117558117 117558804 + 0.666667 NA intron (NM_000492, intron 10 of 26) AluY|SINE|Alu 6216 NR_149084 111082987 Hs.583149 NR_149084 ENSG00000232661 CFTR-AS1 BGas CFTR antisense RNA 1 ncRNA 155-40 chr15 86307872 86308182 + 0.666667 NA intron (NR_046012, intron 2 of 3) L1ME3D|LINE|L1 8941 NR_046012 727915 Hs.451281 NR_046012 ENSG00000260125 AGBL1-AS1 - AGBL1 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-162 chr5 141263804 141264081 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 18547 NM_018935 56121 Hs.130757 NM_018935 ENSG00000113248 PCDHB15 PCDH-BETA15 protocadherin beta 15 protein-coding 125.667-10 chr1 111041882 111042105 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -78049 NM_001006945 55791 Hs.25245 NM_018372 ENSG00000121931 LRIF1 C1orf103|HBiX1|RIF1 ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 protein-coding 160.333-121 chr16 73365419 73365790 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -21201 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 296.333-42 chr8 87745354 87746035 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 128321 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 169.667-45 chr12 82463134 82463478 + 0.666667 NA intron (NR_144942, intron 8 of 10) L1MA5A|LINE|L1 -104501 NR_033192 29080 Hs.582627 NM_014167 ENSG00000133773 CCDC59 BR22|HSPC128|TAP26 coiled-coil domain containing 59 protein-coding 130.667-165 chr5 65928318 65928633 + 0.666667 NA intron (NM_001253697, intron 1 of 25) intron (NM_001253697, intron 1 of 25) 1900 NM_001253699 55914 Hs.591774 NM_018695 ENSG00000112851 ERBIN ERBB2IP|HEL-S-78|LAP2 erbb2 interacting protein protein-coding 142.667-180 chr5 109935462 109935730 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 52414 NR_033175 100289673 Hs.368405 NR_033175 LINC01848 - long intergenic non-protein coding RNA 1848 ncRNA 150.333-179 chr19 28785478 28785881 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -57985 NR_110759 100420587 Hs.569956 NR_110759 ENSG00000283403 LOC100420587 - SHC binding and spindle associated 1 pseudogene pseudo 113-144 chr3 135873860 135874048 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -91774 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 125-32 chr13 77519225 77519523 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -16300 NM_001160706 8796 Hs.534699 NM_003843 ENSG00000136155 SCEL - sciellin protein-coding 173 chr1 44548945 44549308 + 0.666667 NA intron (NM_001319957, intron 1 of 13) AluSz6|SINE|Alu 3633 NR_049849 100847089 NR_049849 ENSG00000263381 MIR5584 - microRNA 5584 ncRNA 116.667-193 chr7 99815355 99815571 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -12550 NM_057096 64816 Hs.306220 NM_022820 ENSG00000021461 CYP3A43 - cytochrome P450 family 3 subfamily A member 43 protein-coding 168.667-80 chr17 63214201 63214695 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 6 of 25) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 225819 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 256.667-50 chr20 38053848 38054282 + 0.666667 NA intron (NM_021215, intron 3 of 6) intron (NM_021215, intron 3 of 6) 20319 NM_021215 58490 Hs.278839 NM_021215 ENSG00000101413 RPRD1B C20orf77|CREPT|K-H|Kub5-Hera|NET60|dJ1057B20.2 regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B protein-coding 164.667-220 chr7 31581537 31581851 + 0.666667 NA intron (NM_194300, intron 7 of 12) intron (NM_194300, intron 7 of 12) 28692 NM_194300 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 205-62 chr3 168610624 168611041 + 0.666667 NA intron (NR_021485, intron 4 of 15) intron (NR_021485, intron 4 of 15) 58978 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 144-100 chr3 26862505 26862798 + 0.666667 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 168094 NM_001317811 116135 Hs.517868 NM_052953 ENSG00000179796 LRRC3B LRP15 leucine rich repeat containing 3B protein-coding 184.333-59 chr17 62005735 62006240 + 0.666667 NA intron (NM_005121, intron 9 of 29) intron (NM_005121, intron 9 of 29) 59291 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 155.667-149 chr2 21605580 21605984 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 104870 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 152.333-409 chr9 131865301 131865722 + 0.666667 NA intron (NM_001253881, intron 5 of 6) intron (NM_001253881, intron 5 of 6) -125567 NM_001304275 2889 Hs.127897 NM_005312 ENSG00000107263 RAPGEF1 C3G|GRF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 125.333-22 chr10 33653931 33654175 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 118627 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 122.333-193 chr7 74100048 74100295 + 0.666667 NA intron (NM_001204426, intron 4 of 14) AluJr|SINE|Alu 6954 NM_001204426 3984 Hs.647035 NM_002314 ENSG00000106683 LIMK1 LIMK|LIMK-1 LIM domain kinase 1 protein-coding 192.333-45 chr13 51783248 51783796 + 0.666667 NA intron (NM_001031719, intron 4 of 7) L1ME1|LINE|L1 20640 NM_001270424 79758 Hs.266728 NM_024705 ENSG00000102796 DHRS12 SDR40C1 dehydrogenase/reductase 12 protein-coding 159-86 chr3 197298696 197299034 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001366205) promoter-TSS (NM_001366205) -253 NM_001366204 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 211.333-117 chr2 102082882 102083345 + 0.666667 NA intron (NM_001320978, intron 1 of 11) intron (NM_001320978, intron 1 of 11) 12723 NM_001288706 3554 Hs.701982 NM_000877 ENSG00000115594 IL1R1 CD121A|D2S1473|IL-1R-alpha|IL1R|IL1RA|P80 interleukin 1 receptor type 1 protein-coding 125.333-167 chr7 77203184 77203407 + 0.666667 NA intron (NM_020879, intron 2 of 18) intron (NM_020879, intron 2 of 18) -3476 NM_006682 10875 Hs.520989 NM_006682 ENSG00000127951 FGL2 T49|pT49 fibrinogen like 2 protein-coding 257-16 chr14 58173444 58173917 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -21467 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 147-64 chr2 52628351 52628633 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74123 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 122.667-139 chr4 89880965 89881220 + 0.666667 NA intron (NM_001371403, intron 1 of 8) intron (NM_001371403, intron 1 of 8) 1581 NM_001371403 150.667-397 chr9 73866520 73866825 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL -504859 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 207-74 chr22 35298186 35298642 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001135729) promoter-TSS (NM_001135729) -861 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 169.667-37 chr11 112107401 112107766 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 20710 NM_001276504 6392 Hs.356270 NM_003002 ENSG00000204370 SDHD CBT1|CII-4|CWS3|PGL|PGL1|QPs3|SDH4|cybS succinate dehydrogenase complex subunit D protein-coding 126.667-42 chr13 23241201 23241468 + 0.666667 NA intron (NM_000231, intron 3 of 7) L1MEc|LINE|L1 60413 NM_000231 6445 Hs.37167 NM_000231 ENSG00000102683 SGCG 35DAG|A4|DAGA4|DMDA|DMDA1|LGMD2C|LGMDR5|MAM|SCARMD2|SCG3|gamma-SG sarcoglycan gamma protein-coding 182-56 chr2 197406098 197406571 + 0.666667 NA intron (NM_012433, intron 9 of 24) intron (NM_012433, intron 9 of 24) 28759 NM_001308824 23451 Hs.632554 NM_012433 ENSG00000115524 SF3B1 Hsh155|MDS|PRP10|PRPF10|SAP155|SF3b155 splicing factor 3b subunit 1 protein-coding 112.667-155 chr20 60840618 60840875 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -238318 NR_109919 100506470 Hs.125674 NR_109919 ENSG00000229606 LINC01718 - long intergenic non-protein coding RNA 1718 ncRNA 139.333-90 chr17 44839256 44839604 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6899 NM_001271880 51751 Hs.151787 NM_016438 ENSG00000131097 HIGD1B CLST11240|CLST11240-15 HIG1 hypoxia inducible domain family member 1B protein-coding 164.333-71 chr14 101755731 101756090 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4663 NM_001352914 5527 Hs.368264 NM_002719 ENSG00000078304 PPP2R5C B56G|B56gamma|PR61G protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma protein-coding 149.667-273 chr3 192704649 192705050 + 0.666667 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 22692 NM_004113 2257 Hs.390250 NM_004113 ENSG00000114279 FGF12 EIEE47|FGF12B|FHF1 fibroblast growth factor 12 protein-coding 153.667-57 chr11 3976703 3977097 + 0.666667 NA intron (NM_001277962, intron 2 of 12) AluSx|SINE|Alu -117785 NM_001318064 6240 Hs.445705 NM_001033 ENSG00000167325 RRM1 R1|RIR1|RR1 ribonucleotide reductase catalytic subunit M1 protein-coding 194.667-29 chr11 79323339 79323826 + 0.666667 NA intron (NM_001098816, intron 1 of 33) MLT2C1|LTR|ERVL 78527 NR_030598 100126333 NR_030598 ENSG00000211997 MIR708 MIRN708|hsa-mir-708 microRNA 708 ncRNA 196.667-122 chr5 63889166 63889484 + 0.666667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 72967 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 192-45 chr12 64231584 64231980 + 0.666667 NA Intergenic MER3|DNA|hAT-Charlie -9486 NM_001300941 144577 Hs.444671 NM_152440 ENSG00000174206 C12orf66 - chromosome 12 open reading frame 66 protein-coding 175-33 chr17 54677128 54677427 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -223414 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 164.333-6 chr1 180565582 180565997 + 0.666667 NA non-coding (NR_125716, exon 3 of 3) non-coding (NR_125716, exon 3 of 3) 6815 NR_125716 148756 NR_125716 ENSG00000236719 OVAAL LINC01131|OVAL ovarian adenocarcinoma amplified long non-coding RNA ncRNA 137-10 chr10 76097328 76097589 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) L1MCc|LINE|L1 314697 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 147-61 chr2 16763204 16763530 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -97533 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 128.667-154 chr6 40317957 40318177 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 37939 NR_038887 401260 Hs.654837 NM_001001705 LINC00951 - long intergenic non-protein coding RNA 951 ncRNA 153.333-165 chr17 71545781 71546215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -343819 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 211-79 chr5 31317592 31318045 + 0.666667 NA exon (NM_004932, exon 11 of 12) exon (NM_004932, exon 11 of 12) 124132 NM_001362435 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 139-3 chr1 86526031 86526402 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -20862 NR_024602 22802 Hs.567422 NM_012128 ENSG00000016602 CLCA4 CaCC|CaCC2 chloride channel accessory 4 protein-coding 119.667-167 chr6 56125520 56125759 + 0.666667 NA intron (NM_030820, intron 13 of 29) intron (NM_030820, intron 13 of 29) -33977 NM_001318754 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 166.667-153 chr3 87285180 87285464 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8738 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 162-78 chr22 31996052 31996363 + 0.666667 NA intron (NR_149128, intron 4 of 4) AluJr4|SINE|Alu 25384 NR_149128 105372999 Hs.512525 NR_149128 LINC02558 - long intergenic non-protein coding RNA 2558 ncRNA 134.333-129 chr4 90977394 90977702 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 9 of 10) intron (NM_001145065, intron 9 of 10) 742517 NM_207491 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 130-102 chr5 132954627 132954997 + 0.666667 NA intron (NM_014423, intron 1 of 20) AluYa5|SINE|Alu 8822 NM_014423 27125 Hs.519313 NM_014423 ENSG00000072364 AFF4 AF5Q31|CHOPS|MCEF AF4/FMR2 family member 4 protein-coding 151-15 chr10 75079268 75079634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20035 NM_001363514 51207 Hs.178170 NM_016364 ENSG00000079393 DUSP13 BEDP|DUSP13A|DUSP13B|MDSP|SKRP4|TMDP dual specificity phosphatase 13 protein-coding 119.667-122 chr3 134917199 134917548 + 0.666667 NA intron (NM_004441, intron 1 of 15) intron (NM_004441, intron 1 of 15) 122113 NM_004441 2047 Hs.116092 NM_004441 ENSG00000154928 EPHB1 ELK|EPHT2|Hek6|NET EPH receptor B1 protein-coding 134.333-20 chr10 68991504 68991752 + 0.666667 NA intron (NM_015634, intron 1 of 6) intron (NM_015634, intron 1 of 6) 2825 NM_015634 26128 Hs.279580 NM_015634 ENSG00000198954 KIF1BP KBP|KIAA1279|TTC20 KIF1 binding protein protein-coding 165-60 chr3 178414219 178414522 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -4831 NR_046786 100874330 Hs.201902 NR_046786 ENSG00000223941 LINC01014 KCNMB2-IT1 long intergenic non-protein coding RNA 1014 ncRNA 162-43 chr14 69149543 69149986 + 0.666667 NA intron (NM_003861, intron 1 of 8) intron (NM_003861, intron 1 of 8) 2835 NM_001284207 8816 Hs.509780 NM_003861 ENSG00000139990 DCAF5 BCRG2|BCRP2|D14S1461E|WDR22 DDB1 and CUL4 associated factor 5 protein-coding 140.333-166 chr4 94695754 94696054 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 61629 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 193.667-75 chr20 56133659 56134098 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -114854 NM_019888 4159 Hs.248018 NM_019888 ENSG00000124089 MC3R BMIQ9|MC3|MC3-R|OB20|OQTL melanocortin 3 receptor protein-coding 161.667-262 chr8 130836444 130836781 + 0.666667 NA intron (NM_001115, intron 11 of 17) L2c|LINE|L2 204297 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 209-16 chr10 116596341 116596706 + 0.666667 NA intron (NM_006229, intron 6 of 12) intron (NM_006229, intron 6 of 12) 5510 NM_001303135 5407 Hs.73923 NM_006229 ENSG00000187021 PNLIPRP1 PLRP1 pancreatic lipase related protein 1 protein-coding 162-133 chr9 102752583 102752920 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 233114 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 123-103 chr5 141106251 141106470 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6118 NM_018937 56132 Hs.508987 NM_018937 ENSG00000113205 PCDHB3 PCDH-BETA3 protocadherin beta 3 protein-coding 166.667-209 chr6 137296357 137296727 + 0.666667 NA Intergenic MER4B|LTR|ERV1 -77112 NM_000416 3459 Hs.520414 NM_000416 ENSG00000027697 IFNGR1 CD119|IFNGR|IMD27A|IMD27B interferon gamma receptor 1 protein-coding 177.667-21 chr10 66491713 66492209 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) intron (NM_001127384, intron 11 of 17) -434075 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 160-82 chr3 188380772 188381137 + 0.666667 NA intron (NM_001167671, intron 2 of 10) MIR|SINE|MIR 155549 NM_001167671 4026 Hs.720220 NM_005578 ENSG00000145012 LPP - LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma protein-coding 154.333-376 chr9 124625649 124625993 + 0.666667 NA intron (NM_033334, intron 2 of 9) MLT2B4|LTR|ERVL -32615 NR_038975 100379345 Hs.660412 NR_038975 ENSG00000224020 MIR181A2HG - MIR181A2 host gene ncRNA 147.667-66 chr12 16211558 16211852 + 0.666667 NA intron (NM_001170798, intron 7 of 8) intron (NM_001170798, intron 7 of 8) 65980 NM_001170798 729025 Hs.692712 NM_001170798 ENSG00000188991 SLC15A5 - solute carrier family 15 member 5 protein-coding 147.333-289 chr7 25589988 25590400 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72946 NR_157826 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 129.333-150 chr5 31842843 31843131 + 0.666667 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) AluSq2|SINE|Alu 93172 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 174.333-137 chr7 6376801 6377243 + 0.666667 NA intron (NM_006908, intron 1 of 5) intron (NM_006908, intron 1 of 5) 2495 NM_006908 5879 Hs.413812 NM_006908 ENSG00000136238 RAC1 MIG5|MRD48|Rac-1|TC-25|p21-Rac1 Rac family small GTPase 1 protein-coding 164.667-173 chr4 143036826 143037157 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 147870 NR_136203 105377623 NR_136203 ENSG00000250326 LOC105377623 - uncharacterized LOC105377623 ncRNA 152.667-289 chr5 18052434 18052750 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 245318 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 146.333-319 chr8 58866784 58867096 + 0.666667 NA intron (NM_014729, intron 3 of 8) intron (NM_014729, intron 3 of 8) -207087 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 188-20 chr10 63268863 63269271 + 0.666667 NA non-coding (NR_134512, exon 1 of 22) non-coding (NR_134512, exon 1 of 22) 156 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 200.667-14 chr1 209695483 209695914 + 0.666667 NA intron (NM_181755, intron 1 of 6) AluSc|SINE|Alu -9148 NM_005525 3290 Hs.195040 NM_005525 ENSG00000117594 HSD11B1 11-DH|11-beta-HSD1|CORTRD2|HDL|HSD11|HSD11B|HSD11L|SDR26C1 hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 1 protein-coding 130-119 chr7 27531996 27532261 + 0.666667 NA intron (NM_152740, intron 6 of 7) intron (NM_152740, intron 6 of 7) -83846 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 133.667-123 chr5 111906602 111906865 + 0.666667 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) L1MC2|LINE|L1 -5775 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 136.333-58 chr14 83156236 83156506 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 513739 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 120.333-86 chr19 55866528 55866828 + 0.666667 NA intron (NM_134444, intron 5 of 9) L2b|LINE|L2 -29916 NM_145007 204801 Hs.375039 NM_145007 ENSG00000179873 NLRP11 CLR19.6|NALP11|NOD17|PAN10|PYPAF6|PYPAF7 NLR family pyrin domain containing 11 protein-coding 154-147 chr8 126382278 126382617 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 56952 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 157.333-214 chr20 38915941 38916274 + 0.666667 NA intron (NM_015568, intron 10 of 10) FLAM_C|SINE|Alu -10310 NM_030919 81610 Hs.726442 NM_030919 ENSG00000101447 FAM83D C20orf129|CHICA|dJ616B8.3 family with sequence similarity 83 member D protein-coding 121-49 chr15 24981940 24982160 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_001293) promoter-TSS (NR_001293) 56 NR_001293 91380 NR_001293 ENSG00000276314 SNORD107 HBII-436 small nucleolar RNA, C/D box 107 snoRNA 159.667-20 chr1 111712531 111712926 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001010935, exon 9 of 9) 3' UTR (NM_001010935, exon 9 of 9) 26667 NM_019099 55924 Hs.193406 NM_019099 ENSG00000197852 INKA2 C1orf183|FAM212B inka box actin regulator 2 protein-coding 150-27 chr11 77387262 77387580 + 0.666667 NA intron (NM_001128620, intron 2 of 15) MER5B|DNA|hAT-Charlie -85755 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 120-55 chr18 27657485 27657814 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -314993 NR_134589 105372038 Hs.722107 NR_134589 ENSG00000264151 LOC105372038 - uncharacterized LOC105372038 ncRNA 160.667-79 chr13 20610432 20610888 + 0.666667 NA intron (NM_001353573, intron 12 of 23) L1MB7|LINE|L1 43503 NM_001353575 8100 Hs.187376 NM_006531 ENSG00000032742 IFT88 D13S1056E|DAF19|TG737|TTC10|hTg737 intraflagellar transport 88 protein-coding 139.333-199 chr7 31987019 31987294 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) (TATT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 83251 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 182-69 chr3 119017130 119017447 + 0.666667 NA intron (NM_001353319, intron 1 of 7) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 17558 NM_001353319 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 185.667-110 chr6 132105469 132105831 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9613 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 117.333-167 chr5 66434595 66434935 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76839 NR_105001 101928769 Hs.97903 NR_105001 ENSG00000250313 LINC02229 - long intergenic non-protein coding RNA 2229 ncRNA 132.667-185 chr8 124662156 124662510 + 0.666667 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 66140 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 118.667-84 chr17 42162171 42162435 + 0.666667 NA exon (NM_012285, exon 15 of 17) exon (NM_012285, exon 15 of 17) -7314 NM_001252039 5878 Hs.650382 NM_004583 ENSG00000108774 RAB5C L1880|RAB5CL|RAB5L|RABL RAB5C, member RAS oncogene family protein-coding 209-39 chr13 54672590 54673070 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -360782 NR_031628 100302187 NR_031628 ENSG00000283126 MIR1297 MIRN1297|hsa-mir-1297|mir-1297 microRNA 1297 ncRNA 129.667-134 chr4 180336116 180336321 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 822931 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 241-18 chr12 103008140 103008650 + 0.666667 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -49954 NM_001354304 5053 Hs.560019 NM_000277 ENSG00000171759 PAH PH|PKU|PKU1 phenylalanine hydroxylase protein-coding 113-154 chr4 52008627 52008867 + 0.666667 NA intron (NM_001024611, intron 2 of 4) L1ME1|LINE|L1 11616 NM_001024611 339977 Hs.661450 NM_001024611 ENSG00000188993 LRRC66 - leucine rich repeat containing 66 protein-coding 143-24 chr11 54809596 54809900 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 102916 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 119-31 chr11 104752966 104753169 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143765 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 140.667-246 chr9 27309252 27309521 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -12236 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 156-131 chr7 21136481 21136786 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -291450 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 215.333-202 chr8 123019231 123019637 + 0.666667 NA intron (NM_024295, intron 6 of 7) intron (NM_024295, intron 6 of 7) 6338 NM_001363963 79139 Hs.241576 NM_024295 ENSG00000136986 DERL1 DER-1|DER1|derlin-1 derlin 1 protein-coding 224-107 chr8 109565399 109565758 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001278938, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001278938, exon 7 of 7) 24952 NM_001278938 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 158.667-335 chr8 135141453 135141798 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -92506 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 264.333-15 chr13 109755283 109755806 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_003749, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_003749, exon 2 of 2) 27270 NR_103846 101409253 Hs.578072 NR_103846 ENSG00000234854 LINC00676 - long intergenic non-protein coding RNA 676 ncRNA 230.333-110 chr7 100819660 100820287 + 0.666667 NA intron (NM_004444, intron 5 of 16) intron (NM_004444, intron 5 of 16) -6896 NM_001363494 56996 Hs.521087 NM_020246 ENSG00000146828 SLC12A9 CCC6|CIP1|WO3.3|hCCC6 solute carrier family 12 member 9 protein-coding 128.333-187 chr7 112906102 112906400 + 0.666667 NA intron (NM_152556, intron 2 of 4) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 33624 NM_152556 154743 Hs.489734 NM_152556 ENSG00000164603 BMT2 C7orf60|SAMTOR base methyltransferase of 25S rRNA 2 homolog protein-coding 193-18 chr12 119985532 119985958 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -3491 NM_001367886 92558 Hs.369763 NM_207311 ENSG00000135127 BICDL1 BICDR-1|BICDR1|CCDC64|CCDC64A|H_267D11.1 BICD family like cargo adaptor 1 protein-coding 119.333-92 chr14 95075019 95075336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58326 NM_001195573 23405 Hs.87889 NM_030621 ENSG00000100697 DICER1 DCR1|Dicer|Dicer1e|GLOW|HERNA|K12H4.8-LIKE|MNG1|RMSE2 dicer 1, ribonuclease III protein-coding 116.667-79 chr17 51600750 51600977 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR 165436 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 155.333-356 chr7 23749918 23750285 + 0.666667 NA intron (NM_031414, intron 8 of 23) L1MCa|LINE|L1 39882 NM_032944 56164 Hs.309767 NM_031414 ENSG00000196335 STK31 SGK396|TDRD8 serine/threonine kinase 31 protein-coding 134.667-97 chr2 55544744 55545143 + 0.666667 NA exon (NM_080667, exon 10 of 10) exon (NM_080667, exon 10 of 10) 25348 NM_080667 112942 Hs.264208 NM_080667 ENSG00000163001 CFAP36 BARTL1|CCDC104 cilia and flagella associated protein 36 protein-coding 225-63 chr8 106182876 106183344 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -87068 NM_001198533 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 187.667-94 chr3 96398733 96399145 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 38975 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 123.333-56 chr12 9094903 9095212 + 0.666667 NA exon (NM_001347424, exon 17 of 36) exon (NM_001347424, exon 17 of 36) 21172 NM_001347425 2 Hs.88556 NM_000014 ENSG00000175899 A2M A2MD|CPAMD5|FWP007|S863-7 alpha-2-macroglobulin protein-coding 131.667-63 chr15 74409142 74409507 + 0.666667 NA TTS (NM_001146030) TTS (NM_001146030) 2108 NR_106941 102465530 NR_106941 ENSG00000277391 MIR6881 hsa-mir-6881 microRNA 6881 ncRNA 146-126 chr7 42105804 42106150 + 0.666667 NA intron (NM_000168, intron 3 of 14) intron (NM_000168, intron 3 of 14) 131232 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 116-145 chr7 47603213 47603552 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -18557 NR_108090 101929086 Hs.563487 NR_108090 ENSG00000236078 LINC01447 - long intergenic non-protein coding RNA 1447 ncRNA 132.667-50 chr14 56823257 56823526 + 0.666667 NA intron (NR_146411, intron 2 of 2) intron (NR_146411, intron 2 of 2) 10233 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 112.333-237 chr6 121091976 121092162 + 0.666667 NA intron (NR_104452, intron 34 of 35) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 242411 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 155-54 chr18 7655396 7655713 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 1 of 30) L1MC2|LINE|L1 88238 NM_002845 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 138.333-145 chr5 39335139 39335436 + 0.666667 NA intron (NM_001737, intron 4 of 10) intron (NM_001737, intron 4 of 10) 29208 NM_001737 735 Hs.654443 NM_001737 ENSG00000113600 C9 ARMD15|C9D complement C9 protein-coding 132-88 chr4 32392673 32393035 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 41816 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 207-73 chr22 34211462 34211930 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -288808 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 163.333-69 chr12 98535248 98535581 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_003276, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_003276, exon 4 of 4) -19188 NR_027157 100128191 Hs.594042 NR_027157 ENSG00000257167 TMPO-AS1 - TMPO antisense RNA 1 ncRNA 160.333-36 chr10 16733635 16733956 + 0.666667 NA intron (NM_152724, intron 6 of 7) intron (NM_152724, intron 6 of 7) 83629 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 115-28 chr10 70998321 70998632 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 59423 NR_134313 105378349 Hs.119164 NR_134313 ENSG00000259267 LINC02622 - long intergenic non-protein coding RNA 2622 ncRNA 124.667-26 chr10 41737792 41738071 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 630114 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 205-56 chr22 18070191 18070650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7500 NM_001199319 55670 Hs.517400 NM_017929 ENSG00000215193 PEX26 PBD7A|PBD7B|PEX26M1T|Pex26pM1T peroxisomal biogenesis factor 26 protein-coding 167-14 chr10 83105838 83106278 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 571031 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 170.667-27 chr11 49232232 49232545 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -23786 NM_001193473 2346 Hs.551896 NM_004476 ENSG00000086205 FOLH1 FGCP|FOLH|GCP2|GCPII|NAALAD1|NAALAdase|PSM|PSMA|mGCP folate hydrolase 1 protein-coding 137.333-147 chr5 9539156 9539402 + 0.666667 NA intron (NM_003966, intron 1 of 22) L1MB8|LINE|L1 6796 NM_003966 9037 Hs.27621 NM_003966 ENSG00000112902 SEMA5A SEMAF|semF semaphorin 5A protein-coding 186-90 chr6 67087752 67088229 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -967361 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 150-91 chr3 23370022 23370310 + 0.666667 NA intron (NM_001370225, intron 3 of 5) intron (NM_001370225, intron 3 of 5) 166839 NM_152653 7325 Hs.475688 NM_152653 ENSG00000182247 UBE2E2 UBCH8 ubiquitin conjugating enzyme E2 E2 protein-coding 146.667-229 chr4 39931606 39931877 + 0.666667 NA intron (NM_001100399, intron 2 of 32) MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 46170 NM_001100399 23244 Hs.331431 NM_015200 ENSG00000121892 PDS5A PIG54|SCC-112|SCC112 PDS5 cohesin associated factor A protein-coding 212.333-157 chr9 103698226 103698691 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -301251 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 198-72 chr17 58315139 58315724 + 0.666667 NA intron (NM_024418, intron 15 of 30) intron (NM_024418, intron 15 of 30) -10019 NR_038410 100506779 Hs.718477 NR_038410 ENSG00000265148 TSPOAP1-AS1 BZRAP1-AS1 TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1 ncRNA 237.333-27 chr14 36030578 36031006 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39635 NR_073454 101101773 Hs.640678 NR_073454 ENSG00000257585 LINC00609 - long intergenic non-protein coding RNA 609 ncRNA 161.333-269 chr7 97543918 97544264 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -187995 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 138.333-121 chr3 98034655 98035038 + 0.666667 NA intron (NM_001105580, intron 2 of 9) intron (NM_001105580, intron 2 of 9) 458 NR_047685 200959 Hs.534578 NM_001105580 ENSG00000183185 GABRR3 - gamma-aminobutyric acid type A receptor rho3 subunit (gene/pseudogene) protein-coding 179.667-41 chr13 85856977 85857338 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57738 NM_032229 84189 Hs.525105 NM_032229 ENSG00000184564 SLITRK6 DFNMYP SLIT and NTRK like family member 6 protein-coding 248.333-62 chr3 107595690 107596176 + 0.666667 NA intron (NM_001276286, intron 2 of 16) Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger 72971 NM_020235 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 179.333-135 chr4 54037053 54037337 + 0.666667 NA intron (NM_012110, intron 3 of 5) AluJb|SINE|Alu 27410 NM_012110 26511 Hs.335393 NM_012110 ENSG00000109220 CHIC2 BTL cysteine rich hydrophobic domain 2 protein-coding 130.333-14 chr1 151275366 151275626 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6026 NM_001304764 57592 Hs.186756 NM_020832 ENSG00000143373 ZNF687 PDB6 zinc finger protein 687 protein-coding 170.333-60 chr12 129852523 129852929 + 0.666667 NA intron (NM_133448, intron 1 of 8) L1ME3B|LINE|L1 51299 NM_133448 121256 Hs.507268 NM_133448 ENSG00000151952 TMEM132D MOLT|PPP1R153 transmembrane protein 132D protein-coding 153.333-172 chr18 54788267 54788680 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -40004 NM_004163 5874 Hs.25318 NM_004163 ENSG00000041353 RAB27B C25KG RAB27B, member RAS oncogene family protein-coding 153-56 chr16 8379426 8379707 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 210272 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 144.333-65 chr14 20844811 20845090 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -42106 NM_198234 6035 Hs.78224 NM_002933 ENSG00000129538 RNASE1 RAC1|RIB1|RNS1 ribonuclease A family member 1, pancreatic protein-coding 179.333-72 chr16 6392994 6393400 + 0.666667 NA intron (NM_018723, intron 2 of 15) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy 373494 NM_001308117 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 186.667-153 chr9 106709138 106709542 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 93282 NR_104145 100996590 Hs.147110 NR_104145 ENSG00000234323 LINC01505 - long intergenic non-protein coding RNA 1505 ncRNA 165.333-28 chr10 60621059 60621452 + 0.666667 NA intron (NM_001204403, intron 1 of 43) intron (NM_001204403, intron 1 of 43) -48299 NM_001204404 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 159-105 chr6 132177974 132178287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44152 NR_038981 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 119-41 chr13 96746387 96746583 + 0.666667 NA intron (NM_153456, intron 1 of 1) intron (NM_153456, intron 1 of 1) 237687 NR_051966 100887754 Hs.617003 NR_051966 LINC00359 - long intergenic non-protein coding RNA 359 ncRNA 114.667-35 chr10 59197499 59197672 + 0.666667 NA intron (NM_001143774, intron 1 of 4) intron (NM_001143774, intron 1 of 4) 20118 NM_001143774 84457 Hs.499704 NM_032439 ENSG00000165443 PHYHIPL - phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein like protein-coding 115.667-148 chr3 95074913 95075103 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 136745 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 183.333-95 chr20 49524076 49524441 + 0.666667 NA intron (NM_000961, intron 5 of 9) intron (NM_000961, intron 5 of 9) -41590 NM_004975 3745 Hs.84244 NM_004975 ENSG00000158445 KCNB1 DRK1|Kv2.1 potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 protein-coding 120.333-107 chr2 182257381 182257600 + 0.666667 NA intron (NM_005019, intron 2 of 14) LTR104_Mam|LTR|Gypsy -15427 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 133-71 chr5 18996818 18997017 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 889355 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 212-19 chr10 4452051 4452565 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 45839 NR_108056 100507059 Hs.158438 NR_108054 ENSG00000224382 LINC00703 - long intergenic non-protein coding RNA 703 ncRNA 113-193 chr7 44682645 44682890 + 0.666667 NA intron (NM_002541, intron 10 of 22) AluJb|SINE|Alu -65799 NM_001300959 83637 Hs.77978 NM_031449 ENSG00000122515 ZMIZ2 NET27|TRAFIP20|ZIMP7|hZIMP7 zinc finger MIZ-type containing 2 protein-coding 134-95 chr7 22603495 22603810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40315 NR_038393 100506178 Hs.668122 NR_038393 ENSG00000232759 LOC100506178 - uncharacterized LOC100506178 ncRNA 137.667-167 chr6 131976522 131976814 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25296 NM_001901 1490 Hs.410037 NM_001901 ENSG00000118523 CCN2 CTGF|HCS24|IGFBP8|NOV2 cellular communication network factor 2 protein-coding 175-71 chr5 108147574 108148055 + 0.666667 NA intron (NM_001163315, intron 6 of 8) L1ME3B|LINE|L1 234284 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 125.667-49 chr12 62285559 62285845 + 0.666667 NA intron (NR_147080, intron 1 of 19) L1PB4|LINE|L1 25298 NM_001351163 9958 Hs.434951 NM_006313 ENSG00000135655 USP15 UNPH-2|UNPH4 ubiquitin specific peptidase 15 protein-coding 216.333-98 chr3 102703731 102704197 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 268949 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 193-28 chr16 52701977 52702466 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -95246 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 238-90 chr6 121109836 121110245 + 0.666667 NA intron (NR_104452, intron 33 of 35) AluY|SINE|Alu 224440 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 113-113 chr2 150811714 150811917 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 182918 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 143-67 chr2 55268807 55269186 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_001321004, exon 1 of 15) 5' UTR (NM_001321004, exon 1 of 15) 183 NM_001005369 4528 Hs.149894 NM_002453 ENSG00000085760 MTIF2 - mitochondrial translational initiation factor 2 protein-coding 128.667-101 chr20 10692610 10692959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18785 NM_000214 182 Hs.224012 NM_000214 ENSG00000101384 JAG1 AGS|AGS1|AHD|AWS|CD339|DCHE|HJ1|JAGL1 jagged canonical Notch ligand 1 protein-coding 140.333-17 chr1 171989540 171989821 + 0.666667 NA intron (NM_001278252, intron 4 of 14) intron (NM_001278252, intron 4 of 14) 125488 NR_046845 100874284 NR_046845 ENSG00000233540 DNM3-IT1 - DNM3 intronic transcript 1 ncRNA 167.667-160 chr4 112247984 112248298 + 0.666667 NA intron (NM_018569, intron 1 of 9) L1MC5a|LINE|L1 16354 NM_018569 55435 Hs.435991 NM_018569 ENSG00000138660 AP1AR 2C18|C4orf16|GBAR|PRO0971|gamma-BAR adaptor related protein complex 1 associated regulatory protein protein-coding 151.333-175 chr17 49628856 49629278 + 0.666667 NA intron (NM_001007228, intron 1 of 9) AluSg|SINE|Alu -2478 NM_001370732 8405 Hs.463382 NM_003563 ENSG00000121067 SPOP BTBD32|TEF2 speckle type BTB/POZ protein protein-coding 151.333-283 chr3 78192179 78192599 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -143426 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 184.667-107 chr5 132772355 132772821 + 0.666667 NA intron (NM_001098813, intron 1 of 9) intron (NM_001098813, intron 1 of 9) 4651 NM_001300799 23176 Hs.522057 NM_015146 ENSG00000164402 SEPTIN8 SEP2|SEPT8 septin 8 protein-coding 182-119 chr9 84261568 84262064 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 78942 NR_037638 64078 Hs.535966 NM_022127 ENSG00000197506 SLC28A3 CNT3 solute carrier family 28 member 3 protein-coding 163-42 chr2 68434805 68435244 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 32270 NR_133923 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 204-154 chr4 81048777 81049235 + 0.666667 NA intron (NM_001201, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 18298 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 169.667-99 chr19 49369157 49369509 + 0.666667 NA non-coding (NR_110729, exon 3 of 3) non-coding (NR_110729, exon 3 of 3) 5456 NM_001197301 27120 Hs.515855 NM_014419 ENSG00000104901 DKKL1 CT34|SGY|SGY-1|SGY1 dickkopf like acrosomal protein 1 protein-coding 187.333-129 chr3 79489176 79489644 + 0.666667 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) AluSc|SINE|Alu -18477 NR_037488 100500877 NR_037488 ENSG00000265193 MIR3923 - microRNA 3923 ncRNA 152.333-112 chr14 68981776 68982067 + 0.666667 NA intron (NR_073422, intron 2 of 3) L2c|LINE|L2 2239 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 195-115 chr9 92291339 92291897 + 0.666667 NA TTS (NR_037424) TTS (NR_037424) 929 NR_037424 100500918 NR_037424 ENSG00000281156 MIR3651 mir-3651 microRNA 3651 ncRNA 114.333-79 chr16 12741442 12741737 + 0.666667 NA intron (NM_018340, intron 2 of 3) intron (NM_018340, intron 2 of 3) 21268 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 120-131 chr7 82288863 82289166 + 0.666667 NA intron (NM_000722, intron 3 of 38) intron (NM_000722, intron 3 of 38) 154763 NM_001302890 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 112-84 chr17 52253727 52253993 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -93843 NM_001082534 56934 Hs.463466 NM_020178 ENSG00000154975 CA10 CA-RPX|CARPX|HUCEP-15 carbonic anhydrase 10 protein-coding 167.667-175 chr5 152644786 152645191 + 0.666667 NA intron (NR_109877, intron 4 of 4) intron (NR_109877, intron 4 of 4) -239709 NM_020167 56923 Hs.731911 NM_020167 ENSG00000132911 NMUR2 FM-4|FM4|NMU-R2|NMU2R|TGR-1|TGR1 neuromedin U receptor 2 protein-coding 129.333-184 chr8 13542080 13542335 + 0.666667 NA intron (NM_001348082, intron 1 of 16) L1ME1|LINE|L1 -24662 NM_001007090 157773 Hs.104941 NM_001007090 ENSG00000164743 C8orf48 - chromosome 8 open reading frame 48 protein-coding 190-12 chr10 21740282 21740692 + 0.666667 NA intron (NM_001195626, intron 22 of 22) intron (NM_001195626, intron 22 of 22) 206315 NM_004641 8028 Hs.30385 NM_004641 ENSG00000078403 MLLT10 AF10 MLLT10 histone lysine methyltransferase DOT1L cofactor protein-coding 167-56 chr2 33490300 33490630 + 0.666667 NA intron (NM_001349975, intron 3 of 19) L2|LINE|L2 13816 NM_001349980 25780 Hs.143674 NM_015376 ENSG00000152689 RASGRP3 GRP3 RAS guanyl releasing protein 3 protein-coding 147.333-136 chr17 29730406 29730756 + 0.666667 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) AluJb|SINE|Alu 30851 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 213.667-23 chr11 96336354 96336936 + 0.666667 NA intron (NM_032427, intron 1 of 4) intron (NM_032427, intron 1 of 4) -4793 NR_036125 100422991 NR_036125 ENSG00000266192 MIR1260B mir-1260b microRNA 1260b ncRNA 246.666-5 chr10 92167816 92168512 + 0.666667 NA intron (NM_001178137, intron 4 of 9) intron (NM_001178137, intron 4 of 9) 75115 NM_001178137 22849 Hs.131683 NM_014912 ENSG00000107864 CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 protein-coding 244.667-43 chr14 69790903 69791422 + 0.666667 NA intron (NM_003049, intron 1 of 4) L1ME3C|LINE|L1 6079 NM_003049 6554 Hs.952 NM_003049 ENSG00000100652 SLC10A1 NTCP solute carrier family 10 member 1 protein-coding 153.667-410 chr9 122005710 122006120 + 0.666667 NA intron (NM_194252, intron 3 of 3) MER20B|DNA|hAT-Charlie 87691 NM_001139442 158135 Hs.438937 NM_194252 ENSG00000175764 TTLL11 C9orf20|bA244O19.1 tubulin tyrosine ligase like 11 protein-coding 128.333-20 chr10 16807508 16807739 + 0.666667 NA intron (NM_152724, intron 1 of 7) intron (NM_152724, intron 1 of 7) 9801 NM_012425 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 253.333-3 chr1 167862165 167862614 + 0.666667 NA intron (NM_018417, intron 14 of 32) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 51745 NM_001167749 55811 Hs.320892 NM_018417 ENSG00000143199 ADCY10 HCA2|HEL-S-7a|SAC|SACI|Sacy|hsAC adenylate cyclase 10 protein-coding 122.667-214 chr9 122168036 122168363 + 0.666667 NA intron (NM_001286828, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 8291 NM_198469 254956 Hs.71428 NM_198469 ENSG00000185681 MORN5 C9orf113|C9orf18 MORN repeat containing 5 protein-coding 155.667-242 chr4 43696801 43697203 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -204459 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 305.666-20 chr6 118880152 118880962 + 0.666667 NA intron (NM_017696, intron 6 of 11) intron (NM_017696, intron 6 of 11) -13595 NM_014034 25842 Hs.292316 NM_014034 ENSG00000111875 ASF1A CGI-98|CIA|HSPC146 anti-silencing function 1A histone chaperone protein-coding 114.667-97 chr16 9030271 9030529 + 0.666667 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -61244 NM_014117 29035 Hs.221497 NM_014117 ENSG00000182831 C16orf72 PRO0149 chromosome 16 open reading frame 72 protein-coding 198.333-17 chr1 203615059 203615574 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11471 NM_001001396 493 Hs.343522 NM_001684 ENSG00000058668 ATP2B4 ATP2B2|MXRA1|PMCA4|PMCA4b|PMCA4x ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 4 protein-coding 113.333-201 chr4 178529673 178529995 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -621898 NR_108092 101928656 Hs.508131 NR_108092 ENSG00000251504 LINC01099 - long intergenic non-protein coding RNA 1099 ncRNA 162.333-250 chr8 76999786 77000076 + 0.666667 NA intron (NM_001172086, intron 2 of 4) CpG 147 NM_000318 5828 Hs.437966 NM_000318 ENSG00000164751 PEX2 PAF1|PBD5A|PBD5B|PMP3|PMP35|PXMP3|RNF72|ZWS3 peroxisomal biogenesis factor 2 protein-coding 237.333-63 chr2 209708116 209708598 + 0.666667 NA intron (NM_001039538, intron 10 of 14) L3|LINE|CR1 -63475 NM_182587 285175 Hs.396201 NM_032504 ENSG00000144406 UNC80 C2orf21|UNC-80 unc-80 homolog, NALCN channel complex subunit protein-coding 146-55 chr2 44687678 44687978 + 0.666667 NA intron (NM_024766, intron 3 of 10) intron (NM_024766, intron 3 of 10) 251060 NR_147194 107985879 Hs.436392 NR_147194 ENSG00000259439 LINC01833 K21.1|RP11-89 long intergenic non-protein coding RNA 1833 ncRNA 132.667-156 chr7 4360408 4360729 + 0.666667 NA Intergenic LTR45B|LTR|ERV1 -225731 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 188.667-112 chr4 52433636 52434064 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 222689 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 289.333-44 chr4 122244148 122244710 + 0.666667 NA intron (NM_015312, intron 29 of 83) MER8|DNA|TcMar-Tigger 73826 NM_015312 84162 Hs.408142 NM_015312 ENSG00000138688 KIAA1109 ALKKUCS|FSA|Tweek KIAA1109 protein-coding 163.667-58 chr14 46387501 46387835 + 0.666667 NA intron (NR_102702, intron 3 of 3) L1M1|LINE|L1 -83691 NR_102699 100506412 Hs.207545 NR_102699 ENSG00000258700 LINC00871 - long intergenic non-protein coding RNA 871 ncRNA 144.667-82 chr14 52253532 52253866 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR -13999 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 143-46 chr15 80194389 80194812 + 0.666667 NA TTS (NM_001352888) TTS (NM_001352888) 41601 NM_000137 2184 Hs.73875 NM_000137 ENSG00000103876 FAH - fumarylacetoacetate hydrolase protein-coding 163.333-224 chr5 71774818 71775184 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 55726 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 124.333-190 chrX 153756222 153756466 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -7852 NM_001163257 5365 Hs.632833 NM_005393 ENSG00000198753 PLXNB3 PLEXB3|PLEXR|PLXN6 plexin B3 protein-coding 176.667-78 chr2 135176877 135177261 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 40441 NR_145723 109616967 NR_145723 ENSG00000208308 SNORA40B - small nucleolar RNA, H/ACA box 40B snoRNA 129.333-68 chr15 40753151 40753429 + 0.666667 NA intron (NM_001323894, intron 2 of 12) AluSg|SINE|Alu 1964 NM_018145 55177 Hs.511067 NM_018145 ENSG00000137824 RMDN3 FAM82A2|FAM82C|RMD-3|RMD3|ptpip51 regulator of microtubule dynamics 3 protein-coding 126-4 chr1 228024065 228024375 + 0.666667 NA intron (NM_033131, intron 2 of 3) L1MB5|LINE|L1 17222 NM_033131 89780 Hs.336930 NM_033131 ENSG00000154342 WNT3A - Wnt family member 3A protein-coding 187.333-186 chr7 26222159 26222645 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 20657 NM_016587 11335 Hs.381189 NM_007276 ENSG00000122565 CBX3 HECH|HP1-GAMMA|HP1Hs-gamma chromobox 3 protein-coding 169.667-159 chr4 143820380 143820876 + 0.666667 NA intron (NR_134680, intron 1 of 1) intron (NR_134680, intron 1 of 1) 8720 NR_134680 105377458 Hs.738046 NR_134680 LOC105377458 - uncharacterized LOC105377458 ncRNA 114-153 chr7 122572193 122572451 + 0.666667 NA intron (NM_001167940, intron 7 of 29) intron (NM_001167940, intron 7 of 29) 126795 NM_139175 168433 Hs.126730 NM_139175 ENSG00000188050 RNF133 - ring finger protein 133 protein-coding 138-71 chr20 53896236 53896632 + 0.666667 NA Intergenic MER46C|DNA|TcMar-Tigger -20725 NR_002189 391257 Hs.449977 NR_002189 SUMO1P1 PIC1L|UBL2|UBL6 SUMO1 pseudogene 1 pseudo 114.333-88 chr17 76665752 76665993 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -6056 NR_130916 105274304 Hs.572495 NR_130916 ENSG00000261335 LOC105274304 - uncharacterized LOC105274304 ncRNA 169-69 chr3 132527258 132527557 + 0.666667 NA intron (NM_001329126, intron 54 of 56) intron (NM_001329126, intron 54 of 56) -69863 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 112.667-261 chr8 32237383 32237632 + 0.666667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) intron (NM_013962, intron 1 of 4) -203239 NR_047475 100874286 Hs.147060 NR_047475 ENSG00000254049 NRG1-IT3 - NRG1 intronic transcript 3 ncRNA 130.333-54 chr12 62544458 62544740 + 0.666667 NA intron (NM_001278469, intron 20 of 35) intron (NM_001278469, intron 20 of 35) 58835 NR_121682 283416 Hs.375881 NM_175895 ENSG00000221949 LINC01465 C12orf61 long intergenic non-protein coding RNA 1465 ncRNA 201.333-300 chr9 93370801 93371292 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -24632 NM_001098808 445577 Hs.575636 NM_001098808 ENSG00000204352 C9orf129 bA165J3.3 chromosome 9 open reading frame 129 protein-coding 155-30 chr14 55079569 55079939 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 28107 NM_144578 93487 Hs.594338 NM_144578 ENSG00000168175 MAPK1IP1L C14orf32|MISS|c14_5346 mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 like protein-coding 165-32 chr19 6304051 6304480 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -24290 NM_005934 4298 Hs.10095 NM_005934 ENSG00000130382 MLLT1 ENL|LTG19|YEATS1 MLLT1 super elongation complex subunit protein-coding 124-47 chr16 61751414 61751692 + 0.666667 NA intron (NM_001796, intron 8 of 11) intron (NM_001796, intron 8 of 11) 284885 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 169.333-186 chr4 96156454 96156806 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -154073 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 189.667-128 chr6 80491471 80491936 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 385032 NM_183050 594 Hs.156414 NM_000056 ENSG00000083123 BCKDHB BCKDE1B|BCKDH E1-beta|E1B branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta protein-coding 172.333-56 chr14 84003380 84003884 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1268300 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 154.333-302 chr6 111920653 111921024 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11441 NR_149099 105377946 NR_149099 LINC02527 - long intergenic non-protein coding RNA 2527 ncRNA 140-58 chr2 43581667 43582015 + 0.666667 NA exon (NM_001271643, exon 8 of 18) exon (NM_001271643, exon 8 of 18) 14133 NM_001083953 63892 Hs.369592 NM_022065 ENSG00000115970 THADA ARMC13|GITA THADA armadillo repeat containing protein-coding 155.333-63 chr11 127473379 127473715 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 202477 NR_120580 101929497 Hs.737442 NR_120580 ENSG00000273409 LINC02712 - long intergenic non-protein coding RNA 2712 ncRNA 174.333-130 chr6 51245332 51245782 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -376313 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 140-110 chr7 91039149 91039393 + 0.666667 NA intron (NM_012395, intron 9 of 13) L2c|LINE|L2 -225162 NM_003505 8321 Hs.94234 NM_003505 ENSG00000157240 FZD1 - frizzled class receptor 1 protein-coding 116.333-17 chr1 173629890 173630189 + 0.666667 NA intron (NM_198493, intron 3 of 5) L1M1|LINE|L1 -5299 NM_001195190 730159 Hs.647757 NM_001195190 ENSG00000232113 TEX50 - testis expressed 50 protein-coding 175.667-34 chr13 94371543 94371914 + 0.666667 NA intron (NM_005708, intron 6 of 8) L1ME2z|LINE|L1 107954 NM_001129889 1638 Hs.301865 NM_001922 ENSG00000080166 DCT TRP-2|TYRP2 dopachrome tautomerase protein-coding 119.667-80 chr2 52598795 52599085 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 103675 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 170-98 chr5 127320238 127320641 + 0.666667 NA intron (NM_001308119, intron 2 of 14) AmnSINE1|SINE|5S-Deu-L2 29643 NM_001256545 84466 Hs.438709 NM_032446 ENSG00000145794 MEGF10 EMARDD multiple EGF like domains 10 protein-coding 178-47 chr14 79094378 79094832 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 14 of 20) intron (NR_073547, intron 14 of 20) -105377 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 167-32 chr13 37667904 37668215 + 0.666667 NA intron (NM_003306, intron 5 of 10) intron (NM_003306, intron 5 of 10) -69215 NM_001286666 10631 Hs.136348 NM_006475 ENSG00000133110 POSTN OSF-2|OSF2|PDLPOSTN|PN periostin protein-coding 154.333-12 chr1 100876016 100876332 + 0.666667 NA intron (NM_001261442, intron 3 of 3) intron (NM_001261442, intron 3 of 3) 18668 NM_001033025 2135 Hs.357637 NM_001439 ENSG00000162694 EXTL2 EXTR2 exostosin like glycosyltransferase 2 protein-coding 180.333-29 chr12 117962848 117963293 + 0.666667 NA intron (NM_173598, intron 1 of 19) AluSz|SINE|Alu 5920 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 150-86 chr22 35293226 35293515 + 0.666667 NA intron (NM_001003681, intron 10 of 10) intron (NM_001003681, intron 10 of 10) -5905 NM_001135729 10043 Hs.474705 NM_005488 ENSG00000100284 TOM1 - target of myb1 membrane trafficking protein protein-coding 143.667-3 chr1 37757335 37757757 + 0.666667 NA intron (NM_001099439, intron 3 of 16) intron (NM_001099439, intron 3 of 16) 7574 NM_001099439 284656 Hs.129435 NM_173641 ENSG00000183317 EPHA10 - EPH receptor A10 protein-coding 114.333-42 chr11 65635010 65635335 + 0.666667 NA intron (NM_032223, intron 30 of 34) intron (NM_032223, intron 30 of 34) -1138 NR_039839 100616292 NR_039839 ENSG00000266041 MIR4690 - microRNA 4690 ncRNA 112-187 chr6 140817830 140818022 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 134112 NR_039675 100616180 NR_039675 ENSG00000264390 MIR4465 - microRNA 4465 ncRNA 172-64 chr20 40393115 40393582 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 295888 NM_005461 9935 Hs.169487 NM_005461 ENSG00000204103 MAFB DURS3|KRML|MCTO MAF bZIP transcription factor B protein-coding 122.667-93 chr2 124575872 124576098 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 11 of 23) intron (NM_130773, intron 11 of 23) 550698 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 200.333-82 chr20 47421755 47422228 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -9847 NR_146496 102723442 NR_146494 LINC01754 - long intergenic non-protein coding RNA 1754 ncRNA 119-4 chr1 91121061 91121244 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -98897 NM_032186 84146 Hs.173001 NM_016620 ENSG00000122482 ZNF644 BM-005|MYP21|NatF|ZEP-2 zinc finger protein 644 protein-coding 163.667-195 chr5 27509545 27509855 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 37408 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 204.333-204 chr8 137002626 137003209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 410671 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 162-19 chr10 107575469 107575796 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -410926 NM_052918 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 234.667-24 chr12 41637202 41637612 + 0.666667 NA Intergenic (TTTTA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -126782 NR_135040 101927038 Hs.98588 NR_135040 ENSG00000257784 LINC02400 - long intergenic non-protein coding RNA 2400 ncRNA 148.333-274 chr4 30856344 30856629 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 136117 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 216-15 chr11 59708331 59708833 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 5263 NM_001005324 390201 Hs.589001 NM_001005324 ENSG00000172289 OR10V1 OR11-256 olfactory receptor family 10 subfamily V member 1 protein-coding 136-98 chr8 12771553 12771789 + 0.666667 NA intron (NR_152742, intron 3 of 4) MIRb|SINE|MIR -16145 NM_001329976 91694 Hs.180178 NM_152271 ENSG00000154359 LONRF1 RNF191 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 1 protein-coding 267-61 chr7 38171643 38172166 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -6341 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 119.667-32 chr11 80811574 80811768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48868 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 137.333-135 chr4 92450908 92451246 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 1 of 14) intron (NM_001286838, intron 1 of 14) 146678 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 176.333-120 chr4 61906408 61906747 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 11 of 23) L1ME3G|LINE|L1 255188 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 165-101 chr9 99953758 99954093 + 0.666667 NA intron (NM_017919, intron 4 of 7) intron (NM_017919, intron 4 of 7) 47271 NM_017919 55014 Hs.704031 NM_017919 ENSG00000136874 STX17 - syntaxin 17 protein-coding 131.333-192 chr9 73372941 73373275 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 221243 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 135-27 chr13 78810269 78810539 + 0.666667 NA intron (NR_046869, intron 2 of 4) L1MC5|LINE|L1 29646 NR_046869 100874126 Hs.577893 NR_046869 LINC00331 NCRNA00331 long intergenic non-protein coding RNA 331 ncRNA 184-19 chr12 47290652 47291043 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 16552 NR_135024 105369747 Hs.88617 NR_135024 LOC105369747 - uncharacterized LOC105369747 ncRNA 196.667-50 chr15 64349721 64350178 + 0.666667 NA intron (NM_001329606, intron 1 of 11) intron (NM_001329606, intron 1 of 11) 6224 NM_022048 53944 Hs.646508 NM_022048 ENSG00000169118 CSNK1G1 CK1gamma1 casein kinase 1 gamma 1 protein-coding 150.333-386 chr7 94978195 94978593 + 0.666667 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 68496 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 126.667-29 chr12 13418158 13418422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41545 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 323.667-18 chr3 58305555 58306091 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001348712) promoter-TSS (NM_001348712) -422 NM_001348712 109703458 Hs.446320 NM_001348712 ENSG00000255154 HTD2 - hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2 protein-coding 150.667-242 chr3 62310788 62311215 + 0.666667 NA intron (NR_038281, intron 2 of 4) MER102a|DNA|hAT-Charlie 7946 NR_038282 100506994 Hs.656620 NR_038281 ENSG00000241472 PTPRG-AS1 - PTPRG antisense RNA 1 ncRNA 235-12 chr12 32672365 32672878 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6579 NM_012063 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 164.667-44 chr11 116442138 116442586 + 0.666667 NA Intergenic MER66D|LTR|ERV1 -197060 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 140.667-160 chr4 44037334 44037572 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 20391 NR_131958 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 146-84 chr3 78559783 78560066 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 459535 NM_001145845 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 246.333-21 chr11 116651949 116652488 + 0.666667 NA intron (NR_135069, intron 1 of 2) intron (NR_135069, intron 1 of 2) 12796 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 205.333-112 chr19 44420777 44421355 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -19458 NM_152354 26974 Hs.709428 NM_152354 ENSG00000267508 ZNF285 ZNF285A zinc finger protein 285 protein-coding 121-47 chr14 75836400 75836668 + 0.666667 NA intron (NM_015072, intron 28 of 31) L1MA2|LINE|L1 145461 NM_001329938 7043 Hs.592317 NM_003239 ENSG00000119699 TGFB3 ARVD|ARVD1|LDS5|RNHF|TGF-beta3 transforming growth factor beta 3 protein-coding 125.333-79 chr18 62547882 62548100 + 0.666667 NA intron (NR_126534, intron 4 of 14) L2a|LINE|L2 24966 NR_126534 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 166-11 chr1 151584609 151585034 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27229 NM_001330723 81609 Hs.192326 NM_030918 ENSG00000143376 SNX27 MRT1|MY014 sorting nexin 27 protein-coding 194.333-46 chr14 86272718 86273058 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 338210 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 123.333-131 chr21 15075676 15075922 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10799 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 144.333-242 chr7 8398310 8398627 + 0.666667 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie -35141 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 113-166 chr5 41759046 41759367 + 0.666667 NA intron (NM_001364302, intron 13 of 15) MIRb|SINE|MIR 84451 NM_001364303 5019 Hs.278277 NM_000436 ENSG00000083720 OXCT1 OXCT|SCOT 3-oxoacid CoA-transferase 1 protein-coding 191-16 chr13 85432840 85433306 + 0.666667 NA intron (NR_046989, intron 1 of 3) intron (NR_046989, intron 1 of 3) 69470 NR_046989 100874137 Hs.742643 NR_046989 ENSG00000226317 LINC00351 - long intergenic non-protein coding RNA 351 ncRNA 112.333-249 chr7 79581514 79581703 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 127648 NR_038343 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 170-79 chr3 114522569 114522926 + 0.666667 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 69154 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 198.667-159 chr6 36543506 36544021 + 0.666667 NA intron (NM_007271, intron 1 of 13) AluSx|SINE|Alu 3716 NM_007271 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 117.667-50 chr14 67980628 67980916 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) L1MC|LINE|L1 157180 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 121.333-29 chr11 46062733 46063089 + 0.666667 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) L1ME1|LINE|L1 57908 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 163.333-31 chr10 29128983 29129309 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -159924 NM_032517 84569 Hs.558572 NM_032517 ENSG00000120563 LYZL1 KAAG648|LYC2|LYZD1|PRO1278|bA534G20.1 lysozyme like 1 protein-coding 147.333-205 chr22 27719181 27719516 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 82408 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 152-21 chr10 54411402 54411692 + 0.666667 NA intron (NM_001142773, intron 2 of 31) MIR|SINE|MIR -74683 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 246.667-3 chr1 49113773 49114163 + 0.666667 NA intron (NM_001323575, intron 4 of 12) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -143443 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 163.333-188 chr3 182742549 182742846 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -50807 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 111.667-209 chr5 110233224 110233551 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 280528 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 117.333-62 chr14 80632408 80632615 + 0.666667 NA intron (NM_152446, intron 19 of 24) (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 309227 NR_157142 145508 Hs.162889 NM_152446 ENSG00000100629 CEP128 C14orf145|C14orf61|LEDP/132 centrosomal protein 128 protein-coding 134.333-4 chr1 115161664 115161972 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -72315 NM_005725 10100 Hs.310458 NM_005725 ENSG00000134198 TSPAN2 NET3|TSN2|TSPAN-2 tetraspanin 2 protein-coding 211.667-50 chr18 12542184 12542552 + 0.666667 NA intron (NM_020148, intron 3 of 15) MER33|DNA|hAT-Charlie 109594 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 138-107 chr7 29130224 29130620 + 0.666667 NA intron (NM_001371261, intron 2 of 13) intron (NM_001371261, intron 2 of 13) 5389 NR_120523 101928168 Hs.666750 NR_120523 ENSG00000285412 LOC101928168 - uncharacterized LOC101928168 ncRNA 144.333-61 chr13 75188594 75188983 + 0.666667 NA Intergenic MLT2A2|LTR|ERVL 51593 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 157-9 chr1 168249204 168249515 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_199344, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_199344, exon 8 of 8) -1929 NR_026844 84832 Hs.537067 NR_026844 ENSG00000214262 ANKRD36BP1 ANKRD26L1|ANKRD36BL1 ankyrin repeat domain 36B pseudogene 1 pseudo 118.667-32 chr10 78124455 78124762 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 90745 NM_001142285 6229 Hs.280130 NM_001026 ENSG00000138326 RPS24 DBA3|S24|eS24 ribosomal protein S24 protein-coding 146-63 chr2 132836953 132837283 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 11 of 17) HAL1|LINE|L1 -78439 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 133-38 chr18 66067950 66068184 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 317055 NM_001362438 1005 Hs.541003 NM_004361 ENSG00000081138 CDH7 CDH7L1 cadherin 7 protein-coding 120.333-170 chr7 35608859 35609139 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 86136 NM_022373 64224 Hs.643051 NM_022373 ENSG00000122557 HERPUD2 - HERPUD family member 2 protein-coding 183.333-69 chr17 70649809 70650214 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 480476 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 148.333-375 chr7 136544568 136544852 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -323942 NM_001006630 1129 Hs.535891 NM_000739 ENSG00000181072 CHRM2 HM2 cholinergic receptor muscarinic 2 protein-coding 164.667-85 chr15 80223723 80224051 + 0.666667 NA intron (NM_001352888, intron 1 of 2) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 28326 NM_001352888 100996492 Hs.20034 NM_001352888 ENSG00000259417 CTXND1 LINC01314 cortexin domain containing 1 protein-coding 135-46 chr2 113068477 113068792 + 0.666667 NA intron (NM_173161, intron 1 of 4) MIR3|SINE|MIR 664 NM_173161 84639 Hs.306974 NM_032556 ENSG00000136697 IL1F10 FIL1-theta|FKSG75|IL-1HY2|IL-38|IL1-theta|IL1HY2 interleukin 1 family member 10 protein-coding 145.667-140 chr2 104209232 104209652 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 198890 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 155-48 chr16 78392661 78393046 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 5 of 7) intron (NM_001291997, intron 5 of 7) 293199 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 181-9 chr11 74218460 74218844 + 0.666667 NA intron (NM_001271593, intron 3 of 13) L1MA3|LINE|L1 47363 NM_001271593 51400 Hs.503251 NM_016147 ENSG00000214517 PPME1 ABDH19|PME-1 protein phosphatase methylesterase 1 protein-coding 150.333-426 chr8 136974651 136974959 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 438783 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 144-96 chr22 35325629 35325887 + 0.666667 NA intron (NR_156428, intron 5 of 13) intron (NR_156428, intron 5 of 13) -9882 NR_037471 100500826 NR_037471 ENSG00000266320 MIR3909 mir-3909 microRNA 3909 ncRNA 150.667-318 chr5 159921440 159921848 + 0.666667 NA intron (NM_000679, intron 1 of 1) intron (NM_000679, intron 1 of 1) 5162 NM_000679 147 Hs.368632 NM_000679 ENSG00000170214 ADRA1B ADRA1|ALPHA1BAR adrenoceptor alpha 1B protein-coding 149-127 chr6 42378518 42378924 + 0.666667 NA intron (NM_001297573, intron 2 of 17) MIR3|SINE|MIR 73330 NM_001297573 55809 Hs.485392 NM_018415 ENSG00000124496 TRERF1 BCAR2|HSA277276|RAPA|TREP132|TReP-132|dJ139D8.5 transcriptional regulating factor 1 protein-coding 125-113 chr8 100378561 100378777 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4094 NR_039681 100616451 NR_039681 ENSG00000265599 MIR4471 - microRNA 4471 ncRNA 146.667-20 chr1 171256844 171257167 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001282692) promoter-TSS (NM_001282692) -918 NM_001282692 2326 Hs.1424 NM_002021 ENSG00000010932 FMO1 - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 1 protein-coding 146-125 chr7 39445202 39445491 + 0.666667 NA intron (NM_001370959, intron 7 of 9) intron (NM_001370959, intron 7 of 9) -39000 NR_046711 100861520 Hs.571292 NR_046711 ENSG00000224122 POU6F2-AS1 - POU6F2 antisense RNA 1 ncRNA 147.333-322 chr8 127861342 127861745 + 0.666667 NA intron (NR_003367, intron 1 of 8) intron (NR_003367, intron 1 of 8) 65581 NR_031609 100302185 NR_031609 ENSG00000283710 MIR1204 hsa-mir-1204 microRNA 1204 ncRNA 134-47 chr2 6600378 6600718 + 0.666667 NA Intergenic L1M3|LINE|L1 33239 NR_110500 102800315 Hs.729713 NR_110498 ENSG00000236172 LINC01246 - long intergenic non-protein coding RNA 1246 ncRNA 132-85 chr3 115238998 115239282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91852 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 158.667-345 chr9 34028757 34029148 + 0.666667 NA intron (NM_001370059, intron 1 of 28) AluJr|SINE|Alu 19935 NM_001370067 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 198.333-37 chr12 2075455 2075886 + 0.666667 NA intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 intron (NM_199460, intron 1 of 49).2 22385 NM_199460 775 Hs.118262 NM_000719 ENSG00000151067 CACNA1C CACH2|CACN2|CACNL1A1|CCHL1A1|CaV1.2|LQT8|TS|TS. LQT8 calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C protein-coding 146.333-363 chrX 86735872 86736157 + 0.666667 NA intron (NM_001139515, intron 6 of 11) intron (NM_001139515, intron 6 of 11) 473046 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 122.333-226 chrX 97933058 97933376 + 0.666667 NA Intergenic Eulor8|DNA|TcMar? -368682 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 173.667-146 chr5 135912371 135912810 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -16749 NM_000590 3578 Hs.960 NM_000590 ENSG00000145839 IL9 HP40|IL-9|P40 interleukin 9 protein-coding 124.333-89 chr2 116505917 116506238 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 1162262 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 178-65 chr2 104643864 104644236 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113669 NR_038231 284998 Hs.410180 NR_038231 ENSG00000234177 LINC01114 PANCAT long intergenic non-protein coding RNA 1114 ncRNA 153.667-207 chr2 191715933 191716266 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 25918 NR_131917 105747689 Hs.104972 NR_131917 LOC105747689 - uncharacterized LOC105747689 ncRNA 142.333-132 chr2 185850359 185850636 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -50346 NR_144454 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 123-138 chrX 85845158 85845491 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 9544 NR_031710 100302171 NR_031710 ENSG00000283435 MIR1321 MIRN1321|hsa-mir-1321 microRNA 1321 ncRNA 117.667-116 chr3 50083366 50083631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5421 NR_036627 10181 Hs.439480 NM_005778 ENSG00000003756 RBM5 G15|H37|LUCA-15|LUCA15|RMB5 RNA binding motif protein 5 protein-coding 182.333-72 chr19 55748241 55748632 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10034 NM_176820 338321 Hs.661568 NM_176820 ENSG00000185792 NLRP9 CLR19.1|NALP9|NOD6|PAN12 NLR family pyrin domain containing 9 protein-coding 121.333-170 chr7 53250995 53251195 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 215462 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 149-134 chr7 48235422 48235849 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 8 of 61) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 64177 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 159.333-258 chr5 19286744 19287100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 599350 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 135-56 chr20 37555584 37555968 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -27845 NM_001167820 10904 Hs.472651 NM_006698 ENSG00000166619 BLCAP BC10 BLCAP apoptosis inducing factor protein-coding 132.333-161 chr7 27598777 27599061 + 0.666667 NA intron (NM_152740, intron 4 of 7) intron (NM_152740, intron 4 of 7) -17055 NR_122122 790953 Hs.571330 NR_122122 TSL - testis-expressed, seven-twelve, leukemia ncRNA 130.333-187 chr7 19443309 19443549 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 262007 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 126.667-45 chr13 93211888 93212237 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -14745 NM_005708 10082 Hs.444329 NM_005708 ENSG00000183098 GPC6 OMIMD1 glypican 6 protein-coding 114.667-33 chr10 54831989 54832182 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 4 of 34) intron (NM_001354404, intron 4 of 34) -30794 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 132.667-187 chr8 132279492 132279785 + 0.666667 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 167624 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 134.667-60 chr14 61775439 61775811 + 0.666667 NA intron (NM_003082, intron 4 of 9) intron (NM_003082, intron 4 of 9) 13205 NM_003082 6617 Hs.179312 NM_003082 ENSG00000023608 SNAPC1 PTFgamma|SNAP43 small nuclear RNA activating complex polypeptide 1 protein-coding 234-6 chr10 20747068 20747592 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 150272 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 172-91 chr5 108964180 108964652 + 0.666667 NA intron (NR_146155, intron 13 of 19) MamRep1894|DNA|hAT 39810 NM_001308031 2241 Hs.107418 NM_005246 ENSG00000151422 FER PPP1R74|TYK3|p94-Fer FER tyrosine kinase protein-coding 114.333-144 chr3 89922775 89923101 + 0.666667 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 815317 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 210.666-25 chr12 46661891 46662483 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 163810 NM_018018 55089 Hs.446077 NM_018018 ENSG00000139209 SLC38A4 ATA3|NAT3|PAAT|SNAT4 solute carrier family 38 member 4 protein-coding 342-23 chr20 20654253 20654916 + 0.666667 NA intron (NM_020343, intron 3 of 39) L1MA7|LINE|L1 58060 NM_020343 57186 Hs.472285 NM_020343 ENSG00000188559 RALGAPA2 AS250|C20orf74|bA287B20.1|dJ1049G11|dJ1049G11.4|p220 Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 2 protein-coding 112.333-157 chr22 43260345 43260548 + 0.666667 NA intron (NM_173050, intron 5 of 21) intron (NM_173050, intron 5 of 21) -15496 NR_134582 101927447 Hs.621227 NR_134582 ENSG00000203527 LOC101927447 - uncharacterized LOC101927447 ncRNA 144.667-148 chr2 121768165 121768453 + 0.666667 NA TTS (NR_048556) TTS (NR_048556) 12658 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 133.667-105 chr3 179031473 179031769 + 0.666667 NA intron (NM_152240, intron 3 of 6) intron (NM_152240, intron 3 of 6) 40188 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 114-21 chr12 1785015 1785347 + 0.666667 NA intron (NM_024551, intron 7 of 7).2 intron (NM_024551, intron 7 of 7).2 -35086 NM_001163925 654429 Hs.585579 NM_001039029 ENSG00000166159 LRTM2 - leucine rich repeats and transmembrane domains 2 protein-coding 151.667-177 chr2 182322879 182323278 + 0.666667 NA intron (NM_005019, intron 1 of 14) intron (NM_005019, intron 1 of 14) -81015 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 127.333-161 chr6 129391380 129391659 + 0.666667 NA exon (NM_001079823, exon 36 of 64) exon (NM_001079823, exon 36 of 64) 318658 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 116.333-2 chr1 22308430 22308763 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 42357 NR_039613 100616433 NR_039613 ENSG00000266564 MIR4418 - microRNA 4418 ncRNA 177.667-78 chr2 172422010 172422436 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -5113 NM_001316306 3655 Hs.133397 NM_000210 ENSG00000091409 ITGA6 CD49f|ITGA6B|VLA-6 integrin subunit alpha 6 protein-coding 170-100 chr5 151077123 151077553 + 0.666667 NA intron (NM_001252390, intron 1 of 17) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 3696 NM_006058 10318 Hs.355141 NM_006058 ENSG00000145901 TNIP1 ABIN-1|NAF1|VAN|nip40-1 TNFAIP3 interacting protein 1 protein-coding 164-64 chr2 154983667 154984103 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 285190 NM_002239 3760 Hs.591606 NM_002239 ENSG00000162989 KCNJ3 GIRK1|KGA|KIR3.1 potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 protein-coding 144.667-119 chr18 59188196 59188467 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -31827 NM_001012513 2922 Hs.153444 NM_002091 ENSG00000134443 GRP BN|GRP-10|preproGRP|proGRP gastrin releasing peptide protein-coding 210.333-2 chr1 28092631 28093082 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -4219 NR_104214 2140 Hs.185774 NM_001990 ENSG00000158161 EYA3 - EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 protein-coding 226-60 chr3 119446123 119446703 + 0.666667 NA intron (NM_018266, intron 5 of 8) MER44C|DNA|TcMar-Tigger 17202 NM_018266 55254 Hs.594171 NM_018266 ENSG00000176142 TMEM39A - transmembrane protein 39A protein-coding 131-97 chr8 56563913 56564158 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4212 NR_038236 100507632 Hs.583755 NR_038236 ENSG00000246430 LINC00968 - long intergenic non-protein coding RNA 968 ncRNA 118.333-76 chr15 80095858 80096097 + 0.666667 NA intron (NM_001242912, intron 2 of 6) L3|LINE|CR1 -2439 NM_001242919 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 150-50 chr15 80550114 80550415 + 0.666667 NA intron (NM_014862, intron 8 of 18) L1MC4a|LINE|L1 12680 NR_120363 101929586 Hs.569426 NR_120363 ENSG00000259175 LOC101929586 - uncharacterized LOC101929586 ncRNA 129.333-205 chrX 123639466 123639690 + 0.666667 NA intron (NM_001081550, intron 16 of 38) L1P4|LINE|L1 93474 NM_001081550 57187 Hs.149991 NM_020449 ENSG00000125676 THOC2 CXorf3|MRX12|MRX35|THO2|dJ506G2.1|hTREX120 THO complex 2 protein-coding 182.333-101 chr22 24935507 24935883 + 0.666667 NA intron (NM_001001663, intron 3 of 3) intron (NM_001001663, intron 3 of 3) 11000 NM_001001663 255349 Hs.329040 NM_001001663 ENSG00000206069 TMEM211 bA9F11.1 transmembrane protein 211 protein-coding 230.333-28 chr12 60693323 60693792 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 1004187 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 134-42 chr18 2069813 2070115 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 501541 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 155.667-152 chr2 24737310 24737685 + 0.666667 NA intron (NM_001362950, intron 17 of 23) intron (NM_001362950, intron 17 of 23) -55618 NM_024322 79172 Hs.731569 NM_024322 ENSG00000138092 CENPO CENP-O|ICEN-36|MCM21R centromere protein O protein-coding 258.667-79 chr5 114971081 114971749 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -198002 NR_130785 101927078 Hs.160027 NR_130785 LOC101927078 - uncharacterized LOC101927078 ncRNA 159.333-250 chr5 8815511 8815840 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR -24057 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 208-108 chr3 113652652 113653095 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001009899, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_001009899, exon 7 of 7) 43769 NM_001009899 205717 Hs.632570 NM_001009899 ENSG00000176542 USF3 KIAA2018 upstream transcription factor family member 3 protein-coding 218.333-8 chr1 163892568 163893100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -469643 NR_104294 100422212 Hs.556898 NR_104294 LOC100422212 - eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J pseudogene pseudo 114.333-217 chr8 54518367 54518667 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60582 NM_022454 64321 Hs.98367 NM_022454 ENSG00000164736 SOX17 VUR3 SRY-box transcription factor 17 protein-coding 141.667-124 chr2 165260487 165260800 + 0.666667 NA intron (NM_001040143, intron 2 of 27) MER2|DNA|TcMar-Tigger 19583 NM_001371247 129.333-195 chr8 137375007 137375273 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 38448 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 159.333-203 chr22 49040189 49040487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 173568 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 138.333-95 chr2 145404254 145404481 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 736400 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 128-96 chr5 153053347 153053652 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -81150 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 151.333-441 chr9 79475377 79475705 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -96232 NM_001282753 7091 Hs.444213 NM_007005 ENSG00000106829 TLE4 BCE-1|BCE1|E(spI)|E(spl)|ESG|ESG4|GRG4|Grg-4 TLE family member 4, transcriptional corepressor protein-coding 144-130 chr5 60183533 60183914 + 0.666667 NA intron (NM_001349243, intron 2 of 16) intron (NM_001349243, intron 2 of 16) 188940 NM_001364600 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 155-122 chr7 149002727 149003128 + 0.666667 NA TTS (NR_163906) TTS (NR_163906) 15400 NR_130107 102723099 Hs.621982 NR_130107 ENSG00000281189 GHET1 lncRNA-GHET1 gastric carcinoma proliferation enhancing transcript 1 ncRNA 149.333-287 chr4 93772532 93772817 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001510, exon 16 of 16) 3' UTR (NM_001510, exon 16 of 16) -56079 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 165.333-201 chr5 22532427 22532804 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) -318765 NM_001364108 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 139.667-45 chr12 106072253 106072497 + 0.666667 NA intron (NM_014840, intron 5 of 6) L1ME4a|LINE|L1 67658 NM_014840 9891 Hs.524692 NM_014840 ENSG00000074590 NUAK1 ARK5 NUAK family kinase 1 protein-coding 155-10 chr10 11150209 11150513 + 0.666667 NA intron (NM_001326334, intron 2 of 13) intron (NM_001326334, intron 2 of 13) -14520 NM_001326346 10659 Hs.309288 NM_006561 ENSG00000048740 CELF2 BRUNOL3|CELF-2|CUG-BP2|CUGBP2|ETR-3|ETR3|NAPOR CUGBP Elav-like family member 2 protein-coding 150.333-205 chr2 120682998 120683363 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52688 NM_001371271 205-59 chr3 23006960 23007458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 195369 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 144.667-10 chr1 100095735 100096003 + 0.666667 NA intron (NM_001304829, intron 13 of 15) L1ME1|LINE|L1 37061 NM_001304829 163786 Hs.591447 NM_194292 ENSG00000156876 SASS6 MCPH14|SAS-6|SAS6 SAS-6 centriolar assembly protein protein-coding 210.667-43 chr14 65192828 65193290 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 29288 NR_103769 100128233 Hs.497323 NR_103769 ENSG00000255002 LINC02324 - long intergenic non-protein coding RNA 2324 ncRNA 112-25 chr11 23853877 23854105 + 0.666667 NA Intergenic PrimLTR79|LTR|ERV1 -434801 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 192.333-143 chr5 173584070 173584490 + 0.666667 NA non-coding (NR_027108, exon 4 of 4) non-coding (NR_027108, exon 4 of 4) 4646 NR_027109 285593 Hs.409730 NR_027108 ENSG00000253955 LOC285593 - uncharacterized LOC285593 ncRNA 164.333-89 chr17 16327336 16327726 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 25938 NM_181716 201161 Hs.433422 NM_181716 ENSG00000166582 CENPV 3110013H01Rik|CENP-V|PRR6|p30 centromere protein V protein-coding 156.333-343 chr7 105017604 105017909 + 0.666667 NA intron (NM_182931, intron 1 of 26) intron (NM_182931, intron 1 of 26) 3551 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 162.333-221 chr6 75634152 75634431 + 0.666667 NA intron (NM_001100409, intron 4 of 22) MIR1_Amn|SINE|MIR 32411 NM_015571 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 160.333-96 chr14 50603666 50604118 + 0.666667 NA intron (NM_015915, intron 6 of 13) intron (NM_015915, intron 6 of 13) 43867 NM_181598 51062 Hs.584905 NM_015915 ENSG00000198513 ATL1 AD-FSP|FSP1|GBP3|HSN1D|SPG3|SPG3A|atlastin1 atlastin GTPase 1 protein-coding 139-24 chr12 13426183 13426499 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49596 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 132.333-23 chr10 86918164 86918440 + 0.666667 NA intron (NM_004329, intron 9 of 12) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -37457 NM_001330120 6623 Hs.349470 NM_003087 ENSG00000173267 SNCG BCSG1|SR synuclein gamma protein-coding 140.333-180 chr5 59890839 59891234 + 0.666667 NA intron (NM_001165899, intron 3 of 16) intron (NM_001165899, intron 3 of 16) 2690 NM_001104631 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 137.667-106 chr2 215539503 215539807 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 85948 NR_110607 102724849 Hs.116161 NR_110607 ENSG00000225166 LOC102724849 - uncharacterized LOC102724849 ncRNA 156.667-211 chr20 56316843 56317287 + 0.666667 NA Intergenic L1PBa1|LINE|L1 -41909 NM_080821 116151 Hs.143736 NM_080821 ENSG00000124098 FAM210B 5A3|C20orf108|dJ1167H4.1 family with sequence similarity 210 member B protein-coding 120-20 chr11 21802505 21802795 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -390435 NM_001142649 203859 Hs.154329 NM_213599 ENSG00000171714 ANO5 GDD1|LGMD2L|LGMDR12|TMEM16E anoctamin 5 protein-coding 126-40 chr16 73463666 73463985 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 77020 NR_038234 100506172 Hs.434230 NR_038234 ENSG00000258779 LINC01568 - long intergenic non-protein coding RNA 1568 ncRNA 208.333-23 chr12 4403381 4403828 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23892 NM_020638 8074 Hs.287370 NM_020638 ENSG00000118972 FGF23 ADHR|FGFN|HFTC2|HPDR2|HYPF|PHPTC fibroblast growth factor 23 protein-coding 166.667-57 chr13 64381276 64381633 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -305443 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 166.667-6 chr1 64954710 64955105 + 0.666667 NA intron (NM_001321852, intron 1 of 24) intron (NM_001321852, intron 1 of 24) 11642 NM_001321857 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 114.667-160 chr21 28280576 28280906 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17b|DNA|TcMar-Tigger -52074 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 182.333-111 chr4 30377632 30377935 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -342586 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 213.333-128 chr3 65191967 65192462 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -504214 NM_182920 56999 Hs.656071 NM_182920 ENSG00000163638 ADAMTS9 - ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 protein-coding 121.333-138 chr4 143891847 143892082 + 0.666667 NA intron (NM_198682, intron 1 of 3) L1PA3|LINE|L1 13595 NM_198682 2996 Hs.654368 NM_002102 ENSG00000197465 GYPE GPE|GYPA|MNS|MiIX glycophorin E (MNS blood group) protein-coding 155.667-94 chr14 56977233 56977603 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 164260 NR_029385 100309464 Hs.637962 NR_029385 ENSG00000248550 OTX2-AS1 OTX2OS1 OTX2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 134.667-158 chr5 57320570 57320805 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 106613 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 153.667-297 chr4 88501020 88501413 + 0.666667 NA intron (NM_016323, intron 20 of 22) L2a|LINE|L2 22560 NM_032906 100996939 Hs.26136 NM_032906 ENSG00000145337 PYURF PREY PIGY upstream reading frame protein-coding 127.667-170 chr7 114068159 114068414 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 -18041 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 136.333-203 chr8 76273848 76274123 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -132669 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 204.333-57 chr14 78716688 78716994 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 8 of 20) intron (NR_073547, intron 8 of 20) 313122 NM_004796 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 154.667-86 chr12 104055778 104056092 + 0.666667 NA intron (NM_031302, intron 1 of 11) intron (NM_031302, intron 1 of 11) 8242 NM_001316967 83468 Hs.631650 NM_031302 ENSG00000120820 GLT8D2 - glycosyltransferase 8 domain containing 2 protein-coding 196.667-81 chr2 191798001 191798310 + 0.666667 NA intron (NR_157850, intron 2 of 4) intron (NR_157850, intron 2 of 4) 5315 NR_157850 729254 NR_157850 LOC729254 - hCG2045843 ncRNA 133.333-91 chr20 8093524 8093788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38610 NM_015192 23236 Hs.431173 NM_015192 ENSG00000182621 PLCB1 EIEE12|PI-PLC|PLC-154|PLC-I|PLC-beta-1|PLC154|PLCB1A|PLCB1B phospholipase C beta 1 protein-coding 193.333-153 chr5 122507496 122507944 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -28633 NR_051996 153163 Hs.679757 NR_051996 ENSG00000250328 MGC32805 - uncharacterized LOC153163 ncRNA 119-115 chr4 155811744 155811934 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 52818 NM_001291952 2983 Hs.77890 NM_000857 ENSG00000061918 GUCY1B1 GC-S-beta-1|GC-SB3|GUC1B3|GUCB3|GUCSB3|GUCY1B3 guanylate cyclase 1 soluble subunit beta 1 protein-coding 148.333-8 chr1 62206952 62207389 + 0.666667 NA exon (NM_001164835, exon 4 of 5) exon (NM_001164835, exon 4 of 5) 12321 NM_019079 54596 Hs.685462 NM_019079 ENSG00000240563 L1TD1 ECAT11 LINE1 type transposase domain containing 1 protein-coding 137.667-13 chr1 190473940 190474296 + 0.666667 NA intron (NM_199051, intron 1 of 7) intron (NM_199051, intron 1 of 7) 1892 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 118.667-83 chr17 28828191 28828470 + 0.666667 NA intron (NM_001288635, intron 1 of 3) AluJb|SINE|Alu 14460 NM_001288640 55731 Hs.564533 NM_018182 ENSG00000173065 FAM222B C17orf63 family with sequence similarity 222 member B protein-coding 158.333-247 chr4 152476285 152476665 + 0.666667 NA intron (NM_001349798, intron 2 of 13) L1MD|LINE|L1 12941 NR_036092 100422896 NR_036092 ENSG00000264678 MIR3140 mir-3140 microRNA 3140 ncRNA 162.333-270 chr9 33968699 33969139 + 0.666667 NA intron (NR_163243, intron 5 of 24) L1MB7|LINE|L1 -16065 NR_003685 100113379 NR_003685 ENSG00000238886 SNORD121A - small nucleolar RNA, C/D box 121A snoRNA 176.667-95 chr3 2946756 2947099 + 0.666667 NA intron (NM_175607, intron 13 of 24) AluJo|SINE|Alu 54712 NM_175613 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 133.333-89 chr2 186565895 186566141 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -24038 NM_002210 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 192-73 chr2 103123261 103123663 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -139033 NR_135530 105373519 NR_135530 ENSG00000224095 LINC01935 - long intergenic non-protein coding RNA 1935 ncRNA 141.667-118 chr2 66948001 66948291 + 0.666667 NA intron (NR_110169, intron 4 of 4) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -25656 NR_110600 102724321 Hs.146803 NR_110600 ENSG00000232688 LINC01628 - long intergenic non-protein coding RNA 1628 ncRNA 166.333-35 chr10 99084675 99085076 + 0.666667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 151000 NM_001166246 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 212-5 chr1 41193412 41193873 + 0.666667 NA intron (NM_001172218, intron 1 of 15) L2c|LINE|L2 -30625 NM_001172221 22955 Hs.571874 NM_012236 ENSG00000010803 SCMH1 Scml3 Scm polycomb group protein homolog 1 protein-coding 118.667-64 chr13 103619940 103620171 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 194855 NR_126374 104326190 Hs.334381 NR_126374 ENSG00000234551 LINC01309 TCONS_l2_00007459 long intergenic non-protein coding RNA 1309 ncRNA 179.667-11 chr1 194775272 194775658 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 1313250 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 125-42 chr16 2522602 2522972 + 0.666667 NA intron (NM_001145815, intron 3 of 10) AluJo|SINE|Alu 2416 NM_015944 51005 Hs.740430 NM_015944 ENSG00000162066 AMDHD2 CGI-14 amidohydrolase domain containing 2 protein-coding 186.667-33 chr13 45967254 45967673 + 0.666667 NA intron (NM_001330564, intron 15 of 18) intron (NM_001330564, intron 15 of 18) 85283 NM_001076788 23091 Hs.136102 NM_015070 ENSG00000123200 ZC3H13 KIAA0853|Xio zinc finger CCCH-type containing 13 protein-coding 248-33 chr18 21721224 21721681 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -16678 NM_138340 171586 Hs.397978 NM_138340 ENSG00000158201 ABHD3 LABH3 abhydrolase domain containing 3 protein-coding 132.333-63 chr16 35671345 35671583 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -75088 NR_033985 400533 Hs.499135 NR_033985 ENSG00000261122 LINC02167 - long intergenic non-protein coding RNA 2167 ncRNA 116-101 chr22 46944998 46945203 + 0.666667 NA intron (NR_104292, intron 10 of 13) intron (NR_104292, intron 10 of 13) -29058 NR_122047 642757 Hs.632786 NR_122047 ENSG00000280080 TBC1D22A-AS1 - TBC1D22A antisense RNA 1 ncRNA 163.667-229 chr7 28141115 28141463 + 0.666667 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -39168 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 143-50 chr16 18832035 18832404 + 0.666667 NA intron (NM_015092, intron 51 of 62) intron (NM_015092, intron 51 of 62) -30670 NM_015161 23204 Hs.634882 NM_015161 ENSG00000170540 ARL6IP1 AIP1|ARL6IP|ARMER|SPG61 ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 1 protein-coding 160-90 chr4 114349162 114349481 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -249081 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 165.667-131 chr3 179350468 179350771 + 0.666667 NA intron (NM_033540, intron 2 of 17) intron (NM_033540, intron 2 of 17) 2910 NM_033540 55669 Hs.478383 NM_017927 ENSG00000171109 MFN1 hfzo1|hfzo2 mitofusin 1 protein-coding 147.333-217 chr3 99554633 99555049 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -83753 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 140.667-84 chr15 47196623 47196963 + 0.666667 NA intron (NM_001198999, intron 1 of 19) intron (NM_001198999, intron 1 of 19) 12704 NM_001198999 80031 Hs.511265 NM_020858 ENSG00000137872 SEMA6D - semaphorin 6D protein-coding 150-110 chr4 185660316 185660684 + 0.666667 NA intron (NM_001145672, intron 5 of 20) intron (NM_001145672, intron 5 of 20) -3531 NM_001145674 8470 Hs.481342 NM_003603 ENSG00000154556 SORBS2 ARGBP2|PRO0618 sorbin and SH3 domain containing 2 protein-coding 133-76 chr5 68237364 68237592 + 0.666667 NA intron (NM_181523, intron 2 of 15) intron (NM_181523, intron 2 of 15) 21722 NM_181523 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 117-64 chr17 79935511 79935850 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_019020, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_019020, exon 12 of 12) -8955 NR_110850 101928766 Hs.630666 NR_110850 ENSG00000262585 LINC01979 - long intergenic non-protein coding RNA 1979 ncRNA 162-101 chr5 100946397 100946675 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -43254 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 140-13 chr1 192223629 192223898 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 65301 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 174.333-30 chr12 77884301 77884682 + 0.666667 NA intron (NM_001024383, intron 1 of 39) MLT2B3|LTR|ERVL 53597 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 136.333-74 chr16 59065204 59065503 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -331037 NM_001286220 2806 Hs.599470 NM_002080 ENSG00000125166 GOT2 KAT4|KATIV|KYAT4|mitAAT glutamic-oxaloacetic transaminase 2 protein-coding 171.667-93 chr2 221953199 221953563 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -344766 NR_161172 151278 Hs.350729 NM_153038 ENSG00000163081 CCDC140 - coiled-coil domain containing 140 ncRNA 120.667-10 chr1 168602703 168603030 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 26261 NM_002995 6375 Hs.546295 NM_002995 ENSG00000143184 XCL1 ATAC|LPTN|LTN|SCM-1|SCM-1a|SCM1|SCM1A|SCYC1 X-C motif chemokine ligand 1 protein-coding 158-10 chr10 26194017 26194488 + 0.666667 NA intron (NM_017433, intron 32 of 34) L2a|LINE|L2 -22055 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 147-82 chr20 15978759 15979089 + 0.666667 NA intron (NM_001351664, intron 10 of 14) intron (NM_001351664, intron 10 of 14) 6958 NR_130924 613266 Hs.309149 NR_130924 LOC613266 - uncharacterized LOC613266 ncRNA 188.333-141 chr7 46681306 46681716 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 15611 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 133.333-24 chr10 53922398 53922765 + 0.666667 NA intron (NM_001354411, intron 26 of 34) intron (NM_001354411, intron 26 of 34) -563649 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 156.667-298 chr6 61258789 61259249 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -315111 NM_001190706 100463487 NM_001190706 MTRNR2L9 HN9 MT-RNR2 like 9 protein-coding 243-65 chr7 99526390 99526881 + 0.666667 NA intron (NM_145102, intron 6 of 6) AluSx|SINE|Alu 20630 NM_001318084 23660 Hs.110839 NM_014569 ENSG00000196652 ZKSCAN5 ZFP-95|ZFP95|ZNF914|ZSCAN37 zinc finger with KRAB and SCAN domains 5 protein-coding 114.667-75 chr14 30254537 30254879 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -304415 NM_001308097 55632 Hs.509008 NM_017769 ENSG00000092140 G2E3 KIAA1333|PHF7B G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 116.667-120 chr22 29099162 29099487 + 0.666667 NA intron (NM_001039570, intron 3 of 8) intron (NM_001039570, intron 3 of 8) 26289 NM_032045 83999 Hs.229335 NM_032045 ENSG00000183762 KREMEN1 ECTD13|KREMEN|KRM1 kringle containing transmembrane protein 1 protein-coding 154.667-334 chr6 39389413 39389700 + 0.666667 NA intron (NM_001289024, intron 2 of 9) MER117|DNA|hAT-Charlie 41834 NM_001289024 221458 Hs.588202 NM_145027 ENSG00000164627 KIF6 C6orf102|dJ1043E3.1|dJ137F1.4|dJ188D3.1 kinesin family member 6 protein-coding 121.333-54 chr14 71382023 71382317 + 0.666667 NA intron (NM_001354285, intron 2 of 24) intron (NM_001354285, intron 2 of 24) -16167 NR_001276 319139 NR_001276 ENSG00000207444 SNORD56B RNU56B small nucleolar RNA, C/D box 56B snoRNA 118-94 chr3 135766788 135767129 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -198770 NM_001190447 5523 Hs.518155 NM_002718 ENSG00000073711 PPP2R3A PPP2R3|PR130|PR72 protein phosphatase 2 regulatory subunit B''alpha protein-coding 117.333-5 chr1 59859954 59860232 + 0.666667 NA intron (NM_015888, intron 14 of 21) intron (NM_015888, intron 14 of 21) 45144 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 133.667-55 chr15 66412126 66412424 + 0.666667 NA intron (NM_002755, intron 1 of 10) intron (NM_002755, intron 1 of 10) 25402 NM_002755 5604 Hs.145442 NM_002755 ENSG00000169032 MAP2K1 CFC3|MAPKK1|MEK1|MKK1|PRKMK1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 protein-coding 113-98 chr2 22841502 22841822 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 305183 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 175.667-7 chr1 154232101 154232530 + 0.666667 NA intron (NM_001127320, intron 4 of 24) AluSc|SINE|Alu 11360 NM_014847 9898 Hs.490551 NM_014847 ENSG00000143569 UBAP2L NICE-4|NICE4 ubiquitin associated protein 2 like protein-coding 143.333-21 chr10 7319347 7319614 + 0.666667 NA intron (NM_001029880, intron 4 of 20) intron (NM_001029880, intron 4 of 20) 89861 NM_001018039 57713 Hs.407983 NM_001018039 ENSG00000198879 SFMBT2 - Scm like with four mbt domains 2 protein-coding 119-21 chr10 91228542 91228860 + 0.666667 NA TTS (NR_046435) TTS (NR_046435) 8038 NM_032373 84333 Hs.500512 NM_032373 ENSG00000180628 PCGF5 RNF159 polycomb group ring finger 5 protein-coding 118.333-168 chr5 112185791 112186117 + 0.666667 NA intron (NM_001347887, intron 17 of 23) intron (NM_001347887, intron 17 of 23) 24469 NR_002922 654322 Hs.689709 NR_002922 ENSG00000238363 SNORA13 ACA13 small nucleolar RNA, H/ACA box 13 snoRNA 144-28 chr11 101443016 101443337 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A2|LTR|ERVL 76729 NR_037485 100500823 NR_037485 ENSG00000263885 MIR3920 - microRNA 3920 ncRNA 151.333-264 chr22 42754448 42754725 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -33285 NM_001318038 53947 Hs.105956 NM_017436 ENSG00000128274 A4GALT A14GALT|A4GALT1|Gb3S|P(k)|P1|P1PK|PK alpha 1,4-galactosyltransferase (P blood group) protein-coding 162-126 chr8 119198869 119199132 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -9363 NM_052886 114569 Hs.201083 NM_052886 ENSG00000147676 MAL2 - mal, T cell differentiation protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 174.667-111 chr3 1853142 1853627 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -245419 NM_001350095 152330 Hs.298705 NM_175607 ENSG00000144619 CNTN4 AXCAM|BIG-2 contactin 4 protein-coding 126.667-87 chr2 174557445 174557822 + 0.666667 NA TTS (NR_104080).8 TTS (NR_104080).8 439 NR_104088 101954278 NR_104088 ENSG00000202337 RNU6-8 U6-8 RNA, U6 small nuclear 8 snRNA 189-70 chr4 121010013 121010486 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 62286 NM_024574 79625 Hs.709520 NM_024574 ENSG00000173376 NDNF C4orf31|NORD neuron derived neurotrophic factor protein-coding 213-81 chr7 39806622 39807073 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73279 NR_026999 349114 Hs.414183 NM_198284 LINC00265 NCRNA00265 long intergenic non-protein coding RNA 265 ncRNA 179.667-129 chr7 119851452 119851920 + 0.666667 NA intron (NR_131960, intron 1 of 4) intron (NR_131960, intron 1 of 4) 55689 NR_131962 105375475 Hs.566654 NR_131960 ENSG00000225546 LINC02476 LVCAT5 long intergenic non-protein coding RNA 2476 ncRNA 129-71 chr2 226867396 226867666 + 0.666667 NA intron (NM_001349069, intron 5 of 8) MIRb|SINE|MIR 31477 NM_032276 84236 Hs.471514 NM_032276 ENSG00000144468 RHBDD1 RHBDL4|RRP4 rhomboid domain containing 1 protein-coding 119.333-183 chr5 154334521 154334853 + 0.666667 NA intron (NM_198321, intron 4 of 11) intron (NM_198321, intron 4 of 11) -12419 NR_031626 100302181 NR_031626 ENSG00000221430 MIR1294 MIRN1294|hsa-mir-1294|mir-1294 microRNA 1294 ncRNA 244.333-93 chr7 4871897 4872418 + 0.666667 NA intron (NM_018059, intron 2 of 14) intron (NM_018059, intron 2 of 14) -10127 NM_020144 56903 Hs.487409 NM_020144 ENSG00000218823 PAPOLB PAPT|TPAP poly(A) polymerase beta protein-coding 132.333-134 chr5 113383041 113383435 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 2 of 18) intron (NM_001085377, intron 2 of 18) 51751 NM_032028 83942 Hs.519507 NM_032028 ENSG00000212122 TSSK1B FKSG81|SPOGA4|STK22D|TSK1|TSSK1 testis specific serine kinase 1B protein-coding 141.333-190 chr5 54418757 54419171 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -36735 NM_006308 8988 Hs.41707 NM_006308 ENSG00000169271 HSPB3 DHMN2C|HMN2C|HSPL27 heat shock protein family B (small) member 3 protein-coding 212-132 chr5 95402537 95403069 + 0.666667 NA intron (NM_152548, intron 3 of 9) intron (NM_152548, intron 3 of 9) 11437 NM_152548 153643 Hs.276287 NM_152548 ENSG00000153347 FAM81B - family with sequence similarity 81 member B protein-coding 116.667-18 chr11 20812106 20812426 + 0.666667 NA intron (NM_001288714, intron 3 of 18) L1MA6|LINE|L1 142680 NM_006157 4745 Hs.657172 NM_006157 ENSG00000165973 NELL1 IDH3GL|NRP1 neural EGFL like 1 protein-coding 214.333-95 chr3 67011793 67012265 + 0.666667 NA TTS (NM_032505) TTS (NM_032505) 13722 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 143.333-280 chr8 25632600 25632885 + 0.666667 NA Intergenic Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 173509 NM_152562 157313 Hs.33366 NM_152562 ENSG00000184661 CDCA2 PPP1R81|Repo-Man cell division cycle associated 2 protein-coding 141.667-257 chrX 69008053 69008360 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 157247 NM_001032396 64219 Hs.522679 NM_022368 ENSG00000181191 PJA1 PRAJA1|RNF70 praja ring finger ubiquitin ligase 1 protein-coding 197.667-58 chr18 54114709 54115263 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107426 NR_002970 677819 Hs.655869 NR_002970 ENSG00000207233 SNORA37 ACA37 small nucleolar RNA, H/ACA box 37 snoRNA 168-85 chr4 102843006 102843361 + 0.666667 NA intron (NR_131185, intron 2 of 2) ERVL-E-int|LTR|ERVL 13869 NR_131185 105377348 Hs.661187 NR_131185 ENSG00000246560 UBE2D3-AS1 - UBE2D3 antisense RNA 1 ncRNA 276-24 chr14 69507637 69508308 + 0.666667 NA intron (NM_001161498, intron 6 of 12) AluJo|SINE|Alu 23244 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 128.667-17 chr1 233772742 233772974 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -131818 NM_173508 148641 Hs.158748 NM_173508 ENSG00000183780 SLC35F3 - solute carrier family 35 member F3 protein-coding 299-3 chr1 182836118 182836851 + 0.666667 NA non-coding (NR_148933, exon 2 of 2) non-coding (NR_148933, exon 2 of 2) -2863 NR_033302 1660 Hs.191518 NM_001357 ENSG00000135829 DHX9 DDX9|LKP|NDH2|NDHII|RHA DExH-box helicase 9 protein-coding 141.333-213 chr6 88808383 88808718 + 0.666667 NA intron (NM_003800, intron 11 of 15) L1MCc|LINE|L1 155068 NM_001286428 8732 Hs.567378 NM_003800 ENSG00000111880 RNGTT CAP1A|HCE|HCE1|hCAP RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase protein-coding 171.667-17 chr10 29708632 29709062 + 0.666667 NA intron (NM_001323599, intron 1 of 38) intron (NM_001323599, intron 1 of 38) 26954 NM_003174 6840 Hs.499209 NM_003174 ENSG00000197321 SVIL - supervillin protein-coding 113.333-102 chr17 67603405 67603646 + 0.666667 NA intron (NM_181671, intron 5 of 9) MIRb|SINE|MIR -114308 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 112.333-254 chr7 136886960 136887207 + 0.666667 NA intron (NM_001006629, intron 1 of 1) L1MA9|LINE|L1 -16084 NR_030165 574443 NR_030165 ENSG00000207597 MIR490 MIRN490|hsa-mir-490|miR-490 microRNA 490 ncRNA 137-39 chr18 8004411 8004657 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 7 of 30) intron (NM_002845, intron 7 of 30) 362500 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 202.333-60 chr14 74209546 74210005 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -29674 NM_182894 338917 Hs.449771 NM_182894 ENSG00000119614 VSX2 CHX10|HOX10|MCOP2|MCOPCB3|RET1 visual system homeobox 2 protein-coding 133.333-181 chr8 79978815 79979106 + 0.666667 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) intron (NM_014018, intron 2 of 2) 51299 NM_014018 28957 Hs.521124 NM_014018 ENSG00000147586 MRPS28 HSPC007|MRP-S28|MRP-S35|MRPS35 mitochondrial ribosomal protein S28 protein-coding 124.667-30 chr10 81508192 81508410 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -366893 NM_001370082 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 111.667-251 chr8 50413153 50413443 + 0.666667 NA intron (NR_135795, intron 4 of 18) (GATA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 249167 NM_001321778 54212 Hs.584914 NM_018967 ENSG00000147481 SNTG1 G1SYN|SYN4 syntrophin gamma 1 protein-coding 123.333-32 chr10 61357676 61357982 + 0.666667 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie -94810 NR_120643 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 130.333-191 chr7 38872555 38872800 + 0.666667 NA intron (NM_014396, intron 2 of 28) intron (NM_014396, intron 2 of 28) 36514 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 123-71 chr22 28101339 28101528 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 8 of 22) AluJb|SINE|Alu -180821 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 148.333-151 chr16 28149519 28149811 + 0.666667 NA intron (NM_001270940, intron 9 of 24) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 62300 NM_015171 23214 Hs.460468 NM_015171 ENSG00000169180 XPO6 EXP6|RANBP20 exportin 6 protein-coding 188.333-91 chr22 24567957 24568492 + 0.666667 NA intron (NM_001278656, intron 3 of 3) intron (NM_001278656, intron 3 of 3) 12225 NM_004175 6634 Hs.356549 NM_004175 ENSG00000100028 SNRPD3 SMD3|Sm-D3 small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide protein-coding 201-4 chr1 64492396 64492915 + 0.666667 NA intron (NM_020925, intron 1 of 26) intron (NM_020925, intron 1 of 26) -13259 NM_001293274 57685 Hs.443891 NM_020925 ENSG00000158966 CACHD1 - cache domain containing 1 protein-coding 162.333-200 chr5 71994137 71994478 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -113168 NM_005909 4131 Hs.335079 NM_005909 ENSG00000131711 MAP1B FUTSCH|MAP5|PPP1R102 microtubule associated protein 1B protein-coding 235-5 chr1 86241782 86242308 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger -85061 NR_146340 255631 Hs.659516 NM_152890 ENSG00000171502 COL24A1 - collagen type XXIV alpha 1 chain protein-coding 182-58 chr2 231323343 231323691 + 0.666667 NA intron (NM_001352759, intron 19 of 19) intron (NM_001352759, intron 19 of 19) -39191 NR_039937 100616317 NR_039937 ENSG00000263641 MIR4777 - microRNA 4777 ncRNA 138.333-64 chr14 62155878 62156282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16107 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 170-84 chr3 178966531 178966956 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 105066 NM_022470 64393 Hs.371609 NM_022470 ENSG00000172667 ZMAT3 PAG608|WIG-1|WIG1 zinc finger matrin-type 3 protein-coding 261-58 chr8 81083914 81084444 + 0.666667 NA intron (NM_018440, intron 1 of 8) L1MDa|LINE|L1 27889 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 184.667-64 chr2 151613036 151613437 + 0.666667 NA intron (NM_001271208, intron 77 of 182) intron (NM_001271208, intron 77 of 182) 121240 NM_004543 4703 Hs.588655 NM_004543 ENSG00000183091 NEB NEB177D|NEM2 nebulin protein-coding 116.333-215 chr8 136711531 136711742 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) MER11A|LTR|ERVK 180838 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 128.667-108 chr21 36765827 36766192 + 0.666667 NA intron (NM_001352515, intron 7 of 10) intron (NM_001352515, intron 7 of 10) 66894 NM_005069 6493 Hs.146186 NM_005069 ENSG00000159263 SIM2 HMC13F06|HMC29C01|SIM|bHLHe15 SIM bHLH transcription factor 2 protein-coding 148-85 chr2 156158391 156158733 + 0.666667 NA intron (NR_110250, intron 1 of 3) intron (NR_110250, intron 1 of 3) 96369 NR_110249 101929378 Hs.171192 NR_110249 ENSG00000226383 LINC01876 - long intergenic non-protein coding RNA 1876 ncRNA 147.667-11 chr1 107144849 107145148 + 0.666667 NA intron (NM_001330665, intron 1 of 6) intron (NM_001330665, intron 1 of 6) -3071 NM_001113228 22854 Hs.133046 NM_014917 ENSG00000162631 NTNG1 Lmnt1 netrin G1 protein-coding 122-79 chr3 133605608 133605861 + 0.666667 NA intron (NM_001363889, intron 27 of 27) L1ME2z|LINE|L1 31300 NM_001134423 55573 Hs.518265 NM_017548 ENSG00000091527 CDV3 H41 CDV3 homolog protein-coding 180.667-77 chr2 236381652 236381972 + 0.666667 NA intron (NR_073043, intron 11 of 19) L1MD|LINE|L1 -117467 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 177.333-117 chr3 194309868 194310245 + 0.666667 NA intron (NR_024480, intron 1 of 2) intron (NR_024480, intron 1 of 2) 2748 NR_024480 100131551 Hs.128066 NR_024480 ENSG00000214145 LINC00887 HEIRCC long intergenic non-protein coding RNA 887 ncRNA 144.667-96 chr15 60456838 60457235 + 0.666667 NA intron (NR_147171, intron 5 of 16) intron (NR_147171, intron 5 of 16) 22106 NM_024611 79664 Hs.200943 NM_024611 ENSG00000128915 ICE2 BRCC1|NARG2 interactor of little elongation complex ELL subunit 2 protein-coding 183.333-61 chr17 13484896 13485291 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 58553 NR_031679 100302287 NR_031679 ENSG00000221698 MIR548H3 MIR548H-3|MIRN548H3|hsa-mir-548h-3 microRNA 548h-3 ncRNA 154.667-166 chr2 40742902 40743266 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -230649 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 158.333-32 chr10 43380701 43381067 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 9240 NM_001184963 53828 Hs.130497 NM_173160 ENSG00000150201 FXYD4 CHIF FXYD domain containing ion transport regulator 4 protein-coding 220-98 chr5 179197020 179197487 + 0.666667 NA intron (NM_014244, intron 4 of 21) intron (NM_014244, intron 4 of 21) 136880 NM_014594 30832 Hs.272328 NM_014594 ENSG00000177932 ZNF354C KID3 zinc finger protein 354C protein-coding 116.333-92 chr17 65986111 65986314 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 17 of 26) L1M6|LINE|L1 -159669 NR_126542 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 132.333-113 chr3 100309380 100309749 + 0.666667 NA intron (NM_001199198, intron 13 of 18) intron (NM_001199198, intron 13 of 18) -25193 NM_020202 56954 Hs.439152 NM_020202 ENSG00000114021 NIT2 HEL-S-8a nitrilase family member 2 protein-coding 129.667-28 chr10 76249251 76249615 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 466672 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 231.666-8 chr14 45681885 45682567 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 33376 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 190.333-49 chr15 57001758 57002172 + 0.666667 NA intron (NM_001322164, intron 3 of 19) intron (NM_001322164, intron 3 of 19) 82520 NM_001322165 6938 Hs.511504 NM_003205 ENSG00000140262 TCF12 CRS3|HEB|HTF4|HsT17266|TCF-12|bHLHb20|p64 transcription factor 12 protein-coding 144.667-181 chr22 38478870 38479122 + 0.666667 NA intron (NM_016657, intron 2 of 3) intron (NM_016657, intron 2 of 3) 10900 NM_006855 11015 Hs.745072 NM_006855 ENSG00000100196 KDELR3 ERD2L3 KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3 protein-coding 119.333-193 chr6 134562634 134562940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22782 NR_125856 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 135-8 chr10 36282019 36282272 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 503843 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 237.333-78 chr3 54260062 54260577 + 0.666667 NA intron (NM_018398, intron 2 of 37) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 137767 NM_018398 55799 Hs.656687 NM_018398 ENSG00000157445 CACNA2D3 HSA272268 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3 protein-coding 183.667-97 chr4 19692145 19692551 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -559557 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 217.667-56 chr3 96691476 96691878 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -122917 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 160.333-209 chr4 55373093 55373516 + 0.666667 NA TTS (NM_024592) TTS (NM_024592) 12276 NR_037969 100506462 Hs.718667 NR_037969 ENSG00000249700 SRD5A3-AS1 - SRD5A3 antisense RNA 1 ncRNA 217.667-3 chr1 108038039 108038612 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73145 NM_006113 10451 Hs.267659 NM_006113 ENSG00000134215 VAV3 - vav guanine nucleotide exchange factor 3 protein-coding 143.333-145 chr2 143272534 143272877 + 0.666667 NA intron (NM_018460, intron 6 of 13) intron (NM_018460, intron 6 of 13) 143286 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 157.667-122 chr17 40683527 40683988 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18580 NM_152349 125113 Hs.6920 NM_152349 ENSG00000213424 KRT222 KA21|KRT222P keratin 222 protein-coding 127.667-142 chr5 79524656 79525012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10700 NM_004272 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 158.333-16 chr1 162566060 162566499 + 0.666667 NA exon (NM_001324114, exon 2 of 10) exon (NM_001324114, exon 2 of 10) 4380 NM_001324114 6675 Hs.492859 NM_003115 ENSG00000117143 UAP1 AGX|AGX1|AGX2|SPAG2 UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 protein-coding 182-117 chr9 37443714 37444148 + 0.666667 NA intron (NM_014872, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 21235 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 118-119 chr7 8271288 8271563 + 0.666667 NA intron (NR_125740, intron 3 of 5) L1MEc|LINE|L1 -8813 NM_004968 3382 Hs.487561 NM_004968 ENSG00000003147 ICA1 ICA69|ICAp69 islet cell autoantigen 1 protein-coding 125.333-45 chr12 26530982 26531210 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 302098 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 166-78 chr3 48532659 48533016 + 0.666667 NA intron (NM_001317135, intron 9 of 13) AluJr|SINE|Alu 17184 NR_106881 102465494 NR_106881 ENSG00000278799 MIR6823 hsa-mir-6823 microRNA 6823 ncRNA 160.333-285 chr8 114170374 114170711 + 0.666667 NA Intergenic MER31-int|LTR|ERV1 -733603 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 116-30 chr12 1028980 1029317 + 0.666667 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) AluSz|SINE|Alu 1400 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 171.667-107 chr22 43261767 43262129 + 0.666667 NA intron (NM_173050, intron 5 of 21) intron (NM_173050, intron 5 of 21) -13994 NR_134582 101927447 Hs.621227 NR_134582 ENSG00000203527 LOC101927447 - uncharacterized LOC101927447 ncRNA 174.667-62 chr15 87480025 87480324 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -96755 NR_026869 145978 Hs.350808 NM_152454 ENSG00000259527 LINC00052 NCRNA00052|TMEM83 long intergenic non-protein coding RNA 52 ncRNA 145-106 chr6 141978664 141979004 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109965 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 139-15 chr10 82365272 82365634 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -132533 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 122.667-191 chr8 82755909 82756139 + 0.666667 NA Intergenic (CT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -156080 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 135.667-109 chr22 25128819 25129109 + 0.666667 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) -16272 NR_038941 100128531 Hs.662126 NR_038941 ENSG00000203280 LOC100128531 - uncharacterized LOC100128531 ncRNA 209-109 chr7 31396033 31396419 + 0.666667 NA Intergenic L1MC|LINE|L1 -55500 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 125.667-87 chr2 13256817 13257015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -249903 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 115.667-79 chr14 77254810 77255058 + 0.666667 NA intron (NM_020431, intron 23 of 23) L1ME4a|LINE|L1 -11284 NR_031661 100302236 NR_031661 ENSG00000221754 MIR1260A MIR1260|MIRN1260|hsa-mir-1260|hsa-mir-1260a|mir-1260a microRNA 1260a ncRNA 152.333-313 chr5 126308382 126308733 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -23382 NR_105039 101927488 Hs.432319 NR_105039 LOC101927488 - uncharacterized LOC101927488 ncRNA 166.667-148 chr3 42041850 42042233 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -45159 NR_146089 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 133.333-28 chr10 85234830 85235093 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -36023 NR_120667 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 131.667-151 chr4 109183663 109183961 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 118846 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 147.667-98 chr14 37079462 37079799 + 0.666667 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) L2c|LINE|L2 -92396 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 139.333-119 chr2 170791817 170792128 + 0.666667 NA intron (NM_001289947, intron 2 of 4) intron (NM_001289947, intron 2 of 4) 8181 NM_001289947 285141 Hs.443729 NM_001289947 ENSG00000204334 ERICH2 - glutamate rich 2 protein-coding 176-53 chr2 234700307 234700650 + 0.666667 NA intron (NR_132376, intron 2 of 2) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 17810 NR_132376 106144537 Hs.580616 NR_132376 ENSG00000280744 LINC01173 - long intergenic non-protein coding RNA 1173 ncRNA 146.667-27 chr1 245237028 245237358 + 0.666667 NA intron (NM_018012, intron 2 of 14) intron (NM_018012, intron 2 of 14) -2676 NR_151721 111216275 Hs.663694 NR_151721 ENSG00000232192 KIF26B-AS1 - KIF26B antisense RNA 1 ncRNA 207.333-34 chr10 76126980 76127572 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 5 of 6) intron (NM_001305581, intron 5 of 6) 344515 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 112.667-144 chr2 239826491 239826727 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 63749 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 135.333-14 chr1 180827266 180827575 + 0.666667 NA intron (NR_137330, intron 9 of 12) intron (NR_137330, intron 9 of 12) -85477 NM_020950 57710 Hs.734816 NM_020950 ENSG00000135835 KIAA1614 - KIAA1614 protein-coding 153.667-110 chr13 77554526 77554907 + 0.666667 NA intron (NM_003843, intron 1 of 31) MIRc|SINE|MIR 19010 NM_003843 8796 Hs.534699 NM_003843 ENSG00000136155 SCEL - sciellin protein-coding 111.667-98 chr16 85989747 85990001 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 71527 NR_106832 102466732 NR_106832 ENSG00000274134 MIR6774 hsa-mir-6774 microRNA 6774 ncRNA 113.333-130 chr2 86371287 86371565 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -33343 NM_001164730 65055 Hs.368884 NM_022912 ENSG00000068615 REEP1 C2orf23|HMN5B|SPG31|Yip2a receptor accessory protein 1 protein-coding 121.667-188 chr7 23397586 23397813 + 0.666667 NA intron (NM_006547, intron 3 of 14) intron (NM_006547, intron 3 of 14) 1253 NR_145734 109616981 NR_145734 ENSG00000212264 SNORD65C - small nucleolar RNA, C/D box 65C snoRNA 135-85 chr5 55893216 55893472 + 0.666667 NA intron (NM_001297572, intron 6 of 10) intron (NM_001297572, intron 6 of 10) 40022 NM_001242639 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 151.667-368 chr8 90839315 90839685 + 0.666667 NA intron (NM_022351, intron 3 of 12) L2b|LINE|L2 47725 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 116-11 chr1 193831158 193831377 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 526522 NR_125789 101929184 Hs.146728 NR_125789 ENSG00000232077 LINC01031 TCONS_00000361 long intergenic non-protein coding RNA 1031 ncRNA 154-145 chr8 123756086 123756362 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -12215 NM_001317918 157769 Hs.459174 NM_144963 ENSG00000176853 FAM91A1 - family with sequence similarity 91 member A1 protein-coding 219.333-11 chr1 165574166 165574541 + 0.666667 NA intron (NR_026744, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu 7802 NR_026744 400794 Hs.374847 NR_026744 ENSG00000237463 LRRC52-AS1 - LRRC52 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-276 chr4 100484754 100485194 + 0.666667 NA intron (NM_001159694, intron 1 of 10) intron (NM_001159694, intron 1 of 10) 33048 NM_016242 51705 Hs.152913 NM_016242 ENSG00000164035 EMCN EMCN2|MUC14 endomucin protein-coding 197-77 chr3 156367803 156368338 + 0.666667 NA intron (NM_172159, intron 1 of 13) intron (NM_172159, intron 1 of 13) 77033 NM_001308222 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 163.667-142 chr21 31308509 31308967 + 0.666667 NA intron (NM_001353686, intron 2 of 27) intron (NM_001353686, intron 2 of 27) 35616 NM_001353686 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 127-46 chr2 63916881 63917218 + 0.666667 NA intron (NM_001005739, intron 15 of 22) intron (NM_001005739, intron 15 of 22) 75169 NM_006759 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 150.333-87 chr12 85950321 85950677 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 76204 NM_006183 4922 Hs.80962 NM_006183 ENSG00000133636 NTS NMN-125|NN|NT|NT/N|NTS1 neurotensin protein-coding 174-59 chr2 219181079 219181467 + 0.666667 NA intron (NM_001321109, intron 6 of 8) intron (NM_001321109, intron 6 of 8) 2564 NM_001321110 79137 Hs.516707 NM_024293 ENSG00000144567 RETREG2 C2orf17|FAM134A|MAG-2 reticulophagy regulator family member 2 protein-coding 118.667-98 chr2 80875545 80875836 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 562311 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 124.667-216 chr9 91200706 91201061 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 81821 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 240-67 chr4 98700415 98700974 + 0.666667 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 41792 NR_148380 105377342 Hs.122081 NR_148380 LOC105377342 - uncharacterized LOC105377342 ncRNA 162.667-242 chr6 72697248 72697583 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) intron (NM_001160132, intron 1 of 13) 66920 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 167-93 chr7 22441307 22441613 + 0.666667 NA intron (NM_001164460, intron 4 of 4) MIR|SINE|MIR 58822 NM_001164460 256227 Hs.729825 NM_207342 ENSG00000105889 STEAP1B - STEAP family member 1B protein-coding 194-5 chr1 225531251 225531661 + 0.666667 NA intron (NM_001008493, intron 3 of 14) intron (NM_001008493, intron 3 of 14) -102601 NM_194442 3930 Hs.435166 NM_002296 ENSG00000143815 LBR C14SR|DHCR14B|LMN2R|PHA|PHASK|TDRD18 lamin B receptor protein-coding 154.333-329 chr7 83536147 83536461 + 0.666667 NA intron (NM_012431, intron 1 of 16) intron (NM_012431, intron 1 of 16) 105127 NM_001178129 9723 Hs.440730 NM_012431 ENSG00000170381 SEMA3E M-SEMAH|M-SemaK|SEMAH|coll-5 semaphorin 3E protein-coding 143-38 chr14 20798258 20798535 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3968 NM_198232 6035 Hs.78224 NM_002933 ENSG00000129538 RNASE1 RAC1|RIB1|RNS1 ribonuclease A family member 1, pancreatic protein-coding 228.667-60 chr4 115234454 115235026 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -121120 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 183-54 chr2 25055145 25055573 + 0.666667 NA intron (NM_001319099, intron 1 of 22) intron (NM_001319099, intron 1 of 22) 12896 NM_001319099 22979 Hs.4892 NM_014971 ENSG00000084710 EFR3B KIAA0953 EFR3 homolog B protein-coding 141.667-52 chr11 85061295 85061556 + 0.666667 NA intron (NM_001351274, intron 5 of 26) intron (NM_001351274, intron 5 of 26) -138004 NM_001300983 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 168.667-135 chr22 29912973 29913308 + 0.666667 NA intron (NM_153051, intron 1 of 18) AluJr|SINE|Alu 29966 NM_021090 8897 Hs.474536 NM_021090 ENSG00000100330 MTMR3 FYVE-DSP1|ZFYVE10 myotubularin related protein 3 protein-coding 136-94 chr6 163509172 163509410 + 0.666667 NA intron (NM_206853, intron 3 of 6) L1ME3Cz|LINE|L1 94573 NM_206854 9444 Hs.510324 NM_006775 ENSG00000112531 QKI Hqk|QK|QK1|QK3|hqkI QKI, KH domain containing RNA binding protein-coding 177.333-49 chr14 44393493 44393876 + 0.666667 NA Intergenic Tigger13a|DNA|TcMar-Tigger 113599 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 179.667-36 chr12 100115674 100116164 + 0.666667 NA intron (NM_001006947, intron 1 of 12) AluSx|SINE|Alu 26955 NM_015054 23074 Hs.572154 NM_015054 ENSG00000111647 UHRF1BP1L SHIP164 UHRF1 binding protein 1 like protein-coding 229.666-17 chr2 108309733 108310375 + 0.666667 NA TTS (NM_176825) TTS (NM_176825) -12184 NR_037191 151234 Hs.447681 NR_037191 ENSG00000237223 SULT1C2P1 SULT1C1P sulfotransferase family 1C member 2 pseudogene 1 pseudo 120.333-197 chr8 133851525 133851736 + 0.666667 NA Intergenic Helitron1Na_Mam|RC|Helitron -34866 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 150-138 chr8 5570870 5571213 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -576127 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 146.333-241 chr4 133714963 133715249 + 0.666667 NA Intergenic Charlie9|DNA|hAT-Charlie 486683 NM_001114734 132430 Hs.49889 NM_001114734 ENSG00000254535 PABPC4L - poly(A) binding protein cytoplasmic 4 like protein-coding 139.667-95 chr2 171058180 171058483 + 0.666667 NA intron (NM_001136555, intron 2 of 18) intron (NM_001136555, intron 2 of 18) 8642 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 204-127 chr3 926772 927093 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -166092 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 254.334-16 chr17 55827794 55828250 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 76917 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 140.333-83 chr17 54943079 54943380 + 0.666667 NA intron (NM_001321176, intron 12 of 16) L1MD2|LINE|L1 25425 NR_135677 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 112.333-194 chr4 127800294 127800486 + 0.666667 NA intron (NM_001317381, intron 5 of 19) AluJr|SINE|Alu 16867 NM_001317382 22824 Hs.135554 NM_014278 ENSG00000164070 HSPA4L APG-1|HSPH3|Osp94 heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like protein-coding 186.667-135 chr7 30688111 30688560 + 0.666667 NA intron (NM_001202481, intron 2 of 13) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -5810 NM_001202483 1395 Hs.546246 NM_001883 ENSG00000106113 CRHR2 CRF-RB|CRF2|CRFR2|HM-CRF corticotropin releasing hormone receptor 2 protein-coding 150.333-360 chr6 64194694 64195077 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 388049 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 143.667-100 chr17 67153173 67153548 + 0.666667 NA intron (NM_001330447, intron 17 of 32) L2|LINE|L2 -91416 NR_136398 101928021 Hs.569824 NR_136398 LOC101928021 - uncharacterized LOC101928021 ncRNA 112-15 chr10 41885929 41886244 + 0.666667 NA Intergenic (ATGGA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 481959 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 113-135 chr3 30082389 30082669 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -148373 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 147-120 chr6 54162485 54162809 + 0.666667 NA intron (NM_001281746, intron 8 of 11) intron (NM_001281746, intron 8 of 11) 51204 NM_001281747 90523 Hs.449276 NM_138569 ENSG00000146147 MLIP C6orf142|CIP muscular LMNA interacting protein protein-coding 157-102 chr5 25620462 25620905 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 429730 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 154.333-126 chr17 71311661 71311974 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -109638 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 158.333-111 chr17 52603850 52604248 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 213527 NR_146898 105371830 NR_146898 ENSG00000263317 LINC01982 - long intergenic non-protein coding RNA 1982 ncRNA 143-17 chr10 58869143 58869405 + 0.666667 NA Intergenic 7SK|RNA|RNA -130244 NR_108046 100507008 Hs.170953 NR_108046 LINC00844 - long intergenic non-protein coding RNA 844 ncRNA 134.333-143 chr5 130000787 130001055 + 0.666667 NA intron (NM_175856, intron 2 of 2) AluSc8|SINE|Alu 96456 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 156-70 chr2 67985514 67985827 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 77334 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 116-149 chr7 108818640 108818884 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65825 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 115-151 chr8 78048115 78048342 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -468112 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 145.667-44 chr11 5040228 5040521 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6152 NM_001001916 119679 Hs.553558 NM_001001916 ENSG00000205495 OR52J3 OR11-32 olfactory receptor family 52 subfamily J member 3 protein-coding 130.333-180 chr6 52608054 52608338 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 30898 NR_103447 401264 Hs.544586 NR_103446 ENSG00000225791 TRAM2-AS1 - TRAM2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 163.333-93 chr14 76730769 76731243 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30462 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 159.333-315 chr7 85773895 85774201 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 352926 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 171.667-37 chr11 104249635 104249935 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -85638 NM_033135 80310 Hs.352298 NM_025208 ENSG00000170962 PDGFD IEGF|MSTP036|SCDGF-B|SCDGFB platelet derived growth factor D protein-coding 160.333-144 chr2 81671528 81671860 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -204748 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 120.667-108 chr20 51231742 51232088 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4a|LINE|L1 -208808 NM_002237 3755 Hs.118695 NM_002237 ENSG00000026559 KCNG1 K13|KCNG|KV6.1|kH2 potassium voltage-gated channel modifier subfamily G member 1 protein-coding 115.667-165 chr4 76141118 76141386 + 0.666667 NA intron (NM_001278603, intron 2 of 10) intron (NM_001278603, intron 2 of 10) 7145 NM_017426 53371 Hs.430435 NM_017426 ENSG00000138750 NUP54 - nucleoporin 54 protein-coding 194.667-56 chr18 44830822 44831295 + 0.666667 NA intron (NM_001130110, intron 2 of 3) intron (NM_001130110, intron 2 of 3) 139108 NR_036203 100422829 NR_036203 ENSG00000265957 MIR4319 - microRNA 4319 ncRNA 146.667-308 chr7 53256197 53256631 + 0.666667 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 220781 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 175-79 chr8 129514617 129515000 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) -30666 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 156-73 chr2 88478630 88478974 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -26109 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 117.333-93 chr19 34931384 34931642 + 0.666667 NA intron (NR_024018, intron 2 of 5) intron (NR_024018, intron 2 of 5) 4610 NR_024018 90075 Hs.657402 NM_194325 ENSG00000168661 ZNF30 KOX28 zinc finger protein 30 protein-coding 190.333-56 chr17 32522265 32522760 + 0.666667 NA intron (NM_015194, intron 21 of 21) intron (NM_015194, intron 21 of 21) 35519 NM_003885 8851 Hs.500015 NM_003885 ENSG00000176749 CDK5R1 CDK5P35|CDK5R|NCK5A|p23|p25|p35|p35nck5a cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 protein-coding 112.667-111 chr2 11128910 11129207 + 0.666667 NA non-coding (NR_040080, exon 2 of 9) non-coding (NR_040080, exon 2 of 9) 3118 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 207-115 chr8 71272885 71273282 + 0.666667 NA intron (NM_001370336, intron 10 of 17) L4_C_Mam|LINE|RTE-X 83623 NM_172058 2138 Hs.444971 NM_000503 ENSG00000104313 EYA1 BOP|BOR|BOS1|OFC1 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 1 protein-coding 166.333-187 chr5 83056316 83056706 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_174909, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_174909, exon 4 of 4) 7826 NR_003139 677765 Hs.693283 NR_003139 ENSG00000238835 SCARNA18 SCARNA18A|U109 small Cajal body-specific RNA 18 ncRNA 246-90 chr6 47768275 47768809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13497 NM_181744 221391 Hs.213717 NM_181744 ENSG00000124818 OPN5 GPR136|GRP136|PGR12|TMEM13 opsin 5 protein-coding 235.333-124 chr8 109452644 109453076 + 0.666667 NA exon (NM_177531, exon 43 of 78) exon (NM_177531, exon 43 of 78) -86840 NM_198120 9166 Hs.409368 NM_004215 ENSG00000147654 EBAG9 EB9|PDAF estrogen receptor binding site associated antigen 9 protein-coding 143.333-259 chr7 25992170 25992544 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -42371 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 198.667-175 chr7 81528911 81529402 + 0.666667 NA intron (NR_136264, intron 3 of 4) intron (NR_136264, intron 3 of 4) 32663 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 161-19 chr13 33313225 33313535 + 0.666667 NA intron (NM_001243476, intron 5 of 17) intron (NM_001243476, intron 5 of 17) 21886 NR_146541 105370154 NR_146541 LINC02344 - long intergenic non-protein coding RNA 2344 ncRNA 116.333-153 chr4 48693732 48694041 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 2 of 63) intron (NM_015030, intron 2 of 63) 86413 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 213-19 chr14 29631983 29632361 + 0.666667 NA intron (NM_001330069, intron 10 of 18) intron (NM_001330069, intron 10 of 18) 294924 NM_001348390 5587 Hs.508999 NM_002742 ENSG00000184304 PRKD1 CHDED|PKC-MU|PKCM|PKD|PRKCM protein kinase D1 protein-coding 140.333-232 chr8 81467634 81467890 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6239 NM_001080526 646480 Hs.653176 NM_001080526 ENSG00000205186 FABP9 PERF|PERF15|T-FABP|TLBP fatty acid binding protein 9 protein-coding 130.667-127 chr2 223395474 223395842 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 206703 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 205.667-33 chr12 32190360 32190831 + 0.666667 NA intron (NR_148725, intron 1 of 9) L1MA9|LINE|L1 83748 NM_001354187 636 Hs.505202 NM_001714 ENSG00000151746 BICD1 BICD|bic-D 1 BICD cargo adaptor 1 protein-coding 153.333-350 chr6 27620949 27621228 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -72947 NR_038294 100507173 Hs.635987 NR_038292 ENSG00000281706 LINC01012 - long intergenic non-protein coding RNA 1012 ncRNA 117.333-210 chr8 117569711 117569912 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49098 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 164-16 chr10 68285714 68286043 + 0.666667 NA intron (NM_001033083, intron 8 of 8) AluJb|SINE|Alu -45815 NM_001322445 3189 Hs.643472 NM_012207 ENSG00000096746 HNRNPH3 2H9|HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 protein-coding 172-71 chr22 49984380 49984851 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 21749 NR_106879 102465493 NR_106879 ENSG00000276753 MIR6821 hsa-mir-6821 microRNA 6821 ncRNA 118-38 chr14 61603886 61604166 + 0.666667 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) MER57E1|LTR|ERV1 -33373 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 172-67 chr20 54178165 54178546 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4369 NM_001128915 1591 Hs.89663 NM_000782 ENSG00000019186 CYP24A1 CP24|CYP24|HCAI|HCINF1|P450-CC24 cytochrome P450 family 24 subfamily A member 1 protein-coding 149-153 chr9 35852834 35853132 + 0.666667 NA intron (NM_001042589, intron 12 of 13) intron (NM_001042589, intron 12 of 13) 17418 NM_001004487 392309 Hs.527480 NM_001004487 ENSG00000168828 OR13J1 OR9-2 olfactory receptor family 13 subfamily J member 1 protein-coding 177.667-50 chr14 76030681 76031023 + 0.666667 NA intron (NR_045664, intron 3 of 7) L1MC5a|LINE|L1 45089 NM_001255995 112752 Hs.532626 NM_052873 ENSG00000119650 IFT43 C14orf179|CED3|RP81|SRTD18 intraflagellar transport 43 protein-coding 214.333-30 chr11 114030625 114031236 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28781 NM_001354750 7704 Hs.591945 NM_006006 ENSG00000109906 ZBTB16 PLZF|ZNF145 zinc finger and BTB domain containing 16 protein-coding 115.333-79 chr15 26328933 26329120 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 213213 NR_038852 503519 Hs.371380 NR_038851 ENSG00000259150 LINC00929 - long intergenic non-protein coding RNA 929 ncRNA 132.667-89 chr2 99238535 99238804 + 0.666667 NA Intergenic LTR46|LTR|ERV1 16438 NM_175735 254773 Hs.436468 NM_175735 ENSG00000185674 LYG2 LYGH|LYSG2 lysozyme g2 protein-coding 213.333-34 chr11 100800449 100800935 + 0.666667 NA intron (NM_152432, intron 3 of 23) intron (NM_152432, intron 3 of 23) -112737 NR_133571 100128386 Hs.635125 NR_133571 ENSG00000248027 LOC100128386 - uncharacterized LOC100128386 ncRNA 253-48 chr4 53451617 53452177 + 0.666667 NA intron (NM_001134938, intron 12 of 14) AluSg4|SINE|Alu -48180 NR_046622 100873939 Hs.662372 NR_046622 ENSG00000250930 LNX1-AS1 - LNX1 antisense RNA 1 ncRNA 214.333-14 chr1 219999401 219999963 + 0.666667 NA intron (NM_004446, intron 17 of 31) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 46823 NM_004446 2058 Hs.497788 NM_004446 ENSG00000136628 EPRS EARS|GLUPRORS|HLD15|PARS|PIG32|QARS|QPRS glutamyl-prolyl-tRNA synthetase protein-coding 194-135 chr7 151345491 151345919 + 0.666667 NA intron (NM_001363529, intron 2 of 14) intron (NM_001363529, intron 2 of 14) 3893 NM_001363529 51667 Hs.647082 NM_016118 ENSG00000013374 NUB1 BS4|NUB1L|NYREN18 negative regulator of ubiquitin like proteins 1 protein-coding 113.667-220 chr8 143449368 143449560 + 0.666667 NA intron (NM_015117, intron 9 of 11) AluSx|SINE|Alu -18732 NM_201589 389692 NM_201589 ENSG00000182759 MAFA INSDM|RIPE3b1|hMafA MAF bZIP transcription factor A protein-coding 163-78 chr6 72786692 72787178 + 0.666667 NA intron (NM_001160132, intron 1 of 13) AluY|SINE|Alu 156440 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 118-103 chr5 67974594 67974813 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 181490 NR_130779 101928858 Hs.334066 NR_130779 ENSG00000249364 LOC101928858 - uncharacterized LOC101928858 ncRNA 150.667-153 chr18 1159105 1159456 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 200349 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 131-52 chr2 84796032 84796309 + 0.666667 NA intron (NM_001370, intron 68 of 76) intron (NM_001370, intron 68 of 76) 84914 NM_001307978 129293 Hs.469134 NM_001080824 ENSG00000186854 TRABD2A C2orf89|TIKI1 TraB domain containing 2A protein-coding 173.667-157 chr6 129728057 129728391 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18047 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 140.333-6 chr1 58790178 58790576 + 0.666667 NA intron (NR_108106, intron 1 of 1) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR 5226 NR_108106 100131060 Hs.680604 NR_034014 ENSG00000234807 LINC01135 - long intergenic non-protein coding RNA 1135 ncRNA 241.666-8 chr2 126614908 126615591 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 -40686 NM_001256584 2995 Hs.59138 NM_002101 ENSG00000136732 GYPC CD236|CD236R|GE|GE:GPC:GPD:GYPD|GPC|GPD|GYPD|PAS-2|PAS-2' glycophorin C (Gerbich blood group) protein-coding 121.667-198 chr8 17820500 17820773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19057 NM_001363061 57509 Hs.7946 NM_020749 ENSG00000129422 MTUS1 ATBP|ATIP|ATIP3|ICIS|MP44|MTSG1 microtubule associated scaffold protein 1 protein-coding 190.667-113 chr6 65968295 65968802 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 180669 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 150-130 chr7 26954951 26955256 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -90513 NM_003930 8935 Hs.200770 NM_003930 ENSG00000005020 SKAP2 PRAP|RA70|SAPS|SCAP2|SKAP-HOM|SKAP55R src kinase associated phosphoprotein 2 protein-coding 117-26 chr10 104435565 104435884 + 0.666667 NA intron (NM_001008723, intron 15 of 17) L2|LINE|L2 44551 NR_120624 101927523 Hs.407539 NR_120624 ENSG00000225768 LINC02620 - long intergenic non-protein coding RNA 2620 ncRNA 135.667-28 chr11 49216300 49216621 + 0.666667 NA Intergenic MER9a1|LTR|ERVK -7858 NM_001193473 2346 Hs.551896 NM_004476 ENSG00000086205 FOLH1 FGCP|FOLH|GCP2|GCPII|NAALAD1|NAALAdase|PSM|PSMA|mGCP folate hydrolase 1 protein-coding 151.667-284 chr5 104535819 104536130 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -563500 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 142-140 chr7 19664303 19664550 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 41010 NR_036101 100422967 NR_036101 ENSG00000265932 MIR3146 mir-3146 microRNA 3146 ncRNA 148.333-415 chr9 105271649 105271977 + 0.666667 NA intron (NM_001330731, intron 1 of 15) AluSx1|SINE|Alu 27162 NM_001286730 23446 Hs.573495 NM_022109 ENSG00000070214 SLC44A1 CD92|CDW92|CHTL1|CTL1 solute carrier family 44 member 1 protein-coding 187.333-112 chr2 198675876 198676299 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -300990 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 156.667-262 chr5 31777155 31777518 + 0.666667 NA intron (NM_178140, intron 1 of 24) LTR12C|LTR|ERV1 138205 NM_178140 23037 Hs.481819 NM_015022 ENSG00000133401 PDZD2 AIPC|PAPIN|PDZK3|PIN1 PDZ domain containing 2 protein-coding 205-46 chr2 13804202 13804683 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 596516 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 166.667-246 chr9 100572862 100573342 + 0.666667 NA intron (NM_001198812, intron 9 of 9) AluJo|SINE|Alu -4977 NM_001018116 347273 Hs.99004 NM_001018116 ENSG00000170681 CAVIN4 MURC|cavin-4 caveolae associated protein 4 protein-coding 140.667-233 chr8 122319289 122319625 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 249187 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 199-80 chr5 40281289 40281701 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 229204 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 215-60 chr4 22141860 22142349 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -193353 NM_147182 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 121.333-183 chr8 124290509 124290737 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -43225 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 137-99 chr7 51922510 51922813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -529405 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 144.667-301 chr8 110784716 110785089 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 242531 NR_125416 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 127.667-88 chr2 123118935 123119163 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -45568 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 145.333-69 chr12 81697659 81698030 + 0.666667 NA intron (NM_003625, intron 3 of 32) intron (NM_003625, intron 3 of 32) 60663 NM_001220476 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 168-32 chr14 103486039 103486404 + 0.666667 NA intron (NM_001128920, intron 14 of 15) AluSx|SINE|Alu 36609 NM_001823 1152 Hs.173724 NM_001823 ENSG00000166165 CKB B-CK|BCK|CKBB|CPK-B|HEL-211|HEL-S-29 creatine kinase B protein-coding 122.333-41 chr12 322601 322929 + 0.666667 NA intron (NM_001042603, intron 16 of 27) intron (NM_001042603, intron 16 of 27) -59892 NM_001190997 6540 Hs.504398 NM_016615 ENSG00000010379 SLC6A13 GAT-2|GAT2|GAT3 solute carrier family 6 member 13 protein-coding 113.333-116 chr2 27485920 27486105 + 0.666667 NA intron (NM_015662, intron 1 of 47) intron (NM_015662, intron 1 of 47) 3731 NM_015662 26160 Hs.127401 NM_015662 ENSG00000138002 IFT172 BBS20|NPHP17|RP71|SLB|SRTD10|osm-1|wim intraflagellar transport 172 protein-coding 175.667-139 chr8 13349779 13350151 + 0.666667 NA intron (NM_024767, intron 4 of 4) intron (NM_024767, intron 4 of 4) -73181 NM_001348083 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 293.667-3 chr1 169653816 169654343 + 0.666667 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 -23955 NM_003005 6403 Hs.73800 NM_003005 ENSG00000174175 SELP CD62|CD62P|GMP140|GRMP|LECAM3|PADGEM|PSEL selectin P protein-coding 135.333-75 chr18 69101122 69101371 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR -299642 NM_152721 220164 Hs.278285 NM_152721 ENSG00000206052 DOK6 DOK5L|HsT3226 docking protein 6 protein-coding 123-129 chr8 133132341 133132613 + 0.666667 NA intron (NM_003235, intron 46 of 47) intron (NM_003235, intron 46 of 47) -29875 NM_001045556 6503 Hs.75367 NM_006748 ENSG00000155926 SLA SLA1|SLAP Src like adaptor protein-coding 118-50 chr16 71230748 71230995 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001198542) promoter-TSS (NM_001198542) -149 NM_001270974 54768 Hs.351914 NM_017558 ENSG00000157423 HYDIN CILD5|HYDIN1|HYDIN2|PPP1R31 HYDIN axonemal central pair apparatus protein protein-coding 125.667-96 chr2 59212706 59212928 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4891 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 141-43 chr2 72488792 72489161 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 16 of 19) L2a|LINE|L2 337057 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 280.667-11 chr10 30853714 30854250 + 0.666667 NA intron (NM_001143766, intron 6 of 7) AluSz|SINE|Alu 130763 NR_134497 105376480 Hs.461867 NR_134497 ENSG00000230720 LINC02644 - long intergenic non-protein coding RNA 2644 ncRNA 169-112 chrX 86471059 86471456 + 0.666667 NA intron (NM_001139515, intron 2 of 11) intron (NM_001139515, intron 2 of 11) 208289 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 149.667-419 chr9 13218564 13218902 + 0.666667 NA intron (NM_003829, intron 8 of 45) intron (NM_003829, intron 8 of 45) 60831 NM_003829 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 117.333-118 chr20 11516547 11516751 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -243266 NR_038972 339593 Hs.434320 NR_038972 LOC339593 - uncharacterized LOC339593 ncRNA 160-44 chr14 69466981 69467325 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17575 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 171.667-60 chr16 8396316 8396734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 193313 NM_001290095 283953 Hs.150849 NM_001146336 ENSG00000232258 TMEM114 - transmembrane protein 114 protein-coding 119-82 chr2 208716885 208717087 + 0.666667 NA intron (NR_136588, intron 3 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 174344 NR_136588 101927960 Hs.159960 NR_136588 LOC101927960 - uncharacterized LOC101927960 ncRNA 157-81 chr21 32878164 32878470 + 0.666667 NA Intergenic (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat -64614 NM_001162496 56245 Hs.517235 NM_019596 ENSG00000205929 C21orf62 B37|C21orf120|PRED81 chromosome 21 open reading frame 62 protein-coding 205.667-59 chr17 51453868 51454295 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 18654 NR_146897 105371828 Hs.640153 NR_146897 LINC02073 - long intergenic non-protein coding RNA 2073 ncRNA 217-54 chr20 2710554 2710974 + 0.666667 NA intron (NM_001110514, intron 7 of 17) L1ME4b|LINE|L1 17886 NM_001110514 57593 Hs.471955 NM_020833 ENSG00000088881 EBF4 COE4|O/E-4 EBF family member 4 protein-coding 143.667-90 chr16 74500862 74501133 + 0.666667 NA intron (NR_027264, intron 4 of 26) intron (NR_027264, intron 4 of 26) -79527 NM_001011880 497190 Hs.454670 NM_001011880 ENSG00000140839 CLEC18B MRCL2 C-type lectin domain family 18 member B protein-coding 163.333-105 chr15 90860077 90860416 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -8342 NM_002569 5045 Hs.513153 NM_002569 ENSG00000140564 FURIN FUR|PACE|PCSK3|SPC1 furin, paired basic amino acid cleaving enzyme protein-coding 127.667-130 chr4 94749875 94750167 + 0.666667 NA intron (NR_121610, intron 2 of 2) intron (NR_121610, intron 2 of 2) 7512 NR_121610 100507012 Hs.128612 NR_121610 BMPR1B-DT BMPR1B-AS1 BMPR1B divergent transcript ncRNA 121.667-71 chr17 60835784 60836107 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 158094 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 187-68 chr5 155539224 155539640 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 525677 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 124-72 chr20 52338328 52338669 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -146513 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 167.667-146 chr4 13736514 13736946 + 0.666667 NA intron (NR_121681, intron 2 of 3) intron (NR_121681, intron 2 of 3) 81551 NR_121681 101929071 Hs.543714 NR_121681 ENSG00000250634 LINC01182 - long intergenic non-protein coding RNA 1182 ncRNA 156.333-16 chr1 98581381 98581731 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 -80165 NM_015976 51375 Hs.197015 NM_015976 ENSG00000162627 SNX7 - sorting nexin 7 protein-coding 117.667-91 chr2 112756161 112756483 + 0.666667 NA exon (NM_152515, exon 4 of 9) exon (NM_152515, exon 4 of 9) 8287 NR_130712 150468 Hs.434250 NM_152515 ENSG00000169607 CKAP2L - cytoskeleton associated protein 2 like protein-coding 149.333-91 chr12 48121913 48122207 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001166688) promoter-TSS (NM_001166688) -587 NM_001166687 5213 Hs.75160 NM_000289 ENSG00000152556 PFKM ATP-PFK|GSD7|PFK-1|PFK-A|PFK1|PFKA|PFKX|PPP1R122 phosphofructokinase, muscle protein-coding 170.667-131 chr5 32109924 32110285 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_178140, exon 25 of 25) 3' UTR (NM_178140, exon 25 of 25) 64215 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 156-78 chr2 230652273 230652677 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 48054 NR_040038 151475 Hs.528154 NR_040038 ENSG00000226125 LINC01907 - long intergenic non-protein coding RNA 1907 ncRNA 141.667-145 chr3 82730041 82730440 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 744098 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 168.333-178 chr6 53137623 53138116 + 0.666667 NA intron (NM_003643, intron 2 of 5) intron (NM_003643, intron 2 of 5) 10972 NM_003643 8521 Hs.23589 NM_003643 ENSG00000137270 GCM1 GCMA|hGCMa glial cells missing transcription factor 1 protein-coding 113.333-253 chr8 58230814 58231068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 41160 NR_105005 101929528 Hs.563551 NR_105005 ENSG00000253281 LOC101929528 - uncharacterized LOC101929528 ncRNA 213.333-19 chr10 22625594 22626089 + 0.666667 NA intron (NM_005028, intron 1 of 9) intron (NM_005028, intron 1 of 9) 88267 NM_001330062 5305 Hs.57079 NM_005028 ENSG00000150867 PIP4K2A PI5P4KA|PIP5K2A|PIP5KII-alpha|PIP5KIIA|PIPK phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha protein-coding 167.333-85 chr14 82925039 82925385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 282580 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 186.333-38 chr12 27757694 27758178 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 13646 NM_001146221 100287284 NM_001146221 ENSG00000205693 MANSC4 - MANSC domain containing 4 protein-coding 150.667-152 chr17 78729306 78729609 + 0.666667 NA intron (NM_004762, intron 1 of 12) L1ME4b|LINE|L1 -5707 NM_001292018 9267 Hs.191215 NM_004762 ENSG00000108669 CYTH1 B2-1|CYTOHESIN-1|D17S811E|PSCD1|SEC7 cytohesin 1 protein-coding 171-76 chr8 123436827 123437240 + 0.666667 NA intron (NM_018024, intron 4 of 5) intron (NM_018024, intron 4 of 5) 20259 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 115-130 chr5 158275168 158275375 + 0.666667 NA Intergenic MLT1M|LTR|ERVL-MaLR 134502 NR_109888 101927697 Hs.483960 NR_109888 ENSG00000276778 LINC02227 - long intergenic non-protein coding RNA 2227 ncRNA 207.333-66 chr12 95849416 95849871 + 0.666667 NA intron (NR_135014, intron 1 of 2) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 9196 NR_135015 105369921 Hs.125549 NR_135014 ENSG00000258343 LOC105369921 - uncharacterized LOC105369921 ncRNA 112.667-126 chr2 74376088 74376305 + 0.666667 NA intron (NM_001190837, intron 4 of 30) intron (NM_001190837, intron 4 of 30) -1461 NM_023019 1639 Hs.516111 NM_004082 ENSG00000204843 DCTN1 DAP-150|DP-150|P135 dynactin subunit 1 protein-coding 134-21 chr12 1260617 1260861 + 0.666667 NA intron (NR_027946, intron 13 of 18) intron (NR_027946, intron 13 of 18) 232991 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 157.333-331 chr8 52552846 52553279 + 0.666667 NA intron (NM_207413, intron 1 of 4) intron (NM_207413, intron 1 of 4) 12368 NM_207413 389658 Hs.527111 NM_207413 ENSG00000196711 ALKAL1 AUGA|AUGB|FAM150A|UNQ9433 ALK and LTK ligand 1 protein-coding 132-28 chr11 134084930 134085173 + 0.666667 NA intron (NM_001205329, intron 1 of 7) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 15979 NM_032801 83700 Hs.150718 NM_032801 ENSG00000166086 JAM3 JAM-2|JAM-3|JAM-C|JAMC junctional adhesion molecule 3 protein-coding 121.333-153 chr5 166510049 166510401 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 416145 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 227.667-21 chr14 59297017 59297524 + 0.666667 NA intron (NM_001270520, intron 3 of 24) MamRep38|DNA|hAT 33829 NM_014992 23002 Hs.19156 NM_014992 ENSG00000100592 DAAM1 - dishevelled associated activator of morphogenesis 1 protein-coding 249.333-44 chr18 1309870 1310450 + 0.666667 NA intron (NR_023926, intron 2 of 5) AluY|SINE|Alu 49469 NR_023926 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 113.333-141 chr2 213256170 213256456 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27896 NR_161186 100130451 Hs.608433 NR_144752 SPAG16-DT - SPAG16 divergent transcript ncRNA 164-79 chr3 194660744 194661071 + 0.666667 NA intron (NM_018385, intron 5 of 13) intron (NM_018385, intron 5 of 13) 11284 NM_018385 55341 Hs.744061 NM_018385 ENSG00000041802 LSG1 - large 60S subunit nuclear export GTPase 1 protein-coding 153-19 chr11 66871758 66872099 + 0.666667 NA intron (NM_022172, intron 2 of 20) intron (NM_022172, intron 2 of 20) 14864 NM_024036 78999 Hs.209979 NM_024036 ENSG00000173621 LRFN4 FIGLER6|SALM3|SALM3. leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 4 protein-coding 138-48 chr17 73732206 73732573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5465 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 163.667-226 chr7 5385341 5385730 + 0.666667 NA intron (NM_001080495, intron 5 of 29) AluSx1|SINE|Alu 38011 NM_001080495 84629 Hs.520638 NM_001013722 ENSG00000182095 TNRC18 CAGL79|TNRC18A trinucleotide repeat containing 18 protein-coding 235-55 chrX 47442765 47443202 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 24686 NM_001324156 7592 Hs.496074 NM_007130 ENSG00000147124 ZNF41 MRX89 zinc finger protein 41 protein-coding 161.333-140 chr2 34045682 34046016 + 0.666667 NA intron (NR_126403, intron 4 of 5) intron (NR_126403, intron 4 of 5) -21377 NR_132381 106144585 Hs.580486 NR_132381 ENSG00000237790 LINC01318 - long intergenic non-protein coding RNA 1318 ncRNA 195.667-120 chr6 72632218 72632682 + 0.666667 NA intron (NR_120503, intron 1 of 3) L1PA16|LINE|L1 1955 NR_120503 100507381 Hs.662412 NR_120503 ENSG00000233844 KCNQ5-IT1 - KCNQ5 intronic transcript 1 ncRNA 129.333-161 chr5 129558652 129558883 + 0.666667 NA intron (NM_133638, intron 7 of 22) L1M5|LINE|L1 -98078 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 118-85 chr22 48509064 48509266 + 0.666667 NA intron (NM_001082967, intron 1 of 3) L1MA5|LINE|L1 19612 NM_001082967 25817 Hs.436854 NM_015381 ENSG00000219438 TAFA5 FAM19A5|QLLK5208|TAFA-5|UNQ5208 TAFA chemokine like family member 5 protein-coding 141.333-220 chr7 26704248 26704611 + 0.666667 NA intron (NM_003930, intron 9 of 12) intron (NM_003930, intron 9 of 12) 66558 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 194.667-73 chr2 140612233 140612621 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 41 of 90) intron (NM_018557, intron 41 of 90) -25742 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 159-64 chr2 125603702 125604064 + 0.666667 NA Intergenic THE1C-int|LTR|ERVL-MaLR 514102 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 144-111 chr3 94423469 94423757 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 360552 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 112.333-41 chr11 88617535 88617786 + 0.666667 NA intron (NM_001143831, intron 3 of 8) L1MD2|LINE|L1 113084 NR_049724 100873989 Hs.616625 NR_049724 ENSG00000255082 GRM5-AS1 - GRM5 antisense RNA 1 ncRNA 294.667-60 chrX 129884185 129884803 + 0.666667 NA Intergenic FAM|SINE|Alu -21627 NM_001166221 10813 Hs.458598 NM_006649 ENSG00000156697 UTP14A NYCO16|SDCCAG16|Utp14|dJ537K23.3 UTP14A small subunit processome component protein-coding 121.333-7 chr1 79683089 79683343 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -676486 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 189.333-153 chr5 33196457 33196877 + 0.666667 NA Intergenic Kanga1a|DNA|TcMar-Tc2 -33068 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 125.333-158 chr6 90534778 90535082 + 0.666667 NA intron (NM_145331, intron 13 of 16) intron (NM_145331, intron 13 of 16) 52142 NM_145332 6885 Hs.594838 NM_003188 ENSG00000135341 MAP3K7 CSCF|FMD2|MEKK7|TAK1|TGF1a mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 protein-coding 144.667-150 chr2 137640984 137641347 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 20 of 27) L2a|LINE|L2 286767 NR_120402 101928273 Hs.560928 NR_120402 LOC101928273 - uncharacterized LOC101928273 ncRNA 153-88 chr22 47827904 47828201 + 0.666667 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) intron (NR_122046, intron 8 of 8) 196378 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 158.333-231 chr4 73655235 73655557 + 0.666667 NA Intergenic MER94|DNA|hAT-Blackjack -34765 NM_201431 166824 Hs.529677 NM_177532 ENSG00000169435 RASSF6 - Ras association domain family member 6 protein-coding 137-110 chr8 136061159 136061442 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -469498 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 115-51 chr13 62255171 62255419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43013 NR_125787 103752583 Hs.578048 NR_125787 LINC01075 - long intergenic non-protein coding RNA 1075 ncRNA 117-56 chr16 78320799 78321141 + 0.666667 NA intron (NM_001291997, intron 4 of 7) intron (NM_001291997, intron 4 of 7) 221316 NR_120436 51741 Hs.461453 NM_016373 ENSG00000186153 WWOX D16S432E|EIEE28|FOR|FRA16D|HHCMA56|PRO0128|SCAR12|SDR41C1|WOX1 WW domain containing oxidoreductase protein-coding 112.333-124 chr2 51829973 51830159 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) intron (NR_135237, intron 6 of 10) -540582 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 228-28 chr14 52204149 52204706 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63271 NM_001281469 5729 Hs.306831 NM_000953 ENSG00000168229 PTGDR AS1|ASRT1|DP|DP1|PTGDR1 prostaglandin D2 receptor protein-coding 131.667-208 chr8 141001964 141002279 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001316342) promoter-TSS (NM_001316342) -42 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 144.333-263 chr8 70184981 70185346 + 0.666667 NA intron (NM_001321711, intron 4 of 21) intron (NM_001321711, intron 4 of 21) -113911 NM_024504 63978 Hs.736037 NM_024504 ENSG00000147596 PRDM14 PFM11 PR/SET domain 14 protein-coding 142.333-271 chrX 147981923 147982338 + 0.666667 NA intron (NM_152578, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 793 NM_152578 158521 Hs.128580 NM_152578 ENSG00000176988 FMR1NB CT37|NY-SAR-35|NYSAR35 FMR1 neighbor protein-coding 175.333-164 chr6 150768861 150769357 + 0.666667 NA intron (NM_001329803, intron 3 of 13) intron (NM_001329803, intron 3 of 13) 48010 NM_001329801 57480 Hs.189781 NM_001029884 ENSG00000120278 PLEKHG1 ARHGEF41 pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G1 protein-coding 118-14 chr11 90897719 90897923 + 0.666667 NA intron (NR_104190, intron 6 of 6) L2a|LINE|L2 -28619 NR_031663 100302228 NR_031663 ENSG00000221586 MIR1261 MIRN1261|hsa-mir-1261 microRNA 1261 ncRNA 117.333-50 chr14 27056261 27056567 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 147772 NR_036193 100423019 NR_036193 ENSG00000265165 MIR4307 - microRNA 4307 ncRNA 199.667-94 chr3 74793306 74793755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -272390 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 192.333-151 chr6 125863064 125863572 + 0.666667 NA intron (NM_181782, intron 3 of 15) intron (NM_181782, intron 3 of 15) -44460 NR_126386 104355145 Hs.590370 NR_126386 ENSG00000232131 NCOA7-AS1 - NCOA7 antisense RNA 1 ncRNA 129-114 chr6 134174164 134174530 + 0.666667 NA intron (NM_001291995, intron 2 of 10) intron (NM_001291995, intron 2 of 10) 519 NM_001291995 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 149.667-6 chr1 32582529 32582824 + 0.666667 NA intron (NR_111980, intron 2 of 3) intron (NR_111980, intron 2 of 3) 43249 NR_111980 653121 Hs.546479 NM_144621 ENSG00000160062 ZBTB8A BOZF1|ZBTB8|ZNF916A zinc finger and BTB domain containing 8A protein-coding 113.333-272 chrX 69472273 69472482 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -32858 NM_015686 27112 Hs.87619 NM_015686 ENSG00000130054 FAM155B CXorf63|TED|TMEM28|bB57D9.1 family with sequence similarity 155 member B protein-coding 147-24 chr11 97525660 97525950 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1017380 NR_135097 105369443 Hs.599377 NR_135097 ENSG00000256684 LINC02737 - long intergenic non-protein coding RNA 2737 ncRNA 146-40 chr16 52054312 52054726 + 0.666667 NA intron (NM_001242473, intron 2 of 5) L1M5|LINE|L1 19416 NM_001242473 388276 Hs.534669 NM_001242473 C16orf97 - chromosome 16 open reading frame 97 protein-coding 113.667-104 chr2 70390817 70391125 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88904 NM_001329755 84908 Hs.516077 NM_032822 ENSG00000035141 FAM136A - family with sequence similarity 136 member A protein-coding 115.667-197 chr7 18161457 18161713 + 0.666667 NA intron (NM_001204144, intron 1 of 12) intron (NM_001204144, intron 1 of 12) -34276 NR_031635 100302140 NR_031635 ENSG00000221393 MIR1302-6 MIRN1302-6|hsa-mir-1302-6 microRNA 1302-6 ncRNA 136.333-208 chr8 89506964 89507336 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 250561 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 243.333-95 chr6 45528778 45529473 + 0.666667 NA intron (NM_001015051, intron 7 of 7) intron (NM_001015051, intron 7 of 7) 106850 NM_001278478 860 Hs.535845 NM_004348 ENSG00000124813 RUNX2 AML3|CBF-alpha-1|CBFA1|CCD|CCD1|CLCD|OSF-2|OSF2|PEA2aA|PEBP2aA RUNX family transcription factor 2 protein-coding 142-82 chr3 33433443 33433851 + 0.666667 NA intron (NM_001128160, intron 1 of 14) AluSg|SINE|Alu 6731 NM_001128160 7342 Hs.729120 NM_014517 ENSG00000153560 UBP1 LBP-1B|LBP-1a|LBP1A|LBP1B upstream binding protein 1 protein-coding 186-44 chr19 919567 920070 + 0.666667 NA intron (NM_032551, intron 3 of 4) CpG-12951 2485 NM_032551 84634 Hs.208229 NM_032551 ENSG00000116014 KISS1R AXOR12|CPPB1|GPR54|HH8|HOT7T175|KISS-1R KISS1 receptor protein-coding 139.333-205 chr7 115822407 115822701 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D2|LTR|ERVL 145759 NM_001244583 22797 Hs.125962 NM_012252 ENSG00000105967 TFEC TCFEC|TFE-C|TFEC-L|TFECL|bHLHe34|hTFEC-L transcription factor EC protein-coding 149-53 chr16 53187524 53187947 + 0.666667 NA intron (NM_001352127, intron 2 of 38) L2|LINE|L2 -20230 NM_001352156 80205 Hs.59159 NM_015287 ENSG00000177200 CHD9 AD013|CHD-9|CReMM|KISH2|PRIC320 chromodomain helicase DNA binding protein 9 protein-coding 143.333-219 chr5 27708108 27708371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 235947 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 120.333-199 chr9 4173006 4173241 + 0.666667 NA intron (NM_001042413, intron 2 of 10) intron (NM_001042413, intron 2 of 10) -20940 NM_152629 169792 Hs.162125 NM_152629 ENSG00000107249 GLIS3 NDH|ZNF515 GLIS family zinc finger 3 protein-coding 154.333-7 chr1 82498509 82498781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -404538 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 125.333-74 chr17 80838139 80838445 + 0.666667 NA intron (NM_020761, intron 10 of 33) intron (NM_020761, intron 10 of 33) -32660 NR_110852 101928855 Hs.670692 NR_110852 ENSG00000262833 LOC101928855 - uncharacterized LOC101928855 ncRNA 193.667-93 chr4 48808317 48808763 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -22503 NM_001079841 54940 Hs.518750 NM_017830 ENSG00000109180 OCIAD1 ASRIJ|OCIA|TPA018 OCIA domain containing 1 protein-coding 162.667-267 chr8 76394372 76394839 + 0.666667 NA Intergenic Charlie4a|DNA|hAT-Charlie -12049 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 124-90 chr5 19197182 19197448 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 688957 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 207.667-5 chr1 118277753 118278211 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -92754 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 155.333-397 chr8 117774064 117774376 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 146693 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 158.667-78 chr12 84445565 84445966 + 0.666667 NA Intergenic L1PA12|LINE|L1 467034 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 204.333-132 chr3 177408520 177408979 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33172 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 206.667-85 chr3 40664779 40665237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 140048 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 166-111 chr7 98382942 98383234 + 0.666667 NA intron (NM_018842, intron 1 of 13) AluSx|SINE|Alu 18002 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 118-43 chr14 79646897 79647088 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 15 of 20) intron (NR_073547, intron 15 of 20) 367612 NR_073546 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 180-37 chr14 63974176 63974588 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 11 of 114) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 120743 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 160.333-224 chr4 150067503 150067849 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -10769 NM_001040260 166614 Hs.591683 NM_152619 ENSG00000170390 DCLK2 CL2|CLICK-II|CLICK2|CLIK2|DCAMKL2|DCDC3|DCDC3B|DCK2 doublecortin like kinase 2 protein-coding 276.333-25 chr2 127872250 127872922 + 0.666667 NA intron (NM_001199140, intron 3 of 7) intron (NM_001199140, intron 3 of 7) 12274 NM_031445 83607 Hs.546449 NM_031445 ENSG00000144233 AMMECR1L - AMMECR1 like protein-coding 129.667-117 chr3 41430636 41430989 + 0.666667 NA intron (NR_136342, intron 32 of 34) intron (NR_136342, intron 32 of 34) 231307 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 127.667-198 chr9 107295568 107295866 + 0.666667 NA intron (NM_001244713, intron 1 of 9) intron (NM_001244713, intron 1 of 9) 10948 NM_001244713 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 126.667-166 chr7 42989803 42990029 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 57540 NR_156497 64983 Hs.50252 NM_031903 ENSG00000106591 MRPL32 HSPC283|L32mt|MRP-L32|bMRP-59b mitochondrial ribosomal protein L32 protein-coding 131.667-62 chr15 70776117 70776375 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12688 NM_018003 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 115.667-57 chr12 48292756 48292959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36123 NM_181788 341567 Hs.155833 NM_181788 ENSG00000187166 H1FNT H1.7|H1T2 H1 histone family member N, testis specific protein-coding 132.333-38 chr12 13025696 13026000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18533 NM_020853 57613 Hs.132660 NM_020853 ENSG00000084444 FAM234B KIAA1467 family with sequence similarity 234 member B protein-coding 114.333-229 chr8 115575542 115575728 + 0.666667 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 92378 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 117.333-197 chr7 99171372 99171680 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu -27418 NM_181349 57154 Hs.189329 NM_020429 ENSG00000198742 SMURF1 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 207.667-113 chr7 45523159 45523655 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50733 NM_001281768 107 Hs.192215 NM_021116 ENSG00000164742 ADCY1 AC1|DFNB44 adenylate cyclase 1 protein-coding 171.333-110 chr3 12629370 12629739 + 0.666667 NA intron (NM_001354691, intron 1 of 16) MIRb|SINE|MIR 33954 NM_001354690 5894 Hs.159130 NM_002880 ENSG00000132155 RAF1 CMD1NN|CRAF|NS5|Raf-1|c-Raf Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 210-145 chr8 88308525 88308963 + 0.666667 NA intron (NM_005941, intron 1 of 9) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 18739 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 142-138 chr7 16997423 16997746 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -115601 NM_176813 155465 Hs.100686 NM_176813 ENSG00000173467 AGR3 AG-3|AG3|BCMP11|HAG3|PDIA18|hAG-3 anterior gradient 3, protein disulphide isomerase family member protein-coding 165.333-205 chr5 39709473 39709844 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 189227 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 119.333-131 chr2 122877301 122877581 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 196040 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 156.333-167 chr2 17726907 17727217 + 0.666667 NA intron (NM_024624, intron 6 of 26) intron (NM_024624, intron 6 of 26) 26748 NM_001142286 79677 Hs.526728 NM_024624 ENSG00000163029 SMC6 SMC-6|SMC6L1|hSMC6 structural maintenance of chromosomes 6 protein-coding 124-40 chr15 63726134 63726370 + 0.666667 NA intron (NM_003922, intron 17 of 77) AluSx|SINE|Alu 107696 NM_003922 8925 Hs.210385 NM_003922 ENSG00000103657 HERC1 MDFPMR|p532|p619 HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1 protein-coding 194-122 chr6 106654069 106654601 + 0.666667 NA intron (NM_018292, intron 7 of 10) AluY|SINE|Alu -23844 NM_001318746 84816 Hs.155839 NM_032730 ENSG00000130347 RTN4IP1 NIMP|OPA10 reticulon 4 interacting protein 1 protein-coding 226.667-75 chr5 127935429 127935939 + 0.666667 NA intron (NM_001317938, intron 6 of 6) intron (NM_001317938, intron 6 of 6) 147491 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 232-88 chr8 113259075 113259663 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) intron (NM_001363185, intron 3 of 66) 117783 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 153-33 chr12 90856199 90856596 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61626 NR_038868 439916 Hs.350600 NM_001039384 ENSG00000196243 LINC00615 C12orf37 long intergenic non-protein coding RNA 615 ncRNA 160.667-262 chr6 40837706 40838046 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 185404 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 135-6 chr1 173948169 173948548 + 0.666667 NA intron (NM_001300852, intron 13 of 18) LTR54B|LTR|ERV1 -30980 NM_000488 462 Hs.75599 NM_000488 ENSG00000117601 SERPINC1 AT3|AT3D|ATIII|ATIII-R2|ATIII-T1|ATIII-T2|THPH7 serpin family C member 1 protein-coding 120-141 chr8 131450302 131450602 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -409543 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 150-128 chr7 18218751 18219077 + 0.666667 NA intron (NM_001321872, intron 2 of 11) L1ME4a|LINE|L1 -71178 NM_001321896 9734 Hs.196054 NM_014707 ENSG00000048052 HDAC9 HD7|HD7b|HD9|HDAC|HDAC7|HDAC7B|HDAC9B|HDAC9FL|HDRP|MITR histone deacetylase 9 protein-coding 118.333-39 chr11 29772677 29773020 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 154046 NR_149106 105376606 Hs.577275 NR_149106 ENSG00000255117 LINC02546 - long intergenic non-protein coding RNA 2546 ncRNA 193.333-39 chr11 97800359 97800815 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1220362 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 142-81 chr3 29869057 29869455 + 0.666667 NA intron (NM_001003792, intron 7 of 13) intron (NM_001003792, intron 7 of 13) 64900 NR_046556 100873977 Hs.581453 NR_046556 ENSG00000235593 RBMS3-AS1 - RBMS3 antisense RNA 1 ncRNA 143-51 chr16 19103016 19103287 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -10781 NM_001034841 162073 Hs.530899 NM_001034841 ENSG00000205730 ITPRIPL2 - ITPRIP like 2 protein-coding 185.667-41 chr16 67750340 67750740 + 0.666667 NA intron (NM_001320238, intron 2 of 12) intron (NM_001320238, intron 2 of 12) -31224 NM_030819 81577 Hs.307084 NM_030819 ENSG00000141098 GFOD2 - glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2 protein-coding 183.667-100 chr4 46500425 46500911 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -110540 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 179.333-202 chrX 64292878 64293359 + 0.666667 NA intron (NM_017677, intron 12 of 13) intron (NM_017677, intron 12 of 13) -62511 NM_130388 142689 Hs.56281 NM_130388 ENSG00000198881 ASB12 - ankyrin repeat and SOCS box containing 12 protein-coding 272.667-25 chr18 10825386 10825921 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 7 of 51) AluSx|SINE|Alu -66004 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 149.333-332 chr6 43471625 43471939 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5741 NM_001146016 93643 Hs.520145 NM_080604 ENSG00000137221 TJAP1 PILT|TJP4 tight junction associated protein 1 protein-coding 144.667-188 chr3 21870080 21870335 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86932 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 130.667-150 chr3 160329821 160330113 + 0.666667 NA intron (NM_001190242, intron 7 of 18) intron (NM_001190242, intron 7 of 18) 53799 NM_001190242 57560 Hs.478095 NM_020800 ENSG00000068885 IFT80 ATD2|SRTD2|WDR56 intraflagellar transport 80 protein-coding 128-68 chr3 15773826 15774044 + 0.666667 NA intron (NM_001349280, intron 2 of 26) L1MD|LINE|L1 -17388 NM_001195099 23243 Hs.335239 NM_015199 ENSG00000206560 ANKRD28 PITK|PPP1R65 ankyrin repeat domain 28 protein-coding 278-42 chr4 107001501 107002216 + 0.666667 NA intron (NM_014421, intron 1 of 3) intron (NM_014421, intron 1 of 3) 34455 NM_014421 27123 Hs.211869 NM_014421 ENSG00000155011 DKK2 DKK-2 dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 protein-coding 144.667-18 chr1 181844550 181844878 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 216998 NM_001009992 127665 Hs.684328 NM_001009992 ENSG00000179930 ZNF648 - zinc finger protein 648 protein-coding 113.667-4 chr1 34539952 34540280 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 129578 NR_030278 693137 NR_030278 ENSG00000207941 MIR552 MIRN552|hsa-mir-552 microRNA 552 ncRNA 156-87 chr3 39060014 39060473 + 0.666667 NA intron (NM_001346228, intron 1 of 18) L1MB7|LINE|L1 7951 NM_001346228 57599 Hs.109778 NM_020839 ENSG00000114742 WDR48 P80|SPG60|UAF1 WD repeat domain 48 protein-coding 194-100 chr4 57092349 57092841 + 0.666667 NA intron (NM_001553, intron 1 of 4) intron (NM_001553, intron 1 of 4) -17167 NR_034081 255130 Hs.691061 NR_034081 ENSG00000245067 IGFBP7-AS1 - IGFBP7 antisense RNA 1 ncRNA 158-6 chr1 172521297 172521603 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10899 NM_016227 51430 Hs.204559 NM_014283 ENSG00000094975 SUCO C1orf9|CH1|OPT|SLP1 SUN domain containing ossification factor protein-coding 236.667-27 chr14 70571153 70571605 + 0.666667 NA Intergenic THE1C|LTR|ERVL-MaLR 29311 NM_005466 10001 Hs.497353 NM_005466 ENSG00000133997 MED6 ARC33|NY-REN-28 mediator complex subunit 6 protein-coding 124.333-19 chr10 54974237 54974455 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 3 of 34) intron (NM_001354404, intron 3 of 34) -173055 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 119.667-164 chr6 43452608 43452858 + 0.666667 NA intron (NM_001286656, intron 4 of 5) intron (NM_001286656, intron 4 of 5) 2815 NM_001286656 65989 Hs.337251 NM_023932 ENSG00000171462 DLK2 DLK-2|EGFL9 delta like non-canonical Notch ligand 2 protein-coding 144.667-123 chr18 80081571 80081839 + 0.666667 NA TTS (NR_103445) TTS (NR_103445) 14449 NR_103445 100506070 Hs.593610 NR_103445 ENSG00000261126 RBFADN - RBFA downstream neighbor ncRNA 181.333-113 chr4 43580376 43580764 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -88027 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 123.333-113 chr2 139426027 139426366 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 528872 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 172.333-5 chr1 168283411 168283889 + 0.666667 NA intron (NM_005149, intron 1 of 7) intron (NM_005149, intron 1 of 7) 2773 NM_005149 9095 Hs.716656 NM_005149 ENSG00000143178 TBX19 TBS19|TPIT|dJ747L4.1 T-box transcription factor 19 protein-coding 178-121 chrX 135265071 135265543 + 0.666667 NA intron (NR_110381, intron 1 of 3) L1MA2|LINE|L1 13246 NM_001355522 101928677 NM_001355522 ENSG00000238210 ETDA - embryonic testis differentiation homolog A protein-coding 184.667-98 chr5 67088537 67089009 + 0.666667 NA intron (NM_001297651, intron 2 of 25) intron (NM_001297651, intron 2 of 25) 84118 NM_001297651 375449 Hs.595458 NM_015183 ENSG00000069020 MAST4 - microtubule associated serine/threonine kinase family member 4 protein-coding 121.667-14 chr1 152181243 152181462 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22124 NM_001122965 126638 Hs.376144 NM_152364 ENSG00000215853 RPTN - repetin protein-coding 119-66 chr18 6332854 6333099 + 0.666667 NA intron (NM_001365765, intron 1 of 18) intron (NM_001365765, intron 1 of 18) 26054 NR_158611 91133 Hs.128279 NM_173464 ENSG00000154655 L3MBTL4 HsT1031 L3MBTL histone methyl-lysine binding protein 4 protein-coding 199.333-208 chr4 101003874 101004352 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 236759 NR_107033 102465868 NR_107033 ENSG00000273882 MIR8066 hsa-mir-8066 microRNA 8066 ncRNA 112.333-113 chr2 19509718 19509958 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -151215 NM_145260 130497 Hs.123933 NM_145260 ENSG00000143867 OSR1 ODD odd-skipped related transcription factor 1 protein-coding 235.333-96 chr5 79147274 79147682 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35669 NM_001713 635 Hs.80756 NM_001713 ENSG00000145692 BHMT BHMT1|HEL-S-61p betaine--homocysteine S-methyltransferase protein-coding 145.667-93 chr14 92346601 92346945 + 0.666667 NA intron (NM_153647, intron 3 of 17) MER5B|DNA|hAT-Charlie 22965 NM_153646 123041 Hs.385530 NM_153646 ENSG00000140090 SLC24A4 AI2A5|NCKX4|SHEP6|SLC24A2 solute carrier family 24 member 4 protein-coding 113.333-6 chr1 70228417 70228671 + 0.666667 NA exon (NM_001350605, exon 2 of 12) exon (NM_001350605, exon 2 of 12) 7164 NR_146810 9295 Hs.479693 NM_004768 ENSG00000116754 SRSF11 NET2|SFRS11|dJ677H15.2|p54 serine and arginine rich splicing factor 11 protein-coding 245-58 chr5 111684290 111684657 + 0.666667 NA intron (NR_040093, intron 2 of 6) intron (NR_040093, intron 2 of 6) 71778 NM_001142483 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 164.333-153 chr3 30876209 30876491 + 0.666667 NA intron (NM_207359, intron 1 of 14) intron (NM_207359, intron 1 of 14) 18311 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 116.333-36 chr10 80102775 80103058 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 23671 NR_072985 80195 Hs.169982 NM_025125 ENSG00000133678 TMEM254 C10orf57|bA369J21.6 transmembrane protein 254 protein-coding 126-56 chr2 108590058 108590423 + 0.666667 NA intron (NM_001193488, intron 1 of 9) (ATGT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 1934 NM_001193488 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 135.667-38 chr12 55794043 55794389 + 0.666667 NA intron (NM_033082, intron 7 of 10) intron (NM_033082, intron 7 of 10) 23508 NM_033082 84324 Hs.505676 NM_033082 ENSG00000205323 SARNP CIP29|HCC1|HSPC316|THO1 SAP domain containing ribonucleoprotein protein-coding 170.667-46 chr14 69537442 69537797 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 37252 NM_001271507 56936 Hs.458319 NM_020181 ENSG00000267909 CCDC177 C14orf162|PLPL coiled-coil domain containing 177 protein-coding 146.333-170 chr2 216698343 216698637 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2941 NM_000599 3488 Hs.607212 NM_000599 ENSG00000115461 IGFBP5 IBP5 insulin like growth factor binding protein 5 protein-coding 154.333-245 chr4 71405765 71406055 + 0.666667 NA intron (NM_003759, intron 4 of 22) intron (NM_003759, intron 4 of 22) 66857 NM_003759 8671 Hs.5462 NM_003759 ENSG00000080493 SLC4A4 HNBC1|KNBC|NBC1|NBC2|NBCe1-A|SLC4A5|hhNMC|kNBC1|pNBC solute carrier family 4 member 4 protein-coding 133.333-79 chr2 64781648 64781865 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81875 NR_110224 101927438 Hs.580313 NR_110224 ENSG00000234572 LINC01800 - long intergenic non-protein coding RNA 1800 ncRNA 179-59 chr20 37440844 37441288 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 79237 NM_001317075 10904 Hs.472651 NM_006698 ENSG00000166619 BLCAP BC10 BLCAP apoptosis inducing factor protein-coding 122.333-103 chr2 141032139 141032393 + 0.666667 NA intron (NM_018557, intron 11 of 90) L1ME3G|LINE|L1 -445581 NR_106979 102465692 NR_106979 ENSG00000283506 MIR7157 hsa-mir-7157 microRNA 7157 ncRNA 145-9 chr10 34800896 34801182 + 0.666667 NA intron (NM_001184789, intron 1 of 22) intron (NM_001184789, intron 1 of 22) 14257 NM_001184788 56288 Hs.131489 NM_019619 ENSG00000148498 PARD3 ASIP|Baz|PAR3|PAR3alpha|PARD-3|PARD3A|PPP1R118|SE2-5L16|SE2-5LT1|SE2-5T2 par-3 family cell polarity regulator protein-coding 156.667-165 chr2 13278938 13279304 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -272108 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 200.667-155 chr8 106045680 106046080 + 0.666667 NA intron (NR_125797, intron 1 of 4) intron (NR_125797, intron 1 of 4) 14623 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 129-98 chr5 51674661 51674958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 291361 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 125.333-26 chr10 74546461 74546686 + 0.666667 NA intron (NM_001369123, intron 7 of 9) intron (NM_001369123, intron 7 of 9) -17249 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 249.667-97 chr8 82254757 82255308 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -412746 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 232-81 chr7 21138236 21138802 + 0.666667 NA Intergenic Ricksha_a|DNA|MULE-MuDR -289564 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 176.333-118 chr4 46793283 46793639 + 0.666667 NA intron (NM_130902, intron 2 of 2) LTR19A|LTR|ERV1 115784 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 198-155 chr5 84478545 84478976 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93880 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 116.333-221 chr9 129439141 129439343 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -49418 NR_038955 100506190 Hs.529860 NR_038955 LINC00963 MetaLnc9 long intergenic non-protein coding RNA 963 ncRNA 149.667-119 chr14 60594185 60594488 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44880 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 116-52 chr15 70694816 70695022 + 0.666667 NA intron (NM_018003, intron 3 of 18) intron (NM_018003, intron 3 of 18) 7363 NM_001008224 55075 Hs.108049 NM_018003 ENSG00000137831 UACA NUCLING uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats protein-coding 145.333-105 chr16 25473890 25474310 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -216255 NM_001012981 342357 Hs.513451 NM_001012981 ENSG00000155592 ZKSCAN2 ZNF694|ZSCAN31|ZSCAN34 zinc finger with KRAB and SCAN domains 2 protein-coding 128.333-67 chr15 77197604 77197861 + 0.666667 NA intron (NM_024776, intron 4 of 7) intron (NM_024776, intron 4 of 7) 27672 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 165-84 chr6 42028078 42028515 + 0.666667 NA intron (NM_001136017, intron 1 of 4) intron (NM_001136017, intron 1 of 4) 20598 NM_001287434 896 Hs.534307 NM_001760 ENSG00000112576 CCND3 - cyclin D3 protein-coding 112.667-184 chr4 39009575 39009826 + 0.666667 NA intron (NM_001303228, intron 1 of 6) L1PA17|LINE|L1 22709 NM_024943 80008 Hs.374147 NM_024943 ENSG00000121895 TMEM156 - transmembrane protein 156 protein-coding 150.333-66 chr11 103926063 103926349 + 0.666667 NA intron (NM_025208, intron 6 of 6) MIR|SINE|MIR 76300 NR_039842 100616457 NR_039842 ENSG00000264200 MIR4693 - microRNA 4693 ncRNA 169.333-281 chr8 140048042 140048387 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 17 of 22) intron (NM_001160372, intron 17 of 22) 52321 NR_144431 359809 Hs.26814 NR_144431 ENSG00000282164 PEG13 - paternally expressed 13 ncRNA 159-50 chr19 58137946 58138246 + 0.666667 NA intron (NM_024620, intron 3 of 3) L1MB8|LINE|L1 12693 NM_024620 79673 Hs.458377 NM_024620 ENSG00000181894 ZNF329 - zinc finger protein 329 protein-coding 153.667-292 chr4 62203567 62203960 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41998 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 207.667-49 chr18 61113156 61113603 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -220051 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 179.333-105 chr2 180401286 180401614 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -290654 NR_104320 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 177-67 chr5 125255067 125255521 + 0.666667 NA intron (NR_109882, intron 4 of 5) intron (NR_109882, intron 4 of 5) 218463 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 185.667-45 chr17 17191361 17191886 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_015134, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_015134, exon 23 of 23) 14710 NM_178836 201164 Hs.729079 NM_178836 ENSG00000179598 PLD6 ZUC phospholipase D family member 6 protein-coding 118.667-186 chr8 24825363 24825666 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88247 NM_005382 4741 Hs.458657 NM_005382 ENSG00000104722 NEFM NEF3|NF-M|NFM neurofilament medium protein-coding 124.667-189 chr7 52350775 52351047 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -684722 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 188.333-65 chr19 30384918 30385249 + 0.666667 NA intron (NM_014717, intron 1 of 4) intron (NM_014717, intron 1 of 4) 12699 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 298.333-21 chr2 70535025 70535878 + 0.666667 NA intron (NM_003236, intron 1 of 5) intron (NM_003236, intron 1 of 5) 17995 NM_001308159 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 143-123 chr8 52869281 52869560 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -70488 NM_005285 2831 Hs.248117 NM_005285 ENSG00000183729 NPBWR1 GPR7 neuropeptides B and W receptor 1 protein-coding 201.333-268 chr7 92355969 92356410 + 0.666667 NA intron (NM_019004, intron 9 of 19) intron (NM_019004, intron 9 of 19) 81125 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 115.333-126 chr20 53188926 53189110 + 0.666667 NA intron (NM_001193421, intron 1 of 2) MIRb|SINE|MIR 3735 NM_001193421 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 145.333-176 chr3 9549178 9549499 + 0.666667 NA intron (NM_198560, intron 2 of 3) intron (NM_198560, intron 2 of 3) 4484 NM_198560 375323 Hs.56782 NM_198560 ENSG00000156959 LHFPL4 GARLH4 LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein-coding 155-73 chr2 172085630 172085987 + 0.666667 NA exon (NM_001038493, exon 1 of 2) exon (NM_001038493, exon 1 of 2) 301 NM_178120 1745 Hs.407015 NM_178120 ENSG00000144355 DLX1 - distal-less homeobox 1 protein-coding 211.333-200 chr5 179560927 179561413 + 0.666667 NA intron (NM_001040452, intron 2 of 17) AluSz|SINE|Alu 1439 NM_001040452 80230 Hs.306769 NM_025158 ENSG00000176783 RUFY1 RABIP4|ZFYVE12 RUN and FYVE domain containing 1 protein-coding 140.333-108 chr2 121460979 121461247 + 0.666667 NA exon (NM_001142274, exon 11 of 38) exon (NM_001142274, exon 11 of 38) -69767 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 123.667-188 chr8 135536520 135536717 + 0.666667 NA intron (NM_006558, intron 2 of 8) L2c|LINE|L2 79162 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 173-59 chr3 125299133 125299501 + 0.666667 NA intron (NM_001348436, intron 5 of 8) intron (NM_001348436, intron 5 of 8) 57963 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 169-99 chr8 65923031 65923377 + 0.666667 NA Intergenic AluSg4|SINE|Alu -81140 NM_001242318 5150 Hs.527119 NM_002603 ENSG00000205268 PDE7A HCP1|PDE7 phosphodiesterase 7A protein-coding 117.667-131 chr4 30559383 30559659 + 0.666667 NA Intergenic MER57B1|LTR|ERV1 -160848 NM_002589 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 156-2 chr1 38929801 38930172 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001304746) promoter-TSS (NM_001304746) -467 NM_001304746 54933 Hs.524626 NM_017821 ENSG00000158315 RHBDL2 RRP2 rhomboid like 2 protein-coding 126.667-171 chr7 92409659 92410007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27481 NR_145992 105375396 NM_001317905 ENSG00000230927 TMBIM7P - transmembrane BAX inhibitor motif containing 7, pseudogene pseudo 173-82 chr6 50536052 50536417 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -177310 NM_172238 83741 Hs.434107 NM_172238 ENSG00000008197 TFAP2D TFAP2BL1 transcription factor AP-2 delta protein-coding 167.667-106 chr2 102555015 102555485 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2b_Pri|DNA|TcMar-Tigger -64303 NM_003048 6549 Hs.250083 NM_003048 ENSG00000115616 SLC9A2 NHE2 solute carrier family 9 member A2 protein-coding 210.667-120 chr7 54758262 54758740 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_110040) promoter-TSS (NR_110040) 710 NM_014302 23480 Hs.488282 NM_014302 ENSG00000132432 SEC61G SSS1 SEC61 translocon gamma subunit protein-coding 127.667-181 chr8 106779870 106780162 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -9772 NM_139166 137735 Hs.374668 NM_139166 ENSG00000174429 ABRA STARS actin binding Rho activating protein protein-coding 163.667-60 chr14 56663322 56663729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 83727 NM_017799 54916 Hs.497253 NM_017799 ENSG00000070269 TMEM260 C14orf101|SHDRA transmembrane protein 260 protein-coding 117.333-163 chr5 12237520 12237772 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -333200 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 167-44 chr15 74016445 74016795 + 0.666667 NA intron (NM_033247, intron 2 of 4) intron (NM_033247, intron 2 of 4) 21904 NM_033247 5371 Hs.526464 NM_002675 ENSG00000140464 PML MYL|PP8675|RNF71|TRIM19 promyelocytic leukemia protein-coding 114.333-80 chr16 14272040 14272344 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -30096 NR_132983 100129781 Hs.190748 NR_132983 MIR193BHG - MIR193B host gene ncRNA 183.333-36 chr13 42545092 42545536 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17422 NM_033012 8600 Hs.333791 NM_003701 ENSG00000120659 TNFSF11 CD254|ODF|OPGL|OPTB2|RANKL|TNLG6B|TRANCE|hRANKL2|sOdf TNF superfamily member 11 protein-coding 168.333-158 chr5 17473540 17473890 + 0.666667 NA intron (NR_134270, intron 1 of 2) L1PA14|LINE|L1 29705 NR_134271 102723526 NR_134270 ENSG00000249662 LINC02218 - long intergenic non-protein coding RNA 2218 ncRNA 173.667-193 chr9 102107794 102108209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -369421 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 113.667-5 chr1 45481475 45481706 + 0.666667 NA intron (NM_007170, intron 1 of 10) FAM|SINE|Alu 9573 NM_001320800 10420 Hs.591499 NM_007170 ENSG00000070759 TESK2 - testis associated actin remodelling kinase 2 protein-coding 231.333-34 chr12 66321394 66321877 + 0.666667 NA intron (NM_001370285, intron 7 of 12) intron (NM_001370285, intron 7 of 12) 19090 NR_135081 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 199-38 chr18 73406168 73406606 + 0.666667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 81446 NR_038340 100505817 Hs.197042 NR_038340 ENSG00000261780 LINC02582 - long intergenic non-protein coding RNA 2582 ncRNA 303.333-72 chr8 20545747 20546444 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 68831 NR_145737 109616983 NR_145737 SNORD3F - small nucleolar RNA, C/D box 3F snoRNA 190.667-20 chr11 23402546 23402999 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16418 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 133-37 chr18 35529204 35529509 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -31396 NM_001098817 125476 Hs.464903 NM_194281 ENSG00000153391 INO80C C18orf37|IES6|hIes6 INO80 complex subunit C protein-coding 214.667-10 chr10 9100816 9101297 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -174557 NR_108039 100507163 Hs.649223 NR_108039 LINC00709 - long intergenic non-protein coding RNA 709 ncRNA 121.333-96 chr2 201636727 201636967 + 0.666667 NA exon (NM_152388, exon 4 of 12) exon (NM_152388, exon 4 of 12) 5823 NM_152388 65062 Hs.12319 NM_152388 ENSG00000155755 TMEM237 ALS2CR4|JBTS14 transmembrane protein 237 protein-coding 248.667-44 chr16 49190039 49190699 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 91469 NM_004352 869 Hs.458423 NM_004352 ENSG00000102924 CBLN1 - cerebellin 1 precursor protein-coding 113-67 chr15 59767169 59767492 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78010 NM_004330 663 Hs.592515 NM_004330 ENSG00000140299 BNIP2 BNIP-2|NIP2 BCL2 interacting protein 2 protein-coding 172-5 chr1 77727534 77728045 + 0.666667 NA intron (NM_015017, intron 11 of 24) intron (NM_015017, intron 11 of 24) 32063 NM_201626 23032 Hs.480597 NM_015017 ENSG00000077254 USP33 VDU1 ubiquitin specific peptidase 33 protein-coding 115.667-163 chr4 71800647 71800972 + 0.666667 NA intron (NM_001204306, intron 1 of 13) L1PA10|LINE|L1 3232 NM_001204307 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 118-92 chr3 76181690 76182016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -396304 NM_001290208 100131827 Hs.556877 NM_001128223 ENSG00000227124 ZNF717 OB1|X17|ZNF838 zinc finger protein 717 protein-coding 155.667-364 chr8 106479467 106479840 + 0.666667 NA intron (NM_001198532, intron 1 of 15) intron (NM_001198532, intron 1 of 15) 31729 NM_001198532 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 183.333-107 chr3 158909267 158909704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107431 NM_022736 64747 Hs.58663 NM_022736 ENSG00000118855 MFSD1 SMAP4 major facilitator superfamily domain containing 1 protein-coding 147-87 chr21 35417490 35417835 + 0.666667 NA intron (NR_073512, intron 2 of 2) intron (NR_073512, intron 2 of 2) 163102 NR_073512 100506403 Hs.536609 NR_073512 ENSG00000159216 LOC100506403 - uncharacterized LOC100506403 ncRNA 113.333-146 chr2 239254833 239255118 + 0.666667 NA intron (NM_006037, intron 2 of 26) L1MEd|LINE|L1 -50487 NR_036229 100423043 NR_036229 ENSG00000265215 MIR4269 - microRNA 4269 ncRNA 156.333-222 chr22 37460640 37461050 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 25539 NM_002405 4242 Hs.517603 NM_002405 ENSG00000100060 MFNG - MFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 134.333-35 chr12 5953399 5953635 + 0.666667 NA exon (NM_000552, exon 48 of 52) exon (NM_000552, exon 48 of 52) -7285 NM_001278597 57101 Hs.148970 NM_020373 ENSG00000047617 ANO2 C12orf3|TMEM16B anoctamin 2 protein-coding 112-192 chr7 123822799 123822996 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 8758 NR_002731 26062 Hs.381305 NR_002731 HYAL6P HYAL6|HYALP1 hyaluronidase 6, pseudogene pseudo 163-93 chr9 107252492 107252832 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30617 NM_002874 5887 Hs.521640 NM_002874 ENSG00000119318 RAD23B HHR23B|HR23B|P58 RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein protein-coding 167-53 chr19 51561346 51561693 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9764 NM_007147 7728 Hs.119014 NM_007147 ENSG00000105497 ZNF175 OTK18 zinc finger protein 175 protein-coding 174-51 chr2 53520473 53520886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -247104 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 157-93 chr3 193456152 193456518 + 0.666667 NA intron (NM_032279, intron 16 of 29) L2c|LINE|L2 -77582 NM_198505 344905 Hs.658032 NM_198505 ENSG00000187527 ATP13A5 - ATPase 13A5 protein-coding 114.333-145 chr3 95152076 95152266 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 213908 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 153-16 chr11 45839797 45840185 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -7127 NM_001127457 1408 Hs.532491 NM_021117 ENSG00000121671 CRY2 HCRY2|PHLL2 cryptochrome circadian regulator 2 protein-coding 231-44 chr3 151207837 151208514 + 0.666667 NA intron (NM_053002, intron 14 of 42) intron (NM_053002, intron 14 of 42) -4959 NM_013308 29909 Hs.549152 NM_013308 ENSG00000174946 GPR171 H963 G protein-coupled receptor 171 protein-coding 114-156 chr7 138203725 138203939 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 80074 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 144-150 chr8 86567371 86567663 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 53082 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 126.333-79 chr2 13368331 13368563 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -361434 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 116.667-29 chr12 12091116 12091349 + 0.666667 NA intron (NM_001370269, intron 6 of 7) intron (NM_001370269, intron 6 of 7) 19764 NM_138722 79370 Hs.210343 NM_030766 ENSG00000121380 BCL2L14 BCLG BCL2 like 14 protein-coding 209.667-15 chr10 6455916 6456358 + 0.666667 NA intron (NM_001282644, intron 15 of 17) intron (NM_001282644, intron 15 of 17) 105821 NR_148966 399716 Hs.737229 NR_148966 LINC02656 - long intergenic non-protein coding RNA 2656 ncRNA 154-144 chr8 123357487 123357808 + 0.666667 NA exon (NM_014109, exon 12 of 28) exon (NM_014109, exon 12 of 28) -9517 NR_030382 693130 NR_030382 ENSG00000283172 MIR548D1 MIRN548D1 microRNA 548d-1 ncRNA 146.333-87 chr14 48828464 48828892 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 757702 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 140-62 chr2 98859582 98859914 + 0.666667 NA intron (NM_207362, intron 1 of 9) L1MB7|LINE|L1 76477 NM_207362 343990 Hs.469398 NM_207362 ENSG00000196872 KIAA1211L C2orf55 KIAA1211 like protein-coding 139-30 chr13 93641429 93641689 + 0.666667 NA intron (NM_005708, intron 2 of 8) MIR|SINE|MIR 216914 NR_046536 100873973 Hs.615939 NR_046536 GPC6-AS2 - GPC6 antisense RNA 2 ncRNA 158.667-186 chr20 39685362 39685726 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -318917 NR_109936 100505663 Hs.559348 NR_109936 ENSG00000237767 LINC01370 HI-LNC25|HILNC25 long intergenic non-protein coding RNA 1370 ncRNA 139-16 chr10 99110092 99110402 + 0.666667 NA intron (NM_021828, intron 3 of 11) intron (NM_021828, intron 3 of 11) 125628 NM_001166246 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 155.667-257 chr4 109319909 109320190 + 0.666667 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 17014 NR_160939 645078 Hs.518784 NM_001039778 ZCCHC23 - zinc finger CCHC-type containing 23 ncRNA 165.333-88 chr15 91112993 91113429 + 0.666667 NA intron (NM_001323039, intron 1 of 12) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 11415 NM_001323040 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 271.667-23 chr14 44039556 44040177 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 467417 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 194.333-48 chr15 77148667 77149042 + 0.666667 NA intron (NM_024776, intron 6 of 7) AluJr|SINE|Alu 76550 NR_026813 81698 Hs.656938 NM_030944 LINC00597 C15orf5 long intergenic non-protein coding RNA 597 ncRNA 139.333-145 chr3 39165447 39165808 + 0.666667 NA Intergenic Charlie25|DNA|hAT-Charlie -10986 NM_001320560 64651 Hs.370950 NM_033027 ENSG00000144655 CSRNP1 AXUD1|CSRNP-1|FAM130B|TAIP-3|URAX1 cysteine and serine rich nuclear protein 1 protein-coding 222.667-93 chr8 42340720 42341225 + 0.666667 NA intron (NM_002690, intron 2 of 13) intron (NM_002690, intron 2 of 13) 2478 NM_002690 5423 Hs.654484 NM_002690 ENSG00000070501 POLB - DNA polymerase beta protein-coding 142.333-133 chr2 191850390 191850675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3444 NM_004657 8436 Hs.26530 NM_004657 ENSG00000168497 CAVIN2 PS-p68|SDPR|SDR|cavin-2 caveolae associated protein 2 protein-coding 136.667-35 chr11 99911083 99911428 + 0.666667 NA intron (NM_001243270, intron 5 of 23) intron (NM_001243270, intron 5 of 23) 355110 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 114-139 chr6 124995801 124995972 + 0.666667 NA intron (NR_104440, intron 1 of 6) AluSx1|SINE|Alu 12518 NM_152553 154214 Hs.12876 NM_152553 ENSG00000146373 RNF217 C6orf172|IBRDC1|OSTL|dJ84N20.1 ring finger protein 217 protein-coding 190.667-137 chr7 32943509 32943937 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_003500) promoter-TSS (NR_003500) -553 NR_003500 441212 Hs.648086 NM_001039754 ENSG00000205763 RP9P - RP9 pseudogene pseudo 152.667-294 chr5 71691292 71691583 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -27838 NM_004291 9607 Hs.1707 NM_004291 ENSG00000164326 CARTPT CART CART prepropeptide protein-coding 115-128 chr5 87789777 87790025 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 127859 NR_149089 111082994 Hs.544037 NR_149089 LINC02488 CTD-2316B1 long intergenic non-protein coding RNA 2488 ncRNA 138.333-170 chr6 76071121 76071464 + 0.666667 NA intron (NM_001563, intron 1 of 16) intron (NM_001563, intron 1 of 16) 1370 NM_001563 3617 Hs.590893 NM_001563 ENSG00000112706 IMPG1 GP147|IPM150|SPACR|VMD4 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 protein-coding 145.333-121 chr18 68985308 68985697 + 0.666667 NA intron (NM_001093729, intron 8 of 9) LTR33A|LTR|ERVL 187422 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 155-127 chr8 74162999 74163416 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 158154 NM_001363050 56704 Hs.657367 NM_020647 ENSG00000104369 JPH1 CMT2K|JP-1|JP1 junctophilin 1 protein-coding 253-38 chr2 81637580 81638184 + 0.666667 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -170936 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 185.667-51 chr18 2316168 2316540 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 255151 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 167.333-267 chr8 139134235 139134620 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -220386 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 222.666-19 chr17 80666859 80667505 + 0.666667 NA intron (NM_020761, intron 3 of 33) intron (NM_020761, intron 3 of 33) 122344 NM_020761 57521 Hs.133044 NM_020761 ENSG00000141564 RPTOR KOG1|Mip1 regulatory associated protein of MTOR complex 1 protein-coding 153-147 chr8 90407945 90408349 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 186659 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 203-6 chr1 159711166 159711473 + 0.666667 NA TTS (NM_000567) TTS (NM_000567) 3270 NM_001329057 1401 Hs.76452 NM_000567 ENSG00000132693 CRP PTX1 C-reactive protein protein-coding 226.667-64 chr4 36012265 36012855 + 0.666667 NA intron (NR_146893, intron 36 of 36) intron (NR_146893, intron 36 of 36) 231379 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 157-72 chr2 161851413 161851732 + 0.666667 NA intron (NM_001354443, intron 5 of 25) intron (NM_001354443, intron 5 of 25) 222643 NM_001935 1803 Hs.368912 NM_001935 ENSG00000197635 DPP4 ADABP|ADCP2|CD26|DPPIV|TP103 dipeptidyl peptidase 4 protein-coding 181.333-114 chr4 43826637 43827169 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -189958 NR_131959 100506827 Hs.156197 NR_131958 ENSG00000251350 LINC02475 LVCAT1 long intergenic non-protein coding RNA 2475 ncRNA 118.667-156 chr5 38964792 38965005 + 0.666667 NA intron (NM_001285439, intron 15 of 38) intron (NM_001285439, intron 15 of 38) 109501 NM_152756 253260 Hs.407926 NM_152756 ENSG00000164327 RICTOR AVO3|PIA|hAVO3 RPTOR independent companion of MTOR complex 2 protein-coding 213-56 chr3 180630767 180631317 + 0.666667 NA intron (NM_181426, intron 14 of 19) intron (NM_181426, intron 14 of 19) 28879 NM_001288582 151613 Hs.43213 NM_133462 ENSG00000163728 TTC14 DRDL5813|PRO19630 tetratricopeptide repeat domain 14 protein-coding 114-143 chr6 166873073 166873393 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10708 NM_001318937 6196 Hs.655277 NM_021135 ENSG00000071242 RPS6KA2 HU-2|MAPKAPK1C|RSK|RSK3|S6K-alpha|S6K-alpha2|p90-RSK3|p90RSK2|pp90RSK3 ribosomal protein S6 kinase A2 protein-coding 186.667-29 chr12 22551967 22552285 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7580 NM_001286177 9847 Hs.271014 NM_014802 ENSG00000111731 C2CD5 CDP138|KIAA0528 C2 calcium dependent domain containing 5 protein-coding 211.667-49 chr18 10988385 10988915 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 2 of 51) L1MA10|LINE|L1 160112 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 122-40 chr15 41638890 41639164 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -21385 NM_001080541 23269 Hs.187569 NM_001080541 ENSG00000174197 MGA MAD5|MXD5 MAX dimerization protein MGA protein-coding 162.333-263 chr8 129538798 129539145 + 0.666667 NA intron (NR_130917, intron 1 of 3) intron (NR_130917, intron 1 of 3) 36047 NR_130919 137196 Hs.679457 NR_130917 ENSG00000229140 CCDC26 RAM CCDC26 long non-coding RNA ncRNA 131-58 chr21 29059154 29059432 + 0.666667 NA intron (NM_001282907, intron 15 of 15) intron (NM_001282907, intron 15 of 15) 14355 NM_006585 10694 Hs.125113 NM_006585 ENSG00000156261 CCT8 C21orf112|Cctq|D21S246|PRED71 chaperonin containing TCP1 subunit 8 protein-coding 146-111 chr5 119554416 119554809 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -74946 NM_001367956 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 141-52 chr3 44760020 44760379 + 0.666667 NA intron (NM_001320334, intron 1 of 2).2 Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 1420 NM_020696 57456 Hs.744955 NM_020696 ENSG00000163807 KIAA1143 - KIAA1143 protein-coding 174.333-160 chr9 91120407 91120802 + 0.666667 NA intron (NR_135306, intron 2 of 2) intron (NR_135306, intron 2 of 2) 1542 NR_135306 100129347 Hs.522287 NR_135306 ENSG00000229694 LINC00484 C9orf73 long intergenic non-protein coding RNA 484 ncRNA 196.667-39 chr13 60861940 60862396 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 189213 NR_047003 101926930 Hs.578045 NR_047003 LINC00378 - long intergenic non-protein coding RNA 378 ncRNA 150.667-321 chr5 177523195 177523526 + 0.666667 NA intron (NM_001366500, intron 8 of 9) MER2|DNA|TcMar-Tigger -6399 NM_001321732 51428 Hs.484288 NM_016222 ENSG00000183258 DDX41 ABS|MPLPF DEAD-box helicase 41 protein-coding 190.667-102 chr5 78158683 78159100 + 0.666667 NA intron (NM_003664, intron 13 of 26) AluSq2|SINE|Alu 135807 NM_001271769 8546 Hs.532091 NM_003664 ENSG00000132842 AP3B1 ADTB3|ADTB3A|HPS|HPS2|PE adaptor related protein complex 3 subunit beta 1 protein-coding 338.667-21 chr3 71592822 71593625 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9234 NM_001244810 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 141.333-197 chr5 133972871 133973184 + 0.666667 NA intron (NM_003374, intron 8 of 8) intron (NM_003374, intron 8 of 8) 4338 NR_134247 105379183 Hs.543907 NR_134247 LOC105379183 - uncharacterized LOC105379183 ncRNA 143.667-131 chr2 121416666 121417037 + 0.666667 NA intron (NM_001207051, intron 22 of 37) MIRb|SINE|MIR -114029 NR_023343 100151683 Hs.689638 NR_023343 ENSG00000264229 RNU4ATAC MOPD1|RFMN|RNU4ATAC1|TALS|U4ATAC RNA, U4atac small nuclear (U12-dependent splicing) snRNA 155.667-102 chr14 70764284 70764639 + 0.666667 NA intron (NM_033141, intron 2 of 12) intron (NM_033141, intron 2 of 12) 18991 NM_001284232 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 158-91 chr3 174879052 174879368 + 0.666667 NA intron (NM_207015, intron 1 of 13) intron (NM_207015, intron 1 of 13) 19876 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 123-24 chr11 27840815 27841029 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -118892 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 215-25 chr16 54715161 54715737 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 132784 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 158.333-59 chr11 116624374 116624750 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -14860 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 160.667-123 chr17 53769730 53770162 + 0.666667 NA Intergenic Tigger17a|DNA|TcMar-Tigger -52981 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 192-76 chr2 144764578 144765018 + 0.666667 NA intron (NR_033870, intron 1 of 4) Charlie18a|DNA|hAT-Charlie 96831 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 204.333-104 chr2 158256639 158257201 + 0.666667 NA intron (NM_138803, intron 9 of 13) L2b|LINE|L2 90270 NR_038850 554201 Hs.570262 NR_038850 ENSG00000227480 CCDC148-AS1 - CCDC148 antisense RNA 1 ncRNA 151-98 chr4 161703437 161703877 + 0.666667 NA intron (NM_001128428, intron 6 of 14) intron (NM_001128428, intron 6 of 14) -319076 NR_125888 101928052 Hs.647993 NR_125888 ENSG00000249419 LOC101928052 - uncharacterized LOC101928052 ncRNA 372.333-4 chr12 38916352 38917309 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -11239 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 135.667-47 chr13 88598835 88599118 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -27877 NR_047490 100861553 Hs.560132 NR_047490 ENSG00000261666 LINC00560 - long intergenic non-protein coding RNA 560 ncRNA 113-5 chr1 105886155 105886396 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 141978 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 120.667-162 chr7 77482562 77482868 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -54580 NM_002835 5782 Hs.61812 NM_002835 ENSG00000127947 PTPN12 PTP-PEST|PTPG1 protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12 protein-coding 122.333-40 chr11 131252255 131252586 + 0.666667 NA Intergenic Tigger16a|DNA|TcMar-Tigger -118195 NM_001352003 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 119.667-173 chr7 25814547 25814794 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24551 NR_157808 646588 Hs.72068 NR_157808 ENSG00000223561 LOC646588 - uncharacterized LOC646588 ncRNA 167-18 chr10 124739019 124739408 + 0.666667 NA intron (NM_014661, intron 1 of 4) MIR|SINE|MIR 5165 NM_014661 9679 Hs.129195 NM_014661 ENSG00000189319 FAM53B KIAA0140|bA12J10.2|smp family with sequence similarity 53 member B protein-coding 157.667-103 chr14 73047906 73048344 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10409 NM_021239 58517 Hs.531106 NM_021239 ENSG00000119707 RBM25 NET52|RED120|RNPC7|S164|Snu71|fSAP94 RNA binding motif protein 25 protein-coding 220.333-101 chr4 48648528 48648920 + 0.666667 NA intron (NM_015030, intron 3 of 63) L1MB8|LINE|L1 131575 NM_015030 285527 Hs.595553 NM_015030 ENSG00000075539 FRYL AF4p12|KIAA0826|MOR2 FRY like transcription coactivator protein-coding 151.667-359 chr8 62473875 62474154 + 0.666667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 225160 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 211.333-105 chr2 33089864 33090346 + 0.666667 NA intron (NM_206943, intron 3 of 33) intron (NM_206943, intron 3 of 33) -44492 NM_001166265 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 137-72 chr4 85095641 85095951 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 128312 NR_152782 404201 Hs.46730 NM_205857 ENSG00000180769 WDFY3-AS2 C4orf12|FBI4|NCRNA00247 WDFY3 antisense RNA 2 ncRNA 145-62 chr21 33965019 33965452 + 0.666667 NA intron (NR_134558, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu -11147 NR_134561 101928126 Hs.436879 NR_134561 LOC101928126 - uncharacterized LOC101928126 ncRNA 130.667-188 chr7 104465690 104466072 + 0.666667 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) L1PREC2|LINE|L1 137225 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 112.333-279 chr9 104627147 104627366 + 0.666667 NA Intergenic AluSq4|SINE|Alu -9052 NM_001001956 286362 Hs.553682 NM_001001956 ENSG00000136839 OR13C9 OR37L|OR9-13 olfactory receptor family 13 subfamily C member 9 protein-coding 118-111 chr6 45107308 45107528 + 0.666667 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) intron (NM_001350325, intron 2 of 10) 90352 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 159.667-266 chr5 111121783 111122106 + 0.666667 NA intron (NM_139281, intron 19 of 22) intron (NM_139281, intron 19 of 22) 29772 NM_139281 134430 Hs.533237 NM_139281 ENSG00000134987 WDR36 GLC1G|TA-WDRP|TAWDRP|UTP21 WD repeat domain 36 protein-coding 147.333-275 chr6 55303754 55304044 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_C|SINE|Alu -23570 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 145-133 chrX 54834543 54834808 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 20305 NR_002953 677799 Hs.679783 NR_002953 ENSG00000221716 SNORA11 SNORA11A|U107 small nucleolar RNA, H/ACA box 11 snoRNA 136.333-141 chr4 31853742 31854022 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -143497 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 158-28 chr11 124501224 124501575 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42255 NM_001005195 219858 Hs.553634 NM_001005195 ENSG00000170953 OR8B12 OR11-317 olfactory receptor family 8 subfamily B member 12 protein-coding 126.333-32 chr12 8125144 8125419 + 0.666667 NA intron (NM_194448, intron 1 of 3) L1ME4a|LINE|L1 1649 NM_194450 50856 Hs.504657 NM_016184 ENSG00000111729 CLEC4A CD367|CLECSF6|DCIR|DDB27|HDCGC13P|LLIR C-type lectin domain family 4 member A protein-coding 209.667-77 chr22 19618452 19618941 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -51857 NR_024381 150185 Hs.719752 NR_024381 LINC00895 - long intergenic non-protein coding RNA 895 ncRNA 172.333-45 chr13 64266012 64266514 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -190252 NR_145420 144766 Hs.719557 NR_145420 ENSG00000227674 LINC00355 - long intergenic non-protein coding RNA 355 ncRNA 147.333-266 chr5 100175396 100175741 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 212686 NR_027503 100133050 Hs.534796 NR_027503 LOC100133050 - glucuronidase beta pseudogene pseudo 113.333-187 chr4 1137335 1137578 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -14292 NR_033768 100379220 Hs.635208 NR_033768 ENSG00000215367 TMED11P p24a1|p24alpha1 transmembrane p24 trafficking protein 11, pseudogene pseudo 203.667-43 chr18 41896116 41896586 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58883 NM_002647 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 133-73 chr5 38508529 38508766 + 0.666667 NA intron (NM_001127671, intron 7 of 19) AluY|SINE|Alu 47999 NM_001127671 3977 Hs.133421 NM_002310 ENSG00000113594 LIFR CD118|LIF-R|SJS2|STWS|SWS LIF receptor subunit alpha protein-coding 141-50 chr3 40741019 40741266 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 216182 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 230.667-93 chr8 142846078 142846470 + 0.666667 NA intron (NM_002066, intron 3 of 3) intron (NM_002066, intron 3 of 3) 11473 NM_002066 2765 Hs.661218 NM_002066 ENSG00000104499 GML LY6DL glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like protein-coding 148-92 chr20 49074632 49075000 + 0.666667 NA exon (NM_001256135, exon 10 of 24) exon (NM_001256135, exon 10 of 24) 28504 NM_001316 1434 Hs.90073 NM_001316 ENSG00000124207 CSE1L CAS|CSE1|XPO2 chromosome segregation 1 like protein-coding 155.667-100 chr14 69682114 69682432 + 0.666667 NA intron (NM_014734, intron 2 of 5) AluJr|SINE|Alu 70677 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 147.667-51 chr11 42728751 42729049 + 0.666667 NA Intergenic FLAM_A|SINE|Alu -475210 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 148.333-246 chr3 32568540 32568894 + 0.666667 NA intron (NM_016141, intron 2 of 12) intron (NM_016141, intron 2 of 12) 2141 NM_016141 51143 Hs.529495 NM_016141 ENSG00000144635 DYNC1LI1 DLC-A|DNCLI1|LIC1 dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 protein-coding 144-88 chr20 52269974 52270376 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78190 NM_199427 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 125.333-88 chr2 37981380 37981646 + 0.666667 NA intron (NM_001170793, intron 4 of 9) intron (NM_001170793, intron 4 of 9) 31049 NM_144713 151393 Hs.591566 NM_144713 ENSG00000115841 RMDN2 BLOCK18|FAM82A|FAM82A1|PRO34163|PYST9371|RMD-2|RMD2|RMD4 regulator of microtubule dynamics 2 protein-coding 143.333-104 chr15 86140182 86140511 + 0.666667 NA intron (NM_152336, intron 1 of 24) intron (NM_152336, intron 1 of 24) -23629 NR_120368 101929701 Hs.132570 NR_120368 ENSG00000260477 LINC01584 - long intergenic non-protein coding RNA 1584 ncRNA 124.333-67 chr18 1966391 1966622 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 604999 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 140.667-39 chr10 82807353 82807730 + 0.666667 NA intron (NR_163252, intron 3 of 8) intron (NR_163252, intron 3 of 8) -574621 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 118.333-77 chr15 90743467 90743747 + 0.666667 NA intron (NM_001287246, intron 2 of 22) FAM|SINE|Alu 26261 NM_001287246 641 Hs.725208 NM_000057 ENSG00000197299 BLM BS|MGRISCE1|RECQ2|RECQL2|RECQL3 BLM RecQ like helicase protein-coding 165.667-16 chr10 35761165 35761473 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16983 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 178-32 chr12 6900143 6900480 + 0.666667 NA Intergenic MER66A|LTR|ERV1 -4511 NM_001135217 10233 Hs.155586 NM_006992 ENSG00000010626 LRRC23 LRPB7 leucine rich repeat containing 23 protein-coding 112.333-108 chr19 34063348 34063528 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -109066 NM_015578 26065 Hs.744009 NM_015578 ENSG00000257103 LSM14A C19orf13|FAM61A|RAP55|RAP55A LSM14A mRNA processing body assembly factor protein-coding 135.333-176 chr7 46622689 46623068 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3D|LINE|L1 74244 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 210-143 chr8 54080054 54080495 + 0.666667 NA intron (NM_001279356, intron 2 of 7) AluJb|SINE|Alu 21280 NM_001279360 10434 Hs.744046 NM_006330 ENSG00000120992 LYPLA1 APT-1|APT1|LPL-I|LPL1|hAPT1 lysophospholipase 1 protein-coding 163.667-3 chr1 62114958 62115340 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 35 of 43) AluSq2|SINE|Alu -36293 NR_036059 100422946 NR_036059 ENSG00000283690 MIR3116-2 - microRNA 3116-2 ncRNA 176.667-55 chr14 49760906 49761211 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -7095 NM_014315 23588 Hs.509264 NM_014315 ENSG00000165516 KLHDC2 HCLP-1|HCLP1|LCP kelch domain containing 2 protein-coding 112.667-44 chr11 115589996 115590248 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85707 NM_014333 23705 Hs.370510 NM_014333 ENSG00000182985 CADM1 BL2|IGSF4|IGSF4A|NECL2|Necl-2|RA175|ST17|SYNCAM|TSLC1|sTSLC-1|sgIGSF|synCAM1 cell adhesion molecule 1 protein-coding 230.667-59 chr4 48464009 48464459 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -19109 NM_152679 201780 Hs.132591 NM_152679 ENSG00000145248 SLC10A4 P4 solute carrier family 10 member 4 protein-coding 147-144 chr9 19133836 19134171 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -6397 NR_038064 123 Hs.3416 NM_001122 ENSG00000147872 PLIN2 ADFP|ADRP perilipin 2 protein-coding 226-62 chr3 138353706 138354216 + 0.666667 NA intron (NM_001252090, intron 1 of 5) intron (NM_001252090, intron 1 of 5) 4741 NM_001252090 22808 Hs.527021 NM_012219 ENSG00000158186 MRAS M-RAs|R-RAS3|RRAS3 muscle RAS oncogene homolog protein-coding 144.333-62 chr13 98715446 98715776 + 0.666667 NA intron (NM_005073, intron 9 of 22) intron (NM_005073, intron 9 of 22) 37061 NM_005073 6564 Hs.436893 NM_005073 ENSG00000088386 SLC15A1 HPECT1|HPEPT1|PEPT1 solute carrier family 15 member 1 protein-coding 127.667-27 chr11 24173073 24173378 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -323828 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 134.667-74 chr15 86740814 86741076 + 0.666667 NA intron (NM_152336, intron 23 of 24) intron (NM_152336, intron 23 of 24) -191935 NR_135682 105370954 Hs.668501 NR_135682 ENSG00000259636 LOC105370954 - uncharacterized LOC105370954 ncRNA 189.333-162 chr5 107320351 107320826 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -309574 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 121.333-6 chr1 68075199 68075454 + 0.666667 NA intron (NR_040077, intron 3 of 9) L1PA15|LINE|L1 -23695 NM_004675 9077 Hs.194695 NM_004675 ENSG00000162595 DIRAS3 ARHI|NOEY2 DIRAS family GTPase 3 protein-coding 149-126 chr6 35790510 35790936 + 0.666667 NA intron (NM_001348773, intron 2 of 2) LTR48B|LTR|ERV1 6600 NM_001252597 1208 Hs.1340 NM_001832 ENSG00000137392 CLPS - colipase protein-coding 173.333-31 chr10 117059112 117059439 + 0.666667 NA intron (NM_001258300, intron 1 of 17) L1MD1|LINE|L1 -53698 NM_001258298 57698 Hs.501140 NM_018330 ENSG00000187164 SHTN1 KIAA1598|shootin-1 shootin 1 protein-coding 211.667-96 chr6 35794053 35794546 + 0.666667 NA TTS (NM_001252598) TTS (NM_001252598) 3024 NM_001252597 1208 Hs.1340 NM_001832 ENSG00000137392 CLPS - colipase protein-coding 125.667-190 chr8 110264339 110264674 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -288735 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 125-127 chr9 83918050 83918290 + 0.666667 NA intron (NM_001271928, intron 1 of 15) AluJr4|SINE|Alu 3262 NM_017576 55582 Hs.697514 NM_017576 ENSG00000165115 KIF27 - kinesin family member 27 protein-coding 117.333-79 chr17 28029189 28029366 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL -13400 NM_016231 51701 Hs.208759 NM_016231 ENSG00000087095 NLK - nemo like kinase protein-coding 198-104 chr2 220481870 220482167 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -575453 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 183.333-32 chr12 65613177 65613659 + 0.666667 NA TTS (NR_146529) TTS (NR_146529) 10549 NR_146529 105369807 NR_146529 ENSG00000256268 LINC02454 - long intergenic non-protein coding RNA 2454 ncRNA 148-40 chr14 59762741 59762983 + 0.666667 NA intron (NM_021136, intron 1 of 8) intron (NM_021136, intron 1 of 8) 107914 NM_021136 6252 Hs.368626 NM_021136 ENSG00000139970 RTN1 NSP reticulon 1 protein-coding 134-71 chr3 132472973 132473295 + 0.666667 NA intron (NM_001329126, intron 21 of 56) intron (NM_001329126, intron 21 of 56) 55632 NM_015268 23317 Hs.12707 NM_015268 ENSG00000138246 DNAJC13 PARK21|RME8 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13 protein-coding 138-86 chr4 172727124 172727402 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_125894) promoter-TSS (NR_125894) -385 NR_125894 101928314 Hs.566023 NR_125894 GALNTL6-AS1 - GALNTL6 antisense RNA 1 ncRNA 142.667-213 chr7 127833584 127833921 + 0.666667 NA intron (NM_014390, intron 11 of 23) L1MB3|LINE|L1 -163757 NR_027330 27099 Hs.657377 NM_014411 ENSG00000279078 SND1-IT1 C7orf54|NAG8|NSG-X SND1 intronic transcript 1 ncRNA 114-111 chr4 149265138 149265424 + 0.666667 NA intron (NR_125887, intron 12 of 12) intron (NR_125887, intron 12 of 12) 110986 NR_125887 101927849 Hs.434595 NR_125887 ENSG00000248210 LINC02355 - long intergenic non-protein coding RNA 2355 ncRNA 143.333-72 chr13 34090733 34091017 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -257168 NR_146542 105370158 NR_146542 LINC02343 - long intergenic non-protein coding RNA 2343 ncRNA 135.667-104 chr20 48396271 48396604 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 36526 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 154-31 chr11 104749627 104749967 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -140495 NR_120585 102723895 Hs.48803 NR_120585 ENSG00000256422 LINC02552 - long intergenic non-protein coding RNA 2552 ncRNA 123-133 chr9 28059021 28059207 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) LTR14B|LTR|ERVK -485248 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 185.333-6 chr1 77612709 77613168 + 0.666667 NA intron (NM_001308237, intron 4 of 13) L1MA9|LINE|L1 69720 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 165.667-73 chr17 61713425 61713894 + 0.666667 NA intron (NM_032043, intron 17 of 19) AluSx1|SINE|Alu -122440 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 128.667-131 chr4 94173207 94173492 + 0.666667 NA intron (NR_125922, intron 1 of 8) AluSx3|SINE|Alu 34207 NR_125922 101929210 Hs.518877 NR_125922 ENSG00000246541 LOC101929210 - uncharacterized LOC101929210 ncRNA 185-19 chr14 100521702 100522228 + 0.666667 NA intron (NM_001350950, intron 3 of 5) L1MC5|LINE|L1 46105 NM_001159531 57596 Hs.211751 NM_020836 ENSG00000183092 BEGAIN - brain enriched guanylate kinase associated protein-coding 163.333-199 chr4 70146342 70146706 + 0.666667 NA intron (NR_033311, intron 7 of 7) intron (NR_033311, intron 7 of 7) -7713 NM_214711 401137 Hs.518795 NM_214711 ENSG00000187533 PRR27 C4orf40 proline rich 27 protein-coding 133-49 chr2 218718606 218718888 + 0.666667 NA intron (NM_014640, intron 1 of 19) intron (NM_014640, intron 1 of 19) 7912 NM_014640 9654 Hs.471405 NM_014640 ENSG00000135912 TTLL4 - tubulin tyrosine ligase like 4 protein-coding 190.667-24 chr11 64442178 64442630 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6653 NR_073177 100996455 Hs.634142 NR_073177 ENSG00000181908 LINC02724 - long intergenic non-protein coding RNA 2724 ncRNA 138.333-161 chr6 22395807 22396091 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -93114 NM_001163558 5617 Hs.1905 NM_000948 ENSG00000172179 PRL GHA1 prolactin protein-coding 120.333-11 chr1 160772427 160772645 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -23638 NM_001261457 4063 Hs.403857 NM_002348 ENSG00000122224 LY9 CD229|SLAMF3|hly9|mLY9 lymphocyte antigen 9 protein-coding 180.333-54 chr2 67952803 67953182 + 0.666667 NA Intergenic MER47A|DNA|TcMar-Tigger 110012 NM_001190265 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 207-83 chr3 195557228 195557732 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14155 NM_001316325 5504 Hs.535731 NM_006241 ENSG00000184203 PPP1R2 IPP-2|IPP2|PPP1R2A protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 protein-coding 112.333-219 chr5 152856251 152856565 + 0.666667 NA intron (NR_109877, intron 2 of 4) intron (NR_109877, intron 2 of 4) 115941 NR_109877 101927134 Hs.531423 NR_109877 ENSG00000249484 LINC01470 - long intergenic non-protein coding RNA 1470 ncRNA 173.667-184 chr8 129740243 129740715 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 46145 NM_031415 56169 Hs.133244 NM_031415 ENSG00000147697 GSDMC MLZE gasdermin C protein-coding 124.667-158 chr4 180006293 180006560 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 1152723 NR_033918 728081 Hs.535735 NR_033918 ENSG00000248197 LINC00290 NCRNA00290 long intergenic non-protein coding RNA 290 ncRNA 146.667 chr1 19336620 19336900 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 24434 NM_001040125 54896 Hs.647620 NM_017765 ENSG00000040487 SLC66A1 LAAT-1|LAAT1|PQLC2 solute carrier family 66 member 1 protein-coding 172.333-16 chr10 44455350 44455776 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -70466 NM_199168 6387 Hs.522891 NM_000609 ENSG00000107562 CXCL12 IRH|PBSF|SCYB12|SDF1|TLSF|TPAR1 C-X-C motif chemokine ligand 12 protein-coding 136-18 chr12 40870593 40870857 + 0.666667 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) intron (NM_001256064, intron 1 of 15) -37632 NM_175038 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 137.667-23 chr10 33347295 33347517 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12501 NM_001244972 8829 Hs.131704 NM_003873 ENSG00000099250 NRP1 BDCA4|CD304|NP1|NRP|VEGF165R neuropilin 1 protein-coding 210-44 chr14 92661052 92661556 + 0.666667 NA intron (NM_024832, intron 7 of 9) intron (NM_024832, intron 7 of 9) 85070 NM_001319987 79890 Hs.326822 NM_024832 ENSG00000100599 RIN3 - Ras and Rab interactor 3 protein-coding 139.667-91 chr2 139710537 139710816 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 813352 NR_033658 647012 Hs.639411 NR_033658 YY1P2 - YY1 transcription factor pseudogene 2 pseudo 132.667-41 chr12 66576089 66576360 + 0.666667 NA intron (NM_001366722, intron 2 of 24) L3|LINE|CR1 102852 NM_001366722 23426 Hs.505946 NM_021150 ENSG00000155974 GRIP1 FRASRS3|GRIP glutamate receptor interacting protein 1 protein-coding 201-38 chr14 90372133 90372689 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24091 NM_001363669 801 Hs.282410 NM_006888 ENSG00000198668 CALM1 CALML2|CAM2|CAM3|CAMB|CAMC|CAMI|CAMIII|CPVT4|DD132|LQT14|PHKD|caM calmodulin 1 protein-coding 113.333-144 chr2 226396379 226396587 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR 253689 NR_046102 646736 Hs.712836 NR_046102 LOC646736 - uncharacterized LOC646736 ncRNA 114.667-106 chr17 42541383 42541713 + 0.666667 NA intron (NM_000263, intron 5 of 5) intron (NM_000263, intron 5 of 5) 5307 NM_000263 4669 Hs.50727 NM_000263 ENSG00000108784 NAGLU CMT2V|MPS-IIIB|MPS3B|NAG|UFHSD N-acetyl-alpha-glucosaminidase protein-coding 196.333-64 chr17 56252567 56253056 + 0.666667 NA intron (NM_001370326, intron 3 of 20) AluJr|SINE|Alu 99336 NM_001370326 162282 Hs.673040 NM_153228 ENSG00000153930 ANKFN1 - ankyrin repeat and fibronectin type III domain containing 1 protein-coding 278.667-46 chr6 41927153 41927814 + 0.666667 NA exon (NM_004053, exon 2 of 7) exon (NM_004053, exon 2 of 7) 5984 NM_004053 705 Hs.106880 NM_004053 ENSG00000112578 BYSL BYSTIN|Enp1 bystin like protein-coding 122.333-10 chr1 119689200 119689403 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22633 NM_006623 26227 Hs.487296 NM_006623 ENSG00000092621 PHGDH 3-PGDH|3PGDH|HEL-S-113|NLS|NLS1|PDG|PGAD|PGD|PGDH|PHGDHD|SERA phosphoglycerate dehydrogenase protein-coding 123.667-121 chr3 56323675 56323872 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 2 of 17) intron (NR_132749, intron 2 of 17) 144694 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 151.667-130 chr15 95762516 95762903 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 329616 NR_027132 145820 Hs.652702 NR_027132 ENSG00000259134 LINC00924 - long intergenic non-protein coding RNA 924 ncRNA 175.333-32 chr12 92167848 92168144 + 0.666667 NA TTS (NR_135037) TTS (NR_135037) 21911 NR_135037 101928617 Hs.434392 NR_135036 LOC101928617 - uncharacterized LOC101928617 ncRNA 160.333-15 chr1 69588410 69588752 + 0.666667 NA intron (NM_001366842, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR 19240 NM_001366842 57554 Hs.479658 NM_020794 ENSG00000033122 LRRC7 DENSIN leucine rich repeat containing 7 protein-coding 112.333-19 chr10 15604820 15605144 + 0.666667 NA intron (NM_001291494, intron 18 of 28) intron (NM_001291494, intron 18 of 28) 114940 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 115.333-118 chr2 186637212 186637398 + 0.666667 NA intron (NM_001145000, intron 6 of 27) AluJb|SINE|Alu 37100 NM_001144999 3685 Hs.436873 NM_002210 ENSG00000138448 ITGAV CD51|MSK8|VNRA|VTNR integrin subunit alpha V protein-coding 148-47 chr15 83134041 83134390 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_016073, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_016073, exon 6 of 6) 26570 NR_148560 53346 Hs.513094 NM_023003 ENSG00000136404 TM6SF1 - transmembrane 6 superfamily member 1 protein-coding 158.667-203 chr3 22329896 22330224 + 0.666667 NA Intergenic L1MEi|LINE|L1 372921 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 139.333-89 chr17 42822830 42823138 + 0.666667 NA TTS (NR_106839) TTS (NR_106839) 895 NM_001313999 8678 Hs.716464 NM_003766 ENSG00000126581 BECN1 ATG6|VPS30|beclin1 beclin 1 protein-coding 148.333-395 chr8 121128453 121128892 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -316626 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 154.333-73 chr12 125723675 125723981 + 0.666667 NA Intergenic (TATATC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 101376 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 138-5 chr1 117678269 117678508 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 72340 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 206-26 chr10 115608860 115609467 + 0.666667 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) intron (NM_207303, intron 26 of 28) 515798 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 147.667-389 chr9 27218824 27219138 + 0.666667 NA intron (NM_001290077, intron 19 of 21) intron (NM_001290077, intron 19 of 21) 63812 NR_026679 158035 Hs.201554 NR_026679 ENSG00000283945 LINC00032 C9orf14|NCRNA00032 long intergenic non-protein coding RNA 32 ncRNA 165-67 chr4 65624116 65624509 + 0.666667 NA intron (NM_001281767, intron 2 of 16) intron (NM_001281767, intron 2 of 16) 45176 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 150.333-31 chr10 20960612 20960913 + 0.666667 NA intron (NM_001173484, intron 4 of 6) intron (NM_001173484, intron 4 of 6) -63160 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 199-65 chr3 18500806 18501182 + 0.666667 NA intron (NR_125803, intron 4 of 6) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -55402 NM_001322874 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 131.667-119 chr21 37198545 37198877 + 0.666667 NA intron (NM_003316, intron 44 of 45) intron (NM_003316, intron 44 of 45) -4785 NR_046651 100874006 Hs.570411 NR_046651 ENSG00000228677 TTC3-AS1 - TTC3 antisense RNA 1 ncRNA 121-8 chr1 147394252 147394515 + 0.666667 NA intron (NR_038423, intron 3 of 3) L1MD1|LINE|L1 123492 NR_038423 100289211 Hs.323484 NR_038423 ENSG00000278811 LINC00624 - long intergenic non-protein coding RNA 624 ncRNA 173-63 chr4 35237304 35237723 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -967766 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 154.333-133 chr18 50889522 50889925 + 0.666667 NA intron (NM_002396, intron 1 of 15) LTR49-int|LTR|ERV1 10605 NM_001168335 4200 Hs.233119 NM_002396 ENSG00000082212 ME2 ODS1 malic enzyme 2 protein-coding 150-139 chr8 27557269 27557627 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53303 NR_106902 102465508 NR_106902 ENSG00000284280 MIR6843 hsa-mir-6843 microRNA 6843 ncRNA 194.333-7 chr1 93229334 93229764 + 0.666667 NA intron (NM_001306076, intron 17 of 28) intron (NM_001306076, intron 17 of 28) 48833 NM_001306076 343099 Hs.482873 NM_206886 ENSG00000122483 CCDC18 NY-SAR-41 coiled-coil domain containing 18 protein-coding 144.667-78 chr14 41023250 41023624 + 0.666667 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) L1PB4|LINE|L1 68726 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 123.667-159 chr5 79415407 79415765 + 0.666667 NA intron (NM_004272, intron 5 of 8) intron (NM_004272, intron 5 of 8) 98250 NM_001277077 9456 Hs.591761 NM_004272 ENSG00000152413 HOMER1 HOMER|HOMER1A|HOMER1B|HOMER1C|SYN47|Ves-1 homer scaffold protein 1 protein-coding 228-66 chr5 58501708 58502073 + 0.666667 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger 10455 NM_001304429 202309 Hs.547697 NM_152687 ENSG00000175857 GAPT C5orf29 GRB2 binding adaptor protein, transmembrane protein-coding 153.333-143 chr15 65481454 65481782 + 0.666667 NA intron (NR_135485, intron 8 of 20) intron (NR_135485, intron 8 of 20) 35656 NR_135486 54878 Hs.458609 NM_017743 ENSG00000074603 DPP8 DP8|DPRP-1|DPRP1|MST097|MSTP097|MSTP135|MSTP141 dipeptidyl peptidase 8 protein-coding 143.333-130 chr2 27588664 27588957 + 0.666667 NA intron (NM_001271286, intron 2 of 12) L1ME1|LINE|L1 5768 NM_032434 84450 Hs.529178 NM_032434 ENSG00000243943 ZNF512 - zinc finger protein 512 protein-coding 161-34 chr17 44305262 44305730 + 0.666667 NA intron (NR_110802, intron 2 of 3) AluJr|SINE|Alu 2935 NR_110802 101926996 Hs.666688 NR_110802 RUNDC3A-AS1 - RUNDC3A antisense RNA 1 ncRNA 138-45 chr17 60501267 60501599 + 0.666667 NA intron (NM_006380, intron 1 of 12) AluSz|SINE|Alu 24807 NM_001282476 10513 Hs.84084 NM_006380 ENSG00000062725 APPBP2 APP-BP2|HS.84084|PAT1 amyloid beta precursor protein binding protein 2 protein-coding 143-130 chr8 137466148 137466446 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52709 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 162.333-145 chr22 24512917 24513225 + 0.666667 NA intron (NM_016327, intron 4 of 9) L1MB2|LINE|L1 17739 NM_016327 51733 Hs.731656 NM_016327 ENSG00000100024 UPB1 BUP1 beta-ureidopropionase 1 protein-coding 176.333-165 chr8 64295284 64295616 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 1 of 4) intron (NR_125826, intron 1 of 4) 73108 NR_125826 102724623 Hs.586375 NR_125826 ENSG00000253554 LINC01414 - long intergenic non-protein coding RNA 1414 ncRNA 153-93 chr3 48382431 48382742 + 0.666667 NA intron (NM_207102, intron 10 of 10) L1ME3G|LINE|L1 10367 NM_001159929 285231 Hs.288793 NM_207102 ENSG00000164049 FBXW12 FBW12|FBXO12|FBXO35 F-box and WD repeat domain containing 12 protein-coding 172.333-86 chr2 150547765 150548260 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 24209 NR_110241 101929260 Hs.732324 NR_110241 ENSG00000236049 LINC01920 - long intergenic non-protein coding RNA 1920 ncRNA 154.333-44 chr10 106974919 106975242 + 0.666667 NA intron (NM_001206569, intron 1 of 25) intron (NM_001206569, intron 1 of 25) 189626 NM_001206571 114815 Hs.591915 NM_052918 ENSG00000108018 SORCS1 hSorCS sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 protein-coding 143-63 chr2 30082283 30082539 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -64596 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 161.667-139 chr2 128117037 128117419 + 0.666667 NA intron (NR_027671, intron 8 of 40) AluSx1|SINE|Alu 26028 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 112.667-62 chr14 36317437 36317626 + 0.666667 NA intron (NM_001144891, intron 1 of 8) intron (NM_001144891, intron 1 of 8) 3106 NM_016586 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 169.667-127 chr3 34130494 34130946 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 332090 NM_013374 10015 Hs.475896 NM_013374 ENSG00000170248 PDCD6IP AIP1|ALIX|DRIP4|HP95 programmed cell death 6 interacting protein protein-coding 125-52 chr18 61773737 61773958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25671 NR_103449 100996669 Hs.586981 NR_103449 LINC01544 - long intergenic non-protein coding RNA 1544 ncRNA 140.667-242 chr8 138410424 138410775 + 0.666667 NA intron (NM_001362965, intron 1 of 19) L1P1|LINE|L1 86662 NM_015912 51059 Hs.126024 NM_015912 ENSG00000147724 FAM135B C8ORFK32 family with sequence similarity 135 member B protein-coding 131 chr1 14646054 14646290 + 0.666667 NA intron (NM_201628, intron 1 of 14) L1ME1|LINE|L1 47455 NM_015209 23254 Hs.368823 NM_015209 ENSG00000189337 KAZN KAZ kazrin, periplakin interacting protein protein-coding 192-134 chr7 38088275 38088694 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -89761 NM_032016 83930 Hs.309753 NM_032016 ENSG00000010270 STARD3NL MENTHO STARD3 N-terminal like protein-coding 178.333-129 chr4 136649558 136650048 + 0.666667 NA Intergenic MER129|LTR?|LTR? -543953 NR_134640 729307 Hs.552764 NR_134640 LINC02510 - long intergenic non-protein coding RNA 2510 ncRNA 167.333-86 chr14 86387447 86387897 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 452994 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 194.667-158 chr8 130593120 130593575 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -149673 NM_001362926 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 179.667-99 chr4 76772462 76772858 + 0.666667 NA intron (NM_020859, intron 10 of 10) intron (NM_020859, intron 10 of 10) 125484 NM_001029870 345079 Hs.257292 NM_001029870 ENSG00000186212 SOWAHB ANKRD56 sosondowah ankyrin repeat domain family member B protein-coding 116.333-174 chr5 78496917 78497147 + 0.666667 NA intron (NM_005779, intron 4 of 4) L2a|LINE|L2 136415 NR_110885 9522 Hs.482587 NM_004866 ENSG00000085365 SCAMP1 SCAMP|SCAMP37 secretory carrier membrane protein 1 protein-coding 126-81 chr4 59357825 59358030 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 344354 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 128.333-39 chr11 83830359 83830711 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 17 of 27) MIR|SINE|MIR -148110 NM_001142702 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 172.667-25 chr10 108514561 108515015 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -445495 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 252-34 chr15 67021888 67022495 + 0.666667 NA intron (NR_135686, intron 2 of 5) AluSx1|SINE|Alu 41991 NR_135686 102723493 Hs.419760 NR_135686 LOC102723493 - uncharacterized LOC102723493 ncRNA 127-100 chr8 125780547 125780857 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 170495 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 114.333-17 chr1 231793895 231794191 + 0.666667 NA intron (NM_001164547, intron 6 of 7) AluSx|SINE|Alu 24474 NR_002227 27184 Hs.720568 NR_002227 DISC2 DISC1-AS1|DISC1OS|NCRNA00015 disrupted in schizophrenia 2 ncRNA 229-72 chr9 1655992 1656449 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -359127 NM_003070 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 116.667-154 chr5 7781169 7781346 + 0.666667 NA intron (NM_020546, intron 18 of 24) intron (NM_020546, intron 18 of 24) 69876 NM_001089584 134121 Hs.709979 NM_001089584 ENSG00000215217 C5orf49 - chromosome 5 open reading frame 49 protein-coding 138.333-78 chr17 61903983 61904314 + 0.666667 NA intron (NM_001351695, intron 9 of 24) AluJo|SINE|Alu 23834 NM_020748 57508 Hs.279646 NM_020748 ENSG00000108506 INTS2 INT2|KIAA1287 integrator complex subunit 2 protein-coding 218.667-27 chr12 115039468 115039943 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -355530 NM_016569 6926 Hs.744016 NM_005996 ENSG00000135111 TBX3 TBX3-ISO|UMS|XHL T-box transcription factor 3 protein-coding 153.667-163 chr18 13702099 13702543 + 0.666667 NA intron (NM_001098801, intron 1 of 4) MER57-int|LTR|ERV1 24237 NM_152352 125228 Hs.13034 NM_152352 ENSG00000177150 FAM210A C18orf19|HsT2329 family with sequence similarity 210 member A protein-coding 201-19 chr10 90990429 90990955 + 0.666667 NA intron (NR_131214, intron 4 of 5) AluSq2|SINE|Alu -42474 NR_134319 105378430 Hs.512240 NR_134319 LOC105378430 - uncharacterized LOC105378430 ncRNA 161.667-29 chr10 82072165 82072572 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 160552 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 129-130 chr8 107382295 107382598 + 0.666667 NA intron (NM_001199859, intron 1 of 8) intron (NM_001199859, intron 1 of 8) -45931 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 202.667-10 chr1 178178545 178178944 + 0.666667 NA intron (NM_170692, intron 1 of 17) intron (NM_170692, intron 1 of 17) 84640 NM_170692 9462 Hs.496139 NM_004841 ENSG00000075391 RASAL2 NGAP RAS protein activator like 2 protein-coding 137-23 chr12 38786888 38787220 + 0.666667 NA intron (NM_153634, intron 6 of 19) L1MA2|LINE|L1 118537 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 156-20 chr10 64673870 64674188 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -151499 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 131.333-64 chr16 88303390 88303629 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109228 NR_110944 101928880 Hs.634835 NR_110944 ENSG00000260420 LINC02182 LA16c-444G7.2 long intergenic non-protein coding RNA 2182 ncRNA 188.333-137 chr6 148923424 148923827 + 0.666667 NA intron (NM_005715, intron 2 of 7) AluYk11|SINE|Alu 41059 NR_038408 100128176 Hs.557541 NR_038408 UST-AS1 - UST antisense RNA 1 ncRNA 138.333-146 chr5 40481732 40482063 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -198018 NM_000958 5734 Hs.199248 NM_000958 ENSG00000171522 PTGER4 EP4|EP4R prostaglandin E receptor 4 protein-coding 178-72 chr20 5293515 5293983 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22983 NM_144773 128674 Hs.375029 NM_144773 ENSG00000101292 PROKR2 GPR73L1|GPR73b|GPRg2|HH3|KAL3|PKR2|dJ680N4.3 prokineticin receptor 2 protein-coding 147-51 chr16 63614431 63614719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1507488 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 129-47 chr17 73757292 73757502 + 0.666667 NA TTS (NM_001278587) TTS (NM_001278587) 19543 NM_001278587 100134391 Hs.694655 NM_001278587 LOC100134391 - uncharacterized LOC100134391 protein-coding 175-27 chr15 65445270 65445641 + 0.666667 NA non-coding (NR_135486, exon 22 of 22) non-coding (NR_135486, exon 22 of 22) -22508 NM_020962 57722 Hs.458607 NM_020962 ENSG00000103742 IGDCC4 DDM36|NOPE immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4 protein-coding 174.333-25 chr12 29635911 29636250 + 0.666667 NA intron (NM_175861, intron 5 of 17) L1MC5a|LINE|L1 -136387 NM_001353179 341350 Hs.674588 NM_183378 ENSG00000187950 OVCH1 OVCH ovochymase 1 protein-coding 182-15 chr10 26190503 26190950 + 0.666667 NA intron (NM_017433, intron 31 of 34) intron (NM_017433, intron 31 of 34) -25581 NM_000818 2572 Hs.231829 NM_000818 ENSG00000136750 GAD2 GAD65 glutamate decarboxylase 2 protein-coding 121.333-98 chr20 31330648 31330847 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -22162 NM_001037731 245930 Hs.580703 NM_001037731 ENSG00000215545 DEFB116 DEFB-16 defensin beta 116 protein-coding 249.667-105 chr9 29198328 29198803 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 1 of 5) intron (NM_001354574, intron 1 of 5) 13734 NM_001354575 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 161-98 chr8 77450570 77450925 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_125830) promoter-TSS (NR_125830) 50 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 163.667-30 chr10 96537179 96537531 + 0.666667 NA intron (NM_020123, intron 9 of 14) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -23429 NM_012465 7093 Hs.154296 NM_012465 ENSG00000095587 TLL2 - tolloid like 2 protein-coding 117-156 chrX 75289046 75289233 + 0.666667 NA intron (NR_030774, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 15054 NM_145052 139596 Hs.91612 NM_145052 ENSG00000094841 UPRT FUR1|UPP uracil phosphoribosyltransferase homolog protein-coding 153.667-267 chr3 136286514 136286859 + 0.666667 NA intron (NM_000532, intron 6 of 14) L2|LINE|L2 36346 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 159.667-114 chr15 80402281 80402604 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1940 NM_014862 9915 Hs.459070 NM_014862 ENSG00000172379 ARNT2 WEDAS|bHLHe1 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 protein-coding 171.667-166 chr8 113932056 113932423 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -495300 NM_001363185 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 156.333-170 chr2 26643390 26643686 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -2172 NM_001029881 130106 Hs.591579 NM_001029881 ENSG00000157884 CIB4 KIP4 calcium and integrin binding family member 4 protein-coding 202.333-130 chr4 92850622 92851115 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 546469 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 144-67 chr18 71710485 71710762 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J-int|LTR|ERVL-MaLR 71603 NR_126324 102724913 NR_126324 ENSG00000265352 LINC01899 - long intergenic non-protein coding RNA 1899 ncRNA 174.667-19 chr10 5523299 5523749 + 0.666667 NA intron (NR_120497, intron 1 of 2) MamGypLTR1b|LTR|Gypsy -1437 NM_005185 810 Hs.239600 NM_005185 ENSG00000178363 CALML3 CLP calmodulin like 3 protein-coding 153-108 chr5 23650919 23651216 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 143412 NM_001310214 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 132.333-163 chr7 48400600 48400834 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 38 of 61) intron (NM_152701, intron 38 of 61) 229259 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 160-104 chr5 168121158 168121583 + 0.666667 NA intron (NM_001368145, intron 9 of 26) intron (NM_001368145, intron 9 of 26) -44475 NR_162139 113219458 NR_162139 MIR12125 - microRNA 12125 ncRNA 177.667-114 chr6 35984185 35984600 + 0.666667 NA intron (NM_138718, intron 5 of 17) AluSx3|SINE|Alu 40108 NM_138718 116369 Hs.435836 NM_052961 ENSG00000112053 SLC26A8 SPGF3|TAT1 solute carrier family 26 member 8 protein-coding 205-93 chr8 13484730 13485317 + 0.666667 NA intron (NM_024767, intron 2 of 4) intron (NM_024767, intron 2 of 4) 29828 NM_182643 10395 Hs.134296 NM_006094 ENSG00000164741 DLC1 ARHGAP7|HP|STARD12|p122-RhoGAP DLC1 Rho GTPase activating protein protein-coding 128-11 chr10 120407976 120408227 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48853 NM_001318167 196051 Hs.40479 NM_001030059 ENSG00000203805 PLPP4 DPPL2|PPAPDC1|PPAPDC1A phospholipid phosphatase 4 protein-coding 190-96 chr4 158245284 158245733 + 0.666667 NA intron (NM_018342, intron 12 of 12) MIR|SINE|MIR 35022 NM_018342 55314 Hs.176227 NM_018342 ENSG00000164124 TMEM144 - transmembrane protein 144 protein-coding 173.333-133 chr3 131397214 131397634 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15650 NR_033268 131870 Hs.282050 NM_152395 ENSG00000198585 NUDT16 - nudix hydrolase 16 protein-coding 146.667-156 chr2 40742532 40742851 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -230256 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 150-38 chr14 26758981 26759282 + 0.666667 NA intron (NR_147061, intron 3 of 6) L1MA8|LINE|L1 -50217 NR_110557 102724890 Hs.569381 NR_110556 ENSG00000257185 LINC02293 - long intergenic non-protein coding RNA 2293 ncRNA 143.333-242 chr6 67158709 67158991 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -896501 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 136.333-164 chr5 32746982 32747325 + 0.666667 NA intron (NM_001364460, intron 2 of 6) HAL1|LINE|L1 35832 NM_001204375 4883 Hs.13528 NM_000908 ENSG00000113389 NPR3 ANP-C|ANPR-C|ANPRC|C5orf23|GUCY2B|NPR-C|NPRC natriuretic peptide receptor 3 protein-coding 112.667-235 chr6 122233558 122233878 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -165833 NM_001135564 3298 Hs.158195 NM_004506 ENSG00000025156 HSF2 HSF 2|HSTF 2 heat shock transcription factor 2 protein-coding 162.667-304 chrX 146972506 146972837 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -157927 NM_001244892 100133053 NM_001244892 ENSG00000235699 CXorf51B CXorf51A chromosome X open reading frame 51B protein-coding 157.667-95 chr13 105222488 105222918 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -243164 NM_001161814 267012 Hs.381382 NM_172370 ENSG00000182346 DAOA LG72|SG72 D-amino acid oxidase activator protein-coding 122.667-45 chr14 49637158 49637453 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2075 NM_018139 55172 Hs.231761 NM_018139 ENSG00000165506 DNAAF2 C14orf104|CILD10|KTU|PF13 dynein axonemal assembly factor 2 protein-coding 119.333-214 chr8 87704819 87705116 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 169048 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 123-93 chr5 10922038 10922258 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -160914 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 160.667-215 chr3 191516098 191516413 + 0.666667 NA intron (NR_120606, intron 1 of 6) intron (NR_120606, intron 1 of 6) 55092 NM_001083308 152138 Hs.690618 NM_001083308 ENSG00000253548 PYDC2 POP2|cPOP2 pyrin domain containing 2 protein-coding 176.333-127 chr4 123134670 123135017 + 0.666667 NA intron (NM_001345856, intron 14 of 15) L1M3|LINE|L1 211765 NM_145207 166378 Hs.709648 NM_145207 ENSG00000145375 SPATA5 AFG2|EHLMRS|SPAF spermatogenesis associated 5 protein-coding 138-73 chr3 19819419 19819707 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 114654 NM_144715 151651 Hs.733920 NM_144715 ENSG00000163576 EFHB CFAP21 EF-hand domain family member B protein-coding 125.333-192 chrX 27532722 27532910 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -57528 NM_001353448 347442 Hs.720885 NM_001136533 ENSG00000189186 DCAF8L2 WDR42C DDB1 and CUL4 associated factor 8 like 2 protein-coding 167.333-32 chr1 215084577 215084915 + 0.666667 NA intron (NM_001017425, intron 1 of 6) intron (NM_001017425, intron 1 of 6) 2009 NM_001017425 3776 Hs.497745 NM_014217 ENSG00000082482 KCNK2 K2p2.1|TPKC1|TREK|TREK-1|TREK1|hTREK-1c|hTREK-1e potassium two pore domain channel subfamily K member 2 protein-coding 171.333-35 chr12 29128253 29128665 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL -20819 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 215.333-121 chr22 38525092 38525500 + 0.666667 NA intron (NM_001363017, intron 10 of 11) intron (NM_001363017, intron 10 of 11) -18985 NM_006386 10521 Hs.528305 NM_006386 ENSG00000100201 DDX17 P72|RH70 DEAD-box helicase 17 protein-coding 204-183 chr7 46632063 46632447 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR 64867 NR_134575 730338 Hs.640207 NR_134575 ENSG00000233539 LOC730338 - uncharacterized LOC730338 ncRNA 144-143 chr7 6332513 6332857 + 0.666667 NA intron (NM_001037163, intron 1 of 1) AluJb|SINE|Alu 16282 NM_001037163 84792 Hs.696146 NM_001037163 ENSG00000286075 FAM220A ACPIN1|C7orf70|SIPAR family with sequence similarity 220 member A protein-coding 115.333-22 chr1 242144801 242145109 + 0.666667 NA intron (NM_001320272, intron 6 of 10) intron (NM_001320272, intron 6 of 10) -145857 NM_001004343 440738 Hs.534971 NM_001004343 ENSG00000197769 MAP1LC3C ATG8J|LC3C microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma protein-coding 207-94 chr4 185303496 185303840 + 0.666667 NA intron (NM_001317781, intron 6 of 18) AluY|SINE|Alu 75330 NM_018409 55805 Hs.558513 NM_018409 ENSG00000109771 LRP2BP - LRP2 binding protein protein-coding 152.667-320 chr6 46545281 46545589 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -53368 NM_001251973 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 212-141 chr6 108576537 108577153 + 0.666667 NA intron (NM_201559, intron 2 of 3) intron (NM_201559, intron 2 of 3) 15928 NM_001455 2309 Hs.220950 NM_001455 ENSG00000118689 FOXO3 AF6q21|FKHRL1|FKHRL1P2|FOXO2|FOXO3A forkhead box O3 protein-coding 193.333-93 chr2 111522565 111523047 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27645 NR_136163 541471 Hs.560805 NR_015395 ENSG00000172965 MIR4435-2HG AGD2|LINC00978|MIR4435-1HG|MORRBID|lncRNA-AWPPH MIR4435-2 host gene ncRNA 151-43 chr16 72362156 72362478 + 0.666667 NA intron (NR_126330, intron 8 of 13) MIR|SINE|MIR -189867 NM_001160213 83449 Hs.714939 NM_031293 ENSG00000118557 PMFBP1 SPGF31|STAP polyamine modulated factor 1 binding protein 1 protein-coding 146.667-253 chr5 29386809 29387121 + 0.666667 NA intron (NR_104628, intron 2 of 4) LTR80B|LTR|ERVL 9011 NR_104628 101929681 Hs.549659 NR_104628 LINC02064 - long intergenic non-protein coding RNA 2064 ncRNA 159.667-320 chr8 84519238 84519555 + 0.666667 NA intron (NM_001354308, intron 2 of 9) intron (NM_001354308, intron 2 of 9) 103912 NM_001354308 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 193.667-63 chr2 159872995 159873453 + 0.666667 NA intron (NM_002349, intron 12 of 34) intron (NM_002349, intron 12 of 34) 31532 NM_001198760 100526664 Hs.153563 NM_001198759 ENSG00000248672 LY75-CD302 CD205|CLEC13B|DEC-205|LY75|Ly-75|gp200-MR6 LY75-CD302 readthrough protein-coding 130.667-38 chr10 103094588 103094939 + 0.666667 NA intron (NM_001351194, intron 11 of 17) AluSc|SINE|Alu 59058 NM_001351192 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 202-63 chr17 48134004 48134455 + 0.666667 NA intron (NM_001075099, intron 12 of 12) L1ME4b|LINE|L1 22282 NR_031607 100302211 NR_031607 ENSG00000221739 MIR1203 MIRN1203|hsa-mir-1203 microRNA 1203 ncRNA 150.667-171 chr2 40043339 40043781 + 0.666667 NA intron (NR_038441, intron 2 of 4) intron (NR_038441, intron 2 of 4) 125926 NR_038441 100128590 Hs.744988 NR_038441 ENSG00000227028 SLC8A1-AS1 - SLC8A1 antisense RNA 1 ncRNA 120.333-157 chr5 115070163 115070367 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 99643 NM_001300759 55521 Hs.519514 NM_018700 ENSG00000152503 TRIM36 ANPH|HAPRIN|RBCC728|RNF98 tripartite motif containing 36 protein-coding 123.667-45 chr12 25322124 25322430 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -71348 NM_001369786 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 166-80 chr3 152061558 152061997 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -133602 NR_110203 101928142 Hs.680207 NR_110202 AADACL2-AS1 - AADACL2 antisense RNA 1 ncRNA 150.667-304 chr5 64688091 64688419 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -2248 NM_001164442 100132916 Hs.591776 NM_001164442 ENSG00000145642 SHISAL2B FAM159B shisa like 2B protein-coding 213-31 chr17 47176356 47176862 + 0.666667 NA intron (NM_001256, intron 2 of 18) L2|LINE|L2 12686 NM_001256 996 Hs.463295 NM_001256 ENSG00000004897 CDC27 ANAPC3|APC3|CDC27Hs|D0S1430E|D17S978E|H-NUC|HNUC|NUC2 cell division cycle 27 protein-coding 128.333-166 chr5 159410999 159411317 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 55118 NR_027110 285627 Hs.552766 NR_027110 ENSG00000253298 LINC01845 - long intergenic non-protein coding RNA 1845 ncRNA 200-56 chr14 63094861 63095445 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49695 NM_139318 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 112-85 chr17 59788794 59789105 + 0.666667 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) intron (NM_001329400, intron 5 of 9) -52317 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 136.333-101 chr2 159410073 159410438 + 0.666667 NA intron (NM_001329858, intron 13 of 36) intron (NM_001329858, intron 13 of 36) -123552 NM_001128213 151525 Hs.20848 NM_152528 ENSG00000196151 WDSUB1 UBOX6|WDSAM1 WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 protein-coding 182-4 chr1 86905790 86906111 + 0.666667 NA intron (NR_144513, intron 1 of 4) MER58A|DNA|hAT-Charlie 8176 NM_004261 9403 Hs.362728 NM_004261 ENSG00000183291 SELENOF SEP15 selenoprotein F protein-coding 124.333-6 chr1 85109143 85109506 + 0.666667 NA intron (NM_001288563, intron 14 of 21) intron (NM_001288563, intron 14 of 21) -24470 NR_039619 100616481 NR_039619 ENSG00000266110 MIR4423 mir-4423 microRNA 4423 ncRNA 153.333-318 chr4 164981365 164981689 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -3870 NM_001012414 391712 Hs.654633 NM_001012414 ENSG00000183439 TRIM61 RNF35 tripartite motif containing 61 protein-coding 113-62 chr14 73600989 73601204 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 9390 NM_152331 122970 Hs.49433 NM_152331 ENSG00000177465 ACOT4 PTE-Ib|PTE1B|PTE2B acyl-CoA thioesterase 4 protein-coding 184-68 chr3 113014782 113015245 + 0.666667 NA intron (NM_001319110, intron 1 of 5) L3|LINE|CR1 4658 NM_001319109 25871 Hs.591288 NM_015412 ENSG00000163608 NEPRO C3orf17|NET17 nucleolus and neural progenitor protein protein-coding 154.333-336 chr8 64597152 64597468 + 0.666667 NA intron (NM_004820, intron 5 of 5) intron (NM_004820, intron 5 of 5) -15418 NR_152770 401463 Hs.651960 NR_015374 ENSG00000254102 LOC401463 - uncharacterized LOC401463 ncRNA 162.667-214 chr5 51617320 51617703 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 234063 NM_002202 3670 Hs.505 NM_002202 ENSG00000016082 ISL1 ISLET1|Isl-1 ISL LIM homeobox 1 protein-coding 143-108 chr6 156815631 156815995 + 0.666667 NA intron (NM_020732, intron 1 of 19) intron (NM_020732, intron 1 of 19) -36082 NR_039676 100616154 NR_039676 ENSG00000271899 MIR4466 mir-4466 microRNA 4466 ncRNA 206-32 chr11 77271227 77271705 + 0.666667 NA intron (NM_182833, intron 5 of 16) intron (NM_182833, intron 5 of 16) 30200 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 254-72 chr7 22741843 22742288 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -14445 NR_131935 541472 Hs.512234 NR_131935 ENSG00000179428 LOC541472 - uncharacterized LOC541472 ncRNA 131-67 chr3 185285583 185285924 + 0.666667 NA intron (NM_001242317, intron 2 of 12) intron (NM_001242317, intron 2 of 12) 2792 NM_001242314 9175 Hs.591306 NM_004721 ENSG00000073803 MAP3K13 LZK|MEKK13|MLK mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 protein-coding 133.333-183 chr8 86546146 86546433 + 0.666667 NA intron (NM_003909, intron 9 of 16) intron (NM_003909, intron 9 of 16) 31854 NM_003909 8895 Hs.191219 NM_003909 ENSG00000085719 CPNE3 CPN3|PRO1071 copine 3 protein-coding 176.667-140 chr7 143289504 143289868 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001224) promoter-TSS (NM_001224) 98 NM_001224 835 Hs.368982 NM_001224 ENSG00000106144 CASP2 CASP-2|ICH1|NEDD-2|NEDD2|PPP1R57 caspase 2 protein-coding 125.333-119 chr4 55989887 55990141 + 0.666667 NA intron (NM_025009, intron 14 of 25) MER58B|DNA|hAT-Charlie 41069 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 138.667-189 chr7 29408319 29408595 + 0.666667 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) intron (NM_001293072, intron 6 of 12) -71255 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 134.667-88 chr18 34962948 34963341 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -13784 NM_001143826 10982 Hs.532824 NM_014268 ENSG00000166974 MAPRE2 CSCSC2|EB1|EB2|RP1 microtubule associated protein RP/EB family member 2 protein-coding 183-16 chr10 88519297 88519699 + 0.666667 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) intron (NM_018363, intron 4 of 6) 63820 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 177.333-32 chr12 15236405 15236695 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15133 NM_032918 85004 Hs.199487 NM_032918 ENSG00000134533 RERG - RAS like estrogen regulated growth inhibitor protein-coding 210-93 chr3 98957679 98958096 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -56192 NM_080927 131566 Hs.203691 NM_080927 ENSG00000057019 DCBLD2 CLCP1|ESDN discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 protein-coding 179-68 chr3 156137570 156138080 + 0.666667 NA intron (NM_172160, intron 1 of 13) AluSx1|SINE|Alu -5137 NM_003471 7881 Hs.654519 NM_003471 ENSG00000169282 KCNAB1 AKR6A3|KCNA1B|KV-BETA-1|Kvb1.3|hKvBeta3|hKvb3 potassium voltage-gated channel subfamily A member regulatory beta subunit 1 protein-coding 203-9 chr1 180482372 180482947 + 0.666667 NA intron (NM_032360, intron 3 of 7) intron (NM_032360, intron 3 of 7) 19918 NM_032360 84320 Hs.200051 NM_032360 ENSG00000230124 ACBD6 - acyl-CoA binding domain containing 6 protein-coding 112.667-142 chr2 217143797 217144070 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -138800 NR_133642 105373877 NR_133642 DIRC3-AS1 - DIRC3 antisense RNA 1 ncRNA 389.333-12 chr22 32706290 32707069 + 0.666667 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) intron (NM_003490, intron 6 of 13) -94137 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 120.333-75 chr17 5596819 5597107 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12454 NM_001033053 22861 Hs.652273 NM_014922 ENSG00000091592 NLRP1 AIADK|CARD7|CIDED|CLR17.1|DEFCAP|DEFCAP-L/S|MSPC|NAC|NALP1|PP1044|SLEV1|VAMAS1 NLR family pyrin domain containing 1 protein-coding 186.667-136 chr7 31283005 31283423 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 57512 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 115.667-95 chr17 5465772 5466105 + 0.666667 NA intron (NM_020162, intron 1 of 11) intron (NM_020162, intron 1 of 11) 3044 NM_001199699 56919 Hs.250456 NM_020162 ENSG00000005100 DHX33 DDX33 DEAH-box helicase 33 protein-coding 114-147 chr7 48208478 48208693 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 3 of 61) L1MA4|LINE|L1 37127 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 220-73 chr22 40672213 40672593 + 0.666667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -6775 NM_005297 2847 Hs.248122 NM_005297 ENSG00000128285 MCHR1 GPR24|MCH-1R|MCH1R|SLC-1|SLC1 melanin concentrating hormone receptor 1 protein-coding 113-126 chr20 49602664 49602881 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -34635 NM_000961 5740 Hs.302085 NM_000961 ENSG00000124212 PTGIS CYP8|CYP8A1|PGIS|PTGI prostaglandin I2 synthase protein-coding 196.667-58 chr17 33670056 33670416 + 0.666667 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -136476 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 131.667-147 chr4 73447164 73447402 + 0.666667 NA intron (NM_001354717, intron 7 of 14) (TTCC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 11062 NM_001134 174 Hs.518808 NM_001134 ENSG00000081051 AFP AFPD|FETA|HPAFP alpha fetoprotein protein-coding 150.667-346 chr6 159414138 159414459 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30767 NR_125873 102724053 Hs.98463 NR_125873 ENSG00000234777 LINC02529 - long intergenic non-protein coding RNA 2529 ncRNA 213.666-19 chr17 41662352 41662951 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22452 NR_033415 284116 Hs.725790 NR_033415 ENSG00000214514 KRT42P - keratin 42 pseudogene pseudo 156-117 chr5 111940322 111940623 + 0.666667 NA intron (NR_046678, intron 2 of 3) intron (NR_046678, intron 2 of 3) 27964 NR_046678 100873948 Hs.147716 NR_046678 ENSG00000250095 NREP-AS1 - NREP antisense RNA 1 ncRNA 216.333-54 chr16 20765299 20765779 + 0.666667 NA intron (NM_005622, intron 1 of 13) intron (NM_005622, intron 1 of 13) 1525 NM_005622 6296 Hs.706754 NM_005622 ENSG00000005187 ACSM3 SA|SAH acyl-CoA synthetase medium chain family member 3 protein-coding 118-96 chr4 36996480 36996796 + 0.666667 NA Intergenic Tigger4b|DNA|TcMar-Tigger -5141 NR_134669 100508631 Hs.397553 NR_134669 ENSG00000261761 LINC02616 - long intergenic non-protein coding RNA 2616 ncRNA 150.333-401 chr8 70759866 70760165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90676 NM_001011720 389668 Hs.458938 NM_001011720 ENSG00000221947 XKR9 XRG9 XK related 9 protein-coding 158.333-149 chr2 78249542 78249866 + 0.666667 NA intron (NR_110288, intron 1 of 3) L1M1|LINE|L1 41027 NR_110288 101927967 Hs.406952 NR_110288 LOC101927967 - uncharacterized LOC101927967 ncRNA 143.667-16 chr10 14597094 14597466 + 0.666667 NA intron (NM_001282695, intron 2 of 5) intron (NM_001282695, intron 2 of 5) 7121 NM_001282696 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 151.667-325 chr6 151097115 151097494 + 0.666667 NA intron (NM_001350486, intron 27 of 27) intron (NM_001350486, intron 27 of 27) -5371 NR_162145 113219461 NR_162145 MIR12131 - microRNA 12131 ncRNA 194.333 chr1 20971046 20971483 + 0.666667 NA intron (NM_003760, intron 6 of 31) intron (NM_003760, intron 6 of 31) 17168 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 123.667-49 chr13 113443730 113443917 + 0.666667 NA intron (NM_199162, intron 2 of 6) AluSx1|SINE|Alu 5335 NM_199162 113622 Hs.98669 NM_138430 ENSG00000153531 ADPRHL1 ARH2 ADP-ribosylhydrolase like 1 protein-coding 115.333-31 chr11 9638278 9638511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25683 NM_001297714 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 153.333-92 chr12 45033664 45034063 + 0.666667 NA intron (NM_001004329, intron 2 of 3) intron (NM_001004329, intron 2 of 3) 17236 NM_001004329 440097 Hs.302764 NM_001004329 ENSG00000185610 DBX2 - developing brain homeobox 2 protein-coding 154-117 chr5 156564815 156565141 + 0.666667 NA intron (NM_001128209, intron 3 of 7) intron (NM_001128209, intron 3 of 7) 237814 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 149-109 chr5 17123045 17123444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32748 NR_162112 113218490 NR_162112 MIR10522 - microRNA 10522 ncRNA 157.333-68 chr11 81321590 81321948 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -558966 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 180.667-121 chr6 51254733 51255256 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -366876 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 198.667-139 chr4 114105165 114105563 + 0.666667 NA Intergenic LTR81C|LTR|Gypsy -125717 NM_024590 79642 Hs.22895 NM_024590 ENSG00000180801 ARSJ ASJ arylsulfatase family member J protein-coding 120-81 chr3 19028267 19028568 + 0.666667 NA Intergenic L1MB8|LINE|L1 -120093 NM_144633 131096 Hs.475656 NM_144633 ENSG00000183960 KCNH8 ELK|ELK1|Kv12.1|elk3 potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 protein-coding 191.667-91 chr4 47817573 47817995 + 0.666667 NA intron (NM_006587, intron 1 of 21) intron (NM_006587, intron 1 of 21) -13561 NR_125880 101927179 Hs.570822 NR_125880 LOC101927179 - uncharacterized LOC101927179 ncRNA 141.667-243 chr9 34954934 34955232 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2404 NR_136307 23349 Hs.7989 NM_015297 ENSG00000122733 PHF24 - PHD finger protein 24 protein-coding 135.333-179 chr7 84122292 84122545 + 0.666667 NA intron (NM_006080, intron 3 of 16) L1PA5|LINE|L1 72371 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 126-44 chr17 82307007 82307280 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 10465 NM_006137 924 Hs.36972 NM_006137 ENSG00000173762 CD7 GP40|LEU-9|TP41|Tp40 CD7 molecule protein-coding 113-121 chr20 4843798 4844075 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -20328 NM_014737 9770 Hs.631504 NM_014737 ENSG00000101265 RASSF2 CENP-34|RASFADIN Ras association domain family member 2 protein-coding 142-146 chr7 77940145 77940423 + 0.666667 NA exon (NM_001127358, exon 12 of 18) exon (NM_001127358, exon 12 of 18) 100154 NM_001127359 57157 Hs.203965 NM_020432 ENSG00000006576 PHTF2 - putative homeodomain transcription factor 2 protein-coding 112.333-261 chr8 81830076 81830337 + 0.666667 NA intron (NM_001348189, intron 4 of 9) L1PA16|LINE|L1 11979 NR_145472 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 124.667-77 chr16 17947667 17947886 + 0.666667 NA Intergenic LTR104_Mam|LTR|Gypsy 384886 NM_001282507 101059938 Hs.634612 NM_001282507 ENSG00000214967 NPIPA7 NPIPA8 nuclear pore complex interacting protein family member A7 protein-coding 125.333-96 chr2 133792401 133792680 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B4|LTR|ERVL -224077 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 129.333-44 chr12 15492554 15492837 + 0.666667 NA intron (NM_030667, intron 2 of 26) intron (NM_030667, intron 2 of 26) -53916 NM_030668 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 149-3 chr1 99152794 99153091 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111350 NM_001166252 9890 Hs.13245 NM_014839 ENSG00000117600 PLPPR4 LPPR4|LPR4|PHP1|PRG-1|PRG1 phospholipid phosphatase related 4 protein-coding 111.667-50 chr11 75257884 75258184 + 0.666667 NA Intergenic LTR33A|LTR|ERVL 17260 NM_001195528 100507050 Hs.577323 NM_001195528 ENSG00000261594 TPBGL - trophoblast glycoprotein like protein-coding 198.667-174 chr7 79306320 79306761 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 1 of 20) L3|LINE|CR1 -146417 NR_038346 100505881 Hs.31474 NR_038343 ENSG00000234456 MAGI2-AS3 - MAGI2 antisense RNA 3 ncRNA 137-67 chr4 14470856 14471168 + 0.666667 NA non-coding (NR_126435, exon 7 of 7) non-coding (NR_126435, exon 7 of 7) 359044 NR_033931 152742 Hs.135435 NR_033931 ENSG00000248698 LINC01085 - long intergenic non-protein coding RNA 1085 ncRNA 174.667-140 chr5 45689142 45689618 + 0.666667 NA intron (NM_021072, intron 1 of 7) intron (NM_021072, intron 1 of 7) 7000 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 193.667-145 chr9 118711570 118712094 + 0.666667 NA intron (NR_151725, intron 2 of 3) MIR3|SINE|MIR 32161 NR_151725 111216287 NR_151725 LINC02578 - long intergenic non-protein coding RNA 2578 ncRNA 159.667-203 chr22 28238482 28238787 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 5 of 22) L1MEf|LINE|L1 -221235 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 178.333-149 chr6 46557166 46557632 + 0.666667 NA intron (NM_016593, intron 10 of 11) AluSz6|SINE|Alu -65332 NM_001251973 10231 Hs.440168 NM_005822 ENSG00000172348 RCAN2 CSP2|DSCR1L1|MCIP2|RCN2|ZAKI-4|ZAKI4 regulator of calcineurin 2 protein-coding 148-99 chr3 69323676 69324055 + 0.666667 NA intron (NM_015123, intron 1 of 22) intron (NM_015123, intron 1 of 22) 62223 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 128.667-194 chr9 75298103 75298455 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3|DNA|TcMar-Tigger 209765 NM_012383 26578 Hs.494192 NM_012383 ENSG00000134996 OSTF1 OSF|SH3P2|bA235O14.1 osteoclast stimulating factor 1 protein-coding 170-86 chr3 197149122 197149581 + 0.666667 NA intron (NM_001366216, intron 5 of 23) intron (NM_001366216, intron 5 of 23) 34521 NM_001366221 1739 Hs.292549 NM_004087 ENSG00000075711 DLG1 DLGH1|SAP-97|SAP97|hdlg discs large MAGUK scaffold protein 1 protein-coding 187-25 chr17 19631713 19632036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16276 NM_001369137 224 Hs.499886 NM_000382 ENSG00000072210 ALDH3A2 ALDH10|FALDH|SLS aldehyde dehydrogenase 3 family member A2 protein-coding 156-71 chr2 71507493 71507833 + 0.666667 NA intron (NM_001130985, intron 4 of 54) (GAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 40964 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 177.667-7 chr1 116194751 116195153 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 83197 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 147-57 chr18 9392575 9392994 + 0.666667 NA intron (NM_020648, intron 3 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 58011 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 114.333-232 chr8 124614619 124614805 + 0.666667 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) intron (NM_001282971, intron 3 of 14) 75589 NM_005005 4715 Hs.15977 NM_005005 ENSG00000147684 NDUFB9 B22|CI-B22|LYRM3|MC1DN24|UQOR22 NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 protein-coding 194-67 chr2 21241080 21241498 + 0.666667 NA Intergenic L1PA4|LINE|L1 117303 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 146-19 chr12 1406013 1406339 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 16 of 19) MIR|SINE|MIR -94315 NR_028415 100292680 Hs.391695 NR_028415 ENSG00000249628 LINC00942 - long intergenic non-protein coding RNA 942 ncRNA 122.333-119 chr2 235898293 235898590 + 0.666667 NA intron (NM_001037131, intron 10 of 17) intron (NM_001037131, intron 10 of 17) 269945 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 157-122 chr7 29039148 29039581 + 0.666667 NA intron (NM_001371256, intron 15 of 16) intron (NM_001371256, intron 15 of 16) 59397 NR_038965 100506497 Hs.586328 NR_038965 ENSG00000272568 LOC100506497 - uncharacterized LOC100506497 ncRNA 183-72 chr20 51511326 51511732 + 0.666667 NA intron (NM_012340, intron 3 of 10) L2a|LINE|L2 31190 NM_001258297 4773 Hs.744148 NM_012340 ENSG00000101096 NFATC2 NFAT1|NFATP nuclear factor of activated T cells 2 protein-coding 186-40 chr16 7896504 7896927 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 563870 NM_145891 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 184-7 chr1 94947373 94947777 + 0.666667 NA intron (NR_033998, intron 2 of 3) intron (NR_033998, intron 2 of 3) 19547 NR_033998 729970 Hs.297988 NR_033998 ENSG00000235501 LOC729970 - hCG2028352-like ncRNA 130-126 chr8 67229968 67230264 + 0.666667 NA intron (NM_006421, intron 23 of 38) intron (NM_006421, intron 23 of 38) 113665 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 150-35 chr12 112869724 112870038 + 0.666667 NA intron (NR_145127, intron 9 of 22) intron (NR_145127, intron 9 of 22) -36896 NM_002534 4938 Hs.524760 NM_002534 ENSG00000089127 OAS1 E18/E16|IFI-4|OIAS|OIASI 2'-5'-oligoadenylate synthetase 1 protein-coding 121.333-53 chr14 70529912 70530236 + 0.666667 NA intron (NM_003814, intron 1 of 1) AluSg4|SINE|Alu 4930 NM_003814 8748 Hs.177984 NM_003814 ENSG00000134007 ADAM20 - ADAM metallopeptidase domain 20 protein-coding 157.667-327 chr8 78563564 78563871 + 0.666667 NA intron (NM_181839, intron 1 of 2) L2|LINE|L2 -5214 NR_125389 101927003 Hs.614849 NR_125389 ENSG00000254266 PKIA-AS1 - PKIA antisense RNA 1 ncRNA 128-67 chr3 9353501 9353724 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9442 NM_001114092 25917 Hs.443081 NM_015453 ENSG00000134077 THUMPD3 - THUMP domain containing 3 protein-coding 129.333-91 chr2 42044579 42044829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3317 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 117.667-200 chr8 127130617 127130899 + 0.666667 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 -48537 NR_119373 103164619 Hs.571401 NR_119373 ENSG00000254166 PCAT2 CARLO4|CARLo-4|PCA2|TCONS_00015167 prostate cancer associated transcript 2 ncRNA 155.333-366 chr7 53646635 53647071 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 165078 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 222-59 chr3 62691013 62691532 + 0.666667 NA intron (NM_003716, intron 3 of 29) L1MC1|LINE|L1 184144 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 113.333-104 chr18 6014810 6014999 + 0.666667 NA intron (NR_158609, intron 15 of 17) L2b|LINE|L2 -118950 NM_001080209 645369 NM_001080209 ENSG00000206432 TMEM200C TTMA transmembrane protein 200C protein-coding 144.333-32 chr10 113356691 113356987 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -193992 NM_001177660 3026 Hs.422542 NM_004132 ENSG00000148702 HABP2 FSAP|HABP|HGFAL|NMTC5|PHBP hyaluronan binding protein 2 protein-coding 115.333-200 chr7 52856961 52857305 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -178500 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 245.333-90 chr4 104656716 104657224 + 0.666667 NA intron (NR_125926, intron 4 of 9) THE1D|LTR|ERVL-MaLR -162076 NR_132741 80319 Hs.12248 NM_025212 ENSG00000168772 CXXC4 IDAX CXXC finger protein 4 protein-coding 178.667-111 chr3 192614787 192615167 + 0.666667 NA intron (NM_004113, intron 2 of 5) intron (NM_004113, intron 2 of 5) 99955 NR_046598 100873987 Hs.628012 NR_046598 ENSG00000230126 FGF12-AS2 - FGF12 antisense RNA 2 ncRNA 261-46 chr5 55825681 55826397 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25318 NM_001297572 133396 Hs.55378 NM_139017 ENSG00000164509 IL31RA CRL|CRL3|GLM-R|GLMR|GPL|IL-31RA|PLCA2|PRO21384|hGLM-R interleukin 31 receptor A protein-coding 158.667-89 chr13 81439264 81439618 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -212458 NR_047494 100861546 Hs.539621 NR_047494 ENSG00000260094 LINC00564 - long intergenic non-protein coding RNA 564 ncRNA 129.667-30 chr11 9658123 9658376 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -5828 NM_001297714 23075 Hs.153026 NM_015055 ENSG00000133789 SWAP70 HSPC321|SWAP-70 switching B cell complex subunit SWAP70 protein-coding 154.333-114 chr16 84574849 84575175 + 0.666667 NA intron (NM_021149, intron 3 of 3) intron (NM_021149, intron 3 of 3) 43066 NM_021149 23406 Hs.289092 NM_021149 ENSG00000103187 COTL1 CLP coactosin like F-actin binding protein 1 protein-coding 119-25 chr11 3856784 3857019 + 0.666667 NA TTS (NR_039835) TTS (NR_039835) 839 NR_039835 100616453 NR_039835 ENSG00000284525 MIR4687 - microRNA 4687 ncRNA 176-65 chr4 60111013 60111405 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -811410 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 137.667-14 chr1 211051395 211051658 + 0.666667 NA intron (NM_002238, intron 5 of 10) L2b|LINE|L2 81848 NR_046784 100874296 Hs.737764 NR_046784 KCNH1-IT1 - KCNH1 intronic transcript 1 ncRNA 186.667-146 chr8 61145172 61145651 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142559 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 234.333-33 chr16 77975395 77975951 + 0.666667 NA intron (NM_020927, intron 8 of 8) intron (NM_020927, intron 8 of 8) -46875 NM_005752 10143 Hs.177936 NM_005752 ENSG00000166509 CLEC3A CLECSF1 C-type lectin domain family 3 member A protein-coding 178-31 chr11 113217471 113217850 + 0.666667 NA intron (NM_000615, intron 8 of 17) Plat_L3|LINE|CR1 56241 NR_034101 100288346 Hs.661826 NR_034101 ENSG00000227487 NCAM1-AS1 - NCAM1 antisense RNA1 ncRNA 126.667-52 chr14 68136957 68137326 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) AluSz|SINE|Alu 313549 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 114-25 chr12 48852363 48852555 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_004818) promoter-TSS (NM_004818) -296 NM_004818 9416 Hs.130098 NM_004818 ENSG00000174243 DDX23 PRPF28|SNRNP100|U5-100K|U5-100KD|prp28 DEAD-box helicase 23 protein-coding 112.667-190 chr4 65864379 65864666 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8A|LINE|L1 -194027 NM_001281765 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 243.666-7 chr12 40864984 40865640 + 0.666667 NA intron (NM_001256064, intron 1 of 15) L1MB7|LINE|L1 37374 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 157-58 chr2 27717721 27718024 + 0.666667 NA intron (NR_160725, intron 2 of 2) intron (NR_160725, intron 2 of 2) 1749 NR_160725 105374378 NR_160725 LOC105374378 - uncharacterized LOC105374378 ncRNA 158.667-184 chr2 241294816 241295263 + 0.666667 NA intron (NM_005336, intron 1 of 27) AluSx1|SINE|Alu -20148 NM_001349315 4735 Hs.721234 NM_004404 ENSG00000168385 SEPTIN2 DIFF6|NEDD-5|NEDD5|Pnutl3|SEPT2|hNedd5 septin 2 protein-coding 237.667-85 chr9 97672008 97672457 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001351506, exon 23 of 23) 3' UTR (NM_001351506, exon 23 of 23) 25177 NR_149093 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 156.333-194 chr2 145768347 145768735 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -818516 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 153.333-82 chr12 10559983 10560297 + 0.666667 NA intron (NR_146456, intron 1 of 2) intron (NR_146456, intron 1 of 2) 6761 NR_146455 101060038 NR_146455 LINC02446 - long intergenic non-protein coding RNA 2446 ncRNA 117.667-44 chr13 33274296 33274608 + 0.666667 NA intron (NM_001243476, intron 5 of 17) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -3102 NR_046693 100874241 Hs.662433 NR_046693 ENSG00000236581 STARD13-AS STARD13-AS2 STARD13 antisense RNA ncRNA 172.333-42 chr12 95771589 95772036 + 0.666667 NA intron (NM_001329701, intron 2 of 9) intron (NM_001329701, intron 2 of 9) 18383 NM_001329702 59277 Hs.201034 NM_021229 ENSG00000074527 NTN4 PRO3091 netrin 4 protein-coding 157.667-318 chr8 39053903 39054225 + 0.666667 NA intron (NR_027638, intron 12 of 20) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -35379 NR_145988 109616979 NR_145736 ENSG00000207199 SNORD38D - small nucleolar RNA, C/D box 38D snoRNA 212-22 chr10 44204175 44204607 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -88359 NM_001258000 100130539 Hs.694626 NM_001258000 ENSG00000277288 C10orf142 - chromosome 10 open reading frame 142 protein-coding 211.333-195 chr5 127878561 127878928 + 0.666667 NA intron (NM_001317938, intron 6 of 6) L1PA2|LINE|L1 175355 NM_001317938 728586 Hs.582532 NM_001317938 ENSG00000230561 CCDC192 LINC01183 coiled-coil domain containing 192 protein-coding 111.667-16 chr1 177879248 177879516 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90540 NM_033127 89866 Hs.149540 NM_033127 ENSG00000120341 SEC16B LZTR2|PGPR-p117|RGPR|RGPR-p117|SEC16S SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor protein-coding 126.667-172 chr7 148746960 148747311 + 0.666667 NA intron (NM_001370660, intron 2 of 21) L1ME4c|LINE|L1 47425 NM_001370664 8454 Hs.146806 NM_003592 ENSG00000055130 CUL1 - cullin 1 protein-coding 345.667-12 chr22 48815154 48815895 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 35229 NR_039761 100616415 NR_039761 ENSG00000266887 MIR4535 - microRNA 4535 ncRNA 121-92 chr3 43724223 43724543 + 0.666667 NA intron (NM_001355186, intron 7 of 7) L1MC5a|LINE|L1 -32789 NM_001346468 55129 Hs.656657 NM_018075 ENSG00000160746 ANO10 SCAR10|TMEM16K anoctamin 10 protein-coding 118.333-160 chr5 11582406 11582614 + 0.666667 NA intron (NM_001288717, intron 2 of 20) intron (NM_001288717, intron 2 of 20) 6407 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 112.333-15 chr1 233720902 233721216 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96907 NR_039625 100616390 NR_039625 ENSG00000265744 MIR4427 - microRNA 4427 ncRNA 137-96 chr7 19157941 19158246 + 0.666667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -12672 NM_152898 222894 Hs.592168 NM_152898 ENSG00000146618 FERD3L N-TWIST|NATO3|NTWIST|PTFB|bHLHa31 Fer3 like bHLH transcription factor protein-coding 153.667-167 chr19 8395920 8396311 + 0.666667 NA intron (NM_004218, intron 1 of 4) intron (NM_004218, intron 1 of 4) -5424 NR_038237 100507567 Hs.637720 NR_038237 ENSG00000269386 RAB11B-AS1 MIR4999HG RAB11B antisense RNA 1 ncRNA 186.333-18 chr10 73580712 73581089 + 0.666667 NA intron (NM_001350995, intron 1 of 21) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -5225 NM_152586 159195 Hs.657355 NM_152586 ENSG00000166348 USP54 C10orf29|bA137L10.3|bA137L10.4 ubiquitin specific peptidase 54 protein-coding 194.667-65 chr2 78471001 78471429 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74316 NR_136311 105374820 Hs.570225 NR_136311 LOC105374820 - uncharacterized LOC105374820 ncRNA 119.667-172 chr7 7690756 7691054 + 0.666667 NA intron (NM_002947, intron 2 of 7) UCON74|DNA?|DNA? 27702 NM_002947 6119 Hs.487540 NM_002947 ENSG00000106399 RPA3 REPA3|RP-A p14 replication protein A3 protein-coding 118-30 chr14 21854428 21854748 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -183571 NM_001317107 26687 NM_001317107 ENSG00000276240 OR4E1 OR4E1P olfactory receptor family 4 subfamily E member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 210.333 chr1 17534625 17535046 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4863 NR_137287 55160 Hs.443460 NM_018125 ENSG00000074964 ARHGEF10L GrinchGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like protein-coding 113.333-112 chr19 12295357 12295611 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001164276) promoter-TSS (NM_001164276) -585 NM_001353553 51710 Hs.296731 NM_016264 ENSG00000197857 ZNF44 GIOT-2|KOX7|ZNF|ZNF504|ZNF55|ZNF58 zinc finger protein 44 protein-coding 116.667-82 chr17 63994231 63994464 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4004 NM_001191031 92340 Hs.708161 NM_001164257 ENSG00000224383 PRR29 C17orf72 proline rich 29 protein-coding 165.667-163 chr5 136584607 136584904 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -219279 NM_001167577 57113 Hs.591263 NM_020389 ENSG00000069018 TRPC7 TRP7 transient receptor potential cation channel subfamily C member 7 protein-coding 185.333-76 chr18 54523533 54523832 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64077 NM_001307955 284254 Hs.376146 NM_173629 ENSG00000178690 DYNAP C18orf26 dynactin associated protein protein-coding 123.667-191 chr8 144007360 144007653 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4774 NM_001134374 375686 Hs.97726 NM_198572 ENSG00000186583 SPATC1 SPATA15 spermatogenesis and centriole associated 1 protein-coding 143-75 chr2 174150059 174150426 + 0.666667 NA intron (NM_001011708, intron 3 of 9) MSTC|LTR|ERVL-MaLR 98290 NM_001011708 29789 Hs.157351 NM_013341 ENSG00000138430 OLA1 DOC45|GBP45|GTBP9|GTPBP9|PTD004 Obg like ATPase 1 protein-coding 114.333-44 chr11 78458809 78459142 + 0.666667 NA intron (NM_024678, intron 11 of 13) AluSx1|SINE|Alu -29139 NR_120564 101928865 Hs.407574 NR_120564 ENSG00000251323 LINC02728 - long intergenic non-protein coding RNA 2728 ncRNA 171.667-29 chr11 57003096 57003518 + 0.666667 NA Intergenic LTR1B|LTR|ERV1 14393 NM_001005323 390181 Hs.554520 NM_001005323 ENSG00000181273 OR5AK2 - olfactory receptor family 5 subfamily AK member 2 protein-coding 123-114 chr7 16069148 16069506 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -141159 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 148-79 chr2 60775808 60776208 + 0.666667 NA intron (NM_022894, intron 8 of 21) AluSx3|SINE|Alu 19740 NM_022894 64895 Hs.387471 NM_022894 ENSG00000115421 PAPOLG - poly(A) polymerase gamma protein-coding 127.333-145 chr5 125470901 125471187 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22217 NR_109887 101927460 Hs.407582 NR_109887 ENSG00000260192 LINC02240 - long intergenic non-protein coding RNA 2240 ncRNA 113-34 chr12 5465952 5466226 + 0.666667 NA intron (NM_001102654, intron 1 of 1) intron (NM_001102654, intron 1 of 1) -28043 NM_002527 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 154.333-53 chr11 23049733 23050104 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -189444 NM_001195637 100500938 Hs.555029 NM_001195637 ENSG00000255359 CCDC179 - coiled-coil domain containing 179 protein-coding 157.333-16 chr1 104316564 104316968 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 243743 NR_033990 100129138 Hs.514487 NR_033990 ENSG00000215869 LOC100129138 - THAP domain containing 3 pseudogene pseudo 118.333-187 chr7 4303674 4303876 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -168938 NR_158215 105375131 NR_158215 LOC105375131 - uncharacterized LOC105375131 ncRNA 145.333-43 chr10 94231715 94231987 + 0.666667 NA intron (NM_001165979, intron 4 of 31) MER1B|DNA|hAT-Charlie 55219 NR_033969 100128054 Hs.677562 NR_033969 ENSG00000268894 PLCE1-AS1 - PLCE1 antisense RNA 1 ncRNA 112-5 chr1 61799385 61799659 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 11 of 43) intron (NM_001350145, intron 11 of 43) -46553 NR_162146 113219465 NR_162146 MIR12132 - microRNA 12132 ncRNA 149.333-344 chr6 114476838 114477230 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -414157 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 158.667-300 chr7 29173203 29173527 + 0.666667 NA intron (NM_001293069, intron 2 of 13) MER94|DNA|hAT-Blackjack 16692 NM_001371263 219.333-55 chr15 40145691 40146168 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15080 NM_001211 701 Hs.513645 NM_001211 ENSG00000156970 BUB1B BUB1beta|BUBR1|Bub1A|MAD3L|MVA1|SSK1|hBUBR1 BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase B protein-coding 131.333-88 chr2 82216285 82216581 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -640370 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 114.333-183 chr5 144216179 144216376 + 0.666667 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) intron (NM_001370487, intron 2 of 2) 10886 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 155.333-359 chr7 33175461 33175837 + 0.666667 NA intron (NM_198428, intron 4 of 22) MER57C2|LTR|ERV1 46085 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 273.667-2 chr1 64204516 64205155 + 0.666667 NA intron (NM_001366232, intron 1 of 9) intron (NM_001366232, intron 1 of 9) 1212 NR_158769 148581 Hs.388746 NM_152489 ENSG00000177414 UBE2U - ubiquitin conjugating enzyme E2 U protein-coding 180.667-29 chr12 54858091 54858507 + 0.666667 NA TTS (NM_058173) TTS (NM_058173) 3783 NM_058173 118430 Hs.348419 NM_058173 ENSG00000172551 MUCL1 SBEM mucin like 1 protein-coding 136.333-95 chr2 82100257 82100581 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -633473 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 154.667-56 chr11 6238347 6238809 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001037329) promoter-TSS (NM_001037329) -511 NM_001037329 1262 Hs.434618 NM_001037329 ENSG00000132259 CNGA4 CNCA2|CNG-4|CNG4|CNG5|CNGB2|OCNC2|OCNCBETA|OCNCb cyclic nucleotide gated channel alpha 4 protein-coding 146.667-127 chr17 5375801 5376115 + 0.666667 NA intron (NM_001083585, intron 13 of 16) AluSz|SINE|Alu -43683 NR_027682 84268 Hs.462086 NM_032308 ENSG00000129197 RPAIN HRIP|RIP RPA interacting protein protein-coding 160.667-152 chr2 105305688 105306007 + 0.666667 NA intron (NM_001142621, intron 2 of 11) AluSx1|SINE|Alu 23809 NR_137328 9392 Hs.446350 NM_004257 ENSG00000135966 TGFBRAP1 TRAP-1|TRAP1|VPS3 transforming growth factor beta receptor associated protein 1 protein-coding 414-7 chr20 31058227 31058952 + 0.666667 NA Intergenic (GGAAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -199075 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 176.333-53 chr14 79898689 79899102 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -312524 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 209-78 chr3 40545041 40545655 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20388 NM_001098414 285268 Hs.19977 NM_198484 ENSG00000172888 ZNF621 - zinc finger protein 621 protein-coding 156.667-170 chr2 26966891 26967303 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3540 NM_012326 22924 Hs.515860 NM_012326 ENSG00000084764 MAPRE3 EB3|EBF3|EBF3-S|RP3 microtubule associated protein RP/EB family member 3 protein-coding 123.667-31 chr10 64845457 64845790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20095 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 127-21 chr10 92505650 92505929 + 0.666667 NA intron (NR_136399, intron 10 of 25) L2a|LINE|L2 -8028 NM_001165946 3416 Hs.500546 NM_004969 ENSG00000119912 IDE INSULYSIN insulin degrading enzyme protein-coding 114-136 chr6 54249566 54249737 + 0.666667 NA intron (NM_138569, intron 11 of 12) intron (NM_138569, intron 11 of 12) -58790 NM_014464 27283 Hs.127011 NM_014464 ENSG00000137251 TINAG TIN-AG tubulointerstitial nephritis antigen protein-coding 145-24 chr12 127851541 127851817 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29938 NR_033987 400087 Hs.524846 NR_033987 ENSG00000256597 LINC02393 - long intergenic non-protein coding RNA 2393 ncRNA 162.333-95 chr17 71941385 71941787 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 84393 NR_110876 102723505 Hs.547482 NR_110876 ROCR LINC02095 regulator of chondrogenesis RNA ncRNA 192.667-155 chr7 7859165 7859651 + 0.666667 NA intron (NM_001302350, intron 4 of 4) intron (NM_001302350, intron 4 of 4) 109344 NR_110018 100505921 Hs.634989 NR_110018 LOC100505921 - uncharacterized LOC100505921 ncRNA 163.333-3 chr1 15254081 15254418 + 0.666667 NA intron (NM_052929, intron 2 of 30) intron (NM_052929, intron 2 of 30) 7024 NM_052929 114827 Hs.659997 NM_052929 ENSG00000142621 FHAD1 - forkhead associated phosphopeptide binding domain 1 protein-coding 139.667-35 chr12 22719088 22719411 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 94078 NM_018638 55500 Hs.29464 NM_018638 ENSG00000139163 ETNK1 EKI|EKI 1|EKI1|Nbla10396 ethanolamine kinase 1 protein-coding 186.667-124 chr6 40602078 40602543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14946 NM_020737 57497 Hs.250015 NM_020737 ENSG00000156564 LRFN2 FIGLER2|KIAA1246|SALM1 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 protein-coding 210.667-126 chr8 82728873 82729381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -182977 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 161.333-83 chr13 105499698 105500093 + 0.666667 NA intron (NR_040247, intron 1 of 6) intron (NR_040247, intron 1 of 6) 5786 NR_040247 282706 Hs.558713 NR_040247 ENSG00000232307 DAOA-AS1 DAOA-AS|DAOAAS|G30 DAOA antisense RNA 1 ncRNA 112.667-24 chr1 242406889 242407158 + 0.666667 NA intron (NM_001320272, intron 2 of 10) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 42445 NM_001195812 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 221-2 chr1 45303720 45304117 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_024270) promoter-TSS (NR_024270) 8 NR_024270 400752 Hs.334348 NR_024270 ENSG00000281912 LINC01144 - long intergenic non-protein coding RNA 1144 ncRNA 155.667-311 chr6 118661812 118662150 + 0.666667 NA intron (NM_001178035, intron 1 of 13) intron (NM_001178035, intron 1 of 13) -10390 NM_206921 387119 Hs.656959 NM_206921 ENSG00000111860 CEP85L C6orf204|NY-BR-15|bA57K17.2 centrosomal protein 85 like protein-coding 127-79 chr6 35407710 35407938 + 0.666667 NA intron (NM_001171818, intron 3 of 8) intron (NM_001171818, intron 3 of 8) -44537 NM_021922 2178 Hs.302003 NM_021922 ENSG00000112039 FANCE FACE|FAE FA complementation group E protein-coding 174.667-4 chr1 70633772 70634207 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -72464 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 198.333-45 chr12 58378358 58378749 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -213149 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 184.667-40 chr16 74649607 74650066 + 0.666667 NA intron (NM_001370539, intron 2 of 11) L1MC5a|LINE|L1 17041 NM_001370536 55159 Hs.567525 NM_018124 ENSG00000168411 RFWD3 FANCW|RNF201 ring finger and WD repeat domain 3 protein-coding 142-129 chr6 121579888 121580171 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 144383 NM_000165 2697 Hs.74471 NM_000165 ENSG00000152661 GJA1 AVSD3|CMDR|CX43|EKVP|EKVP3|GJAL|HLHS1|HSS|ODDD|PPKCA gap junction protein alpha 1 protein-coding 118-128 chr8 19809899 19810136 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL -7132 NM_001353516 55174 Hs.512627 NM_018142 ENSG00000104613 INTS10 C8orf35|INT10 integrator complex subunit 10 protein-coding 158-54 chr15 92235280 92235657 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -158413 NM_006011 8128 Hs.302341 NM_006011 ENSG00000140557 ST8SIA2 HsT19690|SIAT8-B|SIAT8B|ST8SIA-II|ST8SiaII|STX ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 protein-coding 144.333-67 chr14 36631212 36631625 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -26150 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 119.333-54 chr11 82038524 82038795 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 5 of 7) intron (NR_120571, intron 5 of 7) -147823 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 164-112 chr8 53103557 53103905 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 147906 NM_001318497 4986 Hs.106795 NM_000912 ENSG00000082556 OPRK1 K-OR-1|KOR|KOR-1|OPRK opioid receptor kappa 1 protein-coding 148-148 chr6 132098422 132098719 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 16693 NR_039673 100616191 NR_039673 ENSG00000265669 MIR548AJ1 - microRNA 548aj-1 ncRNA 112-87 chr17 67716013 67716307 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1673 NM_001303272 25926 Hs.463936 NM_015462 ENSG00000130935 NOL11 - nucleolar protein 11 protein-coding 150.333-252 chr22 29376647 29376951 + 0.666667 NA intron (NM_001166019, intron 1 of 20) intron (NM_001166019, intron 1 of 20) 11771 NM_001166019 162 Hs.368794 NM_001127 ENSG00000100280 AP1B1 ADTB1|AP105A|BAM22|CLAPB2 adaptor related protein complex 1 subunit beta 1 protein-coding 120.333-185 chr8 82180461 82180742 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -338315 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 164-52 chr2 721590 721890 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -44334 NM_001352680 129787 Hs.6729 NM_152834 ENSG00000151353 TMEM18 lncND transmembrane protein 18 protein-coding 130.333-204 chr8 54855314 54855700 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 239411 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 168-103 chr7 52674343 52674841 + 0.666667 NA Intergenic LTR82A|LTR|ERVL -361041 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 122.333-94 chr2 69168810 69169056 + 0.666667 NA intron (NM_032208, intron 13 of 17) intron (NM_032208, intron 13 of 17) 65251 NR_036073 100423030 NR_036073 ENSG00000266649 MIR3126 mir-3126 microRNA 3126 ncRNA 225.333-50 chr14 62749198 62749812 + 0.666667 NA intron (NM_172375, intron 9 of 9) PRIMA41-int|LTR|ERV1 295953 NM_172375 27133 Hs.27043 NM_139318 ENSG00000140015 KCNH5 EAG2|H-EAG2|Kv10.2|hEAG2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 5 protein-coding 174-88 chr6 146988657 146989031 + 0.666667 NA intron (NR_034115, intron 6 of 10) L1P3|LINE|L1 -170081 NR_132442 106182249 Hs.575390 NR_132442 ENSG00000196634 LUADT1 - lung adenocarcinoma associated transcript 1 ncRNA 166-114 chr7 135441848 135442241 + 0.666667 NA intron (NM_013316, intron 1 of 10) intron (NM_013316, intron 1 of 10) 68058 NM_013316 4850 Hs.490224 NM_013316 ENSG00000080802 CNOT4 CLONE243|NOT4|NOT4H CCR4-NOT transcription complex subunit 4 protein-coding 125.667-119 chr3 22034529 22034879 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 77565 NR_046876 100874221 Hs.160616 NR_046876 ENSG00000223351 ZNF385D-AS2 - ZNF385D antisense RNA 2 ncRNA 269.667-11 chr11 12425817 12426389 + 0.666667 NA intron (NM_018222, intron 1 of 12) L2b|LINE|L2 48532 NM_018222 55742 Hs.432914 NM_018222 ENSG00000197702 PARVA CH-ILKBP|MXRA2 parvin alpha protein-coding 143.333-291 chr8 118379443 118379704 + 0.666667 NA exon (NM_001363274, exon 4 of 5) exon (NM_001363274, exon 4 of 5) -241428 NR_038210 552860 Hs.571527 NR_038210 ENSG00000281641 SAMD12-AS1 C8orf26|NCRNA00252 SAMD12 antisense RNA 1 ncRNA 145.333-23 chr1 229385898 229386258 + 0.666667 NA Intergenic MER74A|LTR|ERVL -43031 NM_145257 126731 Hs.585011 NM_145257 ENSG00000154429 CCSAP C1orf96|CSAP centriole, cilia and spindle associated protein protein-coding 197-111 chr7 50511667 50512087 + 0.666667 NA intron (NM_001242889, intron 4 of 12) L1MCa|LINE|L1 -19882 NR_033845 100129427 Hs.680434 NR_033845 ENSG00000226122 DDC-AS1 - DDC antisense RNA 1 ncRNA 203.333-79 chr14 62468720 62469258 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -329016 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 139-79 chr5 17976979 17977355 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 169893 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 114.667-161 chr21 30608598 30608835 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 5188 NM_181602 337966 Hs.194301 NM_181602 ENSG00000184724 KRTAP6-1 C21orf103|KAP6.1 keratin associated protein 6-1 protein-coding 264-43 chr5 140423055 140423810 + 0.666667 NA intron (NM_001197030, intron 1 of 9) intron (NM_001197030, intron 1 of 9) 21599 NM_024668 54882 Hs.594084 NM_017747 ENSG00000131503 ANKHD1 MASK|MASK1|PP2500|VBARP ankyrin repeat and KH domain containing 1 protein-coding 116-111 chr3 107186723 107186980 + 0.666667 NA intron (NR_028303, intron 1 of 3) L1MD2|LINE|L1 53787 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 143-97 chr5 137871686 137871982 + 0.666667 NA intron (NM_006790, intron 2 of 9) intron (NM_006790, intron 2 of 9) 3974 NM_001300911 9499 Hs.84665 NM_006790 ENSG00000120729 MYOT LGMD1|LGMD1A|MFM3|TTID|TTOD myotilin protein-coding 169-61 chr22 49426891 49427226 + 0.666667 NA intron (NR_110522, intron 1 of 2) intron (NR_110522, intron 1 of 2) 116408 NR_037440 100500882 NR_037440 ENSG00000264139 MIR3667 - microRNA 3667 ncRNA 126-118 chr8 117775250 117775463 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 145557 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 130-21 chr11 34433087 34433465 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -5658 NM_001752 847 Hs.502302 NM_001752 ENSG00000121691 CAT - catalase protein-coding 218.333-77 chr20 31055765 31056250 + 0.666667 NA Intergenic (TGGAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -201657 NM_001037730 245929 Hs.580793 NM_001037730 ENSG00000215547 DEFB115 DEFB-15 defensin beta 115 protein-coding 121.667-217 chr9 80945004 80945213 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 744427 NM_001303103 7088 Hs.197320 NM_005077 ENSG00000196781 TLE1 ESG|ESG1|GRG1 TLE family member 1, transcriptional corepressor protein-coding 150.667-406 chrX 56587974 56588407 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 24597 NM_013444 29978 Hs.179309 NM_013444 ENSG00000188021 UBQLN2 ALS15|CHAP1|DSK2|HRIHFB2157|N4BP4|PLIC2 ubiquilin 2 protein-coding 160.333-244 chr6 51004221 51004616 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 185547 NM_003221 7021 Hs.33102 NM_003221 ENSG00000008196 TFAP2B AP-2B|AP2-B|PDA2 transcription factor AP-2 beta protein-coding 129.333-13 chr1 247610164 247610515 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 4753 NM_001001914 81469 Hs.653227 NM_001001914 ENSG00000177476 OR2G3 OR1-33 olfactory receptor family 2 subfamily G member 3 protein-coding 166.333-87 chr16 84485101 84485475 + 0.666667 NA intron (NM_020947, intron 5 of 7) intron (NM_020947, intron 5 of 7) -17927 NR_146503 105371374 Hs.610979 NR_146503 ENSG00000261286 ATP2C2-AS1 - ATP2C2 antisense RNA 1 ncRNA 155.333-123 chr16 12291417 12291814 + 0.666667 NA intron (NM_032167, intron 15 of 20) intron (NM_032167, intron 15 of 20) 314881 NM_032167 92017 Hs.458401 NM_032167 ENSG00000048471 SNX29 A-388D4.1|RUNDC2A sorting nexin 29 protein-coding 202-103 chr21 16328892 16329317 + 0.666667 NA intron (NR_027790, intron 4 of 7) intron (NR_027790, intron 4 of 7) -44336 NR_145757 109617014 NR_145757 ENSG00000201025 SNORD74B - small nucleolar RNA, C/D box 74B snoRNA 150-34 chr12 70266653 70266955 + 0.666667 NA intron (NM_001199303, intron 1 of 15) L1MEf|LINE|L1 23090 NM_001199303 4848 Hs.133350 NM_014515 ENSG00000111596 CNOT2 CDC36|HSPC131|NOT2|NOT2H CCR4-NOT transcription complex subunit 2 protein-coding 123-18 chr10 81978704 81978927 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) FLAM_C|SINE|Alu 101128 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 114.667-208 chr5 60889039 60889229 + 0.666667 NA intron (NM_001007233, intron 11 of 12) L1MC4|LINE|L1 -44860 NM_001104558 79993 Hs.274256 NM_024930 ENSG00000164181 ELOVL7 - ELOVL fatty acid elongase 7 protein-coding 175.667-102 chr3 131258112 131258502 + 0.666667 NA intron (NM_001353036, intron 14 of 14) L1PB1|LINE|L1 -103538 NR_002949 152195 Hs.380350 NM_194289 ENSG00000246082 NUDT16P1 NUDT16P nudix hydrolase 16 pseudogene 1 pseudo 179.667-53 chr15 46340863 46341253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 635863 NR_135680 105370802 Hs.447522 NR_135680 ENSG00000259200 LOC105370802 - uncharacterized LOC105370802 ncRNA 154-140 chr8 91918948 91919362 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 98525 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 112-20 chr10 66698605 66698862 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -227303 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 127-10 chr1 207898094 207898406 + 0.666667 NA intron (NM_001025109, intron 3 of 7) AluSz|SINE|Alu 12875 NM_001025109 947 Hs.374990 NM_001773 ENSG00000174059 CD34 - CD34 molecule protein-coding 139-13 chr10 57704923 57705209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -400507 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 161-100 chr8 115257840 115258260 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 409963 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 134.667-132 chr3 42063702 42064096 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR -23301 NR_146089 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 164.333-92 chr17 59786930 59787264 + 0.666667 NA intron (NM_001329400, intron 5 of 9) intron (NM_001329400, intron 5 of 9) -54169 NR_029493 406991 Hs.444569 NR_029493 ENSG00000284190 MIR21 MIRN21|hsa-mir-21|miR-21|miRNA21 microRNA 21 ncRNA 154.667-152 chr18 34645111 34645396 + 0.666667 NA intron (NM_001198939, intron 1 of 21) intron (NM_001198939, intron 1 of 21) 51918 NM_001128175 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 154.667-311 chr5 55130966 55131322 + 0.666667 NA intron (NM_001145734, intron 6 of 10) L1MEf|LINE|L1 28498 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 139-53 chr2 172125396 172125645 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 22514 NR_126376 104326193 Hs.600690 NR_126376 ENSG00000236651 DLX2-DT DLX2-AS1|TCONS_00003049 DLX2 divergent transcript ncRNA 123.667-91 chr2 75377139 75377373 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -146812 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 152.667-368 chr8 72530907 72531225 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -6159 NM_004770 9312 Hs.661102 NM_004770 ENSG00000182674 KCNB2 KV2.2 potassium voltage-gated channel subfamily B member 2 protein-coding 165-83 chr6 35373936 35374275 + 0.666667 NA intron (NM_001171819, intron 2 of 6) intron (NM_001171819, intron 2 of 6) 31547 NM_006238 5467 Hs.696032 NM_006238 ENSG00000112033 PPARD FAAR|NR1C2|NUC1|NUCI|NUCII|PPARB peroxisome proliferator activated receptor delta protein-coding 206.667-146 chr9 14178218 14178735 + 0.666667 NA intron (NM_001369477, intron 2 of 7) intron (NM_001369477, intron 2 of 7) 2326 NM_001282787 4781 Hs.644095 NM_005596 ENSG00000147862 NFIB CTF|HMGIC/NFIB|MACID|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 nuclear factor I B protein-coding 161-96 chr7 139013819 139014243 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22011 NM_080660 92092 Hs.512833 NM_080660 ENSG00000146858 ZC3HAV1L C7orf39 zinc finger CCCH-type containing, antiviral 1 like protein-coding 127.667-60 chr17 54999301 54999622 + 0.666667 NA intron (NM_178509, intron 5 of 17) intron (NM_178509, intron 5 of 17) -30676 NM_001321518 1353 Hs.591171 NM_004375 ENSG00000166260 COX11 COX11P cytochrome c oxidase copper chaperone COX11 protein-coding 155.667-45 chr10 115576510 115576939 + 0.666667 NA intron (NM_207303, intron 26 of 28) L1MA9|LINE|L1 483359 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 112-173 chr5 84608333 84608601 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -223587 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 148.667-111 chr14 33010338 33010668 + 0.666667 NA intron (NM_001165893, intron 1 of 10) MER6|DNA|TcMar-Tigger 71624 NM_001165893 64067 Hs.657892 NM_022123 ENSG00000151322 NPAS3 MOP6|PASD6|bHLHe12 neuronal PAS domain protein 3 protein-coding 116-33 chr12 61883883 61884168 + 0.666667 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) intron (NM_178539, intron 1 of 4) 308814 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 139-17 chr10 103790807 103791110 + 0.666667 NA intron (NM_014631, intron 2 of 13) intron (NM_014631, intron 2 of 13) 44179 NR_038940 100505839 Hs.655149 NR_038940 ENSG00000280693 SH3PXD2A-AS1 - SH3PXD2A antisense RNA 1 ncRNA 124.333-178 chr8 108305209 108305429 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -56602 NM_001568 3646 Hs.405590 NM_001568 ENSG00000104408 EIF3E EIF3-P48|EIF3S6|INT6|eIF3-p46 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E protein-coding 128.667-147 chr5 107443928 107444225 + 0.666667 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 226861 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 114.333-19 chr1 245027201 245027425 + 0.666667 NA intron (NM_032328, intron 3 of 7) HAL1b|LINE|L1 -56444 NR_111907 101928068 Hs.134857 NR_111907 LOC101928068 - uncharacterized LOC101928068 ncRNA 172.333-175 chr8 63941431 63941916 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) L1MEc|LINE|L1 172243 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 120.333-190 chr8 92678980 92679182 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23587 NR_125827 102724710 Hs.125714 NR_125827 ENSG00000253634 LOC102724710 - uncharacterized LOC102724710 ncRNA 128.667-155 chr6 48028469 48028828 + 0.666667 NA intron (NM_207499, intron 1 of 2) MER31-int|LTR|ERV1 40041 NM_207499 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 144-16 chr10 79456780 79457096 + 0.666667 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -11314 NM_153367 219654 Hs.523080 NM_153367 ENSG00000165424 ZCCHC24 C10orf56|Z3CXXC8 zinc finger CCHC-type containing 24 protein-coding 131-42 chr18 12452759 12453141 + 0.666667 NA intron (NM_020148, intron 13 of 15) intron (NM_020148, intron 13 of 15) 20176 NR_136514 105371998 Hs.515283 NR_136514 LOC105371998 - uncharacterized LOC105371998 ncRNA 129-87 chr3 107496246 107496533 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26573 NM_001142568 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 202.333-47 chr12 44437597 44438159 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 437783 NM_001145109 4753 Hs.505326 NM_006159 ENSG00000184613 NELL2 NRP2 neural EGFL like 2 protein-coding 165.667-214 chr9 86629894 86630214 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G|LTR|ERVL-MaLR -275644 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 151-5 chr1 65100303 65100608 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -32709 NM_001321853 3716 Hs.207538 NM_002227 ENSG00000162434 JAK1 JAK1A|JAK1B|JTK3 Janus kinase 1 protein-coding 156-17 chr10 6679053 6679404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44158 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 147.667-206 chr20 49189735 49190127 + 0.666667 NA intron (NM_001319135, intron 1 of 14) intron (NM_001319135, intron 1 of 14) -1561 NM_001322927 6780 Hs.596704 NM_004602 ENSG00000124214 STAU1 PPP1R150|STAU staufen double-stranded RNA binding protein 1 protein-coding 120-61 chr2 17007491 17007742 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -341782 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 234.333-79 chr7 88921816 88922439 + 0.666667 NA intron (NM_181646, intron 1 of 3) intron (NM_181646, intron 1 of 3) -126390 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 141.667-181 chr5 68135699 68136058 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -53998 NR_105003 102467655 Hs.544102 NR_105003 ENSG00000253787 LINC02219 - long intergenic non-protein coding RNA 2219 ncRNA 148.667-256 chr3 97696455 97696840 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -67874 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 317-18 chr4 4369103 4369834 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -16788 NM_001040101 27065 Hs.518595 NM_014392 ENSG00000168824 NSG1 D4S234|D4S234E|NEEP21|P21 neuronal vesicle trafficking associated 1 protein-coding 193-11 chr10 72854456 72854848 + 0.666667 NA intron (NM_138357, intron 2 of 7) MER1B|DNA|hAT-Charlie -39087 NM_152635 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 149-55 chr16 57069460 57069847 + 0.666667 NA intron (NM_001330552, intron 35 of 47) intron (NM_001330552, intron 35 of 47) -22930 NM_152727 221184 Hs.339809 NM_152727 ENSG00000140848 CPNE2 COPN2|CPN2 copine 2 protein-coding 144-102 chr3 33644025 33644306 + 0.666667 NA intron (NM_015097, intron 8 of 38) intron (NM_015097, intron 8 of 38) 15514 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 125.667-44 chr12 3371582 3371889 + 0.666667 NA TTS (NR_146865) TTS (NR_146865) 3627 NR_146865 101930162 Hs.351489 NR_146865 LINC02417 - long intergenic non-protein coding RNA 2417 ncRNA 220-4 chr1 98331806 98332341 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 121362 NR_046088 729987 Hs.683961 NR_046088 ENSG00000226053 LINC01776 - long intergenic non-protein coding RNA 1776 ncRNA 111.667-248 chr7 118206507 118206720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18091 NM_019644 56311 Hs.729340 NM_019644 ENSG00000106013 ANKRD7 TSA806 ankyrin repeat domain 7 protein-coding 176-81 chr6 57111274 57111563 + 0.666667 NA intron (NM_015555, intron 3 of 13) AluSx1|SINE|Alu 21230 NM_001031623 26036 Hs.485628 NM_015555 ENSG00000112200 ZNF451 COASTER|dJ417I1.1 zinc finger protein 451 protein-coding 124.667-124 chr20 44268663 44268954 + 0.666667 NA intron (NM_001256737, intron 5 of 5) L2c|LINE|L2 21500 NM_024034 78997 Hs.517059 NM_024034 ENSG00000124194 GDAP1L1 dJ881L22.1|dJ995J12.1.1 ganglioside induced differentiation associated protein 1 like 1 protein-coding 129.333-204 chrX 115444300 115444656 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -116696 NM_001282337 5358 Hs.496622 NM_005032 ENSG00000102024 PLS3 BMND18|T-plastin plastin 3 protein-coding 142.667-71 chr15 97524368 97524779 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2762 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 137.667-40 chr11 112544824 112545131 + 0.666667 NA intron (NR_104155, intron 3 of 3) intron (NR_104155, intron 3 of 3) 10825 NR_104155 387810 Hs.512255 NR_104155 ENSG00000255484 LINC02764 - long intergenic non-protein coding RNA 2764 ncRNA 206-169 chr7 28188520 28188897 + 0.666667 NA intron (NR_034097, intron 2 of 3) intron (NR_034097, intron 2 of 3) -7913 NM_175061 221895 Hs.368944 NM_175061 ENSG00000153814 JAZF1 TIP27|ZNF802 JAZF zinc finger 1 protein-coding 114.667-136 chr2 117773274 117773574 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3B|LINE|L1 -41267 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 113-155 chr4 53436177 53436359 + 0.666667 NA intron (NM_001134938, intron 10 of 14) MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 58615 NM_001134937 81608 Hs.555109 NM_030917 ENSG00000145216 FIP1L1 FIP1|Rhe|hFip1 factor interacting with PAPOLA and CPSF1 protein-coding 141.667-132 chr20 48267887 48268218 + 0.666667 NA Intergenic LTR45C|LTR|ERV1 -91859 NR_026958 284749 Hs.299080 NR_026958 ENSG00000235621 LINC00494 - long intergenic non-protein coding RNA 494 ncRNA 136.667-147 chr5 115469409 115469750 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 75196 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 175.667-82 chr2 197894591 197895004 + 0.666667 NA intron (NM_006226, intron 1 of 5) MIRb|SINE|MIR 90204 NM_006226 5334 Hs.153322 NM_006226 ENSG00000115896 PLCL1 PLCE|PLCL|PLDL1|PPP1R127|PRIP phospholipase C like 1 (inactive) protein-coding 222.333-30 chr14 51647383 51647868 + 0.666667 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) intron (NM_001042481, intron 2 of 14) 4119 NR_037676 145438 Hs.645410 NR_037676 ENSG00000273888 FRMD6-AS1 C14orf82 FRMD6 antisense RNA 1 ncRNA 187.667-72 chr2 125864525 125865028 + 0.666667 NA Intergenic LOR1a|LTR|ERV1 253209 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 142-130 chr6 125890688 125890966 + 0.666667 NA intron (NM_001199621, intron 9 of 14) intron (NM_001199621, intron 9 of 14) -28428 NM_001199622 135112 Hs.171426 NM_181782 ENSG00000111912 NCOA7 ERAP140|ESNA1|NCOA7-AS|Nbla00052|Nbla10993|TLDC4|dJ187J11.3 nuclear receptor coactivator 7 protein-coding 112-29 chr11 42997162 42997350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 272113 NR_033868 399881 Hs.446761 NR_033868 ENSG00000251557 HNRNPKP3 - heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K pseudogene 3 pseudo 153.333-25 chr1 164378787 164379093 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -180420 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 112.333-204 chr5 55128809 55129126 + 0.666667 NA intron (NM_001145734, intron 6 of 10) intron (NM_001145734, intron 6 of 10) 26321 NM_006144 3001 Hs.90708 NM_006144 ENSG00000145649 GZMA CTLA3|HFSP granzyme A protein-coding 136.333-52 chr14 44478612 44478875 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28540 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 114.667-83 chr14 71120588 71120798 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -199783 NM_001354287 26037 Hs.654657 NM_015556 ENSG00000197555 SIPA1L1 E6TP1|SPAR1 signal induced proliferation associated 1 like 1 protein-coding 121.667-48 chr12 72026781 72027074 + 0.666667 NA intron (NM_173353, intron 9 of 10) intron (NM_173353, intron 9 of 10) 88082 NM_173353 121278 Hs.736576 NM_173353 ENSG00000139287 TPH2 ADHD7|NTPH tryptophan hydroxylase 2 protein-coding 154.333-198 chr22 37833347 37833638 + 0.666667 NA intron (NM_001349853, intron 4 of 7) intron (NM_001349853, intron 4 of 7) 10110 NM_003614 8484 Hs.158353 NM_003614 ENSG00000128310 GALR3 - galanin receptor 3 protein-coding 285.333-12 chr10 58166314 58166888 + 0.666667 NA Intergenic MER39B|LTR|ERV1 101293 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 159.333-129 chr18 41961041 41961450 + 0.666667 NA intron (NM_002647, intron 2 of 24) intron (NM_002647, intron 2 of 24) 6011 NM_001308020 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 156.333-57 chr11 67363461 67363901 + 0.666667 NA TTS (NM_013246) TTS (NM_013246) 9917 NM_013246 23529 Hs.502977 NM_013246 ENSG00000175505 CLCF1 BSF-3|BSF3|CISS2|CLC|NNT-1|NNT1|NR6 cardiotrophin like cytokine factor 1 protein-coding 230.667-31 chr18 12250226 12250768 + 0.666667 NA Intergenic L1PA3|LINE|L1 -3864 NM_001279 1149 Hs.249129 NM_001279 ENSG00000176194 CIDEA CIDE-A cell death inducing DFFA like effector a protein-coding 121.333-22 chr10 66509021 66509367 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 11 of 17) L1MA5A|LINE|L1 -416842 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 135-49 chr2 172873223 172873526 + 0.666667 NA intron (NM_001282899, intron 1 of 27) intron (NM_001282899, intron 1 of 27) 13336 NM_001282900 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 147-13 chr10 70764598 70764919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 17815 NR_134534 219793 Hs.386698 NM_152710 ENSG00000166220 TBATA C10orf27|SPATIAL thymus, brain and testes associated protein-coding 135.333-57 chr15 61164396 61164649 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 64780 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 130-29 chr12 112872058 112872293 + 0.666667 NA intron (NM_001143854, intron 10 of 21) L1MB3|LINE|L1 -34602 NM_002534 4938 Hs.524760 NM_002534 ENSG00000089127 OAS1 E18/E16|IFI-4|OIAS|OIASI 2'-5'-oligoadenylate synthetase 1 protein-coding 171 chr1 37876793 37877283 + 0.666667 NA intron (NR_158630, intron 17 of 24) AluJo|SINE|Alu -17446 NM_005955 4520 Hs.471991 NM_005955 ENSG00000188786 MTF1 MTF-1|ZRF metal regulatory transcription factor 1 protein-coding 164.333-82 chr16 60436709 60437069 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -77096 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 203.667-117 chr8 14395410 14395864 + 0.666667 NA intron (NM_001322881, intron 2 of 6) LTR33|LTR|ERVL 457873 NR_029875 494332 NR_029875 ENSG00000199127 MIR383 MIRN383|hsa-mir-383|mir-383 microRNA 383 ncRNA 141-31 chr15 81841141 81841478 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 204709 NM_032246 84206 Hs.104744 NM_032246 ENSG00000183496 MEX3B MEX-3B|RKHD3|RNF195 mex-3 RNA binding family member B protein-coding 155-28 chr14 27971192 27971569 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -298159 NR_148992 728755 Hs.652058 NR_148991 ENSG00000258932 LOC728755 - uncharacterized LOC728755 ncRNA 239.667-7 chr10 89003308 89003862 + 0.666667 NA intron (NR_028034, intron 2 of 5) intron (NR_028034, intron 2 of 5) -10610 NR_028371 100302740 Hs.244139 NR_028371 FAS-AS1 FAS-AS|FASAS|SAF FAS antisense RNA 1 ncRNA 132-121 chr8 132835369 132835630 + 0.666667 NA intron (NM_001277196, intron 14 of 19) intron (NM_001277196, intron 14 of 19) -31459 NM_003235 7038 Hs.654591 NM_003235 ENSG00000042832 TG AITD3|TGN thyroglobulin protein-coding 149.333-412 chr8 140295630 140295911 + 0.666667 NA intron (NM_001160372, intron 11 of 22) intron (NM_001160372, intron 11 of 22) 161974 NM_001321646 83696 Hs.654911 NM_031466 ENSG00000167632 TRAPPC9 IBP|IKBKBBP|MRT13|NIBP|T1|TRS120 trafficking protein particle complex 9 protein-coding 128-17 chr12 17893010 17893274 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 197051 NM_024730 79785 Hs.732831 NM_024730 ENSG00000111404 RERGL - RERG like protein-coding 137.667-138 chr4 53981056 53981335 + 0.666667 NA Intergenic Tigger4|DNA|TcMar-Tigger 6087 NR_027153 402176 Hs.452943 NM_001011538 RPL21P44 RPL21_17_477 ribosomal protein L21 pseudogene 44 pseudo 129.667-71 chr16 54748607 54748917 + 0.666667 NA Intergenic Charlie24|DNA|hAT-Charlie 99471 NR_134971 101927480 Hs.499208 NR_134971 ENSG00000245694 LOC101927480 - uncharacterized LOC101927480 ncRNA 215.667-126 chr9 33064373 33064871 + 0.666667 NA intron (NM_018225, intron 4 of 11) intron (NM_018225, intron 4 of 11) 12052 NM_018225 55234 Hs.655351 NM_018225 ENSG00000122692 SMU1 BWD|SMU-1|fSAP57 SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor protein-coding 144.667-118 chr18 40816686 40817053 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie 703808 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 163-21 chr14 63574431 63574762 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -31201 NM_001354926 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 145-59 chr20 35313941 35314224 + 0.666667 NA intron (NM_199487, intron 7 of 8) AluSx1|SINE|Alu -21657 NM_178468 128876 Hs.592149 NM_178468 ENSG00000125998 FAM83C C20orf128|dJ614O4.7 family with sequence similarity 83 member C protein-coding 117.667-127 chr3 194445870 194446087 + 0.666667 NA intron (NM_001367549, intron 14 of 33) intron (NM_001367549, intron 14 of 33) 22261 NM_024524 79572 Hs.529609 NM_024524 ENSG00000133657 ATP13A3 AFURS1 ATPase 13A3 protein-coding 121-113 chr5 59063059 59063293 + 0.666667 NA intron (NM_006203, intron 5 of 14) intron (NM_006203, intron 5 of 14) -23700 NM_001197222 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 127.333-164 chr6 156509314 156509561 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 130687 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 132.333-104 chr20 33217702 33218026 + 0.666667 NA intron (NM_178466, intron 1 of 6) L1ME5|LINE|L1 512 NM_178466 128861 Hs.360989 NM_178466 ENSG00000131059 BPIFA3 C20orf71|SPLUNC3 BPI fold containing family A member 3 protein-coding 112.667-34 chr10 129644714 129644982 + 0.666667 NA intron (NM_002412, intron 2 of 4) intron (NM_002412, intron 2 of 4) 177607 NM_002412 4255 Hs.501522 NM_002412 ENSG00000170430 MGMT - O-6-methylguanine-DNA methyltransferase protein-coding 126-113 chr8 86986892 86987220 + 0.666667 NA intron (NM_173538, intron 4 of 10) L1PA16|LINE|L1 120641 NM_173538 168975 Hs.246284 NM_173538 ENSG00000176571 CNBD1 - cyclic nucleotide binding domain containing 1 protein-coding 145.667-278 chr8 64027687 64028046 + 0.666667 NA intron (NR_125826, intron 4 of 4) intron (NR_125826, intron 4 of 4) 258436 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 162-103 chr5 137914580 137914920 + 0.666667 NA intron (NM_001300921, intron 8 of 14) L1MA9|LINE|L1 25293 NM_014386 27039 Hs.716884 NM_014386 ENSG00000078795 PKD2L2 TRPP5 polycystin 2 like 2, transient receptor potential cation channel protein-coding 129.333-61 chr14 34107039 34107289 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -156090 NM_022073 112399 Hs.135507 NM_022073 ENSG00000129521 EGLN3 HIFP4H3|HIFPH3|PHD3 egl-9 family hypoxia inducible factor 3 protein-coding 183-64 chr2 177697325 177697830 + 0.666667 NA intron (NM_001077197, intron 15 of 20) intron (NM_001077197, intron 15 of 20) 24255 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 117.333-69 chr15 65861952 65862145 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -7443 NM_001206836 8766 Hs.321541 NM_004663 ENSG00000103769 RAB11A YL8 RAB11A, member RAS oncogene family protein-coding 150.667-178 chr2 72706619 72706924 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 6 of 19) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 119262 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 125-11 chr10 30883075 30883349 + 0.666667 NA intron (NM_001143766, intron 5 of 7) L1ME3G|LINE|L1 116305 NM_001143769 220929 Hs.660642 NM_182755 ENSG00000183621 ZNF438 bA330O11.1 zinc finger protein 438 protein-coding 145-34 chr14 81625882 81626151 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -2955 NR_110074 101928559 Hs.525499 NR_110074 ENSG00000258977 LINC01467 - long intergenic non-protein coding RNA 1467 ncRNA 223.333-169 chr8 121920431 121920793 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -279172 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 172.333-65 chr17 54772758 54773265 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127680 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 151.333-216 chr2 114845115 114845441 + 0.666667 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -11730 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 168-88 chr5 8800543 8800877 + 0.666667 NA Intergenic L1M3de|LINE|L1 -39022 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 183-48 chr17 43801699 43802213 + 0.666667 NA intron (NM_001932, intron 19 of 19) intron (NM_001932, intron 19 of 19) 21521 NM_001353400 284067 Hs.252707 NM_001136483 ENSG00000231256 CFAP97D1 C17orf105 CFAP97 domain containing 1 protein-coding 176.667-34 chr11 29883267 29883646 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 98937 NR_132652 106456574 Hs.128812 NR_132652 ENSG00000261340 LINC01616 n341006 long intergenic non-protein coding RNA 1616 ncRNA 169.667-69 chr15 34249410 34249798 + 0.666667 NA intron (NM_001042496, intron 13 of 25) GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 24588 NM_001286420 51234 Hs.250905 NM_016454 ENSG00000128463 EMC4 PIG17|TMEM85 ER membrane protein complex subunit 4 protein-coding 147.667-242 chr3 127461110 127461454 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -70612 NR_110147 101927123 Hs.526761 NR_110147 ENSG00000244215 LINC02016 - long intergenic non-protein coding RNA 2016 ncRNA 142-3 chr1 75045666 75045933 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -82635 NM_001001933 431707 Hs.403934 NM_001001933 ENSG00000162624 LHX8 LHX7 LIM homeobox 8 protein-coding 146-2 chr1 33398017 33398416 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22623 NM_198040 1912 Hs.524271 NM_004427 ENSG00000134686 PHC2 EDR2|HPH2|PH2 polyhomeotic homolog 2 protein-coding 116-139 chr6 149156151 149156422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61638 NR_125861 23118 Hs.269775 NM_015093 ENSG00000055208 TAB2 CHTD2|MAP3K7IP2|TAB-2 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 2 protein-coding 115.333-40 chr12 1206566 1206820 + 0.666667 NA intron (NR_027948, intron 12 of 19) intron (NR_027948, intron 12 of 19) 178945 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 127.333-119 chr3 130230126 130230459 + 0.666667 NA intron (NR_027898, intron 8 of 22) L1ME4a|LINE|L1 17472 NR_027898 646300 Hs.170475 NR_027898 COL6A4P2 COL6A4 collagen type VI alpha 4 pseudogene 2 pseudo 211-47 chr2 13858888 13859488 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 541770 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 151.667-146 chr17 61540103 61540391 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 50972 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 181-75 chr8 80104657 80105049 + 0.666667 NA intron (NM_001025253, intron 1 of 7) AluSz|SINE|Alu -24022 NM_001287142 7163 Hs.368433 NM_005079 ENSG00000076554 TPD52 D52|N8L|PC-1|PrLZ|hD52 tumor protein D52 protein-coding 153.333-265 chr3 22919739 22920110 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 282654 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 113-44 chr12 75316818 75317130 + 0.666667 NA intron (NR_149161, intron 3 of 11) intron (NR_149161, intron 3 of 11) 13350 NM_001286547 84698 Hs.733835 NM_032606 ENSG00000180881 CAPS2 UG0636c06 calcyphosine 2 protein-coding 142.667-244 chr9 83672447 83672856 + 0.666667 NA intron (NM_013438, intron 6 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -35184 NR_135839 105376114 Hs.9589 NR_135839 ENSG00000254473 LOC105376114 - uncharacterized LOC105376114 ncRNA 123-51 chr16 49625470 49625672 + 0.666667 NA intron (NM_001271620, intron 5 of 7) intron (NM_001271620, intron 5 of 7) 38753 NM_001330533 23090 Hs.443715 NM_015069 ENSG00000102935 ZNF423 Ebfaz|JBTS19|NPHP14|OAZ|Roaz|ZFP423|Zfp104|hOAZ zinc finger protein 423 protein-coding 119-63 chr17 62079255 62079454 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14076 NM_005121 9969 Hs.282678 NM_005121 ENSG00000108510 MED13 ARC250|DRIP250|HSPC221|THRAP1|TRAP240 mediator complex subunit 13 protein-coding 130.333-40 chr10 114960254 114960551 + 0.666667 NA intron (NM_139169, intron 4 of 7) intron (NM_139169, intron 4 of 7) 22207 NM_139169 142940 Hs.21187 NM_139169 ENSG00000165832 TRUB1 PUS4 TruB pseudouridine synthase family member 1 protein-coding 165-76 chr5 31548739 31549125 + 0.666667 NA intron (NR_134298, intron 7 of 8) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 16631 NM_018356 55322 Hs.519246 NM_018356 ENSG00000082213 C5orf22 - chromosome 5 open reading frame 22 protein-coding 164-103 chr7 27290378 27290749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43334 NR_120507 101410536 Hs.687800 NR_120507 ENSG00000253405 EVX1-AS EVX1-AS1 EVX1 antisense RNA ncRNA 247.667-58 chr20 48895402 48895805 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -26108 NM_006420 10564 Hs.62578 NM_006420 ENSG00000124198 ARFGEF2 BIG2|PVNH2|dJ1164I10.1 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2 protein-coding 158.667-204 chr3 29565436 29565753 + 0.666667 NA intron (NM_001003792, intron 3 of 13) MamGypsy2-LTR|LTR|Gypsy 284282 NM_014483 27303 Hs.221436 NM_014483 ENSG00000144642 RBMS3 - RNA binding motif single stranded interacting protein 3 protein-coding 133-33 chr17 39861949 39862268 + 0.666667 NA intron (NM_012481, intron 1 of 7) intron (NM_012481, intron 1 of 7) 2080 NM_001284514 22806 Hs.371680 NM_012481 ENSG00000161405 IKZF3 AIO|AIOLOS|ZNFN1A3 IKAROS family zinc finger 3 protein-coding 148.333-200 chr2 157195658 157196010 + 0.666667 NA Intergenic MER63C|DNA|hAT-Blackjack -61871 NM_001329868 11227 Hs.269027 NM_014568 ENSG00000136542 GALNT5 GALNAC-T5|GALNACT5 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 protein-coding 200.667-150 chr8 22482842 22483210 + 0.666667 NA intron (NM_005605, intron 3 of 13) MER101-int|LTR|ERV1 42056 NM_001243975 5533 Hs.731683 NM_005605 ENSG00000120910 PPP3CC CALNA3|CNA3|PP2Bgamma protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma protein-coding 154.333-86 chr14 49084357 49084766 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 501819 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 209.333-88 chr17 42492801 42493126 + 0.666667 NA intron (NM_005177, intron 11 of 20) AluSz|SINE|Alu -1810 NR_049845 100847030 NR_049845 ENSG00000264314 MIR548AT - microRNA 548at ncRNA 170-114 chr8 9353321 9353686 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 28452 NR_040039 157273 Hs.650222 NR_040039 ENSG00000248538 LOC157273 - uncharacterized LOC157273 ncRNA 114.333-170 chr5 20345715 20346050 + 0.666667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 40331 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 121.667-133 chr3 178830354 178830635 + 0.666667 NA intron (NM_181361, intron 4 of 4) L1ME3B|LINE|L1 29911 NR_126561 104797538 Hs.478363 NR_126560 KCNMB2-AS1 - KCNMB2 antisense RNA 1 ncRNA 141.333-112 chr2 104523392 104523710 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -13042 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 146-152 chrX 47542592 47542849 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18380 NM_001256197 369 Hs.446641 NM_001654 ENSG00000078061 ARAF A-RAF|ARAF1|PKS2|RAFA1 A-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase protein-coding 111.667-199 chr5 36239674 36239959 + 0.666667 NA intron (NM_001287341, intron 1 of 12) intron (NM_001287341, intron 1 of 12) 1575 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 206.667-28 chr12 24279251 24279732 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 3 of 17) intron (NM_152989, intron 3 of 17) 56220 NR_120472 101928471 Hs.569156 NR_120472 ENSG00000256120 SOX5-AS1 - SOX5 antisense RNA 1 ncRNA 148-117 chr4 66293339 66293609 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 16650 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 139-36 chr14 78959974 78960260 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 10 of 20) intron (NR_073547, intron 10 of 20) -239865 NR_135159 105370586 NR_135159 ENSG00000258419 LOC105370586 - uncharacterized LOC105370586 ncRNA 113.333-37 chr10 108605127 108605355 + 0.666667 NA Intergenic LTR50|LTR|ERVL -535948 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 155-96 chr3 118875619 118876016 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64984 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 178-82 chr3 192079397 192079776 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -159044 NR_046596 100873986 Hs.581652 NR_046596 ENSG00000231383 FGF12-AS1 - FGF12 antisense RNA 1 ncRNA 122-126 chr8 130211410 130211727 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 5 of 29) intron (NM_001362925, intron 5 of 29) 84965 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 158-144 chr9 11864147 11864465 + 0.666667 NA Intergenic MER65C|LTR|ERV1 -829079 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 119.667-46 chr14 48328710 48328975 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -533828 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 155-119 chr7 42279941 42280354 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -42938 NM_000168 2737 Hs.21509 NM_000168 ENSG00000106571 GLI3 ACLS|GCPS|GLI3-190|GLI3FL|PAP-A|PAPA|PAPA1|PAPB|PHS|PPDIV GLI family zinc finger 3 protein-coding 150.333-47 chr10 109012044 109012422 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 911013 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 124.667-8 chr1 95348687 95348981 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3273 NR_146486 101928169 NR_146486 LINC01650 - long intergenic non-protein coding RNA 1650 ncRNA 134-46 chr2 4831444 4831740 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -175370 NR_034134 727982 Hs.444391 NR_034134 ENSG00000231532 LINC01249 - long intergenic non-protein coding RNA 1249 ncRNA 115.667-7 chr1 114728889 114729227 + 0.666667 NA intron (NM_001007553, intron 12 of 19) intron (NM_001007553, intron 12 of 19) -12287 NM_002524 4893 Hs.486502 NM_002524 ENSG00000213281 NRAS ALPS4|CMNS|N-ras|NCMS|NRAS1|NS6 NRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 114.333-101 chr2 61484095 61484435 + 0.666667 NA intron (NM_003400, intron 20 of 24) intron (NM_003400, intron 20 of 24) -13178 NM_014709 9736 Hs.644708 NM_014709 ENSG00000115464 USP34 - ubiquitin specific peptidase 34 protein-coding 111.667-83 chr14 83069637 83069859 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 427116 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 161.333-194 chr3 114937391 114937722 + 0.666667 NA intron (NM_001348805, intron 3 of 10) AluSc8|SINE|Alu -36931 NR_121662 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 113.667-232 chr9 130844302 130844614 + 0.666667 NA intron (NM_005157, intron 1 of 10) intron (NM_005157, intron 1 of 10) 9204 NM_005157 25 Hs.431048 NM_005157 ENSG00000097007 ABL1 ABL|CHDSKM|JTK7|bcr/abl|c-ABL|c-ABL1|p150|v-abl ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase protein-coding 147.667-168 chr2 52964922 52965323 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -262507 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 155-95 chr3 109095081 109095396 + 0.666667 NA intron (NM_014429, intron 6 of 27) intron (NM_014429, intron 6 of 27) -6218 NR_144461 100506506 Hs.278908 NR_144461 ENSG00000239314 MORC1-AS1 - MORC1 antisense RNA 1 ncRNA 130-59 chr2 192235890 192236121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41072 NM_001305134 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 245-22 chr14 65449521 65449990 + 0.666667 NA intron (NR_038170, intron 1 of 10) intron (NR_038170, intron 1 of 10) -21347 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 151.667-374 chr8 115447126 115447433 + 0.666667 NA intron (NM_001282902, intron 4 of 5) intron (NM_001282902, intron 4 of 5) 220734 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 123.333-208 chr8 82164644 82164838 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -322455 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 135.667-199 chr9 40913879 40914278 + 0.666667 NA Intergenic CER|Satellite|Satellite 15014 NR_031629 100302167 NR_031629 ENSG00000275377 MIR1299 MIRN1299|hsa-mir-1299 microRNA 1299 ncRNA 158.333-130 chr19 27617505 27617970 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -175694 NR_146734 101927151 Hs.567934 NR_110687 ENSG00000267575 LOC101927151 - uncharacterized LOC101927151 ncRNA 133.667-165 chrX 42820370 42820647 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42345 NM_025210 80316 Hs.127689 NM_025210 ENSG00000102055 PPP1R2C I-4|PPP1R2P9 PPP1R2C family member C protein-coding 161.667-203 chr5 67002783 67003108 + 0.666667 NA intron (NR_111908, intron 1 of 1) MER20|DNA|hAT-Charlie 1209 NR_111908 101928794 Hs.672435 NR_111908 MAST4-AS1 - MAST4 antisense RNA 1 ncRNA 194.667-152 chr8 99043318 99043747 + 0.666667 NA intron (NM_017890, intron 3 of 61) L2|LINE|L2 30266 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 176.667-4 chr1 41566161 41566669 + 0.666667 NA intron (NM_024503, intron 5 of 8) L2|LINE|L2 -81732 NR_126098 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 164.333-155 chr3 48891351 48891687 + 0.666667 NA intron (NM_000387, intron 2 of 8) AluJb|SINE|Alu 7363 NM_000387 788 Hs.13845 NM_000387 ENSG00000178537 SLC25A20 CAC|CACT solute carrier family 25 member 20 protein-coding 155.667-96 chr14 61306063 61306408 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -15208 NM_006255 5583 Hs.333907 NM_006255 ENSG00000027075 PRKCH PKC-L|PKCL|PRKCL|nPKC-eta protein kinase C eta protein-coding 233.333-25 chr11 5173541 5174104 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 4889 NM_001348257 283110 NM_001348257 OR52Z1 OR52Z1P olfactory receptor family 52 subfamily Z member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 173.333-120 chr3 66950962 66951436 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47108 NM_032505 84541 Hs.116665 NM_032505 ENSG00000163376 KBTBD8 TA-KRP|TAKRP kelch repeat and BTB domain containing 8 protein-coding 143.667-6 chr1 43134136 43134354 + 0.666667 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 -13659 NM_001101376 440585 Hs.657614 NM_001101376 ENSG00000186973 FAM183A - family with sequence similarity 183 member A protein-coding 216.333-19 chr10 66125568 66126054 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 13 of 17) L1MC3|LINE|L1 554386 NR_120647 101928913 Hs.568857 NR_120647 LINC01515 - long intergenic non-protein coding RNA 1515 ncRNA 120.333-85 chr19 33807868 33808113 + 0.666667 NA intron (NM_001129994, intron 5 of 6) intron (NM_001129994, intron 5 of 6) 11120 NM_024076 79047 Hs.221873 NM_024076 ENSG00000153885 KCTD15 - potassium channel tetramerization domain containing 15 protein-coding 161.333-71 chr12 101662744 101663158 + 0.666667 NA intron (NM_206821, intron 19 of 28) intron (NM_206821, intron 19 of 28) -34689 NM_020244 56994 Hs.293077 NM_020244 ENSG00000111666 CHPT1 CPT|CPT1 choline phosphotransferase 1 protein-coding 168.333-187 chr7 8548951 8549268 + 0.666667 NA intron (NM_152745, intron 2 of 2) intron (NM_152745, intron 2 of 2) 115500 NM_152745 30010 Hs.487564 NM_152745 ENSG00000122584 NXPH1 NPH1|Nbla00697 neurexophilin 1 protein-coding 144.667-244 chr5 90273298 90273585 + 0.666667 NA intron (NR_120601, intron 1 of 5) intron (NR_120601, intron 1 of 5) 16630 NR_120601 101929495 Hs.346679 NR_120601 LINC01339 - long intergenic non-protein coding RNA 1339 ncRNA 149-95 chr3 142261656 142261996 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -36241 NR_033289 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 120-5 chr1 197053956 197054222 + 0.666667 NA intron (NM_001994, intron 8 of 11) intron (NM_001994, intron 8 of 11) 13178 NM_001994 2165 Hs.435782 NM_001994 ENSG00000143278 F13B FXIIIB coagulation factor XIII B chain protein-coding 224.333-84 chr3 161545695 161546148 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 49113 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 125-125 chr9 36328353 36328576 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -51408 NM_001190388 10020 Hs.5920 NM_005476 ENSG00000159921 GNE DMRV|GLCNE|IBM2|NM|Uae1 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase protein-coding 132-3 chr1 46020234 46020544 + 0.666667 NA intron (NM_001324320, intron 12 of 29) intron (NM_001324320, intron 12 of 29) 110284 NM_001328651 8503 Hs.655387 NM_003629 ENSG00000117461 PIK3R3 p55|p55-GAMMA|p55PIK phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 3 protein-coding 111.667-191 chr4 156959210 156959397 + 0.666667 NA intron (NR_036641, intron 1 of 6) intron (NR_036641, intron 1 of 6) 12496 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 221.333-99 chr4 47506265 47506864 + 0.666667 NA intron (NM_020453, intron 1 of 22) intron (NM_020453, intron 1 of 22) 21289 NM_020453 57205 Hs.437241 NM_020453 ENSG00000145246 ATP10D ATPVD ATPase phospholipid transporting 10D (putative) protein-coding 142.667-32 chr11 80854642 80854921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91978 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 201.667-103 chr6 51704187 51704743 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 60 of 66) L2c|LINE|L2 82595 NR_125840 101927082 Hs.730296 NR_125840 LOC101927082 - uncharacterized LOC101927082 ncRNA 231.667-42 chr22 20849610 20850067 + 0.666667 NA intron (NM_058004, intron 1 of 54) AluY|SINE|Alu 8973 NM_058004 5297 Hs.529438 NM_002650 ENSG00000241973 PI4KA PI4K-ALPHA|PIK4CA|PMGYCHA|pi4K230 phosphatidylinositol 4-kinase alpha protein-coding 158-100 chr4 187141244 187141562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60583 NR_147159 105377600 Hs.641158 NR_147159 LINC02374 - long intergenic non-protein coding RNA 2374 ncRNA 121.333-40 chr12 33712088 33712297 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -272373 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 132-9 chr1 155881717 155881942 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_152280, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_152280, exon 4 of 4) 22262 NM_152280 23208 Hs.32984 NM_152280 ENSG00000132718 SYT11 SYT12|sytXI synaptotagmin 11 protein-coding 152-3 chr1 44864023 44864432 + 0.666667 NA intron (NM_020365, intron 10 of 11) intron (NM_020365, intron 10 of 11) -20974 NM_003738 8643 Hs.591497 NM_003738 ENSG00000117425 PTCH2 PTC2 patched 2 protein-coding 133-56 chr22 24803857 24804169 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2198 NM_001039948 129049 Hs.474397 NM_133454 ENSG00000167037 SGSM1 RUTBC2 small G protein signaling modulator 1 protein-coding 209.666-53 chr8 37484443 37485043 + 0.666667 NA intron (NR_121620, intron 1 of 6) intron (NR_121620, intron 1 of 6) 9170 NR_121620 100507420 Hs.105962 NR_121620 LINC01605 LincDUSP long intergenic non-protein coding RNA 1605 ncRNA 136.667-42 chr12 113889346 113889616 + 0.666667 NA intron (NM_001146698, intron 21 of 24) intron (NM_001146698, intron 21 of 24) 76844 NM_001146698 9904 Hs.7482 NM_016196 ENSG00000122965 RBM19 Mrd1 RNA binding motif protein 19 protein-coding 113.667-198 chr7 82122176 82122359 + 0.666667 NA intron (NM_000722, intron 5 of 38) intron (NM_000722, intron 5 of 38) 113090 NR_110076 101927356 Hs.571348 NR_110076 ENSG00000223770 LOC101927356 - uncharacterized LOC101927356 ncRNA 114.333-185 chr5 149191091 149191278 + 0.666667 NA intron (NM_001370418, intron 2 of 18) L1MC5|LINE|L1 49453 NM_001370418 22885 Hs.49688 NM_014945 ENSG00000173210 ABLIM3 HMFN1661 actin binding LIM protein family member 3 protein-coding 134.333-189 chr9 104325626 104325922 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55545 NR_135141 105376194 Hs.553289 NR_135141 LOC105376194 - uncharacterized LOC105376194 ncRNA 180-77 chr4 124722106 124722485 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -9563 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 113.667-45 chr12 111924244 111924583 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 25350 NR_036636 8759 Hs.661708 NR_036636 ADAM1A ADAM1|ADAM1P|FTNAP|Ftna|PH-30a ADAM metallopeptidase domain 1A (pseudogene) pseudo 116.333-184 chr6 37289124 37289424 + 0.666667 NA intron (NR_130108, intron 7 of 12) intron (NR_130108, intron 7 of 12) -31119 NR_104442 221468 Hs.520101 NM_145316 ENSG00000172738 TMEM217 C6orf128|dJ355M6.2 transmembrane protein 217 protein-coding 128.667-166 chr7 53395978 53396208 + 0.666667 NA Intergenic LTR24B|LTR|ERV1 360460 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 153.333-331 chr5 75919445 75919844 + 0.666667 NA Intergenic MER110A|LTR|ERV1 -163739 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 175.667-77 chr2 147675508 147675877 + 0.666667 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -168825 NM_001278579 92 Hs.470174 NM_001616 ENSG00000121989 ACVR2A ACTRII|ACVR2 activin A receptor type 2A protein-coding 143.333-64 chr12 51158346 51158654 + 0.666667 NA intron (NM_005653, intron 1 of 14) AluSz|SINE|Alu 14635 NM_005653 7024 Hs.48849 NM_005653 ENSG00000135457 TFCP2 LBP1C|LSF|LSF1D|SEF|TFCP2C transcription factor CP2 protein-coding 131.333-26 chr10 55368133 55368435 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -230758 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 129.667-111 chr20 35861388 35861630 + 0.666667 NA intron (NM_016436, intron 5 of 17) L1ME4a|LINE|L1 89494 NM_016436 51230 Hs.517044 NM_016436 ENSG00000025293 PHF20 C20orf104|GLEA2|HCA58|NZF|TDRD20A|TZP PHD finger protein 20 protein-coding 145.333-63 chr12 26550054 26550339 + 0.666667 NA intron (NM_002223, intron 37 of 56) intron (NM_002223, intron 37 of 56) 282998 NM_002223 3709 Hs.512235 NM_002223 ENSG00000123104 ITPR2 ANHD|CFAP48|INSP3R2|IP3R2 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 protein-coding 125 chr1 41658846 41659208 + 0.666667 NA intron (NM_001127714, intron 1 of 7) intron (NM_001127714, intron 1 of 7) -174344 NR_126098 1907 Hs.1407 NM_001956 ENSG00000127129 EDN2 ET-2|ET2|PPET2 endothelin 2 protein-coding 125.667-141 chr4 163384335 163384565 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 40348 NM_001317091 4889 Hs.519058 NM_006174 ENSG00000164129 NPY5R NPY5-R|NPYR5|NPYY5-R neuropeptide Y receptor Y5 protein-coding 146.333-192 chr22 45600207 45600634 + 0.666667 NA exon (NM_006486, exon 17 of 17) exon (NM_006486, exon 17 of 17) 5227 NR_131244 100506737 Hs.517692 NR_131244 ENSG00000238120 LINC01589 TCONS_00029353 long intergenic non-protein coding RNA 1589 ncRNA 123.667-42 chr12 3818722 3818945 + 0.666667 NA intron (NR_104461, intron 6 of 8) L2|LINE|L2 54566 NR_104461 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 128.667-146 chr5 105410797 105411129 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 311489 NR_000039 9366 Hs.158296 NR_000039 ENSG00000232159 RAB9BP1 RAB9P1 RAB9B, member RAS oncogene family pseudogene 1 pseudo 217.667-37 chr18 2283497 2284049 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 287732 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 167-67 chr21 33563992 33564337 + 0.666667 NA intron (NM_001291412, intron 5 of 10) intron (NM_001291412, intron 5 of 10) 13502 NR_106756 102465248 NR_106756 ENSG00000284448 MIR6501 hsa-mir-6501|mir-6501 microRNA 6501 ncRNA 124-85 chr4 36566902 36567182 + 0.666667 NA intron (NR_149124, intron 3 of 4) L1PB1|LINE|L1 74858 NR_149124 105374400 Hs.570781 NR_149124 ENSG00000248215 LINC02505 - long intergenic non-protein coding RNA 2505 ncRNA 145-35 chr15 35079125 35079398 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6147 NM_001355281 388112 Hs.635882 NM_001355281 ENSG00000255192 NANOGP8 NANOGP1|PN8 Nanog homeobox retrogene P8 protein-coding 200-122 chr5 18517397 18517843 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 710346 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 111.667-29 chr10 36305151 36305382 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 526964 NR_110138 102578074 NR_110138 ENSG00000280719 PCAT5 LINC01452|TPCAT-10-36067 prostate cancer associated transcript 5 ncRNA 199.333-292 chr8 137811607 137812007 + 0.666667 NA non-coding (NR_161374, exon 8 of 8) non-coding (NR_161374, exon 8 of 8) 271738 NR_161374 401478 Hs.654931 NM_001354876 LOC401478 - uncharacterized LOC401478 ncRNA 143.333-146 chr2 151507356 151507753 + 0.666667 NA intron (NM_001271208, intron 163 of 182) MER39|LTR|ERV1 97652 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 161.333-156 chr2 142497078 142497421 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -365548 NM_018557 53353 Hs.656461 NM_018557 ENSG00000168702 LRP1B LRP-1B|LRP-DIT|LRPDIT LDL receptor related protein 1B protein-coding 145-104 chr6 68926314 68926572 + 0.666667 NA intron (NM_001704, intron 3 of 31) intron (NM_001704, intron 3 of 31) 291161 NM_001704 577 Hs.13261 NM_001704 ENSG00000135298 ADGRB3 BAI3 adhesion G protein-coupled receptor B3 protein-coding 142.333-181 chr4 70805436 70805853 + 0.666667 NA intron (NM_001037442, intron 17 of 17) intron (NM_001037442, intron 17 of 17) 33859 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 116.667-201 chr8 93855383 93855627 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60614 NR_039602 100616169 NR_039602 ENSG00000284288 MIR378D2 mir-378d-2 microRNA 378d-2 ncRNA 181-77 chr8 82182898 82183426 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -340876 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 122.667-181 chr7 107619707 107619988 + 0.666667 NA non-coding (NR_163941, exon 13 of 13) non-coding (NR_163941, exon 13 of 13) 39601 NR_163938 254-73 chr7 31125548 31126286 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 73456 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 138.667-2 chr1 42639134 42639468 + 0.666667 NA intron (NM_001080850, intron 12 of 16) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -19122 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 138-57 chr2 107150097 107150503 + 0.666667 NA intron (NR_049853, intron 2 of 3) intron (NR_049853, intron 2 of 3) 199225 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 125.333-46 chr12 27160691 27161043 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78345 NM_001080406 728858 Hs.334003 NM_001080406 ENSG00000214700 C12orf71 - chromosome 12 open reading frame 71 protein-coding 176-58 chr3 61493265 61493633 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68122 NM_002841 5793 Hs.595541 NM_002841 ENSG00000144724 PTPRG HPTPG|PTPG|R-PTP-GAMMA|RPTPG protein tyrosine phosphatase receptor type G protein-coding 206.667-90 chr3 96309290 96309761 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50439 NR_107027 102465864 NR_107027 ENSG00000278103 MIR8060 hsa-mir-8060 microRNA 8060 ncRNA 115.333-231 chr9 132825944 132826153 + 0.666667 NA intron (NM_001317959, intron 10 of 14) intron (NM_001317959, intron 10 of 14) -52296 NR_133631 11092 Hs.62595 NM_018956 ENSG00000165698 SPACA9 C9orf9|Mast sperm acrosome associated 9 protein-coding 249.667-42 chr2 68878863 68879320 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7694 NM_014482 27302 Hs.158317 NM_014482 ENSG00000163217 BMP10 - bone morphogenetic protein 10 protein-coding 147-20 chr11 7722694 7722999 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -16369 NM_198185 341277 Hs.532475 NM_198185 ENSG00000183378 OVCH2 OVTN ovochymase 2 (gene/pseudogene) protein-coding 271-45 chr8 77246768 77247306 + 0.666667 NA Intergenic MER5A1|DNA|hAT-Charlie -203660 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 118-102 chr5 22592327 22592520 + 0.666667 NA intron (NM_004061, intron 1 of 14) intron (NM_004061, intron 1 of 14) 260921 NM_001364106 1010 Hs.113684 NM_004061 ENSG00000154162 CDH12 CDHB cadherin 12 protein-coding 154-73 chr19 30451561 30451872 + 0.666667 NA intron (NM_014717, intron 2 of 4) intron (NM_014717, intron 2 of 4) 79332 NM_001352260 9745 Hs.378901 NM_014717 ENSG00000198597 ZNF536 - zinc finger protein 536 protein-coding 167.333-164 chr22 33067455 33067792 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -9242 NM_003490 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 116.667-90 chr2 12217644 12217988 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) intron (NR_110196, intron 3 of 5) 18686 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 171.333-38 chr13 26316560 26317016 + 0.666667 NA intron (NM_001318368, intron 1 of 12) L1MB3|LINE|L1 62659 NM_001260 1024 Hs.382306 NM_001260 ENSG00000132964 CDK8 K35 cyclin dependent kinase 8 protein-coding 165.333-27 chr10 48260930 48261249 + 0.666667 NA intron (NM_001018071, intron 1 of 28) L1PREC2|LINE|L1 -9332 NM_001318191 143162 Hs.664786 NM_152428 ENSG00000170324 FRMPD2 PDZD5C|PDZK4|PDZK5C FERM and PDZ domain containing 2 protein-coding 189.333-118 chr21 21037548 21037970 + 0.666667 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) 39350 NM_001352595 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 117.333-129 chr22 43903044 43903380 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11199 NM_001371410 119-106 chr3 116956180 116956405 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 34861 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 207.333-49 chr11 72514685 72515255 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -55686 NR_126364 101928555 Hs.376950 NR_126364 ENSG00000227467 LINC01537 - long intergenic non-protein coding RNA 1537 ncRNA 198.667-6 chr1 110709730 110710247 + 0.666667 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -35048 NM_002232 3738 Hs.169948 NM_002232 ENSG00000177272 KCNA3 HGK5|HLK3|HPCN3|HUKIII|KV1.3|MK3|PCN3 potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 protein-coding 139-50 chr2 101904373 101904638 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -78960 NR_103791 100506328 Hs.516245 NR_103791 LINC01127 - long intergenic non-protein coding RNA 1127 ncRNA 217-60 chr3 94992125 94992769 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 54184 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 143-128 chr8 124246846 124247125 + 0.666667 NA intron (NR_125420, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 413 NR_125420 101927588 Hs.617072 NR_125420 ENSG00000214803 LOC101927588 - uncharacterized LOC101927588 ncRNA 158.333-53 chr11 25412720 25413046 + 0.666667 NA Intergenic (TTAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -776240 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 126.333-186 chr9 28069797 28070055 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 5 of 6) intron (NM_152570, intron 5 of 6) -496060 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 121-125 chr6 97442946 97443194 + 0.666667 NA intron (NR_110757, intron 1 of 4) intron (NR_110757, intron 1 of 4) 137484 NR_110757 101927314 Hs.520283 NR_110757 ENSG00000271860 LOC101927314 - uncharacterized LOC101927314 ncRNA 153.333-246 chr21 19623819 19624190 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 275751 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 156.667-356 chr9 70829542 70829873 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 5 of 25) intron (NM_001366143, intron 5 of 25) -19623 NR_029621 406987 NR_029621 ENSG00000207935 MIR204 MIRN204|RDICC|miRNA204|mir-204 microRNA 204 ncRNA 135.333-187 chr8 81761877 81762210 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29595 NM_152284 92421 Hs.183861 NM_152284 ENSG00000164695 CHMP4C SNF7-3|Shax3|VPS32C charged multivesicular body protein 4C protein-coding 165.333-139 chr20 17162929 17163204 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63041 NM_001201528 5126 Hs.315186 NM_002594 ENSG00000125851 PCSK2 NEC 2|NEC-2|NEC2|PC2|SPC2 proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 protein-coding 121.333-184 chr8 130222122 130222449 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 4 of 29) intron (NM_001362925, intron 4 of 29) 74248 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 119-135 chr7 33794597 33794877 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -110178 NM_133468 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 113.667-28 chr10 126144455 126144625 + 0.666667 NA intron (NM_001288974, intron 4 of 18) intron (NM_001288974, intron 4 of 18) -171267 NR_102707 101410540 Hs.557889 NR_102707 ENSG00000233409 FANK1-AS1 - FANK1 antisense RNA 1 ncRNA 236.333-12 chr1 245002488 245003005 + 0.666667 NA intron (NM_001290327, intron 2 of 7) intron (NM_001290327, intron 2 of 7) -31877 NR_111907 101928068 Hs.134857 NR_111907 LOC101928068 - uncharacterized LOC101928068 ncRNA 154.333-371 chr9 86600542 86600849 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -246285 NM_024617 79670 Hs.597057 NM_024617 ENSG00000083223 TUT7 PAPD6|TENT3B|ZCCHC6 terminal uridylyl transferase 7 protein-coding 114.333-50 chr12 9276729 9276940 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6823 NR_024374 642846 Hs.447869 NR_024374 LOC642846 - DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 11-like ncRNA 139.667-55 chr14 64537295 64537614 + 0.666667 NA intron (NR_110550, intron 1 of 3) AluSz|SINE|Alu 2914 NR_110550 102723809 Hs.667192 NR_110550 ENSG00000259116 LOC102723809 - uncharacterized LOC102723809 ncRNA 125-68 chr22 38342622 38342886 + 0.666667 NA intron (NM_001289912, intron 4 of 14) intron (NM_001289912, intron 4 of 14) -24670 NM_001894 1454 Hs.474833 NM_001894 ENSG00000213923 CSNK1E CKIe|CKIepsilon|HCKIE casein kinase 1 epsilon protein-coding 140.333-107 chr2 115449710 115450075 + 0.666667 NA intron (NM_001321912, intron 4 of 25) intron (NM_001321912, intron 4 of 25) 106077 NM_001321913 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 162.333-228 chr6 162542830 162543197 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 1 of 11) L3|LINE|CR1 -184119 NM_001080378 135138 Hs.25791 NM_152410 ENSG00000112530 PACRG GLUP|HAK005771|PACRG2.1|PARK2CRG parkin coregulated protein-coding 178.333-60 chr16 76175674 76176065 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101532 NM_001322189 85445 Hs.461389 NM_033401 ENSG00000152910 CNTNAP4 CASPR4 contactin associated protein like 4 protein-coding 119-46 chr14 59904837 59905130 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14730 NR_075071 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 178.333-172 chr8 113355944 113356323 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 1 of 66) intron (NM_001363185, intron 1 of 66) 21019 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 179.333-80 chr17 72965216 72965699 + 0.666667 NA intron (NM_001352692, intron 4 of 9) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 127231 NM_001352691 201266 Hs.221127 NM_139177 ENSG00000133195 SLC39A11 C17orf26|ZIP-11|ZIP11 solute carrier family 39 member 11 protein-coding 186-110 chrX 126969092 126969496 + 0.666667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 149565 NM_001122716 100130613 Hs.130370 NM_001122716 ENSG00000183631 PRR32 CXorf64 proline rich 32 protein-coding 149-142 chr8 72896762 72897193 + 0.666667 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) -111887 NM_003218 7013 Hs.442707 NM_003218 ENSG00000147601 TERF1 PIN2|TRBF1|TRF|TRF1|hTRF1-AS|t-TRF1 telomeric repeat binding factor 1 protein-coding 147.667-32 chr10 32738975 32739326 + 0.666667 NA intron (NM_001321115, intron 29 of 43) L1MCa|LINE|L1 162322 NR_132768 106633814 NR_132768 SNORA86 - small nucleolar RNA, H/ACA box 86 snoRNA 202-56 chr15 90177397 90177964 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -7240 NM_001324030 10509 Hs.474935 NM_020210 ENSG00000185033 SEMA4B SEMAC|SemC semaphorin 4B protein-coding 139.333-223 chr8 123126798 123127120 + 0.666667 NA intron (NM_001363153, intron 13 of 19) AluSg|SINE|Alu -52088 NM_207006 84985 Hs.379821 NM_032899 ENSG00000147689 FAM83A BJ-TSA-9 family with sequence similarity 83 member A protein-coding 200-96 chr20 62618563 62619131 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23656 NM_016354 28231 Hs.235782 NM_016354 ENSG00000101187 SLCO4A1 OATP-E|OATP1|OATP4A1|OATPE|OATPRP1|POAT|SLC21A12 solute carrier organic anion transporter family member 4A1 protein-coding 200-72 chr17 77371844 77372364 + 0.666667 NA intron (NM_006640, intron 1 of 10) intron (NM_006640, intron 1 of 10) -1233 NM_001113493 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 128.333-33 chr11 12648025 12648320 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -26249 NM_021961 7003 Hs.655331 NM_021961 ENSG00000187079 TEAD1 AA|NTEF-1|REF1|TCF-13|TCF13|TEAD-1|TEF-1 TEA domain transcription factor 1 protein-coding 189-64 chr3 164205592 164205977 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34228 NR_031665 100302148 NR_031665 ENSG00000221251 MIR1263 MIRN1263|hsa-mir-1263 microRNA 1263 ncRNA 168.667-26 chr10 81925123 81925481 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 2 of 10) intron (NR_163253, intron 2 of 10) 47615 NR_163252 10718 Hs.125119 NM_001010848 ENSG00000185737 NRG3 HRG3|pro-NRG3 neuregulin 3 protein-coding 114.333-202 chr7 7454123 7454415 + 0.666667 NA intron (NM_001037763, intron 16 of 34) intron (NM_001037763, intron 16 of 34) 81604 NM_001037763 340267 Hs.491104 NM_001037763 ENSG00000215018 COL28A1 COL28 collagen type XXVIII alpha 1 chain protein-coding 113.333-241 chr7 53753223 53753481 + 0.666667 NA intron (NR_038371, intron 4 of 5) MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 58579 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 121.667-57 chr14 54709883 54710094 + 0.666667 NA intron (NM_001161576, intron 2 of 10) intron (NM_001161576, intron 2 of 10) -44845 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 143.667-163 chr3 113405736 113406019 + 0.666667 NA intron (NR_046728, intron 1 of 5) intron (NR_046728, intron 1 of 5) 1879 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 186.667-107 chr4 93518234 93518722 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 12 of 14) L2a|LINE|L2 -310275 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 114.667-235 chr7 25924306 25924506 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25580 NR_029597 406940 NR_029597 ENSG00000199085 MIR148A MIRN148|MIRN148A|hsa-mir-148|mir-148a microRNA 148a ncRNA 133.667-136 chr6 156169543 156169789 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -209084 NR_145751 109617011 NR_145751 ENSG00000212295 SNORD28B - small nucleolar RNA, C/D box 28B snoRNA 120-10 chr10 31772084 31772337 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 136716 NM_001270699 94134 Hs.499264 NM_018287 ENSG00000165322 ARHGAP12 - Rho GTPase activating protein 12 protein-coding 130.333-216 chr8 142676207 142676522 + 0.666667 NA intron (NR_033343, intron 1 of 2) intron (NR_033343, intron 1 of 2) -4131 NM_005672 8000 Hs.652235 NM_005672 ENSG00000167653 PSCA PRO232 prostate stem cell antigen protein-coding 174.333-85 chr3 27015351 27015858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 200919 NM_001304384 152110 Hs.506115 NM_152534 ENSG00000163491 NEK10 - NIMA related kinase 10 protein-coding 149-147 chr8 100077794 100078114 + 0.666667 NA intron (NM_015668, intron 4 of 27) L1MEc|LINE|L1 27672 NM_001286693 26166 Hs.120021 NM_015668 ENSG00000132554 RGS22 CT145|PRTD-NY2 regulator of G protein signaling 22 protein-coding 127.667-6 chr1 99121560 99121795 + 0.666667 NA intron (NR_033940, intron 1 of 2) intron (NR_033940, intron 1 of 2) -116816 NM_001010861 163404 Hs.483948 NM_001010861 ENSG00000117598 PLPPR5 LPPR5|PAP2|PAP2D|PRG5 phospholipid phosphatase related 5 protein-coding 144.333-234 chr6 96128698 96129045 + 0.666667 NA intron (NM_006581, intron 2 of 2) AluJb|SINE|Alu 112897 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 127.333-191 chr8 103033430 103033671 + 0.666667 NA intron (NM_001695, intron 1 of 12) L2b|LINE|L2 12467 NM_001695 528 Hs.86905 NM_001695 ENSG00000155097 ATP6V1C1 ATP6C|ATP6D|VATC|Vma5 ATPase H+ transporting V1 subunit C1 protein-coding 170-35 chr14 63218416 63218699 + 0.666667 NA intron (NM_020663, intron 1 of 4) intron (NM_020663, intron 1 of 4) 14114 NM_020663 57381 Hs.656339 NM_020663 ENSG00000126785 RHOJ ARHJ|RASL7B|TC10B|TCL ras homolog family member J protein-coding 192.667-49 chr12 33067279 33067641 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -170614 NM_001005242 5318 Hs.164384 NM_004572 ENSG00000057294 PKP2 ARVD9 plakophilin 2 protein-coding 197-99 chr6 45810724 45811220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 126625 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 219-79 chr8 8808774 8809269 + 0.666667 NA intron (NM_004225, intron 1 of 2) MER1A|DNA|hAT-Charlie 84609 NM_004225 9258 Hs.379414 NM_004225 ENSG00000147324 MFHAS1 LRRC65|MASL1|ROCO4 malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 protein-coding 145-50 chr2 99147946 99148260 + 0.666667 NA TTS (NR_146054) TTS (NR_146054) -6400 NM_182911 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 199-89 chr6 36294864 36295308 + 0.666667 NA intron (NM_173676, intron 4 of 7) intron (NM_173676, intron 4 of 7) 24626 NM_001145717 285848 Hs.407002 NM_173676 ENSG00000180316 PNPLA1 ARCI10|dJ50J22.1 patatin like phospholipase domain containing 1 protein-coding 115.333-211 chr8 31551404 31551632 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88234 NM_013962 3084 Hs.453951 NM_004495 ENSG00000157168 NRG1 ARIA|GGF|GGF2|HGL|HRG|HRG1|HRGA|MST131|MSTP131|NDF|NRG1-IT2|SMDF neuregulin 1 protein-coding 131.667-32 chr11 28942795 28943040 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -465369 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 121.333-19 chr10 53881178 53881386 + 0.666667 NA intron (NM_001354411, intron 27 of 34) L1PB4|LINE|L1 -604948 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 146.333-347 chr9 30081373 30081650 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 326943 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 261.333-59 chr20 25022537 25023037 + 0.666667 NA intron (NM_032501, intron 5 of 13) intron (NM_032501, intron 5 of 13) 9919 NM_001252676 84532 Hs.529353 NM_032501 ENSG00000154930 ACSS1 ACAS2L|ACECS1|AceCS2L acyl-CoA synthetase short chain family member 1 protein-coding 186-52 chr2 190596893 190597302 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -51798 NM_001321313 4664 Hs.107474 NM_005966 ENSG00000138386 NAB1 - NGFI-A binding protein 1 protein-coding 140-81 chr4 124619409 124619700 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61120 NR_110838 101927087 Hs.518966 NR_110838 ENSG00000261083 LINC02516 - long intergenic non-protein coding RNA 2516 ncRNA 122.333-48 chr12 130065640 130065916 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3c|DNA|TcMar-Tigger -5557 NR_146538 105370078 NR_146538 LINC02419 - long intergenic non-protein coding RNA 2419 ncRNA 145.333-62 chr11 131169203 131169637 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -201195 NM_001352003 50863 Hs.504352 NM_016522 ENSG00000182667 NTM CEPU-1|HNT|IGLON2|NTRI neurotrimin protein-coding 188.667-75 chr2 76600357 76600804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -385385 NR_110284 101927907 Hs.382185 NR_110284 ENSG00000234653 LOC101927907 - uncharacterized LOC101927907 ncRNA 152-89 chr2 162656735 162657032 + 0.666667 NA intron (NM_033272, intron 2 of 15) MER102b|DNA|hAT-Charlie -112053 NR_110258 101929570 Hs.470445 NR_110258 ENSG00000237750 LOC101929570 - uncharacterized LOC101929570 ncRNA 252-120 chrX 87737633 87738282 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 220155 NM_057162 56062 Hs.49075 NM_019117 ENSG00000102271 KLHL4 DKELCHL|KHL4 kelch like family member 4 protein-coding 169.333-105 chr18 10716428 10716801 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 34 of 51) intron (NM_022068, intron 34 of 51) 43035 NR_106846 102466735 NR_106846 ENSG00000274838 MIR6788 hsa-mir-6788 microRNA 6788 ncRNA 162.333-21 chr10 8623887 8624277 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29691 NR_134492 105376398 Hs.63158 NR_134492 LOC105376398 - uncharacterized LOC105376398 ncRNA 127.667-191 chr9 5365929 5366230 + 0.666667 NA intron (NM_018465, intron 3 of 5) intron (NM_018465, intron 3 of 5) -26203 NM_006911 6013 Hs.368996 NM_006911 ENSG00000107018 RLN1 H1|H1RLX|RLXH1|bA12D24.3.1|bA12D24.3.2 relaxin 1 protein-coding 167.667-50 chr12 97687479 97687874 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 65922 NR_077241 643711 Hs.585557 NR_077240 ENSG00000257501 LOC643711 - platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 pseudogene pseudo 157-80 chr20 38370403 38370726 + 0.666667 NA intron (NM_004139, intron 10 of 14) intron (NM_004139, intron 10 of 14) 24082 NM_004139 3929 Hs.154078 NM_004139 ENSG00000129988 LBP BPIFD2 lipopolysaccharide binding protein protein-coding 191.333-99 chr2 10058731 10059274 + 0.666667 NA intron (NM_001037160, intron 2 of 2) intron (NM_001037160, intron 2 of 2) 14757 NM_001177718 8462 Hs.12229 NM_003597 ENSG00000172059 KLF11 FKLF|FKLF1|MODY7|TIEG2|Tieg3 Kruppel like factor 11 protein-coding 200.333-50 chr16 80955532 80956003 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 41909 NM_001351973 56942 Hs.55028 NM_020188 ENSG00000103121 CMC2 2310061C15Rik|C16orf61|DC13 C-X9-C motif containing 2 protein-coding 157-98 chr4 174660762 174661133 + 0.666667 NA intron (NM_006529, intron 7 of 9) L1MC4|LINE|L1 -138049 NM_001145816 3248 Hs.596913 NM_000860 ENSG00000164120 HPGD 15-PGDH|PGDH|PGDH1|PHOAR1|SDR36C1 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase protein-coding 121.333-133 chr4 59900884 59901100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 887419 NR_133942 105377247 Hs.298228 NR_133941 ENSG00000251266 LINC02429 - long intergenic non-protein coding RNA 2429 ncRNA 156.667-317 chr7 31404382 31404766 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -63848 NM_022728 63974 Hs.45152 NM_022728 ENSG00000164600 NEUROD6 Atoh2|MATH2|Math-2|NEX1M|Nex1|bHLHa2 neuronal differentiation 6 protein-coding 209.667-102 chr7 46247794 46248218 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -326734 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 123.333-18 chr1 187505216 187505519 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 61739 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 196.667-5 chr1 177084962 177085394 + 0.666667 NA intron (NM_207108, intron 1 of 21) MIR3|SINE|MIR -55733 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 166-4 chr1 71999133 71999579 + 0.666667 NA intron (NM_173808, intron 1 of 6) intron (NM_173808, intron 1 of 6) -162344 NR_046218 100852409 Hs.681780 NR_046218 ENSG00000228853 NEGR1-IT1 - NEGR1 intronic transcript 1 ncRNA 131-22 chr13 49399977 49400315 + 0.666667 NA intron (NM_001079670, intron 3 of 10) intron (NM_001079670, intron 3 of 10) 1396 NM_030925 81617 Hs.87159 NM_030925 ENSG00000102547 CAB39L MO25-BETA|MO2L|bA103J18.3 calcium binding protein 39 like protein-coding 165-55 chr3 114095635 114095961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 39061 NM_001256836 79691 Hs.477162 NM_024638 ENSG00000151576 QTRT2 QTRTD1 queuine tRNA-ribosyltransferase accessory subunit 2 protein-coding 156.333-162 chr19 36892131 36892453 + 0.666667 NA exon (NM_001171979, exon 6 of 6) exon (NM_001171979, exon 6 of 6) 23747 NM_001171979 374899 Hs.720312 NM_001037232 ENSG00000185869 ZNF829 - zinc finger protein 829 protein-coding 207.667-7 chr1 211589205 211589672 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -10277 NM_021194 7779 Hs.519469 NM_021194 ENSG00000170385 SLC30A1 ZNT1|ZRC1 solute carrier family 30 member 1 protein-coding 154.667-246 chr3 107482868 107483165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39946 NM_001142568 56987 Hs.124366 NM_020235 ENSG00000114439 BBX ARTC1|HBP2|HSPC339|MDS001 BBX high mobility group box domain containing protein-coding 111.667-26 chr10 30329997 30330217 + 0.666667 NA intron (NM_018109, intron 4 of 8) intron (NM_018109, intron 4 of 8) 19231 NM_018109 55149 Hs.173946 NM_018109 ENSG00000107951 MTPAP PAPD1|SPAX4|TENT6 mitochondrial poly(A) polymerase protein-coding 116-75 chr2 56865178 56865416 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -679527 NR_125368 100129434 Hs.580330 NR_125368 LOC100129434 - uncharacterized LOC100129434 ncRNA 165.667-110 chr20 54506385 54506734 + 0.666667 NA intron (NM_018431, intron 1 of 7) AluJb|SINE|Alu 30966 NM_177959 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 188.666-3 chr1 105275784 105276342 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 342872 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 157.333-18 chr1 109192872 109193231 + 0.666667 NA intron (NM_001284352, intron 13 of 20) intron (NM_001284352, intron 13 of 20) 6502 NM_001284353 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 123.333-105 chr2 75814993 75815341 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -104252 NM_003203 6936 Hs.303808 NM_003203 ENSG00000005436 GCFC2 C2orf3|DNABF|GCF|TCF9 GC-rich sequence DNA-binding factor 2 protein-coding 228.667-11 chr10 92622084 92622670 + 0.666667 NA intron (NM_004523, intron 10 of 21) AluSq2|SINE|Alu 29247 NM_004523 3832 Hs.8878 NM_004523 ENSG00000138160 KIF11 EG5|HKSP|KNSL1|MCLMR|TRIP5 kinesin family member 11 protein-coding 114.333-154 chr4 18992514 18992715 + 0.666667 NA Intergenic MER61A|LTR|ERV1 -970739 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 194.667-7 chr1 80690527 80690892 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 49422 NR_125942 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 141.333-200 chr5 166985260 166985560 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59040 NR_108020 102557615 NR_108020 ENSG00000254130 LINC01947 CTB-7E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1947 ncRNA 182.333-109 chr3 171266180 171266671 + 0.666667 NA intron (NM_001161563, intron 2 of 31) intron (NM_001161563, intron 2 of 31) -159666 NR_030295 693154 NR_030295 ENSG00000207963 MIR569 MIRN569|hsa-mir-569 microRNA 569 ncRNA 112.333-72 chr14 50018740 50018937 + 0.666667 NA intron (NR_131171, intron 6 of 8) intron (NR_131171, intron 6 of 8) -11318 NR_126498 283551 Hs.292580 NM_001012706 ENSG00000214900 LINC01588 C14orf182 long intergenic non-protein coding RNA 1588 ncRNA 128.333-165 chr5 154181611 154181879 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8988 NM_198321 55568 Hs.631797 NM_017540 ENSG00000164574 GALNT10 GALNACT10|PPGALNACT10|PPGANTASE10 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 protein-coding 123.667-79 chr19 30938763 30938983 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -228637 NR_147209 107985312 Hs.211053 NR_147209 ENSG00000267777 LINC01791 - long intergenic non-protein coding RNA 1791 ncRNA 170.333-188 chr6 133771328 133771660 + 0.666667 NA intron (NR_109982, intron 2 of 8) L2|LINE|L2 -49653 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 171-54 chr3 163603332 163603764 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 -300247 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 154.333-172 chr2 192110458 192110742 + 0.666667 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) intron (NM_001305134, intron 4 of 9) 84333 NM_016192 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 124-104 chr6 149875913 149876196 + 0.666667 NA intron (NR_045126, intron 1 of 1) L3|LINE|CR1 -11695 NM_032832 84918 Hs.408355 NM_032832 ENSG00000120256 LRP11 MANSC3|bA350J20.3 LDL receptor related protein 11 protein-coding 161.667-82 chr14 69339570 69340002 + 0.666667 NA intron (NM_020692, intron 11 of 15) intron (NM_020692, intron 11 of 15) 58513 NM_004450 2079 Hs.509791 NM_004450 ENSG00000100632 ERH DROER ERH mRNA splicing and mitosis factor protein-coding 195-52 chr17 76615297 76615651 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28283 NR_110309 55808 Hs.105352 NM_018414 ENSG00000070526 ST6GALNAC1 HSY11339|SIAT7A|ST6GalNAcI|STYI ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1 protein-coding 125.333-44 chr12 11536169 11536486 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -11703 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 132-59 chr2 52836200 52836552 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -133761 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 118-89 chr3 33589328 33589585 + 0.666667 NA intron (NM_001365634, intron 19 of 35) intron (NM_001365634, intron 19 of 35) 70223 NM_001207044 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 221-9 chr1 233590822 233591430 + 0.666667 NA Intergenic HERVL74-int|LTR|ERVL -22980 NM_002245 3775 Hs.208544 NM_002245 ENSG00000135750 KCNK1 DPK|HOHO|K2P1|K2p1.1|KCNO1|TWIK-1|TWIK1 potassium two pore domain channel subfamily K member 1 protein-coding 126-32 chr14 60484716 60485019 + 0.666667 NA intron (NM_174978, intron 3 of 17) intron (NM_174978, intron 3 of 17) 1196 NM_174978 317761 Hs.335754 NM_174978 ENSG00000179008 C14orf39 Six6os1 chromosome 14 open reading frame 39 protein-coding 190.333-18 chr10 52461125 52461676 + 0.666667 NA intron (NR_120641, intron 2 of 3) intron (NR_120641, intron 2 of 3) -6128 NR_120642 101928687 Hs.380362 NR_120641 ENSG00000231131 LNCAROD A-ROD|LINC01468|lnc-MBL2-4 lncRNA activating regulator of DKK1 ncRNA 117-133 chr7 54481059 54481242 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -61175 NM_001301009 222008 Hs.335933 NM_182546 ENSG00000170419 VSTM2A VSTM2 V-set and transmembrane domain containing 2A protein-coding 147.333-26 chr1 210033575 210033927 + 0.666667 NA intron (NM_153262, intron 4 of 7) intron (NM_153262, intron 4 of 7) 95534 NM_001146262 255928 Hs.658866 NM_153262 ENSG00000143469 SYT14 SCAR11|sytXIV synaptotagmin 14 protein-coding 163.333-250 chr6 145157237 145157636 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 529441 NM_001368132 7957 Hs.486696 NM_005670 ENSG00000112425 EPM2A EPM2|MELF EPM2A glucan phosphatase, laforin protein-coding 150.333-379 chr7 29415591 29415903 + 0.666667 NA intron (NM_001293072, intron 6 of 12) intron (NM_001293072, intron 6 of 12) -63965 NM_001293077 1124 Hs.654611 NM_004067 ENSG00000106069 CHN2 ARHGAP3|BCH|CHN2-3|RHOGAP3 chimerin 2 protein-coding 132.333-137 chr5 134131053 134131274 + 0.666667 NA intron (NM_001366502, intron 1 of 7) intron (NM_001366502, intron 1 of 7) 7545 NM_001366502 6932 Hs.573153 NM_003202 ENSG00000081059 TCF7 TCF-1 transcription factor 7 protein-coding 139.333-174 chr4 137985693 137985958 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103189 NR_038380 641364 Hs.570846 NR_038380 ENSG00000250033 SLC7A11-AS1 - SLC7A11 antisense RNA 1 ncRNA 190.333-63 chr19 52339933 52340462 + 0.666667 NA intron (NM_001161425, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 3952 NM_001161427 162963 Hs.147025 NM_173530 ENSG00000167554 ZNF610 - zinc finger protein 610 protein-coding 116.667-14 chr10 28203016 28203354 + 0.666667 NA intron (NR_134517, intron 2 of 16) intron (NR_134517, intron 2 of 16) 78938 NM_173496 143098 Hs.499159 NM_173496 ENSG00000150054 MPP7 - membrane palmitoylated protein 7 protein-coding 194.667-160 chr9 28392480 28392893 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 3 of 6) MER21C|LTR|ERVL 326619 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 148.667-260 chr3 133008270 133008606 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -29850 NM_001136469 66000 Hs.191616 NM_023943 ENSG00000144868 TMEM108 CT124|RTLN transmembrane protein 108 protein-coding 136-103 chr8 110024564 110024851 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48936 NM_014379 27012 Hs.13285 NM_014379 ENSG00000164794 KCNV1 HNKA|KCNB3|KV2.3|KV8.1 potassium voltage-gated channel modifier subfamily V member 1 protein-coding 112.333-239 chr6 169123935 169124204 + 0.666667 NA Intergenic MER52-int|LTR|ERV1 38232 NR_132622 101929484 Hs.364166 NR_132622 ENSG00000223485 LINC01615 - long intergenic non-protein coding RNA 1615 ncRNA 200.333-111 chr4 184439584 184440010 + 0.666667 NA intron (NM_002199, intron 1 of 8) intron (NM_002199, intron 1 of 8) 34753 NM_002199 3660 Hs.654566 NM_002199 ENSG00000168310 IRF2 IRF-2 interferon regulatory factor 2 protein-coding 134-66 chr3 30761898 30762138 + 0.666667 NA intron (NM_207359, intron 14 of 14) intron (NM_207359, intron 14 of 14) 132643 NM_207359 339896 Hs.657052 NM_207359 ENSG00000144644 GADL1 ADC|CSADC|HuADC|HuCSADC glutamate decarboxylase like 1 protein-coding 131.667-46 chr12 70851487 70851722 + 0.666667 NA intron (NM_002849, intron 2 of 13) MIR|SINE|MIR -62684 NM_001207015 5801 Hs.506076 NM_002849 ENSG00000153233 PTPRR EC-PTP|PCPTP1|PTP-SL|PTPBR7|PTPRQ protein tyrosine phosphatase receptor type R protein-coding 185.667-101 chr5 52153236 52153732 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 145453 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 160-3 chr1 48402924 48403255 + 0.666667 NA intron (NM_019073, intron 6 of 12) AluJb|SINE|Alu 69115 NM_001286238 54558 Hs.538103 NM_019073 ENSG00000132122 SPATA6 HASH|SRF-1|SRF1 spermatogenesis associated 6 protein-coding 177.333-55 chr14 67942342 67942821 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) X6B_LINE|LINE|CR1 118989 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 124.667-164 chr5 32929899 32930187 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17400 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 167-87 chr5 101737146 101737561 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 558931 NM_180991 353189 Hs.127648 NM_180991 ENSG00000173930 SLCO4C1 OATP-H|OATP-M1|OATP4C1|OATPX|PRO2176|SLC21A20 solute carrier organic anion transporter family member 4C1 protein-coding 156.667-85 chr12 85704970 85705438 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 131205 NM_005447 9182 Hs.527881 NM_005447 ENSG00000198774 RASSF9 P-CIP1|PAMCI|PCIP1 Ras association domain family member 9 protein-coding 131.667-167 chr5 145263795 145264103 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 571393 NM_182960 153768 Hs.314261 NM_138492 ENSG00000186314 PRELID2 - PRELI domain containing 2 protein-coding 202.667-25 chr11 25407078 25407597 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -781786 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 217-86 chr7 55332321 55332953 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -32811 NM_018697 55915 Hs.595384 NM_018697 ENSG00000132434 LANCL2 GPR69B|TASP LanC like 2 protein-coding 132.333-136 chr5 128496771 128497009 + 0.666667 NA intron (NM_001999, intron 5 of 64) L1M4b|LINE|L1 41355 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 123-105 chr6 121095002 121095247 + 0.666667 NA intron (NR_104452, intron 34 of 35) intron (NR_104452, intron 34 of 35) 239356 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 134.667-56 chr14 48251565 48251942 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -456739 NR_039996 100506433 Hs.547419 NR_039996 ENSG00000259129 LINC00648 - long intergenic non-protein coding RNA 648 ncRNA 137.667-47 chr13 41216736 41217143 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001354073, exon 15 of 15) 3' UTR (NM_001354073, exon 15 of 15) -22370 NM_032138 84078 Hs.63841 NM_032138 ENSG00000120696 KBTBD7 - kelch repeat and BTB domain containing 7 protein-coding 113.333-231 chr6 135282619 135282852 + 0.666667 NA TTS (NM_001134831) TTS (NM_001134831) 43575 NR_030317 693126 NR_030317 ENSG00000207689 MIR548A2 MIRN548A2 microRNA 548a-2 ncRNA 116.333-201 chr8 54037843 54038099 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -15523 NM_201437 6917 Hs.491745 NM_006756 ENSG00000187735 TCEA1 GTF2S|SII|TCEA|TF2S|TFIIS transcription elongation factor A1 protein-coding 162.667-160 chr20 54163489 54163829 + 0.666667 NA intron (NM_000782, intron 6 of 11) MIR|SINE|MIR 10327 NM_000782 1591 Hs.89663 NM_000782 ENSG00000019186 CYP24A1 CP24|CYP24|HCAI|HCINF1|P450-CC24 cytochrome P450 family 24 subfamily A member 1 protein-coding 143.667-121 chr2 14747939 14748223 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 115364 NM_001369364 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 123.333-2 chr1 27440415 27440646 + 0.666667 NA intron (NM_006990, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 47908 NM_005281 2827 Hs.66542 NM_005281 ENSG00000181773 GPR3 ACCA G protein-coupled receptor 3 protein-coding 122.333-182 chr5 175363333 175363563 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 80734 NM_000794 1812 Hs.2624 NM_000794 ENSG00000184845 DRD1 DADR|DRD1A dopamine receptor D1 protein-coding 152.333-75 chr12 10626840 10627255 + 0.666667 NA intron (NM_018423, intron 7 of 10) intron (NM_018423, intron 7 of 10) -13438 NM_001319985 55110 Hs.104650 NM_018048 ENSG00000111196 MAGOHB MGN2|mago|magoh mago homolog B, exon junction complex subunit protein-coding 156.667-194 chr2 171113038 171113491 + 0.666667 NA intron (NM_012290, intron 2 of 20) intron (NM_012290, intron 2 of 20) -46291 NM_001136555 9874 Hs.744917 NM_012290 ENSG00000198586 TLK1 PKU-beta tousled like kinase 1 protein-coding 152-33 chr11 73084434 73084781 + 0.666667 NA intron (NM_014824, intron 2 of 19) AluJr|SINE|Alu 57711 NM_014824 9873 Hs.744959 NM_014824 ENSG00000137478 FCHSD2 NWK|NWK1|SH3MD3 FCH and double SH3 domains 2 protein-coding 121.667-39 chr11 58046549 58046863 + 0.666667 NA intron (NM_001005212, intron 1 of 2) AluSq2|SINE|Alu 15753 NM_001005186 219952 Hs.690432 NM_001005186 ENSG00000279051 OR6Q1 OR11-226 olfactory receptor family 6 subfamily Q member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 150.667-61 chr11 24465343 24465691 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31536 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 162-88 chr3 177543210 177543597 + 0.666667 NA intron (NR_047568, intron 2 of 3) AluSx|SINE|Alu 101482 NR_047568 100505566 Hs.581170 NR_047568 LINC00578 - long intergenic non-protein coding RNA 578 ncRNA 129-76 chr21 17811633 17811936 + 0.666667 NA intron (NM_001100420, intron 2 of 4) intron (NM_001100420, intron 2 of 4) 7572 NM_001100421 54149 Hs.293811 NM_017447 ENSG00000154642 C21orf91 C21orf14|C21orf38|CSSG1|EURL|YG81 chromosome 21 open reading frame 91 protein-coding 177.667-97 chr4 58162304 58162589 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 373882 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 217-27 chr17 31579788 31580389 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 4677 NR_029856 100126356 NR_029856 ENSG00000283978 MIR365B MIR365-2|MIRN365-2|hsa-mir-365b|mir-365b microRNA 365b ncRNA 146.667-219 chr3 107833114 107833538 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 44742 NR_024276 151658 Hs.159043 NR_015414 ENSG00000241469 LINC00635 - long intergenic non-protein coding RNA 635 ncRNA 185-45 chr3 187173813 187174281 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23439 NM_153708 132112 Hs.518480 NM_153708 ENSG00000175077 RTP1 Z3CXXC1 receptor transporter protein 1 protein-coding 136.667-138 chr5 8829637 8829959 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -9934 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 127.333-186 chr8 47374213 47374522 + 0.666667 NA intron (NR_104581, intron 5 of 16) FLAM_C|SINE|Alu 113429 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 139-76 chr4 102158184 102158548 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 165946 NM_001135148 64116 Hs.288034 NM_022154 ENSG00000138821 SLC39A8 BIGM103|CDG2N|LZT-Hs6|PP3105|ZIP8 solute carrier family 39 member 8 protein-coding 164.667-57 chr12 81190769 81191102 + 0.666667 NA intron (NM_024560, intron 8 of 15) L1ME3|LINE|L1 32547 NR_039848 100616133 NR_039848 ENSG00000265227 MIR4699 - microRNA 4699 ncRNA 200-146 chr6 151710100 151710552 + 0.666667 NA intron (NM_001122742, intron 2 of 9) intron (NM_001122742, intron 2 of 9) 19830 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 118.333-94 chr2 7173844 7174079 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -96081 NR_110252 101929452 NR_110252 ENSG00000223884 LOC101929452 - uncharacterized LOC101929452 ncRNA 114.667-70 chr13 53120823 53121042 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30968 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 115-50 chr13 44807907 44808099 + 0.666667 NA intron (NR_038433, intron 1 of 2) L1MB2|LINE|L1 1627 NR_038433 144817 Hs.585616 NR_038433 ENSG00000235097 LINC00330 NCRNA00330 long intergenic non-protein coding RNA 330 ncRNA 216.667-48 chr18 5137668 5138226 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 56765 NR_146900 105371969 Hs.599709 NR_146900 LINC01892 - long intergenic non-protein coding RNA 1892 ncRNA 130.333-161 chr5 20357166 20357550 + 0.666667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 51807 NR_146519 102725105 NR_146519 CDH18-AS1 - CDH18 antisense RNA 1 ncRNA 236.666-17 chr14 78258135 78258818 + 0.666667 NA intron (NR_073547, intron 2 of 20) intron (NR_073547, intron 2 of 20) 88103 NR_158975 9369 Hs.368307 NM_004796 ENSG00000021645 NRXN3 C14orf60 neurexin 3 protein-coding 251.333-42 chr16 71605610 71606305 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -20227 NM_001017967 91862 Hs.513706 NM_052858 ENSG00000140832 MARVELD3 MARVD3|MRVLDC3 MARVEL domain containing 3 protein-coding 182-93 chr6 48890768 48891261 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 572239 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 148-115 chr4 58270419 58270790 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 265724 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 158.333-116 chr17 65385843 65386166 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71537 NR_131984 105827617 NR_131984 ENSG00000263520 LINC02563 CRAT40 long intergenic non-protein coding RNA 2563 ncRNA 121.333-99 chr20 41294417 41294721 + 0.666667 NA intron (NM_015035, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 5551 NM_015035 23051 Hs.380133 NM_015035 ENSG00000174306 ZHX3 TIX1 zinc fingers and homeoboxes 3 protein-coding 123.667-138 chr4 46850882 46851166 + 0.666667 NA intron (NM_130902, intron 1 of 2) intron (NM_130902, intron 1 of 2) 58221 NM_130902 170712 Hs.479656 NM_130902 ENSG00000170516 COX7B2 - cytochrome c oxidase subunit 7B2 protein-coding 117-115 chr5 84506017 84506291 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -121274 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 137-33 chr16 56167434 56167695 + 0.666667 NA intron (NR_027078, intron 2 of 4) intron (NR_027078, intron 2 of 4) 23530 NR_027078 283856 Hs.707433 NR_027078 ENSG00000246379 LOC283856 - uncharacterized LOC283856 ncRNA 145-70 chr3 69531640 69531861 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -145662 NM_015123 23150 Hs.371681 NM_015123 ENSG00000114541 FRMD4B 6030440G05Rik|GRSP1 FERM domain containing 4B protein-coding 163.333-203 chr4 81002161 81002568 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -28344 NM_001201 651 Hs.387411 NM_001201 ENSG00000152785 BMP3 BMP-3A bone morphogenetic protein 3 protein-coding 211-56 chr21 27021357 27021824 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -54502 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 157-73 chr2 172948199 172948565 + 0.666667 NA intron (NM_001282901, intron 1 of 24) intron (NM_001282901, intron 1 of 24) 20177 NM_001282901 11069 Hs.470646 NM_007023 ENSG00000091428 RAPGEF4 CAMP-GEFII|CGEF2|EPAC|EPAC 2|EPAC2|Nbla00496 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 protein-coding 113.333-121 chr2 43284292 43284470 + 0.666667 NA intron (NM_001083953, intron 35 of 37) MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 57170 NR_027251 100129726 Hs.194480 NM_178529 ENSG00000279873 LINC01126 - long intergenic non-protein coding RNA 1126 ncRNA 140-41 chr15 68922465 68922862 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -7837 NR_033671 79400 Hs.657932 NM_024505 ENSG00000255346 NOX5 - NADPH oxidase 5 protein-coding 175.667-115 chr5 88710442 88710805 + 0.666667 NA intron (NR_146284, intron 2 of 3) intron (NR_146284, intron 2 of 3) -19582 NR_152232 645323 Hs.12827 NR_015436 ENSG00000245526 LINC00461 ECONEXIN|EyeLinc1|VISC long intergenic non-protein coding RNA 461 ncRNA 150.333-189 chr2 41030703 41031079 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -518456 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 191.333-12 chr1 162609384 162609811 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR -21266 NM_001354983 4921 Hs.275757 NM_006182 ENSG00000162733 DDR2 MIG20a|NTRKR3|TKT|TYRO10|WRCN discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 205-31 chr14 53475873 53476328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 322746 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 121-57 chr17 55832231 55832536 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 81278 NM_001102402 58488 Hs.285218 NM_021213 ENSG00000141179 PCTP PC-TP|STARD2 phosphatidylcholine transfer protein protein-coding 148.333-209 chr2 194720290 194720664 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10118 NR_110223 101927431 Hs.558215 NR_110223 ENSG00000230173 LINC01790 - long intergenic non-protein coding RNA 1790 ncRNA 149-156 chr9 73081903 73082242 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -69793 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 186.333-27 chr11 18004297 18004769 + 0.666667 NA non-coding (NR_104041, exon 4 of 10) non-coding (NR_104041, exon 4 of 10) 8514 NR_104040 26297 Hs.32470 NM_012139 ENSG00000129158 SERGEF DELGEF|Gnefr secretion regulating guanine nucleotide exchange factor protein-coding 245-6 chr10 53063482 53063931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -292006 NM_000242 4153 Hs.499674 NM_000242 ENSG00000165471 MBL2 COLEC1|HSMBPC|MBL|MBL2D|MBP|MBP-C|MBP1|MBPD mannose binding lectin 2 protein-coding 114.333-43 chr11 75758971 75759204 + 0.666667 NA intron (NR_046090, intron 3 of 3) (TTTG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 9560 NR_046090 283214 Hs.591972 NR_046090 ENSG00000247867 LOC283214 - uncharacterized LOC283214 ncRNA 198.667 chr1 74046193 74046706 + 0.666667 NA intron (NM_001105659, intron 6 of 7) L1PA7|LINE|L1 151727 NM_001105659 127255 Hs.644625 NM_145258 ENSG00000162620 LRRIQ3 LRRC44 leucine rich repeats and IQ motif containing 3 protein-coding 112.333-102 chr18 7096227 7096529 + 0.666667 NA intron (NM_005559, intron 1 of 62) intron (NM_005559, intron 1 of 62) 21419 NM_005559 284217 Hs.270364 NM_005559 ENSG00000101680 LAMA1 LAMA|PTBHS|S-LAM-alpha laminin subunit alpha 1 protein-coding 172.333-115 chr3 114681497 114681883 + 0.666667 NA intron (NM_001348803, intron 6 of 13) MIR|SINE|MIR -56745 NM_001164346 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 187.667-3 chr1 75978473 75978963 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32606 NR_125939 101927342 Hs.216363 NR_125939 LOC101927342 - uncharacterized LOC101927342 ncRNA 163.333-113 chr16 64682030 64682365 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 439866 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 116.333-12 chr1 103112126 103112371 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3726 NM_080630 1301 Hs.523446 NM_001854 ENSG00000060718 COL11A1 CO11A1|COLL6|STL2 collagen type XI alpha 1 chain protein-coding 114.333-7 chr1 105532322 105532568 + 0.666667 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 86490 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 155.667-294 chr5 155939963 155940295 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -386628 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 120-133 chr8 55214500 55214815 + 0.666667 NA intron (NM_052898, intron 1 of 2) intron (NM_052898, intron 1 of 2) 112629 NM_052898 114786 Hs.130197 NM_052898 ENSG00000206579 XKR4 XRG4 XK related 4 protein-coding 281-46 chr8 130391784 130392379 + 0.666667 NA intron (NM_001247996, intron 2 of 30) L2c|LINE|L2 51579 NM_001362924 50807 Hs.655552 NM_018482 ENSG00000153317 ASAP1 AMAP1|CENTB4|DDEF1|PAG2|PAP|ZG14P ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 protein-coding 129-91 chr4 73558498 73558744 + 0.666667 NA Intergenic L3b|LINE|CR1 49818 NR_046377 728040 Hs.640574 NR_046377 ENSG00000250436 LINC02499 - long intergenic non-protein coding RNA 2499 ncRNA 179.333-26 chr10 84342222 84342554 + 0.666667 NA intron (NM_018999, intron 1 of 10) intron (NM_018999, intron 1 of 10) 13799 NM_001284241 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 169.333-150 chr22 26252135 26252470 + 0.666667 NA intron (NM_001184776, intron 1 of 14) intron (NM_001184776, intron 1 of 14) 82828 NM_001184775 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 163.333-28 chr10 12521368 12521723 + 0.666667 NA intron (NM_001351032, intron 3 of 11) L1MEf|LINE|L1 -57208 NR_039700 100616151 NR_039700 ENSG00000263584 MIR4480 - microRNA 4480 ncRNA 222.333-76 chr5 130459706 130460251 + 0.666667 NA Intergenic THE1B-int|LTR|ERVL-MaLR 555513 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 139-33 chr14 53917166 53917431 + 0.666667 NA Intergenic AluSc5|SINE|Alu 31186 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 113.333-254 chr8 67608758 67609031 + 0.666667 NA intron (NM_020361, intron 2 of 10) MLT1J1|LTR|ERVL-MaLR 137466 NM_020361 57094 Hs.658850 NM_020361 ENSG00000165078 CPA6 CPAH|ETL5|FEB11 carboxypeptidase A6 protein-coding 149-121 chr6 1636395 1636707 + 0.666667 NA intron (NM_001253846, intron 9 of 10) intron (NM_001253846, intron 9 of 10) 26636 NM_001453 2296 Hs.348883 NM_001453 ENSG00000054598 FOXC1 ARA|ASGD3|FKHL7|FREAC-3|FREAC3|IGDA|IHG1|IRID1|RIEG3 forkhead box C1 protein-coding 184.333-53 chr15 76693944 76694348 + 0.666667 NA intron (NR_148227, intron 20 of 32) L1M3|LINE|L1 107499 NR_037464 100500855 NR_037464 ENSG00000266449 MIR3713 - microRNA 3713 ncRNA 154.667-182 chr2 105780888 105781263 + 0.666667 NA intron (NM_003581, intron 1 of 4) intron (NM_003581, intron 1 of 4) 36012 NM_001004722 8440 Hs.529244 NM_003581 ENSG00000071051 NCK2 GRB4|NCKbeta NCK adaptor protein 2 protein-coding 143-13 chr1 187429639 187430064 + 0.666667 NA Intergenic LTR38B|LTR|ERV1 -13777 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 134.667-12 chr1 235263416 235263768 + 0.666667 NA intron (NR_135074, intron 2 of 24) intron (NR_135074, intron 2 of 24) 63895 NM_001206794 51742 Hs.575782 NM_016374 ENSG00000054267 ARID4B BCAA|BRCAA1|RBBP1L1|RBP1L1|SAP180 AT-rich interaction domain 4B protein-coding 206.667-134 chr7 81242057 81242530 + 0.666667 NA Intergenic LTR84a|LTR|ERVL 319526 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 181.667-104 chr3 186809883 186810301 + 0.666667 NA TTS (NR_125409) TTS (NR_125409) -3397 NM_181573 5984 Hs.732098 NM_002916 ENSG00000163918 RFC4 A1|RFC37 replication factor C subunit 4 protein-coding 182-50 chr2 120531329 120531831 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 -65231 NR_027181 84931 Hs.334519 NM_032845 ENSG00000280409 LINC01101 - long intergenic non-protein coding RNA 1101 ncRNA 210.333-107 chr3 146918717 146919229 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2950 NR_135560 101927866 Hs.586116 NR_135560 ENSG00000242671 LINC02010 - long intergenic non-protein coding RNA 2010 ncRNA 155.333-388 chr8 86473399 86473715 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_016033, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_016033, exon 10 of 10) 35129 NM_016033 51115 Hs.145386 NM_016033 ENSG00000176623 RMDN1 CGI-90|FAM82B|RMD-1|RMD1 regulator of microtubule dynamics 1 protein-coding 154.333-319 chr7 30052382 30052692 + 0.666667 NA intron (NM_001363473, intron 6 of 12) AluJr4|SINE|Alu 7452 NM_001363474 84725 Hs.233495 NM_032639 ENSG00000106086 PLEKHA8 FAPP2 pleckstrin homology domain containing A8 protein-coding 216.333-18 chr10 58726079 58726565 + 0.666667 NA intron (NM_001080512, intron 3 of 20) MIR|SINE|MIR 11307 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 161-17 chr12 55769671 55770068 + 0.666667 NA intron (NM_033082, intron 9 of 10) MER47A|DNA|TcMar-Tigger 26747 NM_005811 10220 Hs.600883 NM_005811 ENSG00000135414 GDF11 BMP-11|BMP11 growth differentiation factor 11 protein-coding 154-79 chr2 88247117 88247524 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74181 NM_018271 55258 Hs.739080 NM_018271 ENSG00000144115 THNSL2 SOFAT|THS2|TSH2 threonine synthase like 2 protein-coding 137-64 chr3 124661756 124662031 + 0.666667 NA exon (NM_001322998, exon 11 of 15) exon (NM_001322998, exon 11 of 15) -68473 NR_033437 7372 Hs.2057 NM_000373 ENSG00000114491 UMPS OPRT uridine monophosphate synthetase protein-coding 121-72 chr2 129785405 129785744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 91917 NR_149127 105373615 NR_149127 LINC02572 - long intergenic non-protein coding RNA 2572 ncRNA 199.333-291 chr8 137080439 137080863 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 332937 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 148.667-30 chr1 224783686 224784021 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -145801 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 258-59 chr5 27126305 27126846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87989 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 122.667-47 chr14 60894806 60895078 + 0.666667 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) intron (NM_001177963, intron 6 of 6) 86137 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 122-128 chr8 139448234 139448519 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 254747 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 120-124 chr6 73371826 73372102 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -2172 NM_001080507 441161 Hs.671212 NM_001080507 ENSG00000203907 OOEP C6orf156|FLOPED|HOEP19|KHDC2 oocyte expressed protein protein-coding 179.667-35 chr12 31959835 31960254 + 0.666667 NA intron (NM_018169, intron 1 of 5) intron (NM_018169, intron 1 of 5) 629 NM_018169 55196 Hs.445129 NM_018169 ENSG00000174718 RESF1 C12orf35|GET|KIAA1551|UTA2-1 retroelement silencing factor 1 protein-coding 151.333-8 chr1 56076478 56076768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 131536 NR_147161 105378738 Hs.121473 NR_147161 ENSG00000233079 LINC01755 - long intergenic non-protein coding RNA 1755 ncRNA 148.667-233 chr22 28082618 28082941 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 12 of 22) L1MB2|LINE|L1 -162167 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 114.667-82 chr14 63508461 63508799 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001282181) promoter-TSS (NM_001282181) -392 NM_001282181 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 112.333-20 chr10 21796478 21796646 + 0.666667 NA intron (NM_022365, intron 9 of 11) L1MB1|LINE|L1 207168 NM_022365 64215 Hs.499000 NM_022365 ENSG00000136770 DNAJC1 DNAJL1|ERdj1|HTJ1|MTJ1 DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C1 protein-coding 183-106 chrX 54127608 54128008 + 0.666667 NA intron (NM_001300788, intron 9 of 13) AluJr|SINE|Alu 55446 NM_017848 54954 Hs.86045 NM_017848 ENSG00000184083 FAM120C CXorf17|ORF34 family with sequence similarity 120C protein-coding 248.667-23 chr11 116472785 116473315 + 0.666667 NA Intergenic MER39|LTR|ERV1 -166372 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 195.666-37 chr5 155022188 155022746 + 0.666667 NA Intergenic Tigger16b|DNA|TcMar-Tigger 8712 NM_001099293 285643 Hs.567824 NM_001099293 ENSG00000226650 KIF4B - kinesin family member 4B protein-coding 148.667-217 chr20 12201725 12202167 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL 284053 NM_014962 22903 Hs.709366 NM_014962 ENSG00000132640 BTBD3 dJ742J24.1 BTB domain containing 3 protein-coding 177.667-107 chr5 20492889 20493165 + 0.666667 NA intron (NM_001349558, intron 1 of 15) intron (NM_001349558, intron 1 of 15) 82686 NM_001291956 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 146.333-28 chr10 59819223 59819572 + 0.666667 NA intron (NM_005436, intron 3 of 8) intron (NM_005436, intron 3 of 8) -65942 NM_001304732 100507027 Hs.648790 NM_001304731 ENSG00000227877 MRLN LINC00948|Linc-RAM|M1|MLN|MUSER1 myoregulin protein-coding 118-106 chr5 137322184 137322361 + 0.666667 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) AluJb|SINE|Alu 177054 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 118.667-25 chr10 54511073 54511329 + 0.666667 NA intron (NR_134503, intron 1 of 5) intron (NR_134503, intron 1 of 5) 24971 NR_134503 105378311 Hs.623892 NR_134503 ENSG00000234173 LOC105378311 - uncharacterized LOC105378311 ncRNA 173.333-216 chr9 80008282 80008749 + 0.666667 NA intron (NR_121212, intron 3 of 4) L1MB7|LINE|L1 33492 NR_121212 101927477 Hs.571630 NR_121212 LINC01507 XLOC_000303 long intergenic non-protein coding RNA 1507 ncRNA 112.333-29 chr10 116611709 116612026 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9086 NR_103727 5408 Hs.423598 NM_005396 ENSG00000266200 PNLIPRP2 PLRP2 pancreatic lipase related protein 2 (gene/pseudogene) protein-coding 162-41 chr14 55871331 55871734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74858 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 117-23 chr10 78990645 78990856 + 0.666667 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) AluSx1|SINE|Alu 76698 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 126.333-14 chr1 232551518 232551744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36023 NM_020808 57568 Hs.745009 NM_020808 ENSG00000116991 SIPA1L2 SPAL2|SPAR2 signal induced proliferation associated 1 like 2 protein-coding 113.333-269 chr9 33353112 33353424 + 0.666667 NA intron (NM_002504, intron 17 of 23) intron (NM_002504, intron 17 of 23) 49300 NM_001170 364 Hs.455323 NM_001170 ENSG00000165269 AQP7 AQP7L|AQPap|GLYCQTL aquaporin 7 protein-coding 148.333-44 chr10 47118861 47119286 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -181124 NM_004962 2662 Hs.2171 NM_004962 ENSG00000266524 GDF10 BIP|BMP-3b|BMP3B growth differentiation factor 10 protein-coding 174.667-178 chr9 78159705 78160082 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -76182 NM_001330691 84131 Hs.187621 NM_032171 ENSG00000148019 CEP78 C9orf81|CRDHL|IP63 centrosomal protein 78 protein-coding 142-72 chr20 37154888 37155142 + 0.666667 NA intron (NM_213632, intron 8 of 12) L2b|LINE|L2 -24031 NM_001324302 6185 Hs.370895 NM_002951 ENSG00000118705 RPN2 RIBIIR|RPN-II|RPNII|SWP1 ribophorin II protein-coding 166.333-13 chr1 198042503 198042831 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -114331 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 146.667-144 chr18 40432106 40432540 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 366037 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 330-33 chr7 26387954 26388665 + 0.666667 NA intron (NR_136272, intron 1 of 1) intron (NR_136272, intron 1 of 1) -10260 NR_148503 441204 Hs.587432 NR_015364 ENSG00000214870 LOC441204 - uncharacterized LOC441204 ncRNA 125-108 chr7 146867770 146868041 + 0.666667 NA intron (NM_014141, intron 2 of 22) L1PA14|LINE|L1 93634 NM_014141 26047 Hs.655684 NM_014141 ENSG00000174469 CNTNAP2 AUTS15|CASPR2|CDFE|NRXN4|PTHSL1 contactin associated protein like 2 protein-coding 134-18 chr11 4778364 4778592 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -8540 NM_001004752 256892 NM_001004752 ENSG00000280021 OR51F1 OR11-21|OR51F1P olfactory receptor family 51 subfamily F member 1 (gene/pseudogene) protein-coding 116.333-89 chr17 60071185 60071408 + 0.666667 NA intron (NM_022070, intron 5 of 19) L1MC5|LINE|L1 7635 NM_022070 63897 Hs.221899 NM_022070 ENSG00000068097 HEATR6 ABC1 HEAT repeat containing 6 protein-coding 155.667-206 chr22 25049183 25049551 + 0.666667 NA intron (NM_001145206, intron 4 of 10) intron (NM_001145206, intron 4 of 10) 21393 NM_001145206 85379 Hs.419171 NM_001145206 ENSG00000197077 KIAA1671 - KIAA1671 protein-coding 170-34 chr14 55913713 55914070 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -117217 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 145.333-53 chr11 47011965 47012249 + 0.666667 NA intron (NR_103472, intron 2 of 7) AluJr|SINE|Alu 75346 NM_024113 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 124-77 chr3 97134669 97134987 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 3 of 17) MER34A|LTR|ERV1 -304779 NM_173655 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 142-51 chr16 52601825 52602142 + 0.666667 NA intron (NR_033920, intron 1 of 3) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 4992 NR_033920 643714 Hs.662199 NR_033920 ENSG00000249231 CASC16 LINC00918 cancer susceptibility 16 ncRNA 148-7 chr1 85112382 85112677 + 0.666667 NA intron (NM_001288563, intron 15 of 21) L1ME1|LINE|L1 -21265 NR_039619 100616481 NR_039619 ENSG00000266110 MIR4423 mir-4423 microRNA 4423 ncRNA 200.333-108 chr4 112105465 112105915 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39764 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 129-5 chr1 164365986 164366224 + 0.666667 NA Intergenic L1MCc|LINE|L1 -193255 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 171-9 chr10 119730054 119730413 + 0.666667 NA intron (NM_014937, intron 1 of 19) AluSq2|SINE|Alu 4183 NM_014937 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 195.667-116 chr6 55074090 55074522 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -32154 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 159.333-119 chr16 76970439 76970734 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 101650 NR_039870 100616172 NR_039870 ENSG00000266426 MIR4719 - microRNA 4719 ncRNA 139.667-159 chr6 7870099 7870398 + 0.666667 NA intron (NM_001718, intron 4 of 6) intron (NM_001718, intron 4 of 6) 39829 NM_001145549 81567 Hs.150837 NM_022085 ENSG00000239264 TXNDC5 ENDOPDI|ERP46|HCC-2|HCC2|PDIA15|STRF8|UNQ364 thioredoxin domain containing 5 protein-coding 160.667-80 chr13 27685480 27685786 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 63741 NM_015972 51082 Hs.507584 NM_015972 ENSG00000186184 POLR1D AC19|POLR1C|RPA16|RPA9|RPAC2|RPC16|RPO1-3|TCS2 RNA polymerase I and III subunit D protein-coding 205.333-156 chr3 107011631 107012039 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 228803 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 173.667-104 chr22 39530781 39531222 + 0.666667 NA intron (NR_130151, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 1747 NR_130151 91582 Hs.526933 NM_194326 ENSG00000187051 RPS19BP1 AROS|S19BP ribosomal protein S19 binding protein 1 protein-coding 153.333-140 chr15 59866977 59867280 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -137183 NM_012182 27023 Hs.734475 NM_012182 ENSG00000171956 FOXB1 FKH5|HFKH-5 forkhead box B1 protein-coding 197-12 chr1 213519404 213519847 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -405124 NR_046189 100861504 Hs.742586 NR_046189 LINC00538 PROX1UT|Yiya long intergenic non-protein coding RNA 538 ncRNA 161.667-254 chr8 97702093 97702553 + 0.666667 NA intron (NM_001363136, intron 6 of 10) MIR|SINE|MIR 58139 NM_001363138 92140 Hs.377155 NM_178812 ENSG00000147649 MTDH 3D3|AEG-1|AEG1|LYRIC|LYRIC/3D3 metadherin protein-coding 133.333-25 chr10 72172465 72172728 + 0.666667 NA intron (NM_001369110, intron 5 of 8) AluSz6|SINE|Alu 43360 NM_001369088 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 159.667-285 chr6 103811181 103811579 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 1048166 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 219.333-2 chr1 29045453 29046018 + 0.666667 NA intron (NM_001166007, intron 11 of 17) AluJo|SINE|Alu 76766 NM_001171868 399474 Hs.712722 NM_001003682 ENSG00000253304 TMEM200B TTMB transmembrane protein 200B protein-coding 134.333-84 chr2 27577211 27577462 + 0.666667 NA exon (NM_032266, exon 1 of 1) exon (NM_032266, exon 1 of 1) 814 NM_032266 84226 Hs.131021 NM_032266 ENSG00000221843 C2orf16 - chromosome 2 open reading frame 16 protein-coding 152-116 chr4 67956063 67956510 + 0.666667 NA intron (NM_001114387, intron 1 of 9) MIRb|SINE|MIR 7207 NM_001114387 339967 Hs.450110 NM_182606 ENSG00000187054 TMPRSS11A ECRG1 transmembrane serine protease 11A protein-coding 143-96 chr5 124475960 124476245 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -37582 NR_125774 103724389 Hs.582211 NR_125774 LINC01170 - long intergenic non-protein coding RNA 1170 ncRNA 177.333-102 chr3 3982922 3983299 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -182235 NR_149025 100130207 Hs.587205 NR_149025 ENSG00000144455 LOC100130207 - uncharacterized LOC100130207 ncRNA 112.667-186 chr4 52130795 52130980 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 79583 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 169.333-238 chr7 29593360 29593830 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 28062 NM_001329997 222171 Hs.91109 NM_175887 ENSG00000176532 PRR15 - proline rich 15 protein-coding 155.333-244 chr3 174756223 174756491 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102977 NM_207015 254827 Hs.565848 NM_207015 ENSG00000177694 NAALADL2 - N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase like 2 protein-coding 133.667-88 chr21 30055305 30055584 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 111361 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 171.333-206 chrX 84326754 84327133 + 0.666667 NA intron (NM_001177478, intron 8 of 9) (ATTAAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat -101115 NR_031690 100302191 NR_031690 ENSG00000221494 MIR548I4 MIR548I-4|MIRN548I4|hsa-mir-548i-4 microRNA 548i-4 ncRNA 162.333-177 chr3 197798945 197799315 + 0.666667 NA intron (NM_001365717, intron 1 of 19) intron (NM_001365717, intron 1 of 19) 7876 NM_001365718 84859 Hs.518414 NM_032773 ENSG00000186001 LRCH3 - leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3 protein-coding 174.667-90 chr2 108632728 108633146 + 0.666667 NA intron (NM_001193484, intron 1 of 9) intron (NM_001193484, intron 1 of 9) 11686 NM_001193484 3987 Hs.597715 NM_004987 ENSG00000169756 LIMS1 PINCH|PINCH-1|PINCH1 LIM zinc finger domain containing 1 protein-coding 208.333-75 chr2 117696283 117696808 + 0.666667 NA Intergenic MER30|DNA|hAT-Charlie -118146 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 118.333-159 chr5 7155345 7155550 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 113907 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 194.333-145 chr7 108138957 108139412 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -8823 NM_007356 22798 Hs.62022 NM_007356 ENSG00000091128 LAMB4 - laminin subunit beta 4 protein-coding 137.333-49 chr14 73116732 73117109 + 0.666667 NA intron (NM_021239, intron 18 of 18) intron (NM_021239, intron 18 of 18) -19587 NM_000021 5663 Hs.3260 NM_000021 ENSG00000080815 PSEN1 ACNINV3|AD3|FAD|PS-1|PS1|S182 presenilin 1 protein-coding 157.333-348 chr8 124353556 124353882 + 0.666667 NA intron (NM_194291, intron 1 of 6) L1MC4|LINE|L1 18980 NM_194291 157378 Hs.100691 NM_194291 ENSG00000164983 TMEM65 - transmembrane protein 65 protein-coding 130.667-160 chr5 7240415 7240662 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 28816 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 178.333-31 chr12 1961163 1961603 + 0.666667 NA intron (NR_135060, intron 6 of 10) intron (NR_135060, intron 6 of 10) -24807 NR_036546 100271702 Hs.737031 NR_036546 ENSG00000235049 LINC00940 - long intergenic non-protein coding RNA 940 ncRNA 141-35 chr17 10811184 10811546 + 0.666667 NA intron (NR_073458, intron 3 of 3) L1MB3|LINE|L1 -7266 NR_036581 100289255 Hs.306721 NR_036581 ENSG00000263429 TMEM238L LINC00675 transmembrane protein 238 like ncRNA 223.333-131 chr5 107372610 107373089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 298088 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 128-94 chr5 90712874 90713085 + 0.666667 NA intron (NR_003149, intron 42 of 89) intron (NR_003149, intron 42 of 89) 154182 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 207.333-201 chr4 85478167 85478667 + 0.666667 NA intron (NM_001025616, intron 1 of 9) intron (NM_001025616, intron 1 of 9) 3267 NM_001025616 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 116.667-183 chr7 6368839 6369042 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5587 NM_018890 5879 Hs.413812 NM_006908 ENSG00000136238 RAC1 MIG5|MRD48|Rac-1|TC-25|p21-Rac1 Rac family small GTPase 1 protein-coding 228.667-37 chr19 39254672 39255222 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6091 NM_001276254 101180976 Hs.745579 NM_001276254 ENSG00000272395 IFNL4 IFNAN interferon lambda 4 (gene/pseudogene) protein-coding 198.333-163 chr5 67391925 67392370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -195348 NM_005582 4064 Hs.87205 NM_005582 ENSG00000134061 CD180 LY64|Ly78|RP105 CD180 molecule protein-coding 111.667-154 chr20 33764813 33765073 + 0.666667 NA intron (NM_001282933, intron 8 of 14) AluJr|SINE|Alu 32947 NM_001282933 84905 Hs.516989 NM_032819 ENSG00000131061 ZNF341 HIES3 zinc finger protein 341 protein-coding 130.333-99 chr2 31877697 31878004 + 0.666667 NA intron (NR_126032, intron 5 of 6) MER20B|DNA|hAT-Charlie -73870 NR_146994 105374449 Hs.580386 NR_146994 ENSG00000223647 LINC01946 - long intergenic non-protein coding RNA 1946 ncRNA 112.333-161 chr3 70509926 70510128 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -197389 NM_001364677 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 142.333-140 chr20 37080778 37081051 + 0.666667 NA intron (NM_002895, intron 2 of 21) LTR49-int|LTR|ERV1 15083 NM_001323282 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 154.333-243 chr4 56092189 56092497 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77852 NM_020722 57482 Hs.596667 NM_020722 ENSG00000109265 KIAA1211 CRAD KIAA1211 protein-coding 159.333-109 chr15 93981074 93981378 + 0.666667 NA intron (NR_120320, intron 4 of 8) intron (NR_120320, intron 4 of 8) 80525 NR_120323 101927129 Hs.652658 NR_120322 ENSG00000258785 LINC01580 - long intergenic non-protein coding RNA 1580 ncRNA 143.333-135 chr2 68751922 68752183 + 0.666667 NA intron (NM_001364821, intron 1 of 10) intron (NM_001364821, intron 1 of 10) 16675 NM_001364821 9938 Hs.531807 NM_014882 ENSG00000163219 ARHGAP25 HEL-S-308|KAIA0053 Rho GTPase activating protein 25 protein-coding 123-130 chr8 142239901 142240239 + 0.666667 NA intron (NM_001366901, intron 12 of 13) L1MEd|LINE|L1 41714 NR_024378 619434 Hs.393308 NR_024378 ENSG00000254008 LINC00051 C8orf43|NCRNA00051 long intergenic non-protein coding RNA 51 ncRNA 114-92 chr3 123330359 123330549 + 0.666667 NA intron (NM_183357, intron 5 of 20) MIRb|SINE|MIR 85888 NM_001199642 111 Hs.593292 NM_183357 ENSG00000173175 ADCY5 AC5|FDFM adenylate cyclase 5 protein-coding 155-12 chr10 41728647 41728971 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 639236 NR_024380 441666 Hs.255729 NR_024380 ENSG00000215146 LOC441666 - zinc finger protein 91 pseudogene pseudo 200-60 chr14 84641113 84641565 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -630593 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 113-27 chr11 37176931 37177122 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -578747 NM_001243786 5897 Hs.714519 NM_000536 ENSG00000175097 RAG2 RAG-2 recombination activating 2 protein-coding 157.667-45 chr11 4969844 4970158 + 0.666667 NA Intergenic MER92-int|LTR|ERV1 -14288 NM_001004748 401667 Hs.553805 NM_001004748 ENSG00000205496 OR51A2 - olfactory receptor family 51 subfamily A member 2 protein-coding 152.333-8 chr1 50982219 50982621 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12175 NM_078626 1031 Hs.525324 NM_001262 ENSG00000123080 CDKN2C INK4C|p18|p18-INK4C cyclin dependent kinase inhibitor 2C protein-coding 145-18 chr11 101048029 101048361 + 0.666667 NA intron (NR_073143, intron 4 of 5) intron (NR_073143, intron 4 of 5) 80868 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 224.333-115 chr7 10604368 10604888 + 0.666667 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) intron (NR_147499, intron 1 of 2) -98048 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 121.667-151 chr4 173624341 173624645 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 94035 NR_003679 79804 Hs.61435 NR_003679 ENSG00000237125 HAND2-AS1 DEIN|NBLA00301|UPH HAND2 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-165 chr9 27310948 27311485 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14066 NM_020641 54586 Hs.163070 NM_020641 ENSG00000120160 EQTN AFAF|C9orf11|SPACA8 equatorin protein-coding 217.666-17 chr17 75401122 75401729 + 0.666667 NA intron (NM_002086, intron 1 of 5) AluYb8|SINE|Alu 4253 NM_002086 2885 Hs.444356 NM_002086 ENSG00000177885 GRB2 ASH|EGFRBP-GRB2|Grb3-3|MST084|MSTP084|NCKAP2 growth factor receptor bound protein 2 protein-coding 118.333-186 chr7 1019642 1019832 + 0.666667 NA intron (NR_146964, intron 1 of 4) intron (NR_146964, intron 1 of 4) 3289 NR_029898 442907 NR_029898 ENSG00000199023 MIR339 MIRN339|hsa-mir-339|mir-339 microRNA 339 ncRNA 116.667-136 chr3 142321480 142321690 + 0.666667 NA intron (NM_019001, intron 37 of 41) L1PB4|LINE|L1 -96000 NR_033289 256356 Hs.135904 NM_152776 ENSG00000175066 GK5 - glycerol kinase 5 protein-coding 139.333-30 chr10 127265935 127266339 + 0.666667 NA intron (NM_001290223, intron 29 of 51) intron (NM_001290223, intron 29 of 51) -69546 NM_001039762 642938 Hs.613882 NM_001039762 ENSG00000188916 INSYN2A C10orf141|FAM196A|INSYN2 inhibitory synaptic factor 2A protein-coding 149-59 chr18 13319779 13320141 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 41855 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 157.333-243 chr3 119637266 119637583 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23166 NM_022135 64091 Hs.534383 NM_022135 ENSG00000121577 POPDC2 POP2 popeye domain containing 2 protein-coding 273.667-35 chr2 167673354 167673886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -145052 NM_020981 8708 Hs.735833 NM_020981 ENSG00000172318 B3GALT1 beta3Gal-T1 beta-1,3-galactosyltransferase 1 protein-coding 119.667-140 chr4 164468879 164469122 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85745 NM_001166373 55016 Hs.592804 NM_017923 ENSG00000145416 MARCH1 MARCH-I|RNF171 membrane associated ring-CH-type finger 1 protein-coding 193.667-8 chr1 102098772 102099284 + 0.666667 NA Intergenic LTR49-int|LTR|ERV1 -101794 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 154.667-92 chr13 20725900 20726209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22711 NM_138284 53342 Hs.655142 NM_138284 ENSG00000172458 IL17D IL-17D interleukin 17D protein-coding 145.667-63 chr12 57912524 57912935 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16247 NR_148947 283387 Hs.727244 NR_148947 ENSG00000245651 LOC283387 - uncharacterized LOC283387 ncRNA 200-55 chr14 59996801 59997151 + 0.666667 NA intron (NR_075071, intron 17 of 32) intron (NR_075071, intron 17 of 32) 77263 NM_001355272 341883 Hs.666245 NM_198499 ENSG00000131951 LRRC9 - leucine rich repeat containing 9 protein-coding 212.333-122 chr5 144251070 144251611 + 0.666667 NA intron (NM_001370487, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 45949 NM_001370487 57528 Hs.7093 NM_020768 ENSG00000183775 KCTD16 - potassium channel tetramerization domain containing 16 protein-coding 162.667-113 chr18 60155237 60155545 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 217384 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 151-129 chr8 124537839 124538150 + 0.666667 NA intron (NM_001317889, intron 1 of 12) L2a|LINE|L2 1091 NM_032026 83940 Hs.170568 NM_032026 ENSG00000147687 TATDN1 CDA11 TatD DNase domain containing 1 protein-coding 126.667-152 chr6 45216442 45216709 + 0.666667 NA intron (NM_001350325, intron 2 of 10) L1M2|LINE|L1 -18805 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 117.333-18 chr1 210623437 210623716 + 0.666667 NA exon (NM_018194, exon 11 of 12) exon (NM_018194, exon 11 of 12) 294210 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 158-145 chr9 37113847 37114266 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3G|LINE|L1 -6416 NM_032226 84186 Hs.654700 NM_032226 ENSG00000147905 ZCCHC7 AIR1|HSPC086 zinc finger CCHC-type containing 7 protein-coding 176.333-143 chr6 23119512 23119930 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -401797 NR_134614 105374972 Hs.484889 NR_134613 LOC105374972 - uncharacterized LOC105374972 ncRNA 256-10 chr10 86415905 86416430 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49372 NM_017551 2894 Hs.530653 NM_017551 ENSG00000182771 GRID1 GluD1 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 protein-coding 116-117 chr4 88607469 88607802 + 0.666667 NA intron (NM_001318505, intron 3 of 8) AluSz6|SINE|Alu 15155 NM_014606 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 182.667-147 chr6 69715514 69715901 + 0.666667 NA intron (NM_001367272, intron 8 of 15) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 80759 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 164.333-178 chr4 91586442 91586852 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 10 of 10) L2a|LINE|L2 690655 NR_125920 101929194 Hs.626389 NR_125920 LNCPRESS2 - lncRNA p53 regulated and ESC associated 2 ncRNA 160-119 chr8 86216769 86217057 + 0.666667 NA intron (NM_138817, intron 3 of 3) intron (NM_138817, intron 3 of 3) 13468 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 149-77 chr20 33915548 33915842 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78216 NM_016732 22913 Hs.136947 NM_007367 ENSG00000125970 RALY HNRPCL2|P542 RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein-coding 242.667-93 chr6 158788607 158789128 + 0.666667 NA intron (NM_003379, intron 2 of 12) intron (NM_003379, intron 2 of 12) -24114 NR_037482 100500851 NR_037482 ENSG00000265558 MIR3918 mir-3918 microRNA 3918 ncRNA 153-138 chr7 155601582 155601926 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31008 NM_001369813 285888 Hs.146751 NM_001103176 ENSG00000146910 CNPY1 - canopy FGF signaling regulator 1 protein-coding 141.667-168 chr4 182534825 182535218 + 0.666667 NA intron (NM_001080477, intron 3 of 27) intron (NM_001080477, intron 3 of 27) 291619 NM_001080477 55714 Hs.130438 NM_001080477 ENSG00000218336 TENM3 MCOPCB9|ODZ3|TNM3|Ten-m3|ten-3 teneurin transmembrane protein 3 protein-coding 127.333-56 chr15 63630922 63631197 + 0.666667 NA intron (NM_003922, intron 68 of 77) AluJb|SINE|Alu -30232 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-130 chr16 5752859 5753256 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 120590 NR_107032 102465867 NR_107032 ENSG00000273648 MIR8065 hsa-mir-8065 microRNA 8065 ncRNA 352-18 chr2 117742998 117743622 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71381 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 118.333-23 chr1 211462778 211463017 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 30020 NM_183059 343035 Hs.632495 NM_183059 ENSG00000198570 RD3 C1orf36|LCA12 retinal degeneration 3, GUCY2D regulator protein-coding 122.333-166 chr5 11347530 11347827 + 0.666667 NA intron (NM_001288715, intron 7 of 20) intron (NM_001288715, intron 7 of 20) 241239 NM_001288716 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 151.667-229 chr3 122427514 122427812 + 0.666667 NA exon (NM_002264, exon 13 of 14) exon (NM_002264, exon 13 of 14) 11457 NR_125405 102723582 Hs.675056 NR_125405 ENSG00000272758 LOC102723582 - uncharacterized LOC102723582 ncRNA 138.333-156 chr5 112983442 112983678 + 0.666667 NA intron (NR_038352, intron 1 of 8) intron (NR_038352, intron 1 of 8) 6762 NR_038352 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 113-84 chr17 41814959 41815294 + 0.666667 NA intron (NM_021939, intron 1 of 9) AluSx3|SINE|Alu 2416 NM_021939 60681 Hs.463035 NM_021939 ENSG00000141756 FKBP10 BRKS1|FKBP65|OI11|OI6|PPIASE|hFKBP65 FKBP prolyl isomerase 10 protein-coding 132-117 chr8 90792061 90792425 + 0.666667 NA intron (NM_022351, intron 1 of 12) intron (NM_022351, intron 1 of 12) 468 NM_022351 64168 Hs.719466 NM_022351 ENSG00000123119 NECAB1 EFCBP1|STIP-1 N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 protein-coding 147-105 chr5 17721685 17722069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -66239 NM_001355258 391769 NM_001355258 ENSG00000269466 H3.Y - histone cluster 2, H3c pseudogene protein-coding 157.667-14 chr1 151677777 151678098 + 0.666667 NA intron (NM_030918, intron 7 of 11) L1MB2|LINE|L1 38866 NM_001291106 11189 Hs.26047 NM_007185 ENSG00000159409 CELF3 BRUNOL1|CAGH4|ERDA4|ETR-1|TNRC4 CUGBP Elav-like family member 3 protein-coding 161.667-234 chr7 3993604 3993871 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 14 of 44) intron (NM_152744, intron 14 of 44) -135948 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 204.667-86 chr20 46064728 46065195 + 0.666667 NA intron (NM_001348150, intron 7 of 8) intron (NM_001348150, intron 7 of 8) 25001 NM_001348149 57727 Hs.654991 NM_020967 ENSG00000124160 NCOA5 CIA|bA465L10.6 nuclear receptor coactivator 5 protein-coding 118.333-142 chr3 141032979 141033265 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -18225 NM_080862 92369 Hs.655112 NM_080862 ENSG00000175093 SPSB4 SSB-4|SSB4 splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 protein-coding 156-86 chr3 15926345 15926731 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 52767 NR_030289 693148 NR_030289 ENSG00000207815 MIR563 MIRN563|hsa-mir-563 microRNA 563 ncRNA 187.667-107 chr4 60516833 60517243 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -405581 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 112.667-22 chr1 227665377 227665623 + 0.666667 NA intron (NR_102302, intron 5 of 5) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 32207 NR_036753 401983 Hs.681816 NR_036753 ZNF847P gm127 zinc finger protein 847, pseudogene pseudo 113-176 chr5 151681446 151681726 + 0.666667 NA intron (NR_109873, intron 3 of 4) intron (NR_109873, intron 3 of 4) 4641 NR_109873 101927096 Hs.571023 NR_109873 ENSG00000249035 CLMAT3 CTB-113P19.1|SPARC-AS1 colorectal liver metastasis associated transcript 3 ncRNA 176.333-158 chr7 94190932 94191421 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -186821 NR_133909 10282 Hs.489132 NM_005868 ENSG00000105829 BET1 HBET1 Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein protein-coding 168-16 chr11 13241550 13241922 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -34916 NM_001351804 406 Hs.65734 NM_001178 ENSG00000133794 ARNTL BMAL1|BMAL1c|JAP3|MOP3|PASD3|TIC|bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein-coding 151-108 chr5 42763139 42763521 + 0.666667 NA intron (NM_001134848, intron 3 of 8) L1MC3|LINE|L1 6512 NM_001134848 100129792 Hs.745017 NM_001134848 ENSG00000198865 CCDC152 CH5400 coiled-coil domain containing 152 protein-coding 142.667-220 chr8 79820477 79820751 + 0.666667 NA intron (NR_110954, intron 2 of 5) intron (NR_110954, intron 2 of 5) 51123 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 111.667-105 chr17 66524591 66524835 + 0.666667 NA intron (NM_002737, intron 3 of 16) L2a|LINE|L2 -107859 NR_110822 101928001 Hs.650730 NR_110822 PRKCA-AS1 - PRKCA antisense RNA 1 ncRNA 121.333-194 chr9 130347763 130348001 + 0.666667 NA intron (NM_001291815, intron 26 of 97) intron (NM_001291815, intron 26 of 97) 82122 NM_001291815 256158 Hs.32194 NM_144655 ENSG00000148357 HMCN2 - hemicentin 2 protein-coding 147.333-108 chr14 65869566 65869873 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 398617 NR_030355 693210 NR_030355 ENSG00000207781 MIR625 MIRN625|hsa-mir-625 microRNA 625 ncRNA 138.667-129 chr3 46766920 46767183 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10196 NR_160552 100288960 NR_160552 PRSS43P PRSS43|TESSP3 serine protease 43, pseudogene pseudo 136-15 chr12 11517449 11517801 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -30405 NR_033890 338817 Hs.733066 NR_033890 ENSG00000247157 LINC01252 - long intergenic non-protein coding RNA 1252 ncRNA 154-32 chr11 116719671 116720013 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53145 NM_032725 84811 Hs.437341 NM_032725 ENSG00000137656 BUD13 Cwc26|fSAP71 BUD13 homolog protein-coding 163-55 chr3 42153980 42154400 + 0.666667 NA intron (NM_001349249, intron 1 of 14) AluSx1|SINE|Alu 4955 NM_001349248 22906 Hs.535711 NM_014965 ENSG00000182606 TRAK1 EIEE68|MILT1|OIP106 trafficking kinesin protein 1 protein-coding 121-44 chr14 53038116 53038468 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001160147, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_001160147, exon 13 of 13) -87195 NM_001134999 10979 Hs.509343 NM_006832 ENSG00000073712 FERMT2 KIND2|MIG2|PLEKHC1|UNC112|UNC112B|mig-2 fermitin family member 2 protein-coding 191 chr1 17795676 17796081 + 0.666667 NA intron (NM_030812, intron 1 of 2) intron (NM_030812, intron 1 of 2) 40545 NM_030812 81569 Hs.2149 NM_030812 ENSG00000117148 ACTL8 CT57 actin like 8 protein-coding 299-27 chr22 27921492 27922143 + 0.666667 NA intron (NR_026963, intron 1 of 4) intron (NR_026963, intron 1 of 4) -1205 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 141-46 chr2 122172596 122173016 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 417155 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 139-106 chr8 104439581 104439967 + 0.666667 NA intron (NM_001385, intron 4 of 9) AluJr|SINE|Alu 27281 NM_001385 1807 Hs.443161 NM_001385 ENSG00000147647 DPYS DHP|DHPase dihydropyrimidinase protein-coding 122.667-36 chr12 25236934 25237221 + 0.666667 NA intron (NM_001369786, intron 2 of 5) L1MB7|LINE|L1 13852 NM_004985 3845 Hs.505033 NM_004985 ENSG00000133703 KRAS C-K-RAS|CFC2|K-RAS2A|K-RAS2B|K-RAS4A|K-RAS4B|K-Ras|KI-RAS|KRAS1|KRAS2|NS|NS3|RALD|RASK2|c-Ki-ras2 KRAS proto-oncogene, GTPase protein-coding 133.333-155 chr5 156224625 156224876 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102007 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 166.667-167 chr4 75321860 75322222 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -32035 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 193.333-117 chr3 39735200 39735665 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73482 NM_001284423 25924 Hs.594535 NM_015460 ENSG00000170011 MYRIP SLAC2-C|SLAC2C myosin VIIA and Rab interacting protein protein-coding 171-31 chr18 79454398 79454747 + 0.666667 NA intron (NM_001278672, intron 6 of 8) intron (NM_001278672, intron 6 of 8) 54273 NM_001278672 4772 Hs.534074 NM_006162 ENSG00000131196 NFATC1 NF-ATC|NF-ATc1.2|NFAT2|NFATc nuclear factor of activated T cells 1 protein-coding 159.333-281 chr6 51985181 51985512 + 0.666667 NA intron (NM_138694, intron 35 of 66) intron (NM_138694, intron 35 of 66) 102267 NM_170724 5314 Hs.662050 NM_138694 ENSG00000170927 PKHD1 ARPKD|FCYT|FPC|PKD4|TIGM1 PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductin protein-coding 135.667-136 chr4 150923482 150923740 + 0.666667 NA intron (NM_001367550, intron 4 of 56) intron (NM_001367550, intron 4 of 56) 91656 NM_001199282 987 Hs.480938 NM_006726 ENSG00000198589 LRBA BGL|CDC4L|CVID8|LAB300|LBA LPS responsive beige-like anchor protein protein-coding 152.333-173 chr2 45544290 45544694 + 0.666667 NA intron (NM_018079, intron 14 of 20) MIRb|SINE|MIR 66775 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 141-87 chr7 116786408 116786682 + 0.666667 NA intron (NM_000245, intron 19 of 20) intron (NM_000245, intron 19 of 20) -76042 NM_006136 830 Hs.446123 NM_006136 ENSG00000198898 CAPZA2 CAPPA2|CAPZ capping actin protein of muscle Z-line subunit alpha 2 protein-coding 149.667-418 chr9 2796102 2796487 + 0.666667 NA Intergenic MamTip2|DNA|hAT-Tip100 47801 NM_014878 9933 Hs.493309 NM_014878 ENSG00000080608 PUM3 HA-8|HLA-HA8|KIAA0020|PEN|PUF-A|PUF6|XTP5 pumilio RNA binding family member 3 protein-coding 122.333-116 chr2 216595846 216596044 + 0.666667 NA intron (NR_110392, intron 2 of 3) intron (NR_110392, intron 2 of 3) 10993 NR_110392 101928232 Hs.694592 NR_110392 LINC01280 - long intergenic non-protein coding RNA 1280 ncRNA 115.667-185 chr5 173897486 173897787 + 0.666667 NA intron (NM_001308192, intron 1 of 8) intron (NM_001308192, intron 1 of 8) 4585 NM_001308192 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 116-7 chr1 67847810 67848142 + 0.666667 NA intron (NR_040077, intron 1 of 9) ERVL-E-int|LTR|ERVL -14509 NM_018841 55970 Hs.431101 NM_018841 ENSG00000172380 GNG12 - G protein subunit gamma 12 protein-coding 164.667-91 chr17 74916655 74917103 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001282489, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_001282489, exon 3 of 3) 6376 NM_001282489 124590 Hs.376688 NM_173477 ENSG00000182040 USH1G ANKS4A|SANS USH1 protein network component sans protein-coding 153-150 chr8 136595914 136596252 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 65285 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 284-5 chr10 18614074 18614921 + 0.666667 NA exon (NM_001351117, exon 4 of 10) exon (NM_001351117, exon 4 of 10) 37090 NM_001351118 221078 Hs.396175 NM_182543 ENSG00000241058 NSUN6 4933414E04Rik|ARL5B-AS1|NOPD1 NOP2/Sun RNA methyltransferase 6 protein-coding 157.667-211 chr4 52418906 52419210 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 237481 NM_001134223 64854 Hs.7966 NM_022832 ENSG00000109189 USP46 - ubiquitin specific peptidase 46 protein-coding 179-96 chr8 60646795 60647140 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31773 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 145.667-19 chr1 191531237 191531560 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -302900 NR_146892 105371660 Hs.127094 NR_146892 ENSG00000233882 LINC01680 - long intergenic non-protein coding RNA 1680 ncRNA 121-65 chr2 28974814 28975035 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6374 NM_001321538 165186 Hs.525977 NM_199280 ENSG00000189350 TOGARAM2 FAM179A TOG array regulator of axonemal microtubules 2 protein-coding 168.333-177 chr6 52670725 52671171 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_014051) promoter-TSS (NM_014051) -165 NM_014051 28978 Hs.94896 NM_014051 ENSG00000096092 TMEM14A C6orf73|PTD011 transmembrane protein 14A protein-coding 231.666-3 chr10 63222620 63223313 + 0.666667 NA intron (NM_001322252, intron 2 of 24) intron (NM_001322252, intron 2 of 24) 46257 NR_134512 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 155.333-45 chr10 109469652 109470105 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 453368 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 171-5 chr1 55777923 55778383 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 166810 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 218-36 chr17 40708225 40708773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4747 NM_019016 192666 Hs.87383 NM_019016 ENSG00000167916 KRT24 K24|KA24 keratin 24 protein-coding 119.333-110 chr17 50314154 50314365 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -26404 NR_125805 103752589 Hs.612913 NR_125805 ENSG00000251179 TMEM92-AS1 TCONS_00025237|lncRNA-508851 TMEM92 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-86 chr2 72530780 72531162 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 8 of 19) L1MD1|LINE|L1 295062 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 137-59 chr3 11112016 11112382 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -25039 NM_001098213 3269 Hs.1570 NM_000861 ENSG00000196639 HRH1 H1-R|H1R|HH1R|hisH1 histamine receptor H1 protein-coding 184-60 chr20 53698832 53699226 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 90675 NR_134576 105372672 Hs.259350 NR_134576 ENSG00000235415 LOC105372672 - uncharacterized LOC105372672 ncRNA 161-39 chr2 45602136 45602546 + 0.666667 NA intron (NM_018079, intron 2 of 20) intron (NM_018079, intron 2 of 20) 8926 NM_018079 55133 Hs.14229 NM_018079 ENSG00000068784 SRBD1 - S1 RNA binding domain 1 protein-coding 160.667-323 chr9 26787451 26787760 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 105197 NM_024828 79886 Hs.178357 NM_024828 ENSG00000120159 CAAP1 C9orf82|CAAP caspase activity and apoptosis inhibitor 1 protein-coding 239-7 chr1 244045276 244045740 + 0.666667 NA intron (NR_033883, intron 11 of 11) intron (NR_033883, intron 11 of 11) -3431 NM_001278196 10472 Hs.69997 NM_006352 ENSG00000179456 ZBTB18 C2H2-171|MRD22|RP58|TAZ-1|ZNF238 zinc finger and BTB domain containing 18 protein-coding 219.333-6 chr1 106289835 106290393 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -261861 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 232.666-34 chr3 71681963 71682609 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001134649, exon 8 of 8) 3' UTR (NM_001134649, exon 8 of 8) 43116 NM_001134651 317649 Hs.581355 NM_173359 ENSG00000163412 EIF4E3 eIF-4E3|eIF4E-3 eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 protein-coding 123-67 chr2 236331506 236331791 + 0.666667 NA intron (NR_073043, intron 18 of 19) intron (NR_073043, intron 18 of 19) -67303 NM_212556 401036 Hs.639909 NM_212556 ENSG00000182177 ASB18 ASB-18 ankyrin repeat and SOCS box containing 18 protein-coding 162.667-127 chr2 69994357 69994808 + 0.666667 NA intron (NR_033872, intron 8 of 10) intron (NR_033872, intron 8 of 10) -32317 NM_152792 151516 Hs.516253 NM_152792 ENSG00000244617 ASPRV1 MUNO|SASP|SASPase|Taps aspartic peptidase retroviral like 1 protein-coding 155.333-96 chr13 83625530 83625842 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 256707 NM_052910 114798 Hs.415478 NM_052910 ENSG00000178235 SLITRK1 LRRC12|TTM SLIT and NTRK like family member 1 protein-coding 224-42 chr2 12258339 12258688 + 0.666667 NA intron (NR_110196, intron 3 of 5) AluSz6|SINE|Alu 59383 NR_037452 100500884 NR_037452 ENSG00000264089 MIR3681 - microRNA 3681 ncRNA 195.667-89 chr3 63470200 63470635 + 0.666667 NA intron (NR_046677, intron 1 of 4) intron (NR_046677, intron 1 of 4) 27105 NM_144642 132204 Hs.648668 NM_144642 ENSG00000163630 SYNPR SPO synaptoporin protein-coding 148.333-147 chr15 90585496 90585794 + 0.666667 NA intron (NM_001042574, intron 2 of 14) MIR3|SINE|MIR 55722 NM_022769 64784 Hs.567572 NM_022769 ENSG00000140577 CRTC3 TORC-3|TORC3 CREB regulated transcription coactivator 3 protein-coding 120.667-39 chr12 49471988 49472217 + 0.666667 NA intron (NM_001293285, intron 4 of 14) AluJb|SINE|Alu -66928 NM_001314030 23416 Hs.64064 NM_012284 ENSG00000135519 KCNH3 BEC1|ELK2|Kv12.2 potassium voltage-gated channel subfamily H member 3 protein-coding 145.333-285 chr7 127730476 127730829 + 0.666667 NA intron (NM_014390, intron 10 of 23) intron (NM_014390, intron 10 of 23) 78458 NM_014390 27044 Hs.122523 NM_014390 ENSG00000197157 SND1 TDRD11|Tudor-SN|p100 staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 protein-coding 112.333-127 chr2 60479734 60479909 + 0.666667 NA intron (NM_138559, intron 2 of 4) MER131|DNA?|DNA? 73677 NM_001365609 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 176.667-16 chr1 183824763 183825168 + 0.666667 NA intron (NM_001297671, intron 2 of 17) L3|LINE|CR1 19845 NM_001297672 23179 Hs.497148 NM_015149 ENSG00000143344 RGL1 RGL ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 1 protein-coding 139-45 chr19 34767770 34767978 + 0.666667 NA intron (NM_001007248, intron 2 of 3) intron (NM_001007248, intron 2 of 3) 5341 NM_001007248 148103 Hs.590961 NM_001007247 ENSG00000153896 ZNF599 - zinc finger protein 599 protein-coding 169.667-218 chr9 78010987 78011352 + 0.666667 NA intron (NM_002072, intron 1 of 6) intron (NM_002072, intron 1 of 6) 20642 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 130.333-158 chr4 142668397 142668648 + 0.666667 NA intron (NM_003866, intron 2 of 26) L1M2|LINE|L1 178013 NM_001331040 8821 Hs.176376 NM_003866 ENSG00000109452 INPP4B - inositol polyphosphate-4-phosphatase type II B protein-coding 240.667-7 chr1 227191520 227192006 + 0.666667 NA intron (NM_001366019, intron 5 of 36) intron (NM_001366019, intron 5 of 36) 126729 NM_014826 8476 Hs.35433 NM_003607 ENSG00000143776 CDC42BPA MRCK|MRCKA|PK428 CDC42 binding protein kinase alpha protein-coding 178.333-5 chr1 155147586 155147957 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -7240 NM_153741 54344 Hs.110477 NM_018973 ENSG00000179085 DPM3 CDG1O dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatory protein-coding 172.667-75 chr2 15530973 15531343 + 0.666667 NA intron (NR_052013, intron 9 of 50) HAL1|LINE|L1 30176 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 151.333-138 chr14 101445341 101445672 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3430 NR_135240 100507277 Hs.123543 NR_135240 ENSG00000259082 LINC02314 - long intergenic non-protein coding RNA 2314 ncRNA 131.667-39 chr12 5450155 5450496 + 0.666667 NA intron (NM_001102654, intron 1 of 1) intron (NM_001102654, intron 1 of 1) 18217 NM_001102654 4908 Hs.99171 NM_002527 ENSG00000185652 NTF3 HDNF|NGF-2|NGF2|NT-3|NT3 neurotrophin 3 protein-coding 121.667-37 chr11 17653360 17653605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43457 NR_132279 102723330 Hs.471111 NR_132279 ENSG00000255335 LINC02729 - long intergenic non-protein coding RNA 2729 ncRNA 163.667-215 chr6 103731134 103731554 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1128202 NM_001321083 57531 Hs.434340 NM_020771 ENSG00000085382 HACE1 SPPRS HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 protein-coding 122.667-199 chr8 123109931 123110228 + 0.666667 NA intron (NM_001363156, intron 9 of 19) AluSx1|SINE|Alu 36830 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 162-131 chr9 34019256 34019641 + 0.666667 NA intron (NM_001370059, intron 1 of 28) L1MA5|LINE|L1 29439 NM_001370067 55833 Hs.493739 NM_018449 ENSG00000137073 UBAP2 UBAP-2 ubiquitin associated protein 2 protein-coding 201-15 chr1 246694197 246694693 + 0.666667 NA Intergenic MER11A|LTR|ERVK -29964 NM_016002 51097 Hs.498397 NM_016002 ENSG00000143653 SCCPDH CGI-49|NET11 saccharopine dehydrogenase (putative) protein-coding 141.667-25 chr10 47349044 47349408 + 0.666667 NA exon (NM_002900, exon 1 of 4) exon (NM_002900, exon 1 of 4) 863 NM_002900 5949 Hs.591928 NM_002900 ENSG00000265203 RBP3 D10S64|D10S65|D10S66|IRBP|RBPI|RP66 retinol binding protein 3 protein-coding 146.667-114 chr15 68063573 68063988 + 0.666667 NA intron (NM_001320687, intron 2 of 14) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie 9204 NM_001320687 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 200.333-51 chr16 82229416 82229757 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59362 NM_005792 10200 Hs.344400 NM_005792 ENSG00000135698 MPHOSPH6 MPP|MPP-6|MPP6 M-phase phosphoprotein 6 protein-coding 117-4 chr1 91980266 91980494 + 0.666667 NA intron (NM_001726, intron 8 of 18) intron (NM_001726, intron 8 of 18) 28228 NM_001726 676 Hs.482520 NM_001726 ENSG00000137948 BRDT BRD6|CT9|SPGF21 bromodomain testis associated protein-coding 180.333-109 chr6 133338502 133338892 + 0.666667 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 97198 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 158-78 chr20 6552026 6552431 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 125496 NR_109953 101929244 Hs.542488 NR_109953 ENSG00000229876 CASC20 - cancer susceptibility 20 ncRNA 164-30 chr12 117115327 117115661 + 0.666667 NA intron (NR_120464, intron 2 of 2) AluSq|SINE|Alu 16027 NR_120464 101928244 Hs.742266 NR_120464 TESC-AS1 - TESC antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 150.333-173 chr18 13664098 13664485 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001098801, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001098801, exon 5 of 5) 22533 NM_001276251 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 118.333-195 chr7 84145810 84146139 + 0.666667 NA intron (NM_006080, intron 1 of 16) intron (NM_006080, intron 1 of 16) 48815 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 171.667-174 chr8 128518557 128518953 + 0.666667 NA intron (NR_121672, intron 2 of 7) intron (NR_121672, intron 2 of 7) 45924 NR_121673 101927774 Hs.628730 NR_121672 LINC00824 LINC01263 long intergenic non-protein coding RNA 824 ncRNA 244-91 chr6 149589080 149589523 + 0.666667 NA intron (NM_138785, intron 7 of 7) AluSx|SINE|Alu -4315 NR_077247 645958 Hs.632614 NR_077247 RPS18P9 RPS18_6_767 ribosomal protein S18 pseudogene 9 pseudo 266.333-20 chr15 80845758 80846343 + 0.666667 NA intron (NM_018689, intron 1 of 28) intron (NM_018689, intron 1 of 28) -3977 NR_030393 693132 NR_030393 ENSG00000208003 MIR549A MIR549|MIRN549|hsa-mir-549|hsa-mir-549a|mir-549a microRNA 549a ncRNA 130-130 chr8 88792315 88792699 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -465024 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 127.333-19 chr1 212300743 212301077 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001199756) promoter-TSS (NM_001199756) -948 NM_001199756 5525 Hs.744012 NM_006243 ENSG00000066027 PPP2R5A B56A|B56alpha|PR61A protein phosphatase 2 regulatory subunit B'alpha protein-coding 120-6 chr1 204792458 204792720 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36063 NM_001005389 23114 Hs.13349 NM_015090 ENSG00000163531 NFASC NEDCPMD|NF|NRCAML neurofascin protein-coding 116.333-47 chr11 104796470 104796768 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 102051 NR_034066 100506742 Hs.476989 NM_001191016 ENSG00000204403 CASP12 CASP-12|CASP12P1 caspase 12 (gene/pseudogene) protein-coding 185.333-187 chr8 91077356 91077807 + 0.666667 NA intron (NM_001286745, intron 4 of 7) intron (NM_001286745, intron 4 of 7) 7237 NM_001286745 51633 Hs.30532 NM_016023 ENSG00000155100 OTUD6B CGI-77|DUBA-5|DUBA5|IDDFSDA OTU domain containing 6B protein-coding 208-171 chr8 123495538 123496011 + 0.666667 NA Intergenic MER1B|DNA|hAT-Charlie 36369 NM_148177 114907 Hs.403933 NM_058229 ENSG00000156804 FBXO32 Fbx32|MAFbx F-box protein 32 protein-coding 199-36 chr18 13815483 13815921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8447 NM_005913 4161 Hs.248145 NM_005913 ENSG00000176136 MC5R MC2 melanocortin 5 receptor protein-coding 222-32 chr15 99125318 99125943 + 0.666667 NA intron (NM_145728, intron 2 of 3) intron (NM_145728, intron 2 of 3) 20550 NM_015286 23336 Hs.207106 NM_015286 ENSG00000182253 SYNM DMN|SYN synemin protein-coding 143.333-222 chr5 40764699 40764982 + 0.666667 NA exon (NM_001355037, exon 7 of 9) exon (NM_001355037, exon 7 of 9) -8879 NM_012382 23548 Hs.348915 NM_012382 ENSG00000113638 TTC33 OSRF tetratricopeptide repeat domain 33 protein-coding 169.667-113 chr2 138482899 138483254 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -18694 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 140-29 chr12 63775395 63775759 + 0.666667 NA Intergenic A-rich|Low_complexity|Low_complexity -4332 NM_014254 10329 Hs.216386 NM_014254 ENSG00000118600 RXYLT1 HP10481|MDDGA10|TMEM5 ribitol xylosyltransferase 1 protein-coding 175.333-41 chr14 49371723 49372225 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 214406 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 113.667-40 chr12 43216421 43216599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61195 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 188-85 chr5 3311666 3312132 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 134064 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 127.333-136 chr5 34771553 34771906 + 0.666667 NA intron (NM_015577, intron 3 of 17) intron (NM_015577, intron 3 of 17) -67435 NM_144725 153657 Hs.435742 NM_144725 ENSG00000205838 TTC23L MC25-1 tetratricopeptide repeat domain 23 like protein-coding 169-28 chr14 69459151 69459442 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001252148, exon 6 of 6) 3' UTR (NM_001252148, exon 6 of 6) -25432 NM_001161498 400224 Hs.509796 NM_001161498 ENSG00000175985 PLEKHD1 UPF0639 pleckstrin homology and coiled-coil domain containing D1 protein-coding 165.333-162 chr3 32476900 32477280 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 25762 NM_017801 54918 Hs.380627 NM_017801 ENSG00000091317 CMTM6 CKLFSF6|PRO2219 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 6 protein-coding 232.333-91 chr8 111366015 111366538 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10363 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 128.667-55 chr14 53927988 53928291 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20345 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 126-128 chrX 45208098 45208313 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -7329 NM_176819 79742 Hs.98321 NM_024689 ENSG00000147113 DIPK2B 4930578C19Rik|CXorf36|DIA1R|EPQL1862|PRO3743|bA435K1.1 divergent protein kinase domain 2B protein-coding 131.667-202 chr8 118036714 118037005 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) L2a|LINE|L2 74960 NM_000127 2131 Hs.492618 NM_000127 ENSG00000182197 EXT1 EXT|LGCR|LGS|TRPS2|TTV exostosin glycosyltransferase 1 protein-coding 117.667 chr1 19249174 19249385 + 0.666667 NA intron (NM_001271428, intron 1 of 22) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 2245 NM_001271429 23065 Hs.439200 NM_015047 ENSG00000127463 EMC1 CAVIPMR|KIAA0090 ER membrane protein complex subunit 1 protein-coding 143.667-139 chr20 76232 76640 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -11236 NM_153325 245938 Hs.380220 NM_153325 ENSG00000178591 DEFB125 DEFB-25 defensin beta 125 protein-coding 148.667-295 chr4 172185609 172185905 + 0.666667 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) intron (NM_001034845, intron 2 of 12) -372150 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 168-13 chr10 120862434 120862907 + 0.666667 NA intron (NM_018117, intron 4 of 28) intron (NM_018117, intron 4 of 28) 11308 NM_018117 55717 Hs.144447 NM_018117 ENSG00000120008 WDR11 BRWD2|DR11|HH14|SRI1|WDR15 WD repeat domain 11 protein-coding 119-81 chr2 180745481 180745708 + 0.666667 NA intron (NR_104324, intron 3 of 4) L1MC5|LINE|L1 53490 NR_104323 101669767 NR_104319 ENSG00000281131 SCHLAP1 LINC00913|PCAT11|PCAT114 SWI/SNF complex antagonist associated with prostate cancer 1 ncRNA 192.667-17 chr1 225085988 225086479 + 0.666667 NA intron (NM_001367479, intron 21 of 85) AluY|SINE|Alu 156558 NM_001349912 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 156.333-355 chr8 79383992 79384293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51954 NR_162137 113219456 NR_162137 MIR12123 - microRNA 12123 ncRNA 137.333-153 chr5 59473702 59474109 + 0.666667 NA intron (NM_001349242, intron 1 of 16) MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 112593 NM_006203 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 143.333-41 chr10 85586671 85587080 + 0.666667 NA intron (NR_038986, intron 2 of 2) L1MCa|LINE|L1 9144 NR_038986 100507470 Hs.585483 NR_038986 ENSG00000234942 GRID1-AS1 - GRID1 antisense RNA 1 ncRNA 185-2 chr1 246819988 246820317 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 30535 NR_015422 149134 Hs.720494 NM_207326 LINC01341 - long intergenic non-protein coding RNA 1341 ncRNA 112.667-92 chr17 33662942 33663151 + 0.666667 NA intron (NM_001094, intron 1 of 9) intron (NM_001094, intron 1 of 9) -129286 NR_037584 100506677 Hs.652571 NR_037584 ENSG00000265544 AA06 AA02|AA04|AA05 uncharacterized LOC100506677 pseudo 128.667-97 chr2 170144620 170144953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33361 NR_045684 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 139.667-155 chr5 121765716 121766001 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -86024 NM_177478 94033 Hs.105324 NM_177478 ENSG00000181867 FTMT MTF ferritin mitochondrial protein-coding 112.667-114 chr2 25868252 25868555 + 0.666667 NA intron (NM_018263, intron 1 of 11) intron (NM_018263, intron 1 of 11) 10084 NM_018263 55252 Hs.119815 NM_018263 ENSG00000143970 ASXL2 ASXH2|SHAPNS ASXL transcriptional regulator 2 protein-coding 129-134 chr9 102290040 102290341 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -229447 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 175.333-147 chr5 126352783 126353154 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7152 NM_001146319 65983 Hs.363558 NM_023927 ENSG00000155324 GRAMD2B GRAMD3|NS3TP2 GRAM domain containing 2B protein-coding 258.333-76 chr9 35295042 35295542 + 0.666667 NA intron (NM_006377, intron 7 of 38) intron (NM_006377, intron 7 of 38) -46604 NM_001371188 117.333-72 chr16 12617442 12617728 + 0.666667 NA Intergenic MER1A|DNA|hAT-Charlie -102736 NR_039869 100616195 NR_039869 ENSG00000264733 MIR4718 - microRNA 4718 ncRNA 143.667-43 chr11 85542703 85542992 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 3 of 27) intron (NM_001142699, intron 3 of 27) 84423 NM_001142699 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 321.333-28 chr15 67376401 67377096 + 0.666667 NA intron (NM_001031715, intron 10 of 20) intron (NM_001031715, intron 10 of 20) -121550 NM_001271885 79719 Hs.254642 NM_024666 ENSG00000103591 AAGAB KPPP1|PPKP1|PPKP1A|p34 alpha and gamma adaptin binding protein protein-coding 114.333-181 chr5 111776021 111776297 + 0.666667 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) L1ME4b|LINE|L1 -17941 NM_001142476 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 118-65 chr2 14579557 14579860 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -53009 NR_144632 151354 Hs.260855 NM_145175 ENSG00000162981 LRATD1 FAM84A|NSE1|PP11517 LRAT domain containing 1 protein-coding 153.333-51 chr10 68232093 68232401 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_145178) promoter-TSS (NM_145178) -134 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 114-41 chr14 82806493 82806695 + 0.666667 NA Intergenic MER67B|LTR|ERV1 163962 NR_146650 101928599 NR_146650 ENSG00000258743 LINC02301 - long intergenic non-protein coding RNA 2301 ncRNA 200.667-56 chr17 8574156 8574597 + 0.666667 NA intron (NM_005964, intron 5 of 40) L1MB8|LINE|L1 56349 NM_001256012 4628 Hs.16355 NM_005964 ENSG00000133026 MYH10 NMMHC-IIB|NMMHCB myosin heavy chain 10 protein-coding 144-43 chr12 110487564 110487846 + 0.666667 NA intron (NM_013300, intron 5 of 6) intron (NM_013300, intron 5 of 6) 14406 NM_016226 51699 Hs.600114 NM_016226 ENSG00000111237 VPS29 DC15|DC7|PEP11 VPS29 retromer complex component protein-coding 160-58 chr2 28836992 28837442 + 0.666667 NA intron (NM_001008779, intron 4 of 4) intron (NM_001008779, intron 4 of 4) 21220 NM_001008779 245711 Hs.511956 NM_182756 ENSG00000163806 SPDYA RINGO3|RINGOA|SPDY1|SPY1 speedy/RINGO cell cycle regulator family member A protein-coding 154.667-200 chr2 192140334 192140722 + 0.666667 NA intron (NM_001305134, intron 4 of 9) CR1-L3A_Croc|LINE|CR1 54405 NM_016192 23671 Hs.144513 NM_016192 ENSG00000144339 TMEFF2 CT120.2|HPP1|TENB2|TPEF|TR|TR-2 transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2 protein-coding 140.333-67 chr14 75513289 75513574 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -9038 NM_006399 10538 Hs.509964 NM_006399 ENSG00000156127 BATF B-ATF|BATF1|SFA-2|SFA2 basic leucine zipper ATF-like transcription factor protein-coding 205.333-151 chr3 62816771 62817166 + 0.666667 NA intron (NM_003716, intron 1 of 29) intron (NM_003716, intron 1 of 29) 58448 NM_003716 8618 Hs.654933 NM_003716 ENSG00000163618 CADPS CADPS1|CAPS|CAPS1|UNC-31 calcium dependent secretion activator protein-coding 114.333-29 chr10 69167544 69167730 + 0.666667 NA intron (NM_001035260, intron 7 of 7) AluSx1|SINE|Alu -12597 NR_136626 6832 Hs.106469 NM_003171 ENSG00000156502 SUPV3L1 SUV3 Suv3 like RNA helicase protein-coding 189.333-137 chr3 145706321 145706735 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 362657 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 124-99 chr5 130260426 130260645 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 356070 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 130-33 chr14 33786450 33786771 + 0.666667 NA intron (NM_001165893, intron 8 of 10) intron (NM_001165893, intron 8 of 10) 77673 NR_132771 106635522 NR_132771 SNORA89 - small nucleolar RNA, H/ACA box 89 snoRNA 112-106 chr2 70730802 70730989 + 0.666667 NA intron (NM_017482, intron 1 of 12) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 36820 NM_001185054 119 Hs.66187 NM_001617 ENSG00000075340 ADD2 ADDB adducin 2 protein-coding 135.333-100 chr20 1750248 1750534 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 29355 NR_037142 100289473 Hs.641525 NR_037142 ENSG00000232528 LOC100289473 - cytoskeleton associated protein 2-like pseudogene pseudo 176-109 chr9 94990204 94990546 + 0.666667 NA intron (NM_032823, intron 9 of 14) intron (NM_032823, intron 9 of 14) -44821 NR_147614 101928119 Hs.630906 NR_147613 LOC101928119 - uncharacterized LOC101928119 ncRNA 238.667-91 chr8 120634221 120634840 + 0.666667 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR -126723 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 143.333-83 chr14 55801839 55802186 + 0.666667 NA Intergenic LTR8|LTR|ERV1 -5338 NR_026796 645687 Hs.569345 NR_026796 ENSG00000258791 LINC00520 C14orf34 long intergenic non-protein coding RNA 520 ncRNA 230-15 chr11 84395831 84396198 + 0.666667 NA intron (NM_001142699, intron 7 of 27) intron (NM_001142699, intron 7 of 27) -78675 NM_001206769 1740 Hs.367656 NM_001364 ENSG00000150672 DLG2 PPP1R58|PSD-93|PSD93|chapsyn-110 discs large MAGUK scaffold protein 2 protein-coding 140.333-247 chr9 87397851 87398176 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -99215 NM_001288731 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 147-103 chr4 185574530 185574823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39118 NM_001114107 27295 Hs.701364 NM_014476 ENSG00000154553 PDLIM3 ALP PDZ and LIM domain 3 protein-coding 228-38 chr2 22438826 22439466 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 -97333 NR_110577 102723362 Hs.502887 NR_110577 ENSG00000233587 LINC01884 - long intergenic non-protein coding RNA 1884 ncRNA 116-36 chr14 51022567 51022837 + 0.666667 NA intron (NM_015163, intron 3 of 9) intron (NM_015163, intron 3 of 9) 73002 NM_052978 114088 Hs.654750 NM_015163 ENSG00000100505 TRIM9 RNF91|SPRING tripartite motif containing 9 protein-coding 146-44 chr17 56777979 56778310 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55776 NM_001085430 339210 Hs.658949 NM_001085430 ENSG00000214226 C17orf67 - chromosome 17 open reading frame 67 protein-coding 150-28 chr12 8750321 8750657 + 0.666667 NA intron (NR_147950, intron 3 of 8) intron (NR_147950, intron 3 of 8) 52498 NR_147949 57494 Hs.504670 NM_020734 ENSG00000166532 RIMKLB FAM80B|NAAGS|NAAGS-I ribosomal modification protein rimK like family member B protein-coding 142-123 chr5 172200196 172200469 + 0.666667 NA intron (NM_001171183, intron 2 of 3) intron (NM_001171183, intron 2 of 3) 6160 NM_001171183 285588 Hs.716824 NM_001171183 ENSG00000214360 EFCAB9 - EF-hand calcium binding domain 9 protein-coding 114.333-46 chr11 81914253 81914583 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) AluSc|SINE|Alu -23582 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 152-157 chr8 129380670 129381028 + 0.666667 NA intron (NR_130918, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 103293 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 120.667-176 chr9 13332507 13332775 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52928 NM_001330637 8777 Hs.169378 NM_003829 ENSG00000107186 MPDZ HYC2|MUPP1 multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component protein-coding 117.333-119 chr20 18825294 18825518 + 0.666667 NA intron (NR_161343, intron 1 of 2) intron (NR_161343, intron 1 of 2) 4797 NR_161343 100128496 Hs.664484 NR_161342 C20orf78 - chromosome 20 open reading frame 78 ncRNA 220-87 chr5 41430300 41430667 + 0.666667 NA intron (NM_001005473, intron 1 of 2) intron (NM_001005473, intron 1 of 2) 80118 NM_001005473 345557 Hs.145404 NM_001005473 ENSG00000182836 PLCXD3 - phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 3 protein-coding 143.667-209 chr6 33681167 33681572 + 0.666667 NA intron (NM_002224, intron 33 of 57) ERVL-B4-int|LTR|ERVL -16759 NR_037498 100500873 NR_037498 ENSG00000266509 MIR3934 - microRNA 3934 ncRNA 201.333-57 chr11 103286996 103287331 + 0.666667 NA intron (NM_001377, intron 74 of 88) intron (NM_001377, intron 74 of 88) 177737 NM_001080463 79659 Hs.503721 NM_001377 ENSG00000187240 DYNC2H1 ATD3|DHC1b|DHC2|DNCH2|DYH1B|SRPS2B|SRTD3|hdhc11 dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 protein-coding 227.333-53 chr18 27644429 27644967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -302042 NR_134589 105372038 Hs.722107 NR_134589 ENSG00000264151 LOC105372038 - uncharacterized LOC105372038 ncRNA 122.667-141 chr4 125462471 125462732 + 0.666667 NA intron (NM_001291303, intron 9 of 16) intron (NM_001291303, intron 9 of 16) -44658 NR_031746 100302267 NR_031746 ENSG00000283550 MIR2054 hsa-mir-2054 microRNA 2054 ncRNA 138.667-125 chr22 35582122 35582415 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu 35061 NM_005368 4151 Hs.517586 NM_005368 ENSG00000198125 MB PVALB|myoglobgin myoglobin protein-coding 125.333-190 chr9 102497005 102497353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22458 NR_103830 414319 Hs.385790 NR_103830 ENSG00000204250 LINC00587 C9orf107|bA785H23.1 long intergenic non-protein coding RNA 587 ncRNA 155-139 chrX 114334036 114334353 + 0.666667 NA Intergenic L1M3e|LINE|L1 -249884 NM_001256761 3358 Hs.149037 NM_000868 ENSG00000147246 HTR2C 5-HT1C|5-HT2C|5-HTR2C|5HTR2C|HTR1C 5-hydroxytryptamine receptor 2C protein-coding 142-41 chr13 112669177 112669483 + 0.666667 NA intron (NM_207440, intron 1 of 2) intron (NM_207440, intron 1 of 2) -20999 NM_015205 23250 Hs.29189 NM_015205 ENSG00000068650 ATP11A ATPIH|ATPIS ATPase phospholipid transporting 11A protein-coding 139-52 chr2 161138968 161139310 + 0.666667 NA intron (NM_004180, intron 1 of 7) intron (NM_004180, intron 1 of 7) 2176 NM_004180 10010 Hs.132257 NM_004180 ENSG00000136560 TANK I-TRAF|ITRAF|TRAF2 TRAF family member associated NFKB activator protein-coding 118.667-88 chr18 8591052 8591331 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -18254 NM_001025300 201475 Hs.270074 NM_001025300 ENSG00000206418 RAB12 - RAB12, member RAS oncogene family protein-coding 154.333-109 chr15 79720510 79720851 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 176317 NR_037654 10588 Hs.194294 NM_006441 ENSG00000136371 MTHFS HsT19268|NEDMEHM methenyltetrahydrofolate synthetase protein-coding 193.667-126 chr7 55057597 55058069 + 0.666667 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) 38801 NM_201283 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 115.333-228 chr9 13107295 13107548 + 0.666667 NA intron (NM_003829, intron 45 of 45) intron (NM_003829, intron 45 of 45) -134788 NR_132976 106635615 NR_132976 SNORD137 - small nucleolar RNA, C/D box 137 snoRNA 137.667-79 chr18 5147595 5147911 + 0.666667 NA intron (NM_001330553, intron 1 of 1) intron (NM_001330553, intron 1 of 1) 49504 NM_001145194 642597 Hs.437160 NM_001145194 ENSG00000231824 AKAIN1 C18orf42 A-kinase anchor inhibitor 1 protein-coding 120.667-75 chr17 70592303 70592539 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 422886 NM_000891 3759 Hs.1547 NM_000891 ENSG00000123700 KCNJ2 ATFB9|HHBIRK1|HHIRK1|IRK1|KIR2.1|LQT7|SQT3 potassium voltage-gated channel subfamily J member 2 protein-coding 118.333-198 chr7 104447541 104447747 + 0.666667 NA intron (NM_199000, intron 1 of 2) intron (NM_199000, intron 1 of 2) 118988 NM_199000 375612 Hs.659164 NM_199000 ENSG00000187416 LHFPL3 LHFPL4 LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein-coding 127-7 chr1 91955015 91955239 + 0.666667 NA intron (NM_001726, intron 1 of 18) intron (NM_001726, intron 1 of 18) 2975 NM_001726 676 Hs.482520 NM_001726 ENSG00000137948 BRDT BRD6|CT9|SPGF21 bromodomain testis associated protein-coding 195.333-134 chr20 62664010 62664594 + 0.666667 NA intron (NR_024470, intron 3 of 3) intron (NR_024470, intron 3 of 3) 2319 NR_024470 100127888 Hs.671273 NR_024470 ENSG00000232803 SLCO4A1-AS1 - SLCO4A1 antisense RNA 1 ncRNA 135.667-42 chr12 111567638 111568026 + 0.666667 NA intron (NM_001310121, intron 1 of 25) intron (NM_001310121, intron 1 of 25) 31483 NM_002973 6311 Hs.76253 NM_002973 ENSG00000204842 ATXN2 ATX2|SCA2|TNRC13 ataxin 2 protein-coding 170.333-183 chr6 46144975 46145351 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_014936, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_014936, exon 4 of 4) 15174 NM_014936 22875 Hs.643497 NM_014936 ENSG00000001561 ENPP4 NPP4 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 protein-coding 115.333-90 chr16 81775537 81775880 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3583 NM_002661 5336 Hs.372303 NM_002661 ENSG00000197943 PLCG2 APLAID|FCAS3|PLC-IV|PLC-gamma-2 phospholipase C gamma 2 protein-coding 137.333-47 chr14 67223702 67224082 + 0.666667 NA intron (NM_173526, intron 7 of 8) intron (NM_173526, intron 7 of 8) -17543 NM_022474 64398 Hs.652312 NM_022474 ENSG00000072415 MPP5 PALS1 membrane palmitoylated protein 5 protein-coding 136-52 chr2 114876174 114876481 + 0.666667 NA intron (NM_001321910, intron 2 of 26) intron (NM_001321910, intron 2 of 26) -42779 NR_132105 101927591 Hs.553019 NR_132105 ENSG00000231538 DPP10-AS3 - DPP10 antisense RNA 3 ncRNA 146.333-274 chr5 159339633 159339925 + 0.666667 NA intron (NR_037889, intron 2 of 4) intron (NR_037889, intron 2 of 4) 8261 NR_037889 285626 Hs.449275 NR_037889 ENSG00000249738 LOC285626 - uncharacterized LOC285626 ncRNA 123.333-87 chr16 52226675 52226959 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31747 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 131.333-122 chr4 21492165 21492542 + 0.666667 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) AluJr|SINE|Alu -27595 NR_107018 102465859 NR_107018 ENSG00000283281 MIR7978 hsa-mir-7978 microRNA 7978 ncRNA 155.667-186 chr2 203009302 203009637 + 0.666667 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -5410 NM_001114132 65065 Hs.648846 NM_198945 ENSG00000144426 NBEAL1 A530083I02Rik|ALS2CR16|ALS2CR17 neurobeachin like 1 protein-coding 193-59 chr3 136401220 136401532 + 0.666667 NA intron (NM_005862, intron 21 of 33) intron (NM_005862, intron 21 of 33) 151036 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 239.333-35 chr14 65403395 65403911 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -6939 NR_038167 2530 Hs.597649 NM_004480 ENSG00000033170 FUT8 CDGF|CDGF1 fucosyltransferase 8 protein-coding 138 chr1 42658211 42658585 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001330510) promoter-TSS (NM_001330510) -25 NM_001330510 10465 Hs.256639 NM_006347 ENSG00000171960 PPIH CYP-20|CYPH|SnuCyp-20|USA-CYP peptidylprolyl isomerase H protein-coding 112-86 chr17 64632812 64633049 + 0.666667 NA intron (NM_022739, intron 1 of 18) MIRc|SINE|MIR 29377 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 179-40 chr17 60895784 60896201 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 10 of 25) L1PB4|LINE|L1 218141 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 308.667-38 chr8 80490225 80490904 + 0.666667 NA intron (NM_001105539, intron 1 of 5) intron (NM_001105539, intron 1 of 5) 4338 NM_001105539 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 155.667-264 chr5 7065669 7066097 + 0.666667 NA Intergenic MamGypsy2-I|LTR|Gypsy 203471 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 120.667-141 chr5 90791853 90792188 + 0.666667 NA intron (NR_003149, intron 70 of 89) MER105|DNA|hAT-Charlie 233223 NM_032119 84059 Hs.591777 NM_032119 ENSG00000164199 ADGRV1 FEB4|GPR98|MASS1|USH2B|USH2C|VLGR1|VLGR1b adhesion G protein-coupled receptor V1 protein-coding 153-132 chr7 96564882 96565289 + 0.666667 NA intron (NR_163950, intron 3 of 6) intron (NR_163950, intron 3 of 6) -61562 NR_163948 178.667-94 chr21 31177130 31177531 + 0.666667 NA intron (NM_001353686, intron 15 of 27) AluSx1|SINE|Alu -16390 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 212.333-88 chr20 53969409 53969892 + 0.666667 NA intron (NM_001366295, intron 7 of 10) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 89370 NM_001323347 8537 Hs.400556 NM_003657 ENSG00000064787 BCAS1 AIBC1|NABC1 breast carcinoma amplified sequence 1 protein-coding 164.333-244 chr9 18202907 18203266 + 0.666667 NA Intergenic LTR105_Mam|LTR|ERVL -271067 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 142.667-170 chr4 153147283 153147629 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -4878 NM_001351056 23321 Hs.435711 NM_015271 ENSG00000109654 TRIM2 CMT2R|RNF86 tripartite motif containing 2 protein-coding 121.667-160 chr5 41007695 41008045 + 0.666667 NA intron (NM_173489, intron 33 of 41) Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 63472 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 112.667-97 chr17 66853173 66853497 + 0.666667 NA intron (NM_145811, intron 1 of 5) L1ME1|LINE|L1 18218 NM_145811 27091 Hs.278907 NM_014404 ENSG00000075429 CACNG5 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5 protein-coding 173.667-13 chr1 239542432 239542845 + 0.666667 NA intron (NM_001347716, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR -86435 NM_000740 1131 Hs.7138 NM_000740 ENSG00000133019 CHRM3 EGBRS|HM3|PBS cholinergic receptor muscarinic 3 protein-coding 137-106 chr8 124748035 124748324 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19672 NM_001282974 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 115.333-177 chr5 160804382 160804571 + 0.666667 NA intron (NM_001366652, intron 1 of 24) MIRb|SINE|MIR 47735 NM_001366654 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 217-93 chr8 144979114 144979735 + 0.666667 NA intron (NR_023392, intron 4 of 4) intron (NR_023392, intron 4 of 4) -15441 NR_002807 286102 Hs.744580 NR_002807 TMED10P1 S31I125|S31III125|TMED10|TMED10P|TMP21|Tmp-21-I|Tmp21-II|p23|p24delta|p24delta1 transmembrane p24 trafficking protein 10 pseudogene 1 pseudo 149-94 chr3 140296651 140297016 + 0.666667 NA intron (NM_022131, intron 2 of 16) MIRc|SINE|MIR 211956 NR_108084 101927808 Hs.581236 NR_108084 ENSG00000250433 CLSTN2-AS1 - CLSTN2 antisense RNA 1 ncRNA 132-7 chr1 116958499 116958812 + 0.666667 NA intron (NM_020440, intron 4 of 8) MIR|SINE|MIR -43095 NM_004258 9398 Hs.654598 NM_004258 ENSG00000134256 CD101 EWI-101|IGSF2|V7 CD101 molecule protein-coding 111.667-103 chr17 54378848 54379089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -521723 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 114.333-40 chr11 54747119 54747294 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 40374 NM_001005272 81318 Hs.554531 NM_001005272 ENSG00000221840 OR4A5 OR11-111 olfactory receptor family 4 subfamily A member 5 protein-coding 116-160 chr8 126159968 126160233 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -165395 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 125.333-177 chr8 94354285 94354525 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 82539 NM_001256141 100861412 Hs.30561 NM_001256141 ENSG00000265817 FSBP - fibrinogen silencer binding protein protein-coding 157.667-161 chr2 210330715 210331068 + 0.666667 NA intron (NR_110606, intron 1 of 4) L1PA16|LINE|L1 6179 NR_110606 102724820 Hs.659232 NR_110604 LANCL1-AS1 LANCLOT LANCL1 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-215 chr20 44036094 44036457 + 0.666667 NA intron (NM_001098797, intron 3 of 8) intron (NM_001098797, intron 3 of 8) 90379 NM_001098798 84969 Hs.26608 NM_032883 ENSG00000124191 TOX2 C20orf100|GCX-1|GCX1|dJ1108D11.2|dJ495O3.1 TOX high mobility group box family member 2 protein-coding 148.667-205 chr2 165361623 165361962 + 0.666667 NA intron (NM_001040143, intron 18 of 27) intron (NM_001040143, intron 18 of 27) 67737 NM_021007 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 190.667-120 chr6 114096390 114096798 + 0.666667 NA intron (NR_125845, intron 5 of 9) intron (NR_125845, intron 5 of 9) -33717 NM_153612 222537 Hs.645477 NM_153612 ENSG00000249853 HS3ST5 3-OST-5|3OST5|HS3OST5|NBLA04021 heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 protein-coding 168-65 chr3 68587434 68587811 + 0.666667 NA Intergenic MER58C|DNA|hAT-Charlie 86985 NR_135532 105377146 Hs.567895 NR_135532 LOC105377146 - uncharacterized LOC105377146 ncRNA 145.333-183 chr3 45372619 45372906 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15814 NM_015340 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 172.333-186 chr8 109732118 109732492 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40514 NM_001099744 55638 Hs.390738 NM_017786 ENSG00000147642 SYBU GOLSYN|OCSYN|SNPHL syntabulin protein-coding 144-116 chr3 163735491 163735763 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -432326 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 139.333-74 chr14 63479416 63479703 + 0.666667 NA intron (NM_001354926, intron 2 of 2) intron (NM_001354926, intron 2 of 2) 28679 NM_001282182 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 211.667-99 chr6 56951864 56952369 + 0.666667 NA intron (NM_001144769, intron 2 of 96) L2b|LINE|L2 2714 NM_001144769 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 115-155 chr8 120368334 120368561 + 0.666667 NA intron (NM_021110, intron 46 of 47) intron (NM_021110, intron 46 of 47) 76703 NM_014078 28998 Hs.333823 NM_014078 ENSG00000172172 MRPL13 L13|L13A|L13mt|RPL13|RPML13 mitochondrial ribosomal protein L13 protein-coding 145.667-186 chr3 189292449 189292727 + 0.666667 NA intron (NM_198485, intron 4 of 5) MIR|SINE|MIR -51994 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 138.333-17 chr1 230437371 230437657 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -11182 NM_001258311 79605 Hs.520463 NM_024554 ENSG00000177614 PGBD5 - piggyBac transposable element derived 5 protein-coding 167-28 chr12 21273454 21273949 + 0.666667 NA intron (NM_021094, intron 13 of 13) LTR40a|LTR|ERVL 61216 NM_021094 6579 Hs.46440 NM_005075 ENSG00000084453 SLCO1A2 OATP|OATP-A|OATP1A2|SLC21A3 solute carrier organic anion transporter family member 1A2 protein-coding 154.333-33 chr10 60442151 60442480 + 0.666667 NA intron (NM_001204403, intron 2 of 43) AluSx|SINE|Alu -52440 NM_020987 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 123.667-117 chr3 37221043 37221312 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A1|LTR|ERVL -22094 NM_001172713 2803 Hs.344151 NM_002078 ENSG00000144674 GOLGA4 CRPF46|GCP2|GOLG|MU-RMS-40.18|p230 golgin A4 protein-coding 120.333-80 chr17 63298369 63298634 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 8 of 25) L1MB5|LINE|L1 141766 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 124.333-5 chr1 51713584 51713891 + 0.666667 NA intron (NM_148906, intron 2 of 22) L1MC4a|LINE|L1 -16113 NM_148905 114883 Hs.21938 NM_024586 ENSG00000117859 OSBPL9 ORP-9|ORP9 oxysterol binding protein like 9 protein-coding 126.333 chr1 13559361 13559663 + 0.666667 NA Intergenic MER2|DNA|TcMar-Tigger -24245 NM_198389 10630 Hs.468675 NM_006474 ENSG00000162493 PDPN AGGRUS|GP36|GP40|Gp38|HT1A-1|OTS8|PA2.26|T1A|T1A-2|T1A2|TI1A podoplanin protein-coding 147.667-294 chr5 133031101 133031398 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4700 NM_001308128 54819 Hs.29700 NM_017665 ENSG00000155329 ZCCHC10 - zinc finger CCHC-type containing 10 protein-coding 172.333-30 chr11 27779653 27780016 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -57804 NM_170731 627 Hs.502182 NM_001709 ENSG00000176697 BDNF ANON2|BULN2 brain derived neurotrophic factor protein-coding 133.333-93 chr21 15345843 15346108 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -280975 NM_003489 8204 Hs.155017 NM_003489 ENSG00000180530 NRIP1 CAKUT3|RIP140 nuclear receptor interacting protein 1 protein-coding 136.333-70 chr15 91077956 91078349 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -21436 NM_001323031 9899 Hs.21754 NM_014848 ENSG00000185518 SV2B HsT19680 synaptic vesicle glycoprotein 2B protein-coding 148-128 chr5 39669059 39669369 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 148783 NR_104632 101926940 Hs.436359 NR_104632 ENSG00000271334 LINC02104 - long intergenic non-protein coding RNA 2104 ncRNA 207-72 chr22 20382233 20382559 + 0.666667 NA Intergenic AluYh3|SINE|Alu -11719 NM_001256524 7625 Hs.517418 NM_003426 ENSG00000185252 ZNF74 COS52|ZFP520|ZNF520|hZNF7 zinc finger protein 74 protein-coding 148.333-87 chr12 23128220 23128599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47227 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 156.333-310 chr6 64718934 64719250 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -582326 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 192-55 chr14 72482864 72483303 + 0.666667 NA intron (NM_001370294, intron 12 of 14) intron (NM_001370294, intron 12 of 14) -33737 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 142.333-151 chr3 4363079 4363460 + 0.666667 NA intron (NM_001164675, intron 7 of 7) intron (NM_001164675, intron 7 of 7) 59965 NM_001320676 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 144-7 chr1 163367631 163367909 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 45816 NM_031423 83540 Hs.651950 NM_031423 ENSG00000143228 NUF2 CDCA1|CT106|NUF2R NUF2 component of NDC80 kinetochore complex protein-coding 144-65 chr18 41646823 41647220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -126344 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 191.333-7 chr1 80387558 80387964 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -147994 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 130-73 chr22 30121085 30121367 + 0.666667 NA intron (NM_001329457, intron 9 of 11) intron (NM_001329457, intron 9 of 11) 40762 NM_001329457 150280 Hs.120391 NM_152510 ENSG00000176635 HORMAD2 CT46.2 HORMA domain containing 2 protein-coding 246.667-79 chr6 66774415 66775000 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 986828 NR_026540 442229 Hs.390414 NR_026540 SLC25A51P1 MCART3P|bA707M13.1 SLC25A51 pseudogene 1 pseudo 249.667-31 chr15 64501845 64502290 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) intron (NM_015042, intron 1 of 8) 2647 NM_015042 23060 Hs.595451 NM_015042 ENSG00000180357 ZNF609 - zinc finger protein 609 protein-coding 121-69 chr2 70270270 70270573 + 0.666667 NA intron (NM_016297, intron 3 of 5) L1M4|LINE|L1 12284 NM_016297 51449 Hs.567502 NM_016297 ENSG00000116005 PCYOX1 PCL1 prenylcysteine oxidase 1 protein-coding 158.667-314 chr7 135820479 135820773 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71813 NM_205855 389558 Hs.55200 NM_205855 ENSG00000189320 FAM180A UNQ1940 family with sequence similarity 180 member A protein-coding 147.333-56 chr10_GL383545v1_alt 67962 68272 + 0.666667 NA intron (NR_138082, intron 1 of 1) intron (NR_138082, intron 1 of 1) 65099 NR_138082 101060171 Hs.568842 NR_138082 ARMC4P1 - armadillo repeat containing 4 pseudogene 1 pseudo 166-63 chr2 106528441 106528810 + 0.666667 NA intron (NM_001368307, intron 5 of 5) intron (NM_001368307, intron 5 of 5) 41261 NM_001349727 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 123.333-96 chr18 9219375 9219610 + 0.666667 NA intron (NM_001204056, intron 6 of 11) HAL1|LINE|L1 81929 NM_001204056 23253 Hs.464585 NM_015208 ENSG00000101745 ANKRD12 ANCO-2|ANCO1|GAC-1|Nbla00144 ankyrin repeat domain 12 protein-coding 205.333-204 chr6 55155860 55156329 + 0.666667 NA intron (NM_001526, intron 1 of 7) intron (NM_001526, intron 1 of 7) 49634 NM_001526 3062 Hs.151624 NM_001526 ENSG00000137252 HCRTR2 OX2R hypocretin receptor 2 protein-coding 121.333-129 chr4 40979220 40979416 + 0.666667 NA intron (NM_004307, intron 6 of 17) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -122126 NM_001166054 323 Hs.479602 NM_004307 ENSG00000163697 APBB2 FE65L|FE65L1 amyloid beta precursor protein binding family B member 2 protein-coding 118.333-135 chr3 80197969 80198165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -430069 NM_002941 6091 Hs.744218 NM_002941 ENSG00000169855 ROBO1 DUTT1|SAX3 roundabout guidance receptor 1 protein-coding 117-76 chr2 48668283 48668576 + 0.666667 NA intron (NM_172311, intron 8 of 10) intron (NM_172311, intron 8 of 10) 50573 NM_006872 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 155.333-302 chr5 86992597 86992969 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 122171 NR_036243 100422887 NR_036243 ENSG00000265919 MIR4280 - microRNA 4280 ncRNA 120.667-109 chr20 56750196 56750401 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 120992 NM_003222 7022 Hs.473152 NM_003222 ENSG00000087510 TFAP2C AP2-GAMMA|ERF1|TFAP2G|hAP-2g transcription factor AP-2 gamma protein-coding 124-108 chr7 43676555 43676920 + 0.666667 NA intron (NR_163914, intron 1 of 8) L1MA5A|LINE|L1 52786 NM_001371317 181.667-32 chr13 56311893 56312390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -828777 NM_001130404 729233 Hs.723090 NM_001130404 ENSG00000204918 PRR20B PRR20|PRR20A|PRR20C|PRR20D|PRR20E proline rich 20B protein-coding 170.333-33 chr10 79011561 79011929 + 0.666667 NA intron (NR_015429, intron 3 of 7) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 55703 NR_024429 283050 Hs.309176 NR_015429 ENSG00000224596 ZMIZ1-AS1 - ZMIZ1 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-315 chr5 68240839 68241154 + 0.666667 NA intron (NM_181523, intron 2 of 15) intron (NM_181523, intron 2 of 15) 25240 NM_181523 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 114.667-247 chr8 117145798 117146068 + 0.666667 NA intron (NM_173851, intron 1 of 7) L1MA4|LINE|L1 10938 NM_001172814 169026 Hs.532270 NM_173851 ENSG00000164756 SLC30A8 ZNT8|ZnT-8 solute carrier family 30 member 8 protein-coding 114.333-16 chr1 217846957 217847205 + 0.666667 NA intron (NM_138796, intron 9 of 10) intron (NM_138796, intron 9 of 10) -45819 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 139-101 chr8 26902308 26902689 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -35220 NM_000680 148 Hs.52931 NM_000680 ENSG00000120907 ADRA1A ADRA1C|ADRA1L1|ALPHA1AAR adrenoceptor alpha 1A protein-coding 127.333-133 chr4 123946130 123946403 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 172002 NR_027106 285419 Hs.535763 NR_027105 ENSG00000249464 LINC01091 - long intergenic non-protein coding RNA 1091 ncRNA 212.667-6 chr1 106729042 106729546 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -88945 NR_147165 105378889 Hs.568674 NR_147165 ENSG00000237460 LINC01661 - long intergenic non-protein coding RNA 1661 ncRNA 217-57 chr3 29020502 29021061 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 260158 NR_109804 100873979 Hs.99391 NR_109804 RBMS3-AS3 - RBMS3 antisense RNA 3 ncRNA 167-12 chr10 61540466 61540819 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 60601 NR_120645 101928781 Hs.568856 NR_120643 TMEM26-AS1 - TMEM26 antisense RNA 1 ncRNA 161.333-199 chr3 154374675 154375147 + 0.666667 NA intron (NM_001038705, intron 3 of 3) intron (NM_001038705, intron 3 of 3) -50414 NM_001114397 170506 Hs.446270 NM_020865 ENSG00000174953 DHX36 DDX36|G4R1|MLEL1|RHAU DEAH-box helicase 36 protein-coding 205.333-147 chr21 31962193 31962607 + 0.666667 NA intron (NM_014586, intron 5 of 10) intron (NM_014586, intron 5 of 10) 89380 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 121.667-175 chr5 179472980 179473246 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43598 NR_149047 100128340 Hs.710582 NR_149047 LOC100128340 - uncharacterized LOC100128340 ncRNA 192.333-106 chr21 21204768 21205214 + 0.666667 NA intron (NM_001352597, intron 1 of 10) intron (NM_001352597, intron 1 of 10) 57829 NM_001352597 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 139-86 chr6 62957971 62958279 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 361852 NM_001143940 51557 Hs.149585 NM_016571 ENSG00000146166 LGSN GLULD1|LGS lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain protein-coding 153.333-319 chr5 3156346 3156780 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -21272 NR_104617 102467074 Hs.575250 NR_104617 ENSG00000249808 LINC01377 - long intergenic non-protein coding RNA 1377 ncRNA 164.333-115 chr2 62967636 62968071 + 0.666667 NA intron (NM_001354215, intron 15 of 24) intron (NM_001354215, intron 15 of 24) 79858 NR_027069 100132215 Hs.656781 NR_027069 ENSG00000231609 LOC100132215 - uncharacterized LOC100132215 ncRNA 226.333-82 chr3 157012527 157012900 + 0.666667 NA intron (NM_001004316, intron 10 of 12) intron (NM_001004316, intron 10 of 12) -69128 NR_135546 105374177 Hs.634263 NR_135546 ENSG00000241544 LINC02029 - long intergenic non-protein coding RNA 2029 ncRNA 132-97 chr5 27365478 27365816 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -106645 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 115.333-160 chr4 94986223 94986419 + 0.666667 NA intron (NM_001203, intron 2 of 12) intron (NM_001203, intron 2 of 12) -9911 NM_001256792 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 136-10 chr10 80397465 80397738 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -10228 NM_001243779 84293 Hs.500333 NM_032333 ENSG00000122378 PRXL2A Adrx|C10orf58|FAM213A|PAMM peroxiredoxin like 2A protein-coding 122-9 chr1 201862933 201863237 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_106797) promoter-TSS (NR_106797) -288 NR_106797 102466724 NR_106797 ENSG00000277681 MIR6739 hsa-mir-6739 microRNA 6739 ncRNA 134-111 chr8 119846507 119846794 + 0.666667 NA intron (NM_024094, intron 4 of 8) AluSz6|SINE|Alu 9244 NM_024094 79075 Hs.315167 NM_024094 ENSG00000136982 DSCC1 DCC1 DNA replication and sister chromatid cohesion 1 protein-coding 142-94 chr3 184009864 184010249 + 0.666667 NA intron (NR_046570, intron 1 of 2) AluSz|SINE|Alu 3718 NR_046570 100873982 Hs.570696 NR_046570 ENSG00000223882 ABCC5-AS1 - ABCC5 antisense RNA 1 ncRNA 146-121 chr7 10591116 10591404 + 0.666667 NA intron (NR_147499, intron 1 of 2) L1PA16|LINE|L1 -111416 NR_149037 100131472 Hs.170681 NR_149037 LOC100131472 - uncharacterized LOC100131472 ncRNA 210-19 chr10 75821622 75822093 + 0.666667 NA intron (NM_032024, intron 1 of 5) L1PB4|LINE|L1 39096 NM_032024 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 279.333-45 chr2 106860401 106861096 + 0.666667 NA intron (NM_032528, intron 1 of 5) intron (NM_032528, intron 1 of 5) 25280 NR_136313 84620 Hs.98265 NM_032528 ENSG00000144057 ST6GAL2 SIAT2|ST6GalII ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2 protein-coding 274.333-39 chr2 124709621 124710240 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 13 of 23) intron (NM_130773, intron 13 of 23) 684643 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 138.667-89 chr18 75871021 75871434 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -158824 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 188.333-159 chr8 130309041 130309547 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 3 of 29) L2c|LINE|L2 -12761 NR_002765 29065 Hs.639318 NR_002765 ASAP1-IT1 ASAP1-IT|ASAP1IT|ASAP1IT1|DDEF1IT1|HSPC054|NCRNA00050 ASAP1 intronic transcript 1 ncRNA 204.667-126 chr5 112148607 112149031 + 0.666667 NA intron (NM_001347887, intron 22 of 23) intron (NM_001347887, intron 22 of 23) -11707 NR_015370 114915 Hs.12082 NM_053000 EPB41L4A-AS1 C5orf26|NCRNA00219|TIGA1 EPB41L4A antisense RNA 1 ncRNA 116.333-170 chr5 41906789 41906992 + 0.666667 NA intron (NM_175921, intron 1 of 5) intron (NM_175921, intron 1 of 5) 2546 NM_175921 285636 Hs.29899 NM_175921 ENSG00000205765 C5orf51 - chromosome 5 open reading frame 51 protein-coding 170.667-23 chr11 20483698 20484063 + 0.666667 NA intron (NM_005788, intron 13 of 15) intron (NM_005788, intron 13 of 15) 96164 NM_005788 10196 Hs.152337 NM_005788 ENSG00000185238 PRMT3 HRMT1L3 protein arginine methyltransferase 3 protein-coding 118.667-106 chr2 135606459 135606662 + 0.666667 NA intron (NM_001282799, intron 3 of 22) AluSc|SINE|Alu 20208 NM_001282800 23518 Hs.412462 NM_015361 ENSG00000048991 R3HDM1 R3HDM R3H domain containing 1 protein-coding 181.333-109 chr4 15346530 15346924 + 0.666667 NA intron (NM_001135170, intron 1 of 2) intron (NM_001135170, intron 1 of 2) 6739 NM_001135170 114905 Hs.153714 NM_031911 ENSG00000163145 C1QTNF7 CTRP7|ZACRP7 C1q and TNF related 7 protein-coding 146-115 chr5 165577789 165578124 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 1107677 NR_105065 102546299 Hs.437730 NR_105065 ENSG00000241956 LOC102546299 - uncharacterized LOC102546299 ncRNA 169.333 chr1 24476369 24476825 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25747 NM_001251979 11123 Hs.656799 NM_013441 ENSG00000117602 RCAN3 DSCR1L2|MCIP3|RCN3|hRCN3 RCAN family member 3 protein-coding 206-189 chr8 126284609 126285078 + 0.666667 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 -40652 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 122.333-160 chr4 109797169 109797498 + 0.666667 NA intron (NM_001331035, intron 1 of 11) L1MA10|LINE|L1 4666 NM_001318057 3426 Hs.312485 NM_000204 ENSG00000205403 CFI AHUS3|ARMD13|C3BINA|C3b-INA|FI|IF|KAF complement factor I protein-coding 135.667-152 chr5 175750133 175750379 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46277 NM_006650 10814 Hs.193235 NM_006650 ENSG00000145920 CPLX2 921-L|CPX-2|CPX2|Hfb1 complexin 2 protein-coding 116.667-148 chr4 77594815 77595092 + 0.666667 NA intron (NM_006419, intron 1 of 4) intron (NM_006419, intron 1 of 4) 83200 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 276.333-36 chr3 75018115 75018805 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -196016 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 160.667-253 chr5 146103968 146104367 + 0.666667 NA intron (NM_001029869, intron 1 of 3) intron (NM_001029869, intron 1 of 3) 1410 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 149-81 chr20 56573501 56573776 + 0.666667 NA Intergenic MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? -3925 NR_136537 105372682 Hs.517135 NR_136537 ENSG00000225657 LINC01716 - long intergenic non-protein coding RNA 1716 ncRNA 115.667-173 chr5 23340035 23340336 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -167424 NM_020227 56979 Hs.283096 NM_020227 ENSG00000164256 PRDM9 KMT8B|MEISETZ|MSBP3|PFM6|ZNF899 PR/SET domain 9 protein-coding 163-87 chr8 101489475 101489840 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -2782 NM_024915 79977 Hs.661088 NM_024915 ENSG00000083307 GRHL2 BOM|DFNA28|ECTDS|PPCD4|TFCP2L3 grainyhead like transcription factor 2 protein-coding 146.333-129 chr18 13562542 13562904 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) L1MA9|LINE|L1 -48391 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 202.333-51 chr13 39377788 39378234 + 0.666667 NA intron (NM_005780, intron 3 of 3) L2c|LINE|L2 225182 NM_005780 10186 Hs.507798 NM_005780 ENSG00000183722 LHFPL6 LHFP LHFPL tetraspan subfamily member 6 protein-coding 118.667-207 chrX 97236540 97236871 + 0.666667 NA intron (NM_007309, intron 22 of 26) AluY|SINE|Alu 327830 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 138.667-56 chr13 109009011 109009278 + 0.666667 NA intron (NM_015011, intron 22 of 34) intron (NM_015011, intron 22 of 34) 158159 NR_047700 100885782 Hs.655942 NR_047700 ENSG00000236242 MYO16-AS1 - MYO16 antisense RNA 1 ncRNA 194.667-54 chr18 42049596 42050053 + 0.666667 NA intron (NM_001308020, intron 20 of 23) AluSp|SINE|Alu 94590 NM_001308020 5289 Hs.464971 NM_002647 ENSG00000078142 PIK3C3 VPS34|Vps34|hVps34 phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 protein-coding 207.667-21 chr12 2037323 2037809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10786 NR_046768 100874369 Hs.208723 NR_046768 ENSG00000256257 CACNA1C-IT2 - CACNA1C intronic transcript 2 ncRNA 181.333-178 chr8 111043820 111044279 + 0.666667 NA Intergenic LTR57|LTR|ERVL -16616 NR_125417 101927459 Hs.575543 NR_125416 ENSG00000253877 LINC01608 - long intergenic non-protein coding RNA 1608 ncRNA 123.333-109 chr2 110895233 110895508 + 0.666667 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) L1MDa|LINE|L1 162797 NM_001371254 176.667-114 chr4 144499194 144499532 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 146656 NR_037595 646576 Hs.632595 NR_037595 ENSG00000248890 HHIP-AS1 - HHIP antisense RNA 1 ncRNA 120.667-101 chr2 136863223 136863507 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 1 of 27) intron (NM_001316349, intron 1 of 27) 97820 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 188-116 chr8 129007478 129007789 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41632 NR_145483 106144608 NR_145483 ENSG00000229140 LINC00976 - long intergenic non-protein coding RNA 976 ncRNA 112-201 chr8 87918921 87919193 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45042 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 118.667-46 chr11 85910072 85910276 + 0.666667 NA intron (NM_001286159, intron 7 of 10) L2c|LINE|L2 55073 NM_173556 220047 Hs.567774 NM_173556 ENSG00000150676 CCDC83 CT148|HSD9|KP-CoT-23 coiled-coil domain containing 83 protein-coding 263-55 chr5 112684777 112685378 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2189 NR_104673 102467216 Hs.174158 NR_104673 LOC102467216 - uncharacterized LOC102467216 ncRNA 121.667-200 chr8 63648209 63648417 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -121117 NR_038875 286184 Hs.586402 NR_038875 ENSG00000253734 LINC01289 - long intergenic non-protein coding RNA 1289 ncRNA 178.667-139 chr5 176718114 176718450 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -24923 NR_108030 102577424 Hs.349025 NR_108030 ENSG00000248859 LINC01574 HI-LNC12 long intergenic non-protein coding RNA 1574 ncRNA 133.333-34 chr11 98359373 98359623 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -661451 NM_001243271 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 256.333-82 chr8 106600242 106600866 + 0.666667 NA intron (NM_018002, intron 3 of 15) intron (NM_018002, intron 3 of 15) -57254 NM_181354 55074 Hs.127286 NM_018002 ENSG00000164830 OXR1 Nbla00307|TLDC3 oxidation resistance 1 protein-coding 202.333-97 chr2 160397449 160398030 + 0.666667 NA intron (NM_002897, intron 1 of 13) intron (NM_002897, intron 1 of 13) 10143 NR_039946 100616364 NR_039946 ENSG00000283734 MIR4785 mir-4785 microRNA 4785 ncRNA 118.667-143 chr3 158651539 158651808 + 0.666667 NA intron (NM_001308164, intron 6 of 18) intron (NM_001308164, intron 6 of 18) 7145 NM_001308164 85476 Hs.518355 NM_024996 ENSG00000168827 GFM1 COXPD1|EFG|EFG1|EFGM|EGF1|GFM|hEFG1|mtEF-G1 G elongation factor mitochondrial 1 protein-coding 146.667-364 chrX 107953024 107953333 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -17198 NR_110395 101928335 Hs.657090 NR_110395 ENSG00000236064 LOC101928335 - uncharacterized LOC101928335 ncRNA 195.667-66 chr2 17264312 17264700 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 253934 NM_001099218 729475 Hs.515802 NM_001099218 ENSG00000214842 RAD51AP2 - RAD51 associated protein 2 protein-coding 124.667-197 chr7 130751701 130751924 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17779 NM_138693 136259 Hs.125240 NM_138693 ENSG00000266265 KLF14 BTEB5 Kruppel like factor 14 protein-coding 242.333-100 chr8 111604971 111605411 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 228552 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 147-95 chr3 119741255 119741671 + 0.666667 NA intron (NM_033364, intron 13 of 17) intron (NM_033364, intron 13 of 17) 38441 NM_001320316 89876 Hs.341906 NM_033364 ENSG00000183833 MAATS1 AAT1|AAT1alpha|C3orf15|CFAP91|CaM-IP2|SPATA26 MYCBP associated and testis expressed 1 protein-coding 138.333-3 chr1 44284129 44284538 + 0.666667 NA intron (NM_001301698, intron 6 of 7) intron (NM_001301698, intron 6 of 7) -31774 NR_132966 106635545 NR_132966 SNORA110 - small nucleolar RNA, H/ACA box 110 snoRNA 149.667-207 chr2 100166353 100166779 + 0.666667 NA Intergenic Tigger7|DNA|TcMar-Tigger -23976 NM_002285 3899 Hs.444414 NM_002285 ENSG00000144218 AFF3 LAF4|MLLT2-like AF4/FMR2 family member 3 protein-coding 125.333-10 chr1 105583670 105583975 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 35113 NR_125954 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 147-135 chr7 141011824 141012115 + 0.666667 NA intron (NM_053035, intron 1 of 2) AluJr|SINE|Alu 2710 NM_016071 51650 Hs.416207 NM_016071 ENSG00000090263 MRPS33 CGI-139|MRP-S33|PTD003|S33mt mitochondrial ribosomal protein S33 protein-coding 144.667-133 chr2 32734478 32734809 + 0.666667 NA intron (NM_017735, intron 11 of 19) MIR3|SINE|MIR -90790 NR_027099 285045 Hs.434660 NR_027097 ENSG00000230876 LINC00486 - long intergenic non-protein coding RNA 486 ncRNA 220.333-57 chr18 79203998 79204350 + 0.666667 NA intron (NR_148360, intron 9 of 31) intron (NR_148360, intron 9 of 31) 134780 NM_001306085 374868 Hs.465475 NM_198531 ENSG00000166377 ATP9B ATPASEP|ATPIIB|HUSSY-20|NEO1L|hMMR1 ATPase phospholipid transporting 9B (putative) protein-coding 134.667-181 chr7 38963178 38963424 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -14608 NM_007252 11281 Hs.137106 NM_007252 ENSG00000106536 POU6F2 RPF-1|WT5|WTSL POU class 6 homeobox 2 protein-coding 336.667-12 chr2 137211547 137212293 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 7 of 27) intron (NM_001316349, intron 7 of 27) 446375 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 131.333-4 chr1 57800214 57800490 + 0.666667 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -60229 NR_104362 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 112.667-207 chr5 23779460 23779756 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -171740 NR_131245 439936 Hs.638078 NR_131245 ENSG00000248874 C5orf17 - chromosome 5 open reading frame 17 (putative) ncRNA 170.667-83 chr2 99058900 99059270 + 0.666667 NA intron (NR_146001, intron 15 of 18) (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 82095 NR_146001 80705 Hs.120267 NM_025244 ENSG00000135951 TSGA10 CEP4L|CT79|SPGF26 testis specific 10 protein-coding 134.667-167 chr6 35130181 35130467 + 0.666667 NA intron (NM_001366330, intron 1 of 7) L1MC1|LINE|L1 11015 NM_001366324 6954 Hs.435371 NM_018679 ENSG00000124678 TCP11 D6S230E|FPPR t-complex 11 protein-coding 179.667-59 chr16 68878028 68878501 + 0.666667 NA exon (NM_024562, exon 6 of 18) exon (NM_024562, exon 6 of 18) 34733 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 147-31 chr12 65474928 65475230 + 0.666667 NA intron (NR_120431, intron 3 of 3) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 82232 NR_135033 105369187 Hs.738044 NR_135033 ENSG00000250748 LOC105369187 - uncharacterized LOC105369187 ncRNA 112.667-278 chr9 28488454 28488647 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR 230755 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 122.667-42 chr14 30637139 30637442 + 0.666667 NA intron (NM_016106, intron 4 of 24) L1MC4|LINE|L1 14971 NM_001257376 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 123-126 chr8 89003935 89004291 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -676630 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 123-112 chr7 5067324 5067584 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_021163, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_021163, exon 5 of 5) -4606 NR_015343 389458 Hs.733005 NM_203393 ENSG00000273313 RBAKDN - RBAK downstream neighbor ncRNA 214-4 chr1 52244279 52244872 + 0.666667 NA intron (NM_007324, intron 4 of 17) L2b|LINE|L2 102481 NM_004799 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 160.333-22 chr1 163088028 163088492 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 16355 NM_001113380 5999 Hs.386726 NM_005613 ENSG00000117152 RGS4 RGP4|SCZD9 regulator of G protein signaling 4 protein-coding 161-90 chr7 10936264 10936591 + 0.666667 NA intron (NM_002489, intron 3 of 3) intron (NM_002489, intron 3 of 3) 3726 NM_002489 4697 Hs.50098 NM_002489 ENSG00000189043 NDUFA4 CI-9k|CI-MLRQ|COXFA4|MLRQ NDUFA4 mitochondrial complex associated protein-coding 137.667-85 chr2 9045852 9046202 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -42343 NM_001321267 129642 Hs.467634 NM_138799 ENSG00000143797 MBOAT2 LPAAT|LPCAT4|LPEAT|LPLAT 2|OACT2 membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 protein-coding 154.333-249 chr4 106155436 106155736 + 0.666667 NA intron (NM_001290768, intron 24 of 26) L1MA2|LINE|L1 -133108 NR_125928 101929577 Hs.631131 NR_125928 ENSG00000249635 LOC101929577 - uncharacterized LOC101929577 ncRNA 216.667-44 chr17 59727019 59727554 + 0.666667 NA intron (NM_001329394, intron 1 of 11) AluY|SINE|Alu 19632 NM_001329400 81671 Hs.444569 NM_030938 ENSG00000062716 VMP1 EPG3|TANGO5|TMEM49 vacuole membrane protein 1 protein-coding 196-17 chr10 39014256 39014835 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 317949 NR_045000 399746 Hs.742607 NR_045000 ACTR3BP5 FKSG74 ACTR3B pseudogene 5 pseudo 159-78 chr3 42927258 42927726 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -8850 NM_001205272 100506243 Hs.720172 NM_015673 ENSG00000240747 KRBOX1 - KRAB box domain containing 1 protein-coding 120.667-9 chr1 153274392 153274605 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14811 NM_000427 4014 Hs.251680 NM_000427 ENSG00000203782 LOR - loricrin protein-coding 149.667-15 chr1 78775217 78775565 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 125560 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 180.333-11 chr1 224696817 224697226 + 0.666667 NA intron (NR_136287, intron 3 of 4) intron (NR_136287, intron 3 of 4) 80704 NM_152495 149111 Hs.731723 NM_152495 ENSG00000143786 CNIH3 CNIH-3 cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 protein-coding 181.333-117 chr4 52187628 52188033 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 136526 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 200-31 chr11 60730325 60730906 + 0.666667 NA intron (NM_001354471, intron 2 of 6) intron (NM_001354471, intron 2 of 6) 6606 NM_001354471 728588 Hs.739039 NM_001310141 ENSG00000214782 MS4A18 - membrane spanning 4-domains A18 protein-coding 147.333-323 chr8 128069391 128069724 + 0.666667 NA intron (NR_003367, intron 5 of 8) MIRb|SINE|MIR 20405 NR_031612 100302175 NR_031612 ENSG00000221176 MIR1207 MIRN1207|hsa-mir-1207 microRNA 1207 ncRNA 140.333-225 chr8 16144609 16144891 + 0.666667 NA intron (NM_002445, intron 7 of 8) MIRc|SINE|MIR 41522 NM_001363744 4481 Hs.147635 NM_002445 ENSG00000038945 MSR1 CD204|SCARA1|SR-A|SR-AI|SR-AII|SR-AIII|SRA|phSR1|phSR2 macrophage scavenger receptor 1 protein-coding 134.333-159 chr7 68915686 68916081 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 681741 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 259.667-69 chr7 354239 354812 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24900 NR_033960 442497 Hs.704269 NR_033960 ENSG00000249574 LOC442497 - uncharacterized LOC442497 ncRNA 161.333-50 chr11 27311660 27311988 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51391 NM_030771 91057 Hs.143733 NM_030771 ENSG00000109881 CCDC34 L15|NY-REN-41|RAMA3 coiled-coil domain containing 34 protein-coding 184-31 chr15 61446210 61446691 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4b|LINE|L1 -217148 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 173-39 chr18 43973487 43973853 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 558027 NR_110792 101927921 Hs.464986 NR_110792 ENSG00000267337 LINC01478 - long intergenic non-protein coding RNA 1478 ncRNA 117.333-63 chr14 89005659 89005889 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 181123 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 226-20 chr12 122141187 122141771 + 0.666667 NA intron (NM_014938, intron 16 of 16).2 intron (NM_014938, intron 16 of 16).2 -26240 NM_152759 254050 Hs.374856 NM_152759 ENSG00000158113 LRRC43 - leucine rich repeat containing 43 protein-coding 132-6 chr1 116085176 116085379 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -26478 NM_152367 126868 Hs.376194 NM_152367 ENSG00000173212 MAB21L3 C1orf161 mab-21 like 3 protein-coding 178.667-33 chr11 116464211 116464595 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL -175019 NR_135069 101929011 Hs.733911 NR_135069 ENSG00000237937 LINC02702 - long intergenic non-protein coding RNA 2702 ncRNA 112.333-4 chr1 37566576 37566745 + 0.666667 NA TTS (NM_001323623) TTS (NM_001323623) 9720 NM_003462 7802 Hs.406050 NM_003462 ENSG00000163879 DNALI1 P28|dJ423B22.5|hp28 dynein axonemal light intermediate chain 1 protein-coding 122.667-161 chr6 36567691 36567907 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -20320 NM_001305102 11329 Hs.409578 NM_007271 ENSG00000112079 STK38 NDR|NDR1 serine/threonine kinase 38 protein-coding 117-144 chr8 109339236 109339447 + 0.666667 NA non-coding (NR_036471, exon 3 of 5) non-coding (NR_036471, exon 3 of 5) 4994 NR_036471 56943 Hs.492555 NM_020189 ENSG00000120533 ENY2 DC6|Sus1|e(y)2 ENY2 transcription and export complex 2 subunit protein-coding 120-100 chr4 177102498 177102751 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -207250 NM_018248 55247 Hs.405467 NM_018248 ENSG00000109674 NEIL3 FGP2|FPG2|NEI3|ZGRF3|hFPG2|hNEI3 nei like DNA glycosylase 3 protein-coding 244-26 chr12 33199400 33199774 + 0.666667 NA Intergenic LTR12|LTR|ERV1 240232 NM_198992 341359 Hs.118703 NM_198992 ENSG00000110975 SYT10 - synaptotagmin 10 protein-coding 241-64 chr9 95807260 95807756 + 0.666667 NA non-coding (NR_023390, exon 3 of 3) non-coding (NR_023390, exon 3 of 3) -68183 NM_020207 375748 Hs.432364 NM_020207 ENSG00000182150 ERCC6L2 BMFS2|C9orf102|RAD26L|SR278 ERCC excision repair 6 like 2 protein-coding 181.667-115 chr5 7948342 7948747 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 79396 NR_157173 4552 Hs.481551 NM_002454 ENSG00000124275 MTRR MSR|cblE 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase protein-coding 151.333-260 chr22 28522010 28522347 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) L1MEg1|LINE|L1 62309 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 213-29 chr17 18924426 18924954 + 0.666667 NA intron (NM_001243940, intron 9 of 9) AluJb|SINE|Alu -25986 NM_001282417 125206 Hs.462418 NM_152351 ENSG00000154025 SLC5A10 SGLT-5|SGLT5 solute carrier family 5 member 10 protein-coding 130-30 chr12 120986214 120986454 + 0.666667 NA intron (NM_001306179, intron 1 of 9) L1ME4b|LINE|L1 7766 NM_000545 6927 Hs.654455 NM_000545 ENSG00000135100 HNF1A HNF-1A|HNF1|HNF4A|IDDM20|LFB1|MODY3|TCF-1|TCF1 HNF1 homeobox A protein-coding 118-87 chr3 21730432 21730751 + 0.666667 NA intron (NM_024697, intron 1 of 7) L2a|LINE|L2 20619 NM_024697 79750 Hs.21026 NM_024697 ENSG00000151789 ZNF385D ZNF659 zinc finger protein 385D protein-coding 154.333-132 chr18 36256092 36256410 + 0.666667 NA intron (NM_017947, intron 11 of 14) intron (NM_017947, intron 11 of 14) -41462 NM_025135 80206 Hs.436636 NM_025135 ENSG00000134775 FHOD3 FHOS2|Formactin2 formin homology 2 domain containing 3 protein-coding 282.333-51 chr6 63747799 63748331 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 41 of 43) L1P2|LINE|L1 -58771 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 189-52 chr20 14799024 14799455 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) 130279 NR_110318 100379174 Hs.407533 NR_037841 ENSG00000235914 MACROD2-AS1 BA318C17.1|NCRNA00186 MACROD2 antisense RNA 1 ncRNA 188.333-60 chr17 74698115 74698510 + 0.666667 NA intron (NM_001289082, intron 4 of 6) intron (NM_001289082, intron 4 of 6) 14611 NM_001289084 146722 Hs.567706 NM_139018 ENSG00000186074 CD300LF CD300f|CLM-1|CLM1|IREM-1|IREM1|IgSF13|LMIR3|NKIR CD300 molecule like family member f protein-coding 119.667-191 chr9 101398274 101398626 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001278240) promoter-TSS (NM_001278240) 168 NM_019051 54534 Hs.288224 NM_019051 ENSG00000136897 MRPL50 MRP-L50 mitochondrial ribosomal protein L50 protein-coding 136.667-184 chr8 141002856 141003154 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001352699) promoter-TSS (NM_001352699) -926 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 127.333-144 chr5 125155980 125156312 + 0.666667 NA intron (NR_109882, intron 2 of 5) intron (NR_109882, intron 2 of 5) 119315 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 154.667-371 chr7 101688257 101688657 + 0.666667 NA Intergenic CpG -59161 NM_138403 93408 Hs.247831 NM_138403 ENSG00000106436 MYL10 MYLC2PL|PLRLC myosin light chain 10 protein-coding 137-47 chr2 75411794 75412082 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -112130 NR_110281 101927884 Hs.671110 NR_110281 ENSG00000231172 LOC101927884 - uncharacterized LOC101927884 ncRNA 152.667-370 chr8 74889871 74890195 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65499 NM_001324403 51050 Hs.98558 NM_015886 ENSG00000137558 PI15 CRISP8|P24TI|P25TI peptidase inhibitor 15 protein-coding 144.667-272 chr6 144373857 144374215 + 0.666667 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) intron (NM_007124, intron 1 of 73) -31619 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 205-112 chrY 11324431 11324833 + 0.666667 NA Intergenic BSR/Beta|Satellite|Satellite 1096958 NR_033667 352887 Hs.546221 NR_033667 ENSG00000206159 GYG2P1 GYG2P glycogenin 2 pseudogene 1 pseudo 127-58 chr3 46698813 46699061 + 0.666667 NA intron (NM_001370525, intron 2 of 4) AluJr|SINE|Alu -2396 NM_147196 259236 Hs.185777 NM_147196 ENSG00000181585 TMIE DFNB6 transmembrane inner ear protein-coding 164.667-160 chr4 39666416 39666790 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -27738 NM_174921 201895 Hs.205952 NM_174921 ENSG00000163683 SMIM14 C4orf34 small integral membrane protein 14 protein-coding 115.333-214 chr8 66541602 66541802 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48136 NM_152765 254778 Hs.268869 NM_152765 ENSG00000169085 VXN C8orf46 vexin protein-coding 137.333-166 chr5 173928167 173928463 + 0.666667 NA intron (NM_001308193, intron 2 of 7) L1MC1|LINE|L1 35264 NM_001308192 80315 Hs.127126 NM_030627 ENSG00000113742 CPEB4 CPE-BP4|hCPEB-4 cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 protein-coding 115-148 chr7 106230872 106231125 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 53985 NM_005746 10135 Hs.489615 NM_005746 ENSG00000105835 NAMPT 1110035O14Rik|PBEF|PBEF1|VF|VISFATIN nicotinamide phosphoribosyltransferase protein-coding 126.333-86 chr2 46789125 46789348 + 0.666667 NA Intergenic Ricksha_c|DNA|MULE-MuDR -27432 NR_034099 388948 Hs.728895 NR_034099 ENSG00000222005 LINC01118 - long intergenic non-protein coding RNA 1118 ncRNA 132.667-108 chr3 73532763 73533062 + 0.666667 NA intron (NR_121660, intron 1 of 1) intron (NR_121660, intron 1 of 1) 11590 NR_121660 101927296 Hs.662049 NR_121660 LOC101927296 - uncharacterized LOC101927296 ncRNA 124.667-14 chr1 166480753 166481062 + 0.666667 NA intron (NR_146890, intron 1 of 2) intron (NR_146890, intron 1 of 2) 9132 NR_146890 105371590 Hs.575926 NR_146890 ENSG00000234142 LINC01675 - long intergenic non-protein coding RNA 1675 ncRNA 140.333-74 chr15 77345223 77345543 + 0.666667 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) intron (NM_024776, intron 1 of 7) 74721 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 196.667-101 chr3 132775344 132775838 + 0.666667 NA intron (NR_002811, intron 3 of 10) intron (NR_002811, intron 3 of 10) -53132 NR_037804 100532724 Hs.511991 NR_037804 ENSG00000274810 NPHP3-ACAD11 NPHP3 NPHP3-ACAD11 readthrough (NMD candidate) ncRNA 178.667-104 chr3 88573171 88573556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 234907 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 144.667-81 chr14 51639780 51640112 + 0.666667 NA intron (NM_001042481, intron 2 of 14) intron (NM_001042481, intron 2 of 14) 11798 NR_037676 145438 Hs.645410 NR_037676 ENSG00000273888 FRMD6-AS1 C14orf82 FRMD6 antisense RNA 1 ncRNA 116-73 chr2 38546142 38546377 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -30519 NR_110259 101929596 Hs.537341 NR_110259 LINC02613 - long intergenic non-protein coding RNA 2613 ncRNA 115-134 chr6 43767785 43768017 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2308 NM_001171624 7422 Hs.73793 NM_003376 ENSG00000112715 VEGFA MVCD1|VEGF|VPF vascular endothelial growth factor A protein-coding 134-84 chr5 28860455 28860695 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg2|LINE|L1 -66295 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 116.333-165 chr5 18646144 18646359 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 838977 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 115.333-153 chr4 49710722 49710940 + 0.666667 NA Intergenic SAR|Satellite|Satellite 724189 NM_001286791 80157 Hs.479703 NM_025087 ENSG00000109182 CWH43 CWH43-C|PGAP2IP cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog protein-coding 157-54 chr18 3714689 3714984 + 0.666667 NA intron (NM_001308390, intron 4 of 10) AluSz|SINE|Alu 111099 NR_119377 84777 Hs.659053 NM_032691 DLGAP1-AS2 - DLGAP1 antisense RNA 2 ncRNA 166-122 chr8 143318970 143319318 + 0.666667 NA intron (NM_052963, intron 8 of 13) intron (NM_052963, intron 8 of 13) 15736 NM_052963 116447 Hs.528574 NM_052963 ENSG00000184428 TOP1MT - DNA topoisomerase I mitochondrial protein-coding 187.667-120 chr5 86866375 86866883 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 119811 NR_105017 100505878 Hs.246405 NR_105017 LINC02059 - long intergenic non-protein coding RNA 2059 ncRNA 162-91 chr4 33326472 33326953 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 713181 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 146-109 chr5 92918816 92919104 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 652383 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 117.667-171 chr6 133801788 133801974 + 0.666667 NA intron (NR_109982, intron 2 of 8) L1M2|LINE|L1 -19266 NR_027030 154089 Hs.126165 NR_027030 LINC01312 - long intergenic non-protein coding RNA 1312 ncRNA 113.333-49 chr11 74752396 74752583 + 0.666667 NA intron (NM_001098638, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 3640 NM_001098638 254225 Hs.370145 NM_001098638 ENSG00000166439 RNF169 - ring finger protein 169 protein-coding 157-84 chr3 18216407 18216813 + 0.666667 NA intron (NR_161333, intron 4 of 4) MLT1G|LTR|ERVL-MaLR 208729 NM_002971 6304 Hs.517717 NM_002971 ENSG00000182568 SATB1 - SATB homeobox 1 protein-coding 117-110 chr5 9733252 9733453 + 0.666667 NA intron (NR_027112, intron 5 of 12) MER58A|DNA|hAT-Charlie -103001 NM_019599 50834 Hs.567492 NM_019599 ENSG00000169777 TAS2R1 T2R1|TRB7 taste 2 receptor member 1 protein-coding 241-56 chr8 56207576 56208144 + 0.666667 NA intron (NM_002655, intron 1 of 4) intron (NM_002655, intron 1 of 4) 3413 NM_001114634 5324 Hs.14968 NM_002655 ENSG00000181690 PLAG1 PSA|SGPA|ZNF912 PLAG1 zinc finger protein-coding 131.667-25 chr10 82333408 82333687 + 0.666667 NA intron (NM_001370082, intron 3 of 10) intron (NM_001370082, intron 3 of 10) -100627 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 145.333-66 chr12 52909378 52909702 + 0.666667 NA intron (NM_001256293, intron 1 of 8) intron (NM_001256293, intron 1 of 8) -4464 NM_002273 3856 Hs.533782 NM_002273 ENSG00000170421 KRT8 CARD2|CK-8|CK8|CYK8|K2C8|K8|KO keratin 8 protein-coding 185.333-133 chr4 52305946 52306346 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F|LTR|ERVL-MaLR 254842 NR_123728 132671 Hs.527090 NM_145263 ENSG00000163071 SPATA18 Mieap|SPETEX1 spermatogenesis associated 18 protein-coding 218.333-80 chr21 31465437 31465820 + 0.666667 NA intron (NM_003253, intron 1 of 28) AluY|SINE|Alu 93459 NM_003253 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 130.667-102 chr19 56279947 56280292 + 0.666667 NA intron (NM_001354658, intron 2 of 10) L1ME4b|LINE|L1 7371 NM_001354658 100506374 Hs.631532 NM_001354658 ENSG00000267710 EDDM13 - epididymal protein 13 protein-coding 121.667-88 chr2 26337645 26337857 + 0.666667 NA intron (NR_135916, intron 1 of 12) AluSz6|SINE|Alu 8060 NM_001321975 165082 Hs.631878 NM_153835 ENSG00000173567 ADGRF3 GPR113|PGR23 adhesion G protein-coupled receptor F3 protein-coding 112.667-128 chr2 83023315 83023616 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 166662 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 128-71 chr3 75213222 75213552 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1089 NR_049831 100846999 NR_049831 ENSG00000266780 MIR4444-2 - microRNA 4444-2 ncRNA 202.333-82 chr19 10666139 10666739 + 0.666667 NA intron (NM_012218, intron 1 of 19) L1ME2z|LINE|L1 12093 NM_012218 3609 Hs.465885 NM_004516 ENSG00000129351 ILF3 CBTF|DRBF|DRBP76|MMP4|MPHOSPH4|MPP4|MPP4110|NF-AT-90|NF110|NF110b|NF90|NF90a|NF90b|NF90c|NF90ctv|NFAR|NFAR-1|NFAR-2|NFAR110|NFAR2|NFAR90|TCP110|TCP80 interleukin enhancer binding factor 3 protein-coding 182.667-85 chr22 18043939 18044293 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14731 NR_024417 100192420 Hs.589947 NR_024417 ENSG00000235295 LINC01634 - long intergenic non-protein coding RNA 1634 ncRNA 233-32 chr18 36701634 36702315 + 0.666667 NA intron (NM_001281740, intron 17 of 28) intron (NM_001281740, intron 17 of 28) -38556 NR_132982 105372071 NR_132982 LOC105372071 - uncharacterized LOC105372071 ncRNA 148.333-170 chr18 12698944 12699300 + 0.666667 NA non-coding (NR_073537, exon 4 of 13) non-coding (NR_073537, exon 4 of 13) 3601 NM_024899 79959 Hs.236940 NM_024899 ENSG00000101624 CEP76 C18orf9|HsT1705 centrosomal protein 76 protein-coding 121-24 chr11 16926655 16926909 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_145810) promoter-TSS (NR_145810) -760 NR_145810 109623465 NR_145810 SNORD147 - small nucleolar RNA, C/D box 147 snoRNA 169-56 chr20 51869375 51869857 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -6703 NR_110016 101927678 Hs.683840 NR_110016 ENSG00000227964 LINC01429 - long intergenic non-protein coding RNA 1429 ncRNA 160.667-88 chr14 57161413 57161818 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 107290 NM_006544 10640 Hs.743987 NM_006544 ENSG00000070367 EXOC5 HSEC10|PRO1912|SEC10|SEC10L1|SEC10P exocyst complex component 5 protein-coding 150.333-210 chr2 136318119 136318384 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -200096 NM_003467 7852 Hs.593413 NM_003467 ENSG00000121966 CXCR4 CD184|D2S201E|FB22|HM89|HSY3RR|LAP-3|LAP3|LCR1|LESTR|NPY3R|NPYR|NPYRL|NPYY3R|WHIM|WHIMS C-X-C motif chemokine receptor 4 protein-coding 121-67 chr2 51849521 51849792 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 6 of 10) L2a|LINE|L2 -520992 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 174.333-112 chr5 21059815 21060319 + 0.666667 NA Intergenic L1PREC2|LINE|L1 -399413 NR_027027 728411 Hs.88181 NM_207331 ENSG00000183666 GUSBP1 - GUSB pseudogene 1 pseudo 119-42 chr14 30674119 30674449 + 0.666667 NA intron (NM_016106, intron 13 of 24) intron (NM_016106, intron 13 of 24) 51965 NM_001257376 23256 Hs.369168 NM_016106 ENSG00000092108 SCFD1 C14orf163|RA410|SLY1|SLY1P|STXBP1L2 sec1 family domain containing 1 protein-coding 147.667-89 chr13 71216804 71217108 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 201815 NR_047699 100885781 Hs.372660 NR_047699 ENSG00000226846 LINC00348 - long intergenic non-protein coding RNA 348 ncRNA 196.667-145 chr7 85883317 85883749 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 462411 NR_134240 105375380 Hs.679608 NR_134240 ENSG00000225128 LINC00972 - long intergenic non-protein coding RNA 972 ncRNA 212.666-74 chr6 56549800 56550398 + 0.666667 NA intron (NM_001144770, intron 53 of 94) intron (NM_001144770, intron 53 of 94) 92790 NM_015548 667 Hs.604915 NM_001723 ENSG00000151914 DST BP240|BPA|BPAG1|CATX-15|CATX15|D6S1101|DMH|DT|EBSB2|HSAN6|MACF2 dystonin protein-coding 176.667-71 chr19 2092144 2092636 + 0.666667 NA intron (NM_130807, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 3936 NM_130807 126308 Hs.744938 NM_130807 ENSG00000172081 MOB3A MOB-LAK|MOB1C|MOBKL2A|moblak MOB kinase activator 3A protein-coding 157.667-316 chr8 25350781 25351196 + 0.666667 NA intron (NR_159962, intron 1 of 1) intron (NR_159962, intron 1 of 1) 5586 NR_106936 102465527 NR_106936 ENSG00000274988 MIR6876 hsa-mir-6876 microRNA 6876 ncRNA 232-65 chr4 44327663 44328121 + 0.666667 NA intron (NM_198353, intron 1 of 1) MIR|SINE|MIR 120917 NM_198353 386617 Hs.479644 NM_198353 ENSG00000183783 KCTD8 - potassium channel tetramerization domain containing 8 protein-coding 155.667-391 chr9 108326020 108326413 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 529770 NM_006686 10880 Hs.534390 NM_006686 ENSG00000148156 ACTL7B Tact1 actin like 7B protein-coding 145.333-50 chr10 124999502 124999800 + 0.666667 NA intron (NM_001290214, intron 5 of 10) intron (NM_001290214, intron 5 of 10) 6367 NM_001363508 1488 Hs.501345 NM_001329 ENSG00000175029 CTBP2 - C-terminal binding protein 2 protein-coding 198-165 chr6 146870847 146871288 + 0.666667 NA intron (NR_034115, intron 7 of 10) intron (NR_034115, intron 7 of 10) -67243 NR_003954 729176 Hs.486708 NR_003954 KATNBL1P6 - katanin regulatory subunit B1 like 1 pseudogene 6 pseudo 156.667-307 chr6 131717975 131718369 + 0.666667 NA intron (NR_133007, intron 15 of 23) intron (NR_133007, intron 15 of 23) -7155 NM_001145659 643854 Hs.632613 NM_001145659 ENSG00000236761 CTAGE9 - CTAGE family member 9 protein-coding 118-55 chr17 63793948 63794218 + 0.666667 NA intron (NM_203499, intron 3 of 17) intron (NM_203499, intron 3 of 17) 19894 NM_007372 11325 Hs.702010 NM_007372 ENSG00000198231 DDX42 DDX42P|RHELP|RNAHP|SF3B8|SF3b125 DEAD-box helicase 42 protein-coding 157.333-32 chr1 189529063 189529467 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 946745 NM_001317188 339479 Hs.65765 NM_199051 ENSG00000162670 BRINP3 DBCCR1L|DBCCR1L1|FAM5C BMP/retinoic acid inducible neural specific 3 protein-coding 127-105 chr9 85423245 85423482 + 0.666667 NA Intergenic LTR81B|LTR|Gypsy 318666 NM_015239 23287 Hs.719980 NM_015239 ENSG00000135049 AGTPBP1 CCP1|CONDCA|NNA1 ATP/GTP binding protein 1 protein-coding 186.333-162 chr8 78244327 78244838 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -271758 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 191-36 chr20 4220902 4221294 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_000678, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_000678, exon 2 of 2) 28008 NR_033917 728228 Hs.636379 NR_033917 ENSG00000230176 LINC01433 - long intergenic non-protein coding RNA 1433 ncRNA 161.333-34 chr10 65235541 65235954 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H1-int|LTR|ERVL-MaLR -311229 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 199.667-70 chr2 47854380 47854826 + 0.666667 NA intron (NM_001190274, intron 1 of 22) MIR3|SINE|MIR 34116 NM_025133 80204 Hs.352677 NM_012167 ENSG00000138081 FBXO11 FBX11|IDDFBA|PRMT9|UBR6|UG063H01|VIT1 F-box protein 11 protein-coding 232-27 chr14 58815026 58815562 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12994 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 112.333-13 chr1 212122321 212122640 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 44867 NR_036068 100422947 NR_036068 ENSG00000264358 MIR3122 mir-3122 microRNA 3122 ncRNA 137-97 chr7 28948015 28948377 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10134 NM_014817 9865 Hs.744120 NM_014817 ENSG00000255690 TRIL - TLR4 interactor with leucine rich repeats protein-coding 121.667-60 chr14 87226656 87227007 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 321053 NR_038445 283585 Hs.381998 NR_038445 ENSG00000258804 LINC01148 - long intergenic non-protein coding RNA 1148 ncRNA 224.667-54 chr22 40846502 40847033 + 0.666667 NA intron (NM_003932, intron 3 of 11) AluSx3|SINE|Alu 9872 NM_003932 6767 Hs.712713 NM_003932 ENSG00000100380 ST13 AAG2|FAM10A1|FAM10A4|HIP|HOP|HSPABP|HSPABP1|P48|PRO0786|SNC6 ST13 Hsp70 interacting protein protein-coding 140-65 chr2 168104449 168104716 + 0.666667 NA intron (NM_013233, intron 10 of 17) intron (NM_013233, intron 10 of 17) 143013 NM_013233 27347 Hs.276271 NM_013233 ENSG00000198648 STK39 DCHT|PASK|SPAK serine/threonine kinase 39 protein-coding 114-66 chr2 32121960 32122151 + 0.666667 NA intron (NM_001363875, intron 6 of 15) HAL1|LINE|L1 -43786 NM_001193514 55676 Hs.23248 NM_017964 ENSG00000152683 SLC30A6 MST103|MSTP103|ZNT6 solute carrier family 30 member 6 protein-coding 114.667-68 chr13 30499998 30500232 + 0.666667 NA intron (NM_001370340, intron 1 of 4) MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -34138 NM_001363661 3146 Hs.434102 NM_002128 ENSG00000189403 HMGB1 HMG-1|HMG1|HMG3|SBP-1 high mobility group box 1 protein-coding 160-68 chr20 57500804 57501239 + 0.666667 NA intron (NM_001269054, intron 8 of 8) intron (NM_001269054, intron 8 of 8) 23846 NM_001269044 140690 Hs.131543 NM_080618 ENSG00000124092 CTCFL BORIS|CT27|CTCF-T|HMGB1L1|dJ579F20.2 CCCTC-binding factor like protein-coding 143-117 chr7 47837093 47837351 + 0.666667 NA intron (NM_138295, intron 36 of 56) intron (NM_138295, intron 36 of 56) 41931 NR_161269 80099 Hs.287647 NM_025031 C7orf69 - chromosome 7 open reading frame 69 ncRNA 160-17 chr10 64443660 64444116 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -381640 NR_001446 305 Hs.591361 NR_001446 ANXA2P3 ANX2L3|ANX2P3|LIP2|LPC2C annexin A2 pseudogene 3 pseudo 172.333-112 chr3 83765822 83766226 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1103551 NR_033860 440970 Hs.411049 NR_033860 ENSG00000242641 LINC00971 - long intergenic non-protein coding RNA 971 ncRNA 117-95 chr3 102691326 102691598 + 0.666667 NA Intergenic MER131|DNA?|DNA? 256447 NM_175056 131368 Hs.352213 NM_175056 ENSG00000170044 ZPLD1 - zona pellucida like domain containing 1 protein-coding 129.667-171 chr8 83850290 83850674 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -332305 NM_001354325 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 200.667-60 chr17 62926209 62926596 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17813 NR_030363 693218 NR_030363 ENSG00000207552 MIR633 MIRN633|hsa-mir-633 microRNA 633 ncRNA 157.333-285 chr5 104258144 104258498 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -695532 NM_001300741 83594 Hs.434289 NM_031438 ENSG00000112874 NUDT12 - nudix hydrolase 12 protein-coding 136.333-31 chr11 16017499 16017817 + 0.666667 NA intron (NM_033326, intron 12 of 15) intron (NM_033326, intron 12 of 15) -48037 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 149.667-98 chr12 97216101 97216548 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -246452 NR_152618 196475 Hs.652568 NR_024037 ENSG00000255794 RMST LINC00054|NCRMS|NCRNA00054 rhabdomyosarcoma 2 associated transcript ncRNA 122.333-224 chrX 68038231 68038550 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 395105 NM_002547 4983 Hs.128824 NM_002547 ENSG00000079482 OPHN1 ARHGAP41|MRX60|OPN1 oligophrenin 1 protein-coding 204.667-26 chr11 106032732 106033201 + 0.666667 NA Intergenic Charlie20a|DNA|hAT-Charlie -10679 NM_001318749 84437 Hs.266782 NM_032424 ENSG00000170903 MSANTD4 KIAA1826 Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils protein-coding 126.333-20 chr10 51554827 51555086 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 3 of 17) intron (NM_001098512, intron 3 of 17) 144639 NM_015235 23283 Hs.591358 NM_015235 ENSG00000177613 CSTF2T CstF-64T cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant protein-coding 131.667-47 chr12 80240080 80240348 + 0.666667 NA intron (NM_001368062, intron 16 of 62) L1MA4|LINE|L1 30761 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 128.667-130 chr4 69677451 69677820 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24388 NM_001252275 10941 Hs.225950 NM_006798 ENSG00000173610 UGT2A1 UDPGT2A1 UDP glucuronosyltransferase family 2 member A1 complex locus protein-coding 156.667-108 chr14 66576474 66576801 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) MamRep1879|DNA|hAT-Tip100? 69230 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 168-113 chr8 74404511 74404865 + 0.666667 NA intron (NM_001362931, intron 5 of 5) intron (NM_001362931, intron 5 of 5) 54285 NM_001362931 54332 Hs.168950 NM_018972 ENSG00000104381 GDAP1 CMT4|CMT4A|CMTRIA ganglioside induced differentiation associated protein 1 protein-coding 151.333-136 chr14 92253730 92254167 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68633 NM_153648 123041 Hs.385530 NM_153646 ENSG00000140090 SLC24A4 AI2A5|NCKX4|SHEP6|SLC24A2 solute carrier family 24 member 4 protein-coding 191-43 chr3 176486929 176487355 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -27961 NR_107017 102465858 NR_107017 ENSG00000283333 MIR7977 hsa-mir-7977 microRNA 7977 ncRNA 162-105 chr6 65143120 65143424 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) L1ME2z|LINE|L1 -158146 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 149.667-364 chr7 16597208 16597476 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 48412 NM_020319 57037 Hs.157378 NM_020319 ENSG00000106524 ANKMY2 ZMYND20 ankyrin repeat and MYND domain containing 2 protein-coding 147-92 chr3 87508765 87509144 + 0.666667 NA Intergenic MER103C|DNA|hAT-Charlie -232370 NM_000306 5449 Hs.591654 NM_000306 ENSG00000064835 POU1F1 CPHD1|GHF-1|PIT1|POU1F1a|Pit-1 POU class 1 homeobox 1 protein-coding 112.667-19 chr1 206603826 206604111 + 0.666667 NA intron (NM_006893, intron 5 of 14) intron (NM_006893, intron 5 of 14) 8497 NM_006893 1939 Hs.497581 NM_006893 ENSG00000143486 EIF2D HCA56|LGTN eukaryotic translation initiation factor 2D protein-coding 148-94 chr21 19440278 19440589 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 459322 NR_146910 105372746 Hs.580899 NR_146910 ENSG00000233480 LINC01683 C21orf40 long intergenic non-protein coding RNA 1683 ncRNA 233.333-28 chr11 61543621 61544030 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001370210) promoter-TSS (NM_001370210) -949 NM_001370210 9066 Hs.131188 NM_004200 ENSG00000011347 SYT7 IPCA-7|IPCA7|PCANAP7|SYT-VII|SYTVII synaptotagmin 7 protein-coding 169.667-31 chr11 33118314 33118671 + 0.666667 NA intron (NM_001326, intron 3 of 20) intron (NM_001326, intron 3 of 20) 42342 NR_015451 283267 Hs.533701 NR_015451 ENSG00000280798 LINC00294 NCRNA00294 long intergenic non-protein coding RNA 294 ncRNA 114-69 chr2 64535377 64535588 + 0.666667 NA intron (NM_001002243, intron 1 of 8) MIRb|SINE|MIR 9969 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 144.333-28 chr10 90029870 90030252 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -72688 NR_110655 101926924 Hs.500498 NR_110655 ENSG00000226159 LINC01375 - long intergenic non-protein coding RNA 1375 ncRNA 121.333-163 chr6 129220643 129220866 + 0.666667 NA intron (NM_000426, intron 12 of 64) Charlie7|DNA|hAT-Charlie 337613 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 113-212 chr8 135157951 135158231 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -76040 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 195-101 chr7 113971945 113972386 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -53156 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 207.333-38 chr10 101115048 101115490 + 0.666667 NA intron (NR_130724, intron 2 of 2) intron (NR_130724, intron 2 of 2) 15877 NR_130723 100038246 Hs.368784 NM_001085398 ENSG00000236311 TLX1NB APT-B7|TD1|TDI TLX1 neighbor ncRNA 114-106 chr4 88605048 88605303 + 0.666667 NA intron (NM_001271602, intron 2 of 24) intron (NM_001271602, intron 2 of 24) 12695 NM_014606 8916 Hs.35804 NM_014606 ENSG00000138641 HERC3 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 protein-coding 127.667-159 chr7 11346571 11346877 + 0.666667 NA Intergenic (CCCTC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 372852 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 117.667-147 chr5 18027503 18027709 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 220332 NR_134287 646241 Hs.407197 NR_134286 LINC02223 - long intergenic non-protein coding RNA 2223 ncRNA 122.333-123 chr20 22481842 22482148 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -61352 NR_027090 284788 Hs.651993 NR_027089 ENSG00000204684 LOC284788 - uncharacterized LOC284788 ncRNA 159-14 chr10 29023655 29023983 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR 177411 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 141.333-44 chr12 38483724 38484021 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 167098 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 112.333-191 chr4 96590308 96590561 + 0.666667 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) L2|LINE|L2 279731 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 189.333-78 chr18 1501513 1501886 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142070 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 195.667-34 chr12 95201328 95201797 + 0.666667 NA intron (NM_018351, intron 2 of 20) intron (NM_018351, intron 2 of 20) 15905 NM_018351 55785 Hs.506381 NM_018351 ENSG00000180263 FGD6 ZFYVE24 FYVE, RhoGEF and PH domain containing 6 protein-coding 113.667-57 chr14 35246230 35246441 + 0.666667 NA intron (NM_014672, intron 5 of 7) intron (NM_014672, intron 5 of 7) -32223 NM_001282234 5687 Hs.446260 NM_002791 ENSG00000100902 PSMA6 IOTA|PROS27|p27K proteasome subunit alpha 6 protein-coding 132-119 chr8 126444418 126444704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 113917 NR_156466 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 428-6 chr3 70714869 70715850 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 349565 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 142.333-42 chr11 88137910 88138229 + 0.666667 NA intron (NM_022337, intron 2 of 2) HAL1|LINE|L1 37374 NM_022337 23682 Hs.591975 NM_022337 ENSG00000123892 RAB38 NY-MEL-1|rrGTPbp RAB38, member RAS oncogene family protein-coding 192.667-85 chr2 58878713 58879149 + 0.666667 NA intron (NR_033873, intron 3 of 13) intron (NR_033873, intron 3 of 13) -338777 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 131.333-117 chr3 165669765 165670006 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 167538 NR_137635 590 Hs.420483 NM_000055 ENSG00000114200 BCHE BCHED|CHE1|CHE2|E1 butyrylcholinesterase protein-coding 117.667-93 chr2 120695536 120695732 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -40234 NM_001371271 339.333-35 chr5 37062612 37063225 + 0.666667 NA intron (NM_015384, intron 45 of 45) AluJb|SINE|Alu -186128 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 152-131 chr5 146911447 146911827 + 0.666667 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) L3|LINE|CR1 7869 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 188.333-15 chr1 242673904 242674318 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -149414 NM_001320272 200150 Hs.672452 NM_152666 ENSG00000180287 PLD5 PLDC phospholipase D family member 5 protein-coding 125.667-72 chr15 80537143 80537458 + 0.666667 NA intron (NM_014862, intron 8 of 18) L2c|LINE|L2 25644 NR_120363 101929586 Hs.569426 NR_120363 ENSG00000259175 LOC101929586 - uncharacterized LOC101929586 ncRNA 114.333-213 chr8 26322932 26323121 + 0.666667 NA intron (NM_001177591, intron 2 of 9) L2a|LINE|L2 29810 NM_001177591 5520 Hs.146339 NM_002717 ENSG00000221914 PPP2R2A B55A|B55ALPHA|PR52A|PR55A|PR55alpha protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha protein-coding 119-23 chr10 104112326 104112599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -9596 NM_145247 119392 Hs.93667 NM_145247 ENSG00000156384 SFR1 C10orf78|MEI5|MEIR5|bA373N18.1 SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 protein-coding 128.667-186 chr8 109013624 109013909 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -72862 NM_003301 7201 Hs.3022 NM_003301 ENSG00000174417 TRHR TRH-R thyrotropin releasing hormone receptor protein-coding 115.667-113 chr2 46336616 46336911 + 0.666667 NA intron (NM_001430, intron 1 of 15) MER5A1|DNA|hAT-Charlie 39356 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 217-22 chr14 72057216 72057656 + 0.666667 NA intron (NM_001370288, intron 2 of 16) MamRTE1|LINE|RTE-BovB 123909 NM_001370271 9628 Hs.509872 NM_004296 ENSG00000182732 RGS6 GAP|HA117|S914 regulator of G protein signaling 6 protein-coding 154.333-291 chr6 41679381 41679784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 41114 NM_001300805 4188 Hs.520119 NM_005586 ENSG00000112559 MDFI I-MF|I-mfa MyoD family inhibitor protein-coding 238.333-6 chr10 13503909 13504480 + 0.666667 NA intron (NM_001370075, intron 1 of 8) intron (NM_001370075, intron 1 of 8) -1218 NM_001100912 222389 Hs.498740 NM_152751 ENSG00000165626 BEND7 C10orf30 BEN domain containing 7 protein-coding 189.667-11 chr1 215694397 215694797 + 0.666667 NA intron (NM_206933, intron 61 of 71) intron (NM_206933, intron 61 of 71) 127293 NM_016121 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 156.667-49 chr10 75648925 75649242 + 0.666667 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) L1MB3|LINE|L1 1574 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 142-122 chr5 163446229 163446649 + 0.666667 NA TTS (NR_138426) TTS (NR_138426) 8844 NM_004060 900 Hs.79101 NM_004060 ENSG00000113328 CCNG1 CCNG cyclin G1 protein-coding 111.667-236 chr7 31162005 31162295 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 109689 NM_001199635 117 Hs.377783 NM_001118 ENSG00000078549 ADCYAP1R1 PAC1|PAC1R|PACAPR|PACAPRI ADCYAP receptor type I protein-coding 162-29 chr12 31358392 31358779 + 0.666667 NA Intergenic (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 10716 NR_146469 101929027 Hs.266041 NR_146469 ENSG00000256232 LINC02387 - long intergenic non-protein coding RNA 2387 ncRNA 186-20 chr10 109485634 109486037 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 437411 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 195.667-152 chr9 27994889 27995198 + 0.666667 NA intron (NM_001354574, intron 5 of 5) L1MA4|LINE|L1 -421177 NM_001256054 203228 Hs.493639 NM_018325 ENSG00000147894 C9orf72 ALSFTD|DENND9|DENNL72|FTDALS|FTDALS1 C9orf72-SMCR8 complex subunit protein-coding 131-45 chr18 59397782 59398018 + 0.666667 NA Intergenic MER5A|DNA|hAT-Charlie -38635 NM_005570 3998 Hs.465295 NM_005570 ENSG00000074695 LMAN1 ERGIC-53|ERGIC53|F5F8D|FMFD1|MCFD1|MR60|gp58 lectin, mannose binding 1 protein-coding 151-45 chr17 28770039 28770343 + 0.666667 NA intron (NM_001288631, intron 1 of 3) L2a|LINE|L2 26180 NM_004295 9618 Hs.8375 NM_004295 ENSG00000076604 TRAF4 CART1|MLN62|RNF83 TNF receptor associated factor 4 protein-coding 129.667-162 chr7 77409892 77410138 + 0.666667 NA intron (NR_146937, intron 1 of 31) MER5B|DNA|hAT-Charlie -5183 NR_110073 101927243 Hs.547753 NR_110073 LOC101927243 - uncharacterized LOC101927243 ncRNA 140.667-226 chr8 58847493 58847799 + 0.666667 NA intron (NM_014729, intron 4 of 8) L1MEd|LINE|L1 -187793 NM_003580 8439 Hs.372000 NM_003580 ENSG00000035681 NSMAF FAN|GRAMD5 neutral sphingomyelinase activation associated factor protein-coding 211.333-94 chr18 11752871 11753382 + 0.666667 NA intron (NM_001369387, intron 2 of 11) intron (NM_001369387, intron 2 of 11) 1041 NM_001369387 2774 Hs.136295 NM_002071 ENSG00000141404 GNAL DYT25 G protein subunit alpha L protein-coding 125-73 chr3 20766066 20766415 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 423772 NR_110814 101927829 Hs.639381 NR_110814 ENSG00000231304 LOC101927829 - uncharacterized LOC101927829 ncRNA 141-24 chr14 36641478 36641800 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15929 NM_006194 5083 Hs.132576 NM_006194 ENSG00000198807 PAX9 STHAG3 paired box 9 protein-coding 187.667-27 chr12 39897229 39897677 + 0.666667 NA intron (NM_052885, intron 4 of 9) intron (NM_052885, intron 4 of 9) 208628 NM_052885 114134 Hs.558595 NM_052885 ENSG00000151229 SLC2A13 HMIT solute carrier family 2 member 13 protein-coding 120-28 chr12 30971556 30971750 + 0.666667 NA intron (NM_001370301, intron 2 of 6) AluJr|SINE|Alu 44749 NM_001080509 441631 Hs.505141 NM_001080509 ENSG00000110900 TSPAN11 VSSW1971 tetraspanin 11 protein-coding 154.667-268 chr4 41534118 41534557 + 0.666667 NA intron (NM_001289122, intron 3 of 25) MER104|DNA|TcMar-Tc2 -3820 NM_001330672 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 133.667-16 chr1 236885206 236885586 + 0.666667 NA intron (NM_000254, intron 26 of 32) intron (NM_000254, intron 26 of 32) 90104 NM_001291940 4548 Hs.498187 NM_000254 ENSG00000116984 MTR HMAG|MS|cblG 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase protein-coding 175.333-59 chr16 13762904 13763267 + 0.666667 NA Intergenic LTR33A_|LTR|ERVL -157072 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 146.667-356 chr9 79172516 79172860 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27022 NR_109771 101927450 Hs.738041 NR_109771 ENSG00000260995 LOC101927450 - uncharacterized LOC101927450 ncRNA 117-7 chr1 171742169 171742509 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_033704) promoter-TSS (NR_033704) -274 NR_033704 8674 Hs.6651 NM_003762 ENSG00000117533 VAMP4 VAMP-4|VAMP24 vesicle associated membrane protein 4 protein-coding 139.667-139 chr4 79416047 79416433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8012 NM_033214 2712 Hs.98008 NM_033214 ENSG00000196475 GK2 GKP2|GKTA glycerol kinase 2 protein-coding 133-91 chr8 38336834 38337208 + 0.666667 NA intron (NM_023034, intron 4 of 23) AluSx1|SINE|Alu 45250 NM_023034 54904 Hs.434966 NM_017778 ENSG00000147548 NSD3 KMT3F|KMT3G|WHISTLE|WHSC1L1|pp14328 nuclear receptor binding SET domain protein 3 protein-coding 119-76 chr2 71774812 71775069 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 308241 NM_001130983 8291 Hs.252180 NM_003494 ENSG00000135636 DYSF FER1L1|LGMD2B|LGMDR2|MMD1 dysferlin protein-coding 211-59 chr22 38348720 38349222 + 0.666667 NA intron (NR_002821, intron 4 of 4) intron (NR_002821, intron 4 of 4) -30887 NM_001894 1454 Hs.474833 NM_001894 ENSG00000213923 CSNK1E CKIe|CKIepsilon|HCKIE casein kinase 1 epsilon protein-coding 173.667-159 chr6 167829394 167829800 + 0.666667 NA intron (NM_001291964, intron 1 of 32) intron (NM_001291964, intron 1 of 32) 1962 NM_001291964 4301 Hs.614974 NM_005936 ENSG00000130396 AFDN AF6|MLL-AF6|MLLT4|l-afadin afadin, adherens junction formation factor protein-coding 209.667-47 chr14 68619938 68620436 + 0.666667 NA intron (NM_001321818, intron 10 of 10) intron (NM_001321818, intron 10 of 10) 8600 NR_135816 100996664 NR_135816 LOC100996664 - uncharacterized LOC100996664 ncRNA 119.333-48 chr11 42330313 42330552 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -76742 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 139-80 chr5 28616047 28616313 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -310690 NR_033961 729862 Hs.646006 NR_033961 LSP1P3 - LSP1 pseudogene 3 pseudo 237-74 chr8 107536185 107536863 + 0.666667 NA Intergenic MER33|DNA|hAT-Charlie -38606 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 215.333-49 chr13 79965025 79965393 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -45868 NR_104138 101515984 Hs.569290 NR_104138 LINC01080 TCONS_00021856 long intergenic non-protein coding RNA 1080 ncRNA 115.333-203 chr7 80300307 80300480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74046 NR_110075 101927269 Hs.583232 NR_110075 LOC101927269 - uncharacterized LOC101927269 ncRNA 129-25 chr12 12673474 12673798 + 0.666667 NA intron (NM_006143, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 22547 NM_006143 2842 Hs.657862 NM_006143 ENSG00000183150 GPR19 - G protein-coupled receptor 19 protein-coding 149.333-40 chr10 18207231 18207557 + 0.666667 NA intron (NM_201593, intron 2 of 13) MER44A|DNA|TcMar-Tigger -53328 NM_001330060 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 115-13 chr1 162876545 162876734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7824 NM_178550 339512 Hs.407631 NM_178550 ENSG00000185860 CCDC190 C1orf110 coiled-coil domain containing 190 protein-coding 167-105 chr8 122156352 122156693 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 412122 NR_131202 105375734 Hs.628341 NR_131202 SMILR - smooth muscle induced lncRNA, enhancer of proliferation ncRNA 163.333-43 chr10 95160437 95160836 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -33564 NM_207321 142827 Hs.134229 NM_207321 ENSG00000173124 ACSM6 C10orf129|bA310E22.3 acyl-CoA synthetase medium chain family member 6 protein-coding 238.667-92 chr8 125120414 125120856 + 0.666667 NA intron (NM_001349486, intron 3 of 7) intron (NM_001349486, intron 3 of 7) 28775 NM_173685 286053 Hs.388297 NM_173685 ENSG00000156831 NSMCE2 C8orf36|MMS21|NSE2|ZMIZ7 NSE2 (MMS21) homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase protein-coding 121.333-110 chr3 63499017 63499315 + 0.666667 NA intron (NM_001130003, intron 3 of 5) L2a|LINE|L2 50885 NR_046677 100874016 Hs.441275 NR_046677 ENSG00000241359 SYNPR-AS1 - SYNPR antisense RNA 1 ncRNA 170.667-114 chr3 145055919 145056352 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL 1013050 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 173.667-60 chr18 13155246 13155676 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -63299 NM_181482 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 171-21 chr14 66827737 66828165 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 4 of 21) intron (NM_001024218, intron 4 of 21) 320544 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 126.667-88 chr2 185792377 185792647 + 0.666667 NA exon (NM_173651, exon 16 of 23) exon (NM_173651, exon 16 of 23) 7638 NR_144453 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 201.667-27 chr12 119245594 119245913 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 57627 NR_024246 144742 Hs.524782 NR_024246 ENSG00000281196 LINC00934 - long intergenic non-protein coding RNA 934 ncRNA 178-39 chr12 115503467 115503897 + 0.666667 NA Intergenic FRAM|SINE|Alu 644972 NR_030351 693205 NR_030351 ENSG00000207967 MIR620 MIRN620|hsa-mir-620 microRNA 620 ncRNA 144.667-55 chr12 40443478 40443766 + 0.666667 NA intron (NM_173600, intron 34 of 173) intron (NM_173600, intron 34 of 173) 50228 NM_173600 283463 Hs.632712 NM_173600 MUC19 MUC-19 mucin 19, oligomeric protein-coding 178.333-87 chr2 179543383 179543849 + 0.666667 NA intron (NR_104234, intron 4 of 12) intron (NR_104234, intron 4 of 12) 18972 NM_001113398 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 221.333-98 chr4 46432496 46433012 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -42626 NM_000807 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 260-36 chr2 73097475 73097945 + 0.666667 NA intron (NM_001371272, intron 1 of 5) intron (NM_001371272, intron 1 of 5) 15238 NM_001371272 143.333-88 chr14 64471561 64471843 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004857, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_004857, exon 2 of 2) 6203 NM_004857 9495 Hs.656683 NM_004857 ENSG00000179841 AKAP5 AKAP75|AKAP79|H21 A-kinase anchoring protein 5 protein-coding 135-75 chr4 32256186 32256483 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 -94704 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 152.333-124 chr15 67824718 67825026 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001365915) promoter-TSS (NM_001365915) -637 NM_001365915 390598 Hs.451224 NM_001031807 ENSG00000188779 SKOR1 CORL1|FUSSEL15|LBXCOR1 SKI family transcriptional corepressor 1 protein-coding 141.333-126 chr2 225459565 225459807 + 0.666667 NA intron (NM_001371273, intron 3 of 7) AluY|SINE|Alu 58800 NM_020864 57624 Hs.224409 NM_020864 ENSG00000144460 NYAP2 KIAA1486 neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 protein-coding 134-31 chr15 67968339 67968591 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -85714 NM_016166 8554 Hs.162458 NM_016166 ENSG00000033800 PIAS1 DDXBP1|GBP|GU/RH-II|ZMIZ3 protein inhibitor of activated STAT 1 protein-coding 161.667-67 chr13 112903307 112903632 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65169 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 258.333-55 chr6 134356421 134356883 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38594 NM_001143676 6446 Hs.510078 NM_005627 ENSG00000118515 SGK1 SGK serum/glucocorticoid regulated kinase 1 protein-coding 170.667-106 chr22 33043035 33043521 + 0.666667 NA intron (NM_003490, intron 1 of 13) AluSq2|SINE|Alu 9266 NM_001369908 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 127.667-210 chrX 126300368 126300597 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -134193 NM_001013628 340578 Hs.181867 NM_001013628 ENSG00000198354 DCAF12L2 WDR40C DDB1 and CUL4 associated factor 12 like 2 protein-coding 160-86 chr4 100640887 100641275 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 34032 NR_046811 100874275 Hs.136318 NR_046811 ENSG00000250223 LINC01216 EMCN-IT3 long intergenic non-protein coding RNA 1216 ncRNA 155-109 chr5 69052034 69052367 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -22273 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 122.333-56 chr14 53941083 53941348 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7269 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 234.667-44 chr18 1647116 1647497 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -287677 NR_110327 56651 Hs.541165 NM_031416 LINC00470 C18orf2 long intergenic non-protein coding RNA 470 ncRNA 151.667-216 chr3 59174557 59174999 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -124746 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 148-125 chr5 32263970 32264264 + 0.666667 NA intron (NM_001294344, intron 6 of 13) intron (NM_001294344, intron 6 of 13) 48822 NM_001294344 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 114.667-116 chr19 3741847 3742122 + 0.666667 NA intron (NM_001267560, intron 14 of 20) AluSq|SINE|Alu 19708 NM_004886 9546 Hs.25527 NM_004886 ENSG00000011132 APBA3 MGC:15815|X11L2|mint3 amyloid beta precursor protein binding family A member 3 protein-coding 163.333-254 chr7 22314691 22315040 + 0.666667 NA intron (NM_012294, intron 3 of 25) intron (NM_012294, intron 3 of 25) 42289 NM_012294 9771 Hs.174768 NM_012294 ENSG00000136237 RAPGEF5 GFR|MR-GEF|REPAC Rap guanine nucleotide exchange factor 5 protein-coding 142.667-53 chr14 49056039 49056337 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 530192 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 214-116 chr6 82368650 82369052 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4607 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 119.333-218 chr8 104828851 104829044 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -239923 NM_001135703 29967 Hs.600630 NM_013437 ENSG00000147650 LRP12 MIG13A|ST7 LDL receptor related protein 12 protein-coding 140.333-60 chr14 46955967 46956279 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 9 of 16) intron (NM_001113498, intron 9 of 16) -304342 NM_080746 140801 Hs.308332 NM_080746 ENSG00000165496 RPL10L RPL10_5_1358 ribosomal protein L10 like protein-coding 115-112 chr3 71143610 71143863 + 0.666667 NA intron (NR_146142, intron 6 of 19) AluJo|SINE|Alu -11539 NM_001349342 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 113-188 chr6 153782212 153782405 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -228188 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 146.333-326 chr8 104192032 104192314 + 0.666667 NA intron (NM_001348498, intron 20 of 24) intron (NM_001348498, intron 20 of 24) -31162 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 115-5 chr1 95265530 95265719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31414 NM_015485 25950 Hs.483512 NM_015485 ENSG00000122481 RWDD3 RSUME RWD domain containing 3 protein-coding 186.667-111 chr4 173326990 173327302 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6623 NM_001130689 3148 Hs.434953 NM_002129 ENSG00000164104 HMGB2 HMG2 high mobility group box 2 protein-coding 193.667-104 chr5 107562715 107563086 + 0.666667 NA intron (NM_001962, intron 1 of 4) intron (NM_001962, intron 1 of 4) 108037 NM_001962 1946 Hs.288741 NM_001962 ENSG00000184349 EFNA5 AF1|EFL5|EPLG7|GLC1M|LERK7|RAGS ephrin A5 protein-coding 152.667-326 chr6 55639036 55639459 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60033 NM_001287741 54511 Hs.147054 NM_019036 ENSG00000146151 HMGCLL1 bA418P12.1|er-cHL 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1 protein-coding 163-96 chrX 95372068 95372432 + 0.666667 NA Intergenic L1PB3|LINE|L1 -309024 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 188.667-4 chr1 69076615 69077145 + 0.666667 NA intron (NR_146608, intron 1 of 4) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 20982 NR_146608 105378785 Hs.127911 NR_146608 ENSG00000223883 LINC01707 - long intergenic non-protein coding RNA 1707 ncRNA 154-37 chr12 29177829 29178116 + 0.666667 NA intron (NM_001271783, intron 1 of 11) intron (NM_001271783, intron 1 of 11) 28694 NM_001271783 55711 Hs.684482 NM_018099 ENSG00000064763 FAR2 HEL-S-81|MLSTD1|SDR10E2 fatty acyl-CoA reductase 2 protein-coding 156.333-266 chr4 63872779 63873152 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 536485 NM_001010874 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 159-39 chr15 98959510 98959883 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001291858, exon 21 of 21) 3' UTR (NM_001291858, exon 21 of 21) 45960 NM_001102612 145814 Hs.592021 NM_001102612 ENSG00000183571 PGPEP1L - pyroglutamyl-peptidase I like protein-coding 165.333-253 chr8 139357462 139357792 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 345496 NR_104210 51305 Hs.493037 NM_001282534 ENSG00000169427 KCNK9 K2p9.1|KT3.2|TASK-3|TASK3 potassium two pore domain channel subfamily K member 9 protein-coding 130.667-80 chr16 63592895 63593251 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1528990 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 133.333-115 chr3 145526270 145526660 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 542720 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 123-90 chr4 156333328 156333675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -379635 NM_001334 1519 Hs.75262 NM_001334 ENSG00000256043 CTSO CTSO1 cathepsin O protein-coding 126.667-109 chr3 118818347 118818616 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7648 NR_135547 105374060 Hs.99062 NR_135547 LOC105374060 - uncharacterized LOC105374060 ncRNA 136-113 chr9 30439036 30439432 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu -30780 NR_046204 401497 Hs.680131 NR_046204 LINC01242 - long intergenic non-protein coding RNA 1242 ncRNA 111.667-12 chr1 72970076 72970372 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -335946 NR_110677 101927295 Hs.436589 NR_110676 ENSG00000233973 LINC01360 - long intergenic non-protein coding RNA 1360 ncRNA 161.667-79 chr14 66157005 66157320 + 0.666667 NA Intergenic HAL1ME|LINE|L1 -329209 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 144-127 chr4 114846821 114847238 + 0.666667 NA intron (NM_022569, intron 9 of 13) intron (NM_022569, intron 9 of 13) 190270 NR_030303 693162 NR_030303 ENSG00000207931 MIR577 MIRN577|hsa-mir-577|mir-577 microRNA 577 ncRNA 142.333-113 chr2 12713310 12713564 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3435 NM_021643 28951 Hs.467751 NM_021643 ENSG00000071575 TRIB2 C5FW|GS3955|TRB2 tribbles pseudokinase 2 protein-coding 128-2 chr1 89361962 89362184 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1804 NM_001320257 163351 Hs.254338 NM_198460 ENSG00000183347 GBP6 - guanylate binding protein family member 6 protein-coding 149.667-428 chr9 104994562 104994863 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -66557 NM_005502 19 Hs.659274 NM_005502 ENSG00000165029 ABCA1 ABC-1|ABC1|CERP|HDLDT1|TGD ATP binding cassette subfamily A member 1 protein-coding 203-99 chr7 45094043 45094421 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -5263 NM_001146334 23148 Hs.96633 NM_001146334 ENSG00000136274 NACAD - NAC alpha domain containing protein-coding 173.333-85 chr2 9341751 9342174 + 0.666667 NA intron (NM_003887, intron 9 of 27) intron (NM_003887, intron 9 of 27) 80629 NM_001319068 9270 Hs.467662 NM_004763 ENSG00000119185 ITGB1BP1 ICAP-1A|ICAP-1B|ICAP-1alpha|ICAP1|ICAP1A|ICAP1B integrin subunit beta 1 binding protein 1 protein-coding 153.667-141 chr15 96797849 96798172 + 0.666667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 14575 NR_158222 145946 Hs.326528 NM_173499 ENSG00000185594 SPATA8 SRG8 spermatogenesis associated 8 ncRNA 163-26 chr15 50494731 50495092 + 0.666667 NA intron (NM_001128610, intron 16 of 19) AluSx|SINE|Alu 51755 NM_203494 373509 Hs.677758 NM_203494 ENSG00000170236 USP50 - ubiquitin specific peptidase 50 protein-coding 158.333-145 chr2 59640972 59641347 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 423451 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 127.667-89 chr2 123152077 123152382 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -78748 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 122.333-102 chr2 118748912 118749138 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 99158 NM_001426 2019 Hs.271977 NM_001426 ENSG00000163064 EN1 - engrailed homeobox 1 protein-coding 205-100 chr8 89656749 89657263 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 100705 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 193-27 chr15 97337000 97337324 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 184649 NR_120324 101927286 Hs.611279 NR_120324 ENSG00000259664 LINC02254 - long intergenic non-protein coding RNA 2254 ncRNA 168.667-213 chr8 29738679 29739082 + 0.666667 NA intron (NR_026765, intron 1 of 3) intron (NR_026765, intron 1 of 3) 9229 NR_026765 619351 Hs.566911 NR_026765 ENSG00000251191 LINC00589 C8orf75|TSLNC8 long intergenic non-protein coding RNA 589 ncRNA 187.333-27 chr11 5126849 5127298 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 5569 NM_001005160 390054 Hs.546593 NM_001005160 ENSG00000171944 OR52A5 OR11-33 olfactory receptor family 52 subfamily A member 5 protein-coding 179.333-95 chr2 64562523 64562987 + 0.666667 NA intron (NM_001002243, intron 2 of 8) intron (NM_001002243, intron 2 of 8) 37242 NR_039633 100616419 NR_039633 ENSG00000283204 MIR4434 - microRNA 4434 ncRNA 149-105 chr4 130969342 130969637 + 0.666667 NA Intergenic MamRTE1|LINE|RTE-BovB 593128 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 133.667-73 chr2 53655267 53655597 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -112351 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 166-75 chr22 35234684 35235057 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -3814 NR_126356 104310353 Hs.581009 NR_126356 ENSG00000233080 LINC01399 - long intergenic non-protein coding RNA 1399 ncRNA 154-138 chr8 65558702 65559077 + 0.666667 NA intron (NR_033893, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 3777 NR_033893 286186 Hs.449427 NR_033893 ENSG00000254081 LINC01299 - long intergenic non-protein coding RNA 1299 ncRNA 116.667-121 chr22 35359971 35360249 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -20986 NM_002133 3162 Hs.517581 NM_002133 ENSG00000100292 HMOX1 HMOX1D|HO-1|HSP32|bK286B10 heme oxygenase 1 protein-coding 130-114 chr6 144399747 144400035 + 0.666667 NA intron (NM_007124, intron 1 of 73) intron (NM_007124, intron 1 of 73) -5764 NR_132778 106635530 NR_132778 SNORA98 - small nucleolar RNA, H/ACA box 98 snoRNA 143-68 chr2 68203928 68204205 + 0.666667 NA intron (NM_000945, intron 2 of 5) intron (NM_000945, intron 2 of 5) 46178 NM_001329917 56902 Hs.262858 NM_020143 ENSG00000115946 PNO1 KHRBP1|RRP20 partner of NOB1 homolog protein-coding 120.333-133 chr3 109372698 109372991 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35272 NM_018189 55211 Hs.317659 NM_018189 ENSG00000121570 DPPA4 2410091M23Rik developmental pluripotency associated 4 protein-coding 252.667-2 chr1 21010586 21011076 + 0.666667 NA intron (NM_003760, intron 2 of 31) intron (NM_003760, intron 2 of 31) -22399 NR_031657 100302155 NR_031657 ENSG00000221808 MIR1256 MIRN1256|hsa-mir-1256 microRNA 1256 ncRNA 182-16 chr10 65022358 65022823 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15|LINE|L1 -98072 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 221-65 chr7 111419845 111420359 + 0.666667 NA intron (NM_001350961, intron 4 of 7) L1MB3|LINE|L1 142189 NM_032549 83943 Hs.655722 NM_032549 ENSG00000184903 IMMP2L IMMP2L-IT1|IMP2|IMP2-LIKE inner mitochondrial membrane peptidase subunit 2 protein-coding 255.333-61 chr2 197642963 197643621 + 0.666667 NA intron (NM_144629, intron 3 of 8) AluJr|SINE|Alu 32295 NM_144629 130132 Hs.591615 NM_144629 ENSG00000162944 RFTN2 C2orf11|Raftlin-2 raftlin family member 2 protein-coding 205.667-102 chr3 182178670 182179111 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 226526 NR_104146 100996490 Hs.606987 NR_104146 ENSG00000242512 LINC01206 - long intergenic non-protein coding RNA 1206 ncRNA 128-106 chr7 32451409 32451713 + 0.666667 NA Intergenic LTR37A|LTR|ERV1 6933 NR_038454 100130673 Hs.609282 NR_038454 LOC100130673 - phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 2 pseudogene pseudo 117.667-114 chr3 41206291 41206619 + 0.666667 NA intron (NM_001904, intron 1 of 14) intron (NM_001904, intron 1 of 14) 6950 NM_001330729 1499 Hs.476018 NM_001904 ENSG00000168036 CTNNB1 CTNNB|EVR7|MRD19|NEDSDV|armadillo catenin beta 1 protein-coding 142-60 chr17 79533602 79533895 + 0.666667 NA intron (NM_001350451, intron 1 of 14) intron (NM_001350451, intron 1 of 14) -17600 NM_001082575 146713 Hs.135229 NM_001025448 ENSG00000167281 RBFOX3 FOX-3|FOX3|HRNBP3|NEUN RNA binding fox-1 homolog 3 protein-coding 152.333-14 chr1 78641468 78641821 + 0.666667 NA intron (NM_006820, intron 8 of 8) intron (NM_006820, intron 8 of 8) -8145 NR_135641 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 134.333-109 chr22 28162263 28162539 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 6 of 22) intron (NM_001145418, intron 6 of 22) -241789 NR_036169 100423034 NR_036169 ENSG00000264073 MIR3199-1 mir-3199-1 microRNA 3199-1 ncRNA 221.667-56 chr4 6519168 6519639 + 0.666667 NA intron (NM_001206994, intron 2 of 9) L2|LINE|L2 36212 NM_001206995 5522 Hs.479069 NM_020416 ENSG00000074211 PPP2R2C B55-GAMMA|B55gamma|IMYPNO|IMYPNO1|PR52|PR55G protein phosphatase 2 regulatory subunit Bgamma protein-coding 197.333-168 chr4 73218515 73219036 + 0.666667 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) intron (NM_032217, intron 1 of 33) 4282 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 269.333-9 chr11 27568972 27569528 + 0.666667 NA intron (NR_033315, intron 2 of 6) intron (NR_033315, intron 2 of 6) -54203 NR_107054 102465881 NR_107054 ENSG00000278483 MIR8087 hsa-mir-8087 microRNA 8087 ncRNA 115-19 chr1 203007912 203008211 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_036557) promoter-TSS (NR_036557) 430 NM_001349859 92703 Hs.497443 NM_138391 ENSG00000163444 TMEM183A C1orf37 transmembrane protein 183A protein-coding 120.667-178 chr9 103964314 103964629 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35238 NR_109803 101928523 NR_109803 ENSG00000285483 LOC101928523 - uncharacterized LOC101928523 ncRNA 212.333-29 chr12 15600483 15601019 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 54140 NM_030670 5800 Hs.160871 NM_002848 ENSG00000151490 PTPRO GLEPP1|NPHS6|PTP-OC|PTP-U2|PTPROT|PTPU2|R-PTP-O protein tyrosine phosphatase receptor type O protein-coding 185.667-14 chr10 99980280 99980753 + 0.666667 NA intron (NM_015221, intron 1 of 16) L1MB3|LINE|L1 29431 NM_015221 23268 Hs.500771 NM_015221 ENSG00000107554 DNMBP ARHGEF36|CTRCT48|TUBA dynamin binding protein protein-coding 166-108 chr7 15953802 15954202 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -256484 NR_038946 100506025 Hs.649029 NR_038946 ENSG00000229688 CRPPA-AS1 ISPD-AS1 CRPPA antisense RNA 1 ncRNA 214-121 chr6 168641410 168641884 + 0.666667 NA intron (NM_001166412, intron 9 of 12) intron (NM_001166412, intron 9 of 12) 200463 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 140.667-232 chr8 117982929 117983304 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) -62203 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 118.333-150 chr4 57849442 57849726 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E3-int|LTR|ERVL-MaLR 423712 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 176 chr1 12716635 12717120 + 0.666667 NA intron (NR_111984, intron 1 of 2) intron (NR_111984, intron 1 of 2) 762 NR_111984 126767 Hs.464705 NM_001103169 ENSG00000188984 AADACL3 - arylacetamide deacetylase like 3 protein-coding 145.667-43 chr10 124882718 124883074 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -59227 NM_017580 54764 Hs.595158 NM_017580 ENSG00000019995 ZRANB1 TRABID zinc finger RANBP2-type containing 1 protein-coding 132.667-98 chr20 54425374 54425750 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -50031 NM_018431 55816 Hs.473133 NM_018431 ENSG00000101134 DOK5 C20orf180|IRS-6|IRS6 docking protein 5 protein-coding 113-130 chr22 41921193 41921389 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 2006 NR_039760 100616259 NR_039760 ENSG00000283829 MIR378I - microRNA 378i ncRNA 138-49 chr17 81573590 81573952 + 0.666667 NA intron (NM_001369698, intron 12 of 16) intron (NM_001369698, intron 12 of 16) 3662 NR_130139 55666 Hs.464333 NM_017921 ENSG00000182446 NPLOC4 NPL4 NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor protein-coding 113.333-261 chr8 125730200 125730478 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 220858 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 124-61 chr2 66465363 66465578 + 0.666667 NA intron (NM_002398, intron 7 of 12) MER131|DNA?|DNA? -25140 NR_046625 100873998 Hs.734698 NR_046625 ENSG00000230749 MEIS1-AS2 MEIS1-AS1 MEIS1 antisense RNA 2 ncRNA 122.333-176 chr5 131522306 131522602 + 0.666667 NA intron (NM_016340, intron 6 of 27) intron (NM_016340, intron 6 of 27) 112775 NM_001164387 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 215.667-95 chr4 166211008 166211488 + 0.666667 NA Intergenic THE1A-int|LTR|ERVL-MaLR 338011 NM_012464 7092 Hs.106513 NM_012464 ENSG00000038295 TLL1 ASD6|TLL tolloid like 1 protein-coding 148.667-50 chr10 73128101 73128393 + 0.666667 NA intron (NM_001283015, intron 7 of 7) L1MA10|LINE|L1 -2040 NR_145776 109617000 NR_145776 ENSG00000221164 SNORA11F - small nucleolar RNA, H/ACA box 11F snoRNA 119.667-112 chr3 45574565 45574765 + 0.666667 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -20086 NM_014240 8994 Hs.193370 NM_014240 ENSG00000144791 LIMD1 - LIM domains containing 1 protein-coding 163.333-47 chr11 10247075 10247456 + 0.666667 NA intron (NM_030962, intron 1 of 39) L1M5|LINE|L1 46942 NM_030962 81846 Hs.577252 NM_030962 ENSG00000133812 SBF2 CMT4B2|DENND7B|MTMR13 SET binding factor 2 protein-coding 161-28 chr15 64825732 64826144 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001286497) promoter-TSS (NM_001286497) -291 NM_001286499 80119 Hs.112160 NM_025049 ENSG00000140451 PIF1 C15orf20|PIF PIF1 5'-to-3' DNA helicase protein-coding 120.333-71 chr16 62217484 62217763 + 0.666667 NA Intergenic LTR7B|LTR|ERV1 -181185 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 163-94 chr9 136673490 136673880 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001012727, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001012727, exon 5 of 5) 3083 NR_029695 406913 NR_029695 ENSG00000199161 MIR126 MIRN126|miRNA126|mir-126 microRNA 126 ncRNA 169-66 chr3 114512101 114512598 + 0.666667 NA intron (NR_121662, intron 3 of 6) intron (NR_121662, intron 3 of 6) 58756 NR_121661 101929754 Hs.614195 NR_121661 ENSG00000242290 ZBTB20-AS5 - ZBTB20 antisense RNA 5 ncRNA 159-56 chr2 57292121 57292443 + 0.666667 NA Intergenic MER6A|DNA|TcMar-Tigger -615369 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 201-86 chr4 139230773 139231174 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5A|LINE|L1 49252 NM_032623 84709 Hs.710036 NM_032623 ENSG00000137463 MGARP C4orf49|CESP-1|HUMMR|OSAP mitochondria localized glutamic acid rich protein protein-coding 139-19 chr10 119695906 119696263 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -29963 NM_001243195 22876 Hs.369755 NM_014937 ENSG00000198825 INPP5F MSTP007|MSTPO47|SAC2|hSAC2 inositol polyphosphate-5-phosphatase F protein-coding 121-137 chr8 108044970 108045269 + 0.666667 NA intron (NM_178565, intron 2 of 5) L1PA16|LINE|L1 36820 NM_001317942 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 174-92 chr7 135943270 135943653 + 0.666667 NA intron (NM_001128619, intron 3 of 3) intron (NM_001128619, intron 3 of 3) 33898 NM_001128619 767558 Hs.602015 NM_001128619 ENSG00000267697 LUZP6 MPD6|MTPNUT leucine zipper protein 6 protein-coding 138.333-191 chr7 157174022 157174310 + 0.666667 NA intron (NM_014671, intron 4 of 22) AluSz6|SINE|Alu 35240 NM_014671 9690 Hs.118351 NM_014671 ENSG00000009335 UBE3C HECTH2 ubiquitin protein ligase E3C protein-coding 151.333-288 chr3 124563662 124564081 + 0.666667 NA intron (NM_001024660, intron 34 of 59) AluSx|SINE|Alu -20787 NM_007064 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 142.333-27 chr10 72837315 72837623 + 0.666667 NA intron (NM_138357, intron 2 of 7) MIRb|SINE|MIR -56270 NM_152635 170392 Hs.8366 NM_152635 ENSG00000138315 OIT3 LZP oncoprotein induced transcript 3 protein-coding 156.667-264 chr5 33470526 33470895 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29934 NR_047677 6897 Hs.481860 NM_152295 ENSG00000113407 TARS ThrRS threonyl-tRNA synthetase protein-coding 128.667-174 chr8 23480129 23480484 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22575 NM_001128930 9583 Hs.444389 NM_004901 ENSG00000197217 ENTPD4 LALP70|LAP70|LYSAL1|NTPDase-4|UDPase ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 protein-coding 128.667-62 chr15 51333577 51333871 + 0.666667 NA intron (NM_031226, intron 1 of 10) intron (NM_031226, intron 1 of 10) 4872 NM_031226 1588 Hs.260074 NM_000103 ENSG00000137869 CYP19A1 ARO|ARO1|CPV1|CYAR|CYP19|CYPXIX|P-450AROM cytochrome P450 family 19 subfamily A member 1 protein-coding 180.333-88 chr4 21034542 21034936 + 0.666667 NA intron (NM_147182, intron 2 of 8) intron (NM_147182, intron 2 of 8) -50730 NM_001363504 80333 Hs.655705 NM_025221 ENSG00000185774 KCNIP4 CALP|KCHIP4 potassium voltage-gated channel interacting protein 4 protein-coding 135.333-155 chr6 26474560 26474797 + 0.666667 NA intron (NR_038992, intron 3 of 3) intron (NR_038992, intron 3 of 3) 7831 NR_038992 285819 Hs.575357 NR_038992 LOC285819 - uncharacterized LOC285819 ncRNA 114.333-235 chr9 5123859 5124186 + 0.666667 NA intron (NM_004972, intron 23 of 24) L1PB4|LINE|L1 61617 NM_007179 11172 Hs.632648 NM_007179 ENSG00000120210 INSL6 RIF1 insulin like 6 protein-coding 204-143 chr4 19730276 19730740 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -521397 NM_004787 9353 Hs.29802 NM_004787 ENSG00000145147 SLIT2 SLIL3|Slit-2 slit guidance ligand 2 protein-coding 197.333-247 chr9 106235936 106236447 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -364737 NR_107048 102465995 NR_107048 ENSG00000277889 MIR8081 hsa-mir-8081 microRNA 8081 ncRNA 168.667-237 chrX 155241953 155242348 + 0.666667 NA Intergenic LTR87|LTR|ERVL? 22341 NM_171998 116442 Hs.632832 NM_171998 ENSG00000155961 RAB39B BGMR|MRX72|WSMN|WSN RAB39B, member RAS oncogene family protein-coding 271.333-62 chr6 104998513 104998996 + 0.666667 NA intron (NM_001004317, intron 2 of 3) intron (NM_001004317, intron 2 of 3) 41647 NM_001004317 389421 Hs.23616 NM_001004317 ENSG00000187772 LIN28B CSDD2 lin-28 homolog B protein-coding 172.667-32 chr11 28408637 28408978 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 68741 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 211.667-72 chr20 37049387 37049938 + 0.666667 NA intron (NM_002895, intron 11 of 21) intron (NM_002895, intron 11 of 21) 46335 NM_001323282 5933 Hs.207745 NM_002895 ENSG00000080839 RBL1 CP107|PRB1|p107 RB transcriptional corepressor like 1 protein-coding 150-148 chr8 124055290 124055708 + 0.666667 NA intron (NM_001039112, intron 22 of 40) intron (NM_001039112, intron 22 of 40) -14717 NR_040044 439941 Hs.683919 NM_001038706 ENSG00000181171 FER1L6-AS1 C8orf54 FER1L6 antisense RNA 1 ncRNA 183-21 chr11 81947761 81948153 + 0.666667 NA intron (NR_120571, intron 6 of 7) intron (NR_120571, intron 6 of 7) -57121 NR_036186 100422823 NR_036186 ENSG00000264110 MIR4300 - microRNA 4300 ncRNA 112.333-166 chr3 117802486 117802708 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111672 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 268.333-24 chr16 69251524 69252016 + 0.666667 NA intron (NM_006750, intron 2 of 6) AluSp|SINE|Alu -59580 NM_013245 27183 Hs.128420 NM_013245 ENSG00000132612 VPS4A SKD1|SKD1A|SKD2|VPS4|VPS4-1 vacuolar protein sorting 4 homolog A protein-coding 175.667-140 chr8 31835672 31836163 + 0.666667 NA intron (NM_013962, intron 1 of 4) MER3|DNA|hAT-Charlie -189819 NR_104158 100856811 Hs.97362 NR_104156 NRG1-IT1 - NRG1 intronic transcript 1 ncRNA 123.333-157 chr4 41473374 41473615 + 0.666667 NA intron (NM_001289122, intron 1 of 25) intron (NM_001289122, intron 1 of 25) -64663 NM_001330672 22998 Hs.335163 NM_014988 ENSG00000064042 LIMCH1 LIMCH1A|LMO7B LIM and calponin homology domains 1 protein-coding 119.667-106 chr22 32693092 32693409 + 0.666667 NA intron (NM_003490, intron 6 of 13) MER44B|DNA|TcMar-Tigger -107566 NM_000362 7078 Hs.644633 NM_000362 ENSG00000100234 TIMP3 HSMRK222|K222|K222TA2|SFD TIMP metallopeptidase inhibitor 3 protein-coding 111.667-242 chr7 88700427 88700730 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR -59122 NM_181646 219578 Hs.684410 NM_181646 ENSG00000182348 ZNF804B - zinc finger protein 804B protein-coding 204.667-140 chr7 48415296 48415655 + 0.666667 NA intron (NM_152701, intron 41 of 61) intron (NM_152701, intron 41 of 61) 244017 NM_152701 154664 Hs.226568 NM_152701 ENSG00000179869 ABCA13 - ATP binding cassette subfamily A member 13 protein-coding 192.333-103 chr20 31945838 31946408 + 0.666667 NA intron (NM_030815, intron 4 of 4) intron (NM_030815, intron 4 of 4) 5923 NM_030815 81572 Hs.435755 NM_030815 ENSG00000088356 PDRG1 C20orf126|PDRG p53 and DNA damage regulated 1 protein-coding 163.333-112 chr16 63317285 63317735 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -1281072 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 133.667-160 chr9 12137131 12137429 + 0.666667 NA Intergenic MER4D1|LTR|ERV1 -556105 NM_000550 7306 Hs.270279 NM_000550 ENSG00000107165 TYRP1 CAS2|CATB|GP75|OCA3|TRP|TRP1|TYRP|b-PROTEIN tyrosinase related protein 1 protein-coding 159-119 chr8 104259805 104260120 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 36627 NM_001282882 9699 Hs.655271 NM_014677 ENSG00000176406 RIMS2 OBOE|RAB3IP3|RIM2 regulating synaptic membrane exocytosis 2 protein-coding 198.667-54 chr12 129450158 129450599 + 0.666667 NA intron (NM_133448, intron 3 of 8) L1PREC2|LINE|L1 241777 NR_110058 101927735 Hs.569212 NR_110058 ENSG00000256699 TMEM132D-AS2 - TMEM132D antisense RNA 2 ncRNA 168-112 chr8 69916445 69916786 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -81637 NM_030958 81796 Hs.152460 NM_030958 ENSG00000137571 SLCO5A1 OATP-J|OATP-RP4|OATP5A1|OATPJ|OATPRP4|SLC21A15 solute carrier organic anion transporter family member 5A1 protein-coding 206.333-24 chr11 35253299 35253711 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004171, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_004171, exon 11 of 11) 90555 NR_145794 109623487 NR_145794 SNORD164 - small nucleolar RNA, C/D box 164 snoRNA 152.333-29 chr1 198167850 198168180 + 0.666667 NA intron (NM_133494, intron 1 of 9) intron (NM_133494, intron 1 of 9) 11017 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 141-34 chr16 75780956 75781238 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 -54607 NM_001355613 105371346 NM_001355613 ENSG00000283755 CPHXL - cytoplasmic polyadenylated homeobox like protein-coding 121-98 chr3 110681216 110681544 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 388579 NR_045114 100506555 Hs.535689 NR_045114 NECTIN3-AS1 PVRL3-AS1 NECTIN3 antisense RNA 1 ncRNA 200.667-50 chr15 81468696 81469134 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -94702 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 144.667-132 chr2 30128094 30128496 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -18712 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 187-52 chr3 109329567 109330046 + 0.666667 NA intron (NM_001348928, intron 5 of 6) MIR|SINE|MIR 7711 NM_001348928 55211 Hs.317659 NM_018189 ENSG00000121570 DPPA4 2410091M23Rik developmental pluripotency associated 4 protein-coding 129-92 chr4 88385053 88385366 + 0.666667 NA intron (NM_001165136, intron 2 of 21) intron (NM_001165136, intron 2 of 21) 6470 NM_017912 55008 Hs.529317 NM_017912 ENSG00000138642 HERC6 - HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6 protein-coding 176.333-130 chr5 24798034 24798434 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 42349 NR_037896 340107 Hs.145181 NR_037896 ENSG00000248908 LINC02239 - long intergenic non-protein coding RNA 2239 ncRNA 172.667-74 chr2 11057977 11058347 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL 74014 NR_040080 285150 Hs.329841 NM_182586 ENSG00000145063 FLJ33534 - uncharacterized LOC285150 ncRNA 186-89 chr6 35559244 35559612 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -46532 NM_003322 7287 Hs.485208 NM_003322 ENSG00000112041 TULP1 LCA15|RP14|TUBL1 TUB like protein 1 protein-coding 130.667-126 chr2 223387680 223387984 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 214529 NM_003469 7857 Hs.516726 NM_003469 ENSG00000171951 SCG2 CHGC|EM66|SN|SgII secretogranin II protein-coding 218.333-62 chr2 33416648 33417160 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1612 NR_039628 100616136 NR_039628 ENSG00000283591 MIR4430 - microRNA 4430 ncRNA 116.333-44 chr11 83098559 83098776 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 26601 NR_038903 100506233 Hs.503429 NR_038903 ENSG00000246067 RAB30-DT RAB30-AS1 RAB30 divergent transcript ncRNA 211.667-111 chr8 107304475 107304949 + 0.666667 NA intron (NM_001199859, intron 4 of 8) intron (NM_001199859, intron 4 of 8) 31803 NM_001314051 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 172.333-4 chr1 88882000 88882480 + 0.666667 NA intron (NM_001514, intron 2 of 6) AluSz6|SINE|Alu 9327 NM_001514 2959 Hs.481852 NM_001514 ENSG00000137947 GTF2B TF2B|TFIIB general transcription factor IIB protein-coding 168-116 chr8 117832814 117833244 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 3 of 10) intron (NM_000127, intron 3 of 10) 87884 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 145-6 chr1 170361302 170361584 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -77235 NR_026957 284688 Hs.135668 NR_026957 ENSG00000224286 LINC01142 - long intergenic non-protein coding RNA 1142 ncRNA 193.333-29 chr10 112440439 112440803 + 0.666667 NA exon (NM_001303134, exon 5 of 11) exon (NM_001303134, exon 5 of 11) 6293 NM_022494 64429 Hs.196990 NM_022494 ENSG00000023041 ZDHHC6 DHHC-6|ZNF376 zinc finger DHHC-type containing 6 protein-coding 166.333-86 chr16 13842266 13842682 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -77683 NM_005236 2072 Hs.567265 NM_005236 ENSG00000175595 ERCC4 ERCC11|FANCQ|RAD1|XFEPS|XPF ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunit protein-coding 119-19 chr10 75662106 75662401 + 0.666667 NA intron (NR_131178, intron 1 of 7) intron (NR_131178, intron 1 of 7) 14744 NR_131178 83938 Hs.118161 NM_032024 ENSG00000148655 LRMDA C10orf11|CDA017 leucine rich melanocyte differentiation associated protein-coding 162.333-184 chr4 71897263 71897703 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 -91963 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 118.333-213 chr8 137716157 137716450 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -302715 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 188.667-35 chr12 60246839 60247274 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 557686 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 119.333-208 chr8 59742724 59742990 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 538543 NM_001321838 767 Hs.654388 NM_004056 ENSG00000178538 CA8 CA-RP|CA-VIII|CALS|CAMRQ3|CARP carbonic anhydrase 8 protein-coding 119.667-64 chr16 61858328 61858615 + 0.666667 NA intron (NM_001796, intron 3 of 11) intron (NM_001796, intron 3 of 11) 177967 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 146.333-83 chr14 31823975 31824260 + 0.666667 NA intron (NM_001201573, intron 5 of 8) MIRb|SINE|MIR 109548 NM_001201574 80224 Hs.288981 NM_025152 ENSG00000151413 NUBPL C14orf127|IND1|MC1DN21|huInd1 nucleotide binding protein like protein-coding 147-132 chr7 81577301 81577598 + 0.666667 NA non-coding (NR_126026, exon 9 of 9) non-coding (NR_126026, exon 9 of 9) -15630 NR_136264 105369146 Hs.730390 NR_136264 LOC105369146 - uncharacterized LOC105369146 ncRNA 122.333-175 chr5 118164920 118165159 + 0.666667 NA intron (NR_104997, intron 2 of 2) intron (NR_104997, intron 2 of 2) -117535 NR_104609 100505811 Hs.369776 NR_104609 ENSG00000250427 LINC02148 HNCAT21 long intergenic non-protein coding RNA 2148 ncRNA 156.667-210 chr20 55956613 55956865 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 48780 NM_080617 140689 Hs.126141 NM_080617 ENSG00000054803 CBLN4 CBLNL1 cerebellin 4 precursor protein-coding 134-6 chr1 150830710 150831080 + 0.666667 NA intron (NM_001286036, intron 10 of 21) intron (NM_001286036, intron 10 of 21) -22635 NM_000396 1513 Hs.632466 NM_000396 ENSG00000143387 CTSK CTS02|CTSO|CTSO1|CTSO2|PKND|PYCD cathepsin K protein-coding 162-55 chr17 68488255 68488566 + 0.666667 NA intron (NM_001278433, intron 1 of 10) MLT1I|LTR|ERVL-MaLR -23370 NM_212471 5573 Hs.280342 NM_002734 ENSG00000108946 PRKAR1A ACRDYS1|ADOHR|CAR|CNC|CNC1|PKR1|PPNAD1|PRKAR1|TSE1 protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha protein-coding 161.667-174 chr3 116275320 116275601 + 0.666667 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) intron (NM_001318915, intron 1 of 8) -84564 NR_109998 101926903 Hs.26479 NR_109998 ENSG00000240922 LSAMP-AS1 - LSAMP antisense RNA 1 ncRNA 134-67 chr3 78257410 78257657 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -208570 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 184.667-53 chr2 44958961 44959309 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17257 NR_103786 100506108 Hs.503113 NR_103785 ENSG00000236502 SIX3-AS1 SIX3OS SIX3 antisense RNA 1 ncRNA 136-44 chr17 54757898 54758207 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -142639 NM_001321174 10040 Hs.153504 NM_005486 ENSG00000141198 TOM1L1 SRCASM target of myb1 like 1 membrane trafficking protein protein-coding 152-121 chr5 5126473 5126829 + 0.666667 NA Intergenic LTR53|LTR|ERVL 13403 NR_109915 101929176 Hs.208717 NR_109915 CTD-2297D10.2 - uncharacterized LOC101929176 ncRNA 135.667-160 chr6 134838051 134838336 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 111908 NM_022568 64577 Hs.486520 NM_022568 ENSG00000118514 ALDH8A1 ALDH12|DJ352A20.2 aldehyde dehydrogenase 8 family member A1 protein-coding 127-98 chr8 111578045 111578331 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 201549 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 216.667-87 chr5 131646879 131647273 + 0.666667 NA intron (NM_133372, intron 17 of 17) intron (NM_133372, intron 17 of 17) -11847 NM_001164390 51735 Hs.483329 NM_016340 ENSG00000158987 RAPGEF6 KIA001LB|PDZ-GEF2|PDZGEF2|RA-GEF-2|RAGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 6 protein-coding 172.667-83 chr2 70564962 70565458 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -11384 NM_001099691 7039 Hs.170009 NM_003236 ENSG00000163235 TGFA TFGA transforming growth factor alpha protein-coding 130.333-45 chr11 46180113 46180371 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 8287 NR_120565 101928894 Hs.552679 NR_120565 ENSG00000255314 LOC101928894 - uncharacterized LOC101928894 ncRNA 120.667-146 chr5 155704151 155704449 + 0.666667 NA Intergenic MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -622457 NM_000337 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 120.333-17 chr1 197641001 197641250 + 0.666667 NA intron (NR_125340, intron 9 of 19) L2a|LINE|L2 134355 NM_001300858 163486 Hs.125056 NM_019049 ENSG00000213047 DENND1B C1ORF18|C1orf218|FAM31B DENN domain containing 1B protein-coding 145-94 chr5 60614355 60614774 + 0.666667 NA intron (NM_001145208, intron 7 of 9) intron (NM_001145208, intron 7 of 9) 85602 NM_018369 55789 Hs.482233 NM_018369 ENSG00000035499 DEPDC1B BRCC3|XTP1 DEP domain containing 1B protein-coding 142.667-128 chr21 23400706 23401005 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu -16020 NR_040254 266917 Hs.145622 NR_040254 ENSG00000228592 D21S2088E - D21S2088E ncRNA 130.333-32 chr10 67369544 67369777 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 5 of 17) L1ME4b|LINE|L1 33750 NR_106973 102466814 NR_106973 ENSG00000276866 MIR7151 hsa-mir-7151 microRNA 7151 ncRNA 193.333-172 chr7 87712814 87713224 + 0.666667 NA intron (NM_138290, intron 5 of 11) intron (NM_138290, intron 5 of 11) 304 NM_000927 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 233.333-60 chr2 64333767 64334331 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -6710 NR_039632 100616265 NR_039632 ENSG00000283222 MIR4433A MIR4433|hsa-mir-4433a microRNA 4433a ncRNA 122-114 chr7 106828190 106828432 + 0.666667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 -36971 NM_001282426 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 122.333-90 chr2 51911149 51911352 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 7 of 10) intron (NR_135237, intron 7 of 10) -459398 NR_135239 105374596 NR_135239 ENSG00000225444 LINC01867 - long intergenic non-protein coding RNA 1867 ncRNA 114.667-150 chr20 4005970 4006277 + 0.666667 NA intron (NM_001134338, intron 1 of 6) AluSx|SINE|Alu 9435 NM_001134338 11237 Hs.547576 NM_007219 ENSG00000101236 RNF24 G1L ring finger protein 24 protein-coding 114.333-109 chr2 110893650 110893981 + 0.666667 NA intron (NM_001371254, intron 10 of 18) intron (NM_001371254, intron 10 of 18) 161242 NM_001371254 155.333-303 chr5 101336729 101337036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -433600 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 133-25 chr14 43333616 43333902 + 0.666667 NA Intergenic LTR87|LTR|ERVL? 1173524 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 327.667-27 chr8 30056446 30057082 + 0.666667 NA Intergenic LTR16D2|LTR|ERVL 26300 NM_016127 51669 Hs.521487 NM_016127 ENSG00000133872 SARAF FOAP-7|HSPC035|TMEM66|XTP3 store-operated calcium entry associated regulatory factor protein-coding 146-37 chr15 68439566 68439858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7549 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 213.667-86 chr7 38787153 38787659 + 0.666667 NA intron (NM_014396, intron 10 of 28) intron (NM_014396, intron 10 of 28) -100317 NR_028347 340286 Hs.144075 NM_001105282 ENSG00000164556 FAM183BP FAM183B|THEG6 acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) pseudo 124.667-221 chrX 155064926 155065184 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001018025, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001018025, exon 5 of 5) 6081 NM_001018025 4515 Hs.6917 NM_014221 ENSG00000214827 MTCP1 P13MTCP1|p8MTCP1 mature T cell proliferation 1 protein-coding 136-100 chr8 51528737 51529048 + 0.666667 NA intron (NM_144651, intron 4 of 22) MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR 280553 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 202-177 chr7 109551998 109552491 + 0.666667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 407969 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 150.333-429 chr9 2244933 2245338 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 86679 NM_001289400 6595 Hs.298990 NM_003070 ENSG00000080503 SMARCA2 BAF190|BRM|NCBRS|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 protein-coding 161.667-141 chr2 160131761 160132100 + 0.666667 NA intron (NM_001282390, intron 9 of 13) intron (NM_001282390, intron 9 of 13) 68342 NM_000888 3694 Hs.470399 NM_000888 ENSG00000115221 ITGB6 AI1H integrin subunit beta 6 protein-coding 121.667-192 chr7 65299369 65299642 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74294 NM_001287532 168374 Hs.9521 NM_007139 ENSG00000146757 ZNF92 HEL-203|HPF12|HTF12|TF12 zinc finger protein 92 protein-coding 190.333-85 chr21 18090291 18090712 + 0.666667 NA intron (NM_001204178, intron 2 of 5) HAL1ME|LINE|L1 -154332 NM_024944 140578 Hs.283725 NM_024944 ENSG00000154645 CHODL C21orf68|MT75|PRED12 chondrolectin protein-coding 193.667-120 chr6 153669957 153670379 + 0.666667 NA Intergenic PRIMA4_LTR|LTR|ERV1 -340328 NM_001145279 4988 Hs.2353 NM_000914 ENSG00000112038 OPRM1 LMOR|M-OR-1|MOP|MOR|MOR1|OPRM opioid receptor mu 1 protein-coding 208-163 chr8 47845801 47846410 + 0.666667 NA intron (NM_001081640, intron 54 of 84) L1PA16|LINE|L1 -107941 NM_005195 1052 Hs.440829 NM_005195 ENSG00000221869 CEBPD C/EBP-delta|CELF|CRP3|NF-IL6-beta CCAAT enhancer binding protein delta protein-coding 124.667-139 chr3 122086865 122087220 + 0.666667 NA intron (NM_006889, intron 1 of 6) MIR|SINE|MIR 9193 NM_176892 942 Hs.171182 NM_006889 ENSG00000114013 CD86 B7-2|B7.2|B70|CD28LG2|LAB72 CD86 molecule protein-coding 230.667-61 chr4 119549197 119549692 + 0.666667 NA intron (NM_033437, intron 9 of 20) intron (NM_033437, intron 9 of 20) 78293 NM_033430 8654 Hs.647971 NM_001083 ENSG00000138735 PDE5A CGB-PDE|CN5A|PDE5 phosphodiesterase 5A protein-coding 119-126 chr6 35680714 35680975 + 0.666667 NA intron (NM_001145775, intron 2 of 11) intron (NM_001145775, intron 2 of 11) 8071 NM_001145776 2289 Hs.407190 NM_004117 ENSG00000096060 FKBP5 AIG6|FKBP51|FKBP54|P54|PPIase|Ptg-10 FKBP prolyl isomerase 5 protein-coding 147.333-149 chr18 9346490 9346784 + 0.666667 NA intron (NM_020648, intron 2 of 4) AluJr4|SINE|Alu 11864 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 284.333-45 chr9 96225724 96226292 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G3|LTR|ERVL-MaLR -20455 NR_146524 105376162 Hs.662614 NR_146524 ENSG00000232283 HSD17B3-AS1 - HSD17B3 antisense RNA 1 ncRNA 152-35 chr11 99378692 99379054 + 0.666667 NA intron (NM_001243271, intron 2 of 20) L1ME5|LINE|L1 -177272 NM_175566 53942 Hs.656783 NM_014361 ENSG00000149972 CNTN5 HNB-2s|NB-2 contactin 5 protein-coding 153-86 chr22 25551115 25551546 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR -13345 NM_005160 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 174-112 chrX 154069149 154069592 + 0.666667 NA intron (NM_001316337, intron 2 of 4) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 27599 NM_001369394 4204 Hs.200716 NM_004992 ENSG00000169057 MECP2 AUTSX3|MRX16|MRX79|MRXS13|MRXSL|PPMX|RS|RTS|RTT methyl-CpG binding protein 2 protein-coding 149-47 chr15 35734253 35734567 + 0.666667 NA intron (NR_038251, intron 2 of 2) intron (NR_038251, intron 2 of 2) 188215 NR_038251 100507466 Hs.536420 NR_038251 ENSG00000248079 DPH6-DT ATPBD4-AS1|DPH6-AS1 DPH6 divergent transcript ncRNA 150-22 chr11 12272588 12272888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14162 NM_032867 84953 Hs.60371 NM_032867 ENSG00000133816 MICALCL Ebitein1 MICAL C-terminal like protein-coding 164.667-230 chr7 114028907 114029215 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -57266 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 125.667-174 chr7 21224278 21224505 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -203692 NM_001326543 6671 Hs.88013 NM_003112 ENSG00000105866 SP4 HF1B|SPR-1 Sp4 transcription factor protein-coding 159-54 chr2 38685313 38685632 + 0.666667 NA intron (NM_138801, intron 3 of 6) intron (NM_138801, intron 3 of 6) 19358 NM_138801 130589 Hs.435012 NM_138801 ENSG00000143891 GALM BLOCK25|GLAT|HEL-S-63p|IBD1 galactose mutarotase protein-coding 210.667-116 chr7 11070569 11070924 + 0.666667 NA intron (NR_033436, intron 15 of 16) intron (NR_033436, intron 15 of 16) 96874 NR_033435 9678 Hs.655688 NM_014660 ENSG00000106443 PHF14 - PHD finger protein 14 protein-coding 155-125 chr8 62305458 62305771 + 0.666667 NA intron (NM_001304533, intron 1 of 6) intron (NM_001304533, intron 1 of 6) 56760 NR_130764 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 199.667-87 chr21 14865862 14866182 + 0.666667 NA intron (NR_146322, intron 1 of 3) intron (NR_146322, intron 1 of 3) 52646 NR_146322 107987295 NR_146322 LINC02246 - long intergenic non-protein coding RNA 2246 ncRNA 164.333-131 chr2 199130772 199131114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 326996 NR_134967 23314 Hs.516617 NM_015265 ENSG00000119042 SATB2 GLSS SATB homeobox 2 protein-coding 138.667-60 chr14 57929250 57929573 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63319 NM_001306087 341880 Hs.28280 NM_001080455 ENSG00000151812 SLC35F4 C14orf36|c14_5373 solute carrier family 35 member F4 protein-coding 143-42 chr14 67921705 67921975 + 0.666667 NA intron (NM_133509, intron 7 of 10) MER6A|DNA|TcMar-Tigger 98248 NM_001321815 5890 Hs.172587 NM_002877 ENSG00000182185 RAD51B R51H2|RAD51L1|REC2 RAD51 paralog B protein-coding 124.667-113 chr2 167312015 167312273 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 124772 NM_001199144 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 123.333-58 chr12 50436759 50437120 + 0.666667 NA intron (NM_001330415, intron 5 of 15) intron (NM_001330415, intron 5 of 15) -19632 NR_132753 106633800 NR_132753 SNORD133 ZL142|ZL42|ggn68 small nucleolar RNA, C/D box 133 snoRNA 204.333-29 chr10 98245866 98246237 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 22143 NM_032211 84171 Hs.306814 NM_032211 ENSG00000138131 LOXL4 LOXC lysyl oxidase like 4 protein-coding 111.667-227 chr6 134523720 134523931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 16180 NR_125855 101928304 Hs.555076 NR_125855 LOC101928304 - uncharacterized LOC101928304 ncRNA 155.667-372 chr8 127486967 127487333 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -5011 NR_117100 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 124.667-89 chr18 8133265 8133597 + 0.666667 NA intron (NM_002845, intron 13 of 30) L2c|LINE|L2 233603 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 112-50 chr13 43745789 43746017 + 0.666667 NA intron (NM_001347969, intron 1 of 16) THE1C|LTR|ERVL-MaLR 41069 NM_001347970 55068 Hs.128258 NM_017993 ENSG00000120658 ENOX1 CNOX|PIG38|bA64J21.1|cCNOX ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 protein-coding 128.333-87 chr18 73231456 73231754 + 0.666667 NA intron (NR_034133, intron 2 of 5) intron (NR_034133, intron 2 of 5) 32893 NR_034133 400655 Hs.579378 NR_034133 ENSG00000263711 LOC400655 - uncharacterized LOC400655 ncRNA 150-140 chr8 39944818 39945253 + 0.666667 NA intron (NM_194294, intron 1 of 10) MIR3|SINE|MIR 10080 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 114.333-124 chr2 219242251 219242446 + 0.666667 NA intron (NM_024506, intron 5 of 16) L2b|LINE|L2 1283 NM_001286427 79411 Hs.181173 NM_024506 ENSG00000163521 GLB1L - galactosidase beta 1 like protein-coding 158-90 chr3 161113056 161113423 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -7867 NM_001349149 8706 Hs.418062 NM_003781 ENSG00000169255 B3GALNT1 B3GALT3|GLCT3|GLOB|Gb4Cer|P|P1|beta3Gal-T3|galT3 beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (globoside blood group) protein-coding 138.333-72 chr15 87963902 87964162 + 0.666667 NA intron (NM_001320135, intron 12 of 15) L1ME4b|LINE|L1 -17764 NR_162119 113218493 NR_162119 MIR11181 - microRNA 11181 ncRNA 188-68 chr21 36837277 36837792 + 0.666667 NA intron (NM_001352515, intron 6 of 10) intron (NM_001352515, intron 6 of 10) 124824 NM_001352518 3141 Hs.371350 NM_000411 ENSG00000159267 HLCS HCS holocarboxylase synthetase protein-coding 121.667-52 chr13 105727410 105727736 + 0.666667 NA intron (NR_046391, intron 3 of 3) intron (NR_046391, intron 3 of 3) 20743 NR_046391 144920 Hs.567700 NR_046391 LINC00343 LINC00344|NCRNA00343|NCRNA00344 long intergenic non-protein coding RNA 343 ncRNA 162.333-219 chr6 74547540 74547957 + 0.666667 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) L1PA2|LINE|L1 478297 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 116.333-203 chr8 70395887 70396085 + 0.666667 NA intron (NM_001321703, intron 1 of 22) intron (NM_001321703, intron 1 of 22) 7404 NM_001321713 10499 Hs.446678 NM_006540 ENSG00000140396 NCOA2 GRIP1|KAT13C|NCoA-2|SRC2|TIF2|bHLHe75 nuclear receptor coactivator 2 protein-coding 118.667-51 chr12 13374605 13374837 + 0.666667 NA intron (NR_036555, intron 2 of 2) intron (NR_036555, intron 2 of 2) 2024 NR_036555 283422 Hs.448717 NM_182558 ENSG00000180861 LINC01559 C12orf36 long intergenic non-protein coding RNA 1559 ncRNA 137-87 chr5 115433167 115433517 + 0.666667 NA Intergenic MamTip1|DNA|hAT-Tip100 111433 NM_020177 56929 Hs.47367 NM_020177 ENSG00000145780 FEM1C EUROIMAGE686608|EUROIMAGE783647|FEM1A fem-1 homolog C protein-coding 113-165 chr5 37246363 37246572 + 0.666667 NA intron (NM_023073, intron 2 of 51) 7SLRNA|srpRNA|srpRNA -2579 NR_134263 105374727 Hs.170993 NR_134263 ENSG00000286193 LOC105374727 - uncharacterized LOC105374727 ncRNA 153.667-298 chr4 98039454 98039763 + 0.666667 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) L1PB4|LINE|L1 103868 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 203-51 chr2 50187335 50187842 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 18 of 22) L1PA7|LINE|L1 160166 NM_001330092 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 113.333-200 chr4 152407993 152408234 + 0.666667 NA intron (NM_033632, intron 2 of 11) intron (NM_033632, intron 2 of 11) -25584 NM_001013415 55294 Hs.561245 NM_018315 ENSG00000109670 FBXW7 AGO|CDC4|FBW6|FBW7|FBX30|FBXO30|FBXW6|SEL-10|SEL10|hAgo|hCdc4 F-box and WD repeat domain containing 7 protein-coding 148.667-313 chr5 81382818 81383213 + 0.666667 NA intron (NM_130767, intron 2 of 14) L1MC5|LINE|L1 11119 NM_130767 134526 Hs.591756 NM_130767 ENSG00000172497 ACOT12 CACH-1|Cach|STARD15|THEAL acyl-CoA thioesterase 12 protein-coding 148.667-102 chr13 63614980 63615325 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -122283 NR_002171 283491 Hs.363054 NR_002171 OR7E156P - olfactory receptor family 7 subfamily E member 156 pseudogene pseudo 132.667-110 chr3 100138872 100139251 + 0.666667 NA intron (NM_001167924, intron 1 of 9) L1PA8A|LINE|L1 24131 NM_001167924 84319 Hs.581320 NM_032359 ENSG00000184220 CMSS1 C3orf26 cms1 ribosomal small subunit homolog protein-coding 157.667-129 chr18 62870275 62870676 + 0.666667 NA intron (NM_194449, intron 4 of 16) intron (NM_194449, intron 4 of 16) 154934 NM_194449 23239 Hs.465337 NM_194449 ENSG00000081913 PHLPP1 PHLPP|PLEKHE1|PPM3A|SCOP PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 protein-coding 128.333-178 chr6 126180490 126180800 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -159144 NM_001286525 387103 Hs.486401 NM_001012507 ENSG00000203760 CENPW C6orf173|CENP-W|CUG2 centromere protein W protein-coding 158-80 chr20 44872635 44873026 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12875 NM_003404 7529 Hs.643544 NM_003404 ENSG00000166913 YWHAB GW128|HEL-S-1|HS1|KCIP-1|YWHAA tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta protein-coding 156.667-245 chr4 73941776 73942173 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40053 NM_002619 5196 Hs.81564 NM_002619 ENSG00000163737 PF4 CXCL4|PF-4|SCYB4 platelet factor 4 protein-coding 119-34 chr12 19450068 19450335 + 0.666667 NA intron (NM_001267043, intron 1 of 8) intron (NM_001267043, intron 1 of 8) 9602 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 183-33 chr13 97690235 97690633 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 256265 NM_021033 5911 Hs.508480 NM_021033 ENSG00000125249 RAP2A K-REV|KREV|RAP2|RbBP-30 RAP2A, member of RAS oncogene family protein-coding 197.333-222 chr7 141424433 141424903 + 0.666667 NA intron (NM_001195278, intron 2 of 3) L1ME4a|LINE|L1 -126742 NM_001364948 55750 Hs.685880 NM_018238 ENSG00000006530 AGK CATC5|CTRCT38|MTDPS10|MULK acylglycerol kinase protein-coding 224.667-2 chr1 178082306 178082909 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 11386 NR_027982 100302401 Hs.736117 NR_027982 ENSG00000224687 RASAL2-AS1 - RASAL2 antisense RNA 1 ncRNA 119.667-123 chr3 149429878 149430200 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 -44658 NM_004617 7104 Hs.133527 NM_004617 ENSG00000169903 TM4SF4 ILTMP|il-TMP transmembrane 4 L six family member 4 protein-coding 150.333-209 chr2 133537469 133537856 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 2 of 17) intron (NM_207481, intron 2 of 17) 30801 NM_207481 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 181.333-134 chr5 28164681 28165078 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 122786 NR_134265 105374698 Hs.124461 NR_134265 ENSG00000249785 LINC02103 - long intergenic non-protein coding RNA 2103 ncRNA 144.667-312 chr8 131164634 131164934 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -123875 NM_001115 114 Hs.591859 NM_001115 ENSG00000155897 ADCY8 AC8|ADCY3|HBAC1 adenylate cyclase 8 protein-coding 115-146 chr7 83358123 83358402 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -195378 NM_014510 27445 Hs.12376 NM_014510 ENSG00000186472 PCLO ACZ|PCH3 piccolo presynaptic cytomatrix protein protein-coding 177-39 chr2 190528777 190529235 + 0.666667 NA intron (NR_136298, intron 1 of 8) L2a|LINE|L2 5716 NM_001142645 100131211 Hs.659824 NM_001142645 ENSG00000189362 NEMP2 TMEM194B nuclear envelope integral membrane protein 2 protein-coding 122.333-118 chr2 235881227 235881438 + 0.666667 NA intron (NM_001037131, intron 9 of 17) intron (NM_001037131, intron 9 of 17) 287054 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 138-124 chr8 131893083 131893434 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10835 NM_001323553 23167 Hs.204564 NM_015137 ENSG00000132294 EFR3A - EFR3 homolog A protein-coding 179.667-9 chr1 153463494 153463809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3000 NM_002963 6278 Hs.112408 NM_002963 ENSG00000143556 S100A7 PSOR1|S100A7c S100 calcium binding protein A7 protein-coding 134.667-23 chr10 69726762 69727130 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -74960 NM_001368884 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 120-35 chr13 19610544 19610852 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -22961 NM_017520 54737 Hs.269654 NM_017520 ENSG00000196199 MPHOSPH8 HSMPP8|TWA3|mpp8 M-phase phosphoprotein 8 protein-coding 274.333-49 chr3 125322578 125323209 + 0.666667 NA intron (NM_001348436, intron 3 of 8) intron (NM_001348436, intron 3 of 8) 34387 NM_001348433 7707 Hs.592591 NM_021964 ENSG00000163848 ZNF148 BERF-1|BFCOL1|GDACCF|HT-BETA|ZBP-89|ZFP148|pHZ-52 zinc finger protein 148 protein-coding 176.333-83 chr2 57672131 57672567 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -235302 NM_001288838 7444 Hs.715298 NM_006296 ENSG00000028116 VRK2 - VRK serine/threonine kinase 2 protein-coding 280.667-44 chr5 170245955 170246565 + 0.666667 NA TTS (NM_001305393) TTS (NM_001305393) 13254 NM_001305393 133874 Hs.519749 NM_001102609 ENSG00000234511 C5orf58 - chromosome 5 open reading frame 58 protein-coding 201.667-90 chr5 26369870 26370299 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 668502 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 185.667-79 chr2 230653408 230653800 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 46925 NR_040038 151475 Hs.528154 NR_040038 ENSG00000226125 LINC01907 - long intergenic non-protein coding RNA 1907 ncRNA 126-42 chr16 87266997 87267214 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 25347 NR_104667 101928682 Hs.149004 NR_104667 ENSG00000261697 LOC101928682 - uncharacterized LOC101928682 ncRNA 173.333-41 chr12 23672777 23673052 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 9 of 17) intron (NM_152989, intron 9 of 17) -88328 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 145.667-259 chr6 161746846 161747199 + 0.666667 NA intron (NM_004562, intron 7 of 11) intron (NM_004562, intron 7 of 11) 276045 NR_134593 105378098 Hs.691066 NR_134593 LOC105378098 - uncharacterized LOC105378098 ncRNA 120.333-2 chr1 59771109 59771437 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1522 NR_110627 101926944 Hs.720353 NR_110627 LOC101926944 - uncharacterized LOC101926944 ncRNA 140.333-167 chr4 98043035 98043329 + 0.666667 NA intron (NM_174952, intron 5 of 10) L1M3de|LINE|L1 100294 NM_174952 285555 Hs.680226 NM_174952 ENSG00000163116 STPG2 C4orf37 sperm tail PG-rich repeat containing 2 protein-coding 117-46 chr14 58157232 58157452 + 0.666667 NA Intergenic MER53|DNA|hAT -5129 NM_001320173 145407 Hs.26766 NM_001001872 ENSG00000139971 ARMH4 C14orf37|UT2|c14_5376 armadillo like helical domain containing 4 protein-coding 219.667-72 chr5 37699000 37699433 + 0.666667 NA intron (NM_001345998, intron 11 of 17) intron (NM_001345998, intron 11 of 17) 135606 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 203-58 chr2 201751571 201752010 + 0.666667 NA intron (NM_020919, intron 7 of 33) intron (NM_020919, intron 7 of 33) 29143 NM_001135745 57679 Hs.471096 NM_020919 ENSG00000003393 ALS2 ALS2CR6|ALSJ|IAHSP|PLSJ alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2 protein-coding 167-76 chr4 70800598 70800933 + 0.666667 NA intron (NM_001037442, intron 15 of 17) AluSx|SINE|Alu 38738 NM_001098477 2926 Hs.309763 NM_002092 ENSG00000132463 GRSF1 - G-rich RNA sequence binding factor 1 protein-coding 116.667-60 chr14 88862032 88862234 + 0.666667 NA intron (NR_159362, intron 10 of 14) L1MA4|LINE|L1 37482 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 118.667-184 chr7 134916842 134917164 + 0.666667 NA intron (NM_033139, intron 1 of 12) intron (NM_033139, intron 1 of 12) 25545 NM_033140 800 Hs.490203 NM_004342 ENSG00000122786 CALD1 CDM|H-CAD|HCAD|L-CAD|LCAD|NAG22 caldesmon 1 protein-coding 114.667-255 chr9 24517524 24517800 + 0.666667 NA Intergenic L1PB4|LINE|L1 28014 NM_001271706 100129669 Hs.573530 NM_001271706 ENSG00000205442 IZUMO3 C9orf134|bA20A20.1 IZUMO family member 3 protein-coding 175.667-118 chr5 125158689 125159151 + 0.666667 NA intron (NR_109882, intron 3 of 5) intron (NR_109882, intron 3 of 5) 122089 NR_109882 101927421 Hs.121305 NR_109882 LOC101927421 - uncharacterized LOC101927421 ncRNA 126-67 chr22 28418899 28419216 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) MER5B|DNA|hAT-Charlie -40812 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 147-42 chr14 58700342 58700618 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 61643 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 165.667-41 chr12 125765816 125766278 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 143595 NM_001286219 114795 Hs.524838 NM_052907 ENSG00000139364 TMEM132B - transmembrane protein 132B protein-coding 149.333-414 chr8 141289549 141289839 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -35065 NM_001286646 57210 Hs.372492 NM_001080431 ENSG00000022567 SLC45A4 - solute carrier family 45 member 4 protein-coding 151-70 chr20 19923656 19923961 + 0.666667 NA intron (NM_001242581, intron 2 of 11) intron (NM_001242581, intron 2 of 11) 34242 NM_018993 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 182.667-106 chr3 168454281 168454750 + 0.666667 NA intron (NR_021485, intron 3 of 15) L1M5|LINE|L1 -97339 NR_030294 693136 NR_030294 ENSG00000207717 MIR551B MIRN551B|mir-551b microRNA 551b ncRNA 147-32 chr12 89826354 89826741 + 0.666667 NA Intergenic L1M6|LINE|L1 -117181 NM_001366531 490 Hs.506276 NM_001682 ENSG00000070961 ATP2B1 PMCA1|PMCA1kb ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1 protein-coding 162.333-214 chr6 55442875 55443262 + 0.666667 NA intron (NR_109869, intron 3 of 4) MER5B|DNA|hAT-Charlie 115599 NM_207410 389400 Hs.526967 NM_207410 ENSG00000187871 GFRAL C6orf144|GRAL|UNQ9356|bA360D14.1 GDNF family receptor alpha like protein-coding 118.333-192 chr7 69651714 69651952 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 1 of 18) intron (NM_015570, intron 1 of 18) 53358 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 285-12 chr17 67729902 67730621 + 0.666667 NA intron (NM_001303272, intron 6 of 16) AluY|SINE|Alu -10409 NR_003706 100124536 Hs.693446 NR_003706 ENSG00000200394 SNORA38B - small nucleolar RNA, H/ACA box 38B snoRNA 119.333-196 chr6 147293786 147294031 + 0.666667 NA intron (NM_139244, intron 9 of 25) intron (NM_139244, intron 9 of 25) -89294 NR_034115 729178 Hs.557608 NR_034115 STXBP5-AS1 - STXBP5 antisense RNA 1 ncRNA 164-11 chr10 32964276 32964635 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -6225 NM_002211 3688 Hs.643813 NM_002211 ENSG00000150093 ITGB1 CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB integrin subunit beta 1 protein-coding 156.667-190 chr2 133778219 133778557 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -209925 NM_207363 344148 Hs.537329 NM_207363 ENSG00000176771 NCKAP5 ERIH1|ERIH2|NAP5 NCK associated protein 5 protein-coding 132.333-159 chr6 157343536 157343859 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -19438 NM_018452 729515 Hs.157212 NM_018452 ENSG00000215712 TMEM242 BM033|C6orf35 transmembrane protein 242 protein-coding 147.333-122 chr15 67154367 67154657 + 0.666667 NA intron (NM_001145103, intron 1 of 8) intron (NM_001145103, intron 1 of 8) -11643 NM_001145104 4088 Hs.727986 NM_005902 ENSG00000166949 SMAD3 HSPC193|HsT17436|JV15-2|LDS1C|LDS3|MADH3 SMAD family member 3 protein-coding 119.667-76 chr18 715472 715812 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -2978 NR_148711 55556 Hs.658550 NM_017512 ENSG00000132199 ENOSF1 FUCD|RTS|TYMSAS enolase superfamily member 1 protein-coding 130.333-210 chr8 111704733 111705018 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 328236 NR_146282 105375706 Hs.566832 NR_146282 ENSG00000253434 LINC02237 - long intergenic non-protein coding RNA 2237 ncRNA 207.333-120 chr17 72295476 72295900 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -47123 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 134.667-46 chr12 56353332 56353596 + 0.666667 NA intron (NM_198332, intron 8 of 23) intron (NM_198332, intron 8 of 23) 6643 NM_198332 6773 Hs.530595 NM_005419 ENSG00000170581 STAT2 IMD44|ISGF-3|P113|STAT113 signal transducer and activator of transcription 2 protein-coding 127.667-201 chrX 30898794 30898985 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -9635 NM_152787 257397 Hs.188256 NM_152787 ENSG00000157625 TAB3 MAP3K7IP3|NAP1 TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 3 protein-coding 135.667-202 chrX 98499422 98499681 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -935016 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 189-42 chr2 117644402 117644813 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -170084 NM_006773 8886 Hs.744922 NM_006773 ENSG00000088205 DDX18 Has1|MrDb DEAD-box helicase 18 protein-coding 193.333-61 chr15 53795971 53796424 + 0.666667 NA Intergenic L1MCa|LINE|L1 -33319 NR_102334 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 166.667-74 chr15 58191825 58192155 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53609 NM_020980 366 Hs.104624 NM_020980 ENSG00000103569 AQP9 AQP-9|HsT17287|SSC1|T17287 aquaporin 9 protein-coding 151.333-282 chr3 78021760 78022077 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27045 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 234.333-94 chr9 101686566 101687205 + 0.666667 NA exon (NM_133445, exon 2 of 9) exon (NM_133445, exon 2 of 9) 51695 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 198.333-10 chr1 99501733 99502287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14206 NR_125951 101928270 Hs.576048 NR_125951 ENSG00000224445 LINC01708 - long intergenic non-protein coding RNA 1708 ncRNA 210.667-58 chr17 64544562 64545041 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_022739, exon 19 of 19) 3' UTR (NM_022739, exon 19 of 19) 37824 NM_138363 90799 Hs.569713 NM_138363 ENSG00000258890 CEP95 CCDC45 centrosomal protein 95 protein-coding 131.667-94 chr2 68983405 68983650 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 8954 NM_019617 56287 Hs.69319 NM_019617 ENSG00000169605 GKN1 AMP18|BRICD1|CA11|FOV|foveolin gastrokine 1 protein-coding 152.333-240 chr3 101418671 101419020 + 0.666667 NA intron (NM_020654, intron 4 of 23) intron (NM_020654, intron 4 of 23) 94367 NM_020654 57337 Hs.529551 NM_020654 ENSG00000138468 SENP7 - SUMO specific peptidase 7 protein-coding 197-121 chr8 129393697 129394115 + 0.666667 NA intron (NR_130918, intron 1 of 2) MIRc|SINE|MIR 90236 NR_037457 100500839 NR_037457 ENSG00000263763 MIR3686 - microRNA 3686 ncRNA 125-107 chr7 129244205 129244507 + 0.666667 NA intron (NM_001130720, intron 1 of 16) L1ME3Cz|LINE|L1 19326 NM_015328 23382 Hs.600789 NM_015328 ENSG00000158467 AHCYL2 ADOHCYASE3|IRBIT2 adenosylhomocysteinase like 2 protein-coding 229-43 chr3 171917493 171918065 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_LTR|LTR|ERVL -17039 NR_046852 100874219 Hs.730556 NR_046852 ENSG00000234717 TMEM212-AS1 - TMEM212 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-268 chr7 67318134 67318519 + 0.666667 NA intron (NR_040586, intron 4 of 4) L1ME4b|LINE|L1 15688 NR_040586 64940 Hs.632013 NM_022906 ENSG00000106610 STAG3L4 STAG3L4P stromal antigen 3-like 4 (pseudogene) pseudo 147-11 chr10 25610874 25611190 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -40680 NR_108067 101929052 Hs.128298 NR_108067 ENSG00000280809 LINC00836 - long intergenic non-protein coding RNA 836 ncRNA 277.333-42 chr19 40357954 40358595 + 0.666667 NA intron (NM_012268, intron 1 of 12) AluSq2|SINE|Alu -1368 NM_001291311 23646 Hs.257008 NM_012268 ENSG00000105223 PLD3 AD19|HU-K4|HUK4|SCA46 phospholipase D family member 3 protein-coding 137.667-190 chr8 130079543 130079804 + 0.666667 NA intron (NM_001362925, intron 26 of 29) intron (NM_001362925, intron 26 of 29) 5095 NR_045385 100507117 Hs.106015 NR_045385 ENSG00000280543 ASAP1-IT2 - ASAP1 intronic transcript 2 ncRNA 161.667-71 chr14 32342350 32342751 + 0.666667 NA intron (NM_004274, intron 1 of 13) X6A_LINE|LINE|CR1 13252 NM_004274 9472 Hs.509083 NM_004274 ENSG00000151320 AKAP6 ADAP100|ADAP6|AKAP100|PRKA6|mAKAP A-kinase anchoring protein 6 protein-coding 145-100 chr5 156438740 156439041 + 0.666667 NA intron (NM_001128209, intron 2 of 7) MIR|SINE|MIR 111726 NM_001128209 6444 Hs.387207 NM_000337 ENSG00000170624 SGCD 35DAG|CMD1L|DAGD|LGMDR6|SG-delta|SGCDP|SGD sarcoglycan delta protein-coding 141.333-157 chr3 113354565 113354860 + 0.666667 NA intron (NM_001164496, intron 22 of 34) L1PBa|LINE|L1 -49286 NR_046728 100874029 Hs.599665 NR_046728 ENSG00000243849 CFAP44-AS1 WDR52-AS1 CFAP44 antisense RNA 1 ncRNA 129-31 chr12 110341445 110341741 + 0.666667 NA intron (NM_170665, intron 14 of 19) AluSx1|SINE|Alu 60346 NM_170665 488 Hs.506759 NM_001681 ENSG00000174437 ATP2A2 ATP2B|DAR|DD|SERCA2 ATPase sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca2+ transporting 2 protein-coding 201-13 chr1 214611970 214612411 + 0.666667 NA intron (NM_016343, intron 1 of 19) L1PREC2|LINE|L1 8995 NM_016343 1063 Hs.497741 NM_016343 ENSG00000117724 CENPF CENF|CILD31|PRO1779|STROMS|hcp-1 centromere protein F protein-coding 140-114 chr8 59406075 59406438 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 287046 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 113-52 chr13 70274959 70275218 + 0.666667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL -166595 NM_001286725 57626 Hs.508201 NM_020866 ENSG00000150361 KLHL1 MRP2 kelch like family member 1 protein-coding 146.333-237 chr4 95033480 95033772 + 0.666667 NA intron (NM_001256792, intron 1 of 10) intron (NM_001256792, intron 1 of 10) -18051 NM_001256793 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 199.667-29 chr11 95079358 95079843 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -10246 NM_015036 23052 Hs.167115 NM_015036 ENSG00000149218 ENDOD1 - endonuclease domain containing 1 protein-coding 140.667-86 chr15 68435524 68435800 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -3499 NM_001004439 22801 Hs.436416 NM_012211 ENSG00000137809 ITGA11 HsT18964 integrin subunit alpha 11 protein-coding 120-16 chr10 98376150 98376362 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 19051 NR_031619 100302133 NR_031619 ENSG00000284415 MIR1287 MIRN1287|hsa-mir-1287|mir-1287 microRNA 1287 ncRNA 164.333-181 chr4 109076139 109076570 + 0.666667 NA intron (NM_198721, intron 3 of 36) intron (NM_198721, intron 3 of 36) 226304 NM_001256074 84570 Hs.658842 NM_032518 ENSG00000188517 COL25A1 AMY|CFEOM5|CLAC|CLAC-P|CLACP collagen type XXV alpha 1 chain protein-coding 170.667-87 chr2 179433549 179433809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 128909 NM_001113398 151126 Hs.655005 NM_152520 ENSG00000144331 ZNF385B ZNF533 zinc finger protein 385B protein-coding 154.333-239 chr4 40577740 40578038 + 0.666667 NA intron (NM_001371114, intron 1 of 5) FLAM_C|SINE|Alu 51975 NM_001098634 54502 Hs.518727 NM_019027 ENSG00000163694 RBM47 NET18 RNA binding motif protein 47 protein-coding 181-53 chr3 180083120 180083521 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -46383 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 267-70 chr8 85218092 85218673 + 0.666667 NA intron (NM_001099673, intron 1 of 3) intron (NM_001099673, intron 1 of 3) 1992 NM_001099673 401466 Hs.443072 NM_001099670 ENSG00000176731 RBIS C8orf59 ribosomal biogenesis factor protein-coding 170.667-69 chr18 8459424 8459697 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -92526 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 116.667-28 chr12 3982094 3982316 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -108757 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 129-116 chr6 146667750 146667989 + 0.666667 NA intron (NM_024694, intron 7 of 35) MIRb|SINE|MIR 68897 NM_024694 79747 Hs.720870 NM_024694 ENSG00000118492 ADGB C6orf103|CAPN16 androglobin protein-coding 112-34 chr11 94029676 94029947 + 0.666667 NA intron (NM_001098672, intron 1 of 19) intron (NM_001098672, intron 1 of 19) 8457 NM_001098672 341208 Hs.669645 NM_001098672 ENSG00000181333 HEPHL1 ZP hephaestin like 1 protein-coding 235.667-28 chr17 73333657 73334104 + 0.666667 NA TTS (NM_001144952) TTS (NM_001144952) -21879 NM_012121 23580 Hs.3903 NM_012121 ENSG00000179604 CDC42EP4 BORG4|CEP4|KAIA1777 CDC42 effector protein 4 protein-coding 124.333-81 chr2 39698606 39698889 + 0.666667 NA intron (NM_152390, intron 1 of 3) L1M4|LINE|L1 32830 NM_152390 130733 Hs.40808 NM_152390 ENSG00000152154 TMEM178A TMEM178 transmembrane protein 178A protein-coding 133.667-133 chr6 115279702 115280031 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 363969 NR_134602 105377962 Hs.571066 NR_134602 LINC02534 - long intergenic non-protein coding RNA 2534 ncRNA 130.667-91 chr17 76942243 76942527 + 0.666667 NA intron (NM_144677, intron 14 of 16) AluSz|SINE|Alu 26814 NR_136416 105371899 Hs.634683 NR_136416 ENSG00000267568 LOC105371899 - uncharacterized LOC105371899 ncRNA 119.333-177 chr5 86624147 86624484 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 3809 NR_145802 109623460 NR_037402 SNORD138 MIR3607|mir-3607 small nucleolar RNA, C/D box 138 snoRNA 133-88 chr7 78276716 78276960 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 9 of 20) intron (NM_001301128, intron 9 of 20) -70404 NR_003680 399670 Hs.568045 NR_003680 ENSG00000231322 RPL13AP17 RPL13A_6_816 ribosomal protein L13a pseudogene 17 pseudo 113.667-224 chr9 34373224 34373436 + 0.666667 NA intron (NM_020702, intron 1 of 1) MIRc|SINE|MIR 3568 NM_020702 57462 Hs.522083 NM_020702 ENSG00000164976 MYORG IBGC7|KIAA1161|NET37 myogenesis regulating glycosidase (putative) protein-coding 129.667-84 chr19 31863501 31863879 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -162172 NR_110675 100996665 Hs.443685 NR_110673 ENSG00000267779 LINC01533 CTC-360P9.3 long intergenic non-protein coding RNA 1533 ncRNA 148.667-159 chr17 65795844 65796135 + 0.666667 NA intron (NM_001353129, intron 21 of 26) intron (NM_001353129, intron 21 of 26) 30462 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 144-139 chr6 47042489 47042898 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_025048) promoter-TSS (NM_025048) -361 NM_025048 266977 Hs.733762 NM_025048 ENSG00000153292 ADGRF1 GPR110|KPG_012|PGR19|hGPCR36 adhesion G protein-coupled receptor F1 protein-coding 125-100 chr6 89866947 89867258 + 0.666667 NA exon (NM_001137668, exon 8 of 10) exon (NM_001137668, exon 8 of 10) -27367 NM_032602 84694 Hs.334499 NM_032602 ENSG00000135355 GJA10 CX62 gap junction protein alpha 10 protein-coding 146.667-52 chr11 3629652 3629990 + 0.666667 NA intron (NR_002720, intron 2 of 6) L1MC4|LINE|L1 3361 NR_002720 7221 Hs.131910 NR_002720 ENSG00000182048 TRPC2 - transient receptor potential cation channel subfamily C member 2 (pseudogene) pseudo 153-41 chr13 62476686 62477070 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 153221 NR_047038 100874180 Hs.7415 NR_047038 ENSG00000229307 LINC00459 - long intergenic non-protein coding RNA 459 ncRNA 226.333-47 chr18 2511146 2511801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60032 NM_001308401 64863 Hs.126888 NM_022840 ENSG00000101574 METTL4 HsT661 methyltransferase like 4 protein-coding 120.333-192 chr8 102130394 102130645 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4|LINE|L1 5087 NR_049859 100847001 NR_049859 ENSG00000266756 MIR5680 - microRNA 5680 ncRNA 113.667-108 chr2 138591391 138591671 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 89761 NM_001001664 339745 Hs.333297 NM_001001664 ENSG00000144228 SPOPL BTBD33 speckle type BTB/POZ protein like protein-coding 172.333-111 chr3 65658434 65658926 + 0.666667 NA intron (NM_001365904, intron 1 of 24) MER5A1|DNA|hAT-Charlie -235136 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 145.667-313 chr9 97472732 97473024 + 0.666667 NA intron (NM_001302884, intron 9 of 15) L1ME4c|LINE|L1 -28302 NM_001166116 7111 Hs.404289 NM_003275 ENSG00000136842 TMOD1 D9S57E|ETMOD|TMOD tropomodulin 1 protein-coding 152.333-243 chr3 116620921 116621362 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 68668 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 175-26 chr15 59089756 59090171 + 0.666667 NA intron (NM_001270529, intron 11 of 13) intron (NM_001270529, intron 11 of 13) -15183 NM_004701 9133 Hs.194698 NM_004701 ENSG00000157456 CCNB2 HsT17299 cyclin B2 protein-coding 123-69 chr20 52090037 52090342 + 0.666667 NA intron (NM_199427, intron 7 of 8) HAL1ME|LINE|L1 15295 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 156.333-336 chr7 39200825 39201182 + 0.666667 NA intron (NM_001370959, intron 2 of 9) AluJr|SINE|Alu 128131 NR_145730 109616963 NR_145730 ENSG00000206947 SNORA20B - small nucleolar RNA, H/ACA box 20B snoRNA 112-218 chrX 82025042 82025314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 823076 NM_003022 6451 Hs.108029 NM_003022 ENSG00000131171 SH3BGRL HEL-S-115|SH3BGR SH3 domain binding glutamate rich protein like protein-coding 122-70 chr3 1053793 1054058 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -39099 NM_001349362 27255 Hs.387300 NM_014461 ENSG00000134115 CNTN6 NB3 contactin 6 protein-coding 244-38 chr14 86034956 86035501 + 0.666667 NA intron (NR_110155, intron 1 of 3) intron (NR_110155, intron 1 of 3) 100550 NR_110155 101928767 Hs.536380 NR_110155 LINC02328 - long intergenic non-protein coding RNA 2328 ncRNA 151.333-9 chr1 63357093 63357492 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10335 NM_013339 29929 Hs.258501 NM_013339 ENSG00000088035 ALG6 CDG1C ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferase protein-coding 117.333-28 chr10 115175487 115175806 + 0.666667 NA intron (NM_207303, intron 8 of 28) intron (NM_207303, intron 8 of 28) 82281 NM_207303 26033 Hs.501127 NM_207303 ENSG00000107518 ATRNL1 ALP|bA338L11.1|bA454H24.1 attractin like 1 protein-coding 155.333-331 chr6 57178075 57178476 + 0.666667 NA intron (NM_004282, intron 1 of 2) L1MEd|LINE|L1 5949 NM_004282 9532 Hs.745046 NM_004282 ENSG00000112208 BAG2 BAG-2|dJ417I1.2 BCL2 associated athanogene 2 protein-coding 134.333-158 chr7 53547378 53547609 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 264438 NR_038371 401337 Hs.531378 NM_001001707 ENSG00000205628 LINC01446 GS1-179L18.1 long intergenic non-protein coding RNA 1446 ncRNA 176-80 chr6 40021453 40021823 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87176 NM_001358530 4337 Hs.357128 NM_005942 ENSG00000124615 MOCS1 MIG11|MOCOD|MOCS1A|MOCS1B molybdenum cofactor synthesis 1 protein-coding 115.333-35 chr11 57712204 57712483 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001144012) promoter-TSS (NM_001144012) -20 NM_001317078 219541 Hs.43619 NM_153450 ENSG00000156603 MED19 DT2P1G7|LCMR1|MED19AS mediator complex subunit 19 protein-coding 140.667-81 chr14 72722265 72722607 + 0.666667 NA intron (NM_001280544, intron 5 of 9) MER5A|DNA|hAT-Charlie 170213 NM_001280544 8110 Hs.162868 NM_012074 ENSG00000205683 DPF3 BAF45C|CERD4 double PHD fingers 3 protein-coding 130-117 chr7 13015380 13015714 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 327914 NM_005738 10124 Hs.245540 NM_005738 ENSG00000122644 ARL4A ARL4 ADP ribosylation factor like GTPase 4A protein-coding 229.333-23 chr12 27606103 27606532 + 0.666667 NA intron (NM_001198915, intron 2 of 26) intron (NM_001198915, intron 2 of 26) 82111 NM_001198916 8496 Hs.172445 NM_003622 ENSG00000110841 PPFIBP1 L2|SGT2|hSGT2|hSgt2p PPFIA binding protein 1 protein-coding 157.667-293 chr7 27234168 27234517 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8460 NM_001304520 2128 Hs.369879 NM_001989 ENSG00000106038 EVX1 EVX-1 even-skipped homeobox 1 protein-coding 253-41 chr2 154199226 154199799 + 0.666667 NA intron (NM_052917, intron 4 of 12) intron (NM_052917, intron 4 of 12) 255118 NM_001301627 114805 Hs.470277 NM_052917 ENSG00000144278 GALNT13 GalNAc-T13 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 protein-coding 113-77 chr16 53614647 53614943 + 0.666667 NA intron (NM_001127897, intron 22 of 24) intron (NM_001127897, intron 22 of 24) 89064 NM_015272 23322 Hs.298382 NM_015272 ENSG00000103494 RPGRIP1L CORS3|FTM|JBTS7|MKS5|NPHP8|PPP1R134 RPGRIP1 like protein-coding 117-154 chr9 78415013 78415274 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 118018 NM_021154 29968 Hs.494261 NM_021154 ENSG00000135069 PSAT1 EPIP|NLS2|PSA|PSAT|PSATD phosphoserine aminotransferase 1 protein-coding 155-112 chr5 119465768 119466062 + 0.666667 NA intron (NM_000414, intron 2 of 23) L1MA5|LINE|L1 13418 NM_001292028 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 128.333-105 chr2 104135786 104136117 + 0.666667 NA Intergenic X1_LINE|LINE|CR1 272381 NR_037885 100287010 Hs.694603 NR_037885 LOC100287010 - uncharacterized LOC100287010 ncRNA 113-75 chr16 9807995 9808292 + 0.666667 NA intron (NM_001134408, intron 10 of 13) intron (NM_001134408, intron 10 of 13) -352638 NR_126349 104266959 Hs.578888 NR_126349 ENSG00000261075 LINC01195 - long intergenic non-protein coding RNA 1195 ncRNA 167.333-261 chr8 102071862 102072216 + 0.666667 NA intron (NM_001040624, intron 1 of 7) L1M5|LINE|L1 52295 NM_001040629 83988 Hs.492427 NM_032041 ENSG00000104490 NCALD - neurocalcin delta protein-coding 137-68 chr4 30832911 30833219 + 0.666667 NA intron (NM_032457, intron 1 of 2) intron (NM_032457, intron 1 of 2) 112696 NM_032457 5099 Hs.479439 NM_002589 ENSG00000169851 PCDH7 BH-Pcdh|BHPCDH|PPP1R120 protocadherin 7 protein-coding 119.333-126 chr2 64011032 64011298 + 0.666667 NA intron (NM_001005739, intron 1 of 22) intron (NM_001005739, intron 1 of 22) 8263 NM_001005739 51542 Hs.48499 NM_016516 ENSG00000143952 VPS54 HCC8|PPP1R164|SLP-8p|VPS54L|WR|hVps54L VPS54 subunit of GARP complex protein-coding 145.667-204 chr5 8704784 8705200 + 0.666667 NA Intergenic THE1B|LTR|ERVL-MaLR -134740 NR_109932 101929284 Hs.403715 NR_109932 LINC02199 - long intergenic non-protein coding RNA 2199 ncRNA 114-86 chr3 51558086 51558360 + 0.666667 NA intron (NM_001322253, intron 3 of 23) intron (NM_001322253, intron 3 of 23) 16634 NM_001322257 23132 Hs.105399 NM_015106 ENSG00000164080 RAD54L2 ARIP4|HSPC325|SRISNF2L RAD54 like 2 protein-coding 190.667-107 chr5 160230303 160230803 + 0.666667 NA intron (NM_001040442, intron 3 of 5) AluSx3|SINE|Alu 1047 NM_001445 2172 Hs.519719 NM_001445 ENSG00000170231 FABP6 I-15P|I-BABP|I-BALB|I-BAP|ILBP|ILBP3|ILLBP fatty acid binding protein 6 protein-coding 128.667-9 chr1 154228541 154228803 + 0.666667 NA exon (NM_014847, exon 4 of 27) exon (NM_014847, exon 4 of 27) 7717 NM_014847 9898 Hs.490551 NM_014847 ENSG00000143569 UBAP2L NICE-4|NICE4 ubiquitin associated protein 2 like protein-coding 133.667-33 chr12 9789827 9790133 + 0.666667 NA Intergenic L1PB|LINE|L1 -10072 NR_159359 51348 Hs.183125 NM_016523 ENSG00000150045 KLRF1 CLEC5C|NKp80 killer cell lectin like receptor F1 protein-coding 115-101 chr20 44708445 44708622 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -6311 NM_001323370 8839 Hs.592145 NM_003881 ENSG00000064205 CCN5 CT58|CTGF-L|WISP2 cellular communication network factor 5 protein-coding 192-109 chr5 29784602 29785165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -95677 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 120-3 chr1 91380189 91380536 + 0.666667 NA intron (NM_001017975, intron 7 of 38) intron (NM_001017975, intron 7 of 38) 24475 NM_001017975 164045 Hs.454818 NM_001017975 ENSG00000162669 HFM1 MER3|POF9|SEC63D1|Si-11|Si-11-6|helicase helicase for meiosis 1 protein-coding 150-115 chr5 86509632 86510027 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -108112 NM_001867 1350 Hs.430075 NM_001867 ENSG00000127184 COX7C - cytochrome c oxidase subunit 7C protein-coding 253-12 chr10 68234096 68234566 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -2218 NM_145178 220202 Hs.175396 NM_145178 ENSG00000179774 ATOH7 Math5|NCRNA|PHPVAR|RNANC|bHLHa13 atonal bHLH transcription factor 7 protein-coding 162.333-93 chr17 40067546 40067862 + 0.666667 NA intron (NM_199334, intron 1 of 8) intron (NM_199334, intron 1 of 8) 4739 NM_199334 7067 Hs.724 NM_003250 ENSG00000126351 THRA AR7|CHNG6|EAR7|ERB-T-1|ERBA|ERBA1|NR1A1|THRA1|THRA2|c-ERBA-1 thyroid hormone receptor alpha protein-coding 203.333-44 chr11 17084264 17084681 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -6805 NM_001017 6207 Hs.446588 NM_001017 ENSG00000110700 RPS13 S13 ribosomal protein S13 protein-coding 139.333-167 chr4 89890982 89891252 + 0.666667 NA intron (NM_001371403, intron 1 of 8) intron (NM_001371403, intron 1 of 8) -3737 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 116.667-47 chr13 55998791 55999078 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 824480 NR_049804 100846996 NR_049804 ENSG00000264387 MIR5007 - microRNA 5007 ncRNA 196.333-97 chr20 10517102 10517486 + 0.666667 NA intron (NM_001009608, intron 2 of 7) intron (NM_001009608, intron 2 of 7) 81989 NM_001009608 128710 Hs.668782 NM_001009608 ENSG00000149346 SLX4IP C20orf94|bA204H22.1|bA254M13.1|dJ1099D15.3 SLX4 interacting protein protein-coding 243.333-83 chr5 3790254 3790945 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 194767 NM_024337 79192 Hs.424156 NM_024337 ENSG00000170549 IRX1 IRX-5|IRXA1 iroquois homeobox 1 protein-coding 216-120 chr8 25927527 25928029 + 0.666667 NA intron (NM_022659, intron 6 of 15) intron (NM_022659, intron 6 of 15) 117635 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 121.667-102 chr2 199900330 199900632 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -10812 NM_153689 205327 Hs.154494 NM_153689 ENSG00000178074 C2orf69 - chromosome 2 open reading frame 69 protein-coding 219.667-84 chr6 52322259 52322763 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -37769 NM_001366370 4172 Hs.179565 NM_002388 ENSG00000112118 MCM3 HCC5|P1-MCM3|P1.h|RLFB minichromosome maintenance complex component 3 protein-coding 132.333-19 chr10 55192202 55192476 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -391048 NM_001142767 65217 Hs.280209 NM_033056 ENSG00000150275 PCDH15 CDHR15|DFNB23|USH1F protocadherin related 15 protein-coding 134.333-69 chr16 70761693 70761966 + 0.666667 NA intron (NR_034083, intron 3 of 5) MIR|SINE|MIR 6734 NR_034083 100130894 Hs.678899 NR_034083 ENSG00000214353 VAC14-AS1 - VAC14 antisense RNA 1 ncRNA 151.333-119 chr14 22542654 22542975 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 14248 NR_146543 105370400 NR_146543 ENSG00000259054 LINC02332 - long intergenic non-protein coding RNA 2332 ncRNA 178.333-10 chr1 186875655 186876096 + 0.666667 NA intron (NM_024420, intron 3 of 17) intron (NM_024420, intron 3 of 17) 46926 NM_001311193 5321 Hs.497200 NM_024420 ENSG00000116711 PLA2G4A GURDP|PLA2G4|cPLA2|cPLA2-alpha phospholipase A2 group IVA protein-coding 121-17 chr10 69727287 69727482 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -74522 NM_001368884 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 139-65 chr3 131480895 131481193 + 0.666667 NA intron (NM_007208, intron 6 of 9) MIR3|SINE|MIR -1811 NR_002985 677836 Hs.735762 NR_002985 SNORA58 ACA58|SNORA58B small nucleolar RNA, H/ACA box 58 snoRNA 141.333-74 chr16 24060680 24060976 + 0.666667 NA intron (NM_002738, intron 5 of 16) LTR16|LTR|ERVL -142288 NR_106996 102466247 NR_106996 ENSG00000274466 MIR1273H hsa-mir-1273h microRNA 1273h ncRNA 164.667-226 chr7 68706188 68706655 + 0.666667 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 686168 NR_120514 102723427 Hs.583491 NR_120514 ENSG00000225209 LOC102723427 - uncharacterized LOC102723427 ncRNA 161.333-12 chr1 192617003 192617444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18924 NM_144766 6003 Hs.497220 NM_002927 ENSG00000127074 RGS13 - regulator of G protein signaling 13 protein-coding 158.333-296 chr7 34275065 34275379 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 369683 NM_001365308 168667 Hs.660998 NM_133468 ENSG00000164619 BMPER CRIM3|CV-2|CV2 BMP binding endothelial regulator protein-coding 120.333-134 chr3 115459144 115459492 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -164192 NM_002045 2596 Hs.134974 NM_002045 ENSG00000172020 GAP43 B-50|PP46 growth associated protein 43 protein-coding 129-55 chr18 10967808 10968177 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 3 of 51) L1PB1|LINE|L1 180770 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 234.667-62 chr2 237001800 237002382 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 54076 NR_135202 93463 Hs.652810 NR_135202 ENSG00000124835 LOC93463 - uncharacterized LOC93463 ncRNA 141.333-150 chr3 70889377 70889721 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie 175375 NM_001349344 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 155.667-244 chr4 54728260 54728576 + 0.666667 NA intron (NM_000222, intron 13 of 20) intron (NM_000222, intron 13 of 20) 70490 NM_000222 3815 Hs.479754 NM_000222 ENSG00000157404 KIT C-Kit|CD117|MASTC|PBT|SCFR KIT proto-oncogene, receptor tyrosine kinase protein-coding 212.333-71 chr2 125594126 125594607 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 523619 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 149-6 chr1 118383024 118383336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -197952 NM_206996 200162 Hs.528821 NM_206996 ENSG00000155761 SPAG17 CT143|PF6 sperm associated antigen 17 protein-coding 117.333-206 chr8 73088298 73088555 + 0.666667 NA intron (NM_153225, intron 1 of 4) AluJb|SINE|Alu 4746 NM_153225 157869 Hs.439040 NM_153225 ENSG00000164764 SBSPON C8orf84|RPESP somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing protein-coding 167-42 chr15 51335025 51335447 + 0.666667 NA intron (NM_031226, intron 1 of 10) intron (NM_031226, intron 1 of 10) 3360 NM_031226 1588 Hs.260074 NM_000103 ENSG00000137869 CYP19A1 ARO|ARO1|CPV1|CYAR|CYP19|CYPXIX|P-450AROM cytochrome P450 family 19 subfamily A member 1 protein-coding 155.333-265 chr4 77490592 77490913 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -21001 NM_006419 10563 Hs.100431 NM_006419 ENSG00000156234 CXCL13 ANGIE|ANGIE2|BCA-1|BCA1|BLC|BLR1L|SCYB13 C-X-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 138.667-33 chr11 82442132 82442519 + 0.666667 NA Intergenic L1MB2|LINE|L1 -38412 NR_120571 101928989 Hs.145117 NR_120571 ENSG00000245832 MIR4300HG - MIR4300 host gene ncRNA 127-86 chr6 150008608 150008927 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3623 NR_024045 646024 Hs.560537 NR_024045 ENSG00000218358 RAET1K - retinoic acid early transcript 1K pseudogene pseudo 121-93 chr3 79325167 79325470 + 0.666667 NA intron (NM_002941, intron 2 of 30) intron (NM_002941, intron 2 of 30) -86409 NR_110133 101927374 Hs.570644 NR_110133 LOC101927374 - uncharacterized LOC101927374 ncRNA 177.333-130 chr5 20965069 20965490 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -349744 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 281.333-40 chr3 90657198 90657687 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr 1549821 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 170.333-105 chr2 19827783 19828204 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -40861 NR_033875 400946 Hs.289062 NR_033875 ENSG00000228784 LINC00954 - long intergenic non-protein coding RNA 954 ncRNA 225.667-32 chr17 58994328 58994733 + 0.666667 NA intron (NM_001005207, intron 24 of 24) AluJr|SINE|Alu 112350 NM_001320987 4591 Hs.579079 NM_015294 ENSG00000108395 TRIM37 MUL|POB1|TEF3 tripartite motif containing 37 protein-coding 120.333-53 chr14 28634923 28635207 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 130254 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 120.333-113 chr2 202898335 202898623 + 0.666667 NA intron (NM_018256, intron 4 of 12) intron (NM_018256, intron 4 of 12) -13739 NM_001282911 79800 Hs.444982 NM_024744 ENSG00000138380 CARF ALS2CR8|NYD-SP24 calcium responsive transcription factor protein-coding 141.333-12 chr1 209543611 209543953 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -39932 NM_020439 57172 Hs.199068 NM_020439 ENSG00000008118 CAMK1G CLICK3|CLICKIII|VWS1|dJ272L16.1 calcium/calmodulin dependent protein kinase IG protein-coding 145-49 chr2 88467105 88467450 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14584 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 128-20 chr13 79764467 79764696 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -39805 NR_125785 102724076 Hs.208617 NR_125785 ENSG00000229011 LINC01038 - long intergenic non-protein coding RNA 1038 ncRNA 169.333-195 chr5 1696476 1696982 + 0.666667 NA Intergenic L1MEg|LINE|L1 12139 NR_036240 100422966 NR_036240 ENSG00000263746 MIR4277 - microRNA 4277 ncRNA 118.333-88 chr18 9284421 9284666 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_015208, exon 13 of 13) 3' UTR (NM_015208, exon 13 of 13) -50230 NM_020648 57045 Hs.514685 NM_020648 ENSG00000128791 TWSG1 TSG twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 protein-coding 158.333-187 chr22 46169538 46169916 + 0.666667 NA intron (NM_001001928, intron 2 of 7) L1M5|LINE|L1 18932 NM_001362873 5465 Hs.103110 NM_005036 ENSG00000186951 PPARA NR1C1|PPAR|PPARalpha|hPPAR peroxisome proliferator activated receptor alpha protein-coding 215-10 chr11 34730917 34731480 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 98632 NM_001206616 26298 Hs.653859 NM_012153 ENSG00000135373 EHF ESE3|ESE3B|ESEJ ETS homologous factor protein-coding 131.333-106 chr20 59478175 59478444 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -99200 NM_001199505 116154 Hs.473218 NM_080672 ENSG00000087495 PHACTR3 C20orf101|H17739|PPP1R123|SCAPIN1|SCAPININ phosphatase and actin regulator 3 protein-coding 154-45 chr12 110715604 110716051 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -26050 NM_001256413 84329 Hs.211511 NM_032369 ENSG00000122986 HVCN1 HV1|VSOP hydrogen voltage gated channel 1 protein-coding 130.333-206 chr8 80463796 80464032 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21679 NM_001277145 65986 Hs.591868 NM_023929 ENSG00000205189 ZBTB10 RINZF zinc finger and BTB domain containing 10 protein-coding 171.667-28 chr11 42202702 42203092 + 0.666667 NA intron (NR_038309, intron 4 of 5) Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger 50793 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 130.333-163 chr5 32331134 32331449 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18352 NM_001294343 54545 Hs.481836 NM_019061 ENSG00000150712 MTMR12 3-PAP|PIP3AP myotubularin related protein 12 protein-coding 142-145 chr7 66680585 66680959 + 0.666667 NA intron (NM_001367722, intron 1 of 7) AluSq10|SINE|Alu -1394 NM_001367745 27342 Hs.530053 NM_014504 ENSG00000154710 RABGEF1 RABEX5|RAP1|rabex-5 RAB guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 117.667-111 chr22 33013555 33013843 + 0.666667 NA intron (NM_003490, intron 1 of 13) L1MA7|LINE|L1 -6878 NM_133633 8224 Hs.608750 NM_003490 ENSG00000185666 SYN3 - synapsin III protein-coding 262.667-41 chr2 166796458 166796882 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -91817 NM_001199143 129446 Hs.73680 NM_152381 ENSG00000163092 XIRP2 CMYA3 xin actin binding repeat containing 2 protein-coding 128.333-136 chr3 196488797 196489065 + 0.666667 NA intron (NM_152617, intron 1 of 5) AluSz|SINE|Alu 14837 NM_152617 165918 Hs.250648 NM_152617 ENSG00000163961 RNF168 hRNF168 ring finger protein 168 protein-coding 178-95 chr5 115253986 115254431 + 0.666667 NA intron (NM_005023, intron 1 of 8) MER105|DNA|hAT-Charlie 8669 NM_005023 5229 Hs.254006 NM_005023 ENSG00000164219 PGGT1B BGGI|GGTI protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta protein-coding 259.333-41 chr2 33186285 33186850 + 0.666667 NA intron (NM_206943, intron 5 of 33) intron (NM_206943, intron 5 of 33) 51970 NM_001166266 4052 Hs.619315 NM_000627 ENSG00000049323 LTBP1 - latent transforming growth factor beta binding protein 1 protein-coding 174-108 chr9 88166192 88166689 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27959 NM_001350978 645961 Hs.632070 NM_001166137 SPATA31C2 FAM75C2 SPATA31 subfamily C member 2 protein-coding 120.667-77 chr17 78568609 78568856 + 0.666667 NA intron (NM_173628, intron 9 of 80) AluJr|SINE|Alu 8662 NM_173628 8632 Hs.375975 NM_003727 ENSG00000187775 DNAH17 DNAHL1|DNEL2 dynein axonemal heavy chain 17 protein-coding 237-4 chr1 158403092 158403668 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3914 NM_001004475 128360 Hs.553588 NM_001004475 ENSG00000186306 OR10T2 OR1-3 olfactory receptor family 10 subfamily T member 2 protein-coding 177-28 chr15 57559430 57559782 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32298 NR_104370 145781 Hs.437256 NM_001018090 ENSG00000137878 GCOM1 GRINL1A|Gcom2|MYZAP|MYZAP-POLR2M|gcom GRINL1A complex locus 1 protein-coding 200.333-8 chr10 14411281 14411729 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25071 NR_031668 100302116 NR_031668 ENSG00000221371 MIR1265 MIRN1265|hsa-mir-1265 microRNA 1265 ncRNA 152.667-94 chr13 25408729 25409040 + 0.666667 NA intron (NM_016529, intron 1 of 36) intron (NM_016529, intron 1 of 36) 36910 NM_016529 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 163-46 chr2 201896755 201897086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90341 NM_001261436 65061 Hs.348711 NM_139158 ENSG00000138395 CDK15 ALS2CR7|PFTAIRE2|PFTK2 cyclin dependent kinase 15 protein-coding 149-30 chr12 40137605 40137952 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18461 NR_146526 105369734 NR_146526 LINC02471 - long intergenic non-protein coding RNA 2471 ncRNA 159-49 chr18 47826997 47827374 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_005901, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_005901, exon 11 of 11) 103474 NM_005901 4087 Hs.12253 NM_005901 ENSG00000175387 SMAD2 JV18|JV18-1|MADH2|MADR2|hMAD-2|hSMAD2 SMAD family member 2 protein-coding 125.667-197 chr9 35874442 35874733 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4186 NM_001004487 392309 Hs.527480 NM_001004487 ENSG00000168828 OR13J1 OR9-2 olfactory receptor family 13 subfamily J member 1 protein-coding 143.667-108 chr18 2767429 2767728 + 0.666667 NA intron (NM_015295, intron 37 of 47) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -79428 NM_032048 84034 Hs.532815 NM_032048 ENSG00000132205 EMILIN2 EMILIN-2|FOAP-10 elastin microfibril interfacer 2 protein-coding 150.667-274 chr4 94975492 94975789 + 0.666667 NA intron (NM_001203, intron 2 of 12) AluJb|SINE|Alu -20592 NM_001256792 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 185.333-22 chr10 83538964 83539370 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 137922 NR_134317 105378397 Hs.147725 NR_134317 LINC02650 - long intergenic non-protein coding RNA 2650 ncRNA 112.333-132 chr2 118444954 118445252 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 157863 NR_110272 101927709 Hs.274529 NR_110272 LOC101927709 - uncharacterized LOC101927709 ncRNA 220-26 chr11 107270522 107270916 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 187127 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 184.667-55 chr2 60534114 60534439 + 0.666667 NA intron (NM_138559, intron 2 of 4) intron (NM_138559, intron 2 of 4) 19222 NM_001365609 53335 Hs.370549 NM_018014 ENSG00000119866 BCL11A BCL11A-L|BCL11A-S|BCL11A-XL|BCL11a-M|CTIP1|DILOS|EVI9|HBFQTL5|ZNF856 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL11A protein-coding 205-48 chr2 53750600 53751014 + 0.666667 NA exon (NM_001164165, exon 3 of 10) exon (NM_001164165, exon 3 of 10) -16976 NM_001346127 494143 Hs.585944 NM_001008708 ENSG00000143942 CHAC2 GCG1 ChaC cation transport regulator homolog 2 protein-coding 160.667-282 chr7 55644977 55645411 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42838 NR_027340 360132 Hs.446691 NM_182827 ENSG00000176826 FKBP9P1 FKBP9L FKBP prolyl isomerase 9 pseudogene 1 pseudo 159-104 chr6 121244339 121244644 + 0.666667 NA intron (NR_104452, intron 17 of 35) L1PBa|LINE|L1 89989 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 191-85 chrX 84636274 84636688 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -134028 NM_001177479 139324 Hs.559546 NM_144657 ENSG00000165259 HDX CXorf43|D030011N01Rik highly divergent homeobox protein-coding 142-53 chr17 12049880 12050155 + 0.666667 NA intron (NM_001281435, intron 2 of 11) LTR82A|LTR|ERVL 29140 NM_001281435 6416 Hs.514681 NM_003010 ENSG00000065559 MAP2K4 JNKK|JNKK1|MAPKK4|MEK4|MKK4|PRKMK4|SAPKK-1|SAPKK1|SEK1|SERK1|SKK1 mitogen-activated protein kinase kinase 4 protein-coding 112-69 chr15 67572418 67572635 + 0.666667 NA intron (NM_001206804, intron 3 of 21) MER41C|LTR|ERV1 23432 NM_001206804 5607 Hs.114198 NM_002757 ENSG00000137764 MAP2K5 HsT17454|MAPKK5|MEK5|PRKMK5 mitogen-activated protein kinase kinase 5 protein-coding 123-63 chr2 86531352 86531567 + 0.666667 NA intron (NM_001005753, intron 1 of 4) FAM|SINE|Alu 31984 NR_036454 51652 Hs.591582 NM_016079 ENSG00000115561 CHMP3 CGI-149|NEDF|VPS24 charged multivesicular body protein 3 protein-coding 116-151 chr8 9258632 9258877 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 -66297 NR_040039 157273 Hs.650222 NR_040039 ENSG00000248538 LOC157273 - uncharacterized LOC157273 ncRNA 123.333-94 chr17 73811759 73812060 + 0.666667 NA intron (NR_027146, intron 2 of 3) L1ME3G|LINE|L1 16628 NR_027146 283982 Hs.464079 NM_182564 LINC00469 C17orf54 long intergenic non-protein coding RNA 469 ncRNA 287.667-9 chr12 16326993 16327672 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -19810 NM_145792 4257 Hs.389700 NM_020300 ENSG00000008394 MGST1 GST12|MGST|MGST-I microsomal glutathione S-transferase 1 protein-coding 165.333-200 chr5 19598537 19598885 + 0.666667 NA intron (NM_001349559, intron 6 of 12) intron (NM_001349559, intron 6 of 12) 287561 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 133.333-131 chr4 75350872 75351123 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3079 NR_033964 441025 Hs.407667 NR_033964 ENSG00000251383 LINC02483 - long intergenic non-protein coding RNA 2483 ncRNA 125-15 chr10 66852260 66852625 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) intron (NM_001127384, intron 7 of 17) -73594 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 118.333-68 chr14 79918880 79919149 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -292405 NR_038355 100628307 Hs.623865 NR_038355 ENSG00000258766 DIO2-AS1 - DIO2 antisense RNA 1 ncRNA 167.667-13 chr1 209395661 209396005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 23778 NR_146491 101929476 Hs.568721 NR_146491 LINC01698 - long intergenic non-protein coding RNA 1698 ncRNA 156.333-269 chr4 100073168 100073607 + 0.666667 NA Intergenic Charlie1|DNA|hAT-Charlie -116646 NR_125924 101929353 Hs.147584 NR_125924 ENSG00000249710 LOC101929353 - uncharacterized LOC101929353 ncRNA 148.667-74 chr11 74120874 74121240 + 0.666667 NA intron (NM_001286577, intron 8 of 32) L2c|LINE|L2 49945 NM_015531 26005 Hs.557938 NM_015531 ENSG00000168014 C2CD3 OFD14 C2 domain containing 3 centriole elongation regulator protein-coding 124.333-118 chr3 89593367 89593717 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 485921 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 118-124 chr7 78803977 78804288 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -204856 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 210.333-74 chr2 62695560 62695906 + 0.666667 NA intron (NM_001142615, intron 1 of 22) AluJb|SINE|Alu -9891 NM_001354212 23301 Hs.271667 NM_015252 ENSG00000115504 EHBP1 HPC12|NACSIN EH domain binding protein 1 protein-coding 123.667-62 chr15 44486208 44486431 + 0.666667 NA intron (NM_016396, intron 3 of 12) intron (NM_016396, intron 3 of 12) 50581 NR_034171 645212 Hs.594287 NR_034170 EIF3J-DT EIF3J-AS1 EIF3J divergent transcript ncRNA 124.667-74 chr15 91418351 91418589 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -44869 NR_110106 101926928 Hs.638788 NR_110106 ENSG00000258551 CRAT37 - cervical cancer-associated transcript 37 ncRNA 130-101 chr5 132539453 132539686 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 3953 NM_000879 3567 Hs.2247 NM_000879 ENSG00000113525 IL5 EDF|IL-5|TRF interleukin 5 protein-coding 154.333-219 chr3 101767573 101768014 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001303401, exon 11 of 11) 3' UTR (NM_001303401, exon 11 of 11) -11418 NM_001348992 91775 Hs.595933 NM_145037 ENSG00000144815 NXPE3 FAM55C|MST115|MSTP115 neurexophilin and PC-esterase domain family member 3 protein-coding 128.667-86 chr2 31348304 31348617 + 0.666667 NA intron (NM_000379, intron 27 of 35) intron (NM_000379, intron 27 of 35) 66282 NM_000379 7498 Hs.250 NM_000379 ENSG00000158125 XDH XAN1|XO|XOR xanthine dehydrogenase protein-coding 134-62 chr22 47795547 47795796 + 0.666667 NA intron (NR_122046, intron 8 of 8) intron (NR_122046, intron 8 of 8) 163997 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 140.667-155 chr3 190334425 190334784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12158 NM_021101 9076 Hs.439060 NM_021101 ENSG00000163347 CLDN1 CLD1|ILVASC|SEMP1 claudin 1 protein-coding 131-111 chr9 87503963 87504215 + 0.666667 NA intron (NM_004938, intron 2 of 25) intron (NM_004938, intron 2 of 25) 5554 NM_001288729 1612 Hs.380277 NM_004938 ENSG00000196730 DAPK1 DAPK|ROCO3 death associated protein kinase 1 protein-coding 202.667-112 chr4 138272223 138272671 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30098 NM_014331 23657 Hs.390594 NM_014331 ENSG00000151012 SLC7A11 CCBR1|xCT solute carrier family 7 member 11 protein-coding 115-163 chrX 141625433 141625605 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001318917) promoter-TSS (NM_001318917) -345 NM_001318917 645188 Hs.679802 NM_001318917 LOC645188 SPANX-L uncharacterized LOC645188 protein-coding 172-31 chr12 29428715 29429096 + 0.666667 NA intron (NR_073172, intron 1 of 1) intron (NR_073172, intron 1 of 1) 39611 NR_073170 101055625 Hs.569158 NR_073170 ENSG00000257599 OVCH1-AS1 - OVCH1 antisense RNA 1 ncRNA 171.667-160 chr8 79941989 79942337 + 0.666667 NA intron (NM_014018, intron 2 of 2) Charlie13a|DNA|hAT-Charlie -70426 NR_110954 101927040 Hs.350876 NR_110954 ENSG00000249328 LOC101927040 - uncharacterized LOC101927040 ncRNA 153.333-73 chr11 100611335 100611676 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -75783 NM_152432 143872 Hs.44004 NM_032021 ENSG00000165895 ARHGAP42 AD031|GRAF3|TMEM133 Rho GTPase activating protein 42 protein-coding 131.667-176 chr6 165997047 165997295 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9132 NR_026861 90632 Hs.31917 NR_026860 ENSG00000112541 LINC00473 C6orf176|LNC473|bA142J11.1 long intergenic non-protein coding RNA 473 ncRNA 170.333-218 chr8 81091892 81092399 + 0.666667 NA intron (NM_018440, intron 1 of 8) AluJb|SINE|Alu 19923 NM_018440 55824 Hs.266175 NM_018440 ENSG00000076641 PAG1 CBP|PAG phosphoprotein membrane anchor with glycosphingolipid microdomains 1 protein-coding 179-8 chr1 218845461 218845890 + 0.666667 NA intron (NR_031644, intron 6 of 6) intron (NR_031644, intron 6 of 6) 72836 NR_146917 105372925 Hs.666318 NR_146917 LINC01710 - long intergenic non-protein coding RNA 1710 ncRNA 128-8 chr10 51383894 51384250 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 2 of 17) intron (NM_001098512, intron 2 of 17) 84499 NR_030336 693190 NR_030336 ENSG00000207813 MIR605 MIRN605|hsa-mir-605|mir-605 microRNA 605 ncRNA 148.667-14 chr1 109173902 109174338 + 0.666667 NA intron (NM_001284352, intron 6 of 20) AluJo|SINE|Alu -12429 NM_001284353 57535 Hs.708190 NM_020775 ENSG00000116299 KIAA1324 EIG121 KIAA1324 protein-coding 186.333-71 chr2 48304639 48305049 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -9838 NM_002158 3344 Hs.468478 NM_002158 ENSG00000170802 FOXN2 HTLF forkhead box N2 protein-coding 136.333-60 chr14 89254551 89254876 + 0.666667 NA intron (NM_001085471, intron 4 of 6) intron (NM_001085471, intron 4 of 6) 162520 NM_005197 1112 Hs.434286 NM_005197 ENSG00000053254 FOXN3 C14orf116|CHES1|PRO1635 forkhead box N3 protein-coding 131-100 chr8 65093713 65094073 + 0.666667 NA Intergenic ERVL47-int|LTR|ERVL 86447 NR_038901 552859 Hs.156997 NR_038901 ENSG00000280725 LINC00251 C8orf25|NCRNA00251 long intergenic non-protein coding RNA 251 ncRNA 151-117 chr6 82520316 82520602 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 156215 NM_001166392 7162 Hs.71947 NM_006670 ENSG00000146242 TPBG 5T4|5T4AG|M6P1|WAIF1 trophoblast glycoprotein protein-coding 188.667-55 chr17 18776341 18776753 + 0.666667 NA intron (NR_051988, intron 13 of 13) L1ME4b|LINE|L1 -4448 NM_001316921 51030 Hs.87295 NM_016078 ENSG00000171928 TVP23B CGI-148|FAM18B|FAM18B1|NPD008|YDR084C trans-golgi network vesicle protein 23 homolog B protein-coding 119.333-90 chr14 81306442 81306658 + 0.666667 NA intron (NM_001366850, intron 5 of 7) AluSz6|SINE|Alu -85160 NM_201595 2957 Hs.592334 NM_015859 ENSG00000165417 GTF2A1 TF2A1|TFIIA|TFIIA-42|TFIIAL general transcription factor IIA subunit 1 protein-coding 151-9 chr1 210526516 210526817 + 0.666667 NA intron (NM_001122834, intron 9 of 11) MIR3|SINE|MIR 197300 NM_001170580 55733 Hs.58650 NM_018194 ENSG00000054392 HHAT MART2|SKI1|Skn hedgehog acyltransferase protein-coding 115.333-166 chr5 18933683 18933873 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 952494 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 121-130 chr7 14667548 14667818 + 0.666667 NA intron (NM_001350722, intron 13 of 25) L4_A_Mam|LINE|RTE-X 173767 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 130.333-55 chr12 65041027 65041381 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -48913 NR_146276 109729131 Hs.577553 NR_146276 ENSG00000248995 LINC02231 - long intergenic non-protein coding RNA 2231 ncRNA 133-52 chr2 239624643 239624889 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -138094 NR_037808 150935 Hs.555582 NR_037808 LOC150935 - uncharacterized LOC150935 ncRNA 148-75 chr2 40510673 40511036 + 0.666667 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) intron (NM_001112802, intron 1 of 7) 1581 NM_001112802 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 143-124 chr8 57605323 57605701 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140637 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 277-21 chr17 57146417 57147052 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51245 NM_001370427 8165 Hs.463506 NM_003488 ENSG00000121057 AKAP1 AKAP|AKAP121|AKAP149|AKAP84|D-AKAP1|PPP1R43|PRKA1|SAKAP84|TDRD17 A-kinase anchoring protein 1 protein-coding 201-93 chr5 83631718 83632158 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu -69624 NR_136215 105379054 Hs.643801 NR_136215 ENSG00000249835 VCAN-AS1 - VCAN antisense RNA 1 ncRNA 147.667-236 chr3 106248158 106248469 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -378912 NM_001321790 868 Hs.430589 NM_170662 ENSG00000114423 CBLB Cbl-b|Nbla00127|RNF56 Cbl proto-oncogene B protein-coding 142.667-82 chr17 74787095 74787364 + 0.666667 NA intron (NM_017728, intron 3 of 9) intron (NM_017728, intron 3 of 9) 10730 NM_001321264 54868 Hs.370262 NM_017728 ENSG00000109066 TMEM104 - transmembrane protein 104 protein-coding 153.333-166 chr17 81890282 81890588 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001289414) promoter-TSS (NM_001289414) -355 NM_001289414 51529 Hs.534456 NM_016476 ENSG00000141552 ANAPC11 APC11|Apc11p|HSPC214 anaphase promoting complex subunit 11 protein-coding 149.333-113 chr14 58783057 58783454 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -45033 NR_110547 102723742 Hs.232734 NR_110547 ENSG00000258583 LINC01500 - long intergenic non-protein coding RNA 1500 ncRNA 151.667-178 chr2 188845566 188845874 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -55597 NR_161166 116093 Hs.470892 NM_052952 ENSG00000174325 DIRC1 - disrupted in renal carcinoma 1 ncRNA 129-128 chr8 91960565 91960802 + 0.666667 NA intron (NM_004349, intron 10 of 10) intron (NM_004349, intron 10 of 10) 56997 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 113.333-255 chr8 78763663 78763897 + 0.666667 NA intron (NM_001199886, intron 2 of 4) L1MC1|LINE|L1 -39406 NR_077236 101241902 Hs.388511 NR_077236 LOC101241902 - chromosome 4 open reading frame 46 pseudogene pseudo 181.333-146 chr5 146903190 146903631 + 0.666667 NA intron (NM_001271900, intron 2 of 10) AluJb|SINE|Alu 16096 NR_047115 100874361 Hs.193825 NR_047115 ENSG00000249553 PPP2R2B-IT1 - PPP2R2B intronic transcript 1 ncRNA 212-67 chr16 53298824 53299446 + 0.666667 NA intron (NM_001352157, intron 29 of 37) intron (NM_001352157, intron 29 of 37) 72077 NM_001347693 643802 Hs.451336 NM_001207030 LOC643802 - u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein MPP10-like protein-coding 173-91 chr7 153945960 153946441 + 0.666667 NA intron (NR_157195, intron 1 of 24) MER41B|LTR|ERV1 58866 NM_001039350 1804 Hs.490684 NM_001936 ENSG00000130226 DPP6 DPL1|DPPX|MRD33|VF2 dipeptidyl peptidase like 6 protein-coding 121.667-20 chr10 19368294 19368514 + 0.666667 NA intron (NM_001142308, intron 26 of 39) L1MA5A|LINE|L1 319603 NM_001142308 340895 Hs.646734 NM_001142308 ENSG00000204740 MALRD1 C10orf112|DIET1|bA265G8.2 MAM and LDL receptor class A domain containing 1 protein-coding 112.333-206 chr5 72846421 72846623 + 0.666667 NA intron (NM_001364292, intron 1 of 24) intron (NM_001364292, intron 1 of 24) -1617 NM_153188 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 124.667-170 chr5 106365812 106366116 + 0.666667 NA Intergenic Zaphod|DNA|hAT-Tip100 645050 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 176.333-161 chr8 29945743 29946205 + 0.666667 NA intron (NR_024473, intron 2 of 2) intron (NR_024473, intron 2 of 2) 11374 NR_036104 100422876 NR_036104 ENSG00000264788 MIR3148 mir-3148 microRNA 3148 ncRNA 113.667-179 chr5 153343198 153343436 + 0.666667 NA Intergenic Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 -147207 NM_001258019 2890 Hs.519693 NM_000827 ENSG00000155511 GRIA1 GLUH1|GLUR1|GLURA|GluA1|HBGR1 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1 protein-coding 127-12 chr1 240545968 240546254 + 0.666667 NA intron (NM_022469, intron 1 of 1) AluSz|SINE|Alu 66044 NM_022469 64388 Hs.98206 NM_022469 ENSG00000180875 GREM2 CKTSF1B2|DAND3|PRDC|STHAG9 gremlin 2, DAN family BMP antagonist protein-coding 130.333-200 chr7 105027159 105027459 + 0.666667 NA intron (NM_182931, intron 1 of 26) AluJr|SINE|Alu 13104 NM_182931 55904 Hs.592262 NM_018682 ENSG00000005483 KMT2E HDCMC04P|MLL5|NKp44L lysine methyltransferase 2E protein-coding 192.333-108 chr21 29240537 29240962 + 0.666667 NA intron (NR_027072, intron 1 of 1) THE1B|LTR|ERVL-MaLR 47255 NR_027072 193629 Hs.720711 NM_138968 ENSG00000215533 LINC00189 C21orf109|NCRNA00189 long intergenic non-protein coding RNA 189 ncRNA 133.667-118 chr5 66025459 66025710 + 0.666667 NA intron (NM_001253697, intron 11 of 25) intron (NM_001253697, intron 11 of 25) -80011 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 184-111 chr8 120508908 120509415 + 0.666667 NA intron (NM_022045, intron 16 of 21) intron (NM_022045, intron 16 of 21) 63742 NM_022045 27085 Hs.657656 NM_022045 ENSG00000172167 MTBP MDM2BP MDM2 binding protein protein-coding 128.667-109 chr22 40585359 40585742 + 0.666667 NA intron (NM_020831, intron 2 of 14) L1MB3|LINE|L1 51169 NM_020831 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 133.667-134 chr6 121239712 121240055 + 0.666667 NA intron (NR_104452, intron 19 of 35) intron (NR_104452, intron 19 of 35) 94597 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 163-43 chr2 80378544 80378852 + 0.666667 NA intron (NM_001282599, intron 1 of 11) intron (NM_001282599, intron 1 of 11) 65319 NM_001282599 1496 Hs.167368 NM_004389 ENSG00000066032 CTNNA2 CAP-R|CAPR|CDCBM9|CT114|CTNR catenin alpha 2 protein-coding 232.667-14 chr12 63301996 63302398 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -149387 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 184.667-81 chr3 85656704 85657129 + 0.666667 NA intron (NM_001256503, intron 2 of 9) intron (NM_001256503, intron 2 of 9) -69566 NM_153184 253559 Hs.164578 NM_153184 ENSG00000175161 CADM2 IGSF4D|NECL3|Necl-3|SynCAM 2|synCAM2 cell adhesion molecule 2 protein-coding 213.333-218 chr8 134022277 134022645 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 135965 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 121.667-92 chr2 101055669 101055856 + 0.666667 NA intron (NM_001102426, intron 3 of 19) intron (NM_001102426, intron 3 of 19) 53473 NM_000993 6160 Hs.469473 NM_000993 ENSG00000071082 RPL31 L31 ribosomal protein L31 protein-coding 158.667-95 chr14 51528126 51528447 + 0.666667 NA intron (NM_001042481, intron 1 of 14) intron (NM_001042481, intron 1 of 14) 39158 NM_001042481 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 123.667-170 chr7 55027441 55027731 + 0.666667 NA intron (NM_001346941, intron 1 of 21) intron (NM_001346941, intron 1 of 21) 8554 NM_201283 1956 Hs.488293 NM_005228 ENSG00000146648 EGFR ERBB|ERBB1|HER1|NISBD2|PIG61|mENA epidermal growth factor receptor protein-coding 119.667-121 chr3 132515693 132516017 + 0.666667 NA intron (NM_001329126, intron 47 of 56) intron (NM_001329126, intron 47 of 56) -81415 NM_016557 51554 Hs.310512 NM_016557 ENSG00000129048 ACKR4 CC-CKR-11|CCBP2|CCR-11|CCR10|CCR11|CCRL1|CCX CKR|CCX-CKR|CKR-11|PPR1|VSHK1 atypical chemokine receptor 4 protein-coding 127.333-69 chr18 46308705 46308934 + 0.666667 NA Intergenic MIR1_Amn|SINE|MIR -25199 NM_152470 494470 Hs.501114 NM_152470 ENSG00000141622 RNF165 ARKL2|Ark2C|RNF111L2 ring finger protein 165 protein-coding 127.333-11 chr1 168769235 168769494 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -17577 NR_024160 79100 Hs.250624 NR_024160 ENSG00000225826 LINC00626 - long intergenic non-protein coding RNA 626 ncRNA 370-15 chr2 84240919 84241931 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49257 NR_003663 388965 Hs.664098 NM_001013648 FUNDC2P2 - FUN14 domain containing 2 pseudogene 2 pseudo 139.333-70 chr14 48812180 48812508 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 774036 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 278.333-6 chr1 105930198 105930829 + 0.666667 NA intron (NR_146609, intron 5 of 5) intron (NR_146609, intron 5 of 5) 97740 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 114.667-240 chr7 106842856 106843033 + 0.666667 NA Intergenic LTR82B|LTR|ERVL -22338 NM_001282426 5294 Hs.32942 NM_002649 ENSG00000105851 PIK3CG PI3CG|PI3K|PI3Kgamma|PIK3|p110gamma|p120-PI3K phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma protein-coding 183.667-30 chr11 15931755 15932104 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 37692 NR_106721 102464826 NR_106721 ENSG00000284094 MIR6073 hsa-mir-6073 microRNA 6073 ncRNA 157-110 chr6 2865868 2866287 + 0.666667 NA intron (NR_033851, intron 1 of 1) intron (NR_033851, intron 1 of 1) 10433 NR_033851 221756 Hs.8162 NM_182544 SERPINB9P1 SERPINB9P serpin family B member 9 pseudogene 1 pseudo 218.667-97 chr7 7349519 7349889 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 94550 NR_108073 101927354 Hs.520664 NR_108073 LOC101927354 - uncharacterized LOC101927354 ncRNA 112.333-236 chr6 120875822 120876137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 458501 NR_104452 221322 Hs.121396 NM_152730 ENSG00000146350 TBC1D32 BROMI|C6orf170|C6orf171 TBC1 domain family member 32 protein-coding 119-114 chr4 136032884 136033140 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -119332 NR_103763 100507528 Hs.518987 NR_103762 ENSG00000248330 LINC00613 - long intergenic non-protein coding RNA 613 ncRNA 112.667-260 chr8 26365154 26365479 + 0.666667 NA intron (NM_001177591, intron 8 of 9) intron (NM_001177591, intron 8 of 9) 17637 NR_144550 157489 Hs.586388 NR_144550 ENSG00000228451 SDAD1P1 - SDA1 domain containing 1 pseudogene 1 pseudo 196.667-156 chr8 76293277 76293792 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -113120 NR_105006 101926978 Hs.615028 NR_105006 ENSG00000254300 LINC01111 - long intergenic non-protein coding RNA 1111 ncRNA 117-13 chr10 13181816 13182119 + 0.666667 NA intron (NM_018518, intron 7 of 19) intron (NM_018518, intron 7 of 19) 20409 NM_018518 55388 Hs.198363 NM_018518 ENSG00000065328 MCM10 CNA43|DNA43|PRO2249 minichromosome maintenance 10 replication initiation factor protein-coding 124-35 chr14 44759828 44760094 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B1|LTR|ERVL 39165 NR_146457 101927351 Hs.196842 NR_146457 LINC02302 - long intergenic non-protein coding RNA 2302 ncRNA 205.667-58 chr17 39353885 39354368 + 0.666667 NA intron (NM_001370209, intron 1 of 13) Kanga1|DNA|TcMar-Tc2 47500 NM_001184906 84961 Hs.462946 NM_032875 ENSG00000108306 FBXL20 Fbl2|Fbl20 F-box and leucine rich repeat protein 20 protein-coding 146.333-154 chr2 88344768 88345157 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 107731 NM_001135649 344167 Hs.131262 NM_001135649 ENSG00000214336 FOXI3 - forkhead box I3 protein-coding 135.333-97 chr2 189232905 189233220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53301 NM_000393 1290 Hs.445827 NM_000393 ENSG00000204262 COL5A2 EDSC|EDSCL2 collagen type V alpha 2 chain protein-coding 140.333-183 chr5 73660992 73661307 + 0.666667 NA intron (NM_001177693, intron 1 of 35) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 34991 NM_001080479 64283 Hs.482521 NM_001080479 ENSG00000214944 ARHGEF28 RGNEF|RIP2|p190RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor 28 protein-coding 112.333-8 chr1 105641332 105641586 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -22524 NR_125955 101928476 Hs.563856 NR_125954 ENSG00000230768 LINC01676 - long intergenic non-protein coding RNA 1676 ncRNA 157.667-239 chr5 39313210 39313544 + 0.666667 NA intron (NM_001737, intron 6 of 10) L2-3_Crp|LINE|L2 -42728 NM_001243093 2533 Hs.370503 NM_001465 ENSG00000082074 FYB1 ADAP|FYB|PRO0823|SLAP-130|SLAP130|THC3 FYN binding protein 1 protein-coding 175.333-4 chr1 62442120 62442514 + 0.666667 NA intron (NM_001017415, intron 4 of 8) intron (NM_001017415, intron 4 of 8) 5268 NM_003368 7398 Hs.35086 NM_003368 ENSG00000162607 USP1 UBP ubiquitin specific peptidase 1 protein-coding 160-45 chr15 37542170 37542494 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -392275 NM_152453 145942 Hs.179646 NM_152453 ENSG00000166069 TMCO5A TMCO5 transmembrane and coiled-coil domains 5A protein-coding 165.667-4 chr1 82772526 82772890 + 0.666667 NA Intergenic Kanga2_a|DNA|TcMar-Tc2 -130475 NR_147074 103283057 Hs.551280 NR_147074 ENSG00000230817 LINC01362 - long intergenic non-protein coding RNA 1362 ncRNA 147.333-214 chr3 69870965 69871258 + 0.666667 NA intron (NM_198177, intron 1 of 9) MLT1K|LTR|ERVL-MaLR 4887 NM_198177 4286 Hs.166017 NM_000248 ENSG00000187098 MITF CMM8|COMMAD|MI|WS2|WS2A|bHLHe32 melanocyte inducing transcription factor protein-coding 153.333-341 chr5 119457082 119457516 + 0.666667 NA intron (NM_000414, intron 2 of 23) LTR84a|LTR|ERVL 4802 NM_001292028 3295 Hs.406861 NM_000414 ENSG00000133835 HSD17B4 DBP|MFE-2|MPF-2|PRLTS1|SDR8C1 hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 4 protein-coding 178.333-39 chr12 84287213 84287602 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 625392 NM_001146335 55117 Hs.44424 NM_018057 ENSG00000072041 SLC6A15 NTT73|SBAT1|V7-3|hv7-3 solute carrier family 6 member 15 protein-coding 172.333-74 chr18 55927720 55928072 + 0.666667 NA Intergenic MER121|DNA|hAT? -7697 NR_110755 101927273 Hs.434335 NR_110755 ENSG00000260930 LINC01416 - long intergenic non-protein coding RNA 1416 ncRNA 212-57 chr15 39600034 39600629 + 0.666667 NA TTS (NM_003246) TTS (NM_003246) 19252 NM_003246 7057 Hs.164226 NM_003246 ENSG00000137801 THBS1 THBS|THBS-1|TSP|TSP-1|TSP1 thrombospondin 1 protein-coding 171-36 chr2 127506964 127507376 + 0.666667 NA intron (NM_017969, intron 2 of 13) intron (NM_017969, intron 2 of 13) 19319 NM_017969 55677 Hs.469879 NM_017969 ENSG00000163166 IWS1 - interacts with SUPT6H, CTD assembly factor 1 protein-coding 147-40 chr14 50699848 50700192 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -31714 NM_021818 60485 Hs.642842 NM_021818 ENSG00000151748 SAV1 SAV|WW45|WWP4 salvador family WW domain containing protein 1 protein-coding 135-39 chr18 3294077 3294396 + 0.666667 NA Intergenic LTR102_Mam|LTR|ERVL 31517 NM_001144945 103910 Hs.190086 NM_033546 ENSG00000118680 MYL12B MLC-B|MRLC2 myosin light chain 12B protein-coding 169.333-275 chr8 125756666 125757083 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 194323 NR_038447 100130231 Hs.729642 NR_038446 ENSG00000245164 LINC00861 - long intergenic non-protein coding RNA 861 ncRNA 192.667-169 chr8 19016428 19016869 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -2945 NM_015310 23362 Hs.434255 NM_015310 ENSG00000156011 PSD3 EFA6D|EFA6R|HCA67 pleckstrin and Sec7 domain containing 3 protein-coding 250.667-47 chr22 27148141 27148728 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -39082 NM_001318392 105372977 Hs.743180 NM_001318392 LOC105372977 - uncharacterized LOC105372977 protein-coding 142-117 chr5 75903112 75903486 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -180084 NM_001297716 22987 Hs.646953 NM_014979 ENSG00000122012 SV2C - synaptic vesicle glycoprotein 2C protein-coding 121.667-24 chr10 64127717 64128036 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR -605986 NM_001322258 221037 Hs.413416 NM_004241 ENSG00000171988 JMJD1C KDM3C|TRIP-8|TRIP8 jumonji domain containing 1C protein-coding 112.667-82 chr16 57179009 57179236 + 0.666667 NA intron (NM_001354079, intron 1 of 8) intron (NM_001354079, intron 1 of 8) 3428 NM_001354098 80011 Hs.396740 NM_024946 ENSG00000172775 FAM192A C16orf94|CDA018|CDA10|NIP30|PIP30 family with sequence similarity 192 member A protein-coding 111.667-135 chr2 102218428 102218663 + 0.666667 NA intron (NM_001351447, intron 4 of 9) MIRc|SINE|MIR 31231 NM_001351446 8808 Hs.659863 NM_003854 ENSG00000115598 IL1RL2 IL-1Rrp2|IL-36R|IL1R-rp2|IL1RRP2 interleukin 1 receptor like 2 protein-coding 152.667-287 chr5 14999231 14999517 + 0.666667 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -127596 NM_054027 56172 Hs.156727 NM_054027 ENSG00000154122 ANKH ANK|CCAL2|CMDJ|CPPDD|HANK|MANK|SLC62A1 ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator protein-coding 147.333-247 chr4 117108066 117108473 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22693 NM_152402 133022 Hs.570737 NM_152402 ENSG00000174599 TRAM1L1 - translocation associated membrane protein 1 like 1 protein-coding 118-141 chrX 27570286 27570631 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -19886 NM_001353448 347442 Hs.720885 NM_001136533 ENSG00000189186 DCAF8L2 WDR42C DDB1 and CUL4 associated factor 8 like 2 protein-coding 114-5 chr1 78625635 78625878 + 0.666667 NA intron (NM_006820, intron 1 of 8) L1MEg|LINE|L1 5308 NM_006820 10964 Hs.744918 NM_006820 ENSG00000137959 IFI44L C1orf29|GS3686 interferon induced protein 44 like protein-coding 114.333-18 chr1 240931605 240931938 + 0.666667 NA intron (NM_001350116, intron 5 of 16) intron (NM_001350116, intron 5 of 16) -200501 NR_036069 100422856 NR_036069 ENSG00000265831 MIR3123 mir-3123 microRNA 3123 ncRNA 152.333-91 chr13 42590528 42590830 + 0.666667 NA intron (NM_003701, intron 2 of 4) intron (NM_003701, intron 2 of 4) 16527 NM_003701 8600 Hs.333791 NM_003701 ENSG00000120659 TNFSF11 CD254|ODF|OPGL|OPTB2|RANKL|TNLG6B|TRANCE|hRANKL2|sOdf TNF superfamily member 11 protein-coding 130.667-169 chr5 97025417 97025795 + 0.666667 NA intron (NM_005575, intron 15 of 17) intron (NM_005575, intron 15 of 17) 67173 NM_175920 4012 Hs.527199 NM_005575 ENSG00000113441 LNPEP CAP|IRAP|P-LAP|PLAP leucyl and cystinyl aminopeptidase protein-coding 144.667-225 chr4 128927298 128927589 + 0.666667 NA intron (NM_144643, intron 18 of 20) AluJb|SINE|Alu 115599 NM_001287443 79960 Hs.12420 NM_024900 ENSG00000077684 JADE1 PHF17 jade family PHD finger 1 protein-coding 122.333-179 chr5 160832309 160832616 + 0.666667 NA intron (NM_001366652, intron 1 of 24) L1ME3G|LINE|L1 19749 NM_001366654 23120 Hs.109358 NM_025153 ENSG00000118322 ATP10B ATPVB ATPase phospholipid transporting 10B (putative) protein-coding 151.667-179 chr2 190412045 190412347 + 0.666667 NA intron (NM_017694, intron 1 of 7) intron (NM_017694, intron 1 of 7) 3841 NM_017694 54842 Hs.418581 NM_017694 ENSG00000151690 MFSD6 MMR2|hMMR2 major facilitator superfamily domain containing 6 protein-coding 145.667-153 chr20 3737409 3737696 + 0.666667 NA intron (NM_052970, intron 1 of 12) intron (NM_052970, intron 1 of 12) 4867 NM_052970 116835 Hs.516854 NM_052970 ENSG00000132622 HSPA12B C20orf60 heat shock protein family A (Hsp70) member 12B protein-coding 119.667-148 chr5 33257430 33257742 + 0.666667 NA Intergenic LTR16|LTR|ERVL 27851 NR_147008 105374716 Hs.582475 NR_147008 ENSG00000251443 LINC02160 - long intergenic non-protein coding RNA 2160 ncRNA 209.667-69 chr2 143871740 143872198 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65098 NR_110237 101928386 Hs.668251 NR_110237 ENSG00000232377 LOC101928386 - uncharacterized LOC101928386 ncRNA 131.333-134 chr4 110002297 110002621 + 0.666667 NA intron (NM_001357021, intron 18 of 19) AluJb|SINE|Alu 89576 NM_001178131 1950 Hs.419815 NM_001963 ENSG00000138798 EGF HOMG4|URG epidermal growth factor protein-coding 253.667-61 chr6 40908915 40909371 + 0.666667 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) L1MB2|LINE|L1 114137 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 121.667-128 chr3 94169941 94170157 + 0.666667 NA Intergenic MER5C|DNA|hAT-Charlie 106988 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 219.667-22 chr14 76593288 76593760 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -167944 NM_014909 22846 Hs.525479 NM_014909 ENSG00000071246 VASH1 KIAA1036|TTCP 1 vasohibin 1 protein-coding 154-53 chr14 60734891 60735245 + 0.666667 NA intron (NM_001177963, intron 1 of 6) intron (NM_001177963, intron 1 of 6) 307 NM_001177963 4331 Hs.509523 NM_002431 ENSG00000020426 MNAT1 CAP35|MAT1|RNF66|TFB3 MNAT1 component of CDK activating kinase protein-coding 213-27 chr16 69515552 69516013 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 50086 NR_031719 100302119 NR_031719 ENSG00000223109 MIR1538 MIRN1538|hsa-mir-1538 microRNA 1538 ncRNA 180-66 chr3 66210625 66211123 + 0.666667 NA intron (NM_173471, intron 1 of 10) L2b|LINE|L2 -9868 NR_028475 115286 Hs.379386 NM_173471 ENSG00000144741 SLC25A26 COXPD28|SAMC solute carrier family 25 member 26 protein-coding 140-36 chr14 51699803 51700179 + 0.666667 NA intron (NM_001042481, intron 4 of 14) intron (NM_001042481, intron 4 of 14) -17292 NM_001267047 122786 Hs.434914 NM_152330 ENSG00000139926 FRMD6 C14orf31|EX1|Willin|c14_5320 FERM domain containing 6 protein-coding 224.333-131 chr9 84688490 84688980 + 0.666667 NA intron (NM_001369550, intron 1 of 11) intron (NM_001369550, intron 1 of 11) -12870 NM_001369551 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 172-112 chr9 15228996 15229369 + 0.666667 NA intron (NM_001168340, intron 2 of 18) intron (NM_001168340, intron 2 of 18) 21036 NM_001168342 158219 Hs.563630 NM_152574 ENSG00000155158 TTC39B C9orf52 tetratricopeptide repeat domain 39B protein-coding 116.667-103 chr2 136950068 136950365 + 0.666667 NA intron (NM_001316349, intron 2 of 27) AluSx4|SINE|Alu 184671 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 211.333-14 chr1 161304573 161305041 + 0.666667 NA TTS (NM_000530) TTS (NM_000530) 5161 NM_001315491 4359 Hs.591486 NM_000530 ENSG00000158887 MPZ CHM|CHN2|CMT1|CMT1B|CMT2I|CMT2J|CMT4E|CMTDI3|CMTDID|DSS|HMSNIB|MPP|P0 myelin protein zero protein-coding 180-61 chr20 15132912 15133304 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 5 of 17) intron (NM_001351663, intron 5 of 17) -63732 NM_001033087 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 128.667-197 chr9 92873964 92874256 + 0.666667 NA intron (NM_001354536, intron 2 of 5) L1MDa|LINE|L1 3858 NM_001354536 83744 Hs.668378 NM_031486 ENSG00000127081 ZNF484 BA526D8.4 zinc finger protein 484 protein-coding 119.667-12 chr1 172641385 172641608 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17512 NM_001302746 356 Hs.2007 NM_000639 ENSG00000117560 FASLG ALPS1B|APT1LG1|APTL|CD178|CD95-L|CD95L|FASL|TNFSF6|TNLG1A Fas ligand protein-coding 123-22 chr11 3118068 3118301 + 0.666667 NA intron (NM_020896, intron 7 of 21) MER4A1|LTR|ERV1 47126 NM_020896 114879 Hs.436166 NM_020896 ENSG00000021762 OSBPL5 OBPH1|ORP5 oxysterol binding protein like 5 protein-coding 213-88 chr8 141006785 141007356 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4991 NM_001352699 5747 Hs.395482 NM_005607 ENSG00000169398 PTK2 FADK|FAK|FAK1|FRNK|PPP1R71|p125FAK|pp125FAK protein tyrosine kinase 2 protein-coding 134-51 chr2 136531539 136531861 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -233845 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 152-128 chr5 74892373 74892700 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -25570 NM_015566 26049 Hs.91662 NM_015566 ENSG00000198780 FAM169A SLAP75 family with sequence similarity 169 member A protein-coding 209.667-87 chr3 186736756 186737204 + 0.666667 NA intron (NM_001102416, intron 7 of 9) AluSx|SINE|Alu 19621 NM_001102416 3827 Hs.77741 NM_000893 ENSG00000113889 KNG1 BDK|BK|HMWK|KNG kininogen 1 protein-coding 121.333-74 chr18 62573496 62573773 + 0.666667 NA intron (NR_126534, intron 12 of 14) intron (NR_126534, intron 12 of 14) 50609 NR_126534 54877 Hs.114191 NM_017742 ENSG00000141664 ZCCHC2 C18orf49 zinc finger CCHC-type containing 2 protein-coding 142-110 chr5 5653835 5654132 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 231306 NM_015325 23379 Hs.449296 NM_015325 ENSG00000164151 ICE1 KIAA0947 interactor of little elongation complex ELL subunit 1 protein-coding 121-148 chrX 53509423 53509653 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 46803 NR_029513 407054 NR_029513 ENSG00000271886 MIR98 MIRLET7L|MIRN98|hsa-mir-98|miR-98 microRNA 98 ncRNA 176-94 chr8 47357927 47358315 + 0.666667 NA intron (NR_104581, intron 5 of 16) AluJb|SINE|Alu 97183 NM_001080394 23514 Hs.381058 NM_001080394 ENSG00000164808 SPIDR KIAA0146 scaffold protein involved in DNA repair protein-coding 154.333-92 chr14 60589146 60589433 + 0.666667 NA Intergenic LTR75|LTR|ERVL -49927 NR_126480 104548971 NR_126480 SALRNA1 SAL-RNA1|XLOC_023166 senescence associated long non-coding RNA 1 ncRNA 149-148 chr8 114744431 114744864 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 923366 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 196.333-39 chr14 61114014 61114559 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132596 NM_001350253 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 199-49 chr2 88588023 88588344 + 0.666667 NA intron (NM_004836, intron 7 of 16) intron (NM_004836, intron 7 of 16) 36746 NM_001313915 9451 Hs.591589 NM_004836 ENSG00000172071 EIF2AK3 PEK|PERK|WRS eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 protein-coding 151.333-163 chr16 69123597 69123904 + 0.666667 NA intron (NM_001002847, intron 1 of 2) intron (NM_001002847, intron 1 of 2) 8409 NM_001366604 113455421 Hs.85962 NM_001002847 DERPC CHTF8 DERPC proline and glycine rich nuclear protein protein-coding 136.333-226 chrX 111363852 111364108 + 0.666667 NA intron (NM_178152, intron 3 of 6) intron (NM_178152, intron 3 of 6) 47166 NM_000555 1641 Hs.34780 NM_000555 ENSG00000077279 DCX DBCN|DC|LISX|SCLH|XLIS doublecortin protein-coding 117.667-123 chr3 128717170 128717434 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -8834 NM_004637 7879 Hs.684374 NM_004637 ENSG00000075785 RAB7A PRO2706|RAB7 RAB7A, member RAS oncogene family protein-coding 142.667-50 chr14 28597817 28598147 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 167337 NR_125758 103695363 Hs.569360 NR_125758 FOXG1-AS1 FOXG1-AS FOXG1 antisense RNA 1 ncRNA 169.333-66 chr13 53249224 53249588 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -97506 NR_125788 102723875 Hs.149083 NR_125788 LINC01065 - long intergenic non-protein coding RNA 1065 ncRNA 245.333-7 chr1 175952083 175952728 + 0.666667 NA intron (NM_022457, intron 18 of 19) AluSq2|SINE|Alu 16074 NR_162097 113839518 NR_162097 MIR1843 - microRNA 1843 ncRNA 139-54 chr2 188108552 188108885 + 0.666667 NA intron (NR_126396, intron 2 of 2) L1PA15|LINE|L1 178973 NR_126396 104355152 NR_126396 ENSG00000231689 LINC01090 - long intergenic non-protein coding RNA 1090 ncRNA 112-102 chr2 46238030 46238240 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -59272 NM_001430 2034 Hs.468410 NM_001430 ENSG00000116016 EPAS1 ECYT4|HIF2A|HLF|MOP2|PASD2|bHLHe73 endothelial PAS domain protein 1 protein-coding 203-32 chr14 72665596 72665946 + 0.666667 NA intron (NM_001280544, intron 9 of 9) L1MC4a|LINE|L1 148951 NR_106994 102465832 NR_106994 ENSG00000273830 MIR7843 hsa-mir-7843 microRNA 7843 ncRNA 133.333-41 chr12 57405051 57405287 + 0.666667 NA intron (NM_001351204, intron 1 of 25) AluJr4|SINE|Alu 25874 NM_001351218 22864 Hs.443673 NM_014925 ENSG00000179912 R3HDM2 CAG6|PR01365 R3H domain containing 2 protein-coding 169-25 chr14 45775805 45776271 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 -60436 NR_146547 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 165-63 chr4 35995691 35996007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 248090 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 209.666-37 chr3 149609393 149609992 + 0.666667 NA intron (NM_001348362, intron 5 of 9) MER58B|DNA|hAT-Charlie 48333 NM_015472 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 132.667-109 chr3 96844768 96845009 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 1 of 17) intron (NM_001080448, intron 1 of 17) 30294 NM_001278301 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 117.667-194 chr8 107667063 107667260 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -169243 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 188.667-85 chr2 200311300 200311803 + 0.666667 NA intron (NM_001282744, intron 1 of 12) intron (NM_001282744, intron 1 of 12) 2601 NM_001282744 26010 Hs.120323 NM_015535 ENSG00000196141 SPATS2L DNAPTP6|SGNP spermatogenesis associated serine rich 2 like protein-coding 145-32 chr14 69031100 69031419 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 51577 NR_073422 161159 Hs.603341 NR_073422 ENSG00000259062 ACTN1-AS1 C14orf84 ACTN1 antisense RNA 1 ncRNA 268.667-10 chr13 46609661 46610296 + 0.666667 NA intron (NM_001164213, intron 1 of 18) intron (NM_001164213, intron 1 of 18) 56808 NM_001164211 23143 Hs.507971 NM_015116 ENSG00000136141 LRCH1 CHDC1|NP81 leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1 protein-coding 203.333-122 chr2 15642563 15643101 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -47950 NR_110201 101926966 Hs.502835 NR_110201 ENSG00000231031 LINC01804 - long intergenic non-protein coding RNA 1804 ncRNA 112.333-234 chr6 91644703 91644899 + 0.666667 NA intron (NR_104154, intron 2 of 3) L1MB3|LINE|L1 45627 NR_104154 101929083 Hs.586238 NR_104154 CASC6 - cancer susceptibility 6 ncRNA 224.667-40 chr2 35163821 35164273 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -307358 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 160.333-251 chr6 95836168 95836556 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -179612 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 139.667-97 chr2 182116501 182116778 + 0.666667 NA intron (NM_001261425, intron 4 of 5) L2c|LINE|L2 125424 NM_001258314 5136 Hs.191046 NM_005019 ENSG00000115252 PDE1A CAM-PDE 1A|CAM-PDE-1A|HCAM-1|HCAM1|HSPDE1A phosphodiesterase 1A protein-coding 129.333-120 chr3 33713887 33714184 + 0.666667 NA intron (NM_001365634, intron 1 of 35) MIR|SINE|MIR 4219 NM_001365633 23122 Hs.108614 NM_015097 ENSG00000163539 CLASP2 - cytoplasmic linker associated protein 2 protein-coding 191-19 chr14 66913613 66914015 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 5 of 21) intron (NM_001024218, intron 5 of 21) -275626 NM_173526 161142 Hs.412818 NM_173526 ENSG00000172717 FAM71D C14orf54 family with sequence similarity 71 member D protein-coding 125.667-198 chr9 73630943 73631308 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 479260 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 123.333-4 chr1 55775623 55775887 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 169208 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 118.667-203 chr9 77913932 77914182 + 0.666667 NA intron (NM_002072, intron 2 of 6) intron (NM_002072, intron 2 of 6) 117754 NM_002072 2776 Hs.269782 NM_002072 ENSG00000156052 GNAQ CMC1|G-ALPHA-q|GAQ|SWS G protein subunit alpha q protein-coding 148.667-4 chr1 40921106 40921433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58427 NM_001905 1503 Hs.473087 NM_001905 ENSG00000171793 CTPS1 CTPS|GATD5|IMD24 CTP synthase 1 protein-coding 150.667-391 chr8 143493860 143494196 + 0.666667 NA intron (NM_015117, intron 4 of 11) intron (NM_015117, intron 4 of 11) 12220 NR_145785 109623485 NR_145785 SNORD149 - small nucleolar RNA, C/D box 149 snoRNA 137-75 chr4 140225812 140226137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31334 NM_032547 60592 Hs.480815 NM_032547 ENSG00000153130 SCOC HRIHFB2072|SCOCO|UNC-69 short coiled-coil protein protein-coding 111.667-237 chr7 34532897 34533071 + 0.666667 NA intron (NR_033665, intron 2 of 3) intron (NR_033665, intron 2 of 3) -125234 NM_207172 387129 Hs.652373 NM_207172 ENSG00000187258 NPSR1 ASRT2|GPR154|GPRA|NPSR|PGR14|VRR1 neuropeptide S receptor 1 protein-coding 117-100 chr4 32956859 32957121 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 605952 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 163-88 chr8 135777549 135778013 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 320325 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 128.333-140 chr4 57222173 57222419 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -111911 NM_001253835 3490 Hs.479808 NM_001553 ENSG00000163453 IGFBP7 AGM|FSTL2|IBP-7|IGFBP-7|IGFBP-7v|IGFBPRP1|MAC25|PSF|RAMSVPS|TAF insulin like growth factor binding protein 7 protein-coding 111.667-72 chr12 122484464 122484649 + 0.666667 NA intron (NM_001350936, intron 4 of 12) AluJr4|SINE|Alu 16376 NM_017612 55596 Hs.37706 NM_017612 ENSG00000033030 ZCCHC8 - zinc finger CCHC-type containing 8 protein-coding 276-26 chr15 62554120 62554632 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90805 NR_026897 197003 Hs.352253 NM_152648 ENSG00000259458 MGC15885 - uncharacterized protein MGC15885 ncRNA 131.667-21 chr10 50240439 50240779 + 0.666667 NA intron (NM_001143974, intron 3 of 18) intron (NM_001143974, intron 3 of 18) 8001 NM_001143974 56624 Hs.512645 NM_019893 ENSG00000188611 ASAH2 BCDase|HNAC1|LCDase|N-CDase|NCDase N-acylsphingosine amidohydrolase 2 protein-coding 113.667-102 chr2 59271034 59271242 + 0.666667 NA intron (NR_110219, intron 2 of 2) intron (NR_110219, intron 2 of 2) 53430 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 137.667-131 chr3 173752677 173752953 + 0.666667 NA intron (NM_001365928, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 167981 NR_046664 100874010 Hs.624265 NR_046664 ENSG00000228213 NLGN1-AS1 - NLGN1 antisense RNA 1 ncRNA 207.667-117 chr8 67198824 67199271 + 0.666667 NA exon (NM_006421, exon 39 of 39) exon (NM_006421, exon 39 of 39) 115199 NM_001291339 79848 Hs.370147 NM_024790 ENSG00000104218 CSPP1 CSPP|JBTS21 centrosome and spindle pole associated protein 1 protein-coding 261-47 chr5 108484901 108485425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103065 NM_001163315 64839 Hs.657225 NM_022824 ENSG00000145743 FBXL17 FBXO13|Fbl17|Fbx13 F-box and leucine rich repeat protein 17 protein-coding 121-27 chr11 74642152 74642399 + 0.666667 NA non-coding (NR_046410, exon 12 of 12) non-coding (NR_046410, exon 12 of 12) 49693 NR_046410 10714 Hs.82502 NM_006591 ENSG00000077514 POLD3 P66|P68|PPP1R128 DNA polymerase delta 3, accessory subunit protein-coding 199.333-173 chr22 34031198 34031550 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -108486 NM_001362953 9215 Hs.474667 NM_004737 ENSG00000133424 LARGE1 LARGE|MDC1D|MDDGA6|MDDGB6 LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 protein-coding 185.333-86 chr2 56134919 56135279 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -44717 NR_135590 101927165 Hs.679803 NR_135590 LINC01813 - long intergenic non-protein coding RNA 1813 ncRNA 190.333-58 chr17 57489213 57489627 + 0.666667 NA intron (NM_001322250, intron 6 of 13) intron (NM_001322250, intron 6 of 13) 34177 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 121-144 chr9 35405417 35405770 + 0.666667 NA TTS (NM_001371186) TTS (NM_001371186) -1162 NR_003581 158381 Hs.575661 NR_003581 ENSG00000179766 ATP8B5P FetA ATPase phospholipid transporting 8B5, pseudogene pseudo 131.667-38 chr11 124219944 124220314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -4510 NM_001291438 26492 Hs.381319 NM_001291438 OR8G2P HSTPCR120|OR8G2|OR8G4|ORL206|ORL486|TPCR120 olfactory receptor family 8 subfamily G member 2 pseudogene protein-coding 135.333-174 chr7 44090087 44090414 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7710 NM_001284331 27434 Hs.596982 NM_013284 ENSG00000122678 POLM Pol Mu|Tdt-N DNA polymerase mu protein-coding 166.667-115 chr2 97815171 97815594 + 0.666667 NA intron (NM_015348, intron 12 of 40) intron (NM_015348, intron 12 of 40) 80976 NM_207519 7535 Hs.234569 NM_001079 ENSG00000115085 ZAP70 ADMIO2|IMD48|SRK|STCD|STD|TZK|ZAP-70 zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70 protein-coding 150.333-243 chr21 26071705 26072087 + 0.666667 NA intron (NM_001136131, intron 3 of 15) intron (NM_001136131, intron 3 of 15) 68494 NM_001136016 351 Hs.434980 NM_000484 ENSG00000142192 APP AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2|preA4 amyloid beta precursor protein protein-coding 259-43 chr5 92593980 92594465 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 977121 NR_109825 441094 Hs.457407 NR_015369 ENSG00000237187 NR2F1-AS1 - NR2F1 antisense RNA 1 ncRNA 135.333-137 chr5 27215641 27215912 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -177190 NM_016279 1007 Hs.272212 NM_016279 ENSG00000113100 CDH9 - cadherin 9 protein-coding 118.667-7 chr1 102484507 102484711 + 0.666667 NA Intergenic MER77|LTR|ERVL -487375 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 187-11 chr10 60765282 60765692 + 0.666667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity -12844 NM_001170406 983 Hs.732435 NM_001786 ENSG00000170312 CDK1 CDC2|CDC28A|P34CDC2 cyclin dependent kinase 1 protein-coding 192-51 chr14 53947504 53947912 + 0.666667 NA TTS (NR_049843) TTS (NR_049843) 776 NR_049843 100847076 NR_049843 ENSG00000266431 MIR5580 - microRNA 5580 ncRNA 146.333-88 chr14 51191445 51191760 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -48645 NM_030755 81542 Hs.125221 NM_030755 ENSG00000139921 TMX1 PDIA11|TMX|TXNDC|TXNDC1 thioredoxin related transmembrane protein 1 protein-coding 140.333-129 chr21 31935514 31935782 + 0.666667 NA intron (NM_014586, intron 2 of 10) L1MC2|LINE|L1 62628 NM_014586 30811 Hs.109437 NM_014586 ENSG00000142149 HUNK - hormonally up-regulated Neu-associated kinase protein-coding 114.333-216 chr8 54186064 54186276 + 0.666667 NA Intergenic HERVL40-int|LTR|ERVL 50929 NM_014175 29088 Hs.18349 NM_014175 ENSG00000137547 MRPL15 HSPC145|L15mt|MRP-L15|MRP-L7|RPML7 mitochondrial ribosomal protein L15 protein-coding 313.667-16 chr15 100636384 100637095 + 0.666667 NA intron (NM_198243, intron 5 of 5) intron (NM_198243, intron 5 of 5) 34150 NM_198243 140460 Hs.31845 NM_024708 ENSG00000183475 ASB7 - ankyrin repeat and SOCS box containing 7 protein-coding 194.667-24 chr10 102900167 102900580 + 0.666667 NA intron (NR_160733, intron 2 of 2) intron (NR_160733, intron 2 of 2) -17921 NM_199076 54805 Hs.643509 NM_017649 ENSG00000148842 CNNM2 ACDP2|HOMG6|HOMGSMR cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2 protein-coding 120.667-85 chr2 14105953 14106188 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 294888 NR_103814 100499171 Hs.565606 NR_103814 ENSG00000230448 LINC00276 NCRNA00276 long intergenic non-protein coding RNA 276 ncRNA 143-56 chr17 61583209 61583566 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 7832 NM_199290 342538 Hs.591178 NM_199290 ENSG00000253506 NACA2 ANAC|NACAL nascent polypeptide associated complex subunit alpha 2 protein-coding 127.333-48 chr14 45228605 45228928 + 0.666667 NA intron (NM_018353, intron 8 of 16) intron (NM_018353, intron 8 of 16) 24436 NM_018353 55320 Hs.732769 NM_018353 ENSG00000129534 MIS18BP1 C14orf106|HSA242977|KNL2|M18BP1 MIS18 binding protein 1 protein-coding 131-5 chr1 90780671 90780983 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 55334 NR_147932 105378853 Hs.546492 NR_135038 ENSG00000233593 LINC02609 - long intergenic non-protein coding RNA 2609 ncRNA 126.333-71 chr18 587734 587923 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 7448 NM_004066 1068 Hs.122511 NM_004066 ENSG00000177143 CETN1 CEN1|CETN centrin 1 protein-coding 153.667-164 chr18 40143340 40143765 + 0.666667 NA Intergenic MER63B|DNA|hAT-Blackjack 77266 NR_110791 101927900 Hs.385522 NR_110791 ENSG00000261715 LINC01477 - long intergenic non-protein coding RNA 1477 ncRNA 188.667-136 chr7 31801989 31802457 + 0.666667 NA intron (NM_001322057, intron 17 of 17) L1MEc|LINE|L1 115008 NM_006658 10842 Hs.227011 NM_006658 ENSG00000106341 PPP1R17 C7orf16|GSBS protein phosphatase 1 regulatory subunit 17 protein-coding 149-50 chr16 24337530 24337805 + 0.666667 NA intron (NM_006539, intron 1 of 3) (TAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat 82114 NM_006539 10368 Hs.7235 NM_006539 ENSG00000006116 CACNG3 - calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 3 protein-coding 130-2 chr1 45828472 45828778 + 0.666667 NA intron (NM_001324320, intron 2 of 29) intron (NM_001324320, intron 2 of 29) 25012 NM_001319245 23139 Hs.319481 NM_015112 ENSG00000086015 MAST2 MAST205|MTSSK microtubule associated serine/threonine kinase 2 protein-coding 159-117 chr8 68592404 68592841 + 0.666667 NA intron (NR_146186, intron 7 of 12) AluSg|SINE|Alu -261131 NR_038877 286189 Hs.593427 NR_038877 ENSG00000248801 C8orf34-AS1 - C8orf34 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-140 chr16 6739107 6739427 + 0.666667 NA intron (NM_018723, intron 3 of 15) L1MD2|LINE|L1 -34542 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 226-71 chr4 103075797 103076285 + 0.666667 NA intron (NM_001370207, intron 1 of 10) intron (NM_001370207, intron 1 of 10) 720 NM_001300756 133308 Hs.546482 NM_178833 ENSG00000164038 SLC9B2 NHA2|NHE10|NHEDC2 solute carrier family 9 member B2 protein-coding 180.333-84 chr3 119083556 119083905 + 0.666667 NA intron (NM_152538, intron 3 of 8) Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -48884 NM_001015887 152404 Hs.112873 NM_152538 ENSG00000144847 IGSF11 BT-IgSF|CT119|CXADRL1|Igsf13|VSIG3 immunoglobulin superfamily member 11 protein-coding 136.333-199 chr8 28464818 28465150 + 0.666667 NA intron (NM_001258211, intron 2 of 7) intron (NM_001258211, intron 2 of 7) 25245 NM_172366 157574 Hs.741522 NM_172366 ENSG00000214050 FBXO16 FBX16 F-box protein 16 protein-coding 134-103 chr8 19222341 19222690 + 0.666667 NA intron (NR_038919, intron 3 of 4) L2a|LINE|L2 23007 NR_038919 100128993 Hs.697742 NR_038919 LOC100128993 - uncharacterized LOC100128993 ncRNA 112.333-57 chr12 64618678 64618887 + 0.666667 NA intron (NR_040718, intron 1 of 3) intron (NR_040718, intron 1 of 3) -3727 NR_030347 693129 NR_030347 ENSG00000207546 MIR548C MIRN548C microRNA 548c ncRNA 124.333-100 chr2 220800407 220800644 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 771779 NM_001304537 2043 Hs.371218 NM_004438 ENSG00000116106 EPHA4 EK8|HEK8|SEK|TYRO1 EPH receptor A4 protein-coding 152.333-223 chr3 4068992 4069302 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -234157 NM_001320677 6419 Hs.475300 NM_006515 ENSG00000170364 SETMAR METNASE|Mar1 SET domain and mariner transposase fusion gene protein-coding 116.333-109 chr2 29110230 29110523 + 0.666667 NA intron (NM_001287528, intron 1 of 14) intron (NM_001287528, intron 1 of 14) -4502 NR_109844 79745 Hs.122927 NM_024692 ENSG00000115295 CLIP4 RSNL2 CAP-Gly domain containing linker protein family member 4 protein-coding 117-111 chr5 30351447 30351791 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 471059 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 168.667-178 chr5 99240548 99240905 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -293264 NR_110562 102724855 Hs.519477 NR_110562 LINC02113 CTD-2151A2.1 long intergenic non-protein coding RNA 2113 ncRNA 168.333-127 chr3 65583380 65583878 + 0.666667 NA intron (NM_001365904, intron 2 of 24) intron (NM_001365904, intron 2 of 24) -310187 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 140.333-192 chr5 156903522 156903892 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53412 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 206.667-62 chr2 101105622 101106093 + 0.666667 NA intron (NM_001102426, intron 1 of 19) L1MC3|LINE|L1 45590 NM_001330348 11138 Hs.442657 NM_007063 ENSG00000204634 TBC1D8 AD3|GRAMD8|HBLP1|TBC1D8A|VRP TBC1 domain family member 8 protein-coding 127-32 chr15 57875485 57875779 + 0.666667 NA Intergenic L1M3f|LINE|L1 138391 NM_170697 8854 Hs.643455 NM_003888 ENSG00000128918 ALDH1A2 RALDH(II)|RALDH2|RALDH2-T aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 protein-coding 203-63 chr22 31991432 31991916 + 0.666667 NA intron (NR_149128, intron 4 of 4) intron (NR_149128, intron 4 of 4) 20851 NR_149128 105372999 Hs.512525 NR_149128 LINC02558 - long intergenic non-protein coding RNA 2558 ncRNA 140-106 chr7 44206599 44206902 + 0.666667 NA intron (NM_006555, intron 3 of 6) intron (NM_006555, intron 3 of 6) 5772 NM_006555 10652 Hs.520794 NM_006555 ENSG00000106636 YKT6 - YKT6 v-SNARE homolog protein-coding 144.333-265 chr8 78308104 78308477 + 0.666667 NA Intergenic UCON1|Unknown|Unknown -208050 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 192.667-20 chr10 11111851 11112275 + 0.666667 NA intron (NM_001326345, intron 1 of 13) intron (NM_001326345, intron 1 of 13) -6575 NR_046108 439950 Hs.568157 NR_046108 CELF2-AS2 - CELF2 antisense RNA 2 ncRNA 133-85 chr7 27996182 27996450 + 0.666667 NA intron (NM_175061, intron 1 of 4) intron (NM_175061, intron 1 of 4) -184141 NR_034097 100128081 Hs.434307 NR_034097 JAZF1-AS1 - JAZF1 antisense RNA 1 ncRNA 143.667-248 chr8 61390709 61391048 + 0.666667 NA intron (NM_173519, intron 3 of 5) intron (NM_173519, intron 3 of 5) 102908 NM_173519 157807 Hs.591874 NM_173519 ENSG00000177182 CLVS1 C6orf212L|CRALBPL|RLBP1L1 clavesin 1 protein-coding 221.667-38 chr19 28872325 28872863 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -92537 NR_027318 148145 Hs.112651 NR_027318 ENSG00000267339 LINC00906 - long intergenic non-protein coding RNA 906 ncRNA 209.333-241 chr8 107623797 107624305 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -126133 NM_001146 284 Hs.369675 NM_001146 ENSG00000154188 ANGPT1 AGP1|AGPT|ANG1 angiopoietin 1 protein-coding 149.667-151 chr16 74590139 74590455 + 0.666667 NA intron (NR_027264, intron 1 of 26) AluY|SINE|Alu 16817 NM_001145667 2734 Hs.109731 NM_012201 ENSG00000090863 GLG1 CFR-1|ESL-1|MG-160|MG160 golgi glycoprotein 1 protein-coding 150.667-105 chr13 78347678 78347983 + 0.666667 NA intron (NR_047001, intron 3 of 5) intron (NR_047001, intron 3 of 5) -248292 NR_158457 780529 Hs.587755 NR_158457 LOC780529 - uncharacterized LOC780529 ncRNA 154.333-267 chr5 65558006 65558308 + 0.666667 NA intron (NM_001267038, intron 2 of 10) intron (NM_001267038, intron 2 of 10) 5011 NM_001267038 64105 Hs.529778 NM_022145 ENSG00000123219 CENPK AF5alpha|CENP-K|FKSG14|P33|Solt centromere protein K protein-coding 166.667-163 chr4 43084042 43084445 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 190977 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 152-156 chr8 126439958 126440336 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 114652 NR_125421 101927657 Hs.552133 NR_125421 ENSG00000244791 LOC101927657 - uncharacterized LOC101927657 ncRNA 116.667-108 chr20 37202800 37203040 + 0.666667 NA intron (NM_001324305, intron 5 of 17) L1MB5|LINE|L1 -23372 NM_213632 140699 Hs.349125 NM_152503 ENSG00000101353 MROH8 C20orf131|C20orf132 maestro heat like repeat family member 8 protein-coding 166-47 chr16 21688428 21688791 + 0.666667 NA intron (NM_001161683, intron 3 of 23) MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 4180 NM_001161683 146183 Hs.408336 NM_144672 ENSG00000155719 OTOA CT108|DFNB22 otoancorin protein-coding 186.333-146 chr6 150218692 150219110 + 0.666667 NA intron (NM_030949, intron 3 of 3) AluJr|SINE|Alu 75857 NM_030949 81706 Hs.486798 NM_030949 ENSG00000198729 PPP1R14C CPI17-like|KEPI|NY-BR-81 protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 14C protein-coding 136.333-116 chr21 34064643 34064957 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8778 NM_032476 64968 Hs.302742 NM_032476 ENSG00000243927 MRPS6 C21orf101|MRP-S6|RPMS6|S6mt mitochondrial ribosomal protein S6 protein-coding 120.667-19 chr10 49509850 49510070 + 0.666667 NA intron (NM_001346440, intron 5 of 20) intron (NM_001346440, intron 5 of 20) 14321 NM_170753 267004 Hs.49063 NM_170753 ENSG00000225830 PGBD3 - piggyBac transposable element derived 3 protein-coding 163.667-129 chr2 198397914 198398365 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23042 NR_110267 101927619 Hs.632942 NR_110267 LINC01923 - long intergenic non-protein coding RNA 1923 ncRNA 120.333-149 chr5 36202596 36202807 + 0.666667 NA intron (NM_001085411, intron 8 of 11) MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR 38690 NM_001287340 133686 Hs.81907 NM_153013 ENSG00000152620 NADK2 C5orf33|DECRD|MNADK|NADKD1 NAD kinase 2, mitochondrial protein-coding 238-38 chr18 63901477 63901978 + 0.666667 NA intron (NM_002575, intron 5 of 7) intron (NM_002575, intron 5 of 7) -6231 NM_005024 5273 Hs.158339 NM_005024 ENSG00000242550 SERPINB10 PI-10|PI10 serpin family B member 10 protein-coding 131.333-161 chr6 148400338 148400715 + 0.666667 NA intron (NM_001346506, intron 2 of 20) AluJb|SINE|Alu 57688 NM_015278 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 210.333-119 chr4 90146265 90146715 + 0.666667 NA intron (NM_001145065, intron 1 of 10) intron (NM_001145065, intron 1 of 10) 18957 NM_001145065 401145 Hs.654735 NM_207491 ENSG00000184305 CCSER1 FAM190A coiled-coil serine rich protein 1 protein-coding 156.667-114 chr15 22835918 22836316 + 0.666667 NA Intergenic MLT1H|LTR|ERVL-MaLR -2524 NM_001008892 81614 Hs.591003 NM_030922 ENSG00000140157 NIPA2 SLC57A2 NIPA magnesium transporter 2 protein-coding 261.667-49 chr3 81932976 81933656 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52826 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 121-54 chr17 8334470 8334797 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu -5207 NM_153007 146852 Hs.186045 NM_153007 ENSG00000184650 ODF4 CT134|CT136|OPPO1 outer dense fiber of sperm tails 4 protein-coding 132-55 chr18 11402789 11403170 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -51499 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 129.333-23 chr10 84721713 84722022 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 296698 NM_001284242 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 151.667-60 chr11 28309568 28309894 + 0.666667 NA intron (NM_001113528, intron 6 of 6) L2c|LINE|L2 167817 NR_107035 102466876 NR_107035 ENSG00000273912 MIR8068 hsa-mir-8068 microRNA 8068 ncRNA 135.667-144 chr5 73331412 73331746 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -6327 NR_146627 105379033 Hs.145178 NR_146627 LINC02230 - long intergenic non-protein coding RNA 2230 ncRNA 178-45 chr14 62292493 62292946 + 0.666667 NA Intergenic L1P4|LINE|L1 -152746 NR_104063 101954204 Hs.607093 NR_104063 ENSG00000259142 LINC00644 - long intergenic non-protein coding RNA 644 ncRNA 126.333-10 chr1 187970400 187970628 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 526886 NR_132374 106144535 Hs.568709 NR_132374 LINC01037 - long intergenic non-protein coding RNA 1037 ncRNA 185.333-136 chr4 61815379 61815895 + 0.666667 NA intron (NM_001371343, intron 9 of 23) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 346128 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 139-26 chr12 39031085 39031449 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -125676 NM_153634 144402 Hs.40910 NM_153634 ENSG00000139117 CPNE8 - copine 8 protein-coding 283-29 chr4 78793473 78794236 + 0.666667 NA intron (NM_017593, intron 1 of 13) MER33|DNA|hAT-Charlie 17476 NM_198892 55589 Hs.146551 NM_017593 ENSG00000138756 BMP2K BIKE|HRIHFB2017 BMP2 inducible kinase protein-coding 237-55 chr4 165586720 165587240 + 0.666667 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger -97659 NR_121676 101928151 Hs.639858 NR_121676 ENSG00000249500 LINC01179 - long intergenic non-protein coding RNA 1179 ncRNA 155-4 chr1 78915993 78916366 + 0.666667 NA intron (NM_022159, intron 12 of 14) intron (NM_022159, intron 12 of 14) 90551 NM_022159 64123 Hs.132314 NM_022159 ENSG00000162618 ADGRL4 ELTD1|ETL|KPG_003 adhesion G protein-coupled receptor L4 protein-coding 165-8 chr1 224156997 224157442 + 0.666667 NA intron (NR_049764, intron 3 of 3) intron (NR_049764, intron 3 of 3) -26021 NM_003676 8560 Hs.299878 NM_003676 ENSG00000143753 DEGS1 DEGS|DEGS-1|DES1|Des-1|FADS7|HLD18|MIG15|MLD delta 4-desaturase, sphingolipid 1 protein-coding 167.667-219 chr9 123153998 123154479 + 0.666667 NA intron (NR_033234, intron 11 of 18) L1ME3B|LINE|L1 -38761 NR_026677 81571 Hs.708072 NM_030814 ENSG00000236901 MIR600HG C9orf45|GL012|NCRNA00287 MIR600 host gene ncRNA 111.667-33 chr10 58636883 58637121 + 0.666667 NA intron (NM_001080512, intron 2 of 20) intron (NM_001080512, intron 2 of 20) -78013 NR_027508 728640 Hs.729209 NR_027508 FAM133CP - family with sequence similarity 133, member A pseudogene pseudo 135-81 chr4 183473647 183474035 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu 29205 NM_001317343 55602 Hs.592508 NM_017632 ENSG00000168564 CDKN2AIP CARF CDKN2A interacting protein protein-coding 391.333-5 chr10 101878723 101879486 + 0.666667 NA intron (NM_024541, intron 24 of 25) intron (NM_024541, intron 24 of 25) -35184 NM_173197 30819 Hs.97044 NM_014591 ENSG00000120049 KCNIP2 KCHIP2 potassium voltage-gated channel interacting protein 2 protein-coding 149-75 chr20 8510817 8511117 + 0.666667 NA intron (NM_182734, intron 3 of 32) L1MA7|LINE|L1 262263 NR_046809 100874337 Hs.662218 NR_046809 ENSG00000225479 PLCB1-IT1 - PLCB1 intronic transcript 1 ncRNA 125.667-166 chr6 74483887 74484142 + 0.666667 NA intron (NR_110856, intron 2 of 3) L1MC1|LINE|L1 414563 NR_110856 101928516 Hs.384600 NR_110856 ENSG00000223786 LOC101928516 - uncharacterized LOC101928516 ncRNA 117.667-132 chr4 46275002 46275206 + 0.666667 NA intron (NM_001114175, intron 7 of 8) intron (NM_001114175, intron 7 of 8) 114275 NM_001114175 2555 Hs.48372 NM_000807 ENSG00000151834 GABRA2 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha2 subunit protein-coding 151-25 chr12 16621443 16621753 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13384 NM_001243609 55885 Hs.504908 NM_018640 ENSG00000048540 LMO3 RBTN3|RBTNL2|RHOM3|Rhom-3 LIM domain only 3 protein-coding 207-87 chr4 57977933 57978391 + 0.666667 NA Intergenic MER58A|DNA|hAT-Charlie 552290 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 126-2 chr1 78732605 78732970 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 82956 NM_006417 10561 Hs.82316 NM_006417 ENSG00000137965 IFI44 MTAP44|TLDC5|p44 interferon induced protein 44 protein-coding 114-99 chr4 43056034 43056244 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 162873 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 178.333-180 chr9 104475643 104476120 + 0.666667 NA Intergenic LTR88b|LTR|Gypsy? -28382 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 193.667-54 chr17 65730993 65731449 + 0.666667 NA intron (NR_126542, intron 2 of 5) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 95230 NM_001037325 201134 Hs.408676 NM_145036 ENSG00000154240 CEP112 CCDC46|MACOCO centrosomal protein 112 protein-coding 199.667-9 chr1 230731915 230732441 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -15206 NM_001319676 10753 Hs.498021 NM_006615 ENSG00000135773 CAPN9 GC36|nCL-4 calpain 9 protein-coding 207-60 chr2 16821131 16821703 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -155583 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 112-150 chr4 40763127 40763352 + 0.666667 NA intron (NM_024677, intron 4 of 11) intron (NM_024677, intron 4 of 11) 13284 NM_024677 79730 Hs.479602 NM_024677 ENSG00000179299 NSUN7 - NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 7 protein-coding 162.667-215 chr5 53281463 53281760 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 171769 NR_034107 257396 Hs.12326 NR_034107 ENSG00000247796 LOC257396 - uncharacterized LOC257396 ncRNA 115.333-13 chr1 151421075 151421263 + 0.666667 NA intron (NM_001194938, intron 9 of 17) MER44A|DNA|TcMar-Tigger 21036 NM_207171 23126 Hs.489873 NM_015100 ENSG00000143442 POGZ MRD37|WHSUS|ZNF280E|ZNF635|ZNF635m pogo transposable element derived with ZNF domain protein-coding 169-42 chr2 42005635 42005901 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -42253 NM_138370 91461 Hs.408542 NM_138370 ENSG00000162878 PKDCC SGK493|Vlk protein kinase domain containing, cytoplasmic protein-coding 124.333-23 chr11 36298727 36299089 + 0.666667 NA intron (NM_001160167, intron 1 of 8) MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 2620 NM_001160167 79899 Hs.19987 NM_024841 ENSG00000135362 PRR5L PROTOR2 proline rich 5 like protein-coding 139-83 chr5 62792534 62792864 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 213880 NM_181506 100130733 Hs.721348 NM_181506 ENSG00000186105 LRRC70 SLRN leucine rich repeat containing 70 protein-coding 172.333-51 chr14 63546145 63546489 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -2922 NM_001354926 5529 Hs.334868 NM_006246 ENSG00000154001 PPP2R5E B56E|B56epsilon protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon protein-coding 208.333-159 chr9 82293484 82294034 + 0.666667 NA Intergenic AluSz6|SINE|Alu 304987 NM_001001670 389763 Hs.209545 NM_001001670 ENSG00000214929 SPATA31D1 FAM75D1 SPATA31 subfamily D member 1 protein-coding 175.333-172 chr7 50797562 50797931 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4293 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 159.667-27 chr1 178507375 178507809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5517 NM_032126 84066 Hs.534501 NM_032126 ENSG00000240021 TEX35 C1orf49|TSC24 testis expressed 35 protein-coding 153-142 chr8 64893115 64893513 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -94577 NM_004820 9420 Hs.657330 NM_004820 ENSG00000172817 CYP7B1 CBAS3|CP7B|SPG5A cytochrome P450 family 7 subfamily B member 1 protein-coding 302-30 chr2 74151350 74152086 + 0.666667 NA TTS (NM_001317110) TTS (NM_001317110) 3737 NR_045634 100507171 Hs.503348 NR_045634 ENSG00000225439 BOLA3-AS1 - BOLA3 divergent transcript ncRNA 140.333-231 chr8 81259580 81259841 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -20826 NM_001444 2171 Hs.408061 NM_001444 ENSG00000164687 FABP5 E-FABP|EFABP|KFABP|PA-FABP|PAFABP fatty acid binding protein 5 protein-coding 152-76 chr18 13571607 13571903 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 4 of 5) AluY|SINE|Alu -39359 NR_039752 100616130 NR_039752 ENSG00000263527 MIR4526 mir-4526 microRNA 4526 ncRNA 128-7 chr1 219782204 219782402 + 0.666667 NA Intergenic LTR9D|LTR|ERV1 146348 NM_018713 55532 Hs.284450 NM_018713 ENSG00000196660 SLC30A10 HMDPC|HMNDYT1|ZNT10|ZNT8|ZRC1|ZnT-10 solute carrier family 30 member 10 protein-coding 119.667-63 chr16 60215405 60215621 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu 144280 NM_001282301 729159 NM_001282301 NPAP1L - nuclear pore associated protein 1 like protein-coding 202.333-66 chr15 71169209 71169789 + 0.666667 NA intron (NR_120349, intron 1 of 1) L1ME3|LINE|L1 19560 NR_120351 101929196 Hs.680472 NR_120348 THSD4-AS1 - THSD4 antisense RNA 1 ncRNA 144.333-294 chrX 101235800 101236125 + 0.666667 NA exon (NM_001939, exon 4 of 24) exon (NM_001939, exon 4 of 24) 16018 NM_001171184 1821 Hs.159291 NM_001939 ENSG00000102385 DRP2 DRP-2 dystrophin related protein 2 protein-coding 112.667-122 chr2 59009224 59009459 + 0.666667 NA intron (NR_033873, intron 7 of 13) L1MEc|LINE|L1 -208367 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 153.333-205 chr2 88874163 88874500 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 61961 NR_039635 100616399 NR_039635 ENSG00000265510 MIR4436A mir-4436a microRNA 4436a ncRNA 208.667-2 chr1 52645942 52646348 + 0.666667 NA intron (NR_135156, intron 3 of 5) MER20|DNA|hAT-Charlie 12977 NR_135156 348378 Hs.424589 NM_001042693 ENSG00000182183 SHISAL2A FAM159A|PRO7171|WWLS2783 shisa like 2A protein-coding 162.667-293 chr9 71481021 71481463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34271 NM_001366144 80036 Hs.47288 NM_020952 ENSG00000083067 TRPM3 GON-2|LTRPC3|MLSN2 transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 protein-coding 180.667-101 chr3 188981680 188982019 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -34210 NR_046873 100874043 Hs.616287 NR_046873 ENSG00000234076 TPRG1-AS1 - TPRG1 antisense RNA 1 ncRNA 218.333-97 chr5 27598664 27599100 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 126590 NR_038848 643401 Hs.533212 NR_038848 ENSG00000250337 PURPL LINC01021 p53 upregulated regulator of p53 levels ncRNA 159.667-282 chr6 64174214 64174501 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 31 of 43) intron (NM_001292009, intron 31 of 43) 367521 NR_157848 112935969 NR_157848 SCAT8 EYS-AS1 S-phase cancer associated transcript 8 ncRNA 119-79 chr2 129293699 129293964 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3A|LINE|L1 -19940 NR_122040 151121 Hs.531687 NM_001033657 ENSG00000204460 LINC01854 - long intergenic non-protein coding RNA 1854 ncRNA 170-104 chr6 34882706 34883054 + 0.666667 NA intron (NM_001270488, intron 2 of 3) intron (NM_001270488, intron 2 of 3) 5162 NM_005643 6882 Hs.112444 NM_005643 ENSG00000064995 TAF11 MGC:15243|PRO2134|TAF2I|TAFII28 TATA-box binding protein associated factor 11 protein-coding 150.333-221 chr2 174079720 174080156 + 0.666667 NA intron (NM_001011708, intron 8 of 9) intron (NM_001011708, intron 8 of 9) 54658 NR_136175 100128905 Hs.456944 NR_136175 ENSG00000260868 LINC01960 - long intergenic non-protein coding RNA 1960 ncRNA 204.667-113 chr4 124817417 124817921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -104937 NM_020337 57182 Hs.480694 NM_020337 ENSG00000151458 ANKRD50 - ankyrin repeat domain 50 protein-coding 152.333-277 chr4 96596460 96596774 + 0.666667 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) intron (NR_147149, intron 3 of 3) 285914 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 130.333-50 chr12 1049078 1049356 + 0.666667 NA intron (NR_027949, intron 2 of 15) intron (NR_027949, intron 2 of 15) 21469 NM_001301248 23085 Hs.601216 NM_178039 ENSG00000082805 ERC1 Cast2|ELKS|ERC-1|RAB6IP2 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 protein-coding 127.667-76 chr2 24165058 24165315 + 0.666667 NA intron (NR_111929, intron 5 of 5) intron (NR_111929, intron 5 of 5) -9867 NM_001040710 653140 Hs.741736 NM_001040710 ENSG00000186453 FAM228A C2orf84 family with sequence similarity 228 member A protein-coding 186.333-108 chr3 163536625 163537065 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -233544 NR_033945 647107 Hs.408584 NR_033945 ENSG00000241369 LINC01192 CT64 long intergenic non-protein coding RNA 1192 ncRNA 138.667-151 chr4 60887782 60888117 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -34670 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 253-44 chr21 30180705 30181261 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -14178 NM_012131 26285 Hs.258589 NM_012131 ENSG00000156282 CLDN17 - claudin 17 protein-coding 123.333-24 chr1 237882484 237882739 + 0.666667 NA intron (NR_027247, intron 4 of 11) intron (NR_027247, intron 4 of 11) 8311 NM_021186 57829 Hs.136241 NM_021186 ENSG00000116996 ZP4 ZBP|ZP1|ZPB|Zp-4 zona pellucida glycoprotein 4 protein-coding 122.667-16 chr10 74366809 74367092 + 0.666667 NA intron (NM_001369124, intron 4 of 9) intron (NM_001369124, intron 4 of 9) 162374 NR_120673 102723439 NR_120673 LOC102723439 - uncharacterized LOC102723439 ncRNA 118.667-200 chr9 10503426 10503632 + 0.666667 NA intron (NM_002839, intron 2 of 45) intron (NM_002839, intron 2 of 45) 109473 NM_002839 5789 Hs.446083 NM_002839 ENSG00000153707 PTPRD HPTP|HPTPD|HPTPDELTA|PTPD|RPTPDELTA protein tyrosine phosphatase receptor type D protein-coding 160.333-284 chr8 113003054 113003386 + 0.666667 NA intron (NM_198123, intron 6 of 70) AluSq2|SINE|Alu 359727 NR_031745 100302225 NR_031745 ENSG00000238399 MIR2053 hsa-mir-2053 microRNA 2053 ncRNA 242.667-101 chr8 5394220 5394612 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -399502 NM_033225 64478 Hs.571466 NM_033225 ENSG00000183117 CSMD1 PPP1R24 CUB and Sushi multiple domains 1 protein-coding 288.667-9 chr12 109406318 109406995 + 0.666667 NA intron (NM_001101421, intron 7 of 30) AluJb|SINE|Alu 17937 NM_001101421 283446 Hs.512008 NM_173597 ENSG00000174527 MYO1H - myosin IH protein-coding 135.667-162 chr6 147970881 147971227 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -301274 NM_001346505 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 155.333-297 chr5 77214816 77215128 + 0.666667 NA intron (NM_001029853, intron 1 of 20) intron (NM_001029853, intron 1 of 20) 4292 NM_001349748 8622 Hs.584830 NM_003719 ENSG00000113231 PDE8B ADSD|PPNAD3 phosphodiesterase 8B protein-coding 141.667-116 chr2 52977306 52977602 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -274839 NR_039630 100616431 NR_039630 ENSG00000264975 MIR4431 - microRNA 4431 ncRNA 200-14 chr1 221882489 221883020 + 0.666667 NA Intergenic MER68B|LTR|ERVL -42088 NR_125989 101929771 Hs.557001 NR_125989 ENSG00000227925 LINC01655 - long intergenic non-protein coding RNA 1655 ncRNA 116-48 chr15 27505252 27505455 + 0.666667 NA intron (NM_033223, intron 6 of 9) L1MD3|LINE|L1 -344034 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-95 chr12 63186187 63186484 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -33525 NM_000706 552 Hs.2131 NM_000706 ENSG00000166148 AVPR1A AVPR V1a|AVPR1|V1aR arginine vasopressin receptor 1A protein-coding 201.667-72 chr3 26015188 26015642 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -141720 NR_034055 285326 Hs.145246 NR_034055 ENSG00000230891 LINC00692 - long intergenic non-protein coding RNA 692 ncRNA 140.333-88 chr18 41648348 41648622 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -127808 NR_002838 641516 Hs.116612 NR_002838 ENSG00000267313 KC6 - keratoconus gene 6 ncRNA 205.333-114 chr2 21261253 21261606 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 137443 NM_001306137 100129278 Hs.651096 NM_001306137 ENSG00000218819 TDRD15 - tudor domain containing 15 protein-coding 142.333-174 chr4 47010126 47010530 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -16747 NM_001204266 2557 Hs.248112 NM_000809 ENSG00000109158 GABRA4 - gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit protein-coding 184-50 chr2 72513176 72513672 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 10 of 19) intron (NR_135774, intron 10 of 19) 312609 NR_135773 23233 Hs.303454 NM_015189 ENSG00000144036 EXOC6B SEC15B|SEC15L2|SEMDJL3 exocyst complex component 6B protein-coding 196.333 chr1 36187840 36188273 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31896 NM_018067 55700 Hs.356096 NM_018067 ENSG00000116871 MAP7D1 PARCC1|RPRC1 MAP7 domain containing 1 protein-coding 114-178 chr9 116027726 116028038 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102675 NR_024032 58483 Hs.23367 NR_024032 ENSG00000204148 LINC00474 C9orf27|EST-YD1 long intergenic non-protein coding RNA 474 ncRNA 148-68 chr2 11931362 11931702 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -75584 NR_110196 100506457 Hs.197824 NR_110196 ENSG00000224184 MIR3681HG - MIR3681 host gene ncRNA 129.667-177 chr8 121805966 121806353 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -164719 NM_005328 3037 Hs.159226 NM_005328 ENSG00000170961 HAS2 - hyaluronan synthase 2 protein-coding 111.667-161 chr21 34744493 34744727 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1215 NR_038885 100506385 Hs.120179 NR_038885 ENSG00000234380 LINC01426 lincRNA-uc002yug.2 long intergenic non-protein coding RNA 1426 ncRNA 149.667-155 chr17 39288256 39288650 + 0.666667 NA intron (NM_001370208, intron 6 of 14) L1M5|LINE|L1 -8947 NR_162098 113839521 NR_162098 MIR548BC - microRNA 548BC ncRNA 197.667-145 chr8 28870635 28871112 + 0.666667 NA intron (NM_001145159, intron 1 of 15) intron (NM_001145159, intron 1 of 15) 19042 NM_001172562 55756 Hs.162397 NM_018250 ENSG00000104299 INTS9 CPSF2L|INT9|RC74 integrator complex subunit 9 protein-coding 136.667-151 chr5 140256705 140257003 + 0.666667 NA intron (NM_002622, intron 3 of 3) L2a|LINE|L2 46247 NM_002622 5201 Hs.483564 NM_002622 ENSG00000113068 PFDN1 PDF|PFD1 prefoldin subunit 1 protein-coding 169.333-206 chr5 59171430 59171771 + 0.666667 NA intron (NM_001364602, intron 5 of 5) intron (NM_001364602, intron 5 of 5) 104515 NM_001197220 5144 Hs.117545 NM_006203 ENSG00000113448 PDE4D ACRDYS2|DPDE3|HSPDE4D|PDE43|PDE4DN2|STRK1 phosphodiesterase 4D protein-coding 166.333-194 chr5 180815609 180816063 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001364381) promoter-TSS (NM_001364381) -220 NM_001364379 4245 Hs.519818 NM_002406 ENSG00000131446 MGAT1 GLCNAC-TI|GLCT1|GLYT1|GNT-1|GNT-I|GnTI|MGAT mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase protein-coding 121.667-10 chr1 84404442 84404702 + 0.666667 NA intron (NM_021233, intron 2 of 5) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger -3779 NM_058248 58511 Hs.129142 NM_021233 ENSG00000137976 DNASE2B DLAD deoxyribonuclease 2 beta protein-coding 173-11 chr10 122039056 122039518 + 0.666667 NA intron (NM_206862, intron 2 of 22) intron (NM_206862, intron 2 of 22) 50124 NM_206862 10579 Hs.501252 NM_006997 ENSG00000138162 TACC2 AZU-1|ECTACC transforming acidic coiled-coil containing protein 2 protein-coding 157-35 chr12 95834701 95834983 + 0.666667 NA intron (NR_135014, intron 1 of 2) L3|LINE|CR1 23997 NR_135015 105369921 Hs.125549 NR_135014 ENSG00000258343 LOC105369921 - uncharacterized LOC105369921 ncRNA 150.333-158 chr17 53450205 53450609 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -372520 NM_032559 84643 Hs.226805 NM_032559 ENSG00000141200 KIF2B - kinesin family member 2B protein-coding 226.333-83 chr3 183406425 183406891 + 0.666667 NA intron (NM_015078, intron 1 of 29) AluSq|SINE|Alu 21611 NM_015078 23101 Hs.208267 NM_015078 ENSG00000053524 MCF2L2 ARHGEF22 MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 protein-coding 125.333-38 chr11 79526586 79526938 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -85732 NM_001098816 26011 Hs.213087 NM_001098816 ENSG00000149256 TENM4 Doc4|ETM5|ODZ4|TNM4|Ten-M4|ten-4 teneurin transmembrane protein 4 protein-coding 150.667-365 chr8 41733146 41733519 + 0.666667 NA intron (NM_020475, intron 3 of 41) intron (NM_020475, intron 3 of 41) 64290 NM_020476 286 Hs.654438 NM_000037 ENSG00000029534 ANK1 ANK|SPH1|SPH2 ankyrin 1 protein-coding 118-42 chr14 77763921 77764174 + 0.666667 NA intron (NR_161324, intron 1 of 1) intron (NR_161324, intron 1 of 1) -2891 NM_001318844 22938 Hs.445498 NM_012245 ENSG00000100603 SNW1 Bx42|FUN20|NCOA-62|PRPF45|Prp45|SKIIP|SKIP|SKIP1 SNW domain containing 1 protein-coding 128-119 chr8 88017198 88017447 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -143307 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 114.667-37 chr10 82373580 82373833 + 0.666667 NA intron (NR_163253, intron 3 of 10) intron (NR_163253, intron 3 of 10) -140786 NR_120666 101929590 Hs.733268 NR_120666 ENSG00000225738 NRG3-AS1 C10orf100|Em:AC010157.1 NRG3 antisense RNA 1 ncRNA 114.667-244 chr8 73830353 73830685 + 0.666667 NA intron (NR_073119, intron 1 of 5) AluJr|SINE|Alu 48343 NM_001271015 55284 Hs.128841 NM_018299 ENSG00000104343 UBE2W UBC-16|UBC16 ubiquitin conjugating enzyme E2 W protein-coding 125.333-137 chr5 46263580 46263886 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -567353 NM_021072 348980 Hs.353176 NM_021072 ENSG00000164588 HCN1 BCNG-1|BCNG1|EIEE24|HAC-2 hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 protein-coding 151-61 chr2 121984591 121984886 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 229087 NM_004622 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 129.667-142 chr5 114622694 114622978 + 0.666667 NA intron (NR_130785, intron 3 of 12) intron (NR_130785, intron 3 of 12) 46795 NR_134282 101927059 Hs.385789 NR_134282 ENSG00000251542 LINC01957 - long intergenic non-protein coding RNA 1957 ncRNA 157-11 chr1 195730393 195730781 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 358128 NR_146895 105371673 NR_146895 LINC01724 - long intergenic non-protein coding RNA 1724 ncRNA 149.333-168 chr2 25537179 25537421 + 0.666667 NA intron (NM_033147, intron 8 of 19) intron (NM_033147, intron 8 of 19) 112922 NM_001256308 1838 Hs.307720 NM_021907 ENSG00000138101 DTNB - dystrobrevin beta protein-coding 142.333-13 chr1 224897180 224897492 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -32318 NM_144989 127602 Hs.133977 NM_001373 ENSG00000185842 DNAH14 C1orf67|Dnahc14|HL-18|HL18 dynein axonemal heavy chain 14 protein-coding 138-89 chr5 29869163 29869435 + 0.666667 NA Intergenic MLT2B3|LTR|ERVL -11261 NR_134264 105374704 Hs.151157 NR_134264 LOC105374704 - uncharacterized LOC105374704 ncRNA 178.333-44 chr13 33515162 33515593 + 0.666667 NA intron (NM_001243476, intron 4 of 17) intron (NM_001243476, intron 4 of 17) 161417 NM_001243476 90627 Hs.156551 NM_052851 ENSG00000133121 STARD13 ARHGAP37|DLC2|GT650|LINC00464 StAR related lipid transfer domain containing 13 protein-coding 114-80 chr20 52041321 52041624 + 0.666667 NA Intergenic Charlie4z|DNA|hAT-Charlie 64012 NM_001319146 55734 Hs.473082 NM_018197 ENSG00000020256 ZFP64 ZNF338 ZFP64 zinc finger protein protein-coding 122.333-2 chr1 20771834 20772155 + 0.666667 NA intron (NM_016287, intron 5 of 12) intron (NM_016287, intron 5 of 12) 14694 NM_016287 50809 Hs.142442 NM_016287 ENSG00000127483 HP1BP3 HP1-BP74|HP1BP74 heterochromatin protein 1 binding protein 3 protein-coding 170.333-145 chr3 136265691 136266035 + 0.666667 NA intron (NM_000532, intron 5 of 14) AluY|SINE|Alu 15523 NM_000532 5096 Hs.63788 NM_000532 ENSG00000114054 PCCB - propionyl-CoA carboxylase subunit beta protein-coding 179.333-56 chr13 49741204 49741642 + 0.666667 NA intron (NM_002267, intron 2 of 16) L1MA8|LINE|L1 -49936 NR_103802 84650 Hs.433278 NM_032565 ENSG00000123179 EBPL EBRP EBP like protein-coding 113-64 chr15 49299036 49299328 + 0.666667 NA intron (NM_001289030, intron 9 of 10) L1PA15|LINE|L1 -124060 NM_002009 2252 Hs.567268 NM_002009 ENSG00000140285 FGF7 HBGF-7|KGF fibroblast growth factor 7 protein-coding 125.333-87 chr2 35554090 35554408 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3F|LINE|L1 82844 NR_039629 100616475 NR_039629 ENSG00000265301 MIR548AD - microRNA 548ad ncRNA 180.667-122 chr6 65151306 65151795 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 12 of 43) LTR16A|LTR|ERVL -149868 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 148.333-219 chr2 236454375 236454705 + 0.666667 NA intron (NR_073043, intron 6 of 19) intron (NR_073043, intron 6 of 19) 49157 NM_001270585 79781 Hs.591594 NM_024726 ENSG00000132321 IQCA1 4930465P12Rik|DRC11|IQCA IQ motif containing with AAA domain 1 protein-coding 117.667-86 chr2 98559638 98559892 + 0.666667 NA intron (NM_001351428, intron 17 of 24) intron (NM_001351428, intron 17 of 24) 48747 NM_001008215 493753 Hs.596537 NM_001008215 ENSG00000183513 COA5 6330578E17Rik|C2orf64|CEMCOX3|Pet191 cytochrome c oxidase assembly factor 5 protein-coding 120.333-181 chr8 55534990 55535194 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_052898, exon 3 of 3) 3' UTR (NM_052898, exon 3 of 3) -14114 NR_134323 105375843 Hs.662416 NR_134323 ENSG00000254357 LOC105375843 - uncharacterized LOC105375843 ncRNA 148.333-112 chr13 112939389 112939719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 29084 NR_034002 100289410 Hs.667436 NR_034002 MCF2L-AS1 - MCF2L antisense RNA 1 ncRNA 178-94 chr5 109432243 109432684 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -22489 NM_014819 9867 Hs.483036 NM_014819 ENSG00000198961 PJA2 Neurodap1|RNF131 praja ring finger ubiquitin ligase 2 protein-coding 222.667-51 chr22 26125020 26125526 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44189 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 115.333-224 chr8 123811307 123811572 + 0.666667 NA TTS (NM_001317918) TTS (NM_001317918) -40548 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 121-107 chr4 62724839 62725053 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -563181 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 162.333-230 chr6 167486461 167486867 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13874 NR_134591 105378127 Hs.58456 NR_134591 LOC105378127 - uncharacterized LOC105378127 ncRNA 158-15 chr10 90961130 90961458 + 0.666667 NA intron (NR_131214, intron 3 of 5) intron (NR_131214, intron 3 of 5) 13994 NR_131214 105378427 NR_131214 XLOC_008559 - uncharacterized LOC105378427 ncRNA 189-56 chr22 26050220 26050622 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -119041 NM_001184777 23544 Hs.194766 NM_021115 ENSG00000100095 SEZ6L - seizure related 6 homolog like protein-coding 124-96 chr5 85377025 85377335 + 0.666667 NA Intergenic L1MA8|LINE|L1 -905264 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 134.333-140 chr5 85354290 85354582 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -928008 NR_003719 285622 Hs.449272 NR_003719 NBPF22P - NBPF member 22, pseudogene pseudo 165.667-145 chr4 89031158 89031506 + 0.666667 NA intron (NM_014883, intron 1 of 23) intron (NM_014883, intron 1 of 23) 25853 NM_014883 10144 Hs.97270 NM_014883 ENSG00000138640 FAM13A ARHGAP48|FAM13A1 family with sequence similarity 13 member A protein-coding 189.667-119 chr5 130530403 130530810 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 626141 NM_175856 337876 Hs.213137 NM_175856 ENSG00000198108 CHSY3 CHSY2|CSS3 chondroitin sulfate synthase 3 protein-coding 222-89 chr7 78762900 78763261 + 0.666667 NA intron (NM_001301128, intron 2 of 20) intron (NM_001301128, intron 2 of 20) -245908 NR_046689 100874021 Hs.128252 NR_046689 ENSG00000226978 MAGI2-AS2 - MAGI2 antisense RNA 2 ncRNA 188.667-36 chr12 80945098 80945444 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7356 NM_004664 8825 Hs.144333 NM_004664 ENSG00000111052 LIN7A LIN-7A|LIN7|MALS-1|MALS1|TIP-33|VELI1 lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component protein-coding 136.667-95 chr2 128988961 128989209 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 124485 NR_110278 101927881 Hs.570247 NR_110278 LOC101927881 - uncharacterized LOC101927881 ncRNA 119.333-216 chr8 100860332 100860603 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90104 NM_001135702 7534 Hs.492407 NM_003406 ENSG00000164924 YWHAZ 14-3-3-zeta|HEL-S-3|HEL-S-93|HEL4|KCIP-1|POPCHAS|YWHAD tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta protein-coding 207.333-137 chr2 120750563 120750985 + 0.666667 NA intron (NM_001371271, intron 1 of 13) intron (NM_001371271, intron 1 of 13) 14906 NM_001371271 112.667-134 chr2 177506266 177506581 + 0.666667 NA intron (NM_003659, intron 15 of 19) L1MA4|LINE|L1 46373 NM_152517 150737 Hs.447659 NM_152517 ENSG00000196659 TTC30B IFT70|IFT70B|fleer tetratricopeptide repeat domain 30B protein-coding 123-43 chr15 56128141 56128367 + 0.666667 NA intron (NM_001370561, intron 7 of 11) L1M4|LINE|L1 61678 NM_001368074 64864 Hs.745089 NM_022841 ENSG00000181827 RFX7 RFXDC2 regulatory factor X7 protein-coding 184.333-27 chr12 60819606 60819972 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 1130419 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 127-73 chr5 128674913 128675142 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136782 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 165.333-157 chr22 49814668 49814965 + 0.666667 NA intron (NM_001304809, intron 2 of 12) intron (NM_001304809, intron 2 of 12) 9515 NR_146335 23774 Hs.127950 NM_014577 ENSG00000100425 BRD1 BRL|BRPF1|BRPF2 bromodomain containing 1 protein-coding 145-114 chr8 39969915 39970323 + 0.666667 NA intron (NM_194294, intron 3 of 10) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 35164 NM_194294 169355 Hs.676257 NM_194294 ENSG00000188676 IDO2 INDOL1 indoleamine 2,3-dioxygenase 2 protein-coding 152.667-328 chr6 68111255 68111638 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 56095 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 127.667-82 chr2 70181624 70181855 + 0.666667 NA exon (NM_001348761, exon 3 of 10) exon (NM_001348761, exon 3 of 10) 8972 NM_001348763 54980 Hs.720049 NM_017880 ENSG00000115998 C2orf42 - chromosome 2 open reading frame 42 protein-coding 122-3 chr1 42419548 42419792 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_173642, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_173642, exon 5 of 5) 36352 NM_032257 84217 Hs.294009 NM_032257 ENSG00000066185 ZMYND12 - zinc finger MYND-type containing 12 protein-coding 150.667-215 chr20 49860373 49860779 + 0.666667 NA intron (NR_048539, intron 7 of 13) AluSz|SINE|Alu -3283 NR_162136 113219455 NR_162136 MIR12122 - microRNA 12122 ncRNA 206.667-63 chr2 109346387 109346767 + 0.666667 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) -32952 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 270-37 chr3 13286394 13286994 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 133628 NM_024923 23225 Hs.475525 NM_024923 ENSG00000132182 NUP210 GP210|POM210 nucleoporin 210 protein-coding 169.667-67 chr14 99866947 99867352 + 0.666667 NA intron (NM_004434, intron 3 of 21) L1MB2|LINE|L1 73736 NM_004434 2009 Hs.12451 NM_004434 ENSG00000066629 EML1 BH|ELP79|EMAP|EMAPL|HuEMAP EMAP like 1 protein-coding 210-146 chr8 103643445 103643887 + 0.666667 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) L1MD3|LINE|L1 -141756 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 135.333-145 chr5 77826076 77826366 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7|DNA|hAT-Charlie -49860 NM_004607 6902 Hs.291212 NM_004607 ENSG00000171530 TBCA - tubulin folding cofactor A protein-coding 125.333-16 chr1 191936871 191937133 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -221460 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 133.667-77 chr2 127148811 127149096 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -41799 NM_139351 274 Hs.193163 NM_004305 ENSG00000136717 BIN1 AMPH2|AMPHL|CNM2|SH3P9 bridging integrator 1 protein-coding 127.667-97 chr2 180859001 180859367 + 0.666667 NA intron (NR_104324, intron 4 of 4) MamGypLTR3a|LTR|Gypsy -121201 NM_001278555 10477 Hs.470804 NM_006357 ENSG00000170035 UBE2E3 UBCH9|UbcM2 ubiquitin conjugating enzyme E2 E3 protein-coding 126.667-170 chr7 91970160 91970487 + 0.666667 NA intron (NM_147185, intron 1 of 49) L1MA4|LINE|L1 29448 NM_005751 10142 Hs.651221 NM_005751 ENSG00000127914 AKAP9 AKAP-9|AKAP350|AKAP450|CG-NAP|HYPERION|LQT11|MU-RMS-40.16A|PPP1R45|PRKA9|YOTIAO A-kinase anchoring protein 9 protein-coding 118-105 chr5 137218732 137219017 + 0.666667 NA intron (NM_004598, intron 3 of 10) intron (NM_004598, intron 3 of 10) 90677 NR_134246 105379192 Hs.124611 NR_134246 LOC105379192 - uncharacterized LOC105379192 ncRNA 267-14 chr11 112399694 112400321 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 -82225 NR_120559 101928823 Hs.126118 NR_120559 ENSG00000254968 LINC02763 - long intergenic non-protein coding RNA 2763 ncRNA 218-69 chr21 22636015 22636404 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -443075 NR_106746 102466967 NR_106746 ENSG00000275469 MIR6130 hsa-mir-6130 microRNA 6130 ncRNA 112-149 chr4 38190709 38190955 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 70878 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 173.333-25 chr10 42689424 42689878 + 0.666667 NA intron (NR_120658, intron 1 of 3) intron (NR_120658, intron 1 of 3) 2108 NR_120656 101929397 Hs.729796 NR_120656 LINC01518 - long intergenic non-protein coding RNA 1518 ncRNA 139-71 chr4 44922823 44923206 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -196380 NM_001270881 132789 Hs.21398 NM_138335 ENSG00000163281 GNPDA2 GNP2|SB52 glucosamine-6-phosphate deaminase 2 protein-coding 220-10 chr10 43567183 43567779 + 0.666667 NA intron (NM_001099283, intron 1 of 1) intron (NM_001099283, intron 1 of 1) 978 NM_005674 8187 Hs.25040 NM_005674 ENSG00000196793 ZNF239 HOK-2|MOK2 zinc finger protein 239 protein-coding 275.333-45 chr22 49100229 49100865 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 233777 NR_038944 100128946 Hs.535676 NR_038944 ENSG00000205632 LINC01310 WI2-81516E3.1 long intergenic non-protein coding RNA 1310 ncRNA 190.667-136 chr7 31936569 31936989 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) MER4D0|LTR|ERV1 133628 NM_001191057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 267.333-77 chr6 41389591 41390050 + 0.666667 NA Intergenic HAL1|LINE|L1 54212 NM_001199509 9436 Hs.194721 NM_004828 ENSG00000096264 NCR2 CD336|LY95|NK-p44|NKP44|dJ149M18.1 natural cytotoxicity triggering receptor 2 protein-coding 180-48 chr18 67719689 67720085 + 0.666667 NA intron (NR_033921, intron 1 of 4) intron (NR_033921, intron 1 of 4) 94935 NR_146471 101927430 Hs.621261 NR_146471 ENSG00000265555 LINC01903 - long intergenic non-protein coding RNA 1903 ncRNA 146-36 chr15 48867566 48867855 + 0.666667 NA intron (NM_203349, intron 6 of 11) intron (NM_203349, intron 6 of 11) -10424 NM_014335 23741 Hs.255973 NM_014335 ENSG00000255302 EID1 C15orf3|CRI1|EID-1|IRO45620|PNAS-22|PTD014|RBP21 EP300 interacting inhibitor of differentiation 1 protein-coding 160.667-271 chr7 14729429 14729810 + 0.666667 NA intron (NM_001350717, intron 5 of 24) intron (NM_001350717, intron 5 of 24) 111831 NM_145695 1607 Hs.567255 NM_004080 ENSG00000136267 DGKB DAGK2|DGK|DGK-BETA diacylglycerol kinase beta protein-coding 173.333-197 chr8 25864159 25864531 + 0.666667 NA intron (NM_022659, intron 10 of 15) L1ME4a|LINE|L1 181068 NM_022659 64641 Hs.491292 NM_022659 ENSG00000221818 EBF2 COE2|EBF-2|O/E-3|OE-3 EBF transcription factor 2 protein-coding 116-108 chr3 95270452 95270639 + 0.666667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 332282 NR_015400 255025 Hs.130994 NR_015400 ENSG00000239589 LINC00879 - long intergenic non-protein coding RNA 879 ncRNA 308.667-11 chr10 118941133 118941776 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR -88260 NM_199461 340719 Hs.591918 NM_199461 ENSG00000188613 NANOS1 EC_Rep1a|NOS-1|NOS1|SPGF12|ZC2HC12A nanos C2HC-type zinc finger 1 protein-coding 268.333-47 chr5 74400120 74400831 + 0.666667 NA intron (NR_126354, intron 2 of 2) intron (NR_126354, intron 2 of 2) 77989 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 250.333-43 chr3 112369387 112369852 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 36463 NR_158642 4345 Hs.79015 NM_005944 ENSG00000091972 CD200 MOX1|MOX2|MRC|OX-2 CD200 molecule protein-coding 154.333-118 chr17 49563450 49563752 + 0.666667 NA intron (NR_103773, intron 1 of 2) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 10463 NR_103773 100288866 Hs.720309 NR_103773 ENSG00000249906 LOC100288866 - uncharacterized LOC100288866 ncRNA 122-112 chr7 26560823 26561114 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22143 NR_022006 9808 Hs.69749 NM_014769 ENSG00000122548 KIAA0087 - KIAA0087 lncRNA ncRNA 217-44 chr2 34437190 34437744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -240090 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 155.667-341 chr7 114128165 114128472 + 0.666667 NA intron (NR_033766, intron 1 of 19) intron (NR_033766, intron 1 of 19) 41991 NR_033766 93986 Hs.282787 NM_014491 ENSG00000128573 FOXP2 CAGH44|SPCH1|TNRC10 forkhead box P2 protein-coding 148-157 chr8 86716780 86717056 + 0.666667 NA intron (NM_019098, intron 3 of 17) L1MA5A|LINE|L1 26757 NM_019098 54714 Hs.154433 NM_019098 ENSG00000170289 CNGB3 ACHM1 cyclic nucleotide gated channel beta 3 protein-coding 187.333-68 chr14_GL000225v1_random 86212 86630 + 0.666667 NA NA BSR/Beta|Satellite|Satellite NA NA 169-36 chr17 9034446 9034847 + 0.666667 NA intron (NM_004822, intron 2 of 6) AluSx|SINE|Alu 13136 NM_004822 9423 Hs.660885 NM_004822 ENSG00000065320 NTN1 MRMV4|NTN1L netrin 1 protein-coding 148.333-311 chr5 43299909 43300293 + 0.666667 NA intron (NM_002130, intron 1 of 9) LTR33B|LTR|ERVL 13080 NM_001330663 3157 Hs.397729 NM_002130 ENSG00000112972 HMGCS1 HMGCS 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 protein-coding 148.333-216 chr2 228108255 228108690 + 0.666667 NA intron (NM_030623, intron 3 of 10) intron (NM_030623, intron 3 of 10) 73173 NM_030623 80309 Hs.436306 NM_030623 ENSG00000153820 SPHKAP SKIP SPHK1 interactor, AKAP domain containing protein-coding 157.667-36 chr10 84318588 84318871 + 0.666667 NA Intergenic AluSg|SINE|Alu -9860 NM_018999 54462 Hs.461988 NM_018999 ENSG00000107771 CCSER2 FAM190B|Gcap14|KIAA1128|bA486O22.1 coiled-coil serine rich protein 2 protein-coding 168.667-140 chr3 70262862 70263196 + 0.666667 NA intron (NM_001364676, intron 2 of 4) L1MEc|LINE|L1 49609 NM_001364676 107986096 NM_001364676 ENSG00000242120 MDFIC2 - MyoD family inhibitor domain containing 2 protein-coding 142-104 chr4 77142360 77142710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14672 NM_004354 901 Hs.740456 NM_004354 ENSG00000138764 CCNG2 - cyclin G2 protein-coding 117.667-170 chr6 133289926 133290175 + 0.666667 NA intron (NM_172103, intron 2 of 18) intron (NM_172103, intron 2 of 18) 48551 NM_001301013 2070 Hs.596680 NM_004100 ENSG00000112319 EYA4 CMD1J|DFNA10 EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 protein-coding 148.333-144 chr15 77016990 77017333 + 0.666667 NA intron (NM_001321136, intron 2 of 15) intron (NM_001321136, intron 2 of 15) 22035 NM_003978 9051 Hs.129758 NM_003978 ENSG00000140368 PSTPIP1 CD2BP1|CD2BP1L|CD2BP1S|H-PIP|PAPAS|PSTPIP proline-serine-threonine phosphatase interacting protein 1 protein-coding 217.333-59 chr18 58100520 58101136 + 0.666667 NA intron (NM_001144964, intron 1 of 30) AluJo|SINE|Alu -48492 NM_001144969 23327 Hs.185677 NM_015277 ENSG00000049759 NEDD4L NEDD4-2|NEDD4.2|PVNH7|RSP5|hNEDD4-2 NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 158.333-213 chr3 148141971 148142318 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 63985 NR_134937 100507461 Hs.112623 NR_134937 ENSG00000241131 LINC02032 - long intergenic non-protein coding RNA 2032 ncRNA 186.333-96 chr3 22589479 22590006 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 612836 NR_136177 100505877 Hs.125904 NR_136176 ENSG00000233153 UBE2E2-AS1 - UBE2E2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 176-4 chr1 80333164 80333490 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -202428 NR_125941 101927412 Hs.171273 NR_125940 ENSG00000234184 LINC01781 - long intergenic non-protein coding RNA 1781 ncRNA 170.667-157 chr7 75745926 75746402 + 0.666667 NA Intergenic LTR47A|LTR|ERVL -7223 NM_005338 3092 Hs.329266 NM_005338 ENSG00000127946 HIP1 HIP-I|ILWEQ|SHON|SHONbeta|SHONgamma huntingtin interacting protein 1 protein-coding 243-52 chr5 113056050 113056687 + 0.666667 NA intron (NM_001085377, intron 14 of 18) L1PA13|LINE|L1 79570 NR_038352 167227 Hs.443875 NM_152624 ENSG00000172795 DCP2 NUDT20 decapping mRNA 2 protein-coding 211.667-109 chr8 80775572 80776075 + 0.666667 NA intron (NM_001033723, intron 2 of 8) intron (NM_001033723, intron 2 of 8) 98645 NM_001367783 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 213.667-90 chr8 70625945 70626419 + 0.666667 NA intron (NR_038881, intron 1 of 3) L2|LINE|L2 17605 NR_038881 286190 Hs.662204 NR_038881 ENSG00000246366 LACTB2-AS1 - LACTB2 antisense RNA 1 ncRNA 159.667-185 chr2 228691287 228691742 + 0.666667 NA Intergenic L1MEh|LINE|L1 -80119 NR_151716 101928765 Hs.334040 NR_151716 ENSG00000232023 LINC01807 - long intergenic non-protein coding RNA 1807 ncRNA 144-165 chrX 112411332 112411613 + 0.666667 NA intron (NM_001004308, intron 2 of 2) L1MA3|LINE|L1 268466 NM_178175 340596 Hs.297420 NM_178175 ENSG00000182508 LHFPL1 - LHFPL tetraspan subfamily member 1 protein-coding 130.333-13 chr1 117675564 117675809 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69638 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 112.333-186 chr4 73208857 73209082 + 0.666667 NA intron (NM_032217, intron 1 of 33) AluSx|SINE|Alu 14088 NM_001286771 26057 Hs.601206 NM_015574 ENSG00000132466 ANKRD17 GTAR|MASK2|NY-BR-16 ankyrin repeat domain 17 protein-coding 115.333-163 chr4 139435278 139435551 + 0.666667 NA Intergenic L1M4c|LINE|L1 18627 NR_159964 107984036 Hs.605782 NR_159963 LOC107984036 - uncharacterized LOC107984036 ncRNA 129-96 chr5 43178593 43178808 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -13525 NM_153361 167359 Hs.25845 NM_153361 ENSG00000177453 NIM1K NIM1 NIM1 serine/threonine protein kinase protein-coding 120.333-124 chr3 16112819 16113070 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61736 NM_001319051 117248 Hs.411308 NM_054110 ENSG00000131386 GALNT15 GALNACT15|GALNT13|GALNT7|GALNTL2|PIH5|pp-GalNAc-T15 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 protein-coding 112-60 chr14 53288246 53288452 + 0.666667 NA Intergenic L1MB3|LINE|L1 134995 NR_110062 101927620 NR_110062 ENSG00000258731 LOC101927620 - uncharacterized LOC101927620 ncRNA 123.667-134 chr4 34976055 34976276 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -706418 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 128.667-73 chr17 40315696 40315966 + 0.666667 NA intron (NM_000964, intron 1 of 8) intron (NM_000964, intron 1 of 8) -2414 NM_001145302 5914 Hs.654583 NM_000964 ENSG00000131759 RARA NR1B1|RAR retinoic acid receptor alpha protein-coding 115.667-125 chr2 187608191 187608378 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53779 NM_001032281 7035 Hs.516578 NM_006287 ENSG00000003436 TFPI EPI|LACI|TFI|TFPI1 tissue factor pathway inhibitor protein-coding 115.333-77 chr14 84647967 84648302 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -623798 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 125.667-46 chr12 47643714 47643940 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 62203 NM_024604 79657 Hs.437855 NM_024604 ENSG00000005175 RPAP3 Tah1|hSpagh RNA polymerase II associated protein 3 protein-coding 152.333-103 chr14 45589386 45589774 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 126022 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 173.667-163 chr7 46022503 46022874 + 0.666667 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -101416 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 133.333-48 chr14 37067305 37067634 + 0.666667 NA intron (NM_001171170, intron 1 of 10) L1MEd|LINE|L1 -104557 NR_033240 100129794 Hs.601579 NR_033240 ENSG00000258708 SLC25A21-AS1 - SLC25A21 antisense RNA 1 ncRNA 129-106 chr5 143067655 143067998 + 0.666667 NA intron (NR_146198, intron 17 of 22) MLT1N2|LTR|ERVL-MaLR -124674 NR_046816 100874372 Hs.666717 NR_046816 ENSG00000230789 ARHGAP26-IT1 - ARHGAP26 intronic transcript 1 ncRNA 112.667-112 chr2 13489787 13489970 + 0.666667 NA Intergenic MER57A-int|LTR|ERV1 -482865 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 135.667-133 chr4 95126439 95126752 + 0.666667 NA intron (NM_001256792, intron 6 of 10) MIR|SINE|MIR 35104 NM_001256794 658 Hs.598475 NM_001203 ENSG00000138696 BMPR1B ALK-6|ALK6|AMDD|BDA1D|BDA2|CDw293 bone morphogenetic protein receptor type 1B protein-coding 157-100 chr5 5898678 5899069 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 438419 NR_028351 401172 Hs.376760 NM_001001702 ENSG00000250490 LINC02145 - long intergenic non-protein coding RNA 2145 ncRNA 140-128 chr9 76884474 76884805 + 0.666667 NA intron (NM_001308048, intron 1 of 17) Charlie19a|DNA|hAT-Charlie 21448 NM_001308047 158471 Hs.262857 NM_015225 ENSG00000106772 PRUNE2 BMCC1|BNIPXL|C9orf65|KIAA0367 prune homolog 2 with BCH domain protein-coding 128.667-180 chr8 67317215 67317470 + 0.666667 NA intron (NM_006421, intron 1 of 38) MER21C|LTR|ERVL 26439 NM_006421 10565 Hs.656902 NM_006421 ENSG00000066777 ARFGEF1 ARFGEP1|BIG1|P200 ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1 protein-coding 224.333-72 chr20 52848182 52848704 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -123915 NM_173485 128553 Hs.473117 NM_173485 ENSG00000182463 TSHZ2 C20orf17|OVC10-2|TSH2|ZABC2|ZNF218 teashirt zinc finger homeobox 2 protein-coding 115.333-95 chr17 59378688 59379001 + 0.666667 NA intron (NM_001005404, intron 2 of 4) intron (NM_001005404, intron 2 of 4) 12761 NR_039882 100616204 NR_039882 ENSG00000263857 MIR4729 - microRNA 4729 ncRNA 116-21 chr10 64917338 64917600 + 0.666667 NA intron (NR_134456, intron 1 of 1) L1M1|LINE|L1 7049 NR_134456 101928887 Hs.463900 NR_134456 ENSG00000224714 LINC02671 - long intergenic non-protein coding RNA 2671 ncRNA 197.333-139 chr21 35203727 35204176 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -154653 NM_001754 861 Hs.149261 NM_001754 ENSG00000159216 RUNX1 AML1|AML1-EVI-1|AMLCR1|CBF2alpha|CBFA2|EVI-1|PEBP2aB|PEBP2alpha RUNX family transcription factor 1 protein-coding 128.333-132 chr3 115010404 115010708 + 0.666667 NA intron (NM_015642, intron 1 of 9) L1MA3|LINE|L1 60858 NM_001164343 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 145.667-121 chr18 61507810 61508136 + 0.666667 NA intron (NM_031891, intron 6 of 11) intron (NM_031891, intron 6 of 11) 174543 NM_031891 28316 Hs.671510 NM_031891 ENSG00000101542 CDH20 CDH7L3|Cdh7 cadherin 20 protein-coding 127.667-85 chr2 95203741 95204119 + 0.666667 NA Intergenic LOR1b|LTR|ERV1 38121 NM_001291604 7549 Hs.590916 NM_021088 ENSG00000275111 ZNF2 A1-5|ZNF661|Zfp661 zinc finger protein 2 protein-coding 153-140 chr8 59432540 59432921 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 313520 NR_149030 100505501 NR_149030 LOC100505501 - uncharacterized LOC100505501 ncRNA 137.333-206 chr9 102031913 102032319 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -293536 NM_133445 116443 Hs.654783 NM_133445 ENSG00000198785 GRIN3A GluN3A|NMDAR-L|NR3A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3A protein-coding 151.333-97 chr12 22048781 22049143 + 0.666667 NA intron (NR_135117, intron 1 of 6) MER67B|LTR|ERV1 2744 NM_018686 55907 Hs.311346 NM_018686 ENSG00000111726 CMAS CSS cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase protein-coding 145.667-167 chr22 22809730 22810006 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -12908 NR_030755 723778 NR_030755 ENSG00000284049 MIR650 MIRN650|hsa-mir-650 microRNA 650 ncRNA 122.333-215 chr9 23563044 23563256 + 0.666667 NA intron (NR_121602, intron 11 of 27) L2c|LINE|L2 109249 NR_121602 101929563 Hs.533220 NR_121602 ENSG00000283982 LOC101929563 - uncharacterized LOC101929563 ncRNA 148-121 chr4 121395307 121395668 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14469 NM_198179 84109 Hs.368977 NM_198179 ENSG00000186867 QRFPR AQ27|GPR103|SP9155 pyroglutamylated RFamide peptide receptor protein-coding 203-91 chr6 18775040 18775647 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 203559 NR_030312 693125 NR_030312 ENSG00000207775 MIR548A1 MIRN548A1 microRNA 548a-1 ncRNA 137.333-10 chr1 229938543 229938858 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44792 NR_146475 101927504 NR_146473 ENSG00000227043 LINC01682 - long intergenic non-protein coding RNA 1682 ncRNA 173-66 chr4 80237487 80237851 + 0.666667 NA Intergenic MER20|DNA|hAT-Charlie -28919 NM_004464 2250 Hs.37055 NM_004464 ENSG00000138675 FGF5 HBGF-5|Smag-82|TCMGLY fibroblast growth factor 5 protein-coding 111.667-186 chr4 87580587 87580754 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -27859 NM_014208 1834 Hs.678914 NM_014208 ENSG00000152591 DSPP DFNA39|DGI1|DMP3|DPP|DSP dentin sialophosphoprotein protein-coding 179-85 chr6 49419612 49420096 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 43399 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 182.333-141 chr6 132152628 132152995 + 0.666667 NA intron (NR_038981, intron 1 of 2) intron (NR_038981, intron 1 of 2) 18833 NR_038981 100507254 Hs.103070 NR_038981 ENSG00000228495 LINC01013 - long intergenic non-protein coding RNA 1013 ncRNA 148.333-351 chr7 3944978 3945277 + 0.666667 NA intron (NM_152744, intron 5 of 44) AluSx|SINE|Alu -184558 NM_001079653 221935 Hs.653013 NM_152744 ENSG00000146555 SDK1 - sidekick cell adhesion molecule 1 protein-coding 128-116 chr8 54629822 54630196 + 0.666667 NA exon (NM_006269, exon 4 of 4) exon (NM_006269, exon 4 of 4) 13913 NM_006269 6101 Hs.732820 NM_006269 ENSG00000104237 RP1 DCDC4A|ORP1 RP1 axonemal microtubule associated protein-coding 165.333 chr1 22037136 22037517 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -11278 NR_110692 101928043 Hs.617422 NR_110692 ENSG00000228397 LINC01635 - long intergenic non-protein coding RNA 1635 ncRNA 249.667-58 chr22 40547008 40547631 + 0.666667 NA intron (NM_020831, intron 3 of 14) L2a|LINE|L2 -13492 NM_001318139 57591 Hs.654688 NM_020831 ENSG00000196588 MRTFA BSAC|MAL|MKL|MKL1|MRTF-A myocardin related transcription factor A protein-coding 134.667-166 chr6 16915525 16915825 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -154185 NM_001128164 6310 Hs.434961 NM_000332 ENSG00000124788 ATXN1 ATX1|D6S504E|SCA1 ataxin 1 protein-coding 177.333-10 chr1 164016474 164016863 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -542692 NM_001353131 5087 Hs.557097 NM_002585 ENSG00000185630 PBX1 CAKUHED PBX homeobox 1 protein-coding 142-30 chr12 120176471 120176892 + 0.666667 NA intron (NM_006836, intron 9 of 57) intron (NM_006836, intron 9 of 57) 18034 NM_006836 10985 Hs.298716 NM_006836 ENSG00000089154 GCN1 GCN1L|GCN1L1|PRIC295 GCN1 activator of EIF2AK4 protein-coding 298-79 chr8 73764475 73765047 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu -17053 NM_001164384 27067 Hs.561815 NM_014393 ENSG00000040341 STAU2 39K2|39K3 staufen double-stranded RNA binding protein 2 protein-coding 148.333-95 chr12 43618110 43618512 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -66108 NM_025003 80070 Hs.287554 NM_025003 ENSG00000173157 ADAMTS20 ADAM-TS20|ADAMTS-20|GON-1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 20 protein-coding 113.333-259 chr8 105894479 105894714 + 0.666667 NA intron (NR_125796, intron 2 of 7) L1MC4a|LINE|L1 165907 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 117-93 chr22 45258035 45258239 + 0.666667 NA Intergenic MSTB|LTR|ERVL-MaLR -17368 NM_001009880 23313 Hs.592207 NM_015264 ENSG00000100364 KIAA0930 C22orf9|LSC3 KIAA0930 protein-coding 147-140 chr8 84865134 84865453 + 0.666667 NA intron (NM_001287244, intron 5 of 7) intron (NM_001287244, intron 5 of 7) 159366 NM_001287244 138046 Hs.121663 NM_173848 ENSG00000184672 RALYL HNRPCL3 RALY RNA binding protein like protein-coding 237.333-24 chr11 108915034 108915416 + 0.666667 NA intron (NM_004398, intron 16 of 17) L1M4a1|LINE|L1 250156 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 218.667-117 chrX 100319124 100319704 + 0.666667 NA intron (NM_020766, intron 4 of 4) intron (NM_020766, intron 4 of 4) 90859 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 126.667-91 chr2 237558846 237559125 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7589 NM_015893 51052 Hs.247710 NM_015893 ENSG00000071677 PRLH PRH|PRRP prolactin releasing hormone protein-coding 152.333-272 chr4 65570491 65570863 + 0.666667 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 98811 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 145.667-50 chr11 80535896 80536198 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 226756 NR_120570 101928944 Hs.547927 NR_120570 ENSG00000255178 LINC02720 - long intergenic non-protein coding RNA 2720 ncRNA 162.667-150 chr2 226503977 226504298 + 0.666667 NA Intergenic L1MA5|LINE|L1 154656 NR_049887 100847053 NR_049887 ENSG00000263363 MIR5702 - microRNA 5702 ncRNA 133.667-72 chr2 47285434 47285802 + 0.666667 NA intron (NR_110207, intron 1 of 2) L1MB7|LINE|L1 -49697 NR_001568 618 NR_001568 ENSG00000236824 BCYRN1 BC200|BC200a|LINC00004|NCRNA00004 brain cytoplasmic RNA 1 ncRNA 163.333-198 chr4 58302774 58303138 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 233372 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 183-69 chr20 36481973 36482354 + 0.666667 NA intron (NM_183006, intron 1 of 6) intron (NM_183006, intron 1 of 6) 20368 NM_183006 22839 Hs.249600 NM_014902 ENSG00000080845 DLGAP4 DAP-4|DAP4|DLP4|SAPAP-4|SAPAP4 DLG associated protein 4 protein-coding 169 chr1 43563319 43563668 + 0.666667 NA intron (NM_001329137, intron 6 of 34) L2|LINE|L2 32610 NM_002840 5792 Hs.272062 NM_002840 ENSG00000142949 PTPRF BNAH2|LAR protein tyrosine phosphatase receptor type F protein-coding 138.333-50 chr12 83621892 83622166 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 934874 NM_001320322 160335 Hs.577775 NM_152588 ENSG00000179104 TMTC2 IBDBP1 transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 protein-coding 201.667-61 chr2 235847122 235847621 + 0.666667 NA intron (NM_001037131, intron 9 of 17) intron (NM_001037131, intron 9 of 17) 321015 NM_001485 2637 Hs.184945 NM_001485 ENSG00000168505 GBX2 - gastrulation brain homeobox 2 protein-coding 112.667-266 chr8 82330296 82330554 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -488139 NM_022133 64089 Hs.492121 NM_022133 ENSG00000104497 SNX16 - sorting nexin 16 protein-coding 135-15 chr11 31523035 31523291 + 0.666667 NA intron (NM_001288725, intron 2 of 10) AluJr|SINE|Alu 13396 NM_001288725 26610 Hs.175534 NM_019040 ENSG00000109911 ELP4 AN|AN2|C11orf19|PAX6NEB|PAXNEB|dJ68P15A.1|hELP4 elongator acetyltransferase complex subunit 4 protein-coding 209.333-24 chr10 90637871 90638310 + 0.666667 NA Intergenic MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR -97285 NR_110657 101926942 Hs.382666 NR_110657 ENSG00000236373 LINC02653 - long intergenic non-protein coding RNA 2653 ncRNA 208.333-12 chr1 227956977 227957423 + 0.666667 NA Intergenic L1MD2|LINE|L1 -9268 NM_003395 7483 Hs.149504 NM_003395 ENSG00000143816 WNT9A WNT14 Wnt family member 9A protein-coding 148.333-324 chr5 111766850 111767251 + 0.666667 NA intron (NM_001142474, intron 2 of 3) intron (NM_001142474, intron 2 of 3) -8832 NM_001142476 9315 Hs.36053 NM_004772 ENSG00000134986 NREP C5orf13|D4S114|P311|PRO1873|PTZ17|SEZ17 neuronal regeneration related protein protein-coding 215.667-68 chr2 189755836 189756216 + 0.666667 NA intron (NM_022353, intron 2 of 8) intron (NM_022353, intron 2 of 8) -6754 NR_102429 101409258 Hs.738558 NR_102429 OSGEPL1-AS1 - OSGEPL1 antisense RNA 1 ncRNA 182.333-117 chr4 112153042 112153385 + 0.666667 NA intron (NM_152400, intron 1 of 1) intron (NM_152400, intron 1 of 1) 7759 NM_152400 132720 Hs.23439 NM_152400 ENSG00000174749 FAM241A C4orf32 family with sequence similarity 241 member A protein-coding 146.667-264 chr5 113592286 113592572 + 0.666667 NA intron (NM_001345975, intron 27 of 28) intron (NM_001345975, intron 27 of 28) 78735 NM_022828 64848 Hs.231942 NM_022828 ENSG00000047188 YTHDC2 CAHL|hYTHDC2 YTH domain containing 2 protein-coding 150.333-61 chr11 46967295 46967649 + 0.666667 NA intron (NM_001278222, intron 1 of 7) L1M4|LINE|L1 30711 NM_024113 79096 Hs.368296 NM_024113 ENSG00000149179 C11orf49 - chromosome 11 open reading frame 49 protein-coding 133.333-132 chr4 81742786 81743168 + 0.666667 NA Intergenic MER5B|DNA|hAT-Charlie -271070 NM_152545 153020 Hs.591696 NM_152545 ENSG00000138670 RASGEF1B GPIG4 RasGEF domain family member 1B protein-coding 219-68 chr5 45146713 45147217 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 338018 NM_016640 10884 Hs.124165 NM_016640 ENSG00000112996 MRPS30 MRP-S30|PAP|PDCD9|S30mt mitochondrial ribosomal protein S30 protein-coding 200-113 chr4 57988128 57988695 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 547917 NR_133943 105377671 Hs.225045 NR_133943 ENSG00000250340 LINC02494 - long intergenic non-protein coding RNA 2494 ncRNA 163.667-50 chr13 25607971 25608312 + 0.666667 NA intron (NM_016529, intron 24 of 36) MSTB1|LTR|ERVL-MaLR 139367 NM_001313741 51761 Hs.444957 NM_016529 ENSG00000132932 ATP8A2 ATP|ATPIB|CAMRQ4|IB|ML-1 ATPase phospholipid transporting 8A2 protein-coding 121-119 chr5 129568181 129568447 + 0.666667 NA intron (NM_133638, intron 7 of 22) L1ME1|LINE|L1 -107625 NR_125748 103689846 Hs.628635 NR_125748 ENSG00000249421 ADAMTS19-AS1 - ADAMTS19 antisense RNA 1 ncRNA 157.333-257 chr4 57787843 57788154 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 362126 NR_125907 101928851 Hs.555072 NR_125907 ENSG00000248505 LINC02380 - long intergenic non-protein coding RNA 2380 ncRNA 135.667-182 chr8 75006916 75007276 + 0.666667 NA intron (NM_001286778, intron 1 of 13) intron (NM_001286778, intron 1 of 13) 6941 NM_001286778 83690 Hs.436542 NM_031461 ENSG00000121005 CRISPLD1 CRISP-10|CRISP10|LCRISP1 cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 1 protein-coding 120.667-128 chr4 64554454 64554759 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -145146 NM_001363796 253017 Hs.227752 NM_001010874 ENSG00000205678 TECRL CPVT3|GPSN2L|SRD5A2L2|TERL trans-2,3-enoyl-CoA reductase like protein-coding 128.333-189 chr8 9285632 9285919 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -39276 NR_040039 157273 Hs.650222 NR_040039 ENSG00000248538 LOC157273 - uncharacterized LOC157273 ncRNA 114.667-226 chr6 107832975 107833193 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8771 NM_198081 256380 Hs.486109 NM_198081 ENSG00000146285 SCML4 dJ47M23.1 Scm polycomb group protein like 4 protein-coding 138-54 chr2 28354781 28355192 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -37872 NM_005253 2355 Hs.220971 NM_005253 ENSG00000075426 FOSL2 FRA2 FOS like 2, AP-1 transcription factor subunit protein-coding 129-94 chr4 163064143 163064510 + 0.666667 NA Intergenic (AAAG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 29302 NR_039659 100616234 NR_039659 ENSG00000283468 MIR4454 - microRNA 4454 ncRNA 227-5 chr1 219438403 219438882 + 0.666667 NA intron (NR_135822, intron 2 of 3) intron (NR_135822, intron 2 of 3) 118682 NR_135822 102723886 Hs.525963 NR_135822 LYPLAL1-AS1 - LYPLAL1 antisense RNA 1 ncRNA 127.667-144 chr5 117403987 117404222 + 0.666667 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -11408 NR_046089 728342 Hs.434420 NR_046089 LINC00992 - long intergenic non-protein coding RNA 992 ncRNA 161-12 chr11 33465879 33466338 + 0.666667 NA intron (NM_012194, intron 1 of 20) L1PA6|LINE|L1 90000 NM_012194 25758 Hs.502266 NM_012194 ENSG00000110427 KIAA1549L C11orf41|C11orf69|G2 KIAA1549 like protein-coding 172.333-199 chr9 99544474 99544885 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -169422 NR_102271 100996569 Hs.745280 NR_102270 ENSG00000271086 NAMA - non-protein coding RNA, associated with MAP kinase pathway and growth arrest ncRNA 146.667-362 chrX 86260417 86260841 + 0.666667 NA intron (NM_001139514, intron 1 of 11) intron (NM_001139514, intron 1 of 11) -2339 NM_001139515 117154 Hs.86603 NM_053281 ENSG00000126733 DACH2 - dachshund family transcription factor 2 protein-coding 272.667-20 chr15 59311773 59312299 + 0.666667 NA intron (NM_004998, intron 1 of 27) MSTD|LTR|ERVL-MaLR 60835 NM_004998 4643 Hs.654506 NM_004998 ENSG00000157483 MYO1E FSGS6|HuncM-IC|MYO1C myosin IE protein-coding 150-104 chr4 92912178 92912448 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 607914 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 130.667-142 chr3 56332319 56332579 + 0.666667 NA intron (NR_132749, intron 2 of 17) MIRb|SINE|MIR 136018 NR_132749 26059 Hs.476389 NM_015576 ENSG00000187672 ERC2 CAST|CAST1|ELKSL|SPBC110|Spc110 ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 protein-coding 241.667-20 chr12 119865957 119866528 + 0.666667 NA intron (NM_007174, intron 3 of 46) MLT1H1|LTR|ERVL-MaLR 11078 NM_007174 11113 Hs.119594 NM_007174 ENSG00000122966 CIT CITK|CRIK|MCPH17|STK21 citron rho-interacting serine/threonine kinase protein-coding 141-36 chr18 5577583 5577867 + 0.666667 NA intron (NM_001281535, intron 3 of 21) intron (NM_001281535, intron 3 of 21) -33386 NM_001330557 23136 Hs.213394 NM_012307 ENSG00000082397 EPB41L3 4.1B|DAL-1|DAL1 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3 protein-coding 173.667-155 chr6 128557805 128558203 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -37405 NM_002844 5796 Hs.155919 NM_002844 ENSG00000152894 PTPRK R-PTP-kappa protein tyrosine phosphatase receptor type K protein-coding 249-50 chr22 50066531 50067079 + 0.666667 NA intron (NM_015166, intron 10 of 11) L1MC5a|LINE|L1 -8578 NM_001350317 164714 Hs.526713 NM_001080447 ENSG00000138892 TTLL8 - tubulin tyrosine ligase like 8 protein-coding 164.333-69 chr14 90390712 90391109 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5592 NM_001363669 801 Hs.282410 NM_006888 ENSG00000198668 CALM1 CALML2|CAM2|CAM3|CAMB|CAMC|CAMI|CAMIII|CPVT4|DD132|LQT14|PHKD|caM calmodulin 1 protein-coding 131-93 chr7 70992338 70992617 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -139667 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 158.333-28 chr10 20966938 20967329 + 0.666667 NA intron (NM_001173484, intron 3 of 6) L1ME3E|LINE|L1 -69531 NM_006393 10529 Hs.5025 NM_006393 ENSG00000078114 NEBL LASP2|LNEBL nebulette protein-coding 151.333-187 chr19 39022401 39022702 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 9998 NM_178820 126433 Hs.187461 NM_178820 ENSG00000161243 FBXO27 FBG5|Fbx27 F-box protein 27 protein-coding 147-122 chr6 79767956 79768338 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 44099 NR_131786 89758 Hs.288213 NM_001243308 LINC01621 C6orf7 long intergenic non-protein coding RNA 1621 ncRNA 247.333 chr1 70711245 70711853 + 0.666667 NA intron (NR_125938, intron 3 of 6) Tigger2|DNA|TcMar-Tigger 5096 NR_125938 101927244 Hs.568660 NR_125938 ENSG00000229051 LINC01788 - long intergenic non-protein coding RNA 1788 ncRNA 144.333-127 chr2 75670488 75670762 + 0.666667 NA intron (NM_001201334, intron 14 of 16) intron (NM_001201334, intron 14 of 16) 23842 NM_014763 9801 Hs.44024 NM_014763 ENSG00000115364 MRPL19 L19mt|MRP-L15|MRP-L19|MRPL15|RLX1|RPML15 mitochondrial ribosomal protein L19 protein-coding 130 chr1 21672544 21672792 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3311 NM_001330383 5909 Hs.148178 NM_002885 ENSG00000076864 RAP1GAP RAP1GA1|RAP1GAP1|RAP1GAPII|RAPGAP RAP1 GTPase activating protein protein-coding 230.333-11 chr10 24540216 24540682 + 0.666667 NA intron (NM_001282768, intron 16 of 17) AluSg|SINE|Alu 73918 NM_001282770 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 136-114 chr9 76461024 76461421 + 0.666667 NA intron (NM_001490, intron 2 of 3) intron (NM_001490, intron 2 of 3) 2040 NM_001490 2650 Hs.521568 NM_001490 ENSG00000187210 GCNT1 C2GNT|C2GNT-L|C2GNT1|G6NT|NACGT2|NAGCT2 glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 protein-coding 171-37 chr2 160540593 160540999 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 -46989 NM_002897 5937 Hs.470412 NM_002897 ENSG00000153250 RBMS1 C2orf12|HCC-4|MSSP|MSSP-1|MSSP-2|MSSP-3|SCR2|YC1 RNA binding motif single stranded interacting protein 1 protein-coding 139.333-120 chr2 182884575 182884922 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -18111 NM_001463 2487 Hs.128453 NM_001463 ENSG00000162998 FRZB FRE|FRITZ|FRP-3|FRZB-1|FRZB-PEN|FRZB1|FZRB|OS1|SFRP3|SRFP3|hFIZ frizzled related protein protein-coding 150.667-166 chr2 10592693 10593009 + 0.666667 NA intron (NR_048552, intron 16 of 19) intron (NR_048552, intron 16 of 19) 97124 NM_024894 79954 Hs.222494 NM_024894 ENSG00000115761 NOL10 PQBP5 nucleolar protein 10 protein-coding 118-69 chr2 122998553 122998784 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74813 NR_147208 107985818 Hs.580182 NR_147208 ENSG00000232740 LINC01826 lnc-MKI67IP-3 long intergenic non-protein coding RNA 1826 ncRNA 196.667-148 chr7 108051757 108052185 + 0.666667 NA intron (NM_001318046, intron 26 of 33) intron (NM_001318046, intron 26 of 33) -48810 NM_002291 3912 Hs.650585 NM_002291 ENSG00000091136 LAMB1 CLM|LIS5 laminin subunit beta 1 protein-coding 203-43 chr17 29716787 29717301 + 0.666667 NA intron (NM_033389, intron 2 of 14) L2|LINE|L2 44388 NM_001282131 85464 Hs.654754 NM_033389 ENSG00000141298 SSH2 SSH-2|SSH-2L slingshot protein phosphatase 2 protein-coding 212.667-146 chr9 104486292 104486754 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17740 NM_001004485 138805 Hs.553602 NM_001004485 ENSG00000186881 OR13F1 OR9-6 olfactory receptor family 13 subfamily F member 1 protein-coding 139.333-232 chr9 115638113 115638455 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 105955 NR_109805 101928775 Hs.522362 NR_109805 ENSG00000228714 LOC101928775 - uncharacterized LOC101928775 ncRNA 133.333-21 chr10 18426019 18426393 + 0.666667 NA intron (NM_201593, intron 3 of 13) L1MEd|LINE|L1 25631 NM_201570 783 Hs.59093 NM_000724 ENSG00000165995 CACNB2 CACNLB2|CAVB2|MYSB calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 protein-coding 197.667-9 chr1 192027485 192027898 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -130771 NM_130782 64407 Hs.440890 NM_130782 ENSG00000150681 RGS18 RGS13 regulator of G protein signaling 18 protein-coding 123.333-20 chr1 206717407 206717628 + 0.666667 NA intron (NM_004759, intron 1 of 9) L3|LINE|CR1 32612 NM_004759 9261 Hs.643566 NM_004759 ENSG00000162889 MAPKAPK2 MAPKAP-K2|MK-2|MK2 MAPK activated protein kinase 2 protein-coding 177.333-53 chr14 55470144 55470520 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -29787 NM_199047 387332 Hs.528278 NM_199047 ENSG00000182521 TBPL2 TBP2|TRF3 TATA-box binding protein like 2 protein-coding 125.333-30 chr10 107791442 107791799 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR 277673 NR_125760 103695365 Hs.648991 NR_125760 ENSG00000229981 LINC01435 TCONS_00018040 long intergenic non-protein coding RNA 1435 ncRNA 115.333-151 chr4 42936200 42936440 + 0.666667 NA intron (NM_001080476, intron 1 of 3) intron (NM_001080476, intron 1 of 3) 43054 NM_001080476 389207 Hs.162559 NM_001080476 ENSG00000215203 GRXCR1 DFNB25|PPP1R88 glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 protein-coding 191.333-184 chr6 167258883 167259455 + 0.666667 NA Intergenic L1PA8|LINE|L1 30869 NR_157263 112590798 NR_157263 HPAT5 - human pluripotency-associated transcript 5 ncRNA 130.333-124 chr22 35040438 35040687 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -25596 NM_001303508 91464 Hs.567637 NM_001008494 ENSG00000175329 ISX Pix-1|RAXLX intestine specific homeobox protein-coding 128.333-128 chr3 59176690 59176948 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -126787 NM_001351533 200844 Hs.368434 NM_198463 ENSG00000163689 C3orf67 - chromosome 3 open reading frame 67 protein-coding 187-10 chr10 52200342 52200731 + 0.666667 NA intron (NM_001098512, intron 9 of 17) L1PA15|LINE|L1 113592 NR_038277 100506939 Hs.584791 NR_038277 PRKG1-AS1 - PRKG1 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-171 chr2 31978949 31979300 + 0.666667 NA intron (NR_126034, intron 1 of 6) THE1D|LTR|ERVL-MaLR 31540 NM_001137602 51072 Hs.444969 NM_015955 ENSG00000162959 MEMO1 C2orf4|CGI-27|MEMO|NS5ATP7 mediator of cell motility 1 protein-coding 174.667-28 chr10 128200903 128201261 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -74659 NM_001145966 4288 Hs.80976 NM_002417 ENSG00000148773 MKI67 KIA|MIB-|MIB-1|PPP1R105 marker of proliferation Ki-67 protein-coding 127-81 chr6 44913846 44914067 + 0.666667 NA intron (NM_001350324, intron 10 of 11) intron (NM_001350324, intron 10 of 11) 283814 NR_030313 693171 NR_030313 ENSG00000207769 MIR586 MIRN586|hsa-mir-586 microRNA 586 ncRNA 130.667-16 chr1 206796597 206796960 + 0.666667 NA intron (NM_153758, intron 1 of 6) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -24284 NM_000572 3586 Hs.193717 NM_000572 ENSG00000136634 IL10 CSIF|GVHDS|IL-10|IL10A|TGIF interleukin 10 protein-coding 118.333-12 chr1 108972061 108972244 + 0.666667 NA intron (NM_014969, intron 14 of 14) L2a|LINE|L2 -8653 NM_001048210 23155 Hs.658489 NM_015127 ENSG00000121940 CLCC1 MCLC chloride channel CLIC like 1 protein-coding 233-29 chr17 27178060 27178584 + 0.666667 NA Intergenic ALR/Alpha|Satellite|centr -89081 NR_135673 105371703 Hs.649918 NR_135673 LOC105371703 - uncharacterized LOC105371703 ncRNA 119.333-76 chr12 98856219 98856575 + 0.666667 NA intron (NM_152788, intron 17 of 25) MIRb|SINE|MIR 38377 NM_001352220 56899 Hs.506458 NM_020140 ENSG00000185046 ANKS1B AIDA|AIDA-1|ANKS2|EB-1|EB1|cajalin-2 ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B protein-coding 201.333-218 chr5 12118141 12118599 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -213924 NM_001288717 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 163.667-32 chr10 114249974 114250330 + 0.666667 NA intron (NM_001272046, intron 2 of 13) L2b|LINE|L2 10538 NM_001320804 340706 Hs.197741 NM_198496 ENSG00000165816 VWA2 AMACO|CCSP-2|CCSP2|NET42 von Willebrand factor A domain containing 2 protein-coding 115.333-64 chr14 49248060 49248287 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 338207 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 173-2 chr1 67347934 67348274 + 0.666667 NA intron (NM_001319233, intron 9 of 15) intron (NM_001319233, intron 9 of 15) 40740 NM_001559 3595 Hs.479347 NM_001559 ENSG00000081985 IL12RB2 - interleukin 12 receptor subunit beta 2 protein-coding 150-3 chr1 59808865 59809273 + 0.666667 NA Intergenic LTR16A|LTR|ERVL -5880 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 141.667-91 chr16 75352881 75353259 + 0.666667 NA intron (NM_006324, intron 5 of 6) L1MC5|LINE|L1 80433 NM_006324 10428 Hs.461361 NM_006324 ENSG00000153774 CFDP1 BCNT|BUCENTAUR|CENP-29|CP27|SWC5|Yeti|p97 craniofacial development protein 1 protein-coding 149.333-178 chr2 64689834 64690165 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36086 NM_014755 9792 Hs.591569 NM_014755 ENSG00000179833 SERTAD2 Sei-2|TRIP-Br2|TRIPBR2 SERTA domain containing 2 protein-coding 201.667-128 chr9 31369200 31369640 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 12070 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 151-76 chr21 33553876 33554172 + 0.666667 NA exon (NM_032195, exon 3 of 7) exon (NM_032195, exon 3 of 7) 3362 NR_106756 102465248 NR_106756 ENSG00000284448 MIR6501 hsa-mir-6501|mir-6501 microRNA 6501 ncRNA 129-60 chr2 66293310 66293683 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 64832 NR_039938 100616464 NR_039938 ENSG00000264525 MIR4778 - microRNA 4778 ncRNA 122.667-34 chr12 10128966 10129160 + 0.666667 NA intron (NR_125336, intron 1 of 6) intron (NR_125336, intron 1 of 6) 1136 NM_197954 64581 Hs.143929 NM_022570 ENSG00000172243 CLEC7A BGR|CANDF4|CD369|CLECSF12|DECTIN1|SCARE2 C-type lectin domain containing 7A protein-coding 128-56 chr2 238609539 238609838 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -54189 NR_037809 151171 Hs.652076 NR_037809 ENSG00000225493 LINC01107 - long intergenic non-protein coding RNA 1107 ncRNA 164-109 chr7 52172710 52173157 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -779677 NR_157843 107986794 NR_157843 LOC107986794 - uncharacterized LOC107986794 ncRNA 181.667-124 chr5 102707324 102707715 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -36055 NR_103753 285708 Hs.533011 NR_103753 LINC00491 - long intergenic non-protein coding RNA 491 ncRNA 138-32 chr13 75085000 75085330 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 155216 NR_027466 647288 Hs.567920 NR_027466 ENSG00000214249 CTAGE11P - CTAGE family member 11, pseudogene pseudo 122-138 chrX 95275880 95276210 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -212819 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 129-59 chr19 27932468 27932700 + 0.666667 NA intron (NR_146733, intron 2 of 6) L2a|LINE|L2 -138644 NR_027301 148189 Hs.706547 NR_027301 ENSG00000261824 LINC00662 - long intergenic non-protein coding RNA 662 ncRNA 159.333-275 chr5 146062614 146063080 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_152550, exon 10 of 10) 3' UTR (NM_152550, exon 10 of 10) 42730 NM_001029869 153770 Hs.162369 NM_001029869 ENSG00000173261 PLAC8L1 - PLAC8 like 1 protein-coding 119.333-104 chr16 69041396 69041713 + 0.666667 NA intron (NM_024562, intron 17 of 17) intron (NM_024562, intron 17 of 17) -64099 NM_001199280 3038 Hs.592069 NM_005329 ENSG00000103044 HAS3 - hyaluronan synthase 3 protein-coding 156-31 chr11 107354073 107354450 + 0.666667 NA intron (NM_152434, intron 12 of 17) intron (NM_152434, intron 12 of 17) 103585 NM_152434 143884 Hs.212140 NM_152434 ENSG00000152404 CWF19L2 - CWF19 like cell cycle control factor 2 protein-coding 161.333-162 chr2 203580306 203580660 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -45182 NM_213589 65059 Hs.471162 NM_025252 ENSG00000173166 RAPH1 ALS2CR18|ALS2CR9|LPD|PREL-2|PREL2|RMO1|RalGDS/AF-6 Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 protein-coding 188-111 chr8 62153450 62153883 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger -95188 NM_001304533 286183 Hs.654662 NM_173688 ENSG00000185942 NKAIN3 FAM77D sodium/potassium transporting ATPase interacting 3 protein-coding 143-134 chr9 110274741 110275015 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -18371 NM_003329 7295 Hs.435136 NM_003329 ENSG00000136810 TXN TRDX|TRX|TRX1 thioredoxin protein-coding 136.333-200 chr8 63297262 63297511 + 0.666667 NA Intergenic MER102b|DNA|hAT-Charlie 128383 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 183.667-47 chr14 74066419 74066938 + 0.666667 NA TTS (NM_025057) TTS (NM_025057) 17775 NM_001278593 4329 Hs.293970 NM_005589 ENSG00000119711 ALDH6A1 MMSADHA|MMSDH aldehyde dehydrogenase 6 family member A1 protein-coding 172-25 chr11 40496483 40496821 + 0.666667 NA intron (NM_020929, intron 2 of 4) intron (NM_020929, intron 2 of 4) -203522 NR_047673 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 112-62 chr14 60961255 60961556 + 0.666667 NA intron (NM_001177963, intron 6 of 6) L2b|LINE|L2 19674 NM_001350254 57570 Hs.380159 NM_020810 ENSG00000126814 TRMT5 COXPD26|KIAA1393|TRM5 tRNA methyltransferase 5 protein-coding 172.333-97 chr21 26823984 26824356 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5a|LINE|L1 21239 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 111.667-238 chr7 40691414 40691626 + 0.666667 NA intron (NM_024728, intron 13 of 14) intron (NM_024728, intron 13 of 14) 288419 NR_110831 101928744 Hs.639767 NR_110831 ENSG00000232458 LINC01450 - long intergenic non-protein coding RNA 1450 ncRNA 115.667-3 chr1 66580852 66581144 + 0.666667 NA intron (NM_001350218, intron 1 of 22) Charlie22a|DNA|hAT-Charlie 46845 NM_001350218 84251 Hs.132121 NM_032291 ENSG00000118473 SGIP1 - SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1 protein-coding 134.333-43 chr13 28901583 28901948 + 0.666667 NA intron (NM_001366651, intron 2 of 14) L1MD2|LINE|L1 81426 NM_001366651 23281 Hs.22287 NM_015233 ENSG00000132938 MTUS2 CAZIP|ICIS|KIAA0774|TIP150 microtubule associated scaffold protein 2 protein-coding 140.333-168 chr4 104429938 104430309 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60842 NR_125926 101929468 Hs.480435 NR_125926 ENSG00000245384 CXXC4-AS1 - CXXC4 antisense RNA 1 ncRNA 141.333-211 chr6 87200791 87201044 + 0.666667 NA intron (NM_015021, intron 1 of 7) intron (NM_015021, intron 1 of 7) 45352 NM_015021 23036 Hs.444800 NM_015021 ENSG00000188994 ZNF292 Nbla00365|ZFP292|ZN-16|Zn-15|bA393I2.3 zinc finger protein 292 protein-coding 120.667-15 chr10 6742263 6742471 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu 4985 NR_138480 108570035 Hs.568834 NR_138480 LINP1 - lncRNA in non-homologous end joining pathway 1 ncRNA 152-102 chr22 27708966 27709378 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR 92584 NM_002430 4330 Hs.268515 NM_002430 ENSG00000169184 MN1 MGCR|MGCR1|MGCR1-PEN|dJ353E16.2 MN1 proto-oncogene, transcriptional regulator protein-coding 281-18 chr19 47534918 47535597 + 0.666667 NA intron (NM_001277075, intron 9 of 16) L1MB8|LINE|L1 -20194 NR_038457 8775 Hs.126938 NM_003827 ENSG00000105402 NAPA SNAPA NSF attachment protein alpha protein-coding 182.333-21 chr10 84951468 84951850 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 247246 NR_120668 101929624 Hs.588831 NR_120667 ENSG00000237267 LINC01519 - long intergenic non-protein coding RNA 1519 ncRNA 161.667-274 chr9 107806681 107807154 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -317148 NM_001314052 9314 Hs.376206 NM_004235 ENSG00000136826 KLF4 EZF|GKLF Kruppel like factor 4 protein-coding 240.333-9 chr10 32386913 32387600 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8487 NM_001282391 80314 Hs.167805 NM_025209 ENSG00000120616 EPC1 Epl1 enhancer of polycomb homolog 1 protein-coding 115-77 chr17 71075439 71075754 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 126583 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 140-94 chr5 170646664 170647002 + 0.666667 NA intron (NR_136214, intron 4 of 5) L1MC1|LINE|L1 34637 NR_136214 105377716 Hs.570880 NR_136214 ENSG00000253591 LOC105377716 - uncharacterized LOC105377716 ncRNA 140-38 chr14 66535594 66535866 + 0.666667 NA intron (NM_001024218, intron 1 of 21) L1ME3|LINE|L1 28323 NM_001024218 10243 Hs.208765 NM_020806 ENSG00000171723 GPHN GEPH|GPH|GPHRYN|HKPX1|MOCODC gephyrin protein-coding 224.333-120 chr7 98360506 98361091 + 0.666667 NA intron (NM_018842, intron 2 of 13) intron (NM_018842, intron 2 of 13) 40292 NM_018842 55971 Hs.656063 NM_018842 ENSG00000006453 BAIAP2L1 IRTKS BAI1 associated protein 2 like 1 protein-coding 182-44 chr2 51655639 51656020 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 5 of 10) intron (NR_135237, intron 5 of 10) 623228 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 146.667-91 chr13 90834003 90834324 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 92434 NR_027039 144776 Hs.434120 NR_027039 ENSG00000231674 LINC00410 - long intergenic non-protein coding RNA 410 ncRNA 144.333-147 chr20 18100723 18101085 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -36959 NM_001164811 100303755 Hs.488051 NM_001164811 ENSG00000232838 PET117 CSRP2BP PET117 cytochrome c oxidase chaperone protein-coding 143.333-269 chr7 70862417 70862731 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -269570 NM_022479 64409 Hs.488591 NM_022479 ENSG00000185274 GALNT17 GALNACT17|GALNT16|GALNT20|GALNTL3|GalNAc-T17|GalNAc-T19|GalNAc-T5L|WBSCR17 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17 protein-coding 230.333-77 chr3 67672795 67673281 + 0.666667 NA intron (NR_109992, intron 3 of 6) AluSx1|SINE|Alu 18341 NR_109992 101927111 Hs.518057 NR_109992 ENSG00000241316 SUCLG2-AS1 - SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) ncRNA 159.333-149 chr2 40481286 40481627 + 0.666667 NA intron (NM_001112802, intron 1 of 7) MIRb|SINE|MIR -29366 NM_001351491 6546 Hs.31961 NM_021097 ENSG00000183023 SLC8A1 NCX1 solute carrier family 8 member A1 protein-coding 114.667-164 chr22 25631634 25631814 + 0.666667 NA intron (NM_001362778, intron 2 of 19) L1ME1|LINE|L1 67049 NM_001362778 157 Hs.657494 NM_005160 ENSG00000100077 GRK3 ADRBK2|BARK2 G protein-coupled receptor kinase 3 protein-coding 192-37 chr11 108901540 108902105 + 0.666667 NA intron (NM_004398, intron 16 of 17) intron (NM_004398, intron 16 of 17) 236753 NM_004398 1662 Hs.591931 NM_004398 ENSG00000178105 DDX10 Dbp4|HRH-J8 DEAD-box helicase 10 protein-coding 229-49 chr5 2474905 2475351 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -162927 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 162.333-232 chr7 24672824 24673156 + 0.666667 NA intron (NM_016447, intron 10 of 12) L1MB8|LINE|L1 84474 NM_001127453 1687 Hs.520708 NM_004403 ENSG00000105928 GSDME DFNA5|ICERE-1 gasdermin E protein-coding 144.667-322 chr9 70605136 70605422 + 0.666667 NA intron (NM_001366143, intron 18 of 25) intron (NM_001366143, intron 18 of 25) -190622 NM_001206 687 Hs.150557 NM_001206 ENSG00000119138 KLF9 BTEB|BTEB1 Kruppel like factor 9 protein-coding 171.333-65 chr17 57168295 57168675 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 72996 NM_001370427 8165 Hs.463506 NM_003488 ENSG00000121057 AKAP1 AKAP|AKAP121|AKAP149|AKAP84|D-AKAP1|PPP1R43|PRKA1|SAKAP84|TDRD17 A-kinase anchoring protein 1 protein-coding 139.333-236 chrX 28420604 28421018 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 74852 NR_106750 102465140 NR_106750 ENSG00000277569 MIR6134 hsa-mir-6134 microRNA 6134 ncRNA 117.333-147 chr4 43492736 43493064 + 0.666667 NA promoter-TSS (NR_146993) promoter-TSS (NR_146993) -357 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 141.667-231 chr8 125031592 125031989 + 0.666667 NA intron (NM_014846, intron 27 of 28) intron (NM_014846, intron 27 of 28) 33285 NM_003129 6713 Hs.71465 NM_003129 ENSG00000104549 SQLE - squalene epoxidase protein-coding 112.333-207 chr5 72850034 72850311 + 0.666667 NA intron (NM_001364293, intron 2 of 24) intron (NM_001364293, intron 2 of 24) 2033 NM_001364294 3842 Hs.482497 NM_002270 ENSG00000083312 TNPO1 IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN transportin 1 protein-coding 216-116 chr7 67393863 67394328 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 58119 NR_108104 101929736 Hs.634050 NR_108104 ENSG00000106610 LINC01372 - long intergenic non-protein coding RNA 1372 ncRNA 114.333-174 chr5 52774204 52774464 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13582 NM_015946 53918 Hs.644352 NM_015946 ENSG00000152684 PELO CGI-17|PRO1770 pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor protein-coding 158-147 chrX 12351937 12352281 + 0.666667 NA intron (NM_001368402, intron 2 of 17) L1ME3A|LINE|L1 -146571 NM_001368400 9758 Hs.657507 NM_014728 ENSG00000169933 FRMPD4 MRX104|PDZD10|PDZK10 FERM and PDZ domain containing 4 protein-coding 306.333-42 chr7 101806697 101807382 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -8968 NM_181500 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 197.333-102 chr2 24541239 24541807 + 0.666667 NA intron (NM_001362952, intron 1 of 23) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -42954 NM_147233 8648 Hs.596314 NM_003743 ENSG00000084676 NCOA1 F-SRC-1|KAT13A|RIP160|SRC1|bHLHe42|bHLHe74 nuclear receptor coactivator 1 protein-coding 208-158 chr7 39049192 39049665 + 0.666667 NA intron (NM_007252, intron 2 of 10) L1MB8|LINE|L1 -35861 NR_138047 100689074 Hs.675876 NR_138047 POU6F2-AS2 - POU6F2 antisense RNA 2 ncRNA 195.667-58 chr17 48692323 48692852 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 29931 NM_032391 84366 Hs.116467 NM_032391 ENSG00000159182 PRAC1 C17orf92|PRAC PRAC1 small nuclear protein protein-coding 149-62 chr18 44581917 44582220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 50289 NR_131768 105667213 Hs.135737 NR_131768 LINC01601 - long intergenic non-protein coding RNA 1601 ncRNA 160.333-114 chr15 64173937 64174348 + 0.666667 NA intron (NM_022048, intron 11 of 11) intron (NM_022048, intron 11 of 11) -10987 NM_000942 5479 Hs.434937 NM_000942 ENSG00000166794 PPIB B|CYP-S1|CYPB|HEL-S-39|OI9|SCYLP peptidylprolyl isomerase B protein-coding 149.333-350 chr6 132681781 132682133 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_004666, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_004666, exon 7 of 7) 32098 NM_004666 8876 Hs.12114 NM_004666 ENSG00000112299 VNN1 HDLCQ8|Tiff66 vanin 1 protein-coding 156-46 chr14 66277712 66278052 + 0.666667 NA Intergenic L1PA6|LINE|L1 -208489 NM_001351576 440184 Hs.412138 NM_001004331 ENSG00000196553 CCDC196 C14orf53|LINC00238|NCRNA00238 coiled-coil domain containing 196 protein-coding 284-23 chr2 16815298 16815897 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -149763 NM_030797 81553 Hs.467769 NM_030797 ENSG00000197872 FAM49A - family with sequence similarity 49 member A protein-coding 117.667-133 chr4 60925035 60925270 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 2533 NR_039652 100616450 NR_039652 ENSG00000265829 MIR548AG1 - microRNA 548ag-1 ncRNA 112.667-18 chr1 198767831 198768124 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 91005 NR_029612 406955 NR_029612 ENSG00000207975 MIR181B1 MIRN181B1|mir-181b-1 microRNA 181b-1 ncRNA 118.667-33 chr10 93504786 93505031 + 0.666667 NA intron (NM_018131, intron 3 of 8) AluSx1|SINE|Alu 8296 NM_018131 55165 Hs.14559 NM_018131 ENSG00000138180 CEP55 C10orf3|CT111|MARCH|URCC6 centrosomal protein 55 protein-coding 114.333-143 chr3 87703715 87703928 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -88885 NM_001322208 3355 Hs.248136 NM_000866 ENSG00000179097 HTR1F 5-HT-1F|5-HT1F|5HT6|HTR1EL|MR77 5-hydroxytryptamine receptor 1F protein-coding 200.333-17 chr11 24484414 24484905 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 -12394 NM_001252008 338645 Hs.144138 NM_001009909 ENSG00000187398 LUZP2 KFSP2566|PRO6246 leucine zipper protein 2 protein-coding 116.333-190 chr6 73293117 73293353 + 0.666667 NA intron (NR_027005, intron 2 of 4) intron (NR_027005, intron 2 of 4) 16924 NM_001251874 80759 Hs.433062 NM_030568 ENSG00000135314 KHDC1 C6orf147|C6orf148|Em:AC019205.8|KHDC1L|NDG1|bA257K9.4 KH domain containing 1 protein-coding 128-85 chr4 114447521 114447811 + 0.666667 NA Intergenic L1MCb|LINE|L1 -150736 NM_001322113 7368 Hs.144197 NM_003360 ENSG00000174607 UGT8 CGT|UGT4 UDP glycosyltransferase 8 protein-coding 200-168 chr8 74731460 74731775 + 0.666667 NA intron (NR_033830, intron 4 of 5) ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 25924 NR_031744 100302260 NR_031744 ENSG00000283188 MIR2052 hsa-mir-2052 microRNA 2052 ncRNA 176.667-120 chr5 40259653 40260025 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 207548 NR_104633 102467077 Hs.148993 NR_104633 LINC00603 - long intergenic non-protein coding RNA 603 ncRNA 226-79 chr6 24366297 24366912 + 0.666667 NA intron (NM_001195610, intron 1 of 10) intron (NM_001195610, intron 1 of 10) -8545 NM_016356 51473 Hs.61345 NM_016356 ENSG00000146038 DCDC2 DCDC2A|DFNB66|NPHP19|NSC|RU2|RU2S doublecortin domain containing 2 protein-coding 159.667-290 chr7 6425315 6425692 + 0.666667 NA intron (NM_001142936, intron 5 of 12) AluSg4|SINE|Alu 22451 NM_139179 221955 Hs.487498 NM_139179 ENSG00000164535 DAGLB DAGLBETA|KCCR13L diacylglycerol lipase beta protein-coding 130.667-208 chr9 73540729 73541089 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 389044 NM_000700 301 Hs.494173 NM_000700 ENSG00000135046 ANXA1 ANX1|LPC1 annexin A1 protein-coding 153.667-139 chr15 80106228 80106548 + 0.666667 NA intron (NM_001242916, intron 2 of 6) MER58A|DNA|hAT-Charlie 7972 NM_001242919 54469 Hs.596679 NM_019006 ENSG00000086666 ZFAND6 AWP1|ZA20D3|ZFAND5B zinc finger AN1-type containing 6 protein-coding 160.667-308 chr8 108156155 108156495 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -72705 NM_178565 340419 Hs.444834 NM_178565 ENSG00000147655 RSPO2 CRISTIN2|HHRRD|TETAMS2 R-spondin 2 protein-coding 118-21 chr12 48147834 48148175 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001319296, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_001319296, exon 5 of 5) 9511 NM_001319297 140461 Hs.432699 NM_024095 ENSG00000177981 ASB8 PP14212 ankyrin repeat and SOCS box containing 8 protein-coding 229.333 chr1 1172360 1172761 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1346 NM_001130045 254173 Hs.454835 NM_153254 ENSG00000162571 TTLL10 TTLL5 tubulin tyrosine ligase like 10 protein-coding 150.667-372 chr8 77898656 77899061 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 448161 NR_125830 102724874 Hs.571511 NR_125830 LOC102724874 - uncharacterized LOC102724874 ncRNA 161.667-45 chr11 105544728 105545128 + 0.666667 NA Intergenic LTR48|LTR|ERV1 -65145 NM_001077244 2893 Hs.503743 NM_000829 ENSG00000152578 GRIA4 GLUR4|GLUR4C|GLURD|GluA4|NEDSGA glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 4 protein-coding 126-16 chr11 26206137 26206463 + 0.666667 NA intron (NM_001313726, intron 1 of 27) intron (NM_001313726, intron 1 of 27) 17177 NM_001313726 63982 Hs.91791 NM_031418 ENSG00000134343 ANO3 C11orf25|DYT23|DYT24|GENX-3947|TMEM16C anoctamin 3 protein-coding 179.667-102 chr4 93767160 93767651 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 13 of 14) intron (NM_001286838, intron 13 of 14) -61348 NM_005172 474 Hs.532680 NM_005172 ENSG00000172238 ATOH1 ATH1|HATH1|MATH-1|bHLHa14 atonal bHLH transcription factor 1 protein-coding 136.667-131 chr4 105941022 105941386 + 0.666667 NA intron (NM_001184692, intron 7 of 10) AluJr|SINE|Alu 45733 NM_001184690 255743 Hs.518921 NM_198278 ENSG00000168743 NPNT EGFL6L|POEM nephronectin protein-coding 116.667-123 chr22 41400546 41400744 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 18703 NM_003216 7008 Hs.181159 NM_003216 ENSG00000167074 TEF - TEF transcription factor, PAR bZIP family member protein-coding 123-82 chr3 155932302 155932580 + 0.666667 NA intron (NM_003875, intron 13 of 15) (TTACAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 61791 NM_003875 8833 Hs.591314 NM_003875 ENSG00000163655 GMPS GATD7 guanine monophosphate synthase protein-coding 130.333-87 chr17 44317038 44317270 + 0.666667 NA intron (NM_001144825, intron 10 of 10) intron (NM_001144825, intron 10 of 10) 7669 NM_001143780 51629 Hs.744880 NM_016016 ENSG00000013306 SLC25A39 CGI-69|CGI69 solute carrier family 25 member 39 protein-coding 113.667-113 chr2 170218464 170218676 + 0.666667 NA intron (NM_001083615, intron 6 of 33) Charlie29a|DNA|hAT-Charlie 40423 NR_045683 140469 Hs.671900 NM_138995 ENSG00000071909 MYO3B - myosin IIIB protein-coding 132.667-75 chr19 29241659 29241909 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -28633 NM_006003 7386 Hs.743307 NM_006003 ENSG00000169021 UQCRFS1 RIP1|RIS1|RISP|UQCR5 ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 protein-coding 157.667-136 chr2 15410114 15410525 + 0.666667 NA intron (NR_052013, intron 25 of 50) intron (NR_052013, intron 25 of 50) 151015 NR_052013 51594 Hs.467759 NM_015909 ENSG00000151779 NBAS ILFS2|NAG|SOPH neuroblastoma amplified sequence protein-coding 134.667-197 chr8 117786210 117786602 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 134507 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 145.667-65 chr12 65158139 65158503 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -11262 NM_014319 23592 Hs.744150 NM_014319 ENSG00000174106 LEMD3 MAN1 LEM domain containing 3 protein-coding 175.333-121 chr3 89787878 89788260 + 0.666667 NA Intergenic (A)n|Simple_repeat|Simple_repeat 680448 NM_182644 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 214.666-78 chr9 96577431 96578032 + 0.666667 NA intron (NR_147239, intron 1 of 14) L1ME3A|LINE|L1 -10755 NM_001351570 8555 Hs.40582 NM_003671 ENSG00000081377 CDC14B CDC14B3|Cdc14B1|Cdc14B2|hCDC14B cell division cycle 14B protein-coding 146-35 chr15 38743691 38744015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 47255 NR_160786 170.333-98 chr18 13075445 13075935 + 0.666667 NA intron (NM_032142, intron 30 of 44) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR 84328 NM_032142 55125 Hs.100914 NM_018069 ENSG00000101639 CEP192 PPP1R62 centrosomal protein 192 protein-coding 122-124 chr8 127149288 127149552 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 48207 NR_120364 103021165 Hs.573407 NR_120364 CASC19 CARLO6|CARLo-6|LINC01245 cancer susceptibility 19 ncRNA 164-87 chr4 73101379 73101710 + 0.666667 NA intron (NM_032217, intron 25 of 33) AluSz|SINE|Alu -31785 NM_001300729 285521 Hs.356697 NM_173827 ENSG00000163626 COX18 COX18HS cytochrome c oxidase assembly factor COX18 protein-coding 140.333-135 chr3 143041 143361 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -53395 NM_001253387 10752 Hs.148909 NM_006614 ENSG00000134121 CHL1 CALL|L1CAM2 cell adhesion molecule L1 like protein-coding 132.333-71 chr18 34383653 34383970 + 0.666667 NA Intergenic MER49|LTR|ERV1 -109479 NM_032975 1837 Hs.643454 NM_001390 ENSG00000134769 DTNA D18S892E|DRP3|DTN|DTN-A|LVNC1 dystrobrevin alpha protein-coding 114.333-89 chr17 79991103 79991328 + 0.666667 NA intron (NM_019020, intron 3 of 11) intron (NM_019020, intron 3 of 11) -40362 NM_001271846 125058 Hs.369819 NM_019020 ENSG00000167291 TBC1D16 - TBC1 domain family member 16 protein-coding 114.333-70 chr14 43616430 43616641 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 890748 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 143.667-8 chr1 70310093 70310420 + 0.666667 NA intron (NM_030816, intron 5 of 12) intron (NM_030816, intron 5 of 12) 44466 NM_030816 81573 Hs.744989 NM_030816 ENSG00000118454 ANKRD13C dJ677H15.3 ankyrin repeat domain 13C protein-coding 144.667-306 chr8 127060048 127060475 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2|LINE|L1 -19613 NR_109833 101867536 Hs.652970 NR_109833 ENSG00000282961 PRNCR1 CARLo-3|PCAT8 prostate cancer associated non-coding RNA 1 ncRNA 177-38 chr2 144894058 144894467 + 0.666667 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) intron (NR_033870, intron 2 of 4) 226295 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 163.667-243 chr8 24044136 24044519 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 -189521 NM_003155 6781 Hs.25590 NM_003155 ENSG00000159167 STC1 STC stanniocalcin 1 protein-coding 159-17 chr10 103160186 103160482 + 0.666667 NA intron (NM_001351187, intron 3 of 21) L1MB7|LINE|L1 -6513 NM_001351191 22978 Hs.97439 NM_012229 ENSG00000076685 NT5C2 GMP|NT5B|PNT5|SPG45|SPG65|cN-II 5'-nucleotidase, cytosolic II protein-coding 261.333-48 chr2 110819741 110820153 + 0.666667 NA intron (NM_001371254, intron 9 of 18) MIRb|SINE|MIR 87374 NM_001371254 240-92 chr8 103512752 103513324 + 0.666667 NA intron (NM_001348497, intron 1 of 22) intron (NM_001348497, intron 1 of 22) -11128 NR_145698 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 228.667-51 chr20 46131999 46132525 + 0.666667 NA Intergenic LTR16C|LTR|ERVL 13948 NR_126502 958 Hs.472860 NM_001250 ENSG00000101017 CD40 Bp50|CDW40|TNFRSF5|p50 CD40 molecule protein-coding 160.667-14 chr1 92090576 92090908 + 0.666667 NA intron (NM_183242, intron 2 of 8) AluSx|SINE|Alu 10397 NM_183242 284697 Hs.676102 NM_183242 ENSG00000189195 BTBD8 - BTB domain containing 8 protein-coding 142-35 chr13 26826574 26826888 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65945 NM_005288 2835 Hs.123034 NM_005288 ENSG00000132975 GPR12 GPCR12|GPCR21|PPP1R84 G protein-coupled receptor 12 protein-coding 165.667-75 chr17 77177028 77177341 + 0.666667 NA intron (NM_001143999, intron 3 of 16) intron (NM_001143999, intron 3 of 16) -8029 NM_001144001 6397 Hs.464184 NM_003003 ENSG00000129657 SEC14L1 PRELID4A|SEC14L SEC14 like lipid binding 1 protein-coding 120.667-114 chr3 71122425 71122677 + 0.666667 NA intron (NR_146142, intron 6 of 19) intron (NR_146142, intron 6 of 19) 8035 NM_001370548 27086 Hs.59368 NM_032682 ENSG00000114861 FOXP1 12CC4|HSPC215|MFH|QRF1|hFKH1B forkhead box P1 protein-coding 221-47 chr3 82712990 82713468 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 727087 NR_147146 105377180 Hs.531803 NR_147146 ENSG00000239440 LINC02008 - long intergenic non-protein coding RNA 2008 ncRNA 195.667-98 chr4 87107853 87108296 + 0.666667 NA intron (NM_005935, intron 9 of 19) intron (NM_005935, intron 9 of 19) 101073 NM_005935 4299 Hs.480190 NM_005935 ENSG00000172493 AFF1 AF4|MLLT2|PBM1 AF4/FMR2 family member 1 protein-coding 144-107 chr3 65334098 65334511 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -559512 NR_046575 100873983 Hs.663889 NR_046575 ENSG00000240175 MAGI1-AS1 - MAGI1 antisense RNA 1 ncRNA 114.333-128 chr20 4554816 4555094 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -131501 NM_001080123 5621 Hs.472010 NM_000311 ENSG00000171867 PRNP ASCR|AltPrP|CD230|CJD|GSS|KURU|PRIP|PrP|PrP27-30|PrP33-35C|PrPc|p27-30 prion protein protein-coding 148-101 chr3 77906813 77907138 + 0.666667 NA Intergenic MER44A|DNA|TcMar-Tigger 141988 NR_146636 105377172 NR_146636 LINC02077 - long intergenic non-protein coding RNA 2077 ncRNA 127.333-160 chr6 128994510 128994742 + 0.666667 NA intron (NM_000426, intron 1 of 64) intron (NM_000426, intron 1 of 64) 111485 NM_000426 3908 Hs.200841 NM_000426 ENSG00000196569 LAMA2 LAMM|MDC1A laminin subunit alpha 2 protein-coding 123.667-50 chr14 31490604 31490830 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -2678 NM_001197184 2856 Hs.727479 NM_001197184 ENSG00000214943 GPR33 - G protein-coupled receptor 33 (gene/pseudogene) protein-coding 164.333-83 chr16 68963137 68963467 + 0.666667 NA intron (NM_024562, intron 14 of 17) AluSz|SINE|Alu 119771 NM_024562 79613 Hs.13526 NM_024562 ENSG00000103047 TANGO6 TMCO7 transport and golgi organization 6 homolog protein-coding 147.667-186 chr2 124348344 124348700 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 3 of 23) intron (NM_130773, intron 3 of 23) 323235 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 165.667-19 chr10 66544758 66545172 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 10 of 17) intron (NM_001127384, intron 10 of 17) -381071 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 135-68 chr3 116587932 116588182 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 35584 NR_046624 100861506 Hs.641878 NR_046624 LINC00903 LSAMP-AS2 long intergenic non-protein coding RNA 903 ncRNA 137-18 chr11 55602355 55602730 + 0.666667 NA TTS (NM_001004700) TTS (NM_001004700) 1856 NM_001004700 219429 Hs.553620 NM_001004700 ENSG00000172188 OR4C11 OR11-136|OR4C11P olfactory receptor family 4 subfamily C member 11 protein-coding 131.667-161 chr5 57218853 57219079 + 0.666667 NA intron (NM_022913, intron 3 of 11) MIR3|SINE|MIR 4892 NM_001127236 65056 Hs.444279 NM_022913 ENSG00000062194 GPBP1 GPBP|SSH6|VASCULIN GC-rich promoter binding protein 1 protein-coding 142.333-270 chrX 122892452 122892839 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -291598 NM_000828 2892 Hs.377070 NM_000828 ENSG00000125675 GRIA3 GLUR-C|GLUR-K3|GLUR3|GLURC|GluA3|MRX94 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3 protein-coding 155.333-245 chr3 176588923 176589223 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 46459 NR_109968 100505547 Hs.253350 NR_109968 LINC01208 - long intergenic non-protein coding RNA 1208 ncRNA 171.667-138 chr5 137387335 137387741 + 0.666667 NA intron (NM_004598, intron 2 of 10) L1MC1|LINE|L1 111788 NM_004598 6695 Hs.596136 NM_004598 ENSG00000152377 SPOCK1 SPOCK|TESTICAN|TIC1 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 protein-coding 135-47 chr2 136882104 136882475 + 0.666667 NA exon (NM_001316349, exon 2 of 28) exon (NM_001316349, exon 2 of 28) 116744 NM_001316349 80731 Hs.68533 NM_001080427 ENSG00000144229 THSD7B - thrombospondin type 1 domain containing 7B protein-coding 130.333-177 chr6 20328620 20329009 + 0.666667 NA Intergenic LTR81|LTR|Gypsy -73065 NM_001949 1871 Hs.269408 NM_001949 ENSG00000112242 E2F3 E2F-3 E2F transcription factor 3 protein-coding 123-135 chr9 124776851 124777035 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_182487) promoter-TSS (NM_182487) -190 NM_182487 169611 Hs.357004 NM_182487 ENSG00000185585 OLFML2A PRO34319 olfactomedin like 2A protein-coding 133.333-147 chr5 69031516 69031790 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -1726 NR_130778 101928885 Hs.630474 NR_130778 LINC02198 - long intergenic non-protein coding RNA 2198 ncRNA 116.667-122 chr22 39763811 39764032 + 0.666667 NA intron (NM_152512, intron 6 of 6) LFSINE_Vert|SINE|tRNA 129839 NM_152512 150350 Hs.474869 NM_152512 ENSG00000176177 ENTHD1 CACNA1I|dJ370M22.3 ENTH domain containing 1 protein-coding 131.333-104 chr20 55713072 55713406 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -286042 NR_110064 101927796 Hs.737040 NR_110064 ENSG00000224008 LINC01441 - long intergenic non-protein coding RNA 1441 ncRNA 210.667-139 chrX 97920201 97920594 + 0.666667 NA Intergenic L1P3|LINE|L1 -355862 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 153.667-112 chr13 101875810 101876103 + 0.666667 NA intron (NM_175929, intron 1 of 4) intron (NM_175929, intron 1 of 4) 40689 NM_004115 2259 Hs.508616 NM_004115 ENSG00000102466 FGF14 FGF-14|FHF-4|FHF4|SCA27 fibroblast growth factor 14 protein-coding 190.333-109 chr4 167369026 167369441 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -134643 NM_001204352 50859 Hs.481133 NM_016950 ENSG00000196104 SPOCK3 HSAJ1454|TES-3|TICN3 SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3 protein-coding 117.667-39 chr12 63411008 63411224 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 257377 NM_173812 283417 Hs.533644 NM_173812 ENSG00000177990 DPY19L2 SPATA34|SPGF9 dpy-19 like 2 protein-coding 160-133 chrX 92240730 92241123 + 0.666667 NA intron (NM_032969, intron 3 of 5) intron (NM_032969, intron 3 of 5) 405465 NM_001168362 27328 Hs.655673 NM_014522 ENSG00000102290 PCDH11X PCDH-X|PCDH-Y|PCDH11|PCDH11Y|PCDH22|PCDHX|PPP1R119 protocadherin 11 X-linked protein-coding 146.667-254 chr5 30994152 30994463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -199379 NM_004932 1004 Hs.124776 NM_004932 ENSG00000113361 CDH6 CAD6|KCAD cadherin 6 protein-coding 214-3 chr1 49959914 49960503 + 0.666667 NA intron (NM_001323575, intron 1 of 12) L1MA5A|LINE|L1 63746 NR_136623 84871 Hs.551844 NM_032785 ENSG00000186094 AGBL4 CCP6 ATP/GTP binding protein like 4 protein-coding 180.333-55 chr2 68109373 68109758 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -46561 NM_173177 10438 Hs.602900 NM_006333 ENSG00000197223 C1D LRP1|Rrp47|SUN-CoR|SUNCOR|hC1D C1D nuclear receptor corepressor protein-coding 129.333-139 chr4 67632093 67632401 + 0.666667 NA intron (NM_018227, intron 23 of 32) intron (NM_018227, intron 23 of 32) 68908 NM_018227 55236 Hs.212774 NM_018227 ENSG00000033178 UBA6 E1-L2|MOP-4|UBE1L2 ubiquitin like modifier activating enzyme 6 protein-coding 170.333-208 chr7 97495459 97495829 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E2|LTR|ERVL-MaLR -236442 NM_013997 6863 Hs.2563 NM_003182 ENSG00000006128 TAC1 Hs.2563|NK2|NKNA|NPK|TAC2 tachykinin precursor 1 protein-coding 111.667-217 chr6 37573227 37573420 + 0.666667 NA Intergenic AluJr|SINE|Alu -17901 NR_039669 100616413 NR_039669 ENSG00000263926 MIR4462 - microRNA 4462 ncRNA 138-102 chr6 131471188 131471485 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -101890 NR_160934 383 Hs.440934 NM_000045 ENSG00000118520 ARG1 - arginase 1 protein-coding 157.333-114 chr15 25216496 25216813 + 0.666667 NA intron (NR_146177, intron 105 of 147) intron (NR_146177, intron 105 of 147) 1113 NR_003342 100033801 NR_003342 ENSG00000199489 SNORD115-25 HBII-52-25 small nucleolar RNA, C/D box 115-25 snoRNA 164.667-249 chr8 128203695 128204072 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 53767 NR_031613 100302281 NR_031613 ENSG00000221261 MIR1208 MIRN1208|hsa-mir-1208 microRNA 1208 ncRNA 157.667-247 chr5 69080484 69080788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13378 NM_024055 64924 Hs.631975 NM_022902 ENSG00000145740 SLC30A5 ZNT5|ZNTL1|ZTL1|ZnT-5 solute carrier family 30 member 5 protein-coding 164-108 chr7 50897857 50898172 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -104561 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 186-50 chr2 145273341 145273728 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 605567 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 166.667-122 chr2 163629204 163629553 + 0.666667 NA intron (NM_001321825, intron 1 of 1) intron (NM_001321825, intron 1 of 1) 106630 NM_018086 55137 Hs.593650 NM_018086 ENSG00000182263 FIGN - fidgetin, microtubule severing factor protein-coding 151.333-371 chr6 141846115 141846561 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 242461 NM_002511 4829 Hs.552106 NM_002511 ENSG00000135577 NMBR BB1|BB1R|NMB-R neuromedin B receptor protein-coding 162-117 chr8 21150807 21151082 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -147295 NR_104677 101929172 Hs.128668 NR_104677 ENSG00000254334 LOC101929172 - uncharacterized LOC101929172 ncRNA 188-44 chr17 71025397 71025857 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 176552 NR_104152 101928165 Hs.407613 NR_104152 ENSG00000260785 CASC17 LINC00600 cancer susceptibility 17 ncRNA 150.333-427 chr8 138869892 138870333 + 0.666667 NA intron (NM_152888, intron 3 of 64) (TG)n|Simple_repeat|Simple_repeat 43929 NM_152888 169044 Hs.117169 NM_152888 ENSG00000169436 COL22A1 - collagen type XXII alpha 1 chain protein-coding 111.667-96 chr16 57345821 57346053 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -12846 NM_002990 6367 Hs.534347 NM_002990 ENSG00000102962 CCL22 A-152E5.1|ABCD-1|DC/B-CK|MDC|SCYA22|STCP-1 C-C motif chemokine ligand 22 protein-coding 263.667-37 chr17 72416923 72417443 + 0.666667 NA intron (NR_036488, intron 3 of 3) MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 74372 NR_135222 146795 Hs.651743 NR_135222 ENSG00000264026 LINC02003 - long intergenic non-protein coding RNA 2003 ncRNA 178.333-82 chr2 107370153 107370561 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 -20832 NR_049853 100847045 NR_049853 ENSG00000283146 MIR548AU - microRNA 548au ncRNA 115-73 chr17 47298658 47298907 + 0.666667 NA intron (NM_000212, intron 10 of 14) intron (NM_000212, intron 10 of 14) 24831 NR_110881 102724508 Hs.661005 NR_110880 ENSG00000263293 THCAT158 - thyroid cancer-associated transcript 158 ncRNA 155-25 chr12 61889327 61889724 + 0.666667 NA intron (NM_178539, intron 1 of 4) L2a|LINE|L2 303314 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 143.333-47 chr11 11567567 11567944 + 0.666667 NA intron (NM_001363464, intron 1 of 9) intron (NM_001363464, intron 1 of 9) 54250 NM_001363464 374378 Hs.655152 NM_198516 ENSG00000110328 GALNT18 GALNACT18|GALNT15|GALNTL4|GalNAc-T15|GalNAc-T18 polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18 protein-coding 148-167 chr9 73956325 73956680 + 0.666667 NA Intergenic L1PA15-16|LINE|L1 -415029 NR_121182 101927358 Hs.559523 NR_121182 ENSG00000227809 LOC101927358 - uncharacterized LOC101927358 ncRNA 114.667-120 chr2 9876339 9876540 + 0.666667 NA intron (NM_005680, intron 7 of 14) intron (NM_005680, intron 7 of 14) 32965 NM_005680 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 198.667-117 chr20 7389648 7390162 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 18297 NR_107029 102465865 NR_107029 ENSG00000278159 MIR8062 hsa-mir-8062 microRNA 8062 ncRNA 134.333-13 chr10 14683346 14683643 + 0.666667 NA intron (NM_031453, intron 1 of 4) intron (NM_031453, intron 1 of 4) -79093 NM_001282697 83641 Hs.446315 NM_031453 ENSG00000065809 FAM107B C10orf45|HITS family with sequence similarity 107 member B protein-coding 112.333-123 chr2 48610854 48611076 + 0.666667 NA intron (NM_172311, intron 3 of 10) L1MDa|LINE|L1 -6815 NM_001193487 11036 Hs.732016 NM_006872 ENSG00000242441 GTF2A1L ALF general transcription factor IIA subunit 1 like protein-coding 136.667-90 chr2 49478095 49478375 + 0.666667 NA Intergenic L1PA7|LINE|L1 -323708 NM_000145 2492 Hs.1428 NM_000145 ENSG00000170820 FSHR FSHR1|FSHRO|LGR1|ODG1 follicle stimulating hormone receptor protein-coding 170.667-103 chr21 26793027 26793511 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 52140 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 181.667-118 chr5 55058878 55059282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 34824 NM_002104 3003 Hs.277937 NM_002104 ENSG00000113088 GZMK TRYP2 granzyme K protein-coding 118-45 chr15 53646328 53646658 + 0.666667 NA intron (NM_182758, intron 14 of 19) intron (NM_182758, intron 14 of 19) -105390 NR_102335 256764 Hs.122125 NM_182758 ENSG00000166415 WDR72 AI2A3 WD repeat domain 72 protein-coding 129.667-53 chr14 36252850 36253159 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 67633 NM_016586 51562 Hs.368647 NM_016586 ENSG00000151332 MBIP - MAP3K12 binding inhibitory protein 1 protein-coding 139.667-123 chr3 141818785 141819086 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40734 NM_139209 131890 Hs.680654 NM_139209 ENSG00000114124 GRK7 GPRK7 G protein-coupled receptor kinase 7 protein-coding 121-115 chr5 83907565 83907911 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -186883 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 134.667-196 chr8 91925652 91925896 + 0.666667 NA Intergenic LTR27C|LTR|ERV1 91906 NM_175636 862 Hs.368431 NM_004349 ENSG00000079102 RUNX1T1 AML1-MTG8|AML1T1|CBFA2T1|CDR|ETO|MTG8|ZMYND2 RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1 protein-coding 140.667-15 chr1 117037725 117037999 + 0.666667 NA intron (NR_110786, intron 2 of 3) MIRb|SINE|MIR 21628 NR_110786 101929099 Hs.559118 NR_110786 ENSG00000236137 LOC101929099 - uncharacterized LOC101929099 ncRNA 136.333-210 chr8 105799665 105799971 + 0.666667 NA intron (NM_001362837, intron 7 of 7) intron (NM_001362837, intron 7 of 7) 260685 NR_125796 102723356 Hs.571413 NR_125796 ZFPM2-AS1 SCAT3 ZFPM2 antisense RNA 1 ncRNA 191.333-171 chr6 28270244 28270740 + 0.666667 NA intron (NM_001287421, intron 1 of 3) intron (NM_001287421, intron 1 of 3) 3133 NM_001287421 7741 Hs.157883 NM_007151 ENSG00000197062 ZSCAN26 SRE-ZBP|SREZBP|ZNF187 zinc finger and SCAN domain containing 26 protein-coding 154.667-160 chr2 8725322 8725700 + 0.666667 NA non-coding (NR_145964, exon 32 of 32) non-coding (NR_145964, exon 32 of 32) 43455 NM_002166 3398 Hs.180919 NM_002166 ENSG00000115738 ID2 GIG8|ID2A|ID2H|bHLHb26 inhibitor of DNA binding 2 protein-coding 212.333-26 chr11 128456059 128456579 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65991 NM_005238 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 212.667-81 chr2 219873488 219874016 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 31137 NR_146975 105373889 Hs.570066 NR_146975 ENSG00000228909 LINC01803 - long intergenic non-protein coding RNA 1803 ncRNA 148.333-42 chr10 23738221 23738495 + 0.666667 NA intron (NM_001098500, intron 1 of 18) intron (NM_001098500, intron 1 of 18) 43631 NM_001098500 56243 Hs.445885 NM_019590 ENSG00000120549 KIAA1217 ETL4|SKT KIAA1217 protein-coding 138.333-142 chr5 11747948 11748211 + 0.666667 NA intron (NM_001288717, intron 1 of 20) intron (NM_001288717, intron 1 of 20) 156367 NR_109988 1501 Hs.314543 NM_001332 ENSG00000169862 CTNND2 GT24|NPRAP catenin delta 2 protein-coding 112-176 chr5 114249864 114250187 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -112045 NM_021614 3781 Hs.98280 NM_021614 ENSG00000080709 KCNN2 KCa2.2|SK2|SKCA2|SKCa 2|hSK2 potassium calcium-activated channel subfamily N member 2 protein-coding 146.333-307 chr7 50922928 50923212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -129617 NM_001001555 2887 Hs.164060 NM_005311 ENSG00000106070 GRB10 GRB-IR|Grb-10|IRBP|MEG1|RSS growth factor receptor bound protein 10 protein-coding 113.333-219 chr5 157746235 157746544 + 0.666667 NA intron (NM_173491, intron 1 of 3) intron (NM_173491, intron 1 of 3) 2677 NM_173491 134353 Hs.23648 NM_173491 ENSG00000155858 LSM11 - LSM11, U7 small nuclear RNA associated protein-coding 153-72 chr2 47644427 47644734 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74249 NM_022055 56660 Hs.591586 NM_022055 ENSG00000184261 KCNK12 K2p12.1|THIK-2|THIK2 potassium two pore domain channel subfamily K member 12 protein-coding 120.333-6 chr1 83794827 83795153 + 0.666667 NA intron (NR_119375, intron 1 of 2) intron (NR_119375, intron 1 of 2) 65556 NR_119374 101927560 Hs.559661 NR_119374 ENSG00000233008 LOC101927560 - uncharacterized LOC101927560 ncRNA 165.667-22 chr10 109496723 109497131 + 0.666667 NA Intergenic L1MEf|LINE|L1 426319 NM_001324136 7511 Hs.390623 NM_020383 ENSG00000108039 XPNPEP1 APP1|SAMP|XPNPEP|XPNPEPL|XPNPEPL1 X-prolyl aminopeptidase 1 protein-coding 112.667-76 chr15 60723475 60723787 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 42062 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 121-91 chr3 42376689 42376995 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 33768 NM_144634 131375 Hs.234895 NM_144634 ENSG00000157093 LYZL4 LYC4|LYZA lysozyme like 4 protein-coding 123.333-91 chr17 60102137 60102340 + 0.666667 NA non-coding (NR_027408, exon 1 of 1) non-coding (NR_027408, exon 1 of 1) 681 NR_027408 653653 Hs.631741 NR_027408 ENSG00000280852 LOC653653 - adaptor related protein complex 1 sigma 2 subunit pseudogene pseudo 151.333-211 chr2 73383912 73384210 + 0.666667 NA Intergenic MER110-int|LTR|ERV1 -1697 NM_015120 7840 Hs.184720 NM_015120 ENSG00000116127 ALMS1 ALSS ALMS1 centrosome and basal body associated protein protein-coding 143.667-189 chr4 145868355 145868627 + 0.666667 NA intron (NM_178835, intron 5 of 14) intron (NM_178835, intron 5 of 14) 70332 NM_178835 152485 Hs.133916 NM_178835 ENSG00000151612 ZNF827 - zinc finger protein 827 protein-coding 164.667-70 chr14 41131335 41131747 + 0.666667 NA intron (NR_109758, intron 3 of 3) intron (NR_109758, intron 3 of 3) 176830 NR_109757 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 124.333-56 chr15 81571184 81571491 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -197124 NM_001080532 342125 Hs.253489 NM_181841 ENSG00000188869 TMC3 - transmembrane channel like 3 protein-coding 160-107 chr6 164331754 164332065 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 490154 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 134.667-123 chr20 59409910 59410247 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 109467 NM_207033 1908 Hs.1408 NM_000114 ENSG00000124205 EDN3 ET-3|ET3|HSCR4|PPET3|WS4B endothelin 3 protein-coding 142.667-160 chr4 82835740 82836141 + 0.666667 NA intron (NM_001300744, intron 19 of 23) L1MB3|LINE|L1 -37083 NM_024906 79966 Hs.379191 NM_024906 ENSG00000145284 SCD5 ACOD4|FADS4|HSCD5|SCD2|SCD4 stearoyl-CoA desaturase 5 protein-coding 150-126 chr6 105032423 105032718 + 0.666667 NA intron (NM_001004317, intron 3 of 3) AluJb|SINE|Alu 75463 NM_001004317 389421 Hs.23616 NM_001004317 ENSG00000187772 LIN28B CSDD2 lin-28 homolog B protein-coding 155.667-93 chr14 54364128 54364451 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32579 NM_001330173 1033 Hs.84113 NM_005192 ENSG00000100526 CDKN3 CDI1|CIP2|KAP|KAP1 cyclin dependent kinase inhibitor 3 protein-coding 111.667-204 chr5 61607732 61608020 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -29884 NR_161251 285668 Hs.683866 NR_126523 ENSG00000178722 C5orf64 - chromosome 5 open reading frame 64 ncRNA 158.333-163 chr2 159203934 159204262 + 0.666667 NA intron (NM_001350065, intron 20 of 27) MER3|DNA|hAT-Charlie 17263 NR_106948 102465535 NR_106948 ENSG00000275141 MIR6888 hsa-mir-6888 microRNA 6888 ncRNA 221.333-90 chr3 46770693 46771040 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -14011 NR_160552 100288960 NR_160552 PRSS43P PRSS43|TESSP3 serine protease 43, pseudogene pseudo 164.667-41 chr11 102190287 102190650 + 0.666667 NA intron (NM_001130145, intron 4 of 8) AluSz6|SINE|Alu 78020 NM_001195045 10413 Hs.503692 NM_006106 ENSG00000137693 YAP1 COB1|YAP|YAP2|YAP65|YKI Yes associated protein 1 protein-coding 119.667-193 chr9 116786381 116786687 + 0.666667 NA intron (NM_014010, intron 12 of 21) intron (NM_014010, intron 12 of 21) 99229 NM_001099679 22954 Hs.591910 NM_012210 ENSG00000119401 TRIM32 BBS11|HT2A|LGMD2H|LGMDR8|TATIP tripartite motif containing 32 protein-coding 132.333-65 chr16 62368135 62368382 + 0.666667 NA Intergenic MSTB1|LTR|ERVL-MaLR -331820 NM_001796 1006 Hs.368322 NM_001796 ENSG00000150394 CDH8 Nbla04261 cadherin 8 protein-coding 212.333-27 chr12 8896361 8896706 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -17976 NM_004426 1911 Hs.744902 NM_004426 ENSG00000111752 PHC1 EDR1|HPH1|MCPH11|RAE28 polyhomeotic homolog 1 protein-coding 143.333-120 chr18 13296073 13296487 + 0.666667 NA intron (NM_181482, intron 2 of 5) intron (NM_181482, intron 2 of 5) 18175 NM_181481 753 Hs.697787 NM_004338 ENSG00000168675 LDLRAD4 C18orf1 low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 protein-coding 117-2 chr1 68179214 68179421 + 0.666667 NA intron (NM_001193334, intron 1 of 10) L3|LINE|CR1 4293 NR_031664 100302279 NR_031664 ENSG00000221203 MIR1262 MIRN1262|hsa-mir-1262|mir-1262 microRNA 1262 ncRNA 154-95 chr3 117227390 117227733 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 306130 NR_121607 100506724 Hs.125983 NR_121607 ENSG00000242385 LINC00901 LSAMP-AS4|TCONS_00005428 long intergenic non-protein coding RNA 901 ncRNA 115-124 chr5 31901652 31901834 + 0.666667 NA intron (NM_178140, intron 2 of 24) L1MB7|LINE|L1 34416 NR_036241 100422874 NR_036241 ENSG00000266243 MIR4279 - microRNA 4279 ncRNA 118-142 chrX 80429952 80430199 + 0.666667 NA intron (NM_152630, intron 1 of 2) LTR25-int|LTR|ERV1 9628 NM_152630 169966 Hs.367959 NM_152630 ENSG00000174016 TENT5D CT1.26|CT112|FAM46D terminal nucleotidyltransferase 5D protein-coding 174.333-99 chr4 31771728 31772031 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -225500 NR_125936 102723828 Hs.575118 NR_125936 ENSG00000251129 LINC02506 - long intergenic non-protein coding RNA 2506 ncRNA 125-38 chr15 34134529 34134829 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 32596 NM_152595 161779 Hs.156317 NM_152595 ENSG00000182405 PGBD4 - piggyBac transposable element derived 4 protein-coding 204.333-193 chr8 51235489 51235954 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 573724 NM_144651 137902 Hs.444882 NM_144651 ENSG00000147485 PXDNL PMR1|PRM1|VPO2 peroxidasin like protein-coding 191-10 chr10 74756182 74756606 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68861 NM_001370139 23522 Hs.35758 NM_012330 ENSG00000156650 KAT6B GTPTS|MORF|MOZ2|MYST4|ZC2HC6B|qkf|querkopf lysine acetyltransferase 6B protein-coding 197.667-5 chr1 96088092 96088541 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 96248 NR_125991 102723661 Hs.143911 NR_125991 ENSG00000237435 LINC02790 - long intergenic non-protein coding RNA 2790 ncRNA 137.333-164 chr5 157969694 157970005 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -110704 NM_001195555 9685 Hs.644000 NM_014666 ENSG00000113282 CLINT1 CLINT|ENTH|EPN4|EPNR clathrin interactor 1 protein-coding 166.667-46 chr11 108059737 108060078 + 0.666667 NA intron (NM_003478, intron 7 of 18) MIRb|SINE|MIR 51009 NM_003478 8065 Hs.440320 NM_003478 ENSG00000166266 CUL5 CUL-5|VACM-1|VACM1 cullin 5 protein-coding 114.667-257 chr9 27106503 27106824 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 -2478 NM_000459 7010 Hs.89640 NM_000459 ENSG00000120156 TEK CD202B|GLC3E|TIE-2|TIE2|VMCM|VMCM1 TEK receptor tyrosine kinase protein-coding 160.667-27 chr10 16858799 16859196 + 0.666667 NA intron (NM_001081, intron 59 of 66) L1MD|LINE|L1 -41543 NM_152724 6251 Hs.524161 NM_012425 ENSG00000148484 RSU1 RSP-1 Ras suppressor protein 1 protein-coding 145.667-296 chr8 122782928 122783363 + 0.666667 NA intron (NM_001362797, intron 1 of 4) intron (NM_001362797, intron 1 of 4) 1490 NM_014943 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 114.333-150 chr3 118108689 118108972 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -417905 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 116.667-89 chr2 9878373 9878683 + 0.666667 NA intron (NM_005680, intron 7 of 14) intron (NM_005680, intron 7 of 14) 35054 NM_005680 9014 Hs.584833 NM_005680 ENSG00000115750 TAF1B MGC:9349|RAF1B|RAFI63|SL1|TAFI63 TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B protein-coding 238.333-98 chrX 117067455 117068062 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR -249898 NR_145523 100126447 Hs.695847 NR_145523 LOC100126447 - uncharacterized LOC100126447 ncRNA 156-4 chr1 45729024 45729422 + 0.666667 NA intron (NM_001145349, intron 4 of 9) intron (NM_001145349, intron 4 of 9) 21430 NM_005897 3652 Hs.744252 NM_005897 ENSG00000197429 IPP KLHL27 intracisternal A particle-promoted polypeptide protein-coding 165-42 chr2 171969220 171969671 + 0.666667 NA intron (NR_027862, intron 7 of 9) intron (NR_027862, intron 7 of 9) -30508 NR_136276 254042 Hs.298250 NM_199227 ENSG00000172878 METAP1D MAP 1D|MAP1D|MetAP 1D|Metap1l methionyl aminopeptidase type 1D, mitochondrial protein-coding 119.333-69 chr12 38453478 38453684 + 0.666667 NA Intergenic MLT1I-int|LTR|ERVL-MaLR 136807 NM_001013620 144245 Hs.259305 NM_001013620 ENSG00000175548 ALG10B ALG10|KCR1 ALG10 alpha-1,2-glucosyltransferase B protein-coding 165.667-32 chr11 113889057 113889500 + 0.666667 NA Intergenic MSTD|LTR|ERVL-MaLR -13706 NM_001301029 57646 Hs.503891 NM_020886 ENSG00000048028 USP28 - ubiquitin specific peptidase 28 protein-coding 159.667-335 chr8 144090387 144090708 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -4529 NM_001916 1537 Hs.289271 NM_001916 ENSG00000179091 CYC1 MC3DN6|UQCR4 cytochrome c1 protein-coding 114.333-76 chr15 63712348 63712620 + 0.666667 NA intron (NM_003922, intron 24 of 77) L2|LINE|L2 -111657 NR_034080 100130855 Hs.631163 NR_034080 ENSG00000259248 USP3-AS1 - USP3 antisense RNA 1 ncRNA 162 chr1 52100526 52100867 + 0.666667 NA Intergenic HERV16-int|LTR|ERVL -41393 NM_007324 9372 Hs.532345 NM_004799 ENSG00000157077 ZFYVE9 MADHIP|NSP|PPP1R173|SARA|SMADIP zinc finger FYVE-type containing 9 protein-coding 211.333-103 chr2 26021121 26021713 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 -12667 NM_016131 10890 Hs.467960 NM_016131 ENSG00000084733 RAB10 - RAB10, member RAS oncogene family protein-coding 172-29 chr11 113752305 113752618 + 0.666667 NA intron (NM_004724, intron 7 of 15) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 21231 NM_004724 9183 Hs.503886 NM_004724 ENSG00000086827 ZW10 HZW10|KNTC1AP zw10 kinetochore protein protein-coding 121.667-186 chr7 1926396 1926652 + 0.666667 NA intron (NM_001013837, intron 17 of 18) L1MDa|LINE|L1 14047 NM_001304525 8379 Hs.654838 NM_003550 ENSG00000002822 MAD1L1 MAD1|PIG9|TP53I9|TXBP181 mitotic arrest deficient 1 like 1 protein-coding 148-9 chr1 110504679 110505019 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 14326 NM_005549 3744 Hs.248140 NM_005549 ENSG00000143105 KCNA10 Kcn1|Kv1.8 potassium voltage-gated channel subfamily A member 10 protein-coding 113-204 chr8 80979749 80979989 + 0.666667 NA intron (NM_018440, intron 8 of 8) intron (NM_018440, intron 8 of 8) -105088 NM_001033723 619279 Hs.434957 NM_032651 ENSG00000164684 ZNF704 Gig1 zinc finger protein 704 protein-coding 130.333-125 chr22 39954916 39955141 + 0.666667 NA intron (NM_001291826, intron 2 of 6) MARNA|DNA|TcMar-Mariner 8211 NM_001291825 9402 Hs.517499 NM_004810 ENSG00000100351 GRAP2 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 GRB2 related adaptor protein 2 protein-coding 178.667-46 chr13 101088193 101088492 + 0.666667 NA intron (NM_001350749, intron 30 of 43) intron (NM_001350749, intron 30 of 43) -143978 NR_047015 100874161 Hs.143791 NR_047015 LINC00411 - long intergenic non-protein coding RNA 411 ncRNA 180.667-135 chr7 28617663 28618014 + 0.666667 NA intron (NM_182899, intron 4 of 9) intron (NM_182899, intron 4 of 9) -68295 NM_001011666 9586 Hs.437075 NM_004904 ENSG00000146592 CREB5 CRE-BPA|CREB-5|CREBPA cAMP responsive element binding protein 5 protein-coding 148-143 chr6 93787822 93788116 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69666 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 157.667-206 chr4 34964890 34965183 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -695289 NR_147183 105374394 Hs.570782 NR_147183 ENSG00000248685 LINC02484 - long intergenic non-protein coding RNA 2484 ncRNA 223.667-31 chr17 57564775 57565189 + 0.666667 NA intron (NM_001322250, intron 7 of 13) MIR|SINE|MIR -41385 NR_110808 101927557 Hs.639984 NR_110808 ENSG00000266100 LOC101927557 - uncharacterized LOC101927557 ncRNA 167-59 chr2 100789031 100789433 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30907 NM_002518 4862 Hs.156832 NM_002518 ENSG00000170485 NPAS2 MOP4|PASD4|bHLHe9 neuronal PAS domain protein 2 protein-coding 130.333-84 chr16 75640828 75641202 + 0.666667 NA intron (NM_001130089, intron 3 of 14) AluSz6|SINE|Alu 6672 NM_001130089 3735 Hs.3100 NM_005548 ENSG00000065427 KARS CMTRIB|DFNB89|KARS1|KARS2|KRS lysyl-tRNA synthetase protein-coding 189-18 chr12 23701149 23701630 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 9 of 17) intron (NM_152989, intron 9 of 17) -116803 NM_178010 6660 Hs.434948 NM_006940 ENSG00000134532 SOX5 L-SOX5|L-SOX5B|L-SOX5F|LAMSHF SRY-box transcription factor 5 protein-coding 182.333-23 chr11 28252785 28253312 + 0.666667 NA intron (NM_001113528, intron 4 of 6) L2a|LINE|L2 144660 NM_001297775 196074 Hs.243326 NM_152636 ENSG00000169519 METTL15 METT5D1 methyltransferase like 15 protein-coding 115-40 chr12 28619337 28619593 + 0.666667 NA Intergenic L1MA3|LINE|L1 -428727 NR_148936 729291 Hs.129278 NR_148936 LOC729291 - uncharacterized LOC729291 ncRNA 187-71 chr6 41130942 41131389 + 0.666667 NA intron (NR_026938, intron 17 of 22) AluSx|SINE|Alu 23184 NM_001271808 340205 Hs.117331 NM_178174 ENSG00000161911 TREML1 GLTL1825|PRO3438|TLT-1|TLT1|dJ238O23.3 triggering receptor expressed on myeloid cells like 1 protein-coding 129.667-6 chr1 93807710 93807981 + 0.666667 NA intron (NM_001261408, intron 2 of 13) AluJb|SINE|Alu -32462 NR_148965 723788 Hs.659312 NR_148965 ENSG00000137936 MIG7 - mig-7 ncRNA 161.333-158 chr2 146786569 146787045 + 0.666667 NA Intergenic Plat_L3|LINE|CR1 199750 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 258.333-63 chr8 78016083 78016658 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 -499970 NM_006823 5569 Hs.433700 NM_006823 ENSG00000171033 PKIA PRKACN1 cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha protein-coding 261.333-108 chr8 125644344 125644967 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 212446 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 121.333-104 chr21 20999856 21000200 + 0.666667 NA intron (NM_001352595, intron 1 of 14) intron (NM_001352595, intron 1 of 14) 1619 NM_001352595 4685 Hs.473450 NM_004540 ENSG00000154654 NCAM2 NCAM21 neural cell adhesion molecule 2 protein-coding 125-83 chr4 112834358 112834619 + 0.666667 NA intron (NM_001354275, intron 1 of 43) L1MC5a|LINE|L1 16491 NM_001354253 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 181.333-141 chr5 82654217 82654726 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -185684 NR_039773 100616297 NR_039773 ENSG00000283359 MIR3977 - microRNA 3977 ncRNA 203.667-50 chr2 59308209 59308531 + 0.666667 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? 90662 NR_110219 101927285 Hs.570209 NR_110219 ENSG00000222030 LINC01793 - long intergenic non-protein coding RNA 1793 ncRNA 181-82 chrX 39450172 39450543 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -58583 NR_110385 101927449 Hs.553988 NR_110385 ENSG00000236747 LINC01282 - long intergenic non-protein coding RNA 1282 ncRNA 123.667-116 chr3 6416497 6416824 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 388789 NR_110125 101927347 Hs.333345 NR_110123 ENSG00000226258 GRM7-AS3 - GRM7 antisense RNA 3 ncRNA 123.333-47 chr11 46024814 46025168 + 0.666667 NA intron (NR_147890, intron 5 of 18) intron (NR_147890, intron 5 of 18) 95828 NM_001352029 51317 Hs.502458 NM_016621 ENSG00000135365 PHF21A BHC80|BM-006 PHD finger protein 21A protein-coding 182.333-12 chr1 228807212 228807704 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu 71979 NM_021205 58480 Hs.647774 NM_021205 ENSG00000116574 RHOU ARHU|CDC42L1|G28K|WRCH1|hG28K ras homolog family member U protein-coding 136.667-156 chr6 63495880 63496152 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -75996 NM_003463 7803 Hs.227777 NM_003463 ENSG00000112245 PTP4A1 HH72|PRL-1|PRL1|PTP(CAAX1)|PTPCAAX1 protein tyrosine phosphatase 4A1 protein-coding 116.333-134 chr21 33214702 33214907 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15091 NM_001289125 3455 Hs.708195 NM_000874 ENSG00000159110 IFNAR2 IFN-R|IFN-alpha-REC|IFNABR|IFNARB|IMD45 interferon alpha and beta receptor subunit 2 protein-coding 156.333-373 chr9 240397 240784 + 0.666667 NA intron (NM_203447, intron 1 of 47) intron (NM_203447, intron 1 of 47) -24840 NR_160804 157983 Hs.190877 NM_152569 ENSG00000183784 DOCK8-AS1 C9orf66 DOCK8 antisense RNA 1 ncRNA 143.333-159 chr20 59902016 59902362 + 0.666667 NA intron (NM_014258, intron 15 of 44) intron (NM_014258, intron 15 of 44) 31448 NM_014258 10388 Hs.202676 NM_014258 ENSG00000196074 SYCP2 SCP-2|SCP2 synaptonemal complex protein 2 protein-coding 116.333-79 chr16 52105308 52105501 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 20123 NR_104655 102467079 Hs.98466 NR_104655 ENSG00000261749 LINC02180 - long intergenic non-protein coding RNA 2180 ncRNA 126.667-38 chr12 66374870 66375160 + 0.666667 NA intron (NM_001178074, intron 20 of 22) intron (NM_001178074, intron 20 of 22) 72470 NR_135081 92797 Hs.505941 NM_033647 ENSG00000127311 HELB DHB|hDHB DNA helicase B protein-coding 173.333-189 chr7 85094275 85094644 + 0.666667 NA intron (NM_152754, intron 2 of 16) intron (NM_152754, intron 2 of 16) 27472 NM_152754 223117 Hs.201340 NM_152754 ENSG00000153993 SEMA3D Sema-Z2|coll-2 semaphorin 3D protein-coding 239.667-6 chr10 29025666 29026172 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 179511 NM_001278522 283080 NM_001278522 C10orf126 bA492M23.1 chromosome 10 open reading frame 126 protein-coding 139.667-143 chr4 157638975 157639358 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 66676 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 211.667-6 chr1 77563894 77564397 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001308237, exon 14 of 14) 3' UTR (NM_001308237, exon 14 of 14) 118513 NM_015534 26009 Hs.480506 NM_015534 ENSG00000036549 ZZZ3 ATAC1 zinc finger ZZ-type containing 3 protein-coding 166.667-197 chr6 49642021 49642422 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5347 NM_000324 6005 Hs.120950 NM_000324 ENSG00000112077 RHAG CD241|OHS|OHST|RH2|RH50A|RHNR|Rh50|Rh50GP|SLC42A1 Rh associated glycoprotein protein-coding 237-69 chr7 68923612 68924162 + 0.666667 NA Intergenic GA-rich|Low_complexity|Low_complexity 673737 NR_148926 100507468 Hs.362492 NR_108105 CT66 - cancer/testis associated transcript 66 ncRNA 176.333-183 chr9 109591903 109592200 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -48737 NM_001037293 445815 Hs.591908 NM_007203 ENSG00000157654 PALM2-AKAP2 AKAP-2|AKAP-KL|AKAP2|AKAPKL|MISP2|PALM2|PRKA2 PALM2-AKAP2 fusion protein-coding 172.667-15 chr1 222557290 222557639 + 0.666667 NA TTS (NM_005681) TTS (NM_005681) -9360 NM_024746 79802 Hs.665660 NM_024746 ENSG00000143512 HHIPL2 KIAA1822L HHIP like 2 protein-coding 138.667-62 chr14 64140230 64140510 + 0.666667 NA intron (NM_015180, intron 80 of 114) AluSp|SINE|Alu -45245 NR_031677 100313830 NR_031677 ENSG00000221537 MIR548H1 MIR548H-1|MIRN548H1 microRNA 548h-1 ncRNA 210-154 chr9 25518934 25519312 + 0.666667 NA Intergenic MER21C|LTR|ERVL 159735 NM_001004125 286319 Hs.26268 NM_001004125 ENSG00000198680 TUSC1 CCDC89B|TSG-9|TSG9 tumor suppressor candidate 1 protein-coding 130.333-130 chr3 48982035 48982248 + 0.666667 NA intron (NM_001349209, intron 14 of 15) intron (NM_001349209, intron 14 of 15) -7767 NM_177938 54681 Hs.654944 NM_017732 ENSG00000178467 P4HTM EGLN4|HIFPH4|P4H-TM|PH-4|PH4|PHD4 prolyl 4-hydroxylase, transmembrane protein-coding 206.333-129 chr5 42996423 42996889 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3323 NR_104643 643977 Hs.535791 NR_104643 FLJ32255 - uncharacterized LOC643977 ncRNA 113-198 chr8 57842255 57842510 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 96233 NR_134276 286178 Hs.255156 NR_134276 ENSG00000254139 LOC286178 - uncharacterized LOC286178 ncRNA 134.333-146 chr5 178216105 178216362 + 0.666667 NA intron (NR_103510, intron 10 of 13) L1ME3F|LINE|L1 11700 NM_031266 3182 Hs.591731 NM_004499 ENSG00000197451 HNRNPAB ABBP1|HNRPAB heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B protein-coding 115.667-117 chr2 114613077 114613281 + 0.666667 NA intron (NM_001321908, intron 2 of 25) intron (NM_001321908, intron 2 of 25) 151602 NM_001321912 57628 Hs.580539 NM_020868 ENSG00000175497 DPP10 DPL2|DPPY|DPRP-3|DPRP3 dipeptidyl peptidase like 10 protein-coding 130.333-70 chr14 88955275 88955608 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 130790 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 168-115 chr8 113220707 113221080 + 0.666667 NA intron (NM_001363185, intron 3 of 66) L1MC4|LINE|L1 156259 NM_198124 114788 Hs.91381 NM_052900 ENSG00000164796 CSMD3 - CUB and Sushi multiple domains 3 protein-coding 119.667-199 chrX 121555022 121555357 + 0.666667 NA Intergenic L1MA1|LINE|L1 184217 NR_037444 100500869 NR_037444 ENSG00000265456 MIR3672 - microRNA 3672 ncRNA 119-43 chr14 40501925 40502212 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -452643 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 304.333-21 chr21 28278461 28279172 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50149 NR_126012 101927973 Hs.570414 NR_126012 ENSG00000236532 LINC01695 - long intergenic non-protein coding RNA 1695 ncRNA 119.333-165 chr4 181933254 181933468 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -103388 NR_147188 105377573 Hs.333288 NR_147188 ENSG00000251336 TEMN3-AS1 - TENM3 antisense transcript 1 ncRNA 198.666-72 chr4 163518518 163519100 + 0.666667 NA intron (NM_018352, intron 6 of 6) intron (NM_018352, intron 6 of 6) 24119 NM_018352 55319 Hs.267446 NM_018352 ENSG00000198498 TMA16 C4orf43 translation machinery associated 16 homolog protein-coding 142-44 chr14 55658142 55658472 + 0.666667 NA intron (NR_073129, intron 30 of 45) intron (NR_073129, intron 30 of 45) 78100 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 130.333-215 chr8 135781287 135781506 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 323940 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 154.667-32 chr10 5787384 5787719 + 0.666667 NA intron (NM_001115156, intron 3 of 9) intron (NM_001115156, intron 3 of 9) 25883 NM_001494 2665 Hs.299055 NM_001494 ENSG00000057608 GDI2 HEL-S-46e|RABGDIB GDP dissociation inhibitor 2 protein-coding 179.333-126 chr3 74691581 74691948 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -170624 NM_020872 5067 Hs.12723 NM_020872 ENSG00000113805 CNTN3 BIG-1|PANG|PCS contactin 3 protein-coding 139.333-183 chr5 68476223 68476548 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 183808 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 149.667-219 chr2 159603288 159603580 + 0.666667 NA intron (NM_001329857, intron 1 of 36) intron (NM_001329857, intron 1 of 36) -11860 NR_110587 643072 Hs.632541 NR_110587 LOC643072 - uncharacterized LOC643072 ncRNA 154.667-375 chr7 138595030 138595366 + 0.666667 NA intron (NM_174959, intron 11 of 11) intron (NM_174959, intron 11 of 11) 69026 NM_174959 136306 Hs.99414 NM_174959 ENSG00000157703 SVOPL - SVOP like protein-coding 166.333-183 chr5 51805152 51805504 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -202703 NR_147166 105378960 Hs.639310 NR_147166 ENSG00000248789 LINC02118 - long intergenic non-protein coding RNA 2118 ncRNA 157.667-199 chr3 140765030 140765351 + 0.666667 NA Intergenic L1M4a1|LINE|L1 87126 NM_152616 287015 Hs.343487 NM_152616 ENSG00000155890 TRIM42 PPP1R40|T4A1 tripartite motif containing 42 protein-coding 170.667-118 chr3 189394097 189394456 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR -153682 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 182.333-16 chr10 25327355 25327723 + 0.666667 NA intron (NM_020752, intron 2 of 10) intron (NM_020752, intron 2 of 10) -151263 NR_027333 100128811 Hs.700407 NR_027333 ENSG00000233642 GPR158-AS1 - GPR158 antisense RNA 1 ncRNA 117.333-83 chr17 77479123 77479326 + 0.666667 NA intron (NM_001113495, intron 1 of 9) intron (NM_001113495, intron 1 of 9) 3981 NM_001113495 10801 Hs.440932 NM_006640 ENSG00000184640 SEPTIN9 AF17q25|MSF|MSF1|NAPB|PNUTL4|SEPT9|SINT1|SeptD1 septin 9 protein-coding 142.333-169 chr4 33177800 33178080 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 826902 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 114.667-66 chr12 118112171 118112449 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -8299 NM_019086 54621 Hs.187624 NM_019086 ENSG00000176834 VSIG10 - V-set and immunoglobulin domain containing 10 protein-coding 128.667-122 chr3 114036493 114036819 + 0.666667 NA exon (NM_020817, exon 5 of 17) exon (NM_020817, exon 5 of 17) 19870 NM_001353766 57577 Hs.477159 NM_020817 ENSG00000163617 CCDC191 KIAA1407 coiled-coil domain containing 191 protein-coding 118.667-196 chr8 119648613 119648808 + 0.666667 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) L1MB8|LINE|L1 -9871 NM_001040092 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 148-10 chr1 171666533 171666835 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -13996 NM_000261 4653 Hs.436037 NM_000261 ENSG00000034971 MYOC GLC1A|GPOA|JOAG|JOAG1|TIGR myocilin protein-coding 116.333-175 chr5 83720319 83720613 + 0.666667 NA intron (NM_001884, intron 1 of 4) intron (NM_001884, intron 1 of 4) 389 NM_001884 1404 Hs.2799 NM_001884 ENSG00000145681 HAPLN1 CRT1|CRTL1 hyaluronan and proteoglycan link protein 1 protein-coding 221.667-23 chr12 93763648 93764181 + 0.666667 NA intron (NM_001320100, intron 2 of 2) intron (NM_001320100, intron 2 of 2) -26091 NR_110093 101928731 Hs.659971 NR_110092 ENSG00000258274 LOC101928731 - uncharacterized LOC101928731 ncRNA 127.333-5 chr1 84843408 84843676 + 0.666667 NA intron (NM_012152, intron 2 of 2) intron (NM_012152, intron 2 of 2) 49664 NM_012152 23566 Hs.527909 NM_012152 ENSG00000171517 LPAR3 EDG7|Edg-7|GPCR|HOFNH30|LP-A3|LPA3|RP4-678I3 lysophosphatidic acid receptor 3 protein-coding 202-176 chr7 93216551 93216998 + 0.666667 NA intron (NM_001346642, intron 2 of 9) intron (NM_001346642, intron 2 of 9) 2797 NM_001288810 253012 Hs.443169 NM_198151 ENSG00000188175 HEPACAM2 MIKI HEPACAM family member 2 protein-coding 117.333-164 chr5 19284398 19284652 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 601747 NM_001291957 1016 Hs.317632 NM_004934 ENSG00000145526 CDH18 CDH14|CDH14L|CDH24 cadherin 18 protein-coding 146.667-61 chr11 106344253 106344564 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 93001 NR_120551 101928535 Hs.409078 NR_120551 ENSG00000254811 LOC101928535 - uncharacterized LOC101928535 ncRNA 115.667-67 chr13 102758944 102759176 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001146197) promoter-TSS (NM_001146197) 12 NM_001146197 643677 Hs.368382 NM_001146197 ENSG00000175820 CCDC168 C13orf40 coiled-coil domain containing 168 protein-coding 112.333-67 chr14 39421539 39421736 + 0.666667 NA intron (NM_203301, intron 1 of 3) intron (NM_203301, intron 1 of 3) 10863 NM_203301 254170 Hs.146632 NM_203301 ENSG00000165355 FBXO33 BMND12|Fbx33|c14_5247 F-box protein 33 protein-coding 146.667-117 chr15 77384650 77384988 + 0.666667 NA intron (NM_024776, intron 1 of 7) MER58A|DNA|hAT-Charlie 35285 NM_024776 79834 Hs.9587 NM_024776 ENSG00000173517 PEAK1 SGK269 pseudopodium enriched atypical kinase 1 protein-coding 282.667-38 chr5 131316182 131316843 + 0.666667 NA intron (NM_020240, intron 2 of 5) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 52503 NM_001038702 56990 Hs.508829 NM_020240 ENSG00000158985 CDC42SE2 SPEC2 CDC42 small effector 2 protein-coding 125-9 chr10 23381729 23382041 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -37088 NM_001365862 256815 Hs.132442 NM_153714 ENSG00000179133 C10orf67 C10orf115|LINC01552 chromosome 10 open reading frame 67 protein-coding 227.667-37 chr2 169513793 169514321 + 0.666667 NA intron (NM_006063, intron 1 of 5) intron (NM_006063, intron 1 of 5) 4355 NM_006063 10324 Hs.50550 NM_006063 ENSG00000239474 KLHL41 KBTBD10|Krp1|SARCOSIN kelch like family member 41 protein-coding 116-87 chr2 184389966 184390297 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 11156 NR_039638 100616305 NR_039638 ENSG00000266808 MIR548AE1 - microRNA 548ae-1 ncRNA 176.667-72 chr19 32634112 32634557 + 0.666667 NA intron (NM_032139, intron 12 of 28) intron (NM_032139, intron 12 of 28) -25865 NR_145718 109616972 NR_145718 ENSG00000201388 SNORA68B - small nucleolar RNA, H/ACA box 68B snoRNA 175-41 chr2 27198676 27199103 + 0.666667 NA TTS (NM_021095) TTS (NM_021095) -13142 NM_080592 51374 Hs.9527 NM_016085 ENSG00000138085 ATRAID APR--3|APR-3|APR3|C2orf28|HSPC013|PRO240|p18 all-trans retinoic acid induced differentiation factor protein-coding 164-61 chr2 124583100 124583404 + 0.666667 NA intron (NM_130773, intron 11 of 23) Arthur1B|DNA|hAT-Tip100 557965 NM_130773 129684 Hs.660653 NM_130773 ENSG00000155052 CNTNAP5 caspr5 contactin associated protein like 5 protein-coding 122.333-150 chr3 193509594 193509909 + 0.666667 NA intron (NM_032279, intron 2 of 29) intron (NM_032279, intron 2 of 29) -43462 NR_121666 101929198 Hs.450092 NR_046726 ATP13A4-AS1 - ATP13A4 antisense RNA 1 ncRNA 142-26 chr12 40784318 40784632 + 0.666667 NA intron (NM_001256063, intron 1 of 15) intron (NM_001256063, intron 1 of 15) -43463 NM_001256064 1272 Hs.143434 NM_001843 ENSG00000018236 CNTN1 F3|GP135|MYPCN contactin 1 protein-coding 114.667-105 chr17 31252170 31252377 + 0.666667 NA intron (NM_000267, intron 30 of 56) intron (NM_000267, intron 30 of 56) 44966 NM_002544 4974 Hs.113874 NM_002544 ENSG00000126861 OMG OMGP oligodendrocyte myelin glycoprotein protein-coding 122.333-142 chr3 145952008 145952313 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 117025 NR_146297 109729161 NR_146297 ENSG00000240032 LNCSRLR lncRNA-SRLR lncRNA sorafenib resistance in renal cell carcinoma associated ncRNA 113.333-109 chr18 72483542 72483857 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 60643 NM_182511 147381 Hs.569851 NM_182511 ENSG00000141668 CBLN2 - cerebellin 2 precursor protein-coding 150-107 chr4 156641557 156641844 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 330099 NM_016205 56034 Hs.570855 NM_016205 ENSG00000145431 PDGFC FALLOTEIN|SCDGF platelet derived growth factor C protein-coding 145.333-317 chr9 31263134 31263462 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 118192 NR_135134 101929620 Hs.547175 NR_135134 ENSG00000260720 LINC01243 - long intergenic non-protein coding RNA 1243 ncRNA 112-66 chr15 35404998 35405180 + 0.666667 NA intron (NM_080650, intron 6 of 8) L1MA2|LINE|L1 -32725 NR_037507 100500904 NR_037507 ENSG00000265102 MIR3942 - microRNA 3942 ncRNA 175.333-155 chr6 48454837 48455193 + 0.666667 NA Intergenic MLT1L|LTR|ERVL-MaLR -386326 NM_001013732 442213 Hs.659409 NM_207499 ENSG00000244694 PTCHD4 C6orf138|PTCH53|dJ402H5.2 patched domain containing 4 protein-coding 151-122 chr7 38799674 38799967 + 0.666667 NA intron (NM_014396, intron 7 of 28) L1M5|LINE|L1 109371 NM_014396 27072 Hs.592184 NM_014396 ENSG00000006715 VPS41 HVPS41|HVSP41|hVps41p VPS41 subunit of HOPS complex protein-coding 115.667-180 chr5 82398133 82398343 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 118776 NM_001017971 92270 Hs.676227 NM_001017971 ENSG00000205464 ATP6AP1L - ATPase H+ transporting accessory protein 1 like protein-coding 221.667-28 chr14 40658533 40658938 + 0.666667 NA Intergenic Tigger2a|DNA|TcMar-Tigger -295976 NR_109758 644919 Hs.434414 NR_109757 LINC02315 - long intergenic non-protein coding RNA 2315 ncRNA 112.667-254 chr7 102050710 102050929 + 0.666667 NA intron (NM_001913, intron 3 of 22) AluJr|SINE|Alu 233193 NM_181552 1523 Hs.191482 NM_001913 ENSG00000257923 CUX1 CASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GDDI|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75 cut like homeobox 1 protein-coding 170.333-236 chrX 97499594 97500050 + 0.666667 NA intron (NM_006729, intron 26 of 26) intron (NM_006729, intron 26 of 26) 64713 NR_125391 10824 Hs.654372 NR_125391 ENSG00000236256 DIAPH2-AS1 EPAG DIAPH2 antisense RNA 1 ncRNA 128.333-61 chr14 74189934 74190207 + 0.666667 NA intron (NM_001024674, intron 5 of 5) AluJr|SINE|Alu -49379 NM_182894 338917 Hs.449771 NM_182894 ENSG00000119614 VSX2 CHX10|HOX10|MCOP2|MCOPCB3|RET1 visual system homeobox 2 protein-coding 179.333-162 chr6 4346619 4347011 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -141983 NR_149117 105374895 Hs.436882 NR_149117 LINC02533 - long intergenic non-protein coding RNA 2533 ncRNA 119.333-166 chr5 10852503 10852728 + 0.666667 NA Intergenic MLT1K|LTR|ERVL-MaLR -91381 NM_001291963 1611 Hs.75189 NM_004394 ENSG00000112977 DAP - death associated protein protein-coding 113.333-234 chr6 148958788 148959077 + 0.666667 NA intron (NR_038408, intron 2 of 2) intron (NR_038408, intron 2 of 2) 5752 NR_038408 100128176 Hs.557541 NR_038408 UST-AS1 - UST antisense RNA 1 ncRNA 154.333-168 chr2 161812501 161812886 + 0.666667 NA intron (NM_001354443, intron 4 of 25) L1PA16|LINE|L1 188277 NM_001354448 57282 Hs.333958 NM_022058 ENSG00000144290 SLC4A10 NBCn2|NCBE solute carrier family 4 member 10 protein-coding 127.333-20 chr1 217961356 217961593 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 68574 NR_048550 100885798 Hs.434632 NR_048550 ENSG00000231814 LINC00210 NCRNA00210 long intergenic non-protein coding RNA 210 ncRNA 117.333-45 chr12 58568616 58568930 + 0.666667 NA intron (NR_120452, intron 7 of 7) intron (NR_120452, intron 7 of 7) -22929 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 170-109 chr7 16455648 16455999 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 9915 NM_015464 25928 Hs.648106 NM_015464 ENSG00000171243 SOSTDC1 CDA019|DAND7|ECTODIN|USAG1 sclerostin domain containing 1 protein-coding 189.667-59 chr16 59343762 59344077 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 411272 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 127.333-106 chr3 47810796 47811167 + 0.666667 NA intron (NM_014966, intron 3 of 22) AluSx1|SINE|Alu 7843 NM_138615 22907 Hs.517948 NM_014966 ENSG00000132153 DHX30 DDX30|NEDMIAL|RETCOR DExH-box helicase 30 protein-coding 179.667-122 chr6 147563457 147563909 + 0.666667 NA intron (NM_001030060, intron 1 of 1) intron (NM_001030060, intron 1 of 1) 54993 NM_001030060 389432 Hs.567973 NM_001030060 ENSG00000203727 SAMD5 dJ875H10.1 sterile alpha motif domain containing 5 protein-coding 162-46 chr14 88940811 88941129 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 116319 NM_001366535 123016 Hs.303055 NM_144596 ENSG00000165533 TTC8 BBS8|RP51 tetratricopeptide repeat domain 8 protein-coding 116-153 chr8 81676872 81677200 + 0.666667 NA intron (NM_005536, intron 4 of 8) intron (NM_005536, intron 4 of 8) 9289 NM_005536 3612 Hs.656694 NM_005536 ENSG00000133731 IMPA1 IMP|IMPA|MRT59 inositol monophosphatase 1 protein-coding 238.667-82 chr6 129335556 129336176 + 0.666667 NA intron (NM_000426, intron 29 of 64) L3|LINE|CR1 374311 NM_033515 93663 Hs.486458 NM_033515 ENSG00000146376 ARHGAP18 MacGAP|SENEX|bA307O14.2 Rho GTPase activating protein 18 protein-coding 141-44 chr2 82768835 82769131 + 0.666667 NA Intergenic L1M2|LINE|L1 -87820 NR_033423 1720 Hs.169235 NR_033423 DHFRP3 - dihydrofolate reductase pseudogene 3 pseudo 114.667-212 chr5 84794247 84794493 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -409490 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 174.667-175 chr9 17462978 17463360 + 0.666667 NA intron (NM_001365029, intron 20 of 25) intron (NM_001365029, intron 20 of 25) -115897 NM_003026 6456 Hs.75149 NM_003026 ENSG00000107295 SH3GL2 CNSA2|EEN-B1|SH3D2A|SH3P4 SH3 domain containing GRB2 like 2, endophilin A1 protein-coding 191-65 chr7 69944099 69944478 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 2 of 18) intron (NM_015570, intron 2 of 18) 345813 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 221-12 chr10 66681163 66681777 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 9 of 17) intron (NM_001127384, intron 9 of 17) -244566 NM_178011 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 141-41 chr2 7868091 7868459 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31380 NR_110256 101929551 Hs.116006 NR_110256 ENSG00000226506 LOC101929551 - uncharacterized LOC101929551 ncRNA 119-69 chr18 58342314 58342642 + 0.666667 NA intron (NM_001144965, intron 15 of 30) intron (NM_001144965, intron 15 of 30) -108596 NR_029667 406906 NR_029667 ENSG00000284440 MIR122 MIR122A|MIRN122|MIRN122A|hsa-mir-122|miRNA122|miRNA122A|mir-122 microRNA 122 ncRNA 151.333-102 chr12 47955050 47955441 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J|LTR|ERVL-MaLR -8302 NM_024056 79022 Hs.596726 NM_024056 ENSG00000134291 TMEM106C - transmembrane protein 106C protein-coding 149-49 chr15 78441558 78441882 + 0.666667 NA intron (NM_001354994, intron 2 of 21) intron (NM_001354994, intron 2 of 21) 3299 NM_001320942 3658 Hs.436031 NM_004136 ENSG00000136381 IREB2 ACO3|IRE-BP 2|IRE-BP2|IRP2|IRP2AD|NDCAMA iron responsive element binding protein 2 protein-coding 168.667-174 chr5 74256356 74256710 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4c|LINE|L1 51792 NR_105009 102503429 Hs.519391 NR_105009 ENSG00000248942 LINC01335 - long intergenic non-protein coding RNA 1335 ncRNA 148-166 chr9 36040562 36040865 + 0.666667 NA intron (NM_021111, intron 1 of 20) L2a|LINE|L2 3800 NM_001316345 8434 Hs.388918 NM_021111 ENSG00000122707 RECK ST15 reversion inducing cysteine rich protein with kazal motifs protein-coding 162.333-262 chr8 124642484 124642768 + 0.666667 NA intron (NM_001282971, intron 3 of 14) AluSp|SINE|Alu 85847 NM_001363298 9788 Hs.336994 NM_014751 ENSG00000170873 MTSS1 MIM|MIMA|MIMB MTSS I-BAR domain containing 1 protein-coding 181-35 chr2 30282039 30282426 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 50698 NM_030915 81606 Hs.567598 NM_030915 ENSG00000213626 LBH - LBH regulator of WNT signaling pathway protein-coding 168.333-2 chr1 44760691 44761190 + 0.666667 NA intron (NM_006845, intron 16 of 20) intron (NM_006845, intron 16 of 20) -1095 NR_145793 109623476 NR_145793 SNORD160 - small nucleolar RNA, C/D box 160 snoRNA 185.333-141 chr4 93065634 93066071 + 0.666667 NA intron (NM_001286838, intron 2 of 14) intron (NM_001286838, intron 2 of 14) 761453 NM_001286838 2895 Hs.162727 NM_001510 ENSG00000152208 GRID2 GluD2|SCAR18 glutamate ionotropic receptor delta type subunit 2 protein-coding 196.333-30 chr12 77939386 77939842 + 0.666667 NA intron (NM_001024383, intron 1 of 39) intron (NM_001024383, intron 1 of 39) 108720 NM_001024383 89795 Hs.655301 NM_014903 ENSG00000067798 NAV3 POMFIL1|STEERIN3|unc53H3 neuron navigator 3 protein-coding 147.667-331 chr7 30393279 30393618 + 0.666667 NA intron (NR_108081, intron 1 of 2) MER58A|DNA|hAT-Charlie 2563 NR_108081 100506516 NR_108081 ENSG00000281404 LINC01176 - long intergenic non-protein coding RNA 1176 ncRNA 146.667-315 chr7 89313795 89314055 + 0.666667 NA intron (NM_181646, intron 2 of 3) intron (NM_181646, intron 2 of 3) -518188 NM_152706 219557 Hs.112877 NM_152706 ENSG00000164645 TEX47 C7orf62 testis expressed 47 protein-coding 202.667-128 chr6 84388555 84389092 + 0.666667 NA Intergenic L2b|LINE|L2 86106 NR_132100 105377880 Hs.171384 NR_132100 ENSG00000231776 LINC01611 TCONS_l2_00025430 long intergenic non-protein coding RNA 1611 ncRNA 182.333-169 chr9 85218330 85218704 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A|LTR|ERVL-MaLR 512616 NM_001369552 4915 Hs.494312 NM_006180 ENSG00000148053 NTRK2 EIEE58|GP145-TrkB|OBHD|TRKB|trk-B neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 protein-coding 141.333-229 chr7 129751488 129751761 + 0.666667 NA intron (NM_001293163, intron 11 of 11) intron (NM_001293163, intron 11 of 11) 18868 NR_029614 406958 NR_029614 ENSG00000207990 MIR182 MIRN182|miRNA182|mir-182 microRNA 182 ncRNA 122-96 chr5 106850479 106850793 + 0.666667 NA intron (NR_104671, intron 2 of 3) intron (NR_104671, intron 2 of 3) 160378 NR_104671 102467213 Hs.570923 NR_104671 ENSG00000251027 LINC01950 - long intergenic non-protein coding RNA 1950 ncRNA 126.333-62 chr16 6979104 6979406 + 0.666667 NA intron (NM_001142334, intron 1 of 13) intron (NM_001142334, intron 1 of 13) 205446 NM_001142334 54715 Hs.459842 NM_018723 ENSG00000078328 RBFOX1 2BP1|A2BP1|FOX-1|FOX1|HRNBP1 RNA binding fox-1 homolog 1 protein-coding 117.667-60 chr16 22133670 22133874 + 0.666667 NA intron (NM_173615, intron 20 of 33) FLAM_C|SINE|Alu -28759 NM_001365288 100288072 NM_001365288 SDR42E2 - short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 2 protein-coding 127.667-145 chr5 128619323 128619563 + 0.666667 NA Intergenic LTR86C|LTR|ERVL -81198 NM_001999 2201 Hs.519294 NM_001999 ENSG00000138829 FBN2 CCA|DA9|EOMD fibrillin 2 protein-coding 194.667-95 chr3 96757159 96757593 + 0.666667 NA Intergenic L1MA9|LINE|L1 -57218 NM_001080448 285220 Hs.272208 NM_173655 ENSG00000080224 EPHA6 EHK-2|EHK2|EK12|EPA6|HEK12|PRO57066 EPH receptor A6 protein-coding 141-62 chr4 172088289 172088566 + 0.666667 NA intron (NM_001034845, intron 2 of 12) LTR48B|LTR|ERV1 -274820 NR_134656 441052 Hs.386236 NR_134656 LOC441052 - uncharacterized LOC441052 ncRNA 142.667-130 chr22 25222538 25222813 + 0.666667 NA intron (NM_000496, intron 2 of 5) L2a|LINE|L2 3036 NM_000496 1415 Hs.373074 NM_000496 ENSG00000244752 CRYBB2 CCA2|CRYB2|CRYB2A|CTRCT3|D22S665 crystallin beta B2 protein-coding 134.667-104 chr2 147115270 147115644 + 0.666667 NA Intergenic L1ME1|LINE|L1 528400 NR_026904 728773 Hs.334462 NR_026904 PABPC1P2 PABP2|PABP4|PABPCP2|PABPCP4 poly(A) binding protein cytoplasmic 1 pseudogene 2 pseudo 159-107 chr7 21088157 21088475 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 252885 NR_126381 104355138 Hs.650722 NR_126381 ENSG00000232790 LINC01162 - long intergenic non-protein coding RNA 1162 ncRNA 162.667-126 chr2 49584424 49584668 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 389657 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 138-44 chr17 49081080 49081368 + 0.666667 NA Intergenic LTR26C|LTR|ERV1 -51236 NM_001159388 124872 Hs.374679 NM_153446 ENSG00000167080 B4GALNT2 B4GALT|GALGT2 beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 2 protein-coding 123.333-37 chr10 73387991 73388222 + 0.666667 NA intron (NM_004034, intron 7 of 13) AluSx|SINE|Alu 25952 NM_001156 310 Hs.631827 NM_001156 ENSG00000138279 ANXA7 ANX7|SNX|SYNEXIN annexin A7 protein-coding 164-31 chr12 123071642 123071967 + 0.666667 NA intron (NM_020845, intron 1 of 24) MIRb|SINE|MIR -9580 NR_038290 100507091 Hs.683912 NR_038290 ENSG00000251497 PITPNM2-AS1 - PITPNM2 antisense RNA 1 ncRNA 191.667-125 chr8 88982791 88983192 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -655508 NM_005941 4325 Hs.492187 NM_005941 ENSG00000156103 MMP16 C8orf57|MMP-X2|MT-MMP2|MT-MMP3|MT3-MMP matrix metallopeptidase 16 protein-coding 150.667-45 chr10 70613813 70614241 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 -11239 NM_005041 5551 Hs.2200 NM_005041 ENSG00000180644 PRF1 HPLH2|P1|PFP perforin 1 protein-coding 154.667-410 chr9 70297656 70297959 + 0.666667 NA intron (NM_015110, intron 8 of 24) intron (NM_015110, intron 8 of 24) 38829 NM_015110 23137 Hs.534189 NM_015110 ENSG00000198887 SMC5 SMC5L1 structural maintenance of chromosomes 5 protein-coding 148-160 chr8 125533011 125533409 + 0.666667 NA Intergenic MLT1F2|LTR|ERVL-MaLR 101001 NM_001282985 10221 Hs.444947 NM_025195 ENSG00000173334 TRIB1 C8FW|GIG-2|GIG2|SKIP1|TRB-1|TRB1 tribbles pseudokinase 1 protein-coding 208.333-11 chr1 218272004 218272388 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -13097 NM_016052 51018 Hs.660109 NM_016052 ENSG00000067533 RRP15 CGI-115|KIAA0507 ribosomal RNA processing 15 homolog protein-coding 148.667-49 chr10 69843854 69844190 + 0.666667 NA intron (NM_001368898, intron 3 of 33) intron (NM_001368898, intron 3 of 33) 42116 NM_080798 1305 Hs.695934 NM_005203 ENSG00000197467 COL13A1 CMS19|COLXIIIA1 collagen type XIII alpha 1 chain protein-coding 159-112 chr7 94386395 94386822 + 0.666667 NA intron (NR_147206, intron 3 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 5584 NR_147206 101927525 Hs.571263 NR_147206 COL1A2-AS1 TCONS_00013888|lncRNA8975-1 COL1A2 antisense RNA 1 ncRNA 172.333-138 chr5 57615746 57616150 + 0.666667 NA intron (NR_120607, intron 5 of 5) intron (NR_120607, intron 5 of 5) -34712 NR_104668 101928505 Hs.119998 NR_104668 LOC101928505 - uncharacterized LOC101928505 ncRNA 117.667-122 chr3 126399485 126399683 + 0.666667 NA intron (NM_182628, intron 2 of 16) L1MB4|LINE|L1 4675 NM_182628 348807 Hs.591305 NM_182628 ENSG00000163885 CFAP100 CCDC37|MIA1 cilia and flagella associated protein 100 protein-coding 190-62 chr2 51330896 51331283 + 0.666667 NA intron (NR_135237, intron 3 of 10) intron (NR_135237, intron 3 of 10) 298488 NR_135237 730100 Hs.640140 NR_135237 ENSG00000231918 LOC730100 - uncharacterized LOC730100 ncRNA 143.333-22 chr10 15706778 15707102 + 0.666667 NA intron (NM_001291494, intron 2 of 28) L2a|LINE|L2 12982 NM_003638 8516 Hs.171311 NM_003638 ENSG00000077943 ITGA8 - integrin subunit alpha 8 protein-coding 155-108 chr5 65963310 65963640 + 0.666667 NA intron (NM_001253697, intron 1 of 25) AluSq2|SINE|Alu -17902 NR_028474 100303749 Hs.608060 NR_028474 LOC100303749 - LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) pseudogene pseudo 126.667-9 chr1 102127768 102128053 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -130676 NR_110211 118427 Hs.484475 NM_058170 ENSG00000118733 OLFM3 NOE3|NOELIN3|OPTIMEDIN olfactomedin 3 protein-coding 113-49 chr13 40284176 40284507 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu -63839 NR_033877 400123 Hs.577960 NR_033877 ENSG00000215483 LINC00548 - long intergenic non-protein coding RNA 548 ncRNA 114.333-234 chr8 141085105 141085396 + 0.666667 NA Intergenic MER45B|DNA|hAT-Tip100 -43339 NM_001352891 22898 Hs.18166 NM_014957 ENSG00000105339 DENND3 - DENN domain containing 3 protein-coding 234-41 chr2 144778894 144779512 + 0.666667 NA intron (NR_033870, intron 2 of 4) intron (NR_033870, intron 2 of 4) 111236 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 149-9 chr1 154010940 154011339 + 0.666667 NA intron (NM_001159484, intron 34 of 37) intron (NM_001159484, intron 34 of 37) 20377 NM_001030 6232 Hs.546291 NM_001030 ENSG00000177954 RPS27 DBA17|MPS-1|MPS1|S27 ribosomal protein S27 protein-coding 146-48 chr18 8454668 8455045 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -87822 NR_024419 100192426 Hs.666655 NR_024419 ENSG00000266149 LOC100192426 - uncharacterized LOC100192426 ncRNA 247.666-31 chr6 47439326 47440044 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38104 NM_012120 23607 Hs.485518 NM_012120 ENSG00000198087 CD2AP CMS CD2 associated protein protein-coding 179-92 chr7 26648245 26648628 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 10565 NR_161201 285941 Hs.413394 NR_161201 C7orf71 - chromosome 7 open reading frame 71 ncRNA 126.667-106 chr3 71772606 71772979 + 0.666667 NA exon (NM_001126128, exon 4 of 4) exon (NM_001126128, exon 4 of 4) 12356 NM_021935 60675 Hs.528665 NM_021935 ENSG00000163421 PROK2 BV8|HH4|KAL4|MIT1|PK2 prokineticin 2 protein-coding 133.333-121 chr4 20568230 20568578 + 0.666667 NA intron (NM_001289135, intron 27 of 35) intron (NM_001289135, intron 27 of 35) 40129 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 140.333-120 chr20 17577950 17578208 + 0.666667 NA intron (NM_006870, intron 1 of 3) intron (NM_006870, intron 1 of 3) 8004 NM_006870 11034 Hs.304192 NM_006870 ENSG00000125868 DSTN ACTDP|ADF|HEL32|bA462D18.2 destrin, actin depolymerizing factor protein-coding 196.667-92 chr22 34500971 34501453 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR 496704 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 248-66 chr5 1974605 1975057 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 87500 NR_109912 101929081 Hs.519180 NR_109912 ENSG00000249326 CTD-2194D22.4 - uncharacterized LOC101929081 ncRNA 175.667-29 chr12 25833220 25833549 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 40695 NR_036188 100422897 NR_036188 ENSG00000283603 MIR4302 - microRNA 4302 ncRNA 119-55 chr15 71141646 71141855 + 0.666667 NA intron (NM_024817, intron 1 of 16) intron (NM_024817, intron 1 of 16) 301 NM_024817 79875 Hs.387057 NM_024817 ENSG00000187720 THSD4 ADAMTSL-6|ADAMTSL6|FVSY9334|PRO34005 thrombospondin type 1 domain containing 4 protein-coding 207.333-144 chr2 190011082 190011687 + 0.666667 NA Intergenic L1MA7|LINE|L1 51345 NM_005259 2660 Hs.41565 NM_005259 ENSG00000138379 MSTN GDF8|MSLHP myostatin protein-coding 147-84 chr20 57624179 57624463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3895 NM_030776 81030 Hs.302123 NM_030776 ENSG00000124256 ZBP1 C20orf183|DAI|DLM-1|DLM1 Z-DNA binding protein 1 protein-coding 175.333-89 chr2 72340767 72341174 + 0.666667 NA intron (NR_135774, intron 17 of 19) intron (NR_135774, intron 17 of 19) -193108 NM_001277742 56603 Hs.91546 NM_019885 ENSG00000003137 CYP26B1 CYP26A2|P450RAI-2|P450RAI2|RHFCA cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1 protein-coding 181.667-4 chr1 154401884 154402243 + 0.666667 NA TTS (NR_147855) TTS (NR_147855) -3130 NM_001206866 3570 Hs.135087 NM_000565 ENSG00000160712 IL6R CD126|IL-6R-1|IL-6RA|IL6Q|IL6RA|IL6RQ|gp80 interleukin 6 receptor protein-coding 211.333-159 chr4 31291886 31292349 + 0.666667 NA Intergenic L1MA6|LINE|L1 120973 NR_125935 102723778 Hs.210739 NR_125935 ENSG00000251182 LINC02497 - long intergenic non-protein coding RNA 2497 ncRNA 153-8 chr10 7663200 7663572 + 0.666667 NA intron (NM_001001851, intron 1 of 11) MIR|SINE|MIR 3580 NM_030569 80760 Hs.498586 NM_030569 ENSG00000123243 ITIH5 ITI-HC5|PP14776 inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 5 protein-coding 131.333-184 chr8 122779771 122780096 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1722 NM_001362797 22882 Hs.377090 NM_014943 ENSG00000178764 ZHX2 AFR1|RAF zinc fingers and homeoboxes 2 protein-coding 252.333-17 chr13 36571039 36571783 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -102609 NM_203451 400120 Hs.422375 NM_203451 ENSG00000180440 SERTM1 C13orf36 serine rich and transmembrane domain containing 1 protein-coding 237-61 chr5 68536200 68536749 + 0.666667 NA Intergenic L1MC4|LINE|L1 243897 NM_001242466 5295 Hs.132225 NM_181504 ENSG00000145675 PIK3R1 AGM7|GRB1|IMD36|p85|p85-ALPHA phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1 protein-coding 181-11 chr12 3948526 3948917 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 -75273 NM_001286521 57097 Hs.657268 NM_020367 ENSG00000111224 PARP11 ARTD11|C12orf6|MIB006 poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 protein-coding 117.333-124 chr20 58484024 58484213 + 0.666667 NA intron (NR_130908, intron 1 of 1) intron (NR_130908, intron 1 of 1) 30820 NR_130908 164284 Hs.119286 NM_153360 ENSG00000198768 APCDD1L - APC down-regulated 1 like protein-coding 148.667-129 chr15 27581755 27582181 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -420649 NR_120343 101928869 Hs.585699 NR_120343 ENSG00000228740 GABRG3-AS1 - GABRG3 antisense RNA 1 ncRNA 149.333-255 chr3 116117592 116117919 + 0.666667 NA intron (NM_001318915, intron 1 of 8) L1MC3|LINE|L1 -212629 NR_145779 109623450 NR_145779 SNORD155 - small nucleolar RNA, C/D box 155 snoRNA 195-76 chr4 35931856 35932282 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 311870 NR_146893 116984 Hs.479451 NM_015230 ENSG00000047365 ARAP2 CENTD1|PARX ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 protein-coding 211.666-26 chr20 14135572 14136171 + 0.666667 NA intron (NM_001351663, intron 3 of 17) L1M4|LINE|L1 140355 NM_001351663 140733 Hs.661576 NM_080676 ENSG00000172264 MACROD2 C20orf133|C2orf133 mono-ADP ribosylhydrolase 2 protein-coding 175-18 chr12 18359284 18359573 + 0.666667 NA intron (NM_004570, intron 11 of 31) L1MB1|LINE|L1 97888 NM_001288772 5288 Hs.22500 NM_004570 ENSG00000139144 PIK3C2G PI3K-C2-gamma|PI3K-C2GAMMA phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 gamma protein-coding 158.667-304 chr7 53050818 53051068 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 15310 NM_182595 285877 Hs.381970 NM_182595 ENSG00000221900 POM121L12 - POM121 transmembrane nucleoporin like 12 protein-coding 180.333-140 chr8 120835546 120835934 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -23694 NM_021021 6641 Hs.46701 NM_021021 ENSG00000172164 SNTB1 59-DAP|A1B|BSYN2|DAPA1B|SNT2|SNT2B1|TIP-43 syntrophin beta 1 protein-coding 145.667-109 chr17 43804316 43804607 + 0.666667 NA intron (NM_001932, intron 19 of 19) L1MB7|LINE|L1 24026 NM_001353400 284067 Hs.252707 NM_001136483 ENSG00000231256 CFAP97D1 C17orf105 CFAP97 domain containing 1 protein-coding 169-85 chr5 129768337 129768754 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 20451 NM_001257308 100127206 Hs.582534 NM_001257308 ENSG00000186367 MINAR2 KIAA1024L membrane integral NOTCH2 associated receptor 2 protein-coding 125-48 chr17 63144368 63144646 + 0.666667 NA intron (NM_025185, intron 4 of 25) intron (NM_025185, intron 4 of 25) 178272 NM_025185 26115 Hs.410889 NM_015623 ENSG00000170921 TANC2 ROLSA|rols tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 protein-coding 142.333 chr1 19678285 19678559 + 0.666667 NA intron (NM_000871, intron 1 of 2) intron (NM_000871, intron 1 of 2) 13547 NM_000871 3362 Hs.22180 NM_000871 ENSG00000158748 HTR6 5-HT6|5-HT6R 5-hydroxytryptamine receptor 6 protein-coding 126.333-118 chr3 66599947 66600262 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -99683 NM_015541 26018 Hs.518055 NM_015541 ENSG00000144749 LRIG1 LIG-1|LIG1 leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1 protein-coding 125.333-4 chr1 55813580 55813842 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL 131252 NR_147162 105378739 Hs.98895 NR_147162 ENSG00000230250 LINC01753 - long intergenic non-protein coding RNA 1753 ncRNA 129.667-156 chr7 9842299 9842533 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 208146 NR_002790 168741 Hs.545134 NR_002790 PER4 - period circadian regulator 3 pseudogene pseudo 158.333-139 chr2 34872333 34872673 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 194946 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 201-91 chr5 41134525 41134918 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63379 NM_173489 133558 Hs.97714 NM_173489 ENSG00000171495 MROH2B HEATR7B2|SPIF maestro heat like repeat family member 2B protein-coding 165-85 chr6 48948200 48948630 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 514838 NM_000255 4594 Hs.485527 NM_000255 ENSG00000146085 MMUT MCM|MUT methylmalonyl-CoA mutase protein-coding 112-200 chr8 86219203 86219389 + 0.666667 NA intron (NM_138817, intron 2 of 3) intron (NM_138817, intron 2 of 3) 11085 NM_138817 157724 Hs.149095 NM_138817 ENSG00000164893 SLC7A13 AGT-1|AGT1|XAT2 solute carrier family 7 member 13 protein-coding 262.333-73 chr7 110272465 110273021 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -312530 NR_003024 442720 Hs.530096 NR_003024 ENSG00000237064 EIF3IP1 RG208K23 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I pseudogene 1 pseudo 117.667-13 chr1 217780684 217780886 + 0.666667 NA TTS (NR_125784) TTS (NR_125784) 4335 NR_125784 103752555 Hs.602803 NR_125784 ENSG00000234070 SPATA17-AS1 - SPATA17 antisense RNA 1 ncRNA 158-115 chr5 174475153 174475494 + 0.666667 NA intron (NR_125806, intron 2 of 5) L1M4|LINE|L1 138969 NR_125806 101928176 Hs.436014 NR_125806 ENSG00000249306 LINC01411 - long intergenic non-protein coding RNA 1411 ncRNA 151-105 chr5 32241315 32241684 + 0.666667 NA intron (NM_001294344, intron 12 of 13) intron (NM_001294344, intron 12 of 13) -67180 NM_022130 64083 Hs.408909 NM_022130 ENSG00000113384 GOLPH3 GOPP1|GPP34|MIDAS|Vps74 golgi phosphoprotein 3 protein-coding 200.333-160 chr8 129317658 129318109 + 0.666667 NA Intergenic MLT1E3|LTR|ERVL-MaLR -76643 NR_033916 728724 Hs.49902 NR_033916 ENSG00000229140 LINC00977 - long intergenic non-protein coding RNA 977 ncRNA 115.333-59 chr13 84123955 84124143 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16553 NR_046871 100874128 Hs.578060 NR_046871 LINC00333 NCRNA00333 long intergenic non-protein coding RNA 333 ncRNA 174.667-163 chr7 66956657 66957030 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_017994, exon 7 of 7) 3' UTR (NM_017994, exon 7 of 7) 35618 NM_017994 55069 Hs.488478 NM_017994 ENSG00000106609 TMEM248 C7orf42 transmembrane protein 248 protein-coding 120.667-27 chr11 42177001 42177195 + 0.666667 NA Intergenic MLT1B|LTR|ERVL-MaLR 76592 NR_038309 100507205 Hs.99310 NR_038309 LINC02740 - long intergenic non-protein coding RNA 2740 ncRNA 137.667-158 chr5 179557900 179558183 + 0.666667 NA intron (NM_025158, intron 1 of 17) Charlie2b|DNA|hAT-Charlie -1690 NM_001040451 80230 Hs.306769 NM_025158 ENSG00000176783 RUFY1 RABIP4|ZFYVE12 RUN and FYVE domain containing 1 protein-coding 134.667-30 chr10 119215760 119216011 + 0.666667 NA intron (NM_005308, intron 1 of 15) intron (NM_005308, intron 1 of 15) 8314 NM_005308 2869 Hs.524625 NM_005308 ENSG00000198873 GRK5 FP2025|GPRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 protein-coding 124.667-42 chr12 32680786 32681063 + 0.666667 NA intron (NM_001330380, intron 1 of 18) intron (NM_001330380, intron 1 of 18) 1623 NM_012062 10059 Hs.556296 NM_005690 ENSG00000087470 DNM1L DLP1|DRP1|DVLP|DYMPLE|EMPF|EMPF1|HDYNIV|OPA5 dynamin 1 like protein-coding 117-12 chr1 234690968 234691276 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -32920 NR_038856 100506810 Hs.586634 NR_038856 ENSG00000227630 LINC01132 - long intergenic non-protein coding RNA 1132 ncRNA 225.333-88 chr20 35743783 35744207 + 0.666667 NA Intergenic AluSx1|SINE|Alu -1659 NR_136587 9584 Hs.282901 NM_004902 ENSG00000131051 RBM39 CAPER|CAPERalpha|FSAP59|HCC1|RNPC2 RNA binding motif protein 39 protein-coding 150-112 chr5 35973698 35974016 + 0.666667 NA intron (NM_001171873, intron 3 of 5) ERVL-B4-int|LTR|ERVL 17533 NM_152404 133688 Hs.254699 NM_152404 ENSG00000145626 UGT3A1 - UDP glycosyltransferase family 3 member A1 protein-coding 115-145 chr7 71835665 71835889 + 0.666667 NA intron (NM_001363460, intron 4 of 5) intron (NM_001363460, intron 4 of 5) 501614 NM_001017440 83698 Hs.592750 NM_031468 ENSG00000183166 CALN1 CABP8 calneuron 1 protein-coding 216.667-112 chr9 34203300 34203877 + 0.666667 NA intron (NM_001171203, intron 2 of 7) intron (NM_001171203, intron 2 of 7) 24545 NM_016525 51271 Hs.268963 NM_016525 ENSG00000165006 UBAP1 NAG20|SPG80|UAP|UBAP|UBAP-1 ubiquitin associated protein 1 protein-coding 168-48 chr19 39285960 39286324 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -10265 NM_172140 282618 Hs.406745 NM_172140 ENSG00000182393 IFNL1 IL-29|IL29 interferon lambda 1 protein-coding 299.333-16 chr12 65884226 65884975 + 0.666667 NA intron (NM_001300918, intron 3 of 4) intron (NM_001300918, intron 3 of 4) -2275 NR_158985 100129940 Hs.685856 NR_120478 ENSG00000197301 HMGA2-AS1 - HMGA2 antisense RNA 1 ncRNA 116-140 chr6 164297026 164297322 + 0.666667 NA Intergenic MER102c|DNA|hAT-Charlie 524889 NR_131926 105378111 NR_131926 MEAT6 - melanoma-associated transcript 6 ncRNA 188.333-21 chr10 131396302 131396711 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -84785 NM_174937 256536 Hs.126575 NM_174937 ENSG00000176769 TCERG1L - transcription elongation regulator 1 like protein-coding 122.333-30 chr11 23337354 23337647 + 0.666667 NA Intergenic L2a|LINE|L2 81690 NR_107021 102465860 NR_107021 ENSG00000275868 MIR8054 hsa-mir-8054 microRNA 8054 ncRNA 291.667-3 chr1 95173726 95174356 + 0.666667 NA intron (NM_001199691, intron 6 of 7) MIRb|SINE|MIR 56118 NM_001199691 100527978 Hs.483512 NM_001199691 ENSG00000271092 TLCD4-RWDD3 TMEM56-RWDD3 TLCD4-RWDD3 readthrough protein-coding 116-133 chr6 45714712 45715025 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 222729 NR_045674 53405 Hs.485489 NM_016929 ENSG00000112782 CLIC5 DFNB102|DFNB103|MST130|MSTP130 chloride intracellular channel 5 protein-coding 145.333-198 chr3 115284044 115284390 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -136929 NM_001348803 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 151.667-21 chr1 166700252 166700599 + 0.666667 NA Intergenic MLT1O|LTR|ERVL-MaLR 96509 NR_002925 116123 Hs.348539 NM_138784 ENSG00000215834 FMO9P - flavin containing dimethylaniline monoxygenase 9, pseudogene pseudo 149.333-48 chr10 55577340 55577637 + 0.666667 NA intron (NM_001354404, intron 2 of 34) intron (NM_001354404, intron 2 of 34) -21554 NM_001190478 100463289 NM_001190478 ENSG00000249860 MTRNR2L5 HN5 MT-RNR2 like 5 protein-coding 162.667-216 chr5 54313224 54313694 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2886 NM_019087 54622 Hs.659125 NM_019087 ENSG00000185305 ARL15 ARFRP2 ADP ribosylation factor like GTPase 15 protein-coding 116-161 chr8 134077363 134077579 + 0.666667 NA Intergenic L1MEd|LINE|L1 190975 NR_125424 101927822 Hs.129114 NR_125424 ENSG00000253593 LOC101927822 - uncharacterized LOC101927822 ncRNA 112.667-270 chr8 123850228 123850536 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3|LINE|L1 -1605 NM_001039112 654463 Hs.632058 NM_001039112 ENSG00000214814 FER1L6 C8ORFK23 fer-1 like family member 6 protein-coding 113.667-64 chr14 64921485 64921655 + 0.666667 NA intron (NM_001204063, intron 1 of 3) L1ME2|LINE|L1 7115 NM_001202558 100529261 Hs.325531 NM_001202558 ENSG00000125954 CHURC1-FNTB FNTB|FTase-beta CHURC1-FNTB readthrough protein-coding 148.667-334 chr6 67417891 67418292 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -637260 NR_125869 102723883 Hs.566528 NR_125869 ENSG00000223504 LOC102723883 - uncharacterized LOC102723883 ncRNA 140-17 chr10 24745397 24745758 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -21690 NM_020824 57584 Hs.524195 NM_020824 ENSG00000107863 ARHGAP21 ARHGAP10 Rho GTPase activating protein 21 protein-coding 265-24 chr15 62262281 62262860 + 0.666667 NA Intergenic LTR10E|LTR|ERV1 -13775 NR_136885 255180 Hs.370479 NM_173805 GOLGA2P11 - GOLGA2 pseudogene 11 pseudo 177.333-31 chr12 14545344 14545761 + 0.666667 NA intron (NM_024829, intron 2 of 10) intron (NM_024829, intron 2 of 10) -22180 NR_120465 101928290 Hs.131933 NR_120465 ENSG00000256751 PLBD1-AS1 - PLBD1 antisense RNA 1 ncRNA 128.667-190 chr8 135227256 135227562 + 0.666667 NA Intergenic LTR78|LTR|ERV1 -6722 NR_026706 286094 Hs.440978 NR_026706 ENSG00000254083 LINC01591 - long intergenic non-protein coding RNA 1591 ncRNA 139.333-19 chr10 13773739 13774127 + 0.666667 NA intron (NM_001318336, intron 5 of 23) intron (NM_001318336, intron 5 of 23) -66366 NM_001318338 55691 Hs.330463 NM_018027 ENSG00000151474 FRMD4A CCAFCA|FRMD4|bA295P9.4 FERM domain containing 4A protein-coding 186-85 chr5 134328177 134328573 + 0.666667 NA intron (NM_001349366, intron 1 of 8) L1MB8|LINE|L1 38699 NM_016508 51265 Hs.719926 NM_016508 ENSG00000006837 CDKL3 NKIAMRE cyclin dependent kinase like 3 protein-coding 159-20 chr11 39742353 39742742 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR 550583 NR_047674 57689 Hs.745123 NM_020929 ENSG00000148948 LRRC4C NGL-1|NGL1 leucine rich repeat containing 4C protein-coding 176.667-117 chr5 17406297 17406683 + 0.666667 NA intron (NR_134274, intron 1 of 1) MLT1L|LTR|ERVL-MaLR 2344 NR_134274 101929544 Hs.23725 NR_134273 ENSG00000248455 LINC02217 - long intergenic non-protein coding RNA 2217 ncRNA 114-152 chr7 107837689 107838017 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -34620 NM_000111 1811 Hs.1650 NM_000111 ENSG00000091138 SLC26A3 CLD|DRA solute carrier family 26 member 3 protein-coding 161.333-260 chr7 47658218 47658570 + 0.666667 NA intron (NM_001123065, intron 1 of 2) L2c|LINE|L2 3150 NM_001123065 401335 Hs.520816 NM_001123065 C7orf65 - chromosome 7 open reading frame 65 protein-coding 194-109 chr5 110615963 110616464 + 0.666667 NA intron (NM_001039763, intron 8 of 13) L1MA7|LINE|L1 -102298 NR_031644 100302159 NR_031644 ENSG00000221436 MIR548F3 MIR548F-3|MIRN548F3|hsa-mir-548f-3 microRNA 548f-3 ncRNA 161-91 chr7 36824850 36825325 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 94345 NR_031604 100302113 NR_031604 ENSG00000221325 MIR1200 MIRN1200|hsa-mir-1200 microRNA 1200 ncRNA 177.333-81 chr2 58838676 58839064 + 0.666667 NA intron (NR_033873, intron 2 of 13) intron (NR_033873, intron 2 of 13) 318117 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 118.333-144 chr3 193563760 193563974 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8972 NM_032279 84239 Hs.674423 NM_032279 ENSG00000127249 ATP13A4 - ATPase 13A4 protein-coding 139.333-122 chr2 194352228 194352619 + 0.666667 NA intron (NR_110222, intron 1 of 5) intron (NR_110222, intron 1 of 5) 8154 NR_110222 101927406 Hs.385793 NR_110222 ENSG00000225539 LINC01821 - long intergenic non-protein coding RNA 1821 ncRNA 132.667-93 chr2 138724704 138725038 + 0.666667 NA intron (NM_007226, intron 1 of 1) intron (NM_007226, intron 1 of 1) 55519 NM_007226 11249 Hs.435019 NM_007226 ENSG00000144227 NXPH2 NPH2 neurexophilin 2 protein-coding 124.333-58 chr16 10064626 10064926 + 0.666667 NA intron (NM_001134408, intron 2 of 13) intron (NM_001134408, intron 2 of 13) 117291 NM_001134408 2903 Hs.411472 NM_000833 ENSG00000183454 GRIN2A EPND|FESD|GluN2A|LKS|NMDAR2A|NR2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A protein-coding 197.667-129 chr5 133506826 133507240 + 0.666667 NA intron (NM_015082, intron 3 of 15) AluSx|SINE|Alu -79327 NR_031621 100302134 NR_031621 ENSG00000221287 MIR1289-2 MIRN1289-2|hsa-mir-1289-2 microRNA 1289-2 ncRNA 137.333-11 chr1 232070147 232070419 + 0.666667 NA Intergenic L1PB2|LINE|L1 144449 NR_126441 104472714 NR_126441 ENSG00000226758 DISC1-IT1 - DISC1 intronic transcript 1 ncRNA 123.667-63 chr15 60779996 60780272 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 98565 NR_120318 100996876 Hs.511626 NR_120318 RORA-AS2 - RORA antisense RNA 2 ncRNA 155-13 chr10 48946192 48946605 + 0.666667 NA intron (NM_020945, intron 50 of 61) MER5B|DNA|hAT-Charlie -32163 NM_001006939 474354 Hs.202438 NM_001006939 ENSG00000165383 LRRC18 UNQ933|UNQ9338|VKGE9338 leucine rich repeat containing 18 protein-coding 122.667-88 chr2 65325234 65325463 + 0.666667 NA intron (NM_001128210, intron 4 of 5) intron (NM_001128210, intron 4 of 5) 41430 NM_001128210 200734 Hs.59332 NM_181784 ENSG00000198369 SPRED2 Spred-2 sprouty related EVH1 domain containing 2 protein-coding 219.333-12 chr1 176784031 176784506 + 0.666667 NA intron (NM_020318, intron 17 of 22) intron (NM_020318, intron 17 of 22) 245177 NR_030163 574441 NR_030163 ENSG00000202609 MIR488 MIRN488|hsa-mir-488|mir-488 microRNA 488 ncRNA 184.667-18 chr10 63010782 63011220 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -122246 NM_001282405 29982 Hs.449628 NM_030759 ENSG00000148572 NRBF2 COPR|COPR1|COPR2|NRBF-2 nuclear receptor binding factor 2 protein-coding 148-159 chr8 123438760 123439139 + 0.666667 NA intron (NM_018024, intron 5 of 5) intron (NM_018024, intron 5 of 5) 22175 NM_018024 55093 Hs.18029 NM_018024 ENSG00000156795 WDYHV1 C8orf32 WDYHV motif containing 1 protein-coding 117.667-42 chr12 80201850 80202176 + 0.666667 NA intron (NM_001368062, intron 6 of 62) intron (NM_001368062, intron 6 of 62) -7440 NM_173591 283310 Hs.723594 NM_173591 ENSG00000165899 OTOGL C12orf64|DFNB84B otogelin like protein-coding 161.333-119 chr17 73805338 73805669 + 0.666667 NA intron (NR_027146, intron 2 of 3) intron (NR_027146, intron 2 of 3) 18681 NR_040020 400620 Hs.348644 NR_040020 ENSG00000234721 LINC02092 - long intergenic non-protein coding RNA 2092 ncRNA 113.333-50 chr11 77268511 77268708 + 0.666667 NA intron (NM_182833, intron 9 of 16) intron (NM_182833, intron 9 of 16) 33057 NM_182833 220032 Hs.249795 NM_182833 ENSG00000178795 GDPD4 GDE6 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 protein-coding 140-39 chr14 70816750 70817143 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -7433 NM_033141 4293 Hs.445496 NM_033141 ENSG00000006432 MAP3K9 MEKK9|MLK1|PRKE1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 protein-coding 112.667-272 chr8 132550196 132550524 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 11119 NR_026684 93668 Hs.545218 NR_026684 ENSG00000253521 HPYR1 HPRG1|LINC00027|NCRNA00027 Helicobacter pylori responsive 1 ncRNA 127.333-92 chr20 25697699 25697991 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_015655) promoter-TSS (NM_015655) -992 NM_015655 26152 Hs.61881 NM_015655 ENSG00000130684 ZNF337 - zinc finger protein 337 protein-coding 146-112 chr5 119656385 119656671 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26969 NM_182761 340069 Hs.713304 NM_182761 ENSG00000164334 FAM170A ZNFD family with sequence similarity 170 member A protein-coding 239-31 chr2 109249869 109250327 + 0.666667 NA intron (NM_001099289, intron 1 of 9) intron (NM_001099289, intron 1 of 9) 63527 NR_036224 100423027 NR_036224 ENSG00000265965 MIR4266 - microRNA 4266 ncRNA 198-58 chr15 61685964 61686515 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -43679 NR_146448 100506530 Hs.42265 NR_146448 ENSG00000259284 LINC02349 - long intergenic non-protein coding RNA 2349 ncRNA 125-60 chr2 133055043 133055359 + 0.666667 NA intron (NM_207481, intron 6 of 17) intron (NM_207481, intron 6 of 17) 139644 NR_135572 101928185 Hs.680114 NR_135572 ENSG00000233729 NCKAP5-AS1 - NCKAP5 antisense RNA 1 ncRNA 133.667-121 chr5 80177031 80177430 + 0.666667 NA intron (NR_126061, intron 4 of 13) intron (NR_126061, intron 4 of 13) 78818 NM_001174072 256987 Hs.288232 NM_178276 ENSG00000164300 SERINC5 C5orf12|TPO1 serine incorporator 5 protein-coding 211.333-173 chr4 89921809 89922271 + 0.666667 NA intron (NM_001371403, intron 4 of 8) intron (NM_001371403, intron 4 of 8) 27186 NM_007351 22915 Hs.268107 NM_007351 ENSG00000138722 MMRN1 ECM|EMILIN4|GPIa*|MMRN multimerin 1 protein-coding 158-87 chr3 45004887 45005190 + 0.666667 NA intron (NR_023353, intron 3 of 6) L1ME3A|LINE|L1 -21265 NM_003278 7123 Hs.476092 NM_003278 ENSG00000163815 CLEC3B TN|TNA C-type lectin domain family 3 member B protein-coding 129.667-152 chr6 99470201 99470448 + 0.666667 NA intron (NR_144348, intron 9 of 12) intron (NR_144348, intron 9 of 12) -44979 NM_001322416 25957 Hs.520287 NM_015491 ENSG00000132424 PNISR C6orf111|HSPC306|SFRS18|SRrp130|bA98I9.2 PNN interacting serine and arginine rich protein protein-coding 284-13 chr12 49104896 49105623 + 0.666667 NA intron (NM_001352167, intron 2 of 14) intron (NM_001352167, intron 2 of 14) 5641 NM_018113 55716 Hs.272838 NM_018113 ENSG00000139636 LMBR1L LIMR limb development membrane protein 1 like protein-coding 183.333-136 chr5 148993554 148993945 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_024577, exon 17 of 17) 3' UTR (NM_024577, exon 17 of 17) 68660 NR_030310 693169 NR_030310 ENSG00000207714 MIR584 MIRN584|hsa-mir-584 microRNA 584 ncRNA 117.333-91 chr18 74301572 74301771 + 0.666667 NA Intergenic MER101-int|LTR|ERV1 -9708 NM_001914 1528 Hs.465413 NM_001914 ENSG00000166347 CYB5A CYB5|MCB5|METAG cytochrome b5 type A protein-coding 144.667-230 chr5 21031947 21032220 + 0.666667 NA Intergenic L1MC3|LINE|L1 -416548 NR_147185 105374677 NR_147185 LINC02146 - long intergenic non-protein coding RNA 2146 ncRNA 139.667-150 chr5 40839630 40839876 + 0.666667 NA Intergenic AluJr4|SINE|Alu -1614 NM_032587 84674 Hs.200242 NM_032587 ENSG00000132357 CARD6 CINCIN1 caspase recruitment domain family member 6 protein-coding 133.333-10 chr1 117926308 117926698 + 0.666667 NA intron (NM_001135589, intron 1 of 12) LTR91|LTR|ERVL 3118 NM_001135589 54834 Hs.310809 NM_017686 ENSG00000196505 GDAP2 MACROD3|SCAR27 ganglioside induced differentiation associated protein 2 protein-coding 114.667-101 chr16 72738283 72738500 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -73421 NR_159372 101927957 Hs.637253 NR_126330 ENSG00000261008 LINC01572 - long intergenic non-protein coding RNA 1572 ncRNA 122.667-125 chr3 149704316 149704531 + 0.666667 NA intron (NM_001348362, intron 3 of 9) intron (NM_001348362, intron 3 of 9) -1150 NM_001168278 25937 Hs.477921 NM_015472 ENSG00000018408 WWTR1 TAZ WW domain containing transcription regulator 1 protein-coding 182.667-86 chr22 29694084 29694581 + 0.666667 NA intron (NM_181832, intron 16 of 16) intron (NM_181832, intron 16 of 16) -25671 NM_182527 164633 Hs.643608 NM_182527 ENSG00000100314 CABP7 CALN2 calcium binding protein 7 protein-coding 163-37 chr19 7000047 7000483 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 6150 NR_024372 497049 Hs.367930 NM_001011541 FLJ25758 - microtubule affinity regulating kinase 1 pseudogene pseudo 176-59 chr3 120256518 120256876 + 0.666667 NA Intergenic L1PA11|LINE|L1 -12402 NM_153002 165829 Hs.333358 NM_153002 ENSG00000175697 GPR156 GABABL|PGR28 G protein-coupled receptor 156 protein-coding 123.333-57 chr12 19687592 19687850 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 247122 NM_001267043 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 137.333-132 chr4 43485376 43485711 + 0.666667 NA intron (NR_146993, intron 1 of 2) intron (NR_146993, intron 1 of 2) 7000 NR_146993 105374436 Hs.170605 NR_146993 ENSG00000248143 LINC02383 - long intergenic non-protein coding RNA 2383 ncRNA 141.667-104 chr18 66587476 66587838 + 0.666667 NA intron (NM_001271028, intron 1 of 9) intron (NM_001271028, intron 1 of 9) 16433 NM_001271028 28513 Hs.42771 NM_021153 ENSG00000071991 CDH19 CDH7|CDH7L2 cadherin 19 protein-coding 120.667-80 chr18 7516454 7516715 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -50732 NM_001105244 5797 Hs.49774 NM_002845 ENSG00000173482 PTPRM PTPRL1|R-PTP-MU|RPTPM|RPTPU|hR-PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein-coding 143.667-249 chr8 63254411 63254698 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 85551 NM_001277814 253943 Hs.491861 NM_152758 ENSG00000185728 YTHDF3 - YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3 protein-coding 144.333-74 chr14 58710906 58711144 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu 72188 NR_046095 51339 Hs.48950 NM_016651 ENSG00000165617 DACT1 DAPPER|DAPPER1|DPR1|FRODO|HDPR1|TBS2|THYEX3 dishevelled binding antagonist of beta catenin 1 protein-coding 120.333-162 chr5 180737477 180737696 + 0.666667 NA Intergenic MIRc|SINE|MIR 2472 NM_001001657 134083 Hs.554719 NM_001001657 ENSG00000174339 OR2Y1 OR5-2 olfactory receptor family 2 subfamily Y member 1 protein-coding 140-24 chr11 61960279 61960617 + 0.666667 NA intron (NR_134580, intron 9 of 10) AluSx1|SINE|Alu 5213 NM_001363591 7439 Hs.524910 NM_004183 ENSG00000167995 BEST1 ARB|BEST|BMD|Best1V1Delta2|RP50|TU15B|VMD2 bestrophin 1 protein-coding 145-58 chr20 19330560 19330966 + 0.666667 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) L1MC4|LINE|L1 -46167 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 171.333-79 chr2 68548889 68549247 + 0.666667 NA intron (NM_173545, intron 8 of 9) L1MC5|LINE|L1 81483 NM_173545 200558 Hs.720369 NM_173545 ENSG00000169621 APLF APFL|C2orf13|PALF|Xip1|ZCCHH1 aprataxin and PNKP like factor protein-coding 131.333-65 chr17 40274623 40274862 + 0.666667 NA intron (NM_133264, intron 6 of 7) AluJb|SINE|Alu -13137 NM_001254 990 Hs.405958 NM_001254 ENSG00000094804 CDC6 CDC18L|HsCDC18|HsCDC6|MGORS5 cell division cycle 6 protein-coding 163.667-158 chr3 107187975 107188363 + 0.666667 NA intron (NR_028303, intron 1 of 3) L1MD2|LINE|L1 52469 NR_028303 100302640 Hs.648607 NR_028303 ENSG00000242759 LINC00882 - long intergenic non-protein coding RNA 882 ncRNA 177-57 chr4 54564026 54564450 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 42893 NR_134657 339978 NR_134657 ENSG00000250456 LINC02260 - long intergenic non-protein coding RNA 2260 ncRNA 173.333-105 chr20 34173726 34174199 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -61719 NM_003908 8894 Hs.429180 NM_003908 ENSG00000125977 EIF2S2 EIF2|EIF2B|EIF2beta|PPP1R67|eIF-2-beta eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta protein-coding 168-108 chr7 113660121 113660478 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 258710 NM_002711 5506 Hs.458309 NM_002711 ENSG00000154415 PPP1R3A GM|PP1G|PPP1R3 protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A protein-coding 223.333-99 chr22 45455095 45455617 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR 41663 NM_015653 26150 Hs.475110 NM_015653 ENSG00000128408 RIBC2 C22orf11|TRIB RIB43A domain with coiled-coils 2 protein-coding 208.333-66 chr2 13023074 13023536 + 0.666667 NA Intergenic L2|LINE|L2 -16292 NR_038434 100506474 Hs.242196 NR_038434 ENSG00000225649 LOC100506474 - uncharacterized LOC100506474 ncRNA 117.667-187 chr8 48016902 48017182 + 0.666667 NA intron (NM_003350, intron 1 of 3) AluSx1|SINE|Alu 8611 NM_003350 7336 Hs.491695 NM_003350 ENSG00000169139 UBE2V2 DDVIT1|DDVit-1|EDAF-1|EDPF-1|EDPF1|MMS2|UEV-2|UEV2 ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 protein-coding 160.333-210 chr4 55924157 55924448 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -24643 NM_025009 9662 Hs.518767 NM_014645 ENSG00000174799 CEP135 CEP4|KIAA0635|MCPH8 centrosomal protein 135 protein-coding 177-41 chr2 202731377 202731733 + 0.666667 NA intron (NM_173511, intron 4 of 7) AluSx3|SINE|Alu 96586 NM_173511 150864 Hs.471130 NM_173511 ENSG00000138439 FAM117B ALS2CR13 family with sequence similarity 117 member B protein-coding 191.667-111 chr6 73638670 73638989 + 0.666667 NA intron (NM_012434, intron 3 of 10) intron (NM_012434, intron 3 of 10) 15163 NM_012434 26503 Hs.597422 NM_012434 ENSG00000119899 SLC17A5 AST|ISSD|NSD|SD|SIALIN|SIASD|SLD solute carrier family 17 member 5 protein-coding 128-40 chr2 30097891 30098210 + 0.666667 NA Intergenic MamRep605|LTR?|LTR? -48957 NM_001127399 51646 Hs.515890 NM_016061 ENSG00000119801 YPEL5 CGI-127 yippee like 5 protein-coding 149.667-367 chr7 33260775 33261219 + 0.666667 NA intron (NM_198428, intron 6 of 22) intron (NM_198428, intron 6 of 22) 131433 NM_001348043 27241 Hs.372360 NM_014451 ENSG00000122507 BBS9 B1|C18|D1|PTHB1 Bardet-Biedl syndrome 9 protein-coding 152.667-240 chr3 35563627 35563928 + 0.666667 NA Intergenic MSTC|LTR|ERVL-MaLR -75748 NM_001267616 10777 Hs.475902 NM_016300 ENSG00000172995 ARPP21 ARPP-21|R3HDM3|RCS|TARPP cAMP regulated phosphoprotein 21 protein-coding 144.333-174 chr3 112129205 112129591 + 0.666667 NA intron (NM_152785, intron 2 of 5).2 intron (NM_152785, intron 2 of 5).2 3850 NM_001190260 257144 Hs.49614 NM_152785 ENSG00000174500 GCSAM GCAT2|GCET2|HGAL germinal center associated signaling and motility protein-coding 211.666-53 chr9 71841250 71841870 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu 69685 NM_001025780 51104 Hs.380389 NM_016014 ENSG00000107362 ABHD17B C9orf77|CGI-67|FAM108B1 abhydrolase domain containing 17B protein-coding 149.667-166 chr18 3389071 3389497 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -22643 NM_174886 7050 Hs.373550 NM_003244 ENSG00000177426 TGIF1 HPE4|TGIF TGFB induced factor homeobox 1 protein-coding 214-40 chr15 63420290 63420760 + 0.666667 NA intron (NR_120375, intron 4 of 6) MLT1C|LTR|ERVL-MaLR 30295 NR_120375 102723344 Hs.569500 NR_120375 LINC02568 - long intergenic non-protein coding RNA 2568 ncRNA 168.667-93 chr2 21845406 21845675 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -134888 NR_038837 645949 Hs.456782 NR_038837 ENSG00000229621 LINC01822 - long intergenic non-protein coding RNA 1822 ncRNA 169.667-123 chr21 24791165 24791451 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 -49242 NR_046198 339622 Hs.616316 NR_046198 ENSG00000226983 LINC01692 - long intergenic non-protein coding RNA 1692 ncRNA 113.333-69 chr14 20248439 20248629 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu 5742 NM_001004479 390442 Hs.553767 NM_001004479 ENSG00000176198 OR11H4 OR14-36 olfactory receptor family 11 subfamily H member 4 protein-coding 116.333-187 chr6 52224736 52224995 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 19635 NM_052872 112744 Hs.272295 NM_052872 ENSG00000112116 IL17F CANDF6|IL-17F|ML-1|ML1 interleukin 17F protein-coding 131.333-96 chr2 222778165 222778508 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -82700 NM_004457 2181 Hs.655772 NM_004457 ENSG00000123983 ACSL3 ACS3|FACL3|LACS 3|LACS3|PRO2194 acyl-CoA synthetase long chain family member 3 protein-coding 182-108 chr8 99017418 99017852 + 0.666667 NA intron (NR_047582, intron 2 of 8) AluSx|SINE|Alu 4369 NM_015243 157680 Hs.191540 NM_015243 ENSG00000132549 VPS13B CHS1|COH1 vacuolar protein sorting 13 homolog B protein-coding 114.333-84 chr17 1543958 1544231 + 0.666667 NA intron (NM_006224, intron 4 of 11) intron (NM_006224, intron 4 of 11) 18698 NM_006224 5306 Hs.429819 NM_006224 ENSG00000174238 PITPNA HEL-S-36|PI-TPalpha|PITPN|VIB1A phosphatidylinositol transfer protein alpha protein-coding 134-25 chr13 67333544 67333912 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -38659 NR_130792 100874145 Hs.508194 NR_130792 ENSG00000230040 LINC00364 LncRNA00364 long intergenic non-protein coding RNA 364 ncRNA 120-50 chr17 72120098 72120328 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_000346) promoter-TSS (NM_000346) 580 NR_103737 400618 Hs.657374 NR_103737 ENSG00000234899 SOX9-AS1 - SOX9 antisense RNA 1 ncRNA 118.333-112 chr2 104555098 104555386 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -44733 NR_110113 101927360 Hs.650324 NR_110113 ENSG00000234781 LINC01103 - long intergenic non-protein coding RNA 1103 ncRNA 141.333-181 chr4 130299860 130300135 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -76364 NR_147186 105377420 NR_147186 LINC02479 - long intergenic non-protein coding RNA 2479 ncRNA 172-36 chr13 19948535 19948896 + 0.666667 NA Intergenic L1MC1|LINE|L1 -8691 NM_001353159 7750 Hs.507433 NM_003453 ENSG00000121741 ZMYM2 FIM|MYM|RAMP|SCLL|ZNF198 zinc finger MYM-type containing 2 protein-coding 118.667-161 chr5 122423131 122423385 + 0.666667 NA exon (NM_005460, exon 4 of 11) exon (NM_005460, exon 4 of 11) 32169 NM_001308106 9627 Hs.426463 NM_005460 ENSG00000064692 SNCAIP SYPH1|Sph1 synuclein alpha interacting protein protein-coding 193-5 chr1 101241145 101241633 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001400, exon 2 of 2) 3' UTR (NM_001400, exon 2 of 2) 4640 NM_001400 1901 Hs.154210 NM_001400 ENSG00000170989 S1PR1 CD363|CHEDG1|D1S3362|ECGF1|EDG-1|EDG1|S1P1 sphingosine-1-phosphate receptor 1 protein-coding 137.667-198 chrX 40962951 40963232 + 0.666667 NA Intergenic (ATTATAT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -122354 NM_001039591 8239 Hs.77578 NM_004652 ENSG00000124486 USP9X DFFRX|FAF|FAM|MRX99|MRXS99F ubiquitin specific peptidase 9 X-linked protein-coding 128-73 chr3 124606029 124606353 + 0.666667 NA intron (NM_007064, intron 1 of 26) intron (NM_007064, intron 1 of 26) 21532 NM_001322997 8997 Hs.8004 NM_003947 ENSG00000160145 KALRN ARHGEF24|CHD5|CHDS5|DUET|DUO|HAPIP|TRAD kalirin RhoGEF kinase protein-coding 189.333-156 chr5 62312434 62312961 + 0.666667 NA intron (NM_001243952, intron 2 of 20) intron (NM_001243952, intron 2 of 20) 6535 NM_001243952 3796 Hs.558351 NM_004520 ENSG00000068796 KIF2A CDCBM3|HK2|KIF2 kinesin family member 2A protein-coding 232.667-6 chr10 56902765 56903314 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 401520 NR_037490 100500834 NR_037490 ENSG00000264747 MIR3924 - microRNA 3924 ncRNA 144.333-217 chr5 102440021 102440339 + 0.666667 NA intron (NM_173488, intron 6 of 13) MLT1G1|LTR|ERVL-MaLR 58821 NM_001289002 133482 Hs.388874 NM_173488 ENSG00000205359 SLCO6A1 CT48|GST|OATP-I|OATP6A1|OATPY solute carrier organic anion transporter family member 6A1 protein-coding 166.333-47 chr11 72937993 72938316 + 0.666667 NA intron (NM_014824, intron 8 of 19) intron (NM_014824, intron 8 of 19) 123743 NM_033388 89849 Hs.653186 NM_033388 ENSG00000168010 ATG16L2 ATG16B|WDR80 autophagy related 16 like 2 protein-coding 217-58 chr3 32193911 32194495 + 0.666667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -44476 NM_001320308 152189 Hs.154986 NM_178868 ENSG00000170293 CMTM8 CKLFSF8|CKLFSF8-V2 CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 8 protein-coding 182.333-63 chr17 31557085 31557522 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2693 NR_029710 406968 NR_029710 ENSG00000207614 MIR193A MIRN193|MIRN193A|mir-193a microRNA 193a ncRNA 205-101 chr8 120710198 120710808 + 0.666667 NA intron (NM_021021, intron 1 of 6) MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -50750 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 141.333-145 chr3 4963644 4964010 + 0.666667 NA intron (NR_125915, intron 1 of 3) L1MD1|LINE|L1 -15610 NM_003670 8553 Hs.744856 NM_003670 ENSG00000134107 BHLHE40 BHLHB2|Clast5|DEC1|HLHB2|SHARP-2|SHARP2|STRA13|Stra14 basic helix-loop-helix family member e40 protein-coding 236.667-16 chr12 6468380 6468754 + 0.666667 NA intron (NM_199245, intron 1 of 3) intron (NM_199245, intron 1 of 3) 2110 NM_016830 6843 Hs.20021 NM_014231 ENSG00000139190 VAMP1 CMS25|SPAX1|SYB1|VAMP-1 vesicle associated membrane protein 1 protein-coding 154-57 chr15 24657269 24657697 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -17911 NM_018958 23742 Hs.649663 NM_018958 ENSG00000185823 NPAP1 C15orf2 nuclear pore associated protein 1 protein-coding 142-160 chr8 132360549 132360844 + 0.666667 NA intron (NM_004519, intron 1 of 14) intron (NM_004519, intron 1 of 14) 86566 NM_001204824 3786 Hs.374023 NM_004519 ENSG00000184156 KCNQ3 BFNC2|EBN2|KV7.3 potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 protein-coding 112-134 chr3 24219986 24220238 + 0.666667 NA intron (NM_001354714, intron 2 of 8) MER5B|DNA|hAT-Charlie 68788 NR_121667 101927854 Hs.570625 NR_121667 LOC101927854 - uncharacterized LOC101927854 ncRNA 131.667-192 chr8 73275831 73276062 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -16444 NM_001243237 100130301 Hs.202296 NM_001243237 ENSG00000274443 C8orf89 - chromosome 8 open reading frame 89 protein-coding 242.667-68 chr3 45324543 45325036 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -63787 NM_015340 23395 Hs.526975 NM_015340 ENSG00000011376 LARS2 HLASA|LEURS|PRLTS4|mtLeuRS leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial protein-coding 152-107 chr3 88739635 88740007 + 0.666667 NA Intergenic L1ME5|LINE|L1 -367800 NM_005233 2042 Hs.123642 NM_005233 ENSG00000044524 EPHA3 EK4|ETK|ETK1|HEK|HEK4|TYRO4 EPH receptor A3 protein-coding 165.667-38 chr12 42927621 42927961 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -227524 NR_146866 105369740 Hs.577746 NR_146866 ENSG00000258331 LINC02461 - long intergenic non-protein coding RNA 2461 ncRNA 145-72 chr3 94424430 94424710 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 361509 NM_022072 63899 Hs.436594 NM_022072 ENSG00000178694 NSUN3 MST077|MSTP077 NOP2/Sun RNA methyltransferase 3 protein-coding 118.333-202 chr8 60649915 60650158 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -28704 NM_017780 55636 Hs.20395 NM_017780 ENSG00000171316 CHD7 CRG|HH5|IS3|KAL5 chromodomain helicase DNA binding protein 7 protein-coding 143.333-107 chr15 100424009 100424339 + 0.666667 NA intron (NR_120374, intron 3 of 4) AluSp|SINE|Alu 51235 NR_120374 102723320 Hs.416099 NR_120374 CERS3-AS1 - CERS3 antisense RNA 1 ncRNA 136-76 chr4 66831732 66831982 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 555033 NR_031673 100302177 NR_031673 ENSG00000221563 MIR1269A MIR1269|MIRN1269|hsa-mir-1269|hsa-mir-1269a microRNA 1269a ncRNA 117.333-76 chr16 59637877 59638171 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 117167 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 149-43 chr14 55390767 55391049 + 0.666667 NA intron (NM_014924, intron 4 of 9) intron (NM_014924, intron 4 of 9) 20950 NM_014924 22863 Hs.414809 NM_014924 ENSG00000126775 ATG14 ATG14L|BARKOR|KIAA0831 autophagy related 14 protein-coding 164.667-100 chr19 36640290 36640636 + 0.666667 NA intron (NM_001297623, intron 4 of 4) MLT1J|LTR|ERVL-MaLR 26374 NM_001322827 92283 Hs.590972 NM_153257 ENSG00000197808 ZNF461 GIOT-1|GIOT1|HZF28 zinc finger protein 461 protein-coding 195.333-8 chr1 62311466 62312043 + 0.666667 NA intron (NM_181712, intron 1 of 9) intron (NM_181712, intron 1 of 9) 7680 NM_001320269 163782 Hs.283398 NM_181712 ENSG00000132854 KANK4 ANKRD38|dJ1078M7.1 KN motif and ankyrin repeat domains 4 protein-coding 137-3 chr1 21097091 21097370 + 0.666667 NA intron (NM_001198802, intron 2 of 34) intron (NM_001198802, intron 2 of 34) 14153 NM_003760 8672 Hs.467084 NM_003760 ENSG00000075151 EIF4G3 eIF-4G 3|eIF4G 3|eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 protein-coding 192.667-56 chr14 20481649 20482007 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12449 NM_000270 4860 Hs.75514 NM_000270 ENSG00000198805 PNP NP|PRO1837|PUNP purine nucleoside phosphorylase protein-coding 193-31 chr17 772419 772831 + 0.666667 NA intron (NM_016080, intron 4 of 8) L1ME4a|LINE|L1 9655 NM_001366247 51031 Hs.279061 NM_016080 ENSG00000167699 GLOD4 C17orf25|CGI-150|HC71 glyoxalase domain containing 4 protein-coding 241.667-13 chr10 76484393 76484994 + 0.666667 NA intron (NM_001305581, intron 6 of 6) L1ME3A|LINE|L1 -403351 NR_120655 101929328 Hs.664552 NR_120655 ENSG00000236467 KCNMA1-AS1 - KCNMA1 antisense RNA 1 ncRNA 150-60 chr17 60841620 60842003 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) MLT1E1A|LTR|ERVL-MaLR 163960 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 174.333 chr1 62030518 62031006 + 0.666667 NA intron (NM_001350145, intron 29 of 43) L1ME2|LINE|L1 -48024 NR_036058 100422902 NR_036058 ENSG00000263908 MIR3116-1 - microRNA 3116-1 ncRNA 192.333-64 chr16 56284126 56284537 + 0.666667 NA intron (NM_138736, intron 3 of 7) intron (NM_138736, intron 3 of 7) 38811 NR_037499 100500891 NR_037499 ENSG00000265281 MIR3935 - microRNA 3935 ncRNA 233.667-15 chr12 56230894 56231483 + 0.666667 NA intron (NM_173596, intron 3 of 12) intron (NM_173596, intron 3 of 12) 471 NM_001135195 283375 Hs.591018 NM_173596 ENSG00000139540 SLC39A5 LZT-Hs7|MYP24|ZIP5 solute carrier family 39 member 5 protein-coding 128.333-90 chr2 17598851 17599082 + 0.666667 NA intron (NM_001366805, intron 2 of 2) intron (NM_001366805, intron 2 of 2) 58270 NM_003385 7447 Hs.444212 NM_003385 ENSG00000163032 VSNL1 HLP3|HPCAL3|HUVISL1|VILIP|VILIP-1 visinin like 1 protein-coding 168.333-156 chr4 148671392 148671808 + 0.666667 NA Intergenic MIR3|SINE|MIR -226902 NM_001354819 4306 Hs.163924 NM_000901 ENSG00000151623 NR3C2 MCR|MLR|MR|NR3C2VIT nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 protein-coding 147.667-332 chr7 30468365 30468789 + 0.666667 NA intron (NM_006092, intron 1 of 13) intron (NM_006092, intron 1 of 13) 10207 NM_006092 10392 Hs.405153 NM_006092 ENSG00000106100 NOD1 CARD4|CLR7.1|NLRC1 nucleotide binding oligomerization domain containing 1 protein-coding 238.666-36 chr7 70279430 70280084 + 0.666667 NA intron (NM_015570, intron 4 of 18) intron (NM_015570, intron 4 of 18) 681282 NM_001127232 26053 Hs.21631 NM_015570 ENSG00000158321 AUTS2 FBRSL2|MRD26 activator of transcription and developmental regulator AUTS2 protein-coding 180.333-69 chr22 47689143 47689626 + 0.666667 NA intron (NR_122046, intron 6 of 8) AluSz|SINE|Alu 57710 NR_122046 284930 Hs.407567 NR_122046 ENSG00000224271 LOC284930 - uncharacterized LOC284930 ncRNA 438.667-4 chr18 3103270 3104295 + 0.666667 NA intron (NM_019856, intron 21 of 36) intron (NM_019856, intron 21 of 36) -91835 NM_014646 9663 Hs.132342 NM_014646 ENSG00000101577 LPIN2 - lipin 2 protein-coding 151-123 chr7 129870612 129870938 + 0.666667 NA intron (NM_001202498, intron 3 of 6) L2a|LINE|L2 82185 NM_001202498 7328 Hs.643548 NM_003344 ENSG00000186591 UBE2H E2-20K|GID3|UBC8|UBCH|UBCH2 ubiquitin conjugating enzyme E2 H protein-coding 113.333-85 chr15 64675924 64676224 + 0.666667 NA exon (NM_015042, exon 4 of 9) exon (NM_015042, exon 4 of 9) 27207 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 159.333-136 chr19 41152893 41153201 + 0.666667 NA Intergenic AluSq|SINE|Alu 38615 NR_135528 1572 Hs.558318 NM_000774 ENSG00000197446 CYP2F1 C2F1|CYP2F|CYPIIF1 cytochrome P450 family 2 subfamily F member 1 protein-coding 159-32 chr13 38926547 38926869 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 64123 NM_145286 161003 Hs.327794 NM_145286 ENSG00000133115 STOML3 Epb7.2l|SRO stomatin like 3 protein-coding 153.333-343 chr5 132836956 132837247 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -6454 NM_001172700 134549 Hs.519574 NM_133456 ENSG00000164403 SHROOM1 APXL2 shroom family member 1 protein-coding 169.667-114 chr2 144958435 144958788 + 0.666667 NA intron (NR_033870, intron 3 of 4) intron (NR_033870, intron 3 of 4) 290644 NR_033870 401014 Hs.742290 NR_033870 ENSG00000226674 TEX41 DKFZp686O1327|LINC00953 testis expressed 41 ncRNA 177.333-29 chr11 128589909 128590291 + 0.666667 NA Intergenic L1MB4|LINE|L1 -2542 NM_001143820 2113 Hs.369438 NM_005238 ENSG00000134954 ETS1 ETS-1|EWSR2|c-ets-1|p54 ETS proto-oncogene 1, transcription factor protein-coding 196-11 chr1 219200437 219200932 + 0.666667 NA intron (NM_001300770, intron 3 of 4) intron (NM_001300770, intron 3 of 4) 25715 NM_001300772 127018 Hs.657617 NM_138794 ENSG00000143353 LYPLAL1 Q96AV0 lysophospholipase like 1 protein-coding 179.333-188 chr8 120187558 120188036 + 0.666667 NA intron (NM_021110, intron 5 of 47) intron (NM_021110, intron 5 of 47) 62695 NM_021110 7373 Hs.409662 NM_021110 ENSG00000187955 COL14A1 UND collagen type XIV alpha 1 chain protein-coding 209.667-119 chr9 37367249 37367715 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -55214 NM_012203 9380 Hs.155742 NM_012203 ENSG00000137106 GRHPR GLXR|GLYD|PH2 glyoxylate and hydroxypyruvate reductase protein-coding 138.667-71 chr15 61201229 61201562 + 0.666667 NA intron (NM_134261, intron 1 of 10) intron (NM_134261, intron 1 of 10) 27907 NM_134261 6095 Hs.560343 NM_002943 ENSG00000069667 RORA IDDECA|NR1F1|ROR1|ROR2|ROR3|RZR-ALPHA|RZRA RAR related orphan receptor A protein-coding 263.333-3 chr10 7938692 7939411 + 0.666667 NA intron (NM_031923, intron 2 of 6) HAL1|LINE|L1 113440 NR_104329 399717 Hs.158992 NM_207423 ENSG00000197308 GATA3-AS1 - GATA3 antisense RNA 1 ncRNA 173-30 chr15 98636479 98636776 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -11912 NM_000875 3480 Hs.643120 NM_000875 ENSG00000140443 IGF1R CD221|IGFIR|IGFR|JTK13 insulin like growth factor 1 receptor protein-coding 117.667-94 chr2 125902114 125902430 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 215713 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 208-115 chr4 33636704 33637167 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 402958 NR_125902 101928622 Hs.631687 NR_125902 ENSG00000250954 LOC101928622 - uncharacterized LOC101928622 ncRNA 234.333-49 chr3 28671275 28671825 + 0.666667 NA intron (NR_038840, intron 2 of 4) intron (NR_038840, intron 2 of 4) 96272 NR_038840 645206 Hs.376725 NR_038840 LINC00693 - long intergenic non-protein coding RNA 693 ncRNA 160.667-47 chr10 102047341 102047670 + 0.666667 NA intron (NM_024541, intron 1 of 25) AluJb|SINE|Alu 8668 NM_024541 79591 Hs.16004 NM_024541 ENSG00000120029 ARMH3 C10orf76 armadillo like helical domain containing 3 protein-coding 234-15 chr12 24104319 24104748 + 0.666667 NA intron (NM_152989, intron 4 of 17) intron (NM_152989, intron 4 of 17) -107888 NR_030625 100126320 NR_030625 ENSG00000216192 MIR920 MIRN920|hsa-mir-920 microRNA 920 ncRNA 130.333-121 chr22 19869564 19869837 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14826 NM_024627 79680 Hs.105642 NM_024627 ENSG00000215012 RTL10 BOP|C22orf29 retrotransposon Gag like 10 protein-coding 168.333-34 chr11 46822919 46823298 + 0.666667 NA intron (NM_001008938, intron 1 of 43) AluJr|SINE|Alu 23172 NM_001008938 9793 Hs.201253 NM_014756 ENSG00000175216 CKAP5 CHTOG|MSPS|TOG|TOGp|ch-TOG cytoskeleton associated protein 5 protein-coding 147.333-303 chr7 87549312 87549596 + 0.666667 NA exon (NM_001348946, exon 14 of 28) exon (NM_001348946, exon 14 of 28) 51430 NM_001348946 5243 Hs.489033 NM_000927 ENSG00000085563 ABCB1 ABC20|CD243|CLCS|GP170|MDR1|P-GP|PGY1 ATP binding cassette subfamily B member 1 protein-coding 123.667-86 chr2 43075676 43076015 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26600 NR_151714 100506047 Hs.127112 NR_151714 LINC02580 - long intergenic non-protein coding RNA 2580 ncRNA 292.667-41 chr7 107327940 107328609 + 0.666667 NA intron (NM_181733, intron 10 of 20) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger -141783 NM_005295 2845 Hs.657277 NM_005295 ENSG00000172209 GPR22 - G protein-coupled receptor 22 protein-coding 130.667-166 chr5 84445552 84445846 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60819 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 122.333-105 chr2 169983602 169983877 + 0.666667 NA intron (NM_172070, intron 24 of 38) intron (NM_172070, intron 24 of 38) 156231 NM_172070 130507 Hs.379548 NM_172070 ENSG00000144357 UBR3 ZNF650 ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 3 protein-coding 116.333-70 chr14 73862722 73863041 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001371335, exon 4 of 4) 3' UTR (NM_001371335, exon 4 of 4) 10934 NM_001371328 166.333-43 chr11 34383888 34384372 + 0.666667 NA Intergenic LTR33|LTR|ERVL -26120 NM_145804 25841 Hs.23361 NM_145804 ENSG00000166016 ABTB2 ABTB2A|BTBD22 ankyrin repeat and BTB domain containing 2 protein-coding 123.667-183 chr8 100198374 100198562 + 0.666667 NA intron (NM_003114, intron 10 of 18) L1M5|LINE|L1 40133 NM_003114 6674 Hs.591866 NM_003114 ENSG00000104450 SPAG1 CILD28|CT140|HEL-S-268|HSD-3.8|SP75|TPIS sperm associated antigen 1 protein-coding 152.667-198 chr2 143111564 143111887 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -17694 NM_018460 55843 Hs.171011 NM_018460 ENSG00000075884 ARHGAP15 BM046 Rho GTPase activating protein 15 protein-coding 191-21 chr15 69569661 69570006 + 0.666667 NA intron (NR_026979, intron 4 of 4) intron (NR_026979, intron 4 of 4) 8113 NR_026979 145837 Hs.410126 NR_026979 DRAIC - downregulated RNA in cancer, inhibitor of cell invasion and migration ncRNA 288-51 chr7 82748438 82749092 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -304809 NM_001366867 781 Hs.282151 NM_000722 ENSG00000153956 CACNA2D1 CACNA2|CACNL2A|CCHL2A|LINC01112|lncRNA-N3 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1 protein-coding 215-36 chr2 106619243 106619739 + 0.666667 NA Intergenic L1MC2|LINE|L1 132127 NM_001349727 927 Hs.534308 NM_001349727 ENSG00000232001 CD8B2 CD8BP CD8b2 molecule protein-coding 137.667-139 chr4 65571073 65571404 + 0.666667 NA intron (NM_001281767, intron 3 of 16) intron (NM_001281767, intron 3 of 16) 98250 NM_001318761 2044 Hs.654492 NM_004439 ENSG00000145242 EPHA5 CEK7|EHK-1|EHK1|EK7|HEK7|TYRO4 EPH receptor A5 protein-coding 135.667-90 chr2 68454478 68454804 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 12653 NR_133923 554251 Hs.164117 NM_001024680 ENSG00000204923 FBXO48 - F-box protein 48 protein-coding 125-129 chrX 24055598 24055912 + 0.666667 NA intron (NM_001415, intron 2 of 11) intron (NM_001415, intron 2 of 11) 799 NM_001415 1968 Hs.539684 NM_001415 ENSG00000130741 EIF2S3 EIF2|EIF2G|EIF2gamma|MEHMO|MRXSBRK|eIF-2gA eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma protein-coding 115.667-40 chr11 19759550 19759828 + 0.666667 NA TTS (NR_039843) TTS (NR_039843) 394 NR_039843 100616426 NR_039843 ENSG00000264309 MIR4694 - microRNA 4694 ncRNA 142-105 chr4 80454058 80454419 + 0.666667 NA intron (NM_152770, intron 2 of 5) intron (NM_152770, intron 2 of 5) 118518 NM_152770 255119 Hs.527104 NM_152770 ENSG00000197826 CFAP299 C4orf22 cilia and flagella associated protein 299 protein-coding 213.333-82 chr18 68819603 68820001 + 0.666667 NA intron (NM_024781, intron 1 of 7) L1ME3A|LINE|L1 21722 NM_024781 79839 Hs.280781 NM_024781 ENSG00000150636 CCDC102B ACY1L|AN|C18orf14|HsT1731 coiled-coil domain containing 102B protein-coding 144.667-180 chr22 28547668 28547976 + 0.666667 NA intron (NM_001145418, intron 2 of 22) intron (NM_001145418, intron 2 of 22) 87953 NR_106713 102466081 NR_106713 ENSG00000276162 MIR5739 hsa-mir-5739 microRNA 5739 ncRNA 128.667-198 chr9 97692170 97692454 + 0.666667 NA intron (NM_000380, intron 2 of 5) intron (NM_000380, intron 2 of 5) 5097 NR_149093 7507 Hs.654364 NM_000380 ENSG00000136936 XPA XP1|XPAC XPA, DNA damage recognition and repair factor protein-coding 132.667-49 chr14 54739212 54739457 + 0.666667 NA intron (NM_015589, intron 3 of 11) intron (NM_015589, intron 3 of 11) -15499 NM_001161577 23034 Hs.98259 NM_015589 ENSG00000020577 SAMD4A SAMD4|SMAUG|SMAUG1|SMG|SMGA sterile alpha motif domain containing 4A protein-coding 114.333-206 chr7 33047847 33048030 + 0.666667 NA intron (NM_001002009, intron 1 of 9) AluJb|SINE|Alu -6773 NM_001166118 51251 Hs.487933 NM_016489 ENSG00000122643 NT5C3A NT5C3|P5'N-1|P5N-1|PN-I|POMP|PSN1|UMPH|UMPH1|cN-III|hUMP1|p36 5'-nucleotidase, cytosolic IIIA protein-coding 122.333-87 chr2 36971998 36972253 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5589 NM_003162 6801 Hs.127486 NM_003162 ENSG00000115808 STRN PPP2R6A|SG2NA|STRN1 striatin protein-coding 252.667-101 chr8 72728284 72728722 + 0.666667 NA intron (NM_004770, intron 2 of 2) intron (NM_004770, intron 2 of 2) -3542 NR_110656 101926908 Hs.680588 NR_110656 ENSG00000253726 LOC101926908 - uncharacterized LOC101926908 ncRNA 279-20 chr20 19858830 19859350 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -27431 NM_001242581 54453 Hs.472270 NM_018993 ENSG00000132669 RIN2 MACS|RASSF4 Ras and Rab interactor 2 protein-coding 161.667-182 chr4 32302811 32303234 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -48016 NR_134672 101927363 Hs.559406 NR_134672 ENSG00000251329 LINC02353 - long intergenic non-protein coding RNA 2353 ncRNA 205-58 chr3 11716680 11717144 + 0.666667 NA intron (NM_014667, intron 1 of 5) intron (NM_014667, intron 1 of 5) 3627 NM_001284390 9686 Hs.740389 NM_014667 ENSG00000144560 VGLL4 VGL-4 vestigial like family member 4 protein-coding 133.667-40 chr12 59992368 59992692 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 303160 NR_073056 9194 Hs.88156 NM_004731 ENSG00000118596 SLC16A7 MCT2 solute carrier family 16 member 7 protein-coding 120.667-45 chr13 46080151 46080374 + 0.666667 NA intron (NM_001872, intron 4 of 10) intron (NM_001872, intron 4 of 10) 24771 NM_001872 1361 Hs.512937 NM_001872 ENSG00000080618 CPB2 CPU|PCPB|TAFI carboxypeptidase B2 protein-coding 154.333-356 chr8 127451343 127451658 + 0.666667 NA intron (NR_024393, intron 4 of 4) intron (NR_024393, intron 4 of 4) 30639 NR_024393 727677 Hs.673248 NR_024393 ENSG00000246228 CASC8 CARLO1|CARLo-1|LINC00860 cancer susceptibility 8 ncRNA 117.667-175 chr7 32172133 32172385 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 2 of 17) L1PA8A|LINE|L1 -100823 NM_001322057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 131.667-87 chr2 32679389 32679707 + 0.666667 NA intron (NM_017735, intron 9 of 19) intron (NM_017735, intron 9 of 19) 44293 NR_039922 100616219 NR_039922 ENSG00000265057 MIR4765 - microRNA 4765 ncRNA 176.667-35 chr11 44132387 44132904 + 0.666667 NA intron (NM_207122, intron 7 of 13) L3|LINE|CR1 36448 NM_000401 2132 Hs.368404 NM_000401 ENSG00000151348 EXT2 SOTV|SSMS exostosin glycosyltransferase 2 protein-coding 183-74 chr22 37572389 37572772 + 0.666667 NA intron (NM_006498, intron 1 of 3) AluY|SINE|Alu 7507 NM_006498 3957 Hs.531776 NM_006498 ENSG00000100079 LGALS2 HL14 galectin 2 protein-coding 178.667-160 chr8 82679605 82680090 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -232257 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 112.333-2 chr1 28639587 28639865 + 0.666667 NA intron (NM_005644, intron 1 of 5) intron (NM_005644, intron 1 of 5) 3341 NM_001135218 6883 Hs.530251 NM_005644 ENSG00000120656 TAF12 TAF2J|TAFII20 TATA-box binding protein associated factor 12 protein-coding 153-57 chr16 59685897 59686211 + 0.666667 NA Intergenic MSTA-int|LTR|ERVL-MaLR 69137 NR_028471 644649 Hs.250392 NR_028471 APOOP5 - apolipoprotein O pseudogene 5 pseudo 150.667-315 chr5 128864311 128864616 + 0.666667 NA Intergenic (T)n|Simple_repeat|Simple_repeat -100664 NM_014031 28965 Hs.49765 NM_014031 ENSG00000113396 SLC27A6 ACSVL2|FACVL2|FATP6|VLCS-H1 solute carrier family 27 member 6 protein-coding 182.667-105 chr3 155935893 155936381 + 0.666667 NA intron (NM_003875, intron 14 of 15) intron (NM_003875, intron 14 of 15) 65487 NM_003875 8833 Hs.591314 NM_003875 ENSG00000163655 GMPS GATD7 guanine monophosphate synthase protein-coding 172.667-60 chr15 64606137 64606645 + 0.666667 NA intron (NM_015042, intron 1 of 8) AluSx1|SINE|Alu 96890 NM_002537 4947 Hs.744924 NM_002537 ENSG00000180304 OAZ2 AZ2 ornithine decarboxylase antizyme 2 protein-coding 118-121 chr7 31448121 31448345 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -65838 NM_001257967 223075 Hs.224269 NM_194300 ENSG00000180347 ITPRID1 CCDC129 ITPR interacting domain containing 1 protein-coding 148-119 chr4 115330168 115330456 + 0.666667 NA Intergenic L1PA13|LINE|L1 -216692 NM_022569 64579 Hs.591700 NM_022569 ENSG00000138653 NDST4 N-HSST|N-HSST 4|NDST-4|NHSST4 N-deacetylase and N-sulfotransferase 4 protein-coding 124.333-102 chr2 230778630 230778853 + 0.666667 NA intron (NM_001130850, intron 2 of 8) Tigger3a|DNA|TcMar-Tigger 65193 NM_001130850 51719 Hs.603930 NM_016289 ENSG00000135932 CAB39 CGI-66|MO25 calcium binding protein 39 protein-coding 120.333-79 chr17 60140955 60141264 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8864 NR_137422 762 Hs.89485 NM_000717 ENSG00000167434 CA4 CAIV|Car4|RP17 carbonic anhydrase 4 protein-coding 142-66 chr2 151427953 151428279 + 0.666667 NA intron (NM_001177665, intron 7 of 33) AluSz|SINE|Alu 18214 NM_001177663 55183 Hs.536537 NM_018151 ENSG00000080345 RIF1 - replication timing regulatory factor 1 protein-coding 137.333-210 chrX 111443446 111443707 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31384 NM_178152 1641 Hs.34780 NM_000555 ENSG00000077279 DCX DBCN|DC|LISX|SCLH|XLIS doublecortin protein-coding 147-27 chr12 23013525 23013842 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR -161953 NR_120471 101928441 Hs.129111 NR_120471 ENSG00000256321 LOC101928441 - uncharacterized LOC101928441 ncRNA 177.333-141 chr6 69602400 69602756 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 193888 NM_001363722 55788 Hs.271643 NM_018368 ENSG00000168216 LMBRD1 C6orf209|LMBD1|MAHCF|NESI LMBR1 domain containing 1 protein-coding 114.667-233 chr6 168521570 168521867 + 0.666667 NA intron (NM_001166412, intron 2 of 12) AluJr|SINE|Alu 80534 NM_001166412 64094 Hs.487200 NM_022138 ENSG00000112562 SMOC2 DTDP1|MST117|MSTP117|MSTP140|SMAP2|bA270C4A.1|bA37D8.1|dJ421D16.1 SPARC related modular calcium binding 2 protein-coding 172.333-202 chrX 99259744 99260071 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 1150366 NM_001184880 57526 Hs.4993 NM_020766 ENSG00000165194 PCDH19 EFMR|EIEE9 protocadherin 19 protein-coding 134-26 chr13 97032530 97032811 + 0.666667 NA Intergenic THE1D|LTR|ERVL-MaLR -37940 NM_001346195 27199 Hs.352218 NM_080818 ENSG00000165621 OXGR1 GPR80|GPR99|P2RY15|P2Y15|aKGR oxoglutarate receptor 1 protein-coding 127.333-121 chr3 142112214 142112447 + 0.666667 NA intron (NM_001178139, intron 1 of 12) intron (NM_001178139, intron 1 of 12) 37214 NM_001178138 7029 Hs.379018 NM_006286 ENSG00000114126 TFDP2 DP2 transcription factor Dp-2 protein-coding 243-38 chr2 240115494 240116134 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 20491 NM_001163424 150678 Hs.293884 NM_138336 ENSG00000172428 COPS9 CSNAP|MYEOV2 COP9 signalosome subunit 9 protein-coding 159-23 chr11 47464413 47464770 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15455 NM_032645 5913 Hs.81218 NM_005055 ENSG00000165917 RAPSN CMS11|CMS4C|FADS|FADS2|RAPSYN|RNF205 receptor associated protein of the synapse protein-coding 111.667-22 chr10 6576106 6576327 + 0.666667 NA intron (NM_001323265, intron 1 of 17) L1MB3|LINE|L1 4060 NM_001323266 5588 Hs.498570 NM_006257 ENSG00000065675 PRKCQ PRKCT|nPKC-theta protein kinase C theta protein-coding 224.333-78 chr3 24024905 24025370 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 78110 NR_026834 152024 Hs.385606 NR_026834 ENSG00000224074 LINC00691 - long intergenic non-protein coding RNA 691 ncRNA 153.333-435 chr8 136703472 136703829 + 0.666667 NA intron (NR_147196, intron 2 of 5) intron (NR_147196, intron 2 of 5) 172852 NR_147196 107986980 Hs.549694 NR_147196 ENSG00000254101 LINC02055 - long intergenic non-protein coding RNA 2055 ncRNA 126-12 chr10 68548922 68549224 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -11264 NM_030625 80312 Hs.258855 NM_030625 ENSG00000138336 TET1 CXXC6|LCX|bA119F7.1 tet methylcytosine dioxygenase 1 protein-coding 300.333-4 chr1 207173518 207174136 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 69594 NM_000715 722 Hs.1012 NM_000715 ENSG00000123838 C4BPA C4BP|PRP complement component 4 binding protein alpha protein-coding 152.667-306 chr5 123548544 123548875 + 0.666667 NA intron (NM_001364150, intron 2 of 11) FLAM_A|SINE|Alu 3292 NM_004384 1456 Hs.129206 NM_004384 ENSG00000151292 CSNK1G3 CKI-gamma 3|CSNK1G3L casein kinase 1 gamma 3 protein-coding 245.333-83 chr4 40472854 40473541 + 0.666667 NA intron (NM_001098634, intron 2 of 6) MIR|SINE|MIR 28922 NR_039966 100616274 NR_039966 ENSG00000263642 MIR4802 - microRNA 4802 ncRNA 114.667-159 chr21 27146859 27147162 + 0.666667 NA Intergenic AluY|SINE|Alu -179922 NM_007038 11096 Hs.58324 NM_007038 ENSG00000154736 ADAMTS5 ADAM-TS 11|ADAM-TS 5|ADAM-TS5|ADAMTS-11|ADAMTS-5|ADAMTS11|ADMP-2 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 protein-coding 117.667-98 chr2 134549330 134549527 + 0.666667 NA intron (NM_030923, intron 4 of 7) AluSz|SINE|Alu 169572 NM_030923 81615 Hs.369471 NM_030923 ENSG00000152128 TMEM163 DC29|SV31 transmembrane protein 163 protein-coding 119.333-147 chr22 36690500 36690808 + 0.666667 NA intron (NM_006078, intron 1 of 3) MIRb|SINE|MIR 12204 NM_006078 10369 Hs.146766 NM_006078 ENSG00000166862 CACNG2 MRD10 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2 protein-coding 142-135 chr6 148421513 148421896 + 0.666667 NA intron (NM_001346506, intron 2 of 20) L1M5|LINE|L1 78866 NM_015278 23328 Hs.193133 NM_015278 ENSG00000111961 SASH1 CAPOK|DUH1|SH3D6A|dJ323M4.1 SAM and SH3 domain containing 1 protein-coding 185.667-25 chr12 102248249 102248668 + 0.666667 NA Intergenic MLT1J2|LTR|ERVL-MaLR -50625 NM_002674 5367 Hs.707990 NM_002674 ENSG00000183395 PMCH MCH|ppMCH pro-melanin concentrating hormone protein-coding 175.667-96 chr3 61072656 61073034 + 0.666667 NA intron (NR_148922, intron 2 of 3) intron (NR_148922, intron 2 of 3) 178607 NM_002012 2272 Hs.655995 NM_002012 ENSG00000189283 FHIT AP3Aase|FRA3B fragile histidine triad diadenosine triphosphatase protein-coding 122.667-79 chr18 67243879 67244089 + 0.666667 NA Intergenic MLT1D|LTR|ERVL-MaLR 162400 NR_049809 100847002 NR_049809 ENSG00000263354 MIR5011 - microRNA 5011 ncRNA 122.667-97 chr2 178977219 178977503 + 0.666667 NA intron (NM_001316745, intron 3 of 11) intron (NM_001316745, intron 3 of 11) 72776 NM_001316745 285025 Hs.324341 NM_173648 ENSG00000163492 CCDC141 CAMDI coiled-coil domain containing 141 protein-coding 157.667-207 chr4 37781248 37781564 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -45280 NM_018290 55276 Hs.23363 NM_018290 ENSG00000169299 PGM2 MSTP006 phosphoglucomutase 2 protein-coding 146.333-131 chr18 60345603 60345836 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27056 NM_005912 4160 Hs.532833 NM_005912 ENSG00000166603 MC4R BMIQ20 melanocortin 4 receptor protein-coding 192.667-12 chr1 178067460 178067801 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 26363 NR_027982 100302401 Hs.736117 NR_027982 ENSG00000224687 RASAL2-AS1 - RASAL2 antisense RNA 1 ncRNA 163-77 chr6 56334213 56334556 + 0.666667 NA intron (NM_001318752, intron 1 of 28) MIR|SINE|MIR 59744 NM_001318752 81578 Hs.47629 NM_030820 ENSG00000124749 COL21A1 COLA1L|FP633 collagen type XXI alpha 1 chain protein-coding 224.333-100 chr5 101027310 101027697 + 0.666667 NA Intergenic L1PA14|LINE|L1 -124221 NM_175052 7903 Hs.308628 NM_005668 ENSG00000113532 ST8SIA4 PST|PST1|SIAT8D|ST8SIA-IV ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 protein-coding 195-26 chr11 72075498 72075974 + 0.666667 NA intron (NM_001286561, intron 1 of 26) LTR50|LTR|ERVL -3434 NR_036123 100422953 NR_036123 ENSG00000263742 MIR3165 mir-3165 microRNA 3165 ncRNA 148-51 chr16 52367296 52367599 + 0.666667 NA Intergenic MER117|DNA|hAT-Charlie 108883 NR_135281 283854 Hs.266768 NR_135281 ENSG00000260887 CASC22 LINC01373|LincRNA-ENST00000515084|TCONS_00024290 cancer susceptibility 22 ncRNA 116.667-175 chr6 46886259 46886527 + 0.666667 NA intron (NM_001098518, intron 4 of 20) intron (NM_001098518, intron 4 of 20) -17078 NR_110658 101926962 Hs.680113 NR_110658 LOC101926962 - uncharacterized LOC101926962 ncRNA 120.667-107 chr20 45310374 45310581 + 0.666667 NA intron (NM_014276, intron 3 of 11) AluSx1|SINE|Alu -1948 NM_003833 8785 Hs.278489 NM_003833 ENSG00000124159 MATN4 - matrilin 4 protein-coding 173-104 chrX 95606412 95606790 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -543375 NR_031667 100313772 NR_031667 ENSG00000221187 MIR548M MIRN548M microRNA 548m ncRNA 139-92 chr6 151700651 151700951 + 0.666667 NA intron (NM_001122742, intron 1 of 9) intron (NM_001122742, intron 1 of 9) 10305 NM_001122742 2099 Hs.208124 NM_000125 ENSG00000091831 ESR1 ER|ESR|ESRA|ESTRR|Era|NR3A1 estrogen receptor 1 protein-coding 125-118 chr8 119665177 119665511 + 0.666667 NA intron (NM_001330600, intron 1 of 25) intron (NM_001330600, intron 1 of 25) 8046 NM_001330600 5168 Hs.190977 NM_006209 ENSG00000136960 ENPP2 ATX|ATX-X|AUTOTAXIN|LysoPLD|NPP2|PD-IALPHA|PDNP2 ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 protein-coding 115.667-92 chr16 63951461 63951760 + 0.666667 NA Intergenic L1ME2z|LINE|L1 1170453 NM_001330576 1009 Hs.116471 NM_001797 ENSG00000140937 CDH11 CAD11|CDHOB|ESWS|OB|OSF-4 cadherin 11 protein-coding 128.333-148 chr5 2306998 2307209 + 0.666667 NA intron (NR_104616, intron 2 of 2) intron (NR_104616, intron 2 of 2) 5098 NR_104616 100506858 Hs.445071 NR_104616 LOC100506858 - uncharacterized LOC100506858 ncRNA 148.667-150 chr16 65241754 65242148 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -65378 NR_110918 101927650 Hs.634008 NR_110918 ENSG00000259847 LINC02126 - long intergenic non-protein coding RNA 2126 ncRNA 179-83 chr6 20655204 20655672 + 0.666667 NA intron (NM_017774, intron 5 of 15) MER1B|DNA|hAT-Charlie 120981 NM_017774 54901 Hs.657604 NM_017774 ENSG00000145996 CDKAL1 - CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1 protein-coding 178-17 chr10 49650357 49650693 + 0.666667 NA intron (NM_001142929, intron 10 of 14) L2c|LINE|L2 -29126 NM_182554 282966 Hs.131287 NM_182554 ENSG00000178645 C10orf53 - chromosome 10 open reading frame 53 protein-coding 226.667-76 chr5 156673367 156673897 + 0.666667 NA intron (NM_001128209, intron 6 of 7) intron (NM_001128209, intron 6 of 7) -176663 NM_206858 153743 Hs.567727 NM_206858 ENSG00000231989 PPP1R2B PPP1R2P3 PPP1R2 family member B protein-coding 114.667-265 chrX 151996305 151996491 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21722 NM_004961 2564 Hs.22785 NM_004961 ENSG00000102287 GABRE - gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit protein-coding 151.333-39 chr10 6062933 6063234 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001308242) promoter-TSS (NM_001308242) -713 NM_000417 3559 Hs.231367 NM_000417 ENSG00000134460 IL2RA CD25|IDDM10|IL2R|IMD41|TCGFR|p55 interleukin 2 receptor subunit alpha protein-coding 151.667-4 chr1 58074268 58074679 + 0.666667 NA intron (NM_001353980, intron 1 of 5) intron (NM_001353980, intron 1 of 5) 176030 NM_021080 1600 Hs.477370 NM_021080 ENSG00000173406 DAB1 SCA37 DAB adaptor protein 1 protein-coding 159-57 chr2 58426346 58426735 + 0.666667 NA Intergenic AluSp|SINE|Alu -94213 NR_033873 400955 Hs.503210 NR_033873 ENSG00000233723 LINC01122 - long intergenic non-protein coding RNA 1122 ncRNA 271-24 chr2 125595089 125595635 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 522623 NR_146970 105373600 Hs.555059 NR_146970 ENSG00000226813 LINC01941 - long intergenic non-protein coding RNA 1941 ncRNA 118.667-47 chr11 101094259 101094604 + 0.666667 NA intron (NM_000926, intron 2 of 7) intron (NM_000926, intron 2 of 7) 34632 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 114-7 chr1 117696007 117696198 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 90054 NM_017709 54855 Hs.356216 NM_017709 ENSG00000183508 TENT5C FAM46C terminal nucleotidyltransferase 5C protein-coding 142-155 chr8 90272596 90272983 + 0.666667 NA intron (NR_051989, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 51301 NR_051989 100874052 Hs.571514 NR_051989 ENSG00000253394 LINC00534 - long intergenic non-protein coding RNA 534 ncRNA 145.667-226 chr5 99152160 99152481 + 0.666667 NA Intergenic L1PA5|LINE|L1 -222606 NM_001364113 1105 Hs.643465 NM_001270 ENSG00000153922 CHD1 CHD-1|PILBOS chromodomain helicase DNA binding protein 1 protein-coding 259.333-30 chr14 37895719 37896246 + 0.666667 NA TTS (NR_135286) TTS (NR_135286) 6142 NR_135286 400208 Hs.660501 NR_135286 ENSG00000259091 LINC00517 C14orf26 long intergenic non-protein coding RNA 517 ncRNA 118.667-124 chr21 31197023 31197323 + 0.666667 NA intron (NM_001353686, intron 12 of 27) L1PA16|LINE|L1 -36233 NM_001353685 7074 Hs.517228 NM_003253 ENSG00000156299 TIAM1 TIAM-1 T cell lymphoma invasion and metastasis 1 protein-coding 130.667-106 chr2 26153959 26154279 + 0.666667 NA Intergenic L1MB1|LINE|L1 -18969 NM_001168241 150946 Hs.187912 NM_001168241 ENSG00000157833 GAREM2 FAM59B|GAREML GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 protein-coding 189.667-9 chr1 197932143 197932560 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_020204, exon 5 of 5) 3' UTR (NM_020204, exon 5 of 5) 14979 NM_001370213 56956 Hs.442578 NM_020204 ENSG00000143355 LHX9 - LIM homeobox 9 protein-coding 285-2 chr10 50595671 50596224 + 0.666667 NA intron (NM_147156, intron 1 of 10) MIRb|SINE|MIR 28009 NM_147156 259230 Hs.654698 NM_147156 ENSG00000198964 SGMS1 MOB|MOB1|SMS1|TMEM23|hmob33 sphingomyelin synthase 1 protein-coding 151.333-69 chr11 4480505 4480789 + 0.666667 NA Intergenic MSTA|LTR|ERVL-MaLR -8232 NM_001005171 390036 Hs.553726 NM_001005171 ENSG00000196778 OR52K1 OR11-8 olfactory receptor family 52 subfamily K member 1 protein-coding 194-132 chr7 87930994 87931422 + 0.666667 NA Intergenic L1PB1|LINE|L1 -2935 NM_021721 53616 Hs.256398 NM_004194 ENSG00000008277 ADAM22 ADAM 22|EIEE61|MDC2 ADAM metallopeptidase domain 22 protein-coding 153.667-368 chr8 6427236 6427548 + 0.666667 NA intron (NM_001172574, intron 3 of 7) AluJr|SINE|Alu 20239 NM_001322045 79648 Hs.593807 NM_024596 ENSG00000147316 MCPH1 BRIT1|MCT microcephalin 1 protein-coding 123.667-135 chr4 38185807 38186022 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 65960 NM_001253915 23216 Hs.176503 NM_015173 ENSG00000065882 TBC1D1 TBC|TBC1 TBC1 domain family member 1 protein-coding 146.333-16 chr1 174513471 174513742 + 0.666667 NA intron (NM_001366446, intron 13 of 25) AluJr|SINE|Alu 65642 NM_005684 9293 Hs.673850 NM_005684 ENSG00000203737 GPR52 - G protein-coupled receptor 52 protein-coding 134.667-107 chr2 177699459 177699821 + 0.666667 NA intron (NR_136171, intron 2 of 4) intron (NR_136171, intron 2 of 4) 26318 NR_136171 105373764 Hs.666361 NR_136171 ENSG00000229941 LOC105373764 - uncharacterized LOC105373764 ncRNA 198.333-62 chr14 69624110 69624628 + 0.666667 NA intron (NM_014734, intron 1 of 5) MIR|SINE|MIR 12773 NM_014734 9766 Hs.440025 NM_014734 ENSG00000100647 SUSD6 DRAGO|KIAA0247 sushi domain containing 6 protein-coding 155.667-371 chr8 126726424 126726729 + 0.666667 NA Intergenic ERV3-16A3_I-int|LTR|ERVL -168098 NM_174911 157638 Hs.124951 NM_174911 ENSG00000168672 LRATD2 BCMP101|FAM84B|NSE2 LRAT domain containing 2 protein-coding 153.667-316 chr5 74334890 74335204 + 0.666667 NA Intergenic MER74B|LTR|ERVL 12561 NR_105010 101929082 Hs.434316 NR_105010 ENSG00000249343 LINC01333 - long intergenic non-protein coding RNA 1333 ncRNA 150.667-27 chr1 247498732 247499120 + 0.666667 NA Intergenic Charlie3|DNA|hAT-Charlie 7858 NM_001004698 441932 Hs.591526 NM_001004698 OR2W5 OR2W5P|OST722 olfactory receptor family 2 subfamily W member 5 (gene/pseudogene) protein-coding 155-8 chr1 221932467 221932781 + 0.666667 NA intron (NR_149057, intron 1 of 3) L1MA3|LINE|L1 -33786 NR_149071 110806276 NR_149071 LINC02474 - long intergenic non-protein coding RNA 2474 ncRNA 149-79 chr20 45486705 45487083 + 0.666667 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 17141 NM_006103 10406 Hs.2719 NM_006103 ENSG00000101443 WFDC2 EDDM4|HE4|WAP5|dJ461P17.6 WAP four-disulfide core domain 2 protein-coding 153-43 chr14 43105852 43106200 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1401257 NM_032135 84075 Hs.307086 NM_032135 ENSG00000189139 FSCB C14orf155 fibrous sheath CABYR binding protein protein-coding 167.667-117 chr20 19399652 19400059 + 0.666667 NA intron (NM_020689, intron 2 of 16) L1MEc|LINE|L1 -115259 NR_024564 100130264 Hs.683814 NR_024564 ENSG00000179447 LOC100130264 - uncharacterized LOC100130264 ncRNA 148-116 chr4 62685060 62685402 + 0.666667 NA Intergenic L1PA10|LINE|L1 -523466 NR_110595 101927186 Hs.723269 NR_110595 ADGRL3-AS1 LPHN3-AS1 adhesion G protein-coupled receptor L3 antisense RNA 1 ncRNA 170-13 chr10 99399567 99399891 + 0.666667 NA intron (NM_002079, intron 8 of 8) AluJr|SINE|Alu 30895 NM_002079 2805 Hs.500756 NM_002079 ENSG00000120053 GOT1 AST1|ASTQTL1|GIG18|cAspAT|cCAT glutamic-oxaloacetic transaminase 1 protein-coding 138-67 chr20 16451303 16451639 + 0.666667 NA intron (NM_001199866, intron 12 of 22) intron (NM_001199866, intron 12 of 22) 121977 NM_001199866 55614 Hs.101774 NM_024704 ENSG00000089177 KIF16B C20orf23|KISC20ORF|SNX23 kinesin family member 16B protein-coding 249-65 chr7 88279174 88279665 + 0.666667 NA exon (NM_001205315, exon 6 of 6) exon (NM_001205315, exon 6 of 6) 27475 NM_001205315 79689 Hs.521008 NM_024636 ENSG00000127954 STEAP4 STAMP2|SchLAH|TIARP|TNFAIP9 STEAP4 metalloreductase protein-coding 222.333-86 chr7 2967675 2968035 + 0.666667 NA intron (NM_032415, intron 1 of 24) intron (NM_032415, intron 1 of 24) 76012 NM_001324281 84433 Hs.648101 NM_032415 ENSG00000198286 CARD11 BENTA|BIMP3|CARMA1|IMD11|IMD11A|PPBL caspase recruitment domain family member 11 protein-coding 145.333-192 chr3 98783607 98783894 + 0.666667 NA intron (NM_001323359, intron 6 of 10) intron (NM_001323359, intron 6 of 10) 20443 NM_001323367 10402 Hs.148716 NM_006100 ENSG00000064225 ST3GAL6 SIAT10|ST3GALVI ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 protein-coding 197-23 chr11 67511897 67512361 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -3401 NM_005851 10263 Hs.523835 NM_005851 ENSG00000167797 CDK2AP2 DOC-1R|p14 cyclin dependent kinase 2 associated protein 2 protein-coding 179-81 chr5 121445480 121445863 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 123121 NR_104999 102467226 NR_104999 LOC102467226 - uncharacterized LOC102467226 ncRNA 120-148 chr9 109078496 109078740 + 0.666667 NA intron (NM_032012, intron 8 of 17) L1M4a1|LINE|L1 -32320 NR_029506 407036 NR_029506 ENSG00000207698 MIR32 MIRN32|hsa-mir-32|miR-32|miRNA32 microRNA 32 ncRNA 143-62 chr2 27541813 27542146 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu -34543 NM_032266 84226 Hs.131021 NM_032266 ENSG00000221843 C2orf16 - chromosome 2 open reading frame 16 protein-coding 137-24 chr12 43739382 43739786 + 0.666667 NA intron (NM_001098615, intron 5 of 8) AluSx4|SINE|Alu 19206 NM_001271826 83448 Hs.23554 NM_031292 ENSG00000129317 PUS7L - pseudouridine synthase 7 like protein-coding 119.333-168 chr5 25556648 25556879 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 365810 NR_136209 105374693 Hs.628714 NR_136209 LINC02211 - long intergenic non-protein coding RNA 2211 ncRNA 187-47 chr21 33169556 33170007 + 0.666667 NA non-coding (NR_024102, exon 2 of 4) non-coding (NR_024102, exon 2 of 4) 455 NR_024102 728409 Hs.125234 NR_024102 ENSG00000229086 LINC01548 C21orf54 long intergenic non-protein coding RNA 1548 ncRNA 149-146 chr8 96390040 96390325 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -2744 NR_125828 102724804 Hs.571415 NR_125828 ENSG00000253105 LOC102724804 - uncharacterized LOC102724804 ncRNA 131-15 chr10 67144298 67144587 + 0.666667 NA intron (NM_001127384, intron 7 of 17) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 132176 NR_111909 347731 Hs.652155 NM_178011 ENSG00000198739 LRRTM3 - leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 protein-coding 158.333-99 chr15 65004402 65004701 + 0.666667 NA intron (NM_139242, intron 8 of 8) intron (NM_139242, intron 8 of 8) -14637 NM_001127890 51324 Hs.242458 NM_016630 ENSG00000090487 SPG21 ABHD21|ACP33|BM-019|GL010|MAST SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin protein-coding 139.333-35 chr11 60055798 60056066 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001031809) promoter-TSS (NM_001031809) -696 NM_001031809 932 Hs.99960 NM_006138 ENSG00000149516 MS4A3 CD20L|HTM4 membrane spanning 4-domains A3 protein-coding 198.667-148 chr5 44248837 44249279 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -139674 NR_108034 101927075 Hs.617390 NR_108034 ENSG00000248464 FGF10-AS1 - FGF10 antisense RNA 1 ncRNA 150.333-418 chr8 117877611 117877891 + 0.666667 NA intron (NM_000127, intron 1 of 10) intron (NM_000127, intron 1 of 10) 43162 NR_145799 109623457 NR_145799 SNORD168 - small nucleolar RNA, C/D box 168 snoRNA 120.333-76 chr17 6653790 6654084 + 0.666667 NA TTS (NM_001105520) TTS (NM_001105520) -1512 NR_039874 100616466 NR_039874 ENSG00000283301 MIR4520-2 MIR4520B|hsa-mir-4520-2|mir-4520-2 microRNA 4520-2 ncRNA 185.333-88 chr2 63800604 63800965 + 0.666667 NA Intergenic AluJb|SINE|Alu -40180 NM_001001521 7360 Hs.516217 NM_006759 ENSG00000169764 UGP2 UDPG|UDPGP|UDPGP2|UGP1|UGPP1|UGPP2|pHC379 UDP-glucose pyrophosphorylase 2 protein-coding 240-36 chr17 34350657 34351226 + 0.666667 NA Intergenic L1M1|LINE|L1 -5539 NM_005408 6357 Hs.414629 NM_005408 ENSG00000181374 CCL13 CKb10|MCP-4|NCC-1|NCC1|SCYA13|SCYL1 C-C motif chemokine ligand 13 protein-coding 135-113 chr8 121375994 121376355 + 0.666667 NA Intergenic MIR|SINE|MIR -263172 NR_002835 594842 Hs.668686 NR_002835 HAS2-AS1 HAS2-AS|HAS2AS|HASNT|NCRNA00077 HAS2 antisense RNA 1 ncRNA 165 chr1 11110759 11111139 + 0.666667 NA intron (NM_004958, intron 54 of 57) intron (NM_004958, intron 54 of 57) 10930 NR_135063 105376736 Hs.634965 NR_135061 ENSG00000230337 EXOSC10-AS1 - EXOSC10 antisense RNA 1 ncRNA 136.667-171 chr7 123750149 123750466 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1304 NM_003941 8976 Hs.143728 NM_003941 ENSG00000106299 WASL N-WASP|NWASP|WASPB WASP like actin nucleation promoting factor protein-coding 121.333-156 chr6 40960946 40961206 + 0.666667 NA intron (NR_110873, intron 1 of 5) intron (NR_110873, intron 1 of 5) 62204 NR_110873 101929555 Hs.552555 NR_110873 LOC101929555 - uncharacterized LOC101929555 ncRNA 340-23 chr5 93614373 93615306 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 5949 NR_031754 100313887 NR_031754 ENSG00000284336 MIR2277 mir-2277 microRNA 2277 ncRNA 145-29 chr14 48722126 48722411 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 864112 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 126.333-76 chr19 44217372 44217577 + 0.666667 NA intron (NM_001289172, intron 2 of 3) MIR|SINE|MIR 4942 NM_182490 7770 Hs.298089 NM_182490 ENSG00000131115 ZNF227 - zinc finger protein 227 protein-coding 165.333-10 chr1 105905175 105905540 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 122896 NR_146609 105378884 Hs.568533 NR_146609 LINC01677 - long intergenic non-protein coding RNA 1677 ncRNA 194.667-82 chr21 26789573 26790083 + 0.666667 NA Intergenic AluSc|SINE|Alu 55581 NM_006988 9510 Hs.643357 NM_006988 ENSG00000154734 ADAMTS1 C3-C5|METH1 ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1 protein-coding 215.333-5 chr1 59799917 59800415 + 0.666667 NA Intergenic L1M4|LINE|L1 -14783 NM_015888 51361 Hs.378836 NM_015888 ENSG00000134709 HOOK1 HK1 hook microtubule tethering protein 1 protein-coding 195-18 chr10 71878655 71879087 + 0.666667 NA Intergenic L2c|LINE|L2 -27620 NM_001042465 5660 Hs.523004 NM_002778 ENSG00000197746 PSAP GLBA|SAP1 prosaposin protein-coding 177-3 chr1 158459407 158459778 + 0.666667 NA Intergenic LTR33B|LTR|ERVL -5970 NM_001004473 391109 Hs.690410 NM_001004473 ENSG00000173285 OR10K1 OR1-6 olfactory receptor family 10 subfamily K member 1 protein-coding 159.667-81 chr12 61305737 61306127 + 0.666667 NA Intergenic L1MA2|LINE|L1 886907 NM_178539 338811 Hs.269745 NM_178539 ENSG00000198673 TAFA2 FAM19A2|TAFA-2 TAFA chemokine like family member 2 protein-coding 153.667-357 chr7 42661410 42661770 + 0.666667 NA TTS (NR_110833) TTS (NR_110833) 44857 NR_110833 101928795 Hs.566753 NR_110833 ENSG00000238284 LINC01448 - long intergenic non-protein coding RNA 1448 ncRNA 128.333-110 chr2 185796054 185796288 + 0.666667 NA exon (NM_173651, exon 16 of 23) exon (NM_173651, exon 16 of 23) 3979 NR_144453 107985781 Hs.397593 NR_144453 ENSG00000231646 FSIP2-AS1 - FSIP2 antisense RNA 1 ncRNA 225.667-16 chr12 19332055 19332430 + 0.666667 NA intron (NM_001256787, intron 14 of 25) AluJo|SINE|Alu -107250 NM_001363736 121536 Hs.126497 NM_153207 ENSG00000139154 AEBP2 - AE binding protein 2 protein-coding 121.667-208 chr8 117694408 117694605 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 173793 NM_080651 90390 Hs.492612 NM_080651 ENSG00000164758 MED30 MED30S|THRAP6|TRAP25 mediator complex subunit 30 protein-coding 151-112 chr5 150664137 150664435 + 0.666667 NA intron (NM_001122853, intron 2 of 6) intron (NM_001122853, intron 2 of 6) 3035 NM_001122853 91977 Hs.91626 NM_133371 ENSG00000164591 MYOZ3 CS-3|CS3|FATZ-3|FRP3 myozenin 3 protein-coding 136.667-126 chr4 54131200 54131463 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 31168 NM_133267 170825 Hs.371899 NM_133267 ENSG00000180613 GSX2 GSH2 GS homeobox 2 protein-coding 157-32 chr12 56057991 56058328 + 0.666667 NA Intergenic (TCTT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 16241 NM_001029 6231 Hs.447562 NM_001029 ENSG00000197728 RPS26 DBA10|S26|eS26 ribosomal protein S26 protein-coding 200-69 chr17 57005208 57005655 + 0.666667 NA intron (NM_021626, intron 12 of 12) L3b|LINE|CR1 27324 NM_021626 59342 Hs.514950 NM_021626 ENSG00000121064 SCPEP1 HSCP1|RISC serine carboxypeptidase 1 protein-coding 142.667-185 chr6 28263147 28263425 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -3724 NM_152736 7741 Hs.157883 NM_007151 ENSG00000197062 ZSCAN26 SRE-ZBP|SREZBP|ZNF187 zinc finger and SCAN domain containing 26 protein-coding 113.667-189 chr6 119191308 119191499 + 0.666667 NA intron (NM_005907, intron 9 of 12) intron (NM_005907, intron 9 of 12) -42210 NM_001100411 79632 Hs.443789 NM_024581 ENSG00000111879 FAM184A C6orf60 family with sequence similarity 184 member A protein-coding 126.333-134 chr4 76392069 76392382 + 0.666667 NA intron (NM_001042784, intron 3 of 23) L1MA2|LINE|L1 15080 NM_001042784 339965 Hs.529680 NM_178555 ENSG00000163749 CCDC158 - coiled-coil domain containing 158 protein-coding 114.667-248 chr8 120681390 120681602 + 0.666667 NA intron (NM_021021, intron 2 of 6) intron (NM_021021, intron 2 of 6) -79757 NR_125419 101927543 Hs.371902 NR_125419 ENSG00000248318 LOC101927543 - uncharacterized LOC101927543 ncRNA 124-78 chr3 99630163 99630532 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -8247 NM_020351 1295 Hs.654548 NM_001850 ENSG00000144810 COL8A1 C3orf7 collagen type VIII alpha 1 chain protein-coding 129.667-18 chr10 9888376 9888752 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -170158 NR_120636 101928298 Hs.385576 NR_120636 ENSG00000224788 LINC02670 - long intergenic non-protein coding RNA 2670 ncRNA 112-21 chr10 110994638 110994940 + 0.666667 NA intron (NM_007373, intron 3 of 8) intron (NM_007373, intron 3 of 8) 5863 NR_031614 100313921 NR_031614 ENSG00000221214 MIR548E MIRN548E|hsa-mir-548e microRNA 548e ncRNA 126-47 chr18 12960282 12960595 + 0.666667 NA intron (NM_031216, intron 3 of 8) L1MB4|LINE|L1 12427 NM_001013437 81929 Hs.301048 NM_031216 ENSG00000085415 SEH1L SEC13L|SEH1A|SEH1B|Seh1 SEH1 like nucleoporin protein-coding 204.667-45 chr14 77502680 77503156 + 0.666667 NA Intergenic AluSx|SINE|Alu -4102 NM_182509 145501 Hs.29742 NM_182509 ENSG00000100593 ISM2 TAIL1|THSD3 isthmin 2 protein-coding 202.333-63 chr15 41535427 41535882 + 0.666667 NA intron (NM_015540, intron 4 of 24) intron (NM_015540, intron 4 of 24) 8603 NM_015540 26015 Hs.371045 NM_015540 ENSG00000103932 RPAP1 - RNA polymerase II associated protein 1 protein-coding 182.333-26 chr11 65923031 65923333 + 0.666667 NA Intergenic AluJo|SINE|Alu 3756 NM_006442 10589 Hs.356742 NM_006442 ENSG00000175550 DRAP1 NC2-alpha DR1 associated protein 1 protein-coding 134-54 chr2 227260686 227261069 + 0.666667 NA intron (NM_000091, intron 19 of 51) intron (NM_000091, intron 19 of 51) 64287 NR_102371 654841 Hs.659982 NR_102371 ENSG00000236432 LOC654841 - uncharacterized LOC654841 ncRNA 236.333-45 chr2 80055211 80055830 + 0.666667 NA intron (NM_001282598, intron 7 of 17) MER102b|DNA|hAT-Charlie -188937 NR_107047 102465877 NR_107047 ENSG00000276917 MIR8080 hsa-mir-8080 microRNA 8080 ncRNA 165.333-79 chr14 70450180 70450524 + 0.666667 NA Intergenic L1MDa|LINE|L1 -1822 NM_003813 8747 Hs.178748 NM_003813 ENSG00000139985 ADAM21 ADAM 21|ADAM31 ADAM metallopeptidase domain 21 protein-coding 228.667-16 chr11 59403695 59404197 + 0.666667 NA Intergenic MER41-int|LTR|ERV1 19007 NM_001001954 219981 Hs.553648 NM_001001954 ENSG00000172324 OR5A2 - olfactory receptor family 5 subfamily A member 2 protein-coding 201.667-42 chr15 92473167 92473565 + 0.666667 NA intron (NR_161371, intron 2 of 2) MIR|SINE|MIR 1689 NR_161370 145858 Hs.367879 NM_153040 C15orf32 - chromosome 15 open reading frame 32 ncRNA 135-55 chr20 36140271 36140575 + 0.666667 NA intron (NM_001258330, intron 3 of 20) MIRb|SINE|MIR -14317 NM_012156 2036 Hs.437422 NM_012156 ENSG00000088367 EPB41L1 4.1N|MRD11 erythrocyte membrane protein band 4.1 like 1 protein-coding 149-86 chr22 33207508 33207782 + 0.666667 NA Intergenic LTR78B|LTR|ERV1 99116 NR_134617 105373006 Hs.637171 NR_134617 ENSG00000231253 LINC01640 - long intergenic non-protein coding RNA 1640 ncRNA 112.333-5 chr1 44198155 44198411 + 0.666667 NA Intergenic L1M8|LINE|L1 -15188 NM_019100 55929 Hs.8008 NM_019100 ENSG00000178028 DMAP1 DNMAP1|DNMTAP1|EAF2|MEAF2|SWC4 DNA methyltransferase 1 associated protein 1 protein-coding 141.333-77 chr17 58345963 58346360 + 0.666667 NA non-coding (NR_073470, exon 5 of 5) non-coding (NR_073470, exon 5 of 5) 6040 NR_073470 6827 Hs.439481 NM_003168 ENSG00000213246 SUPT4H1 SPT4|SPT4H|SUPT4H|Supt4a SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit protein-coding 177.666-27 chr6 75667840 75668371 + 0.666667 NA intron (NM_001100409, intron 9 of 22) intron (NM_001100409, intron 9 of 22) 66225 NM_015571 26054 Hs.485784 NM_015571 ENSG00000112701 SENP6 SSP1|SUSP1 SUMO specific peptidase 6 protein-coding 117.333-215 chr8 137601062 137601372 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -187629 NR_125428 101927915 Hs.695851 NR_125428 LOC101927915 - uncharacterized LOC101927915 ncRNA 145.333-236 chr5 63991142 63991443 + 0.666667 NA Intergenic L1ME3Cz|LINE|L1 -29000 NM_000524 3350 Hs.247940 NM_000524 ENSG00000178394 HTR1A 5-HT-1A|5-HT1A|5HT1a|ADRB2RL1|ADRBRL1|G-21|PFMCD 5-hydroxytryptamine receptor 1A protein-coding 146-108 chr5 83406870 83407172 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -64653 NM_001164097 1462 Hs.643801 NM_004385 ENSG00000038427 VCAN CSPG2|ERVR|GHAP|PG-M|WGN|WGN1 versican protein-coding 149.667-383 chr7 117313296 117313576 + 0.666667 NA intron (NM_003391, intron 3 of 4) intron (NM_003391, intron 3 of 4) 9622 NR_024047 7472 Hs.567356 NM_003391 ENSG00000105989 WNT2 INT1L1|IRP Wnt family member 2 protein-coding 125-72 chr3 8979930 8980271 + 0.666667 NA TTS (NM_001033117) TTS (NM_001033117) -16628 NM_020165 56852 Hs.375684 NM_020165 ENSG00000070950 RAD18 RNF73 RAD18 E3 ubiquitin protein ligase protein-coding 140.333-224 chr7 138125242 138125623 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1674 NR_039678 100616226 NR_039678 ENSG00000284028 MIR4468 - microRNA 4468 ncRNA 195-103 chr8 75732921 75733396 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 193190 NM_004133 3174 Hs.241529 NM_004133 ENSG00000164749 HNF4G NR2A2|NR2A3 hepatocyte nuclear factor 4 gamma protein-coding 147-124 chr6 94296233 94296586 + 0.666667 NA Intergenic Tigger3b|DNA|TcMar-Tigger 578106 NR_152795 643432 Hs.509936 NR_015362 TSG1 - tumor suppressor TSG1 ncRNA 146.333-247 chr5 10322226 10322598 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -14510 NM_138809 134147 Hs.192586 NM_138809 ENSG00000164237 CMBL JS-1 carboxymethylenebutenolidase homolog protein-coding 163.667-152 chr3 52736856 52737203 + 0.666667 NA TTS (NM_001348413) TTS (NM_001348413) 30923 NM_014041 28972 Hs.11125 NM_014041 ENSG00000114902 SPCS1 HSPC033|SPC1|SPC12|YJR010C-A signal peptidase complex subunit 1 protein-coding 172.333-66 chr17 60857745 60858099 + 0.666667 NA intron (NM_001330413, intron 7 of 25) intron (NM_001330413, intron 7 of 25) 180071 NM_001320470 54828 Hs.655028 NM_017679 ENSG00000141376 BCAS3 GAOB1|MAAB BCAS3 microtubule associated cell migration factor protein-coding 160.333-282 chr8 103495329 103495666 + 0.666667 NA intron (NR_145698, intron 2 of 4) L2a|LINE|L2 3734 NR_145706 105375690 NR_145697 LOC105375690 - uncharacterized LOC105375690 ncRNA 157-23 chr10 91972577 91972906 + 0.666667 NA intron (NM_003972, intron 14 of 37) MER46C|DNA|TcMar-Tigger 48971 NM_003972 9044 Hs.500526 NM_003972 ENSG00000095564 BTAF1 MOT1|TAF(II)170|TAF172|TAFII170 B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 protein-coding 197.667-59 chr18 71163673 71164196 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 415022 NR_038325 100505776 Hs.202072 NR_038325 ENSG00000260676 LINC01541 UTAT39 long intergenic non-protein coding RNA 1541 ncRNA 216.667-108 chr9 5461791 5462280 + 0.666667 NA intron (NR_052005, intron 3 of 7) L1MC3|LINE|L1 11493 NR_052005 29126 Hs.521989 NM_014143 ENSG00000120217 CD274 B7-H|B7H1|PD-L1|PDCD1L1|PDCD1LG1|PDL1|hPD-L1 CD274 molecule protein-coding 119.667-45 chr14 45702982 45703309 + 0.666667 NA Intergenic L1MC5|LINE|L1 12457 NR_146546 105370479 NR_146546 ENSG00000258616 LINC02303 - long intergenic non-protein coding RNA 2303 ncRNA 175.333-61 chr16 67905514 67905897 + 0.666667 NA intron (NM_006742, intron 1 of 2) AluSx1|SINE|Alu 12451 NM_006742 5681 Hs.513683 NM_006742 ENSG00000159792 PSKH1 - protein serine kinase H1 protein-coding 163.333-187 chr3 180216590 180216883 + 0.666667 NA Intergenic L3|LINE|CR1 -179799 NM_001256753 51555 Hs.235331 NM_016559 ENSG00000114757 PEX5L PEX5R|PEX5RP|PXR2|PXR2B|TRIP8b peroxisomal biogenesis factor 5 like protein-coding 164.667-259 chrX 139632889 139633322 + 0.666667 NA intron (NM_001099855, intron 4 of 27) intron (NM_001099855, intron 4 of 27) 9736 NM_001171878 4168 Hs.387262 NM_005369 ENSG00000101977 MCF2 ARHGEF21|DBL MCF.2 cell line derived transforming sequence protein-coding 125-59 chr2 128106370 128106714 + 0.666667 NA intron (NR_027671, intron 3 of 40) intron (NR_027671, intron 3 of 40) 15342 NR_027671 56886 Hs.743306 NM_020120 ENSG00000136731 UGGT1 HUGT1|UGCGL1|UGT1 UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 protein-coding 177.333-161 chr8 13879738 13880039 + 0.666667 NA Intergenic ERVL-E-int|LTR|ERVL 250198 NR_134450 102725080 Hs.130621 NR_134450 LOC102725080 - uncharacterized LOC102725080 ncRNA 115.333-105 chr18 75684356 75684566 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 27942 NR_134646 100505853 Hs.146758 NR_134646 ENSG00000261194 LINC01898 - long intergenic non-protein coding RNA 1898 ncRNA 157.333-138 chr16 71520697 71521012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5266 NM_005769 10164 Hs.251383 NM_005769 ENSG00000140835 CHST4 GST3|GlcNAc6ST2|HECGLCNAC6ST|LSST carbohydrate sulfotransferase 4 protein-coding 178.667-44 chr13 69431907 69432272 + 0.666667 NA Intergenic MER67C|LTR|ERV1 209743 NR_125752 103689913 Hs.585628 NR_125752 ENSG00000235221 LINC00383 LINC00401 long intergenic non-protein coding RNA 383 ncRNA 118-95 chr3 180281629 180281866 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -132426 NR_132416 100505609 Hs.518427 NR_132416 ENSG00000241696 LINC02053 - long intergenic non-protein coding RNA 2053 ncRNA 124-116 chr9 18139597 18139854 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -334428 NM_001040272 92949 Hs.741483 NM_052866 ENSG00000178031 ADAMTSL1 ADAMTSL-1|ADAMTSR1|C9orf94|PUNCTIN ADAMTS like 1 protein-coding 259-30 chr2 227063264 227063808 + 0.666667 NA intron (NM_000092, intron 25 of 47) intron (NM_000092, intron 25 of 47) 101023 NM_000092 1286 Hs.591645 NM_000092 ENSG00000081052 COL4A4 ATS2|BFH|CA44 collagen type IV alpha 4 chain protein-coding 150.333-322 chr5 37578688 37579095 + 0.666667 NA intron (NM_001345998, intron 9 of 17) intron (NM_001345998, intron 9 of 17) 199573 NM_018034 55100 Hs.213690 NM_018034 ENSG00000082068 WDR70 - WD repeat domain 70 protein-coding 135-100 chr7 32151194 32151549 + 0.666667 NA intron (NM_001322059, intron 3 of 17) intron (NM_001322059, intron 3 of 17) -79935 NM_001322057 5137 Hs.143821 NM_005020 ENSG00000154678 PDE1C DFNA74|Hcam3|cam-PDE 1C|hCam-3 phosphodiesterase 1C protein-coding 131-66 chr3 182732716 182733047 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -60623 NM_014616 23200 Hs.478429 NM_014616 ENSG00000058063 ATP11B ATPIF|ATPIR ATPase phospholipid transporting 11B (putative) protein-coding 153-64 chr17 63426050 63426469 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_025185, exon 26 of 26) 3' UTR (NM_025185, exon 26 of 26) 14008 NM_001330421 1534 Hs.355264 NM_001915 ENSG00000008283 CYB561 CYB561A1|FRRS2|ORTHYP2 cytochrome b561 protein-coding 113.667-166 chr5 5024124 5024383 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -10106 NR_026994 340094 Hs.665092 NR_026994 ENSG00000215231 LINC01020 - long intergenic non-protein coding RNA 1020 ncRNA 112-46 chr12 71878386 71878718 + 0.666667 NA intron (NR_027449, intron 3 of 15) AluSz6|SINE|Alu -27569 NR_024072 729633 Hs.716256 NR_024072 MRS2P2 - MRS2 pseudogene 2 pseudo 167.333-181 chr3 161989377 161989755 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 492758 NM_001080440 131149 Hs.585021 NM_001080440 ENSG00000182447 OTOL1 C1QTNF15|C1QTNF16 otolin 1 protein-coding 157-62 chr2 81999724 82000009 + 0.666667 NA Intergenic MIRb|SINE|MIR -532920 NR_110161 100507201 Hs.98589 NR_110161 ENSG00000235519 LINC01815 - long intergenic non-protein coding RNA 1815 ncRNA 183.333-31 chr12 58402076 58402481 + 0.666667 NA Intergenic L1MEc|LINE|L1 -189424 NR_126341 100506869 Hs.290456 NR_126341 ENSG00000258231 LOC100506869 - uncharacterized LOC100506869 ncRNA 123.667-127 chr3 114806723 114806908 + 0.666667 NA intron (NM_001348805, intron 4 of 10) L1MB8|LINE|L1 -47708 NM_001164344 26137 Hs.202577 NM_015642 ENSG00000181722 ZBTB20 DPZF|HOF|ODA-8S|PRIMS|ZNF288 zinc finger and BTB domain containing 20 protein-coding 179.667-132 chr8 56857104 56857441 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 136595 NM_017813 54928 Hs.438689 NM_017813 ENSG00000104331 IMPAD1 GPAPP|IMP 3|IMP-3|IMPA3 inositol monophosphatase domain containing 1 protein-coding 200.667-137 chr6 124270535 124270886 + 0.666667 NA intron (NM_001300737, intron 2 of 7) intron (NM_001300737, intron 2 of 7) -12295 NM_001300740 154215 Hs.656604 NM_153355 ENSG00000188580 NKAIN2 FAM77B|NKAIP2|TCBA|TCBA1 sodium/potassium transporting ATPase interacting 2 protein-coding 189-94 chr8 115201508 115201898 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 466310 NM_001282902 7227 Hs.657018 NM_014112 ENSG00000104447 TRPS1 GC79|LGCR transcriptional repressor GATA binding 1 protein-coding 111.667-171 chr3 121575789 121575992 + 0.666667 NA intron (NM_001012659, intron 2 of 4) AluSz|SINE|Alu 7941 NM_001012659 503582 Hs.224976 NM_001012659 ENSG00000186103 ARGFX - arginine-fifty homeobox protein-coding 140.333-109 chr2 121751814 121752191 + 0.666667 NA Intergenic L1MD|LINE|L1 -3543 NM_001261401 7247 Hs.75066 NM_004622 ENSG00000211460 TSN BCLF-1|C3PO|RCHF1|REHF-1|TBRBP|TRSLN translin protein-coding 120.333-48 chr13 51760439 51760785 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_052950, exon 12 of 12) 3' UTR (NM_052950, exon 12 of 12) 43550 NM_001270424 79758 Hs.266728 NM_024705 ENSG00000102796 DHRS12 SDR40C1 dehydrogenase/reductase 12 protein-coding 147-133 chr7 94923351 94923765 + 0.666667 NA intron (NM_017650, intron 2 of 15) intron (NM_017650, intron 2 of 15) 13660 NM_001166163 55607 Hs.21816 NM_017650 ENSG00000158528 PPP1R9A NRB1|NRBI|Neurabin-I protein phosphatase 1 regulatory subunit 9A protein-coding 162.667-212 chr5 37620073 37620475 + 0.666667 NA intron (NM_001345998, intron 10 of 17) intron (NM_001345998, intron 10 of 17) 214548 NM_001278098 2668 Hs.248114 NM_000514 ENSG00000168621 GDNF ATF|ATF1|ATF2|HFB1-GDNF|HSCR3 glial cell derived neurotrophic factor protein-coding 317.667-39 chr8 87618707 87619421 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 254951 NM_152418 138009 Hs.371738 NM_152418 ENSG00000176566 DCAF4L2 WDR21C DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 2 protein-coding 151.333-168 chr16 80130528 80130826 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 335428 NR_104661 101928248 Hs.659802 NR_104660 ENSG00000260876 LINC01229 - long intergenic non-protein coding RNA 1229 ncRNA 156.333-155 chr18 52287418 52287874 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -52551 NM_005215 1630 Hs.162025 NM_005215 ENSG00000187323 DCC CRC18|CRCR1|HGPPS2|IGDCC1|MRMV1|NTN1R1 DCC netrin 1 receptor protein-coding 204.667-83 chr20 20472267 20472677 + 0.666667 NA intron (NM_020343, intron 37 of 39) intron (NM_020343, intron 37 of 39) 104368 NM_002196 3642 Hs.89584 NM_002196 ENSG00000173404 INSM1 IA-1|IA1 INSM transcriptional repressor 1 protein-coding 182-62 chr21 20736112 20736581 + 0.666667 NA Intergenic Charlie7a|DNA|hAT-Charlie 66762 NR_109788 387486 Hs.576551 NR_024090 ENSG00000224924 LINC00320 C21orf131|NCRNA00320|PRED14 long intergenic non-protein coding RNA 320 ncRNA 135.333-116 chr3 97658816 97659127 + 0.666667 NA intron (NM_001080448, intron 14 of 17) intron (NM_001080448, intron 14 of 17) -105550 NM_177976 84100 Hs.373801 NM_032146 ENSG00000113966 ARL6 BBS3|RP55 ADP ribosylation factor like GTPase 6 protein-coding 155-57 chr19 5176438 5176757 + 0.666667 NA Intergenic AluSc8|SINE|Alu 164215 NM_002850 5802 Hs.744928 NM_002850 ENSG00000105426 PTPRS PTPSIGMA|R-PTP-S|R-PTP-sigma protein tyrosine phosphatase receptor type S protein-coding 149-129 chr6 70691391 70691687 + 0.666667 NA intron (NM_001281440, intron 1 of 10) L1MA3|LINE|L1 23009 NM_001281440 60682 Hs.485717 NM_021940 ENSG00000112305 SMAP1 SMAP-1 small ArfGAP 1 protein-coding 158-134 chr7 157486383 157486756 + 0.666667 NA intron (NR_110157, intron 2 of 3) intron (NR_110157, intron 2 of 3) 20338 NR_110157 101927914 Hs.623826 NR_110157 ENSG00000234210 LOC101927914 - uncharacterized LOC101927914 ncRNA 193.667-141 chr9 34283171 34283642 + 0.666667 NA intron (NM_194313, intron 6 of 12) intron (NM_194313, intron 6 of 12) 45862 NM_194313 347240 Hs.710246 NM_194313 ENSG00000186638 KIF24 C9orf48|bA571F15.4 kinesin family member 24 protein-coding 220.333-28 chr11 44489574 44489962 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -75895 NM_001024844 3732 Hs.527778 NM_002231 ENSG00000085117 CD82 4F9|C33|GR15|IA4|KAI1|R2|SAR2|ST6|TSPAN27 CD82 molecule protein-coding 133-42 chr2 68248508 68248776 + 0.666667 NA intron (NM_000945, intron 1 of 5) MER5A|DNA|hAT-Charlie 3890 NM_000945 5534 Hs.280604 NM_000945 ENSG00000221823 PPP3R1 CALNB1|CNB|CNB1 protein phosphatase 3 regulatory subunit B, alpha protein-coding 130.667-95 chr18 11315328 11315703 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -138963 NR_146901 105371994 Hs.640568 NR_146901 ENSG00000267425 LINC01928 - long intergenic non-protein coding RNA 1928 ncRNA 114.333-54 chr12 51088834 51089012 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5327 NR_045072 81566 Hs.524425 NM_030809 ENSG00000110925 CSRNP2 C12orf2|C12orf22|FAM130A1|PPP1R72|TAIP-12 cysteine and serine rich nuclear protein 2 protein-coding 134.667-81 chr17 60128634 60128868 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -21222 NR_137422 762 Hs.89485 NM_000717 ENSG00000167434 CA4 CAIV|Car4|RP17 carbonic anhydrase 4 protein-coding 198.333-108 chr20 25253104 25253575 + 0.666667 NA intron (NM_002862, intron 1 of 19) MLT2D|LTR|ERVL 5254 NM_002862 5834 Hs.368157 NM_002862 ENSG00000100994 PYGB GPBB glycogen phosphorylase B protein-coding 113.333-153 chr20 49873124 49873370 + 0.666667 NA intron (NR_048540, intron 8 of 11) AluJo|SINE|Alu 9388 NR_162136 113219455 NR_162136 MIR12122 - microRNA 12122 ncRNA 155-7 chr1 202734555 202734834 + 0.666667 NA intron (NM_001314042, intron 23 of 27) intron (NM_001314042, intron 23 of 27) -24240 NM_177402 127833 Hs.25422 NM_177402 ENSG00000143858 SYT2 CMS7|MYSPC|SytII synaptotagmin 2 protein-coding 202.333-52 chr13 63484930 63485529 + 0.666667 NA Intergenic HERVL-int|LTR|ERVL -157135 NR_126409 104355293 Hs.121439 NR_126409 ENSG00000227564 LINC00376 - long intergenic non-protein coding RNA 376 ncRNA 117-112 chr5 32937963 32938177 + 0.666667 NA Intergenic L4_B_Mam|LINE|RTE-X -9373 NR_033832 340113 Hs.434404 NR_033832 ENSG00000248279 LINC02120 - long intergenic non-protein coding RNA 2120 ncRNA 148-54 chr17 44859091 44859447 + 0.666667 NA intron (NM_001142605, intron 17 of 26) intron (NM_001142605, intron 17 of 26) 11386 NR_073504 51751 Hs.151787 NM_016438 ENSG00000131097 HIGD1B CLST11240|CLST11240-15 HIG1 hypoxia inducible domain family member 1B protein-coding 138-56 chr2 83824390 83824743 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 301752 NR_146482 101928031 Hs.547548 NR_146482 ENSG00000232548 LINC01809 - long intergenic non-protein coding RNA 1809 ncRNA 194.667-164 chr9 71943433 71943867 + 0.666667 NA intron (NR_157410, intron 2 of 4) AluSp|SINE|Alu 32011 NM_182505 138241 Hs.534190 NM_182505 ENSG00000155621 C9orf85 - chromosome 9 open reading frame 85 protein-coding 148.667-327 chr6 12191120 12191487 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -99058 NM_001168319 1906 Hs.511899 NM_001955 ENSG00000078401 EDN1 ARCND3|ET1|HDLCQ7|PPET1|QME endothelin 1 protein-coding 135.333-175 chr7 46238989 46239259 + 0.666667 NA Intergenic L1MD1|LINE|L1 -317852 NM_001013398 3486 Hs.450230 NM_000598 ENSG00000146674 IGFBP3 BP-53|IBP3 insulin like growth factor binding protein 3 protein-coding 180.667-152 chr8 133699414 133699763 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -15522 NR_134463 105375773 Hs.445172 NR_134462 LOC105375773 - uncharacterized LOC105375773 ncRNA 126.333-57 chr15 55005060 55005434 + 0.666667 NA Intergenic (TA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -51500 NR_135679 105370829 Hs.174934 NR_135679 ENSG00000260937 LOC105370829 - uncharacterized LOC105370829 ncRNA 141 chr1 45130257 45130481 + 0.666667 NA intron (NM_020883, intron 1 of 13) (AC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 76236 NM_020883 57643 Hs.656613 NM_020883 ENSG00000162415 ZSWIM5 - zinc finger SWIM-type containing 5 protein-coding 125-64 chr20 3080565 3080788 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 4048 NM_000490 551 Hs.89648 NM_000490 ENSG00000101200 AVP ADH|ARVP|AVP-NPII|AVRP|VP arginine vasopressin protein-coding 154.667-386 chr8 89482505 89482907 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 275005 NR_125822 101929709 Hs.651324 NR_125822 ENSG00000251136 LOC101929709 - uncharacterized LOC101929709 ncRNA 113-47 chr12 116247561 116247893 + 0.666667 NA intron (NM_015335, intron 1 of 30) intron (NM_015335, intron 1 of 30) 29459 NM_015335 23389 Hs.603766 NM_015335 ENSG00000123066 MED13L MRFACD|PROSIT240|THRAP2|TRAP240L mediator complex subunit 13L protein-coding 129.333-189 chr8 118976308 118976576 + 0.666667 NA intron (NM_001324095, intron 1 of 7) intron (NM_001324095, intron 1 of 7) 24179 NM_001324095 10584 Hs.176615 NM_006438 ENSG00000184374 COLEC10 3MC3|CL-34|CLL1 collectin subfamily member 10 protein-coding 128-84 chr4 99382857 99383213 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -30289 NM_000669 126 Hs.654537 NM_000669 ENSG00000248144 ADH1C ADH3 alcohol dehydrogenase 1C (class I), gamma polypeptide protein-coding 204-134 chr3 129988134 129988595 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 13644 NM_007117 7200 Hs.182231 NM_007117 ENSG00000170893 TRH Pro-TRH|TRF thyrotropin releasing hormone protein-coding 197.333-63 chr14 49311453 49311986 + 0.666667 NA Intergenic AluSq2|SINE|Alu 274661 NM_001030001 6235 Hs.156367 NM_001032 ENSG00000213741 RPS29 DBA13|S29|uS14 ribosomal protein S29 protein-coding 222.333-67 chr4 71874692 71875084 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 -69368 NM_001204306 2638 Hs.418497 NM_000583 ENSG00000145321 GC DBP|DBP-maf|DBP/GC|GRD3|Gc-MAF|GcMAF|HEL-S-51|VDB|VDBG|VDBP GC vitamin D binding protein protein-coding 127.667-80 chr2 49968343 49968682 + 0.666667 NA intron (NM_001330093, intron 21 of 22) intron (NM_001330093, intron 21 of 22) 5691 NM_001320157 9378 Hs.637685 NM_004801 ENSG00000179915 NRXN1 Hs.22998|PTHSL2|SCZD17 neurexin 1 protein-coding 126.333-133 chr4 67082335 67082641 + 0.666667 NA Intergenic MER4CL34|LTR|ERV1 339512 NR_110747 101927237 Hs.435644 NR_110747 ENSG00000250075 LOC101927237 - uncharacterized LOC101927237 ncRNA 161.667-106 chr17 64618684 64619094 + 0.666667 NA intron (NM_022739, intron 1 of 18) MIR|SINE|MIR 43418 NM_022739 64750 Hs.515011 NM_022739 ENSG00000108854 SMURF2 - SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 protein-coding 148-23 chr11 5737408 5737791 + 0.666667 NA 3' UTR (NM_001005180, exon 1 of 1) 3' UTR (NM_001005180, exon 1 of 1) 1151 NM_001005180 387748 Hs.689609 NM_001005180 ENSG00000181023 OR56B1 OR11-65|OR56B1P olfactory receptor family 56 subfamily B member 1 protein-coding 116.333-73 chr15 78579794 78580035 + 0.666667 NA intron (NM_001307945, intron 1 of 5) intron (NM_001307945, intron 1 of 5) 14394 NM_000745 1138 Hs.1614 NM_000745 ENSG00000169684 CHRNA5 LNCR2 cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit protein-coding 165.333-224 chr6 61994874 61995143 + 0.666667 NA intron (NR_146874, intron 3 of 13) L2|LINE|L2 291217 NM_152688 202559 Hs.519794 NM_152688 ENSG00000112232 KHDRBS2 SLM-1|SLM1 KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2 protein-coding 113.333-106 chr18 9800509 9800719 + 0.666667 NA intron (NM_006868, intron 3 of 6) intron (NM_006868, intron 3 of 6) -85359 NM_032243 84203 Hs.98712 NM_032243 ENSG00000168454 TXNDC2 SPTRX|SPTRX1 thioredoxin domain containing 2 protein-coding 112.333-155 chr22 34914489 34914667 + 0.666667 NA intron (NR_138042, intron 1 of 4) intron (NR_138042, intron 1 of 4) 83338 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 221.667-73 chr7 47762297 47762890 + 0.666667 NA intron (NR_038407, intron 1 of 2) intron (NR_038407, intron 1 of 2) 1117 NR_038407 84847 Hs.488236 NR_038407 ENSG00000146666 LINC00525 - long intergenic non-protein coding RNA 525 ncRNA 248-47 chr22 27027794 27028381 + 0.666667 NA Intergenic L1ME4a|LINE|L1 32431 NM_001318329 284898 Hs.350813 NM_001318329 LOC284898 - uncharacterized LOC284898 protein-coding 209.333-67 chr14 83995665 83996076 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1276062 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 112.667-194 chr4 78874277 78874509 + 0.666667 NA intron (NM_017593, intron 13 of 13) A-rich|Low_complexity|Low_complexity 65045 NM_001350106 152559 Hs.657312 NM_177453 ENSG00000163291 PAQR3 RKTG progestin and adipoQ receptor family member 3 protein-coding 173.333-200 chr8 82630818 82631305 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -281043 NR_134295 101927141 Hs.128557 NR_134295 ENSG00000254394 LOC101927141 - uncharacterized LOC101927141 ncRNA 153.333-407 chr8 80292518 80292928 + 0.666667 NA Intergenic L1MB7|LINE|L1 51334 NR_049894 100847056 NR_049894 ENSG00000265588 MIR5708 - microRNA 5708 ncRNA 166-55 chr17 68447405 68447737 + 0.666667 NA intron (NM_001320772, intron 2 of 11) AluJo|SINE|Alu 9925 NM_017983 55062 Hs.463964 NM_017983 ENSG00000070540 WIPI1 ATG18|ATG18A|WIPI49 WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 protein-coding 112-190 chr7 50078130 50078322 + 0.666667 NA intron (NM_007009, intron 3 of 7) L1MA1|LINE|L1 15020 NM_001159878 11055 Hs.388841 NM_007009 ENSG00000042813 ZPBP ZPBP1 zona pellucida binding protein protein-coding 193.333-124 chr3 88554339 88554891 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat 216159 NM_001368166 111064647 NM_001368165 CSNKA2IP - casein kinase 2 subunit alpha' interacting protein protein-coding 196.667-120 chr5 54947201 54947630 + 0.666667 NA Intergenic (TC)n|Simple_repeat|Simple_repeat 38178 NM_007036 11082 Hs.129944 NM_007036 ENSG00000164283 ESM1 endocan endothelial cell specific molecule 1 protein-coding 164-73 chr22 34709797 34710208 + 0.666667 NA Intergenic MER41B|LTR|ERV1 287914 NR_138042 101926957 Hs.722607 NR_138042 ISX-AS1 - ISX antisense RNA 1 ncRNA 151.333-86 chr11 101126739 101127174 + 0.666667 NA intron (NM_001271162, intron 1 of 7) intron (NM_001271162, intron 1 of 7) 2107 NM_001271161 5241 Hs.32405 NM_000926 ENSG00000082175 PGR NR3C3|PR progesterone receptor protein-coding 147.333-106 chr14 61631512 61631831 + 0.666667 NA intron (NR_039985, intron 1 of 2) intron (NR_039985, intron 1 of 2) -61018 NR_110416 101927780 Hs.254789 NR_110416 ENSG00000250548 LINC01303 - long intergenic non-protein coding RNA 1303 ncRNA 135.667-22 chr10 99251092 99251337 + 0.666667 NA Intergenic L1PA16|LINE|L1 -15339 NM_021828 60495 Hs.500750 NM_021828 ENSG00000172987 HPSE2 HPA2|HPR2|UFS|UFS1 heparanase 2 (inactive) protein-coding 157.667-162 chr2 220588934 220589255 + 0.666667 NA Intergenic MLT1C|LTR|ERVL-MaLR -682529 NR_036228 100422959 NR_036228 ENSG00000266518 MIR4268 - microRNA 4268 ncRNA 146.333-256 chr5 55251826 55252164 + 0.666667 NA Intergenic LTR49|LTR|ERV1 -18278 NR_125347 10309 Hs.3041 NM_021147 ENSG00000152669 CCNO CCNU|CILD29|UDG2 cyclin O protein-coding 123.667-52 chr14 43029296 43029607 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 1422595 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 113-8 chr1 112536611 112536883 + 0.666667 NA intron (NM_017744, intron 14 of 14) intron (NM_017744, intron 14 of 14) 27782 NM_024494 7482 Hs.258575 NM_004185 ENSG00000134245 WNT2B WNT13 Wnt family member 2B protein-coding 199-82 chr5 54785558 54786021 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -41531 NR_104658 102467080 Hs.637409 NR_104658 LOC102467080 - uncharacterized LOC102467080 ncRNA 160.667-217 chr4 18580508 18580839 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -558798 NR_158565 254251 Hs.446201 NM_153686 ENSG00000178177 LCORL MLR1 ligand dependent nuclear receptor corepressor like protein-coding 160.333-183 chr3 42958044 42958369 + 0.666667 NA Intergenic L1M5|LINE|L1 -21105 NM_001129908 729085 Hs.729533 NM_001129908 ENSG00000144649 GASK1A C3orf41|FAM198A golgi associated kinase 1A protein-coding 167.333-200 chr4 157412521 157412919 + 0.666667 NA Intergenic MSTB2|LTR|ERVL-MaLR -159770 NR_026992 340017 Hs.428275 NR_026992 ENSG00000234111 LINC02433 - long intergenic non-protein coding RNA 2433 ncRNA 153.333-304 chr4 85864349 85864585 + 0.666667 NA intron (NM_001287805, intron 1 of 7) intron (NM_001287805, intron 1 of 7) 36530 NM_001287805 83478 Hs.444229 NM_031305 ENSG00000138639 ARHGAP24 FILGAP|RC-GAP72|RCGAP72|p73|p73RhoGAP Rho GTPase activating protein 24 protein-coding 212.667-75 chr2 102338125 102338568 + 0.666667 NA intron (NR_104167, intron 2 of 8) intron (NR_104167, intron 2 of 8) 1089 NM_003856 9173 Hs.66 NM_003856 ENSG00000115602 IL1RL1 DER4|FIT-1|IL33R|ST2|ST2L|ST2V|T1 interleukin 1 receptor like 1 protein-coding 214-115 chr6 64794289 64794692 + 0.666667 NA intron (NM_001292009, intron 22 of 43) MSTA|LTR|ERVL-MaLR -506928 NM_001271675 441155 Hs.546686 NM_001271675 LOC441155 - zinc finger CCCH-type domain-containing-like protein-coding 193.667-117 chr6 143957124 143957554 + 0.666667 NA intron (NM_001289047, intron 2 of 3) intron (NM_001289047, intron 2 of 3) 4071 NM_001317157 5325 Hs.743225 NM_002656 ENSG00000118495 PLAGL1 LOT1|ZAC|ZAC1 PLAG1 like zinc finger 1 protein-coding 143-65 chr2 34379416 34379744 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -297977 NR_126404 104355288 Hs.624529 NR_126404 ENSG00000228262 LINC01320 - long intergenic non-protein coding RNA 1320 ncRNA 239-10 chr10 60109295 60109765 + 0.666667 NA intron (NM_001204403, intron 27 of 43) intron (NM_001204403, intron 27 of 43) 31486 NM_001149 288 Hs.499725 NM_001149 ENSG00000151150 ANK3 ANKYRIN-G|MRT37 ankyrin 3 protein-coding 146-27 chr14 47476149 47476429 + 0.666667 NA intron (NM_001113498, intron 1 of 16) intron (NM_001113498, intron 1 of 16) -133043 NR_103766 161357 Hs.436380 NM_182830 ENSG00000139915 MDGA2 MAMDC1|c14_5286 MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 protein-coding 220.667-70 chr4 20556936 20557528 + 0.666667 NA intron (NM_001289135, intron 25 of 35) Tigger1|DNA|TcMar-Tigger 28957 NR_029631 407000 NR_029631 ENSG00000207732 MIR218-1 MIRN218-1|mir-218-1 microRNA 218-1 ncRNA 116-3 chr1 49042233 49042496 + 0.666667 NA intron (NM_001323575, intron 5 of 12) MIR3|SINE|MIR -215047 NR_125988 101929721 Hs.639985 NR_125988 ENSG00000230114 LOC101929721 - uncharacterized LOC101929721 ncRNA 175.333-116 chr3 25438516 25438991 + 0.666667 NA intron (NR_110892, intron 1 of 6) intron (NR_110892, intron 1 of 6) 10490 NR_110892 5915 Hs.543218 NM_000965 ENSG00000077092 RARB HAP|MCOPS12|NR1B2|RARbeta1|RRB2 retinoic acid receptor beta protein-coding 162.333-26 chr10 33784268 33784670 + 0.666667 NA Intergenic Tigger1|DNA|TcMar-Tigger -11789 NR_038932 100505583 Hs.568804 NR_038932 ENSG00000261683 LINC00838 - long intergenic non-protein coding RNA 838 ncRNA 114.667-34 chr10 58158792 58159075 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A0|LTR|ERVL-MaLR 108961 NM_152230 253430 Hs.30280 NM_152230 ENSG00000151151 IPMK - inositol polyphosphate multikinase protein-coding 217-2 chr1 40906111 40906756 + 0.666667 NA Intergenic L1MD3|LINE|L1 -44070 NM_133467 163732 Hs.355820 NM_133467 ENSG00000179862 CITED4 - Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 4 protein-coding 134.667-184 chr7 74438564 74438923 + 0.666667 NA Intergenic MLT1A1|LTR|ERVL-MaLR -15163 NM_005685 9569 Hs.647056 NM_005685 ENSG00000006704 GTF2IRD1 BEN|CREAM1|GTF3|MUSTRD1|RBAP2|WBS|WBSCR11|WBSCR12|hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1 protein-coding 137.333-66 chr17 47704805 47705150 + 0.666667 NA intron (NM_014726, intron 6 of 8) MIRb|SINE|MIR 9713 NM_014726 9755 Hs.94790 NM_014726 ENSG00000198933 TBKBP1 ProSAPiP2|SINTBAD TBK1 binding protein 1 protein-coding 144.667-320 chr9 28525183 28525462 + 0.666667 NA intron (NM_152570, intron 2 of 6) L1MB8|LINE|L1 193983 NM_152570 158038 Hs.444665 NM_152570 ENSG00000174482 LINGO2 LERN3|LRRN6C leucine rich repeat and Ig domain containing 2 protein-coding 117.667-75 chr18 11125609 11125917 + 0.666667 NA intron (NM_022068, intron 1 of 51) intron (NM_022068, intron 1 of 51) 22999 NM_022068 63895 Hs.436902 NM_022068 ENSG00000154864 PIEZO2 C18orf30|C18orf58|DA3|DA5|DAIPT|FAM38B|FAM38B2|HsT748|HsT771|MWKS piezo type mechanosensitive ion channel component 2 protein-coding 186.333-59 chr17 44920876 44921255 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -5513 NM_001363846 2670 Hs.514227 NM_002055 ENSG00000131095 GFAP ALXDRD glial fibrillary acidic protein protein-coding 199.667-20 chr10 89294876 89295262 + 0.666667 NA Intergenic (GGAAA)n|Simple_repeat|Simple_repeat -6977 NM_001547 3433 Hs.437609 NM_001547 ENSG00000119922 IFIT2 G10P2|GARG-39|IFI-54|IFI-54K|IFI54|IFIT-2|ISG-54 K|ISG-54K|ISG54|P54|cig42 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 2 protein-coding 120.667-131 chr4 112751270 112751476 + 0.666667 NA intron (NM_001354269, intron 1 of 43) MIRc|SINE|MIR 45355 NM_001354269 287 Hs.620557 NM_001148 ENSG00000145362 ANK2 ANK-2|LQT4|brank-2 ankyrin 2 protein-coding 158-8 chr1 207334363 207334713 + 0.666667 NA intron (NM_001114752, intron 6 of 10) L1MEg|LINE|L1 12860 NM_001114752 1604 Hs.126517 NM_000574 ENSG00000196352 CD55 CHAPLE|CR|CROM|DAF|TC CD55 molecule (Cromer blood group) protein-coding 121.333-24 chr10 72206418 72206766 + 0.666667 NA intron (NM_001198799, intron 3 of 12) intron (NM_001198799, intron 3 of 12) 9364 NM_001369088 51008 Hs.500007 NM_015947 ENSG00000138303 ASCC1 ASC1p50|CGI-18|SMABF2|p50 activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 protein-coding 121.667-209 chr8 123095953 123096251 + 0.666667 NA intron (NM_001363149, intron 5 of 21) L2a|LINE|L2 22853 NM_001363149 93594 Hs.492716 NM_145647 ENSG00000156787 TBC1D31 Gm85|WDR67 TBC1 domain family member 31 protein-coding 137.333-38 chr12 121446754 121447117 + 0.666667 NA intron (NM_001005366, intron 13 of 22) Charlie1a|DNA|hAT-Charlie -2583 NR_106957 102465665 NR_106957 ENSG00000284402 MIR7107 hsa-mir-7107 microRNA 7107 ncRNA 116.333-149 chr3 188047910 188048137 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -71616 NR_135538 105374266 Hs.570518 NR_135537 LINC01991 - long intergenic non-protein coding RNA 1991 ncRNA 193.667-134 chr8 86056083 86056499 + 0.666667 NA intron (NM_033126, intron 2 of 2) AluJr|SINE|Alu 13377 NM_033126 85481 Hs.566854 NM_033126 ENSG00000147613 PSKH2 - protein serine kinase H2 protein-coding 138.667-47 chr12 56880104 56880416 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 54148 NM_148897 121214 Hs.380178 NM_148897 ENSG00000170426 SDR9C7 ARCI13|RDHS|SDR-O|SDRO short chain dehydrogenase/reductase family 9C member 7 protein-coding 120.333-70 chr16 60916599 60916882 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 139026 NR_039624 100616345 NR_039624 ENSG00000283795 MIR4426 - microRNA 4426 ncRNA 159.333-318 chr7 145408606 145409070 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -572785 NM_001350887 27010 Hs.660232 NM_022445 ENSG00000196511 TPK1 HTPK1|PP20|THMD5 thiamin pyrophosphokinase 1 protein-coding 115.667-201 chr7 73390141 73390369 + 0.666667 NA Intergenic L1M4b|LINE|L1 -43523 NM_003508 8326 Hs.647029 NM_003508 ENSG00000188763 FZD9 CD349|FZD3 frizzled class receptor 9 protein-coding 118.667-120 chr20 42696661 42696869 + 0.666667 NA intron (NM_133170, intron 6 of 31) intron (NM_133170, intron 6 of 31) 11282 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 140.667-40 chr10 88536497 88536775 + 0.666667 NA intron (NM_018363, intron 4 of 6) L2a|LINE|L2 46682 NM_001031709 55328 Hs.149849 NM_018363 ENSG00000184719 RNLS C10orf59|RENALASE renalase, FAD dependent amine oxidase protein-coding 212.333-80 chr2 218468682 218469170 + 0.666667 NA intron (NM_020935, intron 20 of 25) AluSx|SINE|Alu 49803 NM_007127 7429 Hs.654595 NM_007127 ENSG00000127831 VIL1 D2S1471|VIL villin 1 protein-coding 132-13 chr1 215373029 215373416 + 0.666667 NA Intergenic (AT)n|Simple_repeat|Simple_repeat -194082 NM_001319294 51133 Hs.335139 NM_016121 ENSG00000136636 KCTD3 NY-REN-45 potassium channel tetramerization domain containing 3 protein-coding 125.667-106 chr2 165279016 165279285 + 0.666667 NA intron (NM_001040143, intron 2 of 27) MIRb|SINE|MIR -14905 NM_021007 6326 Hs.93485 NM_021007 ENSG00000136531 SCN2A BFIC3|BFIS3|BFNIS|EIEE11|HBA|HBSCI|HBSCII|NAC2|Na(v)1.2|Nav1.2|SCN2A1|SCN2A2 sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 protein-coding 132.667-87 chr2 89777929 89778211 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -140163 NR_136329 101927050 Hs.578075 NR_136329 LOC101927050 - lysine methyltransferase 2C pseudogene pseudo 168.667-201 chr7 43295926 43296306 + 0.666667 NA intron (NM_001287059, intron 2 of 27) intron (NM_001287059, intron 2 of 27) 145221 NR_037508 100500829 NR_037508 ENSG00000264069 MIR3943 - microRNA 3943 ncRNA 112.333-138 chr2 175366132 175366335 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -184523 NM_001002258 518 Hs.429 NM_001689 ENSG00000154518 ATP5MC3 ATP5G3|P3 ATP synthase membrane subunit c locus 3 protein-coding 137.667-22 chr10 15835522 15835827 + 0.666667 NA intron (NM_024948, intron 6 of 14) intron (NM_024948, intron 6 of 14) 24833 NM_024948 80013 Hs.158870 NM_024948 ENSG00000148481 MINDY3 C10orf97|CARP|DERP5|FAM188A|MST126|MSTP126|my042 MINDY lysine 48 deubiquitinase 3 protein-coding 137.667-2 chr1 53980265 53980582 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 34073 NM_052940 115353 Hs.40094 NM_052940 ENSG00000116212 LRRC42 dJ167A19.4 leucine rich repeat containing 42 protein-coding 203.667-25 chr12 91057871 91058200 + 0.666667 NA 5' UTR (NM_007035, exon 1 of 3) 5' UTR (NM_007035, exon 1 of 3) 319 NM_007035 11081 Hs.125750 NM_007035 ENSG00000139330 KERA CNA2|KTN|SLRR2B keratocan protein-coding 141.667-70 chr14 41878531 41878774 + 0.666667 NA intron (NM_001330106, intron 2 of 4) intron (NM_001330106, intron 2 of 4) 271796 NM_001346175 145581 Hs.136893 NM_152447 ENSG00000165379 LRFN5 C14orf146|FIGLER8|SALM5 leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 protein-coding 136-84 chr5 79073503 79073811 + 0.666667 NA intron (NM_001178005, intron 1 of 6) intron (NM_001178005, intron 1 of 6) 3890 NM_017614 23743 Hs.114172 NM_017614 ENSG00000132840 BHMT2 - betaine--homocysteine S-methyltransferase 2 protein-coding 141-6 chr1 198082737 198083101 + 0.666667 NA Intergenic Zaphod2|DNA|hAT-Tip100 -74079 NM_133494 140609 Hs.24119 NM_133494 ENSG00000151414 NEK7 - NIMA related kinase 7 protein-coding 163-15 chr12 81412818 81413154 + 0.666667 NA intron (NM_001220478, intron 3 of 28) intron (NM_001220478, intron 3 of 28) -43572 NM_001220480 8499 Hs.506216 NM_003625 ENSG00000139220 PPFIA2 - PTPRF interacting protein alpha 2 protein-coding 164.333-133 chr2 202813489 202813836 + 0.666667 NA intron (NM_001288623, intron 8 of 12) intron (NM_001288623, intron 8 of 12) 15572 NM_001288624 130026 Hs.516629 NM_138468 ENSG00000163596 ICA1L ALS2CR14|ALS2CR15 islet cell autoantigen 1 like protein-coding 188.667-147 chr8 48970980 48971385 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -49753 NM_003068 6591 Hs.360174 NM_003068 ENSG00000019549 SNAI2 SLUG|SLUGH|SLUGH1|SNAIL2|WS2D snail family transcriptional repressor 2 protein-coding 213.667-28 chr12 17453456 17453993 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 135354 NR_146522 105369678 NR_146522 LINC02378 - long intergenic non-protein coding RNA 2378 ncRNA 125-76 chr3 118035253 118035587 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -344495 NR_146652 105374057 Hs.518179 NR_146652 ENSG00000241213 LINC02024 - long intergenic non-protein coding RNA 2024 ncRNA 117.667-126 chr3 188800992 188801257 + 0.666667 NA intron (NM_001167672, intron 7 of 9) intron (NM_001167672, intron 7 of 9) 112343 NR_029502 407020 NR_029502 ENSG00000207651 MIR28 MIRN28|hsa-mir-28|miR-28 microRNA 28 ncRNA 205-11 chr1 223217200 223217719 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -74211 NM_003268 7100 Hs.604542 NM_003268 ENSG00000187554 TLR5 MELIOS|SLE1|SLEB1|TIL3 toll like receptor 5 protein-coding 134.667-93 chr2 9915898 9916242 + 0.666667 NA intron (NM_001318977, intron 11 of 13) L1ME1|LINE|L1 -35623 NM_198182 29841 Hs.418493 NM_198182 ENSG00000134317 GRHL1 LBP32|MGR|NH32|TFCP2L2 grainyhead like transcription factor 1 protein-coding 112-24 chr10 123680478 123680797 + 0.666667 NA intron (NM_153442, intron 2 of 2) intron (NM_153442, intron 2 of 2) 14282 NM_153442 2849 Hs.12751 NM_153442 ENSG00000154478 GPR26 - G protein-coupled receptor 26 protein-coding 187.667-81 chr20 42170431 42170934 + 0.666667 NA intron (NM_133170, intron 17 of 31) L1M6|LINE|L1 -514801 NR_110004 101927159 Hs.570383 NR_110004 ENSG00000229042 LOC101927159 - uncharacterized LOC101927159 ncRNA 136.667-56 chr14 55640746 55641001 + 0.666667 NA intron (NR_073129, intron 16 of 45) intron (NR_073129, intron 16 of 45) 60666 NM_001079521 3895 Hs.509414 NM_004986 ENSG00000126777 KTN1 CG1|KNT|MU-RMS-40.19 kinectin 1 protein-coding 168.333-70 chr16 89093133 89093466 + 0.666667 NA promoter-TSS (NM_001243279) promoter-TSS (NM_001243279) -510 NM_001243279 197322 Hs.461727 NM_174917 ENSG00000176715 ACSF3 - acyl-CoA synthetase family member 3 protein-coding 133.667-44 chr12 90117287 90117516 + 0.666667 NA Intergenic L1MA4A|LINE|L1 169708 NR_135019 105369891 Hs.148998 NR_135019 ENSG00000257725 LINC02399 - long intergenic non-protein coding RNA 2399 ncRNA 119.333-157 chr3 189289366 189289678 + 0.666667 NA intron (NM_198485, intron 4 of 5) MIR|SINE|MIR -48928 NR_046722 100874027 Hs.616080 NR_046722 ENSG00000230115 TPRG1-AS2 - TPRG1 antisense RNA 2 ncRNA 203.333-105 chr17 28752066 28752513 + 0.666667 NA Intergenic AluSx3|SINE|Alu 8278 NM_004295 9618 Hs.8375 NM_004295 ENSG00000076604 TRAF4 CART1|MLN62|RNF83 TNF receptor associated factor 4 protein-coding 175-70 chr5 84897699 84898055 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -512997 NM_005711 10085 Hs.482730 NM_005711 ENSG00000164176 EDIL3 DEL1 EGF like repeats and discoidin domains 3 protein-coding 175-74 chr6 95984158 95984544 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -31623 NM_006581 10690 Hs.49117 NM_006581 ENSG00000172461 FUT9 Fuc-TIX fucosyltransferase 9 protein-coding 116.667-166 chr5 138701827 138702108 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 51342 NR_134245 105379194 Hs.445981 NR_134244 ENSG00000253404 LOC105379194 - uncharacterized LOC105379194 ncRNA 131.333-57 chr15 38997668 38997960 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -252855 NR_144508 400360 Hs.376109 NM_207445 ENSG00000175746 C15orf54 - chromosome 15 open reading frame 54 (putative) ncRNA 162.333-37 chr11 18588130 18588472 + 0.666667 NA intron (NM_001040697, intron 1 of 11) intron (NM_001040697, intron 1 of 11) 433 NM_001297771 55293 Hs.407991 NM_018314 ENSG00000151116 UEVLD ATTP|UEV3 UEV and lactate/malate dehyrogenase domains protein-coding 202.333-186 chr9 68869859 68870451 + 0.666667 NA intron (NM_003558, intron 5 of 15) intron (NM_003558, intron 5 of 15) 90090 NM_138333 116224 Hs.655572 NM_138333 ENSG00000187866 FAM122A C9orf42 family with sequence similarity 122A protein-coding 140.333-69 chr14 84133714 84134109 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -1138021 NR_145983 26843 NR_145983 SNORD3P3 RNU3P3|U3|U3.5|u3.7 small nucleolar RNA, C/D box 3 pseudogene 3 snoRNA 250.333-81 chr9 12882984 12883615 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -68910 NR_125775 101929467 Hs.586443 NR_125775 ENSG00000235448 LURAP1L-AS1 - LURAP1L antisense RNA 1 ncRNA 144-2 chr1 57800679 57800955 + 0.666667 NA intron (NM_001353980, intron 3 of 5) intron (NM_001353980, intron 3 of 5) -59764 NR_104362 101926890 Hs.662207 NR_104362 ENSG00000226759 DAB1-AS1 - DAB1 antisense RNA 1 ncRNA 167.667-110 chr2 150771844 150772242 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic 143146 NR_110247 101929282 Hs.126866 NR_110244 ENSG00000224048 LINC02612 - long intergenic non-protein coding RNA 2612 ncRNA 166-121 chr8 135533262 135533703 + 0.666667 NA intron (NM_006558, intron 2 of 8) intron (NM_006558, intron 2 of 8) 76026 NM_006558 10656 Hs.444558 NM_006558 ENSG00000131773 KHDRBS3 Etle|SALP|SLM-2|SLM2|T-STAR|TSTAR|etoile KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 protein-coding 138.333-211 chr9 98729730 98730136 + 0.666667 NA Intergenic L1MB5|LINE|L1 -20998 NM_005458 9568 Hs.198612 NM_005458 ENSG00000136928 GABBR2 EIEE59|GABABR2|GPR51|GPRC3B|HG20|HRIHFB2099|NDPLHS gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 protein-coding 122-100 chr5 128061601 128061803 + 0.666667 NA intron (NR_152809, intron 1 of 2) AluSz6|SINE|Alu 21473 NR_152801 644873 Hs.340623 NR_015360 ENSG00000245937 LINC01184 - long intergenic non-protein coding RNA 1184 ncRNA 167-95 chr7 84071397 84071673 + 0.666667 NA intron (NM_006080, intron 4 of 16) intron (NM_006080, intron 4 of 16) 123254 NM_006080 10371 Hs.252451 NM_006080 ENSG00000075213 SEMA3A COLL1|HH16|Hsema-I|Hsema-III|SEMA1|SEMAD|SEMAIII|SEMAL|SemD|coll-1 semaphorin 3A protein-coding 113-174 chr5 122450795 122451023 + 0.666667 NA exon (NM_001242935, exon 8 of 10) exon (NM_001242935, exon 8 of 10) 28178 NR_051996 153163 Hs.679757 NR_051996 ENSG00000250328 MGC32805 - uncharacterized LOC153163 ncRNA 151.667-254 chr4 96625187 96625529 + 0.666667 NA intron (NR_147149, intron 3 of 3) MIRc|SINE|MIR 314655 NR_147149 105377338 NR_147149 LINC02267 - long intergenic non-protein coding RNA 2267 ncRNA 175.333-5 chr1 63755271 63755673 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -18545 NM_001083592 4919 Hs.128753 NM_005012 ENSG00000185483 ROR1 NTRKR1|dJ537F10.1 receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1 protein-coding 149.667-277 chr4 40167854 40168171 + 0.666667 NA Intergenic L1MEj|LINE|L1 -23068 NM_001278368 399 Hs.654594 NM_004310 ENSG00000168421 RHOH ARHH|TTF ras homolog family member H protein-coding 120.333-45 chr12 117689942 117690205 + 0.666667 NA intron (NM_173598, intron 4 of 19) MER58A|DNA|hAT-Charlie 278917 NM_173598 283455 Hs.375836 NM_173598 ENSG00000171435 KSR2 - kinase suppressor of ras 2 protein-coding 138.333-186 chr7 109228830 109229123 + 0.666667 NA Intergenic Intergenic -344389 NM_001024607 154907 Hs.276325 NM_001024607 C7orf66 - chromosome 7 open reading frame 66 protein-coding 114.333 chr1 45674567 45674864 + 0.666667 NA intron (NM_021639, intron 2 of 12) MER47B|DNA|TcMar-Tigger 11818 NM_021639 60313 Hs.238432 NM_021639 ENSG00000159592 GPBP1L1 SP192 GC-rich promoter binding protein 1 like 1 protein-coding 139.333-17 chr1 232707739 232708007 + 0.666667 NA Intergenic AluSz|SINE|Alu -10198 NR_146922 105373199 Hs.254475 NR_146922 ENSG00000225919 LINC01745 - long intergenic non-protein coding RNA 1745 ncRNA